##fileformat=VCFv4.1
##FILTER=<ID=GOF,Description="Variant fails goodness-of-fit test.">
##FILTER=<ID=HapScore,Description="Too many haplotypes are supported by the data in this region.">
##FILTER=<ID=MQ,Description="Root-mean-square mapping quality across calling region is low.">
##FILTER=<ID=Q20,Description="Variant quality is below 20.">
##FILTER=<ID=QD,Description="Variants fail quality/depth filter.">
##FILTER=<ID=QualDepth,Description="Variant quality/Read depth ratio is low.">
##FILTER=<ID=REFCALL,Description="This line represents a homozygous reference call">
##FILTER=<ID=SC,Description="Variants fail sequence-context filter. Surrounding sequence is low-complexity">
##FILTER=<ID=alleleBias,Description="Variant frequency is lower than expected for het">
##FILTER=<ID=badReads,Description="Variant supported only by reads with low quality bases close to variant position, and not present on both strands.">
##FILTER=<ID=hp10,Description="Flanking sequence contains homopolymer of length 10 or greater">
##FILTER=<ID=strandBias,Description="Variant fails strand-bias filter">
##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allelic frequency for the alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##GATKCommandLine.CombineVariants=<ID=CombineVariants,Version=3.4-0-g7e26428,Date="Thu Jul 19 23:13:38 EDT 2018",Epoch=1532056418771,CommandLineOptions="analysis_type=CombineVariants input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=10000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=2 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=[(RodBindingCollection [(RodBinding name=HC source=/lscratch/5608287//HC.vcf)]), (RodBindingCollection [(RodBinding name=Platypus source=/lscratch/5608287//PL.vcf)])] out=/gpfs/gsfs6/users/MoCha/processedDATA/349418/20170910/349418~098-R~PDC~WES/calls/349418~098-R~PDC~WES.merged.vcf genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED multipleallelesmergetype=BY_TYPE rod_priority_list=HC,Platypus printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false excludeNonVariants=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 suppressCommandLineHeader=false mergeInfoWithMaxAC=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=ALERT,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is adjacent to other variants, but case was too complex for joinAdjacentSNPs to handle. Please review.">
##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
##INFO=<ID=BRF,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of reads around this variant that failed filters">
##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
##INFO=<ID=ClippingRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref number of hard clipped bases">
##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Combined depth across samples">
##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="Stop position of the interval">
##INFO=<ID=ExcessHet,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value for exact test of excess heterozygosity">
##INFO=<ID=FR,Number=.,Type=Float,Description="Estimated population frequency of variant">
##INFO=<ID=FS,Number=.,Type=Float,Description="Fisher's exact test for strand bias (Phred scale)">
##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length around variant locus">
##INFO=<ID=HapScore,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype score measuring the number of haplotypes the variant is segregating into in a window">
##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
##INFO=<ID=JOINED,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is the result of joining adjacent SNPs/MNPs. Please use caution when interpreting sample-specific values.">
##INFO=<ID=MGOF,Number=.,Type=Integer,Description="Worst goodness-of-fit value reported across all samples">
##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MMLQ,Number=1,Type=Float,Description="Median minimum base quality for bases around variant">
##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
##INFO=<ID=NF,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
##INFO=<ID=NR,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
##INFO=<ID=PP,Number=.,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant-quality/read-depth for this variant">
##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=.,Type=Float,Description="Mann-Whitney Rank sum test for difference between in positions of variants in reads from ref and alt">
##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
##INFO=<ID=SOR,Number=1,Type=Float,Description="Symmetric Odds Ratio of 2x2 contingency table to detect strand bias">
##INFO=<ID=START,Number=.,Type=Integer,Description="Start position of reference call block">
##INFO=<ID=SbPval,Number=.,Type=Float,Description="Binomial P-value for strand bias test">
##INFO=<ID=Size,Number=.,Type=Integer,Description="Size of reference call block">
##INFO=<ID=Source,Number=.,Type=String,Description="Was this variant suggested by Playtypus, Assembler, or from a VCF?">
##INFO=<ID=TC,Number=1,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
##INFO=<ID=TCF,Number=1,Type=Integer,Description="Total forward strand coverage at this locus">
##INFO=<ID=TCR,Number=1,Type=Integer,Description="Total reverse strand coverage at this locus">
##INFO=<ID=TR,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
##INFO=<ID=WE,Number=1,Type=Integer,Description="End position of calling window">
##INFO=<ID=WS,Number=1,Type=Integer,Description="Starting position of calling window">
##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
##SentieonCommandLine.Haplotyper=<ID=Haplotyper,Version="sentieon-genomics-201711",Date="2018-07-20T03:02:31Z",CommandLine="/data/MoCha/patidarr/sentieon/sentieon-genomics-201711/libexec/driver --temp_dir /lscratch/5608047// -t 26 -r /data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta -i 349418/20170910/349418~098-R~PDC~WES/349418~098-R~PDC~WES.bwa.final.bam --interval /data/MoCha/patidarr/ref/design/Sureselect.v5.refseq.ensembl.noUTR.notfound.targetbp.hg19.bed --algo Haplotyper -d /data/MoCha/patidarr/ref/dbsnp_138.hg19.vcf --min_base_qual 20 --min_map_qual 30 /lscratch/5608047//349418~098-R~PDC~WES.HC_DNASeq.raw.vcf">
##contig=<ID=chrM,length=16571,assembly=hg19>
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##fileDate=2018-07-19
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chr1	69511	rs75062661	A	G	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=38;PP=1792;SC=TATGGCTGTCACATGGGGAAT;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=69519;WS=69501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	752894	rs3131971	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	762273	rs3115849	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.003;NF=7;NR=28;PP=639;ReadPosRankSum=-0.864;SC=CTGCCAAGGAGGAGCCCGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=35;WE=762281;WS=762263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr1	762589	rs71507461	G	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.61;MQRankSum=-1.244;QD=34.61;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	762592	rs71507462	C	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.61;MQRankSum=-1.244;QD=34.61;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	762601	rs71507463	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQRankSum=-2.614;QD=32.67;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	762632	rs61768173	T	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=5;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.876;NF=5;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.955;SC=AGAACTAGGGTGGAAGGGCCG;SOR=1.773;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=762640;WS=762622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	782981	rs6594026	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.554;NF=7;NR=3;PP=109;ReadPosRankSum=0.044;SC=TAAGACAGGGCGTTGTGAAGA;SOR=0.036;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=10;WE=782989;WS=782971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr1	792263	rs1044922	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.51;QD=25.16;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	792480	rs2905036	C	T	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=60;PP=2033;SC=TTGTGTTCAACATATTTCATT;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=105;WE=792488;WS=792470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	866319	rs9988021	G	A	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=10;PP=844;SC=GTGGCCCAGCGGGGCACTGAC;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=866327;WS=866309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	866511	.	C	CCCCT	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.227;NF=1;NR=5;PP=251;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GGCCGTGACTCCCCTCCCTCC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=6;WE=866519;WS=866501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	871334	rs4072383	G	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-0.893;SC=GAGGACGGTGGCGTCTCCACT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=871342;WS=871324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	876499	rs4372192	A	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=10;PP=482;SC=AGCCGGGGGGATCACTGCTGT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=876507;WS=876489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	877715	rs6605066	C	G	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=6;PP=184;SC=CGAGACGGACCGGGTAGGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=877723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	877831	rs6672356	T	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=8;PP=270;SC=GATGTTCGCCTGGCAGCAGGA;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=877839;WS=877821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	879676	rs6605067	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=389;SC=TCAAAGGAAAGGAACAAATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=879695;WS=879666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	879687	rs2839	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=312;SC=GAACAAATTTTCAAAGACTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=879695;WS=879666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	880238	rs3748592	A	G	5494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=83;PP=2965;SC=AGCCAGCCTTAGAGGTTACTC;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=76;TCR=83;TR=159;WE=880246;WS=880228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	880639	rs35916504	TC	T	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=371;ReadPosRankSum=-2.155;SC=TCCGCTGACTTCCAGCAGGTG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=880647;WS=880629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr1	881627	rs2272757	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=441;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TACAAGGTCAGGGGTGTCCCC;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=35;WE=881635;WS=881617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr1	882033	rs2272756	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.752;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=-0.544;SC=TACCCCAGGAGGGGACATGGA;SOR=1.581;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=23;WE=882041;WS=882023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr1	883625	rs4970378	A	G	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=48;PP=1837;SC=GAAGAGCAGGAGAGAGGGCCG;SOR=0.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=91;WE=883633;WS=883615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	884091	.	C	G	798	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=59.33;NF=5;NR=21;PP=798;QD=32.029662021;SC=CACCTGGCTGCACCCTGGTCA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=26;WE=884109;WS=884081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:73,26:0.26:99
chr1	884091	.	C	CACCCTGGTCCCCCTGGTCCCTTTGGCCCTGCACCTGGCTGG,CACCCTGGTCCCCCTGGTCCCTTTGGCCCTGCACCTGGCTGGACCCTGGTCCCCCTGGTCCCTTTGGCCCTGCACCTGGCTGG	4134.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.65;QD=98.45;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,17,25:0.40,0.60:42
chr1	884101	.	A	C	2405	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=59.24;NF=15;NR=50;PP=2405;QD=37.5349417315;SC=CACCCTGGTCACCCTGGTCCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=65;WE=884109;WS=884081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,65:0.74:88
chr1	886788	rs10465242	G	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=38;PP=1392;SC=TGGGGCTGCAGGTACCTTACC;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=886796;WS=886778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	886817	rs10465241	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=899;SC=AGCTTTATTTCAACACGGTGG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=886825;WS=886807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	887560	rs3748595	A	C	6956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=106;PP=2965;SC=CCAGGCTGACAAGTCAGGCTG;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=209;WE=887568;WS=887550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	887801	rs3828047	A	G	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=30;PP=2095;SC=CCTTCTTGCGAGTGGTCATGG;SOR=1.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=93;WE=887809;WS=887791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	888639	rs3748596	T	C	6316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=96;PP=2965;SC=GCAGAGACTCTTCCCCAGTGC;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=94;TCR=96;TR=190;WE=888647;WS=888629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	888659	rs3748597	T	C	6003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=96;PP=2965;SC=CTCCATACGATCACCATTCTC;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=90;TCR=96;TR=186;WE=888667;WS=888649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr1	889158	rs13303056	GA	CC	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=1373;SC=ACTGGGCCACGAACCTTGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=889167;WS=889148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	889638	rs13303206	G	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=539;SC=AGGGGCTTAGGAGGACCCTCT;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=889646;WS=889628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	892745	rs13303227	G	A	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=995;SC=CTTCACAAGGGTTACCAACTA;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=892753;WS=892735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	894573	rs13303010	G	A	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=88;PP=2852;SC=AGGCCAAATCGGCCCTCGGAC;SOR=1.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=123;WE=894581;WS=894563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	897325	rs4970441	G	C	8758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=150;PP=2965;SC=TTGCCGATGCGCACTCCTGCA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=129;TCR=150;TR=279;WE=897333;WS=897315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr1	897564	rs13303229	T	C	6054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=75;PP=2965;SC=CCGAGACCTTTCTGGATCTGG;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=98;TCR=75;TR=173;WE=897572;WS=897554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	898323	rs6605071	T	C	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=32;PP=1523;SC=CGTTTCCCTCTTGCCCTGTGC;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=898331;WS=898313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	900285	rs4970435	CA	TG	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=7;PP=1775;SC=TTTTGTGGTGCAGCCCCTCCC;SOR=2.461;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=40;WE=900294;WS=900275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	900505	rs28705211	G	C	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1545;ReadPosRankSum=0.991;SC=GTGTGGCGGTGCTGGAGCTGC;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=90;TCR=106;TR=95;WE=900513;WS=900495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,111:0.48:230
chr1	909768	rs2340593	A	G	5825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=89;PP=2965;SC=CTGCCTCCTGAGGTGAGTGCC;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=178;WE=909776;WS=909758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	911595	rs7417106	A	G	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=624;ReadPosRankSum=0.446;SC=CCCTTGCCCCACCTGCCGGCG;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=44;WE=911603;WS=911585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr1	912049	rs9803103	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=510;ReadPosRankSum=0.556;SC=CACTCAGAGATGGCCCCGCAC;SOR=1.008;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=35;WE=912057;WS=912039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr1	912103	rs9803017	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.29;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	914192	rs2340595	G	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=202;SC=GCGGCCCCCTGCTTGGCCAAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=914200;WS=914182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	914333	rs13302979	C	G	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=19;PP=1023;SC=CCCGCCCCCTCGGAGGCCGAC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=914341;WS=914323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	914839	rs34903276	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1121;ReadPosRankSum=-1.115;SC=GGCTGAGGGCCGGGCTGAGGC;SOR=0.742;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=137;TCF=77;TCR=60;TR=68;WE=914860;WS=914829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
chr1	914852	rs13303368	G	C	7598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=61;PP=2962;SC=GCTGAGGCCTGTCCTGAGCCT;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=147;WE=914860;WS=914829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	914876	rs13302983	T	C	8012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=70;PP=2965;SC=TTATTGGGGCTGGGCCCAGCC;SOR=0.921;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=94;TCR=70;TR=164;WE=914884;WS=914866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	914940	rs13303033	T	C	7504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.120;NF=123;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.003;SC=CCAGTGCGGGTGCCCCAGAGC;SOR=0.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=124;TCR=104;TR=227;WE=914948;WS=914930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,277:1.00:278
chr1	915227	rs13303355	A	G	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=68;PP=2945;SC=TCCGTGTCCAATTGTGGCTTG;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=138;WE=915235;WS=915217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	916549	rs6660139	A	G	4997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=62;PP=2764;SC=GGCTCCATCCATGCCCTGAAA;SOR=1.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=154;WE=916557;WS=916539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	935222	rs2298214	C	A	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=1016;SC=CGGTCGCCCCCCTCACGCCCG;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=935230;WS=935212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	948846	rs3841266	T	TA	936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=5;PP=655;SC=GCCTCAGGCTTATAATAGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=14;WE=948854;WS=948836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	948870	rs4615788	C	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=587;SC=TGCTGCCTGCCGAAGCCGGCG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=948878;WS=948860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	948921	rs15842	T	C	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=25;PP=901;SC=TACAGGAGCTTGTGCCGTGGC;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=948929;WS=948911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	949654	rs8997	A	G	7656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=121;PP=2965;SC=CCTACGAGGTACGGCTGACGC;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=102;TCR=121;TR=223;WE=949662;WS=949644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	949925	rs2799070	C	T	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=51;PP=1541;SC=GAGAAATGGCCGCCTCTGTGT;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=949933;WS=949915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	976514	rs79290478	C	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=25.03;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	977330	rs2799066	T	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=16;PP=925;SC=CACCCCTGCGTCCTAGACCAG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=977338;WS=977320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	977570	rs2710876	G	A	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=34;PP=1176;SC=GAGGCCAGGCGGGGTGGGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=977578;WS=977560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	978603	rs35881187	CCT	C	4087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=28;PP=2966;SC=CCACTGAGCCCCTGTGTCCTT;SOR=1.790;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=69;WE=978612;WS=978593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	981087	rs3128098	A	G	7588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=0.912;SC=TGCGGACATCACGTTCCTCCC;SOR=0.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=122;TCR=123;TR=244;WE=981095;WS=981077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,281:1.00:282
chr1	981931	rs2465128	A	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=21;PP=1432;SC=CGCCCTCATCACGACCTCGGA;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=981939;WS=981921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	982941	rs3128102	T	C	10202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=141;PP=2965;SC=CCTTGCCTACTCCCTGCCACA;SOR=0.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=170;TCR=141;TR=311;WE=982949;WS=982931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr1	982994	rs10267	T	C	11257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=164;PP=2965;SC=AGAAGGATTTTCGGAGTGTCC;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=323;TCF=159;TCR=164;TR=323;WE=983002;WS=982984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr1	984147	rs199866572	CAAAAAAAAAAA	C	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9965;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=1055;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=8;WE=984180;WS=984137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	984171	rs140904842	CAG	C	683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=9;PP=583;SC=AAAAAAAAAGCAGGGGGCGGT;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=984180;WS=984137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	984302	rs9442391	T	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=18;PP=617;SC=CCTTCCCCACTCTCCGCGCCT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=984310;WS=984292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	985266	rs2275813	C	T	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=70;PP=2909;SC=GTCCCGGTCCCGTCTTCCTCC;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=985274;WS=985256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	985446	rs2275812	G	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	985449	rs2799067	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	986443	rs2710887	C	T	4269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=68;PP=2440;SC=GCCTCTCATCCGCTCACCGTC;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=131;WE=986451;WS=986433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	987200	rs9803031	C	T	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=59;PP=2526;SC=CGAGAGGTAACGTGCCATCCT;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=987208;WS=987190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	988932	rs2710871	G	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=23;PP=885;SC=CCTCCCGCCCGTCTCTCTGAT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=988940;WS=988922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	990280	rs4275402	C	T	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=27;PP=891;SC=GCTTGCGGGACGTGGTGGTGG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=990288;WS=990270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	990517	rs2710872	C	T	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=49;SC=GACCTAGTGCCGAGGGATGGA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=990525;WS=990507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	1007203	rs4633229	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=431;SC=GGCCCTAATTATCAGTCAGAG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=1007211;WS=1007193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	1007432	rs4333796	G	A	4520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.43;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	1018144	rs9442395	T	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=31;PP=1230;SC=GCGGAGGGACTCAGAGCCGAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=1018152;WS=1018134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	1019175	rs2298215	C	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	1019180	rs9442396	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.40;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	1021415	rs3737728	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=55;PP=1598;SC=ACCGCTGAGCAGACGGGCAGG;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=67;WE=1021423;WS=1021405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	1026707	rs4074137	C	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=514;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CCCCTCTGACCCCAGCAGTGG;SOR=0.587;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=34;WE=1026715;WS=1026697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	1026801	rs4562563	T	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=665;ReadPosRankSum=0.601;SC=CCCACCGCCCTCCACAGAGGC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=47;WE=1026809;WS=1026791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr1	1110987	rs138610889	T	TC	1513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=1177;ReadPosRankSum=0.945;SC=GCTCTCTGCCTCCCGTCACCC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=20;WE=1110999;WS=1110977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr1	1110991	rs60024177	G	C	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=1206;ReadPosRankSum=1.090;SC=TCTGCCTCCCGTCACCCCCAC;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=32;WE=1110999;WS=1110977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr1	1111633	.	A	G	241	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=46.45;NF=12;NR=4;PP=241;QD=17.2357007842;SC=GACGCTGTGCAGGTGGAGAGA;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=16;WE=1111641;WS=1111623;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	1111709	rs9730234	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=-3.388;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr1	1111716	rs112227633	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-2.988;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.461;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr1	1111743	rs111326580	C	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.141;NF=10;NR=14;PP=390;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CGCTGTGCAGCTGGAGAGAGG;SOR=1.109;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=24;WE=1111751;WS=1111733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,8:0.15:55
chr1	1114668	rs6668667	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=504;ReadPosRankSum=1.476;SC=CTTCAAGAGGGGCAAGAGGCC;SOR=0.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=31;WE=1114676;WS=1114658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	1114811	rs113258684	G	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=258;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GGCCTCATGGGGCAGGGGCAG;SOR=0.648;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=26;WE=1114819;WS=1114801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr1	1117398	rs12097586	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GGCTCAGGCCACGCTCTCCGC;SOR=0.580;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=16;WE=1117406;WS=1117388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr1	1118212	rs10907171	T	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=607;ReadPosRankSum=1.249;SC=GGGGCGTGGCTGGGTTGGGGG;SOR=0.557;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=48;WE=1118220;WS=1118202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr1	1120307	rs7539911	G	A	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.203;NF=38;NR=16;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CAGGCCCTCCGGACAGTCTGG;SOR=0.231;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=101;TCF=76;TCR=25;TR=54;WE=1120315;WS=1120297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr1	1133077	rs2274789	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=158;ReadPosRankSum=-1.126;SC=GTCCCCGGCCACCCGGCCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=13;WE=1133085;WS=1133067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr1	1133273	rs12031928	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=0.103;SC=GCCCCAGCCGTGCTGCCTGCC;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=1133281;WS=1133263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	1147243	rs2298211	A	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=524;ReadPosRankSum=0.033;SC=GGTGGGGTCCACAGGAGGGGC;SOR=1.043;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=30;WE=1147251;WS=1147233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr1	1147297	rs2298212	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=-1.601;SC=TGGGGGCCCCGCTGGGCTGGG;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=32;WE=1147305;WS=1147287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr1	1153113	rs12036216	G	A	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=1698;ReadPosRankSum=-1.858;SC=TTCCCCCTCCGAGCTCCGCGG;SOR=0.839;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=189;TCF=82;TCR=107;TR=105;WE=1153121;WS=1153103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,121:0.55:222
chr1	1156131	rs2887286	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.419;SC=AAGACCCAAATAAAGTGGCAC;SOR=0.887;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=58;WE=1156139;WS=1156121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,72:0.53:137
chr1	1158534	rs59317408	G	GAC	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=327;ReadPosRankSum=0.360;SC=ACTCATACACGACACACACGG;SOR=0.610;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=1158542;WS=1158524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	1158562	rs57524763	AAC	A	698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=511;ReadPosRankSum=-0.878;SC=ATGTACACACAACACACGCGC;SOR=0.836;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=13;WE=1158571;WS=1158552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr1	1158631	rs6603781	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=477;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CACTTTCCTCATCCACTTTGA;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=35;WE=1158639;WS=1158621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr1	1159485	rs75700266	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=212;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CCAGGCAACGCGAAAAGCGTC;SOR=0.162;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=16;WE=1159493;WS=1159475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr1	1163804	rs7515488	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=766;ReadPosRankSum=0.588;SC=CACAGGCGAGCGCACGCGGAC;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=48;WE=1163812;WS=1163794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
chr1	1167796	rs190796582	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	1177918	rs3835300	CT	C	2510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.214;NF=42;NR=18;PP=2216;ReadPosRankSum=1.285;SC=GCCAGCCCCCCTGGGCGCCCT;SOR=0.684;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=60;WE=1177926;WS=1177908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr1	1178245	rs11260566	C	T	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=1071;ReadPosRankSum=-1.685;SC=GCACCTGTAGCGTGAAGACCC;SOR=0.668;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=63;WE=1178253;WS=1178235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,97:0.57:171
chr1	1178482	rs78555129	A	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=54;PP=1280;ReadPosRankSum=1.144;SC=ATGAGAACACACACCACGTCC;SOR=0.751;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=186;TCF=59;TCR=127;TR=80;WE=1178490;WS=1178472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,93:0.41:227
chr1	1178925	rs12093154	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=346;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GGCACCTTGGGCAGCAGGCTG;SOR=0.757;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=27;WE=1178933;WS=1178915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr1	1179030	rs111673713	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=0.654;SC=CCCCTCACTCGGAGCAGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=1179038;WS=1179020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	1179309	rs113164957	G	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=427;ReadPosRankSum=0.769;SC=CCAACACCCCGCTCTAAGCTC;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=32;WE=1179317;WS=1179299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr1	1179800	rs115586508	G	A	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1241;ReadPosRankSum=1.009;SC=TCCTTAAGGCGCCGTCGTCCG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=67;TCR=93;TR=80;WE=1179808;WS=1179790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr1	1179983	rs76342560	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-1.531;SC=AGGCATCGCCGGCCAGGAGAA;SOR=2.517;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=1179991;WS=1179973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	1190523	rs1058161	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=307;ReadPosRankSum=0.529;SC=TCCAGCCTGCCGAGGTCACGC;SOR=0.576;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=16;WE=1190531;WS=1190513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	1196863	rs6659787	T	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=24;PP=707;SC=GTTGGGGGAGTAGCTCATCTC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=1196871;WS=1196853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	1216581	rs1262893	G	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GGGTCCCACAGATGCCAGGCG;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=1216589;WS=1216571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	1217011	rs1262894	A	C	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=5.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.03;ReadPosRankSum=-2.392;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr1	1217020	rs1262895	G	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=7.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.214;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr1	1223465	rs58081058	GC	G	337.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=6;PP=266;SC=GGCTGGGCTGGCCAGGGGGTG;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=1223473;WS=1223455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	1225553	.	C	T	299	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5215;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=23;MQ=49.77;NF=12;NR=5;PP=299;QD=19.6336007381;SC=GTCCCGTGTCCCTGCTCCGTC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=17;WE=1225561;WS=1225543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr1	1225612	.	G	A	404	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=27;MQ=59.83;NF=15;NR=11;PP=404;QD=16.8758158672;SC=CCATGTCTCCGCTCCATCCCA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=26;WE=1225620;WS=1225602;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,26:0.43:60
chr1	1225641	rs2748384	C	A	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.98;NF=48;NR=32;PP=1572;SC=CTCATCCCCCCTGTCCCCAGG;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=1225649;WS=1225631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	1225959	rs1570867	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.850;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=611;ReadPosRankSum=-0.284;SC=GTTGGGGTCGCGGCCAGGGAT;SOR=0.673;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=141;TCF=67;TCR=74;TR=45;WE=1225967;WS=1225949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,63:0.37:171
chr1	1226221	rs2273275	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=0.248;SC=CGTGGTACCCAGGATGGCCGG;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=8;WE=1226229;WS=1226211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	1226348	rs586965	C	G	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=22;PP=962;SC=GTGCACCCTCCCCCTCCAGAG;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=1226356;WS=1226338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	1226690	rs114720027	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=0.016;SC=TTGGGGCCTCCGTCCTCTCCC;SOR=0.793;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=16;WE=1226698;WS=1226680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr1	1226757	rs6690013	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=359;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GGTGCTAGGCGGCCGCCGGCT;SOR=0.482;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=23;WE=1226765;WS=1226747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr1	1226889	rs609805	G	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=670;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GGAGCCCAGCGGGCCTCATCT;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=44;WE=1226897;WS=1226879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,50:0.42:118
chr1	1227249	rs621668	T	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=405;ReadPosRankSum=0.327;SC=CACGCGGTGATGTACCCATGC;SOR=0.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=33;WE=1227257;WS=1227239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr1	1229144	rs7552099	G	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.775;NF=4;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=1.156;SC=CCCCTGCCCTGGAGGCCCCGC;SOR=1.858;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=5;WE=1229152;WS=1229134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	1229680	rs2477781	G	T	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=68;PP=2965;SC=GGGACCGAACGTGGTCCCCAC;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=140;WE=1229688;WS=1229670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	1231507	rs619608	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1174;ReadPosRankSum=-1.461;SC=GAGACAGGGCGAGCAGGCATC;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=68;TCR=81;TR=75;WE=1231515;WS=1231497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,85:0.48:176
chr1	1231656	rs1749951	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=553;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TGGACACCCAGGCTCCTGGAG;SOR=0.503;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=43;WE=1231664;WS=1231646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr1	1233941	rs1739855	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=2.435;SC=GAGGAAGGCCTCTCACCGGTT;SOR=0.234;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=1233949;WS=1233931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	1234762	rs143128930	AG	A	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr1	1235710	rs640712	T	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGCTCCCAGCTCTGGGCCAGC;SOR=0.105;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=1235718;WS=1235700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	1238492	rs12408158	G	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=660;ReadPosRankSum=1.367;SC=TGCCTCCCTCGGCCTCTCCCC;SOR=0.463;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=42;WE=1238500;WS=1238482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr1	1239339	rs11260584	T	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=509;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GACCAGGACCTGGAGCACCAC;SOR=0.938;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=32;WE=1239347;WS=1239329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	1242707	rs2274262	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=956;ReadPosRankSum=1.078;SC=CACGTTTCCAAGCACCCTACC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=58;WE=1242715;WS=1242697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr1	1244368	rs373068333	C	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=269;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CTCAGCCGGTCACGGGACGCC;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=22;WE=1244376;WS=1244358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr1	1246004	rs2296474	A	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.304;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=0.454;SC=ACAGGTACGTATTTTTCCAGG;SOR=0.413;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=29;WE=1246012;WS=1245994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chr1	1247578	.	TG	T	975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=24.39;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,36:0.90:40
chr1	1254136	rs4970432	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=778;ReadPosRankSum=-1.550;SC=ACCTAATATAGTTTCAAGAAA;SOR=0.532;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=49;WE=1254144;WS=1254126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr1	1254436	rs1886773	A	G	3456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,90:0.53:170
chr1	1254443	rs1886772	G	A	3534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr1	1254841	rs10907179	C	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=1055;ReadPosRankSum=1.490;SC=TGTAGATGGGCCCGTCGTAGC;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=57;WE=1254849;WS=1254831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,65:0.60:108
chr1	1262591	rs2296472	C	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=921;ReadPosRankSum=1.302;SC=CAGGCCTGGGCGAGGACTCGA;SOR=0.581;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=57;WE=1262599;WS=1262581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,63:0.45:139
chr1	1262695	rs148629756	G	A	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1503;ReadPosRankSum=0.488;SC=ATCATGGAGCGCCTCAGGGGC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=97;TCR=99;TR=98;WE=1262703;WS=1262685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,122:0.50:244
chr1	1262966	rs307349	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=912;ReadPosRankSum=1.139;SC=TCGTGCGCCGCGCCGTCACCG;SOR=0.430;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=53;WE=1262974;WS=1262956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
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chr1	1268847	rs307378	T	G	3845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=79;PP=2457;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GCCCACAGGGTACAAGACGAA;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=275;TCF=132;TCR=143;TR=152;WE=1268855;WS=1268837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,178:0.56:318
chr1	1269554	rs307377	T	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=905;ReadPosRankSum=-1.024;SC=CCAGCCGGGCTGCTACAACCG;SOR=0.458;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=170;TCF=99;TCR=71;TR=76;WE=1269562;WS=1269544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr1	1271924	rs140192690	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=141;ReadPosRankSum=0.775;SC=TGGGGAAGGAGCCTGTCAGCA;SOR=0.275;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=9;WE=1271932;WS=1271914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	1273116	rs307371	A	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=813;ReadPosRankSum=1.812;SC=CCCCATTCACACTGGCTCCTG;SOR=0.658;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=67;WE=1273124;WS=1273106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,82:0.46:178
chr1	1275291	rs11582808	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=-1.498;SC=AGCAGCCCCCGCAGACCCACC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=6;WE=1275299;WS=1275281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr1	1276930	rs75244934	GCA	G	2057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=1609;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GCACACACATGCACACACACG;SOR=0.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=52;WE=1276939;WS=1276920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr1	1276973	rs145370195	G	GACAC	5365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=2972;ReadPosRankSum=-0.739;SC=ACCTCATGCAGACACATGCAC;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=73;TCR=94;TR=78;WE=1276981;WS=1276963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,137:0.54:252
chr1	1277533	rs307362	T	C	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=58;PP=1475;SC=TGGCCACATTTGGGCTGTGCA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=1277541;WS=1277523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	1278237	rs307361	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=447;ReadPosRankSum=-1.804;SC=GCCCACACAATGTCACTCTGT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=31;WE=1278245;WS=1278227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr1	1284490	rs150789461	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=0.904;SC=GCCCGGCCCGGGGCTCGGACG;SOR=2.670;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=22;WE=1284498;WS=1284480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr1	1288471	rs3766183	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=139;ReadPosRankSum=3.050;SC=GGGGAGCTCTCGGTGGCAGGC;SOR=0.194;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=12;WE=1288479;WS=1288465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	1288583	rs3845295	C	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=669;ReadPosRankSum=1.466;SC=TCCCAGCCCCCGACGAGCAGA;SOR=1.389;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=48;WE=1288591;WS=1288573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr1	1288823	rs2296471	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=1.671;SC=AGCCCCTGGGAGAGGGGTGTG;SOR=1.445;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=21;WE=1288831;WS=1288813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	1289367	rs140777846	CTG	C	2490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.073;NF=8;NR=31;PP=1632;ReadPosRankSum=1.927;SC=CAGCCCGGGACTGGGAGCCGC;SOR=0.918;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=39;WE=1289376;WS=1289357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr1	1289911	rs4970365	G	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=702;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GCGGGGTCGGGGCGGCGTCAG;SOR=0.637;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=38;WE=1289919;WS=1289901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr1	1291159	rs201260508	GA	G	294.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=5;PP=179;SC=GTCGGTGGGGGAAGGGGTGGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=1291167;WS=1291149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	1296691	rs2765025	C	G	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CGTTTGCTGACCACCTCCTGG;SOR=0.842;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=62;WE=1296699;WS=1296681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,75:0.62:120
chr1	1309885	rs35745967	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=-1.417;SC=CGTCGGGTTGAGGAGCAGCAG;SOR=0.573;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=27;WE=1309893;WS=1309875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr1	1310074	rs2765035	C	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=673;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CGCCCCCGCGCGGCTTCCTAC;SOR=0.905;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=42;WE=1310082;WS=1310064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr1	1323030	rs146564472	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=522;ReadPosRankSum=-0.872;SC=ACACCCACAGGAGCTCAGACA;SOR=0.469;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=33;WE=1323038;WS=1323020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr1	1323943	.	G	GTC	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.598;SC=ATGTGAGTGTGTGTCTCTCTC;SOR=0.132;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=1323953;WS=1323933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	1323945	.	G	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTGAGTGTGTGTCTCTCTCTC;SOR=0.148;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=1323953;WS=1323933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	1323963	.	CTA	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	1323965	rs146981251	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	1323967	.	A	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	1330726	rs1240746	A	G	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=17;PP=1345;SC=GCGGCCAGGCAGGAGCAGCGG;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=1330734;WS=1330716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	1333598	rs35242196	C	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=632;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GACTAGACAGCTCTGACTGAC;SOR=1.150;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=40;WE=1333606;WS=1333588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,43:0.40:108
chr1	1334052	rs3831366	CTAGAG	C	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.938;NF=2;NR=12;PP=648;ReadPosRankSum=1.423;SC=CCATGGCCACCTAGAGTAGAA;SOR=0.823;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=14;WE=1334064;WS=1334042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr1	1335218	rs2291889	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=226;ReadPosRankSum=0.283;SC=CGTCGGCGTCGTGTCTTCAGT;SOR=0.507;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=1335226;WS=1335208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr1	1335790	rs1240708	A	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=901;SC=AGCTGCCAGTAACTGCCCAGC;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=1335798;WS=1335780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	1336136	rs34091023	GGA	G	1285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=936;ReadPosRankSum=1.447;SC=CAGAGGAGTGGGAGGTTGGTG;SOR=0.377;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=23;WE=1336145;WS=1336126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr1	1337334	rs1171	G	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=1.294;SC=GACATCATCTGTGAGGCTCTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=1337342;WS=1337332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	1342612	rs2275915	G	C	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=542;ReadPosRankSum=-2.599;SC=CCTGCAGGCCGGCGTCCCGAA;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=43;WE=1342620;WS=1342602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr1	1342657	.	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=248;ReadPosRankSum=2.063;SC=CGCTGCCATCTTGCCCGGGTC;SOR=0.293;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=20;WE=1342665;WS=1342647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr1	1354515	rs904589	C	G	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1026;ReadPosRankSum=0.819;SC=CACTCCTTCTCCCCCCCTCCA;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=68;WE=1354523;WS=1354505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,84:0.39:214
chr1	1354594	rs3766165	A	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1144;ReadPosRankSum=1.329;SC=GCGTCCGCAGAGTGGGGCTGG;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=74;WE=1354602;WS=1354584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,76:0.41:187
chr1	1355796	rs145378993	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=0.806;SC=CGAGGCCCCGCGCTGCAGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=7;WE=1355804;WS=1355786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	1361555	rs1695848	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=0.933;SC=GGGGAGGTGGTGCTTCCGACA;SOR=0.818;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=22;WE=1361563;WS=1361545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr1	1361633	rs12022947	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.343;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr1	1361641	rs12030806	C	T	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	1371121	.	C	T	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.414;SC=CCCCGTCCCTCGCGCGCGATG;SOR=0.712;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=84;WE=1371129;WS=1371111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,99:0.56:177
chr1	1374834	rs1892289	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=24;PP=681;SC=AGGCCGGGCCAGAGCGCATCG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=1374842;WS=1374824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	1375185	rs1240699	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	1387348	rs1781143	C	T	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=10;PP=1092;ReadPosRankSum=1.927;SC=GGTCCTGGGGCGGACGCAACC;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=137;TCF=113;TCR=24;TR=62;WE=1387356;WS=1387338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr1	1387667	rs1781144	C	G	10124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=155;PP=2965;SC=CTGTGTCAAGCCCTCACCCTC;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=296;TCF=141;TCR=155;TR=296;WE=1387675;WS=1387657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr1	1387891	rs1624483	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.394;NF=4;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CACAGGTCCTATCCCTGCTGG;SOR=1.995;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=17;WE=1387899;WS=1387881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr1	1387920	rs1625156	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=-1.299;SC=AGGTCCTGGCGCTCTCCCAGC;SOR=2.712;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=10;WE=1387928;WS=1387910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr1	1389695	rs35096659	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQRankSum=-0.210;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	1390717	rs1695866	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=1.024;SC=TTCCAGCTCCAGGCCGGTCCT;SOR=1.371;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=1390725;WS=1390707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	1390875	rs1781147	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.355;NF=8;NR=9;PP=286;ReadPosRankSum=0.279;SC=GACCCCAGGACGTGCTGGAGG;SOR=0.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=17;WE=1390883;WS=1390865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	1390997	rs1781148	T	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=397;ReadPosRankSum=0.823;SC=GCGCCCAGGATCTTTTGGGTC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=20;WE=1391005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr1	1391304	rs1695873	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.257;NF=7;NR=13;PP=179;ReadPosRankSum=-1.188;SC=AAGGTGAGAGTGCCTAGCTGA;SOR=0.424;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=20;WE=1391312;WS=1391294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr1	1395401	.	C	CTG	313.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-1.631;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	1395402	.	CAG	TGC	421	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=58.27;NF=1;NR=6;PP=421;QD=69.2096964089;SC=GCTGAGCCTCCAGTGAACCCG;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=7;WE=1395412;WS=1395392;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	1395402	.	CAG	C	313.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-1.631;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	1398008	rs189474682	G	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GTTTGACTACGGGAGGAAGTG;SOR=0.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=99;TCR=73;TR=75;WE=1398016;WS=1397998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,85:0.42:202
chr1	1403814	rs146537972	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.89;MQRankSum=-1.589;NF=19;NR=18;PP=470;ReadPosRankSum=1.640;SC=CCATGATGGACGCCTGCGTGC;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=37;WE=1403822;WS=1403804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr1	1403972	rs111566296	C	CG	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.838;NF=6;NR=8;PP=460;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CCTGCCTTTGCGGCCCCGCAC;SOR=0.711;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=14;WE=1403980;WS=1403962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	1404001	rs149123833	G	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.287;NF=12;NR=7;PP=364;ReadPosRankSum=0.059;SC=AATACTCCCCGTAATAAAGTC;SOR=0.938;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=19;WE=1404009;WS=1403991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr1	1417696	rs819970	C	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.58;QD=29.88;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	1417782	.	A	G	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=49.29;NF=5;NR=3;PP=79;QD=14.2214015684;SC=CCTGGCCGCCATAGGCTGACT;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=8;WE=1417790;WS=1417772;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr1	1418004	rs819972	T	C	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.737;NF=20;NR=11;PP=520;ReadPosRankSum=-1.639;SC=GGTAAACATATTCATAAAACA;SOR=1.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=31;WE=1418012;WS=1417994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr1	1418531	rs819973	G	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=195;SC=AAAAAGAAAAGAATTAGCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=1418539;WS=1418521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	1421531	rs819976	C	A	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.600;NF=56;NR=45;PP=1653;ReadPosRankSum=-0.119;SC=CCATAGCAACCAGGAACACCA;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=103;TCR=82;TR=101;WE=1421539;WS=1421521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,121:0.54:224
chr1	1421916	rs201951488	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQRankSum=-4.890;QD=0.14;ReadPosRankSum=2.677;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,33:0.13:254
chr1	1421991	rs860213	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQRankSum=-0.587;QD=14.48;ReadPosRankSum=2.378;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr1	1423267	rs819977	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=644;ReadPosRankSum=0.349;SC=TGGATGAAGCAGACGCCTTCC;SOR=0.369;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=42;WE=1423275;WS=1423257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr1	1425700	rs819980	T	C	3418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=66;PP=1967;ReadPosRankSum=-2.427;SC=ACAGCCGCATTGACGTGATGG;SOR=0.657;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=260;TCF=130;TCR=130;TR=127;WE=1425708;WS=1425690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,160:0.49:324
chr1	1425816	rs149187984	G	A	3615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=79;PP=1968;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TGAGTGTCCCGCCTCACCCGG;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=238;TCF=98;TCR=140;TR=137;WE=1425824;WS=1425806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,166:0.57:291
chr1	1430985	rs139902189	C	T	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.553;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1049;ReadPosRankSum=-2.026;SC=GGGGCCTGGGCGCGGGGTCGA;SOR=0.962;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=72;WE=1430993;WS=1430975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,81:0.49:165
chr1	1431165	rs9792879	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-3.827;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=0.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr1	1447756	rs28627708	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.189;NF=3;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=0.108;SC=GGGACCGCGGGTTGGGAGACC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8;WE=1447764;WS=1447746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	1451380	rs9439458	T	C	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.924;NF=26;NR=33;PP=881;ReadPosRankSum=1.641;SC=CTCCGTGTCCTTGCGTCTGCA;SOR=0.505;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=59;WE=1451388;WS=1451370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,66:0.43:153
chr1	1454069	.	A	ACC	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=4.580;NF=17;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=-0.856;SC=ACACACACACACCCAAACGGG;SOR=1.329;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=18;WE=1454077;WS=1454062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr1	1459409	.	T	TG	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.131;NF=0;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=0.357;SC=TGCAGGTGTCTGGGGGGCTCA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=13;WE=1459417;WS=1459399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	1469221	rs6698376	T	C	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.88;QD=31.09;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	1469235	rs60473728	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.361;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=1.007;SC=TCCCCACCTCGGGGCCCTGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=1469243;WS=1469211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	1469263	rs6681228	G	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.073;NF=9;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TGGGGTGGGGGGTTCCCATGG;SOR=0.066;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=1469271;WS=1469253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	1469289	rs28370384	G	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.787;NF=14;NR=1;PP=299;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TCCCTCAGCTGCCTCTCTCCC;SOR=3.069;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=15;WE=1469297;WS=1469279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr1	1469546	rs3128344	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.65;NF=3;NR=16;PP=471;SC=ATGCTCCTGGGTGGGGACTGG;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=1469554;WS=1469536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	1477244	rs7290	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	1479333	rs7533	A	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=672;ReadPosRankSum=-1.878;SC=CCACGTGCACAGGCTGGCAGG;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=48;WE=1479341;WS=1479323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr1	1509825	rs6666293	A	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=912;ReadPosRankSum=-1.964;SC=TCGCCGGAGCAGAGCGCGCGG;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=69;WE=1509833;WS=1509815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,86:0.48:178
chr1	1510035	rs150737039	GGC	G	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=477;ReadPosRankSum=-1.418;SC=GCCGGAAGCGGGCGACGCGAA;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=13;WE=1510044;WS=1510025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
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chr1	1562536	rs11544452	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=904;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TGGAGGTGGCGCTGGGTAACG;SOR=0.730;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=60;WE=1562544;WS=1562526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr1	1564712	rs61774907	G	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=0.660;SC=GGACGGCGGGGATGGGGTCCG;SOR=1.132;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=40;WE=1564720;WS=1564702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr1	1566065	rs139398711	A	AG	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr1	1571640	rs377058079	G	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.90;MQRankSum=0.842;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.210;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	1572968	rs151157623	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.566;NF=3;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TAAGGACCTCCGGTGCCACCC;SOR=0.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=23;WE=1572976;WS=1572958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr1	1574019	rs9442412	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQRankSum=-1.151;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr1	1575616	rs80012316	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.09;QD=29.32;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	1575836	rs72468213	C	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=8.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.22;MQRankSum=-11.002;QD=6.64;ReadPosRankSum=2.744;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,104:0.39:265
chr1	1580738	rs149767621	T	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQRankSum=-9.597;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.418;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,70:0.50:139
chr1	1581558	rs117719933	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.50;QD=30.44;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr1	1581713	rs76922129	A	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.253;NF=45;NR=18;PP=1104;ReadPosRankSum=-1.385;SC=GTACTTTTTAAAACACTAAGA;SOR=0.401;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=112;TCF=88;TCR=24;TR=63;WE=1581721;WS=1581703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr1	1581759	rs61774915	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.862;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.397;NF=49;NR=14;PP=926;ReadPosRankSum=-4.220;SC=AGGGATCACCGTATGCCTCAT;SOR=2.057;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=213;TCF=143;TCR=70;TR=63;WE=1581767;WS=1581749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,51:0.23:221
chr1	1581926	rs61774917	G	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.040;NF=9;NR=40;PP=902;ReadPosRankSum=-0.258;SC=AGGAGAGATAGTTACAGGATA;SOR=0.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=49;WE=1581934;WS=1581916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr1	1582106	rs79942991	T	C	4553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=51;PP=2965;SC=CAGGGAATGTTGTTCGTTCCC;SOR=2.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=128;TCR=51;TR=179;WE=1582114;WS=1582096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	1582202	rs61774918	C	T	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.132;NF=59;NR=65;PP=1993;ReadPosRankSum=0.425;SC=TGCCTTCTGGCCTCCATTGTT;SOR=0.777;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=260;TCF=124;TCR=136;TR=124;WE=1582210;WS=1582192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,120:0.46:262
chr1	1582794	rs4648754	C	A	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.44;QD=26.22;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1582880	rs61774922	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.61;MQRankSum=2.547;QD=7.44;ReadPosRankSum=-2.420;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	1582961	rs61774949	G	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQRankSum=-0.207;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr1	1583003	rs72468214	C	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.572;NF=27;NR=44;PP=947;ReadPosRankSum=-0.760;SC=TCTGCCAGGTCCTTTCACGCA;SOR=0.689;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=57;TCR=88;TR=71;WE=1583011;WS=1582993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr1	1583276	.	TC	T	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.065;NF=5;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.370;SC=CCTCCGTGCTTCCCAAGTGCA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=1583284;WS=1583266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr1	1585597	rs7531938	A	G	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=35;PP=2217;ReadPosRankSum=1.438;SC=CCATTATACCATAATTTCTGG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=108;WE=1585605;WS=1585587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr1	1585642	rs3936009	G	T	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=79;PP=2965;SC=CCTGATGACGGATACGAGCTA;SOR=1.102;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=197;WE=1585650;WS=1585632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	1586752	rs11486023	T	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=13;PP=932;SC=GTTGTCACAGTGACCCTAGGA;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=1586760;WS=1586742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	1588670	rs61774958	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=6;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=57.93;MQRankSum=-3.529;NF=23;NR=2;PP=467;ReadPosRankSum=1.047;SC=ATATTTGAATGTTTTTGTTAA;SOR=1.392;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=25;WE=1588678;WS=1588660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	1588717	rs61774959	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.829;NF=20;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=2.672;SC=TGCGACATTTGGAAGTACAAA;SOR=0.636;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=29;WE=1588725;WS=1588707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr1	1588737	rs61776760	C	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQRankSum=-2.869;QD=6.98;ReadPosRankSum=2.510;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,30:0.23:130
chr1	1588743	rs61776761	A	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.03;MQRankSum=-2.959;QD=6.03;ReadPosRankSum=2.292;SOR=0.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,31:0.21:149
chr1	1588744	rs79724854	AGCG	A	859.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=3.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQRankSum=-2.928;QD=5.34;ReadPosRankSum=2.098;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,31:0.19:161
chr1	1599812	rs12729295	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQRankSum=-4.818;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=2.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr1	1599888	rs2072923	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=7.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=26.269;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.537;NF=42;NR=15;PP=826;ReadPosRankSum=-0.528;SC=AGCTCTTCCCACTCCTCCCGA;SOR=2.381;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=57;WE=1599896;WS=1599878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr1	1599940	rs61776767	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.734;NF=15;NR=48;PP=997;ReadPosRankSum=2.282;SC=GGTACTCTATCGGTTTCCATT;SOR=2.079;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=149;TCF=55;TCR=94;TR=63;WE=1599948;WS=1599930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,35:0.27:130
chr1	1599974	rs113499489	A	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.842;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.065;NF=10;NR=34;PP=696;ReadPosRankSum=-3.262;SC=TCATCCACCAAAAACGCCCAG;SOR=1.364;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=127;TCF=38;TCR=89;TR=44;WE=1599982;WS=1599964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,28:0.23:120
chr1	1602787	rs4639697	G	T	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=193;SC=AAACTTACCTGCCGGGGATAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=1602795;WS=1602777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	1635004	rs874516	T	C	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=46;PP=2169;SC=AGGTCATCTTTTTGACTACTG;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=99;WE=1635012;WS=1634994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	1635619	rs2076329	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=18;PP=693;SC=TGGGTGGGCCTGGGCGGGTCA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=1635627;WS=1635609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	1635749	rs55880629	C	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=21;PP=684;SC=GTTTCACCCCCCGCAGCAGCT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=1635757;WS=1635739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	1636044	rs1059822	G	A	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=60;PP=2948;SC=CGTGCTCCACGTAGTTCATCA;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=1636052;WS=1636034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	1636274	rs2179381	C	T	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=25;PP=1294;SC=GCACCCGGCCCCAGGACAGCA;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=54;WE=1636282;WS=1636264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	1639046	rs138369165	C	G	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.88;QD=26.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1639062	rs149613000	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=28.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	1639801	rs74378830	T	C	99.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.40;QD=19.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	1644908	rs2179383	C	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.84;QD=31.20;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	1645050	rs77869096	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.70;QD=28.69;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	1645838	rs33938712	CA	C	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.52;QD=32.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	1646231	rs200994957	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.77;MQRankSum=-1.981;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	1646236	rs202149796	C	T	245.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.77;QD=35.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	1647722	rs114460890	G	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr1	1647725	rs368680882	GT	AG	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.450;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr1	1647729	.	CA	TG	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr1	1647745	rs72634830	G	A	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.45;ReadPosRankSum=2.385;SOR=0.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr1	1647753	rs74045984	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.01;ReadPosRankSum=2.593;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr1	1647778	rs72901773	C	G	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=29;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.541;SC=TGACCCAGCCCACTCACCTTT;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=101;TCR=48;TR=88;WE=1647786;WS=1647768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,102:0.58:176
chr1	1647814	rs72901775	T	C	2908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=1919;ReadPosRankSum=0.205;SC=CCCTTGCCATTTCCCTTCTCT;SOR=0.434;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=202;TCF=124;TCR=78;TR=109;WE=1647822;WS=1647804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,131:0.54:243
chr1	1647871	rs72909014	T	C	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=64;PP=2109;ReadPosRankSum=0.139;SC=CTTCTCGATGTCGTTTCCGAC;SOR=0.689;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=125;WE=1647879;WS=1647861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,154:0.49:315
chr1	1647893	rs144636354	C	CTTTCTT	4161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.100;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=50;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TTCGTGCTCTCTTTCTTTCAC;SOR=0.987;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=27;TCR=128;TR=60;WE=1647901;WS=1647883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,111:0.45:248
chr1	1647968	rs146207119	C	CAT	1383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.363;HP=1;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.246;NF=1;NR=30;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.275;SC=AAAAATTTCACGAGGCCGGGC;SOR=1.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=2;TCR=78;TR=31;WE=1648010;WS=1647958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
chr1	1647971	rs77394327	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.150;HP=1;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.321;NF=3;NR=24;PP=2368;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AATTTCACGAGGCCGGGCACG;SOR=1.364;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=91;TCF=18;TCR=73;TR=27;WE=1648010;WS=1647958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,36:0.36:100
chr1	1647983	rs74429813	T	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-1.754;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr1	1647990	rs76519969	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-1.260;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr1	1648002	rs77107184	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.358;NF=1;NR=17;PP=1519;ReadPosRankSum=2.034;SC=CCTGTAATCCCAGCACTTTGG;SOR=0.904;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=18;WE=1648010;WS=1647958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	1648018	rs79409185	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQRankSum=-1.820;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.088;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr1	1648027	rs61776857	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=438;SC=CCGAGGCGGGTGGATCACCTG;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=1648035;WS=1648008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	1650657	.	C	G	224	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=224;QD=21.5642677123;SC=CTTTCAGCTACAGTTTGCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=12;WE=1650665;WS=1650655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	1650787	rs1137003	T	C	5007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.04;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,128:0.54:238
chr1	1650797	rs1059830	A	G	5333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=3.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,134:0.52:257
chr1	1650801	rs1137004	T	C	5286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,135:0.52:260
chr1	1650807	rs1137005	T	C	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=3;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=1.196;SC=ATTTTTCTTTTCTCTTTTCAT;SOR=0.576;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=214;TCF=122;TCR=92;TR=109;WE=1650815;WS=1650777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,125:0.47:266
chr1	1650832	rs72909030	A	G	3340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=0.657;SC=TCTGTGATGAACTTTTTCTTT;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=228;TCF=121;TCR=107;TR=115;WE=1650853;WS=1650822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,150:0.52:287
chr1	1650845	rs1059831	G	A	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TTTTCTTTCCGAGACATTTGC;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=219;TCF=110;TCR=109;TR=107;WE=1650853;WS=1650822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,125:0.46:270
chr1	1650920	rs36191908	G	A	4445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=58;PP=1603;ReadPosRankSum=0.574;SC=ACAGCACTGCGTCATGCTTGA;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=68;TCR=105;TR=95;WE=1650928;WS=1650910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,119:0.55:216
chr1	1650938	.	CGG	C	2391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.015;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,111:0.52:212
chr1	1650942	.	A	AAG	4295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,110:0.54:203
chr1	1650960	rs72634834	G	A	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr1	1650967	rs75384210	T	C	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr1	1650996	rs74223875	T	C	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr1	1651003	rs76941027	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=5.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.00;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr1	1651047	.	C	T	395	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=82;MMLQ=27;MQ=58.65;NF=0;NR=18;PP=395;QD=23.8761784748;SC=TCTCCAACTTCAGGCATCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=18;WE=1651055;WS=1651037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr1	1652991	rs114172122	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.545;NF=31;NR=17;PP=692;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GGCCAGGCCAGGGCTGTGTAC;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=48;WE=1653012;WS=1652981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr1	1653004	rs36039898	T	C	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=31;PP=2046;SC=CTGTGTACAGTTGGGTCTTGC;SOR=1.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=96;WE=1653012;WS=1652981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	1653028	rs16825265	C	T	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=43;PP=2279;SC=TCTGTACATCCGCTCACCTGT;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=108;WE=1653036;WS=1653018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	1654038	rs61777494	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=523;SC=TGCGACATTTGGAAGTACAAA;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=1654046;WS=1654028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	1654058	rs61777495	C	T	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.31;QD=48.44;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	1654064	rs200615789	A	T	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.33;QD=44.33;SOR=4.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	1654065	rs35174499	AGCG	A	1852.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=1199;SC=TCACCGAAGAAGCGTTGTTCT;SOR=4.125;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=23;WE=1654075;WS=1654048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	1657021	rs9439499	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQRankSum=-1.434;QD=5.81;ReadPosRankSum=-1.327;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	1663831	rs3817856	C	T	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=24;PP=1015;SC=CAGGAGACCACCATGAGTTCC;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=1663839;WS=1663821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	1664019	rs2294488	T	C	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=18;PP=444;SC=GCTGCGTGCGTGGTGCACAGC;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=1664027;WS=1664009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	1666175	rs61777509	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.05;QD=25.27;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	1669734	rs80140081	G	T	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=17;PP=1523;SC=GGCGCAGGCGGAGGGGTGGGG;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=1669742;WS=1669724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	1670570	rs150051592	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.05;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	1685213	rs2072928	C	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=431;SC=GCGGACGGTGCAGTGCACGTC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=1685221;WS=1685203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	1686040	rs4751	G	T	5766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CCTGCGAGCCGTTCTCACCCA;SOR=0.617;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=98;TCR=74;TR=171;WE=1686048;WS=1686030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,211:1.00:212
chr1	1686087	rs142307360	C	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=977;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CCCCGGAGCTCCTTCACCACC;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=62;WE=1686095;WS=1686077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,79:0.34:234
chr1	1686943	rs2072929	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=949;SC=GGTCACTCAGTGCCCACGCCG;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=1686951;WS=1686933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	1686962	rs2076327	C	T	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=665;SC=CGTGCACCCCCGCACCACCCA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=1686970;WS=1686952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	1687625	rs34306661	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=423;SC=ATGGAAGCCATGCTTGTGAGC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=1687633;WS=1687615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	1688192	rs2281173	A	G	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=33;PP=1887;SC=AAACTTCATCACCAACGCGCC;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=1688200;WS=1688182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	1688469	rs4648623	C	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=277;SC=CCCAGACACCCGGCAGATCCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=1688477;WS=1688459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	1688513	rs4648624	G	T	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	1689762	rs2235537	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=2;PP=175;SC=CCACAGACCTTAGCCCATCGC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=1689770;WS=1689752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	1690126	rs79655042	A	AAC	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=1177;SC=AACAAAACAAAACAGTTTCCT;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=25;WE=1690134;WS=1690116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	1696659	rs5021859	A	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=377;SC=CATCCCTCCCAGTTGTACCTG;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=1696667;WS=1696649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	1823922	rs6688000	A	G	6667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=112;PP=2965;SC=ACCTGTCCGCATCATTTCTGG;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=206;WE=1823930;WS=1823912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	1846582	rs2748987	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.319;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	1853615	rs113294876	T	TCTGA	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=960;SC=CCTATTGGAATCTGGCAGAGG;SOR=2.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=17;WE=1853623;WS=1853605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	1854321	rs2250833	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=148;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CCCGGCTGTCAGGACAAGCCC;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=10;WE=1854329;WS=1854311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	1855450	rs28423370	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.647;SC=ATAGAGCTCTACACCCTGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=11;WE=1855458;WS=1855440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	1856098	rs752965	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=41;ReadPosRankSum=1.248;SC=CGCCAGCACACGTGGCGGTTT;SOR=0.078;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=4;WE=1856106;WS=1856088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	1858309	rs941530	T	C	4090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=57;PP=2410;ReadPosRankSum=-1.596;SC=GACCACACCCTGTTCTGGCCA;SOR=1.242;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=306;TCF=177;TCR=129;TR=156;WE=1858317;WS=1858299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,183:0.52:349
chr1	1859131	rs4648734	C	T	3923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=61;PP=2402;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GCTCGAAGAACGGAGAATGAC;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=325;TCF=187;TCR=138;TR=155;WE=1859139;WS=1859121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,185:0.47:390
chr1	1870210	rs2803323	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GGTCAGGGGCGGGGATGTGGT;SOR=2.448;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=14;WE=1870218;WS=1870200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	1873625	rs12758705	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=442;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CACTGGGTCAGGTGCCACAGT;SOR=0.414;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=31;WE=1873633;WS=1873615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr1	1886500	.	GCGGCTC	G	248.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.054;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	1886507	.	ACACCGGAAGTGC	A	239.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	1886519	.	C	A	117	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=117;QD=16.8634680608;SC=ACCGGAAGTGCGGCTCACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=1886527;WS=1886509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
chr1	1886859	rs3795290	C	T	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=29;PP=1255;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CCGCCCTGTGCGGCTCCGCCC;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=174;TCF=114;TCR=60;TR=87;WE=1886867;WS=1886849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,102:0.47:216
chr1	1887019	rs28548017	A	G	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=1123;ReadPosRankSum=0.565;SC=TCGAAGGCCTAGGAAAATTCT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=54;TCR=102;TR=66;WE=1887027;WS=1887009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr1	1887091	rs139735565	CG	C	1308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.591;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=1065;ReadPosRankSum=-2.208;SC=AGGCCCTCACCGCCCGCCCAC;SOR=0.875;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=29;WE=1887099;WS=1887081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,43:0.40:108
chr1	1887111	rs3838975	GC	G	1156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=924;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CCCTGGCTTGGCCTGGCAGCC;SOR=0.904;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=29;WE=1887119;WS=1887101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr1	1887245	rs28575980	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=904;ReadPosRankSum=0.702;SC=AGCTGGTGGCGGCTTTGTCAT;SOR=0.873;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=57;WE=1887253;WS=1887235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr1	1888193	rs3820011	C	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1514;ReadPosRankSum=-1.308;SC=ACGTAGCTGCCGAAGTCAATG;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=206;TCF=105;TCR=101;TR=95;WE=1888201;WS=1888183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,109:0.46:239
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chr1	1897753	rs4648600	C	G	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=855;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AGGTGGCGAGCCGGCGACAGA;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=47;WE=1897761;WS=1897743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
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chr1	1905790	rs16824603	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
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chr1	1918488	rs4350140	A	G	5013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=78;PP=2965;SC=GAACAGGGAAACAAAGGTCAG;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=79;TCR=78;TR=157;WE=1918496;WS=1918478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	1918535	rs4535948	A	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CCAAAGTGACAGTGGGCGTGG;SOR=0.525;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=49;WE=1918543;WS=1918525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,58:0.41:140
chr1	1918584	rs4603072	C	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=5;HapScore=4;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=920;ReadPosRankSum=0.416;SC=CCCCCAGAGCCCCCCTCACCC;SOR=1.014;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=28;WE=1918603;WS=1918574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr1	1918595	rs4466593	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=920;ReadPosRankSum=0.862;SC=CCCCTCACCCGGGCCAGGGGT;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=22;WE=1918603;WS=1918574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr1	1922303	rs13303195	C	T	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=41;PP=2104;SC=CTGAAACTTCCGTTACTGTGA;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=99;WE=1922311;WS=1922293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	1956362	rs2376805	G	A	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=55;PP=2332;ReadPosRankSum=0.428;SC=CTGTCTGACCGGTGGCTTTGC;SOR=0.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=304;TCF=185;TCR=119;TR=147;WE=1956370;WS=1956352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,174:0.47:369
chr1	1960674	rs28408173	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=896;ReadPosRankSum=-1.131;SC=TCTGGATCAGCCAGGCGGCGG;SOR=0.481;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=62;WE=1960682;WS=1960664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,70:0.40:177
chr1	1960926	rs28581504	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=-0.940;SC=GTCACAGGCATCAAGGCTGGG;SOR=0.177;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=12;WE=1960934;WS=1960916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	1961408	rs28431879	C	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=734;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TCTCCCCCACCGGCCTTCGTG;SOR=1.001;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=48;WE=1961416;WS=1961398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,52:0.42:125
chr1	1982013	rs57743955	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=0.160;SC=GCCCCCGCCCCGCGCCATGGC;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=5;WE=1982021;WS=1982003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	1987803	rs2803309	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GAGGTGGCCAGTCTGAGCATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=1987811;WS=1987799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	1987993	rs12184	T	C	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=44;PP=1401;SC=AGTGCAGGGATGAAGGCCTCA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=1988001;WS=1987983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	1990975	.	TC	T	3070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=2344;ReadPosRankSum=0.611;SC=CTCTCTCTTGTCCAGTTTTCC;SOR=0.861;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=65;WE=1990983;WS=1990965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,100:0.47:212
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chr1	1991123	rs1878746	G	A	6219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=125;PP=2965;SC=TGCCGTTTTCGGAGGTTCACC;SOR=1.288;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=71;TCR=125;TR=196;WE=1991131;WS=1991113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	1991173	rs2247923	A	G	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=74;PP=2144;SC=TGGTGACCGCAGGTGGGGTTT;SOR=2.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=98;WE=1991181;WS=1991163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	2005740	rs2459986	T	C	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=39;PP=907;SC=CTGGTGGATGTGTGGCGGTGG;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=2005748;WS=2005730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	2005805	rs28694018	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GCTCGTCTGCCTGCCTGGCCC;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=8;WE=2005813;WS=2005795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	2075560	rs427811	T	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr1	2075570	rs377283	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.19;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	2077409	rs385039	A	G	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=42;PP=1585;ReadPosRankSum=0.135;SC=CAGAAGCTACATTGTAACACC;SOR=0.604;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=263;TCF=176;TCR=87;TR=117;WE=2077417;WS=2077399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,123:0.42:296
chr1	2082458	rs262670	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=1.062;SC=CCCGGGAACGCGCTGCCCTGG;SOR=3.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=2082466;WS=2082448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	2082489	rs262669	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=0.241;SC=GGGCTTTAGCGGAATTAATCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=2082497;WS=2082479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	2106840	rs12135175	T	C	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=171;SC=ACCCCAATATTCACCCAACCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=2106848;WS=2106830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	2113565	rs262688	T	G	3059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=51;PP=1880;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GTTAGTAGAATGGATGTGGGC;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=253;TCF=147;TCR=106;TR=118;WE=2113573;WS=2113555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,144:0.46:310
chr1	2114116	rs138848308	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=985;ReadPosRankSum=0.548;SC=GGGAGCAGCGCGCCGTGACAT;SOR=0.769;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=68;WE=2114124;WS=2114106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr1	2118539	rs2503699	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=413;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TGCGTGGGCGTGGTGCGGGGC;SOR=0.509;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=27;WE=2118547;WS=2118529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr1	2121118	rs2503701	C	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=745;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GTCCGGGCGCCGCACTCTGCG;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=48;WE=2121126;WS=2121108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr1	2126139	rs6662296	C	G	186.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.35;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	2144982	rs2480714	G	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=571;ReadPosRankSum=0.657;SC=TCGCCTGGCTGCTTCCTCCCG;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=38;WE=2144990;WS=2144972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr1	2160661	rs149898447	C	T	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=953;ReadPosRankSum=1.793;SC=ACTGCTCGCGCTGCACGGCCG;SOR=0.384;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=58;WE=2160669;WS=2160651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr1	2234903	rs2256178	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=520;ReadPosRankSum=-1.213;SC=GCTGTGCATGCGGACGCGCCC;SOR=0.476;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=34;WE=2234911;WS=2234893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr1	2235672	rs2843159	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=611;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GGCGCGTCTCCCTGGTGTGGA;SOR=0.365;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=37;WE=2235680;WS=2235662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr1	2252759	rs35513983	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GAGCAGAGTCACGCAAGCAGA;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=14;WE=2252767;WS=2252749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	2267995	.	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.205;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.678;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=609;ReadPosRankSum=1.856;SC=CTTCTAGAAAGATTGGGCAGG;SOR=0.394;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=45;WE=2268003;WS=2267985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr1	2286947	rs1039100	A	G	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=545;ReadPosRankSum=0.054;SC=TGGGGCTTCTAGCCACCAGCT;SOR=0.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=36;WE=2286955;WS=2286937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	2322726	rs71630976	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=0.480;SC=AGCCCGAGGCGCACGGCGAGT;SOR=1.432;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=9;WE=2322734;WS=2322716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	2328714	rs2645081	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=493;SC=CCTGGGCGTGATGTTTGTGGG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=2328722;WS=2328704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	2337032	rs1129171	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=1.469;SC=GCTGAGAAAGCGCAGCCAGGG;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=2337040;WS=2337022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
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chr1	2340200	rs2494598	T	C	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=951;ReadPosRankSum=0.400;SC=CGGCATGCAGTGTCACCAGCA;SOR=0.569;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=67;WE=2340208;WS=2340190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
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chr1	2399149	rs2494631	A	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TGGTCCCCGTAGGGAGCCCAG;SOR=0.476;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=29;WE=2399157;WS=2399139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,35:0.35:100
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chr1	2411451	rs10797428	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=672;ReadPosRankSum=0.456;SC=ATGCAGACCCAGGGACCGGCC;SOR=0.837;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=43;WE=2411459;WS=2411441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr1	2418935	rs10910082	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=102;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TTCTGTGTCCCTCACTGAGCA;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=2418943;WS=2418933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	2420590	rs10752744	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-1.826;SC=GAGGTGGGGCTTACCCATCCT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=2420598;WS=2420580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	2420913	rs6668720	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-0.934;SC=CATGCCATCCATGGGCATATC;SOR=2.599;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=15;WE=2420921;WS=2420903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr1	2422614	rs2477699	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=25;PP=1347;SC=CAACAGGCCGGCCTCTGGCTC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=2422622;WS=2422604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	2426313	rs79885852	G	A	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1121;ReadPosRankSum=1.672;SC=TGAAGAGGACGTGGAGTCTGG;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=177;TCF=77;TCR=100;TR=83;WE=2426321;WS=2426303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,111:0.47:237
chr1	2426766	rs3001347	A	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=7;PP=477;SC=TCGAGAGGGCACCGAGGAGGC;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=2426774;WS=2426756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	2428874	rs2477706	T	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=14;PP=1177;SC=CGTGTGGTGGTGGGTGGGCGG;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=2428882;WS=2428864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	2430617	rs2296442	C	T	5814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=98;PP=2965;SC=ACGATCCCATCGGGCGTGACT;SOR=0.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=81;TCR=98;TR=179;WE=2430625;WS=2430607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	2433900	rs12736998	C	T	4244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=58;PP=2535;SC=GTGCGGCCCCCGCGTGTCCTG;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=2433908;WS=2433890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	2444414	rs7535528	G	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=52;PP=1953;SC=CCAGCCCAGCGCGTCCAGGGA;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=105;WE=2444422;WS=2444404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	2452569	rs2985862	T	C	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=8;PP=1272;SC=CGATGAGGTCTTTGAACTTGT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=2452577;WS=2452559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	2487766	rs2227313	T	C	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1024;ReadPosRankSum=0.325;SC=TGGACTGGAATGGTGCAGGGG;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=185;TCF=78;TCR=107;TR=82;WE=2487774;WS=2487756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr1	2489200	rs2234158	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=627;ReadPosRankSum=2.365;SC=CCCCCTGCTACGCCCCAGCTC;SOR=0.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=44;WE=2489208;WS=2489190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr1	2490898	rs2257763	C	A	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.519;SC=AACCCGTTTGCGGGGTGGGTG;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=80;WE=2490906;WS=2490888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr1	2490922	rs11573978	G	T	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1207;ReadPosRankSum=0.671;SC=GGGTGGGCACGTGGGGCGAGG;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=69;WE=2490930;WS=2490912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,89:0.44:200
chr1	2490942	rs2281852	C	A	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1315;ReadPosRankSum=0.097;SC=GACCTGCCTGCGGGACCCTGC;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=90;TCR=84;TR=80;WE=2490950;WS=2490932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr1	2491060	rs11573979	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.634;SC=TCGTCCCACACGCAGCTCTGC;SOR=0.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=87;TCR=96;TR=81;WE=2491068;WS=2491050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,106:0.48:223
chr1	2491205	rs2234161	C	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TGTCCTGGCCCGTGGATGGTG;SOR=0.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=58;WE=2491213;WS=2491195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,77:0.52:149
chr1	2491305	rs2234162	C	T	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1286;ReadPosRankSum=0.818;SC=GGACAGAGAACGCCGTGTGTG;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=90;WE=2491313;WS=2491295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,110:0.47:233
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chr1	2518186	rs10752746	A	G	162.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=83;SC=CGGCGGCAGCAAGAAAGGCGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=2518194;WS=2518176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr1	2520500	rs6701238	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CCTTGGGGGCGCTGCCTGCCA;SOR=0.760;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=18;WE=2520508;WS=2520490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	2520527	rs6670198	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=0.707;SC=GCCCTGCCCCTAGGTCCCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=2520535;WS=2520517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	2522392	rs2296443	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=0.662;SC=TCCGAGCAGCGGGTGGGCGTG;SOR=0.307;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=2522400;WS=2522382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	2523344	rs143856922	T	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=601;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGCATGGGGATGGTGGGACCA;SOR=0.448;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=45;WE=2523352;WS=2523334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,63:0.52:122
chr1	2524457	rs745367	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=193;ReadPosRankSum=2.254;SC=GCACTGTGCCTGGCCCCACGG;SOR=0.110;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=15;WE=2524465;WS=2524447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	2525152	rs142405151	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=-1.532;SC=GTGTCCCCACTGAAACCGTGA;SOR=0.190;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=19;WE=2525160;WS=2525142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr1	2525208	rs78027076	C	T	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=556;ReadPosRankSum=0.525;SC=GCTGCTTCTCCGCGGAGAGGG;SOR=0.591;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=36;WE=2525216;WS=2525198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr1	2526458	rs201752067	TG	T	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.920;NF=1;NR=13;PP=493;ReadPosRankSum=1.896;SC=GACAGTCGGCTGTGGGTGCAG;SOR=0.435;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=2526466;WS=2526448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	2526621	rs145401287	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=618;ReadPosRankSum=0.913;SC=CGCCTGGGAGGAGGGCACAGA;SOR=0.425;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=36;WE=2526629;WS=2526611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	2526746	rs3748816	A	G	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1411;ReadPosRankSum=1.260;SC=GCGCCTGTTCATCTCCTCCAG;SOR=0.889;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=189;TCF=98;TCR=91;TR=97;WE=2526754;WS=2526736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,113:0.50:226
chr1	2527678	rs2260976	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=51;PP=1550;SC=TGGGCCTCTCAGGTGAGGTGT;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=61;WE=2527686;WS=2527668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	2527694	rs145687721	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=1.542;SC=GGTGTGGGGCCGGTGGGGGGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=15;WE=2527702;WS=2527684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	2528133	rs2843401	T	C	5372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=105;PP=2965;SC=CAGCGCCTGGTGGGGCCACCC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=73;TCR=105;TR=178;WE=2528141;WS=2528123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	2530259	.	G	GGA	782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.826;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	2530341	rs34705971	A	AG	596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=615;SC=ATAAGAGAGAAGTGCAGGTAA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=2530349;WS=2530331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	2535758	rs4648652	A	G	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1073;ReadPosRankSum=-2.194;SC=GGGTGGCCTCAGCCACCATGG;SOR=1.086;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=66;WE=2535766;WS=2535748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr1	2537166	rs116286701	A	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CCCCGTGCACACGTGCTCTGC;SOR=0.298;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=14;WE=2537174;WS=2537156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	2537229	rs115315993	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.001;SC=GACCCTGCCCCGAGTGATGGT;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=2537237;WS=2537219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	2538344	rs111654423	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GGAAGGCCTCAGACCGAAGGA;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=12;WE=2538352;WS=2538334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	2541269	rs10797440	A	G	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=66;PP=1670;ReadPosRankSum=-2.259;SC=GGATCCTGGCAGCTGCTCGTC;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=189;TCF=76;TCR=113;TR=108;WE=2541277;WS=2541259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,129:0.58:221
chr1	2542653	rs10910111	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=747;ReadPosRankSum=-2.135;SC=GGCGGGGCCTACGTCAGTGTC;SOR=0.857;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=50;WE=2542661;WS=2542643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr1	2560735	rs4648657	A	G	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=9;PP=564;SC=GAGAGCGGGCACGGGGACAGG;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=2560743;WS=2560725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	2560882	rs4648658	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.306;NF=13;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=0.008;SC=CTGCACGGCCGGCGCTCTCCA;SOR=0.457;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=24;WE=2560890;WS=2560872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr1	2560903	rs4648659	T	G	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=27;PP=861;SC=CCATCCCCACTGGGCCTTCGG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=2560911;WS=2560893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	2560975	.	C	CAGGGGAG	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.003;NF=1;NR=6;PP=377;ReadPosRankSum=0.484;SC=AGGCCCAGGGCAGGGGAGAGG;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=7;WE=2560983;WS=2560965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	2573199	rs4648662	A	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=47;PP=1884;SC=AACTCCTGCAACTCGGCCAGG;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=2573207;WS=2573189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	2700117	rs4648502	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=8.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr1	2702595	rs140362845	G	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=713;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CCAACTGCAAGGGTGCCACAG;SOR=1.174;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=39;WE=2702603;WS=2702585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr1	2704112	rs56328393	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=446;ReadPosRankSum=1.908;SC=GCACAGGGGCTGCCTGGGGCC;SOR=0.151;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=24;WE=2704120;WS=2704102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	2705873	rs146426404	G	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=648;ReadPosRankSum=-0.314;SC=GGAAATGTGAGCCGCGGATTT;SOR=0.230;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=33;WE=2705888;WS=2705863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr1	2983963	rs2297828	G	A	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.215;SC=GGCTCGGGCGGCGAGCTGGCT;SOR=0.457;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=179;TCF=108;TCR=71;TR=83;WE=2983971;WS=2983953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,95:0.44:217
chr1	2984087	rs2297829	C	A	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=57;PP=1529;ReadPosRankSum=0.434;SC=CCCAGCGCACCGCCGCCGCCA;SOR=0.864;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=60;TCR=103;TR=88;WE=2984095;WS=2984077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,107:0.55:194
chr1	3310928	rs145881072	C	CCG	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=159;SC=TCCAGGAGGGCCGCCCAGCCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=3310936;WS=3310918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	3311212	rs2493253	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=2.737;SC=ACCTGCCCCACGGGCATCAGC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=6;WE=3311220;WS=3311202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	3311261	rs6702992	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	3319244	rs78946683	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=623;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TGGCCAGCCTGGGTGCAGGCC;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=33;WE=3319252;WS=3319234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	3319339	rs192554855	G	A	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=1772;ReadPosRankSum=0.680;SC=CCACCACCTCGTTCTCTCTCT;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=256;TCF=142;TCR=114;TR=124;WE=3319347;WS=3319329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,154:0.50:305
chr1	3328358	rs870124	T	C	4422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=57;PP=2910;SC=ACCTCCCACATCGCTGCTCAA;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=139;WE=3328366;WS=3328348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	3383593	rs3893316	G	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=240;SC=CCCAGCCTGGGGCAGTCCCCT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=3383601;WS=3383590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	3383665	rs7550948	G	A	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=20;PP=1259;SC=CTCAGCTGGCGGGTTGCAGGG;SOR=1.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=62;WE=3383673;WS=3383655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	3383898	rs6424078	A	G	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=46;PP=1321;SC=GCCAGCTCCCAGAGGTAGCGC;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=3383906;WS=3383888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	3385250	rs1417897	C	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=410;ReadPosRankSum=1.812;SC=TGACCCAAGGCGGGTTACACA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=3385264;WS=3385241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	3385256	rs1891143	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AAGGCGGGTTACACAGAGAGG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=3385264;WS=3385241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	3385330	rs2493249	T	C	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=23;PP=1344;SC=ACCTGAGCCCTGTGGGGTGGC;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=73;WE=3385338;WS=3385320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	3389727	rs2185639	C	T	7047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=105;PP=2965;SC=CGCTGAGAAGCACTTCCACCC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=114;TCR=105;TR=219;WE=3389735;WS=3389717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr1	3390238	rs2493323	T	A	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=59;PP=1745;SC=GATGGCTTTATTAACCAGGAT;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=93;WE=3390246;WS=3390228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	3394456	rs4638054	T	C	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=18;PP=1249;SC=CACTGATCTCTGCCTCCCGGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=3394464;WS=3394446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	3394640	rs4422946	A	G	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.388;SC=TGGACACTGGACCGCTGGCCC;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=49;TCR=97;TR=145;WE=3394648;WS=3394630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr1	3394674	rs4534324	T	C	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=77;PP=1971;SC=TACAGGGAGTTGGCCCTGAGC;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=17;TCR=77;TR=94;WE=3394682;WS=3394664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	3395039	rs10797395	G	A	8360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=124;PP=2965;SC=ACATCCAGGTGGAGAAGATAG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=119;TCR=124;TR=243;WE=3395047;WS=3395029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr1	3395229	rs4553117	T	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=438;SC=ATTAGCTCCATGGGGACCGGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=3395237;WS=3395219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	3395973	rs70938094	ACC	A	3304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=2349;SC=CACCCCCACCACCCCCATCTC;SOR=1.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=58;WE=3395982;WS=3395963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr1	3396609	rs881978	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=307;SC=CGAGGGCTTCCTCAAAGGGAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3396617;WS=3396599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	3397188	rs2487677	T	C	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=45;PP=1416;SC=ACAGCCTGTCTCCAATCAGCA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=56;WE=3397196;WS=3397178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	3407007	rs2821039	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=491;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CTCTGGGCCCGTGAAGTGTCC;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=36;WE=3407015;WS=3406997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr1	3407043	rs2794321	G	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=558;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AAAGGCCAGGGTCCCCTCTGG;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=38;WE=3407051;WS=3407033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr1	3407367	rs2487667	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=295;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CCAAGGCCCCGGGTGCAGCTG;SOR=0.531;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=21;WE=3407375;WS=3407357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	3410223	rs74050550	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=0.520;SC=AGAGGCAACAAGAGGGGTTGG;SOR=0.954;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=22;WE=3410231;WS=3410213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr1	3410581	rs61746168	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=846;ReadPosRankSum=0.449;SC=AAGTGGCCGTGGAAGCCGGCA;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=52;WE=3410589;WS=3410571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr1	3410644	rs61742508	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=479;ReadPosRankSum=0.875;SC=TGTTGACACCAGCACAACCCC;SOR=1.008;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=29;WE=3410652;WS=3410634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr1	3411038	rs61730954	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=0.297;SC=GATGGCAGGCGGCTCCGTAGC;SOR=0.558;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=54;WE=3411046;WS=3411028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,69:0.54:128
chr1	3411184	rs78747258	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=253;ReadPosRankSum=0.120;SC=CACCCAGCTCGCAGTGCCGCC;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=17;WE=3411192;WS=3411174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr1	3411367	rs7516439	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=1.892;SC=CCTCTGGGGATATGTCCCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=3411375;WS=3411357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	3411396	rs77610498	T	C	158.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6265;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-1.221;SC=AGTCACTCGGTAAATGCTTCC;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=3411404;WS=3411386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	3411413	rs2821038	C	T	121.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TTCCTGAGGCCCATCAGTGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=3411421;WS=3411403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	3413426	rs12405358	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=1.731;SC=GGCAGCTCTCATGAGACCCCC;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=10;WE=3413434;WS=3413416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	3413868	rs4648506	C	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=773;ReadPosRankSum=0.358;SC=GCAGGCAGCGCCAGGCGGGCA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=51;WE=3413876;WS=3413858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr1	3414105	rs10909951	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=632;ReadPosRankSum=0.004;SC=AGGCAGGCCCCGGTGGCAAGG;SOR=0.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=41;WE=3414113;WS=3414095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr1	3416449	rs7553399	C	A	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=46;PP=1552;SC=ACACTGGCACCGCTGCTCACA;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=3416457;WS=3416439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	3417131	rs2821031	A	G	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=41;PP=1705;SC=GTGTGTGTGCACGTGTGCATA;SOR=0.845;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=3417139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	3417960	rs4648507	G	A	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=32;PP=1035;SC=CTGGAGCCACGGCCGAGGAGG;SOR=1.217;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=51;WE=3417968;WS=3417950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	3418565	rs2821030	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=32;PP=936;SC=GGGCTCCTGGTGAGTGTGCCC;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=3418586;WS=3418555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	3418613	rs139503756	CCG	C	488.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=6.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQRankSum=-0.644;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.198;SOR=2.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	3418616	rs57408931	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=8.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQRankSum=0.160;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.934;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	3418618	rs57082253	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQRankSum=-0.248;QD=15.49;ReadPosRankSum=2.400;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	3425578	rs139010481	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=273;ReadPosRankSum=-1.621;SC=AGCCTAGCCCGAGGGGTCGCT;SOR=0.494;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=21;WE=3425586;WS=3425568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr1	3440647	rs2794322	T	C	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=13;PP=922;SC=TAGGGATGGCTGAAGCCAGGA;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=3440655;WS=3440637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	3440824	rs10797399	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=789;ReadPosRankSum=0.014;SC=AGCAGGAATGGGGAAGGATCA;SOR=0.452;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=53;WE=3440832;WS=3440814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr1	3496328	rs2821051	T	C	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=5;PP=736;SC=CGACACATCCTCGCCCCTTGC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=3496336;WS=3496318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr1	3512188	rs7554061	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=1.082;SC=TTCTTCTGAACGAGGGGGCAG;SOR=0.257;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=13;WE=3512196;WS=3512178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr1	3518944	rs7521546	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=13;PP=632;SC=GACGGGGTCCTGGCCTCAGCT;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=3518952;WS=3518934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr1	3527944	rs10797402	C	G	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=36;PP=1305;SC=CCCGCGCCCGCTCCGCGGAGC;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=3527952;WS=3527934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	3528082	rs10797403	T	C	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=28;PP=816;SC=TGCCCCGGACTCAGAGCCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=3528090;WS=3528072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	3542106	rs3838971	T	TG	2125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.871;NF=11;NR=36;PP=1306;ReadPosRankSum=1.333;SC=CTCTCCTTGGTGGGGGGACTC;SOR=0.716;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=19;TCR=69;TR=47;WE=3542114;WS=3542096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,83:0.58:144
chr1	3544235	rs5772111	TA	T	1229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=961;ReadPosRankSum=0.149;SC=GACAGGCACATAAATAGCCGC;SOR=0.865;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=8;TCR=63;TR=31;WE=3544243;WS=3544225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr1	3545175	rs147637374	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=1501;SC=TAGCCGCTGCGTTCTGGGAGC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=3545201;WS=3545165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	3548136	rs2760321	T	C	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=47;PP=1722;SC=CCCACTGAAATGCGCGCACTG;SOR=0.838;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=90;WE=3548144;WS=3548126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	3549852	rs2273954	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=500;ReadPosRankSum=-0.904;SC=AAGCATGGAAGGGAAAAAAAG;SOR=0.516;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=26;WE=3549860;WS=3549842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr1	3555428	rs3818330	G	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=0.516;SC=CACTTCTTTAGCATCATCAGA;SOR=0.200;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=23;WE=3555436;WS=3555418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr1	3563512	rs34514629	GC	G	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=240;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CTTAAAACCAGCAGAGACCCG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=3563520;WS=3563502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	3566625	rs145464993	AGCAGGCTG	A	1234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CTGGGCGCGCAGCAGGCTGCA;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=18;WE=3566640;WS=3566615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr1	3566706	rs2251098	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=270;SC=AGCGCCGCCGGCTTCCGCGCG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=3566714;WS=3566696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	3599514	rs57596460	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=463;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GGGCAGGAGACGTAGGCCTCA;SOR=1.285;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=29;WE=3599522;WS=3599504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr1	3599750	rs57492244	TG	T	762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.307;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.257;NF=2;NR=26;PP=656;ReadPosRankSum=0.963;SC=TCATGGTGAGTGGGGGGGCTG;SOR=2.192;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=28;WE=3599758;WS=3599740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr1	3607520	rs3765730	G	A	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.265;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.937;NF=46;NR=22;PP=2601;ReadPosRankSum=0.713;SC=TAGGTGTGACGCGCCATTCAT;SOR=1.097;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=68;WE=3607540;WS=3607510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,89:0.47:188
chr1	3607532	rs12122732	G	A	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.882;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=0.948;NF=48;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GCCATTCATAGGATCTCTTCG;SOR=0.416;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=163;TCF=95;TCR=68;TR=89;WE=3607540;WS=3607510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,108:0.53:203
chr1	3638674	rs1801174	C	T	8401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.618;SC=CCCCAGGCACCGCCATCCGGG;SOR=0.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=104;TCR=157;TR=260;WE=3638682;WS=3638664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,311:1.00:312
chr1	3640085	rs6424091	C	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=22;PP=675;SC=CTGTACGGGTCGGGGGAGGGG;SOR=2.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=27;WE=3640093;WS=3640075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	3640134	rs35939665	TCTGC	T	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=823;SC=AGTTGGCTGATCTGCCTGCCT;SOR=2.200;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=3640145;WS=3640124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	3644085	rs10910017	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=6;PP=407;SC=TGTGGTGACCGAGGGCTCTCA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=3644093;WS=3644075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	3644349	rs2181486	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=67;PP=1959;SC=GCGGCCGGCCAGGGGAACTGG;SOR=1.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=94;WE=3644357;WS=3644339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	3644374	rs2146657	A	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=48;PP=1380;SC=GTGTGGGAGGAGAAGGGGACA;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=3644382;WS=3644364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	3645835	rs2254530	C	A	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.36;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	3645844	rs2096224	G	A	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.00;SOR=2.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	3646137	rs11589885	C	T	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=36;PP=1531;SC=GCAGCAGGGTCCAGAGCAGAG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=3646145;WS=3646127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	3646192	rs1885867	G	A	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=36;PP=1475;SC=AGCACTTGGGGCTGCCCTGGG;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=3646200;WS=3646182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	3646214	rs1885866	T	C	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=38;PP=1227;SC=CCCTGGGTCATGGCCCTTGCT;SOR=0.715;Source=Platypus;TCR=38;TR=74;WE=3646222;WS=3646204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	3646291	rs1885865	G	A	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=40;PP=1461;SC=GGTGGCCAGAGTGACCATGAC;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=3646299;WS=3646281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	3647962	rs1745813	T	C	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=9;PP=1081;SC=CTCTCAGAGATGGGGGCTCGC;SOR=2.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=48;WE=3647970;WS=3647952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	3669356	rs76597070	G	A	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1459;ReadPosRankSum=-1.035;SC=CGCTACTACAGGAAGACGGTA;SOR=0.574;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=178;TCF=82;TCR=96;TR=93;WE=3669364;WS=3669346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,119:0.49:242
chr1	3683690	rs1181873	A	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.942;NF=16;NR=2;PP=306;ReadPosRankSum=0.463;SC=GGCGTGAGCCACTGCACCTGG;SOR=0.997;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=18;WE=3683698;WS=3683680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr1	3686415	rs41315316	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=535;ReadPosRankSum=0.721;SC=CCTTGGCCAACGAGATCTCTG;SOR=0.843;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=41;WE=3686423;WS=3686405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,48:0.37:130
chr1	3688030	rs3737592	C	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=0.609;SC=AAGTGCCCCCCCTGCAACAGT;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=27;WE=3688038;WS=3688020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr1	3698017	rs12745312	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=383;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GGGAAGTCAAGGAGCAGAGCA;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=21;WE=3698025;WS=3698007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr1	3698224	rs17411384	G	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=315;ReadPosRankSum=-0.538;SC=ATCAGCAACTGCAACATTTGT;SOR=3.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=15;WE=3698232;WS=3698214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	3701580	rs57217928	G	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=1.560;SC=AGTTCGGGCTGCAGTAGCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=14;WE=3701588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	3701663	rs2298227	T	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=626;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TGAGGTCCTGTGGGGGCCGGG;SOR=0.775;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=41;WE=3701671;WS=3701653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr1	3701832	rs71634371	C	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=0.197;SC=GGTGTCCACACTTCACCCTTG;SOR=0.929;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=17;WE=3701840;WS=3701822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	3703337	rs2368537	G	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=312;SC=CGGACACGCTGGCCTCAGGAT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=3703345;WS=3703330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	3731959	rs12729542	C	T	3630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=2.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.609;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,98:0.46:213
chr1	3731965	rs12728401	G	A	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,96:0.47:206
chr1	3732103	rs4648409	T	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=46;PP=959;ReadPosRankSum=0.385;SC=GCACAGGACCTGCATTAGGAG;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=74;WE=3732111;WS=3732093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,86:0.53:163
chr1	3732172	rs4233019	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=444;ReadPosRankSum=0.653;SC=CCAGCAACAACGTCCCAGGCC;SOR=0.996;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=26;WE=3732180;WS=3732162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr1	3732639	rs6702916	T	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.256;SC=CACAGCCAGTTTGCAGGTGGA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=3732647;WS=3732629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	3732707	rs6702935	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=167;ReadPosRankSum=0.707;SC=AACCAGAACATGAAGACAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=13;WE=3732715;WS=3732697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	3732782	rs6703035	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=491;ReadPosRankSum=-1.270;SC=CGGGGATGCTTTTTTGAATAA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=30;WE=3732790;WS=3732772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	3742257	rs12759497	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CTTTTTGACTCGGCCTTTCAA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=3742265;WS=3742247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	3743109	rs2275834	A	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=566;ReadPosRankSum=1.115;SC=AAAAGGTAGCATGTTTTCCAT;SOR=1.961;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=34;WE=3743117;WS=3743099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr1	3743132	rs4648344	T	C	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=932;ReadPosRankSum=0.207;SC=AGCTGGGAGATGGCTGAGGTG;SOR=1.017;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=76;TCR=13;TR=47;WE=3743140;WS=3743122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr1	3743151	rs4648345	G	A	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=15;PP=1284;ReadPosRankSum=0.147;SC=TGCAGCAGGCGTGCAGTGATA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=105;TCR=29;TR=70;WE=3743159;WS=3743141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr1	3743319	rs6663840	G	A	3317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.880;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=77;PP=2212;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CTAAGACACAGAAACAGTGAG;SOR=0.437;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=243;TCF=93;TCR=150;TR=130;WE=3743327;WS=3743309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,149:0.55:269
chr1	3743433	rs5772126	T	TG	2372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=41;PP=2040;SC=TTCTACTGGCTGGCAAGGTGG;SOR=1.542;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=46;WE=3743441;WS=3743423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	3745787	rs2275832	T	C	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=796;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CAAAATACATTTCAGCTAAAA;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=50;WE=3745795;WS=3745777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr1	3746583	rs2275828	G	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.362;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr1	3746589	rs2275826	C	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.81;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	3747580	rs6424058	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=-1.576;SC=TGCTGGGCCGCGTGGTGTGTC;SOR=0.399;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=3747588;WS=3747570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	3747603	rs6413779	T	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=515;SC=ACGCGAGGTCTGCTTACCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=3747611;WS=3747593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	3751728	rs34966926	G	GT	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.765;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.936;SC=TGAAGGCTTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=3751736;WS=3751718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	3753013	rs12746541	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.524;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	3753136	rs2275824	A	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=558;ReadPosRankSum=0.728;SC=GGCTCCCCTAACATGCCTCCC;SOR=0.487;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=42;WE=3753144;WS=3753126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr1	3755675	rs1891941	T	C	9001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=151;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TCCCAAGGCGTTCACCAACCT;SOR=0.973;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=112;TCR=152;TR=262;WE=3755683;WS=3755665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,329:0.99:331
chr1	3756120	rs1539649	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=447;ReadPosRankSum=-0.458;SC=CTAAGTATACATAAAACCTAT;SOR=1.556;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=22;WE=3756128;WS=3756110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	3759760	rs115065436	C	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=2.040;SC=TCATTGTCATCCACAGCAGGC;SOR=0.384;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=29;WE=3759768;WS=3759750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr1	3759784	rs10797347	A	G	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=38;PP=1250;SC=TGGCAAGGGAACCACTGTCCC;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=3759792;WS=3759774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	3761479	rs2275822	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=490;ReadPosRankSum=1.156;SC=ACCTGGCGTACGTTCCTTCTA;SOR=1.047;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=29;WE=3761487;WS=3761469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr1	3761650	rs2275821	A	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=688;SC=GCAAGGTTCAATGATCCTCAT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=3761658;WS=3761640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	3765424	rs10492943	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-0.272;SC=ATTCTTGCAGGTAAGAAGCAT;SOR=0.495;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=3765432;WS=3765414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	3769033	rs3819006	AA	TT	4323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=57;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GGAATTCACTAACACATGGAC;SOR=0.771;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=166;TCF=52;TCR=114;TR=81;WE=3769042;WS=3769023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,111:0.55:202
chr1	3774130	rs34891610	A	G	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.655;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr1	3774138	rs12723005	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.837;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr1	3774296	rs12722891	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=457;ReadPosRankSum=0.724;SC=CCGCTGGGCTAGGCGGGGACG;SOR=1.426;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=23;WE=3774304;WS=3774286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	3774312	rs12726906	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=1.757;SC=GGACGGCCCGTCGGGGAGGCG;SOR=0.826;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=17;WE=3774320;WS=3774302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	3775454	rs4376673	C	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=38;PP=1153;SC=TGGCACTCTCCGAGGTCCTGG;SOR=2.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=3775462;WS=3775444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	3776989	rs12129902	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	3782608	rs10909809	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=1.265;SC=TTCTTTGGAGCCTGAGGTGCC;SOR=0.333;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=14;WE=3782616;WS=3782598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	3786189	rs1141070	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=1131;SC=ACCCCTCCACGGTGGGTGCGG;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=3786197;WS=3786179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	3788968	rs111645751	G	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=24;NR=13;PP=837;SC=AGAGCGAGGCGCTGTCTCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=3788987;WS=3788958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	3789178	.	G	GGGCCCTGTCCCTGCCGC	2900	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=66.76;NF=2;NR=56;PP=2900;QD=20;SC=AGTGCCTGCAGGGCCCTGTCC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=3;TCR=73;TR=58;WE=3789186;WS=3789168;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,58:0.76:76
chr1	3789194	.	G	GCGGCCC	5063.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.10;QD=41.17;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	3789195	.	T	C	1616	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MMLQ=24;MQ=66.59;NF=17;NR=57;PP=1616;QD=22.3077190885;SC=GTCCCTGCCGTGGCCCTGTCC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=74;WE=3789203;WS=3789185;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	3789195	.	T	TGTCCCTGCCGC	5063.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.92;QD=43.28;SOR=1.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	3800242	rs3205087	A	G	4565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=57;PP=2381;SC=ACTGTGACCCAAGCAGAATCT;SOR=0.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=126;WE=3800250;WS=3800232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	3806643	rs4520357	T	A	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGGTCCTTAGTGGAGAAGAAA;SOR=0.361;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=77;WE=3806651;WS=3806633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,85:0.58:146
chr1	3807593	rs4274008	G	C	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=75;PP=2738;SC=GGACGTTCGCGTGTCTGTGGC;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=129;WE=3807601;WS=3807583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
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chr1	5934490	rs868163	A	G	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1017;ReadPosRankSum=-1.386;SC=TCCCACCGTCATCAGCCAAAT;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=71;WE=5934498;WS=5934480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr1	5934837	rs1287638	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=460;ReadPosRankSum=0.151;SC=CAAATCGCCCCGGCTCTCGGG;SOR=0.973;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=24;WE=5934845;WS=5934827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr1	5935162	rs1287637	A	T	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=41;PP=1418;SC=CTGCTGCGCCAGCAGACAAGA;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=5935170;WS=5935152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	5935222	rs963030	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=926;SC=CAAGGGGCTATTGCTGGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=5935230;WS=5935212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	5937168	rs3747992	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CGCTCGTCCCGCGCCGGCCCA;SOR=1.352;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=16;WE=5937176;WS=5937158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr1	5937391	rs3747989	C	T	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=72;PP=2281;SC=GTCAGGTAGACGTGCAGTGTC;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=117;WE=5937399;WS=5937381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	5937413	rs3747988	A	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=510;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GCCTTCCAGGAGCAGACACCA;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=40;WE=5937421;WS=5937403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr1	5939544	rs11121915	T	G	3701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=48;PP=2374;SC=CAACATAGGGTACTTCAACTT;SOR=1.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=119;WE=5939552;WS=5939534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	5948677	rs2282281	G	A	5751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=73;PP=2965;SC=TCTCCTTTAGGGAACAGCCAA;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=108;TCR=73;TR=181;WE=5948685;WS=5948667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	5964991	rs3737234	T	C	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=38;PP=1009;SC=GAGGCTGCCGTGGTCACCAAT;SOR=3.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=5964999;WS=5964981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	6027167	rs875574	C	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=240;SC=TCCCTCAGGGCTGGTGTGTTT;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=6027175;WS=6027157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	6027252	rs875573	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=410;SC=TTAGCTAAGCAGATAGCAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=6027260;WS=6027242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	6038583	rs4908639	G	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=795;SC=ATATCAGCACGCTGGTTTCCT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=6038591;WS=6038573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	6100458	rs12566866	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=506;ReadPosRankSum=0.430;SC=GGGGCTCCCCGATGCCCTGAA;SOR=0.909;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=29;WE=6100466;WS=6100448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	6145365	rs2294936	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=558;SC=GAACTATCCCAGGGTCAGCCT;SOR=2.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=6145373;WS=6145355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	6145380	rs36032813	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=1.433;SC=CAGCCTCGTCGGCCTGTCGTG;SOR=0.148;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=6145388;WS=6145370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	6145407	rs2294934	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CGTAAGGCCCGCAAGTCCCCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=6145415;WS=6145397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	6147407	rs4908763	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=568;ReadPosRankSum=1.539;SC=TTTCATGCCCCAGGCTCCTGG;SOR=0.438;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=29;WE=6147415;WS=6147397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr1	6150637	rs12081978	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GCTGGGCACCCGGGTGAGCCG;SOR=2.494;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=6150645;WS=6150627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
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chr1	6155332	rs1555144	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=4;PP=512;SC=CCCGGCAGCCTCCCGCCTGCT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=6155340;WS=6155322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	6157282	rs749434	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=-1.145;SC=CCATCAGGGGCCCCTGTGGTG;SOR=0.132;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=6157290;WS=6157272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	6157434	rs2311802	C	T	6477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GTGAGAGGCCCTGCTGGGCAG;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=108;TCR=96;TR=202;WE=6157442;WS=6157424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,236:1.00:237
chr1	6158562	rs2229002	A	G	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=79;PP=2965;SC=CGAAACTGTCATCTTCCATTA;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=178;WE=6158570;WS=6158552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	6162054	rs6696489	T	C	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=945;SC=CTGGCGCGCCTTGCACCCAGC;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=6162062;WS=6162044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	6170353	rs2281303	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=0.011;SC=CCCAGGTACACGGGGAGGGGT;SOR=0.804;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=14;WE=6170361;WS=6170343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr1	6170424	rs78789357	CG	C	1201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.103;NF=4;NR=17;PP=788;ReadPosRankSum=2.536;SC=CTCCCTGCCCCGTGCAGCCCT;SOR=0.614;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=21;WE=6170432;WS=6170414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr1	6172875	rs4908515	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=363;ReadPosRankSum=-2.028;SC=CCAAGGGGACGGCGCCTGGGA;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=18;WE=6172883;WS=6172865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	6173649	rs2785580	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TGGAACTTGGAGCTGTGTCTC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=6173657;WS=6173639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	6184092	rs2843493	A	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.361;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=753;ReadPosRankSum=-2.070;SC=ACCTCGCCCGACTTCTTCCCC;SOR=0.925;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=42;WE=6184100;WS=6184082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr1	6184192	rs2273041	A	G	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,75:0.56:135
chr1	6184286	rs2273040	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=258;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GGTAGCTGCTACCTCCGCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=16;WE=6184294;WS=6184276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	6185064	rs55930553	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=0.672;SC=TCATCCTGGCGGAAGCAAATG;SOR=0.560;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=6185072;WS=6185054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	6185532	rs2273037	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=662;ReadPosRankSum=1.213;SC=CCATACCCCAGGGGCAGCAGG;SOR=1.317;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=36;WE=6185540;WS=6185522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr1	6186961	rs2746060	A	G	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=7;PP=190;SC=TGATCACCCCAGCCCTAGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=6186969;WS=6186951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	6188377	rs72632513	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=0.691;SC=CCCATCCCCAGCAGGGGCTGC;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=6188385;WS=6188367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	6188546	rs2273034	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=543;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GGCTGGGCTGGGTTGGCCCCT;SOR=0.362;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=36;WE=6188554;WS=6188536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr1	6188779	rs2273033	G	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=581;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AGATACAGGTGGGGGGTGCAG;SOR=0.640;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=33;WE=6188787;WS=6188769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	6195493	rs2250504	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=0.360;SC=TAACAGCCAGGAGCAGAGGAC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=19;WE=6195501;WS=6195483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr1	6196493	rs7526887	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-1.309;SC=AGCAGGTCTCACAGCCAGGAT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=6196501;WS=6196483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	6196517	rs7513548	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=0.976;SC=CTATTGATCCGTCTTCACTGG;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=6196525;WS=6196507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	6196869	rs2250358	A	G	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=869;ReadPosRankSum=-0.782;SC=TGGCCTGGTCAATGGTGATGA;SOR=0.890;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=52;WE=6196877;WS=6196859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,53:0.45:118
chr1	6196943	rs2746066	A	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.391;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr1	6196951	rs2785582	T	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.741;SOR=1.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chr1	6204222	rs17489787	C	G	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=82;PP=2824;SC=AAAGCTGCAACACGGTGAACA;SOR=1.273;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=131;WE=6204230;WS=6204212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr1	6206749	rs61740827	A	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=586;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CCCAGGAGCAATGCCAGTAGG;SOR=0.908;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=39;WE=6206757;WS=6206739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
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chr1	6212408	rs746122	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=263;ReadPosRankSum=0.833;SC=TGGCCCTTGCGTGCTCATGTG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=15;WE=6212416;WS=6212398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr1	6219685	rs75863307	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=21;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GGGGATCGACCGATCCCCATC;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=3;WE=6219693;WS=6219675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	6239937	rs70981314	C	CG	805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=2;PP=662;SC=GCCCGCGCTCCGCCCTGGGCC;SOR=2.737;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=17;WE=6239945;WS=6239927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	6240113	.	G	GC	794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.015;NF=0;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=1.173;SC=GGAGGTGGGCGCCCCCCCTCC;SOR=0.732;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=24;WE=6240121;WS=6240103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr1	6246929	rs114462621	A	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=326;ReadPosRankSum=1.202;SC=TTGCATTCTAAAACATTTTAA;SOR=0.878;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=24;WE=6246937;WS=6246919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr1	6247066	rs4908863	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=2.076;SC=CCATCGACATCGGCAGTAACA;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=6247074;WS=6247056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	6253197	rs115515694	C	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=460;ReadPosRankSum=-1.303;SC=CAACACTGAACTAATATCATT;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=30;WE=6253205;WS=6253187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr1	6253295	rs2311385	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CTCGACCTCCCAGACTCAAGT;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=6253303;WS=6253285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	6257826	rs2294714	T	C	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=41;NR=39;PP=1511;SC=TCTAAGAAAATACACAAATGA;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=6257834;WS=6257816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	6257856	rs2294713	G	A	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=35;PP=1376;SC=TGAAGTTTCAGTCAGTCGGAA;SOR=0.832;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=76;WE=6257864;WS=6257846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	6272137	.	A	C	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=679;ReadPosRankSum=-1.240;SC=GATCTGCCGGAGGGGGGAGAT;SOR=0.717;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=52;WE=6272145;WS=6272127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr1	6278414	rs709209	A	G	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.985;SC=AGCAGGAACAACGCGGCCTCA;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=77;TCR=94;TR=87;WE=6278422;WS=6278404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,110:0.51:216
chr1	6285126	rs79611532	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.472;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=414;ReadPosRankSum=0.501;SC=CAAGGTCACCGGGGCCACTGC;SOR=1.736;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=23;WE=6285134;WS=6285116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr1	6294677	rs75823722	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-1.012;SC=GCTCAAGTTACGGAATGCTGT;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=6;WE=6294685;WS=6294667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	6295958	.	G	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.294;SC=AGCCCGCGCCGCGCAGCCCGC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=6295966;WS=6295948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	6305292	rs61760836	C	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=525;ReadPosRankSum=-1.577;SC=CCCCCTGGTGCCCGAGAGCGC;SOR=0.616;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=17;WE=6305311;WS=6305282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr1	6305303	rs61760837	C	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=525;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CCGAGAGCGCCGCCGGCAGCA;SOR=1.292;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=17;WE=6305311;WS=6305282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	6309319	rs1883608	C	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr1	6313938	rs12735670	C	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=45;PP=1561;SC=GAAGGCGCGGCGGTCGGCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=73;WE=6313946;WS=6313928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	6314349	rs6696630	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=486;SC=CCAGTGTGGCAGGGCCTTGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=6314357;WS=6314339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	6314479	rs12740426	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=219;ReadPosRankSum=-1.425;SC=ACAGCAGCCCCTCCTGAGCCT;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=14;WE=6314487;WS=6314469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	6314683	rs74482647	G	A	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1232;ReadPosRankSum=0.234;SC=CAGGTGGCCAGGGTGAGGGTG;SOR=0.655;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=69;WE=6314691;WS=6314673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,86:0.46:188
chr1	6314822	rs11590458	T	C	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=81;PP=2747;SC=TGGCCGCGAGTGTACACAGCA;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=147;WE=6314830;WS=6314812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	6341369	rs191303476	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=837;ReadPosRankSum=2.454;SC=GAGGGCGGGGGTCAGGGCGGC;SOR=1.047;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=49;WE=6341377;WS=6341359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
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chr1	6387572	rs4908880	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=823;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TGTGTAACTGGGACTATTTTT;SOR=0.817;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=49;TCR=75;TR=60;WE=6387580;WS=6387562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,66:0.44:151
chr1	6387629	rs149253585	CAG	C	910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.514;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=833;ReadPosRankSum=-0.228;SC=AATACAGAAACAGTGAAATCC;SOR=1.972;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=21;WE=6387638;WS=6387619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr1	6399711	rs2235692	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGCCCCACCCAGGACATGCCC;SOR=0.132;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=13;WE=6399719;WS=6399701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	6399780	rs6680950	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CCAATGTATCACCATTTATTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=6399788;WS=6399770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	6453520	rs76483502	C	CG	570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=8;PP=336;SC=GCGCCGGGGGCAATCGAACGC;SOR=1.244;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=6453528;WS=6453510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	6473294	rs7529205	A	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=704;ReadPosRankSum=0.857;SC=TAGAGTAGGAAGCAGTTCTGA;SOR=0.285;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=42;WE=6473302;WS=6473284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr1	6489828	rs186504413	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=56.43;MQRankSum=0.084;NF=3;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGCTGTGGAACGCCCTCCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=6489836;WS=6489818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	6489866	rs2003071	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.473;NF=4;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CCCTGACCCCCTCCCAGGCCA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=6489874;WS=6489856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	6500919	rs3817918	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.836;NF=9;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GCACCGCGCTTTCAGCACGGC;SOR=1.880;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=11;WE=6500927;WS=6500909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	6505779	rs139332523	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.055;NF=2;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=1.714;SC=TGCTGAACCCGGAGCTGGGCC;SOR=1.091;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=8;WE=6505787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr1	6508625	rs149033367	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr1	6508712	rs77656032	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=62;ReadPosRankSum=0.962;SC=TGAGCTCCTGTGACGGCCACG;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=6508720;WS=6508702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	6511582	rs9434774	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=388;ReadPosRankSum=0.065;SC=GGCTTAGGAAAGGGGCTGCAG;SOR=0.976;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=18;WE=6511590;WS=6511572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr1	6521150	rs2986758	A	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=780;ReadPosRankSum=1.053;SC=TCCCCTTCGAATCCCTCGAGA;SOR=0.734;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=50;WE=6521158;WS=6521140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
chr1	6521983	rs45540837	T	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=613;ReadPosRankSum=-0.084;SC=AGGGAACACGTTGTGAAACCA;SOR=0.648;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=40;WE=6521991;WS=6521973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr1	6522601	rs45500997	T	C	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=980;ReadPosRankSum=0.271;SC=TACCCGGTGCTGGCCGCGTGC;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=100;TCR=69;TR=85;WE=6522609;WS=6522591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,90:0.50:179
chr1	6523089	rs45614837	T	C	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=976;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CTCCCCTCGGTCCATCCCAGT;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=63;WE=6523097;WS=6523079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr1	6524501	rs11800462	T	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=855;ReadPosRankSum=0.023;SC=ACAGTCAGTATCTCTGCGGGA;SOR=0.514;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=59;WE=6524509;WS=6524491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr1	6524649	rs35137293	T	C	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1549;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CCCCGCAGTCTAGGCATGGTT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=201;TCF=102;TCR=99;TR=99;WE=6524657;WS=6524639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,103:0.44:235
chr1	6524688	rs3170675	T	C	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=1675;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TGCTGACACATTGGCTGACCT;SOR=0.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=82;TCR=108;TR=104;WE=6524696;WS=6524678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,132:0.59:224
chr1	6526008	rs3007416	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=417;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GAGATCGGAAAGGGCGGCCAA;SOR=0.574;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=29;WE=6526016;WS=6525998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr1	6526093	rs192138039	T	C	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=604;ReadPosRankSum=0.991;SC=GGGACAGGGCTCAAAGCTGCC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=42;WE=6526109;WS=6526083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr1	6526183	rs3007417	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.820;HP=4;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TCCGACGGGCGCCCAGGGGCT;SOR=1.508;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=13;WE=6526191;WS=6526173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr1	6526202	rs45616733	CCGTGCTCT	C	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CTTCCCGGCTCCGTGCTCTCT;SOR=1.262;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=6526217;WS=6526192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr1	6526240	rs45542640	GCGCC	G	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr1	6528219	rs200407689	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=551;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GAGGGTGTCCCATGGGTGCCA;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=36;WE=6528227;WS=6528209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr1	6528589	rs3138150	C	T	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.093;SC=GGGAGGACAGCGTGTCCCCAG;SOR=0.510;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=71;WE=6528597;WS=6528579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr1	6529443	rs730600	A	G	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1128;ReadPosRankSum=0.674;SC=AGGCCTGGCCACTGGCCTGGA;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=82;WE=6529451;WS=6529433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr1	6530435	rs2986753	A	G	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=737;ReadPosRankSum=0.823;SC=GATGGCGTGAACGTAGGGGAG;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=48;WE=6530443;WS=6530425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr1	6530965	rs111312565	C	CG	2641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=40;PP=2417;SC=GGAGTGGGGGCGGGCTCAGGG;SOR=1.136;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=58;WE=6530973;WS=6530955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	6533393	rs61741379	G	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=631;ReadPosRankSum=0.942;SC=GCTGTCGCCAGTGTTGGTGCT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=36;WE=6533401;WS=6533383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr1	6535048	rs77777178	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=0.312;SC=CGGAGCCTGCAACATGGGGCC;SOR=0.830;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=11;WE=6535056;WS=6535038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	6537576	rs78593902	C	T	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1500;ReadPosRankSum=0.015;SC=CTGCGGCTCCCGCCTGTGCTC;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=104;TCR=84;TR=92;WE=6537584;WS=6537566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,103:0.47:220
chr1	6537812	.	C	CTGCTCCGACCTGGGCCAGCTCTCCCTAATGGA	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.98;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	6545390	rs75490131	A	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=403;ReadPosRankSum=-1.040;SC=GTACCTGGCTATCACCGTCGC;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=27;WE=6545398;WS=6545380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr1	6557009	rs3007430	A	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=27;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CAGATCCCTGAGAACCTTACG;SOR=1.082;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=160;TCF=97;TCR=63;TR=81;WE=6557017;WS=6556999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,112:0.54:206
chr1	6579607	rs1556035	C	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=33;PP=972;SC=CTGCCTGGACCTCCAGCCACA;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=6579615;WS=6579597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	6585804	rs13513	C	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=658;SC=AACACTGTTGCTAATAAGGGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=6585812;WS=6585794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6586070	rs7548042	C	T	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=81;PP=2641;SC=CACGCTGAAACGGAAACACAG;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=53;TCR=81;TR=134;WE=6586078;WS=6586060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	6591937	rs932112	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=413;SC=GAGCGAGGAGTTATGTAGTGG;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=6591945;WS=6591927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	6592871	rs149486937	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=244;ReadPosRankSum=0.922;SC=ACAGTGACGCGCTCAAGAACA;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=14;WE=6592879;WS=6592861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	6601773	rs3761927	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=171;SC=GACCATGAGTTTGGTAGGCGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6601781;WS=6601772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	6609559	rs11122091	C	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=1.363;SC=AAGACAACATCCTACATAGTC;SOR=0.191;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=6609567;WS=6609549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	6609851	rs10864622	A	G	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=88;PP=2509;SC=AACTATAAACATTAGGAGAGT;SOR=1.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=37;TCR=88;TR=125;WE=6609859;WS=6609841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	6609896	rs11579888	G	A	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=55;PP=1547;SC=TCAGGGGGCCGTACTACATAC;SOR=2.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=68;WE=6609904;WS=6609886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	6610366	rs2063805	T	C	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=538;SC=GCTGGGATTATAGGCGTGAGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=6610374;WS=6610364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	6610382	rs2063806	C	T	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=689;SC=TGAGCCACCGCGCCTGGCCCT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=6610390;WS=6610372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	6614324	rs79736441	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=399;ReadPosRankSum=0.699;SC=GGGGGTCGCGGTGTTGGGTCT;SOR=1.004;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=23;WE=6614332;WS=6614314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	6614391	rs6693391	A	C	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=1078;SC=TCCACGCCGGACGCCTGGGCT;SOR=0.966;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=6614399;WS=6614381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	6614415	rs6693400	A	G	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=20;PP=1099;SC=AGTAACCGCCACCGTAGGCGC;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=6614423;WS=6614405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	6614535	rs4908923	G	A	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=44;PP=1436;SC=CAGGAACCCCGCTTTAGCAGC;SOR=1.076;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=72;WE=6614543;WS=6614525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	6614653	rs4908924	C	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=335;SC=GAGGGGCCTCCGAGCCGCCGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=6614661;WS=6614643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	6615690	rs925745	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.32;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	6615695	rs925744	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.76;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	6635231	rs10864628	A	G	5861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=61;PP=2965;SC=GGCAGACAAGAAGGCCCCTAG;SOR=1.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=122;TCR=61;TR=183;WE=6635239;WS=6635221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	6645867	rs6682920	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTAACCAGCCGGTGTCACCTG;SOR=0.730;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=6;WE=6645875;WS=6645857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	6646959	rs3833475	GCCTGCCTTC	G	6280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=62;PP=2986;SC=CTGTCAGGGAGCCTGCCTTCC;SOR=0.707;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=84;WE=6646975;WS=6646944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	6659505	rs2232460	G	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=661;ReadPosRankSum=-1.749;SC=GGGAGCCATCGGACCCACCTG;SOR=1.253;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=37;WE=6659513;WS=6659495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,38:0.41:92
chr1	6662913	rs6674407	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.388;SOR=1.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr1	6677064	rs10779795	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GTCTGGCAGAAATCTGTTTCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=6677072;WS=6677054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	6681375	rs6695474	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=432;ReadPosRankSum=-1.416;SC=TGGAAGTGTTCTCGTCAGTAG;SOR=0.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=27;WE=6681383;WS=6681365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr1	6681744	rs3747994	C	T	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=61;PP=1718;SC=GAAGCGACCGCGGGCTTTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=69;WE=6681752;WS=6681734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	6685442	rs12746591	A	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=229;SC=CGGGAGGCCCAAAGGCGTGCG;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=6685450;WS=6685432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	6690140	rs742394	A	G	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=138;SC=CACTCTGACCATGATTTGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=6690148;WS=6690137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	6693097	rs3174820	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.033;NF=4;NR=22;PP=508;ReadPosRankSum=-1.116;SC=AAAGGGCACCAGGGACTCCAG;SOR=1.244;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=26;WE=6693105;WS=6693087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	6694207	rs12727844	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=146;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TGAACACACAATACACGGAAG;SOR=0.374;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=9;WE=6694215;WS=6694197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	6694574	rs6804	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=420;ReadPosRankSum=0.263;SC=GGGGCCCCCCGCGCCAGCTGT;SOR=0.996;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=28;WE=6694582;WS=6694564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr1	6694927	rs2294532	C	T	144.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.7331;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CTGGTCCTGTCCTCTTGAGCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=6694935;WS=6694917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr1	6695802	rs6577583	A	G	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=81;PP=2437;SC=GAAGGTGGCCATTCCCATGCA;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=125;WE=6695810;WS=6695792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	6704635	rs200458	A	G	5002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=81;PP=2965;SC=TGAGAGAAACACCCTGTGGAA;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=159;WE=6704643;WS=6704625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	6711146	rs12145525	T	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=574;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GAGTGTGACATGGCAGCAGCA;SOR=0.382;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=43;WE=6711154;WS=6711136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr1	6713114	rs2235564	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=-0.069;SC=AAGGTGCAGACGATTCCTCTG;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=20;WE=6713122;WS=6713104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	6761702	rs3761925	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=465;ReadPosRankSum=1.098;SC=CCTCCCGTGGCGGGGGTGGGG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=27;WE=6761710;WS=6761692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	6947973	rs3827726	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGAGTTATTACGAAGGAGCTC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=6947981;WS=6947963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	7166332	rs72857584	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	7202190	rs970973	T	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=594;ReadPosRankSum=0.033;SC=TGCCCAGATGTTCCTCTGCAG;SOR=1.040;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=35;WE=7202198;WS=7202180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,46:0.36:129
chr1	7289654	rs113053863	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=1.068;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	7289777	rs4243824	G	A	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=12;PP=491;SC=CACAGAGGGCGGGGGTTGGGC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=7289785;WS=7289767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	7527996	rs1201529	T	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=49;PP=1218;SC=CTTCTGTCTCTGGTGCTCGGG;SOR=3.370;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=56;WE=7528004;WS=7527986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	7595125	rs34371913	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-2.024;SC=ACCACAGGCCGCCCGCCCCAC;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=11;WE=7595133;WS=7595115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	7723534	rs3737907	G	A	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1246;ReadPosRankSum=1.257;SC=ATGACGTGTCGGAGGGCAAGC;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=166;TCF=79;TCR=87;TR=81;WE=7723542;WS=7723524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr1	7723957	rs12128526	G	A	9317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=165;NR=111;PP=2965;SC=CGGGCAGCTCGGAGAGCCTGT;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=165;TCR=111;TR=276;WE=7723965;WS=7723947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
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chr1	7792411	rs2301488	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=1.258;SC=AAGTTACGGACGGCATTTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=11;WE=7792419;WS=7792401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	7796641	rs2071985	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.692;SC=AGCCTCGCACATCCTCGCTCA;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=8;WE=7796649;WS=7796631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	7797096	rs60266879	C	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=807;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TGTAGCCCCCCCTTGCTGTTC;SOR=0.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=48;WE=7797104;WS=7797086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,56:0.56:100
chr1	7797734	rs1417986	T	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=28;PP=856;SC=TACATTTCAGTTTTTTTGTTA;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=7797742;WS=7797724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	7804871	rs72853877	T	C	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=1023;ReadPosRankSum=0.254;SC=CTAACCTGAGTGTTCTGTGAA;SOR=1.034;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=62;WE=7804879;WS=7804861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr1	7807897	rs12133253	A	G	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.09;NF=35;NR=61;PP=1847;SC=AGGCCACTGAAGATCCTGGTT;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=7807905;WS=7807887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	7807966	rs34083763	GT	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;MQRankSum=0.516;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.089;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr1	7809728	.	C	CT	136	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.9136;HP=12;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=136;QD=14.2;SC=GCCAGGTTGCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=7809736;WS=7809718;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	7810923	rs75455404	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.728;NF=6;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=-0.070;SC=ATATTAATCCGAAGCATTTAA;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=7810931;WS=7810913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	7811014	rs1573753	G	A	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=17;PP=2067;SC=AGAAGGGCAAGATATTTTGAT;SOR=2.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=71;TCR=17;TR=88;WE=7811022;WS=7811004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	7811033	rs141739870	GAA	G	1781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.201;NF=23;NR=14;PP=1076;ReadPosRankSum=0.135;SC=ATATTTTAGGGAAAAAATATA;SOR=0.575;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=37;WE=7811042;WS=7811023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr1	7811215	rs10779689	A	G	5384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=82;PP=2965;SC=GAGCCCGTGCAGCCCCTGTTG;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=160;WE=7811223;WS=7811205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	7812398	rs9919223	A	G	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=0;PP=33;SC=CATCTTTAACATATGCTGTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=7812406;WS=7812388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	7826393	rs7515025	T	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=-1.430;SC=TCTTTTGCCGTCAATCCTCAA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=15;WE=7826401;WS=7826385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr1	7831257	rs377389837	ACCCACCCACGACGCCCCCG	A	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	7833485	rs11576572	G	A	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TCATGCTCATGCCTTTACATG;SOR=0.973;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=201;TCF=119;TCR=82;TR=95;WE=7833493;WS=7833475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,114:0.46:248
chr1	7838113	rs697675	A	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=458;ReadPosRankSum=1.148;SC=ATATTATATAATACTCTTCAA;SOR=1.954;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=24;WE=7838121;WS=7838103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr1	7845695	rs228729	T	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=664;SC=CCAGGACTCATACAAGCAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=7845703;WS=7845685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	7847362	rs35115980	C	CT	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=281;SC=TTTAGTATATCTTTTTTAATC;SOR=1.329;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=9;WE=7847370;WS=7847352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	7847614	rs697685	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.698;SC=TAAAGCTAGAGAGGAAAGTAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=7847622;WS=7847604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	7854209	rs11807683	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=0.260;SC=ACAAGGAGTTCGTATTTTGAT;SOR=0.465;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=7854217;WS=7854199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	7861153	rs34433622	C	CT	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=368;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTAAATGGGTCTTTGTTTTTT;SOR=1.197;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=12;WE=7861161;WS=7861143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	7861304	rs707465	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.043;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	7861345	rs488728	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.751;SC=TATACATTATGTAATTGAAAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=7861353;WS=7861335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr1	7887493	rs228696	T	C	7900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=100;PP=2965;SC=CTGCATGGGCTGCCCTTGTCC;SOR=0.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=138;TCR=100;TR=238;WE=7887501;WS=7887483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
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chr1	7890264	rs1773135	A	G	3493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=72;PP=2313;SC=CCAATGCCAGACATTCACTAT;SOR=1.837;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=99;WE=7890272;WS=7890254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	7897133	rs10462021	A	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=558;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CAGTTTTCTCATGGGCAAAAG;SOR=0.462;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=42;WE=7897141;WS=7897123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr1	7903838	rs12068394	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr1	7907007	rs697694	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=0.768;SC=CAGAAACCAAGGAGCATCAGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=7907015;WS=7906997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr1	7913430	rs228648	G	A	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1532;ReadPosRankSum=0.947;SC=GCAAAGAGACGTGGATTTATG;SOR=0.754;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=179;TCF=90;TCR=89;TR=100;WE=7913438;WS=7913420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,116:0.55:212
chr1	7913590	rs11121035	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=679;ReadPosRankSum=-1.725;SC=GTAAAACCAGCTATTTCCTTT;SOR=2.621;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=28;WE=7913598;WS=7913580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr1	7993122	rs9657985	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=0.417;SC=ACGGGGCTATATGAACCTCAT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=7993130;WS=7993112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	7994958	rs9657982	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.593;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=636;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CAGGATTCAGGAAGAATGCAC;SOR=1.668;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=15;WE=7994977;WS=7994948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	7994969	rs9657981	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.630;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=636;ReadPosRankSum=0.609;SC=AAGAATGCACGTGGGAGGTGC;SOR=1.248;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=20;WE=7994977;WS=7994948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr1	7997560	rs9657968	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.697;SC=CCAGGCACTATTTCTGGAGAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=7997568;WS=7997556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	7998963	rs226476	T	G	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=41;PP=1380;SC=AAGTTTACAATAAAATAAGAT;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=7998971;WS=7998953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr1	8022824	rs11548933	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.949;NF=4;NR=3;PP=153;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TTTTTTAAGGCTTGTAAACAT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=7;WE=8022832;WS=8022814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr1	8390384	rs56125713	G	C	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=955;ReadPosRankSum=1.919;SC=CGGTCACCCTGAGCGTCACCA;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=65;WE=8390392;WS=8390374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr1	8390495	rs1058619	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=493;ReadPosRankSum=0.523;SC=CCCCGTCCCCACCCGTCCTGC;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=31;WE=8390503;WS=8390485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr1	8395560	rs7535752	G	T	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=64;PP=1724;ReadPosRankSum=-2.204;SC=CAGCGAGCGCGCGGAGCAGCC;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=78;TCR=136;TR=101;WE=8395568;WS=8395550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,129:0.47:274
chr1	8415418	rs2289733	G	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=513;SC=CTGGGCACACGGGGAGGTTGG;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=8415426;WS=8415408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	8415800	rs113287033	A	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-1.304;SC=CAGACTCTGCAGACAGCCAGA;SOR=0.204;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=8415808;WS=8415790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	8418644	rs11121172	C	A	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	8418650	rs1058766	T	C	4582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.07;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	8420503	rs202121539	G	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	8421203	rs13596	T	C	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=30;NR=32;PP=1045;SC=TGGGAGCCTGTGGCTGGTTAG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=8421211;WS=8421193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	8421966	rs74568545	C	G	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=345;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AAGGAGCAATCAGGCCAAGGG;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=23;WE=8421974;WS=8421956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr1	8422676	rs2252865	T	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=21;PP=1462;SC=TGATCACGAATACCAGCAAAC;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=8422684;WS=8422666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	8424039	rs9628991	C	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=607;SC=GCTTCCTCCCCCTGGGAGGCT;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=8424047;WS=8424037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	8424822	rs139299521	G	A	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1276;ReadPosRankSum=1.024;SC=TGAAGCAGTGGCGGCAGGCGT;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=55;TCR=93;TR=77;WE=8424830;WS=8424812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr1	8424984	rs34269918	GA	G	220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=204;SC=GGGGAGGGGGGAACACCTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=8424992;WS=8424974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	8425798	rs3765972	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=9;PP=459;SC=TCAGCTCCTACGGGCCCAGAG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=8425806;WS=8425788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	8425900	rs3753275	T	C	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=33;PP=1284;SC=GTCTGGAGGGTGTGTTGACGG;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=75;WE=8425908;WS=8425890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	8426061	.	G	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=0.059;SC=CTGACTGTGGGGGAGGGCCTG;SOR=1.302;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=15;WE=8426069;WS=8426051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	8616404	rs12122737	C	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=0.072;SC=CGGACACTGGCATGTTCACTG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=5;WE=8616412;WS=8616394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	8926295	rs28999085	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=350;ReadPosRankSum=1.692;SC=AGGGAGCTGGCGCTGCAGGGC;SOR=0.356;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=26;WE=8926303;WS=8926285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	8926752	rs2781065	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=0.180;SC=GAGACAGGGTTTCACTATACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=3;WE=8926760;WS=8926742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	8927881	rs11809001	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=-0.058;SC=GAGCCACCGCACCTGGCCAAA;SOR=0.112;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=8927889;WS=8927871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
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chr1	8935149	rs2038904	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=-3.494;SC=GAAAGCAGTGAGAATTCTCCT;SOR=0.910;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=8935157;WS=8935139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	9006104	rs5772343	T	TC	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.45;MQRankSum=1.294;QD=15.83;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr1	9009406	rs2274327	C	T	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=995;ReadPosRankSum=0.946;SC=CTACAGAGGACGAAGGTGCGG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=69;WE=9009414;WS=9009396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,84:0.52:161
chr1	9009444	rs2274328	A	C	4386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.01;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	9009444	.	ATGACAGG	CTGACAGC,CTGACAGG	805	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=20,47;NR=23,60;PP=677,805;QD=16.9876249968;SC=GGGGCTCAATATGACAGGCTA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=43,107;WE=9009459;WS=9009434;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:107
chr1	9009451	rs2274329	G	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
chr1	9009470	rs2274330	G	C	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=-1.318;SC=CCCAGGCAGGGGAGTTCCCCA;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=34;WE=9009478;WS=9009460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr1	9009547	rs2274331	C	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=2.273;SC=GGGCAGCCTGCAGGGGAAGGC;SOR=1.329;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=11;WE=9009555;WS=9009537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	9011537	rs7540307	G	A	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1289;ReadPosRankSum=0.347;SC=GAGAAGGGGCGAAGCACAAAG;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=78;WE=9011545;WS=9011527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,86:0.48:180
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chr1	9011627	rs3765967	G	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=905;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TATGGGCAACGCTTGCTGAGT;SOR=0.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=66;WE=9011635;WS=9011617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,78:0.45:173
chr1	9011722	rs3765966	G	T	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=46;PP=1296;SC=AGCGGCTCCCGCCTCCCAATT;SOR=2.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=54;WE=9011730;WS=9011712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	9017204	rs2274333	A	G	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=51;PP=2128;SC=AGTGCAGATCAGCCTGCCCTC;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=123;WE=9017212;WS=9017194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	9030964	rs3737665	C	T	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=823;ReadPosRankSum=-1.912;SC=ATCACCGCAACAAGACCATCC;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=59;WE=9030972;WS=9030954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,73:0.58:125
chr1	9034301	rs72641578	T	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=858;ReadPosRankSum=0.608;SC=TTAACCCACCTGCAAGGAGTG;SOR=0.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=63;WE=9034309;WS=9034291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
chr1	9034421	rs3765964	G	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.734;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1100;ReadPosRankSum=0.851;SC=GGCCACGGGGGGCATCGTGGG;SOR=0.714;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=67;WE=9034429;WS=9034411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr1	9034483	rs74050967	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=829;ReadPosRankSum=1.236;SC=CCCCTTGGCTCTGGGCAGCTT;SOR=0.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=59;WE=9034491;WS=9034473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,62:0.42:148
chr1	9034598	rs3765963	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=897;ReadPosRankSum=1.100;SC=CGATGCGGGTATGGTGTCTGG;SOR=0.466;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=57;WE=9034606;WS=9034588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,67:0.45:150
chr1	9034815	rs35753212	C	CAGA	5899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=53;PP=2924;SC=CTGACCTAGCCAGAAGTGCCT;SOR=1.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=63;WE=9034823;WS=9034805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	9063602	rs4908804	G	C	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=30;PP=827;SC=GAGAAAGACAGGAGGGGGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=9063610;WS=9063592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	9063646	rs4908805	T	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=637;SC=GCTGAGCACGTTGGCTCATGC;SOR=3.528;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=9063654;WS=9063636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	9073801	rs7537425	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=1.815;SC=GTTGGGGACCCTGGGACAGGA;SOR=1.432;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=10;WE=9073809;WS=9073791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	9074861	rs12402973	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=0.183;SC=GCGCTCGGCCCGGGCCTCCGC;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=34;WE=9074869;WS=9074851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
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chr1	9098742	rs11121306	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=488;ReadPosRankSum=1.067;SC=CAGGACACACGGTCCCCAGAT;SOR=0.372;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=32;WE=9098750;WS=9098732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	9165868	rs1705303	A	G	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=138;SC=GGTGGAGCCCAGATCCTTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=9165876;WS=9165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	9305445	rs34603401	A	C	3827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=68;PP=2418;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GCCTATGAAGACATTGCCCGC;SOR=0.850;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=335;TCF=178;TCR=157;TR=151;WE=9305453;WS=9305435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,178:0.46:389
chr1	9306849	rs2310925	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GGAGGTCACTTGCAAGTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=9306857;WS=9306839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	9307033	rs7524046	G	A	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=46;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.104;SC=AGGCTGTGGCGCAGATCCTGC;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=120;TCR=94;TR=104;WE=9307041;WS=9307023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,121:0.48:251
chr1	9307138	rs11121350	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=771;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CCGTGGATGCTGAAGGTGTGT;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=61;TCR=108;TR=68;WE=9307146;WS=9307128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,79:0.39:201
chr1	9307230	rs12032814	T	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=341;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CAGAGGGAGGTTTTCTGTGGG;SOR=0.096;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=19;WE=9307238;WS=9307220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr1	9323463	rs141143158	C	CTGAGGCAG	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=679;ReadPosRankSum=-0.211;SC=AGGGGCTTCCCTGAGGCAGGG;SOR=3.003;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=9323471;WS=9323453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	9323910	rs6688832	G	A	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=63;PP=2067;ReadPosRankSum=0.674;SC=AGCCCTGTGCGGGAGCGGGAC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=133;TCR=127;TR=127;WE=9323918;WS=9323900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,142:0.47:302
chr1	9324571	rs9434742	T	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1357;ReadPosRankSum=-1.162;SC=CCCAGATCTATGCCAGGGAGA;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=83;TCR=107;TR=90;WE=9324579;WS=9324561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,104:0.48:215
chr1	9324670	rs9434743	A	G	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.975;SC=TCCCACAGTCACCCACTGGCC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=76;WE=9324678;WS=9324660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,89:0.48:187
chr1	9416346	rs3795309	C	T	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1378;ReadPosRankSum=0.873;SC=ACACAACCCTCGTGGGGAATA;SOR=0.869;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=175;TCF=104;TCR=71;TR=83;WE=9416354;WS=9416336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,101:0.50:204
chr1	9658465	rs9430181	T	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=634;ReadPosRankSum=-0.263;SC=AGGCAGCTCATCCACCCCTGC;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=36;WE=9658473;WS=9658455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr1	9658707	rs9430182	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TCCACAGGGCGGGGGTGGGGG;SOR=0.457;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=31;WE=9658715;WS=9658697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr1	9661061	rs9430184	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AGGATGTGTGAGAACATGGGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=19;WE=9661069;WS=9661051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	9670483	rs4244632	T	A	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=22;PP=1857;SC=AATAGAAGAATGCCCCCAGAA;SOR=1.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=9670491;WS=9670473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	9670834	rs4926472	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=351;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCCCGGAAGCCGCCCCTGCAG;SOR=0.523;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=18;WE=9670842;WS=9670824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr1	9714177	rs7511971	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=1.639;SC=AGACAACTAAGCTAGCCTCCT;SOR=2.584;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=9;WE=9714185;WS=9714167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	9714247	rs9430611	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=354;ReadPosRankSum=0.461;SC=CATTGGCCACACTACTCACTT;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=29;WE=9714255;WS=9714237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr1	9714538	rs150187930	GT	GGAT,G	1536.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=518;SC=ACCAATGGTTGTGCGAAAGCC;SOR=2.964;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=9714552;WS=9714528;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:35
chr1	9714539	rs56017286	T	G	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=2.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	9714540	.	G	GAGGCCAGACC	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=2965;QD=20;SC=CAATGGTTGTGCGAAAGCCAG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=9714552;WS=9714528;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	9714541	rs56235370	C	CCA	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	9714542	.	GAA	CAG	255	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=255;QD=28.0425340784;SC=ATGGTTGTGCGAAAGCCAGCC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=9714552;WS=9714528;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr1	9714543	rs55851927	A	ACCCC	1501.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.63;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	9714544	rs55746245	A	AG	1276.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.07;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr1	9816620	rs6680090	T	C	4477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=66;PP=2503;SC=AGAATGAAGATGGAATACACT;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=143;WE=9816628;WS=9816610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	9996707	rs12065908	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=492;ReadPosRankSum=-0.726;SC=AATAAACCCACATACCATATG;SOR=1.949;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=26;WE=9996715;WS=9996697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	10001235	rs137978085	TTTCG	T	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.957;NF=1;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=-1.675;SC=CTTTTCTTTCTTTCGTTCGTT;SOR=0.724;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=11;WE=10001246;WS=10001225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	10027540	rs2890358	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=386;ReadPosRankSum=1.833;SC=AAAGCAAAGCGAGAAATAAAT;SOR=0.922;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=17;WE=10027548;WS=10027530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	10132300	rs144188727	CTT	C	1877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.820;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.253;NF=2;NR=34;PP=1324;ReadPosRankSum=-2.138;SC=ACCTGGGACTCTTTTGTAATT;SOR=1.350;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=36;WE=10132309;WS=10132290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,49:0.57:86
chr1	10190884	rs2295294	A	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1261;ReadPosRankSum=0.086;SC=AAGTGTTCAGAAAACAAATCC;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=80;WE=10190892;WS=10190874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,91:0.61:149
chr1	10318652	rs12402052	C	G	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=826;ReadPosRankSum=-1.219;SC=GTATTTTTGCCTATGGGCAGA;SOR=0.965;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=55;WE=10318660;WS=10318642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr1	10322054	rs4846209	G	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1104;ReadPosRankSum=-0.345;SC=AGTTGACACCGTAAGCCCTTG;SOR=1.000;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=71;WE=10322062;WS=10322044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,85:0.51:167
chr1	10322153	rs4846210	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=241;ReadPosRankSum=0.631;SC=TTGTCCTTTCAGGCTATTTCT;SOR=1.058;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=17;WE=10322161;WS=10322143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr1	10327407	rs12141246	A	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=697;ReadPosRankSum=1.483;SC=TTTCTTTTTCACTCTAATTCA;SOR=0.853;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=37;WE=10327415;WS=10327397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr1	10328338	rs1339458	C	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=780;ReadPosRankSum=1.169;SC=GAGTTTCAGTCTCTAGGCTTG;SOR=0.878;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=48;WE=10328346;WS=10328328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr1	10334924	rs17396973	C	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=5;PP=320;SC=GATAATGGTCCTGTGGTGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=10334932;WS=10334914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	10335315	rs6685773	G	A	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=491;SC=AAATTACCTTGTTGCGTGAGT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=10335323;WS=10335305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	10339209	rs35347635	CAT	C	3152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.653;NF=20;NR=34;PP=2268;ReadPosRankSum=0.176;SC=GTGTATTTCACATATTGGTTA;SOR=0.695;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=54;WE=10339218;WS=10339199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr1	10342352	rs3748575	C	T	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=10;PP=543;SC=CCCTACTTTTCCTGCCTTCTC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=10342360;WS=10342342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	10342629	rs3748576	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=271;SC=GGTATTCTATGTAGCTCCACA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=10342637;WS=10342619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	10355834	rs3753037	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-2.501;SC=GGTGAGCATTCCTGGCTGGAG;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=18;WE=10355842;WS=10355824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	10356562	rs2275424	C	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	10356848	rs912961	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=692;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TGTAAAAACAACAGCTCTGAA;SOR=0.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=37;WE=10356856;WS=10356838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr1	10384176	rs3831405	C	CTTGAAA	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.215;NF=0;NR=12;PP=719;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CAATGACCTGCTCAAGTGAGC;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=12;WE=10384184;WS=10384166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr1	10386506	rs12135774	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=483;ReadPosRankSum=1.624;SC=TAACCTTGCATTAGCCAATTC;SOR=0.994;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=23;WE=10386514;WS=10386496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr1	10394536	rs2276100	C	G	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1242;ReadPosRankSum=-1.089;SC=GTTTATCTCTCCATGGATGTT;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=73;WE=10394544;WS=10394526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,88:0.47:187
chr1	10403482	rs1556916	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CCTCTTGTATGTATCTAGTAG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=10403490;WS=10403472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
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chr1	10420918	rs3748578	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=572;ReadPosRankSum=-1.489;SC=ATGATTGACAGTGGCAGTACC;SOR=0.501;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=44;WE=10420926;WS=10420908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr1	10420937	rs3748579	C	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=627;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CCTGGACTAACGTGACTTTAG;SOR=0.668;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=50;WE=10420945;WS=10420927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr1	10421878	rs12125492	A	G	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=906;ReadPosRankSum=0.350;SC=CAAAGTCACCAGATTCGTAAG;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=61;WE=10421886;WS=10421868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,76:0.42:181
chr1	10425117	rs34161257	AT	A	966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.31;NF=15;NR=12;PP=634;SC=TTGGAATTGAATTTTTTTTCT;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=27;WE=10425133;WS=10425107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	10428452	rs12130563	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=384;ReadPosRankSum=0.588;SC=GAGCCTCCACGTGGTCAGCTA;SOR=1.528;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=19;WE=10428460;WS=10428442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr1	10431132	rs12141192	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GTTGAAACTCCCTATTGTTAC;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=15;WE=10431140;WS=10431122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr1	10431158	rs17411502	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=150;ReadPosRankSum=0.577;SC=AGGCAGCTTTTTTCAGCTGAA;SOR=0.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=11;WE=10431166;WS=10431148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr1	10435170	rs11121551	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=345;ReadPosRankSum=1.258;SC=TTCTGCACTCTCTGTTACGTG;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=16;WE=10435178;WS=10435167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	10435324	rs11121552	C	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=280;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CACCAAACACCTTTGCTGTCT;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=19;WE=10435332;WS=10435314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr1	10459779	rs3737155	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=884;ReadPosRankSum=-2.048;SC=GCGTGGGCGCGTTGTCTTCTC;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=44;WE=10459787;WS=10459769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr1	10460485	rs1049887	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.301;NF=25;NR=3;PP=528;ReadPosRankSum=0.555;SC=CCAAAGTTGATGATTTCTTGG;SOR=1.552;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=28;WE=10460493;WS=10460475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	10460716	rs35314429	A	AT	458.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.545;NF=1;NR=21;PP=297;ReadPosRankSum=-1.725;SC=AACTCTAGAGATTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=22;WE=10460724;WS=10460706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr1	10463354	rs3762289	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=0.344;SC=TGTTAAGACACACTTAACAGA;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=20;WE=10463362;WS=10463344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr1	10471789	rs2236678	A	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=-0.152;SC=GTCACTAAGCAGAAAGTCCCC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=10471797;WS=10471779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr1	10473196	rs2229687	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=816;ReadPosRankSum=-0.256;SC=AGTTCCAAGACACCGATGGCA;SOR=1.018;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=59;WE=10473204;WS=10473186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr1	10479635	rs2298570	C	G	10494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=157;NR=147;PP=2965;SC=GCTGGCCCCTCGGGGGCGTGC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=157;TCR=147;TR=304;WE=10479643;WS=10479625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr1	10479678	rs1889309	G	A	3799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=79;PP=2348;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTACTCTCTCGTTTCCTAGGC;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=358;TCF=177;TCR=181;TR=157;WE=10479686;WS=10479668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,186:0.43:434
chr1	10490285	rs649639	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=3;PP=111;SC=GTGCTCAGCGTTGTGCCAGGC;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=10490293;WS=10490275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	10490759	rs143754643	TTGGCTTAAC	T	349.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=1245;SC=TGCGCATGCGTTGGCTTAACT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=10490775;WS=10490749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	10502307	rs33919161	AT	A	524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=292;SC=ATAAATACAGATTTTTTTTTT;SOR=3.160;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=15;WE=10502315;WS=10502297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	10511589	rs666103	T	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=33;PP=908;SC=CCCAGCAATCTGCGCGCCGGG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=10511597;WS=10511579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	10523728	rs200149870	CT	C	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=2.447;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.433;NF=2;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.364;SC=TTCTGACTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=10523736;WS=10523718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	10555257	rs622623	C	T	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=822;ReadPosRankSum=-1.119;SC=CGTTTGAGAACGGAACATCTT;SOR=1.781;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=45;WE=10555265;WS=10555247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr1	10596341	rs12375	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GGAGAGCATTCCTAAAGAAGA;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=32;WE=10596349;WS=10596331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr1	10596388	rs2480779	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=795;SC=AGCACGGCCTACAGGGGGACT;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=10596396;WS=10596378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr1	10678610	rs284237	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GGCTGTGGTAGAGGTCGGGGT;SOR=0.394;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=17;WE=10678618;WS=10678600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr1	10703203	rs146039805	G	GC	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.031;NF=2;NR=7;PP=176;ReadPosRankSum=1.929;SC=CTCTCACCTGGGGGGGGCTCT;SOR=0.928;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=9;WE=10703211;WS=10703193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	10708142	rs778228	A	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=775;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CCGAGGCCGGAAAGGCAGCCT;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=46;WE=10708150;WS=10708132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr1	10709267	rs12143134	C	T	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1386;ReadPosRankSum=-1.354;SC=GAGGAGCTGGCGTTAGAGGAG;SOR=0.758;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=89;WE=10709275;WS=10709257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,104:0.53:195
chr1	10709309	rs284300	C	G	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TGCGGGGGGACGATGGGTGGA;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=84;TCR=89;TR=86;WE=10709317;WS=10709299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,99:0.51:194
chr1	10709441	rs284299	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=759;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GGCTCCCCTCCGCTTCCGCCT;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=54;WE=10709449;WS=10709431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr1	10710849	rs3215814	G	GC	1580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.963;NF=10;NR=27;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AGCTCAGACGGCCGGGGCCTG;SOR=0.415;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=37;WE=10710859;WS=10710839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr1	10713765	rs284294	T	C	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1143;ReadPosRankSum=1.247;SC=CCAGGGGGATTGAGCCAGGCA;SOR=0.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=81;WE=10713773;WS=10713755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,92:0.55:167
chr1	10714330	rs35746667	A	AC	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.932;NF=5;NR=12;PP=700;ReadPosRankSum=0.409;SC=CCACCCTGCTACACCATGGCC;SOR=0.255;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=17;WE=10714338;WS=10714320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr1	10718731	.	CCTCTG	C	118	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=118;QD=46.0;SC=GGCCCCAGCCCCTCTGCTCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=10718743;WS=10718721;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chr1	10719645	rs475980	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=521;ReadPosRankSum=0.642;SC=GTGGATGTGTATAAGGTGTGA;SOR=1.347;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=28;WE=10719653;WS=10719635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	10725498	rs284322	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=900;ReadPosRankSum=2.491;SC=GGGAGCCGGCGTCAGCTCGCT;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=62;WE=10725506;WS=10725488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,75:0.43:176
chr1	11079077	rs2273348	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=18;PP=505;SC=CCCTTAGTGCATGCTGAATAT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=11079085;WS=11079067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	11080723	rs143130606	T	TG	1240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=992;SC=CCCAGCACTTTGGAGGCCGAG;SOR=1.949;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=11080731;WS=11080713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	11086097	rs3215616	A	AT	3088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=44;PP=2519;SC=CTTATTTCTAATGCCACTTTT;SOR=1.112;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=53;WE=11086105;WS=11086087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	11087524	rs1782455	G	A	5253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=82;PP=2965;SC=TGTCCAGGGCGGATGCATCAT;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=160;WE=11087532;WS=11087514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	11087835	rs1782454	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=349;SC=GGTGGGTGACTACCTATACAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=11087843;WS=11087825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	11090916	rs12711521	C	A	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=914;SC=CTGGGTAGATCATCAGGAGGG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=11090924;WS=11090906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	11094665	rs11121684	G	A	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	11095039	rs6695096	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=299;SC=GCTCTCACAGCAGTTCCTATT;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=11095047;WS=11095029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	11104845	rs9430347	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=11;PP=437;SC=CAGAGACACGTGGCAGCAGGT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=11104853;WS=11104835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	11105106	rs2273345	C	T	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=30;PP=1640;SC=GCTGCCCACGCCCCAGAGCAC;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=11105114;WS=11105096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	11105122	rs2273344	C	T	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=28;PP=1793;SC=AGCACTGGCCCGTCCCACAGT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=11105130;WS=11105112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	11106909	rs66761147	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=715;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GGGGACCCCCCGACCCTGAGA;SOR=0.763;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=49;WE=11106917;WS=11106899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr1	11119899	rs7545802	T	C	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=48;NR=79;PP=1838;SC=CCACCTGCAGTGACAGGGCCT;SOR=1.186;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=48;TCR=79;TR=127;WE=11119907;WS=11119889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	11126569	rs2791659	C	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=529;SC=TCACCATAACCCCCGGAGCAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=11126577;WS=11126559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	11126941	rs6701726	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=799;SC=GAGAACTCGGCGGCCCACCAG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=11126949;WS=11126931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	11128001	rs2791657	A	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=800;SC=CCCACGGACCACACCACGCAG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=11128009;WS=11127991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	11128329	rs2791656	A	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=466;SC=GAACAGGAGCACCCCAAAGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=11128337;WS=11128319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	11128654	rs2791655	G	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=835;ReadPosRankSum=1.131;SC=GAGGAGGTCAGAAACAGGCGC;SOR=0.468;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=54;WE=11128662;WS=11128644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
chr1	11129848	rs2791653	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=633;SC=AGGGAACTCCACCGGCCTCAG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=11129856;WS=11129838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	11132217	rs1130683	G	A	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=48;PP=1700;SC=CCAGCTTCCAGCGGTTGCTGA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=11132225;WS=11132207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	11134157	rs2748876	T	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=20;PP=1882;SC=TGCTGGTGCCTTGTCAGCGTC;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=11134165;WS=11134147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	11137778	rs2259886	C	T	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=120;SC=CAGTCTCCAGCGCTGACTGTA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=11137786;WS=11137768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	11140620	.	AACACAC	A	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.36;MQRankSum=1.036;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	11141187	rs2258621	C	G	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=46;PP=1741;SC=GCAGCTGCACCGGCTGCCCGT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=11141195;WS=11141177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	11151779	rs1148482	A	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=227;SC=GCAGTGGCGCAATCTTGCCTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=11151787;WS=11151769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	11159996	.	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.038;SC=GCGTCTGATTATAGTGTGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=17;WE=11160004;WS=11159986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	11187893	rs1770344	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=434;SC=GAGAGAAGCATCAAGAATCAG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=11187901;WS=11187883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	11205058	rs1057079	C	T	6540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=94;PP=2965;SC=CTCCTGCCATCGCAGTTAATT;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=92;TCR=94;TR=186;WE=11205066;WS=11205048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	11288758	rs1064261	G	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=920;SC=CTCGAATGACGTTAAGGAACG;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=11288766;WS=11288748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	11292666	rs10864495	T	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=520;SC=GCACGGTGGCTCATGCCTGTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=11292674;WS=11292656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	11293642	rs17229172	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CATCTCAGTCATAAAGAAATT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=11293650;WS=11293632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	11294474	rs718206	T	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=382;SC=AGCAACAGACTTTTCTGCAAC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=11294482;WS=11294464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	11298790	rs2024627	T	C	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=11;PP=235;SC=TTCAACTAGATATTGATCAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=11298798;WS=11298780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	11301714	rs1135172	A	G	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=68;PP=2466;SC=AGACTGTGGCATCCACCTGCA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=11301722;WS=11301704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	11317320	rs2092642	C	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=663;SC=CGGCCAGGCACGGTGGCTCAA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=11317328;WS=11317310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	11318763	rs2076657	C	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=318;SC=TAGTTCAAACCAAAGAAGACA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=11318771;WS=11318753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	11319587	rs4845988	A	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=362;SC=CTTGTCAGGCAGGGGATTCTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=11319595;WS=11319577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	11561593	rs2817580	G	A	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=51;PP=2236;SC=CTCACTCGGTGGCCCAGGCCC;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=110;WE=11561601;WS=11561583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	11575375	rs2594318	T	A	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=19;PP=2028;SC=GTGGGGTTTGTGTCCCATGAG;SOR=2.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=72;TCR=19;TR=91;WE=11575383;WS=11575365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	11579470	rs2072994	G	A	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=46;PP=2562;SC=CGTGTTTGCCGCTCCCGAGCA;SOR=1.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=127;WE=11579478;WS=11579460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	11593793	rs113116961	T	TGCACACACGCAC	2238.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.888;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.923;NF=15;NR=15;PP=831;ReadPosRankSum=1.263;SC=CAGACACGCATGCACACACAC;SOR=1.863;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=30;WE=11593804;WS=11593783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr1	11708736	rs1055547	T	C	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=42;PP=1773;SC=TGGGGGAGAGTGGAGGCAGGG;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=11708744;WS=11708726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	11709052	.	C	G	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=3;NR=3;PP=75;QD=18.2952020912;SC=GCCCAGCCCACCCCAGCCCAG;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=11709060;WS=11709042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	11710561	rs9614	T	G	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GCGGCGCCGCTTGCTCAGGAA;SOR=0.575;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=82;WE=11710569;WS=11710551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,99:0.44:227
chr1	11714368	rs2272983	T	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=37;PP=1186;SC=GGTCCAGGCGTCGGCTACCTG;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=11714376;WS=11714358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	11740329	rs151210857	AGGCGTGAGCCAC	A	5953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=35;PP=2937;SC=CTAGGATTACAGGCGTGAGCC;SOR=1.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=73;WE=11740348;WS=11740319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	11766424	rs11121804	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=0.454;SC=TGCCCGGAACCTCCCTGAGAA;SOR=1.158;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=27;WE=11766432;WS=11766414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr1	11772229	rs60437934	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=-1.109;SC=ACACGCTTCCATGTTTCCACT;SOR=1.863;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=17;WE=11772237;WS=11772219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	11772303	rs1883574	A	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=749;ReadPosRankSum=1.476;SC=CATGCTGTAGAGTGGTGGTAT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=41;WE=11772311;WS=11772293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr1	11779499	rs4846028	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=181;SC=TTTAAGCTCATTGGGGCTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=11779507;WS=11779494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	11779762	rs12117076	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=620;ReadPosRankSum=0.668;SC=AGCGGCCCCGCGGGACTGGGG;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=46;WE=11779770;WS=11779752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,52:0.47:111
chr1	11782814	rs7414943	G	A	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=40;PP=1307;SC=TATGCTCCAGGAAAACTATTT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=11782822;WS=11782804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	11782886	rs6540990	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.07;QD=28.38;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	11796168	rs146190997	CGGGCG	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=289;SC=GTGGCCGCAACGGGCGGGGCG;SOR=1.402;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=11796180;WS=11796158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	11807426	rs12752700	C	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=865;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GGCCCTGAGACGCCGGAGCAG;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=56;WE=11807434;WS=11807416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr1	11824242	rs4845876	A	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=549;SC=GAGAGGAGCCACTGAGAGACC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=11824250;WS=11824232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	11824303	rs4845877	T	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=17;PP=1233;SC=CAAGAGCAGCTAGGAGTACTG;SOR=1.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=11824311;WS=11824293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	11824346	rs4845878	G	A	3043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=29;PP=1961;SC=AGAATGGGGTGGGGTTGAATG;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=91;WE=11824354;WS=11824336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	11824556	rs4845879	A	G	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=65;PP=1980;SC=CTGGATGGGCAGTTACAGGAG;SOR=1.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=24;TCR=65;TR=89;WE=11824564;WS=11824546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	11824575	rs10864536	T	C	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=3.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	11824578	rs11121825	C	T	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.27;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	11825851	rs10218813	G	C	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=23;PP=1852;SC=GAGGCCTGGAGAGCTTCGCCT;SOR=1.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=88;WE=11825859;WS=11825841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	11826630	rs6668699	C	T	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=18;PP=1084;SC=CCAGGAACCCCCCGGTGCTGT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=11826638;WS=11826620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	11827180	rs6540995	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=36;PP=1955;SC=GGTAGGGGGTAGGAGGTGTTG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=93;WE=11827188;WS=11827170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	11827304	rs6540996	A	G	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=83;PP=2590;SC=TCACAGCCCCAGAGTCTGAGG;SOR=1.001;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=143;WE=11827312;WS=11827294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	11827355	rs6540997	A	G	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=49;PP=1428;SC=CAGGGGTTGGAGTTGGGGGAC;SOR=1.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=68;WE=11827363;WS=11827345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	11828238	rs4845880	G	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=31;PP=1556;SC=CAGCTGTTGCGAAAGTGCCTT;SOR=1.156;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=82;WE=11828246;WS=11828228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	11828319	rs4845881	G	A	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=40;PP=1835;SC=CTGCTGGTCCGGAGCTTCCGA;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=96;WE=11828327;WS=11828309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	11831615	rs6667720	C	T	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=52;PP=2201;SC=GATTGCTCAGCGGCTTCTGTC;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=107;WE=11831623;WS=11831605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	11831756	rs6680385	A	G	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=831;SC=CCTGAGCTCCACACTGGGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=11831764;WS=11831746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	11832100	rs11121827	T	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=11;PP=732;SC=TCCCATCTGCTTACTCTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=11832108;WS=11832090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	11832311	rs10779764	G	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=782;SC=GAGCTTGGCTGTGCAGGTAGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=11832319;WS=11832301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	11836441	rs6699669	TG	CA	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=31;PP=2054;SC=AAGAGGGGCCTGAGGCAGCAG;SOR=1.651;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=99;WE=11836450;WS=11836431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	11836628	rs6699881	T	C	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=61;PP=1865;SC=GGATGCCTGCTGGACACTGGC;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=11836636;WS=11836618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	11836682	rs7538516	C	T	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=37;PP=1271;SC=GCTTTTCCAGCGCCAGTGGGC;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=11836690;WS=11836672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	11838848	rs6697244	G	T	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=54;PP=1870;SC=CTGAGCAGCAGCACACTCCAA;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=98;WE=11838856;WS=11838838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	11839966	rs4846043	G	A	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=412;SC=GGCCTGTGGCGTCAGCGGCTG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=25;WE=11839974;WS=11839956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	11839998	rs4846044	T	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=319;SC=GCTGGTGGAGTGGTGGGCCCA;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=11840006;WS=11839988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	11842144	rs10864542	C	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=487;SC=GTGGCCTCCTCTGTTCCCACC;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=11842152;WS=11842134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	11844330	rs10864543	C	T	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=75;PP=2665;SC=CACTGGGGGCCGTGTTTGCCA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=126;WE=11844338;WS=11844320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	11845113	rs11587953	G	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=648;SC=GGCTGGGCCCGGAAGGCCCCC;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=11845121;WS=11845103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	11845169	rs11586659	T	G	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=23;PP=1181;SC=TCCTGGCCTTTATGGCCCTGG;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=11845177;WS=11845159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	11847334	rs35134728	G	GGAA	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=248;SC=GGGAATGGGTGGAAGAGGCCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=11847342;WS=11847324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	11847759	rs3737966	C	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=182;SC=TCTCTTTGGGCGGCAGGCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=11847767;WS=11847749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	11848879	rs2077360	A	G	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=42;PP=1312;SC=TGCCACAGCCACGCACCGTGG;SOR=1.387;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=61;WE=11848887;WS=11848869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	11849447	rs868014	A	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=40;PP=1335;SC=GGAAGCCGCCAGAGCACCGCG;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=11849455;WS=11849437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	11854457	rs4846051	G	A	5238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=66;PP=2965;SC=GGTAAAGAACGAAGACTTCAA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=148;WE=11854465;WS=11854447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	11854755	rs1994798	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=621;ReadPosRankSum=0.328;SC=GAACAAAGATGTATTTGCAAG;SOR=0.794;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=47;WE=11854763;WS=11854745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,53:0.39:137
chr1	11856378	rs1801133	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=574;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GATGAAATCGGCTCCCGCAGA;SOR=1.228;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=38;WE=11856386;WS=11856368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
chr1	11867044	rs3737964	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=655;SC=CCCTCACCCCTGAAAGGTTTT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=11867052;WS=11867034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	11884555	rs198400	A	G	4398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=67;PP=2556;SC=CTCTTCGTGGAGAAGGAAGGC;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=128;WE=11884563;WS=11884545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	11886124	rs3216184	CT	C	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.545;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	11900035	rs198410	G	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=808;SC=TTGGCCTCCAGTGTGTGAGCC;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=11900043;WS=11900025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	11971266	rs143477276	C	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CTGTCCCAGTCCACTGACTCA;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=12;WE=11971274;WS=11971256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr1	11971345	rs4845889	T	C	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=163;SC=TTGCATCCTTTGATGCAATCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=11971353;WS=11971335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	11980449	rs17037529	T	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=0.977;SC=TGGCCAGCTATAGAAATAGGC;SOR=0.533;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=38;WE=11980457;WS=11980439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr1	11982544	rs2639453	T	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=27;NR=13;PP=781;SC=AAAACACTTGTGCGCGCTCTC;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=11982552;WS=11982534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	11983206	rs3795408	A	G	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=42;PP=1512;SC=GCAGCCCCCCAAAGCTGAGCA;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=11983214;WS=11983196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	12004479	rs112065997	TACACAC	T,TACACACACACACACACAC,TACACACACACAC	744.73	.	AC=1,1,0;AF=0.500,0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=7,7;NR=3,3;PP=1228,1068;SC=CATGCACGCGTACACACACAC;SOR=3.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10,10;WE=12004492;WS=12004469;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:20
chr1	12009955	rs7529452	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.978;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TCATTCTCTTCGCAGACAGGT;SOR=1.187;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=32;WE=12009964;WS=12009945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr1	12009956	rs7551175	G	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.978;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=1411;ReadPosRankSum=0.398;SC=CATTCTCTTCGCAGACAGGTA;SOR=0.364;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=43;WE=12009964;WS=12009945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr1	12010046	rs41278622	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=220;ReadPosRankSum=0.363;SC=CCAGAACATCGGGGAAGAAGG;SOR=2.566;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=11;WE=12010054;WS=12010036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	12010469	rs2273285	G	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=870;ReadPosRankSum=0.353;SC=GTTCCGGCAGGCCAGGAGCCA;SOR=0.734;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=50;WE=12010477;WS=12010459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr1	12024235	rs1130529	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1181;ReadPosRankSum=-1.642;SC=CCCTCAGGAACGTCATTGCCC;SOR=0.906;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=90;WE=12024243;WS=12024225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,104:0.39:270
chr1	12024607	rs7529028	T	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=384;ReadPosRankSum=0.501;SC=ACACCCAGACTCCAGGCTATG;SOR=0.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=19;WE=12024615;WS=12024597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	12026355	rs2230898	A	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=658;ReadPosRankSum=0.077;SC=AAGCCCTGGCAGGGAAGCTGG;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=52;WE=12026363;WS=12026345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr1	12027204	rs2273293	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=758;SC=CCATCAGTGCCGCTCACTGTC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=12027212;WS=12027194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	12033113	rs3737961	A	G	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.90;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	12033120	rs3820190	G	C	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.50;SOR=2.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	12056440	rs2236056	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=441;SC=CGTTGTGACACGGCTGACCTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=12056448;WS=12056430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	12058802	rs41278626	T	C	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=713;ReadPosRankSum=0.207;SC=TGCCTGATGATTTGGTTTACC;SOR=0.378;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=48;WE=12058810;WS=12058792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr1	12062017	rs6680984	T	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=644;ReadPosRankSum=1.126;SC=CCCACCTCCCTCCGTGCCTCT;SOR=0.887;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=39;WE=12062025;WS=12062007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr1	12062205	rs2236057	A	G	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=62;PP=1865;SC=CTGCCGAGACAAGGGTGCTCC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=12062213;WS=12062195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	12065170	rs3766742	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.732;SC=ACAGAGTCGCACTCCGTAACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=12065178;WS=12065160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	12065841	rs1042837	C	T	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.942;SC=AGTGCTTCTCCCTCAACTATG;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=62;TCR=70;TR=68;WE=12065849;WS=12065831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,86:0.53:162
chr1	12066813	rs2273295	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-1.488;SC=GCCTGAGGGCTAGGTTCCTGC;SOR=1.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=12066821;WS=12066803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	12067388	rs11586204	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTCTTCCCACGTGGCCTGGA;SOR=1.071;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=12;WE=12067396;WS=12067378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr1	12069798	rs77262016	T	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=744;ReadPosRankSum=-1.126;SC=GGCTGGCCCGTGTGGCCAAAG;SOR=0.880;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=54;WE=12069806;WS=12069788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr1	12071680	rs1042842	A	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=432;SC=CCTAAGTGCCATGTGGGCTCC;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=12071688;WS=12071670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	12082334	rs11553925	A	T	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1335;ReadPosRankSum=0.641;SC=CACCTGCCAAATGCCAGCACC;SOR=0.704;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=80;WE=12082342;WS=12082324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,94:0.56:169
chr1	12082461	rs11588712	C	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=956;ReadPosRankSum=-2.135;SC=GGCACAGACCCCGAGGTCCAT;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=56;WE=12082469;WS=12082451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr1	12082881	rs11588779	C	T	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1485;ReadPosRankSum=-1.723;SC=TCTGTGCTTCCTTCCTCAGCC;SOR=0.615;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=78;TCR=111;TR=95;WE=12082889;WS=12082871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,107:0.50:212
chr1	12082926	rs2295283	A	G	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=80;PP=2558;SC=TGCAGTTCCTAAGAGGAGCTG;SOR=1.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=33;TCR=80;TR=113;WE=12082934;WS=12082916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	12090001	rs4514248	T	C	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1249;ReadPosRankSum=-3.015;SC=CCTGAACCACTGGTTTTAAGA;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=94;WE=12090009;WS=12089991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,109:0.45:240
chr1	12091210	rs946461	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=686;SC=AGGCCCTGCCTTGGTGGGGGC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=12091218;WS=12091200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	12144662	rs11569821	T	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.489;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	12144667	rs11569822	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.801;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	12157288	rs11569835	T	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=483;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGGGCCTTGTTCTCTCTCCAG;SOR=0.991;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=28;WE=12157296;WS=12157278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,32:0.31:103
chr1	12164437	rs2230622	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=599;ReadPosRankSum=0.333;SC=GTCCCTTAGACGACCTCGTGG;SOR=0.720;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=41;WE=12164445;WS=12164427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr1	12175729	rs1763642	C	T	6205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=91;PP=2965;SC=CACCAACTCCCGTGCCCGCTG;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=185;WE=12175737;WS=12175719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	12175818	rs598661	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=711;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CCTCGACCACAGGGTGGAGTC;SOR=0.407;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=46;WE=12175826;WS=12175808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr1	12183174	rs4846096	A	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=1.486;SC=GTGTGAGCCAATGTGCCTGGC;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=12183182;WS=12183164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	12198635	rs6419481	T	C	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=434;SC=TTCACCCCAATTGAAGTTTCT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=12198643;WS=12198625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	12249031	rs1201157	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=159;ReadPosRankSum=0.413;SC=GCAAGAGCATAGCCCTTGATT;SOR=0.183;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=13;WE=12249039;WS=12249021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr1	12252333	.	C	CTGTG	267	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=267;QD=54.0;SC=GTACAGGCATCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=12252341;WS=12252323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	12401868	rs28551666	A	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=502;ReadPosRankSum=0.170;SC=GCCGGCAGCCATTTGTCCCCT;SOR=0.632;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=29;WE=12401876;WS=12401858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr1	12418700	rs10864552	T	C	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=48;PP=1179;SC=AACCATTGGCTGATGACCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=12418708;WS=12418690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	12469828	rs114587961	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=379;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TTGAGAACTTCAAGAAAAGAC;SOR=0.193;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=27;WE=12469836;WS=12469818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	12567232	rs7554257	A	G	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=57;PP=2666;SC=CTCAGCAGGAACTCATTTAGG;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=125;WE=12567240;WS=12567222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	12638964	rs2275875	T	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=50;PP=1360;SC=CCAGCATACGTGGCAGGAAGG;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=12638972;WS=12638954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	12639018	rs2275874	C	T	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=812;SC=GTGGAGCAGCCGCAGCTCTGA;SOR=3.383;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=12639026;WS=12639008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	12639168	rs3128461	A	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=14;PP=1057;SC=AGTCTGATGTATCCTAGAGCT;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=12639176;WS=12639158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	12725943	rs1419298	T	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=25;PP=999;ReadPosRankSum=-1.056;SC=TCCACACTGGTGTAGTGTTGC;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=97;TCR=53;TR=72;WE=12725951;WS=12725933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,75:0.45:167
chr1	12776218	rs3000860	A	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=386;SC=CAGCAGCCTGAGTGTTCTCAC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=12776226;WS=12776208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	12776344	rs3000859	A	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=33;PP=1779;SC=TGCTGTTGACATGGGTGAGTT;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=12776352;WS=12776334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	12779560	rs3010876	T	C	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=83;PP=2965;SC=TAAAGTATGATCCCGATGTTG;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=151;WE=12779568;WS=12779550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	12779618	rs3010877	T	C	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=59;PP=1903;SC=GCTGTACCAATCCAAGGCATC;SOR=1.232;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=12779626;WS=12779608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	12785093	rs4361998	T	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=413;SC=TTTCACAAAGTGAAGTGAATG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=12785101;WS=12785083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	12785494	rs7513079	G	T	6351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=119;PP=2965;SC=ATCTGCTACTGTTTTTTTCAA;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=88;TCR=119;TR=207;WE=12785502;WS=12785484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	12786070	rs3000930	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=339;SC=GCTAGGGAGGAGGTAGAGGTT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=12786078;WS=12786060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	12820870	rs1132185	T	C	3983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=80;PP=2643;SC=CCTGCATCCTTTCCCACACTT;SOR=1.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=127;WE=12820878;WS=12820860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	12835605	rs41303869	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=326;ReadPosRankSum=0.466;SC=GCAGCAGGGAGGAGAGTCGCT;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=18;WE=12835613;WS=12835597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	12835868	rs1812242	T	C	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=77;PP=1944;SC=AAGAATGGGATGCTGGATGAA;SOR=1.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=29;TCR=77;TR=106;WE=12835876;WS=12835858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	12837634	rs848578	T	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=34;PP=1282;SC=AGCCCAAGATTATTGTGTTCA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=12837642;WS=12837624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	12837840	rs848577	G	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=329;SC=CAATGTGAACGGGAAAGGAAA;SOR=3.126;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=12837848;WS=12837830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	12854530	rs1063776	C	G	7184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=130;PP=2965;SC=TAATGAACTCCAAGGACGGTT;SOR=0.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=97;TCR=130;TR=227;WE=12854538;WS=12854520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	12888601	rs113914674	G	GC	656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=761;SC=AGCAGGCTCCGCCCGCAAGCT;SOR=2.200;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=14;WE=12888615;WS=12888585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	12888706	rs61777005	C	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.352;NF=3;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CACTCTCAGGCCAAGCCCATG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=12888714;WS=12888696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	12907282	rs139731855	G	C	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQRankSum=-5.884;QD=12.99;ReadPosRankSum=2.609;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr1	12907284	rs149796618	TG	CC	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.632;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQRankSum=-6.063;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.426;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,42:0.36:118
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chr1	12907798	rs150096254	A	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=28.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQRankSum=-8.194;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,58:0.22:259
chr1	12907802	rs138087690	CC	TT	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=27.339;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQRankSum=-8.112;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=2.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,60:0.23:262
chr1	12907837	rs1736811	C	T	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.594;NF=71;NR=30;PP=1671;ReadPosRankSum=0.399;SC=CGTACATCTCCGCTGCTGATC;SOR=1.512;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=262;TCF=149;TCR=113;TR=101;WE=12907845;WS=12907827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,103:0.36:288
chr1	12907885	rs848418	T	C	3541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.543;NF=83;NR=72;PP=2223;ReadPosRankSum=-1.494;SC=CTTTTGGCTCTGCAGCCAGGT;SOR=0.477;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=300;TCF=173;TCR=127;TR=155;WE=12907893;WS=12907875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,164:0.49:333
chr1	12908236	rs1736809	G	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=9.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.09;MQRankSum=-3.242;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr1	12908243	rs1736808	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=7.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQRankSum=-1.465;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.769;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr1	13182899	rs28537666	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=8.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQRankSum=0.919;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr1	13182903	.	AG	A	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=9.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQRankSum=1.067;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr1	13183439	rs28713604	T	C	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.449;NF=71;NR=39;PP=1805;ReadPosRankSum=-1.204;SC=TATGCGCTGGTGTTTCGAGGG;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=123;TCR=70;TR=110;WE=13183447;WS=13183429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,142:0.59:239
chr1	13183511	rs72864546	T	C	3807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.314;NF=49;NR=66;PP=1630;ReadPosRankSum=-1.957;SC=GTACATCCCATCATAATAATC;SOR=0.778;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=260;TCF=138;TCR=122;TR=115;WE=13183519;WS=13183501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,118:0.41:291
chr1	13183528	rs76937665	A	C	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=40.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQRankSum=-7.081;QD=11.87;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=1.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,88:0.32:278
chr1	13183532	rs77505369	CC	TT	3069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=42.087;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQRankSum=-7.387;QD=10.92;ReadPosRankSum=-2.894;SOR=1.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,87:0.31:281
chr1	13183567	rs78160026	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=76.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQRankSum=-10.622;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.985;SOR=5.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,31:0.13:240
chr1	13183573	rs76669210	G	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=70.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-10.433;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=6.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,23:0.10:224
chr1	13802325	rs3013105	T	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=335;SC=CAGTCATCCTTGTCCTCGTCT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=13802333;WS=13802315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	13802437	rs3013106	G	A	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=41;PP=1864;SC=CGGCCACACCGGAGAAAATGA;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=13802445;WS=13802427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	13802617	rs79959055	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=0.654;SC=CAGCTCAAGGTTGCCTAAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=23;WE=13802625;WS=13802607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	13910417	rs355025	C	T	3901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=60;PP=2624;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CTCCGGCCCCCCCACCGTCGC;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=247;TCF=143;TCR=104;TR=146;WE=13910425;WS=13910407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,163:0.61:267
chr1	13910741	rs150088145	CGGA	C	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GGCTGAGCGCCGGAGGAGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=13910751;WS=13910731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	13936822	rs404658	G	T	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=828;SC=TAAGGCAGGGGATATATTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=13936830;WS=13936812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	13937089	rs2487643	G	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=693;SC=TCAACAAATAGAATAATCAAT;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=34;WE=13937097;WS=13937079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	13940864	rs2486188	C	G	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=64;PP=2965;SC=TTCATTGGTGCAATCATCGTT;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=13940872;WS=13940854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	14106518	.	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,33:0.26:125
chr1	14143003	rs1046331	A	G	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=94;PP=2965;SC=TCAAAGCTCCAGCTGCAGCCC;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=88;TCR=94;TR=182;WE=14143011;WS=14142993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	14149505	rs2697970	C	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=9;PP=574;SC=TCACTGTGAACATTCATCAAG;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=14149513;WS=14149495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	14149601	rs2697969	C	T	3537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=36;PP=2184;SC=CCACCATGGTCGGCACTGAAT;SOR=1.234;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=100;WE=14149609;WS=14149591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	14149622	rs2697968	T	C	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=50;PP=2310;SC=GTGTGCTTACTGTTATTATTT;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=123;WE=14149630;WS=14149612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	14220186	rs1358577	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=664;ReadPosRankSum=0.980;SC=GCGACATCCAATTCTGCCACA;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=42;WE=14220194;WS=14220176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr1	15287168	rs41301991	C	T	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=978;ReadPosRankSum=0.077;SC=ACCCTGTGCCCTTCTCCCCTA;SOR=0.354;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=68;WE=15287176;WS=15287158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,81:0.54:150
chr1	15390145	rs2076565	A	G	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=853;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TGGCCACTTGAACCCTCCCTC;SOR=0.833;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=57;WE=15390153;WS=15390135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr1	15390178	rs2076564	C	T	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=520;ReadPosRankSum=0.986;SC=ACTACAACTTCACCCTCTGTT;SOR=0.719;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=42;WE=15390186;WS=15390168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
chr1	15390211	rs2076563	G	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=358;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CATCCATGCCGCACACCCAAG;SOR=0.519;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=28;WE=15390219;WS=15390201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr1	15427934	rs10927676	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=187;ReadPosRankSum=0.713;SC=CCTCCCCCAACCCCATTGCTT;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=15427942;WS=15427924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr1	15427982	rs502918	G	A	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=17;PP=959;SC=CTGCCCGTCCGTCTGTTTCTG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=15427990;WS=15427972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	15428358	rs477953	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=375;SC=GTCCACCCACTACCCGTCTAT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=15428366;WS=15428348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	15430031	rs45547637	A	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=483;ReadPosRankSum=0.781;SC=GCAAATCAATATGCAAATCAC;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=36;WE=15430039;WS=15430021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr1	15439083	rs140963536	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	4956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=1004;SC=AGACCCGGGAAAGGTCTTTTT;SOR=3.278;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=22;WE=15439091;WS=15439073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr1	15497727	rs6429722	T	C	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=31;PP=1530;SC=GCCTGGAAGATCGCTGTTTGA;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=15497735;WS=15497717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	15497832	rs41307794	T	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=521;ReadPosRankSum=-0.570;SC=AGGGGTTTGTTATAGGAATTA;SOR=0.614;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=26;WE=15497852;WS=15497822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr1	15497844	rs10429935	T	A	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=1050;SC=TAGGAATTAGTTCTTATGCAT;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=15497852;WS=15497822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	15541412	rs3753315	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GCAGCCATCCGCACGGGAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=15541420;WS=15541407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	15541537	rs3753314	C	T	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=26;PP=1361;SC=GCCTTGTATACATTTATTTTC;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=15541545;WS=15541527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	15541607	rs3820065	T	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=744;ReadPosRankSum=-0.335;SC=CCAAGGCCAATGGCTCGCACT;SOR=0.480;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=45;WE=15541615;WS=15541597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr1	15573689	rs1780596	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=1.150;SC=GCCCTCATCTATTAGGCTGGA;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=15573697;WS=15573679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	15573711	rs1752018	C	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=103;ReadPosRankSum=0.519;SC=CCCGCGGCGCCTGGCGGCGTT;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=15573719;WS=15573701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	15573758	rs1780597	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.929;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	15573769	rs1752017	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	15573775	rs1780598	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.179;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	15573950	rs1780599	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=0.300;SC=GGGGCGGCCCAGCGAGGACTA;SOR=1.329;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=7;WE=15573958;WS=15573940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	15574076	rs1752016	C	T	64.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.52;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	15578195	rs1622686	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=1.682;SC=TTCATTCATTTTAAGTATGAT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=15578203;WS=15578185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	15599025	rs75432354	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.143;SC=ATCCACCTCCGGTGAGTCCGG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=15599033;WS=15599015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	15616139	rs486557	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=998;ReadPosRankSum=1.917;SC=GACGACGCCCGCAAGCCACCC;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=67;WE=15616154;WS=15616129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr1	15616183	rs487338	T	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=752;ReadPosRankSum=-1.387;SC=GGGCTGCCATTGGTGGCTTGG;SOR=0.831;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=56;WE=15616191;WS=15616173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr1	15635296	rs41269435	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=0.693;SC=GGCCACAGCAGACATCACCAA;SOR=0.430;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=10;WE=15635304;WS=15635286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	15671483	rs486089	G	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=414;ReadPosRankSum=-1.635;SC=AGGGGAGTGCGGTGAGGAGTG;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=25;WE=15671491;WS=15671473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr1	15687059	rs4661330	A	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=580;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CACGGGTTTGAAGAAGAGATC;SOR=0.990;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=32;WE=15687067;WS=15687049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr1	15702130	rs17368978	A	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=960;ReadPosRankSum=1.567;SC=AATCATTTCTAGATTTAAAGA;SOR=0.582;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=55;WE=15702138;WS=15702120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr1	15702297	rs2496342	T	G	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=810;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GACACTAGCTTCGTTCCCTGG;SOR=0.811;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=45;WE=15702305;WS=15702287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr1	15707984	rs2473333	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=350;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AGAAAGGCCCGGGCCTCCCTT;SOR=1.371;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=18;WE=15707992;WS=15707974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	15708540	rs1010294	A	G	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=904;ReadPosRankSum=0.529;SC=CAAAGTGTCCATTGAGATGTA;SOR=0.464;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=62;WE=15708548;WS=15708530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,81:0.63:128
chr1	15709555	rs3820067	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=432;ReadPosRankSum=1.479;SC=AGCATGGTACAGGAGTCAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=34;WE=15709563;WS=15709545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr1	15710411	rs2496338	G	C	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=691;ReadPosRankSum=2.408;SC=TTCTCCTGCTGTCTGCAGGGT;SOR=0.689;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=42;WE=15710419;WS=15710401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr1	15714774	rs3737694	T	A	152.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CCTCTGCCCCTCGTCCCTCCC;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=15714782;WS=15714764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	15714831	rs6669577	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;QD=21.20;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,9:1.00:9
chr1	15714842	rs3002000	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=-1.075;QD=7.72;ReadPosRankSum=-2.836;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	15717838	rs2473338	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.733;NF=4;NR=6;PP=148;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TTGAGACGGAATCTCACTCTG;SOR=0.064;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=15717846;WS=15717828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	15723843	rs2294490	G	A	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=906;ReadPosRankSum=0.417;SC=GAGAGATGCTGAGGAAAGAGA;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=58;WE=15723851;WS=15723833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,65:0.47:137
chr1	15724003	rs2253371	A	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=47;PP=1129;ReadPosRankSum=-1.698;SC=TGCTTTTGTAAGTCTTTAAAG;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=66;WE=15724011;WS=15723993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr1	15724033	rs2253372	A	G	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=66;PP=1849;SC=CTAGTGTTTCATTTCCTAGAC;SOR=2.975;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=80;WE=15724041;WS=15724023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	15754484	rs2473356	T	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=17;PP=1163;SC=CGCCCTTGCTTTGCAGCAGCC;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=15754492;WS=15754474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	15769139	rs3765373	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=51;PP=1511;SC=AGACGGAGCCGCAGAGCCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=15769147;WS=15769129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	15769876	rs35149641	G	GC	1748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=1455;SC=TGGGGCCAGGGCCTCCTGCCC;SOR=2.701;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=36;WE=15769884;WS=15769866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	15783096	rs5772641	GA	G	5155.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=26.58;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr1	15783117	rs5772642	C	CA	9033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=83;PP=2967;SC=TATTTGGACACAGCTCTTTTT;SOR=1.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=152;WE=15783125;WS=15783107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	15788269	rs3737696	A	C	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1963;ReadPosRankSum=2.487;SC=TAACCACTATACTGGCTGAGA;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=101;WE=15788277;WS=15788259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr1	15808198	rs7520335	C	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=461;SC=CTTCTTTGTCCGTGACCTCTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=15808206;WS=15808188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	15808702	rs4661635	C	T	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=17;PP=2382;SC=CTATCCCTAGCATTATTCAAA;SOR=3.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=85;TCR=17;TR=102;WE=15808710;WS=15808692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	15808767	rs3820071	G	A	8378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=94;PP=2965;SC=CAGCTCCTCCGGGATCTACCG;SOR=1.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=161;TCR=94;TR=255;WE=15808775;WS=15808757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr1	15808872	rs3766160	G	A	9986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=171;PP=2965;SC=CTGGAACTCCGACCAGGTCTC;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=286;TCF=115;TCR=171;TR=286;WE=15808880;WS=15808862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr1	15809876	rs10927792	G	A	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=63;PP=2850;SC=GCTACGTCACGGGCTGGGGAA;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=147;WE=15809884;WS=15809866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	15809930	rs184117904	G	A	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.833;NF=27;NR=37;PP=931;ReadPosRankSum=0.282;SC=GGCCTGGGAGGGAAGGGAGGT;SOR=0.897;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=64;WE=15809938;WS=15809920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,78:0.43:180
chr1	15812432	rs6429745	A	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=21;PP=1541;SC=AAGCAGGGCCAGTTGCTGGTT;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=15812440;WS=15812422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	15813751	rs2011159	C	T	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=26;PP=2396;SC=CCTCCCACTTCAACTCCCTAT;SOR=2.068;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=84;TCR=27;TR=110;WE=15813759;WS=15813741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	15813969	rs3737704	A	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=41;PP=1177;SC=CAAGGCACTGACCTGCTCACC;SOR=4.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=15813977;WS=15813959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	15820576	rs2020900	T	A	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=37;PP=1059;SC=CCATGCACGCTGGCTCGGGCG;SOR=3.467;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=15820584;WS=15820566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	15820607	rs2020895	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=433;SC=CTTGACTCATACATACATCCA;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=15820626;WS=15820597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	15820618	rs2020898	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=382;SC=CATACATCCAACAGGAGCAGC;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=15820626;WS=15820597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	15822073	rs4646090	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=295;SC=TGGGACCCCAAACTCATTAAG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=15822081;WS=15822063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	15832383	rs1800614	G	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=663;SC=TTTCCACAAAGCCAAGGGTGT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=15832391;WS=15832373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	15832543	rs1052576	T	C	6401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=99;PP=2965;SC=GTGGTCCTGCTGCGCCAGCTC;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=198;WE=15832551;WS=15832533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	15834297	rs2020903	G	A	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=426;SC=CACCTGCAGGGAAGGACCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=15834305;WS=15834287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	15834491	rs4646032	G	A	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=55;PP=1874;SC=CCCCAAGAACGGAGCAGCGAG;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=90;WE=15834499;WS=15834481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	15844615	rs1132312	A	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=15;PP=820;SC=CGACATCACCAAATCCTCCAG;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=15844623;WS=15844605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	15844926	rs1820205	C	T	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=32;PP=1137;SC=TAATTATCCACGTACTTTTAT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=15844934;WS=15844916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	15845022	rs112189619	C	CTGAG	805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=958;SC=TGCAGGTGCACTGTGTGCCAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=15845030;WS=15845012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	15850553	rs4645984	C	CGGGGGCG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	15850613	rs1052571	G	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=5;PP=223;SC=GCTCAGCAGGGCGTCCCAGAG;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=15850621;WS=15850603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	15873386	rs7515244	A	G	4907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=101;PP=2965;SC=ATGCTAGGATAATGGTTTCTT;SOR=1.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=44;TCR=102;TR=145;WE=15873394;WS=15873376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	15874961	rs2295626	T	A	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=82;PP=2467;SC=TTTCTTCACATTTTATCCCAA;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=46;TCR=82;TR=128;WE=15874969;WS=15874951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	15909547	rs6429756	G	A	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=113;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=147;SC=TAAAATAAATGAATTACAATG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=15909555;WS=15909537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	15909624	rs111921608	TGAGTACAG	T	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=2324;SC=CTCAAGCCCCTGAGTACAGGA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=13;WE=15909639;WS=15909614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	15909850	rs6429757	C	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=767;SC=TTGACTGTCCCAAGCATCACT;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=15909858;WS=15909840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	15909895	rs6429758	A	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=446;SC=CCGAATCTGCAGAAGGAAGAA;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=15909903;WS=15909885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	15911031	rs10927808	T	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=234;SC=AGGGTCCAGGTAAATCAACCA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=15911039;WS=15911022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	15911349	rs3737705	G	A	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=1025;SC=TCCGGGGCGCGTCGGAAGCCT;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=15911357;WS=15911339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	15911493	rs6687474	A	G	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=84;SC=TCACCGACCAAACCGCCCGCG;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=15911501;WS=15911483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	15959886	rs3795762	C	G	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=14;PP=1235;SC=TACTGATAAACGTTGAAAATA;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=15959894;WS=15959876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	16011005	.	G	GGGC	1442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.88;QD=43.72;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	16052054	.	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=489;ReadPosRankSum=-0.100;SC=AGCAGGGAGGGGCCCAGAAAG;SOR=0.327;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=31;WE=16052062;WS=16052044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr1	16065303	rs147907985	ACACACT	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=3;PP=281;SC=ACACACTCTCACACACTCACA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=16065316;WS=16065293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	16095316	rs2271545	C	T	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=300;SC=TACCTAAATTCTATTTAAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=16095324;WS=16095306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	16096934	rs10927851	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=9;PP=741;SC=AAGACCGTGTCCCCCCGAGAG;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=16096942;WS=16096924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	16097237	rs10803398	G	A	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=626;SC=GAAGGCGATTGGTTTCCTAGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=16097245;WS=16097227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	16133838	rs66673012	A	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=1.070;SC=TGCCCAGATGATGAAGGCTGG;SOR=2.494;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=16133846;WS=16133828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	16133987	rs7417535	T	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.108;NF=27;NR=32;PP=998;ReadPosRankSum=1.168;SC=ATGCTCATCATAGAGCTCTAG;SOR=0.667;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=59;WE=16133995;WS=16133977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr1	16134072	rs61744357	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-1.048;NF=26;NR=29;PP=807;ReadPosRankSum=0.376;SC=TCCACTAATTCCTCCTCTTCC;SOR=0.602;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=55;WE=16134080;WS=16134062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr1	16134129	rs61738972	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=645;ReadPosRankSum=0.709;SC=ATCTTTTGCTCGTCCTCCAGT;SOR=0.880;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=41;WE=16134137;WS=16134119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr1	16245610	rs35883633	GT	G	57.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	16256007	rs848209	T	C	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1354;ReadPosRankSum=0.922;SC=CTGGGAGAACTAGCAGGTGAA;SOR=0.529;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=87;WE=16256015;WS=16255997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,102:0.50:202
chr1	16259813	rs848210	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=802;ReadPosRankSum=-1.314;SC=CCCTGAATCCAACCAAGCTCA;SOR=0.474;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=50;WE=16259821;WS=16259803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
chr1	16265422	rs848214	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=861;ReadPosRankSum=2.275;SC=GGTGGGGCTGATCAGGGTAGG;SOR=0.745;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=41;TCR=83;TR=54;WE=16265430;WS=16265412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr1	16271156	rs12134932	C	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=785;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CCGGGCCTGGCAGGGGCCGGG;SOR=0.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=45;WE=16271164;WS=16271146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr1	16272250	rs848217	A	G	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=430;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CAGCTTCTGCAGCAGCCATGC;SOR=0.462;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=34;WE=16272258;WS=16272240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr1	16332665	rs34950166	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=873;ReadPosRankSum=1.213;SC=CACCCTGCCGCTCTGCAGAGG;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=48;WE=16332673;WS=16332655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,54:0.42:130
chr1	16342237	rs1739840	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-2.206;SC=TGTTCATGACAGTGCCGTCAG;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=16;WE=16342245;WS=16342227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr1	16344360	rs732286	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=657;ReadPosRankSum=0.541;SC=GGGCCGGGAGAGCACGGGAGG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=40;WE=16344368;WS=16344350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr1	16344402	rs945416	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=3.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr1	16344494	rs1572381	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=967;ReadPosRankSum=-0.745;SC=AGGCGGGCGAGGGCTGGACAG;SOR=0.484;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=55;WE=16344502;WS=16344484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr1	16344625	rs945417	C	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=605;ReadPosRankSum=-0.013;SC=ATTTAGGCCTCTCCATGGCCC;SOR=0.698;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=42;WE=16344633;WS=16344615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,45:0.38:117
chr1	16344664	rs872222	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.613;SC=TCTCCCGTGCGCCGGCCCTGC;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=22;WE=16344672;WS=16344654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr1	16344730	rs945418	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.525;SC=CATTCCAGGCTGATCACAGCA;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=8;WE=16344738;WS=16344720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	16345619	rs945422	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=467;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TCAGCAAAGCTGGGACTGACC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=27;WE=16345627;WS=16345609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr1	16346009	rs3841842	G	GC	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.534;NF=2;NR=20;PP=710;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TTTTGTCTGAGCCCCCTACAA;SOR=1.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=22;WE=16346017;WS=16345999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	16351275	rs10927887	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.012;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=459;ReadPosRankSum=0.036;SC=GTGGCTGTACAGGGAGATTGG;SOR=1.673;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=29;WE=16351283;WS=16351265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr1	16352937	rs1010069	G	A	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=932;ReadPosRankSum=0.202;SC=TGGGGGTTGGGGAGATGGAGG;SOR=1.204;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=54;WE=16352945;WS=16352927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr1	16353400	.	T	C	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=49;QD=20.9428031368;SC=TCAGCCCCGCTTTGGGTATAG;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=16353408;WS=16353390;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr1	16356501	rs1805152	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TCTTGCCGTCGCCTTCCCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=20;WE=16356509;WS=16356491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr1	16356583	rs3737218	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=215;ReadPosRankSum=1.805;SC=GAGTGGGTCACGGCCCTGCTG;SOR=0.927;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=20;WE=16356591;WS=16356573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	16358148	rs2015509	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=617;ReadPosRankSum=-1.459;SC=ATCCCCTTGCTGGCCTGGGTC;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=49;WE=16358156;WS=16358138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,59:0.38:155
chr1	16358685	rs6669935	C	G	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=730;ReadPosRankSum=1.975;SC=CCCTCTCCCTCTCTACTTGCC;SOR=0.471;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=59;WE=16358693;WS=16358675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr1	16358932	rs10803407	T	C	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=970;ReadPosRankSum=-2.589;SC=TCTTCCCCACTCCCAGCAGTG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=93;TCR=38;TR=62;WE=16358940;WS=16358922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,81:0.47:173
chr1	16359051	rs10927892	CA	AG	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=2267;ReadPosRankSum=-1.745;SC=GTGACACACGCAGCCCCCGGG;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=59;WE=16359060;WS=16359041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,79:0.54:146
chr1	16359106	rs10803408	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=668;ReadPosRankSum=1.611;SC=GCCTCCCGTCCCAACCCCGCC;SOR=0.184;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=39;WE=16359114;WS=16359096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr1	16359123	rs9442217	A	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=548;ReadPosRankSum=0.396;SC=CGCCCCGCCCATCTTATCCTG;SOR=0.098;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=30;WE=16359131;WS=16359113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr1	16361916	rs11811753	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.646;NF=7;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=-1.808;SC=GTGAGGGGCCGCTGGGAAGGC;SOR=1.473;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=10;WE=16361924;WS=16361906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr1	16362561	rs55731534	C	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.478;NF=19;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CCTGCTCCTGCCACTGCCGGG;SOR=1.361;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=20;WE=16362569;WS=16362551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr1	16362621	rs2009044	G	A	5162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=62;PP=2965;SC=GAAGAAACTCGGGCTGAGAAA;SOR=1.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=106;TCR=62;TR=168;WE=16362629;WS=16362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	16362661	rs3978493	A	C	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.600;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.978;NF=63;NR=34;PP=1511;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GTCACACTGCATTTGGTGATG;SOR=1.244;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=228;TCF=128;TCR=100;TR=97;WE=16362669;WS=16362651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,125:0.45:278
chr1	16370899	rs945394	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.26;MQRankSum=2.357;NF=4;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=1.029;SC=TTCATGGGTGGGGAGAGCACT;SOR=1.508;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=5;WE=16370907;WS=16370889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	16371067	rs2015352	G	T	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=855;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CCCTGTCCCCGCATCCGCCGA;SOR=0.516;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=56;WE=16371075;WS=16371057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr1	16371932	rs6604909	A	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=0.260;SC=ACCCCAGAGTATACCACCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=4;WE=16371940;WS=16371922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	16372003	rs6604910	G	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=0.527;SC=GGATGGGACTGTCTGTGCCTC;SOR=1.138;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=13;WE=16372011;WS=16371993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr1	16372283	rs6604911	T	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTGGGGGGGGTGCTCTGGGTG;SOR=0.563;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=12;WE=16372291;WS=16372273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	16373124	rs5257	A	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.107;NF=43;NR=36;PP=1108;ReadPosRankSum=1.581;SC=CTTTCTCTTCAGGCTTCTCTC;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=89;TCR=69;TR=79;WE=16373132;WS=16373114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,84:0.45:185
chr1	16373199	rs35820664	CCTT	C	2709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.099;NF=6;NR=43;PP=1931;ReadPosRankSum=0.911;SC=CTGGCCAAAACCTTCTCAGAT;SOR=0.788;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=14;TCR=86;TR=49;WE=16373209;WS=16373189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr1	16373282	rs2095540	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.226;NF=4;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=0.325;SC=TGGCTTGCCCAAAGGGACACA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=19;WE=16373290;WS=16373272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	16374533	rs2014562	G	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=235;ReadPosRankSum=1.107;SC=TCTTCCTCGGGAAAGTGGTAT;SOR=1.156;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=15;WE=16374541;WS=16374523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr1	16374622	rs2863440	C	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=0.690;SC=ACGAAAGCTGCGTCAGAGGGG;SOR=0.400;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=19;WE=16374630;WS=16374612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	16374656	rs2902490	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=221;ReadPosRankSum=0.451;SC=CCTGCCTTCCAGGAACTCAGT;SOR=0.365;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=19;WE=16374664;WS=16374646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	16374994	rs1889788	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.11;MQRankSum=-0.826;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.353;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	16375063	rs1889789	CA	GC	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.282;NF=10;NR=9;PP=752;ReadPosRankSum=0.453;SC=ACAGTCTTTGCAGCTCCCTTC;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=19;WE=16375072;WS=16375053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr1	16375210	rs9633514	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=157;ReadPosRankSum=2.257;SC=CCCCGCCTTGGGCACAGCCAC;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=9;WE=16375218;WS=16375200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	16375510	rs11588392	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=306;ReadPosRankSum=0.494;SC=CGGGCTGCAGGAGAGCAGGAC;SOR=0.333;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=21;WE=16375518;WS=16375500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	16376191	rs7367494	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.260;NF=9;NR=4;PP=197;ReadPosRankSum=0.609;SC=TTTTTTGTGGCGCTGGGGTGA;SOR=0.275;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=13;WE=16376199;WS=16376181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	16376230	rs59006537	A	AT	1128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.457;NF=14;NR=7;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TGAGAGTCCAAAAGGCATTCC;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=21;WE=16376246;WS=16376218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr1	16376232	rs59924562	A	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-1.590;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr1	16376238	rs34589727	TC	T	731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.414;NF=11;NR=9;PP=1209;ReadPosRankSum=0.793;SC=CAAAAGGCATTCCCCCCAAGG;SOR=0.768;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=20;WE=16376246;WS=16376218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr1	16376278	rs7365182	G	A	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.147;NF=41;NR=20;PP=969;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TACTGGGGTCGGGCTCTGGGC;SOR=0.790;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=61;WE=16376286;WS=16376268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,73:0.41:177
chr1	16376319	rs7368151	T	C	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.915;NF=49;NR=41;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GGGGTCTCTGTGGCATCCTGG;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=90;WE=16376327;WS=16376309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,115:0.46:250
chr1	16376458	rs7368166	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=424;ReadPosRankSum=0.598;SC=AGCTCCCCCCTCACCGTACTC;SOR=0.359;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=24;WE=16376466;WS=16376448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr1	16379008	rs2050522	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=0.820;SC=TAGCTGACCTCGGACATGGGG;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=16379016;WS=16378998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	16380196	rs5253	T	C	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=111;PP=2814;SC=GCCAAGGACATGCCACTGGAG;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=66;TCR=111;TR=176;WE=16380204;WS=16380186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	16380243	rs2275166	A	G	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.17;QD=41.31;SOR=2.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	16380252	rs2275167	C	T	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.89;QD=45.57;SOR=2.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	16381718	rs1414498	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.791;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	16381722	rs12691552	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	16381792	rs12047858	T	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=410;ReadPosRankSum=0.288;SC=AAGTTTCCTGTCCTTTATAAT;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=27;WE=16381800;WS=16381782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr1	16381816	rs12029508	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=543;ReadPosRankSum=0.567;SC=TGACAATAGTCACAATAGCCC;SOR=0.778;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=37;WE=16381824;WS=16381806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr1	16382086	rs2297727	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=438;ReadPosRankSum=0.124;SC=GAGAGGGGCCCGCTGATATCC;SOR=0.945;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=28;WE=16382094;WS=16382076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr1	16382730	rs12030469	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=445;ReadPosRankSum=0.559;SC=CCTGCGGCCCCGCCCAGACCC;SOR=0.648;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=21;WE=16382738;WS=16382726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr1	16382791	rs12023153	G	C	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=9;PP=1165;ReadPosRankSum=0.715;SC=TTGCAGGCCTGGGTCTCTTGT;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=98;TCR=16;TR=60;WE=16382799;WS=16382781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
chr1	16382827	rs77508204	CTCT	C	4347.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=2968;ReadPosRankSum=1.141;SC=GGCCCCGCCCCTCTTCCTGGC;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=59;WE=16382842;WS=16382817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,110:0.49:226
chr1	16382831	rs61769890	T	A	4413.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,112:0.49:227
chr1	16382834	rs61769891	T	A	4466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,119:0.49:242
chr1	16382877	rs7517792	A	G	4100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=82;PP=2550;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TGGGCTGGGCACCTTCTACCC;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=342;TCF=182;TCR=160;TR=178;WE=16382885;WS=16382867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,206:0.50:416
chr1	16383329	rs138507185	T	TC	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=6;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.334;NF=4;NR=5;PP=421;ReadPosRankSum=0.759;SC=CTCCTCTACATCCCCCCGCAC;SOR=1.043;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=9;WE=16383344;WS=16383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr1	16383336	rs12746138	G	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=7;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.173;NF=8;NR=5;PP=417;ReadPosRankSum=1.037;SC=ACATCCCCCCGCACCTCCACC;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=13;WE=16383344;WS=16383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr1	16383448	rs10803415	A	C	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.612;NF=35;NR=36;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ACCCCAGCTGACCTGGTACTG;SOR=0.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=71;WE=16383456;WS=16383438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr1	16383581	rs1057844	G	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.02;MQRankSum=-1.547;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	16383605	rs1057845	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.00;MQRankSum=0.204;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	16383668	rs6660218	T	G	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=36;PP=2802;SC=TATCTGCCAGTTGCTCAGTGA;SOR=1.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=109;WE=16383690;WS=16383658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	16383682	rs1057854	G	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=0.232;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.507;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,34:0.23:145
chr1	16383742	rs1057857	C	G	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.392;NF=47;NR=65;PP=1869;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GGCACAGATGCCTTCTGGGGT;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=64;TCR=85;TR=112;WE=16383750;WS=16383732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,139:0.76:182
chr1	16383854	.	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.613;NF=0;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CTGGGACTGGAGCTCCTTACC;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=16383862;WS=16383844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	16384843	rs114956983	G	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.369;NF=2;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GGGATGCCCTGCCCTGGACCC;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=16384851;WS=16384833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	16384868	rs12756288	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.345;NF=2;NR=2;PP=25;ReadPosRankSum=0.637;SC=GTCCAGATATGCCTGGGCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=4;WE=16384876;WS=16384858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	16384986	rs28496958	G	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.26;MQRankSum=0.199;NF=3;NR=3;PP=287;ReadPosRankSum=2.044;SC=CCATGGAGGGGAGGGAGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=6;WE=16385007;WS=16384976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	16384998	rs1807285	GG	CA	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.28;MQRankSum=-0.152;NF=3;NR=3;PP=269;ReadPosRankSum=2.391;SC=GGGAGCCCGGGGGGTGGGTCC;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=16385007;WS=16384976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	16385042	rs77667563	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.519;NF=4;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GGCAGCCGCCGCCGATGCTGC;SOR=1.034;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=7;WE=16385050;WS=16385032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	16385131	rs1832151	C	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.704;NF=3;NR=2;PP=39;ReadPosRankSum=-0.575;SC=AGGGGAGGGGCTGGGCGAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=5;WE=16385139;WS=16385121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr1	16385175	rs17853748	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.35;MQRankSum=-1.573;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr1	16385184	rs75273615	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.38;MQRankSum=-2.034;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	16385248	rs74054903	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQRankSum=-2.834;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.979;SOR=2.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	16385248	.	CCA	TCG	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=44.89;NF=1;NR=3;PP=86;QD=34.8669687156;SC=GAATGGCGTCCCAGATCCAGC;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=4;WE=16385258;WS=16385238;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	16385250	rs74054904	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQRankSum=-2.807;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.632;SOR=2.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	16385323	rs77017249	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-0.967;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	16385330	rs3978476	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-0.967;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	16385797	rs3978478	C	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.883;NF=18;NR=3;PP=366;ReadPosRankSum=-1.077;SC=TGTGCTCACTCTCTCCTTCCT;SOR=2.057;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=21;WE=16385805;WS=16385787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	16385980	rs3884058	G	A	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.206;NF=26;NR=46;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TGGACCCTCTGGGCTGTACCT;SOR=0.742;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=155;TCF=59;TCR=96;TR=72;WE=16385988;WS=16385970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr1	16386008	rs2863452	T	C	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.287;NF=15;NR=40;PP=923;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GGACGATGCCTTGGGGGCTGT;SOR=0.462;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=105;TCF=27;TCR=78;TR=55;WE=16386016;WS=16385998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,65:0.56:117
chr1	16386247	rs2095543	T	C	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.99;QD=24.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	16386416	rs9442230	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.739;NF=4;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-1.846;SC=AGTAATGCTCGTCCTCAGCTG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=8;WE=16386424;WS=16386406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	16386447	rs11576236	G	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=15;PP=354;SC=CCAGCCTGCCGGCTGGGCACT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=16386455;WS=16386437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	16386495	rs71510977	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQRankSum=-1.150;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	16388556	rs2863455	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-1.117;QD=12.76;ReadPosRankSum=2.321;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	16388565	rs7524413	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-1.744;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.803;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	16388646	rs2863456	T	C	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=18;PP=602;SC=CGGGGCGGGATCTGGAGTCGG;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=16388654;WS=16388636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	16388709	rs28570004	G	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=488;SC=GGCAGGAGGAGTGAGCAGGGT;SOR=2.124;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=25;WE=16388717;WS=16388699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	16388756	rs113174531	CACCCAT	C	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQRankSum=0.432;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.903;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	16388766	rs3978469	C	T	414.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.458;NF=5;NR=8;PP=205;ReadPosRankSum=0.075;SC=CACCCATCCCCGTCTCCCAGC;SOR=1.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=13;WE=16388774;WS=16388746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr1	16451767	rs3754334	G	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=780;ReadPosRankSum=0.312;SC=GGCTGTAGGCGATGCGCTTCT;SOR=1.116;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=52;WE=16451775;WS=16451757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr1	16464673	rs2230597	G	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=859;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GTGGGGCGGAGGGGGGTCCTG;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=50;WE=16464681;WS=16464663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr1	16474839	rs35127370	AC	A	762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=555;ReadPosRankSum=2.041;SC=GGAATGCAGAACCCCCTTCCC;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=19;WE=16474847;WS=16474829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	16475123	rs6678616	C	T	4036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=7.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,106:0.45:235
chr1	16475126	rs6678618	C	T	4036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=4.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,108:0.45:240
chr1	16525333	rs74394813	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=0.627;SC=GCTTTGTCTGCACCCTTGGGG;SOR=0.180;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=21;WE=16525341;WS=16525323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	16528218	rs6676143	G	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.649;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=100;ReadPosRankSum=0.034;SC=AGGATGGGAGGGGAGGAGAGC;SOR=0.072;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=8;WE=16528226;WS=16528208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	16528469	rs58225172	GCCTACCCTAGGGAC	GTACCCTAGGGAC,G	974.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=2932;ReadPosRankSum=1.615;SC=TAGGACCCAGGCCTACCCTAG;SOR=1.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=15;WE=16528492;WS=16528459;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.53:51
chr1	16528472	rs200243292	TACCCTAGGGACC	T	970.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=2.002;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	16528484	.	C	T	1516	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=15;PP=1516;QD=91.2218360322;SC=CCCTAGGGACCCATGTCTGCC;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=17;WE=16528492;WS=16528459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	16528843	rs1693540	A	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=9;PP=605;SC=CGGGGTGCCCATCATGGGGAC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=16528851;WS=16528833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	16531205	.	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.811;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=306;ReadPosRankSum=-2.094;SC=TGGGGAGGAAGAGAGCCTGGC;SOR=1.781;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=18;WE=16531213;WS=16531195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr1	16531530	.	G	A	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=26;PP=1454;ReadPosRankSum=-1.228;SC=GGGCAAGGAAGAAACAAGAGC;SOR=0.850;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=188;TCF=122;TCR=66;TR=82;WE=16531538;WS=16531520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,107:0.47:230
chr1	16532498	rs41269185	G	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=635;ReadPosRankSum=1.839;SC=GCGGAAGGCCGGGCAGTGGTC;SOR=0.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=42;WE=16532506;WS=16532488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr1	16533022	rs221052	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=614;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CAAGCCTTTCCTGTCCTCGAT;SOR=0.337;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=35;WE=16533030;WS=16533012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,55:0.64:86
chr1	16535592	.	G	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=0.252;SC=CAGAAGAGAAGATATCAGACC;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=20;WE=16535600;WS=16535582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	16542366	rs41269187	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=357;ReadPosRankSum=1.300;SC=ACTGCACCGTGTGGGTGGGGA;SOR=0.582;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=25;WE=16542374;WS=16542356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	16542937	rs2273312	T	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=0.798;SC=GGTCATTATGTTGCGGGTGGG;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=12;WE=16542945;WS=16542927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	16543175	rs221024	A	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=43;PP=1141;SC=GCTTACCCTGAGCCAAACCCT;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=16543183;WS=16543165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	16543390	rs61769779	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	16555882	rs12748676	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=1.655;SC=GAGCTACTTCCGGGGCTGGGG;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=16555890;WS=16555876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	16558838	rs6700888	C	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=302;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGCACAGCCCCCCATCAGACC;SOR=1.052;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=23;WE=16558846;WS=16558828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
chr1	16559541	rs3738631	C	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=522;ReadPosRankSum=0.793;SC=CAGCCACTCACCATGGGAGAG;SOR=0.413;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=37;WE=16559549;WS=16559531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr1	16562968	rs6603850	C	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=396;SC=GGTCCCAGAGCTAGGGCTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=16562976;WS=16562958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	16577908	rs12069239	G	C	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1397;ReadPosRankSum=0.893;SC=TATCCTTCAGGAGCAGATGGA;SOR=0.588;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=82;WE=16577916;WS=16577898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,97:0.56:173
chr1	16583030	.	C	CA	30	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=30;QD=17.0;SC=ACTCTTGACACAAAAAAACAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=3;WE=16583038;WS=16583020;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,3:0.15:20
chr1	16621183	rs1007150	C	T	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1138;SC=CCCAGTAACCCATCCTTGAGA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=16621191;WS=16621173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	16632188	rs61769833	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=521;ReadPosRankSum=0.407;SC=CAGCTTGGGTGATAGAGTGAG;SOR=1.047;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=39;WE=16632196;WS=16632178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr1	16641899	rs2273311	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=836;ReadPosRankSum=1.303;SC=CTTCACTGTCCGAGGAGCTGG;SOR=0.988;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=45;WE=16641907;WS=16641889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr1	16714095	rs61770605	C	T	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=977;ReadPosRankSum=-1.049;SC=ATGCTCCGTGCGAGTGGAGTT;SOR=0.437;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=56;WE=16714103;WS=16714085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr1	16725818	rs41310375	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=258;ReadPosRankSum=0.805;SC=CTGGGCTGGGACCCTTTCTCT;SOR=0.293;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=17;WE=16725826;WS=16725808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	16726036	rs61769432	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=334;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AAGGAGGCAGAAGGAGGAATG;SOR=2.679;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=18;WE=16726044;WS=16726026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr1	16727305	rs139527123	G	GCTT	3278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.046;NF=5;NR=33;PP=1774;ReadPosRankSum=-1.681;SC=TTGTAGGGAAGCTTCTGCAAC;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=12;TCR=85;TR=38;WE=16727313;WS=16727295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr1	16730413	rs61769436	C	T	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1330;ReadPosRankSum=0.257;SC=CGCAACCAACCTCCCAGCCCC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=79;WE=16730421;WS=16730403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,108:0.59:184
chr1	16730582	rs17419150	C	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CGGAGCAGGTCCATGCCTTGC;SOR=0.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=25;WE=16730590;WS=16730572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr1	16731646	rs3106498	TGTCATTCATCCCATT	CCTCATTCATCCCATT,CCTCATTTATCCCATC	1423.77	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.937;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10,2;NR=27,12;PP=262,213;ReadPosRankSum=0.226;SC=TTCTTGTTTCTGTCATTCATC;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37,14;WE=16731669;WS=16731636;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:44
chr1	16731653	rs526489	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	16731661	rs526513	T	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.80;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	16736132	rs4661746	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=18;PP=623;SC=CTCGCTGCTCTGGTGCAAGAG;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=16736140;WS=16736122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	16736546	rs10907226	C	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=41;PP=1148;SC=CTCCTGGGGACAGGGGAGGGG;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=16736554;WS=16736536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	16748487	rs141537595	G	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=293;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GACGGACATTGGGGGCATTGC;SOR=0.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=24;WE=16748495;WS=16748477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr1	16769949	rs12064256	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.030;SC=TACAGCAGCCGAGCTGCCTTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=16769957;WS=16769939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	16803267	rs156846	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.718;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.792;SC=AGGTCTGTGGTCTGTGACAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=16803275;WS=16803257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	16809796	rs41269205	T	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=1.037;SC=TCAGGAGCTCTTTGGCGCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=12;WE=16809804;WS=16809786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	16862273	rs76517011	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQRankSum=-0.149;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr1	16862294	.	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQRankSum=-1.280;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,23:0.21:111
chr1	16862296	rs1759227	G	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQRankSum=-3.173;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.438;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,30:0.26:117
chr1	16862340	rs200564364	G	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=5.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQRankSum=-8.209;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:262,68:0.21:330
chr1	16862454	rs71248115	T	G	14758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=927;ExcessHet=3.0103;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.41;MQRankSum=-15.493;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.040;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:518,409:0.44:927
chr1	16862461	rs145386412	T	A	21121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=911;ExcessHet=3.0103;FS=3.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.35;MQRankSum=-21.266;QD=23.19;ReadPosRankSum=-1.719;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:370,541:0.59:911
chr1	16862472	rs200621127	G	C	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=917;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.34;MQRankSum=-8.032;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:786,131:0.14:917
chr1	16862502	rs141629643	A	G	14026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=911;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-19.148;NF=314;NR=330;PP=2962;ReadPosRankSum=0.634;SC=ATCAATTCGTAATTTCCCATC;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=1003;TCF=472;TCR=531;TR=644;WE=16862511;WS=16862492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:327,582:0.64:909
chr1	16862566	rs77197089	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=825;ExcessHet=3.0103;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQRankSum=-4.742;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:696,129:0.16:825
chr1	16862638	rs369070338	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQRankSum=-2.409;QD=0.21;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,41:0.11:368
chr1	16862708	rs1762987	T	G	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=15.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=-5.358;QD=26.77;ReadPosRankSum=-2.255;SOR=3.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr1	16862712	rs61769538	G	T	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=19.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQRankSum=-5.309;QD=27.19;ReadPosRankSum=-3.023;SOR=4.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr1	16862714	rs61769539	T	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=14.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQRankSum=-5.136;QD=28.47;ReadPosRankSum=-3.467;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr1	16862732	.	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQRankSum=-4.681;QD=9.15;ReadPosRankSum=-4.392;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	16863258	rs140926795	C	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=30.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-10.176;QD=1.49;ReadPosRankSum=-4.218;SOR=4.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,18:0.09:193
chr1	16863259	rs114741004	T	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=37.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-10.814;QD=1.45;ReadPosRankSum=-5.285;SOR=5.224;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,23:0.12:198
chr1	16863304	rs61769542	T	C	7250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=8.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-12.304;QD=16.29;ReadPosRankSum=-4.016;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,188:0.42:445
chr1	16863308	rs112689425	G	T	7781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=6.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-12.113;QD=16.84;ReadPosRankSum=-2.790;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,199:0.43:462
chr1	16863313	rs76539488	C	T	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-7.698;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:368,118:0.24:486
chr1	16863314	rs74927161	A	G	9455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-12.065;QD=19.06;ReadPosRankSum=-2.789;SOR=1.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:262,234:0.47:496
chr1	16863328	rs61769543	T	G	12112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=569;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.061;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-10.840;NF=209;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.023;SC=AAGAAAGGCGTCGAGTCCTGT;SOR=0.958;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=550;TCF=327;TCR=223;TR=330;WE=16863336;WS=16863294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,302:0.53:566
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chr1	16863398	rs61769545	A	C	7878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-5.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.431;NF=130;NR=200;PP=2962;ReadPosRankSum=2.274;SC=GGGAGGTTTCAGGATCTAAAG;SOR=0.485;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=480;TCF=183;TCR=297;TR=330;WE=16863406;WS=16863388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,330:0.67:495
chr1	16863484	rs199948789	C	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=8.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-2.008;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,19:0.17:112
chr1	16946434	rs367060	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.000;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.444;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
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chr1	16946438	rs28392876	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.567;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.630;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr1	16946535	rs437905	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.953;NF=4;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GGGCCAGGACTGGACGCGTGT;SOR=0.327;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=9;WE=16946543;WS=16946525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	16948473	rs446948	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.906;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr1	16948473	.	CC	TG	306	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=26;MQ=59.51;NF=12;NR=14;PP=306;QD=13.8256874947;SC=AAGTCCTCCTCCTGGGCTGCC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=26;WE=16948482;WS=16948463;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr1	16948474	rs2781579	C	G	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.76;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,64:0.84:76
chr1	16969246	rs11260857	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.978;NF=42;NR=15;PP=769;ReadPosRankSum=0.636;SC=AGGAGGGGCCGCCCACCCAGC;SOR=0.790;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=163;TCF=114;TCR=49;TR=57;WE=16969254;WS=16969236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,68:0.35:192
chr1	16969381	rs9727604	C	T	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.063;NF=42;NR=68;PP=1786;ReadPosRankSum=0.446;SC=AAGGGCCACACGATGAGTGCA;SOR=0.547;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=63;TCR=112;TR=110;WE=16969389;WS=16969371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,113:0.60:188
chr1	16971948	rs2209174	C	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.467;NF=4;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=1.039;SC=TTGCAACTGACCTGTGGGACC;SOR=0.182;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=7;WE=16971956;WS=16971938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	16972068	rs1360575	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.88;MQRankSum=-2.646;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,11:0.16:70
chr1	16972189	rs9728527	C	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.768;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr1	16972940	rs1970921	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.003;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.212;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,34:0.24:139
chr1	16973152	rs1970920	A	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.795;NF=19;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=0.524;SC=CTCAACACTCACCCCACACGA;SOR=0.572;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=39;WE=16973160;WS=16973142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,45:0.28:160
chr1	16973184	rs55828106	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=1.235;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.737;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,34:0.25:134
chr1	16973519	rs2501762	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=7.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.99;MQRankSum=-0.155;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.779;SOR=1.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,34:0.14:240
chr1	16973919	rs141898836	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.687;NF=31;NR=32;PP=904;ReadPosRankSum=1.116;SC=GATAAGCCAGAGTCCCAGGGT;SOR=0.685;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=63;WE=16973927;WS=16973909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr1	16973996	rs200256873	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQRankSum=-2.022;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr1	16974010	rs201140718	G	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.72;MQRankSum=-1.136;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr1	16974021	rs142740321	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.88;MQRankSum=-2.490;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	16974256	.	G	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.493;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=11.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.68;MQRankSum=-5.681;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=3.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	16974511	rs58679574	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=0.139;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,31:0.17:183
chr1	16974592	rs201212576	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-3.937;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,33:0.17:197
chr1	16974637	rs16854791	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-2.436;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.683;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,39:0.26:149
chr1	16974972	rs58464479	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-11.958;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,30:0.19:161
chr1	16975002	rs2093773	C	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-14.558;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.487;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,50:0.22:230
chr1	16975045	rs55763726	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=23.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQRankSum=-6.078;QD=0.66;ReadPosRankSum=-1.921;SOR=2.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,47:0.12:379
chr1	16975084	rs28506999	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.72;MQRankSum=-3.257;QD=1.55;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,63:0.16:391
chr1	16975202	rs28602904	T	C	3858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=646;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.886;NF=122;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=2.149;SC=GCCTCAGCCCTCACCACCAAA;SOR=0.901;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=640;TCF=343;TCR=297;TR=216;WE=16975210;WS=16975192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:432,213:0.33:645
chr1	16975230	rs2761535	G	C	9629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=607;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-17.978;NF=258;NR=228;PP=2962;ReadPosRankSum=2.679;SC=TCCCTTAACCGCAGTGAACTT;SOR=0.663;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=652;TCF=337;TCR=315;TR=486;WE=16975238;WS=16975220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,415:0.69:604
chr1	16975278	rs111244008	A	ACC	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=4.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQRankSum=-4.306;QD=0.55;ReadPosRankSum=-2.009;SOR=1.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:396,43:0.10:439
chr1	16975689	rs201913540	G	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.31;MQRankSum=-1.431;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.015;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr1	16976539	.	A	G	278	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=49.33;NF=24;NR=1;PP=278;QD=12.5108485019;SC=GCTGTGGCCCAGGGCCCTCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=25;WE=16976547;WS=16976529;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:62,25:0.29:87
chr1	16976620	rs55885953	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.03;MQRankSum=-2.050;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,74:0.27:273
chr1	16976641	rs1057417	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQRankSum=-6.649;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,50:0.16:311
chr1	16976649	rs1057333	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQRankSum=-6.159;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,50:0.16:314
chr1	16976679	rs1065528	G	A	3083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.696;NF=54;NR=78;PP=1452;ReadPosRankSum=-3.411;SC=CCGTCTTCACGCGTGTCTCTG;SOR=0.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=101;TCR=147;TR=132;WE=16976689;WS=16976669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,144:0.57:254
chr1	16976681	rs3175284	G	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.79;MQRankSum=-4.267;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.125;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,38:0.15:249
chr1	17017675	rs2743471	C	A	7829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=-0.527;NF=118;NR=175;PP=2962;ReadPosRankSum=0.858;SC=CAGTCAAGACCCGCTGCCAGG;SOR=1.042;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=376;TCF=159;TCR=217;TR=293;WE=17017683;WS=17017665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,338:0.78:434
chr1	17022952	rs557690	C	A	4000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=59;PP=2074;SC=TCCTCCTCCTCCATCTTCAGC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=17022960;WS=17022942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	17023110	rs11260887	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.492;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,18:0.18:101
chr1	17023126	rs2610633	C	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.194;NF=17;NR=17;PP=464;ReadPosRankSum=0.405;SC=AACCCCGCAGCTGGCGGTGTG;SOR=0.542;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=34;WE=17023134;WS=17023116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr1	17023143	rs559507	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.556;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.721;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,23:0.22:104
chr1	17023182	rs614461	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-3.615;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,25:0.23:108
chr1	17023376	rs613579	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.626;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,87:0.28:314
chr1	17023403	rs10907267	G	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.94;MQRankSum=0.665;NF=27;NR=44;PP=862;ReadPosRankSum=1.278;SC=GGAACATCACGTTGAAAGACT;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=244;TCF=96;TCR=148;TR=71;WE=17023411;WS=17023393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,83:0.30:275
chr1	17023483	rs563062	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=257;ReadPosRankSum=0.768;SC=ACCCCTCACCCGCCCCTCTGC;SOR=1.593;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=19;WE=17023491;WS=17023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,21:0.24:87
chr1	17023509	rs563142	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.442;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr1	17023509	.	TCC	CCA	147	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=10;PP=147;QD=16.7056562385;SC=CCTTCCCAACTCCAGATTGGA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=12;WE=17023519;WS=17023499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,12:0.30:40
chr1	17023511	rs563144	C	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=540;SC=TTCCCAACTCCAGATTGGATG;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=17023519;WS=17023499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	17025992	rs12026928	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.938;NF=17;NR=9;PP=392;ReadPosRankSum=-0.998;SC=AGGCGGGACCGGCGGCGGCGA;SOR=0.544;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=26;WE=17026012;WS=17025982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr1	17026004	rs9661305	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=3.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=-0.871;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.666;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,20:0.20:98
chr1	17026043	.	G	GGCA	1707.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=5.453;NF=8;NR=17;PP=836;ReadPosRankSum=2.523;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCTGCTG;SOR=0.337;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=25;WE=17026051;WS=17026033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,53:0.34:156
chr1	17026087	rs678369	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQRankSum=6.254;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.852;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,52:0.28:187
chr1	17026551	rs665763	G	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=1.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr1	17029257	rs12125112	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=1.655;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,18:0.16:114
chr1	17029462	rs11260891	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.636;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.394;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,14:0.16:89
chr1	17030325	rs601893	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=314;ReadPosRankSum=1.247;SC=AGCAAGTGATAAGAGTAGTCT;SOR=0.719;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=9;WE=17030344;WS=17030315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	17030336	rs4661915	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=314;ReadPosRankSum=1.842;SC=AGAGTAGTCTCCGATATTGGC;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=17030344;WS=17030315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	17030716	rs4661917	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=302;ReadPosRankSum=0.315;SC=GTCCTACTCAGCCATGCCTTT;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=26;WE=17030724;WS=17030706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,26:0.24:109
chr1	17033758	rs1736691	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.406;NF=14;NR=10;PP=249;ReadPosRankSum=0.904;SC=GAGAGAATGCAACAGGAGCAG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=24;WE=17033766;WS=17033748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr1	17033805	rs59259153	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.978;NF=16;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=-1.329;SC=CGTGCGCAGGCAGTGGGTGCA;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=29;WE=17033813;WS=17033795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,33:0.28:118
chr1	17033854	rs2476568	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.239;NF=13;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=2.095;SC=TCAGCGGCCGCGTACCCGTCG;SOR=0.880;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=29;WE=17033862;WS=17033844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,33:0.26:129
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chr1	17034125	rs141324796	C	CAGCT	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.438;NF=1;NR=6;PP=334;ReadPosRankSum=-1.763;SC=CAGCAGCAGCCAGCTGAGCAC;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=17034133;WS=17034115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	17034237	.	C	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=8;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=47;QD=16.3542425094;SC=GCGGGAGGGGCGGGGAGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=5;WE=17034258;WS=17034227;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	17034250	rs61773400	C	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.725;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr1	17034361	.	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.662;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr1	17034455	rs140689885	CGCGCGCGT	C	723.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.908;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,25:0.22:114
chr1	17044511	rs2773185	T	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=526;ReadPosRankSum=0.447;SC=TCCCAGCTGCTCTTCCTGCAT;SOR=2.027;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=24;WE=17044519;WS=17044501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr1	17044589	rs944147	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=2.275;QD=1.55;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr1	17044662	rs13374664	G	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.449;NF=2;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=-1.188;SC=ATCAGTCCAGGCCATCTGGCC;SOR=1.390;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=12;WE=17044670;WS=17044652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr1	17044695	rs2773186	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.760;NF=2;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-1.915;SC=CCAGCGCCCAATCACACACAG;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=17044703;WS=17044685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	17046361	rs3856291	A	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	17046456	rs3856292	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,30:0.24:124
chr1	17046549	rs1755332	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=1.181;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,35:0.21:165
chr1	17046595	rs3856293	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-3.977;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,53:0.24:218
chr1	17046613	rs3856294	C	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=1.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,59:0.26:226
chr1	17046698	rs3982089	C	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=210;ReadPosRankSum=0.755;SC=GTTGCTGCCCCGCCCCTGGCT;SOR=0.606;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=20;WE=17046706;WS=17046688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,28:0.26:109
chr1	17083778	rs28455793	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=12.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.07;MQRankSum=-3.447;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.347;SOR=3.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr1	17083807	rs9286084	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=20.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQRankSum=-4.300;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.665;SOR=4.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr1	17083872	rs61635893	G	A	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.993;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.90;MQRankSum=0.205;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr1	17084006	rs2446544	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.38;MQRankSum=-2.856;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.099;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr1	17084948	rs199741699	A	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQRankSum=0.015;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,26:0.20:131
chr1	17084968	rs2761533	G	C	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.176;NF=65;NR=35;PP=1719;ReadPosRankSum=-3.520;SC=CACCGATTCCGCAAGCTGACT;SOR=0.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=174;TCF=111;TCR=63;TR=100;WE=17084976;WS=17084958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,103:0.57:180
chr1	17085006	rs201784242	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQRankSum=-1.438;QD=0.89;ReadPosRankSum=-2.191;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,37:0.15:241
chr1	17085165	rs2490828	G	C	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.58;QD=31.81;SOR=3.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	17085412	rs872964	C	T	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.209;NF=58;NR=33;PP=1152;ReadPosRankSum=0.836;SC=GTTGTGCATGCGGTTCGGAGG;SOR=1.247;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=248;TCF=135;TCR=113;TR=91;WE=17085420;WS=17085402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,99:0.38:259
chr1	17085427	rs2002186	T	C	6061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.676;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.123;NF=95;NR=81;PP=2703;ReadPosRankSum=1.923;SC=CGGAGGTAAATGTGAACCGAG;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=242;TCF=124;TCR=118;TR=176;WE=17085435;WS=17085417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,189:0.72:262
chr1	17085502	rs2329006	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=5.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.203;NF=18;NR=58;PP=1602;ReadPosRankSum=-1.214;SC=GTCCCAGACATCAAAGCATGC;SOR=1.836;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=154;TCF=51;TCR=103;TR=76;WE=17085510;WS=17085492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,64:0.44:147
chr1	17085542	rs2261754	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.814;NF=13;NR=28;PP=665;ReadPosRankSum=1.686;SC=TGGCGGGGCCGGGAGCACCAG;SOR=0.741;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=41;WE=17085550;WS=17085532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,34:0.28:122
chr1	17085564	rs3851921	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.293;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.701;NF=11;NR=26;PP=632;ReadPosRankSum=-2.680;SC=GACTCACTGCAGCTTGTGCGG;SOR=1.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=36;TCR=76;TR=37;WE=17085572;WS=17085554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,24:0.21:113
chr1	17085671	rs3863806	C	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=9.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQRankSum=-6.607;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.829;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr1	17085677	rs3863805	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=6.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQRankSum=-6.920;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr1	17085712	rs3863803	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.974;NF=12;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CCCCGGCCCTCCGGTTCCAGG;SOR=0.741;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=28;WE=17085720;WS=17085702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr1	17085834	rs2005622	G	T	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=25;PP=751;SC=CGGGCCGCAGGGTGAAGCACC;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=17085842;WS=17085824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	17085995	.	G	GC	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=9.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.68;MQRankSum=-2.653;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	17086052	rs1057286	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.70;QD=26.09;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	17086085	rs200532237	G	GC	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.08;QD=26.50;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	17087072	rs79486936	G	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.798;NF=34;NR=44;PP=908;ReadPosRankSum=-0.229;SC=ACTTGTGATCGTTCGGGAACT;SOR=0.678;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=244;TCF=122;TCR=122;TR=78;WE=17087080;WS=17087062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,88:0.29:301
chr1	17087262	rs2926375	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=0.072;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,54:0.29:186
chr1	17087299	rs2179162	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=25.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-11.318;QD=0.32;ReadPosRankSum=-2.328;SOR=3.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,16:0.08:210
chr1	17087365	rs2446556	C	G	4233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.086;NF=81;NR=74;PP=2687;ReadPosRankSum=2.680;SC=TGTAGTGGAACGCCCTGGAGA;SOR=0.537;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=197;TCF=100;TCR=97;TR=155;WE=17087373;WS=17087355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,175:0.80:219
chr1	17087432	rs2446554	G	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=-8.292;QD=0.42;ReadPosRankSum=2.255;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,24:0.12:194
chr1	17087459	rs11576695	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQRankSum=2.046;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.740;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,24:0.14:175
chr1	17087465	rs11260924	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.602;NF=31;NR=31;PP=807;ReadPosRankSum=2.454;SC=GTCCATTAAGGGCCCACAGCG;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=62;WE=17087473;WS=17087449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,62:0.36:173
chr1	17087521	rs11589598	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQRankSum=-2.594;QD=0.58;ReadPosRankSum=-0.845;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,23:0.13:176
chr1	17087541	rs113982165	GGTGCT	G	1438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.970;NF=5;NR=33;PP=1721;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GCATGTAGCAGGTGCTGTAGC;SOR=1.253;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=134;TCF=26;TCR=108;TR=38;WE=17087553;WS=17087531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,46:0.23:196
chr1	17087582	rs10907280	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.332;NF=29;NR=43;PP=1090;ReadPosRankSum=0.792;SC=GAAGTCATTCGATGGCGAGCG;SOR=0.860;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=72;WE=17087601;WS=17087572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,69:0.41:169
chr1	17087682	rs9725203	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQRankSum=-1.506;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr1	17090902	.	A	AT	491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQRankSum=-5.961;QD=3.93;ReadPosRankSum=2.881;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,25:0.20:125
chr1	17091129	rs61769748	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.418;NF=3;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CAAAGAGGCCGGGGAACAAGT;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=6;WE=17091137;WS=17091119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	17197563	rs7556482	G	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=13.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQRankSum=-13.666;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.282;SOR=1.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,44:0.18:249
chr1	17197571	rs76372883	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=14.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=-9.779;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.476;SOR=1.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,39:0.14:287
chr1	17197595	rs201521253	A	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=19.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQRankSum=-11.284;QD=5.13;ReadPosRankSum=-4.444;SOR=1.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,95:0.26:359
chr1	17197609	rs150993810	T	C	3901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=20.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQRankSum=-11.492;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.650;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,110:0.31:360
chr1	17197615	rs146936960	C	A	4321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=21.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQRankSum=-11.774;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,119:0.32:368
chr1	17197619	rs113661539	A	G	4360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=20.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQRankSum=-12.005;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.099;SOR=1.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,125:0.34:372
chr1	17197666	rs74055933	T	C	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=13.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-5.053;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,69:0.19:368
chr1	17197690	rs72642967	T	G	6306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=18.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQRankSum=-10.691;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,159:0.56:282
chr1	17197694	rs72642969	G	A	6034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=19.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQRankSum=-10.691;QD=22.19;ReadPosRankSum=1.459;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,150:0.55:272
chr1	17197710	rs114564385	G	C	4589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=13.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQRankSum=-9.970;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.856;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,118:0.55:216
chr1	17197715	rs202012907	G	A	4396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=14.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.32;MQRankSum=-9.983;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,109:0.55:198
chr1	17197721	.	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQRankSum=-5.528;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.510;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,22:0.12:180
chr1	17197722	.	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=13.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQRankSum=-3.834;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.081;SOR=0.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,29:0.17:168
chr1	17197724	rs3897252	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQRankSum=1.760;QD=0.89;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,23:0.14:164
chr1	17197725	rs75030124	C	G	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQRankSum=-6.004;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,57:0.36:158
chr1	17197736	.	G	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQRankSum=-4.746;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.877;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,17:0.12:146
chr1	17197758	rs143100028	C	G	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=10.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQRankSum=-7.458;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr1	17197764	.	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQRankSum=-6.209;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr1	17197771	rs139655267	G	A	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQRankSum=-6.770;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr1	17197777	rs149102001	T	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQRankSum=-6.591;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr1	17197779	rs138448635	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQRankSum=-4.322;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr1	17198209	rs61768108	A	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=23.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQRankSum=-3.175;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.360;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr1	17198211	rs61768109	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=18.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQRankSum=-3.231;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.476;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr1	17198215	rs61768117	A	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=16.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQRankSum=-3.396;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.470;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr1	17248500	rs6683035	A	G	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.712;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=18;PP=1073;ReadPosRankSum=0.677;SC=AGGCATGCCCACAGCCTCCCC;SOR=0.923;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=69;WE=17248508;WS=17248490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr1	17248532	rs6586566	A	G	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=57;PP=2965;SC=GGGGCTGGCGAGGGCACAGGA;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=146;WE=17248540;WS=17248522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	17249395	rs6586567	A	G	2650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=70;PP=1866;ReadPosRankSum=-0.582;SC=ACTGTAACTCACTGTGGGGCA;SOR=0.481;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=160;TCF=46;TCR=114;TR=102;WE=17249403;WS=17249385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,113:0.63:179
chr1	17250762	rs58609892	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	17250836	rs57174186	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TGCCGGCCACAGAGATGGCAT;SOR=0.622;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=12;WE=17250844;WS=17250826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr1	17251055	rs9435703	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.049;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=650;ReadPosRankSum=0.323;SC=GGCCCACACACGGGGCAAAAG;SOR=0.302;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=49;WE=17251063;WS=17251045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr1	17256313	rs9435710	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=113;ReadPosRankSum=0.256;SC=GGAGGCCCAGGACTCTCACCC;SOR=0.197;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=10;WE=17256321;WS=17256303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr1	17262942	rs7529769	G	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-2.137;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.597;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	17262944	rs7521985	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-2.137;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.597;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	17262953	rs7521989	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-2.362;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	17265327	rs4269813	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=423;ReadPosRankSum=-0.456;SC=CCCCAGCCTCACCTGGGCGTC;SOR=0.748;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=39;WE=17265335;WS=17265317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr1	17265366	rs4269812	C	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=517;ReadPosRankSum=2.519;SC=CGGTTCCTAACTCAGCAGCCT;SOR=0.877;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=43;WE=17265374;WS=17265356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,58:0.32:183
chr1	17265560	rs9435793	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.171;NF=3;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=0.995;SC=CCGCCGAGGCCCCTCCCCGGC;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=13;WE=17265568;WS=17265550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	17266536	rs9435714	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=64;ReadPosRankSum=1.096;SC=GGCCCACGAGGACGCCCAGCG;SOR=0.904;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=8;WE=17266544;WS=17266526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr1	17267302	rs6586577	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.94;MQRankSum=0.699;NF=8;NR=7;PP=180;ReadPosRankSum=1.562;SC=GCTCACTGTAACCTGGAACTC;SOR=0.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=15;WE=17267310;WS=17267292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr1	17267496	rs6586578	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.309;NF=4;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=1.800;SC=ATCTCAGCCTCGAGGATAGTA;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=11;WE=17267504;WS=17267486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr1	17270845	.	C	CG	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.711;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=308;ReadPosRankSum=-1.096;SC=CAGTGCCCCCCTGGGGTTAGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=9;WE=17270853;WS=17270835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr1	17273396	rs7537468	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=525;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AGGGCTCCCTACGAGTGGCGG;SOR=0.477;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=36;WE=17273404;WS=17273386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,40:0.35:115
chr1	17273444	rs7545185	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=302;ReadPosRankSum=-0.378;SC=AGCTCCCCACGCTGCGCCATG;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=24;WE=17273452;WS=17273434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr1	17273493	rs7537563	A	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.408;NF=8;NR=12;PP=311;ReadPosRankSum=0.120;SC=GCAGGTGGGCAAAGCTGTGTG;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=20;WE=17273501;WS=17273483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr1	17275054	rs6698564	G	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=55;ReadPosRankSum=0.772;SC=CCGCCCTGGGGGGTCCTCCTG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=17275062;WS=17275044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	17281003	rs2076606	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=9;PP=266;SC=AGCCCCCATCTGAGGGAGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=17281011;WS=17280993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	17287414	rs2273113	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=6;PP=138;SC=GGGCCGAGGCTGCAGAGCTGG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=17287422;WS=17287404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	17295679	rs4920574	T	C	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=56;PP=1897;SC=GGGCCCTGGCTAAGGTGGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=93;WE=17295687;WS=17295669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	17296882	rs41303881	G	A	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=47;PP=1685;SC=CTGAGAAGCGGGAGGTGGAGC;SOR=1.281;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=17296890;WS=17296872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	17297289	rs9435656	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=277;SC=TCCGGGACCCCAACTTCATCC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=17297297;WS=17297279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	17299014	rs6661019	A	C	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=226;SC=CAGCCCCCCCACCCAGAGCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17299022;WS=17299004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	17301672	rs761423	T	C	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=59;PP=1926;SC=GTGGATAATATGTGTTGAATA;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=108;WE=17301680;WS=17301662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	17301780	rs761422	A	G	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=44;PP=1391;SC=GGAGCTCCTCATGGGCACACA;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=17301788;WS=17301770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	17303589	rs2235932	C	T	5668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=68;PP=2965;SC=CTCGGTGACCCGGCAAGGCCC;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=156;WE=17303597;WS=17303579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	17303792	rs4920588	C	T	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=594;SC=AGGTCAGGCCCATAAGAGCCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=17303800;WS=17303782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	17312743	rs3170740	C	T	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=41;PP=1955;SC=CGGGCAGCGGCGGCCAGGGCT;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=17312751;WS=17312733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	17313157	rs2076605	G	A	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=710;SC=TCAGGCAGGAGCCACGCCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=17313165;WS=17313147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	17313343	rs9435659	G	A	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=25;PP=1274;SC=CCTTGGACACGGCTGCAGCCA;SOR=1.248;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=68;WE=17313351;WS=17313333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	17313654	rs761421	C	T	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=34;PP=1566;SC=CCGGTGGCCGCACCCGTCCCA;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=17313662;WS=17313644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	17314942	rs9435662	G	A	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=71;PP=2167;SC=AGTCATTGGCGCCGTCTCCGC;SOR=1.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=100;WE=17314950;WS=17314932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	17319011	rs2076603	G	A	4031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=57;PP=2536;SC=CCCAAAGTGGGGGTCTCATCA;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=123;WE=17319019;WS=17319001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	17323449	rs9435736	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=3;PP=111;SC=CCACCCTGCCTCACTCCACCT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=17323457;WS=17323448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	17359676	rs1022580	C	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=707;SC=ATTTATGTAACGTTCAACCTC;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=17359684;WS=17359666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	17371152	rs12073028	T	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=584;SC=AACAGAGCCATCGGATGATCT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=17371160;WS=17371142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	17371494	rs9435745	C	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=294;SC=ACATTACTGACACATAATCTT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=17371502;WS=17371484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	17380497	rs2746462	G	T	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=33;PP=995;SC=TCAAGGAGAGGGCGACCACCG;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=17380505;WS=17380487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	17395480	rs2076599	G	A	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=2;PP=770;SC=GGCTCTGGGCGTGTGAGGGAG;SOR=3.365;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=17395488;WS=17395470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	17395521	rs2076598	G	A	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=19;PP=2109;SC=GGAGGCAAACGCCAGGGCCCC;SOR=2.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=76;TCR=19;TR=95;WE=17395529;WS=17395511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	17396498	rs2076596	T	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=886;SC=GGCCTCCCCATTGGACAGCTT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=17396506;WS=17396488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	17396703	rs2076595	T	C	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=80;PP=2926;SC=GGTTCCAGTCTAGGCAGCGCT;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=142;WE=17396711;WS=17396693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	17398066	rs875219	G	C	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	17398069	rs875218	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	17401283	rs3818041	C	T	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=373;SC=TTATCTGCCCCACCCTCCCGA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=17401291;WS=17401273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	17402116	rs3818035	G	T	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=22;PP=1892;SC=TGGCAGGGGCGGGTAATATAT;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=85;WE=17402124;WS=17402106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	17402135	rs3818034	T	C	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=32;PP=1853;SC=ATTGGTTTGCTGCTACCCCAT;SOR=1.397;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=100;WE=17402143;WS=17402125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	17402159	rs3818033	G	A	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=47;PP=2695;SC=CTCCAGCCTCGGGAGGCTAGC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=17402167;WS=17402149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	17402255	rs3818032	C	T	5720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=92;PP=2965;SC=GCTCCACGGGCGCCTGCACCT;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=83;TCR=92;TR=175;WE=17402263;WS=17402245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr1	17402347	rs2647205	C	T	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=90;PP=2809;SC=GGAGTTTCAGCAAATTACCCA;SOR=1.289;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=140;WE=17402355;WS=17402337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	17402418	rs3818031	A	G	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=46;PP=1341;SC=ACCCAGAGTGACATCAGCAGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=17402426;WS=17402408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	17405809	rs2057096	G	A	3662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=38;PP=2104;SC=ATGTCTTGCCGTTCACGGTCA;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=17405817;WS=17405799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	17405916	rs2057095	C	T	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=56;PP=1771;SC=GGGCCCTAGGCAGAGGGCACA;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=17405924;WS=17405906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	17405949	rs2057094	C	T	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=43;PP=1312;SC=TCTTCTGCAGCCAGGGTCCTC;SOR=1.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=17405957;WS=17405939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	17406015	rs2057093	C	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=415;SC=TGTGGGCACCCAGTTTCCAGG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=17406023;WS=17406005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	17406045	rs2057092	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=280;SC=CACGGTCTTCCTATGATTAAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=17406053;WS=17406035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	17410364	rs1883913	G	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=29;PP=863;SC=GAGAGGCCAGGAGAAAGGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=17410372;WS=17410354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	17418883	rs2647184	A	G	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=16;PP=1091;SC=TCTAGGCTGGACTGGGCTGGG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=17418902;WS=17418873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	17418894	rs2273111	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=459;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CTGGGCTGGGATCACTCACTC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=27;WE=17418902;WS=17418873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr1	17419024	rs11203297	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=833;ReadPosRankSum=-0.305;SC=ACATGTCCTTGAGATCTGAGG;SOR=0.819;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=144;TCF=79;TCR=65;TR=57;WE=17419032;WS=17419014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,71:0.40:178
chr1	17419066	rs11203298	T	C	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1388;ReadPosRankSum=1.513;SC=GATCTATCTGTTGCTGGAGCC;SOR=0.449;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=60;TCR=77;TR=83;WE=17419074;WS=17419056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,103:0.62:165
chr1	17422226	rs2076609	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=625;ReadPosRankSum=-1.914;SC=GCTCTGTTGCCGTCTCTAGGA;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=30;WE=17422234;WS=17422216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr1	17422302	rs2076608	T	C	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=21;PP=1204;ReadPosRankSum=0.752;SC=TGTCTTGGGCTTTAGTCTCCT;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=66;WE=17422310;WS=17422292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr1	17431618	rs11203300	A	G	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=30;PP=1010;SC=GAGGGGCTTCAAGAGGAGACT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=17431626;WS=17431608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	17431681	rs2647172	C	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=530;SC=TGAGCCCAGGCGTTTGAGACC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=17431689;WS=17431671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	17531582	rs2293910	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=0.515;SC=TAATCAGGTCGCAGGGTGAAA;SOR=0.551;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=17531590;WS=17531580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	17550121	rs2293912	G	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=593;ReadPosRankSum=1.332;SC=TGCAGGTGAGGGTCTCCTACT;SOR=1.153;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=34;WE=17550129;WS=17550111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr1	17550225	rs3003481	T	C	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=46;PP=1462;SC=TCTATCCCTTTGCCCCTCCAG;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=17550233;WS=17550215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	17550314	rs2293914	G	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GAGGGGCTTGGATTCCTCGGG;SOR=1.193;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=30;WE=17550322;WS=17550304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr1	17601083	rs2293917	C	T	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=55;PP=2965;SC=TGGTTCAGGCCCTTCCTGGTA;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=143;WE=17601101;WS=17601073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	17601165	rs11585357	C	T	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GGGAACCACGCGACAGGTCTG;SOR=0.545;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=80;WE=17601173;WS=17601155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,104:0.46:226
chr1	17609745	rs16824888	C	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CCATGCCTCACCTGCAACCCA;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=21;WE=17609753;WS=17609735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	17657534	rs11203366	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=677;ReadPosRankSum=2.325;SC=TATTGCCCACGGCCCTCCAGC;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=48;WE=17657542;WS=17657524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,68:0.44:155
chr1	17657616	rs11203367	T	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=-1.006;SC=ACGATGAAAGTGGCCAGTGGT;SOR=0.623;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=35;WE=17657624;WS=17657606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
chr1	17660499	rs874881	G	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=515;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TACCTCACCGGGGTGGGTAAG;SOR=0.988;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=34;WE=17660507;WS=17660489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr1	17660660	rs874882	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=0.127;SC=CTGGGAGTTCGAAATATTCCA;SOR=0.330;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=12;WE=17660668;WS=17660650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	17660697	rs1548323	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=1.426;SC=CACAAAGAAATACAATGTGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=17660705;WS=17660687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	17661128	rs1555658	A	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=327;ReadPosRankSum=1.762;SC=TCAAATATCTATAACAAAAAG;SOR=0.807;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=18;WE=17661136;WS=17661118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr1	17661659	rs71575828	C	CAT	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.282;NF=2;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TATACACACACATATATATAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=17661667;WS=17661649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	17661805	rs1635594	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=184;ReadPosRankSum=0.266;SC=AATCCTTACAACAATCCAGTG;SOR=1.061;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=12;WE=17661813;WS=17661795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
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chr1	17662804	rs1748032	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=0.026;SC=CAAATGCTGGCCTGTCCCACG;SOR=0.984;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=17;WE=17662812;WS=17662794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr1	17664770	rs1635586	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CTTGTTGGCAAATCTGTTTTA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=17664778;WS=17664760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	17668270	rs1748021	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TCCCAGCTAGAACTTCAGTCC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=17668278;WS=17668264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	17668563	rs35903413	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=431;ReadPosRankSum=-1.516;SC=CCCGGACACCGACTTCCCGGG;SOR=0.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=27;WE=17668571;WS=17668553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr1	17672642	rs41266003	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CAGGTATGTGCCCTGCGGGGC;SOR=0.848;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=17672650;WS=17672632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	17681277	rs6683201	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=6;PP=170;SC=CTGCTTCCGATTCTAGACAGC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=17681285;WS=17681267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	17683041	rs1635567	T	C	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=80;PP=2618;ReadPosRankSum=1.684;SC=ATCCAGGCAATAGGGTAGCAT;SOR=0.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=46;TCR=81;TR=126;WE=17683049;WS=17683031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr1	17683157	rs1635566	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=634;SC=GGGGGAAGTGAGTCAAAAGAA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=17683165;WS=17683147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	17685174	rs2428735	T	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=640;SC=GTATTAAAGATATTTGACTTG;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=17685182;WS=17685164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	17689954	rs2477150	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=1.119;SC=AGGGTGGGGCCGCTCAGATTG;SOR=0.446;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=5;WE=17689962;WS=17689948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	17699465	rs112394991	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=231;ReadPosRankSum=1.045;SC=TGAGGATTCGGGAGCCGTCCC;SOR=0.352;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=19;WE=17699473;WS=17699455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr1	17707739	rs1204898	T	C	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=30;PP=1022;SC=TCCAGACTAATTTTCTCCACC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=17707747;WS=17707729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	17718671	rs10709483	AG	A	3208.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=45;PP=2534;SC=AGCAACAGCCAGGGTGGCATC;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=17718679;WS=17718661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	17914846	rs1193343	C	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=691;SC=CTGTCTGCGGCGCCCCTGGGG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=17914854;WS=17914836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	17929980	rs1193338	C	G	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=73;NR=50;PP=2162;SC=CGGTGGTGCTCTCTCTCCCCA;SOR=1.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=123;WE=17929988;WS=17929970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	17961345	rs34725104	C	T	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=14;PP=1505;SC=AGCTGGAGATCAGCAGCCTGG;SOR=2.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=65;WE=17961353;WS=17961335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	17991052	rs6695710	T	C	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=51;PP=1957;SC=CTGTGGGCCCTGGGTCACTGT;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=17991060;WS=17991042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	18017522	rs871087	T	C	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=31;PP=2076;SC=AACAATTTATTGCACTTCCTT;SOR=1.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=73;TCR=32;TR=102;WE=18017530;WS=18017512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	18017558	rs871088	A	G	5112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=63;PP=2965;SC=TTCCACTCGCATACTCGACTG;SOR=1.173;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=105;TCR=63;TR=168;WE=18017566;WS=18017548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	18017704	rs871089	C	T	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=89;PP=2569;SC=TGAACACTGCCGCATTAAGTC;SOR=2.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=22;TCR=89;TR=111;WE=18017712;WS=18017694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	18021406	rs905389	T	C	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=44;PP=2273;SC=AATGCATCCGTATGGCAGCCC;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=113;WE=18021414;WS=18021396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	18023290	rs2270979	C	T	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=33;PP=1784;SC=CAGGTGCTTCCCTTAATGCGC;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=18023298;WS=18023280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	18023365	rs2270978	C	T	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=71;PP=2557;SC=TCTCACTCAACGGGCACTGTG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=136;WE=18023373;WS=18023355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	18023509	rs2270977	T	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=39;PP=1655;SC=CCATGCCCGATAGCCACGTGG;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=18023517;WS=18023499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	18023690	rs2270976	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=39;PP=1670;SC=CGACCCCGACATCTGGGTGCG;SOR=0.956;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=18023698;WS=18023680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	18023997	rs3835471	G	GC	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.67;NF=8;NR=4;PP=484;SC=AACTACTTGGGCAGAGCAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=12;WE=18024005;WS=18023987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	18149566	rs2296035	C	A	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.977;NF=86;NR=48;PP=2093;ReadPosRankSum=1.205;SC=GCACGGCCGGCTGGAATGAGC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=169;TCR=96;TR=134;WE=18149574;WS=18149556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,147:0.49:299
chr1	18152582	rs478698	C	T	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1741;ReadPosRankSum=0.769;SC=AGGCCCTGGACTTTCGTGAGA;SOR=0.778;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=104;WE=18152590;WS=18152572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,123:0.49:249
chr1	18434518	rs9660391	G	C	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	18702988	rs10796450	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=306;SC=ACTCTTCCTTTGATCCCCAGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=18702996;WS=18702978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	18704862	rs1043459	A	G	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=998;ReadPosRankSum=-2.983;SC=TGACATCTCCACGACCGGTTT;SOR=0.557;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=65;WE=18704870;WS=18704852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr1	18807536	rs7512414	G	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=232;ReadPosRankSum=-2.144;SC=GACCGGCAAGGTGGTGCTGTC;SOR=1.060;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=17;WE=18807544;WS=18807526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr1	18807620	rs34109355	G	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=312;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CCAGCGGTGGGGTGGGAATGG;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=25;WE=18807628;WS=18807610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr1	18807755	rs34976233	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=577;ReadPosRankSum=0.938;SC=AGCACCACAGGGCTGCAGCTG;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=30;WE=18807763;WS=18807745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	18807781	rs35013594	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=630;ReadPosRankSum=-0.413;SC=ATCCAAGAGGCCCCTATGTCC;SOR=0.455;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=37;WE=18807789;WS=18807771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr1	18807897	rs2992755	C	G	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=68;PP=2965;SC=CCTTGCTGCCCCAGCCAGGAA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=164;WE=18807905;WS=18807887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	18807953	rs11261022	C	A	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1825;ReadPosRankSum=0.269;SC=CCATTTCCCCCGCTTGGGCAG;SOR=0.905;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=210;TCF=118;TCR=92;TR=105;WE=18807961;WS=18807943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,121:0.47:255
chr1	18808056	rs7515150	G	C	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.166;SC=AGTAAACCCCGTGAGCATCCA;SOR=0.713;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=261;TCF=131;TCR=130;TR=119;WE=18808077;WS=18808046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,132:0.43:306
chr1	18808069	rs7528572	A	G	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.128;SC=AGCATCCAGGACTGGGGCAAC;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=133;TCR=131;TR=119;WE=18808077;WS=18808046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,132:0.42:311
chr1	18808292	rs2992753	C	A	8146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=132;PP=2965;SC=AATGGAGGAGCATTTCATACA;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=120;TCR=132;TR=252;WE=18808300;WS=18808282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr1	18808465	rs3007718	T	A	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=64;PP=2715;SC=GAACAGGGGCTGCCTCGGGAG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=116;WE=18808473;WS=18808455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	18808526	rs2992752	A	C	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=63;PP=2486;SC=CTCCCCGCAGACAGGGCCGTG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=123;WE=18808534;WS=18808516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	18809896	rs2992745	A	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TTCTAGGCAAACAGGCAACCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=18809904;WS=18809886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	18810344	rs2992740	G	T	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.525;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr1	18810349	rs6667069	G	C	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.409;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr1	18960722	rs4920523	G	C	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=16;PP=878;SC=ACTGGAGTCAGGGAGTGTACT;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=18960730;WS=18960712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	19071153	rs142874250	C	CGGAT	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.566;NF=18;NR=2;PP=805;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GTAGACAGGACGGATGGATGG;SOR=1.981;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=20;WE=19071161;WS=19071143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	19071179	rs140528968	GATAA	G	109.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-0.734;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.816;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	19071181	.	T	TGGATA	1644	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=57.48;NF=29;NR=5;PP=1644;QD=48.5882352941;SC=GATGGATGGATAAATGGATGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=34;WE=19071194;WS=19071171;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,34:0.89:38
chr1	19071183	rs71027398	AATGG	AATGGATGG,A,ATGGATGG	565.73	.	AC=1,0,0;AF=0.500,0.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.960;NF=18,28;NR=5,5;PP=452,1597;ReadPosRankSum=-1.230;SC=TGGATGGATAAATGGATGGAT;SOR=1.828;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=23,33;WE=19071194;WS=19071171;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.45:38
chr1	19071187	.	G	GATAA	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.989;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.679;SOR=0.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	19166294	rs12033832	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.515;SC=AGAGGGAGACGGATGAGGTGA;SOR=0.894;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=166;TCF=96;TCR=70;TR=80;WE=19166302;WS=19166284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
chr1	19186129	rs9701796	G	C	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=1105;ReadPosRankSum=1.834;SC=GAACAGGGAGGAGATGGTCTT;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=63;TCR=96;TR=64;WE=19186137;WS=19186119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,76:0.43:178
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chr1	19186320	rs9701803	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GGAAAGGAGGGTGGAATTATG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=19186328;WS=19186310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr1	19199473	rs28700162	T	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=477;ReadPosRankSum=1.340;SC=ACACTTCTGTTTTTCTCTGAA;SOR=0.805;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=35;WE=19199481;WS=19199463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr1	19200908	rs28529092	G	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1121;ReadPosRankSum=1.130;SC=AACATCTAGGGTCTCCCACCA;SOR=0.544;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=69;WE=19200916;WS=19200898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr1	19201184	rs6665917	G	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=0.623;SC=AGGTTCAACAGGAGGCCGAGT;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=19201192;WS=19201174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	19201928	rs2230709	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GTGCTGTCAACCAGCTGCAGC;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=72;WE=19201936;WS=19201918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,88:0.49:180
chr1	19201956	rs2230708	A	G	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=994;ReadPosRankSum=0.650;SC=TGTACTTGTCATCCGGGTAGA;SOR=0.820;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=74;WE=19201964;WS=19201946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,87:0.48:181
chr1	19202770	rs7550822	T	C	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=49;PP=2195;SC=TCCGGTGGGATTGTCCTCCTC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=19202778;WS=19202760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	19202917	rs7550938	T	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr1	19202926	rs2230706	T	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.71;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr1	19203997	rs2230705	C	G	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=49;PP=1583;SC=GACGCGAGCACGCGGAACACT;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=19204005;WS=19203987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	19204154	rs6426813	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=-1.670;SC=TGGCTCCCCCGGTTGCCCAGG;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=12;WE=19204162;WS=19204144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	19204173	rs6426814	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=52;ReadPosRankSum=-0.437;SC=GGGGCCCAAAACACCACCTAC;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=4;WE=19204181;WS=19204163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	19205672	rs28497538	T	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=20;PP=1152;SC=GCAGTGCTGGTGCCTGAAATG;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=19205680;WS=19205662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	19208145	rs112548638	G	GGGTTGCCT	3693.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=2978;SC=CAGGTGAGCAGGTGAACGTCC;SOR=1.833;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=42;WE=19208153;WS=19208135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	19208944	rs28566028	A	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=6;PP=593;SC=GCTGGGCTGCACCTCCCCCAC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=19208952;WS=19208934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	19209543	rs6426611	A	G	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=11;PP=930;SC=CAAGGGGCTCAGGGTGGCCTC;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=19209551;WS=19209533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	19210018	rs28508407	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GCACTGAGCCGGGCCCCAGGA;SOR=1.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=10;WE=19210026;WS=19210008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr1	19215834	rs941495	T	C	5266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=74;PP=2965;SC=GGGGCTGAGCTCTGCCCACCC;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=169;WE=19215842;WS=19215824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	19282944	rs4912132	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=0.842;SC=CGGCCGGCCGGGCGGTTCCAG;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=19282952;WS=19282934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	19282981	rs1886768	A	C	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=125;SC=GCCTCCGCAGAGACGGCAGGA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=19282989;WS=19282971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	19403221	rs76098105	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=833;ReadPosRankSum=-2.654;SC=AAAGAGAAAACCTTGACACTA;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=58;WE=19403229;WS=19403211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr1	19408294	rs67232976	G	GC	2589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.903;NF=15;NR=40;PP=1873;ReadPosRankSum=2.496;SC=TTCTTCCCTGGCCCCATGTCT;SOR=0.574;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=108;TCF=25;TCR=83;TR=55;WE=19408302;WS=19408284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,97:0.56:174
chr1	19408380	rs12164540	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=452;ReadPosRankSum=0.510;SC=ACGTTCACAATCTCCCCAACA;SOR=0.972;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=27;WE=19408388;WS=19408370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr1	19411129	rs1043905	A	G	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=888;ReadPosRankSum=1.191;SC=GTTTGATGTCATGGATGTTGA;SOR=0.474;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=57;WE=19411137;WS=19411119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr1	19412464	rs2274009	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	19413261	rs12584	T	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.010;NF=20;NR=17;PP=514;ReadPosRankSum=-1.333;SC=TTATTCTCCATCTCCTCCAAG;SOR=0.351;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=37;WE=19413269;WS=19413251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
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chr1	19419277	rs61766782	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=150;ReadPosRankSum=-0.555;SC=ATACTTGTACCCCTGTACCCT;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=13;WE=19419285;WS=19419267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr1	19420392	rs1106839	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=0.044;SC=GACCTAGTTCGGCGTTTTAGT;SOR=0.333;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=10;WE=19420400;WS=19420382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	19423886	.	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=589;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CTCTATTTTTCTACAAAGTCT;SOR=0.434;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=39;WE=19423894;WS=19423876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr1	19426199	rs2236377	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=672;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TGAAGCTGTTGTTCCAAATAA;SOR=0.940;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=39;WE=19426207;WS=19426189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr1	19437185	rs10916957	G	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GAAACACAAGGCATGTGAGGG;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=19437193;WS=19437175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	19440107	rs9661719	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTGGACTGCTAGATGAGAGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=19440115;WS=19440098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	19446587	rs6693149	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ACTCTGTGACCATATGTAACC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=19446595;WS=19446577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	19447843	rs1044010	C	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=384;ReadPosRankSum=2.271;SC=TGCTGCCGCACAGAGCACAGG;SOR=0.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=26;WE=19447851;WS=19447833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
chr1	19448326	rs6681662	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=424;ReadPosRankSum=0.663;SC=ATCTTGTTCACAGCTATATCT;SOR=0.705;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=29;WE=19448334;WS=19448316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr1	19470662	rs4912050	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=-0.022;SC=TTTCCTTTCTTGGTCACTCAC;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=22;WE=19470670;WS=19470652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr1	19486839	rs946419	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=0.062;SC=GGATAATACTTGTAAAAATCA;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=19486847;WS=19486829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	19491857	rs3748757	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1195;ReadPosRankSum=-1.550;SC=GGAGGCAAGATGGGAGAAAAA;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=100;WE=19491865;WS=19491847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,113:0.59:192
chr1	19499560	rs16862578	T	C	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AAGATGGTGGTACAGTCGATA;SOR=0.550;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=155;TCF=71;TCR=84;TR=71;WE=19499568;WS=19499550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,87:0.50:175
chr1	19499835	rs951908	G	C	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=962;ReadPosRankSum=-1.292;SC=TTTAGGAGATGACTATAGGCA;SOR=0.668;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=56;WE=19499843;WS=19499825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr1	19500729	rs6694521	G	A	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=759;ReadPosRankSum=0.090;SC=CAATAAACTGGTTACATTTCA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=44;WE=19500737;WS=19500719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr1	19510394	rs3762396	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=928;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GATGAACCTTAAAGACAAGTA;SOR=0.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=53;WE=19510402;WS=19510384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr1	19513570	.	TTA	T	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=0;PP=34;QD=40.0;SC=CAAGAAAGTTTTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=1;WE=19513579;WS=19513560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,1:0.33:3
chr1	19554099	rs7515397	T	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	19557713	rs2275403	G	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=-2.458;SC=GCCCCAAACCGGACTCCGCTA;SOR=1.329;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=4;WE=19557721;WS=19557703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	19566881	rs12084825	C	T	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=855;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CCAGGACAGCCTCATCCACCA;SOR=0.948;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=59;WE=19566889;WS=19566871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,70:0.53:133
chr1	19569935	rs144717480	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=-0.061;SC=ATCTAACAGGCGCTCAATACA;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=13;WE=19569943;WS=19569925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	19578053	rs6680255	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=391;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CACCGCGCCGCGGGCTCCGCC;SOR=0.293;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=24;WE=19578061;WS=19578043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr1	19578192	rs2294942	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=318;ReadPosRankSum=0.184;SC=GCGGCGGCTTGGCAGGGAGAG;SOR=2.012;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=19578200;WS=19578182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	19578404	rs41264060	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=970;ReadPosRankSum=1.836;SC=CCGTGGGCTGGCTACCCAGCC;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=73;WE=19578412;WS=19578394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
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chr1	19582338	rs6694099	C	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=396;ReadPosRankSum=-0.426;SC=TTCCAGTTTCCATAGTTGTCA;SOR=0.390;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=25;WE=19582346;WS=19582328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr1	19582563	rs1557133	G	A	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=51;PP=1664;SC=GGCAGGGGGAGGAAGGCCCTT;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=19582571;WS=19582553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	19583400	rs1774075	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=5;PP=373;SC=AAGGGACCCCAACGTGGGGAC;SOR=1.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=19583408;WS=19583390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	19583684	rs1774074	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=174;ReadPosRankSum=0.316;SC=CAAAGCCGCCCTCTCTCCCAC;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=13;WE=19583692;WS=19583674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	19583725	rs1738017	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=540;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CCCCAGCCATTGGCAGGCCGG;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=12;WE=19583742;WS=19583715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	19583734	rs4912057	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=468;ReadPosRankSum=0.562;SC=TTGGCAGGCCGGAGGCTCAGG;SOR=2.322;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=13;WE=19583742;WS=19583715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	19584004	rs1042380	G	A	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=44;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GCACAAAGGAGGAGGTGAATG;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=65;WE=19584012;WS=19583994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,75:0.54:138
chr1	19595137	rs2235795	C	T	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=26;PP=1331;ReadPosRankSum=-1.164;SC=GCGCCATACGCGGCCTGCAGG;SOR=0.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=99;TCR=44;TR=85;WE=19595145;WS=19595127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,102:0.61:167
chr1	19595194	rs75616155	A	G	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TCCTTCCAGAAGCTGTTCAGT;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=116;TCR=99;TR=97;WE=19595202;WS=19595184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,116:0.43:271
chr1	19595892	rs6665423	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=359;ReadPosRankSum=0.519;SC=ATCAGCCCCCGGGCCCAGAGT;SOR=0.542;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=19;WE=19595900;WS=19595882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr1	19596124	rs2235794	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=0.925;SC=GTGCCTGAGGCAGGGGAAGAG;SOR=0.622;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=13;WE=19596132;WS=19596114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	19596156	rs6665756	G	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=339;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CCTGCCGGGTGGTGGCGCTGT;SOR=0.504;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=24;WE=19596164;WS=19596146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr1	19597420	rs12046875	G	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=608;ReadPosRankSum=0.941;SC=GGCCTTGGTAGCAATTTTCAC;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=39;WE=19597428;WS=19597410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
chr1	19600386	rs112053480	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.954;NF=16;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=0.853;SC=TTCGGAGCCCCAGGCCGCCAA;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=30;WE=19600394;WS=19600376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr1	19600538	rs144376466	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.34;MQRankSum=0.767;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	19609254	rs1738025	T	C	7219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=115;PP=2965;SC=CATTCGTGAGTAACCAAATGC;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=100;TCR=115;TR=215;WE=19609262;WS=19609244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	19609522	rs140599506	G	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=501;SC=AGGTGCCTTGGATAGCTGTAC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=19609530;WS=19609512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	19611241	rs1738023	T	C	5370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.92;NF=44;NR=98;PP=2965;SC=TGTTTCCCATTCTTGTCCTCA;SOR=1.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=44;TCR=98;TR=142;WE=19611249;WS=19611231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	19635011	rs1043657	C	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=606;ReadPosRankSum=-1.675;SC=TGGTCAGGTGCGTGTAGGTAG;SOR=0.605;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=37;WE=19635019;WS=19635001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr1	19638309	rs2227295	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=299;SC=GAGGATCTGCAGCTACTGTTA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=19638317;WS=19638299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	19652132	rs214315	T	G	33.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=10;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=9;PP=210;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GGGGCAGTTGTGGGGGGGGGC;SOR=2.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=19652141;WS=19652122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	19652133	.	G	GGT	33.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=8;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GGGCAGTTGTGGGGGGGGGCG;SOR=2.800;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=19652141;WS=19652122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	19669235	rs12124843	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=331;ReadPosRankSum=-1.648;SC=CGCGGCTCTCAGGCAGGGTAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=22;WE=19669243;WS=19669225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	19683301	rs169957	G	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-0.737;SC=AGTGGCCCCTGGAATTCAGGG;SOR=0.846;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=16;WE=19683309;WS=19683291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	19775246	rs10442634	C	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=693;ReadPosRankSum=0.068;SC=TCTCCCTTCACCCTGGCAGTT;SOR=0.695;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=42;WE=19775254;WS=19775236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
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chr1	19923313	rs4912130	T	A	60.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=0.319;SC=CGCAAACCCATAGGCGCAGCC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=19923321;WS=19923308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	19935118	rs138778783	T	TA	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=0.630;SC=AAAAAATAAATAAAAAAAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=19935126;WS=19935108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	19948507	rs728611	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=0.569;SC=AAATCTGTTTAATGATGTTCA;SOR=1.148;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=10;WE=19948515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr1	19950062	rs1737428	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=-0.814;SC=ATCTTCTACATGGAAAATATG;SOR=0.038;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=19;WE=19950070;WS=19950052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	19972586	rs11810271	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=602;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GGGCTGGAAGATGCAGGCAGG;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=33;WE=19972594;WS=19972576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr1	20009790	rs41312012	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CCTGATGAGGCGGCAGCTGCT;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=72;WE=20009798;WS=20009780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,76:0.43:177
chr1	20020993	rs4370779	AC	GT	7141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=67;PP=2947;SC=GGCCGGCGACACGGAGCTGCA;SOR=0.731;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=131;WE=20021002;WS=20020983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	20097285	rs41311997	T	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=1.831;SC=TTAAATCCACTTACTTTCCCT;SOR=0.416;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=20097293;WS=20097275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	20097822	rs11551819	G	A	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=556;ReadPosRankSum=0.182;SC=CCGTCGGGTCGTCCTTCAAGA;SOR=0.661;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=46;WE=20097830;WS=20097812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr1	20097941	rs10917536	G	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=302;ReadPosRankSum=1.808;SC=TCCAGCCACTGCACCAGGCCT;SOR=0.293;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=22;WE=20097949;WS=20097931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr1	20141405	rs41264113	C	T	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1160;ReadPosRankSum=-1.193;SC=AGGCAGATGGCGCAGAAGGCA;SOR=0.509;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=145;TCF=85;TCR=60;TR=71;WE=20141413;WS=20141395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr1	20141611	rs75270523	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=1.590;SC=CACAGGGACCGGTGGGACACT;SOR=0.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=17;WE=20141619;WS=20141601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr1	20216860	rs10799593	G	A	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=29;PP=2371;SC=GTCTTGACTCGTGTTGTTGTT;SOR=1.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=82;TCR=29;TR=110;WE=20216868;WS=20216850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	20221013	rs372964689	TCTAAGTCAG	T	1132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=2938;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AGCTCTTATTTCTAAGTCAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=15;WE=20221037;WS=20221003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	20221029	rs199563201	G	GA	1107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=2033;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TCAGCTTTGGGAATATCCGAA;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=15;WE=20221037;WS=20221003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	20249253	rs149881596	A	AGAGAGG	1420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.945;NF=3;NR=16;PP=1112;ReadPosRankSum=0.955;SC=GAGCCACTGCAGAGAGGGAGA;SOR=0.446;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=19;WE=20249261;WS=20249243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr1	20304962	rs2236771	C	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=377;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CCTTTCCTGTCGTCAACTTGA;SOR=1.302;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=25;WE=20304970;WS=20304952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr1	20305065	rs10732279	C	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=719;SC=TGGGGTTCTGCGCCCTCCCTC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=20305073;WS=20305055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	20395587	rs2148911	G	A	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=62;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.417;SC=ACAATGATACGCAATTTTATA;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=241;TCF=91;TCR=150;TR=99;WE=20395595;WS=20395577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,119:0.42:285
chr1	20446170	rs11298078	GT	G	661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.77;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	20470148	rs6657574	C	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=568;ReadPosRankSum=0.428;SC=TCAGACTGACCTTGCCCTCCA;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=32;WE=20470156;WS=20470138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr1	20490518	rs6426616	T	C	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=75;PP=2302;SC=ACACCTGGGCTGGCTGGAGAA;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=125;WE=20490526;WS=20490508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	20490568	rs371946948	G	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=655;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GGCTCTCTTTGAAGCAGTGCA;SOR=0.894;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=37;WE=20490576;WS=20490558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr1	20499168	rs2301475	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=553;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CTCAGGAATATCTCCTTCCAA;SOR=1.849;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=30;WE=20499176;WS=20499158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	20501362	rs6692902	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.313;SC=CTCCAAATCCCGTTCAGTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=20501370;WS=20501352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr1	20501582	rs12139100	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=556;ReadPosRankSum=0.324;SC=AAGGCACTTCGCCCCGTGATG;SOR=0.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=35;WE=20501590;WS=20501572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr1	20501670	rs41264517	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.843;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=0.979;SC=AAAGGAAGAAGGAAGTTGCAA;SOR=1.362;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=16;WE=20501678;WS=20501660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	20503710	rs10753483	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	20637374	rs10916761	T	C	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=46;PP=1343;SC=AATGGTGAGATTCTTTCTGCT;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=20637382;WS=20637364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	20649814	rs4655194	T	C	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=51;PP=2789;SC=CTCTTGACCCTGATTGCCCAA;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=101;TCR=51;TR=152;WE=20649822;WS=20649804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	20657352	rs2072753	T	C	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=42;PP=1815;SC=CTCTTCTCCCTTTCCGCCAGG;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=20657360;WS=20657342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	20664061	rs742056	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=0.106;SC=AGACACTTCCAAACAGGAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=10;WE=20664069;WS=20664051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	20664128	rs57312184	T	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.988;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=550;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CCCATCACTATCCCTGTCCAG;SOR=1.090;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=36;WE=20664136;WS=20664118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr1	20671833	rs10799629	C	A	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=13;PP=1626;SC=TTAAAGGCTTCTTTAATCCCA;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=20671841;WS=20671823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	20671961	rs11582960	G	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=939;ReadPosRankSum=0.543;SC=TCCAACCGCCGCTACCAAGTG;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=57;WE=20671969;WS=20671951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr1	20672101	rs4655200	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.143;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=557;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGCAGGCGAGCGGCCGGGGGC;SOR=0.312;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=30;WE=20672109;WS=20672091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr1	20676932	rs179471	T	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=276;SC=CACAGAGTACTCTGGTGACAG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=20676940;WS=20676922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	20677533	rs230184	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=40;ReadPosRankSum=0.256;SC=GACATTTAGGCAGGTGTCGTA;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=5;WE=20677541;WS=20677523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr1	20678551	rs230182	A	G	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TGCACAGGCTAAATCTCAACA;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=96;WE=20678559;WS=20678541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,113:0.47:243
chr1	20680760	rs230180	A	G	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=49;PP=1770;SC=TGTGTAGTTGAGTGACGGGGA;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=20680768;WS=20680750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	20827143	rs146877909	CA	C	1127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=1004;SC=GAAAAGGGGGCAGGGGTGCTT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=24;WE=20827151;WS=20827133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	20829761	rs150868809	A	C	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=18;NR=24;PP=783;SC=CTTCTGAAAGAATACTCTTTA;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=20829769;WS=20829751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	20915531	rs602950	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.934;NF=13;NR=2;PP=277;ReadPosRankSum=-1.646;SC=GACACACCCAAGGGGAGGAGC;SOR=0.141;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=20915539;WS=20915521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	20915589	rs3215400	TC	T	1006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.405;NF=19;NR=8;PP=873;ReadPosRankSum=1.229;SC=AGCTCCTGTTTCCCGCTGCTC;SOR=1.078;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=27;WE=20915597;WS=20915579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr1	20915701	rs2072671	A	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.173;NF=28;NR=30;PP=898;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GGAGGCCAAGAAGTCAGCCTA;SOR=0.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=58;WE=20915709;WS=20915691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr1	20940258	rs488991	T	A	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=17;PP=1101;SC=ACAGACCGAGTCTCAGGGCCT;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=20940266;WS=20940248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	20964328	rs2298298	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=700;SC=TTCTTTTCTCATCACAGGCAA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=20964336;WS=20964318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	20972048	rs3131713	G	A	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=20;PP=1116;SC=TCCCCTCTCCGCCAGCTATCC;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=20972056;WS=20972038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	20972111	rs3738136	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=633;ReadPosRankSum=0.233;SC=CCGCCTCGCCGCCATGATGCT;SOR=0.919;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=48;WE=20972119;WS=20972101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr1	20977000	rs1043424	A	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=579;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GCCCTGAAGAATCTGAAGTTA;SOR=0.625;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=39;WE=20977008;WS=20976990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr1	20977221	rs686658	A	T	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=976;SC=CTAAAAGAACATGGCATCCTC;SOR=3.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=20977229;WS=20977211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	20978832	rs6893	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=456;SC=ACCCCCCTCCTTGCCCCGTCT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=20978840;WS=20978822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr1	20981806	rs592851	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=401;SC=ACTCGGCCTTGATATAACAAA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=20981814;WS=20981796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	20982631	rs4704	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=996;ReadPosRankSum=0.270;SC=CACTGCCTCCGCCGTCAATAA;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=67;WE=20982639;WS=20982621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,70:0.50:140
chr1	20987873	rs537816	G	C	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=82;PP=2965;SC=GACCCAGCACGTGCACACCGG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=154;WE=20987881;WS=20987863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	20992606	rs630484	G	T	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.130;SC=CTCCGAGAGGGAAAGGAGTTT;SOR=0.431;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=147;TCF=99;TCR=48;TR=70;WE=20992614;WS=20992596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr1	20992819	rs631357	G	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=1013;ReadPosRankSum=-2.855;SC=TGTAGCGGTCGTCCTCCTGCC;SOR=1.150;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=124;TCF=39;TCR=85;TR=56;WE=20992827;WS=20992809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,69:0.48:143
chr1	21016906	rs493018	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=2;NR=3;PP=48;ReadPosRankSum=0.349;SC=ATTCCTTTTTGGTTATTCAAA;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=21016914;WS=21016896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	21024901	rs522496	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=660;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TCGGCCTCCACGTCATGCTGG;SOR=0.931;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=42;WE=21024909;WS=21024891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr1	21030902	rs900039	G	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=11;PP=883;ReadPosRankSum=0.639;SC=TTCTCCTGGGGACCTGGCCCT;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=64;TCR=17;TR=52;WE=21030910;WS=21030892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr1	21040079	rs10799661	C	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=627;ReadPosRankSum=1.228;SC=GAACCTAGACCTCAGAGCTCG;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=47;WE=21040087;WS=21040069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr1	21042300	rs554111	C	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=-1.620;SC=GGAGTTGACTCTCTGGTGGGG;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=7;WE=21042308;WS=21042290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr1	21043913	rs604659	T	C	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.115;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=21;PP=2962;ReadPosRankSum=0.760;SC=CCCTGGGGACTCTCGGGGCGG;SOR=1.100;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=148;TCF=100;TCR=48;TR=72;WE=21043934;WS=21043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,74:0.48:154
chr1	21043926	rs604645	T	C	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CGGGGCGGCCTCATGCCCTGC;SOR=1.092;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=182;TCF=123;TCR=59;TR=88;WE=21043934;WS=21043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,101:0.49:205
chr1	21044161	rs601329	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1036;ReadPosRankSum=1.642;SC=GGTTCATGGGACGGCAGCGCA;SOR=1.032;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=150;TCF=53;TCR=97;TR=65;WE=21044169;WS=21044151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,90:0.47:191
chr1	21044219	rs601392	A	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CCCAGGACCAACGGGACCAGA;SOR=1.909;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=18;WE=21044227;WS=21044209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr1	21050958	rs592060	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=973;ReadPosRankSum=1.616;SC=TCTGAGAGAGCTGATCACGGC;SOR=0.288;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=56;WE=21050966;WS=21050948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr1	21091861	rs1985278	G	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=371;ReadPosRankSum=-2.510;SC=CCAGGCCAATGGCTCATACCT;SOR=0.763;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=23;WE=21091869;WS=21091851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr1	21099846	rs589755	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGGAAGCAGAACAAGATTTAT;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=21099854;WS=21099836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	21143774	rs12126757	A	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	21167404	rs2230573	A	G	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=22;PP=1301;SC=TGATAGAGTAATTGGCCCATG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=63;WE=21167412;WS=21167394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	21175855	rs7525082	C	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=274;SC=CCAAGTTATTCTATACTATCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=21175863;WS=21175845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	21179969	rs7542882	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=10;PP=492;SC=CATAAGGATTGCTATCAAAAC;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=21179977;WS=21179959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	21180181	rs2305463	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=0.329;SC=CTACACATGTCGAGGATTTAG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=10;WE=21180189;WS=21180171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr1	21180250	rs7543140	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=-1.254;SC=ATCCCTAGGTGAGGCCTGAGA;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=6;WE=21180258;WS=21180240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	21188703	rs10916885	A	T	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=28.217;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=955;ReadPosRankSum=-1.870;SC=GCTTATTATTATTTTTTTTCC;SOR=2.324;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=66;WE=21188711;WS=21188693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,62:0.31:201
chr1	21188871	rs17409373	C	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=700;ReadPosRankSum=-1.732;SC=GAAACTTAAACGTAATTTTAC;SOR=0.412;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=33;WE=21188879;WS=21188861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr1	21219050	rs6685306	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=0.945;SC=ATAAAAAGAGCGTAACAGAAA;SOR=0.518;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=6;WE=21219058;WS=21219040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr1	21295864	rs2271115	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=-1.525;SC=TGCGAGACAACTGATGGAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=12;WE=21295872;WS=21295854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	21325360	rs885363	C	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=396;ReadPosRankSum=0.060;SC=ATTTAAGGAGCAAAAATATAT;SOR=0.506;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=24;WE=21325368;WS=21325350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr1	21327637	rs1395508	C	T	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=41;PP=2560;SC=GTCAAAAATACTAAGTGCCAG;SOR=1.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=126;WE=21327645;WS=21327627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	21377314	rs6426663	C	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=527;SC=AAAATGATGCCTTTACAGGGA;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=21377322;WS=21377304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	21494634	rs61779121	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=57.92;MQRankSum=-1.036;NF=3;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=0.022;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=21494642;WS=21494624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	21502724	.	TGCCGCCGCC	T,TGCCGCC	1105.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=21;NF=5,5;NR=11,11;PP=402,366;SC=GGGGGACCGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=16,16;WE=21502740;WS=21502714;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:29
chr1	21554319	rs6426676	A	G	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=567;SC=CTGCAACCTGAAGCACTGGGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=21554327;WS=21554309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	21560253	rs28368029	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=202;ReadPosRankSum=-0.026;SC=AGATTAATCTGCAGGCTGGAG;SOR=0.425;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=13;WE=21560261;WS=21560243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	21571601	rs12562197	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.910;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=493;ReadPosRankSum=-2.200;SC=AGCAGGCTGCGGGGAGAGGAG;SOR=1.388;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=29;WE=21571609;WS=21571591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr1	21573722	rs2229450	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=336;ReadPosRankSum=-0.069;SC=ACCATCTGTCGGTGGTGTTGA;SOR=1.008;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=21;WE=21573730;WS=21573712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	21582348	rs2076282	T	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.615;SC=TTTCAAGGACTAGATGAAATG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=21582356;WS=21582338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	21583925	rs2076280	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=343;ReadPosRankSum=-0.358;SC=CCTGGGCTCCCCTAGCTTCAA;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=18;WE=21583933;WS=21583915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	21583973	rs3026879	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=514;ReadPosRankSum=1.136;SC=CGGAGCAGGAAGGACCGTGCT;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=31;WE=21583981;WS=21583963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr1	21625145	rs10916958	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=0.210;SC=CGGTGGCACATGTCAGCTCCT;SOR=0.926;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=24;WE=21625153;WS=21625135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr1	21671943	rs2072654	T	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=12;PP=384;SC=CCGGGTTCCCTGCTCCCAGCC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=21671951;WS=21671933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	21751142	rs150916531	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=9.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.51;MQRankSum=-2.181;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.684;SOR=3.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	21751214	rs72476501	G	A	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.094;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.791;NF=86;NR=66;PP=2408;ReadPosRankSum=1.856;SC=CTGACGTCCTGTTCCTCAAAT;SOR=1.089;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=235;TCF=127;TCR=108;TR=152;WE=21751222;WS=21751204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,137:0.64:213
chr1	21752746	rs140646278	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=15.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.19;MQRankSum=-2.302;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.300;SOR=2.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr1	21752766	rs144829292	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.02;MQRankSum=-1.646;QD=1.84;ReadPosRankSum=1.153;SOR=1.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,7:0.12:56
chr1	21752782	rs140348908	T	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQRankSum=-2.189;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.922;SOR=1.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,7:0.11:63
chr1	21753562	rs146549873	A	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	21754920	rs183181907	G	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.290;NF=11;NR=12;PP=294;ReadPosRankSum=0.426;SC=GACTGAGCCTGGGCGCGCCCG;SOR=0.793;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=23;WE=21754928;WS=21754910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	21754996	rs12024079	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.18;QD=28.19;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	21755055	rs12024104	C	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	21755345	rs41302023	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.499;NF=21;NR=22;PP=1198;ReadPosRankSum=0.443;SC=ATCACCCTGCTACGAGACCCC;SOR=0.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=43;WE=21755355;WS=21755335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr1	21755347	rs41310392	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.515;NF=25;NR=26;PP=1847;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CACCCTGCTACGAGACCCCGT;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=51;WE=21755355;WS=21755335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,65:0.54:120
chr1	21755408	rs41312003	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.580;NF=11;NR=21;PP=415;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GCCACGTGGAAGACGTCGTTG;SOR=0.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=32;WE=21755416;WS=21755398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr1	21755453	rs3856177	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.74;QD=32.41;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	21755539	rs3855556	C	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	21755756	rs56343055	G	C	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.134;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.771;NF=47;NR=51;PP=1934;ReadPosRankSum=1.758;SC=CAGTACAACAGCACGCGGGCG;SOR=0.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=98;WE=21755764;WS=21755746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr1	21755867	rs7522332	A	G	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=47;PP=1616;SC=TTCCAGCAGCACTACCAGTAC;SOR=0.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=21755875;WS=21755857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	21755906	rs3738922	G	A	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=41;PP=1242;SC=AGGGAGCAGCGCCTGAGGAGC;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=21755914;WS=21755896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	21756008	rs3894725	G	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=499;SC=GACTACATGAGCCACATCATT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=21756016;WS=21755998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	21756069	rs7532750	G	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=7;PP=174;SC=TGGGGTGTGTGGGGGATAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=21756077;WS=21756059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	21795388	rs1827293	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=692;ReadPosRankSum=-1.800;SC=CAAAATAATTACGGTAAGTTC;SOR=0.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=44;WE=21795396;WS=21795378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr1	21799489	rs1971327	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=197;ReadPosRankSum=0.320;SC=CTGGCATCTATGATGGGCCGA;SOR=1.276;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=16;WE=21799497;WS=21799479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	21799823	rs1971328	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTGGTGTCCAATCCCTCTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=21799831;WS=21799813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	21800185	rs7520015	T	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=1.462;SC=TCTATTATGGTATTCTTAACA;SOR=1.230;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=14;WE=21800193;WS=21800175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	21801346	rs7531217	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=0.338;SC=GTCATATGTGGAGTGTGAATT;SOR=0.199;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=21801354;WS=21801336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	21804815	rs7535654	T	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=557;SC=GTACTCCATTTTGAAGGTGAT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=21804823;WS=21804805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	21805730	rs2316504	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=-0.548;SC=AAAGTCTCCTATTCTCACACT;SOR=0.479;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=20;WE=21805738;WS=21805720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr1	21808159	rs71512991	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQRankSum=-3.192;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr1	21808207	rs146564096	A	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQRankSum=-3.593;QD=0.90;ReadPosRankSum=-2.147;SOR=1.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,8:0.15:53
chr1	21880818	rs142935969	C	CATAT	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=176;SC=ACTCTTTTCCCATATATATAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=21880826;WS=21880808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	21887290	rs1767430	C	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=690;SC=TAGCTAGGAGCCCCGGGAGCC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=21887298;WS=21887280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	21889635	rs1780316	T	C	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=38;PP=1497;SC=TCCCTGACAGTGCCGGCACCG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=21889643;WS=21889625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	21890464	rs1767428	A	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.11;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	21896767	rs1256328	C	T	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=51;PP=2112;SC=CCCTAGCCCCCGGCATGTGCT;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=109;WE=21896775;WS=21896757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	21904199	rs371832452	GC	G	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CCACACGGCAGCCCCCCCCTC;SOR=0.197;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=21904207;WS=21904189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	21925108	rs2794278	T	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=112;SC=ACCCGTACCCTCTGCGAGGAG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=21925116;WS=21925098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	21926187	rs1767445	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.328;SC=CCTTGCCCTCCCCAACCCGGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=21926195;WS=21926177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	21928344	rs2275366	C	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.892;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=1.453;SC=TGGCATCAGGCGTAGCGTGAG;SOR=0.207;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=16;WE=21928352;WS=21928334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr1	21929260	rs829368	A	G	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.554;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=1444;ReadPosRankSum=-0.682;SC=AGGGATGGGGATGCAGGGGAA;SOR=0.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=84;WE=21929268;WS=21929250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	21929456	rs3215988	GC	G	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GAGCCCCAGTGCCCCCCCCAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=21929464;WS=21929446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	21932530	rs1767443	C	A	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=10;PP=711;SC=AGGGAGGGGCCGGGGCCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=21932538;WS=21932520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	21934667	rs829371	G	A	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=727;ReadPosRankSum=0.754;SC=CCCTAGCCACGTCCCTGCTCC;SOR=0.690;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=48;WE=21934675;WS=21934657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
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chr1	21938375	rs2275364	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CTGTCCCTACTTGGACCCAGA;SOR=0.260;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=20;WE=21938383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
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chr1	21939493	rs3767113	G	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=264;ReadPosRankSum=2.108;SC=CCTGGGGGAAGGCACAGGCCC;SOR=0.614;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=19;WE=21939501;WS=21939483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr1	21939741	rs1256282	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=-0.516;SC=GGAGATAAGGGAGGGGTGTGA;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=24;WE=21939749;WS=21939731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr1	21940555	rs2275363	C	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=0.873;SC=CCGAGGGCAGCGTCCAGTGAG;SOR=0.391;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=43;WE=21940563;WS=21940545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr1	21943820	rs2275360	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=733;ReadPosRankSum=-0.145;SC=AGTGCTTCCGGTAGATGCGGG;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=51;WE=21943828;WS=21943810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,60:0.54:111
chr1	21944041	rs150959892	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GGCGCCCCAGGACACCCTCCC;SOR=0.520;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=16;WE=21944049;WS=21944031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	21944352	rs748488	A	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.956;NF=41;NR=13;PP=990;ReadPosRankSum=0.660;SC=AAGGAGGAGGACCTGGTATCC;SOR=0.418;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=104;TCF=82;TCR=22;TR=54;WE=21944360;WS=21944342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr1	21945614	rs115394639	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGCCGCCAGGCGCTGCCTCCC;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=9;WE=21945622;WS=21945604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	21946396	rs12134357	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=218;ReadPosRankSum=1.028;SC=CATCTTCTACTGGCGTGGCCT;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=13;WE=21946404;WS=21946386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	21946415	rs1681255	G	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=912;SC=CTGTCCTCAGGGAGGTGAAGG;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=21946423;WS=21946405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	21948936	rs829415	G	C	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=36;SC=GGCCCCCGCCGGGGCGGCACT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=21948944;WS=21948926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	21953436	rs829412	A	G	7909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=152;PP=2965;SC=CCCACTTTACAGACAGGACCC;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=87;TCR=152;TR=239;WE=21953444;WS=21953426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr1	21961339	rs10799706	A	T	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=76;PP=2623;SC=CACCCCACCGAGGACTTCAGT;SOR=0.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=134;WE=21961347;WS=21961329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	21991760	rs75449578	C	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=784;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GGTCTGCTTCCTCCGAATGGG;SOR=0.872;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=64;WE=21991768;WS=21991750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,79:0.43:184
chr1	21995574	rs7521054	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	21995734	rs78143302	G	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=1.294;SC=CAGCCCTGGCGGGGCGCACTC;SOR=0.635;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=18;WE=21995742;WS=21995724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr1	22013561	rs829420	C	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.080;SC=TCTACTGTAACAATATGTGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=22013569;WS=22013551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	22030189	rs829372	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.717;NF=0;NR=8;PP=97;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TAAAAACATATGTCAAAGTTA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=22030197;WS=22030179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	22032472	rs11426922	A	AT	481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=6;PP=530;SC=TATTCATTTAATTAATAGAAA;SOR=1.112;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=22032480;WS=22032462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	22032570	rs333173	T	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=519;ReadPosRankSum=0.029;SC=AATACCAGAGTCAACCAAATC;SOR=0.706;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=30;WE=22032578;WS=22032560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	22033228	rs56167338	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=849;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TGTCAGTAGCGTTCAGTACCT;SOR=0.518;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=63;WE=22033236;WS=22033218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr1	22050649	rs2275668	C	A	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=780;ReadPosRankSum=0.136;SC=CTAAGTGATACATTCATTTTT;SOR=0.409;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=45;WE=22050657;WS=22050639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr1	22063149	rs10753517	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=2.277;SC=TAAAAGAAACGTTGGATAACA;SOR=0.407;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=23;WE=22063157;WS=22063139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr1	22141206	rs10917051	A	C	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=770;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TGCGGCCTGAACATCCCGGTG;SOR=0.604;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=50;WE=22141214;WS=22141196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,63:0.43:147
chr1	22142346	.	C	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=-1.096;SC=CCTGCCCACACCCCCACACTG;SOR=0.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=22142354;WS=22142336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	22149935	rs897467	T	C	5853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=93;PP=2965;SC=CTGTGATGCCTGAGGAGAATC;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=184;WE=22149943;WS=22149925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	22150257	rs3736357	C	T	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=689;SC=ACTTCCTGGTCCTCCCCGGCC;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=22150265;WS=22150247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	22157689	rs3736355	G	A	6873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=137;PP=2965;SC=GCCAGGTGGTGTGTGGGGTGT;SOR=1.161;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=91;TCR=137;TR=228;WE=22157697;WS=22157679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	22158363	rs4654771	G	A	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=717;SC=GCCCAGTTGGGTAGAGGGGTC;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=36;WE=22158371;WS=22158353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	22160148	rs7547731	C	T	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=30;PP=989;SC=CCTTGGCCCACGGCTCCAGGG;SOR=2.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=22160156;WS=22160138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	22168216	rs7556412	C	T	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1067;SC=TGGTCCTTCTCGTGTCTTGGT;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=22168224;WS=22168206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	22174600	rs3767138	A	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=51;PP=1447;SC=CAGGAAGCAGATGGCAGGAGG;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=78;WE=22174608;WS=22174590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	22177119	rs61777200	A	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=18;PP=452;SC=TGTCCTTCACATGGGGAAGGG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=22177127;WS=22177109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	22179673	rs12049614	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=51;PP=1251;SC=GGCCGACAGGTGGCCTTTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=22179681;WS=22179663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	22180244	.	A	AAAAAT	78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=63.51;NF=1;NR=1;PP=78;QD=43.5;SC=TCTCTCTCAAAAAAATAAAAT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=22180252;WS=22180234;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	22180548	rs12117402	T	C	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=81;PP=2965;SC=TCAACCTCCTTCTCTCTCTGA;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=160;WE=22180556;WS=22180538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	22183471	rs12024579	A	C	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=54;PP=2965;SC=TGGGGGAGAGACAGGAGGGGA;SOR=1.256;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=147;WE=22183479;WS=22183451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	22183739	rs2305562	A	G	7129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=103;PP=2965;SC=AGACCCCAGAAGACAGACTTC;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=104;TCR=103;TR=207;WE=22183747;WS=22183729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	22186234	rs10917056	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=32;PP=1155;SC=AGCCCCATGCACAAGGACAGC;SOR=1.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=22186242;WS=22186224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	22191454	rs897471	G	A	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=76;PP=2516;SC=GATGCTGGCCGCCAGCGGCAC;SOR=1.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=49;TCR=76;TR=125;WE=22191462;WS=22191444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	22199081	rs2501266	A	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=288;SC=AGGTGGCAACACCGCCTGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=22199089;WS=22199071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	22199245	rs2229482	C	T	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=33;PP=1398;SC=TGAGGCCTTCCACCTGGGCCT;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=22199253;WS=22199235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	22199821	rs2454290	G	A	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=33;PP=2064;SC=CTCCGCCCTAGGGACTCTGGG;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=98;WE=22199829;WS=22199811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	22200067	rs2247741	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AACTGGGCAGAGAAGAGCAGG;SOR=0.487;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=18;WE=22200075;WS=22200057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr1	22200082	rs2445136	T	C	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=29;PP=733;SC=AGCAGGGACGTGCCCTGGACC;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=22200090;WS=22200072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	22200835	rs2445135	C	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=226;SC=CTGGATGAAGCGGGTGTGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=22200843;WS=22200829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	22202109	rs2501265	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=9;PP=1022;SC=CCTCCTGCCCCGGCTCCAGAC;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=22202117;WS=22202099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	22203259	rs2454295	A	G	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=48;PP=1437;SC=AGCCACTGAAAGAGCACATGT;SOR=3.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=22203267;WS=22203249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	22205408	rs2454294	T	C	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=5;PP=261;SC=CCAAGTCTCCTGCCTCCCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=22205416;WS=22205404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	22205466	rs2454293	T	C	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=541;SC=AAACCCCCCCTGACCCGGAGC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=22205474;WS=22205456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	22206649	rs989994	T	C	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=41;PP=2222;SC=GCCATTGCAATTGCAACCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=22206657;WS=22206639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	22206942	rs1874793	G	A	4294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=70;PP=2836;SC=GTCCCACGCTGGCCATCTTGG;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=131;WE=22206950;WS=22206932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	22207235	rs1874792	T	C	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=58;PP=1602;SC=CCGGCACCCATGAGGACCACG;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=84;WE=22207243;WS=22207225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	22207804	rs139046040	ACCCAGGGTGGCAG	A	5175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=40;PP=2970;SC=TTCTTTCCCCACCCAGGGTGG;SOR=0.978;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=59;WE=22207824;WS=22207794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	22208030	rs921847	C	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=383;SC=AGGGCTGCAGCCTGGGCCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=22208038;WS=22208020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	22211222	rs4654994	T	C	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=123;NR=62;PP=2965;SC=AGCCCGGCTCTGCCCCCACAC;SOR=1.452;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=123;TCR=62;TR=185;WE=22211230;WS=22211212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	22215088	rs2445140	T	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=23;PP=1264;SC=CGTGAGCCCCTGCACCCGGCC;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=22215096;WS=22215078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	22216574	rs2254358	C	A	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=40;PP=1481;SC=GAATCTGAGCCCCATCCGCAT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=22216582;WS=22216564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	22216604	rs2254357	C	G	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=38;PP=1352;SC=AGCCCACATCCAGCTCCACAA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=69;WE=22216612;WS=22216594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	22217108	rs2501260	G	A	4336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=69;PP=2902;SC=ACACCTCTCGGAACTCTCTGG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=144;WE=22217116;WS=22217098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	22303465	rs116802276	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=538;ReadPosRankSum=0.845;SC=AGTCAGCCCCCTTTGCTTACC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=31;WE=22303473;WS=22303455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr1	22303702	rs4415533	C	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.095;NF=6;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=-1.525;SC=TCAGCTTGTACCCGGGGGCAT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=27;WE=22303710;WS=22303692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr1	22304428	rs12074015	CC	GT	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.25;QD=44.72;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	22304431	rs181658556	G	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.04;QD=43.51;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	22304585	rs12059804	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=12.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.02;MQRankSum=-3.317;QD=2.53;ReadPosRankSum=-2.684;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr1	22304831	rs143312313	C	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.273;NF=23;NR=12;PP=521;ReadPosRankSum=0.154;SC=GGGACCCTCCCGCTGATTGAC;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=35;WE=22304839;WS=22304821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr1	22307340	rs7528228	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.21;QD=30.48;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	22307358	rs7528300	C	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=8;PP=541;SC=TCTACCACACCTGTGGCGGTA;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=22307366;WS=22307348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	22307538	rs7528405	C	T	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=36;PP=1216;SC=CAGGAGCTCCCGGACCTACCA;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=63;WE=22307546;WS=22307528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	22310080	rs10799723	G	A	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=493;SC=TTTGGAGGGTGAAGGAGCTGG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=22310088;WS=22310070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	22310139	rs10733031	T	G	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.30;QD=45.48;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	22310145	rs10733032	C	T	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.63;QD=43.56;SOR=1.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	22310190	rs41266015	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.144;NF=15;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.571;SC=TCCCCAGCAATGACATCGCCC;SOR=0.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=26;WE=22310198;WS=22310180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr1	22310262	rs10733033	G	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=35;PP=1451;SC=CACTCCCTCCGGCTGGTGACA;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=22310270;WS=22310252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	22310411	rs28468423	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.96;QD=43.59;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	22310413	rs7549398	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.96;QD=43.59;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	22310662	rs6426735	G	T	8975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=128;PP=2965;SC=CCCCTGACTCGGTGCTTTTTA;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=128;TCR=128;TR=256;WE=22310682;WS=22310652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr1	22310674	rs7538207	C	T	8127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=129;PP=2965;SC=TGCTTTTTATCGCTGCAGCCA;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=110;TCR=130;TR=239;WE=22310682;WS=22310652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr1	22310725	rs3820287	G	C	4503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=101;PP=2770;SC=CCCTGCTGCCGGTGGTGGACT;SOR=1.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=149;WE=22310733;WS=22310715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	22310824	rs1803531	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=32;PP=725;SC=CCGGCTGCAATGTGAGTCAGC;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=22310832;WS=22310814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	22313017	rs61777963	G	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=596;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CTCTCTGACGGTTCCAGGGTG;SOR=0.990;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=29;WE=22313025;WS=22313007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr1	22313161	rs1803530	T	C	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=78;PP=2029;SC=CCGCCTTCATTGACTGGATTG;SOR=1.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=121;WE=22313169;WS=22313151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	22313197	rs34963341	C	A	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=51;PP=1511;SC=CAGGGCGGCCCGGAGGGCTTT;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=73;WE=22313205;WS=22313187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	22315738	rs4655006	C	T	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.67;QD=30.44;SOR=4.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	22329062	rs143337942	CC	GT	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.546;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-8.218;NF=28;NR=13;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TCTCAAACTCCCGGGCTCAAG;SOR=0.324;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=133;TCF=94;TCR=39;TR=41;WE=22329071;WS=22329052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,38:0.32:120
chr1	22329414	rs10917107	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=809;SC=CCAGTTGAAGGCATGGCTTGG;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=22329422;WS=22329404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	22333595	rs3820290	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=35;PP=1091;SC=CACCAAGACCGGACCTTGTAC;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=22333603;WS=22333585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	22336277	rs3820285	C	G	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=63;PP=2711;SC=TTTGTTTCTGCCTTTGGCTGC;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=133;WE=22336285;WS=22336267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	22336371	rs3806297	C	A	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=53;PP=1755;SC=CAGGGCGGCCCGGAGGGCTTT;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=22336379;WS=22336361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	22408106	rs2501282	G	A	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=46;PP=2529;SC=GGATGGACTAGGGGACGATTA;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=117;WE=22408114;WS=22408096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	22447148	rs12756110	G	C	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=6;PP=119;SC=CCTCCTCTTAGGAATTACGCG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=22447156;WS=22447138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	22447645	rs41420150	C	CTG	1402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=1337;SC=GTGGGAGAGTCTGGGGCCCTG;SOR=3.126;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=28;WE=22447653;WS=22447635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	22832743	rs209732	A	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=467;SC=AGGTATTAGTAAATTGTTGAC;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=22832751;WS=22832733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	22835677	rs209729	A	G	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=86;PP=2906;SC=AAGATTGAGTACAAGCTCTTT;SOR=1.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=40;TCR=86;TR=126;WE=22835685;WS=22835667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	22846709	rs209720	G	A	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=79;PP=2440;SC=GGAGCGGCACGTGGTGACCCA;SOR=1.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=117;WE=22846717;WS=22846699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	22849003	rs998978	A	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=771;SC=CGGGGCCTGAATCTCCCCTCC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=22849011;WS=22848993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	22852715	rs881646	G	C	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=60;PP=2197;SC=CCCCAGAGCCGGTGGCCCCGA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=130;WE=22852723;WS=22852705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	22912910	rs12034618	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=1.986;SC=ACAGTGTGAGCGGTCCCCAAG;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=22912918;WS=22912900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	22913153	rs638058	T	C	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=946;ReadPosRankSum=-2.165;SC=GAGATGCCAGTACCCTTGAGC;SOR=0.828;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=66;WE=22913161;WS=22913143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr1	22915753	rs606002	T	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=1011;ReadPosRankSum=0.670;SC=TTCCCCTGCCTCAGACCCATC;SOR=0.985;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=56;WE=22915761;WS=22915743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr1	22915978	rs521570	A	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TCTGTGCCTCAGTTTCCTCCC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=22915986;WS=22915968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	22919904	rs209696	C	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.211;SC=AGCAGCCGAACGGCATCATCC;SOR=0.911;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=172;TCF=105;TCR=67;TR=83;WE=22919912;WS=22919894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,102:0.48:213
chr1	22922546	rs209692	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=1058;ReadPosRankSum=0.553;SC=TTGGGGTCAGGTCCCGGGCTA;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=25;WE=22922568;WS=22922536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr1	22922560	rs209691	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=1058;ReadPosRankSum=0.558;SC=CGGGCTAGGGGTGGCCTGGCC;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=34;WE=22922568;WS=22922536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr1	22922800	rs209690	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CAGATTCCAGGGTGTCACAGA;SOR=1.609;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=11;WE=22922808;WS=22922790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	22924418	rs12030727	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=773;ReadPosRankSum=0.786;SC=GGCCTCTGGGTCCATCCCCTC;SOR=1.211;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=41;WE=22924426;WS=22924408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr1	22924536	rs66665740	GT	G	816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.034;NF=14;NR=6;PP=644;ReadPosRankSum=1.953;SC=GCACCCTGGGGTTTCCAGTGC;SOR=1.458;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=20;WE=22924544;WS=22924526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr1	22925292	rs664340	C	G	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=33;PP=2132;SC=CAGGCGCCTCCCCGGGCTTTC;SOR=1.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=113;WE=22925300;WS=22925282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	22927314	rs209702	A	G	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GTGAGTGCCAAGCCCTGGCAG;SOR=0.933;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=184;TCF=84;TCR=100;TR=95;WE=22927334;WS=22927304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,109:0.51:214
chr1	22927326	rs209701	T	G	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.228;SC=CCCTGGCAGGTCCGCGGGCGG;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=184;TCF=87;TCR=97;TR=93;WE=22927334;WS=22927304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,107:0.51:210
chr1	22928229	rs200304246	C	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=-1.557;SC=CCGCCGGCACCTCTGATGTAC;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=18;WE=22928237;WS=22928219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr1	22928265	rs209700	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=236;ReadPosRankSum=0.356;SC=GGCAGCCACCAAGCCCACCCC;SOR=1.274;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=12;WE=22928273;WS=22928255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	22928349	rs209699	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.191;SC=CCCTCCTCTCAGGTGCTGGAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=22928357;WS=22928339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	22965438	rs172378	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.618;SC=GCCCCCTCGGAGCCCGTGGCA;SOR=1.051;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=161;TCF=89;TCR=72;TR=67;WE=22965446;WS=22965428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,86:0.47:183
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chr1	22987958	rs10580	A	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=653;SC=CCCTTGCCCAACCAATGCACA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=22987966;WS=22987948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	23045943	rs2869513	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=510;ReadPosRankSum=-1.454;SC=ATCTGGTTTCACAGGGCCCAC;SOR=0.432;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=37;WE=23045951;WS=23045933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr1	23101688	rs1561624	T	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=587;ReadPosRankSum=1.966;SC=GTTGTGAAAATAGATGGATGT;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=40;WE=23101696;WS=23101678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr1	23107832	rs3738296	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=1.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	23108089	rs2817904	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.874;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTCAGGACCCAGAGCCAGGCC;SOR=3.516;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=23108097;WS=23108079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	23208925	rs2229872	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=668;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GGTCCCAGCCGGACCAGCCCA;SOR=0.511;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=43;WE=23208933;WS=23208915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr1	23217443	rs72655556	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=242;ReadPosRankSum=-2.045;SC=AAATTACCTAGTCTTGGGTAT;SOR=0.169;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=18;WE=23217451;WS=23217433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr1	23219493	rs309472	T	C	6048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=88;PP=2965;SC=CCGTGGCAGGTTACGGGCGCT;SOR=0.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=185;WE=23219501;WS=23219483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr1	23280424	rs12048993	G	T	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=1506;ReadPosRankSum=0.289;SC=GCTCCAGCACGTTCTCCGAGA;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=96;WE=23280432;WS=23280414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,107:0.53:202
chr1	23289568	rs10799777	T	C	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=952;SC=GCCCAGCCCATATGCCCAGTT;SOR=1.355;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=23289576;WS=23289558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	23291582	rs4655138	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=475;SC=TTTTATACACGAGGACATCGA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=23291590;WS=23291572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	23342362	rs681648	A	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=32;PP=1131;SC=TGTTTAATGTATACAGAATTT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=23342370;WS=23342352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	23357282	rs6682560	A	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=154;SC=GTGTGTGTGTATACATATACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=23357290;WS=23357272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	23380198	rs579785	A	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=6;PP=1000;SC=TTTTAAAGATAGTCAAATAAC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=23380206;WS=23380188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	23385826	rs79588010	CTT	C	2888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=2162;SC=TTTCTTAACTCTTGAGCTATG;SOR=1.473;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=49;WE=23385835;WS=23385816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	23399932	rs967605	C	T	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=57;PP=1987;SC=ATTGCACATGCCTTTGAGAGG;SOR=1.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=23399940;WS=23399922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	23405794	rs2072945	A	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=425;SC=TTGTGACATCAGGGCTGAGGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=23405802;WS=23405784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	23418153	rs10799790	C	T	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=51;PP=2042;SC=TCTGGCCTGTCCTTCAGGGGC;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=23418161;WS=23418143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	23419261	rs477717	G	A	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=65;PP=2263;SC=CCTTCAGTCCGCTCTCGGTGC;SOR=1.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=23419269;WS=23419251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	23419374	rs3765407	G	T	8002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.99;SOR=1.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	23419383	rs477830	C	T	8653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.01;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	23419855	rs1983965	T	C	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=45;PP=1824;SC=GTTTGATTTGTGTCTTAAGTT;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=94;WE=23419863;WS=23419845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	23519477	rs623988	C	T	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	23519506	.	A	AT	194	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=22;MMLQ=15;MQ=59.29;NF=15;NR=7;PP=194;QD=10.3181818182;SC=TCAGAAAATAATTAAAAAAAA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=22;WE=23519516;WS=23519496;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr1	23664511	rs11586100	T	G	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=180;SC=GTGCCAGAGATTGGAGCAGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=23664519;WS=23664501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	23688933	rs2849028	A	G	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=43;PP=2212;SC=TCTGACTGAAATTCTTCCCAC;SOR=1.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=23688941;WS=23688923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	23693422	rs2849025	T	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=7;PP=1019;SC=GTCAAGCCAATATCCAATTAA;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=23693430;WS=23693412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	23696152	rs665977	G	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=26;PP=771;SC=GAGGCTGGCCGAGAAACCACC;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=23696160;WS=23696142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	23710805	rs605468	A	G	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=29;PP=1576;SC=GTATGTGGATAACAGGGAAGG;SOR=1.233;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=23710813;WS=23710795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	23713952	rs676363	T	G	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=38;PP=1257;SC=CTGAGGAGTTTCAGGGGCCCT;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=23713960;WS=23713942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	23720260	rs2486078	T	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=0.363;SC=GAGGCTGGTTTGAAAAGCTCC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=23720268;WS=23720250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	23724183	rs2275355	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=348;ReadPosRankSum=0.905;SC=TGTTCCTGTACCATCCCTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=21;WE=23724191;WS=23724173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr1	23724514	.	C	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=419;ReadPosRankSum=0.890;SC=GAGCAGCATTCTAGATGTCTT;SOR=0.408;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=29;WE=23724522;WS=23724504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	23735241	rs1198423	G	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=-2.137;SC=AAATTGGCAAGGAGACTGCTT;SOR=0.772;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=15;WE=23735249;WS=23735231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr1	23743581	rs2156087	C	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=1.498;SC=AGTCTAACATCTGGTTGAGCC;SOR=3.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=23743589;WS=23743571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	23751140	rs71514235	G	T	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=1.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,83:0.49:171
chr1	23755513	rs1198430	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr1	23758134	rs1198434	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.732;SC=AAATCAATGGATGCTCAGAGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=23758142;WS=23758130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	23765472	rs1767148	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-1.460;SC=CAAGGATGTGAAGTGTAGACT;SOR=0.250;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=14;WE=23765480;WS=23765462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	23810658	rs71514236	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr1	23836364	rs2075993	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=436;ReadPosRankSum=1.000;SC=GGGGGCAGGCAGGGCCACTCA;SOR=1.150;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=38;WE=23836372;WS=23836354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr1	23847464	rs2075995	C	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=694;ReadPosRankSum=0.667;SC=TCTGGATGAGCTGGTCCAAGG;SOR=0.481;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=48;WE=23847472;WS=23847454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr1	23885498	rs11574	T	C	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=64;PP=2403;SC=AGTTCCGGAGTGAGCTCGGCT;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=23885506;WS=23885488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	23908176	rs78293958	G	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=479;ReadPosRankSum=-1.090;SC=AAGGTAAGGAGGTGGCGCGTG;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=33;WE=23908184;WS=23908166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr1	23965517	rs61777309	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=654;SC=GTGGGCAGGTGCCAGGAATTT;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=23965525;WS=23965507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	23965704	rs10917403	A	C	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=66;PP=2481;SC=GCTTAATGTTAATCTCTCCAA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=23965712;WS=23965694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	23965829	rs10917404	C	T	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=801;SC=AAGGAAAGAACGAATCGATGA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=23965837;WS=23965819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	23966837	rs1317329	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=16;PP=748;SC=AAATGACAGACGCTACCATCA;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=23966845;WS=23966827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	23966894	rs3072132	T	TAAG	2896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=1516;SC=GGTGGCTTTGTAAGAAGAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=31;WE=23966902;WS=23966884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	24018277	rs10917413	C	G	5467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=98;PP=2965;SC=ATAAGGCCCTCGGCCGGAAGC;SOR=1.029;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=170;WE=24018285;WS=24018267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	24077451	rs2235541	C	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.754;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=823;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TGGAAAGCCACGGGGAGCCGA;SOR=0.579;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=51;WE=24077459;WS=24077441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr1	24083649	rs2076346	T	C	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.833;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=1.074;SC=CAAATATTATTTCAGCACTAG;SOR=0.411;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=32;WE=24083657;WS=24083639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr1	24106510	rs3831910	A	AT	1334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1472;SC=GAATAGTATCATTTTCTTCTT;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=36;WE=24106518;WS=24106500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	24119627	rs2232982	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=-0.985;SC=CCTTTTCTCCCGTCCCTCCTA;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=31;WE=24119635;WS=24119617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr1	24122986	rs760941	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=18;NR=6;PP=402;SC=GTGGGTGGGGCGGGGGGGCCT;SOR=2.066;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=24;WE=24122994;WS=24122976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	24133612	rs1018396	G	A	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=41;PP=1581;SC=TGTCCTGAGCGTGATCAGGAT;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=74;WE=24133620;WS=24133602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	24134721	rs719400	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=42;PP=1781;SC=TGACAGCAGATAGCATGTCTT;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=78;WE=24134729;WS=24134711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	24143932	rs2076344	A	G	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1112;SC=TTTCATCCCTAGAGAAAGGCC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=24143940;WS=24143922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	24194770	rs61996282	C	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ATCCCCGGAGCCCGCATCGCT;SOR=0.425;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=16;WE=24194778;WS=24194760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	24200903	rs2229586	G	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=6;PP=575;SC=TCAGCAAAAAGGGGTCCGTGT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=24200911;WS=24200893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	24200921	rs2229585	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=816;SC=TGTCTAGGTGTCTGGGACTGG;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=24200929;WS=24200911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	24200969	rs2229584	T	C	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=22;PP=1247;SC=CCTCTCTCTCTTCCAGGGAGT;SOR=1.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=24200991;WS=24200959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	24200983	rs2229583	C	T	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=25;PP=1330;SC=AGGGAGTGAACTGATTTCTGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=24200991;WS=24200959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	24201094	rs2229581	G	C	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=32;PP=1730;SC=CCTCTGTCTCGGTGACTGAGG;SOR=1.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=81;WE=24201102;WS=24201084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	24201109	rs2229580	C	T	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=34;PP=2256;SC=CTGAGGATCTCGGGGCTTCTT;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=95;WE=24201117;WS=24201099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	24201262	rs2502993	A	G	6804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=97;PP=2965;SC=TGGAGCAGAAAGCAAAGGCCT;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=189;WE=24201270;WS=24201252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	24201357	rs4649124	A	G	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=71;PP=2965;SC=AGCACAGCCAACACTAGCCCT;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=132;WE=24201365;WS=24201347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	24201448	rs3003336	C	T	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=62;PP=2686;SC=ACAAGCTGGCCACATGCTGAT;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=126;WE=24201456;WS=24201438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	24201643	rs2501431	G	A	2915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=44;PP=1937;SC=CCCACATGATGCCCAGGGTCA;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=24201651;WS=24201633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	24201919	rs2502992	TT	CC	6327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=61;PP=2947;SC=TCCGGCGGAGTTGGTGGGAGG;SOR=0.996;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=104;WE=24201928;WS=24201909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	24298212	rs375094442	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.55;MQRankSum=-1.036;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.645;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	24383819	rs7540491	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=1.338;SC=CTGGTCCATGTAGACTAGACT;SOR=0.495;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=24383827;WS=24383809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	24387822	rs7553075	T	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=897;ReadPosRankSum=1.562;SC=CAGAGGAGAATGGGGGCCATC;SOR=0.618;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=51;WE=24387830;WS=24387812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr1	24388371	rs4649168	T	C	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=8;PP=799;SC=ACTGACCCAGTGTGCCCAGAC;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=24388379;WS=24388361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	24388417	rs11811060	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=310;ReadPosRankSum=-1.211;SC=TTCCCTGCAGACATAGGTGGA;SOR=0.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=23;WE=24388425;WS=24388407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr1	24388679	rs3795303	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TCCTCTCCTCTGGTTTTGTTT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=24388687;WS=24388669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	24389509	rs67138023	GAA	G	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.420;NF=4;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.055;SC=TGGGGGACCAGAAACTCTGCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=24389518;WS=24389501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	24392600	rs6682222	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=916;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CACATACCATGTGTCTCCTCT;SOR=0.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=63;TCR=63;TR=59;WE=24392608;WS=24392590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr1	24392671	rs6699525	T	C	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1286;ReadPosRankSum=-1.487;SC=GATCCCTGCCTTACTCTATTT;SOR=0.543;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=75;WE=24392679;WS=24392661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr1	24392796	rs10903076	C	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=545;ReadPosRankSum=1.430;SC=CTGCCCCATCCGGGTCAAGCA;SOR=0.784;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=32;WE=24392804;WS=24392786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr1	24393563	rs16829071	C	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=927;ReadPosRankSum=0.501;SC=CTGCAACGGCCGCTCAAAATA;SOR=0.513;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=64;WE=24393571;WS=24393553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,75:0.41:185
chr1	24393729	rs11249090	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.354;NF=7;NR=20;PP=557;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GGGTGAGGCAGGGGCGGTGCT;SOR=0.264;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=27;WE=24393737;WS=24393719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	24394424	rs7542151	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=627;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CGAACCAGTGGCCAGGGATTT;SOR=0.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=47;WE=24394432;WS=24394414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,57:0.39:148
chr1	24394673	rs12125641	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=58;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CGGGGCAGGGCGGGGCAGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=5;WE=24394681;WS=24394663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr1	24395003	rs6660675	T	G	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=106;SC=AACCCTCTGCTGCTCCCCCCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=24395011;WS=24394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	24400584	rs6660949	G	C	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=21;PP=1372;SC=TTGCTGACCTGTGTGGGCATT;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=24400592;WS=24400574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	24400633	rs10903083	C	G	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=42;PP=1807;SC=TGGCAGGGAGCGGGGTAGGTG;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=24400641;WS=24400623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	24409165	rs4320728	C	T	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=729;ReadPosRankSum=-1.825;SC=TGACACAAAACTCGTACTCCT;SOR=0.587;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=44;WE=24409173;WS=24409155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr1	24416059	rs4393101	T	C	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=13;PP=1262;SC=TGGTGCTCTGTCCCGGGGGCT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=24416078;WS=24416049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	24416070	rs7533060	G	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CCCGGGGGCTGGGCTCCTCCC;SOR=0.215;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=31;WE=24416078;WS=24416049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr1	24416628	rs72648548	T	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,53:0.43:124
chr1	24418768	rs7556176	T	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=520;ReadPosRankSum=-1.863;SC=GGACGTTCAGTGGGGAGCCTG;SOR=0.537;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=46;WE=24418776;WS=24418758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
chr1	24419496	rs4233050	A	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=904;ReadPosRankSum=0.133;SC=CACCCGGACCATGTAGAGCCC;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=72;WE=24419504;WS=24419486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr1	24421334	rs6678411	G	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=572;ReadPosRankSum=0.022;SC=CAGGACTGGGGGTCCTTACCA;SOR=0.843;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=30;WE=24421342;WS=24421324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	24421474	rs6678540	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=648;ReadPosRankSum=0.192;SC=GGGGCCAAACGTCGATCCTGG;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=46;WE=24421482;WS=24421464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr1	24421875	rs11249143	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=285;ReadPosRankSum=0.253;SC=CTGTGGGGGTCGGGGAGCAAA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=16;WE=24421883;WS=24421865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	24421950	rs4319261	C	G	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=702;ReadPosRankSum=-1.026;SC=ATCTCTGAATCGAAGCCAGCA;SOR=0.552;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=42;WE=24421958;WS=24421940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr1	24434595	rs11249170	T	C	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=797;ReadPosRankSum=1.461;SC=TAAATGGCTCTTGCAGGATTG;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=54;WE=24434603;WS=24434585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,84:0.57:147
chr1	24434717	rs11447181	T	TC	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.097;NF=0;NR=4;PP=80;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CAAGGCTGCATCCCCCCGACC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=24434725;WS=24434707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	24447214	rs3795300	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=2.141;SC=AGTGTGTGGCGTGGGCAGGCA;SOR=1.255;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=22;WE=24447222;WS=24447204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	24447468	rs3795299	G	C	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=761;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GAACATGGACGGGAAGGAGGT;SOR=0.667;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=45;WE=24447476;WS=24447458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr1	24448084	rs17852648	G	A	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1823;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GAGCTCCTGCGGGCTCCCTGG;SOR=0.580;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=80;TCR=101;TR=101;WE=24448092;WS=24448074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,118:0.54:219
chr1	24465113	rs10903022	C	T	5707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=94;PP=2965;SC=GGGTGCCCTCCGGCCCGCTGT;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=83;TCR=94;TR=177;WE=24465121;WS=24465103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	24484441	rs946671	A	G	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=39;PP=1089;SC=CATAATTATCATCATCTGAAT;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=24484449;WS=24484431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	24485518	rs10751769	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=5;PP=604;SC=CCCCACCTGCTGCACACCCCC;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=24485526;WS=24485508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	24485813	rs4649194	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=498;SC=AACCAAGGTTTGGGGCATTAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=24485821;WS=24485803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	24485941	rs4649195	T	C	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=27;PP=1556;SC=AAAGTTTCTCTTTCTGCACCA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=24485949;WS=24485931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	24486216	.	GT	G	178	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=58.66;NF=0;NR=8;PP=178;QD=23.75;SC=ATGGTAGGGTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=24486224;WS=24486206;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,8:0.42:19
chr1	24513768	rs4090311	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	24649416	rs1324663	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=0.783;SC=GGACCCAGACCTGGTTCAGGC;SOR=0.144;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=11;WE=24649424;WS=24649406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	24657860	rs2486669	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=408;ReadPosRankSum=0.556;SC=GCGGCTGCCCATTCACGGACC;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=30;WE=24657868;WS=24657850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
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chr1	24662903	rs12062028	G	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=436;ReadPosRankSum=0.447;SC=CAGTTGCCTTGCACTCTAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=20;WE=24662911;WS=24662893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr1	24668667	rs11576645	C	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=844;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGAAGGGTGTCCCCCTGAACC;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=52;WE=24668675;WS=24668657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr1	24668842	rs4648974	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=307;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TCCTCCTAGCTTCTCTGGGTT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=17;WE=24668850;WS=24668832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.72;NF=0;NR=2;PP=76;QD=72.5105488636;SC=ACACCTGTGCACCCTCCACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=24671488;WS=24671454;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
chr1	24673866	rs6691722	A	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=564;ReadPosRankSum=-0.221;SC=AGCAGAAGTCAATCTTCAAGT;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=39;WE=24673874;WS=24673856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr1	24680915	rs12030057	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GCAACCACGTCGCCTTCCTGC;SOR=0.945;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=36;WE=24680923;WS=24680905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr1	24687653	rs532147	T	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-1.006;SC=GTCACGGCACTGGGGCAGAGC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=24687661;WS=24687643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	24690676	rs6694170	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.148;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=590;ReadPosRankSum=0.033;SC=TTCTTCCAGGGAAACTTCTCT;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=38;WE=24690684;WS=24690666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr1	24695749	rs35671964	C	G	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.692;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=875;ReadPosRankSum=1.262;SC=TTTTATGTTACAAAAATAGAA;SOR=1.127;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=53;WE=24695757;WS=24695739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr1	24706113	rs3765428	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=298;ReadPosRankSum=0.105;SC=AATTCGATCTGTATTTAGCAA;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=19;WE=24706121;WS=24706103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	24706269	rs1064842	A	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=871;ReadPosRankSum=0.055;SC=TAGTGTATGCATTCGCTGCAG;SOR=1.108;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=63;WE=24706277;WS=24706259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr1	24706292	rs1142057	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.788;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=710;ReadPosRankSum=0.481;SC=TATTTAGAAATGATGGTGTCC;SOR=0.993;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=53;WE=24706300;WS=24706282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,70:0.45:154
chr1	24706410	rs3765431	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=166;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AAGGTCTAAATGCATTTTATA;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=15;WE=24706418;WS=24706400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	24706438	rs3835230	A	AG	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=238;ReadPosRankSum=2.176;SC=AAACTCTGGCAGTAACAATGA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=24706446;WS=24706428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	24718075	rs2294520	T	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=768;ReadPosRankSum=0.075;SC=ATCTCTTGGCTTGACTATTGA;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=48;WE=24718083;WS=24718065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr1	24727678	rs2078445	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-1.691;SC=CCTAAAGCCACCTATTTGGTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=24727686;WS=24727668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	24746205	rs12125143	C	T	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.001;SC=CATTGGCTAACAGATATGTAT;SOR=0.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=219;TCF=98;TCR=121;TR=95;WE=24746213;WS=24746195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,102:0.41:250
chr1	24768778	rs4648863	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CAGAGTGCCAGCGCCAGGATC;SOR=1.802;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=24768786;WS=24768768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	24779855	rs2272934	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=283;ReadPosRankSum=0.125;SC=TCTCGCCTACTTCTGTGGTCC;SOR=1.721;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=16;WE=24779863;WS=24779845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	24784139	rs10903089	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=1.876;SC=AAGAGGCTAGAAAGTGGCGGA;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=14;WE=24784147;WS=24784129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	24784197	rs195718	T	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=478;ReadPosRankSum=-2.830;SC=ATGCCCTCACTGCTCTGCTCT;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=32;WE=24784205;WS=24784187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr1	24785393	rs2272935	C	T	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TGAGTCAAGCCTCACAGATGT;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=68;WE=24785401;WS=24785383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,78:0.57:136
chr1	24792617	rs195725	T	A	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AAAAATGAGATCGAGAAACAG;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=85;TCR=112;TR=101;WE=24792625;WS=24792607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,116:0.50:230
chr1	24840768	rs196403	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.022;SC=TTTGGTCTTCGGAGTTTTACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=24840776;WS=24840758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	24859617	rs196429	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=365;ReadPosRankSum=-2.070;SC=ATCTCCTGCCGCCCCAGCCTG;SOR=0.262;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=25;WE=24859625;WS=24859607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr1	24859665	rs196430	G	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=599;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CCTCTCCCCCGGTGGGGTGGA;SOR=0.670;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=42;WE=24859673;WS=24859655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr1	24861704	rs196432	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=532;ReadPosRankSum=-0.928;SC=TTGCCCAGACGAGGCGCCCCG;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=34;WE=24861712;WS=24861694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr1	24922056	rs12353957	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=384;ReadPosRankSum=1.687;SC=ACCAGTGTCATGGTCATAGTG;SOR=0.919;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=26;WE=24922064;WS=24922046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr1	24922129	rs10903095	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=0.055;SC=GTTCTGCCACGTGCCAACTGC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=24922137;WS=24922119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	24989762	rs4649011	G	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=34;PP=1151;SC=GTCAAAAATTGTAGTGACTTA;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=24989770;WS=24989752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	25098245	rs9332415	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=946;SC=ATTGGGGTTTTGTAACTAGCT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=25098253;WS=25098235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	25098341	rs7548438	C	T	4300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=62;PP=2835;SC=GGTTCAAGTCCTATGTGTATC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=138;WE=25098349;WS=25098331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	25153692	rs4649022	G	A	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=53;PP=1791;SC=TTATAAATGAGTACTTTAGAG;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=94;WE=25153700;WS=25153682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	25234062	rs34878696	T	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=0.447;SC=CACAGAGGTTTTCAAAAGACT;SOR=0.820;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=25234070;WS=25234052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	25254317	rs7517302	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GCAGCTCCCCCAGGTCCCAGG;SOR=0.578;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=14;WE=25254325;WS=25254307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	25255982	rs75012901	C	T	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.805;SC=GTCTCGGGCACCTCCCATCCC;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=74;WE=25255990;WS=25255972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr1	25256444	rs71514255	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.577;SC=CTCGGCCGCCGCTGCCGCGAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=25256452;WS=25256434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	25291010	rs6672420	A	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=680;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CTCACCGCGGATGAAGGTCGG;SOR=1.118;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=45;WE=25291018;WS=25291000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr1	25350186	rs416365	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CCTAGGCCATGTGATGCCAGA;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=25350194;WS=25350176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	25570081	rs1043879	T	C	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1165;ReadPosRankSum=0.191;SC=GGTAGGTTTTTCATTGGGATT;SOR=0.664;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=71;WE=25570089;WS=25570071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,85:0.55:155
chr1	25570550	rs5773124	A	AT	303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=2;PP=211;SC=TAGATACAGCATTTTTTTTTT;SOR=3.767;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=12;WE=25570558;WS=25570540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	25611035	rs2301153	G	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=16;PP=1502;SC=CTTCCCCCTCGTCCTTCTCGC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=25611043;WS=25611025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	25678002	.	TA	T	154	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=60.98;NF=9;NR=3;PP=154;QD=13.1666666667;SC=CCTGTATCTTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=25678010;WS=25677992;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,12:0.57:21
chr1	25678238	rs3093616	T	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=54;PP=1668;SC=TTAAGATGAGTATTTCACATG;SOR=1.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=25678246;WS=25678228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	25780668	rs34006994	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=541;ReadPosRankSum=-0.675;SC=AAGTTACTGTCGTCAAATTAG;SOR=0.999;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=27;WE=25780676;WS=25780658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr1	25780889	rs141203814	A	ATG	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQ=59.98;MQRankSum=0.986;NF=0;NR=11;PP=798;ReadPosRankSum=1.233;SC=TATTACATAAATGTATGTGTG;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=25780901;WS=25780879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	25780893	rs61775167	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.605;NF=0;NR=14;PP=793;ReadPosRankSum=1.481;SC=ACATAAATGTATGTGTGTGTG;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=14;WE=25780901;WS=25780879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	25780929	.	ATGTG	A	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MMLQ=26;MQ=59.48;NF=0;NR=7;PP=106;QD=15.5714285714;SC=ATGTATATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=25780940;WS=25780919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,7:0.64:11
chr1	25785451	rs35530120	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=445;ReadPosRankSum=-0.146;SC=ACATACTCCCATATGGGCCTG;SOR=0.709;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=23;WE=25785459;WS=25785441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr1	25889342	rs10687390	CAG	C	1413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=1159;SC=CTTCACCGCTCAGAGTCTCGG;SOR=3.193;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=25;WE=25889351;WS=25889332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	25889422	rs12096438	C	T	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=12;PP=793;SC=AACTGACATCCGAAAGGTTTC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=25889430;WS=25889412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	25889632	rs6687605	T	C	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.17;NF=14;NR=30;PP=1094;SC=CTGCACCCCCTCCTTGAAGAG;SOR=1.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=44;WE=25889640;WS=25889622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	25889672	rs6688931	G	A	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=19;PP=557;SC=AGGGGGATTGGCCATGCGGTG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=25889680;WS=25889662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	25890050	rs6661159	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=17;PP=1936;SC=GGCCTGGGCAAGGCCACATCA;SOR=2.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=82;WE=25890058;WS=25890040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	25890189	rs28969504	A	G	7227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=119;PP=2965;SC=TAGAGGAGACAGCTAAGGCCC;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=109;TCR=119;TR=228;WE=25890197;WS=25890179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr1	25890247	rs41291058	C	T	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=1684;ReadPosRankSum=0.058;SC=CGAGGTGCCGCGGCCACAAGC;SOR=0.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=101;TCR=110;TR=107;WE=25890255;WS=25890237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,120:0.50:239
chr1	26085048	rs11321223	AG	A	3870.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=12;PP=2974;SC=GCCTGGCCAAAGGGGGGATGA;SOR=4.209;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=123;TCF=103;TCR=20;TR=103;WE=26085056;WS=26085038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	26090072	rs807270	A	G	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=37;PP=1711;SC=GTTGGGTGGGATAGGAGTCGG;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=26090080;WS=26090062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	26098107	rs2072747	G	A	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=8;PP=1241;SC=GAGAGCCGGCGGCAGATGGAG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=54;WE=26098115;WS=26098097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	26098333	rs807264	G	A	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=54;PP=1739;SC=GCCGAGCGAGGGTGCTGCGGG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=26098341;WS=26098323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	26107688	rs807273	C	A	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=53;PP=2858;SC=TGGCTTGGGCCTGGAGTGGAA;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=139;WE=26107696;WS=26107678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	26107904	rs200524555	AGCACCACGCAG	A	645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.953;NF=0;NR=16;PP=2976;ReadPosRankSum=-0.028;SC=AGCTGCCTAGAGCACCACGCA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=16;WE=26107922;WS=26107894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	26109237	rs12567324	A	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=64;PP=1825;SC=TGGGAGGTTGAGGGTAGGGGT;SOR=2.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=81;WE=26109245;WS=26109227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	26110065	rs3820514	A	G	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=28;PP=2107;SC=GCCTATCACAAAGGCCCTGAG;SOR=1.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=92;WE=26110073;WS=26110055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	26110143	rs3767877	G	A	5492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.295;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=1.141;SC=CCTGCCCTGCGTGGGGCACAG;SOR=0.447;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=160;WE=26110151;WS=26110133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr1	26110298	rs116631146	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.863;NF=4;NR=19;PP=371;ReadPosRankSum=0.886;SC=TCCTGCCGCCGCCCTGGGGCC;SOR=0.983;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=23;WE=26110306;WS=26110288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr1	26127020	rs13373825	G	A	176.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.10;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	26127425	rs6659086	G	A	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=740;SC=CACTGGGAGAGCTCAGGAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=26127433;WS=26127415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	26131654	rs7349185	G	A	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=5;PP=677;SC=GCGGCCAGCTGCGAGGAGGAG;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=26131662;WS=26131644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	26137817	rs74753273	G	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=1.248;SC=CTGAGAGCAGGTGTTCACCTT;SOR=0.821;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=18;WE=26137825;WS=26137807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr1	26138136	rs760598	C	A	6972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.04;NF=124;NR=98;PP=2965;SC=CCTGAGGATTCTTGCCCATCT;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=124;TCR=98;TR=222;WE=26138144;WS=26138126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr1	26138262	rs760597	T	C	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=96;PP=2965;SC=GCCACCTGCCTTCAGGGGAGC;SOR=1.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=50;TCR=96;TR=146;WE=26138270;WS=26138252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	26139096	.	ACTTG	A	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-0.921;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.594;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	26139137	rs10902685	C	T	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=595;SC=GGACCCTGGCCGCTTTGATGA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=26139145;WS=26139127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	26139392	rs3738451	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=26;PP=839;SC=TGAGGGCCTCAGGGACTGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=26139400;WS=26139382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	26139444	rs10751726	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=333;SC=TTTCTGTGCTGAGCCCAGAGG;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=26139452;WS=26139434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	26139919	rs6676509	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=466;SC=AGTACAAGCACGGTGAGTGTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=26139927;WS=26139909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	26140573	rs2294228	C	A	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=62;PP=2256;SC=CACAGAACAACCAGGAGAACT;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=120;WE=26140581;WS=26140563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	26146884	rs984412	C	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=53;PP=2105;SC=AGGCGGCGAGCACTTGGCCGA;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=93;WE=26146892;WS=26146874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	26150023	rs11247758	C	T	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=26;PP=1650;SC=TAGAGAGTGCCCTGTCCCTAG;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=66;WE=26150031;WS=26150013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	26152666	rs6598923	T	C	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=11;PP=1014;SC=AGGAACCTTCTTCTGCCCCCT;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=26152674;WS=26152656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	26152758	rs6598924	A	G	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=48;PP=2129;SC=TCATCATGGCATCTGTAAATG;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=113;WE=26152766;WS=26152748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	26162313	rs34449716	T	G	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TGAAACACTCTTCTGGTCACT;SOR=0.738;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=67;WE=26162321;WS=26162303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
chr1	26310394	rs2275102	A	G	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=20;PP=1043;SC=GTAGGGAGAGAACAGGCTCAT;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=26310402;WS=26310384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	26314564	rs2245979	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=364;SC=AAAGGCCTTCTGGGGAAGGTG;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=26314572;WS=26314554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	26349245	rs35744844	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=877;ReadPosRankSum=0.924;SC=CATTGCCTCCCAGACCTCGGC;SOR=0.632;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=53;WE=26349253;WS=26349235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr1	26349967	rs1938405	C	T	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=45;PP=1338;SC=CTGGAATAGACGCAAGCCCAA;SOR=1.209;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=72;WE=26349975;WS=26349957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	26357178	rs35238823	A	AC	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=0.187;SC=TGTTTGGGGAACCCCCCCCCC;SOR=0.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=26357186;WS=26357168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	26357656	rs2736831	C	A	8530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=124;PP=2965;SC=AACATCAGCTCACCCCTCACT;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=139;TCR=124;TR=263;WE=26357664;WS=26357646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr1	26357855	rs2802321	A	G	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=48;PP=2794;SC=TCCAAGCCCTAACATTTTTCC;SOR=1.220;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=26357863;WS=26357845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	26358752	rs5773143	T	TA	2755.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=13;PP=2398;SC=TGGATCCAACTAACCCTTCTC;SOR=2.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=56;WE=26358760;WS=26358742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	26361549	rs76140591	G	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=527;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GGGGATGCCGGAGAGGATTCC;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=30;WE=26361557;WS=26361539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	26365374	rs4659404	T	G	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=592;SC=TGGTAGAACATTTGCTGAGGA;SOR=2.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=26365382;WS=26365364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	26365549	rs2997452	C	T	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=34;PP=1580;SC=ACCTGGTTTACAACACAGCTG;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=26365557;WS=26365539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	26372144	rs6686190	A	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=591;SC=CAGGGGTCAGAATCTGGGCTG;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=26372152;WS=26372134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	26383645	rs144384652	CCAGGGGT	C	3588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=2943;SC=ATGCTGGTTTCCAGGGGTCAG;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=52;WE=26383659;WS=26383635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	26487940	rs3748856	A	G	7016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=0.834;SC=CTCACGCCGCACCCCTGCAAC;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=110;TCR=122;TR=230;WE=26487948;WS=26487930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,262:0.99:264
chr1	26496455	rs2232648	C	T	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=24;PP=1337;SC=GCCCCTTGGCCGGCCGGGCTG;SOR=1.320;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=26496463;WS=26496445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	26510439	.	G	A	68	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=68;QD=25.6928031368;SC=CCCCTGCTGCGCCCCCCTAGC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=26510447;WS=26510429;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	26511700	rs2783680	A	G	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=72;PP=2390;SC=ACACAAAAACAGGTAGGCAAG;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=122;WE=26511708;WS=26511690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	26524706	rs9970046	A	G	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=47;PP=2401;SC=GCGTTCATTTACATGACATTT;SOR=0.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=101;WE=26524714;WS=26524696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	26527783	rs6703730	G	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=597;SC=CCAGGGAAGAGGTGGGAGGGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=26527791;WS=26527773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	26528922	rs10902720	C	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=343;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AGGTGAGTAACGGAGGCTGCC;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=20;WE=26528930;WS=26528912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr1	26529121	rs6691747	G	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=556;SC=GCAGAGCCTGGCCAGAGCCCA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=26529129;WS=26529111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	26582091	rs3795686	G	A	8938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=122;PP=2965;SC=CCAAGAACCAGCACAAGTAAG;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=160;TCR=122;TR=282;WE=26582099;WS=26582081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr1	26597435	rs4659419	G	A	3832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=43;PP=2463;SC=TGTGCAATAAGTAGCAGAACC;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=123;WE=26597443;WS=26597425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	26597673	rs11247894	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=410;SC=GGAGGGATACGTGAATTCTTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=26597681;WS=26597663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	26601385	rs3795685	G	A	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=13;PP=1188;SC=GTCCAAGCCAGCGGTGATATT;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=26601393;WS=26601375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	26608649	rs12750420	G	A	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=360;SC=AGCCAGGCCCGCCAGCCGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=26608657;WS=26608639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	26608782	rs34209692	C	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=21;PP=1081;SC=GTTGAGGGGGCGGGTGCTTTA;SOR=1.094;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=26608790;WS=26608772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	26608811	.	TCCAGGACAGGGACTGGGGCCGGGA	T	745	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=19;MQ=62.65;NF=4;NR=10;PP=745;QD=58.7690578064;SC=TGGGACTGGGTCCAGGACAGG;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=14;WE=26608860;WS=26608801;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,14:0.45:31
chr1	26608814	rs6672357	A	G	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.95;QD=46.66;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	26608825	.	TGGGGCCG	T	2917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.02;QD=46.31;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	26608835	.	ACCGGGACCGGGACTGGG	A	2774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.947;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.96;MQRankSum=0.366;QD=41.41;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr1	26609259	rs7522905	C	T	6377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=115;PP=2965;SC=GGGGTGCCGGCGTGTTGGGTG;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=90;TCR=115;TR=205;WE=26609267;WS=26609249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	26609307	rs6598952	G	T	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=89;PP=2910;SC=CCATCAGCACGCGGTGACCCA;SOR=1.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=49;TCR=89;TR=138;WE=26609315;WS=26609297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	26610891	rs4332350	A	C	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=51;PP=1758;SC=CTTGTGCATCAGCTGCCTGCC;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=26610899;WS=26610881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	26612042	rs11247898	A	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=25;PP=946;SC=GCTGCAAGGGAAGAGGAAAAG;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=26612050;WS=26612032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	26620846	rs3832184	C	CA	3468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=61;PP=2966;SC=GGGGGAGATGCGGGGCACCGT;SOR=2.007;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=9;TCR=63;TR=69;WE=26620854;WS=26620836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	26627478	rs2276712	T	C	11652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=170;PP=2965;SC=TCTTTTCTTCTGAGCCACACC;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=351;TCF=181;TCR=170;TR=351;WE=26627486;WS=26627468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,437:1.00:437
chr1	26629465	rs11803933	G	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=405;SC=CCAAGCCCAGGGGGTAGCCTG;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=26629473;WS=26629455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	26646726	rs1071849	A	G	6785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.35;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	26646730	rs17645	A	G	6785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.24;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	26648551	rs11247913	G	C	7399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=99;PP=2965;SC=CGGCCTCCTGGGGGTGGGATG;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=222;WE=26648559;WS=26648541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr1	26654937	rs11589684	G	C	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=65;PP=2180;SC=TTCTCCCATGGAGGGATTCCT;SOR=1.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=26654945;WS=26654927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	26662774	rs7517559	C	T	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=71;PP=2965;SC=GGGAAAGGTCCGAAATGAGGG;SOR=1.184;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=112;TCR=72;TR=183;WE=26662782;WS=26662764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	26662904	rs72649360	C	T	5515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=101;PP=2965;SC=GGGTGCCGGCCCCTAGCCTTG;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=62;TCR=101;TR=163;WE=26662912;WS=26662894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	26664219	rs4072445	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=747;SC=CCCAGCCAGCTCAGGAATGGC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=26664227;WS=26664209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	26670444	rs36024412	G	T	4197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=60;PP=2617;SC=TCCAAGACGGGAAGTGGGCCT;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=130;WE=26670452;WS=26670434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	26670609	rs34370465	C	T	5906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=72;PP=2965;SC=CTCCTGCCTGCGCTGGAGCTT;SOR=0.987;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=101;TCR=72;TR=173;WE=26670617;WS=26670599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	26671505	.	AACCTCTTTCCAGGTGGGAAATGAGGCATCAGGAGCACCGGGGCCCTTCACG	A	2134	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=15;MQ=57.49;NF=12;NR=29;PP=2134;QD=52.9024390244;SC=GGCCCTTCACAACCTCTTTCC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=41;WE=26671563;WS=26671483;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,41:0.72:57
chr1	26671522	.	GAAATGAGGCATCA	G	3296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.66;QD=45.79;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	26671538	.	AGCAC	A	3358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.63;QD=46.01;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	26671544	.	GGGGCCCTTCACGACCTCTTTCCAGGTGGGGAACA	G	3271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.60;QD=44.82;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	26689659	rs11247932	G	A	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=73;PP=2620;SC=AGTCAGATGCGGGATAAATGC;SOR=1.146;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=47;TCR=73;TR=120;WE=26689667;WS=26689649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	26691174	rs11247933	C	A	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=88;PP=2965;SC=CATGCCACCACGCTCCAGGCC;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=159;WE=26691182;WS=26691164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	26699048	rs77100517	C	T	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=847;ReadPosRankSum=0.879;SC=TCTGCCAGCTCTGCCCTCTCC;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=59;WE=26699056;WS=26699038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,82:0.57:145
chr1	26700795	rs7520030	T	C	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=55;PP=1875;SC=CCAGCTGTGCTCCCTCCTGGC;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=99;WE=26700803;WS=26700785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	26752992	rs4659441	T	C	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=48;PP=1237;SC=CAGGAAGTTTTGAGGAGCAGG;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=26753000;WS=26752982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	26801229	rs72651510	C	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=291;ReadPosRankSum=-0.663;SC=AATTTAATTGCCCTTTTCTTG;SOR=1.119;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=23;WE=26801237;WS=26801219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr1	26856462	rs11800553	T	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=16;PP=481;SC=AGCTAGTGCCTCTGGACCCGG;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=26856470;WS=26856452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	26869610	rs921893	G	A	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1044;ReadPosRankSum=0.208;SC=AGCAGAAGTAGGAAGAGTAAC;SOR=0.985;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=163;TCF=106;TCR=57;TR=69;WE=26869618;WS=26869600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,76:0.40:191
chr1	26872640	rs116133745	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=0.651;SC=GCCTGGCCCTGCAGGGTGACT;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=14;WE=26872648;WS=26872630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	26879920	rs4970490	T	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=42;PP=2433;SC=TTTACCTGGCTGAGCTGGCTC;SOR=1.413;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=26879928;WS=26879910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
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chr1	26883511	rs2229712	A	C	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=66;PP=1761;ReadPosRankSum=0.385;SC=CGTGAGATCAAGCCACCCTTC;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=290;TCF=156;TCR=134;TR=136;WE=26883519;WS=26883501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,157:0.45:348
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chr1	26900735	rs282179	C	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=524;ReadPosRankSum=2.119;SC=TAGCTTGACACAGTCAGCATG;SOR=0.799;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=30;WE=26900743;WS=26900725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr1	26901090	rs11113	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-1.977;SC=GGGACCCCCACGATTGGCCAC;SOR=0.197;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=26901098;WS=26901080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	27106169	.	C	G	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GAGGATGGAGCTAAGAGTTCA;SOR=1.115;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=103;WE=27106177;WS=27106159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,108:0.51:213
chr1	27107135	.	C	G	8653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=131;PP=2965;SC=GAGAACCACTCAGAGTTTACT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=128;TCR=131;TR=259;WE=27107143;WS=27107125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr1	27320356	rs6689941	T	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=29;PP=968;SC=GCCGCCGCCCTGGGATCCCAT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=27320364;WS=27320346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	27426796	rs4266911	T	C	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=27;PP=1424;SC=CTGGCCCTGGTGTTACTGCCC;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=27426804;WS=27426786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	27427041	rs4418629	T	C	6293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=108;PP=2965;SC=CCTTCAGCTCTTCATTCACCA;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=85;TCR=108;TR=193;WE=27427049;WS=27427031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	27428321	rs6598870	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=496;ReadPosRankSum=0.722;SC=ACCGCAGCTGTGGGAGGGACA;SOR=0.455;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=50;WE=27428329;WS=27428311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr1	27435976	rs3738689	C	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=254;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CAGCCCCCGCCCCCACCCCGC;SOR=0.363;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=21;WE=27435984;WS=27435966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr1	27480757	rs34306208	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=992;ReadPosRankSum=0.803;SC=CCACCAAAGCAACCACCACGA;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=67;WE=27480765;WS=27480747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
chr1	27609980	rs6670124	T	G	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=67;PP=2177;SC=AAGCCACAGATCAAGCACAAG;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=110;WE=27609988;WS=27609970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	27610043	rs41291064	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=1.181;SC=CCATATACCGTCTAGGGTCAC;SOR=0.573;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=9;WE=27610051;WS=27610033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	27660340	rs12758154	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=194;ReadPosRankSum=1.165;SC=TTACTGTACATCTCAGCACCC;SOR=0.264;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=13;WE=27660348;WS=27660333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	27660568	rs35771571	G	A	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=33;PP=1569;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGGCGGCACCGGCACTCCCCA;SOR=0.564;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=173;TCF=116;TCR=57;TR=94;WE=27660576;WS=27660558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,106:0.54:195
chr1	27661037	rs12565684	T	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=642;ReadPosRankSum=1.805;SC=TGGTCTCTCTTAGCCACAGCT;SOR=2.584;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=28;WE=27661045;WS=27661027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	27661755	rs71294466	T	TGTA	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.965;NF=9;NR=1;PP=347;ReadPosRankSum=0.032;SC=AGGGGGTGGTTGGGTTTTCCT;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=27661763;WS=27661745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	27676504	rs149208728	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=580;ReadPosRankSum=0.266;SC=ACGCGGAGGCGGTGCAGGTCC;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=35;WE=27676512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr1	27676925	rs6702341	G	A	4246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.02;MQRankSum=1.110;NF=85;NR=78;PP=2397;ReadPosRankSum=-1.384;SC=GCAAGCGCAAGACGGCGGTGA;SOR=0.652;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=378;TCF=184;TCR=194;TR=163;WE=27676933;WS=27676915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,206:0.45:458
chr1	27679692	rs11247639	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=462;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CATATGTGAGAGAGAATGAGT;SOR=1.565;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=23;WE=27679700;WS=27679682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr1	27679797	rs3813795	A	G	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1403;ReadPosRankSum=1.844;SC=GATGACAGCCAGGCCAGCCGC;SOR=1.028;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=198;TCF=107;TCR=91;TR=101;WE=27679805;WS=27679787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,118:0.52:225
chr1	27679954	rs1128918	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=708;ReadPosRankSum=1.353;SC=GCCAGCTGGGGGGCACACGCC;SOR=0.487;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=40;WE=27679962;WS=27679944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr1	27680292	rs8533	A	G	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=31;PP=1438;SC=AGCCGTGCGAATGGGTGGATG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=27680300;WS=27680282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	27684396	rs4970520	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=1.663;SC=TGCTGATTGAGGACGGGCAGC;SOR=0.255;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=8;WE=27684404;WS=27684386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr1	27688633	rs1138294	G	A	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=802;ReadPosRankSum=-2.020;SC=CACCACCTGGGTGGGGTCATT;SOR=0.588;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=55;WE=27688641;WS=27688623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
chr1	27696011	rs10218730	C	T	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=45;PP=1226;SC=CCCAGCACCACGCCTGGCACC;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=27696019;WS=27696001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	27706621	rs142703194	G	A	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1135;ReadPosRankSum=0.174;SC=ACACCAGCACGACACCTCCGA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=74;WE=27706629;WS=27706611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,86:0.51:167
chr1	27875824	rs4908364	C	T	4814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=71;PP=2965;SC=CAGTCTGAAGCGGCTGGAGTT;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=158;WE=27875832;WS=27875814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	27876482	rs2076457	C	A	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.745;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CAGTAAGGCCCGGGCCCCCGA;SOR=0.375;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=75;WE=27876490;WS=27876472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,95:0.57:167
chr1	27877301	rs188125472	G	A	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1319;ReadPosRankSum=1.183;SC=CCGGGCCTGGGCCTGGCAGGG;SOR=0.889;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=82;WE=27877309;WS=27877291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,97:0.51:191
chr1	27944000	rs1292089	T	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=589;SC=GTAGGTGCCCTGCAAAGGTTA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=27944008;WS=27943990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	27995077	rs56015130	G	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=998;SC=CGTAGTGGGGGTGTTGGGGTG;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=27995085;WS=27995067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	28086955	rs10902671	C	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=346;ReadPosRankSum=-1.169;SC=TGAAAAATAGCTTATATCCTG;SOR=1.008;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=22;WE=28086963;WS=28086945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr1	28220311	rs112334256	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.289;SC=TAGAAACGGGGTTTTCACCAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=28220319;WS=28220307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	28240648	rs28988897	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=912;ReadPosRankSum=0.539;SC=CCGGCTCCCCCGTATGAGGAG;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=60;WE=28240656;WS=28240638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,63:0.42:150
chr1	28240992	rs11538306	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=227;ReadPosRankSum=0.248;SC=CGAGAAGGTGCGGGTCTGGGG;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=14;WE=28241000;WS=28240982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr1	28261593	rs3737809	T	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	28261593	.	TCTGCTCA	CCTGCTCA,CCTGCTCC	400	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27,10;NR=13,8;PP=400,250;QD=10.8692803137;SC=GACAAGGAGTTCTGCTCAGGC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40,18;WE=28261608;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:40
chr1	28261600	rs3737808	A	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=9.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr1	28261658	rs3831926	T	TG	2607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=15;PP=2467;SC=CAACAGTGCCTGAGAATCCCA;SOR=2.139;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=55;WE=28261666;WS=28261648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	28261902	rs3737807	C	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=627;SC=AGCTAGTGGGCCTTAGCAAGT;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=28261910;WS=28261892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	28268573	rs10902678	C	T	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=168;SC=CACCCTTCAGCAGTATGTGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=28268581;WS=28268567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	28268706	rs4908341	G	A	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=28;PP=1572;SC=ACGTCAAAGGGGCCAAACTGC;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=28268714;WS=28268696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	28268833	rs11386058	C	CG	3550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=39;PP=1884;SC=AGGGCCTCCCCCAACATCCAT;SOR=1.264;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=44;WE=28268843;WS=28268823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	28268835	rs5018921	A	C	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=38;PP=1238;SC=GGCCTCCCCCAACATCCATCC;SOR=1.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=28268843;WS=28268823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	28282206	rs3813804	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TGTACATTGTCGGCCACGTGC;SOR=1.525;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=14;WE=28282214;WS=28282196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	28282819	rs4908381	T	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1055;SC=CTGTCACAGCTTCATACCTGG;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=28282827;WS=28282809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	28290231	rs4373781	C	G	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=739;SC=GGCTGGCCCCCCTGTCGTGGC;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=28290239;WS=28290221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	28422946	rs77495942	T	G	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.687;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,48:0.42:113
chr1	28832777	.	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	29016716	rs6678913	T	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=69.11;MQRankSum=3.956;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	29016737	.	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=1.465;QD=19.11;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=2.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr1	29138975	rs1042114	G	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=501;ReadPosRankSum=1.130;SC=CCTAGCGCCTGCCCCAGCGCT;SOR=0.543;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=36;WE=29138983;WS=29138965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr1	29189597	rs2234918	C	T	4282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=74;PP=2563;ReadPosRankSum=0.506;SC=TCGCGCTGGGCTACGCCAATA;SOR=0.588;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=300;TCF=169;TCR=131;TR=163;WE=29189605;WS=29189587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,198:0.53:372
chr1	29345009	rs5773229	C	CTT	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=903;SC=AGTTTAAACACAACATGGTAT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=29345017;WS=29344999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	29345027	rs2985334	T	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=298;SC=TATTGGTTCATTGTTTGCCTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=29345035;WS=29345017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	29365746	rs139715164	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=0.742;SC=ATAATATGACTATTACGATTT;SOR=0.084;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=12;WE=29365754;WS=29365736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	29379992	rs2788888	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=198;ReadPosRankSum=-0.381;SC=AAATATTTTCGTAGAGTTATG;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=29380000;WS=29379982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	29385486	rs2153165	G	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GTTGTTAATAGTTTCAAATAA;SOR=0.864;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=14;WE=29385494;WS=29385476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	29439016	rs4654390	T	A	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=747;ReadPosRankSum=-0.075;SC=GGAAGACCGATGAATACAGGA;SOR=0.290;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=43;WE=29439024;WS=29439006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr1	29447699	rs56040456	G	A	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1604;ReadPosRankSum=0.098;SC=GTAACCCCAAGCGAGGATTAG;SOR=0.819;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=210;TCF=108;TCR=102;TR=101;WE=29447707;WS=29447689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,122:0.48:254
chr1	29475341	rs2230678	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=498;ReadPosRankSum=1.340;SC=CTCTTCCTGCCCTTCCTCTTG;SOR=1.101;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=25;WE=29475349;WS=29475331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	29475394	rs2230677	C	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=-1.458;SC=CCTGCTGCCCCCTTTGCTCCT;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=24;WE=29475402;WS=29475384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr1	29475648	rs2230679	T	G	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=48;PP=1562;SC=TGCGGCTCTTTTCCTTGCTGG;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=81;WE=29475656;WS=29475638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	29529699	rs1062924	T	C	5921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=78;PP=2965;SC=TCTGGATGACTGCTTGCCCCA;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=175;WE=29529707;WS=29529689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	29533232	rs12743830	T	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=393;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GGCACCCTAGTTGCGAGACCC;SOR=0.200;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=23;WE=29533240;WS=29533222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr1	29533473	rs12731683	C	A	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=581;ReadPosRankSum=-2.848;SC=CACATTCAACCCCAGCTCACC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=48;WE=29533481;WS=29533463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr1	29542435	rs2640469	C	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=804;SC=CAGGTACACTCGGCCAATCAG;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=29542443;WS=29542425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	29542637	rs1128400	A	G	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=47;PP=1567;SC=TCAGGAAGGAATCCGTAGTTT;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=29542645;WS=29542627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	29542655	rs34620411	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=-0.648;SC=TTTCCTGAGGGAGAAGAGCAT;SOR=0.494;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=24;WE=29542663;WS=29542645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr1	29542677	rs35345653	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=0.017;SC=AAAGGGTCAACCAGTGATGTT;SOR=0.378;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=21;WE=29542685;WS=29542667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr1	29557224	rs2640466	C	T	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1383;ReadPosRankSum=1.697;SC=CCTTCCCCGGCTTCGGCGCCG;SOR=0.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=102;WE=29557232;WS=29557214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,128:0.53:243
chr1	29563059	rs75011501	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=272;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CGCGCCGCTCCGCTCCGGCTC;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=20;WE=29563067;WS=29563049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr1	29563361	rs67702477	T	C	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=70;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GAGCGTAGGATGGGCGATTGT;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=74;TCR=126;TR=108;WE=29563369;WS=29563351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,132:0.54:243
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chr1	29609502	rs111595207	TG	T	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
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chr1	29633491	rs3835409	T	TCAGCC	432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=456;ReadPosRankSum=-0.455;SC=ACTCTGTGGCTCAGCCCAGCC;SOR=0.275;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=9;WE=29633499;WS=29633481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	29637136	rs2235939	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=320;ReadPosRankSum=0.230;SC=CCTAGGGATGTGAGGGAGCAG;SOR=0.133;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=19;WE=29637144;WS=29637126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
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chr1	29652068	rs2076618	T	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=868;ReadPosRankSum=-0.105;SC=ATACTGGAGTTGGGGTCAGGC;SOR=0.803;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=69;WE=29652076;WS=29652058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,85:0.56:153
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chr1	29843442	.	T	TCTTCCTCCTTCTTCCTTCTCCTTCTCCTC	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=-0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.185;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	31186254	rs1188405	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=-0.867;SC=ACACATGCACACATACACACA;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=31186262;WS=31186250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	31188089	rs1065755	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=988;ReadPosRankSum=2.087;SC=CTGCCACAGGCTCTGAGGCTA;SOR=0.548;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=65;WE=31188097;WS=31188079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,74:0.63:118
chr1	31188901	rs20566	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1218;ReadPosRankSum=-2.005;SC=GAGCAGCCCCAGTCATTGTGC;SOR=0.724;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=183;TCF=84;TCR=99;TR=85;WE=31188909;WS=31188891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,92:0.45:204
chr1	31191516	rs10914186	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=1.924;SC=CTCCAGCCCTGGCCCCGCCCC;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=31191524;WS=31191506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	31196255	rs45601237	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=0.875;SC=CAGTGCTGAGGGTCAGGGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=4;WE=31196263;WS=31196245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	31206637	rs3795438	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=538;ReadPosRankSum=0.589;SC=TGAGGCAGCTCCACCCCTCCC;SOR=0.761;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=34;WE=31206645;WS=31206627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr1	31206806	rs3795437	T	C	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TGGTCAAGAATGACCTGCAAT;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=58;WE=31206814;WS=31206796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr1	31206957	rs12404920	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.188;SC=AGTGGACATATTTGCCTTTGC;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=31206965;WS=31206947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	31208042	rs35351292	C	T	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=878;ReadPosRankSum=0.423;SC=CTTGGAGTTTCTCTTCTCCTC;SOR=0.744;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=60;WE=31208050;WS=31208032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr1	31214571	rs199971598	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CAGCTGAAAGGCAAGGAGAGC;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=56;TCR=73;TR=51;WE=31214579;WS=31214561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,62:0.40:155
chr1	31215364	rs1050663	T	C	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=52;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CCACCTCTACTGAGTGCTCGA;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=143;TCR=105;TR=125;WE=31215372;WS=31215354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,149:0.48:308
chr1	31346199	rs1539360	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=706;ReadPosRankSum=0.862;SC=CAAAGAGGGCGCCCACCACCC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=46;WE=31346219;WS=31346189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr1	31349647	rs2491132	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=771;ReadPosRankSum=-1.105;SC=AGCCTCCGTACGCCAGTGGTC;SOR=0.877;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=46;WE=31349655;WS=31349637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr1	31351513	rs1891419	G	A	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GTTCATCATCGGGAAAGGAGT;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=78;WE=31351521;WS=31351503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,92:0.54:171
chr1	31441453	rs150028252	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=33;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TTCCCTATAATGGTTTTTATA;SOR=0.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=31441461;WS=31441443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	31654940	rs2297959	C	T	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=23;PP=718;SC=AGGGTCAGACCCCGTGCAGGG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=31654948;WS=31654930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	31732390	rs6425725	G	A	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	31733782	rs10914338	T	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=26;NR=13;PP=731;SC=GAAGTAAATTTAAAAAAAAAT;SOR=1.201;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=31733790;WS=31733772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	31733926	rs12121460	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=789;SC=AGTGGCTCACACCTGTAATCC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=31733934;WS=31733916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	31740668	rs3753374	C	T	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=47;PP=2351;SC=CACGAGCCACCGCATCCGGCC;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=31740676;WS=31740658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	31744168	rs3737755	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=48;SC=GATGGAATCTGTGAGCAATCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=31744176;WS=31744158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	31744505	rs113021667	A	AT	882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.44;MQRankSum=0.369;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr1	31754511	rs4949374	G	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=592;SC=TAAGCAGTGTGCTCAATTTTG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=31754519;WS=31754501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	31761989	rs1532859	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=7;PP=1087;SC=TGTTATGGGAGATGACTGCTA;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=31761997;WS=31761979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	31762374	rs1532858	C	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=428;SC=CACTGACCTGCTGTGCTACGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=31762382;WS=31762364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	31764693	rs12135540	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=325;SC=CCTGAGAAAGGATGAAAGGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=31764701;WS=31764683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	31764713	rs142762586	C	CAAG	1060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=656;SC=GAAAGGACGCCAAGAATTAGT;SOR=4.804;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=14;WE=31764721;WS=31764703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	31764930	rs10733007	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=31;PP=869;SC=AGTTCTCAGGTCAGGCACGGT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=31764938;WS=31764920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	31792141	rs4949384	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=510;SC=TTTTTAATGTATAGATATGAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=31792149;WS=31792131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	31836759	.	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=79;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TTCCTCCCACCTCGGCTTCCC;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=6;WE=31836767;WS=31836749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	31840426	rs2271072	C	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=590;SC=GGCCACAGAGCACACAGCCTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=31840434;WS=31840416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	31897493	rs1320585	A	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=762;SC=GTTCTGTGAGAGGTGGGGCTT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=31897501;WS=31897483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	31898132	rs4949400	T	C	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=84;PP=2965;SC=CCAGTTTCCCTGCCTGCACTC;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=116;TCR=84;TR=200;WE=31898140;WS=31898122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	31898162	rs4949401	C	T	7071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=117;PP=2965;SC=GTCCATTCCCCGACCCCTTCT;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=117;TCR=117;TR=234;WE=31898170;WS=31898152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr1	31898234	rs4949402	T	C	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=111;PP=2965;SC=CCTTCTACATTCCTGACGGCT;SOR=1.325;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=64;TCR=111;TR=175;WE=31898242;WS=31898224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	31898279	rs4949403	A	C	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=74;PP=2457;SC=GGCAGGAGGCATGGGGGGCTG;SOR=1.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=107;WE=31898287;WS=31898269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	31898536	rs2275435	C	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=339;SC=TCAGTGTCCCCGGTGCAGGGT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=31898544;WS=31898526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	31898687	rs2275434	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=585;ReadPosRankSum=-0.716;SC=TGCTGCTCATCGACTTTGCGC;SOR=1.524;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=34;WE=31898695;WS=31898677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr1	31899684	rs10454445	A	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=963;SC=AGCCTGCCTGACCCCCCCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=31899692;WS=31899674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	31899704	rs10454446	C	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=608;SC=GCCTGAAGCCCGGCCCCTTAG;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=31899712;WS=31899694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	31902127	rs145048820	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=0.237;SC=TGGGACTTGAGTGGTTGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=18;WE=31902135;WS=31902117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	31905889	rs3050461	A	ACAG	5619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.757;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.190;NF=27;NR=32;PP=2101;ReadPosRankSum=0.542;SC=TAGACGCCACACAGCAGCAGC;SOR=0.263;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=59;WE=31905899;WS=31905879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,125:0.98:127
chr1	31906882	rs11587589	A	G	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=35;PP=1893;SC=ACTGGGCACCAGGCTCATGGG;SOR=1.309;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=100;WE=31906890;WS=31906872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	31907102	rs7417775	A	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=681;SC=CTCTCGGCTCAGTGACAGCCA;SOR=2.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=31907110;WS=31907092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr1	31971680	.	C	CA	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=11.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=-1.352;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.958;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	31971684	rs1316427	C	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.25;MQRankSum=-1.352;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	31971701	rs201612393	GC	G	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.54;MQRankSum=4.726;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	31971705	.	C	A	446	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=63.63;NF=7;NR=2;PP=446;QD=53.4190236164;SC=CATTTGGCCCCAGTGGCTTCA;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=31971714;WS=31971695;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,9:0.47:19
chr1	31971706	.	AG	A	438	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=47;MMLQ=28;MQ=63.5;NF=6;NR=2;PP=438;QD=60.125;SC=ATTTGGCCCCAGTGGCTTCAT;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=31971714;WS=31971695;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,8:0.47:17
chr1	31971707	rs35567548	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.19;MQRankSum=4.545;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	31971711	rs72660888	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.25;MQRankSum=-2.251;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr1	31971715	rs72660889	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.25;MQRankSum=-2.090;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr1	32044641	.	G	A	223	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=27;MQ=59.16;NF=12;NR=1;PP=223;QD=19.8285548113;SC=TTCAGTTATAGTTTAATTTCA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=32044649;WS=32044631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	32044641	.	G	GTTTAATTTCAGTGAGAGCTGGTGTGTCTATGTGTGTGTGTGTGTGATGTCTTCAGTTATAA	499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.99;QD=249.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	32045838	.	GTCTC	G	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=54.36;NF=1;NR=2;PP=78;QD=30.3333333333;SC=GTCTCTCTCTGTCTCTCTCTC;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=32045849;WS=32045828;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	32050203	rs78461805	C	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=0.999;SC=ACTTGGTGGCCCTCCAGTGCC;SOR=0.169;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=32050211;WS=32050198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	32084904	rs1056526	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=945;ReadPosRankSum=1.188;SC=ATCTGTGGCGCGATTATCTGT;SOR=0.561;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=187;TCF=87;TCR=100;TR=70;WE=32084912;WS=32084889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,92:0.39:237
chr1	32086912	rs2280386	A	C	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=353;SC=AGGAGGGACAACCCAAGTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=32086920;WS=32086910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	32090725	rs41527749	C	T	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CAGTGGTGAGCAGGCTGGGGA;SOR=0.812;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=73;WE=32090733;WS=32090715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr1	32092525	rs2271933	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=44;PP=1481;SC=CCGATGCTCCATCTCCAAAAT;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=32092533;WS=32092515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	32092610	rs41263963	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=0.226;SC=GCTCCGGCTCGGGGGATCTGC;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=14;WE=32092618;WS=32092600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	32092735	rs2176807	T	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.680;SC=TTGTGTCCCCTAAGCAGGGTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=8;WE=32092743;WS=32092725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr1	32092918	rs141988488	T	TTCC	3050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=1925;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TCCTACCCAATTACAGGCCTT;SOR=0.593;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=93;TCF=19;TCR=74;TR=43;WE=32092926;WS=32092908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr1	32096265	rs1061770	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-0.400;SC=AGCTGAGCCGAATGTTGCCTT;SOR=1.284;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=6;WE=32096273;WS=32096255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr1	32100551	rs3835520	GA	G	2708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=56;PP=2474;SC=ATCCCTGAATGAAAAAGACAC;SOR=1.429;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=66;WE=32100559;WS=32100541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	32110574	rs41263965	G	A	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1301;ReadPosRankSum=1.936;SC=GTCCGCGCCTGTCAATCTTGG;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=158;TCF=55;TCR=103;TR=81;WE=32110582;WS=32110564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,89:0.52:171
chr1	32118160	rs1061392	C	A	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.36;QD=26.79;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	32119347	rs67961612	AACAC	A	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.95;MQRankSum=0.962;NF=6;NR=4;PP=327;ReadPosRankSum=0.232;SC=GATTACTTGAAACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=10;WE=32119358;WS=32119337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	32119431	rs3817398	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.12;MQRankSum=1.022;NF=23;NR=17;PP=560;ReadPosRankSum=0.601;SC=CCCCAAAGAATTACATGTGTC;SOR=0.461;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=40;WE=32119439;WS=32119421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr1	32121224	rs75341435	C	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=0.546;SC=GCCACAGCATCCTGACAGGTC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=10;WE=32121232;WS=32121214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	32122164	rs7545321	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=221;SC=TGTCCAGCCCAGCTCTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=32122172;WS=32122154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	32122779	rs75640130	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5009;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=2.286;SC=CCAGAGGCCACGATCCTCCAG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=32122787;WS=32122769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	32124597	rs16834652	A	G	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=870;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGATAGAAACAGGTTCTAATA;SOR=0.690;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=61;WE=32124605;WS=32124587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr1	32126070	rs11807560	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=722;ReadPosRankSum=0.864;SC=CGTGCTCCCACGGCTGGGGCA;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=51;WE=32126078;WS=32126060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr1	32127911	rs2271927	C	T	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=989;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AAGGGGTGCCCGCCCTCCCAG;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=63;WE=32127919;WS=32127901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
chr1	32127953	rs2271928	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=924;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CAGGCTTGCCGTCCTTCCCAT;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=59;WE=32127961;WS=32127943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,68:0.54:126
chr1	32128140	rs75145224	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-2.125;SC=ACCACACACATGCGCATGCAT;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=15;WE=32128148;WS=32128130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	32128283	rs1568396	C	G	263.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.864;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr1	32131163	rs1356803	C	G	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1371;ReadPosRankSum=0.534;SC=ACAGAGCTGGCTTTGTGTCTT;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=92;WE=32131171;WS=32131153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,114:0.52:219
chr1	32131295	.	C	CGG	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=8;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=2.780;SC=GAAAGAGTGACGGGGGGGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=16;WE=32131303;WS=32131285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	32133891	rs41312022	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=954;ReadPosRankSum=0.511;SC=TAAGAGGATGGCCAAAGCTAA;SOR=0.492;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=72;WE=32133899;WS=32133881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,82:0.49:168
chr1	32134491	rs2271929	C	G	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=52;PP=1493;SC=CTGCAGGAGCCGGCGGTCCCC;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=70;WE=32134499;WS=32134481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	32136168	rs2292990	G	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=25;PP=1411;SC=TGGCTGACGGGGGGGAGGGGA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=32136176;WS=32136158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	32136398	rs1474182	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=498;ReadPosRankSum=-1.993;SC=GAAAGTCTTGGCTCAAAAGAC;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=30;WE=32136406;WS=32136388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	32136413	rs75826603	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=416;ReadPosRankSum=1.878;SC=AAAGACAACTGTTCCTCCCCT;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=25;WE=32136421;WS=32136403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	32138561	rs141225372	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-0.851;SC=TTCCCTCCTCCCACACTCCCT;SOR=1.214;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=18;WE=32138569;WS=32138551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	32140733	rs2292993	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CGTCATGCACCTTCCAGCCTC;SOR=0.275;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=14;WE=32140741;WS=32140723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr1	32145009	rs4949461	C	T	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=18;PP=1191;SC=TGACAGCTGACGCAACAGTGC;SOR=1.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=32145017;WS=32144999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	32146425	rs11590964	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=355;ReadPosRankSum=1.512;SC=CTGCTAATCCCCCAGAGTACG;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=21;WE=32146433;WS=32146415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr1	32148571	rs10737358	A	G	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=28;PP=1501;SC=GAGGTCCCACAGGTCCGGTGG;SOR=1.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=32148579;WS=32148561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	32149721	rs34976864	G	C	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=669;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GGTTTACCAGGTCGGCCCACG;SOR=0.791;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=41;WE=32149729;WS=32149711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr1	32149982	rs10914466	A	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.253;SC=CTAGCAGAGGAGAAGCCCCGA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=32149990;WS=32149972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	32155284	rs2297682	T	C	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=814;ReadPosRankSum=-3.084;SC=TATGATCATGTCCCCAGGTTT;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=56;WE=32155292;WS=32155274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr1	32155911	rs6425780	G	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TCACTGTCATGTGCAGAAAGG;SOR=0.409;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=9;WE=32155919;WS=32155901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	32155929	rs2297681	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=0.736;SC=AGGGGGTCCCGTTCCCACCCC;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=9;WE=32155937;WS=32155919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	32156722	rs10914467	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=406;ReadPosRankSum=-2.086;SC=AAGCTGCCCCGGCCCCTTCTC;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=23;WE=32156730;WS=32156712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr1	32156869	rs10798884	A	T	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=110;PP=2965;SC=TCCAGGGACCACTCGCTACAG;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=117;TCR=110;TR=227;WE=32156877;WS=32156859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	32157531	rs2297676	T	C	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=34;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GGGGGCTGGATTCCCGAAGGT;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=205;TCF=128;TCR=77;TR=96;WE=32157539;WS=32157521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,104:0.43:243
chr1	32158374	rs3818788	T	C	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TTACCTGAAGTGGGGCATCCG;SOR=0.448;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=74;WE=32158382;WS=32158364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,88:0.59:149
chr1	32159588	rs2275097	A	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=282;ReadPosRankSum=-1.301;SC=ACACACACAAACCCCTGCTTT;SOR=0.861;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=21;WE=32159596;WS=32159578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr1	32160918	rs6656079	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=400;ReadPosRankSum=0.496;SC=CATCACACATATCTTGAGTGG;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=26;WE=32160926;WS=32160908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr1	32163950	rs2297674	G	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=280;ReadPosRankSum=0.669;SC=GGTACTGGTGGGCTGGGGACA;SOR=0.539;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=17;WE=32163958;WS=32163940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr1	32164206	rs2228550	T	G	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=521;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GGGAATACTCTTCTGGAGATG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=31;WE=32164214;WS=32164196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	32165495	rs2228552	G	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=976;ReadPosRankSum=0.064;SC=GATGGCAGACGTCTTCATGAG;SOR=0.792;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=58;WE=32165503;WS=32165485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,73:0.45:162
chr1	32167526	rs1815465	G	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=351;SC=CGAAGACACAGGCACACACAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=32167534;WS=32167516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	32193647	rs1127100	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=251;ReadPosRankSum=1.278;SC=TCCGCTCGGCTGCCCCACCCG;SOR=0.772;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=20;WE=32193655;WS=32193637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr1	32266026	rs552124	A	G	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=38;PP=2129;SC=ATTAAATGACATCACTTGTTC;SOR=1.297;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=32266034;WS=32266016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	32280610	rs6664445	T	C	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CTCCCCTGAGTAGGCACCGAG;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=70;WE=32280618;WS=32280600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,95:0.47:200
chr1	32768067	rs74064094	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.282;NF=8;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=1.379;SC=TTTTTTTTTTCTTTTGGAGTT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=32768075;WS=32768057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	32860161	rs547329	T	C	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=40;PP=1210;SC=CATCATTAGGTCCCGCCTCCC;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=32860169;WS=32860151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	33065947	rs704886	G	C	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=68;PP=2965;SC=GATGGGTCTGGTGATCTGGTC;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=143;WE=33065955;WS=33065937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	33117071	rs583114	T	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=26;PP=761;SC=CCGCGGGGCGTGCTAACGGCT;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=33117079;WS=33117061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	33127730	rs1085416	T	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=53;SC=TGCGATCTGCTAGCCTTGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=33127738;WS=33127720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	33133968	rs2762904	T	C	4553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=64;PP=2773;SC=ATGTTCTTGTTTTTGACTATA;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=33133976;WS=33133958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	33134774	rs359955	A	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=38;PP=845;SC=ATCTTGTCTAAGTTTTATGTT;SOR=1.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=33134782;WS=33134764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	33134989	rs359956	A	G	164.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=3;PP=67;SC=TAGAAAACATAATTTCTCTAG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=33134997;WS=33134979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	33160878	rs360042	C	T	6654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=87;PP=2965;SC=CAGCACTTCCCGGAAATCGGC;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=101;TCR=87;TR=188;WE=33160886;WS=33160868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	33161212	rs360041	T	C	10900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=205;NR=155;PP=2965;SC=TTCTCCTCCATGCTGGGGCTC;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=360;TCF=205;TCR=155;TR=360;WE=33161220;WS=33161202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr1	33233323	rs360523	A	G	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=21;PP=1919;SC=CCTTGCCGTGAGACCTGTGCC;SOR=2.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=85;WE=33233331;WS=33233313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	33234136	rs360522	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=3;PP=389;SC=GCGGAGGTTGTGGTGAGCCAA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=33234144;WS=33234126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	33234153	rs3737993	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=244;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CCAAGATTTCGCTACTGCACT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=18;WE=33234161;WS=33234143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr1	33235626	rs3737995	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=640;ReadPosRankSum=1.005;SC=AGGCGGAGGCGGAGGCTGGCG;SOR=0.484;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=45;WE=33235634;WS=33235616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,59:0.42:139
chr1	33235651	rs12730560	A	G	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1094;ReadPosRankSum=0.150;SC=GACAGAGGCCATGCTGCAGCG;SOR=0.483;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=77;WE=33235659;WS=33235641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,102:0.56:183
chr1	33245802	rs699005	C	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=513;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CGAACTGTACCAGGCCGCTCA;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=38;WE=33245810;WS=33245792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr1	33256884	rs1765223	C	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=0.805;SC=ACACAAAAGCCGATATTAGTC;SOR=0.997;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=26;WE=33256892;WS=33256874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr1	33263502	.	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=112;ReadPosRankSum=0.910;SC=GACAGAGTCTCGCTCTGTCGC;SOR=2.683;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=8;WE=33263510;WS=33263492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	33276424	rs4951787	G	A	3009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=39;PP=1989;SC=CCTCCAACCTGTCTCCTCCAG;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=97;WE=33276432;WS=33276414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	33282775	rs72654020	C	A	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1874;ReadPosRankSum=0.040;SC=GCATTTCCAACCCCCAGGCCT;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=153;TCR=131;TR=136;WE=33282783;WS=33282765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,158:0.45:354
chr1	33293748	rs10753266	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=499;SC=TCTTCCCCTCTCCAGTTTCCT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=33293756;WS=33293738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	33318561	rs702836	T	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=387;SC=TTGTGATAATTGTAAGTATAT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=33318569;WS=33318551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	33318634	rs785274	G	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=30;PP=1452;SC=GTTGGCTGACGTAGTTCACTC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=33318642;WS=33318624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	33330432	rs1284368	A	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=29;PP=933;SC=CAGAGGCCAGAGCCTGGGTTC;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=33330440;WS=33330422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	33485789	.	AAC	A	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.367;NF=0;NR=22;PP=919;ReadPosRankSum=-2.270;SC=AACATGTTAAAACACACACAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=1;TCR=84;TR=22;WE=33485800;WS=33485779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr1	33497070	rs1012884	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=0.543;SC=GGTCTGTCACGTAACTGAGCA;SOR=0.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=33497078;WS=33497060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	33560338	rs804428	A	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=59;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.364;SC=TGGGAGTGTCATGCTGGGCTC;SOR=0.685;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=50;TCR=119;TR=85;WE=33560346;WS=33560328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr1	33641932	rs604941	A	G	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=39;PP=1740;SC=CCAGAGCCGAAATTTGAACCT;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=33641940;WS=33641922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	33642152	rs643402	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=32;PP=848;SC=GAACCTGAGACGGCCAGAGAG;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=33642160;WS=33642142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	33646950	rs622407	A	G	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=66;PP=2306;SC=GGCAGAAGTAATGCTCGCAGC;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=111;WE=33646958;WS=33646940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	33741787	rs12743549	G	A	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TCGCCCCTCCGGCTGCCCTAC;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=71;TCR=92;TR=81;WE=33741795;WS=33741777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr1	33741895	rs12743740	G	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1178;ReadPosRankSum=0.617;SC=GCGGGCCTGGGCAAGGGGCGG;SOR=0.513;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=151;TCF=88;TCR=63;TR=72;WE=33741903;WS=33741885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr1	33742228	rs4475712	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=6;NR=9;PP=182;SC=GCGGGGCCGGTGAGGACTGGG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=33742236;WS=33742218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	33746163	rs10914676	T	C	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=291;SC=CCCTTAGGGCTGAGGGGCAGG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=33746171;WS=33746153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	33760743	rs4641276	T	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=840;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GCTGTGCCCCTACAGTCTCAC;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=49;WE=33760751;WS=33760733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,71:0.50:143
chr1	33777524	rs6679416	T	C	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=11;PP=1305;SC=GCAAGAAGTGTTGTCTTTGCT;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=33777532;WS=33777514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	33778226	rs12563102	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=210;ReadPosRankSum=1.450;SC=GCAGGCAGCCGTGAGAAGCAT;SOR=0.282;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=14;WE=33778234;WS=33778216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	33778591	rs6664593	T	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=224;SC=TCCAGCCAGCTGGTTCTTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=33778599;WS=33778581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	33790496	rs11554674	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=662;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGATGCGGGCGTAGATCTTCA;SOR=1.091;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=44;WE=33790504;WS=33790486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr1	33797075	rs192260786	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TGAAAAGTATAGAAATGGGTA;SOR=1.123;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=15;WE=33797083;WS=33797065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	33799548	rs12044118	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	33799900	rs12734630	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-2.257;SC=GTCTCTGCACGAGAGAGAGTA;SOR=0.116;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=7;WE=33799908;WS=33799890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	33820134	rs12026290	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=417;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CCTGGTGCCACTTCTTTCCAG;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=33;WE=33820142;WS=33820124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr1	33832865	rs6425816	A	G	5197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=93;PP=2965;SC=TGGCACCTGCAGGGGAAGCCT;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=68;TCR=93;TR=161;WE=33832873;WS=33832855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	33834416	rs12144672	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=-0.506;SC=GAAGGGGGAGTCCAAGGGGAG;SOR=0.053;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=13;WE=33834424;WS=33834406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	33836796	rs7545416	C	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=917;SC=GTGTTAAGGACAACAGCCTCT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=33836804;WS=33836786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	33957152	rs4403594	T	G	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=89;PP=2965;SC=CAGGCTCGGGTATAGTGACGC;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=183;WE=33957160;WS=33957142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	33960062	rs9943259	A	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=-0.942;NF=61;NR=53;PP=1558;ReadPosRankSum=0.975;SC=TGTACCTTGCAGAGAAACCCT;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=238;TCF=125;TCR=113;TR=114;WE=33960070;WS=33960052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,128:0.47:270
chr1	33961147	rs3795420	T	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=423;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ATGCTAGAGATAAACTTTCCA;SOR=0.416;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=22;WE=33961155;WS=33961137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr1	33985353	rs2641959	C	G	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TGCGGGGGGCCCTGGAGGGAG;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=91;TCR=78;TR=85;WE=33985361;WS=33985343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,93:0.49:189
chr1	34024928	rs16835591	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=351;ReadPosRankSum=0.635;SC=TGTCACTCCATTGCCCGCTGG;SOR=0.885;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=25;WE=34024936;WS=34024918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr1	34025030	rs16835593	A	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=938;ReadPosRankSum=-0.592;SC=GGTTACCCTGAGTGAGGCCGT;SOR=0.823;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=57;WE=34025038;WS=34025020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr1	34038214	rs2641962	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=484;ReadPosRankSum=-2.448;SC=CAGCTGTACATGGCCTTGGTT;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=30;WE=34038222;WS=34038204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr1	34038413	rs2794602	A	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AGGGTAAAGTATCATAATAAA;SOR=0.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=34038421;WS=34038403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	34043169	rs11291100	TC	T	1467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=987;SC=CCCTTTCGTCTCCCCCCCATC;SOR=2.078;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=36;WE=34043177;WS=34043159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	34052605	rs7526990	A	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=0.516;SC=GATAAGGTCCACTGGCCCGAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=34052613;WS=34052595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	34070826	rs12733436	G	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=367;SC=GATTGCTCTGGACCAGTCTCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=34070834;WS=34070823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	34071434	rs1874044	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=14;PP=720;SC=ACCAGCCTAACTCCTTTCATG;SOR=1.055;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=35;WE=34071442;WS=34071424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	34071525	rs1874045	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=29;PP=1379;SC=TGAGTTGGTTCTTTCCAACTC;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=34071533;WS=34071515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	34092132	rs144162842	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=0.024;SC=GGCCTTTGGCGCTGAACTTAA;SOR=1.136;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=27;WE=34092140;WS=34092122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr1	34158472	rs12757315	C	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr1	34158482	rs12757320	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr1	34166070	rs114196768	T	C	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=880;ReadPosRankSum=-0.393;SC=ATGAATAAAATGGGAAACCCT;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=64;WE=34166078;WS=34166060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr1	34189917	rs519370	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.895;NF=16;NR=26;PP=617;ReadPosRankSum=0.183;SC=CAGAGAGCTACAGAAGGAGTG;SOR=0.979;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=42;WE=34189925;WS=34189907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr1	34189957	rs11346874	AG	A	1605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=1409;SC=AGAGGGCCTCAGGGGAGCACC;SOR=1.863;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=36;WE=34189965;WS=34189947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	34270498	rs10737374	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1085;ReadPosRankSum=1.226;SC=GTCTCCTCCCGCCTGGATCAG;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=39;TCR=86;TR=62;WE=34270506;WS=34270488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr1	34270566	rs11587828	G	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.924;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=490;ReadPosRankSum=0.566;SC=GCCCACCAAGGCCCCACAGAG;SOR=1.623;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=23;WE=34270574;WS=34270556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr1	34285342	rs17342512	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=660;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GGTCGCTCCAGGCCGCAAACA;SOR=0.429;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=43;WE=34285350;WS=34285332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr1	34285381	rs11578857	C	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=860;ReadPosRankSum=0.915;SC=AGGTGATCCGCTTGGACCCTT;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=59;WE=34285389;WS=34285371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr1	34285995	rs3795414	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=0.519;SC=CCTGCAGGAAGGCCAGCCCCT;SOR=0.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=34286003;WS=34285985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	34286045	.	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=177;ReadPosRankSum=-0.947;SC=TTCTTGCAATCAGAAAATTCC;SOR=0.883;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=12;WE=34286053;WS=34286029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr1	34286189	rs3843294	A	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-0.608;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	34329897	rs911218	T	C	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=40;PP=2566;SC=CAAATACCTATGTTGGCTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=86;TCR=40;TR=126;WE=34329905;WS=34329887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	34330067	rs10379	A	C	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1418;ReadPosRankSum=-1.115;SC=GATCCCCAGGAACCCAGACGG;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=87;WE=34330075;WS=34330057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,107:0.51:210
chr1	34663180	rs3795412	G	A	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1438;ReadPosRankSum=2.092;SC=CAGAGGACAGGGGCCGCATCC;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=92;WE=34663188;WS=34663170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,100:0.45:220
chr1	34663208	rs1382602	C	G	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=86;PP=2965;SC=CTCCAACTTGCAAGTCAGCAA;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=168;WE=34663216;WS=34663198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr1	34663411	rs1414474	C	G	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=74;PP=2753;SC=CACGTCCTGACAAGCTCCCTG;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=133;WE=34663419;WS=34663401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	34667863	rs12746310	C	A	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=69;PP=2066;SC=AGTATCAGGTCAGTGAGCTGG;SOR=1.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=105;WE=34667871;WS=34667853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	34673701	rs41266413	A	C	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1608;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGAGTAGCTGATGCCTTCTGG;SOR=0.882;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=98;WE=34673709;WS=34673691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,125:0.50:249
chr1	34684463	rs705207	G	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=511;SC=GGAAAAGCAAGGTTCTGACCA;SOR=1.536;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=34684471;WS=34684453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	35135315	rs2147385	C	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=439;SC=GTAGTATATTCGACTATTACA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=35135323;WS=35135305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	35183838	rs683589	A	C	973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=728;SC=CAGGAAAAAAAAAACAAACAA;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=35183846;WS=35183828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	35184033	rs693582	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=39;PP=1163;SC=AAAGGGAGCACGGAGGGACAA;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=35184041;WS=35184023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	35184084	rs693852	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=597;SC=CCACTACTCACAACTTAACAC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=35184092;WS=35184074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	35227673	rs755931	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=-1.506;SC=AGATCAGCAGATAAGATCAAC;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=20;WE=35227681;WS=35227663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr1	35250720	rs41310442	C	T	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=81;PP=2737;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TGTACGACAACGCAGGCAAGA;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=333;TCF=180;TCR=153;TR=175;WE=35250728;WS=35250710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,200:0.52:386
chr1	35251229	rs476220	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	35259946	rs1764389	G	A	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=60;PP=1988;ReadPosRankSum=0.745;SC=GCGAGTCAGTGTGGGGTGACG;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=146;TCR=115;TR=136;WE=35259954;WS=35259936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,157:0.51:309
chr1	35259961	rs1764390	A	G	9342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=127;PP=2965;SC=GTGACGAGCAATCAGATTTCG;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=163;TCR=127;TR=290;WE=35259969;WS=35259951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr1	35260208	rs61777220	C	T	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1932;ReadPosRankSum=0.113;SC=GGCCGTAGAGCGTCAGATGGC;SOR=0.857;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=248;TCF=128;TCR=120;TR=118;WE=35260216;WS=35260198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,132:0.47:283
chr1	35260769	rs1764391	C	T	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=60;PP=1590;ReadPosRankSum=0.220;SC=TGGCCAAAAACCCCCAAGTCG;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=71;TCR=108;TR=98;WE=35260777;WS=35260759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,116:0.55:211
chr1	35260929	rs3543	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=604;SC=GGGGAAGCAGGTGCTTGCTGG;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=35260937;WS=35260919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	35320690	rs8621	T	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=764;ReadPosRankSum=0.234;SC=CACTATACAGTGATGGGGGTA;SOR=0.472;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=44;WE=35320698;WS=35320680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr1	35332926	rs1001616	G	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=18;PP=553;SC=TGGGAGACAGGGGGACAAGAG;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=35332934;WS=35332916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	35350573	rs34565935	CT	C	1890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.038;NF=15;NR=27;PP=1400;ReadPosRankSum=1.709;SC=CCCACCGTGACTTTACCTCTT;SOR=0.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=42;WE=35350581;WS=35350563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr1	35450916	.	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=409;ReadPosRankSum=0.628;SC=TGGCCGCGCTCCCCCCACCGT;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=29;WE=35450924;WS=35450906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr1	35561510	rs2101973	G	A	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=24;PP=841;SC=AATTATTTAAGTTAGTTATGT;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=50;WE=35561518;WS=35561500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	35562965	rs2971408	G	A	7795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=121;PP=2965;SC=ATCATCTGGCGTGAATAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=121;TCR=121;TR=242;WE=35562973;WS=35562955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr1	35563206	rs6658571	C	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=56;PP=1647;SC=TATTTCCCTACCTTGTTCTTG;SOR=2.568;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=70;WE=35563214;WS=35563196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	35576145	rs2935955	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=CAAATTAAACCGACTTTTAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=35576153;WS=35576135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	35925861	rs2819002	C	A	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=21;PP=1839;SC=CCACGAGAGGCAAAAAAATGG;SOR=1.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=81;WE=35925869;WS=35925851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	35928179	rs144028651	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=333;ReadPosRankSum=0.747;SC=CAGAGTACACGGTGAATGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=22;WE=35928187;WS=35928169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr1	36205166	rs577483	A	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=872;SC=AAATGCAACAATGAATATACT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=36205174;WS=36205156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	36213712	rs516992	G	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=23;PP=683;SC=ACAAATGTCAGTCATTGTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=36213720;WS=36213702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	36216835	rs535638	C	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=931;SC=AACAAAACAACGTAATTGCCA;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=36216843;WS=36216825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	36227588	rs34230082	G	A	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1205;ReadPosRankSum=0.756;SC=AAGTTTACTGGGTTGCATTAC;SOR=0.712;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=188;TCF=95;TCR=93;TR=81;WE=36227596;WS=36227578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,114:0.46:250
chr1	36282503	.	C	T	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1528;ReadPosRankSum=0.147;SC=TAGCCTGTTTCAGCCACCTCG;SOR=0.429;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=80;WE=36282511;WS=36282493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,109:0.58:187
chr1	36307412	.	CAT	C	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=60.67;NF=0;NR=3;PP=144;QD=49.0;SC=TATATATGCACATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=3;WE=36307421;WS=36307402;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,3:0.21:14
chr1	36316418	rs11403763	C	CA	610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.45;QD=25.45;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	36316571	rs4652895	A	C	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=54;PP=1576;SC=GCACTCGCTCAGTCTCTATTC;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=83;WE=36316579;WS=36316561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	36359206	.	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=0.718;SC=AGGGCTCCTCCGTGCCCAGGA;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=36359214;WS=36359196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	36553673	rs399393	A	G	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=49;PP=2461;SC=GCATGGACACACGGCGCAAGC;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=122;WE=36553681;WS=36553663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	36553836	rs12131875	A	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=481;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CAATGGAAGGAGGGAGGAGAG;SOR=0.450;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=31;WE=36553844;WS=36553826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	36556779	rs67749899	CA	C	912.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.129;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.742;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr1	36563158	rs3738360	C	A	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=8;PP=406;SC=GCAGCAGGACCCCCCCCGCGG;SOR=1.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=36563166;WS=36563148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	36565584	rs274753	C	G	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=484;SC=TCTGATGGCTCTCAGGGAGGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=36565592;WS=36565574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	36565617	rs274754	G	A	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=13;PP=579;SC=GGCTGGGAGCGATTTGAGGCA;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=36565625;WS=36565607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	36602943	rs2231318	C	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=772;SC=AGTGGGAAAACGAAGGGGTAG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=36602951;WS=36602933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	36636774	rs139650826	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=875;ReadPosRankSum=1.705;SC=CCCCCCCGCAGGAAGAGTCCC;SOR=0.732;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=56;WE=36636782;WS=36636764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr1	36641729	rs2296263	C	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=196;SC=GGTGCCTGGTCTGCTCCCTTG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=36641737;WS=36641719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	36642420	rs475591	T	C	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=50;PP=1210;SC=CCCGCCTCTCTGCCAGCACCG;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=36642428;WS=36642410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	36752152	rs2242428	C	T	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=940;ReadPosRankSum=-0.640;SC=ATGGAAACTACCGCTCAAATT;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=48;WE=36752160;WS=36752142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr1	36752433	rs6425977	C	T	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=69;PP=2376;SC=GGAGATGAGGCCAAGGAGCAG;SOR=1.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=106;WE=36752441;WS=36752423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	36762396	rs1566589	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=575;SC=GTTACCCCTTCCAGACTCTTA;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=36762404;WS=36762386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	36767400	rs882799	C	T	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=40;PP=1076;SC=ATTAAATGTACGTGCAGGATT;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=36767408;WS=36767390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	36772517	rs138952213	G	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=2.375;SC=GTGAGCGCAAGGGCGGGGACG;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=14;WE=36772525;WS=36772507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	36773405	rs35343437	T	G	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1013;ReadPosRankSum=-1.745;SC=CAGTCAGCCCTGGTCCCCAGC;SOR=0.777;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=69;WE=36773413;WS=36773395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,81:0.45:179
chr1	36773819	rs11263871	C	G	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=35;NR=45;PP=1658;SC=AGGTGTGAGACGAACAGGGTG;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=80;WE=36773827;WS=36773809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	36787888	rs58971913	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=121;ReadPosRankSum=-0.533;SC=AGCGGGAGCCGGGGCCCATCA;SOR=0.714;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=10;WE=36787896;WS=36787878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	36788356	rs7536394	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=22;PP=627;SC=GGTCACGGAGAGGCCCGGACG;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=36788364;WS=36788346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	36809698	.	A	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.415;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=215.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.359;QD=1.82;ReadPosRankSum=-4.993;SOR=6.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,59:0.35:170
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chr1	36886364	rs2275478	C	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=0.456;SC=TAGAAAGCAGCCTTAACCAAA;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=36886372;WS=36886354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	36887702	rs2236565	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=475;ReadPosRankSum=1.831;SC=TGTAGACTTCCGTATCTAGAG;SOR=1.529;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=27;WE=36887710;WS=36887692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr1	36889197	rs11263892	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=184;ReadPosRankSum=-1.650;SC=AGGGAGAGGCTGGGCGCAGTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=36889205;WS=36889187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	36898067	rs34409118	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=321;ReadPosRankSum=-1.258;SC=TGCAGGATGGTTGGGGAGTCT;SOR=0.743;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=19;WE=36898075;WS=36898057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	36898332	rs61772386	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=-0.673;SC=TCACTTATCACCCAAACCAAG;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=36898340;WS=36898322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	36921371	rs1538634	G	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=-1.149;SC=AAGACAGAAAGAAATGATTGA;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=55;WE=36921379;WS=36921361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,63:0.53:119
chr1	36926445	rs3738839	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=550;ReadPosRankSum=0.240;SC=CCTCCTCCCCCCAAGGGCCCT;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=38;WE=36926453;WS=36926435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr1	36927733	rs7065	G	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=12;PP=978;SC=GCAGCGTAGAGGGAGGTGGGT;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=36927741;WS=36927723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	36929673	rs2275473	C	T	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TCCCCTACTCCTGTGCTTCCT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=97;TCR=57;TR=79;WE=36929681;WS=36929663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,96:0.51:190
chr1	36937059	rs3917981	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=955;ReadPosRankSum=0.037;SC=AGACCACCGGAGTGGGACGAG;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=64;WE=36937067;WS=36937049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr1	37335458	rs577094	A	G	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=935;SC=AGCCCTCCCCACATCCCCACC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=37335466;WS=37335448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	37335485	rs509284	A	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.56;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	37335494	rs577813	G	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.40;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	37626981	rs215756	T	C	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=223;SC=TGGTTTAGTCTAGTGCCCCTG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=37626989;WS=37626971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	37948212	rs215205	C	G	2593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TGCCTGTGCCCTGTTTTCCTC;SOR=0.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=107;TCR=91;TR=107;WE=37948220;WS=37948202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,123:0.56:218
chr1	37948912	rs41267299	C	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=999;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GTGTCCCTGCCGACTACCCAC;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=64;WE=37948920;WS=37948902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,76:0.50:153
chr1	37959450	rs215210	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=935;ReadPosRankSum=-2.042;SC=AGCAACTTGCTGGGATTACAA;SOR=1.031;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=185;TCF=81;TCR=104;TR=83;WE=37959458;WS=37959440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,98:0.46:212
chr1	37959470	rs215211	C	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=879;ReadPosRankSum=-1.083;SC=ACATTGTCTTCATCTTCCTGC;SOR=0.993;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=63;WE=37959478;WS=37959460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,78:0.42:184
chr1	37961613	rs2294873	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=456;ReadPosRankSum=0.274;SC=TATAACAAAGACTATTTGGTT;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=29;WE=37961621;WS=37961603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr1	37967707	.	ATTGACAGAGAAGATACATG	A	623	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=623;QD=347.25993623;SC=CTATCCTCTAATTGACAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=37967733;WS=37967697;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr1	37975279	rs215214	C	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=454;SC=ATGCTGAACACAGAAAGCAAC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=37975287;WS=37975269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	37975312	rs2036637	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-1.358;SC=ATGGTACATGTCCCACTGTGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=37975320;WS=37975302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	37980446	rs215873	A	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CGGCTTCCGGAGACGCGTGCA;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=37980454;WS=37980436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	38003381	.	C	A	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TCCTCCTCCTCATCCTCGTCA;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=66;WE=38003389;WS=38003371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr1	38006359	rs2174769	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=445;ReadPosRankSum=0.272;SC=TCACGCTCCTAAAATTCAAAC;SOR=0.467;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=23;WE=38006367;WS=38006349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr1	38019747	rs2273013	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=601;ReadPosRankSum=-0.317;SC=CCTGCTTCACCACCACCCCCG;SOR=0.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=41;WE=38019755;WS=38019737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr1	38022452	rs2273014	C	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=68;ReadPosRankSum=0.351;SC=ATGAAACTTGCCGGCTGTTGG;SOR=0.297;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=7;WE=38022460;WS=38022442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr1	38030696	rs6619	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=0.333;SC=AACAAGACACTTGGGAGTTAT;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=21;WE=38030704;WS=38030686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr1	38046920	rs2360010	G	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=957;ReadPosRankSum=2.248;SC=TAACTAAATAGACAAATTCAA;SOR=0.439;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=137;TCF=91;TCR=46;TR=65;WE=38046928;WS=38046910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr1	38049373	rs3753372	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=812;ReadPosRankSum=-0.372;SC=CTGTACTCTGCGCAACAGAGC;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=51;WE=38049381;WS=38049363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr1	38049552	rs6426024	C	G	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1011;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGAAAGCACCCCAAATGAGCA;SOR=1.045;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=130;TCF=49;TCR=81;TR=63;WE=38049560;WS=38049542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,69:0.49:140
chr1	38061572	rs6697632	G	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=-1.445;SC=CGTCCCTCTCGGCCTCAGAGC;SOR=0.136;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=38061580;WS=38061562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	38078300	rs4652964	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=252;ReadPosRankSum=1.285;SC=TCTTGTGTCTATGTATGCATG;SOR=1.712;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=13;WE=38078308;WS=38078290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr1	38148765	rs684260	A	G	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1424;SC=CAACTGTGGTACCCGTGGTCT;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=38148773;WS=38148755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	38149076	rs34250208	G	A	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=56;PP=2412;SC=CTCCCCACTGGATAGACGAAA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=122;WE=38149084;WS=38149066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	38149193	rs686083	C	T	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=44;PP=1328;SC=CAGAGGGAGCCATAAAAGTGA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=38149201;WS=38149183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	38155265	rs586252	G	C	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=21;PP=1241;SC=AACAGCACTAGGGAGCTGCTT;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=38155273;WS=38155255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	38161694	rs615530	A	G	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=62;PP=1859;SC=CAACTAATAGATGCTTACTGT;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=90;WE=38161702;WS=38161684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	38164724	rs557290	C	G	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=103;PP=2965;SC=GCTCAGGCAGCGCCTTGTTGG;SOR=2.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=38;TCR=103;TR=141;WE=38164732;WS=38164714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	38166022	rs513826	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=636;SC=CTTAAGATTGTGTACATTTTA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=38166030;WS=38166012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	38166327	rs661460	A	T	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=159;SC=ATGACAAAAGAGATAATTGAC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=38166335;WS=38166317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	38167361	.	A	AC	234	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=65.97;NF=7;NR=0;PP=234;QD=33.8571428571;SC=AAAAAAAAAAACCCTCCTTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=38167369;WS=38167351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,7:0.70:10
chr1	38174185	rs557897	G	T	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=884;SC=AGACGTGCTAGTCCCACACCA;SOR=2.476;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=38174193;WS=38174175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	38184316	rs609437	T	C	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=70;PP=1851;SC=GCCTTGACCTTGGTGCCTTGG;SOR=2.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=91;WE=38184324;WS=38184306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	38184470	rs610213	C	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=400;SC=AGGCACGGTCCGCTAGTGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=38184478;WS=38184460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	38185337	rs518583	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=319;SC=GCATATGGTGTGTGCACACAC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=38185345;WS=38185327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	38186189	rs6671088	C	T	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=72;PP=2391;SC=AGGCAGCAACCCCATCAGTTG;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=125;WE=38186197;WS=38186179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	38186294	rs1008879	C	T	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=1054;SC=GACACCAGGGCGGTCACCTAG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=38186302;WS=38186284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	38187447	rs579908	A	G	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=39;PP=1564;SC=CCCTCAGCATATGCACGGCTA;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=38187455;WS=38187437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	38187989	rs12123842	T	C	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=50;PP=1507;SC=GGACAGGGCATATGCCAGCAC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=64;WE=38187997;WS=38187979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	38188841	rs12121777	G	A	6484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=87;PP=2965;SC=GACTTTGACTGGGAGAGAAAG;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=110;TCR=87;TR=197;WE=38188849;WS=38188831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	38192604	rs6699887	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=512;SC=CACATGAACAGTGAGCTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=38192612;WS=38192594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	38293992	rs9329568	C	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=859;SC=TTCTTTTGTTCTGAGACAGAG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=38294000;WS=38293982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	38332074	rs149926262	TCTCTCACA	T	927.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=1078;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCTCTCTCTCTCTCTCACACA;SOR=0.399;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=35;WE=38332091;WS=38332062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr1	38423853	rs9293	G	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=928;SC=CTACATCCCTGAACACTAGAG;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=38423861;WS=38423843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	38425724	rs17531342	T	C	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=14;PP=874;SC=TTTCACCTCCTTTCTACATGG;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=38425732;WS=38425714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	38425895	rs28675056	T	C	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1051;SC=GAACATCTGTTGGGTATCCAG;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=38425903;WS=38425885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	38442547	rs10890216	G	A	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=61;PP=2249;SC=TCAGCAGTCAGTCACTTACCC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=111;WE=38442555;WS=38442537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	38444749	rs7555461	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=797;SC=AGAGAAAAATTACAATATTAC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=38444757;WS=38444739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	38447615	rs7533079	G	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=376;SC=GCTAATTTTGGTTTTTTTTGC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=38447623;WS=38447605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	38449910	rs11210870	T	C	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=23;PP=1955;SC=CATATCCCTCTTCATCTGTGA;SOR=1.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=92;WE=38449918;WS=38449900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	38450367	rs6680796	A	G	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=88;PP=2965;SC=TGAAATTTTCACCCCTACTTA;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=181;WE=38450375;WS=38450357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	38453576	rs10890285	A	C	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=66;PP=1809;SC=GCAAACAACAAGGGTTCTCCA;SOR=1.297;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=104;WE=38453584;WS=38453566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	38455389	rs3935867	C	T	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=36;PP=1053;SC=CTCTGGGGCTCCGGACCCCGG;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=38455397;WS=38455379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	38462898	rs4274021	T	A	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	38462905	rs12724533	C	G	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	38463504	rs7366048	C	T	7323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=130;PP=2965;SC=CTCGATGCCACGGCTGATCAC;SOR=0.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=96;TCR=130;TR=226;WE=38463512;WS=38463494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr1	38464639	rs4570384	C	G	7610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=86;PP=2965;SC=AGCCCCTGAACACATACCAGG;SOR=1.060;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=130;TCR=86;TR=216;WE=38464647;WS=38464629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr1	38488506	.	C	CT	139	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=61.03;NF=4;NR=9;PP=139;QD=11.0769230769;SC=CCTTAGGCCTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=13;WE=38488514;WS=38488496;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr1	39325063	rs1925678	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-1.582;SC=GGCGGGGGACTGGGCGCAGCC;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=19;WE=39325071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr1	39339449	rs12127091	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=479;ReadPosRankSum=-1.024;SC=TTGCAGTAGCCGAGGAGGGTG;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=32;WE=39339457;WS=39339439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr1	39340282	rs880303	C	T	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1158;ReadPosRankSum=1.656;SC=AGGGACACTACGTGATTTGGA;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=82;WE=39340290;WS=39340272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,96:0.47:203
chr1	39340607	rs16825625	A	G	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1290;ReadPosRankSum=0.195;SC=CTGGAATAGAACGGTGACCTC;SOR=0.659;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=84;WE=39340615;WS=39340597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,99:0.46:217
chr1	39352271	rs2147914	G	T	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GGATCTTTCAGCAGTGCTTTA;SOR=0.879;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=108;TCR=67;TR=93;WE=39352279;WS=39352261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,108:0.50:217
chr1	39352492	rs3790441	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=0.836;SC=CTAGGGGTAAGGCAAAAGAGA;SOR=0.877;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=17;WE=39352500;WS=39352482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	39361615	rs9438984	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=370;ReadPosRankSum=-0.782;SC=TAAGAGACTCGTGGACTCCAT;SOR=1.051;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=25;WE=39361623;WS=39361605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr1	39384625	rs61750827	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=2.023;SC=GTGCCCACCCCGCTCCCCATT;SOR=0.148;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=15;WE=39384633;WS=39384615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	39385086	rs7522863	A	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=581;SC=AAAGTTTTCTATGTAATTGTT;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=26;WE=39385094;WS=39385076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	39457006	rs12043492	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=301;ReadPosRankSum=-0.125;SC=GCCTCTTGGGCCGCACTTACC;SOR=0.307;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=9;WE=39457024;WS=39456996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	39457016	rs11547138	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=129;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CCGCACTTACCGCCGCGTCCG;SOR=0.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=5;WE=39457024;WS=39456996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	39466626	rs11205525	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=270;ReadPosRankSum=-1.834;SC=GCCCAAACTCACTTTTTCTTT;SOR=1.158;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=18;WE=39466634;WS=39466616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr1	39466786	rs10888613	C	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=1106;ReadPosRankSum=0.144;SC=CAGGTAGGCCCAGGCAGTGAC;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=67;WE=39466794;WS=39466776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,84:0.59:143
chr1	39549983	rs3736890	G	A	4877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=98;PP=2846;ReadPosRankSum=0.622;SC=GCGAGCGGTCGGGGAGCCTGT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=346;TCF=163;TCR=183;TR=185;WE=39549991;WS=39549973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,223:0.53:420
chr1	39550210	rs260972	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=401;SC=CTCACCAGGGCCTCTGACAAA;SOR=4.047;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=39550218;WS=39550200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	39568249	rs6667815	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.316;SC=ATAACACATTAGAGGCGCTGA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=39568257;WS=39568239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	39568765	rs2282232	T	C	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=945;SC=TTAGAGAAGCTCTCTAGCCAC;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=39568773;WS=39568755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	39571211	rs13374459	T	C	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=648;SC=GCACAAAGGGTCGAGGCTGGG;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=39571219;WS=39571201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	39717566	rs2490948	T	C	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=18;PP=864;SC=GCCCTCCTGGTGCCATACAAA;SOR=0.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=39717574;WS=39717556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	39719812	rs66880209	G	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=-0.242;SC=ACACGTACAGGCCTGGTCTTA;SOR=0.242;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=18;WE=39719820;WS=39719802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	39748921	rs2275188	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=530;ReadPosRankSum=-0.893;SC=ATCTGGAACAGGCTTTTGAAG;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=40;WE=39748929;WS=39748911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr1	39757799	rs16826036	G	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=406;ReadPosRankSum=-2.242;SC=TATTGAAGGAGGAGGGTGCTC;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=34;WE=39757807;WS=39757789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr1	39758634	rs16826038	G	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=75;PP=1728;ReadPosRankSum=0.252;SC=TGCTTATTAGGTTATATCATT;SOR=1.082;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=215;TCF=67;TCR=148;TR=104;WE=39758642;WS=39758624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,110:0.46:241
chr1	39758993	rs6688708	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TTGTACAAAACTTGAATCCAT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=39759001;WS=39758986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	39763242	rs2275187	G	A	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=30;PP=1281;ReadPosRankSum=0.006;SC=TTAATATTCCGGTGTTCTAAT;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=84;WE=39763250;WS=39763232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,86:0.56:154
chr1	39766041	rs41270803	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=738;ReadPosRankSum=-1.252;SC=CGAGGTGAGGAGGTAGAAAGG;SOR=0.544;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=17;WE=39766063;WS=39766031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	39766055	rs2275186	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=383;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGAAAGGGTACCTCTGGGCCA;SOR=0.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=9;WE=39766063;WS=39766031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	39797055	rs16826069	A	G	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=592;ReadPosRankSum=0.607;SC=GGAGGAGGGCATAGCCAGAAA;SOR=0.541;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=46;WE=39797063;WS=39797045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr1	39801815	rs41270807	A	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=627;ReadPosRankSum=1.870;SC=GAGGTCTTAAATTGGAAGAAA;SOR=0.796;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=35;WE=39801823;WS=39801805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr1	39806610	rs3116396	C	T	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=93;PP=2765;SC=TGAACCTCTGCCTCCAACAGT;SOR=1.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=34;TCR=93;TR=127;WE=39806618;WS=39806600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	39812620	rs2490944	G	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1011;SC=GGTTTTTTGTGTTTTGTTTCC;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=39812628;WS=39812610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	39812822	rs2761764	C	A	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=55;PP=1851;SC=AACAGACTGCCGCTCAGGTGG;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=88;WE=39812830;WS=39812812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	39815143	rs16826093	T	A	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=781;ReadPosRankSum=-1.830;SC=CTTTGCATTTTAATTAGACCC;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=55;WE=39815151;WS=39815133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr1	39815344	rs41270811	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TCGCTCTATCGCTTAGGCTGG;SOR=2.494;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=7;WE=39815352;WS=39815334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	39823032	rs147223845	A	AT	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=369;ReadPosRankSum=-0.214;SC=GTTTGGGGGGATTTTTTTTTA;SOR=0.759;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=26;WE=39823040;WS=39823022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr1	39824718	rs2256614	C	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GTTAAACTTACAATTATTCTG;SOR=1.085;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=8;WE=39824726;WS=39824708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	39826391	rs10632223	A	ATTAT	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	39835817	rs2296172	A	G	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=912;ReadPosRankSum=0.198;SC=GGAAACTTCTATGAGTGCTAA;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=58;WE=39835825;WS=39835807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,68:0.55:123
chr1	39843958	rs663449	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=1.777;SC=CTTGAGTGACGTTTTGTTGCC;SOR=1.828;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=39843966;WS=39843948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
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chr1	39908506	rs587404	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CCGTTTGGAAGCCATGAACCA;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=15;WE=39908514;WS=39908496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	39908726	rs588326	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	39913351	rs2296173	A	G	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1482;ReadPosRankSum=0.787;SC=AAAGAGCACTATTGTTCCCTC;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=76;WE=39913359;WS=39913341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,90:0.60:151
chr1	39914363	rs668556	G	C	6422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=95;PP=2965;SC=CCCGAAGATAGTCAGAAACTT;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=99;TCR=95;TR=194;WE=39914371;WS=39914353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	39927507	rs783820	G	A	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=7;PP=1109;SC=ACCGCCAACCGAACAAGTACC;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=39927515;WS=39927497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	39929240	rs7554206	T	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.035;NF=41;NR=18;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.774;SC=AATAGGAAGTTTTGCTCTACC;SOR=1.013;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=59;WE=39929248;WS=39929230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,70:0.49:143
chr1	39957913	rs4660269	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=14;PP=649;SC=GTACCACGCCATGGCTGGCGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=39957921;WS=39957903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	39958080	rs10888798	C	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=210;ReadPosRankSum=1.101;SC=GTGCCGGGCCCTGGCCGAACG;SOR=0.412;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=14;WE=39958088;WS=39958070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	39981522	rs200818147	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQRankSum=-1.288;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.169;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
chr1	39988145	rs6524	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.477;NF=10;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=1.997;SC=TCCAGGACCTTGGCTGGCTGG;SOR=1.674;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=24;WE=39988153;WS=39988135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,11:0.13:86
chr1	39988708	rs2889739	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.921;NF=14;NR=11;PP=352;ReadPosRankSum=0.689;SC=AAGGCTACTCAGCCTATTACT;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=25;WE=39988716;WS=39988698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr1	39991474	rs11583829	AG	CA	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.484;NF=53;NR=50;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CCACTGAGTCAGCCCGCCCAG;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=103;WE=39991483;WS=39991464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr1	39991588	rs3738676	G	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=42;PP=1253;SC=CCTCACTCTCGGTGCCTACTT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=39991596;WS=39991578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	40028180	rs4660293	A	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=643;ReadPosRankSum=-0.306;SC=ACATCTGACTATGTGAAAGAG;SOR=0.340;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=45;WE=40028188;WS=40028170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr1	40030823	rs12127094	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.922;NF=21;NR=8;PP=467;ReadPosRankSum=0.615;SC=CAGGCTGGAACTGATTTAAGA;SOR=0.418;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=29;WE=40030831;WS=40030813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr1	40035686	rs17513135	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=740;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TAAAATGAAACCATGAAGAAC;SOR=0.379;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=50;WE=40035694;WS=40035676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,69:0.55:125
chr1	40036847	rs2293476	G	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CCAGTTAATAGCGAGGTGGGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=40036855;WS=40036837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	40037354	rs41264487	C	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=0.502;SC=GGAGCCAGATCGTTGGACAAT;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=15;WE=40037362;WS=40037344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr1	40041371	rs79094524	G	GA	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=425;ReadPosRankSum=-1.402;SC=GGCCCTGCCAGAAGACGACTC;SOR=0.653;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=13;WE=40041379;WS=40041361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr1	40041699	rs201925786	T	TCGGAGC	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	40092089	rs2695320	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=524;SC=AGCCAGTCCATGAAGCAAAGC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=40092097;WS=40092079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	40098328	rs784625	T	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=41;PP=1503;SC=CACCCCTCTGTGTTTCTTCCT;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=40098336;WS=40098318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	40137754	rs2871601	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.325;NF=0;NR=11;PP=179;ReadPosRankSum=0.026;SC=CGGCGGCGTAGACGCGGAGGT;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=11;WE=40137762;WS=40137744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	40149515	rs784633	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=6;PP=450;SC=GGGGAGCAGCAGGGAGGCCCC;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=40149523;WS=40149513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	40149551	rs11206617	G	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=1094;SC=CGCGGAGGCAGGGGCGGGGAT;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=40149559;WS=40149541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	40149642	rs784634	G	T	6357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=64;PP=2965;SC=GGCGCGTGATGCGCCCGTCGC;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=128;TCR=64;TR=192;WE=40149650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	40149870	rs113763288	C	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=587;SC=GCCCCGCCCACCCCGCCCCCA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=40149878;WS=40149860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	40150370	rs2746058	C	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=160;SC=ACACACAGGGCGGGGTTGCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=40150378;WS=40150360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	40204802	rs140607790	ACTT	A	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=183;ReadPosRankSum=-2.100;SC=AAAAGTGCAGACTTCTTAGCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=40204812;WS=40204792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	40207169	rs497333	T	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=50;PP=1540;SC=TGGTTAGGTTTTTGGGCCTTA;SOR=1.295;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=40207177;WS=40207159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	40214525	rs7520588	T	A	58.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CGAGGTTTTTTATTTTGTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=40214533;WS=40214524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	40219065	rs1046988	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=849;ReadPosRankSum=2.511;SC=GCTCTTGACCCTGCATATCCA;SOR=0.689;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=52;WE=40219073;WS=40219055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,56:0.58:96
chr1	40229297	rs71060328	A	AC	211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.44;QD=30.25;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	40229319	rs493473	G	A	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.93;QD=25.40;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	40229368	rs2463260	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.29;QD=29.94;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	40230336	rs76376226	C	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.097;NF=23;NR=7;PP=438;ReadPosRankSum=0.148;SC=CAGCTCGTTGCTTTTCTTCGG;SOR=1.244;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=30;WE=40230344;WS=40230326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr1	40235277	.	A	G	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5130;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=43.07;NF=3;NR=2;PP=63;QD=19.5542425094;SC=GGAGGCCAGTAGCAAACCCCT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=40235285;WS=40235267;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	40236074	rs230321	A	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.147;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.019;NF=21;NR=8;PP=318;ReadPosRankSum=-1.454;SC=TTCCTCTTTCAGGATCGTTAA;SOR=1.646;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=29;WE=40236082;WS=40236064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,29:0.27:106
chr1	40253726	rs230328	C	T	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.63;QD=25.52;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	40253768	rs60164088	C	CA	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=6;PP=588;SC=CGGATGCGCGCCCCTCCCCTG;SOR=1.942;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=14;WE=40253778;WS=40253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	40253770	rs4068800	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=8;PP=438;SC=GATGCGCGCCCCTCCCCTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=25;WE=40253778;WS=40253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	40253786	rs230329	C	T	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=17;PP=692;SC=CTGCAGCCAGCTTACTCCGAG;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=40253794;WS=40253776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	40254231	rs191559100	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	40319587	rs2294814	A	C	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CTGAAATTAGACAGCAAGAAA;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=64;WE=40319595;WS=40319577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,79:0.46:173
chr1	40363054	rs3134614	G	C	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=21;PP=1516;SC=TTAGTAGCCAGTGAGGTATGC;SOR=1.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=40363062;WS=40363044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	40367592	rs804719	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=12;NR=15;PP=431;SC=CCGCACTCACAAGCGCGCCCC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=40367600;WS=40367582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	40526003	rs3122419	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GAGTTCAGTCTAGCCACAGAA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=16;WE=40526011;WS=40525993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	40533266	rs11207440	T	G	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=29;PP=1176;SC=TGCCGGATCATGTCCTCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=40533274;WS=40533256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	40533287	rs6665926	T	G	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=28;PP=972;SC=CCCTCCACCATGCCCCCCTCC;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=57;WE=40533295;WS=40533277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	40533315	rs6665933	T	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	40533320	rs6665936	T	G	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	40533326	rs6665937	T	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	40533347	rs6665944	T	G	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=68;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=31;PP=1217;SC=TTCCCGCTCATCACTGTTCGC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=40533355;WS=40533337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	40536074	rs58190778	C	CT	5368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=61;PP=2965;SC=TAAAGTTACACGTTGACACAC;SOR=0.870;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=82;WE=40536082;WS=40536064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	40545964	rs3122428	T	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=652;ReadPosRankSum=-1.233;SC=TCTTTCCTAGTGTCTGCCCAG;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=44;WE=40545972;WS=40545954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr1	40555321	rs3131651	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-1.290;SC=GAAAATAAAGCGCAGAGAACT;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=40555329;WS=40555311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	40556922	rs3122439	T	C	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=16;PP=1499;SC=TGTGCAAATATAGTTCCTAGA;SOR=2.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=64;WE=40556930;WS=40556912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	40557656	rs6672053	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=673;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GGATTTATCTGAATAAAAGAA;SOR=0.490;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=37;WE=40557664;WS=40557646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr1	40558256	rs4481840	C	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=371;SC=AGGCCTCAAACAGCATTATCA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=40558264;WS=40558246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	40701378	rs2235985	T	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.916;SC=CTAAAAGTTTTTACAAGCTAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=40701386;WS=40701368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	40705726	rs10889205	A	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=1048;ReadPosRankSum=-1.934;SC=AAGAGAAAGAAGATGATTTTG;SOR=1.104;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=59;WE=40705734;WS=40705716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,65:0.45:145
chr1	40733650	rs187876532	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr1	40733658	rs7516571	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.517;SOR=2.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	40737516	rs6677717	T	G	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=775;SC=ATAAAGAATGTTTTTTCTTTA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=40737524;WS=40737506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	40777138	.	CTG	C	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.977;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=687;ReadPosRankSum=0.956;SC=CCCCGCCCCCCTGTGTTAGCC;SOR=2.128;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=17;WE=40777147;WS=40777128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	40840270	rs10645094	T	TGC	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.34;MQRankSum=5.044;QD=6.09;ReadPosRankSum=2.753;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	40840272	.	T	C	305	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=16;MQ=61.68;NF=21;NR=6;PP=305;QD=12.5841189832;SC=TGCGTGCGTGTGTGTGTGTGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=27;WE=40840280;WS=40840262;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,27:0.48:56
chr1	40840296	rs4561032	T	A	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.06;MQRankSum=6.870;QD=7.98;ReadPosRankSum=3.007;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr1	40840296	.	T	TGA	449	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=61.23;NF=10;NR=10;PP=449;QD=22.6;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=20;WE=40840305;WS=40840286;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr1	40840353	rs1003710	A	G	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.671;NF=31;NR=29;PP=940;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GATGGCGGAAAGGAAAACTGC;SOR=0.592;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=60;WE=40840361;WS=40840343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr1	40879808	rs209605	G	T	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=27;PP=1559;ReadPosRankSum=1.425;SC=CTTATTTCTTGCTATAACATA;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=172;TCF=119;TCR=53;TR=92;WE=40879816;WS=40879798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,111:0.54:206
chr1	40879952	rs2294752	T	G	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=56;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TCTTACAAATTTTGATAAATT;SOR=1.098;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=168;TCF=60;TCR=108;TR=81;WE=40879960;WS=40879942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,100:0.47:211
chr1	40881041	rs209606	C	G	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=569;ReadPosRankSum=0.879;SC=CTTCTTCTTCCGGTTCCAGAA;SOR=0.399;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=42;WE=40881049;WS=40881031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr1	40881840	rs1007263	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=414;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CGCCCTCTTTGCCCTAAGGTT;SOR=0.756;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=17;WE=40881848;WS=40881830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	40928067	rs2036196	A	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=419;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AGGAATATGGATCTTTTTTTT;SOR=0.148;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=27;WE=40928075;WS=40928057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	40955156	rs10789144	A	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=482;SC=TGGTTCTTAGACATCAGCATA;SOR=1.931;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=40955164;WS=40955146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	40980668	rs35672330	T	C	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=801;ReadPosRankSum=0.199;SC=CTGAACATACTTTTGCTGATT;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=47;WE=40980676;WS=40980658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr1	41101572	rs2253835	A	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=20;NR=11;PP=497;SC=GGACCACAGCACGGGGCTGCA;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=41101580;WS=41101562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	41107239	rs7535398	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=631;SC=ACTGGACCTAGAACAGCACCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=41107247;WS=41107229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	41107360	rs491619	T	C	5890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=73;PP=2965;SC=CTCTACCCCGTGATGTCCCAT;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=179;WE=41107368;WS=41107350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr1	41204569	rs1057925	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=385;ReadPosRankSum=2.090;SC=CCCAGCAAAGCCTACAGTCGT;SOR=1.093;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=27;WE=41204577;WS=41204559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	41215075	rs3818758	T	A	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=125;SC=TTTCTCCCTGTTACCTGCTTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=41215083;WS=41215065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	41228898	.	G	A	215	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=58.79;NF=6;NR=3;PP=215;QD=27.7523569497;SC=ATATATGTATGTCTCTATATA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=41228906;WS=41228888;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	41229180	rs4660455	G	A	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=380;SC=CACTATGCCCGGCTGATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=41229188;WS=41229170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	41235177	rs10889608	G	C	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=46;PP=1421;SC=TAGGGCAACTGTCCTGTCCTC;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=41235185;WS=41235167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	41235946	rs3754176	G	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=249;SC=CAGATATTCTGAGAAAAGAAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=41235954;WS=41235936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr1	41284406	rs2361659	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=165;ReadPosRankSum=0.510;SC=GGGCACGACCAGAGCGGGCAG;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=15;WE=41284414;WS=41284396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr1	41285087	rs4660468	T	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=66;PP=1462;ReadPosRankSum=0.346;SC=TCTACCTGGCTGAGAAGGACG;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=250;TCF=120;TCR=130;TR=124;WE=41285095;WS=41285077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,138:0.46:298
chr1	41289993	rs3767940	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=511;ReadPosRankSum=1.899;SC=ATTCTCTGTCTTCATCCTCTC;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=36;WE=41290001;WS=41289983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr1	41292377	rs2025897	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=732;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GTACCCCCTCGCCTGCTCCTC;SOR=0.855;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=50;WE=41292385;WS=41292367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr1	41327873	rs12081504	G	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=1.443;SC=GCCAGCGGCTGCTCTGCGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=16;WE=41327881;WS=41327863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	41453286	rs5773721	GT	G	3109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=67;PP=2787;SC=TAAGGGCACAGTTAACAGTCA;SOR=2.861;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=67;WE=41453294;WS=41453276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	41454425	rs6675122	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.339;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	41456823	rs200861913	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=20.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.462;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.916;SOR=4.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr1	41466681	rs140062309	CCT	C	1035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=830;ReadPosRankSum=1.833;SC=GCTTTTCTCCCCTGTCTGAAT;SOR=1.030;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=21;WE=41466690;WS=41466671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr1	41466803	rs12718433	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=1.594;SC=AGTAGAGTTCGCTGCCTTGGG;SOR=0.557;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=19;WE=41466811;WS=41466793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr1	41473283	rs41308258	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=1.446;SC=TCTTAGGGTGATGCTGTGGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=41473291;WS=41473273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	41475085	rs12144160	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=465;ReadPosRankSum=0.612;SC=AACCTTCACAATGAAGCTGTT;SOR=1.545;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=25;WE=41475093;WS=41475075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr1	41485902	rs3738368	C	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=487;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTTACCTCTCTGTGGCTGAA;SOR=1.645;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=29;WE=41485910;WS=41485892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr1	41494222	rs11578697	G	T	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=698;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TCTCCACACAGGTTCCTACTG;SOR=0.672;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=51;WE=41494230;WS=41494212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,73:0.43:169
chr1	41540853	rs2011981	A	T	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=44.87;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	41540861	rs2011982	T	C	5876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=42.90;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	41541166	rs41269465	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=0.601;SC=CTCCCCCCTGCATTCTCATCC;SOR=1.140;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=6;WE=41541174;WS=41541156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	41582470	rs11209563	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.098;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=144;ReadPosRankSum=0.734;SC=CATAAGCTACTAAAAAATCCT;SOR=0.057;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=12;WE=41582478;WS=41582460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	41582760	rs11209565	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=280;ReadPosRankSum=0.461;SC=AGCCACCCAGGTGCCGAGGCA;SOR=0.660;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=17;WE=41582768;WS=41582750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr1	41618442	rs213768	A	T	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=33;PP=944;SC=CACTGAATGAAGAAATCTAAA;SOR=1.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=41618450;WS=41618432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	41627206	rs11209604	C	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=138;SC=AAGTAATCCACTTCCGAGATT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=41627214;WS=41627196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	41651697	rs12139225	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=244;ReadPosRankSum=1.299;SC=AAAGGATAACGAGTAGTCTAA;SOR=0.380;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=17;WE=41651705;WS=41651687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr1	41848060	rs12092825	C	T	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;SC=CCTGGCACCGCCGGGCCACGC;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=41848068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	41848296	rs4359027	G	A	5842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=101;PP=2965;SC=CCCTGCCTCCGCCGCCGCCGG;SOR=0.949;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=81;TCR=101;TR=181;WE=41848304;WS=41848283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	41949595	rs2759256	G	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=473;SC=ATATTAGCCAGTGCCTCCATC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=41949603;WS=41949585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	41949628	rs2759257	A	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=8;PP=801;SC=GAGAGATGGAATGTGTCAACG;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=41949636;WS=41949618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	41950312	rs2984691	T	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=45;PP=1193;SC=GAGCAGGGAGTGCCTGTTGCC;SOR=1.320;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=71;WE=41950320;WS=41950302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr1	41978566	rs2991344	T	G	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=27;PP=1273;SC=AACCCGTGGGTCCAGCCCCAA;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=41978574;WS=41978556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	41978825	rs2483689	C	G	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=54;PP=2965;SC=CAAGGGAGAGCGCCCATGCCC;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=144;WE=41978833;WS=41978815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	41979156	rs615177	A	G	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1566;ReadPosRankSum=0.592;SC=TGCCTCGTGTAGCCTCCGTGC;SOR=0.327;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=72;WE=41979164;WS=41979146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr1	41983912	rs2810547	C	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=7;PP=1065;SC=TTGTCTGATACTTGGGAGAAC;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=41983920;WS=41983902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	42046613	rs12132697	G	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=645;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GGGGGTAGCCGGATGTCACTG;SOR=0.959;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=38;WE=42046621;WS=42046603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr1	42046812	rs2810565	C	T	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=37;PP=1507;SC=AGGAAGGGGGCTGCCTGAAGG;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=42046820;WS=42046802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	42047300	rs41269473	A	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1368;ReadPosRankSum=0.461;SC=TCCAACTCAGATTCTGGAGGC;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=87;WE=42047308;WS=42047290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,95:0.50:189
chr1	42048745	rs2810566	T	C	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=76;PP=2548;SC=GTGACTGCTGTGGCTCAGGGC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=139;WE=42048753;WS=42048735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	42049032	rs2984694	G	A	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=62;PP=2188;ReadPosRankSum=0.572;SC=TGTCGATCTCGCTGGTGTCCA;SOR=1.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=99;WE=42049040;WS=42049022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr1	42049140	rs2475842	C	G	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=49;PP=2965;SC=CTTCGGTGGACAGGGGCAGGA;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=136;WE=42049148;WS=42049130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	42050366	rs2146315	C	T	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1250;ReadPosRankSum=1.343;SC=GGGTATGGGACGCTGGAAGAA;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=79;WE=42050374;WS=42050356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,99:0.57:174
chr1	42629040	rs2232224	A	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=7;PP=855;SC=GTATTCCCGAACCCCACCAAT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=42629048;WS=42629030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	42630364	rs2071499	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=23;PP=1079;SC=GCACAGTGCGGAGAGCAGGAA;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=42630372;WS=42630354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	42647536	.	TCA	T	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=59.68;NF=1;NR=1;PP=37;QD=20.0;SC=CCTGGAGTGCTCACACACACA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=2;WE=42647545;WS=42647526;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,2:0.13:15
chr1	42693597	rs343376	A	G	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=72;PP=2639;SC=AGTAGGCAGCACATCTTCCTT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=141;WE=42693605;WS=42693587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	42846786	rs11210626	G	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=999;SC=AGGCGGGCCCGGGGAGGGCAG;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=42846794;WS=42846776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	42865468	rs56751964	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=413;SC=ATGCCTTGGCGTCTTCCCTTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=42865476;WS=42865458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	42870338	rs1105670	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=465;SC=CTGGACAAGACACTCCTCAAG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=42870346;WS=42870328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	42880516	rs1055055	T	C	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=35;PP=1989;ReadPosRankSum=0.378;SC=CTACCTCTAGTGAAAGTGAGC;SOR=0.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=91;WE=42880524;WS=42880506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr1	42898843	rs1034268	A	G	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=56;PP=2965;SC=AGGTAGTAAAACATGACCAGG;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=150;WE=42898851;WS=42898833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	42901082	rs3748845	A	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=695;ReadPosRankSum=-0.929;SC=ATGGTAATACAACAAGCAGGC;SOR=1.130;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=36;WE=42901090;WS=42901072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr1	42901173	rs4660634	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=1.912;SC=GGTTCTCTCTCTTACTGTGCC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=42901181;WS=42901163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	42915753	rs11210647	T	C	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.067;SC=ACATAGACTTTATGATCTTTA;SOR=0.657;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=64;WE=42915761;WS=42915743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr1	42948562	rs202122677	GA	G	611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=165;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TGGAACATGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=17;WE=42948570;WS=42948552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	42948585	rs6656344	C	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=0.090;SC=CACTGAGAAACAAGTCTTTAA;SOR=0.752;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=42948593;WS=42948575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	42956001	rs72659920	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.925;SC=CCCAGGAGTTGGAGGTTGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=42956009;WS=42955991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	42956034	rs72659921	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GTGCCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=42956042;WS=42956024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	42962800	rs3748841	A	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=954;ReadPosRankSum=-1.098;SC=CAAAGGAACAAAATCAGAGAC;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=73;WE=42962808;WS=42962790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,93:0.46:201
chr1	42986956	rs72659942	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=-0.644;SC=GGCCAAGTATTTTCTAATTTC;SOR=0.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=6;WE=42986964;WS=42986946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	43002347	rs72659956	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.016;SC=ATTTTTAAATAAAGTATAACT;SOR=0.871;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=9;TCR=69;TR=32;WE=43002366;WS=43002337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr1	43002358	rs72659958	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.231;SC=AAGTATAACTATGTGTCTCAG;SOR=0.733;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=25;WE=43002366;WS=43002337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr1	43002744	rs4660643	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=526;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CCATAGCACTGTAGAATACGT;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=28;WE=43002752;WS=43002734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr1	43011030	rs11210668	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=2.208;SC=TTTCACAGCTATAAATAAAAG;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=43011038;WS=43011022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	43011389	rs6661835	A	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=235;SC=AGACTGAGGCAGGCAGATCGC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=43011405;WS=43011379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	43011396	rs142311566	TCG	T	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GGCAGGCAGATCGCTTGAGCT;SOR=0.250;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=43011405;WS=43011379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	43021810	rs12038786	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=893;SC=AGATTTTATTCTTATATTTGC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=43021818;WS=43021800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	43023713	rs71798684	G	GA	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.174;NF=8;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=0.335;SC=TATATGGTGGGAAAAAAAATA;SOR=0.297;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=13;WE=43023721;WS=43023703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	43030115	rs112012010	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5324;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCCCAAGTAGCTGGGACTACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=43030123;WS=43030105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	43030158	rs67724541	G	A	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.7323;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=35;SC=TAAGGGTTTCGCCATGTTGAC;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=43030166;WS=43030148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	43030190	.	A	ACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGG	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.60;QD=55.35;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	43042703	rs12049046	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=888;ReadPosRankSum=0.007;SC=AAAGATTGAACTAAAGCATGC;SOR=1.659;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=52;WE=43042711;WS=43042693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,59:0.42:139
chr1	43047057	rs12037518	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=341;ReadPosRankSum=-1.027;SC=GGAAATTAGAACATGCTCATA;SOR=2.303;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=16;WE=43047065;WS=43047047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr1	43054909	.	T	C	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5032;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=80;QD=22.9542425094;SC=AAAAAAAAAATCCCTTGTGAT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=43054917;WS=43054908;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,5:0.71:7
chr1	43055243	rs10789417	C	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=632;SC=TTTACTAAACCTAATCCTTTA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=43055251;WS=43055233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	43076555	rs201279077	CTT	C	150.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	43102844	rs16829822	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=220;SC=AAGGTGCATATTGAGGATGCA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=43102852;WS=43102834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	43108188	rs12036818	G	A	5858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=75;PP=2965;SC=ATGATACCCTGCTTCTAGAAA;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=110;TCR=75;TR=185;WE=43108196;WS=43108178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	43110276	rs7523056	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=244;SC=TCTAAGATCCGGGGCCAGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=43110284;WS=43110266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	43111741	rs16829824	G	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=306;SC=TGTGTCAAAGGTACTAACTTC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=43111749;WS=43111731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	43124220	rs3820545	G	A	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=57;PP=2014;SC=TGCGCCGAAGGGAAACTGCTC;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=43124228;WS=43124210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	43124701	rs6600419	A	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=50;PP=1700;SC=TGATTCCTCCATGCATTGCTC;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=43124709;WS=43124691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	43124859	rs3738494	C	T	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=65;PP=2965;SC=ACGACTGTGACATCATAGTGA;SOR=0.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=156;WE=43124867;WS=43124849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	43131653	rs12244	G	A	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=51;PP=1894;SC=TCCATCAGGCGAACAGTGGTC;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=43131661;WS=43131643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	43148483	.	GGGCGCGCGGCCGGTGGGCACCGACTCCGC	G	99.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.05;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	43162182	.	G	GC	185	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MMLQ=15;MQ=59.02;NF=8;NR=3;PP=185;QD=17.6363636364;SC=ACGCAGTTGCGCCCCCCCCCC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=11;WE=43162190;WS=43162172;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,11:0.69:16
chr1	43212431	rs4660662	A	G	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=39;PP=1934;SC=GTTCGGGGGGACCCTGCTGGG;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=43212439;WS=43212421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	43213499	rs3738499	C	T	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=29;PP=858;SC=CTCATCATGGCCCTTCCCTGC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=43213507;WS=43213489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	43228189	rs2816593	T	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=29;PP=833;SC=TCACATCCAATCTCTGAACGT;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=43228197;WS=43228179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	43239395	rs2760075	G	A	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=56;PP=1588;SC=GTTTATAATCGTTGTGACTTT;SOR=3.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=65;WE=43239403;WS=43239385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	43296118	rs12124733	G	A	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=29;PP=1621;SC=GTCCTAGTTCGGATGGAGATG;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=43296126;WS=43296108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	43302971	rs1466548	C	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=82;SC=ACTGTACACACATGCACACAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=43302979;WS=43302961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	43305753	rs12034000	G	A	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=39;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TGTAACTTCCGTACCAACTTA;SOR=0.561;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=195;TCF=122;TCR=73;TR=99;WE=43305761;WS=43305743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr1	43315531	rs56653907	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=221;ReadPosRankSum=-0.957;SC=GGCACTCTTATGTGTTTAGTT;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=16;WE=43315539;WS=43315521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	43409199	rs41310434	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=357;ReadPosRankSum=-0.521;SC=TGGCCGGGCCATTTCCTGGGG;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=26;WE=43409207;WS=43409189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr1	43418026	rs2297972	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=32;PP=1205;SC=CACTCAGGCCCACACTCAGCC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=43418034;WS=43418016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	43630229	rs12135134	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GGGTGAGGACGAACAGAACTG;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=28;WE=43630237;WS=43630219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr1	43649393	rs663336	T	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=627;ReadPosRankSum=-0.708;SC=ACTATCTAGCTCACACCTGGG;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=39;WE=43649401;WS=43649383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr1	43649508	rs663824	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=-1.662;SC=GGAACCTACCAATGGCTCAAA;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=24;WE=43649516;WS=43649498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr1	43650741	rs598336	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=327;ReadPosRankSum=-1.233;SC=CCAGTGACAGTCTTCTTTCTC;SOR=0.504;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=21;WE=43650749;WS=43650731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	43652369	rs6413971	T	C	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=62;PP=2946;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TGTTTTGCATTTTGGGCAGAT;SOR=0.263;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=132;WE=43652377;WS=43652359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr1	43663376	rs513009	A	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=739;ReadPosRankSum=1.245;SC=AAGGAATGAAAGGCTTGCCTA;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=44;WE=43663384;WS=43663366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,52:0.47:111
chr1	43672636	rs11210812	T	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.418;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=0.251;SC=TCTGGGCTGGTGCACGGATCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=9;WE=43672644;WS=43672626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	43675467	rs2453412	G	A	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TTGTCATCTCGCATTCTGGAC;SOR=0.936;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=75;WE=43675475;WS=43675457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,85:0.47:181
chr1	43680855	rs4233492	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=465;SC=GAAGCCTTGCGCAACAGCTGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=43680863;WS=43680845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	43681184	rs612626	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CCTGGCTACACCCTATGCCCA;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=43681192;WS=43681174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	43692506	rs143693731	G	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=1.422;SC=GGGAGTGCCAGCCTCTGTACT;SOR=0.171;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=12;WE=43692514;WS=43692496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	43699813	rs3820588	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=74;ReadPosRankSum=1.502;SC=TATGCCCAGTATGGCCCCTGG;SOR=0.250;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=43699821;WS=43699803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	43699935	rs2477561	C	T	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=36;PP=2138;SC=CAGAAGGAAACGTCTCTGATT;SOR=1.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=111;WE=43699943;WS=43699925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	43738340	rs10890247	A	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=15;PP=915;SC=CTGTGATCTGAACCCTCTGAC;SOR=1.390;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=43738348;WS=43738330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	43771016	rs3831248	TA	T	1951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1583;ReadPosRankSum=-1.192;SC=AGAGCAACGGTAAAGAGGGGC;SOR=0.977;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=47;WE=43771024;WS=43771006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr1	43771090	rs3120044	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.019;SC=TGACCCATGGGACCCTCAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=16;WE=43771098;WS=43771080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	43773033	rs2275180	A	G	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;ReadPosRankSum=1.004;SC=CTTGGAGGGTAAGGGCGACAG;SOR=1.639;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=37;WE=43773041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr1	43774437	rs1467809	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=0.076;SC=GCAGGTATTAGACGGTATCGG;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=43774445;WS=43774427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr1	43782846	rs1198982	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=150;ReadPosRankSum=0.550;SC=TGGACCGTCTGCCCTCTTGTC;SOR=0.582;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=13;WE=43782854;WS=43782836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	43784956	rs1199039	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=402;ReadPosRankSum=0.933;SC=GAGAGAACCTAGCCTCCAAGA;SOR=0.297;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=25;WE=43784964;WS=43784946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr1	43825583	rs145443590	T	TTGAG	852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=794;ReadPosRankSum=0.919;SC=CTATCTAAGATTGAGGGCAAG;SOR=0.699;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=16;WE=43825591;WS=43825573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	43826312	rs710251	C	A	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.510;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=51;PP=1718;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TGCCCACCCTCCCCTTGACTG;SOR=0.924;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=315;TCF=169;TCR=146;TR=122;WE=43826320;WS=43826302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,164:0.42:387
chr1	43855578	rs839753	G	C	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CCGAGGTAGCGAGGTCAGGGG;SOR=0.452;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=144;TCF=46;TCR=98;TR=71;WE=43855586;WS=43855568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,74:0.46:160
chr1	43907092	rs12407785	G	A	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1045;ReadPosRankSum=1.523;SC=GGGTATGGGTGTGAAGTCACA;SOR=0.743;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=78;WE=43907100;WS=43907082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,89:0.54:164
chr1	43916642	rs6954	T	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=849;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GAAGCACTTGTGGCCACCGTC;SOR=0.543;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=68;WE=43916650;WS=43916632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,86:0.47:182
chr1	43919413	rs6692611	A	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGGAGGCCGGAGAGCTCGGGG;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=29;WE=43919421;WS=43919403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr1	43919486	rs182798940	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=1.428;SC=CCGGGCCGGGCGGAGTCCGCG;SOR=0.560;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=15;WE=43919494;WS=43919476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr1	43998397	rs11350891	GT	G	1710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1043;SC=GAAAATCCCTGTTTTTTTACT;SOR=1.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=38;WE=43998405;WS=43998387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	44035352	rs1065771	C	T	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=685;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TGCTATGTGCCGCAGGCGGAA;SOR=0.250;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=48;WE=44035360;WS=44035342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,63:0.56:113
chr1	44044468	rs11210874	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=384;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CCTCTCGCTTCGTGTACCCAC;SOR=0.478;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=28;WE=44044476;WS=44044458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr1	44057257	rs2304353	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=0.875;SC=GGCAGCCAACAGCAGAGAAGG;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=22;WE=44057265;WS=44057247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	44057668	rs7540068	G	T	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=968;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GTCCCTGAGGGTCTGTGATGG;SOR=0.782;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=65;WE=44057676;WS=44057658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr1	44057696	rs7553297	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=715;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CCAGGAGGGTATTTTCTGGAT;SOR=0.925;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=45;WE=44057704;WS=44057686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr1	44058034	rs2117316	G	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=817;ReadPosRankSum=0.552;SC=GCCGTGGTGGGTCCAGAGGTG;SOR=1.779;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=95;TCF=80;TCR=15;TR=45;WE=44058042;WS=44058024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr1	44058265	rs3828151	C	A	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=63;PP=1755;SC=CCCGCACAGCCCAGTCCAGTA;SOR=2.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=16;TCR=63;TR=79;WE=44058273;WS=44058255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	44064319	rs17849103	A	G	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=41;PP=2391;SC=CAGGACCCTCAAGTTTGCTGT;SOR=1.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=87;TCR=41;TR=128;WE=44064327;WS=44064309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	44067859	rs12023161	A	G	4321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=80;PP=2722;SC=GCTAGCCTGCACTGCCAAGAT;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=142;WE=44067867;WS=44067849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	44071221	rs631248	G	A	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=64;PP=2178;SC=TTGTTGTGGTGCCCATTGACC;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=109;WE=44071229;WS=44071211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	44072018	rs1065772	C	T	3802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=64;PP=2225;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TCCCGGAGACCTTTACCTTGG;SOR=0.488;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=252;TCF=146;TCR=106;TR=141;WE=44072026;WS=44072008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,172:0.56:309
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chr1	44078359	rs3791149	T	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=406;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GTGATGGTGCTGTAAGCAGAA;SOR=1.199;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=23;WE=44078367;WS=44078349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr1	44078384	rs499257	T	C	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=854;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TTAACGGGCTTTCTTTTCTTG;SOR=0.966;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=48;WE=44078392;WS=44078374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr1	44078604	rs10890267	A	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=0.008;SC=TTCTCCCCCAATCCCACTGTC;SOR=0.494;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=24;WE=44078612;WS=44078594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr1	44079411	rs603542	T	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=509;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CCCCCTACCATGTGCCTGGCC;SOR=1.568;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=35;WE=44079419;WS=44079401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr1	44083110	rs571862	C	T	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=20;PP=1664;SC=TCTCCATTCTCTGCAGTCCAT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=44083118;WS=44083100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	44083507	rs641365	T	C	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=87;PP=2375;SC=AGACCATGGGTGATTTCTGGA;SOR=1.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=145;WE=44083527;WS=44083497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	44083519	rs641351	G	A	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=83;PP=2647;SC=ATTTCTGGAGGATGGTGTGGG;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=136;WE=44083527;WS=44083497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	44084620	rs16831024	G	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=670;ReadPosRankSum=1.915;SC=TGAGTCCCATGGGGAAGTGGC;SOR=0.532;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=38;WE=44084628;WS=44084610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr1	44084739	rs1143701	C	T	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=69;PP=2781;SC=GTGAGAAGCGCGAGCTGCGTC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=151;WE=44084747;WS=44084729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	44086080	rs568639	T	C	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=51;PP=2595;SC=ACCCCTCCCCTATTCCTTCTC;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=126;WE=44086088;WS=44086070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	44086831	rs1143702	C	T	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1261;ReadPosRankSum=-2.063;SC=GCATGCGCTACGAGGGCGTGG;SOR=0.845;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=183;TCF=79;TCR=104;TR=85;WE=44086839;WS=44086821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,111:0.48:233
chr1	44087496	rs673485	C	T	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=15;PP=1421;SC=GGGTCCAGCACCTGCTCTTGG;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=44087504;WS=44087486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	44119038	rs3215842	A	AT	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.097;NF=1;NR=12;PP=288;ReadPosRankSum=-0.633;SC=GAGCAGTAAGATTTTTTTCCT;SOR=0.622;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=44119046;WS=44119028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	44125962	rs3215843	CA	C	2213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=15;PP=1997;SC=TTTTTACTTTCAAAAAGGTAC;SOR=2.505;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=54;WE=44125970;WS=44125952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	44126143	rs76017264	C	T	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.525;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=55;PP=1413;ReadPosRankSum=1.173;SC=ACCTTTTTTTCGGCCCGGCAC;SOR=1.216;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=129;TCF=38;TCR=91;TR=74;WE=44126151;WS=44126133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,79:0.52:151
chr1	44137257	rs586339	C	A	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=51;PP=2301;SC=GAAGAACAAGCAGCAGCTGCC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=106;WE=44137265;WS=44137247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	44280381	rs37468	A	T	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=1004;SC=AACTTGGTCCATCACAAAACA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=44280389;WS=44280371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	44280425	rs3791064	T	G	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=25;PP=1819;SC=TTTATGTATTTAGTTACGTTC;SOR=1.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=44280433;WS=44280415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	44323736	rs2906465	T	C	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=18;PP=1081;SC=AACAGGTTTTTGAAGTGAATA;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=44323744;WS=44323721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	44386305	rs3120802	C	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=614;SC=GTGGGTGGGGCAGTGCTTCTG;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=44386313;WS=44386295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	44386615	rs3120803	A	G	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=38;PP=1117;SC=GGGGCTGGGTATGGGGGCAAT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=44386623;WS=44386605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	44395786	rs2108202	C	T	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=38;PP=1511;SC=CAACTGATCACTTCATCTCTC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=74;WE=44395794;WS=44395776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	44401384	rs2242637	A	G	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=69;PP=2333;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TGGCCTAGGCAGCAGGTGAGT;SOR=0.305;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=124;WE=44401392;WS=44401374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr1	44415415	rs2240447	C	T	10553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=169;NR=160;PP=2965;SC=TGATGCCTGACGCTTGGCCAT;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=169;TCR=160;TR=329;WE=44415423;WS=44415405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr1	44426025	rs2301993	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=28;PP=966;SC=CTTGCCCTCCGCTCCCATAGT;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=44426033;WS=44426015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	44426948	rs2906596	G	A	5022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=98;PP=2965;SC=GGTCCTGACCGGGGTCTCTGC;SOR=1.439;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=50;TCR=98;TR=148;WE=44426956;WS=44426938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	44432500	rs4660759	C	G	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=69;PP=2605;SC=CCAGTGCCCTCCCCTGCCCAG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=107;WE=44432508;WS=44432490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	44442521	rs12410334	A	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=997;ReadPosRankSum=1.546;SC=GTATGAATGCAAAATGCTGGG;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=41;WE=44442529;WS=44442511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	44451124	.	G	T	247	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=247;QD=28.1771212547;SC=GAGGGGGGGTGCAGACTGGGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=44451132;WS=44451114;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	44457215	rs12403025	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=4;PP=387;SC=ACCAAACACGGGAGGGGGCGG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=44457223;WS=44457205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	44457305	rs12403036	G	A	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=24;PP=1469;SC=CCCACTGCCTGGTTTCTGGGC;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=44457313;WS=44457295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	44457739	rs11376967	T	TC	1091.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=22;PP=1170;SC=ATTTCCCACCTCTGCGGGTCC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=26;WE=44457747;WS=44457729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	44594966	rs2485653	G	A	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=986;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TGGGGATGAAGAGGAGGAACA;SOR=0.752;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=53;WE=44594974;WS=44594956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr1	44595113	rs2429051	G	C	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=66;PP=1883;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GGCCTACCAAGCATTCAGCAC;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=106;TCR=128;TR=117;WE=44595121;WS=44595103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,135:0.50:272
chr1	44595410	rs2485652	A	G	3263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.888;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=2077;ReadPosRankSum=-0.358;SC=ATGCCCCCCAATGGGCTGCCA;SOR=0.504;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=94;TCR=101;TR=123;WE=44595418;WS=44595400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,141:0.63:225
chr1	44595426	rs2429050	G	A	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=1995;ReadPosRankSum=0.687;SC=TGCCAGTCTCGGCTTCCACTG;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=184;TCF=87;TCR=97;TR=114;WE=44595434;WS=44595416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,126:0.60:209
chr1	44595995	rs35084281	G	GC	504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.492;NF=0;NR=18;PP=507;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AGCTAGACTGGCCCCCCGACT;SOR=0.789;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=18;WE=44596003;WS=44595985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	44679556	rs803369	A	G	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=1032;ReadPosRankSum=-2.639;SC=GAAAGCGTTGACTAGGGGAGG;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=64;TCR=84;TR=65;WE=44679564;WS=44679546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr1	44679675	rs74615948	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=176;ReadPosRankSum=1.743;SC=GAATATGTGTCATCCTTGATG;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=12;WE=44679683;WS=44679665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr1	44685815	.	A	G	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=818;ReadPosRankSum=-1.646;SC=ATGCTGCGGCACCGTCATGAG;SOR=0.737;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=56;WE=44685823;WS=44685805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr1	44686140	rs41264674	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=585;ReadPosRankSum=0.748;SC=ACCAGTGGGCGTCCTTGTCCC;SOR=0.430;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=36;WE=44686148;WS=44686130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	44749881	rs16831828	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=109;ReadPosRankSum=0.446;SC=GCTCACTATCGTAGCCACACA;SOR=0.653;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=7;WE=44749889;WS=44749871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	44788398	rs161721	A	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=18;PP=774;SC=ACTTCTTACCATCCCATATTG;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=44788406;WS=44788388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	44818635	rs80152700	C	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=502;ReadPosRankSum=-0.881;SC=AAGTCTATTTCAATACCAAGG;SOR=0.902;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=29;WE=44818643;WS=44818625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr1	44878464	rs12131249	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=-0.513;SC=TCAACAGGTCGGTGGCGTTTT;SOR=0.562;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=9;WE=44878472;WS=44878454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr1	44878509	rs11210991	C	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=395;SC=CCAACTACTTCCCTTTCACTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=44878517;WS=44878499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	45170012	rs12088087	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=47;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCTTGCGTCAACCACAGGGTG;SOR=0.042;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=45170020;WS=45170002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	45443894	rs2487367	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=1.151;SC=CAGAGCGAGGTTCTGTCTCAA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=45443902;WS=45443884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	45444038	rs11556200	G	A	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1638;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCATGTCAGCGTCATCAGGAA;SOR=0.628;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=115;TCR=96;TR=108;WE=45444046;WS=45444028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,126:0.48:261
chr1	45469176	rs12749251	A	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=16;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.483;SC=ACTCCTCCCAAGGGCTCATGT;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=78;TCR=29;TR=60;WE=45469184;WS=45469166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,76:0.60:127
chr1	45470130	rs7528534	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=19;PP=608;SC=TGTGGCCTTTTAGCAGCAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=45470138;WS=45470120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T,TTG	790.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.09;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=7,7;NR=6,6;PP=209,414;SC=CCTCGAGCAGTTGTGTGTGTG;SOR=1.828;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=13,13;WE=45472811;WS=45472788;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.39:23
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chr1	45474157	rs2298006	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=288;ReadPosRankSum=0.575;SC=AGACACACAAGGCTCAATGTT;SOR=0.328;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=19;WE=45474165;WS=45474147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr1	45474750	rs2275599	A	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr1	45474755	rs2275598	C	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
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chr1	45476489	rs3806405	A	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=638;ReadPosRankSum=0.724;SC=TACAGGGGAGAAAAGGCAAAC;SOR=0.375;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=42;WE=45476497;WS=45476479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr1	45476663	rs2298005	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.939;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr1	45479772	rs11211066	G	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=-0.847;NF=18;NR=21;PP=661;ReadPosRankSum=0.074;SC=GAAATAGGCTGGGATTTGGTC;SOR=0.540;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=39;WE=45479780;WS=45479762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr1	45479874	rs6698485	G	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=644;SC=GTGATCTAGCGGAGCAGCCAA;SOR=2.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=45479882;WS=45479864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	45504858	rs61788380	G	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=690;ReadPosRankSum=0.876;SC=TCAAATAAAAGCTTCTCTATT;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=39;WE=45504866;WS=45504848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr1	45524213	rs3738246	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=0.668;SC=ATGGCAAGGGCTCATAAACAC;SOR=0.350;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=11;WE=45524221;WS=45524203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	45671599	rs188223265	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=2.468;SC=GCCCCGGGGGGTGGCTGCGGC;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=45671607;WS=45671589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	45671966	rs4454584	A	G	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=63;PP=2265;SC=ACTGCCGCTTAGCCGGAGAGA;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=45671974;WS=45671956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	45796269	rs3219493	G	C	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=55;PP=1902;SC=GGCACTTTTTGCAAAAGAGAT;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=45796277;WS=45796259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	45797505	rs3219489	C	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=203;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACAGGTGGCACTGTCCAGTGT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=11;WE=45797513;WS=45797495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	45798555	rs3219487	T	C	5777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=75;PP=2965;SC=GTCCCTCTATTGTTCCTATTT;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=92;TCR=75;TR=167;WE=45798563;WS=45798545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	45800156	rs3219484	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=462;ReadPosRankSum=1.636;SC=CCACTTCCCACGGCTGCTCGT;SOR=0.959;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=39;WE=45800164;WS=45800146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr1	45805566	rs3219468	G	C	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=68;NR=74;PP=2837;SC=CCCACTACCCGCTACCCGCGG;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=68;TCR=74;TR=142;WE=45805574;WS=45805556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	45810865	rs17853159	G	A	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=60;PP=1692;ReadPosRankSum=1.033;SC=GGCAAGGAACGCCACCGGCGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=94;TCR=117;TR=107;WE=45810873;WS=45810855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,129:0.54:238
chr1	45810923	rs3893383	G	A	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1402;ReadPosRankSum=1.936;SC=GCATAGTTCCGGGCCCTGGTG;SOR=0.588;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=85;TCR=90;TR=76;WE=45810931;WS=45810913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,81:0.42:191
chr1	45813441	rs2298018	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=315;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TTCCTCCACCTCAAGGATGGG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=16;WE=45813449;WS=45813431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	45813820	rs2153607	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=2.545;SC=CACTGGTCAGGTCAGGGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=13;WE=45813828;WS=45813810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr1	45887288	rs3790582	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GCAAGATAGATTCAGCATGAT;SOR=0.257;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=45887296;WS=45887278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	45961955	rs937290	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=0.428;SC=TCATGGGCTCAGGTGGAACCA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=45961963;WS=45961945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	45962894	rs61788289	T	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.23;ReadPosRankSum=3.574;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr1	45965340	rs7546268	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=743;ReadPosRankSum=-2.642;SC=CTTGCTCTCCTAGCGGGGGAT;SOR=1.165;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=9;TCR=64;TR=35;WE=45965348;WS=45965330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
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chr1	45984852	rs34857974	ATGT	A	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=377;ReadPosRankSum=1.179;SC=AATACATTAAATGTTGTTTTA;SOR=1.493;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=45984862;WS=45984842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr1	46073489	rs2230657	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=510;ReadPosRankSum=1.847;SC=CTTTAGACCCGACAGTCAAGC;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=33;WE=46073497;WS=46073479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr1	46078854	rs2230658	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=355;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CTGAAGGCTCAGAAGAGGATG;SOR=1.242;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=28;WE=46078862;WS=46078844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	46078884	rs2230659	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=365;ReadPosRankSum=-2.074;SC=ATGATAAGACCGAAGAAATGC;SOR=0.957;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=27;WE=46078892;WS=46078874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr1	46080530	rs2991985	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.277;SC=TTAAAAGTCATTTTGACTTTC;SOR=0.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=46080538;WS=46080520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	46080947	rs1972410	A	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1450;ReadPosRankSum=1.245;SC=TTCTTTTTTGAGCCATTACTA;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=87;WE=46080955;WS=46080937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,98:0.54:183
chr1	46081940	rs2356581	T	A	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=10;PP=1385;SC=GGTGATGGGTTCCTGTTACAA;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=46081948;WS=46081930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	46081960	rs2253862	C	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.405;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=534;ReadPosRankSum=2.034;SC=AGGCTGTGGGCGGCCTGGGTT;SOR=1.486;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=35;WE=46081968;WS=46081950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr1	46082431	rs2991988	C	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=715;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CATTTTTAATCCCTTTCCTAT;SOR=0.811;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=45;WE=46082439;WS=46082421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr1	46085879	rs2275086	C	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=183;ReadPosRankSum=-1.339;SC=GAGTAGTAAACCTGTAGGTCT;SOR=0.576;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=12;WE=46085887;WS=46085869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	46086077	rs3014246	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=449;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GGTGAGGAAGCTGGCTTCCAG;SOR=0.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=29;WE=46086085;WS=46086067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr1	46086913	rs3014245	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=165;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TAAGCCTCAACTGTGGCAGAG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=46086921;WS=46086903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	46087577	rs3014242	G	A	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.202;NF=22;NR=42;PP=1113;ReadPosRankSum=0.738;SC=TGGTGGCAGCGGTGGTGCCAC;SOR=1.171;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=64;WE=46087585;WS=46087567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,72:0.41:174
chr1	46087879	rs3014241	A	G	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=25;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.127;SC=GGGAGAGATAAGTGGGATGGG;SOR=1.182;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=165;TCF=106;TCR=59;TR=79;WE=46087887;WS=46087869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,83:0.43:194
chr1	46089225	rs3014240	C	G	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=41;PP=1745;ReadPosRankSum=0.835;SC=GTAGGTAGCTCTACCTCCTCT;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=189;TCF=112;TCR=77;TR=104;WE=46089233;WS=46089215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,125:0.56:222
chr1	46094027	rs1250	A	G	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=807;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GGGAGAACAGACTGGAACTGC;SOR=0.408;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=56;WE=46094035;WS=46094017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr1	46095125	.	A	AT	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5165;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=66.43;NF=4;NR=0;PP=63;QD=31.7114401178;SC=TACTAAGGTAATCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=46095133;WS=46095122;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	46095127	rs74074404	C	T	144.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.12;QD=28.99;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	46095140	.	A	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=1.282;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	46095143	rs10159068	C	A	113.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.383;NF=5;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=1.383;SC=CCCCCCCACCCGATCTTTCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=46095151;WS=46095133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	46095272	rs1135812	T	C	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1298;ReadPosRankSum=0.488;SC=TGTGGAACTCTTTGAGCTCAT;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=72;WE=46095280;WS=46095262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,79:0.59:133
chr1	46096402	rs10708598	AT	A	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=0.171;SC=CAGCCCACAGATTTTTTTCCC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=46096410;WS=46096392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	46124663	rs6671802	A	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=622;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AAACCCTCTCATATTTGAGAA;SOR=0.624;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=48;WE=46124671;WS=46124653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr1	46160260	rs6658700	C	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=622;ReadPosRankSum=-1.799;SC=AAACTTATTTCACATGGTATA;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=40;WE=46160268;WS=46160250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr1	46165875	rs5773892	G	GA	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.002;NF=0;NR=16;PP=220;ReadPosRankSum=1.589;SC=GGTTAAGAGAGAAAAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=16;WE=46165883;WS=46165865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
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chr1	46166956	.	C	CT	93	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=20;MQ=57.9;NF=0;NR=8;PP=93;QD=13.125;SC=TAGTGTCTTACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=8;WE=46166964;WS=46166946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	46195211	rs139068713	TAAC	T	1585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.227;NF=19;NR=9;PP=1200;ReadPosRankSum=1.069;SC=TGTATAGTAATAACAACAAAA;SOR=0.346;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=28;WE=46195221;WS=46195201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr1	46195375	rs28375469	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=50;PP=1376;ReadPosRankSum=0.509;SC=TTTGGGAGATTTGCATACTTC;SOR=0.834;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=161;TCF=58;TCR=103;TR=76;WE=46195383;WS=46195365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,92:0.46:199
chr1	46206540	rs28507722	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=262;ReadPosRankSum=-1.184;SC=TGGATAATTAATCAACTAATT;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=15;WE=46206548;WS=46206530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	46290311	rs10561161	GTA	G	1657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.726;NF=1;NR=29;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.660;SC=ATATTTAAGTGTATATTAATT;SOR=0.756;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=30;WE=46290320;WS=46290301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr1	46347875	rs56242896	A	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	46347878	rs201525530	AT	A	1305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	46347910	rs6665193	G	A	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=20;PP=1258;SC=AGAAAAAGTTGTTATTTAGAA;SOR=1.488;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=63;WE=46347918;WS=46347900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	46348229	rs11211217	C	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TGACTTCTCCCACTAGGTCAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=46348237;WS=46348219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	46379518	rs4256763	A	G	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=86;PP=2852;SC=AAACGGAGGCAAGAGAGACTG;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=139;WE=46379526;WS=46379508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	46424964	rs4460582	G	A	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=20;PP=1244;SC=GCGGCCCGTGGAATGGTGTCC;SOR=1.410;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=46424972;WS=46424954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	46466721	rs11589562	T	C	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=3.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,111:0.52:214
chr1	46473802	rs3922887	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=1.071;SC=AACAAGGTACACTGGAAACTC;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=46473810;WS=46473792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	46473902	rs3922886	A	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=424;ReadPosRankSum=-2.055;SC=GTCTCTGGGGATGGCCATCTT;SOR=0.507;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=29;WE=46473910;WS=46473892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr1	46476587	rs11211247	T	G	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=39;PP=1575;SC=AACTTCAAGATAATTTGGAGA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=46476595;WS=46476577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	46485548	rs946529	G	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=249;ReadPosRankSum=0.786;SC=CAAATGTATGGTCCTGAGGGG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=46485570;WS=46485538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	46485562	rs946528	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=269;ReadPosRankSum=2.128;SC=TGAGGGGATGCGGCAGGGAGA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=6;WE=46485570;WS=46485538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	46487552	rs2275426	G	A	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,53:0.43:124
chr1	46487560	rs946524	A	G	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr1	46491635	rs785478	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=206;ReadPosRankSum=1.296;SC=AGTTCTCTAGCCCCCCGACCA;SOR=1.300;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=15;WE=46491643;WS=46491625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	46493460	rs1707336	T	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TGTCCAAAATTGGCCTCATGA;SOR=0.535;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=188;TCF=100;TCR=88;TR=87;WE=46493468;WS=46493450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,101:0.47:214
chr1	46495434	rs2236560	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=1.514;SC=CTGGCTTCTTGCTAGATTTGC;SOR=0.770;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=8;WE=46495442;WS=46495424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	46496709	rs925524	A	G	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=850;ReadPosRankSum=0.860;SC=TGTCTGAGTCATCCCACACAG;SOR=0.596;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=65;WE=46496717;WS=46496699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,68:0.56:121
chr1	46498375	rs1622208	A	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=761;ReadPosRankSum=-0.134;SC=CGGAGGTGGTAGAGCTGATCC;SOR=1.045;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=44;WE=46498383;WS=46498365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr1	46499526	rs1052607	A	G	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.484;SC=ACATCCATTAAAGTGGGGCCA;SOR=0.728;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=107;TCR=110;TR=114;WE=46499534;WS=46499516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,124:0.51:242
chr1	46500251	rs33931638	G	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=818;ReadPosRankSum=0.923;SC=CAGCTCCAGCGTGCCCAGTTC;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=48;WE=46500259;WS=46500241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,55:0.57:96
chr1	46511487	rs2297883	G	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=371;ReadPosRankSum=0.506;SC=ATGGGTCCTCGTTACTGTACA;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=18;WE=46511495;WS=46511477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
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chr1	46521559	rs785467	A	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=582;ReadPosRankSum=0.703;SC=CCAAAGCTTGATTCTTCAAAT;SOR=0.830;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=42;WE=46521567;WS=46521549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr1	46546208	rs1768803	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=425;ReadPosRankSum=-1.362;SC=GCTGGGATTATAGGCATGAGC;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=22;WE=46546216;WS=46546198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	46598269	rs1707304	C	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.57;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr1	46598273	rs1707303	A	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.62;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr1	46641741	rs11211261	A	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=185;SC=TAGAGATGGGATTTCACCGTG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=46641749;WS=46641738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	46655158	rs6659553	T	C	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=39;PP=1468;SC=ACCCCCACCATCAGGAAGTGG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=46655166;WS=46655148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	46806393	rs41293273	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.105;SC=GTATTTCCTTTCCCTTTTTTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=46806401;WS=46806383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	46806429	rs41293275	A	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=0.684;SC=GGTGGCGCTCACCACCTCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=46806437;WS=46806419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	46806480	rs17361749	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GTCGGAATTACCCCGTGGAGC;SOR=0.846;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=15;WE=46806488;WS=46806470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	46806550	rs41293277	C	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=639;ReadPosRankSum=0.452;SC=GCGTGTGGACCTCGCGACGGT;SOR=1.201;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=43;WE=46806558;WS=46806540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr1	46806703	rs10489769	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=1.613;SC=ACTCCACGGAACGTCCTTAGG;SOR=1.863;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=17;WE=46806711;WS=46806693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	46810405	rs79697925	TG	T	567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.242;NF=13;NR=4;PP=506;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GGCTCTGAGGTGGGGGTCAGG;SOR=1.270;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=17;WE=46810413;WS=46810395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr1	46810530	rs3737744	A	G	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.624;SC=TTTTGACATGACTTACAGTGT;SOR=0.789;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=74;WE=46810538;WS=46810520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,86:0.47:183
chr1	46810670	rs17361763	T	C	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1528;ReadPosRankSum=2.488;SC=GTGCCAAGGATTTTGTGAATG;SOR=0.537;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=89;WE=46810678;WS=46810660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,110:0.54:202
chr1	46810842	rs6684274	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=266;ReadPosRankSum=1.146;SC=ATGACTGGAGCGGTCCTGAGT;SOR=1.751;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=17;WE=46810850;WS=46810832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr1	46812444	rs17357676	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=2.342;SC=GTATAGATGAATGAATAAGTG;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=46812452;WS=46812434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	46812519	rs17361791	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=456;ReadPosRankSum=-2.130;SC=CAGAGGGCATAGACTTGGTGG;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=27;WE=46812527;WS=46812509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr1	46818442	rs41294478	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	46818452	rs17413701	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.874;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	46818479	rs7515598	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=191;ReadPosRankSum=0.265;SC=ACTCCATCAGCGCCATTGCTG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=12;WE=46818487;WS=46818469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	46818508	rs7529674	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=302;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TTTCATTGGGTCATGGCCTCT;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=16;WE=46818516;WS=46818498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr1	46826587	rs55887761	C	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=2.437;SC=AGACCATAACCCACACAAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=9;WE=46826595;WS=46826577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	46827214	rs324414	A	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=4;PP=618;SC=GCTCACTAGTAACTGCTTCTG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=46827222;WS=46827204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	46827485	rs1053624	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=393;ReadPosRankSum=0.182;SC=ATTTTGGCCCCATGTACTTCT;SOR=0.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=27;WE=46827493;WS=46827475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr1	46860237	rs72890727	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=-1.884;SC=AGCGTAGTGGGATGGGCGCGG;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=31;WE=46860245;WS=46860227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr1	46871986	rs324419	T	C	5421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=58;PP=2965;SC=CCCTGCTGTGTGAGGACATGT;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=106;TCR=58;TR=164;WE=46871994;WS=46871976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
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chr1	47013364	rs1258041	T	C	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=34;PP=986;SC=GCAGGCAGGATGGGAGGGCAG;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=47013372;WS=47013354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	47014821	.	A	AAAAAG	547	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=61.51;NF=8;NR=8;PP=547;QD=34.5625;SC=CTCAAAAAAAAAAAAGAAAAA;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=16;WE=47014829;WS=47014811;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
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chr1	47078637	rs4660947	T	C	3112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CCATGAGCAATGCCATATAGC;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=256;TCF=135;TCR=121;TR=115;WE=47078645;WS=47078627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,154:0.47:329
chr1	47080679	rs6671527	G	A	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1727;ReadPosRankSum=1.242;SC=CCGACTCTTCGACTTCTCACC;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=93;TCR=114;TR=106;WE=47080687;WS=47080669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,118:0.49:241
chr1	47099346	rs723333	C	A	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=896;SC=ACACATTTATCCATGGACACA;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=41;WE=47099354;WS=47099336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	47099433	rs201606021	T	TC	2050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.281;NF=15;NR=26;PP=1488;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TACTCCTTTTTCCATCATTTC;SOR=0.627;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=41;WE=47099441;WS=47099423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr1	47108828	rs736188	T	C	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=825;SC=TTCAGTGCCATGAGGTAAATC;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=47108836;WS=47108818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	47109089	rs1745377	A	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=37;PP=1079;SC=TTGGGTGGCTAGTGAGTTGGA;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=47109097;WS=47109079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	47110668	rs1258054	G	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=201;SC=ATTGAGGAGGGCCTAGAAAAC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=47110676;WS=47110658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	47110712	rs1258053	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=485;SC=AATTCATCTGCGCCACAATAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=47110720;WS=47110702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	47110766	rs3215990	G	GC	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=1273;SC=TTGAGCCTCAGCAAGGGTTTC;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=28;WE=47110774;WS=47110756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	47133811	rs11211337	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=0.404;SC=ACCCCGCTGCTGTCGGCGCCC;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=22;WE=47133819;WS=47133801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	47138444	rs616249	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=474;SC=GTGGATGGAGCGATTGATGCA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=47138452;WS=47138434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	47276728	rs2297812	G	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=1038;ReadPosRankSum=-1.646;SC=TAAGTCTGCGGAGCTGAGGTT;SOR=0.638;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=53;WE=47276736;WS=47276718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr1	47278997	rs4646486	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=0.518;SC=TATCCTGATATTCCAGCAGGA;SOR=0.321;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=47279005;WS=47278991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	47279175	rs4646487	C	T	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1200;ReadPosRankSum=0.867;SC=AGAGAAAGCTCGGGAGGGTAA;SOR=0.597;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=82;WE=47279183;WS=47279165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,103:0.52:197
chr1	47279558	rs4646489	CCCT	C	4922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.421;NF=26;NR=50;PP=2971;ReadPosRankSum=0.667;SC=CTAAGCCAATCCCTCCTCCTA;SOR=0.697;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=181;TCF=65;TCR=116;TR=76;WE=47279568;WS=47279548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,131:0.46:282
chr1	47283505	rs4646495	G	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GGTCATGAACGCTCTGTCACT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=47283513;WS=47283495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr1	47284526	rs3766196	C	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=67;ReadPosRankSum=-0.964;SC=CAGGCTGTGACCTCCCTGGGC;SOR=0.395;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=8;WE=47284534;WS=47284516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
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chr1	47395973	rs1126743	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.191;NF=16;NR=36;PP=833;ReadPosRankSum=-0.580;SC=ATTGTTTCCCGATGCAGTTCC;SOR=0.554;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=52;WE=47395981;WS=47395963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,59:0.58:102
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chr1	47504217	rs2221324	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.297;SC=AATTAGATCTATTTAAACGTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=47504225;WS=47504207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr1	47547972	rs1502924	C	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.361;NF=15;NR=7;PP=332;ReadPosRankSum=2.401;SC=TACCTGGCCTCTGATAGAAAC;SOR=0.859;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=22;WE=47547980;WS=47547962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr1	47550246	rs201981953	G	GA	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.178;NF=7;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=0.953;SC=TAGAAATTGGGAAAGATGGGC;SOR=1.480;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=8;WE=47550254;WS=47550236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr1	47571902	rs4926802	C	T	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQRankSum=-9.201;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.230;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr1	47571905	rs28463559	C	T	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-9.309;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,59:0.43:138
chr1	47571943	rs149137568	CTTT	C	1038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=11.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-4.923;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.894;SOR=0.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	47571996	rs4926804	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-2.148;NF=4;NR=22;PP=471;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TGTCTTAACATACTCATGTCT;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=26;WE=47572004;WS=47571986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	47572046	rs4926805	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.169;NF=0;NR=8;PP=260;ReadPosRankSum=-0.003;SC=GAACCTAGGGCCATTCTTATT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=47572067;WS=47572036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	47581122	rs7547893	A	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.295;NF=24;NR=12;PP=616;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GTATAATTTTAAAAAAAAAGT;SOR=0.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=36;WE=47581130;WS=47581112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	47582195	rs10890464	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TCCAGACATTGTAAGTTCCTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=47582203;WS=47582185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	47582246	rs1295463	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CTATGGATTTCGTTTTTGTTT;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=47582254;WS=47582236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	47582292	rs10890465	T	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=267;ReadPosRankSum=2.224;SC=GCTGGAGGGATTAGGACTGGG;SOR=0.685;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=20;WE=47582300;WS=47582282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	47583415	rs6664496	G	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=367;ReadPosRankSum=1.508;SC=TAGATGCCATGTTTTCTTTCT;SOR=0.201;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=19;WE=47583423;WS=47583405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	47607281	rs12564525	C	T	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.643;NF=38;NR=66;PP=1746;ReadPosRankSum=-1.776;SC=CCTGGCTCCACGGATTGGTAT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=78;TCR=135;TR=104;WE=47607289;WS=47607271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,118:0.51:233
chr1	47607641	rs11211465	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=817;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CCTTTTCCTGCATTTGCCCAT;SOR=1.304;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=42;WE=47607649;WS=47607631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr1	47607762	rs2056901	T	C	3114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.035;NF=55;NR=62;PP=1987;ReadPosRankSum=0.478;SC=CACATACACATATTCGTGTCT;SOR=0.766;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=228;TCF=113;TCR=115;TR=117;WE=47607770;WS=47607752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,142:0.48:296
chr1	47607785	rs2056900	G	A	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.489;NF=50;NR=62;PP=1845;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CTTAGGGTACGGCTTGCTCCT;SOR=0.883;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=216;TCF=103;TCR=113;TR=112;WE=47607793;WS=47607775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,133:0.48:275
chr1	47607851	rs2056899	A	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=57.19;MQRankSum=-7.408;NF=25;NR=40;PP=935;ReadPosRankSum=0.184;SC=AGCCTTCCACAATGACATCCT;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=49;TCR=78;TR=65;WE=47607859;WS=47607841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,80:0.50:159
chr1	47608983	rs113777592	G	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.59;MQRankSum=-4.962;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=0.940;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	47609489	rs10789501	T	C	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=43;PP=1413;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GGTTTTTTGCTGTATGAGGAA;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=102;WE=47609497;WS=47609479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,115:0.50:230
chr1	47609668	rs911909	T	C	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1179;ReadPosRankSum=0.947;SC=GCAGAGAAGGTCCCTAGTAAT;SOR=0.450;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=75;WE=47609676;WS=47609658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,92:0.59:157
chr1	47610065	rs149718343	A	C	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.687;NF=65;NR=35;PP=1450;ReadPosRankSum=1.182;SC=CAACTACAGAAGGAGGGGGAG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=131;TCR=72;TR=100;WE=47610073;WS=47610055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,110:0.50:221
chr1	47610293	rs968322	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.87;MQRankSum=-3.929;QD=0.64;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,21:0.14:148
chr1	47611598	rs2405599	T	C	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.157;NF=37;NR=38;PP=1290;ReadPosRankSum=1.072;SC=TGGCCCAACCTAGAGGTATGT;SOR=0.532;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=145;TCF=76;TCR=69;TR=75;WE=47611606;WS=47611588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,84:0.52:162
chr1	47614185	rs760440	G	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.895;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=1.708;SC=TGAATGTCCAGCTCAGGGCTG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=47614193;WS=47614180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	47614434	rs4926600	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.915;NF=30;NR=39;PP=940;ReadPosRankSum=-1.291;SC=TCTCAGGAGGCTCCCTAACCC;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=69;WE=47614442;WS=47614424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,82:0.44:186
chr1	47652870	rs10549554	CCTTGAG	CAG,C	1011.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=1450;ReadPosRankSum=0.633;SC=GTTTCCCTTCCCTTGAGCCTC;SOR=0.529;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=14;WE=47652887;WS=47652860;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:54
chr1	47652875	rs10549555	AGC	A	1011.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr1	47652877	.	CCT	ACA	1422	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14;NR=4;PP=1422;QD=81.9704374923;SC=TTCCCTTGAGCCTCAGGGGGA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=18;WE=47652887;WS=47652860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,18:0.39:46
chr1	47652879	rs60327556	T	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr1	47655816	rs2248907	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=203;ReadPosRankSum=0.437;SC=GAGCTGCCAGACCTGGCCTCC;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=47655824;WS=47655806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	47685455	rs927462	T	C	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=81;PP=2488;SC=GGGCCGTGTGTTTGGGCGCGG;SOR=1.150;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=49;TCR=81;TR=130;WE=47685463;WS=47685445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	47689842	rs34087210	C	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=3.098;SC=CTTAGGGATCCTCCCCACATG;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=14;WE=47689850;WS=47689832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	47691568	rs145295250	GCAGA	G	1503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.137;NF=1;NR=19;PP=889;ReadPosRankSum=-0.962;SC=CATCCTGTGGGCAGACAGACA;SOR=0.890;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=20;WE=47691579;WS=47691558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr1	47726087	rs13376679	T	C	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=61;PP=2502;SC=TCTTGAATGATGTGTTTTTTT;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=136;WE=47726095;WS=47726077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	47765490	rs9436838	T	C	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	47767141	rs6689687	C	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=356;SC=TATTGTAAATCATTCTCAAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=47767149;WS=47767131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	47767914	rs3125630	G	A	4173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=39;PP=2321;SC=ACCTTCGTCTGCTGTCAGAGA;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=115;WE=47767922;WS=47767904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	47770441	rs3122615	A	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=502;SC=CTGAGGGGAGATTCTAAAAGA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=47770449;WS=47770437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	47770806	rs12129594	T	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	47799639	rs7543016	G	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=9;PP=494;SC=CTGCCGCAGCGGGCTGCTCCA;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=47799647;WS=47799629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	47841109	rs2253511	T	C	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=102;SC=TGGCTCATGCTTGTAATCCCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=47841117;WS=47841099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	47842431	rs3125648	G	A	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=18;PP=869;SC=TAAACCTGAAGGCATCCTTGA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=47842439;WS=47842421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	47882497	rs34082359	C	T	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=43;PP=1191;SC=TCAAGCGCGCCGAGCTGCCCG;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=47882505;WS=47882487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	47883019	rs6666370	T	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	47883024	rs2820969	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	47904668	rs3046924	T	TCCGCAC	2440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=1506;SC=CGGCCCCGCATCCGCACCCGC;SOR=0.922;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=22;WE=47904676;WS=47904658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	47904909	rs2405913	G	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=21;PP=1106;SC=AGCCTTCTACGCGGCGTCCCT;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=47904917;WS=47904899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	48459907	rs3814006	C	T	10086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=143;PP=2965;SC=CCCAGTTGCCCGCGATGGCAT;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=318;TCF=175;TCR=143;TR=318;WE=48459915;WS=48459897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr1	48697733	rs212991	T	G	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=84;PP=2965;SC=CTTTCCACATTCTTCGGGACC;SOR=1.044;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=56;TCR=84;TR=140;WE=48697741;WS=48697723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	48707838	rs705430	A	G	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=39;PP=1015;SC=GTCCAGCCTCATTTGCCTCAG;SOR=3.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=48707846;WS=48707828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	48764419	rs1056042	C	T	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=58;PP=2965;SC=AGCAGAACTACAGGCCTTTTT;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=96;TCR=58;TR=154;WE=48764427;WS=48764409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	48869288	rs3738309	T	A	185.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	48902552	rs78784453	G	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=28;PP=1097;SC=AAAAATTCCCGGTCAGGTGTA;SOR=1.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=48902560;WS=48902542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	48902977	rs2261674	G	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1245;SC=GTACAAATACGAGAATTATAC;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=48902985;WS=48902967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	48937691	rs2275309	A	T	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=32;PP=826;SC=CCGTGCGGGGAGGGGCGGCGG;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=50;WE=48937699;WS=48937681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	49052933	rs2803277	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=217;ReadPosRankSum=0.653;SC=TCAGCTTCACTGTCTGAAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=49052941;WS=49052923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	49056695	rs7543402	T	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=500;ReadPosRankSum=1.576;SC=AAGTCTGGGCTGTAGAGCTTG;SOR=0.510;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=45;WE=49056703;WS=49056685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr1	49056770	rs12138134	C	A	98.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	49113247	rs17373849	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=338;ReadPosRankSum=1.035;SC=TTACTTATACGTGGCTCTATG;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=26;WE=49113255;WS=49113237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr1	49113319	rs319953	T	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=609;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TTCATATTGTTGTACGGAGAT;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=51;WE=49113327;WS=49113309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr1	49193394	rs1385152	G	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=410;SC=GCCATCTGTCGTCTTTGGAGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=49193402;WS=49193384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	49224584	rs1128934	G	T	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=42;PP=2485;SC=CTGCCAAGCCGCAGGAGCAGC;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=113;WE=49224592;WS=49224574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	49511424	rs3934240	A	G	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=45;PP=1077;ReadPosRankSum=0.173;SC=AGTTCTTCCTATGGTCCGGGC;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=41;TCR=92;TR=65;WE=49511432;WS=49511408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,81:0.48:170
chr1	50331725	rs10788920	T	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=39;PP=1118;SC=GGAGACAAGATTAGAGAAAGA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=50331733;WS=50331715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	50572096	rs12138061	C	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=982;ReadPosRankSum=1.109;SC=CTGGCAGCCCCACAGTGCTGG;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=40;TCR=79;TR=61;WE=50572104;WS=50572086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr1	50661411	rs2480683	C	T	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=90;PP=2839;SC=ACCAGTCCCCCAACCGGCGCT;SOR=1.116;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=58;TCR=91;TR=148;WE=50661419;WS=50661401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	50666515	rs2494876	C	T	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.667;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=13;PP=1496;ReadPosRankSum=1.684;SC=TTCTGCTTGTCCCCCCAGGTT;SOR=2.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=63;WE=50666523;WS=50666505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr1	50884773	rs4027495	CCGGCGG	C	280.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	50884778	rs2746610	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	50884784	rs368034286	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.817;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	50956212	rs149582773	C	CAAATACAGTGG	6546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=2900;SC=GCTTCAGTATCAAATACAACC;SOR=1.374;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=71;WE=50956220;WS=50956202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	50957509	rs1149790	A	T	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=57;PP=1567;SC=TTTGACATATAACTTTTTTTT;SOR=2.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=50957517;WS=50957499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	51078089	rs17387761	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=489;ReadPosRankSum=0.593;SC=GAGAGCTACTGTATTAATCAG;SOR=0.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=34;WE=51078097;WS=51078079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr1	51323764	rs140713080	A	AT	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.251;NF=0;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=0.143;SC=TGTAATTTAAATTCAAATAGG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=51323772;WS=51323754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	51439777	rs1043141	C	T	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1484;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CCAAAGAAGGCCACCTCCGGG;SOR=0.720;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=87;WE=51439785;WS=51439767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,94:0.59:159
chr1	51753904	rs17392930	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=704;ReadPosRankSum=0.120;SC=TGGCTGCCTGGATTCGAAAGT;SOR=0.605;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=50;WE=51753912;WS=51753894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr1	51767352	rs41287290	G	A	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=65;PP=1479;ReadPosRankSum=-2.324;SC=ACATGTGGTGGAACTGCTTCC;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=82;TCR=127;TR=108;WE=51767360;WS=51767342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,123:0.52:237
chr1	51767912	rs375305601	GC	G	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=4.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.67;ReadPosRankSum=1.570;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,14:0.14:99
chr1	51873951	rs1065754	G	A	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=61;PP=1925;SC=ATTCTTCTTCGTAAGTGGAGA;SOR=1.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=51873959;WS=51873941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	51875072	.	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=0.877;SC=TTGCTCCATCGCCCCCATGAA;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=10;WE=51875080;WS=51875062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	51905949	.	C	CTG	226	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=62.65;NF=3;NR=2;PP=226;QD=45.8;SC=TATACATGTACTGTGTGTGTG;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=5;WE=51905957;WS=51905939;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	52252373	.	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=786;ReadPosRankSum=0.147;SC=TTTGAGAGACAGTAGGGCAGA;SOR=0.573;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=42;WE=52252381;WS=52252363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr1	52266242	rs8375	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.989;NF=25;NR=17;PP=611;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CCAAAGTCTCGGGCTTGATGA;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=42;WE=52266250;WS=52266232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr1	52279650	rs2982846	T	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=725;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GAACAATGTCTACACCAGCTT;SOR=0.849;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=48;WE=52279658;WS=52279640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,55:0.56:98
chr1	52289220	rs67976949	TGTATTAAGGTCAA	T	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=2309;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCCTTTACTTTGTATTAAGGT;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=52289240;WS=52289210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	52290984	rs11205896	T	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=0.332;SC=CCATAGGATGTCCAGGTCTAG;SOR=0.922;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=11;WE=52290992;WS=52290974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr1	52293570	rs2077725	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=847;ReadPosRankSum=0.999;SC=TGGCATTTCCGTTTTTGTTCA;SOR=0.577;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=50;WE=52293578;WS=52293560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr1	52293638	rs706495	G	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=833;SC=TGGAGATTTAGTTCACAATCC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=52293646;WS=52293628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	52303005	rs12944	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=1.383;SC=GTCAGAAAATGAGTGTGTTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=52303013;WS=52302995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	52306027	rs114314660	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CCTCTTCATCGTCATCTTCTA;SOR=0.560;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=17;WE=52306035;WS=52306017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr1	52306063	rs35723519	ATCT	A	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=312;ReadPosRankSum=1.065;SC=CTTCATCATCATCTTCTTCTT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=7;WE=52306073;WS=52306053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	52344414	rs736756	A	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.735;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=0.437;SC=CCCTCCCCCAACCCAGTCTCC;SOR=0.105;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=52344422;WS=52344404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr1	52402856	rs10888741	T	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=511;SC=CTGAGGCCAGTAACCATGTCT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=52402864;WS=52402846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	52402956	rs10888742	G	A	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=40;PP=2494;SC=AATGAATATGGGTCTCATACC;SOR=1.385;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=116;WE=52402964;WS=52402946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	52489322	rs2783178	G	A	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=85;PP=2750;SC=CTGGTACATCGGGCCCTCTGG;SOR=1.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=123;WE=52489330;WS=52489312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	52490418	rs4926906	C	T	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=539;SC=TGTCCTACCCCTTGTTAAGTC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=52490426;WS=52490408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	52517412	rs7529324	A	G	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=57;PP=2874;SC=TTCTTAATGAAAACAGTAGAG;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=136;WE=52517420;WS=52517402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	52820226	rs2820334	G	A	4724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=71;PP=2965;SC=CATTCAGTGCGTATTGGCTCT;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=155;WE=52820234;WS=52820216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	52851729	rs78572338	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	52878300	rs4319263	T	A	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=40;PP=1723;SC=TGAGAAGGTCTGGCACCTGAG;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=52878308;WS=52878290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	52882406	rs6677047	A	G	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=63;PP=2058;SC=CTGTGGATATAAGGATATCTG;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=105;WE=52882414;WS=52882396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	52947711	rs17107242	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.135;SC=CAATGAAAAATATAAGGAATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=52947719;WS=52947701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	52954818	rs17364914	A	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.229;SC=ATAGTACCGTAAAAGCCCTAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=52954826;WS=52954808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr1	53192187	rs269298	C	T	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=6;PP=140;SC=CTGCTACGCTCCTAGCTTGAG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=53192195;WS=53192177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	53237526	rs1571979	G	A	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=34;PP=1014;SC=ATGAATGTCTGTAATATATGG;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=53237534;WS=53237516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	53245472	rs9661082	A	T	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=38;PP=2537;SC=ACACATGATAATTAGATAGAG;SOR=1.488;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=80;TCR=38;TR=117;WE=53245480;WS=53245462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	53250650	rs6588443	G	A	3619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=67;PP=2289;SC=TTGCTGCAGGGATGCCTGTCC;SOR=1.102;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=111;WE=53250658;WS=53250640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	53271225	rs487453	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=35;PP=995;SC=ATTTGTGGGTTGGGTGCAGTG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=53271233;WS=53271215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	53323492	rs10788945	C	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.511;SC=ATAGACCAGACTTTTTACTAG;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=13;WE=53323500;WS=53323482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr1	53420555	rs75463479	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=-0.401;SC=ATGTATGCATAGATCTTGGTA;SOR=0.073;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=53420563;WS=53420545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	53535478	rs1288386	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=18;PP=689;SC=CACAGGTTCCGTCAGCCCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=53535486;WS=53535468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	53537266	rs1769316	G	A	9135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=156;PP=2965;SC=GGCTGGAGACGCTGAACCTGC;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=118;TCR=156;TR=274;WE=53537274;WS=53537256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr1	53543112	rs946590	C	G	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1101;SC=GCCCACATGGCCACAGGTGCT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=53543120;WS=53543102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	53544439	rs1288388	G	A	10950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=197;PP=2965;SC=TCACCAGCCCGCAGGTGCACC;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=338;TCF=141;TCR=197;TR=337;WE=53544447;WS=53544429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr1	53544597	rs1288389	T	C	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=40;PP=1106;SC=GGGGCGCTGGTGGGCATGGCT;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=53544605;WS=53544587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	53553702	rs1288400	A	G	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=15;PP=767;SC=TCTCCAGCTCACTGATCTGGA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=53553710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	53553754	rs1288401	T	C	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=16;PP=1392;SC=CTCCTCATCCTGCTCCACTTG;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=53553762;WS=53553744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	53555783	rs1288403	A	C	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=39;PP=1184;SC=CACAGTCCTGAAGCCCCATGG;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=53555791;WS=53555773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	53558270	rs1288406	A	G	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=53;PP=2651;SC=GCAGGATGCCACGGATGAAGA;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=143;WE=53558278;WS=53558260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	53559310	rs11206091	T	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=689;SC=ATGGCTGGCTTCCCAGCAGCC;SOR=3.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=53559318;WS=53559300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	53569230	rs114930372	T	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.366;SC=TGGGGTGGTCTTGGTGCGGTA;SOR=0.513;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=25;WE=53569238;WS=53569220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr1	53571288	rs1288422	C	G	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=84;SC=CCACCTCCAGCAGACAGCGTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=53571296;WS=53571278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	53574123	rs1769289	C	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=293;SC=CCTTCCTTAACAGAAGTCCTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=53574131;WS=53574113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	53608133	rs3737990	C	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=831;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GTGAGCCTGGCCTGCTGGCAA;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=51;WE=53608141;WS=53608123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr1	53676448	rs1799821	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=610;ReadPosRankSum=0.756;SC=CTCTACTGCCGTCCACTTTGA;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=37;WE=53676456;WS=53676438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr1	53683921	rs12140585	C	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=634;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TCCATACCCTCGCCCCAGCCA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=39;WE=53683929;WS=53683911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr1	53684324	rs3736118	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=2.078;SC=TGAGGAAAATAAAAAAAGGGC;SOR=1.668;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=15;WE=53684332;WS=53684314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	53684525	rs436887	C	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=466;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GGGGGTTGGGCGGGGAACAGT;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=32;WE=53684533;WS=53684515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr1	53686383	rs1679913	C	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TTCTGCGCGCCGCTGCTCGCC;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=53686391;WS=53686373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	53699129	rs17192655	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=0.524;SC=AGTGAGATAGGCAACAAAAGC;SOR=0.674;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=12;WE=53699137;WS=53699119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr1	53712727	rs5174	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=969;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TAATGCCACTCGCTGGGGAGA;SOR=1.204;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=55;WE=53712735;WS=53712717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr1	53716416	rs3737983	G	A	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=67;PP=1665;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GCTCATCTTCGTCTTCTTCTT;SOR=0.865;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=212;TCF=92;TCR=120;TR=113;WE=53716424;WS=53716406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,131:0.51:255
chr1	53723190	rs869987	G	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=0.029;SC=GTTGCCTAAGGTATTGCCTCT;SOR=0.337;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=19;WE=53723198;WS=53723180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr1	53732315	rs2297660	G	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=390;ReadPosRankSum=-0.964;SC=ATGGGCTCTTGCCAGCTGTCA;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=23;WE=53732323;WS=53732305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr1	53736613	rs7542607	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GTGTGCGCACATGTACACGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=53736621;WS=53736610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	53738183	rs7546246	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=740;ReadPosRankSum=-1.984;SC=GGCCATGCATATAGCTGGTCT;SOR=0.564;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=41;WE=53738191;WS=53738173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr1	53742506	rs56300220	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CGGGGCCCGGACGGCCGCAGA;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=21;WE=53742514;WS=53742496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr1	53755151	rs12035577	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=375;ReadPosRankSum=1.620;SC=TTCAACTGGTTACCTCTCCTG;SOR=0.787;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=23;WE=53755159;WS=53755141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr1	53792651	rs3820198	A	C	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.06;MQRankSum=-0.937;NF=22;NR=53;PP=1210;ReadPosRankSum=0.670;SC=CCTTTTCGCAATCCTTGGCCG;SOR=0.975;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=157;TCF=50;TCR=107;TR=75;WE=53792659;WS=53792641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr1	53793511	rs4926972	T	C	897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.14;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=281;ReadPosRankSum=-1.001;SC=ATGCTGGAGCTGCAGCAGCAG;SOR=0.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=28;WE=53793521;WS=53793501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr1	53974987	rs10749691	G	T	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=42;PP=1460;SC=CAGGGGCCGCGTTCACAAAGG;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=53974995;WS=53974977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	53990321	rs541224	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=1;PP=657;SC=AACGGACGAACGGATGGACGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=53990329;WS=53990311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	54258880	rs2273139	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=571;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CCATTCCCAACGCTATAACCA;SOR=0.298;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=38;WE=54258888;WS=54258870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr1	54284551	rs72662323	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCTATAACTGTAGAAAACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=54284559;WS=54284541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	54284814	rs12089209	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=0.273;SC=CTCAACATCACCTTAAAGCAA;SOR=0.961;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=12;WE=54284822;WS=54284804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	54298297	rs72662336	T	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=504;ReadPosRankSum=0.080;SC=TAGTAAAGGTTATTCAGTCAT;SOR=0.733;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=33;WE=54298305;WS=54298287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr1	54331763	rs1883453	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=2;PP=647;SC=GTGAGCCAACATGCCCAGCCC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=54331771;WS=54331753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	54343885	.	A	G	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=696;ReadPosRankSum=1.898;SC=CTAATAATACATGGCATGCCC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=73;TCR=35;TR=50;WE=54343893;WS=54343875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr1	54344282	rs2272928	C	A	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=24;PP=1640;SC=TCTCCTTTACCCGTAAAAGGA;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=54344290;WS=54344272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	54370235	rs3215500	A	AG	594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=610;SC=GGTGGGGGGTAGGGGGAAATA;SOR=4.514;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=17;WE=54370243;WS=54370225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	54483694	rs34764952	C	T	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=21;PP=1151;SC=GGACAGCTCTCACCTGGGGAC;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=54483702;WS=54483684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	54561916	rs7555099	C	T	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=31;PP=1966;SC=TTAATCCTTACGCAATGTAAG;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=93;WE=54561924;WS=54561906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	54605318	rs3841798	T	TG	936.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-1.034;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,56:0.36:154
chr1	54605319	rs36013100	G	GC	2200.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.119;NF=32;NR=67;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GACCATTCATGGGGGGGGCAG;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=33;TCR=70;TR=99;WE=54605327;WS=54605308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,98:0.62:158
chr1	54606804	rs3766465	C	T	5905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=72;PP=2965;SC=CCACGGCCTCCGATGTTGAAG;SOR=1.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=109;TCR=72;TR=181;WE=54606812;WS=54606794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	54607051	rs671103	A	G	7849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=127;PP=2965;SC=AGTTGTTGGGATACTCAGGAC;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=103;TCR=127;TR=229;WE=54607059;WS=54607041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	54607157	rs671539	G	A	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=63;PP=1852;SC=GTGGCTCCCAGTTTCCTCCCT;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=84;WE=54607165;WS=54607147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	54618435	rs7528345	A	T	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=58;PP=2903;SC=CTGGCTTCCCATGTAGAAACT;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=150;WE=54618443;WS=54618425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	54637167	rs625643	T	C	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=433;SC=GAAGTGACGTTGGTAAACATG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=54637175;WS=54637157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	54681920	rs13571	G	C	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=35;PP=1294;SC=GACCTGGACTGTAACGAGGGT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=54681928;WS=54681910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	54706733	rs2297027	A	G	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGCTCGCCCCAGGCCCAGCCG;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=53;TCR=95;TR=78;WE=54706741;WS=54706723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,95:0.52:182
chr1	54717257	.	G	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=301;ReadPosRankSum=0.893;SC=CAGATGGCCAGGGAGACGGAC;SOR=1.426;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=21;WE=54717265;WS=54717247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr1	54871566	.	ACCGC	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CCTGCCTCCCACCGCCCGCCC;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=54871577;WS=54871556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.386;NF=1;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GCGCCGAGCCTCGCCGCCGCC;SOR=0.250;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=5;WE=54871717;WS=54871699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	55014095	rs3753009	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr1	55014099	rs299874	C	T	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.16;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	55014160	rs299872	C	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=19;PP=606;SC=AAGGAGAAATCGCAGAACCCC;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=55014168;WS=55014150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	55072726	rs1616691	T	C	282.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=205;ReadPosRankSum=1.575;SC=GGCACTGCAGTGTGGCAGGGC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=55072734;WS=55072716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr1	55074840	rs1617287	T	A	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=51;PP=1190;ReadPosRankSum=0.103;SC=CCCCAAGGACTCACATACAGT;SOR=1.046;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=23;TCR=94;TR=62;WE=55074848;WS=55074830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr1	55074922	rs2289016	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=668;ReadPosRankSum=-0.610;SC=AGGTCCGCTGGCCCACCACCC;SOR=0.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=42;WE=55074930;WS=55074912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr1	55078046	rs1655528	T	C	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=560;SC=GCATGAGCACTGGCAGGGGTT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=55078054;WS=55078036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	55080612	rs147772009	GGTGT	G,GGTGTGTGTGT	1083.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.369;NF=0,0;NR=18,18;PP=1910,1162;ReadPosRankSum=-1.209;SC=AAGCAGAGCGGGTGTGTGTGT;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=18,18;WE=55080643;WS=55080602;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.51,0.43:35
chr1	55080629	rs1702015	A	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.24;ReadPosRankSum=0.377;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr1	55080629	.	ATGTGCG	GTGTGCA,GTGTGCG	1021	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=8,12;NR=11,27;PP=930,1021;QD=51.761467098;SC=GTGTGTGTGCATGTGCGTGCA;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=19,39;WE=55080643;WS=55080602;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.49:39
chr1	55080635	rs1655525	G	A	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	55085499	rs11206396	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=210;ReadPosRankSum=-1.391;SC=TCTCTATCCCTTGCCCTGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=15;WE=55085507;WS=55085489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	55100328	rs6588520	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.64;MQRankSum=-1.916;NF=11;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=0.691;SC=AAAATAATAATTTGGGGTAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=55100336;WS=55100318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	55118566	rs1655520	C	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=32;PP=1606;SC=TGGAGAGAAGCGGGCACTGGC;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=55118574;WS=55118556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	55119442	rs114952619	C	T	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=58;PP=1723;ReadPosRankSum=1.340;SC=TGGCTTCCAGCGGCCACTCCA;SOR=0.636;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=249;TCF=114;TCR=135;TR=110;WE=55119450;WS=55119432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,129:0.45:284
chr1	55119515	rs1655519	T	G	6616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=116;PP=2965;SC=TGGCTCCAGCTATGGTATCAG;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=102;TCR=116;TR=218;WE=55119523;WS=55119505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	55119546	rs1655518	A	G	6509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=111;PP=2965;SC=AGCACCCATGAGCCCAACTCC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=102;TCR=111;TR=213;WE=55119554;WS=55119536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	55130972	rs471724	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=552;SC=CCTGCCAACCCCCTACCCCCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=55130980;WS=55130962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	55134379	rs627095	C	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=492;SC=CCACCCCAAGCTCCCCTTGTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=55134387;WS=55134369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	55134487	rs478513	G	A	6991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=74;PP=2965;SC=GGGCTCAGTGGGTCTCTCACT;SOR=1.239;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=130;TCR=74;TR=204;WE=55134495;WS=55134477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	55136067	rs2251719	T	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=711;SC=CACTTGAGGGTATGCTGGCTG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=55136075;WS=55136059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	55136529	rs480963	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=33;PP=1104;SC=AACGTGTGTGTGCACAGCGTG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=55136537;WS=55136519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	55138673	rs564400	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=288;SC=GTCTTAATTCCCCCTCCTCCC;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=55138681;WS=55138663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	55139741	rs570218	A	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=21;PP=1138;SC=CTCATCCTTCACATTGGGGAT;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=55139749;WS=55139731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	55161019	.	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=618;ReadPosRankSum=-1.270;SC=CTGGATACCTGAGGGGACTAC;SOR=1.317;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=35;WE=55161027;WS=55161009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr1	55167773	rs646356	T	A	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=47;PP=1647;SC=GCACGAGAGGTCGTGCGCTCC;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=55167781;WS=55167763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	55174819	rs12028701	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=0.132;SC=CAGTGGGTAACAGGGAAAGGG;SOR=0.419;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=30;WE=55174827;WS=55174809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr1	55174882	rs145713883	TTTTG	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=114;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TGTACTAGTTTTTTGTTTGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=55174893;WS=55174872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	55175909	rs41313357	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-2.557;SC=TCCAGCCATGCTCCCTATAAA;SOR=0.770;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=7;WE=55175917;WS=55175899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	55182300	rs1147990	T	A	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=43;PP=1558;SC=CCTATTTATGTCGAGAGCGCC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=83;WE=55182308;WS=55182290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	55197149	rs3815226	T	C	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=42;PP=2316;SC=TGTTTCTGTCTTTAACCCAGG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=108;WE=55197157;WS=55197139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	55251689	rs586462	T	C	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=18;PP=1279;SC=GCCAGTTGAGTTCTGGATCTC;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=55251697;WS=55251679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	55253575	rs665118	T	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=31;PP=898;SC=TGCCCAGGCCTGTGGTGGTGG;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=55253583;WS=55253565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	55266797	rs671108	G	C	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=80;PP=1476;ReadPosRankSum=1.285;SC=TCGTCGATGAGGGCGTCTAGA;SOR=0.880;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=247;TCF=93;TCR=154;TR=123;WE=55266805;WS=55266787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,149:0.49:307
chr1	55266845	rs1147984	C	T	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1363;ReadPosRankSum=1.986;SC=ATGACTGCTCCCTCTGCTCCC;SOR=0.663;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=144;TCF=43;TCR=101;TR=81;WE=55266853;WS=55266835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr1	55271774	rs757581	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=237;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GGAGGCGGGCAGCGCGCAGGC;SOR=0.871;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=22;WE=55271782;WS=55271764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr1	55273422	rs671022	A	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=364;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TGTCCATTGCAGCTGCTCTGT;SOR=1.358;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=19;WE=55273430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr1	55273580	rs9782980	G	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1091;ReadPosRankSum=0.963;SC=GCTGGGCCCCGGCTCCTACAA;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=73;WE=55273588;WS=55273570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,76:0.52:146
chr1	55277430	rs10788986	T	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.88;MQRankSum=-0.333;NF=9;NR=3;PP=181;ReadPosRankSum=0.258;SC=CAAGGAGTGGTTCTGACAGCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=12;WE=55277438;WS=55277420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr1	55277452	.	A	C	103	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=16;MQ=58.88;NF=8;NR=0;PP=103;QD=17.2214015684;SC=CCATGCCCCCACCCCCGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=55277460;WS=55277442;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	55277599	rs600499	T	C	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=39;PP=2145;SC=CCCCCGGCCTTATCAGGTACC;SOR=1.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=98;WE=55277607;WS=55277578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	55279345	rs149536795	CCCGGCCT	C	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=6;PP=760;SC=TTGAGGCTGGCCCGGCCTCCG;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=13;WE=55279359;WS=55279335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	55279688	rs602458	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=328;ReadPosRankSum=-0.169;SC=CTCTCGGAGGGCAGCTCTCCT;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=21;WE=55279696;WS=55279678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	55282556	rs733168	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=0.159;SC=ACACAATTCAACTCATAACAG;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=55282564;WS=55282546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	55307501	rs41297871	A	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TTACTAAGGGAAAGTGCCCTC;SOR=0.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=76;WE=55307509;WS=55307491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,88:0.49:181
chr1	55307640	rs59138759	C	T	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=643;ReadPosRankSum=0.561;SC=AGTGGGGTGTCTTAGAGAAAG;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=33;WE=55307648;WS=55307630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr1	55318108	rs667222	C	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=903;ReadPosRankSum=0.156;SC=ACACGGAACGCGAGGCGTGAG;SOR=0.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=52;WE=55318116;WS=55318098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr1	55319008	rs631749	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=1.978;SC=GTTGATAGGCTTGGGGCTCCT;SOR=0.671;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=12;WE=55319016;WS=55318998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr1	55319902	rs718265	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=765;ReadPosRankSum=1.096;SC=CAAAGGGGATAATGTCCTGGA;SOR=0.486;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=50;WE=55319910;WS=55319892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,64:0.47:135
chr1	55330966	rs611057	T	C	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1121;SC=TACAGAAACCTAAGCCTCACC;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=55330974;WS=55330956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	55336950	rs608458	C	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=564;SC=GGTCAGGATACGGGAACCGGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=55336958;WS=55336940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	55446664	rs2253467	G	C	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	55446671	rs2253466	C	T	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.97;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	55446697	rs2253465	G	A	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.006;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=24;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.328;SC=ACCTGCGCCCGGCTCCCTGCG;SOR=1.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=84;WE=55446705;WS=55446687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr1	55457710	rs2500326	G	A	3342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=56;PP=2028;SC=CCGTTTCTGCGGAGACGACAC;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=97;WE=55457718;WS=55457700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	55457815	rs2495513	C	T	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=917;SC=ACAAAAATGCCGTGCCTTCTC;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=55457823;WS=55457805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	55464743	rs2500340	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=5;PP=1091;SC=CTTGAAGCCTTGAGTTGCAGC;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=55464751;WS=55464733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	55464790	rs2500341	C	G	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=21;PP=2091;SC=AAGCCTGTCTCGGTGTTTAGG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=88;WE=55464798;WS=55464780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	55505732	rs2495482	A	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=35;PP=999;SC=GGGTGTAGGGATGGGAGGCCG;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=55505740;WS=55505722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	55516781	rs599037	G	T	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=31;PP=2377;SC=GGGAATTTGTGACCGAAGCCA;SOR=1.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=76;TCR=31;TR=107;WE=55516789;WS=55516771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	55517861	rs613855	C	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=405;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTCACCAGTGCCTGGGATGTG;SOR=0.318;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=21;WE=55517869;WS=55517851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr1	55517883	rs624612	C	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=490;ReadPosRankSum=0.173;SC=TCTGTAGTTTCTGTGTGTTAA;SOR=0.479;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=27;WE=55517891;WS=55517873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	55518166	rs625619	G	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=24;PP=960;SC=ACCCCAGAGCGTTGCAGCTGT;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=55518174;WS=55518156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	55518190	rs45597632	AC	A	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=9;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=458;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CCTGGGTTGCACCCCCCCCAG;SOR=1.329;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=12;WE=55518206;WS=55518180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	55518198	rs7552350	C	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=694;ReadPosRankSum=0.383;SC=GCACCCCCCCCAGCTGTCACT;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=21;WE=55518206;WS=55518180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr1	55518316	rs2483205	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=672;ReadPosRankSum=0.486;SC=TTGTGTTCGTCGAGCAGGCCA;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=51;WE=55518324;WS=55518306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr1	55518528	rs494198	C	A	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=663;SC=GTGGCTTGGGCTGGGCCCAGG;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=55518536;WS=55518518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	55521899	.	GGGGCGGA	G	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=62.36;NF=0;NR=2;PP=45;QD=29.5;SC=GCGCGGGTAGGGGGCGGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=55521913;WS=55521889;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr1	55523033	rs509504	A	G	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=47;PP=1643;SC=CCAATGCCCAAGACCAGCCGG;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=82;WE=55523041;WS=55523023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	55524116	rs585131	C	T	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	55524197	rs540796	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=136;SC=GCAGGACTGTATGGTCAGCAC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=55524205;WS=55524187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	55524237	rs562556	G	A	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=94;SC=GGCCACAGCCGTCGCCCGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=55524245;WS=55524227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	55524339	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C	978	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=978;QD=327.0;SC=ACCCCTCCTTCGTGTGTGTGT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=55524362;WS=55524329;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr1	55525400	rs483462	G	A	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=104;SC=CCCACTGCCCGCGAGGCTTGG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=55525408;WS=55525390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	55527323	rs630431	G	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=38;PP=1022;SC=ATACCGCCATGCATCAGGGTG;SOR=2.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=55527331;WS=55527313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	55529187	rs505151	G	A	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=53;PP=1982;SC=ACCAGCGAAGGGGCCGTGACA;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=55529195;WS=55529177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	55538385	rs654674	T	C	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=8;PP=1585;SC=TATTCAGTTCTAGAGATTTTT;SOR=3.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=64;WE=55538393;WS=55538375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	55541174	rs487230	A	G	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=830;SC=GACTCGCTCTACTTGTATAGG;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=55541182;WS=55541164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	55546895	rs683880	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=590;SC=TAGCAAGTAGTCGAATGAGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=55546903;WS=55546886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	55547068	rs114901529	T	C	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=54;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TCCCAAATTCTCGTGCTTGTG;SOR=0.605;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=219;TCF=108;TCR=111;TR=112;WE=55547076;WS=55547058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,127:0.51:250
chr1	55555285	rs548852	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=713;SC=TTAATTAAAAGACTCCAACAC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=55555293;WS=55555275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	55557859	rs34673217	A	ATT	401.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=0;NR=10;PP=469;SC=ATTATTACACAGTTACGAACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=55557872;WS=55557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	55557864	rs3736992	C	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TACACAGTTACGAACTAAATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=55557872;WS=55557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	55558661	rs585203	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=216;SC=ATTTCTAATGATATGTAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=55558669;WS=55558651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	55560796	rs503495	T	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=294;SC=GGATTTATTTTCTTTTTGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=55560804;WS=55560788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	55562125	rs580485	G	T	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=144;SC=TATAGAAAACGATAAATAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=55562133;WS=55562115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	55566411	rs67540253	TTAGTC	T	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=997;SC=TGGCAAGAGATTAGTCTAAAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=55566423;WS=55566401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	55567143	rs1165282	T	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=456;SC=ACTAAAGAATTGCAAGTTATG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=55567151;WS=55567133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	55567410	rs615652	A	G	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=64;PP=2006;SC=AGCAGAGGAGAAGAATGAGCA;SOR=1.526;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=93;WE=55567418;WS=55567400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	55572867	rs594226	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=18;PP=1162;SC=GGCAATAACCGAGCACTGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=55572881;WS=55572857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	55575670	rs534741	A	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=112;SC=ATGACTGGTTATGTAACAGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=55575678;WS=55575661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	55614036	rs34030121	CAT	C	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=723;SC=CATCAATAAACATAAAGATAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=55614045;WS=55614026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	55619422	rs1165230	G	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=165;SC=TAGACATCAAGTTTAATATGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=55619430;WS=55619416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	55638075	rs1165222	G	A	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=44;PP=2965;SC=CAGGAGACCAGTGGGAATTGG;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=131;WE=55638083;WS=55638065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	55643837	rs11350615	TA	T	917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=1049;SC=AAAAAGCAAATAAAACTAATT;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=55643845;WS=55643827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	57111169	rs61772962	C	G	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=58;PP=2058;SC=AGTACGCGCTCCGGACCGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=93;WE=57111177;WS=57111159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	57140070	rs55717918	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=398;ReadPosRankSum=-1.359;SC=AACATCAATTAACAGGCCATA;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=29;WE=57140078;WS=57140060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	57158293	rs7419053	G	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=349;SC=AAAGGAATTAGCTGAAATCTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=57158301;WS=57158283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	57170229	rs932447	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1050;SC=CTGAGTTGAGTATTAAGCCCA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=57170237;WS=57170219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	57185818	rs857141	A	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=468;ReadPosRankSum=0.357;SC=AGAATGAAATATTATGAAAGA;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=34;WE=57185826;WS=57185808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr1	57209695	rs1156845	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=392;ReadPosRankSum=0.832;SC=CTTCCTATACTTACCACTACT;SOR=0.428;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=26;WE=57209703;WS=57209685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr1	57221553	rs1774808	GA	TG	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.599;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=2132;ReadPosRankSum=0.110;SC=CTTTTCTTTTGAAAGATAAAA;SOR=0.283;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=55;WE=57221562;WS=57221543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr1	57224460	rs857103	G	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=551;ReadPosRankSum=-1.154;SC=CAAGGCAGCTGATCCACCCAT;SOR=0.819;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=34;WE=57224468;WS=57224450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr1	57252615	rs2275733	A	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	57257817	rs2298130	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=631;ReadPosRankSum=1.277;SC=TTTCCCAGCTTTTTCTGATAT;SOR=0.983;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=38;WE=57257825;WS=57257807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr1	57340727	rs652785	C	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=412;ReadPosRankSum=0.810;SC=TTGTGTAAGGCAAGCACAGTG;SOR=0.718;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=25;WE=57340735;WS=57340717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr1	57372591	rs619545	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=389;ReadPosRankSum=-2.296;SC=ACTGCATAGACGCTAAATACC;SOR=0.334;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=23;WE=57372599;WS=57372581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
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chr1	57422484	rs1013579	C	T	5369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=90;PP=2965;SC=ACTTGACTTCCGCATGGTCTG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=156;WE=57422492;WS=57422474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	57528772	rs1261611	A	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=583;ReadPosRankSum=0.156;SC=GAAAGTATCAAGCCAGGCTCC;SOR=0.208;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=29;WE=57528780;WS=57528762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	58939502	rs12118488	C	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=450;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AAGCACACTTCCCAAGACTGG;SOR=0.807;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=27;WE=58939510;WS=58939492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr1	58946861	rs12144759	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	58971831	rs3087585	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=588;ReadPosRankSum=1.319;SC=GGCTATCAACGAACTCCATTT;SOR=0.597;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=50;WE=58971839;WS=58971821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr1	58971940	rs11207245	C	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-1.983;SC=TTTTTAAAAACTACTACTTTA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=58971948;WS=58971930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr1	59004979	rs902925	C	T	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=37;PP=1146;SC=TTTCACTTGACTACCTGAAAC;SOR=2.381;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=59004987;WS=59004969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	59126676	rs232779	A	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=1;PP=609;SC=GGCAACAAAAAACGTTACTAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=59126684;WS=59126666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	59127086	rs7523134	G	A	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=36;PP=1485;SC=ACCTATGGGAGAGCCTGTATT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=59127094;WS=59127076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	59127193	rs7525365	C	T	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=549;SC=CCTAGAAAAGCATAAAGAAGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=59127201;WS=59127183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	59131311	rs232790	G	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=1007;SC=ACTCTACAATGACAAGAAAAA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=59131319;WS=59131301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	59134607	rs57822474	C	CAG	4638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=49;PP=2493;SC=TCCTGTTTGACGGGGAAGCGG;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=65;WE=59134615;WS=59134597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	59150941	rs2206764	G	A	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=563;SC=ATTAAAATGGGAAAAAAAATT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=59150949;WS=59150931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	59160735	rs2473746	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.22;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	59160885	rs2064374	A	G	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=26;PP=1094;SC=CACTTCTGTAATAATTAAGAA;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=59160893;WS=59160875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	59160982	rs5774423	ATACT	A	1431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=1134;SC=AACTAAGCAAATACTTAGTTC;SOR=1.751;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=20;WE=59160993;WS=59160972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	59248813	rs2760499	G	C	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=40;PP=1246;SC=CAACAGGGCTGTGGCAAGCGG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=59248821;WS=59248803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	59251097	rs2760501	T	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.349;SC=GTGGCCAGGCTACCACAGTGT;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=13;WE=59251105;WS=59251087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	59364615	rs11207326	G	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=-0.961;SC=TAGTCCATCAGAGGAGATAGG;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=15;WE=59364623;WS=59364605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr1	59364918	rs6658104	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=219;ReadPosRankSum=0.904;SC=TACAGCCCACGCAGAGGAAGG;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=16;WE=59364926;WS=59364908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr1	59787350	rs835409	T	G	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=611;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CAATTAAGAATTGGGAGCCCC;SOR=0.112;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=44;WE=59787358;WS=59787340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr1	59844471	rs835435	G	A	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1438;ReadPosRankSum=3.303;SC=TTGATCTCCCGGACTTCTTAT;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=110;TCR=100;TR=98;WE=59844479;WS=59844461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,127:0.48:264
chr1	60223460	rs590704	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CTTATTACCAAAGAAAAGTAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=60223468;WS=60223450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	60228310	rs10626387	T	TTC	6186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=73;PP=2930;SC=CATTAAAGACTTGTCATTTGA;SOR=1.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=15;TCR=76;TR=87;WE=60228318;WS=60228300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	60280749	rs113730234	GT	G	10286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=106;PP=2970;SC=GTAGGAGGGAGTGTGAAGGTG;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=55;TCR=106;TR=161;WE=60280757;WS=60280739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
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chr1	60328613	rs2235798	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=449;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GATCATGATGTCCAAATTAAT;SOR=0.246;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=19;WE=60328621;WS=60328603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	60373666	rs2271800	A	C	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=-1.228;SC=CCGTAACACAAAGGGGCTTCA;SOR=0.184;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=37;WE=60373674;WS=60373656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr1	60381584	rs3738474	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=712;ReadPosRankSum=-0.631;SC=ATCAAACACTCACCTTTCGTT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=45;WE=60381592;WS=60381574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr1	60466911	rs67112814	ACAG	A	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=843;SC=GGCAACAACAACAGCAACAAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=60466921;WS=60466901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	60475930	rs616949	C	G	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=22;PP=2140;SC=TTTTCCTTCACTGGGGAGCTA;SOR=2.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=92;WE=60475938;WS=60475920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	60503762	rs17560663	T	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.190;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=831;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AAAACCAGAGTAGCTTTTCAT;SOR=1.867;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=40;WE=60503770;WS=60503752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr1	60505578	rs680390	A	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=13;PP=1443;SC=CCAATAGTACAATTGCCATAC;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=74;WE=60505586;WS=60505568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	61818422	rs7528918	A	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=36;PP=983;SC=ATGTGGCAAGATTAAATACAC;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=61818443;WS=61818412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	61818428	rs145456582	TACACACAC	T,TACACAC	1127.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=66.34;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,12:0.29,0.71:17
chr1	61872541	rs10889221	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=357;ReadPosRankSum=-1.870;SC=TTGCCAGACCGAGAATCAAAG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=23;WE=61872549;WS=61872531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr1	61892301	rs5774558	T	TG	6193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=82;PP=2966;SC=ACTTGTCTTTTGCACAAAAGG;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=34;TCR=84;TR=114;WE=61892309;WS=61892291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	62160542	rs1151765	A	G	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=227;SC=TATATATCACACTCTTTATAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=62160550;WS=62160532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	62231924	.	T	TTGA	188	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=188;QD=43.995709401;SC=TAGATTTCTGTTGATTCTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=62231932;WS=62231914;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,6:0.32:19
chr1	62232031	rs1286835	C	T	4185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=73;NR=53;PP=2266;SC=ATGGTTCCATCACTAATGGAA;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=126;WE=62232039;WS=62232021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	62232130	rs11207827	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=809;ReadPosRankSum=0.607;SC=ACTCAGTCATTCAACAGATGG;SOR=0.921;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=49;WE=62232138;WS=62232120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,59:0.41:145
chr1	62232173	rs1290444	T	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=713;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CATGGAAATATTTAGCTTCAT;SOR=0.334;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=41;WE=62232181;WS=62232163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr1	62257036	rs1286823	A	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=558;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TCTCTTTTTGAAACTTATAAT;SOR=0.874;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=39;WE=62257044;WS=62257026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr1	62329885	rs35853578	AT	A	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GTAACTTCACATTTTTTTGCA;SOR=0.495;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=62329893;WS=62329875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	62330080	rs2799627	T	G	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=64;PP=2965;SC=AAAGAGAAATTCTTGTTGATG;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=62330088;WS=62330070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	62340855	rs12753462	G	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-1.641;SC=TTGATCAACTGTACAGTAATA;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=62340863;WS=62340845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	62349820	rs72676219	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=483;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGAGTCCCCTCCCATAGTAGG;SOR=0.361;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=29;WE=62349828;WS=62349810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr1	62365217	rs1412622	C	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=16;PP=1199;SC=TGAGTATGCCCTAAAATTGTG;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=62365225;WS=62365207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	62365428	rs5774578	G	GA	385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.164;NF=0;NR=13;PP=443;ReadPosRankSum=0.581;SC=TAATGATTGAGAATTGCGATA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=13;WE=62365436;WS=62365418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	62365461	rs10889269	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.707;SC=GCTGGCCTACGTTTTGGTTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=62365469;WS=62365451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	62374267	rs2151122	T	C	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=261;SC=CCAAACTATATTTAAAGTATG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=62374275;WS=62374257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	62380124	rs4915789	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=266;ReadPosRankSum=0.851;SC=GCGAATCTCCATCTCAGAAAA;SOR=1.306;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=17;WE=62380132;WS=62380114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	62380270	rs1134766	C	T	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1244;ReadPosRankSum=0.580;SC=TCATTCCTAACGTACATAACA;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=97;TCR=99;TR=92;WE=62380278;WS=62380260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,118:0.50:236
chr1	62380298	rs1056513	G	A	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1226;ReadPosRankSum=0.960;SC=CAAAATCACCGGTAACCAGAA;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=186;TCF=85;TCR=101;TR=90;WE=62380306;WS=62380288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,115:0.51:226
chr1	62393394	rs2251182	A	G	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=41;PP=1495;ReadPosRankSum=-2.510;SC=CAAATTTTGCATCTTCAGAGG;SOR=0.973;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=248;TCF=145;TCR=103;TR=111;WE=62393402;WS=62393384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,133:0.45:298
chr1	62417925	.	T	TGAGAGAGA	335	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=58.11;NF=5;NR=0;PP=335;QD=67.8;SC=GAACAAAATCTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=62417933;WS=62417915;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	62417951	.	A	AG	168.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-1.296;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.890;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	62417952	.	A	G	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=58.92;NF=8;NR=1;PP=111;QD=16.1968013941;SC=GAGAGAGAGAAAAATAGGCCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=62417960;WS=62417942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	62417952	.	A	AGAGAGAG	168.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-1.296;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	62456014	rs1134767	G	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=912;ReadPosRankSum=0.436;SC=GGACGAATGCGTATTGGAGAT;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=60;WE=62456022;WS=62456004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr1	62456048	rs12730210	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=650;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TGAGAAGCATGTGTTTTTAAC;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=44;WE=62456056;WS=62456038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr1	62483599	rs34726576	G	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=635;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CCCCATCAAAGGTCAAGCTGG;SOR=0.953;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=35;WE=62483607;WS=62483589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr1	62644118	rs2481703	A	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=634;SC=TGCCCAATGGATTCACCTTGC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=62644126;WS=62644108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	62704134	rs41289438	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=521;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TTGGGAGTAGAGGGTATGCCT;SOR=0.929;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=30;WE=62704142;WS=62704124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	62712999	.	TG	T	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5002;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=31;QD=31.0;SC=TTTTAAGAGATGGGGGTCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=62713007;WS=62712989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	62713224	rs2941679	C	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=33;PP=1666;SC=TGACAGGCCACCATGAGGGCC;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=62713232;WS=62713214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	62713246	rs10889315	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=509;ReadPosRankSum=-2.094;SC=AGGATCCATCGTGGTCCTGCA;SOR=0.689;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=36;WE=62713254;WS=62713236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr1	62728784	rs2666472	A	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=11;PP=760;SC=CAGCAGCTTCACGATGGAGAA;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=62728792;WS=62728774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	62728838	rs2258470	T	C	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=31;PP=1850;SC=GTTCCCGTTGTGATCGGCCAA;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=94;WE=62728846;WS=62728828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	62728861	rs2260581	T	C	5238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=43;PP=2745;SC=TGACAAGCAGTTTCAGGAAGT;SOR=1.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=127;WE=62728869;WS=62728851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	62728918	rs2262110	G	A	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=119;NR=92;PP=2965;SC=CCACCACGGCGGGGCTAGACG;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=119;TCR=92;TR=211;WE=62728926;WS=62728908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	62729015	rs2262106	G	A	5404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=106;PP=2965;SC=ATTCCAAGAGGTTCCCCGGCC;SOR=1.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=66;TCR=106;TR=172;WE=62729023;WS=62729005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	62732421	rs11207949	T	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=527;ReadPosRankSum=1.335;SC=TGGTCTGTGGTGGTCCCAGTT;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=49;WE=62732429;WS=62732411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr1	62733939	rs11207950	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=2.087;SC=AAGTGCCCGCGTTTGTGTCCA;SOR=0.197;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=62733947;WS=62733929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	62737372	rs4609464	A	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=338;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TGGAGAGGTAAGGAGGGACAG;SOR=0.793;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=21;WE=62737380;WS=62737362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	62738904	rs7516290	T	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=17;PP=947;SC=AGGAGGCCGGTGGCTCCTTGG;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=43;WE=62738912;WS=62738894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	62739198	rs17855078	G	A	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TCTTTCTGTCGCTGCCCCACA;SOR=0.419;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=133;TCF=81;TCR=52;TR=72;WE=62739206;WS=62739188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
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chr1	62740449	rs2666507	T	C	6965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.65;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr1	62943264	rs1168008	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=523;SC=GAGTAGTTTACTTGGCAAGAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=62943272;WS=62943254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	62945418	rs1183260	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ACAGTGGTGCAACCACAGCTC;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=9;WE=62945426;WS=62945408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	62953183	rs1168025	C	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=581;SC=TCTCCACAAACAGAAGACAGC;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=62953191;WS=62953173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	62960101	rs10889335	A	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=624;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AACCAGGTCAATCGCAGATCT;SOR=1.067;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=38;WE=62960109;WS=62960091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr1	62960250	rs1168041	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.006;SC=GTGCACAACCTACTTAGTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=62960258;WS=62960240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	62961928	rs1168038	T	C	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=132;SC=CCAGCAAAAATCAACTTTTGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=62961936;WS=62961918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	62970184	rs1168027	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.431;SC=AGATAGCCTATGATTAGACTA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=62970192;WS=62970179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	62973795	rs1184865	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AAAAGACTTAAGGATGCATAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=62973803;WS=62973785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	62976472	rs1168043	T	G	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=424;SC=CAGTACAAGTTGAAAAACCTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=62976480;WS=62976462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	63001120	rs1168018	A	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=486;ReadPosRankSum=0.569;SC=TCCACTGTTCAAAATCAAACT;SOR=1.055;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=28;WE=63001128;WS=63001110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr1	63027411	rs5774610	AG	A	2025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=34;PP=1481;SC=CAGATGCTTAAGTAGATTATG;SOR=2.004;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=63027419;WS=63027401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	63044464	rs11207993	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.045;SC=ATTATTTTAGCTCTTTGATCT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=63044472;WS=63044454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	63050598	rs3850634	T	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTTTGTTAGGTAAACAATAAA;SOR=0.193;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=11;WE=63050606;WS=63050588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	63070537	rs67461605	AGTTAATGTG	A	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=5;PP=1835;ReadPosRankSum=1.513;SC=CCTCATTCCAAGTTAATGTGG;SOR=0.065;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=63070553;WS=63070527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	63085483	rs34571440	T	TA	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	63090858	rs6587980	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=344;ReadPosRankSum=-0.102;SC=ATAGTACAATCACTACCTTTC;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=17;WE=63090866;WS=63090848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr1	63099023	rs10889352	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CAGAAAAAAATATAGTACTAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=63099031;WS=63099015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	63113511	rs746735	C	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=241;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TTATCTTTTTCAGAACTTACT;SOR=0.763;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=19;WE=63113519;WS=63113501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr1	63113689	rs1168088	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=457;SC=TGCTTTATCCTCTACATTTTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=63113697;WS=63113682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	63113719	rs1168089	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=-0.870;SC=ATATCAATCATAATCCCAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=14;WE=63113727;WS=63113709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr1	63153953	rs4344355	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=1.392;SC=GCGGCGACGGCGACGGCGGCG;SOR=0.873;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=31;WE=63153961;WS=63153943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr1	63269580	rs12125325	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=-1.918;SC=GAAATATTTGACAATATTTAT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=63269588;WS=63269570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	63270772	rs1927486	C	T	41.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	63271010	rs10789128	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=1.068;SC=TAGATTAATCTACTTTTGCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=63271018;WS=63271000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr1	63872600	rs12755065	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.852;SC=AAATTGAATATTTTATGAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=63872608;WS=63872590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	63872871	rs6588028	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CATTGCTGTCATCTAGTAATG;SOR=0.293;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=20;WE=63872879;WS=63872861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	63881552	rs4630153	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=190;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AGCTTTTGTTCTACGTTTTTG;SOR=0.686;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=15;WE=63881560;WS=63881542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	63912546	rs12760364	G	T	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-0.987;SC=AAGAAGAAAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=16;WE=63912554;WS=63912536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr1	63920515	rs17319708	C	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=362;ReadPosRankSum=-0.764;SC=ACACTTCTTTCATTTTATCCT;SOR=0.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=19;WE=63920523;WS=63920505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	63975830	rs6588047	T	C	180.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.60;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr1	63997633	rs9804078	A	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=544;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TACTAAAATCATTTAAGCAAT;SOR=0.940;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=31;WE=63997641;WS=63997623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr1	63999826	rs6693255	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=774;ReadPosRankSum=0.585;SC=GTTTCCTTCACAGTTACCATG;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=54;WE=63999834;WS=63999816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr1	63999868	rs6657480	T	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=465;ReadPosRankSum=0.816;SC=TCAAAGTTAATGGAGCCAAAT;SOR=0.774;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=37;WE=63999876;WS=63999858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr1	63999891	rs6657559	T	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=-1.779;SC=AATAAAGGTATAGTATTTTAA;SOR=0.650;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=25;WE=63999899;WS=63999881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr1	64015217	rs217485	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.748;NF=16;NR=11;PP=397;ReadPosRankSum=0.063;SC=GTTATTTCTCGTTGAATACTA;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=27;WE=64015225;WS=64015207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr1	64021096	rs2273367	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=754;ReadPosRankSum=1.521;SC=ACTGGCTGTAGGCTGAGGAAA;SOR=0.672;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=45;WE=64021104;WS=64021086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr1	64036838	rs4915903	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=0.021;SC=TTTGTTTTATGTCTTTGAAAA;SOR=1.688;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=21;WE=64036846;WS=64036828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr1	64038107	rs6588050	G	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=0.484;SC=CTATTTTTATGTGCAGGTTTG;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=27;WE=64038115;WS=64038097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	64097432	rs1126728	C	T	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1817;ReadPosRankSum=-1.163;SC=ACTGAAGATCCGTATTGATGC;SOR=0.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=103;TCR=116;TR=109;WE=64097440;WS=64097422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,124:0.49:255
chr1	64100478	rs6588052	A	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TTCTGCATACATTTATTCCAT;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=7;WE=64100486;WS=64100468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	64102114	rs2269248	A	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	64125544	rs10909	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.100;SC=AGAGGACCTGCGGGCTTAGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=64125552;WS=64125534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	64515379	rs1772626	C	T	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=23;PP=1525;SC=ACCTGACCCTCGATGAACCAA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=73;WE=64515387;WS=64515369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	64608329	rs2762833	G	T	4411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=57;PP=2494;SC=ACATCCCAGCGTGCGGTAAAT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=118;WE=64608337;WS=64608319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	64624612	rs4362024	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=513;SC=GTAATATTATGCATGTTACTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=64624620;WS=64624602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	64624842	rs6668545	A	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=929;ReadPosRankSum=-1.392;SC=GTCAAAATGTAGAGATGTCAA;SOR=0.464;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=55;WE=64624850;WS=64624832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,74:0.59:125
chr1	64643277	rs7527017	C	T	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1181;ReadPosRankSum=-1.447;SC=CAGCAATGGACGGAATTTCAA;SOR=0.620;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=80;WE=64643285;WS=64643267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr1	64669567	rs2806529	A	T	277.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TCATTGTTATATCCCAACTTT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=64669575;WS=64669557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr1	64680682	rs825174	C	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTGGGAGGCTCAGGTGGGTGG;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=64680690;WS=64680672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	64707243	rs825189	G	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	64726414	rs705542	A	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=-1.816;SC=GCTTTTATAAATAACATATTA;SOR=0.746;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=10;WE=64726422;WS=64726404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr1	65016349	rs2164571	A	T	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1407;ReadPosRankSum=0.653;SC=GGTAAGAGGCAATGAGTACTT;SOR=0.958;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=94;WE=65016357;WS=65016339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,123:0.51:243
chr1	65045602	rs5774708	TA	T	700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=22;PP=363;SC=AGCCAGATGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=22;WE=65045610;WS=65045592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	65068638	rs6665437	T	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=32;PP=727;SC=TGTATTCTACTGCATTCAAGT;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=65068646;WS=65068628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	65099978	rs2118102	G	A	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=910;SC=TAGAGGCATAGTAGATAAAGA;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=65099986;WS=65099968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	65107372	rs6664905	C	T	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=19;PP=1793;SC=CAGCATCAAACAGGAGGGACT;SOR=2.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=65107380;WS=65107362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	65113351	rs7534210	T	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=222;SC=GTCCAGAGTCTATGTGGTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=65113359;WS=65113341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	65113568	rs6588100	T	C	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=68;PP=2517;SC=CCAGACCGGATGGCCTTGCCT;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=129;WE=65113576;WS=65113558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	65141676	.	TTAA	T	176.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=4;PP=190;SC=GGTAAAATAATTAATAATAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=4;WE=65141686;WS=65141666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	65255018	rs2500232	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=1.046;SC=CTTTGAAATTGTGTCTTTGTA;SOR=0.683;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=19;WE=65255026;WS=65255008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	65270549	rs12134044	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=389;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TTTTCTTTTAAAATCAGTTCA;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=18;WE=65270557;WS=65270539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	65301669	rs2254002	C	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GTGACATTTTCCATTATAATA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=65301677;WS=65301659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	65303659	rs12129819	C	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1190;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGTAATACTCCTTATCGGTTT;SOR=0.715;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=68;WE=65303667;WS=65303649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,94:0.56:167
chr1	65310489	rs2230588	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=432;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GCTTGATGAATGGGCCACACT;SOR=0.565;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=36;WE=65310497;WS=65310479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr1	65311116	rs2780821	GC	CT	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TAGCTGCTTGGCTAGCACCTC;SOR=0.090;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=6;WE=65311125;WS=65311106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	65313414	rs12739954	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=0.382;SC=GTGATGGACCGTCTGGGAATG;SOR=0.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=19;WE=65313422;WS=65313404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	65316675	rs310216	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=547;ReadPosRankSum=0.489;SC=AGCCGGGGCCGTGGGACCGGT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=38;WE=65316683;WS=65316665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr1	65321388	rs310229	G	A	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=914;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CCTGCTATTCGGGAAATGACC;SOR=0.862;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=55;WE=65321396;WS=65321378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,64:0.45:141
chr1	65325970	rs310224	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=-2.141;SC=GAAATTCCCACGGTTACATCA;SOR=0.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=22;WE=65325978;WS=65325960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr1	65326095	rs200014012	TTGCA	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=1.960;SC=AATATACCCCTTGCATGCATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=65326106;WS=65326085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	65330682	rs2256298	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AAGGGACAGGGTTAAGTTGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=65330690;WS=65330672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	65335062	rs45598436	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=908;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TGGCCAGGACAGCCATCCCTA;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=55;WE=65335070;WS=65335052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr1	65684425	rs11208611	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.453;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=686;ReadPosRankSum=1.339;SC=TTGTTTTGTTCTTTGCATTTA;SOR=1.207;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=50;WE=65684433;WS=65684415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr1	65690461	rs4915685	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CTGGTGAACCGTTAGTCCAGC;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=65690469;WS=65690451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	65830297	rs2296478	G	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	65830299	rs2296479	T	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	65830608	rs1570868	T	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=745;SC=AGAAATGTCATTGAAGACATA;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=65830616;WS=65830598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	65844963	rs3818449	A	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=12;PP=955;SC=TGTTCCCACTATTCCTATCTA;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=65844971;WS=65844953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	65858088	rs6588144	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=490;SC=GCAACTAATCTCTTATGGTAT;SOR=1.839;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=65858096;WS=65858078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	65858145	rs4325172	G	A	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=19;PP=969;SC=TCTGTGAGGAGGACCACGCTG;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=65858153;WS=65858135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	65860687	rs4582839	A	C	5637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=99;PP=2965;SC=TTCTCCAGCCAACAAGAAGTC;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=77;TCR=99;TR=176;WE=65860695;WS=65860677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	65867391	rs4592284	C	G	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=15;PP=917;SC=CTGAATTTCACAATTCAGCCT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=65867399;WS=65867381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	65874626	.	A	AT	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5028;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=33;QD=11.25;SC=AAACAACAGGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=65874634;WS=65874616;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	65886398	rs3790435	T	C	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=758;ReadPosRankSum=0.177;SC=GCGGCCCCAGTTCGGGAGACA;SOR=0.364;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=56;WE=65886406;WS=65886388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr1	65886448	rs3790434	T	C	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.957;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=756;ReadPosRankSum=0.518;SC=CCGGCTCGCTTGTCGTGTGGT;SOR=0.650;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=70;WE=65886456;WS=65886438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,92:0.45:205
chr1	65887013	rs12145690	A	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=1039;ReadPosRankSum=1.531;SC=ATGGACAGAGAAGAAACCAGT;SOR=0.772;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=64;WE=65887021;WS=65887003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr1	66036441	rs1137100	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=641;ReadPosRankSum=0.646;SC=ATTGAAGGAAAGACATTTGTT;SOR=0.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=35;WE=66036449;WS=66036431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr1	66036501	rs2186248	G	T	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=483;SC=CATTAGCTATGTTTTAAATGT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=66036509;WS=66036491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	66058513	rs1137101	A	G	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=991;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GTAATTTTCCAGTCACCTCTA;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=61;WE=66058521;WS=66058503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
chr1	66064293	rs3762273	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	66075586	rs74733149	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=421;ReadPosRankSum=0.335;SC=TTAGATACATATGTGTTGGTA;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=23;WE=66075594;WS=66075576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr1	66085574	rs3790439	T	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=22;ReadPosRankSum=-0.508;SC=ACTATTAATTTTGTATAAATG;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=66085582;WS=66085564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	66087301	rs4655743	G	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.494;SC=GGCCTGTTGTGAGGAAATGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=66087309;WS=66087291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	66088701	rs12067936	C	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.160;SC=AGAATATATACGATTGCAATC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=66088709;WS=66088691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	66102257	rs1805096	G	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.035;SC=AAAATTCTCCGTTGAAGGATT;SOR=0.657;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=68;WE=66102265;WS=66102247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,82:0.50:165
chr1	66618264	rs147320960	CAT	C	782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.392;NF=0;NR=18;PP=730;ReadPosRankSum=0.777;SC=TAAGTGTGTGCATATATATGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=18;WE=66618273;WS=66618254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	66731886	rs6588193	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-0.262;SC=GCTCTCAAAAGTATGTCTCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=66731894;WS=66731876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	66732386	rs6588194	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=0.766;SC=GGTGTGTTGAGAGCTGCAGAG;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=34;WE=66732394;WS=66732376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr1	66732529	rs6701329	A	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.802;SC=TTCCCTACTAATGTAGCAGTA;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=11;WE=66732537;WS=66732519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	66829262	rs783039	A	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=730;ReadPosRankSum=0.228;SC=GACGTGAGTAATTATGACCTG;SOR=1.107;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=43;WE=66829270;WS=66829252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr1	66831256	rs144339850	C	CA	1058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.958;NF=20;NR=9;PP=1043;ReadPosRankSum=1.029;SC=ATCCCTCTCCCAACAAGAATA;SOR=1.140;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=29;WE=66831264;WS=66831246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr1	66831370	rs783036	G	A	5792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=84;PP=2965;SC=CAGATTTGGAGATCCTGGCTG;SOR=0.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=186;WE=66831378;WS=66831360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	67094288	rs72669450	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=1.213;SC=TGACTGCACCAGAGATTTCTG;SOR=0.859;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=7;WE=67094296;WS=67094278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr1	67145322	rs10889644	C	A	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=36;PP=1745;ReadPosRankSum=0.286;SC=ACTTAGGAAGCACATGACCAA;SOR=1.000;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=206;TCF=131;TCR=75;TR=106;WE=67145330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,114:0.50:227
chr1	67149706	rs10749764	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.907;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr1	67155862	rs71660869	TCTC	T	2873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.933;NF=23;NR=30;PP=2125;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TCTCTTTTCTTCTCCTTACAG;SOR=0.944;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=53;WE=67155872;WS=67155852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr1	67160336	rs2146904	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=436;ReadPosRankSum=1.442;SC=ACTGTTCATCATGGAACTCGT;SOR=0.519;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=28;WE=67160344;WS=67160326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr1	67160884	rs16844	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.599;SC=CCACCAACACATTCCCATTCC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=67160892;WS=67160874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	67160981	rs1325268	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.593;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=894;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TTCCCTTTTTCCTGCACGCTA;SOR=1.387;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=41;WE=67160989;WS=67160971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr1	67194911	rs3078564	TTC	T	1124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=939;ReadPosRankSum=0.465;SC=GACATGGATTTTCTCTCTCTT;SOR=0.610;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=22;WE=67194920;WS=67194901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr1	67195184	rs1032635	C	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.088;SOR=1.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr1	67195192	rs1032634	C	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.696;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr1	67266756	rs549148	T	A	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=17;PP=983;SC=GATCCCCTCCTGATGCCTTCT;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=67266764;WS=67266746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	67288045	rs482082	C	T	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=43;PP=2391;SC=GAGTCTTACCCGGCCAGTTTC;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=67288053;WS=67288035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	67303303	rs6698076	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=506;ReadPosRankSum=0.228;SC=AATTTTCTAGACTTTATTTAA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=28;WE=67303311;WS=67303293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr1	67390416	rs3008858	G	C	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1523;ReadPosRankSum=0.862;SC=GGGGAGTGGTGCACCACCCCT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=103;TCR=122;TR=101;WE=67390434;WS=67390406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,118:0.44:270
chr1	67390468	rs1886686	C	G	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1075;ReadPosRankSum=0.567;SC=CCAAGCTCCTCCGTTAGCGGC;SOR=0.797;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=172;TCF=63;TCR=109;TR=73;WE=67390476;WS=67390458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,83:0.42:197
chr1	67394918	rs114914895	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=309;ReadPosRankSum=0.789;SC=AGGAATGAATAATTCTCGTAT;SOR=0.770;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=22;WE=67394926;WS=67394908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	67396222	rs3008861	T	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=84;SC=AACAGGCCATTCTCTGGGCGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=67396230;WS=67396212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	67401623	rs201957541	ACT	A	639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=1051;ReadPosRankSum=0.115;SC=TAATGCATGGACTTTAAATGT;SOR=0.679;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=12;WE=67401638;WS=67401613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr1	67401629	rs116230829	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr1	67401630	rs115331484	A	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr1	67425311	rs2985794	T	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=-0.344;SC=ATATGTAGATTTAGACAGGAT;SOR=0.653;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=14;WE=67425319;WS=67425301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	67438535	rs12131222	A	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=472;ReadPosRankSum=0.555;SC=ATATGCAATAATTGGGGGAAT;SOR=0.298;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=34;WE=67438543;WS=67438525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr1	67442275	rs11208979	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=605;ReadPosRankSum=1.495;SC=TTGTTTCTTACAGGTCCGAAC;SOR=0.936;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=37;WE=67442283;WS=67442265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr1	67447450	rs12039172	A	G	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr1	67452322	rs17497828	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CCCAAACAGTGTTAAAAGCCA;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=67452330;WS=67452312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	67487401	.	GACACAGAC	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.952;NF=3;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=2.273;SC=CACAGACACAGACACAGACAC;SOR=0.204;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=67487416;WS=67487391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr1	67487407	.	GAC	G	427	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=26;MQ=60.99;NF=0;NR=11;PP=427;QD=39.0909090909;SC=CACAGACACAGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=67487416;WS=67487391;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,11:0.52:21
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chr1	67512920	rs1024230	A	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=219;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TCAGTACACAACTGTTAAAGC;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=13;WE=67512928;WS=67512910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	67516191	rs5774854	GA	G	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.097;NF=0;NR=10;PP=125;ReadPosRankSum=0.166;SC=TGGCAAGCTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=67516199;WS=67516181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	67518420	rs77816884	T	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=703;ReadPosRankSum=0.285;SC=CTGACTTCATTTCACAAAATA;SOR=0.400;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=52;WE=67518428;WS=67518410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr1	67518534	rs10157422	C	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1167;ReadPosRankSum=-1.730;SC=GCCACTGTGGCCACCATCTGT;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=71;WE=67518542;WS=67518524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,87:0.42:209
chr1	67519435	rs145865907	C	A	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.85;SOR=2.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	67558739	rs6588237	C	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=12;PP=828;SC=TATCCAGTGGCGTTACATTAT;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=67558747;WS=67558729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	67560897	rs10889653	A	G	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=18;PP=947;SC=TTTACTTAACAATAGATGATA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=67560905;WS=67560887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	67560956	rs11208997	C	T	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=32;PP=1362;SC=CTAACGTTGACTATCTTGGCA;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=67560964;WS=67560946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	67562106	rs6670381	G	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=1.200;SC=CATATGGAAAGTACCTAGTAT;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=15;WE=67562114;WS=67562096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	67577367	rs6588240	A	T	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=31;PP=1181;SC=CTATTAAGTTACTTCTAATTA;SOR=0.814;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=67577375;WS=67577357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	67579245	rs2144655	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.079;SC=ACAGGGTTTCGCCATGTTGGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=67579253;WS=67579235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	67579386	rs2144656	A	G	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=27;PP=1208;SC=ACTAAGTACAATGAGAATCCG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=67579394;WS=67579376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	67633812	rs1884444	G	T	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=819;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ACATGAATCAGGTCACTATTC;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=55;WE=67633820;WS=67633802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr1	67634991	rs11465778	AC	A	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=0.135;SC=TTAATGTTTTACGTGTAATTT;SOR=0.169;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=2;WE=67634999;WS=67634981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	67648460	rs6687620	T	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=19;PP=1903;SC=CATCTTGGCTTGGGACCAGAG;SOR=2.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=85;WE=67648468;WS=67648450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	67685387	rs7530511	T	C	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=73;PP=1883;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TGGAGTTCACTGTTTTTTCAT;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=109;WE=67685395;WS=67685377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,127:0.98:129
chr1	67685443	rs7518660	G	A	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=43;PP=1315;SC=TTATTCTGTTGGGCTTTTCTT;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=67685451;WS=67685433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	67705726	rs10889671	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=7;PP=198;SC=TGTGGCCTAAAGTAAAGGTTA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=67705734;WS=67705716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	67795319	rs1495963	T	C	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=55;PP=2095;SC=AAAAGGCTTCTGTGAGCAGAT;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=67795327;WS=67795309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	67796641	rs147756804	ATTAAC	A	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=1.148;SC=TAATTTTTATATTAACTTAAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=67796653;WS=67796631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	68151685	rs3783466	C	T	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=842;ReadPosRankSum=-1.079;SC=CTGACGGGACCCCTCGCCCTT;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=50;WE=68151693;WS=68151675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr1	68151980	rs2759219	T	G	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=10;PP=1582;SC=ACCCGGGCAGTGGTTGAGGGC;SOR=2.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=68151988;WS=68151970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	68152363	rs3783468	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GTGGTAGGTGGGGGTCAGGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=68152371;WS=68152353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	68152388	rs681673	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.795;SC=GCTGCCTTTGTCCGACTAGAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=68152396;WS=68152378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	68153206	rs3171012	T	C	93.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	68173264	rs2295942	C	T	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.117;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=985;ReadPosRankSum=1.116;SC=GTTATCCAGTCGGGGCTTCTT;SOR=0.717;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=70;WE=68173272;WS=68173253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,80:0.41:194
chr1	68603432	rs1430754	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=187;ReadPosRankSum=-0.251;SC=TTTATCCTGACTTAAGCTGTT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=17;WE=68603440;WS=68603422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr1	68603586	rs983034	C	T	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=65;PP=2581;SC=TGGACTGTGACGCCGCCCCAT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=68603594;WS=68603576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	68603731	rs1831297	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=795;SC=TGTGGGAAACATGAAGGGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=68603739;WS=68603721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	68614013	rs2566789	A	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=54;PP=1667;SC=ACATTACAGAAATCCTAAAGA;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=71;WE=68614021;WS=68614003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	68620762	rs3762371	G	A	6610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=81;PP=2965;SC=CACATGTCAAGATCAATTACA;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=120;TCR=81;TR=201;WE=68620770;WS=68620752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	68659849	rs150301835	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=883;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TCTTGTGATGGTTCTTACGGG;SOR=0.811;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=59;WE=68659857;WS=68659839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,67:0.42:158
chr1	68697553	rs183747507	G	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	68905358	rs1925955	G	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=812;ReadPosRankSum=0.046;SC=GGCTTTGGAAGAGCCTCTTAT;SOR=1.407;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=53;WE=68905375;WS=68905348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr1	68944524	rs17097401	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.369;SC=AATTGGAGACGGAGGAATGGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=10;WE=68944532;WS=68944514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	68944792	rs3762282	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=0.926;SC=TTGCAACTGACTATTGCAGAG;SOR=0.622;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=16;WE=68944800;WS=68944782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	68947318	rs3833522	C	CA	3798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.857;NF=14;NR=60;PP=2368;ReadPosRankSum=0.470;SC=AATACCCCCCCAAAAATCATC;SOR=0.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=30;TCR=129;TR=74;WE=68947326;WS=68947308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,146:0.54:270
chr1	68948280	rs3790479	A	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.453;NF=31;NR=38;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.463;SC=ACTTAACCCTATTAAATTATG;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=69;WE=68948288;WS=68948270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,76:0.46:165
chr1	68948839	rs17130708	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-1.368;SC=AATTAAATGGATTGAGCCAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=68948847;WS=68948829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	68952564	.	A	AAC	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5100;HP=1;HapScore=2;MGOF=80;MMLQ=22;MQ=58.86;NF=2;NR=1;PP=54;QD=19.0;SC=CTATCAATATAACACACACAC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=68952572;WS=68952554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,3:1.00:3
chr1	68960038	rs3790483	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=230;ReadPosRankSum=0.046;SC=AGCTGCTGTTATAGTAAAAGT;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=14;WE=68960046;WS=68960028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	68960349	rs78030459	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.392;NF=2;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=1.248;SC=GAGGCATTCCTGCTCGAAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=68960357;WS=68960339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	68960404	rs72674357	A	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	68960411	rs72674358	T	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	70034263	rs72671185	C	G	3273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.240;NF=64;NR=65;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TAAGGAATAACCCTTGGCAGC;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=132;TCR=138;TR=129;WE=70034271;WS=70034253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,151:0.47:324
chr1	70034370	rs11280966	C	CCAGCCGCGTG	2503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.71;MQRankSum=6.370;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr1	70144097	rs115352313	G	A	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.101;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=887;ReadPosRankSum=1.208;SC=GGAATCCCCCGCAATACCAGA;SOR=0.452;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=63;WE=70144105;WS=70144087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
chr1	70587360	rs641909	C	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=624;SC=TAAAAACTGACAACTTTTTGT;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=70587368;WS=70587350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	70710421	rs370689100	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=757;ReadPosRankSum=-1.591;SC=GGAGTCGGCGACGATCCAAAA;SOR=0.488;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=44;WE=70710429;WS=70710411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr1	70761864	rs371252132	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=489;ReadPosRankSum=0.408;SC=TGAAAGAAATTGATTTTGTTG;SOR=0.676;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=39;WE=70761872;WS=70761854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,48:0.38:125
chr1	70832053	rs6661178	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TATTGTATATGTATTTTTAAT;SOR=1.734;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=21;WE=70832061;WS=70832043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr1	70904523	rs112004441	T	TTGTG,TTGTGTG	1259.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=10.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2,2;NR=29,29;PP=874,349;ReadPosRankSum=1.041;SC=AGTCTTATTATTGTGTGTGTG;SOR=4.452;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=77;TCF=2;TCR=75;TR=31,31;WE=70904531;WS=70904513;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.38:40
chr1	70904800	rs1021737	G	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1050;ReadPosRankSum=3.551;SC=CCAAGTGGAAGTCACAGCTAG;SOR=0.922;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=70;WE=70904808;WS=70904790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,82:0.46:180
chr1	71331498	rs1409986	A	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=28;PP=1002;SC=ATCACAGTAGAGGTGGGAAGA;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=71331506;WS=71331488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	71334870	rs1536537	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=1.079;SC=GTATGTGTGTCGGGGCAGGGG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=30;WE=71334878;WS=71334860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr1	71419499	rs571705	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=538;SC=ACAGTATAAGCTTGCTATAAT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=71419507;WS=71419489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	71440217	rs2072947	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=137;SC=CTCATTTCTACTTCCATGCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=71440225;WS=71440207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	71531596	rs17090778	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=456;SC=ATGCAGAGAAACAAGACTGTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=71531604;WS=71531586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	71533287	rs66461782	A	T	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=114;SC=TTTTTTCTTCACTTGTATATT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=71533295;WS=71533277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	71536594	.	C	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=675;ReadPosRankSum=1.501;SC=GCGACTTCGTCTATTAGATTT;SOR=0.320;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=45;WE=71536602;WS=71536584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr1	71537859	.	G	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=421;ReadPosRankSum=0.246;SC=TTCTCCCTCTGATTCTTTATC;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=25;WE=71537867;WS=71537849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr1	71537943	rs11209745	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=20;PP=561;SC=TCCAAACTAGAGAAAAACAAT;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=71537951;WS=71537933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	71544079	rs10574763	CAAG	C	2457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=10;PP=1907;SC=GTAATATAAACAAGTAGTGGC;SOR=2.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=71544089;WS=71544069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	72058367	rs1334004	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=407;SC=GTAAGGATTGCGTGATGTATA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=72058375;WS=72058357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	72058405	rs1334005	T	C	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=707;SC=GGTTGAGTTTTAAAATGAACG;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=72058413;WS=72058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	72058552	rs1413368	G	A	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=39;PP=1868;SC=CAGCCACACAGGTATAATTGC;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=90;WE=72058560;WS=72058542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	72242039	rs6424448	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=173;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GTTGAAGTACGTATGATTAAT;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=9;WE=72242047;WS=72242029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	72747844	rs3101341	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=376;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CGGGCCGGGGCTCCGGGAAGA;SOR=1.302;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=20;WE=72747852;WS=72747834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	74507711	rs7538410	T	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=303;SC=ATAAGAACCTTTTATTTACTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=74507719;WS=74507701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	74575182	rs1340472	C	T	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=651;SC=ATCCATTTTGCTTCATATCCT;SOR=1.143;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=74575190;WS=74575172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	74646514	rs6701961	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=689;SC=AATAAATATTCTTCAAAAAGG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=74646522;WS=74646504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	74664149	rs4422957	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=665;ReadPosRankSum=1.538;SC=TTCTCATCTGTAGGCCTATGA;SOR=0.995;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=39;WE=74664157;WS=74664139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr1	74665493	rs792310	G	A	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1322;ReadPosRankSum=-0.625;SC=ACGTTTTTGTGGATCCTGCTG;SOR=0.455;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=161;TCF=59;TCR=102;TR=80;WE=74665501;WS=74665483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr1	74666344	rs35329584	A	AC	43.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=61;SC=GACTGCCACCAGCCTGGCTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=74666352;WS=74666334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	74666507	rs9804006	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.921;NF=9;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=0.340;SC=TCTGAGGTACTCAAGAGTTAA;SOR=0.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=20;WE=74666515;WS=74666497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr1	74669973	rs9425024	T	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=143;SC=TATCGTTAAATATATTTTGAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=74669981;WS=74669963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	74670172	rs12046751	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.988;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=463;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TAGAATTAAAACTAGCCATGT;SOR=0.946;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=29;WE=74670180;WS=74670162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr1	74671519	rs571848	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=0.743;SC=TGATGTAGAGATATTTTAAAT;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=74671527;WS=74671509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	74701295	rs505508	T	A	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=157;SC=GCAGCATGTTTTGTGAAAGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=74701303;WS=74701285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	74701950	rs532221	T	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.415;SC=ATTCACCTTATTTTTTAAAGT;SOR=1.247;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=9;WE=74701958;WS=74701940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	74819077	rs6424586	T	G	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=54;PP=2046;SC=ACTAGTTCTATATGCTTATCA;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=99;WE=74819085;WS=74819067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	74836204	rs12141619	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=-0.261;SC=GACAGGCTACCATAAGCTTAG;SOR=0.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=16;WE=74836212;WS=74836194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	74841173	rs2880795	A	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=6;PP=555;SC=CTGAAAGATTAGAAACCTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=74841181;WS=74841163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	74936374	rs596204	A	G	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=29;PP=1348;SC=ATTTGATGTGATATTTGGGGT;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=74936382;WS=74936364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	74936454	rs491922	G	C	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=47;PP=2965;SC=GTGTTGTAAGGCTTCATTTTG;SOR=1.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=86;TCR=47;TR=132;WE=74936462;WS=74936444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	74937749	rs3765674	A	G	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=86;PP=2965;SC=GTCTTTGCCTATGAGGGTGTA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=175;WE=74937757;WS=74937739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	74941210	rs648614	C	T	9325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=136;PP=2965;SC=CTAAATGATCCGTCAAGGGTT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=144;TCR=137;TR=280;WE=74941218;WS=74941200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr1	74941293	rs649058	G	A	9799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.199;SC=GGACCCCACAGTGGACATGAC;SOR=0.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=141;TCR=155;TR=295;WE=74941301;WS=74941283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,355:1.00:356
chr1	75005776	rs6656785	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.623;SC=CTCTTCCCCAACTAGTTACTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=75005784;WS=75005774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	75006027	rs3895907	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=1.194;SC=AGGTTTGTTAAGAAAACTACC;SOR=0.979;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=46;WE=75006035;WS=75006017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr1	75006076	rs3845348	G	A	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=42;PP=1170;SC=AAGGGAGAAAGCATTGCATAT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=75006084;WS=75006066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	75036783	rs9326115	T	C	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=24;PP=2009;SC=TTAAACTCACTGTCTGCCAGC;SOR=2.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=91;WE=75036791;WS=75036773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	75036812	rs9326116	C	T	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=38;PP=2680;SC=TAGACCTGCACGTTGTTGGGG;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=79;TCR=38;TR=117;WE=75036820;WS=75036802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	75037845	rs12723334	A	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.959;NF=32;NR=31;PP=955;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CTCTGGCTTCACTCAGTCTTT;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=63;WE=75037853;WS=75037835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,74:0.53:140
chr1	75038228	rs11580409	A	C	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TCTCTTGCTAAATCTAATTCC;SOR=0.823;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=82;WE=75038236;WS=75038218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,95:0.52:184
chr1	75072264	rs41289216	G	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=679;ReadPosRankSum=0.212;SC=TACAACAAAAGAAACTTGTGT;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=38;WE=75072272;WS=75072254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr1	75097426	rs11210490	G	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=524;ReadPosRankSum=0.397;SC=AAGCCATTTGGAGCAGTGGTT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=30;WE=75097434;WS=75097416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr1	75108648	rs141849106	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TCATAGTTTCACTGTTTTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=75108656;WS=75108638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	75108863	rs623171	A	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=297;ReadPosRankSum=-0.057;SC=ATTCCAACAGATAACTATATT;SOR=0.353;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=22;WE=75108871;WS=75108853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr1	75112573	rs151179245	G	GACACAC	128.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAGACAGACAGACACACACAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=75112581;WS=75112563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	75172001	rs7527057	T	A	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.124;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=24;PP=1386;ReadPosRankSum=0.303;SC=GAATCATTTTTCCAGTAGCCC;SOR=1.009;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=146;TCF=97;TCR=49;TR=78;WE=75172009;WS=75171991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr1	75172756	.	TAA	T	142	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=59.7;NF=1;NR=9;PP=142;QD=14.6;SC=ATTAAAGTGGTAAAAAAAAAA;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=10;WE=75172765;WS=75172746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr1	75175886	rs3819946	T	C	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=817;ReadPosRankSum=-2.065;SC=GTGCCCAAAATCTTTAAGCCA;SOR=0.800;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=51;WE=75175894;WS=75175876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr1	75180401	rs74095154	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=881;ReadPosRankSum=0.544;SC=AATTTCTACCCCTAGTCTGGC;SOR=0.308;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=45;WE=75180409;WS=75180391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr1	75190452	rs1051122	C	T	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=36;PP=1520;SC=GGACTTCTGGCCCACCAAATT;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=75190460;WS=75190442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	75199152	rs277373	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1043;SC=TGCGAAACTTCAGGAGCCCTG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=75199160;WS=75199142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	75199214	rs745108	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	75214390	rs749690	G	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=473;ReadPosRankSum=-1.219;SC=CAGATGATCTGGTTACCCACA;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=38;WE=75214398;WS=75214380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr1	75214441	rs1133891	A	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=633;ReadPosRankSum=-2.100;SC=ACAGCATTCCATGGCAATAGA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=47;WE=75214449;WS=75214431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr1	75602384	rs71500673	G	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GGTGAGTGCGGAGGGGCTCGC;SOR=0.079;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=25;WE=75602392;WS=75602374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr1	75603055	rs1526503	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=849;SC=GTTCTGGGTGAAGGTTGTAGG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=75603063;WS=75603045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr1	75626420	rs2462955	A	T	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=14;PP=1954;SC=GATGAAAACAATGCCTTGGAT;SOR=2.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=80;WE=75626428;WS=75626410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr1	75679569	rs3831898	C	CTT	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.389;NF=2;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-1.520;SC=ATCTTTTAAACTTTTTTTTTT;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=12;WE=75679577;WS=75679559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	75680545	rs688513	T	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CAACTCTCAGTGTCATTGACA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=75680553;WS=75680535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	75681351	rs594470	A	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=1.282;SC=AACTGCATGAAGTAAAAGTAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=75681359;WS=75681341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	75681511	rs595009	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=545;ReadPosRankSum=0.462;SC=TCAGGCAGCATTGTAGGAATT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=41;WE=75681519;WS=75681501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr1	75685643	rs12042874	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=398;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ACTGAATTGATTCTAAGAAAA;SOR=0.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=23;WE=75685651;WS=75685633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr1	75716925	rs588098	C	T	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=57;PP=1788;SC=GGTTTAGCAACACGGAGGGAC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=101;WE=75716933;WS=75716915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	75740845	rs1144298	A	G	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=GTCACAGAAGATTATTGATTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=75740853;WS=75740835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	75766186	rs623850	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=80;SC=AAAGACAACAGTCAATAATAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=75766194;WS=75766176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	75819760	.	G	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=-0.239;SC=ATATAAGTTAGCAGAGGGATT;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=15;WE=75819768;WS=75819750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	75823084	rs1249833	C	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=369;SC=TCTCTGAGCACTGAGTAGAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=75823092;WS=75823074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	76143443	rs7513363	A	G	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.095;NF=22;NR=36;PP=896;ReadPosRankSum=0.591;SC=CAAGGGAGGAACCAAGATGGC;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=58;WE=76143451;WS=76143433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr1	76143505	rs1746748	T	C	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1166;SC=ACGCAGAAGATGGGTGATTTC;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=76143513;WS=76143495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	76190331	rs61124994	C	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=332;ReadPosRankSum=-1.375;SC=CCCGTCCTTCCGCAGCCCAAC;SOR=0.314;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=25;WE=76190339;WS=76190321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr1	76190439	rs59932454	T	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=852;ReadPosRankSum=-1.649;SC=GTGACCCGTGTATTATTGTCC;SOR=0.858;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=51;WE=76190447;WS=76190429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr1	76190569	rs1251075	C	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=461;ReadPosRankSum=0.643;SC=GCAGGGGGCCCTGGGCCAAAA;SOR=0.336;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=27;WE=76190577;WS=76190559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	76194229	rs11316888	GT	G	1660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=1141;SC=AGCTTTATATGTTTTGTTTGG;SOR=1.565;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=30;WE=76194237;WS=76194219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	76194306	rs1146572	A	G	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=93;SC=TCCACAGATAATTTACAATAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=76194314;WS=76194296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	76198309	rs74090724	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=315;ReadPosRankSum=1.025;SC=TTTTAACTTTTCTAAATAATT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=20;WE=76198317;WS=76198299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr1	76198436	rs2275378	T	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=588;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AGTAGGTATATACATTTTAAA;SOR=0.935;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=35;WE=76198444;WS=76198426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	76198785	rs3818855	G	A	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1022;ReadPosRankSum=0.608;SC=ACCTAGATGCGTTTTTCCTTC;SOR=0.849;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=78;TCR=92;TR=73;WE=76198793;WS=76198775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,95:0.44:214
chr1	76199277	rs74090726	A	C	2647.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1601;ReadPosRankSum=-1.013;SC=ATGGATGTACAGGGGTTCAGA;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=214;TCF=96;TCR=118;TR=115;WE=76199285;WS=76199267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,128:0.52:246
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chr1	76199395	rs145811227	G	GA	560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.789;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=434;ReadPosRankSum=1.594;SC=ATTTTTAGAAGAAAAAAAAAG;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=26;WE=76199403;WS=76199385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
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chr1	76251884	rs76671446	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=0.808;SC=GGCCTGAGAGGCGCATCTGCG;SOR=1.730;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=16;WE=76251892;WS=76251874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr1	76252011	rs1146634	G	A	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=35;PP=1432;SC=CAGACAGGGTGGAGTAGGGTT;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=76252019;WS=76252001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	76252687	rs1146636	T	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=628;SC=TGATATTCTATGGTGTTTATT;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=76252695;WS=76252677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	76253045	rs3831900	T	TA	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.364;NF=6;NR=4;PP=327;ReadPosRankSum=0.151;SC=CCTAGTTAGTTACAATTTTTA;SOR=0.079;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=10;WE=76253053;WS=76253035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr1	76255196	rs112787135	TA	T	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TAGCTGAATCTAAAGTTGATG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=76255204;WS=76255186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	76255613	rs11588643	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.882;SC=AGGGACATTTACCTAATACTT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=76255621;WS=76255603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	76257892	rs12703	A	T	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1786;SC=GATTTCTGGCAATTACAAGTC;SOR=1.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=76257900;WS=76257882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	76259973	.	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=584;ReadPosRankSum=0.078;SC=TGCATTACTTCATGGTTCCAT;SOR=0.861;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=41;WE=76259981;WS=76259963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr1	76260956	rs186119549	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=328;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GAAACACTAACGGGTAAGTTG;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=26;WE=76260964;WS=76260936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr1	76261078	rs1146641	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.036;SC=AGGCTGGAGCGCAGCAGCACG;SOR=2.494;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=76261086;WS=76261068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	76262523	rs721204	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=116;ReadPosRankSum=-1.398;SC=CATGTGGAAAGCTGAGCCTGC;SOR=0.193;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=76262531;WS=76262513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	76269372	rs5745323	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CATCATTGCATAATTCAAATC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=9;WE=76269380;WS=76269362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	76269460	rs5745325	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=662;ReadPosRankSum=-0.881;SC=AAACACAGTTGCATCAAATTT;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=39;WE=76269468;WS=76269450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr1	76313874	rs2047435	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=265;ReadPosRankSum=0.591;SC=TAAATACTCACATTTGTTTGT;SOR=0.798;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=17;WE=76313882;WS=76313864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr1	76344011	rs1493367	C	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=866;SC=CAGGTAATTTCTTTATTTGAT;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=76344019;WS=76344001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	76344711	rs5745449	A	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=22;PP=1093;SC=AATATAGTCTACCTTTAAGGA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=76344719;WS=76344701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	76344826	rs5745450	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=1.943;SC=TCATTTTAGAGTGGTTAGGAA;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=13;WE=76344834;WS=76344816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr1	76344856	rs5745451	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-1.451;SC=TCTGATTTTATAGAATTACAT;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=9;WE=76344864;WS=76344846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	76344920	rs5745453	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TGAATGTTCTGTATCTTCTCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=76344928;WS=76344910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	76345640	rs2307077	G	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=-1.029;SC=AGAGTAAAATGATTAACCTAA;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=76345648;WS=76345630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	76346920	rs5745466	C	CAT	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=1269;SC=TCTTACCAAACGTGTTTTCAG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=76346928;WS=76346910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	76349534	rs5745485	C	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=-1.119;SC=TTATAATGACCAGTTTTACAC;SOR=0.211;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=18;WE=76349542;WS=76349524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
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chr1	76378275	rs5745547	G	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=63.02;MQRankSum=1.068;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TAACCCTTGAGTTCCATATGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=76378283;WS=76378265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr1	77627096	rs839825	G	A	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=29;PP=1194;SC=TGATGCTATGGAAAGGGGGAA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=77627104;WS=77627086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	77634948	rs1779199	G	A	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=34;PP=1965;SC=AATTTACCTCGTAACTTCTAT;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=77634956;WS=77634938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	77763542	rs1167206	G	A	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=29;PP=945;SC=CAGAGATAAAGCAAAAATTGA;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=77763550;WS=77763532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr1	77883412	rs1532507	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=0.644;SC=TAATTAAAATCTGAAAATAGT;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=9;WE=77883420;WS=77883402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	78001624	.	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=667;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GCCTGCCTGTGGACGACACCA;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=47;WE=78001632;WS=78001614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,58:0.57:102
chr1	78001881	rs10873948	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=1;PP=25;SC=CACAGTGGCTTATGCCTGTAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=78001889;WS=78001871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr1	78024345	rs79671213	C	CTAT	589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=355;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GCTATTGACTCTATTTTCTGA;SOR=1.634;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=9;WE=78024353;WS=78024335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr1	78031994	rs7552291	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GGACAGTAATATAACACACAA;SOR=0.255;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=78032002;WS=78031984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr1	78045369	rs1565852	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TTAAATATTGGATTTCTAAAT;SOR=1.097;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=21;WE=78045377;WS=78045359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
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chr1	78178976	rs6603958	T	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CCTAAAAAAATATATAAACAT;SOR=0.387;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=15;WE=78178984;WS=78178966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	78184325	rs12142671	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=1.906;SC=CCATTTCTCAACCTAAGGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=23;WE=78184333;WS=78184315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr1	78187045	.	T	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=1.097;SC=GGTTACTGTTTACCTTCCCCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=78187053;WS=78187035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
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chr1	78200005	rs3767037	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-0.015;SC=ATTATACAAATAAAACAAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=78200013;WS=78199995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr1	78383467	rs1749913	G	A	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=909;SC=CTTTATTCTCGTGAAAATATT;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=78383475;WS=78383457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr1	78399207	rs4483454	C	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=28;PP=755;SC=ATTTATTAAGCTAAATATTTT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=78399215;WS=78399197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	78430689	rs11409017	A	AG	4516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=52;PP=2967;SC=TATTAACAAAAGAAGTGGACA;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=95;WE=78430697;WS=78430679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	78478675	rs3790586	G	A	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=10;PP=811;SC=TACAGTTTTTGAAAGTTTAAC;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=78478683;WS=78478665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr1	79094081	rs1333973	T	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=0.370;SC=AGTTGAAGGTTTGTAAAATTA;SOR=0.069;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=4;WE=79094089;WS=79094071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr1	79094593	rs273257	A	G	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=25;PP=1001;SC=CATTTAACCAAACAAGTTTTA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=79094601;WS=79094583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	79095339	rs273256	A	C	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=536;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AGGTGACTTGAGATGTTCTTT;SOR=1.251;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=34;WE=79095347;WS=79095329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr1	79095581	rs987495	T	C	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=929;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GGGTCTGATATCACCAGCATA;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=56;WE=79095589;WS=79095571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr1	79106899	rs273252	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.145;SC=TATATGTGCTTACAGAGTGTA;SOR=1.185;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=20;WE=79106907;WS=79106889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	79106967	rs11577394	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TTATATCACACTTTAAAACTG;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=79106975;WS=79106957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	79355596	rs1061728	A	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=862;SC=TGAGATCAAAATCACTGCTTA;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=79355604;WS=79355586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	79357360	rs2275902	G	C	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=75;PP=2733;SC=AAGAGCGAGGGCTCCTCTTGC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=126;WE=79357368;WS=79357350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	79383766	rs72675852	G	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=-0.277;SC=AAAAAACATTGTCAGTGTTTG;SOR=0.105;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=15;WE=79383774;WS=79383756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	79387242	rs3811440	C	T	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=10;PP=1066;SC=TCGAATGATGCGGAAAAAAAA;SOR=2.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=79387250;WS=79387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	79472141	rs1571992	C	A	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=18;PP=1680;SC=TTGGAATATTCAACTTTAGAG;SOR=2.084;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=75;WE=79472149;WS=79472131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	82302695	rs138982442	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=453;ReadPosRankSum=0.686;SC=TGCAGAATGCGAAGTCTGTGG;SOR=0.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=26;WE=82302703;WS=82302685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr1	82402364	rs142993868	TAATC	T	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.883;NF=8;NR=2;PP=412;ReadPosRankSum=2.541;SC=TAAGTGAAAATAATCAAATAA;SOR=0.693;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=82402375;WS=82402354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	82415814	rs9438715	T	C	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=11;PP=1244;SC=CATGTGTGCATGACTGTATGT;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=82415822;WS=82415804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	82416220	rs2148630	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=0.365;SC=AGTAGGTTCTGTATTACAGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=15;WE=82416228;WS=82416210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr1	82417552	rs7413275	T	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=2.181;SC=TCGCAAATTTTTTTCACCACA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=82417560;WS=82417542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	82421596	rs11163397	C	T	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=63;PP=2642;SC=TTCTGAGACCCGAAGCTTTGG;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=135;WE=82421604;WS=82421586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	82437670	rs144957268	ATTTGT	A	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.778;NF=0;NR=12;PP=917;ReadPosRankSum=-1.806;SC=AACAAGGATAATTTGTTTTAT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=82437690;WS=82437660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr1	82437682	rs41292976	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=936;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TTGTTTTATTGTTTGTTTATC;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=82437690;WS=82437660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	82450182	.	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=0.707;SC=TAATTCTTTTCGGTTGTCTTC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=16;WE=82450190;WS=82450172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	84355734	rs71826512	AAGAACTTCAAGGAT	A	6522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=78;PP=2969;SC=GCGACTGCAGAAGAACTTCAA;SOR=1.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=6;TCR=78;TR=84;WE=84355755;WS=84355724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	84383079	rs17534614	G	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=629;SC=ACTGTCATCAGGAAAATAACC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=84383087;WS=84383069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	84543970	rs199581787	C	G	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=945;ReadPosRankSum=-0.403;SC=CCCCAGCCCCCCTTCCCTTCC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=70;WE=84543978;WS=84543960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,87:0.51:169
chr1	84640691	rs582201	T	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=7;PP=221;SC=TTTAATCATTTTCTAATTTAT;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=84640699;WS=84640681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	84765340	rs10658515	G	GTATA	163.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=4;PP=107;SC=GAGTACTAGTGTATATATATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=4;WE=84765348;WS=84765330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	84791239	rs315555	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.854;SC=GAAAGGCCTGTCCCAGAAGAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=84791247;WS=84791229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	84810396	rs315528	A	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=1.329;SC=GTGTGCCTCAAAATGCTTCCT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=84810404;WS=84810386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	84810815	rs315527	A	G	7942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=126;PP=2965;SC=TGTAAGCAGCAGACTGAGAAA;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=236;TCF=110;TCR=126;TR=236;WE=84810823;WS=84810805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	84853957	rs665074	A	T	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=14;PP=1453;SC=AAATTTTGCAATAAAGGATAA;SOR=2.372;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=84853965;WS=84853947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	84944989	rs2292191	A	G	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=18;PP=1360;SC=GGATAAGAGCAGCAGCAGCGG;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=84944997;WS=84944979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	84946745	rs7413066	C	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=24;PP=684;SC=TAGGGAATCCCTCCTGATATT;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=84946753;WS=84946735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	84986213	rs5775789	AT	A	226.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=83;SC=ACATCAATTGATTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=84986221;WS=84986203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	84991488	rs2292808	T	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=1.718;SC=GCACTGCTTTTAATTGCAAAC;SOR=0.643;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=25;WE=84991496;WS=84991478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr1	84998445	rs6690204	C	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.275;SC=CTGAAATCTACGATAAGATTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=84998453;WS=84998435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	84999571	rs10874451	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=2.200;SC=CTAATATCAATATAATCAATA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=84999579;WS=84999561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	85009821	.	C	T	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=10;PP=876;ReadPosRankSum=2.324;SC=CAAATACCTACGGGCAAGTGA;SOR=0.536;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=92;TCR=21;TR=52;WE=85009829;WS=85009811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr1	85009894	rs12143652	A	G	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=1848;ReadPosRankSum=-1.253;SC=GACAGCTGAAAAAGAGTACAT;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=261;TCF=144;TCR=117;TR=126;WE=85009902;WS=85009884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,148:0.46:322
chr1	85016177	rs1400777	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=314;ReadPosRankSum=0.769;SC=AGAGAAAACTAGATACTGACA;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=20;WE=85016185;WS=85016167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr1	85029077	rs15911	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=354;ReadPosRankSum=-2.444;SC=CGGAAAGGGACTTTTGCAATG;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=24;WE=85029085;WS=85029067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr1	85029376	rs41284597	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-1.783;SC=TCTAAAAAATATAATAGATAA;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=6;WE=85029384;WS=85029366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	85031630	rs2994953	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=855;ReadPosRankSum=-0.707;SC=AAGCATCTGCGATTCCAGTAT;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=60;WE=85031638;WS=85031620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr1	85036239	rs2303306	C	G	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=841;ReadPosRankSum=0.084;SC=CCAATTGCTGCACACATAGAT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=55;WE=85036247;WS=85036229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr1	85039828	rs41299545	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GCTGGTTTCGGCGCCCACGGC;SOR=0.882;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=69;WE=85039836;WS=85039818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr1	85039955	rs2303307	G	A	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.17;MQRankSum=1.250;NF=20;NR=38;PP=1021;ReadPosRankSum=0.020;SC=TCGGGCGGCAGAGCTCAGGCT;SOR=0.968;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=58;WE=85039963;WS=85039945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,71:0.57:125
chr1	85039998	rs142534762	CGCAGCGCCA	C	907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.485;NF=1;NR=13;PP=2985;ReadPosRankSum=0.517;SC=GGCCGCGAGCCGCAGCGCCAG;SOR=0.487;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=14;WE=85040014;WS=85039988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	85040069	rs2911592	GC	AA	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=586;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TAGAGACGAGGCGCCAGCGTC;SOR=0.704;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=85040078;WS=85040059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr1	85113203	rs2994949	T	C	4578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=72;PP=2459;SC=CAGGTCTTGATGCCACACTCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=146;WE=85113211;WS=85113193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	85113229	rs1057746	A	G	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=69;PP=2456;SC=TGATTTGTACATTCTCCTCCA;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=123;WE=85113237;WS=85113219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	85121255	rs4537578	A	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=59;PP=2054;SC=TAAAACACTTAGCAGGAGAAA;SOR=1.042;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=85121263;WS=85121245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	85128262	rs2911563	A	G	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=52;PP=1443;SC=ATGCTTAAGCATCTAAAACTC;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=85128270;WS=85128252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	85128280	rs2994437	T	C	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=42;PP=1264;SC=CTCTAATGCATTCTATACACG;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=85128288;WS=85128270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	85128305	rs11164033	G	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=980;SC=TGGTGAAAGTGAACCTGGTAT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=85128313;WS=85128295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	85131641	rs2911566	G	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=336;SC=GGGTTCCTGAGCTTCCAGTTA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=85131649;WS=85131631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	85131982	rs3096445	T	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=1010;SC=ATCCTTAAAATATCAGTAACA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=85131990;WS=85131972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	85331808	rs146269415	G	GAGA	1764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.944;NF=0;NR=33;PP=1539;ReadPosRankSum=-0.472;SC=ATTCATTGTGGAGAAGTGAAC;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=33;WE=85331816;WS=85331798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr1	85488030	rs2028304	G	A	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=53;PP=2142;SC=CAAGCCACACGAGCATGGTAG;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=85488038;WS=85488020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	85488154	rs2039814	G	C	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=562;SC=ATTGAGGTAAGTATGAGTAAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=85488162;WS=85488144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	85537502	rs4907131	T	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=337;SC=CCAGGGTAAATCTTAGAAAAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=85537510;WS=85537492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	85537522	rs4907132	T	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=409;SC=CATATTCTTATGTTTATTAAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=85537530;WS=85537512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	85538655	rs28417745	A	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.79;QD=25.67;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	85547945	rs7534574	T	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=588;SC=TGAATGACCATTGAACATTAA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=85547953;WS=85547935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	85550156	rs146215625	A	AAT	35.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=0;PP=40;SC=TTTGTTGCAAAATATATATAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=1;WE=85550164;WS=85550146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	85551468	rs111823967	A	ATCAGTTTTTCT	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=2569;SC=TTGCCTACACATCAGGGACTT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=85551476;WS=85551458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	85555672	rs1417351	A	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=5;PP=295;SC=AATTCAATGTATATAATTTAA;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=85555680;WS=85555662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	85559118	rs11304107	CT	C	2447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=24;PP=1659;SC=ATCTTAATTGCTTTTTTTATT;SOR=1.967;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=59;WE=85559126;WS=85559108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	85559452	rs709762	A	G	6049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=101;PP=2965;SC=CTCTGTACTCACTAGGTACCT;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=82;TCR=101;TR=183;WE=85559460;WS=85559442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	85560264	rs709764	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=301;ReadPosRankSum=2.377;SC=TGCCTACATAGCCTAAATTTT;SOR=0.588;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=22;WE=85560272;WS=85560254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr1	85560313	rs709765	T	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=21;PP=444;SC=CAGTTTTTATTGCAAAGTACT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=85560321;WS=85560303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	85561546	rs709766	T	C	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=21;PP=1751;SC=ACTGTCTTAATATTATTTTCT;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=82;WE=85561554;WS=85561536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	85563452	rs199591174	AAAAG	A	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.853;NF=0;NR=18;PP=681;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AGGAAAAAAAAAAAGAATGTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=18;WE=85563463;WS=85563442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	85564138	rs817489	A	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=528;SC=ATTTTAATTGAGATGATGAGT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=85564146;WS=85564128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	85573705	rs11427716	A	AC	4763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=39.37;SOR=1.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr1	85598527	rs36118758	TC	T	2302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=20;PP=1386;SC=TTGTTTTTCTTCCCCCCCCAG;SOR=2.043;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=60;WE=85598535;WS=85598517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
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chr1	85624549	rs709786	C	T	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=37;PP=1990;SC=GTAGACTCAACTGTCTGCATT;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=85624557;WS=85624539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	85624864	rs817412	G	A	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=67;PP=2288;SC=TTCTGCCTCAGATAATTCAGA;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=120;WE=85624872;WS=85624854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	85647713	rs817444	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=6;PP=323;SC=ACCTTGAATTTCTTCCCCCAA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=85647721;WS=85647703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	85648620	rs817443	C	T	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=43;PP=1684;SC=GTATGATGAACTTCTCGGCAG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=79;WE=85648628;WS=85648610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	85648905	rs11161539	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=369;ReadPosRankSum=-1.533;SC=GAAAGAAAAATACGTTATAAA;SOR=0.737;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=21;WE=85648913;WS=85648895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr1	85666327	rs817456	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=342;ReadPosRankSum=0.955;SC=TGGCGGGGGCTCGTCCCAGTC;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=18;WE=85666335;WS=85666317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr1	85733737	rs76553839	TGTTAA	T	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=-1.276;SC=TCTTGTGACTTGTTAAAGATT;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=85733749;WS=85733727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	85741921	rs2735594	G	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=25;PP=1088;SC=TTCCGCTTTCGTCTCCCGCTG;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=85741929;WS=85741911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	85741968	rs12562182	G	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=425;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GGGCACAGCTGCGTTACTCAC;SOR=0.901;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=30;WE=85741976;WS=85741958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr1	85742157	rs1060843	G	C	206.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGCGGGTCGGGAGAAAGACGG;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=9;WE=85742165;WS=85742147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	85787114	rs233116	A	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=636;SC=TCTTGCCGGCAACCGGGGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=85787122;WS=85787104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	85870024	rs61769519	C	T	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CCTGAAAGACCACATTCTAGA;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=88;WE=85870032;WS=85870014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,118:0.50:234
chr1	85930272	rs4001153	GAC	G	1084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=1238;SC=CTGACTCTCTGACACACACAC;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=26;WE=85930281;WS=85930262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	86046561	rs2297140	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-1.469;SC=CCCACCGGGCCCACCGCGCCG;SOR=0.871;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=11;WE=86046569;WS=86046551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	86046924	rs2297141	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=275;ReadPosRankSum=0.405;SC=CGAGGTGGCCGGGCTGGACGA;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=13;WE=86046932;WS=86046914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	86047311	rs9658584	G	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=-1.726;SC=AGTCCCCATAGTCCAGAAGTT;SOR=0.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=29;WE=86047319;WS=86047301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr1	86119898	rs2274738	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.847;SC=ACAGGGACACACAAACCGCGT;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=86119906;WS=86119888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	86146672	rs3767162	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=0.584;SC=TTCACTTTAAGATAATTCCAA;SOR=0.804;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=9;WE=86146680;WS=86146662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	86167957	rs1764298	C	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.90;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	86173298	rs1539444	C	T	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=805;ReadPosRankSum=-0.130;SC=TAAATGGAATCCCCCATGCCC;SOR=1.014;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=55;WE=86173306;WS=86173288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr1	86202016	rs1481200	C	T	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=56;PP=2568;SC=GTCATGGAAACAACTAGAGTC;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=86202024;WS=86202006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	86203052	.	CAT	C	3089.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.898;NF=28;NR=27;PP=2200;ReadPosRankSum=0.360;SC=AATATAACGACATGTGTTCTA;SOR=0.613;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=55;WE=86203061;WS=86203042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr1	86210241	rs11387251	G	GT	677.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=745;SC=TTCTGCCAGGGTTTTATCAAA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=19;WE=86210249;WS=86210231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	86210546	rs7547023	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=923;SC=AATTATATAAGCAAAAAAATC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=86210554;WS=86210536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	86211325	rs10747324	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=203;SC=TAACTCTTACGGTTAGACAGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=86211333;WS=86211315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	86246849	rs313722	A	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.45;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	86249063	rs313724	C	T	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=10;PP=1159;SC=TGAGTTTCTACCTTAAAAGTC;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=86249071;WS=86249053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	86249911	rs313725	A	G	5099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=89;PP=2965;SC=TGTAGAATAAATGCTTGGTGA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=165;WE=86249919;WS=86249901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	86252025	rs12746325	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=-1.590;SC=TTGGAACAAAATATTAAAGTA;SOR=1.044;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=13;WE=86252033;WS=86252015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr1	86334070	rs313775	T	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TCCTTCTCTCTAGCCACAGTT;SOR=0.268;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=10;WE=86334078;WS=86334060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	86334316	rs17411495	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CTCCCTGTAATGCAATAAAAA;SOR=0.484;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=20;WE=86334324;WS=86334306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr1	86340193	rs11161696	G	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=0.574;SC=GCTTTTGAAAGTATGAAATGA;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=86340201;WS=86340183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	86340523	rs1564518	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	86340794	rs1564516	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-1.035;SC=CCAAATAGGTTGGGGACTGCT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=86340802;WS=86340784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	86340892	rs7536101	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=772;ReadPosRankSum=1.240;SC=AGGGGATTCAATGGTAGCAAA;SOR=1.077;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=49;WE=86340900;WS=86340882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr1	86361802	rs7541806	C	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TATGGTCTTACTATGCTAGCA;SOR=0.627;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=17;WE=86361810;WS=86361792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	86372839	rs5775877	T	TG	1097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.830;NF=9;NR=18;PP=650;ReadPosRankSum=-0.593;SC=GAAGTAATTTTGGGGGGGTTA;SOR=0.668;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=27;WE=86372847;WS=86372829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr1	86375654	rs1502657	C	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TTTCTCCCTGCGGACCTAGTG;SOR=0.782;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=69;WE=86375662;WS=86375644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,83:0.41:203
chr1	86377028	rs10493777	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=582;ReadPosRankSum=2.165;SC=GCCTAGATTTCTTCCTATAAA;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=38;WE=86377036;WS=86377018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr1	86453409	rs589698	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-0.115;SC=ATAAAATTCCCTTTGCTATTC;SOR=1.022;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=86453417;WS=86453399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	86554813	rs56934354	G	GA	788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.30;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	86554821	rs12405791	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.67;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	86578449	rs2039602	A	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	86578453	rs11161738	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.80;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	86590915	rs2174767	G	A	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=57;PP=2965;SC=TTAGGAGAGAGCTAAATTTCT;SOR=1.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=97;TCR=57;TR=154;WE=86590923;WS=86590905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	86590948	rs11161746	A	G	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1472;ReadPosRankSum=-1.977;SC=TTTTTGCCTCACTGATGCGAT;SOR=0.854;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=190;TCF=114;TCR=76;TR=88;WE=86590956;WS=86590938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,101:0.46:221
chr1	86591837	rs11161747	G	A	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=52;PP=1196;ReadPosRankSum=-1.015;SC=TACAGCAGTCGCTGGTGATGA;SOR=0.653;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=57;TCR=122;TR=78;WE=86591845;WS=86591827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,83:0.40:209
chr1	86621992	rs1999747	C	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=0.921;SC=GTTGGTCTAACCCCTACCCTA;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=16;WE=86622000;WS=86621982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr1	86821746	rs17129092	A	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=14;NR=15;PP=490;SC=ATATCCCAAAAAACTTGACGT;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=86821754;WS=86821736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	86890931	rs1158505	T	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=80;SC=AAATATTTCATTGTCTTTTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=86890939;WS=86890921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	86891005	rs1158506	C	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=10;PP=605;SC=GTAAGTTTTTCTTTTGTCTGG;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=86891013;WS=86890995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	86896354	rs4292929	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=501;SC=CTTTTTTATGGTGGTAGGTGG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=86896362;WS=86896348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	86896706	rs3737673	C	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=34;PP=967;SC=TCTAAAATTGCTTATAACTTA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=86896714;WS=86896696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	86897970	rs12407985	T	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.58;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	86897973	rs1334150	T	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.43;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	86900332	rs17449526	T	C	4481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=69;PP=2722;SC=TTCCCATGAATGGGACTGAGC;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=149;WE=86900340;WS=86900322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	86900372	rs17409304	C	G	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=78;PP=2965;SC=CTCGCTTGTACAGGCTGGTGA;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=149;WE=86900380;WS=86900362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	86900491	rs56408800	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=45;PP=1295;SC=TCTTTATTATCTCAATTTATT;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=86900499;WS=86900481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	86906114	rs1981082	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=203;SC=AATACAGAAATTGTTTTTAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=86906122;WS=86906104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	86909703	rs3820039	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=-0.611;SC=AGGTAGGTGTTGTGAGTTTGT;SOR=3.160;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=86909711;WS=86909693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr1	86939130	rs2145412	C	T	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=23;PP=1018;SC=TCTGTATCTGCTTGAAGCTAC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=86939138;WS=86939120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	86939390	rs2180762	G	A	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=22;PP=1785;SC=TGTGATGATAGAAACTTTTTC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=80;WE=86939398;WS=86939380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	86956785	rs2753342	C	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TAAAAAAATACTATCAAATTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=86956793;WS=86956775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	86959173	rs2791494	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=571;ReadPosRankSum=0.583;SC=ACCTGGACAATGCAGCCTCCC;SOR=0.486;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=47;WE=86959181;WS=86959163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr1	86959796	rs1321689	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=461;ReadPosRankSum=0.781;SC=AGGGTTTTCCCGTACGTGACA;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=25;WE=86959804;WS=86959786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	86965419	rs1882753	T	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=444;ReadPosRankSum=1.377;SC=TGAATACTACTGCTCTCATCC;SOR=1.302;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=29;WE=86965427;WS=86965409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr1	87036746	rs772599	C	A	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=42;PP=2464;SC=CTGTGCTCTGCATTATGTTTG;SOR=1.195;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=117;WE=87036754;WS=87036736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	87045896	rs4001061	TCCTACA	T	12168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=131;PP=2973;SC=ATGACATTGATCCTACACCTA;SOR=0.707;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=37;TCR=137;TR=168;WE=87045909;WS=87045886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr1	87101245	rs2292831	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=249;ReadPosRankSum=0.537;SC=TCATTTCACTATGAAATTATT;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=16;WE=87101253;WS=87101235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	87101375	rs2292830	C	G	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=617;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CAATGACCTACAAATCAAAAT;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=37;WE=87101383;WS=87101365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr1	87102593	rs41286592	T	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1365;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AGCAACAAGGTATCATTGTAT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=69;TCR=101;TR=81;WE=87102601;WS=87102583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,97:0.49:200
chr1	87170782	rs72959592	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.998;SC=AGAGGCCTGGGAGATGGGCGC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=87170790;WS=87170772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	87185449	rs263465	T	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GTGGTTGAGGTGGGCGGATCA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=87185457;WS=87185439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	87190093	rs112817760	GTAAA	G	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.350;NF=1;NR=7;PP=286;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AATTCAGTAAGTAAATAGAAA;SOR=0.555;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=87190104;WS=87190083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	87200729	rs263483	C	G	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=40;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.233;SC=GTTGACTATACAGCTAAGAAC;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=130;TCR=78;TR=108;WE=87200737;WS=87200719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,125:0.51:247
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chr1	87208953	rs7805	T	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=629;ReadPosRankSum=1.271;SC=CCATCATGACTTTGTATTTAT;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=37;WE=87208961;WS=87208943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
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chr1	87549858	rs2798675	A	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=530;SC=TATATAATGAATGTGTTCTCC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=87549866;WS=87549848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	87558063	rs199905283	TCGC	T	84.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr1	87558066	rs66709085	CCACATA	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=1.309;SC=TTCCCAATCGCCACATACACA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=87558079;WS=87558055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	87558069	rs71907897	CATA	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	87563668	rs1199677	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=463;SC=TATTATCTCTGTAATCTGTGT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=87563676;WS=87563658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	87563771	rs41287739	T	C	95.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCAGTTACTTTTAAATGCATT;SOR=1.447;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=87563779;WS=87563761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	87570398	rs1621247	G	A	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TGTGACTATTGGATTCTTGAA;SOR=0.523;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=77;WE=87570406;WS=87570388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,91:0.54:167
chr1	87598117	rs6686259	T	G	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=600;ReadPosRankSum=-1.568;SC=CGCGGCGGCCTCGGGAGGCCC;SOR=0.510;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=41;WE=87598125;WS=87598107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr1	87599697	rs6576865	G	A	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=921;ReadPosRankSum=2.120;SC=CTCTGGCCACGCTTGCACCCT;SOR=0.536;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=60;WE=87599705;WS=87599687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,64:0.44:145
chr1	87633761	rs10782593	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=104;ReadPosRankSum=0.362;SC=CAGTCCCAAACGCCAGCAGCT;SOR=0.248;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=8;WE=87633769;WS=87633751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	89322982	rs2794318	G	A	3697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=52;PP=2217;SC=ACCAAGTCCAGTTCCACAGCT;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=108;WE=89322990;WS=89322972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	89426902	rs3738055	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=807;ReadPosRankSum=0.311;SC=AAACCTCATCGCTGATGCAGA;SOR=0.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=48;WE=89426910;WS=89426892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
chr1	89427252	rs10922530	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TCTTACAAACGAATAACCTAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=89427260;WS=89427242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	89430420	rs1536259	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=12.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=3.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	89449390	rs112636230	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=11.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-3.069;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.575;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr1	89449399	rs77567101	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=12.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-3.228;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.237;SOR=0.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr1	89478854	rs4656076	C	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=528;SC=GGAAGTACTACGAAGGGGACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=89478862;WS=89478848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	89479063	rs4656077	G	A	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=2058;SC=AAGAACTTCCGGATACAGAGT;SOR=1.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=89479082;WS=89479053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	89479074	rs4656078	C	T	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=55;PP=1745;SC=GATACAGAGTCGGGGCAGATT;SOR=1.561;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=79;WE=89479082;WS=89479053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	89479758	rs3795543	T	C	5736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=70;PP=2965;SC=ATGGTACGTCTCTGTTACCTT;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=173;WE=89479766;WS=89479748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	89486037	rs7555039	C	T	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=21;PP=1506;SC=ACTCACTACCCTCAGAACAGC;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=66;WE=89486045;WS=89486027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	89520329	rs72054220	GAAAAAC	G	3733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=29;PP=2979;SC=AGAGAAAACAGAAAAACAGAA;SOR=1.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=57;WE=89520342;WS=89520319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	89520574	rs10922554	C	A	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;QD=29.65;SOR=2.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	89520636	rs10922555	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.50;QD=41.69;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	89520643	rs10922556	C	T	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.53;QD=45.22;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	89522512	rs4376712	C	T	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=54;PP=2749;SC=GACCCTAAACCGTATACATTT;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=138;WE=89522520;WS=89522502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	89522646	rs1048425	G	C	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=67;PP=2460;SC=CTCCTGGAGGGTTTCTGTGGG;SOR=1.266;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=109;WE=89522654;WS=89522636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	89524657	rs17130717	C	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=859;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CAGCTGAATCCTCAACCTCAT;SOR=0.813;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=55;WE=89524665;WS=89524647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr1	89574026	rs1329119	G	A	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=39;PP=1118;SC=ATTTCCACCAGATTAGTTCCC;SOR=2.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=89574034;WS=89574016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	89575677	rs2026043	T	C	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=185;SC=AATTTTGCCTTGGGTAACCAG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=89575685;WS=89575667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	89579941	rs2230338	T	C	5514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=80;PP=2965;SC=TCCCCACTGCTGATGGCATTG;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=173;WE=89579949;WS=89579931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	89582690	rs1803632	G	C	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=31;PP=1981;SC=CCATTGACTGGAATGCCACCT;SOR=1.386;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=92;WE=89582698;WS=89582680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	89583544	rs2209956	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=500;SC=ATTTGGTTTCTTTTTATTAGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=89583552;WS=89583534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	89597755	rs942442	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=ATTTTAAACTTTTCTTAAATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=89597763;WS=89597745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	89599037	rs72728707	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-9.929;QD=1.39;ReadPosRankSum=2.952;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,22:0.15:144
chr1	89607479	rs6666846	G	T	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.95;SOR=2.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	89607486	rs6658235	T	C	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.61;SOR=3.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	89615979	rs586609	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=321;SC=TACAGTAGGCCTCAGTAAACA;SOR=2.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=89615987;WS=89615969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	89618472	.	GA	G	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.7622;HP=19;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=62;QD=10.8333333333;SC=TAGTGTTAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=6;WE=89618480;WS=89618462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	89637578	rs676913	G	A	8432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=136;PP=2965;SC=AGTGTTCTCAGTGAGGCACAC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=126;TCR=136;TR=262;WE=89637586;WS=89637568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr1	89650850	rs623134	A	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=470;SC=GCTATAACACATATACTTACA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=89650858;WS=89650840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	89652071	rs561042	TC	CT	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.21;QD=44.46;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	89652078	rs608339	A	T	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.53;QD=46.12;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	89652087	rs1142890	CC	TG	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.95;QD=50.74;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	89652090	rs1142888	T	G	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.08;QD=45.33;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	89652094	rs1142887	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.82;QD=48.10;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	89652097	rs1142886	C	T	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.08;QD=45.33;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	89652102	rs655260	A	T	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.95;QD=44.64;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	89661228	rs650448	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=380;SC=GTTGTTTCCATCTCAGGCAGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=89661236;WS=89661218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	89726592	rs535351	G	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=596;SC=TACAGTAGCAGTAAACAGTTC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=89726600;WS=89726582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	89730723	rs9628688	C	T	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=48;PP=1467;SC=TTTCTGAGAACGTACATTTAA;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=89730731;WS=89730713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	89731959	rs12729209	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=896;SC=ACAATGCAAGGATAATCTTAT;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=89731967;WS=89731949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	89733273	rs6690597	T	C	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=57;PP=1735;SC=TATTTAAAAATAGGCTCTTGT;SOR=1.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=79;WE=89733281;WS=89733263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	89845926	rs11361992	GT	G	3090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=32;PP=1546;SC=TATATTCTCTGTTTTTTTTTA;SOR=1.877;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=77;WE=89845934;WS=89845916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	89846152	rs4582772	C	T	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=58;PP=1455;ReadPosRankSum=1.481;SC=CATGCAAGAACCAAGACCCTC;SOR=0.866;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=176;TCF=70;TCR=106;TR=92;WE=89846160;WS=89846142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,117:0.53:219
chr1	89847372	rs4658359	G	T	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=82;PP=2965;SC=GCAGAGGGCAGCTGACTACTA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=159;WE=89847380;WS=89847362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	89847411	rs4658360	C	T	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=70;PP=2965;SC=GCGAGTGAAGCTCCCCACAGA;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=135;WE=89847419;WS=89847401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	89847444	rs4658146	A	G	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=65;PP=2712;SC=GCTGCTGGACATGCATGCGGC;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=89847452;WS=89847434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	89849201	rs928652	C	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=610;SC=GCTTTTTCTTCCTTCCATAGG;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=89849209;WS=89849191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	89849350	rs928653	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=9;PP=354;SC=GGAGGGGTACGTTTATACAAT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=89849358;WS=89849340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	89849441	rs928654	T	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=261;SC=TGCTAAATCTTAAAATAACAA;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=89849449;WS=89849431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	89849574	rs928655	G	A	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=476;SC=TTCAGATTTGGTTTAGTCTCA;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=89849582;WS=89849564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	89849742	rs959460	A	T	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=36;PP=1304;SC=GAGGCTCAAGATAAGAGTCGC;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=89849750;WS=89849732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	89851100	.	G	GT	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=59.28;NF=0;NR=6;PP=81;QD=14.1666666667;SC=CATTCAGCAAGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=89851108;WS=89851090;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,6:0.30:20
chr1	89885854	rs6673154	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=20;PP=696;SC=GCTGGACACCGAGGGTCTGGG;SOR=1.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=89885862;WS=89885844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	89888530	rs4261099	C	T	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=16;PP=1680;SC=ATCATCAGATCGTTGCTCAGC;SOR=2.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=89888538;WS=89888520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	89888552	rs4282800	T	A	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=26;PP=2043;SC=TTACTTCAGGTCATTTTCAGT;SOR=1.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=89888560;WS=89888542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	89888585	rs4415545	C	G	7413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.51;QD=44.13;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	89888588	rs4506445	G	T	7490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.99;QD=43.05;SOR=1.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	90058242	.	G	GT	105	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5052;HP=17;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=17;MQ=61.11;NF=6;NR=3;PP=105;QD=12.2222222222;SC=GAAATGTTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=9;WE=90058250;WS=90058232;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	90171835	rs6657969	C	T	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=18;PP=1676;SC=AAGCTGCCTTCGTTTATATGT;SOR=2.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=76;WE=90171843;WS=90171825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	90178743	rs474536	A	G	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=68;PP=2965;SC=GGTCCAGAAGACAGCCTGGTC;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=130;WE=90178751;WS=90178733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	90179532	rs12032393	A	G	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.335;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1878;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CAGCTAGACAATCTTCAAGAG;SOR=0.691;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=306;TCF=152;TCR=154;TR=121;WE=90179540;WS=90179522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,138:0.40:345
chr1	90470915	rs11808927	T	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=562;SC=TGTTTGCTATTGAATCATCAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=90470923;WS=90470905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	90486412	rs2816881	T	G	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=73;PP=2675;SC=CTTGCAGTGTTTATATCCCTG;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=56;TCR=73;TR=129;WE=90486431;WS=90486402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	90493026	rs10922744	G	A	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1621;SC=ATGAAGATGAGGAAGAAGAAG;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=90493034;WS=90493016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	91179939	.	C	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-1.190;SC=TGTGGCTCATCCCTGCCCCAT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=11;WE=91179947;WS=91179935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	91447985	rs358691	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=388;SC=CATGAATAACCATAGCTACAA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=91447993;WS=91447975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	91728053	rs585898	G	A	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=25;PP=1037;SC=CTGCATTTCCGGCTTGTTGAG;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=91728061;WS=91728043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	91728202	rs555432	T	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=365;SC=AAAAACCATTTTAATTTGGAT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=91728210;WS=91728192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	91731756	.	T	C	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=34;QD=22.9237375157;SC=CCAACAGATATGATCTGATTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=3;WE=91731764;WS=91731746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr1	91739208	rs281964	C	T	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=565;SC=TAACACTACTCGTCAATTCAA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=91739216;WS=91739198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	91739414	rs281963	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=601;SC=AGAAAATATGGAAATTAATCT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=91739422;WS=91739404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	91739457	rs79093507	A	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TATAAACAAAAATAATGATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=91739465;WS=91739447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	91742055	rs281959	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TTATGAATAATGGTAATATTC;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=91742063;WS=91742045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	91742419	rs141161527	AATT	A	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.77;MQRankSum=0.791;NF=6;NR=3;PP=346;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACAGAGAGAAAATTATTTGCA;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=91742429;WS=91742409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	91781304	rs281991	T	C	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=159;SC=TATTTTTTTTTCAGTAGAATT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=91781312;WS=91781294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	91781413	rs281992	T	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=365;ReadPosRankSum=-1.747;SC=CTGCGTCACCTATGATTAAGG;SOR=0.501;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=28;WE=91781421;WS=91781403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr1	91781576	rs12568483	C	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=0.692;SC=AACCTTACTTCTCATACTCAG;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=25;WE=91781584;WS=91781566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	91782011	rs74843031	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=396;ReadPosRankSum=-1.080;SC=CAGCATTTACGATTGCATTTG;SOR=1.247;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=23;WE=91782019;WS=91782001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr1	91784887	rs10493845	G	A	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=912;ReadPosRankSum=1.468;SC=AAATCTTTGCGGTATCTTGTG;SOR=0.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=58;WE=91784895;WS=91784877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,74:0.42:176
chr1	91793877	rs281972	T	C	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=404;SC=CAACCCTGAATCAAGCTTTAG;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=91793885;WS=91793867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	91804353	rs78167983	C	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=344;ReadPosRankSum=-0.724;SC=CCCTGCTGTGCCACCACCACT;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=25;WE=91804361;WS=91804343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr1	91813184	rs281936	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=357;SC=TAAATATCCACAGAAACAATG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=91813192;WS=91813174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	91818065	.	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=331;ReadPosRankSum=-1.310;SC=TCACTTACTTGAGGTCGACCA;SOR=1.189;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=22;WE=91818073;WS=91818055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr1	91841301	rs282036	T	C	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=33;PP=1138;SC=AACACAAAAATATGTGCATTA;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=91841309;WS=91841291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	91844815	rs4658219	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=4.713;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGTTCAATTTTAAAATTCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=91844823;WS=91844805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	91846374	rs282033	C	A	186.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=3;PP=80;SC=TGTGGCAGTGCAGACATAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=91846382;WS=91846364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	91846595	rs5776097	T	TA	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=424;SC=TAGTTACTTTTATTTTAAAAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=91846603;WS=91846585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	91846654	rs282032	A	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=63.51;NF=0;NR=3;PP=51;SC=TGAGGTTTTAACATTTGCTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=91846662;WS=91846644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	91850826	rs147504208	C	CA	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQRankSum=2.605;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	91850970	rs17131419	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=105;ReadPosRankSum=0.389;SC=AATATTTTAACACACAGCACA;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=6;WE=91850978;WS=91850966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	91851253	rs282026	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=603;ReadPosRankSum=1.211;SC=ACTGAAATTTTTGCTTACTAT;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=28;WE=91851261;WS=91851243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr1	91859795	rs282009	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=47;PP=1871;SC=TTGCCAGCAATATGTGATAAG;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=91859803;WS=91859785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	91870289	.	ACTTCCCCGCGGGCGTCGGGCCCCCGTCCCCAC	A	1296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.709;NF=7;NR=8;PP=2970;ReadPosRankSum=3.712;SC=CTGGGTCCCCACTTCCCCGCG;SOR=0.515;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=15;WE=91870328;WS=91870279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr1	91870410	rs17131429	G	C	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1239;ReadPosRankSum=-2.328;SC=CCCCTCTGAGGACCGCCAAGC;SOR=0.731;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=76;WE=91870418;WS=91870400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,104:0.53:197
chr1	91973557	rs553606	T	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=737;SC=TTTTCCTTTTTTAGTCTTGGT;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=31;WE=91973565;WS=91973547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	91974034	rs1876264	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=586;SC=AGGGATGAGGGGATTATATGT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=91974042;WS=91974024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	91980447	rs483532	A	G	7215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=78;PP=2965;SC=CTATTTCTACAAAAGTTATGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=144;TCR=78;TR=222;WE=91980455;WS=91980437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	91980649	rs10874758	G	A	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=40;PP=1100;SC=CAAGGGATCAGTTCAGATCAG;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=91980657;WS=91980639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	91989572	rs488126	T	G	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=11;PP=1708;SC=TTTTTCTGTTTTTGTTTTTTC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=91989580;WS=91989562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	92107937	rs4658107	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=592;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CAACACTACACTAACCTTTTT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=38;WE=92107945;WS=92107927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr1	92108119	rs12044983	A	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=470;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TAGAAGAAGCAGCAAAAGAAG;SOR=0.357;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=24;WE=92108127;WS=92108109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr1	92108899	rs2493202	C	T	3485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=76;PP=2310;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TCTCCTCCATCTGTTGAACGA;SOR=0.909;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=276;TCF=132;TCR=144;TR=137;WE=92108907;WS=92108889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,159:0.49:325
chr1	92174260	rs284878	A	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=58;PP=2090;SC=CAAGGGGCTTAGTGAACGTCT;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=98;WE=92174268;WS=92174250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	92177938	rs1805113	A	G	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GCGGGATAGGAAAGTGCACTC;SOR=0.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=83;WE=92177946;WS=92177928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,95:0.49:195
chr1	92181678	rs2029355	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr1	92184744	rs4658261	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=237;ReadPosRankSum=-0.860;SC=AGAACTGACACTTGGCTTTCT;SOR=0.071;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=18;WE=92184752;WS=92184734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr1	92195601	rs10783002	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=-1.164;SC=GAAGGAGGGTGACAGTGAAAC;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=19;WE=92195609;WS=92195591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	92200593	rs11165376	A	G	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=83;PP=2591;SC=GTACTTCTCAAATCGAAGTGC;SOR=2.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=31;TCR=83;TR=114;WE=92200601;WS=92200583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	92200627	rs10874913	T	C	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.64;SOR=2.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	92200627	.	TGTTATAC	CGTTATAC,CGTTATAT	499	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12,5;NR=50,23;PP=499,491;QD=8.6092131056;SC=CTCTTCCCTTTGTTATACAAG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62,28;WE=92200642;WS=92200617;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:62
chr1	92200634	rs11165377	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	92262874	rs2810904	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=413;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GCCCCTGGCCTGCAGTGCGGA;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=26;WE=92262882;WS=92262864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr1	92428495	rs10783071	C	A	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1452;SC=TGTGAAACTACAGTTGCCTGT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=92428503;WS=92428485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	92430435	.	CGT	C	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9983;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=95;SC=AGATACTTGACGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=92430444;WS=92430425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	92446112	rs11165911	T	C	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=105;SC=ACAAAAGACATTCTTGACTTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=92446120;WS=92446102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	92446398	rs2303967	T	A	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=921;SC=TATGATAGCTTATTAAGACAA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=92446406;WS=92446388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	92447004	rs10875104	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=648;SC=GTCTTGTGATATTGCCCAGGC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=92447012;WS=92446994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	92457843	rs10747493	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.28;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	92568263	rs527412	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.778;SC=TTATAGCCGTAAAAATAATTA;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=6;WE=92568271;WS=92568253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	92573670	rs11166163	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=0.802;SC=ACAGGCCACAGGGGTTCCATG;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=19;WE=92573678;WS=92573660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	92646021	rs1483022	G	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.185;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=892;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ATCAGTCAAAGAAAGGTGAAA;SOR=1.014;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=55;WE=92646029;WS=92646011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,69:0.51:135
chr1	92647223	rs560389	A	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=745;ReadPosRankSum=-0.984;SC=AAGCAAAGTAATAATGATCTT;SOR=0.458;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=47;WE=92647231;WS=92647213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,52:0.43:122
chr1	92647532	rs565156	C	A	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=52;PP=2449;SC=TTTTCTGCAACTAAAAAGTTT;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=115;WE=92647540;WS=92647522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	92711067	rs3131827	A	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=1.652;SC=ATTTCTGTAAATAATGCTGCA;SOR=0.385;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=11;WE=92711075;WS=92711057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr1	92712266	rs974924	C	T	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=14;PP=579;SC=AAGCAAAACACAGAAAAGATT;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=92712274;WS=92712256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	92712598	rs35752451	GAA	G	2056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.599;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr1	92735359	rs1487540	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=344;ReadPosRankSum=1.152;SC=AACAAATATATATATTATACA;SOR=1.650;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=20;WE=92735367;WS=92735349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	92755943	rs3103178	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=2.189;SC=AAGAAGGCATGTATCGACAAA;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=92755951;WS=92755933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	92764828	rs10875348	T	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=27;PP=774;SC=CCAGGTAGAGTAGGCCGAAAG;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=92764836;WS=92764818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	92765848	rs1542685	A	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-0.738;SC=ATCTTGTATTACTTGTACCAA;SOR=0.594;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=18;WE=92765856;WS=92765838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr1	92799151	rs1487537	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=374;SC=GTGAAAAGTTCACATGGATTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=92799159;WS=92799141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	92852504	rs10747411	A	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=197;SC=TCCTGACCTCATGATCTGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=92852512;WS=92852494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	92941874	rs141171648	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=0.139;SC=CACAGTCTAAGGCCTTCAAGC;SOR=0.743;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=16;WE=92941882;WS=92941864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	92946479	rs11164605	G	A	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=23;PP=1218;SC=GGGCGGGTTCGCAGAAGAGGC;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=92946487;WS=92946469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	92979354	rs6603979	A	G	5461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=69;PP=2965;SC=AAGACATCGAACCAGATTTTC;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=163;WE=92979362;WS=92979344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	93029453	rs6656432	A	G	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=103;SC=ACAATTCATAATGAACTATGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=93029461;WS=93029443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	93071048	rs2050597	G	T	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=61;PP=1721;SC=TAAACCATACGTTAAGTATTA;SOR=3.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=11;TCR=61;TR=72;WE=93071056;WS=93071038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	93089823	rs7514716	T	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=34;PP=1314;SC=TCAGTTCATCTTGTAACTCAT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=93089831;WS=93089813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	93128854	rs10747450	A	G	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=560;SC=ACCACCCAAAAAATTATTTCT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=93128862;WS=93128844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	93160902	rs2391199	T	C	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=47;PP=1952;SC=CTTGTTGCAATTGGTAGTGGA;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=91;WE=93160910;WS=93160892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	93163385	rs7418336	A	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=18;PP=859;SC=ATATAAAGGCAATATGCCTTT;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=93163393;WS=93163375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	93163633	rs1017008	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=301;SC=CAGCCAACCACAAACATTGTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=93163641;WS=93163623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	93167610	rs10218567	C	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=76;SC=TATCCACTTACATTTAATAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=93167618;WS=93167600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	93167854	rs10218670	A	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=29;PP=863;SC=GGCAAGACAGACAGATTAAAA;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=93167862;WS=93167844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	93306317	rs10874744	G	A	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=63;PP=2429;SC=TGGCAGAAGCGAAGGGAACCA;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=119;WE=93306325;WS=93306307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	93426866	rs945629	T	C	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.02;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	93426869	rs1415069	G	C	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=2.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	93545157	rs2815419	G	A	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=887;ReadPosRankSum=0.751;SC=AGGAAGAAAGGAAGCAAGTAT;SOR=0.509;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=54;WE=93545165;WS=93545147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr1	93580402	rs11164874	T	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=1.509;SC=GATTAATGACTAAAAATACTT;SOR=0.608;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=26;WE=93580410;WS=93580392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr1	93580581	rs2815427	G	C	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=30;PP=1262;SC=CATATTGATTGCAGTGTGATT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=60;WE=93580589;WS=93580571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	93602194	rs2281524	C	T	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=29;PP=2288;SC=TAAAAAAGCTCAGTAGACAAT;SOR=1.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=104;WE=93602202;WS=93602184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	93646070	rs200461387	T	A	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.706;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=891;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCTCTCCCCCTGACGGCCTCC;SOR=0.418;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=58;WE=93646078;WS=93646060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,65:0.58:113
chr1	93649111	rs17131709	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=1.406;SC=AATGTAAAATGTGTGGATTTC;SOR=0.779;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=23;WE=93649119;WS=93649101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr1	93659350	rs2815411	A	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-1.479;SC=AATAAAAGGAAATATTACCTA;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=12;WE=93659358;WS=93659340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	93672688	rs2783499	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=2.136;SC=AAAATAACAACGGAAAAGAAA;SOR=1.863;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=93672696;WS=93672678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	93672723	rs2815413	A	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=348;ReadPosRankSum=-2.054;SC=GCAGTGAAAAATTCAGAAGTC;SOR=0.628;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=23;WE=93672731;WS=93672713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	93683210	rs624131	A	G	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=209;SC=TTCCCAGGCTAGTCTTGAACT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=93683218;WS=93683200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	93687091	rs797661	G	T	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=2;PP=195;SC=CAATTATAGTGTCACATGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=93687099;WS=93687081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	93698222	rs661566	C	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.770;SC=ATAGATTTTTCGTTAGTTTTT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=93698230;WS=93698212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	93704793	rs5776176	CT	C	182.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=0;PP=146;SC=AACTTGCAGGCTTTTTTTTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=93704801;WS=93704783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	93720070	rs12030843	C	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=482;ReadPosRankSum=-1.353;SC=TAAAGAACAGCTTCGAGAAAA;SOR=0.435;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=30;WE=93720078;WS=93720060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr1	93730416	rs150053356	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=553;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TCCAAGATAGGAATGAAGTAA;SOR=0.351;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=31;WE=93730424;WS=93730406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr1	93744055	rs10874767	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=-0.102;SC=ATACTGATGTGTTGAAAAAAT;SOR=0.400;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=33;WE=93744063;WS=93744045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr1	93826178	rs3088371	A	T	578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=-2.181;SC=AGGATGAAGAAGATGATGATG;SOR=0.320;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=31;WE=93826186;WS=93826168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr1	94009830	rs12409932	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CTTTGAGTGACGCCCTTAAAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=94009838;WS=94009820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	94012287	rs237425	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr1	94108028	rs41292657	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.812;SC=CCAGGCAGTATTCACAACAGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=94108036;WS=94108018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	94312482	rs5776191	T	TC	11863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.201;NF=74;NR=129;PP=2969;ReadPosRankSum=1.430;SC=ACCCCGTTTTTCGAACCCCGC;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=74;TCR=130;TR=203;WE=94312490;WS=94312472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,456:1.00:458
chr1	94312528	rs147446599	G	GC	13383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=43.03;SOR=1.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr1	94312533	rs202198870	G	GC	12906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=58;PP=2970;SC=ACGTCGCGCGGCGGCGCTCGC;SOR=2.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=61;WE=94312592;WS=94312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	94312542	.	G	GC	11615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=46.46;SOR=2.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	94312543	.	C	CCG	2968	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=23;MQ=59.31;NF=2;NR=48;PP=2968;QD=20;SC=GCGGCGCTCGCGCGCAGGTCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=94312592;WS=94312518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	94312544	.	G	C	2275	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=23;MQ=59.56;NF=20;NR=44;PP=2275;QD=36.090175196;SC=CGGCGCTCGCGCGCAGGTCCA;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=109;TCF=22;TCR=87;TR=64;WE=94312592;WS=94312518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:45,64:0.59:109
chr1	94312544	.	G	GC	11302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=48.72;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr1	94312554	.	A	AG	9817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=2954;SC=GCGCAGGTCCAGCCGCGGCTG;SOR=2.337;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=36;WE=94312592;WS=94312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	94312558	.	G	GC	1844.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=16.028;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.707;NF=2;NR=29;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AGGTCCAGCCGCGGCTGGGTC;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=94312592;WS=94312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,58:0.33:176
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	4267.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=16.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.714;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,118:0.67:176
chr1	94312566	rs2391318	G	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=16.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.771;QD=10.61;ReadPosRankSum=-2.018;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,54:0.31:172
chr1	94312567	rs2391319	T	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=7.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=16.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.771;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.317;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,54:0.31:172
chr1	94312571	.	G	GC	1693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.299;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=17.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.842;QD=10.08;ReadPosRankSum=-2.781;SOR=2.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,50:0.30:168
chr1	94312572	.	CGCGGCGGCCGGG	C	2968	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=24;MQ=58.79;NF=0;NR=29;PP=2968;QD=20;SC=CTGGGTCGGGCGCGGCGGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=94312592;WS=94312518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,29:1.00:29
chr1	94312573	.	G	GC	1674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.391;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=18.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.922;QD=10.21;ReadPosRankSum=-3.021;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,46:0.28:164
chr1	94312576	.	G	GC	8062.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;QD=48.28;SOR=2.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	94312579	.	G	GT,GC	6799.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.90;QD=43.59;SOR=2.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,118,38:0.76,0.24:156
chr1	94312584	rs200230769	G	GC	6697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=47.84;SOR=2.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	94343233	rs3789457	T	C	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1648;ReadPosRankSum=0.813;SC=CCTCAGAGGTTTCTCCATCCG;SOR=0.694;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=90;WE=94343241;WS=94343223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,105:0.54:196
chr1	94344580	rs6675820	C	A	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=20;PP=2640;SC=GCCCCGCCTGCCTGAGCGCGG;SOR=2.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=94;TCR=20;TR=114;WE=94344588;WS=94344570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	94344840	rs6681078	A	C	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.357;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=48;PP=872;ReadPosRankSum=-0.531;SC=AGTTCAGGCCAGGGCGGTCAG;SOR=0.171;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=103;TCF=12;TCR=91;TR=57;WE=94344848;WS=94344830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr1	94360107	rs769211	C	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.874;SC=TATGTATCAACAAATACCTTT;SOR=0.283;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=94360115;WS=94360097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	94367097	rs7515191	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=290;ReadPosRankSum=-0.217;SC=AAAATCTATCGCTTCCGCTAT;SOR=0.432;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=24;WE=94367105;WS=94367087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr1	94374576	rs2273406	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=407;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCCCGCGGCGAGTGTCGCCA;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=25;WE=94374584;WS=94374566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr1	94374742	rs743119	C	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CCAGGGGCCGCGCAGCGAAGG;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=94374750;WS=94374732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	94471075	rs1762114	A	G	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=75;PP=2663;SC=GCAGCTCATCAATTGCATCAA;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=131;WE=94471083;WS=94471065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	94471154	rs4147863	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=553;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AGAAAAAAAGCAATTACTGAG;SOR=0.490;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=37;WE=94471162;WS=94471144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr1	94473029	rs67601772	TGTTGG	T	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.842;NF=2;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGGTCTATGTGTTGGGCTTT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=94473041;WS=94473019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	94473605	rs3789386	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=0.483;SC=AAAAATACTAATGAAATTAAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=94473613;WS=94473595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr1	94474452	rs4147856	T	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=720;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GGGGTCAGGATTGGGCTGGCT;SOR=0.955;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=45;WE=94474460;WS=94474442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr1	94476203	rs112614086	CT	C	2683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.373;NF=19;NR=25;PP=1650;ReadPosRankSum=0.406;SC=ACCCGATCCTCTACTTGTATT;SOR=0.606;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=44;WE=94476211;WS=94476193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,79:0.52:152
chr1	94476388	rs1801574	C	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.478;SC=GCTGGACCAGCAGGGTCAGGA;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=59;WE=94476396;WS=94476378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr1	94476555	rs537831	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=165;ReadPosRankSum=-0.325;SC=CCACAGCACAGGGCCCACTAG;SOR=0.122;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=10;WE=94476563;WS=94476545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	94476991	rs4147899	CT	C	1969.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.012;NF=6;NR=54;PP=2324;ReadPosRankSum=2.161;SC=CCCACCCCCCCTCTCTTCAGC;SOR=0.913;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=11;TCR=97;TR=60;WE=94476999;WS=94476981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,82:0.50:164
chr1	94480037	rs2275033	C	T	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=12;PP=863;SC=TGGCTCTGCTCGACCAACACA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=94480045;WS=94480027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	94487354	rs472908	G	A	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=60.05;MQRankSum=-0.961;NF=46;NR=35;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.230;SC=ATTCATGGTAGTTAAGCAAGT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=81;WE=94487362;WS=94487344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,98:0.49:202
chr1	94495930	rs547806	T	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=13;PP=914;SC=AACCCACCGTTGGGTCCTCCC;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=94495938;WS=94495920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	94496253	rs2297671	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=612;SC=CTGAACACTCGCAGTGGTCTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=94496261;WS=94496243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	94511533	rs3789398	G	A	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=46;PP=1271;SC=TGAGAGATCCGCGCAGAGCCC;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=94511541;WS=94511523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	94528363	rs4147833	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGCTCACTCACACCTCCCGAC;SOR=0.423;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=24;WE=94528371;WS=94528353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr1	94544135	rs4147887	A	AC	1017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=19;NR=6;PP=836;SC=CCATCCTCCAACCCCCCTTAC;SOR=2.115;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=25;WE=94544143;WS=94544125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	94544234	rs3112831	T	C	5134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=60;PP=2812;SC=CTTCCTAACGTGTTCCAGTTC;SOR=1.234;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=100;TCR=60;TR=160;WE=94544242;WS=94544224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	94544805	rs139796930	T	TCA	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.709;NF=7;NR=3;PP=427;ReadPosRankSum=1.785;SC=CACATCTCTCTCACACACACA;SOR=0.278;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=94544813;WS=94544795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr1	94549029	rs526016	A	G	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.68;SOR=1.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	94549083	rs574741	T	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=935;SC=CTCCTATATGTTTGAAAACTC;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=94549091;WS=94549073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	94574053	rs11165073	C	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=4;PP=136;SC=TTTTCACCAACTCTCCCTGTT;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=94574061;WS=94574043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	94576968	rs2297634	T	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=8;PP=618;SC=CTTCCTCCCCTGCATGGTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=94576976;WS=94576958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	94578548	rs4847281	T	C	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=38;PP=1998;SC=GGCTGTAGAGTGGGTTGGCAT;SOR=1.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=102;WE=94578556;WS=94578538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	94639337	rs1330858	A	G	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1145;SC=TATACAAAAGAGGCCCTGTCA;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=94639345;WS=94639327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	94639447	rs1999272	C	T	8972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=105;PP=2965;SC=TGGAATTTCACCTTCGAGGTC;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=266;TCF=161;TCR=105;TR=266;WE=94639455;WS=94639437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr1	94667430	rs5776210	G	GA	248.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=10;PP=206;SC=AAATATCACAGAAAAAAAAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=94667438;WS=94667420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	94667970	rs1541098	T	C	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=15;PP=1604;SC=TGAGAAACTCTGGGGGATGGG;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=94667978;WS=94667960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	94668046	rs1541099	C	T	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=82;PP=2965;SC=ACACCAAACTCCTGGCAGATT;SOR=1.068;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=205;TCF=123;TCR=82;TR=205;WE=94668054;WS=94668036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	94670784	rs10443184	T	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=17;PP=495;SC=GGTAAGTATATGTTAAATGTG;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=94670792;WS=94670774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	94674723	rs6684237	G	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=750;SC=TTAATACTTCGTTTCCCATGT;SOR=1.077;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=94674731;WS=94674713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	94883977	rs377528117	AGCC	A	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,9:0.11:82
chr1	94924046	rs2147794	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=1.174;SC=TCTCACTATGATGTGAAAAAG;SOR=0.540;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=94924054;WS=94924036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	94930345	rs16946	G	A	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1006;ReadPosRankSum=1.281;SC=AGGGGAAAAAGGAGCGAGCTG;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=68;WE=94930353;WS=94930335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,88:0.56:158
chr1	94941376	rs681187	G	A	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=127;SC=AATTGATTTTGTGGACATAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=94941384;WS=94941366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	94980671	rs3118109	C	G	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=26;PP=1063;SC=CTCTGTTACTCATTAAACCTA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=94980679;WS=94980661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	95001600	rs698946	A	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=34;PP=1035;SC=CATTCCCTGCAGGGTAGGAGA;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=95001608;WS=95001590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	95211285	rs6541364	C	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=8;PP=825;SC=TTAGGGGACTCTGGCATAGTA;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=95211293;WS=95211275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	95211525	rs1333953	G	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=1055;SC=CTGGAAGCCAGCAGGTTTTAC;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=95211533;WS=95211515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	95286094	rs10782992	G	T	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=31;PP=1212;SC=CGAGTCCCCCGCCTTCACGCA;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=67;WE=95286102;WS=95286084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	95286658	rs6676991	C	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=113;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=687;SC=TGTGTGTGCACGTCTGGAAAT;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=95286666;WS=95286648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	95286675	rs11274910	GTCCCAAATGTAAA	G	1360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=2957;SC=AAATAACTCTGTCCCAAATGT;SOR=1.839;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=95286695;WS=95286665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	95290003	rs6687749	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=683;SC=GGGCACTGTGCGCTCAGCCCT;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=95290011;WS=95289993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	95290305	rs6541372	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=322;SC=CAGCCTATTTTATAAAAAGGA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=95290313;WS=95290295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	95291366	rs10874894	A	G	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=19;PP=1172;SC=CTAATTACGGAGCATTTTCTC;SOR=1.318;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=95291374;WS=95291356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	95293114	rs34462882	C	A	4758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=79;PP=2615;SC=GTACGCAGCTCAACCGCATGG;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=144;WE=95293122;WS=95293104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	95330372	rs859098	G	A	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=46;PP=2068;SC=TCAAGGAACCGTTGTGAAAGG;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=95330380;WS=95330362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	95332864	rs12137650	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=409;ReadPosRankSum=-1.026;SC=TGACTCTGTTCCTTTGTTCTC;SOR=1.170;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=30;WE=95332872;WS=95332854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr1	95333068	rs859096	G	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=39;PP=1226;SC=TCTCTAAGGGGCTAAATTGTG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=95333076;WS=95333058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	95358096	rs859063	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-0.176;SC=TTCATTTCCAATTGCAATCTC;SOR=0.421;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=22;WE=95358104;WS=95358086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr1	95367108	rs10605235	ACC	A	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TATAAACTACACCCCCCCCCC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=95367117;WS=95367105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	95367136	rs859059	G	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=226;SC=TAGTACTTCTGTCTATTCTTA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=95367144;WS=95367126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	95367413	rs116488763	T	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=2044;ReadPosRankSum=1.842;SC=AGAAATGATATGTCCATAGAC;SOR=0.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=57;WE=95367424;WS=95367403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,73:0.69:106
chr1	95367416	rs2275612	C	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.663;SC=AATGATATGTCCATAGACAAA;SOR=0.756;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=27;WE=95367424;WS=95367403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,30:0.29:104
chr1	95367649	rs859058	T	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=738;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GGGAATCTGTTAACCAGCCAT;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=46;WE=95367657;WS=95367639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,50:0.67:75
chr1	95367669	rs2275613	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TTAAAGACATGTACGTACCAG;SOR=1.059;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=19;WE=95367677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
chr1	95367894	rs859057	A	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GTCTTCATAAACAGTTATAAG;SOR=0.425;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=7;WE=95367902;WS=95367884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr1	95699692	.	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
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chr1	95709821	rs259358	T	C	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=75;PP=2954;SC=TTTATGGATGTGGATATACCT;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=156;WE=95709829;WS=95709811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	95709939	rs2296308	T	G	4810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=70;PP=2965;SC=TGAAAGAGAATTTACTTGAGC;SOR=0.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=147;WE=95709947;WS=95709929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	97189091	rs3762411	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=503;ReadPosRankSum=-0.635;SC=AATAACAGGAGGTTGAAACTA;SOR=0.382;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=33;WE=97189099;WS=97189081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr1	97278804	rs273886	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=470;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TGTATGAAGTGTCTAATTTTA;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=26;WE=97278812;WS=97278794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr1	97547831	rs290854	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=18;PP=1582;SC=GCTTTCTGCCGTAAAAACAAG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=72;WE=97547839;WS=97547821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	97771947	rs7556439	C	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-1.100;SC=ACGTGCAAGACAAATCCAACT;SOR=0.610;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=9;WE=97771955;WS=97771937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	97839016	rs1890138	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CTAGCCAGTCATCTGATCCAT;SOR=1.460;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=12;WE=97839024;WS=97839006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr1	97847874	rs72728438	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=84;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TTATTTCTCATGGCAGCTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=8;WE=97847882;WS=97847864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	98039541	rs56293913	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AACAAAACAGAACAGAGAAGA;SOR=1.516;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=22;WE=98039549;WS=98039531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr1	98165091	rs2297595	T	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=840;ReadPosRankSum=1.064;SC=GGGATACTCATTGCTTTGAAT;SOR=0.796;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=52;WE=98165099;WS=98165081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr1	98165107	rs202011255	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=826;ReadPosRankSum=2.060;SC=TGAATACCTACGGGGAAATCA;SOR=0.564;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=54;WE=98165115;WS=98165097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,68:0.57:119
chr1	98348885	rs1801265	G	A	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=910;ReadPosRankSum=1.333;SC=GAAGTGGAACGCAGAGTTGCA;SOR=1.014;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=62;WE=98348893;WS=98348875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr1	98349390	.	C	CA	302	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=61.49;NF=4;NR=14;PP=302;QD=17.2777777778;SC=TTAGGAATCACAAAAAAAAAA;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=18;WE=98349398;WS=98349380;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,18:0.60:30
chr1	98510679	.	GAAAC	G,GAAACAAAC	6633.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=0.157;NF=38,38;NR=59,59;PP=2989,2688;ReadPosRankSum=-1.091;SC=ATTAATATTTGAAACAAACAA;SOR=0.321;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=97,97;WE=98510690;WS=98510669;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.41:164
chr1	98510847	rs74904371	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1152;ReadPosRankSum=1.249;SC=GCTGAAGAGGCGTCCCAAAGA;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=167;TCF=71;TCR=96;TR=72;WE=98510855;WS=98510837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,97:0.47:207
chr1	99127205	rs12723363	A	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=7;PP=215;SC=GGGGAGGTGCAGGAGACGTGG;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=99127213;WS=99127195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	99127392	rs9728148	T	C	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=921;SC=CGGGCAGCAGTGGCTCTTCCG;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=99127400;WS=99127382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	99150635	rs9433747	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=27;PP=894;SC=TAAACATTTGGTGAATATTTT;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=99150643;WS=99150625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	99225627	rs2019213	G	A	4335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=63;PP=2796;SC=CTACGTGGGAGTCATTCCTTA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=132;WE=99225635;WS=99225617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	99387628	rs34854879	T	TA	976.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.152;NF=1;NR=30;PP=541;ReadPosRankSum=-0.804;SC=AAACATTCAATAAAAAAAATG;SOR=1.044;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=31;WE=99387636;WS=99387618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr1	99418948	.	T	TGTGTGTGA	177	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=59.6;NF=0;NR=4;PP=177;QD=45.0;SC=TGTGTGTGTGTGTGAATTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=99418956;WS=99418938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
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chr1	100152443	rs1338576	T	C	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=21;PP=1111;SC=TAGATTCTATTTTTTAAACTG;SOR=1.036;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=100152451;WS=100152433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr1	100185282	rs6679013	G	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=0.712;SC=ATACGGGCAGGGCATGGCAAC;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=11;WE=100185290;WS=100185272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	100194305	rs7522921	C	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=0.502;SC=GATCGTATGTCCATGCTTTGT;SOR=0.726;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=12;TCR=54;TR=31;WE=100194313;WS=100194295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr1	100203501	rs7537095	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=1.037;SC=GTTTCACCATCTCGGCCAGGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=100203509;WS=100203500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	100203571	rs7548709	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=-1.205;NF=22;NR=10;PP=503;ReadPosRankSum=0.215;SC=TGCTGGGATTACAGGCATGAG;SOR=0.708;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=32;WE=100203579;WS=100203561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr1	100203597	rs7513916	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.278;NF=25;NR=19;PP=591;ReadPosRankSum=1.354;SC=ATGCCTAGCCGTGATTCTCCT;SOR=0.467;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=44;WE=100203605;WS=100203587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr1	100203648	rs7537296	C	T	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.141;NF=32;NR=32;PP=840;ReadPosRankSum=-2.045;SC=CAACCATCCACTGATCATGAG;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=64;WE=100203656;WS=100203638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,76:0.43:177
chr1	100203693	rs7514021	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=841;ReadPosRankSum=1.524;SC=TACTGGGGCCGCTCATTTCAA;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=53;WE=100203701;WS=100203683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr1	100206478	rs143957192	C	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=771;ReadPosRankSum=-0.525;SC=AGATTTTATACTTCTCAACAA;SOR=0.576;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=51;WE=100206486;WS=100206468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr1	100214391	rs1416237	T	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TTTACACAACTGGACCATAAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=100214399;WS=100214381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	100316589	rs2307130	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=520;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CAAATCCTCTAGAAGCCAAAA;SOR=0.702;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=33;WE=100316597;WS=100316579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr1	100316765	rs663848	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=-1.727;SC=TTTTAAAGCTCTAAGATAAAT;SOR=0.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=20;WE=100316773;WS=100316755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr1	100329889	rs535461	G	C	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=818;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TTCATTTTAGGCTGGTTTTGT;SOR=0.893;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=44;WE=100329897;WS=100329879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr1	100335883	rs903126	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=388;ReadPosRankSum=0.140;SC=ATTTTATTTCACCTCTAAACT;SOR=0.205;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=23;WE=100335891;WS=100335873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	100336361	rs2230306	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=203;ReadPosRankSum=0.340;SC=AGCTTAAACTCTGGGAATTTT;SOR=0.699;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=12;WE=100336369;WS=100336351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr1	100340225	rs634880	G	A	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=41;PP=2674;SC=TTAAGGTATCGTCTTTTCTTT;SOR=1.543;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=126;WE=100340233;WS=100340215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	100342227	rs3736295	C	T	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=78;PP=2358;SC=ATCTGCTTTACTGATTTTCTT;SOR=2.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=20;TCR=78;TR=98;WE=100342235;WS=100342217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	100343153	rs2291638	A	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=8;PP=1083;SC=AATTGTTTTCATTTTATTTCT;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=100343161;WS=100343143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	100345409	rs2392077	C	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=6;PP=975;SC=TTGTCTCTTTCCTTCCTCCTA;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=100345417;WS=100345399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	100346741	rs3736296	T	C	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=54;PP=2261;SC=CAGGTTTGTTTATATGTTGTT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=107;WE=100346749;WS=100346731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	100350383	rs2234707	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=451;SC=AGGACCAGCAGTGTCAGCATC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=100350391;WS=100350373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	100353675	rs555929	G	A	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=61;PP=2259;SC=GTAAGCAAATGGAAGGATAGC;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=115;WE=100353683;WS=100353665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	100357141	rs2035961	T	A	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=675;SC=AAATTAACTTTCAAATTTATT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=100357149;WS=100357131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	100358200	rs594249	G	A	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=71;PP=2104;SC=TATGTAAATCGATAGTATTCG;SOR=2.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=16;TCR=71;TR=87;WE=100358208;WS=100358190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	100376448	rs2274570	G	A	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=1.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	100376456	rs1541041	T	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	100381109	.	A	AT	65	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=60.63;NF=1;NR=3;PP=65;QD=17.5;SC=ATCAACCATAATTTTTTTTTT;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=100381117;WS=100381099;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,4:0.29:14
chr1	100381869	rs2296885	G	A	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=188;SC=CAAAATAATTGATTATTTCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=100381877;WS=100381860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	100533960	rs6687189	G	A	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=6;PP=1165;SC=GAATCTCTGCGTATTCTTAAG;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=47;WE=100533968;WS=100533950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	100572646	rs201992806	TTAC	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=232;SC=ACATAAATGGTTACTACTACT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=100572656;WS=100572636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	100575933	rs13375867	G	A	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.549;SC=TTTATTAGCCGCTTCTAACTC;SOR=0.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=68;WE=100575941;WS=100575923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr1	100598866	rs472498	GC	AT	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=71;PP=2947;SC=CGCTGGAGCCGCGGAGGTGTG;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=97;WE=100598875;WS=100598856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	100615020	rs181033524	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=1.269;SC=GATTATTTCACTTAATTATTT;SOR=0.465;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=10;WE=100615028;WS=100615010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	100617887	rs2784177	C	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=7;PP=942;SC=GTTAGTGATACACACATTACT;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=100617895;WS=100617877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	100671866	rs34229137	T	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.57;QD=24.14;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	100672060	rs12021720	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=39;PP=1983;SC=CTGAGCTGACTCACAGAGCCC;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=88;WE=100672068;WS=100672050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	100715454	rs3806235	G	A	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=84;PP=2413;SC=TGGGAAACGCGCCTCCCCCTG;SOR=1.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=29;TCR=84;TR=113;WE=100715462;WS=100715444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	100733552	rs4298755	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=553;SC=TCTAGGTGCATAAAAACCCAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=100733560;WS=100733545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	100750733	rs58046505	AGTTTT	A	2149.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=13;PP=1288;SC=CTTAGTAATTAGTTTTGTTTT;SOR=1.702;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=26;WE=100750745;WS=100750723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	100817529	rs35169146	AGT	A,AGTGT	155.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;NF=0,0;NR=7,7;PP=233,152;SC=GGTTTTTACGAGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7,7;WE=100817540;WS=100817519;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.75:8
chr1	100818464	rs594529	T	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=715;ReadPosRankSum=1.208;SC=GGCGAGTGACTTCAGCTGGCC;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=36;WE=100818472;WS=100818454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr1	100908324	rs584350	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTTAATGCAATATAACCAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=100908332;WS=100908318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	100961779	rs149672640	ATT	A	306.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=9;PP=131;SC=CATGAAAAGGATTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=100961788;WS=100961769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	100970346	rs10875295	T	C	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=38;PP=1515;ReadPosRankSum=0.433;SC=ACCTTGCTTATTCTCTTGTTT;SOR=0.491;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=172;TCF=114;TCR=58;TR=102;WE=100970354;WS=100970336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,119:0.56:213
chr1	101005090	rs2809819	G	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=861;ReadPosRankSum=0.026;SC=GCCACCGCGAGTCCACTACCC;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=49;WE=101005098;WS=101005080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr1	101203698	rs3176878	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=365;ReadPosRankSum=0.616;SC=ACAACAAAGACTATTTTTCTC;SOR=0.386;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=20;WE=101203706;WS=101203688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr1	101203827	rs3176879	G	A	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=33;PP=1182;SC=AAGCACAGAAGTCAAAAGTGT;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=101203835;WS=101203817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	101342497	rs2295280	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=0.070;SC=ATAGTGTCTATATAGATCATT;SOR=0.169;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=18;WE=101342505;WS=101342487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	101372607	rs4908106	C	A	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=225;SC=GACTTGTTACCAATTGAACAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=101372615;WS=101372597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	102271775	rs72729629	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TAGGTGAACGCAGCCAATGAT;SOR=0.801;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=82;WE=102271783;WS=102271765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,100:0.52:192
chr1	102296144	rs10493974	T	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=433;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CCAATGCACATTCATTTCTAG;SOR=0.256;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=28;WE=102296152;WS=102296134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr1	102296279	rs10493973	T	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=761;ReadPosRankSum=-1.169;SC=TCTGCCGAAATTTTGCCTTCA;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=51;WE=102296287;WS=102296269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr1	103352451	rs2229783	A	G	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1463;ReadPosRankSum=0.219;SC=TCATATGCTCAATGTCTTGTT;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=163;TCF=71;TCR=92;TR=88;WE=103352459;WS=103352441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,108:0.53:202
chr1	103354115	rs17127203	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=516;ReadPosRankSum=0.457;SC=AACATCACTCTTGTTAACATA;SOR=0.779;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=30;WE=103354123;WS=103354105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr1	103354138	rs1676486	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=538;ReadPosRankSum=-0.485;SC=CTTACTGGAGACCCAGGAGGC;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=39;WE=103354146;WS=103354128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr1	103354428	rs1763347	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=2.194;SC=TTACTGGTAAACCTGGAGGAC;SOR=0.837;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=24;WE=103354436;WS=103354418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr1	103354939	rs113226085	C	CTGTGTGTGTG	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=891;ReadPosRankSum=0.802;SC=ACTTAAAGGACTGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=6;WE=103354948;WS=103354929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	103356107	rs11164634	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=1.906;SC=CAGAGTAGGTATGAATTAGAG;SOR=1.314;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=103356115;WS=103356097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	103356168	rs1085	A	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.095;SC=TACGGAGTTGAAAATAGTAAT;SOR=0.048;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=103356176;WS=103356158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	103379918	rs3753841	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=347;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TGCAGGGCCAGGTTCCCCAGG;SOR=0.826;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=27;WE=103379926;WS=103379908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr1	103380379	.	T	TA	65	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=65;QD=17.5;SC=TAAACAATGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=103380387;WS=103380369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr1	103381129	rs4908273	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=627;ReadPosRankSum=-0.724;SC=GTTTGTAATGCTGTAAAAGAA;SOR=1.101;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=39;WE=103381137;WS=103381119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr1	103400491	rs11164641	GA	AT	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=10;PP=2074;SC=ATTTAAATTTGATTTAATGTC;SOR=2.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=46;WE=103400500;WS=103400481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	103428389	rs1841834	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=1016;SC=CTCAAAAACAGTATTATTACA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=103428397;WS=103428379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	103435626	rs2061710	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	103444679	rs11164649	T	G	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=80;PP=2786;SC=GACAGTTCAATTTCAATATGC;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=146;WE=103444700;WS=103444669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	103449598	rs2615978	G	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=377;SC=AAGTACTCATGATAATATAGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=103449606;WS=103449588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	103455217	rs1463034	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=272;SC=GTGCTGATAACGAGGGAAAAT;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=103455225;WS=103455207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	103461508	rs2622867	T	A	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=12;PP=607;SC=AACATTTCACTTTGAAAGTAA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=103461516;WS=103461498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	103462473	rs2786125	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=432;SC=ACATAGTCTAATTTCTAAAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=103462481;WS=103462463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	103467615	rs2929162	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=438;SC=CTATAGTACACAGTGAGTTAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=103467623;WS=103467605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	103468609	rs2251895	A	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.59;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	103468855	.	TAA	T	900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.136;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.001;NF=6;NR=14;PP=226;ReadPosRankSum=0.840;SC=ACGCCTTTATTAAAAAAAAAA;SOR=0.547;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=20;WE=103468864;WS=103468845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	103471456	rs71752747	CCAT	C	3148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=26;PP=2518;SC=CCCTGTAAAACCATCATCATC;SOR=1.032;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=44;WE=103471466;WS=103471446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	103471734	rs71592255	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT	376.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,3:0.67,0.33:9
chr1	103483514	rs945748	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=298;SC=CTAGTCCTATCGAAGAGTTCG;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=103483522;WS=103483504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	103487394	rs35291481	CT	C	1163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;MQRankSum=0.107;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.151;SOR=3.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr1	103496620	rs7523441	G	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=435;SC=ACTGCACTGCGATGTCCATAT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=103496628;WS=103496610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	103496805	.	GA	G	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=18;MQ=58.62;NF=0;NR=5;PP=76;QD=16.2;SC=GTCCCCCTGGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=103496813;WS=103496795;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,5:0.45:11
chr1	103548319	rs11164662	C	G	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=813;SC=AGTGTAATAACTTTTAGTAAT;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=103548327;WS=103548309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	103573547	rs6691654	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.84;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	104076462	rs6697444	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCACTTCAGGCTCTGAAAAAA;SOR=0.991;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=4;WE=104076470;WS=104076452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	104080169	rs10736038	G	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.373;SC=AGAGACTCTTGCTCTCCCTAG;SOR=1.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=10;WE=104080177;WS=104080159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	104084226	rs10881232	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=0.527;SC=CTTCCTAGTTACCAAATTTAC;SOR=1.508;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=14;WE=104084234;WS=104084216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	104086145	rs10785725	A	G	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=37;PP=1144;SC=ATAATGTTTCATATTTTAGTA;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=104086153;WS=104086135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	104089773	rs7529928	C	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=81;SC=TGAAAAAGTTCGTCTATTCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=104089781;WS=104089763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	104116413	rs17851840	T	C	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.793;NF=23;NR=40;PP=1017;ReadPosRankSum=1.095;SC=AATATATGAATCATCTCATTG;SOR=0.885;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=63;WE=104116421;WS=104116403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
chr1	104256478	rs167447	T	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.18;MQRankSum=-2.515;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.180;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	104297389	rs140363602	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.13;MQRankSum=-0.320;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,10:0.11:89
chr1	107599258	rs2232015	A	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-1.497;SC=AGCGCGCACTACAAGTCCCAG;SOR=2.093;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=10;WE=107599266;WS=107599248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	107946262	rs12126267	G	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=28.32;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	107979396	rs480392	A	C	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=65;PP=2036;SC=GTCTGCCGGGAAATTCCTGGC;SOR=2.229;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=84;WE=107979404;WS=107979386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	108292260	rs6672483	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=19;PP=621;SC=TGGTTTAGAAACATGGGTTAT;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=108292268;WS=108292250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	108293874	rs7516071	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=384;SC=ACATGAAAATAAAAACAAATA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=108293882;WS=108293864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	108293899	rs7518423	T	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=222;SC=TAGAGATATTTACTCAAGACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=108293907;WS=108293889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	108299775	rs34437461	ATG	A	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=2;PP=617;SC=ATGTGTGTATATGTGTGTGTG;SOR=3.816;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=14;WE=108299784;WS=108299765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	108299809	rs12138353	G	A	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=32;NR=11;PP=920;SC=GTGTGTGTGTGTATGCAATTT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=108299817;WS=108299799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	108307642	rs7514025	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TAAAGAGGAACACATTGCTTT;SOR=0.141;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=16;WE=108307650;WS=108307632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	108307727	rs7528153	T	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=672;ReadPosRankSum=-0.398;SC=TCTTCTTTTGTCTTAGAAATG;SOR=1.126;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=40;WE=108307735;WS=108307717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr1	108313258	rs6583048	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.454;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=473;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GATGACTTACCTTTTCTATTG;SOR=0.991;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=29;WE=108313266;WS=108313248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	108315256	rs7416884	G	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-0.617;SC=AGCAAGCAAAGGTTAAAAAAA;SOR=0.124;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=108315264;WS=108315246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	108315305	rs4611048	C	T	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=8;PP=1797;SC=TGTTAATTAGCCTTTCCTAAT;SOR=3.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=71;WE=108315313;WS=108315295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	108507209	rs56193625	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=424;ReadPosRankSum=0.077;SC=CTAGACGTTTGCATTTACACA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=22;WE=108507217;WS=108507199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr1	108507541	rs71796067	GGCC	G	513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.891;NF=0;NR=11;PP=438;ReadPosRankSum=1.400;SC=GCAAGGATGCGGCCGCCGCCG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=11;WE=108507551;WS=108507531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	108679532	rs17513812	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-1.863;SC=CAATTATGACCCAGAATGATA;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=4;WE=108679540;WS=108679522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	108681600	rs34563977	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=-2.117;SC=ACAGTCTGCATCTTAGTAGAA;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=14;WE=108681608;WS=108681590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	108700316	rs829002	G	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=0.753;SC=TTTTAGAGAAGAATCATGTTA;SOR=1.162;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=108700324;WS=108700306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	108724518	rs490680	A	G	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=55;PP=2667;SC=TCTAATGCAGAATATTAAAGT;SOR=1.091;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=135;WE=108724526;WS=108724508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	108724693	rs491785	G	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=824;SC=CTCAGAACTGGTAAGAACCAC;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=108724701;WS=108724683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	108728484	rs862493	T	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=343;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAAATGCCAATTTCATTTTCT;SOR=0.857;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=25;WE=108728492;WS=108728474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr1	108734993	rs521545	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GCTGGTCAACGACCTGAACAC;SOR=0.045;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=108735001;WS=108734987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr1	109143457	rs7534348	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=1.372;SC=TTAAAATACCATGGCAAATAT;SOR=0.301;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=109143465;WS=109143447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr1	109154974	rs2358522	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=0.129;SC=TTAAATAAGCGTATGTATATA;SOR=1.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=15;WE=109154982;WS=109154964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	109170746	rs2133198	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=501;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TGACCATTAACTTTTTGGCAA;SOR=1.038;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=28;WE=109170754;WS=109170736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr1	109173710	rs17025410	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=525;ReadPosRankSum=0.134;SC=TGTGAAAAAGGATTTACAGAA;SOR=0.375;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=39;WE=109173718;WS=109173700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr1	109255513	rs3006864	G	T	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=29;PP=2021;SC=AAGAGGACCCGGATTGCTTTG;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=90;WE=109255521;WS=109255503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	109260357	rs4970804	G	A	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.332;SC=AGTCATCCTCGTAGGTATCTT;SOR=0.777;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=68;WE=109260365;WS=109260347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr1	109265029	rs4423040	G	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=653;ReadPosRankSum=-1.159;SC=TCCTGGGCACGGGCAGAAGGA;SOR=0.463;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=43;WE=109265037;WS=109265019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr1	109268441	rs11582005	G	A	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1408;ReadPosRankSum=2.184;SC=GCTTGGTCCAGTGTAGATCTG;SOR=0.498;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=75;TCR=84;TR=87;WE=109268449;WS=109268431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,107:0.55:194
chr1	109268573	rs4494160	T	C	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=47;PP=1809;SC=AGTGTTTTTGTCTATAACAAG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=109268581;WS=109268563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	109270402	rs10494096	G	A	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=933;SC=TGATGGGACCGCCATTTTCCC;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=109270410;WS=109270392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	109273456	rs4970809	A	G	6806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=108;PP=2965;SC=GCCTCCTAGGATGCATCACAT;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=100;TCR=108;TR=208;WE=109273464;WS=109273446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	109273610	rs4970810	G	A	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=50;PP=1551;SC=ATCCAGGCATGAGCCTTTCCT;SOR=1.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=109273618;WS=109273600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	109289236	rs1124426	C	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=341;SC=CCGGAGGGCGCGGTCTGCTAG;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=109289244;WS=109289226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	109289353	rs1124427	C	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=28;PP=1098;SC=TCCGCAGTGTCGGGAAGATGG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=109289361;WS=109289343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	109289487	rs6604120	C	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=792;SC=AGCCCCAACCCAGCGGTCTGT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=109289495;WS=109289477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	109299453	rs1277044	C	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=340;SC=GGTTTACTAACAGAAAATTCA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=109299461;WS=109299443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	109301019	.	GC	G	35	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=35;QD=42.015449935;SC=TAAACTTTTAGCCAGTAAAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=109301027;WS=109301009;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr1	109301250	rs1277042	G	C	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=36;PP=1171;SC=TGTTCAAAATGCCATTGGTTT;SOR=1.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=50;WE=109301258;WS=109301240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	109315211	rs1623641	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=112;SC=TACATTATATATAACATAAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=109315219;WS=109315201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	109321824	rs1759481	G	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1040;SC=TTAGGAAAAGGGTGCTTTGTA;SOR=4.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=42;WE=109321832;WS=109321814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	109338861	rs1127635	G	C	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=23;PP=989;SC=TTAAGGACCTGGCACTTGGAA;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=109338869;WS=109338851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	109358755	rs11453763	A	AT	3451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=36;PP=1867;SC=TTTTCTTTGCATTTTTTTCTT;SOR=1.149;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=62;WE=109358763;WS=109358745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	109366286	rs7522157	C	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=846;ReadPosRankSum=1.229;SC=AGAATCAGAACAGAAGCTGTG;SOR=0.599;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=61;WE=109366294;WS=109366276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,74:0.44:170
chr1	109366370	rs7522260	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=457;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TCATAAAATACGGTGTGGAGA;SOR=0.827;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=29;WE=109366378;WS=109366360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	109369797	rs11102506	T	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=13;PP=812;SC=CACTGAAAAATGAGCACCCAG;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=109369805;WS=109369787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	109369915	rs7551421	G	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=46;PP=1589;SC=TTTTCTCCACGTTTTGCTTCC;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=109369923;WS=109369905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	109377157	rs5776950	TA	T	1159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=31;PP=776;SC=GTAACTAATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=48;WE=109377166;WS=109377147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	109391486	rs1149142	G	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=21;PP=1331;SC=TTTCTCATGTGTGAATTTGGT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=109391494;WS=109391476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	109395105	rs1277207	C	T	5714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=86;PP=2965;SC=ACAAGTCTCACTATGCATAGC;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=168;WE=109395113;WS=109395095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	109428295	.	C	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TGAAAATACTCAAATATACCA;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=109428303;WS=109428285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	109477348	.	C	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=520;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACACCTCTTGCGGGGCTGTAT;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=31;WE=109477356;WS=109477338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr1	109529322	rs61696019	T	TAA	1946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.24;NF=0;NR=38;PP=1857;SC=GAATGAATATTAGTTATCCTA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=38;WE=109529330;WS=109529312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	109545046	rs184606	C	T	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=616;SC=TAGAAAAAAACATATATATTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=109545054;WS=109545036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	109618308	rs34069017	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=243;SC=GATTCTGTACGTGTTTCAGTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=109618316;WS=109618298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	109649162	rs62623711	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=345;ReadPosRankSum=0.305;SC=CTTACCTATGGATCCTTGGAT;SOR=1.109;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=19;WE=109649170;WS=109649152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr1	109704390	rs643197	C	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=629;SC=GCTCCCTGCCCGGGGTCCCAG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=109704398;WS=109704380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	109704618	rs678238	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=49;PP=1421;SC=GCCTGACCCCATCAAGGGCAC;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=109704626;WS=109704608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	109727475	rs649531	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AAAGGGAAGCTTGAGCAGGGT;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=109727483;WS=109727465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr1	109734157	rs606066	T	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=1033;SC=ATCTGCCCCATTGGTGTGTCC;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=109734165;WS=109734147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	109734225	rs643785	G	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=359;SC=AGACTGACCAGCAGGGACTTC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=109734233;WS=109734222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	109734541	rs645128	C	T	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=46;PP=1289;SC=CCCAGGAGGACTCCTAGCATT;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=109734549;WS=109734531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	109735298	rs658779	T	C	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=48;PP=1545;SC=TTATGAATGGTGTGGCCTCCT;SOR=1.006;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=109735306;WS=109735288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	109735416	rs659543	A	C	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=39;PP=1449;SC=CTCCTGCCCCACTAACACAAT;SOR=0.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=109735424;WS=109735406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	109735504	rs659659	T	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=576;SC=AAGGTACCTGTAGTCTGGCAT;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=109735512;WS=109735494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	109737063	rs2359246	C	T	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=902;SC=TGTGCTACAACGATTGCACCT;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=109737071;WS=109737053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	109737090	rs2359245	G	A	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=22;PP=1366;SC=GCAACACTCCGACCAGGACTT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=109737110;WS=109737080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	109737132	rs2359244	T	C	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=39;PP=1643;SC=TGGCAAACACTGTCACTCTTG;SOR=1.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=95;WE=109737140;WS=109737122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	109737172	rs2359243	C	T	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=48;PP=2006;SC=TTCCAAAGGGCTGAAATACTT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=97;WE=109737180;WS=109737162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	109737314	rs2359242	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.64;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	109737320	rs2359241	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	109742452	rs913178	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=280;SC=AGTGAGAGCTCAGGTCTCTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=109742460;WS=109742442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	109742485	rs913179	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=505;SC=GAACGTGCTCGGATGGGACCT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=109742493;WS=109742475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	109743622	rs3736956	C	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=485;SC=GGATGGGCACCCTGCTCCCCA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=109743630;WS=109743612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	109745618	rs1052878	T	C	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=68;PP=2029;SC=TCAGGAGGCCTAGACATGGAC;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=90;WE=109745626;WS=109745608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	109771063	rs683182	T	C	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=79;PP=2792;SC=CTGTAAGTTATAGTTCTTTTC;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=129;WE=109771071;WS=109771053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	109771881	rs657511	G	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=189;SC=GTGTGTGAAGGAAATCTCAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=109771889;WS=109771871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	109777764	rs114166723	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=0.829;SC=TCTCTTTCTTGTGGTTTCTTA;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=14;WE=109777772;WS=109777754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	109778577	rs658092	T	C	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=23;PP=1252;SC=CTGTCACCGTTTCCTTGGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=109778585;WS=109778567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	109779556	rs631927	T	A	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=56;PP=1875;SC=CCAAGTCAGGTGCTTGAAAGG;SOR=1.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=89;WE=109779564;WS=109779546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	109779621	rs11439617	T	TC	1195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=1095;SC=AGGGCCCAACTCTCAGAATAC;SOR=2.517;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=22;WE=109779629;WS=109779611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	109792735	rs144034706	A	ACGC	3311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=22;PP=1790;SC=CCCCCTCCCAACGCCGCCGCC;SOR=1.164;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=39;WE=109792743;WS=109792725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	109794252	rs454107	T	C	10964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=210;PP=2965;SC=TCCTGGAGAGTGTCCCCTTAG;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=349;TCF=138;TCR=211;TR=348;WE=109794260;WS=109794242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr1	109795026	rs413380	T	C	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=92;PP=2965;SC=AGCTGGACTATGAAGACCAAG;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=167;WE=109795034;WS=109795016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	109795608	rs437444	T	C	5002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=72;PP=2965;SC=CTGAGGTCTTTCAGCTGGACA;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=152;WE=109795616;WS=109795598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	109801121	rs684138	C	T	2853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=40;PP=1759;ReadPosRankSum=-0.599;SC=AGATGCTCACCCACAGCATCA;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=247;TCF=157;TCR=90;TR=114;WE=109801129;WS=109801111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,137:0.46:297
chr1	109804883	rs66795935	C	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=873;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TCAGTGTCCCCCTTCTCTGCT;SOR=0.772;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=68;WE=109804891;WS=109804873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,89:0.47:189
chr1	109806313	rs653635	T	C	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CCAACCCTGGTACCTCAGCCT;SOR=0.879;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=215;TCF=101;TCR=114;TR=89;WE=109806321;WS=109806303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,112:0.43:261
chr1	109807283	rs6657811	A	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=721;ReadPosRankSum=2.328;SC=CGGGCAGGTTATCAGGTGCCT;SOR=1.214;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=37;WE=109807291;WS=109807273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr1	109810200	rs72703203	GG	AA	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=2763;ReadPosRankSum=0.516;SC=GATGAGCACAGGGGGTGGCTC;SOR=0.609;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=71;WE=109810209;WS=109810190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,86:0.51:167
chr1	109812674	.	C	T	3015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=63;PP=1640;ReadPosRankSum=0.751;SC=CCAACCAACACGGCATCCGAC;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=262;TCF=117;TCR=145;TR=117;WE=109812682;WS=109812664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,150:0.48:314
chr1	109813510	rs41279716	A	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=578;ReadPosRankSum=-1.835;SC=CAGGCCCCTCATCACCCCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=29;WE=109813518;WS=109813500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr1	109813719	rs17035665	C	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=949;ReadPosRankSum=-0.129;SC=TGTCCTCCTGCTGCTGGGGCC;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=43;TCR=68;TR=58;WE=109813727;WS=109813709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr1	109814721	rs614174	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=254;ReadPosRankSum=0.138;SC=CACAGCTGTGGCAGAGCTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=14;WE=109814729;WS=109814711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	109814880	rs4970834	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.334;SC=CACTTACTGACCTCTCTGTTC;SOR=0.658;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=75;WE=109814888;WS=109814870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,95:0.49:194
chr1	109815252	rs611917	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=19;PP=1516;SC=GCATGGTCTCATCTTCCTAGG;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=80;WE=109815260;WS=109815242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	109816176	rs441853	A	C	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=54;PP=1541;SC=GCAGCCGGGGAGGCCCCCCTC;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=109816184;WS=109816166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	109823962	rs72703210	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=-0.787;SC=AGGTGGAGAGTTGTCTACATC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=20;WE=109823970;WS=109823952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	109825360	rs643457	C	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=48;SC=AGATCTGAGCCGGAGAGAAAC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=109825368;WS=109825350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	109836835	rs3738777	A	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=864;ReadPosRankSum=1.746;SC=TACCTTTGTCAGAGTACCATG;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=62;WE=109836843;WS=109836825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr1	109838833	rs616899	T	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=452;SC=CTCAGCACAGTGCCCCCCAGA;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=109838841;WS=109838823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	109838918	rs629001	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=580;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GTAGTGCAGTCGGCCAGAGGC;SOR=0.542;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=42;WE=109838926;WS=109838908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr1	109839392	rs604349	A	G	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=25;PP=1950;SC=CATGATCCCCATGCCTCCCTT;SOR=1.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=96;WE=109839400;WS=109839382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	109839433	rs1278285	A	G	5594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=68;PP=2965;SC=CGAGGTCCGTAGTGATGGGGG;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=108;TCR=68;TR=176;WE=109839441;WS=109839423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	109839954	rs603624	G	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=17;PP=556;SC=GAGCCTTGCCGCAGCTTCCCC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=109839962;WS=109839944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	109883576	rs3217347	C	CAT	2634.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=2136;SC=TAACCACACACGATTACCTGC;SOR=2.546;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=43;WE=109883584;WS=109883566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	109884775	rs2228604	T	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=30;PP=940;SC=TCCTTCTTGTTGTATCCTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=109884783;WS=109884765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	109897103	rs11142	A	G	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=61;PP=2705;SC=CTGATGATCTAAAGATTCTTC;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=124;WE=109897111;WS=109897093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	109898263	.	A	ACC	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=62.38;NF=1;NR=3;PP=96;QD=41.4775021096;SC=AGAACATTCCACCCGCCCCCC;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=109898271;WS=109898253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,4:0.50:8
chr1	109912051	rs17646665	A	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=656;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTGAGGCTAAAGACAGTTTCA;SOR=1.871;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=31;WE=109912059;WS=109912041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr1	109958035	rs1465607	T	C	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=740;SC=ATAACTGTCTTACATACTCAC;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=109958043;WS=109958025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	110009434	rs2787015	A	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=9;PP=736;SC=GAGCCAAGCCACCACGCCGCG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=110009442;WS=110009424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	110009654	rs138525393	AC	A	2688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=48;PP=1827;SC=CACCGCCCTGACCCCCCGGCC;SOR=1.065;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=58;WE=110009662;WS=110009644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	110009802	rs2272272	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=-2.685;SC=CCTGGGCTGTGACGCTGACCT;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=16;WE=110009810;WS=110009792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	110018148	rs530565	C	T	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=6;PP=1141;SC=GGTTAGTTCTCGACTTTGGCC;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=110018156;WS=110018138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	110030223	.	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=0.363;SC=GCCCCACCCTCTGCTTTTCTC;SOR=2.964;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=15;WE=110030234;WS=110030213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	110031188	rs12049330	T	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=1.150;SC=AAGGTCCAGCTTAAGGGAGGG;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=14;WE=110031196;WS=110031178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	110086451	rs17575798	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.324;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TCACCAGCTCGGGGGCCCCCC;SOR=0.374;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=67;WE=110086459;WS=110086441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr1	110091271	rs3737182	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=-0.198;SC=ATAGACGGTGCCTCAGCCTGC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=110091290;WS=110091261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	110091282	rs1279195	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=510;ReadPosRankSum=0.901;SC=CTCAGCCTGCCGAGCCGCAGT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=110091290;WS=110091261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	110141421	rs1889470	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=1.200;SC=ACAGAAATGTTTTCATGCTTT;SOR=0.169;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=110141429;WS=110141411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	110153198	rs6658641	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=0.134;SC=GATGGCCTGGGAGAAGTCAGA;SOR=0.169;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=10;WE=110153206;WS=110153188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	110155524	rs2304355	T	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=667;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TTCAGGCCCCTAATCCTCTCT;SOR=0.792;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=39;WE=110155532;WS=110155514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr1	110168888	rs493972	C	G	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.924;SC=TGCGGAGCTGCAGCCTGCCCT;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=80;WE=110168896;WS=110168878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,97:0.43:224
chr1	110169190	rs865774	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=236;ReadPosRankSum=-1.797;SC=GAGGGGCTGCCTAGGAGCCAC;SOR=1.840;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=15;WE=110169198;WS=110169180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	110169957	rs524998	A	G	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GGTGTGGTGCATGTTGGGGGG;SOR=0.878;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=166;TCF=106;TCR=60;TR=81;WE=110169965;WS=110169947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr1	110170896	rs863978	T	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=661;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TGGATGTGCATGCGGTCTGTG;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=47;WE=110170904;WS=110170886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr1	110171705	rs523786	A	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=582;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TGACTTGCACATACCTGCATG;SOR=1.008;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=36;WE=110171713;WS=110171695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr1	110172346	rs5776989	T	TG	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.635;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=0.800;SC=GCGTGCTGGGTGGGGGTCAGG;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=110172354;WS=110172336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	110172658	rs34592756	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=0.205;SC=TGCCTTCCCAATGTAACTACC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=16;WE=110172666;WS=110172648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	110173775	rs568686	G	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=919;ReadPosRankSum=1.590;SC=GCCTCAATGAGCCTGGTCCAT;SOR=0.877;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=59;WE=110173783;WS=110173765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,67:0.38:176
chr1	110200360	rs560018	T	C	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1700;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TGGGGTGCTATGCTCAGAGTG;SOR=0.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=118;WE=110200368;WS=110200350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,129:0.53:243
chr1	110201580	rs650985	C	T	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=-0.975;NF=42;NR=42;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.825;SC=ATACATCCTACGTTACAGAGA;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=84;WE=110201588;WS=110201570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,98:0.49:199
chr1	110201699	rs506008	T	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.549;NF=10;NR=18;PP=547;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGGACGCCTTTCCAAATCTGA;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=28;WE=110201707;WS=110201689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr1	110201809	rs562996	G	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-2.414;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr1	110201812	rs563003	A	G	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-2.367;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr1	110210780	rs530021	C	G	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=47;PP=1412;SC=CGGGGTGAGCCAGGGTCCGCT;SOR=1.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=71;WE=110210788;WS=110210770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	110210818	rs2073483	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=89;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TGCGTGGGGGCGGGGAAGTGT;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=11;WE=110210826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	110212293	rs3819350	C	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=369;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CTGGTGAGTTCTTGGTCTTGC;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=20;WE=110212301;WS=110212283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	110252010	rs1292098	T	C	4616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.85;NF=85;NR=66;PP=2965;SC=CTCTGTTCTGTTTTTTGCCCC;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=151;WE=110252018;WS=110252000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	110252091	rs35677255	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.442;NF=10;NR=44;PP=963;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CTTAATAAAAGCTTGCTGGTT;SOR=1.265;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=114;TCF=28;TCR=86;TR=54;WE=110252099;WS=110252081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr1	110255174	rs929166	T	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.959;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=623;ReadPosRankSum=-2.219;SC=GCTGGCCTGGTGCAGAGAAAG;SOR=1.702;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=29;WE=110255182;WS=110255164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr1	110256075	rs2479390	A	G	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.143;NF=31;NR=5;PP=695;ReadPosRankSum=-1.795;SC=TGGTGGCCCAACTGAGCTTCC;SOR=0.375;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=36;WE=110256083;WS=110256065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr1	110256507	rs886177	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=794;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CTATAACCTGGTTCTCCAAAA;SOR=0.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=44;WE=110256515;WS=110256497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr1	110279701	rs7483	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=925;ReadPosRankSum=1.105;SC=GCTCAGCATACAGGCTTGTTG;SOR=0.440;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=102;TCF=83;TCR=19;TR=44;WE=110279709;WS=110279691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr1	110279821	rs1537234	C	A	3565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=68;PP=2237;ReadPosRankSum=0.372;SC=AATCTTATAACGACCCCAACC;SOR=0.550;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=276;TCF=129;TCR=147;TR=135;WE=110279829;WS=110279811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,165:0.50:331
chr1	110279914	rs1571858	C	T	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.361;SC=GACAGTGCCTCCAAGGTATAG;SOR=0.592;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=59;WE=110279922;WS=110279904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr1	110281941	rs10735234	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=0.012;SC=TATTCTATCCGGGTTAAGATC;SOR=1.075;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=5;WE=110281949;WS=110281931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	110282557	rs199668883	G	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=575;ReadPosRankSum=0.599;SC=TTCAGCGACTGCGCAGCTCCC;SOR=0.537;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=49;WE=110282565;WS=110282547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
chr1	110282972	rs1332018	G	T	3204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=93;PP=2187;ReadPosRankSum=0.800;SC=CTTTATACCCGACATAAGGGG;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=249;TCF=78;TCR=171;TR=134;WE=110282980;WS=110282962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,142:0.53:268
chr1	110292856	rs15864	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=143;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GTTTGCTTCAGCCTCTGGGCC;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=110292864;WS=110292846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	110295772	rs1887547	T	C	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=821;ReadPosRankSum=0.759;SC=GCCAGTCATCTGAGAATGTGG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=63;WE=110295780;WS=110295762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
chr1	110295890	rs1887548	C	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=0.118;SC=GGGACGCGGACAGGGAGGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=17;WE=110295898;WS=110295880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr1	110300441	rs3818562	G	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=722;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TTGAAGCTGTGCTTGATCTTC;SOR=1.162;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=44;WE=110300449;WS=110300431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr1	110300504	rs10776700	A	G	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=61;PP=2740;SC=AGGGGCCAAGACGGTGGGCCA;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=134;WE=110300512;WS=110300494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	110301766	rs373516452	AGTGT	A	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=1.447;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	110304537	rs6676659	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=0.015;SC=GGCCCTTTCCGGAGCCATCTG;SOR=3.056;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=20;WE=110304545;WS=110304527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	110466338	rs333970	C	A	10759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=163;PP=2965;SC=TAACTGGTACCGCCTTGCCCA;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=164;TCR=163;TR=327;WE=110466346;WS=110466328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr1	110466709	rs333971	T	C	6300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=113;PP=2965;SC=GAGGGATCCTTCAGCCCGCAG;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=71;TCR=113;TR=184;WE=110466717;WS=110466699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	110467745	rs333972	A	G	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=920;SC=GATGTCTAATACCAGCCCTGT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=110467753;WS=110467735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	110467831	rs41313284	T	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=496;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TAAGGTAAGATTCTGACTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=39;WE=110467839;WS=110467821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr1	110558276	rs11384766	A	AC	1412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=1039;SC=ATTAGATAAAATTTTGAGTTT;SOR=1.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=110558284;WS=110558266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	110560915	rs186724	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AGCCTCTGGTCTCCTATGTTC;SOR=1.302;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=17;WE=110560923;WS=110560905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr1	110577108	.	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-0.118;SC=ACTGCAGACAGAATATCGCGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=110577116;WS=110577098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	110591687	rs41281356	G	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=316;ReadPosRankSum=-0.672;SC=ACCTAGAAATGAGGTACTGCG;SOR=0.426;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=22;WE=110591695;WS=110591677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr1	110603286	rs144523285	A	AGGTGCTTCCTCCGTGGTGTCCAGGCAGG	3282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=2965;SC=TTGGAGGCAGAGGTGGGCTGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=17;WE=110603294;WS=110603276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	110607455	rs146795178	G	A	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=64;PP=1897;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TAGAGGGCCCGTCTCTGGGGC;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=110;WE=110607463;WS=110607445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,123:0.56:219
chr1	110612925	rs2274568	G	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=15;PP=574;SC=AGAGAGGGTCGGGCTGCGCGC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=110612933;WS=110612915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	110709719	rs7527375	TG	CA	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=49;PP=2312;SC=AGGAGCTGGATGCAGAGGACC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=97;WE=110709728;WS=110709709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	110716511	rs12747833	C	T	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=655;SC=ATGGCGCTGCCGACGTGCTGG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=110716519;WS=110716501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	110882444	rs814771	A	G	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=56;PP=2574;SC=GCGGGGGCGAATCGCGCAGCA;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=119;WE=110882452;WS=110882434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	110883569	rs3738752	A	T	13703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=212;NR=198;PP=2965;SC=GGGGCTTCCCACTTGGTGGCC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=410;TCF=212;TCR=198;TR=410;WE=110883577;WS=110883559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,493:1.00:493
chr1	110924353	rs3738750	G	A	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=28;PP=1110;SC=CAGTAACAACGAAAGCCCCAA;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=110924361;WS=110924343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	110998766	rs7551116	T	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=387;SC=GGGGTGAGACTTTTGCCAGTG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=110998774;WS=110998756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	110998854	rs7514102	G	A	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=34;PP=1469;SC=CTCTCCTTAGGTCCCCTTCTT;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=87;WE=110998862;WS=110998844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	111059812	rs3841846	C	CGA	1096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.792;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr1	111060224	.	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=937;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TCCACCTCAGCAAAGTAGACT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=62;WE=111060232;WS=111060214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr1	111060669	rs1281175	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=1092;ReadPosRankSum=2.296;SC=TGACCACCTTTAGCTCCCTAT;SOR=1.066;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=57;WE=111060677;WS=111060659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr1	111060752	rs34970857	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=878;ReadPosRankSum=0.723;SC=ACCGAGACCACGGCCACAGCA;SOR=0.720;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=55;WE=111060760;WS=111060742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr1	111061062	rs1281174	T	C	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1368;ReadPosRankSum=1.510;SC=GCATCCTTTTTTCCCGGTCTC;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=79;WE=111061070;WS=111061052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,93:0.46:203
chr1	111144526	rs4839071	T	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=172;SC=AAATTGCCCTTTGTCAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=111144534;WS=111144516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	111144661	rs12407942	A	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=501;ReadPosRankSum=0.054;SC=CCTGCCTGTCATCAGGACCAG;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=38;WE=111144669;WS=111144651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr1	111434170	rs137933588	CTGGTG	C	1062.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.304;NF=0;NR=19;PP=826;ReadPosRankSum=1.578;SC=ACTGAAGAGGCTGGTGTGGGG;SOR=0.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=19;WE=111434182;WS=111434160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr1	111436857	rs1578956	TC	GT	7052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=42;PP=2947;SC=CACCCTGTACTCGTGCAAATG;SOR=1.215;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=119;WE=111436866;WS=111436847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	111437129	rs1343817	A	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.37;MQRankSum=0.910;NF=4;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=-0.554;SC=TAGAGATAGAAATGAAGTGGA;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=17;WE=111437137;WS=111437119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr1	111437176	rs5777031	G	GA	285.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=75;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.98;NF=2;NR=8;PP=409;SC=TAATTGGGGGGAAAATTTGTA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=111437184;WS=111437166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	111441829	rs1803259	C	T	5014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=81;PP=2733;SC=CTGCAGTAGTCCTGTGGTGAA;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=144;WE=111441837;WS=111441819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	111494194	rs2232041	C	T	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1460;ReadPosRankSum=-1.821;SC=CTTAGATTGGCCATGGAAGCA;SOR=0.832;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=103;TCR=82;TR=87;WE=111494202;WS=111494184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,99:0.48:206
chr1	111661413	rs325916	T	C	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=55;PP=2965;SC=AAATCTAATATTGTGCCTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=143;WE=111661421;WS=111661403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	111661528	rs325917	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=541;ReadPosRankSum=-1.405;SC=CCCTGAGTGATGGGAAAAAAA;SOR=0.504;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=45;WE=111661539;WS=111661518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr1	111662723	rs325918	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CACAGCAGTGGTACTGTAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=13;WE=111662731;WS=111662713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	111663040	rs647665	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQRankSum=2.440;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.351;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	111726026	rs2243393	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=17;PP=1280;SC=ATGATTTACTGTGTAGTTCAC;SOR=1.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=62;WE=111726034;WS=111726016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	111726213	rs694180	A	G	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=736;SC=TGCCCTGGTAAGTATTGTACT;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=111726221;WS=111726203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	111726288	rs2275122	T	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GACCCAGTCATGAAAGATCGT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=111726296;WS=111726278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	111730901	rs608881	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=508;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GCCCATTTGCCTCCCGCTTGA;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=35;WE=111730909;WS=111730891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr1	111732003	rs35906145	T	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=0.145;SC=ATATCTTCAGTTCTCATTTCC;SOR=1.071;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=10;WE=111732011;WS=111731993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	111737183	rs660173	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=7;PP=597;SC=GGTGAGCCGTCCAGGGGCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=111737191;WS=111737173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	111737398	rs9970286	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=1.801;SC=GCAAGATCATGCAGACCCCGA;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=15;WE=111737406;WS=111737388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	111739771	rs3833538	G	GCAGGACAAA	2703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.577;NF=8;NR=24;PP=2897;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TGGAATATGGGCAGGCCCTGA;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=21;TCR=65;TR=32;WE=111739779;WS=111739761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,72:0.45:160
chr1	111742838	rs639306	G	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.24;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	111742838	.	GAGA	CAGA,CAGG	111	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=11,6;NR=1,1;PP=97,111;QD=10.9809343789;SC=ACTAGCCCCAGAGAGGGCATG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12,7;WE=111742849;WS=111742828;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:12
chr1	111742841	rs12756391	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	111770423	rs755467	T	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=433;ReadPosRankSum=-3.117;SC=CAGCAGGAAATTTGGTGAGGA;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=29;WE=111770431;WS=111770413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	111778241	rs2764544	C	T	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=635;SC=TATTGCACCTCGTTTCTTTGT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=111778249;WS=111778231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	111778468	rs961364	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=670;ReadPosRankSum=1.023;SC=TGACGGATGAGGGGAGGAGGA;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=36;WE=111778476;WS=111778458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr1	111778824	rs2251608	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=1.078;SC=GGGGTGGGGCTGGGGAGAGTC;SOR=0.184;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=111778832;WS=111778814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	111783982	rs13721	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=369;ReadPosRankSum=0.130;SC=CAAGATCACGCGGCTCCAGGA;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=31;WE=111784004;WS=111783972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,39:0.36:108
chr1	111783996	rs2494007	A	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=37;PP=2233;SC=TCCAGGATCAACAGGTTCCCT;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=98;WE=111784004;WS=111783972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	111784103	rs201299163	A	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=617;ReadPosRankSum=-1.516;SC=TTAGGTGGGGAATGGTGATAT;SOR=0.546;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=34;WE=111784111;WS=111784093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr1	111784148	rs2764551	T	G	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=978;SC=TGTTCAAAGATAGAAGCTTCT;SOR=2.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=111784156;WS=111784138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	111784816	rs11102221	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=402;ReadPosRankSum=0.748;SC=GCCACCCTTCGAATCTCTGTG;SOR=1.071;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=26;WE=111784824;WS=111784806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr1	111785929	rs8535	C	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.263;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=331;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CCTTGCCAGGCTGGCCTTTGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=8;WE=111785938;WS=111785919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr1	111785930	rs1056825	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.306;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=759;ReadPosRankSum=0.623;SC=CTTGCCAGGCTGGCCTTTGGA;SOR=0.063;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=22;WE=111785938;WS=111785919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr1	111825883	rs4406629	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.93;MQRankSum=-1.096;NF=29;NR=18;PP=733;ReadPosRankSum=2.798;SC=ATCAGAATGATTTTAAATCCT;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=47;WE=111825904;WS=111825873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr1	111826007	rs58982671	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.402;NF=17;NR=20;PP=599;ReadPosRankSum=-0.344;SC=CGACTGACACCGGCAGCAACG;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=37;WE=111826015;WS=111825997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr1	111826023	rs6688201	C	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.81;MQRankSum=-0.493;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.841;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr1	111833441	rs11102235	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.132;NF=34;NR=30;PP=878;ReadPosRankSum=0.806;SC=CAAACAACTCGTTACAAAAAC;SOR=0.403;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=64;WE=111833449;WS=111833431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,82:0.44:185
chr1	111833488	rs34698010	C	CCT	2866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.149;NF=9;NR=37;PP=1889;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTTCATGAAACCTCCTCGTCT;SOR=0.812;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=20;TCR=92;TR=46;WE=111833496;WS=111833478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,78:0.44:179
chr1	111833517	rs12026825	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=726;ReadPosRankSum=-0.929;SC=ACAGGTGGCCGACTCTGGAGC;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=47;WE=111833525;WS=111833507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
chr1	111854207	rs4839122	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=834;ReadPosRankSum=0.301;SC=CTCACTGAGGTTGTAACAATT;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=43;WE=111854215;WS=111854197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr1	111854223	rs6537695	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=871;ReadPosRankSum=-0.907;SC=CAATTTATGGCAAATTGGAAG;SOR=0.645;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=71;TCR=34;TR=53;WE=111854231;WS=111854213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,69:0.53:129
chr1	111854755	rs4423003	A	C	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=209;SC=CAAAACTCACAGCACACTTCA;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=111854763;WS=111854750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	111857087	rs2786151	C	T	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=15;PP=1175;SC=CCAGATCCAACACTAAAGCAA;SOR=1.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=111857095;WS=111857077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	111857154	rs2786152	T	C	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=39;PP=2293;SC=CTATCCTTTGTTTTACAGGAA;SOR=1.169;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=100;WE=111857162;WS=111857144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	111858291	rs2786155	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=699;SC=GAACCATAACTCATTTCATCT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=111858299;WS=111858281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	111858444	rs2786156	C	T	5153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.16;NF=78;NR=85;PP=2965;SC=GCAGTTTGGCCACAGAGTCCA;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=163;WE=111858452;WS=111858434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	111858499	rs6661725	A	G	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=141;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=77;PP=2160;SC=TACTGAGTACATATTCTGTGG;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=115;WE=111858507;WS=111858489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	111858525	rs371155945	TAAATATAAGAATAAGA	T	3456.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.66;QD=43.76;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	111858526	.	AAATATAAGAATAAGACACTATCCTTGGCTT	CAATATAAGAATAAGACACTATCCTTGGCTT	2915	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=27;MQ=66.48;NF=3,8;NR=23,26;PP=2915,975;QD=20;SC=TTGTCAGGCTAAATATAAGAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=26,34;WE=111858563;WS=111858516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,34:1.00:34
chr1	111858526	.	AAATATAAGAATAAGACACTATCCTTGGCTT	A	2915	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=27;MQ=66.48;NF=3,8;NR=23,26;PP=2915,975;QD=20;SC=TTGTCAGGCTAAATATAAGAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=26,34;WE=111858563;WS=111858516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr1	111858542	rs376128132	CACTATCCTTGGCTT	C	3451.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.01;QD=43.69;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	111858589	rs2786157	G	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=393;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=8;NR=33;PP=630;SC=AAGACTGAAAGAATATGAACA;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=111858611;WS=111858579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	111858603	rs2786158	G	T	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.54;QD=29.02;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	111861714	rs2786161	T	A	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=25;PP=1824;SC=TAACATTTAATAGATTTGAAT;SOR=1.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=111861722;WS=111861704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	111861841	rs2275253	A	G	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=65;PP=2709;SC=CTATGACAACATCAAGAGCTT;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=136;WE=111861849;WS=111861831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	111861974	rs2275254	T	C	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=63;PP=2256;SC=CACAACAAATTTGGAGGCGCC;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=103;WE=111861982;WS=111861964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	111862952	rs2256721	T	G	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=50;PP=2448;SC=TTCTGTGCTGTCAGAGCCAAC;SOR=1.067;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=125;WE=111862960;WS=111862942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	111892905	rs3820443	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=2.036;SC=TCATAGGTATTAGGGACTCTT;SOR=2.200;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=17;WE=111892913;WS=111892895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	111893708	rs10158004	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGATGATAAAGGGTAGATGTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=111893716;WS=111893704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	111893958	rs1668	A	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=669;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GAGCGGCTGTAACTACCTTCA;SOR=0.929;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=40;WE=111893966;WS=111893948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr1	111957097	rs7825	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=388;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TAGGCTTCTTCATCCACAGCA;SOR=1.553;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=24;WE=111957105;WS=111957087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr1	111957688	rs3767607	T	C	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.559;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr1	111957693	rs2485319	A	G	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,63:0.41:153
chr1	111958885	rs10489791	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=-1.269;SC=AGCAGAAGGGCCTTACCCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=111958893;WS=111958875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	111962209	rs1419092	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=365;ReadPosRankSum=-2.692;SC=ATGTGCTGGAGCATGAAAGAG;SOR=0.799;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=27;WE=111962217;WS=111962199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr1	111962256	rs17027633	G	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=432;ReadPosRankSum=2.413;SC=TGATGGCATTGTCATAGCCAA;SOR=0.757;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=30;WE=111962264;WS=111962246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	111964262	rs2275794	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=647;ReadPosRankSum=0.820;SC=TTCCATGTAAGTCATAAGACA;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=52;WE=111964270;WS=111964252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,64:0.44:146
chr1	111969294	rs1264892	A	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=1458;ReadPosRankSum=1.049;SC=TTAGTTGGCAAAAACCAAGGG;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=46;WE=111969315;WS=111969284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,50:0.41:123
chr1	111969307	rs2275795	G	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.601;SC=ACCAAGGGAGGGGATGGAGCT;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=45;WE=111969315;WS=111969284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,49:0.42:117
chr1	111969719	rs1264894	A	G	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=865;ReadPosRankSum=0.118;SC=CAGCCCTGTGAGAAACAAAGG;SOR=0.662;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=57;WE=111969727;WS=111969709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr1	111991768	rs11548427	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1307;ReadPosRankSum=3.552;SC=GGGGCACTAGGGGGGGTGGGG;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=96;TCR=82;TR=84;WE=111991776;WS=111991758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
chr1	111991845	rs1270853	C	A	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1421;ReadPosRankSum=1.570;SC=CCGGAGACTCCGCTCCGGCAG;SOR=0.514;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=92;WE=111991853;WS=111991835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,110:0.48:228
chr1	111992019	rs2298187	T	A	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1350;ReadPosRankSum=0.120;SC=TAATTTTTTTTAAAAATCTCC;SOR=0.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=84;WE=111992027;WS=111992009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,97:0.50:193
chr1	111992095	rs1264899	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=944;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CCATCTTGGTCCTGCCCTGAC;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=71;WE=111992103;WS=111992085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,78:0.38:207
chr1	112020222	.	GC	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=47;QD=36.0;SC=CTTCCGCCCTGCCCCCCACCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=2;WE=112020230;WS=112020212;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr1	112020238	rs2211494	A	C	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=289;SC=CACCCACCTGACAACACCTCC;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=112020246;WS=112020228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	112020453	rs17027773	C	G	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=901;ReadPosRankSum=-1.927;SC=TTGGAATTCCCCTCCATACTC;SOR=1.008;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=54;WE=112020461;WS=112020443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr1	112028577	rs2275796	A	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-0.368;SC=ACCCAGTTACAGTAGCTTCTG;SOR=0.563;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=18;WE=112028585;WS=112028567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr1	112029193	rs2252739	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=8;PP=436;SC=TTCATCCGCCAAGACTATGAC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=112029201;WS=112029183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	112029325	rs2800906	A	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=30;PP=967;SC=GCCAGGTCCTACCTCTGCCTC;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=112029333;WS=112029315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	112031654	rs10602160	AACACAC	A	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.410;NF=1;NR=17;PP=801;ReadPosRankSum=-1.629;SC=CATCTGTGAAAACACACACAC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=18;WE=112031667;WS=112031644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr1	112032126	rs58712964	T	C	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=4.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.718;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,23:0.23:100
chr1	112032131	rs61002431	T	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=5.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.535;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,33:0.29:113
chr1	112032205	rs7544118	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=3.564;SC=TGGAGAAGTCCTTTTCCCTGG;SOR=1.005;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=38;WE=112032213;WS=112032195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,33:0.24:138
chr1	112032347	rs2789539	G	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1106;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GAAAGAAAGTGATGTTTGGAG;SOR=0.735;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=63;WE=112032355;WS=112032337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,72:0.64:112
chr1	112033285	rs2275797	G	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=794;ReadPosRankSum=-2.787;SC=TACCTGAAATGAGAGCCAAGG;SOR=0.945;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=42;WE=112033293;WS=112033275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr1	112033456	rs3831359	G	GA	1564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AGTGAAAAGGGAAACAACCAG;SOR=0.555;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=38;WE=112033464;WS=112033446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr1	112033480	rs2275798	T	C	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=619;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GTCCAAGCAGTGCTGCCATGT;SOR=1.188;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=41;WE=112033488;WS=112033470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr1	112033515	rs2252198	T	C	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr1	112033519	rs2252197	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=10.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr1	112042632	rs2229155	A	G	6973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=112;PP=2965;SC=AGACCACACAAGCTTTGAGGA;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=103;TCR=112;TR=215;WE=112042640;WS=112042622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	112106342	rs1591711	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=265;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CTATTTTACACGCTAGGACAA;SOR=0.215;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=20;WE=112106350;WS=112106332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	112106444	rs1591712	G	A	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=53;PP=1892;SC=CCTCCCAGCAGCTATATTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=112106452;WS=112106434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	112234084	rs10489469	G	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=547;ReadPosRankSum=-1.111;SC=AATACAAGAAGAATTTTGACA;SOR=0.966;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=36;WE=112234092;WS=112234074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr1	112237915	rs7525307	A	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.98;MQRankSum=-0.908;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.076;SC=TAACATTCAAAGGAGTTTTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=112237923;WS=112237905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	112240038	.	CT	C	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=1.035;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.599;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr1	112251983	rs3738300	C	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=61;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TATGGTATTTCTAAGCTTCTG;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=48;TCR=107;TR=87;WE=112251991;WS=112251973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,103:0.58:178
chr1	112269872	rs197434	G	A	7448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=84;PP=2965;SC=CTGTCAGGGCGAACCTGCGGC;SOR=1.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=142;TCR=84;TR=226;WE=112269880;WS=112269862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	112305406	.	TA	T	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.127;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.899;SOR=0.213;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr1	112525085	rs17221819	G	A	3891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.344;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=82;PP=2618;ReadPosRankSum=1.521;SC=GGAACACCTCGGGGTCCCGGT;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=307;TCF=137;TCR=170;TR=153;WE=112525093;WS=112525075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,176:0.48:366
chr1	112991698	rs2256883	T	C	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=58;PP=2632;SC=TCTGCACAAATCCACTCTCTA;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=112991706;WS=112991688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	112999227	rs1175641	G	A	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=57;PP=2865;SC=TAGAAAACCAGGTGCCTCCAC;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=129;WE=112999235;WS=112999217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	113052155	rs3790605	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=1.495;SC=CGGGACCAGGCTGTTGCTTCG;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=6;WE=113052163;WS=113052145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	113052186	rs3790606	G	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GACGATTCGGGCAGGACTGTC;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=113052194;WS=113052176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	113063125	rs910697	A	G	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=40;PP=1544;SC=GGCTGGACCAAACCTGAACAC;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=113063133;WS=113063115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	113068577	rs35147679	C	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=649;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TGTCACTTTACAGATGCTGTT;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=43;WE=113068585;WS=113068567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr1	113083439	rs10745330	C	T	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=876;SC=TCAGTGTTTTCATTTTTGGGA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=113083447;WS=113083429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	113098534	rs6658555	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=579;ReadPosRankSum=0.928;SC=ACCTTCTATTCGTTTCCAGTG;SOR=0.530;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=40;WE=113098542;WS=113098524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,62:0.39:160
chr1	113113167	rs71584748	GTATATATATATATA	G	855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=2998;SC=AATAAAAGATGTATATATATA;SOR=3.816;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=18;WE=113113188;WS=113113157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	113113194	rs60579835	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.41;MQRankSum=-1.215;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.548;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr1	113140583	rs12049572	T	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=658;ReadPosRankSum=0.942;SC=TGAACAGATATGATACATACC;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=38;WE=113140591;WS=113140573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr1	113196197	rs2932528	A	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.68;MQRankSum=3.268;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	113202571	rs12120956	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.610;SC=GAGCTATTCTGAGTTGATAAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=113202579;WS=113202561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	113236681	rs3748656	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TGCTACGGGGCGACCACCTGT;SOR=0.840;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=65;WE=113236689;WS=113236671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr1	113237171	rs883593	A	G	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=852;ReadPosRankSum=0.109;SC=TGGAGCTGACAGGGCGCTGGC;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=56;WE=113237179;WS=113237161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr1	113238665	rs71584764	T	TA	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.489;NF=4;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CCGTCTCAATTAAAAAAAATA;SOR=0.330;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=113238673;WS=113238655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	113239382	rs17030651	G	A	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=894;ReadPosRankSum=0.741;SC=CACTGCTGGAGCGGCTGCTCA;SOR=0.489;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=59;WE=113239390;WS=113239372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,72:0.56:129
chr1	113239478	rs2999158	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=236;ReadPosRankSum=1.284;SC=GGTATTCCCATGCCCTTGCCT;SOR=0.363;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=23;WE=113239486;WS=113239468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr1	113240790	rs12133583	G	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=0.405;SC=CCCACTGAAGGTGCAGCCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=15;WE=113240798;WS=113240780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	113241052	rs2306940	T	C	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=559;ReadPosRankSum=1.368;SC=AGGGCAAAGCTCGCCTGAGCC;SOR=0.885;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=40;WE=113241060;WS=113241042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr1	113242488	rs3013431	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=966;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTCTTCCCTCCCATGACCACA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=62;WE=113242496;WS=113242478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,76:0.42:181
chr1	113243048	rs6679	C	T	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1161;ReadPosRankSum=1.207;SC=GGCCCCACAGCCATGACTACC;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=73;WE=113243056;WS=113243038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr1	113244433	rs2279500	T	C	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=38;PP=1189;SC=AATGCCTCCTTCTCCAGCCCT;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=113244441;WS=113244423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	113246229	rs937053	T	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=236;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GGGGGCGGGGTCTCAGGGTGG;SOR=1.371;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=16;WE=113246237;WS=113246219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	113246506	rs2306937	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=0.671;SC=CCCAAACCTCCCTGGAAACCG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=113246514;WS=113246496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	113248365	rs954679	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=-0.758;SC=CCTGTTTTGTAAAGATGGGCT;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=113248373;WS=113248355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	113252614	rs41310100	C	A	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=222;SC=AATACAGACACACACCTTTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=113252622;WS=113252612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	113254125	rs12040903	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=0.422;SC=TGTGCCACACGTTATTCTAAT;SOR=1.064;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=16;WE=113254133;WS=113254115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	113254484	rs4839258	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=174;SC=TTCCCAGTAAAGTGCTTTCTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=113254492;WS=113254474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	113255389	rs10857971	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=299;SC=GCATTCTCAACGGCCCCCACT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=113255397;WS=113255379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	113456546	rs1049434	A	T	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=34;PP=2218;SC=TGGGCCCTCCATCTGTGTCTT;SOR=1.374;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=103;WE=113456554;WS=113456536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	113459676	rs71659381	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CAGCATCAAGGGTACATAAAT;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=8;WE=113459684;WS=113459666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	113471933	.	T	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GGTGGCATTTTAAGTGTAGAT;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=13;WE=113471941;WS=113471923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	113616382	rs56062000	G	GA	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=-1.575;SC=CCTAAGCTCTGAAGGAAACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=113616390;WS=113616372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr1	113636924	rs1216802	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=642;SC=TTTATTTTACTAAATTTTTTC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=113636932;WS=113636914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	113657092	rs1216793	A	C	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=39;PP=2909;SC=AGACAGTAACACGAGGTGAAA;SOR=1.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=120;WE=113657100;WS=113657082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	113657538	rs17442872	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TTGTACTTCAGTCAAGAATGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=8;WE=113657546;WS=113657528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr1	113658887	rs1216791	G	A	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=884;SC=ACCTTTGAGAGTTAAAAATGT;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=113658895;WS=113658877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	113659065	rs10541977	ACT	A	6825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=83;PP=2965;SC=GACGGTAATGACTCTGTTGTT;SOR=1.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=9;TCR=85;TR=92;WE=113659074;WS=113659055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	113662249	rs12568813	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=1.396;SC=GCAAGCAGATGGGTATATAGG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=113662257;WS=113662239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	113666351	rs1728222	G	T	181.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.57;QD=36.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	113666353	rs1728223	G	T	181.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.57;QD=36.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	114137013	rs3834733	C	CAT	754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=829;SC=GTTCAAACATCATGTCTTTTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=114137021;WS=114137003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	114161116	rs1217200	C	A	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=57.24;NF=2;NR=0;PP=52;SC=ACTCATATCACCTCTTTATTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=114161124;WS=114161106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	114196364	rs2359174	T	G	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=412;SC=AAACTGAATTTTTCTGTGAGA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=114196372;WS=114196354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	114196495	rs2359173	A	G	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=37;PP=1569;SC=TCATTTCAACACAGAATGGAT;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=114196503;WS=114196485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	114224782	.	A	AT	220	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=61.98;NF=13;NR=5;PP=220;QD=12.3888888889;SC=AACTGCACTGATTTTTTTTTT;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=18;WE=114224790;WS=114224772;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:33,18:0.35:51
chr1	114240319	rs3835263	T	TA	6360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=81;PP=2936;SC=TCCAGGCATTTACTCAGCTTA;SOR=0.855;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=21;TCR=84;TR=102;WE=114240327;WS=114240309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	114242122	rs3752954	T	C	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=3;PP=144;SC=CCACTCTTTGTCCTTAATCTT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=114242130;WS=114242112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	114242250	rs3752953	C	T	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=13;PP=597;SC=GTATCATCTGCCATTTAATGT;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=31;WE=114242258;WS=114242240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	114247446	rs56275921	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.169;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	114249382	rs6698586	C	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=54;PP=1603;SC=TATCCATGCCCTCTTGCCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=66;WE=114249390;WS=114249372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	114267347	rs1230640	C	T	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=27;PP=1727;SC=GTAAACACTACGTGAATACAA;SOR=1.408;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=85;WE=114267355;WS=114267337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	114280717	rs2273758	A	C	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=15;PP=1601;SC=TGCTTATTCCAATTTCTCCAA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=68;WE=114280725;WS=114280707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	114339956	rs34169583	C	CTAAA	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=1405;SC=ATCGTATTTACTAATTTTTAA;SOR=3.611;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=23;WE=114339964;WS=114339946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	114357750	.	G	A	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=38;QD=18.1928031368;SC=TAAAGGGATTGTAGTAATCTA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=114357758;WS=114357740;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	114372332	.	TA	T	150	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=0.8399;HP=12;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=150;QD=15.6;SC=CTGCATACCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=114372341;WS=114372322;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,10:0.71:14
chr1	114377093	rs1599971	A	G	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=32;PP=988;SC=TCGGTTCTTAAGAATAGTATT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=114377101;WS=114377083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	114377568	rs2476601	A	G	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=63;PP=1946;SC=TCAGGTGTCCATACAGGAAGT;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=114377576;WS=114377558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	114400195	rs11386228	G	GA	47.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=0;PP=30;SC=ATTCTTAGGAGAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=114400203;WS=114400185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	114401231	rs1217418	A	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=338;SC=GGTGACTACAAATAATACCCT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=114401239;WS=114401221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	114401904	rs1217419	T	G	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=438;SC=CAGTAAGCAATGGGTACAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=114401912;WS=114401894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	114424601	rs1217381	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=31;PP=1170;SC=TCCACAGTGTCCTGGAGTATA;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=114424609;WS=114424591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	114641685	rs2774285	A	G	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=17;PP=1609;SC=AGTGAGGGGTAGAATTACGTC;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=114641693;WS=114641675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	114680540	rs17032441	C	T	4270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=95;PP=2444;ReadPosRankSum=0.769;SC=CCCCATCCACCGACTTCTGCT;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=358;TCF=157;TCR=201;TR=167;WE=114680548;WS=114680530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,202:0.48:425
chr1	114682632	rs72690087	G	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=687;ReadPosRankSum=0.720;SC=AGACAGAGGCGGGGAGAAGCG;SOR=1.488;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=36;WE=114682640;WS=114682622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr1	114940632	rs5777192	CA	C	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.378;NF=0;NR=24;PP=348;ReadPosRankSum=-1.615;SC=ATACCAGAGTCAAAAAAAAAA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=24;WE=114940640;WS=114940622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr1	114948281	rs6537825	A	G	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.680;SC=TGCAGGTTCAATTTTCACATG;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=81;WE=114948289;WS=114948271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,91:0.49:185
chr1	114976224	rs12132214	A	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=1.567;SC=TATGGTTTTAAGGCAACAAAC;SOR=0.577;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=14;WE=114976232;WS=114976214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	115128087	rs222493	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=ATCCTCCTCTAACAGCCTGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=115128095;WS=115128077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	115144304	rs12730318	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=521;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CTCTTTAGTACGGAGCAGTAA;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=28;WE=115144312;WS=115144294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr1	115144703	rs28398	A	G	5029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=64;PP=2965;SC=TGACTCAATTATTCCTTGACC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=165;WE=115144711;WS=115144693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	115151373	rs142662286	C	T	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=25;PP=1168;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TCTGTAGAGACACCACCACAA;SOR=0.814;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=72;WE=115151381;WS=115151363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,78:0.46:168
chr1	115161140	rs12145066	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TTAAGACCAACACCCAAAAGT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=115161148;WS=115161130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	115165472	rs222502	T	A	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=96;SC=AAACAAAAATTAAAAAAACTA;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=115165480;WS=115165462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	115168600	rs7541738	A	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=573;ReadPosRankSum=0.575;SC=AAAAACCAACATCCATGTTCC;SOR=0.829;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=37;WE=115168608;WS=115168590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr1	115220420	.	CTCCTTCCTTCCTTCCT	C	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.349;QD=24.70;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	115222434	rs761755	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=320;SC=GGAAATAATTGTTGGAACAAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=115222442;WS=115222424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	115229666	rs79168230	C	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GTATCAGAAACAGGATCCAAG;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=115229674;WS=115229656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	115256669	rs969273	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.148;SC=CACAGGGAATGCAATGCTATT;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=115256677;WS=115256659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	115260738	rs9724613	G	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=382;ReadPosRankSum=0.892;SC=CCCTTCACCAGATTCCCCCCA;SOR=0.148;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=20;WE=115260746;WS=115260728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	115276978	rs57342611	GA	G	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.957;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	115284056	rs7537232	G	T	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=44;PP=2490;SC=AAGGTGAGTCGGCAAGATATT;SOR=1.238;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=128;WE=115284064;WS=115284046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	115323398	rs116839213	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	115398044	rs60659641	GC	G	1182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=14;PP=731;SC=TTCCCCTCCCGCCCCCCCGGG;SOR=1.292;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=27;WE=115398052;WS=115398034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	115399884	rs17544210	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=330;ReadPosRankSum=1.399;SC=ATTTCTTGCCCGTGCTTGAGC;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=15;WE=115399892;WS=115399874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	115399940	rs360614	T	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=164;ReadPosRankSum=-1.735;SC=GTTTAGGTAATGAACTGCTTA;SOR=1.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=13;WE=115399948;WS=115399930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	115401136	rs360615	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=267;SC=TAGAATTTTGGACAATTAATT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=115401144;WS=115401126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	115417093	rs7518392	A	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.469;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=332;ReadPosRankSum=-0.075;SC=TCTTATTTTAAAATTTAATCT;SOR=0.140;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=23;WE=115417101;WS=115417083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr1	115420905	rs360636	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=0.641;SC=ATTACAAGTTTGTTGTAATGC;SOR=0.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=15;WE=115420913;WS=115420895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr1	115437986	rs6661511	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=1.375;SC=TCCCTTTTGCGTAGTATTATG;SOR=0.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=16;WE=115437994;WS=115437976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr1	115455645	rs12409760	A	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=83;ReadPosRankSum=1.614;SC=TTTTTTTTTTAAAAAATAGGC;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=115455653;WS=115455635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	115524216	rs12026343	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.312;SC=TCTGGCATCACGCACACATAT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=115524224;WS=115524206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	115576023	rs10776792	A	G	4125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=46;PP=2557;SC=TTTTGGCCTTACATGTGGGCA;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=124;WE=115576031;WS=115576013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	115576482	rs28566771	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CAATTCTTTCCCAGTTGTATT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=17;WE=115576490;WS=115576472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	115600081	rs3820630	G	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=393;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GATCCCATCCGAGATTCTACC;SOR=1.292;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=23;WE=115600089;WS=115600071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr1	115600137	rs3738704	A	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=481;ReadPosRankSum=0.052;SC=AGGTAGAGTAAGAACCTTGGT;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=32;WE=115600145;WS=115600127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr1	115601528	rs3738702	C	G	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1597;ReadPosRankSum=0.292;SC=TGATGAGTGTCCCATTGCCTT;SOR=0.834;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=234;TCF=121;TCR=113;TR=101;WE=115601536;WS=115601518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,119:0.41:293
chr1	115601615	rs7523818	A	G	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=87;PP=2696;SC=GAAGAAATACAAGGAAAAATG;SOR=1.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=43;TCR=87;TR=130;WE=115601623;WS=115601605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	115604681	rs11102881	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr1	115604798	rs10776795	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=731;ReadPosRankSum=1.873;SC=CTCCGCAGCACCCGAAGAACC;SOR=0.956;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=47;WE=115604806;WS=115604788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,59:0.46:128
chr1	115615358	rs753189	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=288;SC=AGCAGACAACTCGGAGGGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=115615366;WS=115615354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	115631924	rs4240540	C	T	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=487;SC=TCGGGGACCCCGGCCCCGCGC;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=115631932;WS=115631914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	115829313	rs6330	G	A	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1709;ReadPosRankSum=0.322;SC=AGTCCAGTGGGCTTGGGGGAT;SOR=0.706;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=263;TCF=132;TCR=131;TR=124;WE=115829321;WS=115829303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,129:0.44:290
chr1	116224925	rs10923176	G	A	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=13;PP=1792;SC=AGGATTTTTCGTTTAGGACCT;SOR=3.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=65;TCR=13;TR=78;WE=116224933;WS=116224915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	116224940	rs10754330	C	A	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=18;PP=2446;SC=GGACCTGCTTCTTCAGTGAAA;SOR=3.176;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=90;TCR=18;TR=108;WE=116224948;WS=116224930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	116225180	rs10923177	A	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=83;PP=2468;SC=ACTATTTAAGATTCATGGTAC;SOR=4.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=8;TCR=83;TR=91;WE=116225188;WS=116225170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	116228220	rs12145661	C	T	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=649;SC=TGAATTATAGCGTGTTACTAG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=116228228;WS=116228210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	116234083	rs3811013	T	A	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GTGTCTTTTTTAAAAATTCTT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=12;WE=116234091;WS=116234073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	116243877	rs7413162	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=159;ReadPosRankSum=2.424;SC=CATCATCATCGTCATCACTGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=15;WE=116243885;WS=116243867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr1	116245655	rs12402684	G	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=-0.171;SC=AGCAGGCAGAGGGCATTCTCT;SOR=0.949;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=26;WE=116245663;WS=116245645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr1	116245809	rs6667224	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.924;SC=AAAGATGACACAGCATAAATT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=116245817;WS=116245799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	116260532	rs2997741	A	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=1378;ReadPosRankSum=0.361;SC=GAGAAAAGTAACAAAAGTTAC;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=36;WE=116260552;WS=116260522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,46:0.35:131
chr1	116260544	rs3811001	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=1378;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AAAAGTTACACTTCCAGCTGG;SOR=0.845;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=35;WE=116260552;WS=116260522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,45:0.36:124
chr1	116260604	rs2997742	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=268;ReadPosRankSum=-0.184;SC=GCTGGAATGGGAATAGGAGAG;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=17;WE=116260612;WS=116260594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr1	116283343	rs9428083	A	G	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=30;PP=1898;SC=GTGTATAAATACTTACATCCA;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=116283351;WS=116283333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	116283526	rs7538337	G	A	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=48;PP=1357;SC=AGGTCTGGCTGAGGGTTTCTG;SOR=1.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=116283534;WS=116283516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	116287634	rs10801969	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=0.762;SC=GGTTTCCTCTATACTTGCTGT;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=20;WE=116287642;WS=116287624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	116287651	rs10801970	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=0.362;SC=CTGTTACTATGTGACCAAGTT;SOR=0.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=15;WE=116287659;WS=116287641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr1	116310818	rs4484922	G	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.158;SC=ATAAAGCAGAGTTCAGTATAT;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=10;WE=116310826;WS=116310808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr1	116310967	rs4074536	T	C	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1294;ReadPosRankSum=-1.711;SC=TGTTTTTGCGTGACCTTATCT;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=93;WE=116310975;WS=116310957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,113:0.45:250
chr1	116311198	rs4074537	T	C	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=32;PP=741;SC=CCAAATATGCTGTGTGCAGAA;SOR=2.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=41;WE=116311206;WS=116311188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	116534952	rs10923941	GC	TT	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=1010;SC=TTAAATATCAGCCACATTTTC;SOR=4.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=116534961;WS=116534942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	116569530	rs2488429	G	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=707;SC=TTGGCGGCCTGTTCTTTGCAG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=116569538;WS=116569520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	116577981	rs1935828	G	A	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=539;SC=GAAGTGCACCGTAGAGAATGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=116577989;WS=116577971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	116607254	rs1281748	G	T	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=400;SC=GTGAACCTTGGCCCTTTTAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=116607262;WS=116607244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	116609126	rs3833541	TC	T	4987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=60;PP=2966;SC=TTCATTCCACTCCCCGCCTCT;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=83;WE=116609134;WS=116609116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	116948551	rs114408157	C	G	215.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-0.660;SC=ACTAAAAGATCATGGGATTAG;SOR=2.093;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=10;WE=116948559;WS=116948541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	117121865	rs12066192	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=534;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GAACTAATATGTCCAATCCCA;SOR=0.791;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=26;WE=117121881;WS=117121855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr1	117122285	.	G	GTCC	995.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.537;NF=18;NR=42;PP=2986;ReadPosRankSum=5.126;SC=CGTCGTCGTCGTCGTCCTCCT;SOR=0.716;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=159;TCF=44;TCR=115;TR=60;WE=117122296;WS=117122275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,58:0.30:193
chr1	117122288	rs647711	G	C	3557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.354;NF=48;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=3.549;SC=CGTCGTCGTCGTCCTCCTCCT;SOR=0.677;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=221;TCF=108;TCR=113;TR=101;WE=117122296;WS=117122275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,103:0.43:240
chr1	117142531	rs631461	G	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=729;SC=CAGGCAGCATGGGCACATAGC;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=117142539;WS=117142521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	117214318	rs145720526	T	TA	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AAATCCACATTAAAAAAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=117214326;WS=117214308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	117236970	rs614477	G	C	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=62;PP=1854;SC=GGACAGTGCTGCTGCCATGTG;SOR=2.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=78;WE=117236978;WS=117236960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	117487710	rs10159095	AT	GA	4909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=62;PP=2947;SC=TGATCCAGCCATCAGGTGAGC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=90;WE=117487719;WS=117487700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	117509981	rs12410651	G	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr1	117509987	rs12403233	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-1.827;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	117510061	rs12403245	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.514;SC=AATTCATATGCCATACAATGT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=117510069;WS=117510051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	117527645	rs36119404	GTCT	G	1012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.365;NF=2;NR=17;PP=833;ReadPosRankSum=-1.715;SC=GTTTGGGAATGTCTTCTTCTT;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=19;WE=117527655;WS=117527635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr1	117529458	rs10801922	G	A	6339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.95;NF=120;NR=67;PP=2965;SC=GCTGATCGGCGTCGGTCTGTC;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=120;TCR=68;TR=187;WE=117529466;WS=117529448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	117555898	rs2764849	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=147;SC=TTTACCTACCGCTATAGAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=117555906;WS=117555894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	117559726	rs2249265	A	G	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=65;PP=2866;SC=AAGTGTGGTCATGTCTACCAA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=147;WE=117559734;WS=117559716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	117560818	rs3736908	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=391;ReadPosRankSum=0.941;SC=GTCAGCCGCAAGTGATGTTAA;SOR=0.966;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=23;WE=117560826;WS=117560808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr1	117560929	rs3736907	C	A	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1279;ReadPosRankSum=-2.147;SC=GCTCTCACATCTTCCACCAGC;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=80;WE=117560937;WS=117560919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,96:0.51:188
chr1	117602960	rs2244501	C	A	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=37;PP=2188;SC=ACTTGGGGGACCCAGCGAAAT;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=117602968;WS=117602943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	117603188	rs2244406	G	T	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=39;PP=1091;SC=GAGTAGGTCTGGAGCTGGGCC;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=117603196;WS=117603178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	117617705	rs998532	A	G	5617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=87;PP=2965;SC=CGATCAAAAGAAAGAACAGAA;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=169;WE=117617713;WS=117617695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	117618067	rs1289673	C	T	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=77;PP=2639;SC=AGTACACGAACTGGGAGGCTA;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=131;WE=117618075;WS=117618057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	117618722	rs1289672	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=314;SC=AGAGTTTGGGTGTTTCAGGCT;SOR=2.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=117618730;WS=117618712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	117622286	rs2801939	A	G	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=108;PP=2965;SC=GTGTGGTATTATAAGAGTCAG;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=62;TCR=108;TR=170;WE=117622294;WS=117622276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	117631391	rs1555792	T	C	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=42;PP=2433;SC=TTTTCCCATATTGTGGCTGGA;SOR=1.205;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=112;WE=117631399;WS=117631381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	117639828	rs11330257	TA	T	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.760;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	117655093	rs41301281	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GGACAAAGAGGAAAGGACAAA;SOR=0.856;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=15;WE=117655101;WS=117655083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	117656088	rs1289658	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TCTCCTCACCATCACAGTGAA;SOR=0.691;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=39;WE=117656096;WS=117656078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr1	117656274	.	G	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	117656276	rs1290530	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr1	117660608	rs1289655	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=274;SC=TCACACACCACCTCCCTGTCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=117660616;WS=117660598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	117660754	rs749902	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=753;ReadPosRankSum=1.148;SC=CTCCTGAGGACAGAAGCGTAT;SOR=0.520;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=55;WE=117660762;WS=117660744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr1	117663913	rs3795655	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.975;SC=AAGAGAAAGTCTCCAGAACTT;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=7;WE=117663921;WS=117663903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	117690272	rs10754339	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=898;SC=TTTTGTGGCCGAGGCACATTA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=117690280;WS=117690262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	117715026	rs6657810	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=919;ReadPosRankSum=-1.007;SC=TCCTCTTTTCCCACACCTCAG;SOR=0.955;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=57;WE=117715034;WS=117715016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,62:0.40:154
chr1	117957288	rs1289948	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=787;SC=GAGAACAGGAACCTAAAGGGA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=117957296;WS=117957278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	117984776	rs2306444	A	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=484;SC=TGTGCTATGTATACTATGAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=117984784;WS=117984766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	118053126	rs41506254	T	C	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=26;PP=891;SC=AGAACACAGATGAAAAGTCAA;SOR=0.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=54;WE=118053134;WS=118053116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	118065284	rs34350477	C	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	118165328	rs844108	T	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TGAGTCCTCATGGCAACACTG;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=14;WE=118165336;WS=118165318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	118165691	rs1630312	C	T	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1306;ReadPosRankSum=0.271;SC=TCAAAGTGCACGACGTCCGGC;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=78;WE=118165699;WS=118165681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr1	118165973	rs1627787	C	T	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1111;ReadPosRankSum=-2.167;SC=CCAACAAGAACGGGAAGAACG;SOR=0.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=74;WE=118165981;WS=118165963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr1	118166096	rs2884587	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=893;ReadPosRankSum=0.526;SC=ATAATCCCATCTCTGAGCACT;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=58;WE=118166104;WS=118166080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,72:0.41:175
chr1	118320644	rs1780028	A	G	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=104;SC=ATTCCCTAGCAAATTTGTTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=118320652;WS=118320634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	118320859	rs1775749	T	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.49;QD=30.83;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	118321119	rs114485606	T	C	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=53;PP=1664;SC=TACCTCTCTCTACCACCCATC;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=118321127;WS=118321109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	118429438	rs3054231	G	GACA	489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=537;SC=CTACTCTGCAGACAACACCTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=118429446;WS=118429428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	118484265	rs10733098	G	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=158;SC=CCAAGGTAATGCAACTACTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=118484273;WS=118484255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	118492587	rs41276602	T	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TATACTCATTTATTTTTTCTT;SOR=0.387;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=57;WE=118492595;WS=118492577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr1	118526592	rs4347199	G	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=242;SC=TTCAACTGTCGCAAATATGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=118526600;WS=118526582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	118565953	rs10923472	G	A	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=24;PP=1375;SC=AATCTCAGATGGTATCGTTTC;SOR=1.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=118565961;WS=118565943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	118583408	rs10923477	G	A	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=63;PP=2205;SC=AAGGATACAGGTAGTAATTTG;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=118583416;WS=118583398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	118617274	rs1935993	C	T	5548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=99;PP=2965;SC=TTGTTCTTGCCCTGCTGGTTA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=74;TCR=99;TR=173;WE=118617282;WS=118617264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	118623681	rs56768861	TACACAC	T	1085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=970;SC=AATAGTGTCTTACACACACAC;SOR=4.091;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=118623694;WS=118623671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	118644430	rs10754367	A	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=889;SC=TCACTGGTGCATTTGCCTCAG;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=118644438;WS=118644420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	118644524	rs17185492	T	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TTTATCCTTTTCTAACTTAGG;SOR=0.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=70;WE=118644532;WS=118644514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr1	119466275	rs4659129	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.970;SC=AGGAACCTACATTTTGTTCTC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=14;WE=119466283;WS=119466265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	119469188	rs10494217	G	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=759;ReadPosRankSum=0.048;SC=TACTGCTGATGTGGATCTAGG;SOR=0.790;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=49;WE=119469196;WS=119469178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr1	119683063	rs3934789	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=405;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CCTTAGGCGAGGGAAGGCATG;SOR=1.520;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=24;WE=119683071;WS=119683053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr1	119683390	rs12096448	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=396;ReadPosRankSum=-0.262;SC=AGCCGCTATCGGGCGGACTGC;SOR=0.223;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=20;WE=119683398;WS=119683380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr1	119923531	rs2224995	A	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=277;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TTACTCTCTGACTTCTGGCTT;SOR=0.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=16;WE=119923539;WS=119923521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr1	119923724	rs2275607	T	C	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CTTGGTGTGTTTGACAGACTT;SOR=0.497;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=75;WE=119923732;WS=119923714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,85:0.56:152
chr1	119925403	rs1341007	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TCTCAGCCAACTGAACCCACC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=119925411;WS=119925394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr1	119927680	rs6667679	A	G	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1423;ReadPosRankSum=1.122;SC=TAAAAAGGTAAGAAAGATACC;SOR=0.534;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=161;TCF=60;TCR=101;TR=94;WE=119927688;WS=119927670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,107:0.58:185
chr1	119936263	rs3765949	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=9;PP=882;ReadPosRankSum=3.490;SC=ACAGAATTACGTTATTCATTC;SOR=0.885;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=49;WE=119936271;WS=119936253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr1	120057246	rs1047303	C	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.678;NF=3;NR=22;PP=458;ReadPosRankSum=0.127;SC=CACAAGGAGACCCTGAAGTCC;SOR=0.959;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=25;WE=120057254;WS=120057236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr1	120263643	rs550174	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=439;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CTAGTGAGTATACCAAAGATA;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=25;WE=120263651;WS=120263633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	120285546	rs543703	G	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AAGGCACTACGCCTGTACTGC;SOR=0.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=67;WE=120285554;WS=120285536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr1	120293367	rs667246	T	C	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=644;ReadPosRankSum=0.110;SC=GTGTTGTTACTCAGAGGAAGA;SOR=0.715;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=42;WE=120293375;WS=120293357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,65:0.57:115
chr1	120296033	.	AAC	AACAC,A	565	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=60.11;NF=0,0;NR=14,14;PP=565,315;QD=40.5714285714;SC=AATCAAATAAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=14,14;WE=120296042;WS=120296023;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:37
chr1	120336785	rs1052972	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=777;ReadPosRankSum=2.040;SC=TAAACCTTCCCATGGCCAAAG;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=58;WE=120336793;WS=120336775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr1	120336876	rs699778	T	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=686;ReadPosRankSum=1.425;SC=GCTGAAGGGGTCTAGAAGCTT;SOR=0.909;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=39;WE=120336884;WS=120336866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr1	120337384	rs947270	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=-0.735;SC=GGTGTTTTTCTTGGAAGCATA;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=22;WE=120337392;WS=120337374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	120337403	rs947271	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=0.741;SC=TAGATAAGGCAATATGATGGT;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=15;WE=120337411;WS=120337393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	120378657	rs6684816	G	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=732;ReadPosRankSum=0.989;SC=CTTTGGAATTGGAGTGTTCGC;SOR=0.660;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=42;WE=120378665;WS=120378647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr1	120381686	rs5777416	G	GT,GTGTGAGTCA	403.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=2897;ReadPosRankSum=1.028;SC=GTGATTATATGGAGCACCTAG;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=9;WE=120381695;WS=120381682;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.38:32
chr1	120381687	.	G	C	700	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=700;QD=81.6412458386;SC=TGATTATATGGAGCACCTAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=9;WE=120381695;WS=120381682;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr1	120381687	rs34302627	G	GTGAGTCAC	403.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=2.174;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	120384162	rs78204967	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=0.770;SC=CTCCCTTCCCGTAACTTCTCC;SOR=2.564;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=11;WE=120384170;WS=120384152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	120436751	rs35273427	T	C	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.456;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=857;ReadPosRankSum=2.959;SC=ACAGTTTTTGTTTTAGATTCT;SOR=1.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=120436759;WS=120436741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr1	120437718	rs2793823	G	A	7834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=113;PP=2965;SC=TGGAACCACAGTCACATTCCT;SOR=0.803;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=243;TCF=130;TCR=113;TR=242;WE=120437726;WS=120437708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr1	120437884	rs2641348	A	G	8137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=114;PP=2965;SC=GATGCAATTAAGCCTACCCCT;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=240;WE=120437892;WS=120437874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	120458004	rs6685892	A	T	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=14;PP=1113;SC=CTCCTCCAGCACCCCCAGGGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=120458012;WS=120457994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	120461253	rs2793829	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=718;SC=GAAACAAGGGCATCAGAGCTG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=120461261;WS=120461243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	120464165	rs835573	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=519;SC=AGGTCATTTACGTCCTAAGGA;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=120464173;WS=120464155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	120471857	rs2493392	C	T	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=109;PP=2965;SC=AGAAGAGGTACAGAATTATGA;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=66;TCR=109;TR=175;WE=120471865;WS=120471847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	120477998	rs2453056	C	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=14;PP=1058;SC=AGCTAGTCTTCCTATCTTTAA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=120478006;WS=120477988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	120480394	rs2453057	T	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=379;SC=TCCCTCTTATTCCACAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=16;WE=120480402;WS=120480391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	120480709	rs2453058	C	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=547;SC=TATTGTGTTACAAGAAATCAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=120480717;WS=120480699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	120484421	rs2493420	G	A	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=51;PP=1676;SC=AGTAGCATCAGTTTAATCTTA;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=120484429;WS=120484411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	120496119	rs7534585	A	T	5971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.65;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	120496127	rs7534586	A	C	6181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	120506108	rs2934381	G	A	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=19;PP=1145;SC=TTAGGTATCTGAGCATATGCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=120506116;WS=120506098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	120512104	rs2493409	T	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=863;SC=GCCCCTTCCCTGTTTCTAGAT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=120512112;WS=120512094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	120529750	rs2453040	A	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=41;PP=1017;SC=CTCATACAGAAGAAACGACCT;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=120529758;WS=120529740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	120539213	rs2691745	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-6.596;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.304;SOR=1.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,10:0.14:71
chr1	120539331	rs2124109	C	T	2927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.639;NF=63;NR=57;PP=1904;ReadPosRankSum=0.733;SC=CTTGCCTGTCCCTTTCCCAGA;SOR=0.614;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=267;TCF=132;TCR=135;TR=120;WE=120539339;WS=120539321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,139:0.44:318
chr1	120539530	.	G	C	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=51.78;NF=0;NR=5;PP=104;QD=27.7542425094;SC=TTTTTCCTTGGGCTTCCTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=5;WE=120539552;WS=120539520;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,5:0.19:27
chr1	120572572	rs146242578	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	120611496	rs138685616	C	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.35;QD=28.40;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	120611554	rs75248693	TT	CG	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQRankSum=-5.006;QD=5.73;ReadPosRankSum=2.353;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,22:0.20:110
chr1	120611715	rs2794167	A	G	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=58;PP=2005;SC=GGAGGCGTGTAAGGGGTCCCG;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=92;WE=120611723;WS=120611705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	120611758	rs61790276	G	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.522;NF=12;NR=23;PP=620;ReadPosRankSum=-1.059;SC=GGGGAACCCCGGCGGTTGGCG;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=35;WE=120611766;WS=120611748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr1	120611830	rs61790277	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.344;NF=8;NR=11;PP=296;ReadPosRankSum=0.822;SC=GAGTGGCCTCGCTCCGCGCCG;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=19;WE=120611838;WS=120611820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	120611876	rs11801062	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.168;NF=12;NR=11;PP=306;ReadPosRankSum=0.777;SC=AGAGAAGGACCGAGGGGGAGA;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=23;WE=120611884;WS=120611866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	120611964	rs11810554	G	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.991;NF=18;NR=11;PP=372;ReadPosRankSum=1.644;SC=CGGGGGCCGCGCAGCACAGCC;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=29;WE=120611972;WS=120611950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr1	120612006	rs4021006	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=3;HapScore=2;MGOF=76;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.530;NF=18;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=-1.350;SC=GCAGAGCGGGGCGCAGGGCGG;SOR=0.551;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=31;WE=120612014;WS=120611992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr1	120612031	.	G	GCCTCCT	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=-0.540;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr1	120612040	.	T	TCCGCCG	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-2.791;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,11:0.16:69
chr1	120612154	rs56375229	C	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-3.012;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,17:0.26:65
chr1	120612163	rs55899574	C	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-3.264;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr1	120612168	rs11801102	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-2.276;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr1	120612297	rs138452656	C	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.86;QD=24.74;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	120925908	.	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.55;MQRankSum=-2.256;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,17:0.22:77
chr1	121115761	rs150166046	T	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.45;MQRankSum=-1.410;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	121115786	rs199825051	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQRankSum=-1.876;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr1	121116647	rs2772072	T	A	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.414;NF=13;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=0.979;SC=AGCCCCCCTTTAAAAAAAAAG;SOR=0.719;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=15;WE=121116655;WS=121116637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,9:0.16:57
chr1	121116678	rs61806689	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=5.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQRankSum=-1.957;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr1	121116688	rs61806690	A	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQRankSum=-2.736;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.572;SOR=1.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr1	121116933	rs79097880	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.485;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.118;SC=ATTAGGAAGATAGCAGCCATG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=121116941;WS=121116923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	121116953	rs78187610	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.433;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GATCCATCAGAGTGCTTGCCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=121116961;WS=121116943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	144013853	rs6600697	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,25:0.14:178
chr1	144013865	rs6600696	T	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,56:0.26:219
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chr1	144854598	rs3863691	C	T	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=2.009;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,40:0.39:103
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chr1	144865850	rs1613780	G	T	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.99;MQRankSum=-1.078;NF=36;NR=42;PP=1043;ReadPosRankSum=0.277;SC=GTCTTCGATTGTCTTCCCTGA;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=78;WE=144865858;WS=144865840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,92:0.46:201
chr1	144866509	rs924667	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=772;ReadPosRankSum=0.618;SC=CATAAGGAGCGAGTGAAGTAA;SOR=1.327;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=103;TCR=18;TR=47;WE=144866517;WS=144866499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,49:0.37:133
chr1	144866643	rs1620560	G	A	4464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=93;PP=2911;ReadPosRankSum=0.647;SC=TCCCGTAGGCGGTCATTGATG;SOR=0.566;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=393;TCF=182;TCR=211;TR=181;WE=144866651;WS=144866633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,209:0.46:454
chr1	144866662	rs1064044	T	C	4249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=95;PP=2737;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TGCAGATGGATTCCTCCAGGC;SOR=0.517;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=372;TCF=157;TCR=215;TR=173;WE=144866670;WS=144866652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,198:0.47:417
chr1	144868170	rs1628310	C	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=682;ReadPosRankSum=-1.019;SC=ACAGTGCTGGCACCTGGGCAG;SOR=1.069;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=41;WE=144868178;WS=144868160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr1	144868204	rs1747951	A	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=5.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=0.242;SC=TAAGAAGCAAATGGGGTGTCA;SOR=1.206;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=26;WE=144868212;WS=144868194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr1	144871738	rs1698605	C	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=229;ReadPosRankSum=-1.601;SC=TCCTGCTGAGCCTCAGCCAAG;SOR=0.169;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=16;WE=144871746;WS=144871728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	144871755	rs1778159	A	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=0.599;SC=CAAGGAGACCACTGGTGTCTC;SOR=0.169;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=14;WE=144871763;WS=144871745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr1	144871782	rs1778158	A	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=400;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GCCAAGGAGGAGAGGGCCAGT;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=20;WE=144871790;WS=144871772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr1	144871889	rs1698606	A	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=552;ReadPosRankSum=-1.676;SC=AGCCTAGGAAAAGAAAGTTAA;SOR=0.846;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=45;WE=144871897;WS=144871879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr1	144873818	rs1610566	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=1.442;SC=TTGAAGAAAAATCAAACAGGC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=14;WE=144873826;WS=144873808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	144873840	rs1627335	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=0.856;SC=GCAGAGAAAGAGGAGATGAAG;SOR=0.094;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=25;WE=144873848;WS=144873830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr1	144873887	rs1699787	C	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=667;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CTGAATGGGCCTGGTTGGCCT;SOR=0.408;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=122;TCF=90;TCR=32;TR=48;WE=144873895;WS=144873877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,55:0.40:137
chr1	144873962	rs11341221	CT	C	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=2.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,48:0.20:240
chr1	144874038	rs1419160	T	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=806;ReadPosRankSum=0.458;SC=ATCTATAAAATCCATGAATGA;SOR=0.412;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=120;TCF=38;TCR=82;TR=52;WE=144874046;WS=144874028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr1	144874070	rs1610565	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=359;ReadPosRankSum=0.403;SC=TGATGTTCTACAGAGAACTGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=24;WE=144874078;WS=144874060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr1	144874088	rs1419158	G	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TGGAATCCTGGCCTTATGTTT;SOR=3.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=16;WE=144874096;WS=144874078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	144874641	rs1610771	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=0.660;SC=TCTCCACTCAGCCTAGACAAA;SOR=0.031;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=144874649;WS=144874631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	144874760	rs1610774	T	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=854;ReadPosRankSum=0.344;SC=AGGCTTCCAGTTCATCAGACA;SOR=0.850;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=63;WE=144874768;WS=144874750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,80:0.47:172
chr1	144874815	rs1778155	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,28:0.24:115
chr1	144874950	rs1747957	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GGTCACCGAAGCCAACCTGTC;SOR=1.008;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=20;WE=144874958;WS=144874940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	144877176	rs2762875	C	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.325;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.663;NF=46;NR=12;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TTTTGCATGCCGGGTGATAAG;SOR=0.267;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=95;TCF=80;TCR=15;TR=58;WE=144877184;WS=144877166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr1	144877366	rs1807092	A	G	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.309;NF=21;NR=54;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CTATGAGAACATCTCTAAGGA;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=48;TCR=119;TR=75;WE=144877374;WS=144877356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr1	144877390	rs1807093	G	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.588;NF=7;NR=41;PP=866;ReadPosRankSum=0.503;SC=CCCCCAAGCTGAATTCTGGCA;SOR=0.958;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=18;TCR=91;TR=48;WE=144877398;WS=144877380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr1	144879264	rs2798901	A	G	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.95;MQRankSum=-0.685;NF=43;NR=48;PP=1446;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTCAGCTTCCAGGGTCTTTCC;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=91;WE=144879272;WS=144879254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,111:0.67:165
chr1	144879339	rs145959230	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,27:0.25:109
chr1	144879375	rs1747958	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=931;ReadPosRankSum=1.120;SC=TTCAGATCTTTGATGTCCTTT;SOR=0.678;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=53;WE=144879383;WS=144879365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
chr1	144880832	rs12568796	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,19:0.23:81
chr1	144881711	rs937714	T	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.536;NF=2;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=0.276;SC=CCTGTGGACTTTACTCAAGTC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=16;WE=144881719;WS=144881701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	144882581	rs1699836	A	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.398;NF=22;NR=16;PP=776;ReadPosRankSum=-1.741;SC=TTATTCTTTCAATGGTGCTGG;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=38;WE=144882589;WS=144882571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr1	144882823	rs1698647	C	T	4151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=95;PP=2502;ReadPosRankSum=-1.880;SC=TCAGACATTGCTTCTCCCATC;SOR=0.518;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=340;TCF=133;TCR=207;TR=162;WE=144882831;WS=144882813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,194:0.50:391
chr1	144882912	rs1698646	G	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=382;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TGAGGGCTAGGTCTGGTCCTC;SOR=0.355;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=14;TCR=85;TR=28;WE=144882920;WS=144882902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr1	144886063	rs1625285	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=282;ReadPosRankSum=1.830;SC=CCTCATGACCTGCAAGCTCCC;SOR=0.925;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=23;WE=144886071;WS=144886053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr1	144886092	rs1343472	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=468;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GGAAGAATGTCCTACCTGATG;SOR=0.881;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=32;WE=144886100;WS=144886082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr1	144886197	rs1698624	A	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=637;ReadPosRankSum=0.555;SC=TGCTGGTGGAACTCAGCCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=45;WE=144886205;WS=144886187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr1	144886409	rs1620507	A	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=-0.822;SC=AGGCAGTTTTAAATGAGAACA;SOR=0.582;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=144886417;WS=144886399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	144890833	rs11447	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.625;NF=23;NR=4;PP=501;ReadPosRankSum=2.480;SC=CTTGTTAACTTATAATTACAC;SOR=0.302;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=27;WE=144890841;WS=144890823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr1	144892089	rs1614098	G	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.300;NF=9;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TCCCAAGCAGGTCCTCCGCCC;SOR=0.425;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=12;WE=144892097;WS=144892079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	144892149	rs1698709	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.577;NF=14;NR=9;PP=394;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TCTGTGGTGCGTTTCAGTTAC;SOR=0.638;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=23;WE=144892157;WS=144892139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr1	144892368	rs1698708	A	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.152;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,27:0.23:116
chr1	144895460	rs1698703	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=254;ReadPosRankSum=1.208;SC=ACACTGTCTTCAGAACTAACT;SOR=0.456;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=21;WE=144895468;WS=144895450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr1	144906508	rs34169189	C	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.495;NF=27;NR=41;PP=925;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CCTGCACAGCCATCATGGACT;SOR=0.889;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=68;WE=144906516;WS=144906498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,74:0.51:145
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chr1	144910082	rs638780	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=38;PP=1296;SC=CATACACACAAGTTGTTCTTT;SOR=1.437;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=58;WE=144910090;WS=144910072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	144912153	rs1628172	A	G	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=909;SC=TTTCCAAGACAGCCAGTGGGG;SOR=1.096;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=144912161;WS=144912143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	144912233	rs1629011	C	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.204;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.909;NF=18;NR=12;PP=463;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TAAATATTGGCGCAGGGCCTG;SOR=1.007;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=30;WE=144912241;WS=144912223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr1	144915412	rs1698684	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,27:0.20:133
chr1	144915561	rs1778111	G	A	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.394;NF=24;NR=48;PP=1017;ReadPosRankSum=1.195;SC=CTTTCCTTTCGCTGTAGACGC;SOR=0.546;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=146;TCF=44;TCR=102;TR=72;WE=144915569;WS=144915551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr1	144915624	rs1778112	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.241;NF=5;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=-1.785;SC=TTGCAGAGCAGTGTTGCACTA;SOR=0.187;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=21;WE=144915632;WS=144915614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	144916676	rs1698683	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,43:0.22:199
chr1	144916748	rs1747930	C	G	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=556;ReadPosRankSum=2.023;SC=ACTCTCCATACTCTACAGCCA;SOR=0.563;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=41;WE=144916756;WS=144916738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr1	144917546	rs1698682	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=566;ReadPosRankSum=0.726;SC=AGTCTCTCTAAGTCATGATCT;SOR=0.287;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=33;WE=144917554;WS=144917536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr1	144917827	rs11295415	CA	C	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.689;NF=8;NR=2;PP=332;ReadPosRankSum=0.517;SC=ACCTCCAGAGCAACAGCTTTA;SOR=0.473;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=10;WE=144917849;WS=144917817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr1	144917841	rs1698681	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.043;NF=23;NR=7;PP=599;ReadPosRankSum=0.990;SC=AGCTTTATCATGTATTCGCTG;SOR=0.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=30;WE=144917849;WS=144917817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	144918034	rs2655804	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=25;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AGATGTGATCACTCTCCTCAA;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=144918042;WS=144918024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr1	144918957	rs1061308	T	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.853;NF=34;NR=33;PP=900;ReadPosRankSum=0.045;SC=ATTCTGCAATTCTTCTTGTAG;SOR=0.686;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=67;WE=144918966;WS=144918947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,79:0.39:203
chr1	144919008	rs11296953	AC	A	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-0.464;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,27:0.16:165
chr1	144919094	rs1698680	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GAAAGAGGAGCAGAGGGTGCC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=14;WE=144919102;WS=144919084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	144922109	rs1343469	A	G	6107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=561;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=0.932;SC=CACAAAGACTAAAAATAAAAT;SOR=0.761;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=477;TCF=268;TCR=209;TR=227;WE=144922122;WS=144922099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:287,268:0.48:555
chr1	144922171	rs1343470	C	T	7238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=645;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=145;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TCCTGTCCTACGTGACCCTCA;SOR=0.780;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=527;TCF=252;TCR=275;TR=273;WE=144922179;WS=144922161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:312,328:0.51:640
chr1	144922523	rs2455994	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:345,97:0.22:442
chr1	144922583	rs1359300	G	A	3791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=82;PP=2229;ReadPosRankSum=0.329;SC=CTTTTGAGACGACTCCTGAGC;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=378;TCF=175;TCR=203;TR=156;WE=144922591;WS=144922573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,190:0.42:451
chr1	144923823	rs11268079	TAGGAAGAAACGGCA	T	9275.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.17;NF=8;NR=109;PP=2957;SC=AGTCATGGGCTAGGAAGAAAC;SOR=1.644;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=147;TCF=11;TCR=136;TR=117;WE=144923844;WS=144923813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	144930571	rs2762866	C	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=747;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CACTATGTAGCCGTTTTGTAT;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=57;WE=144930579;WS=144930561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr1	144930596	rs2762867	C	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=972;ReadPosRankSum=1.574;SC=GGACCCGGAGCGGCAAATAAT;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=63;WE=144930604;WS=144930586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr1	144930940	rs2147326	T	C	3416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=75;PP=2251;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TCCTCATCTTTCTGTTGTGGA;SOR=0.525;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=240;TCF=93;TCR=147;TR=126;WE=144930948;WS=144930930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,149:0.55:273
chr1	144931087	rs41315684	T	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=426;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GGTTCTTCAGTGCAAATGCTG;SOR=0.639;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=40;WE=144931095;WS=144931077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,46:0.34:134
chr1	144931330	rs2762745	C	T	5036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TGGAGCAGTGCAGAGTATCTC;SOR=0.583;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=384;TCF=183;TCR=201;TR=201;WE=144931338;WS=144931320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,229:0.52:438
chr1	144931392	rs2798893	G	A	3421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=75;PP=2303;ReadPosRankSum=1.133;SC=CTTGATCTCCGCGCCAGAGTC;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=298;TCF=137;TCR=161;TR=143;WE=144931400;WS=144931382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,156:0.46:336
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chr1	144952082	.	T	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=0.000;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-0.383;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.325;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,66:0.18:369
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chr1	144952255	rs148545794	G	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQRankSum=-3.344;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr1	144994658	rs1664022	C	A	4702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.349;SC=GAAGTAGATGCGCAGCTTGAG;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=386;TCF=235;TCR=151;TR=191;WE=144994666;WS=144994648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,216:0.48:450
chr1	144994861	rs2442640	C	T	9918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=188;NR=176;PP=2962;ReadPosRankSum=1.236;SC=GCTGGGGCTACGGCGACATGG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=487;TCF=251;TCR=236;TR=364;WE=144994869;WS=144994851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,402:0.75:538
chr1	144994902	rs4649499	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.17;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:596,73:0.11:669
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chr1	145014186	.	GAA	G	611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.291;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.733;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr1	145014210	rs1778710	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=-0.594;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,45:0.27:167
chr1	145014218	rs1778709	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.388;QD=0.82;ReadPosRankSum=2.107;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,29:0.14:209
chr1	145014263	rs1778708	C	T	3456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.117;NF=90;NR=60;PP=2408;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CACAGCTGTTCGGAGGTTTAG;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=329;TCF=197;TCR=132;TR=150;WE=145014271;WS=145014253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,173:0.45:387
chr1	145014394	rs1107089	C	T	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.551;NF=12;NR=52;PP=1113;ReadPosRankSum=0.211;SC=CTTAGGCACACGTTATATGGT;SOR=0.896;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=27;TCR=111;TR=64;WE=145014402;WS=145014384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr1	145014411	rs1778707	T	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.575;NF=6;NR=37;PP=818;ReadPosRankSum=0.936;SC=TGGTGCATATTCTTTGCCCAC;SOR=1.229;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=95;TCF=16;TCR=79;TR=43;WE=145014419;WS=145014401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr1	145016020	rs657162	T	G	9955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=98;NR=205;PP=2962;SC=AGCTGTCAATTAAACAGAACA;SOR=1.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=99;TCR=206;TR=303;WE=145016043;WS=145016010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr1	145016032	rs112952246	C	CA	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=4.331;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,48:0.18:269
chr1	145016034	.	A	AC	87.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=3.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-0.853;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,35:0.13:276
chr1	145016035	rs80291027	A	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-1.022;QD=1.37;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,48:0.17:279
chr1	145017784	rs11300211	CT	C	186.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.75;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	145017851	rs2596284	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	145018023	rs2799192	G	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=315;ReadPosRankSum=0.472;SC=AGAAAAAATTGGAAGACAGGG;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=33;WE=145018031;WS=145018013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr1	145021024	rs1778692	G	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.680;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.433;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,22:0.12:182
chr1	145021034	rs674066	C	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.673;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,28:0.12:230
chr1	145021089	rs1613515	G	A	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:384,123:0.24:507
chr1	145021265	rs673110	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.15;ReadPosRankSum=0.685;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,30:0.11:276
chr1	145038736	rs1663882	C	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.020;NF=37;NR=13;PP=637;ReadPosRankSum=0.248;SC=GTGTTTGTACCGTCTTCACTC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=50;WE=145038744;WS=145038726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr1	145038815	rs2442664	A	G	6354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.913;SC=AGATGGAAGCATATCTGTTAT;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=164;TCR=108;TR=240;WE=145038823;WS=145038805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,280:0.88:318
chr1	145038952	rs1663881	C	T	3249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=81;PP=2344;ReadPosRankSum=1.361;SC=TAAAGTGTGTCTGGGGGAAGG;SOR=1.010;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=290;TCF=125;TCR=165;TR=133;WE=145038960;WS=145038942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,154:0.42:368
chr1	145039026	rs1663880	T	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=543;ReadPosRankSum=-1.491;SC=AACTGTTGCCTGGCCTCAATA;SOR=0.350;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=147;TCF=41;TCR=106;TR=48;WE=145039034;WS=145039016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,56:0.32:174
chr1	145039523	rs1663879	G	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,38:0.15:262
chr1	145039562	rs1663878	C	T	5002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=0.134;SC=AAGTCTGGAGCGCGGCGAGAA;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=370;TCF=254;TCR=116;TR=190;WE=145039570;WS=145039538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,226:0.53:425
chr1	145039633	rs2762750	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=786;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:664,109:0.14:773
chr1	145039821	rs7554603	C	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,27:0.24:111
chr1	145074919	rs2289798	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=1.470;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,26:0.15:170
chr1	145074939	rs1663854	T	C	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=793;ReadPosRankSum=1.033;SC=TTTATGTTACTGCTGCTACAC;SOR=0.698;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=186;TCF=114;TCR=72;TR=67;WE=145074947;WS=145074929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,83:0.38:219
chr1	145075208	rs6424335	T	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=680;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CGATCCTTCATCTTTCATGCC;SOR=0.484;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=45;WE=145075216;WS=145075198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr1	145075519	rs2596337	G	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=0.349;SC=TCTTCAGTCCGGGGCCCCAGC;SOR=0.685;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=11;WE=145075527;WS=145075509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr1	145075683	rs2762779	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CCGCTGCTGCCCAGCTCCCGG;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=240;TCF=131;TCR=109;TR=93;WE=145075691;WS=145075673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,110:0.39:285
chr1	145075854	rs1663853	G	C	4462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=86;PP=2640;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CGCTGTCTGTGCCCTTCATGG;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=393;TCF=203;TCR=190;TR=181;WE=145075862;WS=145075844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,220:0.47:468
chr1	145075903	rs2596336	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=6.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.496;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:330,49:0.13:379
chr1	145075923	rs6656135	C	T	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=75;PP=1674;ReadPosRankSum=0.680;SC=TTCCTGGTGTCTTCCGGGACT;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=274;TCF=90;TCR=184;TR=113;WE=145075931;WS=145075913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,128:0.42:307
chr1	145103844	rs2590144	G	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=17;PP=918;ReadPosRankSum=-0.653;SC=TCATAATATGGTGCTTCTCAC;SOR=0.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=204;TCF=149;TCR=55;TR=67;WE=145103852;WS=145103834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,75:0.33:228
chr1	145103928	rs2596251	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:379,107:0.22:486
chr1	145103947	rs2794062	T	C	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=69;PP=1797;ReadPosRankSum=2.031;SC=TCAGGCTAAGTAACTCTTTCG;SOR=0.746;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=408;TCF=204;TCR=204;TR=132;WE=145103960;WS=145103937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,157:0.34:467
chr1	145104052	.	AGT	A	1664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=6.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,49:0.31:158
chr1	145104075	rs4145928	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=11.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.902;SOR=2.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,21:0.18:115
chr1	145109430	rs2442653	A	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,28:0.23:121
chr1	145109456	rs7553975	C	T	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=2.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,67:0.28:238
chr1	145109468	rs2442652	A	G	10545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=75;PP=2962;SC=GCTTTAAACTATTGTCAGTGC;SOR=1.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=185;TCR=76;TR=259;WE=145109476;WS=145109446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	145109493	rs2442651	C	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.352;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,104:0.25:422
chr1	145109549	rs2596331	G	T	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:536,172:0.24:708
chr1	145109583	rs2794053	C	A	8580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=808;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=190;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TTCCCTAAGACGTTGGCTTTT;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=678;TCF=379;TCR=299;TR=336;WE=145109591;WS=145109573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:407,390:0.49:797
chr1	145109661	rs2655551	G	A	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=868;ExcessHet=3.0103;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:682,180:0.21:862
chr1	145109809	rs2596327	T	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=393;ReadPosRankSum=-2.034;SC=TAGCTTCTGCTTCCTTTTCCA;SOR=0.543;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=26;WE=145109817;WS=145109799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr1	145112284	.	CCG	C	1085.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.871;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chr1	145112287	rs2794042	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.479;SOR=1.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,16:0.16:99
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chr1	145112485	rs2794039	C	T	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=792;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:585,190:0.25:775
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	1288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,41:0.25:166
chr1	145115810	rs2655557	A	G	12012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=748;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=179;PP=2962;ReadPosRankSum=2.344;SC=TTGAACATGCATTCCACTTAT;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=625;TCF=287;TCR=338;TR=337;WE=145115828;WS=145115800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:335,392:0.54:727
chr1	145115820	rs2655558	T	C	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:579,145:0.20:724
chr1	145139088	rs150935736	C	CG	1973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.34;QD=37.96;SOR=7.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	145209116	.	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.86;MQRankSum=-2.764;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr1	145209612	.	GCCCCGCCAACCGCCGGGGTT	G	1757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.720;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.448;NF=12;NR=7;PP=2964;ReadPosRankSum=0.174;SC=CTCCCGTGGTGCCCCGCCAAC;SOR=2.078;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=19;WE=145209639;WS=145209602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr1	145209811	rs184992727	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQRankSum=-4.329;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,59:0.20:302
chr1	145273302	rs201646101	A	G	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQRankSum=0.166;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:445,148:0.25:593
chr1	145273345	rs75987820	T	C	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=845;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-0.368;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:632,213:0.25:845
chr1	145273431	rs17421312	A	G	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=755;ExcessHet=3.0103;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQRankSum=-3.480;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:573,181:0.24:754
chr1	145273473	rs202082259	T	C	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQRankSum=-1.594;QD=4.09;ReadPosRankSum=-2.576;SOR=1.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:385,130:0.25:515
chr1	145273520	rs2793994	G	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQRankSum=-5.075;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,49:0.25:199
chr1	145281247	rs74721027	T	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQRankSum=-1.055;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	145281361	rs147539840	TC	T	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQRankSum=-10.155;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:419,50:0.11:469
chr1	145281408	rs201164506	C	T	2643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=792;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQRankSum=-9.716;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.676;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:608,183:0.23:791
chr1	145281543	rs8002	C	T	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=737;ExcessHet=3.0103;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQRankSum=-3.626;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.481;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:539,197:0.27:736
chr1	145281613	rs12120756	C	A	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQRankSum=-2.964;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:365,99:0.21:464
chr1	145281633	rs28576333	C	A	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQRankSum=-2.548;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:321,89:0.22:410
chr1	145281656	rs4649852	A	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQRankSum=-2.565;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:301,46:0.13:347
chr1	145281780	rs190671398	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQRankSum=-1.586;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.969;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,24:0.19:127
chr1	145281818	rs2691746	T	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQRankSum=-0.544;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,15:0.17:90
chr1	145281824	rs4089950	T	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=5.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.86;MQRankSum=-0.948;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.040;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,17:0.19:91
chr1	145282093	rs199946317	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.850;NF=5;NR=25;PP=464;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CATTAACAGTGGGTGATCAAC;SOR=0.322;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=110;TCF=13;TCR=97;TR=30;WE=145282101;WS=145282083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,31:0.28:112
chr1	145507826	rs872786	A	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GGTCGTAAGGATGGGAATCGA;SOR=0.920;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=18;WE=145507834;WS=145507816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr1	145510376	rs147038428	A	G	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=18.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	145517561	rs4471211	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=0.805;SC=AGTAATTAGGCGGACTGGAGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=145517569;WS=145517551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	145531980	rs4384171	T	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=551;SC=GGCAAGATGCTTGACCTCAGG;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=145531988;WS=145531970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	145532052	rs28369274	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=7.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=-1.162;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.653;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,59:0.75:79
chr1	145532549	rs1328584	T	C	4161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=49;PP=2454;SC=AGCGATTCTTTTTCAATGTCA;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=113;WE=145532557;WS=145532539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	145533314	rs2274619	T	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=909;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TGACCTCTGGTTACTTCCCTT;SOR=0.718;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=59;WE=145533322;WS=145533304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr1	145535921	rs2274617	T	C	3369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=-0.978;NF=77;NR=53;PP=2145;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TAAAATGCATTACAGGCAACT;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=150;TCR=109;TR=130;WE=145535929;WS=145535911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,154:0.49:313
chr1	145536082	rs2274616	G	A	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=48;PP=1192;ReadPosRankSum=0.456;SC=TTGTCCCCTCGGAGGCTCCGG;SOR=0.904;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=36;TCR=91;TR=66;WE=145536090;WS=145536072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr1	145538139	rs2274615	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=698;ReadPosRankSum=0.051;SC=GGAGGAACAACATTGATTCCT;SOR=0.840;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=40;WE=145538147;WS=145538129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr1	145538664	rs1109216	A	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=364;ReadPosRankSum=0.593;SC=TGCTGATCATATGCCCCTGTG;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=22;WE=145538672;WS=145538654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	145539505	.	C	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TGACTTGGGACAAGAGGGTAG;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=145539513;WS=145539495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	145539892	rs35315146	T	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=616;ReadPosRankSum=0.534;SC=CAAGTTTCACTTTTGCCTCTT;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=37;WE=145539900;WS=145539882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr1	145542281	rs2282014	G	A	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1101;ReadPosRankSum=-2.399;SC=AGCAATGAATGTAGAATAAGG;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=77;TCR=107;TR=78;WE=145542289;WS=145542271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,93:0.42:223
chr1	145555653	rs6424379	C	T	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1401;ReadPosRankSum=-1.128;SC=CACACTACCCCCATGCCCTAT;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=229;TCF=125;TCR=104;TR=94;WE=145555661;WS=145555643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,119:0.43:279
chr1	145558565	rs11801520	C	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=792;SC=GGCTGCTGCTCTCTCTCAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=145558573;WS=145558555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	145561594	rs6670984	C	T	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=55;PP=2005;ReadPosRankSum=0.895;SC=ACAGGGGCCACCCCAGAGCCC;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=136;TCR=104;TR=129;WE=145561602;WS=145561584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,158:0.53:300
chr1	145562087	rs41315701	G	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CCTGGGGCTCGAGGAGAGCCT;SOR=0.784;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=83;WE=145562095;WS=145562077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,97:0.47:207
chr1	145562293	rs11579366	G	C	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1520;ReadPosRankSum=0.951;SC=GCCCAAGCCAGAGGCGCAGGT;SOR=0.759;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=89;WE=145562301;WS=145562283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,111:0.54:205
chr1	145562881	rs10910824	T	C	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=1068;ReadPosRankSum=1.384;SC=AAAGGCTCTGTTGGAAAAGTA;SOR=0.817;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=64;WE=145562889;WS=145562871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,83:0.57:146
chr1	145566535	rs1819347	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=693;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TAGTGAACACCACACAGAAGA;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=38;WE=145566543;WS=145566525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr1	145585317	rs4128488	A	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=34;PP=1696;SC=TGGGGAAGTCAGGATTGAGAT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=88;WE=145585325;WS=145585307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	145586780	rs10910829	T	C	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1264;ReadPosRankSum=0.892;SC=ACTGTGGAGCTCTCCAGTCCT;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=83;WE=145586788;WS=145586770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,102:0.45:228
chr1	145588536	rs9286836	C	T	5229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=TTTGCTTGCCCCTCCCTCAGC;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=145588544;WS=145588526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	145597116	rs9728311	C	T	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=34;PP=1084;SC=TTCCCAGTCACAGATGGGGTG;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=145597124;WS=145597106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	145598459	rs9729715	T	C	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=27;PP=1952;SC=AGGAGGATGATACTAGGTATC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=75;WE=145598467;WS=145598449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	145601861	rs9286837	G	A	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=53;PP=1852;ReadPosRankSum=0.983;SC=GGCTGAGGAAGAGATTTAGAG;SOR=0.452;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=86;WE=145601869;WS=145601851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr1	145608556	rs115748902	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=826;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TCTAAGCATTCGCAATACCCG;SOR=0.549;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=51;WE=145608564;WS=145608546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr1	145826770	rs34955113	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.67;MQRankSum=1.117;NF=6;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGAGTGACTGGCGCAGGACG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=145826778;WS=145826760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	146633933	rs1036852	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=359;ReadPosRankSum=0.921;SC=CACCTCTGTAGTAATCCTAAC;SOR=1.322;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=23;WE=146633941;WS=146633923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr1	146643555	rs1348316	A	G	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=656;ReadPosRankSum=-2.191;SC=AACTGCGGGCATGGGACGCTT;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=51;WE=146643563;WS=146643545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr1	146650058	rs1816802	T	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=587;ReadPosRankSum=0.875;SC=GGACTGCTGATGGAATTGTCA;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=37;WE=146650066;WS=146650048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr1	146656179	rs142231929	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=332;ReadPosRankSum=-0.173;SC=TCTTCAACTTGGGTTTGTCTG;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=22;WE=146656187;WS=146656169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr1	146656292	rs4950385	A	G	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=29;PP=859;SC=CATACTATCAATGTGACTTAT;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=146656300;WS=146656282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	146672906	rs894469	C	T	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=76;PP=2844;SC=CTTCCAGAAACGGAAAGTCAA;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=137;WE=146672914;WS=146672896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	146673178	rs6683215	A	G	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=612;SC=AGGTAAACAGAATGCCAATAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=146673186;WS=146673168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	146680262	rs2354433	A	G	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=518;SC=CCGCCTCCCAAAGTGCTGGGA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=146680270;WS=146680252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	146685121	rs1530336	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=554;SC=GATATCACAGGCACTATCACA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=146685129;WS=146685111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	146687250	rs1822312	A	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=651;SC=AAGTAAACATAGGTAACTGAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=146687258;WS=146687240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	146714255	rs1890040	A	G	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=3;PP=168;SC=CGCCTCGCTCATAGGTGGGCC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=146714263;WS=146714245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	146714281	rs1890041	C	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=-1.270;SC=GCGCAGTCGCCCGCCCCCGCG;SOR=0.275;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=146714289;WS=146714271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	146714392	rs1890042	G	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=566;ReadPosRankSum=0.557;SC=GGGGCCAAGCGCCTGGCTTCT;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=40;WE=146714400;WS=146714382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr1	146714427	rs11588753	G	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=499;ReadPosRankSum=0.817;SC=ACTGAGGGCCGAGCCGAGGCG;SOR=0.979;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=33;WE=146714435;WS=146714417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr1	146714588	rs1890043	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=-1.540;SC=GTTTACCCGCCCGCGCCAGGG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=9;WE=146714596;WS=146714578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr1	146724003	rs3820130	A	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=527;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TATAGAGGCCAGATCCCAAGT;SOR=1.147;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=34;WE=146724011;WS=146723993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr1	146724093	rs1890037	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=1012;SC=GAATAAGTCTACTCAAAAAGT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=146724101;WS=146724083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	146724408	rs3737845	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=416;ReadPosRankSum=-1.103;SC=ACTATGCGACGAGTACTGCTC;SOR=0.192;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=27;WE=146724416;WS=146724398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr1	146728149	rs12119390	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=275;ReadPosRankSum=0.720;SC=GAGTTTATCAATGCCAGCCTT;SOR=0.099;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=23;WE=146728170;WS=146728139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	146728162	rs61409326	T	TA	1981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=14;PP=1657;SC=CCAGCCTTTATACGTGTCTTC;SOR=1.835;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=35;WE=146728170;WS=146728139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	146737490	rs3737848	G	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.600;SC=CAAAATAAGCGTGAAATAAGA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=146737498;WS=146737480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	146739068	rs11239963	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1188;ReadPosRankSum=2.967;SC=GTCTCTCTCTTTTTTTTTAAA;SOR=0.565;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=130;TCF=92;TCR=38;TR=70;WE=146739076;WS=146739058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr1	146739277	rs4143738	T	C	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=41;PP=922;ReadPosRankSum=-1.853;SC=CTTACTTTGTTTACTTTGTTT;SOR=0.508;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=21;TCR=102;TR=50;WE=146739285;WS=146739267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
chr1	146740576	rs11576360	G	A	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1008;ReadPosRankSum=0.565;SC=TGAGCTAATGGCTGTTAAAAC;SOR=0.626;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=166;TCF=64;TCR=102;TR=71;WE=146740584;WS=146740566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,83:0.41:200
chr1	146747153	rs6680778	T	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=571;ReadPosRankSum=2.064;SC=TTTTCTGCTTTCTTGGCTTGC;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=29;WE=146747161;WS=146747143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr1	146748072	rs7534963	A	G	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=AGTGCTGGCTATGTGCAGGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=146748080;WS=146748062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	146751782	rs7547279	A	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=15;PP=634;SC=TGGAGTCCATACTGGGAGAAA;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=146751790;WS=146751772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	146757923	rs9661159	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=1.777;SC=TGTGCTCCAAGGGAAATTGTG;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=15;WE=146757931;WS=146757913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	146759320	rs2275249	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=241;ReadPosRankSum=-0.636;SC=ACAGATGACTCTGGCCACTGG;SOR=0.537;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=22;WE=146759328;WS=146759310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr1	146762984	rs6665723	AG	CA	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.637;SC=ATAAAAATTCAGGAGTGAAGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=146762993;WS=146762983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	146763089	rs10900333	G	A	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=42;PP=1987;SC=AATTTGAAGAGGGCGAGATAC;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=100;WE=146763097;WS=146763079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	146763415	rs3737854	T	C	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=285;SC=TTCTGGAGGCTGAAAGTCCAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=146763423;WS=146763405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	146765454	rs2297752	C	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TGTTTCTAGGCATGTGATACG;SOR=0.373;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=36;WE=146765462;WS=146765444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr1	146766069	rs71083827	C	CAT	2120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=1574;SC=TGAGTGAAGACGTGTTCTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=28;WE=146766077;WS=146766059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	146767062	rs7516430	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-0.920;SC=TCGTTTTGGTAAAGTTGGTTT;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=5;WE=146767070;WS=146767052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr1	146767149	rs4950394	G	T	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=17;PP=798;SC=TGTCCTTCATGCACAGTCTTC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=146767157;WS=146767139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	146767320	rs6537	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=383;SC=CTGAGTTTCAATTTGGTTCTC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=146767328;WS=146767310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	146767353	rs6538	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	147085066	rs35669952	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=359;ReadPosRankSum=-1.695;SC=TCTGACATTCGACAGAGGCCA;SOR=0.880;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=21;WE=147085074;WS=147085056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr1	147086504	rs7512513	A	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=0.763;SC=TTTTATTATCACCTAAAGTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=147086512;WS=147086494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	147087721	rs3737843	T	A	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=513;ReadPosRankSum=0.117;SC=TTTCAGAAACTGAGTAATGGT;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=36;WE=147087729;WS=147087711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,46:0.40:115
chr1	147091972	rs3820129	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=698;ReadPosRankSum=0.997;SC=CCACATGGAGCCTGGGAATAA;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=42;WE=147091980;WS=147091962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr1	147096794	rs867270	A	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=903;SC=TCCTTGTCAAAATGAGATTCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=147096802;WS=147096784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	147096828	rs946902	C	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=500;SC=TGCTTTGAGGCAGTTCCAGGA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=147096836;WS=147096818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	147119273	rs1344	G	A	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=72;PP=2852;SC=AGCAGAGTGCGTGGTATTTTT;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=147;WE=147119281;WS=147119263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	147121977	rs6593795	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=14;PP=731;SC=GCAGAGTCCACGGCTTTCAGC;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=147121985;WS=147121967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	147124310	rs2153463	T	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=14;PP=735;SC=TCGATCATCCTTGCAAATCTC;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=147124318;WS=147124300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	147131465	rs6674938	T	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=9;PP=946;SC=TATCCTCATGTTCAAGACCTT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=147131473;WS=147131455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	147131501	rs34675044	A	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=0.731;SC=TCCCCTTTCAAGTGACTCACA;SOR=0.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=40;WE=147131509;WS=147131491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr1	147131945	rs2275552	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=281;SC=TTGAAATGTATAGCATTAACA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=147131953;WS=147131935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	147142296	rs2883202	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-1.567;SC=CATCCAGCCCTTCAGCAAGCA;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=147142304;WS=147142286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	147230217	rs1692141	T	C	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=23;PP=2047;SC=CACGTCTTTCTTCTCTGAGCC;SOR=2.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=86;WE=147230225;WS=147230207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	147381397	rs34123490	G	GA	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5250;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.803;NF=0;NR=24;PP=274;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TGACGCCAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=24;WE=147381405;WS=147381387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr1	147381444	rs1532399	A	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=845;SC=ATGAAAGGAAAAGGTGCCAAC;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=147381452;WS=147381434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	147400533	.	G	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.748;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.267;NF=15;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=0.859;SC=CTGGAGAGCCGCAGTCCCGGC;SOR=0.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=17;WE=147400541;WS=147400523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	147400842	rs184075267	T	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=210;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GGTGTGCGATTTGCTGCGGCC;SOR=0.444;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=11;WE=147400850;WS=147400832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	147806559	rs10752439	C	T	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=51;PP=2965;SC=ACTTAGCTTGCGTTAAGCAAG;SOR=1.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=99;TCR=51;TR=150;WE=147806567;WS=147806549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	147806874	rs2999607	G	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.78;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	147806880	rs537191	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.78;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	149290881	rs144019609	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQRankSum=-0.867;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,32:0.28:115
chr1	149676401	rs146138154	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.773;NF=28;NR=59;PP=1451;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GCAGACAACCAGAGGGAGAGC;SOR=2.051;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=183;TCF=69;TCR=114;TR=87;WE=149676409;WS=149676391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,49:0.33:150
chr1	149764337	.	AG	A	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=875;SC=TGGAGGCTGCAGGAGCGAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=149764345;WS=149764327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	149876665	rs13067	G	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=-1.685;SC=CAGCCTTGGTGATTCCCACGA;SOR=0.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=40;WE=149876673;WS=149876655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,62:0.46:136
chr1	149878329	rs73006309	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=839;ReadPosRankSum=0.864;SC=TCCCTGTCACGTCTAGCGGGC;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=58;WE=149878337;WS=149878319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr1	149880863	rs68002561	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=892;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TCAGACCTTGACTATACTAAG;SOR=0.792;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=65;WE=149880871;WS=149880853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr1	149880882	rs73006315	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=860;ReadPosRankSum=0.416;SC=AGTTCTAGCACCCATAGATCC;SOR=0.785;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=57;WE=149880890;WS=149880872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr1	149881173	rs55909843	A	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.158;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr1	149881183	rs56351279	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.731;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr1	149908108	rs1868992	A	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=530;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CCGGCATCCTATTTTCCTGGA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=35;WE=149908116;WS=149908098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	149939610	rs73010178	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=0.716;SC=AAATACAATTGGAGAAATAGA;SOR=0.123;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=149939618;WS=149939600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	150122493	rs4553237	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=15;PP=325;SC=TGCGCTTGCCTGCCCTGCGGC;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=150122501;WS=150122483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	150128425	rs1545762	C	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=1049;SC=CCACCTTGGCCGCTGGAACAT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=150128433;WS=150128415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	150129267	rs10749675	G	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=438;SC=AACAGCTGTGGCCCACTGAAG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=150129275;WS=150129257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	150230422	.	GCT	G	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=59.12;NF=2;NR=0;PP=54;QD=30.5;SC=GAGCTCGCTCGCTCTCTCTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=2;WE=150230431;WS=150230412;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
chr1	150234657	rs34714364	G	T	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.136;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=883;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GATCCCCAGGGGGGTCAGAAC;SOR=0.736;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=57;WE=150234665;WS=150234647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,66:0.64:103
chr1	150241230	rs2275780	G	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=486;ReadPosRankSum=0.178;SC=GGTGGGAAGGGGGGTGGGGGC;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=38;WE=150241238;WS=150241220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,45:0.40:112
chr1	150249101	rs11205354	C	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=480;ReadPosRankSum=0.655;SC=ACGTGGAATACATAGAGGGCT;SOR=0.358;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=27;WE=150249109;WS=150249091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	150255587	rs2147324	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.897;SC=CCTTAAACTCTGGTTTCAAAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=150255595;WS=150255577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	150258838	rs1122967	C	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=630;ReadPosRankSum=-1.459;SC=TCTCCCCTCTCTAGCATTTTC;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=44;WE=150258846;WS=150258828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr1	150259400	rs9126	A	C	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=951;ReadPosRankSum=-1.771;SC=GTGACTTCTAATTTGTGTAAA;SOR=0.562;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=17;TCR=78;TR=52;WE=150259408;WS=150259390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr1	150276429	rs471738	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=-1.613;SC=ATGTAATACTGTTTGATCAGT;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=22;WE=150276437;WS=150276419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr1	150276461	rs471657	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=1.358;SC=GACATCAGCCGGGCGTGGTGG;SOR=1.214;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=150276469;WS=150276451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	150277387	rs11205359	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.545;SC=GAGAATCGCTTGAACCCAGAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=150277395;WS=150277377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	150280801	rs8006	G	C	94.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=1.282;SC=TCCAAATATAGAAACAATCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=150280809;WS=150280791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	150281202	rs580060	A	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=483;ReadPosRankSum=1.351;SC=ACTGGGGAGGAAGAGGTTGCA;SOR=0.864;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=24;WE=150281210;WS=150281192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr1	150300727	rs834225	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=219;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TAATTCTTCCTTTCTCCCCAC;SOR=0.124;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=13;WE=150300735;WS=150300717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	150307270	rs1260408	T	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TAACTCCTGGTCTCAAGTGAT;SOR=0.473;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=150307278;WS=150307260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	150321486	rs1625468	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=119;ReadPosRankSum=0.930;SC=GTCTAATTTGGGGAAAATAAA;SOR=0.743;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=9;WE=150321494;WS=150321476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr1	150469480	rs12119249	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=1.472;SC=GGGTTGGGGCCGGGCACAGTG;SOR=0.784;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=8;WE=150469488;WS=150469470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	150470322	rs11590324	C	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=-0.688;SC=AATCCCAACACTTTGGGAGGC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=150470330;WS=150470312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	150471848	rs34802685	A	AT	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=8;PP=92;ReadPosRankSum=-2.317;SC=GATACAAAGAATTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=150471856;WS=150471838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	150477061	rs3738487	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=946;ReadPosRankSum=-0.837;SC=GTACACAATTCGTGATACTTC;SOR=0.971;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=57;WE=150477069;WS=150477051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr1	150483236	rs9661040	A	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TCTCATTTCCACTATATCCTC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=150483244;WS=150483233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	150483355	rs3737240	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=663;ReadPosRankSum=-0.374;SC=ATTCCAGGAACGCCAGCTCCA;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=47;WE=150483363;WS=150483345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr1	150483840	rs4970979	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=366;ReadPosRankSum=-0.246;SC=CAACCACTGTCTCTTCTTTAT;SOR=1.162;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=18;WE=150483848;WS=150483830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr1	150484395	rs149815479	ACC	A	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=0.638;SC=CCATCCATGTACCCCCCCTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=150484404;WS=150484385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	150484987	rs13294	G	A	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=55;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CATTGACATCGGTCGAGTCAC;SOR=0.521;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=89;WE=150484995;WS=150484977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,106:0.58:184
chr1	150485566	rs12031973	T	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	150485571	rs12031974	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.61;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	150522471	rs10668635	C	CTG	1372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.147;NF=17;NR=9;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GTGGAGGGCTCTGAGGGCCCG;SOR=1.197;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=26;WE=150522479;WS=150522461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr1	150526044	rs41317515	G	C	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=94;PP=2965;SC=AGGGGAAGAGGCTATTCCGTC;SOR=0.919;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=169;WE=150526052;WS=150526034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	150526406	rs6681639	C	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=622;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GCCAGCAGGGCCAAGGGCCTT;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=43;WE=150526414;WS=150526396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr1	150528090	rs146160043	G	GACAC	1255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=1367;SC=TATGCACACAGACACATGCCC;SOR=1.942;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=21;WE=150528098;WS=150528080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	150528118	rs149100901	T	TACAC	950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=904;SC=CATACACATGTACACACATAT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=150528126;WS=150528108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	150528175	rs35233292	GCA	G	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=349;SC=ACGCATATGCGCACAGACACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=150528184;WS=150528165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	150528208	rs9728540	C	T	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	150529322	rs34379037	T	TAA	1812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=16;PP=1659;SC=CTGTTCCCTCTGGGCAGAGCT;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=33;WE=150529330;WS=150529312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	150530265	rs71815576	GGCT	G	499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.485;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr1	150530266	.	GCTGAGC	G	607	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=607;QD=110.37963945;SC=GCCATGGCAGGCTGAGCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=150530282;WS=150530256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,6:0.60:10
chr1	150530270	rs376060613	AGCC	A	496.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.05;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr1	150530273	.	CC	AA	608	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=608;QD=110.24464581;SC=CAGGCTGAGCCCCCCAGGAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=150530282;WS=150530256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,6:0.60:10
chr1	150530274	.	C	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.998;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.75;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	150531008	rs10888382	T	C	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=47;PP=2088;SC=TTGGGAACAATGGTGATGAAG;SOR=1.114;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=118;WE=150531016;WS=150530998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	150531050	rs10749657	G	A	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=65;PP=2736;SC=CAGGCCCCCCGCAGCCCCCCA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=138;WE=150531058;WS=150531040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	150531170	rs10749658	C	T	4279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=68;PP=2488;SC=TGGGTAACCACGCCCAGGACA;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=54;TCR=68;TR=122;WE=150531178;WS=150531160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	150531380	rs11204664	T	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=5;PP=225;SC=GCCCCCCTACTGTCCCTTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=150531388;WS=150531370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	150550019	rs11428742	T	TA	1965.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=1501;SC=TCTGCTCTCTTACAACACTAC;SOR=1.287;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=32;WE=150550027;WS=150550009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	150600181	rs2280078	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=547;SC=CTTGTAAATACGCTATCTCTA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=150600189;WS=150600171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	150636333	.	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=0.829;SC=GTTGTGATTCGTTTCACATCA;SOR=0.538;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=11;WE=150636341;WS=150636323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr1	150676485	rs12403609	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=160;SC=AAATATTGAATTTTATTCTAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=150676493;WS=150676475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	150686633	rs34593358	A	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=-1.290;SC=TTTAGACTGAATGCATTTCCA;SOR=0.420;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=17;WE=150686641;WS=150686623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	150771703	rs10788796	T	C	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=54;PP=2071;SC=CTGCCAAAACTGCATGGTTCA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=113;WE=150771711;WS=150771693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	150779755	rs6587522	C	T	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=82;PP=2965;SC=TAAGTTTTGCCTCCTGATCAT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=148;WE=150779763;WS=150779745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	150801466	rs3738483	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=664;SC=CTCTTTTTCTTAACTGAGGTT;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=150801474;WS=150801456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	150814993	.	G	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=1.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr1	150849071	rs66776757	ACC	A	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=38.31;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	150922939	rs143224912	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TGCAGATCACCTTTAGGCTCC;SOR=0.871;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=150922947;WS=150922929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	150936280	rs74681459	C	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=722;ReadPosRankSum=1.822;SC=TTTCTTTTAACATACTCTATA;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=41;WE=150936288;WS=150936270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr1	150938616	rs267739	G	A	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=19;PP=1132;SC=GGCAGCTGGAGTAATGGTTCA;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=150938624;WS=150938606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	150940625	rs267738	T	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=834;ReadPosRankSum=-0.115;SC=GAACCAACGCTCTACCTGGCG;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=58;WE=150940633;WS=150940615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr1	150944541	rs267737	A	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=TGCCTGCAAAACAGGGGGTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=150944549;WS=150944531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	150958836	rs267733	A	G	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.618;SC=GCTGTGGATGACATCACATCT;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=161;TCF=90;TCR=71;TR=84;WE=150958844;WS=150958826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
chr1	150969992	rs2925740	T	C	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=71;PP=2965;SC=GGGGAAGGACTCTGAGAGAAG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=154;WE=150970000;WS=150969982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	150970577	rs2925741	G	T	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=18;PP=1233;SC=CTGCAGCTGCGTTTCTGGGGA;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=150970585;WS=150970567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	150970836	rs1673160	T	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=522;SC=GCATGTGGACTTTTTTTTTCT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=150970844;WS=150970826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	150972538	rs708909	G	A	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=505;SC=CTACAACCCTGTGATGAATGG;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=150972546;WS=150972528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	150974162	rs771204	G	A	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=19;PP=977;SC=TAGCTCTGGAGCCCCTTGGGT;SOR=1.238;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=52;WE=150974170;WS=150974152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	150975108	rs771205	T	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=44;PP=1387;SC=AAAAGGGACTTGGCTGAGGGG;SOR=1.497;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=150975116;WS=150975098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	150990466	rs71090118	C	CAT	1881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=1086;ReadPosRankSum=-1.234;SC=CACTTACCAGCATTTAGCATT;SOR=1.545;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=38;WE=150990476;WS=150990456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
chr1	150990825	rs3738480	A	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=291;SC=CTGGGTACTTATGGCTTTGAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=150990833;WS=150990815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	150991285	rs6664220	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=702;SC=TTGGGAGGCCAAGGCGGGCGG;SOR=3.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=28;WE=150991293;WS=150991275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	150997940	rs3738478	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=691;SC=TTCTGGTGGTTGTGTGTGAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=150997948;WS=150997930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	150998221	rs55774303	AT	A	427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;MQRankSum=0.487;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr1	151001583	rs6691701	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=320;SC=TCCCCTTTCTGCTTTTTCCCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=151001591;WS=151001573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	151006539	rs3738476	C	A	4554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=64;PP=2727;SC=TGATTTCTGGCCTGAGTCAAG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=132;WE=151006547;WS=151006529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	151019180	rs6587553	A	G	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=60;PP=1899;SC=ACTGGATAAAAGGCCTTAGAA;SOR=1.413;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=90;WE=151019188;WS=151019170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	151026815	rs2902810	C	T	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=104;PP=2965;SC=AAAACAGATGCGAGACACCTT;SOR=1.123;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=171;WE=151026823;WS=151026805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	151028234	rs11204767	G	T	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=65;PP=2145;SC=GCTTCACTCCGCTGTCTGAGG;SOR=1.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=93;WE=151028242;WS=151028224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	151039576	.	GA	G	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9996;HP=17;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=18;MQ=55.86;NF=2;NR=0;PP=24;QD=13.5;SC=TTCTTTAATAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=151039584;WS=151039566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr1	151039609	rs3738481	A	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=3;PP=418;SC=CCTTTTTACCAGTATGTGGAG;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=151039617;WS=151039599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	151104598	rs4971005	A	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=252;SC=CCAGACCCAGAAGGCCCGAGG;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=151104606;WS=151104590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	151104950	rs10788800	G	A	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=53;PP=2797;SC=GAGGCCGTGGGCCGCTCCCTT;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=128;WE=151104958;WS=151104940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	151105824	rs4971006	C	G	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=34;PP=1264;SC=GCGGGAGCCCCGGAGTCTCGA;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=151105832;WS=151105814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	151108137	rs4971007	T	G	5528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=59;PP=2965;SC=CCACCTGGGGTCAGCACCTTC;SOR=1.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=100;TCR=59;TR=159;WE=151108145;WS=151108127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	151114882	rs11464219	C	CT	2793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=18;PP=2359;SC=TGTTAGCTTCCTGAGGCTGGG;SOR=1.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=151114890;WS=151114872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	151115017	rs74949844	G	A	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=961;ReadPosRankSum=0.060;SC=GGGGGTCCTGGGGAAAGGCGG;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=54;WE=151115025;WS=151115007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr1	151144086	rs74423006	T	C	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GGTGTTATGGTTTGGAGGATG;SOR=0.614;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=85;WE=151144094;WS=151144076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,99:0.51:196
chr1	151146186	rs7552226	C	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1118;SC=TAGAATGCTGCGTCACGAAGG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=151146194;WS=151146176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	151146276	rs7521416	T	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=164;SC=AGTGCGGGGCTGGGCGCTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=151146284;WS=151146266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	151149601	rs6656261	A	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=402;SC=AGTGGCTCACACCTGTAATTC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=151149609;WS=151149591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	151205303	rs7544947	A	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=676;SC=CAGGCCAGGCACGGTGGCTCA;SOR=4.332;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=151205311;WS=151205293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	151209063	rs12407426	C	T	5984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=84;PP=2965;SC=TAATGGATTACAGCCTCTTGA;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=110;TCR=84;TR=194;WE=151209071;WS=151209053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	151210789	rs7532935	C	T	6265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=101;PP=2965;SC=ATACAGATAACCAGTCACGTT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=200;WE=151210797;WS=151210779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	151212399	rs141190258	C	CCTT	2482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=10;PP=2067;SC=TGCCGGGCCTCCTAACTCTAT;SOR=2.564;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=38;WE=151212407;WS=151212389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	151227371	rs3811405	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=447;SC=GGTGGGGGCCAGGGGCTCATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=151227379;WS=151227361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	151237589	rs3216063	TC	T	2232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=23;PP=1491;SC=GCGGGTCCTTTCCCCCCCTCG;SOR=1.457;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=52;WE=151237597;WS=151237579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	151238222	rs2275900	G	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=522;SC=TCCTTTTGCCGCCTCTTCCCT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=151238230;WS=151238212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	151239051	rs7489	T	C	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=64;PP=1805;SC=TGGACACATCTGAGCCAGCCA;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=98;WE=151239059;WS=151239041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	151239570	rs10888408	C	T	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=52;PP=1674;SC=CCTCTGGCAGCGGCATGCTCC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=74;WE=151239578;WS=151239560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	151254036	rs11587537	T	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr1	151254041	rs3811406	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.20;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	151263782	rs10788803	A	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=270;SC=ATTAACATTAATATTTTGTTA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=151263790;WS=151263772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	151280400	rs1536617	C	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=413;SC=TCCAGGAAAGCAGCTGCTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=151280408;WS=151280390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	151288172	rs1056847	G	A	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=28;PP=1243;SC=ACAGCCCTGTGTCAGGGGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=151288180;WS=151288162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	151288391	rs1752379	A	G	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=2596;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CATCACCCACATCCTCATCCA;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=129;WE=151288399;WS=151288381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,152:0.99:154
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chr1	151337788	rs10788804	A	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=981;SC=TATAAGGAGGACCATAGTGGG;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=151337796;WS=151337778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	151341703	rs55906289	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CCCAGGCCACGCCTCTGTCCA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=13;WE=151341711;WS=151341693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	151341728	rs35093538	G	GC	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=739;SC=TGGAAGAGGCGCCCTGTGGAC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=151341736;WS=151341718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	151372138	rs7172	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=552;ReadPosRankSum=-0.520;SC=ACCGCATTCCGTCCACTCCCG;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=35;WE=151372146;WS=151372128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr1	151372770	rs2495390	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=619;SC=GGGGGACTGGAAGAGTTGTTG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=151372778;WS=151372760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	151373200	rs2495391	T	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=27;PP=1230;SC=CTAAGATGAATCTAAGGTGAA;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=151373208;WS=151373190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	151374025	rs4603	T	C	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1362;ReadPosRankSum=0.239;SC=CAGTTTCAAATCGCCACTGTC;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=94;WE=151374033;WS=151374015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,119:0.54:220
chr1	151377248	rs6667714	T	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=9;PP=986;SC=GTTCCCACCCTCACTCCACAC;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=151377256;WS=151377238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	151379250	rs2274535	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=0.346;SC=ACTTCAGGTCGGAAGGTTTCT;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=151379258;WS=151379240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	151380505	.	AAAG	A	269.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.97;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	151380727	rs2025899	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=302;ReadPosRankSum=2.114;SC=CTGTGGGGGAAAAAAAAAAAG;SOR=0.409;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=21;WE=151380735;WS=151380715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	151381320	rs3831142	GA	G	1256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=10.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.991;QD=11.75;ReadPosRankSum=-2.691;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr1	151384711	rs1887545	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=535;ReadPosRankSum=-0.390;SC=TTCATTAGTAAATTCTTTGTA;SOR=0.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=29;WE=151384719;WS=151384701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr1	151384733	rs3748550	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=673;ReadPosRankSum=0.850;SC=TCTTCCTGAGGGCAAAACTGC;SOR=0.955;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=39;WE=151384741;WS=151384723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr1	151395782	rs2274533	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=2.692;SC=GTTACCCACATGTAAATAAAT;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=151395790;WS=151395772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	151396037	rs2274534	A	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=545;ReadPosRankSum=0.424;SC=TCTGTAATAAAGCACAAAGAG;SOR=1.172;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=28;TCR=75;TR=44;WE=151396045;WS=151396027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,49:0.42:118
chr1	151400879	.	G	C	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=597;ReadPosRankSum=-1.031;SC=TAACAAACTGGGTACCTGGGG;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=55;WE=151400887;WS=151400869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr1	151400942	rs11204811	A	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CACCTATAACACATTCTCCCT;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=32;WE=151400950;WS=151400932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr1	151402045	rs6587577	A	G	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=863;ReadPosRankSum=0.906;SC=TCTGGATGCCAGTTTATTCCA;SOR=1.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=58;WE=151402053;WS=151402035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,69:0.57:120
chr1	151499635	rs2298168	C	T	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=367;SC=GAACACCTGCCTTACCTCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=151499643;WS=151499625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	151501698	rs2096232	A	G	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=83;SC=AGAAACTGCCAAACTACTTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=151501706;WS=151501688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	151501737	rs6678068	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=388;SC=TTTTATTCCCTTGGCAGTGTA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=151501745;WS=151501727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	151508061	rs11204842	A	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TGGTCCTCTCACCCATCCCCA;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=151508069;WS=151508051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	151512802	rs16833376	G	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=779;ReadPosRankSum=-0.436;SC=GCCAGACAGCGGGGTGGACAA;SOR=0.915;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=43;WE=151512810;WS=151512792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr1	151512895	rs3828054	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=971;ReadPosRankSum=2.230;SC=CCAGAGGACCAGGCGGCGGTA;SOR=0.977;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=76;WE=151512903;WS=151512885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,84:0.43:195
chr1	151518486	.	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.93;MQRankSum=2.369;QD=5.72;ReadPosRankSum=2.100;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	151535020	.	A	ATC	136	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=136;QD=46.6666666667;SC=TGTCTGAGCCATCTCTCTCTC;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=151535028;WS=151535010;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	151538507	rs11405272	T	TC	208.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;QD=23.19;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	151542099	rs3748610	G	T	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=27;PP=1363;SC=AGAAACTTGAGGGCTTCCCCT;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=151542107;WS=151542089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	151546931	rs6660238	A	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=626;SC=AGGGGCCTGCAGGTGGATCGA;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=151546939;WS=151546921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	151551320	rs3748608	G	A	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=23;PP=910;SC=GGGCTGGTTTGTAACCTGCCC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=151551328;WS=151551310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	151552301	rs3833527	TG	T	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=694;SC=GTCTTTGTCATGTCTTGCTGT;SOR=1.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=151552309;WS=151552291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	151553918	rs10494267	C	T	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=48;SC=ACCCTTGCTACAAGACACATG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=151553926;WS=151553911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	151554503	rs1891592	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=14;PP=1134;SC=ACTCTGGCTGTGCCATAAGCC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=151554511;WS=151554493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	151634512	rs3831367	A	AT	2072.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=13;PP=1536;SC=AAATGTATTGATTTTTTTCCC;SOR=2.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=51;WE=151634520;WS=151634502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	151634803	rs11808761	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=62;PP=1779;SC=AAGGAAGATAGATTAAATAAG;SOR=4.062;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=67;WE=151634811;WS=151634793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	151675618	rs1308150	T	C	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=39;PP=1834;SC=AAACGCTGGGTACAGAAGGCC;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=151675626;WS=151675608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	151700189	rs72506285	C	CCTG	1440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=963;SC=CAGGATTCTCCCAGAGTCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=23;WE=151700197;WS=151700179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	151740479	rs1196457	C	A	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=160;SC=GACACACCCCCATCTGCCTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=151740487;WS=151740476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	151740666	rs2495397	T	C	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=50;PP=2212;SC=TCGACTCTTCTTGGATATCCC;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=105;WE=151740674;WS=151740656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	5114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=45.67;SOR=2.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	151742553	.	GAGAGAGGGAGAGGGAGACCATGGGGAGAC	G	2975	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=62.11;NF=45;NR=19;PP=2975;QD=20;SC=AGACCGTGGAGAGAGAGGGAG;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=64;WE=151742596;WS=151742543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,64:0.96:67
chr1	151742565	rs140076465	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	6143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.81;QD=41.79;SOR=1.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	151742588	.	C	G	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=61.41;NF=85;NR=43;PP=2965;QD=20;SC=GAGACGGAGACGGAGAGGGAG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=128;WE=151742596;WS=151742543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr1	151747043	rs1123855	C	T	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=74;PP=2965;SC=GCAATGCCAGCGAGGCTCAAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=150;WE=151747051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	151747733	rs1781421	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=880;SC=ACTTTAAAGACATTCCTTTGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=151747741;WS=151747723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	151747799	rs1781419	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=17;PP=1025;SC=GGTTTCTGAGGAAGAAAAAGT;SOR=1.067;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=43;WE=151747807;WS=151747789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	151748425	rs3923394	C	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=38;PP=1127;SC=TTGCTGCTTTCAGAAAGAACC;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=151748433;WS=151748415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	151751081	rs1996729	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=845;SC=AGACTGAGAAGGCATTCCTTC;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=151751089;WS=151751071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	151754112	rs35077383	T	C	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=50;PP=1580;SC=CACCCAAAGCTAGTATAACTA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=151754120;WS=151754102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	151780177	rs3828057	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=-2.803;SC=GAAGTCCGCTCATTCTTCCTG;SOR=1.059;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=18;WE=151780185;WS=151780167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr1	151783688	rs939595	A	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=315;SC=TCTAACAGAGAGTGGTACTCC;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=151783696;WS=151783678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	151789588	rs151171878	C	CTGTGTGTG,CTGTGTG	514.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.4992,0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=6,6;NR=0,0;PP=17,79;SC=TAAGGAGACACTGTGTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6,6;WE=151789596;WS=151789578;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:10
chr1	151789609	rs56273334	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.65;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	151789609	.	CGC	TGT	564	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=26;MQ=59.12;NF=14;NR=2;PP=564;QD=38.5917421789;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGCGCGC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=16;WE=151789619;WS=151789597;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,16:0.64:25
chr1	151789611	rs55841824	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.65;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	151789647	rs12144914	T	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=14;PP=1197;SC=CACACATGCATGCATACACAT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=151789655;WS=151789637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	151811226	rs6673556	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=9;PP=524;SC=GAGGCAGCGAGCAGGTCGCGG;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=151811234;WS=151811216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr1	151820324	rs6587625	T	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=30;PP=1370;SC=AACCAGAGAGTCCACGGGGAT;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=151820332;WS=151820314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	151825991	rs7556386	G	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=569;ReadPosRankSum=-1.237;SC=CCTCAAGAAGGCCTCTGTGGT;SOR=0.570;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=40;WE=151825999;WS=151825981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr1	151862661	rs1060870	G	A	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=44;PP=2133;SC=GATTATAGGCGTGAGCCACAG;SOR=1.068;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=110;WE=151862669;WS=151862651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	151867560	rs3762427	G	A	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=27;PP=1520;SC=TCCAGGAGCCGTCTTCACATT;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=151867568;WS=151867550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	151881885	rs3748805	A	C	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=39;PP=1030;SC=TACTGGCGGCAGGCACAGAGC;SOR=1.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=151881893;WS=151881875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	152005327	rs35135981	TA	T	972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=705;ReadPosRankSum=1.356;SC=ATTACACCTTTATATCGCATC;SOR=0.450;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=21;WE=152005335;WS=152005317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr1	152009530	rs3811422	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=10;PP=437;SC=CTCAGACAGCTTCCGCGCCTG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=152009538;WS=152009520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	152059762	.	C	T	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=744;ReadPosRankSum=-0.123;SC=AAGGAAGCATCCTCTTTTCTT;SOR=0.992;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=42;WE=152059770;WS=152059752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr1	152083325	rs11803731	A	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1090;ReadPosRankSum=0.310;SC=TGCTCCCGCAATGGGGGCCTG;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=69;WE=152083333;WS=152083315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr1	152085505	rs2515663	A	C	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=52;PP=1633;SC=ATTACTGTCAAGATCCAGAAG;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=152085513;WS=152085495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	152185500	rs12726613	C	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=584;ReadPosRankSum=0.630;SC=TCATAGATGACTTTCCTATTT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=25;WE=152185508;WS=152185490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr1	152185750	rs12729662	G	A	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=5.549;SC=CATGTTGGCCGTAGCTGGAAG;SOR=0.627;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=167;TCF=64;TCR=103;TR=116;WE=152185788;WS=152185740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,156:0.92:169
chr1	152191709	rs6662450	C	G	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGAAGAACAACTTGTGCCAGA;SOR=0.901;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=198;TCF=86;TCR=112;TR=82;WE=152191717;WS=152191699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,91:0.38:237
chr1	152191879	rs10788828	G	A	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1518;ReadPosRankSum=-1.250;SC=AGCTAGATCCGTGTTGTTCAC;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=94;WE=152191887;WS=152191869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,111:0.50:222
chr1	152192114	rs7520249	C	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.180;NF=18;NR=42;PP=1041;ReadPosRankSum=1.062;SC=GGACCCATGTCGGCCGCGACT;SOR=1.000;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=140;TCF=48;TCR=92;TR=60;WE=152192122;WS=152192104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,73:0.44:167
chr1	152192293	rs7520375	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.645;NF=23;NR=10;PP=546;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AGGAATGACCCGAGCTAGATC;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=33;WE=152192301;WS=152192283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	152192555	rs41266134	T	C	3884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=61;PP=2461;ReadPosRankSum=0.618;SC=ATGCTGACCATAGCTGGAAGA;SOR=0.777;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=286;TCF=162;TCR=124;TR=146;WE=152192563;WS=152192545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,176:0.53:329
chr1	152192631	rs6587647	C	T	3748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=78;PP=2489;ReadPosRankSum=1.613;SC=CCGTGTTGTCCGTGGCCGGAG;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=333;TCF=168;TCR=165;TR=160;WE=152192639;WS=152192621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,172:0.47:368
chr1	152192687	rs6587648	T	C	10143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=145;NR=160;PP=2965;SC=AGAGGAATGCTCTGAGCTAGA;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=307;TCF=145;TCR=162;TR=305;WE=152192695;WS=152192677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr1	152192978	rs6587649	T	C	9079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=145;PP=2965;SC=AGATCCATGTTGTCCCTGGCT;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=294;TCF=148;TCR=146;TR=293;WE=152192986;WS=152192968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr1	152193052	rs6587650	A	G	7482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=126;PP=2965;SC=AGCCAGACTCATGTTGCCCAA;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=101;TCR=126;TR=227;WE=152193060;WS=152193042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	152193121	rs6587651	G	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1383;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGTAACTTGAGCCAGACCCGT;SOR=1.174;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=150;TCF=60;TCR=90;TR=76;WE=152193129;WS=152193111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr1	152193291	rs6587652	G	T	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=43;PP=2131;ReadPosRankSum=0.755;SC=GATCTGTGTCGTTCACCCCTA;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=162;TCR=89;TR=121;WE=152193299;WS=152193281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,136:0.49:280
chr1	152193544	rs7535536	A	G	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,100:0.42:236
chr1	152193547	rs6587653	G	A	8451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.81;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	152193851	rs11204937	C	T	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1258;ReadPosRankSum=-1.278;SC=GATTTTATTACGAGCCTGAAC;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=77;WE=152193859;WS=152193837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
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chr1	152195728	rs34061715	AT	A	1656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=49;PP=971;SC=GAGTTTAGGCATTTTTTTTTT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=53;WE=152195738;WS=152195717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	152276149	rs77422831	C	T	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.846;NF=49;NR=44;PP=1617;ReadPosRankSum=-1.026;SC=CTGCTCGTGGCGGGATCCTTG;SOR=0.616;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=172;TCF=94;TCR=78;TR=93;WE=152276157;WS=152276139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,109:0.54:201
chr1	152276671	rs7518080	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=26.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQRankSum=-7.203;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.693;SOR=4.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,18:0.20:91
chr1	152276772	rs72697000	C	A	3345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.650;NF=76;NR=56;PP=2050;ReadPosRankSum=1.199;SC=TCCTGCTTGTCCTGGGCCCCG;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=267;TCF=151;TCR=116;TR=132;WE=152276780;WS=152276762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,163:0.50:323
chr1	152276871	rs3126066	A	G	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.017;NF=55;NR=67;PP=1925;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GCCTGGAGCCATCTCCTGATT;SOR=0.587;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=245;TCF=108;TCR=137;TR=122;WE=152276879;WS=152276861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,142:0.49:291
chr1	152276889	rs3126067	A	G	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.057;NF=44;NR=62;PP=1694;ReadPosRankSum=0.003;SC=ATTGTTCGTCATTACGAGTTT;SOR=0.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=89;TCR=128;TR=106;WE=152276897;WS=152276879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,119:0.47:254
chr1	152277168	rs3091276	A	G	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.515;NF=73;NR=55;PP=1907;ReadPosRankSum=0.667;SC=GCCCATGGGCAGACTCAGACT;SOR=0.607;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=240;TCF=140;TCR=100;TR=128;WE=152277176;WS=152277158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,120:0.52:232
chr1	152277345	rs2065956	C	T	4555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.063;NF=85;NR=100;PP=2769;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TATCACTGGCCTGACTACCAC;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=383;TCF=179;TCR=204;TR=185;WE=152277353;WS=152277335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,216:0.48:452
chr1	152277396	rs6681433	T	C	3483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.465;NF=59;NR=81;PP=2300;ReadPosRankSum=1.116;SC=CAGATGAAGCTTGTCCACGCG;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=295;TCF=119;TCR=176;TR=140;WE=152277404;WS=152277386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,159:0.46:342
chr1	152277717	rs9436066	C	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=35.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQRankSum=-1.948;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.932;SOR=1.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr1	152278662	.	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;ClippingRankSum=0.000;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=33.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQRankSum=-4.368;QD=0.25;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=4.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,23:0.07:316
chr1	152278670	rs150427834	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=38.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQRankSum=-4.193;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.668;SOR=5.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,25:0.07:343
chr1	152278689	rs57672167	C	A	7228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-4.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.302;NF=220;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TGTCCTGGCTCACACTGGATC;SOR=0.692;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=493;TCF=336;TCR=157;TR=319;WE=152278697;WS=152278679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,284:0.62:459
chr1	152278762	.	A	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.468;ClippingRankSum=0.000;DP=911;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQRankSum=-8.713;QD=0.79;ReadPosRankSum=3.515;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:828,81:0.09:909
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chr1	152278770	.	ATG	A	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DP=945;ExcessHet=3.0103;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQRankSum=-8.521;QD=0.44;ReadPosRankSum=3.887;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:871,72:0.08:943
chr1	152278775	.	T	A	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DP=957;ExcessHet=3.0103;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=-9.050;QD=0.28;ReadPosRankSum=3.717;SOR=1.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:883,70:0.07:953
chr1	152278788	.	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DP=964;ExcessHet=3.0103;FS=5.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=-10.077;QD=0.04;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:895,67:0.07:962
chr1	152278814	rs2184952	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=824;ExcessHet=3.0103;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-18.396;QD=0.38;ReadPosRankSum=2.128;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:715,107:0.13:822
chr1	152278856	rs11582087	T	G	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQRankSum=2.690;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:334,106:0.24:440
chr1	152279019	rs57670307	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQRankSum=-9.996;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.901;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,71:0.22:317
chr1	152279729	rs3126072	C	T	4087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.145;NF=75;NR=80;PP=2411;ReadPosRankSum=2.508;SC=TGCGAGTGTCCAGAGCTGTCG;SOR=0.657;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=322;TCF=166;TCR=156;TR=155;WE=152279737;WS=152279719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,194:0.50:388
chr1	152279841	rs3126074	G	C	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.42;MQRankSum=-4.757;NF=30;NR=46;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TGGATCCTGAGTGCCCATGGG;SOR=0.506;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=76;WE=152279849;WS=152279831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr1	152280736	rs78974621	T	C	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=6.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-9.681;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.746;SOR=1.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:449,89:0.17:538
chr1	152280759	rs2338554	A	G	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=6.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-9.853;QD=5.49;ReadPosRankSum=5.689;SOR=1.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,106:0.21:516
chr1	152280782	rs2184953	A	G	8282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-4.949;QD=19.49;ReadPosRankSum=2.365;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,268:0.63:425
chr1	152280788	rs66954353	T	G	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=3.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-6.913;QD=4.87;ReadPosRankSum=4.343;SOR=1.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,117:0.28:416
chr1	152280864	rs2184954	A	G	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.588;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.801;NF=52;NR=70;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GGCTGTGATGAGACCCTGAGT;SOR=0.380;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=189;TCF=73;TCR=116;TR=122;WE=152280872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,127:0.65:195
chr1	152280900	rs74129452	T	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.460;NF=31;NR=24;PP=718;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CCGATTGCTCTTGGTGGGACC;SOR=0.697;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=55;WE=152280908;WS=152280890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,57:0.30:188
chr1	152281007	rs7512553	AA	GG	3764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.494;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,108:0.31:351
chr1	152281039	rs7522925	G	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1277;ReadPosRankSum=-1.998;SC=AGTGCTGGGCGCAGACTGTCC;SOR=0.711;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=285;TCF=139;TCR=146;TR=93;WE=152281047;WS=152281029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,108:0.33:329
chr1	152281228	rs7546186	C	G	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.883;NF=38;NR=53;PP=1046;ReadPosRankSum=2.382;SC=CTCACTGTCACTGGCCTGACT;SOR=1.031;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=308;TCF=142;TCR=166;TR=91;WE=152281236;WS=152281218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,88:0.26:336
chr1	152281523	rs80059102	A	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-6.966;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,34:0.18:189
chr1	152281534	rs113544881	A	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=16.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-7.759;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.496;SOR=1.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,29:0.16:185
chr1	152281621	rs34806697	T	C	3449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.761;NF=79;NR=65;PP=1963;ReadPosRankSum=1.025;SC=ACTGGATCCCTGGTTCCTGCT;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=293;TCF=158;TCR=135;TR=144;WE=152281629;WS=152281611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,164:0.50:331
chr1	152281690	rs12407748	C	T	4910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.851;NF=102;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GCTGTCGGCCCGAGAGGAAGC;SOR=0.608;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=383;TCF=187;TCR=196;TR=197;WE=152281698;WS=152281680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,226:0.51:447
chr1	152281948	rs12405241	G	A	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.953;NF=40;NR=34;PP=1171;ReadPosRankSum=0.439;SC=CTCTTGGGACGCTGAGTGCCT;SOR=0.573;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=159;TCF=90;TCR=69;TR=74;WE=152281956;WS=152281938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,87:0.47:185
chr1	152282267	rs12405278	G	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=796;ReadPosRankSum=-1.469;SC=TCTTGTCTGCGCCCAGTGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=49;WE=152282275;WS=152282257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr1	152282311	rs12407807	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=5;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=652;ReadPosRankSum=0.462;SC=CTGCTGGTGGCGGGATCCATG;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=37;WE=152282319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr1	152282917	rs11204978	G	T	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.042;NF=56;NR=50;PP=1600;ReadPosRankSum=1.176;SC=ACCGTCTTGGGATGCTGAGTG;SOR=0.506;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=106;WE=152282925;WS=152282907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,126:0.52:244
chr1	152283236	rs11581433	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.879;NF=25;NR=35;PP=822;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GAAGCTTGTCTGTGCCCAATG;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=60;WE=152283244;WS=152283226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,66:0.42:157
chr1	152283283	rs11586631	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.893;NF=32;NR=28;PP=995;ReadPosRankSum=1.140;SC=CTGCTGGTGGCGGGATCCATG;SOR=0.682;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=60;WE=152283291;WS=152283273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,59:0.41:145
chr1	152283975	rs66831674	A	G	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.099;NF=64;NR=45;PP=1561;ReadPosRankSum=0.632;SC=GCCCATGGGCAGACTCAGACT;SOR=0.884;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=238;TCF=135;TCR=103;TR=109;WE=152283983;WS=152283965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,108:0.46:237
chr1	152284854	rs3120653	A	G	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.92;MQRankSum=-1.119;NF=41;NR=27;PP=998;ReadPosRankSum=0.446;SC=TGTCCTGACCATCTTGGGATG;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=68;WE=152284862;WS=152284844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,87:0.44:198
chr1	152285099	rs74129461	C	T	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.002;NF=48;NR=66;PP=1826;ReadPosRankSum=0.580;SC=TCTGAGTCTTCTGAATGTCCC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=228;TCF=98;TCR=130;TR=114;WE=152285107;WS=152285089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,131:0.48:275
chr1	152285930	rs11584340	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1240;ReadPosRankSum=0.652;SC=GCAGAGTCAGGCTGTTCATGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=87;WE=152285938;WS=152285920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,103:0.50:206
chr1	152286002	rs2011331	T	C	2736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.547;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1508;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CGGCCACGTGTGGACTCTTGG;SOR=0.497;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=215;TCF=128;TCR=87;TR=110;WE=152286010;WS=152285992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,130:0.52:250
chr1	152286032	rs11588170	C	T	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1793;ReadPosRankSum=0.127;SC=TGTCTCAGCCCAGCCTTTCCG;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=129;TCR=118;TR=121;WE=152286040;WS=152286022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,150:0.53:285
chr1	152286367	rs41267154	C	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=477;ReadPosRankSum=0.782;SC=GTGTCTGGAGCCATCTCTTGA;SOR=0.877;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=30;WE=152286375;WS=152286357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr1	152287341	rs34224823	CT	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	152323132	rs12568784	G	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=707;ReadPosRankSum=0.890;SC=TGTTGACCATGAAAGGTGAGA;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=42;WE=152323140;WS=152323122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr1	152325443	.	C	G	4909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.993;NF=84;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TCTGGCTCTTCATGTTGAGAT;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=360;TCF=170;TCR=190;TR=178;WE=152325451;WS=152325433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,211:0.51:417
chr1	152325732	rs12022217	G	A	4273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.906;NF=87;NR=86;PP=2888;ReadPosRankSum=-1.475;SC=AGCCCCCTGAGTGCACTTCAC;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=380;TCF=199;TCR=181;TR=173;WE=152325740;WS=152325722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,194:0.45:433
chr1	152327469	rs76514540	C	T	4432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.227;NF=33;NR=87;PP=2488;ReadPosRankSum=-0.323;SC=AGCCAGATGACTGACTTGAGC;SOR=1.097;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=359;TCF=155;TCR=204;TR=120;WE=152327477;WS=152327459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,164:0.37:442
chr1	152327502	rs138997916	A	G	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=51.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-9.644;QD=5.61;ReadPosRankSum=-5.501;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,63:0.19:340
chr1	152328411	rs6679449	A	G	3793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.873;NF=103;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GTTGGCCATAACTAGACTGAC;SOR=1.119;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=470;TCF=269;TCR=201;TR=159;WE=152328419;WS=152328401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,160:0.33:489
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chr1	152384759	rs7521839	A	G	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=965;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AGGCTCCATAATCAACCTCAG;SOR=0.857;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=67;WE=152384767;WS=152384749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr1	152384833	rs1923492	T	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=38;PP=1173;SC=TGTTTTTAGTTTTCCTTTGTC;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=152384841;WS=152384823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	152484129	rs2105117	G	A	8634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=147;PP=2965;SC=CCTCCCCAGTGTTCAGCCCCA;SOR=0.817;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=130;TCR=147;TR=277;WE=152484137;WS=152484119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr1	152487979	rs2282296	C	T	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=29;PP=1109;SC=CCTCCTGCTGCGGCTCCGGCA;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=152487987;WS=152487969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	152488063	rs1053588	C	T	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=30;PP=1050;SC=GGAGACGCCGCCGACAGCGGA;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=152488071;WS=152488053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	152552285	rs512208	C	A	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.390;NF=48;NR=26;PP=1101;ReadPosRankSum=0.197;SC=AGGGCCACAGCCCCCAGAGCT;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=74;WE=152552293;WS=152552275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr1	152552461	rs4845313	C	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=-1.656;SC=ATTTGTTAGTCCAAAATCTAC;SOR=1.659;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=22;WE=152552469;WS=152552451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr1	152636843	rs9793541	A	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=426;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CCGGCACCAGAGCCCCGATTG;SOR=0.965;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=24;WE=152636851;WS=152636833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	152681543	rs1332496	T	C	6905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=77;PP=2965;SC=TTATCGAAATTCCACCAAGAT;SOR=1.443;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=149;TCR=78;TR=224;WE=152681551;WS=152681533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr1	152681680	rs6143428	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	9660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=7;NR=65;PP=2900;SC=GCTGTGGCTCCAGCTCTGGGG;SOR=2.170;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=152;TCF=12;TCR=140;TR=72;WE=152681688;WS=152681669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr1	152691943	rs1332499	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=372;ReadPosRankSum=1.693;SC=AAACCTTCCTGGTTTTACAGT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=26;WE=152691951;WS=152691933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	152692074	rs1332500	G	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=985;ReadPosRankSum=0.221;SC=GGGCAGGGTAGCAATGGTGCC;SOR=0.535;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=57;WE=152692082;WS=152692064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,65:0.44:148
chr1	152692472	rs873775	A	C	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=53;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GTACTGTGTCACTGACCCATG;SOR=0.719;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=217;TCF=110;TCR=107;TR=102;WE=152692480;WS=152692462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,113:0.46:246
chr1	152692588	rs944682	A	G	3213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=1816;ReadPosRankSum=-0.768;SC=ACACAGGATCATCTGGCTGCT;SOR=0.511;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=253;TCF=117;TCR=136;TR=128;WE=152692596;WS=152692578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,158:0.51:307
chr1	152692781	rs3814350	G	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.917;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AGAATGCACTGCCCCGCTACC;SOR=1.549;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=14;WE=152692789;WS=152692771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr1	152692862	rs3814351	G	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=-1.368;SC=TCATCACTTTGCCTCTGTGCT;SOR=1.688;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=152692870;WS=152692852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	152732106	rs17612167	A	T	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=813;ReadPosRankSum=0.100;SC=TGCCGCTCCAACAGTGCTGCG;SOR=0.747;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=90;TCR=41;TR=56;WE=152732114;WS=152732096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,75:0.46:164
chr1	152732436	rs4845480	G	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=838;ReadPosRankSum=0.201;SC=AGTGCGAAGCGTCACAACCTG;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=41;WE=152732444;WS=152732426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr1	152733301	rs4329520	T	A	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=42;PP=1595;ReadPosRankSum=0.510;SC=CCCAGAACCATGCATAAGTCT;SOR=0.948;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=235;TCF=131;TCR=104;TR=104;WE=152733309;WS=152733291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,128:0.47:274
chr1	152749091	rs41268480	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CCACCACAGACGGCGTAGGTC;SOR=2.303;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=22;WE=152749099;WS=152749081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	152759950	rs11205106	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.850;NF=13;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=0.629;SC=CTCTGGGGGCAGCTGTGGCTC;SOR=0.532;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=28;WE=152759958;WS=152759948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr1	152760106	rs56313719	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.126;NF=12;NR=13;PP=377;ReadPosRankSum=-0.777;SC=AGGGGGCAGCGGCCAGCACTC;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=25;WE=152760114;WS=152760096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr1	152777868	rs36107483	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.716;NF=9;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=-0.083;SC=ACTTTGGGGGACACTTTGGGG;SOR=0.908;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=26;WE=152777876;WS=152777858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr1	152777964	rs17624493	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.978;SC=TCTTGGTGGCGGATTCAGGAG;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=16;WE=152777972;WS=152777954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr1	152882952	.	G	C	157	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=21;MQ=42.34;NF=8;NR=4;PP=157;QD=15.9809343789;SC=GGAGCTCCCAGAGCAGCAGGA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=12;WE=152882960;WS=152882942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,12:0.32:37
chr1	152944594	rs3170863	C	T	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=68;PP=2155;SC=CCTCCAAGAGCAAACAGAAGT;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=48;TCR=68;TR=116;WE=152944602;WS=152944584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	152957573	rs1611760	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=492;SC=AATGGGGGAGTTAAGGGAGAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=152957581;WS=152957563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	152957832	rs1611762	C	A	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=38;PP=1736;SC=AGCCCTGCCACCCCAAGGTGC;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=74;WE=152957840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	152957887	rs1611764	G	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=41;PP=2336;SC=CCAGCCCAAGGTTCCAGAGCC;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=116;WE=152957895;WS=152957877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	152975495	rs2075739	G	A	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=30;PP=1925;SC=ATCCTTTGAAGCATGAGTTCT;SOR=1.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=152975503;WS=152975485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	152975715	.	C	T	352	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=53.96;NF=5;NR=13;SC=CTGAGCCAGGCTGTACCAAGG;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=18;WE=152975723;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr1	152975739	.	T	A	170	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=27;MQ=53.95;NF=2;NR=8;PP=170;QD=20.4771212547;SC=CTGAGCCAGGTTGTACCAAGG;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=10;WE=152975747;WS=152975729;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,10:0.30:33
chr1	152975763	rs1977734	C	A	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.693;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.416;NF=22;NR=11;PP=671;ReadPosRankSum=-1.179;SC=CTGAGCCAGGCTGTACCAAGG;SOR=0.111;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=33;WE=152975771;WS=152975753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,43:0.93:46
chr1	152975829	rs1970328	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=27;PP=1720;SC=AGGTCCCTGAACCAGGCAGCA;SOR=1.289;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=75;WE=152975837;WS=152975819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	152975941	rs1055935	C	G	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=56;PP=2417;SC=CTACACAAAGCTACCAGAGCC;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=118;WE=152975949;WS=152975931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	153004721	rs1334848	A	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=566;SC=GAAAGAACATAGCTTTTTAAG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=153004729;WS=153004711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	153004778	rs3820141	C	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=23;PP=1130;SC=TTATTCTCTGCTTAAATCATC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=153004786;WS=153004768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	153004809	rs3181787	T	C	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=29;PP=1457;SC=CCAGGACCAGTCACTGTTGCA;SOR=0.867;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=65;WE=153004817;WS=153004799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	153004848	rs3795381	T	C	5030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.52;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	153004853	rs3795382	C	T	3572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.03;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr1	153004983	rs12195	C	T	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=30;PP=2069;SC=CCAAAGTGCCCGAGCCCTGCC;SOR=1.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=90;WE=153004991;WS=153004973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	153005156	rs2711	C	T	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=90;PP=2738;SC=TCCCATTCTGCGTATGAGTCC;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=135;WE=153005164;WS=153005146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	153122310	rs510277	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=591;SC=AGTCCTGGGAGTAAGAAGAGC;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=153122318;WS=153122300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	153190590	rs35221508	G	GT	399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=0.651;SC=CGAATCTTGTGTTTTTTTCAG;SOR=0.469;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=10;WE=153190598;WS=153190580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	153233488	rs150026164	C	CGGCGGT	921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=3.271;NF=2;NR=25;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.904;SC=AGACCTCTGGCGGCGGTGGCG;SOR=0.836;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=27;WE=153233496;WS=153233478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr1	153233510	rs6661601	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.765;NF=6;NR=19;PP=462;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TGGCGGCGGCAGCGGCGGTGG;SOR=0.757;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=25;WE=153233518;WS=153233500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	153233701	rs1143390	A	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=0.887;SC=AGTACTCCGGAGGCGGCGGCT;SOR=1.091;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=10;WE=153233709;WS=153233691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr1	153233991	rs11275959	A	ACTCTGGCGGCGG	1488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=10;PP=2965;SC=GTCTGCGGCTACTCTGGCGGC;SOR=0.756;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=153233999;WS=153233981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	153234295	rs12043009	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=539;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GTGGCTCCGGGAGTGGCAAGG;SOR=0.616;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=36;WE=153234303;WS=153234285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr1	153279462	rs66966700	TAAG	T	1591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.525;NF=19;NR=9;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GCGCAGAAAATAAGAGCCACA;SOR=0.547;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=28;WE=153279472;WS=153279452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr1	153283004	rs821423	C	T	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TGAAAGCACTCGGATGGGTTT;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=80;WE=153283012;WS=153282994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,99:0.51:195
chr1	153283179	rs3006473	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=1.300;SC=TGTGGACGGCAGCCCTGGAAG;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=15;WE=153283187;WS=153283169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr1	153314153	rs3006448	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=246;ReadPosRankSum=-1.944;SC=CTCGCCTTTCCCAAGAAGTGG;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=16;WE=153314161;WS=153314143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	153314347	rs3006449	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=1.834;SC=AGCCCCTGCACAGCTGATGGA;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=4;WE=153314355;WS=153314337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	153315467	rs5777858	T	TAAG	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=291;ReadPosRankSum=-0.400;SC=ATGAGAAGGATAAGACAGCAG;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=8;WE=153315475;WS=153315457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	153315579	rs3014863	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.812;NF=30;NR=12;PP=690;ReadPosRankSum=0.166;SC=TCTTAGTGCCAAAGAAGGCAA;SOR=0.895;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=42;WE=153315587;WS=153315569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr1	153315784	rs1865234	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-0.980;SC=GGACTGAAGCTATGTTCACTA;SOR=0.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=18;WE=153315792;WS=153315774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	153320334	rs3006457	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.007;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=791;ReadPosRankSum=-0.768;SC=CTCGGTTGCTTTTTGGCCCAG;SOR=1.682;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=46;WE=153320342;WS=153320324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr1	153320372	rs3006458	T	G	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=1078;ReadPosRankSum=1.220;SC=CAGGCCTGGATACCCAGAGCA;SOR=1.326;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=62;WE=153320380;WS=153320362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,73:0.51:144
chr1	153320581	rs3006459	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=0.076;SC=CAGCACCTGCTTCAGTCTTCT;SOR=0.425;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=153320589;WS=153320571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	153410822	rs10888561	C	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.537;SC=TTTCAAAAAGCCTTCAGGAAA;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=18;WE=153410830;WS=153410812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	153412392	rs3006428	T	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.735;NF=20;NR=26;PP=603;ReadPosRankSum=-1.553;SC=AAAAGGCAAATAGGCAGGTGA;SOR=0.472;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=46;WE=153412400;WS=153412382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,49:0.36:136
chr1	153431406	rs3014837	C	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=590;ReadPosRankSum=1.192;SC=GGCTTGGCTTCTCAATCTTGT;SOR=0.430;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=36;WE=153431414;WS=153431396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	153509892	rs2248745	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=823;ReadPosRankSum=2.748;SC=TCATCAAGTCATCGATGCTGC;SOR=0.556;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=64;WE=153509900;WS=153509882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr1	153517092	rs138957616	GC	G	1763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.538;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=1427;ReadPosRankSum=1.769;SC=TGTGGGAAATGCCCCACGTGG;SOR=1.038;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=44;WE=153517100;WS=153517082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr1	153517172	rs1050923	T	C	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=1938;ReadPosRankSum=-1.794;SC=GCTCCTTTAGTTCTGACTTGT;SOR=0.666;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=235;TCF=131;TCR=104;TR=115;WE=153517180;WS=153517162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,125:0.47:265
chr1	153520138	rs41265162	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=0.040;SC=CGACAGCCAGCGCACCCCCTG;SOR=2.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=153520146;WS=153520128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr1	153520203	rs41265164	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=386;ReadPosRankSum=-1.814;SC=TGAAGTACTCGTGGCAGTAGA;SOR=1.011;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=32;WE=153520211;WS=153520193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr1	153520400	rs56089062	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=2.000;SC=ACCTCCCTCCTTCCTCTCCCA;SOR=1.071;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=11;WE=153520408;WS=153520390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	153520714	.	T	TC	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=69;QD=33.0;SC=TCCAGCCCCCTCCCTTGCTGT;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=3;WE=153520722;WS=153520704;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,3:0.23:13
chr1	153520784	rs28718953	C	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr1	153520790	rs28594230	G	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr1	153520804	rs28452456	A	G	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GAGGGGACGGACACTCTGACT;SOR=0.631;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=33;WE=153520812;WS=153520774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr1	153520954	rs36022742	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=642;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CTCCAGAGGCCTGGCCATCCT;SOR=1.064;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=44;WE=153520962;WS=153520944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr1	153521018	rs28548347	A	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.483;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=308;ReadPosRankSum=-1.070;SC=CCAGCCCCCCAGCTCACCTCT;SOR=2.147;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=23;WE=153521026;WS=153521008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr1	153533898	rs8401	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CCATGGCAGGAAGTCAAGAGT;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=24;WE=153533906;WS=153533888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr1	153534027	rs1047325	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=-1.219;SC=CTCATCCAGGCTGCCCATCAG;SOR=0.876;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=22;WE=153534035;WS=153534017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr1	153587256	rs11548102	A	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TGCAGAGATGAGGACAGGTGC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=153587264;WS=153587246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	153587308	rs11548104	C	T	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=12;PP=946;SC=CAAGTTTTATCTCCAGGCCCA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=153587316;WS=153587298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	153587702	rs41265178	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=277;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GGGTGTGCTCCGTCCATACCG;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=19;WE=153587710;WS=153587692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr1	153588208	rs9792963	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=337;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TGCAGGGCAAGGCCAAGGTGA;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=153588216;WS=153588198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	153588279	rs9792967	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=570;ReadPosRankSum=1.069;SC=TGTGGGAGCAGAAAGGCCAGG;SOR=1.140;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=38;WE=153588287;WS=153588269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr1	153600778	rs3806233	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=264;ReadPosRankSum=1.229;SC=TTCCAGCCCAGGAGACAGAGG;SOR=0.169;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=13;WE=153600786;WS=153600768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	153604029	rs1046379	C	T	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=63;PP=2304;SC=CCCTCAAGACCTTTGAGGAGG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=153604037;WS=153604019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	153604112	rs1046381	G	A	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=39;PP=1983;SC=CCACCCCCTTGCCTCTGACTC;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=153604120;WS=153604102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	153609039	rs4845557	T	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=27;PP=1464;SC=TACGTATTGTTCTTTGTAGAT;SOR=1.068;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=153609047;WS=153609029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	153614712	rs7549308	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=503;ReadPosRankSum=-1.836;SC=AACACCTTTTCTTCCAGAAGA;SOR=0.928;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=37;WE=153614720;WS=153614702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr1	153617510	.	C	CT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=16;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=2;NR=0;PP=30;QD=16.5;SC=GTAACTGTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=153617518;WS=153617500;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr1	153632139	rs6692298	G	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=525;ReadPosRankSum=1.120;SC=TTGGGGAAAGGGAAATTCACT;SOR=1.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=35;WE=153632147;WS=153632129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr1	153635425	rs3795396	G	A	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=413;SC=ACCATATTCCGCTTTGCCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=153635433;WS=153635418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	153636472	rs4515830	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CTACTACTACTAGTAAATAAG;SOR=1.981;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=14;WE=153636480;WS=153636462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	153636860	rs4351684	A	G	3903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=47;PP=2525;SC=AAATGGTTAGAGAGGGACTCA;SOR=1.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=119;WE=153636868;WS=153636850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	153637617	rs3862047	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=209;ReadPosRankSum=-1.174;SC=ATAGCAACAAGCTAAGTAAAC;SOR=0.252;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=16;WE=153637625;WS=153637607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	153640827	rs7536700	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=373;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TTGTGGATTTCAGGCTCTGTT;SOR=0.319;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=28;WE=153640835;WS=153640817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr1	153642835	rs6663046	G	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=499;SC=ACTTACACTTGTCCCCATTCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=153642843;WS=153642825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	153656352	rs9662664	T	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=325;ReadPosRankSum=-1.703;SC=GGAGAACCAATAGCAGAGGAG;SOR=0.459;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=18;WE=153656360;WS=153656342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr1	153658724	rs10908420	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=394;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CCCTCGGGGACGCAAGGGAGA;SOR=1.126;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=26;WE=153658732;WS=153658714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr1	153660514	rs11295572	AC	A	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=0.163;SC=CAGCTCCTCTACCCCCCCAAT;SOR=0.197;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=153660522;WS=153660504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	153661374	rs34402066	CG	C	1400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.14;MQRankSum=0.882;NF=20;NR=13;PP=1151;ReadPosRankSum=0.395;SC=CGGGCGCTCACGGTAGGCTGT;SOR=0.951;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=33;WE=153661382;WS=153661364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr1	153662617	.	T	A	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5002;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=45.51;NF=2;NR=1;PP=32;QD=22.2570708491;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=153662625;WS=153662607;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr1	153662617	rs149726910	T	TCA	56.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.77;QD=18.71;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	153701376	rs12074957	G	C	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=25;SC=CAAGTTTTTTGTGAAGTAACA;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=153701384;WS=153701366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	153742467	.	G	GT	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	153742535	rs111972686	GT	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	153743234	rs6675978	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=822;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TGGGGCTCTTTAGCCCTCAAT;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=53;WE=153743242;WS=153743224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,65:0.55:118
chr1	153743317	rs4345834	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=750;ReadPosRankSum=0.332;SC=TTTTCCTGTCGTTAACATCTG;SOR=0.602;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=42;WE=153743325;WS=153743307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr1	153750207	rs139720425	C	CCTT	2840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=2921;ReadPosRankSum=-0.963;SC=AATCTTACCTCCCTTCTTCCC;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=48;WE=153750222;WS=153750197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,76:0.43:178
chr1	153750214	rs374974027	TC	T	2851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.699;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,78:0.41:189
chr1	153752152	rs143554513	GCT	G	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=1.747;SC=TTCTGGCCTGGCTCTTTCTCC;SOR=0.385;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=5;WE=153752161;WS=153752144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	153791165	rs147317448	AGAG	A	1414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CTACGGACCCAGAGAAGAAAT;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=25;WE=153791175;WS=153791155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr1	153800931	rs144104082	TACACACAC	T	234.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=1666;SC=CTCTCACACATACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=153800946;WS=153800921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	153903129	rs55874907	C	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=818;ReadPosRankSum=-1.727;SC=GTGTGGAGCCCCGGACAGACC;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=50;WE=153903137;WS=153903119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr1	153954646	rs2230324	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=314;ReadPosRankSum=-1.300;SC=GGCTTGTTGCCGTTTCCCTAG;SOR=0.425;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=24;WE=153954654;WS=153954636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr1	154033329	rs72070929	ATAAG	A	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=347;ReadPosRankSum=-1.463;SC=TTTTCAACACATAAGTAAGTT;SOR=1.286;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=8;WE=154033340;WS=154033319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr1	154061855	rs2066135	T	G	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=24;PP=1157;SC=AAGCACGGAATATAAAAGTGC;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=154061863;WS=154061845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	154072601	rs139838869	G	A	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=73;PP=2021;ReadPosRankSum=1.310;SC=ACAATGCATTGGTCCAGGTCT;SOR=0.882;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=229;TCF=94;TCR=135;TR=120;WE=154072609;WS=154072591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,124:0.51:245
chr1	154076366	rs7521047	T	C	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=TAGACTATAATTGGTAGTTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=154076374;WS=154076360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	154108387	rs3001361	G	A	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=110;PP=2965;SC=AATGAGACCCGTTAAGTGCAA;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=65;TCR=110;TR=175;WE=154108395;WS=154108377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	154112167	rs2500223	A	C	232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.77;QD=23.28;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	154186918	rs12408458	G	C	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1031;ReadPosRankSum=1.118;SC=AGCATTCCAAGAGCTTGCCAC;SOR=0.526;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=67;WE=154186926;WS=154186908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,79:0.62:128
chr1	154192143	rs9803862	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=0.216;SC=GCACTGAGCAGGTAAGCCAAG;SOR=0.114;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=21;WE=154192151;WS=154192133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	154192429	rs200832138	T	TA	663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=577;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CAAAAAGATGTAAAAATCCTT;SOR=1.051;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=24;WE=154192437;WS=154192419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr1	154208877	rs3762339	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GTTTTGCTCTATTGCCTAGGC;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=6;WE=154208885;WS=154208867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	154218550	rs11301778	CT	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.842;SC=CATTTCAAGGCTTTTGTGTTT;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=154218558;WS=154218545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	154218639	rs4040743	TTCAG	T	590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=400;ReadPosRankSum=-2.022;SC=TGTTAGCGTGTTCAGTCATTC;SOR=1.109;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=154218650;WS=154218629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	154227239	rs1194604	C	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.771;SC=AATAAAGCTGCATCAGTGCTA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=154227247;WS=154227229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	154228287	rs1194603	T	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=625;ReadPosRankSum=1.250;SC=ACTGTCCAACTGTAAGATTGT;SOR=0.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=48;WE=154228295;WS=154228277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr1	154243115	rs1044013	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GACCCCCAAACATATATCAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=154243123;WS=154243105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	154243457	rs12354278	A	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=548;ReadPosRankSum=-0.132;SC=ATAAAATGAAATCTTCGCCCT;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=35;WE=154243465;WS=154243447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr1	154245917	rs13796	T	C	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=752;ReadPosRankSum=1.161;SC=GGTTCCATAGTCCTCAGCACC;SOR=0.802;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=38;WE=154245925;WS=154245907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
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chr1	154296076	rs1194610	T	C	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=678;ReadPosRankSum=0.177;SC=TTCTGGGCACTGGGATGCTGA;SOR=0.162;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=49;WE=154296084;WS=154296066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr1	154305010	rs1209264	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=0.549;SC=CTCCAGCCTGAGCAGCAGAGC;SOR=0.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=154305018;WS=154305000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	154310048	rs1760795	C	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=947;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCTGGGGTCTCTCCAGGGAGT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=57;WE=154310056;WS=154310038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,65:0.57:114
chr1	154313232	rs1194588	T	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=223;SC=TCTCCGTTCTTGTCTCTCCCC;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=154313240;WS=154313222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	154316434	rs2274988	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=480;ReadPosRankSum=-1.596;SC=AAGAGTACTACGAGGAGTGGG;SOR=0.450;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=32;WE=154316442;WS=154316424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr1	154317153	rs1194587	C	T	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=1020;ReadPosRankSum=0.623;SC=CATCCCGCTCCGTAGGCAACG;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=63;WE=154317161;WS=154317143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr1	154317418	rs1194586	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGGAAAGACTGGCTCTCTCA;SOR=0.260;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=154317426;WS=154317408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	154320942	rs2297607	A	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=988;ReadPosRankSum=-1.561;SC=TGCTCACCACAGTCGTCTGCA;SOR=1.761;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=56;WE=154320950;WS=154320932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,60:0.40:151
chr1	154321072	rs1194591	A	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=738;SC=GAAAGGCCTCATGTGAACACT;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=154321092;WS=154321062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	154321084	rs2297606	G	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=1.499;SC=GTGAACACTGGGGGGCTCTGT;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=154321092;WS=154321062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	154401679	rs2228144	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=655;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CAGAGGTGGCGAGAGGCGTGC;SOR=0.469;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=46;WE=154401687;WS=154401669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr1	154401972	rs6694817	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=827;ReadPosRankSum=0.516;SC=AAATGAGGCTTTGTGCATTCC;SOR=1.005;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=46;WE=154401980;WS=154401962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr1	154426947	rs4845374	T	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=417;ReadPosRankSum=1.294;SC=CTATCTTCAATTTTTTTTTTA;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=25;WE=154426955;WS=154426937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	154437896	rs2229238	T	C	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=74;PP=2238;SC=CTGTGGATGATAAAACACAAA;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=21;TCR=74;TR=95;WE=154437904;WS=154437886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	154442960	rs11265621	G	A	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=987;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TACAGGGCAGGGGCAGGAAAC;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=57;WE=154442968;WS=154442950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr1	154459197	rs4845633	C	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=29;PP=889;SC=CAGGCCACTGCGGTGACCCAT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=154459205;WS=154459187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	154474131	rs4845635	C	G	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=1062;ReadPosRankSum=0.014;SC=CCTCCGTGGCCCGGGAGTTTT;SOR=1.189;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=150;TCF=54;TCR=96;TR=66;WE=154474139;WS=154474121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr1	154474557	rs6703672	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=128;ReadPosRankSum=-1.430;SC=GGCTGCTCCGTGCGCCCCCGG;SOR=0.839;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=154474565;WS=154474547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	154479657	rs10654618	C	CAT	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=1072;SC=ATGCCTGACACGTTTCCTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=154479678;WS=154479647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	154479670	rs6664608	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=316;ReadPosRankSum=-1.736;SC=TTCCTTTTGTCGGAGTCTGAG;SOR=0.243;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=20;WE=154479678;WS=154479647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	154492702	rs10908842	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=392;ReadPosRankSum=0.479;SC=CAGACTAGCTGGCTGGGGATC;SOR=0.405;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=25;WE=154492710;WS=154492692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	154493721	rs6684225	T	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=6;PP=466;SC=CCTTCCAGCTTGGGCTTGGTG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=154493729;WS=154493711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	154514331	rs4845647	C	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=308;ReadPosRankSum=1.472;SC=CTCAGGATGCCGTGAGGATGG;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=154514346;WS=154514321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	154514338	rs4845648	A	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=465;ReadPosRankSum=-2.152;SC=TGCCGTGAGGATGGAGAGAGT;SOR=1.493;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=12;WE=154514346;WS=154514321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	154516571	rs6678164	T	C	5635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=101;PP=2965;SC=TTTTCTGGGCTATGCACGTCA;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=68;TCR=101;TR=169;WE=154516579;WS=154516561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	154523215	rs4520411	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=608;SC=ATCGGTGATACGATCATTTTG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=154523223;WS=154523205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	154523562	rs9427082	G	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=270;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GTCACCCAGAGACCCCAGAGT;SOR=0.065;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=16;WE=154523570;WS=154523552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	154523588	rs10908849	T	G	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=522;SC=CTCCCAGCACTGTGGTCTAGT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=154523596;WS=154523578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	154528053	rs56047170	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=-2.363;SC=TCCCCACTCCGATCTGGATAA;SOR=1.242;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=28;WE=154528061;WS=154528043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr1	154528086	rs4078519	T	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=479;SC=GCTCTTAGTTTGGGCCCCACA;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=154528094;WS=154528076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	154557685	rs9427094	C	T	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=37;PP=1825;SC=GCTCTCCTGTCTCCTTACCCA;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=154557693;WS=154557675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	154561261	rs9427095	G	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=531;SC=TGTTGCAGACGTTTCACAGTT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=154561269;WS=154561251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	154562624	rs201932953	CG	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr1	154562625	rs7532276	G	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.323;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr1	154571174	rs143817514	T	TGGA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=343;SC=TTTTCACTTGTGGAGATGAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=154571182;WS=154571164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	154573967	rs2229857	T	C	7146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=116;PP=2965;SC=TGCGTTTCTTTTGGTCTCAGG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=94;TCR=116;TR=209;WE=154573989;WS=154573957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	154574820	rs1466731	T	C	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=73;PP=2510;SC=CCCTGACTTCTGAGATGCACG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=143;WE=154574828;WS=154574810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	154575040	rs1802645	C	T	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=37;PP=1292;SC=GCTGCTGGTACCTGAGCTGTC;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=154575048;WS=154575030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	154600372	rs6426859	A	G	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=11;PP=839;SC=ACACCCGGAGACTGCCAGTGC;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=33;WE=154600380;WS=154600362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	154687229	rs12134719	A	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	154709682	rs35539682	TG	T	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=23;PP=457;SC=ATAGAAAATTTGGGGGGGGGG;SOR=2.226;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=24;WE=154709691;WS=154709672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	154744807	rs1051614	C	G	6644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=135;PP=2965;SC=GGCTGATGTACAGGATGCGCT;SOR=1.568;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=64;TCR=135;TR=199;WE=154744815;WS=154744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	154744852	rs1131820	A	G	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=70;PP=2080;SC=CATCCGCGCCATTGTCGATCA;SOR=1.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=154744860;WS=154744842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	154744937	rs11589471	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CCAGGCAGGACAGGTGGGGCA;SOR=1.721;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=154744945;WS=154744927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	154832304	rs4845397	T	C	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=27;PP=801;SC=GAGTGTCCTTTAAGCTGACTT;SOR=1.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=39;WE=154832312;WS=154832294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	154832322	rs1218586	A	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=645;SC=CTTTCCTGTTAATTTGACACT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=154832330;WS=154832312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	154842199	.	G	GGCTGCTGCTGCT,GGCTGCTGCTGCTGCT	1613.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=1,1;NR=8,8;PP=188,83;SC=GGGATGCGGTGGCTGCTGCTG;SOR=0.997;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=9,9;WE=154842207;WS=154842189;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.36,0.64:28
chr1	154917551	rs79526479	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=654;ReadPosRankSum=1.078;SC=CCCTGGGCCCCGCAGCTCTTG;SOR=0.453;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=45;WE=154917559;WS=154917541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr1	154917701	rs906594	A	G	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=44;PP=1394;SC=AGCAGGCACCACCAAGCATAT;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=67;WE=154917709;WS=154917691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	154948327	rs12087657	G	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=685;SC=TAAACTACGCGTGTTTTCATT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=35;WE=154948335;WS=154948317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	155006450	rs74520550	CC	AG	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=914;ReadPosRankSum=0.372;SC=CTCACCAGAACCTTGTGTCCA;SOR=1.291;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=22;WE=155006459;WS=155006440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr1	155014426	rs55668940	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AGCAACAGATGAGGAGGGTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=155014434;WS=155014416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	155026114	rs6660884	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=-0.381;SC=ATTGTCCTCACTTTATACATG;SOR=0.602;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=155026122;WS=155026104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	155026871	rs11548311	G	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=598;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CCATTATTTCGCGAATCCAAG;SOR=0.801;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=41;WE=155026879;WS=155026861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr1	155026942	rs6427128	A	C	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=52;PP=1551;SC=CACACTCAGAAGCCACCAGAG;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=90;WE=155026950;WS=155026932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	155028522	rs11264302	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1444;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CCTGACCATGGCAACCCCTCT;SOR=0.621;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=86;WE=155028530;WS=155028512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,100:0.53:190
chr1	155030557	rs11264303	A	C	3858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=74;PP=2070;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GCCTCCAGACAGCTAATACTC;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=360;TCF=197;TCR=163;TR=163;WE=155030565;WS=155030547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,194:0.45:428
chr1	155031031	rs111829929	C	T	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=781;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CAAGGGAAGTCAGTTTCTTAC;SOR=0.870;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=47;WE=155031039;WS=155031021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr1	155033317	rs11264304	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=449;ReadPosRankSum=0.171;SC=AGGTGAGTCCTGGATGCCAGA;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=36;WE=155033325;WS=155033307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr1	155033334	rs12743272	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CAGAGGAAGGGGACTCCACCT;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=27;WE=155033342;WS=155033324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr1	155057499	rs3766918	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=576;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GGGGCTGCGGAGCGGTCAGAT;SOR=0.376;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=76;TCF=62;TCR=14;TR=32;WE=155057507;WS=155057489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr1	155058663	rs17723260	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=588;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GGGCCCCAATGTGAAGATCAA;SOR=0.982;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=39;WE=155058671;WS=155058653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr1	155106054	rs4390169	A	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=706;ReadPosRankSum=1.494;SC=AGTGAGTGTCAGAGCCCTGTG;SOR=0.857;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=41;WE=155106062;WS=155106044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr1	155106227	rs4745	A	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=824;ReadPosRankSum=-0.914;SC=CAGGCCCATGACAATCCACAG;SOR=0.598;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=55;WE=155106235;WS=155106217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr1	155106550	rs9297	A	G	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1227;ReadPosRankSum=1.573;SC=GTGAAGGTGTATGCCACACCT;SOR=0.971;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=70;WE=155106558;WS=155106540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,74:0.57:130
chr1	155108287	rs11264333	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=429;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GGAGCCGAGTGCGCGGGGCGG;SOR=0.452;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=24;WE=155108295;WS=155108277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	155142210	rs4421576	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=595;ReadPosRankSum=0.564;SC=CATCACAGTAAGATCCAATGC;SOR=0.747;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=32;WE=155142218;WS=155142200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr1	155142229	rs4276914	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=469;ReadPosRankSum=1.043;SC=GCCAAAAAACGGAATGCTACA;SOR=0.537;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=28;WE=155142237;WS=155142219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr1	155145392	rs41264911	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-1.007;SC=GAGAAGGGACGGAGAGTCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=14;WE=155145400;WS=155145382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr1	155147781	rs7528026	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=880;ReadPosRankSum=-1.376;SC=CAGACCCCTAGGGTATCCAAG;SOR=0.470;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=53;WE=155147789;WS=155147771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr1	155161794	rs147048677	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.701;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CGTGGGCTGGCGGGGTGGTGG;SOR=0.728;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=8;WE=155161802;WS=155161784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	155162067	rs4072037	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=672;ReadPosRankSum=0.514;SC=GACCAGAACCCGTAACAACTG;SOR=0.808;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=45;WE=155162075;WS=155162057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr1	155178782	rs760077	A	T	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=45;PP=1459;SC=GCGCCGTGACACTCCGAGGCG;SOR=1.166;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=71;WE=155178790;WS=155178772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	155181843	rs2974935	G	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-0.410;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr1	155182164	rs2075570	C	T	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.560;NF=44;NR=24;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.981;SC=TCTTCCTGCCCACCCAATCCA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=68;WE=155182172;WS=155182154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr1	155184975	rs140081212	A	G	5986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=112;PP=2965;SC=ACAAAGGCAAAGAGACAAAGG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=76;TCR=112;TR=188;WE=155184983;WS=155184965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	155186729	rs28445596	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.789;NF=9;NR=14;PP=858;ReadPosRankSum=1.156;SC=CCCCGCTCCCTTGGTCTTGAG;SOR=0.456;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=23;WE=155186750;WS=155186719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr1	155186742	rs1057941	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.219;NF=9;NR=15;PP=858;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GTCTTGAGCCGAGTGGGTGAT;SOR=0.492;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=24;WE=155186750;WS=155186719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	155194768	.	C	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=903;ReadPosRankSum=0.742;SC=GCTCTTCATTCAGCCAGGCAT;SOR=0.501;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=55;WE=155194776;WS=155194758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,61:0.55:111
chr1	155202689	rs10796940	A	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.562;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=104;ReadPosRankSum=-1.578;SC=AGGGGACGGGAACACACAGAC;SOR=1.226;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=7;WE=155202697;WS=155202679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr1	155203060	rs56310840	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.394;NF=9;NR=16;PP=379;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GCTTAGGTGCGGAGGTGGCAC;SOR=0.801;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=25;WE=155203068;WS=155203050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr1	155205669	rs28559737	G	T	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=80;PP=2965;SC=AGACAAAGGCGCAACACTGGG;SOR=1.045;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=144;WE=155205677;WS=155205659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	155206341	rs9628662	T	G	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=814;ReadPosRankSum=0.595;SC=AATCCTGGAGTTGGGTGACGG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=45;WE=155206349;WS=155206331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr1	155209360	rs2075569	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=0.248;SC=AAAAGAAAAACGAAAAGTTTC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=11;WE=155209368;WS=155209350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	155217435	.	AGG	A	430.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.171;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	155217436	.	GGA	ATT	566	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=7;PP=566;QD=69.9408749847;SC=CCCAGAGGTAGGAGGGAAAGG;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=9;WE=155217446;WS=155217426;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,9:0.53:17
chr1	155217438	rs199735676	A	ATT	430.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.764;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	155218168	rs2075568	T	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1173;ReadPosRankSum=-2.270;SC=CCAATCCCCATCCCTGGGGCG;SOR=0.969;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=82;WE=155218176;WS=155218146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr1	155218365	rs734073	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CTTTCACAGCTCCCACGCTCC;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=13;WE=155218373;WS=155218355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	155221837	rs2072647	C	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.217;SC=CCTCCCTCACCCAAAATCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=155221845;WS=155221827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	155224091	rs2075566	C	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=711;ReadPosRankSum=0.973;SC=ACCCGGCTGGCACCAACTGGG;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=30;WE=155224099;WS=155224081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr1	155224301	rs2242577	C	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=556;ReadPosRankSum=-1.098;SC=CCTGAGTGAGCCCCTCACCAC;SOR=0.293;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=35;WE=155224309;WS=155224291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr1	155230131	rs1142287	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=683;ReadPosRankSum=0.065;SC=TAGCTGTGCCCCCCAGGGCAG;SOR=0.620;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=43;WE=155230139;WS=155230121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr1	155231545	rs2242576	T	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=761;ReadPosRankSum=0.885;SC=GAGACCCGGGTCTCAGCTGGC;SOR=0.492;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=43;WE=155231553;WS=155231535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr1	155237639	rs34395206	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	155239624	rs2361543	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=1.423;SC=ACTGTTCTCAGACACTTGTTG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=21;WE=155239632;WS=155239614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr1	155255837	rs11264352	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GGTCCCTGCCTCAGTACGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=155255845;WS=155255827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	155257492	rs11264355	C	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CATCCTGATACTCTCATACTC;SOR=0.551;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=155257500;WS=155257482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	155260350	rs1052177	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.910;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=795;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GGGCCAGAGGAGGGAGGGGCG;SOR=1.231;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=48;WE=155260358;WS=155260340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr1	155260383	rs1052176	G	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1034;ReadPosRankSum=1.122;SC=CTTAGCACCCGCATGATGTTG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=64;WE=155260391;WS=155260373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,79:0.49:162
chr1	155265177	rs2071053	A	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=575;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CCAACCCTACAGGCGCCGCCT;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=43;WE=155265185;WS=155265167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,54:0.39:138
chr1	155269776	rs3020781	A	G	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=434;ReadPosRankSum=-0.936;SC=AATTTTTGTTAAATGAATGAC;SOR=0.530;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=26;WE=155269784;WS=155269766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr1	155279482	rs2297480	T	G	63.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	155289545	rs11264361	T	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=539;ReadPosRankSum=1.962;SC=CCCAGGAACCTCATCCTTCCT;SOR=0.559;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=35;WE=155289553;WS=155289535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr1	155294274	rs914616	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=40;PP=1239;SC=GCGCTGGGCTACACCTCCCTC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=155294282;WS=155294264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	155294772	rs4971075	A	G	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=23;PP=1859;SC=GCTTCCGAATAAACTGCCCTT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=155294780;WS=155294762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	155313047	rs4971051	T	C	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=11;PP=1284;SC=GCTGGGATTATCAGCGTGAGC;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=155313055;WS=155313037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	155408635	rs4971053	T	C	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=98;PP=2965;SC=GAGTCACTTGTGACTGCAGGC;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=172;WE=155408643;WS=155408625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr1	155429490	rs10796946	A	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=1.606;SC=CATATATGATACAGTCCCCAT;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=9;WE=155429498;WS=155429480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr1	155429725	rs10908466	A	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=363;ReadPosRankSum=0.971;SC=TCATAGGAAAATTCAACTTTA;SOR=0.272;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=18;WE=155429733;WS=155429715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	155491413	rs17377506	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=0.963;SC=TCTTTCTCTGCAGAACAGATC;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=155491421;WS=155491403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	155532316	rs12403379	T	C	4235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=44.59;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	155532325	rs12403380	T	C	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=45.17;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	155532332	rs34869594	T	C	4439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=47.23;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	155532341	rs61812107	T	C	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=43.83;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	155581311	rs141265144	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQRankSum=-4.547;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr1	155618415	rs5777949	CT	C	4970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=76;PP=2966;SC=ACTCATGCGCCTTTTCAGATG;SOR=0.878;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=23;TCR=79;TR=99;WE=155618423;WS=155618405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	155630752	rs3738590	A	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=765;ReadPosRankSum=-0.368;SC=AGAATTTGGGAAAAAGAATAG;SOR=0.600;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=55;WE=155630760;WS=155630742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr1	155631307	.	AACACAC	AACACACACACACACAC,A	93.70	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.27;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=3;PP=105;SC=GATCAAGAGAAACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=155631320;WS=155631297;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:2
chr1	155658085	rs2666826	T	C	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=80;PP=2965;SC=CTGGGATCGTTTCCCCTCGCA;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=71;TCR=80;TR=151;WE=155658093;WS=155658075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	155691191	.	GTATA	G	155	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=62.45;NF=6;NR=0;PP=155;QD=27.1666666667;SC=ATGTATGTATGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=155691202;WS=155691181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr1	155699118	rs4933	T	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=532;ReadPosRankSum=0.962;SC=TCAATGCTCTTTGGGGAAGAA;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=41;WE=155699126;WS=155699108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr1	155701073	.	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.036;NF=23;NR=20;PP=757;ReadPosRankSum=2.068;SC=AAAAAAAATTGTTGTCAATTG;SOR=0.736;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=43;WE=155701081;WS=155701063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	155707818	rs41264969	A	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=429;ReadPosRankSum=-1.884;SC=TCTAGAAGTAAGATCTCTTGG;SOR=0.546;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=33;WE=155707826;WS=155707808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr1	155715948	.	G	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQRankSum=1.960;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	155719111	rs2002356	A	C	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=921;SC=TGGCTTTGTTATGGCAGCCAG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=155719119;WS=155719101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	155735012	rs2297775	T	C	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=877;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TCAGGATCCATTGAGGACAAA;SOR=0.726;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=60;WE=155735020;WS=155735002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr1	155743077	rs59791187	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=470;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GAATGCATTTTTGCATTTAGG;SOR=0.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=30;WE=155743085;WS=155743067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr1	155745034	rs113013702	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=461;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CTTCAGAATCTAAATGAGAAG;SOR=0.523;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=21;WE=155745042;WS=155745024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr1	155746340	rs60525991	CT	C	179.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.8338;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCAGAGAGATCTTTTTTTTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=155746348;WS=155746330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr1	155755097	rs822021	G	A	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=61;PP=1841;SC=TTAAAATCCCGTGTTCTCACT;SOR=1.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=155755105;WS=155755087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	155785578	rs148569012	CAACT	C	889.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.935;NF=7;NR=10;PP=679;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CAAATATTACCAACTAACATT;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=17;WE=155785589;WS=155785568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr1	155823002	rs822491	T	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=576;SC=TGTAAAGGTATCCAGAAATAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=155823010;WS=155822992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	155829360	rs1749412	C	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=250;SC=CTTAGCTCAGCGCATCCCCGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=155829368;WS=155829353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr1	155837865	rs822522	G	C	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=44;PP=2497;SC=AGAAGAAGCAGAAGAACCCAC;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=155837873;WS=155837855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	155838267	rs822521	T	C	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=50;PP=2868;SC=AGGAGGCCCATGGGCTGCCAG;SOR=1.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=137;WE=155838275;WS=155838257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	155870416	rs1749409	G	A	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=41;PP=1900;SC=TGACCTTTAAGGGCAAAATGT;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=155870424;WS=155870406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr1	155880391	rs867550	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=1005;ReadPosRankSum=0.703;SC=GTATCCCATCTGGTCATTTAA;SOR=0.586;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=69;WE=155880399;WS=155880381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
chr1	155880573	rs493446	C	G	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=78;PP=2639;SC=GGGCCTTCCTCGGTTGCCCCG;SOR=1.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=114;WE=155880581;WS=155880563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	155880760	rs5777961	C	CA	648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=551;SC=AGAAACCCCCCCATCTTCACC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=155880768;WS=155880750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	155891045	rs625658	A	C	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=466;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGGAACACAGAAGACAGCAGG;SOR=1.516;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=24;WE=155891053;WS=155891035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr1	155899020	rs539602	A	T	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=25;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.504;SC=ACCTAAGGATAAAAAACATGA;SOR=0.934;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=149;TCF=97;TCR=52;TR=79;WE=155899028;WS=155899010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,96:0.54:177
chr1	155903310	rs4661150	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.64;NF=21;NR=1;PP=616;SC=CTCCTGACCTTGTGATCCACC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=155903318;WS=155903300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	155903408	rs4661151	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=645;ReadPosRankSum=-0.917;SC=AGTGGAGACCCTTCAACTTCA;SOR=0.528;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=39;WE=155903416;WS=155903398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,46:0.37:123
chr1	155904177	rs2275079	T	C	9953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=128;PP=2965;SC=CGACCGCTTCTACTCAACCAC;SOR=0.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=295;TCF=167;TCR=128;TR=295;WE=155904188;WS=155904167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr1	155904392	rs2275081	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=491;SC=GATGGCTGCTGTGCCTACTAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=155904400;WS=155904382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	155912486	rs2152051	T	C	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=99;PP=2700;SC=GATCTGCGGTTGAGGCTGTGG;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=57;TCR=99;TR=156;WE=155912494;WS=155912476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	155917880	rs1010033	T	A	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=88;PP=2752;SC=GACTAATGCCTCCCCATCTGC;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=54;TCR=88;TR=142;WE=155917888;WS=155917870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	155928232	rs2364404	T	C	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.45;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	155928242	rs2886069	C	T	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.54;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	155931368	rs4661175	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=545;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ACCCGGCCAAGAGAGGTTGAT;SOR=0.498;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=34;WE=155931376;WS=155931358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	155935244	rs2297649	C	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=476;ReadPosRankSum=0.766;SC=CCCAGTCGGGCAAAAGATCCC;SOR=0.670;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=30;WE=155935252;WS=155935234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr1	155955076	rs4661216	A	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=15;PP=745;SC=GCAACAAGATATATAGGGGAA;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=155955084;WS=155955066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	155981489	rs1475766	C	G	39.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=1.150;SC=CCAAAAAACACACAGGGCAAG;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=155981497;WS=155981486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	156011444	rs2297792	T	C	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.533;NF=33;NR=19;PP=920;ReadPosRankSum=1.012;SC=GGGTCCGGGATATCCCAAAGG;SOR=1.083;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=52;WE=156011452;WS=156011434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr1	156013718	rs150633091	A	AC	1103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.389;NF=16;NR=10;PP=854;ReadPosRankSum=2.459;SC=AGCAGTATGAACCCCATTCAG;SOR=1.058;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=26;WE=156013726;WS=156013708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr1	156021079	rs41265007	G	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=705;ReadPosRankSum=-1.267;SC=GGTCAGGTGTGGAGGGGGAAG;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=45;WE=156021087;WS=156021069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr1	156107534	rs4641	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=50;ReadPosRankSum=0.517;SC=ATCACCACCACGTGAGTGGTA;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=6;WE=156107542;WS=156107524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	156133038	rs7555253	T	C	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=112;SC=TAGCTGCCTATATTCCACATG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=156133046;WS=156133028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	156146218	rs12401573	C	T	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=37;PP=2121;SC=TGGCTGTCCCCAACTCCATCC;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=93;WE=156146226;WS=156146208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	156169610	rs2072499	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=500;ReadPosRankSum=0.830;SC=ATCCCTCCATACTGCTCAAAT;SOR=0.469;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=26;WE=156169618;WS=156169600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr1	156182710	rs2241107	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-0.592;SC=GACGTTCTACTGCTTCCAATC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=9;WE=156182718;WS=156182700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	156202173	rs1052053	A	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=549;ReadPosRankSum=-0.901;SC=ATGACACAGCAAATCTATGAC;SOR=0.725;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=42;WE=156202181;WS=156202163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,49:0.43:114
chr1	156206121	rs1052067	G	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=581;ReadPosRankSum=0.122;SC=ACAGTGTTATGGCACCCTACT;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=43;WE=156206129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,55:0.40:139
chr1	156213921	rs7513351	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1163;ReadPosRankSum=1.091;SC=GATGGGGCCTCACTGTTGTTT;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=72;WE=156213929;WS=156213911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,84:0.46:183
chr1	156215899	rs2075165	G	A	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1217;ReadPosRankSum=-0.215;SC=GGCCTGGGGCGGAGCCTCCCC;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=73;WE=156215907;WS=156215889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr1	156220056	rs1043165	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=-1.106;NF=18;NR=6;PP=374;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CAAGAACCCATTCCAGTGAAA;SOR=0.633;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=24;WE=156220064;WS=156220046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr1	156230141	rs2287025	T	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=0.206;SC=CCTGTCTGAGTGGAAGAGGGC;SOR=2.147;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=12;WE=156230149;WS=156230131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	156230206	rs2287024	C	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=501;ReadPosRankSum=1.394;SC=TTGTGACTGACAAACAGAGCT;SOR=0.671;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=31;WE=156230214;WS=156230196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	156231266	rs759328	G	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=608;ReadPosRankSum=-1.097;SC=AGTGAGCAAGGAAAGCACCAC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=38;WE=156231274;WS=156231256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr1	156233479	rs4661036	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=0.139;SC=TCCAAGGAATTTGGATATGAA;SOR=1.076;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=26;WE=156233487;WS=156233469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr1	156247907	rs2248273	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.188;SC=GAACTGAGGGCAAGGAGTCAT;SOR=0.180;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=156247915;WS=156247897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	156255833	rs2842883	G	C	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=36;PP=1125;SC=GCAGGGCCTGGCTGGTGTGGG;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=156255841;WS=156255823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	156261491	rs3795728	G	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=0.299;SC=GCCTAGGACCGCGGTGGGTGG;SOR=0.255;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=26;WE=156261499;WS=156261481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr1	156279210	rs3001784	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=49;PP=1399;SC=CTGAAATCTATCTTTTCAGTC;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=156279218;WS=156279200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	156280296	rs72414608	GATAA	G	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=1.920;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.929;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	156287360	rs2249790	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=404;ReadPosRankSum=-0.219;SC=AGAAAAGACACTGATTTTAAA;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=22;WE=156287368;WS=156287350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	156287403	rs2296374	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=0.431;SC=AAGGGTCATATTATACTCCTT;SOR=1.501;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=9;WE=156287411;WS=156287393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	156303527	rs2764402	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=0.599;SC=TGCTTCTATACGTACTTACTT;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=9;WE=156303535;WS=156303517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	156304782	rs3762281	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=-0.235;SC=AGTAATAGGGAAAAGGGGCAT;SOR=0.029;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=156304790;WS=156304772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	156347131	rs2245623	G	A	7776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=107;PP=2965;SC=GTGGGCTTTGGCTTCCTCATG;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=225;WE=156347139;WS=156347121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	156351066	rs942679	C	A	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=32;PP=2076;SC=GATTTGCCTGCAGTTATACAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=156351074;WS=156351056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	156352447	rs954916	G	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=0.701;SC=CTGTTCCCCAGTGTGAGTTCC;SOR=2.636;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=156352455;WS=156352437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	156354367	rs6668857	A	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=871;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GACTCCCAGCACTACGAGGAC;SOR=0.646;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=63;WE=156354375;WS=156354357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr1	156374256	rs3431	C	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=697;ReadPosRankSum=-1.293;SC=GTCCTCCCCACTTCATTCTGC;SOR=0.499;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=38;WE=156374264;WS=156374246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
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chr1	156446242	rs2274316	C	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=438;ReadPosRankSum=0.054;SC=CAGAGCAATACCCAGAATTCA;SOR=0.489;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=33;WE=156446250;WS=156446232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
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chr1	156496188	rs6427315	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=547;SC=CCTGAGCTCTAGGTGTCTGCA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=156496196;WS=156496178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	156498673	rs1171564	T	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=766;ReadPosRankSum=1.436;SC=GAGAAGTCACTCGTAACCTTC;SOR=0.496;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=49;WE=156498681;WS=156498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,59:0.44:133
chr1	156499969	rs1171566	T	C	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=58;PP=1575;ReadPosRankSum=0.844;SC=CAAGTCGGCGTAGGTTCCGCA;SOR=0.549;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=184;TCF=72;TCR=112;TR=100;WE=156499977;WS=156499959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,112:0.52:214
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chr1	156503541	rs6699212	T	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=426;SC=CTAGCTGGCCTCAGCTGCTAA;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=156503549;WS=156503531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	156503947	rs6661934	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=989;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TCCAGAGGGCGGGCATGTGAG;SOR=0.312;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=104;TCF=30;TCR=74;TR=57;WE=156503955;WS=156503937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr1	156504579	rs745596	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=0.355;SC=TTGACTGGTGCGGCCCCACAT;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=13;WE=156504587;WS=156504569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	156509552	rs1171570	C	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=9;PP=1445;SC=TGGTGCCAAACGCACAGACAA;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=156509560;WS=156509542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr1	156520173	rs1778819	T	A	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=33;PP=1179;SC=AAAAAAGATGTGACCCCAAGC;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=156520181;WS=156520163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	156520320	rs1778818	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=0.751;SC=TTCCCTGGGACGCGGCCAGGC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=156520328;WS=156520310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	156524221	rs6694580	G	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=587;ReadPosRankSum=0.335;SC=CAAGTGGGCAGGTGAAGGGTC;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=35;WE=156524229;WS=156524211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr1	156526234	rs2489139	C	T	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=16;PP=1007;SC=CATCTCATATCGCACTCACAA;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=156526242;WS=156526224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	156526387	rs11264498	C	G	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=849;ReadPosRankSum=-1.701;SC=ACAGGGTACACTGGAGGCAGC;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=54;WE=156526395;WS=156526377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr1	156526444	rs2488269	T	C	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=48;PP=1747;SC=GCCGCCACTCTCCTCCGGATG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=156526452;WS=156526434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	156526564	rs2489138	C	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CTAGGCTCCGCCGGGGGATCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=156526572;WS=156526554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	156531871	rs1171545	A	G	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=55;PP=1687;SC=CTAGGAATCTACCCTCTTCTT;SOR=1.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=76;WE=156531879;WS=156531861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	156532344	rs7548309	T	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=716;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TACCCTGAGGTCACCCCCAAA;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=36;WE=156532352;WS=156532334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr1	156532908	rs16837492	C	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=853;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GTCCCTGCAACCCAAGACTAC;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=54;WE=156532916;WS=156532898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr1	156532977	rs1171547	T	C	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=57;PP=2377;SC=CCAGCATCTCTTGGTAGACGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=156532985;WS=156532967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	156534525	rs4661184	A	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=221;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GGGAACCTTTAAGCACCACCA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=8;WE=156534547;WS=156534515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	156534539	rs4661185	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=221;ReadPosRankSum=1.087;SC=ACCACCAAATGCGGAGAGGGG;SOR=1.371;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=156534547;WS=156534515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	156536123	rs2066378	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	156536133	rs4382715	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.40;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	156536221	rs2066377	G	C	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=21;PP=980;SC=TCTTCTTCAAGGGAACCACGG;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=156536229;WS=156536211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	156536251	rs947662	T	C	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=35;PP=1620;SC=AACAGTGGCCTAGCTTGGCCA;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=156536259;WS=156536241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	156536353	rs947663	A	G	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=51;PP=1877;SC=GAACATGAGAACACCTTCTCA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=99;WE=156536361;WS=156536343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	156536480	rs947664	T	C	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=486;SC=TCCAACTCCCTTCTCTGCCCA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=156536488;WS=156536470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	156539154	rs6427319	T	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=16;PP=948;SC=TCCATCTTCCTGGACTCCGCT;SOR=1.436;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=156539162;WS=156539144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	156551848	rs6682716	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=578;ReadPosRankSum=1.234;SC=AGGAGCACTGAGAGGCGACTG;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=33;WE=156551856;WS=156551838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	156553102	rs34924172	AG	A	946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.087;NF=13;NR=12;PP=823;ReadPosRankSum=1.772;SC=AAGTCATGAAAGGACCTTCCA;SOR=0.737;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=25;WE=156553110;WS=156553092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	156553762	rs11264502	A	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=815;SC=GTAAGCAGAGACGCTGTTCCC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=156553770;WS=156553752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	156556321	rs10796961	G	A	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=31;PP=1623;SC=CCATGGAGTCGGGCATCTGCA;SOR=1.081;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=156556329;WS=156556311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	156561414	rs6698493	T	C	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=67;SC=GAATCCCAAGTGGAAGGGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=156561422;WS=156561404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	156561557	rs149629319	G	GGGGCCGGGCC,GGGGTCGGGCC	1797.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=10,13;NR=5,5;PP=23,273;SC=CACATGCGCCGGGGCCGGGCC;SOR=2.432;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=15,18;WE=156561565;WS=156561547;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.31,0.69:36
chr1	156561651	rs7516274	G	C	3491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=36;PP=2086;SC=GGGCTCGCGCGTGCCGCGGAT;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=103;WE=156561659;WS=156561641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	156562008	rs1925949	G	A	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1187;SC=CAAGGTCAGTGGCACAACTCT;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=156562016;WS=156561998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	156562143	rs942959	G	A	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=831;SC=AACCACCCTTGACTCTGCCTT;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=156562151;WS=156562133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	156563375	rs6427321	G	A	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=65;PP=2295;SC=GTGGGGTGGGGGAGATTGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=105;WE=156563383;WS=156563365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	156563726	rs6427322	A	C	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=37;PP=1666;SC=ACTTGCTCATATCCCTCACAG;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=156563734;WS=156563716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	156563813	rs6668178	G	A	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=41;PP=1424;SC=CTGCTCTGGAGAAGAAGTACC;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=156563821;WS=156563803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	156563852	rs942963	C	T	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=868;SC=ACCCTGACACCGAGTGTGTCT;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=156563860;WS=156563842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	156563898	rs1270	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=487;SC=TGGGTATTCTTCCCAATAAAG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=156563906;WS=156563888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	156564640	rs3795732	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=420;ReadPosRankSum=-0.085;SC=AGCAGCTGACGTCCCAGAGAT;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=21;WE=156564648;WS=156564630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr1	156564922	rs3795733	C	T	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1273;ReadPosRankSum=1.380;SC=CTAGCCCCGCCATCCTTCTCA;SOR=0.629;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=71;WE=156564930;WS=156564912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr1	156565049	rs72559129	A	AAC	8374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=83;PP=2966;SC=CACCACCTAAAAGTTTCCTCA;SOR=0.852;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=31;TCR=85;TR=108;WE=156565057;WS=156565039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	156565834	rs12024215	G	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=360;ReadPosRankSum=0.764;SC=GGTCAAAGGTGGGGAGAAAAG;SOR=0.090;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=24;WE=156565842;WS=156565824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	156567496	rs879461	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=1.438;SC=TCCAGATAATCTCTCAGGTCT;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=156567504;WS=156567486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	156594364	rs12405992	T	C	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=698;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TGACGCCTCTTATCCCCGACC;SOR=0.820;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=44;WE=156594372;WS=156594354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,50:0.38:132
chr1	156594656	rs12567958	C	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AGCTTGAGATCAGGGCAGGGT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=156594664;WS=156594646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	156617968	rs2277873	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=296;ReadPosRankSum=1.376;SC=AGGTCCTCCCGGGGCCTCTGC;SOR=0.929;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=17;WE=156617976;WS=156617958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	156618768	rs4661209	T	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=376;ReadPosRankSum=0.839;SC=TTGCCTGAAGTGGTCGTGGGT;SOR=0.184;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=22;WE=156618776;WS=156618758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
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chr1	156629037	rs11360	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=1.267;SC=GAGGGGTGGTACTGGAGTCCA;SOR=0.169;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=4;WE=156629045;WS=156629027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	156639753	rs11582300	G	A	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1345;ReadPosRankSum=-1.512;SC=CAAACCCATCGGACTCCCCAT;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=83;WE=156639761;WS=156639743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,103:0.49:209
chr1	156640156	rs3748570	G	A	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=1241;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TTCCTCCTGGGGGCCCTCGGG;SOR=1.004;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=162;TCF=96;TCR=66;TR=84;WE=156640164;WS=156640146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,104:0.53:197
chr1	156640678	rs2886443	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=-1.990;SC=CCCCTGCCCCGGGCCTGGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=16;WE=156640686;WS=156640668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr1	156641537	rs951781	C	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=832;ReadPosRankSum=-3.147;SC=ACTGCCTCTACGCTCTCTTCT;SOR=0.757;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=50;WE=156641545;WS=156641527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr1	156641746	rs140652000	C	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=-1.434;SC=TTCTAAAGACCTCAGTGATTT;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=34;WE=156641754;WS=156641736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr1	156646668	rs4278369	A	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=32;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.957;SC=CAGCTCTGCCACCTGGCTACT;SOR=1.227;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=85;WE=156646676;WS=156646658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,95:0.98:97
chr1	156670545	rs4661213	C	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=427;SC=CCCCCACCACCACCTAGGGAT;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=156670553;WS=156670535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	156705593	rs4311877	G	C	4185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=60;PP=2526;SC=TCAGGCCCACGTGGCCCAGGA;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=68;TCR=60;TR=128;WE=156705601;WS=156705583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	156706285	rs3934562	T	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=224;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GAACCCGTGTTCCTTATGGAG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=156706293;WS=156706275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	156706559	rs8658	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=410;SC=AGCCTGAGGAAACATCTCAGA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=156706567;WS=156706549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	156707775	rs6670122	T	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=816;SC=ACAGCACTTTTTGGACCCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=156707783;WS=156707765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	156708244	rs28697076	C	T	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1667;ReadPosRankSum=-1.233;SC=TGGGAAGATACGAAGGTTAGG;SOR=0.537;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=104;WE=156708252;WS=156708234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,114:0.54:210
chr1	156713512	rs4437869	C	T	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.18;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	156713558	rs4399146	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=538;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGGCTCAGAGGGGGTGCTATT;SOR=0.792;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=33;WE=156713566;WS=156713548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	156737969	rs11264542	C	T	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1386;ReadPosRankSum=-1.716;SC=GCTGGGGCTTCCCAAGCCAAA;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=174;TCF=103;TCR=71;TR=88;WE=156737977;WS=156737959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,111:0.52:214
chr1	156752048	rs2274503	C	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=497;ReadPosRankSum=-0.641;SC=AACAGTGAGGCCTTACTTCAT;SOR=1.033;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=32;WE=156752056;WS=156752038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr1	156752231	rs367770256	AT	A	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=-1.465;SC=AAACACAGATATTTGAGGACT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=156752239;WS=156752221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	156761618	rs2644615	C	T	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1131;ReadPosRankSum=0.685;SC=CCATCTTTGACCGCTGGGCAC;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=71;WE=156761626;WS=156761608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,83:0.54:153
chr1	156784982	rs926103	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=473;ReadPosRankSum=-0.454;SC=ATTCCCTGTGTTGGAGGCAGC;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=25;WE=156784990;WS=156784972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr1	156785617	rs1800601	G	A	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1400;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGGGCAACTCGGCGCATGAAG;SOR=0.468;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=89;WE=156785625;WS=156785607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,107:0.50:214
chr1	156785762	rs11325907	AG	A	3756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=4.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=0.850;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,97:0.59:165
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chr1	156785779	rs1800600	G	A	3474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=0.902;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,86:0.56:154
chr1	156815921	rs12064115	C	T	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=53;PP=1783;SC=GCTAGGAGTGCGAGAAGGATG;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=156815929;WS=156815911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	156816612	rs61813769	G	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=393;SC=TGGCACCCCCGCTCTGAATCA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=156816620;WS=156816602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr1	156838363	rs200132482	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=315;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GTGCTGCTGCGGTGCCAGGTG;SOR=0.797;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=19;WE=156838371;WS=156838353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr1	156845492	.	AGT	A,AGTGTGT	1012.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=9.294;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.375;QD=29.79;ReadPosRankSum=-0.526;SOR=4.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,17,16:0.50,0.47:34
chr1	156846233	rs6334	G	A	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=892;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AGGACTTCCAGCGTGAGGCTG;SOR=0.567;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=64;WE=156846241;WS=156846223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr1	156848995	rs6337	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1161;ReadPosRankSum=0.522;SC=AGCTGCTGGCCGTGGCTAGCC;SOR=0.745;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=78;TCR=36;TR=62;WE=156849003;WS=156848985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr1	156874582	rs201575106	C	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GCCCCTTCAGCCTGCTCCCCT;SOR=1.314;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=11;WE=156874590;WS=156874572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr1	156875092	rs4661074	G	A	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.53;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr1	156875107	rs2644590	C	A	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.20;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	156875377	rs2644591	G	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=161;SC=CCCCAGGATGGGGATCAGCAC;SOR=1.292;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=156875385;WS=156875367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	156875985	rs2644593	G	A	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=26;PP=1832;SC=TGGTTTTGGAGGAAGGTGGGG;SOR=1.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=156875993;WS=156875975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	156877457	rs1952294	T	C	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=88;PP=2965;SC=CAGCACCCATTCTTGCCAAAA;SOR=0.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=168;WE=156877465;WS=156877447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	156883493	rs11264581	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.005;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=464;ReadPosRankSum=1.850;SC=GGGAGCAGCCGCCTGGACCGA;SOR=1.137;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=27;WE=156883501;WS=156883483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr1	156883546	rs12137505	A	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=763;ReadPosRankSum=-1.807;SC=CCCATTCTACAATAAAGGTAT;SOR=1.217;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=58;WE=156883554;WS=156883536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr1	156884365	rs749256	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=535;ReadPosRankSum=0.105;SC=AGGAGAGGAGTGCAGTGGGAG;SOR=0.600;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=31;WE=156884373;WS=156884355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr1	156894006	rs822438	C	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.771;SC=TGTGAGTCGGCGGTATTCGAC;SOR=1.329;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=6;WE=156894014;WS=156893996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	156902259	rs822430	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=347;ReadPosRankSum=0.956;SC=TCCTCGCCACGGTGCAGTATC;SOR=1.054;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=19;WE=156902267;WS=156902249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr1	156907081	rs945508	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=596;ReadPosRankSum=-1.360;SC=CTCAATGGTATGGAAGATCAT;SOR=0.655;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=53;WE=156907089;WS=156907071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr1	156907115	rs868188	T	C	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=634;ReadPosRankSum=0.033;SC=AGGGCCAGGCTTGGAGGAGAG;SOR=1.322;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=42;WE=156907123;WS=156907105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr1	156914240	rs5778015	CCATT	C,CCATTCATT	941.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=2,2;NR=12,12;PP=689,780;SC=TAAGGAGACACCATTCATTCA;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=14,14;WE=156914251;WS=156914230;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:24
chr1	156918137	rs12138039	C	T	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1501;ReadPosRankSum=-3.041;SC=AGGTAGAGGACGAGGCTGACT;SOR=0.528;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=108;TCR=79;TR=93;WE=156918145;WS=156918127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,105:0.51:207
chr1	156939175	rs1336149	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=265;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GTTTCTATAACACAGAAGGAG;SOR=0.310;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=21;WE=156939183;WS=156939165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	156939334	.	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CACCTCCCCTCTGCTCTCATC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=156939342;WS=156939324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	156948956	rs3831270	CCCT	C	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=429;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GACCTTTCCTCCCTCCTTTCC;SOR=2.235;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=10;WE=156948966;WS=156948946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	156954267	rs6427339	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CGCAGTGTCACTGGGAGGTTA;SOR=0.936;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=10;WE=156954275;WS=156954257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
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chr1	157485561	rs3811035	G	A	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=25;NR=32;PP=1191;SC=AACCCTAGGAGGCAAGAGCAC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=157485569;WS=157485551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	157485720	rs1002967	T	C	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=191;SC=TCTTCCCTTGTGCCTGCGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=157485728;WS=157485710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	157489516	rs1332714	T	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=1.957;SC=CACACAGGAATGCAGCTCAGC;SOR=0.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=24;WE=157489524;WS=157489506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	157491173	rs6427383	T	A	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1098;SC=AAAAGTCATATCTCAATCTTG;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=157491181;WS=157491163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	157497263	rs3761961	T	C	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=12;PP=2405;SC=ATACAAAACTTAGAGATGGAG;SOR=3.464;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=82;TCR=12;TR=94;WE=157497271;WS=157497253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	157508882	rs6427384	C	T	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=653;SC=TTACCAGTGACGGAGAGGCTC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=157508890;WS=157508872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	157509025	rs2012199	C	T	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=70;PP=2790;SC=CAGGGCAGCACCCTCATGATG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=141;WE=157509033;WS=157509015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	157514097	rs6679793	A	G	3697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=36;PP=2253;ReadPosRankSum=-0.749;SC=ATGACGCTGTAAGGCATTGTT;SOR=0.474;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=100;WE=157514105;WS=157514087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr1	157550066	rs10489673	T	C	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1447;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TTGCATATTGTGTACTCGGGA;SOR=0.500;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=101;WE=157550074;WS=157550056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,127:0.46:274
chr1	157557701	rs2777962	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=0.272;SC=CATCATTCTCGTCTCCATATC;SOR=0.668;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=15;WE=157557709;WS=157557691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	157559122	rs11582663	C	T	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1565;ReadPosRankSum=2.567;SC=CCAGTAGTGCCGATGATACCA;SOR=0.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=91;WE=157559130;WS=157559112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,102:0.48:214
chr1	157567751	rs1361889	A	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=779;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CTGCTCCAGGATTGGAGAAGG;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=56;WE=157567759;WS=157567741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr1	157651032	rs7546300	T	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-1.039;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.939;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	157668390	rs7522061	T	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=3.104;SC=CATGGAGGATTGAGGAGAAGT;SOR=0.367;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=39;WE=157668398;WS=157668380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr1	157668427	rs12140725	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=515;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CCCCTAAACAGGAAATAGAAA;SOR=1.082;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=31;WE=157668435;WS=157668417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr1	157669668	rs10489678	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=-1.309;SC=TTTTACAAACGTGATGGCTTA;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=19;WE=157669676;WS=157669658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	157670290	rs945635	C	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=609;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GGGCACCGGCCGGGCAGAGGG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=42;WE=157670298;WS=157670280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr1	157718283	rs6696643	A	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=450;ReadPosRankSum=0.274;SC=CTCTATTGCAAACAATGCATC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=31;WE=157718291;WS=157718273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr1	157737504	rs2873413	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GGTGCTGCCTGCAGACACGGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=157737512;WS=157737494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	157740186	rs10540465	GTC	G	1288.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=1294;ReadPosRankSum=0.321;SC=TCCCACAGAAGTCAGGGTTTT;SOR=0.702;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=18;WE=157740197;WS=157740176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr1	157740189	rs57139984	A	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=1302;ReadPosRankSum=0.182;SC=CACAGAAGTCAGGGTTTTACC;SOR=0.624;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=29;WE=157740197;WS=157740176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr1	157744142	rs6700883	A	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=378;ReadPosRankSum=1.020;SC=TGCCCAGCCTACATAGCAGGT;SOR=1.227;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=26;WE=157744150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr1	157767519	rs41273453	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GACCCAAGGACAGCCATTAAG;SOR=0.089;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=157767527;WS=157767509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	157768000	rs3811024	G	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=354;ReadPosRankSum=-2.383;SC=AGTTGAGGTAGGTGAACTCTT;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=30;WE=157768008;WS=157767990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,34:0.37:91
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chr1	157802877	rs2765500	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
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chr1	157806006	rs2765503	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=735;ReadPosRankSum=0.282;SC=CCTTAGGCATGTACTCAGTCA;SOR=0.526;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=49;WE=157806014;WS=157805996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr1	157811392	rs2260040	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=514;ReadPosRankSum=0.430;SC=CCAGGTTGGCGGGGAGAAAGT;SOR=0.782;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=29;WE=157811400;WS=157811382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr1	157963362	rs148023130	GCGGGCTCC	G	954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.850;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.878;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr1	158054379	rs927662	A	G	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=44;PP=1281;SC=GGTGAGCTCCAGCCAGCTCCC;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=158054387;WS=158054369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	158056549	rs41273463	G	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=331;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GAGTGGGCTGGGGGGAGCAGT;SOR=1.375;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=27;WE=158056557;WS=158056539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr1	158057420	rs7514301	A	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=1.878;SC=ACTGGAGCCGATACACTGCAA;SOR=1.063;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=15;WE=158057428;WS=158057410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	158057691	rs3820676	A	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=487;ReadPosRankSum=-1.499;SC=GGGAGTGATAAGGAAGAGTTC;SOR=0.453;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=34;WE=158057699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr1	158058109	rs6427419	C	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=543;ReadPosRankSum=-1.476;SC=CTTCTTTCTCCCTCACAGTTG;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=38;WE=158058117;WS=158058099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr1	158061043	rs2274165	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=0.951;SC=GGGCACACATGGCACATAGGG;SOR=1.981;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=11;WE=158061051;WS=158061033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	158064439	rs41273465	C	A	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1218;ReadPosRankSum=0.147;SC=CCCAGGACCCCACCAATGGCT;SOR=0.650;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=87;WE=158064447;WS=158064429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,114:0.53:214
chr1	158066669	rs41273471	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=875;ReadPosRankSum=1.254;SC=CCCTTTCTCCGTGGTCACCAT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=54;WE=158066677;WS=158066659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr1	158066834	rs6427420	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=653;ReadPosRankSum=-1.348;SC=TTTTAACTTCACAGGAAGTCT;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=41;WE=158066842;WS=158066824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr1	158067047	rs874844	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTTTCACAAAAACCAGAAAC;SOR=0.105;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=158067068;WS=158067037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	158067060	rs11339854	TG	T	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=83;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCAGAAACCATGGGGGAATCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=158067068;WS=158067037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	158146946	rs3021477	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.424;NF=27;NR=17;PP=761;ReadPosRankSum=0.105;SC=CCTGTATGGCTTCTGAGAGAC;SOR=0.866;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=44;WE=158146954;WS=158146936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,54:0.41:132
chr1	158151218	rs859013	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=0.571;SC=CACTTGCTACACGCCTCCAAT;SOR=0.982;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=16;WE=158151226;WS=158151208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr1	158153996	rs426336	T	C	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=34;PP=996;SC=CTCAGGTTCCTAAGACTTCAG;SOR=3.417;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=158154004;WS=158153986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	158224575	rs370074413	CTGTGTGTGTG	C,CTGTG	1421.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=6.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.803;NF=0,0;NR=25,25;PP=409,859;ReadPosRankSum=1.744;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=4.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=2;TCR=80;TR=25,25;WE=158224596;WS=158224565;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.37:35
chr1	158224825	rs411089	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CTCTCTCCATCCTCTTTCTCA;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=158224833;WS=158224815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	158226814	rs41310138	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1130;ReadPosRankSum=2.109;SC=GTCGGGTGAAGCACAGCAGTC;SOR=0.877;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=81;WE=158226822;WS=158226804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr1	158324425	rs1065457	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=521;ReadPosRankSum=0.097;SC=AGTTTTATCCAGATAGTGCAA;SOR=0.613;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=41;WE=158324433;WS=158324415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr1	158326447	rs35184522	C	CT	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=-2.072;SOR=0.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr1	158368315	rs60530245	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=263;ReadPosRankSum=-0.954;SC=TTTTTTGTTAGCTCATCTTGG;SOR=1.536;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=14;WE=158368323;WS=158368305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr1	158368541	rs34465440	A	G	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=760;ReadPosRankSum=-0.929;SC=GGCACAGGTGACAAAGGCCTT;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=40;WE=158368549;WS=158368531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr1	158368846	rs6662382	T	C	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1381;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GCCTTTTGTTTATGATGAGTG;SOR=0.561;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=85;WE=158368854;WS=158368836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,94:0.45:210
chr1	158369319	rs6696357	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=1.004;SC=CTTTGTAATACGAACATTTTC;SOR=0.169;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=158369327;WS=158369309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	158389208	rs34276698	G	GA	541.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=8;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.723;NF=1;NR=42;PP=620;ReadPosRankSum=0.907;SC=TTAATCAATTGAAAAAAAACC;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=43;WE=158389217;WS=158389198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	158389209	.	A	AG	579.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=7;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.590;NF=1;NR=42;PP=421;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TAATCAATTGAAAAAAAACCT;SOR=0.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=43;WE=158389217;WS=158389198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr1	158389630	rs57525598	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TTGAAGTCCTGACCTCAGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=158389638;WS=158389620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	158389659	rs58605957	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=357;SC=GTCTCAGCCTTCCAAAATGCT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=158389667;WS=158389649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	158389693	rs77441663	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-2.005;SC=TGAGAAACTGCACCTGGCCAG;SOR=1.214;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=15;WE=158389701;WS=158389683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr1	158390252	rs12239443	T	G	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=2155;ReadPosRankSum=-1.452;SC=CATGTCCCATTAGCACTGAGT;SOR=0.362;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=95;WE=158390260;WS=158390242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr1	158390501	rs34616883	G	A	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=85;PP=2965;SC=GAAGGGCCCTGTCCAGGACAA;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=155;WE=158390509;WS=158390491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	158435250	rs1002599	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=512;ReadPosRankSum=-1.246;SC=AAATGCCTGCCACCTGCAAAC;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=26;WE=158435258;WS=158435240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	158435278	rs1573519	G	A	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=28;PP=1786;SC=GAAATTTCCCGTACATTTCCA;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=88;WE=158435286;WS=158435268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	158436299	rs4657080	T	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.09;NF=32;NR=69;PP=2304;SC=GTTAAAGAGCTATTTTTTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=101;WE=158436307;WS=158436289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	158436354	rs67123344	AT	A	983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=30;PP=696;SC=TGTTTTATACATTTTTTTTCA;SOR=4.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=30;WE=158436362;WS=158436344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	158450192	rs61741711	C	T	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1886;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GCTTCTTGGCCTCTCTTACAG;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=207;TCF=118;TCR=89;TR=109;WE=158450200;WS=158450182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,124:0.52:238
chr1	158450314	rs6679056	A	G	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=59;PP=1938;ReadPosRankSum=-1.229;SC=GATGTTAACGAATTTGTGATA;SOR=0.901;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=209;TCF=97;TCR=112;TR=105;WE=158450322;WS=158450304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,116:0.49:237
chr1	158507157	rs2051665	A	T	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.368;QD=13.20;ReadPosRankSum=2.288;SOR=0.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr1	158507160	rs2051666	T	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.337;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr1	158507222	rs5778082	GA	G	1486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.253;NF=14;NR=32;PP=704;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CCAGGGTTATGAAAAAAAATC;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=34;TCR=78;TR=46;WE=158507230;WS=158507212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,72:0.39:183
chr1	158507360	rs77684327	G	C	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=460;ReadPosRankSum=0.905;SC=TAAAATGACAGGTCTAGAGAA;SOR=0.569;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=36;WE=158507368;WS=158507350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr1	158507398	rs2051067	G	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=400;ReadPosRankSum=0.689;SC=GTCAGGCTCTGAATGTAGGCA;SOR=0.223;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=24;WE=158507406;WS=158507388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	158549421	rs77690058	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=846;ReadPosRankSum=0.479;SC=GATGGTCAGCGTATAGCAGGT;SOR=0.984;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=46;WE=158549429;WS=158549411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr1	158580887	rs3768535	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTTTTTAAGATCCTACAATAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=158580895;WS=158580877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	158580921	rs66981873	GCA	G,GCACACACACA	354.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=29.56;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,7:0.42,0.58:12
chr1	158582646	rs2251969	T	C	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=795;ReadPosRankSum=-0.048;SC=ACTTGCCCTCTGCCAGGGCTT;SOR=0.589;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=68;WE=158582654;WS=158582636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr1	158587390	rs857716	C	T	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1092;ReadPosRankSum=1.070;SC=TAGTTAAGAACCGAAGGAAAT;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=71;WE=158587398;WS=158587380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr1	158587784	rs857717	T	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=708;SC=AATTCTTCCATAATAATATAA;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=158587792;WS=158587774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr1	158588916	rs7553252	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=-1.496;SC=AATACATGCTCTCAGAGTCTC;SOR=0.083;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=10;WE=158588924;WS=158588906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	158592935	rs3753068	G	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=619;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CAGTGATCTCGGGAAGTCTCT;SOR=0.918;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=39;WE=158592943;WS=158592925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr1	158595824	rs56954229	T	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=501;ReadPosRankSum=0.903;SC=GAAGGGAAAATCTTACAGAGG;SOR=0.462;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=27;WE=158595832;WS=158595814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr1	158595842	rs11265038	C	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=703;ReadPosRankSum=-0.077;SC=AGGCTACAGACAATAAAATCC;SOR=0.336;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=41;WE=158595850;WS=158595832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr1	158596524	rs12088990	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-1.833;SC=TAGTGATGGAAACACCTCCTT;SOR=0.051;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=11;WE=158596532;WS=158596514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	158597309	rs12044097	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=0.110;SC=AAAGTTCTGCATATGATCTTA;SOR=1.795;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=24;WE=158597317;WS=158597299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr1	158597507	rs3737515	G	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=1000;ReadPosRankSum=0.520;SC=TGCTTCATTAGCAAGCTCTGC;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=60;WE=158597515;WS=158597497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,70:0.48:146
chr1	158606449	rs3738791	G	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=491;ReadPosRankSum=0.079;SC=CAGGCTCATGGGCCACCAGCT;SOR=0.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=32;WE=158606457;WS=158606439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr1	158607788	rs2518492	T	G	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=964;SC=TACTCGCTTGTATTATCCACA;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=158607796;WS=158607778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	158609300	rs17635857	C	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=0.590;SC=AAATGGTCTCCTAACATGGGA;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=16;WE=158609308;WS=158609290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr1	158612236	rs863931	A	G	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1034;ReadPosRankSum=0.522;SC=CAAGCGCTACACTCAATCAGG;SOR=0.671;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=73;WE=158612244;WS=158612226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,78:0.50:157
chr1	158614198	rs6702040	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.596;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=0.722;SC=TATGAGGAATCAAATGAGAGG;SOR=0.320;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=29;WE=158614206;WS=158614188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	158618223	rs857677	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=367;ReadPosRankSum=1.003;SC=AAAAAGAGAACCAAAGAAGAG;SOR=0.257;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=31;WE=158618231;WS=158618213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr1	158618480	rs11265044	A	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.252;SC=AAAAGTAAGGATATGTACCAG;SOR=1.802;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=11;WE=158618488;WS=158618470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	158619728	rs2482965	A	C	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.129;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1838;ReadPosRankSum=-0.683;SC=CCCCAGCGGGAATTCAATTCC;SOR=0.339;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=78;WE=158619736;WS=158619718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr1	158637865	.	GAAA	G	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5001;HP=16;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=58.96;NF=0;NR=8;PP=87;QD=11.25;SC=GAGATAAGATGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=8;WE=158637876;WS=158637855;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	158639601	rs2298801	A	G	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=815;ReadPosRankSum=0.215;SC=ATAAAAATGAATGCTTTTCCT;SOR=0.380;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=46;WE=158639609;WS=158639591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
chr1	158644105	rs703116	T	A	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=918;ReadPosRankSum=-0.063;SC=ACAAACTCTGTTAAACTAGAT;SOR=0.508;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=59;WE=158644113;WS=158644095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
chr1	158647495	rs325996	A	T	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=96;PP=2965;SC=CACTCATGACAGCAAGATTTC;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=165;WE=158647503;WS=158647485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	158647522	rs703121	A	G	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1106;ReadPosRankSum=2.655;SC=GTCCCTTGTGACTGTGAAACA;SOR=0.469;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=56;TCR=92;TR=73;WE=158647530;WS=158647512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,87:0.49:178
chr1	158647631	rs325995	T	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=723;SC=ATCCCTGCAGTCATTAACAAG;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=158647639;WS=158647621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	158647669	rs703122	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.095;SC=ATAGCAAGCATTACAGGGCAA;SOR=0.078;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=8;WE=158647677;WS=158647659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	158654786	rs385096	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=521;SC=TGTTTCTAAACGGAATCTAAT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=158654794;WS=158654776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	158654852	rs857937	A	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=587;ReadPosRankSum=0.446;SC=TTCCTTCTCTAGAGATCTTAG;SOR=0.289;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=36;WE=158654860;WS=158654842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr1	158655036	rs435080	G	A	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=66;PP=2296;SC=CCCTCTCAGCGACCCGCTCCT;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=113;WE=158655044;WS=158655026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	158655162	rs2564859	C	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=39;PP=1167;SC=GATTCTGTTACTTGCTAGTTC;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=158655170;WS=158655152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	158656281	rs2564858	T	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=7;PP=315;SC=AATATGTACTTACGGTTTCCT;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=16;WE=158656289;WS=158656271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	158656347	rs111674514	C	CAGAG,CAG	507.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.4980,0.5020;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2,2;NR=8,8;PP=12,348;SC=TAAAATGTGTCAGAGAGAGAG;SOR=0.836;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=10,10;WE=158656355;WS=158656337;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:13
chr1	158687163	rs28568406	G	A	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1487;ReadPosRankSum=0.122;SC=AAAGAATATCGGGAAGACCAT;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=202;TCF=114;TCR=88;TR=95;WE=158687171;WS=158687153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,105:0.44:241
chr1	158687224	rs857703	G	A	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=62;PP=1896;ReadPosRankSum=0.595;SC=TCAGAAGAGGGAATCCTCAAT;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=122;TCR=119;TR=124;WE=158687232;WS=158687214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,136:0.49:277
chr1	158724537	rs34126693	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=0.657;SC=GAGGTAAAGCTTAAGAGATAT;SOR=0.120;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=158724545;WS=158724527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	158725080	rs16841001	C	T	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1312;ReadPosRankSum=0.373;SC=CAATCCACTCCGTTACCCAAC;SOR=0.738;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=74;WE=158725088;WS=158725070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,90:0.57:157
chr1	158736215	rs6666753	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=53;PP=2074;SC=TTTTCTCACTGAGCAAGTTTG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=158736223;WS=158736205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	158747492	rs857835	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TCCATGCCAAAACTTCATTTC;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=9;WE=158747500;WS=158747482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	158813819	rs857870	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=604;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GTAAGCCCCCAGGTCCCTCAG;SOR=0.997;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=48;WE=158813827;WS=158813809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr1	158909164	rs2325704	C	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=18;PP=1249;SC=ACTGAGAATTCACTGCATTTT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=158909172;WS=158909154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	158913525	rs856082	A	G	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=3.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	158913532	rs4656498	C	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.07;SOR=3.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	158943295	rs71084295	T	TCACA	392.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=1;PP=428;SC=AAAGGGATTTTCACACACACA;SOR=2.833;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=158943303;WS=158943285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	158946629	.	A	AATATATGTAT	665	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=61.4;NF=2;NR=3;PP=665;QD=138.0;SC=CACAGAAAATAATATATGTAT;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=158946637;WS=158946619;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,5:0.31:16
chr1	158986477	rs866484	G	C	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=77;PP=2965;SC=CCACCCAACAGTTCTTCAACT;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=174;WE=158986485;WS=158986467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	158987941	rs856046	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=644;SC=GCCCTGTGTTATACTGAGGTC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=158987949;WS=158987931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	159002222	rs861318	A	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=756;SC=AGACCTATTAAAATCTAATAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=159002230;WS=159002212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	159002301	rs2518553	T	C	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=44;PP=2293;SC=AAACAGAAAATGAATACTTTC;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=123;WE=159002309;WS=159002291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	159002377	rs1057027	C	A	6453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=98;PP=2965;SC=CCAGGAACAGCGTCAGCTTCC;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=88;TCR=98;TR=186;WE=159002397;WS=159002367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	159002389	rs1057028	T	A	6059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=100;PP=2965;SC=TCAGCTTCCATATCCTTCAGA;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=78;TCR=100;TR=178;WE=159002397;WS=159002367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	159035656	rs61828164	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=531;ReadPosRankSum=-1.080;SC=ATGGGAAATACGTTATTCTTA;SOR=0.622;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=29;WE=159035664;WS=159035646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr1	159169463	rs3027001	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=403;ReadPosRankSum=0.099;SC=CTGTGTAAGACTATTCATGGC;SOR=1.173;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=32;WE=159169471;WS=159169453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr1	159169641	rs862999	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=22;PP=788;SC=TCATCTTCCTTGGCCACTACT;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=159169649;WS=159169631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	159174824	rs863001	G	C	8619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=140;PP=2965;SC=CTCATTTCCCGTGCTGTTTGC;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=129;TCR=140;TR=269;WE=159174832;WS=159174814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr1	159174920	rs863002	C	T	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=-0.992;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr1	159175004	rs17838198	CT	C	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=581;SC=CTCTTGGTGCCTTTTCCTTCT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=15;WE=159175012;WS=159174994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	159175354	rs12075	G	A	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=31;PP=1417;ReadPosRankSum=0.697;SC=GGAGACTATGGTGCCAACCTG;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=134;TCR=68;TR=92;WE=159175362;WS=159175344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,107:0.45:240
chr1	159175527	rs13962	G	A	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=65;PP=1915;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GCCTGTCCTGGCACAGCTGGC;SOR=0.407;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=243;TCF=102;TCR=141;TR=121;WE=159175535;WS=159175517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,141:0.51:274
chr1	159272060	rs2251746	T	C	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CCAGATATGATACAGAAAACA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=97;TCR=63;TR=98;WE=159272068;WS=159272050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,114:0.58:197
chr1	159273853	.	C	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=682;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GGCAGCCTTTCAGAAGAGACA;SOR=0.845;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=43;WE=159273861;WS=159273843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr1	159320979	rs10908710	G	A	2904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=67;PP=1725;ReadPosRankSum=0.452;SC=GGTCTTTCTCGCCCTCTACAT;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=255;TCF=116;TCR=139;TR=121;WE=159320987;WS=159320969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,141:0.47:299
chr1	159402584	rs11419544	G	GT	2476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=50;PP=2729;SC=CTATCAAGGAGTTATTACTTT;SOR=2.082;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=62;WE=159402592;WS=159402574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	159402630	rs146980188	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.927;NF=9;NR=14;PP=529;ReadPosRankSum=-1.533;SC=CTGCCCATGGTATTGATCTTC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=23;WE=159402638;WS=159402620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	159409196	rs6691297	T	C	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=38;PP=2048;SC=TGAGAACCTCTGAGTGTAATA;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=110;WE=159409204;WS=159409186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	159409533	rs10908721	G	A	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=13;PP=2366;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TGCTTTACTGGGACTATGTGA;SOR=3.229;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=81;TCR=14;TR=94;WE=159409541;WS=159409523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr1	159409734	rs10908722	G	T	8300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=132;PP=2965;SC=TCATCCGAATGGATCTTCATC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=132;TCR=132;TR=264;WE=159409742;WS=159409724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr1	159409857	rs12048482	A	G	5278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=105;PP=2965;SC=GCCAGCCCATATCATTGGCAG;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=59;TCR=105;TR=164;WE=159409865;WS=159409847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	159505297	rs4656837	C	T	6540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=95;PP=2965;SC=TGCCACAGAACGGCAAATTGA;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=98;TCR=95;TR=193;WE=159505305;WS=159505287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	159558258	rs2808661	A	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1076;ReadPosRankSum=0.110;SC=GTTACTTTGTAGAAGCTCAGC;SOR=0.600;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=62;WE=159558266;WS=159558248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,72:0.55:131
chr1	159684047	.	CCACACACACA	C	320.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=1279;ReadPosRankSum=0.375;SC=CAGTTACACACCACACACACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=159684064;WS=159684037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	159750802	rs3806189	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr1	159799599	rs11422063	C	CA	2269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=1995;SC=CAGATGCATGCAAAGAAGGAT;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=48;WE=159799607;WS=159799589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	159824967	rs2501340	G	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=30;PP=1324;SC=TCGACCTACTGTCCTTTGTGA;SOR=0.824;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=66;WE=159824975;WS=159824957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	159825061	rs2501339	G	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=475;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CGTATCTGGAGAGCCCTGCAG;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=36;WE=159825071;WS=159825051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr1	159825916	rs11587021	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=637;ReadPosRankSum=0.088;SC=CACAGCCTGGCAGGTGCCTGA;SOR=0.414;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=43;WE=159825924;WS=159825906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	159827456	rs2494503	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=0.417;SC=GGCACTGATAACCCAAGGAAA;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=159827464;WS=159827446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	159828128	rs2494504	A	G	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=46;PP=1432;SC=CAGAGCCAAGAAGGGCCATGT;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=159828136;WS=159828118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	159828746	rs2501337	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=1.722;SC=AGCAGAAGCAGGGCTTCAGGA;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=11;WE=159828754;WS=159828736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	159832425	rs2494507	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=0.200;SC=CACTGCCTGGGGTGGCAGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=23;WE=159832433;WS=159832415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	159842088	rs2494518	T	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GTTCCCCCCATCCTATTTTAC;SOR=2.066;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=7;WE=159842096;WS=159842078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	159842103	rs11265289	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=147;ReadPosRankSum=1.102;SC=TTTTACTCCACCTTCAGTACC;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=159842111;WS=159842093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	159842691	rs4460634	C	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=1000;ReadPosRankSum=0.222;SC=CATCTCTTTGCGGGAGGGAAG;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=60;WE=159842699;WS=159842681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr1	159850401	rs7550537	C	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=415;ReadPosRankSum=0.328;SC=CCTGAGCCAGCAGTTCTGCTT;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=26;WE=159850409;WS=159850391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	159854392	rs2501325	C	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=2.359;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	159869932	.	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.084;SC=GCTGCCGCCTCGGCGCCGCCA;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=159869940;WS=159869922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	159890459	rs11265297	T	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=919;SC=ACCAGAACTGTTACCAAATGC;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=159890467;WS=159890449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	159897126	rs13052	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=452;SC=AGCCTCACATCAGGGATGTTC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=159897134;WS=159897116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	159897388	rs1934074	C	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=-0.706;SC=ATGTGAAGCTCGCTAGGCCCT;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=35;WE=159897396;WS=159897378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr1	159897559	rs1319080	G	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=-1.824;SOR=1.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	159897681	rs142211405	TAA	T	830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=355;SC=GTTCCTCCTGTAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=23;WE=159897690;WS=159897671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr1	159898100	rs3747615	A	G	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=45;PP=1920;SC=TGCCTCGCCCACTGCTCTGGC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=83;WE=159898108;WS=159898090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	159898913	rs7543462	A	G	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=14;PP=977;SC=CAGAGCTAGGAAGAACAAGCG;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=159898921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	159902526	rs3827531	T	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=31;PP=854;SC=GGGGGCAGGATGAGAAACCCA;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=159902534;WS=159902516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	159906156	rs10908750	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=584;ReadPosRankSum=1.165;SC=TGCATAGGTAACCCTGGACCC;SOR=0.656;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=33;WE=159906164;WS=159906146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr1	159906849	rs10797055	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=-1.335;SC=CACCCTGTCTACTGCACCCAG;SOR=0.439;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=159906857;WS=159906839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	159907362	rs7524321	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.791;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	159907367	rs7526647	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	159907441	rs12751760	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.777;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr1	159912899	rs3747617	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=584;ReadPosRankSum=1.018;SC=CACACTCTCCCCAGCCCGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=39;WE=159912907;WS=159912889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr1	159922369	rs2840583	C	T	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=49;PP=1380;SC=AATCAGGGATCGGGTCTGTTT;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=62;WE=159922377;WS=159922359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	159922458	rs1317520	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=142;SC=GGCAAAAGCAAACAAACCCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=159922466;WS=159922448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	159923111	rs2789417	T	G	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=21;PP=1276;SC=TAGACACATATATTGTACTGC;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=159923119;WS=159923101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	160085868	rs2854244	A	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=191;SC=TCTCCTCTGCACGCCCCAGCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=160085876;WS=160085858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	160090674	rs2854246	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=1148;SC=CCTGACTCTCTGGCTCTCCCT;SOR=2.480;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=52;WE=160090692;WS=160090664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	160090681	rs67915591	CCCTT	C	2470.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;PP=2039;SC=CTCTGGCTCTCCCTTCCTCCC;SOR=2.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=43;WE=160090692;WS=160090664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	160093222	rs2820581	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=53;PP=1905;SC=CCCACACGCCCGACCCGGGAA;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=99;WE=160093230;WS=160093212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	160093911	rs2820582	T	C	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=758;SC=AGCTCATCTTTTGTCAGCTCC;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=160093919;WS=160093901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	160093927	rs2854248	T	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=605;SC=GCTCCCAGGCTCTAAGATAGA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=160093935;WS=160093917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	160094343	rs1023420	T	C	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=129;SC=ACCATGCCTATGCCCCTGCTA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=160094351;WS=160094333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	160098543	rs1063125	G	A	2690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.899;NF=71;NR=47;PP=1985;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CCATCTGCTCGGACAAGACGG;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=138;TCR=92;TR=118;WE=160098551;WS=160098533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,124:0.48:257
chr1	160098927	rs5778151	A	AG	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=217;ReadPosRankSum=0.530;SC=GTGTCTCCAAAGCCTCTTGCT;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=7;WE=160098935;WS=160098917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	160100264	rs17846714	C	T	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GCTTCAAATTCGACACGGATG;SOR=1.021;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=249;TCF=117;TCR=132;TR=105;WE=160100272;WS=160100254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,123:0.43:286
chr1	160110965	rs114964592	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=104;ReadPosRankSum=1.550;SC=CACTTCCCCCAGTGCCCTTCA;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=160110973;WS=160110955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	160124875	rs6427504	G	A	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=12;PP=1038;SC=CTGACTCGAGGTGGACCCAAT;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=160124883;WS=160124865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	160128671	rs4656888	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=227;ReadPosRankSum=0.021;SC=GAATGATGTGGTGGGTGACAG;SOR=1.473;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=15;WE=160128679;WS=160128661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr1	160128994	rs10908764	C	T	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=421;SC=ACACCTGGGCCGTTAGAGAAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=160129002;WS=160128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	160134205	rs11265338	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=482;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GGCTGTTGGCCACAGTCACTG;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=26;WE=160134213;WS=160134195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	160137300	rs4656889	A	C	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=25;PP=795;SC=CACCTCGGAGAAGCAGAGGAG;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=160137308;WS=160137290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	160140998	rs1209804	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGATCCTTGGTCTCTCCTCC;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=13;WE=160141006;WS=160140988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr1	160141196	rs625549	C	T	6666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=96;PP=2965;SC=AAAATGCCTACTTAGAACTGG;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=108;TCR=96;TR=204;WE=160141204;WS=160141186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	160141268	rs12058214	T	C	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1581;ReadPosRankSum=-1.235;SC=AAGAATGGCATCAAAATGGTT;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=89;WE=160141276;WS=160141258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,103:0.51:203
chr1	160141285	rs669162	C	T	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,88:0.47:186
chr1	160141285	.	CC	TG	983	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=27;NR=38;PP=983;QD=15.9456596133;SC=GGTTATTATCCCTGGGGTGAG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=64;TCR=90;TR=65;WE=160141294;WS=160141275;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:89,65:0.42:154
chr1	160141286	rs625129	C	G	6698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.01;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	160141636	rs1891265	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TGCTTAATACCCTTAGTTTAA;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=18;WE=160141644;WS=160141626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	160145707	rs11805919	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=-0.421;SC=GACGGCATGGCTCTGATTAAA;SOR=0.169;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=6;WE=160145715;WS=160145698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	160146173	rs881291	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=517;ReadPosRankSum=0.368;SC=CAAGATGGATTGAGGCTGCGT;SOR=1.146;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=30;WE=160146181;WS=160146163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr1	160147502	rs731852	T	G	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.97;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	160147502	.	TGACAGGGG	GGACAGGGA,GGACAGGGG	1772	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8,22;NR=21,47;PP=1677,1772;QD=59.6713060297;SC=AGAGTGAGAGTGACAGGGGAG;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=29,69;WE=160147529;WS=160147492;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.42:69
chr1	160147510	rs731853	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr1	160147517	rs11801984	A	G	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr1	160147521	rs11806793	C	T	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr1	160151345	.	CA	C	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9999;HP=17;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=26;MQ=55.26;NF=2;NR=0;PP=22;QD=12.5;SC=GACTTAGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=2;WE=160151353;WS=160151335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,2:0.17:12
chr1	160151421	rs11265350	G	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=484;ReadPosRankSum=0.090;SC=AGAAGCCTTAGGGTGTACAGA;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=31;WE=160151429;WS=160151411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr1	160151450	rs7519748	T	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=892;ReadPosRankSum=0.099;SC=CTGACACTGTTTCCTCTCTCC;SOR=1.212;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=46;WE=160151458;WS=160151440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr1	160151624	rs36097870	G	GC	2664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=2149;ReadPosRankSum=1.447;SC=TCACAAAACAGCCCAGCACTC;SOR=0.395;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=60;WE=160151632;WS=160151614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,97:0.52:186
chr1	160156027	rs12131640	C	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=367;ReadPosRankSum=1.237;SC=TCTGGCATCTCTCTCTCCTGC;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=28;WE=160156035;WS=160156017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr1	160164668	rs1186693	T	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=3;PP=305;SC=GCACATGCAATCCCCCACACA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=160164676;WS=160164658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	160165095	rs2275703	A	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1132;SC=CCAGACAAGCACCTCCAGTAT;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=160165103;WS=160165085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	160165451	rs10908769	C	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=11;PP=427;SC=TGCCCCCCCCCCCGGCTCCTC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=160165459;WS=160165441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	160169473	rs959166	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=277;SC=TCCTCTTTTGTTGTTTAGTTC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=160169481;WS=160169463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	160178356	rs667306	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=20;PP=1108;SC=TTTCTCCACGAGCCCTAAGGA;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=160178364;WS=160178346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	160181509	rs8192602	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=42;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GGACAAAGGTGGGGGAGGGGA;SOR=0.981;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=117;TCF=30;TCR=87;TR=54;WE=160181517;WS=160181499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr1	160233345	rs6688586	C	A	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=2;PP=21;SC=AGGAGAATTGCTTGAACCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=160233353;WS=160233335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	160247185	rs10594	G	C	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=38;PP=1069;SC=TACCTGTCATGGGCAATAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=160247193;WS=160247175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	160251792	rs2795067	A	G	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=57;PP=2965;SC=ATGTGATGGAAAATGAAGAGA;SOR=1.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=149;WE=160251800;WS=160251782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	160260233	rs2298104	T	C	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.43;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	160263124	rs1317944	C	T	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=68;PP=2686;SC=TGTTATATACCAATCAAGTAT;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=160263132;WS=160263114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	160265515	rs3789042	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=911;SC=ATGGGAGAAATAGGTACTTAC;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=160265523;WS=160265505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	160275434	rs2066320	A	G	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=87;PP=2965;SC=ATCGGGGTGGAAGGGAATGGT;SOR=1.273;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=51;TCR=87;TR=138;WE=160275442;WS=160275424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	160302444	rs4656897	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=245;SC=TGCTTATCCAGTTTTACTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=160302452;WS=160302434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	160303416	rs1802778	G	A	7334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=104;PP=2965;SC=TAGATTGCCAGTTCCACACTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=108;TCR=104;TR=212;WE=160303424;WS=160303406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr1	160309664	rs1886419	T	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=26;PP=1370;SC=CACATCCTCTTTCCTTTATTC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=160309672;WS=160309654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	160313733	rs1886417	C	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=694;SC=TGTCCCCCTGCCTTGCCTCAG;SOR=3.193;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=160313741;WS=160313723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	160318940	rs6669689	A	G	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=38;PP=1332;SC=CTGCTGGGAAAACATCCATAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=160318948;WS=160318930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	160318984	rs16831846	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=303;ReadPosRankSum=-1.204;SC=CTCACACTTATTAGTGAAAAC;SOR=0.297;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=18;WE=160318992;WS=160318974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr1	160320938	rs12240253	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=0.244;SC=TGGAACTGGGCCCTCCTCCTT;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=160320946;WS=160320928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	160321065	rs12239747	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=681;ReadPosRankSum=2.569;SC=CCTTCCCACTATGTGCCATGC;SOR=0.729;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=43;WE=160321073;WS=160321055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr1	160321359	rs6664438	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=485;ReadPosRankSum=-0.708;SC=AAGCCAACCTCGGACTGTTGG;SOR=0.383;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=36;WE=160321367;WS=160321349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
chr1	160321499	rs6664627	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=880;ReadPosRankSum=-1.225;SC=TCGTCTGTGACCCCCTGTCTG;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=62;WE=160321507;WS=160321489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr1	160323903	rs7528638	C	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.926;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=553;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CCTCGTACCCCCCAGGTGGAG;SOR=0.293;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=31;WE=160323911;WS=160323893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr1	160325921	rs45503695	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.718;SC=ATGAGCCAGCTACTGTCTCCC;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=160325929;WS=160325911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	160327820	rs17370539	G	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=290;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TTATTCCATAGTTGGTGCTTA;SOR=1.101;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=17;WE=160327828;WS=160327810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	160393905	rs12086448	A	G	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=46;PP=2713;SC=AGGAGCAGAAAAACCCCAGGG;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=125;WE=160393913;WS=160393895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	160394155	rs68148622	CT	C	869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=687;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TATTCTCTCACTACTTTCCTC;SOR=0.548;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=19;WE=160394163;WS=160394145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr1	160458782	rs3795327	A	G	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=61;PP=2965;SC=TCCTCCCCTCAGTGGTCATTT;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=103;TCR=61;TR=164;WE=160458790;WS=160458772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	160519812	rs3832278	C	CA	902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.328;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AGCCCAGGCCCATCTACAAGT;SOR=1.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=16;WE=160519823;WS=160519802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr1	160519815	rs58960001	C	CT	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.299;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=1320;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CCAGGCCCATCTACAAGTCCC;SOR=1.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=16;WE=160519823;WS=160519802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr1	160580015	rs1061217	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=325;ReadPosRankSum=1.832;SC=TTCACCCTTCAGCCTCTATTC;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=25;WE=160580023;WS=160580005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr1	160582213	rs2025515	C	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.204;HP=12;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=0.643;SC=AAAAAAAAAACTTCCTCATTT;SOR=0.408;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=12;WE=160582221;WS=160582203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	160582248	rs11265449	C	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=319;ReadPosRankSum=1.984;SC=TATTCCCTCTCTACGGAGAGT;SOR=0.386;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=19;WE=160582256;WS=160582238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr1	160585554	rs149160	C	G	5591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=68;PP=2965;SC=CTGATGATGACTGTCCTTATA;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=99;TCR=68;TR=167;WE=160585562;WS=160585544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	160585706	rs151607	C	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GGATTTTCTCCTAAAGCCTCC;SOR=0.395;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=26;WE=160585714;WS=160585696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr1	160650913	rs4656926	A	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=429;SC=AGGAGGCTGAATAGGACCCCC;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=160650921;WS=160650903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	160717872	rs527733	T	G	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=141;SC=TCCAGGAGGTTGTTGTGTTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=160717880;WS=160717862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	160722064	rs527342	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=519;SC=GCTTAACTTCATCTTAATGGT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=160722072;WS=160722054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	160766179	rs3831924	C	CT	108.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=108;SC=CTGGGAGATTCTTTTTTTTGT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=160766187;WS=160766169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	160789196	rs537540	A	C	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=39;PP=1293;SC=GCTATGGGGTATCTGGTCCAA;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=53;WE=160789204;WS=160789186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	160849030	rs3766358	T	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=466;SC=CTCAACACACTCACACATACC;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=160849038;WS=160849020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	160849060	rs3766359	G	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=836;SC=GGACAAACTCGACCTTACTCA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=160849068;WS=160849050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	160849082	rs3820094	A	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=12;PP=1362;SC=AGGTCCCTGCAGTCCCCACAG;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=160849090;WS=160849072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	160849367	rs2274905	G	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=365;SC=CTACATCCTGGCCTCAAACTT;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=160849375;WS=160849357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	160850280	rs4656957	G	A	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=942;SC=AACATTACAGGAGAGAACCAA;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=160850288;WS=160850270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	160850936	rs2236515	T	C	10024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=137;PP=2965;SC=GCCAGCAGCCTTCTGTACCTG;SOR=0.860;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=301;TCF=164;TCR=137;TR=301;WE=160850944;WS=160850926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr1	160851619	rs10908808	A	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=180;SC=AAAAAAAGATATAAGTATTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=160851627;WS=160851609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	160851826	rs2274907	A	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=50;PP=1772;SC=CTCTGGGTAGACTGCTTTGCT;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=89;WE=160851834;WS=160851816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	160851894	rs2274908	G	A	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=30;PP=1660;SC=TGTCATTCTCGTGCACGCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=160851902;WS=160851884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	160852022	rs2274909	C	T	3699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=61;PP=2113;SC=CCAGAGCCTCCCTGTCTGAGA;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=160852030;WS=160852012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	160852046	rs2274910	T	C	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=59;PP=1907;SC=GAGGGTTCATTTCAGCCCCAT;SOR=1.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=94;WE=160852054;WS=160852036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	160854526	rs2297559	G	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=490;SC=TGCATCTCAAGGACATGCTCT;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=160854534;WS=160854516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	160920809	rs3829790	A	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr1	160920813	rs790059	A	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.97;QD=36.15;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	160920966	rs6680969	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=613;ReadPosRankSum=0.100;SC=GCACTTCCCACGCATGTCATT;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=38;WE=160920974;WS=160920956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr1	160921230	rs4656971	T	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CATCTTGTGTTCTGCTCACCT;SOR=0.468;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=160921238;WS=160921220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	160969008	rs3831190	T	TG	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=21;PP=1159;SC=CAGGTATGGGTGGGGTAACAG;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=29;WE=160969016;WS=160968998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	160969585	rs790056	C	T	5397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=75;PP=2965;SC=TCACTCACGGCACCTACAGTA;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=92;TCR=75;TR=167;WE=160969593;WS=160969575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	160971146	rs790055	A	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=17;PP=917;SC=CAGGGAGCCTAAGGAGAAAGA;SOR=1.077;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=160971154;WS=160971136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	160990875	rs28365980	TC	CA	8972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=1.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	160990878	rs28365978	C	T	8923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.53;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	161009645	rs185784991	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=256;ReadPosRankSum=0.045;SC=AAAGGGGCACGGGATTAGGCT;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=13;WE=161009653;WS=161009635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	161010774	rs2516841	A	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=338;SC=TATGGTAGCTAGGTGTGGTGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=161010782;WS=161010764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	161010791	rs2073657	C	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=215;SC=GTGTCTCACACCTGTAATCCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=161010799;WS=161010781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	161011716	rs2774276	G	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=16;PP=652;SC=GCTTCTATCCGTTGGGGTGGT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=161011724;WS=161011706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	161011736	rs144100508	GGA	G	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.053;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr1	161013121	rs2516839	C	T	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=38;PP=1101;SC=GTCTTTGTATCTCCTGATTCA;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=161013129;WS=161013111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	161017556	rs2774279	C	T	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.89;NF=48;NR=44;PP=2065;SC=ATGCATATGACCTGCGCTGAG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=161017564;WS=161017546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	161019040	rs3813609	G	C	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=69;PP=2571;SC=GCGGAGTCCAGGGAACAGCAG;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=147;WE=161019048;WS=161019030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	161022380	rs4396136	G	A	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=65;PP=2505;SC=CATGAAGGTCGGTGCAGGGGA;SOR=0.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=161022388;WS=161022370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	161022639	rs3813610	C	G	60.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=39;SC=AGAGAGGGACCTCAGGCACCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=161022647;WS=161022629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	161043735	rs4656285	A	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=15;PP=380;SC=GGTGGCAGTGAGGCTGAAGAG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=161043743;WS=161043725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	161043764	rs4656978	G	A	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=245;SC=TGCTGTGTGCGTGTGCATACT;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=161043772;WS=161043754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	161047125	rs60601836	CTATA	C	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=459;SC=CTGTCACATACTATATATAGC;SOR=3.258;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=161047136;WS=161047118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	161049358	rs3820097	G	A	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=20;PP=1089;SC=GGCTCAGACCGTACCCAGAGA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=161049366;WS=161049348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	161049383	rs77444104	G	T	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=22;PP=1191;SC=CGCTTACCCAGCACTCGGAGC;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=161049391;WS=161049373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	161132777	rs17356051	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=31;PP=1233;SC=AACCGCCGAGGCCGCCGGGCT;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=161132785;WS=161132767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	161143351	rs377565818	A	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=0.319;SC=GAGGACAGGGATCCAGACTGG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=12;WE=161143359;WS=161143341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	161162173	rs7512012	G	A	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=292;SC=GGTGAGTGCCGGCCACCATGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=161162181;WS=161162163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	161163037	rs4233367	T	C	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=17;PP=800;SC=GCCCAGTGCCTGGGCCTGGCA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=161163045;WS=161163027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	161163633	rs3813622	C	T	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=62;PP=2175;SC=AGGCACAGAACGGAAGTGGGG;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=109;WE=161163641;WS=161163623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	161167698	rs4589131	T	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=1008;SC=GCCAGAAGTGTAAGTGGGTGG;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=161167706;WS=161167688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	161168004	rs33941127	C	T	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=77;PP=2965;SC=GAGATGCCACCGACTCCGGAT;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=134;WE=161168012;WS=161167994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	161176137	rs4656993	A	G	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=17;PP=1012;SC=ACTCCTTGCTATCTTTTGGGG;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=161176145;WS=161176127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	161184059	rs10629771	C	CTG	522.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=800;ReadPosRankSum=1.011;SC=AAATTGGCCTCTGTGTGTGTG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=16;WE=161184067;WS=161184049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr1	161184097	rs1136224	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=376;SC=GTGTATGTTCATGTACACTTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=161184105;WS=161184087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	161185058	rs2070901	G	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=18;PP=978;SC=TCAGGGAACTGCTCGCTGAGC;SOR=1.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=161185066;WS=161185048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	161187665	rs2070902	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=215;SC=TTCCCTTAGACGGCTCCCCTC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=161187673;WS=161187655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	161192845	rs141599125	CCACACA	C	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=32;PP=1363;SC=AAGCTCCTGCCCACACACACA;SOR=1.828;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=35;WE=161192860;WS=161192835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	161196166	rs3813628	A	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GACCATGTGGAAGTTTCTGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=161196174;WS=161196156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	161197244	rs4233368	C	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GGGCCGTAACCTGATTCTCTG;SOR=1.508;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=161197252;WS=161197241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	161200487	rs4073054	C	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=576;SC=CTAGACCCCACGATACCTGAA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=161200495;WS=161200484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	161201350	rs11265567	G	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	161201350	.	GCG	TCA	285	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=58.46;NF=0;NR=5;PP=285;QD=67.6935749724;SC=GAGTGCAGTGGCGTGATCTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=161201360;WS=161201340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	161201352	rs11265568	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.384;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	161202605	rs2307424	G	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=641;ReadPosRankSum=0.082;SC=ACCGGAAGACGGGCAGGTCCT;SOR=0.597;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=42;WE=161202613;WS=161202595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr1	161204906	rs3123553	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=5;PP=241;SC=ACTCCAGCCTGGGCAACAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=161204914;WS=161204896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	161205898	rs6686001	G	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=1.352;SC=GGTCCCCAGGGGTGGATAGTA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=161205906;WS=161205888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	161209164	rs79769623	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=1.019;SC=AGCCGAGATCGCAGCACTGCA;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=7;WE=161209172;WS=161209154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	161228843	rs16832733	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=183;ReadPosRankSum=0.417;SC=CGGGATCCCAGGGAGGCGAGG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=11;WE=161228851;WS=161228833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	161275729	rs34307129	G	A	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=33;PP=2018;SC=CAGCTTTGGTGCTTCTGCTGT;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=97;WE=161275737;WS=161275719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	161276434	rs6674383	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=12;PP=713;SC=CCCCCAACCTATCAGTCCTCC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=161276442;WS=161276424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	161279518	rs11579939	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=4;PP=634;SC=GTCACCTTCCTGCTCCTGCTT;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=29;WE=161279526;WS=161279508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	161483656	rs56157533	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=8.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-8.481;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.650;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,51:0.23:223
chr1	161487863	rs143182858	C	T	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQRankSum=-2.843;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,98:0.49:199
chr1	161488017	rs150991486	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.297;NF=6;NR=19;PP=397;ReadPosRankSum=-1.480;SC=TAAAGGAAAATTTAAATGGAG;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=25;WE=161488025;WS=161488007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	161495040	rs63749092	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.630;NF=42;NR=24;PP=1271;ReadPosRankSum=-1.195;SC=GCGCAACGTGCTCATTTTTGA;SOR=0.504;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=66;WE=161495048;WS=161495030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr1	161495477	rs72633678	A	T	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=93;PP=2965;SC=GGGGCTCCACACGCATCCCCA;SOR=0.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=117;TCR=93;TR=210;WE=161495485;WS=161495467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	161495885	rs404508	T	C	4385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=62;PP=2856;SC=TAGAGGTGACTTTTGACATTG;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=131;WE=161495893;WS=161495875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	161496134	rs753856	C	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=14.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQRankSum=-5.432;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=2.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,27:0.26:102
chr1	161496178	rs368844	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-6.472;QD=2.02;ReadPosRankSum=-2.670;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,13:0.17:78
chr1	161514542	rs396991	A	C	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=19;PP=1765;SC=TTACTCCCAAAAAGCCCCCTG;SOR=2.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=74;WE=161514550;WS=161514532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	161518333	rs10127939	A	T	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.543;NF=56;NR=48;PP=1593;ReadPosRankSum=-1.343;SC=GCTTGAGATGAGGCTCTCATT;SOR=0.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=233;TCF=123;TCR=110;TR=104;WE=161518341;WS=161518323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,130:0.48:273
chr1	161518908	rs138032965	C	T	375.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.043;NF=2;NR=10;PP=255;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CTCCCCTGCCCTCCTCTGCCC;SOR=2.225;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=161518916;WS=161518898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr1	161561287	rs151302833	A	G	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=217;SC=AGGCCACAGCACAAAATTGGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=161561295;WS=161561277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	161563281	rs149146947	A	AG	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.856;NF=3;NR=6;PP=313;ReadPosRankSum=2.236;SC=AGGTGAGTACAGGTTGTCTCA;SOR=0.793;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=161563289;WS=161563271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr1	161565381	rs76277413	A	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.990;NF=38;NR=17;PP=818;ReadPosRankSum=-0.965;SC=CCAATTTGAGATGAGTAATCC;SOR=1.399;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=166;TCF=100;TCR=66;TR=55;WE=161565389;WS=161565371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,66:0.33:198
chr1	161569419	rs430178	C	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.37;QD=29.67;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	161577204	rs200837054	G	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.94;MQRankSum=-1.143;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.414;SOR=1.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,43:0.36:121
chr1	161577657	rs61802306	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.075;NF=17;NR=19;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CGAGCAGTACGGGGCTGAGGA;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=36;WE=161577677;WS=161577647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr1	161577669	rs61802307	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.951;NF=19;NR=17;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GGCTGAGGATGAGGCCCAGAG;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=36;WE=161577677;WS=161577647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr1	161594226	rs61803008	C	T	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=11;PP=1304;SC=CTCTTATTACCCCCATGGGAT;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=161594234;WS=161594216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	161594246	rs61803009	G	T	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=16;PP=1607;SC=TGGGGGTCATGTGTCTTGAGG;SOR=2.043;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=69;WE=161594254;WS=161594236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	161594525	rs61803010	GT	CG	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=1199;SC=TCTTTGACAAGTGCCAACAGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=161594534;WS=161594515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	161596283	rs418215	G	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.56;QD=30.29;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	161599693	rs76714703	T	C	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.08;QD=30.74;SOR=2.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	161600104	.	A	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQRankSum=-6.635;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.986;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,16:0.18:90
chr1	161600287	rs143868437	AT	A	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.069;NF=0;NR=14;PP=409;ReadPosRankSum=0.319;SC=CAGGAGCCCAATTTTCCCAAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=14;WE=161600295;WS=161600277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	161601133	rs61803027	T	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=527;SC=CCCTTTACTCTCCCAAAGGTC;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=161601141;WS=161601123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	161642985	rs182968886	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.109;NF=28;NR=32;PP=813;ReadPosRankSum=-1.456;SC=GCTACACGCTGTACTCATCCA;SOR=0.602;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=177;TCF=87;TCR=90;TR=60;WE=161642993;WS=161642975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,52:0.30:176
chr1	161676904	rs1340977	T	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=184;SC=CAAATCTGAATGATGAAAGCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=161676912;WS=161676894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	161676970	rs1340978	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=675;SC=GAGACAGTTAAATTTACTTCC;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=161676978;WS=161676960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	161680258	rs6427618	G	A	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=40;PP=1714;SC=CTGGTTTCCCGTACCAGCAGC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=85;WE=161680266;WS=161680248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	161682975	rs6688140	G	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=913;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CTCTGCCTCCGCCGCCAACCC;SOR=0.672;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=48;WE=161682983;WS=161682965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr1	161683136	rs11746	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=999;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TCTGGCCACCGGAAGCCTGGG;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=57;WE=161683144;WS=161683126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr1	161695639	rs7520519	G	T	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=66;PP=2935;SC=TGCCCTATGCGCCAGTGTTCG;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=137;WE=161695647;WS=161695629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	161696088	rs1417582	T	C	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=98;PP=2965;SC=CCGACGCACATCCTGGCTTCT;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=77;TCR=98;TR=175;WE=161696096;WS=161696078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	161696782	rs11585450	G	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=205;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TCCCGGGGCCGGGTGAGTGCC;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=18;WE=161696790;WS=161696772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr1	161696998	rs1875763	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CGAGAAGAACCATGCAAGCCG;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=161697006;WS=161696988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	161697319	rs34868416	G	A	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=49;PP=1755;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CTGCTCAAAGGCCTTCTGAGC;SOR=0.697;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=208;TCF=101;TCR=107;TR=108;WE=161697327;WS=161697309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,122:0.51:240
chr1	161721351	rs7540096	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=55;SC=TTGAGAAGCAAAAATGAAGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=161721359;WS=161721341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	161721707	rs1063178	C	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=841;SC=CAATGGGATACGAAGTGGATA;SOR=1.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=161721715;WS=161721697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	161722779	rs35439833	C	CAAA	508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=7;NR=2;PP=248;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=161722787;WS=161722769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	161736035	rs2298019	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TCGTGCGGCAAAAGTAGTTTG;SOR=1.845;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=12;WE=161736043;WS=161736025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	161751741	rs1058405	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=447;ReadPosRankSum=0.313;SC=TTTGGATTTGATGCCTTGGGA;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=37;WE=161751749;WS=161751731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	161822959	rs2340717	C	T	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=328;SC=GGTGAAACATCCATTTCTATG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=161822967;WS=161822949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	161823011	rs2257107	T	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=-0.446;SC=CTATATTTTATAGGTTAAATC;SOR=0.586;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=14;WE=161823019;WS=161823001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr1	161823197	rs3215134	G	GT	2907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.634;NF=7;NR=46;PP=1917;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TCCCTAGAAGGTTGGTAAACT;SOR=0.476;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=13;TCR=80;TR=53;WE=161823205;WS=161823187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,97:0.61:160
chr1	161928327	rs9482	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=574;ReadPosRankSum=0.056;SC=AAAGTTCGTCAGTTCCTCCTT;SOR=0.689;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=39;WE=161928335;WS=161928317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr1	161954448	rs12726227	C	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	161967681	rs2499836	A	G	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GTTGTTCCCCACCCAGCAGGA;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=169;WE=161967689;WS=161967671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr1	161976234	rs12022536	A	G	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=42;PP=1585;SC=TGATTTGTTCATTTTCCTTGG;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=161976242;WS=161976224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	161976272	rs34863451	G	GA	1753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=37;PP=1153;SC=TCCTGAGAAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.437;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=49;WE=161976290;WS=161976262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	161993192	rs12130792	T	C	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.861;NF=43;NR=64;PP=1947;ReadPosRankSum=0.581;SC=CAGAGCGAAGTAGAGAACTAG;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=186;TCF=78;TCR=108;TR=107;WE=161993200;WS=161993182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,131:0.58:226
chr1	161993269	.	CG	C	1152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.038;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.907;NF=1;NR=30;PP=793;ReadPosRankSum=-0.684;SC=ATGGCTGGGGCGGGGGGTCTC;SOR=1.421;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=31;WE=161993277;WS=161993259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr1	162257033	rs10800405	C	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=0.322;SC=TTCCCCACACCTGTCTGGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=162257041;WS=162257023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	162313518	rs3751285	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=674;ReadPosRankSum=-1.746;SC=GCATATCTGAACAACTTTAGA;SOR=0.890;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=38;WE=162313526;WS=162313508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr1	162313597	rs347278	T	C	5822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=83;PP=2965;SC=TCCTCACCCATCCTGTTCTTC;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=179;WE=162313605;WS=162313587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	162313735	rs3751284	C	T	4931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=80;PP=2965;SC=ATGGAGAGAGCGAGAGGAACA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=157;WE=162313743;WS=162313725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	162335052	rs905721	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=344;ReadPosRankSum=1.293;SC=CCCAGATGCCCATGCTGCCCG;SOR=2.380;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=18;WE=162335060;WS=162335042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr1	162335424	rs1964052	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=438;SC=GTCACTTTCCTTAAGTTTTTG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=162335432;WS=162335414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	162344390	rs164159	A	G	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=56;PP=1673;SC=CGTGCTGGGTATCCCCCAAGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=162344398;WS=162344380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	162345091	rs164181	G	A	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=688;SC=TGGTGAGAGCGCTGTGTTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=162345099;WS=162345081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	162345199	rs164182	T	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=598;ReadPosRankSum=-0.608;SC=AATGTCTGGGTTATAGAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=44;WE=162345207;WS=162345189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr1	162348637	rs164187	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.296;SC=GGGAGCCTGGCGGTTCCAGGG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=162348645;WS=162348627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	162348662	rs164188	C	T	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=385;SC=CACCACTCCTCGTAGCAGGTC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=162348670;WS=162348652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	162367071	rs17852003	C	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1617;ReadPosRankSum=-1.193;SC=GCCTTATCTTCAAGGCAAGAC;SOR=0.882;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=191;TCF=102;TCR=89;TR=99;WE=162367079;WS=162367061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,113:0.51:222
chr1	162367235	rs164124	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=536;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCTGAAAGTTGTATCTTTAAA;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=30;WE=162367243;WS=162367225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr1	162467014	rs10919549	C	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=679;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CCTCCAGGTACCAGGCTTCCA;SOR=1.100;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=42;WE=162467022;WS=162467004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr1	162470961	.	A	AT	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=60.61;NF=0;NR=4;PP=34;QD=10.75;SC=ATTTATGATGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=162470969;WS=162470951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	162546863	rs12129762	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=1.284;SC=CACAGACATATTTCTTGTTAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=162546871;WS=162546853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	162560360	.	T	TTCTC	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.666;NF=1;NR=12;PP=557;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CCTCTTGGACTTCTCTCTCTC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=13;WE=162560368;WS=162560350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	162722846	rs1632311	C	G	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=741;SC=AAAAATAAAACCATGTCCTCT;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=162722854;WS=162722836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	162725655	rs1115570	A	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=208;SC=TCAACCAATCAGTATTTATTT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=162725663;WS=162725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	162737116	rs2298258	C	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=1.771;SC=TCATCATCCTCTGGAGGCAGT;SOR=0.768;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=18;WE=162737124;WS=162737106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	162740327	rs1780003	T	C	5926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.693;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GTGGGCAGGGTGTCAAGGGAG;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=82;TCR=107;TR=188;WE=162740335;WS=162740317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chr1	162742180	rs1704762	T	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=681;SC=CCTCTGGATTTCAGTATTGGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=162742188;WS=162742170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	162743418	rs1355287	G	T	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=57;PP=1811;SC=TTTTCCTTTAGGTATTTCATC;SOR=1.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=162743426;WS=162743408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	162748588	rs907074	C	A	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=494;SC=GCAAGTCCTGCCTTAGCAGGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=162748596;WS=162748578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr1	162754244	rs61812969	T	G	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.65;QD=31.72;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	162760551	rs1704754	C	T	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=10.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQRankSum=0.136;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.426;SOR=1.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr1	162760554	rs71519246	T	C	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.77;QD=34.76;SOR=2.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	162765475	rs2684884	G	C	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.16;QD=26.90;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	162766476	rs1780019	C	T	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.486;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.012;NF=35;NR=61;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AGGTAATTTTCGTTTTATGGA;SOR=0.997;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=193;TCF=78;TCR=115;TR=96;WE=162766484;WS=162766466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,119:0.50:236
chr1	162822771	rs2684878	A	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=91;ReadPosRankSum=0.158;SC=ATGCCTATTCATGTTGGCCCA;SOR=0.292;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=9;WE=162822779;WS=162822761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr1	163038613	rs7515900	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.570;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=1.689;SC=CCAGCTATTTCTCTCCACCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=163038621;WS=163038603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	163038853	rs10917671	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=224;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TTTTTTACAGGCATATGAATA;SOR=1.414;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=15;WE=163038861;WS=163038843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	163117351	rs3768560	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TTGATGAGGGGTGAAGAGGGA;SOR=1.071;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=9;WE=163117359;WS=163117341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	163122528	rs1354939	G	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=521;ReadPosRankSum=0.028;SC=AAAACAGTCAGCTGGAGAAAT;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=23;WE=163122536;WS=163122518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr1	163142537	rs10917691	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=297;SC=GGAGTTCATTGTTCAGGGAAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=163142545;WS=163142527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	163142555	rs12035879	G	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=241;SC=AATGACTAATGTTATTGCATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=163142563;WS=163142545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	163172574	rs2292270	G	C	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=31;PP=1696;SC=AAATAACTTGGTTCTCACCTT;SOR=1.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=163172582;WS=163172564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	163187263	rs2814368	G	A	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=441;SC=AGTCTTTCCTGTAAATTATAA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=163187271;WS=163187253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	163297322	rs16852612	A	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=544;ReadPosRankSum=-1.075;SC=TACAAATAGTATATGGAATTC;SOR=0.815;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=31;WE=163297330;WS=163297312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr1	163297381	rs12691496	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=257;ReadPosRankSum=0.722;SC=AAAATTATGGGGTTTTTTTTG;SOR=1.085;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=163297389;WS=163297371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	163298548	rs2271226	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=0.373;SC=CAGAAATCTCTTTCTGAAAAT;SOR=0.072;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=163298556;WS=163298538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	163306431	rs7541849	G	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATCCTATACAGTTTTATTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=163306439;WS=163306421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	163309302	rs2999852	C	T	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=81;PP=2330;SC=CTTTAAAAAACAAAATTTGTT;SOR=2.224;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=23;TCR=81;TR=104;WE=163309310;WS=163309292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	163313539	rs11802875	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=-1.372;SC=CTAAAATTGTCGGTGGTTTCT;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=10;WE=163313547;WS=163313529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr1	163317811	rs12758792	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=0.157;SC=TTCAAAACCTCGGTATTTTCC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=163317828;WS=163317801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	163317820	rs116491450	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=-2.912;SC=TCGGTATTTTCCAAAAGAGTT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=163317828;WS=163317801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	164532433	rs142958296	T	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=693;ReadPosRankSum=1.236;SC=CAGTTTGATCTTGAGAGTCCA;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=50;WE=164532441;WS=164532423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr1	164789444	rs1538488	A	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=380;SC=CCAATATGTCACCAGGTGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=164789452;WS=164789434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	165173216	rs1354509	A	G	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=47;PP=1427;SC=CTAGGAAACAATCACCCAGGT;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=165173224;WS=165173206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	165175374	rs4656435	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.740;SC=GGGATGAGGTGACATCAGTGG;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=165175382;WS=165175364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	165180089	rs1532815	T	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=18;PP=516;SC=TATATAATACTTGAGGAGGCC;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=165180097;WS=165180079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	165180174	rs181684163	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AACATTGCTTCCCTTCAGGTA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=165180182;WS=165180164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	165218679	rs9970062	C	T	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=43;PP=2786;SC=CCAGGCTGAGCAGCTCCCGCT;SOR=1.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=92;TCR=43;TR=135;WE=165218687;WS=165218669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	165324833	rs76307003	A	G	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGAGGAGAAGAAACGATGCGT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=43;TCR=89;TR=72;WE=165324841;WS=165324823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr1	165375895	rs283697	A	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=394;SC=CCGCTAGCCCAATGGAATTAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=165375903;WS=165375885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	165376043	rs283696	T	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=25;PP=1051;SC=GCCAGCACTGTCTCACCTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=165376051;WS=165376033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	165376227	rs111545739	C	CCG	931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.35;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	165376231	.	CTG	C	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.43;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	165377389	rs283692	T	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=151;SC=GGAGGACCAATAACATGGGAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=165377397;WS=165377379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	165377552	rs2134095	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=949;ReadPosRankSum=-0.371;SC=GCTCAGTTAGGACTCTGTTAA;SOR=0.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=59;WE=165377560;WS=165377542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr1	165378729	rs66800417	TACAC	T,TAC	2622.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.75;QD=40.98;SOR=1.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,34,30:0.53,0.47:64
chr1	165378733	rs12406497	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.943;QD=17.01;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	165378733	.	CAC	TAT	1183	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=59.2;NF=14;NR=9;PP=1183;QD=53.7594728201;SC=TGTGTATACACACACACACAC;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=23;WE=165378743;WS=165378719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr1	165378735	rs138671935	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.943;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	165380027	rs185905	C	T	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=952;ReadPosRankSum=-2.154;SC=TGAAAAGCTGCTTGTCAGCAG;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=60;WE=165380035;WS=165380017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr1	165386567	rs2281986	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=227;ReadPosRankSum=1.504;SC=ATCACTTGGGCATTGGGACAG;SOR=0.317;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=165386575;WS=165386557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	165389129	rs1128977	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=1.378;SC=CTCCACAGATGGCACAGATGT;SOR=1.007;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=17;WE=165389137;WS=165389119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	165389285	rs157870	C	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=574;ReadPosRankSum=0.587;SC=AAGCACAGAGCCAGAGTAAAT;SOR=1.063;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=34;WE=165389293;WS=165389275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr1	165398115	rs113471	T	C	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=720;ReadPosRankSum=0.520;SC=CTGGGGTATCTGTGTAGCTGG;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=56;WE=165398123;WS=165398105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr1	165533005	rs453717	C	A	6289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GGAAGTCAGCCGGCGGATTTT;SOR=0.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=187;WE=165533013;WS=165532995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr1	165533188	rs367199	A	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=530;SC=AAAATCTCTGATGGCCATTTC;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=165533196;WS=165533178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	165601466	rs9333378	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=524;ReadPosRankSum=0.969;SC=TTCCTTCCCTGGGGACAGGAG;SOR=0.909;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=33;WE=165601474;WS=165601456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr1	165601566	rs9333379	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=194;ReadPosRankSum=1.973;SC=GATTTTAGATTGCTGGTGGGT;SOR=0.663;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=16;WE=165601574;WS=165601556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	165619079	rs6681	C	T	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=805;SC=CTTCCACAGACGCAAGATGGC;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=165619087;WS=165619069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	165620401	rs9333475	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=0.781;SC=GCCCTTAGTGCGCTGTATTTG;SOR=3.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=14;WE=165620409;WS=165620391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	165621322	rs77176546	TATTATC	T	1675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.216;NF=3;NR=25;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.891;SC=TTCACTGAGCTATTATCAGGG;SOR=0.459;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=28;WE=165621335;WS=165621312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,46:0.41:112
chr1	165636446	rs72698055	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=0.372;SC=TGGCTCCTATGAGGGCAAACT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=165636454;WS=165636436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	165638405	rs17416948	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=793;ReadPosRankSum=-0.807;SC=TGAATAATAGTCATACGAATA;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=43;WE=165638413;WS=165638395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr1	165648710	rs1143660	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=711;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GGCCATCAGCGCCCCCTTTAC;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=50;WE=165648718;WS=165648700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr1	165649715	rs16849374	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.380;SC=ATACTGGTTTTGTCCTCACCT;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=165649723;WS=165649705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	165721223	rs7512095	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=177;ReadPosRankSum=1.486;SC=CTTGCAACTTTTCTTTAAGTT;SOR=1.329;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=165721231;WS=165721213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr1	165859630	rs477033	C	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=59;PP=2332;SC=GGGTATGTATCTGTATTGGTG;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=165859648;WS=165859620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	165859640	rs138035087	G	GTGT	2275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.559;NF=8;NR=26;PP=1288;ReadPosRankSum=0.446;SC=CTGTATTGGTGTGTTGGGGGG;SOR=0.587;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=34;WE=165859648;WS=165859620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr1	166029970	rs4353067	T	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=574;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TGTCATTCCCTAAAAGCAGAT;SOR=0.791;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=42;WE=166029978;WS=166029960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr1	166124134	rs896402	A	G	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=95;PP=2965;SC=TGTAAGTTAAAAATGATTCTG;SOR=1.198;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=59;TCR=95;TR=153;WE=166124142;WS=166124124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	166590254	rs558874	A	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=785;ReadPosRankSum=-0.561;SC=TTGCATAGTAAATGTGTGTGT;SOR=1.255;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=44;WE=166590262;WS=166590244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr1	166591043	rs530513	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=0.096;SC=TACTCAGACTTATGGGGTTTT;SOR=0.789;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=18;WE=166591051;WS=166591033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr1	166818566	rs2075946	A	G	3243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=68;PP=1895;ReadPosRankSum=0.799;SC=TGCGGCGGGCATTCCGAGGCC;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=94;TCR=118;TR=123;WE=166818574;WS=166818556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,148:0.59:249
chr1	166827602	rs10800270	A	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=-0.577;SC=AATCTTATTTAAAAAATCTTT;SOR=0.776;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=14;WE=166827610;WS=166827592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr1	166838866	rs71253526	A	AATTTT	733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=761;SC=CTTTATACTTAAAGTATCCAC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=14;WE=166838874;WS=166838856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	166839174	rs4657609	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TTAAAGAGACGGGGTTTTTTA;SOR=0.202;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=29;WE=166839182;WS=166839164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	166905927	rs33958744	C	T	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=657;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CCCACCAGGACGAAGAAGAGG;SOR=0.575;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=49;WE=166905935;WS=166905917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr1	166944256	rs59211434	TTC	T	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	166944273	rs12116418	T	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	166958601	rs2296837	T	C	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1830;ReadPosRankSum=0.033;SC=TGCCGAACCGTAAGGCCAGCC;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=134;TCR=106;TR=110;WE=166958609;WS=166958591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,131:0.43:306
chr1	166958710	rs11578336	T	G	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=51;PP=1148;ReadPosRankSum=0.991;SC=TTACTGCTCCTCAGACTGGGC;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=55;TCR=106;TR=77;WE=166958718;WS=166958700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr1	166958937	rs41269702	G	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=0.737;SC=GGATCCTCACGGCTGTTTCTC;SOR=0.765;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=16;WE=166958945;WS=166958927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	166961857	rs7511933	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=334;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CAACTAAAGAGGCTTTTGTGG;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=166961865;WS=166961847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	166963234	rs3736988	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TTTAAAATTTTTGCTTCTCAA;SOR=0.330;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=14;WE=166963242;WS=166963224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr1	166974420	rs1041238	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=933;ReadPosRankSum=0.712;SC=ATATCTGTATTTGTTTCCACT;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=47;WE=166974428;WS=166974410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr1	167059336	rs2281964	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GGCACTGGTCCGGAATGTGTA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=167059344;WS=167059334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	167059462	rs2281963	G	C	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=742;ReadPosRankSum=0.801;SC=GGGCACTGGAGAGAAAAGGGG;SOR=0.742;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=50;WE=167059470;WS=167059452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr1	167059575	rs28384507	G	T	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=893;ReadPosRankSum=0.807;SC=GCAGCCTCCAGACAGGTCTGA;SOR=0.835;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=61;TCR=100;TR=67;WE=167059583;WS=167059565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,82:0.43:189
chr1	167082869	rs12122365	G	A	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=16;PP=1836;SC=TAAAATCAAAGCCAGGTTTCT;SOR=2.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=63;TCR=16;TR=79;WE=167082877;WS=167082859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	167088473	rs1410244	C	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=488;ReadPosRankSum=0.560;SC=CAGGTCCCTGCCTCTTCCCGC;SOR=0.745;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=29;WE=167088481;WS=167088463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	167095163	rs267745	G	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=590;ReadPosRankSum=0.900;SC=ACCCCAATGAGGGCTTCCTGA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=46;WE=167095171;WS=167095153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr1	167095765	rs6668826	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=851;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGCAGGAGGCGCCGCGCAGAC;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=58;WE=167095773;WS=167095755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr1	167095881	rs3795605	G	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=510;ReadPosRankSum=-0.321;SC=AGAGGAGGCGGCAGACAGGAG;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=29;WE=167095889;WS=167095871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr1	167097070	rs61748781	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=634;ReadPosRankSum=-1.169;SC=TATTCTTCCCGCAGTAATTCC;SOR=1.157;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=39;WE=167097078;WS=167097060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr1	167097739	rs2281959	C	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=380;ReadPosRankSum=0.266;SC=CGGAGAAGCACTGACAGGGAG;SOR=0.728;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=24;WE=167097747;WS=167097729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr1	167353258	rs35617253	AT	A	976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.65;QD=26.40;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	167367193	rs7524019	C	T	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=25;PP=1871;SC=TCACTGTGCTCAGCTAATTTT;SOR=1.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=89;WE=167367201;WS=167367183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	167382374	rs10753757	A	C	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=34;PP=1058;SC=CTTTTTCTTAATTTGGTGGCA;SOR=1.342;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=167382382;WS=167382364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	167382399	rs67647055	AGTGT	A	747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=667;SC=CGTGTGTGTGAGTGTGTGTGT;SOR=1.493;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=167382410;WS=167382389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	167403504	rs952962	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=239;SC=CACCCCCCTCATCCTCAGCCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=167403512;WS=167403494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	167404078	rs3108156	G	A	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=19;PP=822;SC=GACATTACTCGATCCAAGAAG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=167404086;WS=167404068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	167407858	rs33937946	G	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=626;ReadPosRankSum=0.076;SC=CCAAAACATCGTACTCCTCTC;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=46;WE=167407866;WS=167407848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr1	167408670	rs840016	C	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=829;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CGTTACTGCTCCGCGAGGGCG;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=51;WE=167408678;WS=167408660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr1	167515272	rs7513428	T	C	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=21;PP=1085;SC=AAACCCCCCTTGCCTTAGAAG;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=167515280;WS=167515262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	167599583	rs3738221	G	A	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=519;ReadPosRankSum=1.310;SC=ACGGCCGGGAGCGGAGGGGAC;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=30;WE=167599591;WS=167599573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr1	167734793	rs763283	C	T	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=18;PP=1131;SC=GTCCTACTTTCAACTACCCTT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=167734801;WS=167734783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	167802517	rs182120205	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-0.741;SC=ATTTATGGACCAGAAACAAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=4;WE=167802525;WS=167802507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	167806696	rs1034464	T	C	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=39;PP=1214;SC=GTCCCCATTGTATCTTAGGTG;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=167806704;WS=167806686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	167815030	rs12048517	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=762;ReadPosRankSum=0.202;SC=TACAGAATCGAATCCTGTGGC;SOR=0.623;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=40;WE=167815038;WS=167815020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr1	167817639	rs203795	A	G	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.877;NF=39;NR=37;PP=1185;ReadPosRankSum=0.343;SC=TCAGTCTGACACCACTTGTGA;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=76;WE=167817647;WS=167817629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,82:0.56:147
chr1	167823505	rs3738235	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	167823512	rs3738236	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.999;SOR=1.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr1	167825485	rs2071921	T	C	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1266;ReadPosRankSum=-1.671;SC=ACTGCACCAATGACAATGTAG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=98;TCR=120;TR=99;WE=167825493;WS=167825475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,116:0.43:271
chr1	167825606	rs2071922	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=706;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCTTCTCCATAAATCTCCAGG;SOR=0.369;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=48;WE=167825614;WS=167825596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr1	167830006	rs7518237	G	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TCTGGATACTGCAGATATACA;SOR=0.063;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=18;WE=167830014;WS=167829996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	167849414	rs203849	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=163;ReadPosRankSum=1.705;SC=CACTGGCAACACCGATGGATA;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=14;WE=167849422;WS=167849404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr1	167906239	rs203788	A	C	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=18;PP=603;SC=TGCGGAGTCGATACCTGGGTG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=167906247;WS=167906229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	168013850	rs11558511	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=296;ReadPosRankSum=0.540;SC=TCAGAGGATGTGACAAAATAT;SOR=0.969;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=28;WE=168013858;WS=168013840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr1	168014204	rs41271647	T	A	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1731;ReadPosRankSum=0.306;SC=GACCTCAATCTTGATCGCTCT;SOR=0.873;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=227;TCF=120;TCR=107;TR=117;WE=168014212;WS=168014194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,137:0.52:263
chr1	168035104	rs380095	G	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=473;SC=TGACTAGGCAGCAGTAGAGTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=168035112;WS=168035094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	168106716	rs6664903	T	C	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=59;PP=1914;SC=AGTGAATTCGTCCCGAAGCCA;SOR=1.563;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=88;WE=168106724;WS=168106706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	168200733	rs11588504	T	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=20;PP=1274;SC=TATATGTATTTTTTTTTTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=168200741;WS=168200723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	168206118	rs55947108	GTTTAA	G	3353.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=47;PP=2598;SC=CACAGAAGCTGTTTAATTTAA;SOR=2.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=47;WE=168206130;WS=168206108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	168208308	rs12142742	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=27;PP=974;SC=AAGCCCATTCTGCTGGATAAT;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=62;WE=168208316;WS=168208298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	168262289	rs7543224	A	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	168262299	rs7520743	C	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.732;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr1	168274201	rs4656579	G	A	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=20;PP=1068;SC=TTTGGTGTGGGAGTTCACAGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=168274209;WS=168274191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	168278264	rs1883148	G	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=413;SC=TGGCAACAGGGTGGAGTTCTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=168278272;WS=168278254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	168282261	rs3885717	T	A	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=44;PP=1444;SC=AGGAGCCTCTTTGCACAGCGA;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=168282269;WS=168282251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	168510122	rs470733	T	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.755;NF=7;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GTGAGTATAATCTCAGTCCAT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=168510130;WS=168510112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	168511155	rs76400946	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.288;NF=15;NR=5;PP=302;ReadPosRankSum=1.405;SC=TTCCTGAGGATGGCAGCATTT;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=20;WE=168511163;WS=168511145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	168513067	rs61801330	C	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.850;NF=11;NR=9;PP=270;ReadPosRankSum=0.958;SC=AGTCAAAACCCGAGTCAAACC;SOR=0.385;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=20;WE=168513075;WS=168513057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr1	168513109	rs3820404	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.669;NF=8;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=1.596;SC=TTGCCTCCCTATTCTTTATCT;SOR=1.058;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=20;WE=168513117;WS=168513099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,20:0.23:88
chr1	168545949	rs34933908	G	A	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.944;NF=59;NR=57;PP=1844;ReadPosRankSum=-2.206;SC=AAGTGGAGAAGCTGTCTGTGA;SOR=0.608;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=116;WE=168545957;WS=168545939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:15,140:0.90:155
chr1	168549422	rs6427130	C	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=33;PP=1108;SC=TAATGTGAGTCTGCCTCCTCA;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=168549430;WS=168549412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	168550535	rs79981832	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=-1.190;SC=GTTTATACTCACCTTTTATGA;SOR=0.257;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=14;WE=168550543;WS=168550525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	168665747	rs78760104	C	CT	1146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.214;NF=8;NR=15;PP=895;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CTCCTGTCCCCGGCCCCTTTC;SOR=0.613;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=23;WE=168665755;WS=168665737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr1	168665974	rs524705	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.132;SC=GGACACTTAATCTCACTTTGC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=168665982;WS=168665964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	168670140	rs113747482	TGTGTGG	T	509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=1.778;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	168683471	rs78032017	G	A	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=1142;ReadPosRankSum=2.404;SC=GCAGGAATATGGGCACCTCTT;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=72;WE=168683479;WS=168683461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,84:0.59:142
chr1	168698173	rs1052591	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=886;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GGCTCTGTGGCGTGGGCATGC;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=54;WE=168698181;WS=168698163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr1	169076212	rs1200128	G	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATCTTTCCCGGGCGGCGCAT;SOR=0.148;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=9;WE=169076220;WS=169076202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	169080837	rs1200138	C	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=896;SC=ATAATGTAGTCTTAAAGCAAC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=169080845;WS=169080827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	169094100	rs968304	T	A	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=24;PP=1712;SC=CCTACTAATGTTTTTCTCTCT;SOR=1.561;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=169094108;WS=169094090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	169099037	rs10919070	A	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.697;SC=GTCGTTATAAACTTGGGCACT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=169099045;WS=169099027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	169099061	rs1200157	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=210;SC=TTTCATTTCAGCAAAATCACA;SOR=2.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=169099069;WS=169099051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr1	169102223	rs61803315	G	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.004;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=500;ReadPosRankSum=-1.234;SC=GCTCCAGTTTGAAGTTCCATT;SOR=1.404;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=26;WE=169102231;WS=169102213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	169138027	rs10919082	A	G	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=648;ReadPosRankSum=0.178;SC=GTATCTATATATATGTTATGC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=37;WE=169138035;WS=169138017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr1	169138181	.	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=298;ReadPosRankSum=0.703;SC=CAGCACAGTTCAAACATTGTT;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=15;WE=169138189;WS=169138171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	169138307	rs4656656	C	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=817;ReadPosRankSum=-2.392;SC=TGTATGCCAACCAGAAAAAAA;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=23;WE=169138326;WS=169138297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr1	169138318	rs4656657	T	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=817;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CAGAAAAAAATATCTAAATTC;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=24;WE=169138326;WS=169138297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr1	169138868	rs3737681	C	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=373;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CTATATGAAACGCTAACTTAT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=21;WE=169138876;WS=169138858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	169159866	rs7526721	G	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=123;ReadPosRankSum=1.193;SC=AAAAATGTTTGATTTTAATAC;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=9;WE=169159874;WS=169159856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	169160037	.	T	TAAGAAAACAACCAGAAAAATGGTGAAG	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	169200111	rs10800420	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TTAACTCTCCCCTTTTAATTG;SOR=1.158;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=11;WE=169200119;WS=169200101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	169216412	rs2040445	C	G	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=811;SC=AAATAAAGTACGGTACTGAGT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=169216420;WS=169216402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	169256501	rs4589164	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=533;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CATTGCTCTCCTATTAACAAA;SOR=0.305;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=33;WE=169256509;WS=169256491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr1	169272299	rs10919130	A	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=348;ReadPosRankSum=-0.326;SC=ATTATTCTCAAGTAATAAATT;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=27;WE=169272307;WS=169272289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr1	169272451	rs10800427	A	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.95;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	169272451	.	AGG	TGA	434	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=18;PP=434;QD=24.3733937431;SC=ATAATCAAAAAGGCAATAGTT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=20;WE=169272461;WS=169272441;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,20:0.87:23
chr1	169272453	rs10800428	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.94;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	169279196	rs34054662	T	TA	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=-2.293;SC=CTGAAAATGATAAAAAAATTA;SOR=0.307;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=5;WE=169279204;WS=169279186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	169293721	rs1140523	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=541;ReadPosRankSum=1.070;SC=CAATGAAAACGAATCTTTCAC;SOR=1.008;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=38;WE=169293729;WS=169293711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,41:0.39:105
chr1	169345704	rs12563090	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=207;ReadPosRankSum=-1.665;SC=TTGAATATAGGGTATAGCATG;SOR=0.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=15;WE=169345712;WS=169345694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	169349608	rs3830533	C	CTA	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=1.453;SC=AGTAACTATACTGTTAAATCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=169349616;WS=169349600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	169351596	rs3905328	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=0.408;SC=CATGGAAAGCATTTGGCATTA;SOR=1.389;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=22;WE=169351604;WS=169351586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr1	169390957	rs35107735	A	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=165;ReadPosRankSum=1.109;SC=GGAGGCAAAAACCCCTGACTG;SOR=0.273;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=11;WE=169390965;WS=169390947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	169391154	rs3820059	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=456;ReadPosRankSum=1.305;SC=ATAATTTTTAAAAGTAGTAGT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=31;WE=169391162;WS=169391144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	169394226	rs10919168	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=412;ReadPosRankSum=0.271;SC=TGTTATGCCCACTCTAGAGGA;SOR=1.101;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=23;WE=169394234;WS=169394216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	169435027	rs2678166	C	T	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=12;PP=1216;SC=AAAAATCAAACACATCCAGGC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=169435035;WS=169435017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	169455703	rs72706085	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=0.693;SC=TGTATTCATCCGCCATGGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=15;WE=169455711;WS=169455693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	169484552	rs3820060	T	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=0.229;SC=CCAGGCACCTTAAGAACTAAG;SOR=2.808;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=14;WE=169484560;WS=169484542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr1	169492676	rs9332643	C	T	373.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=0.626;SC=CAGCTTTCTTCAGAACTAAAG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=12;WE=169492684;WS=169492666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr1	169493953	rs12131397	A	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=271;ReadPosRankSum=0.584;SC=ACTACATTGTAGTAGAGAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=20;WE=169493961;WS=169493943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr1	169494196	rs2301515	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.324;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=1.363;SC=AAAATATATACAATAAAGTAA;SOR=0.199;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=34;WE=169494204;WS=169494186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr1	169498834	rs6009	T	C	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=6;PP=1313;SC=GATCAAAGTCTGAGGAAAATA;SOR=3.500;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=56;WE=169498842;WS=169498824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	169498975	rs6030	T	C	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CTCATGTCCATAGGCATGTTG;SOR=0.515;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=63;WE=169498983;WS=169498965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr1	169499190	rs2157581	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=1.221;SC=AATGAATGGCATAATAAGCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=169499198;WS=169499180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	169499951	rs9332620	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=207;ReadPosRankSum=1.997;SC=GAAATAACCCCGACTCTTCCA;SOR=1.112;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=16;WE=169499969;WS=169499941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	169510233	rs9332607	G	A	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.489;NF=52;NR=53;PP=1664;ReadPosRankSum=1.319;SC=CTAGAGAAAGGGTTGTATGGC;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=105;WE=169510241;WS=169510223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,127:0.52:243
chr1	169510380	rs9287090	G	A	2867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.403;NF=69;NR=62;PP=1947;ReadPosRankSum=0.125;SC=GCATCTGACCGAGGGCTGGGG;SOR=0.564;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=266;TCF=146;TCR=120;TR=131;WE=169510388;WS=169510370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,140:0.48:291
chr1	169510524	rs1800594	A	G	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-4.736;NF=61;NR=54;PP=1783;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CGAGGGCTGGAGAAAGGTTTG;SOR=0.673;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=115;WE=169510532;WS=169510514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,119:0.50:240
chr1	169510641	.	C	T	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.573;ClippingRankSum=0.000;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=1753;ReadPosRankSum=-0.676;SC=GAGAAATGGGCATCTGACCGA;SOR=0.659;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=206;TCF=104;TCR=102;TR=107;WE=169510649;WS=169510631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,129:0.54:240
chr1	169511555	rs6032	T	C	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1280;ReadPosRankSum=0.598;SC=GGAGGGTCCTTCCAGGGCCTC;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=75;WE=169511563;WS=169511545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,95:0.45:209
chr1	169511734	rs4525	T	C	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1297;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GGGTCCCTTATGCTTAGCATG;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=205;TCF=94;TCR=111;TR=101;WE=169511742;WS=169511724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,116:0.47:248
chr1	169511755	rs4524	T	C	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1467;ReadPosRankSum=-1.681;SC=TTCTTGACTTTTGAATTCTCC;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=72;TCR=102;TR=87;WE=169511763;WS=169511745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,101:0.47:213
chr1	169512027	rs6021	T	C	2323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=39;PP=1218;ReadPosRankSum=0.642;SC=TATCTGTGTTTGAAGAAACGA;SOR=0.810;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=214;TCF=123;TCR=91;TR=96;WE=169512035;WS=169512017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,113:0.47:243
chr1	169512093	rs6017	A	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1552;ReadPosRankSum=1.439;SC=CTTCTTCCTGATTCAATGATG;SOR=0.682;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=251;TCF=128;TCR=123;TR=106;WE=169512101;WS=169512083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,118:0.42:282
chr1	169512120	rs6016	G	A	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GGAATGACCTGATTCCTAATG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=125;TCR=123;TR=100;WE=169512128;WS=169512110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,113:0.41:277
chr1	169513436	rs9287092	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CAGGGAGATACATAGAGGAGC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=169513444;WS=169513426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	169515874	rs13306345	T	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.546;NF=0;NR=18;PP=331;ReadPosRankSum=0.544;SC=AACAGACGCATAGACCAATGG;SOR=3.309;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=18;WE=169515882;WS=169515864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr1	169519049	rs6025	T	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=23;PP=1188;SC=CTGTATTCCTTGCCTGTCCAG;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=169519057;WS=169519039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	169525766	rs2239853	T	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=489;SC=TGTTAGGAACTGAGGAAAGTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=169525774;WS=169525756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	169525808	rs2239854	G	A	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.47;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	169551682	rs6028	T	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=12;PP=492;SC=AAATGGTAGATTGTGGTTTTT;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=169551690;WS=169551672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	169560727	.	T	TA	199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.86;NF=2;NR=9;PP=199;QD=18.6363636364;SC=AATGAATGATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=11;WE=169560735;WS=169560717;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,11:0.58:19
chr1	169564167	rs742127	G	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=371;SC=GGAGGTGAAAGAGATTATAGT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=169564175;WS=169564157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	169566313	rs6127	C	T	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=74;PP=2289;SC=AAGCCGTTGTCACAAGAGAAA;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=111;WE=169566321;WS=169566303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	169572545	rs201543202	CTGTGTGTG	C	1383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=1565;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=10;WE=169572565;WS=169572535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr1	169572557	rs199963384	G	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr1	169580972	rs3917730	C	CAT	535.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.627;NF=1;NR=10;PP=421;ReadPosRankSum=0.567;SC=AAAAGCCACACAGAGAGCAAT;SOR=1.646;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=11;WE=169580980;WS=169580962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr1	169582317	rs6125	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TTCATGAGCACGTGTTGAGGG;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=16;WE=169582325;WS=169582307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr1	169582401	rs3917721	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=1.242;SC=GAATTAACAGCAATGTCATGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=169582409;WS=169582391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	169588354	rs3917696	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=519;ReadPosRankSum=0.914;SC=TGAAAAGTTAGCATAAAGTTT;SOR=0.651;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=33;WE=169588362;WS=169588344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr1	169672343	rs4987314	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CATATCTGCTCATCCATCAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=169672351;WS=169672333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	169673838	rs2229569	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=647;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TTTCCCAAAGGGTGAGTACAG;SOR=0.428;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=35;WE=169673846;WS=169673828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr1	169677709	rs1051091	A	G	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.631;SC=CTTCTTCAGTAAGAGATTTGT;SOR=0.591;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=89;WE=169677717;WS=169677699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,108:0.52:209
chr1	169678024	rs4987285	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=1.187;SC=CAGGCTGAGCTAGACACTTAG;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=16;WE=169678032;WS=169678014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	169679472	rs4987281	G	GCT	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=716;ReadPosRankSum=-0.023;SC=AGAATTAACAGCTCTGTGAAA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=169679480;WS=169679462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	169694918	rs5356	A	G	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=48;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GGTAGCTTCCATCTGATTCAA;SOR=0.558;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=105;WE=169694926;WS=169694908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,114:0.50:226
chr1	169695110	rs3917432	T	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.615;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=369;ReadPosRankSum=1.550;SC=TCAGACTAAATGACTTTTAAG;SOR=1.697;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=20;WE=169695118;WS=169695100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr1	169695984	rs3917428	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=440;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TCATGAGGAAGAATTGATGTT;SOR=0.914;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=27;WE=169695992;WS=169695974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr1	169696946	rs5368	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=796;ReadPosRankSum=0.687;SC=GTTGATCCATGTAATTCAAAT;SOR=0.604;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=41;WE=169696954;WS=169696936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr1	169697444	rs1076637	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.970;SC=GAGTACTTGGCGTTTGTTGAG;SOR=0.454;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=14;WE=169697452;WS=169697434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr1	169698825	rs1534904	T	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=72;PP=2654;SC=CTGAGGATTTTAAAGAGCACC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=121;WE=169698833;WS=169698815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	169698921	rs2076059	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.146;SC=AAGGGTAGATCCCAAAGTCCT;SOR=0.169;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=169698929;WS=169698911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	169699819	rs3917419	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=319;ReadPosRankSum=-0.603;SC=AAGAACACTGGAAACTAGAAC;SOR=0.748;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=17;WE=169699827;WS=169699809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	169702705	rs932307	G	A	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1649;ReadPosRankSum=1.249;SC=TGGTCTAATGGCACTGACTTA;SOR=0.512;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=221;TCF=119;TCR=102;TR=112;WE=169702713;WS=169702695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,124:0.48:260
chr1	169762807	rs10489177	T	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=638;ReadPosRankSum=0.302;SC=CCAGATGGTCTTCTATAGTGA;SOR=0.841;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=40;WE=169762815;WS=169762797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr1	169768033	rs6680938	T	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=13;NR=2;PP=357;SC=ATTACTATGATACTAGTATCT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=169768041;WS=169768023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	169768080	rs6668114	C	A	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=759;ReadPosRankSum=-0.605;SC=AACATTCTGACAGTTGGATTG;SOR=1.542;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=28;WE=169768088;WS=169768069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr1	169773160	rs3766138	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=1.117;SC=TTAAAGTAAATTTGGCTCTTG;SOR=1.127;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=15;WE=169773168;WS=169773150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	169773317	rs11590604	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=807;ReadPosRankSum=0.102;SC=TAATGGAACTGCTGGACATGG;SOR=0.665;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=53;WE=169773325;WS=169773307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr1	169777169	rs34657513	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.023;SC=TTTAAGAGGATTTTAATTTAT;SOR=1.802;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=169777177;WS=169777159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	169795214	rs57068023	CT	C	731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=421;SC=TTTAAAACAACTTTTTTTTTC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=19;WE=169795222;WS=169795204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	169795276	rs6682137	A	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=292;SC=TGCAATGGCGAAATCTCGGCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=169795284;WS=169795266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	169797127	rs6427223	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=272;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CATATATATTGCTACTTTATA;SOR=0.504;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=17;WE=169797135;WS=169797117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	169800062	rs10489175	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=100;ReadPosRankSum=-0.799;SC=ACTAAAAAACCGTTAGTGTGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=169800070;WS=169800052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	169812765	rs3062271	ATTC	A	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.423;NF=10;NR=4;PP=518;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TGCTATTATTATTCTTATGTG;SOR=0.330;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=14;WE=169812775;WS=169812755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr1	169819605	rs6664099	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=281;SC=TGCTGAGCACAGTGCTGACGA;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=169819613;WS=169819595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	169823296	rs112604424	G	GCTTGA	1802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=1923;SC=TTAATTTTGTGCTTGACTTGA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=30;WE=169823304;WS=169823286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	169823718	rs4656197	T	C	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=94;PP=2965;SC=GCTAATCTTTTGGGGTAAGCT;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=187;WE=169823726;WS=169823708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	169831993	rs7525259	A	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=917;SC=TTTCAGTGAAAAGTATTAAGC;SOR=1.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=169832001;WS=169831983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	169833492	.	C	CTTTGAAAAAATAACT	1736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.494;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
chr1	169835950	rs12133843	A	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=264;SC=AACCAAATATATGACTCATCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=169835958;WS=169835940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	169839595	rs10919260	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.190;SC=TATTTATTATACTCAAATCTA;SOR=0.123;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=15;WE=169839603;WS=169839585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	169847683	rs6683056	G	A	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=331;SC=CAATTTCTATGAACACCATAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=169847691;WS=169847673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	169890933	rs518928	A	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=47;PP=1616;SC=CTAAAAAAGAAAAAAAAGAAT;SOR=1.497;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=70;WE=169890941;WS=169890923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	169891056	rs3838393	CT	C	234.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=159;SC=ATATCATTAACTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=169891064;WS=169891046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	169941761	rs511443	A	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=446;SC=TGGTTAAAGAAACAAACTACA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=169941769;WS=169941751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	169951748	rs638486	A	G	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=156;SC=TTTTCCTAACATAATAATAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=169951756;WS=169951738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	169952385	rs2057249	G	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=5;PP=1258;SC=CAGTCTATTTGAATAGAAAGC;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=169952393;WS=169952375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	170001151	rs11277624	ATACTCATT	A	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=2954;ReadPosRankSum=0.744;SC=AGGATCATCCATACTCATTGA;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=170001166;WS=170001141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	170004508	rs12750962	A	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=-0.573;SC=AACTGAGAGAACAAGTGATCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=170004516;WS=170004498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	170004722	rs4656732	G	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=817;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GTACCGAAACGATCATTCTCC;SOR=0.466;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=53;WE=170004730;WS=170004712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,66:0.57:115
chr1	170008281	rs74942897	CAT	C	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=0.908;SC=AAAAATACCACATGTGCTTAA;SOR=0.527;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=3;WE=170008290;WS=170008271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	170043482	rs3841721	A	AAACTAGCG	2065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=1549;ReadPosRankSum=1.305;SC=CCCGTCTGCTAAACTAGCGTT;SOR=1.032;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=23;WE=170043490;WS=170043472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr1	170115156	rs550297	G	A	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=933;ReadPosRankSum=1.534;SC=TAAAATGACAGTCTCAAGTTC;SOR=0.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=82;TCR=26;TR=54;WE=170115176;WS=170115146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr1	170135608	rs61825691	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=1.315;SC=AAGGATGGGTCTCTGTACTTG;SOR=0.709;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=14;WE=170135616;WS=170135598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr1	170501385	rs7531125	A	C	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=28;PP=1331;SC=GTTGGGCAGGATTCTCTGAGG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=170501393;WS=170501375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	170502517	rs1412892	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=145;SC=AGGCTAAGCTATGTAGTTAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=170502525;WS=170502507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	170508755	rs141412003	G	GT	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CATTTAACCCGTTTTTTCCCA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=11;WE=170508763;WS=170508745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr1	170511604	rs7538037	T	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=730;ReadPosRankSum=1.480;SC=TTTCATAAACTCATTTTTATG;SOR=1.013;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=40;WE=170511612;WS=170511594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr1	170521376	rs913257	G	A	5925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=80;PP=2965;SC=ATTGCTACACGAACAAGAAGT;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=179;WE=170521384;WS=170521366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr1	170633186	.	AT	A	37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=18;MQ=59.35;NF=4;NR=0;PP=37;QD=10.75;SC=CTCTTTTCCAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=170633194;WS=170633177;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr1	170927572	rs35425940	T	TC	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=0.202;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.898;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	170928671	rs2294740	T	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=487;ReadPosRankSum=1.605;SC=GGAATGCTAGTTGTCATGCCA;SOR=0.980;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=31;WE=170928679;WS=170928661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr1	170965611	rs199803364	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=1066;ReadPosRankSum=0.542;SC=TGAATATCACCGGCATGTGAT;SOR=0.764;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=94;TCR=63;TR=67;WE=170965619;WS=170965601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,80:0.44:183
chr1	170993444	rs3077629	G	GGT	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=497;ReadPosRankSum=2.392;SC=ATTTATATGGGGTGTGTGTGT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=170993452;WS=170993434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr1	171080080	rs1736557	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=473;ReadPosRankSum=0.284;SC=CTGGTTGTACGTGAAGCAGAT;SOR=1.705;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=29;WE=171080088;WS=171080070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr1	171112490	rs1736565	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=0.419;SC=AAGATACATACAGTTTGAGGT;SOR=1.619;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=43;WE=171112498;WS=171112480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr1	171155103	rs6657314	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TTTATTTCTACTTATTGATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=171155111;WS=171155093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	171168584	rs2020862	CA	TG	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=970;ReadPosRankSum=-1.921;SC=ATGGGAAACTCAGGCTCAGAT;SOR=0.688;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=29;WE=171168593;WS=171168574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr1	171174531	rs2020863	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=870;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GCCATCTTTGAGGATGGAACA;SOR=0.521;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=55;WE=171174539;WS=171174521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr1	171227216	rs10912675	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=581;ReadPosRankSum=-0.551;SC=ATCTTCCTCATGCAGGAGAAC;SOR=1.031;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=39;WE=171227224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr1	171227487	rs12141555	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	171250044	rs742350	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=714;ReadPosRankSum=1.996;SC=CCCTCCCAACCCCAATTGTGA;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=120;TCF=74;TCR=46;TR=47;WE=171250052;WS=171250034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,62:0.41:152
chr1	171251509	rs12091482	G	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-2.117;SC=TGTTTTTGGTGTGCCATGTGA;SOR=1.911;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=15;WE=171251517;WS=171251499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr1	171252287	rs1126692	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr1	171252449	.	G	GA	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=52;QD=22.0;SC=AAATGAAAAAGAAAAAAAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=171252457;WS=171252439;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	171292017	rs2076322	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-1.026;SC=AAAAGTAAATAAAATTACAAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=171292025;WS=171292016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	171301033	rs2294483	C	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.78;ReadPosRankSum=-1.687;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	171303925	rs3820170	C	T	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1506;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TACTGAAAGTCCTCTCTTTGG;SOR=0.556;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=179;TCF=79;TCR=100;TR=95;WE=171303933;WS=171303915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,107:0.52:207
chr1	171306323	rs3737924	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.150;SC=GTGAACTGGGCGGGGAATTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=171306331;WS=171306313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	171306582	rs35591720	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=526;ReadPosRankSum=0.898;SC=ATGTAGCTTGCTCTAGGGCAA;SOR=1.054;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=35;WE=171306590;WS=171306572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr1	171311003	rs1042772	A	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=0.149;SC=AGGGTTACACAAAGTCATGCT;SOR=0.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=28;WE=171311011;WS=171310993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr1	171558385	rs72717850	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=79;SC=CTGTACACTTCCTTTCACTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=171558393;WS=171558375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	171673749	rs3835498	AT	A	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=107;ReadPosRankSum=0.577;SC=ATATTCCTAAATGTAGTTGTG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=171673757;WS=171673739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	171679958	rs10913530	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=0.060;SC=CTGAACACTAGTTTAAAAAAG;SOR=0.255;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=23;WE=171679966;WS=171679948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr1	171707272	rs10753179	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=1.030;SC=CCATGCCCCATTAATTTTTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=171707280;WS=171707262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr1	171753039	rs2232816	A	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=720;ReadPosRankSum=-1.930;SC=GAAGATGGACATGACGCAGAT;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=52;WE=171753047;WS=171753029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,65:0.47:137
chr1	171754865	rs732304	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	171755170	rs2232818	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=944;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CTGAGCTGTCGGCTAGAGTCA;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=59;WE=171755178;WS=171755160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr1	171763522	rs909958	C	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=621;ReadPosRankSum=0.620;SC=GACTTGTTTCCTTCTTTTTCC;SOR=0.689;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=69;TCR=26;TR=39;WE=171763530;WS=171763512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr1	171765591	rs2232826	G	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=678;ReadPosRankSum=0.163;SC=CCTGATGTGAGGTCATTCTGA;SOR=1.075;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=46;WE=171765599;WS=171765581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr1	171956803	rs3736790	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=807;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TAGAATATGCCGAGTTTCTAC;SOR=1.049;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=113;TCF=76;TCR=37;TR=51;WE=171956811;WS=171956793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,57:0.41:139
chr1	172011059	rs3736791	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=298;ReadPosRankSum=-1.141;SC=ACCTGGAAAAGGATTCTAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=16;WE=172011067;WS=172011049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr1	172051223	.	C	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.580;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=289;ReadPosRankSum=0.276;SC=ATTTACTATTCTCTCAGTAAA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=15;WE=172051231;WS=172051213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	172222629	rs145316116	TCTCTCCTCTCCTCTC	T	1218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=1;PP=2974;SC=CAATTTTCTGTCTCTCCTCTC;SOR=4.407;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=11;WE=172222651;WS=172222628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	172308238	rs6697844	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=549;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GAACATCTCACTGTGAAATAT;SOR=0.677;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=38;WE=172308246;WS=172308228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr1	172356437	rs6688654	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=42;PP=1349;SC=ACATCAGCACAGCCACCGTGT;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=172356445;WS=172356427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	172410967	rs1063412	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AGGTAGAATGGACACAGACAT;SOR=0.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=35;WE=172410975;WS=172410957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr1	172411496	rs2230471	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=367;SC=AAGAAGCCAGACCAGTCCCTA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=172411504;WS=172411486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	172417781	rs2157451	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=303;SC=TACACCATCAATGTTCAATAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=172417789;WS=172417771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	172425529	rs2285170	C	G	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=860;ReadPosRankSum=0.055;SC=ATTTCCTCACCTCTCTCTGTC;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=71;WE=172425537;WS=172425519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,83:0.43:193
chr1	172431210	rs4916261	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.150;SC=AAGGATGTATGAAGGACTTTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=172431218;WS=172431200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	172434375	rs2901655	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=416;ReadPosRankSum=0.158;SC=ATGTATAAAGGCACATTTCTT;SOR=0.342;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=26;WE=172434383;WS=172434365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr1	172434812	rs2901656	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=778;ReadPosRankSum=-0.719;SC=ATAAAAGTTCCCCTATTGGCA;SOR=0.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=49;WE=172434820;WS=172434802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,65:0.42:153
chr1	172437592	rs1129942	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=491;ReadPosRankSum=0.114;SC=CATCCAGAAAGCATTCACTAC;SOR=0.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=36;WE=172437600;WS=172437582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr1	172634734	rs2639653	T	C	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=8;PP=1294;SC=CTATTCCTTGTTGAAAGCTCC;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=172634742;WS=172634724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	173176362	.	C	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-0.033;SC=AAAAGGGGAACGTGCGATAAA;SOR=0.984;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=12;WE=173176370;WS=173176352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr1	173556699	rs301698	G	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=301;SC=AAAGCACAGAGTCTTATTCTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=173556707;WS=173556689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr1	173702764	rs45467799	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=400;ReadPosRankSum=-0.464;SC=ATTACATTTCCTTATCGCTTG;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=20;WE=173702772;WS=173702754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
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chr1	173836194	rs17359906	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAAGAGATCAGGTACAGATTT;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=173836202;WS=173836184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	173839240	rs1322774	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GATTTTGAAACTTTACCAGAT;SOR=0.330;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=173839248;WS=173839230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	173842467	rs9286895	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	173855208	rs16846520	A	G	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=928;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AGGAAGAGACAGTTGCTCCTG;SOR=0.840;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=59;WE=173855216;WS=173855198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,72:0.50:145
chr1	173855298	rs1322775	A	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=-1.904;SC=CTCTTCCCCTATGAGCCATAA;SOR=0.244;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=18;WE=173855306;WS=173855288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr1	173878832	rs5878	T	C	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CCAGCCACTCTTGCAGCACCT;SOR=0.859;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=69;WE=173878840;WS=173878822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,74:0.41:179
chr1	173878862	rs5877	T	C	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=872;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GTTCCTTCTCTACCTTGGCCA;SOR=0.525;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=57;WE=173878870;WS=173878852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr1	173961807	rs377599781	AAC	A	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-0.303;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.875;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	173961837	rs6425268	C	G	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.186;NF=14;NR=5;PP=338;ReadPosRankSum=0.613;SC=CACACACACACAGAGAGAGAG;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=19;WE=173961845;WS=173961827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	174188285	rs2103640	G	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=23;PP=1079;SC=AGAGAAGTTTGCAGAACTGAA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=174188293;WS=174188275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	174221887	rs11351373	GT	G	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=484;SC=GATGTAACTGGTTTCATTGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=174221895;WS=174221877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	174274062	rs2142864	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=607;SC=TTATTTAAATACTATCTTTCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=174274070;WS=174274052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	174274349	rs2860909	T	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=336;SC=GTGTTGTGGGTAGAAGTGGTG;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=174274357;WS=174274339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	174417231	rs7516240	G	A	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=21;PP=1483;SC=GTCTGCAGGTGTCTTTAAATT;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=70;WE=174417239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	174516999	rs41266050	C	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=1034;SC=TAGTCTTACACCGAGACAGAC;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=174517007;WS=174516989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	174927388	rs10798329	G	C	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=531;SC=TGATATTTGAGTTAAAGTATG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=174927396;WS=174927378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	174969271	rs1046439	C	T	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=26;PP=1772;SC=TCCTGTTCCTCCTTCTGCGCG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=174969279;WS=174969261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	174984073	.	TC	T	271	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=57.81;NF=0;NR=9;PP=271;QD=32.4444444444;SC=AATTTTCTTTTCTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=174984081;WS=174984063;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr1	174984074	rs7540740	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.35;QD=24.52;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	175046488	rs2072033	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=253;ReadPosRankSum=1.072;SC=GCACATCTCCGTGGCTTTCTT;SOR=0.352;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=19;WE=175046496;WS=175046478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr1	175046789	rs2072032	A	G	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1496;ReadPosRankSum=0.125;SC=GGGGGAGGCCAGGGAGGAACA;SOR=0.766;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=92;WE=175046797;WS=175046779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr1	175052828	rs2072031	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.450;SC=GCCTGTCACAGAACCTTGGAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=11;WE=175052836;WS=175052818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	175053101	rs2072030	A	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=48;PP=1107;ReadPosRankSum=0.950;SC=TGTGAGATGTATGCTGTGGAT;SOR=0.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=46;TCR=109;TR=68;WE=175053109;WS=175053091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr1	175054548	rs1573758	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=449;ReadPosRankSum=0.410;SC=CAGGTCTGCACCCGGGGACTG;SOR=1.037;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=31;WE=175054556;WS=175054538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr1	175086461	rs6690229	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTGGGATGGCATCCCTTCATA;SOR=0.184;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=175086469;WS=175086451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	175087884	rs2269654	CA	TG	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.827;NF=43;NR=27;PP=2471;ReadPosRankSum=0.998;SC=TGAGGCCGGGCATGGAGTACA;SOR=0.771;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=96;TCR=58;TR=70;WE=175087893;WS=175087874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,86:0.46:185
chr1	175092674	rs2285215	C	T	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=56;PP=2512;SC=AGGGAGGTTCCGGTGGGGAAG;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=175092682;WS=175092664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	175092840	rs2072041	T	C	3685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=73;PP=2393;SC=CTCACACTTATCAGGAGAGAA;SOR=1.353;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=113;WE=175092848;WS=175092830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	175096333	rs2072040	A	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=963;SC=ATCTTTACTGATCACATTGCT;SOR=4.073;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=175096341;WS=175096323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	175097349	rs7547567	C	T	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=800;SC=AGAACCAGCACCGGAAAGCCT;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=175097357;WS=175097339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	175104790	rs4651323	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	175104796	rs4651324	G	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.15;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	175105880	rs2072037	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=651;SC=GGTTCTGAAAGCCTCAGACAC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=175105888;WS=175105870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	175105942	rs4650703	G	A	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=20;PP=1623;SC=TTGGAATTCCGTTTTTTATTT;SOR=1.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=175105950;WS=175105932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	175113578	rs10912897	T	C	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=32;PP=1084;SC=ACAGAGACAATGATATCGCAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=64;WE=175113586;WS=175113568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	175116046	.	C	CT	151	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5876;HP=15;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=20;MQ=61.04;NF=11;NR=1;PP=151;QD=12.8333333333;SC=CTTGATGTGGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=12;WE=175116054;WS=175116036;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	175116252	rs4651335	C	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=945;SC=CCAGCTGTGGCAGCTTGGGGC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=175116260;WS=175116242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	175129924	.	C	CCTT	503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=0.965;QD=21.90;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	175129946	rs2072035	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.919;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	175292672	rs34842046	A	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=300;ReadPosRankSum=1.475;SC=CCCCACTTCAAAAAAGGGGTA;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=18;WE=175292680;WS=175292662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr1	175293424	rs2213635	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=1.465;SC=GCTTTTAAAATATAAAGCTAA;SOR=0.086;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=175293432;WS=175293421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	175299301	rs2027867	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=621;ReadPosRankSum=0.888;SC=AGGCGGCCTCTTGGCCATCCC;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=65;TCR=27;TR=38;WE=175299309;WS=175299291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,40:0.34:118
chr1	175324518	rs55715761	GCA	G	645.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=825;ReadPosRankSum=-0.017;SC=AAGCTGATGAGCAATCCTTGT;SOR=0.906;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=13;WE=175324529;WS=175324508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr1	175324521	rs55973835	A	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=833;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CTGATGAGCAATCCTTGTGGA;SOR=0.948;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=15;WE=175324529;WS=175324508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr1	175324651	rs2228359	A	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1013;ReadPosRankSum=1.245;SC=TGCGGCTTCCATCGGTGGATT;SOR=0.528;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=75;WE=175324659;WS=175324641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr1	175335412	rs1385540	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-1.194;SC=ACACTTATCTAATATTTTGCT;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=175335420;WS=175335402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	175336530	rs6697701	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=-1.778;SC=CCTATTCATATCTTGTGTTTA;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=24;WE=175336538;WS=175336520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr1	175348723	rs859427	C	T	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=18;PP=1159;SC=ACCAATGCCCCTGGGGACCAG;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=175348731;WS=175348713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	175355128	rs859436	C	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=4.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.510;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr1	175355152	rs72723450	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=692;ReadPosRankSum=1.211;SC=GCGTCTCTCCCCCACCGCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=42;WE=175355160;WS=175355142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,48:0.43:112
chr1	175355391	rs859437	A	G	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=72;PP=2282;SC=CAAAAGCCACAGTGTCCGAGA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=109;WE=175355399;WS=175355381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	175360690	rs859444	C	T	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=669;SC=AAAATGGGGGCGATGTCTCTT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=175360698;WS=175360680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	175362736	rs3752517	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=360;SC=TCAGCAGGTCGTTACCACATA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=175362744;WS=175362734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr1	175375635	rs2239818	G	A	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=73;PP=1956;ReadPosRankSum=0.581;SC=CCAAGGGCACGTTAATGTTGT;SOR=1.043;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=241;TCF=94;TCR=147;TR=111;WE=175375643;WS=175375625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,134:0.47:284
chr1	175375683	rs859399	T	C	6566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=111;PP=2965;SC=CTTTGCTGGATGTGTTGTAGT;SOR=0.890;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=90;TCR=111;TR=201;WE=175375691;WS=175375673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	175375802	rs859398	T	C	6958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=105;PP=2965;SC=ATCAGGTTGATGCCAATGAGC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=216;WE=175375810;WS=175375792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	175911247	rs12123116	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.184;SOR=1.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	175911256	rs139905798	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.483;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	175916267	rs6674353	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=14;PP=1280;SC=GGTGTATTTCTATAATCCTGT;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=175916275;WS=175916257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	175937540	rs4534339	C	T	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=42;PP=2397;SC=AAAGGCTGTACGGAGGGGAAC;SOR=1.389;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=118;WE=175937548;WS=175937530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	175951347	rs10798430	T	A	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=0;PP=974;SC=TAAAATTAGGTTACAGAAAAA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=175951355;WS=175951337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	176012807	rs4233165	G	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=428;SC=CAAACCAAATGTATGATTCAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=176012815;WS=176012797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	176015573	rs10494497	T	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CAAATTGTACTAGACCTCATA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=176015581;WS=176015563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	176102808	rs1330863	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.023;SC=CACCGTACTGTCACAATTTCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=176102816;WS=176102798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	176102974	rs2481662	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CTTCCCTGTATGTACTTACAT;SOR=0.707;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=13;WE=176102982;WS=176102964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr1	176103954	rs2502845	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.280;SC=GTATTCTACTCGCTAACTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=176103962;WS=176103944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	176103982	rs78569232	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TGAAATCCAACGCATTAAGGA;SOR=0.922;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=13;WE=176103990;WS=176103972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	176129276	rs520661	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=426;ReadPosRankSum=1.097;SC=TCTTCAATTCGAAGCCAAAAA;SOR=0.849;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=33;WE=176129284;WS=176129266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr1	176153658	rs791744	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=417;SC=AAAAAAAATATGACTGTAACA;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=176153666;WS=176153648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	176661229	rs115416265	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=589;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GTTAAAATCTCCATCTCTTGT;SOR=0.927;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=41;WE=176661237;WS=176661219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,56:0.40:140
chr1	176845528	rs2076341	C	T	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=491;SC=GGAAAGGCAACGCTCCTGTAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=176845536;WS=176845518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	176857347	rs2072935	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=11;PP=356;SC=AGAGCTGCATAAGAGAACAGG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=176857355;WS=176857337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	176863836	rs2281180	G	C	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.140;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=2205;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GTCCCTTGCTGTGGCACTCCA;SOR=0.342;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=110;WE=176863844;WS=176863826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr1	176863867	rs2228956	T	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=57;PP=2037;SC=AGCCGCCATGTGCTTGGTGCC;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=118;WE=176863875;WS=176863857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	176992553	rs172917	A	G	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=59;PP=2385;SC=TTTCGGGGTCACATTGGTGTT;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=176992561;WS=176992543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	176992676	rs10798496	C	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=30;PP=971;SC=TGGCATCCAGCTGGCTCCCCT;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=176992684;WS=176992666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	176998368	rs10753142	T	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=77;SC=CTTGCCTAGCTCAAACCCAAG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=176998376;WS=176998358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	177199323	rs3176442	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=81;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCCCTAAGAACCCAACCTGCA;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=10;WE=177199331;WS=177199313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr1	177898799	rs623479	C	T	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=242;SC=CATTGTGAAGCTAATCTTAAG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=177898807;WS=177898789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	177899121	rs545608	G	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=1.203;SC=ACTCTGCCCGGGGTTGATTGG;SOR=1.230;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=18;WE=177899129;WS=177899111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	177901619	rs7531399	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=700;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CAGGGGGGCCGCTTACCTCTG;SOR=0.642;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=48;WE=177901627;WS=177901609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr1	177901655	rs3748792	G	A	3320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,84:0.53:159
chr1	177901658	rs7554597	C	T	3342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,87:0.51:169
chr1	177901713	rs522367	T	C	6678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=88;PP=2965;SC=ACCTGGAAAGTAATGAGGCAG;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=193;WE=177901721;WS=177901703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	177901741	rs684227	A	G	5267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=82;PP=2965;SC=TCCTCTGCTCAGGACTGGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=164;WE=177901749;WS=177901731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	177902387	rs61745560	C	A	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=841;ReadPosRankSum=0.208;SC=TCGTCTCCAGCGGGGGATGCG;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=63;WE=177902395;WS=177902377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr1	177902482	rs3813648	G	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1056;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGACCTGCAGGTTGGCTTCTT;SOR=0.879;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=71;WE=177902490;WS=177902472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr1	177902725	rs3813649	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=715;ReadPosRankSum=0.068;SC=CTTGGCTGAACTGGCGGAACT;SOR=0.717;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=49;WE=177902733;WS=177902715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr1	177902753	rs591120	G	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=63;PP=2526;SC=ATACTTCGTGGTCTAGCAGCC;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=122;WE=177902761;WS=177902743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	177905469	rs7522194	C	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=499;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CATCAGGAGGCTGGGAAGTTT;SOR=0.816;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=29;WE=177905477;WS=177905459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr1	177906292	rs61816275	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=0.710;SC=CCCTTTCCTGCTTCCTCCCCA;SOR=0.728;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=10;WE=177906300;WS=177906282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	177913980	rs532842	T	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=288;SC=AGTGTTTCACTTCCTCTCCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=177913988;WS=177913970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	177915474	rs842192	A	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=668;ReadPosRankSum=0.057;SC=AAAATGAAAAATGGATCCATA;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=44;WE=177915482;WS=177915464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr1	177916890	.	A	AAGGGACAGGGAGGGGAGGTGAGGGG	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=66.69;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	177917499	rs17360489	G	A	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=1093;ReadPosRankSum=0.524;SC=GAAGTCGGGGGAACACGGGCC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=71;WE=177917507;WS=177917489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr1	177929521	rs35891059	G	A	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1250;ReadPosRankSum=1.532;SC=CTTGCTCTTCGGAATCATTAA;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=78;WE=177929543;WS=177929511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr1	177929554	rs10913472	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=913;ReadPosRankSum=1.651;SC=ATAAAACAATCAGATTTTGTG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=46;TCR=81;TR=57;WE=177929562;WS=177929544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,64:0.45:141
chr1	177929987	rs12040910	T	C	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=42;PP=1628;SC=GGGACCTACATGCACCAGCTG;SOR=0.791;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=96;WE=177929995;WS=177929977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	177930027	.	G	GAGGGATGTAGAACTTCATGGGTGCTTTGGGACC	2119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=6.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr1	177930642	rs945640	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=469;SC=ATGATCCATCGTAAGGCTGAC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=177930650;WS=177930632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	177930894	rs945641	C	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=659;SC=CAAAAACACACAGGAAGAAGT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=177930902;WS=177930884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	177933443	rs3813651	G	A	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=50;PP=1711;SC=AGCAGTGAGCGGGGTCCTGGG;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=177933451;WS=177933433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	177933505	rs3813652	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=1.216;SC=TGCTCCAAAGCGTGGGCAGGT;SOR=3.242;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=16;WE=177933513;WS=177933495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr1	177934351	rs72703030	G	T	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.425;SC=TCCTGTTTCTGAAAGTTCTTA;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=34;TCR=90;TR=63;WE=177934359;WS=177934341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr1	177935050	rs1889981	T	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=416;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GCAGCCACTGTGGGTGTCCAT;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=27;WE=177935058;WS=177935040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr1	177935203	rs954502	A	G	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=37;PP=1397;SC=GAAACCAATGAAGAACTTGAC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=177935211;WS=177935193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	177935275	rs1415085	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=598;SC=TGAAAGCCACAGTTAATTCTA;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=177935283;WS=177935265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	177937009	rs35959058	G	A	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=923;ReadPosRankSum=0.075;SC=AAGAGTGAGGGACAGGCCGAT;SOR=0.748;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=41;TCR=74;TR=58;WE=177937017;WS=177936999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,80:0.56:142
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chr1	178489978	rs3813636	T	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=1.265;SC=CAGGGCTCACTGGATCCCCTT;SOR=0.599;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=40;WE=178489986;WS=178489968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr1	178492447	rs7527160	T	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=1.115;SC=GTATATACGCTGCAGTGGGAC;SOR=1.206;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=6;WE=178492455;WS=178492437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	178494428	rs6664493	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=0.300;SC=GAGGAGTGTACGAAAGGGCCT;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=10;WE=178494436;WS=178494418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	178499068	rs6675811	T	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AATAAACAAATGACTTACAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=178499076;WS=178499058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	178514165	rs12141152	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=714;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GGGTTCCAGGCGAGATGAGAC;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=41;WE=178514173;WS=178514155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr1	178514203	rs12044868	C	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=1.654;SC=AACTGAGCTCCCAATGCATTT;SOR=1.325;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=20;WE=178514211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr1	178514560	rs34632529	A	AT	6405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=88;PP=2966;SC=TTGAAGGTTGATTTTGACTAC;SOR=0.713;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=50;TCR=98;TR=136;WE=178514568;WS=178514550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	178515135	rs4650992	A	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=455;SC=GAAAACTAAGACCTTCCCACT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=178515143;WS=178515125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	178646815	rs12748987	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=1.029;SC=GGGAAAGGATCATCTCTTCAA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=178646823;WS=178646805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	178745798	rs11323887	CT	C	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=5;PP=344;SC=ATTTGCTTAACTTTTTTTTTT;SOR=3.193;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=23;WE=178745807;WS=178745788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	178746031	rs75184054	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TGTTTGTTCACATACTTAAAT;SOR=0.616;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=12;WE=178746039;WS=178746021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	178754783	.	G	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TATAGAAAACGATCAATCTCA;SOR=0.709;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=25;WE=178754791;WS=178754773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr1	178780650	rs12131426	A	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=678;SC=GAAAAATAAGACTCATTGATA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=178780658;WS=178780640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	178820159	rs1544124	C	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=356;SC=TAAAAACTTTCTGTGTAGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=178820167;WS=178820149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	178852800	rs76381760	T	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=1.833;SC=TTAAAATCTGTCCTTTCTGGG;SOR=0.922;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=9;WE=178852808;WS=178852790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	178854162	rs6425503	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=303;SC=TTTCAAGGGACTGAAAAATAA;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=178854170;WS=178854152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	178858624	rs34280213	A	T	30.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	178858711	rs10798635	C	A	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=705;SC=TTTATTTTTACATTGTGAAAT;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=178858719;WS=178858701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	178858759	rs3753534	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=24;PP=1069;SC=TAAAAAATAGGATAACTTTTC;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=178858767;WS=178858749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	178861278	rs114815547	G	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=-0.724;SC=ATTACAAGAAGAAACTATTAT;SOR=1.136;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=178861286;WS=178861268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	178866674	rs17674780	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GAAGTGATACAGCTCAACTCT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=18;WE=178866682;WS=178866664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr1	178871217	rs2275100	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=529;ReadPosRankSum=0.481;SC=TTCTGTTTCCGCTAATTATCT;SOR=1.132;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=31;WE=178871225;WS=178871207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr1	178876054	rs116065010	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=561;ReadPosRankSum=0.889;SC=GAACATATGTAAAAGAGTTCC;SOR=1.032;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=30;WE=178876062;WS=178876044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr1	179292442	rs2902277	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=410;SC=CCATGCTGTCGTGTTTTATGG;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=179292450;WS=179292432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	179304892	rs1034269	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=532;SC=CACCCTGGTGTCACTTTCTAT;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=22;WE=179304900;WS=179304882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	179308803	rs3753524	G	A	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=38;PP=1156;SC=CAGATTTGAGGGTGATATTCC;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=179308811;WS=179308793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	179310439	rs7547733	C	T	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=88;PP=2805;SC=TCATTATATTCGAGCAGGTAA;SOR=1.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=46;TCR=88;TR=133;WE=179310447;WS=179310429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	179312102	rs4651024	T	C	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=87;PP=2781;SC=GAACCAGAAATGTGGTAAACA;SOR=0.921;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=67;TCR=87;TR=154;WE=179312110;WS=179312092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	179312249	rs11350945	AT	A	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=749;SC=GTCTAATTTGATTATAGTAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=179312257;WS=179312239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	179317895	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	1237	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=58.01;NF=4;NR=2;PP=1237;QD=206.666666667;SC=TTCGGGTGGGATGTGTGTGTG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=179317928;WS=179317885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,6:0.50:12
chr1	179319580	rs3753527	T	C	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=101;PP=2965;SC=AGTATCTTGGTATGCTGTGAG;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=50;TCR=101;TR=151;WE=179319588;WS=179319570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	179320665	rs13306732	A	G	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=75;PP=2421;SC=GTTGGTGGGCAATGTTGAGGA;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=107;WE=179320673;WS=179320655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	179322810	rs41314037	G	T	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=57;PP=1536;ReadPosRankSum=1.546;SC=TGTCACTGAAGATTGGGTAGC;SOR=0.490;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=187;TCF=76;TCR=111;TR=102;WE=179322818;WS=179322800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,116:0.52:223
chr1	179335499	.	C	CT	90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=56.8;NF=5;NR=0;PP=90;QD=18.6;SC=TAGTTGTCATCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=179335507;WS=179335489;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,5:0.33:15
chr1	179339334	rs6666358	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=104;SC=AAAATTTACAGTATCTTTGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=179339342;WS=179339324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	179347832	rs10798674	T	C	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=51;PP=2020;SC=AGAAGGCAGTTTGTCCCCCAC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=179347840;WS=179347822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	179351606	rs4625243	G	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=92;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=53;SC=GCCATGTCCCGATGATTATTT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=179351614;WS=179351602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	179354304	rs7541905	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=370;SC=CATTCAAGGTATTAACCTCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=179354312;WS=179354294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	179364391	rs61173288	A	G	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=50;PP=1519;SC=AGAAGCTTATATAGCTTCTGA;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=179364399;WS=179364381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	179380472	rs5779024	GT	G	1150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=627;SC=TTTAAAATTTGTTTTTTTTGT;SOR=1.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=27;WE=179380480;WS=179380462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	179398563	rs4652382	C	G	302.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	179398573	rs142726448	C	T	306.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=30.62;ReadPosRankSum=1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr1	179401564	rs10706073	CT	C	1824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.614;NF=14;NR=34;PP=745;ReadPosRankSum=1.592;SC=ACATCCCATCCTTTTTTTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=48;WE=179401573;WS=179401554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,76:0.96:79
chr1	179437827	rs7514278	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=77;SC=CTAAAGGTTTGTTGCAATACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=179437835;WS=179437817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	179452194	rs6668035	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=453;SC=AACTCTTTCTCATAGCTGATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=179452202;WS=179452184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	179452522	rs12407885	G	C	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=680;SC=TTTTAAAGCAGAATGTTTCTG;SOR=3.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=179452530;WS=179452512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	179462149	rs7549194	A	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=464;SC=AGATTTTTGAAGTTCAATTGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=179462157;WS=179462139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	179494665	rs4620484	C	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=306;SC=AGGGTCCTGCCCTGTCACCCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=179494673;WS=179494655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	179497359	rs6698201	T	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=14;PP=800;SC=AAATGGAAAATGTAAGCTTCC;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=179497367;WS=179497349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	179503806	rs6425572	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=242;SC=AATGAGTTTCGAAATCAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=179503814;WS=179503796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	179504025	rs141228272	AAAG	A	5022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=44.85;SOR=1.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	179504043	rs6658180	C	G	5538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=47;PP=2474;SC=AGAAGAACAACAAGAAGAAGA;SOR=1.162;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=119;WE=179504051;WS=179504015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	179504130	rs6425574	G	A	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=74;PP=2248;SC=CTTTATTCAGGTTGTATTTAT;SOR=1.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=116;WE=179504138;WS=179504120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	179520254	rs1410591	C	G	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=30;PP=2062;SC=CTCCCTCAGGCATGTGACTTT;SOR=1.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=179520262;WS=179520244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	179520506	rs1410592	G	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=41;PP=1297;SC=GAAGCTGAACGGCAGCAGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=179520514;WS=179520496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	179521932	rs2274626	G	T	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=79;PP=2448;SC=CAAATTTGGAGTGACCAGAGT;SOR=1.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=110;WE=179521940;WS=179521922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	179544898	rs1079292	T	C	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=52;PP=2076;SC=GCCCGCGGCCTCCGCCGCTCC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=179544906;WS=179544888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	179561645	rs4652418	A	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=529;SC=TTAAAACTGGAGTCTCAGTTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=179561653;WS=179561635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	179561683	rs4652419	A	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=984;ReadPosRankSum=-1.350;SC=GTTTTTTTTTAAATCTTTTTT;SOR=2.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=41;WE=179561691;WS=179561673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr1	179562740	rs61310274	G	C	7527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=119;PP=2965;SC=ACCGAGGAAGGGTTGCCCCTA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=234;WE=179562748;WS=179562730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	179604864	rs4628468	C	T	6334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=87;PP=2965;SC=TCCCGCCAGACGCTGTGCCGA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=180;WE=179604872;WS=179604854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	179605058	rs4483370	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=379;SC=TTTTTCACATGTCTCTTAAAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=179605066;WS=179605048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	179620253	rs6682666	G	A	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=56;PP=1661;SC=ATTTCACCACGTCAAGGTATA;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=179620261;WS=179620243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	179632347	rs7547484	A	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=632;SC=AGGAAAGTCAAACTGATATAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=179632355;WS=179632337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	179852074	rs1281378	T	C	4350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=89;PP=2551;SC=TCTCCTGTTATGACCAGGAGA;SOR=1.301;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=53;TCR=89;TR=142;WE=179852082;WS=179852064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	179852165	rs138905212	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=8.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr1	179852552	rs605807	T	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=559;SC=GATCTAACCTTTCAGTCTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=179852560;WS=179852542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	179858333	rs1300068	C	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=270;SC=ACTTCTCTAGCGTAAATAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=179858341;WS=179858323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	179858444	rs2245425	G	A	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=25;PP=1329;SC=TCCTATATTAGCAGTGAGTGA;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=70;WE=179858452;WS=179858434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	179876988	rs609521	C	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=15;PP=551;SC=GATAAGCAACCTTCAGTGCTA;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=179876996;WS=179876978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	179887125	rs627897	G	A	7313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=107;PP=2965;SC=ATGAAAACGCGGCCTTCAAAG;SOR=0.837;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=123;TCR=107;TR=230;WE=179887133;WS=179887115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	179983665	rs2501607	G	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=98;PP=2965;SC=ATATACAAAGGAGAGTCATTC;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=33;TCR=98;TR=131;WE=179983673;WS=179983655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	179989742	rs2477120	G	C	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=50;PP=2207;SC=TCCCAAACCAGAAGGGCTACT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=105;WE=179989750;WS=179989732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	179992076	rs2477117	A	G	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=659;SC=AGTTTTGCTCATTTAAAAATA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=179992084;WS=179992066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	179993793	rs4622030	T	C	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=7;PP=145;SC=ATGATTTGATTGCATAAGAAG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=179993801;WS=179993783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	180010702	rs4652461	T	C	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=119;SC=TTTTTTACTATGAATAAGACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=180010710;WS=180010692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	180022343	rs9425854	T	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=39;PP=1177;SC=GTTGTGGATATGTTCTCTCAA;SOR=1.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=180022351;WS=180022333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	180059736	rs67852047	GACATACCT	G	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=1424;SC=GACATAGATTGACATACCTAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=180059751;WS=180059726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	180059811	rs10798729	A	C	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=15;PP=1830;SC=TTATTATAGTAATATGTTTAT;SOR=2.245;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=180059819;WS=180059801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	180080115	rs3767202	T	G	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=7;PP=735;SC=CTAACCTTATTGTCTTCTAAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=180080123;WS=180080105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	180144291	.	C	CA	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5739;HP=13;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=55.54;NF=7;NR=2;PP=111;QD=12.8888888889;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=9;WE=180144299;WS=180144281;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,9:0.45:20
chr1	180145088	rs2298206	A	G	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=2125;ReadPosRankSum=2.111;SC=ACGTGCAGACACTGCGGGAGA;SOR=0.273;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=103;WE=180145096;WS=180145078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr1	180155376	rs2298207	C	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.19;NF=3;NR=6;PP=180;SC=AGTGTGCGTTCCTGTAAGGCT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=180155390;WS=180155366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	180155382	rs3216058	AG	A	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=251;SC=CGTTCCTGTAAGGCTGGGCAC;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=180155390;WS=180155366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	180159797	rs3215795	TC	T	419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=380;SC=GCAGGGAAGCTCCCTTGAATT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=180159805;WS=180159787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	180180669	rs164980	A	G	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=26;PP=929;SC=TAACTCGTGCATAGTGGCAGG;SOR=0.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=180180677;WS=180180659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	180180756	rs355610	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CCCCTCAACCCAGGCAGGACT;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=10;WE=180180764;WS=180180746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	180241155	rs3806302	G	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=-1.116;SC=AGCAGGGCTGGAGGGGCCAGG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=28;WE=180241163;WS=180241145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr1	180257692	rs2254465	A	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=10;PP=313;SC=AAGTTTACCAAGAGACAGAGA;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=180257700;WS=180257682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	180283659	rs2764433	T	C	66.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=16.51;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	180757056	rs3761904	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-1.004;SC=ATCATTGTTTAAACTTCTGAT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=180757064;WS=180757046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	180757117	rs34984251	G	GT	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=333;SC=CACTTAAGAGGATTTTCTTGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=180757125;WS=180757107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	180803922	rs2271669	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TCAACTAAAGTAATCATGCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=180803930;WS=180803912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	180849494	rs10914123	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=157;ReadPosRankSum=0.429;SC=TTGGGTAGCATGTAAGCTAAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=180849502;WS=180849484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	180885430	rs10732273	T	C	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=66;PP=2905;SC=ACATCCAGCCTGATGGCCCCC;SOR=0.977;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=91;TCR=66;TR=157;WE=180885438;WS=180885420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	180886810	rs3761905	C	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=2.237;SC=CAGCATATGGCTGTGCCCACA;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=19;WE=180886818;WS=180886800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr1	180897521	rs7544551	C	T	7690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=104;PP=2965;SC=CGTTATTTTCCTCTAATCCCT;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=123;TCR=104;TR=227;WE=180897529;WS=180897511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr1	180897792	rs35197779	ATGC	A	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.42;MQRankSum=1.368;NF=0;NR=8;PP=281;ReadPosRankSum=-0.865;SC=ATCTAGCCAAATGCTGCTGCT;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=8;WE=180897802;WS=180897782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	180905352	rs3795505	C	T	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.277;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=46;PP=1688;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TTACAGAAAGCCACGAGTCCC;SOR=0.966;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=248;TCF=137;TCR=111;TR=112;WE=180905360;WS=180905342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,137:0.46:298
chr1	180905448	rs3795504	G	T	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1676;ReadPosRankSum=-1.602;SC=CAGCTTCCTTGTGTCCTGAAG;SOR=0.534;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=213;TCF=97;TCR=116;TR=105;WE=180905456;WS=180905438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,134:0.51:261
chr1	180913597	rs2331995	A	G	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=66;PP=2965;SC=CAGCAAGGGGAACCGGTCCAG;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=144;WE=180913605;WS=180913587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	180933498	rs4652543	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.403;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=457;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GTCCAGGCCCCGGTTCCTGGG;SOR=3.373;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=20;WE=180933506;WS=180933488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr1	180953853	rs3747957	A	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=687;ReadPosRankSum=-2.182;SC=TCTTCATCACATTGTCCAGCC;SOR=0.772;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=55;WE=180953861;WS=180953843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr1	180962282	rs1411478	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GAGCCCAGAGAAGAAGACCAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=5;WE=180962290;WS=180962272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	181003340	rs61482628	A	AG	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=293;ReadPosRankSum=0.140;SC=TATTACACTCAGACTCCAGGA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=9;WE=181003348;WS=181003330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	181018258	rs3863720	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.961;NF=13;NR=32;PP=863;ReadPosRankSum=0.406;SC=AATTTATTTCGGTTGGGTACG;SOR=1.257;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=45;WE=181018266;WS=181018248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr1	181024528	rs75073791	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=0.612;SC=TAATGGGATTGAGCATTTATG;SOR=0.373;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=44;WE=181024536;WS=181024518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,57:0.55:104
chr1	181058272	rs113028155	G	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.685;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	181058313	rs3747955	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-1.712;SC=CCCGCCGCTCGTGCCTCTTGG;SOR=0.912;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=9;WE=181058321;WS=181058303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	181058618	rs1416829	C	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.660;SC=CGCGACCCCCCGCGCTGCCTG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=181058626;WS=181058608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	181058643	rs1361365	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=7;PP=218;SC=TGCGCGCCGCAACCAGCGGAG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=181058651;WS=181058633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	181684605	rs12407563	A	G	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=1033;SC=ATTCAAAAGGAGAGAAAGAAA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=181684613;WS=181684595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	181686216	rs7540850	T	C	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.06;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	181714466	rs375841404	AT	A	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=7.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.198;SOR=1.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr1	181719679	rs704332	C	T	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=60;PP=1826;SC=GTTGGAGGAGCGAGAAAGTAT;SOR=1.587;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=181719687;WS=181719669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	181726413	rs704330	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=188;SC=CATTAAATAAGCATTTTCCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=181726421;WS=181726403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	181727273	rs704329	G	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=23;PP=656;SC=CACAAGAGCCGACTGAGCCCC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=181727281;WS=181727263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	181750469	rs704328	G	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=279;SC=TCTCCTATCTGTCTGCATCCT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=181750477;WS=181750465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	181752769	.	A	AT	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.6037;HP=14;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=15;MQ=57.96;NF=9;NR=1;PP=104;QD=10.8;SC=ATGTCTTTCAATTTTTTTTTT;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=181752777;WS=181752759;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	181752923	rs36163765	AAGCTT	A	2488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=1972;SC=TGCCAAAGGTAAGCTTAGCTT;SOR=1.047;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=36;WE=181752935;WS=181752913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	181759657	rs704326	G	A	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=58;PP=2436;SC=TATGGACCCCGCCGATGACGG;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=70;TCR=58;TR=128;WE=181759665;WS=181759647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	182355046	rs2296519	A	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=667;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AGGACAAAACACTAAGAGTCA;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=48;WE=182355054;WS=182355036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr1	182356399	rs1058111	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=665;ReadPosRankSum=0.217;SC=GTAAAGTACTAGAGCCATCGA;SOR=0.642;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=50;WE=182356407;WS=182356389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,67:0.47:142
chr1	182369078	rs6698722	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=912;ReadPosRankSum=1.186;SC=AGCCAGAGACGGGTCTGTATA;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=48;WE=182369086;WS=182369068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr1	182369233	rs6674281	A	G	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1276;ReadPosRankSum=0.080;SC=AGCAGAGAATAAACGTGCAGC;SOR=0.844;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=77;WE=182369241;WS=182369223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
chr1	182429295	rs10572829	CTG	C	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=1015;SC=ATGCGTGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=21;WE=182429306;WS=182429285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	182429728	rs266508	T	C	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=12;PP=761;SC=AATTTGTCTCTTTGCTTTTGC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=182429736;WS=182429718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	182441446	rs569654	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.814;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=276;ReadPosRankSum=0.916;SC=AGGCTGGTGGGGGATGTCAGT;SOR=0.080;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=16;WE=182441454;WS=182441436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	182441835	rs1968710	C	A	54.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAACCCCAACCCTTAACCAGG;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=182441843;WS=182441825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	182443014	rs647224	G	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GGAAGATGTGGCAATTGGTAG;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=64;WE=182443022;WS=182443004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr1	182443462	rs649437	T	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1451;ReadPosRankSum=1.414;SC=CTGGCAGGACTTGCAGCATTT;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=94;TCR=85;TR=88;WE=182443470;WS=182443452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,103:0.50:207
chr1	182491107	rs607269	A	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=459;SC=CTTATAATATAGTGTTCTCCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=182491115;WS=182491097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	182496829	rs7535533	A	G	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1135;ReadPosRankSum=0.465;SC=GAAGATCAGTATAGAGACCAA;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=66;TCR=86;TR=77;WE=182496837;WS=182496819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,89:0.51:176
chr1	182501933	rs266534	C	A	7732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=103;PP=2965;SC=GAAAGTAAGTCATTTCTGTAT;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=112;TCR=103;TR=215;WE=182501954;WS=182501923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr1	182502033	rs266535	G	T	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=70;PP=2239;SC=GCAGCCTGGAGTCTAGCAAAA;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=108;WE=182502041;WS=182502023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	182509269	rs266531	G	A	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=684;SC=GACTATTTCAGTAGGCCAAAA;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=182509277;WS=182509259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	182509292	rs3856115	A	G	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=10;PP=1124;SC=ATGGATCCACAGTCTCCTTTC;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=182509300;WS=182509282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	182509617	rs3911280	C	A	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=397;SC=TAGGACTGCCCAGCAGAAACT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=182509625;WS=182509607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	182517357	rs6657620	G	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=453;SC=CTGGCCTTGCGTTTTTTGGGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=182517365;WS=182517356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	182544581	rs36053738	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=-1.992;SC=CACACTGAGGCTTGTTTGGAC;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=35;WE=182544589;WS=182544571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr1	182549019	rs533259	A	G	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=28;PP=1492;SC=TCACAGCTTCATGTAGTGGTG;SOR=1.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=182549027;WS=182549009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	182551337	rs627928	A	C	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.665;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1106;ReadPosRankSum=-1.527;SC=GAGCTTTCAGATCCTCAAATG;SOR=1.186;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=144;TCF=85;TCR=59;TR=68;WE=182551345;WS=182551327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,84:0.49:171
chr1	182551494	rs75403961	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=426;ReadPosRankSum=-1.620;SC=GATGGGAGGAATCTCAAGGAA;SOR=0.434;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=26;WE=182551502;WS=182551484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	182554403	rs12742422	T	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=507;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GAAAAACTTTTCCTATCATAA;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=30;WE=182554411;WS=182554393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr1	182569626	rs1144566	T	C	4433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=87;PP=2496;SC=CGTCAGCTCGTGGGTCTCATG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=182569634;WS=182569616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	182571003	rs610367	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=0.379;SC=GGCCCTTCTACCTCTACACCT;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=182571011;WS=182570993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	182571277	rs569790	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=472;ReadPosRankSum=0.952;SC=TCTGGGGTTGCGGGAAAGAAG;SOR=0.785;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=33;WE=182571285;WS=182571267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr1	182573227	rs509476	T	C	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=30;PP=1707;SC=TCAAGTGCGCTTCTACCTCTC;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=182573235;WS=182573217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	182778367	rs971040	G	A	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=94;PP=2965;SC=CAAAGTAGACGGAGTAGCTTT;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=73;TCR=94;TR=167;WE=182778375;WS=182778357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	182784022	rs2275171	T	C	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=711;ReadPosRankSum=-0.962;SC=ATGCATGGCATCTCACATGGT;SOR=0.908;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=46;WE=182784030;WS=182784012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr1	182850727	rs6677840	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=19;PP=877;SC=TAAGAATGACTTGGGAAGCCA;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=182850735;WS=182850717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	182854017	rs3130492	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=271;ReadPosRankSum=0.329;SC=TAGAATTCCTGAAGTTAGTGA;SOR=1.123;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=17;WE=182854025;WS=182854007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr1	182869085	rs181245893	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=339;ReadPosRankSum=-2.218;SC=ACAAATTTGTGAAATATAAAA;SOR=0.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=23;WE=182869093;WS=182869075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	182993025	rs10911194	C	T	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.009;SC=TCAACGCCGCCTTCAACGTGA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=137;TCR=106;TR=109;WE=182993033;WS=182993015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,143:0.47:307
chr1	182993358	rs12030652	G	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=415;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CCTCACGGGCGCAGACGGCCG;SOR=1.508;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=17;WE=182993366;WS=182993348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr1	183072590	rs2296288	T	C	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=901;ReadPosRankSum=0.514;SC=GTGGTTCCTGTGAGAACACCT;SOR=0.935;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=69;WE=183072598;WS=183072580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr1	183072701	rs2296289	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=0.483;SC=CTGGGGGCAACGTGGCCTTTT;SOR=0.433;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=46;WE=183072709;WS=183072691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,55:0.57:96
chr1	183077296	rs3835273	A	AG	578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=576;ReadPosRankSum=0.983;SC=ATTTAGTGCTAAAGAGGGCGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=18;WE=183077304;WS=183077286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr1	183077615	rs3765521	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	183077618	rs3765522	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.16;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	183079509	rs2296291	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=226;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GCTCAGTTCCCCAGTTTACAC;SOR=0.126;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=183079517;WS=183079499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	183079853	rs6672093	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=246;ReadPosRankSum=1.254;SC=GAAGAAGGAATGGGTGACTTT;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=17;WE=183079861;WS=183079843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr1	183084607	rs3736888	AC	GA	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=998;ReadPosRankSum=0.328;SC=GATTTTACTTACGTATCTGGC;SOR=0.547;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=28;WE=183084616;WS=183084597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr1	183085696	rs6424888	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=649;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TGTTTTATCCATTTTTCATTG;SOR=0.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=47;WE=183085704;WS=183085686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr1	183085755	rs20563	A	G	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1194;ReadPosRankSum=0.515;SC=TGAATGTAATATTGAAACAGG;SOR=0.741;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=77;WE=183085763;WS=183085745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,90:0.53:170
chr1	183086757	rs2296292	A	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=381;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCTCTCTGCAGAAGACCTTG;SOR=1.034;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=27;WE=183086765;WS=183086747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr1	183093875	rs20557	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=731;ReadPosRankSum=-1.249;SC=TCGATCCCAATGCAGTTGGAA;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=53;WE=183093883;WS=183093865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr1	183094547	rs20558	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=617;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AATTGCAATCTGTATGGGACC;SOR=0.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=45;WE=183094555;WS=183094537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr1	183095185	rs55856623	TAA	T	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.619;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	183095234	rs1886501	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.294;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=635;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TGCCTGAGAAATGTCCTGTGT;SOR=1.152;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=33;WE=183095242;WS=183095224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	183095477	rs2296293	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=580;ReadPosRankSum=-0.007;SC=GACTTTGACAGCCTCAGTCTA;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=33;WE=183095485;WS=183095467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	183096253	rs3066017	T	TATA	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	183096634	rs1413390	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-1.595;SC=GGTGAACAAGGTAGATGTGGT;SOR=0.051;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=183096642;WS=183096624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	183096668	rs1413389	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GACTTATGTTCCAGTTGGGAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=183096676;WS=183096658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	183097956	rs34133998	G	GTTA	814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.124;NF=0;NR=11;PP=410;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CTAAAGCAAGGTTAGTATAGT;SOR=0.811;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=183097964;WS=183097946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr1	183098001	rs10797851	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TAAACTACTCATAGATTATAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=183098009;WS=183097991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	183099701	rs2296300	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=403;ReadPosRankSum=1.504;SC=GATTGCAAACGTCTGAGGTGG;SOR=0.616;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=24;WE=183099709;WS=183099691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	183100555	rs2333620	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr1	183100562	.	G	GT	1600.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.826;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr1	183100563	.	G	GTGTGTGTGTGT	1557.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.303;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr1	183100596	rs2333619	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-1.821;QD=14.97;ReadPosRankSum=2.258;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr1	183100596	.	ATT	GTG	606	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=57.15;NF=1;NR=14;PP=606;QD=43.9645249908;SC=GTGTGTGTGTATTGTCTTATC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=15;WE=183100606;WS=183100586;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr1	183100598	rs4047797	T	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-1.759;QD=15.39;ReadPosRankSum=2.111;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	183101427	rs148796825	AAAT	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=138;SC=ACTCCATTTCAAATAATAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=183101437;WS=183101423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
chr1	183101444	rs12071514	A	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.732;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	183101471	rs12061219	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGCATTACCTGAATTTTACTT;SOR=1.127;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=183101479;WS=183101461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	183101686	rs12095664	G	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=799;ReadPosRankSum=-2.196;SC=AGTATAATTTGAAAGTGGTTT;SOR=0.925;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=47;WE=183101694;WS=183101676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,56:0.40:139
chr1	183102719	rs73036945	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGCCCCACCCCGTCTCTCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=183102727;WS=183102709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	183104003	rs3831074	GGTCTGT	G	2772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=2122;ReadPosRankSum=3.619;SC=AGTCCAAATGGGTCTGTGATG;SOR=0.632;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=0;TCR=92;TR=40;WE=183104016;WS=183103993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr1	183104079	rs2296298	C	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=-1.238;SC=TTTATGCTGGCAAGTCTCAGG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=18;WE=183104087;WS=183104069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	183104340	rs35182436	AT	A	913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.741;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=328;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CACTAGAGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.637;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=26;WE=183104348;WS=183104330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr1	183105399	rs2296296	C	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.732;SC=AGCCCATGCTCTCTTCCATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=183105407;WS=183105389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	183105534	rs20560	T	C	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.177;SC=TTGATAGGCGTGTGAACGATA;SOR=0.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=126;TCF=78;TCR=48;TR=70;WE=183105542;WS=183105524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,86:0.55:156
chr1	183106739	rs10797854	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=-0.361;SC=TATAAAAGGAGCGGGAGCATA;SOR=1.721;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=16;WE=183106747;WS=183106729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	183155715	rs60707856	CT	C	766.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=1090;ReadPosRankSum=2.188;SC=TCTGGGGCTCCTCCAGAGACG;SOR=0.330;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=16;WE=183155725;WS=183155705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr1	183155717	rs61418038	C	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=1086;ReadPosRankSum=2.001;SC=TGGGGCTCCTCCAGAGACGGA;SOR=0.363;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=20;WE=183155725;WS=183155705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	183155778	rs6703054	A	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AAATAGTAAGACAATAAGCTG;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=183155786;WS=183155768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	183176926	.	C	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=6.532;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TGCATAATTTCTATCAATAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=183176934;WS=183176916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	183184524	rs2274981	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=-1.028;SC=TAGTTGCTTCCAATGCCGCAT;SOR=1.102;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=16;WE=183184538;WS=183184514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	183184616	rs2274980	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=347;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GTGACAACTCCGGACGGTGCA;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=23;WE=183184624;WS=183184606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr1	183184815	.	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=1.000;SC=GAGCCCCTACCCTGTGCCAAA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=17;WE=183184823;WS=183184805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	183184848	rs875794	T	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=-2.319;SC=AGTACATCATTTGGGCTATCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=183184856;WS=183184838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	183187494	rs10911285	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=704;ReadPosRankSum=1.944;SC=TTTGGAAGCATGTCCCTAATT;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=54;WE=183187502;WS=183187484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr1	183187603	rs1129723	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=843;ReadPosRankSum=0.532;SC=AGCCAGCTGTCACTGGAGAAC;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=55;WE=183187611;WS=183187593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,61:0.45:136
chr1	183191144	rs2296307	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=281;ReadPosRankSum=1.418;SC=TAGGACTTGTCGGCAAGCAAA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=19;WE=183191152;WS=183191134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr1	183192304	rs1047980	T	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=348;ReadPosRankSum=0.209;SC=TGAGCTATGGTCAAAGCCTGT;SOR=0.321;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=20;WE=183192312;WS=183192294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr1	183192496	rs3738824	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=209;ReadPosRankSum=-0.533;SC=AATTAGAGCAAACTATGATTG;SOR=1.897;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=11;WE=183192504;WS=183192486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	183194619	rs2021956	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TCTCAGTCCTATGCCCCCTTC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=183194627;WS=183194615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	183201970	rs2296303	G	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=363;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CTGGCAGAAAGTGAAGCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=25;WE=183201978;WS=183201960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	183205523	.	CA	C	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=33;QD=12.0;SC=AACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=183205531;WS=183205522;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr1	183206573	rs1047981	G	A	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=61;PP=1895;ReadPosRankSum=-1.618;SC=AGCGTACACAGAAGAATCTGG;SOR=0.642;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=243;TCF=125;TCR=118;TR=119;WE=183206581;WS=183206563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,145:0.48:300
chr1	183207603	rs1925043	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AAGTGTATAGTCATGACCAAT;SOR=0.502;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=18;WE=183207611;WS=183207593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr1	183209086	rs2477436	C	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GCCCGGCTGCCGCTGTATTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=183209094;WS=183209076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	183212171	rs3768594	C	A	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=96;SC=ATACTATTTGCTCTAGGCAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=183212179;WS=183212161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	183212548	rs3768593	T	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=603;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CTGCCATAAATATTTCTCAAC;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=43;WE=183212556;WS=183212538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr1	183253213	rs607332	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.434;SC=TTAGGGAACAGGCTTCCTGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=4;WE=183253221;WS=183253203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	183253959	rs603850	T	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=-0.448;SC=AGGGACAGAGTGGGAGAGAAC;SOR=0.381;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=25;WE=183253967;WS=183253949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr1	183273751	rs2276879	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=-1.190;SC=CCATCTGCACCTCCCTCCAGC;SOR=1.981;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=183273759;WS=183273741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	183471295	rs789193	G	T	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=118;SC=CCTTTCACATGAAGTCATTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=183471303;WS=183471285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	183486859	rs789169	G	A	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=84;PP=2965;SC=TCACAACACTGCAAGGCCAGG;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=100;TCR=84;TR=184;WE=183486867;WS=183486849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	183516100	rs699246	G	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=254;SC=ATTTCAGAGCGTTTTTTCTCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=183516108;WS=183516090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	183516440	rs2702182	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=426;SC=CTGCTTCTCTGAGATACTGTA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=183516448;WS=183516430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	183525452	rs699244	T	G	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=46;PP=1414;SC=ATTTGTTATCTGTCACCCTTC;SOR=1.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=60;WE=183525460;WS=183525442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	183534935	rs2296164	C	T	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=665;SC=CAGGGAGCGACGGTCAGAACC;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=183534943;WS=183534925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	183542387	rs2274064	T	C	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=34;PP=1918;SC=TCGAAACAGCTTGCCCACAGG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=95;WE=183542395;WS=183542377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	183555879	rs789191	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=1.698;SC=TGCCTCACCTGCTGATTTATT;SOR=0.290;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=10;WE=183555887;WS=183555869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
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chr1	183616926	rs1174657	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=831;ReadPosRankSum=-0.677;SC=CCAAGGTCCTTGGTTTCCTGG;SOR=0.777;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=56;WE=183616934;WS=183616916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr1	183617105	rs1174658	A	G	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=992;ReadPosRankSum=-1.653;SC=CATTTGAAAAAACTGTCCAGG;SOR=0.535;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=62;WE=183617113;WS=183617095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,79:0.47:169
chr1	183617266	rs17436878	C	G	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CCAGTGCTCTCCCAGTTAAAA;SOR=0.522;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=103;WE=183617274;WS=183617256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr1	183711483	rs3820689	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TACCTGAGACCATAATTCTTC;SOR=1.414;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=16;WE=183711491;WS=183711473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	183775638	rs11579867	A	T	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=40;PP=1406;SC=AGCTGGCGAGATGGTGAACTT;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=183775646;WS=183775628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	183817016	rs3010054	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-0.077;SC=AGATATGTGAGGAAAGATTAA;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=183817024;WS=183817006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	183852914	rs10797919	G	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=559;ReadPosRankSum=1.920;SC=TTCCATATGTGAACAGATGGG;SOR=1.075;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=31;WE=183852922;WS=183852904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr1	183861021	rs75352181	C	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=230;SC=TGGCCAAGTCCACCTTAAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=183861029;WS=183861011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	183866849	rs12031722	G	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=544;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CGAGAGTTATGCAGGGTTGTG;SOR=0.193;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=35;WE=183866857;WS=183866839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr1	183871637	rs4604659	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=1.825;SC=TGTGACCTACGACAACATATG;SOR=0.200;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=11;WE=183871645;WS=183871627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr1	183876182	rs11591089	C	T	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=56;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CAGCTGCTGACGCCAGCACCA;SOR=0.456;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=98;WE=183876190;WS=183876172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,104:0.51:205
chr1	183895178	rs4328036	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=715;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TACAGCTGCCGTTGTCAGTAC;SOR=0.602;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=43;WE=183895186;WS=183895168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr1	183895435	rs4382680	A	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.020;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-1.842;SC=GAAGGGAGGGACCAGTGGCCC;SOR=2.441;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=14;WE=183895443;WS=183895425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr1	183908222	rs3010040	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AGGAGACTTACGGAACAGGGA;SOR=0.088;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=16;WE=183908230;WS=183908212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr1	183909717	rs2296713	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=407;ReadPosRankSum=1.326;SC=AGACTCACACGGGATGCTTGT;SOR=0.684;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=31;WE=183909725;WS=183909707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr1	183909934	rs1887278	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=293;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GTAAGGAAATGGCAGAGGAGA;SOR=0.479;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=17;WE=183909942;WS=183909924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr1	183913540	rs17504460	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-1.292;SC=TAAAAAGTCACGAGTCTAGTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=183913548;WS=183913530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	183942950	rs2296714	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=923;SC=GAGAATAACCCAGCCCTTCTG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=183942958;WS=183942940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	183944089	rs2077202	A	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=225;SC=CAAAAATTTCATTGTGCCTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=183944097;WS=183944083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	183944444	rs2378795	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=302;SC=TTCTATCAATCCCAGGAAGTA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=183944452;WS=183944434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	183947757	rs3833521	G	GA	427.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.485;NF=0;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=0.206;SC=GCTACTCCTGGAAAAAAAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=183947765;WS=183947747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr1	184760001	rs570441	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=519;ReadPosRankSum=0.309;SC=CATTAAGTGGTTTCCCTGCAG;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=25;WE=184760009;WS=184759991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr1	184764067	rs581100	C	G	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CCCCTATAACCCTTTGGCTTT;SOR=0.554;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=83;WE=184764075;WS=184764057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,107:0.47:230
chr1	184777079	rs338564	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=319;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GTGTCCTCCCGCAACATGATG;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=17;WE=184777087;WS=184777069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	184777101	rs338565	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=497;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CTAAAGAGACGCGACGTATTT;SOR=0.631;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=29;WE=184777109;WS=184777091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr1	184777177	rs543912	C	A	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1295;ReadPosRankSum=-1.599;SC=TCTTTACCCTCATCCACCACG;SOR=0.489;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=195;TCF=119;TCR=76;TR=98;WE=184777185;WS=184777167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,111:0.49:228
chr1	184777467	rs338566	A	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.533;SC=ATCAAATGCAAGTTGTTAAAG;SOR=0.346;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=184777475;WS=184777457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	184868251	rs3753575	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=168;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TCAGAAATACGGCTGTGCTAT;SOR=0.313;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=15;WE=184868259;WS=184868241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr1	185094277	rs7523448	G	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AACTGGGTTTGAAAAATGTTT;SOR=0.724;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=185094285;WS=185094267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	185119794	rs1544051	C	T	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=219;SC=GTAATTGTTGCAGCACATGAT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=185119802;WS=185119784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	185135745	rs950327	A	G	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=793;ReadPosRankSum=0.563;SC=CTACTAGTTCATCTTCTATAA;SOR=0.674;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=55;WE=185135753;WS=185135735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,61:0.54:112
chr1	185137454	rs58809696	T	TAAATGATAGAC	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.542;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr1	185137461	rs56166198	A	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.48;ReadPosRankSum=-2.044;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr1	185137464	.	T	TAA	651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=-2.204;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr1	185143721	rs10489579	A	G	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=49;PP=2501;SC=TGACCATGGAATTAAAAGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=185143729;WS=185143711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	185153545	rs76544683	G	GT	1375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=1171;SC=TAACAATGATGGGCTTTTTTT;SOR=1.885;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=185153553;WS=185153535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	185171869	rs6698109	A	G	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=61;PP=2159;SC=GAGTTATTACACTTATCTCTG;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=185171877;WS=185171859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	185176015	.	A	G	25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=25;QD=29.8856062736;SC=AATCATTTATACTTCTAATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=185176023;WS=185176005;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	185240474	rs12041704	A	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=35;PP=1184;SC=CCCAAACAGTAATTATCAAGA;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=185240482;WS=185240464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	185259731	rs2378909	A	G	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=755;SC=ATTAAAATGTAAAATAAAATG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=185259739;WS=185259721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	185267114	rs10174	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=752;SC=GTGTACCTCTACTAACCATAA;SOR=3.126;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=185267122;WS=185267104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	185833565	rs7556537	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.249;SC=ATTGTTTTTGATGATGACGTA;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=12;WE=185833573;WS=185833555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	185833880	rs41458549	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=532;ReadPosRankSum=0.378;SC=ATCCACATGTATGTTCTCCAA;SOR=1.042;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=31;WE=185833888;WS=185833870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr1	185984517	rs6665753	T	C	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=960;ReadPosRankSum=-0.113;SC=ATACGTGTCATGTAGCCAATG;SOR=0.339;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=163;TCF=68;TCR=95;TR=78;WE=185984525;WS=185984507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,93:0.49:190
chr1	186022032	rs10911808	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=0.550;SC=TAAACTGTTATGAGAATTCTA;SOR=1.230;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=186022040;WS=186022022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	186026474	rs12129650	T	C	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CTGCCTTCCATAACCTGGTTC;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=89;WE=186026482;WS=186026464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,104:0.46:226
chr1	186030902	rs10737266	G	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=0.280;SC=AATTTTTACCGAAATTGAGCA;SOR=0.569;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=13;WE=186030910;WS=186030892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	186031041	rs7522627	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1076;ReadPosRankSum=1.953;SC=AATATACTTGCGTTGTAAGGA;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=68;WE=186031049;WS=186031031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr1	186084541	rs144346158	A	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=794;ReadPosRankSum=0.838;SC=ATCAGAACTCATACAGGTAAG;SOR=0.725;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=48;WE=186084549;WS=186084531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr1	186105796	rs41317497	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=442;ReadPosRankSum=-1.126;SC=GCTTTTTTCCGTAGGTCCTCC;SOR=2.431;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=24;WE=186105804;WS=186105786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
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chr1	186270894	rs1547084	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=612;ReadPosRankSum=-1.007;SC=AGATCTGTGCACCTACCTTAG;SOR=0.897;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=35;WE=186270902;WS=186270884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr1	186273994	rs2273779	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=428;ReadPosRankSum=-0.688;SC=TTCAACAATTCGGAAAATCAA;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=31;WE=186274002;WS=186273984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr1	186276661	rs61831150	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr1	186277088	rs68069719	G	C	6386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=85;NR=109;PP=2965;SC=TCCACCACCTGTGACAAGCCC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=85;TCR=109;TR=194;WE=186277096;WS=186277078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	186277989	rs3737940	A	G	2922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1746;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TGAGAAAACCAAAGACGACAC;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=109;WE=186277997;WS=186277979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,134:0.51:263
chr1	186305914	rs12085497	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=1.471;SC=TAACTTATTAATTTGCTTTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=186305922;WS=186305904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	186313249	rs2950829	A	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=60;PP=1843;SC=TATCAGAATAACAGATTTTCC;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=75;WE=186313257;WS=186313239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	186316656	rs3753564	G	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.300;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=1.539;SC=CTGTTATAAAGAGCTTATGAA;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=14;WE=186316664;WS=186316646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr1	186321242	rs61744267	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=2.211;SC=TCTGCTCTTACCTAAACATAA;SOR=0.914;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=12;WE=186321250;WS=186321232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	186329869	rs2026187	C	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=380;ReadPosRankSum=1.968;SC=AGTATTTCAACTCACTAACAA;SOR=0.477;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=25;WE=186329877;WS=186329859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr1	186352347	rs4651309	A	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=0.389;SC=GCTAGAATCAAGAAGATTTAG;SOR=0.904;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=25;WE=186352355;WS=186352337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr1	186357523	rs1290390	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=207;SC=TCAACACTCATCTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=186357531;WS=186357513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	186358588	rs1003127	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ATATGTACGCATATCTTTAAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=186358596;WS=186358578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	186359750	rs3115752	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=1.284;SC=GTTTGTATGCGTTATTTAGGT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=186359758;WS=186359740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	186363119	rs12084264	C	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=200;ReadPosRankSum=0.064;SC=ACTAGTCATTCTTTTGATGTC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=14;WE=186363127;WS=186363109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr1	186648197	rs5277	C	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=438;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TACATGTCAACACATAACTCA;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=24;WE=186648205;WS=186648187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	186649221	rs2745557	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.504;SC=AGTTCTTTCGAACTCTAGCGG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=8;WE=186649229;WS=186649211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	186839861	rs7547993	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.380;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.086;NF=30;NR=33;PP=1039;ReadPosRankSum=1.308;SC=GACAAAGGGGGCCTTTGGTGA;SOR=0.395;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=63;WE=186839869;WS=186839851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr1	186839879	rs12720508	AAG	A	1633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.238;NF=4;NR=25;PP=1074;ReadPosRankSum=0.217;SC=TGACATGCGTAAGAGTGCCCT;SOR=0.860;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=29;WE=186839888;WS=186839869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,45:0.40:112
chr1	186901738	rs12720584	TTCTTCTTTTAAAA	T	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=2971;SC=CGGCCTTATTTTCTTCTTTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=186901758;WS=186901728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	186919732	rs4650709	A	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.61;SOR=3.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	186919993	rs969357	G	A	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=53;PP=1528;SC=GTAGCTTTCTGTTGAGAGAGA;SOR=2.505;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=186920001;WS=186919983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	186925168	rs5007825	A	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=410;SC=CACCGTGCCCAGCCCAAAGAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=186925176;WS=186925166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	186925194	rs5007824	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=740;SC=TTTAAACATGTATTTTGGAGT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=186925202;WS=186925184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	186925552	rs2307199	T	C	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=64;PP=1962;SC=GCATTTTAATTATTATTAACA;SOR=2.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=186925560;WS=186925542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	186946912	rs2307198	G	A	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=87;PP=2584;SC=AGAAAGTACAGGGCTCCAGGT;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=36;TCR=87;TR=123;WE=186946920;WS=186946902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	187610537	rs10159161	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	187610538	rs10157977	C	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=162;SC=GGACAAAGAACCCCGTCTTTA;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=187610546;WS=187610527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	187610698	rs10157987	C	A	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=707;ReadPosRankSum=0.706;SC=GAAACCATGCCCCCACCCCTA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=52;WE=187610706;WS=187610688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr1	187610852	rs10159182	A	T,C	4611.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=31,39;NR=33,44;PP=1038,1301;SC=CCATGTGCCCATGGAATCTCC;SOR=0.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=64,83;WE=187610860;WS=187610842;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.42:186
chr1	187611003	rs12076164	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CAATATCAGCATTTAAGTTTA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=187611011;WS=187610993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	192128183	rs4454527	G	A	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=924;SC=AAACATTTTCGTATGTTACCC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=192128191;WS=192128173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	192129370	rs4329489	G	A	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=157;SC=TAATGTAAATGCAATTTTCAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=192129378;WS=192129360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	192335271	rs59139714	C	CTAAT	1696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=1376;SC=TAAAAGTTAACTAATCACTAT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=23;WE=192335279;WS=192335261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	192544795	rs2984920	A	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=383;SC=CACCAAGAAAAGGGGAACTTC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=192544803;WS=192544785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	192545099	rs7535818	G	A	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=51;PP=1436;SC=ATTTTAACAAGTTATCTTTAA;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=192545107;WS=192545089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	192548543	rs1323291	T	G	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=306;ReadPosRankSum=1.417;SC=TTGGCCTTTTTTGGGTGTCTT;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=19;WE=192548551;WS=192548533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr1	192548559	rs2816308	G	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=254;ReadPosRankSum=1.123;SC=GTCTTGACAGGCCAAGAAGAA;SOR=0.754;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=15;WE=192548567;WS=192548549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	192779227	rs2746073	T	A	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=6;PP=1051;SC=TTGGTAAAAATGCGTTCAGCT;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=192779235;WS=192779217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	192780088	rs5779653	GCT	G	12138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=114;PP=2969;SC=CATTCTGCATGCTCTCTTTTC;SOR=0.956;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=60;TCR=117;TR=170;WE=192780102;WS=192780078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr1	192780337	rs10607546	CAA	C	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=854;SC=AAAAGTGAAACAAAGTAATCA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=192780346;WS=192780327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	193039846	rs76437632	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CACCTAACATGTAGTAGAAGT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=193039854;WS=193039836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	193051685	rs2275444	G	A	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=17;PP=1412;SC=CTTTTGTTCCGAATTAGATCC;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=193051693;WS=193051675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	193054154	rs10921309	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=22;PP=890;SC=TGAATAATACGTGTGTACCTA;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=193054162;WS=193054144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	193074371	rs10801175	A	G	150.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=61;SC=ACGCCGCGGCACTCCTGCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=193074379;WS=193074361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	193074651	rs10921310	T	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=12;PP=983;SC=GGTCACCTCCTCGCAGCTGAG;SOR=1.355;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=193074659;WS=193074641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	193090865	rs10737621	C	A	5456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=83;PP=2965;SC=GGTACGCGCGCACCTGACGCC;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=92;TCR=83;TR=175;WE=193090873;WS=193090855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	193094375	rs4466634	T	C	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=51;PP=1588;SC=TACTTATCTATCTATTTATCA;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=193094383;WS=193094365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	193104827	rs10921318	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=TTTTTTTCTGGAAAAATTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=193104835;WS=193104817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	193202001	rs10921328	C	G	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=109;SC=CCACTGCACTCTAGCCTGGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=193202009;WS=193201991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	193205272	rs3738244	T	A	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=20;PP=1827;SC=ATAAGACTCTTTCACATGAAT;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=193205280;WS=193205262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	196227526	rs977157	A	G	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=51;PP=1982;SC=GGTCCGACTGATCACTGGATG;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=196227534;WS=196227516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	196242764	rs558895	T	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=604;SC=ATTTCTCGTATGGCTTTTGAA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=196242772;WS=196242754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	196251522	rs2477357	T	C	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.73;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	196254970	rs2477360	C	T	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=43;PP=1237;SC=TGTTGACATACGTAAAAAGTT;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=196254978;WS=196254960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	196311513	rs6658788	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=-0.978;SC=GTCTGAAGATGACATTATATG;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=196311521;WS=196311503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	196398619	rs1538684	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=524;SC=GTTAGATAAATAAGCCACTTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=196398627;WS=196398609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	196398974	rs12121250	T	A	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=409;SC=CCAAAGCACATTTCATAAAGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=196398982;WS=196398964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	196438061	rs1339954	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	196461513	rs4607811	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=226;SC=ATGCAAGCAACCATATCTTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=196461521;WS=196461503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	196654324	rs1061147	A	C	2999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=54;PP=1906;ReadPosRankSum=2.296;SC=GAAATACAGCAAAATGCACAA;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=238;TCF=125;TCR=113;TR=116;WE=196654332;WS=196654314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,139:0.46:299
chr1	196658497	rs482934	G	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=1.126;SC=TCTAATATGAGTGTTTATTAC;SOR=0.473;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=23;WE=196658505;WS=196658487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr1	196658905	rs12029785	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.736;SC=TATTATGAGGGTTTCTTCTTG;SOR=0.086;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=196658913;WS=196658895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	196659231	rs201671665	C	A	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=1814;ReadPosRankSum=-0.790;SC=TGGATATAATCAAAATCATGG;SOR=0.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=47;WE=196659245;WS=196659221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr1	196659237	rs1061170	C	T	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=2070;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TAATCAAAATCATGGAAGAAA;SOR=0.451;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=54;WE=196659245;WS=196659221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr1	196684625	rs203674	G	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTTATTAGTAGATCTAATCAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=196684633;WS=196684615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	196695742	rs3753396	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=558;ReadPosRankSum=0.349;SC=ATAAAATTCAATGTGTTGATG;SOR=0.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=38;WE=196695750;WS=196695732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr1	196709774	rs1065489	G	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.550;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr1	196714827	rs183157978	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CTCATTTCTTTCACCAGAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=196714835;WS=196714817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	196714885	.	AT	A	1300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.785;NF=19;NR=11;PP=1015;ReadPosRankSum=0.021;SC=CGTTTGCCTTATTTGAACTTG;SOR=0.724;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=30;WE=196714893;WS=196714875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr1	196743927	rs385390	A	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=355;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TAAATTCAGAACCACACTTGG;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=23;WE=196743935;WS=196743917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr1	196743964	rs446868	C	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.046;NF=23;NR=16;PP=517;ReadPosRankSum=0.677;SC=ATTTCAAACCCCAAACAGTGC;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=39;WE=196743972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr1	196757392	rs400344	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.620;NF=8;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=0.978;SC=GATTCATTTCCGAATCTTCCT;SOR=0.280;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=9;WE=196757400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr1	196757874	rs387111	G	A	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.409;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.445;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr1	196757881	rs387107	G	T	2796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=3.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.495;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr1	196758778	rs384032	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.284;NF=8;NR=5;PP=194;ReadPosRankSum=0.587;SC=TTTAAGCTCCGTGACACATTG;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=13;WE=196758786;WS=196758768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr1	196874356	rs10801578	G	T	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=62;PP=2965;SC=CAACAGCAGAGGGAAATTCTT;SOR=1.191;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=103;TCR=62;TR=165;WE=196874364;WS=196874346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	196884258	rs150845796	A	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.79;MQRankSum=-4.541;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,26:0.29:91
chr1	196884290	rs200244837	T	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQRankSum=-1.474;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=0.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr1	196887457	rs10494745	G	A	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=41;PP=1842;ReadPosRankSum=0.486;SC=TGTAAATTGGGATATAATGCG;SOR=0.822;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=238;TCF=149;TCR=89;TR=117;WE=196887465;WS=196887447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,130:0.50:258
chr1	197008597	rs5990	A	C	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=29;PP=1114;SC=TCAGGTGTTAATTACAATCTC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=197008605;WS=197008587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	197009798	rs5998	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=22;PP=718;SC=TGTGTGGTCTATTGTCAAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=197009806;WS=197009788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	197026672	rs1759009	A	G	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=100;SC=AATATTCATCATGTCAAGCAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=197026680;WS=197026662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	197029345	rs1332661	G	A	128.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=98;SC=AAAGATTGCTGAAAATAGCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=197029353;WS=197029335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	197030201	rs5997	T	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=991;SC=GAGCCAAACATGTTTCTAAAA;SOR=4.849;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=197030209;WS=197030191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	197031021	rs6003	C	T	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=58;PP=2044;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GCAACCATAACGCATGTTCTC;SOR=0.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=115;WE=197031029;WS=197031011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr1	197053373	rs12677	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=493;SC=AGTTGTACACGGAGAGCAAAA;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=197053381;WS=197053363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	197055925	rs10754213	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=13;PP=549;SC=CTATATTTAATTGCTTACCTT;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=197055933;WS=197055915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	197059878	rs4915315	G	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=621;SC=CGGCTAATGCGTTAGCTTTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=197059900;WS=197059868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	197059892	rs10754214	A	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=829;SC=GCTTTTTAAAATGGTAACTAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=197059900;WS=197059868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	197059928	rs4915316	A	G	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=11;PP=1469;SC=GATATCATGTAGATGAATTGC;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=59;WE=197059936;WS=197059918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	197070815	rs1412640	T	C	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=54;PP=2580;SC=TTTCTCTTTGTAATTTTGCAG;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=197070823;WS=197070805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	197070901	rs964201	A	G	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=53;PP=2965;SC=TATGTTCTGTACATCCTGAAA;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=136;WE=197070909;WS=197070891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	197091537	rs4915337	A	T	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=45;PP=2226;SC=ATGCTTTAAGAGACATATCCA;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=111;WE=197091545;WS=197091527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	197094030	rs6676084	C	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=952;SC=TCCAAAGCAACCTGAGAGTTT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=197094038;WS=197094020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	197101621	rs3737111	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=AATACACTTATAGTCTTAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=197101629;WS=197101611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	197104149	rs35659894	TA	T	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=607;SC=TATGTATAATTAAAGAATGAC;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=197104157;WS=197104139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	197108946	rs17550662	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=339;ReadPosRankSum=0.067;SC=CCACAGCGATAATGGGTTTTG;SOR=1.437;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=19;WE=197108954;WS=197108936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr1	197109042	rs1332663	C	T	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=273;SC=CATTAAAATACAAATTCCCTA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=197109050;WS=197109032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	197112533	rs6677082	G	A	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=54;PP=2923;SC=TAACATTTACGGAATTAAAGG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=132;WE=197112541;WS=197112523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	197113073	rs1571964	G	A	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=10;PP=565;SC=ATCACAGAATGGTTAAAACAT;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=197113081;WS=197113063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	197141243	rs6428389	A	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=497;SC=CACTATATATATCTCTCTCTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=197141251;WS=197141233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	197147516	rs75990074	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=229;ReadPosRankSum=2.117;SC=TTCTATCTTACTTAATAAAGG;SOR=1.154;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=16;WE=197147524;WS=197147506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr1	197316408	rs1572514	T	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=409;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GAAGAAACAGTATAAAGATAT;SOR=0.330;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=26;WE=197316416;WS=197316398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	197316435	rs1337167	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=13;PP=1715;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TCAATATGACTAAGAGTTGAC;SOR=1.508;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=69;WE=197316443;WS=197316425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr1	197325908	rs2786098	T	G	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=34;PP=1949;SC=AGGCAAATGCTCTATAATTCA;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=197325916;WS=197325898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	197390368	rs3902057	A	G	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=71;PP=2945;SC=TCAGCTGCCTATGTCCATCTG;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=134;WE=197390376;WS=197390358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	197398086	rs7534863	A	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AAATAATAATACTATGTCTCT;SOR=1.185;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=58;WE=197398094;WS=197398076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,69:0.53:129
chr1	197407942	rs980371	A	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=387;SC=TTCAGACAGAATGAAACAATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=197407950;WS=197407932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	197447037	rs41302107	T	C	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=687;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GAGATGGGGATCCACACACTG;SOR=0.412;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=45;WE=197447045;WS=197447027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr1	197480927	rs12142127	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=695;ReadPosRankSum=1.800;SC=CCAGCTTCCCCTGATCTGAGC;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=53;WE=197480935;WS=197480917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr1	197480986	rs10494755	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=599;ReadPosRankSum=-1.525;SC=TCCATTTCACCTGAGTAAGGA;SOR=1.255;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=34;WE=197480994;WS=197480976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr1	197482167	rs2013617	C	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=459;SC=AATGTGATTTCATAAGAAACA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=197482175;WS=197482157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	197510025	rs3902061	G	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=237;SC=TTCTAATTTGGAAGTATAAAC;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=197510033;WS=197510015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	197510299	rs3850628	G	A	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=300;SC=TCAGGGATACGCATATCACTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=197510307;WS=197510289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	197515253	.	ATGTTCAG	A	100	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=100;QD=60.0;SC=AAATTATTTCATGTTCAGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=197515267;WS=197515243;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr1	197515715	rs4303099	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=107;SC=AACTATAAACGTAAAATAAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=197515723;WS=197515705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	197515777	rs4316386	A	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=641;SC=TCAAATAAACAGCATAAGTAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=197515785;WS=197515767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	197515981	rs10922249	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-1.495;SC=CAAGAACTAGTATTTGCACAA;SOR=0.061;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=9;WE=197515989;WS=197515971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	197576307	rs11411505	A	AT	504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.67;NF=0;NR=11;PP=438;SC=TTCACTCTCTATAAAAAAAAC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=197576315;WS=197576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	197741951	rs2477067	C	A	1386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=997;SC=GATCTTGTCCCAAAAAAAAGA;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=197741959;WS=197741941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	197742171	rs2488396	C	T	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=ATACATTTCACGTGACTGTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=197742179;WS=197742161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	197872019	rs4539165	G	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=311;ReadPosRankSum=-1.554;SC=GACAGATCGCGGAGCTGCACG;SOR=0.389;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=23;WE=197872027;WS=197872009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr1	197874949	rs2270763	T	C	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.379;SC=ACTATGTGGATCCAGCTACTG;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=66;WE=197874957;WS=197874939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,76:0.58:130
chr1	197876533	rs1546244	C	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=440;SC=GCACATTGATCGTTATTTTCC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=197876541;WS=197876523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	197886517	.	C	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=889;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CCAACCCAATCTACAGGCACT;SOR=0.966;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=53;WE=197886525;WS=197886507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr1	197890422	rs12122995	C	G	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=16;PP=1399;SC=TGACTCAACTCTTTCCTTCCA;SOR=2.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=63;WE=197890430;WS=197890412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	197898023	.	C	CAA	64	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=15;MQ=58.8;NF=2;NR=0;PP=64;QD=35.0;SC=AAACCTATATCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=197898031;WS=197898013;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr1	198214462	rs12046935	G	A	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTAAAAGCCTGTGTGATCCAG;SOR=0.559;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=90;WE=198214470;WS=198214452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,118:0.55:213
chr1	198233402	rs370944444	GT	G	341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	198288709	rs6679100	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=464;ReadPosRankSum=3.034;SC=TGTGCAAGTCATACCTCCCCA;SOR=1.206;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=26;WE=198288717;WS=198288699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr1	198701289	rs1932433	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=174;SC=ATCTTAATTTTGATTACTCTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=198701297;WS=198701287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	198703306	rs6683595	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGACATATCTCTGCATGTGTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=198703314;WS=198703296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	198704294	rs7540378	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=110;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TGGAAGAGGGCACTCGGGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=10;WE=198704302;WS=198704284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	198721192	rs12403075	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-0.949;SC=CACATATTTATTAAATGGGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=198721200;WS=198721182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	200089872	rs10494808	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=476;ReadPosRankSum=-0.081;SC=ATAGTTCTTACGACTCAGGTG;SOR=0.386;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=28;WE=200089880;WS=200089862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr1	200090120	rs3762398	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=574;ReadPosRankSum=0.855;SC=CTCAACCAACGATTGCTAAAT;SOR=1.157;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=32;WE=200090128;WS=200090110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr1	200143281	rs1060060	C	T	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=929;ReadPosRankSum=-1.551;SC=AGCACCTGAACGGGGATGTGC;SOR=0.750;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=57;WE=200143289;WS=200143271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr1	200143442	rs1060061	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTGCTCCAAGTAACGCTAATT;SOR=3.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=200143450;WS=200143432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	200182614	.	G	C	429.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=249;ReadPosRankSum=1.736;SC=AAGAAAGGAAGAAAAAGGCCA;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=14;WE=200182622;WS=200182604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
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chr1	200182654	.	TCGGAACGACC	CCGGAACGACC,CCGGAACGACT	310	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=18,10;NR=11,8;PP=99,310;QD=4.61280043266;SC=TCTCCTTCCGTCGGAACGACC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29,18;WE=200182672;WS=200182644;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:29
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chr1	200342046	rs6677545	A	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=272;ReadPosRankSum=0.581;SC=GATTGGGTTAAATTCAAATCA;SOR=1.038;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=18;WE=200342054;WS=200342036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	200523514	rs7548174	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr1	200538962	rs73070685	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=-0.458;SC=ATTTGCACACGGATAAGAAAA;SOR=0.596;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=14;WE=200538970;WS=200538952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr1	200544650	rs142403729	TACAC	T	1794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.876;NF=24;NR=9;PP=1569;ReadPosRankSum=2.173;SC=ATATACAATTTACACACACAC;SOR=0.151;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=33;WE=200544661;WS=200544640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr1	200555203	rs58696327	G	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TTTAGAAAATGTTTGCTAAAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=200555211;WS=200555193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	200558363	rs6665951	T	C	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=24;PP=1131;SC=TAGCCAATGTTTCCATTTCTA;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=200558371;WS=200558353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	200561456	rs16846948	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=400;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CAATTCAATATAGTCTAGTAT;SOR=1.819;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=20;WE=200561464;WS=200561446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr1	200567596	rs2809358	T	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CAGTATGAAATTGTTAAATTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=200567604;WS=200567586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	200569392	rs2809357	C	A	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=58;PP=2965;SC=TAAGGAAGGTCGGAAAAATAC;SOR=1.351;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=103;TCR=58;TR=161;WE=200569400;WS=200569382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	200574959	rs2808238	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=192;ReadPosRankSum=2.306;SC=ATGCTCTTTCTATCTAGTGAA;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=14;WE=200574967;WS=200574949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	200575744	rs10577607	CTAAA	C	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=530;ReadPosRankSum=-1.504;SC=GGGTAGAAGGCTAAATAAATA;SOR=0.278;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=13;WE=200575755;WS=200575734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	200575794	rs2794410	A	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=787;ReadPosRankSum=0.628;SC=CAATGAGAATACAATAAAGAT;SOR=0.915;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=39;WE=200575802;WS=200575784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr1	200578093	rs2794409	G	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=30;PP=885;SC=AATTTATTTTGATGTTTTGCA;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=200578101;WS=200578083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	200583380	rs2808241	T	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=259;ReadPosRankSum=0.577;SC=TGGCCATGACTGATTTGAACT;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=20;WE=200583388;WS=200583370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr1	200586932	.	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=843;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GTTAGACATTCTATTCTTCAG;SOR=0.992;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=51;WE=200586940;WS=200586922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr1	200594240	rs2809350	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=985;SC=GAGGTATTAGGTGATCTCAAT;SOR=3.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=200594248;WS=200594230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	200618238	rs6665604	T	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=20;PP=804;SC=GCGACTTCTCTGAATGTATAG;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=200618246;WS=200618228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	200619530	rs2809365	T	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=6;PP=1060;SC=CCATAAAACATAGTTAACTGC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=200619538;WS=200619520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	200635617	rs78479136	G	A	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=60;PP=2965;SC=CAGAAGGATGGCTGTCCTTCG;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=130;WE=200635625;WS=200635607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr1	200877850	rs41299637	T	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=524;ReadPosRankSum=1.210;SC=TTTCTTTTACTCCTGCAGAGG;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=43;WE=200877858;WS=200877840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr1	200880869	rs45547233	A	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.561;NF=11;NR=25;PP=501;ReadPosRankSum=0.504;SC=CCGGCAGCAGAGAGCTGGTCG;SOR=0.494;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=36;WE=200880877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr1	200880978	rs296520	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.440;NF=1;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GTGGGAGCTGCGCCGCGCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=4;WE=200880986;WS=200880968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	200881161	.	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.741;NF=17;NR=9;PP=430;ReadPosRankSum=-1.140;SC=TGCACGCCTCCGGAGCACCCG;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=26;WE=200881169;WS=200881151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	200881392	rs10800746	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=1.139;SC=GGGTAATCCCCGTCTAGGAAG;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=8;WE=200881400;WS=200881382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	200943793	rs71991687	CAGGA	C	5776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.16;NF=55;NR=35;PP=2970;SC=CTGCCCACACCAGGAAGGAGA;SOR=1.963;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=90;WE=200943804;WS=200943783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	200944840	rs296563	T	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=0.876;SC=AGTGGGAGGATGGAAGGCAGG;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=8;WE=200944848;WS=200944830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr1	200956288	rs2275485	A	G	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1308;ReadPosRankSum=-1.298;SC=CCAGGCACTCAGCCGACACAG;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=159;TCF=70;TCR=89;TR=81;WE=200956296;WS=200956278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,93:0.50:186
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chr1	200958111	rs12143520	A	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=0.734;SC=GTTGGGAGTCACCCATATCAC;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=6;WE=200958119;WS=200958101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	200959052	rs57758014	T	G	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=980;ReadPosRankSum=0.049;SC=CCCCTGCCCATGTACGCTCCC;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=56;WE=200959060;WS=200959042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
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chr1	200960307	rs2297909	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=338;ReadPosRankSum=0.205;SC=AGAGGGAGCCGGTGAGCAGGG;SOR=0.195;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=22;WE=200960315;WS=200960297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr1	200960886	rs12123633	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=1118;ReadPosRankSum=0.637;SC=GGGCTCCACACTCAGGCACCT;SOR=0.581;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=32;WE=200960906;WS=200960876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,38:0.43:89
chr1	200960898	rs12145860	A	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=1118;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CAGGCACCTTAGCCCTCTCTG;SOR=0.523;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=34;WE=200960906;WS=200960876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr1	200960915	rs12142447	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TCTGTCTGTGTACAGGCTGGC;SOR=0.418;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=28;WE=200960923;WS=200960905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr1	200965601	rs10920088	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=381;SC=AAGGGGGAACGCAGGAACCCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=200965609;WS=200965591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	200967490	rs10920089	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=448;SC=GATGGGGTGGAGGGGCATGGC;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=200967498;WS=200967480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	200968879	rs16847508	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=491;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ATATAAGGAAGTACAAGGATC;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=24;WE=200968887;WS=200968869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr1	200969766	rs6692235	G	A	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1418;ReadPosRankSum=0.080;SC=GGACGGGGCCGAGTGAGCTGC;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=74;TCR=97;TR=90;WE=200969774;WS=200969756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,106:0.53:201
chr1	200969921	rs6692427	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=553;ReadPosRankSum=0.103;SC=GGAGTGGGACGGCGGGAAGAA;SOR=1.067;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=38;WE=200969929;WS=200969911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr1	200969942	rs6667956	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=1.159;SC=GGGTGCGATAAAGAAGATAAA;SOR=1.091;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=28;WE=200969950;WS=200969932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr1	200969983	rs6656481	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=0.630;SC=GACCTATAATTCCAGCACTTT;SOR=0.384;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=16;WE=200969991;WS=200969973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr1	200971521	rs56770229	G	A	2841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=4.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,78:0.49:159
chr1	200971528	rs41269929	G	T	2643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=5.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.526;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr1	201009182	rs12139527	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=712;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATCAGCTGCCAAGGTGCCCAG;SOR=0.803;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=44;WE=201009190;WS=201009172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,51:0.41:123
chr1	201009556	rs1546416	A	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NR=24;PP=788;ReadPosRankSum=0.680;SC=GAGCCCACCAATGAGCAAAAT;SOR=0.660;Source=Platypus;TCR=50;WE=201009564;WS=201009546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr1	201009897	rs6427875	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=441;SC=CCAGGAGCCCTGAGTCAACAG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=201009905;WS=201009887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	201010862	rs6675915	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=351;SC=GGCTGACGTTTCCACCACTGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=201010870;WS=201010852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	201012247	rs2279944	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CCTCTGCCATCGAGGTCGGCC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=14;WE=201012255;WS=201012237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	201012597	rs41267497	G	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=824;ReadPosRankSum=1.179;SC=TGGCCATGACGGGGGGCAGGG;SOR=0.516;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=50;WE=201012605;WS=201012587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr1	201016120	.	CT	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.732;SC=TTTCACTCTTCTGGGCTTCCT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=201016128;WS=201016115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	201016646	rs2297905	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=382;ReadPosRankSum=0.517;SC=CCCAAAGTAGCACCTACCTCC;SOR=0.968;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=21;WE=201016654;WS=201016636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr1	201017687	rs35713982	C	CT	1486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=1132;ReadPosRankSum=2.116;SC=AAGGAGGGGGCTCACATTGGA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=30;WE=201017695;WS=201017677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,51:0.40:127
chr1	201020105	rs6702590	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=248;ReadPosRankSum=0.399;SC=GGCCCTCAGCATCTCACCAGG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=23;WE=201020113;WS=201020095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr1	201020360	rs12138260	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.176;SC=GGTGTGGACAGATGAGCAAAC;SOR=0.836;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=17;WE=201020368;WS=201020350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	201021619	rs12029212	C	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=182;ReadPosRankSum=0.342;SC=CTCCAGTGCACATTAGAACAG;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=13;WE=201021627;WS=201021609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr1	201038687	rs7415038	A	G	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=79;PP=2920;SC=TGAAGTTGGTAAACCAGGTGG;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=137;WE=201038695;WS=201038677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	201044748	rs1998721	A	G	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=36;PP=1210;SC=CAGTACCTGTATGGAGGGAGG;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=201044756;WS=201044738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	201047075	rs4915477	A	G	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=42;PP=2608;ReadPosRankSum=-1.112;SC=GTGTCATGGCACCCGACTCCA;SOR=1.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=131;WE=201047083;WS=201047064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,145:0.99:147
chr1	201047111	rs9427714	A	G	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=64;PP=2965;SC=GGATACCGCTACACACCACGA;SOR=1.272;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=111;TCR=64;TR=175;WE=201047119;WS=201047101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	201052310	rs12742169	A	T	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.20;SOR=1.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	201052310	.	AGA	TGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=53;NR=24;PP=2947;QD=20;SC=GGTCAGCCAGAGAGGCTGGTT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=77;WE=201052320;WS=201052300;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,77:0.96:80
chr1	201052312	rs12742170	A	C	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	201052474	rs12724643	T	C	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=44;PP=1467;SC=CAGAGGATGGTCTACAGTGCT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=201052482;WS=201052464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr1	201079235	rs1325310	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=446;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CCAAGGGGGCCTCCCCAAGCC;SOR=0.904;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=25;WE=201079243;WS=201079225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
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chr1	201112981	rs8158	A	G	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=32;PP=1515;SC=GTTGCTCAGTATATGCATCCG;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=201112989;WS=201112971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	201113118	rs3738266	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=873;SC=CCATTATCTGAGGCCAGGGCT;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=201113126;WS=201113108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr1	201116018	rs3752979	C	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=13;PP=460;SC=AGGGCCACCACGTCTTAGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=201116026;WS=201116008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	201120730	rs2068152	C	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=1.068;SC=AGACAGTTGACAACTATGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=201120738;WS=201120721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	201122784	rs6684980	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=527;ReadPosRankSum=0.404;SC=CTCTGTGCCCCACCCTTCCTC;SOR=1.118;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=32;WE=201122792;WS=201122774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr1	201122816	rs16847895	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=1051;ReadPosRankSum=-1.515;SC=GCACTATCCTTAGGGAGGCCA;SOR=0.562;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=64;WE=201122824;WS=201122806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr1	201122947	rs1925361	T	G	5075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=87;PP=2965;SC=GGCCGTGCACTGTGGTCGTGA;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=167;WE=201122955;WS=201122937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	201162411	rs12089471	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=324;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGTCAAAGAGGAGGCAGAACT;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=21;WE=201162419;WS=201162401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr1	201162643	rs10800761	G	A	58.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=1.150;SC=ACAGTGACGCGATCTCAGCTC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=201162651;WS=201162633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	201163191	rs1107128	G	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.241;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=249;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TCTTGCTCCTGGGGTGAGTGG;SOR=0.269;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=18;WE=201163199;WS=201163181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr1	201166281	rs7533096	C	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=677;ReadPosRankSum=0.284;SC=AACACATAGCCGTGTCTAGTA;SOR=0.628;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=39;WE=201166289;WS=201166271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr1	201166383	rs4915221	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=967;ReadPosRankSum=-0.109;SC=GATCTGTACCGCTGCACAGCA;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=61;WE=201166391;WS=201166373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr1	201166435	rs11589317	T	C	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=70;PP=2202;SC=TGAGACTCACTGTCATCGAAG;SOR=1.006;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=120;WE=201166443;WS=201166425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	201169601	rs35998091	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.549;SC=ACCATAGGTGCCTCACACCTG;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=201169609;WS=201169591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	201170772	rs10157730	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=724;SC=ATGGTACCAGAGCCTATGAGG;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=32;WE=201170780;WS=201170762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	201170824	rs10158976	C	G	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=27;PP=1619;SC=AGCTCTCCTGCTGGGTGTTTG;SOR=1.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=84;WE=201170832;WS=201170814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	201171007	rs10800762	T	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CAGGGATGCTTCAGGTCTAGT;SOR=1.017;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=19;WE=201171015;WS=201170997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	201173104	rs832160	C	T	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=1017;SC=GTTGGTGCAACGTGTGTGTTG;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=201173112;WS=201173094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	201174204	rs12725611	C	T	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=22;PP=1427;SC=CCTATTTCCCCGGCAGCCATC;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=201174212;WS=201174194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	201175227	rs832156	C	A	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=38;PP=1844;SC=AGGATAAAGACCTTCAGTCCA;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=95;WE=201175235;WS=201175217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	201175274	rs9651057	A	G	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=48;PP=2215;SC=CAAGGAGCCCAGGCATCAGGA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=109;WE=201175282;WS=201175264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	201175715	rs1341631	G	T	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=62;PP=2291;SC=GGGTCCAGTCGGCTTCAGGCT;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=110;WE=201175723;WS=201175705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	201176018	rs10753895	A	G	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=29;PP=1192;SC=GAAGCTGGAGACAGCAATGGG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=201176026;WS=201176008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	201178788	.	A	G	1417	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=52.79;NF=52;NR=32;PP=1417;QD=17.2829906256;SC=ATGGTTTAGGAGGTTCTGGAG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=249;TCF=135;TCR=114;TR=84;WE=201178796;WS=201178778;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:165,84:0.34:249
chr1	201178904	.	A	G	1106	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=27;MQ=45.54;NF=35;NR=18;PP=1106;QD=21.5239851424;SC=GGGGGTTCTGAAGAAATGGGG;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=53;WE=201178912;WS=201178894;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:81,53:0.40:134
chr1	201178924	.	AAG	GAA	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=41.43;NF=44;NR=33;PP=2944;QD=20;SC=GTCAGTGAATAAGGCAGGTTA;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=77;WE=201178934;WS=201178914;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:56,77:0.58:133
chr1	201181223	rs12070919	A	G	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=100;PP=2965;SC=GGTGACACGAACTCCAAGGAT;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=93;TCR=100;TR=193;WE=201181231;WS=201181213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	201181973	rs201190585	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=886;ReadPosRankSum=0.554;SC=TCCAGAGCTTCCGGTTCTCTG;SOR=1.047;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=54;WE=201181981;WS=201181963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr1	201182693	rs149805659	G	A	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=82;PP=2363;ReadPosRankSum=1.035;SC=GATGCTACCCGGAGTTCCACA;SOR=0.827;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=304;TCF=145;TCR=159;TR=149;WE=201182701;WS=201182683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,175:0.46:378
chr1	201185752	rs143770388	G	A	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=789;ReadPosRankSum=0.344;SC=CGAGGCCCCCGCTGACAGCAC;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=56;WE=201185760;WS=201185736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr1	201187764	rs10920144	T	C	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=46;PP=1854;SC=CATCGGATGCTGTCTTTGCTC;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=103;WE=201187772;WS=201187754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	201187828	rs3738268	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=51;PP=1435;SC=GAGGTGAGCATGGGATAGCCC;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=91;WE=201187836;WS=201187818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	201187954	rs6667020	C	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=387;SC=TGAGCCACATCTTAGGGGCCC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=201187962;WS=201187944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	201193668	rs6687494	G	T	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=348;SC=TTTTCTTGTCGACGTTGTGTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=201193676;WS=201193665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	201195119	rs3738270	C	T	4798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=64;PP=2679;SC=CGACCGCATCCACACCAACCG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=145;WE=201195127;WS=201195109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	201197358	rs3753972	G	C	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=8;PP=790;SC=CTTTGCCCAAGCTTAGAGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=201197366;WS=201197348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	201197471	rs3753973	T	C	5239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=66;PP=2926;SC=CAGGGTGGGGTGGCTGCCCCT;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=91;TCR=66;TR=157;WE=201197479;WS=201197461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	201263330	rs1779301	C	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=351;SC=GTTGACTTGGCCATTGTTTCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=201263338;WS=201263320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	201285759	rs1779297	A	G	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=976;ReadPosRankSum=-0.496;SC=AGGATGAGAAATACCAGGCCA;SOR=0.448;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=59;WE=201285767;WS=201285749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	201286614	rs11336457	GA	G	2853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=16;PP=805;SC=TTTTTGGTCTGAAAAAAAAAA;SOR=2.194;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=41;WE=201286636;WS=201286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	201286628	rs1772823	C	G	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=24;PP=1563;SC=AAAAAAATCACCTTTGAGTAG;SOR=1.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=201286636;WS=201286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	201286678	rs1794867	C	T	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=45;PP=2118;SC=GACCAGGCAGCGTGGCAACTC;SOR=1.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=115;WE=201286686;WS=201286668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	201286771	rs1722779	C	T	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=64;PP=2155;SC=TCCAGCAGGCCGCGGCAGGGG;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=112;WE=201286779;WS=201286761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	201288007	rs1794868	G	A	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=7;PP=175;SC=ACATTCAGCCGGTGCATAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=201288015;WS=201287997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	201288898	rs1722759	A	C	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=30;PP=1831;SC=CCACCCCCAGATCCACTTCTG;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=83;WE=201288906;WS=201288888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	201288955	rs1626370	G	A	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=52;PP=2364;SC=AAGAGACTGGGCATGCGGGAG;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=115;WE=201288963;WS=201288945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	201289175	rs1628151	G	A	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=16;PP=786;SC=CTTTCCTTCCGTTTTCATCTT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=201289183;WS=201289165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	201290968	rs1779292	T	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=12;PP=1213;SC=CCCAGGCTGATAGTGTGGTGG;SOR=2.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=201290976;WS=201290958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	201291283	rs1772832	C	T	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=58;PP=1574;SC=ATCAGCAGGGCGGGGCCTGCC;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=75;WE=201291291;WS=201291273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	201292036	rs1779289	T	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=2;PP=353;SC=GCTTGCCCTATCTGGAACCAC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=201292044;WS=201292028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	201292110	rs1779288	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=19;PP=998;SC=AGGCTCCCCATTGACCCCCCT;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=201292118;WS=201292100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	201293970	rs1620046	C	T	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=352;SC=GCTCAGAGCCCGGCAGAAGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=201293978;WS=201293960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	201335899	rs1573230	C	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=601;SC=TACTGCACCCCGTTCCATCAT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=201335907;WS=201335889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	201355522	rs4128458	T	C	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=905;SC=GCCCCCTGCTTTGCCAAAGAG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=201355530;WS=201355512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	201355943	rs2799677	C	T	3832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=67;PP=2537;SC=GCATGGAGGACTTCTCCAAGA;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=117;WE=201355951;WS=201355933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	201360281	rs2719184	A	G	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=75;PP=2533;SC=TTTCAGATGGAAAGAGCTTCG;SOR=1.452;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=113;WE=201360289;WS=201360271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	201368463	rs28364652	G	GT	1352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.561;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr1	201368725	.	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=0.456;SC=TGGGGCTGGTCGGCTGCCCGG;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=201368733;WS=201368715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	201383616	rs2026593	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=329;SC=CTCCAGCCCCACCCTGCCCCG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=201383624;WS=201383606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	201383643	rs2026594	A	C	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=11;PP=830;SC=CTGCCAGGCTAACCTGCAGGG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=201383651;WS=201383633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	201434740	rs1053592	G	A	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=33;PP=1833;SC=GGGAAGATGCGTAGAGGTGGG;SOR=1.237;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=86;WE=201434748;WS=201434730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	201435069	rs1053582	C	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=405;ReadPosRankSum=0.562;SC=CCTATGCCAGCTCCCCCTCAT;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=27;WE=201435077;WS=201435059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr1	201453289	rs576697	T	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=463;SC=CCTAGGACCCTGCCTGCATGC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=201453297;WS=201453279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	201687406	rs11588142	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=392;ReadPosRankSum=0.254;SC=AGGTGGGGAGGAGGTGACAGG;SOR=1.697;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=21;WE=201687414;WS=201687396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr1	201687451	rs11576721	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=598;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GCTGGGGTGCATGTGAGGGGA;SOR=0.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=42;WE=201687459;WS=201687441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr1	201688515	rs9662744	T	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=0.571;SC=TGCAACTTCCTAATCCCTACC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=201688523;WS=201688505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	201688832	rs67974334	T	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=369;ReadPosRankSum=-0.443;SC=ACTGCCACTTTCACTCTCCCT;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=24;WE=201688840;WS=201688822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr1	201749520	rs529581	G	C	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=906;ReadPosRankSum=-2.435;SC=CTGTTTTAACGATTGACCTTC;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=59;WE=201749528;WS=201749510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,65:0.42:153
chr1	201751989	rs35144347	C	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=375;ReadPosRankSum=0.456;SC=TGCCACCAACCCCTCTCAGGT;SOR=0.979;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=25;WE=201751997;WS=201751979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	201752429	rs527725	A	C	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=540;ReadPosRankSum=0.138;SC=CTCTGTGCTTAGCAAATAGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=25;WE=201752437;WS=201752419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	201763184	rs564440	T	C	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=1093;SC=TCCCAATTCCTTGCCCTTCTC;SOR=1.487;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=201763192;WS=201763174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	201763499	rs567185	C	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=162;SC=GAACTCCTGACCTCAGGTGAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=201763507;WS=201763489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	201772863	rs34105833	T	TG	3366.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=67;PP=2936;SC=GTTTGGGGGGTGGGAAGTAGG;SOR=2.040;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=3;TCR=77;TR=70;WE=201772871;WS=201772853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	201816639	rs146207613	ATCTTTT	A	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;ReadPosRankSum=0.927;SC=TGTGAAAAAAATCTTTTTCTT;SOR=0.788;Source=Platypus;TCR=12;TR=21;WE=201816652;WS=201816629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr1	201821443	rs1400875	T	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=494;ReadPosRankSum=0.010;SC=CTGACAAAGATCTGGATCTGA;SOR=0.868;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=30;WE=201821451;WS=201821433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr1	201824390	rs11576508	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GCGGGAAACAGTAACTTGAGA;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=27;WE=201824398;WS=201824380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr1	201826340	rs2172935	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=860;ReadPosRankSum=0.690;SC=TACCTTGATACTTCAGCCACA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=53;TCR=91;TR=58;WE=201826348;WS=201826330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,68:0.40:169
chr1	201826482	rs2132363	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.105;SC=AAATTCGAGACTCAGAAATTC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=201826490;WS=201826472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	201832864	rs2494115	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-0.465;SC=GTGAATGTTGGAAGGACAGGG;SOR=1.302;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=201832872;WS=201832854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	201837934	rs34353605	CGT	C,CGTGT	1553.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.276;NF=7,7;NR=31,31;PP=944,1315;ReadPosRankSum=0.268;SC=GGTAAGTGGCCGTGTGTGTGT;SOR=1.034;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=38,38;WE=201837947;WS=201837924;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.51:61
chr1	201838107	rs2820310	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=0.718;SC=TTGGCTTGGCGCGGTGGCTCA;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=201838115;WS=201838097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	201840059	rs150361248	GTTATT	G	1359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=1098;SC=TTGGTCCTGAGTTATTTTATT;SOR=2.694;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=21;WE=201840071;WS=201840049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	201840464	rs2644124	T	C	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=32;PP=976;SC=AGGTAGAACCTCATCTTTCTT;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=201840472;WS=201840454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	201844128	rs2678203	G	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=21;PP=930;SC=GATCCCAACAGTGGGGTACCC;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=201844136;WS=201844118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	201860626	rs2250377	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=537;ReadPosRankSum=0.646;SC=CTGGCTTCATATACCCACCTA;SOR=1.096;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=37;WE=201860634;WS=201860616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr1	201865763	rs8028	A	G	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=46;PP=1148;ReadPosRankSum=-1.469;SC=GTGCAGTGGGACTGACAGTGA;SOR=0.822;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=154;TCF=57;TCR=97;TR=70;WE=201865771;WS=201865753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,83:0.49:170
chr1	201869257	rs2820312	G	A	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1293;ReadPosRankSum=0.752;SC=GCCACTGGGCGTCTGTTTCTC;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=82;WE=201869265;WS=201869247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr1	201924749	rs3820438	G	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=480;ReadPosRankSum=2.231;SC=CCCTTGTCCAGGCTCCCAAGG;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=37;WE=201924757;WS=201924739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr1	201926386	rs57833794	C	CT	2156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.031;NF=21;NR=37;PP=1090;ReadPosRankSum=0.828;SC=GAAATATGGTCTTTTTTTTCC;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=58;WE=201926394;WS=201926376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,94:0.49:192
chr1	201969082	rs1130790	G	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=658;ReadPosRankSum=0.562;SC=TGCTGCGTCAGCACATGGACA;SOR=1.069;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=44;WE=201969090;WS=201969072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr1	201970562	rs4332408	T	C	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=83;PP=2965;SC=TCTGCTTTGTTTCATACCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=71;TCR=83;TR=154;WE=201970570;WS=201970552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	201970748	rs4131469	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=424;ReadPosRankSum=0.905;SC=CACTCCCCACGGGGCCAGAGA;SOR=0.980;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=25;WE=201970756;WS=201970738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr1	201970986	rs35227221	C	CA	797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=821;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GATGGGAAAACACTGGGTCAG;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=21;WE=201970994;WS=201970976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr1	201973565	rs3820439	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=692;ReadPosRankSum=1.148;SC=GGGCCAAATCGTCCTTAAGAA;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=46;WE=201973573;WS=201973555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr1	201980119	rs2819361	C	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=310;SC=CTTGAAGAGACGGTGTCCGCA;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=201980127;WS=201980109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	201981862	rs2819362	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=0.985;SC=CCCCCTCCCCTGGCAGCTCTG;SOR=0.299;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=19;WE=201981870;WS=201981852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr1	202092046	rs3795593	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=-0.457;SC=GGGCCCCCTGCACTCACCTGC;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=202092054;WS=202092036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	202092157	.	C	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=397;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TAAGCAGGGTCTCTGGGGGTG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=26;WE=202092165;WS=202092147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr1	202092360	rs3795595	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=1133;ReadPosRankSum=-2.532;SC=CCTAACCCCGGCAAGGATGGG;SOR=0.805;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=64;WE=202092368;WS=202092350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr1	202092415	rs3795596	A	G	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1547;ReadPosRankSum=1.518;SC=ATCTGACAGGAGCACCAGGGC;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=94;WE=202092423;WS=202092405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,120:0.59:202
chr1	202092580	rs7516762	T	C	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1180;ReadPosRankSum=1.813;SC=ACCTGAAGAGTGCCTGGAACT;SOR=0.620;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=69;TCR=87;TR=87;WE=202092588;WS=202092570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,101:0.56:179
chr1	202096815	rs3820380	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=747;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GTCCTTCCTTGTCCCCATAGA;SOR=0.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=56;WE=202096823;WS=202096805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr1	202107422	.	A	AAC	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.473;NF=4;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.261;SC=TGCCCTCCCCAACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=6;WE=202107430;WS=202107412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	202129826	rs4309039	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=686;ReadPosRankSum=1.915;SC=TCTGCCCTCCTGTGCCTGCTG;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=42;WE=202129834;WS=202129816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr1	202130754	rs3934648	T	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=31;PP=827;SC=GCCCCCAACATGCACAATCCA;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=202130762;WS=202130744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	202155331	.	CTGCCCCCTTGCCCCCT	C	294	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=57.5;NF=0;NR=2;PP=294;QD=152.0;SC=CAGGGCCCCTCTGCCCCCTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=2;WE=202155354;WS=202155321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr1	202155543	rs2993432	A	C	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=61;PP=2437;SC=ATCCTGGTGCACTGCAGGAGG;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=104;WE=202155551;WS=202155533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	202156135	rs139095833	C	CCCTCGCT,CCCTCGCTCCTCGCTCCTCGCT	624.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=1;NR=4;PP=355;SC=CTGCAGGCCCCCCTCGCTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=202156143;WS=202156125;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:10
chr1	202156482	rs3010088	G	A	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=12;PP=1117;SC=GAAGGAGTACGAGGTACACTT;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=202156490;WS=202156472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	202156628	rs3010089	A	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=46;PP=1534;SC=GCTGGCTCTTACGCACCCCTG;SOR=1.320;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=202156636;WS=202156618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	202163063	rs2361431	T	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=14;PP=579;SC=GCTGCGGCCATCGCGCCGTGC;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=202163071;WS=202163053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	202163364	rs2077598	C	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=297;SC=CCTGGTCCTGCGGGCTGCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=202163372;WS=202163354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	202163516	rs1812761	C	A	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=19;PP=1394;SC=AAATACCAGGCGAGCAGGGAG;SOR=1.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=202163524;WS=202163506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	202163621	rs3120747	G	A	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=675;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TGGACCCTGAGCGGGAGGGCG;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=121;TCF=57;TCR=64;TR=49;WE=202163629;WS=202163611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,54:0.37:146
chr1	202183308	rs10920362	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=533;ReadPosRankSum=0.281;SC=GAGGGCCGCTCAGCGAGGGCG;SOR=0.454;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=34;WE=202183316;WS=202183298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	202194441	rs3010067	G	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=436;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGCCTGGTGGGGGGTACTGTG;SOR=1.255;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=20;WE=202194449;WS=202194431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	202196931	rs1452070	G	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=20;PP=1609;SC=AGTATTAAACGCATCGTAGAT;SOR=2.084;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=202196939;WS=202196921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	202197161	rs3795598	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=219;ReadPosRankSum=1.547;SC=CCTCATTTTACATAGAGCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=14;WE=202197169;WS=202197151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	202266547	rs788827	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=26;PP=1675;SC=TCTCCCTGGCCAAGCCCAGAG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=202266555;WS=202266537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	202266607	rs788826	C	T	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=58;PP=2430;SC=AAGCCTTTGCCCTAATGACTG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=122;WE=202266615;WS=202266597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	202274936	rs705762	T	C	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=25;PP=945;SC=GCAAGTCCTGTAGGGAGGTGT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=202274944;WS=202274926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	202276494	rs896551	C	T	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=51;PP=1761;SC=CCATCCACCCCGAGGCCTTCT;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=202276502;WS=202276484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	202287206	rs788795	T	C	5126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=74;PP=2965;SC=GGCGGGCCTGTCCCCCTGCCC;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=159;WE=202287214;WS=202287196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	202287537	rs788794	G	A	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=30;PP=2057;SC=TGGCCGCCGCGCTGCCCCTGG;SOR=1.315;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=90;WE=202287545;WS=202287527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	202287813	rs788793	T	C	5021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=96;PP=2965;SC=TCCTCAGCTTTGCCTCCATGC;SOR=1.054;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=164;WE=202287821;WS=202287803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	202318316	rs930734	A	C	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=61;PP=1581;SC=CCTACAGATGAGCCTTTGACC;SOR=1.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=23;TCR=61;TR=84;WE=202318324;WS=202318306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	202386075	rs2843413	T	C	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1517;SC=TGTGGCTTTGTAGTATTTGTA;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=202386083;WS=202386065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	202457784	rs3820374	T	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.94;NF=10;NR=39;PP=1149;SC=TGTCATTTTGTGTATCTACCC;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=202457792;WS=202457774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	202457852	.	AAC	A	71	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=71;QD=39.5;SC=TGCTGATTTAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=202457861;WS=202457842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr1	202531741	rs2249811	C	T	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=798;SC=GCCCTGAGGTCTGGGAACGCT;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=202531749;WS=202531731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	202536848	rs2292489	C	T	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=17;PP=1305;SC=CTAGACTGGGCGTTCTACTGG;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=63;WE=202536856;WS=202536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	202572105	rs55968420	GCC	G	5437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=52;PP=2378;SC=CCCCCACTCTGCCCCCCCACA;SOR=0.978;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=83;WE=202572120;WS=202572095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	202574784	rs1968583	G	A	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=50;PP=1966;SC=TGTCCTCCTGGCTCTCCCCAG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=202574792;WS=202574774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	202703053	rs4310498	G	A	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=37;PP=1309;SC=TGTCCGAGATGGCTTGGCCTT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=202703061;WS=202703043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr1	202715244	rs3216061	G	GA	1501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.24;MQRankSum=1.754;NF=29;NR=18;PP=841;ReadPosRankSum=0.483;SC=TTTTCCATAGGAAAAAAAATC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=47;WE=202715252;WS=202715234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr1	202715284	rs1141108	G	A	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.937;NF=63;NR=44;PP=1577;ReadPosRankSum=-1.600;SC=ATTTATATTTGTAAGGAGGAC;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=197;TCF=119;TCR=78;TR=107;WE=202715292;WS=202715274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,113:0.52:217
chr1	202718028	rs1892163	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-1.135;SC=ATTTTACTAAATAATACCCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=202718036;WS=202718019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	202718069	rs61751237	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=384;ReadPosRankSum=-1.789;SC=TCCATAAGCCTTACCAATTTA;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=21;WE=202718077;WS=202718059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	202718202	rs1892164	G	A	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=936;ReadPosRankSum=0.358;SC=TCATCTCATCGTGGGAAAACA;SOR=0.819;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=69;WE=202718210;WS=202718192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr1	202722277	rs4950742	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TTTCAGACTCGGCTTTGTAAG;SOR=0.275;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=202722285;WS=202722267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	202731986	rs140328663	C	CCTCAA	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=808;SC=TTCTCCACTTCCTCATCATCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=202731994;WS=202731976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	202733238	rs3196669	C	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=698;ReadPosRankSum=0.415;SC=TTCTGGCTTCCGTTGTCTCCT;SOR=0.592;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=45;WE=202733246;WS=202733228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,55:0.60:92
chr1	202735751	rs12140729	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CAACGCCAATTTTGTGAGGGT;SOR=0.675;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=11;WE=202735768;WS=202735741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr1	202743973	rs11337395	AT	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	202777105	rs112577603	C	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TAGGCAGCCCCAAACTTGACG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=202777113;WS=202777096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	202827191	rs6663182	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=297;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TCAGCCTCCCGACCAGAGACC;SOR=0.608;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=19;WE=202827199;WS=202827181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr1	202827398	rs6687459	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.474;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	202887295	rs2275734	G	A	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1287;ReadPosRankSum=0.098;SC=AGACAAATCCGTACCTGAATT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=84;WE=202887303;WS=202887285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,108:0.48:225
chr1	202888947	rs3182429	T	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.559;NF=22;NR=12;PP=421;ReadPosRankSum=-0.641;SC=TCACATGTACTGTTTCTGTGT;SOR=0.584;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=34;WE=202888955;WS=202888937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr1	202889207	rs7520522	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=2;PP=25;SC=TTTGAGAGGCTAAGGCAGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=202889215;WS=202889197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	202897431	rs10800882	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	202931839	rs2232854	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=0.480;SC=TGAAGTATGGGGAGAAGAAAG;SOR=0.901;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=30;WE=202931847;WS=202931829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr1	202931958	rs2232853	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=79;ReadPosRankSum=-1.732;SC=AGCTGGGAATGGGTATACTCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=202931966;WS=202931948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	202931998	rs2232852	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=45;ReadPosRankSum=0.497;SC=TTAGCAGCACCGCCATCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=4;WE=202932006;WS=202931989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	202933992	rs1418445	G	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-1.645;SC=CAATAATATAGTTGAGGGACA;SOR=1.302;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=12;WE=202934000;WS=202933982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	202934381	rs189649985	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=120;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TGTTTAGAAGGAAGGGCGGCC;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=202934389;WS=202934371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	202936456	rs12137082	G	C	36.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	202955854	rs112080607	C	T	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=63;PP=1684;ReadPosRankSum=0.266;SC=CAGGGCATAGCGAGCACAGCT;SOR=0.823;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=272;TCF=133;TCR=139;TR=119;WE=202955862;WS=202955844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,145:0.44:333
chr1	202956340	rs705754	T	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=510;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GTGGGAGAACTCCAGGATCAC;SOR=0.872;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=31;WE=202956348;WS=202956330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr1	202956457	rs112796376	C	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-0.292;SC=AGAGAGGTTGCTAGCAAAGTT;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=16;WE=202956465;WS=202956447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	202978032	rs1418444	C	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-0.295;SC=AGATATAAGACGTGATACCAG;SOR=0.313;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=202978040;WS=202978022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	203003870	rs782800	G	A	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=51;PP=1831;SC=AGGGAAGGCCGAGGGGAGCTG;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=91;WE=203003878;WS=203003860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	203004627	rs5780134	A	AC	1201.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;QD=30.81;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	203006243	rs782805	A	G	6222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=93;PP=2965;SC=AACTTTCCTCAGATCTAGACC;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=201;WE=203006251;WS=203006233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	203008174	rs61821060	G	C	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GAGGGGGACCGCCTGGGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=146;WE=203008182;WS=203008163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr1	203008286	rs10920553	C	G	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=67;PP=2228;SC=GTCAGGAGACCTTGGCGGCCA;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=112;WE=203008294;WS=203008276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	203012705	rs7547566	C	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=62;PP=1914;SC=ACACCTTGACCAAGAGAGCAG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=87;WE=203012713;WS=203012695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	203012906	rs4950908	G	A	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=795;SC=CAGTTGGGGCGGGAGCTCTGT;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=203012914;WS=203012896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	203023122	rs2291691	A	C	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.746;NF=25;NR=42;PP=1078;ReadPosRankSum=-1.398;SC=TGGGAAGTGCATTGAAGGGCA;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=67;WE=203023130;WS=203023112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,72:0.65:110
chr1	203023240	rs10635298	G	GGC	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.971;NF=0;NR=9;PP=323;ReadPosRankSum=-0.505;SC=CAGGCCCGCTGCCAGTGCCGG;SOR=1.821;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=203023248;WS=203023230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	203025209	rs11590950	G	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=771;ReadPosRankSum=-3.050;SC=AGGGCACCCAGAGGGTGAGTC;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=56;WE=203025217;WS=203025199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr1	203028711	rs4590732	C	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.549;SC=TTGGGGTGGTCAGGTGTTCCT;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=203028719;WS=203028701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	203030207	rs2270544	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=1.404;SC=GGTTGGGACTGATACTCCCAT;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=37;WE=203030215;WS=203030197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr1	203030685	rs2270543	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=41;ReadPosRankSum=0.514;SC=GATACTGGGATGTCTTTTTCC;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=203030693;WS=203030675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	203032922	rs1416262	C	T	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=569;ReadPosRankSum=-0.867;SC=TACCTTCCTCCCCCATAATAG;SOR=1.356;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=31;WE=203032930;WS=203032912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr1	203036757	rs2275354	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=1.149;SC=TGATGCTGGATGTGAGACAGG;SOR=0.408;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=30;WE=203036765;WS=203036747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr1	203040673	rs9803710	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=325;SC=AGCAGCTTCAAAAAGGTGTGT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=203040681;WS=203040663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	203040740	rs11583155	T	C	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=905;SC=CTTGGACCCTTGGAAAATGGT;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=203040748;WS=203040730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	203040816	rs2270540	G	C	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=43;PP=1751;SC=TCTATGGACTGCAGGCACGCC;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=203040824;WS=203040806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	203053768	rs903356	T	C	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.791;SC=AGTCAGGCCTTACTTACCCCC;SOR=0.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=64;WE=203053776;WS=203053758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr1	203054883	rs147554078	C	T	2969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=65;PP=2083;ReadPosRankSum=0.300;SC=ACACCTTACACGCCCACGGCA;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=253;TCF=117;TCR=136;TR=123;WE=203054891;WS=203054873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,136:0.48:283
chr1	203055101	rs4950877	A	G	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=751;ReadPosRankSum=-0.276;SC=GGGTCGGAAAAGGCTTGTTCC;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=48;TCR=79;TR=60;WE=203055109;WS=203055091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr1	203134135	rs5780149	A	AT	1361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=1389;ReadPosRankSum=0.471;SC=CTCCTCTGTGATTTTCTATTA;SOR=1.189;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=40;WE=203134143;WS=203134125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr1	203137784	rs35823777	A	ACT	3155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=1901;ReadPosRankSum=0.851;SC=TCCTCCCGTGACTTCAGTGTG;SOR=0.597;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=45;WE=203137792;WS=203137774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,81:0.55:146
chr1	203143395	rs3737872	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.386;SC=CTGAGGAACCTGGAACTTTCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=203143403;WS=203143385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	203143725	rs2642531	G	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=0.284;SC=CCACTCCGAGGCTGAGGGGAT;SOR=0.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=32;WE=203143733;WS=203143715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr1	203148633	rs4950927	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=46;PP=1927;SC=GATCCTGGCCACAGAAGGAGC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=203148641;WS=203148623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
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chr1	203153555	rs12128727	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.889;SC=CTTTGCTACACATCAGGCAGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=203153563;WS=203153545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr1	203155882	rs4950928	G	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=1028;SC=TCCACTCCCCGACGCGGCAAA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=203155890;WS=203155872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	203174864	rs4950932	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CAGGGTTGGGTGAAGTAGCTC;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=8;WE=203174872;WS=203174854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	203174921	rs2486951	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=340;ReadPosRankSum=1.348;SC=GTGGGCACAGATAAGCCACAT;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=20;WE=203174929;WS=203174911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr1	203175107	rs2494296	A	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=-1.662;SC=GTTTGGGTGGACTGGCTCCCC;SOR=0.474;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=16;WE=203175115;WS=203175097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	203186950	rs150192398	C	CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=27.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.807;SOR=5.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr1	203187341	rs142759151	T	TGGTCAA	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.433;NF=3;NR=8;PP=621;ReadPosRankSum=-2.832;SC=TATTGTATGCTGGTCAAGGTC;SOR=0.709;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=11;WE=203187349;WS=203187331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr1	203188692	rs2486958	A	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=496;ReadPosRankSum=1.077;SC=ATTCTCTGCAATTGGCATCCT;SOR=0.410;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=33;WE=203188700;WS=203188682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr1	203191262	rs2244385	C	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCTCGGGGCTCAAAAGAAGCC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=203191270;WS=203191252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	203192448	rs3216011	GC	G	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.785;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=503;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCCCCTGTGAGCCCCAGGTAG;SOR=0.109;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=203192456;WS=203192438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr1	203311736	rs1891180	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=264;ReadPosRankSum=-1.046;SC=AAGTTGGGGATGGAGGGCAGA;SOR=0.256;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=21;WE=203311744;WS=203311726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	203317162	rs7543148	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=567;ReadPosRankSum=0.067;SC=GGCAGTCGCACTCCTGGGGGC;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=35;WE=203317170;WS=203317152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr1	203465396	rs2242199	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=461;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CTACATTCCCTGCATGACACT;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=37;WE=203465404;WS=203465386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	203652444	rs1419114	A	G	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=44;PP=1876;SC=AGCTGCGTTCAAGGGATGCAC;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=101;WE=203652452;WS=203652434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	203667409	rs2228445	T	C	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=47;PP=2347;SC=ATGTCACGCTTATCATCCTGG;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=103;WE=203667417;WS=203667399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	203740615	rs3737976	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=534;ReadPosRankSum=1.896;SC=GGTAGGTTTTTCCTTCTAATC;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=37;WE=203740623;WS=203740605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr1	203741368	rs3737973	C	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TCACTGCAAACAAACAGCATG;SOR=0.679;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=22;WE=203741376;WS=203741358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr1	203743122	rs3820194	G	A	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1580;ReadPosRankSum=0.629;SC=TCACTCCCTCGGCACACTGCA;SOR=0.950;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=96;WE=203743130;WS=203743112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,120:0.54:223
chr1	203743653	rs3766748	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=951;ReadPosRankSum=0.539;SC=ATTATGCAGACTTTCAGCCAT;SOR=0.642;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=57;WE=203743661;WS=203743643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr1	203766827	rs872032	T	C	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=48;PP=1650;ReadPosRankSum=1.402;SC=CAAAACAGCCTGCTAAAAAGA;SOR=0.940;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=226;TCF=121;TCR=105;TR=115;WE=203766835;WS=203766817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,139:0.53:261
chr1	203787700	rs4951260	T	C	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=15;PP=1112;SC=GTTTACAGGGTGACAGCTGCC;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=203787708;WS=203787690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	203803016	rs6694647	A	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=32;PP=1086;SC=TTTCTTTTCTACTTGTTTGTG;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=203803024;WS=203803006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	203818973	rs41299639	C	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.629;NF=25;NR=34;PP=950;ReadPosRankSum=-1.252;SC=GAGATGTAGCCTCTTGCAATA;SOR=0.930;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=59;WE=203818981;WS=203818963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr1	203819177	rs11808915	T	C	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=859;ReadPosRankSum=-0.033;SC=ATACTGTGTATTGCTTTAGGT;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=53;WE=203819185;WS=203819167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr1	203821200	rs7512877	G	A	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=815;SC=CTTTGTGTCCGTGAGACTAGG;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=203821208;WS=203821190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	203821314	rs41264265	G	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.419;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.399;NF=29;NR=25;PP=871;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CCTCACCCCCGGAGGTGTCTG;SOR=0.707;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=54;WE=203821322;WS=203821304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,62:0.54:114
chr1	204006538	rs4951291	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=368;SC=ATCACCTTCCTCTCATGCTGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=204006546;WS=204006528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	204006597	rs4951039	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=7;PP=839;SC=ACAAGCCCGCGCGATGGGAGT;SOR=2.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=204006605;WS=204006587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	204010389	rs10437107	G	T	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=49;PP=1377;SC=GGAATCGGGCGGAGTGATTAG;SOR=3.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=57;WE=204010397;WS=204010379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	204081655	.	A	ACACACT	329	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=61.53;NF=8;NR=2;PP=329;QD=33.2;SC=ACACACACACACTTTCTCTCT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=204081663;WS=204081645;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,10:0.56:18
chr1	204081892	rs2250538	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=212;ReadPosRankSum=-1.708;SC=TGTGGGTTCACAAGTAAGCTT;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=13;WE=204081900;WS=204081882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	204085609	rs7551756	A	G	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.705;SC=AAAAGTCTCAATGGGGTCTGT;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=77;WE=204085617;WS=204085599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,101:0.46:219
chr1	204085821	rs141072876	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GGTCCTGTTCGGTGGGTGTAG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=14;WE=204085829;WS=204085811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	204091165	rs114792458	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=353;ReadPosRankSum=0.271;SC=TTATGACGGCCGGCTGCCGTG;SOR=0.967;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=19;WE=204091173;WS=204091155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	204091245	rs2692018	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=596;ReadPosRankSum=-0.577;SC=CTCCTTCTGCGTCCACTTTTC;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=36;WE=204091253;WS=204091235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr1	204094963	rs12566764	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=608;ReadPosRankSum=0.611;SC=CATCCATCACCGTTCCCCTTC;SOR=0.139;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=30;WE=204094971;WS=204094953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr1	204094987	rs34758764	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=539;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GCCCCACAGCCCGCAGGCTGG;SOR=2.257;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=28;WE=204094995;WS=204094977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr1	204108961	rs11799485	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=1.139;SC=GCATGTTACTATACTGAATAC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=204108969;WS=204108959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	204110334	rs10793755	A	G	3998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=51;PP=2629;SC=GACCTAAATCAAGGTCTAACT;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=131;WE=204110342;WS=204110324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	204110547	rs3737657	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=595;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GGCCAGCTCCCGTTCCAACAC;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=34;WE=204110555;WS=204110537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr1	204115934	rs2293337	C	T	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=38;PP=1601;SC=AGTGCTGGGACATTGCCTTCC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=204115942;WS=204115924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	204124865	rs2368564	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=514;ReadPosRankSum=0.166;SC=TCTAACATGACCTGTGCATTG;SOR=0.321;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=34;WE=204124873;WS=204124855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr1	204125272	rs3795574	C	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=406;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GGCGCTCCCCCCACCCACAGC;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=25;WE=204125280;WS=204125262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	204125987	rs3730103	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=1.013;SC=ACTCAGGCAATTGGGGAAGGT;SOR=1.833;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=12;WE=204125995;WS=204125977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr1	204129671	rs5707	A	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=581;ReadPosRankSum=1.312;SC=CAGATGACCTAGGGCGGCCCA;SOR=0.579;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=37;WE=204129679;WS=204129661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr1	204159611	rs71745629	CT	C	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.356;NF=8;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=0.799;SC=CACCTGCGCCCTCAGCCCCGC;SOR=1.368;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=9;WE=204159619;WS=204159601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr1	204159787	rs4889	G	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=0.883;SC=CGGCTGCTGGGGGCTCCCGGA;SOR=1.040;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=36;WE=204159795;WS=204159777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr1	204159922	rs35431622	T	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=862;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TTCTAGCTGCTGGCCTAGGAC;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=65;WE=204159930;WS=204159912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr1	204198209	rs3795571	A	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=406;ReadPosRankSum=0.711;SC=TGTCTACCTCATGGATGCTGC;SOR=0.620;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=23;WE=204198217;WS=204198199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	204199614	rs10900562	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=868;ReadPosRankSum=0.289;SC=CCGCTTCTCCCTCATGGAGCC;SOR=0.460;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=58;WE=204199622;WS=204199604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr1	204210750	rs4412655	C	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=632;ReadPosRankSum=-0.777;SC=TGTGAATGAGCACCCAGGGCT;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=33;WE=204210758;WS=204210740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr1	204210791	rs4951325	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=501;ReadPosRankSum=1.551;SC=TTACTTCTAGGGGAAGATGGG;SOR=0.956;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=28;WE=204210799;WS=204210781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr1	204214975	rs66602475	TACACAC	T	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.069;NF=0;NR=4;PP=162;ReadPosRankSum=-1.552;SC=GCACCCTGTGTACACACACAC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=204214988;WS=204214965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	204216410	rs4951329	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=448;ReadPosRankSum=0.367;SC=TATCAATGGCCGGAACCTTTG;SOR=0.902;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=30;WE=204216418;WS=204216400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr1	204216468	rs4512713	C	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=689;ReadPosRankSum=0.640;SC=TCCCAATCCCCGCCAGCTCAG;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=49;WE=204216476;WS=204216458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,56:0.41:135
chr1	204216601	rs4288652	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=557;ReadPosRankSum=1.574;SC=ACGGGGGAAAGAGGCGTTCAC;SOR=0.546;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=40;WE=204216609;WS=204216591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr1	204219850	rs4951331	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=0.057;SC=ACCATGGTCCGTCACCTCTGG;SOR=1.138;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=29;WE=204219858;WS=204219840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr1	204230581	rs3795569	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=489;ReadPosRankSum=-1.264;SC=CTCAGCCTGTGGGGAGAGGCA;SOR=0.968;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=27;WE=204230589;WS=204230571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr1	204234196	.	G	GGT	1042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.139;NF=1;NR=26;PP=1013;ReadPosRankSum=0.884;SC=GCACAAGAAGGGTGTGTGTGT;SOR=1.201;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=27;WE=204234205;WS=204234186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr1	204234222	rs4076020	T	C	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr1	204234225	rs4073136	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	204237416	rs10900571	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=939;ReadPosRankSum=1.466;SC=CCAAAGGCGACGGCTTTGCGG;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=65;WE=204237424;WS=204237406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr1	204378775	rs17855962	T	C	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1510;ReadPosRankSum=-1.867;SC=GATGGGGTCTTTGAGTCACGA;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=85;WE=204378783;WS=204378765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,106:0.45:238
chr1	204379617	rs3014626	T	C	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=45;PP=2393;SC=TTGCCCCTTGTTAGCCTGTTG;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=97;WE=204379625;WS=204379607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	204409281	rs3014631	C	G	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=8;PP=1380;SC=ATAAGCAAAGCGGTCCCCTCC;SOR=2.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=204409289;WS=204409271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	204413297	rs2292459	C	T	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	204413297	.	CGG	TGA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=45;NR=39;PP=2947;QD=20;SC=GGGCCTGTTTCGGAGAAAGGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=84;WE=204413307;WS=204413287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr1	204413299	rs2292460	G	A	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	204418889	rs2999492	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=241;SC=TCTCCCAAGGCGCACTGGCCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=204418897;WS=204418879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	204418939	rs3014637	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=784;SC=CCCTCCTCCCCTTCCAAGGCC;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=204418947;WS=204418929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	204426052	.	A	C	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=66.83;NF=0;NR=2;PP=26;QD=30.3856062736;SC=ACACACACACACCAGCCGAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=204426060;WS=204426042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr1	204429212	rs5013460	AT	TG	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	204429215	rs5013458	TA	AG	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	204429285	rs2999485	A	G	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=203;SC=AGAGGGAAGAAATGAAACATG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=204429293;WS=204429275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	204429838	rs2271414	C	G	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=862;SC=GACTCAGTGGCAAGGGAGATA;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=204429846;WS=204429828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	204433093	rs2271415	A	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=684;SC=CCCCCTCACAATCTTACTACC;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=204433101;WS=204433083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	204433511	rs11455991	T	TC	514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=538;SC=GGAAATCGAGTCAAAACACAG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=204433519;WS=204433501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	204434277	rs2942149	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=327;SC=AAAGAAAGTTTGGAAATGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=204434285;WS=204434267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	204438334	rs1124777	C	T	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=58;PP=2075;SC=GCAGTTTGCCCGGCAATTGTT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=204438342;WS=204438324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	204438643	rs1553921	G	T	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=54;PP=2447;SC=CCTGTGGGGAGAGTGAGTTGT;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=204438651;WS=204438633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	204495595	.	G	GT	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=0.9998;HP=22;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=60.58;NF=1;NR=2;PP=28;QD=10.6666666667;SC=CATTTTTTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=204495603;WS=204495585;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr1	204505976	rs35493922	GA	G	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=0.680;SC=ATAAGACAATGAAAAAAATTA;SOR=0.124;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=204505984;WS=204505966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	204506107	rs4245738	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=300;ReadPosRankSum=-0.209;SC=ATCCAGATTTCAAGATCCCAT;SOR=0.710;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=21;WE=204506115;WS=204506097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	204512100	rs4252717	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=1.650;SC=AGGGAAGTGGTTTTTTTTCTT;SOR=1.675;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=204512108;WS=204512090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	204515863	rs2290855	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TTTTTGCTTTCAGTTAATTAG;SOR=1.201;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=17;WE=204515871;WS=204515853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr1	204516025	rs2290854	A	G	4253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=70;PP=2511;ReadPosRankSum=-1.034;SC=TTTAGCAAGAACTATTTTGCA;SOR=0.677;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=352;TCF=194;TCR=158;TR=159;WE=204516033;WS=204516015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,205:0.47:436
chr1	204518842	rs4245739	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.719;NF=1;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=1.718;SC=GCATTTATTCCGTTCACTTAC;SOR=1.911;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=17;WE=204518850;WS=204518832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr1	204587047	rs11588857	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TTCCTCCCTGGATTCCAGGGC;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=18;WE=204587055;WS=204587037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	204587569	rs3747631	G	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GGCTGGAGGAGAGCACGGCCC;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=72;WE=204587577;WS=204587559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,89:0.40:222
chr1	204588140	rs3747630	G	A	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1802;ReadPosRankSum=0.342;SC=AGGCGCGGGGGTGGATGAAGG;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=219;TCF=127;TCR=92;TR=110;WE=204588148;WS=204588130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,130:0.51:256
chr1	204589101	rs3789044	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=466;ReadPosRankSum=0.187;SC=TAGCAAGAGTGGGGCCACGAG;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=30;WE=204589109;WS=204589091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr1	204889909	rs76242821	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	204915393	rs2595960	A	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=24;PP=1457;SC=ATGCACCAGGAAGTGAGCTAA;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=204915401;WS=204915383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	204915757	rs2595959	G	A	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1709;ReadPosRankSum=-1.171;SC=CTCTATGGCCGAGGCCATCTC;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=93;TCR=110;TR=111;WE=204915765;WS=204915747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,131:0.53:247
chr1	204917708	rs147883938	AAAAAC	A	1755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.743;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.302;NF=13;NR=15;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TGGATTTGTTAAAAACAAAAC;SOR=1.195;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=28;WE=204917720;WS=204917698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,49:0.38:130
chr1	204917909	rs2802835	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=-0.066;SC=AAGTCTTGAATAGGCAAAGGA;SOR=0.287;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=14;WE=204917917;WS=204917899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	204919494	rs2066306	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.682;SC=TCACTGGGTCCGTTCCCCAAC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=204919502;WS=204919489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	204921258	rs12141283	A	G	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1214;ReadPosRankSum=-1.341;SC=AGTGAAGGGGAAAAAGAGTGC;SOR=0.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=71;TCR=84;TR=78;WE=204921266;WS=204921248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr1	204943285	rs2595945	A	T	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=43;PP=2389;SC=GGCACTCGAGATTGCTTCTCT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=122;WE=204943293;WS=204943275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	204943947	rs2246662	C	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GCCTGGAGGTCAAAGGTAAAG;SOR=0.340;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=25;WE=204943955;WS=204943937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	204943991	rs2246661	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	204943991	.	CA	TG	171	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=11;PP=171;QD=18.7056562385;SC=TGGAGAGGGACAAGGAGGCCA;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=204944000;WS=204943981;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	204943992	rs2794861	A	G	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.86;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	204945338	rs34566896	CTA	C	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=632;ReadPosRankSum=0.527;SC=CCTCCCCTCTCTATAGGAGAC;SOR=0.861;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=204945347;WS=204945328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr1	204966428	rs2802808	C	G	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=63;PP=2568;SC=CTACCACCATCGCCACCACCA;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=121;WE=204966436;WS=204966418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	204966690	rs2794858	G	A	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=50;PP=1607;SC=ACCCGTGACTGGATGCTCAGT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=204966698;WS=204966680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	204966749	rs2595944	A	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=669;SC=TGACACACACACACTCCTTGG;SOR=2.242;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=28;WE=204966757;WS=204966739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr1	205027737	rs2275697	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=138;ReadPosRankSum=-2.097;SC=CCCAGTGAAAGCTCATGAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=13;WE=205027745;WS=205027727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr1	205028152	rs57918586	A	AC	1246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=1329;ReadPosRankSum=2.170;SC=CTGGGGTCCCACCCAGAGTGG;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=38;WE=205028160;WS=205028142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr1	205028581	rs2305278	C	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=543;ReadPosRankSum=0.774;SC=GAGGCCCTTGCCCCAGGCCTC;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=30;WE=205028589;WS=205028571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr1	205028823	rs5780262	A	AG	1077.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.313;NF=2;NR=26;PP=990;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GAGTGTGAAGAGGGAGGGGAA;SOR=0.392;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=28;WE=205028831;WS=205028813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr1	205030862	rs41264869	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=0.316;SC=TCTTTGTCCTCTCCATCTCAG;SOR=0.056;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=9;WE=205030870;WS=205030852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	205031116	rs2229866	C	T	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=55;PP=2786;SC=AACGGGGAGCCTCTGGCCTCC;SOR=1.007;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=134;WE=205031124;WS=205031106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	205031744	rs2242001	G	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=832;ReadPosRankSum=0.038;SC=CATGCATATGGTGGCTTTCAG;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=53;WE=205031752;WS=205031734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,64:0.52:123
chr1	205031769	rs2242000	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=801;ReadPosRankSum=0.485;SC=CTGAGTTTAGGTGTTTCCAAA;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=53;WE=205031777;WS=205031759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr1	205033283	rs1470637	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=439;SC=TAGTCCAGGCGGGAGATTTGA;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=205033291;WS=205033273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	205033374	rs2305277	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=34;PP=1885;SC=ATGGCGTGGCTTCAAAGGGCA;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=97;WE=205033382;WS=205033364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	205034434	rs3901740	G	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=769;ReadPosRankSum=-1.781;SC=CCTCCTTCTAGAGAGACAGGG;SOR=1.139;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=46;WE=205034442;WS=205034424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr1	205034488	rs4460698	A	G	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=32;PP=871;SC=AGAAACCCATAGCCTAAGCGC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=205034496;WS=205034478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	205038731	rs2305275	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.851;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=489;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CCTCCCTGACCCCTCTCCCGC;SOR=2.523;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=27;WE=205038739;WS=205038721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr1	205039295	rs56283998	A	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=286;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CCATAGGAGGAGGTTGAGAGG;SOR=0.880;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=22;WE=205039303;WS=205039285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr1	205041158	rs2229868	C	T	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=657;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CCCGAGTCAGCGGCCTGCATC;SOR=0.403;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=46;WE=205041166;WS=205041148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr1	205041542	rs3903399	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	205042115	rs56338794	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=290;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ATCGGGTCTCCTCCCAGTACC;SOR=0.864;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=17;WE=205042123;WS=205042105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	205042939	rs17416088	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=1.667;SC=CCACCTCCGACGGACACAGCC;SOR=1.852;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=17;WE=205042947;WS=205042929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	205052939	rs4950979	G	A	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=38;PP=1907;SC=GCCTCTTGACGAGTCTCAAGT;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=205052947;WS=205052929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	205053219	rs4951168	C	T	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=40;PP=1677;SC=TTCTAAGCGCCGAGTCTGACA;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=79;WE=205053227;WS=205053209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	205069404	rs11240356	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=728;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AAGCAACTACGGGAAGGATAA;SOR=0.484;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=45;WE=205069412;WS=205069394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr1	205085358	rs12025836	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-0.489;SC=ACTAAATACTTTGTTTTTGAA;SOR=0.582;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=205085366;WS=205085348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	205091105	rs12033568	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=0.140;SC=GAAGAGACTGGCGCAAGCTCC;SOR=0.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=12;WE=205091113;WS=205091095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	205116635	rs11367	A	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=614;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CATGGCCAAAAGGTGAGGGGG;SOR=1.552;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=37;WE=205116643;WS=205116625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr1	205119981	rs3851295	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=2.732;SC=AGCACTGCTGCGTACCTAAGC;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=21;WE=205119989;WS=205119971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr1	205129319	rs1062715	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=-0.701;SC=GGGCACAAGGGAAGTGTCCTC;SOR=1.229;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=22;WE=205129327;WS=205129309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr1	205130413	rs3851294	A	G	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=1058;SC=TGTAAAGAACAGCTTTCCAGA;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=205130421;WS=205130403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	205133169	rs61822658	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=213;ReadPosRankSum=-0.399;SC=ATCAGAACCATGGAACTACCG;SOR=1.048;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=16;WE=205133177;WS=205133159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	205240913	rs9659978	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=3;PP=293;SC=TCCTGAGCGCACACATGCCAG;SOR=2.985;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=205240921;WS=205240903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	205272926	rs1106201	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CCGCGAGCTCCAAGGCTGTCT;SOR=0.464;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=145;TCF=87;TCR=58;TR=74;WE=205272934;WS=205272916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,85:0.51:166
chr1	205272983	rs1106202	C	G	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1621;ReadPosRankSum=-1.215;SC=GATGGAGGAGCAGCCCTGAAG;SOR=0.583;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=103;WE=205272991;WS=205272973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,123:0.51:243
chr1	205275206	rs4951195	AG	TT	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=17;PP=1470;SC=GAGGCTTGAGAGTTGTGCTCT;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=39;WE=205275215;WS=205275196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	205275421	rs4951197	A	G	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=34;PP=1233;SC=GGTTGGAGAGACCGAAGTCAG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=205275429;WS=205275411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	205312280	rs7549293	C	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=594;SC=CAGCAAATGCCTGTTGGTTTC;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=205312288;WS=205312270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	205325609	rs2298250	C	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=42;PP=1812;SC=ACCAGCAGGCCCTCAGAATGC;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=205325617;WS=205325599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	205385498	rs6688045	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=700;ReadPosRankSum=0.885;SC=ACATCAATCACCAGGGTGAAT;SOR=0.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=55;WE=205385506;WS=205385488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr1	205389592	rs7531012	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=830;ReadPosRankSum=-2.152;SC=CGTAGTATTGGGCCAGGTGAA;SOR=0.794;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=51;WE=205389600;WS=205389582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr1	205492756	rs7529442	A	G	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=61;PP=2462;SC=CCATGGAGGTAAGGGCCTCTG;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=113;WE=205492764;WS=205492746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	205495392	rs2297837	A	G	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=67;PP=2965;SC=AGCTGGGGGTAGAGGATCATT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=135;WE=205495400;WS=205495382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	205495976	rs1544154	A	G	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=112;PP=2965;SC=GTGAGGCCTCAGGGGCAGGGT;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=68;TCR=112;TR=180;WE=205495984;WS=205495966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	205498021	rs7531230	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=-0.407;SC=AGAGCCACGATCCCTGCAGCC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=205498029;WS=205498011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	205498326	.	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=153;ReadPosRankSum=0.333;SC=GGCCGCCTCTCTCCCGGGCGG;SOR=0.169;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=10;WE=205498334;WS=205498316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	205499577	rs6668356	C	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;ReadPosRankSum=-1.935;SC=GAGGCCCCAGCCCCAGCAGAG;SOR=0.563;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=16;WE=205499585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr1	205499660	rs41264895	C	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=460;ReadPosRankSum=0.634;SC=GGAAATGAGACGCTGCCTCGA;SOR=0.996;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=25;WE=205499668;WS=205499650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	205500543	rs11240507	T	C	3205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=1748;ReadPosRankSum=0.497;SC=GGACAAGAGATCACATGGAGC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=148;TCR=123;TR=116;WE=205500551;WS=205500533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,159:0.45:352
chr1	205554085	rs7526132	G	C	3958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,104:0.58:180
chr1	205554095	rs7515820	A	C	3795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.87;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,98:0.59:166
chr1	205555145	rs7531623	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.711;SC=GCTCAACAGCGCCCGGTCTCT;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=205555153;WS=205555135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	205561493	.	GCT	G	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=0;NR=3;PP=23;QD=19.3333333333;SC=GTCTCTCTGTGCTCTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=205561502;WS=205561483;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	205561496	rs74231752	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=2.515;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.559;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	205568213	rs2282449	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=642;ReadPosRankSum=2.726;SC=ACACCTTCCACGTGAAGTTTT;SOR=0.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=47;WE=205568221;WS=205568203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
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chr1	205568438	rs2282451	G	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=4;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=498;ReadPosRankSum=1.064;SC=GTCGGGGAGCGGGGGAGCAGG;SOR=1.051;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=13;WE=205568450;WS=205568428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr1	205568442	rs2282452	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=962;ReadPosRankSum=-1.450;SC=GGGAGCGGGGGAGCAGGAGAT;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=21;WE=205568450;WS=205568428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr1	205615791	rs6673283	A	G	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=45;PP=2011;SC=CAATGATAGCATTTTAGACAT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=114;WE=205615799;WS=205615781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	205615947	rs4951250	C	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=737;SC=AAAAAAAAAACACCTTTTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=30;WE=205615955;WS=205615937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	205630893	rs3761916	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=217;ReadPosRankSum=0.324;SC=GCATTCTCCAAAGTTGCTTGC;SOR=0.193;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=16;WE=205630901;WS=205630883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	205689807	rs823094	T	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.516;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TACCATGATATAATGATTAAA;SOR=0.147;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=22;WE=205689815;WS=205689797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	205696671	rs1772147	G	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=663;SC=TTGTATACTCGAGCACAGCCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=205696679;WS=205696661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	205739396	rs823139	T	G	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=33;PP=1806;SC=TTAATAAAATTGTCAGGTGGG;SOR=1.212;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=87;WE=205739404;WS=205739386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	205744138	rs708725	G	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=867;ReadPosRankSum=-1.793;SC=GGGATCGGGGGTCGCTCGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=56;WE=205744146;WS=205744128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr1	205744218	rs1572931	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=733;ReadPosRankSum=-2.059;SC=GTCTGGGCTGCTCTGACGAGA;SOR=0.469;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=44;WE=205744226;WS=205744208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr1	205764640	rs823156	G	A	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=42;PP=1243;SC=GACACAGACAGAGGTCAGAGG;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=205764648;WS=205764630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	205766159	rs5780304	CA	C	3176.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=44;PP=2329;SC=CAAAATGACGCAAAGACCACT;SOR=0.832;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=56;WE=205766167;WS=205766149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	205767885	rs708727	G	A	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1471;ReadPosRankSum=-2.400;SC=GTGTGGCCACGTTGTCTGGGT;SOR=0.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=91;WE=205767893;WS=205767875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,100:0.57:175
chr1	205801872	rs1361754	A	G	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=947;ReadPosRankSum=-1.395;SC=ATCAGCCACAATGTTCTTCGT;SOR=0.890;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=61;WE=205801880;WS=205801862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,73:0.46:158
chr1	205809642	rs10900525	G	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=157;SC=GAGCTGAAGGGGTGTCTCTGC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=205809650;WS=205809632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	205814497	rs1891460	T	C	5692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=83;PP=2965;SC=CCATAGATGATGCCATCACGC;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=184;WE=205814505;WS=205814487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr1	205886381	rs11240591	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=749;ReadPosRankSum=0.058;SC=CGCCCTGCTCCCACCCTCACA;SOR=0.763;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=45;WE=205886389;WS=205886371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr1	205888143	rs11240593	G	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=824;ReadPosRankSum=-0.565;SC=CCTTCAGAAAGATAACAGCCA;SOR=1.002;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=50;WE=205888151;WS=205888133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr1	205890679	rs12759719	T	C	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=27;PP=1902;SC=TGCTTGCTGTTCCCGAGGGCC;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=205890687;WS=205890669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	205892411	rs3811427	T	C	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,56:0.44:128
chr1	205892415	rs3811426	C	T	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.627;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,58:0.45:129
chr1	205893699	rs9438402	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.12;MQRankSum=1.242;NF=11;NR=21;PP=424;ReadPosRankSum=-1.537;SC=GCCAAGGCCATTCTCTGTTAG;SOR=1.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=32;WE=205893707;WS=205893689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr1	205893753	rs34907090	AT	A	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.279;NF=0;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTAAATAGCATTTTTTGCAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=205893761;WS=205893743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	205896235	rs11240594	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=150;ReadPosRankSum=0.087;SC=GAGACTAAGTGTGACAACAGT;SOR=0.276;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=205896243;WS=205896225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	205896475	rs7366204	C	T	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=31;PP=1327;SC=TCTTGATTTACTTCCAATCCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=205896483;WS=205896465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	205896948	rs3811424	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=0.485;SC=CCTCAGCCCAATGATCTCCCC;SOR=0.052;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=205896956;WS=205896938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	205897876	rs12568779	C	T	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TAGAGTTCATCTTGTCTCCCT;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=90;WE=205897884;WS=205897866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,109:0.51:214
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chr1	206224412	rs35608965	T	C	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=41;PP=2704;SC=CACCCTCCCTTCATCCTTCCC;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=129;WE=206224420;WS=206224402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	206225011	rs33990840	G	C	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=66;PP=2478;SC=GGCAGACTTCGGCTTCCCTTG;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=139;WE=206225019;WS=206225001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	206231151	rs33976516	C	G	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=68;PP=2247;SC=AGGAAAGACTCGCTGGGGTCT;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=206231159;WS=206231141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	206231259	rs33985287	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=725;SC=AGCCCTGTCTAAAGCGGAGCG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=206231267;WS=206231249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	206515372	rs76848142	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.792;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.695;NF=23;NR=18;PP=614;ReadPosRankSum=0.757;SC=GGGAATGAGCGCCTTGGTTTA;SOR=1.075;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=41;WE=206515380;WS=206515362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr1	206516159	rs199928990	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	206516261	rs201036189	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.25;MQRankSum=0.013;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.514;SOR=2.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	206566860	rs11361942	TA	T	951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.962;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-5.735;NF=37;NR=7;PP=478;ReadPosRankSum=-1.969;SC=AAGCCCCCCTTAAAAAAAAAA;SOR=1.299;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=109;TCF=85;TCR=24;TR=44;WE=206566869;WS=206566850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr1	206566904	rs2919105	T	C	3720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=5.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.431;NF=112;NR=29;PP=2918;ReadPosRankSum=-0.254;SC=CTTTTCAGCGTCAAGCCAAGT;SOR=1.694;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=211;TCF=161;TCR=50;TR=141;WE=206566912;WS=206566894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,142:0.63:226
chr1	206567084	rs75573336	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQRankSum=-5.695;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:347,57:0.14:404
chr1	206567100	rs2480377	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.880;NF=23;NR=49;PP=881;ReadPosRankSum=0.561;SC=AGACATTCCCCGATACTATTG;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=77;TCR=166;TR=72;WE=206567108;WS=206567090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,83:0.29:291
chr1	206567165	rs2480376	T	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.577;QD=0.85;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,10:0.13:77
chr1	206592517	rs9661663	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	206603535	rs2297539	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CAATTCCTCTGGTGGTGGAAA;SOR=0.915;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=43;WE=206603543;WS=206603525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr1	206623685	rs12725078	G	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=769;ReadPosRankSum=-2.973;SC=GACAAGAATTGTATGAGCACA;SOR=0.793;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=49;WE=206623693;WS=206623675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr1	206623866	rs11809494	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CAGAAGGAAGCGATTATATAT;SOR=0.207;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=14;WE=206623874;WS=206623856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	206626607	rs11120575	G	A	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=41;PP=1953;SC=CCCGAGAGCTGTCCTTTAAGA;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=95;WE=206626615;WS=206626597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	206626779	rs2483059	A	G	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=32;PP=879;SC=CTCTATGGGAATGAGACTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=206626787;WS=206626769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	206626828	rs2483058	C	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=387;SC=GCCAACCCCTCGGGGGTCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=206626836;WS=206626818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	206631518	rs10864212	G	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=253;SC=GTTACAGTCTGTTTGGAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=206631540;WS=206631509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	206631532	rs12565311	T	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=371;SC=GGAAAAAGAGTCATGCTAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=206631540;WS=206631509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	206646427	rs1930437	C	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-0.767;SC=TGTGGAATGGCCACATGGAGC;SOR=0.330;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=206646435;WS=206646417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	206647742	rs1539242	A	G	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=63;PP=2824;SC=GCGAGGTGCAAGTGAGGGAGT;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=139;WE=206647750;WS=206647732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	206647787	rs1539243	T	C	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=77;PP=2371;SC=ACCAGAACATTGTCAAGCTCT;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=138;WE=206647795;WS=206647777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	206648378	rs1059704	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-1.149;SC=TCAGACCAGCGGCAGGCCTGG;SOR=0.352;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=206648386;WS=206648368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	206651107	rs2297545	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=520;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GGATCACCACGGAGAAGCCGG;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=34;WE=206651115;WS=206651097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr1	206651350	rs2297543	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GTTGCTGGAACGAGTTCTTCC;SOR=0.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=11;WE=206651358;WS=206651340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	206665896	rs2336940	C	G	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=35;PP=1886;SC=CGAGGGCTGACCTCCAACCCC;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=206665904;WS=206665886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	206666734	rs12026566	T	G	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=687;ReadPosRankSum=1.684;SC=GAGAAAGCGGTTGTGTATCTG;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=43;WE=206666742;WS=206666724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
chr1	206667441	rs2184030	G	A	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=63;PP=1951;SC=GTCCATTTTCGAAGAAGCCCT;SOR=1.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=206667449;WS=206667431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	206670827	rs12754274	G	T	3197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=29;PP=2113;SC=TGTGTGCTTCGAAGCGTGAAG;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=92;WE=206670835;WS=206670817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	206680983	rs2095124	A	C	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=29;PP=1102;SC=ACCCGCTACTATTGGACCCCG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=206680991;WS=206680973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	206758077	rs4418597	T	A	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=63;PP=1771;SC=AAGCCCACCCTCTAAAACTCC;SOR=1.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=206758085;WS=206758067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	206766799	.	GGAGA	G	172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=34.55;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	206766825	rs144194477	CGA	C	141.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.37;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	206766857	.	C	CGTGTGTGT	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.48;QD=42.79;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	206769047	rs11584983	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=531;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TCCTTGAACATTGTGTCTTTC;SOR=1.376;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=28;WE=206769055;WS=206769037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr1	206770283	rs11284613	AC	A	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.411;SC=TGTTCCAAAGACCCCCCCAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=206770291;WS=206770273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	206772194	rs373767533	ACT	A	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.381;NF=7;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=-0.238;SC=CCAGACAATAACTCTGAGTGT;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=206772203;WS=206772184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	206772753	rs4845116	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=374;SC=CACTACTCAGATTGAGAGGAA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=206772761;WS=206772743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	206773659	rs6662929	A	G	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=55;PP=1873;SC=GTCGTCCTTCAGGGCTGATGG;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=206773667;WS=206773649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	206776200	rs6668054	C	T	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.90;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	206776203	rs6675741	T	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.67;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	206778642	rs4077413	A	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	206810946	rs17013271	C	T	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=5;PP=1563;SC=ACATAGGATTCTATATTCTTC;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=58;WE=206810954;WS=206810936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	206904464	rs10863805	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=660;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CTCCCACTTCCTTCCTCCTGT;SOR=0.834;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=46;WE=206904472;WS=206904454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr1	206904644	rs58152125	C	CGT	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.679;NF=3;NR=16;PP=659;ReadPosRankSum=2.690;SC=GGGAAGAGCCCGTGTGTGTGT;SOR=0.474;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=19;WE=206904653;WS=206904634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr1	206905043	rs4073250	C	T	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TGACCATCACCGAGTTTATGA;SOR=0.486;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=186;TCF=112;TCR=74;TR=81;WE=206905051;WS=206905033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,94:0.43:218
chr1	206943297	rs3024509	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=390;ReadPosRankSum=0.555;SC=TGTCCATCACACTTAGGGGAC;SOR=1.218;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=23;WE=206943305;WS=206943287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr1	206943351	rs3024494	T	C	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=375;SC=CCAAATGCCTTGCCTCACAGC;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=206943359;WS=206943341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	206944112	rs3024492	T	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=-1.636;SC=GAGATCTGACTCCAGGAGTCT;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=206944120;WS=206944102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	206944233	rs1554286	A	G	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=52;PP=2803;SC=GCAAGGGAAAAAACTGATCTG;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=128;WE=206944241;WS=206944223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	206944645	rs1518111	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=278;SC=GGAAGCAGAGTCTCCCTTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=206944653;WS=206944635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	206944861	rs1518110	A	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=20;PP=709;SC=TTTTTTAAATAAAATTGGCTC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=206944869;WS=206944851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	207014472	rs2243188	A	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=471;ReadPosRankSum=0.363;SC=GAGGTAGATCAGGAGGGTGCC;SOR=0.741;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=30;WE=207014480;WS=207014462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr1	207015957	rs2243191	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=757;ReadPosRankSum=-1.598;SC=GAAGTAATGTTCTCAGCTTGA;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=45;WE=207015965;WS=207015947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr1	207040659	rs2232360	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=0.054;SC=TAGAGTTTCTGCCTGCTTCAT;SOR=0.263;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=19;WE=207040667;WS=207040649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	207087053	rs72758947	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=450;ReadPosRankSum=-0.545;SC=AATCTTCCCAAGTGAAACATT;SOR=0.474;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=31;WE=207087061;WS=207087043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr1	207111257	rs291095	G	T	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=21;SC=GCTTGACAGCGGTCTTCTCCA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=207111265;WS=207111247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	207195779	rs2842726	A	G	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=82;PP=2965;SC=TTAGGGATAGAAATTGGCATA;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=150;WE=207195787;WS=207195769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	207237233	.	GGT	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr1	207241440	rs4030464	AGT	A	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,9:0.16:55
chr1	207243851	rs923109	A	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=7;PP=221;SC=CCCTGTCTCCACTCAAATTAG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=207243859;WS=207243841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	207245045	rs11120137	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=527;SC=TACGTCCAAATGTAGTTTGCT;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=207245053;WS=207245035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	207245080	rs35425352	A	AT	245.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.161;SC=TGTTGGAATTATTTTTTTTTT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=207245088;WS=207245070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr1	207262980	rs12711513	T	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=743;ReadPosRankSum=-1.190;SC=TTTGGTGTCCTTTTGCGGTGT;SOR=0.642;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=50;WE=207262988;WS=207262970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,59:0.45:132
chr1	207263829	rs6690037	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=611;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GTGCCGCTGTAAGTTAGATCT;SOR=0.879;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=40;WE=207263837;WS=207263819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr1	207268779	rs7542292	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=786;ReadPosRankSum=0.221;SC=AGGTTCAAGCAGTTCTCATGC;SOR=0.920;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=35;WE=207268787;WS=207268769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr1	207288897	rs12031629	T	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.28;SOR=2.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	207297484	rs2842707	G	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=420;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TGATGCCTTCGCTGAGTATTT;SOR=0.315;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=20;WE=207297492;WS=207297474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr1	207297680	rs1126618	T	C	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=61;PP=2055;SC=AAACAATAGGTGTTTGGAGAC;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=121;WE=207297688;WS=207297670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	207314388	rs12043615	C	T	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=794;ReadPosRankSum=-0.710;SC=ATGTATTCTGCAATGTGCTAC;SOR=2.133;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=38;WE=207314396;WS=207314378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr1	207510289	rs2490257	T	C	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=51;PP=1543;SC=ACCAACACCTTAGAAACCCAC;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=207510297;WS=207510279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	207512577	rs10641442	T	TTAA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=194;SC=CTTGATTAAGTTAATGTGTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=207512585;WS=207512567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	207520788	rs1257729	G	A	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=164;SC=GTATTTTTCAGTAGAGACGGT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=207520796;WS=207520778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	207643949	rs10863322	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=390;SC=CCCAAAGCTGGTCTGCAACAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=207643957;WS=207643939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	207646586	rs184770702	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTTATTATCTCCCACCCAAAA;SOR=0.591;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=23;WE=207646594;WS=207646576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr1	207653178	rs12032512	C	G	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=11;PP=1861;SC=TATGATTATTCAGGAATTCAG;SOR=2.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=65;TCR=11;TR=76;WE=207653186;WS=207653168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	207653395	rs17617	C	A	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=87;PP=2965;SC=AAACACAGAGCACGGTAAGTT;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=160;WE=207653414;WS=207653385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	207679229	rs4844599	T	G	7441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=90;PP=2965;SC=CTTTGATGCTTCTATGGTCTT;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=121;TCR=91;TR=211;WE=207679237;WS=207679219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	207679307	rs4844600	A	G	7035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=105;PP=2965;SC=TAACTGATGAATTTGAGTTTC;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=117;TCR=105;TR=222;WE=207679315;WS=207679297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr1	207753621	rs2274567	A	G	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=85;PP=2853;SC=CATGGTGAGCATACCCCAAGC;SOR=1.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=133;WE=207753629;WS=207753611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	207757936	rs646817	A	G	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=2;PP=952;SC=CTGTAGAATCACCTTGGATTA;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=207757944;WS=207757926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	207758232	rs1752688	A	G	4596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=101;PP=2965;SC=GTCAGTATCCACTTCCACATA;SOR=1.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=38;TCR=101;TR=139;WE=207758240;WS=207758222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	207782916	rs4844609	A	T	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=100;PP=2965;SC=GAGTTTCTTTACCCTCACTGA;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=181;WE=207782924;WS=207782906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	207782931	rs6691117	A	G	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=94;PP=2965;SC=CACTGAGATCATCAGATTTAG;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=77;TCR=94;TR=171;WE=207782939;WS=207782921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	207784968	rs3818361	A	G	8103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=114;PP=2965;SC=ATAAGATATAACAAAGGAAAT;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=115;TCR=115;TR=227;WE=207784976;WS=207784958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr1	207790088	rs3811381	C	G	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=110;PP=2965;SC=ACAAGTGACCCTCAAGGGAAT;SOR=1.070;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=79;TCR=110;TR=188;WE=207790096;WS=207790078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	207795320	rs2296160	A	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=21;PP=967;SC=CCTTTTAGGTACACATGATGC;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=207795328;WS=207795310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	207818719	rs11118237	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=668;ReadPosRankSum=0.593;SC=CGAGGCTAGAGCTCTGCTCAG;SOR=0.777;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=44;WE=207818727;WS=207818709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr1	207850589	rs34451130	A	C	107.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	207851611	rs2296158	A	G	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.080;NF=39;NR=49;PP=1311;ReadPosRankSum=0.023;SC=CATCCAGTTCAGATCCCAAAT;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=182;TCF=77;TCR=105;TR=88;WE=207851619;WS=207851601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,108:0.46:236
chr1	207857158	rs12411037	T	C	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.509;NF=71;NR=24;PP=1833;ReadPosRankSum=0.433;SC=AAGTAGTAATTTAATTGGGTA;SOR=0.505;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=169;TCF=130;TCR=39;TR=95;WE=207857166;WS=207857148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,109:0.56:196
chr1	207888739	rs7553211	G	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.356;NF=8;NR=24;PP=495;ReadPosRankSum=0.804;SC=TCCAGTGTGTGAACGTGAGTA;SOR=1.228;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=32;WE=207888747;WS=207888729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr1	207888760	rs2796261	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.657;NF=13;NR=22;PP=609;ReadPosRankSum=2.155;SC=GAAAGAACTACGTAGTTTGGA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=35;WE=207888768;WS=207888750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	207890866	rs2796257	T	C	3365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.313;NF=72;NR=49;PP=2010;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GGAACTCCCCTTGGAGATATT;SOR=0.597;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=152;TCR=102;TR=121;WE=207890874;WS=207890856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,153:0.50:308
chr1	207941191	rs2724374	G	T	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=48;PP=1533;SC=CCTGCTTATAGTTTTTCAAAA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=63;WE=207941199;WS=207941181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	207956559	rs1962149	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=8.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CACCCTATGAGTTTAAAGGAT;SOR=3.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=207956567;WS=207956549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	207958446	rs35366573	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=-1.019;SC=ATTGTTATTGCCATAGGTAAG;SOR=0.487;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=28;WE=207958454;WS=207958436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr1	207959122	.	CTTT	C	621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;QD=38.86;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	207959136	rs373519619	T	TAA	661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;QD=36.76;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	207992546	rs12123251	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=0.606;SC=CCCCATTGCCGTCGACTGACG;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=21;WE=207992554;WS=207992536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	208062260	rs2745952	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=0.900;SC=GCTCCAGCCCTCTGTGTGTGA;SOR=0.465;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=23;WE=208062268;WS=208062250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr1	208062973	rs2745953	A	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.929;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=576;ReadPosRankSum=-2.843;SC=CCGCCTGGGAAGACAGAGAAA;SOR=0.865;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=44;WE=208062981;WS=208062963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,69:0.40:171
chr1	208063067	rs2179634	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.026;NF=17;NR=19;PP=457;ReadPosRankSum=2.893;SC=TACCCCGTCCGCAAGAAGGAT;SOR=0.248;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=36;WE=208063075;WS=208063057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	208071105	rs3738460	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-2.034;SC=CGTCTATTTCATATCTATCCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=208071113;WS=208071095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	208207839	rs3736963	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1390;SC=GGTTCTCACCGTATCTGCTGA;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=208207847;WS=208207829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	208208034	rs12128144	G	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=721;SC=AGATAGCTGTGGGGTAGAGAG;SOR=2.531;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=208208042;WS=208208024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	208208124	rs6540448	C	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=ATAACCCAATCAAATAGCTAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=208208132;WS=208208114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	208211887	rs905100	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=540;SC=TGTCTCCCGATTGCACCTTCT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=208211895;WS=208211877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	208213125	rs1751580	A	G	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=74;PP=2953;SC=GTGGGCACAGACAGGGCAGGA;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=68;TCR=74;TR=142;WE=208213133;WS=208213115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	208219164	rs1536471	A	C	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=5;PP=1392;SC=GCCAGGAGCGAGGGGCGCCCT;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=53;WE=208219172;WS=208219154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	208252489	rs2274445	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=200;SC=CCCCCCACATTAAACTCACTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=208252497;WS=208252481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr1	208270184	rs149213633	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=586;ReadPosRankSum=1.344;SC=AGGCACAGGCGATACCCGCAG;SOR=0.902;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=33;WE=208270192;WS=208270174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr1	208276399	rs10654695	C	CCTCT	5144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=26;PP=2973;SC=GAGGACAATTCCTCTCTCTGC;SOR=1.695;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=55;WE=208276407;WS=208276389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	208390155	rs4844657	C	T	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=2.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,76:0.39:196
chr1	208390162	rs4844658	T	C	2713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=6.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.700;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,76:0.38:198
chr1	208390469	rs3748735	C	T	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=58;PP=1942;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GAGTTGATGGCCACACCCTCA;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=254;TCF=134;TCR=120;TR=118;WE=208390477;WS=208390459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,139:0.47:298
chr1	209602593	rs140174613	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=0.791;SC=CACCTGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=17;WE=209602601;WS=209602580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	209605636	rs3842530	TAGCAGCAGCAGC	T	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.861;NF=2;NR=9;PP=2663;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GCCACCACCGTAGCAGCAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=11;WE=209605655;WS=209605626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	209779805	rs880783	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=563;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CTGGGAGCAGGAGGAAGGTTG;SOR=1.402;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=26;WE=209779813;WS=209779795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr1	209781417	rs112536633	TAC	TACAC,T	125.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=1,1;NR=6,6;PP=210,119;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GGCACACGGGTACACACACAC;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7,7;WE=209781428;WS=209781407;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.57:7
chr1	209782545	rs9430006	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=0.921;SC=GTCCCTGGGGATCTTACAGAA;SOR=0.075;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=209782553;WS=209782535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	209784663	rs10746421	A	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=1.198;SC=CACAGAGGAGACCTGCTTGCA;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=209784671;WS=209784653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	209784927	rs2076230	G	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=558;ReadPosRankSum=0.933;SC=GGGTGGGAAAGCTGTTCTGGG;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=33;WE=209784935;WS=209784917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr1	209785011	rs2076226	G	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=0.183;SC=TTGGAGCTCCGTGTACCCTCT;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=209785019;WS=209785001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	209785206	rs11119315	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=896;ReadPosRankSum=0.604;SC=CAGCCCGGGCGTCCGCCCAGA;SOR=0.432;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=60;WE=209785214;WS=209785196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr1	209785957	rs2272879	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.839;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=0.563;SC=CAGAAGGAAGTGTAGGGGGGC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=209785965;WS=209785947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	209786078	rs2272880	G	A	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=702;ReadPosRankSum=2.492;SC=CTGCCCCATCGACTCTTCTTC;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=51;WE=209786086;WS=209786068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr1	209788703	rs1049607	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=498;ReadPosRankSum=-0.529;SC=TCAGGTCCGCTGAGCGCAGCA;SOR=1.195;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=42;WE=209788711;WS=209788693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr1	209792015	rs5780528	A	AC	3708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=53;PP=2741;SC=CTGGAAGACAACACGCATTTG;SOR=1.247;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=59;WE=209792023;WS=209792005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	209799253	rs2179402	A	G	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=49;PP=1756;SC=GGTAGCGATTACAGTAGCCTC;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=82;WE=209799261;WS=209799243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	209800976	rs2072938	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.453;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.896;SC=AAAAACTCACCCCCAGAGGAC;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=171;TCF=62;TCR=109;TR=64;WE=209800984;WS=209800966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,72:0.38:191
chr1	209804095	rs4844863	G	A	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=738;SC=GAGGGGGACCGTCAGCCATCA;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=209804103;WS=209804085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	209805895	rs2072940	C	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-1.017;SC=GGTCCTGCCCCCTTCCTCTCC;SOR=1.508;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=209805903;WS=209805885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	209811886	rs2076356	T	G	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=961;SC=CACCATTCTGTGACTGCCACC;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=209811894;WS=209811876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	209812063	rs2076357	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CGTCCTGAGATCCCAGCATAT;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=209812071;WS=209812053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	209849002	rs3817870	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=654;ReadPosRankSum=0.012;SC=CTGCAGGTCATTCCCGCCTCC;SOR=0.530;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=43;WE=209849010;WS=209848992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr1	209849399	rs3830766	AG	A	1121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=598;ReadPosRankSum=-0.220;SC=ACAGACCGAGAGAGGAATGGA;SOR=0.610;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=16;WE=209849414;WS=209849389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr1	209849406	rs1473683	T	G	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=30;PP=926;SC=GAGAGAGGAATGGAGAGACAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=209849414;WS=209849389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	209950681	rs649275	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=398;SC=ATATTGGCCCTTCCTCCTCCT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=209950689;WS=209950671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	209950760	rs669694	C	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=16;PP=740;SC=TGAGCACCAGCAACTGCAGGC;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=209950768;WS=209950750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	209951400	rs41303303	C	G	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=954;ReadPosRankSum=-0.035;SC=ATCCTAAGTACTGAGTTCATT;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=106;TCR=49;TR=64;WE=209951408;WS=209951390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,72:0.39:184
chr1	209952865	rs623360	C	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=39;PP=1110;SC=TTTTTAAGGACTGATCATTGG;SOR=2.221;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=209952873;WS=209952855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	210001586	rs616227	A	G	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=926;SC=CTGGTCTCCCAGATAGTGCTG;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=210001594;WS=210001576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	210003388	rs599663	A	C	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=11;PP=744;SC=TTAACATCTCATTTGACCTTT;SOR=1.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=35;WE=210003410;WS=210003378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	210003402	rs599649	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=14;PP=902;SC=GACCTTTTCCTAATTTCTACA;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=210003410;WS=210003378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	210004199	rs585627	C	G	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=37;PP=2156;SC=GAGTGAACCACAACAAGTTTC;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=210004207;WS=210004189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	210006437	rs655712	GC	AT	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=711;SC=ATCAATGAACGCTATTGTTGG;SOR=2.948;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=16;WE=210006446;WS=210006427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	210006603	rs656566	C	T	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=61;PP=2803;SC=AAACATCCCCCGAAGAGTTCA;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=136;WE=210006611;WS=210006593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	210008367	rs685248	C	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=1031;SC=GGGAAGACCACAAAACCCCTC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=210008375;WS=210008357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	210008673	rs686582	T	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=914;SC=TGGGGCACAGTTGTAGCTAGA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=210008681;WS=210008663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	210012102	rs1962735	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=484;SC=TGTTGAGCCAAGCCCTGCGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=210012110;WS=210012092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	210015568	rs10570454	GCT	G	2898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=22;PP=1991;SC=ACATGTAAATGCTCTCAGTCA;SOR=1.376;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=41;WE=210015577;WS=210015558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	210111733	rs12025114	G	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=1.005;SC=CTGTGGTCTGGAGCCGGCTGA;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=24;WE=210111741;WS=210111723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr1	210126264	rs200494206	CTTA	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=1.645;SC=GTGCATATTACTTATTATGTG;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=210126274;WS=210126254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	210407339	rs34824193	T	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-0.629;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	210411266	rs11347154	GT	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-0.263;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.938;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	210536025	rs7527939	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=261;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GAACTTAGGTCACAGAACACT;SOR=2.925;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=13;WE=210536033;WS=210536015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	210536078	rs2294848	C	G	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=17;PP=1189;SC=CGTGCCTGCACCTTAGTCCAC;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=210536086;WS=210536068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	210560647	rs2273009	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=1.068;SC=ATAGCAAGCTGGAGGGGAGTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=210560655;WS=210560645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	210560682	rs3215543	A	AAT	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=0.313;SC=GAAAGGCTAGAAGTGTGTAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=210560690;WS=210560672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	210577873	rs2066721	G	C	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=11;PP=563;SC=TTCGCTGCCTGTACTACACCA;SOR=1.096;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=210577881;WS=210577863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	210591742	rs3215542	TG	T	1497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=40;PP=1281;SC=GGAGCTGGAGTGGGGGGTGAG;SOR=3.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=40;WE=210591750;WS=210591732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	210686570	rs4545340	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=0.166;SC=ACATTGAATAACATGTCTATT;SOR=1.151;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=19;WE=210686591;WS=210686560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr1	210761462	rs4297293	G	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=52;PP=1515;SC=GATCCTTGCTGCTGTGTTAGG;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=210761470;WS=210761452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	210804430	rs4951682	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=880;ReadPosRankSum=-1.635;SC=ACAAACAGAGGTACTGGCTAC;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=54;WE=210804438;WS=210804420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr1	211276828	rs3762452	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=414;ReadPosRankSum=-1.281;SC=AGAATGGTCTCAATACTCACT;SOR=0.646;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=24;WE=211276836;WS=211276818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr1	211280724	rs199641326	TAA	T	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.961;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.66;MQRankSum=0.595;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.202;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr1	211380770	rs7525401	T	C	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=62;PP=2965;SC=CAGGACGCCCTGCTGGGCCGA;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=150;WE=211380778;WS=211380760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	211444382	rs36104032	G	A	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.59;NF=8;NR=2;PP=215;SC=TGTATTTTTAGTAGAGACGGG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=211444390;WS=211444372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	211451393	rs72088513	TATC	T	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=852;SC=ATAGTAAAGATATCATCAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=211451403;WS=211451383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	211451467	rs11577985	T	C	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=726;ReadPosRankSum=2.015;SC=AGCTTCCAGATAAGACAATTG;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=44;WE=211451475;WS=211451457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr1	211452529	.	TA	T	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9997;HP=15;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=57.6;NF=2;NR=0;PP=26;QD=14.5;SC=AACGCTGTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=2;WE=211452537;WS=211452519;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr1	211527609	rs7530570	C	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=686;SC=TACAGGAGGCCCCTTCTGGGT;SOR=3.477;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=211527617;WS=211527599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	211533990	rs67772854	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=590;ReadPosRankSum=0.763;SC=AGGTGTAATCACTGTGAGGCC;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=46;WE=211533998;WS=211533980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr1	211545458	.	TC	T	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=57.64;NF=5;NR=0;PP=154;QD=31.4;SC=TTTTTTTTTTTCTTATTTGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=5;WE=211545466;WS=211545448;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	211545459	rs201958376	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-2.109;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=4.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	211545462	.	A	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQRankSum=-2.684;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.960;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	211652755	rs11119749	T	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=1.097;SC=GGGCTGCCCGTGCATCCTCAT;SOR=0.238;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=211652763;WS=211652745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	212141784	rs150857619	C	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=-0.397;SC=TTATATTTTACAACTTTTCAT;SOR=0.269;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=12;WE=212141792;WS=212141774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	212142054	.	GA	G	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=21;MQ=60.63;NF=0;NR=6;PP=82;QD=14.3333333333;SC=AGCTGCCTGGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=212142062;WS=212142044;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,6:0.40:15
chr1	212151914	rs112654546	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=440;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGCTTTAAGGAAAAGAGCTTT;SOR=0.960;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=20;WE=212151922;WS=212151904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr1	212154688	rs114914822	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=0.389;SC=TGAAAAAGTACATGTGGCATT;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=212154696;WS=212154678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	212209367	rs3215984	T	TC	603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=728;SC=CAGGGCCGACTCCAATTCTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=16;WE=212209375;WS=212209357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	212217971	rs35704923	C	CTT	658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=12;NR=4;PP=711;SC=TTGTGTTACTCTATATATTTT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=16;WE=212217979;WS=212217961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	212220847	rs2970592	G	A	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=32;PP=857;SC=CCTTTCCCCTGTCAAAGTTAC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=212220855;WS=212220837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	212236157	rs4951436	G	T	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=11;PP=1553;SC=TCTACAAAATGTAAACTGAAA;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=67;WE=212236165;WS=212236147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	212241714	.	TA	T	498	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=15;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=61.86;NF=0;NR=40;PP=498;QD=12.525;SC=AGTTTTTGTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=40;WE=212241723;WS=212241704;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,40:0.62:65
chr1	212250820	rs17656453	T	C	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=216;SC=AACTGAAATATAGTTTTAGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=212250828;WS=212250810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	212251103	rs6658972	A	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=323;SC=ATCTGAAGATATATATGCTGT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=212251111;WS=212251093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	212251367	rs5780675	GT	G	1350.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=12;PP=729;SC=GAAATCTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=2.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=38;WE=212251375;WS=212251357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	212273639	rs3135474	C	T	4930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=81;PP=2965;SC=GCCCCCAGGGCAAAGTGCAAT;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=154;WE=212273647;WS=212273629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	212274413	rs6540718	A	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=21;PP=635;SC=AGCGGAAAGAAATTGCCAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=35;WE=212274421;WS=212274403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	212530192	rs792439	T	C	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=787;SC=ATTTTTTTGCTTATTGTATAC;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=212530200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	212560327	rs792449	A	G	6578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=113;PP=2965;SC=GGTAGACCAGAAAGACGGCCA;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=195;WE=212560335;WS=212560317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	212791288	rs3839030	CGT	C	418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;QD=32.21;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	212792191	rs11571552	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCCTCCTCCAAATGTGGACAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=212792199;WS=212792184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	212798977	rs3122712	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=1000;ReadPosRankSum=2.049;SC=AAACCCACTAATGTGCTCAAT;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=58;WE=212798985;WS=212798967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,67:0.67:100
chr1	212799870	rs3122713	A	G	4053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=53;PP=2896;SC=CAGAGATGTGAACGTCATGGC;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=212799878;WS=212799860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	212799949	rs3795842	C	T	5586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=75;PP=2965;SC=GGGCTGGAGACGGTTGGTTCT;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=100;TCR=75;TR=175;WE=212799957;WS=212799939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	212900434	rs3835160	C	CG	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=1.412;SC=CTTCATCTTGCCAGTTCACCA;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=7;WE=212900442;WS=212900424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	212900487	rs2244935	A	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=12;PP=924;SC=TTCTCTCCTAAACTGCCCCTA;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=212900495;WS=212900477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	212911836	rs15702	T	C	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TTCAGTACCATGTCAGAGGTT;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=80;WE=212911844;WS=212911826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr1	212912108	rs67229635	ATT	A	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.812;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	212955454	rs11120026	G	A	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.965;SC=TTAGAGATGGGTATGTGTTAT;SOR=0.312;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=71;WE=212955462;WS=212955444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,81:0.54:149
chr1	212960866	rs3738800	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=446;ReadPosRankSum=-1.454;SC=CAAAAATAACCCAGAAATTAA;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=31;WE=212960874;WS=212960856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr1	212970375	rs1284800	A	G	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=8;PP=1011;SC=ACCATGCCCGACCTCTACTTA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=212970383;WS=212970365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	212985466	rs12130945	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=0.476;SC=TGAGCCACCGCGCCCAGCCTA;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=9;WE=212985474;WS=212985456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	213009469	rs10864004	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=590;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CATTATTTCAATGGTTCTGTT;SOR=0.451;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=37;WE=213009477;WS=213009459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr1	213031709	rs2201603	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=33;ReadPosRankSum=1.029;SC=GGAGGTGGGGCCCCAGGAGGA;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=213031717;WS=213031704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	213031948	rs11120047	G	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=673;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GGTGAATGGGGCCCCCCGGGA;SOR=0.755;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=41;WE=213031956;WS=213031938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr1	213032568	rs12023052	T	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=697;ReadPosRankSum=0.816;SC=GTCAGATCCTTAAAAGACCGG;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=46;WE=213032576;WS=213032558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr1	213046236	rs1890932	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-1.349;SC=ATTTAACCTAGTGGTTTGAAC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=213046244;WS=213046226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	213056819	rs2644547	A	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=50;PP=2008;SC=GCCTGGCCAAAAATTTTTCTT;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=213056827;WS=213056809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	213056892	rs12125982	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=0.824;SC=TTGCTATCAAATATTTACATT;SOR=0.409;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=27;WE=213056900;WS=213056882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	213058852	rs7536716	T	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=1.911;SC=AAGATACGGATTCTAAACACT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=213058860;WS=213058842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	213061362	rs2291772	T	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=0.472;SC=CAGATGTGTTTAGGAGGAATG;SOR=0.622;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=14;WE=213061370;WS=213061352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	213061460	rs2291771	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTTTAAACTTTAAAGGATTCA;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=213061468;WS=213061450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	213062017	rs112024320	T	TTTG	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=750;SC=CATGGTTTTATTTGTTGTTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=15;WE=213062025;WS=213062007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	213068192	rs2792558	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=293;SC=TATTATTTTTTAGGCTGTTGG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=213068200;WS=213068182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	213068233	rs12408694	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=805;SC=CACTACAGTGCATTAAATTTG;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=213068241;WS=213068223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	213068404	rs17019870	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.237;SC=CTGTAAGTAATATTTTTATGA;SOR=0.931;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=18;WE=213068412;WS=213068394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	213068436	rs17019873	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.179;NF=3;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=1.216;SC=AGAAGTATGTATAGAATAAAT;SOR=2.104;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=13;WE=213068444;WS=213068426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	213068542	rs146462077	C	CTGAT	1779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.876;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.926;NF=22;NR=5;PP=1373;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TTTTAATCTTCTGATTGTTTT;SOR=1.546;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=27;WE=213068550;WS=213068532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr1	213068595	rs3207090	C	T	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=951;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GAACCAAAAACGGTTATGTTG;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=100;TCR=52;TR=62;WE=213068603;WS=213068585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,78:0.42:187
chr1	213178340	rs11120076	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=1.615;SC=GAGCAACTATGTCCACTCCCT;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=213178348;WS=213178330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	213224719	rs4951476	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	213405414	rs11271079	GGCAACTGAGGAT	G	1158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.065;NF=8;NR=9;PP=2934;ReadPosRankSum=1.568;SC=AGGCTCCAAAGGCAACTGAGG;SOR=0.374;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=17;WE=213405433;WS=213405404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr1	213414324	.	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.523;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1126;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GATTCTGGTTCAAGTTCAGAA;SOR=0.812;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=72;WE=213414332;WS=213414314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr1	214478459	rs6540819	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=899;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GGCTTTTGTTGTTGCATGATA;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=63;WE=214478467;WS=214478449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,70:0.43:161
chr1	214492091	rs370961529	GT	G	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=0.524;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.204;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	214492286	rs1134647	G	A	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=858;ReadPosRankSum=0.347;SC=AAGCATCTCGGATTCCCTGAC;SOR=0.641;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=64;WE=214492294;WS=214492276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr1	214500852	rs115367134	A	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=381;ReadPosRankSum=0.409;SC=TTAGATTTTTAAAAAATGTCT;SOR=1.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=21;WE=214500860;WS=214500842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	214503489	rs2291830	T	G	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=25;PP=919;ReadPosRankSum=2.101;SC=AGACTGAAGCTTTATCTTTTT;SOR=1.028;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=164;TCF=99;TCR=65;TR=73;WE=214503497;WS=214503479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,90:0.45:201
chr1	214504604	rs2270704	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=372;ReadPosRankSum=1.331;SC=GTTGTATGATTTTATTTCCCC;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=21;WE=214504612;WS=214504594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr1	214542668	rs3002311	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGGAATATATATTTCAATAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=214542676;WS=214542658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	214542819	rs1135352	T	C	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1620;ReadPosRankSum=0.959;SC=CTTGGACATCTTCTGGACAGC;SOR=0.449;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=210;TCF=128;TCR=82;TR=101;WE=214542827;WS=214542809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,120:0.48:249
chr1	214551276	rs3013451	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=438;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CAGAGAATGAGTCACATTGAC;SOR=1.965;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=24;WE=214551284;WS=214551266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	214560293	rs2270703	G	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=801;ReadPosRankSum=0.497;SC=GAGGAGGTGGGGAGGCCTGGG;SOR=1.345;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=94;TCF=22;TCR=72;TR=45;WE=214560301;WS=214560283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr1	214564340	rs7550799	T	C	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=52;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CCAGAGAGGATCGGCTCCAGG;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=44;TCR=126;TR=71;WE=214564348;WS=214564330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,84:0.43:196
chr1	214564442	rs11120307	C	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TATAAAAAGACCAGATAGACA;SOR=1.220;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=19;WE=214564450;WS=214564424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	214566952	rs4655342	A	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=597;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AAGAGTGAATAGGAAAAGAGA;SOR=1.092;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=38;WE=214566960;WS=214566942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr1	214567013	rs11322819	CG	C	1599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.580;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=675;ReadPosRankSum=0.458;SC=GCCATCAAGTCGGGGGGGATT;SOR=0.715;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=32;WE=214567021;WS=214567003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr1	214587815	.	A	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=-0.550;SC=ACCAAAAATCACTAACTTTGC;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=13;WE=214587823;WS=214587805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	214638172	rs10864100	C	T	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=90;PP=2627;SC=GGACGCCGCCCGCCTATCCTG;SOR=2.156;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=28;TCR=90;TR=118;WE=214638180;WS=214638162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	214791895	rs76226363	T	C	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TTTGTCTGCCTCTTGGGTCCT;SOR=0.590;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=153;TCF=85;TCR=68;TR=81;WE=214791903;WS=214791885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr1	214825289	rs71679696	CT	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	214826196	rs335524	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=11;PP=622;SC=CAGACATACCGAGAGAAATTG;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=214826204;WS=214826186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	214826364	rs335523	G	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=14;PP=369;SC=TCATGATTTCGAATGGTTTAT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=214826372;WS=214826354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	214826810	rs11303309	CT	C	1084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.300;NF=14;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GATCATAGAACTTTTTTTTTT;SOR=1.519;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=32;WE=214826819;WS=214826800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr1	214828812	rs435043	A	G	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=91;PP=2627;SC=AACATATGGTATGCGTGCATA;SOR=1.891;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=34;TCR=91;TR=125;WE=214828820;WS=214828802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	214830617	rs438034	A	G	5591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=68;PP=2965;SC=GGAGAATGGTAGAGGACCAAC;SOR=0.901;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=157;WE=214830625;WS=214830607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	214837110	rs7289	C	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=67;PP=2007;SC=TGGAGTCCAACGGCAGTGAGA;SOR=3.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=9;TCR=67;TR=76;WE=214837118;WS=214837100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	215345263	rs3834061	GTCTCTC	G	1187.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.34;QD=42.42;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	215368514	rs1556907	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=769;SC=TTATGTTTACATTTAAAATAT;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=215368522;WS=215368504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	215799210	rs77792891	A	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=-2.270;SC=CTTCATCCACATACTGAAAAA;SOR=0.312;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=30;WE=215799218;WS=215799200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr1	215802247	rs111033435	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=542;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCTGACGCTGCGGTGAAGAGA;SOR=0.462;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=37;WE=215802255;WS=215802237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	215848641	rs2797235	T	C	7808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=114;PP=2965;SC=CGGCCTGGATTGTCTGATTTC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=119;TCR=114;TR=233;WE=215848649;WS=215848631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr1	215853748	rs5780842	GT	G	948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=552;ReadPosRankSum=0.400;SC=TTAAGTTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=31;WE=215853756;WS=215853737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr1	215901492	rs2820718	C	T	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.507;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1132;ReadPosRankSum=1.080;SC=TCCAATTCAACAGAACTGAAT;SOR=0.513;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=74;WE=215901500;WS=215901482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,91:0.53:172
chr1	215914646	rs6694510	T	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=0.164;SC=TATAAAATGCTCTTGATTCTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=215914654;WS=215914636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	215914826	rs35309576	T	C	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=608;ReadPosRankSum=0.556;SC=TTAAGATCCATTGGGGCTGCT;SOR=0.843;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=38;WE=215914834;WS=215914816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr1	215916563	rs11120616	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=921;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TGTGAATGGAGTCAAATTTTC;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=65;WE=215916571;WS=215916553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,73:0.43:170
chr1	215931928	rs12095085	T	A	298.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=1.791;SC=ACTTCTTTTTTTTTTTTACCT;SOR=2.946;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=12;WE=215931936;WS=215931918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr1	215953480	rs7514451	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.814;SC=GTTGTCTGGCCTGGCATATCA;SOR=0.074;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=215953488;WS=215953470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	215956304	rs7518466	A	G	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=50;PP=1391;SC=TAGACAGGGAAGTTTCTCTTA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=215956312;WS=215956294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	215960167	rs10864198	T	G	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=56;PP=1794;SC=GCCACAATGTTCTGTGGCTTC;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=72;WE=215960175;WS=215960157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	215963374	rs11120629	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TCAAATCAGCGCCTCCGAGAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=11;WE=215963382;WS=215963364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	215986932	.	CAA	C	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=327;ReadPosRankSum=-0.055;SC=AAGGAAGAAACAATATTTAGA;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=10;WE=215986941;WS=215986922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	216051287	rs7518358	A	G	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=52;PP=1328;ReadPosRankSum=1.718;SC=ACCAAAACTCAGGCTGTTCTG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=56;TCR=96;TR=79;WE=216051295;WS=216051277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,99:0.52:190
chr1	216052549	rs6669557	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=0.265;SC=CATTTTCTAAATGGCTACATT;SOR=0.593;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=216052557;WS=216052539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	216062505	rs75163086	TG	T	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=296;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AATGAACACTTGGTAAAGGCC;SOR=0.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=216062513;WS=216062495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	216107915	rs41277206	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=-1.414;SC=TAATTCTAGGGCATTTATATA;SOR=0.707;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=23;WE=216107923;WS=216107905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr1	216166588	.	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=577;ReadPosRankSum=0.108;SC=AGAATTCATAATAAGAGTTTC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=34;WE=216166596;WS=216166578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr1	216172380	rs10864219	A	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=202;ReadPosRankSum=0.361;SC=AATCCCACTTATTTTTCTTGG;SOR=1.554;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=15;WE=216172388;WS=216172370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr1	216172444	rs79931267	A	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=1.275;SC=TCAAGTCAAAACTAAAATATA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=216172452;WS=216172434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	216219781	rs6657250	A	G	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=24;PP=1693;SC=ACCTGTGACTATGTAGTTCTC;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=79;WE=216219789;WS=216219771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	216246675	rs35944387	AG	A	868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=598;ReadPosRankSum=1.204;SC=TATCGCATAAAGGGCTTGAGT;SOR=0.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=19;WE=216246683;WS=216246665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr1	216348764	rs1805049	C	T	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=73;PP=2397;SC=TGGAAACCACCTAAGATGGAT;SOR=1.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=111;WE=216348772;WS=216348754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	216370130	rs386851	T	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=602;SC=TTTTTAAATTTAATTCACACA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=216370138;WS=216370120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr1	216424275	rs696723	C	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTGCACTGGCCTGAATTTTGG;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=70;WE=216424283;WS=216424265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr1	216495191	rs7515253	T	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=660;ReadPosRankSum=-1.679;SC=CTACTATTTTTTTTTTAGATT;SOR=0.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=34;WE=216495199;WS=216495181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr1	216495400	rs2089947	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=47;PP=1212;ReadPosRankSum=0.424;SC=TATATGCATTATGTGAATTTA;SOR=0.385;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=120;TCF=31;TCR=89;TR=67;WE=216495408;WS=216495390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,84:0.56:149
chr1	216496947	rs1805050	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1184;ReadPosRankSum=1.825;SC=GAAGAGATGGGGTATTATAGA;SOR=0.615;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=79;TCR=92;TR=77;WE=216496955;WS=216496937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,92:0.44:210
chr1	216500830	rs1339963	G	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=556;ReadPosRankSum=1.134;SC=TTGCCAAATGGTATAAAGATA;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=27;WE=216500838;WS=216500820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr1	216592003	rs4253963	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=930;ReadPosRankSum=-1.091;SC=GCCCATCTACTGTCTTTTCTA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=71;WE=216592011;WS=216591993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,86:0.48:178
chr1	216595306	rs10779261	C	T	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=ATAAAACTTGCAGAATTGCTA;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=216595314;WS=216595296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	216679858	rs144848582	A	AT	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.488;SC=GGAAGGGAGGATTTTTTTTTA;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=9;WE=216679866;WS=216679848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	216692669	rs945453	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=556;ReadPosRankSum=-2.103;SC=CATCCTCAAACGAAAGAGACC;SOR=0.994;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=34;WE=216692677;WS=216692659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr1	216824505	rs10863261	C	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=1.531;SC=AAGGCAATGTCAACTCTATTA;SOR=0.092;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=216824513;WS=216824495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	217671771	rs724803	C	G	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=51;PP=1996;SC=TTAGAGGGAACCTAACTAAAA;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=217671779;WS=217671761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	217947738	rs6604561	G	A	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1279;ReadPosRankSum=0.014;SC=TGCAATTACAGAAGGCAAAGC;SOR=0.824;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=79;TCR=74;TR=73;WE=217947746;WS=217947728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,79:0.45:175
chr1	218458551	rs946213	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=341;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CCCGGAACTCTGGGCTAGACG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=218458565;WS=218458541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	218458557	rs3831934	AG	A	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=343;ReadPosRankSum=-0.608;SC=ACTCTGGGCTAGACGACCCCG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=218458565;WS=218458541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	218475533	rs2251169	C	T	251.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-0.549;SC=ACCCCCCTTGCAAAAATGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=218475541;WS=218475523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr1	218519928	rs113711540	A	AAAAC	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TTTCGCATCAAAAACAACAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=2;WE=218519936;WS=218519918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	219366400	rs35359058	T	TG	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=4;PP=272;SC=TCTTTTTTTTTGGGGGGGGGC;SOR=1.739;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=12;WE=219366408;WS=219366390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	219383848	rs5781096	A	ACTTTTT	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=881;SC=TATGTATTCTACTTTTAAGTA;SOR=2.200;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=13;WE=219383856;WS=219383838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	219383867	rs940571	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=672;SC=TATGTTTTTGTTTTTAGGAGG;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=219383875;WS=219383857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	219383905	rs940570	A	G	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=22;NR=10;PP=738;SC=GCATGGCAATACATTTAGCAT;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=219383913;WS=219383895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	219706428	rs10746385	T	C	8350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=126;PP=2965;SC=TGGGTTTTTATGCATAGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=128;TCR=126;TR=254;WE=219706436;WS=219706418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr1	219783279	rs79789352	T	A	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.007;NF=35;NR=63;PP=1612;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GTCCTCAGAGTCAAGCAGGAC;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=98;WE=219783287;WS=219783269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,79:0.53:149
chr1	220089352	rs2231734	A	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=0.102;SC=ATGGAACTACAGGAGGGATAT;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=11;WE=220089360;WS=220089342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	220142023	rs1061248	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=0.409;SC=AATAATTGTCCTGTGTGACTT;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=14;WE=220142031;WS=220142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	220142070	rs1061242	C	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.954;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=497;ReadPosRankSum=-0.886;SC=AATCATAAAACGGTCTGTATC;SOR=0.128;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=34;WE=220142078;WS=220142060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr1	220145371	rs2795315	T	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=410;SC=ACAATTTACTTAAATATTCTT;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=220145379;WS=220145361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	220145584	rs1982986	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AAAAGACAACCTGGGAGTGAG;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=11;WE=220145592;WS=220145574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	220145637	rs1982985	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=1.010;SC=CATAGTGACCATCAGTATATC;SOR=1.688;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=220145645;WS=220145627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	220145655	rs1982984	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-0.684;SC=ATCAGAGTTACCTTATCATTG;SOR=0.283;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=220145663;WS=220145645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	220151808	rs3215088	C	CAA	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=581;ReadPosRankSum=-0.731;SC=TGAGAAACCTCGTTTTATAAA;SOR=0.257;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=220151816;WS=220151798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	220151999	rs144577435	A	C	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1571;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TGCATTTTGCAATCAGCGCTT;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=74;TCR=92;TR=94;WE=220152007;WS=220151989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,117:0.55:211
chr1	220153332	rs34917248	T	TAA	4337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=30;PP=2557;SC=ACTTATTTTTTAAGAGTCTAC;SOR=1.378;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=62;WE=220153340;WS=220153322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	220154246	rs35193743	AT	A	399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=269;SC=GAGCTTTTCAATTTTTTTTTT;SOR=3.383;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=17;WE=220154254;WS=220154236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	220154768	rs1061160	C	T	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=865;ReadPosRankSum=0.653;SC=CTCTGTGTGACTGTACCCATT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=64;WE=220154776;WS=220154758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,76:0.38:200
chr1	220156090	rs2647462	T	C	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=46;PP=2237;SC=GAGCATTCTCTTGCACTCCAA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=220156098;WS=220156080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	220156427	rs1391566	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-1.132;SC=AACTTTTTAATAAAAATGGCT;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=220156435;WS=220156420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	220160360	rs2647435	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=686;SC=ATCTGCTGACATTGTAGCTTT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=220160368;WS=220160350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	220160433	rs2647434	A	G	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=35;PP=2162;SC=ACTATTAAGAATTGAATTAAT;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=104;WE=220160441;WS=220160423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	220162195	rs2254494	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=35;PP=1037;SC=GAGATATTTATAAAACTTTGG;SOR=3.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=220162203;WS=220162185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	220178717	rs5781162	T	TA	1694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=24;PP=1355;SC=AAAGATGATATAAACCAAAGT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=34;WE=220178725;WS=220178707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	220184164	.	A	AAAAG	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.718;QD=29.04;ReadPosRankSum=-2.933;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	220191932	.	G	GA	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=61.53;NF=0;NR=3;PP=28;QD=10.6666666667;SC=AGCATGTTTAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=220191940;WS=220191922;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr1	220192495	rs2245457	C	G	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=55;PP=1626;SC=GATACTTAATCAATAATAAAT;SOR=4.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=61;WE=220192503;WS=220192485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	220197545	rs2577159	C	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=765;SC=AAAGAAATCACGTTCTACTAA;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=220197553;WS=220197535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	220197625	rs2230301	G	T	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=46;PP=2303;SC=TATGTTTAGAGTCTATCCTCT;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=119;WE=220197633;WS=220197615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	220205943	rs2789816	G	A	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=838;SC=GTGACTAATTGAAGTAATTGA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=220205951;WS=220205933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	220205980	rs2577138	A	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=553;SC=GCTTCTAAAGAAAATGAAATG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=220205988;WS=220205970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	220207017	rs2647456	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=451;SC=ACATAAAAGACAGAAAAGAAA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=220207025;WS=220207007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	220208154	rs2789817	C	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=453;SC=CTGTTAATATCCTTAAGTAGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=220208162;WS=220208144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	220231180	rs34887640	CT	C	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=535;ReadPosRankSum=0.517;SC=TTTAAAATTACTGTGAAAAAC;SOR=0.894;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=15;WE=220231188;WS=220231170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr1	220239448	rs1146773	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=775;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TTAACTGCTGTTTTTCATTGT;SOR=0.438;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=44;WE=220239456;WS=220239438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,55:0.52:106
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chr1	220603310	rs10553491	TGTGA	T	942.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=1519;ReadPosRankSum=1.714;SC=TGTGTGTGTGTGTGAGAGAGA;SOR=0.892;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=23;WE=220603332;WS=220603298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,33:0.89:37
chr1	220603324	rs12402904	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.260;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr1	220603516	rs34808456	G	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=682;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GTTGAGTGTGGTTATTGGGAA;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=40;WE=220603524;WS=220603506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr1	220607685	rs1361256	G	A	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=49;PP=1759;SC=GGTACTACCCGAAGAAGAAAA;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=85;WE=220607693;WS=220607675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	220607891	rs1338767	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=15;PP=1489;SC=TTAGCCCTTTAAGAAAAAAGT;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=220607899;WS=220607881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	220608142	rs12032166	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=-0.579;SC=AAATCACGAGCCTGGACTTTC;SOR=0.954;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=20;WE=220608150;WS=220608132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr1	220789236	rs2786599	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=27;PP=848;SC=GGGAAAATTGCGTTTTTTTAA;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=220789244;WS=220789226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	220789362	rs12137627	T	A	233.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	220808921	rs10746403	T	C	4079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=73;PP=2631;SC=TCTTCCCAAATTTGTGTTTTT;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=126;WE=220808929;WS=220808911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	220824115	rs12123306	G	C	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=50;PP=1772;SC=CTGTGTTAGTGCCCTTGCTGA;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=220824123;WS=220824105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	220825523	rs3737296	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=39;PP=1133;SC=CATTTTGTTCATTAAGAGTTT;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=220825531;WS=220825513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	220970028	rs2642438	A	G	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=42;PP=2217;SC=TGGCGAGGCCACCGCCCAGTG;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=112;WE=220970036;WS=220970018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	220986516	rs12144830	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=1.444;SC=TGAGCTTTGACGGGATGGTGC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=220986524;WS=220986506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	220986546	rs17650107	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=342;ReadPosRankSum=-0.919;SC=CTGTGCGTGCGGAGGCCCTGT;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=18;WE=220986554;WS=220986536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	221053545	rs12141189	T	C	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=973;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GTCTCCGCTCTCAGCCGCCTA;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=69;WE=221053553;WS=221053535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr1	221054761	rs17597773	C	G	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=42;PP=1018;ReadPosRankSum=2.462;SC=AGCCGACTAACAGTCAGAAAT;SOR=1.145;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=21;TCR=80;TR=51;WE=221054769;WS=221054751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr1	221055463	rs2247213	G	A	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1404;ReadPosRankSum=0.038;SC=GACACTGAACGGCCCTCTTGT;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=89;WE=221055471;WS=221055453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,114:0.55:209
chr1	221057524	.	T	TGGCGC	1547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=1269;ReadPosRankSum=1.095;SC=TCTCCCGGTGTGGCGCGGCGC;SOR=0.622;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=24;WE=221057532;WS=221057514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr1	221057646	rs2738755	C	T	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.277;NF=39;NR=36;PP=1262;ReadPosRankSum=-2.149;SC=GGTGGAGCCCCGGCTGCGGAT;SOR=0.404;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=75;WE=221057654;WS=221057636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,84:0.56:151
chr1	221057739	rs11578466	C	G	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1399;ReadPosRankSum=1.355;SC=CTGGACATGGCCCCCAGCGAC;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=93;TCR=91;TR=87;WE=221057747;WS=221057729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,108:0.50:214
chr1	221058059	rs2738756	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=448;ReadPosRankSum=-1.165;SC=TGTACTAGGGCGGAGGGGATC;SOR=0.581;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=23;TCR=59;TR=30;WE=221058067;WS=221058049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,41:0.41:99
chr1	221507141	rs7555947	C	T	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=17;PP=1115;SC=TGTGAACATACTTTCATAGGC;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=221507149;WS=221507131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	221509335	rs72746037	A	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=705;ReadPosRankSum=0.934;SC=CAGGGTAGACAGAGAAACAAA;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=54;WE=221509343;WS=221509325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr1	221912361	rs1141714	T	C	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=32;PP=1891;SC=CTCGGCTTGGTTCATTGGTAT;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=221912369;WS=221912351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	221912808	rs1136448	T	C	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=62;PP=2963;SC=TGGCTTGGGTTTGGGCCTGAT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=134;WE=221912820;WS=221912798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	221912881	.	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=724;ReadPosRankSum=-0.506;SC=ATTCAGCGAGCGGGCAGAGCC;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=79;TCR=70;TR=55;WE=221912894;WS=221912871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,62:0.40:155
chr1	222697088	rs3748662	G	A	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AGATGCAACCGGAAAATCAAG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=96;TCR=87;TR=81;WE=222697096;WS=222697078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,114:0.49:235
chr1	222700416	rs1487523	C	T	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1446;ReadPosRankSum=0.074;SC=AATAGACAGGCAATAATGGGA;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=92;WE=222700424;WS=222700406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,111:0.49:228
chr1	222705270	rs4846373	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=696;ReadPosRankSum=0.277;SC=ATCCGAGTTCTAGTAAGCAGA;SOR=0.689;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=42;WE=222705278;WS=222705260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr1	222705546	rs17163175	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TGAGTACTAGGACTGAGTCCC;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=222705554;WS=222705536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	222713503	rs3748664	C	G	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=933;ReadPosRankSum=1.478;SC=GGCCCTGGCGCGTGATGGGGT;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=48;TCR=73;TR=52;WE=222713511;WS=222713493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,62:0.42:146
chr1	222713631	rs3748666	G	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=451;ReadPosRankSum=1.037;SC=CGCTTGCCATGTGAGCCTGCC;SOR=1.190;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=30;WE=222713639;WS=222713621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr1	222713750	rs3828079	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=-0.624;SC=GGAAGAGATCGCCCAGAAGGG;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=222713758;WS=222713740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	222721288	rs4846382	C	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=984;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CCACCTGGCCCAACAAGAATA;SOR=0.631;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=61;WE=222721296;WS=222721278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr1	222734628	rs10495195	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=557;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GTTAGGTAAGCTCTAAATGAA;SOR=0.473;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=28;WE=222734636;WS=222734618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr1	222736498	rs11485180	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=277;ReadPosRankSum=0.072;SC=TAGTAATAAACACTGTATGTT;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=18;WE=222736506;WS=222736488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	222737265	rs35877231	G	T	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=467;SC=AGACAATACAGAAACAGATGG;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=222737273;WS=222737255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	222737481	rs17464254	C	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=2.067;SC=AAAGAAAGAACAGTCTTGTAA;SOR=0.951;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=22;WE=222737489;WS=222737471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr1	222737568	rs3008640	C	T	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=196;SC=TAATATGCTCCCTTTAAATTT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=222737576;WS=222737558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	222750744	rs3008644	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-2.136;SC=TCCCTCTGCCCCTCAGTCTCA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=222750752;WS=222750736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	222751034	rs2936033	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=617;ReadPosRankSum=0.007;SC=TAGATAACCATTAGTCAAAAA;SOR=1.455;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=30;WE=222751042;WS=222751024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr1	222798106	rs3008617	G	A	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=26;PP=939;SC=ATTCTTTTGTGTAGGTTGGAC;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=222798114;WS=222798096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	222802006	rs2936053	A	G	5142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=69;PP=2965;SC=GGTACAAGATAAGACAGAATT;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=149;WE=222802014;WS=222801996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	222802803	rs3748626	T	G	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=70;PP=2965;SC=AAAAAAACCCTGGGAATCAGG;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=153;WE=222802811;WS=222802793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	222802926	rs3008620	C	T	6742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=105;PP=2965;SC=TTTTGGATAGCGAAAAAACAA;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=216;WE=222802934;WS=222802916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr1	222821211	rs61824282	C	T	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=13;PP=526;SC=ATTCCTATAACAATGGTATTA;SOR=0.927;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=222821219;WS=222821201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	222823529	rs17465637	A	C	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=712;SC=CTGAGAAGTTATTTTTTGTCA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=32;WE=222823537;WS=222823519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	222823743	rs67180937	T	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.77;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	222825403	rs3002150	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=11;PP=464;SC=AAAGCTGACTGTAATTCCTGC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=222825411;WS=222825393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	222825717	rs10495198	T	C	5348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=100;PP=2965;SC=AATAGAGAACTCAGTATCATA;SOR=1.239;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=58;TCR=100;TR=158;WE=222825725;WS=222825707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	222825761	rs2936019	G	A	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=74;PP=2212;SC=TCTATTTTTAGGGTAATATAT;SOR=2.137;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=25;TCR=74;TR=99;WE=222825769;WS=222825751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	222826481	rs2291832	G	A	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=27;PP=1192;SC=ATGTAAGTGCGTTCATGAATA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=222826489;WS=222826471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	222832010	rs35822937	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=306;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GTATTCAGACAGAATGCCAGG;SOR=1.467;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=20;WE=222832018;WS=222832000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	222832295	rs2291834	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=440;SC=AAAAACTAAATTTTAAGTTAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=222832303;WS=222832285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	222833601	rs3002153	T	C	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=54;PP=1380;SC=TGGAGCCACCTGTGAGACCTC;SOR=1.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=73;WE=222833609;WS=222833591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	222837594	rs2270707	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=422;SC=CAATGCAGCAGTGAAGCTGAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=222837602;WS=222837584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	222838216	rs2936026	C	T	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=48;PP=1587;SC=ATCTATCTCTCTTTTTCAGAT;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=78;WE=222838224;WS=222838206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	222846882	rs12138316	G	A	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=654;SC=ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGG;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=222846890;WS=222846872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	222860734	rs3008638	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	222886119	rs3811465	A	G	7444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=137;PP=2965;SC=CTCGGTAGCTATCATGGCCGC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=112;TCR=137;TR=249;WE=222886127;WS=222886109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr1	222919895	rs2378607	T	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=4;PP=430;SC=ATTATGGAGATTGACGGTTTC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=222919903;WS=222919885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	222923001	rs2068814	A	G	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=1075;ReadPosRankSum=0.924;SC=CCACCTGGTCATATGTACTAT;SOR=0.840;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=48;WE=222923009;WS=222922991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr1	222923351	rs6683071	A	G	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=23;PP=701;SC=GCTGGGGTCCAAGAGTATGGA;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=222923359;WS=222923341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	223152868	rs1815607	G	A	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=791;SC=GGTGAATTATGTGGTATATGA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=223152876;WS=223152858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	223156382	rs2926159	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=110;SC=TTATGATGCTCTGTTTTTGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=223156390;WS=223156372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	223168213	rs2609359	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.544;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TCCTTTTTTTTTTCATATCAC;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=19;WE=223168221;WS=223168203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr1	223177574	rs2609355	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=42;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AGTTTTATAAAGAGGTGGACT;SOR=1.040;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=70;WE=223177582;WS=223177564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr1	223283910	rs7512943	A	G	4948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=61;PP=2914;SC=ACATCCTGGAAATCCTCAGGC;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=223283918;WS=223283900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	223284528	rs5744174	A	G	4479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=79;PP=2965;SC=ACCCCAGAGAACGAGTCAGGG;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=132;WE=223284536;WS=223284518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	223285200	rs5744168	G	A	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GCATTGTCTCGGAGATCCAAG;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=86;WE=223285208;WS=223285190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,100:0.60:166
chr1	223285833	rs45528236	G	T	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1231;ReadPosRankSum=2.065;SC=AGGAATATTTGGTTGGAGGAA;SOR=0.697;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=81;WE=223285841;WS=223285823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,94:0.53:176
chr1	223532570	rs1547788	T	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.789;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=581;ReadPosRankSum=-2.719;SC=TCAGAACCCCTATTGGAGCTT;SOR=1.101;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=40;WE=223532578;WS=223532560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr1	223567803	rs10907376	G	A	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=40;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GAGCAGCGCGGCCTGCGGCGG;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=71;WE=223567811;WS=223567793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,78:0.55:142
chr1	223712870	rs112481227	G	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=729;ReadPosRankSum=-0.965;SC=GTGCCTTTAAGAGGTGACACG;SOR=0.495;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=48;WE=223712878;WS=223712860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr1	223715248	rs36108579	GT	G	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=377;ReadPosRankSum=-1.073;SC=ACAAGATTGAGTTCTTGGCTT;SOR=0.624;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=12;WE=223715256;WS=223715238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	223716349	rs4072246	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=818;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GCCACAGAACGTGCATGGTAT;SOR=0.666;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=106;TCF=77;TCR=29;TR=52;WE=223716357;WS=223716339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr1	223717379	rs61823524	A	C	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=1191;SC=CCCTGCCCCAACTTGCACCTT;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=223717387;WS=223717369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	223717484	rs34158997	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=833;ReadPosRankSum=1.597;SC=AGTTGATGCCGAGCTTGCTGC;SOR=1.104;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=54;WE=223717492;WS=223717474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr1	223718462	rs61823525	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=0.229;SC=TTGTTCCTTCGTGACCAATGT;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=16;WE=223718470;WS=223718452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
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chr1	223718764	rs35808016	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=647;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTTAGTGAACCTTCCATGTCT;SOR=1.298;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=33;WE=223718772;WS=223718754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr1	223722780	rs34606532	G	A	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=941;ReadPosRankSum=-0.389;SC=AGTGGGAATCGGATCATTTGA;SOR=0.489;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=65;WE=223722788;WS=223722770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr1	223799857	rs34786756	C	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=1181;ReadPosRankSum=0.874;SC=CCAGCTTCTACCACAGGAAAC;SOR=0.474;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=31;WE=223799879;WS=223799847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr1	223799871	rs35116708	C	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=1181;ReadPosRankSum=1.526;SC=AGGAAACAGACGCTGCTGGCT;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=34;WE=223799879;WS=223799847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr1	223805804	rs34893034	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=192;ReadPosRankSum=-2.640;SC=CTGCCCCATGCGCTTACAGTC;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=14;WE=223805812;WS=223805794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	223807239	rs34693465	C	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=192;ReadPosRankSum=0.439;SC=GGAAGGAGCCCTGTGGCACAG;SOR=0.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=14;WE=223807247;WS=223807229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr1	223807262	rs34900680	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=1.882;SC=CCTAGAGGCCGTGGGCTAGCT;SOR=0.191;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=11;WE=223807270;WS=223807252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	223814682	rs67990281	A	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=430;ReadPosRankSum=0.872;SC=GAGAAGCCATATGCCTCACAT;SOR=0.285;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=27;WE=223814690;WS=223814672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr1	223815575	rs34187970	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.461;SC=CTCTCTCTCCGGCTCATGGGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=223815583;WS=223815565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	223816322	rs66602040	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=350;ReadPosRankSum=-1.027;SC=AGCCCTAAGAATACGGAAAAC;SOR=0.504;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=26;WE=223816330;WS=223816312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr1	223816347	rs61825210	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=538;ReadPosRankSum=-1.743;SC=ACAAAGGGCCAGAGCAGAGCA;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=40;WE=223816355;WS=223816337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr1	223830566	rs11584107	G	A	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=1605;ReadPosRankSum=0.193;SC=AGACTCAATGGCATGAAACAG;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=206;TCF=75;TCR=131;TR=104;WE=223830574;WS=223830556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,138:0.57:244
chr1	223841913	rs11585533	C	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=623;ReadPosRankSum=0.483;SC=CAAACCCAGACGGACACATCA;SOR=1.281;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=33;WE=223841921;WS=223841903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr1	223853099	rs66700641	C	A	3196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=58;PP=1871;ReadPosRankSum=0.003;SC=CAACAGCAAGCCCGCTTCCTT;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=120;WE=223853107;WS=223853089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,149:0.48:311
chr1	223900408	rs25655	C	G	6933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=104;PP=2965;SC=GCTCCCACGACAGGGCCATCA;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=217;WE=223900416;WS=223900398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	223905532	rs17596	G	A	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=57;PP=1928;SC=AAGGAGCCCTGGGTAAGTGAT;SOR=1.104;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=223905540;WS=223905522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	223931648	rs1222137	T	C	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=138;SC=CCAAACCCTCTGACCCAACCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=223931656;WS=223931638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	223934720	rs17600	G	A	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=33;PP=1588;SC=GCTATGAAGCGCTATCAGGGG;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=223934728;WS=223934710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	223938565	rs1153968	A	C	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=822;ReadPosRankSum=0.018;SC=TCAACCTCTTACTCCTCCCTT;SOR=0.487;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=54;WE=223938573;WS=223938555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr1	223951841	rs751128	T	C	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=616;ReadPosRankSum=-2.287;SC=GCTCTGGTTATGTGTCCACAG;SOR=1.276;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=43;WE=223951849;WS=223951831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr1	223990623	rs77933928	G	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=739;ReadPosRankSum=-1.430;SC=GGGAAAAAAGGTAGCCAAGGA;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=40;WE=223990631;WS=223990613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	224301749	rs6690695	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	224302154	rs3066024	T	TGAG	2313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=35;PP=2044;SC=GTCTGGGAGATGAGAAGGGAG;SOR=2.437;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=36;WE=224302162;WS=224302144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	224318151	rs3065998	T	TTTG	2214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=1702;SC=GTTATTGATTTTTGTTCTTTT;SOR=2.448;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=34;WE=224318159;WS=224318141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	224321984	rs1472167	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=397;SC=TTATGAATTTCTGATTTTAGA;SOR=1.942;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=224321992;WS=224321974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	224345012	rs7543762	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=426;SC=CTGGTAGAGAGACATTTTAAG;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=224345020;WS=224345002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	224444628	rs10799556	C	T	4700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=56;PP=2595;SC=ATTCAGATTCCTTCTACATCC;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=139;WE=224444636;WS=224444618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	224444901	rs2897055	G	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=280;SC=AAGAGAAAGTGCATTCACTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=224444909;WS=224444891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	224468986	rs34156240	C	CGTGT,CGT	410.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=0,0;NR=11,11;PP=108,326;SC=ACTCTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11,11;WE=224468994;WS=224468976;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:9
chr1	224482216	rs2404783	T	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=374;SC=TTACAGATTTTGACAGCAACA;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=224482224;WS=224482206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	224492381	rs7522125	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=855;SC=TAGGCTTTTTCCTCATAACTG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=224492389;WS=224492371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	224492746	rs3754090	C	T	6768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=124;PP=2965;SC=CTTTCTTTTGCAGGACAGCTT;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=95;TCR=124;TR=219;WE=224492754;WS=224492736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	224495852	rs7534447	C	T	5921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=89;PP=2965;SC=TGGAACTTATCCGTGGTGTTG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=174;WE=224495860;WS=224495842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	224505570	rs3066969	T	TAA	2459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=1577;SC=GCTCTAACAATAAGACTCACC;SOR=0.922;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=33;WE=224505578;WS=224505560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	224505719	rs4436353	T	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=144;SC=AAATAAATTTTCATGAATATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=224505727;WS=224505709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	224514275	rs4653578	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=216;SC=TAAACTCTTCGTTAATAAAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=224514283;WS=224514265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	224517842	rs2896990	C	T	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=80;PP=2837;SC=CGTCGGTCTTCCAAGCCACAG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=153;WE=224517850;WS=224517832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	224517907	rs4146965	A	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=57;PP=1710;SC=GCCCGCCGCGATCGCCGGGCC;SOR=2.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=224517915;WS=224517897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	224544529	rs7517754	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GGATTCGAGGACCACACGCCT;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=6;WE=224544537;WS=224544519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	224585958	rs7522956	A	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=0.209;SC=CAGATATTTAATCTGCCTCAA;SOR=1.473;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=22;WE=224585966;WS=224585948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr1	224588825	rs7518109	T	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.825;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	224600910	rs10916612	C	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.11;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	224600920	rs10916613	C	A	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.76;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	224606249	rs10495219	C	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=21;SC=AGAAGTTCTGCGTTATGCGAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=224606257;WS=224606239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	224621368	rs2405033	G	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=8;PP=697;SC=TCACCAGCTGGCGGTAAGGGA;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=32;WE=224621376;WS=224621358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	224805112	rs1532557	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=443;ReadPosRankSum=0.042;SC=TTCGCTGCATCCCGCCGGGCG;SOR=0.581;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=24;WE=224805120;WS=224805102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr1	225230608	rs2501107	C	T	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=32;PP=1617;SC=TAAATCTATGCTTGAGAATTC;SOR=1.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=225230616;WS=225230598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	225237850	rs2501086	A	C	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=254;SC=GTCATGGATAATTTTGAAGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=225237858;WS=225237840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	225266966	rs3105559	C	G	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=768;SC=AGAAGAATTTCTGGAGCATTT;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=225266974;WS=225266956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	225268343	rs3128651	A	G	5996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	225268346	rs3128652	G	A	6054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	225270409	rs3128655	A	T	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=775;SC=GCTTGATAAAAACTGTAAAGT;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=225270417;WS=225270399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	225273248	rs3128658	G	T	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=6;PP=714;SC=CATTTTAGATGTTTCAGTATG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=225273256;WS=225273238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	225273633	rs3105565	T	A	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=88;SC=TATTTACTAGTTTGAATACCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=225273641;WS=225273623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	225477491	rs12024361	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.751;SC=GGTATTTTTACATCAAAATTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=225477499;WS=225477481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr1	225477793	rs12042900	T	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.419;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AAGTAAGTACTTTTTGTCTTT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=11;WE=225477801;WS=225477783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr1	225492545	rs1995482	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=-1.491;SC=CTAAGTGTTCAACTTTCTCTT;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=6;WE=225492553;WS=225492535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	225492845	rs12034925	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=2.501;SC=TTTTTGTTTGCGAAAAGAGAC;SOR=1.207;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=16;WE=225492853;WS=225492835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	225511905	rs10799300	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=31;PP=2260;SC=ATGTAATACATTAACTGTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=105;WE=225511913;WS=225511895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	225512083	rs12032942	A	G	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=70;PP=2072;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AACATCTGTCATGATTTGGAA;SOR=1.027;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=92;WE=225512091;WS=225512073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	225519445	rs78032721	G	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=603;SC=AAGAAATCCTGTTTGAGTCGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=225519453;WS=225519435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	225525299	rs5781398	G	GA	524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=553;SC=AACTGTCAGGGAAAAAATAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=225525307;WS=225525289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	225528183	rs3856145	C	A	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=1.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	225528183	.	CAACCCC	AAACCCC,AAACCCT	725	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=40,13;NR=19,5;PP=725,231;QD=12.8774781788;SC=CAGAAATAGACAACCCCCATT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59,18;WE=225528197;WS=225528173;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:59
chr1	225528189	rs115148958	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,21:0.29:73
chr1	225533684	rs6667999	A	G	3812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=51;PP=2605;SC=AGATGATGACAAAATTGTAGA;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=136;WE=225533692;WS=225533674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	225533931	rs17522489	A	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=43;PP=1465;SC=AGCAAAGAACAAGAACATAGT;SOR=1.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=225533939;WS=225533921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	225534219	rs7527925	T	C	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=42;PP=1772;SC=CTTTGCACTGTAATCATGCAA;SOR=0.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=225534227;WS=225534209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	225534348	rs7535953	G	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=458;SC=TCCCAGTCTAGACTTACTAGT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=225534356;WS=225534338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	225539665	rs3856150	T	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=272;SC=ATGTCGTACATTATCTTACAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=225539673;WS=225539655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	225586737	.	AT	A	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=16.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.563;QD=3.59;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr1	225611688	rs2230416	G	A	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=1039;ReadPosRankSum=-2.277;SC=AGGTGCTGTCGTGGCTCAGAA;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=68;WE=225611696;WS=225611678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,87:0.55:157
chr1	225685928	rs1629896	A	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=271;SC=CTAAAAGGGCAGGACTATGGA;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=225685936;WS=225685918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	226019633	rs1051740	T	C	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=747;ReadPosRankSum=-0.550;SC=TCTCAACAGATACCCTCACTT;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=55;WE=226019641;WS=226019623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr1	226019653	rs1131873	G	A	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1582;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TCAAGACTAAGATTGAAGGTA;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=88;WE=226019661;WS=226019643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,106:0.65:163
chr1	226019774	rs2260863	G	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=35;PP=1040;SC=AATTATAGGTGACTGAGATGT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=226019782;WS=226019764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	226026616	rs2292567	G	A	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1122;ReadPosRankSum=0.170;SC=TAACTGCCCCGTCCTCGCCAA;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=32;TCR=101;TR=67;WE=226026624;WS=226026606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,86:0.54:159
chr1	226027067	rs35708670	G	GGTGT	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.566;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	226036309	rs360063	A	G	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.012;SC=CTCTGTGAACAAACACCCTCC;SOR=0.800;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=65;WE=226036317;WS=226036299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr1	226044489	rs60955535	G	GC	768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=9;PP=743;SC=TGCTCTATGTGCCCCAGTGAG;SOR=1.136;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=19;WE=226044497;WS=226044479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	226044714	.	G	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=517;ReadPosRankSum=0.416;SC=CTGATGATCGGGTTCTAGGAG;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=41;WE=226044722;WS=226044704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr1	226044766	rs9919303	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=488;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CGTGGGCCACGCGGCTCTGAG;SOR=1.012;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=32;WE=226044774;WS=226044756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr1	226048744	rs34700682	CA	C	758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.093;NF=1;NR=14;PP=464;ReadPosRankSum=-1.105;SC=CTCAGGTTACCAAGCACACAT;SOR=0.669;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=15;WE=226048752;WS=226048734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	226053805	rs7515156	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=0.136;SC=TTCTGTGGCCGGGGGAGCCCC;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=18;WE=226053813;WS=226053795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	226054333	rs45492299	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=484;ReadPosRankSum=0.599;SC=CCCACAGTGAGGAAGAGGTAA;SOR=0.794;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=34;WE=226054341;WS=226054323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr1	226054681	rs360085	T	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=375;SC=GCTCAACAACTCACTAGCTGC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=226054689;WS=226054671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	226054714	rs2292563	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=1.815;SC=GATACCAGCCGGCCCCCTTTG;SOR=0.117;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=13;WE=226054722;WS=226054704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr1	226055595	rs2292564	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=243;ReadPosRankSum=0.775;SC=TACCCAGCAAGTCCCCTGAGA;SOR=1.450;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=19;WE=226055603;WS=226055585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr1	226074563	rs360057	T	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.916;NF=17;NR=15;PP=542;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GGGCAGCGAGTCAGTCTCCGA;SOR=0.518;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=32;WE=226074571;WS=226074553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr1	226074727	rs148675652	C	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.479;NF=10;NR=16;PP=355;ReadPosRankSum=-2.778;SC=CAATGTACATCTCCTGGCGGC;SOR=0.880;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=26;WE=226074735;WS=226074717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr1	226075410	rs57114136	GC	G	628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.856;NF=0;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=0.423;SC=ACCCCGCACCGCCCCCCCGCG;SOR=1.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=17;WE=226075418;WS=226075400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	226076919	rs360058	G	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.676;SC=AGGGAAGGAGGGAGGGAGGTC;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=226076927;WS=226076909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	226125543	rs60825997	G	GA	672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=594;SC=GGTCATCTGGGAGGCTGAAGT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=226125551;WS=226125533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	226180813	rs151278173	TTTC	T	97.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.19;QD=24.49;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	226180824	.	T	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=74.28;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr1	226252232	rs2036870	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=16;PP=451;SC=TATGTATCCACATAATTTAAC;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=226252240;WS=226252222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	226253316	rs1849032	G	T	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;PP=1214;SC=TTTTGTGCTAGTTATGTTTTT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=226253324;WS=226253306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	226334578	rs1219666	G	A	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=64;PP=2061;SC=ACTTGCATCAGGCAATTAAAA;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=87;WE=226334586;WS=226334568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	226352498	rs2306120	T	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1368;ReadPosRankSum=2.145;SC=ACCTTTTTTTTTCTTGCTCTT;SOR=0.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=105;TCR=75;TR=88;WE=226352506;WS=226352488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,100:0.50:200
chr1	226353521	rs2306121	T	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=25;PP=1243;ReadPosRankSum=1.359;SC=TTGCCAACATTATCCTCATTA;SOR=0.350;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=134;TCF=97;TCR=37;TR=77;WE=226353529;WS=226353511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,88:0.58:153
chr1	226411317	rs10915962	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=-1.540;SC=GCCTTCCCAGCCCCTGGCCCG;SOR=0.681;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=24;WE=226411325;WS=226411307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr1	226438449	rs6678137	T	C	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=4;PP=325;SC=AAGGTTTCCTTCCATAGATAT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=226438457;WS=226438439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	226438484	rs200360309	TCTCA	T	553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=502;ReadPosRankSum=0.546;SC=ATATAGATGGTCTCACTATTT;SOR=0.412;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=10;WE=226438495;WS=226438474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	226474132	rs10799347	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=0.715;SC=GACATACACAGAAGTCATTAT;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=20;WE=226474140;WS=226474122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr1	226485327	rs11390947	A	AT	660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AAACTTGTAAATTTTTTACTG;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=16;WE=226485335;WS=226485317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr1	226488826	rs11577454	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=198;ReadPosRankSum=0.896;SC=TTAATTTAACAAATTAGACTT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=16;WE=226488834;WS=226488816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	226550924	rs747657	G	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=347;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CCAACAGTTTGATTAGGAGAA;SOR=0.504;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=22;WE=226550932;WS=226550914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr1	226551897	rs3219143	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TAATTCTCACAATGCCCATGG;SOR=1.845;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=12;WE=226551905;WS=226551887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	226555302	rs1136410	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=739;ReadPosRankSum=0.865;SC=AAGCATTTCCACCTTGGCCTG;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=46;WE=226555310;WS=226555292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
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chr1	226570840	rs1805415	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=286;ReadPosRankSum=-1.934;SC=TACGGTCCTGTTTTTTAACCT;SOR=0.884;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=21;WE=226570848;WS=226570830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	226573364	rs1805414	A	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=633;ReadPosRankSum=0.299;SC=CCATGCCATCAGCTACTCGGT;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=43;WE=226573372;WS=226573354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr1	226576270	rs2255403	A	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AATAAGTGGGACACAACTCCT;SOR=0.452;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=76;WE=226576278;WS=226576260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr1	226589709	rs2666428	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=494;ReadPosRankSum=0.698;SC=ATTCCAAGCACCTGGAAAAAC;SOR=0.619;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=30;WE=226589717;WS=226589699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr1	226589958	rs1805404	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=358;ReadPosRankSum=0.454;SC=CTTTCTGCTGGTCATCCCACC;SOR=1.353;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=21;WE=226589966;WS=226589948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr1	226595647	rs907187	C	G	3744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=78;PP=2375;ReadPosRankSum=-0.658;SC=CTAGCTGCCGCCAAAGCTCCG;SOR=0.558;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=248;TCF=112;TCR=136;TR=147;WE=226595655;WS=226595637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,169:0.57:295
chr1	226923505	rs708776	G	T	7061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=118;PP=2965;SC=AGGCTTGTCCGGATCTTGGGG;SOR=0.913;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=96;TCR=118;TR=214;WE=226923513;WS=226923495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr1	226923938	rs6667260	A	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=752;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CAGCTCAGGGAATCAGAGGAC;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=44;WE=226923946;WS=226923928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,54:0.35:156
chr1	226924642	rs3754415	C	T	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=53;PP=1737;ReadPosRankSum=0.646;SC=GGAGGGCGAGCGAGCCCTGCC;SOR=0.484;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=216;TCF=119;TCR=97;TR=108;WE=226924650;WS=226924632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,122:0.49:247
chr1	227165097	rs3806263	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GTGGGCGAGCGGGTGGCCCCA;SOR=1.123;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=13;WE=227165105;WS=227165087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	227170768	rs2256060	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=1.544;SC=CCTGTCCCTATGGGGGCTGCA;SOR=0.458;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=227170776;WS=227170758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	227171210	rs12739480	G	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.988;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=729;ReadPosRankSum=0.242;SC=GGGCCCACCCGTCTCCCTGGG;SOR=1.101;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=41;WE=227171218;WS=227171200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr1	227171741	.	G	C	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.392;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=721;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGTGTGGGGGGGGGGACGGTG;SOR=0.274;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=52;WE=227171749;WS=227171731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr1	227171958	rs7530213	G	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=383;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CCAGCAGACAGGTGGGGCCAG;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=28;WE=227171966;WS=227171948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr1	227182033	rs2802269	G	A	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=47;PP=1761;SC=TCGGGGTGAAGCTGGGCTTGG;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=104;WE=227182049;WS=227182023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	227182575	rs1045247	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=556;ReadPosRankSum=-2.133;SC=CCATGCCTCCAGAGGACAAAG;SOR=0.576;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=43;WE=227182583;WS=227182565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,47:0.39:119
chr1	227217005	rs3820651	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=1.029;SC=TTAATCATATCCCAATTATAC;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=227217013;WS=227216995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	227218069	rs5781458	C	CAT	1490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=17;NR=7;PP=1205;SC=TTTTTTAACACGATTTAAAAT;SOR=2.235;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=24;WE=227218077;WS=227218059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	227221222	rs11586734	C	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=442;ReadPosRankSum=0.234;SC=GCACCAAACACCCAAATTTAA;SOR=2.368;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=23;WE=227221230;WS=227221212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr1	227221251	rs12031609	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=325;ReadPosRankSum=2.070;SC=AAAAATTAATTTTCCCCCATT;SOR=0.034;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=20;WE=227221259;WS=227221241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	227222515	rs113874316	G	GACAA	3675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=2669;SC=GTTTTAGACAGACAAACAGCC;SOR=1.638;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=47;WE=227222523;WS=227222505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	227223367	rs10495272	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=304;ReadPosRankSum=0.757;SC=AAGAAAATTCGTAACACTCAC;SOR=1.122;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=18;WE=227223375;WS=227223357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr1	227227740	rs12026688	A	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.012;SC=TGATTAAGTAAAACAAACATT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=227227748;WS=227227730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	227239746	rs10799381	G	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=627;SC=CAATGTGCAGGCTTAGCAAAT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=227239754;WS=227239736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	227288655	rs2104863	G	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=166;SC=CAGGTACTCAGTAAGTATTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=227288663;WS=227288645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	227300277	rs488104	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	227330759	rs12139502	A	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=51;PP=1587;SC=TAAGAAATAGATAGCTATATG;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=227330767;WS=227330749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	227335329	rs6685954	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TTACTTAAGATACACAATAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=227335337;WS=227335319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	227348349	rs3754419	A	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=0.126;SC=TGAAAAAATAAATAAATTCAA;SOR=0.324;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=23;WE=227348357;WS=227348339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	227381326	rs6696485	C	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=519;SC=CAAATAATAACAACAACAAAG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=227381334;WS=227381324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	227381373	rs3768436	G	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=934;SC=AATTTTTTTTGGTTGACGATA;SOR=3.145;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=38;WE=227381381;WS=227381363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	227381442	rs11585910	A	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.285;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=0.916;SC=GTTGCTAGATATTACATGGTA;SOR=0.442;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=53;WE=227381450;WS=227381432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr1	227381674	rs35780410	TA	T	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.756;NF=0;NR=11;PP=372;ReadPosRankSum=-1.739;SC=AGTAAACTAATAAGGGTGAAA;SOR=0.100;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=227381682;WS=227381664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr1	227387143	rs3768435	A	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=144;SC=CTTACCCTGTATGAAATGCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=227387151;WS=227387133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	227387361	rs3768434	A	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=19;PP=551;SC=TGTCTGAAACACAAAAAGAAA;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=227387369;WS=227387351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	227834233	rs78467777	TC	T	2238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.196;NF=32;NR=41;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TGTGTATTTTTCCCCCCCCCA;SOR=0.775;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=170;TCF=68;TCR=102;TR=73;WE=227834241;WS=227834223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,102:0.41:246
chr1	227920061	rs1060295	T	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=1.929;SC=GCTGCCTCTCTTCCACCCGTC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=227920069;WS=227920051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr1	227922918	rs2295994	A	C	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.960;SC=CGCCGGGGACATCGACCCCCA;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=123;TCR=70;TR=86;WE=227922926;WS=227922908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,92:0.43:213
chr1	227923081	rs7419238	G	A	8618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=133;PP=2965;SC=TTTCTGCCCCGCCAGCGCCTG;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=114;TCR=133;TR=247;WE=227923089;WS=227923071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr1	227935280	rs2236361	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-0.188;SC=GAGTCAGCCACGTGCTGCAGC;SOR=1.554;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=17;WE=227935288;WS=227935270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	227935355	rs2236360	T	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=638;ReadPosRankSum=0.164;SC=CTCCAGTCCATGGGTGACGGC;SOR=0.831;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=50;WE=227935363;WS=227935345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr1	227935444	rs2236359	A	G	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.735;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=894;ReadPosRankSum=0.043;SC=ACAGATGAGCAGGGATGTCTG;SOR=0.581;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=57;WE=227935452;WS=227935434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,68:0.44:155
chr1	227968107	rs10799448	G	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=729;ReadPosRankSum=0.890;SC=CTGCTGGCTCGCAGATGGCAT;SOR=0.667;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=49;WE=227968115;WS=227968097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr1	228003676	rs75865065	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=0.309;SC=CCCTCCCCCATGTCCCCTGCC;SOR=0.569;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=13;WE=228003684;WS=228003666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	228033197	rs9426581	A	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1465;SC=GCTGCAGGAGATGCAGCTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=228033205;WS=228033187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	228033258	rs61741607	T	A	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=906;ReadPosRankSum=0.784;SC=ATGTCCTACATCATGCCCGAC;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=137;TCF=77;TCR=60;TR=64;WE=228033266;WS=228033248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,77:0.47:165
chr1	228109137	rs35718701	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=645;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GAGCCCAGGAACTCAGCCTGT;SOR=1.167;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=32;WE=228109145;WS=228109127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr1	228112121	rs4653889	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=42;PP=1202;SC=GCAAGGGCCGATCAGTGAGCC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=228112129;WS=228112111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	228113046	rs8192629	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=716;ReadPosRankSum=-0.844;SC=GGCACTCGAGCGCACTCATGC;SOR=0.650;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=48;WE=228113054;WS=228113036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,65:0.56:117
chr1	228113163	rs3795768	A	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=38;PP=1259;SC=GCGCCTGGGCAGCCGCCTCTG;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=228113171;WS=228113153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	228129197	rs631768	T	C	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=37;PP=1251;SC=GGAGACTCCATGGGGACCCTC;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=228129205;WS=228129187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	228194775	rs76933265	C	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.653;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=-2.558;SC=CGGCCCCCCCCGGCGCTCACG;SOR=0.228;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=23;WE=228194783;WS=228194765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	228284991	rs2070960	C	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.219;SC=AGGGAGTGGGCTGGGCTGGGC;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=124;TCF=84;TCR=40;TR=60;WE=228284999;WS=228284981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,71:0.50:143
chr1	228289843	rs1128456	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.506;SC=AGGTCCCGGGCCCGCCGCTCT;SOR=0.700;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=17;WE=228289851;WS=228289833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr1	228289976	rs2295995	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=509;ReadPosRankSum=1.377;SC=CACCCCTGTTAGCCCCTGCTG;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=30;WE=228289984;WS=228289966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr1	228327999	rs4653908	C	T	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1063;ReadPosRankSum=0.429;SC=AAGAGGTGGCCCCGGATGCTG;SOR=0.485;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=129;TCF=56;TCR=73;TR=73;WE=228328007;WS=228327989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr1	228333652	rs11577976	G	A	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=942;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AAGTGCTGTCGGGACTGCAAG;SOR=1.088;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=57;WE=228333660;WS=228333642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr1	228334418	rs3216021	GAT	G	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.001;NF=15;NR=1;PP=587;ReadPosRankSum=0.909;SC=GCCCAGCAAGGATCTGACTAA;SOR=0.400;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=16;WE=228334427;WS=228334408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	228334436	rs55873533	G	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.001;NF=22;NR=2;PP=421;ReadPosRankSum=0.310;SC=TAAAGCAGTCGTGGGTGTGGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=24;WE=228334444;WS=228334426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr1	228335125	rs1803695	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=0.437;SC=CGGTGCAGGCCGTGCAGGCCA;SOR=1.061;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=16;WE=228335133;WS=228335115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr1	228335959	rs11580599	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.153;SC=GAAAGCTGTCCCACAGCCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=6;WE=228335967;WS=228335949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr1	228346425	rs4653910	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CCTTCCCTGCGGCGGCCGCTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=228346433;WS=228346415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	228352160	rs4348717	T	C	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=35;PP=904;SC=TAGCAGTGTGTGGTTCCTGCC;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=228352168;WS=228352150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	228362682	rs2298014	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=642;ReadPosRankSum=0.277;SC=GGTGCCCGGGGGCCGGCTCGG;SOR=0.740;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=42;WE=228362690;WS=228362672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr1	228399799	rs11582369	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=743;ReadPosRankSum=0.336;SC=AGGCCGCGTGCGCCGAGCAGG;SOR=0.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=50;WE=228399807;WS=228399789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr1	228402508	rs2776853	C	T	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=25;PP=2007;SC=GAAGCCTCCCCTGCAACCCCC;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=92;WE=228402516;WS=228402498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	228404198	rs61501937	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=717;ReadPosRankSum=0.706;SC=ACGAGGAGGCGCAGCTGCTGG;SOR=0.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=51;WE=228404206;WS=228404188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr1	228404668	rs3795777	T	C	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=11;PP=1085;SC=TGGCCAAGTTTGTGCTCAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=228404676;WS=228404658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	228405118	rs5781507	G	GA	158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=7;PP=135;SC=AGTGTCAACTGAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=228405126;WS=228405108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	228412106	rs1771482	T	C	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=17;PP=1172;SC=TCTGAAACTTTAGTTTCTGTG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=228412114;WS=228412096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	228412227	rs1771480	TG	CA	7473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=57;PP=2947;SC=CAGGAGCCAGTGCCACACTGA;SOR=1.159;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=87;TCR=58;TR=138;WE=228412236;WS=228412217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	228412308	rs1757152	G	A	6449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=80;PP=2965;SC=GCTCCAGCTCGAAAGTGTGCA;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=122;TCR=80;TR=202;WE=228412316;WS=228412298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	228431095	rs1771455	A	G	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=69;PP=2423;SC=CAGGCAAGACAGATGCCGGGG;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=123;WE=228431103;WS=228431085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	228431235	rs11584385	G	A	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=354;SC=CCACCTAATTGCCTCTTTTCT;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=228431243;WS=228431225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	228431930	rs10916293	C	T	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=63;PP=2812;SC=GAATCTTCAGCGCCTGTGAAA;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=153;WE=228431938;WS=228431920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	228432987	rs1757129	G	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=996;SC=AGAGCATCTTGAGTCTGTGGA;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=228432995;WS=228432977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	228433217	rs2487384	A	G	3999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=66;NR=66;PP=2719;SC=AGCCCCAGACAGAGGTGACGT;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=132;WE=228433225;WS=228433207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	228434395	rs7517088	T	C	7367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=128;PP=2965;SC=GCATAGAGGCTGCGGGCTGCA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=113;TCR=128;TR=241;WE=228434403;WS=228434385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr1	228434467	rs7517108	T	C	6468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=120;PP=2965;SC=CCTGTGAGGCTGGGGGCCAGC;SOR=0.926;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=94;TCR=121;TR=212;WE=228434475;WS=228434457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	228437603	rs6426494	T	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=27;PP=1773;SC=GGCCTTGTCTTCCCAGTGCTG;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=228437611;WS=228437593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	228444297	rs7532141	T	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=693;ReadPosRankSum=0.397;SC=TCTCCCCAGTTCTGCCTTCCT;SOR=0.685;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=38;WE=228444305;WS=228444287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr1	228444318	rs7532144	T	G	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=32;PP=1668;SC=GACCTAGATGTTGGTGGTCAC;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=228444326;WS=228444308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	228444565	rs7532342	T	A	7400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=123;PP=2965;SC=GGCCAGGCGGTCGCCGGGGAG;SOR=0.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=227;WE=228444573;WS=228444555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	228444741	rs3795780	C	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=536;SC=TCCACTTCTCCATGCCCTCAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=228444749;WS=228444731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	228447513	rs7525075	T	G	6317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	228447519	rs7525078	T	A	6113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	228456147	rs878388	T	C	6958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=101;PP=2965;SC=CCTACTTTCTTGTCTAGGCCC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=220;WE=228456155;WS=228456137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr1	228461129	rs1188724	A	G	5111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=67;PP=2965;SC=TCAAAAGTGCACATGGAGGCC;SOR=1.029;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=98;TCR=67;TR=165;WE=228461137;WS=228461119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	228461408	rs11398292	A	AG	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=1527;SC=GTGGCCCTGAAGGGAGCGGGG;SOR=1.659;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=37;WE=228461416;WS=228461398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	228461757	rs474735	G	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1215;ReadPosRankSum=-1.202;SC=AAGGTGAGCCGGGCATGGGGC;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=74;WE=228461765;WS=228461747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,91:0.54:168
chr1	228464100	rs936884	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=0.085;SC=GGTTCTAAAGGCGGTGGTCTC;SOR=1.981;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=9;WE=228464108;WS=228464090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	228464248	rs1188721	T	G	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=38;PP=2299;SC=CGGACGTGGATGGCAGCTGGA;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=228464256;WS=228464238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	228464276	rs1188722	T	C	4640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=54;PP=2731;SC=CGGTCTGCGGTTCCAGCAGGG;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=228464284;WS=228464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	228464842	rs936885	C	G	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=54;PP=2470;SC=GTGCCTGACTCGGCCTCTGCC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=228464850;WS=228464832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	228465346	rs493945	A	G	3278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=60;PP=2226;SC=GCCCACTGACAACGTGCGCAT;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=103;WE=228465354;WS=228465336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	228465370	rs867599	T	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=47;PP=2084;SC=CCAGGAAGGTTCGAGGACAGG;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=88;WE=228465378;WS=228465360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	228466750	rs3795782	T	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=852;SC=ACGCTGGGTCTGGGCAGCTCA;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=228466758;WS=228466740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	228466862	rs3820627	C	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=1134;ReadPosRankSum=1.212;SC=CCAGCGACTGCTCCTCCCCAA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=72;WE=228466870;WS=228466852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,86:0.62:138
chr1	228471046	rs41303079	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=485;ReadPosRankSum=0.506;SC=TAGCGGGGCACGGGGCCACCC;SOR=0.544;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=24;WE=228471054;WS=228471036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr1	228471379	rs56168609	G	C	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=76;PP=2924;SC=TGACCCTGCGGCTCACCATCA;SOR=0.895;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=137;WE=228471387;WS=228471369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	228480282	rs1150908	A	G	7631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=107;PP=2965;SC=AAGGGGCCACAGCTGTGCTGC;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=124;TCR=107;TR=231;WE=228480290;WS=228480272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr1	228480964	rs10158357	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=4;PP=1231;SC=GTCCAGTTGGATTCTGTGTCT;SOR=3.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=228480972;WS=228480954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	228482010	rs449133	C	T	3559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=80;PP=2432;ReadPosRankSum=0.326;SC=TGAGGCAGGACGGGTCCAGGT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=346;TCF=164;TCR=182;TR=150;WE=228482018;WS=228482000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,166:0.43:388
chr1	228482028	rs4653547	G	C	4915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=0.465;SC=GGTGTGAGCTGCAGATCCGTG;SOR=0.817;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=346;TCF=168;TCR=178;TR=188;WE=228482036;WS=228482018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,213:0.55:387
chr1	228482285	rs1150909	T	C	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=1203;SC=CAGGAGGTGTTCTCATGCTCA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=228482293;WS=228482275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	228486404	rs56021350	C	T	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.997;SC=ACCTCGGCCACGCTCACTGTC;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=77;WE=228486412;WS=228486394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,92:0.49:186
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chr1	228494357	rs3795795	C	T	3736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=71;PP=1765;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CCCAGGCTAGCGTGGCCCAGG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=67;TCR=136;TR=105;WE=228494365;WS=228494347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,120:0.51:234
chr1	228494382	rs1150911	T	G,C	5097.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=18,14;NR=49,57;PP=1281,1200;SC=AGCGCAGTTCTTGTGCTTTGG;SOR=2.303;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=138;TCF=32;TCR=106;TR=67,71;WE=228494390;WS=228494372;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.53,0.47:150
chr1	228494438	rs3795797	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=580;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CCAACTGAGACGGCTCCACAG;SOR=0.571;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=29;WE=228494446;WS=228494428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr1	228494696	rs4653939	G	A	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=866;ReadPosRankSum=1.855;SC=GGGCGGGTGCGAGCGTGGAGT;SOR=0.471;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=57;WE=228494704;WS=228494686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr1	228494790	rs435776	G	A	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=1052;ReadPosRankSum=0.573;SC=GCTGGTACGCGGAGTGGAGCA;SOR=0.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=65;WE=228494798;WS=228494780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,83:0.52:159
chr1	228495696	rs419173	T	C	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=901;SC=ACAGATGGGCTATGGCAAAAG;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=36;WE=228495704;WS=228495686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	228496014	rs876180	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=770;ReadPosRankSum=-0.265;SC=AGGGCGTGACGCCCGAGGACG;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=48;WE=228496022;WS=228496004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
chr1	228497053	rs379620	A	G	4704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=64;PP=2965;SC=CTCCATTCAGAAAGGCCTTCC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=82;TCR=64;TR=146;WE=228497061;WS=228497043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	228503677	rs1150912	A	G	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.048;SC=GAACCCGTGCACACCTCGGAG;SOR=1.155;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=102;TCR=65;TR=165;WE=228503685;WS=228503667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,191:0.99:193
chr1	228504472	rs1188732	T	C	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=35;PP=1315;SC=CGCACAGGCATGCTTCACCTG;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=75;WE=228504480;WS=228504462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	228504591	rs61825301	C	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=-1.480;SC=GCAGTCACCACGCCCTACTGC;SOR=0.951;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=30;WE=228504599;WS=228504581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr1	228504669	rs61825302	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=2;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=541;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TGGCCTCTGCGCGGCTCACCG;SOR=1.015;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=13;WE=228504678;WS=228504659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr1	228504670	rs11810627	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=3;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=760;ReadPosRankSum=0.373;SC=GGCCTCTGCGCGGCTCACCGT;SOR=0.450;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=20;WE=228504678;WS=228504659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	228504701	rs111792077	G	GCTCC	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=603;SC=TGGTGGGCGAGCTTTTCCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=228504709;WS=228504691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	228505204	rs4653942	G	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=859;ReadPosRankSum=1.897;SC=GTGGTGGCTCGCAGCAGCCAC;SOR=0.504;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=66;WE=228505212;WS=228505194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr1	228505668	rs1188729	C	G	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=52;PP=2901;SC=GAAGATGTCTCTCTGGAGCTT;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=92;TCR=52;TR=144;WE=228505676;WS=228505658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	228505699	rs1188728	T	C	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=69;PP=2829;ReadPosRankSum=-1.271;SC=CTGAGGCTGGTGAGGTCATCT;SOR=0.350;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=165;WE=228505707;WS=228505689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr1	228505739	rs3795801	G	A	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1483;ReadPosRankSum=0.772;SC=CATCCAGCCCGGTGGGCGGTT;SOR=0.756;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=174;TCF=88;TCR=86;TR=90;WE=228505747;WS=228505729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,108:0.50:214
chr1	228509427	rs373610	A	G	6517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=90;PP=2965;SC=ACTGGCCTGGACCGTGCTGAT;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=105;TCR=90;TR=195;WE=228509435;WS=228509417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	228520763	rs384553	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=267;ReadPosRankSum=0.535;SC=CCTTCCTCCAGGCCCTGGCGG;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=12;WE=228520771;WS=228520753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	228520880	rs416564	C	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=1.022;SC=TTATGGCTGACCCCTTTTCTG;SOR=0.716;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=23;WE=228520888;WS=228520870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr1	228520973	rs369909	C	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=502;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GCTGAGAGACCTCCAGGTGGC;SOR=0.475;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=38;WE=228520981;WS=228520963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr1	228522029	rs57891072	TA	T	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=245;ReadPosRankSum=-1.868;SC=CCTGAGTGTGTAGAGTTCCAG;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=228522037;WS=228522023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	228522047	rs520552	A	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=130;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CAGGGCTCCAAGGCCCAGGTT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=7;WE=228522055;WS=228522037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr1	228523005	.	T	TG	100	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=100;QD=31.5;SC=GGGCCGTGAGTGGGGGTGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=228523013;WS=228522995;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
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chr1	228523447	rs10799473	T	C	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=767;SC=TCAGATGTGCTGGGGTTGGGA;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=43;WE=228523456;WS=228523432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	228523448	rs1757161	G	A	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.586;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	228523618	rs1757160	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=0.880;SC=AGGAGTGGGGGACAGGACAGC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=12;WE=228523626;WS=228523608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr1	228524642	rs56063628	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=336;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GCCTATGGCATGGGGTGCCTG;SOR=1.483;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=18;WE=228524650;WS=228524632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	228524919	rs3795807	G	A	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1308;ReadPosRankSum=-3.307;SC=AGGCAGGCCAGGGTGTCATGA;SOR=0.905;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=149;TCF=68;TCR=81;TR=72;WE=228524927;WS=228524909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr1	228524961	rs3795808	C	A	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1345;ReadPosRankSum=1.658;SC=TGCAGGTGCCCGGAGGTGACA;SOR=0.824;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=80;WE=228524969;WS=228524951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr1	228525627	rs1757127	C	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CACTTCAGCACCCCCATCCCT;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=72;TCR=50;TR=69;WE=228525635;WS=228525617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr1	228525898	rs1188717	C	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=487;ReadPosRankSum=0.400;SC=AGGCCCCTAGCAGGGTCGTCC;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=26;WE=228525906;WS=228525888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr1	228526011	rs11577699	C	T	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=892;ReadPosRankSum=-0.051;SC=AGTGGGGGGCCGCTGAGGCCC;SOR=0.547;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=57;WE=228526019;WS=228526001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,72:0.46:155
chr1	228526486	rs58480216	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=381;ReadPosRankSum=1.157;SC=TGGGGGCCTCGTGGCCCACAG;SOR=0.540;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=27;WE=228526494;WS=228526476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr1	228526665	rs505629	T	C	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=311;ReadPosRankSum=-2.768;SC=TGCCCATAGCTGTGGCCGGCC;SOR=0.896;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=27;WE=228526673;WS=228526655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr1	228527844	rs11588701	T	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-1.159;SC=CCTCAGTGCCTGCCCTTGGCT;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=228527852;WS=228527834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	228528412	rs1150916	G	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.246;SC=CCTGACCTTCGCCCCGGCCCC;SOR=0.782;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=72;WE=228528420;WS=228528402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,88:0.49:179
chr1	228528563	rs1188710	C	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=855;ReadPosRankSum=0.015;SC=AGGCACCCTGCAGGCCCTGGG;SOR=1.054;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=54;WE=228528571;WS=228528553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,63:0.51:124
chr1	228529429	rs141828109	A	AGACGGCTCAGCCAGCCTGTGGCATGG	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.959;NF=0;NR=4;PP=1973;ReadPosRankSum=2.278;SC=TTCCTGGGACAGACGGCTACA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=4;WE=228529437;WS=228529419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	228539300	rs3795812	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	228550429	rs11585049	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=1.828;SC=CTCCCAGCCCCCAGTCACCGG;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=21;WE=228550437;WS=228550419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr1	228559450	rs186870748	G	A	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=1258;ReadPosRankSum=-1.817;SC=AGCCCCCTCCGGGGGGGCCCC;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=75;WE=228559458;WS=228559440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,85:0.50:171
chr1	228560139	rs498382	A	G	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=30;PP=1044;SC=TGTCCCAGTCAGAGGAGGAGG;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=228560147;WS=228560129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	228612838	rs2230656	G	T	6708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=99;PP=2965;SC=GCAACTTGCGGATTAGCAGCT;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=109;TCR=99;TR=208;WE=228612846;WS=228612828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr1	228613052	rs1188474	T	C	4704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=96;PP=2517;SC=GGCCCCGCGGTGTCCTCTGCC;SOR=1.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=51;TCR=96;TR=147;WE=228613060;WS=228613042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	228645063	rs10916317	A	G	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=13;PP=1343;SC=TTCTCGAGATAGTAGGTGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=228645071;WS=228645053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	228681749	rs3795817	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=243;SC=TCCTTCACCCCGAGGCGTGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=228681757;WS=228681739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	228699477	rs6665115	T	C	9156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.169;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CCTGGCCACGTGGTCACTCAT;SOR=0.349;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=291;TCF=152;TCR=139;TR=290;WE=228699485;WS=228699467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,333:1.00:334
chr1	229385669	rs71561726	TTC	T	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
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chr1	229568231	rs527621	T	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=15;PP=419;SC=GAGGCTAGGCTCTCAGCGCTA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=229568239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr1	229694422	rs72559415	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GACCCGTACGCCTCAGCCCGC;SOR=1.296;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=12;WE=229694430;WS=229694412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	229730452	rs2295625	G	A	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=54;PP=2235;ReadPosRankSum=1.382;SC=CCTGCTGAGCGCTCCACAGCC;SOR=0.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=163;TCR=111;TR=133;WE=229730460;WS=229730442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,156:0.48:326
chr1	229738170	rs3753886	T	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1021;ReadPosRankSum=1.866;SC=CATCCTTGACTCGCTTAATGC;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=70;WE=229738178;WS=229738160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr1	229738236	rs4925500	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.731;SC=TGGGCATGTCGGGGGGCTCCA;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=63;WE=229738244;WS=229738226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,78:0.51:153
chr1	229746019	rs2273573	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TAACCCAGTACGTGGCAGGAT;SOR=1.044;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=23;WE=229746027;WS=229746009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr1	229750343	rs2273574	T	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=735;ReadPosRankSum=0.300;SC=AGACCAGCCATGTGGCTAAGT;SOR=1.130;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=93;TCF=20;TCR=73;TR=41;WE=229750351;WS=229750333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,46:0.45:102
chr1	229768297	rs1473719	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.207;SC=ATAGGAAATACTAAGGTAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=229768305;WS=229768287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	229772693	rs3811473	T	G	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1239;ReadPosRankSum=0.054;SC=GCCCAGGAAGTCTCAATAGAT;SOR=0.905;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=69;WE=229772701;WS=229772683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
chr1	229781532	rs881694	T	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.842;SC=CAGAGAGCAGTCTTCTTCCCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=229781540;WS=229781522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	229781744	rs2274994	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=825;ReadPosRankSum=0.111;SC=ATGTGTCCTCTAGCTCCTCCC;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=46;WE=229781752;WS=229781734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr1	229783236	rs6587349	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr1	229783240	rs2274995	T	C	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr1	229795045	rs41309637	G	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TACGGCCTAAGGCTATGGGAC;SOR=0.455;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=25;WE=229795053;WS=229795035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr1	230371883	rs3811488	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=631;ReadPosRankSum=-1.784;SC=TGCATTACCTGTCAGGGGTGT;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=37;WE=230371891;WS=230371873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr1	230384970	rs1923950	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=569;ReadPosRankSum=-1.683;SC=ATTACATGACGCCTGAGCAGA;SOR=1.259;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=36;WE=230384978;WS=230384960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr1	230386341	rs2273966	T	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=634;ReadPosRankSum=0.738;SC=GACAGAGAAGTGCCTCAGCTC;SOR=0.676;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=41;WE=230386349;WS=230386331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr1	230415025	rs6698963	A	G	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1217;ReadPosRankSum=0.586;SC=CCCACACTCTAAGGCACTCTC;SOR=0.463;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=74;WE=230415033;WS=230415015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,78:0.51:152
chr1	230451880	rs139819979	ATATG	A	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GTATACATACATATGTATATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=230451891;WS=230451870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	230451911	.	TATAC	T	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=374;ReadPosRankSum=1.279;SC=TATGTATGTGTATACATACAT;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=230451922;WS=230451901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr1	230451978	rs11122492	G	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=12;PP=575;SC=ATGTGTATACGTACATATGTG;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=230451986;WS=230451968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	230459433	rs35048134	GC	G	737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=483;SC=CATCCCAAAGGCCCCCCCTCA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=230459441;WS=230459423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	230473103	rs10864744	A	C	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=716;ReadPosRankSum=0.871;SC=AGTATTCAGCAAGCACAGATC;SOR=0.600;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=40;WE=230473111;WS=230473093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr1	230497940	rs828479	G	T	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=13;PP=1092;ReadPosRankSum=-1.597;SC=GCACGAGAGGGTGGGGGAGGA;SOR=0.648;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=79;TCR=20;TR=61;WE=230497948;WS=230497930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,61:0.60:101
chr1	230498232	rs2820384	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GGAAGCCCTCCTGGGGCTCCA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=9;WE=230498240;WS=230498222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr1	230503684	rs2632571	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=117;ReadPosRankSum=1.467;SC=CTCAAGGTCACGCAAGCTGGC;SOR=0.381;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=10;WE=230503692;WS=230503674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr1	230513128	rs828463	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=-0.348;SC=ACATCAACACGTGATAAATCC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=230513136;WS=230513124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	230778491	rs4846864	G	C	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=554;ReadPosRankSum=0.393;SC=CCTCTGTGGCGGTCTCTTCGG;SOR=0.427;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=143;TCF=38;TCR=105;TR=52;WE=230778499;WS=230778481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,61:0.38:160
chr1	230795148	rs139561919	A	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=501;ReadPosRankSum=0.195;SC=CTTCCATTTCATTTGTATATG;SOR=1.645;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=25;WE=230795156;WS=230795138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr1	230795177	rs1359866	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=473;ReadPosRankSum=0.194;SC=ATATCATTGCTATAATTTTTT;SOR=1.387;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=31;WE=230795185;WS=230795167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr1	230796326	rs3736983	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-1.074;SC=TTCACATTCTATCAGCAATAT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=230796334;WS=230796325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	230810834	rs144025811	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AGTTACCCTCGCTTTTTAATC;SOR=0.708;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=193;TCF=95;TCR=98;TR=82;WE=230810842;WS=230810824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,105:0.46:227
chr1	230819295	rs5781596	ATTC	A	2258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.710;NF=14;NR=24;PP=1706;ReadPosRankSum=2.147;SC=ATAAACATTAATTCTTCTTCT;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=38;WE=230819305;WS=230819285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,62:0.41:151
chr1	230820763	rs150768186	C	CACATT	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=461;ReadPosRankSum=0.342;SC=TCGGAAGTCTCACATTAGACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=9;WE=230820771;WS=230820753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr1	230822607	rs1536591	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=566;ReadPosRankSum=0.744;SC=TTATTGACGCGCACATATGTA;SOR=1.917;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=29;WE=230822615;WS=230822597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr1	230825942	rs3000064	A	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=0.306;SC=TGCTTAGAAGAGTCTGCGGCA;SOR=0.965;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=23;WE=230825950;WS=230825932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	230828987	rs2478534	C	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=914;ReadPosRankSum=1.888;SC=TTTCCCCCCCCATATTCAGCT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=64;WE=230828995;WS=230828977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,66:0.62:107
chr1	230829139	rs1051038	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=623;ReadPosRankSum=1.855;SC=AGCAGCCTTAAGCATCTTGGA;SOR=0.690;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=43;WE=230829147;WS=230829129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr1	230840096	rs1926723	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=215;ReadPosRankSum=0.621;SC=GGGGAGATGATGCACAGTTAG;SOR=0.247;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=16;WE=230840104;WS=230840086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	230841687	rs7080	T	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=34;PP=2359;SC=ACCGGGGAGATAGTTTCTTCA;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=107;WE=230841695;WS=230841677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	230845794	rs699	A	G	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=49;PP=2178;ReadPosRankSum=2.247;SC=ACTGGCTCCCATCAGGGAGCA;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=164;TCR=87;TR=141;WE=230845802;WS=230845784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,167:0.57:292
chr1	230846679	rs11122576	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=109;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TTTCATTGTCTCAATATTCCC;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=6;WE=230846687;WS=230846669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	230883466	rs12143120	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=684;ReadPosRankSum=1.260;SC=GTGAGTGGGGCGAGCAGGGGA;SOR=0.481;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=46;WE=230883474;WS=230883456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr1	230883484	rs6690251	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=582;ReadPosRankSum=-0.118;SC=GGAAGGAGCATAGATGAGGCC;SOR=0.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=33;WE=230883492;WS=230883474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr1	230883499	rs6690254	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=422;ReadPosRankSum=-0.297;SC=GAGGCCGAGGTTCAGCAGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=22;WE=230883507;WS=230883489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr1	230891248	rs2493145	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=2.183;SC=CCAAGAGGCACGGGGCTGGGG;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=11;WE=230891256;WS=230891238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	230895340	rs28359608	C	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=332;ReadPosRankSum=0.411;SC=AGGACCAAAGCTTTGGCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=23;WE=230895348;WS=230895330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr1	230898231	rs2282318	T	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr1	230898494	rs2282319	C	T	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=65;PP=1665;ReadPosRankSum=0.455;SC=CCGACCACAACGAGTTCTGGA;SOR=0.805;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=111;WE=230898502;WS=230898484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,134:0.59:227
chr1	230898615	rs3215985	G	GA	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.283;NF=0;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=1.753;SC=TAAGGGCTGGGAAAAAATCAG;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=11;WE=230898623;WS=230898605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	230903234	rs11122590	A	G	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=203;SC=AGGGTGCCCCAGTGGCCTCCC;SOR=1.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=230903242;WS=230903224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	230903350	rs3828126	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=405;ReadPosRankSum=0.876;SC=AAGACTTCACTGGGGGTGTGG;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=39;WE=230903358;WS=230903340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr1	230904911	rs11122593	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=465;ReadPosRankSum=-0.300;SC=TGACTCTGCTCTTTCCATGTT;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=31;WE=230904919;WS=230904901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	230914612	rs12130847	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=293;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CCTTGCGGACAGGAACAAGAT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=20;WE=230914620;WS=230914602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	230914729	rs1933631	A	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GATGGCATTTAAGGACTTCAA;SOR=1.346;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=18;WE=230914737;WS=230914719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr1	230928351	rs2282321	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.673;SC=GAATTGTATTCGGACAGGGGA;SOR=1.819;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=230928359;WS=230928341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	230933898	rs2297831	C	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=574;ReadPosRankSum=0.605;SC=TCCCCCTTCTCTCCTATCAGG;SOR=1.218;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=44;WE=230933906;WS=230933888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr1	230979657	rs41314280	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=610;ReadPosRankSum=-0.046;SC=GGTGGGACATGAGAAAGGACA;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=42;WE=230979665;WS=230979647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr1	231003851	rs11122619	G	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GCCTCACGCCGGCAGGTGCCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=231003859;WS=231003843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	231042732	rs3811502	T	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=871;ReadPosRankSum=1.392;SC=ACGTTTCTGATACTGATGGAA;SOR=0.646;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=49;WE=231042740;WS=231042722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr1	231047310	rs10580953	TAC	T	347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.078;NF=1;NR=7;PP=251;ReadPosRankSum=-1.109;SC=AAAAAAAAGATACAGACTCAT;SOR=1.038;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=8;WE=231047319;WS=231047300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	231057247	rs2275333	A	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=-0.904;SC=TGATCACCTGACCCCTATAAG;SOR=0.391;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=21;WE=231057255;WS=231057237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	231059784	rs3748774	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.402;SC=GCTAGTCCATCATATCTAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=231059792;WS=231059774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	231060736	rs3748775	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=654;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GAAAGGAATATCGAGAAGAGT;SOR=1.066;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=36;WE=231060744;WS=231060726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr1	231064578	.	T	TCTC	188	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5003;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=188;QD=52.7948512811;SC=CCCAGGCAATTCTACCTCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=231064586;WS=231064568;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	231064611	rs950029	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=0.314;SC=AGGGAGTAGCGTGCCACCATG;SOR=0.255;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=231064619;WS=231064601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	231067236	rs11122624	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=686;ReadPosRankSum=0.055;SC=CAAAATGCTGCATTAGTATCA;SOR=0.953;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=45;WE=231067244;WS=231067226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr1	231067318	rs11122625	G	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=234;ReadPosRankSum=-1.904;SC=GGTTAAACCAGACCTGTAAAC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=15;WE=231067326;WS=231067308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	231069340	rs12749386	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TCATGACATCCTCTGGTACAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=231069348;WS=231069330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	231069652	rs1890351	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=193;ReadPosRankSum=0.038;SC=ATAATTGTTAAAATTGAGATT;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=231069660;WS=231069642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	231081304	rs6673085	T	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=138;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CAGCTCTACTTCTTTATGCTA;SOR=0.116;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=9;WE=231081312;WS=231081294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr1	231092211	rs34436246	T	TG	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=435;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CATAACTGTCTGGTCTTGCTT;SOR=0.802;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=15;WE=231092219;WS=231092201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr1	231093785	rs59207624	CT	C	606.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.832;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.74;MQRankSum=0.490;NF=21;NR=3;PP=444;ReadPosRankSum=-1.593;SC=CCATCCAAACCTTTTTTTTTT;SOR=3.690;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=24;WE=231093793;WS=231093775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr1	231114420	rs114508011	A	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.174;SC=TTGAGCAGGGAGAGCGGCGAG;SOR=0.385;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=9;WE=231114428;WS=231114410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	231114465	rs76376323	C	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=92;ReadPosRankSum=1.202;SC=GGCCGCAGCCCGGCGGACAGG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=8;WE=231114473;WS=231114455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	231114595	rs11122174	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.869;SC=AAGGCGCATGCGCGACAGCCC;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=231114603;WS=231114585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	231124055	rs10779804	T	C	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=769;ReadPosRankSum=-1.069;SC=TATTATCTTGTATTATTTCAG;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=41;WE=231124063;WS=231124045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr1	231175644	rs12025055	C	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=-1.275;SC=GGGAAGAGCCCCAGCTCGCGG;SOR=0.804;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=231175652;WS=231175634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	231353589	rs4658907	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=1.566;SC=TGGAAAGTGCAGGAGGGTAAT;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=20;WE=231353597;WS=231353579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr1	231377081	rs518686	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=753;ReadPosRankSum=0.032;SC=ACCACCACGGCTTAGCAAAGA;SOR=0.385;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=114;TCF=78;TCR=36;TR=59;WE=231377089;WS=231377071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr1	231400905	rs849714	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	231401204	rs6702011	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=407;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TTAAGCCATATTTTCTTCACT;SOR=1.467;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=20;WE=231401212;WS=231401194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr1	231401596	rs532226	T	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=896;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TACATAAAACTTGACGCTTTA;SOR=0.857;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=53;WE=231401604;WS=231401586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr1	231401902	rs574553	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=669;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AACCAAAAGAGTCTACAACTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=44;WE=231401910;WS=231401892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr1	231480507	rs1009227	A	G	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.87;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	231486989	rs2474633	A	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=215;SC=TGCTTATGTAAATTGTTTTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=231486997;WS=231486979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	231487017	rs2474634	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=492;SC=GTTAACTTGCTTATTGAATAC;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=231487025;WS=231487007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	231488524	rs2437150	C	T	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=67;PP=2803;SC=GCTGTAAGACCTAATTCTAAA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=121;WE=231488532;WS=231488514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	231502244	rs371204614	AT	A	122.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr1	231502245	rs1435167	T	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=1.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	231502310	rs1435166	T	C	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=500;SC=CCTAAGAGTATGGACAATATT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=231502318;WS=231502300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	231506557	rs2256908	G	A	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=548;SC=TCACAAATACGTCTCAATAAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=231506565;WS=231506547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	231664607	rs41303127	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=494;ReadPosRankSum=-2.500;SC=GTTATTTATCCGGAGGGGGAG;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=31;WE=231664615;WS=231664597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr1	231697030	rs1982095	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TTTCACATTTGTTATATAATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=231697038;WS=231697020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	231830295	rs3738401	G	A	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TGTCTCTCTCGGCCCTTCAGT;SOR=0.549;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=80;WE=231830303;WS=231830285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr1	231936016	rs2759354	A	G	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=93;PP=2880;SC=AGCTACCAGCACATCGTGTTT;SOR=1.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=37;TCR=93;TR=130;WE=231936024;WS=231936006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	232098847	rs12754734	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=1188;ReadPosRankSum=0.585;SC=CAAGGCTGCCCGATGTCCTAA;SOR=0.385;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=34;WE=232098867;WS=232098837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	232098859	rs4266866	C	G	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.493;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.564;SC=ATGTCCTAAGCATAAAGCCTA;SOR=0.231;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=31;WE=232098867;WS=232098837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	232144598	rs821616	A	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=-0.701;SC=GCTTATCCAGAGCCTACAGCT;SOR=0.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=27;WE=232144606;WS=232144588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr1	232144887	rs821617	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=396;ReadPosRankSum=-1.415;SC=AATATTGGGAAGGCTTCCCAT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=18;WE=232144895;WS=232144877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr1	232534776	rs586719	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCAAAAACATCTACGATTGGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=232534784;WS=232534772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	232535030	rs629939	C	T	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=74;PP=2965;SC=CTGGTCAGAGCAGAAATAAAC;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=154;WE=232535038;WS=232535020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	232551416	rs12569188	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=-1.508;SC=GTCACAGCACGGGCACCAGCC;SOR=0.547;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=26;WE=232551424;WS=232551406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr1	232568293	rs1547741	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=798;SC=ATTCAGAGCCACAAGGCTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=232568301;WS=232568283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	232596728	rs74807360	G	A	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1486;ReadPosRankSum=-2.551;SC=GGGTCAGAGTGGCCACGGCTA;SOR=0.824;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=93;WE=232596736;WS=232596718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,107:0.58:183
chr1	232650750	rs3795366	A	G	5878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=78;PP=2965;SC=TCTGCAGGACAGAAGTGATGC;SOR=0.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=106;TCR=78;TR=184;WE=232650758;WS=232650740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	232650867	rs4649383	C	T	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=64;PP=1932;ReadPosRankSum=0.300;SC=TCACACCCATCTTGGGCACAG;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=117;TCR=123;TR=125;WE=232650875;WS=232650857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,140:0.51:275
chr1	232941354	rs12567597	G	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1050;ReadPosRankSum=0.322;SC=CGCGCGGTCTGTGCCCCGCCG;SOR=0.822;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=60;WE=232941362;WS=232941344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr1	232941390	rs2814526	C	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=429;ReadPosRankSum=2.305;SC=TGGACTTCCCCACGCTGTTGG;SOR=0.498;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=32;WE=232941398;WS=232941380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr1	233113827	rs1045158	G	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=354;ReadPosRankSum=2.115;SC=CCTTCCAGGCGTTTCTTTTAG;SOR=0.831;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=26;WE=233113835;WS=233113817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr1	233121791	rs12038915	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.127;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=766;ReadPosRankSum=0.820;SC=CCAGGAGCCCGTGCCACCATC;SOR=1.465;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=42;WE=233121799;WS=233121781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,44:0.72:61
chr1	233122127	rs41309639	C	T	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=664;ReadPosRankSum=-0.003;SC=CAAGGAGAGCCGGCTGCCCGA;SOR=0.547;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=48;WE=233122135;WS=233122117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr1	233134086	rs56231757	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=511;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCTGCCACCACTCGGGGCATT;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=36;WE=233134094;WS=233134076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	233137225	rs140788891	CATAA	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=1;PP=47;SC=AACTCCATCTCATAAATAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=1;TCF=0;TCR=1;TR=1;WE=233137236;WS=233137215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	233150270	rs6424263	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTAGGCCCAATATAATTTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=233150278;WS=233150260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	233152910	rs11271054	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.605;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	233225957	rs3215688	CA	C	765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.689;NF=2;NR=25;PP=338;ReadPosRankSum=1.168;SC=TGAGTTAAGGCAAAAAAAAAA;SOR=0.244;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=27;WE=233225965;WS=233225946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr1	233296891	rs2296515	T	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=369;SC=TCCCTAAGCCTCTCAGCGGGC;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=233296899;WS=233296881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	233296908	rs2296516	T	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=8;PP=567;SC=GGGCATTTTGTTTTCTTTCTC;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=233296916;WS=233296898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	233335836	rs192010690	G	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=457;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CCTGCCTAAGGCTATTTAGTC;SOR=0.633;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=25;WE=233335844;WS=233335826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr1	233336044	rs12024129	T	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.127;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=634;ReadPosRankSum=1.657;SC=ACGATAAGCATGGGGAACTGT;SOR=0.327;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=46;WE=233336052;WS=233336034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr1	233353955	.	CAAAAAAAA	C	203	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=15;MQ=55.41;NF=0;NR=3;PP=203;QD=68.6666666667;SC=TACATAAAAGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=233353970;WS=233353945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	233362930	rs701176	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.560;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=1.244;SC=TCACGTCCCCGGTGTGCCTTC;SOR=0.261;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=30;WE=233362938;WS=233362920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr1	233395214	rs2139998	T	A	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=456;SC=GATACTTTTTTAATTTTACTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=233395222;WS=233395204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	233749855	rs2795294	A	G	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=171;SC=CGGGGCCAGAAGAGGCGGCGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=233749863;WS=233749847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	234040742	rs12136133	A	C	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=37;PP=2035;SC=CAGTCTTCCCAGGCTAGCGGC;SOR=1.482;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=110;WE=234040750;WS=234040732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	234041422	rs57010808	G	C	11024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=186;NR=158;PP=2965;SC=CCAGCGGGCCGGTGGGGCTCA;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=344;TCF=186;TCR=158;TR=344;WE=234041430;WS=234041412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr1	234367549	rs2236220	T	C	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=51;PP=1308;SC=GCGCTGACTCTGCAGAGCTGC;SOR=2.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=66;WE=234367557;WS=234367539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	234442376	rs674385	G	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=162;SC=TGGCCATGAGGCCTTAAAGGG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=234442384;WS=234442366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	234452542	rs41314292	G	A	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1225;ReadPosRankSum=0.228;SC=GCTTTAGATCGCTTGTCCTTT;SOR=0.607;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=68;TCR=101;TR=89;WE=234452550;WS=234452532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,106:0.52:203
chr1	234458668	rs35870005	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=0.730;SC=GCCAGACAGAGGAGGGTGCCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=234458676;WS=234458658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	234509259	rs10910420	G	C	6367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=95;PP=2965;SC=CGCCGCGTGAGTTGCTTTTTG;SOR=0.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=210;WE=234509267;WS=234509249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	234510262	rs4300255	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=736;SC=GCGCAGAGAAAACCTTGCCTG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=234510270;WS=234510252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	234519385	rs10797539	T	C	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.34;NF=7;NR=1;PP=158;SC=TTATGTTGAATAATATGTTAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=234519393;WS=234519375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	234519452	rs58896934	C	CT	410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=2;PP=206;SC=ATTTCAAATCCTTTTTTTTTC;SOR=3.126;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=10;WE=234519460;WS=234519442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	234527575	rs3862040	C	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=188;SC=TTTGTTTATTCACTTATTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=234527583;WS=234527565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	234528006	rs3754317	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=1;PP=795;SC=TGCTTGAGCCAATGAGGCAGA;SOR=5.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=234528014;WS=234528003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	234529552	rs2175594	C	T	6831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=62;PP=2702;SC=CGGTCCACTCCGCTTGGTTAT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=234529560;WS=234529542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	234529570	rs2175593	G	A	6611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=60;PP=2573;SC=TATCTGCTTCGACCAAATTAG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=234529578;WS=234529560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	234541622	rs2271444	G	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=554;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GAGAGTGAGGGCGATGAGGTT;SOR=0.394;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=33;WE=234541630;WS=234541612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr1	234546245	rs1141264	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=658;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CTGCTAAAAACGTACAAATGC;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=40;WE=234546253;WS=234546235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr1	234546354	rs41266235	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=1.443;SC=CCGTGCTGGACTCTATGAGGG;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=24;WE=234546362;WS=234546344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr1	234561590	rs4920240	T	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAACAGAAAATTAACATCAAA;SOR=1.371;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=234561598;WS=234561580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	234563060	rs443685	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=193;ReadPosRankSum=-0.118;SC=CTACCATACTTACTTTTCCAT;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=15;WE=234563068;WS=234563050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	234582457	rs270527	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.23;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	234582461	rs2203167	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	234582651	rs4920246	T	C	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=849;ReadPosRankSum=0.555;SC=GCATTGGTACTAAACTTCATA;SOR=0.464;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=51;WE=234582659;WS=234582641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,69:0.49:142
chr1	234584231	rs2102596	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=780;ReadPosRankSum=-0.178;SC=ATTACCTATACTGAGTCTTCA;SOR=0.696;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=51;WE=234584239;WS=234584221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,67:0.42:160
chr1	234584445	rs7527374	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GAAATACAACCGAGATGAACT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=234584453;WS=234584435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	234586253	.	G	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=399;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GAAGTCCAATGGAGCTACACG;SOR=0.902;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=26;WE=234586261;WS=234586243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr1	234593403	rs6693478	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=-0.975;SC=TAAATTATCTTTAATCTCACC;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=13;WE=234593411;WS=234593393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr1	234596202	rs270511	T	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-0.545;SC=AGAAGCTCAATACCATTAGGT;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=14;WE=234596210;WS=234596192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr1	234601586	rs270504	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=14;PP=465;SC=GATCTCTTACGCTGCAGGCTA;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=234601594;WS=234601576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	234603386	rs270502	G	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=725;SC=ATGGGTGAAAGAGCCAACATC;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=234603394;WS=234603376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	234608725	rs34245359	A	AT	49.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=2;PP=30;SC=TCAGAGGGAGATTTTTTTTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=234608733;WS=234608715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	234614921	rs517558	G	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=1;PP=21;SC=GTGCGCACAGGACCGGCCGGC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=234614929;WS=234614911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	234744480	rs11502	G	A	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=26;PP=1046;SC=CTTGGCTGCCGCCTCACGCTG;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=234744488;WS=234744470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	234745009	rs7545855	A	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.18;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	234953875	rs138215498	C	CA	70.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.11;QD=23.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	235275367	rs145333621	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-0.524;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	235285740	rs4659823	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=262;ReadPosRankSum=-1.626;SC=AAATGGGAATCAAAAGAATTC;SOR=0.813;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=19;WE=235285748;WS=235285730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr1	235340245	.	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=321;ReadPosRankSum=1.011;SC=TACATATTTTCTGCTTCTTAC;SOR=0.978;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=23;WE=235340253;WS=235340235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr1	235357303	rs34768226	A	ATG	999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=2003;ReadPosRankSum=1.660;SC=AAATACTTGCACAACAGAACG;SOR=0.232;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=21;WE=235357322;WS=235357293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	235357314	rs35180803	AT	A	1067.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=1987;ReadPosRankSum=1.494;SC=CAACAGAACGATTGTTATGTT;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=26;WE=235357322;WS=235357293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr1	235357543	rs10802438	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TAAGAAAAAAAGTATGTCGTA;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=235357551;WS=235357533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	235383188	rs4659654	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=2.435;SC=CATCTTTGTCATCCAGATTTT;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=21;WE=235383196;WS=235383178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr1	235392546	rs12731746	T	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=387;ReadPosRankSum=-1.948;SC=TTTCACTTACTTCTTCTTCAC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=27;WE=235392554;WS=235392536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr1	235394541	rs7518225	A	C	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.245;SC=AAGAAAAAAAACCCAAAATAT;SOR=1.112;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=235394549;WS=235394531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	235397937	rs35818300	GCA	G	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=0.842;SC=GGGTAAACAGGCACACACACA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=235397946;WS=235397927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	235505313	rs3841735	A	AT	867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=518;ReadPosRankSum=1.110;SC=GAAATTTTCAATTTTTTTATT;SOR=0.386;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=24;WE=235505321;WS=235505303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr1	235543476	.	TTGTGTGTGTGTGTG	T	1405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.68;QD=40.16;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	235564924	rs17543709	G	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=494;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TTATGAATCAGCACGGTCATT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=27;WE=235564932;WS=235564914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr1	235594182	rs2291687	A	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=563;SC=GGTTTAATAGAGAATTGTTAG;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=235594190;WS=235594172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	235594250	rs2291688	A	G	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=CTATTAATAGATAACAAGATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=235594258;WS=235594240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	235598973	rs2055127	C	T	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=19;PP=1453;SC=AGCCCTCCATCGCACCAAATG;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=235598981;WS=235598963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	235601958	rs3819974	G	T	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=606;SC=GTGAAAACTAGATCTTGTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=235601966;WS=235601948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	235715523	rs14326	A	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=784;ReadPosRankSum=-2.946;SC=GGAGGTCCGCAGCTGCCTGGG;SOR=1.421;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=42;WE=235715531;WS=235715513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr1	235715556	rs423026	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=412;ReadPosRankSum=1.336;SC=GCACAGAGCACAGGTGCTCAG;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=23;WE=235715564;WS=235715546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr1	235715601	rs400948	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=0.116;SC=TCCAGGGAAGAGGTGTCCACG;SOR=0.141;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=15;WE=235715609;WS=235715591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	235747005	rs2774335	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-0.503;SC=AGCTGAGCTTCGGGCGGAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=13;WE=235747013;WS=235746995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	235747154	rs2774336	A	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=759;ReadPosRankSum=0.156;SC=TGCCCCTAGAAGTAACCAAAG;SOR=0.484;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=48;WE=235747162;WS=235747144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr1	235878431	rs3831362	A	AGTT	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=2.380;SC=GTCAGTCCTAAGTTGTTGTTG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=235878439;WS=235878421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr1	235918688	.	C	CAAAAGAAAAG	1147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.88;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=2.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	235918870	rs61738992	T	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1066;ReadPosRankSum=0.281;SC=ACTGGTTGGCTAGCAAGGAAA;SOR=0.840;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=139;TCF=48;TCR=91;TR=60;WE=235918878;WS=235918860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,66:0.42:156
chr1	236141174	rs3213190	T	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=548;ReadPosRankSum=1.119;SC=TCTTCATTTCTGTTCGATACA;SOR=0.380;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=41;WE=236141182;WS=236141164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr1	236142253	rs12032474	T	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=687;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TGAGCCTCCATGTGCCCCCAG;SOR=1.559;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=38;WE=236142261;WS=236142243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr1	236142565	rs1536132	T	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.00;SOR=4.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	236142565	.	TCAAGC	CCAAGC,CCAAGG	422	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3,1;NR=41,16;PP=422,340;QD=10.3811639215;SC=CTGGGGTGGGTCAAGCCTGCA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44,17;WE=236142578;WS=236142555;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:44
chr1	236142570	rs3738524	C	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr1	236143302	rs3831989	C	CA	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.043;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.265;NF=4;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=-1.504;SC=CCCCTTTGTGCAAAAAAAACA;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=17;WE=236143310;WS=236143292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr1	236144754	rs3820558	C	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGGCATTGTACCGTGGATATC;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=236144762;WS=236144753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	236144951	rs3738525	A	G	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=825;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GGATTCACCAAGTCAGTCTCA;SOR=0.516;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=54;WE=236144959;WS=236144941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr1	236145145	rs715956	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=1.443;SC=GATGAGGTTTTTCTGAATACT;SOR=0.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=236145153;WS=236145135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	236154057	rs139359390	AGGACTACAT	A	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=2127;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ATGGTCACCCAGGACTACATG;SOR=0.960;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=6;WE=236154073;WS=236154047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	236154365	rs4660137	G	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AGACCTGCATGGCAGAGGGGG;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=16;WE=236154373;WS=236154355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	236157277	rs16833075	T	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.017;NF=11;NR=43;PP=981;ReadPosRankSum=-1.223;SC=CCACGAGGGCTGCCTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=23;TCR=88;TR=54;WE=236157285;WS=236157267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr1	236189314	.	G	C	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.992;SC=CTGGCCGGGAGTCATCGTGGA;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=66;WE=236189322;WS=236189304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,82:0.46:177
chr1	236205090	rs2385052	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	236205121	rs4297282	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CACCATGTAATGCTCACAACT;SOR=0.275;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=236205129;WS=236205111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	236208688	rs10733131	AT	GA	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=755;ReadPosRankSum=-1.423;SC=ATGATCTATAATACACATTAC;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=17;WE=236208697;WS=236208678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	236208773	rs10733133	C	T	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=29;PP=1375;ReadPosRankSum=0.349;SC=AAATTTTCAACTGATTCCCTG;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=184;TCF=119;TCR=65;TR=88;WE=236208781;WS=236208763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,99:0.46:215
chr1	236209024	rs3768088	C	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=666;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GGAAAAATATCGATAGATTTT;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=37;WE=236209032;WS=236209014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr1	236209081	rs3768089	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CAGTGCTATAGAGCGATGGCA;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=236209089;WS=236209071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	236228557	rs146690175	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.171;SC=AGCGGGCGCGCCGCGGGGCAG;SOR=0.655;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=10;WE=236228565;WS=236228547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	236305885	rs7522547	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.607;SC=CGCGATGCGCGGAGACCCCCG;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=8;WE=236305893;WS=236305875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	236381825	rs1055851	G	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=253;ReadPosRankSum=1.360;SC=ATTACCTACTGTGTTGTAATA;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=17;WE=236381833;WS=236381815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr1	236381897	rs1615601	T	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-1.262;SC=AAGAAAAAGCTTATTAGTAAG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=10;WE=236381905;WS=236381887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	236381917	rs1614938	T	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GGCTAACATGTTGCATACTGT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=236381925;WS=236381907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr1	236385165	rs2463189	G	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=276;ReadPosRankSum=-0.165;SC=AAAAAGCTTGGACTCAGTGGA;SOR=1.928;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=236385173;WS=236385155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	236385360	rs2477587	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=513;ReadPosRankSum=0.919;SC=AAAATTGAACCGCATTTGGCT;SOR=0.851;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=35;WE=236385368;WS=236385350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr1	236385379	rs2463188	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=0.522;SC=CTAAACGATAAGTAAGTTTTG;SOR=0.608;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=24;WE=236385387;WS=236385369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr1	236393654	rs2812471	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=545;SC=GCTCATGCCTATAATCCTAGC;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=236393662;WS=236393644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	236413147	rs1726639	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=214;ReadPosRankSum=1.666;SC=TTGATATCAATGAGAATATTT;SOR=1.578;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=16;WE=236413155;WS=236413137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	236413230	rs2477599	T	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=494;ReadPosRankSum=0.911;SC=TTGCTCACAATCTTCTAATTC;SOR=0.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=41;WE=236413238;WS=236413220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr1	236413282	rs2056713	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=369;ReadPosRankSum=-0.109;SC=AAAGAAGTTCGTAAGTTTAGT;SOR=1.093;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=24;WE=236413290;WS=236413272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr1	236413362	rs2477598	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.572;SC=CAATGATATACACTAAATATA;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=236413370;WS=236413352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	236413384	rs2477597	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=0.468;SC=ATACATTCCATTATAAAAATC;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=236413392;WS=236413374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	236415347	rs1749589	T	C	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=799;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AGGAGGGACTTACCTTATTAG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=53;WE=236415355;WS=236415337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr1	236415444	rs1618510	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=377;ReadPosRankSum=-1.905;SC=TATTTTTTTTGGAATTTCTTC;SOR=0.468;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=236415452;WS=236415434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	236416921	rs2812465	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=490;ReadPosRankSum=-0.256;SC=ACTTCCTATCCTCGTGGCACC;SOR=0.651;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=25;WE=236416929;WS=236416911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr1	236433135	rs3834089	AT	A	1108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=12;PP=942;SC=GTCACATATAATACCTTTGAT;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=20;WE=236433143;WS=236433125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	236444879	rs11281666	G	GGCCCGGCCCT	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=68.17;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	236444973	rs1269025	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=1.916;SC=CGCTATCACTCGGGCTTACCT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=27;WE=236444981;WS=236444963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr1	236557771	rs966365	G	A	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=44;PP=2645;SC=CTAAACAGATGGGGAGAGGCA;SOR=1.324;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=86;TCR=44;TR=130;WE=236557779;WS=236557761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	236557928	rs966364	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=999;SC=TTTTCGACCCGACTTTTATCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=236557936;WS=236557918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	236572389	rs659901	G	A	278.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=1.628;SC=AAAAAAAAAGGAGTAAGGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=236572397;WS=236572379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr1	236572475	rs669710	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=0.263;SC=TTTAAATTAAAGCAAACCCGC;SOR=0.399;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=30;WE=236572483;WS=236572465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr1	236577761	rs625444	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	236577762	rs625443	C	T	186.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=37.35;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	236590497	rs1759388	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=0.200;SC=TCTTGATAAGCAGCATTGTTT;SOR=0.292;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=11;WE=236590505;WS=236590487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	236590563	rs1778861	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GTAGTCCAGCCCTTCTGATTT;SOR=0.872;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=14;WE=236590571;WS=236590553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr1	236590629	rs636378	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr1	236590659	rs636048	G	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	236590816	.	T	G	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=32;QD=22.2570708491;SC=TTTTTTGAGATTTATAGAGTT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=236590824;WS=236590806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
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chr1	236722182	rs819432	A	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=717;SC=TATATTCAGAAAATAATATAC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=236722190;WS=236722172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	236729956	rs653737	T	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=734;ReadPosRankSum=-0.416;SC=CTTTTCGCCATAGGCAGCCGC;SOR=0.641;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=49;WE=236729964;WS=236729946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr1	236744720	rs11338847	TA	T	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=1.307;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	236748570	rs657629	T	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=44;PP=1010;ReadPosRankSum=0.076;SC=CATAAAACAATTTTTTCAACT;SOR=0.864;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=27;TCR=94;TR=55;WE=236748578;WS=236748560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr1	236763031	rs477226	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=343;ReadPosRankSum=0.196;SC=CAACCTAGAACGAGTAGCAGT;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=21;WE=236763039;WS=236763021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	236881403	rs2275399	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CCAAAGAAAACCTTTCCAAAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=236881411;WS=236881393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	236882110	rs1341865	G	A	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=19;PP=1156;SC=TTAAGGAAAAGATGGATGCTT;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=236882118;WS=236882100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	236882303	rs1341864	T	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=26;PP=706;SC=TGGTGTCCATTGGCGCTGAAG;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=236882311;WS=236882293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	236883240	rs1768053	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=171;SC=TTATGAATACTGTATTTATAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=236883248;WS=236883230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	236883421	rs1341863	C	T	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=45;PP=1709;SC=TTGATGGCAACGTGAAAATGA;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=97;WE=236883429;WS=236883411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	236883564	rs1341862	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=604;SC=TGAGCAAGATGTTTTAAAGTC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=236883572;WS=236883554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	236890781	rs1768056	A	G	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=170;SC=CAAGGAAGTCAAAAGGAGAGG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=236890789;WS=236890775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	236894647	rs819640	G	A	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=65;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.710;SC=TGAGTTACAGGAAATTTGAAG;SOR=0.592;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=61;TCR=115;TR=100;WE=236894655;WS=236894637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,120:0.58:206
chr1	236897633	rs707203	A	G	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=21;PP=2462;SC=ATGGGGGCGAAGGGGGAGGAT;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=80;TCR=21;TR=101;WE=236897641;WS=236897623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	236897926	rs75131881	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=246;ReadPosRankSum=-1.062;SC=TAAGGAGACTGTCTGGTTCCC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=236897934;WS=236897916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	236899899	rs11355106	TC	T	1035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.833;NF=0;NR=27;PP=819;ReadPosRankSum=0.089;SC=TGTGGAAGGATCCCCCTCCAG;SOR=0.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=27;WE=236899907;WS=236899889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr1	236900018	rs7542508	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.728;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	236900598	rs7521191	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	236902560	rs7527525	C	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.766;NF=46;NR=19;PP=1098;ReadPosRankSum=0.055;SC=GGGGAGGGGGCTTGCTGGTGT;SOR=0.674;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=65;WE=236902568;WS=236902550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,75:0.62:121
chr1	236902594	rs2288601	C	G	5548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=104;NR=76;PP=2965;SC=TTTGTGTTTGCGGAGCAGCTT;SOR=0.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=180;WE=236902602;WS=236902584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	236902865	rs2288602	A	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TCCTGGCGCCACGGGAAGCCC;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=71;WE=236902873;WS=236902855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr1	236902955	rs7544174	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.404;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=440;ReadPosRankSum=0.749;SC=GTGAATATCATTTTGGCCCTG;SOR=0.280;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=29;WE=236902963;WS=236902945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr1	236912723	rs112529745	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCTTAAAAATGTGTTTAGTAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=236912731;WS=236912713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	236914610	rs3738545	G	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=413;SC=CTTGACTTCTGTGTACCTAAA;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=236914618;WS=236914600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	236924506	rs2282366	A	G	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=70;PP=2332;SC=CTGCTTTAGCAGGAGTCCACT;SOR=1.092;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=115;WE=236924514;WS=236924496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	236925844	rs12063382	G	A	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=820;ReadPosRankSum=1.154;SC=CCGCCTACTCGGGCCCAGGCA;SOR=0.506;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=51;WE=236925852;WS=236925834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr1	236972186	rs12759827	A	G	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=50;PP=1463;SC=TACGAGTAACACTGCAGAGAC;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=236972194;WS=236972176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	237038161	rs1770449	T	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=42;PP=1163;SC=GTTATACTAATGAGCTTTGTC;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=237038169;WS=237038151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	237433625	rs2275287	C	T	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=81;PP=2706;SC=ATAAAAAGTACGTGAGGGATT;SOR=1.422;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=123;WE=237433633;WS=237433615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	237519389	rs149837870	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-1.053;SC=TGTACTATTAGTGTTCAAACT;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=16;WE=237519397;WS=237519379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr1	237551241	rs71561868	G	GTC	315.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=321;SC=AGCAGGCACTGTCTATCTCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=237551249;WS=237551231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	237551376	rs10754602	T	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=1096;SC=AATGATTTTTTATCCTTACAG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=237551384;WS=237551366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	237580606	rs6673182	G	T	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.14;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	237580612	rs6673187	G	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	237617757	rs3765097	C	T	4173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=63;PP=2872;SC=AGTCCGTAAGCCTAAGTCTGC;SOR=0.898;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=136;WE=237617765;WS=237617747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	237619875	rs5781961	A	AT	704.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.90;MQRankSum=1.231;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,34:0.87:39
chr1	237620049	rs2045955	T	C	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=53;PP=1937;SC=AGAAGCATGATTGGGTTCATA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=237620057;WS=237620039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	237632285	rs35662567	A	AT	1241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=1388;SC=TAGATGTAACAGAGGATATTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=237632293;WS=237632275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	237632595	rs71561877	T	TGTG	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=298;SC=TTGAGTGAGGTGTGGTGGTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=237632603;WS=237632585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	237670140	rs2618702	A	G	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=797;ReadPosRankSum=1.652;SC=ATTTATTTTCAGATTCTGTGA;SOR=0.416;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=55;WE=237670148;WS=237670130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr1	237675163	rs67622164	G	A	207.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6705;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.431;NF=0;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AAAAAAACAGGTATTGATGCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=237675171;WS=237675153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	237693610	.	C	CA	137	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5008;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=54.97;NF=9;NR=5;PP=137;QD=10.0;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=14;WE=237693618;WS=237693600;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,14:0.29:49
chr1	237693921	rs2779365	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TTTAAAATTCAGATTCAAGGC;SOR=0.657;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=9;WE=237693929;WS=237693911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	237711644	rs2618661	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=655;SC=GGAAGAACAGTAATGAGGTAG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=237711652;WS=237711634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	237711797	rs2253273	A	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=43;PP=1769;SC=TCACCCCATCACAAGAAGCAA;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=237711805;WS=237711787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	237730124	rs2805390	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=772;SC=CTGGAGGCTCATCTCCTCTGC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=237730132;WS=237730114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	237730169	rs2779401	C	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=312;SC=ACCAGTGTTTCCCACAGCACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=237730177;WS=237730159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	237732395	rs2805396	G	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=285;SC=GGGTGGGTGCGATTTTCCTGG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=237732403;WS=237732388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	237753074	rs11331089	AT	A	1275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=559;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CTAAAACTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.504;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=44;WE=237753082;WS=237753064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr1	237754340	rs1332777	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=340;ReadPosRankSum=-2.073;SC=TATGTGAGGAAGGTTACAGTC;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=20;WE=237754348;WS=237754330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	237755188	rs2618713	C	T	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TTATTTCTATCTGTCACTCAT;SOR=0.837;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=132;TCF=44;TCR=88;TR=64;WE=237755196;WS=237755178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr1	237755203	rs2779430	T	C	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=790;ReadPosRankSum=-1.058;SC=ACTCATTATGTTTTACATCTC;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=110;TCF=32;TCR=78;TR=47;WE=237755211;WS=237755193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr1	237757027	rs1478915	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=1.606;SC=TGTGACCAAGGTATTTCTATT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=237757035;WS=237757017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	237765200	rs2805418	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	237765470	rs791541	A	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-1.420;SC=TATAGCATTGATTTATTCTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=237765478;WS=237765460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	237794603	rs1759123	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.670;SC=GTGGCTTATTAAATACTGTGA;SOR=0.340;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=237794611;WS=237794593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
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chr1	237801770	rs707189	T	C	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=54;PP=2159;SC=TTGACTTTCTTAGATTTGCTG;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=237801781;WS=237801760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	237802559	rs530109	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.79;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	237813126	rs625006	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=1.691;SC=CCCTTTGAAGATTATCTACTG;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=237813134;WS=237813116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	237814783	rs684923	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=324;ReadPosRankSum=0.114;SC=TAAATGAACACGCAAAGATGC;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=20;WE=237814791;WS=237814773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	237814898	rs2184014	C	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCATGCTTGACGCTGGGAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=237814906;WS=237814888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	237817514	rs3831940	GA	G	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.803;NF=10;NR=5;PP=218;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GAGGAGAAATGAAAAAAAAAT;SOR=0.264;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=15;WE=237817522;WS=237817504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr1	237823256	rs10925485	A	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=311;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CACGTGTAAAACAATTTTTAA;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=23;WE=237823264;WS=237823246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr1	237824332	rs471647	G	A	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=137;SC=TTTTTCTAAAGAATAATCTGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=237824340;WS=237824322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	237831103	rs477245	C	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=528;SC=TATTCCTTTACGGTATCTAAT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=237831111;WS=237831093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	237841390	rs34967813	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=274;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CCTTATGAACAAGAAATCAAG;SOR=0.971;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=17;WE=237841398;WS=237841380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	237862164	rs1521745	G	C	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=10;PP=618;SC=AAATATTACTGTTGTGTCATT;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=237862172;WS=237862154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	237862436	rs1521744	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=56;SC=GGATTTGTAATAAAGTCTTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=237862444;WS=237862426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	237863439	rs12754190	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=11;PP=1039;SC=TAGAGTAATGGAGAAATAAAC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=237863447;WS=237863429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	237863718	rs2797436	T	G	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=43;PP=1303;SC=CAATGCTGTCTTCATTATTTG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=237863726;WS=237863708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	237865203	rs939699	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=575;SC=CTGAATAGTACATAGCTTAAG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=237865211;WS=237865193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	237872714	rs35261418	GT	G	1092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	237881770	rs2797441	C	T	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=19;PP=879;SC=AGAAAGATACCGAGGATGAAG;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=237881778;WS=237881760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	237890437	rs2685301	C	T	6454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=97;PP=2965;SC=AACTACTGTCCAAGCAGAGGA;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=193;WE=237890445;WS=237890427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	237893674	rs2797445	C	T	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=65;PP=2575;SC=TTTAGTGGGGCTCTAAGATGA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=130;WE=237893682;WS=237893664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	237923053	rs2253831	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=862;ReadPosRankSum=0.599;SC=TCAGTGGCCACGTGGTTTCTA;SOR=0.615;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=61;WE=237923061;WS=237923043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr1	237951451	rs2256242	A	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=44;PP=928;ReadPosRankSum=1.662;SC=ATGTTTTAGAATGAATATTGT;SOR=1.523;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=51;WE=237951459;WS=237951441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr1	237951482	rs16835818	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=528;ReadPosRankSum=0.450;SC=GTGCAATACCGTAATAATTTA;SOR=1.770;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=28;WE=237951490;WS=237951472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr1	237955649	rs68129840	CTGTG	C	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.256;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	237955678	rs144369382	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.71;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	237955680	rs146659498	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	237957146	rs790902	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=0.346;SC=TAATTTTAACGTATTTATTTT;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=25;WE=237957154;WS=237957136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr1	237957161	rs790901	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=501;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TATTTTTCCTATGTAGGTCCC;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=32;WE=237957169;WS=237957151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr1	237957309	rs790900	A	C	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.883;SC=TGAGTAAATAATTATATGAGA;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=78;WE=237957317;WS=237957299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr1	237958750	.	A	AT	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5004;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=28;QD=11.3333333333;SC=TAATGTCTCCATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=237958758;WS=237958740;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	237965035	rs2790346	C	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr1	237965043	rs2790347	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr1	237965094	rs2794820	G	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=0.191;SC=TCAGGCTCTCGCAAGCCTATG;SOR=0.539;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=11;WE=237965102;WS=237965084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr1	237969638	rs790879	A	G	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=491;ReadPosRankSum=0.966;SC=AACAAATAAAACAAAGAAAAA;SOR=0.489;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=28;WE=237969646;WS=237969628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr1	237991862	rs140195803	TG	T	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=314;ReadPosRankSum=0.423;SC=GCACAACTTGTGGTTTCACTG;SOR=0.299;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=11;WE=237991870;WS=237991852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	238045590	rs2794813	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GTATCAGTTTCTATTCTATTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=238045598;WS=238045580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	238046253	rs2794814	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CTTGGTTCTATGCCTTACAAA;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=238046261;WS=238046243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	238048325	rs2298100	A	G	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=5;PP=153;SC=TCATGTAATTAGTAACAAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=238048333;WS=238048315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	238050334	.	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-1.406;SC=AGTTATCACTTCGCCTTATCT;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=238050342;WS=238050324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	238051933	rs2236595	C	T	357.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=211;ReadPosRankSum=0.415;SC=TAGGTGTCTACTCCATATTGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=238051941;WS=238051923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	238053974	.	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AGACTCTCCGCCTCCTCTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=238053982;WS=238053964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	240255203	rs12727981	G	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=268;ReadPosRankSum=0.083;SC=CCGCAGCGACGGCAGCCACGG;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=18;WE=240255211;WS=240255193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	240255568	rs140531536	GGGC	G	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr1	240256822	rs10926124	C	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=831;ReadPosRankSum=2.946;SC=AGCACCGGGCCGACGGCGGCC;SOR=0.673;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=44;WE=240256830;WS=240256812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr1	240286453	rs3738434	T	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=484;ReadPosRankSum=-1.702;SC=CAGTGCTCGCTCTTAATGACT;SOR=1.402;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=23;WE=240286461;WS=240286443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr1	240286774	rs112160077	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	240370629	rs10926166	C	G	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1624;ReadPosRankSum=0.345;SC=AGTTTCAAACCAGCCACGAAC;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=277;TCF=133;TCR=144;TR=113;WE=240370637;WS=240370619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,136:0.41:332
chr1	240421383	rs10926181	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=0.807;SC=TTTGGGCTGAGGGATATGATG;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=10;WE=240421391;WS=240421373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	240421437	rs10926182	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	240492543	rs6686353	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=852;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ATGCAAATGCGGTGTCTTCAG;SOR=0.936;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=42;WE=240492551;WS=240492533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr1	240492734	rs3795677	G	A	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.685;SC=TGCTCAATTCGTCGCAAACTG;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=90;TCR=107;TR=100;WE=240492742;WS=240492724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,120:0.51:234
chr1	240497265	rs10157874	A	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=511;ReadPosRankSum=-0.313;SC=ATTTTTACATATAGTCATATT;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=32;WE=240497273;WS=240497255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	240497598	rs12122068	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=179;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GACTTTTCAATGTTTTTAGAG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=240497606;WS=240497588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	240601269	rs2356386	A	G	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=7;PP=1100;SC=ATAATTGTGCATGAATAAAAT;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=51;WE=240601277;WS=240601259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	240635491	rs2210861	G	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=108;SC=ATAAATTAGCGTCTGTAGCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=240635499;WS=240635483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	240655330	rs9287248	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=2;PP=309;SC=TTCTGAGTAAGACACCTTCTG;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=240655338;WS=240655320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	240656797	rs11806449	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.177;NF=19;NR=24;PP=656;ReadPosRankSum=0.299;SC=GAAAAGAGAGGGGCTGGCTGT;SOR=0.449;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=43;WE=240656805;WS=240656787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,54:0.60:90
chr1	240656824	rs10926280	C	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.313;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.148;NF=9;NR=11;PP=268;ReadPosRankSum=3.787;SC=CCGTAGAGTACGGGATCAATC;SOR=0.417;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=20;WE=240656832;WS=240656814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr1	240656841	rs45519645	A	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.827;NF=5;NR=10;PP=515;ReadPosRankSum=-2.048;SC=AATCTTACTTATTTTTTTTTT;SOR=0.486;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=15;WE=240656860;WS=240656831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	240656852	.	T	TA	541	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=25;MMLQ=19;MQ=59.78;NF=2;NR=6;PP=541;QD=68.75;SC=TTTTTTTTTTTATTTTAGACA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8;WE=240656860;WS=240656831;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	240656854	rs76554946	T	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=2.499;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=1.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr1	240975213	rs2275742	T	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=24;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AGCAATGTGTTTTACCTTAAA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=99;TCR=45;TR=79;WE=240975221;WS=240975203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,81:0.54:150
chr1	240975435	rs2275744	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=600;ReadPosRankSum=-0.804;SC=ATGTGTGCCTCGAAGTTCCCA;SOR=0.855;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=8;TCR=65;TR=33;WE=240975443;WS=240975425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr1	240977964	rs12744536	G	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=0.262;SC=TTAAACACATGTAATTGTCAT;SOR=0.148;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=4;WE=240977972;WS=240977954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	240978276	rs199649548	AT	A	238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=0;NR=6;PP=220;SC=CACAATTGATATCACTTTAGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=240978284;WS=240978266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	240979803	rs3738068	G	A	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=245;SC=CATAAATTCAGTAAGGTCTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=240979811;WS=240979793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	241519098	rs4659599	T	A	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=45;PP=1615;SC=CTTGGTCCACTCTCAAGATAC;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=241519106;WS=241519088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	241667244	rs4659607	G	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=700;ReadPosRankSum=1.564;SC=GCATCCAGCTGCGGGATAACT;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=42;WE=241667252;WS=241667234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr1	241712134	rs11556464	C	T	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1209;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TCTAGGTTGGCTCATTACAAG;SOR=0.570;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=164;TCF=101;TCR=63;TR=86;WE=241712142;WS=241712124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr1	241728198	rs12139441	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=349;ReadPosRankSum=0.137;SC=ACTGGTTTTAATTACTGTGGA;SOR=0.407;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=22;WE=241728206;WS=241728188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr1	241729687	rs140702304	AAGCTCCCTGGTCAC	A	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.173;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.398;NF=11;NR=2;PP=2963;ReadPosRankSum=0.285;SC=TTCCTTCCAAAAGCTCCCTGG;SOR=1.670;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=13;WE=241729708;WS=241729677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr1	241755348	rs1053230	C	T	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1063;ReadPosRankSum=0.223;SC=ATCTTTCCTCCGCTTGAGAAG;SOR=0.479;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=64;WE=241755356;WS=241755338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr1	241755567	rs1053221	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=1.007;SC=GTGTTCTGCTTATAATTAAAC;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=16;WE=241755575;WS=241755557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	241761349	rs45572340	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=432;ReadPosRankSum=-0.133;SC=AAAGAAGGGTTTCTTTTGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=21;WE=241761357;WS=241761339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	241767930	rs632966	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=503;SC=GGGGGAAACCGGGCATAAGAG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=241767938;WS=241767920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	241798631	rs3737604	C	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=870;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TATTAAAATACGATAACTGGC;SOR=0.569;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=55;WE=241798639;WS=241798621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr1	241838057	rs67170285	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr1	241838065	rs66585415	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr1	241847018	rs10802979	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.390;SC=GAGTATCATACAGTTAATTTA;SOR=1.385;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=7;WE=241847026;WS=241847008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	241886754	rs10926548	T	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.84;ReadPosRankSum=-0.255;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr1	241886764	rs10926549	A	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.37;ReadPosRankSum=-2.233;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr1	241907691	rs7418599	A	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=512;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GTTCTTTCCCATAGGTATGGG;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=37;WE=241907699;WS=241907681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
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chr1	241958738	rs78461872	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=2.116;SC=TGCAGTCCCAGAAAAGTCTTG;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=6;WE=241958746;WS=241958728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	241964559	rs4658661	C	G,T	4637.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=34,32;NR=39,43;PP=1161,1151;SC=AAAATGGCAACGTTTGGATGA;SOR=0.924;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=73,75;WE=241964567;WS=241964549;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.54:190
chr1	242015820	rs2526704	A	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=203;SC=AGTGGCTTGCACCTGTTGTCC;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=242015828;WS=242015810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	242020495	rs2995544	C	T	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=691;SC=CTAAAACTTACAGTAGAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=242020503;WS=242020485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	242020804	rs4149896	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=1.079;SC=TCTGACTACTATATATTACTT;SOR=0.361;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=21;WE=242020812;WS=242020794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr1	242024923	rs4149919	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=777;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GGCTCTGTGCAGAATGTACAT;SOR=0.245;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=48;WE=242024931;WS=242024913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr1	242030151	rs735943	A	G	4833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=65;PP=2926;SC=TCAAGAAGTCATAGTTGGGAT;SOR=1.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=163;WE=242030159;WS=242030141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	242035382	rs4149963	C	T	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=32;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.424;SC=CTTTCATTTACGAAGAAGACC;SOR=1.239;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=93;WE=242035390;WS=242035372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,104:0.59:177
chr1	242035438	rs4149965	G	A	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CTTTTCTGAAGTGTTTGTGCC;SOR=0.534;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=247;TCF=136;TCR=111;TR=118;WE=242035446;WS=242035428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,134:0.48:277
chr1	242042545	rs1776148	A	G	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=41;PP=1639;SC=TTACGAGAAGAGGCATGTTCT;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=242042553;WS=242042535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	242042690	rs1418760	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=886;SC=TATATGTAAGAAAAAATAGAT;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=242042698;WS=242042680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	242045275	rs1635498	C	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=42;PP=1438;SC=CTCCAAGCTACGTTTATCTCA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=242045283;WS=242045265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	242053042	rs851797	A	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=32;PP=898;SC=TTTGTATATTAACTTTATAAT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=242053050;WS=242053032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	242253024	rs7523793	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TATTATGTGTTGTTCAGAGAA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=242253032;WS=242253014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	242264102	rs12124966	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=-0.500;SC=AAAAAAAAAAAGGGGGCAGGT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=13;WE=242264110;WS=242264092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	242511556	rs112478548	AACAAAG	A	2248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=2046;SC=TGAAAGAGGAAACAAAGACAA;SOR=2.049;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=36;WE=242511569;WS=242511546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	242612420	rs2654871	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AGAGCCCAGCGAAGTCCTTAT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=242612428;WS=242612418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	243328887	rs199575184	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=37.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.88;MQRankSum=-9.833;QD=1.85;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=5.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,26:0.15:174
chr1	243329049	rs3766664	G	A	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.998;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.634;NF=44;NR=69;PP=1514;ReadPosRankSum=1.994;SC=TACCAAAGAAGTTTCCTTATC;SOR=1.126;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=324;TCF=150;TCR=174;TR=113;WE=243329057;WS=243329039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,125:0.33:375
chr1	243329075	rs61833876	T	C	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.283;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.474;NF=26;NR=58;PP=1202;ReadPosRankSum=1.291;SC=CACTTTTCTCTTTTCCAGGAG;SOR=1.417;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=287;TCF=123;TCR=164;TR=84;WE=243329083;WS=243329065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,86:0.28:312
chr1	243332884	rs140816120	AAG	A	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.97;MQRankSum=1.434;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.547;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	243335940	rs74889777	GA	G	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.389;NF=5;NR=2;PP=77;ReadPosRankSum=2.161;SC=TCTCAGACAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=7;WE=243335948;WS=243335930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	243362331	rs2789172	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.60;QD=30.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	243388370	rs10926973	A	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=311;ReadPosRankSum=0.316;SC=AGCTAAAAGGAGAGAAAGTTC;SOR=1.931;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=17;WE=243388378;WS=243388360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	243419429	rs3904682	T	A	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1360;ReadPosRankSum=1.385;SC=GGGAGAAAGCTGGACATTTCC;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=83;WE=243419437;WS=243419419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,91:0.55:164
chr1	243481431	rs2783972	A	G	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=75;PP=2467;SC=GACAGATTGTATAAAGAAAAT;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=43;TCR=75;TR=118;WE=243481439;WS=243481421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	243493484	rs2636324	C	T	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=160;SC=TGGATACTTACGTATTTCGTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=243493492;WS=243493474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	243579112	rs10927011	G	A	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=642;SC=AGCAAATGGAGGCCCAGCATG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=243579120;WS=243579102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	244528127	rs9782996	T	C	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=43;PP=1322;SC=GGAGTTAGAATTGCACATCCT;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=244528135;WS=244528117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	244528167	rs141949962	G	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=283;ReadPosRankSum=-1.122;SC=ACTACTGCCAGGGAGTTCTAG;SOR=0.379;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=244528175;WS=244528157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	244601152	rs3127465	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=835;SC=AATTAATGACCTCCTGCCAAA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=244601160;WS=244601142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	244624635	rs3006006	G	C	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=520;SC=CCGGGACCCAGGCGCCTGCAG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=244624643;WS=244624625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	244624887	rs3124058	T	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=856;SC=CCCATGCGCCTCGGGACCGCT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=244624895;WS=244624877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	244715966	rs35587664	G	A	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=76;PP=1824;ReadPosRankSum=1.474;SC=TGATCTTATCGCGGGATGGAA;SOR=0.780;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=228;TCF=80;TCR=148;TR=113;WE=244715974;WS=244715956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,142:0.53:269
chr1	244773784	rs6698173	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=480;SC=ATTTTTAAAATGCTTCATCTT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=244773792;WS=244773774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	244773803	rs6698180	T	C	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=310;SC=TTAATTTCTGTGTGATCTTTT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=244773811;WS=244773793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	244803205	rs60280231	CTT	C	329.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.55;ReadPosRankSum=0.156;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,11:0.79:14
chr1	244817239	rs41269389	G	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.612;SC=ATATGAATGAGGCTAACATTT;SOR=0.903;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=63;WE=244817247;WS=244817229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,66:0.42:157
chr1	245005373	rs10927335	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.119;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=273;ReadPosRankSum=0.894;SC=GAGTATCTGTATTTTTTATTT;SOR=1.188;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=19;WE=245005381;WS=245005363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	245005492	rs150123625	T	TG	701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=614;ReadPosRankSum=2.305;SC=TGCTTATTTTTACAGGTAGAA;SOR=0.955;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=16;WE=245005500;WS=245005482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	245005713	rs12095737	A	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GAAATCTTAAAATGCTTGAAC;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=245005721;WS=245005703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	245018456	rs113724064	TAGCA	T	775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=590;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TAATCTTAGGTAGCAAGCAAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=14;WE=245018467;WS=245018446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	245021132	rs9730334	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=160;ReadPosRankSum=-1.004;SC=CTTACACTAACGGACAAAAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=245021140;WS=245021122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	245021291	rs11299108	TA	T	504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=10.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=2.081;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.721;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	245027349	rs6675421	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.238;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,73:0.42:174
chr1	245133489	rs7545078	T	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GGGGGCCGGGTGGCAGACGGG;SOR=0.957;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=21;WE=245133497;WS=245133479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr1	245133539	rs7542813	A	G	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=23;PP=1088;SC=GTGGCGCGAAACGGGGACAGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=245133558;WS=245133529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	245133549	rs10536649	GGC	G	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=480;ReadPosRankSum=0.657;SC=ACGGGGACAGGGCGCGCGCTC;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=13;WE=245133558;WS=245133529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr1	245133623	rs145835471	T	TCCTCC	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.521;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,15:0.23:66
chr1	245133662	rs61844237	G	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=-2.198;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr1	245179171	rs1196365	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=759;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CCAAAGTGATCAGCAGACCGC;SOR=0.975;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=41;WE=245179179;WS=245179161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr1	245179188	rs1196366	G	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=548;ReadPosRankSum=2.189;SC=CCGCATCACTGTGCTGCCTGG;SOR=0.956;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=29;WE=245179196;WS=245179178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr1	245222634	rs694793	C	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=3;PP=756;SC=TTGGAGAAACCTGGCCTTTTC;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=245222642;WS=245222624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	245222839	rs579269	G	T	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=49;PP=1384;SC=AATCCTTACCGGAAACTAAAA;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=245222847;WS=245222829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	245318688	rs12409851	C	T	6064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=81;PP=2965;SC=GATGTAGCGTCGGTGGAACCT;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=190;WE=245318696;WS=245318678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	245703819	rs7551348	T	C	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=953;SC=ACATCATTCTTTGTAAATCGT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=245703827;WS=245703809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	245703990	rs9919234	G	T	5618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=66;PP=2965;SC=ACGAGGGGTTGTTTAAGAGAA;SOR=1.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=106;TCR=66;TR=172;WE=245703998;WS=245703980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	245765800	rs7541927	T	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=12;PP=728;SC=TGCATGTATATCGCAGAGTAT;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=245765808;WS=245765790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	245849342	rs116705728	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=577;ReadPosRankSum=0.030;SC=GCCCCAGCCCGGCCTCACCCA;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=31;WE=245849350;WS=245849332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr1	245850095	rs871840	C	T	4615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.355;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=1.573;SC=AGGCCCAGGACGCAGGGAGCA;SOR=0.486;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=351;TCF=142;TCR=209;TR=189;WE=245850103;WS=245850085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,204:0.54:375
chr1	245850166	rs201987019	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=51;PP=1168;ReadPosRankSum=-1.667;SC=GGTGAGCAGTCGTGCCACAGT;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=63;TCR=128;TR=75;WE=245850174;WS=245850156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,82:0.41:200
chr1	245851304	rs6701084	A	G	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=86;PP=2952;SC=GCAGGGCGACAGTCAGCCACT;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=60;TCR=86;TR=146;WE=245851312;WS=245851294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	245861571	rs3205034	C	T	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=68;PP=2028;SC=AAATCGATGACGTGGAGCGCC;SOR=1.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=95;WE=245861579;WS=245861561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	245912840	rs8025	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=624;ReadPosRankSum=0.833;SC=AGACACACGCCGTATTTCCCT;SOR=0.576;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=46;WE=245912848;WS=245912817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr1	246021851	rs34527613	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=390;ReadPosRankSum=1.361;SC=CCAACAGGCCGAGGTTGATGC;SOR=1.298;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=27;WE=246021859;WS=246021841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	246021941	rs2362587	T	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=594;ReadPosRankSum=-1.823;SC=TGCTTATGATTGCCTGGCACA;SOR=0.737;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=52;WE=246021949;WS=246021931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr1	246022071	rs2185370	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=2.648;SC=AGCACAGGAGCGAGGGAAGCA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=7;WE=246022079;WS=246022061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	246027024	rs12123124	A	G	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr1	246027029	rs61830203	A	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr1	246027034	rs2153404	G	C	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=25;PP=1257;SC=ACCTCATTACGACAGGGCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=78;WE=246027042;WS=246027014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	246091457	rs6669768	T	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=49;PP=1303;SC=GTTGACAGGATGCCAGGGGTT;SOR=1.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=68;WE=246091465;WS=246091447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	246091515	rs2275318	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=661;SC=ACACCTCCCACGAAGTGCAAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=246091523;WS=246091505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	246091531	rs6669866	T	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=479;SC=GCAATTCTCCTCAAGATGCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=246091539;WS=246091521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	246093465	rs11295264	GA	G	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.844;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.466;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr1	246110573	rs10802300	A	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=26;PP=1186;ReadPosRankSum=-1.229;SC=AAGAGCAAGTAGCTAAAGGAA;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=114;TCR=57;TR=77;WE=246110581;WS=246110563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,87:0.44:200
chr1	246110895	rs10924400	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=128;ReadPosRankSum=0.825;SC=TAAATTACCAGAATTTACCAG;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=246110903;WS=246110885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	246670230	.	ACCG	A	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.98;MQRankSum=0.473;NF=4;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=0.369;SC=CAGGGGCAGCACCGCCAAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=246670240;WS=246670222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	246670281	rs6671418	G	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=3;PP=468;SC=GCGGCTGCCGGCCGCCCGACG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=246670289;WS=246670271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	246670299	rs10603677	CT	C	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=-1.386;QD=5.60;ReadPosRankSum=-2.328;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	246670333	rs6426303	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=18;PP=1500;SC=CGACTCAGGTAGGCGAGGGCG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=246670341;WS=246670323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	246670481	rs7520453	C	G	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1220;ReadPosRankSum=0.882;SC=CGTTTCCCCTCTTGGCGGTTG;SOR=0.600;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=167;TCF=65;TCR=102;TR=80;WE=246670489;WS=246670471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,98:0.49:202
chr1	246704563	rs764243	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.538;SC=TATCAGTTCACGGTGACAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=246704571;WS=246704553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	246707858	rs3129568	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=-2.400;SC=TGCGCCTCCCAAAACAGTGCT;SOR=0.793;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=10;WE=246707866;WS=246707848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr1	246711789	rs3124131	T	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=9;PP=715;SC=CCTAAAAAAATAAAATAAAAA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=246711797;WS=246711779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	246712033	rs1890160	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=319;SC=TTGGATTTAAAAGAAACATGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=246712041;WS=246712023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	246714728	rs9426201	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.328;SC=ACTAGAATTAGATGCAAAAAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=246714736;WS=246714718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	246720174	rs3120710	A	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=3;PP=141;SC=CCTTGGCATGAAACTTGGCTT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=246720182;WS=246720164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	246720798	rs3124071	G	A	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=36;NR=56;PP=1964;SC=AGTCACAGTGGATCACTCGTA;SOR=1.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=92;WE=246720806;WS=246720788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	246727558	rs3120713	G	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=464;SC=GATATTCTATGTAAAACACTG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=246727566;WS=246727548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	246754778	rs35302997	G	GA	157.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=130;SC=GCAAAGGTTAGAAAATGAAGT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=246754786;WS=246754773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	246755124	rs6702823	T	C	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=53;PP=2328;SC=GGTGAGAACTTGCAAAACACC;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=116;WE=246755132;WS=246755114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	246797710	rs35650980	G	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=506;SC=TTAACTGTTTGTTTGTTTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=246797722;WS=246797700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	246797714	rs11396823	G	GT	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=555;SC=CTGTTTGTTTGTTTTTTTGCT;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=18;WE=246797722;WS=246797700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	246797974	rs6680646	T	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=598;SC=TTCTTTGTTTTATGTTTTCAA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=246797982;WS=246797964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	246804824	rs12401692	T	C	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=101;SC=GTTGCTTCTTTGGGGGTTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=246804832;WS=246804814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	246805435	rs12748305	G	T	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	246829278	.	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GTTTTTCTTTCAGGAATTCTG;SOR=0.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=246829286;WS=246829268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	246899123	rs61852479	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=0.908;SC=TGTGAGCCACTGTGCCTGGCC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=246899131;WS=246899113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	246922390	rs1127098	A	G	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=53;PP=1216;ReadPosRankSum=0.243;SC=CTTTTATGGGATCTGATGTGT;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=199;TCF=91;TCR=108;TR=93;WE=246922398;WS=246922380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,112:0.46:246
chr1	246929483	rs12144408	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=534;ReadPosRankSum=0.452;SC=TTTTTTATCTATGTTATATTT;SOR=0.493;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=34;WE=246929491;WS=246929473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr1	246939513	rs3795467	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=726;ReadPosRankSum=-2.430;SC=TGGCAGTTGCGCAGTCATCCC;SOR=0.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=43;WE=246939521;WS=246939503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr1	246939610	rs3838991	A	ATATT	2564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=1462;ReadPosRankSum=1.514;SC=GGGCATCTCTATATTTATTTT;SOR=0.526;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=33;WE=246939618;WS=246939600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,67:0.42:159
chr1	246939746	rs3795466	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=750;ReadPosRankSum=0.155;SC=TACGAATTAACTCATTTAAAA;SOR=0.900;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=39;WE=246939754;WS=246939736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr1	246939856	rs3795465	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=-0.317;SC=ACCAGAAGCAGTTTTCGCAAG;SOR=0.883;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=47;WE=246939864;WS=246939846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr1	246939943	rs6685364	T	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=561;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CTGCTCTAGCTTGAGCAGCTT;SOR=1.128;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=34;WE=246939951;WS=246939933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr1	246940179	rs3795464	G	A	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr1	246940182	rs3795463	C	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=5.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr1	246940442	rs3795462	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CCCTGCTGGATGAGAACCCAG;SOR=2.275;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=13;WE=246940450;WS=246940432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	246940790	rs66929931	TAAAGA	T	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=405;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GACACATTTGTAAAGAAAAGG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=246940802;WS=246940780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	246942159	rs7512440	G	A	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.838;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TCCAGTTGACGCCAAGGCACC;SOR=0.998;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=65;WE=246942167;WS=246942149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr1	247006160	rs5021094	G	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=100;ReadPosRankSum=0.253;SC=AGGAATACTAGAGCCAAACAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=247006168;WS=247006150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	247025531	rs55727006	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GCCTGTAATCCCTGCACTTTG;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=15;WE=247025539;WS=247025521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	247031237	rs2800222	C	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CGTGGTAATACTAGCTAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=247031245;WS=247031227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	247109014	rs2642982	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=0.903;SC=TCGGGCTGACGCAGCTGGACC;SOR=2.812;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=247109022;WS=247109004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	247109168	rs6426191	G	A	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1461;ReadPosRankSum=0.051;SC=TTAAGGTTCCGAGTAGCTCCT;SOR=0.511;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=163;TCF=100;TCR=63;TR=92;WE=247109176;WS=247109158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr1	247109267	rs2642983	A	C	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1051;ReadPosRankSum=0.790;SC=TGCCATTTCAAATTCACGCAG;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=46;TCR=74;TR=57;WE=247109275;WS=247109257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,70:0.50:139
chr1	247129945	rs1779985	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.798;SC=CTAATCAGCTAGGTATGGGGG;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=247129953;WS=247129941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	247130577	rs4971282	C	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=1.329;SC=TATTAAAAAGCCACTGGATTG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=247130585;WS=247130572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	247150740	rs3749427	T	C	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=39;PP=1591;SC=GGTTAAAGGCTTTTCCACATT;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=247150748;WS=247150730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	247151557	rs2642992	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=52;PP=1564;SC=AGAAGACAAAACTGGAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=247151565;WS=247151547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	247162658	rs2642973	C	T	7553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=126;PP=2965;SC=ACCTGAGTGTCTGGCTGTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=87;TCR=126;TR=213;WE=247162666;WS=247162648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr1	247241850	rs41305955	G	C	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=994;ReadPosRankSum=0.411;SC=CCGCTTCCTGGCGGTTCCCTT;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=64;WE=247241866;WS=247241840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,87:0.48:182
chr1	247242032	rs3806269	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=595;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ACGCACCGAGCTCGCCACATT;SOR=0.624;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=34;WE=247242040;WS=247242022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr1	247365430	rs10754539	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1147;ReadPosRankSum=0.118;SC=AAAGGTGTCAACACAACCCTT;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=64;TCR=75;TR=74;WE=247365438;WS=247365420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,83:0.52:159
chr1	247419509	rs1778540	T	C	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=32;PP=2593;SC=TATTACCATATAAATCTTCTT;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=110;WE=247419517;WS=247419499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	247419664	rs1778541	C	T	6654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=114;PP=2965;SC=TGCTCTTCACCCAGGCAATAT;SOR=0.982;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=87;TCR=114;TR=201;WE=247419672;WS=247419654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	247485932	rs10924984	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=7;PP=673;SC=TCCTCAGAGCACCCGAGTAAG;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=247485940;WS=247485922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	247486678	rs7540329	T	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=14;PP=302;SC=TGTTTCATGGTGCTTTTCATA;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=247486686;WS=247486668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	247587408	rs7525979	C	T	3279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=79;PP=2034;ReadPosRankSum=1.523;SC=CTGTGCACACCGTGGTGTTCC;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=267;TCF=107;TCR=160;TR=136;WE=247587416;WS=247587398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,152:0.53:289
chr1	247587477	rs3806268	G	A	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1520;ReadPosRankSum=0.273;SC=TGGACTGGGCGTCGGGGACAC;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=86;WE=247587485;WS=247587467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,92:0.51:181
chr1	247587531	rs4925543	A	G	5077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.210;SC=TCCACTGTCGAGAGGTGAGCC;SOR=1.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=166;WE=247587539;WS=247587521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,178:0.99:180
chr1	247588960	rs3738447	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.676;SC=TCTTCTTGGCGCTTGCCTCCT;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=247588968;WS=247588950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	247593142	rs12060377	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.270;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	247597329	rs12124866	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=396;SC=TCAGGTGTGTCCTGATGCTTC;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=13;WE=247597337;WS=247597326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	247597364	.	G	GAT	568.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-1.460;QD=21.06;ReadPosRankSum=-2.342;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	247597365	rs10925022	G	A,GTGTTCTGAGGCCTTCTCTATTCCAGAGCTCTCTGGTCAGA	1858.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=43;NR=1;PP=1188;SC=CTCTGGTCAGGTGTGTTCTGA;SOR=3.180;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=247597373;WS=247597355;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.70,0.30:27
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chr1	247599232	rs10754557	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GTGGAGCGTGGGTGAGAGACA;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=247599240;WS=247599222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	247614617	rs4925663	C	T	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GGCAATAAAGCCATAGGAGAG;SOR=0.736;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=71;WE=247614625;WS=247614607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr1	247614693	rs6695302	C	T	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=63;PP=2669;SC=GTGTCATTCACAGCGGTGTCA;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=127;WE=247614701;WS=247614683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	247614896	rs11583410	A	C	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.481;SC=GGGCTTGCAGATGGCCACGTA;SOR=0.806;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=88;WE=247614904;WS=247614886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr1	247615340	rs55889481	C	T	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=954;ReadPosRankSum=2.077;SC=TGAATAATACCTGAGAAGAGG;SOR=0.855;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=37;TCR=78;TR=57;WE=247615348;WS=247615330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr1	247615358	rs10925030	C	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=912;ReadPosRankSum=0.028;SC=AGGAATTGATCACTTTCCTCC;SOR=0.420;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=52;WE=247615366;WS=247615348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr1	247654498	rs61070846	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=688;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GGCCTGGACTGGAGAAAATTC;SOR=1.020;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=49;WE=247654506;WS=247654488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
chr1	247654993	rs10925061	T	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=51;PP=1463;ReadPosRankSum=0.037;SC=TTGCCATGTCTTGTGAGGAAA;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=191;TCF=79;TCR=112;TR=91;WE=247655001;WS=247654983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,102:0.46:220
chr1	247655275	rs12141850	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=-0.388;SC=ACCATCGTCATTCCCAGCATC;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=38;WE=247655283;WS=247655265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr1	247690320	rs2141543	C	T	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1238;ReadPosRankSum=0.063;SC=GTGTGGAATGCCTGGTGTTTC;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=74;WE=247690328;WS=247690310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,85:0.55:155
chr1	247690417	rs12404733	T	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=992;ReadPosRankSum=0.871;SC=TCATTTTCTGTTAAGCATTTA;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=56;TCR=79;TR=69;WE=247690425;WS=247690407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr1	247695413	rs138735337	G	A	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=63;PP=1971;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CATAATGACAGTGTAATGGAG;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=107;TCR=112;TR=121;WE=247695421;WS=247695403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,142:0.57:251
chr1	247695612	rs6657127	G	A	5309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=79;PP=2965;SC=TCCAGGAAGGGGAGGTTGGCA;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=87;TCR=79;TR=166;WE=247695620;WS=247695602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	247695756	rs6697472	T	C	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=71;PP=2064;SC=GAGGGTCGTGTGGAGAAGCCC;SOR=1.122;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=118;WE=247695764;WS=247695746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	247702118	rs2103336	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=707;ReadPosRankSum=1.519;SC=TTCTGTTGCCCGCCACCACCC;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=51;WE=247702126;WS=247702108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr1	247712303	rs41315846	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.58;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	247719769	rs56043070	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=597;ReadPosRankSum=0.499;SC=AAAGAAAACGGTAAGAACAGA;SOR=0.437;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=41;WE=247719777;WS=247719759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr1	247726822	rs142922665	CTTTT	C	5697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=47;PP=2924;SC=CAACCAAATGCTTTTTTTGAA;SOR=1.051;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=75;WE=247726833;WS=247726812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	247752161	rs10925085	T	C	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=54;PP=2290;SC=ACCCTCACCCTGCAGCTGCCC;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=247752169;WS=247752151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	247835352	rs1151641	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=3;PP=910;SC=GTATGAAAAACCAGTAAAATC;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=247835360;WS=247835342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	247835674	rs28446289	G	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1482;ReadPosRankSum=0.226;SC=GTGCGGATACGGAGAATAGCA;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=91;WE=247835682;WS=247835664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr1	247835908	rs28556931	T	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=838;ReadPosRankSum=1.104;SC=GCAATAGCCATGACCATGCTG;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=53;WE=247835916;WS=247835898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr1	247835950	rs1151640	T	C	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=944;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TGGTTCATAATAGTACTGTAA;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=58;WE=247835958;WS=247835940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr1	247836008	rs28555391	G	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=760;ReadPosRankSum=0.155;SC=CCATGGTGGTGAAGAGAACCA;SOR=0.754;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=42;WE=247836016;WS=247835998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr1	247836207	rs28711149	T	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=930;ReadPosRankSum=0.072;SC=GTTATAGATTTTGGCAATGAT;SOR=0.747;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=55;WE=247836215;WS=247836197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr1	247921100	rs1552812	T	G	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=58;PP=2434;SC=CCAATAGACCTCCTACTGCAA;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=123;WE=247921108;WS=247921090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	247921352	rs1552813	C	T	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=42;PP=2121;SC=ATCTATCATACGCCATCACAC;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=247921360;WS=247921342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	247921717	rs10888359	C	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=540;SC=ATATTCCCAACAAATCTAGAA;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=247921725;WS=247921707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	247978087	rs10888248	G	A	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=30;PP=1822;SC=ATTGAAAGAAGAAAAGCAACA;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=247978095;WS=247978077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	247978319	rs6695283	A	G	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=47;PP=2003;SC=TGGAAGGCAAATAGAGTAGGC;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=88;WE=247978327;WS=247978309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	247978541	rs35979231	AAGG	A	7413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=84;PP=2948;SC=ACAGTAGGATAAGGAGAAGGT;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=24;TCR=87;TR=105;WE=247978551;WS=247978531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	247978996	rs10888249	A	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=53;PP=1750;SC=AAAACCCCATAAGGATAAATT;SOR=1.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=247979004;WS=247978986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	248004614	rs6667389	G	A	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=79;PP=2965;SC=TGGTCACCTCGGTGATATAAA;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=197;WE=248004622;WS=248004604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	248004687	rs10888255	C	G	7299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=103;PP=2965;SC=AATCTGATTGCGCCCACAGAA;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=128;TCR=103;TR=231;WE=248004695;WS=248004677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	248004775	rs10888256	C	T	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=114;PP=2965;SC=ACCAACCTGGCACAGAGCCCA;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=90;TCR=114;TR=204;WE=248004783;WS=248004765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	248004848	rs4607924	G	C	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=62;PP=2607;SC=CATAGGCCATGAAGGCCAGGA;SOR=1.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=108;WE=248004856;WS=248004838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	248004877	rs10888257	C	T	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	248004884	rs1339845	T	C	5257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.81;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	248005213	rs7522811	G	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=32;PP=1173;SC=TGTGGGGGATGAAAAACATTC;SOR=1.131;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=52;WE=248005221;WS=248005203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	248023966	rs3737277	C	T	4231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=82;PP=2672;SC=AGTTGGAGGACGCCTTGACTC;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=137;WE=248023974;WS=248023956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	248024073	rs3737276	A	C	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=522;SC=GATTCGGGTCAGTAATTCTTC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=248024081;WS=248024063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	248028219	rs946696	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=0.450;SC=GCCAGCGCCCGGCCCTGGGTC;SOR=1.473;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=248028227;WS=248028209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	248039713	rs3811445	A	G	3583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=58;PP=2276;SC=TGCCACCCACAACAATAGCAG;SOR=0.993;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=101;WE=248039721;WS=248039703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	248058755	rs1337876	A	G	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.64;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	248058761	rs11204543	G	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	248058797	rs1856248	T	G	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=4;PP=1635;SC=ATAAAAAGCATAGAAGAATGC;SOR=4.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=61;WE=248058805;WS=248058787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	248058845	rs4500353	A	C	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=35;PP=2409;SC=ATCAGCTGTTATTATTATTAT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=111;WE=248058853;WS=248058835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	248058879	rs6587387	A	T	5226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=67;PP=2965;SC=TCTGTTCAGCAGCAGTAGAGA;SOR=1.102;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=167;WE=248058887;WS=248058869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	248059252	rs61750779	C	T	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1143;ReadPosRankSum=-1.411;SC=GGCCTATGACCGGTGTGTGGC;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=80;WE=248059260;WS=248059242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,89:0.41:216
chr1	248084222	rs12048237	T	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=918;SC=CACAAGTACTTTTCTATTTTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=248084230;WS=248084212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	248084464	rs11204564	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.27;QD=27.47;SOR=3.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	248085124	rs4590708	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=794;SC=CACTAACCACGACAAGGTTGT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=248085132;WS=248085114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	248085149	rs112174271	C	G	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=16;PP=1011;SC=GCCTTCTATACTATGTTCACC;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=248085157;WS=248085139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	248129020	rs41308168	C	T	8434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=109;PP=2965;SC=AAGCCCTTCTCCTTGGTTTTA;SOR=0.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=148;TCR=109;TR=257;WS=248129010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr1	248154493	rs201911921	T	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-6.740;QD=2.95;ReadPosRankSum=-3.589;SOR=1.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,25:0.21:120
chr1	248154505	rs200140719	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=13.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-8.646;QD=0.33;ReadPosRankSum=-4.066;SOR=2.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,11:0.12:95
chr1	248202344	rs6658141	G	C	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.968;NF=56;NR=61;PP=1957;ReadPosRankSum=0.517;SC=TTATACCTATGTACGTCCAAG;SOR=0.539;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=251;TCF=114;TCR=137;TR=117;WE=248202352;WS=248202334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,147:0.48:306
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chr1	248224099	rs6666048	T	C	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.336;NF=30;NR=53;PP=1498;ReadPosRankSum=1.638;SC=ATGGCTCTAATTGGAAACCTA;SOR=0.916;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=181;TCF=71;TCR=110;TR=83;WE=248224107;WS=248224089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,96:0.46:209
chr1	248224216	rs6658227	C	T	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.468;NF=48;NR=37;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.025;SC=ACCATTGTTCCTAAGATGGCA;SOR=0.565;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=85;WE=248224224;WS=248224206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,92:0.51:182
chr1	248224294	rs6658256	C	T	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.786;NF=62;NR=54;PP=1673;ReadPosRankSum=-1.436;SC=TTCTTCTTCTCGGCATTAGGA;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=135;TCR=117;TR=116;WE=248224302;WS=248224284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,117:0.42:279
chr1	248224398	rs55937620	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-16.707;NF=39;NR=62;PP=1143;ReadPosRankSum=2.908;SC=GAGCAAAAGAATGTGTGTGCT;SOR=0.986;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=282;TCF=136;TCR=146;TR=101;WE=248224406;WS=248224388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,110:0.36:305
chr1	248224754	rs55893924	T	C	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.012;NF=29;NR=41;PP=1114;ReadPosRankSum=1.285;SC=TTGTCTACACTTATCTACGTC;SOR=0.504;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=155;TCF=62;TCR=93;TR=70;WE=248224762;WS=248224750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,77:0.43:179
chr1	248247140	rs111755774	G	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.865;NF=1;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=0.970;SC=GGTAAAAATGGCAGCTCCATA;SOR=0.330;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=248247148;WS=248247130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	248263626	rs4146708	T	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=360;ReadPosRankSum=0.144;SC=ATCATGGCCATCCCCACTCCC;SOR=0.984;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=28;WE=248263634;WS=248263616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,32:0.36:88
chr1	248366792	rs12562957	T	C	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=80;PP=1620;ReadPosRankSum=-0.641;SC=CTAAAATTTGTGGACTTATGA;SOR=0.906;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=263;TCF=112;TCR=151;TR=132;WE=248366800;WS=248366782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,152:0.49:312
chr1	248367415	rs4916082	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=478;ReadPosRankSum=0.895;SC=CATAAATCTGCAATGACATAT;SOR=0.262;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=23;WE=248367423;WS=248367405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr1	248402758	rs6666148	C	T	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.037;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.228;SC=AAATTCATCACTTTTTCTGTG;SOR=0.985;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=150;TCF=72;TCR=78;TR=82;WE=248402766;WS=248402748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr1	248457979	rs6667171	C	A	2969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=-0.810;NF=34;NR=43;PP=2634;ReadPosRankSum=-1.333;SC=CCCCAGCCACCGTTTCAGGGC;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=77;WE=248458001;WS=248457969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,86:0.40:214
chr1	248457993	rs11204625	C	G	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.785;NF=29;NR=42;PP=2634;ReadPosRankSum=-1.762;SC=TCAGGGCTTCCTTGACCTCAC;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=166;TCF=70;TCR=96;TR=71;WE=248458001;WS=248457969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,76:0.39:196
chr1	248458676	rs6678138	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.610;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.254;NF=10;NR=0;PP=510;ReadPosRankSum=-0.339;SC=ACCAGCATCATGTCCATGAGG;SOR=3.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=10;WE=248458697;WS=248458666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr1	248458689	rs6674940	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.749;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.399;NF=13;NR=2;PP=510;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CCATGAGGGAAAGTTGGCTCA;SOR=2.584;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=15;WE=248458697;WS=248458666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr1	248458717	rs12745228	C	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.029;NF=21;NR=10;PP=384;ReadPosRankSum=-1.058;SC=GTACATGGGCCTGTGGAGCCG;SOR=0.925;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=31;WE=248458725;WS=248458707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr1	248458736	rs28409263	A	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.363;NF=24;NR=16;PP=438;ReadPosRankSum=-1.775;SC=CGGTGGTCCCAGTGAATCAGG;SOR=0.564;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=40;WE=248458744;WS=248458726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,47:0.40:117
chr1	248458760	rs12135684	C	A	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.537;NF=24;NR=21;PP=632;ReadPosRankSum=-0.221;SC=ATCATGAGGGCATTGCTAAAC;SOR=0.466;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=45;WE=248458768;WS=248458750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr1	248458875	rs11339452	CT	C	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.632;NF=2;NR=13;PP=499;ReadPosRankSum=1.542;SC=TATTTCTCATCTCCATAATTT;SOR=0.734;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=15;WE=248458883;WS=248458865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr1	248486895	rs4244184	G	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=924;ReadPosRankSum=0.060;SC=AAAAGAAGACGTTAGCAGACA;SOR=1.163;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=150;TCF=96;TCR=54;TR=58;WE=248486903;WS=248486885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,68:0.39:173
chr1	248486913	rs4244185	A	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=884;ReadPosRankSum=0.133;SC=ACAGCAAAACATGAAATTTAT;SOR=0.923;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=180;TCF=109;TCR=71;TR=72;WE=248486921;WS=248486903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,84:0.40:211
chr1	248487016	rs4451579	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=775;ReadPosRankSum=-0.258;SC=TGAGAGGATTCAGCATGGGAG;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=48;WE=248487024;WS=248487006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
chr1	248487638	rs7555310	A	G	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.036;NF=19;NR=34;PP=1038;ReadPosRankSum=0.098;SC=CATCTTGGGTACAGTGGTGCA;SOR=0.919;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=53;WE=248487646;WS=248487628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
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chr1	248512498	rs28448343	A	G	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=765;ReadPosRankSum=0.511;SC=ATCTGCATCCAGATGACACTG;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=48;WE=248512506;WS=248512488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
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chr1	248551560	rs954474	C	T	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TGACTGCATCCTACACCAGGA;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=72;WE=248551568;WS=248551550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,80:0.46:173
chr1	248551636	rs954475	T	G	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CACCTGCTCTTCACACATGAT;SOR=0.665;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=67;WE=248551644;WS=248551626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr1	248551955	rs28437787	C	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=0.358;SC=ACTTTCAATACCAGCTGTGCT;SOR=0.132;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=248551963;WS=248551945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	248570440	rs6695780	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=0.855;SC=GGTAAATGGGGGACTCTGTGG;SOR=0.252;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=11;WE=248570448;WS=248570430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	248604454	rs113331655	CAT	C	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.584;NF=5;NR=3;PP=433;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CCAACTTTATCATATCTCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=8;WE=248604473;WS=248604444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	248604465	rs76925977	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.177;NF=7;NR=4;PP=433;ReadPosRankSum=0.702;SC=ATATCTCTTTCGTGTACCCTA;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=11;WE=248604473;WS=248604444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	248604542	rs61834485	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.911;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.902;NF=23;NR=14;PP=652;ReadPosRankSum=2.092;SC=TGTTCAGCAACGCCCGTTTCC;SOR=0.834;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=37;WE=248604550;WS=248604532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,40:0.82:49
chr1	248604559	rs150497047	T	TTC	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.598;NF=2;NR=9;PP=454;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TTCCCCTGGCTTCTTTGCCCT;SOR=2.538;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=11;WE=248604567;WS=248604549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,7:0.13:54
chr1	248604614	rs201226597	A	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.24;MQRankSum=-3.230;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=1.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr1	248604694	rs199872993	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=8.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.41;MQRankSum=-1.162;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.104;SOR=2.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr1	248604765	rs144165631	T	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.98;MQRankSum=-2.560;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.480;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,70:0.65:107
chr1	248605065	rs201562043	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQRankSum=-3.592;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr1	248617173	rs78428672	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQRankSum=-5.601;QD=18.52;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	248617181	.	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=6.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQRankSum=-5.663;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.598;SOR=3.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
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chr1	248637046	rs148025314	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.49;MQRankSum=-7.215;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,51:0.39:132
chr1	248637065	rs139758663	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.88;MQRankSum=-4.823;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=1.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr1	248637362	rs77686526	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.778;NF=49;NR=19;PP=961;ReadPosRankSum=0.710;SC=ATTCTGCCGCCGGCCACAGGA;SOR=1.667;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=193;TCF=121;TCR=72;TR=68;WE=248637370;WS=248637352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,42:0.26:160
chr1	248637416	rs75924848	GC	CT	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=4.153;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQRankSum=-6.082;QD=1.03;ReadPosRankSum=-2.836;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,23:0.10:236
chr1	248637480	rs74498773	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=4.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.70;MQRankSum=-5.797;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.149;SOR=1.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,45:0.17:265
chr1	248637543	rs139993642	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.11;MQRankSum=-7.116;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.527;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,35:0.20:173
chr1	248637685	rs201431222	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQRankSum=-3.940;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.493;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	248651927	.	A	G	703	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=40.83;NF=35;NR=8;PP=703;QD=17.1574700592;SC=CACACTGGAAAGTTGGATTTC;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=145;TCF=104;TCR=41;TR=43;WE=248651935;WS=248651917;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:102,43:0.30:145
chr1	248652058	rs199730299	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.37;MQRankSum=-1.090;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.843;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,5:0.10:49
chr1	248685253	rs9727474	T	C	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=65;PP=2229;SC=CCCAGCTCTATGTGGCCATGG;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=128;WE=248685261;WS=248685243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	248685719	rs9330305	A	T	3011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1858;ReadPosRankSum=-2.877;SC=CATCATATTCATGTACCTTCA;SOR=0.514;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=238;TCF=128;TCR=110;TR=122;WE=248685727;WS=248685709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,140:0.53:264
chr1	248722507	rs199706827	C	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	248722611	rs200169450	C	G	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.53;QD=46.77;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	248722613	rs199532952	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.79;MQRankSum=-0.938;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr1	248722621	rs201345491	G	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.19;MQRankSum=-0.420;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.769;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr1	248722624	rs200919674	C	T	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.46;MQRankSum=-0.622;QD=27.14;ReadPosRankSum=1.561;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr1	248722659	rs201896684	C	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.68;MQRankSum=1.782;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr1	248722671	rs140437806	T	A	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.49;QD=35.61;SOR=1.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	248722739	rs200935922	G	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQRankSum=-8.059;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,32:0.22:143
chr1	248722752	.	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=10.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.05;MQRankSum=-7.717;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=1.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,21:0.16:130
chr1	248722756	.	T	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=9.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=-7.462;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.483;SOR=1.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,18:0.15:124
chr1	248722767	.	T	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.933;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=10.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-7.092;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.631;SOR=2.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,16:0.14:114
chr1	248722777	rs77589892	T	A	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.31;MQRankSum=1.127;QD=28.97;ReadPosRankSum=-1.503;SOR=1.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr1	248722788	.	G	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=10.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-5.650;QD=2.28;ReadPosRankSum=-3.623;SOR=2.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,11:0.13:87
chr1	248722883	rs78125102	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.84;QD=41.34;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	248722888	rs78981094	C	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.82;QD=45.48;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	248737230	rs199863869	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQRankSum=-0.980;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	248737259	rs189248971	C	G	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=27.47;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	248737293	rs200427293	GC	AG	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=8.127;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.91;MQRankSum=-0.730;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr1	248737319	rs77940099	G	A	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.278;NF=54;NR=16;PP=1142;ReadPosRankSum=-1.063;SC=CATGTGGGAGGAGCAGGTGGC;SOR=0.479;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=170;TCF=135;TCR=35;TR=70;WE=248737327;WS=248737309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,70:0.47:150
chr1	248737343	rs61833441	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=12.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQRankSum=-5.230;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,42:0.20:214
chr1	248737348	rs61833442	G	A	4119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQRankSum=-3.222;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,150:0.61:244
chr1	248737511	rs150608839	A	G	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.559;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.983;NF=38;NR=67;PP=1580;ReadPosRankSum=0.723;SC=AGTCTCACAGAAAAAACTCAG;SOR=0.934;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=281;TCF=113;TCR=168;TR=105;WE=248737519;WS=248737501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,104:0.38:272
chr1	248737595	rs150601708	A	G	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.78;MQRankSum=-0.456;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.834;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr1	248789454	rs1892441	G	C	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=20;PP=1375;SC=TCCTTAGGAAGCCTTATCCTC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=248789462;WS=248789444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr1	248790075	rs1892443	A	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=47;PP=1743;SC=GCCACGTAGCAGTCATAGGCC;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=87;WE=248790083;WS=248790065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	248801572	rs201969645	A	G	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.78;QD=32.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	248801575	rs199693554	C	G	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=49.14;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	248801592	.	C	T	895	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=110;MMLQ=28;MQ=45.15;NF=27;NR=16;PP=895;QD=21.6225863383;SC=TCCCTGCTAGCCCTTCCTGAT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=43;WE=248801619;WS=248801582;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr1	248801610	.	GC	AT	1524	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=110;MMLQ=28;MQ=40.55;NF=24;NR=18;PP=1524;QD=37.5587589253;SC=GATCACAGTCGCCACCCTGAT;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=42;WE=248801619;WS=248801582;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr1	248801778	rs201643849	A	T	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.28;QD=29.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	248801944	rs143010547	TCAGCACG	T	2641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.25;QD=43.31;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	248813135	rs4916153	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=186;SC=GGTGGCATGTGGGTCACTTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=248813143;WS=248813125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	248814052	rs28533004	T	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQRankSum=-1.910;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.071;SOR=1.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	248814080	rs1782242	A	C	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.58;QD=25.56;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	248814126	rs28418327	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.474;NF=19;NR=27;PP=548;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GGAAACGGGCGTTGCTGAACA;SOR=0.641;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=46;WE=248814134;WS=248814116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr1	248814203	.	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.19;MQRankSum=-1.894;QD=5.61;ReadPosRankSum=-2.026;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	248814209	rs148876159	GAT	G	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=-0.041;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	248814216	rs202080638	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQRankSum=-1.596;QD=23.60;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	248844959	rs55871516	T	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1120;ReadPosRankSum=0.695;SC=GATTTGGAAATAGGAGATCAT;SOR=0.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=73;WE=248844967;WS=248844949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr1	248845097	rs2000390	C	T	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=66;PP=1977;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GTGGATCACACTGGATCTGCA;SOR=0.671;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=223;TCF=111;TCR=112;TR=126;WE=248845105;WS=248845087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,146:0.56:261
chr1	248845356	rs41311583	G	T	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=986;ReadPosRankSum=1.720;SC=CTGCGAGTCAGGGAGTTACGG;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=81;TCR=81;TR=69;WE=248845364;WS=248845346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,88:0.44:201
chr1	248845411	rs11485825	G	A	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=53;PP=1484;ReadPosRankSum=0.016;SC=GATCCAAAACGGAGAGGTTCT;SOR=1.020;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=149;TCF=64;TCR=85;TR=87;WE=248845419;WS=248845401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,104:0.56:186
chr1	248845458	rs4509608	C	T	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1002;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGATGCTGATCGAGAGTGATG;SOR=0.913;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=58;WE=248845479;WS=248845448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr1	248845471	rs4575113	T	C	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=54;PP=2465;SC=GAGTGATGACTGCAATGATGA;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=94;WE=248845479;WS=248845448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	248845499	rs4462184	A	G	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=50;PP=2165;SC=CCCCACCAGCACTGCCAGATA;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=90;WE=248845507;WS=248845489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	249110906	rs4926508	G	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=417;ReadPosRankSum=-1.601;SC=TTGGGTCCCAGCCCCTCTTGT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=22;WE=249110914;WS=249110896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr1	249142239	rs201281707	G	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.340;SC=GAAGCCGTACGCATGTGGCGA;SOR=0.967;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=60;WE=249142247;WS=249142229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,64:0.47:135
chr2	45895	rs4241318	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=24;PP=1224;SC=GGTCTCGGGGATTGCGGGGTC;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=45903;WS=45885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	224919	rs2290911	A	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CATTTCTGTTACCTGCCAAAA;SOR=0.680;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=27;WE=224927;WS=224909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr2	224970	rs2290912	C	T	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=39;PP=1160;SC=TAGTATATATCATACAAAATA;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=224978;WS=224960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	230912	rs2306060	A	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=384;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GAAGTCAGTGAAACTACGAAG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=22;WE=230920;WS=230902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr2	234130	rs3748872	T	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=566;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GTTAAACCTTTACTGTCTAAC;SOR=0.854;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=35;WE=234138;WS=234120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr2	242732	rs113405432	T	TAAC	906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=43.18;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	242793	rs62114506	G	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.052;NF=21;NR=10;PP=1305;ReadPosRankSum=0.490;SC=TAGATTCAAAGTTACCATTAG;SOR=0.826;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=31;WE=242808;WS=242783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr2	242800	rs10181051	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.013;NF=22;NR=15;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AAAGTTACCATTAGATTGACA;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=37;WE=242808;WS=242783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
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chr2	262553	rs7596678	T	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1130;SC=TGGGATCTTCTCAGAGAAAAT;SOR=1.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=262561;WS=262543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	264019	rs7595075	C	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=373;ReadPosRankSum=0.018;SC=CGTCCCGAGGCTGCCCAGGAA;SOR=0.453;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=22;WE=264027;WS=264009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr2	264895	rs4854300	G	C	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=19;PP=2608;SC=GGGCAAGAGGGTGGCAGTGCG;SOR=2.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=87;TCR=19;TR=106;WE=264903;WS=264885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	269352	rs6755722	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=340;ReadPosRankSum=-1.637;SC=AAAAAAGTACGTAATATGCTT;SOR=0.582;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=27;WE=269360;WS=269342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr2	271797	rs59937473	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.614;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=91;ReadPosRankSum=0.900;SC=GGTGTGTAAAGAAGGGGAGCT;SOR=0.086;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=271805;WS=271787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	272203	rs11553746	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=653;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GGGTCATTGACAGCGGTGCTG;SOR=1.219;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=42;WE=272211;WS=272193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,50:0.40:125
chr2	272840	rs12714401	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=689;SC=TTTATATTATGAATTAGAAGC;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=272848;WS=272830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	272926	rs12714402	A	G	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=51;PP=2174;SC=TGGAATCTTCATTGGTCAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=125;WE=272934;WS=272916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	273070	rs12714403	A	G	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=58;PP=1834;SC=GGGGCTGTGAAGTCCTTCTTG;SOR=1.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=273078;WS=273060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	277003	rs79716074	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.301;SC=AAAAGTAATCAAGTTAAAACC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=277011;WS=276993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	283231	rs368562757	A	AT	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=849;SC=AATAAATCGCATTTTTTTGCA;SOR=1.923;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=29;WE=283239;WS=283221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	672745	rs34848618	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=603;SC=TCCCACCGGCTGTGGGGCCAT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=672753;WS=672735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	675831	rs2293084	G	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=653;SC=CAGGAGGATGGAAACAGGATT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=675839;WS=675821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	676177	rs2293083	C	G	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=81;PP=2482;SC=CTGCAATACACTGAACTCTCC;SOR=1.470;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=123;WE=676185;WS=676167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	676457	rs2293082	G	C	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=12;PP=1372;SC=GCTGCAGCCCGGCACAGCCCT;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=676465;WS=676447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	676478	rs3215297	T	TGTAA	5318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=26;PP=1899;SC=CCAGAACTCCTGTGTCACTAC;SOR=1.835;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=66;WE=676488;WS=676468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	677213	rs3749138	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=395;SC=GCCACAGGCCGGGTGCTCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=677221;WS=677203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	905385	.	GGTCTGGTCTTTCATTTCCTCCCGGCCTCCTCGCCTGCACTGC	G	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=2.345;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr2	905427	.	C	G	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=45.36;NF=1;NR=7;PP=101;QD=16.9714015684;SC=GCCTGCACTGCGTCTGGTGTT;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=8;WE=905435;WS=905417;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr2	905442	rs62103942	A	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=4.205;QD=30.29;ReadPosRankSum=-2.734;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr2	1079130	rs4971429	G	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.35;SOR=2.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	1079130	.	GCG	ACA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=75;NR=17;PP=2947;QD=20;SC=TGAGCAGGAGGCGTGCGTCAC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=77;TCR=19;TR=92;WE=1079151;WS=1079120;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,92:0.96:96
chr2	1079132	rs4971430	G	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=2.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	1079143	rs4971431	A	G	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=30;PP=2483;SC=TGCGTCACCTATCCCCACCCC;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=83;TCR=30;TR=113;WE=1079151;WS=1079120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	1079320	rs4971432	C	T	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=96;PP=2949;SC=TCTGTGTGGGCGGAAGCCACC;SOR=1.212;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=60;TCR=96;TR=156;WE=1079328;WS=1079310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	1168781	rs28505970	C	A	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=37;PP=1356;SC=GCTGCAGGGTCCCCAGGGCCA;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=1168789;WS=1168771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	1241592	rs146197111	C	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=365;SC=GCATCAGCCTCGAAACTCACG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=1241600;WS=1241582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	1241883	rs35402865	G	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=50;PP=1577;SC=TGATTAACCCGAAACAGAAAA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=69;WE=1241891;WS=1241873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	1241944	rs28502413	G	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=622;SC=CATTAAAAATGAAGCCATCAG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=1241952;WS=1241934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	1243312	rs28760535	T	C	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.99;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	1243318	rs28436921	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.68;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	1243608	rs28570180	A	C	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=26;PP=890;SC=GTATTTTCTGATTCATGATGT;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=1243616;WS=1243598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	1243645	rs28411047	T	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=464;SC=CAGTCTCTGGTTTTTTGAAAT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=1243653;WS=1243635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	1251087	rs58278307	A	AAAGGTT	2966.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=13;PP=1916;SC=TGTAATTTTCACCCCTCTGCA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=1251096;WS=1251077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	1251088	rs55953201	C	T	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=741;SC=GTAATTTTCACCCCTCTGCAG;SOR=1.263;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=47;WE=1251096;WS=1251077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	1263005	rs9330340	A	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=403;SC=GTAAAGTTTAATGTTACCAAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=1263013;WS=1262995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	1263297	rs9330341	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=0.691;SC=TTTGTTCTGCGTGGTCCATTG;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=18;WE=1263305;WS=1263287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr2	1263356	rs62106570	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.949;SC=CTGGACCCATTCTCCTGCCCT;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=1263364;WS=1263346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	1271110	rs28626835	G	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=189;ReadPosRankSum=0.948;SC=AGCGCTGCACGTTTCCAATCC;SOR=0.591;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=15;WE=1271118;WS=1271100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr2	1271230	rs13023962	A	G	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=36;PP=1315;SC=TTGCTTCAGCATCGTGGCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=1271238;WS=1271220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	1320143	rs4927635	C	T	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CAGATTGAGACGAAGGTATGC;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=75;TCR=101;TR=88;WE=1320151;WS=1320133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,97:0.48:202
chr2	1320300	rs35466197	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.91;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	1320304	rs74994128	CG	AC	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	1437410	rs4927578	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=420;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CACTGAGGAGCGGCAACTCCC;SOR=0.371;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=21;WE=1437418;WS=1437400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr2	1442551	rs34191654	AT	A	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=0.925;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.268;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	1457364	rs2070881	A	G	5029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=39;PP=2965;SC=CTCCGGAGAGACCCCACTTAT;SOR=1.967;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=112;TCR=39;TR=151;WE=1457372;WS=1457354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	1459806	rs4927610	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=425;SC=CTGCTACCACAGGGTCCTCCT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=1459814;WS=1459796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	1481155	rs2280132	G	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=219;ReadPosRankSum=-0.158;SC=ACGCGCGCCTGCGGCCTGTGC;SOR=1.049;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=15;WE=1481163;WS=1481145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr2	1481231	rs2175977	G	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=13;PP=634;SC=GGCCGCGCCAGCGAGGTCCCC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=1481239;WS=1481221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	1488668	rs6715129	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=0.067;SC=CATGAACTCTTCCTTCTTTTT;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=1488676;WS=1488658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	1491497	rs6727192	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.438;NF=14;NR=5;PP=381;ReadPosRankSum=0.685;SC=ACAGAAAGAATGAGACTCCGT;SOR=0.551;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=19;WE=1491518;WS=1491487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr2	1491510	rs72230434	CA	C	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=14;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.585;NF=8;NR=6;PP=413;ReadPosRankSum=1.647;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=14;WE=1491518;WS=1491487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	1497442	rs9679267	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.053;NF=19;NR=7;PP=360;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GCAAACTGCCAGGCAGTGTCA;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=26;WE=1497450;WS=1497432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr2	1497803	rs1126797	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=758;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CTCTGCGGGACGGTGACTGGT;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=124;TCF=30;TCR=94;TR=50;WE=1497811;WS=1497793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,54:0.39:138
chr2	1499899	rs732608	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=538;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GCAAATTCCCCGAAGACTTTG;SOR=0.853;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=40;WE=1499907;WS=1499889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,52:0.31:168
chr2	1499927	rs732609	A	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=512;ReadPosRankSum=0.325;SC=TGACAGCATCACTGGCATGAA;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=40;WE=1499935;WS=1499917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,49:0.31:156
chr2	1500665	rs867983	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CAGGAGCAATCTGGGGATAGA;SOR=0.569;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=1500673;WS=1500655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	1520676	rs1126799	T	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=595;ReadPosRankSum=0.540;SC=CTCCCTCGGGTGACTTGGATC;SOR=0.948;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=33;WE=1520684;WS=1520666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr2	1544610	.	C	G	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.402;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=1836;ReadPosRankSum=1.763;SC=TCCGTGTTTCCTAGTCCGTTC;SOR=0.233;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=57;WE=1544625;WS=1544600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr2	1544617	rs12615819	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.539;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=2071;ReadPosRankSum=-2.709;SC=TTCCTAGTCCGTTCTGCACCT;SOR=1.431;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=51;WE=1544625;WS=1544600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr2	1546327	rs1042589	C	G	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1648;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CAGGCAAATCCGAAATCAGCA;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=113;WE=1546335;WS=1546317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,132:0.48:274
chr2	1639122	rs2241457	T	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=322;SC=AGTGGTCACATGGGACTCTCG;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=1639130;WS=1639112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	1642537	rs6729142	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.99;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	1642539	rs6742040	C	T	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.15;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	1642545	rs6742039	C	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.63;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	1642803	.	CGGGTCTCATTTCAAGGTTTCCTGGGTGTGCACCGCCCCTGATGCTCTGAGCT	C	176.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=10.40;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	1647171	rs6730800	T	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=41;PP=2316;SC=CCCGGAGGTCTACCCTGGGGA;SOR=1.249;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=115;WE=1647179;WS=1647161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	1652822	rs1863135	T	G	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=77;PP=2965;SC=TGGATGCGTCTATGTAGGAGG;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=84;TCR=77;TR=160;WE=1652830;WS=1652812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	1664654	rs17841813	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=476;SC=GCATCTTACCATTCACACTGA;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=1664662;WS=1664644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	1667310	rs12475392	G	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=19;PP=1494;SC=TGTCAGCTGCGGAATTCTGTG;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=74;WE=1667318;WS=1667300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	1747993	rs62116430	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CGAAGCCCCGGACCCCGCGCC;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=1748001;WS=1747983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	1813057	rs12988270	G	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=700;ReadPosRankSum=0.442;SC=GCAAAAGGCTGTCTGAAAATG;SOR=0.400;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=36;WE=1813065;WS=1813047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr2	1842968	rs6728368	T	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=798;ReadPosRankSum=0.948;SC=AGCCGTCGCATCCTGGCGTGG;SOR=0.435;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=56;WE=1842976;WS=1842958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,62:0.43:145
chr2	1843285	rs10196494	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	1844458	rs4381806	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=403;ReadPosRankSum=1.009;SC=TGTTGACATATACTTGCTTTG;SOR=0.859;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=24;WE=1844466;WS=1844448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr2	1844652	rs7425544	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=-1.457;SC=CACCCCACACCGTTGATTTCA;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=21;WE=1844660;WS=1844642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr2	1844676	rs7425542	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5123;FS=8.820;HP=20;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.629;NF=0;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=-1.794;SC=AGCTTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=1844684;WS=1844666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	1893049	rs71442304	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=664;ReadPosRankSum=0.282;SC=CTATCCTCCGGGGTTTCATTT;SOR=0.406;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=42;WE=1893057;WS=1893039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr2	1914255	rs17039160	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=715;ReadPosRankSum=1.721;SC=GGCACAGGCAGTCCTGATGGG;SOR=0.951;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=41;WE=1914263;WS=1914245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr2	1915749	rs12988500	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-2.029;SC=CATGGAGAGCAGCCGGTGCTC;SOR=2.948;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=19;WE=1915757;WS=1915739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr2	1926437	rs1529667	G	T	5829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=83;PP=2965;SC=GCGTCCTTCCGGGGAAGTCCT;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=177;WE=1926445;WS=1926427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	1946646	rs7355555	A	C	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=57;PP=2068;ReadPosRankSum=-2.004;SC=ATTGACCAAGAAGAACAATTT;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=149;TCR=107;TR=135;WE=1946654;WS=1946636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,148:0.51:288
chr2	1946770	rs148009982	TTCCTCC	T	2532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.00;MQRankSum=4.904;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr2	1946914	rs3748988	A	G	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=746;ReadPosRankSum=0.195;SC=CCCCTGGCTCATCATTGTCCT;SOR=0.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=53;WE=1946922;WS=1946904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr2	3193040	rs17682	G	A	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=953;ReadPosRankSum=0.595;SC=AAAGAGCTGCGACTGTTTGAG;SOR=0.420;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=66;WE=3193048;WS=3193030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr2	3200948	rs1037467	C	A	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=251;SC=CCTTAAATGGCAAAAATGAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=3200956;WS=3200938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	3212247	rs7584823	G	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=1.471;SC=TCATCTGTCAGTTGGGAGGGG;SOR=0.749;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=18;WE=3212255;WS=3212237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
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chr2	3217777	rs11127386	A	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=439;SC=CCGCTCCCCCAACCCCACGAC;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=3217785;WS=3217767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	3217794	rs10865535	T	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=576;SC=CGACAGGCCCTGGTGTGTGAT;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=3217802;WS=3217784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr2	3277947	rs2694081	T	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TACCCTTAAGTGGGGTGCACA;SOR=0.420;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=3277955;WS=3277937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	3356849	rs4854122	A	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=595;SC=TATAACTTTCATAACTAATAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=3356857;WS=3356839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	3356953	rs2875394	A	T	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=51;PP=2660;SC=AAAAAGCATGATATGTTTAGG;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=131;WE=3356961;WS=3356943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	3358458	rs146001084	ATTATGAAGTTAGAT	A	2813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=37;PP=2974;SC=TTTAATAGAGATTATGAAGTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=37;WE=3358479;WS=3358448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	3391826	rs11127423	C	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=2.356;SC=GCAGCGAAGCCGCGCGCCCGG;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=29;WE=3391834;WS=3391816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr2	3392021	rs140551015	C	T	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.955;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1464;ReadPosRankSum=-1.009;SC=TCAGCACGTTCTTCGGAGACA;SOR=0.508;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=242;TCF=142;TCR=100;TR=110;WE=3392029;WS=3392011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,124:0.43:288
chr2	3392075	rs10865541	T	C	3156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TCGACTCCTTTACTACCTCCG;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=112;WE=3392083;WS=3392065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,148:0.43:346
chr2	3392295	rs11686212	A	G	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1416;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CCTGAGCATGAGCGAGATGGA;SOR=0.657;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=243;TCF=120;TCR=123;TR=93;WE=3392303;WS=3392273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,115:0.39:296
chr2	3392513	rs12999423	TT	CA	4077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=2816;ReadPosRankSum=0.599;SC=CAGTGCCCCTTTAGGGATGGA;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=91;TCR=94;TR=84;WE=3392522;WS=3392503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,106:0.48:220
chr2	3393565	rs71396985	C	CAA	1846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.021;NF=7;NR=21;PP=1165;ReadPosRankSum=-1.092;SC=GGAGGGCGGACGAGTTTTATT;SOR=0.418;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=28;WE=3393573;WS=3393555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr2	3425514	rs7558487	G	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=66;PP=2218;SC=GCACACTGACGTTGTCACCAT;SOR=1.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=95;WE=3425522;WS=3425504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	3425948	rs10206964	T	C	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=161;SC=CCCGTCAGGATGCCTGTGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=3425956;WS=3425938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	3428508	rs10166880	T	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=361;ReadPosRankSum=-1.586;SC=ATACATAATTTCGTAGCCTCA;SOR=0.277;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=19;WE=3428516;WS=3428498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	3469278	rs4971513	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=328;ReadPosRankSum=-0.317;SC=CTCTCTACACCGCGTCTGTAT;SOR=0.587;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=23;WE=3469286;WS=3469268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr2	3469463	rs4971514	G	C	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=37;PP=1399;SC=GGATTTCCCTGCAGGTACCTG;SOR=0.971;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=3469471;WS=3469453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	3469506	rs35561008	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=143;ReadPosRankSum=-1.696;SC=AAAGGCCTTATGATAGTTCTT;SOR=0.823;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=16;WE=3469514;WS=3469496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr2	3470115	rs7593516	T	C	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	3470124	rs7574517	G	A	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.89;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	3470186	rs11691759	G	C	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=40;PP=1554;SC=CCTGCGCTGAGCATTTCACCT;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=3470194;WS=3470176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	3470254	rs11677515	T	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=35;PP=1056;SC=GGTTAAGTGATATCCAGCTAC;SOR=1.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=3470262;WS=3470244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	3481626	.	A	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=1463;ReadPosRankSum=1.557;SC=TTCAAGCCCCACTTACTGAGT;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=44;WE=3481645;WS=3481616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr2	3481637	rs4535074	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.702;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=1463;ReadPosRankSum=1.432;SC=CTTACTGAGTTGGAAAGCTCC;SOR=0.240;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=42;WE=3481645;WS=3481616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr2	3481659	rs4321399	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=0.861;SC=TAGAGAAGGCGCTTCTCCCTG;SOR=0.491;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=37;WE=3481667;WS=3481649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr2	3481716	rs4535075	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=-0.620;SC=CCAAGGAGTATACAGGTGTTT;SOR=0.399;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=25;WE=3481724;WS=3481706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
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chr2	3483390	rs7569694	T	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-1.271;SC=GCCCAGGACTTCCCCGCAGTT;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=13;WE=3483398;WS=3483380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	3488502	rs9752130	A	G	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=934;ReadPosRankSum=0.533;SC=AGATGCTGTCAGCCTCGCATC;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=172;TCF=104;TCR=68;TR=74;WE=3488510;WS=3488492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,107:0.45:237
chr2	3502909	rs10627319	A	ACTT	3019.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.970;NF=3;NR=38;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CCTTCTACTTAGTATTTATTA;SOR=0.825;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=9;TCR=99;TR=41;WE=3502918;WS=3502899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr2	3502910	rs58219575	G	T	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.189;NF=16;NR=38;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.082;SC=CTTCTACTTAGTATTTATTAA;SOR=0.797;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=142;TCF=47;TCR=95;TR=54;WE=3502918;WS=3502899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,75:0.42:179
chr2	3504290	rs6146601	GTGTACCTGCCGCCGCA	G	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=1039;ReadPosRankSum=0.254;SC=GCTCGTGGGTGTGTACCTGCC;SOR=0.602;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=3;WE=3504313;WS=3504280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	3504687	rs9950	A	G	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGTCCCTCACATCGAAGTACC;SOR=0.629;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=76;WE=3504695;WS=3504677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,94:0.44:212
chr2	3504819	rs34240449	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.11;MQRankSum=1.155;NF=11;NR=24;PP=532;ReadPosRankSum=-1.951;SC=ACGCAAGCTCACACCCACCCA;SOR=0.469;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=35;WE=3504827;WS=3504809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr2	3504893	rs35008570	G	GA	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.004;NF=0;NR=10;PP=296;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCATAAAAATGAAACTACACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=3504901;WS=3504883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	3518643	rs7566663	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=106;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GCTGGAGCCATGGCAGAGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=3518651;WS=3518633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr2	3523324	rs10179340	A	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=25;PP=839;SC=GCCGCGCTTTATCTTATAGGG;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=3523332;WS=3523314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	3523444	rs6751350	C	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ATTCAAGCCCCGACCCTGTCC;SOR=0.631;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=5;WE=3523452;WS=3523434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	3595834	rs13002108	C	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=0.976;SC=CTTCCCTTTCCCCTAACTTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=3595842;WS=3595824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	3605468	rs12711976	A	G	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CACAGGGTTTATTAGGCCACC;SOR=0.718;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=195;TCF=83;TCR=112;TR=94;WE=3605476;WS=3605458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,105:0.48:220
chr2	3605528	rs62106013	T	G	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr2	3605538	rs34613047	A	C	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr2	3627648	rs7576238	G	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=37;PP=1355;SC=CTCTGGAGTTGCCCAGAGGGC;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=3627656;WS=3627638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	3651351	rs72767190	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=460;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGTTCCTAAGGCCGGGGCTCC;SOR=1.096;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=26;WE=3651359;WS=3651341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr2	3652616	rs3769507	G	C	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=32;PP=1467;SC=TTCTGCAGGTGAGGCATGGGT;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=67;WE=3652624;WS=3652606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	3653576	rs7604806	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=668;SC=TGATAAATGTACCTGCTTTAG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=3653584;WS=3653566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	3653844	rs3739147	T	C	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=33;PP=874;SC=GTCAGTAGCCTGCACTGGTGG;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=3653852;WS=3653834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	3660752	rs3811531	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=551;SC=GCGGCTGGGCTGCAGGCGGGG;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=3660760;WS=3660742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	3685046	rs3811528	T	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=624;SC=GGTCGGGTTATCCGTGCACGT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=3685054;WS=3685036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	3685074	rs3811527	A	G	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=7;PP=727;SC=GGAGGAGGCCACGGTGTCACC;SOR=2.252;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=39;WE=3685082;WS=3685064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	3688910	rs113226829	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-1.763;SC=AGTGTGAGTGCGCTGAGATCA;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=16;WE=3688918;WS=3688900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
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chr2	3726163	rs2043080	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=0.212;SC=CAACGGTTCGTTCATCGAAGT;SOR=0.512;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=27;WE=3726171;WS=3726153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
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chr2	3749151	rs66473381	GGAA	G	2827.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.944;NF=3;NR=41;PP=1978;ReadPosRankSum=3.036;SC=TGACAACTCAGGAAGAAGAAG;SOR=0.631;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=44;WE=3749161;WS=3749141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
chr2	3749267	rs11681270	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CTCAGACTGTGCTATTTCCCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=3749275;WS=3749257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	3751606	rs56104311	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=1.275;SC=GGCGGCGGGCCGCGAGCGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=10;WE=3751614;WS=3751596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr2	3756073	rs17505481	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=0.449;SC=TCGTTTCTAAGGAGTCTGGAA;SOR=1.659;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=13;WE=3756081;WS=3756063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr2	3774436	rs357940	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=741;SC=TGGTCTGCCTCTCTCTGCATC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=3774456;WS=3774426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	3774448	rs12711970	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCTGCATCCTTCCTGGACCC;SOR=1.791;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=22;WE=3774456;WS=3774426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr2	3774519	rs357941	T	C	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=39;PP=1792;SC=AGGGCAGTGCTGTGCACACTG;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=104;WE=3774527;WS=3774509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	3800383	rs357969	C	T	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=62;PP=1777;ReadPosRankSum=0.150;SC=ATCTTTTGGGCGACTCAAAGG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=85;TCR=124;TR=103;WE=3800391;WS=3800373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,114:0.47:241
chr2	3800496	rs357968	C	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=751;ReadPosRankSum=0.027;SC=CAACAGTGAGCATGCTTCGTA;SOR=0.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=52;TCR=78;TR=55;WE=3800504;WS=3800486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,65:0.41:158
chr2	3815250	rs10180257	A	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=632;SC=TCTCTGAGGAACTTGTGTCTT;SOR=2.115;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=3815258;WS=3815240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	3815532	rs11404437	A	AT	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=1.228;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	4672834	rs71906919	CTG	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=136;ReadPosRankSum=1.006;SC=TTTCCTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=4672843;WS=4672817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	7001225	.	ACACACACACG	A	405	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=2;PP=405;QD=23.6666666667;SC=ATGTACGTATACACACACACG;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=7001243;WS=7001214;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr2	7001233	rs3085147	ACG	A	2308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.50;SOR=2.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	7001249	rs202012587	ACACACACACC	A	466.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	7001251	.	ACACACACC	A	539.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr2	7001259	.	C	A	1437	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MMLQ=26;MQ=59.73;NF=54;NR=22;PP=1437;QD=19.3654106914;SC=ACACACACACCCACACACTTA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=7001267;WS=7001249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	7003879	rs2712039	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=104;SC=GGACTGGAGTGTTTTATTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=7003887;WS=7003869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	7005069	rs2595172	C	T	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=15;PP=1338;SC=AGAACCGGCTCTACAGACCAG;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=7005077;WS=7005059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	7005369	rs11678810	A	G	3952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=61;PP=2422;SC=GTGCCTCCTGACAGGCGCCCA;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=7005377;WS=7005359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	7005992	rs4669108	C	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=819;SC=GGCAGGAGCCCTGGGGCTGGG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=7006000;WS=7005982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	7017903	rs10182815	A	G	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=9;PP=1422;SC=TGGCATACAGAGACTGCTCTG;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=7017911;WS=7017893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	7019079	rs6704746	A	G	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=28;PP=1640;SC=GATGAATTTCACAAAGCAATC;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=7019087;WS=7019069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	7027323	rs9917321	T	A	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=75;PP=2495;SC=CTTTTGCTGATTTCCTTCAAG;SOR=1.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=123;WE=7027331;WS=7027313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	7050426	rs6725201	G	C	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1165;ReadPosRankSum=0.177;SC=AGGCCGTCAAGGTGTGGGGAT;SOR=0.962;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=193;TCF=87;TCR=106;TR=89;WE=7050434;WS=7050416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,105:0.43:246
chr2	7050483	.	A	ATGTGTG	782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.153;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr2	7076975	rs55971680	A	AGTGT,AGT	160.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.516;NF=2;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=-0.900;SC=CACACACAGTAGTGTGTGTGT;SOR=1.075;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=7076984;WS=7076965;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.29:17
chr2	7130521	rs1622254	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.343;NF=1;NR=5;PP=109;ReadPosRankSum=1.434;SC=ATATTTACACACACACACACA;SOR=2.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=6;WE=7130529;WS=7130511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	7137067	rs364891	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=532;SC=GATGACCACAACAAGGTACCG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=7137075;WS=7137057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	7137317	rs378548	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-2.003;SC=TTCTTGTTGAGGCCTTCACAC;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=7137325;WS=7137307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	7154632	rs309325	T	C	7618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=105;PP=2965;SC=GATTAGAAACTGCAATTAGCT;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=127;TCR=105;TR=232;WE=7154640;WS=7154622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr2	7164578	rs376219	A	G	5017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=70;PP=2965;SC=AGCGAGACGAAGGCTGCGCGC;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=153;WE=7164586;WS=7164568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	7164746	rs392709	C	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=32;PP=985;SC=AGCTTGGTGCCTACTCCTGTG;SOR=1.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=43;WE=7164754;WS=7164736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	7164812	rs392409	C	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=353;SC=AACATTAACTCATGAGCGCCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=7164820;WS=7164802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	7170388	.	CTGTGTGTG	C,CTG	525	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=58.56;NF=0,0;NR=30,30;PP=39,525;QD=1.4;SC=CAGAGAGAGACTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=98;TCF=2;TCR=96;TR=30,30;WE=7170403;WS=7170377;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:98
chr2	7243449	rs10617957	AGTGTGT	A	7136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.368;NF=48;NR=54;PP=2997;SC=TGCATGAGTGAGTGTGTGTGT;SOR=1.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=102;WE=7243464;WS=7243439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr2	7386192	rs72770055	T	C	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=23;PP=2140;SC=TGCGCATGTGTGTGTGCGTGT;SOR=2.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=75;TCR=23;TR=98;WE=7386200;WS=7386182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	7403641	rs111726098	T	TACACAC,TACAC	1930.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=11,11;NR=6,6;PP=720,42;SC=CAGGTATAGATACACACACAC;SOR=2.964;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=17,17;WE=7403649;WS=7403631;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:40
chr2	7421569	rs142314951	C	CTG	613.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.6312;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.162;NF=16;NR=0;PP=669;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGATGCACGTCTGTGTGTGTG;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=16;WE=7421577;WS=7421559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr2	7471480	.	T	TCACA	213	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=55.4;NF=3;NR=3;PP=213;QD=36.0;SC=TCTTTGTCTTTCACACACACA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=6;WE=7471488;WS=7471470;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,6:0.60:10
chr2	7471732	rs6732990	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	7540646	rs5829105	C	CA	720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=619;ReadPosRankSum=-1.975;SC=GAAGGTCAAGCAAGCATTCGA;SOR=0.846;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=18;WE=7540654;WS=7540636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr2	7540695	rs2163257	C	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=256;ReadPosRankSum=1.587;SC=ACAAACACTTCATGGACAGAT;SOR=0.656;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=15;WE=7540703;WS=7540685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr2	7540784	rs4669196	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=2.166;SC=AAAGAATATATAAAGTTTATT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=7540792;WS=7540774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	7594516	rs1466671	G	A	11999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=1.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr2	7594520	rs1466672	C	T	12294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr2	8178735	rs1364054	A	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=569;ReadPosRankSum=-0.218;SC=TGTGCTAATTATCTCTGTGAT;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=39;WE=8178743;WS=8178725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr2	8822912	.	A	C	845	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=24;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=58.34;NF=35;NR=7;PP=845;QD=20.9469336321;SC=AAAAAAAAAAAAAAAACCCTT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=42;WE=8822920;WS=8822902;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr2	8866844	rs13024421	C	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=588;SC=GTACTGAATACTGCAGGCAAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=8866852;WS=8866834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	8870814	rs6431959	A	G	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=24;PP=1902;SC=TCTGTCATAAAGGTACAGTAA;SOR=1.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=84;WE=8870822;WS=8870804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	8871342	rs1044280	C	A	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=60;PP=2893;SC=CCTTTTCAAGCTGGGAGTCAT;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=130;WE=8871350;WS=8871332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	8898036	rs6750682	A	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=1053;SC=CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=8898044;WS=8898026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	8910987	rs12476359	A	T	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=62;PP=1738;SC=AAAAGCATTTAAAAATTAATA;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=92;WE=8910995;WS=8910977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr2	9514917	rs33930824	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=283;ReadPosRankSum=0.332;SC=CAGCCAAGTACATCGAGAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=18;WE=9514925;WS=9514907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
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chr2	9547171	rs10929579	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=473;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GCCTGGGTCAGTGGAACCCAT;SOR=1.110;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=25;WE=9547179;WS=9547161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr2	9552379	rs10929581	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=0.653;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.049;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
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chr2	9554255	rs10208358	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=372;ReadPosRankSum=0.536;SC=GTAAAACCACGTGAACATCAA;SOR=1.101;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=19;WE=9554263;WS=9554245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	9554280	rs12474647	A	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=556;ReadPosRankSum=1.115;SC=AAGCGCAGACAATCAATGATC;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=31;WE=9554288;WS=9554270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
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chr2	9569972	rs7589401	A	T	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=773;ReadPosRankSum=0.180;SC=GGGTGATGGAACTAGAATTAT;SOR=0.893;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=47;WE=9569980;WS=9569962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr2	9571054	rs2002044	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=0.995;SC=CTCTATATGGCATGTATGGTT;SOR=0.027;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=9571062;WS=9571044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	9572888	rs12478467	A	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=1.146;SC=AAGTACTATTAAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=4;WE=9572896;WS=9572878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	9576553	rs6432003	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=289;ReadPosRankSum=0.667;SC=AAGATAATAATGTGGTCTTGG;SOR=1.012;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=20;WE=9576561;WS=9576543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
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chr2	9583922	rs11681316	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=0.149;SC=AGCCTTTCACATGCACTCGGA;SOR=0.399;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=13;WE=9583930;WS=9583912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr2	9615556	rs6432007	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AGTGAGGCGGTGTGGCCTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=9615564;WS=9615546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	9616035	rs7591166	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	9616301	rs3831465	TAGG	T	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=-0.411;SC=AATCAGTATATAGGAGAAGGA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=9616311;WS=9616291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr2	9630244	rs3833563	AT	A	381.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=418;ReadPosRankSum=1.191;SC=GCTGTGATTGATTTGTAGGTC;SOR=0.610;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=10;WE=9630252;WS=9630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
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chr2	9642478	rs34367192	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GCTACAGTTACGTTACAGTGA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=9642486;WS=9642468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	9642521	.	C	T	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=28;QD=20.9237375157;SC=CTCCTGGCTCCGTCACCCACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=9642529;WS=9642511;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	9650350	rs35431407	C	CATAA	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.28;MQRankSum=1.212;NF=0;NR=11;PP=534;ReadPosRankSum=1.085;SC=TAAATAGAGCCTTATAATCAG;SOR=1.769;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=11;WE=9650358;WS=9650340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr2	9661184	rs4328603	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=645;SC=TGCTGCTACATGGGATGGGGT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=9661192;WS=9661174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	9662410	rs35744046	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=317;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GACATATACATACACTATACC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=18;WE=9662418;WS=9662400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr2	9695906	rs12692386	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=336;SC=CGACGCCCCCAGAAGTGCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=9695914;WS=9695896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	9981672	rs112717131	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.039;NF=18;NR=1;PP=388;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TGCTTGAACCTGGGAAGCGGA;SOR=1.338;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=19;WE=9981680;WS=9981662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	9983529	rs114421205	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=7.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.423;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr2	9983529	.	GC	AA	407	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=60.31;NF=7;NR=8;PP=407;QD=30.6978583241;SC=CCCCGAGCGCGCGGTTTCCCT;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=15;WE=9983538;WS=9983519;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:37,15:0.29:52
chr2	9983530	rs114862830	C	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=7.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.423;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr2	9983582	rs62621835	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.400;NF=10;NR=7;PP=175;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TCTCGCGTTTCCGGCCGGAAG;SOR=0.794;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=17;WE=9983599;WS=9983572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr2	9983591	rs35818430	A	AG	3135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=24;PP=1589;SC=TCCGGCCGGAAGCTTCTCCAG;SOR=0.824;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=34;WE=9983599;WS=9983572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	9983686	rs2303914	G	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.24;MQRankSum=1.045;NF=7;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=0.815;SC=CCTCGAGGAGGCGGTAAGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=19;WE=9983694;WS=9983676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	9983704	rs144776624	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.26;MQRankSum=-0.836;NF=6;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=1.689;SC=GAGGCGGTGCACCTGGCGGGC;SOR=0.871;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=16;WE=9983724;WS=9983694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	9983716	rs385513	A	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=22;PP=784;SC=CTGGCGGGCCACGATCGCCGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=9983724;WS=9983694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	9985247	rs76407483	A	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=627;ReadPosRankSum=-1.138;SC=ATTTTTTATTAATAAAGTTGC;SOR=1.188;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=88;TCF=70;TCR=18;TR=33;WE=9985255;WS=9985237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr2	9989442	rs16867195	A	G	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.10;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	9991556	rs287991	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=3;PP=262;SC=TGGGTTAATTGAAAAAAAAAG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=9991564;WS=9991546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	9994288	rs4669471	C	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=804;SC=ATGCTACATACAGACCCCAGA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=9994296;WS=9994279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	10008872	rs12623017	A	G	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=46;PP=1579;SC=GTCTTCAAAGAAAAGTTGTAG;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=10008880;WS=10008862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	10044941	rs450192	G	T	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=8;PP=1074;SC=TTAAAAATAAGTTTTGTTGCA;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=10044949;WS=10044931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	10045014	rs400917	C	T	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;QD=45.24;SOR=1.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	10045024	rs396190	G	A	7881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=42.15;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr2	10045147	rs448327	A	G	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=73;PP=2332;SC=TAAGTGTGTGACATATATTGT;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=103;WE=10045155;WS=10045137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	10050947	rs1054561	T	C	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=29;PP=1025;SC=ATCCTATAGCTAAAATGGCAA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=10050968;WS=10050937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	10050960	rs1054565	A	G	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=29;PP=1043;SC=AATGGCAAAAACTGTTAAGTA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=10050968;WS=10050937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	10051053	rs10495576	G	C	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=263;SC=GTAAGTGTACGTCAATTTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=10051061;WS=10051043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr2	10059097	rs2303921	A	C	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1524;ReadPosRankSum=0.617;SC=GAAATCTCAGATAGTGCTTCA;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=85;WE=10059105;WS=10059087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,101:0.53:192
chr2	10059329	rs193108127	T	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=-0.305;SC=AATGCTTAAGTTTTTTACTTT;SOR=0.260;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=10059337;WS=10059319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	10059770	rs1820965	G	T	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=38;PP=2332;SC=CACTGGTCGAGTCAACAGCAA;SOR=1.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=111;WE=10059778;WS=10059760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	10092933	rs141313862	CTTAG	C	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTCCCAGTTTCTTAGTTATTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=10092944;WS=10092927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	10094992	rs2303918	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=4;PP=508;SC=AGCTTATGATACCTTGCAGTA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=10095000;WS=10094982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	10095185	rs16867251	T	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=571;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TCAATGGAGATGAAGACAGCG;SOR=0.996;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=43;WE=10095193;WS=10095175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr2	10101468	rs16867256	A	G	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=688;ReadPosRankSum=-1.022;SC=CGGAATCTCAATACTGACCAG;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=49;WE=10101476;WS=10101458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr2	10105535	rs41264203	T	C	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.787;NF=29;NR=37;PP=920;ReadPosRankSum=0.626;SC=CTGGGCGCCTTATGTCCAGCC;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=66;WE=10105543;WS=10105525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr2	10105644	.	T	C	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=58.27;NF=0;NR=5;PP=43;QD=15.5542425094;SC=ACTATCCTCTTCCCTTTTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=10105652;WS=10105634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,5:0.36:14
chr2	10139017	rs33958552	C	CAT	340.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=0;PP=254;SC=CATATATATACATATATATAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=10139025;WS=10139007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	10188649	rs11687357	A	T	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=1026;ReadPosRankSum=-2.795;SC=GGAACTATGTATGCAGCTTCC;SOR=0.790;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=58;WE=10188657;WS=10188639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,87:0.54:162
chr2	10225241	rs6432058	C	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=687;SC=CTGAGTAAGACGATGTTTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=10225249;WS=10225231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	10226306	rs34098251	G	GC	4450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=59;PP=2185;SC=GAATAGACCAGCGAGCTCTGA;SOR=1.160;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=12;TCR=68;TR=70;WE=10226314;WS=10226296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	10262920	rs1130609	T	G	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=905;ReadPosRankSum=0.945;SC=TCGCTGCGCCTCCACTATGCT;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=55;WE=10262928;WS=10262910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,57:0.46:125
chr2	10264057	rs6432065	T	C	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=49;PP=1009;ReadPosRankSum=-1.925;SC=TCGTCTTGTATGTTTTTCCAT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=60;TCR=114;TR=76;WE=10264065;WS=10264047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
chr2	10281903	rs5829249	G	GC	829.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=9;PP=795;SC=GGTGGCCATGGCCTGGGGCTG;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=10281911;WS=10281898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	10282147	rs11896140	T	C	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=1350;ReadPosRankSum=0.496;SC=GCTATGCCCCTTGCTCTTTCA;SOR=0.840;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=62;TCR=97;TR=79;WE=10282155;WS=10282137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr2	10332876	rs56228505	AC	A	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.131;SC=CTGCCACTCCACCCCCCCCTG;SOR=0.646;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=10332884;WS=10332866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	10563236	rs55737425	G	A	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=81;PP=2414;SC=TGGGGGCGGGGCTGCATGTGT;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=122;WE=10563244;WS=10563226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	10566792	rs2270306	C	G	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=36;PP=1859;SC=CCCATCCTCTCTGGAAGCATA;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=95;WE=10566812;WS=10566782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	10566804	rs2270307	A	G	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=41;PP=2034;SC=GGAAGCATAAAGAACAGTGAG;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=102;WE=10566812;WS=10566782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	10595534	rs6721235	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=64;PP=2391;SC=CTGGATTCTTTTCCTGTTTTT;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=113;WE=10595542;WS=10595524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	10717806	rs2287059	C	T	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=70;PP=2608;SC=ACGGTGGTGTCGGATACACTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=140;WE=10717814;WS=10717796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	10762302	rs70953325	TA	T	5724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=82;PP=2951;SC=GGTAAACAGTTAACACAGGAA;SOR=1.135;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=13;TCR=84;TR=94;WE=10762310;WS=10762292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	10774531	rs77767350	C	T	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=211;SC=AACAAGGCTTCAGCTGAAATG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=10774539;WS=10774521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	10794618	rs200890328	T	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=674;ReadPosRankSum=0.335;SC=TGAGTTGGGGTAGAGACAAAC;SOR=1.156;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=41;WE=10794626;WS=10794608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr2	10808776	rs55925118	C	CAA	1762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=15;PP=1059;SC=ATTACTAAAACTACTCACGCA;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=21;WE=10808784;WS=10808766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr2	10908662	rs12468989	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=0.392;SC=ATGGCTTGGCGCCTGGGTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=10908670;WS=10908652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr2	10908893	rs1198849	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=774;ReadPosRankSum=-1.265;SC=GGCCGCCTACAACACTCTGAA;SOR=0.851;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=50;WE=10908901;WS=10908883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr2	10911891	rs1198850	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=13;PP=1042;SC=AGTGCCCGGGTGTGGGTGTGT;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=10911899;WS=10911881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	10912153	rs2171773	T	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=278;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TGGACGAGGATGCTCCCTGCC;SOR=1.387;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=14;WE=10912161;WS=10912143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr2	10912719	rs72777388	G	A	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=71;PP=1938;ReadPosRankSum=-2.209;SC=CAGACATGGTGGTCCCTCGAT;SOR=1.050;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=209;TCF=87;TCR=122;TR=112;WE=10912727;WS=10912709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,144:0.57:254
chr2	10914867	rs56195743	A	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=185;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CCACTCCCGCACAAGGCCTAG;SOR=0.956;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=11;WE=10914875;WS=10914857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr2	10915020	rs2969881	A	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.616;SC=AGGGTCCTCCAGGTTTGGTTC;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=87;TCR=51;TR=73;WE=10915028;WS=10915010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr2	10915037	rs13020917	C	T	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1342;ReadPosRankSum=-1.464;SC=GTTCATCTCCCGCTGCGGGGG;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=94;TCR=55;TR=80;WE=10915045;WS=10915027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr2	10922516	rs1686482	A	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=365;ReadPosRankSum=0.462;SC=GTATCCAGAAACAGCAGTATT;SOR=0.283;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=19;WE=10922524;WS=10922506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr2	10924524	rs1198873	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=0.123;SC=TCTCATTTTATGGAAGAGCGA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=13;WE=10924532;WS=10924514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr2	10928777	rs2952626	A	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=929;ReadPosRankSum=1.202;SC=GAAAGCCTATAATCAGCTGTT;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=59;WE=10928785;WS=10928767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr2	10928906	rs1734432	T	C	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1181;ReadPosRankSum=0.418;SC=CTGATTTAAATAGACAAAGTT;SOR=0.600;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=68;WE=10928914;WS=10928896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,77:0.43:180
chr2	10928962	rs1734431	A	G	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.988;SC=ATCCATTTAGAAAGTATTCTC;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=60;WE=10928970;WS=10928952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr2	10929133	rs1734430	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.025;SC=GACAAGGGACAATCAGGAGGC;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=10929141;WS=10929123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	10929867	rs11904084	T	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=986;ReadPosRankSum=0.665;SC=GCAGTTGAAGTGGTTTACCTC;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=74;WE=10929875;WS=10929857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr2	10930050	rs1686514	A	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=406;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AAATCCAATTAACACTTAATG;SOR=0.228;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=29;WE=10930058;WS=10930040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr2	10930106	.	ATTT	A	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.9987;HP=18;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=59.8;NF=0;NR=5;PP=60;QD=12.6;SC=CTTATAGGTAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=10930116;WS=10930096;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,5:0.28:18
chr2	10931001	rs1614107	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=92;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TTTGAGACACAGTCTCTCTCT;SOR=0.045;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=10931009;WS=10930991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	10932082	rs1734421	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=385;ReadPosRankSum=0.315;SC=CATCAAACAATTGGGCCAAGA;SOR=0.148;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=18;WE=10932090;WS=10932072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	10933249	rs4799	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=678;ReadPosRankSum=0.294;SC=ATCCTCCGCTCCGTCCCCCGA;SOR=1.035;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=45;WE=10933257;WS=10933239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr2	10937037	rs1734343	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTGACACATATTTCATCTTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=10937045;WS=10937027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	10937095	rs56147885	T	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=426;ReadPosRankSum=1.676;SC=TTATAGATAATTCAGGTACAA;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=28;WE=10937103;WS=10937085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr2	10937409	rs1686444	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=0.406;SC=ATCTGCTTCACATAGACTCAG;SOR=0.927;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=12;WE=10937417;WS=10937399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr2	10937980	rs17365181	T	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=252;ReadPosRankSum=1.589;SC=CAATGGTCTATTGAATGAGAT;SOR=1.785;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=16;WE=10937988;WS=10937970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
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chr2	10942687	rs4758	C	T	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=1353;ReadPosRankSum=0.769;SC=GGTTGAAATTCGATGGAGTTA;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=181;TCF=105;TCR=76;TR=92;WE=10942695;WS=10942677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,106:0.51:207
chr2	10950284	rs1734449	G	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.000;NF=30;NR=5;PP=683;ReadPosRankSum=1.107;SC=CATATATTAAGTCATTTAAGA;SOR=1.230;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=54;TCR=11;TR=35;WE=10950292;WS=10950274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr2	10952790	rs6726687	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=339;ReadPosRankSum=1.115;SC=CTCCCTCCGCTGGCCCGCACC;SOR=1.026;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=27;WE=10952798;WS=10952780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr2	10959292	rs56321198	C	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.180;SC=TATGACTAGACCTCATTTTGT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=10959300;WS=10959285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	10959384	rs55770944	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=184;ReadPosRankSum=0.392;SC=CTACTCTGGGAGTTTCCTCTA;SOR=0.489;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=14;WE=10959392;WS=10959374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr2	10959407	rs72779451	A	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=0.511;SC=TACCGGGTGCATTAGCCATGG;SOR=0.635;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=16;WE=10959415;WS=10959397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr2	10959461	rs72779452	G	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=543;ReadPosRankSum=-2.110;SC=ATAGGGAGTGGGCAGGAGAAG;SOR=0.499;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=21;WE=10959483;WS=10959451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr2	10959475	rs72779453	G	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=543;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GGAGAAGTTGGTGAGCCTGAA;SOR=0.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=18;WE=10959483;WS=10959451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr2	10960866	rs56121730	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=480;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TGGGGTGGCCCGAAGCCAGGG;SOR=0.479;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=37;WE=10960874;WS=10960856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr2	10960952	rs56025654	G	A	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1093;ReadPosRankSum=1.421;SC=CCAGTGGTCGGCACACCCACA;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=78;WE=10960960;WS=10960942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,89:0.54:165
chr2	10961184	rs1686497	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=1.843;SC=CAGAATTTTCAGGTCGTGTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=10961192;WS=10961174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	10994418	rs1198852	T	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=334;SC=TGAGCCACTGTGTCCGGCCTC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=10994426;WS=10994410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	10994937	rs1198851	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=116;ReadPosRankSum=0.405;SC=GGTGGCCTCCCTTTCCATAAG;SOR=0.959;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7;WE=10994945;WS=10994927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	11053020	rs3732104	A	G	6404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=111;PP=2965;SC=GCGTGGACGCAGCCGAGGGCC;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=84;TCR=111;TR=194;WE=11053028;WS=11053010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr2	11053740	rs3732105	C	T	5736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=98;PP=2965;SC=GTGGTGTCATCGCCATCGCCC;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=83;TCR=98;TR=181;WE=11053748;WS=11053730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr2	11264830	rs7560331	G	A	5371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=68;PP=2965;SC=CGTGGACCTGGCAACCTGCTC;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=160;WE=11264838;WS=11264820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	11273407	.	GTC	G	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,14:0.17:80
chr2	11273722	rs371357801	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=0.421;SC=GCGCTGGTGAGTACCTGCCCT;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=15;WE=11273730;WS=11273712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	11295226	rs148805827	C	CG	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	11295329	.	T	G	48	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=48;QD=13.7952020912;SC=GGGGCGAATCTGGGGGCGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=6;WE=11295337;WS=11295319;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,6:0.19:31
chr2	11295867	rs7598570	G	C	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=39;PP=989;SC=AGCTGCTGCCGGCTGGGAGCC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=11295875;WS=11295857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	11300732	rs2271622	C	T	5761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=82;PP=2965;SC=CCCCCTCACTCGGAGCCTCTC;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=176;WE=11300740;WS=11300722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr2	11300869	rs6432182	T	C	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=54;PP=1263;SC=ATGTTATTTGTGAATGGTATG;SOR=1.413;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=81;WE=11300877;WS=11300859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	11312181	rs12987956	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AGTAAGAACCGGACTCACATG;SOR=0.533;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=21;WE=11312189;WS=11312171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr2	11312224	rs3732103	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CAAGTGTCTACGTAGTAGGGT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=11312232;WS=11312214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	11348364	rs141148984	C	CTAACT	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=345;SC=ATGAATAAACCTATTAATTCA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=11348372;WS=11348354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	11348609	rs5829297	CAAAT	C	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=247;SC=CATAAATTTACAAATAAAAGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=11348620;WS=11348599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	11356190	rs726843	G	A	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=12;PP=571;SC=TTCAAGGCACGTATTACTATG;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=11356198;WS=11356180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	11357100	rs57554471	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=167;SC=CACCCACCTCGGCCTCCCAAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=11357108;WS=11357090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	11359031	rs9808228	G	T	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=3;PP=77;SC=AAAACATGGGGATTACTAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=11359039;WS=11359021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	11359120	rs2230774	G	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=10;PP=337;SC=TATGGAATCAGTTTCTCTACA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=11359128;WS=11359110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	11680896	rs34137466	CAA	C	1195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.229;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.444;NF=2;NR=20;PP=928;ReadPosRankSum=1.156;SC=GGAGGACCGTCAAAGAGTTTA;SOR=1.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=22;WE=11680905;WS=11680886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr2	11702661	rs10929757	A	C	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=67;PP=2441;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGCCCCCCAAACCCTTTCCAG;SOR=0.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=127;WE=11702669;WS=11702651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr2	11718591	rs1529868	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1055;SC=AGCTGCTAAACCCACAGAGCT;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=11718599;WS=11718581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	11728854	rs72772076	G	A	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=54;PP=1850;ReadPosRankSum=0.014;SC=GTGCCAAGTCGCTGCTGTTCC;SOR=0.563;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=238;TCF=138;TCR=100;TR=125;WE=11728862;WS=11728844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,138:0.53:259
chr2	11738091	rs1435547	T	C	6287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=126;PP=2965;SC=CTCTGCTCCATGTGTGGCATT;SOR=1.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=76;TCR=126;TR=202;WE=11738099;WS=11738081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	11738765	rs1865575	C	T	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=908;SC=AAACCCAGTGCGCATGTTTGC;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=11738773;WS=11738755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	11741157	rs16857679	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CTTGTGTAGCAATATCACTTG;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=17;WE=11741165;WS=11741147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr2	11741193	rs11681838	C	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=457;SC=CATTTAGTAACAGCCTTGACC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=11741201;WS=11741183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	11751166	rs55890755	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=0.653;SC=AGGTGCTGTGCGCAGGGAGGG;SOR=0.306;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=14;WE=11751174;WS=11751156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr2	11752635	rs2304399	T	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=17;PP=765;SC=GGCAGAAAATTGAGGATGTGG;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=11752643;WS=11752625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	11755443	rs2252958	T	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=248;ReadPosRankSum=0.716;SC=CTCAGCCTACTTGTCCCTGTC;SOR=0.037;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=15;WE=11755451;WS=11755433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr2	11757009	rs6735957	A	G	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=761;SC=GAGAGTAAATATTGTGGTCAA;SOR=3.545;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=11757031;WS=11756999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	11757023	rs892868	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.076;SC=TGGTCAACTTCGGATCGGAGA;SOR=0.257;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=13;WE=11757031;WS=11756999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	11774324	rs2304402	G	A	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1236;ReadPosRankSum=0.434;SC=GGCGGCCCCCGACATCATGCA;SOR=0.713;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=85;WE=11774332;WS=11774314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,99:0.50:197
chr2	11778184	rs33962728	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TTGCCATTCAGCTGAGAGAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=11778192;WS=11778174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	11810095	rs6432225	G	A	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=45;PP=2253;SC=CACCACGTGCGCGGACAGCGC;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=11810103;WS=11810085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	11817812	rs4669769	G	C	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=42;PP=1932;SC=CCAGCTGGGAGACCTCGCAGG;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=97;WE=11817820;WS=11817802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	11853774	rs12465629	T	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=20;SC=ATGTTCAAAATGTAGAGTTCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=11853782;WS=11853764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	11853988	rs12465630	A	T	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=40;PP=1318;SC=ACATTTTAAGATTAGAGAAAA;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=11853996;WS=11853978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	11854099	rs4668739	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=439;SC=CCGCAGCACTTGCTGGATGCT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=11854107;WS=11854089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	11905636	rs3214670	GT	G	2279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;QD=27.47;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	11905876	rs10209969	C	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=44;PP=1201;SC=TCTCAGGGCACGGGGACCTGG;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=11905884;WS=11905866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	11924950	rs3795974	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=846;ReadPosRankSum=0.229;SC=CACTGGATGGTGATGTAGGAC;SOR=1.090;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=64;WE=11924958;WS=11924940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr2	11931931	rs78343196	A	AT	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=223;ReadPosRankSum=-0.591;SC=GTTTTCTCTGATTTTTTTTTA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=14;WE=11931939;WS=11931921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	11932173	rs7561070	G	T	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=44;PP=1350;SC=CTTAGCAAGTGTTGGTTTTGT;SOR=2.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=11932181;WS=11932163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	11936798	rs2577264	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=440;SC=AAGAAAGAATAGGAAGGCACC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=11936806;WS=11936788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr2	15319070	rs5829492	TA	T	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.107;NF=10;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=1.127;SC=TTTGAAACATTAAAAAAAAAA;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=18;WE=15319078;WS=15319060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	15378822	rs140225141	G	GAATT	224.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=95;SC=TTAAAAAAAAGAATAGTGAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=15378830;WS=15378812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	15470848	rs34395824	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=481;ReadPosRankSum=0.688;SC=TGGTCCAGCGCAATAGGTCAG;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=30;WE=15470856;WS=15470838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr2	15491994	rs10605991	GCACACACACA	G	1194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.262;NF=19;NR=15;PP=2219;ReadPosRankSum=0.205;SC=TGGTCTGCATGCACACACACA;SOR=0.800;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=34;WE=15492013;WS=15491984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr2	15493881	rs2277915	A	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=575;ReadPosRankSum=-0.320;SC=GAAGAAGAATATTCAATCTAA;SOR=1.026;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=33;WE=15493889;WS=15493871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr2	15519992	rs2058866	G	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=316;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GTTATAGAGAGGGAAGATTCA;SOR=0.660;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=24;WE=15520000;WS=15519982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr2	15523266	rs6756934	A	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=337;SC=ATGGTCATCAATCTTGTATCC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=15523274;WS=15523256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	15523307	rs3834149	TA	T	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-2.116;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr2	15523549	rs3755129	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=0.839;SC=CACCACTCTATATCCACATCA;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=7;WE=15523557;WS=15523539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr2	15533689	rs2380650	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.368;SC=AACTATTCACTTACCAAATGA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=15533697;WS=15533679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	15533734	rs139494535	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=2156;ReadPosRankSum=-1.156;SC=TTGTCTGAGAGAAATGAAAGC;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=7;WE=15533742;WS=15533724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	15533779	rs9710889	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=-0.383;SC=ATGAAAAGTCGTAGCAACTTT;SOR=0.510;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=26;WE=15533787;WS=15533769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr2	15533884	rs9710962	C	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=893;ReadPosRankSum=0.607;SC=AATACCATTCCGCAAACAAAA;SOR=0.922;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=17;WE=15533907;WS=15533874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	15533895	rs13417550	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	15533899	rs11689153	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	15564718	rs10929367	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.624;SC=ATGTATGTGGTTTGTGTATCT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=15564726;WS=15564708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	15567649	rs3796002	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TCCTTTGTAGTATTTAATTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=15567657;WS=15567639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	15601287	rs11411624	A	AT	1381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.977;NF=22;NR=9;PP=771;ReadPosRankSum=1.101;SC=TTATCAATATAAAAAAGAAGG;SOR=0.973;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=31;WE=15601295;WS=15601277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr2	15601441	rs7590340	C	T	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACAGAATTTCCAGGGCTTGTA;SOR=0.394;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=85;WE=15601449;WS=15601431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,111:0.62:180
chr2	15601574	rs7590458	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=1.587;SC=TATGAAACACCTTGAAATGAC;SOR=0.512;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=15601582;WS=15601564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	15607842	rs4668909	T	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr2	15614404	rs13014906	T	C	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=991;ReadPosRankSum=0.073;SC=CTTCTCCAGCTCTAGTCTCCA;SOR=0.623;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=57;WE=15614412;WS=15614394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,62:0.65:95
chr2	15615910	rs1990754	A	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.362;SC=AAGTTTTCACAGATGAAACAG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=79;WE=15615918;WS=15615900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,91:0.43:211
chr2	15616013	rs1990755	C	G	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=664;ReadPosRankSum=1.027;SC=ATCTAAGAAGCGAAAAACAAA;SOR=0.357;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=31;TCR=65;TR=48;WE=15616021;WS=15616003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr2	15616030	rs1990756	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.060;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=0.597;SC=CAAATCAATACAAATGCATCT;SOR=0.212;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=40;WE=15616038;WS=15616020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr2	15618339	rs1125534	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=1.124;SC=ATCACATTTCGTAGAACTCAC;SOR=1.038;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=11;WE=15618347;WS=15618329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr2	15623608	rs10201564	C	G	100.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=-1.611;SC=AAAATTAAGGCCGAAAATGAG;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=15623616;WS=15623598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	15644107	rs3732002	C	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.57;ReadPosRankSum=-2.226;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr2	15644111	rs3732003	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.76;ReadPosRankSum=-1.429;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr2	15644401	rs2287265	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TAAAATGTCCCTTTATAATGA;SOR=0.899;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=32;WE=15644409;WS=15644391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr2	15674686	rs13029846	T	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=676;ReadPosRankSum=1.364;SC=GGGTGGTAAATAGCTGTGTTG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=45;WE=15674694;WS=15674676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr2	15676686	rs10208972	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.099;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=802;ReadPosRankSum=0.181;SC=CTACAGAAGAGGGGGAAATTA;SOR=2.030;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=41;WE=15676694;WS=15676676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr2	15678368	rs7595512	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CATTTGAGCACACATACAGCT;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=15678376;WS=15678358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	15678482	rs2380657	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=570;ReadPosRankSum=1.462;SC=CGTTTTTAGTTTCTCCACTCA;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=40;WE=15678490;WS=15678472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr2	15678501	rs66736557	GA	G	919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.485;NF=11;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=0.468;SC=CATTATTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=0.663;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=27;WE=15678509;WS=15678491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr2	15679609	rs2058868	A	T	88.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TCTCTAATAAAGCTTCCCTCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=15679617;WS=15679599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	15691791	rs55977282	G	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=427;ReadPosRankSum=-1.147;SC=ACATGGTTTTGTGGCTCAATT;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=31;WE=15691799;WS=15691781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr2	15691886	rs7572131	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.490;SC=CATATATATGGAATATAGTGA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=15691894;WS=15691876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	15694164	rs34789730	T	TA	1929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CAGAAAAACATTGAATTTCAC;SOR=0.760;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=32;WE=15694172;WS=15694154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr2	15731998	rs10221770	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=0.374;SC=CGCCACTGCCACGCCGTGTCA;SOR=0.302;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=26;WE=15732006;WS=15731988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr2	15735648	rs2302929	T	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=811;ReadPosRankSum=0.140;SC=ATCTATCCCATTGATCTTAGG;SOR=0.714;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=55;WE=15735656;WS=15735638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
chr2	15736697	rs2032778	G	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	15746220	rs41264195	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=364;ReadPosRankSum=-0.880;SC=ATTTTGTATACGATGGTTTTC;SOR=1.000;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=26;WE=15746228;WS=15746210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr2	15747393	rs10929378	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=913;ReadPosRankSum=0.990;SC=AAACTTTGAACAACATCAAGC;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=59;WE=15747401;WS=15747383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr2	15753279	rs2302934	C	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAAATGGATGCAGATCAAACA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=15753287;WS=15753269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	15768981	rs62122280	C	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=288;ReadPosRankSum=0.941;SC=TTGTAGGGCTCTATTATATTC;SOR=0.207;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=15;WE=15768989;WS=15768971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr2	15769607	rs807635	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=113;ReadPosRankSum=0.903;SC=TATATCATACCTATAATCTAT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=15769615;WS=15769597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	15840505	rs4668460	C	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=854;ReadPosRankSum=-0.642;SC=ATGTTTGGATCTATTGCAGCC;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=60;WE=15840513;WS=15840495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr2	15840522	rs4668461	G	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AGCCATACTGGGAACATCAGG;SOR=0.864;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=71;WE=15840530;WS=15840512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,80:0.47:169
chr2	15840645	rs4668962	T	C	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1024;ReadPosRankSum=2.043;SC=ACTGCCCCACTTCTGGACTTA;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=66;WE=15840653;WS=15840635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr2	15841288	rs1421609	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CATTGATGTGGCTATCTGTGT;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=10;WE=15841296;WS=15841278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	17696573	rs834514	C	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=41;PP=1749;SC=CATATTAGGACCTGCTATAGT;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=17696581;WS=17696563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	17698678	rs665312	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=37;PP=1383;SC=TATTTTGGCTACTGAGTGATG;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=17698686;WS=17698668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	17773524	rs2680827	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=429;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TTTCAACCTTGTTTTTATTCC;SOR=0.399;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=25;WE=17773532;WS=17773514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr2	17836722	.	TCA	T,TCACA	266	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=57.03;NF=0,0;NR=7,7;PP=126,266;QD=18.4285714286;SC=CTGCAGCTATTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=7,7;WE=17836731;WS=17836712;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.30:23
chr2	17883218	rs11681696	T	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=209;SC=TAAAAAAAAATTTAAACCGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=17883226;WS=17883208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	17884495	rs1065381	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=17;PP=971;SC=TTTTCAAGGGCAGATAAATGT;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=49;WE=17884503;WS=17884485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	17888457	rs6734462	G	A	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1221;SC=CAGTGGGAATGATACAGTAAA;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=17888465;WS=17888447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	17890091	.	G	GTATA	103	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=103;QD=59.0;SC=TGAAAATTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=17890099;WS=17890081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr2	17897488	rs35195207	T	C	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=63;PP=1934;SC=TTCAGTTGCCTCTGATTGTAG;SOR=1.456;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=93;WE=17897496;WS=17897478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	17898326	rs12469221	C	T	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=18;PP=1016;SC=AATGGGATAGCCATGAAAATT;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=17898334;WS=17898316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	17899558	rs77083822	C	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=160;SC=AAATAATTATCTATAGTTCAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=17899566;WS=17899548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	17913266	rs2052746	A	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=378;SC=TGCAAATTAGATTTACATCAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=17913274;WS=17913256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	17927275	rs12474069	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=272;SC=ATATTAAACTCAACAAAATAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=17927283;WS=17927265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	17954027	rs300175	G	A	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=59;PP=1868;SC=AGGCAACTCAGTGAAGTAGAG;SOR=1.374;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=89;WE=17954035;WS=17954006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	17954284	rs142043428	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTATTAAATGGGAGGAGATTG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=17954292;WS=17954274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	17959405	rs143973077	G	GTA	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.280;NF=1;NR=18;PP=525;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TTGTATATGTGTATATATATA;SOR=0.160;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=19;WE=17959413;WS=17959395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	17959420	.	T	TAC	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.141;NF=0;NR=18;PP=579;ReadPosRankSum=0.745;SC=TATATATATATACACACACAC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=18;WE=17959428;WS=17959410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr2	17998025	rs34069439	A	T	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=54;PP=2405;SC=GGGGCAGCGAAGGCTGCAGTG;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=17998033;WS=17998015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	17998095	rs35858730	C	T	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=47;PP=2534;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CCAGCCCACCCACCTTCAGGG;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=114;WE=17998103;WS=17998085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,142:0.99:144
chr2	17998331	rs13001625	T	C	9037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=160;PP=2965;SC=CAGACCTCCTTAACCGCGGCA;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=114;TCR=160;TR=274;WE=17998339;WS=17998321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr2	18112473	rs4240213	G	A	6119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=CCGATAAGGAGTACTACTTTG;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=195;WE=18112481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	18113623	rs4832524	A	G	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.870;SC=GCGGATGCACACCTTCATTAC;SOR=0.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=66;WE=18113631;WS=18113613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,85:0.58:146
chr2	18113789	rs3747515	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=316;ReadPosRankSum=0.632;SC=ATCCTTTCCCGACATTAGGTT;SOR=0.582;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=16;WE=18113797;WS=18113779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr2	18757501	rs3902946	G	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGAATTTGTCGAGCCCATGCT;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=23;WE=18757509;WS=18757491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr2	18768164	rs78862800	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=528;ReadPosRankSum=-1.134;SC=ACCCCCCGGAACAGCAAAGTA;SOR=0.443;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=38;WE=18768172;WS=18768154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr2	18768850	rs16985306	A	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=721;ReadPosRankSum=0.786;SC=ACCTCATTCCAGGCTCATTCT;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=40;WE=18768858;WS=18768840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr2	18770540	rs6720633	G	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=202;ReadPosRankSum=0.862;SC=TCCCTTTTCTGTACTCTTTCC;SOR=0.171;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=18770548;WS=18770530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr2	20131079	rs1191778	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=35;NR=33;PP=1335;SC=CTTCATCTGTTCATGGTATTG;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=68;WE=20131087;WS=20131069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	20131184	rs1191779	C	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=655;SC=AAACATTTTTCAAAATTGAGG;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=20131192;WS=20131174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	20233135	rs1191824	T	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=523;SC=TAAATAGGGTTATACAAAACC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=20233143;WS=20233125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	20302487	.	AAGG	A	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=8.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=-0.192;QD=5.57;ReadPosRankSum=3.992;SOR=2.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr2	20403794	rs10205485	A	T	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=46;PP=1919;SC=CGTTGAGGCCAGATGAGTGGT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=98;WE=20403802;WS=20403784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	20405050	rs6531225	A	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=494;SC=ACCACTGCCCACAGGCATGAC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=20405058;WS=20405040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	20423154	rs4666375	A	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=1164;SC=AGCAGTGGAGAACCCGAGTGC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=20423162;WS=20423144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	20699625	rs13010768	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCTGAGCAAGGTCCTTCACC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=3;WE=20699633;WS=20699615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr2	20699667	rs342089	C	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.525;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=181;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CAGCAGTCACCCCACATCTAG;SOR=0.051;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=13;WE=20699675;WS=20699657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	20700900	rs342088	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=27;PP=1183;SC=CTTCTTTGCTAGCCTTGGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=20700908;WS=20700890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	20798006	rs34750020	CT	C	1128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.799;NF=8;NR=14;PP=824;ReadPosRankSum=1.433;SC=GCTTGTTTGCCTGCAACTAGA;SOR=0.582;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=22;WE=20798014;WS=20797996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr2	20818454	rs3732152	T	A	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=35;PP=1722;SC=GGGGCTGGGCTTCTGGTTGGC;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=94;WE=20818462;WS=20818444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	20818517	rs3732150	T	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.401;SC=ATAAGACACATTGGGCTCTGG;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=73;WE=20818525;WS=20818507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,89:0.55:161
chr2	20818816	rs111886213	G	A	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1652;ReadPosRankSum=1.295;SC=TGTCCATCTCGTCCATGGCTT;SOR=0.837;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=119;WE=20818824;WS=20818806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,136:0.48:281
chr2	20822218	rs4666444	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=456;SC=CACCACAGAGTGGGGGGCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=20822226;WS=20822208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	20823612	rs13030108	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=13;PP=606;SC=CTCTGTCCAGAACACTCTCAG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=20823620;WS=20823602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	20823724	rs6531248	T	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=22;PP=738;SC=CACAGGCGGCTGGCAGCAGGA;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=20823732;WS=20823714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	20823816	rs2305460	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.133;HP=5;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CAGCAGGGGGGTCAGAGGAAG;SOR=0.313;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=17;WE=20823824;WS=20823806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr2	20823850	rs6733419	T	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	20823858	rs2305459	C	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.85;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	20824498	rs2305458	C	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=33;PP=1326;SC=TTACGGTCCACGGATGACACG;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=20824506;WS=20824488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	20824691	rs17663045	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=507;ReadPosRankSum=0.150;SC=GAGGATTTCCCACAAGTGTCC;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=33;WE=20824699;WS=20824681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr2	20841053	rs369949630	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=498;ReadPosRankSum=2.319;SC=GTGCCAGGTACGCCCGCCTGC;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=13;WE=20841067;WS=20841043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	20841059	rs4666449	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=469;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GGTACGCCCGCCTGCTGCCCC;SOR=0.382;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=12;WE=20841067;WS=20841043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	20845273	rs2304423	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=620;ReadPosRankSum=0.508;SC=CGCCTGCCAGGGGAAAAGAAG;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=41;WE=20845281;WS=20845263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr2	20870579	rs13013489	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=227;ReadPosRankSum=0.049;SC=CACTGCGGCGGCTGGGCTTCG;SOR=0.825;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=19;WE=20870587;WS=20870569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr2	20871190	rs4666457	A	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=70;PP=1786;SC=AGGTAGCGCGAGGGCCGGGGA;SOR=1.774;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=100;WE=20871198;WS=20871180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr2	20884586	rs10182643	G	C	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=48;PP=2558;SC=AGGCAGAGCTGCTTCTGGAAA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=20884594;WS=20884576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
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chr2	20939708	rs653347	C	T	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.322;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
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chr2	21227383	rs1800479	C	G	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=1220;ReadPosRankSum=0.368;SC=AAGAAAATCACAATGAGTTTT;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=70;WE=21227391;WS=21227373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr2	21232195	rs693	G	A	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1859;ReadPosRankSum=-1.502;SC=TATCTTCTAGGGTCTCTCGGA;SOR=0.605;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=229;TCF=126;TCR=103;TR=101;WE=21232203;WS=21232185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,108:0.42:255
chr2	21232803	rs584542	T	C	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.47;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	21232803	.	TG	CA,CG	744	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=16,33;NR=28,56;PP=726,744;QD=17.7151789741;SC=TGCTCAAGAATGTCATTTATT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=44,89;WE=21232812;WS=21232793;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.49:89
chr2	21232804	rs1041968	G	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr2	21235475	rs568413	T	C	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=54;PP=1771;SC=AGACCCATCATATGATAGTGT;SOR=2.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=21235483;WS=21235465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	21236482	rs488329	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=379;SC=GACCTTCACAACAATATTGTA;SOR=1.911;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=21236490;WS=21236472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	21237238	rs3749054	A	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.879;SC=TTAAAAATTTAAAAAAATGTC;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=21237246;WS=21237228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	21241744	rs12720828	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=275;ReadPosRankSum=-1.277;SC=ATAGGCCTGCCGCTTAGTGGG;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=20;WE=21241752;WS=21241734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr2	21245813	rs1801700	G	A	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=996;ReadPosRankSum=-1.147;SC=AGAAGTTGGTGTTCATCTGGA;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=74;WE=21245821;WS=21245803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,92:0.50:184
chr2	21250914	rs679899	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=352;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TTCTTTCAGAGCTTCTTTCAC;SOR=1.532;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=24;WE=21250922;WS=21250904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,33:0.32:104
chr2	21252365	.	GAGGAAGGA	G	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;MQRankSum=1.843;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.219;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr2	21255573	rs10701091	C	CCATCT	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=649;SC=TCAAATCTAACTTCAAAACCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=21255581;WS=21255563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	21263900	rs1367117	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=350;ReadPosRankSum=1.280;SC=CTCTTTCAGGGTGCACTGGCT;SOR=0.430;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=25;WE=21263908;WS=21263890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr2	21266774	rs17240441	GGCAGCGCCA	G	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=419;ReadPosRankSum=0.732;SC=CAGCAGCGCAGGCAGCGCCAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=21266790;WS=21266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	23860238	rs75133321	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=755;ReadPosRankSum=0.034;SC=AAGACTATTAGTGAGTGCGGC;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=48;WE=23860246;WS=23860228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr2	23865260	rs642931	T	C	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1055;ReadPosRankSum=0.114;SC=CCACCCTGATTGCACACTCCT;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=168;TCF=75;TCR=93;TR=79;WE=23865268;WS=23865245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,86:0.46:187
chr2	23919169	rs72796125	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=618;ReadPosRankSum=0.253;SC=CTCCTCACCCCGCCCGCTCTC;SOR=0.809;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=33;WE=23919177;WS=23919159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr2	23926233	rs72796138	C	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=816;ReadPosRankSum=1.708;SC=GGAGCTTCATCGAGTCCCCAA;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=51;WE=23926241;WS=23926223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr2	23977060	.	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=213;ReadPosRankSum=-1.412;SC=TCTACAAGTTGTGATTTGTCA;SOR=1.071;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=16;WE=23977068;WS=23977050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr2	24021231	rs17509001	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=378;ReadPosRankSum=1.797;SC=ACAACTCAAATTGATTATTCT;SOR=1.319;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=19;WE=24021239;WS=24021221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr2	24042550	rs2879639	C	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=731;SC=AAAAATATACCATAATTCTAA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=24042558;WS=24042540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	24055058	rs10432637	G	C	6905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=105;PP=2965;SC=ACACCCCACTGTCTTTAGTTT;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=206;WE=24055066;WS=24055048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr2	24087621	rs72788214	A	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=1.224;SC=AATTTACTCAAATAACATTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=24087629;WS=24087611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr2	24108557	rs72790304	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=435;ReadPosRankSum=0.159;SC=CAATTAAAATGAAAAATATTT;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=25;WE=24108565;WS=24108547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	24108652	rs7579201	T	C	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=42;PP=2207;SC=TCGACGATTCTGTCGGATGTT;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=24108660;WS=24108642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	24111311	rs72790306	T	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=0.284;SC=CATCAACATTTGCTTATATAA;SOR=1.151;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=28;WE=24111319;WS=24111301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr2	24149439	rs61739076	G	A	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=852;ReadPosRankSum=0.851;SC=GCCTCATCCAGAGTGACGCCG;SOR=0.633;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=56;WE=24149447;WS=24149429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,66:0.67:98
chr2	24181159	rs12616678	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TACTTTCTTTGTACTTTTACA;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=12;WE=24181167;WS=24181149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	24238928	rs72781680	C	T	305.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=0.889;SC=CCCTCCGGTCCCGGTTCCCAG;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=24238936;WS=24238918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr2	24239189	rs113601626	T	TCCTGGC	2120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.140;NF=4;NR=22;PP=1581;ReadPosRankSum=-0.291;SC=AGGCACCTGGTCCTGGCCCTG;SOR=0.729;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=26;WE=24239197;WS=24239179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr2	24245659	rs17712391	C	T	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=22;PP=1381;ReadPosRankSum=1.090;SC=GCTGGCAGCACGGCCCTGGCG;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=116;TCR=45;TR=81;WE=24245667;WS=24245649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr2	24246175	rs12989842	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=882;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GTAAACCTGCCGTCCCAGGCC;SOR=1.525;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=85;TCF=16;TCR=69;TR=47;WE=24246183;WS=24246165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr2	24246679	rs925228	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=603;ReadPosRankSum=0.808;SC=TACCAAGCTCAGGGCATCCAT;SOR=0.411;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=35;WE=24246687;WS=24246669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr2	24255862	rs10179142	C	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1301;SC=CAGAAGTAATCGAGTTAACAT;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=24255870;WS=24255852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	24255991	rs17763442	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=432;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CTAAAAAATCCGAACAAAACA;SOR=0.844;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=29;WE=24255999;WS=24255972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	24262060	rs3731620	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=539;ReadPosRankSum=-0.702;SC=AGTCTGAGACGTCAGCCATTT;SOR=0.806;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=37;WE=24262068;WS=24262050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr2	24272645	rs116520786	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=0.560;SC=GGAGCGACGGCGGGGCTGGGG;SOR=1.096;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=11;WE=24272665;WS=24272635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	24272657	rs111634163	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=857;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GGGCTGGGGCCGGAGCCGAGC;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=24;WE=24272665;WS=24272635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr2	24276736	rs11125393	T	C	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=845;ReadPosRankSum=0.542;SC=TTTTCCAATATCCTACTCCTT;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=53;WE=24276744;WS=24276726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,64:0.41:157
chr2	24277104	rs12469126	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=-1.750;SC=TGTTGCAGGTATGGTGGAGCC;SOR=0.826;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=25;WE=24277112;WS=24277094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr2	24283853	rs13016301	A	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=661;ReadPosRankSum=-1.760;SC=TGGGATCAGCACTCTGCCCTC;SOR=1.405;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=32;WE=24283861;WS=24283843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr2	24291445	rs72783611	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-1.299;SC=AATTGAAATACGTTTTTAGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=7;WE=24291453;WS=24291435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	24300563	rs10209238	T	C	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=970;ReadPosRankSum=0.549;SC=GCAGCAGACGTTGGGGGCCCT;SOR=1.148;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=61;WE=24300571;WS=24300553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr2	24300740	rs10194831	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=0.885;SC=TGAAAAAGCACACAGGGACAC;SOR=0.446;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=24300748;WS=24300730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	24302246	rs2303287	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=382;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CTTCCTTTCTCGGGGTAATGT;SOR=0.449;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=27;WE=24302254;WS=24302236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr2	24307250	rs36207095	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=2.413;QD=14.17;ReadPosRankSum=4.419;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	24307260	.	A	ACAGGGCAGGG	823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.12;MQRankSum=0.744;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.097;SOR=1.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr2	24338428	rs1056123	T	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=288;ReadPosRankSum=1.134;SC=AATAATAAAATTGTCTTTCAT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=19;WE=24338436;WS=24338418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
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chr2	24343867	rs67397664	ACTTT	A	567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=343;ReadPosRankSum=1.438;SC=TCTTGATAGGACTTTCTTTCA;SOR=0.116;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=8;WE=24343878;WS=24343857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	24344060	rs33913065	T	G	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1347;ReadPosRankSum=1.809;SC=AATATTCATCTGCCCGGACAC;SOR=0.819;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=87;WE=24344068;WS=24344050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,111:0.47:234
chr2	24345562	rs7592020	C	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.742;SC=GGTGGTCCATCATTCAGGGCC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=24345570;WS=24345552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	24358001	rs12329297	G	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TTTAGCTAAAGAAGATACTGA;SOR=0.886;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=12;WE=24358009;WS=24357991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr2	24358160	rs12329043	A	C	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATATGGAAAAAAGAATTAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=24358168;WS=24358150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	24369674	rs11693860	C	T	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=63;PP=2184;SC=ACAAGGATAACGAAAAAAGAA;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=49;TCR=63;TR=112;WE=24369682;WS=24369664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	24384424	rs4665667	T	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=38;PP=2385;SC=ATTTGAAACCTTTGGCAAGAG;SOR=1.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=109;WE=24384432;WS=24384414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	24386925	rs35664527	C	CA	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=309;SC=TATTTTCACACAAAAAAAGTA;SOR=1.981;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=24386933;WS=24386915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	24387178	rs113322110	G	GC	1857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=33;PP=1706;SC=TTGAGCCTCAGCAGGAACGGG;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=37;WE=24387186;WS=24387168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	24388096	rs4665668	G	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=273;SC=AGCTGGCACCGATGTCTCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=24388104;WS=24388086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	24395269	rs918802	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=294;SC=AGCCTTTCCTTCGTTCAAGTA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=24395277;WS=24395259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	24395294	rs918803	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=543;SC=TAGAAATTTCTTAAGTTTTCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=24395302;WS=24395284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	24395506	rs889830	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=46;PP=1098;SC=CGGACTCAAGTGATCCTCCCA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=63;WE=24395514;WS=24395496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	24398281	rs2042467	T	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=443;SC=CCCAAAGGCCTGGCTCTCAAC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=24398289;WS=24398271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	24400769	rs55661701	A	C	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1007;ReadPosRankSum=1.296;SC=TGCATTCTACATATGTTCTAG;SOR=0.692;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=58;WE=24400777;WS=24400759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,79:0.47:167
chr2	24402127	rs61193015	C	CAA	2241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=1712;SC=TAAAATGAAACGAGAATGTTG;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=33;WE=24402135;WS=24402117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	24413298	rs2288073	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=30;PP=1508;SC=AAGCTCATCTATGCAGACAAG;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=24413306;WS=24413288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	24429234	rs138070209	CCCGGCGGGAAGGAAGGTGGAGATGCAGGGGG	C	650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.316;NF=3;NR=7;PP=1289;ReadPosRankSum=-1.527;SC=CATGGGGGGGCCCGGCGGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=10;WE=24429272;WS=24429224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	24431184	rs2303291	C	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=575;ReadPosRankSum=-1.526;SC=TGCACCCAGGCGGTCCTACGG;SOR=0.730;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=37;WE=24431192;WS=24431174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr2	24432138	rs2303292	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=678;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGCTAGAACACTCCACCCGCC;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=36;WE=24432146;WS=24432128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr2	24432211	rs2303293	C	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=1031;SC=AGGGGTCTAGCGTCTAAGGTC;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=24432219;WS=24432201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	24432620	rs2303294	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=346;ReadPosRankSum=0.469;SC=GTCTGCCAGGAAGGCCTTAAG;SOR=1.093;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=20;WE=24432628;WS=24432610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr2	24432667	rs2303295	C	G	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=25;PP=1937;SC=TGATGCTACCCCCAGACGCGT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=95;WE=24432675;WS=24432657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	24432839	rs2303296	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=761;ReadPosRankSum=0.141;SC=GTCTTGTATAATTTCCCACTG;SOR=0.862;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=34;TCR=82;TR=51;WE=24432847;WS=24432829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr2	24432937	rs2303297	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=0.825;SC=TTTTAAATCCCGGCACAAACC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=24432945;WS=24432927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	24433595	rs147548718	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CTCGGAGCTGGTTCCCCACCC;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=12;WE=24433603;WS=24433585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
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chr2	24484150	rs4665680	T	C	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=781;SC=TATAAGTATATTTATTTGTTT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=24484158;WS=24484140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	24521493	rs7559133	C	T	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=22;PP=1518;SC=CAGGTAGCTCCATCATCATTC;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=24521501;WS=24521483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
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chr2	24524725	rs72793213	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=1.847;SC=CTTTTCAAGTATAACTTGTTG;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=7;WE=24524733;WS=24524715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	24524958	rs7603997	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=942;ReadPosRankSum=-1.439;SC=TCACCATCAACGTCAGCCAGA;SOR=0.902;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=60;WE=24524966;WS=24524948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr2	24881409	rs55807924	T	TG	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.439;SC=ATGGCTGTAATTATCTATTCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=24881417;WS=24881399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	24896389	rs4665712	T	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=197;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GCCAGTTTGGTTTTTTCTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=17;WE=24896397;WS=24896379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr2	24905927	rs11125744	G	C	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=59;PP=2313;SC=TAATGAATACGAGCGTCTACA;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=117;WE=24905935;WS=24905917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	24929851	rs3731628	A	T	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1446;ReadPosRankSum=-1.194;SC=CCAGGATGCCAAACAATTCCT;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=88;WE=24929859;WS=24929841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,114:0.54:211
chr2	24933689	rs7593430	A	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=232;SC=TTTCTTCATTATCTCAAAGTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=24933697;WS=24933679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	24951374	rs56265609	T	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=375;ReadPosRankSum=-1.501;SC=ATTATTTAACTGATGGAGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=27;WE=24951382;WS=24951364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr2	24952740	rs11439247	C	CT	1044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=20;PP=941;SC=CGAAGTCTCACCTGTCACCAG;SOR=2.066;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=21;WE=24952748;WS=24952730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	24962533	rs55923052	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=294;ReadPosRankSum=0.383;SC=TAGTTTTCTTTGAGAATGAAT;SOR=0.557;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=19;WE=24962541;WS=24962523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	24974945	rs11125763	T	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=15;PP=768;SC=AGAGTTCTCTTCTCCAGCAAA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=24974953;WS=24974935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	24975122	rs3731630	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.712;SC=GAACATTATGTAAAGTGAAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=24975130;WS=24975112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	24985719	rs12612839	T	G	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=1073;ReadPosRankSum=-1.302;SC=GTAGCATCATTAAGAGCCTGA;SOR=0.419;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=59;WE=24985727;WS=24985709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr2	25015984	.	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=343;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CCCTCCGCCCGAGTGCCTCAC;SOR=0.801;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=20;WE=25015992;WS=25015974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr2	25022442	rs34475213	TA	T	92.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=1;PP=87;SC=AAAGTTCTGGTAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=25022450;WS=25022432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	25022598	rs1550116	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=271;ReadPosRankSum=-1.587;SC=TCCCGTAAACAGTCTGAAGAG;SOR=0.576;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=19;WE=25022606;WS=25022588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr2	25037042	rs1003064	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GACCTGTACAGTCTCCACTTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=25037050;WS=25037041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	25039804	rs2099505	G	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=214;SC=TTTATATACTGTACATTACTC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=25039812;WS=25039794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	25040423	rs10178420	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.173;NF=19;NR=11;PP=440;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GAGATTGAATGTCAGTGATCC;SOR=0.461;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=30;WE=25040431;WS=25040413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr2	25046090	rs1127568	T	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=11;PP=449;SC=AGTCAAAATCTGAGATGATTT;SOR=1.214;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=25046098;WS=25046080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	25047408	rs7604576	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=880;ReadPosRankSum=-0.561;SC=TTTTCTACCTACAGACACAGA;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=58;WE=25047416;WS=25047398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
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chr2	25064193	rs2241759	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=1.099;SC=CCCGGTAGTCGGGCAAGCCGC;SOR=0.742;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=22;WE=25064201;WS=25064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr2	25100738	rs10865315	C	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=393;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGGGCAACAGCTGTACCTGGG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=27;WE=25100746;WS=25100728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr2	25100902	rs2033656	C	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=-1.506;SC=TGACAGAGGTCCACAGCCCCT;SOR=0.883;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=18;WE=25100910;WS=25100892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr2	25141538	rs11676272	A	G	4201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=84;PP=2638;ReadPosRankSum=-0.662;SC=ACGGCGAGGGAAGCCAGCTTG;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=383;TCF=204;TCR=179;TR=171;WE=25141546;WS=25141528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,205:0.45:457
chr2	25190127	rs6749438	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=372;ReadPosRankSum=-0.159;SC=ATTTAGACACGAATCTTTTCT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=30;WE=25190135;WS=25190117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr2	25194586	rs7593743	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=378;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CGGGGGCGGAGAGGAGGCCGG;SOR=0.357;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=22;WE=25194594;WS=25194576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr2	25194741	rs7593864	G	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1074;ReadPosRankSum=1.313;SC=GAGACCTGCCGGGCTCCTTCC;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=147;TCF=55;TCR=92;TR=70;WE=25194749;WS=25194731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr2	25313988	rs11414211	T	TG	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=316;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GAATGGCACATGGCAGATGTC;SOR=1.721;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=25313996;WS=25313978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	25314186	rs2918630	T	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=893;ReadPosRankSum=0.811;SC=TTCCCATTCTTATTCCAGGTG;SOR=1.135;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=52;WE=25314194;WS=25314176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr2	25316045	rs10495751	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=1.779;SC=GGAACTATATTGTTAGGCTAA;SOR=1.057;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=27;WE=25316053;WS=25316035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr2	25360186	rs112767688	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=1468;ReadPosRankSum=1.076;SC=CCGACCCTGGCCTTCTGCCCG;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=32;WE=25360204;WS=25360176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr2	25360196	rs116074763	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.808;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CCTTCTGCCCGCTCCTGTCCC;SOR=1.301;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=31;WE=25360204;WS=25360176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr2	25362194	rs6718083	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=0.294;SC=ACCACTAATGGTGAGAAGTTA;SOR=0.201;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=14;WE=25362202;WS=25362184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr2	25368005	rs10188516	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CTGCATAGTGGGCTTAAGGCT;SOR=0.313;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=21;WE=25368013;WS=25367995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr2	25368030	rs10180231	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-1.645;SC=GGAAAGCAAGTTTCTCGAGTA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=25368038;WS=25368020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	25374912	rs17046887	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=926;ReadPosRankSum=0.315;SC=TGACATGGGCGAGTCCCTGGG;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=64;WE=25374920;WS=25374902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,84:0.55:152
chr2	25376681	rs113389176	G	A	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1141;ReadPosRankSum=1.507;SC=CCCAGTATTGGGGTTCCTCAT;SOR=0.482;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=146;TCF=57;TCR=89;TR=75;WE=25376689;WS=25376671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,102:0.54:188
chr2	25377176	rs2164808	T	C	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=53;PP=1541;SC=TCCCCGTCTATGAAATGAAGT;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=25377184;WS=25377166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	25377329	rs2118404	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=0.060;SC=TAGATGGCAGCGCCTCCCAGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=25377337;WS=25377319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	25384456	rs10654394	C	CGCCGCTGCT	2813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.579;NF=6;NR=18;PP=2978;ReadPosRankSum=1.304;SC=TTCTGCCCTGCGCCGCTGCTG;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=24;WE=25384464;WS=25384446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr2	25384705	rs6713396	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	25462327	rs72810046	C	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=370;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GGGTTGTCCTCTACACTGTTC;SOR=1.292;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=20;WE=25462335;WS=25462317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr2	25463483	rs2289195	G	A	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=25;PP=1403;SC=CAGCTGAGAAGGTGGAGGGGA;SOR=1.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=25463491;WS=25463473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	25466888	rs2289093	G	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=473;SC=TGCAGGCCCAGCGGTGTCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=25466896;WS=25466878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	25469502	rs2276598	C	T	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=54;PP=2965;SC=CTGGTGGCTCCAGGCCCTTAG;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=145;WE=25469510;WS=25469492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	25469913	rs2276599	C	T	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=31;PP=2965;SC=CCAGCAGGGACACTCACCTGC;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=102;TCR=31;TR=133;WE=25469921;WS=25469903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	25472784	rs11681447	C	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=497;SC=GCTGCGAATGCAAACCCATCC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=25472792;WS=25472774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	25551692	rs12995245	C	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=75;SC=TGTGGGTCTGCAGGCTCACCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=25551700;WS=25551682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	25602142	rs2304426	G	A	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=43;PP=2965;SC=GGGAGGCAGAGGACTCTTTGT;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=115;TCR=43;TR=158;WE=25602150;WS=25602132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	25602310	rs2304427	C	T	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=92;PP=2860;SC=TTGCTTCTCCCGTTACTCGTT;SOR=1.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=40;TCR=92;TR=132;WE=25602318;WS=25602300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	25610287	rs66917623	G	T	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=856;SC=CAGGGTGGGTGAGCGTGGAGA;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=25610295;WS=25610277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	25650631	rs34648410	A	G	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=54;PP=1506;SC=TTAGCATCCAATACCTCATAA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=63;WE=25650639;WS=25650621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	25650668	rs3832082	C	CT	1057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=1124;SC=GTTTTGCCTACTTCCTGGACT;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=27;WE=25650676;WS=25650658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	25656880	rs1395949	C	G	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=49;PP=1416;SC=GTGGGGAAGTCGGGAGAAAGT;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=61;WE=25656897;WS=25656870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	25973060	rs33994557	C	T	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1661;ReadPosRankSum=2.709;SC=TGGAGAAGTTCGGCTGCACTT;SOR=0.471;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=96;WE=25973068;WS=25973050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,109:0.50:218
chr2	25973309	rs10178552	C	T	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=66;PP=1921;SC=AGAAATATTCCAGTTGAAAAA;SOR=2.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=81;WE=25973317;WS=25973299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	25994220	rs6721104	A	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=276;ReadPosRankSum=-2.079;SC=CAATGTAAAAAATTTTCAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=18;WE=25994228;WS=25994210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr2	25994412	rs71399322	A	AG	3126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.743;NF=23;NR=43;PP=2353;ReadPosRankSum=-2.866;SC=CGACGATACTAGGGAAAAAAA;SOR=0.708;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=66;WE=25994420;WS=25994402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,116:0.56:209
chr2	26022277	rs34816614	T	C	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=1.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,85:0.63:135
chr2	26082046	rs34236477	GT	G	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=124;SC=CTAGGCTCAAGTTGATTCTCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=26082065;WS=26082036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	26082057	rs13422450	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=3;PP=90;SC=TTGATTCTCCTAACCTAGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=26082065;WS=26082036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	26082212	rs13425195	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.456;SC=TATTTAATTATAGCTGAACTT;SOR=2.187;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=26082220;WS=26082202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	26152793	rs3731640	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=347;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CCTCCCTCCCGTAGGCTCTTT;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=20;WE=26152801;WS=26152783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr2	26176947	rs79316183	C	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	26203678	rs1465878	T	C	6230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=82;PP=2965;SC=CTCGTTCACCTGGGGCTTGTT;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=118;TCR=82;TR=200;WE=26203686;WS=26203668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr2	26204640	rs6721440	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.840;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr2	26321526	rs11678157	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=604;SC=TTTTCTGCATTGTAGGAATAG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=26321534;WS=26321516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	26350136	rs2289022	G	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1138;SC=ACTCTGCTCTGTCTTTGTAAA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=26350144;WS=26350126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	26357748	rs2243834	G	T	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=25;PP=1759;SC=CTGTTGAATCGTGATTTTATC;SOR=1.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=26357756;WS=26357738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	26399214	rs4665830	G	A	6633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=106;PP=2965;SC=CCTTCCCAGGGGAGTACGCCG;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=88;TCR=106;TR=194;WE=26399222;WS=26399204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	26405985	rs10779956	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=26;PP=748;SC=CTCCCTCACCAGGTGTGGTGT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=26405993;WS=26405975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	26407937	rs181971256	A	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=4;PP=176;SC=GAGGGCGACCAGGAGTACGTG;SOR=1.244;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=26407945;WS=26407927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	26408064	rs4665833	T	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=391;SC=CAGGGCTCGATCTCATCTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=26408072;WS=26408054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	26414523	rs149347225	TAGA	T	1691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.407;NF=2;NR=24;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GATGTTTAGGTAGAAGAAGAG;SOR=0.658;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=26;WE=26414533;WS=26414513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr2	26415429	rs5001914	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=430;SC=GCCGAGGCGGAGGATCATTTG;SOR=4.047;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=26415437;WS=26415419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	26416301	rs7582341	A	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=10;PP=854;SC=CCTGACTCATAAAATCATTTT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=26416309;WS=26416291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	26417533	rs1865324	C	A	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=490;SC=ACATGAGCTCCCTGGCCCTGC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=26417541;WS=26417523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	26420708	rs13387855	T	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=39;PP=1343;SC=AGAGGCCACATCAAAGCTAAT;SOR=0.955;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=26420716;WS=26420698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	26420809	rs2289019	G	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=473;SC=CACCTAGGGGGTTTTGTGTCG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=26420817;WS=26420799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	26454996	rs7593175	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=8;PP=628;SC=TAAAGAGGGCATATAGCTTCA;SOR=1.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=26455004;WS=26454986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	26477125	rs147970487	G	GACT	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=658;SC=ATTCCAGAATGACTATCTTGA;SOR=1.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=12;WE=26477133;WS=26477115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	26512957	rs1056471	G	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=382;SC=CTATTAAATAGTTTGCACTTA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=26512965;WS=26512947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	26536299	rs11886746	C	G	3878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=48;PP=2182;SC=TGCTGTGGACCGGCCCCCAGA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=121;WE=26536307;WS=26536289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	26537499	rs10187359	A	C	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=968;ReadPosRankSum=1.757;SC=CACCTGCAGAAACGTGTGTGC;SOR=1.033;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=61;WE=26537507;WS=26537489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,70:0.42:165
chr2	26587076	rs11674089	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=183;ReadPosRankSum=-0.579;SC=GCGCCACTGCGCCTGGCTTTA;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=11;WE=26587084;WS=26587066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	26590084	rs6748996	T	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=-0.838;SC=TAGCCTACACTCTAGGTAAGG;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=41;WE=26590092;WS=26590074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr2	26590118	rs6731447	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=543;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TTACTATAGTCAGTGACTGGT;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=40;WE=26590126;WS=26590108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr2	26607992	rs934280	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=42;PP=1210;SC=TTGGAACAGCTTTTGCCAACA;SOR=2.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=26608000;WS=26607982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	26609469	rs7585892	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=0.773;SC=AAATGCCTCCGAGTAGAAAGG;SOR=1.545;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=15;WE=26609477;WS=26609459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr2	26647277	rs7423300	T	G	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=822;SC=TGCACTGTGCTGGACTCTTAG;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=26647285;WS=26647267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	26652671	rs4356622	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.641;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=889;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CTGCTCTTGGAGGGCCCCTGG;SOR=2.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=34;WE=26652679;WS=26652660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr2	26653457	rs4450561	G	A	6751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=74;PP=2965;SC=TTGGAGTATCGTCTTCATAAT;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=125;TCR=74;TR=199;WE=26653465;WS=26653447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr2	26663187	.	T	TTG	368.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.41;MQRankSum=0.350;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr2	26667273	rs116115107	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=812;ReadPosRankSum=0.256;SC=ATAGAGGTGACGGGGATGGAG;SOR=0.597;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=50;WE=26667281;WS=26667263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,66:0.56:117
chr2	26667615	rs939820	T	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=783;SC=TGAGAAGTTTTGGGAGATTTG;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=26667623;WS=26667605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	26671544	rs4072407	A	G	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.119;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=598;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TCTCCTCCCCATGACCCAACT;SOR=0.761;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=44;WE=26671552;WS=26671534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr2	26676322	rs1402962	A	G	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.68;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	26677810	rs2280516	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=-2.589;SC=CATGTGGGGCAGTTGGCTCTT;SOR=0.301;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=9;WE=26677818;WS=26677800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	26679394	rs1054737	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=557;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GAGCTGGACCGCCAAAGGCTG;SOR=0.933;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=41;WE=26679402;WS=26679384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr2	26705527	rs74802025	G	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-1.387;SC=GTGTGTGTGTGTGAGTGGGCG;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=18;WE=26705535;WS=26705517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr2	26707593	rs55763868	T	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=5.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CAGAACCAAATGCTGTCTTGG;SOR=0.954;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=16;WE=26707601;WS=26707583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
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chr2	26801795	rs75930789	C	T	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=59;PP=1858;SC=TTTCTTAGAACATTTGTTGTG;SOR=1.386;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=26801803;WS=26801785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	26804122	rs744539	T	G	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=28;PP=2353;SC=TAGAGGTGAGTGTGGGCCCAG;SOR=2.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=110;WE=26804130;WS=26804112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	26804143	rs744540	T	C	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=44;PP=2726;SC=TACAAAGTCATACTTCAAACC;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=90;TCR=44;TR=133;WE=26804151;WS=26804133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
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chr2	26804247	rs935172	T	C	6607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=114;PP=2965;SC=TCCCCAGAAGTGAATCCGAAA;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=83;TCR=114;TR=197;WE=26804255;WS=26804237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	26818006	rs1148962	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=437;ReadPosRankSum=-1.719;SC=CTCTATGGCCTTTCCACCCCT;SOR=1.449;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=28;WE=26818014;WS=26817996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr2	26818021	rs1148963	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=451;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ACCCCTCACCCCTCAGTCCCC;SOR=1.411;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=30;WE=26818029;WS=26818011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr2	26846282	rs1615551	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=458;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CCCCACCTACTTTTAGGATTT;SOR=0.651;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=30;WE=26846290;WS=26846272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr2	26951449	rs1663002	G	A	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=736;SC=GCCCCGAGGGGCCTGGAGCAC;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=26951457;WS=26951439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	26997031	rs13007156	G	A	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=961;ReadPosRankSum=0.137;SC=CCCAGGTCTGGGCCTCTTGAC;SOR=0.615;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=97;TCR=46;TR=59;WE=26997039;WS=26997021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr2	27014980	rs12992046	T	C	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=961;ReadPosRankSum=0.773;SC=TCCACTGAACTTACCTTTCTT;SOR=0.722;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=62;WE=27014988;WS=27014970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr2	27015118	rs13014800	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.375;NF=6;NR=10;PP=244;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGTAAGCTCCGGGAGCTTCCC;SOR=0.415;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=16;WE=27015126;WS=27015108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr2	27015141	rs35344721	G	GC	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.268;NF=2;NR=7;PP=317;ReadPosRankSum=1.232;SC=CAACCCCTATGCCACCCTCCT;SOR=0.078;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=9;WE=27015149;WS=27015131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	27015903	rs2289017	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=469;ReadPosRankSum=-0.537;SC=ATTCTGTGAATAGTTTCCTAC;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=27;WE=27015911;WS=27015893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr2	27015969	rs2289018	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=1012;ReadPosRankSum=-1.124;SC=AAAGCAGCCCGTGGCCCTTCA;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=56;WE=27015977;WS=27015959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,65:0.53:122
chr2	27157396	rs920437	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	27157400	rs920436	A	G	304.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.10;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	27163044	rs3739085	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=360;ReadPosRankSum=1.327;SC=AGGAGTGGTATGTTTCCTAGA;SOR=1.097;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=26;WE=27163052;WS=27163034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
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chr2	27167784	rs3739088	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=1.927;SC=TCTTTTGTGTCCTCTCCTCCC;SOR=1.569;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=27167792;WS=27167774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr2	27262763	rs146244277	GGGA	G	5037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=71;PP=2971;SC=CTGGGTGTCAGGGAGGAGGCG;SOR=2.221;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=7;TCR=77;TR=78;WE=27262773;WS=27262753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
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chr2	27276202	rs3806520	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=305;ReadPosRankSum=1.508;SC=GGCTGGCTCCGGCTCTCCCAC;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=21;WE=27276210;WS=27276192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
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chr2	27280127	rs6721395	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=466;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TTCTGTCCTGGTATCTGTTCA;SOR=1.758;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=28;WE=27280135;WS=27280117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr2	27290525	rs11681145	A	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=774;ReadPosRankSum=0.236;SC=GTCTGTACCCACTGCCACTGA;SOR=0.771;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=53;WE=27290533;WS=27290515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,70:0.40:177
chr2	27291661	rs7575465	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=0.773;SC=AACCCAGCAAGGCACTGTTCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=14;WE=27291669;WS=27291651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr2	27292651	rs10865461	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=0.500;SC=TTCAGAATAATTTTCTGCTTC;SOR=0.156;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=7;WE=27292659;WS=27292641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	27293150	rs1053609	G	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=817;ReadPosRankSum=2.938;SC=TTATGTTCAAGCCCAGGATAT;SOR=0.509;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=53;WE=27293158;WS=27293140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr2	27302165	rs2289360	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=375;ReadPosRankSum=0.430;SC=ATGCCACCTCTGCCTGGCTCT;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=26;WE=27302173;WS=27302155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
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chr2	27307769	rs2304682	G	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1030;ReadPosRankSum=1.693;SC=ACGTAGCACCGAGCACAACAG;SOR=0.478;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=62;WE=27307777;WS=27307759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr2	27315252	rs2304681	G	A	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CTCCTGCACCGTTCTCTCCCT;SOR=0.535;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=149;TCF=94;TCR=55;TR=77;WE=27315260;WS=27315242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,104:0.51:204
chr2	27319826	rs9677784	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=11;PP=322;SC=TTCAGGTGAGAAAACTAAGGC;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=27319834;WS=27319816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	27323385	rs1131375	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=641;ReadPosRankSum=1.191;SC=GAATTGGGGCCAACTCCAATA;SOR=1.559;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=39;WE=27323393;WS=27323375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr2	27323468	rs4665371	A	C	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=54;PP=1973;SC=GACCTGGATTAAAATCTGCCA;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=91;WE=27323476;WS=27323458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	27324036	rs1057394	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CTGGGACCAGGCAGGGGGCAC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=6;WE=27324044;WS=27324026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr2	27324340	.	G	A	196	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=54.39;NF=0;NR=10;PP=196;QD=23.0771212547;SC=CTCTGGGCCCGGGGGCATCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=10;WE=27324348;WS=27324330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,10:0.40:25
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chr2	27351948	rs6715286	T	G	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=80;PP=2965;SC=GTAGCCAGGATACATACGTCT;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=150;WE=27351956;WS=27351938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	27354173	rs11126874	C	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=703;SC=ATCTTGTCAGCGGCAACCTCA;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=27354181;WS=27354163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	27355454	rs4665948	A	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=460;SC=TTCAGCCACCACCCAAAGTCT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=27355462;WS=27355444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	27424496	rs1006898	G	A	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=12;PP=1051;SC=TCAAAGGAGGGCTTTGAGAAA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=27424504;WS=27424486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	27424636	rs1395	G	A	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.003;SC=TGGCATGCTGGAGCCCATGCT;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=71;WE=27424644;WS=27424626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,87:0.45:192
chr2	27426362	rs2580761	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=354;ReadPosRankSum=-0.701;SC=ACCTCAGAGCGGGCCTGGAAG;SOR=0.074;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=18;WE=27426370;WS=27426352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr2	27426514	rs1275521	G	C	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=26;PP=1652;SC=CCCTTGTCATGCACACAGATG;SOR=1.429;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=27426522;WS=27426504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	27428147	rs1298361	A	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=551;SC=TACTATAGCCAAGACCAGCCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=27428155;WS=27428137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	27428295	rs1275524	A	G	7279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=103;PP=2965;SC=CTGACCCCACAATGATAACTG;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=138;TCR=104;TR=241;WE=27428303;WS=27428285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr2	27428702	rs1275525	A	C	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=369;SC=CCCTGTTGACATCATTCCCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=27428710;WS=27428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	27428815	rs1275526	C	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=31;PP=1456;SC=CTCAGCTTATCTCTTCTTTTC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=27428823;WS=27428805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	27428877	rs1275527	C	G	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=43;PP=1505;SC=CCCCACACCACGGCTTACTGC;SOR=0.965;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=76;WE=27428885;WS=27428867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	27435250	rs1275533	A	G	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=49;PP=2227;SC=GCGCCTCACGACCCGGGTAGT;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=107;WE=27435258;WS=27435240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	27435374	rs11608	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=0.836;SC=AAGCAGGGTCGCTGGCCAGCC;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=44;WE=27435382;WS=27435364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr2	27438710	rs11126918	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=0.627;SC=TTGCTTAAGCGCCTTTCATTC;SOR=0.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=9;WE=27438718;WS=27438700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	27440642	rs188327098	A	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CCAGCGCCATAAACCCCTCGC;SOR=0.923;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=66;WE=27440650;WS=27440632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr2	27440785	rs1275536	C	T	7922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=105;PP=2965;SC=AGGCCCTCACCGATCCCTCCT;SOR=0.924;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=241;TCF=136;TCR=105;TR=241;WE=27440793;WS=27440775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr2	27445315	rs3214689	G	GT	1832.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.090;NF=15;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GAAGGTAGGAGTTGGTGCAGG;SOR=0.579;Source=Platypus;WE=27445323;WS=27445305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr2	27449293	rs7593448	C	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=202;ReadPosRankSum=-1.302;SC=CCCTGGAGTACAAGCTGGAAT;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=14;WE=27449301;WS=27449283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	27457210	rs79244431	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=0.589;SC=GCAGGGAAGCTGGAGGGAAAG;SOR=0.148;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=27457218;WS=27457200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	27460968	rs1141313	A	G	2939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1895;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TGGCTCACGCAGAGCAGCAAA;SOR=0.635;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=261;TCF=128;TCR=133;TR=130;WE=27460976;WS=27460958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,146:0.46:318
chr2	27462076	rs3739092	C	T	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.790;NF=30;NR=23;PP=901;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TTCACCTGCCCCCGCAGGAGG;SOR=0.754;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=53;WE=27462084;WS=27462066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,60:0.39:153
chr2	27462405	rs2014252	T	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=0.107;SC=TTTCTTCCCTTCCCAGCACAT;SOR=0.527;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=5;WE=27462413;WS=27462395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	27497815	rs60631624	T	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	27505782	rs62130709	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=691;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GTGCCAGGGACGGGGCAGGGC;SOR=0.957;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=87;TCF=17;TCR=70;TR=37;WE=27505790;WS=27505772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr2	27522543	.	C	CCTATCTAT	2099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=1064;SC=CGCACTCAGCCCTATCTATCT;SOR=1.312;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=21;WE=27522551;WS=27522533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	27528692	rs4665963	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=0.067;SC=CCAGGTGGGCTCTAGGGGAGG;SOR=0.540;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=24;WE=27528700;WS=27528682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr2	27532870	rs62130714	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=687;ReadPosRankSum=1.221;SC=GGAATAACACAATGAAGAGGA;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=46;WE=27532878;WS=27532860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr2	27535311	rs5830041	T	TG	6227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=70;PP=2936;SC=CTTCTTCCCCTGGCTGTCAGC;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=99;WE=27535319;WS=27535301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	27549833	rs35568684	CA	C	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=7.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.86;ReadPosRankSum=2.827;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr2	27550967	rs1049817	A	G	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=439;ReadPosRankSum=0.181;SC=TTCGAGCCTTAGGAGGGTTGG;SOR=0.684;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=31;WE=27550975;WS=27550957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr2	27556721	rs3739095	G	A	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=994;ReadPosRankSum=-1.160;SC=GCTCAAATCAGTGCTTAATCC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=60;WE=27556729;WS=27556711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,74:0.51:144
chr2	27558252	rs11684134	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=472;ReadPosRankSum=0.730;SC=AGGGGGAGATAAAAGGAAATG;SOR=0.780;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=29;WE=27558260;WS=27558242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr2	27566520	rs11689803	T	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=1.696;SC=TTCCCCATCTTTTCTCCCTCA;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=20;WE=27566528;WS=27566510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr2	27589810	rs2280737	T	C	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=57;PP=1575;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TGAGCTAGAGTGAATGAAGAG;SOR=0.607;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=193;TCF=89;TCR=104;TR=110;WE=27589818;WS=27589800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,124:0.54:230
chr2	27591804	rs80051818	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=381;ReadPosRankSum=0.775;SC=AGAGCTGTTTTACTATTGGGC;SOR=1.063;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=23;WE=27591812;WS=27591794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr2	27592423	rs7602534	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=455;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CTGCCTGAGACACAGACATAG;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=37;WE=27592431;WS=27592413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr2	27595756	rs1528533	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=115;ReadPosRankSum=-1.921;SC=AGTAAATAGTGTACGAGGATG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=7;WE=27595764;WS=27595746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	27597805	rs3215365	CTT	C	746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.924;NF=11;NR=7;PP=645;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGATCAAGGACTTACTGCAGA;SOR=0.946;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=18;WE=27597814;WS=27597795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	27598097	rs4665972	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=2.588;SC=GCTCTGCCTCTCAGATTCATG;SOR=1.105;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=19;WE=27598105;WS=27598087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr2	27599132	rs12475426	G	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.001;SC=GTCTTGAGAGGGAGGGGAAGT;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=68;WE=27599140;WS=27599122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
chr2	27600239	rs13472	G	A	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=32;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CACTGAGCTCGTGAAGTGCCT;SOR=0.736;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=107;TCR=59;TR=88;WE=27600261;WS=27600229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,98:0.50:196
chr2	27606098	rs2384629	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=755;SC=TATTTCACAGAAATATAAGAA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=27606106;WS=27606088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	27656822	rs3214499	G	GA	1567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=1321;ReadPosRankSum=0.999;SC=AGTGATTTGTGACTCTGTTAT;SOR=0.736;Source=Platypus;TCF=18;TR=32;WE=27656830;WS=27656812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr2	27659491	rs780102	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=238;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AAAGGGAATATGTTTGTGCCT;SOR=0.409;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=18;WE=27659499;WS=27659481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr2	27663215	rs1260341	T	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=400;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CATGCCTTCTTTGACATTTAA;SOR=0.512;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=24;WE=27663223;WS=27663205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr2	27663416	rs1260342	G	T	3045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=53;PP=1803;ReadPosRankSum=0.657;SC=GATTGGTCACGACCACTCTTG;SOR=0.828;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=236;TCF=126;TCR=110;TR=118;WE=27663424;WS=27663406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,140:0.50:279
chr2	27665361	rs780112	C	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=363;ReadPosRankSum=1.292;SC=ACCCTTGCCCCGTCCTACTGC;SOR=0.825;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=28;WE=27665369;WS=27665351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,40:0.41:98
chr2	27667297	rs4803	A	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=-1.569;SC=CAGCTCTACCAACTACTGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=15;WE=27667305;WS=27667287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr2	27667520	rs10635082	T	TTTTG	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	27669341	rs11333597	AT	A	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=665;ReadPosRankSum=-0.269;SC=ACTGCTCTGGATTCTCAAGCT;SOR=0.986;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=20;WE=27669349;WS=27669331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr2	27669365	rs11430923	G	GT	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.215;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr2	27685388	rs780110	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=358;ReadPosRankSum=-0.331;SC=AGTAAGGACTGACACAAGAGA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=18;WE=27685396;WS=27685378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	27688601	rs1647276	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=319;ReadPosRankSum=0.878;SC=TGGTTATTGGCCAGCCTCTCA;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=21;WE=27688609;WS=27688591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr2	27706640	rs2272417	T	C	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=593;ReadPosRankSum=-0.435;SC=TTCTCCCCAGTACGCAACTTG;SOR=1.089;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=33;WE=27706648;WS=27706630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr2	27715207	rs8395	T	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=387;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GGGAGTGGCATTACCCTCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=22;WE=27715215;WS=27715197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr2	27715416	rs2303369	C	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1023;ReadPosRankSum=0.372;SC=TCCAGCCTCCCCCATCCCAGA;SOR=0.835;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=64;WE=27715424;WS=27715406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,69:0.51:135
chr2	27716494	rs704795	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=GGAGGAAGCCGTTGGTGGACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=27716502;WS=27716484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	27721971	rs813592	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=531;ReadPosRankSum=-2.064;SC=GCTTCTGCTTTCCAGCCACTG;SOR=0.731;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=31;WE=27721979;WS=27721961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr2	27722416	rs1260320	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=539;ReadPosRankSum=-3.097;SC=GGTGCTAGAAGGCAGGAAGTT;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=29;WE=27722424;WS=27722406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr2	27728777	rs2293572	C	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ATTGGCAGGTCTAGATCCAAG;SOR=0.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=22;WE=27728785;WS=27728767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr2	27729480	rs2293571	G	A	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1373;ReadPosRankSum=2.437;SC=TGAGGATGTGGCCCGGATGGA;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=82;WE=27729488;WS=27729470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,95:0.56:170
chr2	27730940	rs1260326	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=473;ReadPosRankSum=1.017;SC=CAGACCTTGCTGGTGAGAGTC;SOR=0.709;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=31;WE=27730948;WS=27730930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr2	27801403	rs1919125	C	G	4191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1628;ReadPosRankSum=0.021;SC=AGTCCATGTACTCAAGTGAAG;SOR=0.607;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=226;TCF=119;TCR=107;TR=97;WE=27801411;WS=27801393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,118:0.41:290
chr2	27801418	rs1919126	C	A	4250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1735;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GTGAAGTCTGCAGAATTAACC;SOR=0.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=99;WE=27801426;WS=27801408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,119:0.42:282
chr2	27801493	rs1919127	T	C	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1189;ReadPosRankSum=0.145;SC=CTTCAGGCTGTGAAATCTACA;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=215;TCF=101;TCR=114;TR=94;WE=27801501;WS=27801483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,114:0.45:253
chr2	27801759	rs1919128	A	G	2809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1858;ReadPosRankSum=1.023;SC=TGGGACAGATATTTTGCAGCC;SOR=0.552;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=241;TCF=129;TCR=112;TR=109;WE=27801767;WS=27801749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,127:0.46:276
chr2	27804432	rs28381983	T	C	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=72;PP=2375;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CCATCGCAGTTCCTCTGAGAG;SOR=0.709;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=258;TCF=131;TCR=127;TR=129;WE=27804440;WS=27804422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,154:0.52:295
chr2	27822721	rs67556120	TAGGCAG	T	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=488;ReadPosRankSum=0.613;SC=TGTCCTGACTTAGGCAGTCAG;SOR=3.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=27822734;WS=27822711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	27830990	rs6547734	G	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=-0.421;SC=TGCACTTGAGGAAGTACGTGA;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=20;WE=27830998;WS=27830980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr2	27838058	rs11127071	C	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=661;ReadPosRankSum=0.721;SC=GTCCAGGGCTCCCTACCTTCA;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=46;WE=27838066;WS=27838048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr2	27839107	rs6737921	T	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=798;ReadPosRankSum=0.072;SC=ATAGTCTTCATACTATTTCTT;SOR=0.763;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=56;WE=27839115;WS=27839097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr2	27851120	rs12615690	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GAACACTGTTTGCAGCTACAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=27851128;WS=27851110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr2	27852637	rs6547738	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=1.175;SC=TCTAAGTGCAATATTCTTAAG;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=13;WE=27852645;WS=27852628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
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chr2	27857992	rs4666009	T	A	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GGCTTTGATTTTTTTGTGGCT;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=85;WE=27858000;WS=27857982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,103:0.51:203
chr2	27861707	rs11692692	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-1.350;SC=TAAATTTTGCGTTTGTTGGCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=27861715;WS=27861697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	27884878	rs1569152	C	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=182;SC=TGCCTTCTAACTGGTATCCCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=27884886;WS=27884868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	27887034	rs9678851	C	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.185;SC=GTCGCGCCCCCCGACAGCGGT;SOR=0.516;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=66;WE=27887042;WS=27887024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr2	27892023	rs2272406	A	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=1.527;SC=AAGGCCATCTAAAAAAAAAAT;SOR=1.414;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=15;WE=27892031;WS=27892013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	27910706	rs13023094	A	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=186;ReadPosRankSum=0.622;SC=ATGATTATGTACTTAGCTTCT;SOR=0.136;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=17;WE=27910714;WS=27910696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr2	27994597	rs34796799	G	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=475;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTTGTTGTTGGTTGGGGGCCT;SOR=0.484;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=34;WE=27994614;WS=27994587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr2	27995781	rs3736594	A	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=GAAATACTTGAAGGAACCTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=27995789;WS=27995771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	28066122	rs74446114	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=576;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CCACCTATTATATTAAAACTA;SOR=1.014;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=35;WE=28066130;WS=28066112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr2	28268467	rs6738887	C	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=160;SC=TCTTGCCTAACGTTAGGAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=28268475;WS=28268457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	28464290	rs114295720	C	T	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=989;ReadPosRankSum=1.743;SC=AACGATATACCGGTGATGCCC;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=70;WE=28464298;WS=28464280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr2	28464435	rs6737817	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=15;PP=428;SC=GATCTTGGCTTACTGCAACCT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=28464443;WS=28464425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	28718897	rs4665423	A	G	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=32;PP=1720;SC=ACACAGAGGAACATAAAAGCA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=28718905;WS=28718887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	28748857	rs4666085	T	C	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=39;PP=1507;SC=GCCCCTCTCCTTCCCAACACA;SOR=0.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=28748865;WS=28748847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	28748916	rs10181687	A	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=37;PP=1245;SC=CCACTTTATCACTGGAGCCCA;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=57;WE=28748924;WS=28748906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	28752498	rs6728486	T	C	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=37;PP=2662;SC=GGATAAAGCTTAGAGACTGAC;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=85;TCR=37;TR=122;WE=28752506;WS=28752488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	28752555	rs4473343	T	C	7038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=85;PP=2965;SC=AACAAAATAATATTTAGCCAA;SOR=1.107;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=132;TCR=85;TR=217;WE=28752563;WS=28752545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr2	28752727	rs6710800	C	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=65;PP=1831;SC=TGATGACCCTCGTACCATTTT;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=14;TCR=65;TR=79;WE=28752749;WS=28752717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	28752741	rs6725577	A	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=45;PP=1238;SC=CCATTTTACCATGAACTCGGC;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=53;WE=28752749;WS=28752717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	28761257	rs7589169	A	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=28;PP=889;SC=AGGTGAGGCCACGGGCCTAGG;SOR=1.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=28761265;WS=28761247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	28761282	rs7589254	A	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;PP=560;SC=CCCCAAGGGCAGTGGGGCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=28761290;WS=28761272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	28761981	rs6753929	G	C	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CAGAGCATTTGTAAACCTGGT;SOR=0.865;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=77;WE=28761989;WS=28761971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,84:0.47:180
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chr2	28771452	rs56019402	CTA	C	1708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.400;NF=15;NR=20;PP=1657;ReadPosRankSum=1.595;SC=GAAGTCCCTTCTATATATATA;SOR=0.361;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=35;WE=28771461;WS=28771442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
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chr2	28771624	rs11680168	T	G	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=33;PP=2092;SC=TCTAATGCGTTCCCTGGTACT;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=28771632;WS=28771614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	28771897	rs11680304	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=205;SC=ACCTGAGATGTGAATCCTGTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=28771905;WS=28771887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	28785754	rs7560628	G	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=272;SC=CATTGACAAGGATGGGTTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=28785762;WS=28785744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	28788428	rs34237604	AG	A	262.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=352;SC=GCCTTGAGCCAGGAATCCAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=28788436;WS=28788418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	28789643	rs10186460	T	C	12667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=182;PP=2965;SC=TTCATTTTCTTTCTTGGACCC;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=361;TCF=178;TCR=183;TR=360;WE=28789651;WS=28789633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,455:1.00:455
chr2	28795893	rs13005799	G	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	28795899	rs13007288	C	T	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	28795962	rs13005854	G	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=7;PP=627;SC=TAGGGGCTGCGGAGTGGGGAC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=28795970;WS=28795952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	28800894	rs877832	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CTCCACCATACATTTGATTGC;SOR=0.693;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=28800902;WS=28800884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	28816425	rs10176136	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	28816829	rs376532276	G	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=20.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.94;ReadPosRankSum=-3.930;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr2	28816830	rs368325462	A	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=8.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.96;ReadPosRankSum=-2.836;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,5:0.10:52
chr2	28816948	rs4665429	C	T	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=57;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TGCATGTATACGTGTACACGT;SOR=0.716;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=240;TCF=119;TCR=121;TR=117;WE=28816956;WS=28816938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,136:0.48:283
chr2	28821662	rs7557359	C	T	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=37;PP=1063;SC=GCCTGCAGAGCAGGGAGTGGA;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=28821670;WS=28821652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	28824303	rs1106882	C	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=290;SC=CTAGGATTATCCACCTACACC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=28824311;WS=28824293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	28824793	rs7601771	C	G	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=72;PP=2937;SC=CAACTTTGTTCACCATCTCCG;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=142;WE=28824801;WS=28824783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	28824940	rs67381370	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=670;SC=GAGACAGCCAGGGGCATGGAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=28824948;WS=28824930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	28840691	rs1534478	C	T	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=56;PP=1763;SC=CAATTAAGGGCCTTGCCGAAT;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=77;WE=28840699;WS=28840681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	28841021	rs1881256	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=340;SC=GATAGCCATGGAACCCATTCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=28841029;WS=28841011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	28841049	rs1881255	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=432;SC=GCCTTGGTTGGTCTGAATGAA;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=28841057;WS=28841039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	28847806	rs11127181	C	G	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.553;SC=AATGGAATGACCTTTGTACTG;SOR=0.572;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=60;WE=28847814;WS=28847796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr2	28849461	rs149607211	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=2442;ReadPosRankSum=0.392;SC=CCTGGCCCTGCCCCGAGCTCC;SOR=1.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=28849483;WS=28849451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	28853352	rs6713038	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.349;SC=GGCTGCAGGCCCCTGGGGTAG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=28853360;WS=28853342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	28853377	rs6731155	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=1.531;SC=CTGCTCTGTGTGTCAGAGCCA;SOR=1.508;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=28853385;WS=28853367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	28854816	rs2272388	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=41;ReadPosRankSum=1.237;SC=GTTGACTCCCGTCAACAACCA;SOR=0.204;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=6;WE=28854824;WS=28854807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	28854958	rs2199619	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=199;ReadPosRankSum=-0.073;SC=GAGGACTTTGCGGTTGTGGTG;SOR=0.985;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=21;WE=28854966;WS=28854948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,26:0.28:93
chr2	28855918	rs34314459	A	AG	3343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=48;PP=2438;SC=TGAGCAGCCAAGGCCTGGTGG;SOR=1.053;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=55;WE=28855926;WS=28855908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr2	28863738	rs56350389	A	G	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1040;ReadPosRankSum=0.386;SC=CCCCTCAGAGAGGAAAGTGTC;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=68;WE=28863746;WS=28863728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr2	28865760	rs2272387	T	C	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GAACAGCCGATTGCTCCCAGA;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=67;WE=28865768;WS=28865750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr2	28865968	rs57817040	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=0.852;SC=CTATAGCCACTCTCTTCACCG;SOR=0.148;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=28865976;WS=28865958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	28975107	rs2276547	G	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=516;SC=CTGCGTCCCCGTCTGCCGCCG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=28975115;WS=28975097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	29001691	rs1128416	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=12;PP=581;SC=TTCATGGACAATATACAGATT;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=29001699;WS=29001681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	29041877	rs13009357	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=591;SC=AAACATTCTGTTTTTAAAAGA;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=29041885;WS=29041867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	29045323	rs4436918	C	T	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=24;PP=855;SC=CTATTATATACATTACACCTT;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=29045331;WS=29045313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	29052256	rs12998251	T	C	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=226;SC=TGTTTTTTAATGTGCTTCTAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=29052264;WS=29052246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	29052283	.	G	GT	36	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=36;QD=20.0;SC=GGTATTCTGGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=29052291;WS=29052273;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr2	29063384	rs13006361	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-0.591;SC=GTTGTTTACTGAGCTCTAGTC;SOR=1.659;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=29063392;WS=29063374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr2	29087799	rs13030945	C	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=945;SC=GGTATTTTCCCAAATATCTTT;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=29087807;WS=29087789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	29129300	rs36066576	AT	A	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.045;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.335;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr2	29135468	rs6715296	C	G	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=825;ReadPosRankSum=1.718;SC=AATGGAAAGGCGACAATAGCA;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=51;WE=29135476;WS=29135458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr2	29136435	rs35033327	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=450;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GCCTACATCCAGCATTTAGTC;SOR=0.461;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=33;WE=29136443;WS=29136425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr2	29145725	rs9653591	G	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.938;NF=4;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.692;SC=TTTTCATAAGGTAGATTGGGG;SOR=0.838;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=8;WE=29145733;WS=29145715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	29152384	rs34113296	T	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=-1.909;SC=TTATTTTTTTTGTCTCCAAAC;SOR=0.756;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=16;WE=29152392;WS=29152374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	29152456	rs1140697	A	G	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=38;PP=2225;SC=TTAGCATTGAAGAACGTCTGG;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=29152464;WS=29152446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	29161010	rs4233731	G	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=531;SC=GTTTTACCCCGGGTGCAATGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=29161018;WS=29161000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	29169612	rs3087649	T	C	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1390;ReadPosRankSum=0.375;SC=GAGATTCTGATTTAGATCCTG;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=85;WE=29169620;WS=29169602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,92:0.47:195
chr2	29222070	rs13009279	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.903;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=540;ReadPosRankSum=0.073;SC=TGAGCCAAGAGCCCTGCTGAA;SOR=0.158;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=39;WE=29222078;WS=29222060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr2	29222388	rs57018089	G	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=496;ReadPosRankSum=1.058;SC=GTCAAGGGCCGCAGGCCTCCA;SOR=0.484;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=28;WE=29222396;WS=29222378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr2	29226498	rs12613325	G	A	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=65;PP=2094;SC=TTCCCAGCCCGTTACCTCCAG;SOR=1.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=29226520;WS=29226488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	29226512	rs12623297	A	G	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=57;PP=1798;SC=CCTCCAGGCCAGGGAGTCCTC;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=88;WE=29226520;WS=29226488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	29226559	rs12619829	C	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=945;SC=GTAAGAGCTCCAAGTCAAACC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=29226567;WS=29226549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	29239942	rs11685375	T	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=717;ReadPosRankSum=-2.029;SC=TGGCACACAGTAGAAACATTT;SOR=0.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=42;WE=29239950;WS=29239932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,55:0.62:89
chr2	29240005	rs13409097	T	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=796;ReadPosRankSum=-1.616;SC=AGAGTTTGCCTTGACCTTGTG;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=51;WE=29240013;WS=29239995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,60:0.43:140
chr2	29240060	rs11127202	A	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=803;ReadPosRankSum=-0.744;SC=GAGAAGATGCAGCTGAAGCAG;SOR=1.113;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=46;WE=29240068;WS=29240050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
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chr2	29240673	rs35166194	G	A	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=1765;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CTTCCCCTCCGGGGCAGCGGG;SOR=0.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=41;WE=29240694;WS=29240663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr2	29240686	rs34261417	A	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=1765;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GCAGCGGGACACTGTCTGTGC;SOR=0.867;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=50;WE=29240694;WS=29240663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr2	29240783	rs1109758	A	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=664;ReadPosRankSum=0.453;SC=CAGCATCCCCATCAGCCGGCA;SOR=0.404;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=50;WE=29240791;WS=29240773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,62:0.57:108
chr2	29245933	rs13420380	G	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=715;ReadPosRankSum=1.538;SC=CTGCAACAGGGCCTGGCCTTG;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=51;WE=29245941;WS=29245923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr2	29246044	rs6721861	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=1.004;SC=GTGTGCTTGGTGGTGACTGGG;SOR=0.535;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=29;WE=29246052;WS=29246034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	29247304	rs66715573	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=740;ReadPosRankSum=-2.308;SC=GGGGAGAGGCCCTGGGATGTG;SOR=0.535;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=43;WE=29247312;WS=29247294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr2	29249903	rs11884174	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.301;SC=GGGCCTGGGGGCAGAGAAGGC;SOR=0.874;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=29249911;WS=29249893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	29268166	rs374512405	A	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=1.981;SC=CAGTGTGGCCACTGACATCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=29268174;WS=29268156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	29287708	rs10182566	C	T	248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=131;SC=GGGGTGACTGCGTGAGTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=29287716;WS=29287698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	29287926	rs139768554	C	CGCT	3142.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=1896;SC=GGGCTCTCCTCGCTGCTGCTG;SOR=0.752;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=35;WE=29287934;WS=29287916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	29294629	rs34253433	C	T	5951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=99;PP=2965;SC=CTTCCATAGGCGGTGGAGGGA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=190;WE=29294637;WS=29294619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr2	29294754	rs17744093	G	C	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=1941;SC=CCCATTTTGAGAGATTCTCTG;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=29294762;WS=29294744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	29295016	rs10200693	A	G	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=45;PP=1955;SC=ATGGGATGGCATTTGGAAGCT;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=106;WE=29295024;WS=29295006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	29295676	rs13385188	G	A	3485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=53;PP=2445;SC=TGCTGTCCTCGCTGTCACTAA;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=111;WE=29295684;WS=29295666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	29296870	rs62132765	C	T	4849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=81;PP=2965;SC=CCATATCTTTCCTTTTGCCTG;SOR=0.857;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=152;WE=29296878;WS=29296860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	29297068	rs35929540	C	T	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=35;PP=1261;SC=TTTTCAAGAACTGAATGCCAC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=29297076;WS=29297058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	29356669	rs3100232	A	G	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=78;PP=2259;SC=TTTTGAAAACATCGAAACCAA;SOR=1.590;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=114;WE=29356677;WS=29356659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	29366875	rs3217572	C	CACAG	624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=1.035;SC=TGTTCAAGGACACAGTATGGT;SOR=0.469;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=8;WE=29366883;WS=29366865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	29375775	rs113615666	C	CT	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=165;ReadPosRankSum=1.064;SC=GATTGCTTCACTTTTTTTTGT;SOR=0.668;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=12;WE=29375783;WS=29375765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	29383256	rs3100246	G	T	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.920;NF=19;NR=29;PP=835;ReadPosRankSum=-1.164;SC=GGGGAACTCCGCCTCGGAGAG;SOR=0.785;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=48;WE=29383264;WS=29383246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,65:0.55:118
chr2	29383374	rs2305450	G	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=27;PP=804;SC=ATTCTTTAGAGTACAAAAGGT;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=29383382;WS=29383364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	29390299	rs11364047	AG	A	1631.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.786;NF=10;NR=19;PP=1805;ReadPosRankSum=0.618;SC=TTAAACCTGAAGACCAGCTAC;SOR=0.540;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=29;WE=29390309;WS=29390289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr2	29390301	rs72790253	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.730;NF=11;NR=9;PP=938;ReadPosRankSum=-0.612;SC=AAACCTGAAGACCAGCTACTT;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=20;WE=29390309;WS=29390289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr2	29404545	.	A	G	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1416;ReadPosRankSum=0.518;SC=ACGAGCTCCAATGAGATGGGT;SOR=0.663;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=89;WE=29404553;WS=29404535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,98:0.49:202
chr2	29416572	rs1670283	T	C	5553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=80;PP=2965;SC=CGAACAGAGATCTCTGCAGCT;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=165;WE=29416580;WS=29416562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	29419591	rs1670284	G	T	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=22;PP=1745;SC=CTTTAAGACTGTTTCATATAG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=79;WE=29419599;WS=29419581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr2	29543663	rs2293564	T	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=627;SC=TGACCTGCCATTGAGGAGTGT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=29543671;WS=29543653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr2	29754721	rs11689790	T	C	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=496;ReadPosRankSum=1.872;SC=TCTGGAAATGTGTAACCAAAA;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=40;WE=29754729;WS=29754711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr2	30143499	rs4358080	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=409;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GCAGCGGCAGGAGCCACAGGA;SOR=2.004;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=21;WE=30143507;WS=30143489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr2	30682360	rs829574	G	A	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=623;SC=TGATGAGCCCGGTGCACTGTT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=30682368;WS=30682350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	30682470	rs55723517	A	T	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=980;ReadPosRankSum=-0.006;SC=CAAATGGATGATGTGATATAT;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=60;WE=30682478;WS=30682460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,72:0.60:120
chr2	30682630	rs829573	T	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=484;ReadPosRankSum=0.750;SC=GTTTTTGTCTTGCTTCATATA;SOR=0.234;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=29;WE=30682638;WS=30682620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr2	30748733	rs766880	G	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-1.386;SC=ACATATCCTAGGCACATCCTT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=30748741;WS=30748723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
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chr2	30791152	rs6749074	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=725;SC=TTGTCTCAAGAAATGAGATAT;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=30791160;WS=30791142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	30828792	rs2248777	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=371;ReadPosRankSum=-1.129;SC=TAAGGAGCGCGCAACCTAGAT;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=23;WE=30828800;WS=30828782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr2	30862842	rs150564049	AG	A	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=287;ReadPosRankSum=-1.836;SC=CAGGAACACCAGTATCTCTAA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=9;WE=30862850;WS=30862832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
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chr2	30863092	rs12467646	C	T	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=859;ReadPosRankSum=0.211;SC=TCCACTTTCACGTCCACCGGT;SOR=0.894;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=53;WE=30863100;WS=30863082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr2	30863108	rs12471868	A	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=743;ReadPosRankSum=0.545;SC=CCGGTATCCAATAGACACCCT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=50;WE=30863116;WS=30863098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr2	30955528	rs2276567	C	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=597;SC=AGGGCCCGGCCACCTCCCACC;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=30955536;WS=30955518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	30959262	rs509380	G	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1458;ReadPosRankSum=1.511;SC=AGGGGTGAGAGTTCCTCTTCT;SOR=0.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=66;WE=30959270;WS=30959252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr2	30961400	rs35032002	AG	A	1522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=1235;SC=GCCGTGTAAAAGCACTCAGAT;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=30961408;WS=30961390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	30973825	rs1879283	C	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=359;SC=TAGACTTGGACTGCATGAATG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=30973833;WS=30973815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	30973913	rs62142187	A	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=20;PP=1644;SC=GTTCTCCCCAACTCAAGGTTT;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=30973921;WS=30973903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	30975961	rs62142192	G	T	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=43;PP=1926;SC=AACATTATTTGGGACCATCCT;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=30975969;WS=30975951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	30977073	rs485100	G	A	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=58;PP=2833;SC=TTCCACCTTCGTAAATGTTCA;SOR=1.106;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=142;WE=30977081;WS=30977063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	30986989	rs579016	G	T	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=38;PP=2075;SC=GGGCTCCCCAGTGACTTACCC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=30986997;WS=30986979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	31009977	rs1915125	G	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=312;SC=GGGTATGCTCGTGTGGGGCTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=31009985;WS=31009967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	31133939	rs2278079	G	C	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=64;PP=2285;SC=GTAAGACAAAGAAGAGAGTGA;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=31133947;WS=31133929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	31135184	rs2288101	G	T	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=43;PP=1318;SC=TGGAGGATCTGCTGGGTGTAT;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=31135192;WS=31135174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	31168527	rs114089882	G	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=294;ReadPosRankSum=1.269;SC=TTATAGTGCAGGTTGCAGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=18;WE=31168535;WS=31168517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr2	31178393	rs73923310	T	C	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=1182;SC=CCAGAAGAACTGGGGGTTGCA;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=31178401;WS=31178383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	31178818	rs2288100	C	T	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=29;PP=1445;SC=CCTTGGGCAACTTGATGAGCT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=71;WE=31178826;WS=31178808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	31181139	rs2303325	C	T	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=531;SC=CAAAGACTTCCGTACCTATTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=31181147;WS=31181129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	31188957	rs889896	C	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=628;SC=GTGCCTGGCACGTAGTTAGAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=31188965;WS=31188947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	31401290	rs4952052	A	C	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=27;PP=1995;SC=TAAAGGGCTGAAGGGGACAGA;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=91;WE=31401298;WS=31401280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	31409342	.	T	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=1.407;SC=ACTGCATTAATCTCTGGATGC;SOR=0.511;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=45;WE=31409350;WS=31409332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr2	31410708	rs1822496	C	T	5796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=110;PP=2965;SC=CAGAAAGACACAATTATTCAC;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=74;TCR=110;TR=184;WE=31410716;WS=31410698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	31414807	rs1562022	C	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=702;SC=CTACCCTATACAGGTAGAAGC;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=31414815;WS=31414797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	31415967	rs7591444	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=2.577;SC=AACCTCACCCTGAGAGCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=18;WE=31415975;WS=31415957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr2	31416213	rs11124248	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=2.764;SC=AACGCCTAGTTATCAGGACCC;SOR=0.530;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=28;WE=31416221;WS=31416203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr2	31416305	rs11124249	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	31416309	rs11124250	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	31416317	rs12619774	C	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	31423365	rs111554796	G	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=440;ReadPosRankSum=-1.678;SC=AGGTGGCTTCGATGAGGATGT;SOR=0.898;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=26;WE=31423373;WS=31423355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr2	31424696	rs75525195	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=-0.856;SC=AAAGAAGCGATGGGAAGGGGG;SOR=0.317;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=31424704;WS=31424686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr2	31424885	rs11692905	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=875;ReadPosRankSum=-0.226;SC=AGAGTGGCCCCGGGTGAATGA;SOR=0.940;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=50;WE=31424893;WS=31424875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr2	31457817	rs2236170	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=0.745;SC=ATGGGAAGCCTTCAGTTGAGG;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=31457825;WS=31457807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	31467351	rs2295473	T	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=543;ReadPosRankSum=1.293;SC=TTTCAGGTGCTCTCTTTTCTT;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=35;WE=31467359;WS=31467341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr2	31483890	rs13028669	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=276;ReadPosRankSum=0.022;SC=CAGTGCATCATGTGTGTGACA;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=31483898;WS=31483880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr2	31484334	rs654650	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=757;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GTAGGGGAAGGAATGATGCAA;SOR=0.925;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=40;WE=31484342;WS=31484324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr2	31488965	rs619002	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CATTCTGGTGCTCATAGGAGG;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=13;WE=31488973;WS=31488955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr2	31562323	.	G	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=0.968;SC=GGGCAGATCAGAAGAGACAGC;SOR=0.330;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=10;WE=31562331;WS=31562313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
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chr2	31570626	rs4952083	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr2	31571241	rs13415401	G	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=-0.537;SC=TAGGGAAAGAGAAGGATGCCA;SOR=0.864;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=23;WE=31571249;WS=31571231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr2	31571786	rs1884725	A	G	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=638;ReadPosRankSum=1.408;SC=AAGGAACTGTAAAGCTTATTC;SOR=0.952;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=38;WE=31571794;WS=31571776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr2	31572398	rs1429374	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=1.411;SC=GAAGATCATTATAAGATCTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=13;WE=31572406;WS=31572388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr2	31572482	rs11408029	T	TG	1306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=993;ReadPosRankSum=0.609;SC=GCTTCCTATATGGGGTCAGCA;SOR=0.512;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=30;WE=31572490;WS=31572472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr2	31587235	rs1018505	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=495;SC=ACATCATCCCGTGAAAAAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=31587243;WS=31587225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	31588288	rs2365842	T	A	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=42;PP=1844;SC=ACAAAATGGCTCATCCCGCCC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=91;WE=31588296;WS=31588278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	31589847	rs2295475	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=676;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CTTGGCCACCGATGTATATCT;SOR=0.614;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=42;WE=31589855;WS=31589837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr2	31590785	rs761926	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.637;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=362;ReadPosRankSum=-0.300;SC=AATTTGCAAACCAGGGCCACC;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=21;WE=31590793;WS=31590775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr2	31590917	rs17011368	T	C	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1354;ReadPosRankSum=0.167;SC=TTGTTCTTTATAGCATCCTGA;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=86;WE=31590925;WS=31590907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,114:0.55:207
chr2	31591384	rs45446491	ACAGG	A	994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=876;ReadPosRankSum=2.324;SC=ACTCCTCTACACAGGCAGCCC;SOR=0.509;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=20;WE=31591395;WS=31591374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr2	31593265	rs17323225	T	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=633;ReadPosRankSum=-0.336;SC=ATTCCAGTTATGTTACTCCCA;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=53;WE=31593273;WS=31593255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr2	31596679	rs190083422	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=0.557;SC=GGTCAGCCACTAGCCAACTCA;SOR=0.304;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=33;WE=31596687;WS=31596669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr2	31596731	rs17395224	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=764;ReadPosRankSum=-1.488;SC=TACACTGACCGTACTCACTTG;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=50;WE=31596739;WS=31596721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr2	31596955	rs4952086	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.677;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	31596963	rs4952087	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=6.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.27;ReadPosRankSum=-2.368;SOR=2.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	31600146	rs10187719	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CCTTGCTCTGTAGGGGCTGCA;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=31600154;WS=31600136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr2	31609448	rs477626	A	C	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=41;PP=1335;SC=TCTTACTACAATGTCTCCCTC;SOR=1.216;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=31609456;WS=31609438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	31611367	rs206847	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-1.904;SC=AAACAACTCATGGATAAACAA;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=31611375;WS=31611357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	31621598	rs10175754	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-1.203;SC=ACACCTGGGATGGCAGAACCC;SOR=0.434;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=18;WE=31621606;WS=31621588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr2	31626045	rs1346644	G	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=282;ReadPosRankSum=-1.967;SC=ATGAACTCAGGGAGAGGAGTC;SOR=0.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=24;WE=31626053;WS=31626035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr2	31628705	rs1366814	T	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=821;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TAGGAAACAATGTAAGGCCTA;SOR=0.910;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=52;WE=31628713;WS=31628695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr2	31805619	rs619857	T	C	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=9;PP=581;SC=GTGCGCGCTCTACGCTGCGCT;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=31805627;WS=31805609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	31805880	rs142200057	A	AG	7804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=85;PP=2936;SC=CCGTAGCCGGAGGCTTCGCGA;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=108;WE=31805888;WS=31805870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	32312700	rs7561519	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=226;SC=TTCACATGATTGTCCAGATTT;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=32312708;WS=32312690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	32314473	rs469305	A	T	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	32324072	rs7566162	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=550;SC=ATTGTTCATGTTTTCACAGGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=32324080;WS=32324062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	32361482	rs11392886	T	TC	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=0;PP=112;SC=AAGGGACGGTTAGTAGTACTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=32361490;WS=32361472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	32362079	rs10627985	G	GTATA	3019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=2344;SC=CAGCATTTTAGTATATTTTCC;SOR=0.818;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=40;WE=32362087;WS=32362069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	32369901	rs2365556	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=355;SC=CACAGTGAGCTGAGATCATGC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=32369909;WS=32369891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	32390834	rs6733481	A	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=1.510;SC=AAGGGGACGGAAGCCGGAGGC;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=4;WE=32390842;WS=32390824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	32461493	rs55638726	T	TC	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=224;SC=AATTCTGAGTTTTATCTTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=32461501;WS=32461483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	32667058	rs55734616	C	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	32667061	rs60955793	T	A	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.69;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	32667182	rs60197615	G	C	4839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=61;PP=2965;SC=TGAGAAGCTTGTTAATACTCT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=32667190;WS=32667172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	32667562	rs2276592	A	G	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=56;PP=1701;SC=CTTTCTAGGTACACCTGCAAT;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=66;WE=32667570;WS=32667552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	32670824	rs184692713	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=175;ReadPosRankSum=1.512;SC=ATATATATGCTGATAACAGTC;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=32670832;WS=32670814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	32706579	rs9646977	T	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=509;SC=TCATGCCTGTTATCCCAGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=32706587;WS=32706569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	32707476	rs71446071	T	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=680;ReadPosRankSum=0.207;SC=TAAACCACAGTTTTTTTTCCA;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=37;WE=32707484;WS=32707466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr2	32712875	rs2366891	A	C	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=46;PP=1373;SC=TCAGGTATGAATTCAGGAGAA;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=32712883;WS=32712865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	32749880	rs2710609	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	32749890	rs2710610	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	32749893	rs2710611	A	T	229.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	32749903	rs2710612	T	C	229.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	32855615	rs2710623	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=349;SC=TACAATTGCTACTGGAAGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=32855623;WS=32855605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	32860415	rs11124286	C	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=46;PP=1814;SC=ATCCAGAACTCGTGCAGCAAA;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=32860423;WS=32860405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	32865521	rs1031261	G	C	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1281;ReadPosRankSum=0.648;SC=TATGACTTTTGTGCTTATTAA;SOR=0.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=72;TCR=93;TR=84;WE=32865529;WS=32865511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,89:0.47:188
chr2	32889576	rs12988468	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-1.436;SC=TATTTTTATGATAAAACTATA;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=32889584;WS=32889566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	32927863	rs2273659	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=738;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TTTTCTTCCCGCTTCTATCAG;SOR=1.143;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=48;WE=32927871;WS=32927853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr2	32958838	rs3830967	CTT	C	1491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=1064;ReadPosRankSum=0.503;SC=ACAATAAGGACTTATTTATAT;SOR=1.675;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=28;WE=32958847;WS=32958828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr2	32959024	rs1551177	T	C	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=66;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GTATGGAAATTACTTGGCATT;SOR=0.512;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=210;TCF=80;TCR=130;TR=112;WE=32959032;WS=32959014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,129:0.52:248
chr2	32959075	rs3818266	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=537;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTTAATTTATGTTTGAATTTT;SOR=0.655;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=84;TCF=10;TCR=74;TR=30;WE=32959083;WS=32959065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
chr2	32961691	rs17497801	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=1.030;SC=AGATTAGGTACACCTGCAAGT;SOR=1.646;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=15;WE=32961699;WS=32961681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	32961745	rs10200333	T	A	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=17;PP=1460;SC=TAATTATTTTTACTTGATTTT;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=32961753;WS=32961735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr2	33172358	rs78055007	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GGGGCCGGACCGCGCGCGACC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=33172366;WS=33172348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr2	33335847	rs218226	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=836;ReadPosRankSum=-1.142;SC=ACCATTTTCCCAAGTTATGGT;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=50;WE=33335855;WS=33335837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr2	33392911	rs6728094	G	A	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.656;SC=ATCAAGGAGAGCCCTTCTGCC;SOR=0.794;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=214;TCF=111;TCR=103;TR=109;WE=33392919;WS=33392901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,130:0.52:250
chr2	33407186	rs6759943	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=658;ReadPosRankSum=0.699;SC=TACTGGACTTTTATTGGTTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=27;WE=33407194;WS=33407176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr2	33407285	rs2367619	G	A	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=38;PP=1760;ReadPosRankSum=0.440;SC=CACGTATGCTGGTATAGTCCT;SOR=0.800;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=223;TCF=135;TCR=88;TR=99;WE=33407293;WS=33407275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,111:0.44:254
chr2	33412077	rs1065324	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-0.657;SC=CAGGCAAGGCGTTGGGGACGC;SOR=0.592;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=21;WE=33412085;WS=33412067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,23:0.29:79
chr2	33413640	rs6712473	G	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=496;ReadPosRankSum=0.010;SC=CCAATCTGTTGTAGTGAAATT;SOR=1.398;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=25;WE=33413648;WS=33413630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr2	33413949	rs4542826	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=161;ReadPosRankSum=1.049;SC=TGCTTTAGCAGTGTCTTACAG;SOR=0.185;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=14;WE=33413957;WS=33413939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr2	33414009	rs3922572	T	A	249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=10;PP=253;SC=AATGCTTTTTTAAAAAAAAGG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=33414017;WS=33413999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	33442549	rs2290449	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.293;SC=GGCTGTGAGGGACAGCAGTGC;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=33442557;WS=33442539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	33447202	rs2290448	C	T	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1608;ReadPosRankSum=-0.352;SC=AGCGGGTTAACAACACCTTTT;SOR=0.700;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=98;WE=33447210;WS=33447192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,113:0.48:235
chr2	33525382	rs935996	A	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=494;SC=TGGAGTGATAAATACTAAAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=33525390;WS=33525376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	33540138	rs2276591	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=516;SC=AGATTTATTTGCCATCTGTTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=33540146;WS=33540128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	33540172	rs3216704	A	AT	1331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=994;SC=AATGAAACCGATTTTTTTCAA;SOR=3.516;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=34;WE=33540180;WS=33540162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	33540248	rs1058840	G	A	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=49;PP=2027;SC=TCTGTGGTCCGCAAGGGGAGT;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=106;WE=33540256;WS=33540238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	33568191	rs5024712	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=233;SC=CTATGTTGGCTGGGTGCATGG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=33568199;WS=33568181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	33572555	rs6706620	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=335;ReadPosRankSum=1.184;SC=TGACTGGGCAGTGCCGCTCCC;SOR=0.508;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=22;WE=33572563;WS=33572545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	33585796	rs4422143	T	C	5227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=88;PP=2671;SC=ACATCAGGCGTGGGATGGGGA;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=149;WE=33585804;WS=33585786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	33586464	.	C	CT	61	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=16;MQ=57.38;NF=4;NR=0;PP=61;QD=16.25;SC=GATGTTGAATCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=33586472;WS=33586454;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,4:0.40:10
chr2	33614187	rs642472	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=400;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CTCTGAGCTGCGAGGGGGTGG;SOR=1.453;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=20;WE=33614195;WS=33614177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr2	33622448	rs2367734	T	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=411;SC=GAGTTTCAGTTTGAGAAGATG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=33622456;WS=33622438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	33622475	rs12053346	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=2.260;SC=GTTCTGGAGATGTACATTAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=33622483;WS=33622465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	33623306	rs2034693	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=550;SC=TTGTCTGTGACTGAAGCAATG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=33623314;WS=33623298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	33623387	rs624060	AT	GC	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=26;PP=2947;SC=TCCTCACAGAATAATATCCAA;SOR=1.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=83;WE=33623396;WS=33623377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	33623734	rs622716	A	G	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=78;SC=ACAGCATGGAATTGCAAGTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=33623742;WS=33623710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	33643740	rs6724875	T	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=0.649;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.592;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	33752129	rs11292992	GC	G	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=1.511;SC=GAATTTCCTAGCCACACATTG;SOR=0.233;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=33752137;WS=33752119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	33784135	rs12470399	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=0.647;SC=AACCAGAAGAAGGAGGCTGAA;SOR=0.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=10;WE=33784143;WS=33784125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr2	33784801	rs12478742	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=350;ReadPosRankSum=-1.433;SC=TGTCATGGAGGACAGCCATTG;SOR=0.709;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=17;WE=33784809;WS=33784791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	33787976	rs10572554	CCTAA	C	1573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=23;PP=1185;SC=GAGAATTGACCCTAACTAACT;SOR=2.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=24;WE=33787987;WS=33787966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	33787994	.	A	C	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=47;QD=10.2214015684;SC=ACTAACTATGAACTATTTATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=8;WE=33788002;WS=33787984;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	33952022	rs4670913	C	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=4;PP=417;SC=AGAGGAAAACCCAGGAAATGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=33952030;WS=33952013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	33952055	rs2290101	C	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=763;SC=GAAAACTCAGCGGGGGCAGGA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=33952063;WS=33952045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	33952413	rs4477896	T	C	4398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2965;SC=CTCAGCAGGATAGTGAGGGCC;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=33952421;WS=33952403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	33952456	rs2367810	C	G	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=68;PP=2965;SC=ACACCGCCACCCACCACTCCA;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=152;WE=33952464;WS=33952446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	33952621	rs11684598	G	A	7878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=1.163;SC=CTTCGGTGGCGTAAGCCACAC;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=139;TCR=108;TR=246;WE=33952629;WS=33952611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,286:1.00:287
chr2	35696612	rs4670472	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=7;PP=197;SC=GTTTTAGTGTCTATGTGCATG;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=35696620;WS=35696602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	36704144	rs848547	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=887;ReadPosRankSum=1.660;SC=TCTGCTTCACCGCCCAGTGTG;SOR=0.579;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=57;WE=36704152;WS=36704134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,64:0.52:123
chr2	36737128	rs12997487	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=455;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CTTCACAGCCGAGGAACTATG;SOR=0.570;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=29;WE=36737136;WS=36737118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr2	36739553	rs848526	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=35;PP=789;SC=TGTGTACACATGGCCCTTCCC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=36739561;WS=36739543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	36740643	rs2293254	C	G	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=10;PP=776;SC=GACTCTGTAGCCTGTTTCTCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=36740651;WS=36740633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	36756288	rs711247	T	C	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=74;PP=2058;SC=TCTCTTATTTTGGTCCAGGAG;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=130;WE=36756296;WS=36756278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	36775315	rs2270333	C	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=7;PP=339;SC=AGAAGTCATCCCTTTGTTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=36775323;WS=36775305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	36779144	rs10180760	T	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=801;SC=ATGGGAGGGGTCTGCATGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=36779152;WS=36779134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	36781401	rs1533946	T	C	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=48;PP=1879;SC=TTCACAATTATAGTCCTAGGT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=36781409;WS=36781391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	36782656	rs10178965	G	A	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=10;PP=1286;SC=ATAAAACCATGATATATAATG;SOR=2.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=36782664;WS=36782646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	36783127	rs10194100	T	C	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=32;PP=1881;SC=TACCTGAGAGTTGCTTCCCTG;SOR=1.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=36783135;WS=36783117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	36783215	rs10181664	C	T	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=54;PP=1943;SC=TGTAATAATACCGGAAAGTGG;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=96;WE=36783223;WS=36783205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	36805676	rs2075226	A	G	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=21;PP=1313;SC=CACCAGCCCCAAAGGCTGGGA;SOR=1.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=36805684;WS=36805666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	36806021	rs2072534	G	A	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=55;PP=1659;SC=GTGACCAAAAGCAAAATACAG;SOR=2.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=71;WE=36806029;WS=36806011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	36806051	rs2072533	A	G	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=932;SC=AGACAAAAACATTTCAAGGAA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=36806059;WS=36806041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	36808350	rs848638	C	T	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=17;PP=2253;SC=AGGATGAAATCAAAGCTTTCT;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=79;TCR=17;TR=96;WE=36808358;WS=36808340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	36808732	rs848637	T	G	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=46;PP=1713;SC=TCAAAATTTTTACTGTAGGAG;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=80;WE=36808740;WS=36808722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	36810473	rs11691767	G	T	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=59;PP=2208;SC=CTTTCCTTGCGTTGCTGAGGA;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=36810488;WS=36810463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	36810586	rs14291	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=31;PP=833;SC=CATCATCTGATGTATCAAAGA;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=36810594;WS=36810576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	36824956	rs5830430	G	GC	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=468;SC=CGGCCGTAGGGCTGCCGGTCG;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=12;WE=36824964;WS=36824946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	36825137	rs1544655	G	A	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.69;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	36825170	rs2287104	T	C	168.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.10;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	36825330	rs11441122	C	CG	260.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=120;SC=CGGCCCAGCCCGCCCAGCCCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=36825338;WS=36825320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	36943338	rs4670597	C	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=379;SC=AGGCCAGCCACTGACATCTCT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=36943346;WS=36943328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	36943419	rs4670598	T	C	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=20;PP=1275;SC=TGATGCAGTCTATCCCCACAC;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=36943427;WS=36943409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	36965582	rs35608380	TC	T	113	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=119;SC=TATATTAGGGTCCTTTGTAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=36965590;WS=36965572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	37000877	rs116154541	A	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	37001570	rs974964	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=34;PP=1197;SC=CAGGGTTTGACGGTTTCCACA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=37001578;WS=37001560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	37010574	rs3821147	G	A	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=63;PP=2622;SC=AGAAACCCACGGTGTCTTTGA;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=132;WE=37010582;WS=37010564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	37076498	rs62132520	A	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=392;ReadPosRankSum=1.115;SC=CTTCAGCAGAACAAAAGGGCA;SOR=0.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=21;WE=37076506;WS=37076488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr2	37076594	rs62132521	T	C	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1089;ReadPosRankSum=-1.368;SC=AGATGATGCATTGCGTCATAC;SOR=0.528;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=68;WE=37076602;WS=37076584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,78:0.43:180
chr2	37077015	rs723674	C	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=604;SC=CTACCATGTCCTGCTGGTTTC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=37077023;WS=37077005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	37078095	rs10668550	A	AT	375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;MQRankSum=0.459;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.521;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr2	37094945	rs2540923	A	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=18;PP=1240;SC=TAAAGAAAAAACATATACTTA;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=37094953;WS=37094935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	37095139	rs6752845	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-1.207;SC=ACGTAAGAAAGCTTACTTAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=37095147;WS=37095129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	37096970	rs2160379	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=261;SC=TGTCAATAAACGATCACTTTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=37096978;WS=37096960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	37111045	rs2691106	T	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=412;ReadPosRankSum=-1.359;SC=CCAAGTGCATTTTGTGCTCCA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=29;WE=37111053;WS=37111035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr2	37129618	rs148671880	A	ATAAT	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	37230728	rs1007823	T	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=798;ReadPosRankSum=0.896;SC=GAGCAGCTCTTACTATCTGTT;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=51;WE=37230736;WS=37230718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr2	37241050	rs17020125	G	A	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1281;ReadPosRankSum=0.049;SC=ACAGCTGGCTGGAAGATCCTT;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=73;WE=37241058;WS=37241040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr2	37248015	rs17020136	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.161;SC=ATGAAAACTTTTCCAAAAATA;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=37248023;WS=37248005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr2	37255015	rs2540998	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GCAGCAAAATGTCTCAAGGTG;SOR=0.665;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=18;WE=37255023;WS=37255005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr2	37255806	rs17020143	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=591;ReadPosRankSum=2.210;SC=ATTTTAAGAACGCACATTAAA;SOR=0.361;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=34;WE=37255814;WS=37255796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr2	37302556	rs34545380	GA	G	2545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=27.67;SOR=2.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	37306343	rs6743906	G	A	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=26;PP=1093;SC=GAAAAACTGTGAAAGTATCCC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=37306351;WS=37306333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	37317869	rs4670654	C	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=578;SC=AAAACAGGTACGTAATTATTT;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=37317877;WS=37317859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	37318041	rs4670655	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=TAGTGAGTATAAAATAAAATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=37318049;WS=37318031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr2	37406680	rs10205833	C	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1128;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGTGGAAATGCAAAAAAGATA;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=72;WE=37406688;WS=37406670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,86:0.46:185
chr2	37406761	rs4459710	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.755;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=-0.492;SC=TTTATTTGGGTCTATGTTTTG;SOR=0.073;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=33;WE=37406769;WS=37406751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	37406807	rs2111630	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=-0.984;SC=CAATATCATCATGTCCACTCG;SOR=0.007;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=19;WE=37406815;WS=37406797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr2	37410537	rs6544061	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=677;ReadPosRankSum=0.124;SC=ATAGAAATTTCAAAGAATTAT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=45;WE=37410545;WS=37410527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr2	37414431	rs6724820	A	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=280;ReadPosRankSum=1.576;SC=AAAACTAAAGAATCTCCAAAC;SOR=1.550;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=15;WE=37414439;WS=37414421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	37415496	rs11124566	G	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=488;SC=CCTGCAATGAGGAACCGCCTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=37415504;WS=37415486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	37428743	rs2540973	C	T	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	37438993	rs1137437	G	A	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=24;PP=1608;SC=TACCTGGAACGCTCTCACTTT;SOR=1.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=78;WE=37439001;WS=37438983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	37456032	rs2098386	C	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=17;PP=1121;SC=TCTTCTTCAACTAAGGAAGCT;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=37456040;WS=37456022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	37458711	rs3213745	G	A	9257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=146;PP=2965;SC=CTGCGGCCATGGCGGGCAAAG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=144;TCR=147;TR=290;WE=37458719;WS=37458701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr2	37480249	rs1056021	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.697;SC=GACAATCTACAAAGAACAAGT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=37480257;WS=37480239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	37499289	rs11124574	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=252;SC=ACCAGTCTTATCACTTTGTAA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=37499297;WS=37499286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	37518045	rs10177176	G	C	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=67;PP=2965;SC=CCAATCCCCAGAGCATCTCAC;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=159;WE=37518053;WS=37518035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	37586681	rs2302651	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=505;ReadPosRankSum=-0.946;SC=AATGAAAGCCATTTCTTTAGA;SOR=0.257;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=31;WE=37586689;WS=37586671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr2	38177525	rs11687301	A	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=856;ReadPosRankSum=2.539;SC=GGTGAGCTACAGAACAGTTCT;SOR=0.867;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=67;TCR=13;TR=48;WE=38177533;WS=38177515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr2	38178406	rs4670799	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=493;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GCTTCCAACGATGTTCTCCAG;SOR=1.355;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=26;WE=38178414;WS=38178396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr2	38179134	rs4670800	G	A	7930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=119;PP=2965;SC=TACAGCACAGGTCATTCTCCA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=234;WE=38179142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr2	38179414	rs72332368	CTG	C	2406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CTTTCATAGCCTGTAGAATTC;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=37;WE=38179423;WS=38179404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr2	38298593	rs34468862	G	GA	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.508;SC=ATATTTCTGGGAAAAAAATCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=38298601;WS=38298583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	38526547	rs3765052	G	A	173.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.282;SC=AATAAGTTATGTACAATAAAC;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=38526555;WS=38526537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr2	38536626	rs2305243	T	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=291;ReadPosRankSum=2.058;SC=TTCGAAGCTCTCGTTTAAAGT;SOR=0.481;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=17;WE=38536634;WS=38536616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr2	38537626	rs2305245	A	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=398;ReadPosRankSum=0.973;SC=TTGTAAACAGAAGAAAGAAAA;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=21;WE=38537634;WS=38537616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr2	38541581	rs71400348	C	CTAT	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	38542573	rs12712583	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TTATTTTGTATCTCAGCGCAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=9;WE=38542581;WS=38542563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
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chr2	38829682	rs13028141	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=739;ReadPosRankSum=-0.159;SC=CGATCTCCCCCTCCTCGGTCT;SOR=0.652;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=63;WE=38829690;WS=38829672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr2	38903022	rs17576472	T	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=-1.581;SC=GAATTGAAGTTTTAAAAGTGC;SOR=0.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=10;WE=38903030;WS=38903012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr2	38907327	rs35368702	AT	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=1.242;SC=TACCTCGCTAATTTTTTTAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=38907335;WS=38907317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	38916970	rs6741892	A	T	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CCCAAATATAAATGACCATGA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=90;WE=38916978;WS=38916960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,100:0.55:183
chr2	38925610	rs12465156	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GGATGTTAGCAGTTAATTTAG;SOR=0.392;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=15;WE=38925618;WS=38925600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	38956947	rs2272445	A	G	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=46;PP=1328;SC=CTATGCTACAAGTGACCCAAT;SOR=2.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=38956955;WS=38956937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	38977371	rs3112183	C	T	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=57;PP=1639;SC=ATGCACGTTACGCAAAATCTG;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=80;WE=38977379;WS=38977361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	38977402	rs3134630	T	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=38;PP=1166;SC=CAATTACTTATTTGCCTTAAA;SOR=3.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=38977410;WS=38977392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	39006603	rs3112201	T	G	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=29;PP=1087;SC=AAACTCCTGATCTCCAAGGAT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=39006611;WS=39006593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	39008949	rs1056104	G	A	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=30;PP=1383;ReadPosRankSum=2.093;SC=CCACCATATGGTCCAGAAAAT;SOR=1.089;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=190;TCF=113;TCR=77;TR=88;WE=39008957;WS=39008939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,105:0.46:228
chr2	39025555	rs1530853	G	A	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=86;PP=2965;SC=GATCAAGTTCGCAACGAAGCT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=154;WE=39025563;WS=39025545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	39025632	rs1530852	A	G	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=50;PP=1451;SC=AACAGGCAGGATAGGTTATTG;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=39025640;WS=39025622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	39030074	rs13029406	C	T	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=44;PP=1332;SC=CAAAAAACCTCAGATGATGAC;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=39030082;WS=39030064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	39042639	rs3112138	G	A	5162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=70;PP=2965;SC=AAAGAGAAATGAGAACCAACT;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=159;WE=39042647;WS=39042629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr2	39045885	rs10176932	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=658;SC=CCATTTTACACGGCTGGTAAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=39045893;WS=39045884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	39050019	rs3112146	G	T	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=214;SC=AAAATTCACAGCTAACATACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=39050027;WS=39050009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	39050061	rs34582261	AT	A	1057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=1077;SC=CATGCCCTTGATTTCCCCCAT;SOR=5.486;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=28;WE=39050069;WS=39050051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	39050141	rs3770681	A	C	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=38;PP=2079;SC=TTACAAACGGAGACTTAAAAG;SOR=1.266;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=107;WE=39050149;WS=39050131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	39065729	rs17494315	C	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=495;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CAAAATTCAACGTCAAATACA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=25;WE=39065737;WS=39065719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr2	39075356	rs11124651	A	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CAAACTTTAAAATAATTATAT;SOR=0.141;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=39075364;WS=39075346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	39082344	rs7598922	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=911;ReadPosRankSum=0.023;SC=AGGTGGTCCATTCAGAGAATC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=52;WE=39082352;WS=39082334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr2	39084292	rs1131752	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AGCACCTGAAATGTGAAGAAT;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=17;WE=39084300;WS=39084282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	39090696	rs3099999	T	C	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=76;PP=2386;SC=TACACACATATCTTCAATCAG;SOR=1.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=103;WE=39090704;WS=39090686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	39108773	rs3099948	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=0.586;SC=ATTTTCTGGTATGTTTGCTTA;SOR=0.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=39108781;WS=39108763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	39117117	rs7565111	G	A	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=720;ReadPosRankSum=0.575;SC=AACCACCGCAGGCAACATGGG;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=48;WE=39117125;WS=39117107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr2	39117285	rs3112175	T	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=0.325;SC=TAACTTTTATTTAAGAGTTAT;SOR=2.494;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=39117293;WS=39117275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	39162785	rs5830547	CT	C	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.293;NF=10;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-0.753;SC=ACTGTAATTTCTTTTTTTTAC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=11;WE=39162793;WS=39162775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	39178061	.	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=273;ReadPosRankSum=-1.167;SC=GCCCTGCTGCATGTATTTTTG;SOR=1.201;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=18;WE=39178069;WS=39178051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr2	39185048	rs422854	C	T	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=7;PP=1274;SC=TGCAAAGGCCCCTGGAGATAG;SOR=3.486;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=39185056;WS=39185038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	39187190	rs6755527	T	C	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=30;PP=2084;SC=GGACTTCGAGTCCTCTCCGGC;SOR=1.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=39187198;WS=39187180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	39187519	rs958412	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=741;SC=GCGCCTACAAACTGGAGGCGG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=39187527;WS=39187509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	39198966	rs2305516	A	G	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=13;PP=1445;SC=AGCTGAGTTTATGGACTTTGA;SOR=2.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=63;WE=39198974;WS=39198956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	39214821	rs2290445	A	C	264.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=1.413;SC=AATTGCTTATAATTAAAAGTA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=39214829;WS=39214811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr2	39222132	.	T	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.294;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	39224351	rs1454223	G	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=769;SC=AAGTAGTTTAGAAACTTAATC;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=39224359;WS=39224341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	39224615	rs5830551	G	GT	480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=429;SC=GAAAATGCAAGTTTTTTTCTG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=39224623;WS=39224605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	39233500	rs7577088	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=391;SC=TTAATGAAATGAGTGTTTTGT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=39233508;WS=39233490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	39251375	rs10634554	T	TCAC	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=250;SC=TATTCAACTGTCACAATAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=39251383;WS=39251365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	39262068	rs10153761	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=47;PP=1245;SC=AGGTACAAGACAAAAATATCT;SOR=2.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=56;WE=39262076;WS=39262058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	39281730	rs997344	G	C	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=185;SC=CATTCAATGAGAGGCATATAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=39281738;WS=39281720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	39406572	rs7566123	C	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=931;SC=GAAAATCTTCCAGTTTGTGTA;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=39406580;WS=39406562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	39411863	rs141702509	A	ATG	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=85;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTGCGTATGTATGTGTGTGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=39411871;WS=39411853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	39440727	rs10196407	G	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;PP=718;SC=AACACCATGCGGAAGGGTCCT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=39440735;WS=39440717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	39452861	rs11124663	C	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=13;PP=597;SC=ATGGGGTAGCCAGATGCATTG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=39452869;WS=39452851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	39479122	rs3770678	G	C	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=191;SC=AAACATGATCGCTAAAAATGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=39479130;WS=39479112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	39494197	rs2302749	C	T	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=996;SC=AGAGATGAAACAGCCAAGAAA;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=39494205;WS=39494187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	39494469	rs10865149	C	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=442;SC=GATCAGTGCACAAAGGATGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=39494477;WS=39494459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	39507417	rs3755176	T	A	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=19;PP=742;SC=TACTACCTCTTGTATCTGGGT;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=39507425;WS=39507407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	39514136	rs3755172	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=10;PP=264;SC=TGAAAATGATTAATCTTCATG;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=39514144;WS=39514126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	39514204	.	G	C	69	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=69;QD=25.9428031368;SC=CTCTGACATAGTGTCATTATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=39514212;WS=39514194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	39526842	rs2111382	A	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=679;ReadPosRankSum=1.581;SC=GCAACTTAATAATTCTTGAAT;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=34;WE=39526850;WS=39526832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr2	39542658	rs5830562	AT	A	281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=8;PP=123;SC=CACTTTGCAAATTTTTTTTTT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=39542666;WS=39542648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	39553271	rs3815594	A	G	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=32;PP=2598;SC=AGATTCTTCAATGATGATGCA;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=86;TCR=32;TR=118;WE=39553279;WS=39553261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	39558928	rs6760382	G	A	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=103;SC=GTACATGCCTGAATTACTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=39558936;WS=39558918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	39564620	rs1125839	C	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=703;SC=GTAAGTAAAGCCTTAGTTTAA;SOR=1.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=39564628;WS=39564610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	39570427	rs3732053	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=798;SC=CAATAAAACATAGCTTGCTTT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=39570435;WS=39570417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	39583446	rs8545	A	G	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1286;SC=CTTTCATCATAATAATTTCTT;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=55;WE=39583454;WS=39583436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	40392313	rs434725	G	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=759;SC=ATCACTGTGAGAGCAAGTGAT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=40392321;WS=40392303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	40402064	rs6760003	A	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=0.721;SC=CTGCCTGACAACCCACCCAAG;SOR=0.826;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=21;WE=40402072;WS=40402054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr2	40402275	rs6734847	G	A	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=335;SC=TGAGGTCAATGGCCCTAAACA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=40402283;WS=40402265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	40402602	rs10199306	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TAAACAATCCCAACTGAAATT;SOR=0.256;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=18;WE=40402610;WS=40402592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr2	40403104	rs106706	A	G	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=19;PP=893;SC=ACTTCTGTACATTATTAGATA;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=40403112;WS=40403094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	40404839	rs433572	C	T	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=781;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TAGGGAGACACGGAGAGAGAA;SOR=1.308;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=44;WE=40404847;WS=40404829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr2	40564647	rs11893826	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr2	40564655	rs11893746	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	40655563	.	CCACACACACA	C,CCACACA	1051.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.500;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13,13;NR=4,4;PP=682,468;SC=ACACACTGAACCACACACACA;SOR=2.910;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=17,17;WE=40655580;WS=40655553;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.41,0.53:34
chr2	42165754	rs10192292	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=764;ReadPosRankSum=-0.029;SC=CAGGTGGAACCTGCAAGAAAG;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=52;WE=42165762;WS=42165744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr2	42165961	rs7590930	T	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-1.732;SC=TGGCCTCCCCTTGTTGTGCTG;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=42165969;WS=42165951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	42275260	.	G	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	42275726	rs11891679	C	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=624;ReadPosRankSum=1.092;SC=CGGGCCCGCGCCTGGGCTGCG;SOR=1.096;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=34;WE=42275734;WS=42275716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr2	42275819	rs11897440	T	C	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TGCCCGGCGGTGCCGCGGTGG;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=87;WE=42275827;WS=42275809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,99:0.47:212
chr2	42280300	rs34482969	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AGGAGAGAGAGGGGGAACCTG;SOR=1.140;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=7;WE=42280308;WS=42280290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	42280358	rs35771566	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=357;ReadPosRankSum=0.845;SC=GACCTAATGACCTGCCCTCGG;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=21;WE=42280366;WS=42280348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	42282632	rs13401037	A	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=2.384;SC=TTCTCTGGGGACCCTTGTCTC;SOR=0.668;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=18;WE=42282640;WS=42282622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr2	42491751	rs35132936	C	T	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=114;SC=AGATTATAGCCTAAGCATTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=42491759;WS=42491741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	42492191	rs13016514	A	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=34;PP=982;SC=TTCTTCCTTAAAAAGGAAATA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=42492199;WS=42492181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	42510018	rs6736913	A	G	5143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=67;PP=2965;SC=TCCGACCGGGAAAATAGTTTA;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=152;WE=42510026;WS=42510008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr2	42511903	rs6744779	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=631;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AGTGGAATCTATTGTAATTTT;SOR=0.434;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=47;WE=42511911;WS=42511893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr2	42515388	rs10202624	A	G	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=24;PP=1111;SC=TCATTTATGTATTATTGATGA;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=42515396;WS=42515378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	42515437	rs28651764	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=-0.642;SC=GACTGGCAGAAGAAAGCAAAA;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=26;WE=42515445;WS=42515427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr2	42522756	rs10490555	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	42531871	rs12464702	G	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGCCTTTTGCGACATGCTACA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=42531879;WS=42531861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	42544821	rs7558501	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=0.124;SC=AGCAGAACATCAGAGTTCCCT;SOR=0.093;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=42544829;WS=42544811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	42553210	rs2286703	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.455;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=589;ReadPosRankSum=0.705;SC=TACAAGTAAACGTGGCTAGTT;SOR=2.303;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=27;WE=42553218;WS=42553200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
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chr2	42560975	rs7572231	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=280;ReadPosRankSum=-0.323;SC=AGTCTCCAGCAGCCACAGAAA;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=20;WE=42560983;WS=42560965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr2	42588195	rs3764906	T	C	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=937;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GGGCCGCCACTTCTCATGTCC;SOR=0.883;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=62;WE=42588203;WS=42588185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr2	42719847	rs113015907	T	TG	3896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.670;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=24;PP=2975;ReadPosRankSum=0.052;SC=TGGCCGCGCCTGGGCCTCGCT;SOR=2.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=84;WE=42719868;WS=42719837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,117:0.98:119
chr2	42719860	rs112592817	G	GC	6122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=34;PP=2975;SC=GCCTCGCTGGGCGCGCACCCC;SOR=2.049;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=97;WE=42719868;WS=42719837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	42795954	rs78106475	T	C	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=41;NR=40;PP=1418;SC=TGGGAGCGGGTTCCGGGAGCG;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=81;WE=42795962;WS=42795944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	42836516	rs6720277	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=704;ReadPosRankSum=0.073;SC=AATATTGAATAAAATGTTGAT;SOR=1.132;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=29;WE=42836524;WS=42836506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr2	42925079	rs148782944	TTTC	T	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=5;PP=156;ReadPosRankSum=0.236;SC=TTTGTGTATCTTTCTTCTTCT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=42925089;WS=42925069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	42931217	rs2304658	A	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TCTTCTTCACACATTTTAAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=42931225;WS=42931207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	42935961	rs4953577	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=591;ReadPosRankSum=1.666;SC=CAAACAGTAACGTGTTTGGGC;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=34;WE=42935969;WS=42935951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr2	42935979	rs4953578	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=691;ReadPosRankSum=-1.467;SC=GGCAAGTTCACTTCCTTGAGT;SOR=0.715;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=38;WE=42935987;WS=42935969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr2	42996709	.	ATGTGTGTGTGTG	A	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=1162;ReadPosRankSum=0.246;SC=AACCTCTGAAATGTGTGTGTG;SOR=1.948;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=7;WE=42996728;WS=42996699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	42996759	rs34567167	AAGAG	A	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.167;NF=8;NR=5;PP=523;ReadPosRankSum=-0.943;SC=GTGTGTGTGAAAGAGAGAGAG;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=13;WE=42996770;WS=42996749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	42996819	rs13413507	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.146;NF=18;NR=9;PP=437;ReadPosRankSum=0.584;SC=GGCTGCTGTGGGAGGATGCCC;SOR=0.903;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=27;WE=42996827;WS=42996809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr2	42997614	rs2241850	G	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=844;ReadPosRankSum=1.918;SC=AAGAGGCAGGGGCTGGGCTGG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=50;WE=42997622;WS=42997604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr2	43011169	rs4953660	G	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=756;ReadPosRankSum=1.575;SC=TGTCTCCCCGGTGCATGCCAT;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=41;WE=43011177;WS=43011159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr2	43015612	rs3816181	G	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=791;ReadPosRankSum=1.386;SC=GCCCCCTCCCGCTAGGGCCAG;SOR=0.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=69;TCR=28;TR=51;WE=43015620;WS=43015602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr2	43015719	rs3816183	T	C	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1172;ReadPosRankSum=1.539;SC=GGGCCTCCGATGAACATGACT;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=94;WE=43015727;WS=43015709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,108:0.54:201
chr2	43015757	rs3816184	G	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1021;ReadPosRankSum=0.141;SC=CCTGCAATGCGCAAAGTGGGG;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=46;TCR=83;TR=70;WE=43015765;WS=43015747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,78:0.55:142
chr2	43015902	rs3816185	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	43019730	rs2304656	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=0.138;SC=GGAGGCCCGCAGCTCCGCCCA;SOR=0.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=12;WE=43019738;WS=43019720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr2	43625404	rs77442683	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GGAGCTGCTCCTTATCCCAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=43625412;WS=43625394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	43655276	rs200282553	CAGA	C	3161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.642;NF=12;NR=36;PP=1965;ReadPosRankSum=0.549;SC=ATGCTGAGAGCAGAAGAAGTA;SOR=0.700;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=26;TCR=88;TR=48;WE=43655286;WS=43655266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,85:0.43:198
chr2	43779206	rs142593751	G	GT	815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=809;ReadPosRankSum=0.268;SC=ACACAGATACGTATGTTTTTA;SOR=0.598;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=20;WE=43779214;WS=43779196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr2	43799070	rs3752355	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	43802261	rs970175	C	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=225;SC=ATTAAATACACAGAATGACCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=43802269;WS=43802251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr2	43905898	.	G	C	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=65;QD=19.9542425094;SC=GGTGGAGGTGGAGGTGGAGGT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=5;WE=43905906;WS=43905888;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,5:0.26:19
chr2	43905898	rs142175341	G	GAGGTGGAGGTGC	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	43958774	.	G	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=436;ReadPosRankSum=0.746;SC=AATGATTTAAGGTAAAATACT;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=24;WE=43958782;WS=43958764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr2	43991357	rs7565517	A	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=465;SC=ACTTTTTCTTATCTTTAAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=43991365;WS=43991347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	44101537	rs138296512	A	AT	2774.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.025;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=2353;ReadPosRankSum=1.156;SC=CCTTTCCCTTACTTTTTAGGT;SOR=0.453;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=46;WE=44101546;WS=44101527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr2	44101538	rs28517482	C	T	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.025;HP=5;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=2361;ReadPosRankSum=1.159;SC=CTTTCCCTTACTTTTTAGGTT;SOR=0.453;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=65;WE=44101546;WS=44101527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr2	44101649	rs10667526	G	GC	1785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.695;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=43;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GAGAGCAAGTGCCCCCCACCC;SOR=1.727;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=46;WE=44101657;WS=44101639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr2	44101711	rs13405698	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=219;ReadPosRankSum=1.098;SC=AAGGCTTTTCTGAACCATGGG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=44101719;WS=44101701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr2	44104925	rs6544718	T	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1359;ReadPosRankSum=1.000;SC=ATCCTCAGTGTCATGGAGCTG;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=85;WE=44104933;WS=44104915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,91:0.52:176
chr2	44116836	rs2955280	C	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=671;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CATAAATCTGCAGAGGTATTT;SOR=0.689;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=45;WE=44116844;WS=44116826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr2	44123672	rs3839036	TC	T	860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.505;NF=18;NR=3;PP=745;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TATAGTATTCTCAAATAAGGT;SOR=1.332;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=21;WE=44123680;WS=44123662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr2	44145374	rs7568481	G	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=983;ReadPosRankSum=1.771;SC=AATCTGTTACGATTATGCCAA;SOR=0.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=57;WE=44145382;WS=44145364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr2	44152180	rs4952694	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=504;ReadPosRankSum=0.280;SC=ATAAATGAAAGCGTGAAGAAT;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=37;WE=44152188;WS=44152170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr2	44161854	rs143170527	G	GA	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.347;NF=14;NR=8;PP=331;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AGCAAGAAGGGAAAAAAAAAC;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=22;WE=44161862;WS=44161844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr2	44172444	rs28394191	A	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=652;ReadPosRankSum=-0.003;SC=CTTGCATCACATATTTCCTTT;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=40;WE=44172452;WS=44172434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr2	44172550	.	G	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=736;ReadPosRankSum=1.821;SC=ATGAATCTAAGCGGTCACTAA;SOR=0.435;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=46;WE=44172558;WS=44172540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr2	44173422	rs7594526	T	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GAAATCAGTGTGAAGGTAAAA;SOR=0.444;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=18;WE=44173430;WS=44173412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr2	44175366	rs72877186	A	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=541;ReadPosRankSum=1.490;SC=AGGGGGGAAAAAACCTGAGTT;SOR=0.768;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=31;WE=44175374;WS=44175356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	44177560	rs59338949	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.955;SC=CTAAAAGACACACATAACTAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=44177568;WS=44177550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	44177701	rs58811869	G	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=709;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGCAATATTAGAGGGACTTAC;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=46;WE=44177709;WS=44177691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr2	44184511	.	T	C	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.688;SC=AACATTTAAGTTGATCATCTT;SOR=0.509;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=76;WE=44184519;WS=44184501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
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chr2	44187829	rs10190161	A	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=345;SC=TATTTTGATAAGCCAAAGATC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=44187837;WS=44187819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr2	44502788	rs3738985	A	C	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CGGATCCAGGAAGCTCAACAG;SOR=1.064;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=85;WE=44502796;WS=44502778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,105:0.44:237
chr2	44508835	rs11124986	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GTTTCCAGTTGTTATTTACTC;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=44508843;WS=44508825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	44512971	rs3768919	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GTAAAAATACGTTGCAACCAT;SOR=0.250;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=13;WE=44512979;WS=44512961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	44531484	rs3738984	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=1.605;SC=GATGGTAAGTCCTCATGACAG;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=18;WE=44531492;WS=44531474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr2	44547574	rs698761	G	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CCGCTAAAATGAGAATAAGGT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=73;WE=44547582;WS=44547564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr2	44547909	rs8886	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=-1.407;SC=TGAATGTAACTGCTTTAAGAA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=44547917;WS=44547899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	44548613	rs2241871	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=0.149;SC=AAAAATTAAATAGAAGGCCTT;SOR=1.363;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=20;WE=44548621;WS=44548603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr2	44548930	rs75407306	G	A	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1426;ReadPosRankSum=1.923;SC=TATCTAGTTCGGGAATCTGTC;SOR=0.523;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=198;TCF=89;TCR=109;TR=88;WE=44548938;WS=44548920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,103:0.44:236
chr2	44549735	rs77212913	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.146;SC=CTGGGGAGTCAACATAGCAAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=44549743;WS=44549725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	44556298	rs2033951	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=-0.988;SC=TCTTTTATAATAACTGTTTTA;SOR=0.452;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=16;WE=44556306;WS=44556288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr2	44565447	rs2289463	A	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=1.394;SC=AAACTGCATAAATATTTTGAT;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=44565455;WS=44565437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	44569474	rs2304769	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.426;SC=CAAAATAAACGTTTTAAGTCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=8;WE=44569482;WS=44569464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	44569700	rs61004197	AAAT	A	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.098;NF=2;NR=12;PP=564;ReadPosRankSum=-0.164;SC=TTCTGAAAGAAAATAATGAGA;SOR=0.910;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=14;WE=44569710;WS=44569690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr2	44569739	.	T	TA	61	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.9997;HP=15;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=59.82;NF=0;NR=5;PP=61;QD=12.8;SC=TACACTCCATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=44569747;WS=44569729;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,5:0.38:13
chr2	44570776	rs17580226	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.390;SC=CATAGGGATACATGAATCAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=44570784;WS=44570766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	44570804	rs12053381	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=156;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CTTCTCCCTCCCTCACATGCG;SOR=0.145;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=44570812;WS=44570794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	44573624	rs698763	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TAGACTTAACGTTGTACAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=44573632;WS=44573614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	44573658	rs698764	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	44617324	rs1085486	T	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=292;ReadPosRankSum=0.709;SC=CTTTTTTGAATACTAAAAATG;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=21;WE=44617332;WS=44617314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr2	44858687	rs10191477	T	C	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=738;ReadPosRankSum=0.422;SC=AAGCAATCCTTCTGCCTCAGC;SOR=0.954;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=43;WE=44858695;WS=44858677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr2	44942384	rs343957	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=498;ReadPosRankSum=0.677;SC=TTTTTGGTCACTTCACAATCA;SOR=1.382;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=25;WE=44942392;WS=44942374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr2	45170153	rs4953152	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=434;ReadPosRankSum=-1.153;SC=CAGGGAAGCCGTGACTCCTGG;SOR=0.333;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=27;WE=45170161;WS=45170143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr2	45171842	rs338074	A	G	5112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=88;PP=2940;SC=CGGAGCGCGCAGACACCGGCA;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=162;WE=45171850;WS=45171832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	45640334	rs3755072	T	C	3209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=48;PP=1990;ReadPosRankSum=1.409;SC=CACTGCAGTTTTGCTCTTCTT;SOR=0.529;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=214;TCF=132;TCR=82;TR=117;WE=45640342;WS=45640324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,143:0.54:266
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chr2	45812666	rs34838023	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=645;ReadPosRankSum=1.386;SC=AAATTGTCAAATATACCGTCA;SOR=0.453;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=38;WE=45812674;WS=45812656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr2	45826526	rs35501868	CT	C	3336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=17;PP=2966;SC=AGTACAACCCCTATGCTAGTC;SOR=2.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=67;WE=45826534;WS=45826516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	45829286	rs12998864	A	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GGTAAAAAAGAGATGCAAGAT;SOR=0.175;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=16;WE=45829294;WS=45829276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr2	45879610	rs637909	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=455;SC=CCTCCCCGTCATTCCGGGAAC;SOR=1.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=45879618;WS=45879600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	46203796	rs2278786	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=1.340;SC=TGGGGTAGGGGAGACTATGCA;SOR=1.088;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=22;WE=46203804;WS=46203786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr2	46234568	rs10188306	A	G	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=39;PP=1418;ReadPosRankSum=0.367;SC=AGAGGTATGCACTAATGCAAT;SOR=0.600;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=219;TCF=142;TCR=77;TR=104;WE=46234576;WS=46234558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,115:0.43:267
chr2	46237446	rs1987070	C	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=892;ReadPosRankSum=0.921;SC=TTATTCCATACATGCATAGAT;SOR=0.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=58;WE=46237454;WS=46237436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr2	46378419	rs35676949	T	TAC	243.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-0.213;QD=18.70;ReadPosRankSum=2.276;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr2	46602722	rs7567582	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=327;SC=CGCCCTGTTCTGTCTGTTCCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=46602730;WS=46602712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	46603671	rs7557402	C	G	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=35;PP=1644;SC=TCTTTCCCCCCCATTAGTGAG;SOR=0.987;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=85;WE=46603679;WS=46603661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	46605659	rs7571218	A	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=356;SC=GTTAATTAGCAGCCCCTCTAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=46605667;WS=46605649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	46605954	rs7598371	G	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=797;SC=GCTGTCTGGTGGACAGCAAAG;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=46605962;WS=46605944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	46608542	rs13006131	C	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=675;SC=CCTTCAGCATCTTATAGCTGA;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=46608550;WS=46608537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	46707808	.	C	CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG	3947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.11;QD=69.26;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr2	46739157	rs3814045	A	G	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=39;PP=2271;SC=CACTAGCTTCACTTCCCAGAG;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=46739165;WS=46739147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	46771134	rs6714484	G	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=35;PP=1047;SC=AACAAACAGAGCCGGATAAGC;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=46771142;WS=46771124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	46799852	rs1451153	G	T	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=616;SC=AAAATATAATGGGTTTGTTAA;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=46799860;WS=46799842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	46818992	rs17818315	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=275;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TGATACAAGACGAAAAATCTG;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=22;WE=46819000;WS=46818982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr2	46819815	rs2305350	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=26;PP=777;SC=GTATACATATATTTCCTGCTA;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=46819823;WS=46819805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	46840735	rs3213985	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr2	46844247	rs113423551	G	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.921;SC=AGAAAGGGAGGGGCGGGCAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=46844255;WS=46844237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr2	47045267	rs2289931	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=358;ReadPosRankSum=1.141;SC=GCAGCAACCCGGGCCAGCCCA;SOR=1.382;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=18;WE=47045275;WS=47045257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr2	47045309	rs2289933	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=1406;ReadPosRankSum=0.016;SC=TCTTGCCTCTCCTCCTCCAGG;SOR=1.322;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=33;WE=47045329;WS=47045299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr2	47045321	rs17773492	A	G	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TCCTCCAGGGAACTCTTTGAA;SOR=1.012;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=37;WE=47045329;WS=47045299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr2	47049409	rs2278715	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.926;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=128;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GCCAGTCCCCCACTTCGGTCT;SOR=0.160;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=15;WE=47049417;WS=47049399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr2	47049453	rs1053952	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GTCCTCCTAGAGAAATCTAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=47049461;WS=47049443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	47081092	rs11687883	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=0.623;SC=AAGGATGATACGGTTTGGCTG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=47081100;WS=47081082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	47083028	.	ATATG	A	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=59.42;NF=4;NR=0;PP=84;QD=26.25;SC=GCATCTATATATATGTATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=4;WE=47083052;WS=47083018;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,4:0.17:24
chr2	47083044	rs1079	A	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.52;QD=28.91;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	47083252	rs11691225	G	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=1.045;SC=TCCCTTTTCTGTTATTGGCAA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=18;WE=47083260;WS=47083242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	47085398	rs2278711	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TGCGTGAGTCCGTCTGAACGA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=47085406;WS=47085388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	47132945	rs7600882	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TAGATATATAGAGAGAGAATA;SOR=1.426;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=6;WE=47132953;WS=47132935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	47133055	rs11890177	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=578;ReadPosRankSum=0.702;SC=TGTTTCATTATGGCTCATTCT;SOR=0.547;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=38;WE=47133063;WS=47133045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr2	47177787	rs2033533	G	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=398;SC=AGCTGCCCTTGCACTTACAGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=47177795;WS=47177777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	47201797	rs6745836	A	T	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=600;ReadPosRankSum=0.727;SC=AAATTTTTTTAAAAAACCTCA;SOR=0.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=43;WE=47201805;WS=47201787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr2	47220448	rs60188383	C	CT	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TGTTACAACTCTAACTTTTCA;SOR=1.751;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=47220456;WS=47220438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	47220622	rs17480869	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=654;ReadPosRankSum=0.661;SC=AGCTCCGGGAGGTGCTGCGGA;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=43;WE=47220630;WS=47220612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr2	47221693	rs7576915	A	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=760;ReadPosRankSum=2.366;SC=CCAGTCTCACATCTCACGCAG;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=53;WE=47221701;WS=47221683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr2	47233048	rs13407983	G	A	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1183;ReadPosRankSum=0.877;SC=CCCAAACAATGTCCCACCCAC;SOR=0.906;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=261;TCF=137;TCR=124;TR=98;WE=47233056;WS=47233038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,110:0.37:296
chr2	47233749	rs13424540	T	C	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.04;MQRankSum=-0.782;NF=46;NR=29;PP=960;ReadPosRankSum=0.930;SC=GGACCCCTGGTGGGTAAATGC;SOR=0.575;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=75;WE=47233757;WS=47233739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,93:0.38:242
chr2	47238631	rs55944397	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=98;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GTGGCAGCAGCTGGCTGTGCA;SOR=1.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=8;WE=47238639;WS=47238621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr2	47248833	rs7565682	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	47248833	.	AA	GC	144	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=144;QD=49.3669687156;SC=AGCAGAACAAAATTTGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=47248842;WS=47248823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	47248834	rs7565683	A	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	47250819	rs12988535	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=394;SC=AGCAGCCACAAGTCTCGGTTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=47250827;WS=47250809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr2	47273668	rs12712986	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.608;SC=ATGGGGAGGAGAGTGAGGCTT;SOR=0.096;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=8;WE=47273676;WS=47273658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr2	47277035	rs77908208	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=195;ReadPosRankSum=0.895;SC=TCACTGGGCCCTGTGATGCTA;SOR=0.357;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=12;WE=47277043;WS=47277025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr2	47277207	rs3816066	CA	AG	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=2336;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CTCCTTGGGCCACTGTGTGCA;SOR=0.788;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=176;TCF=84;TCR=92;TR=73;WE=47277216;WS=47277197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,93:0.42:224
chr2	47314048	rs2280647	T	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	47314052	rs1474394	T	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=186;SC=CAATCATGTTTTGTGGCCAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=47314060;WS=47314045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	47348347	rs1880583	C	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=37;PP=1303;SC=CTCCCCTCACCCCTAGCTGTC;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=47348355;WS=47348337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	47357458	rs58184321	A	G	6276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=122;PP=2965;SC=TCACTTCGTTATCTGTCATTC;SOR=1.464;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=62;TCR=122;TR=184;WE=47357466;WS=47357448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr2	47380145	rs17036300	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=0.069;SC=GGAAGTCTTTTGGGCTGGTTT;SOR=0.821;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=11;WE=47380153;WS=47380135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr2	47380203	rs815809	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=301;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GGTGATCCCTTGAAATTAAAT;SOR=0.968;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=26;WE=47380211;WS=47380193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr2	47380305	rs6749284	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.872;SC=AATAAATTTGCCCATATTTCC;SOR=0.859;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=6;WE=47380313;WS=47380295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	47382214	rs815806	C	G	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=23;PP=1502;SC=GGAACGAGAGCGGCACGAAGG;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=47382222;WS=47382204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	47382300	rs815805	G	A	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1451;ReadPosRankSum=1.416;SC=CAAGGGGCAGGCCATCTTACC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=101;WE=47382308;WS=47382290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,115:0.59:196
chr2	47382342	rs815804	G	T	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=60;PP=1570;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CCACCCACCAGGTCTTCCCTT;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=96;TCR=101;TR=115;WE=47382350;WS=47382332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,134:0.59:228
chr2	47399601	rs4953472	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=244;ReadPosRankSum=-1.163;SC=AAGCTAACCTAAAGAGTTAAA;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=17;WE=47399609;WS=47399591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	47403383	.	G	T	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=22;QD=11.3542425094;SC=ACTAGAGGAAGCCCCCCTGAA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=5;WE=47403391;WS=47403373;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	47605109	rs189454727	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.210;SC=CGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=47605117;WS=47605099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	47672569	rs1981929	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	47797123	rs139772114	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=-1.423;SC=AGGCGCCGGGGAAGTCCCAGC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=17;WE=47797131;WS=47797113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr2	48010558	rs1042820	C	A	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=872;ReadPosRankSum=1.959;SC=CCTTGGCGCGCTCCGCGTCAC;SOR=0.571;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=54;WE=48010566;WS=48010548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr2	48010654	rs55927047	C	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=1.578;SC=GGGGTGGGGTCGAAGGCGGGG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=18;WE=48010662;WS=48010644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	48018081	rs1800932	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=722;ReadPosRankSum=-0.103;SC=ACTTCTCACCAGGAGATTTGG;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=47;WE=48018089;WS=48018071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr2	48018314	rs3136282	T	A	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=499;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAAACA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=48018322;WS=48018304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	48023115	rs1800935	T	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=517;ReadPosRankSum=0.306;SC=AACGTGCAGATGAAGCCTTAA;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=43;WE=48023123;WS=48023105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,49:0.43:115
chr2	48030458	rs2072447	G	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=463;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TGAAAGTTATGTCTTATAATG;SOR=0.232;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=24;WE=48030466;WS=48030448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr2	48030838	rs2020911	A	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=1.537;SC=ACTGATTCTTAAAGTTTTGTT;SOR=0.522;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=30;WE=48030846;WS=48030828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
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chr2	48032937	rs3136359	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-0.846;SC=TGAAGTACATTTAAACAATAT;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=48032945;WS=48032927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	48033551	rs3136367	C	G	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.655;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=1436;ReadPosRankSum=-1.153;SC=GGGCACTTCTCTTGCTAGCAC;SOR=1.017;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=184;TCF=108;TCR=76;TR=84;WE=48033559;WS=48033541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,101:0.45:223
chr2	48040904	rs373765859	G	GA	3528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=34;PP=2074;SC=TATTAACACAGAAAAAAGATG;SOR=1.377;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=61;WE=48040912;WS=48040894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	48059471	rs142115222	AAAAT	A	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.238;NF=7;NR=9;PP=695;ReadPosRankSum=0.727;SC=TTTTCTATTAAAAATAAGTGT;SOR=0.680;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=16;WE=48059482;WS=48059461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr2	48066232	rs368463059	CT	C	130.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9991;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=0.157;SC=TAATGAATAGCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=48066240;WS=48066222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	48573895	rs79073127	G	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=52;PP=1263;ReadPosRankSum=0.144;SC=GGCAAGGTCAGTGTTTATGAA;SOR=0.525;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=44;TCR=98;TR=77;WE=48573903;WS=48573885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,85:0.54:156
chr2	48687120	rs75251775	A	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=746;ReadPosRankSum=-0.227;SC=TAAATTGTCTATCCACTTAGA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=38;WE=48687128;WS=48687110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr2	48718367	.	A	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=721;ReadPosRankSum=0.683;SC=CATTCTAGAGAATGGCAAGAG;SOR=0.823;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=35;WE=48718375;WS=48718357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr2	48722755	rs4443044	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=255;ReadPosRankSum=1.744;SC=TTTGTGTATGTTGGATGCAGG;SOR=1.248;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=17;WE=48722763;WS=48722745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	48722897	rs142541304	G	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=533;ReadPosRankSum=-0.940;SC=AGTCGAGAAGGCCTTGCACAG;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=45;WE=48722905;WS=48722887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr2	48725610	rs3811519	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=1.095;SC=CTCTAAGATACAACACTCTGT;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=13;WE=48725618;WS=48725600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	48725932	rs149710448	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=1.749;SC=TGGTAAGTATCTAATGTTCAA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=16;WE=48725940;WS=48725922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr2	48734576	rs6716341	G	A	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=57;PP=1909;SC=CCCTGCAGGAGTTAGGACACT;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=88;WE=48734584;WS=48734566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	48738388	rs62135170	C	T	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=999;SC=TATAATTTCCCTACTCCACAT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=48738396;WS=48738378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	48738687	rs4528813	G	C	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=47;PP=1363;SC=ATTTCAGGAGGAAGAGGACAT;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=56;WE=48738695;WS=48738677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	48757264	rs192357652	C	G	43.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	48822381	rs2140551	G	A	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=40;PP=2294;SC=AAATAGAAAAGAAGTGGATTA;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=105;WE=48822389;WS=48822371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	48844968	rs2293269	C	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=38;PP=1737;SC=TCCGAGGGCACTGCGTGCCGC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=88;WE=48844976;WS=48844958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	48873978	rs10432667	A	G	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=87;PP=2965;SC=AACAAATTCTAATGTGGAGTC;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=75;TCR=87;TR=162;WE=48873986;WS=48873968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	48898798	rs3920390	T	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=33;PP=1393;SC=CGGATAATGTTATTGTCTGTC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=48898806;WS=48898788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	48906625	rs1965508	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=32;PP=1177;SC=ATCAGTTGGATTATATTGCAT;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=48906633;WS=48906615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	48915871	rs11125179	A	G	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=115;PP=2965;SC=AGCCCATAATATCTTCACAGG;SOR=1.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=66;TCR=115;TR=181;WE=48915879;WS=48915861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	48921375	rs2293275	T	C	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=24;PP=959;SC=TGTTTTGTTATTCACTTTCCT;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=48921383;WS=48921365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	48925746	rs6755901	C	T	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=15;PP=755;SC=CTTTTGGTTTCTACTTACTCT;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=48925754;WS=48925736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	48925986	rs70946824	AT	A	393.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.87;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr2	48952701	rs6545063	C	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=410;SC=GAGGAACATGCAAATAGTGCC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=48952709;WS=48952691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	48956431	rs11892719	T	A	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=735;ReadPosRankSum=-0.154;SC=TCTGCATGATTATGAGCTATG;SOR=0.867;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=44;WE=48956439;WS=48956421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
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chr2	48960032	rs10495960	G	A	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=1867;ReadPosRankSum=1.899;SC=ATTCCCGAAGGCATTCCCAAG;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=126;TCR=91;TR=119;WE=48960040;WS=48960022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,131:0.51:257
chr2	48982485	rs4073367	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=0.499;SC=AACCACCAAGTTTTGGGTTCT;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=48982493;WS=48982475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	48982622	rs4073366	C	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=264;ReadPosRankSum=1.162;SC=GCATCAAGGGCGCCGCGACGG;SOR=0.704;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=18;WE=48982630;WS=48982612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	49189921	rs6166	C	T	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1159;ReadPosRankSum=0.697;SC=AGTGGAACCACTGGTGACTCT;SOR=0.876;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=72;WE=49189929;WS=49189911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr2	49191041	rs6165	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=2.262;SC=TGACCCCTAGCCTGAGTCATA;SOR=1.528;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=25;WE=49191049;WS=49191031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr2	49215977	rs2072488	G	A	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=684;SC=AGATGAGAGAGGAACGCAGAA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=49215985;WS=49215967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	49216136	.	C	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=679;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTTCAAAGCTCAGCCCCACGA;SOR=1.220;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=45;WE=49216144;WS=49216126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
chr2	49216284	rs2072487	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=244;SC=ATGCGGTCTTCAGCTGAGGTA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=49216292;WS=49216274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	49217916	rs2072486	T	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.202;SC=ATACGTGAATTAGGCTCATGT;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=49217924;WS=49217906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	49241849	rs6708637	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.192;SC=TTTCCAATCCGCATTTTCAGA;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=49241857;WS=49241839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr2	49244559	rs2091787	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=354;ReadPosRankSum=1.044;SC=AGTATCAAGTAGGCCTTTTAG;SOR=0.537;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=24;WE=49244567;WS=49244549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr2	49381585	rs1394205	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CTGATTTCTTCCTGCATTTGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=49381593;WS=49381575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	49510173	rs7578654	A	C	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=-1.289;SC=CTGCTATATAACTTGATCTCT;SOR=1.108;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=29;WE=49510181;WS=49510163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr2	50201110	rs9636391	A	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=33;PP=1825;SC=AGCTACCTGCAAGTTTTCACA;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=50201118;WS=50201100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	50201383	rs4971883	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-1.201;SC=AATGGCTGACGCACTACGGCA;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=15;WE=50201391;WS=50201373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr2	50246224	rs7571903	C	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=655;ReadPosRankSum=0.614;SC=CCCTGTTTTGCAAATCCTTCC;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=50246257;WS=50246217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	50246232	rs146211469	TCCAAAACATTA	T	298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.47;MQRankSum=1.336;NF=4;NR=1;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TGCAAATCCTTCCAAAACATT;SOR=0.321;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=5;WE=50246257;WS=50246217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	50246249	rs7586095	T	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.306;NF=8;NR=3;PP=907;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CATTACCTCATCTGTGCTTTC;SOR=0.616;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=11;WE=50246257;WS=50246217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	50280283	rs1363050	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.478;SC=TTAAGCTAGTTTCAAAGGAAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=50280291;WS=50280273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	50280338	rs1363049	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TAGAAAAGACGCATATGCAGA;SOR=0.375;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=25;WE=50280346;WS=50280328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr2	50434759	rs1715984	C	G	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=800;SC=GACTTTGAATCAAATATTATA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=50434767;WS=50434749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	50539771	.	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=660;ReadPosRankSum=0.368;SC=TGTTAAACCTGAGGTATGTTT;SOR=0.528;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=41;WE=50539779;WS=50539761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr2	50574485	rs13422484	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.668;NF=17;NR=27;PP=552;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TCCTCCTGGAAGGTCCTCACT;SOR=0.478;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=49;TCR=89;TR=44;WE=50574493;WS=50574475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,48:0.32:151
chr2	50692459	rs12713101	T	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=0.143;SC=ACTGCTTCTATGGGTTATGAC;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=50692467;WS=50692449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
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chr2	50693504	rs75315267	AAC	A	2386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=1469;SC=GAACCCAAATAACAGTTACTG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=50693513;WS=50693494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr2	50733860	rs7584062	A	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.18;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	50758657	rs2066948	T	C	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=617;SC=TTATCATTTATTTAAGACTTC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=50758665;WS=50758647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	50858107	rs961405	T	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;PP=1048;SC=AGAAAAGGAATGTCTGCTTAT;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=50858115;WS=50858097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	50966283	rs1546667	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=0.108;SC=TTGTATGTCACAAATCTGTAG;SOR=0.904;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=50966291;WS=50966273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	51125560	rs1014688	A	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	51125707	rs62140645	C	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=11;PP=489;SC=GAAAATGAAACGGGATATTGT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=51125715;WS=51125697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	51125819	rs147883364	AAATT	A	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=192;ReadPosRankSum=0.909;SC=TTTTCCTATGAAATTAATTGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=51125830;WS=51125809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	51146914	rs58905388	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=1.938;SC=AATTCCTCCAACAGATGGCAC;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=51146922;WS=51146904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	51148872	rs36106628	T	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	51149072	rs7423296	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=371;ReadPosRankSum=-1.345;SC=ACAAAGAGGATAAAGAGGAGA;SOR=0.992;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=27;WE=51149080;WS=51149062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr2	51149102	rs4327263	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=293;ReadPosRankSum=-1.170;SC=ATAAGTATTATGAACATATGT;SOR=0.948;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=28;WE=51149110;WS=51149092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr2	51150432	rs112205397	C	CA	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=128;ReadPosRankSum=-0.981;SC=GAATTTACTACAAAAAAGGGT;SOR=0.746;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=6;WE=51150440;WS=51150422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	51150462	rs72823581	A	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=203;ReadPosRankSum=-0.310;SC=ACAATGGGTCAGCTGCAAATA;SOR=1.014;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=15;WE=51150470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	51206342	rs35296842	C	G	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=13;PP=1569;SC=AGAAAGTAAGCGATTTCCTCT;SOR=2.568;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=67;WE=51206350;WS=51206332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	53831866	rs7585615	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=469;ReadPosRankSum=-0.086;SC=AGGAAGGGGTGTAAACCACAC;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=32;WE=53831874;WS=53831856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr2	53920931	rs7563054	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=1.937;SC=TGTGTTCACCGATGAATCTTA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=13;WE=53920939;WS=53920921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	53921270	rs3731970	C	T	54.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	53955850	rs17521008	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=545;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TAATCTTACCCGATGAAATAA;SOR=1.585;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=33;WE=53955858;WS=53955840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr2	53955982	rs1127767	T	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=736;ReadPosRankSum=-1.149;SC=TCTCAGCATTTTCCTAAAGCA;SOR=0.842;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=51;WE=53955990;WS=53955972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr2	54023247	rs72502136	GT	G	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5739;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=123;ReadPosRankSum=1.896;SC=GTTGTGTCAGGTTTTTTTTTT;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=54023255;WS=54023237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr2	54024626	rs2692514	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=197;ReadPosRankSum=-2.364;SC=GGCTTTTGTGCATTGAAATAT;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=14;WE=54024634;WS=54024616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr2	54035374	rs2692519	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=2.021;SC=AACTTAAGCCATAACTGAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=9;WE=54035382;WS=54035364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr2	54035447	rs1127362	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=561;ReadPosRankSum=-0.058;SC=AAGATTTGCAATCAACTAAAG;SOR=0.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=34;WE=54035455;WS=54035437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr2	54041983	rs2542571	G	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=400;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ACCTTAAAGTGCTCTCTGTTT;SOR=1.034;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=28;WE=54041991;WS=54041973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
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chr2	54120025	rs805408	A	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=575;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CTTTCATGTGAATCTGCAACC;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=40;WE=54120033;WS=54120015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr2	54120204	rs805409	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGCTCCAAGCACACTCCCCTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=54120212;WS=54120194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	54120820	rs805412	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CCTTAAAGAGGCAAAAACGTC;SOR=0.749;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=25;WE=54120828;WS=54120810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr2	54122956	rs698856	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-3.026;SC=CAGTACCAGCATAACTTTGTC;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=9;WE=54122964;WS=54122946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	54122984	rs698857	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=0.227;SC=AACAACACTACAAAAATAACA;SOR=0.048;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=54122992;WS=54122974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	54125258	rs805416	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.113;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-2.748;SC=TAGTGAAGAATACTGCTCCTA;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=6;WE=54125266;WS=54125248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	54125495	rs805417	T	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=0.479;SC=ATAGTTCCTTTAAAAAAAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=20;WE=54125503;WS=54125485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr2	54127041	rs805423	C	T	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=701;ReadPosRankSum=-0.905;SC=CATTCTTTTCCTGTTGGCGTT;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=41;WE=54127049;WS=54127031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr2	54133737	.	G	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.312;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=1448;ReadPosRankSum=-0.349;SC=AGCCTTACCTGACTGTATGAA;SOR=1.227;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=41;WE=54133752;WS=54133727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr2	54133744	rs805316	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=1623;ReadPosRankSum=0.409;SC=CCTGACTGTATGAACTTGTAG;SOR=0.430;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=44;WE=54133752;WS=54133727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr2	54135429	rs805319	G	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=265;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AAAACAATTAGTGCAGACTTT;SOR=0.336;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=15;WE=54135437;WS=54135419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	54144448	rs805325	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=1.335;SC=TAATAGTCTGTATCATATGGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=7;WE=54144456;WS=54144438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	54152927	rs2302879	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;ReadPosRankSum=-0.847;SC=ATTCAAGTGATAGCTACTTAA;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=9;WE=54152935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	54155240	rs805349	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=356;ReadPosRankSum=0.750;SC=GTGTATAATCACCAATATACT;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=29;WE=54155248;WS=54155230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr2	54158957	rs805352	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=386;ReadPosRankSum=0.127;SC=GCTGAGACTCCCACTAACCAC;SOR=1.828;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=18;WE=54158965;WS=54158947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr2	54161885	rs805357	G	T	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=528;ReadPosRankSum=0.776;SC=AAAAAAATAAGTAAGGATATT;SOR=0.889;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=30;WE=54161893;WS=54161875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr2	54343012	rs7573491	C	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=0.079;SC=ACTTCCGCTCCGCCATGACAC;SOR=0.166;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=18;WE=54343020;WS=54343002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr2	54362437	rs2357954	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.256;SC=AAATTTAATATTGTAGGACCA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=54362445;WS=54362427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	54482703	rs76397255	GGGGCCC	G	3901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.372;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.038;NF=15;NR=72;PP=2977;ReadPosRankSum=0.078;SC=CCCACGTTCAGGGGCCCGGGC;SOR=1.048;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=221;TCF=44;TCR=177;TR=87;WE=54482716;WS=54482693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,106:0.44:242
chr2	54482989	rs6740641	C	T	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=73;PP=2268;ReadPosRankSum=1.199;SC=AGGCAGAGGCCGCTTCTAGGC;SOR=0.876;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=248;TCF=116;TCR=132;TR=132;WE=54482997;WS=54482979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,149:0.53:279
chr2	54494370	rs865816	A	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=730;SC=GGCACAAAGAAGCTCCCAATA;SOR=2.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=54494378;WS=54494360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr2	54586040	.	T	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=0.185;SC=ATACTGATTATATGTCCATAA;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=54586048;WS=54586030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr2	54608883	rs11677654	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTTTTCCATCATGGGCACAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=5;WE=54608891;WS=54608873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr2	54844926	rs7569127	T	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CTTAACTGTCTCACCGTGGTG;SOR=1.236;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=10;WE=54844934;WS=54844916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr2	54848728	rs12713274	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CACTCATAAAATTTGCCAATA;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=7;WE=54848736;WS=54848718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	54855137	rs2971887	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=862;ReadPosRankSum=0.606;SC=AGGGAAGGCATAGCTTCATTG;SOR=0.950;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=67;TCR=26;TR=52;WE=54855145;WS=54855127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr2	54855454	rs17046036	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.150;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	54858664	rs2229503	C	T	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=1301;ReadPosRankSum=0.469;SC=TGTGGGAGAACAGACAAAATC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=77;WE=54858672;WS=54858654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,87:0.44:196
chr2	54877146	rs3739109	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=0.649;SC=GCAGCCACCCAGGGGTGCTGG;SOR=1.773;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=13;WE=54877154;WS=54877136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr2	54882381	rs2271329	G	A	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=61;PP=1387;ReadPosRankSum=0.373;SC=TGCAGCTGGCGTCAAGATGTA;SOR=0.514;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=168;TCF=60;TCR=108;TR=98;WE=54882389;WS=54882371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,109:0.58:187
chr2	54884870	rs966003	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.589;SC=TTAGAGTAGACGATAGACTGG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=54884878;WS=54884860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	55040426	rs2631840	A	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=837;ReadPosRankSum=0.692;SC=GGAAGGAGCCATATATATGCA;SOR=0.400;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=59;WE=55040434;WS=55040416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr2	55071101	.	T	TTGTGTGTGTG	493	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=53.64;NF=2;NR=1;PP=493;QD=165.333333333;SC=CTTTAGGGTTTTGTGTGTGTG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=3;WE=55071109;WS=55071091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,3:0.27:11
chr2	55077061	rs12713278	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=693;SC=TTCTATTTGTAGAATTGCTGC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=55077069;WS=55077051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	55122589	rs6545454	A	G	5292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=102;PP=2965;SC=CTGGGACTAGAGTGAGGCAAA;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=66;TCR=102;TR=168;WE=55122597;WS=55122579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	55138272	rs2304688	G	A	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=188;SC=ACTAATATGGGTTATATTTAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=55138280;WS=55138262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	55155672	rs10164886	A	G	5513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=89;PP=2965;SC=CACCTGCCACATGCCTCCTGC;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=182;WE=55155680;WS=55155662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr2	55155957	rs17418194	C	T	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=38;PP=1111;SC=AGCCAGAGTGCGTTTTCTTTG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=55155965;WS=55155947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	55176112	rs13394146	C	T	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=62;PP=2324;SC=GTTAAACAATCACTTGTAGTC;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=125;WE=55176120;WS=55176102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	55180965	rs4671998	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQ=59.13;NF=13;NR=2;PP=346;SC=TGGAGGTTGCGGTGAGCTGAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=55180973;WS=55180955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	55186229	rs12623902	T	C	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=643;SC=GAAGATGTTGTTTTGTTTACA;SOR=1.292;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=26;WE=55186237;WS=55186219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	55186394	rs17346629	A	C	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=28;PP=781;SC=CGGAAAAGAGAGGCCGTAAGC;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=55186402;WS=55186384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	55187297	rs58866010	A	AG	2987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=29;PP=2363;SC=AGAGGGCCGGAGGGGTAGTGG;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=59;WE=55187305;WS=55187287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	55200800	rs2255112	T	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=356;ReadPosRankSum=1.039;SC=TGCTAAAGAATCTTATTAACC;SOR=0.914;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=17;WE=55200808;WS=55200790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr2	55201038	rs2255026	C	T	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=27;PP=777;SC=TCAAAAAGAACGGAATGATTT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=55201046;WS=55201028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	55214618	rs2580769	A	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=496;SC=TGTTTTCCAGACATCTCACCT;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=55214626;WS=55214608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	55214912	rs2580770	C	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=271;SC=AAAACAAAAACGCTACTACAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=55214920;WS=55214902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr2	55404925	rs6545477	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.029;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=225;ReadPosRankSum=0.572;SC=CATCTGAAGGCAAAAATGAAA;SOR=0.152;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=17;WE=55404933;WS=55404915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
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chr2	55436934	rs9677948	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=938;ReadPosRankSum=0.683;SC=TTTAGTGAGAGCATCTAGATT;SOR=0.594;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=52;WE=55436942;WS=55436924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr2	55439963	rs2118283	C	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=604;SC=GAAAGGCTTTCTTATGTCTTT;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=55439971;WS=55439953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	55449318	rs4435493	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=-0.907;SC=GTTGTCAACATAGATCATTGC;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=13;WE=55449326;WS=55449308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr2	55449464	rs17852670	T	C	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=751;ReadPosRankSum=2.315;SC=TTATGTATCTTTGCACACTTT;SOR=0.545;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=47;WE=55449472;WS=55449454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,56:0.38:149
chr2	55470115	rs11357	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=-1.863;SC=TTTGCACTTACATCACCCACT;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=5;WE=55470123;WS=55470105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	55471382	rs61109509	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=0.586;SC=AAAATGAAAATAAAAGTATAT;SOR=0.527;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=18;WE=55471390;WS=55471372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr2	55471407	rs2589083	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=527;SC=AATGTCATAATGTACTTTAAG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=55471415;WS=55471397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	55473386	rs3833559	CAT	C	2205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=1625;ReadPosRankSum=0.960;SC=CTAACAATAACATGTAACAAA;SOR=0.547;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=38;WE=55473395;WS=55473376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr2	55473681	rs2589081	A	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=798;SC=GTCACATAATACTTGCAAGTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=55473689;WS=55473671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	55489629	rs2589093	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TTTAGATTTATTCTCAAATAT;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=15;WE=55489637;WS=55489619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	55490819	rs1056445	G	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=611;ReadPosRankSum=-0.351;SC=AGCAGCCCCAGTGAGCACATC;SOR=0.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=39;WE=55490827;WS=55490809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr2	55518742	rs2249856	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=853;SC=TGTGCACTTGTTTCACACTTA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=55518750;WS=55518732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	55522422	rs2589110	A	G	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=59;PP=2910;SC=TTATTCTGATAACTGGCCTAG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=55522430;WS=55522412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	55527108	rs1545121	G	A	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=59;PP=1974;SC=TGATGATGCTGATGAGCTTTT;SOR=1.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=55527116;WS=55527098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	55528257	rs2576699	A	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=16;PP=878;SC=GCTGGCAATGACGCATTCACC;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=55528265;WS=55528247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	55528514	rs2589117	A	G	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=147;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=20;SC=TCAATCATGTATAATACAGAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=55528522;WS=55528504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	55566531	rs12621734	A	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=-0.992;SC=AGTGGAAAATAAATGGGCTAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=55566549;WS=55566521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	55566538	rs71821845	CTATT	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.199;SC=AATAAATGGGCTATTTATTTA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=3;WE=55566549;WS=55566521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	55576634	rs2589090	C	T	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=54;PP=2816;SC=TCCTAAATAACAGATATTCCA;SOR=1.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=144;WE=55576642;WS=55576624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	55582601	rs5831355	T	TTTGACACA	1110.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=1169;SC=TTTTTCTCATTTACTTGTGAA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=19;WE=55582609;WS=55582591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	55582635	rs2589104	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.235;NF=27;NR=8;PP=625;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GCTAGCAATATTTCCATAAGC;SOR=0.139;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=35;WE=55582643;WS=55582625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr2	55582684	rs1437394	A	T	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=41;PP=2480;SC=GACCATATAAATTCAATGAAC;SOR=1.523;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=82;TCR=41;TR=123;WE=55582692;WS=55582674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	55589364	rs13019339	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-1.379;SC=AAATAGTATCGTTTCTGAAAA;SOR=0.053;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=55589372;WS=55589354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	55589434	rs3111412	T	A	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=23;PP=1307;SC=ACTGAAAGAATTTTACAAACC;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=55589442;WS=55589424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	55591017	rs114386931	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=599;ReadPosRankSum=1.715;SC=TGAAGTATTTTAGGAGATAGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=36;WE=55591025;WS=55591007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr2	55760940	rs4671248	G	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=467;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CTTAAGGAACGAGAACAGTGA;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=29;WE=55760948;WS=55760930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr2	55762957	rs3762513	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.311;SC=ATTAAGTTTACACCTAGATCT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=16;WE=55762965;WS=55762947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr2	55764754	rs11280083	AATATGAATAC	A	1000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=2968;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TTTCTCTAATAATATGAATAC;SOR=1.329;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=17;WE=55764771;WS=55764744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr2	55771050	rs3816489	C	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=482;ReadPosRankSum=0.783;SC=ATTCTAATTGCTCTTATTGTC;SOR=1.123;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=27;WE=55771058;WS=55771040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr2	55771161	rs1045910	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1407;ReadPosRankSum=0.296;SC=CCACAAAAAGACCTGAAGATT;SOR=0.517;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=76;WE=55771169;WS=55771151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,96:0.47:203
chr2	55805440	rs2903704	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=0.124;SC=GGGGTACATATGAAACTCCAA;SOR=0.649;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=21;WE=55805448;WS=55805430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr2	55808969	rs1975486	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=0.711;SC=TTATTTAAACCTCTATTCCTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=55808977;WS=55808959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	55812073	rs7594279	T	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=325;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GTCAGAAATCTATTATTTTGC;SOR=0.132;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=22;WE=55812081;WS=55812063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr2	55812201	rs61762670	G	C	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1416;ReadPosRankSum=0.635;SC=TCACTCTGCTGAGCTTCTTGC;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=112;TCR=100;TR=92;WE=55812209;WS=55812191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,117:0.46:255
chr2	55844445	rs782594	T	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=590;ReadPosRankSum=0.114;SC=TCCACCGCTCTAGCCGCCGCC;SOR=2.651;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=28;WE=55844453;WS=55844435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr2	55863360	rs35916020	T	TA	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.086;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.783;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	55873301	rs2627776	T	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TTCCACTTTTTAAAGCAATAT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=55873309;WS=55873291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	55883317	rs2627765	G	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=-0.996;SC=GGAAAATCTCGGGGAATAACA;SOR=0.662;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=22;WE=55883325;WS=55883307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	55889062	rs782604	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=301;ReadPosRankSum=-0.358;SC=ATCATAAAACGTAACAAACAT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=17;WE=55889070;WS=55889052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	55894247	rs782637	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.532;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=499;ReadPosRankSum=0.765;SC=ATATAGGAAATAAGTACATTA;SOR=1.325;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=33;WE=55894255;WS=55894237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr2	55898929	rs2627771	AC	GT	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCCACTGCACACCAGCCTGGG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=55898938;WS=55898919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	55899228	rs782631	A	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.496;SC=TCTGGAAACAAGAGGCAGTTT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=11;WE=55899236;WS=55899218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	55912120	rs782572	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=337;ReadPosRankSum=-1.682;SC=GAAGTACCAATCTCTCTTCTC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=21;WE=55912128;WS=55912110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr2	55914621	.	T	C	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=28;QD=31.3856062736;SC=TGGACTCTGGTTGTCTGGAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=55914629;WS=55914611;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,2:0.29:7
chr2	55920663	rs62165235	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-2.308;SC=AAAGGGAAATTTGGAATTTAG;SOR=0.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=55920671;WS=55920653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	56149475	rs2277886	C	G	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=54;PP=2493;SC=GTACTTATTTCAAATTCCATC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=56149483;WS=56149465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	56216052	rs10865292	G	A	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=968;ReadPosRankSum=-1.104;SC=GAAATTTGGTGTTTAATTTTG;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=69;WE=56216060;WS=56216042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr2	58275666	rs986512	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=334;ReadPosRankSum=-1.526;SC=CTTAAGGTGTGTCCTGCACTG;SOR=0.575;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=24;WE=58275674;WS=58275656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
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chr2	58381785	rs848294	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=229;ReadPosRankSum=-0.871;SC=TGGGGTCTCTTTGACCCATTT;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=13;WE=58381793;WS=58381775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	58388696	rs848291	A	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=23;PP=1006;SC=GTCCACACTGAGAATTATCAC;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=58388704;WS=58388686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	58392789	rs848288	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.937;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.948;NF=30;NR=15;PP=2078;ReadPosRankSum=-2.692;SC=CCAACTGTCATTGTTAGATTT;SOR=0.274;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=45;WE=58392807;WS=58392779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr2	58392797	rs148383677	TTTA	T	2049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.007;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.972;NF=13;NR=16;PP=2083;ReadPosRankSum=-1.660;SC=CATTGTTAGATTTATTTTCAT;SOR=0.381;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=29;WE=58392807;WS=58392779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr2	58449041	rs200325071	CA	C	1547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.805;SC=ATATATAAAACAAAGGCATTT;SOR=0.616;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=32;WE=58449049;WS=58449031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr2	58459320	.	CAAAGA	C	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.683;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=505;ReadPosRankSum=-0.138;SC=AACAGAATCACAAAGAAAAGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=58459332;WS=58459310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	60614572	rs243080	G	A	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=40;PP=1710;SC=GAACGGCTCTGCAAGATGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=79;WE=60614580;WS=60614562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	60687959	rs7569946	A	G	6602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=81;PP=2965;SC=AGAAGCGCAAACTCCCGTTCT;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=184;WE=60687967;WS=60687949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	61007782	rs10496089	A	G	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=29;PP=2646;SC=ATAATTATAAAGTTTCATGTA;SOR=1.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=84;TCR=29;TR=113;WE=61007790;WS=61007772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	61008036	rs3845814	C	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=672;SC=ACTATAGTCCCCTTCCTCCTT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=61008044;WS=61008026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	61014952	rs4672404	A	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=618;SC=TTTGGGAGGCAGAGGCGGGCA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=61014960;WS=61014942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	61119005	rs62149422	A	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=528;ReadPosRankSum=1.826;SC=TAGTTGCTTCATATACTAGCT;SOR=0.748;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=33;WE=61119013;WS=61118995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr2	61145498	rs149570046	AT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=3.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	61448776	rs2290324	A	C	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=51;PP=1778;SC=TATTTAGATCAATCTGAACCC;SOR=1.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=61448784;WS=61448766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	61450454	rs2123111	A	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=468;SC=ATTAGTGGAAATAAGTTTTTC;SOR=2.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=61450462;WS=61450444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	61483715	rs68101593	A	T	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	61483725	rs72811484	T	A	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	61484556	rs2060824	T	C	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=228;SC=TCAATGAACATATAACAAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=61484564;WS=61484546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	61522047	rs35292974	T	C	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=409;SC=AGATAAATTATTTTTATCAAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=61522055;WS=61522037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	61522123	rs13014347	T	C	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=12;PP=910;SC=CCACTTGATCTTCACTTGAAT;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=61522131;WS=61522113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	61528299	rs11428092	T	TA	1908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=32;PP=1360;SC=ATACCATCTATAAAAAACAGG;SOR=1.536;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=39;WE=61528307;WS=61528289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	61538602	rs141750762	G	GAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAA	1184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=78.98;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	61552484	rs2593624	T	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=8;PP=391;SC=AACAGATTTTTAAAAAGTACT;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=61552492;WS=61552474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	61570886	rs72381726	AAAGT	A	1628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=1442;SC=TCCTTTCAACAAAGTAAGATA;SOR=4.977;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=28;WE=61570897;WS=61570876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	61575308	rs6722430	A	G	4867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=83;PP=2965;SC=TCTTTCTGACATGCCTTGGGA;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=153;WE=61575316;WS=61575298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	61576517	rs811378	G	A	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=35;PP=1219;SC=TCAACAAGATGTAAGTGGAGA;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=61576525;WS=61576507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	61605614	rs10208769	T	A	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=27;PP=803;SC=ATTCTTGCATTTGTCAGCAAA;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=61605622;WS=61605604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	61647901	rs778155	A	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=31;PP=967;SC=AGGAATTGATATAAGTAAATA;SOR=1.123;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=61647909;WS=61647891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	61648932	.	A	ACG	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=201;SC=ACACACACACACGCGCGCGCG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=61648940;WS=61648922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	61761169	rs1446532	G	A	60.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	62053878	rs11392751	G	GA	69.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=99;SC=TCAAAAAAAAGAAGAAAACGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=62053886;WS=62053868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	62065759	rs6545910	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=714;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GGAGTTTCTGCAATTCTTTCA;SOR=0.992;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=56;WE=62065767;WS=62065749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,68:0.42:162
chr2	62066417	rs36214963	ATATAT	A	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.493;NF=6;NR=0;PP=273;ReadPosRankSum=0.589;SC=ACAAAATATCATATATTATAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=62066429;WS=62066407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	62066927	rs4672457	A	G	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=68;PP=2718;SC=TCCTGCATCCACAAGCTGACC;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=62066935;WS=62066917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	62069528	rs11125896	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=487;ReadPosRankSum=0.897;SC=TATATAGTGACTGGAGCTGAA;SOR=0.914;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=29;WE=62069536;WS=62069518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr2	62073918	rs58256183	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCTCTGACTGCTTCCTGTCGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=62073926;WS=62073908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	62074140	rs113296637	A	AAC	348.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=369;SC=CTCTACTAAAAACAAAACTTA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=62074148;WS=62074130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	62081012	rs4270331	A	C	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=71;PP=2708;SC=CAGCGGGCTGAGCCACTTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=62081020;WS=62081002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	62081217	rs1881616	A	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=696;SC=CTGGCCCGGGACGGGAAAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=62081225;WS=62081207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	62095994	rs4672463	A	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=21;PP=609;SC=AAACTTGGCCAGGCACGGTGG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=62096002;WS=62095984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	62099156	rs3828276	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=1.892;SC=AACAGATGACTACAAAGCTTT;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=62099164;WS=62099146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	62104343	rs7571143	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=0.328;SC=TCCACTGCTGCCTTACTATCA;SOR=0.086;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=62104351;WS=62104333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	62104660	rs36062307	TA	T	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.994;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.988;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr2	62107376	rs5831625	T	TC	1536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=1058;SC=TAAAGTTTGTTTTTTAAACTT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=62107384;WS=62107366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	62107632	rs2272429	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-0.517;SC=ATTTGAAGATGCAACATGATT;SOR=0.358;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=18;WE=62107640;WS=62107622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr2	62110571	.	G	T	21	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9998;HP=20;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=21;QD=27.8856062736;SC=AAAAAAAAAAGACTCACCTAA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=62110579;WS=62110561;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	62112221	rs11429418	G	GA	840.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.607;NF=6;NR=17;PP=522;ReadPosRankSum=-1.454;SC=CAGATGGGGGGGAAAAAAAAG;SOR=0.730;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=23;WE=62112230;WS=62112211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
chr2	62112222	rs67059162	G	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=-1.688;QD=10.89;ReadPosRankSum=-2.009;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr2	62112246	rs57035931	C	CT	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=15.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.817;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr2	62228180	rs55785307	C	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=0.871;SC=GTTAGCTTGTCTATTCAGCTT;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=62228188;WS=62228170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	62729653	rs6713096	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.138;NF=23;NR=38;PP=1012;ReadPosRankSum=1.626;SC=CAGTGATCACAATGAATTTGT;SOR=0.777;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=61;WE=62729661;WS=62729643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,68:0.40:172
chr2	62729674	rs4672527	T	C	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=76;PP=2760;SC=AGTAGTCAGGTAAGATTGAAT;SOR=1.187;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=122;WE=62729682;WS=62729664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	62729747	rs11443505	G	GA	2606.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=42;PP=1836;SC=ATTTAAGATAGAAAAAATTAT;SOR=1.039;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=56;WE=62729755;WS=62729737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	62733189	rs17854454	C	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=2753;ReadPosRankSum=-2.927;SC=GACTCTGGACCGGTCCGATTG;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=69;TCR=119;TR=83;WE=62733209;WS=62733165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,104:0.46:226
chr2	62733201	rs78110679	A	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=48;PP=2753;ReadPosRankSum=-1.531;SC=GTCCGATTGGAATCACTGAAC;SOR=0.870;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=166;TCF=56;TCR=110;TR=69;WE=62733209;WS=62733165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,85:0.43:198
chr2	62733253	rs11676567	C	T	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=61;PP=1947;SC=GCACCGGATCCGGCAGCTCCA;SOR=1.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=62733261;WS=62733243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	62738883	rs6757222	C	T	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=981;SC=TTTTTTGGTTCGGTGGCATTT;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=62738891;WS=62738873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	62738931	rs6757448	G	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=25;PP=1383;SC=CCTGCTATATGAAGCAGCTGC;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=62738939;WS=62738921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	62739135	rs4405748	A	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=440;SC=AAAATATTTTATATATTACAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=62739143;WS=62739125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	63170921	rs2302567	C	G	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1225;SC=ACCCACTGTGCTATTTTCTCC;SOR=2.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=49;WE=63170929;WS=63170911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	63272724	rs2018650	T	C	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=1041;SC=TTTAAAACTTTTAACATTTTG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=63272732;WS=63272714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	63283178	rs17850223	C	G	6549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=108;PP=2965;SC=CGCACCAGCTCAGCCCCATGG;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=91;TCR=108;TR=199;WE=63283186;WS=63283168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr2	63486429	rs992214	C	T	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=34;PP=1498;SC=TTAAAAATAGCGTTAATTCTT;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=63486437;WS=63486419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	63540523	rs1517402	A	T	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=40;PP=1180;SC=TTTAACATATATCTGTGATAC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=63540531;WS=63540513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	63605772	rs2292794	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=348;SC=CAGGAAAGATAAAATTAAAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=63605780;WS=63605762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	63609017	rs2138796	A	T	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=12;PP=645;SC=AAAACTCATCAATGAAAAATA;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=63609025;WS=63609007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	63631830	rs6724115	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=35;PP=989;SC=AGATAAACTTTGGTTTTTCTT;SOR=1.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=63631838;WS=63631820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	63631889	rs4671501	A	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=381;SC=TATTAAAGAAAATCAATTACT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=63631897;WS=63631879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	63631921	rs4671502	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=187;SC=CAGCAACATACAAGTATATAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=63631929;WS=63631911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	63664829	rs11896820	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=289;SC=ATAGCATTTTATAAAAATATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=63664837;WS=63664822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	63720210	rs7563623	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=273;SC=GAATAAACATACTCTAGTGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=63720218;WS=63720200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	63798333	rs4671068	C	T	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=665;SC=GCATAAGCCACCGCGCCTGGT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=63798341;WS=63798323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	63816672	rs10469944	C	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=439;SC=GCGTTTGCAGCAGACGTGTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=63816680;WS=63816662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	63822672	rs34038003	A	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1533;SC=GGGAGTAGAGAAGGGATTTTA;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=63822680;WS=63822662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	63822785	rs2305157	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=9;PP=232;SC=ACTACCACTGTTTATTAACTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=63822793;WS=63822775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	63826164	rs7591566	C	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=204;SC=AATGCATTTTCCTATGCTATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=63826172;WS=63826154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	63826528	rs7606045	T	G	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=103;SC=TTTCTTGTTTTTGTTTAGTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=63826536;WS=63826518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	64139834	rs2302808	A	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr2	64139901	rs2302809	A	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=267;SC=CTTATAAAGAACCAGTTTATT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=64139909;WS=64139891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	64140301	rs10207847	A	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1078;SC=ACATGATGAGAACAGTGACAT;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=64140309;WS=64140291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	64143884	rs13027117	T	C	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=249;SC=AAAGTTTCCTTTAAGTTCTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=64143892;WS=64143879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	64147834	rs1440002	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=78;SC=TTAGTTTAACGATTATTATAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=64147842;WS=64147824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	64195997	.	C	CA	115	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9998;HP=14;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.87;NF=4;NR=6;PP=115;QD=11.9;SC=GCCAAAGGGTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=10;WE=64196005;WS=64195987;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:28,10:0.26:38
chr2	64567680	rs12477412	T	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=352;SC=GTCACTTTGATTGTAGGAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=64567688;WS=64567672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	64567916	rs12473206	C	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=41;PP=1284;SC=TCCCACCCCCCACTCCTGTTT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=59;WE=64567924;WS=64567906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	64682364	rs3770741	A	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=675;ReadPosRankSum=0.519;SC=CATCATCTGCAGACACTGTGT;SOR=1.954;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=33;WE=64682372;WS=64682354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr2	64794945	rs7598893	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.049;NF=0;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=0.629;SC=CAGGCCAGGCGCAGTGGATCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=64794953;WS=64794935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	64796479	rs6546087	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TAAATGTTCACTTATATTGAA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=64796487;WS=64796469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr2	64796932	rs2287533	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GAATCTGAAGGGTATAAATAG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=64796940;WS=64796922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr2	65231245	rs11891502	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.839;SC=GAAAACTTTGAGGTTTGAATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=65231253;WS=65231235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	65245365	rs759458	G	A	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1553;ReadPosRankSum=-1.800;SC=ACTCAACAACGTAGAGCTCAA;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=225;TCF=126;TCR=99;TR=114;WE=65245373;WS=65245355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,136:0.50:272
chr2	65315880	rs1420184	G	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1291;SC=CTAATTCTTAGTGCATTTCTA;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=65315888;WS=65315870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	65315903	rs1420185	G	A	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=857;SC=ATCCATAATGGAGCGTGAGGA;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=65315911;WS=65315893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	65473930	rs58944514	AAAATTTTC	A	1667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.623;NF=2;NR=29;PP=2966;ReadPosRankSum=1.878;SC=TGTTAAATCAAAAATTTTCTT;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=31;WE=65473945;WS=65473920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr2	65478371	rs7574628	T	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTGAAATATTTTCAGTTTTTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=65478379;WS=65478361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	65481008	rs268871	A	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=41;PP=1067;SC=GGTAAGTGAAAGGAAAATATC;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=65481016;WS=65480998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	65488538	rs268862	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=42;PP=1238;SC=TACATTAGAAGTGGTGATTTC;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=65488546;WS=65488528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	65492486	rs4671647	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=0.191;SC=GCTCTGGTCACCTCTATAGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=65492494;WS=65492476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	65495570	rs55843720	A	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	65495570	.	AT	CC	947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=19;NR=4;PP=947;QD=43.4986032549;SC=GGTACCAAATATTACGTTCTA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=23;WE=65495581;WS=65495560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr2	65495571	rs60931828	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	65495573	rs72536103	A	AC	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=736;SC=ACCAAATATTACGTTCTACTT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=17;WE=65495581;WS=65495560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	65495887	rs268875	G	A	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=78;PP=2965;SC=GCTTGTTCCCGTCATACCCGT;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=145;WE=65495895;WS=65495877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	65496018	rs11424	C	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.064;NF=5;NR=17;PP=402;ReadPosRankSum=0.429;SC=CTTGGGGAAGCTTTGTTAAAT;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=22;WE=65496026;WS=65496008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr2	65540905	rs8827	C	G	3270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=71;PP=2141;ReadPosRankSum=1.478;SC=CGGAGTCGGGCGCGTCCTGGC;SOR=0.772;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=235;TCF=112;TCR=123;TR=131;WE=65540913;WS=65540895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,147:0.53:278
chr2	65559027	rs2271198	A	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=618;ReadPosRankSum=0.359;SC=AACAGCAAACACTGCATTGCA;SOR=0.722;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=42;WE=65559035;WS=65559017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr2	65561392	rs4671658	C	T	3825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=68;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AGAATCCATTCTCTACTTCTG;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=268;TCF=152;TCR=116;TR=150;WE=65561400;WS=65561382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,180:0.55:330
chr2	65604767	rs268121	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CCTGGTCATCGTCTGACCTGA;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=70;WE=65604775;WS=65604757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr2	65604914	rs268120	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=24;PP=686;SC=TCAAAGCGGCAGTCCTCAGCA;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=65604922;WS=65604904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	66665146	rs2280334	T	C	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=104;PP=2965;SC=CGCTTCCCTCTTTCTCTGTGC;SOR=1.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=57;TCR=104;TR=161;WE=66665154;WS=66665136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	66667186	rs2271856	C	T	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=358;ReadPosRankSum=1.078;SC=CACACACGCGCGCGCGCGCGC;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=18;WE=66667208;WS=66667176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr2	66667200	rs9309387	A	AACACACACAC	320.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	66794834	.	G	A	244	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=244;QD=25.3428375043;SC=TTTGGAGAAGGTGGAAAAAAA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=66794842;WS=66794824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	66798282	rs2861108	G	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=213;SC=TTAATCACAGGGTTCTCTGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=66798290;WS=66798272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	67624779	rs114064178	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr2	67630980	rs3770657	G	A	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=50;PP=2029;SC=TTACTAGGTAGTGAACCTTTT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=89;WE=67630988;WS=67630970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr2	67631831	rs61740794	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=560;ReadPosRankSum=-0.695;SC=TAATAATTCCGAACATGGAGC;SOR=0.960;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=32;WE=67631839;WS=67631821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr2	67632125	rs3770655	C	T	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=23;PP=1089;SC=ATTGGTTCTTCCAGGAAGTTC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=67632133;WS=67632115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	67632214	rs1063571	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=455;ReadPosRankSum=0.687;SC=ATCAGCCATGCCATAAGACTG;SOR=0.905;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=29;WE=67632222;WS=67632204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr2	67637196	rs1569	G	A	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.14;NF=49;NR=85;PP=2698;SC=AAGACTTCACGAAGACTGCTG;SOR=1.386;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=134;WE=67637204;WS=67637186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	67637217	rs35271433	GTGAT	G	2327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.203;NF=2;NR=40;PP=1860;ReadPosRankSum=1.051;SC=ATAACTATCTGTGATTGATAG;SOR=0.867;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=42;WE=67637228;WS=67637207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr2	68272883	rs72821819	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	68352515	rs6742154	A	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=666;ReadPosRankSum=-1.006;SC=TGCTCTGAGCACTGGAGAGAA;SOR=1.112;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=127;TCF=44;TCR=83;TR=40;WE=68352523;WS=68352505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,43:0.30:143
chr2	68364478	rs13009282	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=513;ReadPosRankSum=-2.342;SC=TGTGTTCTCATGTCAAAAACA;SOR=0.954;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=35;WE=68364486;WS=68364468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr2	68385097	rs2044693	A	G	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1463;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCAGAGCGCCAGGGCAGAGGA;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=98;TCR=89;TR=93;WE=68385105;WS=68385087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr2	68389276	rs11402583	G	GA	339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.549;NF=16;NR=4;PP=257;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GTCTCCAAGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.336;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=20;WE=68389284;WS=68389266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	68444143	rs66891931	TAC	T	742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=412;ReadPosRankSum=0.547;SC=AGAGGTATGATACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=9;WE=68444152;WS=68444133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	68444168	rs12328306	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.067;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr2	68444171	rs28585403	C	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.083;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr2	69002281	rs11685672	C	G	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1468;SC=GGGTTCCTCTCTCCTCTCCGC;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=69002289;WS=69002271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	69009304	rs2271834	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=884;SC=TGTTGTCCAACCCAATTTTAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=69009312;WS=69009294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	69043264	rs67399232	CT	C	6574.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=51;PP=2992;SC=AGTTATTTCCCTTTTTTTTTT;SOR=1.270;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=81;WE=69043274;WS=69043254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	69043266	rs78107572	T	A	6583.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=90;NR=52;PP=2409;SC=TTATTTCCCTTTTTTTTTTTA;SOR=1.246;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=142;WE=69043274;WS=69043254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	69043539	rs2271832	G	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=233;SC=AACCCCATCAGAAAGAAGCTC;SOR=1.061;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=69043547;WS=69043529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	69045158	rs10197806	C	A	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=454;SC=AAGCAGGTACCCAGGAAATAA;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=69045166;WS=69045148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	69046719	rs17036006	G	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=195;SC=AGCCCACTCTGAAAGAGAGAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=69046727;WS=69046709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	69049941	rs10177248	T	C	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=81;PP=2542;SC=TTGCAGAGGATGGTCCAAGAG;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=146;WE=69049949;WS=69049931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr2	69180161	rs7561266	T	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=440;SC=AGAATTGAGATCCAACCACAT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=69180169;WS=69180151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	69201894	rs4417751	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=44;PP=1305;SC=TTTAGGAGGTCTGCTTCTTAT;SOR=2.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=55;WE=69201902;WS=69201884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	69297622	rs4591376	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGACCCTGAACGGATAATATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=69297630;WS=69297616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr2	69330284	rs4241349	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=0.309;SC=TGGGTGTCCAGCTTGGTAAGC;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=69330292;WS=69330274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	69350343	rs77890195	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=0.893;SC=AGCTTATGACGGAGCCAGTGT;SOR=1.460;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=20;WE=69350351;WS=69350333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr2	69351621	rs11126217	T	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=399;ReadPosRankSum=-1.627;SC=CCCAAAGGAGTCCTGTGTGTC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=19;WE=69351629;WS=69351611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	69351963	rs76576396	G	A	260.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=1.855;SC=ACCCCAGAGTGTATCAGGCAT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=69351971;WS=69351953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr2	69362161	rs11903639	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=234;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TCATTAGAGACGGTAAAAGAC;SOR=0.877;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=18;WE=69362169;WS=69362151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr2	69362262	rs73934746	C	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=268;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TTTTGACAACCCTTGTAACCC;SOR=0.178;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=22;WE=69362270;WS=69362252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr2	69398531	rs142768308	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=436;ReadPosRankSum=-1.509;SC=TAAAACCTTTCCTTAATCCTT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=27;WE=69398539;WS=69398521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr2	69409029	rs6749826	C	A	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=59;PP=1819;SC=AGGACAGCTTCATATACACTT;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=69409037;WS=69409019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	69420446	rs149300234	G	C	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1071;ReadPosRankSum=0.035;SC=ATGTAATCTTGGTGCATTTGT;SOR=0.505;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=84;WE=69420454;WS=69420436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,109:0.46:239
chr2	69420574	.	G	GTC	279	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=61.58;NF=0;NR=27;PP=279;QD=10.6296296296;SC=CATTAATGGTGTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=27;WE=69420583;WS=69420564;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr2	69420591	.	T	TCTCA	914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.80;MQRankSum=4.653;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr2	69420596	rs7584057	T	C	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.24;MQRankSum=2.366;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	69741609	rs2276689	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=213;ReadPosRankSum=0.311;SC=TTACCGCTGGCTCCTGGGCAG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=21;WE=69741617;WS=69741599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr2	69741753	rs3832159	CTGT	C	714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.953;NF=8;NR=9;PP=747;ReadPosRankSum=0.205;SC=GTTGCTGTTGCTGTTGTTGTT;SOR=0.901;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=17;WE=69741763;WS=69741743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr2	69741854	rs6715776	T	G	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=40;PP=1832;SC=ATTGCTGGTTTCTGGGTTGCT;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=87;WE=69741862;WS=69741844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	69759415	rs2276687	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=1.971;SC=TGTGCACAGGGAAGTTATTCC;SOR=0.954;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=16;WE=69759423;WS=69759405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	69771484	rs3771544	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=765;ReadPosRankSum=1.099;SC=GAGTGCAGTGCACATTAAGTG;SOR=0.719;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=43;WE=69771492;WS=69771474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr2	69784255	rs3771543	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=1.195;SC=TGTTGTAGAACACATTCTTAG;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=69784263;WS=69784245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	69784278	rs3821277	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=115;ReadPosRankSum=1.969;SC=TCTCAGAACTTGGAGATATTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=69784286;WS=69784268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	70015108	rs11683908	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=309;ReadPosRankSum=-1.835;SC=TCAGTGCTCAACAAATGTTTG;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=22;WE=70015116;WS=70015098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr2	70031797	rs3771541	C	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=36;PP=1063;SC=TGGCTGACTTCGCAGCAACAG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=70031805;WS=70031787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	70033584	rs2228203	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=750;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGGATGATGACGCCCACGGTG;SOR=0.346;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=60;WE=70033592;WS=70033574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr2	70033649	rs17037076	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=384;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TCTTCCTCTCGTGCTCTTGGT;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=21;WE=70033657;WS=70033639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr2	70033711	rs3771539	G	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr2	70046255	rs3732269	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr2	70064927	rs1377996	C	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CTCATTTGATCAGTCTGTAAG;SOR=0.463;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=20;WE=70064935;WS=70064917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr2	70066571	rs3832156	C	CTT	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=0.714;SC=TAATCGTTGACTTTTTTTTTT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=6;WE=70066579;WS=70066561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr2	70068057	rs3771533	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=319;ReadPosRankSum=-1.168;SC=CATCCTACATGTGTACCTTGC;SOR=0.646;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=19;WE=70068065;WS=70068047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr2	70068258	rs3836157	CT	C	787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.04;NF=0;NR=25;PP=770;SC=TAAAGCTTAGCTTTTTTGGAG;SOR=4.332;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=25;WE=70068266;WS=70068248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	70076954	rs4852349	A	T	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.53;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	70098808	rs3214007	A	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=558;SC=ATATGAAAGTAAGGAAGAGCT;SOR=2.019;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=27;WE=70098816;WS=70098798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	70120909	rs3214822	GA	G	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GGGGAAAAATGAAAGCTGTGT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=70120917;WS=70120899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	70121197	rs2278934	T	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=367;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GTTGGAGGCCTGTCCCTTTTG;SOR=0.973;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=25;WE=70121205;WS=70121187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr2	70162534	rs2228183	T	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1565;SC=TGGTGCCACTTGGACCCGAAT;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=70162542;WS=70162524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	70164034	rs3771531	T	C	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.642;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=40;PP=2610;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TTCAGGGGATTGCTGCAAACA;SOR=1.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=91;TCR=41;TR=130;WE=70164042;WS=70164024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr2	70164580	rs3217643	C	CAGGG	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=573;SC=AACCCCAGAGCAGGGGTTCAG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=70164588;WS=70164570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	70188676	rs3796097	T	C	4075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=83;PP=2483;SC=CGAAGCAGAGTGGGGATGACT;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=142;WE=70188684;WS=70188666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	70190288	rs34641834	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=0.742;SC=CCAGCCCCTTCCACCTGATTC;SOR=0.651;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=70190296;WS=70190278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	70377653	rs12989348	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1077;ReadPosRankSum=-1.070;SC=GGATCCACTCGATGATGAAAG;SOR=0.934;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=69;WE=70377661;WS=70377643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr2	70454794	rs2592181	G	C	88.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTCACAACAGAATTATTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=70454802;WS=70454784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	70457784	.	C	CA	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5137;HP=15;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=57.93;NF=4;NR=1;PP=49;QD=10.4;SC=AATTTCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=70457792;WS=70457774;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,5:0.26:19
chr2	70479950	rs77060408	A	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-1.408;SC=CTGGTCTCGAATTCCTGACCT;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=5;WE=70479958;WS=70479940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	70485174	rs13019683	A	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.616;SC=CGGGGCTCGCAGGACCTGGGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=70485182;WS=70485164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	70485320	rs11556184	C	T	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=599;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TCGCGGAGCTCGTCTCCTCGC;SOR=0.560;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=43;WE=70485328;WS=70485310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr2	70486407	rs750156	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.904;SC=TAACAACCTCTGCTATTGATG;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=70486415;WS=70486397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	70486475	rs3214762	G	GT	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=435;ReadPosRankSum=1.360;SC=ATAATCTTCTGTTTTTTTCCC;SOR=1.329;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=17;WE=70486483;WS=70486465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr2	70502811	rs112551993	T	TTCTG	690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr2	70520498	rs2272532	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=312;ReadPosRankSum=0.028;SC=ACCAGGGGCCAGACCGCGGGA;SOR=0.336;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=19;WE=70520506;WS=70520488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr2	70520846	rs15656	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CACGCTCCCGCTGTAGGCCCG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=21;WE=70520854;WS=70520836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
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chr2	70676639	rs538118	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.444;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=265;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GGCAGGCCCCATGGGTCAGAT;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=19;WE=70676647;WS=70676629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
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chr2	70917812	rs10084293	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.396;SOR=1.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
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chr2	70995233	rs2287099	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.914;SC=GGCCACCGACGCCGCAGTTCC;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=70995241;WS=70995223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	71004492	rs56316086	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=-0.754;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.625;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr2	71004492	.	TCA	CCT	201	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=60.77;NF=5;NR=2;PP=201;QD=36.3525535517;SC=CTGGGCCTTTTCATTTTTCAT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=7;WE=71004502;WS=71004482;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,7:0.22:32
chr2	71004494	rs56135050	A	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=-0.800;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr2	71012604	rs7566541	G	A	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=43;PP=1753;SC=GGCGACAAGCGTGTGCTGGCT;SOR=0.844;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=71012612;WS=71012594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	71012734	rs7566476	C	G	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=38;PP=1211;SC=TGATTCAGAACTGTTGTTACT;SOR=1.065;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=71012742;WS=71012724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	71017516	rs12713717	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=586;ReadPosRankSum=0.218;SC=GGGGGAACGGACGTCGACCCT;SOR=0.727;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=33;WE=71017524;WS=71017506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr2	71043461	rs722896	C	T	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=92;PP=2965;SC=CTGGTCCAGACGGCCATTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=184;WE=71043469;WS=71043451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	71044211	rs2075221	C	T	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=61;PP=1803;SC=GATAAGCTCTCGCATTTCTGC;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=91;WE=71044219;WS=71044201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	71058835	rs741326	A	G	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=28;PP=1962;SC=GGCTTACCTCACACTTTGGAC;SOR=1.819;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=98;WE=71058843;WS=71058825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	71062833	rs11450450	G	GC	5394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=60;PP=2957;SC=GATGTGGCTTGCTCGGGGCCA;SOR=0.749;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=85;WE=71062841;WS=71062823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	71127696	rs3732243	G	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.453;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	71160421	rs2270262	G	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=687;ReadPosRankSum=-0.042;SC=AGGCCCCGGAGAGGAGGGGCT;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=44;WE=71160429;WS=71160411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr2	71162996	rs11685700	A	G	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=960;SC=AAGGCTGAGCAGCTCTCTCCA;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=71163004;WS=71162986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	71163086	rs11681642	T	C	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=624;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GACTGCTCCATGGCCATGGAG;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=60;WE=71163094;WS=71163076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
chr2	71163173	rs17720303	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=755;ReadPosRankSum=1.042;SC=CAGGCGGTCACCCGAAACTAC;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=55;WE=71163181;WS=71163163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr2	71163220	rs35768563	C	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr2	71163225	rs759219	C	T	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.330;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr2	71163277	rs34965400	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=1.216;SC=CCCGGGCCCCGCTTCTTGCCT;SOR=0.804;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=71163285;WS=71163267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	71170525	.	TGGG	T	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	71170528	.	GG	CA	186	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=186;QD=79.8226249541;SC=TGTGTGGTGGGGGCGGACTCT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=3;WE=71170538;WS=71170523;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,3:0.21:14
chr2	71170530	.	GC	G	191	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=191;QD=80.0102999566;SC=TGTGGTGGGGGCGGACTCTGA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=3;WE=71170538;WS=71170523;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,3:0.21:14
chr2	71170531	.	C	CAG	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	71175511	rs35598289	G	GAA	2246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TAGGACTACAGAAAATGATCA;SOR=0.446;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=34;WE=71175519;WS=71175501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,63:0.51:124
chr2	71175552	rs34723947	T	TG	1861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=1385;ReadPosRankSum=1.159;SC=CTGATTTCTTTGGGGCACACT;SOR=0.618;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=40;WE=71175560;WS=71175542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,72:0.49:147
chr2	71185391	rs967063	A	C	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=68;PP=2717;SC=GAGCACAGAAAGTGCCCAGAA;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=136;WE=71185399;WS=71185381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	71186382	rs17006573	G	A	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=21;PP=636;SC=CAACACTGCCGTCAGCACTCC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=71186390;WS=71186372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	71190384	rs2072462	C	T	6271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=107;PP=2965;SC=GGGCGGGCCGCGTGGAGGGTC;SOR=0.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=94;TCR=107;TR=200;WE=71190392;WS=71190374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr2	71190545	rs2072463	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=605;SC=GTGCAGCAGCGCTTTTCCTCC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=71190553;WS=71190535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	71191777	rs2270263	C	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=849;SC=AATTCCTTTCCGAACGGGGTC;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=71191785;WS=71191770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	71205976	rs1115049	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=22;PP=657;SC=TCCCGGCTGCAGGGAGCGAGA;SOR=1.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=71205984;WS=71205966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	71206058	rs1115050	A	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=240;SC=CCGAGAAGCCAGCAGAGACAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=71206066;WS=71206048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	71206267	rs57527165	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=366;ReadPosRankSum=0.336;SC=CAGTGCGCAGGCGACTGCCCT;SOR=0.557;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=23;WE=71206275;WS=71206257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr2	71211461	rs2160070	T	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=225;ReadPosRankSum=-0.673;SC=AGGCTACATCTCTCCCATCAG;SOR=1.961;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=15;WE=71211469;WS=71211451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr2	71211989	rs3796099	A	G	6055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=96;PP=2965;SC=AGCGGCCCACAATGTGGAATG;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=193;WE=71211997;WS=71211979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	71212130	rs61732224	C	T	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1377;ReadPosRankSum=0.294;SC=CTGATGGGCACGGCGGTGCGC;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=81;WE=71212138;WS=71212120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
chr2	71215941	rs72832796	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=144;ReadPosRankSum=1.128;SC=CCGAGTCCAGGTGTCTCCAAC;SOR=1.317;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=10;WE=71215949;WS=71215931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	71221822	rs2302561	A	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=813;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TCTCACCGACAGCCAGCGTGA;SOR=0.594;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=66;WE=71221830;WS=71221812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr2	71297057	rs888352	C	T	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=66;PP=2046;SC=GCATTTCTAGCAAAGGTGTCT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=93;WE=71297065;WS=71297047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	71305359	rs2302794	G	A	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=50;PP=2965;SC=AGTACCTCAGGGTCTGGGCGT;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=105;TCR=50;TR=154;WE=71305371;WS=71305349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	71305456	rs6713	C	T	6959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=119;PP=2965;SC=AGGTTTTCTTCTGGCGCTGAC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=102;TCR=119;TR=221;WE=71305464;WS=71305446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr2	71351487	rs11541017	G	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=63;PP=2485;SC=AAGAGGGACCGCTTCACTTAC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=116;WE=71351495;WS=71351477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	71357417	rs2012479	C	A	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.210;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=68;PP=2094;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GAGGGCGGGGCGGGAGGCAGA;SOR=1.099;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=106;WE=71357425;WS=71357407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr2	71357634	rs1813348	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=535;SC=TGCGAAAGCGCTCGCGCTGCC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=71357642;WS=71357624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	71360723	rs1813159	A	G	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=49;PP=1361;SC=TTTTGAGAGAAGAGAGAGCAC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=71360743;WS=71360713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	71360735	rs138856662	T	TTCC	3499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=43;PP=2245;SC=AGAGAGCACTTTCCTCCTCAA;SOR=1.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=43;WE=71360743;WS=71360713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	71415479	rs357780	T	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=329;SC=GTCACAGTATTGTGAGACCAC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=17;WE=71415487;WS=71415469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	71417065	rs357777	G	T	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=70;PP=2254;SC=GGTCTCGTGAGGGAATAAACC;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=113;WE=71417073;WS=71417055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	71607539	rs17693408	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=4;PP=165;SC=TATCACTCCAGTTGAATTATT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=71607547;WS=71607529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	71615571	rs2542529	C	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=0;PP=1038;SC=GGGGCAACAACTACCCACAGA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=71615579;WS=71615561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	71620818	rs6741436	C	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1168;SC=GCTCTCGCTTCCCCTGCAACC;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=71620826;WS=71620808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	71627539	rs3771371	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=587;SC=TACTGTTTAACCTATTGTGGA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=71627547;WS=71627529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	71633129	.	TGTAGTC	T	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=53;QD=32.0;SC=TCTTCCCCCATGTAGTCATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=71633142;WS=71633119;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr2	71633275	rs3732233	T	C	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=30;PP=1412;SC=TAGATACAATTTATGATCGAT;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=71633283;WS=71633265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	71633389	rs6714975	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=722;SC=GTAATAGAAACAAGGTAACAA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=71633397;WS=71633379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	71635931	rs12466025	G	T	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=24;PP=833;SC=GACCTTATATGTGGTGTCCTT;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=71635939;WS=71635921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	71636036	rs12474072	A	G	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=TAAATGTATTATGATAGGTAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=71636044;WS=71636026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	71645828	rs4852783	G	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=963;SC=GAATTTTATTGCTGTATTTTA;SOR=1.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=46;WE=71645836;WS=71645818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	71645890	rs4852784	G	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=411;SC=TTTATTTTGTGTACATATGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=71645898;WS=71645880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	71660275	.	T	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=5.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.658;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr2	71708810	rs34707417	T	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=-0.589;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.497;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	71708825	.	T	TATCCATCC	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=1.026;SC=GGTCTTCATCTATCCATCCAT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=71708833;WS=71708815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	71708852	.	C	T	137	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=61.24;NF=6;NR=2;PP=137;QD=21.4714015684;SC=ATCCATCCATCCATCCATGCT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=71708860;WS=71708842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	71708852	.	C	CCATCCATCCATCCATCCATT	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.46;MQRankSum=0.476;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.973;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	71742892	rs13428076	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=497;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GTGGGAGACATGGGGCATGAG;SOR=0.486;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=44;WE=71742900;WS=71742882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr2	71742978	rs13428194	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=-0.203;SC=AGTGTTTACGTATGGCGCTGA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=71742986;WS=71742968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	71743242	rs28500662	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=577;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GGGGGTGGTGGTCCTCCCTCT;SOR=0.884;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=38;WE=71743250;WS=71743232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr2	71747235	rs11675897	A	G	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=26;PP=2032;ReadPosRankSum=1.680;SC=TAATGGAATCATATAATGCAC;SOR=0.855;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=103;WE=71747243;WS=71747225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr2	71747432	rs11687223	G	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=527;ReadPosRankSum=1.400;SC=CCTCCTGGGGGTTTTAGAATC;SOR=1.250;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=28;WE=71747440;WS=71747422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr2	71747851	rs12713755	T	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.70;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	71747851	.	TTCCC	CTCCC,CTCCT	336	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=30,15;NR=10,6;PP=322,336;QD=8.91928031368;SC=CCATCCTGGGTTCCCGGATGT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40,21;WE=71747863;WS=71747841;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:40
chr2	71747855	rs55695728	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=-2.135;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr2	71747899	rs12713756	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=459;ReadPosRankSum=-1.596;SC=GGGATCACCAGAGGATGTTGT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=35;WE=71747907;WS=71747889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr2	71748088	rs56343439	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=1.553;SC=CACTTGGTTGCGGAGGCACCA;SOR=0.518;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=22;WE=71748096;WS=71748078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	71755380	rs4852800	A	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=14;PP=1150;SC=TCAGGGTTTTAGAGGAGAGAC;SOR=1.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=71755388;WS=71755370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	71762232	rs4852801	C	T	6939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=136;PP=2965;SC=GAGCCTCCTGCCCCCAGCAAA;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=86;TCR=136;TR=222;WE=71762240;WS=71762222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr2	71762310	rs4852802	A	G	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=58;PP=2067;SC=GCATCCTGCCAGTATCCCAGA;SOR=1.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=92;WE=71762318;WS=71762300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	71766487	rs7609409	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=908;SC=TAAGGCCTCTGTTGCCCATTT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=71766495;WS=71766477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	71776345	rs736096	CA	TG	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=13;PP=2947;SC=GGCCTCGGGCCACATCTGTTT;SOR=2.503;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=64;WE=71776354;WS=71776335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	71778068	rs2303592	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=357;ReadPosRankSum=0.727;SC=GCATGTGGGGGGGAACTGAGG;SOR=0.680;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=21;WE=71778076;WS=71778058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr2	71780117	rs2303595	C	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=940;ReadPosRankSum=-2.269;SC=TCCCGTGACCCTCTGGTCTAC;SOR=1.107;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=146;TCF=95;TCR=51;TR=67;WE=71780125;WS=71780107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,78:0.47:167
chr2	71780215	rs2303596	T	C	6768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=115;PP=2965;SC=ATGTGGATGATGCCATCCAGT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=97;TCR=115;TR=212;WE=71780223;WS=71780205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
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chr2	71780821	rs2303597	T	C	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=81;SC=GTGTGGTCCCTTTCCCAGCTC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=71780829;WS=71780814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr2	71796865	rs10205023	C	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=694;SC=GGCTGACATACGCAGGGGTGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=71796873;WS=71796855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	71797176	rs10183967	A	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;ReadPosRankSum=-0.280;SC=ACCTCCGGAGACTTCATGCTT;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=23;WE=71797184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr2	71797712	rs3764971	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=214;ReadPosRankSum=-0.616;SC=ATGAGTGACCGGTTCCCCCTC;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=71797720;WS=71797702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr2	71801334	.	C	CAGGCGG	1826.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.399;NF=18;NR=13;PP=1669;ReadPosRankSum=-1.470;SC=GCAGCACAGGCAGGCGGAGGC;SOR=1.022;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=31;WE=71801342;WS=71801324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,46:0.34:134
chr2	71817003	rs1473228	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=11;PP=388;SC=GTCCGTGCCTATCTGTGTGGT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=71817011;WS=71816993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	71817571	rs720541	A	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=780;ReadPosRankSum=0.549;SC=CGTCAGGTGCAGCAAACTCTT;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=43;WE=71817579;WS=71817561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr2	71825677	rs13421969	C	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.268;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=831;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TCCCCTCCCCCTCTCCGGCCC;SOR=0.264;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=42;WE=71825685;WS=71825667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr2	71828423	rs2303604	A	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=381;SC=AACCCGAATAAGTAGACTGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=71828431;WS=71828413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	71829821	rs1529408	G	T	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=924;SC=CGCCTAGTGCGCCTTGATACT;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=71829829;WS=71829811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	71838597	rs2303606	C	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=606;ReadPosRankSum=-2.171;SC=GTGCTTAGATCCTGGCATGGG;SOR=0.732;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=43;WE=71838605;WS=71838587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,51:0.43:119
chr2	71847943	rs12995778	C	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.812;SC=AAATGGACACCCCTAGGTTAC;SOR=1.044;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=71847951;WS=71847933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	71871039	rs84181	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=12;PP=1030;SC=AACTCTGAAGAATGCTGCTTG;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=71871047;WS=71871029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	71871236	rs84182	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=20;PP=616;SC=GTGTGTGCGTACTGGGCAGTG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=71871244;WS=71871226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	71891361	rs2303599	C	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=10;PP=903;SC=TTGGGTGCCCCGTGTTGGCTG;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=71891369;WS=71891351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	71901286	rs2559081	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=448;SC=TCTCTCTAACCTTGCTTCCTT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=71901294;WS=71901276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	71906171	rs1863812	T	C	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=860;SC=GGCCAAAAACTACCTCTCTGT;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=71906179;WS=71906161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	71907930	rs7558412	G	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=239;SC=AGTGGAAGTAGGGGTGGCAGT;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=71907938;WS=71907925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	72692272	rs5832083	A	AAG	4990.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=34;PP=2930;SC=AGGACAAAGTAAGCAACTGCC;SOR=1.466;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=76;WE=72692280;WS=72692262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	72742083	rs57089571	GAC	G	1430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;QD=29.81;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr2	73151231	rs1561247	C	T	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=11;PP=1378;SC=CTCTCGAGTGCGGGGAGGTGT;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=73151239;WS=73151221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	73280303	.	G	A	392	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=56.65;NF=23;NR=5;PP=392;QD=15.2418290195;SC=ACTCTGCCTCGAAAAAAAAAA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=28;WE=73280312;WS=73280292;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,28:0.41:69
chr2	73285752	rs10180720	T	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=595;ReadPosRankSum=-0.892;SC=GAGAGAAGAGTGAATGGATCA;SOR=0.449;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=40;WE=73285760;WS=73285742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr2	73302891	rs3832033	G	GGCCT	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.049;NF=1;NR=7;PP=459;ReadPosRankSum=-1.727;SC=GGCAGCCCTAGGCCTGCCTGC;SOR=2.494;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=8;WE=73302899;WS=73302881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	73316540	rs3901273	A	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CCTTGCTCTGAGAGCCACTGA;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=74;TCR=82;TR=84;WE=73316548;WS=73316530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,108:0.57:191
chr2	73339430	rs4143146	T	G	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=843;ReadPosRankSum=-0.635;SC=AGCCCCGCCCTGTTAGGCCTT;SOR=0.463;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=58;WE=73339438;WS=73339420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
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chr2	73493303	rs13021769	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CACAATACCCTGGACCCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=73493311;WS=73493293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr2	73613031	rs193922695	T	TGGA	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5329;FS=4.309;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.804;NF=10;NR=1;PP=469;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CCGGGCGAGCTGGAGGAGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=73613052;WS=73613021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr2	73650122	rs1881246	T	A	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=79;PP=2639;SC=TTTATTTGCATGTAACCTTTC;SOR=1.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=111;WE=73650130;WS=73650112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	73675019	rs66492706	CT	C	400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=315;SC=TCAAAGCTGGCTTTTTTTCCA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=73675027;WS=73675009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	73675227	rs34628045	T	TCTC	5465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=48;PP=2967;SC=GGCTGTAAGTTCTCTAGAAAC;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=86;WE=73675235;WS=73675217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	73675669	rs2037814	T	G	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=51;PP=2869;SC=CACTCACATGTAGAGGACCTC;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=118;WE=73675677;WS=73675659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	73675844	rs7598901	C	T	8167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=120;PP=2965;SC=AACAAGAGTTCGCAGACAGTC;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=141;TCR=120;TR=261;WE=73675852;WS=73675834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr2	73828310	rs1320374	T	C	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=14;PP=1658;SC=TTCTAAAAACTGTTTCCTGTA;SOR=2.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=62;TCR=14;TR=76;WE=73828318;WS=73828300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	73828538	rs1052161	G	A	5240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=99;PP=2965;SC=GACCTACTGAGGCCATTTGTG;SOR=1.166;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=64;TCR=99;TR=163;WE=73828546;WS=73828528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	73898118	rs7570683	C	T	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1093;SC=GTGACATTGACTGCAGGTAAT;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=73898126;WS=73898108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	73898359	rs4341964	G	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=577;SC=CTCAATCATAGTAAAGGACAT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=73898367;WS=73898349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	73899613	rs2421585	T	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=677;SC=CAAGAAGAATTCCCATGAAGG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=73899621;WS=73899603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	73899955	rs6725284	G	T	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=41;PP=2684;SC=GTTTGTTCCTGTGGAAAATGT;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=87;TCR=41;TR=128;WE=73899963;WS=73899945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	73900210	rs4637150	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=45;PP=1328;SC=TTAGCCCTACATGTAGGGAGA;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=73900218;WS=73900200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	73927931	rs4852974	A	G	5639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=62;PP=2965;SC=CTGTAGCCCTAGTCCCGGGCA;SOR=1.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=111;TCR=62;TR=173;WE=73927939;WS=73927921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	73928098	rs2001490	C	G	10683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.93;NF=154;NR=179;PP=2965;SC=TTCAGATTCACCCACCCAGAA;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=333;TCF=154;TCR=179;TR=333;WE=73928106;WS=73928088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr2	73928366	rs2012574	G	C	7424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=121;PP=2965;SC=GCCATCCCCCGGGAGAGCAAG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=233;WE=73928374;WS=73928355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr2	73957124	rs7210	A	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=25;PP=964;SC=ATAATGTCCCAATACTTTCTT;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=73957132;WS=73957114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	73957227	rs13003035	T	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=348;SC=TATACAAACATGTGTAAGTGA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=73957235;WS=73957217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	73994074	rs2567599	G	A	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=51;PP=1498;SC=ACAAAAAGCAGATCTTTCCAG;SOR=1.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=73994082;WS=73994064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	74000701	rs2116367	C	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=330;SC=AAAGATGAGCCAGTTCAGTTC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=74000709;WS=74000691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	74007136	rs2272051	T	C	5446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=90;PP=2965;SC=CAATGCCAAGTCGGCCAAAAG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=169;WE=74007144;WS=74007126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr2	74007345	rs3813228	A	G	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=37;PP=1121;SC=GCCAGAGGCCAGTAGCACAGG;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=74007353;WS=74007335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	74128361	rs1653258	T	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr2	74128369	rs1632564	G	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.985;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr2	74128391	rs1721241	G	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=41;PP=2033;SC=CTCTTCTCCCGCAAATCCCAA;SOR=0.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=97;WE=74128399;WS=74128381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr2	74128660	.	TG	T	378	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=378;QD=38.1;SC=GGGAAGGAAATGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=74128668;WS=74128650;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr2	74129664	rs1653256	A	G	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.561;SC=ATCACCCATCATCATGACCCT;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=280;TCF=154;TCR=126;TR=130;WE=74129672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,162:0.47:345
chr2	74129712	rs1721243	C	G	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=66;PP=1730;ReadPosRankSum=1.194;SC=AACTCTCCCTCTAAAATGCTT;SOR=0.763;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=250;TCF=105;TCR=145;TR=111;WE=74129720;WS=74129702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,132:0.44:298
chr2	74129895	rs1721244	G	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=821;ReadPosRankSum=-0.600;SC=CTAAACACAGGTCAGCTCATG;SOR=2.024;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=44;WE=74129903;WS=74129885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr2	74135380	rs756127	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=362;ReadPosRankSum=0.979;SC=ATTGTCAGGAGATAGACCCTG;SOR=0.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=24;WE=74135388;WS=74135370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr2	74135797	rs702461	T	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=900;ReadPosRankSum=-0.871;SC=TTGTCTCCACTAGATCTGGCA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=43;WE=74135805;WS=74135787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr2	74135898	rs756128	A	G	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.201;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=53;PP=2110;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CCAACAGGGAAAAGATGACCC;SOR=0.385;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=113;WE=74135906;WS=74135888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr2	74140581	rs891699	A	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=4;PP=1010;SC=AAGAATGAGAATTTTATAAGC;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=74140589;WS=74140571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	74140789	rs891698	T	C	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=77;PP=2756;SC=CAGCCCCTTTTCTGATTCTGA;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=139;WE=74140797;WS=74140779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	74140888	rs891697	A	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CTCTCCTGAGATAGACTGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=19;WE=74140896;WS=74140878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr2	74142164	rs35892339	GA	G	212.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=228;SC=AAAAATTAGGGAAAAATCTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=74142172;WS=74142154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	74146869	rs1721238	G	A	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=217;SC=CCATGCAATAGTGCTGTAAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=74146877;WS=74146859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	74153905	rs831526	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=3;PP=497;SC=GCGCACCCCGCCGCATGTTCA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=74153913;WS=74153895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	74185876	rs4777	A	T	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=61;PP=2703;SC=AATACCATGAAGTTCAGGCTG;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=137;WE=74185884;WS=74185866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	74273383	rs11426743	T	TC	1093.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr2	74300717	rs7560668	T	C	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=954;ReadPosRankSum=1.225;SC=TTATACTCACTTGGGATCTGG;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=59;WE=74300725;WS=74300707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr2	74320262	rs12713810	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TGATGTGGTTCTTTGATAAAA;SOR=1.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=15;WE=74320270;WS=74320252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr2	74327453	rs6738709	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=0.146;SC=CCCCAGTCCCCGACCCAGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=14;WE=74327461;WS=74327443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr2	74362090	rs828879	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=358;SC=AGTCTGGAATATCTGCCTGTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=74362098;WS=74362080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	74374884	rs1667605	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=1.290;SC=GACAGCCGCCGGCCCCGCGGT;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=8;WE=74374892;WS=74374874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr2	74383630	rs11540640	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=660;ReadPosRankSum=-2.027;SC=GTCTATAACAGATAGCAATGA;SOR=0.484;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=43;WE=74383638;WS=74383620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
chr2	74383911	rs828852	G	A	326.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.31;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	74383911	.	GT	AC,AT	88	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1,1;NR=4,8;PP=88,44;QD=28.2935749724;SC=ACATTTTAAAGTAGGCATTTA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5,9;WE=74383920;WS=74383901;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.56:9
chr2	74383912	rs56259334	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	74394034	rs56873314	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CAATAAAACTGAATCACCTTC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=74394042;WS=74394024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	74405867	rs79791015	T	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=501;ReadPosRankSum=1.240;SC=CGGAGCTGGCTAGAGGGAGCG;SOR=1.086;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=35;WE=74405875;WS=74405857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr2	74405952	rs2272240	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GCTGCGAGCCTTTGCAAACCT;SOR=0.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=74405960;WS=74405942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	74425932	rs3821321	G	A	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.210;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=911;ReadPosRankSum=0.109;SC=CGAGGGGCACGCCGGGCCCCC;SOR=1.262;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=53;WE=74425940;WS=74425922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
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chr2	74692191	rs79181168	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1101;ReadPosRankSum=1.151;SC=CACGCCAGCACCCAGCGCCCC;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=79;TCR=74;TR=77;WE=74692199;WS=74692181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,99:0.53:187
chr2	74720002	rs4853026	C	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=313;SC=GGCATGGGCTCTCCTGCTTAA;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=74720010;WS=74719996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr2	74746322	rs6546909	A	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=437;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GGGTTAGGAGAAGGTAATTTC;SOR=0.269;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=28;WE=74746330;WS=74746312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr2	74755778	rs10779958	A	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=0.375;SC=AATGAACTGGAGATGATGGGG;SOR=0.155;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=11;WE=74755786;WS=74755768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	74756111	rs3835033	G	GA	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.016;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr2	74756176	rs2231250	G	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.888;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=820;ReadPosRankSum=0.019;SC=ATCCTCCATGGGGAACGCGAG;SOR=1.169;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=47;WE=74756184;WS=74756166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr2	74761422	rs6707302	T	C	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.381;SC=ACCATGTGGTTCACTTCAGTC;SOR=0.808;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=178;TCF=92;TCR=86;TR=90;WE=74761430;WS=74761412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,111:0.52:212
chr2	74761539	rs17010021	T	A	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1840;ReadPosRankSum=0.866;SC=TGAGTGAAGATGTCCATGCTG;SOR=0.510;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=210;TCF=119;TCR=91;TR=106;WE=74761547;WS=74761529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,123:0.52:237
chr2	74789700	rs11126435	A	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.292;SC=GACTTCCTGCATGAATCATCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=74789708;WS=74789690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	74901602	rs363608	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=282;ReadPosRankSum=1.184;SC=TAAAGAGAACCTCCCATGTGT;SOR=1.781;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=14;WE=74901610;WS=74901592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	74902855	rs2075212	T	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1148;ReadPosRankSum=0.395;SC=TGTATTCCCCTTCCCCACTCC;SOR=0.650;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=72;WE=74902863;WS=74902845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr2	74902872	rs363609	A	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=964;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CTCCGTTTTTATAGAGCTGGC;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=61;WE=74902880;WS=74902862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr2	75061873	rs663504	C	G	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=706;ReadPosRankSum=-1.147;SC=CTCCCTACTCCGGGCCTGGGA;SOR=0.861;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=41;WE=75061881;WS=75061863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr2	75099694	rs28363003	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TGTGTATGTCGATGGGGGGGC;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=22;WE=75099702;WS=75099684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
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chr2	75113572	rs2306806	G	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1190;ReadPosRankSum=0.179;SC=CTTGGGTGTGGAGGGGTTGGT;SOR=0.710;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=76;WE=75113580;WS=75113562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,98:0.54:181
chr2	75113657	rs2229626	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=699;ReadPosRankSum=0.494;SC=AGATGCGCAACGTGGAACTGG;SOR=0.907;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=38;WE=75113665;WS=75113647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr2	75113789	rs2229627	C	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.343;NF=32;NR=30;PP=877;ReadPosRankSum=0.899;SC=CACTCAACCCCGGCAAGCAGA;SOR=0.687;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=62;WE=75113797;WS=75113779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,78:0.38:204
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chr2	75116627	rs4853069	C	T	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.157;SC=ATCCCAGCCCCCCCTGCCTAC;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=58;WE=75116635;WS=75116617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
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chr2	75187573	rs3771799	G	A	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=20;PP=981;SC=ATCCCTAAATGTCAGGCTTGC;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=75187581;WS=75187563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	75187793	rs3821312	A	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=420;SC=AATTTTAGCTACCTAGCCTCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=75187801;WS=75187783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	75425623	rs2024512	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CAGCAATGCCGTGGTCCTCTA;SOR=0.527;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=75425631;WS=75425613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	75425728	rs6715729	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=466;ReadPosRankSum=0.234;SC=CGGCGATGGGAAAGAAGTTGT;SOR=1.143;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=26;WE=75425736;WS=75425718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr2	75720372	rs11126472	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=506;ReadPosRankSum=-1.281;SC=CTAATAGTAGCGATTCAGGCT;SOR=1.140;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=26;WE=75720380;WS=75720362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr2	75720568	rs148155576	CGCTGTCGCT	C	1774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=2980;ReadPosRankSum=0.714;SC=CTGCCATCCTCGCTGTCGCTG;SOR=0.758;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=27;WE=75720584;WS=75720558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr2	75720664	rs6741778	G	A	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=956;ReadPosRankSum=3.199;SC=CTTATCACCAGAGCAGCCAGG;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=58;WE=75720672;WS=75720654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr2	75744918	rs2286995	T	C	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.477;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=951;ReadPosRankSum=-1.248;SC=ACAGTAGCCCTGGGCCACTTC;SOR=0.347;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=133;TCF=91;TCR=42;TR=70;WE=75744926;WS=75744908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,82:0.55:148
chr2	75873733	rs2286238	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=0.873;SC=CTTTCTAGGCTGGGAGAACAC;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=16;WE=75873741;WS=75873723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	75917161	rs41286005	G	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.872;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=904;ReadPosRankSum=0.124;SC=GTTCCTTCCTGATGGTTACAA;SOR=0.944;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=54;WE=75917169;WS=75917151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,64:0.40:160
chr2	77748595	rs7571330	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GTGTTGTGCATTTATAGATTA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=22;WE=77748612;WS=77748585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr2	79254261	rs452267	T	C	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=121;PP=2965;SC=GTAACAGCTATTCATACATCT;SOR=1.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=46;TCR=121;TR=167;WE=79254269;WS=79254251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	79255325	rs2290079	G	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=35;PP=1324;SC=TTTATATTCTGTCTCCCTAGG;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=79255333;WS=79255315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	79255426	rs383969	G	C	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=21;PP=768;SC=TCAGCAGCCTGAGCTTGGCGT;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=79255434;WS=79255416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	79312414	rs3739144	G	A	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=720;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGAATCCTATGGTACAATGAG;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=45;WE=79312422;WS=79312404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr2	79313815	rs2073445	G	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TGGGAAGTTTGGGACCAGTGG;SOR=1.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=18;WE=79313823;WS=79313805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr2	79314094	rs6723688	G	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGAAAGAATCGCAGGGCAAGG;SOR=2.200;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=16;WE=79314102;WS=79314084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	79348129	rs11339710	GA	G	242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.461;HP=15;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=159;ReadPosRankSum=1.752;SC=GGGTCTACTTGAAAAAAAAAA;SOR=5.279;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=79348137;WS=79348119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr2	79349372	rs283891	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-2.670;SC=GTTTACAGATCCTCTAATGTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=79349380;WS=79349362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	79350186	rs3739142	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=163;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TAAGGAAATGGATGTTTGGTT;SOR=0.916;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=12;WE=79350194;WS=79350176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr2	79350347	rs12228	A	G	4918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=60;PP=2867;SC=ACTAGAGGCAACTGGAAAATA;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=82;TCR=60;TR=142;WE=79350355;WS=79350337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	79350505	rs12072	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=539;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CTTTGGAACCCTAAATAATAA;SOR=1.696;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=28;WE=79350513;WS=79350495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr2	79422965	rs1434199	C	G	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=593;ReadPosRankSum=0.265;SC=ACATATCACTCAATGAAAGTT;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=43;WE=79422973;WS=79422955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr2	79750543	rs10205858	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=196;SC=TCCACACTGGCTCAAAAACAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=79750551;WS=79750533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	80801508	rs77824342	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CTAACTGTCTTATTTATTATT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=14;WE=80801516;WS=80801498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr2	80809027	rs17019401	C	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=145;SC=AAACTCCAGACACGTGGTACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=80809035;WS=80809017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	80831481	rs2302875	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGTGGCAAACGTAGATTTAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=80831489;WS=80831471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	80846147	.	C	CT	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.7323;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=61.53;NF=3;NR=0;PP=34;QD=13.0;SC=AAGTAGGGTACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=80846155;WS=80846137;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	84518438	rs1968722	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=468;ReadPosRankSum=0.545;SC=TTTTTTCCAGTCAGCAGCCTC;SOR=0.567;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=32;WE=84518446;WS=84518428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr2	84650707	rs2832	A	G	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=7;PP=890;SC=TGGTGAAAACATCTTAATTCA;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=84650715;WS=84650697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	84676163	rs10202632	C	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=826;SC=TTTACACTTACACAAAATCTA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=84676171;WS=84676153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	84756049	rs4832089	G	A	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=39;PP=2158;SC=CTATGTTGAGGTGTTCTCTCC;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=105;WE=84756057;WS=84756039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	84756341	rs4832090	T	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=444;SC=AAATAAGATTTCACATATTAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=84756349;WS=84756331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	84771480	rs1037863	G	A	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=41;PP=1745;SC=AGGAATATCTGTATCACAGAG;SOR=0.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=84771488;WS=84771470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	84771567	rs1542477	C	T	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=21;NR=44;PP=1384;SC=ATGTCCGCTCCAAGAAAATCA;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=84771575;WS=84771557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	84800605	rs11891970	C	A	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=39;PP=1807;SC=CCATTCAGGCCGCATTTGAAT;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=84800613;WS=84800595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	84806553	rs6547569	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	84822715	rs6761632	C	T	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=7;PP=1244;SC=TATTTCAAACCTGACTTTTAC;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=84822723;WS=84822705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	84834063	rs4276039	T	C	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=62;PP=2965;SC=GCACAAATACTGGGTGCTGCA;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=114;TCR=62;TR=176;WE=84834071;WS=84834053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	84834237	rs4441485	T	C	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=92;PP=2250;SC=AGAATAATTTTGATTCATACA;SOR=2.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=29;TCR=92;TR=121;WE=84834245;WS=84834227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	84897361	rs12470102	T	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	84897517	rs1881095	A	G	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=15;PP=816;SC=CTGTTTATCTAAATTTTTCTG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=84897525;WS=84897507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	84899360	rs4832106	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=631;SC=CCTGTAGGATGTCATTGAGTC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=84899368;WS=84899350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	84915469	rs41490447	A	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TCAAAATTCCAGTGTAGCTCT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=84915477;WS=84915459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	84924823	rs78190897	T	C	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1073;ReadPosRankSum=-1.007;SC=GCAAAAGAAGTAGGAATTTCT;SOR=0.795;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=68;WE=84924831;WS=84924813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,82:0.39:208
chr2	84930815	.	G	GT	31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=18;MQ=61.78;NF=0;NR=2;PP=31;QD=18.0;SC=ATTTAGCAAAGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=84930823;WS=84930805;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr2	84940477	rs4832108	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=338;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGAGGGAAAGTGCTCCCCCAT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=21;WE=84940485;WS=84940467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	84950006	rs1192336	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTGCTTCACATAAGCCATAAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=84950014;WS=84949996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	84955129	rs75124059	T	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-1.487;SC=TGCTGTAGGATGGACCTGGTG;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=16;WE=84955137;WS=84955119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr2	85040418	rs1192361	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.044;SC=TGTGGGGGGCAGAGGAAAGAT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=85040426;WS=85040408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	85041295	rs1192360	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=1.087;SC=TCCCACTGTCTTTGAAGATTT;SOR=2.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=85041303;WS=85041285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr2	85041316	rs1192359	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=0.261;SC=CAGACAACCTTCCATGCCCCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=85041324;WS=85041306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	85051122	rs1649292	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=362;ReadPosRankSum=0.819;SC=CCGGAGTCGCGGCCTCCGCTG;SOR=0.385;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=24;WE=85051130;WS=85051112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr2	85066245	rs736711	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=235;ReadPosRankSum=0.441;SC=AGATTTCAGAGGCTAATCAGA;SOR=1.786;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=14;WE=85066253;WS=85066235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr2	85108252	rs34667238	G	GC	778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=35.40;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	85360828	.	GGGC	G	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.960;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	85532205	rs6741339	C	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=378;SC=GAAGGAAGAGCCATTAAGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=85532213;WS=85532195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	85549868	rs4240199	A	G	6418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.46;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	85549868	.	AGGGGAA	GGGGGAA,GGGGGAG	1250	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=65,30;NR=80,39;PP=1191,1250;QD=8.45359456929;SC=GTTAGGACTTAGGGGAAAAAA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=145,69;WE=85549882;WS=85549858;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:145
chr2	85549874	rs3637	A	G	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,84:0.48:175
chr2	85552186	rs7572750	C	A	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=32;PP=913;SC=AGTCTCTGAACTCAGAGGCAG;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=85552194;WS=85552176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	85552261	rs2292653	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=0.143;SC=ACAGAGGTCTATTTAAACTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=85552269;WS=85552251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	85553784	rs1044973	C	T	5147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.106;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CCGAAAGTGTCCCTTCACGGT;SOR=0.311;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=146;WE=85553792;WS=85553774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr2	85554080	rs4247303	G	A	11870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=249;NR=112;PP=2965;SC=TGGTCTTTCCGGGAAGGCTGC;SOR=1.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=361;TCF=249;TCR=112;TR=361;WE=85554088;WS=85554070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr2	85570186	rs4832001	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.67;MQRankSum=-1.514;NF=7;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CCAGCTGGAAGCAGTGATTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=7;WE=85570194;WS=85570181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr2	85570942	rs9309620	G	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.209;NF=4;NR=17;PP=410;ReadPosRankSum=0.048;SC=AAAGGGTGGGGCAGGCATGTG;SOR=0.346;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=21;WE=85570950;WS=85570932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr2	85571710	rs4832171	A	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=4;PP=1225;SC=ACACACGTGCACCTTACGCCT;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=54;WE=85571718;WS=85571700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	85573033	rs908302	G	A	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=73;PP=2965;SC=ACACGGAGCAGGTTGGCTCCA;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=143;WE=85573041;WS=85573023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	85573049	rs908304	G	A	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1045;ReadPosRankSum=0.188;SC=CTCCAGAAGGGGACACATTGG;SOR=0.451;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=62;WE=85573057;WS=85573039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr2	85576451	rs10590946	GTC	G	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=271;ReadPosRankSum=1.100;SC=GAGACCCCAGGTCTCGCCCAC;SOR=0.320;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=7;WE=85576460;WS=85576441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	85622059	rs6886	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=564;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GGGACTCTCATGGCCCTGAGG;SOR=0.511;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=46;WE=85622067;WS=85622049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr2	85662636	rs7589663	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.514;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=852;ReadPosRankSum=0.267;SC=AGCCACGGACCCCGGGTCTTC;SOR=1.577;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=22;WE=85662658;WS=85662626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr2	85662650	rs6547618	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.409;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=852;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GGTCTTCTCCAAAACCCCTTT;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=20;WE=85662658;WS=85662626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
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chr2	85781318	rs1254896	T	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=37;PP=1696;SC=CAAAGAACAGTCCAATGGATC;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=85781326;WS=85781308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	85788140	rs1254898	C	T	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=27;PP=805;SC=AATATGTGTGCGGGGGTGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=85788148;WS=85788130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	85788402	rs55829881	AC	A	130.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr2	85893741	rs1130866	G	A	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.055;SC=AGCCCTCACAGTCTGGTTCTG;SOR=0.642;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=78;WE=85893749;WS=85893731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr2	85894308	rs3024798	G	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.138;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ATCCTGGGGAGGGAGGGGCCC;SOR=0.327;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=38;WE=85894316;WS=85894298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr2	85895338	rs2077079	T	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CCCTGCTTGGTGCATGGCCCC;SOR=1.714;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=16;WE=85895346;WS=85895328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	85921353	rs1866140	G	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGGGAGTGGGGTGTGGCATGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=85921361;WS=85921343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	85921389	rs1866139	G	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=0.291;SC=ACTGCCCTGAGCTGCTTCTTC;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=85921397;WS=85921379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	85921992	rs2043760	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=259;ReadPosRankSum=0.654;SC=AGATCTCTTCTGTGTTCAAGG;SOR=1.356;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=15;WE=85922000;WS=85921982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr2	85924729	rs11127	C	T	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=826;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TCTAGAGTTACCCAGGGCCTC;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=60;WE=85924737;WS=85924719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr2	85924899	rs1437742	T	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.294;SC=ATCTCCCAGCTTGGGAAAGTG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=85924907;WS=85924889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	85925529	rs4240200	A	G	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=754;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AGGCCCCACAACCTGCTCAGG;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=46;WE=85925537;WS=85925519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr2	85925667	rs4240201	G	A	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=2962;ReadPosRankSum=0.090;SC=GCCCACAGCTGGCTGTTCTCT;SOR=0.624;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=86;WE=85925688;WS=85925657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,106:0.49:216
chr2	85925680	rs4240202	T	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGTTCTCTCCTCTCCAGGTCC;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=82;WE=85925688;WS=85925657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,96:0.49:197
chr2	85925756	rs7908	C	G	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=44;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TCCCGGGAACCTCAGCAACCT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=75;WE=85925764;WS=85925746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr2	85925848	rs12845	C	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=544;ReadPosRankSum=0.969;SC=TCCCCTCTCACGAGAATAAAG;SOR=0.293;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=36;WE=85925856;WS=85925838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr2	85981761	rs17851881	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=590;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GAGCCGGGTCTGCGTCCTCGC;SOR=1.264;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=36;WE=85981769;WS=85981751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr2	86107840	rs11127008	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CCAGCTACTCGGGAGGCTGAG;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=8;WE=86107848;WS=86107830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	86107951	rs34410645	GA	G	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.27;ReadPosRankSum=2.480;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	86107987	rs11127009	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=1.488;SC=TTTTAAAAAATAGACAAGTAG;SOR=1.021;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=10;WE=86107995;WS=86107977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr2	86116168	rs28364795	G	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr2	86116169	rs28364794	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	86258784	rs2278536	T	G	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=943;SC=GCACAGGCTGTGTCACTTGGG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=86258792;WS=86258774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	86259443	rs2276626	C	T	5320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=81;PP=2965;SC=CATCGGCGTCCCCCTCCTCAG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=164;WE=86259451;WS=86259433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	86272191	rs7572386	G	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=109;SC=TCAGAACACAGAGCCCTTGGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=86272199;WS=86272184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	86275985	rs2289239	A	G	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=35;PP=2143;SC=GTGGGGATAAATGCATGCAAT;SOR=1.384;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=104;WE=86275993;WS=86275975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	86279837	rs35618928	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=1.368;SC=CAGAAGCCTTGGAAATCTTCA;SOR=0.204;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=86279845;WS=86279832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	86292656	rs311563	C	T	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=60;PP=1811;SC=AATCCCTAATCGCCTGCCTGG;SOR=2.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=77;WE=86292664;WS=86292646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	86302103	rs3815840	A	G	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=171;SC=CAATCACCAGAATCCGAACAG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=86302111;WS=86302093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	86305123	rs2288117	T	C	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=39;PP=2439;SC=AGAAAAAAGGTCATAAAAAAC;SOR=1.297;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=107;WE=86305131;WS=86305113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	86310110	rs2288118	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=13;PP=775;SC=GCTACAATCACTACAACTTAA;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=86310118;WS=86310100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	86315741	rs2288120	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=830;SC=TGGCTGGAAACGTGATAGTCA;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=86315749;WS=86315731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	86317037	rs4832242	G	C	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=39;PP=2415;SC=GAGGGATCGGGATTTTCTTCC;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=86317045;WS=86317027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	86332809	rs4832245	G	A	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=36;PP=2630;SC=CACGCTACCCGACCAACTCCT;SOR=1.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=88;TCR=36;TR=124;WE=86332817;WS=86332785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	86334199	rs2367201	G	A	4349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=36;PP=2654;SC=TATAAGTGGGGTATGTAATTT;SOR=1.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=92;TCR=36;TR=128;WE=86334207;WS=86334189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	86343476	rs4832022	C	A	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=336;SC=TTGGGTGACACAGCAAGACAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=86343484;WS=86343466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	86343494	rs4832248	G	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=354;SC=CACCCTCTCTGCAAAAAATTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=86343502;WS=86343484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	86344367	rs2059353	T	C	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=230;SC=TTTCAGTAGCTATTTGAATAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=86344375;WS=86344357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	86346308	rs6715623	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=604;SC=TATATTTTTAGTAGTTTATTT;SOR=3.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=86346316;WS=86346298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	86352010	rs4832250	G	T	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=357;SC=ATAATGTATAGAAAGTACTTG;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=86352018;WS=86352000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	86352785	rs4618054	G	A	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=33;PP=1404;SC=GAGATCCAGAGAGGAGAGTAG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=86352793;WS=86352775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	86352825	rs6740228	C	T	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=34;PP=1456;SC=TGTGATTAGTCAAGGGACACA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=86352833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	86359405	rs1559515	G	T	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=27;PP=1818;SC=GGCTGACAGGGTATCAGAGTG;SOR=1.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=89;WE=86359413;WS=86359395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	86362204	rs7606421	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=688;SC=CATTTGGCCACATAACACGTA;SOR=2.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=86362212;WS=86362194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	86363074	rs3770069	A	G	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=34;PP=1606;SC=TTTGTCCTGCATGTGGCAGGC;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=83;WE=86363082;WS=86363064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	86363855	rs7558040	G	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=11;PP=317;SC=TATCTGTGTTGACGGATCATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=86363863;WS=86363845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	86364706	rs56274257	TG	T	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.43;NF=0;NR=24;PP=924;SC=GGAGCAGCAATGGGTCTCACC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=86364714;WS=86364696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	86371883	rs8244	T	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=28;PP=829;SC=TGGCCTCAACTGCACTACCCA;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=86371891;WS=86371873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	86385668	rs1057893	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=12;NR=2;PP=354;SC=ATTCATTGATTAGTGGTTAAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=86385690;WS=86385658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	86385682	rs34945759	TC	T	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=2;PP=783;SC=GGTTAAAACATCAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=19;WE=86385690;WS=86385658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	86385886	rs6739460	A	G	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1446;SC=TGAACAAAAAATACCATAAAC;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=86385894;WS=86385876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	86398074	rs2288115	A	G	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=124;SC=ATATCAATGCAGGGCATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=86398082;WS=86398064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	86398291	rs2288113	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=244;SC=TCTGATGAGTGTATCATGTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=86398299;WS=86398281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	86406438	rs6547663	A	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=262;SC=TTGTATCCACAGGAGGTCCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=86406446;WS=86406428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	86408385	rs6731995	A	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=22;PP=1457;SC=AGCAGCACACAGTGAAAAGCC;SOR=1.450;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=86408393;WS=86408375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	86420255	rs11897696	G	A	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=615;SC=GGCTGGGCACGGTGGCTCGTG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=86420263;WS=86420245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	86422416	rs17551822	T	C	5137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
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chr2	86434569	rs9309634	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=234;SC=CAAGACCAGCTTGGCCAACAT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=86434577;WS=86434559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr2	86479287	rs17438687	G	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=-1.711;SC=TTGGCAGCTTGCCCAATCCTT;SOR=0.616;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=27;WE=86479295;WS=86479277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr2	86481835	rs2276625	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=474;ReadPosRankSum=0.139;SC=TTGAAGATAGCGTGGGATGTA;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=28;WE=86481843;WS=86481825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr2	86491245	rs1863056	C	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1028;ReadPosRankSum=0.760;SC=CAGGCCCCGGCGGCAGATACG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=50;TCR=92;TR=68;WE=86491253;WS=86491235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,77:0.47:165
chr2	86509267	rs1863058	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.844;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=860;ReadPosRankSum=-2.241;SC=CAGCCAACCCGCTCGAAAATA;SOR=1.207;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=49;WE=86509275;WS=86509257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr2	86509388	rs1863059	T	G	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=1099;ReadPosRankSum=1.620;SC=GAGACAAAAATAAATACGATT;SOR=0.872;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=69;WE=86509396;WS=86509378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
chr2	86683642	rs2030259	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=7;PP=249;SC=AGCAACCGTTATAAATGGAAA;SOR=1.061;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=86683650;WS=86683632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	86691250	rs12714187	G	A	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=42;PP=1583;SC=GCTGTACTGCGGCAACTCCAC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=86691258;WS=86691240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	86705565	rs2292887	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=680;SC=TGGGATAGTTTTGTAGTAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=86705573;WS=86705555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	86707504	rs4832290	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=558;SC=TTCCTGCTTTTGTGTTTGTTC;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=86707512;WS=86707494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	86737649	rs966477	G	A	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=24;PP=1041;SC=GGATGGAATAGAGAGAGACAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=86737657;WS=86737639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	86756209	rs1036940	C	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=54;SC=TTTTGCATTTCTACAACACTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=86756217;WS=86756205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	86756280	rs9284788	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=432;SC=CAAGGAACCCGTGTTGATAAT;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=86756288;WS=86756270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	86850022	rs396354	T	C	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=41;PP=1425;SC=TCCCTGGAGTTTCCTCTCTTT;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=86850030;WS=86850012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	86947783	rs76239019	C	T	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=48.95;NF=7;NR=5;PP=164;SC=AGCGCCGCCGCCTCCGGCATG;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=86947791;WS=86947773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	86978895	rs4832311	G	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=105;SC=CTTCCTTTGGGACGCTATAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=86978903;WS=86978885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	86979093	rs10186663	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=29;PP=1063;SC=TTCTCAATGAGGTGATGGTGG;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=86979101;WS=86979083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	86980418	rs34283985	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTCTACTATGGAAAAGAGGGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=86980426;WS=86980413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	86992337	rs3840984	T	TAA	3473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=44;PP=2477;SC=AGTCAGATGTTATTAATGTTT;SOR=1.795;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=49;WE=86992345;WS=86992327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	86998659	rs56328788	CT	C	274.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.43;MQRankSum=1.684;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr2	87015633	rs71378806	T	TGA	4356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=19;PP=2957;SC=GTGAGCAGGCTGAGTTCAAAA;SOR=2.424;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=66;WE=87015641;WS=87015623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	87016506	rs3020726	A	G	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=47;PP=1592;ReadPosRankSum=0.260;SC=GTCCCGGCCAAGGGCGCCCAG;SOR=0.786;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=104;WE=87016514;WS=87016496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,116:0.48:242
chr2	87016922	rs142496274	G	GCGCCCC	2830.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.893;NF=5;NR=37;PP=2309;ReadPosRankSum=0.266;SC=GGTTATGGAGGCGCCCCAGCC;SOR=0.830;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=13;TCR=78;TR=42;WE=87016930;WS=87016912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr2	87017034	rs2944251	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=1.711;SC=TGCGCGCGGACCCCTGTGCTC;SOR=1.002;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=7;WE=87017042;WS=87017024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	87017069	rs2944250	C	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.538;SC=CCCAGCGCACCCGGCGCCCAG;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=87017077;WS=87017059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr2	87106108	rs58443432	T	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQRankSum=1.063;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
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chr2	87303060	rs79162177	C	G	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=13;PP=575;SC=TGCAGGATCTCGTGCTTGAGA;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=87303068;WS=87303050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	87355912	rs201336213	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=5.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQRankSum=-7.367;QD=0.23;ReadPosRankSum=-2.247;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,28:0.13:222
chr2	87356024	rs3101261	C	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.999;NF=1;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CTTGTAAATACGTTTCTGAAA;SOR=0.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=14;WE=87356046;WS=87356014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr2	87356038	rs201869954	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.30;MQRankSum=-1.625;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr2	88272798	rs201020598	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.277;NF=5;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=0.435;SC=CCCCTCCTGCCGCTATCGCCG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=9;WE=88272806;WS=88272788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	88387365	rs78009515	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=326;SC=GCCTCCTGACGCTGCCCTTCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=88387373;WS=88387355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	88387557	rs1542087	A	C	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=65;PP=2305;ReadPosRankSum=0.968;SC=CAGAGCCAGCAGTTCAGCATG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=136;WE=88387565;WS=88387547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,162:0.99:164
chr2	88395989	rs2197077	G	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=25;SC=TGGGGTCAATGGGAGTTTCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=88395997;WS=88395979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	88396080	rs2919883	A	C	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=592;SC=GTAGGCCTGGATTCGATTCAC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=88396088;WS=88396070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	88396120	rs2919882	G	A	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	88396123	rs2970912	C	G	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	88396174	rs2919881	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=30;PP=1585;SC=TGTCCTATATTGACTTCCTCA;SOR=1.115;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=81;WE=88396182;WS=88396164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	88402511	rs1866946	C	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=421;SC=AAGATGGCAACTATTCAAAGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=88402519;WS=88402501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	88402560	rs894197	G	A	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=635;SC=CTAGCTCAATGTGTCTCTCTT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=88402568;WS=88402550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	88406108	rs2919862	C	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=395;SC=CCTCCTATACCCACAGCAGGC;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=88406116;WS=88406098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	88407959	rs2970918	T	C	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=91;PP=2965;SC=CCAACTGGCATGCTGGTAACA;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=163;WE=88407967;WS=88407949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	88409717	rs200741830	T	TGA	565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=1;PP=442;SC=CCTTGATGAATGAGTGTGTGT;SOR=3.767;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=88409725;WS=88409707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	88410102	rs2289497	C	G	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=41;PP=1167;SC=GTGGGTCTCTCGGGAGACCCC;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=88410110;WS=88410092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	88411605	rs2919865	A	T	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=51;PP=2965;SC=TGTTTGAAGAATTTCCTTTCT;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=101;TCR=51;TR=152;WE=88411613;WS=88411595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	88411793	rs2970888	C	A	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=76;PP=2258;SC=CTGCTAAGCCCCTGGTCATTT;SOR=2.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=18;TCR=76;TR=94;WE=88411801;WS=88411783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	88422758	rs2197076	G	A	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=240;SC=TCAAAAATTCGTCTGGTTTCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=88422766;WS=88422748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr2	88870632	rs4972221	A	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=594;SC=ATTATTTAAAAGACTACAAAG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=88870640;WS=88870622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	88874891	rs1805165	C	A	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=76;PP=2899;SC=TCTTTTGTAGCGAAAGGATCC;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=142;WE=88874899;WS=88874881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	88879131	rs1805164	T	C	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=805;ReadPosRankSum=0.688;SC=GTCCCAGGCATTGAATTGGCT;SOR=0.719;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=54;WE=88879139;WS=88879121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
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chr2	88895123	rs13045	T	C	5555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=86;PP=2905;SC=TTCACGGTCTTGGTCCCACTG;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=88895131;WS=88895113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	88895351	rs7571971	T	C	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1352;ReadPosRankSum=0.698;SC=CATGAAGCAGTGCAGTCCATC;SOR=1.095;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=73;WE=88895359;WS=88895341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr2	88926729	rs72416210	CCAG	C	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.121;NF=1;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GCCGCGAGCCCCAGCAGCAGC;SOR=0.934;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=88926742;WS=88926719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	88991520	rs114563957	G	A	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.842;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=954;ReadPosRankSum=0.179;SC=TTCGAAACGTGGGGCGCGGGG;SOR=0.352;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=65;WE=88991528;WS=88991510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr2	88997878	rs908277	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=-0.682;SC=GGCACAGTACCTGTCTTGTAC;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=88997886;WS=88997868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	88999476	rs1158603	G	A	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.335;SC=ATGACAAGAAGAATAAAGTAA;SOR=0.546;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=98;WE=88999484;WS=88999466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,123:0.52:238
chr2	88999603	.	G	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=879;ReadPosRankSum=1.520;SC=CTTTCCATCTGCATCGTGACA;SOR=0.429;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=102;TCF=24;TCR=78;TR=48;WE=88999611;WS=88999593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
chr2	89196621	rs35995534	A	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CTGTGAAGATAAAACTATGCA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=89196629;WS=89196611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	89512775	rs145409842	T	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=828;SC=AACTTCCCAGTGAGCTTCAAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=89512783;WS=89512769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	89534273	rs191223743	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.614;NF=9;NR=8;PP=232;ReadPosRankSum=0.098;SC=AGAATAAACACGGGAATCAGT;SOR=0.269;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=17;WE=89534281;WS=89534263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr2	90007670	rs2847917	G	A	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=7;PP=1216;SC=CTCTCAGTCCGGACACAGCAT;SOR=3.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=90007678;WS=90007660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	90008208	rs138920656	T	G	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=79;PP=2628;SC=GATGTGTGAGTCTGGGCTGCC;SOR=1.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=30;TCR=79;TR=109;WE=90008216;WS=90008198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	90008287	rs147071425	A	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=589;SC=TTTGAAGCTCACTGGGAAGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=90008295;WS=90008277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	90043509	rs201839533	C	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=22.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr2	90108778	rs859745	G	T	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=16;PP=1209;SC=TTGCTGTATGGTTTCAGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=90108786;WS=90108768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr2	91809468	.	C	CTAA	2338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=9.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-12.297;QD=11.24;ReadPosRankSum=3.100;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,64:0.31:208
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chr2	91809472	.	G	GTGACTAACAA	2273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.362;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.603;NF=5;NR=34;PP=2964;ReadPosRankSum=3.793;SC=AAGAGACCGAGGAGTGAGCTA;SOR=0.327;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=137;TCF=12;TCR=125;TR=39;WE=91809480;WS=91809446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,64:0.32:201
chr2	91925022	rs28577290	C	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.75;MQRankSum=-1.970;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.898;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr2	91933102	.	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.68;MQRankSum=-1.509;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr2	95766599	rs115258802	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.451;NF=3;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.895;SC=GTCTTCATATCGTTCTATATA;SOR=0.922;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=8;WE=95766607;WS=95766589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr2	95830652	rs6719142	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=326;SC=ATATCCCATTTGTCCTGATGA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=95830660;WS=95830642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	95830737	rs11395151	C	CA	2043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=20;PP=1535;SC=TGTGTACCCACAAAAACTTAA;SOR=1.284;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=41;WE=95830745;WS=95830727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	95846158	rs3112230	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=203;SC=CAATAGCTTTTATTTTTTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=95846166;WS=95846148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	95847040	rs10578519	TGCG	T	5694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=62;PP=2973;SC=GACAAAGGCTTGCGGCGGCGA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=100;WE=95847050;WS=95847030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	95944902	rs61086044	A	AC	1088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=18;PP=730;SC=GGTGCTGGGCACCGCAGGGTG;SOR=1.681;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=95944910;WS=95944892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	95945568	rs7585914	G	A	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=25;PP=1183;SC=CTTTCTTAGTGACACCCATGT;SOR=1.166;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=95945576;WS=95945558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	95945830	rs7586229	G	T	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=254;SC=TCCCGGTGTGGCTGCCAGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=95945838;WS=95945820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	95947085	rs12992066	A	G	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=101;PP=2965;SC=CTGGTGTGCCAGAGCTGGGAG;SOR=1.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=58;TCR=101;TR=159;WE=95947093;WS=95947075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	95952177	rs7602232	C	G	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=612;SC=GGCTGGGTGACGGGTAGATGG;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=95952185;WS=95952167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	95963242	rs2248415	C	G	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.65;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	96012907	rs7602807	C	G	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=89;PP=2811;SC=CCGCCTCCGCCGCAGACCAGT;SOR=1.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=143;WE=96012915;WS=96012897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	96048862	rs58372613	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=617;SC=GGAGGGAGCCCACCCGCCCAT;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=96048870;WS=96048852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	96049917	.	T	TACACAC	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=58.7;NF=0;NR=3;PP=144;QD=49.0;SC=AACAGATTGCTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=96049925;WS=96049907;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,3:0.30:10
chr2	96076409	rs6577014	C	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=792;SC=AGTTCTGACCCCACTCACCAA;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=96076417;WS=96076399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	96525652	rs77710257	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-0.452;QD=1.28;ReadPosRankSum=1.666;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,5:0.11:46
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chr2	96601240	rs199988716	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=9.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.10;MQRankSum=-5.162;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
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chr2	96610420	rs78473403	G	T	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-11.531;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,41:0.28:147
chr2	96610731	.	C	G	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=47.57;NF=6;NR=0;PP=42;QD=12.7952020912;SC=GTTGCAGTGACCCAAGATCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=6;WE=96610739;WS=96610724;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr2	96610787	.	C	CA	334	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=50.77;NF=29;NR=0;PP=334;QD=12.3793103448;SC=ACTCTGTCTACAAAAAATAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=29;WE=96610795;WS=96610777;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:58,29:0.33:87
chr2	96610836	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=55.7;NF=132;NR=35;PP=2962;QD=20;SC=GTAGATAATATAATAGTCAGG;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=303;TCF=224;TCR=79;TR=167;WE=96610844;WS=96610826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:136,167:0.55:303
chr2	96610899	rs62154593	T	C	16971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=643;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.586;NF=201;NR=166;PP=2962;ReadPosRankSum=3.816;SC=TCCTTCTGTTTGTAAAGTATG;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=550;TCF=299;TCR=251;TR=367;WE=96610907;WS=96610889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,425:0.66:640
chr2	96610921	rs62154594	T	G	17388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=630;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.714;NF=191;NR=196;PP=2962;ReadPosRankSum=2.871;SC=TTCTGAAATATTCTAGAAGAA;SOR=0.511;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=547;TCF=262;TCR=285;TR=387;WE=96610929;WS=96610911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,443:0.71:627
chr2	96610952	rs62154595	T	C	9222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.186;NF=109;NR=206;PP=2962;ReadPosRankSum=1.936;SC=GGTTTAAGAATAACATGCAGC;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=437;TCF=148;TCR=289;TR=315;WE=96610966;WS=96610942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,360:0.72:497
chr2	96611018	rs62154596	G	A	2712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=7.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.070;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.297;NF=1;NR=86;PP=2175;ReadPosRankSum=-1.157;SC=CAAAAAGGATGGACTTTGAAG;SOR=2.410;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=126;TCF=2;TCR=124;TR=87;WE=96611026;WS=96611003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,87:0.67:129
chr2	96616310	rs139114553	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQRankSum=-2.751;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	96616313	.	A	ATT	462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.219;NF=12;NR=0;PP=441;ReadPosRankSum=-0.681;SC=AGAGTTGCCTAATTAGTAAAA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=96616335;WS=96616304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	96616348	rs62154609	C	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.686;NF=18;NR=2;PP=1056;ReadPosRankSum=-1.430;SC=CAAATAGTTTCTAAAGTTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=20;WE=96616370;WS=96616338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr2	96616353	rs150793442	GT	G	266.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.688;NF=12;NR=0;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.323;SC=AGTTTCTAAAGTTGTGTGAAG;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=12;WE=96616370;WS=96616338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr2	96616354	rs78161475	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQRankSum=-3.705;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.770;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr2	96616355	rs62154610	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.688;NF=12;NR=0;PP=937;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TTTCTAAAGTTGTGTGAAGAT;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=12;WE=96616370;WS=96616338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
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chr2	96616442	rs74960926	C	A	3220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=9.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQRankSum=-10.735;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.594;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,86:0.46:186
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chr2	96616607	rs141967446	G	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.25;MQRankSum=-4.516;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,3:0.11:28
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chr2	96616690	rs111409549	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQRankSum=-0.197;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr2	96616957	rs76255864	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQRankSum=-1.981;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.981;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
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chr2	96616976	rs76077075	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQRankSum=-1.645;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr2	96616979	rs80105408	G	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=-1.834;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.834;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
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chr2	96617023	rs78346055	C	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=5.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQRankSum=0.051;QD=37.60;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,34:0.89:38
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chr2	96617029	rs72041793	GA	G	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=-3.225;QD=3.27;ReadPosRankSum=2.350;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr2	96617039	rs74263747	A	C	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-1.901;QD=20.42;ReadPosRankSum=3.583;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
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chr2	96617090	rs72935833	A	G	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=3;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.070;NF=30;NR=25;PP=2137;ReadPosRankSum=1.141;SC=GCTTCAAATAACTTACCATCT;SOR=0.583;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=55;WE=96617098;WS=96617059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,63:0.41:152
chr2	96617106	rs76943414	A	C	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-4.885;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
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chr2	96617113	rs80297803	G	A	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-5.227;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.912;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,64:0.36:178
chr2	96617125	rs75585230	T	C	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-5.738;QD=13.58;ReadPosRankSum=-3.747;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,71:0.37:190
chr2	96617132	rs75695780	T	C	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQRankSum=-6.313;QD=13.37;ReadPosRankSum=-3.158;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,66:0.35:187
chr2	96617155	rs76752473	A	G	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.060;NF=23;NR=28;PP=630;ReadPosRankSum=1.019;SC=TTTTGAAATAATCTAGAAGAA;SOR=0.782;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=51;WE=96617163;WS=96617145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,48:0.30:158
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chr2	96781986	rs3111873	G	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=19;PP=457;SC=GTCGCCCCTCGGGCGGCGCCG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=96781994;WS=96781976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	96795857	rs749458	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=348;ReadPosRankSum=0.036;SC=GTTGCTGCTCTGAGACTTGAT;SOR=0.953;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=30;WE=96795865;WS=96795847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr2	96858914	rs997548	A	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.205;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GAAATGGAGGAGCAGGATTAG;SOR=1.387;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=68;WE=96858922;WS=96858904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,80:0.42:190
chr2	96859034	rs997547	A	G	3277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1794;ReadPosRankSum=0.639;SC=CATCCCTCTCAATCACCTCCA;SOR=0.768;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=202;TCF=103;TCR=99;TR=113;WE=96859042;WS=96859024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,150:0.57:264
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chr2	96932280	.	G	GT	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=450;ReadPosRankSum=0.506;SC=CAGCCTGCGCGTAGTGCAGGC;SOR=0.967;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=12;WE=96932288;WS=96932270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
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chr2	96943473	rs3214063	T	C	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1057;ReadPosRankSum=1.000;SC=AAAAGGAGTATAAAAGTGGGC;SOR=0.706;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=68;WE=96943481;WS=96943463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,83:0.59:141
chr2	96952833	rs3171927	A	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=779;ReadPosRankSum=0.945;SC=GACAACTCCAACTTGGGAAAC;SOR=0.445;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=47;WE=96952841;WS=96952823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr2	96955480	rs3214058	T	C	367.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=251;ReadPosRankSum=-0.870;SC=GAAAAATTTTTTCCTGGGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=11;WE=96955488;WS=96955470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr2	96956315	rs772176	T	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=33;PP=1203;SC=TTGATGCAGGTATCTACATTA;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=96956323;WS=96956305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr2	97315570	rs17685664	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=40;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GGTCTAGATGCCAGATCTCCA;SOR=0.132;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=3;WE=97315578;WS=97315560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr2	97329411	rs78099783	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=1.064;SC=TTATGGAAAACTTTACCTTTT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=97329419;WS=97329401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	97336089	rs2292942	G	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CTGGCCACTGGCTGTTGAGTG;SOR=0.960;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=13;WE=97336097;WS=97336079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	97351840	rs7599598	A	G	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=823;ReadPosRankSum=0.119;SC=CCGCCTCAACACCGTGCTCCC;SOR=0.978;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=54;WE=97351848;WS=97351830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,71:0.43:167
chr2	97353460	rs138874749	G	GGGGAA	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=567;ReadPosRankSum=0.902;SC=AGGGCTCAGGGGGGAAGGGGC;SOR=1.938;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=11;WE=97353468;WS=97353450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	97357108	rs62156206	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=964;ReadPosRankSum=1.398;SC=GTCGACGGGCGCCCTGGCTGG;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=55;WE=97357116;WS=97357098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr2	97357756	rs368566816	CG	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.837;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	97359236	rs62156207	C	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=0.787;SC=CTCCTCTACCCCTCCAGGGCC;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=26;WE=97359244;WS=97359226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr2	97359364	rs61750875	A	G	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.708;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=875;ReadPosRankSum=-2.422;SC=ACGAGAACCCACAGGACACCA;SOR=1.025;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=59;WE=97359372;WS=97359354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,69:0.43:161
chr2	97366088	rs61742095	T	C	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CCCCTACTGTTCATGGTTTGG;SOR=0.987;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=96;WE=97366096;WS=97366078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,104:0.53:198
chr2	97377883	rs3731940	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=0.474;SC=GGCAGCCACTCGACCTCATTG;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=10;WE=97377891;WS=97377873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
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chr2	97399100	rs62156213	T	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.797;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr2	97400324	rs6727384	A	G	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=758;ReadPosRankSum=0.633;SC=CCTCAAGCCCACATCAGCAAT;SOR=0.921;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=45;WE=97400332;WS=97400314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
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chr2	97638038	rs1730120	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=688;SC=GAGGATGGGCACGGTGGCGGC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=97638046;WS=97638028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	97643576	rs1796048	T	C	6210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=114;PP=2965;SC=TACTCCAGCGTTGACGGTTTT;SOR=1.333;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=55;TCR=114;TR=169;WE=97643584;WS=97643566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr2	97747978	rs1257094	C	T	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
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chr2	97814956	rs4386368	G	A	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=493;SC=GTGGACATACGTGTATAGACT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=97814964;WS=97814946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr2	97817564	rs33971912	C	CT,T	939.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=39.77;QD=34.80;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,19,8:0.70,0.30:27
chr2	97817578	rs113800206	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=19.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQRankSum=-2.607;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.503;SOR=1.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr2	97818101	.	T	G	123	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MMLQ=27;MQ=47.92;NF=3;NR=1;PP=123;QD=39.4428031368;SC=TCAAACTCCTTGGCTTCTCAA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=97818122;WS=97818091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr2	97818114	.	G	T	123	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=46.63;NF=4;NR=1;PP=123;QD=31.5542425094;SC=CTTCTCAAGTGATACTTCTGC;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=97818122;WS=97818091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,5:0.45:11
chr2	97818146	.	G	A	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=42.75;NF=5;NR=2;PP=37;QD=10.2530303639;SC=GAGTAGCTGGGATTATAGGAA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=7;WE=97818154;WS=97818136;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,7:0.29:24
chr2	97818161	rs74715701	C	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.32;MQRankSum=-4.616;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
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chr2	97818188	rs141129874	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=4.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQRankSum=-2.569;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
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chr2	97829060	rs143614175	G	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=5.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQRankSum=-1.012;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=1.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
chr2	97829119	.	ATG	A	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=13.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.50;MQRankSum=-2.063;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.672;SOR=3.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
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chr2	97829221	rs200608168	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQRankSum=-1.834;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.264;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
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chr2	97833217	rs150423357	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.13;MQRankSum=-2.855;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	97833342	rs5008284	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=9.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQRankSum=-2.365;QD=2.44;ReadPosRankSum=-3.109;SOR=1.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
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chr2	97833567	rs76160111	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQRankSum=-1.215;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr2	97833569	rs78400826	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQRankSum=-0.828;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr2	97833583	rs72945197	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQRankSum=-1.415;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.130;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr2	97851069	rs62154801	A	G	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.00;QD=31.10;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	97877292	rs10171441	C	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=8;PP=1402;SC=GTGTCTTCTCCGAAACAACCA;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=97877300;WS=97877282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	97877399	rs10186233	T	C	9237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.712;SC=TTTCAAATTCTATTCAGGCTA;SOR=0.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=165;TCR=124;TR=288;WE=97877407;WS=97877389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,343:1.00:344
chr2	97877440	rs35711845	T	C	3524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.94;MQRankSum=-1.060;NF=67;NR=79;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GTTCCGAATATGGCCACGGAA;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=318;TCF=150;TCR=168;TR=146;WE=97877448;WS=97877430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,178:0.47:380
chr2	97877478	rs10194525	G	A	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.93;MQRankSum=1.025;NF=56;NR=85;PP=2471;ReadPosRankSum=1.946;SC=ATCTGGGACAGGTAATTTTGC;SOR=0.680;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=273;TCF=106;TCR=167;TR=141;WE=97877486;WS=97877468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,167:0.51:328
chr2	98192743	.	A	AAC	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	98192749	rs55777246	T	C	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.80;QD=31.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	98196849	rs34131105	G	A	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.95;QD=45.26;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr2	98205924	rs74177639	C	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.46;QD=32.15;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	98206188	rs1868445	C	G	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=66;PP=1939;SC=CTTCCTTAATCGTCGGCTGCA;SOR=1.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=93;WE=98206196;WS=98206178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr2	98276014	rs150112418	CCCTCACCTGCCCTGACCAGAA	C	1176.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=2926;SC=TGGAAGCTGACCCTCACCTGC;SOR=2.066;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=18;WE=98276042;WS=98276004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	98351654	rs34532595	TG	T	664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=605;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GGTGGGGGTGTGGGGCCGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=19;WE=98351662;WS=98351644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr2	98353847	rs11686881	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TCACCTGGCTCATGCCCAGCT;SOR=1.432;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=10;WE=98353855;WS=98353839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr2	98354139	rs17488834	G	T	4319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=88;PP=2487;ReadPosRankSum=0.482;SC=GTAAGCCTCTGCCCCTGTGAT;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=307;TCF=150;TCR=157;TR=164;WE=98354147;WS=98354129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,201:0.52:383
chr2	98354511	rs3192177	G	A	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1112;ReadPosRankSum=-1.502;SC=AGCGGATGGAGTGCCCACCAG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=68;WE=98354519;WS=98354501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,90:0.55:163
chr2	98355990	rs11678558	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.872;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=279;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AGCCCTCCACGCCGGCTCTTC;SOR=0.092;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=15;WE=98355998;WS=98355980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr2	98376989	rs3214760	TA	T	752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=857;SC=CATTTATGGATAAAAAGGTGC;SOR=4.174;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=24;WE=98376997;WS=98376985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	98377512	rs2044458	A	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=222;ReadPosRankSum=0.810;SC=GCTCAGCCTCATGTCACATGC;SOR=0.518;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=13;WE=98377520;WS=98377502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr2	98382886	rs895438	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=571;ReadPosRankSum=1.715;SC=TTGTTAATACGGTGCACTATG;SOR=1.083;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=33;WE=98382894;WS=98382876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr2	98392302	rs17489259	G	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=452;ReadPosRankSum=0.970;SC=AGATCAGCCCGTACCTCCTTG;SOR=0.502;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=28;WE=98392310;WS=98392292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr2	98409046	rs12995673	G	A	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=918;ReadPosRankSum=0.260;SC=TTCAGGCTGCGGCTCCTGGGG;SOR=1.092;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=58;WE=98409054;WS=98409036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr2	98418812	rs11340992	CA	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.780;SC=GTATGAGCTGCAAATAAGGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=98418820;WS=98418802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	98449796	rs6721250	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=329;SC=AAAGAATATACAAATTAGGGG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=98449804;WS=98449786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	98460441	rs66477711	TAG	T	125.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	98460742	rs12712162	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr2	98475979	rs6707750	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-1.224;SC=AATTGTTAGACAAATACATAG;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=98475987;WS=98475969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	98525107	rs1317178	T	C	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=34;PP=1344;SC=AATTATCTTATTAAATATACT;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=98525115;WS=98525097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	98544058	rs6707719	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=-0.110;SC=AAAAATGGACTGCTTAATGGT;SOR=0.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=98544066;WS=98544048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	98611833	rs2279825	T	C	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=2;PP=99;SC=CGCCCAACTTTGCGCCGGAGC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=98611841;WS=98611823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	98611994	rs2279824	G	T	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=22;PP=753;SC=GGTGCAGCGCGCCTAGGAGGC;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=98612002;WS=98611984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	98709684	rs298917	T	C	2996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=70;PP=1641;ReadPosRankSum=2.308;SC=TTCAACTGCATGGGCTTAAGA;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=253;TCF=118;TCR=135;TR=126;WE=98709692;WS=98709674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,149:0.50:299
chr2	98795792	rs4851884	C	G	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.926;NF=49;NR=33;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TAACATAACACAGTCTTCTCA;SOR=0.929;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=82;WE=98795800;WS=98795782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,105:0.45:233
chr2	98795873	rs11419620	T	TG	5261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=76;PP=2965;SC=ATTGGCATTGTGGTTATTCTT;SOR=1.288;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=91;WE=98795881;WS=98795863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr2	98804314	rs1466156	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=9;PP=454;SC=ACTAACAAAGGAATGATTGAC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=98804322;WS=98804304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr2	98928739	.	G	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=808;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CCTCCACCTCGAGCAGCCCTG;SOR=0.825;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=54;WE=98928747;WS=98928729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,66:0.42:159
chr2	98928929	rs1466944	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=-0.546;SC=CGCGCCGCCTATGCCTGCCCT;SOR=1.148;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=12;WE=98928937;WS=98928919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr2	98948224	rs13427344	C	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=573;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TGAAGGTAAACTGGATAGAGG;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=36;WE=98948232;WS=98948214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr2	98994414	rs937725	T	C	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=8;PP=810;SC=AAACTATCAGTGAGTAATTTC;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=98994422;WS=98994404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr2	99154229	rs2278208	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=0.932;SC=CTGCTGCCCCCAGGACCCTGA;SOR=0.772;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=14;WE=99154237;WS=99154219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
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chr2	99163261	rs2278207	T	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=509;ReadPosRankSum=0.964;SC=CCCAGCCATCTGATCTGCTTT;SOR=0.773;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=27;WE=99163269;WS=99163251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr2	99168953	rs1181562	T	C	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=152;SC=TGGGTGATTATGGGATATGAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=99168961;WS=99168943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr2	99204186	rs201247772	T	TA	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-1.524;SC=GTGGTTTTTTTAAAAAAAACA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=99204194;WS=99204176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	99219206	rs7585939	T	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=121;ReadPosRankSum=2.547;SC=AATGGTAAGATCATTTTACTT;SOR=0.628;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=12;WE=99219214;WS=99219196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	99220707	rs4851144	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=270;ReadPosRankSum=1.354;SC=TCTCACAAAGTACAAAATAAT;SOR=0.738;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=16;WE=99220715;WS=99220697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr2	99224998	rs17034241	C	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=478;ReadPosRankSum=1.127;SC=CGGGCCGCGGCGGTAGGGCCG;SOR=1.075;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=28;WE=99225006;WS=99224988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
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chr2	99234601	.	T	TA	396	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=17;MQ=59.95;NF=14;NR=3;PP=396;QD=23.4705882353;SC=TTTTTTTTTTTAAATCAGTTT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=17;WE=99234609;WS=99234591;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,17:0.52:33
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chr2	99272057	rs3754870	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-1.074;SC=AATGTATAAATGTCAAATGTC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=99272065;WS=99272047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	99272802	rs11679648	G	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=942;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GATTTTAAACGGCACATGCTC;SOR=0.519;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=131;TCF=91;TCR=40;TR=60;WE=99272810;WS=99272792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr2	99274653	rs2271670	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=242;ReadPosRankSum=1.072;SC=CCAAAATATTTGTATGTTTAT;SOR=0.791;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=19;WE=99274661;WS=99274643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr2	99725223	rs6542864	A	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=382;SC=CAGTCTCATAAAACTCAAAGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=99725231;WS=99725213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	99725479	rs11396964	A	AT	1255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=1097;SC=GGAATTTGAAATCTTCTTTGA;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=99725487;WS=99725469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	99726043	rs6733624	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=382;SC=AAAAAATTAGACCATTATTTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=99726051;WS=99726033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	99743419	rs13008171	G	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=247;SC=AATGAGCTCTGAATTAGTAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=99743427;WS=99743417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	99771533	rs2516834	C	T	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=86;PP=2674;SC=AGCGGAAACGCTTCAAACCGG;SOR=1.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=40;TCR=86;TR=126;WE=99771541;WS=99771523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	99771590	rs2632260	G	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=41;PP=1155;SC=TCTTGGGCGCGCGCGGTGTTT;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=99771598;WS=99771580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	99778985	rs2632277	T	C	6922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=111;PP=2965;SC=TGGGACGTTCTTGTCTTCTTT;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=99;TCR=112;TR=210;WE=99778993;WS=99778975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	99779131	rs2516835	T	C	7679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=106;PP=2965;SC=AGTATGCTGCTTATCATCAAA;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=128;TCR=106;TR=234;WE=99779139;WS=99779121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr2	99802820	rs6757661	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=29;PP=823;SC=TTTTGAGACGAAGTCTCTCTC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=99802828;WS=99802810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	99804642	rs10865030	T	C	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=17;PP=758;SC=TATTTTAGACTGTGACAAAAG;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=99804650;WS=99804632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	99811249	rs375377487	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=212;ReadPosRankSum=-0.587;SC=ATGAAAAATACGGTGGGGATC;SOR=0.074;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=18;WE=99811257;WS=99811239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr2	99811894	rs7605843	C	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=915;SC=CAGACATTTACCATTTCTTCA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=99811902;WS=99811884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	99812070	rs1044575	G	A	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=59;PP=2050;SC=AGGACTTCCAGCAGAGGAGAA;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=102;WE=99812078;WS=99812060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	99859954	rs201611834	CAGAT	C,CAGATAGAT	828.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;MQ=60.14;MQRankSum=0.417;NF=1,1;NR=19,19;PP=1498,720;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GGTAGGCAAACAGATAGATAG;SOR=3.528;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=20,20;WE=99859965;WS=99859944;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.42:24
chr2	99912307	rs11289179	GA	G	216.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=167;SC=GAATCATAGTGAAAAAAAAGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=99912315;WS=99912297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	99918180	rs10688800	C	CAA	353.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.30;QD=32.16;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	99923088	rs13003899	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=84;SC=AAGTACTTATTGATGTAGACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=99923096;WS=99923082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	99938301	rs13017871	C	T	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=48.56;NF=25;NR=0;PP=708;SC=AGAAACTTTCCACATCTCAGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=99938309;WS=99938291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	99954636	rs11326784	GT	G	323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.67;NF=11;NR=2;PP=246;SC=CTTCCGGCCTGTTTTTTTTTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=99954644;WS=99954626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	99954735	rs4850901	C	A	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=16;PP=1146;SC=TAACCACCTGCAATGCTTTGG;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=99954743;WS=99954725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	99976564	rs3828162	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=146;SC=CTTGTGTTGTAATGAAAGAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=99976572;WS=99976556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr2	99995613	rs145805034	A	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=685;ReadPosRankSum=1.357;SC=AAATGTATTGATAGAACTTTG;SOR=0.629;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=50;WE=99995621;WS=99995603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
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chr2	100915772	rs4851287	A	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=901;ReadPosRankSum=2.043;SC=GCTCCTTTGAAGTGAGAGATC;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=50;WE=100915780;WS=100915762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr2	100916051	rs2033749	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.792;SC=CTCTATAATCTTAGAGCTGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=100916059;WS=100916041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	100916306	rs2033748	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr2	100916315	rs11123823	A	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.011;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr2	100917109	rs13006224	C	T	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1393;ReadPosRankSum=0.974;SC=GTCATACCTCCGAGCTCCCTG;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=92;WE=100917117;WS=100917099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,106:0.49:215
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chr2	101009600	rs1530030	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=0.620;SC=GACCCCGGGCGTCCTCAAAGG;SOR=1.085;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=14;WE=101009608;WS=101009590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	101010082	rs3748930	G	C	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1274;ReadPosRankSum=1.654;SC=GGATCCCCCGGGTCTCTGTCC;SOR=0.571;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=87;WE=101010090;WS=101010072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,102:0.47:219
chr2	101011877	rs2241810	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=507;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CTCCGATCAATCTGCCAAGTA;SOR=1.028;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=35;WE=101011885;WS=101011867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr2	101014247	rs4149517	C	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=332;ReadPosRankSum=-2.351;SC=CCTGTCTGGACGGCCACCAGT;SOR=0.756;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=17;WE=101014255;WS=101014241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr2	101014363	rs2241809	C	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=966;ReadPosRankSum=-0.564;SC=AGTAGACCCACACACACCATT;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=59;WE=101014371;WS=101014350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,70:0.44:158
chr2	101022886	rs4149512	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.438;SC=ACCTCTGTAACATGAAGGAAC;SOR=0.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=11;WE=101022894;WS=101022876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	101031561	rs3828193	G	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=594;ReadPosRankSum=0.273;SC=GAGGTTCTTGGTTCCTCTTGT;SOR=0.454;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=32;WE=101031569;WS=101031551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
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chr2	101086966	rs13411940	C	T	5176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=70;PP=2872;SC=ACATCTTCGTCCCCAGTTCCC;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=153;WE=101086974;WS=101086956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr2	101087104	rs13414632	C	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1175;ReadPosRankSum=0.848;SC=CCCAGGGCAGCTCTGGAGGGA;SOR=2.753;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=50;WE=101087112;WS=101087094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr2	101087191	rs13388529	G	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=260;SC=AGAGGATCAAGAGAGCGAGAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=101087199;WS=101087181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	101093556	rs6726587	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=509;SC=ACTCATTAAATTTACGTAATA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=101093564;WS=101093549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	101095733	rs7561811	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=233;SC=GAGTAGAAAGAAATGCGCATA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=101095741;WS=101095723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	101096802	rs7565675	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=471;SC=AGATCACGGCAGTGATCCCAC;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=101096810;WS=101096792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	101096834	rs13428749	C	A	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=633;SC=CTCTCCACCTCCTCTTTTGCA;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=101096842;WS=101096824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	101096860	rs7568519	T	C	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=781;SC=CTTCTGACTATCTTAGAAGCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=101096868;WS=101096850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	101096903	rs13393776	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=27;PP=797;SC=GCAAGACAACTGCAAGGTCAT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=101096911;WS=101096893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	101096960	rs1519654	C	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=572;SC=CCTTGCAGGGCTCGGGGACTG;SOR=1.542;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=27;WE=101096968;WS=101096950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	101126124	rs1829479	T	A	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=67;PP=2035;SC=TTTCTCCTTATTATGTTACTT;SOR=2.461;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=85;WE=101126132;WS=101126114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	101179341	rs2970988	AG	GA	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=825;SC=CTTCTGTGCCAGTTCCTTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=101179350;WS=101179331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	101186088	rs1052117	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=989;SC=AGAATAAATTCGGAGAAGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=101186096;WS=101186078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	101188373	rs138885839	C	CCTGTGTATGAGTGA	2766.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=2900;SC=TTCACTTCTGCCTGTGTATGA;SOR=2.340;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=23;WE=101188381;WS=101188363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	101520972	rs5832941	A	AT	229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=88;SC=GCCCAATGAAAGAGTGCCTGT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=101520980;WS=101520962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	101541798	rs356651	C	T	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=713;SC=CACCCTGCCCCGTCCATGTGG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=101541806;WS=101541788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	101564628	rs10207725	A	G	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=12;PP=1134;SC=TGAATGTTCAATTTTTGTTTT;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=101564636;WS=101564618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	101566070	rs3739005	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.751;SC=TTTGAATTTTCGAGTTCCCAG;SOR=0.804;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=4;WE=101566078;WS=101566060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	101581246	rs7581886	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=678;SC=TTACCCACCACGCGTTCCTCT;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=101581254;WS=101581236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	101581976	rs4851392	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.200;SC=AGCCTCTCTGATTTTGACCAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=101581984;WS=101581972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	101591304	rs2305160	A	G	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1073;ReadPosRankSum=0.747;SC=GCACTTTAACACACTCGACGT;SOR=0.684;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=82;WE=101591312;WS=101591294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,98:0.45:219
chr2	101609827	rs9223	C	T	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=850;ReadPosRankSum=-0.551;SC=AGAGCCAGACCGTGTTTCAAA;SOR=0.696;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=50;WE=101609835;WS=101609817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr2	101612051	rs2305158	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=2.647;SC=ATAATGCCCCGGCACTGAAGT;SOR=0.929;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=15;WE=101612059;WS=101612041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr2	101619283	rs2278724	C	G	4970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=72;PP=2965;SC=GAGTATCCCTCTAGCCGCCCT;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=90;TCR=72;TR=162;WE=101619291;WS=101619273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	101619321	rs2278723	T	C	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=86;PP=2965;SC=GTCTGGTTGTTACCGAGAGAT;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=164;WE=101619329;WS=101619311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	101620856	rs34386800	TA	T	878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.745;NF=2;NR=37;PP=397;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TGTGGAAGTATAAAAAAAAAA;SOR=0.492;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=39;WE=101620864;WS=101620846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr2	101622696	rs34763346	T	TG	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=540;ReadPosRankSum=0.771;SC=GATCCATATCTGGGATGTAAA;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=16;WE=101622704;WS=101622686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr2	101622728	rs10934	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=0.635;SC=AAATAGAATGCCCAGACCCGT;SOR=1.007;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=16;WE=101622736;WS=101622718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr2	101624471	rs746924	T	C	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.06;NF=87;NR=69;PP=2965;SC=GTCCAGTCCCTTTCTGCCGCC;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=156;WE=101624479;WS=101624461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	101627852	rs1062059	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=345;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGGGCAACCCCGGTGCCTCCC;SOR=0.343;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=20;WE=101627860;WS=101627842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	101635538	rs13007048	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CCTTGGGTCTCGGCTCTTCAT;SOR=0.784;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=16;WE=101635546;WS=101635528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr2	101638888	rs3739014	A	G	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=56;PP=2187;SC=ACTGCCGGGCATCTATGCGGT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=105;WE=101638896;WS=101638878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	101644855	rs11683877	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=633;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TGCCAACTGGGGGCCCTGGGC;SOR=1.242;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=42;WE=101644863;WS=101644845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
chr2	101646144	rs3739015	G	A	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1534;ReadPosRankSum=1.327;SC=AGAGAGAGACGGACGCCAGGG;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=89;WE=101646152;WS=101646122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,103:0.65:159
chr2	101646359	rs12472882	G	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=0.857;SC=CCAGAAAAGCGTCCATGCTTA;SOR=0.723;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=7;WE=101646367;WS=101646349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	101652732	rs4850957	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=266;ReadPosRankSum=0.348;SC=CCCTGCTCTCCGAGGGGCCAA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=17;WE=101652740;WS=101652722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr2	101656726	rs2289953	T	C	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=54;PP=1664;SC=ATCCGCCCCGTGGTGTGACAG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=100;WE=101656734;WS=101656716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	101675808	rs7572457	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=642;ReadPosRankSum=0.859;SC=AACTGTTAGTATGCTACAGTG;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=36;WE=101675816;WS=101675798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr2	101870073	rs874272	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=1.860;SC=TCCGCCTCTCTCTGCGTTCCC;SOR=0.631;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=10;WE=101870081;WS=101870063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr2	101883027	rs3736586	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=692;SC=TCAATGCAGATAGTTTTGTAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=101883035;WS=101883017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	101883046	rs1660694	A	G	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=1;PP=1134;SC=AGCTTTTTGTATAAAATGCTT;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=101883054;WS=101883036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	101898412	rs13151	G	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1269;SC=GTGGACTGCTGTCATCACTTC;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=101898420;WS=101898402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	101911651	rs72822998	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=616;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TTCCTGTAGGAAAGAACAAAG;SOR=0.450;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=36;WE=101911659;WS=101911641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr2	101925026	rs11123868	T	C	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=108;PP=2689;SC=GCCCCGACGCTGGCTTCGCGC;SOR=2.176;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=37;TCR=108;TR=145;WE=101925034;WS=101925016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	101967346	rs6543032	C	T	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=43;PP=2955;SC=AAAAGGTTTTCATTTAAGTGC;SOR=1.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=97;TCR=43;TR=140;WE=101967354;WS=101967336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	101971618	rs6753727	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=558;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TGGAGACCAATCACTTATTGC;SOR=0.340;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=30;WE=101971626;WS=101971608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr2	102000210	rs11694978	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=271;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GCTGTGGCTCGACTTGATCTG;SOR=0.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=21;WE=102000218;WS=102000200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr2	102003962	rs116287156	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CCAGCAGCGCTAGTGCCGGGG;SOR=0.804;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=102003970;WS=102003952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	102018878	rs11123876	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=181;ReadPosRankSum=0.110;SC=CTGTGTGGAAGGGGGTCCTGG;SOR=0.439;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=16;WE=102018886;WS=102018868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr2	102018908	rs2175968	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=660;ReadPosRankSum=0.438;SC=CTTATTGCCCATGGCAGTGTC;SOR=0.432;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=39;WE=102018916;WS=102018898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr2	102029273	rs11689348	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=0.135;SC=ATCGGAGTTATAAAGTTCTAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=102029281;WS=102029263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	102029548	rs1554070	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=655;ReadPosRankSum=-1.751;SC=AGATAACAGGGAGGCATAATA;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=43;WE=102029556;WS=102029538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr2	102031176	rs4851434	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=822;SC=TCCTCTGCCAATGGCCAGGCA;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=102031184;WS=102031166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	102031489	rs4851435	C	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=853;SC=TAAACTGCAACTTCCCCCACC;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=102031497;WS=102031479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	102035192	rs6709913	C	T	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=114;SC=TCCATACACCCCACTATTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=102035200;WS=102035182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	102038849	rs4851436	T	A	8413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=144;PP=2965;SC=TTTCTTTGCCTGTTCTTGCTC;SOR=1.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=99;TCR=144;TR=243;WE=102038857;WS=102038839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr2	102066878	rs4851448	A	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=413;SC=AGAGATGGAGATTTGCCATGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=102066886;WS=102066871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	102067083	rs7585228	T	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=41;PP=1458;SC=ACCTATCAGGTAGCAATACTG;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=102067091;WS=102067073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	102068715	rs11123884	C	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=115;SC=GGAATTAATGCGAATTGTGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=102068723;WS=102068705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	102068872	rs4851449	T	A	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=31;PP=1400;SC=GTGCCCAGCCTCCGGGTGCCA;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=102068880;WS=102068862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	102069002	rs4851450	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=543;SC=ATATTCCTTTTCCTCTTTTCT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=102069010;WS=102068992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr2	102459268	rs17801985	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GCATCTTACTATCTCCATTCT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=102459276;WS=102459258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr2	102483883	rs17745869	T	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=198;ReadPosRankSum=0.949;SC=CCCTCACAGATTTGAGGAATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=102483891;WS=102483873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	102501891	rs57584884	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TTTATCATAAACCATTTCTAA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=102501899;WS=102501881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	102785158	rs3213735	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.679;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr2	102788409	rs2041747	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=568;ReadPosRankSum=0.374;SC=TCACATTTTGGTGTTAAATCC;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=39;WE=102788417;WS=102788399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr2	102792760	rs3917318	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GGTTCAGGAGAGAATGATGAT;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=102792768;WS=102792750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	102957716	rs1420101	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=-1.621;SC=GATTCAAAGTCTAATGAGAGG;SOR=1.164;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=13;WE=102957724;WS=102957706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr2	102965608	rs138892317	G	A	3317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=73;PP=1936;ReadPosRankSum=1.327;SC=GGGGCCAGTCGTGTAGAGCAC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=286;TCF=130;TCR=156;TR=134;WE=102965616;WS=102965598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,163:0.47:350
chr2	102979028	rs2287037	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=498;ReadPosRankSum=-0.616;SC=ATTTTTAAACCTTCATAAGAT;SOR=0.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=30;WE=102979036;WS=102979018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr2	102984279	rs1420098	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.681;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=365;ReadPosRankSum=0.871;SC=TACTAATCTTTTGAAGAATCT;SOR=0.033;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=21;WE=102984287;WS=102984269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	103001402	rs1035130	C	T	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1012;ReadPosRankSum=0.631;SC=ATTGGATGTTCGGGGAAGAAA;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=74;WE=103001410;WS=103001392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,90:0.50:181
chr2	103003265	rs2241116	C	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=187;ReadPosRankSum=-1.719;SC=CATGTGAATTCCCCTCTCAAG;SOR=0.527;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=14;WE=103003273;WS=103003255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	103006387	rs4851570	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=1.651;SC=ACTCAGTGGAATGTGTCAGCA;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=12;WE=103006395;WS=103006377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr2	103039584	rs3817465	A	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=453;ReadPosRankSum=-0.884;SC=CCTGTGTGAGATGCACTTTGT;SOR=0.509;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=22;WE=103039592;WS=103039574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr2	103040247	rs11377261	T	TG	1360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.585;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=1918;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TGTTTCCATGTGCTTTGTTTA;SOR=1.519;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=30;WE=103040257;WS=103040237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr2	103040249	rs2272129	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=1910;ReadPosRankSum=-1.006;SC=TTTCCATGTGCTTTGTTTATT;SOR=1.103;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=34;WE=103040257;WS=103040237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr2	103040945	rs887972	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GGCTTTTCATGGAAAAGCGTG;SOR=2.419;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=16;WE=103040953;WS=103040935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	103059613	rs1558651	A	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=23;PP=1499;SC=AGGACAAAGTATTCTCACCAG;SOR=1.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=103059621;WS=103059603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	103090127	rs17027255	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=1.532;SC=ACTTTTGACCCAGGTGGATGC;SOR=0.098;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=103090135;WS=103090119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	103095404	rs11692304	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=36;PP=1208;ReadPosRankSum=0.501;SC=ACCACAAATCGCCTCCGGTCA;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=174;TCF=110;TCR=64;TR=91;WE=103095412;WS=103095394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,106:0.51:206
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chr2	103120311	rs2075187	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-0.275;SC=AAACTTTTATGAAACCTGATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=103120319;WS=103120301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
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chr2	103136309	rs1403550	T	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=802;ReadPosRankSum=0.061;SC=TCTCCAATAATGATTCCAGGG;SOR=0.939;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=64;WE=103136317;WS=103136299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr2	103136446	rs1403551	T	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=504;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TGTCCCCATTTTCTGTCCTTG;SOR=0.555;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=30;WE=103136454;WS=103136436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr2	103141447	rs2015478	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=557;ReadPosRankSum=-0.421;SC=TGTATGGAGGAGTCCTTACGT;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=34;WE=103141455;WS=103141437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr2	103141651	rs1024798	G	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=-1.443;SC=TTCCTTCAGTGTGCAAGTGTT;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=103141659;WS=103141641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	103149100	rs1014286	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=566;ReadPosRankSum=-0.707;SC=CCATGGACACGGCAGGGACCA;SOR=1.193;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=33;WE=103149108;WS=103149090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr2	103149162	rs2008159	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.378;SC=ATTGTCCACAAGATTGTTTTG;SOR=1.691;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=12;WE=103149170;WS=103149152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr2	103149182	rs2008157	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGTGTTTCTCAAGAGTCTGTC;SOR=1.002;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=8;WE=103149190;WS=103149172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr2	103236392	.	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=603;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GGCGGGGCCCGTGGGCGCCCT;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=39;WE=103236400;WS=103236382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr2	103375056	rs2732838	T	G	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=1342;SC=GCTTAACAAGTACCAAGCTGG;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=103375064;WS=103375046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	103378857	rs2540298	C	G	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=102;PP=2965;SC=TATGAAGATACCCTTATGTAT;SOR=1.580;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=46;TCR=102;TR=148;WE=103378865;WS=103378847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	103380998	rs2540296	C	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=800;SC=CCTGTAATTTCAATATTTTTG;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=103381006;WS=103380988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	103431404	rs887987	T	C	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=929;SC=GGTTGTTGGATGGCATATTCA;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=103431412;WS=103431394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	104995800	rs4851692	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GTGACCCATACCTGATGTCTC;SOR=0.812;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=67;WE=104995808;WS=104995790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,74:0.43:173
chr2	105472013	.	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr2	105472055	rs186512421	T	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=3;PP=60;SC=CGGCAGGGGCTGGCGGCGGCG;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=105472063;WS=105472045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	105654588	rs13399067	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=694;ReadPosRankSum=0.916;SC=GGAGCAGTTTCGTACCGGCTT;SOR=0.520;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=46;WE=105654596;WS=105654578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr2	105665808	rs11538197	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=372;ReadPosRankSum=1.190;SC=AAGATATTGACGTAAGTACAG;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=27;WE=105665816;WS=105665798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr2	105665921	rs3832070	GA	G	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=1.164;SC=TCAGAATAAGGAAAAATGCTG;SOR=0.048;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=105665929;WS=105665911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	105665941	rs3832069	GTT	G	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=-2.189;SC=GCTATACATTGTTTAAGTTGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=105665950;WS=105665931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	105705507	rs11538198	C	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=767;ReadPosRankSum=0.736;SC=AAAGTCTGCTCCCAGAAAAAA;SOR=1.347;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=45;WE=105705515;WS=105705497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr2	105706476	rs75278939	T	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=623;ReadPosRankSum=1.361;SC=TCTTTTTAATTTAAGGGGACC;SOR=0.711;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=39;WE=105706484;WS=105706466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr2	105706584	rs147318136	AAAAAC	A	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.357;NF=0;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=-1.847;SC=TTCTTTCTTTAAAAACAAAAC;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=4;WE=105706596;WS=105706574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr2	105709023	rs6543282	T	C	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=72;PP=1987;SC=TTAGCAAAAGTGAAGGTAATG;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=109;WE=105709031;WS=105709013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	105713697	rs15567	A	G	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=947;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GCGGGAGGTCAGCGCAGGCTG;SOR=0.526;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=70;WE=105713705;WS=105713687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,81:0.49:166
chr2	105713868	rs10206662	A	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.73;SOR=2.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	105713868	.	AAGAAAATAT	GAGAAAATAC,GAGAAAATAT	270	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3,6;NR=10,26;PP=217,270;QD=20.8052211432;SC=TGAAGTTCGTAAGAAAATATA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=13,32;WE=105713885;WS=105713858;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.41:32
chr2	105713877	rs57214748	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=10.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr2	105716266	rs9066	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.429;SC=ATATGTGCCGACATGTGGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=12;WE=105716274;WS=105716256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	105859249	rs35946826	C	T	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CGTCCTGTGGCTCAGTTACCT;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=114;TCR=105;TR=90;WE=105859257;WS=105859239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,111:0.43:259
chr2	105886219	rs2241798	C	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=0.674;SC=ACCCGCCCAGCGACTGGCCTC;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=105886227;WS=105886209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	105897261	rs2679833	C	T	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=44;PP=1236;SC=TGGAGGGGAGCGCACGGTGGC;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=105897269;WS=105897251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	105915128	rs12476720	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=661;ReadPosRankSum=1.641;SC=GCACGGGGGCGCGCTGGGATA;SOR=0.718;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=36;WE=105915136;WS=105915118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr2	105924510	rs2241801	A	G	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CTGAGGCCGCACGCAGCTCGT;SOR=0.687;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=68;WE=105924518;WS=105924500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr2	105953938	rs3217439	G	GC	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=770;ReadPosRankSum=0.773;SC=GGCATGCGGCGACTCAGAGTG;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=21;WE=105953946;WS=105953928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr2	105961703	rs2679842	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=1.351;SC=TTGGTTGTTTGAAATGTTCAT;SOR=0.681;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=15;WE=105961711;WS=105961693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr2	105977903	rs2244182	G	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=222;ReadPosRankSum=0.385;SC=TGTTAACAGAGAGAAAATAAT;SOR=0.384;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=14;WE=105977911;WS=105977893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr2	106013216	rs11891016	T	C	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=134;PP=2965;SC=CTCAGTATAATGCAACTTGAG;SOR=2.126;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=47;TCR=134;TR=181;WE=106013224;WS=106013206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr2	106013248	rs11884297	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=43;PP=932;ReadPosRankSum=-1.344;SC=ATAAATGTGGCTTTGATCAAA;SOR=0.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=10;TCR=90;TR=48;WE=106013256;WS=106013238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr2	106471393	rs6543345	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=363;ReadPosRankSum=-0.266;SC=AGGAGAAAACTGGTTGCAGAG;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=23;WE=106471401;WS=106471383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr2	106687456	rs13014521	G	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=493;ReadPosRankSum=-0.009;SC=TATCAGGCCAGACAAGGTATT;SOR=1.071;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=28;WE=106687464;WS=106687446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr2	106690542	rs35317173	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=1.347;SC=CCACAGGGAAGGGTGGCAGGG;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=106690550;WS=106690532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	106715342	rs3820891	G	A	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=62;PP=1858;SC=ACCTCCCTGCGCTGCTTCAGC;SOR=1.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=90;WE=106715350;WS=106715332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	106717274	rs3739136	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=1.030;SC=TCTTAGACCCAGGCCCTTCAG;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=106717282;WS=106717264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	106717656	rs10177888	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CCTCCCAGAAGAAAAATTACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=106717664;WS=106717646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	106742139	rs4851925	C	T	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=40;PP=1639;SC=GCCAGCCCTACAGAAAGCAAT;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=85;WE=106742147;WS=106742129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	106742177	rs3739137	T	A	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=48;PP=1662;SC=TGAATTTACATGTGCAGGCAC;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=83;WE=106742185;WS=106742167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	106780015	rs3910716	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=5;PP=355;SC=AATGCGTATACAGACATTTAT;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=106780023;WS=106780005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	106780055	rs10631203	C	CTG	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=991;SC=AGCAAACAAACAGAATTAATT;SOR=1.536;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=20;WE=106780063;WS=106780045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	106782398	rs4851115	C	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=753;SC=CAAGAACCCACTTTTGTTTTA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=106782406;WS=106782388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	106810727	rs7604916	A	G	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=70;PP=2041;SC=CCAGGGCCCTACCGCGCGGGG;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=100;WE=106810741;WS=106810717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	106810793	.	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=0.994;SC=CGAGAGCCCCGCCTCCTGCCG;SOR=0.793;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=106810801;WS=106810783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	106992845	rs56959583	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.56;MQRankSum=-1.358;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	106992952	rs4641931	A	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.641;NF=26;NR=15;PP=657;ReadPosRankSum=0.896;SC=CATCTGACCTATGTGGGCAAA;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=41;WE=106992971;WS=106992942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr2	106992963	rs11464214	A	AG	3551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=36;PP=2963;SC=TGTGGGCAAAATTCCTGTGCT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=106992971;WS=106992942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	107007576	rs60043380	A	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=710;ReadPosRankSum=-0.685;SC=ACCAAAATCCATGCTTCTCAA;SOR=2.274;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=31;WE=107007584;WS=107007566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr2	107107694	rs6543414	A	G	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.56;QD=30.03;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	107107765	rs6543415	C	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=33;PP=918;SC=GACCACCAGGCTTCAGTGTGC;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=107107773;WS=107107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	107118896	rs4340514	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.51;QD=28.54;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	107119136	rs4365459	G	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=324;SC=ATTTGCCTCAGAGAACCTGCG;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=107119144;WS=107119126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	107121040	rs146000492	T	TA	3790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=42;PP=1949;SC=AGACCCCATCTAAAAAAAAAT;SOR=1.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=88;WE=107121048;WS=107121030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	107123363	rs144897643	A	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQRankSum=-4.914;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr2	107423188	rs1470591	G	A	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CCTGGAAGCCGGGAAGAACCA;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=64;WE=107423196;WS=107423178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr2	107423395	rs1470590	T	G	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1383;ReadPosRankSum=-1.546;SC=TGGACATCATTATGAGGATTC;SOR=0.736;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=77;WE=107423403;WS=107423385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,86:0.57:152
chr2	107429801	rs6739022	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=103;SC=AGATAATTATCAAACCATTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=107429809;WS=107429791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	107446396	rs877693	T	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=625;SC=AAATCAGAAATACTTCTGGTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=107446404;WS=107446386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	107446430	rs935565	T	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=1084;SC=ATAAGGTATTTTCAACCTGTA;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=107446438;WS=107446420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	107446561	.	C	T	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=908;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TGAATCTTCTCTTTAGTGTTC;SOR=0.799;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=59;WE=107446569;WS=107446551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
chr2	107449174	rs115215441	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TTTTTAAAAATTGCATTTTAA;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=25;WE=107449182;WS=107449164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr2	108618540	rs3731683	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=0.478;SC=AATTGTTCCTGAAATCAAATT;SOR=1.222;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=26;WE=108618548;WS=108618530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr2	108625144	.	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AAAATGTAAGAACAGTTTCTT;SOR=0.507;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=18;WE=108625152;WS=108625134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	108863650	rs9646947	A	C	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1509;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CCAGATTCCCAATGGCGAAGA;SOR=0.637;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=173;TCF=101;TCR=72;TR=99;WE=108863658;WS=108863640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,113:0.52:218
chr2	108863767	rs9308806	A	C	5496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=96;PP=2965;SC=GGGAAAAAGTATGTAATTTCC;SOR=0.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=168;WE=108863775;WS=108863757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	108863898	rs10209928	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=405;ReadPosRankSum=0.787;SC=ATAAATGAAGCATGATTGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=18;WE=108863906;WS=108863888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	108875093	rs2198463	T	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=-1.357;SC=ACCAGAACGATAGTTACAGAA;SOR=2.139;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=13;WE=108875101;WS=108875083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr2	108875198	rs2219078	G	A	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=970;ReadPosRankSum=-0.007;SC=AGTTGTTGGCGGGTCCTGGTT;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=58;WE=108875206;WS=108875188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr2	108875244	rs6722745	T	C	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.501;SC=GCAAAAGACATGCACCGGATC;SOR=0.692;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=104;TCR=64;TR=85;WE=108875252;WS=108875234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,99:0.51:193
chr2	108875464	.	AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT	A	2814.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.203;NF=7;NR=20;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.775;SC=ATTCTTGGAGAAAACTTGGTC;SOR=0.760;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=27;WE=108875493;WS=108875454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,76:0.41:184
chr2	108875471	rs13385082	G	T	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=78;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.147;NF=31;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=1.880;SC=GAGAAAACTTGGTCAGGTGAT;SOR=0.654;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=84;WE=108875493;WS=108875454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,102:0.57:178
chr2	108876948	rs4141931	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=494;SC=GTGGGTAGGCCTAGGAACCAT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=108876956;WS=108876938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	108877062	rs4141932	T	A	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=42;PP=2091;SC=TACTGTGGCTTTGAATGAGAA;SOR=1.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=108877081;WS=108877052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	108877316	rs4141933	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GTTACTCCAGTAAATAAAATA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=108877324;WS=108877306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	108915136	rs7590599	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=259;ReadPosRankSum=-1.267;SC=CTGCCCCTGGTCTTCTTTGCA;SOR=1.148;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=18;WE=108915144;WS=108915126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr2	108915263	rs4149422	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TTTTCCCTCACTTGTTTTGTA;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=18;WE=108915271;WS=108915253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr2	108924707	.	T	TA	897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=875;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GAGTCAGGTATGTGGACAGGC;SOR=0.813;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=24;WE=108924715;WS=108924697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr2	108994808	rs1402467	C	G	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1603;ReadPosRankSum=0.659;SC=CCTTACACGACATGGAGGATT;SOR=1.067;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=211;TCF=116;TCR=95;TR=93;WE=108994816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,102:0.41:250
chr2	108998301	rs77662685	C	T	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1573;ReadPosRankSum=0.418;SC=GACTCATCAACGATTTCCTTT;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=105;TCR=106;TR=102;WE=108998309;WS=108998291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,124:0.49:254
chr2	108998797	rs145051924	A	AG	1633.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=-2.120;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr2	108998798	rs4149434	T	A	3059.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.21;ReadPosRankSum=-2.430;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,90:0.54:168
chr2	108999786	rs4149436	T	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=531;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TAATGGAACATTCTCACTTCT;SOR=0.700;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=34;WE=108999794;WS=108999776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr2	109065858	rs2460947	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=26;PP=668;SC=CCCGCGCTGCTGTCGCCTCCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=109065866;WS=109065848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	109069008	rs2683797	T	C	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=52;PP=1993;SC=GGCTTTCTGTTTCTGTTCTAC;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=109069016;WS=109068998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	109088593	rs111860015	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-1.173;SC=TTTGAATTCTATTGTTTCAAA;SOR=0.668;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=15;WE=109088601;WS=109088583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr2	109089404	rs2243888	C	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=356;SC=ACAGATTCTTCTTAGTGTTAG;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=109089412;WS=109089394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	109098998	rs2577615	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=1.290;SC=TAAGAGTAGCATTTATGAATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=109099006;WS=109098988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	109099385	rs2577614	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=337;ReadPosRankSum=-1.251;SC=ATCCACCCGCCTCGGCCTCCC;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=21;WE=109099393;WS=109099375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	109099477	rs2577613	A	G	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=39;PP=1726;SC=CCTTTTTAATATTGGTTGGGT;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=109099485;WS=109099467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	109099572	rs2718698	C	G	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=38;PP=1288;SC=ACTTCAAAAGCAAAAGAAACA;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=109099580;WS=109099562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	109103012	rs41280574	C	T	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1353;ReadPosRankSum=-2.692;SC=AATCCACGAGCACCTGAAAAC;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=192;TCF=90;TCR=102;TR=86;WE=109103020;WS=109103002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,108:0.45:241
chr2	109109325	rs143344405	TAAGA	T	862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=683;ReadPosRankSum=1.683;SC=CACAAATTCATAAGAAAGAAA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=16;WE=109109336;WS=109109315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	109123996	rs2577596	T	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=0.916;SC=TTCTTTTTTTTTTTGTTTTAC;SOR=0.122;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=109124004;WS=109123986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	109150866	rs375814245	C	G	168.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=4.228;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=0.728;SC=CTTCCCCCCCCTCCCGCGCCC;SOR=2.833;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=109150874;WS=109150856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	109150984	rs143715745	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CGGGAGACGAGGGGCTGAGAG;SOR=1.058;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=20;WE=109150992;WS=109150974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr2	109151155	rs368878460	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	109292280	rs7584953	T	C	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=27;PP=2080;SC=CTAGCCCCATTGGTTGGCCAC;SOR=1.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=72;TCR=27;TR=99;WE=109292288;WS=109292270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	109389463	rs826580	G	A	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=39;PP=1397;SC=GAAATGGGGAGGACTTTCAAT;SOR=1.048;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=109389471;WS=109389453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	109392302	rs61758804	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=549;ReadPosRankSum=1.302;SC=TACCAAATCCATTAGTTCACC;SOR=0.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=39;WE=109392310;WS=109392292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr2	109393522	rs58272304	TG	T	1060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=1087;SC=CTCTAGGTCCTGGGGTAAAGC;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=27;WE=109393530;WS=109393512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	109411248	rs111234702	GAATAT	G	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=674;SC=TACGAAATTTGAATATAATAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=109411260;WS=109411238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	109429146	rs975597	T	A	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=18;PP=801;SC=GAGTTCAAGCTCGTTTAGATA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=109429154;WS=109429136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	109490104	rs6737810	A	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=583;SC=TGATCATTTAAACCAGGGGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=109490112;WS=109490094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	109513321	rs7607563	C	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=710;SC=CCCTCGTTGGCTCCTTGGCTT;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=109513329;WS=109513311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	109513654	rs12623957	G	A	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=104;PP=2965;SC=TCTTCTCGAGGCAATCAAATG;SOR=1.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=75;TCR=104;TR=179;WE=109513662;WS=109513644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	109513786	rs3789738	A	T	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	109522720	rs260639	G	A	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=33;NR=16;PP=906;SC=CCTTCATGTCGGTGGGGTGGG;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=109522728;WS=109522710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	109526969	rs260632	G	A	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=25;PP=1012;SC=CATCCTTCTCGGAGAACATCA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=109526977;WS=109526959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	109527087	rs260631	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=554;SC=AGAGCTGCCCGGTGTCTGTGT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=109527095;WS=109527077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	109527373	rs260630	A	G	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=37;PP=1872;SC=GAGTCCAGGAAGCAGGGCACC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=109527381;WS=109527363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	109539653	rs260643	A	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=227;SC=TGTGGCAAACATCCCTCCCTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=109539661;WS=109539643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	109745782	rs200435574	TGGCCGGTCCCCGCCACGCA	T	1744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=2928;SC=CGGGCTCGGCTGGCCGGTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=16;WE=109745808;WS=109745772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	109929958	rs6748434	A	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=1040;SC=TTGCTGGGTGAGCGCTGTACC;SOR=1.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=51;WE=109929966;WS=109929948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	109988215	rs11680644	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=1.426;SC=ACCTGACCTTCAAGCCCCTTT;SOR=1.473;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=109988223;WS=109988205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	110053248	rs7369523	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=1.769;SC=TGGCCTTCATCTCTTAAAGCC;SOR=0.048;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=110053256;WS=110053238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	110342655	rs369594263	G	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=599;ReadPosRankSum=1.108;SC=TAAGGCGAATGTCTTGAAATA;SOR=0.555;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=37;WE=110342663;WS=110342645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,45:0.39:116
chr2	110372192	rs6594048	A	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=937;SC=GGGGCGCCCTAGGCGGCGAAC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=110372200;WS=110372182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	110373197	rs1560884	G	A	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1606;ReadPosRankSum=0.590;SC=GTGGGAAAAAGGCCTCCCAGT;SOR=0.789;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=90;WE=110373205;WS=110373187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,99:0.52:192
chr2	110855123	rs2004273	G	T	7209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=127;NR=87;PP=2965;SC=AGGGGCTGCTGCAGGGGCCGG;SOR=1.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=127;TCR=87;TR=214;WE=110855131;WS=110855113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	110873470	.	G	GA	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.7795;HP=14;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.63;NF=0;NR=7;PP=73;QD=11.0;SC=GCCTGGGAGGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=110873478;WS=110873460;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,7:0.54:13
chr2	110882699	rs2048243	A	G	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=908;ReadPosRankSum=2.347;SC=AAAGCCAAGAAGATTTTCCAT;SOR=0.501;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=56;WE=110882707;WS=110882689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr2	110886686	rs3838315	A	AGACCAGAT	1606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.124;NF=13;NR=14;PP=2109;ReadPosRankSum=1.004;SC=AAAAAGGCCTAGACAGAACTC;SOR=1.077;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=27;WE=110886694;WS=110886676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr2	110889108	rs11240790	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TGAAGATGTCCCATAAGTAAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=110889116;WS=110889098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	110905664	rs1509417	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=1.204;SC=GGGGTTTGATGTGGTTTGAAT;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=12;WE=110905672;WS=110905654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr2	110919041	rs3817140	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.705;SC=AGTTATAAAAATATCGCTATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=110919049;WS=110919031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	110919321	rs2271244	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=411;ReadPosRankSum=-0.496;SC=AAAGAAACTCCAAATCAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=25;WE=110919329;WS=110919311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr2	110922703	rs11675767	C	T	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=1832;ReadPosRankSum=-1.347;SC=CTTCACTTGACTCTTGGCCTT;SOR=0.652;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=241;TCF=105;TCR=136;TR=117;WE=110922711;WS=110922693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,133:0.47:283
chr2	110959898	rs11240794	C	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=683;ReadPosRankSum=0.760;SC=AGTTTCTTCTCTACTCTTGCA;SOR=0.447;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=44;WE=110959906;WS=110959888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr2	111058854	rs190352639	G	A	169.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.48;QD=21.22;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	111058957	.	A	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=33.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	111406724	rs34802999	T	TCA	655.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=821;ReadPosRankSum=0.316;SC=AATAGGAGAATCACACACACA;SOR=0.631;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=15;WE=111406732;WS=111406714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr2	111413505	rs75153987	G	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=710;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TATAACAGAAGATGAAATGAA;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=44;WE=111413513;WS=111413495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr2	111644475	rs10188079	C	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=30;PP=974;SC=TACGCTTGCTCGTGAAATCAG;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=111644483;WS=111644465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	111644491	rs66815319	TA	T	1337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.53;NF=2;NR=27;PP=1270;SC=ATCAGCCACTTAACTGTTCTG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=29;WE=111644499;WS=111644481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	111721142	rs200046640	ATGTGTG	A	1578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.802;NF=17;NR=5;PP=947;ReadPosRankSum=0.324;SC=CAAATTTGAAATGTGTGTGTG;SOR=1.217;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=22;WE=111721155;WS=111721132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr2	111753449	rs3761707	G	C	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1243;ReadPosRankSum=0.128;SC=AATAATGATGGTCACCGTGAT;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=113;TCR=54;TR=73;WE=111753457;WS=111753439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,76:0.44:173
chr2	111789092	rs3789090	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=410;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TCTGCACTGTGTCCATGCTTA;SOR=0.400;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=22;WE=111789100;WS=111789082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr2	111851198	rs67248863	A	T	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.355;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.087;NF=6;NR=35;PP=820;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TCCCAGCACTATGGGAGGCTG;SOR=0.466;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=41;WE=111851206;WS=111851188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr2	111886332	rs13429049	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CTCATGATACCTTTTTATAGC;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=10;WE=111886340;WS=111886322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	111907691	rs724710	T	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=743;ReadPosRankSum=0.323;SC=TGCGGCGTATTGGAGACGAGT;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=48;WE=111907699;WS=111907681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,55:0.52:106
chr2	111909247	rs3789068	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GTTCTTCAGTATGGAATTTCT;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=8;WE=111909255;WS=111909246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	112528507	.	G	A	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=44.21;NF=6;NR=0;PP=60;QD=15.7952020912;SC=ATTATGTTTCGTAATTTTTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=6;WE=112528515;WS=112528500;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,6:0.25:24
chr2	112536264	rs76115652	G	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.59;QD=29.09;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	112541814	.	T	A	389	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=45.38;NF=22;NR=2;PP=389;QD=17.6571338561;SC=TGAAGAAAGCTGAGGCTTTTA;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=86;TCF=71;TCR=15;TR=24;WE=112541822;WS=112541804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:62,24:0.28:86
chr2	112545981	.	T	G	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=40.42;NF=0;NR=5;PP=42;QD=15.3542425094;SC=AGGAAACTGGTGTATAATAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=112545989;WS=112545971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,5:0.31:16
chr2	112582523	rs74602614	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=26;PP=1571;SC=CTAGTTAGGAGGTAACAAAGA;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=112582531;WS=112582513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	112590989	rs3761697	A	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=647;SC=AAAAACTTACATATGAGAAAG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=112590997;WS=112590979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	112605302	rs4848197	C	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.30;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	112605465	rs4848800	T	C	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=41;PP=1352;SC=GTAAATACGATACAAATGAAT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=112605473;WS=112605455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	112616040	.	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQRankSum=-2.562;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr2	112616059	rs183990854	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.55;MQRankSum=2.541;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr2	112625575	rs6742515	T	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=26;PP=1085;SC=AGAGCTTATCTAAAAGAATAT;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=50;WE=112625583;WS=112625565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	112630412	rs141064868	A	C	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=647;SC=AAAGTAACATAATCATTAAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=112630420;WS=112630402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	112641256	rs2037198	GA	AG	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=2153;SC=AGGCCAGTCTGAAAGCTGAGG;SOR=2.259;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=41;WE=112641265;WS=112641246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	112641283	rs12233011	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=722;SC=ATGGGATGCTACGCACAGCTC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=112641291;WS=112641273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	112686988	rs13027171	G	A	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1101;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGCTCAATCAGTGTACCTAAT;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=68;WE=112686996;WS=112686978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,83:0.47:175
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chr2	112752142	rs7592909	A	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=0.456;SC=GAGTTTGAGAACAACCTGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=112752150;WS=112752132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr2	112753097	rs6726639	A	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1180;ReadPosRankSum=-1.388;SC=TCCCAGTGACACTGAAACTTG;SOR=0.885;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=74;WE=112753105;WS=112753087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr2	112753781	rs34346510	TA	T	2277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.933;NF=5;NR=42;PP=1640;ReadPosRankSum=1.298;SC=TTACCACAGTTAAATAACACC;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=9;TCR=81;TR=47;WE=112753789;WS=112753771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr2	112753883	rs10173553	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=203;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GCTCTTCAGGCCACCAACCAT;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=112753891;WS=112753873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr2	112753950	rs13003919	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=129;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TCTTTCAAAGGCTGTTGTGAT;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=7;WE=112753958;WS=112753940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	112754720	rs4848238	A	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTAGTTTCCCATCAGTTATTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=112754728;WS=112754714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	112754880	rs3811633	G	A	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1057;ReadPosRankSum=1.033;SC=CCCATGACTGGTCTATTGGTA;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=68;WE=112754888;WS=112754870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,83:0.66:125
chr2	112754943	rs3811634	C	T	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1399;ReadPosRankSum=-1.935;SC=CGCCTGGCAACGCAGATCCTG;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=80;WE=112754951;WS=112754933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,91:0.56:163
chr2	112755001	rs2230515	A	G	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=859;ReadPosRankSum=1.402;SC=GATTGGGTTGATTTTATACAT;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=62;WE=112755009;WS=112754991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr2	112761653	rs4848933	C	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=519;ReadPosRankSum=0.895;SC=AATCTCAGTTCCCAGTGGGCC;SOR=0.489;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=26;WE=112761661;WS=112761643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr2	112765973	rs1131244	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=252;ReadPosRankSum=0.007;SC=ACAACTCTTCACAGCGGGAGA;SOR=1.255;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=21;WE=112765981;WS=112765963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr2	112766262	rs10210692	A	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=640;ReadPosRankSum=0.726;SC=GGACGCTGATAGGCTCAGGAA;SOR=0.919;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=45;WE=112766270;WS=112766252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,48:0.38:126
chr2	112770770	rs4374383	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=223;ReadPosRankSum=0.453;SC=CAACATGAGTACTAACCGTAG;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=16;WE=112770778;WS=112770760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr2	112770798	rs4500955	T	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=358;ReadPosRankSum=-0.424;SC=AGGCTGCAGCTGCATCACACA;SOR=1.204;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=23;WE=112770806;WS=112770788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr2	112773366	rs6710591	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=264;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TCTAAAGATTATGTTCTTTTA;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=17;WE=112773374;WS=112773356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr2	112773528	rs111619827	TCTTGTAC	T	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=535;ReadPosRankSum=0.753;SC=ATTGAGTTGCTCTTGTACCTT;SOR=0.693;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=10;WE=112773542;WS=112773518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
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chr2	112785775	rs4848958	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.023;SC=GTTGTATAAATATTAGGCCAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=112785783;WS=112785765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr2	112832684	rs6542026	G	A	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=103;SC=ATTTAAAACCGTATGTTTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=112832692;WS=112832674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr2	112856165	rs4849007	C	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=591;ReadPosRankSum=-0.277;SC=AATTGTCCTTCTTTTAGGATT;SOR=0.577;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=44;WE=112856173;WS=112856155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr2	112858122	rs4848272	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-0.625;SC=ATTTTTTATACAATGGCTTTT;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=112858130;WS=112858112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	112865517	rs7562848	G	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=22;PP=741;SC=CCTCGTACTTGCATGTACTTG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=112865525;WS=112865507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	112896112	rs144500920	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=1.550;SC=CCTGCCCCAGCCGCCCCCCGG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=112896120;WS=112896102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	112917102	rs1320360	G	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=979;SC=TGTACTTGGGGCTGTCCAGCG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=112917110;WS=112917092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	112945188	rs4848281	T	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=345;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GTTCCCGCCCTCTCACCAGTG;SOR=2.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=19;WE=112945196;WS=112945178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr2	112945220	rs11123130	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=0.726;SC=CTAGGGCAGCGTTGCACGGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=112945228;WS=112945210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	112990804	rs143473380	T	TATAAAGA	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-1.290;SC=TGTAAATATTTATAAAGTCAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=112990812;WS=112990794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	112991098	rs11687980	C	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TAAATTATAACCACATCACAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=112991106;WS=112991088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	112995810	rs2254860	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TAAAGTGCAAAGAAAAATCCT;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=112995818;WS=112995800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	113089267	rs7601200	T	C	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=1147;ReadPosRankSum=1.629;SC=TTCATCAAAATACAGTGTCCA;SOR=0.844;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=69;WE=113089275;WS=113089257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,82:0.49:169
chr2	113090047	rs4578863	T	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=382;ReadPosRankSum=0.797;SC=TTGATCCAACTGCTTCACCAT;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=39;WE=113090055;WS=113090037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr2	113240183	rs3811038	T	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=1.572;SC=ATACATTTTCTCCTCTGTCGC;SOR=0.054;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=18;WE=113240191;WS=113240173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	113258671	rs62157516	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.246;NF=11;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=-0.031;SC=AAAGGTGAGCGGGACATTGAA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=11;WE=113258679;WS=113258661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	113258916	rs17846193	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.580;NF=4;NR=18;PP=384;ReadPosRankSum=-0.078;SC=AGTTTGACATCCGGTAATGCA;SOR=0.941;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=22;WE=113258924;WS=113258906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr2	113300330	rs4849071	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TATGACCCCAGATGCATGTGC;SOR=0.997;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=16;WE=113300338;WS=113300320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr2	113305150	rs11123139	G	C	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=42;PP=976;ReadPosRankSum=0.904;SC=CAGAGGTAATGACGGGCGTCC;SOR=0.317;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=102;TCF=18;TCR=84;TR=54;WE=113305158;WS=113305140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,63:0.53:119
chr2	113308516	rs2304555	T	A	6151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=99;PP=2965;SC=AAAATGGCACTGTTATGTTGA;SOR=0.816;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=86;TCR=99;TR=185;WE=113308524;WS=113308506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
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chr2	113309473	rs1545133	C	T	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=60;PP=1936;ReadPosRankSum=1.309;SC=GAGGGTTGTTCGACACAAAAA;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=247;TCF=137;TCR=110;TR=131;WE=113309481;WS=113309463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,155:0.51:304
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chr2	113310197	rs11351307	CT	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=1.735;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
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chr2	113326502	rs13010814	C	T	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=62;PP=1877;SC=GATGATGTTACAGTCACAATC;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=113326510;WS=113326492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	113344047	rs752992	T	C	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=84;PP=2909;SC=CCCCACCCCATCACCACACAG;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=135;WE=113344055;WS=113344037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	113346413	rs3748024	C	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=369;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AGAGGAGGTGCTACTAGATGT;SOR=1.153;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=22;WE=113346421;WS=113346403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr2	113346480	rs41278942	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=350;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CTCCTCTGACGGCAGGAAAAC;SOR=0.747;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=24;WE=113346488;WS=113346470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	113346512	rs1047652	A	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=24;PP=970;SC=GACTGCCCCCACGCCCCTCCC;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=113346520;WS=113346502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	113404708	rs4849091	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=631;ReadPosRankSum=0.344;SC=CTCAAGGGCTGCTGATGGCCG;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=42;WE=113404716;WS=113404698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr2	113479745	rs34781106	AC	A	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=1239;SC=GTGCCCCCCGACCCCCCGTCT;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=39;WE=113479753;WS=113479735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	113480556	rs34912983	GC	G	1696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=6;PP=2047;SC=CCCAGTGAAGGCCCCAGTGTG;SOR=3.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=54;WE=113480564;WS=113480546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	113480938	.	G	GCA	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=11.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.452;NF=2;NR=2;PP=230;ReadPosRankSum=0.852;SC=GGGTACACATGCACACACACA;SOR=2.430;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=4;WE=113480946;WS=113480928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	113481547	rs2063919	A	G	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=46;PP=2576;SC=AGGCCTCAGAAGAATGAGCAA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=116;WE=113481555;WS=113481537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	113482779	rs4849116	A	C	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=53;PP=2642;SC=GTGGGCACCTACACAGGGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=113482787;WS=113482769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	113484319	rs2138604	G	A	5861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=113;PP=2965;SC=GATCCAGGTGGGAGCTGGGTG;SOR=1.201;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=68;TCR=113;TR=181;WE=113484327;WS=113484309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr2	113484353	rs2138605	A	G	4053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=86;PP=2704;SC=CAGGCCCAGCAGGGGCGGAGC;SOR=1.626;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=39;TCR=87;TR=125;WE=113484361;WS=113484343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	113498566	rs3811040	A	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=51;PP=1654;SC=TTCAGCAACTAAAGAGTCAGA;SOR=2.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=113498574;WS=113498556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	113513825	rs6731822	T	C	7626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=132;PP=2965;SC=CTCTGGCTTATGGCTTTTGAC;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=118;TCR=133;TR=250;WE=113513833;WS=113513815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr2	113532885	rs3783550	G	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=817;ReadPosRankSum=-1.623;SC=GAACAAGATGGTAGAAAAAGG;SOR=1.420;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=45;WE=113532893;WS=113532875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr2	113535395	rs2071376	G	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-0.343;SC=TTCTCATAGAGCCTGCCTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=113535403;WS=113535385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	113535438	rs2071375	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=335;ReadPosRankSum=0.425;SC=GTGGGGTGGGCAGGTGGGGGC;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=19;WE=113535446;WS=113535428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	113537223	rs17561	C	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=477;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CTAAAAGGTGCTGACCTAGGC;SOR=0.270;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=30;WE=113537231;WS=113537213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr2	113540177	rs1894399	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=0.978;SC=GGTCTCTGGACCTCTAGTGAG;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=22;WE=113540185;WS=113540167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr2	113540205	rs1609682	G	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=616;ReadPosRankSum=0.824;SC=CAAAAGTATTGAAGATTCAAG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=40;WE=113540213;WS=113540195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr2	113670415	rs2708959	T	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTTGGTGCCTTTCTGGTTGCA;SOR=0.317;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=113670423;WS=113670405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	113670437	rs2723170	A	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=335;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CGAGCATTTCAAACTACAGAG;SOR=0.070;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=18;WE=113670445;WS=113670427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
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chr2	113670709	rs28947188	G	GT	587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.285;NF=1;NR=13;PP=531;ReadPosRankSum=-0.834;SC=GGGCCAAAGTGTAATTCCTAG;SOR=0.648;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=14;WE=113670717;WS=113670699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	113671198	rs2466448	T	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=481;ReadPosRankSum=0.567;SC=ATCCAGTTCATCTCTATTCTA;SOR=0.462;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=26;WE=113671206;WS=113671188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr2	113671303	rs3811045	T	C	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=1544;ReadPosRankSum=0.252;SC=TTAAATGGTCTTTGATACCCC;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=104;TCR=79;TR=101;WE=113671311;WS=113671293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,129:0.58:224
chr2	113671378	rs3811046	G	T	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=64;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GACCCGGCTGGAAGCCCCCTG;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=214;TCF=88;TCR=126;TR=105;WE=113671386;WS=113671368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,134:0.52:256
chr2	113671410	rs3811047	A	G	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=54;PP=1323;ReadPosRankSum=-2.069;SC=AAGCCTCCCCACCATGAATTT;SOR=0.868;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=166;TCF=63;TCR=103;TR=83;WE=113671418;WS=113671400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,99:0.52:191
chr2	113671518	rs3811048	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=-3.430;SC=TTACAGGGTGGGAGAATTGTA;SOR=0.040;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=13;WE=113671526;WS=113671508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr2	113672665	rs2723178	AC	GT	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=840;ReadPosRankSum=1.949;SC=AAGACCACTCACACCTTCAGA;SOR=0.864;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=22;WE=113672674;WS=113672655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr2	113672890	rs2708940	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=-1.834;SC=AGAGCATTTTCCAGTCTCACC;SOR=0.788;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=23;WE=113672898;WS=113672880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr2	113674709	rs2708943	C	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.190;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=2392;ReadPosRankSum=0.434;SC=GATCTAGGTCCAAAGGTGAAG;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=64;WE=113674729;WS=113674699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr2	113674721	rs2723183	A	G	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=2392;ReadPosRankSum=-0.399;SC=AAGGTGAAGAACTTAAACCCG;SOR=0.910;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=71;WE=113674729;WS=113674699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr2	113674887	rs2708944	G	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CCTCCTGCTAGGTGGGCTCAA;SOR=0.416;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=27;WE=113674895;WS=113674877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr2	113675269	rs2723187	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=215;ReadPosRankSum=-0.422;SC=AAAGGAAGTCCGATTCTCCTG;SOR=0.569;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=16;WE=113675277;WS=113675259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr2	113675428	rs2723189	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AATGCCTCTCGCTTTCCTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=113675436;WS=113675418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	113676219	rs2708947	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=0.903;SC=GGTGGGCTCCTGGAACATGCT;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=23;WE=113676227;WS=113676209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr2	113676381	rs2723192	G	A	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TGAGGTCAGCGATTAGGAAAC;SOR=1.092;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=69;WE=113676389;WS=113676371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,88:0.44:201
chr2	113763463	rs2305152	A	C	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=996;ReadPosRankSum=1.971;SC=AAAAAGGTAAAGATCCTCGTG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=70;WE=113763471;WS=113763453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,93:0.49:189
chr2	113763575	rs895497	A	G	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=64;PP=2180;SC=ACACCTCAGCAGGGGAGCATT;SOR=1.107;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=111;WE=113763583;WS=113763565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	113783570	rs13030063	C	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=490;SC=CTTAGACCTGCCATGGGTGAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=113783578;WS=113783560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	113783909	rs6744874	A	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=336;SC=AAAGGCCTGCATACAGCATGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=113783917;WS=113783899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	113785020	rs12711747	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=603;SC=TTAGGATTAGAAAGACATGCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=113785028;WS=113785010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	113785202	rs11673918	G	A	7321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=112;PP=2965;SC=TTGGGGGGTTGACTAAACTGG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=122;TCR=112;TR=234;WE=113785210;WS=113785192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr2	113785727	rs1562304	A	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.19;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	113786833	rs3948121	C	G	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=289;SC=CCCCAGTTGTCACCAGGACAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=113786841;WS=113786823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	113789316	rs2305150	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=16;PP=818;SC=GTGAAGAGAACAAGATAGATC;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=113789324;WS=113789306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	113816940	rs2278716	C	G	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	113816940	.	CCA	GCC	1583	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=24;NR=18;PP=1583;QD=38.9635208301;SC=CAGACCCCAGCCAACTCAGCC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=42;WE=113816950;WS=113816930;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr2	113816942	rs2278717	A	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	113818632	rs2251872	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=504;SC=CCCAGGCATTGGGGCAGCACA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=113818640;WS=113818622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	113818702	rs2515395	G	C	163.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=108;SC=TGAAGACACAGGCTCTGGGGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=113818710;WS=113818692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	113819614	rs2252007	T	C	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=19;PP=1499;SC=CAGGCCGTCTTACAGCAGTCC;SOR=1.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=113819622;WS=113819604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	113830173	rs3811050	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=0.272;SC=CAATTATAGACGAATGGCCTG;SOR=0.204;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=113830181;WS=113830163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	113830201	rs3811051	T	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=683;SC=CGTGCAGCCCTTGGCTGAGTG;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=113830209;WS=113830191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	113830563	rs12469822	G	A	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=130;SC=CAAAAAGTCTGTAAGTGGAGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=113830571;WS=113830553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	113830582	rs4849150	A	C	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=41;SC=GTGTTATTAAACCCATTTTAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=113830590;WS=113830572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	113832312	rs6761276	T	C	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=40;PP=1386;SC=AAGATCTGCATACTTCCTAAC;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=113832320;WS=113832302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	113832333	rs6743376	C	A	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=30;PP=947;SC=AGAGGCTTGGCCCGCACCAAG;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=113832341;WS=113832323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	113832981	rs13005572	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=464;ReadPosRankSum=-1.431;SC=GCCCCCAAACCAAGCTCATCC;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=31;WE=113832989;WS=113832971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr2	113875509	rs2234677	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=1.114;SC=CCCAGGTACTGCCCGGGTGCT;SOR=1.688;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=6;WE=113875517;WS=113875499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	113875565	rs2234678	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=277;ReadPosRankSum=0.123;SC=GGAAGACCTCAGAAGACCTCC;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=17;WE=113875573;WS=113875555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr2	113875584	rs2234679	G	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=447;ReadPosRankSum=0.054;SC=CCTGTCCTATGAGGCCCTCCC;SOR=0.667;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=22;WE=113875592;WS=113875574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr2	113875631	rs16065	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=549;ReadPosRankSum=0.427;SC=TCTCATTTTTTCACCTGAGAA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=34;WE=113875639;WS=113875621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr2	113875753	rs4251969	C	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-2.162;SC=TCTGGGGGATCTGGGCACGGG;SOR=0.573;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=12;WE=113875761;WS=113875743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr2	113875773	rs4251970	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=0.305;SC=GGAGGCATCCATGGGAGACCA;SOR=0.648;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=9;WE=113875781;WS=113875763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr2	113877495	rs928940	G	T	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=580;SC=GTGCATACTCGGACTGGAAAC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=113877503;WS=113877485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	113877538	rs4251986	G	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.883;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr2	113877713	rs878972	A	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.039;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=219;ReadPosRankSum=-1.105;SC=AGGGTAAATTATTTTTAGGAT;SOR=0.120;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=14;WE=113877721;WS=113877703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr2	113887207	rs419598	T	C	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=66;PP=1554;ReadPosRankSum=0.124;SC=AACTAGTTGCTGGATACTTGC;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=276;TCF=126;TCR=150;TR=119;WE=113887215;WS=113887197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,138:0.41:340
chr2	113887262	rs423904	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=51;PP=2946;ReadPosRankSum=1.079;SC=GCCAGGAAAGCCAATGTATGT;SOR=0.715;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=175;TCF=59;TCR=116;TR=79;WE=113887281;WS=113887252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,93:0.43:215
chr2	113887273	rs446433	G	A	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=2946;ReadPosRankSum=0.486;SC=CAATGTATGTGGGCATCACGT;SOR=0.706;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=155;TCF=51;TCR=104;TR=71;WE=113887281;WS=113887252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr2	113887294	rs495282	G	C	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.487;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=842;ReadPosRankSum=1.308;SC=CACTTTGCCCGTCTGTCTGCA;SOR=0.375;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=55;WE=113887302;WS=113887284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr2	113887338	rs495410	A	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=416;ReadPosRankSum=0.782;SC=CCCTAGGTGCAATGTCCTAAT;SOR=1.956;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=20;WE=113887346;WS=113887328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr2	113888557	rs451578	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=232;ReadPosRankSum=-0.354;SC=AAAAATACCCGGGGTCTCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=14;WE=113888565;WS=113888547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr2	113888579	rs432014	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=322;ReadPosRankSum=0.815;SC=TTATTGCTGCTTCCTCTTCTA;SOR=1.002;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=20;WE=113888587;WS=113888569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr2	113888793	rs454078	A	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=-2.211;SC=AAACAACCAAAATTTTTTCTT;SOR=1.102;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=47;WE=113888801;WS=113888783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,57:0.38:149
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chr2	113940681	rs3748914	T	C	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=954;ReadPosRankSum=0.854;SC=AAGACAGCAGTGAGCCTGAGG;SOR=1.612;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=54;WE=113940689;WS=113940671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,63:0.55:114
chr2	113940839	rs4849167	G	C	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.337;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1574;ReadPosRankSum=-1.040;SC=TTTTCCTGGGGGGCTTCAGAC;SOR=0.797;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=233;TCF=117;TCR=116;TR=110;WE=113940847;WS=113940829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,132:0.47:281
chr2	113942903	rs1975535	A	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=467;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CTCTCTGTGTATCCAGGGCTC;SOR=0.335;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=28;WE=113942911;WS=113942893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr2	113943470	rs2241976	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=723;ReadPosRankSum=1.244;SC=GGGAGGGTGGACACCCCCAGG;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=54;WE=113943478;WS=113943460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,56:0.41:137
chr2	113953401	rs923693	A	G	4641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=58;PP=2858;SC=CTGTCTTTGGACTGTCCTCCC;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=132;WE=113953409;WS=113953391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	113953508	rs6755077	G	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=595;ReadPosRankSum=0.098;SC=GCATAGAGGAGCCCAAGTAAT;SOR=1.051;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=34;WE=113953516;WS=113953498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr2	113953657	rs4849169	A	C	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.555;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=848;ReadPosRankSum=-1.043;SC=AGGCTCTGGGAGGCAATGGAT;SOR=1.239;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=56;WE=113953665;WS=113953647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,58:0.40:144
chr2	113953952	rs4848318	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=181;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CCTGTGCCGATGCATGCACAG;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=13;WE=113953960;WS=113953942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	113953973	rs71385890	A	AT	298.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=3.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	113953974	rs10579377	GACA	G	298.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=3.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	113953984	rs7603621	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	113955074	rs902695	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=648;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GCACACTTGCGTGTGTCTGAG;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=39;WE=113955082;WS=113955064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr2	113956371	rs2276561	G	C	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1511;ReadPosRankSum=0.209;SC=CTGCGGCCACGCACTCCGCGC;SOR=0.625;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=93;WE=113956379;WS=113956361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,105:0.56:189
chr2	113956821	rs2305133	C	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=1354;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GCCGAGCCCACCTCCCCGCCG;SOR=0.320;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=31;WE=113956839;WS=113956811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr2	113956831	rs45587631	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=1201;ReadPosRankSum=1.733;SC=CCTCCCCGCCGCTGCGCAGCG;SOR=1.060;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=27;WE=113956839;WS=113956811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr2	113977862	rs4849175	T	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=153;SC=CAGGAATGGTTGGGGAGACAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=113977870;WS=113977852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	113984503	rs2241975	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GGTAATGTAGCAGGCCTGGGA;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=113984511;WS=113984497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	113994079	rs77270532	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGCCCGCCTCTCCTCTCCAG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=113994087;WS=113994073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	113994417	rs1110839	G	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=587;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GGTCCTCATCGCCCCCTTCTT;SOR=1.524;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=32;WE=113994425;WS=113994407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr2	114000458	rs902691	C	A	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=569;SC=TGGGTATCTCCAAGGCACTTG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=114000466;WS=114000448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	114386338	rs149500718	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.67;MQRankSum=-1.526;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	114387907	rs1964835	C	T	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.527;NF=11;NR=43;PP=989;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GACTCAAGAACTACTGCCAAT;SOR=1.127;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=22;TCR=74;TR=54;WE=114387915;WS=114387897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr2	114387950	rs1040646	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.857;NF=0;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=0.556;SC=ATCTAAACTCGGTTGGGCTAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=114387958;WS=114387940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	114391721	rs793079	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.478;NF=25;NR=13;PP=520;ReadPosRankSum=-0.544;SC=CTCCTTAACCTGAGTGCAGTC;SOR=1.111;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=38;WE=114391729;WS=114391711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr2	114392640	rs201528381	CG	C	1189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.602;NF=8;NR=21;PP=934;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TTTTGGGACACGGCAGGCCAG;SOR=0.709;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=29;WE=114392648;WS=114392630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr2	114392716	rs146907164	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.554;NF=9;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=0.022;SC=TGGTACGAGACGGTGGGGAGG;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=26;WE=114392724;WS=114392706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
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chr2	114480812	rs3835109	A	AAAC	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=167;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTAAAAAATTAAACCAAAGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=114480820;WS=114480802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr2	114493509	rs142249018	CT	C	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=457;ReadPosRankSum=1.074;SC=TCAGAATTCCCTTTTTTGTTC;SOR=0.559;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=18;WE=114493517;WS=114493499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr2	114501112	rs3748906	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=258;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TGAAATAATACAAAAATGATT;SOR=0.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=16;WE=114501120;WS=114501102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr2	114513787	rs4538208	C	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=345;ReadPosRankSum=-1.689;SC=CGCAGGGCTCCGGCGCCCCTG;SOR=0.538;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=23;WE=114513795;WS=114513777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr2	114513901	rs4321376	C	T	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=986;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GCACTCCGTCCCGGTTTGGGC;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=62;WE=114513909;WS=114513891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr2	115919677	rs7557011	CT	GC	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=11;PP=858;SC=CCGCCTCCCGCTTCCCAGGCT;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=18;WE=115919686;WS=115919667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	116066984	rs975453	G	A	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=28;PP=770;SC=TGATAATTTCGCATTCAAATG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=116066992;WS=116066974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	116099725	rs843403	A	T	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1364;SC=CAAACTCATTAAGCACTCTCT;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=116099733;WS=116099715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	116497479	rs1550854	A	G	3408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=78;PP=2220;SC=GGTAAGTAACATGGAAGTACT;SOR=1.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=32;TCR=78;TR=110;WE=116497487;WS=116497469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	116497528	rs1550853	A	G	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=47;PP=1349;SC=GTGACTTGACAGATGGTATTC;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=116497536;WS=116497518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	116510817	rs2053724	G	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=730;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GTTAAACCGAGCTCAGAACAT;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=46;WE=116510825;WS=116510807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr2	116525960	rs1446495	G	A	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=47;PP=1586;SC=ATTTCACCACGTAGCTATGTT;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=116525968;WS=116525950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	116534922	rs1374271	A	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=591;ReadPosRankSum=0.976;SC=AGCGTTGTCAAATGCCATCTT;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=37;WE=116534930;WS=116534912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,41:0.39:105
chr2	116539846	rs36082071	GA	G	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.792;NF=7;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CATTTGGGGGGAAAAAACTAT;SOR=0.793;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=9;WE=116539854;WS=116539836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	116548526	rs6735355	A	G	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=173;SC=TAGTAATTCAAAAGAGAAATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=116548534;WS=116548516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	116548820	rs3738879	C	T	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=20;PP=774;SC=GTTTTACCTGCAAATGACTCT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=39;WE=116548828;WS=116548810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	116593675	rs10549769	ATG	A	943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=32.54;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	116593695	rs34212292	GAT	G	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQRankSum=0.578;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr2	116598546	rs272011	G	A	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=253;SC=CTCTGTTCCTGATTACACCGA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=116598554;WS=116598536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	116599659	rs272010	A	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=785;SC=AACTTAGAGTAGAATTAGGTT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=116599667;WS=116599649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	116599927	rs272009	T	C	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=48;PP=1291;SC=AATAATGGACTGTATTTATAC;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=116599935;WS=116599917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	118572471	rs3755492	A	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.360;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=885;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GGCTCAGAAGACCCACGCGCG;SOR=2.066;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=47;WE=118572479;WS=118572461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr2	118575215	rs1052637	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=1.737;SC=ACTGTATTAACCAATGGAGAA;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=17;WE=118575223;WS=118575205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr2	118575468	rs6737733	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=0.871;SC=TTGGCAGAAGCGGGGAGTCCA;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=118575476;WS=118575458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	118583940	rs2303348	C	T	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=885;ReadPosRankSum=0.106;SC=GTTTTCTTCGCTACTTGAAAC;SOR=0.731;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=56;WE=118583948;WS=118583930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr2	118688754	rs971754	T	C	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=50;PP=1601;SC=GAAATGGTGATGAAAAGACAT;SOR=1.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=118688762;WS=118688744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	118704478	rs7580124	T	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=58;PP=1657;SC=TGACATGAACTTTTACAAAAT;SOR=2.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=118704486;WS=118704468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	118704503	rs2303329	A	G	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=50;PP=1414;SC=ACAAGGAGTAATTAGACGCAA;SOR=3.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=58;WE=118704511;WS=118704493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	118705570	rs10186396	A	G	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=8;PP=737;SC=GCGCCTGGCCAAATCTGCTTT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=118705578;WS=118705560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	118706879	rs1035598	A	G	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=55;PP=2351;SC=AAAAATAAGCACATGCTGAAA;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=122;WE=118706887;WS=118706869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	118731573	rs748767	G	A	4623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=63;PP=2605;SC=AGACGGCTCTGCAAGTATATG;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=134;WE=118731581;WS=118731558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	118732975	rs6722547	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=503;SC=AGCAGCAGCATCCTGAGAGAG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=118732983;WS=118732965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	118735395	rs889899	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=255;SC=TTGCTCCCCAGTCTGTAGAGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=118735403;WS=118735385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	118752903	rs148615806	T	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=260;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCCATCTGAGTCTAGCTCCTA;SOR=0.435;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=18;WE=118752911;WS=118752893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr2	118753097	rs17584619	C	T	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=48;PP=1466;SC=CAAAACAGAGCGATTAAACAA;SOR=1.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=118753105;WS=118753087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	118753148	rs10633675	A	ATC	1211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1243;SC=CCACTCAGATATGTCTTATAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=118753156;WS=118753138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	118764242	rs34609704	C	CA	1993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=12;PP=1358;SC=ACACAGTAGACACTCAAAAGT;SOR=1.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=30;WE=118764250;WS=118764232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	118766024	rs10864966	A	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=6;PP=1595;SC=CAGACATGGAAGAAGTTAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=60;WE=118766032;WS=118766014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	118771663	rs12477588	A	G	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=45;PP=1600;SC=GGGGTGGAGTACAAAGCGGAA;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=118771671;WS=118771653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	118866033	rs11407321	G	GA	1756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=1534;SC=TGTATATATGGATAAATATAT;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=34;WE=118866041;WS=118866023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	119604255	rs79126103	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=563;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGCGCCTGGCGCCCGGGTGC;SOR=0.839;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=36;WE=119604263;WS=119604245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr2	119700096	rs2077344	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=1.087;SC=TTGCACGTAATCATCACTAAT;SOR=2.861;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=21;WE=119700104;WS=119700086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr2	119700116	.	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.327;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=-0.878;SC=TACTGTCTGGAGTGCTTCAAT;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=11;WE=119700124;WS=119700106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr2	119739127	rs10623500	C	CATTT	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.904;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.688;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	119739128	.	T	A	176	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=59.48;NF=9;NR=3;PP=176;QD=17.5642677123;SC=AGGTATTTCCTTTTTTTTTTT;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=12;WE=119739136;WS=119739118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,12:0.35:34
chr2	119739269	rs56216274	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=461;ReadPosRankSum=0.832;SC=ATCCCAGCTACGACTGTCCCT;SOR=0.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=31;WE=119739277;WS=119739259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr2	119748135	rs3835093	TC	T	2377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.156;NF=28;NR=40;PP=915;ReadPosRankSum=1.769;SC=TATTATCTCCTCCCCCCCCCC;SOR=0.516;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=68;WE=119748143;WS=119748125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,108:0.52:206
chr2	119749477	rs2304708	T	G	5913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=104;PP=2965;SC=CTGATTCCTTTGTTCTTAGGA;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=76;TCR=104;TR=180;WE=119749485;WS=119749467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr2	119749611	rs4848530	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=0.014;SC=TGTGCTGGGGCTTGCCCTAGG;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=20;WE=119749619;WS=119749601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr2	119915132	rs11308896	CG	C	2013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.34;NF=34;NR=12;PP=1658;SC=CGAGGGTTTACGGGGGCCGGT;SOR=2.494;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=46;WE=119915140;WS=119915122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	119915249	rs7556873	T	C	8002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=85;PP=2965;SC=AGATGCCGCGTACCTGGCAGC;SOR=1.133;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=137;TCR=85;TR=222;WE=119915257;WS=119915239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr2	119988565	rs838100	G	A	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1349;ReadPosRankSum=0.448;SC=TGACCTGAGAGCCTCAGACCC;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=99;TCR=103;TR=101;WE=119988573;WS=119988555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,123:0.52:238
chr2	120003642	rs838083	C	T	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=27;PP=733;SC=CCAGCATGCTCTTTTTGATAT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=120003650;WS=120003632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	120005839	rs5833785	CT	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,14:0.21:66
chr2	120005840	.	TC	CC	1269	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000,0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=3,4;NR=40,12;PP=1269,435;QD=29.8372093023;SC=GTCCAGCACCTCCCCCCCCCA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=43,16;WE=120005848;WS=120005826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:64,16:0.20:80
chr2	120005840	rs67985074	TC	T	885.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000,0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3,4;NR=40,12;PP=1269,435;ReadPosRankSum=0.490;SC=GTCCAGCACCTCCCCCCCCCA;SOR=0.660;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=43,16;WE=120005848;WS=120005826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr2	120012412	rs41279770	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=750;ReadPosRankSum=-1.175;SC=GGAGGGAGTTCAGCTTCGTTC;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=49;WE=120012420;WS=120012402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr2	120014985	rs838072	A	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=0;PP=1051;SC=GGCTCTGGCAATCTATTTTTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=38;WE=120014993;WS=120014984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	120015164	rs111712266	A	G	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1627;ReadPosRankSum=0.461;SC=TCTGCTGCTCACTTGTGCCTG;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=206;TCF=86;TCR=120;TR=101;WE=120015172;WS=120015154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,111:0.49:228
chr2	120059895	rs16744	G	GGAAA	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=556;SC=AAAGAGAGAAGGAAAGACCTG;SOR=3.912;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=120059903;WS=120059885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	120059921	rs8600	C	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=266;ReadPosRankSum=-0.464;SC=AAAGAAATAACCAGATTTTAG;SOR=0.874;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=13;WE=120059929;WS=120059911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	120059988	rs1890	T	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=22;PP=1113;SC=ATTTCAAAAATTCAGCAGTGG;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=120059996;WS=120059978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	120060082	rs1052500	T	C	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=37;PP=1338;SC=TTTGTAGTTCTTATAATCTTC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=120060090;WS=120060072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	120078689	rs6719102	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	120078778	rs1132267	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=7;PP=258;SC=CTTAAAGGGATATCTACAAGA;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=120078786;WS=120078768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	120124178	rs140555495	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=-2.088;SC=TTGTCCAGAGATGCAACTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=21;WE=120124186;WS=120124168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr2	120125029	rs2084202	A	G	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=34;PP=2318;SC=TCCGTGGCCGAGAGCTTGGAG;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=120125037;WS=120125019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	120125053	rs3731608	C	G	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr2	120125058	rs3731607	C	T	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,74:0.52:142
chr2	120125363	rs3091405	C	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=193;ReadPosRankSum=0.023;SC=GGCTTCGCTGCAGCCCCGGCC;SOR=0.616;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=13;WE=120125371;WS=120125353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr2	120125384	rs3091406	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTCCCTAGTGCCTGGCCCGG;SOR=1.473;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=12;WE=120125392;WS=120125374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr2	120125689	rs8192503	A	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=1.021;SC=CTGGGCTGTCATCAGGCCACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=120125697;WS=120125679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	120125910	rs2276596	C	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=1.961;SC=GGAAGGGCATCTGCTCATCAA;SOR=0.646;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=22;WE=120125918;WS=120125900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr2	120125936	rs2244135	T	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=19;PP=669;SC=GCTCAGCAGCTCAGACTGGAA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=120125944;WS=120125926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	120125973	rs3091407	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.355;SC=CTCTCAAACTGCCTGAGGCCC;SOR=1.688;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=8;WE=120125981;WS=120125963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	120128482	rs956309	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=295;ReadPosRankSum=0.044;SC=CAATGGGGCACGTGTGGGAAA;SOR=0.327;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=23;WE=120128490;WS=120128472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr2	120129841	rs8192506	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1108;ReadPosRankSum=0.021;SC=GGAAGATGCCATGAAAGCTTA;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=83;WE=120129849;WS=120129831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,94:0.54:173
chr2	120187344	rs11123523	A	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=141;SC=CCTCCTTATTATTCTTAAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=120187352;WS=120187334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	120189404	rs4340531	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=8;NR=4;PP=209;SC=CCTGCGGAGAAGTCCCGGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=120189412;WS=120189394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	120189433	rs4599130	G	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.22;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	120194651	rs3217464	A	AGTGTGC	7712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=70;PP=2957;SC=CACCAACCAGACGATCTGCTT;SOR=1.088;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=111;TCF=26;TCR=85;TR=95;WE=120194659;WS=120194641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	120197670	rs1042656	G	A	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=21;PP=1072;SC=GTCTCTGTCCGTGGGTGACCC;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=120197678;WS=120197660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	120199140	rs1126839	A	G	5264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=88;PP=2965;SC=TCACCTCCCCATTGAGGAAGC;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=69;TCR=88;TR=157;WE=120199148;WS=120199130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	120209689	rs2587692	A	G	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=75;PP=2347;SC=GGTTATGAGCAGGAGCTGTGG;SOR=1.203;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=121;WE=120209697;WS=120209679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	120221585	rs2253870	G	A	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=428;SC=TTGGTATTAAGTGCAGCCTCA;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=120221593;WS=120221575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	120221871	.	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=633;ReadPosRankSum=1.924;SC=GCCAGAGCCTGAGGGGCTGGG;SOR=1.528;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=84;TCF=23;TCR=61;TR=37;WE=120221879;WS=120221861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr2	120221984	rs2579647	A	C	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=321;SC=TGAATGAGGAACTGGGTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=120221992;WS=120221974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	120230998	rs2579641	G	A	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=907;SC=TCCTGTCCCCGGGTTCGTGGG;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=120231006;WS=120230988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	120231165	rs2587701	T	C	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=50;PP=1258;SC=AGGTGAGCCATGGGCCCAGGC;SOR=1.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=120231173;WS=120231155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	120231303	rs2587702	T	C	234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=133;SC=AGGGGGAAAGTGATTTGAACC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=120231311;WS=120231293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	120303820	rs2579624	A	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=743;ReadPosRankSum=0.913;SC=AAAAGAAAAGAAGTACCTAAT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=42;WE=120303828;WS=120303810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr2	120330181	rs114202428	A	G	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=60;PP=1868;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CAGTTGGTTGACCAGTTGCTC;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=112;TCR=110;TR=120;WE=120330189;WS=120330171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,139:0.54:257
chr2	120344873	rs6726971	T	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=396;ReadPosRankSum=0.075;SC=CAAACACATATCAGTGATGAA;SOR=0.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=23;WE=120344881;WS=120344863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr2	120358763	rs115643780	G	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=466;ReadPosRankSum=0.892;SC=AGAAGAGAGGGTATCACATTT;SOR=1.297;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=24;WE=120358771;WS=120358753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr2	120362897	rs1521914	T	A	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=41;PP=1237;SC=GTATCAAGTGTCAGTACAGTT;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=120362905;WS=120362887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	120366057	rs11398750	G	GT	608.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.964;HP=12;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=331;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TCTGGACACAGTTTTTTTTTT;SOR=3.215;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=19;WE=120366065;WS=120366047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,23:0.88:26
chr2	120366295	rs1521915	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=1.121;SC=GACAAGTAAATTGTCAACCAT;SOR=0.859;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=8;WE=120366303;WS=120366285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr2	120369300	rs10864986	T	C	6622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=117;PP=2965;SC=ATAAACGGGTTGTTCGCAATC;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=222;WE=120369308;WS=120369290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr2	120385094	.	GATAT	G	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	120385157	rs2177093	C	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=707;ReadPosRankSum=0.887;SC=GGAAAATATGCAAATATATAT;SOR=0.288;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=43;WE=120385165;WS=120385147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr2	120387637	rs12711931	G	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=276;SC=TGGTAGATTAGACTGTGTGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=120387645;WS=120387627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	120388128	rs2272057	A	G	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=902;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGGATTTTCAATCTTCTTTCA;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=84;TCR=31;TR=55;WE=120388136;WS=120388118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr2	120388412	rs2272058	G	A	4167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=85;PP=2600;SC=CAAAACATCAGTCTTGAGCAT;SOR=1.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=130;WE=120388420;WS=120388402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	120404629	rs11349518	AT	A	1210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.75;MQRankSum=0.417;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr2	120409430	rs1521912	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=170;SC=ACAAAAGTAGATGGAACTAAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=120409438;WS=120409420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	120414083	rs6761357	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=776;SC=ATTTGCTTTCCGTGGGCCACT;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=120414091;WS=120414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	120438523	rs13011768	A	G	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TGGAGTTCCAATCTCGTACCA;SOR=0.625;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=78;WE=120438531;WS=120438513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,85:0.45:190
chr2	120438696	rs939777	A	G	7676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=106;PP=2965;SC=TCACCTTCCAACCTGTGAGTG;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=126;TCR=106;TR=230;WE=120438704;WS=120438686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr2	120439230	rs1983406	C	G	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.526;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=58;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TGGGCAAAGACGGGGAGAAGC;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=200;TCF=96;TCR=104;TR=106;WE=120439238;WS=120439220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,132:0.54:245
chr2	120635074	rs61737537	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TTAGAGTCAAATTTTTTGTAA;SOR=0.392;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=9;WE=120635082;WS=120635064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	120643280	rs74866537	G	GT	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.541;SC=AGACTGCTCAGTTTTTTCAGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=120643288;WS=120643270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr2	120684054	rs114505813	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=0.590;SC=TCTCTGCTTCCTTTTCTCTGC;SOR=0.148;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=120684062;WS=120684044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	120689934	rs116070201	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=567;ReadPosRankSum=1.111;SC=CAAATTGTAGGATTTGATTCA;SOR=2.155;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=27;WE=120689942;WS=120689924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr2	120690217	rs6542551	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=353;ReadPosRankSum=1.618;SC=ACAAAGATACGCAAAAATTGA;SOR=1.028;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=25;WE=120690225;WS=120690207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr2	120704164	rs3214717	A	AT	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=555;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AGTTATCTAAATGTTTCAAAT;SOR=0.503;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=9;WE=120704174;WS=120704154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr2	120704166	rs2289580	G	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=584;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TTATCTAAATGTTTCAAATAA;SOR=0.503;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=12;WE=120704174;WS=120704154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr2	120713017	rs116814404	A	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	120714279	rs76920374	G	C	71.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	120714506	rs72840427	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GAGATATTTCGCCTTGTAAGT;SOR=0.631;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=13;WE=120714514;WS=120714496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	120718672	rs6737776	T	G	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=AATCATCATGTTTAAGTGCAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=120718680;WS=120718662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	120720384	rs72840431	A	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.459;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=536;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GAAAGCTGAAAATGTTTTTAG;SOR=1.194;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=32;WE=120720392;WS=120720374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr2	120725704	rs10194955	A	G	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=345;SC=ACTACTGCCCACTAGTCAAAT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=120725712;WS=120725694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	120734635	rs3189128	A	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=281;ReadPosRankSum=0.099;SC=AACAACATCAACAAATAAATA;SOR=0.593;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=20;WE=120734643;WS=120734625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr2	120734737	rs3832049	C	CA	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5148;FS=2.667;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.693;NF=0;NR=11;PP=156;ReadPosRankSum=-1.587;SC=TGGCATTTTACAAAAAAAAAA;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=120734745;WS=120734727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr2	120776972	rs3216703	TG	T	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.49;NF=1;NR=21;PP=932;SC=GATCAGGCACTGTAACATTCA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=120776980;WS=120776962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	120799843	rs147885599	C	A	126.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TTTAGCATCACCTGAAGTACT;SOR=2.303;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=120799851;WS=120799833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	120830627	rs72841604	T	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=0.174;SC=TTCACTTGGGTTTTTCTCTTG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=120830635;WS=120830617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	120830815	rs3738970	A	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=415;SC=AGACAAAATTATTTGTGGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=120830823;WS=120830805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	120849106	rs17049981	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=784;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TAAAATTTCCCTTACTTCTGT;SOR=0.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=40;WE=120849114;WS=120849096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr2	120858144	rs41279786	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=-1.044;SC=TCTCTAAGGTGTATATAAAAT;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=120858152;WS=120858134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	120861844	rs17049991	C	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.794;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=617;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CTTTGGGACTCTTTGTCATGC;SOR=0.352;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=107;TCF=46;TCR=61;TR=47;WE=120861852;WS=120861834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr2	120885310	rs1034489	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=858;ReadPosRankSum=1.305;SC=CTTATTGGAAGCAACGATTGG;SOR=0.866;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=58;WE=120885318;WS=120885300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,68:0.43:160
chr2	120889173	rs3738968	G	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.433;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.047;NF=25;NR=8;PP=453;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GGGTTATTTTGCCTTTTTTTT;SOR=0.215;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=33;WE=120889183;WS=120889163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr2	120918585	rs12617570	A	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=611;ReadPosRankSum=-1.030;SC=ATTTTTGCCAAAGACAGTTTT;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=37;WE=120918593;WS=120918575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr2	120979463	rs76403228	A	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=0.125;SC=GCGAAGGCCAAGTGGAGTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=120979471;WS=120979453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	120980428	rs11550347	G	C	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1376;ReadPosRankSum=1.342;SC=GGCAAAGACGGCCCAGTAGCT;SOR=0.649;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=78;WE=120980436;WS=120980418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,105:0.54:194
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chr2	121038350	rs34186672	CAA	C	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=551;ReadPosRankSum=0.146;SC=GCTGTCAGAACAAAAGACATT;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=17;WE=121038359;WS=121038340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr2	121043403	rs4091515	G	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=159;SC=GGCAGATTTTGTTCCCCTTAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=121043411;WS=121043393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	121043429	rs74540542	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-2.589;SC=TGTTAATTACCGATAATGTTT;SOR=0.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=121043437;WS=121043419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	121103903	rs11900747	T	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=259;ReadPosRankSum=-1.332;SC=GCCACCCGGATCCCCGGGTGG;SOR=0.743;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=16;WE=121103911;WS=121103893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	121708663	rs10864866	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=519;SC=TGTAATTCACAGATGACCAGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=121708671;WS=121708660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	121712729	rs10175446	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.36;QD=30.78;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	121713022	rs6718382	C	G	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	121713030	rs12614482	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.02;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	121713041	rs12617878	T	C	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=832;SC=AGGATGGGGCTAGCAGATCTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=121713049;WS=121713012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	121726447	rs2592595	G	A	8484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=155;PP=2965;SC=GAAGCAGCTCGGCGGCCAGCG;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=98;TCR=155;TR=253;WE=121726455;WS=121726437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr2	121729323	rs2677507	A	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=2;PP=282;SC=TGGCATGCCCAGGTCTGGGTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=121729331;WS=121729316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	121729360	rs2592592	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=487;SC=CATGTGCCCCTGGCAGGACTG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=121729368;WS=121729350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	121729490	rs2592591	C	T	4203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=62;PP=2569;SC=CCCTGAGTAACAGACTGTCCT;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=136;WE=121729498;WS=121729480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	121729686	rs2592590	T	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=726;SC=AGGACCAGGCTTGTGGGCTGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=121729694;WS=121729676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	121730138	rs3106962	C	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=662;SC=GGGGTCACTTCAGGGCATGTG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=121730146;WS=121730128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	121735914	rs182948437	T	TG	666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=446;ReadPosRankSum=0.855;SC=CGGGGAGGGCTGGGGGGGTGC;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=22;WE=121735922;WS=121735904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr2	121740190	rs1968619	C	T	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;QD=46.19;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	121740194	rs1530580	T	G	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=43.08;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	121740505	rs280196	C	T	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=27;PP=803;SC=GCCCCACTGACGCCCCATGGC;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=121740513;WS=121740495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	121744225	rs2276553	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=35;PP=1056;SC=GATGGGGCAGAAGAGAGTCTG;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=121744233;WS=121744215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	121746956	rs3738880	G	T	5667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=105;PP=2965;SC=CACCGTAGACGCCCTGGCCAG;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=181;WE=121746964;WS=121746946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	121747406	rs12711538	G	A	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=2361;ReadPosRankSum=1.551;SC=TGGGGTCCCCGATTCAGCCCT;SOR=0.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=115;WE=121747414;WS=121747396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr2	121747429	rs10167980	A	G	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=48;PP=1768;SC=CTGGAGTGCCACCACCTCACC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=96;WE=121747437;WS=121747419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	121981950	rs11890430	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=-1.169;SC=TGTGGTAGCCATCATTGCTCT;SOR=0.557;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=24;WE=121981958;WS=121981940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr2	121982011	rs4384798	T	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=506;ReadPosRankSum=-1.242;SC=AAAGGTGCAGTGCCACAGTAT;SOR=1.183;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=29;WE=121982019;WS=121982001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr2	121989489	rs2304667	G	A	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=33;PP=1497;ReadPosRankSum=1.457;SC=ACAGGTTGGCGATCTTCTCAA;SOR=1.004;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=165;TCF=103;TCR=62;TR=95;WE=121989497;WS=121989479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,104:0.56:187
chr2	121995151	rs2260394	T	C	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=913;ReadPosRankSum=-0.182;SC=AGCCTTGAAGTGTCTCCAAGA;SOR=0.647;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=144;TCF=95;TCR=49;TR=65;WE=121995159;WS=121995141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
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chr2	122006851	rs17006283	A	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.241;SC=CAGCAACAACAGTGATGACTA;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=122006859;WS=122006841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	122038940	rs35023952	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=434;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GCAGACCACCGGGGCCCAGGG;SOR=0.358;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=26;WE=122038948;WS=122038930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr2	122042750	rs13415738	A	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=595;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CGCGCCGAGGACCCAGCGGCG;SOR=0.861;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=40;WE=122042758;WS=122042740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr2	122125104	rs2304663	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=500;ReadPosRankSum=0.770;SC=GCTGGCCAGACGGGAGGGAGC;SOR=0.542;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=32;WE=122125112;WS=122125094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr2	122145157	rs2015439	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GAGAAAAAACGGCATACTTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=122145165;WS=122145154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	122161850	rs9807995	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=322;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GTCGGAACTGCACTATCGGGA;SOR=0.326;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=21;WE=122161858;WS=122161840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr2	122205778	rs34350940	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=-0.693;SC=TCCTGTGCCTGGGCAGCCTCT;SOR=0.201;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=19;WE=122205786;WS=122205768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	122216419	rs2304560	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=572;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TACTTACCCGAATAATTAACC;SOR=0.344;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=35;WE=122216427;WS=122216409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr2	122273187	rs6711830	C	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=397;ReadPosRankSum=-0.381;SC=AACTGGAAAACAAAGGGGGCG;SOR=0.148;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=29;WE=122273195;WS=122273177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr2	122273475	rs79295629	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=258;ReadPosRankSum=1.397;SC=CTTATATACATTTGTCTAGAG;SOR=0.793;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=12;WE=122273483;WS=122273465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	122283313	rs12052948	G	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=751;ReadPosRankSum=-0.251;SC=ATAATCATCAGTGTTCTGTGA;SOR=1.017;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=44;WE=122283321;WS=122283303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr2	122286442	rs934760	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=0.295;SC=TTATGTGGGAAGACAAACCCC;SOR=0.393;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=10;WE=122286450;WS=122286432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr2	124771950	rs115178827	C	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=0.198;SC=AAAGTAGGTGCAATGCCTTTG;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=16;WE=124771958;WS=124771940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	125192068	rs1425745	T	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=35;PP=1352;SC=CAGAATCAGATGTTGCTGACT;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=78;WE=125192076;WS=125192058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	125232609	rs4411700	G	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=743;SC=GAGAGAAAGAGAATGGCAGAT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=125232617;WS=125232599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	125405302	rs924802	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=636;ReadPosRankSum=-1.322;SC=TTGCTTCTAACGTCTCTTGCT;SOR=0.691;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=46;WE=125405310;WS=125405292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr2	125504806	rs192880351	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=676;ReadPosRankSum=1.274;SC=TGTCTTCCAGATGGAACACCA;SOR=1.197;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=42;WE=125504814;WS=125504796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr2	125530488	.	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=419;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GGGCTGAGAGGAACCTCAAGG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=31;WE=125530496;WS=125530478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr2	127657221	rs3795873	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=15;PP=652;SC=GCACACGGCCCAGCCCTCCAC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=127657229;WS=127657211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	127808226	rs2071270	A	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=576;ReadPosRankSum=0.475;SC=GCAGCAGGACAGTATGGGGCT;SOR=1.145;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=31;WE=127808234;WS=127808216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr2	127808532	rs2043798	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=571;ReadPosRankSum=1.026;SC=AGGTGGTCCAGGGACAGCCAG;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=37;WE=127808540;WS=127808522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr2	127808909	rs6745677	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=826;ReadPosRankSum=-2.082;SC=GCACCCAAGCGACAGGGCCGG;SOR=0.917;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=53;WE=127808917;WS=127808899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,69:0.60:115
chr2	127811042	rs76414720	G	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=864;ReadPosRankSum=2.169;SC=CAGTGAGGGCGAGAAGGACAG;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=62;WE=127811050;WS=127811032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,70:0.50:139
chr2	127811712	rs35339559	G	GCA	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=181;ReadPosRankSum=0.357;SC=CACCACGCATGCAGAGCAAGC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=127811720;WS=127811702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	127816846	rs140171337	CTG	C	1045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=23;PP=1059;SC=AGGTGTGAAACTGTGTGTGTG;SOR=2.376;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=23;WE=127816855;WS=127816836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	127819777	rs61748157	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GGTTGAGCTGCAGGAGAGACA;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=65;TCR=96;TR=89;WE=127819785;WS=127819767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,106:0.55:194
chr2	127821085	rs2071268	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=256;ReadPosRankSum=-1.716;SC=CCTCCCACGACTCTGACTCTG;SOR=0.375;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=21;WE=127821093;WS=127821075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr2	127821453	rs78935905	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.791;NF=32;NR=16;PP=811;ReadPosRankSum=1.115;SC=ACTGGGCACCGCAGCACGCAG;SOR=0.538;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=48;WE=127821461;WS=127821443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,56:0.60:93
chr2	127821499	rs72481904	T	C	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=946;ReadPosRankSum=0.770;SC=GGCACCGTGCTGGGCCTCACC;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=73;WE=127821507;WS=127821489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,99:0.58:172
chr2	127825968	rs934826	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=-1.192;SC=GGGCCCTTGAGGCCGAGAGAA;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=20;WE=127825976;WS=127825958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	127826632	rs67327804	A	G	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=617;ReadPosRankSum=0.405;SC=GGAGGGCACTAAGCGGGGCCT;SOR=0.604;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=32;WE=127826640;WS=127826622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr2	127944781	rs11384285	A	AC	1008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=803;SC=GTGATCAGCGAACACAAATAC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=127944789;WS=127944771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	127945023	rs75876537	C	G	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=844;ReadPosRankSum=0.187;SC=TCTCAGTGCTCCCTGAATGCT;SOR=0.628;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=50;WE=127945031;WS=127945013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr2	127950904	rs885276	A	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	127951458	rs2089109	GC	AT	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.459;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=2142;ReadPosRankSum=-1.222;SC=AAAAGAGCCAGCGGGGACGGG;SOR=1.058;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=58;WE=127951467;WS=127951448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,75:0.42:178
chr2	127953054	rs7568070	A	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=451;ReadPosRankSum=1.357;SC=GGAGGTACACAGTCCAAGACA;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=39;WE=127953062;WS=127953044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr2	128015367	rs4662718	C	T	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=35;PP=1107;SC=TTTTATAATACTTATAATCAC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=128015375;WS=128015357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	128028792	rs4150499	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=10;PP=642;SC=TTTGGGATTCTCTCCCTCCAG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=128028800;WS=128028782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	128029065	rs11345447	GA	G	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.488;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.031;NF=1;NR=11;PP=121;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TATATATGAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.111;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=12;WE=128029073;WS=128029055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr2	128030377	rs4150487	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=154;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CCAGGAATCATAGTGTACCCC;SOR=0.169;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=12;WE=128030385;WS=128030367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	128050134	rs4150402	T	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=372;SC=CACCTATGCCTATTGTTACAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=128050142;WS=128050124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	128050483	rs2271026	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=-2.080;SC=ACTACTGGGCTCTTGCCCATA;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=18;WE=128050491;WS=128050473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr2	128076022	rs9636237	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AAAATTATGATTATCCAAATT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=128076030;WS=128076012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	128081682	rs12622436	C	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=373;ReadPosRankSum=0.406;SC=AATCCCCCCTCTCCCTCCCAG;SOR=0.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=34;WE=128081690;WS=128081672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr2	128083212	rs10439214	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=223;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TGCAGTAAGCCGCATTCACGC;SOR=0.384;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=14;WE=128083220;WS=128083202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr2	128175862	rs1799808	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=247;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CCCTGCTGGACGGCATCCTTG;SOR=0.321;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=17;WE=128175883;WS=128175852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr2	128175875	rs1799809	G	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=846;SC=CATCCTTGGTGGGCAGAGGTG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=128175883;WS=128175852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	128176195	rs2854700	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=484;SC=AGCTTGGGGTGAAAGGACACA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=128176203;WS=128176185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	128177377	rs1158867	C	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=615;SC=GACCCTCAATCCCAGCTTCCG;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=128177385;WS=128177367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	128180872	rs5936	G	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=234;ReadPosRankSum=0.925;SC=TCAATTGCTCGCTGGACAACG;SOR=0.454;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=20;WE=128180880;WS=128180862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
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chr2	128249441	rs334152	C	T	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=189;SC=TCCACTTTACCGACTCGTTTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=128249449;WS=128249435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	128271958	rs10432384	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=658;ReadPosRankSum=0.607;SC=CCCTCCCTCCCGCTTACCCAG;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=119;TCF=46;TCR=73;TR=51;WE=128271966;WS=128271948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,61:0.44:139
chr2	128281469	rs2303947	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=0.279;SC=GCAAAAGTTACCACTGAGGAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=128281477;WS=128281459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	128321770	rs2404991	G	A	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1212;ReadPosRankSum=1.135;SC=CCACAAGACCGGCGTGGCCAT;SOR=0.774;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=74;WE=128321778;WS=128321760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,81:0.64:126
chr2	128338519	rs35136538	T	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=392;ReadPosRankSum=1.831;SC=CCAGGGCCTATGCTCAAACCC;SOR=0.301;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=23;WE=128338527;WS=128338509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr2	128339456	rs4662740	G	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=879;ReadPosRankSum=0.233;SC=GCCCCCACCTGCCTCCCCAGG;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=56;WE=128339464;WS=128339446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr2	128341722	rs144080203	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=961;ReadPosRankSum=-1.668;SC=CATCAACTTCGCCAACGAGCA;SOR=0.488;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=59;WE=128341730;WS=128341712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,73:0.59:124
chr2	128342547	rs4662741	G	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=31;PP=1007;SC=CAGGGAGACCGTGGAAAGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=128342555;WS=128342537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	128345909	rs138664801	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.427;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=192;ReadPosRankSum=0.265;SC=CTCTTCTTCCCCATGGGTGGG;SOR=0.283;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=16;WE=128345917;WS=128345899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	128345960	rs10928773	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=310;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GCCCTGTGTCTCCACAGGCTT;SOR=0.404;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=22;WE=128345968;WS=128345950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr2	128346228	rs11673952	A	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=172;SC=CTCTGGGTCCACAGCATGCAG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=128346236;WS=128346218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	128350551	rs11678239	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.058;NF=18;NR=52;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.962;SC=GGTCACCTCTGGCCATCCGCG;SOR=0.424;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=133;TCF=30;TCR=103;TR=70;WE=128350559;WS=128350541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr2	128350578	rs58867441	T	TG	3115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=67;PP=2936;SC=CCCTCGGCCTTGGCACCTCCA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=2;TCR=71;TR=69;WE=128350586;WS=128350568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	128351346	rs7558838	T	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=199;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CAGCTCAAAGTGTGGTCCCCA;SOR=1.345;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=14;WE=128351354;WS=128351336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr2	128363530	rs11382004	G	GC	1801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1661;SC=GGGCGGCTGGGCCGCGGGACC;SOR=2.437;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=36;WE=128363538;WS=128363520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	128367092	rs777432	G	A	3371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=-1.199;NF=72;NR=58;PP=2117;ReadPosRankSum=0.568;SC=ATCTGGAATCGAAGACCCAGA;SOR=0.595;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=217;TCF=123;TCR=94;TR=130;WE=128367100;WS=128367082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,150:0.59:253
chr2	128369752	rs12053039	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=1.477;SC=GCTCCACCCCAGGAGGCTGTG;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=15;WE=128369760;WS=128369742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr2	128369896	rs777435	A	G	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=878;ReadPosRankSum=1.243;SC=CCCGGATCACAGGCCAGGTGA;SOR=0.902;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=58;WE=128369904;WS=128369886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr2	128369917	rs12052654	C	T	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=936;ReadPosRankSum=2.172;SC=GCCCAGAGCACAGAATCTCTG;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=63;WE=128369925;WS=128369907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr2	128370200	rs705092	G	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=149;ReadPosRankSum=0.179;SC=CTCCCATCCCGGCCCCATTCA;SOR=0.082;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=11;WE=128370208;WS=128370190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	128377833	rs2248519	C	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=426;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CAGAGGTGCACAAGAGCTGTG;SOR=0.801;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=28;WE=128377841;WS=128377823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr2	128382859	rs2245297	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=270;ReadPosRankSum=2.297;SC=GGGCAAGAGCCCGGCCACGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=13;WE=128382867;WS=128382849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
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chr2	128388862	rs13025959	G	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=784;ReadPosRankSum=-0.788;SC=ATTCCTGCGAGCCGCTGCGAC;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=48;WE=128388870;WS=128388852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr2	128389343	rs10208043	C	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=620;ReadPosRankSum=1.515;SC=GCTGGGGCGGCGGCCAGCCCA;SOR=0.502;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=39;WE=128389351;WS=128389333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr2	128389422	rs10183797	G	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=-1.969;SC=CACCGCAGCTGGTGGCGGCAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=128389430;WS=128389412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	128393261	rs2255178	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=350;ReadPosRankSum=0.865;SC=GGGCCGCAGCTGGAGACCCAG;SOR=0.212;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=23;WE=128393269;WS=128393251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr2	128393289	rs2255177	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=553;ReadPosRankSum=1.863;SC=AGTGTGTCCATCACCCAGGAG;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=36;WE=128393297;WS=128393279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr2	128393800	rs2255161	T	C	3495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=66;PP=1530;ReadPosRankSum=0.056;SC=TTCTAGCCTATGACAAGCATA;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=134;TCR=139;TR=130;WE=128393808;WS=128393790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,172:0.51:339
chr2	128394098	rs141425821	C	T	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=1813;ReadPosRankSum=0.652;SC=TGGACTATGACCGCCGTGTCC;SOR=0.711;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=276;TCF=138;TCR=138;TR=124;WE=128394106;WS=128394088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,144:0.44:325
chr2	128394758	rs2255039	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=563;ReadPosRankSum=-0.058;SC=ACGGCCCCAATGGCAGGAGCC;SOR=0.330;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=39;WE=128394766;WS=128394748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr2	128394875	rs59579995	C	CA	4045.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=2976;ReadPosRankSum=0.929;SC=CTCTGACCCCCCCGTCCCCTG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=48;TCR=74;TR=55;WE=128394885;WS=128394865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,104:0.53:196
chr2	128394877	rs56272236	C	T	4103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=1.189;SC=CTGACCCCCCCGTCCCCTGTC;SOR=0.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=94;TCR=73;TR=83;WE=128394885;WS=128394865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr2	128394955	rs11686946	A	G	2522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=66;PP=1690;ReadPosRankSum=0.922;SC=ATGAACAAGCAGCGGGGCTCC;SOR=0.911;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=106;WE=128394963;WS=128394945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,120:0.50:238
chr2	128396807	rs891515	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=575;ReadPosRankSum=0.705;SC=CATGGACAGCAGGAGGGGAGA;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=34;WE=128396815;WS=128396797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr2	128400608	rs4662751	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=561;ReadPosRankSum=1.561;SC=TGCCCAGGCCCTTGGCCTTCT;SOR=1.105;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=37;WE=128400616;WS=128400598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr2	128411934	rs6707277	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=358;ReadPosRankSum=0.036;SC=CACACAGGAGAGGTGGCAGGT;SOR=0.243;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=18;WE=128411942;WS=128411924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr2	128411950	rs6707282	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=362;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CAGGTGTGCCAGGAAGGGCTG;SOR=0.313;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=24;WE=128411958;WS=128411940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr2	128431188	rs6430942	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.131;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=387;ReadPosRankSum=1.385;SC=CCAGCCCCGCACCCTTCACGG;SOR=1.688;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=25;WE=128431196;WS=128431178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr2	128432511	rs140650322	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.32;MQRankSum=1.305;NF=17;NR=15;PP=512;ReadPosRankSum=-1.583;SC=CGGGGCTGTACGAGGGCGAGC;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=32;WE=128432519;WS=128432501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr2	128432620	.	TGGGTTGCCG	T	1028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.592;NF=0;NR=16;PP=2976;ReadPosRankSum=0.379;SC=CGCCGAGCCCTGGGTTGCCGG;SOR=0.792;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=128432636;WS=128432610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr2	128459039	rs1048211	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CGAAGACCGAACCGCTTCAGC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=9;WE=128459047;WS=128459029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	128464116	rs34550770	G	A	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1034;ReadPosRankSum=0.406;SC=CAGGTCCTGGGCCCCCTCGGC;SOR=0.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=66;WE=128464124;WS=128464106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr2	128467473	rs72846240	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AGAGAACACCTTGCCACTCTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=128467481;WS=128467463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	128474887	rs3771293	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GCTTGAGCTACATAAATAGTG;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=13;WE=128474895;WS=128474877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	128495645	rs6754215	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1459;ReadPosRankSum=0.681;SC=AAACAAGAAGGGTGCATGAAC;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=88;WE=128495653;WS=128495635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,103:0.55:187
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chr2	128522189	rs62621432	T	C	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1485;ReadPosRankSum=-1.029;SC=ATCTCTAACATATTGCAAAGG;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=213;TCF=120;TCR=93;TR=95;WE=128522197;WS=128522179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,118:0.46:259
chr2	128608184	rs11556864	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	128608271	.	GA	G	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=17;MQ=59.09;NF=1;NR=5;PP=73;QD=13.1666666667;SC=TAATCAAAAGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=6;WE=128608279;WS=128608261;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	128608290	.	T	C	182	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=19;MQ=59.24;NF=5;NR=8;PP=182;QD=16.6747086575;SC=AAAATCAAAATAATCAAAAAC;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=13;WE=128608298;WS=128608280;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,13:0.57:23
chr2	128615577	rs74857120	G	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=835;ReadPosRankSum=1.156;SC=GTGGCGCGGGGGAGTCTGGCA;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=55;WE=128615585;WS=128615567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,79:0.42:186
chr2	128699833	rs1370229	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.060;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=-1.979;SC=CATGTTGAGGCTTCCACAACA;SOR=2.279;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=10;WE=128699841;WS=128699823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr2	128708063	rs2461463	T	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=25;PP=580;SC=CCAACAAAGATGATTAAGAAG;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=128708071;WS=128708053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	128744580	rs2948068	A	G	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=59;PP=1775;SC=AGAGAGGGAAACAAAATGCCA;SOR=1.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=88;WE=128744588;WS=128744570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	128753854	rs1550174	T	C	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=37;PP=2246;SC=TGGGACACTTTGTTTTATGCT;SOR=1.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=114;WE=128753862;WS=128753844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	128757804	rs10928793	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=696;ReadPosRankSum=0.296;SC=TCGGTATCACCAGGCCCTCAG;SOR=0.558;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=38;WE=128757812;WS=128757794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr2	128772310	rs35312230	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=423;ReadPosRankSum=1.442;SC=TTCTGTGTTACGTATTTTACC;SOR=0.705;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=25;WE=128772318;WS=128772300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr2	128849114	rs4476299	T	C	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=63;PP=2064;SC=TCTGGTGTCCTATCCCTTCCC;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=128849122;WS=128849104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	128860835	rs7355336	A	G	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=930;SC=CAATTACTACATGCATTTCCT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=128860843;WS=128860825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	128870808	rs4662775	T	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1426;SC=GCAAAATCAATTATGTATTCA;SOR=1.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=63;WE=128870816;WS=128870798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	128872595	rs56397917	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=701;ReadPosRankSum=-0.099;SC=GGGCATAATCCGAGGTAATGG;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=35;WE=128872603;WS=128872585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr2	128874061	rs10210598	G	A	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=513;SC=CCTACGTGGAGAGTCAACCAC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=128874069;WS=128874051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	128877837	rs4662593	G	C	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=930;SC=AGGGTTGGGAGAGGAAAACCA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=128877845;WS=128877827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	128878014	rs4662594	G	A	8196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=140;PP=2965;SC=CACCTTTAAAGGTTTGGCAGT;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=120;TCR=140;TR=260;WE=128878022;WS=128878004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr2	128878667	rs6430990	T	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=326;SC=CATTCGAAGATATTCTTAATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=128878675;WS=128878657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	128880899	rs4480941	T	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=467;SC=ATCAGCAGCATTTAACAGTGT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=128880907;WS=128880889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	128880993	rs4633871	A	G	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=49;SC=CAGTATGCACATAACTGAAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=128881001;WS=128880983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	128890878	rs34066685	T	TG	2129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.042;NF=6;NR=36;PP=1629;ReadPosRankSum=1.103;SC=GTTTCTCCCTTGCCTAGTCCC;SOR=0.718;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=86;TCF=9;TCR=77;TR=42;WE=128890886;WS=128890868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr2	128913757	rs3738923	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=0.575;SC=TTTCTCAGCTGTATGTAAAGT;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=12;WE=128913765;WS=128913747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	128915057	rs13392666	T	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=1.192;SC=GAGAATTGTATCTCTAGAGAT;SOR=0.479;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=10;WE=128915065;WS=128915047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr2	128929028	rs17178432	A	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TTCTAAGAACATAGTGTGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=128929036;WS=128929018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	128934400	rs2290111	T	C	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=882;ReadPosRankSum=-0.444;SC=ACGATGGCACTGATTCTCCCC;SOR=0.777;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=67;WE=128934408;WS=128934390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,79:0.53:149
chr2	128936000	rs2290110	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=-1.411;SC=TGTGTCTGTATGAGTGTTTCA;SOR=0.530;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=15;WE=128936008;WS=128935990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
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chr2	128939606	rs62160075	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	128939799	rs17178720	C	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1145;ReadPosRankSum=-1.411;SC=GAGAAATGGACGGCTACAGGT;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=78;WE=128939807;WS=128939789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,92:0.47:196
chr2	128939817	rs1699	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GGTTCTGGAAGTCAGGGTACT;SOR=0.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=79;WE=128939825;WS=128939807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,92:0.47:197
chr2	128941483	.	G	GGT	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.732;NF=0;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=0.105;SC=GTTTTTTCATGGTGTGTGTGT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=128941491;WS=128941473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	128944424	rs744265	T	C	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=567;ReadPosRankSum=-1.747;SC=GATGTGTGAGTGAATCACGAT;SOR=0.653;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=34;TCR=70;TR=50;WE=128944432;WS=128944414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr2	128947505	rs11542865	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.009;SC=TTAAAGCTCTGTTGGATTTGT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=128947513;WS=128947495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	129075961	rs61732881	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.025;NF=15;NR=19;PP=439;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GGGGGTCGGGTGTGGGGAACA;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=34;WE=129075969;WS=129075951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr2	130737578	rs4233601	G	A	315.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.060;NF=15;NR=2;PP=323;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TTGCAGGGGCGCAGAGAGCTC;SOR=0.610;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=17;WE=130737586;WS=130737568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr2	130738163	rs144773989	G	A	5128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.44;QD=28.65;SOR=1.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	130750446	rs199529770	C	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQRankSum=-3.289;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	130897055	rs28751929	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=325;SC=TAGCGGAAGTGTCAGGAAATG;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=130897063;WS=130897045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	130897218	rs13006246	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.069;NF=5;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TCTGCTTCAGTGCGGGCAGGA;SOR=1.141;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=16;WE=130897226;WS=130897208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	130897234	rs3177472	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.190;NF=8;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=1.511;SC=CAGGATGGCACGCTCCGCCAC;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=22;WE=130897242;WS=130897224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr2	130897620	.	A	G	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=53.79;NF=5;NR=2;PP=61;QD=13.6816017925;SC=TTCCTCCGGGACTGCCTGGGG;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=7;WE=130897628;WS=130897610;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr2	130899804	rs138331089	T	C	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.31;QD=25.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	130900188	rs28743163	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.663;NF=20;NR=14;PP=514;ReadPosRankSum=2.139;SC=TGCCCCAGCTACGATGTTCCC;SOR=1.066;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=34;WE=130900196;WS=130900178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr2	130902067	rs60089935	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.364;NF=25;NR=23;PP=793;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GAGGAGAGGACTGGCGGAGTC;SOR=0.686;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=48;WE=130902075;WS=130902057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,32:0.35:91
chr2	130902194	rs60152285	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQRankSum=-0.616;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	130902549	rs34080706	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.470;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	130910847	rs4511676	G	A	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1348;ReadPosRankSum=0.234;SC=AGCTGGGGACGGGTCAGGGCC;SOR=0.645;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=89;WE=130910855;WS=130910837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,104:0.50:210
chr2	130925088	rs10909567	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=376;ReadPosRankSum=0.666;SC=CATTCACAGACGTCTGATGAG;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=22;WE=130925096;WS=130925078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr2	130930819	rs60309319	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.290;NF=20;NR=9;PP=435;ReadPosRankSum=1.323;SC=CCCACTGCCCCGAGCACCACT;SOR=0.388;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=29;WE=130930827;WS=130930809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr2	130939288	rs1968676	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=547;ReadPosRankSum=1.989;SC=GGCGGGGAAGAGAAATGGCGA;SOR=0.572;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=39;WE=130939296;WS=130939278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr2	130939348	rs1817097	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=321;ReadPosRankSum=0.455;SC=CGCCTGCGTTGTGGCGGCCTC;SOR=0.262;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=23;WE=130939356;WS=130939338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr2	130940090	rs1968675	G	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;ReadPosRankSum=0.118;SC=TTCCGGGTACGCCCGGCCCGC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=14;WE=130940098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr2	130941034	rs34409208	T	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQRankSum=-3.510;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.570;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	130941065	rs6737226	T	C	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=13;PP=1166;SC=GTGGAGCCTCTGTCCCTGCTC;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=130941073;WS=130941055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	130948303	rs12612244	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-2.148;SC=CCAGGTCAGATGTTGTCTACC;SOR=1.919;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=9;WE=130948311;WS=130948293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr2	130951548	rs1052319	G	A	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=63;PP=2414;SC=TGGTGATCTCGGCCACAGACA;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=130951556;WS=130951538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	130951566	rs7340193	G	A	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=60;PP=2200;SC=ACAGCTGCTCGTGGTAGGCCT;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=106;WE=130951574;WS=130951556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	130951581	rs1052312	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQRankSum=-7.131;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
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chr2	130952540	rs56151061	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.319;NF=13;NR=2;PP=313;ReadPosRankSum=0.890;SC=TGTGAGCCACCGCGCCCGGCC;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=15;WE=130952548;WS=130952530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	130952718	rs3853852	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQRankSum=-8.244;QD=3.05;ReadPosRankSum=-4.157;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,21:0.15:139
chr2	130952725	rs3863907	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-7.788;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.986;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,21:0.16:134
chr2	130960023	rs4663031	T	C	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.610;NF=51;NR=54;PP=1386;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GTAGGCAGTTTGGTTCTGGGT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=217;TCF=107;TCR=110;TR=105;WE=130960031;WS=130960013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,112:0.46:244
chr2	130961729	rs201980950	A	AT	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQRankSum=-1.238;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr2	130987792	rs12992461	G	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=939;ReadPosRankSum=1.077;SC=GCACATCAGCGTGCTGGTGCC;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=59;WE=130987800;WS=130987782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr2	131103635	rs11542415	C	T	3263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=2115;ReadPosRankSum=0.320;SC=CCAAAGATGACAGCCACCGGG;SOR=0.779;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=228;TCF=111;TCR=117;TR=125;WE=131103643;WS=131103625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,145:0.54:271
chr2	131126793	.	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=0.258;SC=TGGGAGTTTTCAAGGAAGATT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=20;WE=131126801;WS=131126783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr2	131487673	rs272128	A	C	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=90;PP=2965;SC=TGCCATGCTCACATACCTGTA;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=65;TCR=90;TR=155;WE=131487681;WS=131487663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	131520663	rs1905235	T	C	6220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=102;PP=2965;SC=CAGGGACCAATCCCGGCTGGA;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=94;TCR=102;TR=196;WE=131520671;WS=131520653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	131671572	rs181363725	G	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=851;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CCAGAGCCAGGTGCACACCTG;SOR=0.385;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=53;WE=131671580;WS=131671562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr2	131672950	rs12464119	A	G	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1824;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AAGGCACCCAACTCGCACCAA;SOR=0.628;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=100;WE=131672958;WS=131672940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,117:0.48:245
chr2	131673316	rs3739129	C	T	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=59;PP=1490;ReadPosRankSum=-0.762;SC=ACTGCGGCCCCGGGGCTGAGG;SOR=0.856;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=189;TCF=73;TCR=116;TR=90;WE=131673324;WS=131673306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,108:0.50:216
chr2	131673577	rs34513288	T	C	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1611;ReadPosRankSum=0.885;SC=CACCAGCCGGTAATGAGTGTG;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=97;TCR=117;TR=104;WE=131673585;WS=131673567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,119:0.50:240
chr2	131674285	rs3739127	A	G	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1181;ReadPosRankSum=0.870;SC=TTATTGAGTCAATAGTTCTAG;SOR=1.078;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=207;TCF=120;TCR=87;TR=83;WE=131674293;WS=131674275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,102:0.42:244
chr2	131769237	rs13023338	G	A	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=960;SC=AGAGCCCATCGGAGCTGATGG;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=131769245;WS=131769227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	132111121	rs11895354	G	A	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.90;QD=42.98;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	132111123	rs370814343	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.90;QD=42.98;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	132111127	rs13410274	G	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.97;QD=41.78;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	132111166	.	G	GCC	449.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.33;QD=44.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	132111167	.	G	GCCGCCGCCGC	449.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.33;QD=44.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	132120501	rs146351322	C	CT	3573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=27;PP=2347;SC=AAGACGCTGACTTTTTTTGTG;SOR=2.147;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=78;WE=132120509;WS=132120491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	132121350	rs371054387	G	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=8;NR=8;PP=252;SC=GACCGATGCTGCTCCAGCCGG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=132121358;WS=132121340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	132200568	rs62176150	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.815;NF=20;NR=20;PP=655;ReadPosRankSum=0.120;SC=CACTGATCTCCAGCTGGATCT;SOR=0.567;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=40;WE=132200576;WS=132200558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr2	132229578	.	CA	AT	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQRankSum=-10.506;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.056;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,43:0.31:137
chr2	132229583	rs16848770	T	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQRankSum=-10.340;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,45:0.31:143
chr2	132248584	rs10182785	T	C	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=35;PP=1895;SC=CCCTGGCACTTCCCCCATGAA;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=87;WE=132248592;WS=132248574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	132249372	rs6706952	C	T	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=156;SC=AGGGCCACGCCGCCGCTGTGC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=132249380;WS=132249362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	132273988	rs199565961	GC	G	602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQRankSum=-0.785;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	132273994	rs372388255	T	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQRankSum=-1.136;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	132491544	rs7599401	C	G	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=43;PP=1257;SC=TTATTTTTCTCTCTGTGTTTT;SOR=1.451;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=66;WE=132491552;WS=132491534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	132494171	rs4850247	G	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.142;NF=32;NR=26;PP=697;ReadPosRankSum=-0.511;SC=AGGGTATTCTGTGGTCAACTT;SOR=0.759;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=58;WE=132494179;WS=132494161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr2	132494272	rs4850248	A	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=566;SC=AGTAATAACTATAATTTTATA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=132494280;WS=132494262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	132558335	rs12992187	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.210;SC=GTCTACTCAGGTTCAGCTGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=132558343;WS=132558325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	132586836	rs199980894	A	AG	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.040;NF=0;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=1.166;SC=CTGGGGCAGTAGGCGTCGAAG;SOR=1.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=132586844;WS=132586826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	132586854	rs4558626	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=3;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.860;NF=2;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-1.122;SC=AAGGTTGGACCGGGACTGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=6;WE=132586874;WS=132586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	132586866	rs186960073	C	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.392;NF=2;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GGACTGGCCGCAAAGCTGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=5;WE=132586874;WS=132586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	132591808	rs55998054	T	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.873;NF=29;NR=20;PP=750;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GATGCCTCGCTCTCAAAGTCG;SOR=0.989;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=49;WE=132591816;WS=132591798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,53:0.43:122
chr2	132592178	rs9751367	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.155;NF=15;NR=13;PP=400;ReadPosRankSum=1.402;SC=TGCTGGGGAGTTGGGGCAGGG;SOR=0.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=28;WE=132592186;WS=132592168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr2	132593636	rs59199382	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.566;NF=4;NR=5;PP=148;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GCTGCCTCGGCGGCAGGTGAC;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=9;WE=132593644;WS=132593626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	133014491	.	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-1.487;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.727;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,15:0.16:94
chr2	133014497	.	G	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-1.604;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,24:0.22:107
chr2	133014504	rs79813268	G	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=7.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-1.829;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=1.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,26:0.23:111
chr2	133014510	rs9287404	T	C	2315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQRankSum=-5.418;QD=20.49;ReadPosRankSum=2.334;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,61:0.54:113
chr2	133014511	rs76230250	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-3.836;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.954;SOR=0.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,17:0.14:118
chr2	133014518	rs78879023	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=-3.379;QD=2.49;ReadPosRankSum=2.625;SOR=0.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,17:0.13:134
chr2	133014546	.	C	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQRankSum=-4.317;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,18:0.10:178
chr2	133014592	.	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.862;ClippingRankSum=0.000;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=27.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-13.732;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.828;SOR=2.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,63:0.21:298
chr2	133014602	rs75245503	G	C	6780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=15.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-10.223;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=1.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,167:0.53:313
chr2	133014612	rs74853538	A	C	7967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=7.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-9.127;QD=22.83;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=1.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,203:0.58:349
chr2	133014619	rs78327226	C	T	4486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=6.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-12.407;QD=12.16;ReadPosRankSum=-3.178;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,117:0.32:369
chr2	133014640	rs78867621	C	T	5311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-12.318;NF=73;NR=45;PP=2702;ReadPosRankSum=1.025;SC=GGATGCCGGACGGCCCTCGGC;SOR=0.912;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=385;TCF=219;TCR=166;TR=118;WE=133014665;WS=133014630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,146:0.33:439
chr2	133014651	rs111708138	A	AC	10621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=3;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.428;NF=53;NR=107;PP=2966;ReadPosRankSum=0.187;SC=GGCCCTCGGCACCACCGAGAC;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=91;TCR=179;TR=160;WE=133014665;WS=133014630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,287:0.63:455
chr2	133014657	rs113237573	G	A	5525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-10.640;NF=80;NR=56;PP=2308;ReadPosRankSum=2.174;SC=CGGCACCACCGAGACCCGCCT;SOR=0.831;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=407;TCF=227;TCR=180;TR=136;WE=133014665;WS=133014630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:298,166:0.36:464
chr2	133014678	rs72869462	A	G	13098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-5.820;NF=155;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.012;SC=CATGAGCCCCAGGTCCCGCCA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=440;TCF=232;TCR=208;TR=292;WE=133014686;WS=133014668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,330:0.67:495
chr2	133014703	rs72869464	T	C	13591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=64;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.016;NF=143;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=0.515;SC=GACCCCGAGGTGACCTCAGCC;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=424;TCF=205;TCR=219;TR=292;WE=133014711;WS=133014693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,332:0.68:489
chr2	133014721	rs72869465	T	C	12494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.340;NF=133;NR=144;PP=2962;ReadPosRankSum=0.392;SC=GCCACAAACCTAACGCCAGGG;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=393;TCF=184;TCR=209;TR=277;WE=133014729;WS=133014711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,314:0.69:454
chr2	133014751	rs75204936	T	C	3823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=69;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.432;NF=49;NR=63;PP=1826;ReadPosRankSum=0.053;SC=TCGTTTCTCATCCATCCTCCA;SOR=0.605;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=330;TCF=139;TCR=191;TR=112;WE=133014759;WS=133014741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,120:0.33:368
chr2	133014776	rs72869466	CA	TG	3674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.647;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.421;NF=39;NR=52;PP=2944;ReadPosRankSum=0.708;SC=GGTCAAGCTCCAGGAGACCGG;SOR=0.459;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=273;TCF=106;TCR=167;TR=91;WE=133014796;WS=133014761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,103:0.33:313
chr2	133014786	rs72869468	G	A	3644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.802;NF=36;NR=59;PP=1187;ReadPosRankSum=0.066;SC=CAGGAGACCGGCATGCCCCCC;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=95;TCR=159;TR=95;WE=133014796;WS=133014761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,113:0.39:292
chr2	133075726	rs2598810	A	G	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.652;NF=31;NR=25;PP=840;ReadPosRankSum=0.646;SC=CACACTGGAGAGAAGCCCTAC;SOR=0.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=56;WE=133075734;WS=133075716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr2	133075904	rs113311843	C	CA	2989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.596;NF=22;NR=46;PP=2510;ReadPosRankSum=0.367;SC=AGAAACAATACAATGCAATGT;SOR=0.519;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=68;WE=133075912;WS=133075894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,104:0.46:224
chr2	133402607	rs1131671	C	T	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1053;SC=TGGTTTTATTCATTTACTGTG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=133402615;WS=133402597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	133683658	rs2577634	G	T	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=11;PP=544;SC=ACACACTTTAGGTCCATGTGT;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=133683666;WS=133683648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	133881425	rs2278457	G	A	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=836;ReadPosRankSum=1.589;SC=AAGCAGAAGGGAGTACATGGG;SOR=0.688;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=61;WE=133881433;WS=133881415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,76:0.45:169
chr2	133971448	rs13393624	T	A	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=906;ReadPosRankSum=-2.205;SC=CTAGAGGAATTCCTTCCTTGG;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=60;WE=133971456;WS=133971438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr2	134884700	rs6430498	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=539;ReadPosRankSum=1.209;SC=GCCCCACGTGGTGAGGATATG;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=37;WE=134884708;WS=134884690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr2	135076111	rs4954134	C	G	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=143;SC=GTTCTTTAGGCCACAGCTTGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=135076119;WS=135076101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	135096097	rs7598410	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=629;SC=AATGATATTCTCTCAGGGTGA;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=135096105;WS=135096087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	135160755	rs3748900	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=41;PP=922;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GCCATTGGCTGTGAAAATGGG;SOR=1.470;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=113;TCF=33;TCR=80;TR=53;WE=135160763;WS=135160745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,53:0.41:129
chr2	135214259	rs2289470	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=337;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TCCTCATCTCGATGGTCTCAT;SOR=0.561;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=24;WE=135214267;WS=135214249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr2	135214418	rs56024138	AT	A	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=109;ReadPosRankSum=1.205;SC=GCGTATTTTCATTTTTTTTTT;SOR=0.610;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=10;WE=135214426;WS=135214408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr2	135260628	rs80237714	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-9.341;QD=1.05;ReadPosRankSum=3.483;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,32:0.15:220
chr2	135260665	rs201742966	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-7.144;QD=4.02;ReadPosRankSum=-1.932;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,25:0.17:145
chr2	135260672	rs199988367	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-6.750;QD=3.78;ReadPosRankSum=-2.219;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,20:0.16:128
chr2	136467164	rs2304367	C	A	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=54;PP=1527;SC=AGTTCGATTACTTTCCTTAGG;SOR=2.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=73;WE=136467172;WS=136467154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	136527443	rs113881162	G	GTGAT	5470.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=45;PP=1597;SC=AACTGAGGTTGTGATTGATTA;SOR=0.950;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=55;WE=136527451;WS=136527433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	136545844	rs1042712	C	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=29;NR=12;PP=928;SC=GGCCGGTAAACATAGATGAAG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=136545852;WS=136545834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	136546110	rs2278544	A	G	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=212;SC=TGGTGGGTCCAGCATCTAGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=136546118;WS=136546100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	136548169	rs892716	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=CACTCCTGCAAATAGCAGATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=136548177;WS=136548159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	136548192	rs1808756	G	A	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=81;SC=TCCAACAGGGGAAGGTGCACG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=136548200;WS=136548182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	136555659	rs2322659	T	C	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=53;PP=2235;SC=CATCACCTCATTGTAATCTCC;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=136555667;WS=136555649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	136558157	rs748841	C	T	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=155;SC=TAAGAACAAGCGCCCAGAGGA;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=136558165;WS=136558147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	136561557	rs2304371	G	A	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=36;PP=1258;SC=GGCTCATTCAGCGTGATCCAA;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=136561565;WS=136561547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	136565028	rs10928549	C	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=652;SC=CCTCCATGCACCCAACCCACT;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=136565036;WS=136565018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	136569848	rs12988076	C	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=382;SC=GTACCACCCACCTTCCAATCA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=136569856;WS=136569838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	136575199	rs6719488	G	T	8369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=127;PP=2965;SC=AGTAGGCAACGCCTGGGAGGC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=130;TCR=128;TR=257;WE=136575207;WS=136575189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr2	136575534	rs4954449	T	C	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=61;PP=2386;SC=GCTTCCCAGATTCTCTGATAG;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=46;TCR=61;TR=107;WE=136575542;WS=136575524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	136594158	rs2236783	G	A	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=26;PP=2219;SC=CATCACTGAGGGTCTGGAGTT;SOR=1.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=71;TCR=26;TR=97;WE=136594166;WS=136594148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	136610598	rs4988226	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=516;SC=TACCACTTAAAGAAGTATTAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=136610606;WS=136610588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	136614255	rs309180	G	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=25;PP=1470;SC=TGTCTCACTCGATTACTCCAA;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=136614263;WS=136614245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	136622825	rs309177	A	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=43;PP=1146;SC=ACAACATAGCATGGGAAGTCA;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=136622833;WS=136622815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	136873549	rs2680880	A	T	1880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=54;PP=1622;SC=GTTAAAAAAAATTTTTAAAGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=136873557;WS=136873539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	137639616	rs1465612	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=535;SC=TAATGAAAAACTTGCAATACC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=137639624;WS=137639609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	137640006	rs11298935	CT	C	222.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=167;SC=AAAATAGACTCTTTTTTTTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=137640014;WS=137639996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	137814477	rs17727482	C	G	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=2641;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TCATAGCTCCCCCTCTCTTTG;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=70;WE=137814497;WS=137814467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,76:0.49:155
chr2	137814489	rs61748666	T	G	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=2949;ReadPosRankSum=0.075;SC=CTCTCTTTGGTGGTTTGCAAT;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=74;WE=137814497;WS=137814467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr2	137852550	rs61741426	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1537;ReadPosRankSum=0.191;SC=AAGACATGCCGTTCAGGGAGT;SOR=0.864;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=89;WE=137852558;WS=137852540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,103:0.58:177
chr2	137852698	rs7561482	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=531;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CCAGGTATTACGCCTTTATGC;SOR=0.467;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=32;WE=137852706;WS=137852688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr2	137917922	rs4954474	T	A	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=61;PP=1665;ReadPosRankSum=-0.071;SC=ACTGTCATGATCCTCAGGGGA;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=264;TCF=122;TCR=142;TR=111;WE=137917930;WS=137917912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,134:0.44:305
chr2	137928320	rs61746979	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=282;ReadPosRankSum=0.504;SC=GGATTTAGAACGAGGCAGCGC;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=20;WE=137928328;WS=137928310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr2	137990811	rs71419534	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5133;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.403;SC=TGATAGAGTAAGAGGGTTTGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=137990819;WS=137990801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	138000226	rs7605259	T	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=28;PP=666;SC=TTGTGGAATGTGAGCACCTTT;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=36;WE=138000234;WS=138000216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	138030271	rs10182152	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TAGACCTACTGTAAATTATAA;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=22;WE=138030279;WS=138030261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr2	138163391	rs1551281	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=905;SC=TAGTGTGCATTTTACTCTTTA;SOR=3.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=138163399;WS=138163381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	138169158	rs1463285	T	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1316;SC=TTTAATATCTTAATGTCTCTT;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=138169166;WS=138169148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	138208631	rs1453302	G	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=51;PP=1458;SC=AGCTAAAAAAGCTATCCTCAT;SOR=3.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=138208639;WS=138208621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	138237038	rs1584435	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=510;ReadPosRankSum=1.618;SC=CTTCAGGTCCCTGTCAGAATG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=35;WE=138237046;WS=138237028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr2	138375815	rs17692768	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.312;SC=ATAAGGGCATTGCATGATGAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=138375823;WS=138375805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	138375896	rs7574994	G	A	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr2	138375896	.	GTC	ATA	1267	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=25;NR=12;PP=1267;QD=35.6883209422;SC=ATAATCAAAGGTCTGTTGTAT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=37;WE=138375910;WS=138375886;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,37:0.57:65
chr2	138375898	rs73961010	C	A	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
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chr2	138376209	rs17743744	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=2.058;SC=TTAGAGTAAGCGGTGCCAGTA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=138376217;WS=138376199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr2	139045972	rs6733578	T	C	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=75;PP=2965;SC=TTCTGCCAGATACCTGTGGTA;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=154;WE=139045980;WS=139045962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr2	139046301	rs12691943	A	G	6567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=105;PP=2965;SC=CCACCATTTCATCGTATCACT;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=94;TCR=105;TR=199;WE=139046309;WS=139046291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr2	139046385	rs13382964	G	A	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=71;PP=2332;SC=CTCCAGCAGGGTCTGCGTGAC;SOR=1.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=95;WE=139046393;WS=139046375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	139308397	rs148464901	T	TTCTCTC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	139429068	rs10803570	G	A	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=93;PP=2965;SC=TGCTGTCTGCGTACGCCATGG;SOR=0.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=68;TCR=93;TR=161;WE=139429076;WS=139429058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	140992337	rs13387241	C	A	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1310;ReadPosRankSum=-1.848;SC=CATGAAATAACGAATATTCTT;SOR=0.858;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=231;TCF=124;TCR=107;TR=89;WE=140992345;WS=140992327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,101:0.39:262
chr2	141004513	rs11895946	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.876;SC=AGTGCTTCCTCTTTCAAAAAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=141004521;WS=141004510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	141004529	rs2129483	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=302;SC=AAAACACCTCAATTGCAGTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=141004537;WS=141004519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	141026986	rs12477489	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=543;ReadPosRankSum=0.745;SC=TAAATAAAGCGTCTGACTTGT;SOR=0.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=36;WE=141026994;WS=141026976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr2	141027926	rs3748865	A	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=883;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CTGCAACAACAAAGAAAAAAA;SOR=0.772;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=51;WE=141027934;WS=141027916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,58:0.41:140
chr2	141032088	rs1386356	C	T	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1008;ReadPosRankSum=0.536;SC=CTTCATAGCGCGTTGGACAGA;SOR=0.925;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=66;WE=141032096;WS=141032078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,78:0.45:172
chr2	141032220	rs76176617	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=565;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GGACATTTTTCTTCAGTCATA;SOR=1.038;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=30;WE=141032228;WS=141032210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr2	141128181	.	G	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=591;ReadPosRankSum=0.256;SC=ATTATTTAAAGATTCTATCCT;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=34;WE=141128189;WS=141128171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr2	141260668	rs4444457	A	G	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=56;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.938;SC=CACACTGTCGATATCCTAGAG;SOR=0.981;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=162;TCF=54;TCR=108;TR=80;WE=141260676;WS=141260658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,90:0.47:192
chr2	141267744	rs1948051	T	C	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=79;SC=AGGAGGCGATTGTAGTTATTG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=141267752;WS=141267734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	141283603	rs1352047	T	G	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=52;PP=1626;SC=TACCTCATTTTCAAAGATTAT;SOR=3.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=61;WE=141283611;WS=141283593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	141284041	rs7562323	A	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=266;SC=AACTCTGGGAAGCCAAACTTG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=141284049;WS=141284031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	141298467	rs6729619	A	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1172;SC=TCATGAATACACTAACACAAT;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=141298475;WS=141298457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	141298674	rs13013854	T	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr2	141298682	rs11694934	G	C	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=69;PP=996;SC=AATAAAGAGGGTGTATTGGTA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=100;WE=141298690;WS=141298664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	141298749	rs11694970	G	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=16;PP=459;SC=TAAACTATTAGACTGCCTCAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=141298757;WS=141298739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	141299317	rs9287535	A	G	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=12;PP=1281;SC=TATACAATGAAAAAACACATT;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=141299325;WS=141299307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	141473409	.	CA	C	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=26;QD=34.5;SC=TGAATATAAACATTTTTTTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=141473417;WS=141473399;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr2	141473505	rs4954852	A	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=0.598;SC=GAAAACTCACATAAAACTTGG;SOR=0.973;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=22;WE=141473513;WS=141473495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr2	141474402	rs5834770	G	GA	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=459;ReadPosRankSum=-1.043;SC=ATAAGACACAGAAAAAAAATA;SOR=0.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=27;WE=141474410;WS=141474392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr2	141474456	rs1372255	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=0.680;SC=GTGTTAGGATCATATTGCAAC;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=141474464;WS=141474446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr2	141528358	rs73961489	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=300;ReadPosRankSum=0.359;SC=TTTTTCTAATGTTTAACTGAC;SOR=1.426;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=16;WE=141528366;WS=141528348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
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chr2	141533646	rs78669171	A	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=0.775;SC=GACCTGGCACAAATTCATTAG;SOR=0.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=141533654;WS=141533636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	141533662	rs996361	T	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=565;SC=ATTAGTGTGATTTACCTTGCT;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=141533670;WS=141533652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	141571329	rs3749010	T	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=0.529;SC=TTCCATTCCCTGAACTGATCC;SOR=0.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=30;WE=141571337;WS=141571319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr2	141571440	rs17575847	C	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=1.201;SC=CCACCTAGCACCACTGGATTT;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=141571448;WS=141571430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	141571456	rs60071104	G	GA	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=-0.263;SC=GATTTGAGGGGAAAAAAATAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=141571464;WS=141571446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	141571480	rs17575875	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GAAAGTTCAGATTTTTGTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=141571488;WS=141571470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	141598473	rs35745624	A	AT	4352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=25;PP=2988;SC=TTTAAAAAAAAAATCATACTT;SOR=2.366;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=85;WE=141598481;WS=141598463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	141598681	rs74787922	A	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=761;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AGGAAAGAGAAGATTTAAAGG;SOR=0.652;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=102;TCF=22;TCR=80;TR=55;WE=141598689;WS=141598671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr2	141707694	rs1980343	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=4;PP=223;SC=CATGTATATTCTTGCCTAATA;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=141707702;WS=141707685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	141709419	rs1429348	T	G	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=34;PP=1594;SC=AGTGAGCATTTGGTACTTGCC;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=141709427;WS=141709409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	141747249	rs1429365	A	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=752;ReadPosRankSum=0.833;SC=GGGAAGCAAGATTAATTATTT;SOR=0.505;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=18;TCR=56;TR=43;WE=141747257;WS=141747239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr2	141747293	rs1429366	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=0.961;SC=TTTTGAATGATAGTTACAGAA;SOR=1.578;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=19;WE=141747301;WS=141747283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	141751461	rs11678316	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=467;ReadPosRankSum=0.703;SC=TAGGTTCAATCTGCATCAAAG;SOR=0.079;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=25;WE=141751469;WS=141751451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr2	141751592	rs13007735	G	A	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1710;ReadPosRankSum=0.150;SC=CATCGCTTCCGTCTAGGCAGT;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=100;TCR=102;TR=105;WE=141751600;WS=141751582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,125:0.50:250
chr2	141762830	rs13413663	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=278;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CATTTTAATTCCTTTAGTTTC;SOR=0.404;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=16;WE=141762838;WS=141762820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr2	141771058	rs3791766	T	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=0.249;SC=AAGATAAATCTTTTATAACTT;SOR=0.512;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=141771066;WS=141771048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	141816367	rs189985686	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=359;ReadPosRankSum=2.863;SC=ATGACTCACTCACTTCAACAC;SOR=1.382;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=24;WE=141816375;WS=141816357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr2	141816621	rs1525579	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=205;SC=AAAGATGTCTAACCTATAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=141816629;WS=141816611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	141945949	rs1249434	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=581;SC=TCTTTTTAAACGCAAACTTTT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=141945957;WS=141945939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	142567717	.	AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAG	A	81.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	142567738	rs28529494	G	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.740;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr2	143713700	rs351674	T	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.012;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr2	143718459	.	T	TAAAA	119	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=58.71;NF=1;NR=8;PP=119;QD=14.2222222222;SC=TTTCAAAAGTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=9;WE=143718467;WS=143718449;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,9:0.22:41
chr2	143746494	rs10496935	C	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=561;ReadPosRankSum=-1.566;SC=GTCATCACTTCATTGTCCCTG;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=31;WE=143746502;WS=143746484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr2	143787161	rs6429999	C	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.796;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr2	143787274	rs6430000	C	T	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=36;PP=1102;SC=TTACCTAATGCCATTTTTATT;SOR=1.306;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=56;WE=143787282;WS=143787264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	143791014	rs2304700	G	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=594;ReadPosRankSum=-0.890;SC=ATGAACAAGGGACAGAAGGCA;SOR=0.298;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=40;WE=143791022;WS=143791004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr2	143798189	rs9013	A	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=955;ReadPosRankSum=2.240;SC=TGTTCCAAACAAAGATGTTTT;SOR=0.313;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=56;WE=143798197;WS=143798179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr2	143913004	rs2580857	T	G	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=689;SC=TCATGGAAAATTGTATGTTTA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=143913012;WS=143912994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	143973860	rs1451805	G	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=188;SC=GAAAACTTCCGTCACTGCAAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=143973868;WS=143973850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	143986002	rs12691671	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=-1.352;SC=TCCATACCACTTATAGATTTT;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=143986010;WS=143985992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	144194565	rs17230746	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=464;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TAAGTCACTACGACAGTGATA;SOR=0.785;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=35;WE=144194573;WS=144194555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr2	144934655	rs5834992	A	AG	676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=673;SC=ACAGCACCAAAGGGGAAATCC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=144934663;WS=144934645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	145121339	rs10206546	G	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=716;SC=TTGACTGCACGCAGTCTAAGT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=145121347;WS=145121329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	145255210	rs12691693	T	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=704;ReadPosRankSum=-0.616;SC=CTTGTAATAATAGCAGAATGA;SOR=0.413;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=47;WE=145255218;WS=145255200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr2	145255399	.	TATATATATATATGTCATTCTCAACATATATATATATATGTCATTCTCAAC	T	392.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;MQRankSum=0.498;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.414;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr2	145255430	.	A	AT	340	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=64.86;NF=0;NR=8;PP=340;QD=43.875;SC=CAACATATATATATATATGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=145255438;WS=145255420;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr2	145275180	.	GT	G	423	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=423;QD=89.6;SC=GTTTGTTACTGTTTGGTGTGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=5;WE=145275192;WS=145275170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,5:0.24:21
chr2	145275181	.	TTTG	T	189.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	145275183	.	TG	AC	394	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=394;QD=55.9334843578;SC=TGTTACTGTTTGGTGTGTTGC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=8;WE=145275192;WS=145275170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,8:0.29:28
chr2	145275184	.	G	GAC	189.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	147596973	rs4411641	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=258;ReadPosRankSum=0.117;SC=CTAAATTTGAATGATAAAATA;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=16;WE=147596981;WS=147596963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	148657117	rs1128919	G	A	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1264;ReadPosRankSum=-1.633;SC=CTTATTTTCCGGAGATGGAAG;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=68;WE=148657125;WS=148657107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,84:0.58:146
chr2	148657300	.	C	G	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.862;SC=ATTTTTCCCCCCCTTTTCCAC;SOR=0.882;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=275;TCF=147;TCR=128;TR=104;WE=148657308;WS=148657290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,127:0.39:327
chr2	148674797	rs3764955	G	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TCTTATGCATGGTTTATTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=148674805;WS=148674787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	148676092	.	G	C	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=778;ReadPosRankSum=0.419;SC=ACCATGGCTAGAGGATTGGCA;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=52;WE=148676100;WS=148676082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr2	148680427	rs2303392	G	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=0.265;SC=ACGCTATAGTGTGTATACCTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=148680435;WS=148680425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr2	148716428	rs2307394	T	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CAAAGCATGATTTATTAACTA;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=19;WE=148716436;WS=148716418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr2	148733548	rs2307399	T	TA	1934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=40;PP=1299;SC=TCAAATCCTTTAAAAAAATTG;SOR=1.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=43;WE=148733556;WS=148733538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	149243260	rs2121344	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=272;SC=GAGAGGCATCGAATCTCCGAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=149243268;WS=149243250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	149449185	rs6724787	G	A	6892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=105;PP=2965;SC=ATTTGTTTCTGCCAGGCATTT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=215;WE=149449193;WS=149449175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	149520214	rs10193313	C	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=233;SC=GCAATGTTTTCTTATATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=149520222;WS=149520204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	149853960	rs6738277	A	G	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.235;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=1090;ReadPosRankSum=0.944;SC=GTATATGGCAAGGGACAGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=48;WE=149853968;WS=149853950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr2	150062776	rs79466863	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CTTCTGATACGGTTGATACAT;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=6;WE=150062784;WS=150062766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	150427516	rs4500908	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=369;SC=AAGTCTTAATCTATTACCAAA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=150427524;WS=150427506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	150432377	rs12232959	C	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=352;SC=AATAAACATTCCAGGTAGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=150432385;WS=150432367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	150432469	rs10932467	G	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	150432976	rs11545261	C	T	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=36;PP=1375;SC=CTGGACATGTCTGTATTGCAC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=150432990;WS=150432966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	150433128	rs11680630	C	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=271;SC=TGTTATAAACCTGTCTTCCTT;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=150433136;WS=150433118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	150443689	rs4667420	C	G	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=67;PP=2728;SC=ACAAAACAGACGAGTGATCGA;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=131;WE=150443697;WS=150443679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	150443813	rs4667419	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=32;PP=897;SC=CCAGAACTCGCCCCCATGCCA;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=150443821;WS=150443803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	151328284	rs11338446	GA	G	1609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=5;NR=48;PP=847;SC=CACTATGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.338;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=53;WE=151328293;WS=151328273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	151900223	rs7589036	T	C	12106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=213;NR=155;PP=2965;SC=GGAACTAGATTGGTTACCACA;SOR=0.968;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=368;TCF=213;TCR=155;TR=368;WE=151900231;WS=151900213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,449:1.00:449
chr2	151900390	rs150701043	TAAAAACAAAAAC	T	1927.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=2990;SC=ATTGTGAGCTTAAAAACAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=26;WE=151900409;WS=151900380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	152108261	rs4665119	T	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=666;SC=CCACTTTCTTTTCTCTGCAGA;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=152108269;WS=152108251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	152109159	rs289885	C	T	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=844;SC=TTGCATTTTCCTTCCTAGAAG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=152109167;WS=152109149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	152117780	rs2271811	T	C	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=693;ReadPosRankSum=2.759;SC=ATCGTTCTTATTAGCCCTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=40;WE=152117788;WS=152117770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr2	152117957	rs2271813	T	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=507;ReadPosRankSum=0.092;SC=AGCCTAGTCCTGAGCCTCTGG;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=39;WE=152117965;WS=152117947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr2	152118032	rs80001583	G	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=1.586;SC=ACCTGGGAAGGGTGCAGCGAG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=152118040;WS=152118022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	152118271	rs55775354	G	A	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,55:0.42:132
chr2	152118275	rs56376752	A	G	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,56:0.41:138
chr2	152118338	rs35240993	G	GT	882.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.624;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TTTTGGTTTCGTTTTTTGTTC;SOR=0.416;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=80;TCF=13;TCR=67;TR=26;WE=152118346;WS=152118328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr2	152138522	rs3771886	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=365;ReadPosRankSum=-1.038;SC=CCTTCTTTAGTTGAATATTTT;SOR=1.519;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=20;WE=152138530;WS=152138512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	152139271	rs10169816	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=0.531;SC=TAAAGCCTAACGGCCTCCCAA;SOR=0.941;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=5;WE=152139279;WS=152139261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	152139416	rs1048135	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TTCATCTGGCGAATGCTCCTT;SOR=0.850;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=16;WE=152139424;WS=152139406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr2	152139493	rs10182245	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=2.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=0.832;SC=AATAAATATTATAAGCATAGC;SOR=1.609;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=13;WE=152139501;WS=152139483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr2	152266473	rs2290368	T	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=713;ReadPosRankSum=0.178;SC=CAGCCGGAGCTGGGAAAGTCG;SOR=0.558;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=59;WE=152266481;WS=152266463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr2	152266731	rs2290367	T	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.312;SC=GAATGTGGCGTGGGCTCAGGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=152266739;WS=152266721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	152267072	rs4664045	T	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1250;ReadPosRankSum=0.998;SC=TAGCGGAGAGTGGGGCGCTCT;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=72;TCR=85;TR=79;WE=152267080;WS=152267062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,93:0.50:186
chr2	152267672	rs7585604	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=416;SC=TTCATTTGCAGGAGTTAGAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=152267680;WS=152267662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	152273503	rs6735771	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=487;SC=ATGAGAGACAGACATTAAAAG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=152273520;WS=152273493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	152293199	rs146266097	ATTAATATT	A	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.282;SC=ATACCTGCATATTAATATTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=152293214;WS=152293191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr2	152316344	rs75645585	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.253;SC=GCCATTTGCTGTTGAATTAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=152316352;WS=152316338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	152317669	rs116443402	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=330;ReadPosRankSum=0.084;SC=TTGAATCTTCGTCTTTAAAAG;SOR=1.207;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=20;WE=152317677;WS=152317659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	152320118	rs2123465	G	A	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=964;ReadPosRankSum=-0.554;SC=AGCAGCAACAGTGGAAAATGC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=52;WE=152320126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr2	152322095	rs2444257	A	T	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.318;SC=AATGAAAAATAATGAAGAAAT;SOR=0.671;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=101;TCR=66;TR=77;WE=152322103;WS=152322085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,88:0.45:194
chr2	152325288	rs115283798	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=847;ReadPosRankSum=-1.576;SC=GTTATTTAGGCTTCTTGCTTA;SOR=0.837;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=129;TCF=38;TCR=91;TR=50;WE=152325296;WS=152325278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,63:0.43:147
chr2	152331418	rs1065177	C	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.694;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CAAAAACCTTCTGGCACAGAT;SOR=1.985;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=21;WE=152331426;WS=152331408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr2	152349026	rs2288195	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=0.057;SC=AGGAGAGACCGTGAATGAGTG;SOR=1.314;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=23;WE=152349034;WS=152349016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr2	152349798	rs115730804	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=393;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TGAGAAAGGCGTGTTTTTATG;SOR=0.065;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=24;WE=152349806;WS=152349788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr2	152350462	rs4664455	T	C	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=933;ReadPosRankSum=0.821;SC=GGGGGAAATGTTATGTTTAAT;SOR=1.595;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=45;WE=152350470;WS=152350440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr2	152369117	rs13023600	T	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=4;PP=1743;SC=CGTGAGCCACTGCACCTGGTG;SOR=4.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=65;WE=152369125;WS=152369107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	152417767	rs115631125	C	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=515;ReadPosRankSum=0.199;SC=CATAGAGGGGCGTGTCTGTGA;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=34;WE=152417775;WS=152417757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr2	152432311	rs33988153	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=350;ReadPosRankSum=0.542;SC=CTCTGTACTTTGGCTGTGGAA;SOR=1.483;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=30;WE=152432319;WS=152432301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	152490458	rs6710212	A	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=57;PP=1912;SC=AGTTGCTTGCAGTAACCATCT;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=152490466;WS=152490448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	152500449	rs13013209	C	G	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.367;NF=30;NR=38;PP=1124;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCTGGCACTTCTTGGCCAACA;SOR=0.933;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=68;WE=152500457;WS=152500439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr2	152527572	rs7426114	C	T	5807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=82;PP=2965;SC=TGAGCCAACACCATGCCCATG;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=176;WE=152527580;WS=152527562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	152531077	rs6711382	A	G	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=77;PP=2965;SC=ATTAAGTCATACCAATCCCGT;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=152;WE=152531085;WS=152531067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	152536498	rs6735208	T	A	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=60;PP=1880;SC=GCAGGTTGTATTTGTGAATAA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=96;WE=152536506;WS=152536488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	152552062	rs6433569	A	C	8862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=116;PP=2965;SC=TTGTCAGTACATCACATGGTA;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=285;TCF=169;TCR=116;TR=285;WE=152552070;WS=152552052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr2	152566433	rs12464543	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=23;PP=708;SC=TACCATTACAAAAATGATTAG;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=152566441;WS=152566423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	152573902	rs34733773	A	AGGC	5455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=30;PP=2924;SC=TCTTCAAGGGAGGCAATGTCC;SOR=1.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=62;WE=152573910;WS=152573892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	152573981	rs4611637	A	G	4746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=68;PP=2485;SC=CTGGAGGATCAGCCAGAGGCG;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=133;WE=152573989;WS=152573971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	152581866	rs4300824	T	C	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=64;PP=2965;SC=CTCATAGTAATTCAACTGCTC;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=113;TCR=64;TR=177;WE=152581874;WS=152581856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	152584153	rs4664499	A	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=593;SC=GAGTTGAGATAAGTAATTTCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=152584161;WS=152584143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	152684704	rs150910136	A	AC	1800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.87;MQRankSum=1.201;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=1.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,74:0.86:86
chr2	152729138	rs770609	T	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=CTATAAAGAATTTCAAGAATC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=152729146;WS=152729128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	152828281	rs7607341	C	G	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=870;SC=GAACATCTCTCTCTTCCCCTG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=152828289;WS=152828271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr2	153004736	rs72864741	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.187;NF=12;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GCCTTGTACTCACAGTTAGTG;SOR=0.497;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=27;WE=153004744;WS=153004726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr2	153192324	rs2003332	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.819;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=206;ReadPosRankSum=-0.347;SC=CACCCCGTGCCGGGAGCGAGC;SOR=0.219;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=15;WE=153192332;WS=153192314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr2	153378459	rs4664114	T	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=610;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TTAAACAGAATGCTATGAACC;SOR=0.589;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=64;WE=153378467;WS=153378449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr2	153378574	rs4664592	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.313;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=-2.120;SC=TTATGAAAAAAGTAATGAAAG;SOR=0.213;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=23;WE=153378582;WS=153378564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	153378652	rs4664593	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=0.790;SC=TTGCTTCTGCGACAGAGATAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=153378660;WS=153378642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	153405594	rs1155779	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-0.989;SC=AAATTTCTTTGAGAACTAACC;SOR=0.874;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=22;WE=153405602;WS=153405584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr2	153415170	rs6705427	A	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.615;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CTGGTGGAAAAAACAAAACTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=153415178;WS=153415160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	153415234	rs200953857	T	TG	720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;MQRankSum=1.028;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr2	153415244	rs72868279	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=0.983;QD=26.63;ReadPosRankSum=4.037;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr2	153415376	rs6434098	T	G	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=879;ReadPosRankSum=0.912;SC=GAATTTTATGTGGTCACAGCA;SOR=0.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=59;WE=153415384;WS=153415366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,74:0.46:161
chr2	153417325	rs6713836	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=564;ReadPosRankSum=0.598;SC=AGGAACAGCAAGTTATACATG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=29;WE=153417333;WS=153417315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr2	153435288	rs12693407	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.913;SC=ATTTATAATGGTGTAAGTTTC;SOR=0.223;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=153435296;WS=153435278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	153471255	rs70974877	T	TCAAAACAAAACAAAACAAAA,TCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAA	902.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=500;SC=AAACTCCATCTCAAAACAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=3;WE=153471263;WS=153471245;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.44,0.56:9
chr2	153473435	rs7596408	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=396;SC=CCTGGTAGAAGCAAATATGTA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=153473443;WS=153473425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	153473521	rs12693415	A	C	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=20;PP=1395;SC=GGTCCCTAATAATCTTGGAGC;SOR=1.340;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=153473529;WS=153473511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	153473794	rs2304556	T	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=773;SC=TACCTTCATTTCAGAGGAATG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=153473802;WS=153473784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	153476066	rs5835439	G	GCCA	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=6;PP=572;SC=CGCCGCCGCCGCCCCCTCCTC;SOR=1.244;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=13;WE=153476074;WS=153476056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	153478931	rs7609122	T	C	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=537;SC=TGTGCCGCCTTGTGAAATGTG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=153478939;WS=153478921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	153481943	rs2346532	T	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=18;PP=1395;SC=TTCTCTTTGATGTCTTTAGCT;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=153481951;WS=153481933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	153482128	rs12478681	G	A	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=74;PP=2777;SC=CAGCAAAGCCGGCATGGGTGT;SOR=1.186;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=48;TCR=74;TR=122;WE=153482136;WS=153482111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	153492910	rs1561267	G	T	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=17;PP=926;SC=TCCCCATTGAGTTTCACTGGG;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=153492918;WS=153492900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	153497168	rs1465818	C	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=274;SC=TTCTCTGCAACTGAGCAGAAT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=153497176;WS=153497163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	153502243	rs71394494	G	GTATT	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=324;SC=TTGGGCAAGGGTATTTGCTGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=153502251;WS=153502233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	153504552	rs12693429	G	A	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=34;PP=1068;SC=TAGCAAACACGGAAGAATTTT;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=153504560;WS=153504542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	153514583	rs6713779	G	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=610;SC=AGATACCATTGTTATATAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=153514591;WS=153514573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	153514610	rs12999331	T	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=441;SC=TAAGAACATCTATGTGTAACA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=153514618;WS=153514600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	153519524	rs1036526	A	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=14;PP=1251;SC=GAATTCCATTAGAAAAAAATA;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=153519532;WS=153519514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	153520782	rs3762507	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=549;SC=GAGAAAAATTATATTTGGAAA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=153520790;WS=153520772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	153520819	rs3762506	C	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=353;SC=GAGAAATAAGCGTCTAACATG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=153520827;WS=153520809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	153529361	rs2304559	T	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=157;SC=TTATTAGACATAAAACAACTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=153529369;WS=153529351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	153535670	rs10166987	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=25;PP=718;SC=TTAAAATCTACAGAACTGAGA;SOR=1.347;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=38;WE=153535678;WS=153535660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	153549814	rs10172024	G	C	5467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.56;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	153549819	rs13003670	C	T	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.85;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	153572438	rs2346548	C	T	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=14;PP=1170;SC=GACCTAGATTCTGAAATCTTG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=153572446;WS=153572428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	153576548	.	G	GTCAGTCTTAAATGATTGGCTGCCAATGTTTCATTTCTTTATCATTCCCCTCCCCCCTTTTTTACCCTTTTTTGAATGTGCATGGAATGTAAATTA	3839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=57.31;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	153576580	.	A	ATTTC	1937	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=59.3;NF=3;NR=34;PP=1937;QD=53.0810810811;SC=CCAATGTTTCATTTATCATTC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=37;WE=153576588;WS=153576570;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr2	153577013	rs9646744	G	A	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=55;PP=2135;SC=TTATAGTATTGCTTTCCTACC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=153577021;WS=153577003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	155099146	rs9288324	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.615;SC=CATCTTGGTAGTATCTCTGCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=155099154;WS=155099143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	155306884	rs201440806	A	AT	676.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=698;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AAAGCTAAAGACGAAATAAGC;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=18;WE=155306893;WS=155306874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr2	155306885	rs697648	C	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=1065;SC=AAGCTAAAGACGAAATAAGCT;SOR=2.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=42;WE=155306893;WS=155306874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	157183211	rs35479735	TC	T	996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=759;SC=CTGGATTGTCTCCCTCCCTCC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=157183219;WS=157183201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	157189011	rs834836	G	C	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=1262;SC=CTCCGCGTCTGTCTTCATTCA;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=157189019;WS=157189001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	157406249	rs2116665	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1103;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGGAAAGTGCGTGTGAGCGGC;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=74;WE=157406264;WS=157406239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr2	157406296	rs2116664	A	C	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=853;ReadPosRankSum=0.041;SC=TATGCCAGGTATCTGGGAGGG;SOR=0.538;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=58;WE=157406304;WS=157406286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,79:0.61:130
chr2	157425801	rs67602053	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=-1.165;SC=TGTTATTGGTAAGTTGATAAA;SOR=0.976;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=7;WE=157425809;WS=157425791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr2	157426114	rs147508905	ACTGGCAGCAAT	A	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CAGTGACAGAACTGGCAGCAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=157426132;WS=157426104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	157427593	rs1469652	T	C	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=20;NR=12;PP=530;SC=GCTTTATTTCTCATTTTCTAA;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=157427601;WS=157427583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	157427837	rs1469651	C	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=565;ReadPosRankSum=0.364;SC=ACCACAATTCCTATTGTAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=15;WE=157427858;WS=157427827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr2	157427850	rs1469650	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.262;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=565;ReadPosRankSum=1.621;SC=TTGTAAACGCGGAATGGCTTA;SOR=2.066;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=157427858;WS=157427827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr2	158157361	rs3214040	C	T	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=44;PP=1912;SC=TCTATGGCCACGGAGACCACC;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=88;WE=158157369;WS=158157351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	158162475	rs3214039	C	T	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=23;PP=651;SC=AGAGAGTCCACCACTAAACAC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=158162483;WS=158162465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	158162521	rs3816595	T	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=225;SC=GTGTGGGTCCTGCAGTCAACT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=158162529;WS=158162511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	158165004	rs6728956	C	T	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=265;SC=TTAACTGTTGCTAACAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=158165012;WS=158164994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	158283710	rs155614	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=325;SC=TATTCCTCCAAAGGTAATTGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=158283718;WS=158283707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	158284056	rs155613	C	T	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=105;SC=AAACGAAATACAAATGTTACA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=158284064;WS=158284046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	158291107	rs70987792	T	TAG	211.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=1.221;SC=TGTGTGTGCGTAGAGAGAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=158291115;WS=158291097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
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chr2	158400908	rs6728987	C	T	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=13;PP=1562;SC=AACTAAGTACCTCTATCCTCA;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=158400916;WS=158400898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	158401137	rs10432556	T	C	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=50;PP=1184;SC=AACAAGAAAATGTAATTTTGT;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=61;WE=158401145;WS=158401127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	158626980	rs1146031	C	T	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=36;PP=1591;SC=CGGCAACATTCTCCCCTTGCC;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=73;WE=158626988;WS=158626970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	158636910	rs2227861	G	A	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=38;PP=1454;ReadPosRankSum=0.724;SC=AGCACTCCACGGCTTGGCCAG;SOR=0.524;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=90;WE=158636918;WS=158636900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,108:0.55:196
chr2	158637137	rs1866885	A	G	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=35.38;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	158637138	rs35392775	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.000;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.898;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr2	158655883	.	C	CAA	244	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=11;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=60.89;NF=14;NR=3;PP=244;QD=14.8823529412;SC=TATAGTAAGCCAAAAAAAAAA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=17;WE=158655891;WS=158655873;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,17:0.61:28
chr2	158978178	rs10804389	C	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=370;ReadPosRankSum=-0.403;SC=ATGCCAGCAACTCTTTGTTAT;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=20;WE=158978186;WS=158978168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr2	159028800	rs2222390	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=412;SC=AATTTAAATAACAATTCATTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=159028808;WS=159028790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	159035344	rs3836162	A	AT,ATT	2194.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=2.782;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.000;QD=21.31;ReadPosRankSum=-1.088;SOR=1.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,56,45:0.54,0.44:103
chr2	159077019	rs958671	A	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=13;PP=891;SC=TATAGAAAAAAGTTCCCTCTG;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=159077027;WS=159077009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	159166069	rs7559772	T	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=60;PP=1827;SC=AAAGTCTTTCTTATTTTTATT;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=75;WE=159166077;WS=159166059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	159195225	rs11686762	T	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AGGACTCAGTTTTATCTTATC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=159195233;WS=159195215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	159195562	rs61746487	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=0.506;SC=TAAGTCTTTCAAAGACAGTTT;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=21;WE=159195570;WS=159195552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr2	159312733	rs1111212	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-2.519;SC=ACCTCGTTCCCTTACCAAAAT;SOR=1.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=159312741;WS=159312723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	159312776	rs3796107	GA	TT	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=734;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GAGTCTTTCAGAAGAGTTATG;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=19;WE=159312785;WS=159312766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr2	159434492	rs2356188	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.63;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	159434492	.	GAATAGTTA	AAATAGTTA,AAATAGTTG	98	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=11,5;NR=2,2;PP=98,60;QD=10.2131701959;SC=TACATGTTCCGAATAGTTAAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13,7;WE=159434508;WS=159434482;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:13
chr2	159434500	rs2356189	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.769;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	159434727	rs10933494	T	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=505;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAATAGAATTCTGTCTGTTG;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=28;WE=159434735;WS=159434717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr2	159434802	rs72184107	ATC	A	555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=385;ReadPosRankSum=0.625;SC=TGAATTTTTCATCTCTCTTAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=159434811;WS=159434792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr2	159520085	rs3771679	G	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=1.540;SC=CTTAGCTTGTGTGTGAAGGGG;SOR=0.078;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=159520093;WS=159520075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	159522879	rs2248854	C	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACATATGAGACTGGAACTCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=159522887;WS=159522869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	159530651	rs2711034	A	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=436;ReadPosRankSum=-1.891;SC=TTCTGTAGGAATCACACACCA;SOR=0.192;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=26;WE=159530659;WS=159530641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr2	159534863	rs2356505	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GGAAACACACACAGCCTGTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=159534882;WS=159534856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	159534874	rs2356506	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=376;SC=CAGCCTGTTTCTGCCATAGTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=159534882;WS=159534856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	159534889	rs2711040	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.233;SC=ATAGTTTTGCCATTAGCCCCC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=159534897;WS=159534879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	159661077	rs2271663	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=394;SC=CTGGAGGGATCCCTCTGAGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=159661085;WS=159661067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	159663599	rs9869	T	C	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=53;PP=2105;SC=ATACAGACACTGGATGCCCTG;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=114;WE=159663607;WS=159663589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	159672168	rs1515922	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=486;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AATATTTCATGACCAAGAAGA;SOR=1.964;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=31;WE=159672176;WS=159672158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr2	159672252	rs61740878	G	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=1098;ReadPosRankSum=0.113;SC=TGCACATGGCGCATCAAAAAC;SOR=0.995;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=71;WE=159672260;WS=159672242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr2	159672442	rs10016	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=385;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGTAAATTAAGCAGCTTTTGT;SOR=0.167;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=26;WE=159672450;WS=159672432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	159954175	rs34588551	C	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=22;PP=1033;SC=AGAGACTTCTCCAGTCCTGCA;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=52;WE=159954183;WS=159954165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	160019863	rs12466551	A	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=42;PP=1944;SC=AAAGATGGAAACCTAAGATTA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=160019871;WS=160019853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	160033174	rs759034	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=161;SC=CCAGAGAGCCAGACTTGGGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=160033182;WS=160033164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	160034919	rs4665031	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=322;SC=ACCTTATCCTATTACACGTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=160034927;WS=160034916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	160035195	rs12988603	C	T	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=91;PP=2965;SC=TCCTCAGCAACATCTCCCTGA;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=165;WE=160035215;WS=160035185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	160035207	rs6748288	T	C	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=86;PP=2965;SC=TCTCCCTGAATGGCAAGGCCG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=149;WE=160035215;WS=160035185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	160043591	rs142957747	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=195;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GCTGCTGGCCGTTCCTCCAAC;SOR=0.603;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=14;WE=160043599;WS=160043581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr2	160050682	rs75263328	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=1.181;SC=ATTAAAATGATACCGAAAATT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=160050690;WS=160050672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	160073895	rs4665042	G	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=716;SC=GGTTCAAAGGGGGAGGACATA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=160073903;WS=160073885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	160075886	rs146371641	G	GC	6788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=75;PP=2936;SC=GCAGCGTGATGCCCTCAAAGG;SOR=0.764;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=35;TCR=80;TR=110;WE=160075894;WS=160075876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	160076026	rs2303334	C	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=33;PP=997;SC=AGCCACATGCCTGGTATTCCT;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=160076034;WS=160076016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	160076077	rs2303335	T	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=700;SC=ATCCGGCCAGTGTCACCCTTC;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=160076085;WS=160076067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	160082354	rs12692544	C	T	7433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.48;SOR=1.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	160082364	rs34344829	A	G	7024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.74;SOR=1.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	160082384	rs13419975	T	A	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=73;PP=2127;SC=TACTGCACAGTCTCCATGTAA;SOR=1.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=104;WE=160082392;WS=160082374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	160084224	rs2042494	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=679;SC=ATGTTCTGTCGTGGGTTTGCA;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=160084240;WS=160084214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	160084263	rs2042495	A	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=24;PP=1115;SC=ACGGTGTTCCAGGTGTGGGAG;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=160084271;WS=160084253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	160084534	rs2288111	A	G	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=109;SC=CTTCTCCAGCAGTGAAGGCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=160084542;WS=160084524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	160087535	rs3821301	T	G	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=77;PP=2370;SC=CCTTAAGAAATCCCCATTTGT;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=36;TCR=77;TR=113;WE=160087543;WS=160087525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	160112881	rs7591849	G	T	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=18;NR=28;PP=805;SC=TGTTCTGTGCGCCTTGCTTAA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=160112889;WS=160112871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	160114437	rs3213715	G	A	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1039;SC=ATTAATACAAGGTGAGGTTAA;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=160114445;WS=160114427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	160116281	rs4665052	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=811;ReadPosRankSum=2.029;SC=TCTAATAAACATAACTTTCAT;SOR=0.415;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=43;WE=160116289;WS=160116271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr2	160132196	rs35620648	A	AC	2700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=37;PP=1384;SC=AAACACTGAAACCCCCCCAAA;SOR=0.906;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=47;WE=160132204;WS=160132186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	160136337	rs174264	G	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=27;PP=1083;SC=TTCACTATGCGGACACCTCAT;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=160136345;WS=160136327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	160176943	rs174229	A	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=19;PP=617;SC=AAAGAAAACAAATAATTAGAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=160176951;WS=160176933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	160181543	.	TTA	T	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=65.19;NF=0;NR=3;PP=93;QD=36.0;SC=CTTTCAGTTATTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=160181552;WS=160181533;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr2	160182302	rs415793	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=373;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TTTTAGTGAACTACTTGTAGA;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=25;WE=160182310;WS=160182292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr2	160203934	rs965163	A	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=2;PP=914;SC=ATATTAGGCAAGTAATAAACA;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=160203942;WS=160203924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	160231108	rs6742788	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=424;SC=CCAAAAGCCTATTTTTGCTTA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=160231116;WS=160231098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	160239378	rs2302927	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=294;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TTAAAAGAGCAAAACATGAGT;SOR=0.174;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=15;WE=160239386;WS=160239368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	160241785	rs372315034	T	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=798;ReadPosRankSum=0.499;SC=GCTCAGTTTGTCCACAGTGGG;SOR=0.878;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=101;TCF=24;TCR=77;TR=42;WE=160241793;WS=160241775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr2	160241936	rs1469015	A	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	160243183	rs918351	TA	AT	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=1420;SC=CATGATTTCGTATCTTCTAAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=160243192;WS=160243173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	160255276	rs62171541	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=1.441;SC=ATATAACTGATGCCAGTATAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=160255284;WS=160255266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	160261721	rs35567166	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.849;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.128;SC=ATAAAGGATATAATTATTACT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=160261737;WS=160261711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	160261729	rs74694096	AC	A	346.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=34.67;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	160285060	rs57144725	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACTCCTCAAACAACCCAAATA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=160285068;WS=160285050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	160285575	rs12473781	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-1.133;SC=CCCTTTGCTCCGGCTCTTCTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=160285583;WS=160285565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	160285660	rs10754963	T	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.355;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=206;ReadPosRankSum=0.300;SC=TACATCAAACTTGCATAAATA;SOR=1.195;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=17;WE=160285668;WS=160285650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr2	160295297	rs2302923	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-1.751;SC=CGGGTACTTTCAAAGTGTTCT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=160295305;WS=160295287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	160304741	rs12470533	A	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=0.138;SC=TCACTTATGTAAATGTGGATA;SOR=1.051;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=23;WE=160304749;WS=160304731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr2	160335315	rs72947590	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TTGTATACTTTTAAAAATATA;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=160335323;WS=160335305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	160602258	rs59109898	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=-1.651;SC=TCTCTGAAATAAAACTTCTTC;SOR=1.880;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=160602266;WS=160602248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	160604452	rs11555185	C	T	3152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=69;PP=1877;ReadPosRankSum=0.006;SC=GTTCTAGGGACTCCAGAAATT;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=251;TCF=108;TCR=143;TR=123;WE=160604460;WS=160604442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,149:0.50:296
chr2	160605268	rs1365803	T	C	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=594;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTGCAGTCCCTCCAGCACTTG;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=41;WE=160605276;WS=160605258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr2	160621354	.	G	GT	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5048;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=60.9;NF=0;NR=8;PP=94;QD=12.875;SC=GACATTAGTTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=160621362;WS=160621344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	160637267	rs2303552	C	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TAGGTGCACACTGAAAATTTA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=12;WE=160637275;WS=160637257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	160637324	rs2303551	A	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=416;ReadPosRankSum=0.060;SC=GAGAATTGAAAAGCCATCAGT;SOR=0.458;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=27;WE=160637332;WS=160637314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr2	160654524	rs2556106	G	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=287;ReadPosRankSum=-0.726;SC=GGGCGGGATGGCCGGCCGGGT;SOR=0.443;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=22;WE=160654532;WS=160654514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr2	160663435	rs12463589	T	C	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=27;PP=1278;SC=GTACATTTATTTCCTGACTGT;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=65;WE=160663443;WS=160663425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr2	160673526	rs2059696	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=1.013;SC=GTAGTATTATATTCTTCTTTG;SOR=0.338;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=11;WE=160673534;WS=160673516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
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chr2	160708645	rs2162500	C	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=256;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GGTTGCCATTCTGCCATAGGC;SOR=0.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=14;WE=160708653;WS=160708635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr2	160710922	rs2729705	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=-0.500;SC=ATGTTATAGTTGCAAGAAAGC;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=28;WE=160710930;WS=160710912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr2	160711045	rs3951216	G	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-1.165;SC=TTCCAGCACGGTCTAAAGAAG;SOR=0.260;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=19;WE=160711053;WS=160711035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr2	160711556	rs975490	T	G	4164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=79;PP=2603;SC=TATTGTTGAGTCTTGTCCATT;SOR=1.406;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=124;WE=160711564;WS=160711546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	160714990	rs41264213	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=527;ReadPosRankSum=-1.626;SC=TGAAATACCTATAAGAGGAAA;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=27;WE=160714998;WS=160714980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr2	160729005	rs1397706	C	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1085;ReadPosRankSum=2.011;SC=TTTATTTCATCCACATGGCTG;SOR=0.823;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=70;WE=160729013;WS=160728995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,83:0.41:201
chr2	160729134	rs1397705	A	C	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=71;PP=2138;SC=AATTTGTTTTATGGTATTATC;SOR=2.279;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=92;WE=160729142;WS=160729124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	160729186	rs10168271	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=368;ReadPosRankSum=0.893;SC=CTGTCACATGTGTGGGCCCCT;SOR=2.861;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=22;WE=160729194;WS=160729176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr2	160734722	rs2292387	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=-0.857;SC=GACTCCAATCCTGAAGATCAT;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=17;WE=160734730;WS=160734712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr2	160735008	rs2292388	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=789;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CTCAAATCTACAAAAGGAGAA;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=46;WE=160735016;WS=160734998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr2	160737495	rs2729712	A	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=406;SC=CTTACCTTTTATTTTCCAGCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=160737503;WS=160737485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	160737560	rs2729711	G	T	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=23;PP=1657;SC=GGTAAAACAGGAAGAATATAA;SOR=1.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=82;WE=160737568;WS=160737550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	160737621	rs11675155	C	T	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.281;SC=CACAGTTGGGCGTCTTATTGT;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=93;TCR=62;TR=74;WE=160737629;WS=160737611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr2	160738677	rs16822581	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1045;ReadPosRankSum=0.691;SC=ACATCTGCTAGAGAATGAATG;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=73;WE=160738685;WS=160738667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr2	160742862	rs2271383	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=660;ReadPosRankSum=0.579;SC=CTAAGCTATTGGTGAGTGAGA;SOR=1.109;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=37;WE=160742870;WS=160742852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr2	160746800	rs34592866	T	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=720;ReadPosRankSum=-0.009;SC=AAACATAAGCTTCTTTCCAAG;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=45;WE=160746808;WS=160746790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,60:0.41:145
chr2	160760972	rs1397707	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=306;ReadPosRankSum=0.779;SC=GCTCCAGAGCCCCCCCGCCCC;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=16;WE=160760980;WS=160760962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr2	160761082	rs6760195	T	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=944;ReadPosRankSum=0.472;SC=ACTGCGGGGCTGGCGTGCCCG;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=67;WE=160761090;WS=160761072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,72:0.50:145
chr2	160805993	rs6726923	C	G	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=239;SC=CATCACCAACCAGACCAGAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=160806001;WS=160805983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	160807742	rs952184	A	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=559;SC=ATATTTATTAATATTTTTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=160807750;WS=160807732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	160813249	rs3749113	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=0.342;SC=AATTTTCTTGGGCAGAAAGAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=160813257;WS=160813239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	160826648	rs77807608	T	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=666;ReadPosRankSum=0.444;SC=CAAATGAATCTAGGTTCATAC;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=45;WE=160826656;WS=160826638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr2	160833188	rs2715918	A	G	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=27;PP=1760;SC=TGCCAGAGTCATTCTTACCGT;SOR=1.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=160833196;WS=160833178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	160840367	rs1058440	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.703;SC=ACTTGGGATACTCACCCCTCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=160840378;WS=160840357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	160840370	rs5835784	AC	A	269.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=239;SC=TGGGATACTCACCCCTCAGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=160840378;WS=160840357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	160843623	rs6757188	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=302;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CAAATTAAAATAGTGTTGGTC;SOR=0.541;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=23;WE=160843631;WS=160843613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr2	160862183	rs151215519	T	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=625;ReadPosRankSum=0.677;SC=TGTGTTCCAGTGTGTGTACTG;SOR=1.325;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=37;WE=160862191;WS=160862173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr2	160872980	.	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.99;ReadPosRankSum=3.405;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr2	160872990	rs71422290	GT	G	1094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.75;ReadPosRankSum=1.379;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr2	160873005	rs184542449	G	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.17;ReadPosRankSum=3.431;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr2	160873021	rs2715939	G	A	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.54;SOR=2.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	160873270	rs2667040	A	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=34;PP=1036;SC=CTGTGCTGATACCGATGGGCA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=160873278;WS=160873260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	160873294	rs3833577	T	TA	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=533;SC=GCAATTCTTATAAAAAAAATA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=160873302;WS=160873284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	160876827	rs1511213	A	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=466;SC=TGCAAAGGAGATAACACCCTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=160876835;WS=160876817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	160889673	rs2203053	G	A	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=942;ReadPosRankSum=-3.015;SC=AAAACAACCAGGTCTTATTTT;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=37;TCR=94;TR=54;WE=160889681;WS=160889663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr2	160898783	rs3792194	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.250;SC=ATATATCGAAAGCATTTTTTA;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=160898791;WS=160898773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	160901517	rs4665143	A	G	4572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=71;PP=2965;SC=CCAGGCAACCACTGCCTCCTA;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=137;WE=160901525;WS=160901507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr2	160919040	rs11285500	AC	A	352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=369;SC=TCCGCGCCCCACCCCCTCCGG;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=11;WE=160919048;WS=160919030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	160958349	rs34330288	GA	G	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=16;PP=301;SC=TGGTTCCCTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.708;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=20;WE=160958357;WS=160958339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	160964057	rs13009231	G	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.379;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	160964057	.	GGA	TGG	602	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=602;QD=50.4206057586;SC=CAAAGCTGTTGGAGTCATGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=160964067;WS=160964047;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr2	160964059	rs13008664	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=2.057;SOR=1.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr2	160968743	rs66470452	CA	C	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=381;ReadPosRankSum=0.605;SC=TTAGGTTAAACAAGATTCCAA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=13;WE=160968751;WS=160968733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr2	161028992	rs1037694	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TTTCACCAAGTGTATGTTATT;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=161029000;WS=161028982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	161138652	rs1870105	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=330;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TTAAGTTTCAGTTTCCAATTC;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=20;WE=161138660;WS=161138642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr2	161157303	rs62177260	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CATCTTGTTCGGTGCATGCAT;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=5;WE=161157311;WS=161157293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	161797329	rs1524626	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AAACCCTGCCCAGGGACTCTC;SOR=0.146;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=11;WE=161797337;WS=161797319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr2	161797513	rs1524625	A	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=823;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TCATGTTTCAAAACACCAGAG;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=51;WE=161797521;WS=161797503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr2	162059969	rs11884495	A	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=803;ReadPosRankSum=0.308;SC=ATCAGTGAATATCAGGCTAAC;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=45;WE=162059977;WS=162059959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr2	162072738	rs1267034	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=391;ReadPosRankSum=-1.587;SC=TATCTTAATAATATTATAGGG;SOR=0.243;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=21;WE=162072746;WS=162072728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr2	162091836	rs3754970	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=485;ReadPosRankSum=-1.594;SC=ACAGATATTTTTGTTTGTTTC;SOR=0.264;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=28;WE=162091844;WS=162091826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr2	162175290	rs1116165	T	C	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=26;PP=1686;SC=TGAATAAACATTTTTGTGCTT;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=162175298;WS=162175280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	162197734	rs201130240	G	A	53.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.34;QD=17.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	162224193	rs58162668	G	GT	3588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=43;PP=2969;SC=TATAAAAGGAGTTTTTATTTT;SOR=1.009;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=81;WE=162224201;WS=162224183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	162224495	rs2303318	A	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=293;ReadPosRankSum=-1.902;SC=AACTCTCATCATATTACATTT;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=14;WE=162224503;WS=162224485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr2	162241846	rs62188123	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr2	162247772	rs1921674	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=22;PP=779;SC=GATTTAAATTCGAATTTTTGA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=162247780;WS=162247762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	162265270	rs16845844	A	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=262;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TCTGGTCATCATTATTTTTGG;SOR=1.734;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=18;WE=162265278;WS=162265260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr2	162274607	rs200480786	ATGTGTG	A	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=0.241;SC=AGGTGTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=3.596;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=3;WE=162274620;WS=162274597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	162280748	rs890076	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr2	162815262	rs12466127	C	A	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=516;SC=TCTTATGGTACTTTTCTTTAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=162815270;WS=162815252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	162821515	rs4233647	G	A	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=6;PP=973;SC=TACACCTCTCGTTTTAATTTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=162821523;WS=162821505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	162929709	rs1861978	T	G	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=85;SC=CGCAAGAGTTTCAGCCTAAAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=162929717;WS=162929707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	162929732	rs35128070	G	A	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=187;SC=TGAAGACCCCGCGAAGTGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=162929740;WS=162929722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	162929979	rs17574	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=650;SC=GCAGTCCCAGAAGAACCTTCC;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=162929987;WS=162929969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	163030336	rs3764917	T	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=0.447;SC=TTGCATGTGATGAATGTCATT;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=20;WE=163030344;WS=163030326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr2	163051415	rs1468916	C	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=193;SC=AACATCACTTCTAAGTCACAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=163051423;WS=163051405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	163124051	rs1990760	C	T	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=73;PP=2342;SC=TTTTGCAGTGCTTTGTTTTCT;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=111;WE=163124059;WS=163124041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	163128824	rs3747517	T	C	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=38;PP=1518;SC=AACTGTCTCATGTTCGATAAC;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=163128832;WS=163128814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	163136505	rs35337543	C	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=648;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TAAGCCCATACTTCTCTGGTT;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=43;WE=163136513;WS=163136495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr2	163241144	rs34382064	C	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=365;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TAAAAAGTCACCATTTTGTGA;SOR=0.200;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=24;WE=163241152;WS=163241134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr2	163369305	.	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TGGAAAATTTCTCTTTAATTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=163369313;WS=163369295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	163695055	.	T	TC	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CGAGGAGCGCTCCCCCGGAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=163695063;WS=163695045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	164468360	rs2231899	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTAAATAGGCATCAGAACTCT;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=164468368;WS=164468350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	165349459	rs1051160	G	A	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.55;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	165349459	.	GTAAT	ATAAC,ATAAT	363	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=16,34;NR=0,2;PP=330,363;QD=23.9667421789;SC=TTTTCACATGGTAATGTTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=16,36;WE=165349471;WS=165349449;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:36
chr2	165349463	rs11765	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.896;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	165350911	rs115094739	T	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=252;ReadPosRankSum=0.278;SC=TCATTTCTAATACACAAATGT;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=17;WE=165350919;WS=165350901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
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chr2	165358672	rs4667463	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=0.496;SC=AGAAAATAACATAAATTATTA;SOR=1.096;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=165358680;WS=165358662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr2	165424837	rs17437781	A	G	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1204;ReadPosRankSum=-1.444;SC=TTTTCTGTAGAATTATTGGCG;SOR=0.905;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=78;WE=165424845;WS=165424827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,98:0.52:190
chr2	165476253	rs61748245	A	T	7980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=87;PP=2965;SC=ACAGATGTAAATGGAGAACAG;SOR=1.068;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=136;TCR=87;TR=223;WE=165476261;WS=165476243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr2	165477903	rs62173895	G	C	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=468;SC=CGAGGTGCCGGCTAGGCAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=165477911;WS=165477893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	165560236	rs17185198	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=431;ReadPosRankSum=0.256;SC=AGCATTTTTTATACTTACAGA;SOR=0.702;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=28;WE=165560244;WS=165560226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr2	165578581	rs6414069	A	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=524;ReadPosRankSum=0.463;SC=ACAAAACTACACACCTTATCT;SOR=1.104;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=38;WE=165578589;WS=165578571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr2	165578602	rs74459242	C	T	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=973;ReadPosRankSum=0.493;SC=GTCTCATCCACGCTCATGGAT;SOR=0.738;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=59;WE=165578610;WS=165578592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,75:0.59:128
chr2	165584407	rs12692743	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	165630460	rs355865	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=0.306;SC=ATGTGCTTTATGCAATAAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=165630468;WS=165630450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	165657066	rs62173958	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=1.940;SC=ATCTCTCTCCTAGGCAGCATA;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=28;WE=165657074;WS=165657056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr2	165657096	rs62173959	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=459;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TCAAAATTTTGTACTTGAAAT;SOR=0.914;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=26;WE=165657104;WS=165657086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr2	165657142	rs7588491	A	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=228;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TTCATAATGAACCCAAACTGG;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=14;WE=165657150;WS=165657132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr2	165698715	rs71028447	A	AG	710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=640;SC=TCCCACCGCTAGGCTGCGCTT;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=165698723;WS=165698705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	165793764	rs17438137	A	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=0.029;SC=GATGTTTCTGATACCATGGTT;SOR=0.242;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=165793772;WS=165793754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr2	165809138	rs10544528	ATG	A	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=606;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CAGTTGCAGCATGTGTGTGTG;SOR=1.101;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=165809147;WS=165809128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	166012203	rs3731760	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=479;ReadPosRankSum=0.212;SC=GCCACCACACCCAGCCTATGC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=27;WE=166012211;WS=166012193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr2	166018800	.	ATATAT	A	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.397;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.458;NF=7;NR=7;PP=629;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ATCTTAAAAAATATATTATGT;SOR=1.426;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=14;WE=166018812;WS=166018790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr2	166153499	rs7593568	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-1.495;SC=TCTAAGTTTTATTTTATGTGT;SOR=1.179;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=166153507;WS=166153489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	166164215	rs3214603	CA	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=0.284;SC=ATAGAAATGGCAAAAAAAAGG;SOR=0.160;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=5;WE=166164223;WS=166164205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	166170127	rs2121371	T	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=655;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AACCTAATTATAGCCAGTGTC;SOR=0.943;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=41;WE=166170135;WS=166170117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr2	166172317	rs1838846	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=37;PP=827;ReadPosRankSum=0.381;SC=TTTTTTAAAAAAATATGCCAG;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=46;WE=166172325;WS=166172307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr2	166179650	rs1867864	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=711;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTTGTTTCTTCTCTTGTTATT;SOR=0.889;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=47;WE=166179658;WS=166179640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr2	166183577	rs17184707	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.035;SC=TAAAATACTTCCTGACTTGAT;SOR=1.769;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=15;WE=166183585;WS=166183567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr2	166221582	rs3769951	C	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=4;PP=570;SC=GGGGGGGGCACACCTAATTAA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=166221590;WS=166221572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	166221883	rs67174953	GTATC	G	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.736;NF=0;NR=6;PP=269;ReadPosRankSum=0.904;SC=CTATCTATCTGTATCTATCTA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=166221894;WS=166221873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	166229922	rs6432821	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=186;SC=CTTTGTACCATGGAAATGTCA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=166229930;WS=166229912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr2	166514165	rs12620509	C	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=177;ReadPosRankSum=0.306;SC=CCCTAGCCAACAAGGGTTGGC;SOR=0.293;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=17;WE=166514173;WS=166514155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr2	166514594	rs10803800	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TGAGTTAACCATTTTCATATT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=166514602;WS=166514584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	166535918	rs777346	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGCCTTACACCATGACCCCGG;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=67;WE=166535926;WS=166535908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,91:0.57:159
chr2	166610972	rs67722214	CA	C	302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=186;SC=GAGTAAAAACCAAAAAAAAAT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=166610980;WS=166610962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	166611006	rs62174818	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=554;SC=AATTGCCAAACTCAGTCTGAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=166611014;WS=166610996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	166611086	rs41268661	C	T	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=34;PP=1927;SC=CAACATCTCACTTGTGCTTGT;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=99;WE=166611094;WS=166611076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	166618262	rs1968294	C	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=301;SC=AGAGCTGTTACCTGCTTGGGC;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=166618270;WS=166618252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	166618301	rs138707955	C	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=-0.873;SC=CAGTTGAAAACGCTGTTAAAG;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=166618309;WS=166618291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	166621354	rs2113840	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=4;PP=730;SC=TACCACAATATGGATTTGGGA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=166621362;WS=166621344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	166740469	rs115504901	A	G	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1008;ReadPosRankSum=0.412;SC=TGGCTCGTGGAGTCTGTTTCA;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=56;WE=166740477;WS=166740459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr2	166740578	rs34701755	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CATAAATGCCCCAAAAACATA;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=14;WE=166740586;WS=166740568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr2	166788336	rs7592429	T	C	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=58;PP=1879;SC=GCATCCAATGTATTTCCCAAG;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=166788344;WS=166788326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	166797646	rs1432273	C	T	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=69;PP=2965;SC=ATCTGGTTCACAGTCTCCAGG;SOR=0.988;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=165;WE=166797654;WS=166797636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	166799596	rs13000534	T	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=193;SC=AATGCCAGTCTACCTTACAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=166799604;WS=166799587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	166799893	rs10930190	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=39;PP=1177;SC=TTAGAAATGAGAGAAATAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=166799901;WS=166799883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	166810161	.	G	GCCCGCTCA	902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=384;SC=CCGCCCGCCCGCCCGCTCACC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=166810169;WS=166810151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	166810373	rs1347041	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=27;PP=774;SC=TCGGAGGGAGAGGCGGGCCTG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=166810381;WS=166810363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	166810433	rs5836068	GT	G	649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=536;SC=GGACCCGGAGGTGAGGGCTGC;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=166810441;WS=166810423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	166848003	rs121917956	G	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1159;ReadPosRankSum=0.308;SC=AAAAGGTGGCGTCTGTAAGCA;SOR=0.999;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=69;WE=166848011;WS=166847993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr2	166892444	rs34673057	TAAA	T	100.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.834;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	166892448	rs114707732	A	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.902;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	166892788	rs2298771	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=522;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CCAATTTCTGCTGTATGATTG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=35;WE=166892796;WS=166892778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr2	166893081	rs7601520	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=0.942;SC=TTACACCAATGTAGGGAAGAG;SOR=1.002;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=10;WE=166893089;WS=166893071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	166894230	rs2020318	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=440;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GTTACATATGTATACATGTGC;SOR=0.763;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=28;WE=166894238;WS=166894220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr2	166896143	rs2126152	T	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TTCCACCAGATAATAACATAC;SOR=0.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=9;WE=166896151;WS=166896133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	166896178	rs490317	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.981;SC=GCTCTTAGAACATAATGCTTA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=166896186;WS=166896168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	166897864	rs6432860	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=1.185;SC=GGTCCATCACAACCAGGTTGA;SOR=0.869;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=19;WE=166897872;WS=166897854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr2	166900606	rs6753355	A	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=1.563;SC=TAATATGGACATTTGAATGTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=166900614;WS=166900596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	166903188	rs538921	A	C	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=22;PP=1616;SC=TTCCTCATACAACCACCTGCT;SOR=1.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=77;WE=166903196;WS=166903178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	166903445	rs7580482	T	C	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1189;ReadPosRankSum=1.860;SC=AAATGACCAATACAAAAAATA;SOR=0.541;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=78;WE=166903453;WS=166903435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,93:0.48:195
chr2	166904346	rs1461193	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=39;PP=902;ReadPosRankSum=-1.672;SC=ACTATGCTATGATATTGCCTA;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=23;TCR=68;TR=51;WE=166904354;WS=166904336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr2	166905480	rs994399	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=1.128;SC=AAAGAAAGTCGTATGATGAAC;SOR=0.939;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=33;WE=166905488;WS=166905470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr2	166908571	.	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=202;ReadPosRankSum=1.611;SC=CAATTTTCTTGAAAACATAGA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=166908593;WS=166908561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	166908585	.	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=202;ReadPosRankSum=-0.712;SC=ACATAGATTTCATTCATAAAT;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=166908593;WS=166908561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	166909559	rs3812719	C	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.985;NF=18;NR=41;PP=961;ReadPosRankSum=-1.056;SC=CTGGAATTACCGAAATAGTTT;SOR=0.759;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=59;WE=166909567;WS=166909549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,68:0.50:136
chr2	166915014	rs8191987	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-2.193;SC=TTAATTTGATATTTAGCTATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=166915022;WS=166915004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	166915335	rs10930201	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTAAAGTGCCCCATGAAAAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=166915343;WS=166915325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	166930214	rs566839	T	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=678;SC=TTTTAAAGAGTGGACTAAGAG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=166930222;WS=166930204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	167060449	rs10180721	A	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=462;SC=AAAATCTGAAAAATAAATATT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=167060457;WS=167060439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	167060980	rs77944059	GAAAC	G	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=127;SC=CCAAGGTAAAGAAACAAACAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=167060991;WS=167060970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	167085124	rs10199799	T	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.04;SOR=2.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	167085141	rs58519838	CTT	C	3327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=13;PP=2707;SC=TAAAGAATAACTTATATCCTT;SOR=2.895;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=56;WE=167085150;WS=167085131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	167090042	rs722204	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=514;SC=AGTCAATTCTGAAACTCACTA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=167090050;WS=167090032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	167099158	rs6746030	A	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=83;PP=2612;SC=GAGAACCTCCATACACAACCT;SOR=1.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=130;WE=167099166;WS=167099148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	167137120	rs4525717	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=35;PP=1219;SC=GAGAAAAAAGCAGAGAACATG;SOR=0.844;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=65;WE=167137128;WS=167137110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	167149693	rs7588632	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=1014;SC=CATACACCAGGTACATATGCC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=167149701;WS=167149683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	167162277	rs4429487	G	A	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1426;ReadPosRankSum=0.480;SC=TAAATTTGCCGTTTCAAAAAG;SOR=0.624;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=121;TCR=95;TR=98;WE=167162285;WS=167162267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,124:0.45:273
chr2	167163043	rs9646771	T	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=676;ReadPosRankSum=-0.597;SC=TCCAGTCCGGTGGGTTATTCA;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=46;WE=167163051;WS=167163033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr2	167163199	rs9646772	A	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=0.990;SC=AACTTTTCCTAAGAAAAAAAT;SOR=0.856;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=21;WE=167163207;WS=167163189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	167163663	rs4447616	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=0.312;SC=GTTTACCTTTCTACATGGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=167163671;WS=167163653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	167168093	rs6432901	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=590;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TGAAGGGCAGCTGTTTGCCAG;SOR=1.532;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=34;WE=167168101;WS=167168083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr2	167279922	rs6738031	C	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.105;SC=TTCTCTGATCCATATATATAT;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=12;WE=167279930;WS=167279912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	167284520	rs3748895	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-0.634;SC=ACTGAAACTTTCTACTATGTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=167284528;WS=167284510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr2	167313313	rs67265532	AATAT	A	87.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=373;SC=TCAAGACTAAAATATATATAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=167313345;WS=167313303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	167313329	rs71428927	T	G	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=31.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	167313333	rs56951383	T	G	82.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;QD=27.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
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chr2	167334085	rs7565062	G	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=451;ReadPosRankSum=0.405;SC=CAAATCAGGAGTTGGCTTTAA;SOR=1.047;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=29;WE=167334093;WS=167334075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr2	167759948	rs7599152	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=224;ReadPosRankSum=0.012;SC=GAGTGTATCACTGATAAAAGG;SOR=0.449;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=19;WE=167759956;WS=167759938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr2	167760451	rs5836125	AG	A	832.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=673;ReadPosRankSum=1.387;SC=TTCCTTGCCTAGCCTACCATT;SOR=0.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=18;WE=167760459;WS=167760441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr2	167992286	rs6720763	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-0.506;SC=ACATTTTACCTGAAGCATATT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=167992294;WS=167992276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	168040906	rs10497320	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=345;ReadPosRankSum=0.279;SC=TTGGCCTTACGATTGTATCCT;SOR=0.901;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=21;WE=168040914;WS=168040896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr2	168041152	rs16853169	T	C	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=815;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CTTATATTTGTAAGGTTCTCG;SOR=1.010;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=46;WE=168041160;WS=168041142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr2	168074761	rs139161535	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=742;ReadPosRankSum=-0.672;SC=ACTTCTTCCCGTAATACCTTT;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=48;WE=168074769;WS=168074751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr2	168873763	rs16854564	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=1.290;SC=AGATAGTTATAACAGTAATAA;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=168873771;WS=168873753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	168986154	rs925846	A	G	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=59;PP=1846;SC=AACATCAAATATGATACACAT;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=98;WE=168986162;WS=168986144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	169103796	.	C	CGCCGGG	280.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=84;SC=CAGCCTGTGCCGCCGGGGCCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=169103804;WS=169103786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	169403993	.	AATCCTACCAACACTTTATTGGGATAATTGAGTAATGTGTAACTGGTGGCATTAAGAATCAC	A	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr2	169487610	rs11347055	GT	G	152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=61.19;NF=0;NR=3;PP=43;SC=CTATATCCTGGTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=169487618;WS=169487600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	169674806	rs2461389	G	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=12;PP=334;SC=TAGGACTGCAGGTGTGTGCCA;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=169674814;WS=169674796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	169688112	rs138293199	A	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CTTTCATACAAATGCGATGAC;SOR=1.643;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=25;WE=169688120;WS=169688102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	169690729	rs522893	T	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.764;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=789;ReadPosRankSum=0.553;SC=GTATGTTTTTTACTCTAGGCC;SOR=0.388;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=51;WE=169690737;WS=169690719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr2	169707428	rs540652	C	T	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TACCAAGACACATTCCTTCCT;SOR=0.943;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=89;WE=169707436;WS=169707418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,105:0.50:208
chr2	169707552	rs488621	A	G	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TCCATTTTGCATAACAACTGG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=63;TCR=93;TR=82;WE=169707560;WS=169707542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,95:0.54:177
chr2	169713084	rs11385898	T	TA	1100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.302;NF=19;NR=20;PP=552;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GACTCCGTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.557;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=39;WE=169713092;WS=169713074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr2	169717541	rs2632372	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=365;ReadPosRankSum=-0.676;SC=ATATTTCCATTGGGACCGATT;SOR=0.207;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=29;WE=169717549;WS=169717531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr2	169721377	rs479661	G	A	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1302;ReadPosRankSum=0.866;SC=AAAAAAGAAGGAGGATGGTGG;SOR=0.805;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=69;WE=169721385;WS=169721367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,84:0.54:157
chr2	169727879	rs61598834	G	GA	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=1.312;SC=ATAAAAACAAGAAAAAAAGAG;SOR=0.746;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=8;WE=169727887;WS=169727869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr2	169728069	.	GAAA	G	769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.891;NF=3;NR=17;PP=295;ReadPosRankSum=0.765;SC=TCTGACACTAGAAAAAAAAAA;SOR=0.184;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=20;WE=169728079;WS=169728059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	169730344	rs16856071	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GTTTTAAAATATATTATAGTT;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=169730352;WS=169730334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	169763148	rs560887	T	C	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=84;PP=2735;SC=TTGCTTTTTATGCTTGTATCT;SOR=0.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=161;WE=169763156;WS=169763138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
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chr2	169764546	rs2232328	C	G	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=65;PP=1567;ReadPosRankSum=0.858;SC=ATTCCCTACTCTGTTCATATG;SOR=0.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=206;TCF=72;TCR=134;TR=97;WE=169764554;WS=169764536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,114:0.47:244
chr2	169780366	rs579275	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=153;ReadPosRankSum=-1.590;SC=GATGCAAAGATGCATGATTGC;SOR=0.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=12;WE=169780374;WS=169780356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	169789016	rs497692	T	C	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=670;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CAAGAGCTGTTGCACTCAGTA;SOR=0.986;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=52;WE=169789024;WS=169789006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr2	169801488	rs853789	A	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=603;SC=AAGATAGTAAACAAGAAAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=169801496;WS=169801478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	169814347	rs853773	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GAAATTTTTCATTCTTTAGAG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=169814355;WS=169814337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	169814655	rs853772	G	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CAGAGAGAGGGTTATATTAAT;SOR=0.204;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=12;WE=169814663;WS=169814645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr2	169824739	rs4148789	T	TA	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=488;ReadPosRankSum=0.648;SC=GATGAGAAGCTAACCAAAAAC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=169824757;WS=169824729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	169824743	rs2389613	C	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.44;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr2	169824749	rs28405534	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	169826877	rs2193831	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=840;ReadPosRankSum=2.842;SC=CTTCCCCAGACGGGTTATTGT;SOR=0.501;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=54;WE=169826885;WS=169826867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr2	169830051	rs2389605	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=1.683;SC=TGGTTATTCACTGAACACTGT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=169830059;WS=169830048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	169830155	rs2287623	G	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=988;ReadPosRankSum=2.153;SC=ACACCTTTCTGTTTGATCAAT;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=61;WE=169830163;WS=169830145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr2	169830328	rs2287622	A	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=728;ReadPosRankSum=0.440;SC=TGGTTTAATGACCATGTTGAG;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=44;WE=169830336;WS=169830318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr2	169842809	rs2287618	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	169847203	rs4148780	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GTACTTCCTCTGGAGGCCACA;SOR=0.350;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=11;WE=169847211;WS=169847193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	169847544	rs2287614	T	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CAATATTAGATTCTCACTGTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=169847552;WS=169847534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	169869901	rs4148777	A	G	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1257;ReadPosRankSum=1.370;SC=CGTAGTCAATAAAAACATCTG;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=72;WE=169869909;WS=169869891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,93:0.51:184
chr2	169870882	rs4148776	A	G	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=984;ReadPosRankSum=0.758;SC=GAAAAACATAAGGATTTAAAG;SOR=0.874;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=65;TCR=87;TR=66;WE=169870890;WS=169870872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr2	169873205	rs10199694	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=195;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GTGCATGAAAGTATTCTCTGC;SOR=0.311;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=16;WE=169873213;WS=169873195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr2	169952233	rs1059261	T	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=502;ReadPosRankSum=0.618;SC=AGACTTTTTATTGTTGAAACA;SOR=1.338;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=27;WE=169952241;WS=169952223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr2	169985418	rs41268683	T	C	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;ReadPosRankSum=-1.193;SC=AAGAAGACTATTTGTGGCCAC;SOR=0.492;Source=Platypus;TCF=36;TR=46;WE=169985426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr2	169988946	rs74839579	T	A	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=6.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr2	169997051	rs990626	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=401;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TAGGCAGTTCGATGGCTGCAG;SOR=0.405;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=27;WE=169997059;WS=169997041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr2	170003432	rs4667591	T	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=711;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCAGACTCGATTTTAGGTTCC;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=43;WE=170003440;WS=170003422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr2	170025198	rs143342962	GA	G	1160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.825;NF=2;NR=34;PP=811;ReadPosRankSum=0.889;SC=TGCCATGGGGGAAAAAAACAT;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=36;WE=170025206;WS=170025188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr2	170027039	rs115478315	A	G	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1809;ReadPosRankSum=-1.778;SC=ATTCTATGGTAAGCTTCTCAA;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=131;TCR=92;TR=111;WE=170027047;WS=170027029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,139:0.49:285
chr2	170050472	rs2075248	T	C	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=52;PP=1664;SC=GACAAGCTGGTTGTAGCATGG;SOR=2.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=170050480;WS=170050462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	170053505	rs2228171	C	T	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=67;PP=1957;SC=CGCCCAGATGCGCATTGGAAC;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=103;WE=170053513;WS=170053495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	170053580	rs2302696	C	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=734;SC=GAGCAAAACACAAGCATGTTC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=170053588;WS=170053570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	170055255	rs16823023	T	C	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=27;PP=2085;SC=ACAACATGCATCTCTGGAACG;SOR=1.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=75;TCR=27;TR=102;WE=170055263;WS=170055245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	170058497	rs16856600	G	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=524;SC=GGCAAAAAACGCTGCAAAATG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=170058505;WS=170058487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	170059190	rs2239599	T	C	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=11;PP=1439;SC=CATTCACACATAGCAGGATTC;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=170059198;WS=170059180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	170077165	rs3815572	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.886;SC=AAACAAATTCCAAAGCACGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=170077173;WS=170077155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	170082013	rs2075246	A	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=660;ReadPosRankSum=-1.145;SC=CATGGCTCCTACAAAAGAACC;SOR=0.460;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=39;WE=170082021;WS=170082003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr2	170088477	rs2302693	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	170089824	rs2239596	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=657;ReadPosRankSum=-1.925;SC=AAATGTATTGTCCAAACAAAT;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=34;WE=170089832;WS=170089814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr2	170096018	rs830973	G	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=565;ReadPosRankSum=-0.887;SC=AAACTGGCTCGGGTTAGTTCA;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=40;WE=170096026;WS=170096008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr2	170099446	rs831041	T	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TCTGAAACATTCTGGGTATGT;SOR=0.875;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=173;TCF=109;TCR=64;TR=82;WE=170099454;WS=170099436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,105:0.48:219
chr2	170099473	rs831042	T	C	2551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1468;ReadPosRankSum=0.347;SC=TACGACAGCCTGCTTCATCCG;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=123;TCR=88;TR=102;WE=170099481;WS=170099463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,123:0.47:260
chr2	170099895	rs2075255	A	C	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=3.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=-0.896;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,75:0.45:166
chr2	170099899	rs2075254	G	A	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=3.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=-0.881;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,82:0.44:185
chr2	170103336	rs831043	T	C	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1235;ReadPosRankSum=0.493;SC=CACACTGCTCTGTGGGTGGTT;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=184;TCF=83;TCR=101;TR=94;WE=170103344;WS=170103326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,113:0.48:236
chr2	170103351	rs2075249	G	T	6499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=95;PP=2965;SC=GTGGTTCATTGGTTGGGTCCC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=179;WE=170103359;WS=170103341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr2	170113609	rs148998067	A	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=261;ReadPosRankSum=-2.067;SC=AGAACTAAGTATCGGGGATGA;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=21;WE=170113617;WS=170113599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr2	170115588	rs2241190	T	C	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.947;SC=ACTGAACTACTGTGCGTCTCG;SOR=0.669;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=100;WE=170115596;WS=170115578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,131:0.46:282
chr2	170137037	rs115371758	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=592;ReadPosRankSum=1.072;SC=CAACTAAATGCGAAGAAGGAA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=41;WE=170137045;WS=170137027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr2	170149034	rs34980705	G	GAT	578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.58;MQRankSum=1.648;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.397;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	170163768	rs2247506	T	C	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=867;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCAAATACAGTGCAAGGACTA;SOR=0.545;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=64;WE=170163776;WS=170163758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,77:0.48:159
chr2	170175334	rs2229263	T	C	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=49;PP=2442;SC=CACCCAGGAGTTGGGGATGCA;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=170175342;WS=170175324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	170218816	rs1559013	T	C	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=17;PP=729;SC=CGAGAGGCTCTGGCTGGGCTC;SOR=1.159;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=170218824;WS=170218806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	170218847	rs1559014	C	G	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=23;PP=1194;SC=CACTGGCCGGCGCTAGGCAGG;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=170218855;WS=170218837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	170336024	rs1879466	G	C	2486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=33;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.090;SC=AGCTAGGCCTGCACGGCTGTG;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=187;TCF=115;TCR=72;TR=92;WE=170336032;WS=170336014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,116:0.51:228
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chr2	170360765	rs72885849	G	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=278;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TGATCTATTCGAATATTATAT;SOR=1.371;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=16;WE=170360773;WS=170360755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
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chr2	170531614	rs11688600	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-1.282;SC=ACAGTTTAACATAATAATATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=170531622;WS=170531604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr2	170558231	rs11685651	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=0.653;SC=GAAAAGTGTATCACTTAAGAT;SOR=0.301;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=170558239;WS=170558221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr2	170605981	rs4667607	C	T	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=16;PP=1019;SC=ATCTAGTCGGCGGACAAACTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=170605989;WS=170605971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	170606438	.	TATAC	T	522	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=47;MMLQ=28;MQ=59.06;NF=1;NR=11;PP=522;QD=44.1666666667;SC=TATATATATATATACACACAC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=170606458;WS=170606428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,12:1.00:12
chr2	170606450	.	C	T	688	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=59.31;NF=5;NR=12;PP=688;QD=42.5159536792;SC=TACACACACACATATATGTGT;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=17;WE=170606458;WS=170606428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr2	170606476	.	CAT	C	435	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=84;MMLQ=26;MQ=56.3;NF=0;NR=10;PP=435;QD=46.2;SC=TATATGTATACATATATATGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=170606485;WS=170606466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	170606496	.	C	CGCAT	299	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=138;MMLQ=18;MQ=54.99;NF=1;NR=10;PP=299;QD=29.9090909091;SC=TGTATATATACGTATGTATAC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=170606504;WS=170606486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	170606588	.	A	G	148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.6268;HP=2;HapScore=2;MGOF=83;MMLQ=24;MQ=54.83;NF=7;NR=0;PP=148;QD=26.110173221;SC=ATATATACGTATGTATGTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=170606596;WS=170606578;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr2	170606724	rs10164599	A	G	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=20;PP=750;SC=AAGGTAATATAGAATATTTGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=170606732;WS=170606714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr2	170632896	rs10930376	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=388;ReadPosRankSum=1.015;SC=TTCTACACCATGTGGTGATAA;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=28;WE=170632904;WS=170632886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr2	170632960	rs150673586	C	CA	807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GGCCTGCCCACAAAAAAAACC;SOR=0.727;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=29;WE=170632977;WS=170632950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
chr2	170632969	rs55969365	C	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.326;SC=ACAAAAAAAACCACAAGAAGA;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=32;WE=170632977;WS=170632950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr2	170633023	rs11422611	T	TA	1039.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.138;HP=5;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=927;ReadPosRankSum=0.416;SC=CCACAGAAAATAGGAACCTGC;SOR=1.095;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=38;WE=170633031;WS=170633013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr2	170633067	rs6745191	G	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=551;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TTCAAGGCCTGGAACCTGGAT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=34;WE=170633075;WS=170633057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr2	170633103	rs11325477	GA	G	1984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=35;PP=1650;SC=GTCTAAGAATGAATCACCTTA;SOR=1.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=40;WE=170633111;WS=170633093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	170668106	rs2246149	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.474;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	170668813	rs3731674	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.276;NF=22;NR=2;PP=480;ReadPosRankSum=-2.405;SC=TTCAGTGGGGCAATCTCAGCT;SOR=0.185;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=24;WE=170668821;WS=170668803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr2	170676227	rs1541776	T	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=346;SC=GATTTAGAAATATTTTCTTCC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=170676235;WS=170676217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	170678590	rs137986141	ATAAG	A	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.19;MQRankSum=1.447;NF=0;NR=12;PP=492;ReadPosRankSum=1.614;SC=AAAAAAAAGAATAAGTAAGCA;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=12;WE=170678601;WS=170678580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr2	170680879	rs3769767	G	A	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=399;SC=TAACGCGACAGGTGATCTTAG;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=170680887;WS=170680869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	170762487	rs10171268	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=15;PP=1594;SC=TGATATTTAACATGAATGTGT;SOR=2.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=71;WE=170762495;WS=170762477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	170782037	rs1461958	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=250;SC=ATACTATGATCACATCATTAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=170782045;WS=170782027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	170783769	rs72891954	G	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=755;SC=AGTGTGGTAAGTTTTTTTCTT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=170783777;WS=170783759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	170850738	rs1461959	T	C	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=610;SC=TGAAATAATTTGAGTTGCTTG;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=170850746;WS=170850728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	170873361	rs10497356	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=402;ReadPosRankSum=-1.296;SC=TTCATTATTTTTCCCTTTACT;SOR=0.728;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=23;WE=170873369;WS=170873351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr2	170885930	rs77587723	C	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=333;ReadPosRankSum=0.320;SC=CTGGAGAAAGCTCACCCAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=25;WE=170885938;WS=170885920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr2	170917544	rs72876447	T	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=271;SC=GTAAATTTTTTATAATTTTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=170917552;WS=170917534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	170917983	rs79097626	CTT	C	3941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.870;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.107;NF=3;NR=76;PP=1552;ReadPosRankSum=1.572;SC=TAAGAGGGAGCTTTTTTTTTT;SOR=2.743;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=97;TCF=5;TCR=92;TR=79;WE=170917993;WS=170917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr2	170938389	rs79645018	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=591;ReadPosRankSum=3.196;SC=TCATCATTTTCGCTACGAATT;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=40;WE=170938397;WS=170938379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr2	171055942	rs35521414	T	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.986;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=477;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TTTGGTGTTTTATGCACACTG;SOR=0.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=28;WE=171055950;WS=171055932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr2	171056569	rs6756347	T	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.342;SC=ATAGTACATATGTTTTACTAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=171056577;WS=171056563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	171070810	rs67994603	G	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=464;ReadPosRankSum=1.615;SC=AGTATCAGTCGGCTTTTCTTA;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=31;WE=171070818;WS=171070800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr2	171070850	rs13423313	G	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=634;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTCACATGTGGTCTCCTGCTC;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=39;WE=171070858;WS=171070840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr2	171070912	rs13385825	T	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=544;ReadPosRankSum=-1.265;SC=GCTCAGTCACTGAGCTTGTCA;SOR=0.939;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=43;WE=171070920;WS=171070902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr2	171071369	rs4667626	C	T	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=69;PP=2133;SC=GTTTTCTTGACGTGTGCAGTT;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=97;WE=171071377;WS=171071359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	171073887	rs2161916	G	A	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1095;ReadPosRankSum=-2.831;SC=TTGGCACCCCGTTCTGGATGG;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=81;WE=171073895;WS=171073877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,100:0.46:216
chr2	171074008	rs6713360	G	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.814;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=619;ReadPosRankSum=3.513;SC=TTAGGGAGAAGAAAGTCCATT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=32;WE=171074016;WS=171073998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr2	171092445	rs1035625	A	G	334.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=1.654;SC=GGGCCTTTTTAGGACATCTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=171092453;WS=171092435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	171225841	rs4668246	A	G	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1418;ReadPosRankSum=0.827;SC=ACAGCTGGCCAAGGTTCTCCA;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=94;WE=171225849;WS=171225831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,121:0.47:255
chr2	171239560	rs12471568	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=0.961;SC=TATTTACCTCAATACCATTTA;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=18;WE=171239568;WS=171239550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr2	171240249	rs11675394	C	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=680;ReadPosRankSum=0.206;SC=GGGTGAAACGCGCCTCCAATC;SOR=0.588;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=43;WE=171240257;WS=171240239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr2	171242865	rs9646733	G	T	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=8;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=1534;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GAAGTGCTGGGTTTTTTTTAT;SOR=0.484;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=41;WE=171242886;WS=171242855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr2	171242878	rs9646782	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=1534;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TTTTTTATTAAGGCTTACATA;SOR=0.518;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=35;WE=171242886;WS=171242855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr2	171243546	.	A	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.138;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=0.645;SC=TGGGCAAGGGATGGTGCCTGG;SOR=0.404;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=17;WE=171243554;WS=171243536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	171248778	rs62170829	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=0.055;SC=ACTTCAGGCTGGGCAACAGAG;SOR=1.445;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=16;WE=171248786;WS=171248768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr2	171249093	rs2013102	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=1.659;SC=TGGGATAAGACACTTGCTTTC;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=19;WE=171249101;WS=171249083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr2	171256597	rs7561268	A	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-1.602;SC=AAGAGGGAGAATGGACTTTGG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=171256605;WS=171256591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	171256930	.	T	TA	79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=60.51;NF=0;NR=2;PP=79;QD=41.0;SC=TTTTTTTTTTTATCGAGATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=171256938;WS=171256920;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr2	171257945	rs7568041	A	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=545;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GACTGACTGAATGAAGGTCTG;SOR=0.510;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=32;WE=171257953;WS=171257935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr2	171260708	rs10930425	C	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=1054;SC=TCCTGGTGGTCCCAAGGCTAG;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=171260716;WS=171260698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	171260787	rs6736609	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.77;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	171260787	.	GTACCCGTGGA	ATACCCGTGGA,ATACCCGTGGG	850	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=44,21;NR=45,15;PP=850,685;QD=9.94124957918;SC=CATTGATGCTGTACCCGTGGA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89,36;WE=171260805;WS=171260777;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:89
chr2	171260797	rs33962844	A	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=8.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.31;ReadPosRankSum=-2.678;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr2	171260820	rs6751520	T	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=44;PP=2122;SC=CCGCCCGCTCTTGGACATGTT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=100;WE=171260828;WS=171260810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	171261021	rs6751781	T	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=801;SC=TATATGGTGGTTTGTAAGAAT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=171261029;WS=171261011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	171264091	rs138990294	T	TGCTCTGGATATGAAA	1670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=2973;SC=CTTTATCTGGTGCTCTGGATA;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=12;WE=171264099;WS=171264081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	171300575	rs17426211	C	A	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=765;ReadPosRankSum=1.381;SC=CAGATTTGCACCAAATATAGT;SOR=0.830;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=46;WE=171300583;WS=171300565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr2	171300648	rs4667639	T	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.883;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=-0.879;SC=AGTTCCCTTCTAGCAGCCCTC;SOR=1.296;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=33;WE=171300656;WS=171300638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr2	171319997	rs12477518	A	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=478;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GCTTCCAAAAAGGACTGTCTA;SOR=0.828;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=38;WE=171320005;WS=171319987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr2	171323280	rs67549561	CTGTGTCCTAAGAT	C	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.593;NF=0;NR=11;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CTGGCCATCCCTGTGTCCTAA;SOR=0.668;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=171323300;WS=171323270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	171323328	rs4359605	T	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=241;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=197;SC=AAACATGTAATTGGCTAGTTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=171323336;WS=171323318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	171355198	rs6761297	A	G	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=79;PP=2965;SC=ATCACTGGGTACTGGGAAAAA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=143;WE=171355206;WS=171355188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	171355329	rs6733198	G	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=846;SC=AGACTCCAACGTAACAATGGT;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=171355337;WS=171355319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	171356274	rs10185178	G	A	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=40;PP=1266;SC=AGATACAAAAGGGTCAGAGAG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=171356282;WS=171356264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	171358211	rs7593940	G	A	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=20;PP=1201;SC=CGGGCAATAGGCTGGAGGGGA;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=171358219;WS=171358201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	171358474	rs7608168	T	A	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=144;SC=TCAGGAGCACTGGAATGAGTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=171358482;WS=171358464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	171508262	rs6724627	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=716;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CAAAGTGGCCGTAAAGCTGTT;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=48;WE=171508270;WS=171508252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
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chr2	171632385	rs10626619	C	CTT	2780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=21;PP=1646;SC=AAAATAAAAACAATACGAAAT;SOR=1.010;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=33;WE=171632393;WS=171632375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	171633554	rs17694562	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-0.047;SC=AACAAAATACATACTTAATAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=171633562;WS=171633544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	171634104	rs55923006	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=424;ReadPosRankSum=1.191;SC=AAGTGTATGTCAGGGACATCA;SOR=0.249;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=22;WE=171634112;WS=171634094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr2	171634347	rs11334749	TA	T	2711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=47;PP=2194;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CAATTGTTACTATAGATAGAA;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=10;TCR=70;TR=54;WE=171634355;WS=171634337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,77:0.65:119
chr2	171634395	rs1065651	C	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=794;ReadPosRankSum=1.032;SC=GATAAAAATGCAGAAGTATAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=38;WE=171634403;WS=171634385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr2	171636496	rs55693618	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.363;SC=AGAATTATTTCAGTAGAAGTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=171636504;WS=171636486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	171654663	rs2287111	A	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=-2.025;SC=TCATAGAACTATAAGCAGTCA;SOR=1.813;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=11;WE=171654671;WS=171654653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr2	171678379	rs2241165	C	T	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=916;SC=GACACCGTTCCATATTTGAAG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=171678387;WS=171678369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	171678625	rs769404	T	C	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=65;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GCGTGGCCCATGGATGCACCA;SOR=0.704;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=206;TCF=88;TCR=118;TR=112;WE=171678633;WS=171678615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,126:0.54:235
chr2	171693455	rs769390	A	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=-1.171;SC=GTTGCTTTAAAAGTTCAGTCC;SOR=0.657;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=21;WE=171693463;WS=171693445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr2	171702480	rs701492	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=169;ReadPosRankSum=-0.427;SC=ATCTCATTGACTCTTCATTTT;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=12;WE=171702488;WS=171702470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	171705157	rs35403424	AT	A	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=0.047;SC=GACTGGGTGTATTTTTTTTTT;SOR=2.455;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=26;WE=171705165;WS=171705147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	171709430	rs769391	A	G	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=0.503;SC=CTGAGAGACTACTGCTGCTGT;SOR=0.892;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=14;WE=171709438;WS=171709420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	171786169	rs2676158	A	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=4;PP=194;SC=CGACTCGGCCAGGGGGCGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=171786177;WS=171786159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	171786239	rs3770442	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=1.351;SC=CTCCACCCCCCCTCATTTTTA;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=8;WE=171786247;WS=171786229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	171793357	rs35123411	C	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TATCCTCACACCACTGCACTC;SOR=0.136;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=12;WE=171793365;WS=171793347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	171818289	rs2557804	G	A	6266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=125;PP=2965;SC=AGATGTGGCTGATAATAACAG;SOR=1.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=67;TCR=125;TR=192;WE=171818297;WS=171818279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
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chr2	171906469	rs3217296	GA	G	2096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.386;NF=6;NR=34;PP=1588;ReadPosRankSum=0.373;SC=CTCTGAAAAGGAGAAAAAAAA;SOR=0.780;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=40;WE=171906477;WS=171906459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,63:0.52:122
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chr2	171916664	rs2676130	A	T	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=40;PP=1114;SC=AATCAGACAAATCTGTAGATG;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=171916672;WS=171916654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	171974424	rs142720641	TACAC	T	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=264;ReadPosRankSum=-0.003;SC=ACTTTATACTTACACACACAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=171974435;WS=171974414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	172016756	rs113416007	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.123;SC=TCCGCGGCGCGGGAGAGGAGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=172016764;WS=172016746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	172180771	rs10205459	A	G	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=12;PP=627;SC=ATCCACACTCAGTGCATTTTC;SOR=1.151;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=32;WE=172180779;WS=172180761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	172188368	rs13023973	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=542;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GAAAGGACTCCGGAGAGTTCC;SOR=0.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=36;WE=172188376;WS=172188358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr2	172193808	rs3731987	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.167;SC=AAAGTAGACATTGAGATTAAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=172193816;WS=172193798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	172216969	rs3731986	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=489;ReadPosRankSum=0.715;SC=CTGAGTTTTCTTTTACTTTTT;SOR=0.712;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=31;WE=172216977;WS=172216959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr2	172378657	rs884409	T	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=657;ReadPosRankSum=-0.376;SC=ACTGCCCTACTCAACCTCCCC;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=42;WE=172378665;WS=172378647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr2	172378818	rs868106	A	G	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=53;PP=1359;ReadPosRankSum=1.103;SC=CCACCAGGCAATGAGCGCCCT;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=44;TCR=86;TR=80;WE=172378826;WS=172378808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,87:0.61:143
chr2	172378889	rs2356782	C	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=505;ReadPosRankSum=1.067;SC=CTCCCCACCCCCAAGAGGCCC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=24;WE=172378897;WS=172378879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr2	172379099	rs146713767	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1143;ReadPosRankSum=-1.158;SC=CTGCTGGGGTCGGCACTGCTC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=68;WE=172379107;WS=172379089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,70:0.58:120
chr2	172379649	rs115283512	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=316;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCAGCCCACGCGCCCCGGAAA;SOR=0.866;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=18;WE=172379657;WS=172379639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr2	172379686	rs960750	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=892;ReadPosRankSum=-0.699;SC=GAGCCTGCGCGATCGGGGGCG;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=72;TCR=22;TR=52;WE=172379694;WS=172379676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr2	172379781	rs960749	G	A	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AAAGATTGCCGGAGCGAGAAT;SOR=0.549;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=245;TCF=130;TCR=115;TR=113;WE=172379789;WS=172379771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,131:0.44:298
chr2	172379936	rs960748	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.359;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=675;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AGTGTGTTTCGCCGCCCTGCC;SOR=0.200;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=40;WE=172379944;WS=172379926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr2	172398311	rs7586144	T	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=726;SC=CAGGTCAGTATTTCAGTGTAT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=172398319;WS=172398301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	172409790	rs143524630	TA	T	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.504;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=408;ReadPosRankSum=2.014;SC=TATTGCTTTTTAAATAATTTA;SOR=2.066;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=13;WE=172409798;WS=172409780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr2	172411273	rs10455	G	A	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=827;SC=GAGTTAAACAGTGAAGTAGCA;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=172411281;WS=172411263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	172549248	rs6433311	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AATTTTTCATACTATATGTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=172549256;WS=172549238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	172563922	rs312925	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=0.154;SC=TTTAATGATAGAATGCATTCA;SOR=0.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=25;WE=172563930;WS=172563912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr2	172569134	rs5836347	AT	A	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.793;NF=12;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=-1.275;SC=TTTGTTTTCGATTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=172569142;WS=172569124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	172582281	rs139032813	A	ATTAC	1268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=799;SC=GATTCCTTTTATTATGTATTA;SOR=0.906;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=14;WE=172582289;WS=172582271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	172582344	rs139881666	AAC	A	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=202;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GAAAAATAATAACATACATTG;SOR=0.694;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=10;WE=172582353;WS=172582334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	172644229	rs2292813	T	C	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=41;PP=2351;SC=GTGGTAAAGATAGCCACTGAG;SOR=1.035;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=172644237;WS=172644219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	172650382	rs6745143	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.076;SC=ATCTTGAAAAGAAGGAGGTGA;SOR=0.293;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=172650390;WS=172650372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
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chr2	172864845	rs6730085	C	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=395;ReadPosRankSum=0.646;SC=GGGCGGCGAGCGAGTGCTCGC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=22;WE=172864853;WS=172864835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr2	172865009	rs62183782	T	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=706;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GCGCTCAGACTTCTCGGCGCA;SOR=0.897;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=46;WE=172865017;WS=172864999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr2	172944748	rs58045367	G	A	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=678;SC=TGTGGGGGAAGCACTTGAGGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=172944756;WS=172944738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	172966250	rs2228184	T	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=51;PP=2200;SC=AGGCCAAGTATTGAGTCTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=172966258;WS=172966240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	173332115	rs2272499	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=315;ReadPosRankSum=1.499;SC=ACTCAGAGTCGAGGCCATTTG;SOR=0.382;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=25;WE=173332123;WS=173332105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr2	173333720	rs17676773	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=270;ReadPosRankSum=0.929;SC=TCTGGGATCCGGTCCCAAGAT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=15;WE=173333728;WS=173333710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	173334161	rs147116420	T	TATGATTTAGTACC	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=2922;ReadPosRankSum=0.134;SC=ATTTCTGTAATATGATTTAGT;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=173334169;WS=173334151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	173339808	rs11895564	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=337;ReadPosRankSum=0.252;SC=GTTTGGCATTGCAGTAAAAAA;SOR=0.351;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=20;WE=173339816;WS=173339798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr2	173344474	rs1920979	A	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=620;ReadPosRankSum=0.409;SC=TATGGTGAGCATCCCTCTGTC;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=39;WE=173344482;WS=173344464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr2	173352103	rs2293649	C	T	2905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=1742;ReadPosRankSum=-1.525;SC=ATGGCGATGACGCCCATGAGG;SOR=0.490;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=240;TCF=130;TCR=110;TR=116;WE=173352111;WS=173352093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,140:0.47:296
chr2	173353060	rs1319059	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=2.918;SC=AATAAGCATTGTAAGTAAATC;SOR=0.346;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=173353068;WS=173353050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr2	173368989	.	TA	T	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.704;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
chr2	173369000	rs61499296	A	AT	695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr2	173423360	rs72896113	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=310;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AACTTCCTCTCTATTTCTCTC;SOR=1.044;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=22;WE=173423368;WS=173423350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr2	173429496	rs10531054	TTAGG	T	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=276;ReadPosRankSum=-1.486;SC=AAAGTTCCATTTAGGTAGGAA;SOR=0.301;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=173429507;WS=173429486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	173600783	rs34574292	C	CG	3351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=42;PP=2274;SC=AAAGGTAGCTCGCCGGGGGCC;SOR=0.959;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=49;WE=173600791;WS=173600773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	173659913	rs7585729	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=405;SC=ATGCAACTCTTGTAGTATATT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=173659921;WS=173659903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	173686663	rs2258180	G	T	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1053;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GGATGTCTGAGAACTTTGAGA;SOR=0.689;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=65;WE=173686671;WS=173686653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
chr2	173686798	rs2258175	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=408;ReadPosRankSum=1.431;SC=GCTCAAAAACATCTCTGGCTT;SOR=0.418;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=25;WE=173686806;WS=173686788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr2	173793096	rs3835838	GA	G	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=455;SC=GCATTTTTAGGAATGACGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=173793104;WS=173793086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	173861340	rs2290374	G	A	5136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=88;PP=2965;SC=TTGTTTAAAAGTCCTGAATTC;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=159;WE=173861348;WS=173861330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	173861450	rs2290375	A	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.04;SOR=3.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	173861456	rs5010643	G	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.81;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	173866203	rs2028934	C	T	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=38;PP=1098;SC=CCTCATCACACTGAAATGTGT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=173866211;WS=173866193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	174055731	rs2289399	A	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=944;ReadPosRankSum=0.517;SC=TAATTAGCCAATAAGTAGAAA;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=56;WE=174055739;WS=174055721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
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chr2	174074353	rs2289398	T	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.090;SC=TTTATTTTGTTATGGTGGGTT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=174074361;WS=174074351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr2	174123399	rs820008	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=0.431;SC=CACTTTCTCAAATTCTGTAAT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=4;WE=174123407;WS=174123389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	174223675	rs11675433	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=0.442;SC=TCTATACAGCCGTTATGAAAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=174223683;WS=174223665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	174227876	rs767074	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=306;ReadPosRankSum=-0.924;SC=CAAGTGTCTCATTGAAAAGGG;SOR=0.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=21;WE=174227884;WS=174227866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr2	174228418	rs4972555	C	T	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=514;SC=ATCAGAAACTCTGAATGTGTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=174228426;WS=174228408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	174228744	rs1529887	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GAAGGGGACCTAGAGGAAACC;SOR=2.862;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=12;WE=174228752;WS=174228734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	174230153	rs2288993	C	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=12;PP=1132;SC=TTTTGAAGTTCTGTGTTTTGT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=174230161;WS=174230143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	174230983	rs35959156	G	GT	1017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.27;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	174232076	rs3816061	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GTCTTAATGAGAAGATGATAG;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=174232084;WS=174232066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	174829412	.	C	CCGGCGG	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	174946760	rs11558990	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=17;PP=881;SC=ACCTGGGTCATACTTGTCCAC;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=174946768;WS=174946750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	174987794	rs34684057	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=16;PP=1019;SC=AAACTTTTTAATAAGGAGAAA;SOR=1.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=174987802;WS=174987784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	174988189	rs10930639	C	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=667;SC=AAATAACAAGCCCAGGAATAA;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=174988197;WS=174988179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	175199895	rs3856434	G	A	5898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=97;PP=2965;SC=GTAATTTTTCGTTATGGCTTC;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=73;TCR=97;TR=170;WE=175199903;WS=175199885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	175215287	rs67384376	G	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=6;PP=220;SC=GTGATGCATGGTATAAGGACC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=175215295;WS=175215277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	175244756	rs2358666	T	C	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=146;SC=CAGCCTGATTTCTGTCTTTTA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=175244764;WS=175244746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	175262970	rs41270193	C	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=167;SC=TAAAAGTGTTCTTTTTATTTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=175262978;WS=175262960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	175265666	rs13016842	A	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.66;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	175268763	rs2358672	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=426;SC=GAATCATGATATACAGATACA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=175268771;WS=175268753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	175287778	rs2290158	G	A	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=67;PP=2076;SC=CCTGAGAGGTGAAGCCACAAA;SOR=1.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=102;WE=175287786;WS=175287768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	175289144	rs3739150	C	A	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=163;SC=AAGACTTAGACTAACACTGAA;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=175289152;WS=175289134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	175292364	rs17256082	T	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=142;SC=CAAACCTTATTTGTAGAGATG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=175292372;WS=175292354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	175292580	rs145699077	TTCAAATTTATCAG	T	1494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=2973;SC=AAAGATGAAATTCAAATTTAT;SOR=2.115;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=20;WE=175292600;WS=175292570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	175300997	rs6757461	G	A	6578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=102;PP=2965;SC=ATTCATACTCGTTGGTAATAT;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=93;TCR=102;TR=195;WE=175301005;WS=175300987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	175306691	.	G	A	146	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=26;MQ=58.11;NF=5;NR=2;PP=146;QD=25.8244589353;SC=GCCCAGGCTGGTCTTGAACTC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=175306699;WS=175306681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	175309624	rs12993286	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=511;SC=TATAATAATTCGTCTCTACTA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=175309632;WS=175309614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	175309792	rs34291465	T	C	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=82;PP=2965;SC=CCCTCAAAGTTCTCCATAAAT;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=175309800;WS=175309782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	175318396	.	G	A	272	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=22;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=54.33;NF=8;NR=5;PP=272;QD=23.5977855806;SC=TCAAAAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=175318404;WS=175318386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	175335076	rs2358637	G	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=584;SC=AATTTTTTTCGACTAAACACA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=175335084;WS=175335066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	175431707	rs2163236	C	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=615;ReadPosRankSum=0.012;SC=CTACCCCACTCCAGGCAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=35;WE=175431715;WS=175431697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr2	175436576	rs112447307	A	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=631;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GAGGCAGAGGAGGCGGCCCGG;SOR=0.913;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=44;WE=175436584;WS=175436566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr2	175436940	rs4972450	G	A	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=77;PP=2965;SC=CCGGTTGTGCGGACTTGATTG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=159;WE=175436948;WS=175436930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	175439512	rs1367218	T	C	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=38;PP=2259;SC=TTCCACAAGATGTGCTCCATC;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=82;TCR=39;TR=119;WE=175439520;WS=175439502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	175439536	rs12624277	G	A	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=853;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TTTGAAAAGCGGCTCACAAGT;SOR=0.639;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=152;TCF=93;TCR=59;TR=61;WE=175439544;WS=175439526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,69:0.39:177
chr2	175439681	rs3049897	T	TA	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.733;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr2	175613169	rs2305414	A	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=7;PP=1268;SC=AAGGTGGTCTAGAGGCGGTCA;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=175613177;WS=175613159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	175613600	rs2646159	T	C	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=141;SC=GAGGCAAGCATAAAACTCTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=175613608;WS=175613590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	175614908	rs139930312	CAA	C	1077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=6.880;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.43;MQRankSum=-0.355;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr2	175622178	rs11327107	TG	T	677.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=689;SC=GCCACCATCCTGGGTGATTTA;SOR=3.716;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=175622186;WS=175622168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	175622788	rs2646164	G	A	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=57;PP=1899;SC=TAGTGTGAACGTTTTTCTCAA;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=104;WE=175622796;WS=175622778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	175622907	rs2600687	T	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=418;SC=GAGGCTGAGGTGGGTGGATCA;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=175622915;WS=175622897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	175624107	rs34695580	GA	G	3371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=54;PP=1586;SC=CTTCATCCTGGAAAAAAAAAT;SOR=0.888;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=79;WE=175624115;WS=175624097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	175629021	rs7560774	C	A	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=43;PP=1844;SC=GATTTGGGGGCCTCCAGCACT;SOR=0.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=102;WE=175629029;WS=175629011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	175677022	rs12613075	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=445;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GCAACCCGCACTGCAAATGGC;SOR=1.079;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=25;WE=175677030;WS=175677012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr2	176804220	rs148648399	T	TAC	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=337;ReadPosRankSum=-1.344;SC=ATCTAGTGTGTACACACACAC;SOR=0.614;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=8;WE=176804228;WS=176804210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	176844508	rs77165351	A	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.655;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	176844644	rs12373766	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=0.832;SC=TTAGAAAAAGCGAATTAGAAG;SOR=1.085;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=12;WE=176844652;WS=176844634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr2	176945012	rs1868101	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=0.913;SC=CACCACCACCGCCGCCGCCAC;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=11;WE=176945020;WS=176945002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	176948287	.	A	C	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.126;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.972;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=53;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CAAAGTGTCTATTTCGAATTT;SOR=1.285;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=173;TCF=65;TCR=108;TR=76;WE=176948295;WS=176948277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr2	176988290	rs56007470	C	CGCA	1987.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=1689;ReadPosRankSum=1.051;SC=CATTCGCAGCCGCAGCAGCAG;SOR=0.808;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=38;WE=176988298;WS=176988280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,53:0.36:147
chr2	176989023	rs711822	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-0.615;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	176996023	rs4972804	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr2	177014970	rs1867863	G	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=280;ReadPosRankSum=-1.651;SC=GTCGAACGGTGGTGGCTCAGA;SOR=0.559;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=17;WE=177014978;WS=177014960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	177036211	rs2857535	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=345;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CCACCCACTCGCTCAGCGCCC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=22;WE=177036219;WS=177036201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr2	177036754	rs1051929	T	C	2977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CAGCGCCAACTTGCAGGGCAG;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=133;TCR=136;TR=128;WE=177036762;WS=177036744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,138:0.46:300
chr2	177134172	rs2305161	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=0.018;SC=CGCCGGAAGTCCCTAGCCAGG;SOR=0.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=177134180;WS=177134162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr2	178301428	rs3754989	C	T	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=107;SC=GTCATTCTCTCTAACTGAAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=178301436;WS=178301418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	178326838	rs1979059	C	G	185.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	178326847	rs1979058	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	178358072	rs1348849	C	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=471;ReadPosRankSum=-0.755;SC=TAGACAATTACATAAATGAGT;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=25;WE=178358080;WS=178358062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr2	178362572	rs12468046	G	A	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=10;PP=381;SC=TGCACCTATTGTAAGGGTGTT;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=178362580;WS=178362562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	178378452	rs2364854	T	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=183;SC=TAAGAAAATGTCAGACTTGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=178378460;WS=178378442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	178417142	rs11694988	C	T	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=95;PP=2834;SC=AGCTTGCAGGCGGAGGACCCG;SOR=3.533;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=16;TCR=96;TR=111;WE=178417150;WS=178417132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	178417225	rs11695035	C	T	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=19;PP=1544;SC=AGGCCTTGTACAGGGCCTGGG;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=178417233;WS=178417223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	178481818	rs10497497	G	T	4396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=78;PP=2965;SC=TACATTTTCCGATTTGGGTCA;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=103;TCR=78;TR=181;WE=178481826;WS=178481808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	178482094	rs28630685	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.18;QD=31.68;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	178482594	rs61742858	G	T	2648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.805;NF=54;NR=58;PP=1741;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CTCTGCCCTGGGTGGCATGTC;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=101;TCR=108;TR=112;WE=178482602;WS=178482584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,122:0.55:223
chr2	178494173	rs3830637	G	GGGA	2141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=15;PP=1406;SC=ACACTGGCAGGGGAGGATGAG;SOR=1.298;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=28;WE=178494181;WS=178494163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	178528703	rs13025391	C	T	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=51;PP=1894;SC=GGAAGAACCTCGCTTTATTAC;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=178528711;WS=178528693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	178528789	rs13025904	G	A	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=38;PP=1043;SC=TGAACCCTTCGCAAATCACAA;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=178528797;WS=178528779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	178534110	rs2222711	G	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=484;SC=TTTCAGGAGTGCTTCCTTAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=178534118;WS=178534100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	178534324	rs6433687	A	G	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=68;PP=2186;SC=TTAATCTGTGATTATGTGTAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=105;WE=178534332;WS=178534314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	178540293	rs3770016	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=39;PP=1682;SC=CTTTTGTTGCATTCCTAAACA;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=178540301;WS=178540283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	178545713	rs4538242	C	T	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=659;SC=ATAAACACATCTATGGGAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=178545721;WS=178545703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	178561947	rs2886424	G	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=654;ReadPosRankSum=0.166;SC=AAGTTTAGCTGGTTTACACAT;SOR=0.555;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=37;WE=178561955;WS=178561937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr2	178565815	rs10201180	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=255;ReadPosRankSum=0.077;SC=TTTTGGTTTCTGTTAAGGGGA;SOR=0.357;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=20;WE=178565823;WS=178565805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr2	178576681	rs13428806	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=0.980;SC=CTGAGCAACAGTCAACTCTGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=178576689;WS=178576671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	178592676	rs186368693	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=676;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CATTTTGTATTTGGGAAACCA;SOR=0.472;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=42;WE=178592684;WS=178592666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr2	178633945	rs34543540	A	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=301;ReadPosRankSum=1.201;SC=CTAGTCCTCCAGCTCCCAATG;SOR=0.208;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=26;WE=178633953;WS=178633935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr2	178681716	rs1438059	G	C	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=45;PP=1144;SC=TATGAAAGCAGGCAGCCACCA;SOR=2.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=54;WE=178681724;WS=178681706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	178764364	rs3037901	A	AAT	166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=168;SC=CAGATTCTTAAATATATATAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=178764372;WS=178764354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	178769992	rs2695096	T	C	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=956;SC=TGCACACTTCTTCTATATGCC;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=178770000;WS=178769982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr2	178936614	rs6433711	C	T	7578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=115;PP=2965;SC=AGGGGGATACCGAGGCAGATT;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=122;TCR=115;TR=237;WE=178936622;WS=178936604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
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chr2	179203797	rs1434087	G	A	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=85;PP=2965;SC=GAACTCAGTCGGCACCTAACT;SOR=0.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=64;TCR=85;TR=149;WE=179203805;WS=179203787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	179204568	rs9646740	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-1.609;SC=AGTTTATGGGCGTTAGATTGA;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=179204576;WS=179204558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	179208974	rs12464380	G	A	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1274;ReadPosRankSum=1.752;SC=TTCCTCCCCCGTCCTGTGTTT;SOR=0.744;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=95;WE=179208982;WS=179208964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,107:0.48:222
chr2	179213872	rs964165	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.470;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=679;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTTTGAAGAACGGGAGAGGTC;SOR=0.143;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=95;TCF=74;TCR=21;TR=48;WE=179213880;WS=179213862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr2	179363909	rs371719002	AT	A	472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=16.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.427;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
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chr2	179395958	rs3813250	T	C	2692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=65;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GAATTCTTGCTGCCAAAGTCG;SOR=0.837;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=118;TCR=124;TR=119;WE=179395966;WS=179395948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,131:0.49:268
chr2	179396354	rs3829748	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=845;ReadPosRankSum=0.816;SC=CCAGGGTGAGGACTCCACTCG;SOR=0.876;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=49;WE=179396362;WS=179396344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr2	179397561	rs3829747	C	T	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=1706;ReadPosRankSum=0.910;SC=AAGGCGGATGCGCTTGGGTCG;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=196;TCF=96;TCR=100;TR=107;WE=179397569;WS=179397551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,125:0.56:223
chr2	179398823	rs2857265	G	A	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=748;ReadPosRankSum=2.309;SC=GCTGTCGGACGCCAAAGTACC;SOR=0.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=53;WE=179398831;WS=179398813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,70:0.41:169
chr2	179400130	rs56273463	G	A	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1606;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TGTCCTACACGGAGCCATCTT;SOR=0.599;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=201;TCF=95;TCR=106;TR=99;WE=179400138;WS=179400120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,120:0.50:240
chr2	179403593	rs2303539	G	A	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1728;ReadPosRankSum=-2.498;SC=TAATGAAAAGGGAGTCAGCTT;SOR=0.346;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=90;WE=179403601;WS=179403583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,105:0.50:209
chr2	179404786	rs2288325	A	T	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=799;ReadPosRankSum=-1.706;SC=AAATGATCATATGTCTCACCA;SOR=0.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=48;WE=179404794;WS=179404776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
chr2	179405885	rs3731751	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CACATTTTGATTGTGGTGGTG;SOR=2.147;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=10;WE=179405893;WS=179405881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	179406003	rs3731750	C	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=485;ReadPosRankSum=1.641;SC=TACAAAATGTCCTTACCAATT;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=30;WE=179406011;WS=179405993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr2	179406191	rs3731749	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=530;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CACTTCTTTGCGCTCCACAAT;SOR=1.196;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=37;WE=179406199;WS=179406181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
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chr2	179412966	rs35445420	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=989;ReadPosRankSum=0.532;SC=CTAAGACTGCGGAGGATTTGC;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=58;WE=179412974;WS=179412956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,67:0.43:157
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chr2	179427186	rs2366751	A	G	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1295;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TTTTGCTGCCACCATCACTTT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=96;TCR=98;TR=85;WE=179427194;WS=179427176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,103:0.45:228
chr2	179427536	rs3829746	T	C	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ACTTCTCTTATGGTCAAATTC;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=82;WE=179427544;WS=179427526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,90:0.48:188
chr2	179430997	rs3731746	G	A	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=48;PP=1679;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GATCTCAGGCGTTGGACGACC;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=105;WE=179431005;WS=179430987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,122:0.54:226
chr2	179436020	rs744426	G	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CTTTCCTTGCGTTCTAGATGA;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=85;TCR=89;TR=77;WE=179436028;WS=179436010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,87:0.43:201
chr2	179443217	rs3769864	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.701;SC=TGTACTGAAATAAAAACACAT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=179443225;WS=179443208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	179444137	rs2288571	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=0.845;SC=AATAGCAGAGATAAATTACTG;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=18;WE=179444145;WS=179444127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr2	179444768	rs4145333	C	G	7610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=139;PP=2965;SC=TCCAAATTAGCTACTCTGAAG;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=115;TCR=139;TR=254;WE=179444776;WS=179444758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr2	179444939	rs2303838	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=466;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GTCACATTGACAGGTGGCCCA;SOR=1.036;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=30;WE=179444947;WS=179444929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,32:0.36:89
chr2	179447848	rs4894029	T	C	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1021;ReadPosRankSum=1.157;SC=TCCAAGAAACTGTTGGCATCG;SOR=0.738;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=71;WE=179447856;WS=179447838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,95:0.49:192
chr2	179448911	rs16866400	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-1.772;SC=ACTACTCTCTGTGTCTTGGAG;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=179448919;WS=179448901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	179449231	.	G	T	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TCACTATCTGGTCTGTCCCAA;SOR=0.490;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=197;TCF=84;TCR=113;TR=92;WE=179449239;WS=179449221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,106:0.48:222
chr2	179451420	rs2042996	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=668;ReadPosRankSum=0.578;SC=TCTGTAACTAGTGATGTAGCC;SOR=0.329;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=41;WE=179451428;WS=179451410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr2	179454394	rs1560221	A	G	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GCCACTTTAGATAGACAAATG;SOR=0.586;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=88;WE=179454402;WS=179454384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,102:0.46:220
chr2	179455207	rs2163009	T	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1155;ReadPosRankSum=-1.285;SC=TCCATTGTGCTGTGCCAGGTT;SOR=0.338;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=164;TCF=69;TCR=95;TR=80;WE=179455215;WS=179455197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr2	179457147	rs16866406	G	A	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1651;ReadPosRankSum=1.596;SC=TGAACCAGCTGGATTCTCCAC;SOR=0.419;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=94;WE=179457155;WS=179457137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,114:0.47:241
chr2	179458591	rs2288569	C	T	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1220;ReadPosRankSum=0.747;SC=TGGTCCAGGACGGTCTGCAGA;SOR=0.544;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=74;WE=179458608;WS=179458581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,82:0.46:179
chr2	179464527	rs1001238	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=791;ReadPosRankSum=0.296;SC=ATGTTAACATTGGTTCCTTCT;SOR=0.884;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=54;WE=179464535;WS=179464517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr2	179477332	rs34928195	AT	A	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	179514433	rs2562845	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=540;ReadPosRankSum=-1.437;SC=TATTCAACACTGTAACATATA;SOR=0.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=28;WE=179514441;WS=179514423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr2	179515388	.	G	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1011;ReadPosRankSum=1.505;SC=AAATGACCAAGAAATAATGAG;SOR=0.879;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=88;TCR=42;TR=61;WE=179515396;WS=179515378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,71:0.45:158
chr2	179529666	.	T	C	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=955;ReadPosRankSum=0.911;SC=TGAAAGATATTAGCAATTCAC;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=28;TCR=76;TR=55;WE=179529674;WS=179529656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
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chr2	179548954	rs78092378	T	TCAA	2531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.40;MQRankSum=4.636;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
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chr2	179558366	rs2042995	T	C	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=27;PP=1186;SC=CTTTTGGAAATGGCAACGTGA;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=68;WE=179558374;WS=179558356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	179566146	rs2251987	T	G	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=51;NR=30;PP=1724;SC=ACATGGAAGGTTTTGTTCTGA;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=179566154;WS=179566136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	179576596	rs2742331	A	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=-0.258;SC=TTCCTAAAAAATAGGCCTCCC;SOR=1.387;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=179576604;WS=179576586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr2	179578730	rs2562839	G	A	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1432;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TCTTAAGGCCGGATACTTTGT;SOR=0.358;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=89;WE=179578738;WS=179578720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,104:0.50:208
chr2	179579093	rs12693164	T	C	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.033;NF=57;NR=59;PP=2021;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TTTTCCAGCATTGGCTGGTTC;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=118;TCR=119;TR=116;WE=179579101;WS=179579083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,146:0.52:281
chr2	179579212	rs2562838	T	C	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1669;ReadPosRankSum=-1.449;SC=CTGAAATGGGTTCAGCGCCTT;SOR=0.757;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=190;TCF=85;TCR=105;TR=89;WE=179579220;WS=179579202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,112:0.48:231
chr2	179579822	rs2562836	T	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GGATACTGGTTAGGAAGTTCT;SOR=0.889;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=76;WE=179579830;WS=179579812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr2	179580583	rs2562834	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=149;ReadPosRankSum=-1.425;SC=AAATAATCTTTGCTAGAGAGG;SOR=0.128;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=13;WE=179580591;WS=179580573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr2	179582162	rs62178977	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=876;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CTCTCACATACAGAGCAGAAA;SOR=0.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=51;WE=179582170;WS=179582152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr2	179582327	rs13390491	C	T	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.974;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=885;ReadPosRankSum=-1.923;SC=CCCTATGTGGCTCTGGTCAGT;SOR=0.406;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=55;WE=179582335;WS=179582317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,66:0.44:150
chr2	179582537	rs2627043	G	T	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1426;ReadPosRankSum=0.604;SC=AAGTTTGCGCGCTGTAAAGAA;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=188;TCF=90;TCR=98;TR=75;WE=179582545;WS=179582527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,86:0.40:217
chr2	179582605	rs6750145	A	G	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=45;PP=1912;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TTCAATTCATAAAAGTTTTAA;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=140;TCR=96;TR=110;WE=179582613;WS=179582595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,123:0.45:275
chr2	179583398	rs62178978	T	C	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=41;PP=1529;ReadPosRankSum=2.433;SC=TTAAAAGATGTATATATTGGG;SOR=0.872;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=207;TCF=115;TCR=92;TR=99;WE=179583406;WS=179583388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,117:0.47:251
chr2	179583496	rs16866465	T	G	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1222;ReadPosRankSum=-2.059;SC=GTCTCCACTTTCTAATGGCTG;SOR=0.777;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=74;WE=179583504;WS=179583486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,94:0.43:221
chr2	179585266	rs2562831	C	T	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=56;PP=2259;SC=TGTTTCTAACCTGCTTTCGAT;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=179585274;WS=179585256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	179585393	rs2562830	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=1.473;SC=AGGAGGTGCTACCAGAAAAAA;SOR=1.768;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=18;WE=179585401;WS=179585383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr2	179587130	rs12693166	C	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.979;SC=AGATTTTCATCGTCTCTTAAA;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=81;WE=179587138;WS=179587120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,90:0.49:183
chr2	179587687	rs2742327	T	C	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=2401;ReadPosRankSum=1.291;SC=GGCTCACAGTTAGCAACTGGA;SOR=0.620;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=244;TCF=124;TCR=120;TR=124;WE=179587695;WS=179587677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,138:0.49:280
chr2	179595117	rs17076	C	G	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AAAGAAAAAACAAGCAAAAGA;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=57;WE=179595125;WS=179595106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr2	179598228	rs12993099	A	G	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1095;ReadPosRankSum=0.329;SC=CTGCTCGCTCAATGATTTTGG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=67;WE=179598236;WS=179598218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,84:0.55:153
chr2	179600563	rs2742348	G	A	8635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=142;PP=2965;SC=CAAACTTGTTGGAAGCCTTAC;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=122;TCR=142;TR=264;WE=179600571;WS=179600553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr2	179605180	rs746578	C	T	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TCAAGATGAGCGCACTTTGTG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=66;WE=179605188;WS=179605170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,78:0.57:136
chr2	179614952	rs10803917	A	G	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=79;PP=2965;SC=ACCAATGCTAACTCTTCTTCC;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=179614960;WS=179614942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	179615887	rs922984	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=22;PP=998;SC=GATTTTCATGTCCTCTCTAGA;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=179615895;WS=179615877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	179615931	rs922985	C	G	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=16;PP=1004;SC=CTTCACTTCTCAAAGTTCTTG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=179615939;WS=179615921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	179615994	rs922986	T	C	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=32;PP=1645;SC=TCTCCATTAATGTTTTTCTAG;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=179616002;WS=179615984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	179618019	rs3754953	T	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=135;SC=AACAGAAAACTACATTCCCCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=179618027;WS=179618009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	179620951	rs7585334	C	T	4341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=43;PP=2812;SC=CAATTAACCACCTTCTACACT;SOR=1.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=134;WE=179620959;WS=179620941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	179621477	rs6433728	C	T	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=69;PP=2582;SC=TGGGACTTGGCGGACTCTCTT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=123;WE=179621485;WS=179621467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	179623758	rs2291310	C	T	5376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=64;PP=2965;SC=TACAGCATTACTAGCAACAAA;SOR=1.301;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=115;TCR=64;TR=179;WE=179623766;WS=179623735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	179623939	rs6705594	T	C	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=92;PP=2280;SC=ACCACAAAAATGAGTGGATTT;SOR=2.197;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=30;TCR=92;TR=122;WE=179623947;WS=179623929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	179629363	rs4894043	T	C	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=53;PP=2247;SC=AAAGCGTGTATTCTTGCCCAT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=179629371;WS=179629353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	179629461	rs2291311	C	T	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=57;PP=1752;SC=CCGGATATCACGGCACAGAAG;SOR=1.384;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=87;WE=179629469;WS=179629451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	179632710	rs2291313	T	C	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=43;PP=1891;ReadPosRankSum=0.132;SC=AACTGGGAATTACTGGAATGT;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=203;TCF=119;TCR=84;TR=108;WE=179632718;WS=179632700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,131:0.52:254
chr2	179633298	rs4471922	G	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.413;SC=CCCATCGTATGGCTATCCCAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=179633306;WS=179633288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	179634376	rs72125115	GTA	G	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.155;NF=12;NR=12;PP=838;ReadPosRankSum=0.660;SC=ATATATATGTGTATATATATA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=24;WE=179634400;WS=179634366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr2	179634389	rs66507452	TA	T	769.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.24;MQRankSum=0.771;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr2	179634391	rs66897330	TA	T	769.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.24;MQRankSum=0.837;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr2	179634961	rs33917087	C	A	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.584;SC=TTTACTGGAACAGTGTCATGG;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=206;TCF=108;TCR=98;TR=87;WE=179634969;WS=179634951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,110:0.45:242
chr2	179635882	rs4894047	C	T	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=403;SC=TCTTTTAAAACGATAACGATC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=179635890;WS=179635872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	179635919	rs13011633	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.638;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=403;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TTGAAAAGGACAAATCCTATG;SOR=1.528;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=20;WE=179635927;WS=179635909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	179639297	rs3816781	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=266;SC=TTATCTCCCCCATACTATCAG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=179639305;WS=179639287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	179642425	rs719201	G	A	4721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=53;PP=2965;SC=AACTTATCACGCTTACCATCA;SOR=1.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=142;WE=179642433;WS=179642415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	179643886	rs2291302	A	G	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=40;PP=1613;SC=AATTTACATCAAATAGTTATA;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=72;WE=179643894;WS=179643876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	179643934	rs2291301	A	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=35;PP=1522;SC=GCAAGGAGCTATGATAAATGT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=179643942;WS=179643924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	179644035	rs1552280	G	A	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=41;PP=1491;SC=CTTGATTCTTGAATCAAATCC;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=179644043;WS=179644025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	179644855	rs10497520	T	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=20;PP=918;SC=TCTCCAACTTTAGGTTCTTGA;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=45;WE=179644863;WS=179644845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	179650408	rs35813871	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=497;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AGGGCTAGCTGTGCGGGGGCG;SOR=0.330;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=33;WE=179650416;WS=179650398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr2	179650701	rs6715406	C	T	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1042;ReadPosRankSum=0.692;SC=GTTGGGGAGGCTCAGCTACCT;SOR=0.390;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=70;WE=179650709;WS=179650691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,87:0.59:147
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chr2	179667090	rs3816849	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=0.295;SC=GAACAATTCACCTTTATGTTT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=34;WE=179667098;WS=179667080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr2	179702268	rs1032283	A	G	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=62;PP=2879;SC=ATGGTGCAAGAGGGGACTCAG;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=130;WE=179702276;WS=179702258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	179702577	rs3045731	A	AGG	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=763;SC=ACAACCTACAAGGTTAAAATT;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=16;WE=179702585;WS=179702567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	179702610	rs2078403	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=190;SC=GCAAGAATTACGGATGAGAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=179702618;WS=179702600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	179719966	rs1872203	A	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-0.026;SC=AAGGAGCATGATACATGAATA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=16;WE=179719974;WS=179719956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	179732980	rs10165177	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=653;SC=TATGAAGACAAATTTTTTTTT;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=179732988;WS=179732970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	179732997	rs10165253	A	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=148;ReadPosRankSum=0.837;SC=TTTTAAGCCTAATTTCTATAG;SOR=0.243;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=10;WE=179733005;WS=179732987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr2	179753245	rs7573293	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=549;SC=TTTTAGTTTACGAAACTACCT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=179753253;WS=179753235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	179753549	rs1873164	G	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=254;SC=GGCATAGCAGGAAGCAAAAAT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=179753557;WS=179753539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	179783696	rs12467323	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=1.022;SC=ATGCTTGTGTCCCCCCGAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=179783704;WS=179783686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr2	179809500	rs9677932	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=410;SC=TTATATAAACCATCTCATGTA;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=179809508;WS=179809490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	179825838	rs11303440	TG	T	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=395;ReadPosRankSum=1.604;SC=GAAAGCTTTTTGGACCAAAGA;SOR=0.560;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=12;WE=179825846;WS=179825828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	179826241	rs6725028	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-0.935;SC=AAAAAGAATAATGATATTAGC;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=179826249;WS=179826231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	179839833	rs10930846	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=424;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AGGACTCAGCACTCTCAAACT;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=32;WE=179839841;WS=179839823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr2	179979930	rs2289993	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=1036;ReadPosRankSum=1.275;SC=AGCGCAAAGATTGGCATAACA;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=65;WE=179979938;WS=179979920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,75:0.43:174
chr2	179980070	rs2044479	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=295;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TGTCGTTACAGTTAAGTGACA;SOR=0.765;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=18;WE=179980078;WS=179980060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr2	179982125	rs3217565	AAGAT	A	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.279;NF=8;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=-1.956;SC=ATTCTTCAACAAGATAGATAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=179982136;WS=179982115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	179989039	rs2289992	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=455;ReadPosRankSum=-2.329;SC=TTACGTGTAGGTAAGTGTTCA;SOR=0.200;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=25;WE=179989047;WS=179989029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr2	179997177	rs3214766	AT	A	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TTGAGATAACATTTTTTAAAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=10;WE=179997185;WS=179997167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	180039068	rs13013868	C	T	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=26;PP=2965;SC=AATCCAAAAGCTGTTAAAATA;SOR=2.472;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=105;TCR=26;TR=131;WE=180039076;WS=180039058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	180047746	rs1446673	G	C	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=15;PP=2073;SC=ACAATAGAAAGAATCATTAGT;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=71;TCR=15;TR=86;WE=180047754;WS=180047736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	180047908	rs6757681	T	C	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=72;PP=2284;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TCCGTCTGTCTTTTCCTCCTA;SOR=0.887;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=24;TCR=73;TR=96;WE=180047916;WS=180047898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr2	180308335	rs10171283	C	G	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=144;SC=GTCAAGAAATCATTATTTTCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=180308343;WS=180308325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	180383498	rs4567894	C	A	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=103;SC=AAAGAGTCTCCTTCAACAGTA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=180383506;WS=180383488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	180725481	rs259816	T	C	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.14;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	180810180	rs6433817	C	T	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.731;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=31;PP=2266;ReadPosRankSum=1.409;SC=CTCTGTCATTCGCAACTCTAC;SOR=1.447;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=97;WE=180810188;WS=180810170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr2	180810264	rs6433818	A	T	5476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=93;NR=82;PP=2965;SC=AATTTGAACCACTTGAATTTT;SOR=0.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=175;WE=180810272;WS=180810241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	180815528	rs2304858	A	T	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=28;PP=1147;SC=TAATCTGAACATAAATTCTGA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=180815536;WS=180815518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	180823590	rs10497553	C	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=171;SC=CTGAAACACCCTAAGCTTTGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=180823598;WS=180823580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	180835589	rs4894140	A	G	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=49;PP=2589;SC=TATAGCTAAAAGTTAACAGAA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=107;WE=180835597;WS=180835579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	180835792	rs3768837	T	A	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=78;PP=2261;SC=CTAAGCATAATACTTCGTGTG;SOR=2.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=21;TCR=78;TR=99;WE=180835800;WS=180835782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	180837806	rs6433821	T	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=11;PP=1244;SC=CATCCAACATTTTTATCCCAA;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=180837814;WS=180837796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	180843126	rs2367990	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=339;SC=CTACATAGTGCTCCTTAATTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=180843134;WS=180843116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	180846743	rs3738943	G	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=536;SC=TAAATTTTTTGAAGAGCAGAA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=180846751;WS=180846733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	182344846	rs11412304	G	GT	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	182350447	rs155102	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=1.942;SC=CTCAATAAATATTTATTGAAT;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=182350455;WS=182350443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	182350743	rs155103	A	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1153;ReadPosRankSum=1.062;SC=TCAAATTGGTACTTGATTTCT;SOR=0.495;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=36;TCR=89;TR=66;WE=182350751;WS=182350733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr2	182359613	rs165419	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=243;SC=AGTGAAGTACGTAAAACTGGT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=182359621;WS=182359603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	182374328	rs3816521	T	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=318;ReadPosRankSum=0.808;SC=GGAGTTTTATTTTTTTTTAAT;SOR=0.739;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=25;WE=182374336;WS=182374318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr2	182374534	rs1143674	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=725;ReadPosRankSum=0.128;SC=TGAAAAAAACAGTAGGAATAT;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=43;WE=182374542;WS=182374524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr2	182374553	rs2305584	A	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=5;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=657;ReadPosRankSum=-0.106;SC=ATTTTCCTTTATTCAAATTAT;SOR=1.131;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=20;WE=182374575;WS=182374543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr2	182374567	rs2305583	A	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=657;ReadPosRankSum=0.295;SC=AAATTATTGTATGGCATTTAA;SOR=1.379;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=17;WE=182374575;WS=182374543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr2	182376546	rs1466109	T	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=33;PP=1093;SC=ATCGAGAGGGTGTAATGAGTG;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=182376554;WS=182376536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	182387133	rs7602504	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=349;ReadPosRankSum=1.710;SC=TTAAAAGTAAATGGTAGAATT;SOR=1.893;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=19;WE=182387141;WS=182387123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	182392143	rs56095368	G	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=743;ReadPosRankSum=0.365;SC=GTTAATATTTGTAACAACCTA;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=48;WE=182392151;WS=182392133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr2	182395345	rs1143676	G	A	2775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1766;ReadPosRankSum=1.272;SC=GGCATAGTCCGGTTCTTGTCC;SOR=0.696;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=103;WE=182395353;WS=182395335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,126:0.50:254
chr2	182399097	rs7562325	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=0.153;SC=ATGTTGCGCATGTAAGATTAC;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=42;WE=182399105;WS=182399087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr2	182399638	rs2124443	A	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=26;PP=866;SC=TTGTACTTCTATTGATCTCAT;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=182399646;WS=182399628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	182399685	rs41265949	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=236;ReadPosRankSum=-1.573;SC=CAATTACCAACATTAGTCTAC;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=182399693;WS=182399675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	182402790	rs6747500	G	A	88.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	182403792	rs57234957	A	AT	4470.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=2936;SC=ACTGGTTGACAATAAGCGGTG;SOR=2.002;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=76;WE=182403800;WS=182403782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	182403851	rs10180793	G	A	6011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=85;PP=2965;SC=CTTCCATTAAGTCACCATCTA;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=192;WE=182403859;WS=182403841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	182412633	rs139036113	G	GACACACACACACAC	718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.017;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.541;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,24:0.24:100
chr2	182412723	rs34890422	C	CGT	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=96;ReadPosRankSum=0.847;SC=TAAGTAAAAACGTACAATTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=4;WE=182412731;WS=182412713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr2	182413259	rs12997453	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=0.461;SC=TATTACATTGAGTTTTTACCT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=17;WE=182413267;WS=182413249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
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chr2	182521578	rs1473295	G	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TCCCGATCTCGAAGATGCCCC;SOR=0.702;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=87;WE=182521586;WS=182521568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,114:0.54:213
chr2	182543455	rs1801262	T	C	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=722;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GCGTTCATGGTTTCGAGGTCG;SOR=1.020;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=42;WE=182543463;WS=182543445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr2	182766836	.	ATCT	A	2068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=1301;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AGAAAGAGTCATCTTCTATGT;SOR=0.682;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=32;WE=182766846;WS=182766826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr2	182780126	rs78774163	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=658;ReadPosRankSum=0.967;SC=AGCAGTTGCAGACAAAAGAAA;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=39;WE=182780134;WS=182780116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr2	182783653	rs2303553	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=1.884;SC=AAGCTTTTCATTCAAAGTCTT;SOR=1.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=182783661;WS=182783643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	182794534	rs1051085	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TTGTATGTCAGTATTTTTCAT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=182794542;WS=182794524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	182928555	rs1196161	G	C	4564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=73;PP=2785;SC=GTCATGAGTGGTGAATCATGG;SOR=0.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=138;WE=182928563;WS=182928545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	182981846	rs1882211	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TGAAAACTTTGCACTCTTTTC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=182981854;WS=182981836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	182981968	rs1882212	A	G	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=880;ReadPosRankSum=0.064;SC=ATGAATCAGCATTCCCTGAAG;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=70;WE=182981976;WS=182981958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,86:0.47:184
chr2	183066377	.	C	CA	318	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=18;MQ=59.45;NF=9;NR=8;PP=318;QD=19.0;SC=TTTAACATGACAAAAAAAAAA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=17;WE=183066398;WS=183066367;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:35,17:0.33:52
chr2	183088584	rs3754929	G	A	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=24;PP=1585;SC=TACTTTTTCAGACTTACCTTG;SOR=1.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=183088592;WS=183088574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	183106758	rs2568667	T	G	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=613;SC=TCAGATACAGTGTAGGTAGAA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=183106766;WS=183106748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	183584755	rs6729801	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=378;ReadPosRankSum=1.172;SC=TGCACATGGCGATTTTTTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=22;WE=183584763;WS=183584745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr2	183593451	rs3832045	AT	A	678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.935;NF=11;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=-0.971;SC=ATATGTTAGAATTTTTTTTTC;SOR=0.543;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=26;WE=183593459;WS=183593441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	183593697	rs288280	C	T	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1383;ReadPosRankSum=0.979;SC=GCTATCCCAGCCTCTTCATTT;SOR=0.648;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=154;TCF=56;TCR=98;TR=82;WE=183593705;WS=183593687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,90:0.50:180
chr2	183595767	.	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=300;ReadPosRankSum=-0.120;SC=GAAATTTTGTCAACTCCATAC;SOR=0.709;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=18;WE=183595775;WS=183595757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr2	183597063	rs288282	T	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr2	183597318	rs825660	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=752;ReadPosRankSum=-0.675;SC=AAAGAAACACATTTAGAAATT;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=44;WE=183597326;WS=183597308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr2	183616592	rs3098359	C	T	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=55;PP=1759;SC=CTAGATAACTCTGAATCATTA;SOR=2.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=74;WE=183616600;WS=183616582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	183616748	rs3115425	G	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=637;ReadPosRankSum=0.413;SC=ATGATGGGGGGGTTTTTTGTG;SOR=0.692;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=52;WE=183616756;WS=183616738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,64:0.41:156
chr2	183616913	rs61748254	A	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=-1.344;SC=ACTCTGTAACATGGTAAGGCA;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=37;WE=183616921;WS=183616903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr2	183622319	rs141152570	AATAAT	A	86.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=2;NR=0;PP=57;SC=GTCACTGATAAATAATATAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=183622331;WS=183622309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	183622547	rs288334	T	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-0.146;SC=AAGCTTATCATTATCAGTAAG;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=19;WE=183622555;WS=183622537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr2	183627504	rs192618	A	G	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.870;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1014;ReadPosRankSum=0.675;SC=CAACTGTTAAATTTTATTTCT;SOR=0.302;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=64;WE=183627512;WS=183627494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr2	183627619	rs190830	C	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=1.410;SC=TCTGTTTTCTCATCCTTGTCA;SOR=1.721;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=16;WE=183627627;WS=183627609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	183699584	rs7775	G	C	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=63;PP=2522;SC=ATTTAGTTGCGTGCTTGCCGG;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=118;WE=183699592;WS=183699574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	183699768	rs73977799	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=412;SC=TAACAACTGGGTCAGACTGCA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=183699776;WS=183699758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	183703336	rs288326	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=30;PP=948;SC=ACTTTAGCCCGAATGACTGGG;SOR=1.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=183703344;WS=183703326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	183793653	rs74942055	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=506;ReadPosRankSum=-0.312;SC=TAAGAATAAAATCAAGGTATT;SOR=0.322;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=34;WE=183793661;WS=183793643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr2	183799570	rs139260477	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=-1.314;SC=CCTAGGCAGGATAACAAATAA;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=16;WE=183799578;WS=183799560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr2	183806893	rs140820523	TA	T	942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=425;SC=CACAAGTTTCTAAAAAAAAAA;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=23;WE=183806901;WS=183806883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	183806980	rs79263912	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=2;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=1.174;SC=ATCTGGCAAGTAGGAAACACA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=183806988;WS=183806970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	183822374	rs17265866	G	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=175;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TACTCTGAAAGCATACTAACT;SOR=0.627;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=183822382;WS=183822364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	183832100	.	C	CA	91	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=64.74;NF=0;NR=6;PP=91;QD=16.1666666667;SC=CTATAAAGTACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=183832108;WS=183832090;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr2	183841691	rs144939357	GA	G	171.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=94;SC=TGTAGTAATAGAAAAAAAAAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=183841699;WS=183841680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr2	183848053	rs35142583	A	G	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.284;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.454;SC=AGAGGACAGTAGCCAATTCCT;SOR=0.615;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=195;TCF=100;TCR=95;TR=102;WE=183848061;WS=183848043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,126:0.52:244
chr2	183848114	rs1400130	T	C	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=82;PP=2121;SC=TGAACCACTATGGGGAAAGAC;SOR=1.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=45;TCR=83;TR=126;WE=183848122;WS=183848104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	183850877	rs41270217	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr2	183860298	rs10497617	G	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=399;SC=GACTTAAGTAGTGAACATTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=183860306;WS=183860290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	183867004	rs141187393	G	GA	272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=11;PP=250;SC=CAGTCTAGGAGAAAAAAAAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=183867012;WS=183866994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	183902656	rs111233403	C	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=609;ReadPosRankSum=0.823;SC=CCCACGGCCTCCCTTGCCCTT;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=42;WE=183902664;WS=183902646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr2	183943952	rs72890349	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=790;ReadPosRankSum=-1.683;SC=CTCATTTTCCCCCTTTATGCG;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=39;TCR=73;TR=51;WE=183943960;WS=183943942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr2	183988984	rs2705719	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.806;SC=CTTCCCGGTGCAAAAACCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=183988992;WS=183988974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	183995729	rs76921397	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=-1.907;SC=TTAGGGTCCCCAACAGGGTCC;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=17;WE=183995750;WS=183995719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr2	183995742	rs925803	A	C	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=23;PP=885;SC=CAGGGTCCTGATCAGTTGCCC;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=183995750;WS=183995719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	184022112	rs72894593	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=275;ReadPosRankSum=0.523;SC=ATCTTGTAGTAATTTGCATTC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=19;WE=184022120;WS=184022102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr2	184024190	rs3748884	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=350;ReadPosRankSum=-0.033;SC=TTTATAAACAAAGGAGTTATT;SOR=0.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=18;WE=184024198;WS=184024180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	184024462	rs7562034	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=-2.321;SC=GTATTGATTTGTATGCCATTA;SOR=0.909;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=18;WE=184024470;WS=184024452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr2	184025723	rs72896518	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=267;ReadPosRankSum=0.353;SC=TTCTAGAATTGCCTATGACAC;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=21;WE=184025731;WS=184025713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	184025750	rs140119771	TA	T	818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.963;NF=5;NR=10;PP=486;ReadPosRankSum=-0.487;SC=AACAATAACCTAACCGTTTTT;SOR=0.492;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=15;WE=184025758;WS=184025740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr2	185243700	rs12693375	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GCAAAAGTAACGGCAGTTTTT;SOR=0.807;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=14;WE=185243708;WS=185243690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr2	185463815	rs147358574	C	CCT	3087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,99:0.54:183
chr2	185798504	rs4667000	A	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=635;ReadPosRankSum=0.643;SC=AACATGACCAAAAAAGGGGTA;SOR=0.928;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=37;WE=185798512;WS=185798494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr2	185800905	rs12476147	A	T	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1343;ReadPosRankSum=0.830;SC=CATCTTCAACAATCTTCACCA;SOR=0.769;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=91;TCR=121;TR=93;WE=185800913;WS=185800895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,108:0.44:243
chr2	185801747	rs4667001	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr2	185801755	rs4667002	A	G	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.40;SOR=1.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	185801917	rs728534	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr2	185802211	rs5836928	C	CACA	990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=720;ReadPosRankSum=1.976;SC=GTAAAAAGAACACAATACTTT;SOR=0.627;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=15;WE=185802219;WS=185802201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	185802243	rs1366842	C	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=636;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TCAAATGCAACAATGATACAT;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=35;WE=185802251;WS=185802233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr2	185802363	rs12477430	A	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=826;ReadPosRankSum=-1.692;SC=GATATGAAACACATGAGTCAG;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=51;WE=185802371;WS=185802353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr2	185803445	rs112183442	G	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1101;ReadPosRankSum=1.443;SC=GCAGCACGCTGCAGCTGCTGC;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=67;WE=185803453;WS=185803435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,84:0.50:169
chr2	186610344	rs11884004	T	G	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=57;PP=1794;SC=TGGACCCAAATAAGCTGGAAA;SOR=1.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=186610352;WS=186610334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	186610388	rs17813736	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=1121;SC=TTTAAGTACTGGACACCATTC;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=186610396;WS=186610378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	186611566	rs6758484	C	A	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=96;PP=2858;SC=AAAATATTAACAGAAAAATTG;SOR=2.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=28;TCR=96;TR=124;WE=186611574;WS=186611556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	186611938	rs12618129	G	A	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=520;SC=CCTGATTTCTGTTAGGCCCTG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=186611946;WS=186611928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	186625770	rs7562137	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=531;ReadPosRankSum=2.737;SC=ATTTTACGAAAAAAAACTCAG;SOR=0.328;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=23;WE=186625778;WS=186625760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr2	186627943	rs17228441	T	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=35;PP=1349;SC=GGTTCAATTATTTCAGCGCAG;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=186627951;WS=186627933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	186629349	rs1986166	G	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=26;PP=856;SC=TCTTTCAACTGACATTTACTG;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=186629357;WS=186629339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	186647270	rs140906899	T	TA	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GATCTTACAGTACAGGTCCTT;SOR=0.301;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=7;WE=186647278;WS=186647260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	186654592	rs992822	A	G	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=30;PP=1563;SC=GAAGCAATCAATGCTATACTA;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=70;WE=186654600;WS=186654582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	186655726	rs10931199	G	A	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=26;PP=1247;SC=TCTTCATTACGATCTCAACTT;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=186655734;WS=186655716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	186656657	rs10173807	C	T	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=50;PP=1699;SC=GGTTTGCCAACGGACATTTAG;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=186656665;WS=186656647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	186656840	rs17815052	T	C	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=735;ReadPosRankSum=-2.237;SC=CAGAATTAAATGTGACCTCAT;SOR=0.790;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=55;WE=186656848;WS=186656830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr2	186656956	rs17229201	T	C	3342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=60;PP=1926;SC=TTTAATGAAATGGAATCTGAA;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=186656964;WS=186656946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	186657089	rs17229222	C	A	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=26;PP=1280;SC=ATGAGAGATCCCCACAAAGAG;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=186657097;WS=186657079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	186658056	rs60029104	G	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=36;PP=1526;SC=CAAAGAGATCGATTTAGATCA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=186658064;WS=186658046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	186658438	rs10490391	C	T	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=61;PP=2408;SC=TTTTGTGATACGTTTCCAAAA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=118;WE=186658446;WS=186658428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	186658565	rs10490392	G	T	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=30;PP=1260;SC=CTGTAGTAGAGAAAGAAGACA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=186658573;WS=186658555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	186659359	rs2161036	G	T	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=28;PP=1253;SC=CAAAGAGTAAGGGAAGTCACA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=186659367;WS=186659349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	186661673	rs55938253	A	G	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=98;PP=2965;SC=GCAGTTTCTTACAAAAGCTGC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=192;WE=186661681;WS=186661663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	186664473	rs11686997	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=13;PP=910;SC=GGAAAAAATATGAATCAAAAC;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=186664481;WS=186664463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	186664963	rs10931200	C	A	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=33;PP=1416;SC=TAGTGTACCCCTTTGCAACAA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=186664971;WS=186664953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr2	186665824	rs11695215	A	G	5369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=71;PP=2965;SC=AGCACCATTTAACAAGCATTG;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=152;WE=186665832;WS=186665814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	186667121	rs7605884	T	C	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=26;PP=1421;SC=CAGGCTTTCTTTTCTTTCAAT;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=186667129;WS=186667111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	186668714	rs17826419	A	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=514;ReadPosRankSum=-1.490;SC=CCTGTTTCAAAAATAGCGAGT;SOR=1.075;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=33;WE=186668722;WS=186668704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr2	186670104	rs7576532	A	C	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=37;PP=1722;SC=TTGTATATGAACAGTTCATAG;SOR=0.930;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=186670112;WS=186670094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	186670780	rs16827154	T	A	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=25;PP=1371;SC=TGATGAGATATACACACATTT;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=186670788;WS=186670770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	186670979	rs4666689	T	C	4646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=78;PP=2965;SC=GAAATAAGAATTCGAACATCA;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=145;WE=186670987;WS=186670969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	186671357	rs17826534	G	A	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=35;PP=1786;SC=CAAAACCAACGAGAAAGTAAA;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=186671365;WS=186671347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	186671912	rs1862066	G	A	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=55;PP=2553;SC=ATTTTCCAACGTCAGGTTAAC;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=186671920;WS=186671902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	186672527	rs72900086	T	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.372;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=956;ReadPosRankSum=0.616;SC=GATGTGCCCCTACCTAAACCT;SOR=0.935;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=56;WE=186672535;WS=186672517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr2	186678241	rs34138386	A	AT	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.34;NF=11;NR=3;PP=518;SC=TAGGCATTTGATTTTAATATT;SOR=3.258;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=14;WE=186678249;WS=186678231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	186678887	rs2161035	T	C	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=757;SC=ATCTCAAGCCTGGTGATATTT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=186678895;WS=186678877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	186680041	rs2287606	G	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=416;SC=ATGCCATAAGGTAAGAAAATA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=186680049;WS=186680031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	186696759	rs2302913	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=212;SC=TTACTGTTTGCATAAATACCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=186696767;WS=186696749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	186697876	rs1468999	A	G	5153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=84;PP=2965;SC=AATGTCTTCAACTTTGTCAAA;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=163;WE=186697884;WS=186697866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	187364811	rs4144786	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=1.312;SC=GGTAAGGACTGTAAATATGCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=187364819;WS=187364801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	187370673	rs11690758	G	C	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=767;ReadPosRankSum=-1.021;SC=ACAGTGCCTGGGTTCAAATCC;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=59;WE=187370681;WS=187370663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr2	187455278	rs9333287	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=0.299;SC=GAACTGGAGCCGGCCCCCTCC;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=187455286;WS=187455268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	187487160	rs9333288	G	A	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1062;ReadPosRankSum=-1.466;SC=AAATTTTGGTGAGTCTTCTGG;SOR=0.816;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=71;WE=187487168;WS=187487150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr2	187487269	rs6741369	G	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=0.997;SC=AAGGGCACAGGGTATAACAAC;SOR=0.141;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=187487277;WS=187487259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	187490371	rs2197787	T	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=133;ReadPosRankSum=-2.095;SC=CCTAGTTTGTTAAAAATATGT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=9;WE=187490379;WS=187490361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr2	187501682	rs56136540	G	A	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=18;PP=2621;SC=ACAAAATATTGCATAAGTAAA;SOR=2.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=94;TCR=18;TR=112;WE=187501690;WS=187501672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	187521260	rs3738919	C	A	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=464;SC=GGAAATTTAGCTTTGTAAAGT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=187521268;WS=187521250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	187532417	rs2230616	G	A	3983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=51;PP=2378;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TCCTGATCATGTCTTTCTTCC;SOR=1.076;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=80;TCR=52;TR=130;WE=187532425;WS=187532407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,151:0.99:153
chr2	187540732	rs3213964	G	A	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=151;SC=GTTTTTTAAAGAACGACAGCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=187540740;WS=187540722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	187541810	rs2887831	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=15;PP=1202;SC=TGAGGGAAGATAAATTTTATG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=187541818;WS=187541800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	6358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=52;PP=2988;SC=GCCTCATCCAACAGCAGCAGC;SOR=0.895;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=76;WE=187559037;WS=187559019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	187559222	rs6705757	T	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=33;PP=989;SC=CCCTTCCCTATCCATTCCTAT;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=187559230;WS=187559212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr2	187698037	rs7609183	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=357;SC=AGTTGGTTGCGTATCAATAAT;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=187698045;WS=187698027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	187698751	rs7559533	G	A	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=63;PP=2033;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CTATGCATTCGGTACACCTAA;SOR=1.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=94;WE=187698759;WS=187698741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr2	188216783	rs858744	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=497;ReadPosRankSum=0.438;SC=TAAACCAAAGCTATATGTATA;SOR=1.473;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=29;WE=188216791;WS=188216773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr2	188216807	rs858745	T	C	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=27;PP=2124;SC=AATTCCAAACTTCTCAAGCTG;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=188216815;WS=188216797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	188227921	rs698582	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=0.986;SC=CTATATTCCAATGTAGAAAGG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=188227929;WS=188227915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	188243633	rs3771084	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=-1.143;SC=CAAGACATCTAGTAATTTTCT;SOR=0.801;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=12;WE=188243641;WS=188243623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr2	188245640	rs1511877	G	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=251;SC=GACATTATATGAAAATCTATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=188245648;WS=188245630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	188250301	rs698577	T	A	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=32;PP=997;SC=ACCAGAAAATTCAGGGTACAC;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=188250309;WS=188250291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	188332692	rs8176592	A	G	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=1002;ReadPosRankSum=0.616;SC=GGTAAGCCATATGTGATAGTG;SOR=0.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=42;TCR=91;TR=61;WE=188332700;WS=188332682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr2	188343497	rs7586970	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-1.568;SC=ATGAGCCGCATTCTTCCAACC;SOR=0.779;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=15;WE=188343505;WS=188343487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr2	188348696	rs144825443	TAAAC	T	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TTAAATGTCTTAAACAATTTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=188348707;WS=188348694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	189448896	rs2048138	A	T	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=874;SC=TGCAACTGAAATTGTTGTTTA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=189448904;WS=189448886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	189857993	rs12693525	T	C	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=11;PP=601;SC=CTACTCCAACTTTTGGGAGAT;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=189858001;WS=189857983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	189860975	rs112143266	AGT	A	51.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr2	189860996	.	G	A	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=57.15;NF=0;NR=4;PP=76;QD=27.6928031368;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=189861004;WS=189860986;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr2	189861029	.	T	TACACACAC	101	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=54.16;NF=4;NR=0;PP=69;SC=TATCTATATATATACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=189861039;WS=189861019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	189861031	rs62181730	T	C	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=55.68;NF=4;NR=1;PP=51;SC=TCTATATATATACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=189861039;WS=189861019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	189862203	rs3134654	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=9;PP=394;SC=TCTCTGACACCATGTTGTTAC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=189862211;WS=189862193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	189863389	rs13306272	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=29;PP=1074;SC=CATATAATGCCAATCTCCCAG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=189863397;WS=189863379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	189864080	rs1800255	G	A	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=40;PP=1748;SC=TAGAGGTGGAGCTGGTCCCCC;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=189864088;WS=189864070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	189866199	rs2271682	T	A	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=45;PP=1989;SC=ACTACCTGGATATAAAAAGAA;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=102;WE=189866207;WS=189866189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	189867844	rs3736489	T	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=911;SC=ATCTATTGATTATCTGTCTAT;SOR=3.202;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=189867852;WS=189867834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	189867882	rs3736490	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=211;SC=CCTCTCCCCCCTCTGTAAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=189867890;WS=189867872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	189874873	rs10204508	C	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.044;NF=28;NR=6;PP=597;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GATTTTATAACCAATTCCCAT;SOR=1.025;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=34;WE=189874881;WS=189874863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr2	189875421	rs1516446	T	G	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=70;PP=2965;SC=TTGATGTGCATCTGGCATTCC;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=189875429;WS=189875411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	189875695	rs3768660	T	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-0.424;SC=TTGAATAGAATAAATAAAATT;SOR=1.385;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=15;WE=189875703;WS=189875685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
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chr2	189904233	rs10197596	T	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=267;ReadPosRankSum=-1.998;SC=CAAGAGCAGCTGTAAGGTGGC;SOR=1.420;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=17;WE=189904241;WS=189904223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	189907937	rs6434312	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=21;PP=805;SC=GACCTCTGTCACCTCGGTCTC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=189907945;WS=189907927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	189918337	rs6750027	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TTAAGGAAGGTCCTTAAGGAT;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=189918345;WS=189918327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	189923104	rs7556733	A	G	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=21;PP=1543;SC=TGCGTTTATTAAGCAGTAATT;SOR=1.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=189923112;WS=189923094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	189923630	rs5837121	AT	A	1839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.773;NF=11;NR=41;PP=588;ReadPosRankSum=1.610;SC=CTATAAACACATTTTTTTTTT;SOR=0.777;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=20;TCR=85;TR=52;WE=189923639;WS=189923620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,87:0.64:137
chr2	189925548	rs6414122	T	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=36;PP=1092;SC=TGAATCTGTGTAAGTTTAACA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=189925556;WS=189925538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	189926229	rs72904404	A	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr2	189927506	rs7424947	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.319;SC=TGAAACTTACCCATAAGTCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=189927514;WS=189927496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	189928834	rs74497802	TG	T	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=403;ReadPosRankSum=0.572;SC=GTAAAAATAGTGTTGCATTTT;SOR=0.990;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=189928842;WS=189928824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	189932831	rs2229495	T	C	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=33;PP=1228;SC=CAGAGGTACCTGGAGAGCCCT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=69;WE=189932839;WS=189932821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	189933686	rs72904419	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-1.226;SC=CCGCTTATTTGGAATTTTACA;SOR=0.743;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=6;WE=189933694;WS=189933676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	189945538	rs55929725	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAAATCAAATTAAACTCAAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=189945546;WS=189945532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	189945654	rs57206096	T	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=539;ReadPosRankSum=0.670;SC=TGAAGGTAAATCTCCCCAGAG;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=33;WE=189945662;WS=189945644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr2	189948651	rs55963648	G	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=282;ReadPosRankSum=1.047;SC=AGAGAATTGTGATTTAATTCA;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=16;WE=189948659;WS=189948641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	189948696	rs56310996	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=379;ReadPosRankSum=-0.650;SC=CCTTTATGTTGAGTATAAACT;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=28;WE=189948704;WS=189948686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr2	189949759	rs58532741	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=-1.816;SC=CTCCTGTTTACATTGAATTTA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=20;WE=189949767;WS=189949749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr2	189949786	rs61311233	TG	AT	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.455;HP=7;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GCTAAAAGGGTGGGGAAATGT;SOR=1.516;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=25;WE=189949795;WS=189949776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr2	189950069	rs60860012	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GATAAATATTGTTGAGACAGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=189950077;WS=189950059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	189950556	rs60355473	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=642;ReadPosRankSum=-2.536;SC=ATTAAACCCTGTACTCTGTCA;SOR=1.174;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=41;WE=189950564;WS=189950546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr2	189953508	rs58106884	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=747;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCTGTAAAAGCGATATGTTGA;SOR=0.455;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=125;TCF=45;TCR=80;TR=52;WE=189953516;WS=189953498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr2	189953551	rs58243388	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=457;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATACATCAACGTCCTTTTCAT;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=28;WE=189953559;WS=189953541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr2	189962098	rs73051214	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=444;ReadPosRankSum=0.654;SC=AAATGTATACTTTCTTATTGA;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=27;WE=189962106;WS=189962088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr2	189962199	rs72906358	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=215;ReadPosRankSum=2.074;SC=GAATAAAGCCATGTGCATATA;SOR=1.370;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=12;WE=189962207;WS=189962189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
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chr2	189968808	rs147860045	TA	T	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-0.936;SC=AGTGAATGGTTAAGAGGCATC;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=189968816;WS=189968798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	189974958	rs4128539	G	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=593;SC=TACCAAAATTGGTATTGCCAC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=189974966;WS=189974948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	189997838	rs62182417	G	A	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.54;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	190044515	.	T	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GATGCAGCTTTAAATAGGAAG;SOR=0.250;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=190044523;WS=190044505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	190313268	rs77312241	C	T	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=59;PP=1513;ReadPosRankSum=0.464;SC=TACTTTAAGACTGGCTTTGTT;SOR=0.913;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=169;TCF=55;TCR=114;TR=85;WE=190313276;WS=190313258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr2	190313396	rs6738193	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=9;PP=378;SC=TGCCTATAGCATATTCTGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=190313404;WS=190313386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	190313441	rs79567107	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=320;ReadPosRankSum=1.241;SC=GAGGTATTACCTGAGAAGGAT;SOR=1.078;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=18;WE=190313449;WS=190313431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr2	190313570	rs28760459	T	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=0.613;SC=GGTATGTAGTTTTTGGTGTTT;SOR=1.087;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=19;WE=190313578;WS=190313560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	190313613	rs28509172	G	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ACCATTTGGTGTCTGGAACAC;SOR=1.196;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=12;WE=190313621;WS=190313603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	190313890	rs17271036	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=0.514;SC=TCTTAAGTTTCGGCAAATCTA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=190313898;WS=190313880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	190314052	rs10196323	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=468;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AAAGTAGCACCGATCTTTTCT;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=30;WE=190314060;WS=190314042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr2	190314085	rs28627748	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=545;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ATGAGCTACTTCTAAAAATCA;SOR=0.557;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=32;WE=190314093;WS=190314075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr2	190314186	rs10196675	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TGTGTGTAGTGTTTGAATGTT;SOR=0.346;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=22;WE=190314194;WS=190314176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	190315720	rs10202780	G	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=1.417;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr2	190315723	rs10178969	A	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.907;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr2	190316625	rs13389403	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=267;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AAACCAGGTATGGTATAATTA;SOR=0.591;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=24;WE=190316633;WS=190316615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr2	190319990	rs1224958	A	G	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=5;PP=1285;SC=TAAATTCCTTACACATGTTTG;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=51;WE=190319998;WS=190319980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	190320083	rs6737615	C	A	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.712;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=34;PP=1284;ReadPosRankSum=0.464;SC=TGCCAAAATCCTCAAGCCAGG;SOR=0.957;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=204;TCF=121;TCR=83;TR=92;WE=190320091;WS=190320073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,103:0.43:238
chr2	190323964	rs78478456	G	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TTATGATTTAGTATGTTTGGT;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=190323972;WS=190323954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	190324006	rs115176763	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=1.699;SC=TGGCATGCCATTGTTTTCCTA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=190324014;WS=190323996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	190324047	rs111249433	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=244;ReadPosRankSum=-0.481;SC=TAAGAGTTTTATCTTTCTCCA;SOR=0.502;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=190324055;WS=190324037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr2	190324195	rs74699810	T	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=551;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GAAGATATGATTCAAGTGTTT;SOR=0.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=32;WE=190324203;WS=190324185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr2	190324215	rs75875035	G	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TTAATTCACTGTATTTTTAGT;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=26;WE=190324223;WS=190324205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
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chr2	190327179	rs77698215	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=675;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TCAAAACACCATCCTTTTAAT;SOR=0.434;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=47;WE=190327187;WS=190327169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr2	190327389	rs112863490	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=444;ReadPosRankSum=-0.478;SC=ATTTTTTATTATGAGGAAATA;SOR=0.200;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=190327408;WS=190327379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr2	190327400	rs2304701	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=692;ReadPosRankSum=1.180;SC=TGAGGAAATATATAAACACCA;SOR=1.675;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=190327408;WS=190327379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	190328382	rs113875420	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=259;ReadPosRankSum=-2.035;SC=TTTCTCTAACCTATTGATATT;SOR=0.247;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=18;WE=190328390;WS=190328372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr2	190328561	rs77997560	C	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=947;ReadPosRankSum=2.078;SC=TATTTGTCACCACTTCTGCAG;SOR=0.901;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=58;WE=190328569;WS=190328551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,68:0.43:159
chr2	190328699	rs142586889	A	AT	1050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=1024;ReadPosRankSum=0.970;SC=TAAGATTTTGATCATTAGCCT;SOR=1.213;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=27;WE=190328707;WS=190328689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr2	190329873	rs13429203	A	G	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1005;ReadPosRankSum=2.092;SC=CAAAGGCTGCATTTGGCTGCT;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=77;WE=190329881;WS=190329863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,90:0.50:180
chr2	190331081	rs76407376	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=367;ReadPosRankSum=0.887;SC=AATGTACAGCATGTCAGAAAT;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=22;WE=190331089;WS=190331071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	190332108	rs7606348	T	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AAGTGAACCCTCAGATAATGG;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=190332116;WS=190332098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	190430177	rs2304704	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=39;PP=1799;SC=TCCAGAGCAGAACGTACTCCA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=86;WE=190430185;WS=190430167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	190443304	rs1439815	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=42;PP=1259;SC=AGATACTATTCCCATCACATG;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=49;WE=190443312;WS=190443294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	190444630	rs1439816	C	G	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=70;PP=2721;SC=GGCGGGGTGACAAAAAGCGAT;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=130;WE=190444638;WS=190444620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	190445076	rs4287798	T	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=260;SC=CCAGAACTCGTGTAGAGTTGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=190445084;WS=190445066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	190448047	rs987028	T	C	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=29;PP=2257;SC=TTTTAAGTTGTCTTTTCACTT;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=190448055;WS=190448037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	190448514	.	T	TAC	191	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=46;MMLQ=16;MQ=59.12;NF=0;NR=12;PP=191;QD=16.1666666667;SC=CTCTCTCTCATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=190448522;WS=190448504;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,12:0.57:21
chr2	190448546	rs71946330	CACATAT	C	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=566;SC=CACACACACACACATATACAC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=190448560;WS=190448536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	190448550	.	TAT	CAC	171	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=64;MMLQ=28;MQ=60.41;NF=0;NR=4;PP=171;QD=56.1169687156;SC=CACACACACATATACACAGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=190448560;WS=190448536;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,4:0.29:14
chr2	190531426	rs1437880	G	A	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=51;PP=2650;SC=TGTCATTTCCGGATGCATTAT;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=190531434;WS=190531416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	190531615	rs3828267	T	C	2906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1942;ReadPosRankSum=-0.171;SC=ACAAGCTGCATTGGAGACTCA;SOR=0.632;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=229;TCF=111;TCR=118;TR=111;WE=190531623;WS=190531605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,132:0.49:271
chr2	190560817	rs77445225	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=161;ReadPosRankSum=-0.154;SC=TGTATTTTTTTCCTTAAACCA;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=11;WE=190560825;WS=190560807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	190570001	rs11319823	TA	T	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=406;SC=TAGGCAATAATAAAAAAAAAA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=22;WE=190570009;WS=190569991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	190593168	rs3067424	ATTTTT	A	824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.303;NF=1;NR=16;PP=679;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TCCTTATTTTATTTTTATTTT;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=17;WE=190593180;WS=190593158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr2	190593311	rs1225087	C	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=634;SC=TTACAAGTGTCAGCCACCGTG;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=190593319;WS=190593301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	190595258	rs1225090	G	T	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=39;PP=1347;SC=GTCAACAATTGGTTGTAGATG;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=190595266;WS=190595248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	190602513	rs1225099	T	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=8;PP=273;SC=TATCTATTTTTGAACGTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=190602521;WS=190602503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr2	190611459	rs2254167	A	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=549;SC=TTTTTGAATGAAAGTTCTTGA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=190611467;WS=190611449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	190617643	rs2243876	A	G	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=52;PP=1878;SC=ACTGTGTTGCATTTGTTAAAA;SOR=0.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=97;WE=190617651;WS=190617633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	190636411	rs6942	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CACATTATCACAGAAACAGTG;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=190636419;WS=190636401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	190640475	rs3816196	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TAAATGATCAATATTAAATAC;SOR=1.880;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=18;WE=190640483;WS=190640465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr2	190643257	rs7591929	G	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=653;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TGGGAGTTGTGTAGATTCCTG;SOR=0.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=43;WE=190643265;WS=190643247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr2	190647108	rs10168387	T	C	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=8;PP=1078;SC=ACCACTAAACTTAAAACTTTT;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=190647116;WS=190647098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	190660683	rs5742981	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=353;ReadPosRankSum=-1.012;SC=CTGAGGTAAGGTAATTATATT;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=19;WE=190660691;WS=190660673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr2	190670539	rs3214425	T	TA	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.195;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	190682632	rs3791773	G	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.263;SC=TCTAGAATTGGAGGAGGAGAC;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=190682640;WS=190682622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	190708982	rs5743112	C	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-2.489;SC=CCCAGCCCTGCTTCCCTTTTT;SOR=0.065;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=190708990;WS=190708972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	190722343	rs735559	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=2.049;SC=TTCTCTCGATTCCTCCTTTCC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=190722351;WS=190722333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	190788123	rs77427005	G	T	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.933;NF=47;NR=51;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GTATTCATTGGGAATCTCAAC;SOR=0.361;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=98;WE=190788131;WS=190788113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,112:0.56:200
chr2	191064753	rs6753459	C	T	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=873;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GGGACCAATACTGTGATCTTG;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=62;WE=191064761;WS=191064743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,70:0.43:161
chr2	191109448	rs7582209	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=-0.977;SC=ATTTAGGTCAGGGTTAGTGGA;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=11;WE=191109456;WS=191109438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr2	191109533	rs11883568	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=688;ReadPosRankSum=0.373;SC=ACCAATGGAGCACTAATACCC;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=46;WE=191109541;WS=191109523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr2	191111045	rs17736581	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=23;SC=TGTCACTTTCAGTCAAATTAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=191111053;WS=191111035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	191114229	rs2244076	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr2	191114235	rs2244075	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	191116355	rs3791792	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.930;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=0.306;SC=CTATCTATATATTCTTTTCCA;SOR=0.221;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=20;WE=191116363;WS=191116345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr2	191117206	rs291402	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	191159232	rs188339	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=332;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CAGTTCTAGTAGGGGGAAAGA;SOR=0.635;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=21;WE=191159240;WS=191159222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr2	191161622	rs1058180	T	C	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.649;SC=ATGACTCCCGTGCAACCTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=165;TCF=71;TCR=94;TR=89;WE=191161630;WS=191161612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,107:0.54:200
chr2	191175639	rs36074132	GT	G	1073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=938;SC=AGAACAAAAAGTTTTAAAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=22;WE=191175647;WS=191175629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	191184475	rs291466	A	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=958;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GCGCTGCCCCATCGCCAAACA;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=68;WE=191184483;WS=191184465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr2	191184524	rs3749022	C	T	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=56;PP=1666;SC=TCTCCCGGACCGTTCCAGCGC;SOR=1.222;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=90;WE=191184532;WS=191184514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	191208795	rs760307	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=290;ReadPosRankSum=0.686;SC=CGTCGCCTCTCCGCGGGTAGG;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=23;WE=191208803;WS=191208785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr2	191224981	rs4656	G	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=721;ReadPosRankSum=1.967;SC=ACTTCAAGACGCTGGCTGATG;SOR=1.015;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=43;WE=191224989;WS=191224971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,55:0.40:138
chr2	191227197	rs2067420	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGTTGACTTCGTTTTTTTATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=191227205;WS=191227187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	191227235	rs2067421	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=-0.768;SC=AATTGGAAATTTTGGAATTTC;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=191227243;WS=191227225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	191227492	rs972689	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.931;SC=ACCATGAACTAAATGTTTGGA;SOR=0.238;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=191227500;WS=191227482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	191231458	rs11544940	G	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=29;PP=1359;SC=CAACAGAGGAGGAAACAGCAG;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=64;WE=191231466;WS=191231448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	191231503	rs10931450	G	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=552;ReadPosRankSum=-0.764;SC=GTAACAAGGTGGCATCTGAAG;SOR=1.005;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=36;WE=191231511;WS=191231493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr2	191235901	rs1882891	A	C	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=53;PP=1839;SC=TGCCATACTGAGGGCCATGGG;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=109;WE=191235909;WS=191235891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	191354658	rs59123011	C	CCT	1636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.977;NF=5;NR=19;PP=986;ReadPosRankSum=-1.129;SC=ACAAATGCCCCGAGAAGCCTA;SOR=0.548;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=24;WE=191354666;WS=191354648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr2	191373775	rs6707244	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GGGTTGGTTTCCCTTTCCAGA;SOR=1.547;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=191373783;WS=191373765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr2	191383348	rs12053190	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TGTTTGCAAAACCTAAAGTAA;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=191383356;WS=191383338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	191535311	rs2109957	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTATGAAACTAAACAATGCA;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=11;WE=191535319;WS=191535301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr2	191545821	rs12618075	A	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=488;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AAACAGAGCTATAATTTCTGT;SOR=1.911;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=30;WE=191545829;WS=191545811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr2	191552148	rs6716415	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.128;NF=0;NR=7;PP=86;ReadPosRankSum=-0.720;SC=AAAAAAAAGTCATTACTGACA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=191552156;WS=191552138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	191777768	.	AT	A	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=26;QD=17.5;SC=GCTATTTGTGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=191777776;WS=191777758;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	191839976	rs1914408	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=312;ReadPosRankSum=-1.457;SC=GACAATGCCTCGTGGCTTACC;SOR=0.538;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=23;WE=191839984;WS=191839966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr2	191841759	rs2066804	G	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=767;ReadPosRankSum=1.166;SC=GTTCTAAAAAGGAGAAAAGCT;SOR=0.908;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=26;TCR=64;TR=44;WE=191841767;WS=191841749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr2	191843830	rs2280235	A	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TGAGAAAAAAAACCTACGGTA;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=29;WE=191843838;WS=191843820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr2	191848312	rs12477076	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=736;SC=GATGCAGCAGTGAGAGCGTGG;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=191848320;WS=191848302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	191860012	rs35178261	A	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=-0.862;SC=ATTAAAGGGAATCATGGTATA;SOR=0.261;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=12;WE=191860020;WS=191860002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	191922841	rs3024866	G	A	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=56;PP=2042;SC=TCGGTTGCTGGAGAGGAAATC;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=191922849;WS=191922831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	191937663	rs145606660	G	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.780;SC=TTCCCATAAAGAAATATTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=6;WE=191937671;WS=191937653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr2	191996518	rs1551443	T	C	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=31;PP=1840;SC=TAGTATCATCTGAATGTCCCA;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=89;WE=191996526;WS=191996508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	192161058	rs11397643	G	GT	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=9;PP=258;SC=GTTTTTGTCAGTTTTTTTTAA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=192161066;WS=192161048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	192214833	rs67146186	A	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=11;PP=592;SC=TAAGAAGTACACTGAGTTAAC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=192214841;WS=192214823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	192214966	rs59642822	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=17;PP=550;SC=GTATTTTTCTTCAGTCCTTGT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=192214974;WS=192214956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	192225294	rs2138913	A	G	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=5;PP=1660;SC=TGAGAAGGAAAAAAAGCATGG;SOR=4.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=58;TCR=5;TR=62;WE=192225302;WS=192225284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	192225477	rs71403288	G	GTGTTGTTGT	1831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=2997;SC=TTTCTATGTGGTGTTGTTGTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=26;WE=192225485;WS=192225467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	192226908	rs2271769	G	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=452;SC=CCATGTTACCGATGTGAACAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=192226916;WS=192226901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	192227230	rs12988758	T	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=991;SC=ACAAGAATTCTATTTTTGTTA;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=192227238;WS=192227220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	192247808	rs34460997	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=GTTTGCTTCAATCAGATTATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=192247816;WS=192247804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	192247836	rs4641883	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=379;SC=TAGGCAGCTGCATTGAGAAAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=192247844;WS=192247826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	192248169	.	GTT	G	29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=65.19;NF=0;NR=2;PP=29;QD=27.0;SC=TATTTTCACTGTTTTTTATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=192248178;WS=192248159;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr2	192248174	rs79897977	T	A	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=17.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	192250543	rs13000398	A	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=21;PP=1447;SC=TGATGGTGTAATTAGGAATAA;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=192250551;WS=192250533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	192250568	rs13026888	T	C	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=32;PP=1987;SC=TAAAACAATATAGTGAGGAAG;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=192250576;WS=192250558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	192250726	rs13018796	G	A	5029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=87;PP=2921;SC=AGCATTTTGAGAGCAGGATGA;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=61;TCR=87;TR=148;WE=192250734;WS=192250716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr2	192279327	rs2271767	T	C	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=75;PP=2965;SC=AGAGGTTCCATTGGTGGATGT;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=166;WE=192279335;WS=192279317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	192701393	rs10167187	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.201;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=902;ReadPosRankSum=0.751;SC=CTTCCACGGCACCGGAAACGG;SOR=1.402;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=27;WE=192701415;WS=192701383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	192701407	rs61735649	G	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.108;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=902;ReadPosRankSum=2.146;SC=GAAACGGGCTGTTTCACAAAC;SOR=1.405;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=22;WE=192701415;WS=192701383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr2	192701453	rs114763644	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.390;SC=CCTGAAAAGACGGACAATGTA;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=192701461;WS=192701443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	192711162	rs4471838	A	C	5608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.972;SC=GCATAGGGGGAACTGACCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=97;TCR=79;TR=174;WE=192711170;WS=192711152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,207:0.99:209
chr2	192820898	rs7606017	T	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GAAGAATGTCTACCAATTTTC;SOR=0.798;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=14;WE=192820906;WS=192820888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr2	196545817	rs16838394	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=308;ReadPosRankSum=-1.907;SC=GTAATTCTCACATAATTGTGG;SOR=0.973;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=19;WE=196545825;WS=196545807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr2	196582816	rs842736	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=298;SC=CTTATTATACTCCACTATATG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=196582824;WS=196582806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	196602582	rs75708451	A	AAAT	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=344;ReadPosRankSum=0.635;SC=TTAAGTAGTAAAATATGCTTT;SOR=0.519;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=11;WE=196602590;WS=196602572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr2	196636662	rs1145939	C	G	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=57;PP=1796;SC=AAAGGTCTAACAATAGCTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=73;WE=196636670;WS=196636652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	196663997	rs7567285	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=19;PP=1340;SC=TAATATCCGATAACTTCATCT;SOR=1.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=196664005;WS=196663987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	196673533	rs13411834	A	G	4519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=65;PP=2621;SC=CCATGTACAAAGGTTGGCATA;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=134;WE=196673541;WS=196673523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	196681284	rs2280452	A	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.084;SC=ACAACAATAGAGGTCACAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=196681292;WS=196681274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	196682630	rs975417	C	A	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=215;SC=TCAAGTTCTGCCCTTAAAATA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=196682638;WS=196682620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	196709683	rs16840768	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=601;ReadPosRankSum=-1.107;SC=TAAATCTACTGTTATTTAATA;SOR=0.220;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=32;WE=196709691;WS=196709673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr2	196720466	rs16841010	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=0.366;SC=GTGTTATGTGCTAGTACGAAC;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=196720474;WS=196720456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	196720705	rs16841018	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=1.375;SC=GGAGCTACTATTTTTGCCACT;SOR=0.784;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=11;WE=196720713;WS=196720695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	196749504	rs60214909	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=0.243;SC=AAGCACCAACGGACCAGATCA;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=196749512;WS=196749494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	196749544	rs341947	C	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	196756535	rs79407338	GAA	G,GA	1688.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=2,2;NR=52,52;PP=543,270;SC=GCCCCTTAATGAAAAAAAAAA;SOR=3.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=54,54;WE=196756544;WS=196756525;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.54:63
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chr2	196866420	rs6434811	C	T	5351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=71;PP=2965;SC=CAATTAAGTCCGTGAAATCTT;SOR=0.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=93;TCR=71;TR=164;WE=196866428;WS=196866410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	196891449	rs1072600	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-1.295;SC=GAGACACATATTTGAATTAAA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=196891457;WS=196891439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	196892695	rs62203391	T	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1240;ReadPosRankSum=0.031;SC=AAGATGTCTTTCTCTATAGCA;SOR=0.535;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=158;TCF=92;TCR=66;TR=76;WE=196892703;WS=196892685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr2	196912067	rs4850381	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=-1.197;SC=GTTAGCCTATACAACTTACAT;SOR=1.501;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=16;WE=196912075;WS=196912057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr2	196915991	rs10174065	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=390;ReadPosRankSum=0.908;SC=AAAAATATGAAGGGGAAAAAA;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=26;WE=196915999;WS=196915981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr2	196933188	rs13028754	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.132;SC=GGCGCGCCGCTAGGCGGCTAG;SOR=0.105;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=196933196;WS=196933178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	196935811	rs12693777	T	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=297;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TAACCAAATGTATATAGAAAG;SOR=0.714;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=17;WE=196935819;WS=196935801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr2	197004439	rs1054537	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=319;ReadPosRankSum=-1.146;SC=TAACTTGAGAAATATTGAGGT;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=24;WE=197004447;WS=197004429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr2	197010782	rs16845711	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=276;ReadPosRankSum=0.826;SC=CTGCAGCACTAAAATAAAATT;SOR=0.447;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=19;WE=197010790;WS=197010772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr2	197010823	rs2271888	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.072;SC=ATTCATTCACCTAAACACTTT;SOR=1.735;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=11;WE=197010831;WS=197010813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr2	197021141	rs6712829	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=0.766;SC=ACTAAAATAGGTACTATTTAG;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=197021149;WS=197021131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	197021276	rs10931726	T	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=853;ReadPosRankSum=0.587;SC=AAATTTCTGCTCGACAATCCT;SOR=0.890;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=61;WE=197021284;WS=197021266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr2	197021372	rs12478353	T	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=568;ReadPosRankSum=-1.423;SC=CAGCAAATTTTCCTCTGGGGG;SOR=1.394;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=31;WE=197021380;WS=197021362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr2	197065889	rs3795921	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=-0.480;SC=ACAACAGCACATAGCTTTATC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=197065897;WS=197065885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	197065964	rs3820908	C	A	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=635;ReadPosRankSum=1.413;SC=AGCTTCTGAACCTGCCTGTCC;SOR=0.559;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=38;WE=197065972;WS=197065954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr2	197066175	rs4566380	T	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr2	197084982	rs2305568	T	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=33;PP=902;SC=GAATAATATGTGTGTACCTTG;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=197084990;WS=197084972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	197092767	rs3748873	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=10;PP=615;SC=TGGGTTCTATAAAAAAACTAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=197092775;WS=197092757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	197106759	rs2045277	T	C	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=43;PP=1794;SC=AACTGTGCCCTCTCCTTTCAC;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=197106767;WS=197106749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	197118729	rs4850690	C	T	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=50;PP=2480;SC=GAGGCACATACGACATTATCT;SOR=1.082;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=124;WE=197118737;WS=197118719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr2	197135806	rs4850693	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CAAGATGTTTTGCAAAGGATG;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=197135814;WS=197135796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr2	197184321	rs1531111	C	T	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=61;PP=2324;SC=TCGCTGTCCCCGGCCTGGAGT;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=116;WE=197184329;WS=197184311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	197208366	rs6757981	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=425;ReadPosRankSum=0.584;SC=TTATATTTCACACTTAGTTAC;SOR=0.542;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=30;WE=197208374;WS=197208356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr2	197208531	rs6716054	T	G	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=868;ReadPosRankSum=-1.208;SC=ATTATAACCTTTCTCTCCGTA;SOR=0.894;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=57;WE=197208539;WS=197208521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr2	197504545	rs1879128	C	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=712;ReadPosRankSum=-0.612;SC=TGGTCGGAGGCTCGCGAGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=46;WE=197504553;WS=197504535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr2	197534692	rs7590083	C	T	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=57;PP=1810;SC=GTGCTTCTTACTCTCATCAAA;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=197534700;WS=197534682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	197541296	rs17271281	G	A	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=639;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TAATCCTTGAGCATAACCAGT;SOR=0.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=41;WE=197541304;WS=197541286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr2	197584504	rs2680970	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AAAAAAATTGCAAAATGATAT;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=197584512;WS=197584494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	197593787	rs2460436	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CTTAATCAGACATTATTATTG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=197593795;WS=197593777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	197594203	rs2577580	G	C	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=934;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TAGAACCCTAGCAGCCCCATG;SOR=1.201;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=52;WE=197594211;WS=197594193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr2	197595762	rs2680967	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=693;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CTTCATTAACGTAGTTGTCAG;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=37;TCR=66;TR=51;WE=197595770;WS=197595752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr2	197597012	rs75295851	A	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=130;ReadPosRankSum=1.133;SC=TAGGAAACCAATTAATTTCTT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=8;WE=197597020;WS=197597002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	197645397	rs76804254	C	T	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=59;PP=1391;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CTGGAGAATACACAGACAAGA;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=162;TCF=55;TCR=107;TR=93;WE=197645405;WS=197645387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,110:0.60:183
chr2	197737173	.	G	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=769;ReadPosRankSum=-1.651;SC=ACCTCGTACCGACAGTCTGAT;SOR=0.273;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=50;WE=197737181;WS=197737163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr2	197758148	rs332299	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	197777589	rs12693800	C	T	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=17;PP=1524;SC=GGTTAATGTTCATGTAACAGT;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=197777597;WS=197777579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	197943296	rs115010914	G	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.149;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=-1.024;SC=CAGAATTCATGAAATCCTGAT;SOR=0.208;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=29;WE=197943304;WS=197943286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr2	197953372	rs146161383	TAAGTC	T	1522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.427;NF=16;NR=9;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.935;SC=ACAGACAACTTAAGTCAAGTC;SOR=0.880;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=25;WE=197953384;WS=197953362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr2	197954676	rs116733165	G	A	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TTACTTACCCGATGATAACAA;SOR=0.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=99;WE=197954684;WS=197954666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,119:0.52:231
chr2	197954780	rs4300850	A	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=824;ReadPosRankSum=0.211;SC=AAACAGAGCAACTCACGGCAA;SOR=0.486;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=50;WE=197954788;WS=197954770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr2	197986048	rs2697270	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=467;ReadPosRankSum=-0.305;SC=AGACTAAGAGTGTCATACCTG;SOR=1.069;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=28;WE=197986056;WS=197986038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr2	197989945	rs2579395	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CCGACTGGAGTGCACTATGCA;SOR=0.123;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=197989953;WS=197989935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
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chr2	198175297	rs10931780	G	C	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=767;ReadPosRankSum=0.832;SC=GCCGCCGCCCGCTACCTGGTC;SOR=0.877;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=43;WE=198175305;WS=198175287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr2	198257795	rs4685	T	C	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.553;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1248;ReadPosRankSum=-2.001;SC=ATGTCTCAAATACATTGGGCC;SOR=1.096;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=73;WE=198257803;WS=198257785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr2	198265173	rs788017	T	A	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
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chr2	198266943	rs788019	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=466;SC=ATCAACTATTCAGCCAAACTG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=198266951;WS=198266933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	198267770	rs3217350	G	GAA	664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=294;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CTGAAAAAGAGAAAAGAGAAG;SOR=0.466;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=198267778;WS=198267760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr2	198281743	rs699318	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=-1.653;SC=GCTCATTCTCTTTTCTATGTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=198281751;WS=198281733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	198283305	rs788023	T	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=520;ReadPosRankSum=0.150;SC=GATCAGGGGTTTTCCCTCCTG;SOR=0.500;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=36;WE=198283313;WS=198283295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr2	198355135	rs148517124	T	TTG	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.40;MQRankSum=1.408;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.714;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	198362018	rs8539	T	C	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=650;ReadPosRankSum=0.832;SC=CTCCAATGTTTTTGTATTTAT;SOR=0.979;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=37;WE=198362026;WS=198362008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr2	198365043	rs1116734	C	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=239;ReadPosRankSum=0.061;SC=TAGCGGCGACCGCTGGGGCGA;SOR=0.119;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=16;WE=198365051;WS=198365033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr2	198380635	rs75909202	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=0.855;SC=GTTCCTCGTTCGCCCTCTCCC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=198380643;WS=198380625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	198508951	rs10497806	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=725;ReadPosRankSum=1.708;SC=CCTCAATCACGAGCCTTGGGC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=50;WE=198508959;WS=198508941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr2	198511086	rs16866970	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=258;ReadPosRankSum=0.729;SC=GCTGGAAAATGTGCTTTAAAC;SOR=0.095;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=17;WE=198511094;WS=198511076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr2	198643631	rs700655	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=718;ReadPosRankSum=0.231;SC=GTAAACTGGCGTACAAAACCT;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=53;WE=198643639;WS=198643621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,66:0.42:156
chr2	198669754	rs770659	G	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=16;PP=397;SC=GGAGCGCACCGGTGCCTAGCG;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=198669762;WS=198669744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	198669871	rs770658	G	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.99;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	198950240	rs1064213	G	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1162;ReadPosRankSum=1.017;SC=CTGTCAGATTGTAGCAATGAA;SOR=0.703;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=75;WE=198950248;WS=198950230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,86:0.46:185
chr2	200173684	rs10153730	T	G	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=113;PP=2965;SC=GCCAGCCCTGTAGAGAGAGGA;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=67;TCR=113;TR=180;WE=200173692;WS=200173674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr2	200245245	rs1348813	C	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=780;SC=AATACACAAACCTCAACCAGG;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=200245253;WS=200245235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	200298313	rs7596597	A	G	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=50;PP=1553;SC=GAAGGGAAGCAACAGTTATAA;SOR=1.583;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=200298321;WS=200298303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	200323452	rs114693875	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=1.080;SC=TCGACTTTGGAGATAGGAGGG;SOR=0.186;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=27;WE=200323460;WS=200323442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
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chr2	200677625	rs2030653	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=195;SC=GGCCTGATGTCTTCCTGACAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=200677633;WS=200677615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	200820505	rs281766	T	G	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=18;PP=1613;SC=CAGGCACCGGTGTGAAGGGTC;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=200820513;WS=200820495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	200828526	rs2118548	T	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=879;ReadPosRankSum=0.884;SC=CTCAAAATTATTAGAATAATT;SOR=0.533;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=67;WE=200828534;WS=200828516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr2	200873144	rs113489455	AATACAAAAAAAACTTG	A	1667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.368;NF=3;NR=21;PP=2929;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGAATGATGCAATACAAAAAA;SOR=1.175;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=24;WE=200873167;WS=200873134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,47:0.35:133
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chr2	201171191	rs10931898	C	G	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1543;ReadPosRankSum=-1.877;SC=GGGAAAGGAGCTAGGGAGGGC;SOR=0.389;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=180;TCF=77;TCR=103;TR=95;WE=201171199;WS=201171181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,110:0.52:210
chr2	201171207	rs12614621	G	C	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1442;ReadPosRankSum=-1.619;SC=AGGGCGTGTGGAGGGACGAGA;SOR=0.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=85;WE=201171215;WS=201171197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,100:0.51:197
chr2	201194279	rs3739119	C	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=697;SC=CCTGCAGCTGCCTCCTGGGAG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=201194287;WS=201194269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	201254049	rs3820881	G	C	5081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=87;PP=2965;SC=CTCCAAACTAGGTAATGCAGT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=169;WE=201254057;WS=201254039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	201254171	rs4674015	A	G	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=48;PP=1462;SC=CATAAGTAACATTTACTGAAA;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=201254179;WS=201254161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	201354935	rs3795969	C	G	4321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=69;PP=2965;SC=GGAGGGCAGGCAAGGCGCGGT;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=144;WE=201354943;WS=201354925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	201371768	rs3739116	G	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=562;ReadPosRankSum=-0.516;SC=AATTTTTGCCGCCCAACACTT;SOR=1.002;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=38;WE=201371776;WS=201371758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr2	201397647	rs842939	A	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TATCAGTTATACTTTTTCTTT;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=201397655;WS=201397637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	201397724	rs1036533	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=175;ReadPosRankSum=1.554;SC=ATGGAAACTGGCTCACTTTTT;SOR=0.807;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=13;WE=201397732;WS=201397714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr2	201437334	rs12052989	T	C	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1199;ReadPosRankSum=-1.239;SC=AAATCATCCCTGGAAACCTAG;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=184;TCF=109;TCR=75;TR=87;WE=201437342;WS=201437324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,118:0.50:237
chr2	201440939	rs66861543	CT	C	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=0.542;SC=ACCAAGGGGCCTTTTTTTTTT;SOR=1.675;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=201440947;WS=201440929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr2	201445152	.	C	T	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=2;PP=58;QD=18.5542425094;SC=ACTTCACTGACTTCTGCTTCA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=5;WE=201445160;WS=201445142;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	201445314	rs62279328	G	A	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	201451006	rs4470327	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=0.488;SC=GGCTTTCTCCCGTAACAGCGG;SOR=0.962;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=23;WE=201451014;WS=201450996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr2	201460104	rs7597590	A	G	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=597;ReadPosRankSum=-0.169;SC=ACCGTGCAGCAAAGTCCAGAT;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=38;WE=201460112;WS=201460094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr2	201464295	rs10179964	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=326;ReadPosRankSum=0.547;SC=TCATTAGGCCTGGGATGGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=27;WE=201464303;WS=201464285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr2	201466954	rs2248130	C	G	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=713;ReadPosRankSum=3.165;SC=TCTTGGTAGACTGTGCCTCTA;SOR=0.939;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=43;WE=201466962;WS=201466944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,58:0.45:129
chr2	201468732	rs2293525	C	G	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1424;ReadPosRankSum=-1.239;SC=GATATGTTCTCTTTTTAGACA;SOR=0.895;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=94;TCR=62;TR=83;WE=201468740;WS=201468722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,98:0.52:188
chr2	201469625	rs13406379	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.015;NF=5;NR=26;PP=550;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGATGGGGCCGGGGTGGGCTG;SOR=0.900;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=31;WE=201469633;WS=201469615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
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chr2	201474179	rs17593811	C	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGCTGTTTCTCTACCCCTTTT;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=42;TCR=94;TR=64;WE=201474187;WS=201474169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
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chr2	201485649	rs4672866	T	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-1.436;SC=GTTGGTGATATCCAATGCAGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=201485657;WS=201485639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	201488758	rs2348021	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=372;ReadPosRankSum=0.986;SC=AACAAATATCAGTTAAAATGC;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=30;WE=201488766;WS=201488748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr2	201515939	rs868810	T	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=31;PP=718;SC=GTTCTCCAAATGCACATGAGG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=201515947;WS=201515929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	201521472	rs2287011	G	A	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=819;SC=GGGATTCTTGGAGGGAAATAT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=201521480;WS=201521462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	201521731	rs4674302	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AAAACTATGAATGGATATTTT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=23;WE=201521739;WS=201521721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr2	201523736	rs10931910	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=2.219;SC=TTTTAGAAACAAGAAACTTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=201523744;WS=201523726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	201677454	rs2270281	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=-2.284;SC=CAGGCATGACCTAGGGTAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=14;WE=201677462;WS=201677444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr2	201677791	rs2270280	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=254;ReadPosRankSum=-1.899;SC=TTTGTGCCTGTATCGGGTATA;SOR=0.474;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=15;WE=201677799;WS=201677781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	201683695	rs2881880	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=731;ReadPosRankSum=0.705;SC=TGTGACTATATTTTTCTAAGA;SOR=0.524;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=46;WE=201683703;WS=201683685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr2	201686122	rs3815501	T	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=661;SC=TCTGATGCCATTTTGTACCTG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=201686130;WS=201686112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	201686666	rs6705053	C	T	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=684;SC=GTGGTGGGCGCCTGTAGTTCC;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=201686674;WS=201686656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	201719916	rs72927093	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.674;NF=1;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=-1.312;SC=CATGTAATGTAGGCTGGGCAC;SOR=0.180;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=201719924;WS=201719906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	201721782	rs41271451	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=276;ReadPosRankSum=-0.593;SC=CACAACAGGCCGGGTGCAGTG;SOR=1.276;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=16;WE=201721790;WS=201721772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr2	201722827	rs17383109	C	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=307;ReadPosRankSum=0.830;SC=TAGAAAGATGCATGCAAATTT;SOR=0.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=15;WE=201722835;WS=201722817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	201747351	rs72929010	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=0.282;SC=CAAAATCTTTCGCCGGGCATG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=201747359;WS=201747341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	201768238	rs7917	C	T	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=972;ReadPosRankSum=0.552;SC=CATCATGATACTTTGGATGCT;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=65;WE=201768246;WS=201768228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,75:0.43:174
chr2	201785657	rs2307358	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=371;ReadPosRankSum=-1.355;SC=TTTATATTAATAGAATTTGTC;SOR=0.089;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=19;WE=201785665;WS=201785647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr2	201785837	rs2307362	G	A	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=887;ReadPosRankSum=0.129;SC=AATTGTGGATGAGAAGGAAGA;SOR=0.321;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=59;WE=201785845;WS=201785827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,73:0.58:126
chr2	201873724	.	G	A	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=1086;ReadPosRankSum=0.173;SC=GTTTCCCTCTGAGGATGAAGA;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=63;WE=201873732;WS=201873714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,86:0.46:189
chr2	201881677	rs13405753	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=609;ReadPosRankSum=0.545;SC=ACCTTAAAAAATACTTAAAAT;SOR=0.193;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=31;WE=201881685;WS=201881667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
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chr2	201950456	rs150160270	A	AAT	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr2	202072973	rs41419046	A	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=496;ReadPosRankSum=-1.299;SC=TTATTTTCACATTTTCTTTCT;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=29;WE=202072981;WS=202072963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr2	202122995	rs3769823	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=727;ReadPosRankSum=-1.257;SC=ATTGAAAGTAAAAGAAACTTC;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=43;WE=202123003;WS=202122985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr2	202141676	.	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,23:0.21:112
chr2	202151163	rs3769818	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=770;ReadPosRankSum=0.409;SC=CAGTCACAATATTATGTGATG;SOR=0.461;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=52;WE=202151171;WS=202151153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr2	202152162	rs13113	T	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=761;ReadPosRankSum=-0.103;SC=TTGTTTGAAATCTTTTAAAAA;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=51;WE=202152170;WS=202152152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr2	202153225	rs700635	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.744;SC=AATTCAGATGCGAATTCAAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=202153233;WS=202153215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	202153252	rs700636	A	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=-0.020;SC=AGACATTCAGAGAGTCAGAGC;SOR=0.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=15;WE=202153260;WS=202153242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr2	202211443	rs1406122	C	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=42;PP=978;ReadPosRankSum=0.160;SC=ACTTGGAGTGCTGAGATTTTT;SOR=0.858;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=131;TCF=40;TCR=91;TR=58;WE=202211451;WS=202211433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,72:0.44:162
chr2	202215409	rs71022364	C	CAAAACAAAACAAAACAA	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	202215492	rs13014235	C	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.086;NF=15;NR=13;PP=386;ReadPosRankSum=1.846;SC=GGAGCTGGTACAAGAGGAGTT;SOR=0.615;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=28;WE=202215500;WS=202215482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr2	202245244	rs3795966	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=0.316;SC=ACTTGTATAAAAGGTCAGTTA;SOR=2.147;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=10;WE=202245252;WS=202245234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	202245944	rs3832088	TAA	T	755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=17;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=520;ReadPosRankSum=3.077;SC=ACCCAGAGCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=13;WE=202245963;WS=202245934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr2	202245955	rs72937131	A	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.97;ReadPosRankSum=3.950;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr2	202246034	rs3731709	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AGTTATCCTTGGTAAATATAA;SOR=0.027;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=202246042;WS=202246024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	202248788	rs7579617	T	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=764;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CATGAAAATATAGCTGAGGAA;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=45;WE=202248796;WS=202248778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr2	202248979	rs7579853	T	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=730;ReadPosRankSum=-0.250;SC=AGATTGAAAGTCTAGATTAAT;SOR=1.114;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=42;WE=202248987;WS=202248969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr2	202249060	rs2540328	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=0.803;SC=TAAAAATCCCCAAATCTGGAA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=202249068;WS=202249050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	202252539	rs2244438	G	A	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1127;ReadPosRankSum=0.663;SC=AAGGCTCTCTGTCGGGGTGAC;SOR=0.591;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=69;WE=202252547;WS=202252529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,74:0.51:144
chr2	202252856	rs2540330	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.182;SC=ACCTGGAATATAGAAGTAATA;SOR=1.501;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=14;WE=202252864;WS=202252846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr2	202252873	rs2540331	A	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-0.475;SC=AATAACAACAAACCAAAATCA;SOR=1.204;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=12;WE=202252881;WS=202252863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	202257930	rs3815515	C	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.791;SC=AAGCAAGAAGCGTATATATAT;SOR=0.105;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=202257938;WS=202257920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	202259903	rs144631526	AC	A	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.967;NF=4;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.327;SC=GATGATTAAAACAGCAATCAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=202259911;WS=202259893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	202260049	rs2256584	G	A	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=53;PP=2647;SC=CTTTAAGTTTGTGCTGAAGGT;SOR=1.171;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=138;WE=202260057;WS=202260039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	202264156	rs13022344	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TCAGATAAGACATGGTTCCGC;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=73;WE=202264164;WS=202264146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,84:0.43:195
chr2	202264316	rs6732993	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.365;SC=AAAGCAACGTCCTAGAAAGCA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=202264324;WS=202264306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr2	202272032	rs11691865	T	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CACTGAACAATGGCTACTAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=202272040;WS=202272022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr2	202285100	rs4507084	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=516;ReadPosRankSum=1.473;SC=ATTTTCTCCTATAAGCGATAG;SOR=0.608;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=26;WE=202285108;WS=202285090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr2	202337730	rs1019299	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.944;NF=13;NR=8;PP=245;ReadPosRankSum=0.111;SC=ATACTCCCACAGGAACACTGG;SOR=0.919;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=21;WE=202337738;WS=202337720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr2	202342402	rs12990557	G	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.285;NF=11;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.125;SC=TCTCTGGCCTGTCCCATCTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=11;WE=202342410;WS=202342392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr2	202342802	rs2243791	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-0.917;SC=ATTAATTGTGTCCTACAGGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=14;WE=202342810;WS=202342792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr2	202344179	rs34469362	GT	G	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=216;SC=TAATATAAAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=12;WE=202344187;WS=202344169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	202352649	rs2714481	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=0.368;SC=TAAAAGATCCAATTGGTAAAT;SOR=0.760;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=16;WE=202352657;WS=202352639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	202357949	rs2714482	A	C	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=25;PP=1472;SC=TTGTCTTTACAAAGCCTCTGA;SOR=1.276;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=202357957;WS=202357939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	202402250	rs3083390	AAC	A	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.654;NF=0;NR=7;PP=262;ReadPosRankSum=0.727;SC=AAAAACAATAAACACATATGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=202402259;WS=202402240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	202410300	rs10804117	A	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-1.264;SC=CCTCTTCAGGATGATTACTTT;SOR=0.212;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=8;WE=202410308;WS=202410290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	202447009	rs13425990	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-0.074;SC=CACATACATCCAATATACTAT;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=12;WE=202447017;WS=202446999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	202468136	rs10205247	T	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=0.281;SC=TTGTTTCTCATGAAAAATATC;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=202468144;WS=202468126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	202469361	rs12474206	C	T	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=67;PP=2436;SC=CCAAATTTGGCGTCTCCTGTG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=202469369;WS=202469351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	202469472	rs7572583	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=707;SC=ACATAACTAGATGAAACATCA;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=202469480;WS=202469462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	202490812	rs73989521	C	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=986;ReadPosRankSum=0.512;SC=ACCAGAAGAGCCACCACGAGA;SOR=0.587;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=74;WE=202490820;WS=202490802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,78:0.38:208
chr2	202491995	rs2540450	G	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=825;ReadPosRankSum=0.455;SC=GATAAGAAAAGTTGCTGTTAT;SOR=0.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=48;WE=202492003;WS=202491985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr2	202492883	rs59917717	TAA	T	957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.669;NF=3;NR=15;PP=578;ReadPosRankSum=-1.403;SC=CTAGAAAATATAAAAGTTTCT;SOR=0.648;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=18;WE=202492892;WS=202492873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr2	202494630	rs377654281	AT	A	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.057;NF=1;NR=20;PP=233;ReadPosRankSum=0.445;SC=CCTGGTAGCCATTTTTTTTTT;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=21;WE=202494638;WS=202494620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr2	202501448	rs1208081	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=465;ReadPosRankSum=0.193;SC=CTATCACAACTTAACCTTGGT;SOR=0.777;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=31;WE=202501456;WS=202501438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr2	202505545	rs56321285	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=-0.852;SC=AATGATACTAGTCAATTTTTC;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=202505553;WS=202505535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	202507982	rs6723016	T	C	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=40;PP=1953;SC=CCTTAGTGATTCCCAGCTCGT;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=202507990;WS=202507972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	202509814	rs3754932	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=378;SC=AATTAATAAATTGCTGCACTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=202509822;WS=202509804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	202523347	rs2597900	C	T	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=885;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CCTTAGTAGACGGCAGCAGAG;SOR=0.993;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=54;WE=202523355;WS=202523337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
chr2	202526366	rs62193397	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	202528830	rs74887695	A	AT	3603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=32;PP=2709;SC=TTCATCTATGATTTTTCATGG;SOR=1.356;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=68;WE=202528838;WS=202528820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	202531136	rs17384314	G	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=470;ReadPosRankSum=-1.544;SC=AATTTAAAATGTGTCTGCATT;SOR=0.384;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=30;WE=202531144;WS=202531126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr2	202534303	rs145833090	TATAGGAAGAGCTTAA	T	132.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	202538300	rs11375204	G	GA	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=15;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.001;NF=14;NR=4;PP=279;ReadPosRankSum=-2.082;SC=AATTAAAAAAGAAAAAAAAAG;SOR=1.384;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=18;WE=202538308;WS=202538290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr2	202546113	rs1208073	T	C	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=14;PP=1322;SC=CAGTCTTGAATCCAGGTCCAA;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=202546121;WS=202546103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	202557702	rs6725443	C	T	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1287;SC=ACATCTCTGCCGTAGAACAGA;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=202557710;WS=202557692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	202566741	rs7603563	T	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=260;SC=ACAGATTTAATTGATTTCACT;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=202566749;WS=202566731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	202569992	rs3219171	A	T	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=74;PP=2408;SC=AATGATACTGATGTCAGAGTG;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=105;WE=202570000;WS=202569982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	202570232	rs3219170	A	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=411;SC=ACTTATGGTAAACAAAATCCC;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=202570240;WS=202570222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	202574825	rs1210940	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=186;SC=AATCCATCAACAAGAAACAAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=202574833;WS=202574815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	202575821	rs3219168	G	A	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=27;PP=1090;SC=GAACGACTCAGTATTTCTGGA;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=202575829;WS=202575811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	202575907	rs2882231	A	G	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=19;PP=606;SC=CACATGAAACACAATCACTAG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=202575915;WS=202575897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	202580370	rs3219167	G	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=5;PP=2018;SC=ATGCTCTGCTGTATGTTGAGC;SOR=5.161;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=75;TCR=5;TR=80;WE=202580378;WS=202580360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	202598113	rs2276615	C	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=1107;SC=TTTCGTCATTCACTTCTGACA;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=202598121;WS=202598103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	202606639	rs3731703	G	A	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=43;PP=1268;SC=TTATTATGATGTGATTATGAT;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=202606647;WS=202606629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	202608877	rs4673207	C	A	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=755;SC=CAGTGCATAGCAAGAAGTAAA;SOR=5.353;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=202608885;WS=202608867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	202625615	rs3219156	C	T	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=57;PP=2895;SC=TGAGATGGCACTGGCTTTTCA;SOR=1.052;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=141;WE=202625623;WS=202625605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	202688293	rs4675229	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=5;PP=607;SC=TGTACTTCGTAATACCTTCTG;SOR=2.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=27;WE=202688301;WS=202688283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	202698422	rs66588345	ATCT	A	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.57;MQRankSum=-0.210;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr2	202712095	rs917958	A	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=22;PP=1265;SC=CTCTTATTTCATTTGCTAGGG;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=202712103;WS=202712085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	202736953	rs35273085	G	A	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TTGGCAACAGGGTTTTCGGGT;SOR=0.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=101;WE=202736961;WS=202736943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,121:0.46:261
chr2	202737083	rs13032025	A	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=837;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TCTTTAAGGGATCTTTAAGCA;SOR=0.669;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=52;WE=202737091;WS=202737073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr2	202741064	rs2072504	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=1.691;SC=TTGTTTTCCCGGGACTCTTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=202741072;WS=202741054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	202741256	rs4675235	A	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=661;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GGAGGAAGAGACTTCACTTGC;SOR=0.709;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=25;WE=202741277;WS=202741246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr2	202741269	rs4675236	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=661;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TCACTTGCCCGCTTTGCCCTG;SOR=0.822;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=22;WE=202741277;WS=202741246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr2	202939654	rs10221698	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=475;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TATGTTCCTGTCAGCAAACCT;SOR=0.677;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=33;WE=202939662;WS=202939644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr2	202955454	rs1568535	G	C	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=30;PP=1856;SC=TGGCTCAGGGGTCAGCAGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=202955462;WS=202955444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	202962022	rs66578258	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GAAATACAAAATAAGGGAGGA;SOR=0.518;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=202962030;WS=202962012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr2	202962310	.	CT	C	72	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=19;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=20;MQ=61.06;NF=0;NR=5;PP=72;QD=15.0;SC=GGTACCATTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=5;WE=202962318;WS=202962300;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,5:0.29:17
chr2	202964380	rs2882486	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=24;PP=1212;SC=CTTCAAAGGAGAGCTACAATG;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=202964388;WS=202964370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	202964528	rs2350722	T	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=29;PP=1292;SC=CGGTAAGAACTCAAATGTCTT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=202964536;WS=202964518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	202964986	rs6755174	C	A	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=14;PP=1252;SC=GTTCATCCCCCTACCTGCAAT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=202964994;WS=202964976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	202965222	rs6726731	A	G	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.36;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	202989742	rs56243480	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=42;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GCAGTGAGCCGAGATCGTGCC;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=5;WE=202989750;WS=202989732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	202990653	.	G	A	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=58.62;NF=0;NR=5;PP=94;QD=25.7542425094;SC=TGGTGTTCCTGGCTGCTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=202990661;WS=202990643;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,5:0.33:15
chr2	203000730	rs9679591	A	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	203000810	rs35537724	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GAATGAAGCCGCAGACCTTCG;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=15;WE=203000818;WS=203000800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr2	203003066	rs3043926	G	GGTGT	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=849;ReadPosRankSum=-0.527;SC=ATATGAACTAGGTGTGTGTGT;SOR=1.385;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=19;WE=203003074;WS=203003056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr2	203029951	rs7582695	T	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.190;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=326;ReadPosRankSum=-0.237;SC=AGAAGTGTTTTAAGTGTTTGC;SOR=0.114;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=20;WE=203029959;WS=203029941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	203051886	rs6722588	C	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=495;SC=GGATACCATGCACAGTTGTAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=203051894;WS=203051876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	203052947	rs35468542	G	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1145;ReadPosRankSum=1.085;SC=ACCCAAAAGCGAGAGAGAAGG;SOR=0.694;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=76;WE=203052955;WS=203052937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,91:0.46:199
chr2	203058233	rs13024221	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=307;ReadPosRankSum=1.257;SC=TCCGGTAGGTTGGGCAAGCCA;SOR=0.728;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=21;WE=203058241;WS=203058223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr2	203058861	rs34823131	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=0.821;SC=TCATCTCACAAGGATGCCTCA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=15;WE=203058869;WS=203058851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr2	203079307	rs3769817	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=293;SC=TTTAGCATTCTTAACAGGTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=203079315;WS=203079297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	203139738	rs11397579	A	AC	261.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=341;SC=AATAGCTTCTACACCTTCATT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=203139746;WS=203139728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	203152355	rs7572505	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=771;ReadPosRankSum=-0.849;SC=ATGCTATCTTGCTAATTTATT;SOR=0.560;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=52;WE=203152363;WS=203152345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,55:0.45:122
chr2	203155015	rs11310035	GT	G	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=543;ReadPosRankSum=-0.279;SC=ATCCCTTTAAGTTTTGTTTGT;SOR=0.375;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=18;WE=203155023;WS=203155005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr2	203168173	rs1054446	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.484;SC=AAAGGAATTACGATTATATCA;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=203168181;WS=203168163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	203378398	rs10714063	CT	C	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=202;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TAACAAAATACTTTTTTAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=9;WE=203378406;WS=203378388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	203378616	rs7575056	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TTTATTTGCTCCTTTTAAATT;SOR=0.307;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=203378624;WS=203378606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	203621800	rs16839308	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-1.242;SC=AACGTGCAACATGAAATCCTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=203621808;WS=203621794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	203651278	rs55689177	CA	C	730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.670;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.316;NF=16;NR=6;PP=286;ReadPosRankSum=0.809;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=22;WE=203651286;WS=203651268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr2	203661779	rs6704822	A	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=13;PP=310;SC=CAAGTGTTCAATTGACCAAAT;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=203661787;WS=203661769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	203690387	rs1344959	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=486;SC=TTTAAATGGGGATTATCAGAT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=203690395;WS=203690377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	203693559	rs4675296	C	G	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=66;PP=2965;SC=TACATAGAATCCTCAAATTTA;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=164;WE=203693567;WS=203693549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	203747242	.	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=0.767;SC=TAGTAGAGACGGGGTTCCACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=203747250;WS=203747232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	203748544	rs34788166	A	AT	1837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=39;PP=819;SC=ATTTGTAGAAATTTTTTTTTT;SOR=1.352;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=42;WE=203748552;WS=203748534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	203748594	rs10196719	A	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=663;SC=GGAGTGCAGTAGTGCAATCTT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=203748602;WS=203748584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr2	203921270	rs4673241	A	G	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=34;PP=1028;SC=TTTACTGAGAACAACTAGGTT;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=203921278;WS=203921260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr2	203996870	rs6748898	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=51;PP=1494;SC=GAATAAGGCTAATAAAGCTAA;SOR=2.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=65;WE=203996878;WS=203996860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	204002809	rs10180815	A	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=348;SC=CTCTCAAGCTATTTTGTTTTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=204002817;WS=204002799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	204054882	rs71034227	TACACACACACACACACACAC	TACAC,T	655.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1,1;NR=5,5;PP=495,117;SC=AAGATGTGTGTACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=6,6;WE=204054909;WS=204054872;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:16
chr2	204062061	rs4675323	A	G	7121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=102;PP=2965;SC=AAAGGCCACCATCCCCAAAAA;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=121;TCR=102;TR=223;WE=204062069;WS=204062051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr2	204090887	rs2351773	C	G	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=31;PP=1168;SC=TGAACCTTTACCTACTAGCAC;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=204090895;WS=204090877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	204110748	rs56317341	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-1.803;SC=AAGATCGCTTGAGGCCAGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=204110756;WS=204110738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	204111394	rs13015873	T	C	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.33;NF=25;NR=2;PP=717;SC=CATTTATTGATACAGTTAATT;SOR=3.126;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=204111409;WS=204111384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	204111398	rs10586509	GTTAA	G	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=1288;SC=TATTGATACAGTTAATTCAGA;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=204111409;WS=204111384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	204111443	rs6435176	A	G	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=21;PP=1843;SC=TCCAAATTAAATTGATTATTT;SOR=2.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=84;WE=204111451;WS=204111433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	204111705	rs6751894	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=697;SC=ATGTTTAGGCTGGGCACGGTG;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=37;WE=204111713;WS=204111695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	204116660	rs3731694	A	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=366;ReadPosRankSum=1.786;SC=GATTATTTTGATACAGAAATA;SOR=0.347;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=24;WE=204116668;WS=204116650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr2	204116690	rs2043449	C	T	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=25;PP=1910;SC=TCTGTTTCAGCGGACCCTTTT;SOR=1.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=88;WE=204116698;WS=204116680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	204116887	rs2351771	T	G	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=54;PP=1566;SC=ATAGTATTTATTTTTTGAGTA;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=204116895;WS=204116877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	204154552	rs1048013	C	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=698;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TTCTGCCCAGCTTCAAGATAT;SOR=0.979;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=53;WE=204154560;WS=204154542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr2	204154686	rs10170454	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=298;SC=TATTTTAGACAGAGGTTTGCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=204154694;WS=204154676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	204206977	rs4675333	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=27;PP=842;SC=GGACCAAGTCCAGTTCTGTTA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=204206985;WS=204206967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	204216255	.	G	GT	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.9985;HP=15;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=18;MQ=59.35;NF=2;NR=2;PP=46;QD=12.25;SC=TCAGTGTTTAGTTTTTTTTTT;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=204216263;WS=204216245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	204240891	rs141056236	TC	T	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.613;NF=3;NR=13;PP=534;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CCTCTATAGATCTTTGGTTCT;SOR=1.042;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=16;WE=204240899;WS=204240881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr2	204261723	rs3731652	G	C	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=60;PP=1913;SC=GCAGGCAGATGCAGTCATCTG;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=92;WE=204261731;WS=204261713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	204305093	rs3814365	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,45:0.41:110
chr2	204305155	.	G	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.747;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=691;ReadPosRankSum=1.652;SC=CTTTCAGGAGGGGGAGGAGGG;SOR=1.144;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=43;WE=204305163;WS=204305145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr2	204322298	rs2469953	T	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=876;ReadPosRankSum=1.137;SC=CAGCTGTTTCTTTTTTCCCCA;SOR=0.665;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=53;WE=204322306;WS=204322288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr2	204355822	rs2469962	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GAACTTGGTCGAGTTATGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=204355830;WS=204355812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	204732714	rs231775	A	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1440;ReadPosRankSum=0.050;SC=GAACCTGGCTACCAGGACCTG;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=96;TCR=60;TR=83;WE=204732722;WS=204732704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,89:0.50:177
chr2	204732850	rs231776	A	G	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=75;PP=2443;SC=CAGCAGTCAAAGGCAGTGATT;SOR=1.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=107;WE=204732858;WS=204732840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	204822670	rs5837889	A	AT	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr2	204824178	rs146016344	AGT	A	1157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.717;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr2	204824283	rs10172036	T	G	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.865;NF=53;NR=52;PP=1823;ReadPosRankSum=-1.636;SC=AGCATTTAGATAATTTATGCT;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=105;WE=204824291;WS=204824273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,131:0.58:227
chr2	205829991	rs236843	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=0.297;SC=CCCAACTGGCCGCATTTAAGC;SOR=1.550;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=28;WE=205829999;WS=205829981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr2	205912210	rs7563474	C	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=49;SC=ACATAAAAGCCTGTTGTAAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=205912218;WS=205912200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	205912403	rs1510765	T	C	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=15;PP=641;SC=AGTCTGAAACTGGTTGTTCCA;SOR=1.005;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=205912411;WS=205912393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	205969023	rs2289024	A	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=573;SC=TCCAGTTTTCAAAGAAATTAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=205969031;WS=205969013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	205969220	rs2289025	G	A	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=97;PP=2965;SC=ACTTCGCCAAGAACTAAGGAC;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=58;TCR=97;TR=155;WE=205969228;WS=205969210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	205978113	rs368750104	CA	C	1119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.33;QD=46.66;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	205978114	.	A	G	401	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.42;NF=21;NR=1;PP=401;QD=19.8077823885;SC=AATCCTGAGCAGGGGTGTGTG;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=22;WE=205978128;WS=205978104;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr2	205978117	.	GGTGT	G	1007	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=60.75;NF=15;NR=1;PP=1007;QD=63.125;SC=CCTGAGCAGGGGTGTGTGTGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=205978128;WS=205978104;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	205978118	.	GTGT	G	1218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.51;QD=40.62;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	205986321	rs2289023	A	G	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=23;PP=2024;SC=CCAGGGCTCAAGATGTCTTCC;SOR=1.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=86;WE=205986329;WS=205986311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	206036918	rs736320	C	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=805;ReadPosRankSum=-0.687;SC=ATATTGTTTTCCTTTCTTCTG;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=47;WE=206036926;WS=206036908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
chr2	206041366	rs11329569	TA	T	132.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.253;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	206050355	rs62172732	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=737;ReadPosRankSum=-0.394;SC=TCAGTTCTGTATGAGAACTTA;SOR=0.693;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=36;WE=206050363;WS=206050345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr2	206364737	rs10197347	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.680;SC=CAAGGCCATCTGAGTATGACC;SOR=0.671;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=17;WE=206364745;WS=206364727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr2	206364791	rs11683289	C	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=257;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TTGAATTCATCTTTTCTAAGA;SOR=0.458;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=17;WE=206364799;WS=206364781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr2	206418032	rs6730102	G	A	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=47;PP=1785;SC=ATCTCTAATTGCTTTTCTCTC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=206418040;WS=206418022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	206480054	rs13387277	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=103;SC=ATCACTTCTGCTCCCATCCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=206480062;WS=206480044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	206481612	rs35710107	TGA	T	1569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=0;PP=1615;SC=TGGAAGTGAATGAGAGAGAGA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=34;WE=206481621;WS=206481602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	206562250	rs849558	C	T	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=13;PP=981;SC=TTCTTTGGGTCGTTGATTTCT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=206562258;WS=206562240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	206565500	rs3771051	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=670;ReadPosRankSum=0.122;SC=TCCAAGGCCACCATCTCTGGT;SOR=0.394;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=40;WE=206565508;WS=206565490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr2	206581033	rs849541	G	A	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=35;PP=1087;SC=CTCTACATCAGGTTCACCTCC;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=206581041;WS=206581023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	206592695	rs849526	T	C	3734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=49;PP=2190;SC=ATGGCTACTATGTCAAATCCT;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=115;WE=206592703;WS=206592685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	206608039	rs849568	T	C	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=48;PP=1824;SC=CCCGCCTGGTTAGCAGCCGCT;SOR=1.067;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=81;WE=206608047;WS=206608029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	206614646	rs10932123	T	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=610;SC=AGGGACCTAGTGGTCCCCCAG;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=206614654;WS=206614636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr2	206882440	rs185379040	A	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=739;ReadPosRankSum=1.800;SC=GAGGTGTCTGATGTGTAATGT;SOR=0.390;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=53;WE=206882448;WS=206882430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
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chr2	206911191	rs34828561	C	CA	271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=5;NR=1;PP=114;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=206911199;WS=206911181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	206921451	rs818009	G	A	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=48;PP=2290;SC=CTTCCAATTCGGTTTCCAGGT;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=106;WE=206921459;WS=206921441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	206921763	rs17220727	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.681;SC=TTAAAAATTGCGTCACTATAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=206921771;WS=206921753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	206927850	rs17286674	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=1.586;SC=ATTTCACTGAGGGACTTCTGG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=206927858;WS=206927840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	207008675	rs35409448	C	CT	2689.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.568;NF=28;NR=23;PP=1825;ReadPosRankSum=-1.573;SC=TACATCCCCCCCTTCATGGCA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=51;WE=207008683;WS=207008665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr2	207008763	rs1127566	C	A	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.537;NF=58;NR=56;PP=1849;ReadPosRankSum=0.183;SC=CGCGAGAGAGCGCATCCTCCC;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=114;WE=207008771;WS=207008753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,137:0.49:281
chr2	207012483	rs11548670	A	G	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=820;ReadPosRankSum=1.926;SC=ATACCTGCAGATCACATTCAC;SOR=0.472;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=47;WE=207012491;WS=207012473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr2	207023595	rs4147709	C	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GTCAATGGACCAAACAAACAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=207023603;WS=207023585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	207023620	rs4147708	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AACAAACAGAAGCGTGAGCCA;SOR=0.622;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=13;WE=207023628;WS=207023610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	207024886	rs113729178	G	GC	660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.45;QD=30.03;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	207025444	rs11689362	T	C	3745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.933;NF=80;NR=61;PP=2154;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GGTAAAATCATCTTTGTATAG;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=325;TCF=189;TCR=136;TR=141;WE=207025452;WS=207025434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,180:0.46:389
chr2	207027407	rs35430253	C	CT	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.119;NF=6;NR=13;PP=629;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TTCAACCTTTCCTACAAGACT;SOR=0.772;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=19;WE=207027415;WS=207027397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr2	207041053	rs3732083	T	C	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TTCTTACTAATTAGGACATAA;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=75;TCR=59;TR=68;WE=207041061;WS=207041043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr2	207041441	rs3732082	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=1130;ReadPosRankSum=0.712;SC=ACTCCACAGTGTCCCGGAAGT;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=65;WE=207041449;WS=207041431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,79:0.43:185
chr2	207169731	rs10932150	G	A	3267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=54;PP=2034;ReadPosRankSum=0.379;SC=GCCAGTGTGAGAAAATGTAAC;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=256;TCF=145;TCR=111;TR=128;WE=207169739;WS=207169721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,151:0.52:293
chr2	207172627	rs7582864	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=773;ReadPosRankSum=-0.891;SC=TTTCTGTCCAATCTGTGGCTG;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=41;WE=207172635;WS=207172617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr2	207173390	rs79484112	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AGCAGCAGATGAGCTTCAAAA;SOR=0.561;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=64;WE=207173398;WS=207173380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr2	207174316	rs3732084	T	C	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1285;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AAGAAGCCAGTCTTCGGAAGG;SOR=0.723;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=69;WE=207174324;WS=207174306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr2	207175070	rs138061259	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1084;ReadPosRankSum=0.181;SC=ATGCCAGACAGCGAAAATCAG;SOR=0.630;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=69;WE=207175078;WS=207175060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr2	207426875	.	C	T	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=603;ReadPosRankSum=0.706;SC=TAATAACTAGCTTTGTGCACT;SOR=0.723;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=38;WE=207426883;WS=207426865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
chr2	207452151	rs3832131	GT	G	1014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=586;SC=TCATTGGAAAGTTTTTTTTTC;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=29;WE=207452159;WS=207452141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	207472573	rs1991537	A	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=174;SC=TGATAGAGTAATGTTCATTCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=207472581;WS=207472563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	207472606	rs5838036	G	GT	344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=197;ReadPosRankSum=1.618;SC=TCCATGGACAGTTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=16;WE=207472614;WS=207472596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
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chr2	207613980	rs13427620	G	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=688;SC=CCCTGGCTCAGTGGAACTAAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=207613988;WS=207613970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	207621759	rs1990849	A	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=61;PP=2063;SC=TGACATCATAATAAAGCTAAA;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=207621767;WS=207621749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr2	207824384	rs11903403	T	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=865;ReadPosRankSum=-1.249;SC=ACAACTCAAGTATACGCAAGC;SOR=0.785;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=73;TCR=32;TR=49;WE=207824392;WS=207824374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr2	207824548	rs1453168	G	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=48;PP=1477;SC=TATCCATTCCGGCTCTAAAAA;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=207824556;WS=207824538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	207824650	rs1453169	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.180;SC=GTTTAGGCCTAAGGAAGCCTA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=207824658;WS=207824640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	207825656	rs13397039	A	T	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=62;PP=1616;ReadPosRankSum=0.763;SC=ATTTCAATGCATCTTGGTGTA;SOR=0.842;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=185;TCF=61;TCR=124;TR=91;WE=207825664;WS=207825646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,99:0.47:211
chr2	207833848	rs7582092	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=19;PP=1184;SC=ATAGAAATCCATTCTTCCAAA;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=207833856;WS=207833838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	207911100	.	G	GAGA	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQRankSum=3.050;QD=28.57;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr2	207911115	.	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQRankSum=-0.219;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.403;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	207911118	.	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQRankSum=-0.238;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.466;SOR=0.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr2	207911123	rs57504830	A	G,AAAGAAGAAG	997.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=53.08;QD=36.95;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,20,7:0.74,0.26:27
chr2	207946141	rs2287507	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1022;ReadPosRankSum=-1.422;SC=AGTTTAAGGGACAAAATGTTT;SOR=0.969;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=57;WE=207946149;WS=207946131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr2	207946164	rs2287506	T	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=694;ReadPosRankSum=0.435;SC=GTTTAAATCCTATCTCTTCCA;SOR=1.598;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=37;WE=207946172;WS=207946154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr2	207974818	rs2244923	C	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=44;PP=993;ReadPosRankSum=1.382;SC=TTTCTATGCACGTGAATGTAG;SOR=0.872;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=46;TCR=88;TR=65;WE=207974826;WS=207974808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr2	207974875	rs2244918	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=500;ReadPosRankSum=1.274;SC=AAATGCAGACATAAAGTATGT;SOR=1.419;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=30;WE=207974883;WS=207974865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr2	207988613	rs2700166	C	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=564;SC=CTTCAGCCCCCAGCCCTCCTT;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=207988621;WS=207988603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	207998800	rs2284934	C	T	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=563;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CTGGCCAAGACGGGAACATGC;SOR=0.800;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=40;WE=207998808;WS=207998790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr2	207999021	rs2284933	G	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	208031796	rs2037893	C	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=382;ReadPosRankSum=-1.212;SC=TAGAGGGAGCCTAGGTAGACG;SOR=0.415;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=26;WE=208031804;WS=208031786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr2	208031992	rs1269424	T	A	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=74;PP=2276;SC=CCTGCACAATTCACGTTAGGG;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=117;WE=208032000;WS=208031982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	208447642	rs12478868	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	208477852	rs2551949	G	A	7102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=89;PP=2965;SC=CTTTCTCACAGTAAATTGCCT;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=211;WE=208477860;WS=208477842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr2	208477956	rs2709416	C	T	5172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=96;PP=2965;SC=GTTCCAGTGTCTGAAGAAGAT;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=164;WE=208477964;WS=208477946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	208489101	rs4234080	C	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.924;SC=GAGGGCCATTCCGCCTGCACC;SOR=0.380;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=17;WE=208489109;WS=208489091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr2	208633413	rs4675711	T	C	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=73;PP=2381;SC=CCAGCTGCGCTAGGAGCAGCA;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=102;WE=208633421;WS=208633403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	208693261	rs720632	C	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=642;ReadPosRankSum=-1.101;SC=AAGACTGAAGCCAGCAAGACA;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=46;WE=208693269;WS=208693251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr2	208693307	rs720631	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=398;ReadPosRankSum=0.825;SC=GTGCAGCTGGTGGCACAATCT;SOR=0.632;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=28;WE=208693315;WS=208693297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr2	208717440	rs10932211	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=415;ReadPosRankSum=0.316;SC=AGGCAGGGAAAGGCTGAAAAA;SOR=0.811;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=27;WE=208717448;WS=208717430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr2	208811097	rs10932215	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=642;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CTACCTTATACTTTGAAGTAT;SOR=0.741;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=46;WE=208811105;WS=208811087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr2	208811284	rs10932216	C	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=528;ReadPosRankSum=-0.310;SC=GTACTTTTAACACTACAGAAC;SOR=0.770;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=38;WE=208811292;WS=208811274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,43:0.40:108
chr2	208841964	rs4441448	A	G	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=54;PP=2469;SC=TTGTCAGCTCATTCTGCCGCC;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=208841972;WS=208841954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	208986385	rs2305429	A	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=14;PP=1458;SC=AAACAACAAAAGAGGACATAT;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=208986393;WS=208986375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	208986637	rs2305430	T	C	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=98;PP=2965;SC=TGTAGTCCTCTCTCTCATAGA;SOR=1.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=54;TCR=98;TR=152;WE=208986645;WS=208986627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	208989037	rs2242074	A	G	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.127;NF=24;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=2.771;SC=TGCTGCATTCATAGTGGCGGC;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=44;WE=208989045;WS=208989027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr2	209007559	rs796287	T	G	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=48;PP=1600;SC=TGAACAGAGATACAGTCGTCT;SOR=1.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=209007567;WS=209007549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	209010558	rs2854723	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.465;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=406;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GCTGGTAGTCAGGGTACTCCC;SOR=0.338;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=32;WE=209010566;WS=209010548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr2	209010891	rs2289917	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=810;ReadPosRankSum=0.674;SC=GTGGGACTGCGGGAACGTCAC;SOR=0.480;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=51;WE=209010899;WS=209010881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr2	209030330	rs34111482	G	GT	70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.50;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	209030572	rs6721025	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=21;PP=588;SC=GGTATCAAGCACATCAATTTA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=209030580;WS=209030562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	209033126	rs189090184	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=327;ReadPosRankSum=1.707;SC=GGCCGGGCGCGGTGGCTCAAG;SOR=0.425;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=13;WE=209033146;WS=209033116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr2	209033138	.	C	T	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=69;QD=51.8856062736;SC=TGGCTCAAGCCTGTAATCCCA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=2;WE=209033146;WS=209033116;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr2	209033173	rs7562540	A	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=4;PP=125;SC=CAAGGCGGGCAGATCGCGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=209033181;WS=209033163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	209035485	rs6435420	T	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=751;SC=ATTTTGCAGATGAGGAAACTA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=209035493;WS=209035475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	209035658	rs6748431	C	T	6169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=109;PP=2965;SC=AATTTACAATCTCACACCTAC;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=91;TCR=109;TR=200;WE=209035666;WS=209035648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr2	209035849	rs4292037	A	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=836;SC=TGTCCATCCAAAGTTTCATTT;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=209035857;WS=209035839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	209036605	rs10932244	T	C	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=24;PP=1920;SC=CAACCAGACATAGAAATCTAA;SOR=1.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=90;WE=209036613;WS=209036595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	209036712	rs10804166	T	C	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=79;PP=2897;SC=CCAGGCTTACTCTGTTTGCGG;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=133;WE=209036720;WS=209036702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	209036778	rs6435421	A	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=46;PP=1552;SC=AAGGAGAGGCAGAGAGATGAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=209036786;WS=209036768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	209045657	rs10208685	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=320;ReadPosRankSum=0.056;SC=ATCATAAGTATTAAATACAGT;SOR=0.420;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=14;WE=209045665;WS=209045647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr2	209045839	rs56342568	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=-0.548;SC=CTCCTAAACATTTAGAAACAT;SOR=0.022;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=209045847;WS=209045829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	209046162	rs6435425	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.769;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	209046162	.	GTA	ATG	373	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=7;PP=373;QD=53.3084843578;SC=AATAAAATTGGTATGATTGTT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=209046172;WS=209046152;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,8:0.47:17
chr2	209046164	rs6435426	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.919;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	209049840	rs10804167	C	T	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=36;NR=62;PP=1794;SC=TCCCATCCCTCCCTCCCCCAC;SOR=1.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=98;WE=209049848;WS=209049830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	209101905	rs57383668	GA	G	1300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=710;SC=TAACGGGAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.909;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=36;WE=209101913;WS=209101895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	209138946	rs6705163	C	T	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=627;SC=GCTGAATAAGCTGAGCTCCTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=209138954;WS=209138936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	209163556	rs7569723	C	T	4353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=86;PP=2581;SC=AGAGAATGTTCATGTGACTGA;SOR=1.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=35;TCR=86;TR=121;WE=209163564;WS=209163546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	209168853	rs893256	C	T	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=34;PP=1658;SC=ACATTGTTGCCATTGAAGGCC;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=209168861;WS=209168843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	209176807	rs12624141	T	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=322;SC=GAGGCATTTTTACCCAAAGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=209176815;WS=209176797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	209178993	rs200717603	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=472;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGAAGTAATAACTTCTTATTT;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=27;WE=209179001;WS=209178983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr2	209180073	rs41305979	C	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=718;ReadPosRankSum=0.944;SC=ACATGGATATCCGTCAGTTTG;SOR=0.440;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=48;WE=209180081;WS=209180063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr2	209184844	rs934712	A	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=2;PP=80;SC=CTAAATGAGAATATATTAATA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=209184852;WS=209184834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	209184980	rs10932258	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=9;PP=362;SC=TTGTAGATGAGTTCTTGTATT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=209184988;WS=209184970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	209184999	rs10932259	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=10;PP=439;SC=TTAAAAACCCCAAAATTCTTC;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=209185007;WS=209184989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	209189912	rs893255	A	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=14;PP=737;SC=TTTTACAGATATTAAGAGAGT;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=209189920;WS=209189902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	209190330	rs2363468	T	C	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=64;PP=2812;SC=TTGCTGGAATTGAGGATTGTG;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=146;WE=209190338;WS=209190320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	209190519	rs893254	A	T	9159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr2	209190528	rs893253	C	G	9459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.00;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr2	209191082	rs1529979	C	A	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=53;PP=1831;SC=TTCAAGTGGCCAATCAGGAAG;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=209191090;WS=209191072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	209191099	rs1529978	T	C	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=57;PP=1560;SC=GAAGCAAAAATGAGGGTGATG;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=81;WE=209191107;WS=209191089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	209194696	rs1437414	G	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=705;SC=AAAATTTCAAGCTAAAACGTA;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=209194704;WS=209194686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	209195099	rs1866045	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=549;SC=AACTATCACCGTGCTGTAGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=209195107;WS=209195089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	209195133	rs12694109	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=4;PP=1135;SC=AGCTGCAGGCTCAGAGCAGCA;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=45;WE=209195141;WS=209195123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	209199945	rs2363469	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1160;SC=TGCCTCATAGAATATAGTTGA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=209199953;WS=209199935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	209201054	rs6744236	T	C	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=230;SC=TTTTGTTTCCTGTCACTCTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=209201062;WS=209201044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	209201739	rs7596571	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=334;SC=TAGTTTAATATGTACTTTAGT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=209201747;WS=209201729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	209203122	rs4675756	C	G	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=1;PP=235;SC=AATTTTTTAACGGTATAAATG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=209203130;WS=209203112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	209204714	rs2289171	G	A	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=17;PP=1659;SC=TAATATATAAGTAGACTATTT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=74;WE=209204722;WS=209204704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	209209827	rs2304544	G	A	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=38;PP=2255;SC=ACCTATTTCTGCCCTAAGTTG;SOR=1.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=119;WE=209209835;WS=209209817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	209209997	rs2043718	C	T	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=686;SC=AGTTTTATTACAGCATTTATC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=209210005;WS=209209987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	209212707	rs2304545	G	A	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=37;PP=1262;SC=TTGGGCAGACGGGCAAGGAGG;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=209212715;WS=209212697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	209212769	rs55754111	G	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=0.133;SC=AAGAGTAAATGTGCTTATTCT;SOR=0.748;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=21;WE=209212777;WS=209212759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr2	209214770	rs2118297	A	G	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=57;PP=2539;SC=GAGGAGATACACAAAAGAAGC;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=129;WE=209214778;WS=209214760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	209215448	rs994696	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=449;SC=GAGGAAAGATATTTTCTGAGT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=209215456;WS=209215438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	209215586	rs994697	A	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=19;PP=729;SC=ACAGCAGTGAAGAAGATTTCA;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=209215594;WS=209215576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	209219190	rs6435453	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=765;SC=AGCACTCAATAAAAGTTAACT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=209219198;WS=209219180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	209220157	rs10208191	G	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=622;SC=CAGTTCTGTGGCTGTTTAGAC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=209220165;WS=209220147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	209224874	rs11357589	CA	C	2148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=18;PP=1493;SC=AGCAGTTTGTCAACCAGCATA;SOR=1.421;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=35;WE=209224882;WS=209224864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	209293168	rs962595	C	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=463;SC=TGCAGCAGAACAACAACACTC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=209293176;WS=209293158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	209302328	rs61742329	C	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=695;ReadPosRankSum=0.307;SC=GGGAAAATATCGGCTGTTCCA;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=45;WE=209302336;WS=209302318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr2	209315573	rs1370371	G	A	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=61;PP=2414;SC=AACCTCAGATGTTCTCAAGAC;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=117;WE=209315581;WS=209315563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	209353607	rs6726003	A	G	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=289;SC=CCCTGTCTCAAGAAAAGATAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=209353615;WS=209353603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	209353656	rs11335842	GT	G	776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=406;SC=GCTCTGCTAAGTTTTTTTTTT;SOR=2.621;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=21;WE=209353664;WS=209353646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	209358027	rs3820900	C	T	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=98;PP=2965;SC=GTCGGTGGAACCTCTCCGTGG;SOR=1.095;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=68;TCR=98;TR=166;WE=209358035;WS=209358017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr2	210517785	rs2254169	C	T	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=744;SC=CGGTTTGCTACAAATTTTTCC;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=210517793;WS=210517775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	210594540	rs4673486	A	G	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=95;PP=2965;SC=CGAATGCAAGATATAGTTAAA;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=113;TCR=95;TR=208;WE=210594548;WS=210594530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr2	210594717	rs11389149	C	CT	2223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=2387;SC=CCAATCTTGTCTTTTTAAAAA;SOR=3.797;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=55;WE=210594725;WS=210594707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	210594768	rs7594601	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=1051;SC=AGGTCCCAGATTGTAGACCTG;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=210594776;WS=210594758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	210659434	rs7603924	A	G	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=553;SC=CTCGATAGTGAGTAAATCTCA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=210659442;WS=210659424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	210678691	rs2159745	T	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=49;PP=1500;SC=TTACACTGTTTCTATTATCTT;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=56;WE=210678699;WS=210678681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	210745681	rs2370838	C	A	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=41;PP=2078;SC=CTTTCATTTCCTAGGTACTGT;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=210745689;WS=210745671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	210786137	rs9288415	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=410;SC=AAACTACTACGTTTGTGTCAT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=210786145;WS=210786127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	210843383	rs2075117	G	A	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=63;PP=2223;SC=AGCCATCCCAGCAGGCTTCGC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=115;WE=210843391;WS=210843373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	210846867	rs2723222	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=289;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TCAGTGTCATAGTTTTTGTAA;SOR=0.231;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=22;WE=210846875;WS=210846857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr2	210880893	rs7570090	C	T	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1037;ReadPosRankSum=1.343;SC=GGAAGATTTGCGGGAAACAGG;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=68;WE=210880901;WS=210880883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr2	210882171	rs2075116	A	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=0.113;SC=TTTAGGAGTTACTTATTTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=13;WE=210882179;WS=210882161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr2	210882456	rs2243769	G	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=219;SC=AAGTGGATATGCTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=210882464;WS=210882446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	210882677	rs2723213	C	T	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=144;SC=CTATGTTGGCCAGGCTGGTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=210882685;WS=210882667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	210889759	rs6435550	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=519;ReadPosRankSum=-1.240;SC=GTCTCACCCAAAATTCATGCA;SOR=0.739;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=27;WE=210889767;WS=210889749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr2	211069438	rs263677	G	A	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=71;PP=2136;SC=GTAGAGAATGGTCTCATTTAA;SOR=1.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=211069446;WS=211069428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	211162998	rs7592060	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	211167132	rs2292300	A	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=895;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAAGAGCTAAACTCATCCCAA;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=66;WE=211167140;WS=211167122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,76:0.45:170
chr2	211168181	rs35179660	T	TC	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.812;NF=2;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=-1.114;SC=TCAGTTCCATTTTTGCCTATC;SOR=0.027;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=211168189;WS=211168171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	211168346	rs12469767	A	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=0.149;SC=GAGTGGGGTCATCCCTGGCTG;SOR=0.563;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=21;WE=211168354;WS=211168336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr2	211302627	rs41272663	C	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=695;ReadPosRankSum=-1.535;SC=ATTAGTTCTGCTGAAGCAAAT;SOR=0.594;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=43;WE=211302635;WS=211302617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr2	211302685	rs13420747	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-0.221;SC=AAAGCATGGCTAAGGGGAAAT;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=13;WE=211302693;WS=211302675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	211319824	rs2287432	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=433;ReadPosRankSum=1.235;SC=TATAGAAACATGATTACCGTG;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=31;WE=211319832;WS=211319814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr2	211340937	rs3214410	A	AT	679.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=447;SC=CGAATCATGTATTTTTTTAAA;SOR=1.270;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=14;WE=211340945;WS=211340927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	211341204	rs56033100	G	GC	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=120;SC=GAGGGCGGCGGCGGCGCCCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=211341212;WS=211341194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	211421452	rs3835047	A	ATCT	2166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.505;NF=19;NR=18;PP=1710;ReadPosRankSum=0.339;SC=GCCACAAATCATCAAAATGAC;SOR=0.990;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=37;WE=211421460;WS=211421442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr2	211444533	rs35833900	G	GGT	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=583;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TGTTTCTTCGGGTGTGTGTGT;SOR=0.836;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=14;WE=211444542;WS=211444523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr2	211452598	rs149496892	TAC	T	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=1.807;SC=ATAAAAAAGATACAGTCTGTG;SOR=0.412;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=211452607;WS=211452593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	211456637	rs1047883	A	G	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	211456637	.	ACC	GCT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=55;NR=48;PP=2947;QD=20;SC=CTTGGACAACACCCTCCCTGC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=103;WE=211456647;WS=211456627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,103:0.95:108
chr2	211456639	rs2229589	C	T	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	211470086	rs2277909	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=89;ReadPosRankSum=0.000;SC=GACAGACTAGTGATAACATTT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=8;WE=211470094;WS=211470076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr2	211473070	rs2287600	G	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.926;NF=47;NR=18;PP=1133;ReadPosRankSum=-1.417;SC=AAATAAATTTGTCTTCTTTTT;SOR=0.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=88;TCR=34;TR=65;WE=211473078;WS=211473060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,77:0.53:145
chr2	211481257	rs2287599	C	G	5527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=85;PP=2965;SC=CACTGAAAGGCCTCAACAGGT;SOR=0.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=72;TCR=85;TR=157;WE=211481265;WS=211481247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	211513118	rs4673540	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=706;SC=GGCTACCACTCGAGCTAATGA;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=211513126;WS=211513108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	211514995	rs34449727	G	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=690;ReadPosRankSum=-0.096;SC=AGCCCCGACTGGAACTATAGG;SOR=0.531;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=44;WE=211515003;WS=211514985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr2	211523457	rs6435580	C	T	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1118;ReadPosRankSum=0.242;SC=CACTGTGTTACGTCATGTTGG;SOR=0.308;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=79;WE=211523465;WS=211523447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,96:0.59:164
chr2	211527827	rs5838215	GT	G	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr2	211533070	rs10932347	A	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=44;PP=1344;SC=GAGGGGCAGGATAGAATGTTA;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=67;WE=211533078;WS=211533060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	212251864	rs3748962	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=515;ReadPosRankSum=0.288;SC=CATCTCGGTATACAAACTGGT;SOR=0.297;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=31;WE=212251872;WS=212251854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr2	212252809	rs934607	G	A	5965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AAGCCACATGGGTCGTATGAA;SOR=0.988;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=49;TCR=141;TR=189;WE=212252817;WS=212252799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr2	212285103	rs2289086	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.085;SC=TTAGTGCTTATGAACTATTAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=212285111;WS=212285093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	212286934	rs3791709	A	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=1.412;SC=TGTTGTTTTAATCGTAATGAT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=212286942;WS=212286924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	212292967	.	T	TAAA	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	212292969	.	T	TAAAATA	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	212295875	rs6710946	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CCCAGGTTTTCCCATTTTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=15;WE=212295883;WS=212295865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr2	212488870	rs3215298	G	GC	1321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=1332;SC=TTCTTACAAAGAAAAACACAC;SOR=3.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=212488878;WS=212488860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	212544026	rs67647157	CT	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=187;ReadPosRankSum=0.267;SC=TGGCAAATGACTTTGGTGGCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=212544034;WS=212544016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	212587321	rs13002712	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=396;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TTAATGAAACGCTGCCAAAAC;SOR=0.679;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=26;WE=212587329;WS=212587311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr2	212589986	rs35778743	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=367;ReadPosRankSum=-1.403;SC=AGCTGAGTTCTGGAGTGACAA;SOR=1.296;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=29;WE=212589994;WS=212589976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr2	212615516	rs6757068	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=207;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GAAATACTCCTGCTCCTTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=19;WE=212615524;WS=212615506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr2	213872853	.	TACA	T	313	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=17;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=56.17;NF=0;NR=5;PP=313;QD=68.0;SC=AAAAAAAAAATACAACAACAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=213872876;WS=213872843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	213872868	.	A	C	338	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=56.57;NF=0;NR=6;PP=338;QD=62.1285354245;SC=CAACATTAGTATCAGATTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=213872876;WS=213872843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	213886454	rs2291241	A	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1369;SC=TCTGGTTAGAAAAATGAAAAA;SOR=1.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=213886462;WS=213886444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	213886647	rs141472671	A	ATTTTATCT	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=345;ReadPosRankSum=0.882;SC=ACAGCATAAGATTTTATCTTC;SOR=1.762;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=6;WE=213886655;WS=213886637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	213914343	rs2165444	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=318;SC=TGGTCATTACCGACTACATAA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=213914351;WS=213914333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	214012405	rs6738070	A	C	5976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=2.786;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:10,230:0.96:240
chr2	214012508	rs6709554	C	T	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=65;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.698;SC=TATTGGAGTGCTCCCTTTCGG;SOR=1.201;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=186;TCF=57;TCR=129;TR=88;WE=214012516;WS=214012498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,97:0.47:205
chr2	214228792	rs12469417	C	T	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=419;SC=TTGAATTTTACTTTTTAGATT;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=214228800;WS=214228782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	214228959	rs4146048	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=10;PP=652;SC=GATATTTAAAGGTGAGTAAGT;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=214228967;WS=214228949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	214233812	rs6752347	C	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=32;PP=1031;SC=AGTGTGGAAACAATTTTAATT;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=214233820;WS=214233802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	214794743	rs12623569	A	C	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1090;ReadPosRankSum=1.881;SC=GATCTATGTAAAGGCGATTGC;SOR=0.543;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=151;TCF=71;TCR=80;TR=68;WE=214794751;WS=214794733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr2	215102929	rs1912207	T	A	3520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=50;PP=2216;SC=TGTTACCTCATATTGAAGTTG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=215102937;WS=215102919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	215593261	.	C	CT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=19;MQ=55.35;NF=2;NR=0;PP=30;QD=16.5;SC=TGGCATTAGACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=215593269;WS=215593258;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr2	215595645	rs16852600	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=428;ReadPosRankSum=1.451;SC=CTATACTGCTCATTTTGACAG;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=29;WE=215595653;WS=215595635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr2	215595765	rs6435849	C	G	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=48;PP=1576;SC=AACAGCGCTTCCTAAAATAAA;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=215595773;WS=215595755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	215595861	rs34664471	G	GA	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	215595872	rs28685662	G	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=383;SC=AAAAAAAAAAGCATTCTTTTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=215595880;WS=215595851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	215632124	rs5031008	ATT	A	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.059;NF=12;NR=3;PP=536;ReadPosRankSum=-0.880;SC=CAACTTGACTATTTTAAAGTC;SOR=0.402;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=15;WE=215632133;WS=215632114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	215632155	rs5031009	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.076;NF=22;NR=8;PP=480;ReadPosRankSum=-0.352;SC=CACACCTTGATTCAAGAATAT;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=30;WE=215632163;WS=215632145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr2	215632192	rs5031011	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.094;NF=35;NR=18;PP=878;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TAATTTTTACGTTGAACTACT;SOR=0.824;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=53;WE=215632200;WS=215632182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr2	215632255	rs2070094	C	T	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,89:0.48:186
chr2	215632255	.	CA	TG	1066	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=43;NR=30;PP=1066;QD=15.335176368;SC=ACTATATCCACATGCCCATTC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=73;WE=215632264;WS=215632245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr2	215632256	rs2070093	A	G	6623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.23;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	215634055	rs6704780	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.369;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=347;ReadPosRankSum=2.017;SC=ATGAACAAAACGGAAATTAAA;SOR=1.708;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=24;WE=215634063;WS=215634045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	215645464	rs2229571	C	G	6318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=100;PP=2965;SC=TACTGTTTTTCCTCCCTGATG;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=83;TCR=100;TR=183;WE=215645472;WS=215645454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	215674090	rs35933323	T	G	6534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=93;PP=2965;SC=CCAGAAACTGTGCGACCCGTG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=208;WE=215674098;WS=215674080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
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chr2	215674323	rs1129804	C	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=490;SC=AGGCTCCTCGCAGAGCGGGAA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=215674331;WS=215674313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	215674341	rs17489363	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=457;SC=GAAGCAAGGAAGCCTCGGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=215674349;WS=215674331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	215674371	rs34732883	C	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=305;SC=AAGCTGCAGGCCAGCGACTCG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=215674379;WS=215674361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	215797332	rs17426207	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=515;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ATTGGTCACACGCTGAGATTG;SOR=0.861;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=35;WE=215797340;WS=215797322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr2	215797527	rs10532785	AATTC	A	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.389;NF=0;NR=8;PP=298;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AAATAAAGTTAATTCATTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=215797538;WS=215797517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	215802112	rs3738884	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=1.609;SC=TTGTAGAGACGGGGTTTCACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=215802120;WS=215802102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	215809610	rs148640011	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=1.981;SC=TATATATATATACACACACAT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=215809618;WS=215809600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	215812297	rs2274412	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=883;ReadPosRankSum=-0.994;SC=GCAATAAAAGGGGAGTTAGGT;SOR=0.599;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=59;WE=215812305;WS=215812287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr2	215820013	rs10498027	G	A	3155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=67;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TGACACAGACGTAAGTGATGA;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=249;TCF=120;TCR=129;TR=128;WE=215820021;WS=215820003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,151:0.53:284
chr2	215821580	rs17492577	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=157;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CCCATCTAGTTTAAAACTGCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=215821588;WS=215821570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	215833415	rs4673925	A	G	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=16;PP=885;SC=TCATTTGTATAACATTCCAGA;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=215833423;WS=215833405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	215833622	rs6756540	G	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=299;SC=TCAACTTTTTGTTTCTGTTAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=215833630;WS=215833612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	215840414	rs17493319	C	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=357;SC=CTTCTAAGTACTTTATTCTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=215840422;WS=215840404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	215840829	rs7594021	A	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=262;SC=AACTTCAGAAACTATATATAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=215840837;WS=215840819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	215848034	rs7608150	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=172;SC=ATCACCCTGGTTGCTCTTTGA;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=215848042;WS=215848024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	215851246	rs7559069	A	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=657;SC=ATGGCAATAAATGTCAAAAAG;SOR=2.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=215851254;WS=215851236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	215855780	rs4533467	G	A	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=72;PP=2009;SC=AATGTGAGGCGCTTGTTATGC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=97;WE=215855788;WS=215855770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	215862383	rs1980844	G	A	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=8;PP=1211;SC=TCTATGAACAGGACTTATTCA;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=215862391;WS=215862373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	215862633	rs1326748	C	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=938;SC=TTACATTGAACTTATGATCGT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=215862641;WS=215862623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	215872334	rs940279	G	A	3983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=31;PP=2775;SC=CTGGAAGAGAGGCAATTTAAT;SOR=1.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=89;TCR=31;TR=120;WE=215872342;WS=215872324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	215874965	rs6733264	G	T	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=551;SC=AAGATAGAAAGAAATCAGTCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=215874973;WS=215874955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	215875251	rs1409607	A	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=900;SC=ATCCATTTCCACATGGCAAAT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=215875259;WS=215875241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	215876166	rs7560008	A	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=660;SC=TACTCACTGGAATTTATGGGA;SOR=3.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=215876174;WS=215876156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	215878240	rs7594353	G	A	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	215878246	rs10192100	C	T	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=1.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	215880108	rs6753310	C	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=513;SC=TTCCAAAAGCCGAATAAATGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=215880116;WS=215880098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	215890312	rs2177423	A	G	144.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=36.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	215890324	rs5838479	G	GT	135	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=33.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	215917415	.	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1000;ReadPosRankSum=0.251;SC=TACCCTACAGCAAGGATGTGC;SOR=0.593;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=40;TCR=99;TR=64;WE=215917423;WS=215917405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr2	215940242	rs6711179	T	C	3444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=74;NR=41;PP=2268;SC=TATTGTGCAATCATAACCCTG;SOR=1.144;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=115;WE=215940250;WS=215940232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	215976231	rs2948978	A	T	209.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=188;SC=ACAAAAAAAAATTTTTGAAAT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=215976239;WS=215976221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	216182769	rs4672766	A	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=7;PP=1116;SC=CAGAATTTTCACGTTGAATTC;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=216182777;WS=216182759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	216190654	rs7563206	C	T	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=9;PP=771;SC=TATTTAAAAGCGGTTCATAAG;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=216190662;WS=216190644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	216190691	rs2177737	A	C	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=19;PP=993;SC=AAAATCAATAAGTCTTTTGTT;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=216190699;WS=216190681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	216191515	rs6751557	C	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=194;SC=AAGTGCTGCTCGTGTCTCACA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=216191523;WS=216191505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	216198049	rs10179873	A	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=11;PP=1155;SC=TTCTTTGTTTATGATTTTACT;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=216198057;WS=216198039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	216211712	rs10932609	A	T	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=79;PP=2442;SC=ATTCAGTTCAACCCTTTATGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=37;TCR=79;TR=116;WE=216211720;WS=216211702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	216212279	rs4673992	G	C	4284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=59;PP=2835;SC=AAAACAGAAGGCTGCTAATCA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=216212287;WS=216212269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	216214492	rs10498036	T	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=468;SC=ACTGGATCCATAGTTTTTGGT;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=216214500;WS=216214482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	216226642	rs13394662	A	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=3;PP=239;SC=TACCTGTAGAAAGAGACTGTC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=216226650;WS=216226632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	216229850	rs7579867	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=42;PP=1250;SC=TCCCTAAGAGCAGTACTGCTA;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=216229858;WS=216229840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	216232556	rs7568287	C	T	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=12;PP=1356;SC=GAGACAAACACGGAAGTGGAT;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=216232564;WS=216232546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	216235089	rs1250209	C	T	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=79;PP=2757;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TCCACTATGACGTTGTAGGTG;SOR=0.282;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=151;WE=216235097;WS=216235079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr2	216236532	rs10804241	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CATCACACCCGGCCATGAAGC;SOR=1.051;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=15;WE=216236540;WS=216236522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	216237929	rs2289199	A	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=3.059;SC=GCTGTTAGATAAAAAAAATCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=216237937;WS=216237920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	216240126	rs3214672	AAC	A	1161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.843;NF=5;NR=14;PP=765;ReadPosRankSum=0.154;SC=GCTGAAAGAAAACAAAATTAA;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=19;WE=216240135;WS=216240116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr2	216242917	rs1132741	T	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=635;ReadPosRankSum=1.673;SC=TGGTGACAACTCCCTGAGCTG;SOR=0.468;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=40;WE=216242925;WS=216242907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr2	216243832	rs1250204	T	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=48;PP=2497;SC=TTTATTCCAATGAACAACGGT;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=83;TCR=48;TR=131;WE=216243840;WS=216243811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	216248305	rs1250203	G	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=734;SC=TCGAATGATCGCTTACATGAG;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=216248313;WS=216248295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	216248707	rs35639338	TAA	T	760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.754;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=0.996;SC=TCTGAATAAGTAAAAGCTGGT;SOR=0.016;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=10;WE=216248716;WS=216248697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	216249587	rs13652	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=7;PP=513;SC=CTGTACCTGTCTCTCCGTAAG;SOR=1.708;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=23;WE=216249595;WS=216249577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	216249819	rs1250201	C	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=104;SC=GTAAATACTACGTGTAATTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=216249827;WS=216249809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	216251697	rs35343655	G	A	104.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	216253039	rs1250215	G	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AGGGGCAAATGGGGCTTATTT;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=74;WE=216253047;WS=216253029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,84:0.58:146
chr2	216256615	rs6709607	T	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=260;SC=AAAGGTAAAATCAATATTTCA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=216256623;WS=216256605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	216262621	rs6725958	A	C	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=944;SC=TTTCCAGAGGACTGTTACTGC;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=216262629;WS=216262611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	216263926	rs2692224	C	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=712;SC=TACATGGGAACCACAAGGACA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=216263946;WS=216263916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	216263938	rs3832178	C	CT	1570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=1297;SC=ACAAGGACAGCTCAGGGCTGT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=29;WE=216263946;WS=216263916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr2	216272819	rs7570208	C	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=8;PP=1230;SC=AAGAGGGGGACGCTTAGCTGA;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=216272827;WS=216272809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	216272900	rs2577301	T	G	5009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.04;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	216272900	.	TGTCAGGA	GGTCAGGA,GGTCAGGT	1095	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=67,30;NR=54,21;PP=1095,769;QD=9.33695216981;SC=TCCACAGTCGTGTCAGGAGGG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121,51;WE=216272915;WS=216272890;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:121
chr2	216272907	rs7596677	A	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr2	216274853	rs5838511	AAC	A	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=678;ReadPosRankSum=1.072;SC=AATTTAAATTAACACACACAC;SOR=0.344;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=14;WE=216274862;WS=216274843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr2	216283958	rs3796123	T	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=771;ReadPosRankSum=-0.824;SC=GTAATAGAGCTACTTACTTGG;SOR=0.383;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=43;WE=216283966;WS=216283948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr2	216288795	rs11693652	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=1.113;SC=TAAATGGCTAGAATGCTGGCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=216288803;WS=216288785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	216295312	rs1250241	T	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=203;SC=TTTTCTTGACTTCCAGAAGTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=216295320;WS=216295302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	216295337	rs7586990	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=138;ReadPosRankSum=0.103;SC=AAGCATGCTGATATACTGGAT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=216295345;WS=216295327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr2	216296730	rs113868976	A	AT	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.291;NF=1;NR=16;PP=180;ReadPosRankSum=-1.447;SC=GGCAGAACAGATTTTTTTTTT;SOR=0.759;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=65;TCF=8;TCR=57;TR=17;WE=216296738;WS=216296720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr2	216298084	rs2289202	G	A	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=903;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GCCCAGCCCCGATGCAGGTAC;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=67;WE=216298092;WS=216298074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,82:0.44:186
chr2	216298230	rs10202709	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=0.519;SC=TAGGTACAAGCTTTTCTAGTT;SOR=0.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=13;WE=216298238;WS=216298220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	216299281	rs1250246	A	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=530;SC=AAATATAAGCAGTTTTTAAAC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=216299289;WS=216299280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	216299550	rs2577290	G	A	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=6.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=-0.903;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.032;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,77:0.46:169
chr2	216299550	.	GC	AA	2449	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=24;MQ=60.12;NF=11;NR=46;PP=2449;QD=43.902945173;SC=ACAACCGGCTGCAAATAATTG;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=145;TCF=40;TCR=105;TR=57;WE=216299559;WS=216299540;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:88,57:0.39:145
chr2	216299551	rs2692234	C	A	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=6.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=-0.897;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.097;SOR=1.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr2	216299571	rs10648691	T	TTAC	5254.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=72;PP=2924;SC=AAGGAAAACGTTACATTTGCA;SOR=2.468;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=2;TCR=88;TR=74;WE=216299579;WS=216299561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	216299629	rs1250247	C	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=858;SC=TGAATATTGACGTACATATTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=216299637;WS=216299619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	216300482	rs1250259	T	A	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=38;PP=1165;SC=CCCCAGGCACTGGACGGCCAG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=216300490;WS=216300472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	216808354	rs150285041	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=412;SC=GACGAGGTCAGGAGATCGAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=216808362;WS=216808344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	216810468	rs62183184	A	C	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=78;PP=2761;SC=CTAAGGTAGAAAAATGGACCA;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=216810476;WS=216810458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	216811707	rs1344695	G	T	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=850;SC=TGATCACAACGAGTTATTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=216811715;WS=216811697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	216861273	rs2303845	T	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=277;SC=ACAATATCAATTAAAACTTAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=216861281;WS=216861263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	216878008	rs1864253	C	G	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=74;PP=2493;SC=CACTCGCACCCGCAGCAGCAG;SOR=1.017;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=131;WE=216878016;WS=216877998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	216903894	rs10197542	A	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=300;ReadPosRankSum=0.799;SC=ACTTAAAAATAAGAAAAATGT;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=16;WE=216903902;WS=216903884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr2	216904019	rs9288513	A	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=945;ReadPosRankSum=-0.972;SC=CTTTCTCCTTAAAGGTCTCCT;SOR=0.763;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=57;WE=216904027;WS=216904009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr2	216923679	rs1429148	C	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.021;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1188;ReadPosRankSum=0.253;SC=CCTCCATGCTCTTTCATCCAG;SOR=0.635;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=175;TCF=91;TCR=84;TR=81;WE=216923687;WS=216923669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,96:0.48:199
chr2	216982370	rs3815855	C	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=772;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TCACATAGTTCAGTGTCCACA;SOR=0.869;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=42;WE=216982378;WS=216982360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr2	217012901	rs207906	A	G	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=48;PP=1770;SC=AGGTGACAACAAAAAGTCAGA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=88;WE=217012909;WS=217012891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	217055171	rs12470053	A	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=609;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CATTCTCAATATGAATAGCAG;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=37;WE=217055179;WS=217055161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr2	217069151	rs1438162	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=764;ReadPosRankSum=1.641;SC=CTGGTGTTCTATGATTGAAGT;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=38;TCR=82;TR=49;WE=217069159;WS=217069141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr2	217123958	rs169616	T	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=457;SC=CTGTTGGCTCTGGGGGTGCCA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=217123966;WS=217123948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	217148417	rs876771	C	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=929;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGCACTTGACCGAGCCATCAC;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=56;WE=217148425;WS=217148407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr2	217364452	rs284573	C	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=465;SC=GTCTGTGCATCTAATACCATT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=217364460;WS=217364442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	217364539	rs284572	C	T	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=28;PP=1544;SC=ACAGCAATCCCTGTTTTGTTT;SOR=1.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=71;WE=217364547;WS=217364529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	217498290	rs5838590	C	CGCCGCTGCT	371.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.19;QD=37.17;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	217541582	rs2160549	T	C	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=63;PP=2397;SC=AGATGCCACGTTTGCGGCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=130;WE=217541590;WS=217541572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	218577575	rs1835333	T	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=273;SC=AGTTTGCATCTGTCACCCACC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=218577583;WS=218577565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	218604247	rs4672848	A	C	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=22;PP=1001;SC=GCATAAGTAGAACTGGGGCAG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=218604255;WS=218604237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	218604356	rs4294980	G	A	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=41;PP=1401;SC=GCCAGGGAGAGGCAACTTGCA;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=218604364;WS=218604346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	218674697	rs918949	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=413;ReadPosRankSum=2.085;SC=ACAGAGTTGACGAAGAGCACA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=35;WE=218674705;WS=218674687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr2	218675144	rs918950	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=0.080;SC=CAGAAGGAACGCTGCTTTTCA;SOR=0.384;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=33;WE=218675152;WS=218675134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr2	218675199	rs1035672	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-1.318;SC=CAGTCTGAACGTTTGATGATT;SOR=0.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=218675207;WS=218675189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr2	218682474	rs12694422	A	G	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1083;ReadPosRankSum=0.783;SC=TGCTGCCCCCACTGGGACTGG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=94;TCR=85;TR=81;WE=218682482;WS=218682464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,95:0.46:205
chr2	218682771	rs3796026	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=899;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TAGAATAGCCACCATAGGCCA;SOR=0.888;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=64;WE=218682779;WS=218682761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,82:0.43:189
chr2	218683154	rs2571445	A	G	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=742;ReadPosRankSum=3.085;SC=ATGGCCCGCCAGCCGAAGCCA;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=51;WE=218683162;WS=218683144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
chr2	218683257	rs2571442	A	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.804;SC=ACTGAGCTCGAGCCTGGCTTT;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=172;TCF=95;TCR=77;TR=81;WE=218683265;WS=218683247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,101:0.51:197
chr2	218683368	rs34144104	C	T	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TCTGGGCAGACGGGCTGGGCT;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=49;TCR=75;TR=79;WE=218683376;WS=218683358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,95:0.66:143
chr2	218694510	rs55877504	CT	C	3226.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=1796;SC=TCAAGCCCTGCTTTGAAAAGC;SOR=1.117;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=39;WE=218694520;WS=218694500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	218694512	rs55694913	T	G	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=24;PP=1112;SC=AAGCCCTGCTTTGAAAAGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=59;WE=218694520;WS=218694500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	218694551	rs16858298	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=475;ReadPosRankSum=-0.449;SC=AGGAAGTCACAGCAAATGCTA;SOR=0.886;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=40;WE=218694559;WS=218694541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr2	218694691	rs10188605	A	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr2	218694842	rs4674219	C	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.839;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CTGCAAAGGACCCCAAGGCTC;SOR=0.084;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=218694850;WS=218694832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	218694962	rs10165160	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=113;ReadPosRankSum=-2.499;SC=TGGTGAGAGGCAGCCCCCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=7;WE=218694970;WS=218694952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr2	218695102	rs3796028	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=703;ReadPosRankSum=-2.381;SC=GGCTGGATCCGTCTTCTGGTA;SOR=0.511;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=45;WE=218695110;WS=218695092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
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chr2	218750453	rs35040165	A	AG	1418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=1021;ReadPosRankSum=0.744;SC=CTTGACACAGAGGACAGCACT;SOR=0.527;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=29;WE=218750461;WS=218750443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr2	218758070	rs56217129	C	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.091;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=1.549;SC=CAGGTACACACAATCATCCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=218758078;WS=218758060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	218758123	rs141673800	GCA	GCACA,G	1070.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.902;NF=12,12;NR=19,19;PP=1067,55;ReadPosRankSum=1.925;SC=GTGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=31,31;WE=218758132;WS=218758113;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.75:57
chr2	218801767	rs4674232	C	T	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=35;PP=1057;SC=TTTTCCTCCCCGCAAAACTCC;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=218801775;WS=218801757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	219000310	rs2230054	C	T	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.062;NF=54;NR=45;PP=1829;ReadPosRankSum=0.651;SC=TCTTCCTGCTCTGCTGGCTGC;SOR=0.765;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=99;WE=219000318;WS=219000300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,101:0.53:189
chr2	219082119	rs2271541	G	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=604;ReadPosRankSum=0.055;SC=CAGCAGGGCCGCTCCCTCCGT;SOR=0.374;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=34;WE=219082127;WS=219082109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	219082330	rs12694432	A	G	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=57;PP=1429;ReadPosRankSum=0.126;SC=CTAATCCCCAATGTTGTCCAG;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=197;TCF=87;TCR=110;TR=99;WE=219082338;WS=219082320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,111:0.47:235
chr2	219093278	rs60528331	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=248;SC=GCAAAGAAACAAGTGCTCAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=219093286;WS=219093274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	219099260	rs1018288	G	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=566;SC=TTTCAACTCCGTCCATAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=219099268;WS=219099250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	219099484	rs10932765	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=420;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TAATTCTGCATACTACATATT;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=21;WE=219099492;WS=219099474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr2	219103580	rs10169718	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=644;ReadPosRankSum=-0.031;SC=CCATGTGAGTATAGAATTTGG;SOR=2.303;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=37;WE=219103588;WS=219103570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr2	219104316	rs34974153	AT	A	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.697;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.360;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	219117482	rs35271699	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GCTGCTGCCCGATTCCACAGC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=219117490;WS=219117472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	219128506	rs2292549	C	T	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=36;PP=1030;SC=CTGTCTCTACCGGGCCCCACT;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=219128514;WS=219128496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	219134864	rs147309598	TC	AA	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.039;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=1223;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGAGTCAGCTCTGCGCGACG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=26;WE=219134873;WS=219134854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr2	219138940	rs4791	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=524;ReadPosRankSum=0.101;SC=TAGACATAAACTTTATTACAT;SOR=0.945;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=36;WE=219138948;WS=219138930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr2	219139573	rs6734242	G	A	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=133;SC=TGCTCGTTCTGTTATCTGTCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=219139581;WS=219139563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	219140288	rs2292550	G	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=-1.114;SC=TGTAGTCCTCGGGGCTGATGG;SOR=0.889;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=34;WE=219140296;WS=219140278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr2	219142023	rs2168703	G	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=635;SC=TCCCTAGTGTGCCGGGGTCCG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=219142031;WS=219142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	219142491	rs2271543	C	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=1616;ReadPosRankSum=-1.968;SC=AGCTGGGGAACGCCACCAAGT;SOR=0.745;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=43;WE=219142500;WS=219142481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr2	219142492	rs2168704	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=1024;ReadPosRankSum=1.580;SC=GCTGGGGAACGCCACCAAGTT;SOR=0.867;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=30;WE=219142500;WS=219142481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr2	219142594	rs3817266	C	T	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1171;ReadPosRankSum=1.529;SC=GGTCCCCATCCCTTCCCTGGG;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=71;WE=219142602;WS=219142584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,85:0.59:144
chr2	219142773	rs6707559	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CAGAAGGAAGCGCTTGGCTCC;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=12;WE=219142781;WS=219142763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr2	219143229	rs2292551	G	A	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1351;ReadPosRankSum=1.344;SC=TTAAGTCTCTGGGACTCACCT;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=86;WE=219143237;WS=219143219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,101:0.50:202
chr2	219143327	rs2292552	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=910;ReadPosRankSum=0.267;SC=CAGGCCCAAATCTGCCCCGCT;SOR=0.555;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=55;WE=219143335;WS=219143317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
chr2	219144089	rs12987180	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=517;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GGACACAGACGGCCGGGCATG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=36;WE=219144097;WS=219144079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr2	219144149	rs12987219	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=160;ReadPosRankSum=1.417;SC=CCAGCCCCCAGTACTTTCCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=10;WE=219144157;WS=219144139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	219144815	rs2045435	T	C	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=80;PP=2645;SC=TATCACTCACTGCTCTCTCCT;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=74;TCR=80;TR=154;WE=219144823;WS=219144805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	219146607	rs7585702	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=146;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GGTGGCCTCATCTGCTCCAAG;SOR=1.356;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=12;WE=219146615;WS=219146597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr2	219146803	rs2292553	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.63;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CCCAGGGGGCGGAGGGCCTGG;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=219146811;WS=219146793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	219146868	rs2292554	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=0.414;SC=TGGACATGGCTGCTCACGGGC;SOR=0.991;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=4;WE=219146876;WS=219146858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	219146882	rs2292555	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.64;ReadPosRankSum=1.668;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	219153982	rs34353396	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=0.510;SC=GGTGGGGACCTGAAGTTCTTG;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=5;WE=219153991;WS=219153972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	219153983	rs10707182	GA	G	524.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=498;SC=GTGGGGACCTGAAGTTCTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=219153991;WS=219153972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	219187901	rs1870125	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=1.501;SC=ACGTCCAGAGCCGGCAGGCAG;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=219187909;WS=219187891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	219204417	.	A	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=0.079;SC=CACCAAAGGAATGGAGATGTG;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=219204425;WS=219204407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	219206435	rs62182085	C	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=533;ReadPosRankSum=0.223;SC=TCAGGGGTATCAGCAGGTGGA;SOR=0.264;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=32;WE=219206443;WS=219206425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr2	219206645	rs62182086	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TGGGATGGGGACAGGGATCAG;SOR=0.839;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=14;WE=219206653;WS=219206635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr2	219206919	rs3816562	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=308;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAGACAGAAGCCAGGGCAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=17;WE=219206927;WS=219206909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr2	219209393	rs1350336	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=11;PP=920;SC=CCTCCCCAAAACTCTGACCTC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=219209401;WS=219209383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	219221982	rs144807145	G	GTC	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=0.611;SC=AGAAAGTCCAGTCTCTCTCTC;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=6;WE=219221990;WS=219221972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr2	219227756	rs6723716	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=622;SC=CAGGTGGGAATGGGGCTTTCA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=219227764;WS=219227746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	219231807	rs3845833	C	T	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=38;PP=1209;SC=CCAAGATGCCCATCTTGAGGG;SOR=1.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=219231815;WS=219231797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	219232354	rs7608923	C	A	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=1930;SC=AAGGCTCCAGCGCCCCTTAGC;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=219232362;WS=219232344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	219254622	rs2695342	A	G	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=77;PP=2965;SC=CCCGCCGAGCAGACATCAGAG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=162;WE=219254630;WS=219254612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	219257688	rs2045433	T	C	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=36;PP=1500;SC=CACCAAGGAGTTCACCCCCAC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=219257696;WS=219257678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	219263277	rs2695344	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=14;PP=398;SC=CTTCTGGCAGACGCCGCTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=219263285;WS=219263267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	219265094	rs2579958	T	C	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=62;PP=2805;SC=GCGCTCCTGTTCGCTCGAGGT;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=145;WE=219265102;WS=219265084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr2	219265136	rs11463820	T	TC	7360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=91;PP=2965;SC=GAGAGGGAACTCTTCGGGGGT;SOR=0.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=3;TCR=95;TR=94;WE=219265144;WS=219265126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	219266204	rs2252235	T	C	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=23;PP=2414;SC=TCCTCCTGGCTCAGGGGTTCA;SOR=2.221;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=103;WE=219266212;WS=219266194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	219267781	rs2227255	C	T	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=36;PP=1994;SC=AGCGTCCTCACGTGGATGAGT;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=219267789;WS=219267771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	219267913	rs2227258	A	G	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=82;PP=2965;SC=ATGCAGCCCAATGAACCTGCG;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=161;WE=219267921;WS=219267903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	219288382	rs4672893	A	G	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1022;SC=TGCTCCCCCAAGCCCCTGAGC;SOR=4.461;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=219288390;WS=219288372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	219295835	rs4674307	G	A	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=45;PP=1329;SC=ACTTTGGGAGGCTGAGGCGGG;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=219295843;WS=219295825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	219305404	rs2305833	G	C	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=24;PP=1463;SC=AGGTAGCTGTGCACCAGCTAA;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=219305412;WS=219305394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	219319657	rs6436058	A	G	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=36;PP=1595;SC=TGTTCCTCACAAGGCCTGACG;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=219319665;WS=219319647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	219320207	.	C	A	528	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=22;NR=0;PP=528;QD=25.5805096612;SC=AACCAATCAACTGATGGAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=219320215;WS=219320197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	219321692	rs5838699	CA	C	583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=1;PP=383;SC=GACTGGATCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=23;WE=219321700;WS=219321682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	219339283	rs549026	T	C	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=5;PP=1151;SC=ATTTGGAGGTTATTTGTCACT;SOR=3.398;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=219339291;WS=219339273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	219353195	rs10932782	C	T	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=42;PP=1248;SC=ACACAAGAAACACAAATATAC;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=219353203;WS=219353185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	219362735	rs114092169	T	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=380;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GTAAGTACAGTACATAATGAT;SOR=0.699;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=23;WE=219362743;WS=219362725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr2	219433597	rs526897	G	A	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=4;PP=1462;SC=GCGGCTCATTGTTTTCCGCTG;SOR=4.548;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=58;WE=219433605;WS=219433587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	219433888	rs689116	C	A	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=45;PP=1361;SC=CCTTGCCGGACGCCTCTCGCG;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=219433896;WS=219433878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	219445860	rs34214861	GAA	G	1656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.02;NF=0;NR=25;PP=1080;SC=CTATGGAAAAGAAATGGGTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=219445869;WS=219445850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	219447912	rs2952825	A	G	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=64;PP=2606;SC=GAGAGAGAGAACGTTTGTGTG;SOR=1.814;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=25;TCR=74;TR=89;WE=219447929;WS=219447901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	219447916	.	TTGTG	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;QD=13.44;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,4:1.00:4
chr2	219447952	.	GTGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	G	1014	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=49.02;NF=2;NR=32;PP=1014;QD=29.9117647059;SC=GTGTGTGTGTGTGTGTCTCTC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=34;WE=219447985;WS=219447942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,34:0.87:39
chr2	219480804	rs485765	G	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=60;PP=1513;SC=CCTGGATAGTGGGGGGTGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=219480812;WS=219480794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	219487299	rs1850169	A	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.48;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	219492924	rs612874	T	C	4961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=83;PP=2499;SC=ACCAGCTTTGTGGCCAGAGCA;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=143;WE=219492932;WS=219492914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	219498759	rs7574429	T	G	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=34;PP=1884;SC=AGAGTAGGCATGGTCCTTGGG;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=88;WE=219498767;WS=219498749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	219501133	rs2278530	G	A	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=74;PP=2965;SC=AGCCCCTTTGGCCCCTGGCCA;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=155;WE=219501141;WS=219501123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	219501328	rs1055816	G	A	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=43;PP=1233;SC=AAGGGTTGGTGTGCTGGCTTT;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=219501336;WS=219501318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	219508988	rs3770214	T	C	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=54;PP=2081;SC=TCTTCAGCACTCAAGTCAGAA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=93;WE=219508996;WS=219508978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	219509618	rs2230115	C	A	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=97;PP=2965;SC=TAGAGTGGGGCCGGTGTGCCA;SOR=0.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=74;TCR=97;TR=171;WE=219509626;WS=219509608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	219513675	rs146514201	C	T	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=55;ReadPosRankSum=3.270;SC=TGAGTGATGGCGGCACTCCAC;SOR=0.759;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=205;TCF=94;TCR=111;TR=98;WE=219513683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,132:0.53:251
chr2	219517088	rs4674323	T	C	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=1037;SC=TAGGAGTTAGTTACTAGTAGA;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=219517096;WS=219517078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	219525582	rs6722185	A	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=399;SC=CCACACAGTAATGCTGACCTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=219525590;WS=219525572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	219527108	rs200147929	A	AC	893.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=703;ReadPosRankSum=1.171;SC=AACGTGTGGAACATCAGGGTG;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=19;WE=219527116;WS=219527098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr2	219689522	rs72966064	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	219691566	rs1467320	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=263;SC=GGATGGCATGAGAAACCCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=219691574;WS=219691556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	219692527	rs11385903	G	GC	2128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=1663;SC=ATCACCAACAGCCCTTTCCGG;SOR=1.078;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=41;WE=219692535;WS=219692517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	219692790	rs5838710	A	AG	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=41;PP=1827;SC=GCATCCCTGCAGGGAGGGGCG;SOR=1.685;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=43;WE=219692798;WS=219692780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr2	219746827	rs10180544	T	C	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=734;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TGTTGTTAGATGGGGCTCTCC;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=57;WE=219746835;WS=219746817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
chr2	219824731	rs78141300	G	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TCATCTCGGCGCTCACCTGGA;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=67;WE=219824739;WS=219824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,80:0.56:142
chr2	219824992	rs75803206	G	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=379;ReadPosRankSum=0.333;SC=CGCCGGGCTCGGGCGGGGGAA;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=19;WE=219825000;WS=219824982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	219825661	rs34430748	C	T	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=914;ReadPosRankSum=-0.155;SC=ACCCAGGGGCCGCGCCCATCC;SOR=0.517;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=61;WE=219825669;WS=219825651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,81:0.58:140
chr2	219903258	rs6736922	T	G	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=834;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GTGAGCATCATGTCCTTGGGA;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=52;WE=219903266;WS=219903248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
chr2	219903723	rs4674354	C	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=466;ReadPosRankSum=-1.080;SC=ATGGATTCTCCACCTTCTGGG;SOR=1.009;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=27;WE=219903731;WS=219903713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr2	219903787	rs4672910	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=0.731;SC=AATAAATCAATCAAAGCATAA;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=19;WE=219903795;WS=219903777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr2	219906066	rs11674400	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.775;SC=AAGACTCAGTCCCATGGGGCT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=219906074;WS=219906065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	219906367	rs16859497	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=616;ReadPosRankSum=1.491;SC=GATTCCCTGACTTTTCCTGCT;SOR=0.833;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=36;WE=219906375;WS=219906357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr2	219920037	rs394452	A	G	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=1084;ReadPosRankSum=-1.979;SC=CCTCCCCCGGAGTCCAGCTGC;SOR=0.705;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=59;WE=219920045;WS=219920027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
chr2	219920412	rs3731881	A	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TCAGCCTGTGAGGCTCGCGGT;SOR=0.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=79;WE=219920420;WS=219920402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,89:0.47:190
chr2	219922073	rs34694069	G	GC	775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=668;ReadPosRankSum=1.422;SC=CCCCGGGCGGGCTCTTCACCT;SOR=0.111;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=17;WE=219922081;WS=219922063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr2	219923410	rs71974827	G	GAGA	1586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=943;ReadPosRankSum=0.190;SC=AGCTGACTCTGAGAAGAAGCT;SOR=0.461;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=22;WE=219923418;WS=219923400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr2	219941063	rs897477	G	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=260;ReadPosRankSum=-1.063;SC=CTTGGAAGCTGTTCTCCAAGT;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=17;WE=219941071;WS=219941053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr2	220012576	rs7585742	G	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=0.554;SC=TTCCAATTCAGTATTAGGTAC;SOR=0.320;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=21;WE=220012584;WS=220012566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr2	220022176	rs6436120	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=398;SC=CCCAACCCCACATTCGAATTA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=220022184;WS=220022166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	220022435	rs2030452	G	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=231;ReadPosRankSum=0.816;SC=TACAGAGTAAGGGTGCTAAAA;SOR=0.299;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=19;WE=220022443;WS=220022425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr2	220028900	rs6753739	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=551;ReadPosRankSum=0.563;SC=AGAACTGATCAGGCCACACTG;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=34;WE=220028908;WS=220028890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr2	220033734	.	C	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=564;ReadPosRankSum=1.693;SC=TATCCCTTCTCACCTCCAGAT;SOR=0.557;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=33;WE=220033742;WS=220033724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr2	220033830	rs3795986	A	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=863;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GGAGGCTAGGAAAAGTTTGGG;SOR=1.278;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=39;WE=220033838;WS=220033820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr2	220033956	rs6436121	T	C	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=5;PP=185;SC=ATCTCAATTCTGCACCCACCT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=220033964;WS=220033946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	220037393	rs4674361	A	G	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=52;PP=2218;SC=AAGTGAAAGGAGCACCGGGCT;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=220037401;WS=220037383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	220037666	rs1127102	A	G	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=42;PP=1851;SC=GACATTAGCGAGAGACGGCAG;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=92;WE=220037674;WS=220037656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr2	220040330	rs1127101	A	G	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=55;PP=1943;SC=CATGAGCTACATATTTCTTCT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=220040338;WS=220040320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
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chr2	220041455	rs6436125	C	T	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=14;PP=1266;SC=GCCGGGAGGCCGGGGAGGGGG;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=220041463;WS=220041445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	220045035	rs7577690	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=296;ReadPosRankSum=0.609;SC=GGGGATGGGAGTGGAGTGATA;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=21;WE=220045043;WS=220045025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	220046349	rs2272017	G	C	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=1101;ReadPosRankSum=0.641;SC=GTTCATCCTGGTTCTCCTGCC;SOR=0.630;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=74;WE=220046357;WS=220046339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr2	220046975	rs3731900	C	A	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1294;ReadPosRankSum=-2.351;SC=GGGTCCCCCCCAGATGGAGTG;SOR=0.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=71;TCR=95;TR=75;WE=220046983;WS=220046965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr2	220047393	rs3731901	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.184;SC=GTAGGGCTTCCTGGCTAGGAG;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=11;WE=220047401;WS=220047383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	220071803	rs6714820	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=267;ReadPosRankSum=0.305;SC=GCCCAGCGGACAGGGACTTTG;SOR=0.179;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=17;WE=220071811;WS=220071793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr2	220071879	rs66491679	TG	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=1.113;SC=GGCTTGAAGCTGGGGGGGGGT;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=220071887;WS=220071869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	220072766	rs4674366	G	T	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=920;SC=GCAGGGTAATGGCAGCCAAGT;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=220072774;WS=220072756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	220072852	rs4674367	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=429;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGCTTCAACCCTACCCTGTCG;SOR=1.098;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=22;WE=220072860;WS=220072842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr2	220078496	rs2139823	T	C	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=36;PP=1992;SC=GACACAGGCCTCAGGCCCCCT;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=95;WE=220078504;WS=220078486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	220082365	.	C	CA	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=1.571;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.070;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	220083276	.	C	T	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=2620;ReadPosRankSum=-0.234;SC=AGGCCAGAGTCCCCAGAGCCA;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=68;WE=220083287;WS=220083266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,90:0.62:146
chr2	220083279	rs1109866	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CCAGAGTCCCCAGAGCCATCC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=49;WE=220083287;WS=220083266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,54:0.38:143
chr2	220083365	.	C	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=476;ReadPosRankSum=0.083;SC=ACGGGCCCTTCGGCCTCGCAG;SOR=1.015;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=30;WE=220083373;WS=220083355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr2	220085845	rs2276633	A	G	6629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=106;PP=2965;SC=CATGCAGGGCAGTGGTCTCAG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=89;TCR=106;TR=195;WE=220085853;WS=220085835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr2	220087354	rs72955435	A	C	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TCTCCCAGTCACCAGGAACAC;SOR=0.931;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=62;WE=220087362;WS=220087344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,67:0.48:140
chr2	220087441	rs2276635	T	C	2957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=1857;ReadPosRankSum=-1.186;SC=TGGGCGAGGCTAGCAGCTGCT;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=207;TCF=110;TCR=97;TR=114;WE=220087449;WS=220087431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,136:0.54:252
chr2	220088248	rs908196	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.835;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=-1.494;SC=CGGTTTTCCCAAAGACACTGT;SOR=0.027;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=220088256;WS=220088238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	220089590	rs3216709	T	TG	869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=714;ReadPosRankSum=1.423;SC=CGGGGTGGGGTGGGGAAGAGA;SOR=1.360;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=21;WE=220089598;WS=220089580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	220089685	rs2276637	G	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=595;SC=TTAAGAGACAGTTCCTGATTT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=220089693;WS=220089675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	220090147	rs55842930	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=651;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CACTACAGACTTGAGCAGGCA;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=38;WE=220090155;WS=220090137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr2	220091765	rs72955440	A	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=316;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TAGCTGTGTGACTTTACCAAG;SOR=0.960;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=21;WE=220091773;WS=220091755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	220096903	rs3817424	A	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=667;ReadPosRankSum=-0.398;SC=TTCCTAGAATACTATAACTGG;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=34;WE=220096911;WS=220096893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr2	220098287	rs72955447	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=-0.113;SC=AAAGGTAGATGAGGGATTCCC;SOR=0.153;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=220098295;WS=220098277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	220100683	rs2293078	C	G	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1802;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CTCTTGGGTGCCCTACTCGCC;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=106;WE=220100704;WS=220100673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,124:0.50:250
chr2	220100922	rs56927225	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=634;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TGGTTGAGGGAATTTGGGATG;SOR=1.065;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=30;WE=220100930;WS=220100912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr2	220101783	rs72955452	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=554;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CCACCATGCCCGGCCTACCTT;SOR=0.573;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=31;WE=220101791;WS=220101773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	220108300	rs11552796	T	C	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=2.174;SC=AGCCATGGCGTTTACAGCGCT;SOR=0.769;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=37;WE=220108308;WS=220108290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
chr2	220113242	rs7601549	T	G	5995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=101;PP=2965;SC=TGGAGGCGCTTCAGCCCCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=71;TCR=101;TR=172;WE=220113250;WS=220113232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr2	220113384	rs8447	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=0.306;SC=CTTACACTTGGGGGTAGCGGG;SOR=0.160;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=220113392;WS=220113374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	220116509	rs45488900	G	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=-0.130;SC=GTGGCCAGATGCATGGAAGGA;SOR=0.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=29;WE=220116517;WS=220116499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr2	220117458	rs1024131	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=267;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATCCCATCTGGCTCCTCTCCC;SOR=0.870;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=22;WE=220117466;WS=220117448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr2	220118076	.	C	CGG	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=6.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=2.576;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.959;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
chr2	220118531	rs939574	G	C	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=579;ReadPosRankSum=0.421;SC=CCCCAAAGGAGAGGGGCAATT;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=43;WE=220118539;WS=220118509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,52:0.40:130
chr2	220135208	rs2891733	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=0.988;SC=GCACTCTGATCGGGGGGCCAA;SOR=0.663;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=17;WE=220135216;WS=220135198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr2	220136155	rs7594971	T	C	6846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=110;PP=2965;SC=CATCTGCCACTGCAACCTAGA;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=135;TCR=110;TR=245;WE=220136163;WS=220136145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr2	220136351	rs3731892	G	A	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.630;NF=43;NR=55;PP=1760;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CTGCAGAAAAGGTATACCACG;SOR=0.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=188;TCF=81;TCR=107;TR=98;WE=220136359;WS=220136341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,108:0.51:212
chr2	220136371	rs3731894	T	C	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.393;NF=46;NR=56;PP=1465;ReadPosRankSum=-1.682;SC=GAGCAGCTGTTGGTGGCAGAG;SOR=0.790;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=193;TCF=88;TCR=105;TR=102;WE=220136379;WS=220136361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,116:0.52:222
chr2	220145286	rs2276638	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=370;ReadPosRankSum=0.353;SC=CTCCTCTGCACCCACTTTCTG;SOR=0.703;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=21;WE=220145294;WS=220145276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr2	220146402	rs3731896	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=815;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GGAGCCCATCCCAGAGGGAGG;SOR=0.538;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=52;WE=220146410;WS=220146392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr2	220146609	rs3832110	C	CG	339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=0.339;SC=TGAGGTCCCCCGCTCAGGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=9;WE=220146617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	220146651	rs3731897	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=319;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TCCTCATCCTGCCTTTCCAGG;SOR=1.159;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=21;WE=220146659;WS=220146641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr2	220147732	rs2276639	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=554;ReadPosRankSum=1.985;SC=CCAAGCCTGTCTCCTGTGTTG;SOR=0.526;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=27;WE=220147740;WS=220147722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr2	220150567	rs72955484	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TAGGAGGGGACTGCACCCATA;SOR=0.036;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=220150575;WS=220150557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	220168607	rs2271593	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.15;ReadPosRankSum=-2.539;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr2	220168616	rs2271594	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.973;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr2	220194247	rs3832109	A	AATT	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGGACCTCTGAATTCTCACAG;SOR=0.138;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=220194255;WS=220194237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr2	220195446	rs6707009	C	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TTCCCCCCTCCCCATCTCTAA;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=10;WE=220195454;WS=220195436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr2	220197207	rs2048737	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CAGGATCGCTTTCTTGGCCCT;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=220197215;WS=220197197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	220197321	rs2385405	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=-1.852;SC=TGGAGCCCCTCGGAGCTCCCA;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=46;WE=220197329;WS=220197311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr2	220197388	rs2385404	C	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=765;ReadPosRankSum=0.950;SC=CCGGCCAAGTCTCAGTGAAGG;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=55;WE=220197396;WS=220197378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
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chr2	220197492	rs2385402	C	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=554;ReadPosRankSum=0.542;SC=TTCAGCCAATCGTGAGCGGGC;SOR=0.876;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=40;WE=220197500;WS=220197482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr2	220197835	rs139479208	ATAATATTATATATTAT	A	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=2.148;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	220239534	rs3731904	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=676;SC=GCACTAGAGGGGAAGCAGCCC;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=220239542;WS=220239524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	220239561	rs3731905	C	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=14;PP=1048;SC=CAGAGAGGGTCTGGGGTGGGT;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=220239569;WS=220239551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	220246218	rs6436148	T	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=55;PP=2325;SC=GAGTCGGCGCTCGGAACAGCC;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=119;WE=220246226;WS=220246208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	220249299	rs5838737	C	CT	1315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.469;NF=0;NR=45;PP=1066;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTTGTTTTTTCTTTTTTTTGA;SOR=2.342;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=45;WE=220249307;WS=220249289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,49:0.96:51
chr2	220249329	rs2002892	C	T	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=671;SC=TCGCTCTTGTCGCCCAGTCTG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=220249337;WS=220249319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	220250147	rs907679	A	G	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=33;PP=1558;SC=AGTCCTCACCACAGGCTGGGT;SOR=1.130;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=220250155;WS=220250137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	220250322	rs878437	C	A	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=84;PP=2954;SC=GGGACTCTGCCGCCCTCCCCA;SOR=0.926;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=64;TCR=84;TR=148;WE=220250330;WS=220250312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	220250826	rs2271456	G	A	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=41;PP=1321;SC=GGGCACTGCAGCCAGCCAGGC;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=220250834;WS=220250816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	220250897	rs11352428	AG	A	558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=544;SC=CAGACTAAGCAGGGTGGTCCT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=220250905;WS=220250887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	220251178	rs2271457	T	C	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=50;PP=1446;SC=CATGACGATATGTGGAGATGA;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=87;WE=220251186;WS=220251168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	220251208	rs1040009	T	C	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=42;PP=1447;SC=TACTCATAAGTAACAGACAGC;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=76;WE=220251216;WS=220251198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	220252287	rs138394024	CTCG	C	2192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=16;PP=1508;SC=TGACTCCTCTCTCGCACCCAC;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=220252297;WS=220252277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	220264412	rs13018645	A	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=1228;SC=GATGAGTATTATTCTGTTAAG;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=220264420;WS=220264402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	220264543	rs58721028	C	CAT	5303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=2965;SC=TGCCTAGGAACGTGTCTGCAC;SOR=1.034;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=68;WE=220264551;WS=220264533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	220283259	rs1318299	A	G	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=77;NR=65;PP=2600;SC=CGGGCTTCCCACTCGGCTCCC;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=142;WE=220283267;WS=220283249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	220283277	rs2017800	T	C	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=69;PP=2965;SC=CCCCGCTGAGTTCGCCCGTGT;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=220283285;WS=220283267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	220283826	rs907677	T	G	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=65;PP=2053;SC=AGGCCTGGGGTCTGGGGTCCC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=112;WE=220283834;WS=220283816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	220284779	rs12991025	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=14;PP=1093;SC=CCAGCTTTATCACCCGCAACT;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=220284787;WS=220284769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	220306413	rs4674398	G	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=785;SC=CATGTGCCTAGGGCTCCGGAG;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=220306421;WS=220306403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	220308581	rs10932805	A	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=2;PP=452;SC=GGGGGTCCCCAGTGCTGGGCA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=220308589;WS=220308571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	220315970	rs10932806	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=546;ReadPosRankSum=0.251;SC=TGCTGCTCAAGTGTATCATCA;SOR=1.596;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=34;WE=220315978;WS=220315960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr2	220316579	rs4674399	C	T	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=31;PP=879;SC=CCGTGACTCTCCCCTGGCCCA;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=220316587;WS=220316569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	220330642	.	TGTGCGCGC	T	686.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.83;MQRankSum=2.475;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.404;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr2	220330644	.	TGCGCGCGTGTGC	T	1453	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=23;MQ=61.2;NF=16;NR=4;PP=1453;QD=73.55;SC=CGTGTGTGTGTGCGCGCGTGT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=20;WE=220330669;WS=220330634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,20:0.47:43
chr2	220330646	rs1976618	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.272;NF=13;NR=3;PP=1230;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGTGTGC;SOR=0.263;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=16;WE=220330669;WS=220330634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr2	220330657	rs68012340	GTGCA	G	685.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.66;MQRankSum=2.791;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.671;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr2	220330661	rs1976617	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.702;NF=46;NR=6;PP=1142;ReadPosRankSum=-1.500;SC=GTGTGCGTGCACGTGTGCGTG;SOR=0.368;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=52;WE=220330669;WS=220330634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr2	220330724	rs1567488	C	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.39;MQRankSum=-2.467;NF=42;NR=25;PP=893;ReadPosRankSum=0.325;SC=CGCGTGCGTGCGCGTATGCTG;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=67;WE=220330732;WS=220330714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr2	220330804	rs1567487	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=719;ReadPosRankSum=-2.747;SC=GGGCCACCTGTGCTCCCCCCG;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=59;WE=220330814;WS=220330794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,84:0.47:179
chr2	220333642	rs148131894	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=808;ReadPosRankSum=-2.073;SC=TGCACTCACTGCACATTGCCC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=157;TCF=76;TCR=81;TR=65;WE=220333650;WS=220333632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,64:0.37:172
chr2	220333950	rs10167209	T	C	3892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=55;PP=2244;SC=TGTCCATTCCTGACTTCCTGC;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=220333958;WS=220333940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	220337196	rs1039897	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=462;SC=AGCTTTGCCCGTCTTCTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=220337204;WS=220337186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	220341935	rs201853159	A	AG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.52;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	220341937	.	G	GGCGGGGCCTGGTACAGCGGC	1503	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=1503;QD=306.0;SC=AGGAGATGAGGCCCTGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=220341946;WS=220341927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr2	220341938	.	C	T	90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=90;QD=31.1928031368;SC=GGAGATGAGGCCCTGGCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=4;WE=220341946;WS=220341927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,4:0.21:19
chr2	220341938	.	C	CGGGGCCTGGTACAGCGGCT	1170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=68.87;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	220346596	rs3731906	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=251;SC=GAAACAGGCTCTAATCAGTGA;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=220346604;WS=220346586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	220353013	rs875098	G	A	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1143;ReadPosRankSum=2.390;SC=GCCCTGCACCGCACATCTCCT;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=65;WE=220353021;WS=220353003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr2	220353104	rs875097	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=809;ReadPosRankSum=0.037;SC=GGGAGGGGCTAGGCCGGAGTG;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=44;WE=220353112;WS=220353094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr2	220353440	rs62191888	G	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=780;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GTGGGACAGGGCTTGAGGGGT;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=44;WE=220353448;WS=220353430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,50:0.42:118
chr2	220353532	rs13026308	C	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=746;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TCCAGAGGTACCCCAGACCTA;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=54;WE=220353540;WS=220353522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr2	220354108	rs55760516	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=2.055;SC=TGTCACCTCAAGGCCAGCCAG;SOR=0.785;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=22;WE=220354116;WS=220354098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr2	220354365	rs56132883	C	T	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.930;SC=CCAAGCCTTTCGTCCTTGACA;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=103;TCR=117;TR=101;WE=220354385;WS=220354355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,116:0.43:270
chr2	220354757	rs6742231	G	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.839;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=235;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TCCTGGCTGGGGTGGGGGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=15;WE=220354765;WS=220354747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr2	220355529	rs12464085	A	G	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1547;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CTCCACGGCCACCACGTGCTC;SOR=0.723;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=209;TCF=106;TCR=103;TR=102;WE=220355537;WS=220355519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,116:0.47:249
chr2	220356449	rs6747041	G	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=650;ReadPosRankSum=-0.248;SC=AGCACCCAGGGACCTCCCCCG;SOR=1.931;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=34;WE=220356457;WS=220356439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr2	220356520	rs12473286	G	T	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1121;ReadPosRankSum=1.274;SC=TGTCAGCTCCGGAGATGGTGA;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=78;WE=220356528;WS=220356510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,86:0.49:177
chr2	220356806	rs907146	C	T	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=92;PP=2965;SC=GGTCTGCATACGTCAATCAAG;SOR=0.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=120;TCR=92;TR=212;WE=220356814;WS=220356796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr2	220357594	rs1078212	C	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=191;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CTGAGCCAGGCGGGCCTGGGG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=10;WE=220357602;WS=220357590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	220358198	rs1050816	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr2	220361265	rs2385541	A	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=254;SC=ACTCTTGAGTAGGGTTTGAGT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=220361273;WS=220361255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	220361486	rs2010592	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GGCTGTGGCCGGGCCTGTCTT;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=14;WE=220361494;WS=220361479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr2	220361520	rs16859986	C	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=514;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CCTGACTCGGCCCGCGGGTAG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=27;WE=220361528;WS=220361510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr2	220362283	rs2010528	C	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=1.560;SC=GTCCCTTTAACAGCCAAGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=11;WE=220362291;WS=220362273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr2	220362899	rs2029251	C	G	6094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=111;PP=2965;SC=TCGCTCGCGTCGACGTGGCCT;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=79;TCR=111;TR=190;WE=220362907;WS=220362889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	220366953	rs2385539	G	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=322;ReadPosRankSum=0.564;SC=AAGTAGGGAGGGGGAGGGCAG;SOR=0.263;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=18;WE=220366961;WS=220366943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr2	220371181	rs10932808	T	A	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=42;PP=1279;SC=GGGGAACCCCTCAGCTGATGG;SOR=1.394;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=220371189;WS=220371171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	220379560	rs3731909	C	G	3344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=73;PP=2208;ReadPosRankSum=0.856;SC=CTGGAGCAGCCCCCCGAGACC;SOR=0.578;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=284;TCF=134;TCR=150;TR=143;WE=220379568;WS=220379550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,159:0.50:316
chr2	220380125	rs1872858	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=0.441;SC=TCCTCAACAGGGCTTCCCTTC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=15;WE=220380133;WS=220380115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	220397811	rs6731344	T	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=598;SC=TCAGTGGGGTTGGGGAGAGGT;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=220397833;WS=220397801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	220397825	rs6716083	C	T	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=654;SC=GAGAGGTCTGCGGACCTCTGC;SOR=2.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=29;WE=220397833;WS=220397801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	220402624	rs11689270	G	T	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=11;PP=929;SC=GAGCTCTCCCGGTCCCACTCT;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=220402632;WS=220402614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	220402671	rs11689281	G	T	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.24;SOR=2.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	220402680	rs11695248	T	C	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.02;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	220404381	rs1976616	A	G	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=80;PP=2766;SC=GGGCTGCCACATAGTCGGAGT;SOR=0.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=141;WE=220404389;WS=220404371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	220405321	rs6436155	T	C	4377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=66;PP=2490;SC=AGCAGCTGCCTGGTCCCCATC;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=147;WE=220405329;WS=220405311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	220406239	rs13004994	T	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.39;SOR=1.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	220406239	.	TG	GA,GG	519	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=15,37;NR=8,16;PP=294,519;QD=15.1072989071;SC=ATGTCCGAATTGGCATGGAAA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=23,53;WE=220406248;WS=220406229;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:58
chr2	220406240	.	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.965;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr2	220406722	rs3731912	T	C	7146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=124;PP=2965;SC=GCTCCTCGCCTAGCGTCACCA;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=109;TCR=124;TR=233;WE=220406730;WS=220406712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr2	220406944	rs7581251	G	A	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=402;SC=CTTATCAAAAGGACAACGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=220406952;WS=220406934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	220412256	rs8179770	T	C	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=43;PP=1881;SC=CAGTGCTCTTTCTCACTGGGT;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=220412264;WS=220412246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	220413661	rs12996466	C	T	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=887;SC=AGCCTAGCAACCTTCCATAAA;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=220413669;WS=220413651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	220414016	rs6436156	C	T	4397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=94;PP=2956;SC=GGCCACCAGACCCTGCTTATC;SOR=1.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=51;TCR=94;TR=145;WE=220414024;WS=220414006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	220415717	rs3731918	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=436;SC=CTTGGCGGCAGGAAGGTGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=220415725;WS=220415707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	220415752	rs6745782	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=10;PP=337;SC=GGGCACAGCGCGGCACCTGAA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=220415760;WS=220415742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	220416164	rs6761575	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=85;SC=CACCCCAAGTTCTGGAAAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=220416172;WS=220416163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	220416570	rs4672931	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=727;SC=GCATGGCCCCCAGGAGGAGAG;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=220416578;WS=220416560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	220416591	rs4672932	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=652;SC=ATGCATCTTCCCTCCCTGAAG;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=220416599;WS=220416581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	220416803	rs4672933	A	T	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=54;PP=2284;SC=CAGGATGTACACTCTCTGTCG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=220416811;WS=220416793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	220416967	rs4672934	C	T	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=17;PP=529;SC=CTAGCGAGGCCGGAGCCACCT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=220416975;WS=220416957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	220417364	rs181520135	G	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=752;ReadPosRankSum=0.778;SC=ACGTAGCGCCGTCGCCTTCGC;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=45;WE=220417372;WS=220417354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr2	220419236	rs10932813	T	C	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=41;PP=1662;SC=GGGAATCCGCTGTGAAGGAGA;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=95;WE=220419244;WS=220419226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	220419339	rs10932814	T	C	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=71;PP=2061;SC=TGGATACAGCTGTACTCCACC;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=130;WE=220419347;WS=220419329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	220420956	rs10932816	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.004;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=681;ReadPosRankSum=2.076;SC=CGAGACACACATCCTGGCCTT;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=220420964;WS=220420946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr2	220421417	rs1983210	C	G	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=103;PP=2965;SC=GTGGTGTCAGCTCCGAGACCA;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=56;TCR=103;TR=159;WE=220421425;WS=220421407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	220423243	.	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.479;SC=CTGCCTCACCCGCCAGATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=220423251;WS=220423233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	220427996	rs11904583	T	C	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=689;SC=AACAGTGGCCTGGGAGTGAAG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=220428004;WS=220427992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	220428381	rs2303543	A	T	5818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=105;PP=2965;SC=CATTGCACAGACACCCCCGCA;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=71;TCR=106;TR=176;WE=220428389;WS=220428371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr2	220430203	rs1039898	C	T	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=65;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CAACGACACCCTGTCCTGGGG;SOR=0.534;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=211;TCF=82;TCR=129;TR=109;WE=220430211;WS=220430193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,130:0.54:240
chr2	220431458	rs62191614	A	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-1.691;SC=CCTGGCCCAGATACAAGAAAT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=220431466;WS=220431454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	220431631	rs1043537	G	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=690;ReadPosRankSum=-1.179;SC=GGTGCTTGACGGCATGCAGGA;SOR=1.360;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=38;WE=220431639;WS=220431621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr2	220431919	rs4674412	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=17;PP=905;SC=GCGGATGGCAAGCCTGTGAGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=220431927;WS=220431909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	220432014	rs61732787	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=385;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CAGAACCGTGGAACACCACGT;SOR=0.196;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=21;WE=220432022;WS=220432004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr2	220433113	rs12623922	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=0.869;SC=GTAGGATACCTAGAAGCGCAT;SOR=2.000;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=12;WE=220433121;WS=220433103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	220435034	rs10180675	A	G	6477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=600;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=0.368;SC=CCTGGCAGTAAAGCACCTTGA;SOR=0.696;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=482;TCF=264;TCR=218;TR=239;WE=220435042;WS=220435024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:295,302:0.51:597
chr2	220439474	rs36032184	C	T	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=1111;ReadPosRankSum=1.579;SC=CTGAGGAGGGCCTCTTCAGAT;SOR=0.540;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=79;WE=220439482;WS=220439464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,90:0.55:165
chr2	220462640	rs681747	G	T	6017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=79;PP=2965;SC=CAGACGGGGAGGTTCGGTATG;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=104;TCR=79;TR=183;WE=220462648;WS=220462630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr2	220466199	rs620698	G	T	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=26;PP=1260;SC=TGTGCAAGGAGCCCAAGAGAA;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=220466207;WS=220466189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	220466344	.	G	GT	219	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=62.07;NF=11;NR=4;PP=219;QD=14.8;SC=AGTAAATTGAGTTTTTTTTTT;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=15;WE=220466352;WS=220466334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,15:0.41:37
chr2	220471116	rs633200	C	G	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=53;PP=1879;SC=GGACCTGGACCCTGCTTACTG;SOR=0.844;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=99;WE=220471124;WS=220471106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	220476443	rs627530	C	T	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=62;PP=2830;SC=CCTTCTCCGTCTGCCAGCCCT;SOR=0.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=77;TCR=62;TR=139;WE=220476451;WS=220476433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	220476645	rs581547	T	C	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=85;PP=2944;SC=GGGGCTGCCATGGGCAGGCTG;SOR=0.890;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=154;WE=220476653;WS=220476635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	220479312	rs624773	T	C	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=41;PP=1664;SC=CTCTGTACCCTACCTTGTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=220479320;WS=220479302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	220480639	rs640807	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=30;PP=765;SC=GGGAGTGACATGGGCCTGGGG;SOR=1.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=220480647;WS=220480629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	220480693	rs665845	G	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=16;PP=844;SC=TGAGGCCTTCGCAGAGACCTC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=220480701;WS=220480683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	220494118	rs597306	A	C	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=40;PP=1767;SC=GAGCCCCCCCACTCAGGGACC;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=220494126;WS=220494108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	220495167	rs612078	A	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=650;SC=GTCCCCTGCTAAGGGCTGAGT;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=220495175;WS=220495157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	220500423	rs589767	A	G	7448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	220500426	rs639214	A	G	7572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	220502137	rs621515	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=312;SC=TGTGTGTGTTCTGTGTGTTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=220502145;WS=220502127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	220502367	rs635311	A	C	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=81;PP=2965;SC=GGGTCCCTGGATGCTGGTCTG;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=155;WE=220502375;WS=220502357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	220505265	rs684428	T	C	9016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=132;NR=130;PP=2965;SC=GTCCCAGCGTTTGTTGCTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=132;TCR=130;TR=262;WE=220505273;WS=220505255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr2	220586367	rs368069746	AAG	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=49;ReadPosRankSum=1.067;SC=CATCTAGAAAAAGAGAGAGAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=2;WE=220586376;WS=220586357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr2	220771223	rs4674470	C	T	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=62;PP=2028;SC=AAGATGCCCCCAGGTGACATC;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=100;WE=220771231;WS=220771213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	220771290	rs4674471	G	A	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=32;PP=915;SC=TGTGCATTTTGCCAGGGAAAC;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=42;WE=220771298;WS=220771280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	220771310	rs4674472	A	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=25;PP=761;SC=CCAGAGTTGCACGATTTCTAT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=220771318;WS=220771300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	220771378	rs4674473	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=302;SC=GCATATGTGTATGGCATGCCT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=220771386;WS=220771368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	222290902	rs2303901	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AAGAAGTCACAGGGACTGACA;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=23;WE=222290910;WS=222290892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr2	222301357	rs3213844	T	C	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=975;ReadPosRankSum=-0.766;SC=AGGAACAATCTCATTAGCATT;SOR=0.442;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=60;WE=222301365;WS=222301347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr2	222301713	rs2303900	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.288;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=908;ReadPosRankSum=-1.174;SC=ACACAACAAACACAAGGACTC;SOR=1.339;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=50;WE=222301721;WS=222301703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr2	222301912	rs2303897	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=685;ReadPosRankSum=0.980;SC=AAATGGGCTGCGCACAATTTT;SOR=1.797;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=38;WE=222301920;WS=222301902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr2	222307534	rs2288628	G	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.587;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=613;ReadPosRankSum=-0.835;SC=TTTGTAAAGGGGGTGACCCAC;SOR=1.385;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=40;WE=222307542;WS=222307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr2	222307778	rs67269206	CAAGATGA	C	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=0.135;SC=GAAACACATTCAAGATGAAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=222307792;WS=222307768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	222320427	rs2288627	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=723;ReadPosRankSum=-1.511;SC=GTCTTAGGAGGTAGAACTTCT;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=47;WE=222320435;WS=222320417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr2	222321225	rs6718949	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-1.235;SC=AGCAAAATGTCTGCTGAACCA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=222321233;WS=222321215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	222431521	rs35574019	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr2	222431574	.	G	GAGAAGA	532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;QD=38.05;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	222431671	rs200402394	A	G	180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.42;QD=18.08;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	222434898	rs11687492	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.044;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=354;ReadPosRankSum=1.248;SC=GGAAACGTGATGGGAATAGAA;SOR=0.386;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=31;WE=222434906;WS=222434888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr2	222435035	rs200647532	TCC	T	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.180;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	222435048	rs2710504	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	222437136	rs11381414	A	AG	471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=11;PP=455;SC=AGGGCGGCCGAGCCCCGCCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=222437144;WS=222437126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	223065870	rs3731858	C	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1112;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GAAACCATTGCCTTAAAATGT;SOR=0.763;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=67;WE=223065878;WS=223065860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr2	223066017	rs199895781	A	AC	795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=60.21;MQRankSum=1.680;NF=7;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CCACTGCCCCACCCCCCCCAA;SOR=0.572;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=26;WE=223066025;WS=223066007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr2	223161624	rs12694578	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GTCAGCCGTTACCCCCCGCCC;SOR=0.859;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=223161632;WS=223161614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	223161889	rs12623857	A	G	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=39;PP=1490;SC=TGATAAAAACACCGCCGAGCT;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=223161897;WS=223161879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	223162024	rs6754024	T	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=440;SC=CAGTCTTCTGTCCTATCCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=223162032;WS=223162014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	223423362	rs4674664	A	G	7416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=115;PP=2965;SC=ACATCCCACCACTCACCACCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=115;TCR=115;TR=230;WE=223423370;WS=223423352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
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chr2	223436607	rs7185	C	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=18;PP=804;SC=AAGGGTCCAACATTGATTTCT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=223436615;WS=223436597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr2	223785504	rs6739824	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.993;SC=GCCACTTGACTATTGTTTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=3;WE=223785512;WS=223785494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr2	223785846	rs6728234	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.789;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=557;ReadPosRankSum=0.204;SC=GACTTGATCTGTTTTGTTGAT;SOR=2.027;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=27;WE=223785854;WS=223785836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr2	223787559	rs11891410	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=0.839;SC=GGTAAGTTCAGTGTCTGTGAC;SOR=0.446;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=38;WE=223787567;WS=223787549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
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chr2	223793480	rs1550420	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	223799207	rs935030	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=539;SC=CAACACAGTTCACCATTTTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=223799215;WS=223799197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	223806194	rs1550426	C	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.946;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr2	223917629	rs3795886	C	T	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=49;PP=2638;SC=GTGCGGCCGGCGGCGGCAGCG;SOR=1.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=138;WE=223917637;WS=223917619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	223917812	rs10201907	T	C	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=69;PP=2335;SC=AGCCGCTGCCTGTGGTGTCGG;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=119;WE=223917820;WS=223917802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	223917983	rs12621643	T	G	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGGCAGACGATGAGCTGGAGG;SOR=0.332;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=167;WE=223917991;WS=223917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,201:1.00:202
chr2	223918080	rs10189762	C	G	5301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=94;PP=2965;SC=GGACCCCTGCCGGTGGCTCCA;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=164;WE=223918088;WS=223918070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	224629851	rs11455542	C	CT	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=516;ReadPosRankSum=0.865;SC=CTCAGTAAGTCTGGTTAATAT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=35;WE=224629859;WS=224629841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr2	224629876	rs10644138	C	CCAT,CCATCAT	2505.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=23,23;NR=12,12;PP=815,560;SC=ATTATTAACACCATCATCATC;SOR=2.262;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=35,35;WE=224629884;WS=224629866;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.49,0.51:57
chr2	224634775	rs189803495	A	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=0.389;SC=TCCTATTTTTAAAAACCGTAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=224634783;WS=224634765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	224637967	rs16865186	A	G	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=636;ReadPosRankSum=-1.245;SC=CTAGGAAAATACAACAGGTCA;SOR=0.459;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=40;WE=224637975;WS=224637957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr2	224743591	rs602675	C	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=59;PP=1680;SC=CATAACACCTCCTTAAGATTT;SOR=3.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=70;WE=224743599;WS=224743581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	224743652	rs547234	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=624;SC=TGTAATCCCAACACTTTGGGA;SOR=3.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=224743660;WS=224743642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	224744701	rs516849	A	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=792;SC=GAGGCAAGCAATTTGTTACTC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=224744709;WS=224744691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	224758906	rs625150	C	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=20;PP=1573;SC=AGCCAGGTTCCTGGGGGTCTC;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=73;WE=224758914;WS=224758896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	224760494	rs597349	G	A	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=173;SC=GGTGTACAACGGGTCATTCAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=224760502;WS=224760484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	224763816	rs530065	C	T	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=45;PP=1287;SC=GGATGTAGAACAGAAATCACC;SOR=2.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=224763824;WS=224763806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	224765894	rs604990	G	A	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=12;PP=1151;SC=TGGCTCTGAAGGATACTGCAG;SOR=2.137;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=224765902;WS=224765884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	224770780	rs622896	C	T	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=248;SC=ACAACAGAAACTTGACTTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=224770788;WS=224770770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	224777094	rs541712	T	C	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=74;PP=1871;SC=CACTTTAAGTTGTTCTTCAAA;SOR=1.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=30;TCR=74;TR=104;WE=224777113;WS=224777084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	224777105	rs113054269	G	GTGAT	4579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=57;PP=2957;SC=GTTCTTCAAAGTGATTAAGAA;SOR=1.915;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=59;WE=224777113;WS=224777084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	224822043	rs3738960	C	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=6;PP=462;SC=GTCTCCGCCCCTGCCCTCTCT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=224822051;WS=224822033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	224842150	rs7597833	T	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=357;SC=TCTGCAACTATTGACATTAGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=224842158;WS=224842140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	224844919	rs729631	C	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=205;SC=CCCACACACACTGCCTGGCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=224844927;WS=224844909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	225376032	rs6743816	G	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=400;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CGATAAGGCAGAGTAAGGATT;SOR=0.321;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=25;WE=225376040;WS=225376022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr2	225378382	rs3830376	ATAAT	A	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.736;NF=0;NR=4;PP=157;ReadPosRankSum=0.207;SC=TTATCACTTGATAATTAAATT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=225378393;WS=225378372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	225664782	rs77823647	TAAA	T	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=308;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CATAAATAATTAAAAAAAACC;SOR=1.483;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=14;WE=225664792;WS=225664772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr2	225665074	rs1560859	G	A	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=552;SC=TTCAAAGTTTGCTGGCATTTT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=225665082;WS=225665064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	225668717	rs141021252	ATG	A	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.957;NF=17;NR=5;PP=660;ReadPosRankSum=-1.079;SC=AAATAGAAATATGTGTGTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=22;WE=225668728;WS=225668707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	225670901	rs4674941	G	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=761;ReadPosRankSum=1.365;SC=TTGCATGTTTGATAGCTGTCT;SOR=0.905;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=42;WE=225670909;WS=225670891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr2	225672460	rs12328236	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1430;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GGAGCATGCCGTACAGGGGCA;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=82;WE=225672468;WS=225672450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,101:0.53:192
chr2	225684166	rs7572725	A	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=1270;ReadPosRankSum=-1.806;SC=TTCTTACCTTAAGGTCACCGG;SOR=0.582;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=87;WE=225684174;WS=225684156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,100:0.50:200
chr2	225688041	rs13405571	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTTCAAATTGAAAAAAAAAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=225688049;WS=225688033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	225688100	rs13431331	G	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=465;ReadPosRankSum=0.941;SC=GTTTTCATCTGACAGTGCTAG;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=29;WE=225688108;WS=225688090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr2	225695290	.	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=270;ReadPosRankSum=0.251;SC=AAGTGCTGTGCCATCGATTTT;SOR=1.026;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=19;WE=225695298;WS=225695280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr2	225695334	rs66902027	TG	T	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=436;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGAATGCTGTTGGGAAAAAAA;SOR=1.473;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=15;WE=225695345;WS=225695324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr2	225699079	rs10177782	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=1.257;SC=AATTATCTGCTCATGCCAGAT;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=225699087;WS=225699069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	225702565	rs6724332	G	A	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=49;PP=1197;ReadPosRankSum=-1.707;SC=AAGCAAAGCTGTTCAGTGGCC;SOR=0.690;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=76;WE=225702573;WS=225702555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,95:0.47:203
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chr2	225709926	rs7577271	A	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.268;SC=ATACCTTTCCACTTGCAGAAT;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=68;WE=225709934;WS=225709916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,75:0.45:167
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chr2	225750861	rs2304336	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=535;ReadPosRankSum=0.660;SC=CAGTTCCTCCCGCTCCTCCAC;SOR=0.686;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=33;WE=225750869;WS=225750851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr2	225751256	rs71734299	TA	T	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=2.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	225751293	rs2304334	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.711;SC=CATTGGAGACAGCTTTCATTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=225751301;WS=225751283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	225781669	rs12987341	GT	AC	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=566;ReadPosRankSum=-1.051;SC=GAGAGAAGATGTGGACATTTA;SOR=1.159;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=14;WE=225781678;WS=225781659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr2	225796112	rs17271574	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=1.418;SC=GGGCCCTGGGGTACTTTCTAT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=225796120;WS=225796102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	225796458	rs35061287	ATC	A	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=315;ReadPosRankSum=0.967;SC=GTTGGATTTCATCTCTTAGTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=225796467;WS=225796448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	225811581	rs13021295	T	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1881;ReadPosRankSum=-2.045;SC=AATCTGTGGATTTCTTCTTGG;SOR=0.916;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=51;WE=225811600;WS=225811571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr2	225811592	rs78257220	T	A	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1881;ReadPosRankSum=-2.633;SC=TTCTTCTTGGTTTACTCTCCT;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=61;WE=225811600;WS=225811571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
chr2	225848579	rs375205	T	C	4787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=69;PP=2944;SC=GTCCCCTAACTCCCTCTGGAC;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=145;WE=225848587;WS=225848569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	225875158	rs590233	A	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=833;SC=ACCTAGAGGAAAATATAAAAT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=225875166;WS=225875148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	226273490	rs2048935	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=485;SC=TGGCCATAATTATTGGAGTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=226273498;WS=226273480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	226273689	rs2048936	T	C	6252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TGAAGGCCTATGATGGCTTGG;SOR=0.817;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=97;TCR=110;TR=204;WE=226273697;WS=226273677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,238:0.99:240
chr2	226447844	rs6436570	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=1.371;SC=CACAGAGTACGGGGTCTTGAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=226447852;WS=226447834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	226491770	rs3748993	A	C	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=53;PP=1436;ReadPosRankSum=1.118;SC=AACACCAGGGACACCTGTGGT;SOR=0.615;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=65;TCR=96;TR=90;WE=226491778;WS=226491760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,111:0.59:188
chr2	226516346	rs11884382	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=0.913;SC=TAGACAACTTTCGCATTTGCT;SOR=1.302;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=21;WE=226516354;WS=226516336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr2	227892498	rs7580776	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=0.455;SC=TACTCTTAATATAAGAAAAGG;SOR=0.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=227892506;WS=227892488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	227914975	rs2251223	T	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.469;SC=AACGAAAGTTTAAATGCATGC;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=227914983;WS=227914965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	227915847	rs13027659	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=1.742;SC=TCCTCTTCTCCCTTGCATCCC;SOR=0.803;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=50;WE=227915855;WS=227915837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr2	227966148	rs16823202	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	227966298	rs59443812	T	TA	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.172;NF=5;NR=16;PP=223;ReadPosRankSum=-1.367;SC=AAACATGCCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.213;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=21;WE=227966306;WS=227966288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
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chr2	227973410	rs55741079	C	A	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=993;ReadPosRankSum=0.991;SC=ATTAAGACTTCTGGCTACACA;SOR=0.579;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=62;WE=227973418;WS=227973400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr2	227973623	rs12475686	A	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=599;ReadPosRankSum=-1.238;SC=CAATCATCAGACATAGAAATC;SOR=0.606;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=35;WE=227973631;WS=227973613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr2	227974113	rs6436654	A	G	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.261;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1283;ReadPosRankSum=-2.607;SC=AATCACAGCCACCAGCACATC;SOR=0.621;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=218;TCF=105;TCR=113;TR=84;WE=227974121;WS=227974103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,123:0.44:282
chr2	227974191	rs6436655	A	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=770;ReadPosRankSum=0.309;SC=CAGTCCGGGCACGGTGGTTCA;SOR=0.419;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=50;WE=227974199;WS=227974181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,65:0.44:148
chr2	228029532	.	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-2.279;SC=CCAGCAAGGTGAGTGGGGGCT;SOR=0.627;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=8;WE=228029540;WS=228029522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	228102723	rs13424243	G	C	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=804;ReadPosRankSum=1.478;SC=CTTCTGTGACGGGGCCAAAGG;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=40;TCR=79;TR=58;WE=228102731;WS=228102713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr2	228102752	rs1882435	C	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=704;ReadPosRankSum=-1.326;SC=TAAAAACAAACCCTAATACTG;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=24;TCR=70;TR=44;WE=228102760;WS=228102742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr2	228104760	rs7579991	C	T	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=23;PP=1573;SC=CAAAGAGTCACCATGAAGTCA;SOR=1.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=79;WE=228104768;WS=228104750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	228109626	rs113428834	T	TG	2068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=36.94;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	228109784	rs6750210	C	T	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=568;SC=TTAAAACAGTCGTGCAAGAAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=228109792;WS=228109774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	228111435	rs10178458	T	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=37;PP=1803;SC=CCAGGGACACTGGGCTACCCA;SOR=1.138;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=98;WE=228111443;WS=228111425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	228111600	rs10168566	G	T	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.92;SOR=2.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	228111604	rs10168567	G	T	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.35;SOR=2.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	228111651	rs10192026	A	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=502;SC=GCTTTGTTTTACTTTTGAGAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=228111659;WS=228111641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	228112186	rs4321358	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=24;PP=1653;SC=GGGAGAGGATACACAATAGCA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=228112194;WS=228112176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	228113175	rs6436669	A	G	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=57;PP=2142;SC=CCTGCTAAAGAAGAAGATATA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=109;WE=228113183;WS=228113165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	228118403	rs12621551	T	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=43;PP=1337;SC=GTGTCTAGGATGAAGTCCTTG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=228118411;WS=228118393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	228124702	rs4332918	A	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GAAAGGGAACAGAGATCTCTT;SOR=0.948;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=21;WE=228124710;WS=228124692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr2	228128540	rs10205042	C	T	5484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.05;NF=105;NR=73;PP=2965;SC=ATGGCCAGGCCTGAAAGGAAG;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=105;TCR=73;TR=178;WE=228128548;WS=228128530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	228131912	rs10933174	C	A	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1090;SC=TTTAGATGAACTTGGAGGGAG;SOR=1.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=228131920;WS=228131902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	228135631	rs28381984	C	T	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=47;PP=1658;SC=CCTGGAACTCCGGGAGTGAAA;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=228135639;WS=228135621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	228144706	rs6729152	G	T	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=46;PP=1493;SC=ATGTAGAAATGATCAATATAT;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=228144714;WS=228144696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	228145543	rs6436671	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=34;PP=1969;SC=AGAAGAATGACTGGTACAGCA;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=94;WE=228145551;WS=228145533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	228146991	rs111486503	AATAT	A	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=1;PP=81;SC=CCATCTTAAAAATATATATAT;SOR=2.303;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=228147002;WS=228146981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	228149107	rs6436672	A	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=29;PP=822;SC=GCTGATTCTCAGGCTAATAAA;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=228149115;WS=228149097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	228154095	rs7593281	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=253;SC=CAGAAATTTGCTACTAAATTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=228154103;WS=228154085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	228158418	rs7569636	T	C	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1564;SC=GGCTGAGAAGTGATTAGGTGG;SOR=1.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=228158426;WS=228158408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	228158648	rs7608999	G	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=433;SC=TTAATTACCTGTTTACCAGCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=228158656;WS=228158638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	228159063	rs6436675	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=244;SC=CTGGACAAAATCATGGGGTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=228159071;WS=228159053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	228169632	rs11680670	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CCTGGGTTAACGGGATGGTTG;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=228169640;WS=228169622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	228174175	rs34134749	TACAA	T	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=42;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CTTGAAAATCTACAAACAGAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=228174186;WS=228174165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	228175629	rs183218622	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CCTACAGTTTCTGGCTGGCTT;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=228175637;WS=228175619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr2	228194480	rs3211097	AG	TT	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=1785;ReadPosRankSum=-1.120;SC=AGGAACAAGCAGTGACACATC;SOR=0.821;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=48;WE=228194489;WS=228194470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr2	228194570	rs6706656	G	A	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=52;PP=1516;SC=GCTTACTGCCGTAGGCTAACC;SOR=2.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=67;WE=228194578;WS=228194560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	228194639	.	T	TA	127	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=11;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=61.53;NF=0;NR=4;PP=127;QD=34.0;SC=TCTACTGCATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=228194661;WS=228194629;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr2	228197368	rs4500938	A	G	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=69;PP=2230;SC=AGAGAAGAGCAAAGAGGCTTT;SOR=1.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=98;WE=228197376;WS=228197358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	228204929	rs4420693	C	T	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=19;PP=1328;SC=AGCCTTGTATCGAGGTTCTTT;SOR=1.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=228204937;WS=228204919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	228204982	rs4442987	C	T	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=44;PP=2356;SC=ATTTCTATTTCCTTCCCTCTC;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=228204990;WS=228204972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	228207625	rs6738078	G	A	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=71;PP=1974;SC=GGTAATTGACGTATGCTATCC;SOR=2.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=92;WE=228207633;WS=228207615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	228220528	rs12478005	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=1.065;SC=TCATACAATATTTTAAAGTGA;SOR=1.153;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=26;WE=228220536;WS=228220518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr2	228384735	rs1135969	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=0.441;SC=GGGATCCACAAAAAGTGAAAG;SOR=1.089;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=18;WE=228384743;WS=228384725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr2	228396028	rs75511074	C	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=480;ReadPosRankSum=0.391;SC=CTGTAATTATCTGACTTTAAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=25;WE=228396036;WS=228396018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr2	228399480	rs7588620	T	C	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=5;PP=425;SC=TAAGTTTACCTGTGTTTCATG;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=228399488;WS=228399470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	228401306	rs113750157	GA	G	1102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.039;NF=17;NR=17;PP=563;ReadPosRankSum=-0.004;SC=TTTTTTTTAAGAAAAAAAATG;SOR=0.642;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=34;WE=228401314;WS=228401283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr2	228416498	rs7598597	C	T	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=206;SC=CTACAAGTTACGTTAAACTGT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=228416506;WS=228416496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	228416712	rs13426457	A	G	7801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=103;PP=2965;SC=GCATGCCCACAGGATTCGGCA;SOR=1.102;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=155;TCR=103;TR=258;WE=228416720;WS=228416702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr2	228476253	rs2138402	C	G	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=34;PP=1641;SC=GCTGAAGCCTCTGCAGTTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=228476261;WS=228476243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	228493211	rs28739019	G	A	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1167;ReadPosRankSum=0.973;SC=GGCTTTTGGCGAGGGCTTTGC;SOR=0.602;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=73;WE=228493219;WS=228493201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr2	228560800	rs11334205	GA	G	3681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=67;PP=1946;SC=CACAGCCCCTGAAAAAAAACA;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=83;WE=228560808;WS=228560780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	228565656	rs11694828	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=1.265;SC=TGAGGTTGCTGGAGAAAGCAG;SOR=0.235;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=228565664;WS=228565646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr2	228736313	rs12478068	G	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=407;ReadPosRankSum=1.754;SC=AGGACCGCGCGGTGCAACCTG;SOR=0.146;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=25;WE=228736321;WS=228736303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr2	228736341	rs56333712	C	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=614;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GCACCCGCGTCCCGCTGCTGT;SOR=0.852;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=38;WE=228736349;WS=228736331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr2	228736527	rs12470042	A	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=575;ReadPosRankSum=2.412;SC=AGGAGGGCGCAGCCACTGAAA;SOR=0.412;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=34;WE=228736535;WS=228736517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr2	228736608	rs10933219	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CCTTCAGATGCTGGACTCTTC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=228736616;WS=228736598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	228740927	rs4972994	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.433;NF=11;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.632;SC=TAGTAGAGACGGGGTTTCACC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=228740935;WS=228740921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	228741250	rs7571353	T	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=1.662;SC=TAGGAAAAATTATTCCACTGA;SOR=0.042;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=19;WE=228741258;WS=228741240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr2	228750239	rs4973445	G	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=837;ReadPosRankSum=-2.501;SC=AATACATTATGTTTTAAAAAT;SOR=0.808;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=41;WE=228750247;WS=228750229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr2	228758456	rs35758334	C	A	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AACATGAAGTCTTTATTAACA;SOR=0.552;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=67;WE=228758464;WS=228758446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr2	228758554	rs1715828	A	T	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GCTCTGGGACACTGCGTCTGG;SOR=0.539;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=63;WE=228758562;WS=228758544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,85:0.52:163
chr2	228767618	rs2949014	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=982;SC=AAGAATTAGATGGAATCTGGT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=228767639;WS=228767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	228767631	rs2946931	G	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=399;ReadPosRankSum=0.569;SC=AATCTGGTAAGGTAATTGCAT;SOR=2.604;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=21;WE=228767639;WS=228767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr2	228776996	rs3748862	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=488;ReadPosRankSum=0.681;SC=TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGT;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=23;WE=228777004;WS=228776986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr2	228855866	rs16824283	G	C	5395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=75;PP=2965;SC=TCCTCTGGGGGCTGGCTGTTC;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=87;TCR=75;TR=162;WE=228855874;WS=228855856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr2	228973383	rs67714256	A	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=0.246;SC=ATTAGCTCTGAATGCTATTTT;SOR=0.042;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=228973391;WS=228973373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	228973660	rs7561798	A	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=54;PP=1647;SC=AAGAACCTGGAGGAACCCAGA;SOR=1.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=73;WE=228973668;WS=228973650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	228973723	.	C	CT	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=15;MQ=61.43;NF=0;NR=6;PP=93;QD=16.5;SC=AGCTCTCTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=228973731;WS=228973713;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,6:0.43:14
chr2	228992850	rs6734166	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=0.252;SC=TCTATTTTCATGAAAGATTTC;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=10;WE=228992858;WS=228992840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr2	228996637	rs4479423	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=594;ReadPosRankSum=0.906;SC=TTAAAATTTCGAATTAAATGA;SOR=1.445;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=14;WE=228996658;WS=228996627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr2	228996650	rs4353646	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=594;ReadPosRankSum=0.183;SC=TTAAATGAATATTCAAGTTCA;SOR=1.072;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=19;WE=228996658;WS=228996627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr2	228996672	rs4585022	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=368;ReadPosRankSum=-0.649;SC=CTGACAAGAAGAAAGTGGCGT;SOR=1.206;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=24;WE=228996680;WS=228996662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr2	229035351	rs12618108	T	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=2.375;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr2	229035357	rs4630759	T	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=398;ReadPosRankSum=-2.168;SC=ATAGTTTTTTTAAATTAAGAT;SOR=0.507;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=16;WE=229035365;WS=229035341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr2	229035442	rs4334483	A	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=104;SC=ATAACTTTTGAATCCCTTGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=229035450;WS=229035432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	230092889	rs1419944	C	T	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=55;PP=1614;SC=CAAATAAAACCGATACAAGCA;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=230092897;WS=230092879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	230092950	rs1419945	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=551;SC=CCTACTTGTTCATATGACTAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=230092958;WS=230092940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	230096587	rs1226982	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=7;PP=666;SC=GCTGCTATAACGAAATACCAC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=230096595;WS=230096577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	230135527	rs1227013	C	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=302;SC=AACGCCTGAACCCGTGCGTTT;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=230135535;WS=230135517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	230135711	rs67686611	G	GC	2240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=1571;SC=CTGGCCCCCGGCTCCCGGGTG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=230135719;WS=230135701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	230231889	rs2302769	A	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=33;PP=1025;SC=TTTGAGAATGAGAAGGCCTTT;SOR=1.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=230231897;WS=230231879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	230282624	rs6760224	G	A	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=170;SC=GACAGGAAAGGGGGTTGTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=230282632;WS=230282623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr2	230666898	rs10432554	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr2	230668968	rs4972915	G	A	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=39;PP=1192;SC=AAAAATATATGTGCAATCCTG;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=230668990;WS=230668958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	230668982	rs4973229	T	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=0.120;SC=AATCCTGAAGTGACAGACTTC;SOR=1.347;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=17;WE=230668990;WS=230668958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr2	230675495	.	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.623;SC=AATGCCTATAATATTAGTAAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=230675503;WS=230675485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	230701501	rs2303560	C	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=341;ReadPosRankSum=-1.287;SC=TACTTCCCTCCCTCTGCCCAT;SOR=0.529;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=26;WE=230701509;WS=230701491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr2	230744570	rs479492	C	T	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=174;SC=TTTTAAGTACCTGGCTCACAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=230744578;WS=230744560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	230875311	rs11675143	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=424;ReadPosRankSum=0.701;SC=ACCTGTGTCTGGCACAGGTAG;SOR=0.666;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=28;WE=230875319;WS=230875301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr2	230914766	rs6748654	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=1.310;SC=ATGCCAAACATTTTTAGCATG;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=13;WE=230914774;WS=230914756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr2	230923648	rs9750739	C	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-0.246;SC=CGTGCCTGGCCTAAAATGGTA;SOR=2.800;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=230923656;WS=230923638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	231036311	rs12988385	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=470;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GCCCTTCTCTTCTGTTCTCCA;SOR=1.079;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=27;WE=231036319;WS=231036301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr2	231036754	rs34897866	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.886;SC=AGGGAAAAGTATAGGTTTGGG;SOR=1.082;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=28;WE=231036776;WS=231036744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	231036768	rs34034766	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.755;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=1075;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GTTTGGGGTTTGCATCCAACT;SOR=1.393;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=35;WE=231036776;WS=231036744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr2	231036866	rs13018234	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=644;ReadPosRankSum=-1.914;SC=TCTTCATCCTGCAGAAGGTGC;SOR=0.553;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=47;WE=231036874;WS=231036856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr2	231037481	rs12995739	T	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=1.154;SC=CACACCCTCGTCCCCGACGCT;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=231037489;WS=231037472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	231042276	rs1135791	A	G	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=1463;ReadPosRankSum=1.876;SC=TCCTAGGGTCATTCCTTCACA;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=105;WE=231042284;WS=231042266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,134:0.55:243
chr2	231042802	rs2241525	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=953;ReadPosRankSum=-1.598;SC=ATTACACACACGGGTATTTTC;SOR=0.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=162;TCF=96;TCR=66;TR=68;WE=231042810;WS=231042792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,86:0.42:206
chr2	231048549	rs145404147	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	231050569	rs2114591	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.917;SC=CAACAGATCCGTGCTCTGTCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=231050577;WS=231050559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr2	231072709	rs1365776	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=652;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ATCTTACCTCCTGGGAGGCTT;SOR=0.845;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=39;WE=231072717;WS=231072699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr2	231076032	rs3769837	G	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=162;SC=TCTCCTGCCTGTTCAAGCTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=231076040;WS=231076028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr2	231077112	rs28930679	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=366;ReadPosRankSum=0.664;SC=GTCTTCTTCCGCATTCATTTT;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=29;WE=231077120;WS=231077102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr2	231077154	rs41309096	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=561;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CACTGAAGGAGGAAAGGAAAT;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=34;WE=231077162;WS=231077144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,38:0.43:89
chr2	231077561	.	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=0.360;SC=GGATCTCATCGCTTTGCTGGG;SOR=1.430;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=24;WE=231077569;WS=231077551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,26:0.29:89
chr2	231077725	rs1129411	A	G	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=31;PP=1018;SC=CTGCTCTGCCATTCATAGGAA;SOR=1.107;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=231077733;WS=231077715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	231077868	rs7601176	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CCCCAGGTGCAGAGAACTGAT;SOR=2.376;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=231077876;WS=231077858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	231077911	rs7601190	A	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=GTGGCCCCTTAATATTTTATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=231077919;WS=231077901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	231081405	rs7580912	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TTCCAAACTCTGGAAGCCCTG;SOR=0.184;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=231081413;WS=231081395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	231103185	rs2278197	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=276;ReadPosRankSum=-1.848;SC=TTTGACAAATATTTGACTGAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=231103193;WS=231103175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	231106244	rs2288328	G	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.024;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=-1.619;SC=TTAAAGTTTTGCTTCCTTGCC;SOR=1.279;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=26;WE=231106252;WS=231106234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,26:0.33:78
chr2	231110497	rs56246923	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=-1.684;SC=TTCTACACCCGAATATTAGAG;SOR=0.355;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=25;WE=231110505;WS=231110487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr2	231115524	rs72988209	A	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=538;ReadPosRankSum=0.211;SC=CCTTGGTGACAGCAACTGGAG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=36;WE=231115532;WS=231115514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr2	231120255	rs367703666	CGG	C,CG	494.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.65;QD=29.10;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,8:0.53,0.47:17
chr2	231120258	rs201594901	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.053;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	231149108	rs4972946	G	A	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=25;PP=775;SC=GAGAAGGCAGGAAAACAGCCA;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=231149116;WS=231149098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	231175763	rs78116662	G	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.311;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.973;NF=34;NR=16;PP=781;ReadPosRankSum=0.653;SC=AGCCACACATGTTAGAGAAAC;SOR=0.351;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=50;WE=231175771;WS=231175753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr2	231177200	rs3086614	CTT	C	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=1.778;SC=ACTTACAGTACTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=231177209;WS=231177190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	231226488	rs11891724	C	T	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GGCCCAAGGTCCTGAGGGGAA;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=90;WE=231226496;WS=231226478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,102:0.60:171
chr2	231330899	.	C	CA	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=0.9999;HP=19;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=47.8;NF=2;NR=0;PP=30;QD=16.5;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=231330907;WS=231330889;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr2	231331694	rs1678159	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=301;ReadPosRankSum=0.712;SC=CAGATCATGGAGGTTTGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=231331709;WS=231331684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	231331701	rs3214547	A	AG	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=281;ReadPosRankSum=0.357;SC=TGGAGGTTTGAGGCACGGACA;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=231331709;WS=231331684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	231331799	rs1649869	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=691;ReadPosRankSum=-0.452;SC=TTATCATACATTGAGAGCTCC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=46;WE=231331807;WS=231331789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr2	231331896	rs1050224	G	A	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1317;ReadPosRankSum=0.955;SC=CAGAAGCCTCGAGCGGGGCAC;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=63;TCR=77;TR=77;WE=231331904;WS=231331886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,86:0.50:171
chr2	231337960	rs1615190	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=500;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GGGGAGTGGGCAGTCACTAAT;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=29;WE=231337968;WS=231337950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr2	231363252	rs34979917	TA	T	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	231406680	rs836237	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=420;ReadPosRankSum=-0.455;SC=AATGAGCAGATGTACACCCGA;SOR=0.965;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=33;WE=231406688;WS=231406670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
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chr2	231407663	rs9288668	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=724;ReadPosRankSum=-1.455;SC=TTTATTTAGCCATTCTTATCT;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=48;WE=231407671;WS=231407653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,66:0.38:172
chr2	231683487	rs16836174	CTT	C	1048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.964;NF=1;NR=23;PP=878;ReadPosRankSum=-1.377;SC=ATCAGGCACTCTTATTGATTC;SOR=0.039;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=24;WE=231683496;WS=231683477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr2	231738168	rs2289235	G	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=610;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CAAGAGGGGGGGCTCAGTGGG;SOR=0.786;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=37;WE=231738176;WS=231738158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr2	231738263	rs2289234	C	T	3195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.59;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr2	231738269	rs2289233	G	A	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.03;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,82:0.57:145
chr2	231738318	rs3816150	T	C	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=707;ReadPosRankSum=1.067;SC=GAAAGGGTCATGTCTAGAGAG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=53;WE=231738326;WS=231738308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr2	231740443	rs202135244	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CTACCTCGACGAGAACTACGA;SOR=0.766;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=71;WE=231740457;WS=231740433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr2	231742864	rs62195287	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=0.835;SC=TCTTCTTTCCGGCTGCTCTCT;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=21;WE=231742872;WS=231742854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr2	231774844	rs2396777	G	A	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.476;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=33;PP=1589;ReadPosRankSum=0.870;SC=AGCAGTTGACGTTGGAGAAAC;SOR=0.952;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=159;TCF=100;TCR=59;TR=94;WE=231774852;WS=231774834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,105:0.57:184
chr2	231775094	rs3749073	C	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1150;ReadPosRankSum=0.739;SC=GCCCATGATGCCCATGGGAAG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=82;WE=231775102;WS=231775084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,93:0.51:181
chr2	231775297	rs1992186	T	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=1001;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GGCTCACCAGTAGCGGGTAAC;SOR=0.926;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=59;WE=231775305;WS=231775287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,70:0.44:158
chr2	231860838	rs2271369	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.62;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	231860848	rs6722863	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.21;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	231861032	rs72362780	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	4005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=8.920;NF=13;NR=33;PP=2966;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATTCCACCTCTCAGCAGCCTA;SOR=0.677;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=132;TCF=49;TCR=83;TR=46;WE=231861066;WS=231861022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,120:0.49:246
chr2	231864289	rs2136474	A	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=361;SC=TGTCAAGAAGACGCAGGGCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=231864297;WS=231864279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	231864529	rs6436986	A	G	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=68;PP=2478;SC=TCCTGAGGTGAGCAGTCACCT;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=231864537;WS=231864519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	231864600	rs7573039	T	C	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=51;PP=1738;SC=CCAACTTCTGTAATCTACTCC;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=231864608;WS=231864590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	231864646	rs11684067	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=0.829;SC=GCTGAGCCTCAGTTTCCTTAT;SOR=0.412;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=12;WE=231864654;WS=231864636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr2	231865018	rs13406394	A	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=233;SC=TGTGTTCCAGACTCCCCCGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=231865026;WS=231865008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	231865047	rs3817173	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=690;SC=CCAGGGCAGGTGCCTCCCTCA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=231865055;WS=231865037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	231865090	rs2271376	T	C	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=17;PP=1372;SC=GGGCCTCTGATTCGCGCCGGC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=231865098;WS=231865080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	231865269	rs2271375	G	T	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=89;PP=2810;SC=AGCGCGAGGGGCTGGAGCCTC;SOR=1.457;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=50;TCR=89;TR=137;WE=231865277;WS=231865259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	231867220	rs10933364	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=256;SC=GGGGTCTTTCAGTAGGGACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=231867228;WS=231867213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	232079409	rs79587894	C	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=488;ReadPosRankSum=-2.200;SC=GAGCTTGAATCCTGTGGGATC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=25;WE=232079417;WS=232079399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr2	232087474	rs1626450	AT	GA	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=1461;SC=GTTGAAGTTGATAAAGTTTCT;SOR=1.739;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=29;WE=232087483;WS=232087464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	232196472	rs1729082	T	A	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=18;PP=1594;SC=TGTCAGGGTGTCCATGGCATT;SOR=2.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=72;WE=232196480;WS=232196462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	232196564	rs1669083	C	T	5187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=68;PP=2965;SC=AGCCCCAGCTCGGAGAACTCT;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=232196572;WS=232196554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
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chr2	232225535	rs35889244	C	CG	2364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=1797;SC=CCAGCCCCCACGGGACCCCCC;SOR=0.910;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=41;WE=232225543;WS=232225525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	232235950	rs16828017	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=269;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CGGTGTGGACAGCTCAGCCAG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=18;WE=232235958;WS=232235940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	232236068	rs75457429	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=0.963;SC=GGAAAGAGCCGGCCCGCCAGT;SOR=1.663;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=14;WE=232236076;WS=232236058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	232263127	rs2290130	G	A	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=1723;ReadPosRankSum=0.143;SC=CTGCCCCCACGTCCCCTTCAT;SOR=0.815;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=229;TCF=110;TCR=119;TR=113;WE=232263135;WS=232263117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,137:0.51:267
chr2	232326801	rs2595514	A	T	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=67;PP=2245;SC=TCCCAATGAGATGTTAGACTC;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=106;WE=232326809;WS=232326791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	232458443	rs10933378	T	C	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=73;PP=2965;SC=GCCCCTGGACTCCAGCCTGTA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=141;WE=232458451;WS=232458433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	232653481	rs3830626	A	ACT	1171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.045;NF=1;NR=17;PP=775;ReadPosRankSum=1.531;SC=TTATTCTAAGACTCTGTAATT;SOR=0.650;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=18;WE=232653489;WS=232653471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr2	232790053	rs5268	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=0.241;SC=CTCCGAAGGCCGGCTGGGCGG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=232790061;WS=232790043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr2	232888856	rs896990	T	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=171;SC=TTAATGAATATTTCTTATACA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=232888864;WS=232888846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	232952286	rs11887184	A	G	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=21;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.898;SC=ATCTCCCGCAACAGTCCCTGA;SOR=1.102;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=149;TCF=97;TCR=52;TR=72;WE=232952294;WS=232952276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr2	233028070	rs3116181	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=260;ReadPosRankSum=1.205;SC=AGGGCAGGAGATTTTAAACTT;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=233028078;WS=233028060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	233243660	rs2014448	T	C	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=42;PP=1744;SC=CTGACCTGATTTTTGCTCTCC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=76;WE=233243668;WS=233243650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	233244586	rs2853374	C	G	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=36;PP=1269;SC=TGCCTGCCTCCGCCCGCCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=233244594;WS=233244576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	233245090	rs2260307	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-5.070;NF=13;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=1.479;SC=TGTGGGGCTCAGGGCTGTGGG;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=23;WE=233245098;WS=233245080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,17:0.20:86
chr2	233245141	rs2260309	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.496;NF=19;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GTGCCCGGTATGTGTGGAACC;SOR=0.579;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=34;WE=233245149;WS=233245131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,21:0.17:127
chr2	233245210	rs13034594	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=3.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQRankSum=-7.231;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,42:0.21:196
chr2	233245958	rs200610301	C	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQRankSum=1.227;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr2	233271697	rs369374441	TAC	T	887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.112;NF=8;NR=11;PP=701;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CAGCTGCCCCTACACACACAC;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=19;WE=233271706;WS=233271687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr2	233272162	rs2678517	G	A	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1152;ReadPosRankSum=1.950;SC=GGGAATCCTGGCTATGGAGTG;SOR=0.363;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=66;WE=233272170;WS=233272152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr2	233272528	rs6728119	G	T	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1700;ReadPosRankSum=-1.594;SC=GACCTCTATCGCATATCCTGA;SOR=0.652;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=218;TCF=101;TCR=117;TR=107;WE=233272536;WS=233272518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,126:0.49:257
chr2	233272925	rs2678518	A	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.083;NF=33;NR=11;PP=783;ReadPosRankSum=0.430;SC=TGAGGAGGGGACACGGGGCCA;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=44;WE=233272933;WS=233272915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr2	233273107	rs1130346	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=9.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-9.578;QD=3.60;ReadPosRankSum=-4.271;SOR=1.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,21:0.21:101
chr2	233274145	rs2090543	G	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.87;QD=30.34;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	233274169	rs2091555	T	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.510;NF=34;NR=6;PP=714;ReadPosRankSum=-1.732;SC=GTGAGTGCCGTGGGGTGGCCC;SOR=1.012;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=88;TCF=70;TCR=18;TR=40;WE=233274177;WS=233274159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr2	233323177	rs2003780	T	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=16;PP=704;SC=AAGTTTGAGCTTCAGTTTCCT;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=233323185;WS=233323167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	233344991	rs2741279	T	G	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=57;PP=2066;SC=CACACAGTGTTGGGCCCTGCA;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=233344999;WS=233344981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	233345249	rs1190432	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=554;SC=GCCCCCTTGCCCCCCACCCAG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=233345257;WS=233345239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	233346027	rs746379	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
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chr2	233350000	rs2573246	C	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=261;ReadPosRankSum=-1.650;SC=ACAGGGGCCACAGGTCAGAGG;SOR=0.191;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=14;WE=233350008;WS=233349990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	233350548	rs113660447	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=511;ReadPosRankSum=2.620;SC=ATCCGCGGCCGCTGGCAGGGC;SOR=0.372;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=33;WE=233350556;WS=233350538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr2	233385396	rs1550094	G	A	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=694;SC=GCCCCCCAGCGCCCTGCAAGG;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=233385404;WS=233385386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	233386229	rs2853444	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=43;PP=1489;SC=GTCTTCACTCTCCTCTTGGGG;SOR=1.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=233386237;WS=233386219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	233386583	rs2853445	T	C	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.177;SC=CCAGGTGAGGTTGAAAAGGCT;SOR=0.919;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=79;TCR=70;TR=84;WE=233386591;WS=233386573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr2	233387635	rs733603	A	G	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=31;PP=1329;SC=AATAGAGTGTAGGGAGGCCGG;SOR=0.920;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=65;WE=233387643;WS=233387625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	233388311	rs733602	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.192;SC=TTTCCAATGCCCCGTCCCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=7;WE=233388319;WS=233388301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	233388813	rs2741299	T	G	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=38;PP=1206;SC=TGCTCGGGCCTCGTCCGGGAC;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=233388821;WS=233388803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	233389060	.	G	A	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=346;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GGAGGCCGGAGCCGCGCGGAG;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=24;WE=233389068;WS=233389050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr2	233389167	rs58091792	G	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=70;ReadPosRankSum=0.432;SC=CTCCGGAAAGGGCTTACCCCA;SOR=0.084;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=233389175;WS=233389157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	233389918	rs2853447	A	G	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=48;PP=2263;SC=CCACTCCTCCATCTGTAGGTC;SOR=1.171;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=233389926;WS=233389908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	233390937	rs2245601	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.240;SC=TGGAGGGGCCAGTGCTGACAC;SOR=0.819;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=18;WE=233390945;WS=233390927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr2	233391463	rs2278478	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=300;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GGAGGAAGCTAGAAGCCCCCA;SOR=1.390;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=20;WE=233391471;WS=233391453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr2	233391965	rs4973537	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.147;NF=5;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=1.432;SC=GCAGTGAGCCAAGCTCGTGCC;SOR=0.394;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=6;WE=233391973;WS=233391955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr2	233400074	rs2767	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GAGGAGCCACAGTCCCTAATG;SOR=1.852;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=19;WE=233400082;WS=233400064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr2	233400171	rs114315112	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TCAATGCTCAATGGCTCCCCT;SOR=0.148;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=233400179;WS=233400161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	233404294	rs11674608	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CAGCTGACAACGCTGTGGTCA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=8;WE=233404302;WS=233404284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	233404334	rs140146282	C	CGGGCTGGCT	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.663;NF=5;NR=5;PP=1686;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CCAGGCTGGCCGGGCTGGCTG;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=10;WE=233404342;WS=233404324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr2	233404590	rs12996322	G	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=382;ReadPosRankSum=0.349;SC=GGTCTGAGGGGTATTGGGGCC;SOR=0.627;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=18;WE=233404598;WS=233404580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	233407120	rs2853462	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=799;ReadPosRankSum=-0.048;SC=CCTCTTTCCTCGGTGACTCCC;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=50;WE=233407128;WS=233407110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr2	233408190	rs34697564	A	AC	513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-0.766;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.866;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr2	233408220	rs10714586	AG	A	2633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=24;PP=1995;SC=AGGAGGCCTGAGGGGGGGCAG;SOR=1.900;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=70;WE=233408228;WS=233408210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	233408239	rs2573206	C	G	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=44;PP=2965;SC=AGCCACTAAGCGTGGGGGTGG;SOR=1.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=99;TCR=44;TR=143;WE=233408247;WS=233408229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	233408283	rs13018423	C	T	2798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.101;NF=72;NR=38;PP=1836;ReadPosRankSum=-0.542;SC=CCTGCCCACCCCACCCTGACA;SOR=0.925;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=246;TCF=150;TCR=96;TR=110;WE=233408291;WS=233408270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,131:0.47:281
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chr2	233409013	rs2250451	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AGCCCTTCACGCCAACCTCTG;SOR=1.880;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=233409021;WS=233409003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	233414341	rs4973540	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	233415978	rs11899983	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=808;ReadPosRankSum=0.365;SC=TTAGGAATTATCTTCCTGAGA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=51;WE=233415986;WS=233415968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,64:0.43:148
chr2	233421284	rs3830645	CT	C	4931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=83;PP=2966;SC=GAACTTGAGACTTTTATTATC;SOR=1.273;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=9;TCR=89;TR=91;WE=233421292;WS=233421274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	233429144	rs10603391	GTATTT	G	129.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=32.46;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	233470843	rs7571133	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=660;ReadPosRankSum=0.338;SC=GCCAAGATCTGTAACGCTGAC;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=58;WE=233470851;WS=233470833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,72:0.41:177
chr2	233470900	rs55750809	TC	T	2536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=1498;ReadPosRankSum=0.225;SC=GCTCTTTAAATCCCCTTTCAC;SOR=0.654;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=144;TCF=39;TCR=105;TR=50;WE=233470908;WS=233470890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,96:0.40:243
chr2	233470931	rs10171498	C	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=973;ReadPosRankSum=0.883;SC=CTACGATTTTCGACGTTTTCC;SOR=0.630;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=75;WE=233470939;WS=233470921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,87:0.40:220
chr2	233641010	rs41266951	A	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAAAGAATATAGAAACCTTAC;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=14;WE=233641018;WS=233641000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr2	233641083	rs737027	G	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=645;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TAGCTCTGTTGCTATTTGCCA;SOR=1.013;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=40;WE=233641091;WS=233641073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr2	233652137	rs3217559	T	TG	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=333;ReadPosRankSum=-0.099;SC=GCTTAAAAAATGTGGGGGTGG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=9;WE=233652145;WS=233652127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	233655236	rs13393621	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	233660704	rs2305139	T	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=461;ReadPosRankSum=0.509;SC=GGGCAGGCACTGTTATTATGT;SOR=0.954;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=24;WE=233660712;WS=233660694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr2	233681512	rs1078323	T	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CGAATACTACTGGTCAGTGCT;SOR=0.375;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=12;WE=233681520;WS=233681502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr2	233684833	rs11689661	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.056;SC=CTAACTGGCTCTTATTACTTC;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=233684841;WS=233684823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	233708806	rs3816334	A	G	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=37;PP=1968;SC=AGCAGCAGCAACAGCAACAGC;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=233708814;WS=233708796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	233710713	rs4973054	G	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=350;SC=GAGGTCAACTGCTGCACCTGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=233710721;WS=233710703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	233712049	rs2305137	G	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=583;SC=CTCCCCTCCCGTTTTGCAGTT;SOR=2.049;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=233712057;WS=233712039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	233712226	rs10555297	CACA	C	1850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=1530;SC=CAGCAGCTGCCACAGCAGCAG;SOR=1.880;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=233712236;WS=233712216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	233712248	rs12328151	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.432;NF=4;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=1.116;SC=AGCAGCAGCCGCCACAGCAGC;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=21;WE=233712256;WS=233712238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr2	233721455	rs1947105	G	A	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=29;PP=1044;SC=AATTTGAGCCGCTTGGTTGCC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=233721463;WS=233721445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	233723182	rs1284	G	A	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=20;PP=1142;SC=ACCATTAAAAGTTGGGGCTCC;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=233723190;WS=233723172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	233740055	rs35523521	AAGAG	A	2398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.264;NF=19;NR=20;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CTGTTTCAAAAAGAGAGAGAG;SOR=0.738;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=39;WE=233740066;WS=233740045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,67:0.39:172
chr2	233740227	rs778338	A	G	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=56;PP=1725;SC=CCAGGGTTGGAGTGGTGGTCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=79;WE=233740235;WS=233740217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	233744130	rs67252740	GCCC	G,GC	770.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.45;QD=36.70;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,14,7:0.67,0.33:21
chr2	233744133	.	C	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.550;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.267;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	233749913	rs368210261	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=468;ReadPosRankSum=1.160;SC=GCCAGCCAGGCGCGGTGATCT;SOR=0.831;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=29;WE=233749921;WS=233749903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
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chr2	233752639	rs2250665	A	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=479;SC=AAATTTGCATATTCTAAAAAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=233752647;WS=233752635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	233752944	rs72427034	ACACG	A	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.270;NF=2;NR=12;PP=672;ReadPosRankSum=-1.021;SC=ACACACACACACACGCACGCA;SOR=0.478;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=14;WE=233752955;WS=233752934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr2	233757679	rs748002	G	A	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1380;ReadPosRankSum=1.869;SC=AGAAGTGGTCGGCCGCATAAC;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=91;WE=233757687;WS=233757669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,112:0.52:217
chr2	233757697	rs895432	A	G	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=86;PP=2965;SC=AACGGTACACAATGTCACACA;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=166;WE=233757705;WS=233757687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	233759695	rs938569	G	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=1022;ReadPosRankSum=0.467;SC=CCTTGGCTGAGACAGAGGAGC;SOR=1.486;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=106;TCF=32;TCR=74;TR=54;WE=233759703;WS=233759685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr2	233785015	rs778354	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=569;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TAATCTCCTCGGGCTGTAGGA;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=27;WE=233785023;WS=233785005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr2	233791608	rs1878289	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=1.114;SC=CCATTTAGAGCCAAACATGTC;SOR=1.101;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=16;WE=233791616;WS=233791598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr2	233791648	rs2592127	G	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=472;ReadPosRankSum=1.089;SC=GTCAGACGCAGTCCTTCGTAT;SOR=0.645;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=33;WE=233791656;WS=233791638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr2	233792565	rs2921705	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=2.655;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr2	233834975	rs4973588	A	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=275;ReadPosRankSum=0.254;SC=GCAAGGAGGCATTCTGCTCCA;SOR=0.534;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=22;WE=233834983;WS=233834965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr2	233880271	rs60652209	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=416;ReadPosRankSum=1.425;SC=CCACCCAGCCATCCACCCATT;SOR=1.104;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=27;WE=233880279;WS=233880261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr2	233899126	rs2233391	C	A	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=2031;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TTTGCAGCTTCACGACAGGGC;SOR=0.726;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=252;TCF=134;TCR=118;TR=134;WE=233899134;WS=233899116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,154:0.52:295
chr2	233925166	rs1141328	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=1.649;SC=CTGCCGGCCCGGCCGAGGAGG;SOR=0.793;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=11;WE=233925174;WS=233925156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr2	233925406	rs34218488	T	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=488;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GTTGTTCTTATGTCACAGGAC;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=33;WE=233925414;WS=233925396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr2	233925491	rs4246649	A	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=184;SC=AGCTGGTCTCATGGCAGGTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=233925499;WS=233925481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	233990412	rs55913569	C	T	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=15;PP=1044;ReadPosRankSum=0.106;SC=CCGGGTTGTGCGCACAGTGTC;SOR=0.725;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=60;WE=233990420;WS=233990402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,66:0.62:106
chr2	233998646	rs6738961	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=269;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CTGGCACATGCGGCTCAACAG;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=18;WE=233998654;WS=233998636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	234053816	rs144181925	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=790;ReadPosRankSum=0.039;SC=TAACATAGAATAGATGCTTTG;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=43;WE=234053824;WS=234053806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,65:0.57:114
chr2	234054237	rs140053128	T	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=640;ReadPosRankSum=0.250;SC=TGATGAGGAGTTGCCCCTCCC;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=44;WE=234054245;WS=234054227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr2	234054873	rs1135173	G	A	4076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=88;PP=2474;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GCCTGTTGTCGTCCATTGAAG;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=336;TCF=163;TCR=173;TR=174;WE=234054881;WS=234054863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,197:0.49:404
chr2	234054989	rs36180605	T	G	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=968;ReadPosRankSum=0.370;SC=CTTGACCCTCTGTCTCTAACG;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=65;WE=234054997;WS=234054979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,77:0.48:160
chr2	234055004	rs36189208	T	C	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=713;ReadPosRankSum=1.166;SC=CTAACGCTGCTGCCCACAGGT;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=56;WE=234055012;WS=234054994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
chr2	234066969	rs36127492	C	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=952;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TCCTGCAGCTCATTAAGTCAC;SOR=0.433;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=59;WE=234066977;WS=234066959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr2	234067017	rs148118779	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=724;ReadPosRankSum=0.737;SC=TGGTGGAAACAGAGAAGGAGA;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=53;WE=234067025;WS=234067007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,58:0.43:136
chr2	234067089	rs36165346	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=421;ReadPosRankSum=-0.459;SC=AACTTCTAAAATGGGCTGTGA;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=30;WE=234067097;WS=234067079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr2	234070171	rs28605534	G	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=1.040;SC=CTTTGTTAAAGTCGCACCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=234070179;WS=234070161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	234070190	rs28609111	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=178;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TTGCAGGGGAGTGTCTAGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=11;WE=234070198;WS=234070180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	234070233	rs28576692	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=350;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TGGACACATGTTTCCAGGTTG;SOR=0.795;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=20;WE=234070241;WS=234070223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr2	234072626	rs141642539	T	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=348;SC=GAGGCAAGGGTGGGCTCAGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=234072634;WS=234072616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	234078056	rs11386687	AC	A	1406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AGGTAATGGAACTCCTTCCCC;SOR=0.701;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=28;WE=234078064;WS=234078046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr2	234078582	rs10754947	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=0.963;SC=TATGCTCCTCGCCCCACACCT;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=234078590;WS=234078572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr2	234091158	rs4571051	T	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=958;ReadPosRankSum=-0.185;SC=AAGCAAAGGATGGTGTCTGTT;SOR=0.408;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=75;WE=234091166;WS=234091148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,89:0.60:148
chr2	234093035	rs6740918	G	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=778;ReadPosRankSum=0.900;SC=AACTGAATCCGTGTTCTCCCC;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=49;WE=234093043;WS=234093025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr2	234103862	rs138305144	G	GA	328.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=433;ReadPosRankSum=2.071;SC=TGGATCCACTGCAGGCATAAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=234103871;WS=234103852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	234103863	rs62192895	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=425;ReadPosRankSum=1.536;SC=GGATCCACTGCAGGCATAACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=234103871;WS=234103852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	234107070	rs7569827	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=573;ReadPosRankSum=0.325;SC=TTATGAAAGCGCCCTGGGCTT;SOR=0.634;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=29;WE=234107078;WS=234107060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	234112649	rs7609436	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=8;PP=571;SC=CAATGTTACATGTCTCTATCT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=234112657;WS=234112639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	234113057	rs7346	G	A	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=910;ReadPosRankSum=0.074;SC=GCTCCTTCACGTGCTCATCCT;SOR=0.767;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=65;WE=234113065;WS=234113047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,80:0.46:175
chr2	234113301	rs9247	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=764;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CGAGCTCCCGCATCACGGCAA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=52;WE=234113309;WS=234113291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,64:0.38:168
chr2	234113421	rs70958391	C	CGTATGTGT	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.767;NF=0;NR=10;PP=562;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TGCGTGAGTGCGTATGTGTGT;SOR=0.277;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=10;WE=234113429;WS=234113411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	234160345	rs2289477	T	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-1.354;SC=CCTCGGGGACTGCCAGTGTGT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=234160353;WS=234160335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	234160669	rs10199278	C	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=-0.607;SC=AACCTGAGGCCGAGTCCCTGG;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=12;WE=234160677;WS=234160659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	234173503	rs12994997	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=0.194;SC=GGGCTCTGGCGAGGTACTATT;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=234173511;WS=234173493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	234181556	rs2289476	C	A	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=897;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TTTGCGGAACCGATTAATCAC;SOR=0.911;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=53;WE=234181564;WS=234181546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr2	234181593	rs2289475	G	C	4341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=72;PP=2861;SC=ATCAAAGAATGTCTTGCCTTT;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=131;WE=234181601;WS=234181583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	234182240	rs2289472	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=354;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTGGGTTTCTCTTGGCTGGGG;SOR=0.437;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=23;WE=234182248;WS=234182230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr2	234183368	rs2241880	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=0.007;SC=CAATGTGGATACTCATCCTGG;SOR=1.084;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=20;WE=234183376;WS=234183358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr2	234183468	rs2241879	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.758;SC=TTGATATGGTGACAGAGCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=234183476;WS=234183458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	234184417	rs3792109	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=791;ReadPosRankSum=1.172;SC=TGAATGTCACGGTCCCTTTGT;SOR=0.477;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=54;WE=234184425;WS=234184407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr2	234189907	rs145264492	ATT	A	169.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=67;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AACTTACCCGATTTCTCTGCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=234189916;WS=234189897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
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chr2	234200977	rs60739904	TA	T	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.495;NF=0;NR=14;PP=495;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CCTGCTCTCTTAACGTGCTGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=14;WE=234200985;WS=234200967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
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chr2	234217679	rs77217878	C	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.513;SC=GATGTTGAAGCCGGTACAAGG;SOR=0.465;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=5;WE=234217687;WS=234217669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	234227507	rs139252176	G	A	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1607;ReadPosRankSum=-1.020;SC=GGGCGGCTCTGGGAAGGGGCA;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=86;WE=234227515;WS=234227497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,91:0.47:192
chr2	234227523	rs2304777	A	G	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=99;PP=2965;SC=GGGCATTTACATGGAAGGAGA;SOR=0.977;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=175;WE=234227531;WS=234227513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	234227693	rs2304776	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AGATGGTAGACGGAGCCCAGG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=18;WE=234227701;WS=234227683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr2	234235749	rs2304774	G	C	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=1006;ReadPosRankSum=0.604;SC=CTGCCTGTCTGCTCTCTCTCC;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=56;WE=234235757;WS=234235739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr2	234235820	rs2304773	C	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1037;ReadPosRankSum=1.011;SC=GCACCGATGCCGAAGAGGACA;SOR=0.866;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=150;TCF=85;TCR=65;TR=69;WE=234235828;WS=234235810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,77:0.44:175
chr2	234238254	rs745498	T	G	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=39;PP=1620;SC=GTAGAGGGCATAGTCTTCTAG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=234238262;WS=234238244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	234247627	rs2241874	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=278;SC=AATGTGTGCATTCTTAGCGCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=234247635;WS=234247617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	234255547	rs1046974	G	A	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=46;PP=2009;SC=CAAGAATGACGTTGATGAGTG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=234255555;WS=234255537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	234294561	rs3075537	T	TTC	6032.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.158;NF=20;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.137;SC=AGCACTCTTGTTATAAATAAA;SOR=0.753;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=176;TCF=42;TCR=134;TR=93;WE=234294569;WS=234294551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,156:0.52:299
chr2	234294772	rs75094306	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AGATAACTTATAACTTTTCTG;SOR=1.148;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=12;WE=234294780;WS=234294762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	234294791	rs838716	G	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.62;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	234347091	rs3214826	TA	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=73;ReadPosRankSum=0.076;SC=GTGTGCTTGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=234347099;WS=234347081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	234358615	rs41270765	T	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=-1.859;SC=CCGCACACACTCTCCTTGCAC;SOR=0.388;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=28;WE=234358623;WS=234358605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr2	234363177	rs80051853	C	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=251;ReadPosRankSum=0.523;SC=ATGAAATGCTCTAAAATCGAT;SOR=0.634;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=16;WE=234363185;WS=234363167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	234367022	rs61739478	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=461;ReadPosRankSum=-1.657;SC=TCATCAGGCTACAGCATCATC;SOR=1.174;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=33;WE=234367030;WS=234367012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,34:0.36:95
chr2	234368821	rs2290464	T	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=394;ReadPosRankSum=1.266;SC=CAGGTGTAATTGGGCTTTCGG;SOR=0.599;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=34;WE=234368829;WS=234368811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,48:0.38:126
chr2	234372761	rs55692234	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr2	234372767	rs2924811	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=1.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
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chr2	234375944	rs2305540	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=1.720;SC=GGCCTTGCAGCTCCTCCCTCT;SOR=0.765;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=12;WE=234375952;WS=234375934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
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chr2	234394293	rs147953945	TTAAA	T	1519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=1594;ReadPosRankSum=-1.550;SC=ATCAAACATCTTAAATAAGCA;SOR=1.103;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=32;WE=234394304;WS=234394283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr2	234394329	rs1470864	C	A	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=28;PP=1489;ReadPosRankSum=1.103;SC=TTCTCACTAACTTCTCTATCA;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=105;TCR=55;TR=84;WE=234394337;WS=234394319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,90:0.52:172
chr2	234394487	rs1048603	G	A	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=65;PP=1622;ReadPosRankSum=-1.145;SC=ACGGGAAGACGATAGAAATCG;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=225;TCF=85;TCR=140;TR=102;WE=234394495;WS=234394477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,121:0.46:264
chr2	234394569	rs2603547	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=588;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GGGCAGGGGCATAGGTCCTCT;SOR=1.312;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=35;WE=234394577;WS=234394559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr2	234396542	rs2167885	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=384;ReadPosRankSum=-0.878;SC=GGGGCAGAGCGACGGGAGCAA;SOR=0.836;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=22;WE=234396550;WS=234396532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr2	234398195	rs112451786	G	GA	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.600;NF=0;NR=10;PP=127;ReadPosRankSum=2.122;SC=TACTGTTTTAGAAAAAAAAAA;SOR=0.298;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=234398203;WS=234398185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	234405374	rs2602386	A	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTATTACTTAAGAGTTGTCTA;SOR=0.132;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=234405382;WS=234405364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	234407160	rs2603546	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=253;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TAAATGTAATCATACGAAAGT;SOR=0.101;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=16;WE=234407168;WS=234407150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr2	234421283	rs143258246	A	AATATTATTTTTCTTAGT	609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.062;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.359;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr2	234429739	rs141501074	T	TTTC	1686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=1320;ReadPosRankSum=0.121;SC=TAGTGACCCATTTCTCTTCCT;SOR=1.276;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=29;WE=234429747;WS=234429729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr2	234432017	rs838543	A	G	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1330;ReadPosRankSum=0.426;SC=AGCTGGAAAGACATGTGGAGA;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=88;WE=234432025;WS=234432007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,101:0.42:238
chr2	234432186	rs78430608	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=549;ReadPosRankSum=0.771;SC=TGCCAACACCGTCAACATAAC;SOR=0.662;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=34;WE=234432194;WS=234432176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr2	234433124	rs838549	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.126;NF=49;NR=30;PP=1139;ReadPosRankSum=0.002;SC=TATTTCTTCAGTAATTTTTTT;SOR=0.729;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=184;TCF=110;TCR=74;TR=79;WE=234433135;WS=234433114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,97:0.44:218
chr2	234433245	rs201148037	CCAT	C	1975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.141;NF=3;NR=36;PP=1710;ReadPosRankSum=0.217;SC=TTCATCATGACCATCAGAAAC;SOR=0.688;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=89;TCF=3;TCR=86;TR=39;WE=234433255;WS=234433235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr2	234438246	rs56828432	C	CT	1059.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=854;ReadPosRankSum=-0.089;SC=AAGGACTGTCCTAGGAGCTAG;SOR=0.551;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=22;WE=234438254;WS=234438236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr2	234438354	rs12692193	C	T	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=191;SC=GAAAAGTAAACATTTCTTTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=234438362;WS=234438344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	234442437	rs11332355	CA	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.280;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	234449316	rs2167884	G	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=751;ReadPosRankSum=-0.572;SC=ACCTTCCGCAGTGGTCCATGC;SOR=0.819;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=48;WE=234449324;WS=234449306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr2	234449462	rs1545525	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=-1.495;SC=TGAGAAATAATTGCATACTTA;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=9;WE=234449470;WS=234449452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	234450822	rs1901812	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.842;SC=CACCTAGCAATTAAACCGCAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=234450830;WS=234450821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	234457900	rs3965793	T	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=2.255;SC=AACAAAAATATTGATATAGTT;SOR=0.156;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=234457908;WS=234457890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	234469664	rs6753062	T	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=382;ReadPosRankSum=1.649;SC=CCATAGGGTATAGGCCAAGTC;SOR=1.113;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=28;WE=234469672;WS=234469654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr2	234527118	rs1042605	A	G	3908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.913;NF=81;NR=76;PP=2607;ReadPosRankSum=-2.786;SC=TGTTGCGAACAGACTTTGTTT;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=301;TCF=154;TCR=147;TR=157;WE=234527126;WS=234527108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,175:0.53:332
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chr2	234627937	rs2011404	T	C	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1014;ReadPosRankSum=1.828;SC=TTAACCTCTGTGGGGCGGTGC;SOR=0.689;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=76;WE=234627945;WS=234627927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,90:0.50:179
chr2	234687963	rs17868344	A	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.724;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=745;ReadPosRankSum=0.157;SC=CACACCCCGTATTTTACAAAT;SOR=0.515;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=47;WE=234687971;WS=234687953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr2	234688036	rs6431631	C	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=556;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GCAGCAGTAGCCTCAAGTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=39;WE=234688044;WS=234688026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr2	234698016	rs17862886	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=299;ReadPosRankSum=0.928;SC=GGAGGAATGGGGATCTAAGAT;SOR=0.723;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=234698024;WS=234698006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr2	234698097	rs12468017	T	C	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=570;ReadPosRankSum=1.479;SC=GGACTTGTGCTGGGGGCAGGG;SOR=0.358;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=44;WE=234698105;WS=234698087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr2	234698126	rs17862888	C	G	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=978;ReadPosRankSum=0.719;SC=ATTCCACCCACCATACTTGTT;SOR=0.352;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=58;WE=234698134;WS=234698116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr2	234702520	rs17868350	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=413;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GGCCACAGCTCCCCAGCCTGT;SOR=0.650;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=24;WE=234702528;WS=234702510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	234704150	rs2885297	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=2;PP=1402;SC=TCAGCAGGACTGGGGTAGGGC;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=234704158;WS=234704140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	234704607	rs1076454	C	T	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=935;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GCACGTCCCTCACCAGGTGTG;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=62;WE=234704615;WS=234704597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,74:0.46:162
chr2	234704690	rs759173	T	C	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=47;SC=TCGTAGCCCTTGGTGAGGCTC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=234704698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	234704746	rs759172	G	C	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=58;PP=2965;SC=CAGGAGGCCTGTAGGAGTCCC;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=97;TCR=58;TR=155;WE=234704754;WS=234704736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	234707341	rs1500479	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=444;ReadPosRankSum=-0.849;SC=AGACAGAACGTGAGGCCCTGA;SOR=0.207;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=35;WE=234707349;WS=234707331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr2	234708428	rs13013882	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=191;ReadPosRankSum=0.387;SC=CCCCTCAGGTGAGGATGGCTA;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=18;WE=234708436;WS=234708418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr2	234708570	rs11563069	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=0.642;SC=TACGCAGACCGCAGAGCAGCT;SOR=0.573;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=37;WE=234708578;WS=234708560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr2	234708629	rs13018934	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=-1.174;SC=GCCACTCAGCGTACCTGTGTT;SOR=2.192;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=19;WE=234708637;WS=234708619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr2	234708720	rs2041652	T	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=299;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CCTAGATATATGCACAGCTCT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=16;WE=234708728;WS=234708710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr2	234713812	rs2041651	G	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=481;ReadPosRankSum=0.907;SC=CCAGGGGTGAGGGAGTGGAGA;SOR=0.919;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=32;WE=234713820;WS=234713802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
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chr2	234720734	rs988344	A	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TCTCACTTGGAGGCTCCCCAG;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=234720742;WS=234720724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr2	234732311	rs17868361	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
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chr2	234737372	rs7564261	C	A	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=737;ReadPosRankSum=1.128;SC=CGAGGCCCTGCGGGTGCTGTC;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=47;WE=234737380;WS=234737362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr2	234738175	rs502059	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=0.037;SC=CTCTGCAGGGACCAAGGCATT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=15;WE=234738183;WS=234738165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	234738472	rs582432	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=486;ReadPosRankSum=2.165;SC=GCTGTTCCCCGAGGAAACAGG;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=30;WE=234738480;WS=234738448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr2	234740136	rs879665	G	A	3895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.375;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=79;PP=2439;ReadPosRankSum=0.699;SC=AAGTGATACCGCTACTGATGA;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=161;TCR=145;TR=165;WE=234740144;WS=234740126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,186:0.50:371
chr2	234740157	rs879664	G	A	4117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=92;PP=2438;ReadPosRankSum=0.677;SC=CAAGATGACCGTTTTCCAGAC;SOR=0.809;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=311;TCF=142;TCR=169;TR=166;WE=234740165;WS=234740147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,197:0.50:391
chr2	234740310	rs879666	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=2.950;SC=CATGCCATGTCGAGACCGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=12;WE=234740318;WS=234740300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	234740703	.	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=273;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TGCTGTGTGACGCTGGGATGG;SOR=0.092;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=15;WE=234740711;WS=234740693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	234740758	rs213547	A	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=536;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AACACGCTTGATGAATGACAG;SOR=0.968;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=30;WE=234740766;WS=234740748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr2	234740797	rs76276350	C	CAAAA	1901.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=2359;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TCCTCCAAAGCTGTGTGTATC;SOR=0.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=28;WE=234740806;WS=234740787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr2	234740798	rs3064782	T	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=2354;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CCTCCAAAGCTGTGTGTATCA;SOR=0.648;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=41;WE=234740806;WS=234740787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr2	234740985	rs474242	G	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.820;QD=24.28;ReadPosRankSum=-1.916;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,58:0.61:95
chr2	234740985	.	GGC	AGG	1724	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=60.11;NF=15;NR=28;PP=1724;QD=41.3364622061;SC=AGTCCACCCCGGCACTCGGGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=43;WE=234740995;WS=234740975;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:45,43:0.49:88
chr2	234740987	rs658482	C	G	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.820;QD=24.28;ReadPosRankSum=-1.905;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,58:0.61:95
chr2	234741022	rs122856	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.778;NF=18;NR=23;PP=1992;ReadPosRankSum=1.145;SC=GTGGGAGGCATGTGGCAAGCT;SOR=0.363;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=41;WE=234741036;WS=234741012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr2	234741028	rs5839496	A	AG	1575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.775;NF=11;NR=20;PP=1963;ReadPosRankSum=1.928;SC=GGCATGTGGCAAGCTGAGACC;SOR=0.424;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=31;WE=234741036;WS=234741012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr2	234749151	rs213555	C	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=521;ReadPosRankSum=1.484;SC=AAGAATTCGGCTGAGATTCAC;SOR=1.588;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=24;WE=234749159;WS=234749141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr2	234749258	rs10511	T	C	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=50;PP=2022;ReadPosRankSum=0.739;SC=CACCTACCTCTCTTCTGAGTT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=126;TCR=100;TR=114;WE=234749266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,142:0.51:278
chr2	234749354	rs12582	G	A	2853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=64;PP=1885;ReadPosRankSum=0.339;SC=CTGGCGTCCGGAGCCCTGGGG;SOR=0.817;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=86;TCR=119;TR=108;WE=234749362;WS=234749344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,126:0.53:239
chr2	234749780	rs3821238	G	C	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1732;ReadPosRankSum=0.586;SC=AAATATTCCAGAACTATTTCC;SOR=0.740;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=189;TCF=94;TCR=95;TR=97;WE=234749788;WS=234749770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,107:0.50:212
chr2	234750542	rs3732215	G	C	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1215;ReadPosRankSum=1.054;SC=CCTCCTCCTGGAGTTCCAGTT;SOR=0.771;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=73;WE=234750550;WS=234750532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr2	234750831	rs3806589	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=344;ReadPosRankSum=0.130;SC=GGACTCTTTCTGGAGATACGA;SOR=0.418;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=31;WE=234750839;WS=234750821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr2	234752638	rs7583713	C	T	117.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGCTAGTAAACTGGAATAAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=234752646;WS=234752628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
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chr2	234754273	rs2302156	T	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=-0.793;SC=ATGCTCTTTATGGGTTCTGTA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=234754281;WS=234754263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr2	234754506	rs2302155	G	A	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AAGAGCTTCTGAGTATAGCTG;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=73;WE=234754514;WS=234754496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,84:0.51:164
chr2	234756240	rs2286431	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=-1.944;SC=TGCACCCACTGGAGCCATCTA;SOR=0.541;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=36;WE=234756248;WS=234756230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr2	234761225	rs2286430	C	T	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=1033;ReadPosRankSum=-1.359;SC=ATCTCTCCTTCGTTTCTTTCC;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=171;TCF=91;TCR=80;TR=70;WE=234761233;WS=234761215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,85:0.41:205
chr2	234761355	rs554699	G	A	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=1164;ReadPosRankSum=2.039;SC=CAAAGTGACAGGCAAAAAAAA;SOR=0.502;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=74;WE=234761365;WS=234761345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr2	234762480	rs626110	A	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1195;ReadPosRankSum=2.307;SC=AAGGTGGGGAAGACCCTTACC;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=76;WE=234762488;WS=234762470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr2	234762946	rs34087988	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=0.106;SC=TCCTCAGAGCCCCTTCCCTTC;SOR=2.833;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=234762954;WS=234762936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	234763226	rs503913	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=498;ReadPosRankSum=0.895;SC=ACTCCGCCCTCCCTGCCTTCC;SOR=0.501;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=32;WE=234763234;WS=234763216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr2	234846198	rs1019103	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=539;SC=ATAGGCCAAAGTGACCTGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=234846206;WS=234846188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	234847573	rs9646720	A	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=838;ReadPosRankSum=0.153;SC=GGAAGTTGGGAGGGAATGCTA;SOR=0.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=53;WE=234847581;WS=234847563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,60:0.48:124
chr2	234847823	rs2302153	A	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.517;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=631;ReadPosRankSum=-0.526;SC=TCCAAAGGTGAGGGTGGGAGC;SOR=1.466;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=36;WE=234847831;WS=234847813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr2	234854540	rs13004520	G	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=1201;ReadPosRankSum=2.370;SC=GACTTCACAAGAGATCCACTG;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=35;WE=234854560;WS=234854530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr2	234854552	rs17868387	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=1201;ReadPosRankSum=0.729;SC=GATCCACTGTATATCCTGGAC;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=39;WE=234854560;WS=234854530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr2	234863788	rs7593557	G	A	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=840;ReadPosRankSum=-1.395;SC=TTCAGCACCAGTGAGCAAGAC;SOR=0.717;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=48;WE=234863796;WS=234863778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr2	234875433	rs12185625	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=494;ReadPosRankSum=0.480;SC=CCACACGGCCAGAAATGGGGC;SOR=0.270;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=31;WE=234875441;WS=234875423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr2	234878261	rs6760498	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=0.627;SC=AGTGTGGGGCGGGGAAGAAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=234878269;WS=234878251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	234888643	rs6745987	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GCCAGTGTGCTACCTACTTTC;SOR=0.871;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=234888651;WS=234888633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	234892127	rs4663995	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CAATTAACAATGTGGCAATTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=234892135;WS=234892117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	234967539	rs593668	T	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=875;ReadPosRankSum=0.391;SC=TCCGGGAGACTACATGCAGGA;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=58;WE=234967547;WS=234967529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,65:0.42:156
chr2	235950187	rs1469375	T	C	3312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=66;PP=1664;ReadPosRankSum=0.923;SC=CCAAGTCCGATGCTCCCACAT;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=268;TCF=136;TCR=132;TR=131;WE=235950195;WS=235950177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,165:0.49:339
chr2	235951369	rs114710262	G	A	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.05;MQRankSum=1.084;NF=38;NR=40;PP=1292;ReadPosRankSum=-2.119;SC=AGGACCGCCCGGTGTCCAGCC;SOR=0.647;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=78;WE=235951377;WS=235951359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,97:0.46:209
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chr2	235961111	rs6754815	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr2	236653453	rs372718570	G	A	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1418;ReadPosRankSum=0.685;SC=GAACACGAGCGAGATTCCTCT;SOR=0.718;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=81;TCR=89;TR=85;WE=236653461;WS=236653443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,98:0.48:205
chr2	236682914	rs2696411	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr2	236685731	rs113739109	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.062;NF=9;NR=16;PP=291;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TGCTGGGCGCGGTGGCTCATG;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=25;WE=236685739;WS=236685721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr2	236685762	rs138493201	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.278;NF=5;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=0.410;SC=CAGCACTTTGAGAGGCCAAGG;SOR=1.246;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=20;WE=236685770;WS=236685752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr2	236691982	rs1878154	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=406;ReadPosRankSum=1.548;SC=ATTTAGATGTATGCTTAATGT;SOR=1.051;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=27;WE=236691990;WS=236691972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr2	236692238	rs12466588	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=1.068;SC=GGACGTACCCACAAAACATTA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=236692246;WS=236692228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	236706612	rs140030205	A	AT	1307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.937;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.851;NF=5;NR=33;PP=574;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GCTAAGGTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=87;TCF=9;TCR=78;TR=38;WE=236706620;WS=236706602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr2	236708166	rs2292708	C	T	3480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1978;ReadPosRankSum=-0.872;SC=ACCTGTTCACCGTGAGTGTCA;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=249;TCF=120;TCR=129;TR=128;WE=236708174;WS=236708156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,162:0.52:312
chr2	236716006	rs8178996	T	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=355;ReadPosRankSum=1.062;SC=TCCCTCCCTGTCGCCGGAGAT;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=28;WE=236716014;WS=236715996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr2	236761396	rs13006916	C	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=38;PP=1407;SC=AGCCCGTGCCCGTCAGTCCTC;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=236761404;WS=236761386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	236839616	rs77020450	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=0.418;SC=CAAGGTCCTTCGTTGTAAGCC;SOR=0.343;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=24;WE=236839624;WS=236839606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr2	236957822	rs2034648	G	A	6709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=123;PP=2965;SC=TGACTGGCCAGTCGAGCTCAT;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=85;TCR=123;TR=208;WE=236957830;WS=236957812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr2	237105055	rs1254681	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.605;SC=AAAGACGCAGCGTAGGCCGAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=237105063;WS=237105045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	237146643	rs72060634	TGTG	T	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.980;NF=2;NR=10;PP=468;ReadPosRankSum=-0.320;SC=GGAGGTTAGTTGTGGTGGTGG;SOR=1.210;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=12;WE=237146653;WS=237146633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr2	237149941	rs6756597	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=672;ReadPosRankSum=-1.037;SC=CCAAACGTGGCTGGAGATTTC;SOR=0.242;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=42;WE=237149949;WS=237149930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr2	237150166	rs2015983	A	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=610;ReadPosRankSum=-1.087;SC=CTCTCCATTGAGATGCCGTCG;SOR=1.167;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=42;WE=237150174;WS=237150156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr2	237247036	rs111440161	G	GA	2040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=3.861;NF=7;NR=47;PP=866;ReadPosRankSum=0.481;SC=CTGGGAGAGAGAAAAAAAAAT;SOR=0.574;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=121;TCF=19;TCR=102;TR=54;WE=237247044;WS=237247026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,88:0.52:168
chr2	237252454	rs72978647	C	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=662;ReadPosRankSum=-1.871;SC=TGAAGACTTTCTGAAATGACA;SOR=1.137;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=41;WE=237252462;WS=237252444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr2	237255303	rs62192371	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=356;ReadPosRankSum=-1.411;SC=GGGCAGGAGAAGGCTCCTTCC;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=27;WE=237255311;WS=237255293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
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chr2	237995735	rs138951874	G	GTTGTT	800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.696;NF=6;NR=5;PP=493;ReadPosRankSum=-1.325;SC=AAAATTTTGTGTTGTTTTGTT;SOR=0.478;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=11;WE=237995743;WS=237995725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
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chr2	238244963	rs6728818	A	G	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.806;SC=AACAGTGGCCATCTTTGTGGC;SOR=0.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=96;TCR=57;TR=79;WE=238244971;WS=238244953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr2	238253149	rs2646258	G	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=929;ReadPosRankSum=0.243;SC=TTAGGAATCCGTTCCTCACAC;SOR=0.993;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=54;WE=238253157;WS=238253139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr2	238253930	rs2256485	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=384;ReadPosRankSum=1.719;SC=TGGCCCCCAGAAATACACAGA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=22;WE=238253938;WS=238253920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	238255120	rs2270656	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=218;ReadPosRankSum=-1.287;SC=CCCAGGTGGCCGGGTCAGAAC;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=12;WE=238255128;WS=238255110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr2	238257013	rs2646265	G	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=42;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.600;SC=GGTATCCAGGGAATCCTCTTT;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=58;TCR=89;TR=70;WE=238257021;WS=238257003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr2	238257127	rs3790990	C	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=412;ReadPosRankSum=0.157;SC=AGTCATCAAACGAAAACACTC;SOR=0.848;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=21;WE=238257135;WS=238257117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	238257213	rs2646264	C	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=576;ReadPosRankSum=-1.518;SC=CTTGGAGCCTCCTGGCAGCAA;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=40;WE=238257221;WS=238257203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr2	238257353	rs2646263	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=308;ReadPosRankSum=0.647;SC=TGCCTGGCACACCATAACCAC;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=23;WE=238257361;WS=238257343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr2	238258814	rs3790993	C	G	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.103;SC=GGCCCCGGTTCCCGATTCCTC;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=75;WE=238258822;WS=238258804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,86:0.51:167
chr2	238259675	rs3790995	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=688;ReadPosRankSum=-1.718;SC=CAGTAGTACTGAAGAGGAGGG;SOR=0.391;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=35;WE=238259683;WS=238259665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr2	238261112	rs4663726	GC	AA	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=1591;ReadPosRankSum=-0.545;SC=AGCCTGCTTGGCAATGTGCCC;SOR=0.850;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=40;WE=238261121;WS=238261102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr2	238261850	rs2646257	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=215;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TTGCACAGCATTGTGGAAGTA;SOR=0.362;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=13;WE=238261858;WS=238261840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	238266146	rs2645777	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=0.052;SC=AGGAAGAGCCCGTCTGCAGGA;SOR=0.051;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=238266154;WS=238266136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr2	238266633	rs4663730	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=1.206;SC=GCAAGGCTTCGAGGGACAAGC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=13;WE=238266641;WS=238266623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr2	238267058	rs4663731	G	A	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=27;PP=1907;SC=TTTTATCAACGTGTTTTAAAG;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=94;WE=238267066;WS=238267048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	238267717	rs2646254	C	T	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1324;ReadPosRankSum=-1.853;SC=AAGAACCAGGCAATCCTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=98;TCR=98;TR=86;WE=238267725;WS=238267707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,104:0.45:232
chr2	238269871	rs2645769	C	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=511;ReadPosRankSum=-1.813;SC=CTTTGCTCTACAGTAAGAATC;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=33;WE=238269879;WS=238269861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
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chr2	238271882	rs11385011	T	TA	996.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.054;NF=15;NR=16;PP=552;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TATAAAGACATAAAAAAAACT;SOR=0.455;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=31;WE=238271890;WS=238271872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
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chr2	238305211	rs1553032	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TCTGAAAAGGCCTATAAATCC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=238305219;WS=238305210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr2	238451167	rs28418886	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=958;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GCGGGATCTCGAGCGTCTGTC;SOR=0.730;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=65;WE=238451175;WS=238451157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,79:0.54:147
chr2	238475826	rs112601669	C	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=720;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TGACAGCCAGCTTGTCAAGAA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=49;WE=238475834;WS=238475816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr2	238483164	rs6766	T	C	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CACCAAGATGTGGAAATCCTG;SOR=1.039;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=73;WE=238483172;WS=238483154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,84:0.54:155
chr2	238484222	rs10202062	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=195;ReadPosRankSum=-1.528;SC=AGCTGCAGCCGTGGAGCCCGC;SOR=1.911;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=13;WE=238484230;WS=238484212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr2	238485256	rs75983679	T	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=746;ReadPosRankSum=1.224;SC=GAGTTGGGTCTTCCCCTGCGC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=42;WE=238485264;WS=238485246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr2	238485481	rs75901095	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=687;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AACAGAGTAGGGAAGGGAGCC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=39;WE=238485489;WS=238485471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr2	238486767	rs11542159	A	G	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1818;ReadPosRankSum=0.181;SC=GAGAGGTGGCACCCACATCCA;SOR=0.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=116;WE=238486775;WS=238486757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,128:0.54:236
chr2	238494161	rs13414922	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TTCCCACCCCCAATCCAGGCC;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=238494169;WS=238494151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr2	238494494	rs75483841	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=-3.180;SC=GACCTCACCCCCTCCCCTCAC;SOR=0.412;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=14;WE=238494502;WS=238494490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr2	238494681	rs34052613	G	A	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1539;ReadPosRankSum=1.566;SC=CGTTCTTCACGTACCGAAGAG;SOR=0.862;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=233;TCF=113;TCR=120;TR=115;WE=238494689;WS=238494671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,139:0.47:293
chr2	238494742	rs3751112	A	G	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1133;ReadPosRankSum=1.663;SC=CAGCTTGAACACACGGGGCTG;SOR=0.583;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=128;TCF=37;TCR=91;TR=68;WE=238494750;WS=238494732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,84:0.53:159
chr2	238499863	rs146534321	A	AAATTCTTCAGGAGACTCT	1435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=6;PP=2897;SC=TGGTCTTCCCAAGCCATGAAA;SOR=1.382;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=11;WE=238499882;WS=238499853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	238499866	rs114742872	C	T	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.90;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	238499866	.	CCATGAAAC	TCATGAAAC,TCATGAAAT	163	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=12,5;NR=7,5;PP=163,121;QD=10.4090111867;SC=TCTTCCCAAGCCATGAAACTT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=19,10;WE=238499882;WS=238499853;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.79:24
chr2	238499874	rs2292870	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.525;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	238499969	rs80043020	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=270;ReadPosRankSum=-0.318;SC=CTGAGGCTGAGGAGATGGAAA;SOR=0.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=16;WE=238499977;WS=238499959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	238499997	rs6745883	TA	CG	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=59;ReadPosRankSum=0.422;SC=CCGTGAACATTACTCCACACA;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=4;WE=238500006;WS=238499987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	238500642	rs10084167	A	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=37;PP=1065;SC=GAATCCCAGCACTTTGGAAGG;SOR=2.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=238500650;WS=238500632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	238536255	rs10170083	C	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=256;ReadPosRankSum=0.528;SC=GCTGGAGCAACGGGCCCCGCG;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=20;WE=238536263;WS=238536245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
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chr2	238656936	rs2304431	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=305;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTTATCATTCATAGCCCCATC;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=27;WE=238656944;WS=238656926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr2	238657142	rs11692182	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TGTTCCCCAGCGAGGGAACTG;SOR=0.242;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=14;WE=238657150;WS=238657132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	238658030	rs200556733	TA	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=79;ReadPosRankSum=1.445;SC=GTCTTTAGATTAAAAAAAAAA;SOR=0.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=238658038;WS=238658020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	238659708	rs3769062	C	T	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=452;ReadPosRankSum=1.756;SC=TTTATTTTCCCTTAACGCTTA;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=26;WE=238659716;WS=238659698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr2	238659963	rs3835808	TAA	T	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=187;ReadPosRankSum=1.556;SC=CAACTTAACTTAAAAAAAAAA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=12;WE=238659972;WS=238659953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	238661832	rs733579	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.77;MQRankSum=0.396;NF=7;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=-0.075;SC=TTCTGATCCATTTGCTCTAAG;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=238661840;WS=238661822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	238661870	rs3832061	GT	G	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=9;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.965;NF=6;NR=4;PP=143;ReadPosRankSum=0.768;SC=AGGACTGAGGGTTTTTTTTTA;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=10;WE=238661878;WS=238661860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	238664884	rs11680940	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GAGCATTTTGTCAGGCCATGA;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=29;WE=238664892;WS=238664874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr2	238665965	rs10180757	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=1.086;SC=AATGCTGACAATGAGTTCAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=238665973;WS=238665955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	238667311	rs7566942	T	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=584;ReadPosRankSum=-1.395;SC=TTCCTGCTTCTGAAGTAACTT;SOR=0.348;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=45;WE=238667319;WS=238667301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr2	238667501	.	G	GAA	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=17;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.738;NF=0;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=-1.525;SC=TAAAAAAAAAGAAAAAAAATC;SOR=2.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=12;WE=238667509;WS=238667491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr2	238667552	rs2279639	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=61.43;MQRankSum=1.465;NF=0;NR=6;PP=60;ReadPosRankSum=1.137;SC=TGAATATGTGTGTACATAATT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=238667560;WS=238667542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	238668783	rs3213869	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=627;ReadPosRankSum=-0.062;SC=GTTGGATACCAAGGTCCTACC;SOR=0.975;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=46;WE=238668791;WS=238668773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr2	238668802	rs3213868	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=724;ReadPosRankSum=0.222;SC=CCAAGATGACAAAAGAAGAGT;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=49;WE=238668810;WS=238668792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,60:0.41:145
chr2	238671117	rs734388	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=1.183;SC=CTTGTTTCTCATGACTCTTTG;SOR=0.395;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=15;WE=238671125;WS=238671107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr2	238672425	rs11680012	G	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=736;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TCAGGCCCGAGGGCTGGTGGT;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=51;WE=238672433;WS=238672415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr2	238672703	rs3739038	C	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=921;ReadPosRankSum=0.629;SC=AGAGCCAGGGCACTTCAATCC;SOR=0.506;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=48;WE=238672711;WS=238672693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr2	238683166	rs2279644	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=-0.907;SC=TAGTGGGGACGGTACAGAGAG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=36;WE=238683174;WS=238683156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr2	238688244	rs1151798	A	G	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=442;SC=TCTCTGTCCTATCTGGGAGCG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=238688252;WS=238688234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	238727640	rs150487579	G	GA	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=0.362;SC=ACATCTGGAAGAAAAAATCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=4;WE=238727648;WS=238727630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	238728798	rs201313145	CCTAT	C	1417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.088;NF=16;NR=9;PP=1156;ReadPosRankSum=2.094;SC=CTTACCTGATCCTATCTTTTA;SOR=0.764;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=25;WE=238728809;WS=238728788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr2	238729954	rs74272432	A	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.814;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	238731931	rs4663794	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AGATTCTGTTCTCTCACATGT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=238731939;WS=238731921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr2	238999883	rs1128552	T	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=18;PP=935;SC=CAATGATTGCTGGCCTTGGGA;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=238999891;WS=238999873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	239000091	rs17069	T	G	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=665;SC=TGGCACTTGTTTAGCATTTAA;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=239000099;WS=239000081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	239005586	rs13033964	G	A	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=39;PP=1313;SC=GTGGGCAGGCGGCAGGATCCG;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=239005594;WS=239005576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	239006879	rs12993309	C	T	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=45;PP=1332;SC=GTGTCCCCTTCGACGTGGCCA;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=239006887;WS=239006869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	239007755	rs68159827	CATT	C	1157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=951;SC=CCCTTTTGATCATTATTAACT;SOR=2.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=21;WE=239007765;WS=239007745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	239007806	rs1054640	A	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=15;PP=1119;SC=GTGCAGCTCCAGGTCATTCCT;SOR=1.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=239007814;WS=239007796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	239007850	rs1054641	T	A	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=35;PP=1888;SC=GACTCAGCTTTTACCTTAATT;SOR=1.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=93;WE=239007858;WS=239007840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	239007991	rs15787	T	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=35;PP=1083;SC=AAGGAACTACTTGATGATTTT;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=239007999;WS=239007981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	239010455	rs5839683	GGAA	G	580.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=535;SC=GAGGGAAGGAGGAAGGAGCTG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=12;WE=239010465;WS=239010454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	239010690	rs34878344	C	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=21;PP=666;SC=GCTAGAGACCCGGGAGGGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=239010698;WS=239010680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	239010719	rs36066915	T	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=21;PP=506;SC=TGCACCACGCTGCCGTCAGTG;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=239010727;WS=239010709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	239016539	rs935415	C	G	6149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=87;PP=2965;SC=GACTCCTGCTCATGGGTACCC;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=186;WE=239016547;WS=239016529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	239016640	rs878134	G	T	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=55;PP=1738;SC=GGGAGACAGGGTGAGCAGTCA;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=239016648;WS=239016630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	239025523	rs11903074	T	C	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=37;PP=1698;SC=GTGGGTCACATGTGTGCCCTC;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=97;WE=239025531;WS=239025513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	239033901	rs10172440	T	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=30;PP=1377;SC=CCAGGCCCATTCACCCACAGG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=239033909;WS=239033891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	239034043	rs10170048	A	C	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=680;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CACAGCCCCAAGTGGGCCACC;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=239034051;WS=239034033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr2	239036416	rs12692214	T	C	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=53;PP=1579;SC=CCGGGGCCCCTAGCCAGCCTC;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=80;WE=239036424;WS=239036406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	239038912	rs57813708	T	C	6301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=105;PP=2965;SC=ACCTGCAGCTTCGGCGCCGCT;SOR=0.838;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=90;TCR=105;TR=195;WE=239038920;WS=239038902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr2	239039057	rs13033248	A	G	4785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=52;PP=1999;SC=GGAGGCCTCAATCCCAGCGGC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=97;WE=239039065;WS=239039047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	239039075	rs13006204	G	T	4596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=47;PP=1851;SC=GGCTGAGCCCGCAGGGTCTGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=90;WE=239039083;WS=239039065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	239039637	rs4663845	T	C	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=23;PP=867;SC=CTCAAGACAGTGGCCTGCAGG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=239039645;WS=239039627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	239039864	rs202227187	G	A	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1113;ReadPosRankSum=1.171;SC=TTTGTCCCCCGAGCAGTTCCT;SOR=0.976;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=67;WE=239039872;WS=239039854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,90:0.47:190
chr2	239039896	rs10182906	G	C	6072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=78;PP=2965;SC=ACGGGGCTCCGGTGCCCTACA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=174;WE=239039904;WS=239039886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr2	239040187	rs12692215	T	C	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=74;PP=2731;SC=GCAAGTCAGGTCTGACCCTGC;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=132;WE=239040195;WS=239040177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	239049540	rs2241985	G	A	7778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=97;PP=2965;SC=ATGCCACCGCGGCCTCCTGGC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=116;TCR=97;TR=212;WE=239049548;WS=239049530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr2	239050033	rs12692216	C	T	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=70;PP=2402;SC=GCCCGGGCCGCCCACCTGCCC;SOR=1.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=100;WE=239050041;WS=239050023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	239051550	rs935411	T	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=17;PP=445;SC=TTGGGAACTTTGCCTTCTACA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=239051558;WS=239051540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	239053436	rs12623661	G	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=6;PP=617;SC=CAGTGAGGGGGGCATTTCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=239053444;WS=239053426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	239053685	rs13013945	A	C	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=49;PP=1285;SC=CACTGGGCTCAGTGCAACTCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=239053693;WS=239053675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	239054504	rs11674140	G	T	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=72;PP=2319;SC=CTTCCCTGGGGCCTGGTTCTA;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=133;WE=239054512;WS=239054494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	239056746	rs11674655	T	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=284;SC=TGGTGAGGATTGGGGCTCCTG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=239056754;WS=239056736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	239059484	rs7605194	T	C	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=32;PP=1547;SC=TGCATGAGAATGGCGCGCTGG;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=239059492;WS=239059474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	239071244	rs35047785	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TCACTGAGGTAGATCCTTGGC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=239071252;WS=239071234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	239073046	rs6760421	C	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=28;PP=924;SC=TTCGCTCGGCCTCCACAAGCT;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=53;WE=239073054;WS=239073036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	239075812	rs3795905	C	T	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=71;PP=2934;SC=GGAACTCTGCCCACACTGGCC;SOR=0.904;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=131;WE=239075820;WS=239075802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	239075867	.	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=911;ReadPosRankSum=1.000;SC=GCCTACGGACGTGACACGCAC;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=65;WE=239075875;WS=239075857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr2	239075935	rs3820817	A	G	4976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=69;PP=2965;SC=CTTATCCAGGAAAGAAAGAGT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=148;WE=239075943;WS=239075925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	239082166	rs3832064	G	GC	3339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=23;PP=2431;SC=CTCTTATAGGGCCTTTTACCT;SOR=1.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=57;WE=239082174;WS=239082156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	239092474	rs2305173	C	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1204;SC=TCTTATATTTCAAAATGAACC;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=239092482;WS=239092464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	239093788	rs6431588	T	C	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=451;SC=CAATAACCAATTTGAGTATCA;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=239093796;WS=239093778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	239102856	rs3795903	A	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=14;PP=1213;SC=TAAATTTCACATAAGAGTAAA;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=239102864;WS=239102846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	239103574	rs35393292	G	A	4811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=85;PP=2943;SC=TTTTCAAAGAGGAAGATCATG;SOR=1.096;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=53;TCR=85;TR=138;WE=239103582;WS=239103564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	239103603	rs7558210	C	G	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=73;PP=2308;SC=CCTGCTTTGACACAAGTTTGC;SOR=1.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=100;WE=239103611;WS=239103593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	239112344	rs113428548	G	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=268;SC=AGTCCCGGACGCCACCAATCG;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=239112352;WS=239112334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	239133641	rs72992741	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=1.486;SC=TGCCTGGCCCAGGACTTCCTC;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=239133649;WS=239133640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	239133980	rs7558525	C	T	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=905;ReadPosRankSum=1.670;SC=CGAGAGGGCCCGGCTGTGCCC;SOR=0.664;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=53;WE=239133988;WS=239133970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr2	239134056	rs7572285	A	G	3584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,96:0.51:189
chr2	239134063	rs7584376	G	T	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr2	239134138	rs7572392	A	C	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=891;ReadPosRankSum=0.246;SC=ACCATCAGGGACTCTGGAAAC;SOR=0.905;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=52;WE=239134146;WS=239134128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr2	239136143	rs3795902	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.923;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TGACTCTGTCCCCACCTCCCT;SOR=0.058;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=12;WE=239136151;WS=239136133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr2	239139883	rs13425452	G	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=903;ReadPosRankSum=-0.315;SC=ACACATTCGCGAGGGGAGCGC;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=53;WE=239139891;WS=239139873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,63:0.37:171
chr2	239140403	rs35825433	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=-1.938;SC=CCTCAACTTGTGGTGGCCTCT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=239140411;WS=239140393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	239140426	.	A	AC	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	239140434	rs111384196	C	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.002;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	239140728	rs11689033	A	G	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1313;ReadPosRankSum=-1.604;SC=CTGGCTGGAGAAATCCGGTGT;SOR=1.055;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=139;TCF=77;TCR=62;TR=76;WE=239140736;WS=239140718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,88:0.57:154
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chr2	239148996	rs140615710	CCCGT	C	1930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.917;NF=12;NR=17;PP=1289;ReadPosRankSum=0.258;SC=CAGGCGTCCACCCGTCCGTCC;SOR=0.781;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=29;WE=239149007;WS=239148986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr2	239160475	.	T	G	173	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5007;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=58.19;NF=0;NR=10;PP=173;QD=20.7771212547;SC=GGGGTGGGGGTGGGGGGCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=239160483;WS=239160465;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,10:0.67:15
chr2	239165663	rs2304669	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=639;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TGCCCGGCAGTGCCAGCGAGG;SOR=0.598;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=45;WE=239165671;WS=239165653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr2	239181904	rs2304674	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=0.690;SC=TAGCTCTTACAAACTGAGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=25;WE=239181912;WS=239181894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr2	239184581	rs10462023	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=731;ReadPosRankSum=0.491;SC=TAGCTTCCTAGGTGTCCTTTC;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=44;WE=239184589;WS=239184571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr2	239185922	rs2304673	T	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=160;ReadPosRankSum=0.236;SC=GATAACAGGCTAGATAATACC;SOR=0.057;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=239185930;WS=239185912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	239229372	rs13398676	C	A	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1207;ReadPosRankSum=0.834;SC=CGCCGCTGACCGAGAAGCTGC;SOR=0.436;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=93;WE=239229380;WS=239229362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,102:0.46:220
chr2	239229440	rs112673616	A	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,76:0.41:186
chr2	239234396	rs75651012	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=1.282;SC=ACAGAAGATAATGCACACTCT;SOR=1.961;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=15;WE=239234404;WS=239234386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr2	239242719	.	G	GT	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5035;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=2;NR=2;PP=39;QD=10.75;SC=ATGGATATTAGTTTTTTTTTT;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=4;WE=239242727;WS=239242709;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr2	239253266	rs56304316	C	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=602;ReadPosRankSum=1.873;SC=TTCGCCCTTTCCTGGCGAGAG;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=41;WE=239253274;WS=239253256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr2	239306268	rs3739070	A	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=673;ReadPosRankSum=0.157;SC=TGAGCTGCAGATGTGGCACAG;SOR=0.081;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=41;WE=239306276;WS=239306258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr2	239342096	rs41264155	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=1.768;SC=AAGGTGCCCCGTAGCTGGGAG;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=239342104;WS=239342086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	239344263	rs11885523	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GAGGGGGACCGTGTCCATGCT;SOR=0.846;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=12;WE=239344271;WS=239344253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	239344412	rs3191996	C	T	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=990;ReadPosRankSum=-1.332;SC=CGTTGCGAATCGCGGCCACTG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=61;WE=239344420;WS=239344402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr2	239344663	rs11904390	T	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=543;ReadPosRankSum=-0.719;SC=AGGCCAGTACTGTGGAGCTCG;SOR=0.491;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=37;WE=239344671;WS=239344653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr2	240003870	rs1063639	G	A	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.501;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=850;ReadPosRankSum=0.123;SC=ACAGGACGCTGGGGTCGCTGT;SOR=1.213;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=54;WE=240003878;WS=240003860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr2	240016771	rs2279273	C	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1116;ReadPosRankSum=2.329;SC=GGGAGGGAGACGGTCAGAGAG;SOR=0.460;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=138;TCF=44;TCR=94;TR=77;WE=240016779;WS=240016761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr2	240016824	rs2279274	A	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=740;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CCCTGGGCGCACTCCGGGGTC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=36;WE=240016832;WS=240016814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr2	240029736	rs7585225	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=-1.673;SC=CCTGCCCCGGTCGGCGTTACC;SOR=0.742;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=7;WE=240029744;WS=240029726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	240048505	rs3828206	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CAGCCCAGGCGTTCTGCCCTG;SOR=0.275;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=240048513;WS=240048495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	240048544	rs3791448	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.940;SC=GCTAACTGGGCCCCTTCCAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=240048552;WS=240048534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	240055901	rs2278778	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-0.090;SC=AGCGTGGGCAGCCTCAGAGCC;SOR=0.235;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=11;WE=240055909;WS=240055891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	240066417	rs2290087	A	G	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=881;ReadPosRankSum=-2.394;SC=GAAGCTGCACAAAAAGGAGAT;SOR=0.436;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=61;WE=240066425;WS=240066407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,85:0.59:145
chr2	240066526	rs2290088	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=390;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TCAACACTGCTGTGTTGCTGC;SOR=0.118;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=33;WE=240066534;WS=240066516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr2	240158529	rs3842554	A	AAGAAAATCAAAGATCCTT	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=1793;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GTATTTGCCAATGTAGAATAA;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=3;WE=240158537;WS=240158519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr2	240323453	.	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CGGCCGTGAGGGTGTGGGGTG;SOR=1.057;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=11;WE=240323461;WS=240323443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	240323661	rs1709851	C	A	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=61;PP=2961;SC=TGTTGAGTTACAGGTCGGCCC;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=240323669;WS=240323651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	240500413	rs6543554	A	G	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=69;PP=1670;ReadPosRankSum=0.518;SC=TGAATCCACCATCGTACCTGC;SOR=0.939;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=280;TCF=127;TCR=153;TR=119;WE=240500421;WS=240500403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,138:0.42:325
chr2	240500437	rs10180205	C	T	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1695;ReadPosRankSum=2.017;SC=TCTTGGATGCCGTCCGATTGC;SOR=0.685;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=110;TCR=151;TR=107;WE=240500445;WS=240500427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,121:0.40:302
chr2	240504878	rs6719279	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=739;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GGTAGCCATTCTAGTCATAGT;SOR=0.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=44;WE=240504886;WS=240504868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,52:0.40:129
chr2	240721384	rs2898872	C	A	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=962;SC=TGAATTGACTCCTGCTTGGCC;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=240721392;WS=240721374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	240721598	rs12613844	T	G	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1642;ReadPosRankSum=2.076;SC=GACACAGTGATGATTCATACA;SOR=0.386;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=89;WE=240721606;WS=240721588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr2	240900691	rs4077387	C	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=739;ReadPosRankSum=1.306;SC=CGGCAGATGCCTGTACTTCAT;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=58;WE=240900699;WS=240900681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,67:0.48:140
chr2	240922822	rs958960	C	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CTATGAATTTCCAGAAATGGT;SOR=0.112;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=13;WE=240922830;WS=240922812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	240954079	rs11693245	G	A	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1147;ReadPosRankSum=-2.618;SC=TAGTATAAATGCTATTAAAAC;SOR=0.834;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=68;WE=240954087;WS=240954069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr2	240957243	rs6746937	C	T	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=856;ReadPosRankSum=0.871;SC=TGGCTTGCTTCGGCCTCCTCT;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=58;WE=240957251;WS=240957233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr2	240957801	rs10804402	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GGGAGAAAGGGTGGAAGATAC;SOR=0.133;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=17;WE=240957809;WS=240957791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	240958129	rs4149540	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=0.372;SC=TCACTGCATTCCAGAGAAAAG;SOR=0.960;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=11;WE=240958137;WS=240958119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr2	240961728	rs2083411	T	C	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1673;ReadPosRankSum=0.034;SC=CATAGCGCAGTTTGCACTGCA;SOR=0.554;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=95;WE=240961736;WS=240961718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,116:0.50:234
chr2	240961852	rs7596788	A	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=740;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GAAACCTCTTAGTGATAAAAA;SOR=1.348;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=43;WE=240961860;WS=240961842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr2	240964714	rs11541494	G	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=293;ReadPosRankSum=0.477;SC=GAGCCGCAAGGCCATGGCTAC;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=20;WE=240964722;WS=240964704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	241066280	rs4292120	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=737;ReadPosRankSum=-0.322;SC=ACATTAGCGCCTCCGCCCCCT;SOR=0.904;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=43;WE=241066288;WS=241066270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,60:0.51:118
chr2	241073170	rs747741	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=0.364;SC=AATAAGGCTGCCTGCCAGTGG;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=11;WE=241073178;WS=241073160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	241073450	rs3749078	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AAGGTTATGTCAGGTGCGTTT;SOR=0.204;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=13;WE=241073458;WS=241073440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	241075809	rs13406410	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=591;ReadPosRankSum=1.405;SC=GGTGCCCGCCCGCTGGGGTGC;SOR=1.257;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=33;WE=241075817;WS=241075799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr2	241079884	rs508944	A	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=1.775;SC=GCATGGATTTAAAAAAAAAAT;SOR=0.409;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=15;WE=241079892;WS=241079874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr2	241375527	rs2352823	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GCGCCGGGAACCCGGGCCTGG;SOR=0.374;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=14;WE=241375535;WS=241375517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	241390516	rs3828336	C	T	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=35;PP=1456;ReadPosRankSum=1.275;SC=GGTGAGCGGCCGAGTTCCTTT;SOR=0.556;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=171;TCF=109;TCR=62;TR=90;WE=241390524;WS=241390506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,107:0.51:211
chr2	241390828	rs140201581	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=0.987;SC=GTGGGTGTACGGGAAGCTAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=241390836;WS=241390818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	241392491	rs4268920	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr2	241395353	rs12695019	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=252;ReadPosRankSum=0.373;SC=GGCCGCCTCGATCCAGCCTGC;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=16;WE=241395361;WS=241395343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr2	241395503	rs2292832	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr2	241401566	rs35971355	G	A	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=3;PP=227;SC=CTGCCACGGCGGGGGAAACAT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=241401574;WS=241401556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	241403955	rs3830536	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	8207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=27;PP=2967;SC=TGCACACGTGGTGACGCCTGC;SOR=1.863;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=50;WE=241404002;WS=241403945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	241404213	rs41266965	T	C	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=66;PP=2208;SC=GTCCTGGATGTGGCCCCATTG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=119;WE=241404221;WS=241404203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	241404317	rs2229458	C	T	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=48;PP=1663;SC=CCCAGGGCCCCGGGCCTGAGG;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=241404325;WS=241404307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	241404968	.	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=880;ReadPosRankSum=-1.032;SC=TCACCAAGCCGGACATGACCA;SOR=0.464;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=62;WE=241404976;WS=241404958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr2	241405400	rs10700206	C	CGTG	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=507;SC=TCACCTGGCACGGGCCCTTAC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=241405408;WS=241405399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	241405485	rs2228330	C	T	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=8;PP=785;SC=GTGACGACGGCAGCGGCTCGG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=241405493;WS=241405475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	241405528	rs2228331	A	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=28;PP=1145;SC=TGACCTCTGCAGCCGGAAGGT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=241405536;WS=241405518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	241405873	rs62187180	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GCCTGGCCTCGCCTGCCTTTC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=241405881;WS=241405863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	241465261	rs35186665	G	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1240;ReadPosRankSum=0.367;SC=CGTTGTGGCAGTGAGTCTGGA;SOR=0.803;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=77;TCR=115;TR=85;WE=241465269;WS=241465251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,103:0.45:228
chr2	241465361	rs68048482	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=271;ReadPosRankSum=0.903;SC=GAGGCCACCCTATGGCAGGGC;SOR=1.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=15;WE=241465369;WS=241465351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr2	241492255	rs4676428	G	T	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CCCCAGGACCGAAATATCTTT;SOR=0.949;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=87;WE=241492263;WS=241492245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,105:0.55:191
chr2	241492528	rs10933614	A	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-1.092;SC=ACCTGACGGGATGCCCTTGAG;SOR=0.509;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=21;WE=241492536;WS=241492518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr2	241496567	rs7609147	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=459;ReadPosRankSum=-2.255;SC=CCTGGGCCCCAGGTCAGGGTC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=34;WE=241496575;WS=241496557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr2	241512470	rs2001823	G	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=540;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTCCCCGGCCGGGGCTATGGG;SOR=1.809;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=27;WE=241512478;WS=241512460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr2	241516094	rs34344571	G	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1201;ReadPosRankSum=0.879;SC=CAGCTGCCTCGGCCAGCGCCA;SOR=0.556;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=92;WE=241516102;WS=241516084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,111:0.53:211
chr2	241516241	rs76791955	C	T	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1744;ReadPosRankSum=-1.065;SC=GCGGCCCAGCCCTGACCTGCC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=101;WE=241516249;WS=241516231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,110:0.54:202
chr2	241526259	rs55650580	T	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=152;ReadPosRankSum=0.366;SC=CGGCGGCGGCTGACTCGCCTT;SOR=0.513;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=11;WE=241526267;WS=241526256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	241528927	rs55893551	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TCCTGGAGCCGGTTTCTTTTT;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=241528935;WS=241528917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr2	241528968	rs55976923	G	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=0.847;SC=GTACCAGGAGGCCTTGCGAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=241528976;WS=241528958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	241531479	rs3792269	A	G	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=819;ReadPosRankSum=-0.667;SC=AGGACAGGCCAGGCCGCTGGG;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=56;WE=241531487;WS=241531469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,67:0.59:114
chr2	241531575	rs3792270	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CAGGTGAGGCACGTGGCCAGC;SOR=1.270;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=241531583;WS=241531565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr2	241531737	rs2975762	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=-1.472;SC=ACCTTCCCCTACTGTCCTCTT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=241531745;WS=241531727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	241531954	rs56027088	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=546;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GGCCAGGTGTGGTGGCTCACA;SOR=1.027;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=30;WE=241531962;WS=241531944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr2	241533845	rs2975763	T	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=11;PP=551;SC=GGCACGGGGTTGCTGGCAGGA;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=241533853;WS=241533835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr2	241534163	rs17846975	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=0.049;SC=CACGTGCTCTGCCTGCCGAAG;SOR=0.239;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=21;WE=241534171;WS=241534153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
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chr2	241537569	rs17846981	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AGTGCTCGCCTGTCCCCCCAC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=34;WE=241537577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	241537617	rs58715822	TC	T	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=572;ReadPosRankSum=-1.875;SC=CCCCTATCTGTCCTGGCAGAC;SOR=0.965;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=17;WE=241537625;WS=241537607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr2	241538061	rs55878652	T	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=477;ReadPosRankSum=0.298;SC=CCCATCTGTCTTTGCAGGTCT;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=36;WE=241538082;WS=241538051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr2	241538074	rs2975766	A	G	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=41;PP=1826;SC=GCAGGTCTCCATCATGGCAGT;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=91;WE=241538082;WS=241538051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	241538229	rs2975767	A	G	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=489;SC=CCCTGCCAGGAGGCTGCGGCC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=241538237;WS=241538219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	241555784	rs12052926	G	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=190;ReadPosRankSum=1.206;SC=TTCCTCCTCCGTCTCTCTATT;SOR=0.317;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=241555792;WS=241555774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	241555991	rs1509	G	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=0.379;SC=CTGCCAGGGGGCTCATGATAT;SOR=1.299;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=23;WE=241555999;WS=241555981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr2	241558397	rs6437353	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=279;ReadPosRankSum=-1.341;SC=ACTCCACACCGTGGCAGTGAA;SOR=0.817;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=21;WE=241558405;WS=241558387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr2	241558547	rs7582275	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=1.232;SC=GGGGGTTTGTGCCACCTTAGA;SOR=1.005;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=29;WE=241558555;WS=241558537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	241569329	rs2975785	A	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=25;PP=1393;SC=CCCCCTGCTCACTCTCTGCTG;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=71;WE=241569337;WS=241569319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	241569454	rs139197368	G	A	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1493;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CTACTTGGGCGTCCTGCTGGT;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=92;TCR=73;TR=93;WE=241569462;WS=241569444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,109:0.53:207
chr2	241569585	rs35155396	C	T	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TGCTGTGCACCTTGCCCTTCG;SOR=0.711;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=94;WE=241569593;WS=241569575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,106:0.54:195
chr2	241569849	rs12468377	C	T	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1316;ReadPosRankSum=1.119;SC=AGGAGGGCGGCTTCTGCTTCA;SOR=0.492;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=80;WE=241569857;WS=241569839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,83:0.51:163
chr2	241570092	rs12468453	C	T	4009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=62;PP=2420;ReadPosRankSum=-1.913;SC=CAGTGCGCCTCGCAGTGGGCT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=308;TCF=185;TCR=123;TR=160;WE=241570100;WS=241570082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,187:0.50:372
chr2	241570127	rs12468485	C	T	4691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=87;PP=2636;ReadPosRankSum=0.412;SC=CTCCTGGAGACGATCCGTCGC;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=372;TCF=195;TCR=177;TR=189;WE=241570135;WS=241570117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,222:0.50:448
chr2	241570249	rs3749172	A	C	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.832;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CGTGGCTCCCAGTGCTAAGGC;SOR=1.499;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=64;TCR=138;TR=200;WE=241570257;WS=241570239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,215:1.00:216
chr2	241570391	rs2975786	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=16;PP=512;SC=AAGGAGCCCGAGATCAGCCCT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=241570399;WS=241570381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	241621811	rs376333472	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQRankSum=0.110;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	241622002	rs182755222	C	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-1.989;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.050;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr2	241622009	rs192736899	C	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQRankSum=-2.662;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.550;SOR=1.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr2	241622103	rs116505219	A	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.360;NF=8;NR=10;PP=235;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CATCTCCAGGAAGCAGGCCCC;SOR=1.329;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=18;WE=241622111;WS=241622093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr2	241622126	rs192451353	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=-6.538;QD=6.29;ReadPosRankSum=2.592;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
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chr2	241627213	rs115170552	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=487;ReadPosRankSum=-1.122;SC=TGGCCCTGCCGTGGGCAGCAT;SOR=0.922;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=36;WE=241627221;WS=241627203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr2	241627410	rs62187800	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=0.750;SC=GTGGCCACAGGCCACCCGAGG;SOR=0.492;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=21;WE=241627418;WS=241627400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr2	241627928	rs1560619	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=858;ReadPosRankSum=0.517;SC=TGCACAGGACAGGTAGGCAGA;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=62;WE=241627936;WS=241627918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,76:0.54:141
chr2	241628022	rs145746752	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=455;ReadPosRankSum=0.115;SC=ATTTCAGCTCGTCTCCCCCGA;SOR=0.970;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=33;WE=241628030;WS=241628012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr2	241631390	rs146209567	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-6.779;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,18:0.20:92
chr2	241631476	rs4328629	C	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.219;NF=12;NR=13;PP=417;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GCAGCTCGGGCCCTGCTGCCT;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=25;WE=241631484;WS=241631466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr2	241659368	rs6437368	C	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=244;SC=GAAGTGCTGCCCACTGCAGGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=241659376;WS=241659358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	241661112	rs11886385	A	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=863;ReadPosRankSum=0.121;SC=ACGTGTTCCTAGGAAACTCTT;SOR=1.221;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=47;WE=241661120;WS=241661102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr2	241661192	rs11901423	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.241;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CGAGCCCTGCGGGGCAGCCTG;SOR=0.446;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=70;WE=241661200;WS=241661182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,84:0.45:187
chr2	241674222	rs3755533	T	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.675;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=297;ReadPosRankSum=1.430;SC=GGGAGCGGGGTGGGGGACAGG;SOR=1.556;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=21;WE=241674230;WS=241674212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr2	241680633	rs4414678	G	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.847;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	241680644	rs1013225	G	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=6;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=588;ReadPosRankSum=-1.322;SC=CGCACCCCCCGACACACACTC;SOR=1.721;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=18;WE=241680652;WS=241680623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr2	241680802	rs56024577	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=330;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GCACTGTAGGGACAGGAGGGA;SOR=0.720;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=27;WE=241680810;WS=241680792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr2	241684660	rs1529665	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.483;SC=CAGCTGTAAATCCATCAAGGG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=241684668;WS=241684650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	241696840	rs10594016	ATCC	A	1990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr2	241702561	rs11688298	T	A	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=335;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CAGCAGGCAGTTGGGGGTGGC;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=23;WE=241702569;WS=241702551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr2	241708675	rs2288753	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=0.759;SC=GCTTCCAGCACTGGCCTCAGC;SOR=1.646;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=18;WE=241708683;WS=241708665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	241713429	rs2288751	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GAACAGGGCCTATGCAGGCCC;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=241713437;WS=241713419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	241713646	rs1063353	A	G	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=866;ReadPosRankSum=0.160;SC=GCAGGACTCAAGGCTGCCACC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=60;TCR=86;TR=65;WE=241713654;WS=241713636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr2	241722613	rs2288749	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGACCTGTGCAGTGTGGAGTG;SOR=1.091;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=15;WE=241722621;WS=241722603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr2	241725637	rs74002922	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CCACACCTCCGCGGGGGCACA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=241725645;WS=241725627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	241726646	rs2288746	A	G	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.991;SC=CCCAGCGGCCAACGGCAGGCG;SOR=0.764;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=212;TCF=116;TCR=96;TR=109;WE=241726655;WS=241726636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,120:0.50:242
chr2	241728843	rs2288745	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=467;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CCAGACAAGCCAGGCCCCCAA;SOR=0.420;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=32;WE=241728851;WS=241728833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr2	241737017	rs10167412	C	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=674;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GACCATGGCCCCCAGCAACCC;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=48;WE=241737025;WS=241737007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr2	241808825	rs140694338	AGGCCTCCCT	A	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=2211;SC=CCATCCTTCAAGGCCTCCCTG;SOR=2.494;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=241808841;WS=241808815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	241810957	rs10196315	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=607;SC=TCCTTCTGCCCCTGGTCCCCA;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=241810965;WS=241810947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	241812566	rs12997245	G	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=411;SC=CCGATGCTGCGGATTCGGCCC;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=241812574;WS=241812556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	241815307	rs12478859	CA	TG	8747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=63;PP=2947;SC=CATCTGCCCCCAACCCTGCCC;SOR=1.251;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=103;TCR=67;TR=166;WE=241815316;WS=241815297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	241815473	rs12695032	G	A	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=67;PP=1921;SC=CTGGATTGTCGAGGGCGCGGC;SOR=2.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=81;WE=241815481;WS=241815463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	241816545	rs6732985	C	T	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=24;PP=1344;SC=AGCAGTGCTGCGGAGGATGCC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=241816553;WS=241816535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	241818279	rs4273214	C	A	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=71;PP=2515;SC=ACACACCTGTCCCATGCCCAC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=137;WE=241818287;WS=241818269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	241827618	rs6707763	T	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=194;SC=GCTGCTGACCTGGGAGAGAAT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=241827626;WS=241827608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	241827696	rs4675869	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=591;SC=AGGCCCCCGCAGCCAGCACCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=241827704;WS=241827686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	241828012	rs6708304	T	C	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=76;PP=2257;SC=CGCCCTGCAGTTCTGCCCAGT;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=106;WE=241828020;WS=241828002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	241828034	rs6707568	A	G	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=48;PP=1346;SC=CTCGGGCGCCAGGAAGAGCAC;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=241828042;WS=241828024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	241830944	rs10171053	G	T	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=24;PP=1436;SC=TGACCAGGAGGGTGCGCCTAC;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=76;WE=241830952;WS=241830934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	241830969	rs10171067	G	A	4950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=33;PP=1911;SC=AGAGCTGGGCGCTGGCCGGCA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=97;WE=241830977;WS=241830959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	241831005	rs10195453	C	T	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=51;PP=2768;SC=GGCTGAGGATCCTTCTCAAGC;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=129;WE=241831013;WS=241830995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	241831264	rs6737320	G	A	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=47;PP=1727;SC=CTGCCAACTTGGCCCCTGCCC;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=241831272;WS=241831254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	241831296	rs6709469	C	G	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=38;PP=1612;SC=TCACCTGCAGCCCTCTCTGCT;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=241831304;WS=241831286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	241831471	rs6709742	CA	TG	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=781;SC=CAGCGTCCTACATGAGGTTTT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=241831480;WS=241831461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	241834770	rs4293565	A	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=80;SC=CACACACAGAAGACAGTCGCC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=241834778;WS=241834760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	241834944	rs4468809	T	C	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=47;PP=2370;SC=CGATGGCTGCTACCAGCAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=122;WE=241834952;WS=241834934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	241835379	rs12105122	G	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=610;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GCACCTGCACGGCCATGGCTG;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=30;WE=241835387;WS=241835369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr2	241835421	rs13426919	A	G	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=16;PP=543;SC=GCATCCCTTCAACAGTGGCAG;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=241835440;WS=241835411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	241835432	rs10933514	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=15;PP=471;SC=ACAGTGGCAGGTGAGGGCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=241835440;WS=241835411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	241861904	rs4514870	G	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=12;PP=881;SC=CCCAGCCCCTGCCTGGCGGGT;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=241861912;WS=241861894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	241865156	rs4675847	T	C	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=62;PP=2594;SC=CCGGCCTCTGTCAGGTGAACG;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=136;WE=241865164;WS=241865146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	241868956	rs4407242	G	A	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=4;PP=223;SC=ACTCCGCTCCGTTACAGCCTA;SOR=1.445;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=241868964;WS=241868946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	241869378	rs6756731	A	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=354;SC=ACGTCCCCAGATCATCTCCTG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=241869386;WS=241869373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	241871956	rs12472087	G	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=1154;SC=GGTCCCTGCAGTGCACTTTGA;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=241871964;WS=241871946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	241872597	rs4441463	A	G	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=41;PP=1467;SC=GCCAGTCTCCAGGAGCAGCTG;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=241872605;WS=241872587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	241889171	rs12479396	G	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=214;SC=ACCAGGTCCCGGGGAATGGCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=241889179;WS=241889161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	241889937	rs4077132	A	G	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=48;PP=1546;SC=GGTGATGGTGAGGCTGGGGGG;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=241889945;WS=241889927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	241898824	rs10169006	A	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=29;PP=923;SC=GAGAGCCTCCAGGACCTAGCG;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=241898832;WS=241898814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr2	241974289	rs2074822	G	A	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=384;SC=CACCTCAGGCGTGTGAAACTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=241974297;WS=241974279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	241976615	rs34203344	CG	C	4897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=55;PP=2951;SC=ACTCCTCATCCGGGTTCCCGC;SOR=1.171;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=87;WE=241976623;WS=241976605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	241979550	rs7571117	T	C	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=68;PP=2486;SC=AGGTGGAGAATGGCTCTGCGG;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=127;WE=241979558;WS=241979540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr2	241987554	rs7590504	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=361;SC=GGGAGATGCTGAGCTCCATGG;SOR=2.985;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=241987562;WS=241987544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	241991029	rs10206324	A	G	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=10;PP=499;SC=CCCCTGCTGCAGCCAGGCCCC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=241991037;WS=241991019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	241991875	rs57214830	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=527;ReadPosRankSum=1.057;SC=TGGGACGCCGGTGCCAGGCAG;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=37;WE=241991883;WS=241991865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr2	242002828	rs7581709	C	T	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=26;PP=1986;SC=GGAGGTGGCACGCCTCCCGAG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=71;TCR=26;TR=97;WE=242002836;WS=242002818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	242003487	rs17852471	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=672;ReadPosRankSum=0.343;SC=AGAGCGGCGGCGGGGCCTACC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=51;WE=242003495;WS=242003477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr2	242003558	rs34771867	T	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=42;PP=1040;SC=GCGGCAGGCCTGCCTGCTCCC;SOR=1.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=242003566;WS=242003548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	242004199	rs2286319	G	C	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=46;PP=2321;SC=GAGCAAGGGCGGGGCTGGAGC;SOR=1.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=125;WE=242004207;WS=242004189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	242004219	rs11464431	T	TG	7742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=66;PP=2957;SC=CAGGGACCCCTGCCACGCCCC;SOR=1.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=111;WE=242004227;WS=242004209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr2	242004866	rs2286321	A	G	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1528;ReadPosRankSum=-1.811;SC=ACCGCCGCACAGACTTTGTGG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=96;WE=242004874;WS=242004856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,112:0.61:184
chr2	242007465	rs5839780	AC	A	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-1.442;SC=TGTGGACTGTACCACCTGCCG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=242007473;WS=242007455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	242009273	rs13000549	G	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=228;ReadPosRankSum=0.522;SC=TTCTCAAACCGTGTTCTTGCC;SOR=0.495;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=242009281;WS=242009266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	242011151	rs6760731	A	G	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=10;PP=593;SC=TGCCCCACCCATCGGCCCCAT;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=32;WE=242011159;WS=242011141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	242011330	rs6746124	C	A	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1163;ReadPosRankSum=0.620;SC=CTTGGTGGCCCACCCTCGTCC;SOR=0.491;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=73;WE=242011338;WS=242011320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,96:0.62:154
chr2	242021000	rs140631844	A	ATCAGG	2786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=2162;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GCCACCCTGCATCAGGTCATC;SOR=0.444;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=38;WE=242021008;WS=242020990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr2	242021216	rs2302045	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=972;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TCGGTAAGTCGGGGCTTGGCC;SOR=0.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=52;WE=242021224;WS=242021206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr2	242021742	rs2108485	G	T	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1284;ReadPosRankSum=1.114;SC=CGAGACAAAGGCCTTTCCAGT;SOR=0.618;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=80;WE=242021750;WS=242021732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,95:0.47:201
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chr2	242027926	rs2067987	T	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TCAGCACTGCTAAAGGAAGCG;SOR=0.136;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=8;WE=242027934;WS=242027916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr2	242039198	rs3796093	T	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=981;ReadPosRankSum=0.632;SC=TTGGAGGCTGTAGTCAGTTTG;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=55;WE=242039206;WS=242039188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,59:0.49:120
chr2	242047530	rs34777851	G	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=838;ReadPosRankSum=0.024;SC=AAAAAAAGTGGCTGGTCTCTA;SOR=0.733;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=46;WE=242047538;WS=242047520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,55:0.38:145
chr2	242047718	rs55792951	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=0.034;SC=CTCTGTAGCTGTGAGGAGGAG;SOR=0.589;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=39;WE=242047726;WS=242047708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr2	242047750	rs6708265	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=508;ReadPosRankSum=0.923;SC=ACGCCACGGCACTCAGCGCAG;SOR=0.651;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=28;WE=242047758;WS=242047740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr2	242062117	rs2302048	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=1511;ReadPosRankSum=0.156;SC=AGTGGTGCCCGGCGCCACTCC;SOR=0.635;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=44;WE=242062138;WS=242062107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
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chr2	242062410	rs2302051	C	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCAGCCGCCCGAGGCAGGTG;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=242062418;WS=242062400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	242063350	rs13385610	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=1.027;SC=CAGGCATTGATTGCAAATACC;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=9;WE=242063358;WS=242063340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	242063448	rs2302052	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=423;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GGGTCCTGGCGGCTGAGTCGC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=29;WE=242063456;WS=242063438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr2	242065601	rs75080735	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.778;NF=20;NR=15;PP=437;ReadPosRankSum=0.215;SC=CTATGGGGCCCGGGACATACT;SOR=0.415;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=35;WE=242065609;WS=242065584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr2	242065624	rs2240541	A	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.789;NF=19;NR=12;PP=412;ReadPosRankSum=-2.026;SC=GCCGTAAGCCATCTCGATGGT;SOR=1.004;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=31;WE=242065632;WS=242065614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr2	242065944	rs35129131	C	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=977;ReadPosRankSum=-1.852;SC=AGTAACAGCTCCCTGTCATCC;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=64;WE=242065952;WS=242065934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr2	242066314	rs2240542	T	C	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=59;PP=2779;SC=CCAGGGCTCCTGCAAGGCTCA;SOR=1.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=143;WE=242066322;WS=242066304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	242066830	rs2240544	G	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1212;ReadPosRankSum=1.404;SC=CCTGTTCACCGTGCACTGGCA;SOR=0.944;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=52;TCR=98;TR=70;WE=242066838;WS=242066820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
chr2	242072280	rs11684830	G	A	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=23;PP=1872;SC=CTCCCACCAAGGGACTTACCC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=80;WE=242072288;WS=242072261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	242072357	rs34401965	G	A	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1176;ReadPosRankSum=-1.769;SC=TCTGAGTCCCGGTGAAGATGT;SOR=0.572;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=75;WE=242072365;WS=242072347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,93:0.44:211
chr2	242077321	rs11696044	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=1.206;SC=GGATTCAGAGCTAAGAACTCC;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=242077329;WS=242077311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr2	242077348	rs10933530	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=259;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TCACACAGTGCGGGAGGTCAG;SOR=0.705;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=17;WE=242077356;WS=242077338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr2	242077496	rs1470414	C	T	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=794;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CATGACGTGACGGTGCCCTGG;SOR=0.685;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=52;WE=242077504;WS=242077486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr2	242078057	rs11681962	T	C	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=982;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TGAGGCAAAGTTGCACACTCA;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=67;TCR=10;TR=45;WE=242078065;WS=242078047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
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chr2	242079007	rs2074828	A	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=849;ReadPosRankSum=-0.536;SC=ACTGCAAAACATTAGTGAAGC;SOR=0.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=61;WE=242079015;WS=242078997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr2	242079103	rs6728712	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-1.234;SC=GCGATGATTCGTTCTTAAAGG;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=16;WE=242079111;WS=242079093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	242079261	rs11676695	C	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=383;ReadPosRankSum=0.620;SC=CACTGCTGGTCTTGAGGCCAG;SOR=1.358;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=18;WE=242079269;WS=242079251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr2	242079553	rs10933532	C	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=0.042;SC=GACGACCATGCAGAAGCCAGC;SOR=0.747;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=27;WE=242079561;WS=242079543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr2	242082222	rs2074834	C	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	242082262	rs6709462	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=6;PP=552;SC=CAGAGAGCGCTGTCCTGCTCT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=242082270;WS=242082252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	242082480	rs758068	A	C	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=34;PP=1175;SC=CAAGCTTCCAACTCTAACAAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=242082488;WS=242082470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	242082559	rs2066941	T	C	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=470;SC=CCAACTAATTTATAATGCTGA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=242082567;WS=242082549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	242088921	rs3806599	A	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=2;PP=409;SC=CACAGCGACTAGCACCGATTG;SOR=2.636;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=242088929;WS=242088911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	242098115	.	G	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TCTTTACTGGGAGCACAGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=11;WE=242098123;WS=242098105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	242099961	rs2017989	C	T	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=35;PP=1133;SC=AGCTAGCGGGCTGTGTGTGGA;SOR=1.539;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=242099969;WS=242099951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	242105939	rs11694223	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=579;ReadPosRankSum=-1.808;SC=CACACACTGGCCTCTCGGGCC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=32;WE=242105947;WS=242105929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr2	242121959	rs34186191	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=883;SC=ACACCTGCTCGCCATCTTCTG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=242121967;WS=242121949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	242122130	rs113069444	A	G	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=47;PP=1393;ReadPosRankSum=1.087;SC=GCCTGGAGACAGTGTACCTGG;SOR=0.664;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=94;WE=242122138;WS=242122120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,106:0.45:238
chr2	242122602	rs1974555	T	G	107.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGCATTCACGTGCTGTCCGAG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=242122610;WS=242122601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	242139491	rs2013250	C	T	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=38;PP=2804;SC=GAGCCACTGACGTTTCCTTCC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=98;TCR=38;TR=136;WE=242139499;WS=242139481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	242141719	rs2074840	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=745;ReadPosRankSum=-0.327;SC=CCCTGCATGACGTGAGCTCGG;SOR=0.569;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=48;WE=242141727;WS=242141709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr2	242142737	rs1179530	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=5;PP=426;SC=CCACAGGCCGTTCGCCCCCAG;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=242142745;WS=242142727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	242149073	rs10192730	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=49;SC=CCTGCCCTCCGCTCACGCCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=242149081;WS=242149063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	242150091	rs58527121	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=0.533;SC=CTCATTTCTATTTCTTTCTTC;SOR=0.200;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=18;WE=242150099;WS=242150081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	242151585	rs7593101	C	T	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=50;PP=1870;ReadPosRankSum=-1.435;SC=TCAACTTCTACTCCTCACCCG;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=263;TCF=148;TCR=115;TR=117;WE=242151593;WS=242151575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,158:0.46:346
chr2	242151748	rs7566006	G	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=424;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CGGAGACCCAGGCAGGGGACA;SOR=0.285;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=28;WE=242151756;WS=242151738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr2	242157228	rs78605785	G	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=723;ReadPosRankSum=1.449;SC=ACCGGCGCCCGGTGGCCGAGC;SOR=1.291;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=46;WE=242157236;WS=242157218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr2	242163359	rs7590653	G	A	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.414;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1231;ReadPosRankSum=2.591;SC=TGAGCAGCCCGAGGGCTCAGA;SOR=0.379;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=76;WE=242163367;WS=242163349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,102:0.56:181
chr2	242168976	rs15129	T	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=425;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TGGTTGGGTTTGGGTCAGCAG;SOR=0.223;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=21;WE=242168984;WS=242168966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr2	242176019	rs2305073	T	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=521;ReadPosRankSum=1.687;SC=GGGGGGCACATGGACACATAC;SOR=1.031;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=30;WE=242176027;WS=242176009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr2	242179134	rs10153800	G	A	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1712;ReadPosRankSum=1.501;SC=CCATCACCCCGCCATACTCTT;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=99;WE=242179142;WS=242179124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,120:0.54:224
chr2	242192848	rs7578199	T	C	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1405;ReadPosRankSum=0.902;SC=CTGGGCCACATTGACATCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=79;WE=242192856;WS=242192838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,95:0.51:186
chr2	242203916	rs11891776	A	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=22;PP=764;SC=CAGGCTCCAGAGGGTTCCTGG;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=242203924;WS=242203906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	242206956	rs35334418	C	T	4553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=55;PP=2647;SC=CTCCTAACAGCGACCTTGGTT;SOR=1.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=139;WE=242206964;WS=242206946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	242255830	rs13006939	C	T	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=600;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GCCATTTCCTCCCTGAGGCGT;SOR=0.737;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=44;WE=242255838;WS=242255820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr2	242259614	rs6745662	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=338;ReadPosRankSum=-1.053;SC=CCTTTTCTCTGTAGAGGCTTG;SOR=1.341;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=24;WE=242259622;WS=242259604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr2	242274489	rs56390510	G	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TTAACCGATTGAATGGTGTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=242274497;WS=242274479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	242283071	rs6750169	C	T	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=494;SC=TTGTAGTCAACAGCAATGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=242283079;WS=242283061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	242283094	rs6707518	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=818;SC=AGTCTGTGCTAATGTTCTCGT;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=242283102;WS=242283084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	242287487	rs12619647	T	G	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TAGAATTTTTTGGGGGGGTAG;SOR=0.289;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=12;WE=242287495;WS=242287477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	242289663	rs3217007	C	CATT	1244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=880;SC=CAGTTACTAACATTGTGTCAG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=18;WE=242289671;WS=242289653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	242312477	.	G	GT	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5009;HP=13;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=18;MQ=58.73;NF=3;NR=0;PP=27;QD=10.6666666667;SC=CCTTCATGTGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=242312485;WS=242312467;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	242374215	rs35614125	C	T	66.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	242374238	rs56352948	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.444;SC=GCAATAGAGCGAGACTCAGTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=242374246;WS=242374228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	242374358	rs16843671	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=386;ReadPosRankSum=1.707;SC=TTATTAAAAATCTGAATCTTT;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=27;WE=242374366;WS=242374348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr2	242374519	rs34882686	C	T	272.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	242396033	rs2074775	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=360;ReadPosRankSum=1.365;SC=GTACATACACATTTTACAGGA;SOR=0.986;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=26;WE=242396041;WS=242396023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr2	242396057	rs192949940	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=865;ReadPosRankSum=1.152;SC=GCCTGGCACTGTGTGAGGCTG;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=52;WE=242396065;WS=242396047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr2	242396087	rs2074774	A	T	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=27;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TGGTCAGGAGAGTAGTAGCGG;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=164;TCF=110;TCR=54;TR=85;WE=242396095;WS=242396077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,102:0.50:204
chr2	242402061	rs13011791	T	A	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=55;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GATTTTTTTTTAAAATAAATC;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=58;TCR=112;TR=84;WE=242402069;WS=242402051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,94:0.50:187
chr2	242405021	rs2240482	C	T	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1505;ReadPosRankSum=0.371;SC=CAGTGCAGGTCGTGCATTGAC;SOR=0.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=225;TCF=115;TCR=110;TR=93;WE=242405029;WS=242405011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,115:0.43:266
chr2	242407478	rs10933558	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=351;ReadPosRankSum=0.775;SC=GGCACCTGCCATCAAGGAAAA;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=26;WE=242407486;WS=242407468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr2	242407746	rs10933559	A	G	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=730;ReadPosRankSum=-0.955;SC=TGCGCCGCCTATGCGGACATT;SOR=0.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=50;WE=242407754;WS=242407736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr2	242415523	rs73006397	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CACAGTGGCTCATACCTGTAA;SOR=1.828;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=16;WE=242415531;WS=242415513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr2	242432704	rs2271030	G	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=344;ReadPosRankSum=0.891;SC=ATGCTGTCTTGCAGGATGACT;SOR=0.756;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=17;WE=242432712;WS=242432694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	242433348	rs2018761	A	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=23;PP=1294;SC=TGCTTGTCCCATATCCTGGGT;SOR=1.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=63;WE=242433356;WS=242433338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	242440221	rs13013693	G	A	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TCTGGGACCGGAGACAAACCC;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=77;WE=242440229;WS=242440211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr2	242443377	rs35172632	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=551;ReadPosRankSum=1.072;SC=CGACACTTCCGTGTGAAACTG;SOR=0.954;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=41;WE=242443385;WS=242443367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr2	242590237	rs4464318	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=431;SC=AGGGCCTCCTTCTCTTTCCTA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=242590245;WS=242590236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	242594622	rs6712888	C	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=19;PP=1241;SC=CCTGGCACCACGTGCCACCAG;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=242594630;WS=242594612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	242605962	rs4675930	C	T	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=50;PP=2965;SC=GGCTTTGTACCGCCCTTTTTC;SOR=1.382;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=98;TCR=50;TR=148;WE=242605970;WS=242605952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	242607451	rs62190299	T	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=265;SC=TCCCCTCTTGTGTCACCCAGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=242607459;WS=242607447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	242607807	rs35275267	G	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1420;SC=CCCTTTCCCTGATGGTCTGGT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=242607815;WS=242607797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	242607924	rs62190301	A	G	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=42;PP=1963;SC=CGGCTCGGCCACCCACCTGCC;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=109;WE=242607932;WS=242607914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	242609436	rs78151009	C	T	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=13;PP=1105;SC=TGTCCTCACCCGTGAGGAGGA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=242609444;WS=242609426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	242609504	rs111275706	T	C	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=47;PP=2593;SC=GGCGGCAGAATGGTGTCTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=92;TCR=47;TR=139;WE=242609512;WS=242609494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	242609554	rs77157539	C	T	5770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=77;PP=2965;SC=CCCCCCATTTCGTTTCTTTTT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=95;TCR=77;TR=172;WE=242609562;WS=242609544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr2	242609647	rs76692745	G	C	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=73;PP=2017;SC=TGTGATTGCCGGTGACCCTTG;SOR=1.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=103;WE=242609668;WS=242609637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	242609660	rs62190307	C	G	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=63;PP=1971;SC=GACCCTTGGCCGGTCCCCTGT;SOR=1.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=242609668;WS=242609637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	242609987	rs34509415	G	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	242609992	rs35803955	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.79;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	242610253	rs35454903	T	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=37;PP=893;SC=AGACAGGCAGTGGGGCGTGCA;SOR=3.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=242610261;WS=242610243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	242610738	rs11538896	T	C	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=47;PP=2913;SC=TGTCTCTGCTTGGAGGTGCCC;SOR=1.475;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=99;TCR=47;TR=146;WE=242610746;WS=242610728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	242610773	rs7601000	T	A	5859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=72;PP=2965;SC=CTGGTGGAGCTGCAGCCTTCA;SOR=1.157;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=112;TCR=72;TR=184;WE=242610781;WS=242610763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	242611547	rs34859751	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=23;PP=1539;SC=AAGGGCCCTTGACTCACACCC;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=73;WE=242611555;WS=242611537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	242612909	rs1130906	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=5;PP=182;SC=TCGGGGAGCCAGAGATCCCCG;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=242612917;WS=242612904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	242613089	rs7943	A	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=21;PP=639;SC=CTTGGGCTCCACGTCCGAGTT;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=242613097;WS=242613079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	242613133	rs7740	T	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=13;PP=363;SC=GCTGCAGTGGTAATGTGTGGG;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=242613141;WS=242613123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	242615462	rs5860	T	C	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.72;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	242615472	rs3209844	G	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.99;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	242615528	rs34706919	TG	T	2326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=27;PP=1691;SC=GCGTCTCCAGTGGGCAGCCTT;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=43;WE=242615536;WS=242615518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	242617792	rs4076640	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=414;SC=TTGCTGACACAACTGTGCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=242617800;WS=242617784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	242617851	rs4076639	A	G	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=16;PP=1092;SC=CTAGTGTGCAATTCTGGGATT;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=242617859;WS=242617841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	242618171	rs4675905	T	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=691;SC=GGTACCAAGATGTGAGACTGT;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=242618179;WS=242618161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	242618195	rs10663952	C	CTT	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=1049;SC=TATTGTGGCTCGTTTAATTTT;SOR=4.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=242618203;WS=242618185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	242618218	rs4675904	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.75;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	242622370	rs35815994	A	C	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=619;SC=AAAACTTAGCATGGTGGCATG;SOR=1.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=242622378;WS=242622360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	242641566	rs111766881	C	T	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=57;PP=1556;SC=CGGAGTCCTCCGTGCCGCAGC;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=81;WE=242641574;WS=242641556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	242643998	rs35512800	G	A	3348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=42;PP=2425;SC=AAAAAAGACAGAAAACCTTTG;SOR=1.016;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=108;WE=242644006;WS=242643973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	242644173	rs4675889	A	G	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=47;PP=1397;SC=ACCAGAACTGAGTTCTGACAG;SOR=1.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=242644181;WS=242644163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	242651331	rs75067052	A	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=728;SC=AAAACAAAACACAAAACTTGC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=242651339;WS=242651321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	242659067	rs77890618	G	A	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=1221;SC=GGGGGTCCTCGTGGGGGTGAA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=242659075;WS=242659057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	242662761	rs7572153	T	C	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=604;SC=CAGGAGAAGGTGCTCCATGGC;SOR=2.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=242662769;WS=242662751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	242674803	rs77940364	G	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=912;ReadPosRankSum=1.962;SC=TACCCCGTGCGGCGCTTGCCG;SOR=0.858;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=62;WE=242674811;WS=242674793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,79:0.46:171
chr2	242674959	rs62191977	T	G	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=56;PP=1633;SC=AGCTGCGGCGTTTCCGCGTCC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=79;WE=242674967;WS=242674949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	242680366	rs4073890	A	G	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.899;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr2	242680375	rs79423321	C	T	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr2	242680430	rs4073889	A	G	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GTCTCATAGGATCTTCTTCCT;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=72;WE=242680438;WS=242680420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,88:0.53:167
chr2	242681922	rs142473303	C	T	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1712;ReadPosRankSum=0.857;SC=GCAGCGTCCCCGTCTTTGACG;SOR=0.896;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=205;TCF=115;TCR=90;TR=108;WE=242681930;WS=242681912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,116:0.51:229
chr2	242684115	rs4234097	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=609;ReadPosRankSum=0.128;SC=TGCTTCTCTTTGCCCCAAGGT;SOR=0.573;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=38;WE=242684123;WS=242684105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr2	242684394	rs4675884	G	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.579;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=853;ReadPosRankSum=-1.449;SC=GGGACCCCCCGCCAAGGACAG;SOR=2.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=42;WE=242684402;WS=242684383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr2	242688203	rs34519321	C	T	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.451;SC=ACTCTCTGGGCGGCAGTGCCA;SOR=0.840;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=77;WE=242688211;WS=242688193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,95:0.44:217
chr2	242688292	rs34767042	C	T	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1502;ReadPosRankSum=0.713;SC=ACCTGTGTGCCGCCCGCCTGT;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=197;TCF=76;TCR=121;TR=88;WE=242688300;WS=242688282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,103:0.44:235
chr2	242688366	rs35386923	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=712;ReadPosRankSum=1.652;SC=AGGTCTCAGACAGGAGTCACT;SOR=0.307;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=48;WE=242688374;WS=242688356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr2	242688434	rs34077392	T	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=860;ReadPosRankSum=0.264;SC=GTGAGGATGGTCCTGGTGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=15;WE=242688450;WS=242688424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	242688442	rs35249772	T	TC	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=860;ReadPosRankSum=0.539;SC=GGTCCTGGTGTCCCTCGTGCT;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=242688450;WS=242688424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	242688672	rs78280775	C	T	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=18;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.597;SC=ACATGGTGCTCGGGTCACAGG;SOR=0.661;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=113;TCR=34;TR=76;WE=242688680;WS=242688662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,89:0.51:173
chr2	242688870	rs113047262	T	C	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=45;PP=1190;ReadPosRankSum=0.120;SC=CCTGCAGACATCTCCACTCAG;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=67;WE=242688878;WS=242688860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr2	242690745	rs1105273	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=923;ReadPosRankSum=0.081;SC=CTGGAGCACGCGCTGGGCTCC;SOR=1.089;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=58;WE=242690753;WS=242690724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,67:0.54:123
chr2	242743651	rs744986	G	A	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=621;SC=GGGGAGGCCGGGGATCCTTGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=242743659;WS=242743641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	242813124	rs13016102	T	C	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=47;PP=1732;SC=AACTGAATCATAGCCTCTCAC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=89;WE=242813132;WS=242813114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	242839372	rs78233573	G	A	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=747;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TGATGTCCTCGTTCTGCAGGT;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=50;WE=242839380;WS=242839362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,60:0.43:138
chr3	239313	rs35603824	C	CG	503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.414;NF=9;NR=8;PP=198;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GATCCCAGCCCGGGGGGGGTT;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=17;WE=239321;WS=239303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
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chr3	367757	rs162734	G	C	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1207;ReadPosRankSum=1.103;SC=CGTGAGTATTGTTTCAAACGA;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=70;WE=367765;WS=367747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,90:0.44:206
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chr3	386520	rs1499046	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=0.575;SC=TAAATTCTGCCGGGCACTGCA;SOR=1.956;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=23;WE=386528;WS=386510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr3	391001	rs2272524	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTACTTTCCGCTTTTAAAAA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=13;WE=391009;WS=390991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	391100	rs13060847	A	G	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.57;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	402273	.	C	CT	153	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=58.01;NF=0;NR=11;PP=153;QD=14.4545454545;SC=ATTGTACTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=402281;WS=402263;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,11:0.65:17
chr3	403288	rs9824311	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.198;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr3	403297	rs9839027	C	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.676;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr3	403308	rs9824442	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.751;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=903;ReadPosRankSum=-1.714;SC=GTATGACTAGGACATAGAAAA;SOR=1.251;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=17;WE=403316;WS=403278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr3	403345	rs9846775	A	G	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=15;PP=1464;SC=TTTCTTCCACAAAAGTTTAAA;SOR=2.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=72;WE=403353;WS=403335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	404771	rs4684390	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=13;PP=1205;SC=ATGAAACCCACTGGAACATTT;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=404779;WS=404761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	417979	rs3773381	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=263;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TGTGACAACTATTTGTGATTT;SOR=1.676;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=15;WE=417987;WS=417969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr3	417994	rs930237	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=17;PP=925;SC=TGATTTTGACATGTGACAGAA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=49;WE=418002;WS=417984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	418089	rs3773380	C	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=927;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GGCTGGAACACGACATTTTTA;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=60;WE=418097;WS=418079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr3	439963	rs6442827	A	G	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=72;PP=2965;SC=GACTCACCCAATAGAGGTATT;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=153;WE=439971;WS=439953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	440028	rs6771714	T	C	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=87;PP=2350;SC=GGGGCGATAATGATAGCATTT;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=440036;WS=440018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	440088	rs6771803	T	A	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=56;PP=1607;SC=GAGATTATATTTGGGGAAGTC;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=440096;WS=440078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	447069	rs11705894	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=367;SC=TCAATGCTAACACAAATGTCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=447077;WS=447059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	1215013	rs7632166	A	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=1043;ReadPosRankSum=1.155;SC=GTGAGTGTGAATGCTCCAGTA;SOR=0.889;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=65;WE=1215021;WS=1215003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr3	1215083	rs13077503	C	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AAGTGCTTTACGTGAATTATT;SOR=0.430;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=21;WE=1215091;WS=1215073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr3	1320271	rs3732517	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=567;ReadPosRankSum=0.997;SC=CTTAGGCTCAGTGATCACCTT;SOR=1.474;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=38;WE=1320279;WS=1320261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,41:0.39:105
chr3	1337203	rs565499	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=281;ReadPosRankSum=1.695;SC=TGGGGAAGTAAGACAAAGAAT;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=1337211;WS=1337196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	1424850	rs2291100	T	G	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=84;PP=2965;SC=TTGTCTACTCTGGGGAAGATG;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=88;TCR=84;TR=172;WE=1424858;WS=1424840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	2777622	rs1554198	A	G	6209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=96;PP=2965;SC=AATACATAGAAGAGAGAAAGG;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=195;WE=2777630;WS=2777612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr3	2924726	rs148052844	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=1.981;SC=TAATTGTGCACATAATGATGT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=2924734;WS=2924716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	3030223	rs13068264	C	A	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=41;PP=1244;SC=TGTAATCTACCGAAGTGGCAT;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=3030231;WS=3030213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	3076401	rs6790908	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=722;ReadPosRankSum=0.622;SC=GGCCTGACAACCACAGCCCCA;SOR=0.885;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=46;WE=3076409;WS=3076391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr3	3076443	rs6803232	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=463;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CCAGGACTCCATTCTCCGTGG;SOR=1.015;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=34;WE=3076451;WS=3076433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,45:0.43:105
chr3	3078840	rs9820464	C	T	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=40;PP=1764;ReadPosRankSum=-0.671;SC=ATGAAACAGCCCCCACCTTTT;SOR=1.040;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=281;TCF=167;TCR=114;TR=112;WE=3078848;WS=3078830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,136:0.39:346
chr3	3080527	rs163543	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=465;SC=AGAGTACTCACTGAAAGTGAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=3080535;WS=3080517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	3080611	rs10510251	G	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=439;ReadPosRankSum=0.267;SC=TTGTCTCCTTGTGCAGTCCCC;SOR=0.466;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=33;WE=3080619;WS=3080601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr3	3081750	rs6802588	A	T	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AGAATGGTCGAGGCTTTGGTT;SOR=0.686;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=83;WE=3081758;WS=3081740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,90:0.46:197
chr3	3081825	rs339285	T	C	4570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=78;PP=2623;SC=CCTCAGCTGATGCCTCTAGAT;SOR=0.897;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=138;WE=3081833;WS=3081815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	3081959	rs339284	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=574;ReadPosRankSum=0.211;SC=GAAGAAGGTATCGTTTATGCT;SOR=0.412;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=35;WE=3081967;WS=3081949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr3	3082003	rs339283	T	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TTTCTTCAATTCTAAAATGTG;SOR=0.207;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=19;WE=3082011;WS=3081993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	3084147	rs163560	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=543;ReadPosRankSum=-1.790;SC=AAGAGAGTCTATGCCCCTTGA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=31;WE=3084155;WS=3084137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr3	3085004	rs163562	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.646;SC=CCGTATACCACGCAAAATTCA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=3085012;WS=3084994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	3115478	rs163897	T	C	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=66;PP=1754;SC=AATTGTCAGCTGAATCTAAGA;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=108;WE=3115486;WS=3115468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	3115514	rs340807	C	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=268;ReadPosRankSum=-1.161;SC=AGAGGACCTACAATAACCAAA;SOR=0.794;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=21;WE=3115522;WS=3115504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr3	3137155	rs11389765	A	AT	744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=17;PP=387;SC=AAGATCAGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=19;WE=3137163;WS=3137145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	3139383	rs334802	C	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=323;SC=TCCAGCAAAACTCACTGGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=3139391;WS=3139375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	3139957	rs2290610	T	C	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=63;PP=2321;SC=AAATTCACAATTGAGGTTCCA;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=3139965;WS=3139947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	3143267	rs6771148	G	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=562;SC=GAGTACTTGAGAAGAACGGGT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=3143275;WS=3143257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	3170792	rs334773	C	T	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=42;PP=1487;SC=CTGTGCCTTCCGAAGCAGTAT;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=3170800;WS=3170782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	3170910	rs334772	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=387;SC=TTGGAAACCTATATAAATGGA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=3170918;WS=3170900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	3171460	rs334769	C	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1152;SC=TGACCTGTTACGTGAAAAAGG;SOR=2.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=3171468;WS=3171450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	3171502	rs334768	C	A	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=32;PP=1676;SC=AAGTGCTTTGCCTGTGTTTCT;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=3171510;WS=3171492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	3171713	rs113671187	G	GCCTGACT	3923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=47;PP=2673;SC=TTAGCTAAGTGCCAGTAGCTT;SOR=2.022;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=50;WE=3171721;WS=3171703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	3179262	rs334767	A	T	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=426;SC=TATGCCCGTCATAAACCCTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=3179270;WS=3179252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	3189059	rs1621648	T	C	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=70;SC=GATACTAAAATGGTGGCAAGG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=3189067;WS=3189057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	3189279	rs1705805	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=21;PP=938;SC=TGAAGATCGCAAAAGAGGAGA;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=3189287;WS=3189269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	3189398	rs1669348	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=26;PP=1039;SC=GTAAGTATATACTAGGCTTGG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=3189406;WS=3189388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	3192524	rs4183	A	ATAAC	1570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=1223;SC=AATTTGTTAGATAACTTTATC;SOR=3.258;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=22;WE=3192532;WS=3192514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	3193957	rs1705800	A	C	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=0;PP=191;SC=GTGCCTCAGCATCCCGAGCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=3193965;WS=3193955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	3196273	rs11300080	AT	A	358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=305;SC=TAAAATACTCATTTTTTTTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=3196281;WS=3196263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	3197871	rs1705789	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=411;SC=TGGCCTACCATATATAAAGTA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=3197879;WS=3197861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	3215954	rs1669321	A	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=72;PP=2355;SC=TACTATATAAAAACATATATA;SOR=1.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=100;WE=3215962;WS=3215944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	3217128	.	AT	A	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=43;QD=16.3333333333;SC=GTCAGTAGCTATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=3217136;WS=3217118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr3	3221430	rs1672753	C	T	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=64;PP=1912;SC=CGAGGGAGGGCCCGTGTCGCG;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=100;WE=3221438;WS=3221420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	3886580	rs4685689	A	G	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=71;PP=2965;SC=ATAACATCGCAAAGACTGTGG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=144;WE=3886588;WS=3886570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	3887876	rs2120609	T	C	5541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=81;PP=2965;SC=TTAAGGTTAATGGGACCCTTC;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=175;WE=3887884;WS=3887866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	4403767	rs2819561	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=110;ReadPosRankSum=-0.522;SC=AAGTTCTGAGAAAAGCCCAAT;SOR=1.863;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=8;WE=4403775;WS=4403757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	4403817	rs2633851	TT	AC	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=393;ReadPosRankSum=2.349;SC=GGGGAAGACTTTCCTTGGTTG;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=12;WE=4403826;WS=4403807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	4403837	rs2633852	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=0.649;SC=GTCAGTCCATAGTGGGCAGGC;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=18;WE=4403845;WS=4403827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr3	4404087	rs2819560	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TAAAAAGGGCAGCACATTCAA;SOR=2.833;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=9;WE=4404095;WS=4404077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	4461569	rs711667	G	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=329;SC=TGAGCAAGGTGCAGTGTTTGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=4461577;WS=4461559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	4461698	rs711666	C	T	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=41;PP=1711;SC=GCAAAGGGTACCTATTTTGCA;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=4461706;WS=4461688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	4562667	rs1038639	T	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=799;ReadPosRankSum=1.202;SC=AGAGTTTCATTTTCATACACT;SOR=0.570;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=46;WE=4562675;WS=4562657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr3	4687470	rs5846330	G	GCT	811.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.510;NF=1;NR=19;PP=987;ReadPosRankSum=-1.113;SC=CTGTATATAGGCTCTCTCTCT;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=20;WE=4687478;WS=4687460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr3	4687548	rs4271897	A	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	4687577	rs4303850	A	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=78;SC=ATGTGTGTGTATATATATAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=4687585;WS=4687567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	4693656	rs6442894	C	T	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=6;PP=963;SC=GGATGCTACACGTGACACTGG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=4693664;WS=4693646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	4693937	rs6442895	G	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=650;SC=CTCTTTCAAGGCTGACGCACC;SOR=1.259;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=4693945;WS=4693927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	4694010	rs6442896	A	C	249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=8;PP=180;SC=AAATACACTCAGTCACCTTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=4694018;WS=4694000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	4699727	rs2306871	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=314;ReadPosRankSum=-0.554;SC=TTCTTCTCCGTTCCTGTGGAT;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=20;WE=4699735;WS=4699717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr3	4699776	rs2306870	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=423;ReadPosRankSum=0.529;SC=TTGGCATGCATGGTTCTTGAT;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=32;WE=4699784;WS=4699766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr3	4699936	rs2306869	G	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=329;ReadPosRankSum=1.093;SC=CCACCACTCTGCGTGGAGGTG;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=23;WE=4699944;WS=4699926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr3	4699967	rs2306868	C	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CCCAAGGTATCATTTTAAAAT;SOR=0.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=16;WE=4699975;WS=4699957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr3	4702797	rs6783245	C	T	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=963;ReadPosRankSum=0.529;SC=TGCCTGTCTCCTTTTGGTCTC;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=49;WE=4702805;WS=4702787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,65:0.53:122
chr3	4702858	rs11446330	C	CT	1148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=834;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GAGTATGGAGCGTGGAGATTT;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=20;WE=4702866;WS=4702848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr3	4703937	rs7632000	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GTGAGCACTCCCGCATGCTCA;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=13;WE=4703945;WS=4703927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	4708924	rs17041147	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.674;SC=AAAGTTGTAGGAAGACCCTCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=4708932;WS=4708922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	4708997	rs7625003	G	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=0.690;SC=GCTTTCTTTAGTCTACGCTTA;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=4709005;WS=4708987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	4711619	rs78163413	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.902;SC=GAGAATTCCCGAATTTGATTT;SOR=0.264;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=4711627;WS=4711609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	4712413	rs2306875	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=339;ReadPosRankSum=-1.647;SC=TGTTTTCTAGGTTGGTTCTTT;SOR=1.140;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=18;WE=4712421;WS=4712403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	4716811	rs2306877	A	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=768;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CTGACCTTCTACGATTAACTA;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=50;WE=4716819;WS=4716801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr3	4725619	rs3215005	CA	C	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.226;NF=0;NR=19;PP=577;ReadPosRankSum=-1.207;SC=ACCAAGATCACAAGCTGTTTG;SOR=0.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=19;WE=4725627;WS=4725609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr3	4732670	rs4685801	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=1.728;SC=TACTAAAAAAGAAGGTAGTAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=4732678;WS=4732664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	4738774	rs3749382	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=0.429;SC=TGAGGCAGCTAATGAGTTCCA;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=11;WE=4738782;WS=4738764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	4738999	rs149795767	G	GGTGT,GGT	651.74	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.290;NF=0,0;NR=13,13;PP=84,492;ReadPosRankSum=1.662;SC=GAGAGTGAGAGGTGTGTGTGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=13,13;WE=4739007;WS=4738989;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.86:21
chr3	4753712	rs2306881	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=255;ReadPosRankSum=1.697;SC=CTGCCGTTAAAGGGAGCTAAA;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=16;WE=4753720;WS=4753702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	4767262	rs7613447	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=950;ReadPosRankSum=0.382;SC=AGAACGCCACTGAGGTGTGTT;SOR=0.618;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=47;TCR=91;TR=73;WE=4767270;WS=4767252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,87:0.54:162
chr3	4817057	rs6442905	T	C	6452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=92;PP=2965;SC=ATGAAAAGAATGTAGCGCTTA;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=106;TCR=93;TR=197;WE=4817065;WS=4817039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr3	4842231	rs2291862	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.391;SC=AATTCTACGACTGATATTTTC;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=71;WE=4842239;WS=4842221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,83:0.48:173
chr3	4856180	rs711631	T	C	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=36;PP=945;SC=GCATTGTCACTGTGCTGAGTC;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=4856188;WS=4856170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	4856234	rs901854	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=72;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TACTCAGGAAGCCGTCCAAAG;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=10;WE=4856242;WS=4856224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr3	4856650	rs2304820	T	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=641;ReadPosRankSum=-1.043;SC=CCCAAGTAGATGAGGTCTCAC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=73;TCR=22;TR=45;WE=4856658;WS=4856640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr3	4856993	rs6442911	C	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=710;SC=GGCGGGGTGCCTGCCCAGTTA;SOR=3.981;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=4857001;WS=4856983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	4859725	rs9844268	G	A	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=17;PP=1523;SC=CTTTACCAAGGCTGCTCAGCT;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=68;WE=4859733;WS=4859715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	4872790	.	GTCTC	G	341	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5181;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=56.1;NF=0;NR=7;PP=341;QD=49.2857142857;SC=GTCTGTCTTTGTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=4872801;WS=4872780;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,7:0.27:26
chr3	4872811	.	T	TCACACACACA	222.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.489;NF=0;NR=7;PP=693;ReadPosRankSum=1.534;SC=TCTCTCTCTCTCTCTCACACA;SOR=2.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=4872823;WS=4872801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr3	4872813	rs5018278	T	A	232.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQRankSum=-0.489;QD=29.10;ReadPosRankSum=1.534;SOR=2.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr3	4872813	.	TCT	ACA	420	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=53.13;NF=0;NR=7;PP=420;QD=67.6382678375;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=4872823;WS=4872801;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,7:0.39:18
chr3	4872815	rs5018277	T	A	479.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;QD=34.23;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,13:0.93:14
chr3	4878419	.	CTTTTTTTTTTT	C	1428	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=21;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=1428;QD=178.875;SC=GTGACTCAGTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=8;WE=4878437;WS=4878409;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,8:0.44:18
chr3	4927281	rs4685841	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=900;SC=ACCATCACAATTTAAAAGGCC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=4927289;WS=4927271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	4927308	rs6794077	A	G	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=18;PP=1120;SC=GGTTGCTCACAGAACAAAACA;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=4927316;WS=4927298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	4940687	.	A	AGAG	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	4942300	rs3762783	T	C	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.857;SC=GTGAACTTTTTTTGCAAAGGA;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=175;TCF=85;TCR=90;TR=80;WE=4942308;WS=4942290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,95:0.44:214
chr3	4942430	rs3762784	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=445;ReadPosRankSum=0.876;SC=ATCAGCTGGGGCCTGGATTTC;SOR=1.291;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=29;WE=4942438;WS=4942420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr3	5024415	rs11398309	A	AT	186.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=0;PP=144;SC=CAGTAAATGCATTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=5024423;WS=5024406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	5025514	rs139879256	G	GGTGT,GGTGTGTGTGT	307.75	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0,0;NR=8,8;PP=522,109;SC=GCAGATTCAGGGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8,8;WE=5025522;WS=5025504;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
chr3	5214034	rs62255884	C	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=1.146;SC=TAGCTAATATCCTAGTGTAAT;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=5214042;WS=5214024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	5214126	rs2270750	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	5229643	rs144177905	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=0.498;SC=GCCCCGACGGCCCCGCGTCGC;SOR=0.764;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=16;WE=5229651;WS=5229633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr3	5241223	rs377120	C	T	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=32;PP=2168;SC=TGTGATGATACAGCCTCAGTT;SOR=1.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=110;WE=5241231;WS=5241213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	5241309	rs410509	C	A	6226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=100;PP=2965;SC=TCCAGAAAGCCGTCAAGTTAG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=93;TCR=100;TR=193;WE=5241317;WS=5241299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr3	5251805	rs62255914	C	T	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=762;ReadPosRankSum=1.224;SC=TGATGTTTGTCGATGGCATGT;SOR=0.378;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=41;WE=5251813;WS=5251795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr3	6903298	.	G	A	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=51;PP=1948;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GAGGGAAAACGGGATCCACAG;SOR=0.862;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=125;WE=6903306;WS=6903288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,139:0.55:253
chr3	6903601	rs342034	A	G	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=74;PP=2105;SC=CCAGGTAGGGATGCGCTCCCT;SOR=2.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=19;TCR=74;TR=93;WE=6903609;WS=6903591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	7188116	rs3749448	G	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=0.468;SC=GCACTCTCACGTGGTGCTTTC;SOR=1.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=12;WE=7188124;WS=7188106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr3	7340328	.	CTG	C	1814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.737;NF=17;NR=12;PP=1275;ReadPosRankSum=0.033;SC=TTTGACATCTCTGTGGAAACA;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=29;WE=7340337;WS=7340318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr3	7494245	.	TTGTGTGTGTG	T	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.319;NF=6;NR=2;PP=1412;ReadPosRankSum=0.590;SC=CAATGCCAATTTGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=8;WE=7494262;WS=7494235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr3	7678010	rs7611935	G	A	4476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=90;PP=2939;SC=TATCCTCCCCGACCGGACTAA;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=142;WE=7678018;WS=7678000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr3	7678090	rs7612048	G	A	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=42;PP=1303;SC=CACTGTCATTGTTTGAAAAAT;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=64;WE=7678098;WS=7678080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	7732726	rs5846531	AT	A	198.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=0;PP=145;SC=AACTTTGCAGATTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=7732734;WS=7732716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	8299404	rs145434533	AGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG	A,AGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG	292.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.49;QD=36.59;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,4,4:0.50,0.50:8
chr3	8299494	.	G	GGAAGGAAAGAAA	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=-0.605;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	8299606	.	AAAGGAAGG	A	377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=0.000;QD=31.48;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr3	8496486	rs7651102	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.79;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	8496486	.	GC	AA	179	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=179;QD=58.1169687156;SC=AATATAAATAGCAGTAGAAGT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=8496495;WS=8496482;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr3	8496487	rs7629563	C	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.79;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	8543713	rs5846598	G	GT	3285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=41;PP=2093;SC=ACTTTTTCTTGTTCCCCTTCC;SOR=1.109;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=49;WE=8543721;WS=8543703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	8543757	rs2324625	A	C	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=752;SC=AAAGGTAATGAGAAGGGAACT;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=8543765;WS=8543747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	8556617	rs12715649	A	G	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=50;PP=2219;SC=CTAGATGGTGATCACATGGGA;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=115;WE=8556625;WS=8556607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr3	8556784	rs12715650	A	C	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=39;PP=985;SC=GTGAGGCCAAAGCATGGAAAG;SOR=1.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=8556792;WS=8556774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	8665360	rs9809581	A	G	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=63;PP=2223;SC=AAAGAGAGAGAGACACAGACC;SOR=1.016;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=108;WE=8665368;WS=8665350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	8667896	rs355058	T	C	3329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=48;PP=1857;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TGCCACAGCATTGAGACACTG;SOR=0.721;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=244;TCF=134;TCR=110;TR=111;WE=8667904;WS=8667886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,153:0.50:308
chr3	8675539	rs2276800	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=763;ReadPosRankSum=1.239;SC=GGACTCACGCGGGCCAGCCAG;SOR=0.904;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=46;WE=8675547;WS=8675529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr3	8675778	rs11131140	T	C	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=306;SC=TAGAGAGGAATTGTACCATTT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=8675786;WS=8675768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	8676204	rs3774210	A	G	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=65;PP=2927;SC=GCACACTTGTATCTCCAGCAT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=142;WE=8676212;WS=8676194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	8676945	rs3816911	T	C	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=36;PP=1995;SC=AATAGTGACATAGGAAATGCA;SOR=1.104;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=8676953;WS=8676935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	8701430	rs371133	T	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=922;ReadPosRankSum=-1.028;SC=TATGTATTCATTCATTCAATG;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=57;WE=8701438;WS=8701420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr3	8705277	rs12634985	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CTGGCTGGGTGTGATATCTCC;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=8705285;WS=8705267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
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chr3	8809184	rs237902	G	A	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=2222;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TGAGCCGCAAGTTCTGCCAGA;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=142;TCR=127;TR=128;WE=8809192;WS=8809174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,142:0.48:297
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chr3	8809703	rs2228485	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=905;ReadPosRankSum=-1.690;SC=GCACACACGCGTTCCCGCTCA;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=65;WE=8809711;WS=8809693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr3	8931984	rs656626	A	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=684;SC=CCAGAAAGCAAAAATATAATT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=8931992;WS=8931974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	8932189	rs607531	C	T	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=587;SC=TGTATCGTCCCATTTATATAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=8932197;WS=8932179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	8943988	rs464302	C	A	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=60;SC=AAGTAAATTTCTTTGGTTTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=8943996;WS=8943978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	8955240	rs430781	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=615;SC=AGTAAATGAATAAATTTAATA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=8955248;WS=8955230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	8955389	rs373572	C	T	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=33;PP=988;SC=TTCGATTTCTCGAACTATTTC;SOR=1.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=8955397;WS=8955379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	8988809	rs689296	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=133;SC=AAATATGCAACCCTGCATTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8988817;WS=8988799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	9005078	rs615967	C	T	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=61;PP=2503;SC=ATGGTCGCTCCCGAGGATGCT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=9005086;WS=9005068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	9034558	rs511815	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.918;SC=GGATTGACACCAGCAGGGAAA;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=73;WE=9034566;WS=9034548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr3	9036010	rs637172	T	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=694;ReadPosRankSum=1.342;SC=CTTCACAGAATTCTCGACTCC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=50;WE=9036018;WS=9036000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr3	9066853	rs421041	T	C	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1206;ReadPosRankSum=0.640;SC=CACTGCAGGCTGGCTTCTGCA;SOR=0.858;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=87;WE=9066861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,112:0.57:197
chr3	9068577	rs1703128	T	C	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CTAGCACCTGTTCTGCAGATT;SOR=0.556;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=74;WE=9068585;WS=9068567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,88:0.53:165
chr3	9069747	rs416685	A	G	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=773;ReadPosRankSum=0.044;SC=AGTTTCCATCACGGTGAATGG;SOR=1.000;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=45;WE=9069755;WS=9069737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr3	9069918	rs504153	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CCGTGAACGCCGAAATGCAAT;SOR=0.429;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=69;WE=9069926;WS=9069908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,78:0.57:137
chr3	9074617	rs9839715	C	T	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=193;SC=TTTTAGGGGACCTTAATTTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=9074625;WS=9074607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	9091151	rs610457	C	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=760;ReadPosRankSum=1.442;SC=CATCAGGCCCCTTCTACCCAG;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=59;WE=9091159;WS=9091141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr3	9122948	rs2664089	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=30;PP=1267;SC=ACCATTGCCTAGATCCTGACA;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=9122956;WS=9122938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	9123116	rs2669986	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.847;SC=CTTTGAGCCTCAGCTACCTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=9123124;WS=9123106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	9123134	rs2664088	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=59;ReadPosRankSum=0.108;SC=TCACCTATCAAATAAAAAGCT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=4;WE=9123142;WS=9123124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	9166281	rs735253	G	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=-1.113;SC=AACCTGCAGAGCCAGGGCCCT;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=9166289;WS=9166277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr3	9422210	rs2596916	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=0.123;SC=GGTCTGACTGTTTCCATATTG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=9422218;WS=9422200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr3	9426224	rs1129174	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=659;ReadPosRankSum=0.066;SC=TCTGGAATGCGACACGTATGG;SOR=1.087;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=38;WE=9426232;WS=9426214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr3	9489767	rs2258735	T	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=1163;SC=CTATAATCCCTAGAAGAAACT;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=9489775;WS=9489757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr3	9727002	rs787836	G	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=0.511;SC=GCCTGTCTGAGTTCCACGTGT;SOR=0.905;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=15;WE=9727010;WS=9726992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr3	9743398	rs144534173	TGGAG	T	1730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.587;NF=14;NR=15;PP=1196;ReadPosRankSum=-2.079;SC=ACAGGTGGTATGGAGGGAGGG;SOR=0.605;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=29;WE=9743409;WS=9743388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr3	9757086	rs697820	C	G	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=779;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CCCAGGCCCTCCATCCCAGTG;SOR=0.650;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=46;WE=9757094;WS=9757076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr3	9757754	rs708571	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=2.007;SC=CTGAAAGCCCGGCAATAAATT;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=10;WE=9757762;WS=9757744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	9768336	rs3868893	C	G	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1254;ReadPosRankSum=0.756;SC=AGTTCACCCTCTTTCCCCTAC;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=79;WE=9768344;WS=9768326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr3	9769008	rs3891072	A	T	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1299;ReadPosRankSum=1.410;SC=TCATTCATTGAATACATCCTT;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=81;WE=9769016;WS=9768998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,90:0.44:204
chr3	9783147	rs696513	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.932;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=0.902;SC=GGCCAGCCCTATTTTATAAAA;SOR=3.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=9783155;WS=9783137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	9787712	.	G	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=0.022;SC=GTGGGGCACAGAGTTTCTTGG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=19;WE=9787720;WS=9787702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	9788168	rs2269112	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.112;SC=GTGTGACTCACAGCCACAGAT;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=20;WE=9788176;WS=9788158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr3	9798140	rs2072668	C	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=866;ReadPosRankSum=-2.404;SC=AGGGCTCATTCTGTGTCTGTC;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=59;WE=9798148;WS=9798130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,65:0.46:140
chr3	9798475	rs113561019	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=297;ReadPosRankSum=0.308;SC=AGCCTGTGGGGACCTTATGCT;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=21;WE=9798483;WS=9798465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr3	9798773	rs1052133	C	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=624;ReadPosRankSum=-0.628;SC=CTGCGCCAATCCCGCCATGCT;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=37;WE=9798781;WS=9798763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr3	9801080	rs2304277	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=438;ReadPosRankSum=0.409;SC=TGTGTGCCCAGTGTGATGCCA;SOR=0.580;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=26;WE=9801088;WS=9801070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
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chr3	9821914	rs14204	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.495;SC=GGAAGGGCCACGGCCCTCTAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=9821922;WS=9821910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr3	9828676	rs7621556	G	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=0.036;SC=CCTCTTTTGGGTTAGGCTGCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=9828684;WS=9828666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	9829171	rs2290309	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=1.623;SC=AAAGTACAACGAAGATAAAAC;SOR=1.140;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=8;WE=9829179;WS=9829161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr3	9841989	rs6443266	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=35;PP=1016;SC=AGGTAAGTTCACCATGGAGGA;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=50;WE=9841997;WS=9841979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	9852059	rs34761997	C	CGAT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=185;SC=CCCCGGTCCTCGACCCCTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=9852067;WS=9852049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	9852148	rs9827444	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=1.158;SC=TGGGGTGGAGGGACTGGGGGT;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=9852156;WS=9852138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	9859456	rs3806672	C	G	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=1717;ReadPosRankSum=-0.025;SC=AAGGAGACCCCCAGCCCTATG;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=49;WE=9859468;WS=9859446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr3	9859460	rs3806671	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=724;ReadPosRankSum=-0.731;SC=AGACCCCCAGCCCTATGCCTG;SOR=0.795;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=25;WE=9859468;WS=9859446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr3	9860623	rs3806668	T	G	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=621;ReadPosRankSum=1.035;SC=TGTGGTTACCTCCACTCTCCC;SOR=0.758;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=50;WE=9860631;WS=9860613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr3	9867625	rs3732527	C	T	4193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=85;PP=2272;ReadPosRankSum=1.670;SC=CCAAGTCCCGCGGACGAGGTG;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=306;TCF=136;TCR=170;TR=156;WE=9867633;WS=9867615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,202:0.53:383
chr3	9868577	rs12490900	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.060;SC=AGCCTTACCCACTCAGCCCTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=9868585;WS=9868576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	9870414	rs17050593	C	T	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=757;ReadPosRankSum=0.813;SC=TACTGCGGCCCCCGTAACTAG;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=45;WE=9870422;WS=9870404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr3	9870857	rs2290303	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1070;ReadPosRankSum=0.385;SC=ACACCGTGCAGTGTCGGAAGG;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=74;WE=9870865;WS=9870847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,103:0.45:231
chr3	9871030	rs2290305	T	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=590;ReadPosRankSum=0.688;SC=ATTGACCGGATGCTGGACCGC;SOR=0.532;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=40;WE=9871038;WS=9871020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr3	9874670	rs7622954	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCTCAGAAACGCCTCTTTGAC;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=9874678;WS=9874660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	9876295	rs35783864	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.113;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr3	9876301	rs13088594	G	T	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.41;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	9885022	rs3846165	T	C	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=393;SC=TTAGGTGGCTTGTCCCAGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=9885030;WS=9885016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	9896351	rs279563	A	G	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=65;PP=2249;SC=ACAGAAAACAAAAGGTGCGAG;SOR=1.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=100;WE=9896359;WS=9896341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	9918811	rs61742367	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=-0.693;SC=TCGATCCGCCGTGCTTACGCG;SOR=1.079;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=29;WE=9918819;WS=9918801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr3	9920041	rs56111543	A	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=760;ReadPosRankSum=0.059;SC=TGACCTGTATACCCATTAAAG;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=50;WE=9920049;WS=9920031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,55:0.57:96
chr3	9920138	rs17851444	G	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ACTTGGGGTAGAGAAGGCTAA;SOR=0.890;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=34;WE=9920146;WS=9920128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr3	9920247	rs62247501	C	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GGGTTCCCATCTCTCTCATTG;SOR=0.830;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=12;WE=9920255;WS=9920237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr3	9932337	rs279558	G	C	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=8;PP=855;SC=AATAGGGTCAGTGGGCCGCTT;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=9932345;WS=9932327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr3	9934753	rs35365817	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.626;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=964;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TTTGCTGAGCATTTTGCCCTC;SOR=0.714;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=63;WE=9934761;WS=9934743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,69:0.42:163
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chr3	9952788	rs279571	T	C	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=896;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TTCTCCCTGATGAACTCTCCT;SOR=0.868;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=70;WE=9952796;WS=9952778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,75:0.44:170
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chr3	9956894	rs693802	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=0.292;SC=CTGAGCAGTCCCTCAGCCGCC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=10;WE=9956902;WS=9956884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr3	9957455	rs1056286	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=510;ReadPosRankSum=0.293;SC=GCAGCCGGCTCGAACGAGAGG;SOR=0.835;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=35;WE=9957463;WS=9957445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr3	9960070	rs708567	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=265;ReadPosRankSum=0.325;SC=GCAGCTGACTCAGGGGTGGAG;SOR=0.220;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=9960078;WS=9960060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr3	9962157	rs783494	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=596;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CCAGCCTTCCTCACCCCTCTC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=43;WE=9962165;WS=9962147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr3	9962767	rs34198416	TATTC	T	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.127;NF=2;NR=7;PP=414;ReadPosRankSum=0.076;SC=TCACAGAACATATTCATTCAT;SOR=0.706;Source=Platypus;TCF=5;TR=9;WE=9962778;WS=9962757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr3	9962816	rs376511	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=184;ReadPosRankSum=0.703;SC=CATTAATTGCAGTATCTGTGC;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=12;WE=9962824;WS=9962806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	9969932	rs57179462	TGG	T	2454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.504;NF=14;NR=28;PP=1486;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGGCTGGGGTTGGGGTGTTGC;SOR=0.628;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=42;WE=9969941;WS=9969922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,65:0.47:137
chr3	9970031	rs279549	A	G	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=64;PP=2605;SC=GCCCGACTGCAACTGCTGACC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=136;WE=9970039;WS=9970021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	9972493	rs279545	G	A	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=11;PP=1264;SC=TTGATGCTGGGAATTTGGAGA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=9972501;WS=9972483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	9975247	rs183956	C	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=43;PP=1327;SC=TGGGACCAGGCGCGGGACCTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=9975255;WS=9975237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	9976159	rs279552	A	G	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=23;PP=1517;SC=AGTCCCAGCTATGCTCTGGGG;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=72;WE=9976167;WS=9976149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	9991388	rs279601	G	C	7773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=132;PP=2965;SC=GCTTCTTGCTGCAGAAGCTCT;SOR=0.937;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=105;TCR=132;TR=237;WE=9991396;WS=9991378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr3	10030236	rs496181	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.396;NF=12;NR=7;PP=393;ReadPosRankSum=0.040;SC=CTGAGGTAGATTGAAATAAAA;SOR=0.338;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=19;WE=10030244;WS=10030226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr3	10085035	rs803335	G	T	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=139;SC=CCAGACAGACGACAGTGCAAG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=10085043;WS=10085025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	10088223	rs200221245	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.763;NF=11;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TGTACTGATTTGTTAACTGTT;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=14;WE=10088231;WS=10088213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr3	10088239	rs201770712	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-4.598;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.797;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr3	10088242	rs199726231	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-4.369;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.235;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr3	10088266	rs72492997	G	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.744;HP=4;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.611;NF=20;NR=6;PP=404;ReadPosRankSum=0.584;SC=GACAATAGGTGTTTGACCTGG;SOR=1.373;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=26;WE=10088274;WS=10088256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr3	10088299	rs112887807	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-5.278;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,51:0.37:137
chr3	10088308	rs72492998	T	C	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=-5.355;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,57:0.40:143
chr3	10088343	rs73126218	A	G	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.155;NF=28;NR=21;PP=753;ReadPosRankSum=1.682;SC=GTGCTAAGAAATAAGATTCGA;SOR=0.486;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=49;WE=10088351;WS=10088333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr3	10088404	.	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.81;MQRankSum=-1.893;QD=15.69;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr3	10088407	.	AG	A	973.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.94;MQRankSum=-2.036;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=1.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr3	10088409	rs375350046	TAAG	T	891.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQRankSum=-2.300;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=1.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr3	10088422	rs144167368	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.69;MQRankSum=-2.197;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr3	10088443	rs145517746	C	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.47;MQRankSum=-1.005;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr3	10088444	rs142624538	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.47;MQRankSum=-1.005;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr3	10088461	rs150415982	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQRankSum=-1.946;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr3	10089723	rs12330369	G	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.202;NF=21;NR=13;PP=542;ReadPosRankSum=0.519;SC=TTTTTGACACGTACTGCCAGC;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=34;WE=10089731;WS=10089713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr3	10089738	rs62245508	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=4;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.032;NF=22;NR=15;PP=1293;ReadPosRankSum=0.929;SC=GCCAGCAGGTATGTTGAAACA;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=37;WE=10089757;WS=10089728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr3	10089749	rs12330599	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.825;HP=2;HapScore=4;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.781;NF=18;NR=18;PP=1293;ReadPosRankSum=1.549;SC=TGTTGAAACATTTATTTTGGC;SOR=0.429;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=36;WE=10089757;WS=10089728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr3	10089772	rs79830642	CA	GG	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.675;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-4.946;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr3	10089775	rs75389047	A	G	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-5.026;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr3	10089815	rs77169020	A	C	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=11.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-6.349;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=2.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr3	10089818	rs78988497	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=14.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQRankSum=-6.483;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=2.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr3	10089828	rs77263972	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=13.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQRankSum=-6.675;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.036;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr3	10089834	rs74351786	A	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=15.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQRankSum=-6.279;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.161;SOR=2.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr3	10089841	rs74509181	C	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=10.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQRankSum=-5.741;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.598;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr3	10089852	rs75274508	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.393;HP=1;HapScore=4;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.801;NF=1;NR=12;PP=997;ReadPosRankSum=0.309;SC=CTGGGTCTCAAGAAAGCTCAA;SOR=2.584;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=13;WE=10089860;WS=10089805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr3	10089886	rs73811818	G	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=68;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.615;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=1.678;SC=CTTGATGAAAGGAAGAGACTT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=8;WE=10089894;WS=10089876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr3	10090933	.	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-3.983;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.503;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,3:0.14:22
chr3	10091252	rs77076948	A	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQRankSum=-1.644;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr3	10091261	rs80128604	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.91;MQRankSum=-1.589;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr3	10105661	rs369470214	CT	C	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=37.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQRankSum=-12.043;QD=4.34;ReadPosRankSum=-2.932;SOR=3.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,41:0.18:222
chr3	10105665	.	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=27.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-10.132;QD=0.67;ReadPosRankSum=-2.086;SOR=3.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,27:0.12:219
chr3	10142949	rs3172417	C	T	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=1504;ReadPosRankSum=0.334;SC=CTGATTAGACCCCAGATAAAT;SOR=0.855;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=259;TCF=110;TCR=149;TR=104;WE=10142957;WS=10142939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,131:0.42:311
chr3	10188428	rs1678607	T	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=37;PP=997;SC=GTCAGGCACGTTATCCAATCT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=10188436;WS=10188418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	10189929	rs1681660	T	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=24;PP=744;SC=CCTTATAGAATACCCTCGAGT;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=10189937;WS=10189919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	10219508	rs2306696	T	C	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=2350;ReadPosRankSum=1.097;SC=CAGAGTTCTCTCCGTCCCTTC;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=71;WE=10219518;WS=10219498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,95:0.48:196
chr3	10219510	rs1711109	C	T	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GAGTTCTCTCCGTCCCTTCCA;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=92;WE=10219518;WS=10219498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr3	10219729	rs1681663	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=242;SC=GCCCTCCTTGAGTGGGGCCCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=10219737;WS=10219719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	10241987	rs263410	A	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=6;PP=380;SC=GACTTCCAGAACCAGTCTCTC;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=10241995;WS=10241977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	10242243	rs263411	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=0.791;SC=TTTTATTTAAGGAAATGAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=16;WE=10242251;WS=10242233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr3	10251196	rs459864	A	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=783;SC=AGACTGGCATAGTCTGAGGAC;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=10251204;WS=10251186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	10251340	rs464286	C	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1074;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCCCTCATTCCTTGAGAAGCG;SOR=0.699;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=78;WE=10251348;WS=10251330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,95:0.54:175
chr3	10258493	rs2302862	T	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GGGGTCAGAGTATGTGGTACC;SOR=1.091;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=10258501;WS=10258483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr3	10258514	rs2302861	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=314;ReadPosRankSum=0.218;SC=TGGGAGGTTATTGGTGGCGTT;SOR=2.271;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=16;WE=10258522;WS=10258504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr3	10258762	rs2302860	G	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=322;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TCAGAGAATGGGACCAGGCTG;SOR=2.226;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=23;WE=10258770;WS=10258752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr3	10261237	rs3895949	A	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=334;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CTCCTGAACTAGTGATCTGCC;SOR=0.536;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=9;WE=10261256;WS=10261227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr3	10261248	rs3895948	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.287;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=-1.589;SC=GTGATCTGCCTGCCTGGGCCT;SOR=0.269;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=14;WE=10261256;WS=10261227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr3	10261294	rs3895947	AC	GT	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=655;ReadPosRankSum=-1.250;SC=GAGCCACCGCACCTGGCTGCC;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=22;WE=10261303;WS=10261284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr3	10276163	rs708035	T	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TCCTCAGTGATATTCCAAGCA;SOR=0.644;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=191;TCF=108;TCR=83;TR=85;WE=10276171;WS=10276153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,100:0.44:228
chr3	10280753	rs11465932	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=339;ReadPosRankSum=0.440;SC=GCATTTGGATGCTCATGTGTG;SOR=3.511;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=18;WE=10280761;WS=10280743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr3	10283716	rs796552	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=1.510;SC=CCTGATTCAGAAACCTGATTT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=10283724;WS=10283706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	10290839	rs2072577	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=553;ReadPosRankSum=-0.584;SC=GGGTCGCCAGGAAGGGTGGTG;SOR=0.956;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=35;WE=10290847;WS=10290829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr3	10302172	rs394558	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AACCCCAGAGGTCAGCATGGA;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=151;TCF=56;TCR=95;TR=70;WE=10302180;WS=10302162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr3	10302369	rs451952	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=725;ReadPosRankSum=0.909;SC=GTAAAGCTTGTACCAGGCATC;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=42;WE=10302377;WS=10302359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr3	10302395	rs439483	G	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=616;ReadPosRankSum=-1.147;SC=TTTTAGTTCTGTTGATGAAAT;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=35;WE=10302403;WS=10302385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr3	10302479	rs402330	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=439;SC=GGCCTCCAGGGAACAAACTGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=10302487;WS=10302469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	10311939	rs2075352	C	T	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1243;ReadPosRankSum=0.502;SC=TCAGCCGTTCCGGAGCCTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=89;WE=10311947;WS=10311929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,111:0.52:214
chr3	10312507	rs2075353	A	G	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1148;ReadPosRankSum=2.393;SC=CAGATTGCCTATGGGAGGAGC;SOR=0.584;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=179;TCF=98;TCR=81;TR=72;WE=10312515;WS=10312497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,101:0.45:226
chr3	10318230	rs3217211	A	AT	1692.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=1439;ReadPosRankSum=1.848;SC=TGTCAAGTTGATGAGGACAGC;SOR=0.750;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=35;WE=10318238;WS=10318220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr3	10320865	rs2075355	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=435;ReadPosRankSum=0.307;SC=TTTGAGTGACATGGTTTGGAA;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=21;WE=10320873;WS=10320855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr3	10328250	rs35683	A	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=401;ReadPosRankSum=-1.867;SC=GCCAACCACTATCCTGCAGAT;SOR=1.051;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=20;WE=10328258;WS=10328240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr3	10334448	.	TA	T	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.042;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,35:0.19:180
chr3	10342876	rs696221	C	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=917;ReadPosRankSum=-0.471;SC=TCCCAGTTGTCTGGTTAGTTG;SOR=0.752;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=86;TCR=37;TR=54;WE=10342884;WS=10342866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr3	10347546	rs3835090	CAACAGT	C	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=77;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TCAAGGATCCCAACAGTGTGT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=10347559;WS=10347536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	10359628	rs1642977	T	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=188;ReadPosRankSum=0.424;SC=CCACCCTGGATCCATGAATGA;SOR=0.339;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=13;WE=10359636;WS=10359618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr3	10382111	rs171337	T	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1512;ReadPosRankSum=-0.224;SC=GCTCTCAGGGTCCTGCCCAGG;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=77;WE=10382119;WS=10382101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,87:0.58:150
chr3	10382148	rs154242	G	A	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1750;ReadPosRankSum=0.009;SC=TGCCCACCCCGGGCCTGGTTA;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=111;TCR=78;TR=95;WE=10382156;WS=10382138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,109:0.52:208
chr3	10396754	rs703907	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=721;ReadPosRankSum=0.120;SC=GGCAGGAATGACCTACCTAAA;SOR=0.978;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=47;WE=10396762;WS=10396744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr3	10400253	rs775019	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=717;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GGAAGGAAATCCCCATGGGCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=10400274;WS=10400243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	10400264	rs1618260	T	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	10400264	.	TTA	CTG	699	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=699;QD=83.6075416514;SC=CCCATGGGCATTATGTGGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=10400274;WS=10400243;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	10400266	rs1076080	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	10400643	rs28113	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=570;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GGGGAGCCCAGGGAATGCTCC;SOR=0.919;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=33;WE=10400651;WS=10400633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr3	10413601	rs2289273	G	A	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=59;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AGTGGACGTCGCCGACATAGG;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=270;TCF=146;TCR=124;TR=126;WE=10413609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,147:0.46:323
chr3	10413715	rs2289274	G	A	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=890;ReadPosRankSum=-1.847;SC=GGCGTACCAGGTTGTTGTCCT;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=62;WE=10413723;WS=10413705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,72:0.47:153
chr3	10417177	rs139459100	C	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=13;PP=1062;ReadPosRankSum=0.752;SC=CGGCGACCACCAGCACCGTCA;SOR=0.369;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=102;TCF=82;TCR=20;TR=59;WE=10417185;WS=10417167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,69:0.57:120
chr3	10419856	rs56113011	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=1.085;SC=GATGAGGTAACTGAGGCCGAG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=10419864;WS=10419846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	10420087	rs751122	T	C	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=36;PP=1617;SC=CCCCGTCCTGTTGTTTGGCTG;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=10420095;WS=10420077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	10420875	rs4684686	G	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=754;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGTCAGAGCCGGTGGGGAGGG;SOR=0.381;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=42;WE=10420883;WS=10420865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr3	10421107	rs7616000	A	G	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=48;PP=1221;ReadPosRankSum=0.772;SC=GTGTGGGGATACGGGTTGGGG;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=126;TCF=28;TCR=98;TR=61;WE=10421115;WS=10421097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr3	10427190	rs725027	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=300;SC=ATAGAGATGCCGCAGAGGTTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=10427198;WS=10427180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	10442539	rs17032820	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=1.892;SC=AGAGCCAAGGATCAAAGTCTC;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=10442547;WS=10442529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	10452231	rs34907	G	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=624;SC=TGTGTGAGCCGTGAGTGCCCC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=10452239;WS=10452221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	10885920	rs2304725	T	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=582;ReadPosRankSum=-1.364;SC=TGGCCATCTCTGACGGGATCG;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=43;WE=10885928;WS=10885910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,59:0.46:128
chr3	10975745	rs2272399	C	T	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1330;ReadPosRankSum=0.677;SC=TGATTTATTCCGGACAGGAAG;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=97;TCR=102;TR=94;WE=10975753;WS=10975735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,121:0.48:251
chr3	11061806	.	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=522;ReadPosRankSum=0.787;SC=GAGGAGGCTTGGGGACCATGA;SOR=0.651;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=27;WE=11061814;WS=11061796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr3	11300707	rs901865	T	C	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=17;PP=1193;SC=CCATAACTGGTGGCTGCTCTT;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=11300715;WS=11300697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	11518755	rs4684782	T	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=63;PP=1539;SC=AGATGAACAATGATGATAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=78;WE=11518763;WS=11518745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	11551856	rs369095431	TA	T	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=1.917;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr3	11643465	rs2276749	T	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=905;SC=GCAGGGTCTGTATTCTGGGTT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=11643473;WS=11643455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	11667714	rs3856802	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=237;ReadPosRankSum=0.401;SC=TAACCAAATACGGAAGCTGAA;SOR=0.787;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=17;WE=11667722;WS=11667704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr3	11744544	rs11411195	G	GA	890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.538;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=718;ReadPosRankSum=2.273;SC=AATAAAAGGGGAAAAAATAAT;SOR=0.175;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=25;WE=11744552;WS=11744534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr3	11744584	rs6781438	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-1.666;SC=CTCTTAGAATCCTAGTCATTA;SOR=0.086;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=22;WE=11744592;WS=11744574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr3	11871074	.	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=286;ReadPosRankSum=-0.075;SC=TCAAGAGTGACGTGATTTACA;SOR=0.350;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=20;WE=11871082;WS=11871064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr3	11880816	rs303862	C	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=31;PP=912;SC=TGGCACAAAACGGAGTAAAAT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=11880824;WS=11880806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	11886365	rs392621	T	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=865;ReadPosRankSum=-1.127;SC=ATGTACTAACTGCACTCAGCA;SOR=0.555;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=60;WE=11886373;WS=11886355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,76:0.53:143
chr3	11887991	rs408600	C	G	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1255;ReadPosRankSum=0.153;SC=GGTCTGAACTCGGCCCTGCCT;SOR=0.594;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=94;TCR=49;TR=78;WE=11887999;WS=11887981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,91:0.57:160
chr3	11912681	.	A	T	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=53.87;NF=4;NR=1;PP=24;QD=11.7542425094;SC=TTTAACAAAGAAGAGATTGGA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=5;WE=11912689;WS=11912671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr3	11912797	rs62246062	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.15;QD=30.44;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	11924613	rs369394286	AG	A	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.08;QD=34.05;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	11924678	rs11919713	C	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.45;MQRankSum=0.828;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.299;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr3	11925489	rs2470561	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.769;NF=14;NR=8;PP=310;ReadPosRankSum=-0.941;SC=AGGATGGGATCGCCATAAACC;SOR=0.816;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=22;WE=11925497;WS=11925479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr3	11925610	rs421090	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.462;NF=4;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=1.052;SC=TGTTAGTGTTCTGAATGTTCA;SOR=0.493;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=17;WE=11925618;WS=11925600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr3	12045891	rs79624759	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.73;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	12045899	rs77368781	C	T	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	12045923	rs73135622	A	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=8;PP=993;SC=GGCTAAGCCGACGCCTCAGCC;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=12045931;WS=12045913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	12045986	rs67270413	G	A	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=40;PP=1757;SC=CCGCGCCACCGGACCCCGTAG;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=12045994;WS=12045965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	12046013	rs72624441	A	C	4310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=61;PP=2252;SC=GCGCCCCCAGACCTTTAAGCC;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=126;WE=12046021;WS=12046003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr3	12046076	rs2618395	T	C	4045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=40;NR=62;PP=1851;SC=TCATCGCCAATCTGCCCAACG;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=102;WE=12046084;WS=12046066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	12046124	rs76272937	AG	GC	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	12046131	rs74213196	A	C	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.39;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	12046148	rs2623874	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	12046168	rs2623875	A	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=66.68;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	12046297	.	A	C	201	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=1;PP=201;QD=21.4337465952;SC=GCAGCAGCTTATTCAGCTCGC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=12046305;WS=12046287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	12046362	rs2923856	G	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	12046364	rs2923857	G	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	12046372	rs2623877	G	C	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	12046445	rs2600235	TT	GC	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=11;PP=963;SC=GCCGGGCGCCTTCGCCCTCGG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=12046454;WS=12046435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	12202866	rs308950	C	G	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=844;SC=CTAATATGCTCTGTGACCCTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=12202874;WS=12202856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	12208652	rs795008	A	G	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=1074;SC=GCAACAGTGAACTAAAATTCT;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=12208660;WS=12208642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	12208671	rs795009	G	T	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=1181;SC=CTGGAAAGTTGCATGCCCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=12208679;WS=12208661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	12229015	rs794999	A	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=48;PP=1899;SC=CGGCCCCACCACCCACGGAGA;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=96;WE=12229023;WS=12229005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	12232074	rs310764	A	G	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=55;PP=1904;SC=AAGCCAAAGCAGAGACCATCC;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=12232082;WS=12232064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	12232208	rs310765	T	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=433;SC=GCTTGGTGGTTATGTCCCATG;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=12232216;WS=12232198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	12317739	rs151229409	GAAGGGAGGAAGGA	G	2521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.08;MQRankSum=5.123;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr3	12537955	rs299651	T	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=222;ReadPosRankSum=0.728;SC=TTTCCTAGATTTTTAGTGTTT;SOR=0.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=19;WE=12537963;WS=12537945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr3	12557941	.	ATATATG	A	289	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=58.52;NF=9;NR=0;PP=289;QD=35.5555555556;SC=AACAAACAAAATATATGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=12557958;WS=12557931;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	12557945	.	ATGTGTG	A	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=0.405;SC=AACAAAATATATGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=12557958;WS=12557931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	12560763	rs1618545	A	T	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1007;ReadPosRankSum=1.098;SC=AGAATATCAAATTGATCTTGT;SOR=0.952;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=41;TCR=85;TR=61;WE=12560771;WS=12560753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,70:0.48:146
chr3	12570572	rs299632	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1041;ReadPosRankSum=0.800;SC=CCTCCTTACACACTAATGTCA;SOR=0.648;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=38;TCR=78;TR=64;WE=12570580;WS=12570562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr3	12573998	rs167257	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=436;ReadPosRankSum=0.605;SC=AAGGTTTATATTGTTACATTC;SOR=1.015;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=24;WE=12574006;WS=12573988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr3	12598839	rs2255655	C	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=0.421;SC=GCTGCCGCCACAGCCGGGGAT;SOR=0.341;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=16;WE=12598847;WS=12598829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr3	12613866	rs2648307	T	C	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=643;ReadPosRankSum=-0.869;SC=GGAAGGCTCATGAAAAGGTAA;SOR=0.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=48;WE=12613874;WS=12613856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr3	12617996	rs1542848	G	A	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=828;ReadPosRankSum=-1.812;SC=TTGGATGATTGTGATTTCATC;SOR=0.949;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=51;WE=12618004;WS=12617986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr3	12618262	rs9855183	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=695;ReadPosRankSum=0.554;SC=TGAGTTTCGACGTGCCCCTGC;SOR=0.560;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=43;WE=12618270;WS=12618252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr3	12626516	rs3729931	G	A	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AATGGGGGGTGAATGAACAAC;SOR=0.895;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=63;WE=12626524;WS=12626506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr3	12628920	rs2290159	G	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=1.336;SC=AAGCTGCTGAGGGACAGGCCA;SOR=2.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=12628928;WS=12628910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr3	12645007	rs2596828	C	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1064;ReadPosRankSum=0.410;SC=GTCTGGACCACGCCCTGGGAG;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=216;TCF=99;TCR=117;TR=85;WE=12645020;WS=12644997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,94:0.38:246
chr3	12647547	rs3214791	T	TG	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TTCTACCTTTTCTGTACCACC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=12647555;WS=12647542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	12650482	rs2454440	T	A	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=41;PP=1238;SC=AAAAGACAACTTCATTTCTTG;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=12650490;WS=12650472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	12660291	rs3729926	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=0.992;SC=CAAAAGTATTCAACCCAAGAA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=39;WE=12660299;WS=12660281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr3	12776428	rs3732687	A	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=461;ReadPosRankSum=1.130;SC=GTCTCAATGAACCACAGTCAT;SOR=1.123;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=28;WE=12776436;WS=12776418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr3	12778198	rs111237179	G	A	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=887;ReadPosRankSum=0.450;SC=AGGTCTTGACGCCCCTGCCCC;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=60;WE=12778206;WS=12778188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr3	12779409	rs2271209	A	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=1039;SC=AGATGGGGGTACTGTCCTTGG;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=12779417;WS=12779399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	12783779	.	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=265;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCAAGACAATCTCATGCCCGC;SOR=1.214;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=12783787;WS=12783769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr3	12791172	rs937915	T	C	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=9;PP=454;SC=GCAACGTGAGTTGAGCAGGGT;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=12791180;WS=12791162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	12810629	rs112818257	CCGGGACTGG	C	1313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=2941;SC=CCCTCACTGCCCGGGACTGGC;SOR=0.826;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=16;WE=12810645;WS=12810619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	12810755	rs7641959	G	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=12;PP=315;SC=CATACCTCCCGGAAGGCTGAG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=12810763;WS=12810745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	12810783	rs61606491	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-2.726;SC=GCTCCGGCCTCGGCCATCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=6;WE=12810791;WS=12810773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	12810837	rs7619736	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-1.803;SC=AGGGCTCCTCAAGTGCGGCCA;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=12810845;WS=12810827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	12838293	rs12631514	G	C	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=80;PP=2644;SC=TTCAGGTGCAGCCCGCCGCCG;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=131;WE=12838301;WS=12838283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	12845158	rs9835677	G	A	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=33;PP=1016;SC=TGGAGCAGGAGAGGGGGCCCT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=12845166;WS=12845148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	12848822	rs11718898	T	C	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=41;PP=2375;SC=CCTCTGGTGGTCAAAGTGAAG;SOR=1.384;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=115;WE=12848830;WS=12848812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	12849011	rs34529773	TA	T	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=24;PP=623;SC=TAGTTTATGGTAAAAAAACAA;SOR=1.688;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=29;WE=12849019;WS=12848997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	12849031	rs59302336	C	CA	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;MQRankSum=0.205;QD=21.92;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr3	12856856	rs2305398	A	G	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=51;PP=1548;SC=CGGCAAACACAGCCCCCGAAG;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=12856864;WS=12856846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	12857493	rs2305397	C	T	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=53;PP=2830;SC=GAGCATATGCCTGTGCTGGTA;SOR=1.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=130;WE=12857501;WS=12857483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	12857823	rs731646	C	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=16;PP=944;SC=CAGGGAGGGCCGTGTTGCATC;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=12857831;WS=12857813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	12858028	rs3732675	T	C	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=40;PP=2256;SC=TGTGGCTGACTCTTTCTACAA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=12858036;WS=12858018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	12859004	rs3732678	A	C	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=64;PP=2608;SC=GGGCCAGGCCACCAGCGGGAG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=12859012;WS=12858994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	12875443	rs12629133	G	A	4637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=81;PP=2753;SC=GAAGGATTCCGCTTCAGCCCC;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=139;WE=12875451;WS=12875433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	12942408	rs9818523	G	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=720;ReadPosRankSum=0.511;SC=TTTGGTGTGCGGCTGGCGACC;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=47;WE=12942416;WS=12942398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr3	12942850	rs56387830	GC	G	1293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=14;PP=1195;SC=TGGGGGGGTGGCCAGGGCTGG;SOR=1.061;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=30;WE=12942858;WS=12942840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	12954868	rs2600322	A	G	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=28;PP=1967;SC=ACAGCCAGACATGGACCCTGG;SOR=1.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=100;WE=12954876;WS=12954858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	12956531	rs2255964	G	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1195;SC=CTGGGGAGCCGGCGGACTGGC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=12956539;WS=12956521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	12962074	rs35319679	G	A	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=697;ReadPosRankSum=-2.669;SC=ACCACCCCAGGGTTGCAGATG;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=40;WE=12962082;WS=12962064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr3	12976863	rs2600206	T	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=10;PP=1081;SC=TCAAGCTCCGTGCTTGGAAGG;SOR=2.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=46;WE=12976871;WS=12976853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	13359433	rs354477	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=0.656;SC=GGAAGTCCACGGGCACCTGCT;SOR=0.327;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=13;WE=13359441;WS=13359423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr3	13361238	rs2276748	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=235;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TGGTCTGTCCCAGATGATGTC;SOR=0.201;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=17;WE=13361246;WS=13361228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr3	13361287	rs354478	C	T	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=474;ReadPosRankSum=0.240;SC=CGGCGATCCACCACAAAAGCC;SOR=0.521;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=33;WE=13361295;WS=13361277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr3	13361391	rs354479	A	G	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=55;PP=2247;SC=CGCGGGGTCCAAGACGCCGAC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=119;WE=13361399;WS=13361381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	13364876	rs514084	G	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=965;ReadPosRankSum=0.070;SC=CCTGGAAGCTGGTCTGGATGG;SOR=1.196;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=61;WE=13364884;WS=13364866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr3	13367357	rs113734634	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=659;ReadPosRankSum=0.799;SC=CCCACGGCCCGGGCCACAGCC;SOR=0.583;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=39;WE=13367365;WS=13367347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr3	13367406	rs665064	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=516;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TGCTGTTGGCCGAGGAGCTCC;SOR=0.968;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=33;WE=13367414;WS=13367396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr3	13368892	rs2271509	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=154;ReadPosRankSum=0.280;SC=TGCGGACAACGCAGGTGTTGT;SOR=0.632;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=15;WE=13368900;WS=13368873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr3	13379400	rs3773302	C	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1114;ReadPosRankSum=0.365;SC=GCAGCAGCACCTCCACCTGCA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=81;WE=13379408;WS=13379390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr3	13379452	rs3773301	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=970;ReadPosRankSum=0.581;SC=GTGTGGGGATGCAGTGCTGGC;SOR=0.977;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=143;TCF=67;TCR=76;TR=66;WE=13379460;WS=13379442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,79:0.46:172
chr3	13383540	rs2271504	A	G	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1361;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TCAGGTCCATAAAGGGGAAGT;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=96;TCR=99;TR=91;WE=13383548;WS=13383529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,112:0.48:235
chr3	13393166	rs11292029	CT	C	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=16;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.645;NF=10;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=0.599;SC=TTTGATTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.445;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=11;WE=13393185;WS=13393157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	13395475	rs2280085	G	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=603;ReadPosRankSum=0.989;SC=GGCAGCTCAGGCTCGATGCTG;SOR=0.212;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=40;WE=13395483;WS=13395465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr3	13395579	rs2280084	C	A	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=770;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CAGGTCCAGCCGGGGGTTGCG;SOR=0.434;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=48;WE=13395587;WS=13395569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr3	13407556	rs3732671	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=660;ReadPosRankSum=-1.885;SC=TTTACCCGGATGCCGCTGCAG;SOR=0.954;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=53;WE=13407564;WS=13407546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr3	13415146	rs6810356	G	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=6;PP=963;ReadPosRankSum=0.067;SC=TGAAGTCGAGGCTTGCTCAGA;SOR=1.003;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=82;TCR=10;TR=51;WE=13415154;WS=13415136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
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chr3	13420624	rs6442378	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=469;ReadPosRankSum=1.184;SC=CTTAGGCCACGTAGAGCAAAG;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=29;WE=13420632;WS=13420614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr3	13421150	rs7628051	C	T	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.709;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1609;ReadPosRankSum=0.572;SC=ACCGGCCGGGCTGGGTCTCCT;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=198;TCF=117;TCR=81;TR=105;WE=13421158;WS=13421140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,121:0.52:232
chr3	13421320	rs7625586	T	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=682;ReadPosRankSum=0.105;SC=ATCTCTGCACTCTGCTCTCAG;SOR=0.502;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=34;WE=13421328;WS=13421310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr3	13438830	rs13066607	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GGGCTGCAGAAGACAAACAGG;SOR=0.393;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=13438838;WS=13438820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	13523010	rs2655218	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=158;ReadPosRankSum=-0.615;SC=AGCCCTCGGATGGCCTTCCAC;SOR=0.278;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=17;WE=13523018;WS=13523000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	13543274	rs59143878	C	T	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1186;ReadPosRankSum=0.038;SC=AGCATTAGGCCCCCCTCCCCG;SOR=0.605;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=69;WE=13543282;WS=13543264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr3	13544310	rs2290197	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=711;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GTTTCCTGAGGGGTGGGTGGG;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=37;WE=13544318;WS=13544300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr3	13574075	rs9827959	C	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=590;ReadPosRankSum=1.649;SC=ATAACCCCCCCATCCCTGGCT;SOR=1.206;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=31;WE=13574083;WS=13574065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	13612936	rs3732666	A	G	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1289;ReadPosRankSum=0.907;SC=GCATGCACCGAGCCTGGGCAA;SOR=0.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=74;WE=13612944;WS=13612926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,83:0.52:161
chr3	13649762	rs2276747	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=1.041;SC=CAGGCAGCCCGGAGAGAGTGC;SOR=0.188;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=13649770;WS=13649752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	13655682	rs3773270	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=737;ReadPosRankSum=1.669;SC=CTGCTCTTCCCTGGCTGCGGC;SOR=0.162;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=39;WE=13655690;WS=13655672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr3	13659897	rs4596126	A	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=119;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TTACCCCACAAGTTGGAACCC;SOR=0.330;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=13659905;WS=13659887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	13669537	rs1966825	T	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=660;ReadPosRankSum=0.696;SC=TGGGGGCTTTTAGGGCTTTAG;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=39;WE=13669545;WS=13669527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr3	13670481	rs2242023	A	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GCTCCTACACATGCCAGAGGA;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=94;TCR=105;TR=87;WE=13670489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,99:0.41:239
chr3	13670536	rs9843344	A	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CGATGATGGGACCAAGTGTGT;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=59;WE=13670544;WS=13670526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,65:0.41:157
chr3	13670776	rs4684968	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=182;ReadPosRankSum=0.042;SC=GGGATGCCTTTGGCCGGGGCT;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=18;WE=13670784;WS=13670766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr3	13670837	rs4684969	T	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	13678173	rs2290188	G	T	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=736;ReadPosRankSum=1.251;SC=CCTCCCTCTCGTCCCAGCCCC;SOR=0.426;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=36;WE=13678181;WS=13678163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr3	13679044	rs4684148	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=655;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TGGGTGACCCGGCCTATCCTC;SOR=0.434;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=40;WE=13679052;WS=13679034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr3	13679203	rs1061375	G	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1546;ReadPosRankSum=1.041;SC=CAGCCTTCACGGGGGACACCA;SOR=0.521;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=95;WE=13679211;WS=13679193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,108:0.55:198
chr3	13679335	rs1061376	C	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=710;ReadPosRankSum=0.095;SC=TTGCCCTGGACGTGGAGATGA;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=44;WE=13679343;WS=13679325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr3	13679829	rs7820	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=0.713;SC=TTTTGTTTAACTATAAAGTAG;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=22;WE=13679837;WS=13679819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr3	13679855	rs7596	T	A	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.779;SC=GTACATTATATAAAAAAAAGT;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=16;WE=13679863;WS=13679845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr3	13679906	rs77628528	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.135;SC=AGAGGAAAACGCCTCTTGGTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=13679914;WS=13679896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	13896140	rs3762719	A	G	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.875;NF=39;NR=58;PP=1441;ReadPosRankSum=0.842;SC=GGATGTCGGCAGAGCAGCCAC;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=97;WE=13896148;WS=13896130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,107:0.57:187
chr3	13896284	rs12639607	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=267;ReadPosRankSum=-1.420;SC=CGTAGGTGAACGCAGCCTCCC;SOR=1.954;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=15;WE=13896292;WS=13896274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	13916407	rs3749319	G	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=454;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CCCTAGAGCCGGTAAGACTCT;SOR=1.316;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=22;WE=13916415;WS=13916397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr3	14105882	rs4684179	C	A	331.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=17;PP=474;SC=AGCAGCAGCCCCAGCAGCAGC;SOR=2.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=22;WE=14105890;WS=14105872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	14106310	.	T	TCCAGCACCAGCAGTC	1266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=5;PP=1136;SC=CAGCAGCAGCTCCAGCACCAG;SOR=1.708;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=14;WE=14106318;WS=14106300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	14106499	rs2607779	G	A	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=851;SC=GAGAGGCCCCGTGGGTATTCT;SOR=0.952;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=14106507;WS=14106489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	14154231	rs2731316	T	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=556;SC=TATGTCAAGATGTCAAGACCT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=14154239;WS=14154221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	14158220	rs2731313	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=649;SC=GGCAGGAAAAGAAGCACTGAA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=14158228;WS=14158210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	14173963	rs4685074	G	T	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=54;PP=2517;SC=TAGCCCTGAGGTTGCTTCCTG;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=14173971;WS=14173953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	14174146	rs4685075	T	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=31;PP=962;SC=GGGCCCACAGTGGTGGCTGGA;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=14174154;WS=14174128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	14174427	rs4685076	A	T	5805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=97;PP=2965;SC=TTGGCCACAAAAACCCCAGGT;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=87;TCR=97;TR=184;WE=14174435;WS=14174417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	14174509	.	G	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=-2.354;SC=TTCTTCATCTGAATAACAGGA;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=41;WE=14174517;WS=14174499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr3	14175262	rs2340917	T	C	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=46;PP=2077;SC=GAGTCATTCATGGCAACAGCC;SOR=1.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=121;WE=14175270;WS=14175252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	14176446	rs6766740	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=1018;SC=CTAGGATCAGGTTCCTGCGCC;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=14176454;WS=14176436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	14187449	rs2228001	G	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1091;SC=GCTCACAGCTGCTCAAATGGG;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=14187457;WS=14187439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	14187699	rs2733532	T	C	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=7;PP=202;SC=AGGCGAGGGTTAGTAATCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=14187707;WS=14187689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	14188700	rs2733533	C	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=816;ReadPosRankSum=0.114;SC=TGACTTGAGGCTGGGGCAGAA;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=83;TCR=35;TR=51;WE=14188708;WS=14188690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,56:0.42:132
chr3	14188762	rs2733534	G	C	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1730;ReadPosRankSum=0.904;SC=CCCTGAGCTTGTCTTCTCTGC;SOR=0.540;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=255;TCF=145;TCR=110;TR=113;WE=14188770;WS=14188752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,134:0.44:302
chr3	14189340	rs2607749	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=-1.575;SC=GGCCTGGGGAAGGAAGAGGCC;SOR=1.508;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=15;WE=14189348;WS=14189330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr3	14190237	rs2279017	T	G	7037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=117;PP=2965;SC=GGCACCTGTGTCGGGTGAGCA;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=100;TCR=117;TR=217;WE=14190245;WS=14190227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	14190268	rs2470353	G	C	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1367;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TGGCCAGCAGGGGAACAAGGC;SOR=0.604;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=181;TCF=75;TCR=106;TR=95;WE=14190276;WS=14190258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,108:0.51:210
chr3	14193889	rs2227998	C	T	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.896;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=52;PP=1420;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GCCACGTGTCCCTGGAATGCA;SOR=0.909;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=91;WE=14193897;WS=14193879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,111:0.44:253
chr3	14197987	rs2958057	A	T	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=35;PP=1448;SC=CCATGTGTTTAGCCTGAAACT;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=14197995;WS=14197977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	14199887	rs2228000	G	A	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=66;PP=1760;ReadPosRankSum=0.445;SC=TGAGGATGCCGCTGGCAAGCT;SOR=0.898;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=187;TCF=73;TCR=114;TR=103;WE=14199895;WS=14199877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,116:0.57:205
chr3	14201400	rs3731124	T	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=1.314;SC=CAATGTTGTTTGTTATGGTGC;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=15;WE=14201408;WS=14201390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	14208625	rs3729587	G	C	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=1064;ReadPosRankSum=0.063;SC=CAAGCTCTTTGCACCGACAAG;SOR=0.719;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=61;WE=14208633;WS=14208615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr3	14211865	rs3731081	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=-0.211;SC=AATTAGTGATCTGACTCCAAA;SOR=0.197;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=14211873;WS=14211855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr3	14214524	rs2229089	G	A	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=48;PP=1127;ReadPosRankSum=1.442;SC=ACTTTGGAGAGAAGGCTCTTC;SOR=0.524;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=128;TCF=35;TCR=93;TR=69;WE=14214532;WS=14214514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,79:0.52:152
chr3	14220095	rs2607775	C	G	4514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=100;PP=2665;ReadPosRankSum=0.092;SC=AATTCCACTTCGCGAGTGACG;SOR=0.815;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=380;TCF=185;TCR=195;TR=182;WE=14220103;WS=14220085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,222:0.47:470
chr3	14220517	rs3731054	C	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TTTCCGTAACCCCCCCTCCGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=14220525;WS=14220507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	14223224	rs3733170	C	T	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1810;ReadPosRankSum=1.892;SC=ACCCCCACTCCCTTGAAATGT;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=108;WE=14223232;WS=14223204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,131:0.46:282
chr3	14486392	rs3773189	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.647;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=286;ReadPosRankSum=1.935;SC=CCCCTGCCCCAATGCTTTGCC;SOR=0.091;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=18;WE=14486400;WS=14486382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr3	14526538	rs1062540	G	A	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CGACGGGGCCGGCGGCTTTCC;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=46;WE=14526546;WS=14526528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr3	14526612	rs35363110	AT	A	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.222;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	14526656	rs1126666	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=287;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AATTGTGGGTATGTGTGCGTG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=14526675;WS=14526646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	14526667	rs138405130	C	CGTGT	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=441;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TGTGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.859;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=14526675;WS=14526646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr3	14537867	rs11918344	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=205;ReadPosRankSum=-0.465;SC=GTCCCACGACAGTGCTCATGG;SOR=1.144;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=18;WE=14537875;WS=14537857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr3	14538072	rs11333211	CA	C	2985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.171;NF=6;NR=44;PP=1777;ReadPosRankSum=-1.872;SC=TGGATGCCTGCAAGGAACACG;SOR=0.619;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=91;TCF=23;TCR=68;TR=50;WE=14538080;WS=14538062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,94:0.60:157
chr3	14548494	rs2276755	A	G	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=64;PP=2166;SC=GGGACCTGGGAGGAGAGAGGG;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=97;WE=14548502;WS=14548484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	14551444	rs9845816	A	G	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=45;PP=1729;SC=CCACTGTGTAACTGACGGCAC;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=14551452;WS=14551434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	14552994	rs4685168	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=650;SC=GCCGCTGGAGAAAAAGAGGCC;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=14553002;WS=14552984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	14554476	rs4516597	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.726;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=55;PP=1716;ReadPosRankSum=-0.732;SC=AAGTCACAGTTCTAATCTCAT;SOR=1.447;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=79;WE=14554484;WS=14554466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr3	14555009	rs4685170	C	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=295;SC=TTCTCCCTCCCGTGCCAAGGC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=14555017;WS=14554999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	14555216	rs4685171	T	C	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=61;PP=1584;SC=TGTGGGCCAGTGCGGCGTCCC;SOR=1.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=94;WE=14555224;WS=14555206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	14555367	rs4685172	T	C	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=258;SC=GACAGGTCCATTGGGAGACAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=14555375;WS=14555357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	14555739	rs4361268	G	A	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=18;PP=1171;SC=AGGGCTTGGTGCTGTGACTCA;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=14555747;WS=14555729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	14555758	rs138623401	C	CAGTT	3124.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=24;PP=2348;SC=CAGTTTCTCTCAGAGAGTGGC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=38;WE=14555766;WS=14555748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	14555811	rs4613440	A	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=44;NR=47;PP=1883;SC=TCTCAGCCGGACTGTCAGGCT;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=14555819;WS=14555801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	14561627	rs5846840	A	AG	1457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=1329;SC=CCTGCCTCTGAGGCCTCAGTG;SOR=2.093;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=31;WE=14561635;WS=14561617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	14563258	rs4234526	A	G	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=707;SC=TTCCATCGACACTGAGCAGCC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=14563266;WS=14563248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	14565017	rs4685173	G	A	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=16;PP=1570;SC=AGTCAGAACTGAGATACACAT;SOR=1.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=64;WE=14565025;WS=14565007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	14702848	rs3832217	A	AT	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=2.285;SC=CTTTTTCAAGATTTTTTTGTG;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=14702856;WS=14702846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	14702982	rs2276754	C	A	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=42;PP=2444;SC=GCTTCTTGTCCATTCCATGTG;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=116;WE=14702990;WS=14702972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	14703297	rs9840626	C	G	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1344;ReadPosRankSum=1.837;SC=GGGTTGTTATCGAGCCATTTC;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=73;TCR=102;TR=93;WE=14703305;WS=14703287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,102:0.52:195
chr3	14703401	rs55915506	CATAATTACA	C	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.77;MQRankSum=1.326;NF=0;NR=11;PP=2769;ReadPosRankSum=-1.128;SC=CAAATGAAGACATAATTACAA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=11;WE=14703417;WS=14703391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	14706745	rs142447115	T	TATTG	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=479;ReadPosRankSum=1.847;SC=AGTAAGGAGATATTGATTGAT;SOR=1.445;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=8;WE=14706753;WS=14706735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	14706770	rs73022117	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-1.360;SC=TGATTGATTGAAGCACTTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=14706778;WS=14706760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	14708918	rs2280383	A	G	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=32;PP=1940;SC=TGGGTAATTCATACTTCTTTC;SOR=1.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=103;WE=14708926;WS=14708908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	14712473	rs1901	G	A	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.043;SC=AGTTTGCCCCGCCGTCAGATT;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=62;WE=14712481;WS=14712463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,67:0.63:107
chr3	14724413	rs9821143	G	A	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=51;PP=1857;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TACCCCGTCCGACATCTTGGG;SOR=0.584;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=223;TCF=127;TCR=96;TR=113;WE=14724421;WS=14724403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,124:0.49:254
chr3	14725668	rs12488352	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=436;SC=CTTCTTTCCTGGGCCATTTAC;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=14725676;WS=14725658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	14725878	rs34230332	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=-1.739;SC=AGCAGCGGACAGTTGTGGAAA;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=30;WE=14725886;WS=14725868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr3	14745857	rs17040196	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=322;ReadPosRankSum=1.342;SC=AGCTGAAAGGGCCACATGGAA;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=26;WE=14745865;WS=14745847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,30:0.34:89
chr3	14755572	rs6765537	A	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=569;ReadPosRankSum=-0.321;SC=AGGGAGAACCATCACCTGCCT;SOR=0.681;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=34;WE=14755580;WS=14755562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr3	14755617	rs6790129	C	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=387;ReadPosRankSum=0.474;SC=CTTGCTGGCCCTATTCAATAC;SOR=0.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=26;WE=14755625;WS=14755607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr3	14756730	rs9869372	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=16;PP=712;SC=TCTGCCCATAACCTGCGGTGA;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=14756738;WS=14756720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	14768534	rs7636830	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=486;ReadPosRankSum=-0.487;SC=GGCCGCAGGTAAGGAGGCTGA;SOR=1.127;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=21;WE=14768542;WS=14768524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr3	14768554	rs17255247	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-0.215;SC=AAAGGTGGGCGAAGGCCTATC;SOR=0.450;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=18;WE=14768562;WS=14768544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr3	14801550	rs2729697	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CACCCCAGCCGCAGCCACCTC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=11;WE=14801558;WS=14801540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	14813825	rs294624	G	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=192;SC=TCCAACCATCGCTGACATCTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=14813833;WS=14813815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	14905513	rs172429	T	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=10;PP=979;SC=GAAGTAGGAATTTTGTGCCTG;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=14905521;WS=14905503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	14939198	rs2117775	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=0.166;SC=CTGGACCCCCGGGTTCCACTT;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=18;WE=14939206;WS=14939188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	14939364	rs2117774	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=1.044;SC=ACCCAGGGATGTGACTCCAGG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=14939372;WS=14939354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr3	14939479	rs2164356	G	T	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=22;PP=1294;ReadPosRankSum=-1.566;SC=ACGTCTTCCTGGCCCGGGAGC;SOR=0.923;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=159;TCF=106;TCR=53;TR=76;WE=14939487;WS=14939469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,99:0.53:188
chr3	14939679	rs2307090	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=554;ReadPosRankSum=0.226;SC=ATGCAAATCAGTGGGACATCT;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=28;WE=14939687;WS=14939669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr3	14940098	rs1656415	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=0.091;SC=GGCTTCCCGCAGGAGGAGAAC;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=12;WE=14940106;WS=14940088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	14942024	rs2307088	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=245;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CGCCAAAGCCTGGACCCTGCC;SOR=2.268;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=18;WE=14942032;WS=14942014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	14942675	rs293906	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=667;SC=GCAGGCAACCGTCTCTCTTGT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=14942683;WS=14942665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	14949102	rs293910	G	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=638;ReadPosRankSum=2.595;SC=AAGACGCCTGGTAGGGGCCCT;SOR=0.714;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=43;WE=14949110;WS=14949092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr3	14949268	rs9818644	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=1.518;SC=GGCGAGGCTCCGATAAGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=15;WE=14949276;WS=14949258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr3	14952526	rs1716969	T	G	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=538;ReadPosRankSum=-2.600;SC=TGGAATAGGGTGAGAGGAGAG;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=36;WE=14952534;WS=14952516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr3	14960170	rs293916	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=341;SC=TAGGTGGACATGGTCCCTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=14960178;WS=14960160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	14960204	rs2117776	G	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=215;ReadPosRankSum=0.769;SC=AGGAGAAGCCGGTCTACACTT;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=17;WE=14960212;WS=14960194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	14963337	rs13060887	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=764;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GCTCAAGGGGCATCTGAGTGA;SOR=0.479;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=47;WE=14963345;WS=14963327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,61:0.54:113
chr3	14965466	rs4685234	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=404;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AAAGACAAGCCGCAGGCACGC;SOR=0.512;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=20;WE=14965474;WS=14965456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr3	14965507	rs4685235	A	G	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=20;PP=1532;SC=GGCTTCTTTCAGTTACAGAGC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=14965515;WS=14965497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	15311325	rs1287467	A	G	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=34;PP=1098;SC=CCTTGGCGGCACGGAGCACCT;SOR=1.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=15311333;WS=15311315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	15311464	rs1287468	G	T	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=154;SC=CAAAAAATAAGCATCCCAAGG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=15311472;WS=15311454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	15345924	rs9828229	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=440;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CGGCGGAAACGTCCTGTGCTC;SOR=0.739;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=25;WE=15345932;WS=15345914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr3	15371819	rs3773464	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.447;SC=ACAACATGTGCAATTGGATCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=15371827;WS=15371818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	15473764	rs1563416	G	A	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=91;PP=2648;SC=TTTATATCATGTTTCCAAACC;SOR=1.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=33;TCR=91;TR=124;WE=15473786;WS=15473754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	15537724	rs111329177	T	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CCCCACCCCATCCCCCTCACC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=15537732;WS=15537714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	15537992	rs9847828	A	G	109.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=0.566;SC=GACTGTCTCTATAGAATTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=15538000;WS=15537982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	15539976	rs141810796	C	CCACACA,CCACA	4569.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=21,21;NR=24,24;PP=1581,41;SC=GCATGTGCATCCACACACACA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=45,45;WE=15539984;WS=15539966;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.98:96
chr3	15610070	rs905650	C	T	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=51;PP=1288;ReadPosRankSum=-1.429;SC=AATTCATAGGCAGGGATTTTT;SOR=0.884;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=53;TCR=88;TR=79;WE=15610078;WS=15610060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,89:0.54:164
chr3	15643043	rs2019160	A	G	3397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=2174;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CAAACGCGAAATCGGCAGCAC;SOR=0.803;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=120;WE=15643051;WS=15643033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,144:0.51:282
chr3	15717693	rs2246960	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=0.510;SC=CCTTGTCAACGTGTAGCTCGG;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=15717701;WS=15717683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	15736385	rs2455814	A	T	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=90;PP=2965;SC=TCTCCCACCCACCCAGTTCAA;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=158;WE=15736393;WS=15736375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	15737610	rs2470547	T	C	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=928;ReadPosRankSum=0.462;SC=AAACTCCCATTAGGTCTTTCA;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=53;WE=15737618;WS=15737600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr3	15737689	rs2470548	G	A	3386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,87:0.53:163
chr3	15737698	rs2470549	T	C	3445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=2.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,90:0.54:168
chr3	15752830	rs2455833	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TATTTTACACTAAAGAATTGT;SOR=1.230;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=7;WE=15752838;WS=15752820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr3	15753641	rs2455834	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=477;ReadPosRankSum=0.250;SC=CAAAGGTTACACTTACCTGAA;SOR=0.632;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=35;WE=15753649;WS=15753631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr3	15756215	rs924754	A	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=524;ReadPosRankSum=0.655;SC=TAATGTGTAAACCTTAGTTTT;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=29;WE=15756223;WS=15756205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr3	15807692	rs73038264	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=0.517;SC=AACATTAAGAATAACAAAAAT;SOR=1.123;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=28;WE=15807700;WS=15807682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr3	15807725	rs6789076	T	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=528;ReadPosRankSum=0.109;SC=TTCTTATTACTCAGAGGTTAC;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=34;WE=15807733;WS=15807715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr3	15815757	rs73038271	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.239;SC=AAATCCATGAAGTTAATGAAT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=15815765;WS=15815747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	15900973	rs62243667	A	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=514;ReadPosRankSum=0.647;SC=GCCGCCGCCGACCGGCCCACT;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=36;WE=15900981;WS=15900963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr3	15901053	rs71064238	CT	C	648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=581;SC=CTGAGAAGACCTGCGGGCAGG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=15901061;WS=15901043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	16305674	rs14080	C	G	7643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=136;PP=2965;SC=TGTCATAAATCACTTTTATAA;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=99;TCR=136;TR=235;WE=16305682;WS=16305664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr3	16312564	rs842259	C	T	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=2069;ReadPosRankSum=0.852;SC=CTTTGCGCCACCTTACTCTAA;SOR=0.271;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=108;WE=16312572;WS=16312554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr3	16312716	rs11284055	GT	G	341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=259;SC=GTTGTTAACCGTTTTTTTTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=16312724;WS=16312706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	16313878	rs842260	G	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=276;SC=ATTTGATTTTGCTTTTTTGAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=16313886;WS=16313868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	16327855	rs842274	T	G	4197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=79;PP=2765;SC=TTAGATTGTGTCAGCAGCTAA;SOR=1.156;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=130;WE=16327863;WS=16327845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	16343092	rs842283	T	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=687;SC=TTTAAGACCTTTGCTACAAAA;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=16343100;WS=16343082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	16450872	rs1546650	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=418;ReadPosRankSum=-0.740;SC=ACCCTGACTGTAGCGCTCACC;SOR=0.572;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=26;WE=16450880;WS=16450862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,34:0.36:94
chr3	16535229	rs3815962	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=792;SC=CCCATGTACTCACCAGCACTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=16535237;WS=16535219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	16635866	rs13067997	C	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-1.030;SC=ACTGTTGCTCCCATGGGAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=16635874;WS=16635856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	16639754	rs3773827	G	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=392;ReadPosRankSum=-1.177;SC=ACTAAAAGAAGGTTCGATGAT;SOR=0.800;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=26;WE=16639762;WS=16639744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr3	16646745	rs9847342	C	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=48;PP=1753;SC=CGACCGGCTCCAGGAGGAGCA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=16646753;WS=16646735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	16926599	rs7626446	T	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	16926607	rs7626448	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.91;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	16926642	rs6442655	A	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	16926648	rs6442656	T	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.87;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	16926666	rs7626542	T	G	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=21;PP=1111;SC=GGTCGCCTCGTCCACGGGCGG;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=16926674;WS=16926656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	16974610	rs9880307	C	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=607;ReadPosRankSum=-1.744;SC=ATTGGACAGCCGGAGTATTTT;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=38;WE=16974618;WS=16974600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr3	17051081	rs28498854	T	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-1.456;SC=GATTTTTTTCTAGGAAATTAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=17051089;WS=17051078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	17053499	rs4602367	A	G	2980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.019;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=1918;ReadPosRankSum=0.943;SC=GAGGAGGAGGAAAGCCTCATA;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=119;WE=17053507;WS=17053489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,135:0.58:233
chr3	17077268	rs17272796	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=806;ReadPosRankSum=-1.327;SC=TTCTCTAATACGAGTTGAGGT;SOR=0.872;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=50;WE=17077276;WS=17077258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr3	17131421	rs35185988	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=530;ReadPosRankSum=0.119;SC=TTACAATAAACCATTATGGAG;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=33;WE=17131429;WS=17131403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr3	17131501	rs11549706	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=0.538;SC=GAATAATATTCGGGATTTTAA;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=17131509;WS=17131491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	17208267	rs1138454	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=750;ReadPosRankSum=-1.507;SC=ACCTGTTTAATGGCCCCTGAC;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=57;WE=17208275;WS=17208257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,65:0.41:157
chr3	17209153	rs56166267	G	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=462;ReadPosRankSum=0.026;SC=GGGGATGCTGGCTCTAACATC;SOR=0.960;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=25;WE=17209161;WS=17209143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr3	17209195	rs2305291	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=549;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGCCCTCCCCGCGGCAGGCGG;SOR=0.622;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=36;WE=17209203;WS=17209185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr3	18055231	rs61978649	A	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=668;ReadPosRankSum=-0.080;SC=AGACAGTCACAGTAGTCCAGA;SOR=0.518;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=26;TCR=77;TR=48;WE=18055239;WS=18055221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr3	18057982	rs9310538	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.842;SC=GAGGGACCTAATGGGAGGGCG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=18057990;WS=18057972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	18058059	rs9310539	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=-1.487;SC=CTGAGATCTGATTGTTTAAAC;SOR=0.657;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=10;WE=18058067;WS=18058049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr3	18058093	rs62240226	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=0.847;QD=13.85;ReadPosRankSum=2.346;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	18308436	rs7432753	A	G	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=13;PP=1743;SC=TTGACCAACAAAGGTCTAAAT;SOR=2.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=18308444;WS=18308426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	18419553	rs9310557	C	T	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=7;PP=1382;SC=ATCCTAGACACAGAGGCCTCT;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=18419561;WS=18419543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	18419859	rs10460976	G	A	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=821;SC=TTCATTGGCTGAATTGTTTTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=18419867;WS=18419849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	18427924	rs2229261	G	T	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=15;PP=910;SC=TGCTGATGAGGGGGGCAGGAC;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=18427932;WS=18427914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	19436587	rs10470642	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=241;SC=GCTCTGTCTCTTACCACAGGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=19436595;WS=19436577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	19491459	rs78346521	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	19925807	rs9882578	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GGGAAACTTAATCTAACGGAG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=19925815;WS=19925798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr3	19930003	rs4858714	G	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=709;ReadPosRankSum=-1.830;SC=GAAAATTTGCGAATTCCAGAT;SOR=1.026;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=47;WE=19930011;WS=19929993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr3	19940877	rs2931385	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-1.099;SC=GTATTTTTTAAATTCTATGCA;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=19940885;WS=19940867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	19941074	rs2931386	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=334;ReadPosRankSum=0.301;SC=AAATATACATAAGGCGAAGAA;SOR=0.919;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=16;WE=19941082;WS=19941064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	19946992	rs2931394	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	19947105	rs66526230	A	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=0.913;SC=AGTATAATTAAACTTACATTT;SOR=0.440;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=18;WE=19947113;WS=19947095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr3	19947296	rs2929377	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=144;ReadPosRankSum=1.218;SC=AACCTTATCATGCAAGATGCA;SOR=2.086;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=14;WE=19947304;WS=19947286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr3	19959756	rs2929366	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr3	19961330	rs2931403	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=476;ReadPosRankSum=1.007;SC=CTTACCAGTACTGAAATTTTA;SOR=0.491;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=30;WE=19961338;WS=19961320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr3	19974700	rs2929350	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=376;ReadPosRankSum=-1.028;SC=TTAGTTCCTATGGAAAGTGGA;SOR=1.427;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=24;WE=19974708;WS=19974690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr3	19975139	rs17180771	C	T	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1634;ReadPosRankSum=0.328;SC=GCTGTATTATCCGTTCATGGG;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=99;TCR=60;TR=84;WE=19975147;WS=19975129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,93:0.49:190
chr3	19975582	rs2929349	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=0.290;SC=CTGGCTACAAAGACGCCTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=19975590;WS=19975572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	19992432	rs6773437	G	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=10;PP=1186;SC=GGCCAAATACGGGAAATAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=19992440;WS=19992422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	20011871	rs17796230	G	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=-1.795;SC=CTGATTCCAGGGTCTGTGGTA;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=10;WE=20011879;WS=20011861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr3	20017489	rs4858122	GG	CC	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=224;SC=AAAGATGCTTGGTAACCATTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=20017498;WS=20017479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	20025665	rs34961993	G	GA	219.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=2;PP=96;SC=AGTCACCTGTGAAAAAAAAAT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=20025673;WS=20025655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	20027708	rs11128931	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=0.995;SC=AGAAATTTTTATCCTAGAGAT;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=15;WE=20027716;WS=20027698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr3	20042462	rs13093485	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=317;ReadPosRankSum=1.085;SC=AGCATGAGGGGTTTTGCTGCA;SOR=1.019;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=20;WE=20042470;WS=20042452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr3	20042834	rs4103004	C	T	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1207;ReadPosRankSum=0.024;SC=TCTATTGCTGCGTATTCTTCT;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=70;WE=20042842;WS=20042824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr3	20053581	rs2686326	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=742;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TTGGAATTACCTTTCTTTGCC;SOR=0.842;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=48;WE=20053589;WS=20053571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr3	20113830	rs3021408	G	A	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=34;PP=1872;SC=TTTAGGCCGAGGAGTCTTGTA;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=20113838;WS=20113820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	20113989	rs3749180	C	A	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1538;SC=ATAACGAGTTCATTGTAGCGT;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=20113997;WS=20113979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	20114044	rs3828349	T	C	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	20114048	rs3828348	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.08;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	20136611	rs2293140	C	T	329.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.361;SC=TTCAGTCCTACAGGAGTTCAG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=20136619;WS=20136601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr3	20136645	rs2293141	A	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=299;ReadPosRankSum=1.513;SC=TTACCAGTGAACTTAAAGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=16;WE=20136653;WS=20136635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr3	20141301	rs11128939	T	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=0.081;SC=GAGAGAGAGATAGACATACCA;SOR=2.376;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=10;WE=20141309;WS=20141291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	20141356	rs35424474	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=218;ReadPosRankSum=0.787;SC=CTTTGCAGCTCTTGAGAAAGT;SOR=1.244;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=17;WE=20141364;WS=20141346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	20142360	rs4858764	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.20;ReadPosRankSum=-2.625;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	20143020	rs4858155	G	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.414;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=681;ReadPosRankSum=0.395;SC=ACCTAAAATTGTACTTGACTC;SOR=0.215;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=85;TCF=21;TCR=64;TR=43;WE=20143028;WS=20143010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr3	20156302	rs2365794	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=-1.271;SC=AAGGTGATTGTCACAGATAAT;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=20156310;WS=20156292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	20168875	rs41285061	C	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=453;ReadPosRankSum=-0.583;SC=ATTTATATAACTAGGATAGGT;SOR=0.551;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=19;WE=20168883;WS=20168865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr3	20188074	rs2686314	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=566;SC=GCAAATGTTACCCTTTTATGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=20188082;WS=20188064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	20212189	rs1052930	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=654;SC=AATATCCAACAAAACCTTCAT;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=20212197;WS=20212179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	20216519	rs61729306	T	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CAACTCCCAGTGTGTCTTGAG;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=24;WE=20216527;WS=20216509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr3	20219694	rs6550401	T	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CACATTTCCTTTCATAAATGA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=20219702;WS=20219684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	20219885	rs6550402	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=27;PP=789;SC=GAAGTATTCACAAGAAAGCAT;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=20219893;WS=20219875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	21462754	rs451242	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=21;PP=1499;SC=GAATGGGTCCAGGAGCTGGCC;SOR=1.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=21462762;WS=21462744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	21462787	rs427233	G	A	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=47;PP=2650;SC=GAGGAAGCGCGGAAGTCTGGA;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=129;WE=21462795;WS=21462777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	21462880	rs4455340	A	G	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=971;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CTGCTAGAGGATTTGGTAGAA;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=67;WE=21462888;WS=21462870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr3	21467245	rs186892	A	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.842;SC=GAGGAAAAAAATCTTAGCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=11;WE=21467253;WS=21467235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	21606027	rs66546661	AT	A	322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=3;PP=203;SC=AGCAAAATGTATTTTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=13;WE=21606035;WS=21606017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	23364883	rs9844558	G	A	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=836;SC=TATTCTAGACGATTTAAGAAG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=23364891;WS=23364873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	23364918	rs11921580	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=428;ReadPosRankSum=0.552;SC=TTTGGCATGACCCCAGGGCTA;SOR=0.937;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=27;WE=23364926;WS=23364908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr3	23930908	.	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=364;ReadPosRankSum=1.212;SC=AGTTCAGTCTACTAGTTGAGA;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=21;WE=23930916;WS=23930898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr3	23987002	.	A	AGGC	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=4;PP=469;SC=CGCGGCGCTGAGGCGGCGGCG;SOR=1.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=9;WE=23987010;WS=23986992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	23996371	rs4858095	T	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=822;SC=TTCATTTAGGTGGCCATTATG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=23996379;WS=23996361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	24006477	rs4858097	T	A	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=12;PP=908;SC=GGTTTGTCCATTGAGTAAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=24006485;WS=24006467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	24009279	rs67657770	A	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=7;PP=507;SC=GACTTCTCCAAATACATTTCT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=24009287;WS=24009269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	24009341	rs61755049	A	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=290;ReadPosRankSum=-1.537;SC=TTTGATGCAAAGGAACGTACT;SOR=0.852;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=20;WE=24009349;WS=24009331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
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chr3	25542571	rs2116703	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=1.188;SC=CCATCACTTCGTTACTCAAAA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=25542579;WS=25542564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	25611472	rs369808161	GACACACACAC	G	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=1321;ReadPosRankSum=0.075;SC=CATGTGTGCAGACACACACAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=25611489;WS=25611462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	25639973	rs11372851	A	AT	2240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=42;PP=1197;SC=CGGTTTCTAGATTTTTTTTCA;SOR=1.439;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=47;WE=25639981;WS=25639963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr3	25661557	rs3832214	T	TA	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=153;ReadPosRankSum=0.992;SC=TATATACCTATAAAGATTTAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=25661565;WS=25661547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	25665706	rs180834908	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=1.036;SC=ACATCTCTCCACAGCTATAAT;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=25665714;WS=25665696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr3	25666156	rs2293787	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=723;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TCAATTGATTCCAATCTTAAT;SOR=0.849;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=43;WE=25666164;WS=25666146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr3	25671778	rs3736605	C	T	1234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=888;ReadPosRankSum=1.004;SC=TGTGTATACACATATATATAC;SOR=1.462;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=56;WE=25671786;WS=25671768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr3	25674091	rs3736601	C	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=530;ReadPosRankSum=1.506;SC=AAAACATACCCAAAAAAGTCA;SOR=0.437;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=28;WE=25674099;WS=25674081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	25679738	rs60422476	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=1.856;SC=AAACTTTCTCTACCTTGTGTT;SOR=0.965;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=21;WE=25679746;WS=25679728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr3	25706277	rs10433573	A	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=433;ReadPosRankSum=0.644;SC=CTTCAAAGGCAGCCTTAGCCT;SOR=0.354;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=36;WE=25706285;WS=25706267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr3	25775253	rs1488992	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.191;SC=AATATTCTTGTTTATAAAACA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=25775261;WS=25775249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	25775356	rs6550987	A	C	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=721;ReadPosRankSum=0.890;SC=AGATAGCCACACCATACCTGC;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=42;WE=25775364;WS=25775346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr3	25805879	rs11129208	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=214;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CACACAGAAATGTATAATGAA;SOR=1.136;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=15;WE=25805887;WS=25805869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr3	25836023	rs9831075	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=0.553;SC=TTTTTAAATGCTATATGTGAA;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=25836031;WS=25836013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	26751736	rs146526715	C	T	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=720;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CTGCCAACGACGCTGACCTTT;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=55;WE=26751744;WS=26751726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,62:0.39:161
chr3	27184801	rs10865812	T	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=0.091;SC=TTATACTATGTTTCTGATTTG;SOR=1.994;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=18;WE=27184809;WS=27184791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr3	27204052	rs17854381	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=769;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CCCTGAGCATGTGGGGTGGCA;SOR=0.779;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=52;WE=27204060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr3	27233376	rs11926580	G	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=1.186;SC=ATACAGAAATGGATATAAATA;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=27233384;WS=27233366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	27233498	rs11926556	C	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.427;SC=CATCATGAACCGATTGAAATA;SOR=0.856;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=76;WE=27233506;WS=27233488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr3	27243045	rs17680166	G	C	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1794;ReadPosRankSum=0.451;SC=TACCTTCTGGGACTGGTTCAT;SOR=0.696;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=231;TCF=116;TCR=115;TR=108;WE=27243053;WS=27243035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,123:0.46:270
chr3	27243119	rs17680194	G	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1157;ReadPosRankSum=0.838;SC=GGCCACGGATGTCTTTGAATA;SOR=0.672;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=51;TCR=93;TR=70;WE=27243127;WS=27243109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,73:0.44:166
chr3	27243871	rs34940413	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=393;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AGAAAAAGAATTGCATTTTTA;SOR=0.749;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=26;WE=27243879;WS=27243861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
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chr3	27297684	rs12494667	C	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr3	27326089	rs376980124	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=391;ReadPosRankSum=-0.885;SC=ATCTTTATACTTACTAACGGT;SOR=0.655;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=11;WE=27326105;WS=27326079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	27326097	rs11129280	G	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=685;ReadPosRankSum=1.116;SC=ACTTACTAACGGTTACTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=17;WE=27326105;WS=27326079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr3	27326451	rs10510594	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=401;ReadPosRankSum=-0.071;SC=ACAACCTATCATCTATATAAA;SOR=0.387;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=31;WE=27326459;WS=27326441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr3	27326553	rs34894168	AC	A	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=256;ReadPosRankSum=0.319;SC=TCTGTGCGGGACACTAACACT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=27326561;WS=27326543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	27329417	rs10510593	A	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GTTGCTTATAAACTGATCTGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=27329425;WS=27329407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	27332282	rs62255594	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr3	27332820	rs10510592	A	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=944;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TATATATTTCAAAGGAGCTTT;SOR=1.181;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=56;WE=27332828;WS=27332810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr3	27350384	rs77257134	G	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=311;ReadPosRankSum=0.051;SC=TATAGTAGCAGAACTGGAAAG;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=22;WE=27350392;WS=27350374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr3	27353716	rs552647	C	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=468;ReadPosRankSum=0.432;SC=CCAAAAGCACCCAAGGAAGCA;SOR=0.823;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=29;WE=27353724;WS=27353706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr3	27363637	rs11393122	T	TA	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.342;SC=TTATAACAAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=13;WE=27363645;WS=27363627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr3	27387462	rs56104872	G	GGTAA	2389.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=2;PP=1749;SC=ATTAAGAATCGCTATGGTAAA;SOR=4.849;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=30;WE=27387471;WS=27387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	27387463	rs2370957	C	A	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=3;PP=829;SC=TTAAGAATCGCTATGGTAAAT;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=36;WE=27387471;WS=27387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	27394419	rs12494966	T	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=276;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TCCTTTAAAATTAAACCAGAG;SOR=0.264;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=16;WE=27394427;WS=27394409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr3	27424718	rs1472256	A	G	6858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=117;PP=2965;SC=TATCATCATCATCTTGAAGCA;SOR=0.924;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=94;TCR=117;TR=211;WE=27424726;WS=27424708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr3	27427616	rs17630711	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=0.412;SC=AATGCTTCATATAGTTTAAAA;SOR=2.030;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=17;WE=27427624;WS=27427606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	27433397	rs2307035	A	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AGATTTTTCAATCATGAGGAT;SOR=0.027;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=27433405;WS=27433387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	27463229	rs79251239	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=395;ReadPosRankSum=1.188;SC=CGTTGGATGCCTCAGCACCCG;SOR=0.594;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=26;WE=27463237;WS=27463219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,34:0.35:97
chr3	27494620	rs12639265	A	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=180;ReadPosRankSum=1.071;SC=TTCAACAAAAAGACTAAACAT;SOR=0.776;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=15;WE=27494628;WS=27494610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr3	27759338	.	C	A	133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=58.68;NF=1;NR=7;PP=133;QD=20.9714015684;SC=AAAAAAAAAACCCTAATGTTG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=27759346;WS=27759328;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,8:0.40:20
chr3	27759404	rs2581183	C	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	27763427	rs368178421	G	GCGGCGC	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=3.376;NF=2;NR=11;PP=601;ReadPosRankSum=0.836;SC=GGCGGCGGCGGCTGCAGCGGC;SOR=1.085;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=13;WE=27763435;WS=27763417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr3	28358057	rs11706332	C	T	193.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=145;SC=AGTTCCAGTACAGTCTTAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=28358065;WS=28358047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	28373462	rs139773536	C	CA	2034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=27.50;SOR=1.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	28381887	rs3762797	A	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=271;SC=AAAAGATAAAAATTACCTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=28381895;WS=28381877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	28520417	rs1563656	T	A	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=33;PP=1332;SC=CTATCAAAACTACAAGGTGTA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=28520425;WS=28520407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	28520576	rs60690028	T	C	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	28533458	rs13099814	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=886;SC=TAAACAATGGACAGCTCAGTT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=28533466;WS=28533448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	28557206	rs376564844	CTGTGTG	C,CTGTG	257.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=36.82;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,4,3:0.57,0.43:7
chr3	28557236	rs7617655	G	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=GTGTGTGTGTGTATACACATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=28557244;WS=28557226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	29476428	rs3773018	G	A	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=701;SC=TCTGCTGCCCGTGCTGTTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=29476436;WS=29476418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	29529907	rs2371695	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=1172;ReadPosRankSum=1.727;SC=AATAACATGGGTTTTTTTCTC;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=21;WE=29529922;WS=29529897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr3	29529913	rs5847572	TTC	T	790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=1194;ReadPosRankSum=2.596;SC=ATGGGTTTTTTTCTCTCTCTC;SOR=0.743;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=17;WE=29529922;WS=29529897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr3	29804300	rs7340719	C	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=2.241;SC=GGGTACAATTCTCAAATCAAG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=29804308;WS=29804290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	29804487	rs1371839	A	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=629;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CCAGGTAAGAAATTCACTAAT;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=46;WE=29804495;WS=29804477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr3	29804509	rs1371840	T	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=673;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AGTGACTGAATGATGCCGAGG;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=53;WE=29804517;WS=29804499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr3	29922333	rs13324314	C	T	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=94;PP=2965;SC=TATTCATTCCCGACCCTTTTG;SOR=1.064;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=64;TCR=94;TR=158;WE=29922341;WS=29922311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	29925518	rs2218724	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=752;SC=GGCAGTAAGCATAGAGATATA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=29925526;WS=29925508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	29941267	.	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=936;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TCAGTCACCTGAGGCTAATAT;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=65;WE=29941275;WS=29941257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr3	29977739	rs1449287	T	C	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=58;PP=1866;SC=TCAGATGTGATATTCTCCATT;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=81;WE=29977747;WS=29977729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	30713126	rs11466512	T	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=2.128;SC=TGTTTCCCCATCAGAATATAA;SOR=1.476;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=14;WE=30713134;WS=30713116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr3	30732821	rs2276767	C	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=440;ReadPosRankSum=0.392;SC=ACCCTGCTTGCACTCACTATA;SOR=0.735;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=25;WE=30732829;WS=30732811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr3	30842298	.	GACACACAC	G	369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.7266;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=4;NR=1;PP=284;SC=GACACAGATAGACACACACAC;SOR=2.494;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=30842313;WS=30842288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	30885806	rs1494738	T	C	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=928;ReadPosRankSum=0.555;SC=AATTAACAGATAATGATACTG;SOR=0.523;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=51;WE=30885814;WS=30885796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr3	30935904	rs11921654	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=382;ReadPosRankSum=0.507;SC=TAACCTTTTAGGTACGGAAAA;SOR=1.085;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=20;WE=30935912;WS=30935894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr3	31621228	rs58289734	T	TAAA	525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=455;SC=AATGTAATGATGAAGAGTACA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=31621236;WS=31621218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	31642037	rs11713598	A	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=252;SC=TATTTGGTCAATATTATGCAT;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=31642045;WS=31642027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	31658678	.	C	CTT	35	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=22;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=20;MQ=61.07;NF=0;NR=2;PP=35;QD=19.0;SC=TGATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=31658686;WS=31658668;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,2:0.20:10
chr3	31663515	rs10662891	A	AGTGTG	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=919;SC=TTGGTTTTATAGTTTTAAGTA;SOR=2.948;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=31663523;WS=31663505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	31677395	rs11129457	T	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=349;SC=TCATCATAGTTCAGTAAACCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=31677403;WS=31677385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	31725316	rs2278959	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1156;ReadPosRankSum=-2.461;SC=TTGGGTGTTCGTGACAGCTGG;SOR=1.023;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=75;WE=31725324;WS=31725306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr3	31725691	rs2278960	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=24;PP=732;SC=CAACCACTGTTAAGCAAATTC;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=38;WE=31725699;WS=31725681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	32022333	rs10610936	GCACA	G	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.561;NF=6;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=0.071;SC=ACACACGCACGCACACACACA;SOR=1.942;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=8;WE=32022344;WS=32022323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	32022680	rs76150980	G	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=0.927;SC=ATGGTCCGTGGGCGCCCGGGA;SOR=0.874;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=15;WE=32022688;WS=32022670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr3	32022771	rs62244394	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=159;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GCCGCGCGTGCCTGCTCCAAA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=9;WE=32022779;WS=32022761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	32030544	rs11129475	C	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=-1.465;SC=GAAGGTCACACTGCAGCACTA;SOR=0.468;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=32030552;WS=32030534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr3	32030998	rs4639011	C	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=715;ReadPosRankSum=1.540;SC=CAGATATGATCGAAGGCATCC;SOR=1.169;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=44;WE=32031006;WS=32030988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr3	32031024	rs4449357	C	T	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.737;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=857;ReadPosRankSum=-0.894;SC=ACAAGCCTATCAAAGATCAGC;SOR=0.868;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=52;WE=32031032;WS=32031014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr3	32031135	rs6419811	A	G	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1063;ReadPosRankSum=0.843;SC=ATGCTTCCTCAGTTCTAACGT;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=68;WE=32031143;WS=32031125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr3	32031615	rs13064905	A	C	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.138;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,95:0.43:220
chr3	32031622	rs13087612	T	C	3727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.117;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,97:0.44:220
chr3	32031643	rs13065048	A	G	3836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=-1.139;NF=44;NR=47;PP=1492;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TTCACACCTCACACAACACAC;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=91;WE=32031651;WS=32031633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,108:0.43:250
chr3	32031962	.	A	G	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=53.48;NF=79;NR=111;PP=2965;QD=20;SC=AAGACCTTCCATCACAATTCA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=79;TCR=111;TR=190;WE=32031970;WS=32031952;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	32032397	rs4955216	G	T	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1470;ReadPosRankSum=1.098;SC=CATTCACATCGCATTAGACAT;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=91;TCR=96;TR=94;WE=32032405;WS=32032387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,111:0.52:215
chr3	32181761	rs9835387	C	T	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=17;PP=1306;SC=TCATTTCTGACATCATCCGTG;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=32181769;WS=32181751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	32188006	rs9839702	G	A	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=614;SC=ATCCTATCATGAACATGTTAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=32188014;WS=32187996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	32200233	rs2305362	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	32433333	rs3732846	C	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr3	32433342	rs149855043	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr3	32433585	rs3732845	G	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=262;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GCGAGGCCGAGGTTCTACAGG;SOR=1.518;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=22;WE=32433593;WS=32433575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr3	32493682	rs342745	A	G	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=69;PP=2052;SC=CCCAACCTGGAGGACTGGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=86;WE=32493690;WS=32493672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	32568145	rs35822941	CCA	C	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=2.691;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr3	32758761	rs201528016	TTG	T	1143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=728;ReadPosRankSum=2.131;SC=GTTTTTCAATTTGTGTCTTTC;SOR=0.980;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=19;WE=32758770;WS=32758751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr3	32761749	rs60731094	CT	C	3001.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=63;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.901;SC=GAAATTTTAACTTTTTTTTGC;SOR=0.827;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=148;TCF=33;TCR=115;TR=77;WE=32761757;WS=32761739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,130:0.54:240
chr3	32766905	rs6550155	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=379;ReadPosRankSum=0.273;SC=CAACATTAAAATTTTTCTGTG;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=21;WE=32766913;WS=32766895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr3	32774782	rs9798936	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.674;SC=TGTTTCCATTATCACCAAAAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=32774790;WS=32774772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	32776232	rs55889827	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=317;ReadPosRankSum=0.070;SC=TCCTCATAATAAAAGAGCCTT;SOR=0.614;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=20;WE=32776240;WS=32776222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr3	32801173	rs9832822	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=-0.086;SC=ATATATTTGTAAGGAAAGCAA;SOR=0.899;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=22;WE=32801181;WS=32801163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr3	32805828	.	C	CCA	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=14;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=54.3;NF=3;NR=1;PP=110;QD=28.5;SC=GGCTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=4;WE=32805836;WS=32805806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,4:0.21:19
chr3	32805843	rs7430248	G	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=1.415;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr3	32815231	rs2396631	A	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=770;SC=TACCCCTGACATTTGGCCAAA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=32815239;WS=32815221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	32915214	rs6799979	C	G	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=19;PP=2038;SC=GGAAGCTGGTCGTTCGGTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=88;WE=32915222;WS=32915204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	32927400	rs36019845	G	A	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=999;ReadPosRankSum=2.796;SC=CTAATGCCTCGAAGTTGTTTC;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=70;WE=32927408;WS=32927380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr3	32927509	rs6774703	G	T	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=80;PP=2598;SC=AAGCCGTGACGGCGAGGCATA;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=129;WE=32927517;WS=32927499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	32933036	rs13096271	G	A	2648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1631;ReadPosRankSum=0.768;SC=ACTGCCAGTCGGCACGCTTTC;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=198;TCF=110;TCR=88;TR=95;WE=32933044;WS=32933026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,118:0.51:230
chr3	32933360	.	C	CTT	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.340;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	32995928	rs2228428	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=810;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TCCAAATTTACTCTGCTGACA;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=51;WE=32995936;WS=32995918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,65:0.61:107
chr3	33055721	rs4302331	A	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=32;PP=1389;SC=AGGTGGCTGCACACTGCATCC;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=65;WE=33055729;WS=33055711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	33093190	rs12632196	T	C	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=13;PP=1234;SC=ACACCCCTCCTCAAATTAATC;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=33093198;WS=33093180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	33094973	.	C	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1105;ReadPosRankSum=-1.138;SC=ACCTCACCCTCGATTCTTACC;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=73;WE=33094981;WS=33094963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,81:0.46:176
chr3	33099880	rs7637435	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=593;SC=TAATGACTGCTGGAAAAATTT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=33099888;WS=33099870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	33135592	rs61749982	T	C	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CAAGGCTCTCTGCCAGATACG;SOR=0.821;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=219;TCF=113;TCR=106;TR=97;WE=33135600;WS=33135582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,120:0.47:257
chr3	33138544	rs7614776	A	G	11859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.51;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr3	33138544	.	ACAGAG	GCAGAA,GCAGAG	2331	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=57,139;NR=61,124;PP=1760,2331;QD=15.3683718209;SC=AGAACCAGCAACAGAGGGAGG;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=263;TCF=139;TCR=124;TR=118,263;WE=33138557;WS=33138534;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:263
chr3	33138549	rs7637099	G	A	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,159:0.46:348
chr3	33165436	rs6777433	T	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=1.099;SC=ATTGAGGTACTATTTATATAC;SOR=0.892;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=20;WE=33165444;WS=33165426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr3	33171659	rs4392367	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=357;ReadPosRankSum=0.414;SC=AGAGTTCATCAAGGTCCACTG;SOR=1.646;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=18;WE=33171667;WS=33171649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr3	33174156	rs1135127	T	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=973;ReadPosRankSum=-0.292;SC=ACAGGGACACTTGGGGCCTCT;SOR=0.199;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=33;WE=33174176;WS=33174146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr3	33174168	rs1135128	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=973;ReadPosRankSum=0.323;SC=GGGGCCTCTCGGATGAGCACT;SOR=0.172;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=24;WE=33174176;WS=33174146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr3	33175793	rs4234239	C	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=594;ReadPosRankSum=1.168;SC=CTGGTGGCTACGAGAAAATAT;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=33;WE=33175801;WS=33175783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr3	33175854	rs58617854	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.588;SC=CCCTGAAGTAAGAAACAGAGG;SOR=0.074;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=6;WE=33175862;WS=33175844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	33255592	rs9637517	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=767;ReadPosRankSum=0.369;SC=AGCACAAAGAACTTTCCTGTG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=51;WE=33255600;WS=33255582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr3	33318798	rs77302970	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=215;ReadPosRankSum=1.424;SC=TGGGAGAGGCGAAGAGGCCCA;SOR=1.835;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=13;WE=33318806;WS=33318788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr3	33359050	rs67505561	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TTTTGTAGCAATGATGAGATT;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=17;WE=33359058;WS=33359040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr3	33414923	rs2291898	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=-1.161;SC=TAATGGTCACGTTGGATCCAG;SOR=0.077;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=19;WE=33414931;WS=33414913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	33418636	.	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=1.201;SC=GTCACATTCCCTAAGGGCTGT;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=13;WE=33418644;WS=33418626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	33419422	rs2291897	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=228;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CACTGTAACTCAAAAGGCAGC;SOR=0.671;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=17;WE=33419430;WS=33419412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr3	33426883	rs17030546	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=0.384;SC=AATTCTACTTCAACTAAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=6;WE=33426891;WS=33426873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr3	33431826	rs41285089	C	T	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=747;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TAAGACATCACTTCAAAATTA;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=48;WE=33431834;WS=33431816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr3	33434128	rs62252101	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=617;ReadPosRankSum=0.163;SC=AAGTAAATGCGTAAGTACAAT;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=36;WE=33434136;WS=33434118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr3	33434831	rs2293250	G	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=0.302;SC=TGTGAATACCGGTGGGACCCT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=34;WE=33434839;WS=33434821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr3	33444286	rs623244	T	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=437;ReadPosRankSum=0.837;SC=TCACACAAACTAGATACCTGT;SOR=0.613;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=31;WE=33444294;WS=33444276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr3	33454342	rs2272152	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=547;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TGCGGAAAATGAGTACTTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=32;WE=33454350;WS=33454332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr3	33458266	rs3736563	T	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=896;ReadPosRankSum=1.455;SC=TAATTTTCCATTGATCTCAGG;SOR=0.805;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=62;WE=33458274;WS=33458256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr3	33467364	.	T	TTTTAA	315	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=59.85;NF=0;NR=6;PP=315;QD=54.5;SC=ATAGTTTTTTTTTTAAGATCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=33467372;WS=33467354;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	33481400	rs2272153	G	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=562;ReadPosRankSum=1.290;SC=GAAGGAGCCGGAGCTCCGCTG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=33;WE=33481408;WS=33481390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	33540329	rs6782108	T	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-1.324;SC=CTGGGGGTTATTATAATGCCC;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=15;WE=33540337;WS=33540319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr3	33552004	rs2049281	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.809;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=500;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AATAACTGTATCCCAAATGTA;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=29;WE=33552012;WS=33551994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr3	33592978	.	A	AT	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.45;NF=1;NR=6;PP=73;QD=11.7142857143;SC=GATGATGATGATTTTTTTTTT;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=7;WE=33592986;WS=33592968;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	33605300	rs7643855	G	A	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1027;ReadPosRankSum=0.574;SC=TTCACTGTCTGTAAGATAATG;SOR=0.486;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=68;WE=33605308;WS=33605290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr3	33615874	rs9841413	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=0.356;SC=CTTCTACTTTGATTTTTAATA;SOR=0.307;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=33615882;WS=33615864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr3	33617790	rs4629282	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=743;ReadPosRankSum=-0.009;SC=AAGAAGGAAAATAGATTTGAA;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=50;WE=33617798;WS=33617780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr3	33618551	rs11391504	G	GA	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	33653622	rs6807542	T	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=202;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GGTCCTTTCTTCTATTTGCCT;SOR=0.509;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=33653630;WS=33653612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr3	33668662	rs72499357	ATTAAGT	A	1282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.134;NF=0;NR=16;PP=772;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TCTTTCACCTATTAAGTTTAT;SOR=0.866;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=16;WE=33668675;WS=33668652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr3	33853496	rs114074378	C	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=355;ReadPosRankSum=1.422;SC=CATTTTAAACCAGTTGTAATT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=33853504;WS=33853486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr3	33879770	rs3203777	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.145;NF=22;NR=30;PP=787;ReadPosRankSum=0.153;SC=AGCCGATTTGGTTAACAGATC;SOR=0.893;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=52;WE=33879778;WS=33879760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr3	35725102	rs55756117	T	C	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=141;SC=AAGTTTGGTTTTAAAAATCTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=35725110;WS=35725092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	35725250	rs969818	C	T	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=27;PP=1596;SC=TGACTCGCAGCCTTGCTGTCT;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=78;WE=35725258;WS=35725240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	35731725	rs1513476	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=530;SC=TAGGGATAGACAAAACATTGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=35731733;WS=35731715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	35756778	rs2305233	A	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=573;SC=AATCCTAACCAACCTTTTTCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=35756786;WS=35756768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	35778773	rs2278757	A	G	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=35;PP=1195;SC=AACAGCAGCCACCACAGCAGC;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=35778781;WS=35778763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	35779750	rs2012153	A	G	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=40;PP=1491;SC=TGCAATATCCAGCAGTCTCTT;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=35779758;WS=35779740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	35780735	rs35497369	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=9;PP=612;SC=ATGTGTCCTGTGTCTGCCTCA;SOR=1.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=32;WE=35780743;WS=35780725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	35785296	rs6550367	T	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=19;PP=1562;SC=TATCTACATTTTCATTCTCTG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=72;WE=35785304;WS=35785286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	35785608	rs2305234	G	A	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TTGACTCTGTGTGGAAAAGTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=35785616;WS=35785598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	35835152	rs78090629	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=475;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CAGACCAAAATAGTCTCTTCA;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=32;WE=35835160;WS=35835142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr3	36888575	rs12497299	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=272;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CTCAATTCCCCGTTGCTGAGG;SOR=0.446;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=14;WE=36888583;WS=36888565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	36896653	rs9818599	G	C	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=17;PP=1615;SC=AAACCCAAGAGCTGGACTTAC;SOR=2.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=36896661;WS=36896643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	36897812	rs11712950	T	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr3	36899593	rs7619089	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=0.200;SC=TCTTAGGGGACAGCAGACCCT;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=27;WE=36899601;WS=36899583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr3	36915524	rs4510338	T	C	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.168;NF=36;NR=7;PP=817;ReadPosRankSum=0.744;SC=TGTGTGTATATATATATATAC;SOR=1.038;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=43;WE=36915532;WS=36915514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr3	36915814	rs4296548	T	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=0.143;SC=TGAGAAGGGGTGTTTGTCATG;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=21;WE=36915822;WS=36915804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr3	36934343	rs5847939	CAT	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.366;NF=0;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAAAACAAAACATATATATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=1;WE=36934352;WS=36934333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	36934534	rs9832646	G	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=424;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GGTTATTAAAGCAAAAAAGTT;SOR=0.752;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=28;WE=36934542;WS=36934524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr3	36937106	rs11129741	G	A	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.801;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=864;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TACTCTCCCCGTGAGAGCCAT;SOR=0.394;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=62;WE=36937114;WS=36937096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr3	36940741	rs9864910	G	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=573;ReadPosRankSum=1.281;SC=TAACCAGCTCGGTAGTATCCC;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=33;WE=36940749;WS=36940731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr3	37034946	rs1800734	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=1.047;SC=AGCTACAGCTGAAGGAAGAAC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=37034954;WS=37034936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	37096024	rs749072	T	C	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1156;ReadPosRankSum=0.104;SC=TATGAGAACATAGGCCTCTAG;SOR=0.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=49;TCR=89;TR=71;WE=37096032;WS=37096014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr3	37163039	rs336595	G	A	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=20;PP=986;SC=TGATAAAAATGAAAATAAACA;SOR=0.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=37163047;WS=37163029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	37336365	rs74345885	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.938;SC=GTTGCTGATACCTTAAGGGGA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=37336373;WS=37336355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	37512646	rs11713408	TG	CC	3250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=2475;ReadPosRankSum=0.882;SC=ATTACTGCTGTGGTGGAAATG;SOR=0.968;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=157;TCF=54;TCR=103;TR=70;WE=37512655;WS=37512636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,86:0.47:182
chr3	37535865	rs472893	TG	CA	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=571;ReadPosRankSum=2.620;SC=CCAGTCTGGATGGCATCCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=37535874;WS=37535855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	37535984	rs2507940	C	G	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.994;NF=34;NR=30;PP=870;ReadPosRankSum=0.389;SC=CTCCTTCCTTCCCCCTAGAGT;SOR=0.575;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=64;WE=37535992;WS=37535974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr3	37536225	rs267523	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=1.892;SC=TCTACCTGCCCGGAGGGCACC;SOR=0.172;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=16;WE=37536233;WS=37536215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr3	37560597	rs17815094	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.545;SC=TTTTTTTTCCCGCTGAGGGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=37560605;WS=37560587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	37574951	rs267561	G	A	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1133;ReadPosRankSum=1.329;SC=CACGTTCCAGGAGAGATTGGT;SOR=0.972;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=72;WE=37574959;WS=37574941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,87:0.47:186
chr3	37575039	rs267560	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GTTCCCTGTCGCTGTTCCTCC;SOR=0.462;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=23;WE=37575047;WS=37575029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr3	37774304	rs58228096	C	T	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1362;ReadPosRankSum=0.018;SC=GGGACACAGACGGGACCCTTC;SOR=0.905;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=88;WE=37774312;WS=37774294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,95:0.53:180
chr3	37778481	rs1118148	G	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=801;ReadPosRankSum=-1.218;SC=AGAGGTAAGGGGGGGGTTTAA;SOR=0.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=61;WE=37778489;WS=37778471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr3	37778615	rs2276866	A	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=0.583;SC=CTTGAGCCGCAAAGTGGAATT;SOR=1.148;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=13;WE=37778623;WS=37778605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr3	37818805	rs2276003	G	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=0.453;SC=TACCACTCCTGCCTCTACAAT;SOR=0.227;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=11;WE=37818813;WS=37818795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr3	38010784	rs186390027	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=267;ReadPosRankSum=-0.810;SC=ACCCTCCATCCTGGCTGTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10;WE=38010792;WS=38010774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	38080952	rs7625806	T	G	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=74;PP=2965;SC=GAGCCTCAGCTGCTTCGTCTG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=164;WE=38080960;WS=38080942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr3	38081031	rs7616776	A	T	6994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=98;PP=2965;SC=ACTTGTACTCAGCCGAGGTCA;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=110;TCR=98;TR=208;WE=38081039;WS=38081021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr3	38104303	rs76374685	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.921;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=607;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GTATGTCTTTCTCTGGCTTGA;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=35;WE=38104311;WS=38104293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr3	38104353	rs3752614	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=677;SC=AACCTAGATGGTCCTCCGTTT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=38104361;WS=38104343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	38125705	rs7652276	G	A	4937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=81;PP=2879;SC=GAGTCCTCCCGCCTTCCACGC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=156;WE=38125713;WS=38125695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	38125844	rs62240733	G	A	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=26;PP=794;SC=TAGTAGTAGTGGTGGTGGTAG;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=38125852;WS=38125834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	38125880	rs374790897	GGTA	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=491;SC=TGGTAGTAGTGGTAGTAGTAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=38125890;WS=38125870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	38134438	rs11129778	A	G	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=56;PP=1705;SC=GCCACTGACCACAGTAGCATT;SOR=2.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=76;WE=38134446;WS=38134428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	38151731	rs12630114	T	C	11675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=196;PP=2965;SC=AGTTTGAGTATTTCGGGAGCC;SOR=0.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=350;TCF=154;TCR=196;TR=349;WE=38151739;WS=38151721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr3	38170810	rs156265	C	G	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=86;PP=2965;SC=CTCTGGCCTTCTCCTTCTCCA;SOR=0.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=161;WE=38170818;WS=38170800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr3	38348949	rs818823	G	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=617;SC=TGAGGGTAGGGGTTCTCCAGG;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=38348957;WS=38348939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	38350479	rs818819	T	C	4476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=46;PP=2519;SC=ACCGGGCCCATGCCATTATCC;SOR=1.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=140;WE=38350487;WS=38350469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	38350519	rs818818	G	A	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=84;PP=2965;SC=TGTTGGGGCCGTGTTGCTGAC;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=198;WE=38350527;WS=38350509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr3	38350543	rs818817	A	G	6206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=92;PP=2965;SC=GATCGCCTACAGTCTTCCCCA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=98;TCR=92;TR=190;WE=38350551;WS=38350533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr3	38350630	rs704929	C	A	4882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=90;PP=2965;SC=AAGCGAGTACCGGGCATGTAC;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=55;TCR=91;TR=145;WE=38350638;WS=38350620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	38354390	rs695939	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GAATCACCTCATGCTGGCACA;SOR=0.425;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=21;WE=38354398;WS=38354380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr3	38354839	rs72867262	G	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=0.852;SC=GCAAGCTGGGGTCTTGGCCCT;SOR=1.863;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=13;WE=38354847;WS=38354829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr3	38355184	rs12186097	T	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.533;NF=27;NR=17;PP=719;ReadPosRankSum=3.064;SC=TGTGCGCGCGTGTGCACGCGC;SOR=0.255;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=44;WE=38355192;WS=38355174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr3	38355509	rs696253	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=1.068;SC=CCGCCTGCCACGGCCGGCCAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=38355517;WS=38355499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	38357961	rs240033	C	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=974;ReadPosRankSum=-1.374;SC=TCCCTGCTGCCGGAAACGCGA;SOR=0.582;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=64;WE=38357969;WS=38357951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,70:0.44:159
chr3	38390020	rs2615631	C	A	6412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=84;PP=2965;SC=TCTACACTTCCTTTTTTAAAA;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=123;TCR=84;TR=207;WE=38390028;WS=38390010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr3	38401677	rs818851	C	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=535;SC=TTGCAGCCCTCGTGCCTGTTC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=38401685;WS=38401667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	38401839	rs818850	T	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=46;PP=1428;SC=GGACTCAGGGTGGTGTTCATG;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=38401847;WS=38401829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	38401918	rs818849	A	G	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=30;PP=977;SC=AGGGATTCCTATTCTCCTTCT;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=38401926;WS=38401908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	38402007	rs818848	T	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=243;SC=GCATCTGTTGTCACCAGGTCC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=38402015;WS=38401997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	38404472	rs17118	C	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=0.259;SC=CGGGCTTCGACTTCTCTCAAG;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=44;WE=38404480;WS=38404462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr3	38406648	rs704942	T	C	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=31;PP=1371;SC=GCTGTGACACTGGTGTGTGGT;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=80;WE=38406656;WS=38406638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	38406773	rs704943	G	T	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=39;PP=1338;SC=ACCAGCAGCTGCAGGTAACTG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=38406781;WS=38406763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	38406793	rs2234608	T	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=31;PP=1114;SC=GTGGCTACGTTGTGTGAGTGT;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=38406801;WS=38406783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	38408248	rs704946	G	A	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=27;PP=2669;SC=GGAGGTAATTGTTCATTCTGT;SOR=2.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=89;TCR=27;TR=116;WE=38408256;WS=38408238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	38408361	rs843890	G	A	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.05;NF=66;NR=107;PP=2965;SC=ACTCACATACGGAGGTTGGTT;SOR=1.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=66;TCR=107;TR=173;WE=38408369;WS=38408351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr3	38408459	rs2234617	A	G	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=793;SC=GACTGAAAACATTGATAAGCA;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=38408467;WS=38408449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	38409600	rs704947	T	G	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=32;PP=1854;SC=TTTTCATGCTTTGTGTGTGTC;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=38409608;WS=38409590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	38411731	rs150130857	G	GCACACACACA,GCACACACACACA	418.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;NF=0,0;NR=6,6;PP=84,130;SC=GCACTGTAGCGCACACACACA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=6,6;WE=38411739;WS=38411721;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:10
chr3	38442490	rs2070488	G	A	5314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=70;PP=2965;SC=AGAGACCATCGGAATTTGTTT;SOR=0.913;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=86;TCR=70;TR=156;WE=38442498;WS=38442470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	38519424	rs2070489	A	G	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=60;PP=2664;SC=TCTGCAACGAACGCTTCACTC;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=38519432;WS=38519414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	38521156	rs13097628	T	C	5138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=62;PP=2965;SC=AGTTCTGTGCTGTCTTCTCTC;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=169;WE=38521164;WS=38521146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	38524742	rs1046048	C	T	5029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=71;PP=2928;SC=GGTCGGTCAACGGCACTACCT;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=146;WE=38524750;WS=38524732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	38593128	.	TG	T	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.237;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr3	38622467	rs7430407	T	C	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1642;ReadPosRankSum=1.352;SC=TCTCCTCATCTTCTTCTTGGT;SOR=0.491;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=214;TCF=120;TCR=94;TR=99;WE=38622475;WS=38622457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,118:0.48:245
chr3	38627629	rs7645173	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.205;NF=1;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=0.667;SC=TGAAAGCCCAAGGAGCCCTTG;SOR=1.008;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=18;WE=38627637;WS=38627619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr3	38627658	rs112524625	T	TCC	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.722;NF=0;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TGACACCTATTCCCCCCCCGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=6;WE=38627666;WS=38627648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	38648062	rs6599222	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TCCAAAGCTCCCACCAGTGGG;SOR=0.368;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=38648070;WS=38648052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr3	38674712	rs6599230	T	C	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.07;MQRankSum=1.027;NF=31;NR=32;PP=721;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CTTGCTTCTCTGCCATGCGCT;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=63;WE=38674720;WS=38674702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr3	38739574	rs6599241	T	C	7122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=101;PP=2965;SC=ATGTTGACCATGATGAGGAAG;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=123;TCR=101;TR=224;WE=38739582;WS=38739564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr3	38739845	rs6599242	A	G	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TACCGAAGATAGAGTAGATGA;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=215;TCF=114;TCR=101;TR=110;WE=38739853;WS=38739835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,117:0.48:242
chr3	38748833	rs6790627	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-1.265;NF=23;NR=11;PP=522;ReadPosRankSum=0.825;SC=CATTGTAGTATTTCTTCTGCT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=34;WE=38748841;WS=38748823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr3	38764782	rs4076737	G	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=287;ReadPosRankSum=1.200;SC=TGTCTGATGCGGGCGCCCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=18;WE=38764790;WS=38764772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr3	38766675	rs6795970	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=473;ReadPosRankSum=1.095;SC=CTCAGCAGGGACCTGAGGAAC;SOR=1.372;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=29;WE=38766683;WS=38766665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr3	38766825	rs11129804	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=564;ReadPosRankSum=-2.216;SC=GAGGGTCCCAACTGGGTGCCT;SOR=0.786;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=34;WE=38766833;WS=38766815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr3	38768334	rs7374804	T	C	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGAGTGGGAGTTTCACCACCA;SOR=0.777;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=85;WE=38768342;WS=38768324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,87:0.47:185
chr3	38784029	rs6599250	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=674;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTCTGCATTATAGTGTGGTCA;SOR=1.310;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=42;WE=38784037;WS=38784019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr3	38791507	rs12054245	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=482;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GCTTCTGCTGCTCACATGGGA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=25;WE=38791515;WS=38791497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr3	38805157	rs78916443	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CATAAATAAGGATAACCTGGG;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=8;WE=38805165;WS=38805147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr3	38812650	rs10212338	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TGGAGCAAACGTTCATGGTGT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=9;WE=38812658;WS=38812640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr3	38812708	rs4420804	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=535;ReadPosRankSum=-0.183;SC=AGCCCTGTCTCCTACCCACCA;SOR=0.375;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=37;WE=38812716;WS=38812698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr3	38835461	rs141207048	C	A	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1233;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AGTAAAGCGACGGAAGTTGTT;SOR=0.889;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=170;TCF=73;TCR=97;TR=80;WE=38835469;WS=38835451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,94:0.45:207
chr3	38892282	.	G	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=818;ReadPosRankSum=1.015;SC=TTGAATGCAAGAATAAAATTA;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=44;WE=38892290;WS=38892272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr3	38938299	.	C	CT	55	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5852;HP=15;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=18;MQ=60.54;NF=4;NR=0;PP=55;QD=14.75;SC=CATGTAGGATCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=38938307;WS=38938289;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	38945560	rs4073113	A	G	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=53;PP=1723;SC=GGTTTTCTCCACAAGGGAGAC;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=78;WE=38945568;WS=38945550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	38946872	rs4514993	A	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=797;SC=TCAAAACTTAACAAACTACTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=38946880;WS=38946858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	38949363	rs6599267	A	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=13;PP=1000;SC=TAAATGAATTATTTCAATTTG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=38949371;WS=38949353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	38951753	rs7429404	T	C	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=618;SC=CCAAGCTTCTTTTTCCTTCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=38951761;WS=38951743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	38961537	rs6779297	T	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=31;PP=763;SC=AAAAAAACATTGAAAGGAAAG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=38961545;WS=38961527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	38967103	rs4676474	C	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=770;SC=GGCCTGTGACCTCCAAGGTGA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=38967111;WS=38967093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	38968511	rs144777985	T	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTTGATTTTTTTTTCCATTTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=38968519;WS=38968501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	39149092	rs6786764	A	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=756;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GACCGACCCGACGCCAGTAGC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=52;WE=39149100;WS=39149082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,60:0.36:166
chr3	39166484	rs784508	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=13;PP=670;SC=TTATCCATGCCCCTTGACCTG;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=39166492;WS=39166474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	39166509	rs784507	A	G	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=801;SC=GCTGCTGGCTATGCTTCAGTG;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=39166517;WS=39166499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	39166743	rs2669852	T	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=203;SC=TGCAAGGTGGTCTGGACCTTC;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=39166751;WS=39166733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	39167905	rs784506	G	A	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=48;PP=1453;SC=CCTGACAGCCGGGTGGGGCCT;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=39167913;WS=39167895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	39169693	rs1298712	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=544;SC=AGCAGAACAAAACTGGCTAAA;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=39169701;WS=39169683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	39169712	rs1274969	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=596;SC=AAATACTCAATTTTGTATATT;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=39169720;WS=39169702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	39175576	rs784492	G	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=717;SC=GGACGTTCACGTGGGGAATTC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=39175584;WS=39175566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	39178899	rs784495	C	T	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=70;PP=2849;SC=TGGGGACTGGCGGGCATGGGC;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=39178907;WS=39178889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	39179909	rs784497	G	A	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=39;PP=1578;SC=GCACGTGAATGGACGTGGGAG;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=39179917;WS=39179899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	39180099	rs784498	T	C	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=78;PP=2826;SC=TGGAGGCCATTGAAATCTGCA;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=161;WE=39180107;WS=39180089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	39180162	rs811969	A	C	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=91;PP=2965;SC=TGGTGGGGAAACCTGCATGAT;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=169;WE=39180170;WS=39180152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	39180263	rs704959	G	A	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=59;PP=1944;SC=AAGGCCCGAAGGTCCCTGAGG;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=39180271;WS=39180253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	39184959	rs1274958	C	T	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=TCATCCAGGACGCCTGATGTG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=39184967;WS=39184949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	39185077	rs1274957	G	A	5917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=85;PP=2965;SC=GGTTCCCCACGCTCCCTTCCT;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=174;WE=39185085;WS=39185067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	39185248	rs784519	A	G	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=2528;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AAGATGCTGTAGAAGAATCAG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=114;WE=39185256;WS=39185238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,136:0.99:138
chr3	39185968	rs810743	A	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=235;SC=AGAGGGATGTAAGAAGCACAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=39185976;WS=39185958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	39186728	rs784517	C	T	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=45;PP=1436;SC=CCCGGCGAGCCCGCTTCAGGA;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=39186736;WS=39186718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	39226127	rs3732383	C	T	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=61;PP=1982;ReadPosRankSum=0.049;SC=GTTTGACCTCCGACCTCCTGG;SOR=0.686;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=223;TCF=112;TCR=111;TR=114;WE=39226135;WS=39226117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,125:0.49:255
chr3	39229900	rs6805248	T	C	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=65;PP=2965;SC=AAACAGATGCTGCTGCTGCTG;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=146;WE=39229908;WS=39229890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr3	39308293	rs4271863	A	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.60;QD=25.15;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	39323163	rs11715522	A	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=49;PP=1754;SC=CTGCCAACTTAAACGCCTCCA;SOR=1.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=39323171;WS=39323153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	39431081	rs2270770	G	A	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=30;PP=1311;SC=AAACACGCCTGCAAACCCTCC;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=39431089;WS=39431071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	39432096	rs146503045	A	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=426;ReadPosRankSum=0.879;SC=TGTGAGAGTCAGAAGTGGTGG;SOR=0.794;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=32;WE=39432104;WS=39432086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr3	39433147	rs1995236	G	A	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=63;PP=2038;SC=AGGATAGTTCGGCTTAGCCAC;SOR=1.188;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=98;WE=39433155;WS=39433137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	39437800	rs9877539	A	G	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=45;PP=2841;SC=TAAACATGGGATAACAGAGAC;SOR=1.470;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=88;TCR=45;TR=132;WE=39437808;WS=39437790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	39452123	rs2077797	G	A	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.01;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	39452129	rs2077799	G	T	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.06;SOR=2.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	39453610	rs2723	C	T	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=34;PP=1591;SC=CAGTTTTATTCTAACTTTAAT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=39453618;WS=39453600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	39554786	rs2233204	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=294;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TCAAAATCCACAATTATACTA;SOR=0.118;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=17;WE=39554794;WS=39554776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr3	40204178	rs1714414	T	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=9;PP=1105;SC=TGAAGACCTTTGATAATCATA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=40204186;WS=40204168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	40231883	rs1317317	C	T	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=72;PP=2639;SC=AAGAGCCCGACTGGGCTCAGA;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=125;WE=40231891;WS=40231873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	40251188	rs35424380	TA	T	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=-0.989;SC=AAGGTAAAACTAAAAGTCCAT;SOR=0.119;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=7;WE=40251196;WS=40251178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	40251282	rs2679798	G	A	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=35;PP=1713;SC=GGGTTATTGGGAACAAGAAGC;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=40251290;WS=40251272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	40251392	rs1799418	T	C	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=51;PP=2511;SC=AGGCTCGGGATCCCCAGACTC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=116;WE=40251400;WS=40251382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	40251628	rs1799419	G	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=244;SC=AGCTTCTGCAGTGGGGTGTTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=40251636;WS=40251618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	40353259	rs1470937	T	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=9;PP=416;SC=GATCATTTCTTTATATACACA;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=40353267;WS=40353249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	40498845	rs2276868	C	T	3745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=54;PP=2061;SC=CGCCTAACGCCGCCAACATGG;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=40498853;WS=40498835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	40498933	rs4973904	A	G	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=44;PP=1524;SC=CTGAGGCGCCAAACGGCTCCC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=40498941;WS=40498923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	40503520	.	A	ACTGCTGCTGCTGCTG,ACTGCTGCTGCTGCTGCTG	1625.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2,2;NR=6,6;PP=274,82;ReadPosRankSum=-1.109;SC=TACTAAGGGTACTGCTGCTGC;SOR=0.869;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=8,8;WE=40503529;WS=40503510;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.32,0.62:37
chr3	40503809	rs11539046	G	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=50;PP=1467;SC=TGTTGAGGCTGGAGTTAGGAG;SOR=3.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=59;WE=40503817;WS=40503799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	40505886	rs11129881	C	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=14;PP=1124;SC=TGGATGATTTCGGATTACCTG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=40505894;WS=40505876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	40519429	rs4553952	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TCTTACTTTTTCAAACCTAGA;SOR=0.871;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=7;WE=40519437;WS=40519419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr3	40557271	.	TTG	T	311	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=4;NR=5;PP=311;QD=34.8888888889;SC=AGCACAGATATTGTGTGTGTG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=9;WE=40557282;WS=40557261;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,9:0.50:18
chr3	41274764	rs2691680	C	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=1;PP=734;SC=AAGGCTAGAACAGATATTTAG;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=41274772;WS=41274754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	41607701	rs1565957	C	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=34;PP=1003;SC=CAAATGATGTCCACTGCTTCA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=41607709;WS=41607691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	41796025	rs201354756	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=0.112;SC=CATAAAAAAATAGGGCAGTCT;SOR=0.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=41796033;WS=41796015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr3	41841716	rs4973986	A	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=643;ReadPosRankSum=-1.366;SC=AAGCCCTGGGACTGAGCAGAA;SOR=1.425;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=38;WE=41841724;WS=41841706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr3	41923513	rs59960840	GAGGCC	GGGCC,G	1177.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=1217;SC=CCAGTAGAATGAGGCCATCAC;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=41923527;WS=41923503;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:27
chr3	41923515	rs61575884	GGCCA	G	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	41923519	.	A	G	622	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=21;NR=2;PP=622;QD=28.5552701107;SC=GAATGAGGCCATCACATCACC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=23;WE=41923527;WS=41923503;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr3	41925260	rs113374533	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=2973;SC=CACAATCCCACAGAGAAAAAA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=41925284;WS=41925257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	41925301	rs1716685	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=125;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=504;SC=CTGCAGGTTCTAAATTACAGA;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=41925309;WS=41925291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	41925398	rs1052501	C	T	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=45;PP=2403;SC=TGGAGCTCAGCTGTGTGCGAA;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=41925406;WS=41925388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	41925423	rs1716687	T	C	4873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=64;PP=2724;SC=GTAAACCAATTACGTGAGCAA;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=41925431;WS=41925407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	41937000	rs1717003	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.42;NF=14;NR=2;PP=325;SC=AAAATATAAACGTTACTTACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=41937008;WS=41936990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	41938500	rs1717005	G	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=594;SC=TATCCACTGCGATGGAAAGAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=41938508;WS=41938490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	41939993	rs1625226	T	A	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=1153;ReadPosRankSum=1.547;SC=ATCTGTGGTTTAAAAAAAAAG;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=56;WE=41940001;WS=41939983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr3	41942199	rs1717007	T	C	4942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=87;NR=78;PP=2965;SC=ACTCAGTTGTTAGAGTGTCTT;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=165;WE=41942207;WS=41942189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	41952781	rs1716991	C	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=36;PP=2163;SC=TTGTCTTGCACTGATCCCTCT;SOR=1.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=41952789;WS=41952771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	41957466	rs1716698	T	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=25;PP=982;SC=CTACTGTCCCTACCTTTTCTG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=41957474;WS=41957456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	41960006	rs1716975	T	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=15;PP=458;SC=AATTCTGAAATACTTTCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=28;WE=41960014;WS=41959996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	41961168	rs1716979	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=0.386;SC=ACCTGGTTTTTAGTCCAGCTC;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=16;WE=41961176;WS=41961158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr3	41977214	rs3934103	C	T	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=112;SC=AAATTTTATCCAAAAATAACA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=41977222;WS=41977204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	41977488	rs58069203	CCT	C	5365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=64;PP=2966;SC=ACAGAGTGCCCCTGAGAGGTT;SOR=1.142;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=77;WE=41977497;WS=41977478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	41996136	rs2272007	T	C	7994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=118;PP=2965;SC=TTCAGGCCTTTTGCACTTATC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=121;TCR=118;TR=239;WE=41996144;WS=41996126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr3	41996275	rs7651623	A	G	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=65;PP=2140;SC=TCTCACATACAATAGAATAAC;SOR=1.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=97;WE=41996283;WS=41996265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	42133149	rs4974011	C	G	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=721;ReadPosRankSum=0.565;SC=TCTCTTGCTCCGTGCTGCTTG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=43;WE=42133157;WS=42133139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr3	42304784	rs1868522	A	G	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1366;ReadPosRankSum=1.924;SC=GGACCGCCAGAAATCATGTTG;SOR=0.907;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=79;WE=42304792;WS=42304774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,97:0.41:235
chr3	42305131	rs754635	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=1.212;SC=ATGGCTGTAGCGAGCAAAGGA;SOR=0.297;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=13;WE=42305139;WS=42305121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	42438754	rs13054	T	C	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=949;ReadPosRankSum=-1.200;SC=GCCATGCAGGTGGCTACAGCT;SOR=0.580;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=77;WE=42438762;WS=42438744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr3	42445679	rs40416	C	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.513;SC=AGAGTGATGTCAGGGAAGGTA;SOR=0.160;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=6;WE=42445687;WS=42445669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr3	42448296	rs33518	T	C	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CACAGCACCATAGCCTCCAGT;SOR=0.465;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=142;TCF=93;TCR=49;TR=66;WE=42448304;WS=42448286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr3	42687278	rs73085333	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=684;SC=CTTGAAAACACTATTGATGTT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=42687286;WS=42687268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	42728144	rs6805421	A	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=881;ReadPosRankSum=0.079;SC=TCCCTCTCCAACCAGGTCCCC;SOR=0.790;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=58;WE=42728152;WS=42728134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,60:0.42:142
chr3	42733468	rs123509	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=0.867;SC=CAATGTGCTGTGCCTGACTAA;SOR=0.420;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=39;WE=42733476;WS=42733458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr3	42735150	rs11079	T	C	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=570;ReadPosRankSum=-0.122;SC=AGTTTTTGCATCCAGAGCTCA;SOR=0.829;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=40;WE=42735158;WS=42735140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
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chr3	42738297	rs2290973	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=349;ReadPosRankSum=-4.085;SC=ACACCTGGCAGGATGGCTGTG;SOR=0.537;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=19;WE=42738305;WS=42738287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr3	42738935	rs116767540	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.645;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=342;ReadPosRankSum=1.291;SC=TGGCACCGTGGGGGTGCAGAG;SOR=0.030;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=23;WE=42738943;WS=42738925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr3	42750446	rs2240860	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=675;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CTGCCCACCCGGCCAGGCCGA;SOR=0.201;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=41;WE=42750454;WS=42750436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr3	42754912	rs3895740	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTACATTGGTAGTGATGGGAC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=42754920;WS=42754902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	42772038	rs12495805	A	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=956;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTGATCTCTGACACTTGTGCC;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=54;WE=42772046;WS=42772028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr3	42784630	rs12635736	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-1.329;SC=GAGACCCCACAGACTGAAGAT;SOR=0.475;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=16;WE=42784638;WS=42784620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr3	42787469	rs2240859	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=494;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TCCCTGGCGAAGATAGGAGCT;SOR=0.788;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=32;WE=42787477;WS=42787459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr3	42788914	rs12490743	G	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GCCTACATGGGAATAGTAATC;SOR=1.106;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=14;WE=42788922;WS=42788904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr3	42793337	rs11929390	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=0.148;SC=GGGGTGGACCTCGGGTAGAGG;SOR=2.165;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=10;WE=42793345;WS=42793327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	42799554	rs111697736	TAC	TACAC,T	48.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.908;NF=4,4;NR=2,2;PP=88,110;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCTCCGGTGGTACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6,6;WE=42799563;WS=42799544;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.36:11
chr3	42799858	rs339678	T	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=323;SC=GCATCAGAAATGAAGCCTCAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=42799866;WS=42799848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	42835889	rs6764909	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=0.369;SC=CCATAATCCTAAAGTTAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=16;WE=42835897;WS=42835879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	42907112	rs2228468	A	C	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=54;PP=1754;SC=TCTGAGAACTACCCTAACAAG;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=84;WE=42907120;WS=42907102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	42917047	rs9865715	A	G	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=78;PP=2965;SC=TTGAGGATGGAGCCAAAGGAG;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=152;WE=42917055;WS=42917037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	42947776	rs6789928	T	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=19;NR=9;PP=457;SC=CAGAGCGCTCTTCCGCGACCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=42947784;WS=42947766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	42954912	rs11129987	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=455;SC=GGACCAGATCCTTAAATCAAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=42954920;WS=42954902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	42956273	rs1427801	T	C	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=47;PP=1423;SC=CACATTGCATTGCACATCAGA;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=42956281;WS=42956263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	42956984	rs834579	A	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=255;SC=AACATTTACCATGTACTCTAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=42956992;WS=42956974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	43073761	rs658958	G	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1115;ReadPosRankSum=1.736;SC=TCTCTCAGGCGTCTTGGCTCC;SOR=0.962;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=66;WE=43073769;WS=43073751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr3	43074430	rs2948619	A	G	3137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,81:0.47:172
chr3	43074434	rs2936817	C	T	3128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,82:0.47:176
chr3	43074871	rs588335	A	G	5162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=86;PP=2965;SC=TCTGGTGGGCACCCGATGTGC;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=168;WE=43074879;WS=43074861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr3	43095101	rs536119	A	G	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=67;PP=2965;SC=GAGAAATGCCAGAACCCAGCC;SOR=1.092;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=168;WE=43095109;WS=43095091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	43096875	rs484260	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=885;ReadPosRankSum=1.039;SC=GGTGCCAGCCGTAGCTGCACC;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=54;WE=43096883;WS=43096865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr3	43097710	rs664628	A	G	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1106;ReadPosRankSum=1.110;SC=CAGGGTGTCTACAGAACATGC;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=90;TCR=71;TR=73;WE=43097718;WS=43097700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,94:0.49:192
chr3	43121559	rs604033	C	T	7146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=102;PP=2965;SC=GAATGAGGGACGGGATGTCCA;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=128;TCR=102;TR=230;WE=43121567;WS=43121549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
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chr3	43414318	rs6441771	A	G	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=25;PP=984;SC=CGTGGAAGAGAGACCAGCTTG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=43414326;WS=43414308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	43474222	.	G	A	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=614;ReadPosRankSum=1.027;SC=AGTGCGTGCTGAAAACAAGAA;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=30;WE=43474230;WS=43474212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr3	43591327	rs17409162	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=768;ReadPosRankSum=-0.257;SC=AACACTCATCGTTTCAAAAGC;SOR=0.489;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=52;WE=43591335;WS=43591317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr3	43591405	rs1842805	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.694;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TCATCCTTTTTCATGTTATCT;SOR=0.119;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=20;WE=43591413;WS=43591395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr3	43592906	rs9829081	T	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=546;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AATTTACATATAATAAACTGC;SOR=0.426;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=38;WE=43592914;WS=43592896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr3	43618280	rs56389778	T	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=526;ReadPosRankSum=0.008;SC=AACAGGACACTGGTCCACTCA;SOR=0.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=45;WE=43618288;WS=43618270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,49:0.37:132
chr3	43642126	rs6441785	C	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=58.62;MQRankSum=-0.632;NF=4;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=1.684;SC=AGTTTCAAAACTAAAAACTTT;SOR=0.377;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=15;WE=43642134;WS=43642116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr3	43756577	.	C	CTGTGTG	686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-2.450;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr3	44283525	rs9850927	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=1.101;SC=GAGGGGCCCCAGCGGGCCGGC;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=44283533;WS=44283515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr3	44283672	rs9833423	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=536;ReadPosRankSum=1.727;SC=GGCCGGGGGGTGCCGGGAAAA;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=44;WE=44283680;WS=44283662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
chr3	44283808	rs7645375	C	A	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.169;SC=CGCAGGGGCCCGGTGAGCCCG;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=83;WE=44283816;WS=44283798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,96:0.54:179
chr3	44284584	rs9284879	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=456;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AAATATTAAGGTTGAATTCCA;SOR=0.801;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=33;WE=44284592;WS=44284574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr3	44296403	rs4682960	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=366;ReadPosRankSum=0.830;SC=TTTAGAGAAGTGGATAGTTCT;SOR=1.193;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=20;WE=44296411;WS=44296393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr3	44310592	rs5004668	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.795;SC=GTGAACTGAATATGAATATTT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=44310600;WS=44310582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	44329394	rs11294162	TG	T	764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=387;ReadPosRankSum=0.979;SC=ATTGTTTCCATGGGGGGGTAC;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=17;WE=44329402;WS=44329384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr3	44332176	rs1488637	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=288;ReadPosRankSum=0.173;SC=CTTCTTCCATTAGTGTCTTAG;SOR=1.287;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=19;WE=44332184;WS=44332166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr3	44362408	rs9857957	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GAGTACATATGTTTAAGTTTT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=44362416;WS=44362406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	44399668	rs4682970	T	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=604;SC=CTTGAGACCTTTATTATCATG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=44399676;WS=44399658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	44408864	rs372993721	G	GT	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=468;SC=GTAATAGAATGTTTAAAAGAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=13;WE=44408872;WS=44408854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	44437781	rs28439262	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=378;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TTATGTGTGTGCTTCAAAAAG;SOR=0.800;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=28;WE=44437789;WS=44437771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr3	44437870	rs6441838	A	C	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=33;PP=1020;SC=TGTTAACATGAGTGTGTGCTC;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=44437878;WS=44437860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	44540791	rs36046723	TTC	T	3704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.304;NF=20;NR=45;PP=2588;ReadPosRankSum=0.696;SC=CATAAGGTTTTTCTCTCCAGT;SOR=0.456;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=146;TCF=56;TCR=90;TR=65;WE=44540800;WS=44540781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,105:0.49:214
chr3	44599103	rs2293600	T	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=0.791;SC=AGAGGGAAAATAGTTTTGTGC;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=44599111;WS=44599093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	44609781	rs188732606	T	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=571;ReadPosRankSum=-1.712;SC=CCTGAGCGATTGGAGCTTGTC;SOR=1.220;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=36;WE=44609789;WS=44609771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr3	44612050	rs9873604	C	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TCCCGACTCACTGACCACCAG;SOR=0.566;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=73;WE=44612058;WS=44612040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,83:0.51:164
chr3	44635461	rs13319803	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=340;ReadPosRankSum=0.050;SC=CCTTCCTCTGGTACAGAGAAT;SOR=1.524;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=18;WE=44635469;WS=44635451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr3	44763037	rs7640654	A	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=0.207;SC=AAATGCAATGAATGTGGGAAT;SOR=0.974;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=17;WE=44763045;WS=44763027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr3	44775962	rs4682752	A	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=768;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GAGAGTTAACATGCAGAAGAA;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=84;TCR=48;TR=57;WE=44775970;WS=44775952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,66:0.42:158
chr3	44803108	rs56236286	AAAGACAG	A	6660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.706;NF=21;NR=79;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.444;SC=AGCTCTGGGTAAAGACAGAAG;SOR=0.744;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=262;TCF=51;TCR=211;TR=100;WE=44803122;WS=44803098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,179:0.41:438
chr3	44826315	rs56895721	G	GT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=11;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AAAATCCAGTGTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=44826323;WS=44826305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	44827793	rs7642843	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-0.365;SC=ATAGGAAATTTACATCTTGTG;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=9;WE=44827801;WS=44827783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	44840612	rs5848711	A	AT	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=610;ReadPosRankSum=1.706;SC=GTCTTTGGAGATATAGAACTG;SOR=2.876;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=16;WE=44840620;WS=44840602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr3	44854563	rs3762636	A	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=770;ReadPosRankSum=2.570;SC=CTTTTTTCCCAAAGCTTTTCT;SOR=0.930;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=79;TCR=37;TR=57;WE=44854571;WS=44854553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr3	44868474	rs149715297	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=919;ReadPosRankSum=1.493;SC=CCTATGAGGTCGCTTTTCTTC;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=55;WE=44868482;WS=44868464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr3	44869026	rs4682999	A	T	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=78;PP=2686;SC=AGCAGGTAAAATTCCTGTTAC;SOR=0.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=134;WE=44869034;WS=44869016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	44882784	rs6766221	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GACCAAGTCTCGCTATGTTGC;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=44882792;WS=44882774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	44884647	rs3804583	C	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=980;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AAACCTACGCCTGGAAAGTCA;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=69;WE=44884655;WS=44884637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,75:0.41:184
chr3	44906746	rs10429	A	G	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=59;PP=1752;SC=GTGGGACTGTATCCTAGGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=80;WE=44906754;WS=44906736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	44929287	rs2271087	G	C	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1158;ReadPosRankSum=1.153;SC=CTGGCAAAGAGGTGAGCACCC;SOR=0.658;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=220;TCF=107;TCR=113;TR=93;WE=44929295;WS=44929277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,124:0.48:257
chr3	44932270	rs937837	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=0.303;SC=GTGACCCCGGCAAAACCTGCT;SOR=0.916;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=28;WE=44932278;WS=44932260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr3	44935019	rs62242575	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CAAGCCTGCTCCTGTCCCAGG;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=44935027;WS=44935009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	44943069	rs1995640	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=749;ReadPosRankSum=0.156;SC=CTGGGGACTACGAAGGTGGCA;SOR=0.428;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=48;WE=44943077;WS=44943059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr3	44943389	rs1995641	G	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=937;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TGAGAATGGCGAGAAAATCAC;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=63;WE=44943397;WS=44943379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,72:0.50:144
chr3	44948479	rs3749195	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=545;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GACCGCCATCCGCAAAGGTGA;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=29;WE=44948487;WS=44948469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr3	44948590	rs9876921	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=749;ReadPosRankSum=-0.165;SC=GGAGTTACACGTAATTTCAAT;SOR=0.850;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=47;WE=44948598;WS=44948580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr3	44948770	rs4622937	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=0.030;SC=TTGGGGGTGGGCCTGGGCAAC;SOR=1.639;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=12;WE=44948778;WS=44948760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	44952407	rs1520082	G	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=253;ReadPosRankSum=1.100;SC=TACTGGGGGGGTATGATGAAT;SOR=0.787;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=19;WE=44952415;WS=44952397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr3	44952942	rs6777798	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.900;SC=TTCTGGACATATATCTTGCAC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=44952950;WS=44952932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	45017904	rs6441873	AG	TT	3414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.858;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=2394;ReadPosRankSum=0.323;SC=TGGGTTTGCCAGTGAGGAGGC;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=74;WE=45017913;WS=45017894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,88:0.58:151
chr3	45049186	rs11130040	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-1.689;SC=AAACTTGGAGATTTGGGAACA;SOR=0.260;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=45049194;WS=45049176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	45052775	rs6794	G	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=718;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GCAGAGTGTTGTGCACAAGGA;SOR=0.419;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=50;WE=45052783;WS=45052765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr3	45068074	rs2301282	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-2.154;SC=TCATCTAGGGAACTTGAGTAA;SOR=0.963;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=16;WE=45068082;WS=45068064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr3	45077123	rs13963	G	A	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1435;ReadPosRankSum=0.873;SC=GGGCACCCTGGGCACCCCTCA;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=79;WE=45077131;WS=45077113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr3	45077458	rs8318	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=1.397;SC=GGAGGGCAGGGGCCGCGGGAG;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=16;WE=45077466;WS=45077448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	45127515	rs9874077	T	C	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=50;PP=1784;SC=ATTGATGTTGTCATTGTAGAT;SOR=1.103;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=85;WE=45127523;WS=45127505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	45132637	rs1879240	T	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=301;SC=TGTTCATCACTGTCCCCAAAG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=45132645;WS=45132627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	45134822	rs3749191	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=449;ReadPosRankSum=0.036;SC=GGCCTCTTGTTGGAAGCTGGG;SOR=0.905;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=28;WE=45134830;WS=45134812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr3	45137087	rs2037358	T	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=455;SC=AAAACAGGCATGAAGCATGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=45137095;WS=45137077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	45187581	.	T	TCTCCGCACC	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.585;NF=3;NR=1;PP=1165;ReadPosRankSum=0.221;SC=CCCCGCCCTCTCTCCGCACCC;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=4;WE=45187589;WS=45187571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	45187671	rs1863837	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=584;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CACTCCACGCCATCCGCCTCC;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=41;WE=45187679;WS=45187661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr3	45187785	rs2276862	C	G	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=932;ReadPosRankSum=0.183;SC=GCCATGACTCCGGGACGCCTC;SOR=0.554;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=65;WE=45187793;WS=45187775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr3	45267310	rs41118	C	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr3	45267321	rs395917	C	T	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=770;ReadPosRankSum=1.465;SC=GCCGCCGCCGCCTCCTCCGGG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=17;WE=45267329;WS=45267300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr3	45500174	rs745551	C	A	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=48;NR=10;PP=1541;SC=GCGACACTCCCTGTCAAAAAA;SOR=2.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=58;WE=45500186;WS=45500153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	45515648	rs11919039	T	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=342;SC=GTCCCTGCTTTTCCTACCTTA;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=45515656;WS=45515638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	45517799	rs3733117	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=294;SC=CTTCTCAGCTTCTTCCAGGCA;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=45517807;WS=45517789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	45527099	rs7640603	C	G	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=34;PP=1928;SC=CTAGTGCTTACTTTTCTCACT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=91;WE=45527107;WS=45527089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	45527218	rs7610357	T	C	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=61;PP=2401;SC=TGAACATGCTTACCCAGCAGG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=113;WE=45527226;WS=45527208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	45530401	rs3733116	G	A	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=872;SC=TCCTTCACTCGTCCCCATACC;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=45530409;WS=45530391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	45533224	rs2128361	G	A	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=64;PP=1975;SC=CCAACATCGCGTCTTTCACTG;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=98;WE=45533232;WS=45533214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	45542083	rs2306522	T	C	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=39;PP=1132;SC=TAAGCACTTATACTGCTTTGC;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=45542091;WS=45542073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	45559519	rs2170549	T	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=51;PP=1574;SC=AGGAGAAAGCTGAGGCCAGGA;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=91;WE=45559527;WS=45559509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	45565554	rs267220	A	G	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=23;PP=1187;SC=CCCTGATGGTAATGGCTGCTC;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=45565562;WS=45565544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	45636335	rs267238	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=75;ReadPosRankSum=0.156;SC=ACACACACACACGGCACCTGG;SOR=0.595;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=45636343;WS=45636325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	45637253	rs267237	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AGCCCAGGACCCCTTCTGTGT;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=70;WE=45637261;WS=45637243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr3	45637439	rs267236	T	C	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.052;NF=28;NR=31;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.014;SC=CGCCAGCTGGTCTGGACGGTT;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=59;WE=45637447;WS=45637429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,75:0.48:156
chr3	45637830	rs13086458	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=0.577;SC=GGGGTTCTTGAGATTGGGGAA;SOR=1.436;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=17;WE=45637838;WS=45637820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	45677635	rs11379880	C	CT	6481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	45677637	.	GCA	TGC	2937	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=52;NR=57;PP=2937;QD=20;SC=CTCTTGTCCTGCAAGGAGCCT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=109;WE=45677647;WS=45677627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,109:0.92:119
chr3	45677638	rs5848762	CA	C	6505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	45715159	rs35737275	CT	C	564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=395;SC=AATCCCACCCCTTTTAGGAGG;SOR=1.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=45715167;WS=45715149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	45715688	rs2578679	G	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=5;PP=555;SC=TCTTCTTCCAGTAAGTACTCC;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=45715696;WS=45715678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	45718327	rs7640969	T	G	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=19;PP=1535;SC=CACAGCACCCTCTGCTGATTT;SOR=2.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=74;WE=45718335;WS=45718317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	45776875	rs111484566	CT	C	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr3	45780906	rs3733107	A	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=202;SC=TCTAAAGTCTAGGGCAGTTGT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=45780914;WS=45780896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	45785325	rs184202097	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TCTGATGTTACTGCCTTGATG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=45785333;WS=45785315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	45799871	rs2251347	C	T	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=32;PP=1178;SC=CTGGACCCACCGTCAGAGACC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=68;WE=45799879;WS=45799861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	45817418	rs758386	A	G	6680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=106;PP=2965;SC=ACGCCTTCTCACACTCCTCAT;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=216;WE=45817426;WS=45817408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr3	45821624	rs2252547	T	C	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=63;PP=1552;SC=CGCTGAGGACTGAGGATGGCC;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=45821632;WS=45821614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	45936237	rs3764864	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CTACTCAGATGATTCTGAAAT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=45936245;WS=45936227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	45938939	rs2236938	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CAATGTCCTTGTCTGGGATTC;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=4;WE=45938947;WS=45938929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr3	45964959	rs6800954	C	T	55.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TAAGACTCTGCAAGCATGAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=45964967;WS=45964949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	45977866	rs4535265	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=310;ReadPosRankSum=0.212;SC=TGGTCCCCAGCGCCGGCACTG;SOR=0.582;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=18;WE=45977874;WS=45977856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	45977899	rs1873002	T	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=18;PP=1170;SC=CTCCTCCCAATGCCACACCTG;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=45977907;WS=45977889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	45979877	rs9875616	G	A	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=382;SC=CTGTGAATCAGTTTAGGAGGT;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=45979885;WS=45979867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	45989044	rs2234358	T	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=0.594;SC=AATTTGCAAGTCATGGCTGTG;SOR=0.919;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=17;WE=45989052;WS=45989034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr3	45996761	rs1463680	G	A	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=20;PP=917;SC=CATTTGGGTCGAGAGAATCAG;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=45996769;WS=45996751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	46001063	rs1532071	G	A	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=48;PP=1297;ReadPosRankSum=-1.449;SC=GGAAGAAAAGGAGAGAGAATC;SOR=0.525;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=48;TCR=93;TR=75;WE=46001071;WS=46001053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr3	46007702	rs1994490	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=344;ReadPosRankSum=0.590;SC=AAGGTGCATCTTCCCATGGAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=46007710;WS=46007692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr3	46008790	rs3796375	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=932;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CAGCAAGCTCGCCTCCATCTG;SOR=1.093;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=56;WE=46008798;WS=46008780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,68:0.58:118
chr3	46009491	rs3796376	C	T	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=55;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CCAGGCGCTCCAGGCTGGCCC;SOR=0.563;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=125;WE=46009499;WS=46009481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,141:0.49:289
chr3	46009864	rs3733100	C	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1208;ReadPosRankSum=0.136;SC=TAGCTCCAGGCCCTGCAGGCA;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=69;WE=46009872;WS=46009854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,73:0.56:131
chr3	46010077	rs4683158	C	T	5879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=92;PP=2965;SC=CATGCGCTCCCGTAGCTGCTT;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=178;WE=46010085;WS=46010067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr3	46016599	rs3821884	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GACAATGATATATGTGGAAGG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=46016607;WS=46016589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	46016851	rs751552	A	T	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=635;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GAAAAAGCAGATTACATAGAG;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=37;WE=46016859;WS=46016841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
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chr3	46021218	rs4682801	G	T	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=15;PP=932;SC=ACTTGACAAAGCGGATCCCAT;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=46021226;WS=46021208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr3	46480958	rs2073495	C	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=507;ReadPosRankSum=0.625;SC=TAGCCCATGCCTCATTGTTAT;SOR=0.441;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=33;WE=46480966;WS=46480948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr3	46480994	rs55787894	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=271;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AGAAGGTGGCATCATCCACGC;SOR=1.853;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=15;WE=46481002;WS=46480984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr3	46484898	rs7615975	T	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-1.941;SC=ATGAGGTAAGTCCCCATCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=46484906;WS=46484888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	46487775	rs4682816	C	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AGAACTATTCCTCTGTGAATT;SOR=0.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=22;WE=46487811;WS=46487765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr3	46487787	rs201856214	TTTGCACCCTTAAAATTA	T	1408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.930;NF=17;NR=2;PP=2964;ReadPosRankSum=0.049;SC=CTGTGAATTATTTGCACCCTT;SOR=0.665;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=19;WE=46487811;WS=46487765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr3	46501284	rs10662431	C	CCTT	2097.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=1864;SC=ACTGAACACTCCTCCTACGGC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=35;WE=46501292;WS=46501274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	46593147	rs1879325	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=758;SC=ACAAACAGAAAACAGTTTTAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=46593155;WS=46593137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	46620614	rs11130097	T	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=390;ReadPosRankSum=-3.078;SC=ATTTCTAAAGTCTTTGAACTG;SOR=1.070;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=26;WE=46620622;WS=46620604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr3	46654132	rs2139637	G	A	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=41;PP=2354;SC=GGTCAAGTGCGACACATTTGG;SOR=1.353;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=116;WE=46654140;WS=46654122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	46658737	rs9832679	A	G	7511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=105;PP=2965;SC=GATCTCAAGCATTTCTGGGAA;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=132;TCR=105;TR=237;WE=46658745;WS=46658727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr3	46658872	rs9870935	G	T	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=71;PP=2098;SC=AAAATACATCGTATAATTTAG;SOR=2.212;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=92;WE=46658880;WS=46658862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	46713102	rs6776565	C	T	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1296;ReadPosRankSum=1.561;SC=ACCAAGAGAGCGAGGGAGACA;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=86;WE=46713110;WS=46713092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,88:0.46:192
chr3	46714797	rs11130103	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=395;ReadPosRankSum=0.454;SC=CCTCTGGGGGCCCCTGGCTTG;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=24;WE=46714805;WS=46714787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr3	46714821	rs11130104	C	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=444;ReadPosRankSum=1.609;SC=CTCTGGCCTCCCTCTCACCTG;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=31;WE=46714829;WS=46714811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr3	46717065	rs7635360	C	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=423;ReadPosRankSum=0.105;SC=CGCATGAGGCCTCCCTGGACA;SOR=0.323;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=28;WE=46717073;WS=46717055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr3	46717931	rs6808525	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=537;ReadPosRankSum=1.249;SC=GACTAAGCACTGGGGTCTGGA;SOR=1.004;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=38;WE=46717939;WS=46717921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr3	46717957	rs9876451	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GCATGCCCACACCAGCCTCCC;SOR=1.308;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=23;WE=46717965;WS=46717947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr3	46718298	rs6806400	A	G	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=36;NR=36;PP=1401;SC=AGCCCTCCCCAGCCCACCCTA;SOR=0.770;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=72;WE=46718306;WS=46718288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	46722692	rs13080080	G	T	3618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=53;PP=1900;ReadPosRankSum=2.142;SC=GTGAGGGCCCGGTCCACCCCT;SOR=0.523;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=255;TCF=152;TCR=103;TR=125;WE=46722700;WS=46722682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,169:0.52:325
chr3	46723551	rs4683310	G	A	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1138;ReadPosRankSum=0.606;SC=AATTCCCCACGTGATTCCGCC;SOR=0.672;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=81;WE=46723559;WS=46723541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr3	46723663	rs4683311	C	T	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=711;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CTCAGACGCCCTCCCTTCCTC;SOR=1.185;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=43;WE=46723671;WS=46723653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr3	46724569	rs9847407	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CTCTCTGCCCCGCAGACCCCC;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=46724577;WS=46724559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr3	46933960	rs1001284	C	G	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=70;PP=2688;SC=TGCGCTGCCACTCGCGCGCGC;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=124;WE=46933968;WS=46933950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr3	46944274	rs1138518	T	C	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=56;PP=2378;SC=GTTTCTGCAATGGCGAGGTAA;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=132;WE=46944282;WS=46944264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	46963502	rs4587	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=937;SC=AAGACCATCCTCTGCAGGACA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=46963510;WS=46963492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	46965197	rs2290546	C	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=48;PP=1606;SC=CTGTGGAAAACGCGCTGCCAC;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=46965205;WS=46965187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	46967040	rs2290545	G	A	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1147;SC=AAGAATAGAGGGAACAAGCAG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=46967048;WS=46967030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	46982365	rs6804732	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=518;SC=AGGACAGCCATGGGCAGAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=46982373;WS=46982355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	47018214	rs936181	T	C	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=55;PP=2065;SC=CAGCCGTAGTTGCCTCCATCT;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=47018222;WS=47018204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	47029426	rs1108301	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=155;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CTCCCCCACCGTGACTCTGCG;SOR=0.972;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=10;WE=47029434;WS=47029416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	47029661	rs12152493	G	A	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=634;ReadPosRankSum=0.129;SC=AATGGTACACGTGTGTCCTGG;SOR=0.354;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=45;WE=47029669;WS=47029651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr3	47033937	rs13066214	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=439;ReadPosRankSum=0.454;SC=TTGCCTCCTCCACCCTGTGCC;SOR=1.553;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=24;WE=47033945;WS=47033927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr3	47035625	rs936185	G	A	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=35;PP=1123;SC=GAGCAAAGCAGGCGAGCTGGG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=47035633;WS=47035615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	47035900	rs749512	C	T	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=714;ReadPosRankSum=-0.284;SC=GTTTGCCCTCCGGCCCATGTA;SOR=0.786;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=48;WE=47035908;WS=47035890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr3	47036756	rs11720139	C	G	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=57;PP=1906;ReadPosRankSum=2.143;SC=CCTGGAGGCCCGCTGCCAAGA;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=121;WE=47036764;WS=47036746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,138:0.53:262
chr3	47038135	rs11396344	C	CA	3607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=42;PP=2897;SC=GCTAGGGGTCCGGGGGGAGAA;SOR=0.737;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=65;WE=47038143;WS=47038125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	47043386	rs73075647	C	T	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1562;ReadPosRankSum=0.294;SC=GGCTGGGTGCCACTCATCTCT;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=99;WE=47043394;WS=47043376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,122:0.53:230
chr3	47043538	rs2305634	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=959;ReadPosRankSum=-1.113;SC=ACACCTCTTCCTTGGAGTCAG;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=63;WE=47043546;WS=47043528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,76:0.47:162
chr3	47043622	rs2305635	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=884;ReadPosRankSum=-1.211;SC=CCTGGCTGGTGCCACTGGTGC;SOR=0.731;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=53;WE=47043630;WS=47043612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr3	47044122	rs11928558	A	T	6863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=122;PP=2965;SC=CTGACCTATTACCCCCACCCC;SOR=1.100;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=85;TCR=123;TR=207;WE=47044130;WS=47044112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr3	47045739	rs1079276	C	G	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=55;PP=1304;ReadPosRankSum=-1.704;SC=GCCAGACTCCCAGACCCCAGC;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=192;TCF=73;TCR=119;TR=87;WE=47045747;WS=47045729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr3	47045846	rs2305637	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=-0.914;SC=AGCAGCCGCTCCCCCCAGGAG;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=51;WE=47045854;WS=47045836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr3	47046842	rs2305638	G	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.893;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=439;ReadPosRankSum=0.569;SC=GGCAGACTAGGGGGCAGATAA;SOR=2.235;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=26;WE=47046850;WS=47046832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr3	47047176	rs5848810	A	AG	2357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=2077;ReadPosRankSum=0.285;SC=TGGAGTGGCCAGGGGGCAGTC;SOR=0.622;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=61;WE=47047184;WS=47047166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,91:0.54:169
chr3	47050908	rs3214838	AG	A	1811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.825;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.245;NF=7;NR=46;PP=1386;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TGGGCAGCCCAGGGGGGTGAG;SOR=0.405;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=11;TCR=87;TR=53;WE=47050916;WS=47050898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
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chr3	47079112	rs6768722	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=-1.398;SC=GGTCTTGGACGGACTCCCAAA;SOR=1.042;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=15;WE=47079120;WS=47079102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr3	47079310	.	C	CA	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.891;NF=3;NR=12;PP=604;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GGCTAGGAAACAGAGAATCCT;SOR=1.106;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=15;WE=47079318;WS=47079300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	47125385	rs4082155	G	A	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1412;ReadPosRankSum=0.577;SC=GCTCTCTTTGGGCTCTATTTC;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=83;WE=47125393;WS=47125375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,105:0.47:224
chr3	47142907	rs60548476	TCC	T	2337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.928;NF=31;NR=12;PP=1538;ReadPosRankSum=0.059;SC=ACAGCCTATTTCCCCATCAGA;SOR=1.079;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=43;WE=47142916;WS=47142897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr3	47161214	rs11923706	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=256;ReadPosRankSum=0.750;SC=CAGTCTCGGGTATGTCTTTAT;SOR=0.116;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=18;WE=47161222;WS=47161204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr3	47162661	rs6767907	A	G	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=57;PP=1511;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CAGGCAGGCGATTATCTATTT;SOR=0.822;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=77;TCR=117;TR=92;WE=47162669;WS=47162651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,106:0.45:235
chr3	47187075	rs6442059	C	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CCCCTCACATCAGGTCATGTG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=19;WE=47187083;WS=47187065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr3	47198826	rs11708451	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.373;SC=TTGAGCCCAGGAGTTCAGTTA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=47198834;WS=47198816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C,CGCG	916.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQ=60.22;NF=0,0;NR=17,17;PP=319,505;SC=CAGGTCCGACCGCGGCGGCGG;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=17,17;WE=47205518;WS=47205492;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.39,0.61:23
chr3	47270336	rs73067298	A	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=0.638;SC=GAGTAGCCCCAATTCTCTGAG;SOR=0.302;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=17;WE=47270344;WS=47270326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr3	47276968	rs2276854	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.242;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=361;ReadPosRankSum=0.393;SC=TCACTGAGGCCCCCATCCTCC;SOR=1.172;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=25;WE=47276976;WS=47276958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr3	47277458	rs1874264	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=3;PP=280;SC=GAGAACAGACATCAAGGGGCA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=47277466;WS=47277448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	47282303	rs2276853	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=413;ReadPosRankSum=0.281;SC=TGCTTCTCCCGTAGTGACTTC;SOR=0.206;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=27;WE=47282311;WS=47282293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr3	47286227	rs6772449	G	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=395;SC=ATCCTCCCATGCACCCACCGA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=47286235;WS=47286217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	47287603	rs35871850	A	AT	1369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=8;PP=1125;SC=CAAGAAGAGGAGCTCTTGGAG;SOR=1.885;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=24;WE=47287611;WS=47287593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	47305928	rs140345125	TTTTTA	T	1210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=840;ReadPosRankSum=0.870;SC=TACTGAATGCTTTTTATTTGT;SOR=0.715;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=20;WE=47305940;WS=47305918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr3	47316725	rs903538	G	A	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=3;PP=1049;SC=AAATGATAGTGAGTGAGCTTT;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=47316733;WS=47316715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	47318747	rs924009	T	G	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=65;PP=2785;SC=GCCCAGTCAGTTGAAGGCAAA;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=143;WE=47318755;WS=47318737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	47322496	rs807936	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=901;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGTTTCAGTTCCCAAAATTAA;SOR=0.788;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=55;WE=47322504;WS=47322486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr3	47361082	rs2302278	G	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.614;QD=3.78;ReadPosRankSum=-2.539;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr3	47363971	rs17410853	G	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCTGGGCTAAGTAATGTCAGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=47363979;WS=47363961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	47376095	rs295450	A	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=19;PP=1037;SC=TTGGCAGTGGAGAGCCAGGCT;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=47376103;WS=47376085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	47449058	rs900688	T	C	5053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=96;PP=2965;SC=CATTGGACACTCTTCAGCCTG;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=171;WE=47449066;WS=47449048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	47451411	rs3736177	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=741;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CCTTGCCTGTCGCACAGGGAG;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=50;WE=47451419;WS=47451401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr3	47452087	rs900689	G	A	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=36;PP=1901;SC=AACCCATCCCGGCACAGCACC;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=100;WE=47452095;WS=47452077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
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chr3	47452786	rs1531875	G	A	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1616;ReadPosRankSum=0.091;SC=ACCCCTATGAGCATCCTGAGA;SOR=0.637;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=199;TCF=113;TCR=86;TR=101;WE=47452794;WS=47452776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr3	47453216	rs11707038	G	A	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GCAGTGTGGGGTGGCAGGGCA;SOR=0.932;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=69;WE=47453224;WS=47453206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr3	47454399	rs6789730	G	A	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.25;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	47456225	rs6442066	T	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=28;PP=1148;SC=CTGTTCTTCATCAGGACTCTT;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=50;WE=47456233;WS=47456215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	47459679	rs12487736	C	T	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=959;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CACACGCAGACGTGGCCTGCC;SOR=0.771;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=144;TCF=97;TCR=47;TR=67;WE=47459687;WS=47459669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr3	47462200	rs900690	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=381;SC=GCGTTGGCTGTCCCACTGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=47462208;WS=47462190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	47462587	rs900691	A	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=84;PP=2514;SC=GAGGAGCAGTACCCGGACTGC;SOR=2.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=28;TCR=84;TR=112;WE=47462595;WS=47462577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	47464122	rs1038394	A	G	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1039;ReadPosRankSum=1.736;SC=GAGGCATGGCAAGGCCCCCCA;SOR=0.484;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=69;WE=47464130;WS=47464112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,75:0.55:137
chr3	47539751	rs2170814	T	C	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=64;PP=2123;SC=GCAAGAAGCCTGTTGCCCAGG;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=105;WE=47539759;WS=47539741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	47539969	rs13059519	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=0.288;SC=GGAAAGGACACCCAGAGTCAG;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=36;WE=47539977;WS=47539959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr3	47543389	rs3816779	G	A	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=784;ReadPosRankSum=-2.776;SC=CTCTACAGATGTTTATCAAGG;SOR=1.347;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=89;TCF=19;TCR=70;TR=40;WE=47543397;WS=47543379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr3	47555142	rs2291298	C	A	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.761;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=66;PP=1738;ReadPosRankSum=1.987;SC=ACGACGGAGGCTGGAGAGCAA;SOR=0.905;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=260;TCF=116;TCR=144;TR=111;WE=47555150;WS=47555132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,138:0.45:306
chr3	47604299	rs4858839	C	T	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=194;SC=CATACAGCAACCAAATAATAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=47604307;WS=47604289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	47614413	rs2280567	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=0.550;SC=GGCAGCCACGGCCACAGTAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=3;WE=47614421;WS=47614403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	47618953	rs3732530	C	A	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1156;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAGCTCTGGCCCTTGAGGGTC;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=77;WE=47618961;WS=47618943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,86:0.49:175
chr3	47676861	rs62262088	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=1.430;SC=GCTTTGTTACTAGCGTGCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=47676869;WS=47676851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	47676902	rs3216712	C	CA	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	47680066	rs12633923	C	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=2;PP=1024;SC=ATATTATATCCTGTGAGAACT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=47680074;WS=47680056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	47680119	rs12636863	T	C	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1031;ReadPosRankSum=-2.440;SC=TAGAATTATTTAGAGTCCCCT;SOR=1.116;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=134;TCF=88;TCR=46;TR=62;WE=47680127;WS=47680109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,70:0.49:143
chr3	47712202	rs1141601	T	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=632;ReadPosRankSum=0.228;SC=CACTAGCACCTTTACTCTAAG;SOR=1.109;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=42;WE=47712210;WS=47712192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr3	47734700	rs12635438	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=0.790;SC=GACAGAAAGCACAGACCAGTG;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=31;WE=47734708;WS=47734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr3	47762030	rs12495204	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=-1.295;SC=AAAAGACTCCATAAGTGAGAA;SOR=0.188;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=16;WE=47762038;WS=47762020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	47770380	rs6442081	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.064;SC=CAGCCTGGGCGACAGACTCCA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=47770388;WS=47770370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	47777467	rs62262133	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=1.412;SC=TAGAGGCTTACAACTACAAAA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=47777475;WS=47777457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr3	47894881	rs67063081	CGAG	C	431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.694;NF=0;NR=8;PP=268;ReadPosRankSum=2.304;SC=CAGGGTCAGTCGAGGGGGGGA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=47894891;WS=47894871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
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chr3	47956424	rs1137524	C	T	2778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=1824;ReadPosRankSum=1.263;SC=GTTCCTGTGACGGTTTCTAAA;SOR=0.753;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=228;TCF=113;TCR=115;TR=112;WE=47956432;WS=47956414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,131:0.49:265
chr3	47956506	rs11707679	T	C	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=50;PP=1183;ReadPosRankSum=0.400;SC=AGAAATTGGATATGGGATTAG;SOR=0.863;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=175;TCF=66;TCR=109;TR=75;WE=47956514;WS=47956496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,89:0.46:194
chr3	47957996	rs2230169	C	G	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ACCTCTGTTTCTGAGGACAAA;SOR=0.792;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=69;WE=47958004;WS=47957986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr3	47958037	rs1060407	G	T	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TATTTCTGTGGATGATATAAT;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=144;TCF=81;TCR=63;TR=77;WE=47958045;WS=47958027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,92:0.55:167
chr3	48019232	rs6770467	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=258;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CTCCAACAAGAACACTACCAC;SOR=0.409;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=15;WE=48019240;WS=48019222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr3	48019258	rs6770477	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=511;ReadPosRankSum=0.110;SC=GAAATAATTCATATGCTTCCA;SOR=0.324;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=33;WE=48019266;WS=48019248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr3	48040283	rs11711953	C	T	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=1752;ReadPosRankSum=1.219;SC=AATGAAGTCCCGCTTTATCTC;SOR=0.476;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=204;TCF=93;TCR=111;TR=105;WE=48040291;WS=48040273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,115:0.49:236
chr3	48209486	rs3731539	C	T	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=86;PP=2582;SC=ATGGAACTTCCGAAAACATTC;SOR=1.355;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=47;TCR=87;TR=133;WE=48209494;WS=48209476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	48219320	rs3731514	AAC	A	6502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.186;NF=45;NR=93;PP=2993;ReadPosRankSum=1.474;SC=AACAAATAGGAACACACACAC;SOR=0.946;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=166;TCF=60;TCR=106;TR=138;WE=48219331;WS=48219310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,239:0.99:241
chr3	48225509	rs3731503	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.191;SC=AACACTAGACTTCTAGGTGAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=48225517;WS=48225499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	48309270	rs73072383	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.094;SC=AATGAAAATATAGGTCCTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=48309278;WS=48309260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	48414197	rs9852211	A	T	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=25;PP=1351;SC=GGCAAAGCCTATAAATTCAGA;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=62;WE=48414205;WS=48414187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	48414215	rs9815103	G	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=546;ReadPosRankSum=-1.456;SC=AGAGCAGCCCGGAGAGGAGAA;SOR=0.533;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=34;WE=48414223;WS=48414205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr3	48415007	rs4858793	C	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=378;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TGACTGAGAACAGCCTGATGG;SOR=1.385;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=18;WE=48415015;WS=48414997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr3	48416756	rs4858817	A	G	148.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CCTTCCTAAGAGGGTACAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=48416764;WS=48416754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr3	48419723	rs7630741	G	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.937;SC=TTTGGAAGAGGCTTCCAAATA;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=48419731;WS=48419713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	48419897	rs6442117	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=562;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CACTATGGATCGGAAAAAAAC;SOR=1.149;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=38;WE=48419905;WS=48419887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr3	48422235	rs6784322	T	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=460;ReadPosRankSum=1.460;SC=GAAGGCAGTGTTCCTCTGTCT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=29;WE=48422243;WS=48422225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr3	48450706	rs3217706	TC	T	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CCCTCACCCATCCCCCCCGTG;SOR=0.765;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=48450714;WS=48450696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	48451300	rs3214871	AG	A	910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.612;NF=7;NR=14;PP=692;ReadPosRankSum=0.590;SC=CTACCTTGGCAGGCCCCACCC;SOR=0.844;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=21;WE=48451308;WS=48451290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr3	48454468	rs3214041	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1392;ReadPosRankSum=1.318;SC=GCCCATTCTCCCAGCCACACC;SOR=0.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=186;TCF=74;TCR=112;TR=82;WE=48454476;WS=48454458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,93:0.44:211
chr3	48455626	rs6794875	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CCAGTCACACAGTGTCCTCCA;SOR=0.420;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=48455634;WS=48455616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	48461313	rs2362450	C	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=580;ReadPosRankSum=1.116;SC=CTACCTCTGACGGTGACAGCG;SOR=0.395;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=36;WE=48461321;WS=48461303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr3	48462461	rs11130171	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=0.040;SC=AAGAGGACCCAGGATGAGGGA;SOR=0.180;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=12;WE=48462469;WS=48462451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
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chr3	48463711	rs9883927	T	C	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=955;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CTCCCAGCAGTCATGCCCTGG;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=60;WE=48463719;WS=48463701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr3	48474249	rs2279077	A	G	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=996;ReadPosRankSum=-0.848;SC=AGGCCCCTCAAGTCCACCATG;SOR=0.816;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=63;WE=48474257;WS=48474239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr3	48476431	rs13062723	C	G	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=73;PP=2919;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CTGGGCTGCACAGAGTCCTGG;SOR=0.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=128;WE=48476439;WS=48476421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr3	48481647	rs3774808	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=346;ReadPosRankSum=-1.312;SC=GTCTACGACAGAGGGTGGGGC;SOR=1.095;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=26;WE=48481655;WS=48481637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr3	48505302	rs6442124	A	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=0.928;SC=TGGGGCGGGCATCTAGACTGC;SOR=0.576;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=23;WE=48505310;WS=48505292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr3	48505964	rs2242150	C	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=980;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GATGGAACCACTCTGTTCTTG;SOR=0.796;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=70;WE=48505972;WS=48505954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr3	48508585	rs11797	C	T	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.971;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=57;PP=1766;ReadPosRankSum=-1.727;SC=GGAAGAGCTACAGCCTAGGCA;SOR=0.459;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=259;TCF=117;TCR=142;TR=115;WE=48508593;WS=48508575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,142:0.46:309
chr3	48510210	rs3135952	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=417;ReadPosRankSum=0.275;SC=GGCCACCTCACAGGGTGCCCC;SOR=0.506;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=26;WE=48510218;WS=48510200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr3	48515079	rs4858795	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GCTATGGCTCCTGTAGCTCTT;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=48515087;WS=48515069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	48576483	rs7615170	C	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=273;SC=GGTTACGAGGCGGAGGTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=48576491;WS=48576473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	48602523	rs138595277	G	GGGC	6563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=65;PP=2924;SC=AGACCCCGCTGGCAGCCCCCC;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=92;WE=48602531;WS=48602513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr3	48604016	rs17256786	C	G	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=404;ReadPosRankSum=0.482;SC=ACAGATGGGACCAGGCTGTGA;SOR=0.467;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=34;WE=48604024;WS=48604006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,46:0.37:125
chr3	48604059	rs41290686	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=479;ReadPosRankSum=-0.793;SC=AAGTCACCCCGATCTCTGACC;SOR=0.877;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=39;WE=48604067;WS=48604049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,53:0.34:158
chr3	48624611	rs2255532	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1092;ReadPosRankSum=1.148;SC=CTTCCCACTACGCCCACTATA;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=72;WE=48624619;WS=48624601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr3	48625266	rs1264194	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=884;ReadPosRankSum=-0.002;SC=CTTCTCCAGCTGGCCCTAGGA;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=79;WE=48625274;WS=48625256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,100:0.57:176
chr3	48658467	rs3895736	C	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=575;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GATGCTGAGACCAGGACCAAG;SOR=3.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=26;WE=48658475;WS=48658457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr3	48659009	rs9834639	G	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=728;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CTTGCTCCAGGGCCCAGCCAG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=49;WE=48659017;WS=48658999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr3	48663046	rs7631574	C	T	152.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.282;SC=CTCCCGAGTCCTTCCTACACC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=48663054;WS=48663036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr3	48663345	.	G	T	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=469;ReadPosRankSum=0.090;SC=ACCTGGAGGCGGCCTAGGGGT;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=27;WE=48663353;WS=48663335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr3	48666923	rs2276852	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=164;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AGAGGGGGTCATAGACCTAAA;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=12;WE=48666931;WS=48666913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	48668394	rs3821876	G	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=666;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CATACACTTGGATGCCTCCTA;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=40;WE=48668402;WS=48668384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr3	48669447	rs13324142	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=787;ReadPosRankSum=0.063;SC=TAGGTGACCACGAAGCCGAAG;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=51;WE=48669455;WS=48669437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
chr3	48669648	rs2276850	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AAGTGGTGGTGGGGGGCACAT;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=71;WE=48669656;WS=48669638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,88:0.47:188
chr3	48670827	rs34368826	G	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=925;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GGAGCACCTAGGGACATGATA;SOR=0.649;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=59;WE=48670835;WS=48670817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,71:0.41:173
chr3	48672693	rs66952042	CCGAGGCGTCGCAAGCGGAGAATGCCTGCTCCAG	C	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.528;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr3	48675856	rs13096357	C	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TAGACTCAGCCAGGCTCCTTG;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=48675864;WS=48675846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	48678011	rs2310997	G	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=0.748;SC=GGAAGAAAATGGGGGGCAGGG;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=9;WE=48678019;WS=48678001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr3	48678971	rs9878063	T	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=390;ReadPosRankSum=0.875;SC=TGGAGCCAGGTCAGGTTACAG;SOR=0.453;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=26;WE=48678979;WS=48678961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	48681053	rs9868809	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=-0.851;SC=CTGCCAGGAGCCCAAAGAGCC;SOR=0.476;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=50;WE=48681061;WS=48681043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr3	48681765	.	CAG	C	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.42;NF=0;NR=4;PP=75;QD=20.0;SC=CCGGGCAGGGCAGAGAGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=48681774;WS=48681755;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	48682658	rs34638686	C	T	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GGCAGGGGGGCGTGTCAGGAC;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TCR=64;TR=79;WE=48682666;WS=48682648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,89:0.56:158
chr3	48688114	rs73078349	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=-1.151;SC=CCCACTGCCCGCCACTCCTGC;SOR=0.732;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=9;WE=48688122;WS=48688104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	48689192	rs2286652	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=186;ReadPosRankSum=-0.082;SC=TGGTCGCAGAGCATGGAAGGA;SOR=0.260;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=16;WE=48689200;WS=48689182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr3	48689787	rs12107418	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=477;ReadPosRankSum=0.474;SC=CCACTTGAATACTGCCTTTCA;SOR=0.358;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=32;WE=48689795;WS=48689777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr3	48690110	rs2302295	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=468;ReadPosRankSum=-1.525;SC=GGACCCACAGTAGACCTTAAT;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=28;WE=48690118;WS=48690100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr3	48691316	rs12107252	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=717;ReadPosRankSum=-1.729;SC=CTTACTAAGCTGACAGTCTTT;SOR=0.672;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=56;WE=48691324;WS=48691306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,59:0.36:165
chr3	48694038	.	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=1.093;SC=AGGCCGTGGCCTCAGAAGTGA;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=10;WE=48694046;WS=48694032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	48694147	rs2286651	G	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=15;PP=979;ReadPosRankSum=-0.056;SC=AGCGCGGGCGGCAGACGCACG;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=59;WE=48694155;WS=48694137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr3	48697654	rs3821875	C	G	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=1428;ReadPosRankSum=1.389;SC=CCCCTGGGTGCTGATGGCAAA;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=96;TCR=117;TR=89;WE=48697662;WS=48697644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,111:0.43:258
chr3	48699519	rs3733086	C	T	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=1753;ReadPosRankSum=0.609;SC=AGGACACCGGCTTGGGACCGT;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=102;TCR=121;TR=110;WE=48699527;WS=48699509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,121:0.47:255
chr3	48709758	.	GA	G	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=1.775;QD=1.95;ReadPosRankSum=1.799;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr3	48719453	rs34096717	A	C	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1490;ReadPosRankSum=-2.511;SC=CCTCCACCTGAATTCCCCTAA;SOR=0.607;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=94;WE=48719461;WS=48719443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,109:0.47:232
chr3	48719637	rs9883469	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=725;ReadPosRankSum=0.622;SC=CATCTAGAGCGTCAGCGAGGC;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=46;WE=48719645;WS=48719627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr3	48720303	rs9812977	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=0.842;SC=CATGCTCACCGGGAGGTCCCA;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=48720311;WS=48720293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	48725707	rs1048940	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=632;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CTAGCAAGCTCACTCCCCACT;SOR=0.440;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=42;WE=48725715;WS=48725697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr3	48732223	rs11557629	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=747;ReadPosRankSum=1.701;SC=CGTCCCCCCAGTGGGGGACTA;SOR=0.830;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=71;TCR=18;TR=43;WE=48732231;WS=48732205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr3	48732480	rs17080319	T	C	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1164;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATCTCTCACATCTCCTCGCCA;SOR=0.529;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=66;WE=48732488;WS=48732470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
chr3	48752654	rs11708786	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=479;ReadPosRankSum=-0.016;SC=ATTTGTTACCCAAGATTATCC;SOR=0.719;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=27;WE=48752662;WS=48752644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr3	48754877	rs9834996	G	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=1.118;SC=CTGACGGGCGGTTGGGTGGAT;SOR=1.473;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=48754885;WS=48754867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr3	48897078	rs6414612	A	G	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=61;PP=2085;SC=TGGCAAGAAAAAGGTGAATTA;SOR=1.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=48897086;WS=48897068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	48982732	rs9864243	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GAGAGCTTCAGCCAGCTAGAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=48982740;WS=48982722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	49008048	rs373542476	G	A	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1039;ReadPosRankSum=1.473;SC=AGCTCCAGCTGTGCCCTGGTG;SOR=0.583;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=88;TCR=49;TR=74;WE=49008056;WS=49008038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
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chr3	49139406	rs35673421	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=0.762;SC=ACAGAACTGAGTAGACCCCTA;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=18;WE=49139414;WS=49139396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
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chr3	49148890	rs4292260	T	C	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.934;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1646;ReadPosRankSum=-1.153;SC=CCATCCTCCCTTATCCTCCTC;SOR=0.909;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=107;WE=49148898;WS=49148880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,116:0.39:295
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chr3	49156473	rs11552724	C	G	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1037;ReadPosRankSum=0.831;SC=GGATCTCCATCCTTGCTCTCC;SOR=0.463;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=71;WE=49156481;WS=49156463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,82:0.42:196
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chr3	49213030	rs11713297	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=-0.047;SC=TCTCTCTCCTTCTTGCAGGAA;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=15;WE=49213038;WS=49213020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
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chr3	49249381	rs9867285	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=139;ReadPosRankSum=-1.817;SC=AGATCACAAGATCAGGAGATC;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=49249389;WS=49249371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	49269758	rs2099526	G	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.000;NF=11;NR=21;PP=498;ReadPosRankSum=1.562;SC=AATCTAGCATGATTGACTTTA;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=32;WE=49269766;WS=49269748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr3	49294250	rs13068038	C	A	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1628;ReadPosRankSum=0.190;SC=GGGGGAAAGACAAGAAGCAGC;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=102;TCR=104;TR=99;WE=49294258;WS=49294240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,114:0.47:242
chr3	49298139	rs7626076	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=666;ReadPosRankSum=2.739;SC=CGGGACACCTGTGGCAGGGCT;SOR=0.382;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=43;WE=49298147;WS=49298129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr3	49298205	rs4955417	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=757;ReadPosRankSum=1.036;SC=GGGCCTCTGGTGGCCTGTAGG;SOR=0.702;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=54;WE=49298213;WS=49298195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,63:0.45:139
chr3	49313978	rs13077498	C	T	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1452;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGTTTTCTCTCGGGGCACAGA;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=83;WE=49313986;WS=49313968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,100:0.57:176
chr3	49322027	rs2304442	T	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=582;ReadPosRankSum=1.777;SC=CCTATGGGAATCAAAGCACTC;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=44;WE=49322035;WS=49322017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,48:0.68:71
chr3	49343175	rs2230929	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=471;ReadPosRankSum=1.655;SC=CCACATGGGCGTCCCTTCCAG;SOR=1.075;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=32;WE=49343183;WS=49343165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr3	49362369	rs56038006	C	T	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.640;SC=TGTTGTCTAGCTTGCTCAACT;SOR=0.943;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=72;WE=49362377;WS=49362358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr3	49373045	rs34514189	A	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=778;ReadPosRankSum=-1.628;SC=GAGAGACAGAAATTTACTGTA;SOR=0.429;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=51;WE=49373053;WS=49373035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
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chr3	49395757	rs1800668	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.859;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	49406095	rs11716445	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=550;ReadPosRankSum=1.468;SC=ATGGCAGACGGTCTAAAACAG;SOR=0.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=35;WE=49406103;WS=49406085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr3	49450449	rs6779524	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=1.564;SC=CAGATTCCCACCCCAGCCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=19;WE=49450457;WS=49450439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr3	49455330	rs11715915	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=508;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CCACACGCCTCCGCTGCACCC;SOR=1.837;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=26;WE=49455338;WS=49455320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr3	49463926	rs6762593	A	G	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=53;PP=1485;SC=AAGCTCAAAGATCAAAGGTGC;SOR=1.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=49463934;WS=49463916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	49548008	rs2131107	C	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=15;PP=1025;SC=CTGCCCCTCTCGGGGAGGACC;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=49548016;WS=49547998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	49548294	rs2329024	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=75;PP=2395;SC=GAGTTCTCATTTTCCATTTTA;SOR=1.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=107;WE=49548302;WS=49548284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	49568095	rs2311801	G	A	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=111;SC=TCTCTAGGGGGGAGGAATCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=49568103;WS=49568085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	49570200	rs1801143	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1230;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TCTACCTGCACACAGTCATTC;SOR=1.033;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=76;WE=49570208;WS=49570190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,87:0.49:177
chr3	49689210	rs34762726	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.071;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=386;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CCAGGGCCTGGCCCCAAGTGA;SOR=1.155;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=23;WE=49689218;WS=49689200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr3	49690199	rs4855885	G	A	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1069;ReadPosRankSum=1.552;SC=TCCGCAGCACGGCCCGCAAGA;SOR=0.364;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=67;WE=49690207;WS=49690189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr3	49690496	rs11709525	C	T	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1612;ReadPosRankSum=1.033;SC=AGACACCCTCCGGCAGCTCCA;SOR=0.533;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=179;TCF=85;TCR=94;TR=95;WE=49690504;WS=49690486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,124:0.53:236
chr3	49701983	rs9858542	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GCAAACTGACGGAAGGTATGC;SOR=1.227;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=35;WE=49701991;WS=49701973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,37:0.34:110
chr3	49713753	rs6778597	T	C	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=22;PP=2166;SC=GCACTAGCTTTTAGGAAGCAG;SOR=2.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=90;WE=49713761;WS=49713743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	49714225	rs1131095	T	C	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1648;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CCCTGTATTATGTGGACCTCA;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=118;TCR=120;TR=128;WE=49714233;WS=49714215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,146:0.53:273
chr3	49719729	rs9822268	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.375;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=0.553;SC=AGAGCGTCGAGGGGGCTGGGA;SOR=0.032;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=49719737;WS=49719719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr3	49721532	rs3197999	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.025;NF=25;NR=30;PP=833;ReadPosRankSum=-0.679;SC=GCTGGCCAGCGGGACCTTGCG;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=55;WE=49721540;WS=49721522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr3	49721798	rs13085791	C	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.704;NF=25;NR=14;PP=620;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TCTCACTCTCCCGCACACGTC;SOR=0.756;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=39;WE=49721806;WS=49721788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr3	49722356	rs9837520	G	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.892;NF=18;NR=17;PP=437;ReadPosRankSum=0.999;SC=GTGACTCTCAGTCCATTGCCC;SOR=0.677;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=35;WE=49722364;WS=49722346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,39:0.32:120
chr3	49723735	rs184629099	C	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQRankSum=-4.221;QD=4.62;ReadPosRankSum=2.752;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	49723823	rs7431215	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQRankSum=-4.339;QD=1.57;ReadPosRankSum=-1.810;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,12:0.18:65
chr3	49724808	rs3020779	T	C	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=58.88;MQRankSum=-5.583;NF=37;NR=46;ReadPosRankSum=0.807;SC=TGTGATCATTTGGGAACTTGT;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=83;WE=49724816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,93:0.45:206
chr3	49725948	rs141881740	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQRankSum=-3.524;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.266;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr3	49726028	rs62262685	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQRankSum=-3.247;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr3	49726070	rs62262686	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQRankSum=-1.340;QD=2.89;ReadPosRankSum=-2.562;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
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chr3	49739507	rs1491985	G	C	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=914;ReadPosRankSum=0.946;SC=TTCCTCACCTGACCTCCAGTG;SOR=0.313;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=58;WE=49739515;WS=49739497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,80:0.61:131
chr3	49744392	rs3749241	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=441;ReadPosRankSum=0.495;SC=GTCTAGCAAGATTGTGCCAGG;SOR=0.142;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=26;WE=49744400;WS=49744382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr3	49749976	rs34823813	G	A	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1016;ReadPosRankSum=0.534;SC=CACGGTGATCGCACAGGGTCT;SOR=0.529;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=74;WE=49749984;WS=49749966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,105:0.44:236
chr3	49750188	rs3749240	T	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=421;ReadPosRankSum=0.929;SC=AGCAACACACTTCTGTGGGGG;SOR=0.271;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=29;WE=49750196;WS=49750178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr3	49753003	rs34614773	T	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.142;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=9;PP=844;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CCTGTCCCCCTGCAGAGCCCT;SOR=1.023;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=77;TCR=16;TR=55;WE=49753011;WS=49752993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,56:0.58:96
chr3	49753788	rs11720705	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=790;ReadPosRankSum=-0.760;SC=AAGCAGGAGCATGTGGGTGGC;SOR=1.013;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=57;WE=49753796;WS=49753778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr3	49760039	rs1466685	T	C	4147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=61;PP=2357;SC=CTGGATGCGCTGCAGCACTGC;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=130;WE=49760047;WS=49760029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	49785133	rs7374183	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=2.552;SC=AAGTGACTTCGTGCTTTGAGA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=49785141;WS=49785123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	49832261	rs6802890	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=0.244;SC=ACTGCAACACAGGTTGGCTCG;SOR=0.173;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=13;WE=49832269;WS=49832251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr3	49834571	rs6809879	A	G	285.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=194;ReadPosRankSum=1.143;SC=GCACCTGCCTACACCCAATTT;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=12;WE=49834579;WS=49834561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr3	49842625	rs2234391	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TCTATCGTCCATCCTCTCTGC;SOR=0.825;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=9;WE=49842633;WS=49842615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr3	49842881	rs11400401	T	TG	802.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.651;NF=2;NR=22;PP=819;ReadPosRankSum=0.862;SC=CTGGTAGGGGTGGGTTTAGGG;SOR=0.887;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=24;WE=49842889;WS=49842871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr3	49843723	rs3819325	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	49847642	rs1799844	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TGGGTCAGAAGTGGGACTGGC;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=67;WE=49847650;WS=49847632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,84:0.58:146
chr3	49848414	rs28535523	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=555;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CCCAGGCTCTCACCAGGGCAC;SOR=0.515;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=39;WE=49848422;WS=49848404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr3	49866584	rs35129566	T	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1172;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GAGAAGGCACTGTCTTCACCC;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=102;TCR=70;TR=83;WE=49866592;WS=49866574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,93:0.48:192
chr3	49877585	rs9858428	G	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.239;SC=GGCACACCCTGACCCAGGAGG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=49877593;WS=49877575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	49877638	.	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=472;ReadPosRankSum=1.741;SC=CAAGGGTCCTGGGCAGAGATA;SOR=1.078;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=26;WE=49877646;WS=49877628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr3	49878264	rs1996663	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=0.496;SC=AGGCCAATGCCCAGTAAGGAC;SOR=0.859;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=49878272;WS=49878254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr3	49878395	rs1996664	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=863;ReadPosRankSum=0.320;SC=TTCTCCTTCAACCTCTGTTCA;SOR=0.934;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=55;WE=49878403;WS=49878385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr3	49881134	rs2246832	A	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=430;ReadPosRankSum=1.317;SC=AACCAAGGTGATGACTGGAGC;SOR=0.502;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=31;WE=49881142;WS=49881124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr3	49884852	rs146175744	AAAGAG	A	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	49897830	rs2681780	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=360;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GCACCCCTTCCAGGCCTCAAA;SOR=0.257;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=20;WE=49897838;WS=49897820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr3	49898000	rs2777888	A	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1184;ReadPosRankSum=0.403;SC=CAAAACCAAGAAGGGGATAGT;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=63;TCR=76;TR=74;WE=49898008;WS=49897990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr3	49898273	rs2681781	A	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=667;ReadPosRankSum=-1.720;SC=AGAAAGGTGGATTGCCTGAAA;SOR=0.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=44;WE=49898281;WS=49898263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,53:0.43:124
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chr3	49928691	rs7433231	T	C	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=60;PP=2361;SC=TACTCCATGCTGCGGGCTACC;SOR=0.834;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=49928699;WS=49928681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	49936102	rs2230590	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GCCAGGGCCTTGGATAGGTAC;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=26;WE=49936110;WS=49936092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr3	49940078	rs2230593	C	T	2609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1632;ReadPosRankSum=-1.090;SC=GTGGGCCACCCGCAGCACAGG;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=195;TCF=85;TCR=110;TR=101;WE=49940086;WS=49940068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,117:0.53:222
chr3	49948320	.	G	C	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=833;ReadPosRankSum=0.751;SC=GTAGCCATCTGAGAGCGGGAC;SOR=1.342;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=47;WE=49948328;WS=49948310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr3	49949071	rs868891	A	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=637;ReadPosRankSum=0.114;SC=GGGAGTACACAGGCTTCCCTG;SOR=0.992;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=46;WE=49949079;WS=49949061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr3	49978069	rs6772095	C	T	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=76;PP=1799;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TAGCACGTAGCCTCGTCCTCA;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=242;TCF=85;TCR=157;TR=115;WE=49978077;WS=49978059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,126:0.48:263
chr3	50103917	rs2023953	G	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=734;ReadPosRankSum=2.410;SC=AACACCAGCAGCTGTCAGACC;SOR=0.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=50;WE=50103925;WS=50103907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr3	50114515	rs7061	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=1.196;SC=ACGAGACTTACCGAGATGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=34;WE=50114523;WS=50114505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr3	50129374	rs5848907	T	TA	1084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=1122;SC=ACTATTTGGATTATCTTATAA;SOR=5.211;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=50129382;WS=50129364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	50129399	rs2013208	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.342;NF=23;NR=7;PP=485;ReadPosRankSum=-0.620;SC=ATCTGTGGGCCGTGTGTATTT;SOR=0.322;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=30;WE=50129407;WS=50129389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr3	50144667	rs3216783	C	CT	877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.041;NF=5;NR=21;PP=659;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GTAAATTTCCCTTTTTTTAGT;SOR=0.551;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=26;WE=50144675;WS=50144657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr3	50144951	rs1061474	T	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=917;ReadPosRankSum=-1.029;SC=GCGTCAGCGCTTTCTCTGTAG;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=54;WE=50144959;WS=50144941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,57:0.37:154
chr3	50148305	rs2301166	C	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.741;SC=ATATATGACTCAGATTAGTTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=50148313;WS=50148295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	50153356	rs1138536	T	C	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=747;ReadPosRankSum=-2.569;SC=TGGACATCTATCGACGATCCA;SOR=0.719;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=44;WE=50153364;WS=50153346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr3	50197097	rs1046953	C	T	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1206;ReadPosRankSum=1.420;SC=CCCTACTGACCGGGGCCTGGC;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=80;WE=50197105;WS=50197087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,99:0.52:191
chr3	50212512	rs2624833	G	T	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=913;ReadPosRankSum=-1.791;SC=TCTAACCCCTGTTCCTCGTCT;SOR=0.911;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=65;WE=50212520;WS=50212502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
chr3	50222926	rs1046956	T	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=432;ReadPosRankSum=0.325;SC=TGACCAGGAGTTGGAGGAGCT;SOR=0.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=29;WE=50222934;WS=50222916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr3	50223593	rs2073726	T	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=928;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTAGGGGAGTCTTATGGGTA;SOR=0.621;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=53;WE=50223601;WS=50223583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr3	50223977	rs11717349	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.925;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=1.131;SC=CCCTCGGTGCCTGCCCCGAAG;SOR=1.550;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=16;WE=50223985;WS=50223965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr3	50224225	rs12632110	A	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.000;NF=24;NR=21;PP=680;ReadPosRankSum=1.003;SC=GAGTCCTTGCACAGTGGTGAA;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=45;WE=50224233;WS=50224215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr3	50225029	rs11711407	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=590;ReadPosRankSum=-1.146;SC=TGGAAATCCCACATGGGTGCC;SOR=0.944;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=36;WE=50225037;WS=50225019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr3	50251833	rs5848902	A	AG	4635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=53;PP=2936;SC=CTGTGCCTACAGGTCGAGGAC;SOR=0.895;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=87;WE=50251841;WS=50251823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	50255663	rs35926495	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.407;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr3	50255666	rs56048629	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr3	50306752	rs67324803	G	GC	2310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=38;PP=1690;SC=GCCGCCCCCAGCCCCCACGCC;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=43;WE=50306760;WS=50306742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	50308040	rs55689339	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.551;SC=GCAGGGAGGTCGAGGTGGCTG;SOR=0.049;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=50308048;WS=50308030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	50308718	rs4688739	A	G	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=613;SC=AACCTCACTCACTCCCAGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=50308726;WS=50308708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	50329826	rs1076872	A	G	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=58;PP=2917;SC=GCCACACGCCACGCGCGCCAC;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=100;TCR=58;TR=158;WE=50329834;WS=50329816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	50332697	rs13100173	G	A	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=44;PP=2271;SC=AGGCTGTGGTGGATCTGGTAG;SOR=1.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=113;WE=50332705;WS=50332687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	50357869	rs709210	A	C	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=43;PP=1381;SC=ATGGCCCATGACACCGCCAGC;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=50357877;WS=50357859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	50387873	rs73082914	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=604;ReadPosRankSum=-1.795;SC=TCTGACTATCCTCTAGCCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=26;WE=50387881;WS=50387863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr3	50513613	rs41291734	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.402;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CTCCAGACGCCGGGCCCAGTG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=24;WE=50513621;WS=50513603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr3	50597092	rs1034405	G	A	6343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=102;PP=2965;SC=GGCCACTCACGCATGGATGGC;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=89;TCR=102;TR=191;WE=50597100;WS=50597082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr3	50598396	rs41291736	G	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=1014;ReadPosRankSum=-1.449;SC=CAGAGGCGGCGTCCCGCCCAT;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=72;WE=50598404;WS=50598386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,85:0.51:167
chr3	50609123	rs636168	T	C	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=38;PP=2462;SC=CAGCCACTTATATTCTCTGTG;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=86;TCR=38;TR=124;WE=50609131;WS=50609113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	50609624	rs2232248	T	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=51;PP=1935;SC=TGTTTATTCCTCGGCCAGAAA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=91;WE=50609632;WS=50609614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	50645635	rs621975	T	G	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=82;PP=2475;SC=ACCAATCCAGTGCAAGTCAAG;SOR=2.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=111;WE=50645643;WS=50645625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	50645793	rs622502	C	G	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=41;PP=2127;SC=TGCCTCCCCCCTCAGACTCAC;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=108;WE=50645801;WS=50645783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	50678001	rs608961	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=376;SC=CTCCCTGCCACGCTTCTAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=50678009;WS=50677991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	50683809	rs876105	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=36;PP=1055;SC=TCCCCCTCTTTCCAGCTATGG;SOR=1.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=50683817;WS=50683799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	50684489	rs4468971	A	G	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=27;PP=1480;SC=AGGATGGAGTAGGGGGAACCA;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=50684497;WS=50684479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	51246360	rs4301044	A	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=46;PP=1337;SC=CAGCACTTAGATTGGTTGGTG;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=51246368;WS=51246350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	51273711	rs1480362	A	G	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=19;PP=1936;SC=AAATTCATTGATTTATGGAAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=64;TCR=19;TR=83;WE=51273719;WS=51273701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	51273773	rs1480361	T	C	5138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=69;PP=2965;SC=TATGTTGTTTTAGTTTCTGCA;SOR=0.986;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=95;TCR=69;TR=163;WE=51273781;WS=51273763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	51274902	rs11386090	T	TA	2213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=1879;ReadPosRankSum=0.335;SC=CCTGATGGCTTACTCTCCATA;SOR=0.430;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=47;WE=51274910;WS=51274892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr3	51393706	rs35251332	C	CAG	3715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=38;PP=2905;SC=TCTAGGAAAACGGGCAGTACA;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=57;WE=51393714;WS=51393696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	51395571	rs1542574	C	T	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=267;SC=TCCAGACCTACGCCACAAACC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=51395579;WS=51395561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	51418348	rs2241784	G	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=725;SC=GGAGCTTGCTGCTGAAGAAAC;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=51418356;WS=51418338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	51422766	rs13091931	G	T	1031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.93;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr3	51460031	rs55798953	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TCAAGCTGTCGCATCAAGAGA;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=51460039;WS=51460021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	51468970	.	C	CA	39	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=55.85;NF=0;NR=3;PP=39;QD=14.0;SC=GATTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=3;WE=51468978;WS=51468960;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,3:0.16:19
chr3	51469107	rs4611808	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=26;PP=925;SC=TTTGTTAATACAAAACAAGCA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=51469115;WS=51469097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	51469248	rs35971989	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.553;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=2.058;SC=CAAAAAGTACAAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=51469256;WS=51469238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	51517625	.	T	TTG	262	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=62.65;NF=7;NR=0;PP=262;QD=37.8571428571;SC=TTAAACTAGTTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=51517633;WS=51517615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,7:0.58:12
chr3	51517678	.	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=364;ReadPosRankSum=0.617;SC=GAAATCTAGCGTATGAGTTGT;SOR=0.604;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=21;WE=51517686;WS=51517668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr3	51664773	rs376688588	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.640;NF=17;NR=16;PP=465;ReadPosRankSum=1.399;SC=TTGTGGACAGCAGTGAATCTG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=33;WE=51664781;WS=51664763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr3	51697493	rs904145	A	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=50;PP=1577;SC=CACCAAGCTGAAAGGCAGTGA;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=51697501;WS=51697483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	51738101	rs2518461	G	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=0.914;SC=AGACTCTCCAGCCCTCTTCCT;SOR=0.646;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=36;WE=51738109;WS=51738091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr3	51895850	rs986539	C	T	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=25;PP=1106;SC=CATTTATGTACTTCCCATTTA;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=51895858;WS=51895840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	51907736	rs7635409	A	G	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=31;PP=2089;SC=GGACACAGATATAGCAGACCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=100;WE=51907744;WS=51907726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	51908226	rs1505403	T	C	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=29;PP=1259;SC=CAGGGTATGCTAGGAAGGGGC;SOR=0.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=52;WE=51908234;WS=51908216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	51908430	rs6794320	T	C	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=85;PP=2965;SC=GCTACCTCATTCCATTTTCCA;SOR=0.913;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=154;WE=51908438;WS=51908420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	51911103	rs201734789	TTTTTC	T	347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;MQRankSum=0.000;QD=21.73;ReadPosRankSum=-1.530;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr3	51929360	rs34574240	GA	G	1125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1071;SC=GGGCTTTCAAGAAAAAAAGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=51929368;WS=51929350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	51936949	rs7635125	T	C	9865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=168;NR=136;PP=2965;SC=AGACACTAGCTACTAGCACTA;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=304;TCF=168;TCR=136;TR=304;WE=51936957;WS=51936939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr3	51978220	rs28547534	A	G	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=102;PP=2965;SC=TGCTGGAACCACTGGGGCCGT;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=77;TCR=102;TR=179;WE=51978228;WS=51978210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	51990119	rs28587738	A	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=13;PP=465;SC=CCTGCTCGGCACGCCGCCCGC;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=51990127;WS=51990109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	51990315	rs28651222	A	G	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=44;PP=1808;SC=TCCCGACTCCACTCGGACTCT;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=96;WE=51990323;WS=51990305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	52232979	rs3216487	A	ATTTAC	2023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.377;NF=3;NR=31;PP=1689;ReadPosRankSum=0.902;SC=TACTGTCAGTATTCATTTGGT;SOR=0.636;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=102;TCF=12;TCR=90;TR=34;WE=52232987;WS=52232969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,57:0.35:163
chr3	52236762	rs352169	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=0.607;SC=TAAGAGATGAGTTGTGAACCA;SOR=0.330;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=29;WE=52236770;WS=52236752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr3	52237970	rs352168	C	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=877;ReadPosRankSum=-1.585;SC=TCCAGGACATCATGCAAAAGC;SOR=1.036;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=55;WE=52237978;WS=52237960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr3	52238656	rs352167	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=305;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TTCACCAAAATGCAGCTGTGT;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=52238664;WS=52238647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	52238677	rs352166	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=404;ReadPosRankSum=0.372;SC=TTCACAACCACCATTCTGTAC;SOR=0.099;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=24;WE=52238685;WS=52238667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr3	52256697	rs352140	C	T	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=982;ReadPosRankSum=0.920;SC=CCTCCAGTCGCGGTAGCTCCG;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=63;WE=52256705;WS=52256687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr3	52258372	rs352139	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CCCCCAGCTCTACCTCCACCC;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=52258380;WS=52258362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	52264907	rs352143	T	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=840;ReadPosRankSum=-0.427;SC=AGTTGACCATTTTCTGCTTGA;SOR=0.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=49;WE=52264915;WS=52264897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr3	52266191	rs11717081	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TGCGCCTCCCGCTGCAGACCT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=7;WE=52266199;WS=52266181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr3	52272945	rs11441245	C	CG	740.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.366;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.456;NF=12;NR=10;PP=413;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GGCCGAGAGCCGGGGGGGGGC;SOR=1.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=22;WE=52272953;WS=52272935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr3	52279951	rs114645176	T	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=368;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CCCGCTTCCTTCGCGGCTCCA;SOR=0.997;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=25;WE=52279959;WS=52279941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr3	52293312	rs55847657	C	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1597;ReadPosRankSum=1.798;SC=TTCTTTTGTTCTTACAGAGCC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=112;TCR=112;TR=109;WE=52293320;WS=52293302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,124:0.45:274
chr3	52293859	rs3210487	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=-0.254;SC=AAGTTCGATCATACTGCATCT;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=23;WE=52293867;WS=52293849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr3	52325039	rs35976326	G	A	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1155;ReadPosRankSum=2.237;SC=ACAACCTCCCGGACCGCGATG;SOR=0.607;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=63;TCR=106;TR=72;WE=52325047;WS=52325029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,90:0.44:203
chr3	52325759	rs2276834	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=647;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CATTGTCTTGAGAGGTGGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=41;WE=52325767;WS=52325749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr3	52366044	rs34762015	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=453;ReadPosRankSum=0.969;SC=GTCAGAAGAGGGAAACAATTT;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=27;WE=52366052;WS=52366034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr3	52379420	rs11718125	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.924;SC=GCAGGAGTCATGGCCCTCCTT;SOR=2.115;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=52379428;WS=52379415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	52382822	rs7633687	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=1.700;SC=CCCTGCTCCTCGGGAGGACTC;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=11;WE=52382830;WS=52382812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	52383120	rs34355561	G	A	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=63;PP=1787;ReadPosRankSum=0.289;SC=GCCCATGCACGTCGGAGGGTG;SOR=0.953;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=227;TCF=100;TCR=127;TR=107;WE=52383128;WS=52383110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,126:0.47:270
chr3	52387078	rs35860312	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=442;ReadPosRankSum=-1.613;SC=GACTGGGAAGTGTCCCAAGAC;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=31;WE=52387086;WS=52387068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr3	52391473	rs57849650	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CTGTGGGGCTGATGGTTGCAG;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=14;WE=52391481;WS=52391463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	52391735	rs11714402	A	C	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=53;PP=1202;ReadPosRankSum=1.564;SC=GGAGACCAAGAGGAGCGCCTT;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=95;WE=52391743;WS=52391725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,114:0.49:235
chr3	52396944	rs11706515	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=605;ReadPosRankSum=0.066;SC=GAGGAGGGCCGGATGAAGCTG;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=34;WE=52396952;WS=52396934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr3	52400740	rs3752819	G	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=802;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CAGGCGGTCCGTCTCCCAGTG;SOR=0.541;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=47;WE=52400748;WS=52400730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr3	52404111	rs746239	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1443;ReadPosRankSum=1.381;SC=AGAACTGGGTGCCTACTCCCT;SOR=0.573;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=91;WE=52404119;WS=52404101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,103:0.45:227
chr3	52409421	rs56002041	A	G	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=812;ReadPosRankSum=-1.003;SC=ATCCTGGGCAACTGGTTGGGT;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=51;WE=52409429;WS=52409411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr3	52409931	rs371247102	A	G	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1761;ReadPosRankSum=1.246;SC=CAAGAGGTCCACCTAACCCTG;SOR=0.697;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=113;WE=52409939;WS=52409921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,136:0.50:273
chr3	52415865	rs770284	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=644;SC=GAGCGCCTCCAGGGCGTGCTG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=52415873;WS=52415855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	52417638	rs28481563	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=1.295;SC=CAGGCTGCGCTGGGGCAGCGG;SOR=0.437;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=4;WE=52417646;WS=52417628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	52420414	rs11720365	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.803;SC=CTGTCCTCAAGCCTTCCCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=52420422;WS=52420404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	52420901	rs11721277	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=290;ReadPosRankSum=0.857;SC=GCCAGCCAGCGAGTGAGGACA;SOR=1.232;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=19;WE=52420909;WS=52420891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr3	52428988	rs11708581	C	A	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1252;ReadPosRankSum=-1.172;SC=AGCTGCTAGTCCTCCGCTGCC;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=101;TCR=104;TR=96;WE=52428996;WS=52428978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,128:0.48:264
chr3	52430526	rs12163565	G	A	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=64;PP=1690;ReadPosRankSum=1.090;SC=AGTAGCCTTGGTGAAGACTTC;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=207;TCF=87;TCR=120;TR=114;WE=52430534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,133:0.55:243
chr3	52430698	rs365048	A	G	4542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=64;PP=2633;SC=CTGGAGCGCCATAAGTTTGGG;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=142;WE=52430706;WS=52430688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	52431671	rs390802	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=628;ReadPosRankSum=1.228;SC=GTAACTCTGAGGGCTGGGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=34;WE=52431679;WS=52431661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr3	52432214	rs11711974	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=552;ReadPosRankSum=1.118;SC=CCGAGTCAGCGGCCACTGGAC;SOR=0.881;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=35;WE=52432222;WS=52432204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr3	52453893	rs498778	C	T	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=893;SC=CCAACAGAGGCTTCCATGGAT;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=52453901;WS=52453883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	52454262	rs3886875	T	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=760;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AATAGAAAGATGTGCTACACT;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=55;WE=52454270;WS=52454252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,65:0.40:164
chr3	52471942	rs82825	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=400;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GGCCACAGGGGTGAGTTCCAG;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=29;WE=52471950;WS=52471932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr3	52475886	rs56380397	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.687;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=363;ReadPosRankSum=-1.939;SC=CACCGCCCCCGGCCACTTTCC;SOR=0.354;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=22;WE=52475894;WS=52475876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr3	52477080	rs2016575	T	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=818;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TTTCGGACCATGGCTCCTGGG;SOR=0.748;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=63;WE=52477088;WS=52477070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,81:0.47:173
chr3	52478783	.	CGCACACAAACACTGCACAT	C	759	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5005;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=58.23;NF=3;NR=6;PP=759;QD=87.4444444444;SC=ACTCGGCACACGCACACAAAC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=9;WE=52478809;WS=52478773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,9:0.82:11
chr3	52488202	rs1035002	C	T	138.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=80;SC=TGAGTCCCCACGTCCTCTGCC;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=52488210;WS=52488192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	52489627	rs1319202	G	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=746;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GCTAGTCTGCGCCGGGCGGCG;SOR=0.421;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=80;TCF=65;TCR=15;TR=45;WE=52489635;WS=52489617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr3	52491836	rs12629472	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=200;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CTTGCCACAAGGGCTGTTGGT;SOR=0.270;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=14;WE=52491844;WS=52491826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr3	52492085	rs4687614	G	A	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=685;SC=ATATAACTGCGTTCATTAATA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=52492093;WS=52492075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	52492707	rs1541495	T	C	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=54;PP=1846;SC=TTGATAAAAATCTGCTTCCGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=99;WE=52492715;WS=52492697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	52505758	rs3065763	G	GAT	3809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=25;PP=2400;SC=TGACAGAAAAGGTGGAAATCC;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=51;WE=52505766;WS=52505748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	52506282	rs4312651	A	G	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=18;PP=1008;SC=TGGGCATGCGACACTGTTCCC;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=52506290;WS=52506272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	52506426	rs6784615	C	T	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=913;SC=TAAGGCCCAGCGCTGCACAGC;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=52506434;WS=52506416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	52506491	rs6445486	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=681;SC=TGGGTGTCCTAATTTAATCAT;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=52506499;WS=52506481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	52510592	rs9856575	G	A	5264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=114;PP=2965;SC=CCACAACAGCGTCTCCGAGAT;SOR=1.597;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=52;TCR=114;TR=166;WE=52510600;WS=52510582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr3	52512318	rs2109559	A	G	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=47;PP=1955;SC=AGGACCTCACAGTTTTGGGAT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=52512326;WS=52512308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	52513940	rs4687618	T	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=551;SC=GGAGCCAGTTTGGGGGGCTTG;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=52513948;WS=52513930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	52518786	rs4687619	T	C	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=50;PP=1310;SC=CTCTGCTTTGTGCCACGGTCT;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=52518794;WS=52518776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	52519854	rs17263770	G	C	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=57;PP=1258;ReadPosRankSum=1.469;SC=GTAAGGAAGAGGTTGGAAAGG;SOR=0.992;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=99;WE=52519862;WS=52519844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,110:0.56:195
chr3	52523405	rs887515	C	T	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=572;ReadPosRankSum=-0.173;SC=CCGGCCCCAGCGGAAGTCCCA;SOR=1.068;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=37;WE=52523413;WS=52523395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr3	52524974	rs4687621	A	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=319;SC=CCACTTCTTAACCGGGGTGGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=52524982;WS=52524964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	52536308	rs758801	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.125;SC=CAGATGCAGTACCTACAACCA;SOR=0.193;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=52536316;WS=52536298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	52537840	rs376491747	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.899;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=811;ReadPosRankSum=0.073;SC=AACGCTTCTGCGGGCTGCTTC;SOR=0.553;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=61;WE=52537848;WS=52537830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,76:0.44:173
chr3	52537969	rs4687545	T	C	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=78;NR=90;PP=2965;SC=AAGCGTGCCCTCTGCGGGAAG;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=168;WE=52537977;WS=52537959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	52538300	rs7613444	G	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.255;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=2.641;SC=GGTGGCTGTGGGGGGTGCATG;SOR=0.118;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=20;WE=52538308;WS=52538290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr3	52540773	rs1010553	T	C	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=656;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CCGCCAATGGTGTGATCCACA;SOR=0.385;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=55;WE=52540781;WS=52540763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr3	52544470	rs9835659	A	G	3980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=85;PP=2609;SC=TGAGCTGGACATGAGAGGTGG;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=39;TCR=85;TR=124;WE=52544478;WS=52544460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	52546487	rs7644763	C	T	5197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=93;PP=2965;SC=CTGTCTTCCCCGTGCTTGGGA;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=84;TCR=93;TR=177;WE=52546495;WS=52546477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr3	52546820	rs2015971	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=707;ReadPosRankSum=0.685;SC=GCTCCTCCCGCCCCTGCTCCC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=47;WE=52546828;WS=52546810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
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chr3	52551284	rs67409736	G	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.336;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
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chr3	52553625	rs112646045	TGTAA	T	3564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.037;NF=8;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=1.019;SC=CACATGCACGTGTAAGTGTGT;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=16;TCR=124;TR=66;WE=52553636;WS=52553615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,93:0.49:191
chr3	52554304	rs7630214	G	C	7793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=124;PP=2965;SC=CCGAACGCGGGCCGTGAGTCT;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=113;TCR=124;TR=237;WE=52554312;WS=52554294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr3	52555316	rs13081028	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-1.586;SC=CTGGAGGTACGTATATGGGGG;SOR=0.919;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=52555324;WS=52555306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr3	52555957	rs9853056	T	C	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1225;ReadPosRankSum=0.549;SC=GGGATGGCCGTGTGTGTACAG;SOR=0.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=91;WE=52555965;WS=52555947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr3	52556890	rs4434138	A	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=813;ReadPosRankSum=-2.244;SC=TCGGGTGGGCATAGTCAGCCT;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=60;WE=52556898;WS=52556880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr3	52557038	rs4234633	C	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=848;ReadPosRankSum=0.805;SC=GCTTTTCCTGCAGATGTGGCC;SOR=0.681;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=54;WE=52557046;WS=52557028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr3	52558008	rs13303	T	C	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=25;PP=1277;ReadPosRankSum=1.812;SC=GGCAAGCCCATGGGCTTTGGC;SOR=0.791;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=99;TCR=46;TR=78;WE=52558016;WS=52557998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,80:0.52:155
chr3	52558133	rs13621	T	C	4851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=87;PP=2885;ReadPosRankSum=-0.275;SC=ATGATGCTGATGACGACTTCT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=383;TCF=210;TCR=173;TR=198;WE=52558141;WS=52558123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,229:0.50:455
chr3	52558904	rs34005367	A	T	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;ReadPosRankSum=-0.375;SC=AGGTCTGGGGACACAAAGTGT;SOR=0.636;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=75;WE=52558912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,94:0.51:183
chr3	52559167	rs72449664	CGGGG	C,CG	1957.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=10.601;HP=18;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=18,18;NR=11,11;PP=149,293;ReadPosRankSum=1.988;SC=TTGCTGGGGGCGGGGGGGGGG;SOR=1.876;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=29,29;WE=52559178;WS=52559157;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.34:53
chr3	52561779	rs11711421	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1517;ReadPosRankSum=0.244;SC=AGGGCGGCTCCGTGCCTGCCC;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=82;WE=52561787;WS=52561769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,97:0.47:208
chr3	52567617	rs66782572	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GGAGCGCGGGACGCCGGGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=22;WE=52567625;WS=52567607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr3	52584431	rs34372721	T	TCTC	1111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=826;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TTAGAAGGAATCTTACCTGCC;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=19;WE=52584439;WS=52584421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr3	52584715	rs2878628	A	G	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=652;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TCTGAGAAGGATAACTCGAAT;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=51;WE=52584723;WS=52584705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr3	52584787	rs2251219	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=0.967;SC=GACTTCCACCTGGTGCTGGAG;SOR=0.653;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=25;WE=52584795;WS=52584777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr3	52610651	rs17264436	T	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=43;PP=1152;ReadPosRankSum=0.488;SC=CTGTTTCTTCTGGGTGAATGA;SOR=0.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=74;WE=52610659;WS=52610641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,96:0.55:175
chr3	52637486	rs2276824	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TATGAGAACACCTAGAAGACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=52637494;WS=52637476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	52643307	rs3733045	A	G	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=484;ReadPosRankSum=1.637;SC=TCCTCAAAATAAAAATGGCTT;SOR=0.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=29;WE=52643315;WS=52643297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr3	52643685	rs3755806	T	C	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GCTCATTGTATGTACAGGCAT;SOR=0.658;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=75;WE=52643693;WS=52643675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr3	52659124	rs34215106	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=215;ReadPosRankSum=0.235;SC=GCAGAAAGAATGCACCCCCAG;SOR=2.093;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=14;WE=52659132;WS=52659114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr3	52676065	rs11719685	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=1.482;SC=TTTATTACTACAAAAAAAAAA;SOR=0.990;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=52676073;WS=52676055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	52677387	rs138751274	G	A	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.580;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1392;ReadPosRankSum=-0.170;SC=AAAAAGCTTAGAAACTTGGTA;SOR=0.381;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=83;WE=52677395;WS=52677377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,98:0.56:175
chr3	52678621	rs138200462	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.384;NF=10;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GGATGGTCTCGATCTCTTGAC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=52678629;WS=52678611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	52692124	rs2336149	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.547;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=549;ReadPosRankSum=-1.166;SC=TCTTCCTTTTGAACTTACTTT;SOR=2.303;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=26;WE=52692132;WS=52692114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr3	52692359	rs2590846	C	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.005;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=855;ReadPosRankSum=-1.519;SC=AAAGTACTTTCTAAGAGAAAT;SOR=1.376;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=44;WE=52692367;WS=52692349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr3	52720080	rs1108842	A	C	3712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=60;PP=2199;ReadPosRankSum=-1.073;SC=AGGCAGGTTGATGTGTTTGTG;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=292;TCF=159;TCR=133;TR=137;WE=52720088;WS=52720070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,176:0.49:361
chr3	52721305	rs11177	G	A	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1110;ReadPosRankSum=-0.730;SC=GCTAAAAAGCGGGGTCACAAG;SOR=0.490;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=83;TCR=52;TR=70;WE=52721313;WS=52721295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr3	52722266	rs3836492	AT	A	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.525;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.972;NF=1;NR=10;PP=122;ReadPosRankSum=0.397;SC=GACTCAAGTCATTTTTTTTTT;SOR=0.191;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=11;WE=52722274;WS=52722256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	52722335	rs3774349	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CTTGCGTCATAGGGGTTTGCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=52722343;WS=52722325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	52726695	rs6762813	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=601;ReadPosRankSum=-0.557;SC=AATATATAAGCTATAACATGT;SOR=2.364;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=31;WE=52726703;WS=52726685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr3	52727257	rs2289247	G	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=732;ReadPosRankSum=0.197;SC=ATTTTTTACTGTGCTTGCTCA;SOR=0.824;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=48;WE=52727265;WS=52727247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr3	52728804	rs6976	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.355;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=953;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TTACTTCCCACGCATGCTATC;SOR=1.037;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=144;TCF=79;TCR=65;TR=66;WE=52728812;WS=52728794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,76:0.42:179
chr3	52729685	rs140214041	T	TTAAA	458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=291;ReadPosRankSum=0.390;SC=AGAAGAGCTGTTAAACTGACT;SOR=0.330;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=8;WE=52729693;WS=52729678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	52740182	rs6617	C	G	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=830;ReadPosRankSum=1.440;SC=CCAGACCTTACCCCTCACGGT;SOR=0.875;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=51;WE=52740190;WS=52740172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,62:0.46:136
chr3	52741581	rs34636695	AT	A	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=0.865;SC=AGGAATATGGATTTTTTTTTT;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=18;WE=52741589;WS=52741571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr3	52778347	rs2268026	T	C	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=1015;ReadPosRankSum=0.170;SC=ACAGAGTCACTTCCATTCCTA;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=41;TCR=69;TR=59;WE=52778355;WS=52778337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr3	52797634	rs1029871	G	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CTTGGCATTGGTGGCAGCTAC;SOR=0.096;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=52797642;WS=52797624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	52800284	rs2230535	T	C	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1600;ReadPosRankSum=0.897;SC=AGTGGTTCTCTAACACTCGGG;SOR=0.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=92;WE=52800292;WS=52800274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,115:0.62:185
chr3	52802402	rs2230534	A	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=682;ReadPosRankSum=1.014;SC=CCTGATTCTCAGGCAGAAGCT;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=51;WE=52802410;WS=52802392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr3	52804487	rs13071584	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=343;ReadPosRankSum=1.208;SC=AACAAAGAAGTAGAAGTAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=24;WE=52804495;WS=52804477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr3	52814256	rs2302417	T	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.869;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr3	52815905	rs2710323	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=0.318;SC=TGCAAACATCTTGTTTGTGGT;SOR=2.704;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=52815913;WS=52815895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr3	52818301	rs11715487	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=697;ReadPosRankSum=0.470;SC=ACCCAGGTGTGTGGCTTGCAG;SOR=1.188;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=40;WE=52818309;WS=52818291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr3	52818579	rs2239551	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=1.054;SC=GCCTAGAGGAGCAGATAAAGC;SOR=0.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=52818587;WS=52818569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	52819327	rs2268023	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	52820855	rs36051478	CGAAT	C	437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.273;NF=8;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=-0.621;SC=ACTTATGTGTCGAATGAATGA;SOR=0.776;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=9;WE=52820866;WS=52820845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	52820981	rs678	A	T	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=0.941;NF=33;NR=32;PP=872;ReadPosRankSum=-1.131;SC=GACAGGGAGGAGAGGGCCAAC;SOR=0.509;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=65;WE=52820989;WS=52820971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,79:0.54:147
chr3	52821011	rs1042779	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=818;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CAGGCCCTGCAGATGTCGCTG;SOR=0.925;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=62;WE=52821019;WS=52821001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr3	52821177	rs2286798	A	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TGGGGCTCTAATTATTTTCTC;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=28;WE=52821185;WS=52821167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr3	52821992	rs68094128	CT	C	3077.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.506;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.775;NF=10;NR=48;PP=2276;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GCCACTCCCCCTCCCATCAGC;SOR=0.830;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=108;TCF=28;TCR=80;TR=58;WE=52822000;WS=52821982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,94:0.49:191
chr3	52830764	rs2240921	C	T	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=1001;ReadPosRankSum=0.963;SC=GGACCATCGACGGTGTTACCT;SOR=0.969;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=61;WE=52830772;WS=52830754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,81:0.47:174
chr3	52833805	rs3617	C	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=562;ReadPosRankSum=0.102;SC=GGAAGATATGCAAGAGGAAGA;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=37;WE=52833813;WS=52833795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr3	52837793	rs4481150	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TCCCCAGCTGTGTCCACTGCT;SOR=0.512;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=52837801;WS=52837783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	52838654	rs9968117	C	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=538;ReadPosRankSum=0.804;SC=TAGGGCTGGTCGGCCAAGCAG;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=37;WE=52838662;WS=52838644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr3	52847544	rs17331178	C	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AGGTGGTCAGCAAATCTCAGG;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=34;WE=52847552;WS=52847534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr3	52847601	rs2071044	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=0.044;SC=ACATGGAGGGCAGGGAGTCCT;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=20;WE=52847609;WS=52847591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr3	52852060	rs2245538	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TGGGTGTGCCTCTCTCACCTT;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=7;WE=52852068;WS=52852050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr3	52853340	rs7620907	G	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=6;PP=861;SC=ACCCCACCCCGCTCTATGGGG;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=52853348;WS=52853330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	52853401	rs3821831	C	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=624;ReadPosRankSum=1.206;SC=GGCCGGAAGGCAGCTTACAGA;SOR=1.101;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=40;WE=52853409;WS=52853391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr3	52854140	rs9831977	T	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GGCGACTAAATGCACCAGCAT;SOR=0.120;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=13;WE=52854148;WS=52854130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	52857778	rs34860124	T	A	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.057;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=1063;ReadPosRankSum=2.552;SC=GGGGGTGTCATAAAGGCTGGG;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=65;WE=52857786;WS=52857768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr3	52864272	rs377651066	TAGTC	T	1908.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.990;NF=16;NR=13;PP=1325;ReadPosRankSum=1.353;SC=AATTGAGACATAGTCAGCATA;SOR=0.602;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=29;WE=52864283;WS=52864262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr3	52864584	rs2071042	A	G	3493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=84;PP=2160;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CGGCAGTAGTAGTCTGGTGGA;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=273;TCF=121;TCR=152;TR=145;WE=52864592;WS=52864574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,166:0.53:316
chr3	52864635	rs2276818	A	G	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=58;PP=1457;ReadPosRankSum=-0.835;SC=TGCTGCAGGTACGGACAGGCC;SOR=1.211;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=161;TCF=47;TCR=114;TR=78;WE=52864643;WS=52864625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr3	52867288	rs4687661	A	T	6578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=90;PP=2965;SC=AGTTCCTGGGAAAGGCTCCTG;SOR=1.034;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=123;TCR=90;TR=213;WE=52867296;WS=52867278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr3	52867595	rs60332615	C	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.506;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=294;ReadPosRankSum=-1.431;SC=CACACCTGCACCCCCATCCCC;SOR=0.208;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=28;WE=52867603;WS=52867585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr3	52867715	rs6787916	G	C	5789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=79;PP=2965;SC=TCAGGTCCTCGTCCTTCACAG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=92;TCR=79;TR=171;WE=52867723;WS=52867705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	52867811	rs6776876	A	T	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=78;PP=2965;SC=GCCTCGGTAGAAAGGCACACC;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=152;WE=52867819;WS=52867801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	52868610	rs11922961	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=376;ReadPosRankSum=-1.395;SC=GCCGGGCCCATAGCTACAAAT;SOR=0.302;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=18;WE=52868618;WS=52868600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr3	52868668	rs142854055	G	GCACACA,GCACACACA	3567.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.37;QD=48.21;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,39,35:0.53,0.47:74
chr3	52868670	rs62255421	G	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=16;PP=1534;SC=ACACAGATGCGCACACACACA;SOR=1.659;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=108;TCF=78;TCR=30;TR=82;WE=52868678;WS=52868654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	52868716	rs77032405	GC	G	2536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=8;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.078;NF=24;NR=50;PP=1067;ReadPosRankSum=0.706;SC=ATCTATCTAGGCCCCCCCCAC;SOR=0.626;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=45;TCR=93;TR=74;WE=52868724;WS=52868706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,105:0.53:199
chr3	52870729	rs11431693	C	CA	6221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=37.03;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	52874446	rs6769789	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=574;ReadPosRankSum=2.423;SC=AACGATGCTGCGGGATGACCT;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=35;WE=52874454;WS=52874436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr3	52874779	rs7638431	G	A	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=76;SC=GCAATGGCACGATCTCGCCTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=52874787;WS=52874769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	52877647	rs55829187	C	CA	2820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=18;PP=1660;SC=CTGAGGGCTACAGGTGAGCTT;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=39;WE=52877657;WS=52877637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	52877649	rs56008508	G	A	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=19;PP=1103;SC=GAGGGCTACAGGTGAGCTTTC;SOR=1.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=54;WE=52877657;WS=52877637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	52877720	rs4687668	T	C	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=39;PP=1809;SC=GGGATAAAAATGCAACATGGC;SOR=1.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=101;WE=52877728;WS=52877710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	52878721	rs7650966	G	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=324;SC=CAGACCAAATGCAGGACACAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=52878729;WS=52878711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	52878746	rs10663469	C	CAG	1021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=871;SC=AGAGTTAAAACAAGTTTGGTT;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=52878754;WS=52878736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	52878825	rs7629528	C	A	3082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=40;PP=1865;SC=AGGAGCTGCTCATGCAGGGAC;SOR=1.227;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=106;WE=52878833;WS=52878815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	52881634	rs5848962	T	TG	4100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=47;PP=2725;SC=AAGAGAGCTGTGGTACCTCTT;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=61;WE=52881642;WS=52881624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	52883654	rs3216716	CT	C	517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=533;SC=GGAGGGTGTGCTCAAACCCAG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=52883662;WS=52883644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	52886914	rs4687675	A	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=647;SC=GCCTTTGAAAACCCTAAAAGG;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=52886922;WS=52886904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	52952433	rs3733034	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=1.105;SC=AGGAAATATACCCTCTGAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=52952441;WS=52952423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	52960013	rs11360013	GC	G	2133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=16;PP=2027;SC=CTGCAGCCCTGCCATAGTGGC;SOR=2.041;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=47;WE=52960021;WS=52960003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	52960256	rs34584015	AG	A	2110.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.43;MQRankSum=3.792;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.341;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr3	52960260	.	GC	AC	1813	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000,1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=69.55;NF=24,5;NR=35,35;PP=1224,1813;QD=21.3351052974;SC=TTTTAGAGGGGCGAAAAGCAT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59,40;WE=52960268;WS=52960250;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,59:1.00:59
chr3	52960260	.	GC	G	1813	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000,1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=69.55;NF=24,5;NR=35,35;PP=1224,1813;QD=21.3351052974;SC=TTTTAGAGGGGCGAAAAGCAT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59,40;WE=52960268;WS=52960250;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,40:0.98:41
chr3	52960261	rs34585187	C	A	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.73;MQRankSum=3.792;QD=26.50;ReadPosRankSum=1.835;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr3	52968726	rs2257216	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=698;ReadPosRankSum=0.241;SC=TCTCTAATAATAACGTTTATT;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=41;WE=52968734;WS=52968716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr3	52968801	rs2710315	T	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=52;PP=1635;SC=GGGTTTTCCATGCTGATGTGG;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=52968809;WS=52968791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	53003021	rs2245424	G	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=440;ReadPosRankSum=0.090;SC=ACTTCAAAGAGCTTCCAGTTC;SOR=1.279;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=24;WE=53003029;WS=53003011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr3	53003179	rs11717619	A	C	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1916;ReadPosRankSum=-2.150;SC=ATCCTCCCAAAACAAAGGAAA;SOR=0.732;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=249;TCF=124;TCR=125;TR=121;WE=53003187;WS=53003169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,143:0.46:310
chr3	53126672	rs141077598	TTGCCCTGGACAAGGC	T	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.620;NF=1;NR=7;PP=2930;ReadPosRankSum=-0.504;SC=AGTGGTGACCTTGCCCTGGAC;SOR=0.654;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=8;WE=53126694;WS=53126662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr3	53154132	rs373476566	ATTAACTGCAC	AGCAC,A	229.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=2472;ReadPosRankSum=0.779;SC=AACTCTCTTGATTAACTGCAC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=53154151;WS=53154122;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.44:16
chr3	53154139	rs199819350	GCACT	G	229.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.433;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	53154143	.	T	G	418	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=418;QD=75.4618687579;SC=TTAACTGCACTTTCTATTCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=53154151;WS=53154122;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr3	53212574	rs2306571	C	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=345;ReadPosRankSum=1.702;SC=AGGCTGGACCCTGGAGAGGGG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=28;WE=53212582;WS=53212564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr3	53213538	rs2035451	C	G	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=28;PP=1333;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGGAGGTCTACGAGGGAGGGA;SOR=0.858;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=191;TCF=123;TCR=68;TR=85;WE=53213546;WS=53213528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,94:0.45:210
chr3	53213815	rs3830263	C	CGTGT	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.290;NF=0;NR=20;PP=790;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CGAGCCGTGCCGTGTGTGTGT;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=20;WE=53213824;WS=53213805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	53215875	rs11130350	A	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=654;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CCCAGTGTAGATACAGCAGCT;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=41;WE=53215883;WS=53215865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr3	53216024	rs41305600	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.218;SC=AGAAACCAGCCCAGGCCATGC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=53216032;WS=53216014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	53216051	rs6445568	T	C	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=156;SC=CCTCTTTTCCTCGGAGAGGCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=53216059;WS=53216041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	53217413	rs2306572	A	G	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=25;PP=1184;ReadPosRankSum=1.927;SC=CTAGGGGTTGAAGAAGAGGCT;SOR=0.389;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=133;TCF=93;TCR=40;TR=70;WE=53217421;WS=53217403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,77:0.53:145
chr3	53220129	rs45513792	G	T	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=891;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CTGTGAATCGGGCTGTGGCCC;SOR=0.440;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=49;WE=53220137;WS=53220119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr3	53220215	rs2230494	G	A	7510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=97;PP=2965;SC=GCAGAGGAGAGTACTTTGCCA;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=227;WE=53220223;WS=53220192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr3	53220375	rs41275531	G	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=728;ReadPosRankSum=-1.407;SC=GCCTCCTGCCGTCACCACCCC;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=43;WE=53220383;WS=53220365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr3	53220444	rs6793352	T	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=678;SC=GTGTCTCCCCTTCAGGCCACT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=53220452;WS=53220434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	53220569	rs45596236	G	A	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=19;PP=1757;SC=CCCTCAGTGAGGGAGCCTCCT;SOR=2.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=53220577;WS=53220559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	53220763	rs3830265	GCTCAGAGC	G	5285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=67;PP=2942;SC=AGGGCTACTGGCTCAGAGCCC;SOR=1.421;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=6;TCR=70;TR=72;WE=53220778;WS=53220753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	53221510	rs41315886	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CCCCCCAACTCCAGTTCCTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=53221518;WS=53221500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	53222761	rs2306574	C	T	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1350;ReadPosRankSum=0.069;SC=CAATGTGCTGCTGGACCGGGA;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=87;TCR=79;TR=92;WE=53222769;WS=53222751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,116:0.57:202
chr3	53223286	rs67531107	GCTGGT	G	2336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=40;PP=2032;SC=GCTGGGCTGGGCTGGTCTGGG;SOR=1.773;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=43;WE=53223298;WS=53223276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	53223927	rs1075865	C	G	3952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=45;PP=2088;SC=TGGGAGTGACCGGAAACATCA;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=111;WE=53223935;WS=53223917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	53224002	rs900495	T	C	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=55;PP=1895;SC=TGGAGCCACCTTTCAGGCCCA;SOR=1.104;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=91;WE=53224010;WS=53223992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	53259850	rs3163	C	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=727;ReadPosRankSum=1.126;SC=GCAGCTCAGCCGGCTTCCCAC;SOR=0.420;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=103;TCF=45;TCR=58;TR=49;WE=53259858;WS=53259840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr3	53259996	rs3816767	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=0.252;SC=AGGGTGAGCAGTGGTGGGCCC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=53260004;WS=53259986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	53260716	rs2279322	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=219;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GCACGTCCAACGCTCGGCTCT;SOR=0.026;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=15;WE=53260724;WS=53260706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr3	53260903	rs2279323	G	C	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TTCTGTGAGGGAGAGCACACG;SOR=0.835;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=74;WE=53260911;WS=53260893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr3	53261019	rs41275535	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-1.272;SC=GGGCCTGTCCCTGTCCCAGGG;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=53261027;WS=53261009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	53262400	rs3736153	G	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=659;ReadPosRankSum=0.759;SC=GATAAACTGAGGATACAGGAT;SOR=0.567;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=54;WE=53262408;WS=53262390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr3	53262472	rs3736154	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=0.703;SC=CCATGGGAGCGTTAGTTACTG;SOR=0.278;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=19;WE=53262480;WS=53262462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	53263279	rs3736156	A	G	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=62;PP=2336;SC=AGGTGTAAACACCCTGGCTAA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=124;WE=53263287;WS=53263269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	53264485	rs1131728	A	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=372;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TGTTCTGCTCAGCAATGTAGC;SOR=0.169;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=31;WE=53264493;WS=53264475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr3	53265581	rs17234092	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=257;ReadPosRankSum=0.724;SC=AGACCCAACACGGGAGGACAG;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=17;WE=53265589;WS=53265571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr3	53267100	rs2242300	C	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=0.387;SC=CCTGGATGTGCGGGTCAGAGC;SOR=0.614;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=24;WE=53267108;WS=53267090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr3	53267133	rs6445573	G	C	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=28;PP=1465;SC=GTGTCTGGGCGAGGGGTGAAG;SOR=1.141;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=72;WE=53267141;WS=53267123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	53267155	rs2242301	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=622;ReadPosRankSum=1.009;SC=TGGGGAGGGCGGCTTGTGCAT;SOR=0.479;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=41;WE=53267163;WS=53267145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr3	53267296	rs2242302	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=625;ReadPosRankSum=2.268;SC=GCCAACTGGGGACAGGGGGCA;SOR=1.508;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=35;WE=53267304;WS=53267286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr3	53267342	rs2242303	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=418;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CCACAACACCGAGGAGCCTTC;SOR=1.734;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=19;WE=53267350;WS=53267332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr3	53269046	rs1051485	T	C	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=696;ReadPosRankSum=1.429;SC=GGTGCTGCAGTGGGGCCGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=52;WE=53269054;WS=53269036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
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chr3	53269275	rs2242304	T	C	63.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GGAGCCTGCATTCTGGGTAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=53269283;WS=53269265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr3	53276052	rs9827244	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=1.742;SC=GCCCAGCCAGGTCTCCTCAAA;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=53276060;WS=53276042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	53277476	rs7356056	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=359;ReadPosRankSum=0.215;SC=CTCCAATCAGCGCTCCCACCA;SOR=0.960;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=24;WE=53277484;WS=53277466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr3	53277653	rs9858133	G	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=1.142;SC=AAGAGGGAGGGGAGGACATGG;SOR=0.787;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=16;WE=53277661;WS=53277643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr3	53277675	rs12635973	C	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AAACGAGAAACCCTTTTCTGC;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=14;WE=53277683;WS=53277665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr3	53321631	rs9628	A	C	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=85;PP=2965;SC=TCTTGGTCAGAACCTGCAAGT;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=62;TCR=85;TR=147;WE=53321639;WS=53321621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	53324819	rs201612547	ATGGCAC	A	2934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=22;PP=2686;SC=CCTTACCGGGATGGCACTGGC;SOR=1.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=45;WE=53324832;WS=53324809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	53324915	rs3732834	A	G	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=60;PP=1922;SC=AAAGACAGACAGATATAAGAA;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=117;WE=53324923;WS=53324905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	53529140	rs312480	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=500;ReadPosRankSum=0.146;SC=CGCCCCCGCCTCAACGCCCAG;SOR=0.843;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=28;WE=53529148;WS=53529130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr3	53685039	rs2276836	T	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=162;ReadPosRankSum=0.439;SC=TTTTAGGGAATGTGGTTGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=18;WE=53685047;WS=53685029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr3	53700550	rs2250736	T	C	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=585;ReadPosRankSum=0.218;SC=GCTGGACAGATGTGCTCTACT;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=57;WE=53700558;WS=53700540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr3	53758049	rs2070617	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.778;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=482;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TCCATTCCCCGAAAAGCACTT;SOR=1.442;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=33;WE=53758057;WS=53758039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,44:0.34:128
chr3	53766026	rs2612033	T	C	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=58;PP=2128;SC=CCTCCCAAGATGTCTTTGTCA;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=125;WE=53766034;WS=53766016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	53766212	rs2306866	A	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=79;ReadPosRankSum=2.046;SC=CAGCGTGCACATGAGCTGCTG;SOR=0.105;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=6;WE=53766220;WS=53766202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	53776995	rs2612026	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=35;PP=1808;SC=TTCTTTTCCTTTGGAGACAAA;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=53777003;WS=53776985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	53777176	rs2680648	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.489;SC=CCCAGAATTGTTGGGCTGAAT;SOR=1.094;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=59;WE=53777184;WS=53777166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,65:0.54:120
chr3	53778620	rs28365115	C	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=0.158;SC=GCCTCTGAGTCGTGAAGAGAG;SOR=0.044;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=53778628;WS=53778610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr3	53778875	rs2253795	G	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=654;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CTCTCCTCCCGGCTGGGCTGG;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=40;WE=53778883;WS=53778865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr3	53779825	rs3821860	A	G	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=67;PP=1969;ReadPosRankSum=0.547;SC=GCATTTACTTAACTGCCTGTC;SOR=0.605;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=222;TCF=84;TCR=138;TR=110;WE=53779833;WS=53779815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,134:0.50:268
chr3	53796744	rs3774567	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TGCCCTTAAATCTCCACACAC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=53796752;WS=53796734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	53806803	rs2278517	G	C	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=12;PP=1907;SC=TCAGGCTGTGGCGGGCCGTCA;SOR=2.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=73;WE=53806825;WS=53806793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	53806817	rs35146621	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=902;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GCCGTCACGGGGACAGCCGGC;SOR=0.950;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=51;WE=53806825;WS=53806793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr3	53806949	.	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,36:0.19:188
chr3	53814197	rs1829423	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=24;PP=758;SC=CAGGAAAGGAGAGAGACATCA;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=53814205;WS=53814187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	53856653	rs2241808	C	T	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;PP=893;ReadPosRankSum=0.259;SC=AGGCACAGGCCGCGCTCCACC;SOR=0.567;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=20;TCR=76;TR=50;WE=53856661;WS=53856643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr3	53857676	rs17053532	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=533;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GTGGCCAGTACAGCACGCGGC;SOR=0.471;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=34;WE=53857684;WS=53857666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr3	53857803	rs12676	A	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GCTCCCCGCGAGCACGTCCTT;SOR=0.517;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=31;WE=53857811;WS=53857793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr3	53880789	rs2232332	A	G	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=48;PP=1465;SC=CTGCCGGCTCAAGGGGCATGC;SOR=2.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=53880797;WS=53880779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	53882663	rs1025690	G	A	7742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=112;PP=2965;SC=CGGCTTCAACGTGACGCTTGG;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=126;TCR=112;TR=238;WE=53882681;WS=53882653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr3	53882673	rs5849009	G	GT	7856.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=112;PP=2975;SC=GTGACGCTTGGTTTTTTCTCT;SOR=0.758;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=45;TCR=131;TR=151;WE=53882681;WS=53882653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr3	53883722	rs1025689	C	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=15;PP=875;SC=ATCTAATCCCCGGAGACTTGA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=53883730;WS=53883712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	53883910	rs4687751	C	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=568;SC=TCCCCTTCTACGCATAACCAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=53883918;WS=53883900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	53886912	rs3733075	C	T	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CATTTTCCTACATCGGCTTCC;SOR=0.747;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=216;TCF=109;TCR=107;TR=88;WE=53886920;WS=53886902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,104:0.41:256
chr3	53890787	rs3821867	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=314;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GAGAACTTGGGTTTGTTTCCA;SOR=0.278;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=20;WE=53890795;WS=53890777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr3	53892553	rs13315972	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-1.652;SC=GTCTTGGGCACGTGGGTCTCG;SOR=2.505;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=18;WE=53892561;WS=53892552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	53892641	rs9840079	T	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ACTAGAGGTATGGGCGAAGCC;SOR=0.946;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=150;TCF=93;TCR=57;TR=66;WE=53892649;WS=53892631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,71:0.42:168
chr3	53905308	rs1046677	T	C	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=844;ReadPosRankSum=0.914;SC=CCAGGGCTTTTCCTTCAAACA;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=54;WE=53905316;WS=53905298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr3	53906513	rs4687757	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=732;ReadPosRankSum=0.014;SC=TCTGTCCAACGATTCCAAAAG;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=50;WE=53906521;WS=53906503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,56:0.38:147
chr3	53906663	rs2289203	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=0.414;SC=TTCCCTAAGTTAGACTGGGCA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=53906671;WS=53906653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	53906951	rs12632292	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATCTACAATCAGTTGACATTC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=53906959;WS=53906941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	53910118	rs744277	A	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=2066;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CTGGGGGGGGAAAAGAAAAGG;SOR=1.114;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=40;WE=53910129;WS=53910108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr3	53910121	rs5849012	AG	A	890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr3	53910899	rs5849013	GA	G	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	53910919	rs11419180	G	GT	331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=17;PP=272;SC=ATGCTCAAGTGTTTTTTTTTC;SOR=5.283;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=18;WE=53910927;WS=53910909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	53911540	rs3733079	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=266;ReadPosRankSum=-0.266;SC=AGTAGGAGTCGGTGTGACTAT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=14;WE=53911548;WS=53911530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr3	53912341	rs3733081	C	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=656;ReadPosRankSum=-1.020;SC=ATTATGATACCAATAGTGGTG;SOR=1.227;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=96;TCF=76;TCR=20;TR=39;WE=53912349;WS=53912331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr3	53915930	rs2276843	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	53915937	rs2276844	T	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	53916130	rs2276845	A	G	3392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=66;PP=1691;ReadPosRankSum=-1.001;SC=CTGGGTCATTATGGCCGGAGA;SOR=0.756;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=264;TCF=118;TCR=146;TR=116;WE=53916138;WS=53916120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,165:0.50:331
chr3	53921022	rs1020082	T	C	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr3	53921028	rs10440151	T	G	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr3	53922620	rs3816144	A	G	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=767;ReadPosRankSum=2.350;SC=CTTGCCCATTATTCCAAATGG;SOR=0.665;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=54;WE=53922628;WS=53922610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,57:0.44:131
chr3	54354510	rs9879885	T	C	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=69;PP=2541;SC=TAGAAGAAATTGATGGCCTCC;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=54354518;WS=54354500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	54419776	rs35870700	T	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=1.761;SC=ATGCCATCATTTTTCACACGT;SOR=2.891;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=11;WE=54419784;WS=54419766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr3	54919185	rs11716356	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.980;SC=GCTCCAAGGCAGGTCCCTTAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=54919193;WS=54919175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	54919272	rs1405330	A	G	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=24;PP=1646;SC=TGGGGGAGTGATACTTATTCA;SOR=1.431;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=78;WE=54919280;WS=54919262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	54919351	rs10510774	A	G	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1113;ReadPosRankSum=1.720;SC=TGGCAGATGAATGGTAAGAAT;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=76;WE=54919359;WS=54919341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,96:0.56:172
chr3	54919480	rs2293662	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=777;ReadPosRankSum=0.599;SC=TGTAAATATTGACATGCTCTT;SOR=0.579;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=54;WE=54919488;WS=54919470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,60:0.42:143
chr3	54921903	rs3773594	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=-0.430;SC=AGCCTGCAGATGCTGCACAAT;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=16;WE=54921911;WS=54921893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	54922235	rs2360659	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=573;ReadPosRankSum=0.520;SC=GAGCAGATTAGCGGCTCGGGC;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=31;WE=54922243;WS=54922225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	54928487	rs58625954	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.642;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr3	54928489	rs58346602	A	T	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr3	54928496	rs1526595	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=22;PP=1094;SC=TGAATGTCACTGCCTTAAGTG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=54928504;WS=54928477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	54928762	rs1526594	G	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=222;ReadPosRankSum=2.067;SC=GTCCAGGTCAGGTTTATGAAG;SOR=1.730;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=17;WE=54928770;WS=54928752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr3	54930640	rs79621910	C	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.711;SC=AGTGAGGCCCCCTCTATACTG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=54930648;WS=54930630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	54930699	rs6445708	A	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=354;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TTACCTGATGAAGGCTGTCGG;SOR=0.330;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=24;WE=54930707;WS=54930689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr3	54930773	rs17253119	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=726;ReadPosRankSum=1.795;SC=TTTCCACTTCAAGGGACTTCC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=51;WE=54930781;WS=54930763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr3	54930794	rs17054524	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=784;ReadPosRankSum=-2.023;SC=TGAAAGCTGGCGACAAGGAGA;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=53;WE=54930802;WS=54930784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr3	54933763	rs41277455	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=309;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CTCTCTTAACGTGTACACTGT;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=20;WE=54933771;WS=54933753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr3	54933872	rs41277457	A	G	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1372;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CTCCTGGATGAACGGAAATCT;SOR=0.590;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=76;WE=54933880;WS=54933862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr3	54934054	rs17253231	A	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=0.020;SC=CATCTCCTTCAAACCAAGACT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=18;WE=54934062;WS=54934044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	54961949	rs4245920	C	T	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=76;PP=2678;SC=GACTGAGTCTCCTTGGGCGTC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=54961957;WS=54961939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr3	55038898	rs4955827	A	G	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=66;PP=2031;SC=GAAAACAGCCACACATTTCTG;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=102;WE=55038906;WS=55038888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	55733390	rs4955865	C	T	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=3;PP=563;SC=TGGAGGTAAGCAGCGATGAAA;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=55733398;WS=55733386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	55989276	rs140781604	TTGTGTGTGTGTG	T	1318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=13.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=2.709;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.544;SOR=3.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr3	56019805	rs6806267	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=349;SC=ACTGACTTATTTCCATCTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=56019813;WS=56019795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	56019905	rs6445762	C	A	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=20;PP=1682;SC=TGCAGTGGCCCGAGGAAAACC;SOR=1.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=56019913;WS=56019895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	56020159	rs7613818	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=366;SC=ATAACTAAACGAAGCAAACTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=56020167;WS=56020149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	56026034	rs4974160	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=321;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TGGGCAACCACGCAGTCCATG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=16;WE=56026042;WS=56026024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr3	56037025	rs5849124	C	CAT	5939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=32;PP=2974;SC=GGAAGAAACTCAAATATTTTC;SOR=1.798;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=79;WE=56037033;WS=56037015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	56037241	rs35658351	CA	C	3174.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=49;PP=1978;SC=ATTAGCTCAACAAAATCCATG;SOR=3.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=50;WE=56037257;WS=56037231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	56037249	rs34984094	A	AG	3113.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=46;PP=2260;SC=AACAAAATCCATGCATTCGCA;SOR=3.578;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=47;WE=56037257;WS=56037231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	56041187	rs1379715	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=0.364;SC=AAGCATGATTCTTTTTCTTAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=56041195;WS=56041177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	56114750	rs17825159	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CTAAAGATTCGTAAAAGATCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=56114758;WS=56114740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	56591208	rs62255965	G	C	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.272;NF=39;NR=22;PP=999;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TTGCTGAGCGGCGGCGGCAAC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=61;WE=56591216;WS=56591198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr3	56591278	rs150150392	T	TGGGGTAAGCA	3328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=6.023;NF=8;NR=34;PP=2976;ReadPosRankSum=1.417;SC=GCCATGAACTTGGGGTAAGCA;SOR=0.714;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=105;TCF=25;TCR=80;TR=42;WE=56591286;WS=56591268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr3	56593543	rs12486047	C	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=105;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TCTTGCATTACCACCTTAGTA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=10;WE=56593551;WS=56593533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr3	56593680	rs11130525	T	C	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=26;PP=851;SC=GTTTTATTTATAGTGGTTAGA;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=56593688;WS=56593670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	56597954	rs6769055	C	T	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=966;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CACCTGCAACCCCTAATATGC;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=54;WE=56597962;WS=56597944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,63:0.39:163
chr3	56599258	rs10687224	G	GTATT	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=2.068;SC=CAAGATATTTGTATTCCCCTT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=6;WE=56599266;WS=56599248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	56605404	.	T	TA	125	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=125;QD=19.1428571429;SC=TAAAGCTTATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=56605412;WS=56605394;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,7:0.70:10
chr3	56627048	rs1388256	A	G	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=13;NR=14;PP=518;SC=AAGAACTGCAAAGAAAATGGA;SOR=0.746;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=56627056;WS=56627038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	56627598	rs1491170	A	G	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=56;PP=2795;SC=CTGTTCTCTCAGTCAACACAC;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=140;WE=56627606;WS=56627588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	56650051	rs77152637	A	ACTT	2572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=1702;SC=GAATTCTACGACTTCTAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=32;WE=56650059;WS=56650041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	56650178	rs9833926	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=352;SC=AAAAATTAACAAAACTTGAGG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=56650186;WS=56650168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	56653424	rs61747991	A	T	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr3	56653427	rs61747994	T	C	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr3	56653609	rs10534869	CGT	C	6376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=78;PP=2966;SC=ATGTAAACCCCGTCAACAACT;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=10;TCR=79;TR=88;WE=56653618;WS=56653599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	56654002	rs145212077	GTTTGT	G	2146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.474;NF=2;NR=40;PP=1973;ReadPosRankSum=0.459;SC=CTGTTGAACGGTTTGTTTTAA;SOR=0.458;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=42;WE=56654014;WS=56653992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr3	56655441	rs73083715	A	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.216;SC=AAAATTTTTGAATGACAAAAT;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=11;WE=56655449;WS=56655431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr3	56658481	rs2291499	G	C	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1048;ReadPosRankSum=0.447;SC=CTGCGTTAAAGAAAATGAAAA;SOR=0.605;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=62;WE=56658489;WS=56658471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr3	56661586	rs56758331	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-0.588;SC=GAGGAGTTACGTGCTCAAAAG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=56661594;WS=56661576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	56661909	rs143894847	AAAT	A	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=62.13;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAAGCCACACAAATAATATTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=56661919;WS=56661899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	56667682	rs9835332	G	C	6915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=100;PP=2965;SC=TGTGGAAACTGTACTGACATA;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=107;TCR=101;TR=207;WE=56667690;WS=56667672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr3	56672608	rs4681945	G	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=789;SC=AATAAATATGGTACTGTCCAA;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=56672616;WS=56672598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr3	56694742	rs41276465	A	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.270;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=362;ReadPosRankSum=1.092;SC=AGAAACATTAAAAAACTTTTC;SOR=0.180;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=23;WE=56694750;WS=56694732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr3	56694877	rs9858728	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.934;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=570;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CATAAGAAAAATACATAGTAA;SOR=1.091;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=38;WE=56694885;WS=56694867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr3	56695060	rs7619465	T	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=279;SC=AAGAAAATTTTAAAAACATGT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=56695068;WS=56695050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	56700180	rs34101168	TA	T	555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=10;PP=314;SC=CAAGGGAAGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=20;WE=56700188;WS=56700170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	56700429	rs2306930	G	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=324;ReadPosRankSum=0.868;SC=ATAAGAAAATGAAAAATTAAC;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=19;WE=56700437;WS=56700419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	56703708	rs141727197	AGTGT	A	1494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=1318;ReadPosRankSum=0.289;SC=TCATACATGAAGTGTGTAAGT;SOR=0.998;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=26;WE=56703719;WS=56703698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr3	56703746	rs13094666	A	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=746;ReadPosRankSum=0.701;SC=TTTTAAAAATAACAACATCAC;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=46;WE=56703754;WS=56703736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr3	56716922	rs958755	T	G	5894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=89;PP=2965;SC=GCCATTTTGTTGGGAGGACTC;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=75;TCR=89;TR=164;WE=56716930;WS=56716912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	56763316	rs1565376	G	A	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=2523;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TACTTTCACCGTGCCTGCTGT;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=89;TCR=29;TR=62;WE=56763336;WS=56763306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
chr3	56763328	rs1565377	T	C	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=22;PP=2523;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GCCTGCTGTTTCCACAGGAAG;SOR=0.578;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=140;TCF=100;TCR=40;TR=73;WE=56763336;WS=56763306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr3	56771251	rs3772219	A	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=508;ReadPosRankSum=0.130;SC=TGACAACACAAGACTCGAGAG;SOR=0.513;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=43;WE=56771259;WS=56771241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr3	56785556	rs6792241	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=0.186;SC=TCCCATAAAGCTGCAGAAACA;SOR=0.242;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=21;WE=56785564;WS=56785546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr3	56787451	rs3821412	C	T	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=33;PP=1301;SC=ACAGTTCTCACGAAGCACCAC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=68;WE=56787459;WS=56787441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	56808956	rs34038168	A	AC	1306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=2.707;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.550;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr3	56808959	.	A	C	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=2.603;QD=26.82;ReadPosRankSum=1.239;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr3	56932708	rs7633179	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=785;SC=AAGGAGGGAAGCCAATAAAGA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=56932716;WS=56932698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	57011234	rs13080107	T	C	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=732;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TTTTTCTGGCTGCCTAATCCA;SOR=0.629;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=57;WE=57011242;WS=57011224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
chr3	57131529	rs6764188	A	C	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1851;ReadPosRankSum=-0.309;SC=ATTGCCCAATAAGTTGGCACC;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=130;TCR=90;TR=110;WE=57131537;WS=57131519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,128:0.48:268
chr3	57132200	rs2291462	A	G	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CGGGAGTGCAAGTGGGAACAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=108;TCR=104;TR=98;WE=57132208;WS=57132190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,114:0.46:248
chr3	57137090	rs2247656	A	G	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1152;ReadPosRankSum=0.720;SC=AGTAGTCTAGAGCCAAATTTC;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=71;WE=57137098;WS=57137080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr3	57138419	rs6780995	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=631;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GCAGCTGGTCGTCTCTGTAGT;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=41;WE=57138427;WS=57138409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr3	57139833	rs1545982	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=0.142;SC=CCAGTGGCCTGGGGGTCGCTT;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=57139841;WS=57139823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	57139972	rs1545981	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=843;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TGTGCGGTGCATGGTCGAAGG;SOR=1.093;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=59;WE=57139980;WS=57139962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr3	57140108	rs2035654	G	A	2690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=61;PP=1755;ReadPosRankSum=0.286;SC=GATACTTTGAGACTTGATAGA;SOR=0.825;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=208;TCF=89;TCR=119;TR=103;WE=57140116;WS=57140098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,125:0.48:261
chr3	57148968	rs11916303	C	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AAAGATGTGTCCCTCAAAAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=57148976;WS=57148958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr3	57233679	rs143889572	ATAAAT	A	380.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=38.07;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	57276258	rs11346575	GA	G	899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=604;SC=TGTAATAATTGAAAAAAAACC;SOR=2.517;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=27;WE=57276266;WS=57276248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	57294085	rs10510791	C	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=80;PP=2780;SC=GTAGAAAAAACATTTACATGA;SOR=1.340;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=45;TCR=80;TR=124;WE=57294093;WS=57294075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	57294884	rs150865255	CAAATT	C	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=1299;SC=TAAATTCTTACAAATTAAATT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=25;WE=57294896;WS=57294874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	57321916	rs883244	T	G	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=8;PP=1131;SC=TCAGAAACAATGTATTCATTT;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=57321924;WS=57321906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	57323170	rs528035	A	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=48;PP=1323;SC=AAAAAAATACATATGTAATTC;SOR=2.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=57323178;WS=57323160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	57335876	rs4060726	C	T	6002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=90;PP=2965;SC=AGTAAGCTACCGGAGAGTGCC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=169;WE=57335884;WS=57335866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr3	57542173	rs2241988	C	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=747;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GAAGCTGAGCCGGGCTGAAGC;SOR=0.639;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=45;WE=57542181;WS=57542163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr3	57563120	rs80155592	GA	G	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.713;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.248;NF=0;NR=13;PP=325;ReadPosRankSum=1.864;SC=AGACCCTGGGGAAAAATTGTT;SOR=1.278;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=13;WE=57563128;WS=57563110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr3	57582718	rs57877028	GAAA	G	1462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=545;ReadPosRankSum=0.979;SC=GCGGGCGGAGGAAAAAAACAG;SOR=0.416;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=21;WE=57582728;WS=57582708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr3	57613814	rs77006676	CTG	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=576;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TCTTTCTACCCTGTAACTAGC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=14;WE=57613823;WS=57613804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr3	57627500	rs9873675	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=40;PP=1118;SC=CAAAACAAAATAAAAAAGGTG;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=45;WE=57627508;WS=57627490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	57627580	rs9816093	A	C	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=73;SC=ACACAGATTGATTTTTCCTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=57627588;WS=57627570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	57649224	.	T	TAC	36.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.99;QD=18.12;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	57743337	rs13400	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=0.806;SC=GGAGGAACTCCTCTTTGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=57743345;WS=57743327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	57846577	rs2306056	C	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr3	57857439	rs111294347	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-1.131;SC=AGTACAGAGTATTTTTCACAT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=17;WE=57857447;WS=57857429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr3	57898260	.	G	A	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=56;PP=1662;ReadPosRankSum=0.743;SC=GCGGGACACTGACATTGCTTC;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=219;TCF=95;TCR=124;TR=100;WE=57898268;WS=57898250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,115:0.48:242
chr3	57908594	rs3832206	CT	C	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.899;NF=16;NR=7;PP=323;ReadPosRankSum=-1.875;SC=TATCTGCACACTTTTTTTTTC;SOR=0.730;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=23;WE=57908602;WS=57908584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr3	57994719	rs1658338	T	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=50;PP=1389;SC=CAGGGGTGGGTTATAGGGGGC;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=52;WE=57994727;WS=57994709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	58089516	rs6445945	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.358;SC=TAGCTTTGAAATAATCTCCCA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=58089524;WS=58089508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	58089594	rs3215311	GT	G	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.246;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=545;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TTTATGTTTTGTTCAGTGTGG;SOR=1.358;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=15;WE=58089602;WS=58089584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr3	58089851	rs1522385	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.075;NF=4;NR=17;PP=334;ReadPosRankSum=0.462;SC=TCTGGAGGGTGCTCGGCCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=21;WE=58089859;WS=58089841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr3	58089877	rs1522386	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.942;NF=1;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=-0.827;SC=ACTCATGGGTAGTTGCTTCCC;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=13;WE=58089885;WS=58089867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	58092346	rs2177153	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=-0.941;SC=GAGCTGTCGTAACATAGAATA;SOR=0.420;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=22;WE=58092354;WS=58092336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr3	58112440	rs2362903	A	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=0.139;SC=TTCCTTTCGCACCGGGGGATT;SOR=0.478;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=24;WE=58112448;WS=58112430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr3	58121626	rs6445948	T	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=446;ReadPosRankSum=-1.218;SC=AGGCACTAATTGGAAAATATG;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=27;WE=58121634;WS=58121616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
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chr3	58133803	rs66977380	AT	A	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=1.861;SC=TTCAAGGCTCATTTTTTTTTC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=58133811;WS=58133793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr3	58155230	rs9870243	C	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=396;ReadPosRankSum=0.123;SC=CCTGGGGTTACTGTGTAGGGT;SOR=1.781;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=22;WE=58155238;WS=58155220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr3	58156176	rs4681660	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=0.601;SC=TAATTGCCACGCTCTCCCACC;SOR=0.264;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=58156184;WS=58156166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	58179028	rs3732630	T	C	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=930;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CTAACTCATCTTTCCAGGACA;SOR=1.080;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=59;WE=58179036;WS=58179018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr3	58186719	rs3772985	C	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=364;ReadPosRankSum=1.985;SC=CACAGCAGTCCTCACCTCCGC;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=27;WE=58186727;WS=58186709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr3	58186911	rs4234389	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GAGGGAAACCAGCTGTCCCCT;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=19;WE=58186919;WS=58186901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr3	58194051	rs3732631	C	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=597;ReadPosRankSum=1.777;SC=AAAGAGAATTCCCAGGGGTTT;SOR=0.619;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=41;WE=58194059;WS=58194041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr3	58196639	rs2292677	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=-1.554;SC=GACATCCTGGCGCTGCTCTGG;SOR=0.160;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=19;WE=58196647;WS=58196629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr3	58270963	rs6774235	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=21;PP=1110;SC=TGAATGTCTCTTTGGGCCCCT;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=58270971;WS=58270953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	58303123	rs1473971	G	A	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=622;ReadPosRankSum=0.655;SC=CTGTGCTTCAGTGTGGTTTCT;SOR=0.907;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=40;WE=58303131;WS=58303113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr3	58355273	rs9867320	G	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGCTGGAGTCGGGGCACGGTG;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=26;WE=58355281;WS=58355263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr3	58368449	rs11917591	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=701;ReadPosRankSum=0.631;SC=AATCTGTGAATTATGGTCACA;SOR=0.572;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=46;WE=58368457;WS=58368439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr3	58376992	rs11923253	G	A	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1229;ReadPosRankSum=0.023;SC=ACTTTAGATGGGTTAATGAAA;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=67;TCR=86;TR=73;WE=58377000;WS=58376982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr3	58382846	rs3191903	C	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.416;SC=GGGACACTTGCCGGCTGCTGG;SOR=0.513;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=68;WE=58382854;WS=58382836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,85:0.48:176
chr3	58384995	rs11712213	G	A	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1362;ReadPosRankSum=1.250;SC=CGTGTTCTGTGGAACTAAAAT;SOR=0.583;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=77;WE=58385003;WS=58384985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr3	58385194	rs4075152	T	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=668;ReadPosRankSum=0.030;SC=GTAGTAAAGATTCTTGCGGTC;SOR=0.203;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=33;WE=58385202;WS=58385184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr3	58389462	rs4339119	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=554;ReadPosRankSum=-1.362;SC=GGATTGGGCCAGGGGCTGGAG;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=43;WE=58389470;WS=58389452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr3	58394850	rs56232415	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=0.348;SC=TCTCAGCCAGCCTTTAGGCTA;SOR=0.094;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=12;WE=58394858;WS=58394840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	58395356	rs73085806	T	C	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1082;ReadPosRankSum=0.872;SC=GTAAGCCTGCTGTCTCTCTGC;SOR=0.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=119;TCR=96;TR=83;WE=58395364;WS=58395346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,97:0.38:252
chr3	58395490	rs140856155	G	GT	497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.673;HP=7;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.889;NF=2;NR=15;PP=604;ReadPosRankSum=-1.227;SC=CTGGGGTGCAGTTTTTTTGGG;SOR=0.111;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=17;WE=58395509;WS=58395480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr3	58395501	rs34734687	G	GA	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.283;NF=1;NR=14;PP=611;ReadPosRankSum=-2.039;SC=TTTTTTTGGGGAAAAAAAAAG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=15;WE=58395509;WS=58395480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr3	58395863	rs56384862	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=922;ReadPosRankSum=-0.628;SC=CATTCAGCGAAGTACAGCAAC;SOR=0.904;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=58;WE=58395871;WS=58395853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr3	58398447	rs62258134	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=1.207;SC=GGACCCTGCACCAGAGTAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=58398455;WS=58398437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr3	58410554	rs34579268	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=648;ReadPosRankSum=-1.929;SC=AGCACCGAGGCACCTGCCCAG;SOR=0.515;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=38;WE=58410562;WS=58410544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,39:0.41:95
chr3	58415590	rs2070662	C	A	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1355;ReadPosRankSum=0.789;SC=ACCACTGTGCCGCCAGCTGTG;SOR=0.384;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=162;TCF=70;TCR=92;TR=87;WE=58415598;WS=58415580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,108:0.53:202
chr3	58416535	rs1126551	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr3	58416538	rs4264746	T	C	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.72;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	58416770	rs138623728	T	TTTA	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.45;MQRankSum=1.248;QD=22.16;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	58417416	rs62259772	C	T	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.601;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=361;ReadPosRankSum=1.472;SC=TGGACACTAACAGACATGCCC;SOR=0.342;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=29;WE=58417424;WS=58417406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr3	58484521	rs9853873	T	C	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=72;PP=1942;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TGAGTGCTTCTTGGAGATGCA;SOR=1.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=223;TCF=85;TCR=138;TR=107;WE=58484529;WS=58484511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,132:0.50:263
chr3	58494546	rs11716125	G	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=596;ReadPosRankSum=1.437;SC=AATTAAAATGGGAGAACATGA;SOR=0.917;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=40;WE=58494554;WS=58494536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr3	58510439	rs116616864	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=1.327;SC=CCAGCCTTCCCGTGGGAGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=16;WE=58510447;WS=58510429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr3	58516383	rs4387990	G	A	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1334;ReadPosRankSum=0.349;SC=GAACAAGGACGGGCACAAGTT;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=54;TCR=107;TR=83;WE=58516391;WS=58516373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,103:0.54:191
chr3	58519097	.	A	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=389;ReadPosRankSum=-1.539;SC=TTGGACCTCAAAGCCAGTGCT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=23;WE=58519105;WS=58519087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr3	58520306	rs7611026	G	C	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=69;PP=2752;SC=CTGGCACCTTGAAATCTTCTC;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=58;TCR=69;TR=127;WE=58520314;WS=58520296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	58520859	rs4681862	A	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1251;SC=TCTGGTGACTATGGAGAGACA;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=58520867;WS=58520849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	58552329	rs11539086	C	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=308;ReadPosRankSum=0.081;SC=AGCTCTCTCTCTTCGCTGGTC;SOR=0.385;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=25;WE=58552337;WS=58552319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr3	58553160	rs7637862	T	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=-1.247;SC=CAGGGCTGCTTCCTGCGGTGA;SOR=0.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=58553168;WS=58553150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	58555343	rs7632668	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=0.600;SC=GCTCTGCTTTCCTCCAGGGTC;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=16;WE=58555351;WS=58555333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr3	58555386	rs7609991	G	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=428;ReadPosRankSum=0.220;SC=CCAGGTGCTTGCGGGGCCCAG;SOR=0.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=29;WE=58555394;WS=58555376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr3	58575110	rs6445991	A	G	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=49;PP=1475;SC=GACTGGTCAGAGTCAAAGTCC;SOR=1.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=69;WE=58575118;WS=58575100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	58621935	rs6791782	C	T	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=197;SC=TTTAAGGCCCCTGGGAGGTGA;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=58621943;WS=58621933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	58625875	rs33966924	C	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=579;ReadPosRankSum=-0.542;SC=ATGTCAAATGCCTTCTGTCCC;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=40;WE=58625883;WS=58625865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr3	58631184	rs111621495	G	GAAATA	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=139;ReadPosRankSum=-1.257;SC=ATGAATGAATGAAATAAAATA;SOR=1.158;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=3;WE=58631192;WS=58631174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr3	58635197	rs9811989	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=559;ReadPosRankSum=0.279;SC=AACTAAAAATGCCTTGCCACT;SOR=0.675;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=35;WE=58635205;WS=58635187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr3	58641352	rs57504511	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=212;ReadPosRankSum=0.696;SC=AAAATCCAGTCGGAAACTGGC;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=15;WE=58641360;WS=58641342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr3	59025434	rs6446005	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CACAAACCACGAACAAGCTGA;SOR=0.582;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=9;WE=59025442;WS=59025424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	59908126	rs1385816	A	G	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=688;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TGGGAAGAACATGGACGTGAA;SOR=0.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=49;WE=59908134;WS=59908116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr3	59996946	rs7612646	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=454;ReadPosRankSum=0.141;SC=GAGTTTATAATGTCAGGATTT;SOR=1.308;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=22;WE=59996954;WS=59996936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr3	60898271	rs6793737	G	A	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=1032;SC=ACAGGATATAGATTTATAAAG;SOR=2.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=60898279;WS=60898261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	60898434	rs11130795	T	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1081;ReadPosRankSum=0.259;SC=TTCTCACAATTTGCAGAAACT;SOR=0.524;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=63;WE=60898442;WS=60898424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,74:0.58:127
chr3	61734539	rs3821880	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTGTGGGTTTTCCTCTCTTCC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=61734547;WS=61734529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	62229553	rs1352882	C	T	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=85;PP=2965;SC=ATGAAAGTATCCCTATTATTC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=173;WE=62229561;WS=62229543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr3	62357146	rs71296764	G	A	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1184;ReadPosRankSum=2.470;SC=TCGTATCCCCGGTGTTATCAC;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=68;WE=62357154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,91:0.56:163
chr3	62431387	.	G	GA	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=15;MQ=56.57;NF=4;NR=0;PP=53;QD=14.25;SC=AAGTAAAAATGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=62431395;WS=62431377;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,4:0.40:10
chr3	62431402	rs73840192	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.985;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	62431415	rs6791296	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=-1.074;SC=AAAAACCCCATGAGAAACAAT;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=11;WE=62431423;WS=62431405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	62452895	rs35688133	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=227;ReadPosRankSum=0.108;SC=TTTTAGTATCCATTTGAATTA;SOR=0.382;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=18;WE=62452903;WS=62452885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr3	62477211	.	AAC	A	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=59.23;NF=1;NR=7;PP=132;QD=17.25;SC=ATCAACGTACAACACACACAC;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8;WE=62477220;WS=62477201;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,8:0.33:24
chr3	62483906	rs62243490	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=658;ReadPosRankSum=-0.204;SC=AGGCATTAGTCGGGACGGCTG;SOR=0.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=48;WE=62483914;WS=62483896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,55:0.42:132
chr3	62484015	rs62243491	G	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=1.138;SC=TTTAGGAAATGTCATTTTTCC;SOR=0.090;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=62484023;WS=62484005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	62498378	rs1376917	G	A	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=17;PP=1144;SC=AAAACTGAATGTAACTCAACA;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=62498386;WS=62498368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	62501634	rs9863956	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=352;ReadPosRankSum=1.030;SC=TATACTCAGACGGACCACTGT;SOR=0.065;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=22;WE=62501642;WS=62501624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr3	62556622	rs833663	A	G	6797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=103;PP=2965;SC=ACCTAAGGGAAAGGAGAAAGA;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=99;TCR=103;TR=201;WE=62556630;WS=62556612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr3	62612013	rs2248008	C	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=574;SC=CAAGCTGGCACGGATTTACTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=62612021;WS=62612003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	62612145	rs2248013	C	A	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=37;PP=1387;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TGTGACTCTTCAAGCACAAAT;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=229;TCF=145;TCR=84;TR=99;WE=62612153;WS=62612135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,118:0.45:265
chr3	62612195	rs2248019	G	T	2961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=62;PP=1904;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CACAAAGACGGGACATCAAAT;SOR=0.736;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=291;TCF=147;TCR=144;TR=129;WE=62612203;WS=62612185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,147:0.42:350
chr3	62612280	rs2367310	C	T	5784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=123;PP=2965;SC=GAAGGAAGAACGTCTTAAATT;SOR=1.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=50;TCR=123;TR=173;WE=62612302;WS=62612270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	62612294	rs2367311	T	C	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=108;PP=2965;SC=TTAAATTTGCTAAGCCTTTTT;SOR=2.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=30;TCR=108;TR=138;WE=62612302;WS=62612270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	62612309	rs2367312	G	C	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=87;PP=2638;SC=CTTTTTTGTTGTACAAAGAAG;SOR=3.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=102;WE=62612317;WS=62612299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	62612342	rs2248023	T	C	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=51;PP=1471;SC=ACGTTTGGAGTTCCTTCTGCA;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=55;WE=62612350;WS=62612332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	62612385	rs1349591	G	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=90;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=569;SC=TTACTAACATGGTTTTTACTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=62612393;WS=62612375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	62631553	rs4588354	G	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=468;ReadPosRankSum=-1.402;SC=GAGGTTATTGGCAAGGCCCCT;SOR=1.027;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=29;WE=62631561;WS=62631543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr3	62636826	rs4688302	C	T	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1170;SC=GGTCTTTGTCCCATGGCCCAG;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=62636834;WS=62636816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	62647928	rs6770658	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=458;SC=TCAATAATCAATGTGCTTCCT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=62647936;WS=62647918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	62648267	rs112379731	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=0.892;SC=TGGTAGGCAGCTGCTAAGACA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=62648275;WS=62648257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	62739092	rs478123	A	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=13;PP=769;SC=CCACAGCTCTAGGCCCAGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=62739100;WS=62739082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	63437858	rs6806334	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=601;ReadPosRankSum=1.737;SC=GTGCATTCTATGTAATACTGA;SOR=0.422;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=49;WE=63437866;WS=63437848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr3	63437977	rs6793874	C	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=438;SC=TTTAAAAATCCCTCAAAAGTG;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=63437985;WS=63437967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	63466382	rs6772726	G	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CTGAACCAAGGGCAATGCTCT;SOR=0.081;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=63466390;WS=63466372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	63596277	rs6445369	A	C	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=743;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GTCTCACAATAATTTTTATTC;SOR=0.312;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=48;WE=63596285;WS=63596267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr3	63649259	rs7612738	G	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	63649492	rs7634688	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=283;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTTCTTTATAAATCACTCAGT;SOR=0.850;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=15;WE=63649500;WS=63649482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr3	63817430	rs2291533	G	C	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1583;ReadPosRankSum=-1.021;SC=AGCTTCAACAGTGTGAGTTTC;SOR=0.549;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=90;TCR=101;TR=94;WE=63817438;WS=63817420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,115:0.50:229
chr3	63821083	rs62253803	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=22;ReadPosRankSum=0.470;SC=ATAATAAAACAGTGTTACATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=63821091;WS=63821073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	63821914	rs2637982	C	G	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=12;PP=695;SC=GAAATGCCTACGGTAGTTTTC;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=63821922;WS=63821904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	63849473	.	C	CGCGGCG	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=110;QD=59.0;SC=CCATGGCGTGCGCGGCGGCGG;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=2;WE=63849481;WS=63849463;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr3	63898360	.	G	GGCAGCAGCA	447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=1.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	63967900	rs1053338	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=625;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATTCATCCGAAAATGGATGGC;SOR=0.533;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=42;WE=63967908;WS=63967890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr3	63968469	rs142586136	CGTT	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=177;ReadPosRankSum=0.566;SC=AGCACTCACACGTTGTATATT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=63968479;WS=63968459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	63982082	rs3774729	G	A	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.829;SC=AGTGCCAGCCGTGAACAATGT;SOR=0.694;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=76;WE=63982090;WS=63982072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,85:0.56:153
chr3	63996262	rs1046025	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTTTATACAGCTGACCTGGGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=63996270;WS=63996252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	64005226	rs2888013	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=573;ReadPosRankSum=0.383;SC=TAGGAGTAGAAGTACAACAAG;SOR=0.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=30;WE=64005234;WS=64005216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr3	64008510	rs3846221	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TATACACACATACTCACATAC;SOR=1.009;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=64008518;WS=64008500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr3	64009432	rs3836531	AT	A	624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.736;NF=7;NR=10;PP=435;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GGAGCTTAAAATTTTTTGAAA;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=17;WE=64009440;WS=64009422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr3	64133350	rs27673	A	G	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=58;PP=1983;SC=AGTGTTGGCCATCATAGGTCA;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=64133358;WS=64133340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	64145759	rs2306380	T	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=587;ReadPosRankSum=-2.043;SC=CGAACCTGAATAGACACAGAC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=41;WE=64145767;WS=64145749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr3	64145913	rs26942	T	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TTAAGGTGAGTCTCTACTAAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=64145921;WS=64145903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	64184676	rs695937	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=574;SC=GTGAGAAAGAGGAAAAAACCT;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=64184684;WS=64184666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	64518994	rs1017537	T	C	5100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=111;PP=2965;SC=TGTGATGTCCTCAAAAAAGCA;SOR=1.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=53;TCR=111;TR=164;WE=64519002;WS=64518984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	64525171	rs11130968	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=-2.260;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	64525177	rs11130969	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	64526610	rs11130970	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-1.742;SC=GACTATCCTCGCTGCACTGTA;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=64526618;WS=64526604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	64526651	rs3841969	CCAATGTG	C	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.062;NF=7;NR=1;PP=434;ReadPosRankSum=0.939;SC=TCCATACTAGCCAATGTGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=8;WE=64526665;WS=64526641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	64526717	rs3796384	G	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.234;NF=28;NR=13;PP=690;ReadPosRankSum=-1.271;SC=CATGCTTGCTGTCTGAATGGA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=41;WE=64526725;WS=64526707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr3	64526942	rs3796383	A	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=400;ReadPosRankSum=0.888;SC=AGGATGGGAAAGCATTTCCAG;SOR=1.309;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=28;WE=64526950;WS=64526932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr3	64527321	rs1373163	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.065;HP=7;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=459;ReadPosRankSum=1.396;SC=TCACAAAAAATAGGGTGTGAT;SOR=3.660;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=20;WE=64527329;WS=64527311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	64527336	rs1036919	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=0.099;SC=TGTGATGATCCGAGATGTGAA;SOR=2.939;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=19;WE=64527344;WS=64527326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr3	64527378	rs1036918	G	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=1010;SC=GACATTGTTCGCACTAAAACT;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=64527386;WS=64527368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	64527465	rs1036917	C	A,T	3288.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=42,34;NR=25,14;PP=1174,654;SC=TGAACAAAGACATCCTGTTCT;SOR=1.371;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=67,48;WE=64527473;WS=64527455;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.42:131
chr3	64554254	rs7635677	T	C	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=992;ReadPosRankSum=1.603;SC=GTTTTTTAATTACACGGAGTT;SOR=0.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=59;WE=64554262;WS=64554244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr3	64580169	rs13320542	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=707;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGACAAATTTCCTTTCTCCCT;SOR=0.490;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=42;WE=64580177;WS=64580159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr3	64589851	rs9985304	A	G	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=53;PP=1466;ReadPosRankSum=2.262;SC=GCCATGTCTGAGAATGTTAGC;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=98;TCR=110;TR=101;WE=64589859;WS=64589841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,119:0.48:250
chr3	64600829	rs56869336	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.268;SC=ACATCCAGTACGACAGTCATG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=64600837;WS=64600819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	64617042	rs6768487	G	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=162;ReadPosRankSum=-1.415;SC=TGAAAGCTCTGCCTCTGCATG;SOR=0.018;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=11;WE=64617050;WS=64617032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	64617070	rs6445420	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=0.162;SC=AGGAAGGAAGCAGTATCTGGC;SOR=0.091;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=13;WE=64617078;WS=64617060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	64617699	rs7640062	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=-1.168;SC=TAAAAATGACAAGAAAGTCAA;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=10;WE=64617707;WS=64617689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	64619048	rs11717158	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.677;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=0.437;SC=GCCCTGGCAACAGTGCACAGA;SOR=2.494;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=17;WE=64619056;WS=64619038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr3	64667059	rs73124286	G	T	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=57;PP=1818;SC=AAGAGAGATGGGAGGTTGATT;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=94;WE=64667067;WS=64667049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	65350694	rs55638583	A	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1069;ReadPosRankSum=0.088;SC=GGTGTGCAGAAGCCCTGTATC;SOR=0.535;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=62;WE=65350702;WS=65350684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,70:0.47:149
chr3	65353448	rs7634490	G	A	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=49;PP=1497;SC=TTTGGTTTACGTAGGAATCAT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=65353456;WS=65353438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	65416648	rs4688566	C	A	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=44;PP=1323;SC=TAATTCTTCACGCTTATGCCC;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=65416656;WS=65416638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	65425560	rs142043619	T	TCTG	854.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=735;ReadPosRankSum=0.366;SC=CAACCTTCTGTCTGCTGCTGC;SOR=1.276;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=15;WE=65425568;WS=65425550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr3	65464625	rs7636096	G	A	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=235;SC=TGGGTTAGAAGAGATATCTTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=65464633;WS=65464615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	65479068	rs7641222	A	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AGGTGAACTGAAATCTCCTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=65479076;WS=65479058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr3	65595659	.	A	G	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.63;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=58.62;NF=2;NR=6;PP=104;QD=17.3464015684;SC=AAGAGAAAGAAACTTTGATGT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=8;WE=65595667;WS=65595649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	65595659	.	A	AATAGACCATTCTGAGGTAGAAGGAAAGGAAGGAAAGAGAGAAGGGGAAGGAACTGGGAGAAGAGAAGGGGAGAGGGAGAGAGGAAGGGAAAGAG	1050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;MQRankSum=-0.230;QD=95.52;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr3	65607592	.	T	TCACACACACACA	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=1200;ReadPosRankSum=-1.221;SC=CCTGGACTTTTCACACACACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=65607600;WS=65607582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr3	65607637	rs3749455	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=4;PP=277;SC=GCCAAAGTCCAACTACTTACA;SOR=1.828;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=17;WE=65607645;WS=65607627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	66023592	rs28696109	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=4;PP=631;SC=GGAGGGAAGCAGGAAATCGAG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=66023600;WS=66023582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr3	66354911	rs813636	G	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=902;ReadPosRankSum=2.698;SC=GGGGAGGCTTGTGAGCTTCTG;SOR=0.368;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=55;WE=66354919;WS=66354901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,56:0.38:149
chr3	66419793	rs11277069	CCAGGTGTA	C	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=1238;ReadPosRankSum=1.172;SC=CTTCAATCAGCCAGGTGTACA;SOR=0.396;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=16;WE=66419808;WS=66419783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr3	66419942	rs1129179	A	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=2194;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TAGACGTGGCAAAGACAAGAA;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=64;WE=66419964;WS=66419932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,72:0.46:155
chr3	66419956	rs13874	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=2194;ReadPosRankSum=-1.544;SC=ACAAGAATTACGCTGGCAAAG;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=62;WE=66419964;WS=66419932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,70:0.46:153
chr3	66421147	rs332378	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=572;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TTTCTATTTATTGTGCAAAAT;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=34;WE=66421155;WS=66421137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr3	66428282	rs1046844	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GCCTGCAGTGCAAACCCTCTT;SOR=0.515;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=17;WE=66428290;WS=66428272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr3	66430811	rs2279290	T	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1247;ReadPosRankSum=0.122;SC=AAGCAAGTACTGGGCTTCCGC;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=87;TCR=74;TR=86;WE=66430819;WS=66430801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,99:0.54:182
chr3	66432680	rs332371	A	G	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1004;ReadPosRankSum=1.382;SC=TCTGCTTCACAGTTACTGAGG;SOR=0.636;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=68;WE=66432688;WS=66432670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,73:0.50:146
chr3	66433312	rs900172	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=-1.586;SC=AACACAGTGCAATTCTTTCAA;SOR=0.105;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=66433320;WS=66433302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	66433676	rs900171	A	G	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=1223;ReadPosRankSum=-1.063;SC=TCAGGGGTCAAGTGGTGCCGC;SOR=0.753;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=47;TCR=92;TR=73;WE=66433684;WS=66433666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr3	66433937	rs9872772	T	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GCATCTGAGATTCTGTCTCAG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=66433945;WS=66433927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	66434372	.	TCA	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-2.147;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr3	66444330	rs67550176	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.711;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=0.235;SC=AAGAAATAAATTGCATCCAGC;SOR=2.314;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=22;WE=66444338;WS=66444320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr3	66444615	rs6793110	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=355;ReadPosRankSum=1.501;SC=GGAAGCTGTCGCTGCTGATAT;SOR=1.759;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=21;WE=66444623;WS=66444605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr3	66451907	rs12494912	T	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=853;ReadPosRankSum=0.965;SC=ATTAGTCACATTGACCTGTTT;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=42;WE=66451915;WS=66451897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr3	66455797	rs3796148	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=0.710;SC=TGAAGTCCCCTGGGTGCATGC;SOR=0.339;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=20;WE=66455805;WS=66455787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr3	66463251	rs4856924	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.52;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	66463251	.	GCAC	ACAC,ACAG	379	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=29,11;NR=4,1;PP=379,207;QD=12.5385215923;SC=ACACCACACCGCACAGCAATC;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=33,12;WE=66463262;WS=66463241;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.94:35
chr3	66463254	rs12493943	C	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr3	66465259	rs4856928	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AAGGAAAGGGTGGCGTTTGGT;SOR=0.072;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=66465267;WS=66465249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	66550756	rs1403625	G	C	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.25;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	66550762	rs1403626	G	C	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.27;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	67048762	rs4856833	T	C	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=36;PP=1412;SC=ATAGCTGGAGTCGGGGCCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=67048770;WS=67048752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	67054649	rs13096789	T	C	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=66;PP=1537;ReadPosRankSum=-1.598;SC=TAGAGAGAATTGTTGGACGAC;SOR=0.885;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=274;TCF=122;TCR=152;TR=112;WE=67054657;WS=67054639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,132:0.43:307
chr3	67276059	rs9868022	G	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=160;SC=GGGAAATGGAGAGTAACCACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=67276067;WS=67276049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr3	67411166	rs902321	A	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=827;SC=ATGTGCATATAACTTCCTTTT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=67411174;WS=67411156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr3	68606548	rs7616164	G	T	5062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=96;PP=2965;SC=TATTGTGCCTGTTGAGAACCA;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=64;TCR=96;TR=159;WE=68606556;WS=68606538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	68782213	rs6549143	A	G	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=929;ReadPosRankSum=0.261;SC=ATTTTCTGCAAAGGGGCCATG;SOR=0.898;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=60;WE=68782221;WS=68782203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr3	68788363	rs1504301	G	T	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GGAAAACAAAGGCCAAATAAT;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=47;TCR=89;TR=67;WE=68788371;WS=68788353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr3	68788465	rs1504300	G	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=0.422;SC=TTAAATTTACGGTTGGTAAAT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=68788473;WS=68788455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	68801921	rs9835691	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=2.435;SC=CAACCCTAGGTTTCTTTGGGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=15;WE=68801929;WS=68801911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	69036678	rs4855540	G	C	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,62:0.37:168
chr3	69036683	rs4855541	G	A	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,64:0.37:171
chr3	69036707	rs4855542	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1258;ReadPosRankSum=0.004;SC=GCATATGCCTGGGTAGATGAA;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=82;WE=69036715;WS=69036697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
chr3	69036782	rs4855350	G	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=291;ReadPosRankSum=0.400;SC=TACATTAATAGAACTCTTCTT;SOR=0.600;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=21;WE=69036790;WS=69036772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr3	69037633	rs9310136	G	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.671;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr3	69038217	rs4855543	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=0.449;SC=AGGATATAACATGACTTTTCA;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=29;WE=69038225;WS=69038207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr3	69047141	rs4855544	G	A	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=1896;ReadPosRankSum=2.264;SC=GTACTGAAGCGGAGAGCACAT;SOR=0.709;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=112;WE=69047149;WS=69047131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,139:0.53:261
chr3	69053447	rs9860095	A	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=1.091;SC=AACATTTTCCATTTGAGAGTC;SOR=0.693;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=14;WE=69053455;WS=69053437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	69054266	rs11417320	A	AT	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=1056;ReadPosRankSum=0.084;SC=TTTATACTAGATGTTAACATT;SOR=0.892;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=31;WE=69054274;WS=69054256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr3	69054341	rs6781612	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=43;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.906;SC=GATTGGTTGCTCTGCAGTACT;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=117;TCR=85;TR=104;WE=69054349;WS=69054331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,114:0.49:232
chr3	69058783	rs56761230	C	T	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=27;PP=1257;ReadPosRankSum=0.306;SC=AGAAATAATACCTACCTTATA;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=79;WE=69058791;WS=69058773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,92:0.64:143
chr3	69088918	rs146136734	T	TC	71.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=39;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTTTATCTAATAGTAACATAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=69088926;WS=69088908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	69091640	rs9985501	C	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=607;SC=CCCAGAGTTACACACTTTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=69091648;WS=69091630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	69093598	rs2271118	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=203;SC=AGTATACAGGTTTCCAGAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=69093606;WS=69093588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	69096614	rs2292199	G	A	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=87;PP=2965;SC=TTATTGGTGTGGAAGAAACCA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=174;WE=69096622;WS=69096604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr3	69104695	rs6549179	T	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=19;PP=675;SC=GAAAAAATATTATTAATACAA;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=69104703;WS=69104685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	69104752	rs6549180	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=12;PP=338;SC=AAACAAACTACAGAGTATTAC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=69104760;WS=69104742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	69106304	rs59405823	CC	TG	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.770;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=795;ReadPosRankSum=-1.175;SC=AGTTACACAACCCATCCAAGA;SOR=1.251;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=20;WE=69106313;WS=69106294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,24:0.31:78
chr3	69137539	rs3853159	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=236;SC=TGTTCAACAATGGTTCCATCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=69137547;WS=69137529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	69169080	.	T	G	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=568;ReadPosRankSum=-1.579;SC=CTTCATCTGTTTCTTGGATAT;SOR=0.326;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=34;WE=69169088;WS=69169070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr3	69225588	rs11128118	T	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=15;PP=1173;SC=ACCCCTGAACTAGATTATCTG;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=61;WE=69225596;WS=69225578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	69225875	rs9872199	T	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=581;SC=TTAAGGTCATTCAGAGGTACA;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=69225883;WS=69225865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	69225911	rs9868107	A	G	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=287;SC=TCAGAGGAGAAATTTAAGAGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=69225919;WS=69225901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	69229976	rs12054011	G	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=5;PP=723;SC=CATGATCCGTGAGGCGGTTTT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=69229984;WS=69229966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	69230026	rs9818314	T	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=19;PP=1203;SC=ATCCAGGTGTTGCGTGTTTTT;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=69230034;WS=69230016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	69230061	rs9831516	G	A	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=28;PP=1661;SC=TGAAGAGTACGAGGATGCACG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=69230069;WS=69230051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	69230801	rs9836305	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=43;PP=1246;SC=CGGAGAGCAGGTGGGACTGGG;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=69230809;WS=69230791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	69242770	rs11310698	CA	C	1723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=18;PP=808;SC=GTAGGGGACTCAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=48;WE=69242778;WS=69242760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	69244162	rs9853587	G	A	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=17;PP=1239;SC=GCTCAGAGGCGTTGTTCATAC;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=69244170;WS=69244152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	69245454	rs9310141	T	C	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=74;PP=2965;SC=TGACTTTTCGTCTCCAGTGTC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=146;WE=69245462;WS=69245444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr3	69245949	rs9860235	G	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=353;SC=AAATCTCAGAGAGCAAAAATA;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=69245957;WS=69245947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	69246152	rs13059488	A	G	5515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=85;PP=2965;SC=TGCACAAACAAGCCACTTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=173;WE=69246160;WS=69246142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	69246274	rs13059687	A	G	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=78;PP=2335;SC=ATTGTAACAAAGCATGTTCCT;SOR=1.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=28;TCR=78;TR=106;WE=69246282;WS=69246264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	69265291	rs7643175	T	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQ=59.98;NF=21;NR=1;PP=579;SC=GGCGACAAAGTGAGACTCCAT;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=69265312;WS=69265281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	69265304	rs77475566	C	CA	1023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=27;NR=3;PP=753;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAACC;SOR=4.112;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=30;WE=69265312;WS=69265281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	69265371	rs62254460	G	C	4952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=53;PP=2919;SC=TGATTAACATGTTTTGAACAG;SOR=1.231;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=146;WE=69265379;WS=69265361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	69267578	rs4855301	A	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=540;SC=TAGTTAGAGGACCCTTTTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=69267586;WS=69267568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	69271206	rs6549189	T	C	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=41;PP=1208;SC=GTAGATAGAGTTTGGCTTTTG;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=69271214;WS=69271196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	69273656	rs9848940	G	T	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=24;PP=2680;SC=GATTGGCAATGTGATATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=90;TCR=24;TR=114;WE=69273664;WS=69273646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	69299185	rs73099842	C	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1545;ReadPosRankSum=0.424;SC=GCAGTTTGTCCAATCTTACCT;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=183;TCF=105;TCR=78;TR=91;WE=69299193;WS=69299175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr3	69299233	rs4361282	C	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1434;ReadPosRankSum=1.014;SC=TGGTTTCGCTCTCTACTTCGA;SOR=0.700;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=201;TCF=101;TCR=100;TR=97;WE=69299241;WS=69299223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,115:0.49:234
chr3	69341983	.	TG	T	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.4999;HP=16;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=32;QD=17.5;SC=TTTTTTTTTTTGCAAAAGGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=2;WE=69341991;WS=69341979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr3	69359704	.	A	AAC	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;MQRankSum=-2.993;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.995;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr3	69359730	rs142506790	CACAGAGAGAGAGAG	C	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.187;NF=2;NR=27;PP=647;ReadPosRankSum=3.371;SC=CACACACACACACAGAGAGAG;SOR=2.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=29;WE=69359751;WS=69359718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr3	69362706	rs1483895	C	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=734;ReadPosRankSum=0.467;SC=GTCAGGGCCACGGCTGGCAAG;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=50;WE=69362714;WS=69362696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr3	69362722	rs2314992	C	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=405;ReadPosRankSum=-1.485;SC=GCAAGCAAACCTTTGGACTCG;SOR=0.497;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=22;WE=69362730;WS=69362712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
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chr3	71064872	rs151011253	T	TA	757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.142;NF=1;NR=21;PP=569;ReadPosRankSum=-1.877;SC=CAGACGAGGATAAAAAAGGCA;SOR=0.696;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=22;WE=71064880;WS=71064862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr3	71247572	rs56850311	A	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.200;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.406;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr3	72495777	rs13066407	C	G	6025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=115;NR=93;PP=2965;SC=TTTGGCCTTCCGAGGAGTGGA;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=115;TCR=93;TR=208;WE=72495785;WS=72495767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr3	72495945	rs13088771	A	G	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=119;PP=2965;SC=ACTGGAAGAGAGAGCGAGGAA;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=68;TCR=119;TR=187;WE=72495953;WS=72495935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr3	72873729	rs17690898	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=523;ReadPosRankSum=0.033;SC=AAAGAACTTACTATACAGGAT;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=31;WE=72873737;WS=72873719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr3	73004157	rs1532190	T	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=332;ReadPosRankSum=2.174;SC=GTAGCATTATTTACCTATCAG;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=19;WE=73004165;WS=73004147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr3	73016974	rs3821379	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=433;ReadPosRankSum=0.260;SC=CCCAAAGCATAGAGTTATACC;SOR=0.093;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=23;WE=73016982;WS=73016964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr3	73024350	rs1052278	C	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=801;ReadPosRankSum=-0.454;SC=TGTCTTGTGACCAAGGAAATA;SOR=0.478;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=60;WE=73024358;WS=73024340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr3	73046508	rs9834246	G	C	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.35;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	73046544	rs9310254	T	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	73046561	rs9873229	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr3	73096591	rs71277513	A	ATAAT	705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.814;NF=0;NR=14;PP=706;ReadPosRankSum=0.124;SC=TGTCTGGTTGATGATTGATTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=73096599;WS=73096581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr3	73110076	rs726029	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=303;ReadPosRankSum=-3.186;SC=GAATCAATGGGAATTTAACCC;SOR=0.678;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=22;WE=73110084;WS=73110066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr3	73111368	rs2231924	T	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=546;ReadPosRankSum=-1.888;SC=GAACCAATTTTCCACAATGTC;SOR=0.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=32;WE=73111376;WS=73111358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr3	73111809	rs2231926	A	G	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=913;ReadPosRankSum=1.400;SC=TTTGATAGGCATTGCGGCTGG;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=127;TCF=58;TCR=69;TR=61;WE=73111817;WS=73111799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr3	73111973	rs2231928	A	G	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=965;ReadPosRankSum=-1.048;SC=GCTCAAGACCATGGGTTGGAG;SOR=0.802;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=60;WE=73111981;WS=73111963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr3	73111998	rs1060584	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.054;NF=30;NR=34;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.201;SC=AATGTTCACACTTCTATTTGG;SOR=0.626;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=64;WE=73112006;WS=73111988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,90:0.47:192
chr3	73112919	rs3841614	T	TA	666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.137;NF=2;NR=8;PP=334;ReadPosRankSum=-0.250;SC=AGATTTTTAATACCTACAGAG;SOR=0.434;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=10;WE=73112927;WS=73112909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr3	73112974	rs11708712	A	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=0.695;SC=TGTACTTTTTAAAAATTGGGC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=15;WE=73112982;WS=73112964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	73434086	rs6787588	A	G	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=62;PP=1804;SC=CTTCTTCTGCATAAACACAAG;SOR=1.454;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=92;WE=73434094;WS=73434076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	73437112	rs6549532	A	G	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=45;NR=48;PP=1675;SC=GTAGGAAGCCAATTTACCTGG;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=73437120;WS=73437102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	73437225	rs3830251	T	TA	647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.741;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.550;NF=5;NR=18;PP=465;ReadPosRankSum=-2.026;SC=ATTAATCTTTTAAAAAAAAAG;SOR=1.781;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=23;WE=73437233;WS=73437215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
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chr3	73450198	rs3816831	G	A	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=39;PP=1269;SC=CCCTTCTTCCGTTGTCAGTAT;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=73450206;WS=73450188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	73453201	rs2291464	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=658;SC=TGGAGGAAAACTATAGGGTGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=73453209;WS=73453191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	73453325	rs2291463	C	T	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=50;PP=2172;SC=AGGGATCCAGCACGGGTGGGC;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=109;WE=73453333;WS=73453315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr3	73651621	rs11343439	TA	T	1037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.316;NF=4;NR=35;PP=670;ReadPosRankSum=-0.803;SC=TCCTTTGGGTTAAAAAAAAAA;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=39;WE=73651630;WS=73651611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr3	73673523	rs112594802	G	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=640;ReadPosRankSum=0.625;SC=TGCTCGCCGTGCGTCAAGGGT;SOR=0.381;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=42;WE=73673531;WS=73673513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr3	73673578	rs6763344	G	C	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=15;PP=839;SC=GCGCGTCGCAGGCGTCGCGCA;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=73673586;WS=73673568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	74315580	rs615824	C	G	5384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=47;PP=2965;SC=CTCACTATGGCGGATAGTAAC;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=115;TCR=47;TR=162;WE=74315588;WS=74315570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	74344134	rs1352475	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=285;ReadPosRankSum=0.713;SC=ATGGAACATCAGATGAAACAA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=20;WE=74344142;WS=74344124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr3	74413676	rs6549590	T	C	2653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1366;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CTGCTATGCATTGGAACATGC;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=93;WE=74413684;WS=74413666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,127:0.51:247
chr3	74474166	rs7619184	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=441;SC=AGACCTTCCTTTCTTTTAGAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=74474174;WS=74474156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	75386297	rs6769147	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.567;NF=8;NR=8;PP=209;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GGATACAAAGGCTGTGCTGAG;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=16;WE=75386305;WS=75386287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr3	75386380	rs4677501	T	G	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=18;PP=534;SC=ATGACTTCAGTGGGTGGATTC;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=75386388;WS=75386370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	75679893	rs200917196	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.50;MQRankSum=-3.016;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.287;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
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chr3	75679958	rs200114452	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=1.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.55;MQRankSum=-2.809;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,24:0.15:164
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chr3	75680122	.	C	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.83;MQRankSum=1.910;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
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chr3	75680148	rs199578100	A	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr3	75781044	rs150868127	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.23;MQRankSum=-1.645;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	75781107	.	G	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	75781109	.	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	75781115	.	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	75781165	rs144578658	A	G	32.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr3	75786572	rs149841758	T	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.68;MQRankSum=-0.705;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
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chr3	75786737	rs78297221	A	T	2903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.944;NF=39;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GTTTTTCCACATTCATTACAT;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=67;WE=75786768;WS=75786727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,78:0.42:187
chr3	75786748	rs112332186	C	T	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.654;NF=40;NR=34;PP=2962;ReadPosRankSum=0.552;SC=TTCATTACATCCATACGGTTT;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=97;TCR=83;TR=74;WE=75786768;WS=75786727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,86:0.41:211
chr3	75786753	rs3009020	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=5.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-0.834;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,39:0.19:209
chr3	75786760	rs145576551	TC	T	3370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.199;NF=19;NR=38;PP=2966;ReadPosRankSum=0.395;SC=ATACGGTTTTTCCCCGTGTGA;SOR=0.799;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=139;TCF=43;TCR=96;TR=57;WE=75786768;WS=75786727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,93:0.43:218
chr3	75786832	rs11122676	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=3.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-1.624;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,53:0.27:193
chr3	75786833	rs139448820	G	A	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.014;NF=33;NR=39;PP=2096;ReadPosRankSum=0.345;SC=CATTACATACGTAAGGTTTCT;SOR=0.645;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=79;TCR=95;TR=72;WE=75786853;WS=75786822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,77:0.41:190
chr3	75786845	rs62250105	T	C	2695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.824;NF=30;NR=38;PP=2096;ReadPosRankSum=0.325;SC=AAGGTTTCTCTCCTGTGTGAG;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=68;WE=75786853;WS=75786822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,73:0.40:181
chr3	75786888	rs1615736	C	T	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.057;NF=27;NR=27;PP=2465;ReadPosRankSum=0.231;SC=TGACTTCTGACGAAAGGTTTT;SOR=0.631;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=54;WE=75786902;WS=75786878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,52:0.41:128
chr3	75786894	rs144168413	GT	G	1782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.939;NF=19;NR=23;PP=2469;ReadPosRankSum=-0.041;SC=CTGACGAAAGGTTTTTCCACA;SOR=0.572;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=42;WE=75786902;WS=75786878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,49:0.42:117
chr3	75787049	rs201485350	C	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.32;MQRankSum=-1.226;QD=23.94;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr3	75787057	rs145650973	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.11;MQRankSum=-0.067;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr3	75788085	rs201605431	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.11;MQRankSum=-4.584;QD=0.46;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,9:0.10:87
chr3	75788105	.	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQRankSum=-5.290;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,10:0.09:106
chr3	75788109	.	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQRankSum=-5.360;QD=0.87;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,10:0.09:108
chr3	75788114	rs375615433	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.38;MQRankSum=-5.536;QD=0.82;ReadPosRankSum=1.500;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,10:0.09:107
chr3	75788130	.	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.45;MQRankSum=-5.605;QD=0.75;ReadPosRankSum=2.094;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,10:0.09:109
chr3	75788137	rs199883677	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.59;MQRankSum=-5.908;QD=0.69;ReadPosRankSum=1.694;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,10:0.09:114
chr3	75790783	.	G	GGTCTCCAGCATCATGTCCCTGTACAGGTTTCTTCTGAGCATCATCCAGGTCCTGCTACTCCTCCCAGGTGAAGTGCATAGCTACCTCCTCAAAGGATGCCAACTCCTGTAATGATAGCAGGCTGTTATAA	2073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=9.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.81;MQRankSum=-4.780;QD=22.30;ReadPosRankSum=-3.894;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr3	75790798	.	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=11.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQRankSum=-1.555;QD=3.85;ReadPosRankSum=-2.791;SOR=1.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,13:0.16:79
chr3	75986663	rs12171318	C	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQRankSum=-4.945;QD=20.67;ReadPosRankSum=1.652;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	75986686	rs62269817	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.255;NF=44;NR=13;PP=721;ReadPosRankSum=-2.659;SC=GGATGTGGACATGGGCTCCGG;SOR=0.354;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=57;WE=75986703;WS=75986676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr3	75986695	rs79015247	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQRankSum=-2.967;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,18:0.18:102
chr3	75986717	rs78834776	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-1.447;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,43:0.32:136
chr3	75986719	rs62269818	G	C	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQRankSum=-6.317;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,92:0.67:137
chr3	75986794	.	G	A	1763	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MMLQ=28;MQ=50.17;NF=47;NR=75;PP=1763;QD=14.735829611;SC=AGTTGGATGCGAATTTCACTT;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=122;WE=75986802;WS=75986784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:74,122:0.62:196
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chr3	75986833	.	C	T	1031	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=24;MQ=49.82;NF=3;NR=49;PP=1031;QD=20.4956002413;SC=GTCTTTGGTTCGACGTTTAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=120;TCF=27;TCR=93;TR=52;WE=75986841;WS=75986823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
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chr3	78711350	rs9864412	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TGTTCATTCATAGCAACTCTC;SOR=0.343;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=9;WE=78711358;WS=78711340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr3	87275442	rs72591121	G	GA	159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.82;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	87295049	rs11540913	T	C	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=498;SC=CAATGTCTACTACAGCAAAAG;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=87295057;WS=87295039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	88040682	rs6301	T	A	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1676;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TTGATAAAATTCATAGCACAG;SOR=0.724;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=235;TCF=118;TCR=117;TR=102;WE=88040690;WS=88040672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,119:0.46:261
chr3	88188420	rs9813894	G	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1117;SC=ACAGCTCTCAGTACTTCCAAA;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=88188428;WS=88188410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	88189341	rs7653652	T	C	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=68;PP=2607;SC=AGTCACAGGATATTTCAGGCT;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=123;WE=88189349;WS=88189331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr3	88190768	rs7432826	C	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=52;PP=1872;SC=ATAAAACTTGCATTAACAGAT;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=94;WE=88190776;WS=88190758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	88190809	rs7432838	C	T	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=56;PP=1642;SC=CTGATGAAAACGGTTCAGAAA;SOR=1.408;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=83;WE=88190817;WS=88190799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	88199179	rs6551277	T	C	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=121;NR=71;PP=2965;SC=TTGTTGCCGTTGTCTTTCCCC;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=121;TCR=73;TR=192;WE=88199193;WS=88199169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr3	88199185	rs11374933	T	TC	6476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=81;PP=2979;SC=CCGTTGTCTTTCCCCCCCAGT;SOR=1.054;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=130;WE=88199193;WS=88199169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr3	88199298	rs6551278	T	C	7206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=141;PP=2965;SC=TATGCGACACTGTCACCAACC;SOR=1.035;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=101;TCR=141;TR=242;WE=88199306;WS=88199288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr3	89498619	rs1028011	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=329;SC=CTCCTGGTTTATAACACTGAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=89498627;WS=89498609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	90264768	rs6803112	A	G	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=34;PP=1408;SC=TTCACTTTCCACTTTCTGAGG;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=79;WE=90264776;WS=90264758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	90276511	rs9815264	G	A	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=18;PP=830;SC=AAGTATCTAGGATCTCTCATT;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=90276519;WS=90276501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	90276661	rs9815542	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=1060;SC=GAGCACACATGTTCTCAGAGC;SOR=1.421;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=90276669;WS=90276651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	93593119	rs6123	T	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.483;NF=40;NR=17;PP=826;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TCCAAACTGATGGACATGAGT;SOR=0.998;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=57;WE=93593127;WS=93593109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,59:0.44:134
chr3	93643009	.	TGG	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr3	93646396	rs8178610	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GAAAAAAATGCAGATACAGAA;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=93646404;WS=93646386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	94225786	rs1906643	G	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.896;NF=13;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=1.456;SC=TTCTTTATATGCTGAAATAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=14;WE=94225794;WS=94225776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr3	97194422	rs7624823	T	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=304;SC=AGGGATCCCATAAGAATCCAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=97194430;WS=97194412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	97356617	rs62262805	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TGCTTATCTTCATTTGATCCA;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=97356625;WS=97356607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	97503750	rs138194402	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=0.519;SC=TAAACATGGAAAAATTTATAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=15;WE=97503758;WS=97503740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr3	97591153	rs17301717	C	T	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1609;ReadPosRankSum=-2.603;SC=GAACCGGTTTCTCAGACTAAC;SOR=0.734;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=96;WE=97591161;WS=97591143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,120:0.47:254
chr3	97593485	rs2279897	C	T	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.236;SC=TTGACAATCTCGTGGAAGCAG;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=76;WE=97593493;WS=97593475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr3	97607290	rs13065340	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=485;ReadPosRankSum=0.980;SC=CATTACATCCGCTTCAAATGG;SOR=0.525;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=32;WE=97607298;WS=97607280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr3	97660084	rs11544446	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=295;ReadPosRankSum=-0.904;SC=CATCTGTGTGCATTTCTCCCT;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=22;WE=97660092;WS=97660074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr3	97660198	rs832089	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	97666183	rs2307808	TCTC	T	1935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.056;NF=18;NR=16;PP=1430;ReadPosRankSum=1.274;SC=AGACAGGAAATCTCCTCCTCT;SOR=0.658;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=34;WE=97666193;WS=97666173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr3	97673268	rs832079	A	C	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1094;SC=TCACGTGAGTAGAGTGGGCCA;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=97673276;WS=97673258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	97677897	rs55907650	T	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=634;ReadPosRankSum=1.319;SC=TCACATACCTTCAGCATAAAC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=39;WE=97677905;WS=97677887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr3	97686575	rs699304	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=0.811;SC=CCATTACACCTTCGTGAGAAC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=97686583;WS=97686565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
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chr3	97727753	rs832029	G	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=681;ReadPosRankSum=-1.562;SC=GTATGTGATGGTGTGTTCAAA;SOR=0.865;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=38;WE=97727761;WS=97727743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr3	97731434	rs11426005	C	CA	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.936;NF=0;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.251;SC=AAAAAGAGACCAAAAAAACCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=8;WE=97731442;WS=97731424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr3	97805954	rs13082722	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=388;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AATAAAATGCTACCGCTTTGT;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=21;WE=97805962;WS=97805944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr3	97806616	rs4518168	G	A	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1042;ReadPosRankSum=0.144;SC=ACGCACTAATGATATTTATTT;SOR=1.309;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=61;WE=97806624;WS=97806606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr3	97983782	rs185693793	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.92;MQRankSum=-0.888;NF=16;NR=17;PP=590;ReadPosRankSum=0.689;SC=TTTTTATTTTCGCAGGTTCTG;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=33;WE=97983790;WS=97983772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr3	98001777	rs72487753	G	C	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=23;PP=2428;SC=ATTGCTGACAGAGTTTGTTCT;SOR=2.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=84;TCR=23;TR=107;WE=98001785;WS=98001767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	98002419	rs16839214	A	G	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=19;PP=1034;SC=TCTTTTCACAATCCTAAAAAA;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=98002427;WS=98002409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	98002587	rs16839611	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=51;PP=1767;SC=TTATACAATCATAATTCCTTT;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=98002595;WS=98002577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	98073591	rs11288615	TA	T	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.236;NF=5;NR=28;PP=750;ReadPosRankSum=-0.942;SC=TAAATGTTCTTAAAAAAATTA;SOR=0.798;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=33;WE=98073599;WS=98073581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr3	98110406	rs144759043	G	GA	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.146;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	98188365	rs9861575	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=684;ReadPosRankSum=-0.093;SC=AATAACTGTGGCATATTATAA;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=36;WE=98188373;WS=98188355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr3	98225660	rs3762660	T	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=806;ReadPosRankSum=0.136;SC=CACATGATCTTTAGGACCTCA;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=54;WE=98225668;WS=98225650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr3	98240317	rs142862428	T	TA	1180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GAAGATAAGTTAGAGTTTACG;SOR=0.280;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=28;WE=98240325;WS=98240307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr3	98241836	.	G	GGCCGC	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=2.995;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr3	98252027	rs1529047	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CAACAAAGAAGGAAGTGTTAA;SOR=0.072;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=98252035;WS=98252017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	98281349	rs9850648	G	T	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=89;PP=2622;SC=TCTAATAGCTGGTATCAAAAT;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=45;TCR=89;TR=134;WE=98281357;WS=98281339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	98304467	rs1729995	T	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=690;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TGCCCCGCCGTTCTCCACGAT;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=41;WE=98304475;WS=98304457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr3	98475083	rs893832	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.113;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	98490141	rs844160	A	T	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=538;SC=ACCCTTATTAATTTGTGGCTT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=98490149;WS=98490131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	98503683	rs704585	C	T	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=24;PP=1918;SC=TTTCTACTTGCGCAACAAGTG;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=88;WE=98503691;WS=98503673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	98518160	rs62821060	T	TA	534.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.814;NF=12;NR=8;PP=374;ReadPosRankSum=-1.128;SC=CACTAATAATTAAAAAAAAAA;SOR=0.582;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=20;WE=98518168;WS=98518150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr3	98540982	rs852701	A	G	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=768;SC=TAACAGTGATACTGCTGAGAT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=98540990;WS=98540972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	98541012	rs866873	G	A	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=10;PP=1296;SC=TCTTAGCCCAGTGCTACCCAG;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=98541020;WS=98541002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	98541116	rs828616	G	A	7407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=102;PP=2965;SC=CATAATAGGGGATACCTTTAC;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=122;TCR=102;TR=224;WE=98541124;WS=98541106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr3	98541422	rs828617	G	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=438;SC=CAAAAGATAAGGATATATGAT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=98541430;WS=98541412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	98541633	rs828618	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=635;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GTATTTTACAGGGAAAAAAGC;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=40;WE=98541641;WS=98541623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr3	98542485	rs142035943	G	GAAGAA	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=488;SC=ATTCTGCTATGAAGTCATGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=98542493;WS=98542475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	98544353	rs828622	G	A	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=19;PP=579;SC=TAAAAACTTTGCCAACTTTTG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=98544361;WS=98544343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	99536937	rs1718240	C	T	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=58;PP=1561;SC=GGAGCCCTTCCGTGCGCCTCA;SOR=3.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=65;WE=99536945;WS=99536927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	100053684	rs3830303	C	CG	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=122;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GTTCGGGCCGCGGGGGAGGCT;SOR=0.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=100053692;WS=100053674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr3	100067468	rs277649	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=1.436;SC=CTTACGTGTTCGTATTAAAGG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=100067476;WS=100067458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	100086861	rs277640	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=-1.247;SC=AGCTACCATATATTTCCTAAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=14;WE=100086869;WS=100086851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	100092526	rs11384494	A	AG	765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr3	100092527	.	G	GGTGC	1253	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=15;PP=1253;QD=86.4;SC=AATTCAACTAGTCCAGTTAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=15;WE=100092536;WS=100092517;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,15:0.39:38
chr3	100092528	.	T	A	1261	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=15;PP=1261;QD=71.987289586;SC=ATTCAACTAGTCCAGTTAAGT;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=18;WE=100092536;WS=100092517;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,18:0.43:42
chr3	100092528	rs3832198	T	TGCA	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr3	100170553	rs7641299	G	A	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1184;ReadPosRankSum=0.572;SC=TTTTCATTCTGTATTCTCAGC;SOR=0.853;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=69;WE=100170561;WS=100170543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr3	100277476	rs7645690	G	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=571;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CTCTTTGCCTGTAACTTCTCT;SOR=0.982;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=32;WE=100277484;WS=100277466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr3	100277514	rs7645700	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=216;ReadPosRankSum=-1.497;SC=GTTTGCTCCCGGAGACTTCCC;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=13;WE=100277522;WS=100277504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	100295733	rs7427360	A	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.396;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=972;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CTATTTTAAAAACCGTCTAAC;SOR=1.037;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=52;WE=100295741;WS=100295723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr3	100354524	rs1144122	A	G	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=38;PP=2589;SC=AAAACAGGTAAAGGATGTCAC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=79;TCR=38;TR=117;WE=100354532;WS=100354514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	100354698	rs1718281	T	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.36;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	100368692	rs1144118	A	G	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=59;PP=1751;SC=AGAAATTGCTATCTTGATATA;SOR=1.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=100368700;WS=100368682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	100472848	rs905604	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=139;ReadPosRankSum=0.191;SC=TTTGCTTTGTTTTGGAAATTG;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=100472856;WS=100472838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	100554525	rs79498378	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=1.111;SC=GCAATACAATAAACAATGGAG;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=22;WE=100554533;WS=100554515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr3	100558508	rs113833109	C	T	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=836;ReadPosRankSum=0.602;SC=GAAGTGGCATCGTGAGGAGGG;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=60;WE=100558516;WS=100558498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr3	100558547	rs113915012	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=774;ReadPosRankSum=1.165;SC=TGGGACACTACCTAAATGATG;SOR=0.750;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=47;WE=100558555;WS=100558537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr3	100559117	rs78799633	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TTTACTGTGGACATGTTTCCA;SOR=0.582;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=100559125;WS=100559107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr3	100565031	rs6774830	G	C	379.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=269;ReadPosRankSum=-1.277;SC=GAACATTGCTGAGAGCAATGC;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=13;WE=100565039;WS=100565030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr3	100581261	rs10567225	AT	A	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.250;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.504;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr3	100583033	.	C	CAATA	2451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=1710;ReadPosRankSum=0.241;SC=ACAGAGCAGCCAATACCTTTA;SOR=0.638;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=92;TCF=9;TCR=83;TR=33;WE=100583041;WS=100583023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,64:0.45:141
chr3	100594326	rs3839090	CGGCATA	C	1846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=1643;ReadPosRankSum=1.077;SC=TGCTTAATCTCGGCATAGATT;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=32;WE=100594339;WS=100594316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,50:0.41:122
chr3	100595596	rs13434191	G	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=0.754;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.274;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	100604389	rs200411886	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=202;ReadPosRankSum=-1.024;SC=CCACTGTGTGGTCTTGGTCAT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=14;WE=100604397;WS=100604379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	100605206	rs1987384	A	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=367;SC=AAAATCACAGAGGGATTCAGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=100605214;WS=100605196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	100617532	rs41273553	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr3	100621426	rs2576365	C	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=705;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GTTCAAAGTTCATAAAAGAAA;SOR=0.531;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=48;WE=100621434;WS=100621416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,53:0.45:118
chr3	100621683	rs41273557	TC	AA	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=375;ReadPosRankSum=1.294;SC=AGTTGACACTTCCTGAGAAGT;SOR=0.160;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=100621692;WS=100621673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	100945069	rs146849728	TTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	T	317.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=1459;SC=CTTCTAAACTTTATATATATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=100945114;WS=100945059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	100945983	rs486352	A	T	175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=166;SC=TGTGCTAAAAATTTTTTTAAT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=100945991;WS=100945973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	100946742	rs521661	T	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=55;PP=1867;SC=AAGGGGCAGGTGTTCCACTCA;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=91;WE=100946750;WS=100946732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	100949842	rs348867	G	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=20;PP=951;SC=GGTGTGCTTGGAGAGTCCTGA;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=45;WE=100949850;WS=100949832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	100963154	rs571391	G	A	4936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=62;PP=2965;SC=TGGAAAGTGTGTGGATCTGTC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=149;WE=100963162;WS=100963144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	100976755	rs7613046	G	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=33;PP=1016;SC=TCTCTGAAAAGCCTGGACAAC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=100976763;WS=100976745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	100992385	rs348866	C	T	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=1;PP=635;SC=ACTAACATAGCAGGCATACTG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=100992393;WS=100992375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	100994497	rs533852	C	T	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=28;PP=1246;SC=CAAAACAGAGCATCACTCACA;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=100994505;WS=100994487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	101038339	rs546090	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=847;SC=CTAAATTATCGTAAATTTTGA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=101038347;WS=101038329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	101039107	rs573908	A	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=303;SC=TGGAAAGATAAAAACAAATGT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=101039115;WS=101039097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	101046671	rs9849770	C	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=601;ReadPosRankSum=2.493;SC=CTGAAATAATCAACAAATAAG;SOR=0.265;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=38;WE=101046679;WS=101046661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr3	101051794	rs2068494	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ATTGAAATATCTTAAATTTAG;SOR=0.180;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=101051802;WS=101051784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	101060716	rs6441598	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.764;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=1.987;SC=AATGTGACTTTAAAAATCCCT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=11;WE=101060724;WS=101060706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr3	101066717	rs2433031	T	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TATACTCACATTGCTGGCTTA;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=11;WE=101066725;WS=101066707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr3	101066964	rs7636229	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.732;SC=AAACATTATATGACACTTGTT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=101066972;WS=101066954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	101066992	rs2553421	A	T	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=104;SC=TACTTTTTTTAAAAAAAAGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=101067000;WS=101066982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	101070420	rs75017790	A	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=-2.199;SC=TATACTAAAAACTATAGTAAA;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=101070428;WS=101070410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	101080694	rs7616677	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=303;ReadPosRankSum=0.099;SC=ATGGGCATAATTCAGATGACA;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=17;WE=101080702;WS=101080684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr3	101085413	rs939443	G	A	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1024;ReadPosRankSum=-2.140;SC=AGTTCTCAACGGTTTCAGTGG;SOR=0.672;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=66;WE=101085421;WS=101085403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,78:0.39:201
chr3	101085683	rs58636547	TAAAAA	T	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=96;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTTAAATTCCTAAAAAAAAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=101085695;WS=101085673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	101136385	rs4482646	C	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=419;ReadPosRankSum=2.590;SC=GTACGGGATTCATATTATTTC;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=22;WE=101136393;WS=101136375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr3	101136402	rs9859077	G	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=350;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TTTCAAATGTGGTAAGTTGAA;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=22;WE=101136410;WS=101136392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr3	101177644	rs12496159	A	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=505;ReadPosRankSum=-0.950;SC=AAAATCACAGAAAGTTAGAGA;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=101177652;WS=101177634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
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chr3	101219889	rs7621830	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=243;ReadPosRankSum=0.904;SC=AAAGATAATAGGTTAAAAGCA;SOR=0.706;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=18;WE=101219897;WS=101219879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr3	101231871	rs9681493	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=374;ReadPosRankSum=-1.385;SC=CAGCTGCCGCCTGCGCCTCCC;SOR=0.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=23;WE=101231879;WS=101231861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr3	101231921	rs9682313	T	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=438;ReadPosRankSum=-0.988;SC=AGCCCTTCTCTGACCCTTTCT;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=30;WE=101231929;WS=101231911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr3	101299031	rs144008875	CAAT	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=163;ReadPosRankSum=-2.352;SC=AATTTTATCTCAATAAAGCTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=101299041;WS=101299021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	101304414	rs3804776	G	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GAAGGTATTAGTGGCAAATTA;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=13;WE=101304422;WS=101304404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	101308846	rs6441614	G	A	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=167;SC=TTTTTCAGCAGTTTTTTTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=101308854;WS=101308843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	101308874	rs3762729	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.967;SC=AAATCAGCACCGTAGAAGACA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=101308882;WS=101308864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	101371899	rs2303474	G	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.640;SC=CAACTTAAAAGAATTCCCTAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=101371907;WS=101371889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	101383321	rs13081846	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AACCATGCAGTAAGTTGGATT;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=101383329;WS=101383311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	101383562	rs11712748	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=381;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GAGCCACCTAGTAAGGGATAG;SOR=0.980;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=30;WE=101383570;WS=101383552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr3	101389864	rs9837549	T	C	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=18;PP=1930;SC=CTACTGTTGTTAGTGGGCTTC;SOR=2.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=80;WE=101389872;WS=101389854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	101400167	rs3094296	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=453;ReadPosRankSum=1.408;SC=TCTTAGTAATTTAACTGCATT;SOR=0.633;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=32;WE=101400175;WS=101400157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr3	101404813	rs2303473	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=430;ReadPosRankSum=0.023;SC=TTAACTATACAAAGTACAAGA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=32;WE=101404821;WS=101404803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr3	101443461	rs994573	T	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=564;SC=CTCCTTCAGATTACAAGCTCC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=101443469;WS=101443451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	101446207	rs3070526	AAT	A	1759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=1245;ReadPosRankSum=1.861;SC=TAAAAATAACAATATGTTTCC;SOR=1.102;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=32;WE=101446225;WS=101446197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr3	101484335	rs2625282	G	A	6000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=103;PP=2965;SC=CAGAAGTTCAGGGGCAGCAGC;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=175;WE=101484343;WS=101484325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	101504624	rs2625289	A	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=371;SC=TTATCGGAAGATTATCGTAGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=101504632;WS=101504614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	101572822	rs2925334	C	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=1.394;SC=GTTGGCTAACCAAGATGACTG;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=101572830;WS=101572812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	101575882	rs595788	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=16;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.111;NF=13;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=1.694;SC=TCTGGATTTTTTTTTTTTTTT;SOR=1.008;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=18;WE=101575890;WS=101575867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	101576029	rs3217713	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	2882.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.256;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,59:0.39:150
chr3	105238890	rs11291806	CT	C	2741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=13.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.763;QD=32.26;ReadPosRankSum=3.181;SOR=0.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,73:0.86:85
chr3	105238901	rs2291376	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.924;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.065;NF=41;NR=32;PP=1802;ReadPosRankSum=4.017;SC=TTTTTTTTTTTCCCCCAAAGG;SOR=0.466;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=73;WE=105238909;WS=105238880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,72:0.73:98
chr3	105252377	rs2171146	G	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=7;PP=977;SC=CATTGCCTGAGTTTCTGGAGT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=105252385;WS=105252367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	105253475	rs6437601	A	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=593;ReadPosRankSum=0.835;SC=CAGATGAAAGACCCTATCATC;SOR=0.374;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=35;WE=105253483;WS=105253465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr3	105258861	rs1044240	A	G	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=909;ReadPosRankSum=-1.879;SC=CCACCAAAAAATGCCATCAAA;SOR=1.062;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=200;TCF=93;TCR=107;TR=68;WE=105258869;WS=105258851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,89:0.39:230
chr3	105260596	rs599278	T	C	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=78;PP=2576;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CTTCAACAGCTATCACAGTTC;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=128;WE=105260604;WS=105260586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr3	105404031	rs16851440	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=547;SC=GGAAATGGTATAATAGGAAGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=105404039;WS=105404021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	105412286	rs10635036	C	CTT	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=6;PP=537;SC=CAAAACCACTCTACCATATCT;SOR=1.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=11;WE=105412294;WS=105412276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	105422844	rs2305037	C	T	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=27;PP=1247;SC=TTGGTGAACCCGTTGGGCTGC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=105422852;WS=105422834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	105438806	rs7624400	G	A	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=12;PP=1080;SC=ACTCAAATACGCTGAGTCATA;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=105438814;WS=105438796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	105452751	rs1992520	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=325;SC=TCATTTCAAACAAAGCACTTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=105452759;WS=105452741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	105453034	rs6768096	A	G	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=637;SC=TTTCCAGCACAAATTGTTAGT;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=105453042;WS=105453024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	105455955	rs2289746	T	C	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=11;PP=678;SC=GAGAGTCTTATTTATTTCAAG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=105455963;WS=105455945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	105468330	rs1443098	C	T	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=159;SC=TGTCCACATACTAAATAGCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=105468338;WS=105468329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	105495432	rs9809911	G	T	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=76;PP=2163;SC=TAAACACCTAGATGCATGCAA;SOR=1.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=103;WE=105495440;WS=105495422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	105586538	rs2221379	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=481;SC=TTCCTCCATCGATTAGAGCAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=105586546;WS=105586528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	105588069	rs11711088	G	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=901;SC=CTCGCAGCACGTCAGAAAGGA;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=105588077;WS=105588059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	107451907	rs4855764	C	T	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=69;PP=2438;SC=TCTGCTCATACTGTGGGTTGG;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=125;WE=107451915;WS=107451897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	107519843	rs1532325	T	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=4;PP=1283;SC=TGGTAGAGAATGTTAGCTCTT;SOR=4.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=107519851;WS=107519833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	107524110	rs35374854	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TAAGTAACAGCAGTAACTGTT;SOR=0.048;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=107524118;WS=107524100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	107646728	rs4855779	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AGGACGCAGAGATCCATTACT;SOR=1.930;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=107646736;WS=107646718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	107646807	rs9837335	G	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=453;ReadPosRankSum=0.504;SC=CGGGCTGCCCGGGACTTCATC;SOR=0.439;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=27;WE=107646815;WS=107646797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr3	107646895	rs9861097	T	C	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.963;NF=48;NR=36;PP=1402;ReadPosRankSum=1.262;SC=CAGCCGCTCTTCCGGGAGCGC;SOR=0.952;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=84;WE=107646903;WS=107646885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,96:0.52:183
chr3	107647001	rs35976982	CA	C	1653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=3.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.013;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.441;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr3	107776511	rs709436	C	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=218;SC=GTTATTCTAACGATCAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=107776519;WS=107776501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	107777051	rs3762679	C	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr3	107789790	rs56063635	T	A	54.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AACATATACTTCAAGGAGACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=107789798;WS=107789780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	107798755	rs75680983	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.305;SC=CAAAGGAGTACCTATCCCCAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=107798763;WS=107798745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	107809798	rs445541	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=11;NR=10;PP=355;SC=CGCAGGTGTCCGGAGCAGCAG;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=107809806;WS=107809788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	107882643	rs327168	G	A	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=6;PP=160;SC=TGAATTATGTGTTAAGAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=107882651;WS=107882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	107884211	rs327167	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.17;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	107884211	.	TTGTAGGTTC	CTGTAGGTTC,CTGTAGGTTT	408	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=24,10;NR=3,1;PP=408,201;QD=16.398933798;SC=GTTAAACCATTTGTAGGTTCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27,11;WE=107884228;WS=107884201;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:27
chr3	107884220	rs56197414	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr3	107937231	rs1289761	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=337;SC=TCTAATTTTGTCTATACTGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=107937239;WS=107937221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	107937286	rs1289760	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=14;PP=742;SC=ATAGTCAAAAAGAATAATTCT;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=107937294;WS=107937276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	107937544	rs2305447	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.703;SC=GTTAGTTATACTCCAAATGTC;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=107937552;WS=107937534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	107937571	rs1289759	G	A	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=168;SC=TTTAAGCAAAGAACTGCTGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=107937579;WS=107937561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	107937602	rs1289758	C	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=ACTTTTCTTTCAAATGATTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=107937610;WS=107937592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	107938240	rs1289754	G	C	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=7;PP=937;SC=GGAAAAAGAAGGGTCGTTTAC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=107938248;WS=107938230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	108070544	rs75377690	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=717;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TAATGGCCACAAAACAATTAT;SOR=0.085;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=18;WE=108070564;WS=108070534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	108070556	rs9846218	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=877;ReadPosRankSum=0.262;SC=AACAATTATTTGTATGAATGT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=21;WE=108070564;WS=108070534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr3	108072243	rs6766283	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=0.395;SC=GGCATTAATTCTCTTTATAAC;SOR=0.054;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=15;WE=108072251;WS=108072233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	108072298	rs6779254	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=389;ReadPosRankSum=0.871;SC=GCTTTCTTCATTTATGTTCCT;SOR=0.260;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=22;WE=108072306;WS=108072288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr3	108072704	rs6779650	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TTTCCTAATATGCCATGAGCT;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=17;WE=108072712;WS=108072694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr3	108081277	rs6779094	C	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr3	108095365	rs2124736	G	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr3	108096098	rs1463426	C	G	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=41;PP=2676;SC=ATTTTTCTTGCTTCTAGCCTC;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=96;TCR=41;TR=137;WE=108096106;WS=108096088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	108096227	rs1463425	G	C	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=98;PP=2965;SC=GCCTGTCGGAGCAGACAATTC;SOR=1.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=62;TCR=98;TR=160;WE=108096235;WS=108096217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	108107704	rs1463431	C	T	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=777;SC=TGAAGGAGAACAAAGATGAAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=108107712;WS=108107694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	108107925	rs7616341	C	A	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=50;PP=1196;ReadPosRankSum=0.298;SC=CACGAACCTGCAACCAAAACG;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=155;TCF=56;TCR=99;TR=76;WE=108107933;WS=108107915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,83:0.48:173
chr3	108117694	rs13087507	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=352;ReadPosRankSum=0.583;SC=GGTCCTGGGAGAGAAAAGATG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=20;WE=108117702;WS=108117684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr3	108129348	rs1078455	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-1.030;SC=AATGTGAAAATGCTGAAGACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=108129356;WS=108129338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	108135606	rs56933265	TAA	T	2707.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=1978;SC=CACTATTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=39;WE=108135617;WS=108135596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	108135609	rs116262927	A	T	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	108135799	rs11927603	C	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=768;ReadPosRankSum=0.790;SC=TTTCACAAAACTACATAATTA;SOR=0.495;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=48;WE=108135807;WS=108135789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr3	108140148	rs4593038	A	G	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=403;SC=GAGTGGCTCCAGGGATCCGCA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=108140156;WS=108140138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	108147295	rs1350235	C	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=341;SC=CCCCTCCCTACTTCCATGTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=108147303;WS=108147285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	108147728	rs3900940	T	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=531;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TTTATTTGAGTCTGTAGCAAG;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=29;WE=108147736;WS=108147718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr3	108156633	rs113832514	A	AAAAG	696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=618;SC=ACCTTCTGGAAAAAGAAAGAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=108156641;WS=108156623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	108158574	rs3996040	C	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=20;PP=1117;SC=CCAGATACACCGTTACTGACC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=108158582;WS=108158564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	108172817	rs6437783	C	T	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=30;PP=1895;SC=CACACTATTACCCTAGCAGTT;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=108172825;WS=108172807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	108188755	rs11917965	A	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=1.549;SC=AAACACCATTAAGATAAAATG;SOR=1.536;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=108188763;WS=108188745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	108188993	rs9868484	G	A	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=61;PP=1894;SC=ACAAACATGTGCCAATTGAAG;SOR=1.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=95;WE=108189001;WS=108188983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	108189735	rs73850899	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=200;ReadPosRankSum=-1.307;SC=CTGACTGAAGTGTTCATTTTA;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=22;WE=108189743;WS=108189725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr3	108189750	rs12495639	C	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=935;SC=ATTTTAATCCCGGGCATTCTC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=108189758;WS=108189740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	108195406	rs3996003	C	T	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GAGGAAAACACTGTTAAGATT;SOR=0.813;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=75;WE=108195414;WS=108195396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,84:0.55:154
chr3	108211869	rs140450152	A	AAAGG,AAAGGAAGG	2413.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.39;QD=48.27;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,29,21:0.58,0.42:50
chr3	108214537	rs2603140	T	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=574;SC=TGGTGTTCTATAATTTTTTCA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=108214545;WS=108214528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	108229171	rs2249886	T	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=445;SC=AGGCTGATCATACCCTAAGCA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=108229179;WS=108229161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	108229437	rs150536264	G	GA	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.198;NF=5;NR=15;PP=252;ReadPosRankSum=-1.427;SC=GATTCAACCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.530;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=20;WE=108229448;WS=108229427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr3	108272414	rs76336584	T	TA	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=297;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AAGTAGAAAATAAAAAAGCAA;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=12;WE=108272422;WS=108272404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr3	108272588	rs72470117	T	TA	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=285;ReadPosRankSum=0.553;SC=CTGAAGTTATTAAAAAAAATA;SOR=0.648;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=17;WE=108272596;WS=108272578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr3	108295067	rs16854713	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=199;ReadPosRankSum=-0.461;SC=TAAAAGTTTCGGCATTTTGCA;SOR=0.534;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=15;WE=108295075;WS=108295057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr3	108300856	rs73850559	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	108324365	rs41267019	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=0.436;SC=GGTGGGGGTGCGGGGAATGGT;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=108324373;WS=108324355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	108327050	rs10684119	T	TAAC	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.80;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	108355423	rs10711079	AT	A	314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=255;SC=CACATCAGTGATTTTTTTCTA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=10;WE=108355431;WS=108355413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	108355575	rs10711080	CT	C	504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.94;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	108356501	rs143129590	T	TTTAAGGTAGTA	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=2442;SC=TGCATTAAATTTTAAGGTATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=108356509;WS=108356491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	108369954	rs2969900	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ATAGTTGATATAGATTACTAA;SOR=0.582;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=108369962;WS=108369944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	108373022	rs2969901	G	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=31;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.893;SC=AAGAGCAGTTGAGGAAAGAAC;SOR=0.827;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=188;TCF=123;TCR=65;TR=97;WE=108373030;WS=108373012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,116:0.52:223
chr3	108393134	rs41267025	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GACATCAGAGTTCTTAAAGAA;SOR=1.301;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=19;WE=108393142;WS=108393124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr3	108394771	rs12486790	G	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=477;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TATAGGTGGTGTAAAGTTAGA;SOR=0.443;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=38;WE=108394779;WS=108394761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr3	108403086	rs9856097	T	C	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=55;PP=2965;SC=TAGGAAGACCTCTTGTGAAAG;SOR=1.190;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=154;WE=108403094;WS=108403076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr3	108474507	rs1374821	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=414;ReadPosRankSum=0.251;SC=TTTGTCTTTATTACCCAAGAA;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=30;WE=108474515;WS=108474497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr3	108475974	rs11708527	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=549;ReadPosRankSum=1.352;SC=AGTACTCCCCGGGTTGATCAG;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=34;WE=108475982;WS=108475964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr3	108541761	rs9879812	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=-1.680;SC=AAGATTTCTCTGAAAAAAAGA;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=35;WE=108541769;WS=108541751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr3	108541931	rs5851618	CAT	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=293;SC=TATTTTGAAACATGTTAATGA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=108541940;WS=108541921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	108549720	rs2290055	T	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TTTTATGAAATGTCATTCAAC;SOR=0.278;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=17;WE=108549728;WS=108549710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	108557820	rs7651205	T	C	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=30;PP=1608;SC=ACCAGGTATGTTGTGATTCAG;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=70;WE=108557828;WS=108557810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	108565815	rs2593831	T	C	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=703;SC=TAACCAAGAATAGGCAATAGT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=108565823;WS=108565805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	108567923	rs2715716	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=912;SC=GTTTATATTTGCAGCCAAATG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=108567931;WS=108567913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	108634973	rs10933973	C	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=907;ReadPosRankSum=0.430;SC=AGCTCCATTACCATCATTGTT;SOR=1.244;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=55;WE=108634981;WS=108634963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr3	108703422	rs1868195	A	G	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=161;SC=ATTCTTTCACATCTCTGTTGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=108703430;WS=108703412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	108703587	rs2290057	C	T	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=22;PP=1185;SC=TAATGAAGAGCTTCTTTTCAT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=108703595;WS=108703577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	108725694	rs2044586	C	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=189;SC=TTATATTTTACTTTCTAACTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=108725702;WS=108725693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	108754238	rs4855576	A	T	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=29;PP=833;SC=TGATATTGAAAAGAATTTAAA;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=108754246;WS=108754228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	108754320	rs11438791	T	TAA	111	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	108754346	.	CA	C	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=11;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=26;QD=10.0;SC=CAAAGAATAACAAAAAAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=108754354;WS=108754336;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	108776343	rs1031252	C	T	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=52;PP=1463;SC=TCTAGAGTTACATTTAAAAAG;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=72;WE=108776351;WS=108776333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	108782160	rs895738	T	C	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=113;SC=TAAGACTATATGCTCCAGAGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=108782168;WS=108782150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	108788461	rs2305238	T	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=12;PP=1226;SC=TGAAGATAACTGAAGAAAGAT;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=108788469;WS=108788451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	108829765	rs6437822	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=133;SC=AACGTTTCACCGTGCTATTAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=108829773;WS=108829755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	108855578	.	A	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=193;ReadPosRankSum=0.800;SC=CTCAGCTCACAGGGCTTCCAG;SOR=0.519;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=15;WE=108855586;WS=108855568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	108855774	rs1356071	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=16;NR=26;PP=709;SC=TATTTATCATATCTCCTACAG;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=108855782;WS=108855764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	108855801	rs1356072	T	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=11;NR=20;PP=542;SC=GGTTGATAATTCCTTTTGTCT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=108855809;WS=108855791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	108867128	rs4855697	A	G	4079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=51;PP=2544;SC=TTTTGTTGGAAGACCCTGCAA;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=119;WE=108867136;WS=108867118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	109019435	rs9865540	G	A	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=421;SC=GTGGGAGGCTGAGGAGGGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=109019443;WS=109019425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	109027157	rs7611135	C	T	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=92;PP=2823;SC=ATGAAATTCACGATGAGTATT;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=53;TCR=92;TR=145;WE=109027165;WS=109027147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	109027820	rs7611871	G	A	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=468;SC=GTAGGGACCGGACGAATCATG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=109027828;WS=109027810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	109049720	rs112463757	C	CTAAGGGT	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=48;SC=CAAAAATGGCCTAAGGAGCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=109049728;WS=109049710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	109050980	rs1163438	T	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=273;SC=GACAGAATCTTGCTCTGTCGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=109050988;WS=109050970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	109052732	rs3762648	T	C	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=53;PP=1934;SC=CTGCCTTTGATAGACATTTTT;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=95;WE=109052740;WS=109052722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	109052934	rs7642495	G	A	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=326;SC=AGGCACCAACGCAGTTACTGG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=109052942;WS=109052924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	109056183	rs9836011	A	T	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.02;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	109178707	rs769534	C	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=27;PP=787;SC=TTCCCTAATTCCATCCTTTTT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=109178715;WS=109178697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	109178758	rs769533	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=334;SC=GTTTTCTTCACAATTTCACCA;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=109178766;WS=109178748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	110611137	rs1381838	G	A	4688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=71;PP=2901;SC=AAGCTCTATCGATTTCAAGTG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=148;WE=110611145;WS=110611127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	110791113	rs4682228	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=589;SC=CGTTCTCTGGAGCAGCGAGGC;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=110791121;WS=110791103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	110792906	rs2399372	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=498;SC=GGTAGACACTGGTTTTGTATT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=110792914;WS=110792896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	110793050	rs2399373	G	A	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=44;PP=1766;SC=GGGCACAGATGTTGTGACTTA;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=89;WE=110793058;WS=110793040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	110830746	rs10575342	ATGTGTG	A	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;MQRankSum=0.535;QD=38.58;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
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chr3	111260975	rs2276873	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1780;SC=ATAAACAGACCCAGGCGTGTG;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=111260983;WS=111260965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	111261242	rs3832264	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	1481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=2973;SC=CCTTGTGACTGCTGCTGAAAT;SOR=4.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=11;WE=111261250;WS=111261232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	111263826	rs1513325	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GAAGTGACTAGGGTTTTTAAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=111263834;WS=111263816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	111356083	rs1533270	G	C	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=32;PP=1594;SC=GTTCATCCCCGTCAGGTGCAG;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=77;WE=111356091;WS=111356073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	111426690	rs76262777	T	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=543;ReadPosRankSum=1.196;SC=TTAATTTTTGTTTTGTTTTGT;SOR=0.427;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=34;WE=111426698;WS=111426680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr3	111451603	rs3821919	G	C	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=35;PP=1131;SC=AAAATGAGCAGCATATACAGC;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=111451611;WS=111451593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	111604541	rs1283007	G	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=137;ReadPosRankSum=0.187;SC=AGAGGAGTTGGGAATTTTATG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=14;WE=111604549;WS=111604531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr3	111637904	rs2399399	G	A	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1460;ReadPosRankSum=-2.741;SC=CCATTTCTGTGTTGATTAATC;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=89;WE=111637912;WS=111637894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,112:0.65:172
chr3	111638132	rs951660	A	C	94.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=94;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTTATTCAGGAATAGGCTTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=111638140;WS=111638122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	111638952	rs6779756	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-1.021;SC=CTCTCTAGCTCGCTTATATGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=111638960;WS=111638943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	111651285	rs754914	G	A	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=906;ReadPosRankSum=0.821;SC=TTTGCTTTTCGTTTTTGTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=43;TCR=75;TR=58;WE=111651293;WS=111651275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr3	111658290	rs712509	T	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=420;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GTTATCTCAGTGTGTCTTGTT;SOR=0.446;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=23;WE=111658298;WS=111658280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr3	111658486	rs712510	T	G	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=48;PP=1659;SC=AGGTACTTTTTCCAGGTGTCA;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=79;WE=111658494;WS=111658476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	111659377	rs698358	T	C	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=39;NR=29;PP=1462;SC=TCTCTTTTCCTCCAGGAAAAA;SOR=1.068;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=111659385;WS=111659367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	111664064	rs17426817	A	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=1.079;SC=CATGCTTCTCAGTTGCATCGA;SOR=1.136;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=19;WE=111664072;WS=111664054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr3	111677505	rs62277620	T	C	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=888;ReadPosRankSum=0.235;SC=TTATACACCTTATAAACTACC;SOR=0.507;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=53;WE=111677513;WS=111677495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr3	111677526	rs11713044	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=879;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CCTTCAAACAGCTATTTCTCT;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=55;WE=111677534;WS=111677516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr3	111685328	rs774859	T	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=294;SC=TGGATTTTGTTATGCACCTCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=111685336;WS=111685322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	111685348	rs774858	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=404;SC=CCTTGACCCCATGTGTGTGTG;SOR=4.514;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=20;WE=111685356;WS=111685338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	111685371	rs3217516	T	TGG	628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=0.308;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	111686738	rs799570	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.977;SC=GAAGACAGCTGTTCTGTGTCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=111686746;WS=111686728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	111692829	rs774852	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=137;SC=TGGCCGTTCTCTTTGAGGAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=111692837;WS=111692819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	111705275	rs150902974	G	GTTTGT	1937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1699;SC=TATTTAAGCTGTTTGTTTTGT;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=34;WE=111705283;WS=111705265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	111710201	rs71773737	AT	A	1392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=6;PP=1448;SC=AAATACTTTTATTTTTCTTTC;SOR=3.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=40;WE=111710209;WS=111710191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	111718507	rs73232059	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=105;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CCTCCAGGGCCCTTTCTTTTA;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=111718515;WS=111718497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	111719493	rs774764	A	G	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=580;SC=GTGCCTTCCTAGGGCCCATGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=111719501;WS=111719483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	111719605	rs73232060	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr3	111730546	rs3749310	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=409;SC=GTGTCCAGCCGTATCCTTCCA;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=111730554;WS=111730536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	111730591	rs3749311	G	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=7;PP=828;SC=TTGGCTTTAAGCTCTTTGTTG;SOR=2.252;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=111730599;WS=111730581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	111730766	rs3828394	G	A	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=943;SC=ACCAGAGGGAGGGTCTGAAGC;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=111730774;WS=111730756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	111732608	rs8070	G	A	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=621;SC=CTCCGCTTCCGTTTTCCTGAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=111732616;WS=111732598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	111757212	rs7625876	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=556;SC=GGCTTATGGTATGAGTCCAGC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=111757220;WS=111757202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	111760771	rs774774	A	G	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=71;PP=2965;SC=TTACAGGTAAAACAGAAAGCA;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=149;WE=111760779;WS=111760761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	111763085	rs4682350	C	T	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=10;PP=1279;SC=TCAGATACCTCAACTATTCTT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=111763093;WS=111763075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	111763278	rs7650559	G	T	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=64;PP=1953;SC=CTTGGAAGTGGTTGGGGATTC;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=86;WE=111763286;WS=111763268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	111765834	rs1561911	G	A	6700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GGCTTCGGTCGGATTACTCGT;SOR=0.267;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=214;TCF=114;TCR=100;TR=213;WE=111765842;WS=111765824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,253:1.00:254
chr3	111766215	rs1318554	A	G	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=46;PP=2855;SC=CTAAACCATGATGAAAACCAC;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=133;WE=111766223;WS=111766205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	111766559	rs1688304	T	G	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=18;SC=AAAAAGAAAATAAAGGAAAAT;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=111766567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	111769417	rs7625159	G	A	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=3;PP=1143;SC=AAAGCTTGTCGATCAAGGAAG;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=111769425;WS=111769407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	111776135	rs55971748	T	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=383;SC=ATGCAGCTCATGAGTGATGGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=111776143;WS=111776125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	111785208	rs11715561	G	A	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=25;PP=1318;SC=TCTCAGGCTCGTGAACTTTCT;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=111785216;WS=111785198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	111793316	rs191454	G	T	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=38;PP=1206;SC=TTACCTGTTTGTTATATTTTC;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=111793324;WS=111793306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	111794365	rs1907639	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=724;SC=CCTTACTTTCAAGTGGCACTC;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=111794373;WS=111794355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	111797655	.	C	G	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.743;SC=CTCTGTGTTTCCACCTACGGG;SOR=0.720;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=84;WE=111797663;WS=111797645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,103:0.60:172
chr3	111799845	rs340151	A	T	6798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=112;PP=2965;SC=GGGACATGGAAGTGGACGACC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=96;TCR=112;TR=208;WE=111799853;WS=111799835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr3	111805438	rs3833596	G	GT	1769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=1475;SC=CGGCGGGACAGTAGTAGGACC;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=32;WE=111805446;WS=111805428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	111828423	rs340167	G	A	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=75;PP=2692;SC=GCCCTCTCTGGGTCGTTATTT;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=129;WE=111828431;WS=111828413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	111838203	rs35833422	CAA	C	4837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=35;PP=2950;SC=GCCTGGGTGACAAGAGTGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=73;WE=111838212;WS=111838193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	111843883	rs923745	T	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=493;SC=CAATAAATTATACAGCAGAAG;SOR=2.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=111843891;WS=111843873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	111851817	rs950528	C	T	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=730;SC=TGGCAGTTTCCTTACCCAACT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=111851825;WS=111851807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	111851890	rs879652	A	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=34;PP=1627;SC=TCCTTGCTGTATTGTCCTGTC;SOR=1.053;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=86;WE=111851898;WS=111851880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	111860222	rs1492480	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=350;SC=CTAGAGGGTCAATTTGACTCC;SOR=2.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=111860230;WS=111860212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	111870228	rs6781137	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1071;ReadPosRankSum=0.676;SC=TTTGCTCATTCTCACAGCCAG;SOR=1.153;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=60;WE=111870236;WS=111870218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr3	111885896	rs4682084	A	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=83;SC=TAATTTAAAAATGTAACTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=111885904;WS=111885886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	111898538	.	G	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=417;ReadPosRankSum=-1.853;SC=ACCTGGCTTTGATTTTTCAAG;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=28;WE=111898546;WS=111898528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	111904539	rs2399407	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.80;MQRankSum=-0.159;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr3	111918216	rs13098660	A	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=388;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CTTTTAAGCCAAAAGCCTTAA;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=31;WE=111918224;WS=111918206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,39:0.41:96
chr3	111921225	rs6781844	G	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=212;ReadPosRankSum=-1.652;SC=TCTATTATTTGCAGCAACTTT;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=14;WE=111921233;WS=111921215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr3	111923047	rs4422273	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAATTGCACGATTTACTGGT;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=111923055;WS=111923037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	111923123	rs4434123	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TATTACTTCAGTCTCATTAAA;SOR=0.490;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=15;WE=111923131;WS=111923113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr3	111926950	rs17505536	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=0.318;SC=TCTGTTGCTGGTGTTGAAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=111926958;WS=111926940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	111936200	rs1388857	C	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=767;ReadPosRankSum=1.013;SC=AGTATAATAACAAAAAATTCA;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=17;WE=111936215;WS=111936190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	111936207	rs6779306	T	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=627;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TAACAAAAAATTCAAGATACC;SOR=0.484;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=13;WE=111936215;WS=111936190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	111950367	rs55735606	C	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=-1.802;SC=ACAAAAAATACATGAATATTA;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=16;WE=111950375;WS=111950357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	111958679	rs13065023	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=1.284;SC=AAGATATTACTTGCTTACCAT;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=13;WE=111958687;WS=111958669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	111958862	rs13089635	C	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=408;ReadPosRankSum=-1.479;SC=ACCTTTGATACAAACACACAT;SOR=0.579;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=26;WE=111958870;WS=111958852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr3	111962774	rs13089316	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=303;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CTTTCTTTATTATTAGCACTT;SOR=1.141;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=16;WE=111962782;WS=111962764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr3	111981696	rs5851826	CA	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.45;MQRankSum=2.458;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	111981703	.	AC	TC	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=3,3;NR=0,0;PP=197,183;QD=72.6666666667;SC=CTACAAAAAAACATATATTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=3,3;WE=111981711;WS=111981693;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr3	111981703	.	AC	A	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=3,3;NR=0,0;PP=197,183;QD=72.6666666667;SC=CTACAAAAAAACATATATTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=3,3;WE=111981711;WS=111981693;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr3	111981704	rs5003791	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.69;MQRankSum=2.472;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.190;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr3	111981849	rs9860819	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1445;ReadPosRankSum=-1.363;SC=TAGGCATCCCCTTCATTTCAC;SOR=0.666;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=188;TCF=113;TCR=75;TR=82;WE=111981857;WS=111981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,92:0.44:210
chr3	111981878	rs9809384	T	C	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.573;SC=ATTATGAATATCCAGCGCCAA;SOR=0.644;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=213;TCF=104;TCR=109;TR=89;WE=111981886;WS=111981868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,101:0.42:242
chr3	111981924	rs9809404	T	C	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=1152;ReadPosRankSum=0.459;SC=AAACAGGGCTTATTAAAAGAA;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=69;TCR=114;TR=75;WE=111981932;WS=111981914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,89:0.42:210
chr3	111983157	rs62276974	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=295;ReadPosRankSum=-0.555;SC=TAAACACCATGAGAAAAGCAA;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=23;WE=111983165;WS=111983147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr3	111983197	rs6788397	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=1.970;SC=GAATCTGCATCATTCAGAAAA;SOR=0.475;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=17;WE=111983205;WS=111983187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr3	111984970	rs4682098	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=25;SC=TTTAGTTGGGTAGTTTTCAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=111984978;WS=111984969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	111985048	rs4682099	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=-0.568;SC=ATAGCTTCCAGTGTATGAAAT;SOR=1.402;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=111985056;WS=111985038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	111988992	rs13069541	T	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=1.800;SC=TGATATTCCTTGTTAATTTTC;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=11;WE=111989000;WS=111988982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr3	111993716	rs6805112	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	111993915	rs4682100	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=1.554;SC=AAGTGAGAAAAACATTAAAAA;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=7;WE=111993923;WS=111993905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	111999736	rs147052896	A	ACTTGTTTTCT	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=1107;ReadPosRankSum=0.093;SC=CAGTTTCACTACTTTTCATGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=111999744;WS=111999726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	112005423	rs7621431	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATTGAAAATATTGAGCTAAAG;SOR=0.733;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=12;WE=112005431;WS=112005413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr3	112052103	rs2276772	G	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=450;ReadPosRankSum=0.604;SC=GAAGGAGGGCGCAGGGCAGGC;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=32;WE=112052111;WS=112052093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr3	112052173	rs9883527	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=49;PP=1393;SC=CTTCGGCTCTTGCCACAATCT;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=89;WE=112052181;WS=112052163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	112059768	rs1131199	C	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=259;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ATGCCCTTCTCTCATCTGTCT;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=19;WE=112059776;WS=112059758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr3	112063850	rs2272022	C	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=543;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GCTGTACACACCTGCTTCCTT;SOR=0.601;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=35;WE=112063858;WS=112063840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr3	112066360	rs7612748	C	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=594;ReadPosRankSum=-0.836;SC=AGGACTCAGACCAGGTGCTTA;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=43;WE=112066368;WS=112066350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr3	112184927	rs2171513	A	G	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=25;PP=2041;SC=TGATCATTCAATGGTCCCTGT;SOR=1.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=90;WE=112184935;WS=112184917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	112185025	rs9288952	G	A	5767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=92;PP=2965;SC=TCTTGAGTTCGGTCCAATGAC;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=80;TCR=92;TR=172;WE=112185033;WS=112185015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr3	112190137	rs2931761	G	T	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=91;PP=2965;SC=GGAAGTAAACGATACAGGAGC;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=200;WE=112190145;WS=112190127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr3	112253058	rs35560667	C	CA	1494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.759;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.768;NF=33;NR=19;PP=977;ReadPosRankSum=-1.176;SC=CTAAATTTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=52;WE=112253066;WS=112253048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,58:0.91:64
chr3	112253193	.	C	CA	390	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=59.54;NF=0;NR=30;PP=390;QD=13.1333333333;SC=GCCTAGAAGCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=30;WE=112253201;WS=112253181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:28,30:0.52:58
chr3	112253233	rs138522909	AAAG	A	769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=787;ReadPosRankSum=-1.346;SC=GATTAGACCGAAAGAAGAAAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=27;WE=112253243;WS=112253223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr3	112256837	rs116799247	G	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=1.282;SC=GTTTTCTTAAGAGTAAATGAA;SOR=0.693;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=3;WE=112256845;WS=112256827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	112267523	rs9809247	G	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=52;PP=1525;SC=TAACTAGCACGTAATCTGCTA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=112267531;WS=112267513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	112280218	rs2279532	G	A	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=10;PP=986;SC=TTGCCCCGCCGGAGAAAGCGG;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=112280226;WS=112280208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	112289320	rs9869455	G	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=468;SC=GTAATCAAGTGCAGTGTAATT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=112289328;WS=112289310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	112289372	rs9869579	G	A	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=19;PP=914;SC=CATTTACACCGTGTTTCTTTC;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=112289380;WS=112289362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	112301458	rs5851844	C	CCTTAGTAAT	2389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=2900;SC=TAAGGTTTTCCCTTTAAAAAT;SOR=2.584;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=22;WE=112301466;WS=112301448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	112338027	rs13084615	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=798;SC=GGTGAAGGCTTTGGGCCTAAT;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=112338035;WS=112338017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	112415652	rs10934180	G	C	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=244;SC=ATCAGGAGCTGAAAGAGGACA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=112415660;WS=112415642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	112538571	rs35585943	CT	C	583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=4;PP=387;SC=TACAATGATACTTTTTTTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=21;WE=112538579;WS=112538561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	112545910	rs58161637	GT	G	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.238;NF=5;NR=6;PP=376;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CAGTAGACTTGTGGCCCTCCC;SOR=0.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=11;WE=112545918;WS=112545900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr3	112546473	rs1997281	G	A	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.091;NF=40;NR=30;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTCTTAATGCGATAGGAGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=70;WE=112546481;WS=112546463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,75:0.44:171
chr3	112642568	rs9865242	C	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=520;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TGTAATGCCTCAGATGCCTTC;SOR=0.547;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=37;WE=112642576;WS=112642558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr3	112647613	rs1466872	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTCTTAACTCTTTTAAAAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=112647621;WS=112647603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	112647832	rs9826308	A	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=388;ReadPosRankSum=-0.481;SC=TCCAGGAGATATGCGCAGCTG;SOR=0.813;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=22;WE=112647840;WS=112647822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr3	112647988	rs9868053	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.144;NF=18;NR=8;PP=507;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CATTTGTTTCCGTCACAAATC;SOR=0.554;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=26;WE=112647996;WS=112647978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr3	112648125	rs6438117	G	T	4521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-2.425;QD=17.73;ReadPosRankSum=1.226;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,118:0.46:255
chr3	112648125	.	GGT	TGG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.82;NF=45;NR=53;PP=2944;QD=20;SC=TGATGGCCACGGTACGAATCT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=98;WE=112648135;WS=112648115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:111,98:0.47:209
chr3	112648127	rs4596117	T	G	4521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-2.859;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,119:0.47:255
chr3	112648222	rs2171509	T	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.922;NF=11;NR=28;PP=709;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TGTTTCTTTCTTGTAGGCTTT;SOR=1.043;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=39;WE=112648230;WS=112648212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr3	112666859	rs2133946	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=632;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TTTTCACATTCTTCAGACTAT;SOR=0.118;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=33;WE=112666867;WS=112666849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr3	112693753	rs62263759	A	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=428;ReadPosRankSum=0.728;SC=TCCTCCACACAGGTACAGAAG;SOR=0.895;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=27;WE=112693761;WS=112693743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr3	112709828	rs2272393	C	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=10;PP=763;SC=TCTCTCTGCCCGTCTTCTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=112709836;WS=112709818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	112710242	rs2248029	T	C	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=1991;ReadPosRankSum=-1.516;SC=ACCGCTTCCCTGGCCGTCCGG;SOR=0.886;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=213;TCF=112;TCR=101;TR=113;WE=112710250;WS=112710232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,117:0.50:235
chr3	112724713	rs116476089	C	T	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=63;PP=1861;ReadPosRankSum=0.258;SC=GCAACTTTCTCTGTGGTTTCC;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=227;TCF=99;TCR=128;TR=109;WE=112724723;WS=112724703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,131:0.46:282
chr3	112727184	rs2306857	A	T	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=123;PP=2965;SC=CTTTGCACAAAACTTTTGGCA;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=74;TCR=124;TR=197;WE=112727192;WS=112727174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr3	112738318	rs2293560	C	T	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=17;PP=1713;SC=CACCCCCGCCCACATGCGCCG;SOR=2.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=77;WE=112738326;WS=112738308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	112738625	rs7633507	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=665;SC=AGGAGCCCGGCGGGAGGCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=112738633;WS=112738615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	112935114	rs146281507	TAGA	T	4642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.905;NF=14;NR=60;PP=2968;ReadPosRankSum=1.527;SC=AGCTCGAAAGTAGAAGAAGTG;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=31;TCR=131;TR=74;WE=112935124;WS=112935104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,123:0.46:270
chr3	112935138	rs4682130	C	G	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.992;NF=42;NR=56;PP=1543;ReadPosRankSum=2.278;SC=GAGGTTTTCTCTTCAGTCTGA;SOR=0.596;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=88;TCR=118;TR=98;WE=112935146;WS=112935128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,118:0.50:236
chr3	112969767	rs115866915	T	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=521;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TGCTGCCTCTTGTTACTCTTA;SOR=0.385;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=38;WE=112969775;WS=112969757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr3	112993292	rs13093741	C	T	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.04;MQRankSum=-0.947;NF=47;NR=43;PP=1376;ReadPosRankSum=1.527;SC=CCTCCAAACTCGGCAACCCTG;SOR=0.585;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=90;WE=112993300;WS=112993282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,115:0.48:241
chr3	112993367	rs13094203	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=960;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CTGCTTCCCCGCAGTGTCCAG;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=63;WE=112993375;WS=112993357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr3	112997554	rs775228	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1042;ReadPosRankSum=-1.103;SC=TGGCCAGCAAAGAGCAGCAGA;SOR=0.564;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=68;WE=112997562;WS=112997544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,69:0.42:163
chr3	112998268	rs2650100	G	A	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TCCCCCCATCGCGGCTGTCCG;SOR=0.517;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=55;TCR=71;TR=68;WE=112998276;WS=112998258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr3	112999611	rs775229	A	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=619;ReadPosRankSum=0.751;SC=ATAAACCTGCATCTGGTGTGA;SOR=0.301;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=40;WE=112999619;WS=112999601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr3	113004155	rs41271355	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr3	113005754	rs5022662	A	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	113010303	rs17321330	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=0.288;SC=ACTTTCAGGCGAGTTCAGTTT;SOR=1.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=113010311;WS=113010293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	113010466	rs2291905	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=533;ReadPosRankSum=-2.360;SC=AGGATAAGACTGCCTTTCCTA;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=39;WE=113010474;WS=113010456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr3	113012797	rs810209	G	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=687;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CTTAGCACCTGCATTTTAAAC;SOR=1.192;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=37;WE=113012805;WS=113012787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr3	113012974	rs775217	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=519;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TAGAGTTTGGAATATGCTATA;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=27;WE=113012982;WS=113012964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr3	113013848	rs11398178	A	AT	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.51;MQRankSum=1.144;NF=0;NR=8;PP=275;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TTGATTAAAGATAAGAATATA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=113013856;WS=113013838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	113015436	rs808949	G	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=410;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CAAGGCCTAAGATCCTGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=20;WE=113015444;WS=113015427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	113015464	rs3829889	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=729;ReadPosRankSum=1.324;SC=GGGGGCTCGCGGACCAGCTCC;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=74;TCR=13;TR=44;WE=113015472;WS=113015454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr3	113015553	rs808950	A	C	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=55;PP=2012;ReadPosRankSum=1.432;SC=CCAAAGATCAACCCCCTTCTC;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=150;TCR=110;TR=131;WE=113015575;WS=113015543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,162:0.52:311
chr3	113022870	rs4682484	T	C	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=59;PP=1950;SC=CTGGAGCTCATGGATTCGTTC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=113022878;WS=113022860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	113022996	rs2270782	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=1.560;SC=AAAGAAAATAGACAAAAACAC;SOR=1.112;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=11;WE=113023004;WS=113022986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr3	113024018	rs2270785	T	C	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=922;ReadPosRankSum=0.265;SC=AGCCCCGTGTTGTGAAATGGT;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=74;WE=113024026;WS=113024008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,79:0.53:149
chr3	113027214	rs775231	A	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=1.673;SC=TAGTCACTAGAAAAATAACTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=113027222;WS=113027204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	113045561	rs3732809	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=2.019;SC=GTACTTTACAATACAAGGTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=113045569;WS=113045551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	113046640	rs13064411	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=1.795;SC=GGAGTTCTGCATCGAAAGTGA;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=19;WE=113046648;WS=113046630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr3	113077745	.	A	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=300;ReadPosRankSum=0.066;SC=AGATCTGTTCATCAAAATGGG;SOR=0.763;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=21;WE=113077753;WS=113077735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr3	113119301	rs7647220	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GGAAAATCCCCAAATGCTCTT;SOR=0.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=113119309;WS=113119291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	113138763	rs2129434	T	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	113169372	.	GA	G	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.596;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr3	113285185	rs375522521	TTGTG	T	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	113313947	rs2614193	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=0.082;SC=AACCTACTTTCAGAATTAAGA;SOR=1.214;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=11;WE=113313955;WS=113313937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	113373930	rs930818	A	G	6257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=87;PP=2965;SC=ATCAGGAAGCACTGTGGCTAT;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=194;WE=113373938;WS=113373920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr3	113376110	rs10606566	TTGC	T	2329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=1973;SC=GTTGTTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.047;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=40;WE=113376120;WS=113376100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	113499458	rs1430944	G	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=632;SC=CTTTAGGTCTGTCTCTCAAAG;SOR=1.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=113499466;WS=113499448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	113557690	rs9990079	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.427;NF=26;NR=1;PP=517;ReadPosRankSum=1.277;SC=GCGCGCGCTGGAGGTGGGCGC;SOR=1.643;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=27;WE=113557698;WS=113557680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr3	113557787	rs66781755	AGCC	A	10786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=85;PP=2948;SC=CCGTCAGGTAAGCCGCGGGCC;SOR=1.155;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=65;TCR=88;TR=145;WE=113557797;WS=113557777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr3	113594377	rs13079383	A	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1431;ReadPosRankSum=0.262;SC=AGGGACGACTATACCTTTCAG;SOR=0.575;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=94;WE=113594385;WS=113594367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,115:0.45:253
chr3	113595156	rs2712350	C	G	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=40;PP=1217;SC=AAGAAAATCTCCCTCATACTC;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=113595164;WS=113595146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	113609403	rs9862440	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=466;ReadPosRankSum=-0.530;SC=ACCGTGGGGTGCTCTATTCTA;SOR=0.157;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=26;WE=113609411;WS=113609393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr3	113619872	rs2632244	C	T	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=1603;SC=TTTTCTGTCACTTTAGAGCCT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=113619880;WS=113619862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	113631884	rs2712341	A	C	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=22;PP=1232;SC=TAACATAGAGACTGCTTTATT;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=56;WE=113631892;WS=113631874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	113632108	rs2712340	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GTGGTGGCGCGCGCTTGTAAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=113632116;WS=113632098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	113655157	.	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=639;ReadPosRankSum=1.731;SC=TCAGGCCATTGAAGACCCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=43;WE=113655165;WS=113655147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr3	113655207	rs3765114	C	T	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1037;ReadPosRankSum=0.328;SC=GAACCTTCAACCGAACAGCAG;SOR=0.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=66;WE=113655215;WS=113655197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,77:0.47:164
chr3	113659308	rs2029228	G	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=0.257;SC=CCCCCTGCTAGAGCCAACTAC;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=20;WE=113659316;WS=113659298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	113664183	rs68028538	CAG	C	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.197;NF=12;NR=1;PP=530;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GCATAAAAAACAGAAATTTTC;SOR=0.127;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=13;WE=113664192;WS=113664173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr3	113673125	rs11921691	A	G	7340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=1.726;SC=GGCTCTTCCAAGATGCCAGCT;SOR=0.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=111;TCR=115;TR=225;WE=113673133;WS=113673115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,261:1.00:262
chr3	113679589	rs12629415	C	A	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1043;ReadPosRankSum=0.153;SC=GAGCCAACTCCGCTTCCTTCC;SOR=0.469;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=75;WE=113679597;WS=113679579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,88:0.49:180
chr3	113679725	rs3732785	C	T	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=45;PP=1394;SC=GATGAGTGATCTTGTGTGGGA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=113679733;WS=113679715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	113720517	rs6784095	T	A	3837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=75;PP=2300;ReadPosRankSum=-1.435;SC=TTTTCTGACGTTCCTCCTCTT;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=320;TCF=153;TCR=167;TR=146;WE=113720525;WS=113720507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,182:0.47:386
chr3	113720624	rs6438178	C	T	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=97;PP=2776;SC=GATAGTCAAGCGTCTACCAAA;SOR=2.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=21;TCR=97;TR=118;WE=113720632;WS=113720614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	113784007	rs34428541	A	AT	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.697;HP=12;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.115;NF=12;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=0.720;SC=TTTCCTGAAGATTTTTTTTTT;SOR=0.077;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=16;WE=113784015;WS=113783997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr3	113785149	rs3830297	ATATGT	A	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=-0.898;SC=TAAGTTACTTATATGTGCCTT;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=113785161;WS=113785139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr3	113795834	rs7631864	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GGGATGCAGGGAAGGAGTGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=113795842;WS=113795824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	113801826	rs13086657	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=258;ReadPosRankSum=1.129;SC=TTGTAGACTTCGTCTTGTCAG;SOR=0.558;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=17;WE=113801834;WS=113801816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	113801965	rs13071100	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=0.032;SC=AAGTTTTAAATTGTAGGGTGC;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=7;WE=113801973;WS=113801955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	113858350	rs2251177	C	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=405;SC=TACTTACTTGCTGGGGGAAGC;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=113858358;WS=113858340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	113890789	rs3732783	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=483;ReadPosRankSum=-1.349;SC=TGGAGTTCTCTGCCCCACAGG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=36;WE=113890797;WS=113890779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr3	114018441	rs73238032	T	C	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1227;ReadPosRankSum=0.931;SC=GTCCTCCCTCTAGTGGCTGAG;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=84;WE=114018449;WS=114018431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,97:0.46:210
chr3	114026673	rs11714612	A	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=12;PP=1407;SC=GAAGAGAGAGATGTCATATTG;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=114026681;WS=114026663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	114027065	rs35641088	C	CGTGT	948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=22;PP=1216;SC=ATCAGTGCTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=23;WE=114027073;WS=114027055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	115529088	rs140486681	C	CTG	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=-0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.992;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	115529092	rs56145932	G	C	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=-0.000;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.414;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	115529360	rs2289269	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.077;SOR=1.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr3	115529370	rs2289268	A	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.505;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr3	115535432	rs36098686	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-1.114;SC=TTTTGACATATGGAAGGTAAC;SOR=0.591;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=19;WE=115535440;WS=115535422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr3	116163634	rs138580275	GAC	G	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.40;MQRankSum=-2.127;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.773;SOR=2.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr3	116163653	.	AC	A	621.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.86;MQRankSum=2.186;QD=10.54;ReadPosRankSum=2.772;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr3	116163655	.	ACAAACACACAC	A	804.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.56;MQRankSum=2.334;QD=11.33;ReadPosRankSum=2.396;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr3	116728168	rs142045736	AC	A	2226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=1726;ReadPosRankSum=0.731;SC=TTCTAAGAGAACCGCCACCTG;SOR=0.866;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=46;WE=116728176;WS=116728158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr3	116728295	rs11381408	G	GA	550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=583;SC=CTTAATTAAAGAAAAAATACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=116728303;WS=116728285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	118269774	rs9816586	A	G	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=69;PP=2210;SC=CAGGATGGCTATAAAAGAGAA;SOR=1.424;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=118269782;WS=118269764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	118269825	rs57227846	GT	G	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=25.03;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	118624369	rs62275716	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=303;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TCAGCAGAACCCTTCATTTTC;SOR=0.148;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=21;WE=118624377;WS=118624359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr3	118649060	rs2903250	G	T	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=72;PP=2253;SC=AGGACTGCTGGCTGACCCCGG;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=110;WE=118649076;WS=118649050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	118865801	rs4077931	C	T	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1099;ReadPosRankSum=-2.102;SC=AAAGACCTTCCGTACAGATTG;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=63;WE=118865809;WS=118865791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr3	118866376	rs56317615	C	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=1158;ReadPosRankSum=-1.290;SC=CCCTCCATCTCATCCAAATTG;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=52;TCR=91;TR=73;WE=118866384;WS=118866366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,93:0.51:183
chr3	118866515	rs9864127	C	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=525;SC=AGGGGTACAACGGAAGGGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=118866523;WS=118866505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	118867047	rs9289122	C	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=266;ReadPosRankSum=0.277;SC=CAGAAATTGACCAAGGAAAGG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=20;WE=118867055;WS=118867037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr3	118870025	rs11373158	A	AC	2187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=1730;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TGACCACATAATTTTGCTCAG;SOR=0.848;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=42;WE=118870033;WS=118870015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr3	118870222	rs73185896	G	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=-0.928;SC=AACAAAGTACGTACAACTCTG;SOR=0.207;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=19;WE=118870230;WS=118870212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	118909159	rs9840317	A	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=29;PP=1218;SC=GCAACACAACAAGACTTTGTG;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=59;WE=118909167;WS=118909149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	118909962	rs3796356	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=932;SC=GTAAGACCTGTGGTCTTGGGG;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=118909970;WS=118909952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	118909987	rs3796357	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=582;SC=GCCATTTTTACTTACTGGTGG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=118909995;WS=118909977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	118912961	rs62263545	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=1.346;SC=ATGTAAGATATGGTACACTTT;SOR=2.219;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=21;WE=118912969;WS=118912951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr3	118913261	rs36002465	T	TC	1699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.850;NF=0;NR=40;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TCCTCTCTCCTCCCAAGACTT;SOR=0.595;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=3;TCR=72;TR=40;WE=118913269;WS=118913251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr3	118913337	rs7628485	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GTCTTTCAGTAAGGAATTCTA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=118913345;WS=118913327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr3	118922650	rs55795433	C	CA	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=273;ReadPosRankSum=0.305;SC=AACAAACAAACAAAAAAATCT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=118922662;WS=118922645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	118922654	rs12186112	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=370;ReadPosRankSum=-1.459;SC=AACAAACAAAAAAATCTGTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=118922662;WS=118922645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	118930791	rs5868	G	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=791;SC=GCTATCAGCAGCTGCAACCAG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=118930799;WS=118930781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	118931389	rs6784208	C	T	5199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=68;PP=2965;SC=CACCAAAAGACCCAGGGTCAT;SOR=0.953;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=160;WE=118931397;WS=118931379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	118935284	rs68075325	CACGCACAT	C	342.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.08;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	118935300	rs73187814	C	T	318.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	118948618	rs4422293	G	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=597;ReadPosRankSum=2.174;SC=GAGATGTTTTGATACAGGCAA;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=34;WE=118948626;WS=118948608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr3	118948716	rs4422294	G	A	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.500;SC=ACACAGAAGGGCAGTTGTCAA;SOR=0.586;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=101;WE=118948724;WS=118948706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,117:0.44:267
chr3	119013928	rs3732412	A	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=521;ReadPosRankSum=-1.985;SC=TCGAGTTGTGATAGAGTCGGT;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=29;WE=119013936;WS=119013918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr3	119087482	.	G	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=334;ReadPosRankSum=-1.880;SC=ATCTTAGCGTGGTGAGGGAAG;SOR=0.516;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=23;WE=119087490;WS=119087472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr3	119101039	rs73187863	T	A	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=11;PP=1582;SC=AATAGAAATATTTAGAGTCTC;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=66;WE=119101047;WS=119101029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	119101885	rs147532572	T	TTG	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=443;ReadPosRankSum=0.969;SC=CTGCTTCAGGTTGTAAGGCAA;SOR=1.751;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=11;WE=119101893;WS=119101875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	119101925	rs16829782	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=370;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TTCTTCCACACGGTAGGTCTA;SOR=1.289;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=23;WE=119101933;WS=119101915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr3	119101958	rs376381685	C	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=576;ReadPosRankSum=-1.948;SC=CCACTGGTTGCAATGGAGATG;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=34;WE=119101966;WS=119101948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr3	119118104	rs4688001	A	G	4341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=67;PP=2580;SC=CAGTGCCTGTAGAAGGTAAGA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=128;WE=119118112;WS=119118094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr3	119133183	rs3732413	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=749;ReadPosRankSum=0.265;SC=TTCAAAGGGCGGCCCGGAAAG;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=42;WE=119133191;WS=119133173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr3	119171280	rs1919586	C	G	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1151;ReadPosRankSum=0.030;SC=AGAATATAGTCAATGAACTGT;SOR=0.515;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=82;WE=119171288;WS=119171270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr3	119188213	rs75416321	G	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=0.324;SC=CCCGCAGGAGGCGTGGCCCGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=16;WE=119188221;WS=119188203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr3	119188895	rs6438531	C	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=-0.976;SC=AAAATGCTCTCGCATGGGAAA;SOR=0.391;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=18;WE=119188903;WS=119188885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr3	119197285	rs4688005	A	G	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1260;ReadPosRankSum=0.270;SC=ATTGTTTGTCATGAAACTCAC;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=64;TCR=85;TR=84;WE=119197293;WS=119197275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,99:0.55:179
chr3	119198873	rs4688007	G	A	3522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=2038;ReadPosRankSum=-1.980;SC=ACTGATTTAGGACGACCTGTC;SOR=0.691;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=273;TCF=143;TCR=130;TR=133;WE=119198881;WS=119198863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,167:0.51:328
chr3	119236017	rs4461452	G	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.597;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CTAATGACTCGTTTTTCCTAA;SOR=1.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=9;WE=119236025;WS=119236007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr3	119246477	rs77922702	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-0.959;SC=AAAGAGGTTTTTAAGAAGGTG;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=13;WE=119246485;WS=119246467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	119263680	rs2228017	C	T	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1759;ReadPosRankSum=-0.971;SC=ACAGCGTTGCCACTTCTTTCA;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=90;TCR=108;TR=110;WE=119263688;WS=119263670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,136:0.55:248
chr3	119263770	rs9282638	T	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=539;ReadPosRankSum=0.528;SC=GATTCCTGCATGGTCAGGAAT;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=45;WE=119263778;WS=119263760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr3	119305379	rs25676	T	A	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=993;ReadPosRankSum=-1.588;SC=CAGCCTATGCTGTGAATAGCA;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=57;WE=119305387;WS=119305369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr3	119334986	rs2247660	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=531;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TGGCAACCCCGGAGATTGAAA;SOR=0.976;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=33;WE=119334994;WS=119334976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr3	119336728	rs4688020	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CACTAATATTCTGAAAAAGTG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=119336736;WS=119336718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	119338956	rs2280669	A	G	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=592;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GCTCCTAACCATGGCATTTCC;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=40;WE=119338964;WS=119338946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr3	119339010	rs1877595	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=482;ReadPosRankSum=0.926;SC=TAAATGTGAAGTAAAAATGTG;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=32;WE=119339018;WS=119339000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr3	119339054	rs1877594	C	T	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CAAGCTAAACCGTCATCCTTC;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=25;WE=119339062;WS=119339044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr3	119347611	rs56163046	C	A	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=1.031;NF=68;NR=59;PP=1808;ReadPosRankSum=-1.179;SC=GCCAGATAAACCAAGTGAAAT;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=269;TCF=138;TCR=131;TR=127;WE=119347619;WS=119347601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,160:0.49:328
chr3	119361250	rs8007	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.483;SC=GAAAAGAGGCATGCCTATCAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=119361258;WS=119361240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	119361412	rs77900383	T	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=421;ReadPosRankSum=0.049;SC=CTAGAAGCTGTGGAAAGAAAA;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=42;WE=119361420;WS=119361402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr3	119367390	rs2688643	T	C	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=53;PP=2021;SC=AGAGCTTCTCTGAGATGTCAT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=119367398;WS=119367380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	119373301	rs2688630	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=1.559;SC=GGATATTGCTGGGCTACAGTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=119373323;WS=119373291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	119373315	rs2688629	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=-0.424;SC=TACAGTGGGATGGGGTGAGGC;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=119373323;WS=119373291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	119378872	rs1880040	G	A	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=66;PP=1782;ReadPosRankSum=-0.174;SC=CCTGCTCCTCGCAGCAGTGAA;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=94;TCR=125;TR=117;WE=119378880;WS=119378862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,132:0.50:264
chr3	119379186	rs4688023	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=727;ReadPosRankSum=1.413;SC=AGGTGGTAGACAGCCCCTTCC;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=49;WE=119379194;WS=119379176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr3	119394168	rs2293235	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.294;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	119395799	rs2280578	A	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=0.111;SC=GTCAACAGAGACCCGACCACG;SOR=0.789;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=22;WE=119395807;WS=119395789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr3	119422204	rs7624672	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=349;SC=ACGGTTGTCCTTGGTCGGGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=119422212;WS=119422194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	119426307	rs9848716	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=397;ReadPosRankSum=-0.944;SC=ATCCAAGATATTCTCTATATT;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=25;WE=119426315;WS=119426297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr3	119434527	rs6438544	G	C	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=48;PP=1966;SC=TCCATACTCTGCAGAATATGT;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=96;WE=119434535;WS=119434517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	119459682	rs57901016	T	TTG	164.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	119501580	rs3841391	G	GC	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=-1.030;SC=AGTGCTGGCAGCCCCCTGAGG;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=13;WE=119501588;WS=119501570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr3	119501780	rs2472668	G	A	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=47;PP=1644;SC=AGTGCCACCAGGTCCTTCTTC;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=119501788;WS=119501770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	119501798	rs2461831	T	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=43;PP=1238;SC=TTCTCTCCACTTTACAGCCCA;SOR=1.497;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=119501806;WS=119501788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	119529113	rs3732356	G	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=56;PP=1565;SC=CGTGGGTGTGGGCATGCTTGT;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=119529121;WS=119529103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	119533733	rs6785049	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=-1.174;SC=TCTTCCTCTCGCCCCCAACTT;SOR=1.634;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=13;WE=119533741;WS=119533723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr3	119533773	rs6797879	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=10;PP=784;SC=CTGGTGCCGGTCTGTGGGCTG;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=119533781;WS=119533763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	119533910	rs4058490	T	C	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=66;PP=2175;SC=CAGTGTTCAATGCGGAGACTG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=130;WE=119533918;WS=119533900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	119534153	rs2276707	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=515;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GCCCCTCCATCCTGTTACCAT;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=37;WE=119534161;WS=119534143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr3	119721171	rs12108149	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AGGTAAACTATATTCTTTATT;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=15;WE=119721179;WS=119721161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	119886548	rs9858566	G	C	6799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=88;PP=2965;SC=GGCTAAAGCCGAGCTCCTTGG;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=193;WE=119886556;WS=119886538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr3	119886776	rs902790	T	A	4978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=101;PP=2965;SC=AGCCGCCTCTTTCTGGTAGGA;SOR=1.231;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=62;TCR=101;TR=162;WE=119886784;WS=119886766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	119900260	rs1488764	T	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=287;SC=AAGAGGTCAATGAGCAGTAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=119900268;WS=119900250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	119904125	rs902791	A	G	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=2.106;SC=GACAGAGACCATATCAGATGT;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=191;WE=119904133;WS=119904115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,216:0.99:218
chr3	119904315	rs902792	G	C	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=40;PP=1217;SC=TTGTGAACATGCTGGAGCATG;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=119904323;WS=119904305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	119904366	rs5852234	A	ACTG	927.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=851;SC=GTATGTAAAAACTGCAGCATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=119904374;WS=119904356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	119905641	rs2319542	G	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=41;PP=1412;SC=CTGCAAAAGAGTCAAGGTCAA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=74;WE=119905649;WS=119905631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	119911667	rs2319543	G	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=759;SC=ATGAGAAACAGGAACTTTGGA;SOR=3.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=119911675;WS=119911657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	119962322	rs1492272	G	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=709;SC=GCACAATACCGACCTAGATCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=119962330;WS=119962312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	119962471	rs373980418	A	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=946;ReadPosRankSum=0.227;SC=GTGTGATGAGAAACTGGGCTG;SOR=0.582;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=59;WE=119962479;WS=119962461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,65:0.43:150
chr3	120067797	rs4676696	G	A	4057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=71;PP=2795;SC=GGTTGTTCTTGGCCAGCAGCG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=123;WE=120067805;WS=120067787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	120123953	rs1147701	T	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=413;SC=TCAGAGGGCCTTGGCAACAAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=120123961;WS=120123943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	120130883	rs67083358	GACACACACACACACATACATGC	G	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5776;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=1008;SC=TCGACACACAGACACACACAC;SOR=2.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=17;WE=120130914;WS=120130873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	120134720	rs3215378	A	AG	601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.63;NF=14;NR=1;PP=625;SC=TCCGCAAGGTACCACATTGGC;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=120134728;WS=120134710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	120134883	rs2272515	T	C	4964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=62;PP=2893;SC=TCCTAAAACATACAATCATAA;SOR=0.974;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=145;WE=120134891;WS=120134873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	120169641	rs1147708	T	C	10538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=141;NR=182;PP=2965;SC=GGCCCCGCGCTGACCTGGGAA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=142;TCR=182;TR=323;WE=120169649;WS=120169631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,404:1.00:404
chr3	120320939	rs12762	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=26;ReadPosRankSum=1.475;SC=GTCAGTTGTACGGTGGGTTGT;SOR=0.760;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=6;WE=120320947;WS=120320929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr3	120369575	rs3817627	T	G	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1353;ReadPosRankSum=-1.389;SC=CTGGCCAAAATCCCTTAGAAG;SOR=0.791;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=202;TCF=106;TCR=96;TR=87;WE=120369583;WS=120369565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,96:0.41:232
chr3	120371369	rs1054095	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=399;ReadPosRankSum=0.978;SC=CATTCAGGCTGCAAATGGTTG;SOR=1.092;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=24;WE=120371377;WS=120371359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr3	120371414	rs2551607	G	A	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=24;PP=1031;SC=GAGCAGTAGGGAGGGTGTGGA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=120371422;WS=120371404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	120389316	rs2255543	T	A	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=56;PP=2058;SC=TGTGAGTGACTTGGCCTTCGT;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=106;WE=120389324;WS=120389306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr3	120389491	rs17140269	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=1.368;SC=AACGACCTGTAGGCTCTAATG;SOR=0.193;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=6;WE=120389499;WS=120389481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	120394604	rs2733825	T	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=614;ReadPosRankSum=-1.862;SC=AGGAATAGGATTCAGAGCTCT;SOR=0.805;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=33;WE=120394612;WS=120394594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr3	120409526	rs2288096	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TCCATAAAAGCCTGCCTCATT;SOR=2.030;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=120409534;WS=120409516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	120413158	rs7612975	G	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=801;SC=GCATATTTCTGTAGGCATAAT;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=120413166;WS=120413148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	120417330	rs61758778	A	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TTAAAACTTCATGGCGCTTTG;SOR=0.721;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=48;WE=120417338;WS=120417320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,68:0.39:175
chr3	120500093	rs3732401	C	T	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1340;ReadPosRankSum=2.035;SC=TGATGATTCTCCACCCCGTCC;SOR=0.435;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=88;WE=120500101;WS=120500083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,95:0.51:187
chr3	121100116	rs35624942	GT	G	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=8;PP=506;SC=AATTTGTGTGGTTTTTTTTTA;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=26;WE=121100124;WS=121100106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	121137976	rs6782025	C	T	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=23;PP=885;SC=CTTTGAGAAACCATATTCAGG;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=121137984;WS=121137966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	121138015	rs6782033	C	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=25;PP=828;SC=AGCATCACTACTCAACTGCTA;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=121138023;WS=121138005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	121150957	rs185567338	C	T	118.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ATTCTACTTCCCCCACGCCCC;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=121150965;WS=121150951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr3	121154974	rs1381057	T	C	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=43;PP=2318;SC=CAAACCTGTTTGGTCACTTTG;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=121154982;WS=121154964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	121155198	rs2030531	C	T	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=51;PP=1478;SC=GTCCACAGTTCAGTGCTCACA;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=68;WE=121155206;WS=121155188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	121186543	rs1381058	A	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=56;PP=1717;SC=ATATATGAAAAAGGTCTGATT;SOR=2.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=72;WE=121186551;WS=121186533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	121195302	rs10591564	TACAC	T	2845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=1768;SC=TTCAGGTAAATACACACACAC;SOR=1.075;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=33;WE=121195315;WS=121195292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr3	121208176	rs3218651	T	C	5518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=70;PP=2965;SC=TGTCTGTTCATGAGATTGCTT;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=170;WE=121208184;WS=121208166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	121208833	rs3218649	G	C	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=66;PP=2420;SC=AATGGAACATGTCTGATGTTC;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=117;WE=121208841;WS=121208823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	121212277	rs11351457	AT	A	1508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=11;PP=844;SC=TAAAATTGACATTTTTTTTTT;SOR=2.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=43;WE=121212295;WS=121212267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	121228833	rs3732406	A	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=6;PP=1313;SC=CAGTCATACAACCTCACTAAA;SOR=2.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=121228841;WS=121228823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	121238749	rs702018	G	A	4761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=69;PP=2837;SC=TGCCAGCACGGCCAACCATCT;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=121238757;WS=121238739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	121241058	rs13059229	C	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=41;PP=1121;SC=GTGTATCTGTCTAAATCATAA;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=121241066;WS=121241048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	121263720	rs702017	C	A	6532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=131;PP=2965;SC=TAGCTTGTCTCTTTCGTAGTC;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=64;TCR=131;TR=195;WE=121263728;WS=121263710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr3	121265176	rs3806614	G	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=9;PP=1087;SC=AGATTGAGAAGCATTATGCAA;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=121265184;WS=121265166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	121265522	rs11714774	A	C	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=42;PP=1257;SC=ACCAAGCAAAACTAGTAGGCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=121265530;WS=121265512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	121295729	rs140537962	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=0.378;SC=CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=20;WE=121295737;WS=121295719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr3	121339354	rs7640859	T	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=27;PP=1559;SC=AACCTAACTGTTTTTCTTACT;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=75;WE=121339362;WS=121339344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	121339520	rs35295338	A	C	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1107;ReadPosRankSum=0.326;SC=ACTTGCTCTTATGGTTTGATG;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=62;WE=121339528;WS=121339510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr3	121340536	rs4676684	T	C	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=52;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CACCTGCAGGTGTGCCCCGCC;SOR=0.975;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=180;TCF=79;TCR=101;TR=87;WE=121340544;WS=121340526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,104:0.49:211
chr3	121350583	rs1128159	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=1.383;SC=AGAGGGAAGTCTGTCCAGAAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=121350591;WS=121350574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	121350966	rs9869984	C	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=19;PP=740;SC=TAATCATATACAGCCACAGCT;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=121350974;WS=121350956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	121351338	rs2070180	C	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GGCTCTGCTTCGTACACTGGC;SOR=0.982;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=53;TCR=81;TR=62;WE=121351346;WS=121351328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr3	121353254	rs2070179	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=646;ReadPosRankSum=1.848;SC=AGCCCACGGGTACCACTAGAA;SOR=0.948;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=37;WE=121353262;WS=121353244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,43:0.38:112
chr3	121353291	rs34667636	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=-0.967;SC=AGAAAAATTAGGGTTGTCTTG;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=34;WE=121353299;WS=121353281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr3	121354381	rs7620842	A	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=79;ReadPosRankSum=0.460;SC=CACTTTAGCCACCAAAGTGCT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=121354389;WS=121354373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	121363680	rs34440810	C	T	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1175;ReadPosRankSum=0.768;SC=CTGCCCTGTCCCTCTCAACTC;SOR=0.993;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=81;WE=121363688;WS=121363670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr3	121388362	rs11363204	AT	A	274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=186;SC=AAAAAGCATAATTTTTTTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=121388370;WS=121388352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	121415610	rs33988592	G	A	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=34;PP=1609;ReadPosRankSum=-2.163;SC=TCTGTGCTTGGGAGTTTTCCG;SOR=1.101;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=94;WE=121415618;WS=121415600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,104:0.54:191
chr3	121433926	rs9854052	T	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	121435621	rs9832267	T	C	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr3	121435624	rs9812411	C	T	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr3	121448675	rs28497949	T	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=681;ReadPosRankSum=0.177;SC=CTGTCCTTTATCAAATGCTCC;SOR=1.041;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=39;WE=121448683;WS=121448665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr3	121489439	rs148949254	TA	T	2210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.689;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1660;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GGACAGAAAATAAACAGATGA;SOR=0.491;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=116;TCF=14;TCR=102;TR=50;WE=121489447;WS=121489429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,78:0.44:178
chr3	121500479	rs149985093	TACACACACACACAC	T,TACACACACACAC	944.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.69;QD=36.34;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,20,6:0.77,0.23:26
chr3	121500699	rs17849995	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=659;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TTTCTTACGGCACTTCGCTAG;SOR=0.434;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=43;WE=121500707;WS=121500689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr3	121507231	rs1141528	A	T	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=1093;ReadPosRankSum=0.248;SC=TTTCTGGATAATCAGTGCTGA;SOR=0.785;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=61;WE=121507239;WS=121507221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,65:0.55:118
chr3	121507371	rs141690316	CTTTTTA	C	953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.380;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.110;NF=1;NR=18;PP=815;ReadPosRankSum=1.266;SC=ATCTTGCATTCTTTTTATTTT;SOR=1.545;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=19;WE=121507384;WS=121507361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr3	121507415	rs4073474	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=601;SC=CCCAATTCTACTATTTTACCA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=121507423;WS=121507405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	121508830	rs6802815	A	T	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=3;PP=1207;SC=GTCCAAATTTAAAAAAAAATC;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=121508838;WS=121508820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	121514458	rs141330650	TA	T	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=11;PP=208;SC=GGAAGGTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.493;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=15;WE=121514466;WS=121514448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	121526037	.	T	G	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=56.28;NF=5;NR=0;PP=72;QD=21.3542425094;SC=ATAGTGCATATACTTGTATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=121526045;WS=121526027;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,5:0.42:12
chr3	121526099	rs4582090	A	G	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.85;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	121526099	.	ATCATATGC	GTCATATGC,GTCATATGT	213	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=58.6;NF=22,12;NR=9,4;PP=152,213;QD=6.0248778241;SC=TTATATACAAATCATATGCGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31,16;WE=121526115;WS=121526089;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:31
chr3	121526107	rs4280673	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.817;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	121526152	rs5852278	TA	T	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=10;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-1.222;SC=ATGCTTCTGATAAAAAAAAAG;SOR=0.749;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=17;WE=121526160;WS=121526142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr3	121526204	rs4543051	G	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=549;SC=TTGATCTGTAGTATATTCTGT;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=121526212;WS=121526194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	121547527	rs1920320	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.991;SC=TAATACATCCAGGAGCTATTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=121547535;WS=121547517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr3	121563271	rs11717089	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=870;ReadPosRankSum=1.898;SC=TTACATTTTACAAAAATTGGT;SOR=0.846;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=21;WE=121563293;WS=121563261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr3	121563285	rs11721291	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=870;ReadPosRankSum=2.144;SC=AATTGGTATTTGTATCTATTT;SOR=0.944;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=25;WE=121563293;WS=121563261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr3	121613205	rs4603998	G	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=266;SC=GAGTTAAACTGAGTTGCTGAA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=121613213;WS=121613195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	121630328	rs6438687	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.357;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=478;ReadPosRankSum=0.593;SC=TCCTCCATTTATCCCCACACT;SOR=1.928;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=25;WE=121630336;WS=121630318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr3	121633964	rs2049331	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=476;ReadPosRankSum=-0.422;SC=ATTGTGGAGGCAATATCTGAA;SOR=0.441;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=27;WE=121633972;WS=121633954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr3	121634171	rs3215370	A	AT	1788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.492;NF=8;NR=35;PP=1001;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGAGGTTAGGATTTTTTTGAG;SOR=0.477;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=103;TCF=16;TCR=87;TR=43;WE=121634179;WS=121634161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr3	121634410	rs9812515	T	A	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1051;ReadPosRankSum=-1.327;SC=GAATAAAACATCAAATATTCA;SOR=0.422;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=102;TCR=36;TR=63;WE=121634418;WS=121634400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr3	121641528	rs7637569	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=382;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TAAGTCACTAGAAGTATGGTG;SOR=1.532;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=22;WE=121641536;WS=121641518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr3	121641693	rs2293616	G	A	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1242;ReadPosRankSum=1.310;SC=TAGACTGGGCGGCTGAGAAAT;SOR=0.400;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=161;TCF=71;TCR=90;TR=72;WE=121641701;WS=121641683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,80:0.42:192
chr3	121641821	rs2293615	A	G	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=902;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGACACTTCTACTTTAAGCAA;SOR=0.651;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=47;WE=121641829;WS=121641811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr3	121642048	rs3817601	A	T	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1253;ReadPosRankSum=0.478;SC=GATTTCTCATAACAGGATCTG;SOR=1.063;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=76;WE=121642056;WS=121642038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr3	121643143	rs3215371	A	AT	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=340;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CTAGGCCAACATTTTTTTTTC;SOR=1.426;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=21;WE=121643151;WS=121643133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr3	121643170	rs2257109	A	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.953;NF=30;NR=11;PP=619;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TCAGACATCAACTAAATTAAT;SOR=0.660;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=41;WE=121643178;WS=121643160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr3	121643303	rs2257115	T	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1215;ReadPosRankSum=0.018;SC=GTATTACGATTAACAACCATA;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=80;WE=121643311;WS=121643293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,87:0.53:165
chr3	121643337	rs2257119	G	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=844;ReadPosRankSum=-0.715;SC=CTCCTTGTACGCTGATAAGGG;SOR=0.848;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=54;WE=121643345;WS=121643327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr3	121643372	rs2257120	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=-1.212;SC=GAAAACATTCCCATTAAGCCC;SOR=1.361;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=33;WE=121643380;WS=121643362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr3	121643427	rs2257123	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.944;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	121643436	rs2257124	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.72;ReadPosRankSum=2.476;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	121643447	rs34567530	A	AT	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=922;ReadPosRankSum=0.711;SC=TAAGCATTGGATTTTTTTCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=121643455;WS=121643417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	121643699	rs2257132	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=416;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GTGTGTAGATGTGAGACAGAG;SOR=0.523;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=25;WE=121643707;WS=121643689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr3	121643804	rs2257212	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=844;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TCTAAATCCCCTTCTGGTTCT;SOR=0.468;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=58;WE=121643812;WS=121643794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
chr3	121643893	rs2257214	T	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=516;ReadPosRankSum=-0.056;SC=AAGTGTTCACTATGTCTGTAT;SOR=0.679;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=31;WE=121643901;WS=121643871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr3	121646495	rs1882002	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TATTTCTTTACAGCAATGCAA;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=18;WE=121646503;WS=121646485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
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chr3	121646759	rs3762819	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=467;ReadPosRankSum=-1.452;SC=GACTTGTTCAGTCATGATTCC;SOR=1.267;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=26;WE=121646767;WS=121646749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr3	121647286	rs1143671	C	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=751;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CCCAGCCCAGCCAGGTCCCCA;SOR=1.113;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=48;WE=121647294;WS=121647276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr3	121647467	rs1316301	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=480;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TTTTCCTTAACATTAATTGTA;SOR=0.175;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=25;WE=121647475;WS=121647457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr3	121647782	rs1316397	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=1.668;SC=GTCCAATATGCAGTAGAAGGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=121647790;WS=121647772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	121648168	rs1143672	G	A	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1993;ReadPosRankSum=1.538;SC=ACAGAAAGCAGAACAACCAAT;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=217;TCF=125;TCR=92;TR=117;WE=121648176;WS=121648158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,139:0.52:269
chr3	121658082	rs874741	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=429;ReadPosRankSum=-1.771;SC=TTTCCTGAAAATGGCTGAAGA;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=20;WE=121658090;WS=121658072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	121659197	rs3817599	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=358;ReadPosRankSum=0.673;SC=CAGTGAAGGGGGTTTGTTTAC;SOR=0.663;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=21;WE=121659205;WS=121659187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr3	121712051	rs2877561	A	C	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=71;PP=2965;SC=GAGTGATATCAAGTGAGCGGT;SOR=0.960;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=167;WE=121712059;WS=121712041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	121712805	rs3915061	G	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=401;ReadPosRankSum=1.304;SC=GAGGCTGGACGGCAGGGACAA;SOR=0.812;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=31;WE=121712813;WS=121712795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr3	121712980	rs3915060	C	T	6697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=94;PP=2965;SC=CCCATGTTCCCGCCCTTGCCC;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=107;TCR=94;TR=201;WE=121712988;WS=121712970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr3	121810427	rs57304749	CT	C	5765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=107;PP=2686;SC=CAAGTTTTACCTTTTTTTTTC;SOR=1.103;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=28;TCR=125;TR=132;WE=121810435;WS=121810417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr3	121825197	rs2681417	G	A	6361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=68;PP=2965;SC=GTATGATGGTGTTATGCAGAA;SOR=1.496;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=138;TCR=68;TR=206;WE=121825205;WS=121825187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr3	121836966	rs10580127	TGA	T	4346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=46;PP=2974;SC=GAGACATTGATGAGAGAGAGG;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=74;WE=121836975;WS=121836956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	121976253	rs9869985	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=661;SC=GCCTTCTCAGGCGGGGCACTG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=121976261;WS=121976243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	121994941	rs2279802	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=322;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GCAGGAAACTGTGCTGGGCTT;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=20;WE=121994949;WS=121994931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr3	122000871	rs4678174	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=14;PP=1213;SC=TGCCCAAACTCCTCCCTCTTA;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=122000879;WS=122000861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	122003045	rs2036400	G	C	6305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=90;PP=2965;SC=CCGCGCCCCCGTCAAGCTACC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=184;WE=122003053;WS=122003035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr3	122003769	rs1042636	A	G	3747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=82;PP=2203;ReadPosRankSum=1.004;SC=CATGGCCCACAGGAATTCTAC;SOR=0.709;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=334;TCF=152;TCR=182;TR=148;WE=122003777;WS=122003759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,189:0.45:419
chr3	122003832	rs1801726	G	C	7966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=137;PP=2965;SC=GACCCGACACGAGCCATTACT;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=90;TCR=137;TR=227;WE=122003840;WS=122003822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr3	122004098	rs4677948	A	T	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=836;SC=GTCCCAGGGAAGAGGAATCGC;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=122004106;WS=122004088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	122056432	rs17589	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=302;ReadPosRankSum=-1.443;SC=ATGAGACTTACGGAAAATTGG;SOR=0.385;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=25;WE=122056440;WS=122056422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr3	122060404	rs34173813	C	T	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.810;SC=GACGAGCTGACGGGCTTTTAG;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=90;TCR=86;TR=73;WE=122060412;WS=122060394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,96:0.43:222
chr3	122081601	.	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.945;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=367;ReadPosRankSum=0.121;SC=AAAGCTAATCGTTATAAAATG;SOR=0.836;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=18;WE=122081609;WS=122081591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr3	122081659	rs9857709	A	G	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.76;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	122081659	.	AA	GC	1047	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5;NR=13;PP=1047;QD=61.137104159;SC=CCCTCCCCCCAACCCCAAAAG;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=18;WE=122081668;WS=122081649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,18:0.53:34
chr3	122081660	rs9857710	A	C	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.51;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	122121563	rs3838601	T	TTTTC	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=477;ReadPosRankSum=-1.664;SC=AAACATCACATTTTCTTTCTT;SOR=2.964;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=12;WE=122121571;WS=122121553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	122128466	rs4306808	G	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=325;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TGCTCAGTGTGCAAGCAGCAG;SOR=0.667;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=19;WE=122128474;WS=122128456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr3	122128757	rs16833120	T	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=392;ReadPosRankSum=-0.227;SC=GGATGTGGTATGAGGATCCAT;SOR=1.319;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=28;WE=122128765;WS=122128747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr3	122133830	rs3749213	T	G	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1781;ReadPosRankSum=0.665;SC=TACCTGACACTATCAAGGACC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=280;TCF=147;TCR=133;TR=125;WE=122133838;WS=122133820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,143:0.45:321
chr3	122145810	rs4677950	T	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=653;SC=CTGACACAGGTACGTGAAAGC;SOR=2.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=122145818;WS=122145800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	122168341	rs3749209	C	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=1071;SC=ATGTACAATCCATTAATATTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=122168349;WS=122168331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	122186188	rs4678193	C	T	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=61;PP=2431;SC=CTCCATGTTACTAATCTGAGC;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=128;WE=122186196;WS=122186178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	122215166	rs10625209	A	AAC	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=252;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGAAGGGGAAAACACACACAC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=122215174;WS=122215164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	122247606	rs7628052	A	G	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=507;ReadPosRankSum=0.709;SC=AAAGGAAAAAATAAAATAAAA;SOR=0.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=32;WE=122247614;WS=122247596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr3	122255708	rs2270859	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=-0.657;SC=CAGCAGGTGAGCTTTTCCTTT;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=12;WE=122255716;WS=122255698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr3	122259606	rs9851180	T	C	6261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=93;PP=2965;SC=GTGGGCCTCATACATCTCTTC;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=103;TCR=93;TR=196;WE=122259614;WS=122259596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr3	122259640	rs28365795	T	C	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=68;PP=1435;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ATCAGATTGATGGCAGGAGAT;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=203;TCF=82;TCR=121;TR=121;WE=122259648;WS=122259630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,147:0.60:243
chr3	122259738	rs145948621	G	GT	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=13.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-1.302;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.896;SOR=1.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr3	122259745	.	GT	TT	465	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000,0.5000;HP=16;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=17;MQ=56.59;NF=1,8;NR=8,17;PP=284,465;QD=32.8888888889;SC=GCAGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=9,25;WE=122259753;WS=122259735;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr3	122259745	.	GT	GTT	465	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000,0.5000;HP=16;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=17;MQ=56.59;NF=1,8;NR=8,17;PP=284,465;QD=32.8888888889;SC=GCAGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=9,25;WE=122259753;WS=122259735;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr3	122259745	rs9831600	G	GT,T	809.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.85;QD=23.14;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,24:0.31,0.69:35
chr3	122259782	rs9868934	A	G	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=24;PP=664;SC=CTGTCTCACAAGCTGGAGTGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=122259790;WS=122259772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	122269380	rs1979853	A	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=52;SC=ATGTTGCTGAATGAATGAATG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=122269388;WS=122269376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	122274757	rs73192127	G	C	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=942;ReadPosRankSum=0.386;SC=CATCTTTCCAGACTGATAACT;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=58;WE=122274765;WS=122274747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,71:0.43:165
chr3	122277268	rs34006803	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GAGTGAGAGCGAGGTAATCCT;SOR=0.485;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=63;WE=122277276;WS=122277258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,73:0.54:135
chr3	122285005	rs12485294	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=1.975;SC=CCCATGTGCTGGGCACGTACA;SOR=0.616;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=14;WE=122285013;WS=122284995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	122287289	rs9839782	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATGGTAGGCCTGCATGCTGAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=122287297;WS=122287279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	122288210	rs2332285	G	A	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1378;ReadPosRankSum=0.108;SC=TCCAAGGACAGGCAGGTAGAT;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=90;WE=122288218;WS=122288200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,101:0.50:204
chr3	122296647	rs7632426	G	A	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=936;ReadPosRankSum=0.129;SC=CGTGCTGCCGGCCGGGAACCG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=65;WE=122296655;WS=122296637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr3	122437321	rs7645033	T	C	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=1561;ReadPosRankSum=2.606;SC=GTGTGGAATATGCTATCTCCT;SOR=0.714;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=110;TCR=109;TR=115;WE=122437329;WS=122437311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,135:0.51:263
chr3	122437834	rs3821688	A	G	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=47;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CTTGTCATCCACTATTTCACA;SOR=0.807;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=33;TCR=81;TR=67;WE=122437842;WS=122437824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr3	122474305	rs6794019	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AAAAAAGATACAAGTTAGTAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=122474313;WS=122474295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	122477795	rs2137210	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-1.153;SC=GCTGACCTGGGAGTGGAATCT;SOR=1.096;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=11;WE=122477803;WS=122477785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr3	122478032	.	C	CCACACACA,CCA	360.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=118;SC=CATGTGCGTTCCACACACACA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=122478040;WS=122478022;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:7
chr3	122512631	rs3806643	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.150;SC=CCACAGGAAGGAGCCCCGGCG;SOR=0.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=6;WE=122512639;WS=122512621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	122513964	rs891406	A	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.210;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	122605544	rs9864868	G	A	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=55;PP=2653;SC=AAACTGTGCAGATATTTTACA;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=130;WE=122605552;WS=122605534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	122630323	rs2303982	T	G	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=38;PP=1281;SC=ATGAGGTAGGTCCGGTTTCTT;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=122630331;WS=122630313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	122630346	rs2303983	T	C	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=33;PP=1014;SC=ACCTGCACAGTCGGTGGCCTC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=122630354;WS=122630336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	122631896	rs2276782	A	T	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=43;PP=1459;SC=GCGCAGGAGGACCTCCACCAG;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=122631904;WS=122631886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	122642401	rs2276780	G	A	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=29;PP=2095;SC=GAATCAGCTTGTGGCTGGTAA;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=99;WE=122642423;WS=122642391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	122642415	rs2276779	G	C	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=36;PP=2328;SC=CTGGTAATCTGGGGGTAAGGC;SOR=1.523;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=117;WE=122642423;WS=122642391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	122642590	rs2276778	G	A	4209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=90;PP=2584;SC=CAGAAGCCGCGATGCTGTTTC;SOR=1.822;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=32;TCR=90;TR=122;WE=122642598;WS=122642580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	122658093	rs55699792	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=1.341;SC=CTCCCTCCACGTACATTGCGG;SOR=1.329;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=122658101;WS=122658083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	122680141	rs13094003	A	G	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=887;ReadPosRankSum=-1.111;SC=ACCAGCTGGAACCACTCACTG;SOR=0.814;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=62;WE=122680149;WS=122680131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr3	122680171	rs4677985	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=956;ReadPosRankSum=0.132;SC=AATTTTGGGTAAGTCATGGAT;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=57;WE=122680179;WS=122680161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr3	122680240	rs34020905	C	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.01;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CCCCAGGGACCACATGGTTGC;SOR=0.410;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=24;WE=122680248;WS=122680230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr3	122807995	rs836860	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-0.100;SC=ACTCACAGTCGTTGGCTCCTT;SOR=0.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=122808003;WS=122807985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	122811042	rs836863	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=408;SC=CACAGGCCCTAGCACTGTTGA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=122811050;WS=122811032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	122821108	rs2717233	C	T	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=746;SC=CACCCTCTAGCTCTCACAGCC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=122821116;WS=122821098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	122821385	rs2241961	T	C	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=89;PP=2164;SC=AAGTGCCAAATGCTTTCATTG;SOR=1.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=42;TCR=89;TR=131;WE=122821393;WS=122821375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	122821478	rs2241962	T	A	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.13;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	122821671	rs2241963	AT	GA	8253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=66;PP=2947;SC=GTTCTCAGCAATGGTGGAGTC;SOR=0.704;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=131;WE=122821680;WS=122821661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	122834887	rs836839	A	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=580;SC=CCACTGATACAGTAAGCTCTT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=122834895;WS=122834877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	122835210	rs836840	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=544;SC=GAAGGGTGCCAGGGGTGGGGT;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=122835218;WS=122835200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	122835232	rs2278668	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GGGACAGGTTTTGAAATGGTG;SOR=0.275;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=122835240;WS=122835222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	122843020	rs836854	T	C	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1441;ReadPosRankSum=0.636;SC=TCCCCCACTTTCCTTCTAAAG;SOR=0.515;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=198;TCF=107;TCR=91;TR=91;WE=122843028;WS=122843010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,107:0.45:236
chr3	122843110	rs861375	G	T	4989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=83;PP=2965;SC=GTTTCTCCACGTTTCACAGGA;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=142;WE=122843118;WS=122843100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	122843212	rs2305051	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=988;ReadPosRankSum=-1.638;SC=GTGTGTGTGTCAGTGGGCGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=58;WE=122843220;WS=122843202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,62:0.57:108
chr3	122864436	rs8739	G	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1035;ReadPosRankSum=1.274;SC=ATGGAGAAGCGGATGTAAGCT;SOR=0.725;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=61;WE=122864444;WS=122864426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,71:0.53:135
chr3	122864587	rs3215241	TAGAC	T	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=388;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TAGAACATCTTAGACAGATGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=122864598;WS=122864577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr3	122865136	rs2673345	T	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=819;ReadPosRankSum=2.505;SC=TAGCACATCCTAACTGCCAGC;SOR=1.119;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=45;WE=122865144;WS=122865126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr3	122869041	rs11720822	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=428;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CTAAAAATCTCTCCTTATGGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=122869061;WS=122869031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	122869053	rs11720885	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=1.009;SC=CCTTATGGCTGCCTCCCCACT;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=122869061;WS=122869031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	122880191	rs8935	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=437;ReadPosRankSum=-0.919;SC=CTGTTGACTGTGTCAAAGACA;SOR=0.887;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=27;WE=122880199;WS=122880181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr3	123008519	rs4677881	T	G	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=3;PP=190;SC=GCGGATGCGGTATGGGGTATG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=123008527;WS=123008516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	123010276	rs9809236	G	A	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=68;PP=1911;ReadPosRankSum=0.348;SC=CCCAGATGTCGGCCCCTCCAC;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=179;TCF=65;TCR=114;TR=109;WE=123010284;WS=123010266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,115:0.59:195
chr3	123014877	rs9881951	C	T	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=660;SC=CTGTTGTCTCCGCCACCTGCT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=123014885;WS=123014867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	123015094	rs9882534	G	C	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=85;PP=2101;SC=GGCCTGAGACGGCCGTGGCTC;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=133;WE=123015102;WS=123015084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	123018963	rs4482616	A	G	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=26;PP=1798;SC=GAGGTGCCCCATACATGGCGT;SOR=1.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=123018971;WS=123018953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	123021838	rs9877581	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=302;SC=GAGCAGCTGCAGTGACAGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=123021846;WS=123021828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	123021870	rs9844212	G	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=185;ReadPosRankSum=0.023;SC=GGACTCTTCAGCACTCCCTTC;SOR=0.145;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=15;WE=123021878;WS=123021860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	123022740	.	G	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAA	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.32;QD=34.03;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	123037047	rs4327330	A	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=114;SC=ACACCCAGGGAAGCCACTCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=123037055;WS=123037037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	123047478	rs9855635	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=921;ReadPosRankSum=-1.605;SC=AGCCACCCACAGCTGTCACTC;SOR=0.953;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=87;TCR=28;TR=63;WE=123047486;WS=123047468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr3	123047666	rs9855969	A	G	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=100;PP=2947;SC=ATGGAGCAGGAGTAAAGCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=48;TCR=101;TR=148;WE=123047674;WS=123047656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	123049707	rs9829332	G	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=299;ReadPosRankSum=1.920;SC=CCCAGGGAGGGAGACGGTACC;SOR=0.146;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=25;WE=123049715;WS=123049697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr3	123049938	rs6806529	A	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.049;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=413;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GAGAAGCAAAAAGATTCACCC;SOR=2.303;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=18;WE=123049946;WS=123049928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	123066555	rs112525497	A	AAAGG	2114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=1745;SC=TGCCCACTTGAAAGGAAGTGG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=29;WE=123066563;WS=123066545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	123167249	rs4678027	G	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=28;PP=847;SC=CGCGGGCAGAGCCCCCGGGGG;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=43;WE=123167257;WS=123167239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	123301242	rs820469	C	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=690;ReadPosRankSum=-1.728;SC=TAGGTTAACACACAGCTGTGG;SOR=0.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=35;WE=123301250;WS=123301232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr3	123303821	rs1271004	G	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=300;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CCCCGGCCCTGCCACCGCCGC;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=19;WE=123303829;WS=123303811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr3	123303960	rs820468	C	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GGACGAGGGGCAGGCGGGGCC;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=14;WE=123303968;WS=123303950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr3	123337414	rs860224	C	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TTCTTGCCCACGGTGCATGGT;SOR=1.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=123337422;WS=123337404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr3	123348179	rs820447	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	123357037	rs820463	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-1.591;SC=GAGACCCCGCATTCTCTGAAA;SOR=0.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=26;WE=123357045;WS=123357027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr3	123357062	rs820464	G	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=337;ReadPosRankSum=0.806;SC=GATGGAGAGGGATAAATTGCC;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=19;WE=123357070;WS=123357052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr3	123368013	rs1254392	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=1.499;SC=ACTCACCATCATCTGACACCT;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=123368021;WS=123368003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr3	123378534	rs39639	C	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=248;ReadPosRankSum=0.450;SC=GATGAAAACTCTCAGAAAAGA;SOR=1.237;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=15;WE=123378542;WS=123378524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr3	123411589	rs40305	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=575;ReadPosRankSum=0.755;SC=TACCATCCACGGTGACTTGGC;SOR=1.041;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=38;WE=123411597;WS=123411579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr3	123418913	rs865358	G	A	9174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=160;PP=2965;SC=GGGTCTTTCCGTTCAGCGTCC;SOR=0.972;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=118;TCR=160;TR=278;WE=123418921;WS=123418903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr3	123426984	rs7641248	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATCACTGTGATTGGATACACA;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=123426992;WS=123426974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	123440967	rs820355	G	A	6643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=98;PP=2965;SC=GTGCCCAGAGGCTCCTACCAT;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=114;TCR=98;TR=212;WE=123440980;WS=123440957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr3	123444785	rs820329	A	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=19;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GGCAGGGGGAACTCACCATTC;SOR=1.193;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=64;WE=123444793;WS=123444775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr3	123451773	rs9833275	G	C	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=18;PP=1109;SC=CTACAGGACAGCTGGCCTTGG;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=123451781;WS=123451763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	123452838	rs4678047	G	A	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=49;PP=1960;SC=GAAGGACCGGGGTCTGCGGGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=123452846;WS=123452828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	123456432	rs2168439	C	T	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=62;PP=1848;SC=CAAATCTGCTCACCTTCTGGC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=80;WE=123456440;WS=123456422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	123457711	rs2198766	C	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=8;PP=1091;SC=CTAATACAGGCTGGATCAGGG;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=123457719;WS=123457701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	123457893	rs9840993	G	A	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=74;PP=2965;SC=TCCACTGCTGGAGCTGAAAAT;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=146;WE=123457901;WS=123457883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	123633612	rs11551801	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=314;ReadPosRankSum=0.465;SC=CACCTGATGAGTTTTCTTCTG;SOR=0.651;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=20;WE=123633620;WS=123633602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr3	123634046	rs2700373	G	A	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=961;ReadPosRankSum=-1.076;SC=CAGCAAGTCCGCTGTTGCTGA;SOR=1.008;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=55;WE=123634054;WS=123634036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,69:0.56:124
chr3	123650432	.	A	G	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=28;MQ=58.94;NF=1;NR=3;PP=60;QD=23.6928031368;SC=ACAAACTTGGAAAATACCTGT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=123650440;WS=123650422;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	123650447	.	TA	T	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9995;HP=16;HapScore=2;MGOF=55;MMLQ=18;MQ=58.94;NF=0;NR=2;PP=22;QD=12.5;SC=ACCTGTTTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=123650455;WS=123650437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr3	123652476	rs6784695	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=363;ReadPosRankSum=-2.803;SC=CAACATTTCCGGAGCCACAAA;SOR=0.365;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=24;WE=123652484;WS=123652466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr3	123665902	rs17310144	T	G	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1411;ReadPosRankSum=-0.306;SC=TCCAGATGCGTTTCTTTTCCA;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=73;TCR=100;TR=79;WE=123665910;WS=123665892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,96:0.48:199
chr3	123666192	rs17375977	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=0.273;SC=AACAAGTCTTCAGAAGTATGA;SOR=1.190;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=18;WE=123666200;WS=123666182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr3	123688760	rs34337446	C	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=676;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TTCAGATCATCCATATTTCAT;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=35;WE=123688768;WS=123688750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr3	123694595	rs138944419	C	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.06;QD=23.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	123851972	rs7627646	G	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=112;SC=CTGATGGTGCGGGGTTACTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=123851980;WS=123851962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	123983604	rs2276739	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=236;ReadPosRankSum=0.638;SC=ACATTTCTCACGTCCTCTTCT;SOR=1.004;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=19;WE=123983612;WS=123983594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr3	123988039	rs2272486	T	C	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=39;PP=1212;SC=AGATGTGGCATGTGCGCAAGC;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=123988047;WS=123988029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	124044949	rs2289778	C	T	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=53;PP=1450;ReadPosRankSum=-1.215;SC=GGAAGAGCTTCGCTGCTGCCC;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=166;TCF=70;TCR=96;TR=95;WE=124044957;WS=124044939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,102:0.55:186
chr3	124048764	rs2276740	C	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=0.813;NF=37;NR=52;PP=1548;ReadPosRankSum=0.738;SC=GTCTGCCATCCGAGATGCAAG;SOR=0.877;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=89;WE=124048772;WS=124048754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,103:0.61:169
chr3	124066121	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.867;NF=0;NR=11;PP=2997;ReadPosRankSum=-2.802;SC=AGGTGAGAAGCTGTGTGTGTG;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=11;WE=124066154;WS=124066111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	124113929	rs482285	A	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.930;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=360;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CCCTCACCCCAGCCCTGGCCT;SOR=0.117;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=27;WE=124113937;WS=124113919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr3	124114068	rs9841322	G	A	2486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1582;ReadPosRankSum=0.665;SC=AACTGATCAAGCAGTTCCAGC;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=96;WE=124114076;WS=124114058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,111:0.58:193
chr3	124128938	rs647010	A	G	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=21;PP=1508;SC=GAAACACCAGATACAGAATCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=124128946;WS=124128928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	124165217	rs624450	G	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=732;ReadPosRankSum=1.933;SC=CACAGCAGCAGATTGGGGATG;SOR=2.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=34;WE=124165225;WS=124165207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr3	124181261	rs535121	C	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1215;ReadPosRankSum=-2.326;SC=AAACTCTGCACGCATTTACAG;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=95;TCR=46;TR=76;WE=124181269;WS=124181251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr3	124195987	rs572145	T	C	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=490;SC=TAGACACTGGTGTCTGAGGGT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=124195995;WS=124195978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	124210344	rs10755077	C	A	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=43;PP=1225;SC=AGTGACACCTCAAAGCTAAGG;SOR=2.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=124210352;WS=124210334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	124281980	rs2256831	T	C	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=43;PP=1034;SC=AAGGAGGCCATGAGCGCTGGC;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=124281988;WS=124281970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	124303786	rs2250757	G	C	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=90;PP=2960;SC=GGTGCCTTCTGTTAGCCAGAC;SOR=1.500;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=43;TCR=90;TR=133;WE=124303794;WS=124303776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	124351229	rs3816201	C	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=715;ReadPosRankSum=0.236;SC=CCTGCCTTCACCACCTCTGAC;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=38;WE=124351237;WS=124351219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr3	124351316	rs1708303	G	A	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=59;PP=2596;SC=CCGAGTCCGTGGCCAACCTGC;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=124351324;WS=124351306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	124351424	rs1660038	T	C	5287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=67;PP=2965;SC=TGCGTCGGCTTAACAGCGGGA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=124351432;WS=124351414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr3	124352573	rs652046	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=4;PP=887;SC=GGAAATTGCGACTGAACAGTT;SOR=3.202;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=124352581;WS=124352563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	124352868	rs10428097	A	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=-1.777;SC=TTTGTGTGTGATGGGGGTAGT;SOR=0.192;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=22;WE=124352876;WS=124352858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr3	124355934	rs2276741	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=2.102;SC=CCTCTTCCGTCTAAACACAGA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=7;WE=124355942;WS=124355924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	124369640	rs11372663	T	TA	5891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=58;PP=2971;SC=TAAGCCTGTTTTTCTCTCTTT;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=124369658;WS=124369630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	124369650	rs2291988	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.15;MQRankSum=-1.257;NF=19;NR=25;PP=753;ReadPosRankSum=0.562;SC=TTTCTCTCTTTTCAGAGTCTA;SOR=0.647;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=44;WE=124369658;WS=124369630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,59:0.44:133
chr3	124374405	rs4677939	A	C	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=778;ReadPosRankSum=0.041;SC=TTTTTGGCTTAACAATGAAGA;SOR=1.105;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=56;WE=124374413;WS=124374395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr3	124376653	rs106520	G	A	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTAAGCACGTGAGTGTCTCCC;SOR=0.919;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=71;WE=124376661;WS=124376643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,90:0.52:172
chr3	124377165	rs2175740	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=5;PP=430;SC=GCCTTGGTGCGTCCCCAAGTG;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=124377173;WS=124377155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	124377430	rs56342323	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=356;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GCCACTTTCAGAAATACCAGA;SOR=0.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=24;WE=124377438;WS=124377420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr3	124378386	rs333297	C	G	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=43;PP=1189;SC=GTAGAGCTAGCGGTTCTGTCT;SOR=3.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=124378394;WS=124378376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	124379641	rs333291	C	A	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=601;SC=AGCTACTCTACACCATTGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=124379649;WS=124379631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	124379748	rs333290	G	C	4520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=56;PP=2889;SC=CCACACTCTTGCCTGCTTCCC;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=141;WE=124379756;WS=124379738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	124379817	rs333289	T	C	5673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=103;PP=2965;SC=GTTCAGATATTGAGGTGAGTT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=75;TCR=103;TR=178;WE=124379825;WS=124379807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	124380793	rs665927	C	T	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=834;SC=TTTAAGAATGCGTCTAAGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=124380801;WS=124380783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	124390796	rs3772782	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=707;SC=GGCATAGCCTCAGGGGTTACT;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=124390804;WS=124390786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	124393610	rs333354	A	G	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=233;SC=TTGAGTGCTGACACCATATGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=124393618;WS=124393600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	124396338	rs333349	T	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=25;PP=1592;SC=CACACATTAGTTCTTGTCCCA;SOR=1.450;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=75;WE=124396346;WS=124396328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	124398571	rs821365	A	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=444;SC=AGATTTTTTTAAAAAACAAAA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=124398579;WS=124398561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	124398589	rs821364	A	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=381;SC=AAAACTTGTTATCTTGAATGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=124398597;WS=124398579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	124412634	rs333283	G	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=41;PP=1329;SC=AATTTTCTGTGTCTTTTTGTT;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=124412642;WS=124412624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	124413424	.	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AATCTGGGGTGCAACTTCTGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=124413432;WS=124413414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	124418846	rs2289427	C	T	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1435;SC=GCCTTCCCAGCGAGCCCTCGG;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=124418854;WS=124418836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	124437747	rs143730660	TC	T	2127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,75:0.46:164
chr3	124449252	rs2279199	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=1.757;SC=ACTTCGCGGGTGACGTCATCG;SOR=0.507;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=11;WE=124449260;WS=124449246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	124449291	rs1139538	A	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=507;ReadPosRankSum=0.420;SC=GCGCCTGGGAATTTGAAGCAA;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=28;WE=124449299;WS=124449281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr3	124450258	rs4678146	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=0.175;SC=TAGCTGCCTCTCCCATTATCT;SOR=0.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=9;WE=124450266;WS=124450248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	124450321	rs10934681	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=188;ReadPosRankSum=0.362;SC=AATCAATCGCTTGTGTTATTA;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=13;WE=124450329;WS=124450311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr3	124451284	rs16835925	T	C	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=26;PP=1641;ReadPosRankSum=1.167;SC=ATGAATTACCTGGGAATTTTG;SOR=0.966;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=201;TCF=141;TCR=60;TR=99;WE=124451292;WS=124451274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,107:0.50:212
chr3	124454174	rs3772804	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TCTGTGCACTAATGTTTTACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=124454182;WS=124454164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	124458816	rs694897	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=211;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TTGGACAAGACGTTAGAGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=15;WE=124458824;WS=124458806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr3	124462710	rs3772807	G	C	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=810;ReadPosRankSum=0.371;SC=TCATGTGACAGGTTTTCTGAT;SOR=0.416;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=51;WE=124462718;WS=124462700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr3	124483089	rs2291079	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=344;ReadPosRankSum=-0.164;SC=AATTCTCTCTCTCCAGAACTG;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=17;WE=124483097;WS=124483079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr3	124483420	rs61761679	G	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GGGACCAGAAGCATGGTAAGC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=21;WE=124483428;WS=124483410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr3	124605736	rs6438861	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr3	124627024	rs1127233	T	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=772;ReadPosRankSum=0.061;SC=TGCTGCTGTGTCTTGAATAGG;SOR=0.291;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=49;WE=124627032;WS=124627014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr3	124629222	rs34208404	TA	T	1418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.227;QD=11.73;ReadPosRankSum=2.169;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,72:0.60:121
chr3	124632127	rs2270780	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=0.046;SC=TTCAGAAACAATCTCTTTAAC;SOR=0.296;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=19;WE=124632135;WS=124632117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	124635404	rs4679164	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-1.474;SC=CCAGACTCCCGAATCTCCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=14;WE=124635412;WS=124635394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr3	124635444	rs4679165	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=0.469;SC=TCCTGTCCCTATGATTCGGAC;SOR=1.085;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=124635452;WS=124635434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	124646705	rs10630030	A	AAAG	7135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=74;PP=2633;SC=AGCTGTTGGGAAAGGTGTATT;SOR=1.151;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=11;TCR=83;TR=83;WE=124646713;WS=124646695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr3	124653710	rs10934701	A	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=42;PP=1129;SC=AATACCATAGATCTCTTCCGA;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=124653718;WS=124653700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	124690112	rs139055974	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=0.831;SC=GGAGAGCCCAATGTGGGAATC;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=9;WE=124690120;WS=124690102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr3	124692689	rs2270778	C	T	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=1342;ReadPosRankSum=2.657;SC=ATTCAGCATACGGGGACATTT;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=89;WE=124692697;WS=124692679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,103:0.53:196
chr3	124692785	rs2270779	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGCTCAATTCCGTAAAGAAGT;SOR=1.148;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=25;WE=124692793;WS=124692775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr3	124729241	rs376392642	G	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=643;ReadPosRankSum=-2.137;SC=AGCCCAACGTGGTACTGTGGT;SOR=0.638;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=62;TCR=14;TR=38;WE=124729249;WS=124729231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr3	124731485	rs10804567	C	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=796;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GAAGAGGACACTGTTGTTGGT;SOR=0.778;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=51;WE=124731493;WS=124731475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr3	124731568	.	G	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=828;ReadPosRankSum=0.992;SC=AACAACTGTGGTTTGGGGAGA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=51;WE=124731576;WS=124731558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr3	124731689	rs78680419	T	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.166;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=756;ReadPosRankSum=1.994;SC=ATCAATCCAGTGGTAGCATCC;SOR=0.497;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=51;WE=124731697;WS=124731679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,61:0.44:139
chr3	124732419	.	A	AGAGGAGGAGGAGGAAGAG	1970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=4.178;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr3	124732842	rs6438871	C	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=411;ReadPosRankSum=0.926;SC=CGACTGTAAACGGAAAAGCCA;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=20;WE=124732850;WS=124732832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr3	124733649	rs6438873	T	G	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=960;ReadPosRankSum=0.318;SC=TGTTTCTTGGTGCATGGCCGC;SOR=0.917;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=63;WE=124733657;WS=124733639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr3	124746347	rs4404487	T	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=537;ReadPosRankSum=-1.958;SC=GAAGACTTTCTGAGGCTGAAA;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=43;WE=124746355;WS=124746337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr3	124774665	.	G	GCAT	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.091;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	124774672	.	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=2.034;SC=GCGGCAGCAGCAGCAGCGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=124774680;WS=124774662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	124774779	rs200147885	A	AGGGCAGC	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.56;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	124802677	rs1574340	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=411;SC=GAAGGTCCTGAGCTTGGGTCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=124802685;WS=124802667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	124802881	rs2981483	A	G	5251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	124802888	rs2981482	C	T	5229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	124803043	rs2981481	G	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=412;SC=TATATGTACAGGTATATATGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=124803051;WS=124803033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	124807315	rs76346373	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=455;ReadPosRankSum=-1.930;SC=TACACACACACGCACAGAATT;SOR=0.451;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=42;WE=124807323;WS=124807305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,54:0.40:135
chr3	124807342	rs75179621	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.300;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=375;ReadPosRankSum=-0.409;SC=AATGTTTTCCTTTTTCAGTCT;SOR=1.152;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=27;WE=124807350;WS=124807332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,29:0.32:92
chr3	124826408	rs6773138	T	C	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1181;ReadPosRankSum=0.680;SC=CCCTTCGCTCTTGGAAGTCTG;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=68;WE=124826416;WS=124826398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,73:0.50:146
chr3	124829220	rs72963853	C	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=580;ReadPosRankSum=-1.299;SC=CCAGAACCTGCTCCTGTGCCT;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=30;WE=124829228;WS=124829210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr3	124837684	rs621383	T	C	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=29;PP=892;SC=AAGACGAAGATGATGTACAGA;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=124837692;WS=124837674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	124839470	rs863642	G	A	6092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=99;PP=2965;SC=CAGGGAGCCCGGGGGAATGCT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=191;WE=124839478;WS=124839460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr3	124854425	rs702048	T	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=797;SC=ATACCAAGAGTACCTGCAGGC;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=124854433;WS=124854415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	124854636	rs2981503	A	T	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=81;PP=2851;SC=TCTGAAATAAAGCAATGGAGA;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=150;WE=124854644;WS=124854626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	124870443	rs73191256	C	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=-1.968;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr3	124896861	rs545103	C	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=39;PP=1144;SC=GGACAGAAAGCCATGGGCCCA;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=124896869;WS=124896851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	124906303	rs144403442	A	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=57;PP=1431;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GCAAGGTTGGATTAGGTGAGG;SOR=0.862;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=179;TCF=65;TCR=114;TR=87;WE=124906311;WS=124906293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr3	124909178	rs4679159	T	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TTTCCTGTCTTGGGCCCGTGA;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=65;WE=124909186;WS=124909168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr3	124911555	rs73193442	C	T	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1298;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GAAAATATAACTGGTTTAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=84;WE=124911563;WS=124911545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,104:0.51:204
chr3	124930044	rs673881	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=367;SC=AGTTAATTACATCTAAAGGGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=124930052;WS=124930034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	124930396	rs1969228	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.641;SC=CCGGGTTACCTTTTTGGTACC;SOR=0.072;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=124930416;WS=124930386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	124930408	rs686088	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=393;SC=TTTGGTACCCAGGTAGATCCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=124930416;WS=124930386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	124951171	rs35950048	CT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.126;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	124951821	rs1053738	C	T	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1451;ReadPosRankSum=0.113;SC=CATTCTCTGACGGGGTGACCT;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=85;TCR=118;TR=84;WE=124951829;WS=124951811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,94:0.41:231
chr3	125179732	.	C	CATAA	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=54;QD=48.5;SC=ACACACATTGCATAGAGTTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=125179740;WS=125179722;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr3	125223368	.	AT	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=9;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.327;NF=14;NR=7;PP=669;ReadPosRankSum=-1.953;SC=GAAAAAAAAAATAACCTTTAA;SOR=0.385;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=21;WE=125223376;WS=125223357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr3	125223456	rs2076724	C	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.917;NF=28;NR=25;PP=856;ReadPosRankSum=1.928;SC=GGTGTAATTTCTGTTACCCAC;SOR=0.516;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=53;WE=125223464;WS=125223446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,57:0.38:151
chr3	125271500	rs78044171	T	C	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=928;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AACGCTTCTCTAGGATAAATG;SOR=0.906;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=58;WE=125271508;WS=125271490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,67:0.48:140
chr3	125282547	rs146042429	C	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=673;ReadPosRankSum=0.563;SC=CTTACCCTCGCTAATAGTCCA;SOR=0.681;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=45;WE=125282555;WS=125282537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr3	125301957	rs189522532	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=1.834;SC=AAGTAAAATGTATAGGTCAAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=125301965;WS=125301947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	125694457	rs61736423	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.594;NF=8;NR=15;PP=251;ReadPosRankSum=0.633;SC=GAGAGCGGTCTGAGCGAGTCG;SOR=1.200;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=23;WE=125694465;WS=125694447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr3	125695947	rs143954222	G	A	55.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	125701099	rs2270986	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=-1.162;SC=CCTCATTTTATGTAACTTTTA;SOR=0.928;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=21;WE=125701107;WS=125701089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr3	125725268	rs111477552	TAACA	T	2329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.110;NF=15;NR=25;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AGGTTTTTGCTAACAAACAAA;SOR=0.477;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=40;WE=125725279;WS=125725258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr3	125725455	rs11543284	G	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=661;ReadPosRankSum=0.274;SC=CTGAGGCTTGGGAACAGAAAA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=45;WE=125725463;WS=125725445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr3	125725559	rs1044215	C	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CTCTTCTTTACCTTCTCAGGC;SOR=0.093;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=125725567;WS=125725549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	125726048	rs2279819	G	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TCACTTCTGCGAGGTACAGCA;SOR=1.013;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=30;WE=125726056;WS=125726038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr3	125734308	rs2279821	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=588;ReadPosRankSum=0.067;SC=CCAACCCAGGGACCACATGGG;SOR=0.607;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=38;WE=125734316;WS=125734298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr3	125752387	rs141723307	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=138;ReadPosRankSum=0.669;SC=GCCTTCACCCTTCCCACCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=12;WE=125752395;WS=125752377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr3	125769757	rs4077563	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=504;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CACGTTGTGGCCGCCTCGAAT;SOR=0.746;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=31;WE=125769765;WS=125769747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr3	125775228	rs7613944	T	C	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=19;PP=920;SC=CCAGGCCGGCTGTCATCATGC;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=125775236;WS=125775218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	125775428	rs6438964	G	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=570;SC=CCAGGAGCACGAAGTCAGAGC;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=125775436;WS=125775418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	125786695	rs4308225	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=875;SC=AGGACTGCCCGACAACCTTTA;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=37;WE=125786703;WS=125786685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	125786760	rs4308226	G	A	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1592;SC=GCAGTGCCCCGCTCCCTGTCC;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=125786768;WS=125786750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	125786879	rs4234270	T	C	4811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=77;PP=2947;SC=ATGGACCAGGTGGTCTCCCTG;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=156;WE=125786887;WS=125786869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr3	125825938	rs9282690	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=976;ReadPosRankSum=0.829;SC=CCCAGTAACACGTGGGAGAGA;SOR=1.099;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=66;WE=125825946;WS=125825928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr3	125826059	rs1127717	T	C	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GTCTTCCACGTCTGTGAAAAC;SOR=0.822;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=69;WE=125826067;WS=125826049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr3	125831572	rs4646744	GGC	G	483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.493;NF=8;NR=3;PP=391;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CCTCCAGCCAGGCGCTGCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=125831581;WS=125831562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr3	125831799	rs79298645	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=510;ReadPosRankSum=1.491;SC=AGGGCCCAGCCGCCTCTTCTA;SOR=0.521;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=34;WE=125831807;WS=125831789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr3	125843400	rs3217578	A	AG	1116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=1172;SC=GCAAGCTGGGAGAGTAGCTGC;SOR=3.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=125843408;WS=125843390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	125844718	rs2278756	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=2.864;SC=GGCAGCTCACGCCTGCTGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=17;WE=125844726;WS=125844708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr3	125848911	rs1868125	A	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=204;SC=CCTTACAACAATGCCTGGCAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=125848919;WS=125848901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	125848945	rs2365002	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=332;SC=AAGAAGCACATGGATGGCTGT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=125848953;WS=125848935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	125849031	rs873696	C	T	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=14;PP=717;SC=TGGAAAGCACCGCGAGGCTGC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=125849039;WS=125849021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	125849238	rs2002287	G	A	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=913;SC=AAGTCAAAGCGACCAGCTTAG;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=125849246;WS=125849228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	125850101	rs4646733	CA	TG	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=1487;SC=AAACAGGTGTCATTCCAAGCC;SOR=2.985;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=27;WE=125850110;WS=125850091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	125850169	rs3821451	T	C	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=31;PP=1779;SC=CTTGGAGTTCTCCTATATGGC;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=125850177;WS=125850159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	125850193	rs3816366	A	G	4808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=50;PP=1844;SC=GCCAGTCTGCATGTGCTCACA;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=112;WE=125850201;WS=125850183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	125850381	rs2305228	A	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1070;SC=TGCCAACCTGACCAGGGTGAG;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=125850389;WS=125850371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	125850434	rs2305227	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=283;SC=GCCTCATCTGCCCTCACAAGG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=125850442;WS=125850424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	125854311	rs3216713	TC	T	4099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=26;PP=2661;SC=TCCACAGAAGTCCCCCCCGTG;SOR=2.430;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=95;WE=125854319;WS=125854301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	125856916	rs6799991	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=285;SC=CCCAGCACCGAGAGGTAGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=125856924;WS=125856906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	125872067	rs56195618	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=1.113;SC=GGGTAGGGAGCCCAGCTTTCC;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=125872075;WS=125872057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	125872261	rs41266445	C	T	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.838;SC=TTTGAGCAGGCAAGTGACCCA;SOR=0.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=69;WE=125872269;WS=125872251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr3	125872293	rs16837178	G	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.394;SC=TTACCATTTTGTCATCATTCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=67;WE=125872301;WS=125872283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr3	125872548	rs41266447	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=0.244;SC=ACCTGGGAGCCGGCTCAAAGC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=125872556;WS=125872538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	125874388	rs2276731	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=547;SC=CAATAGGACCCTGCCTCCTTC;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=125874396;WS=125874378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	125899712	.	CG	GA	4357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=35;PP=2944;ReadPosRankSum=0.477;SC=CAGTTCTGAGCGCTGGCAAGG;SOR=0.585;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=178;TCF=122;TCR=56;TR=100;WE=125899721;WS=125899702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,110:0.57:194
chr3	126070823	rs202091653	C	T	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=970;ReadPosRankSum=-0.221;SC=ATGAGTTCTGCGGCTGGGTTC;SOR=0.828;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=61;WE=126070831;WS=126070813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
chr3	126132880	rs4679240	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AGAGACCACCGCCTGGAAGAG;SOR=0.983;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=16;WE=126132888;WS=126132870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr3	126135070	rs143567171	C	CCGCGTCCCCGGCCTCAGGTCCG	944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr3	126135365	rs6439010	G	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=762;ReadPosRankSum=1.112;SC=CGTCCCCTCCGGCGCGGGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=45;WE=126135373;WS=126135355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr3	126137558	rs4679242	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=572;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AGAAGGACGCCGCCTTGTTCG;SOR=0.951;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=36;WE=126137566;WS=126137548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr3	126138778	rs2271630	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=20;PP=1147;SC=TGCTGAAGCTTGGCTGCAGCT;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=126138786;WS=126138768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	126138889	rs1877967	G	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=701;ReadPosRankSum=1.437;SC=CCAGCCTGAGGAGGAGCCTGG;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=45;WE=126138897;WS=126138879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr3	126142433	rs140223152	CGGA	C	3292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=1945;ReadPosRankSum=1.206;SC=AGCCAGGAGACGGAGAAGACC;SOR=0.499;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=47;WE=126142443;WS=126142423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,83:0.67:123
chr3	126152980	rs76144029	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=1.645;SC=GGTGGGTTTCCGCCTGCCAGC;SOR=1.282;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=14;WE=126152988;WS=126152970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	126157464	rs11444454	T	TG	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.104;NF=0;NR=12;PP=532;ReadPosRankSum=-2.622;SC=TGTTCTTTGATGAAAAATGAA;SOR=3.219;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=12;WE=126157472;WS=126157454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	126158622	rs1799404	A	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=390;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AGTGCAGCAAAGGTCCTCGTC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=32;WE=126158630;WS=126158612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr3	126160884	rs63288960	CATTA	C	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=-0.737;SC=ACAGCCTTCCCATTAATTGTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=3;WE=126160895;WS=126160874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	126169091	rs777493	T	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=833;ReadPosRankSum=-2.075;SC=CAACCTTGGATGCGTAAGGGT;SOR=0.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=66;WE=126169099;WS=126169081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,69:0.39:176
chr3	126169230	rs777494	C	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1094;ReadPosRankSum=0.527;SC=TAGAGATCCACGCACCCTCCC;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=158;TCF=75;TCR=83;TR=70;WE=126169238;WS=126169220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,82:0.43:189
chr3	126169472	rs777495	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=378;SC=CCTACCCGCATCTCCCTTCCT;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=126169480;WS=126169462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	126184941	rs1799389	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GGCACTGGCACTGTTCCCGTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=126184949;WS=126184938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	126185238	rs1687463	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=548;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TGACACTTCCCCATCAGATCA;SOR=0.486;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=33;WE=126185246;WS=126185228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr3	126185265	rs3830336	A	AT	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=473;ReadPosRankSum=0.686;SC=CCAGACCTGCATTTTGCACCC;SOR=0.564;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=15;WE=126185273;WS=126185255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr3	126189919	rs777499	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=0.060;SC=AACTCACCATAATTCTTTAAA;SOR=0.646;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=25;WE=126189941;WS=126189909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr3	126194076	rs812367	T	C	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=1156;ReadPosRankSum=1.094;SC=AGCCCTCCAGTGGGCACTTGA;SOR=0.535;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=198;TCF=75;TCR=123;TR=94;WE=126194084;WS=126194066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,105:0.46:227
chr3	126194357	rs7624748	G	C	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.45;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	126201370	rs75489116	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=0.138;SC=CAACATAACCGGGCTCCCCAC;SOR=0.485;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=26;WE=126201378;WS=126201360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr3	126202257	rs1687477	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=844;ReadPosRankSum=0.505;SC=CTCTCCCCTCGGCCTCCGGGG;SOR=0.889;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=55;WE=126202265;WS=126202247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,74:0.43:173
chr3	126207222	rs777483	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=280;SC=CTGCTAGGCCAGAAGGATGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=126207230;WS=126207212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	126208249	rs777479	A	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=290;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GCTGTCAGCCAACAGTGTCCA;SOR=0.965;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=19;WE=126208257;WS=126208239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr3	126211365	rs116286432	G	A	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=1131;ReadPosRankSum=0.579;SC=ACCACCTGAGGAGAGAAGGGC;SOR=0.847;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=62;TCR=99;TR=75;WE=126211373;WS=126211355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,90:0.44:203
chr3	126211479	rs2307882	C	CCTCT	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=1027;SC=AGCCTGAGCGCCTAACAAGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=18;WE=126211487;WS=126211469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	126215130	rs6797423	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.903;SC=AGCAGTGCCAGTGGCCCCATG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=126215138;WS=126215120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	126218159	rs6771670	T	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=17;PP=1247;SC=ACACTAGATGTGGCAGCCGCC;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=126218167;WS=126218149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	126218769	rs35907154	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=342;SC=AGAGGCACAGTGAAGCCTCGG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=126218777;WS=126218765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	126218788	rs6774768	T	C	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=775;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GGTCAGGATTTGCTGGGCCAC;SOR=2.517;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=126218796;WS=126218778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr3	126219030	rs13072404	T	C	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=56;PP=1450;SC=ACCACCGCTGTGAGGCCCTGG;SOR=1.384;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=126219038;WS=126219020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	126219086	rs13092625	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=30;PP=883;SC=CATGCTCCCCACCAACTTCCA;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=126219094;WS=126219076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	126219627	rs34025926	G	A	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=97;PP=2965;SC=GGTAGTAGCCGCCATTGAACG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=67;TCR=97;TR=164;WE=126219635;WS=126219617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	126219750	rs201018413	A	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=627;SC=AGTGCAAGCCACACACAGCCT;SOR=3.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=126219771;WS=126219740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	126219752	rs139417364	ACACAGCCTGGGC	A	1176.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=2973;SC=TGCAAGCCACACACAGCCTGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=126219771;WS=126219740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	126219973	rs1177565	T	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=10;PP=1328;SC=CTTTGTGTCCTGGCAGCTCCT;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=58;WE=126219981;WS=126219963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	126220539	rs9844797	A	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=607;SC=ATATTTTGGGAAACAGAAGAT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=126220547;WS=126220529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	126220845	rs7643584	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=633;SC=TCCTCAGCTCGGGGGTTGCGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=126220853;WS=126220835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	126226518	rs9784244	C	T	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1166;ReadPosRankSum=-1.385;SC=AATATCACCACTTTGCTTTAT;SOR=0.559;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=177;TCF=111;TCR=66;TR=80;WE=126226526;WS=126226508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,84:0.43:194
chr3	126227185	rs16837531	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=485;ReadPosRankSum=0.008;SC=CTGTGGGTTTGTAAGCTCCTA;SOR=0.587;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=34;WE=126227193;WS=126227175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr3	126228410	rs729456	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=592;ReadPosRankSum=0.811;SC=GCTGGGCCTCGGTTTCCCTGG;SOR=0.700;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=35;WE=126228418;WS=126228400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr3	126236348	rs1687480	T	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=21;PP=1174;SC=CAGCTCCCACTAAGAGGGCAG;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=126236356;WS=126236338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	126243419	rs7613347	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=47;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GGCGCTGGTGAGGCACAGAAA;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=7;WE=126243427;WS=126243409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	126268953	rs869464	T	G	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACGCCTGGCCTTCAGGACCCC;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=28;WE=126268961;WS=126268943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr3	126270735	rs2291509	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=1.028;SC=AAAGTGGCGCGTGCTGGGAGG;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=126270743;WS=126270725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	126270757	rs13071443	G	T	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=847;SC=TAACATGAACGTCTGCATGCA;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=126270765;WS=126270747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	126328101	rs9856833	A	G	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=55;PP=1746;SC=CAGTAAAAGCATACAATAGAT;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=94;WE=126328109;WS=126328091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	126329910	rs777241	A	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=58;PP=2307;SC=TTATCTTTGCATAACAAGTGT;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=126329918;WS=126329900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	126340553	rs3732534	G	A	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=26;PP=2106;SC=ATCTTGATCAGGACATTATCT;SOR=1.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=69;TCR=26;TR=95;WE=126340561;WS=126340543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	126365127	rs11453652	C	CT	1903.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1594;SC=GTGAGTTAAACAAAGTGTTAC;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=36;WE=126365135;WS=126365117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	126373994	rs3108755	A	G	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=51;PP=1842;SC=CCGCCCCCCAACACCGCCCCG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=85;WE=126374002;WS=126373984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	126384945	rs2271988	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=413;ReadPosRankSum=0.508;SC=TCCTGAGGGGCCTTCTCGCCA;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=31;WE=126384953;WS=126384935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr3	126385891	rs2271991	C	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=444;ReadPosRankSum=0.096;SC=TCCCGCCTCTCGTTTAACTGT;SOR=0.465;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=27;WE=126385899;WS=126385881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr3	126386066	rs73859574	A	T	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=63;PP=1819;ReadPosRankSum=-1.396;SC=ACCGATGTCCATCTATATCAC;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=124;TCR=132;TR=121;WE=126386074;WS=126386056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,150:0.50:302
chr3	126633419	rs2303994	C	G	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=675;ReadPosRankSum=-1.195;SC=CTTTGATGCCCGTCAAGAAAT;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=46;WE=126633427;WS=126633409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr3	126644974	rs732462	G	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CTGAAAGGCTGTCTAAAATCC;SOR=1.270;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=126644982;WS=126644964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	126679121	rs113706892	G	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=798;ReadPosRankSum=0.464;SC=CACAGCCACTGTGCCCTGCCG;SOR=1.320;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=44;WE=126679129;WS=126679111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr3	126708453	rs6773789	T	C	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=62;PP=1435;ReadPosRankSum=-1.649;SC=TGCTGTTCACTGTGTTCGCCC;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=254;TCF=104;TCR=150;TR=105;WE=126708461;WS=126708443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,136:0.45:303
chr3	126708647	rs57299665	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=-3.424;SC=TGGGCAGGGGCGCCCCTCCTC;SOR=0.631;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=17;WE=126708655;WS=126708637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr3	126724881	rs12489348	G	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=926;ReadPosRankSum=0.451;SC=TGGGAGTCCTGGGCAAGCAGT;SOR=0.867;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=62;WE=126724889;WS=126724871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr3	126733329	rs80308004	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=706;ReadPosRankSum=-0.356;SC=AGCTGTCCCCCGAGACGGGCC;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=43;WE=126733337;WS=126733319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr3	126735347	rs73861744	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=508;ReadPosRankSum=0.648;SC=CTGTCCCACTCGGGCACCTCC;SOR=0.053;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=30;WE=126735355;WS=126735337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr3	126736049	.	C	T	21	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=21;QD=27.8856062736;SC=TCCTGCCTGGCGGGTAGAAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=126736057;WS=126736039;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	126737268	rs4679323	C	A	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1297;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TGGCTGTGCTCATCGCCTACA;SOR=0.455;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=82;WE=126737276;WS=126737258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,93:0.58:159
chr3	126737466	rs73861745	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=382;ReadPosRankSum=1.890;SC=CCCCCACCCTGCTTCAGCTCA;SOR=1.284;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=22;WE=126737474;WS=126737456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr3	126739012	rs891762	G	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=755;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GGCCACCAGGGCATGCTGCCC;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=45;WE=126739020;WS=126739002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr3	126739291	rs6439030	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=906;SC=GCAGCCTGTGTGGCCTGGGGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=126739299;WS=126739281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	126746690	rs9851451	A	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=775;ReadPosRankSum=0.925;SC=TCTCCTTGCCAGGAACACCAT;SOR=1.071;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=109;TCF=33;TCR=76;TR=46;WE=126746698;WS=126746680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,52:0.41:126
chr3	126746731	rs9833827	T	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=595;ReadPosRankSum=-0.737;SC=AGGGGCAGGTTGGGGGTAGGC;SOR=0.963;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=32;WE=126746739;WS=126746721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr3	126748291	rs6776842	C	T	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=52;PP=1917;ReadPosRankSum=0.699;SC=AGGTGACAGACGGGTCCTCGG;SOR=0.900;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=250;TCF=148;TCR=102;TR=136;WE=126748299;WS=126748281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,140:0.51:272
chr3	126751689	rs6439031	G	A	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=114;PP=2965;SC=GGTGAACACCGTGGGAGCCCA;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=64;TCR=114;TR=178;WE=126751697;WS=126751679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	126880488	rs7625800	T	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=745;SC=CCTGCCCCTCTCTCTGCCTGG;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=126880496;WS=126880478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	127105975	.	T	TA	37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.9998;HP=18;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=50.03;NF=0;NR=3;PP=37;QD=13.3333333333;SC=TGTCATTGTTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=3;WE=127105983;WS=127105965;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,3:0.23:13
chr3	127323830	rs893293	C	T	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=75;PP=2965;SC=AGGAGATGATCGAGAGCATCG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=174;WE=127323838;WS=127323820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	127336934	rs782427	A	G	7613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.914;SC=GGTATAGCTCACATGTGCCCG;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=118;TCR=131;TR=249;WE=127336942;WS=127336924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,296:0.99:298
chr3	127390525	rs41266485	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-0.075;SC=GTGTCCTCATCTGCAAGGGGA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=127390533;WS=127390515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	127391018	rs813633	A	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=441;SC=GTGCCGCGGGAACCCCCTGGG;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=127391026;WS=127391008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	127394820	rs35703629	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=427;ReadPosRankSum=0.149;SC=CAGGAGCCCGCTGCGAGGCCA;SOR=0.182;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=21;WE=127394828;WS=127394810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr3	127396220	rs1658037	T	C	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=11;PP=1038;SC=CCTTGTGTGGTCCTGGACCAG;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=127396228;WS=127396210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	127399132	rs140791161	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=506;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GGGAGGACTTCGTGGAGGCGG;SOR=1.071;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=32;WE=127399140;WS=127399122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr3	127434580	rs627498	G	A	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=26;PP=1990;SC=GGCAGGTCCCGCACCCAGATG;SOR=1.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=91;WE=127434588;WS=127434570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	127434856	rs477554	C	T	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=40;PP=1126;SC=TGAGACCCCCCGCACCTGCCC;SOR=2.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=127434864;WS=127434846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	127558029	rs79868682	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=347;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TTTCAGCATTATTTACAATAG;SOR=0.352;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=19;WE=127558037;WS=127558019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr3	127641968	rs4141499	C	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=16;PP=1294;SC=GAATAAAATTCAGAACATGAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=127641976;WS=127641958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	127774722	rs6802633	AA	GC	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=278;ReadPosRankSum=0.756;SC=AAGAATGTTAAAGTGCTGTGT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=127774731;WS=127774712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	127775480	rs9827668	G	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=431;ReadPosRankSum=0.653;SC=CAAATTTTGCGTATTCATTTT;SOR=1.255;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=22;WE=127775488;WS=127775470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr3	127775499	rs9827421	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=451;ReadPosRankSum=1.459;SC=TTTAAAATAACGTACTACGTT;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=31;WE=127775507;WS=127775489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr3	127779220	rs9848345	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=387;ReadPosRankSum=1.351;SC=CTTTACTGACCGCTCTCTGGG;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=18;WE=127779228;WS=127779210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
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chr3	127783698	rs1044843	A	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=0.597;SC=TCCTTCATATATGTCTCCTCC;SOR=0.631;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=14;WE=127783706;WS=127783688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr3	127784118	rs13070488	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=0.635;SC=AATCATGTTCTTCTGGGTTGG;SOR=0.360;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=25;WE=127784126;WS=127784108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr3	127786551	rs9858267	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=1.856;SC=GGTCTGTGACGTGTGCAGATA;SOR=0.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=23;WE=127786559;WS=127786541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr3	127786675	rs2276867	T	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=328;ReadPosRankSum=0.018;SC=GTTAGACTTTTTCATATGACT;SOR=0.255;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=20;WE=127786683;WS=127786665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr3	127799983	rs1057220	A	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=0.781;SC=AGCGCTGCAGACCACGCCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=127799991;WS=127799973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	127800071	rs1057156	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=450;ReadPosRankSum=1.788;SC=GGAGTCTCTTACTGCTGAAAA;SOR=0.984;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=28;WE=127800079;WS=127800061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr3	127806732	rs115741988	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=586;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CCAACACTCACACCACAAGCA;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=40;WE=127806740;WS=127806722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr3	127816433	rs34228187	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=54;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TCCAAACCCATGCTAGGAGCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=127816441;WS=127816423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	127817810	rs141484366	G	A	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.697;SC=AAGACTTAGAGTCAGTGCTGC;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=78;WE=127817818;WS=127817800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,98:0.49:200
chr3	127817955	rs11720239	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=397;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AGGTTCCCCTAACCTGTAAGA;SOR=1.347;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=17;WE=127817963;WS=127817945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr3	127872506	rs11711710	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=914;ReadPosRankSum=0.649;SC=TCGATCTGGGCTTCTCGTGCT;SOR=0.674;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=71;WE=127872514;WS=127872496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
chr3	127872602	rs11719546	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.412;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=480;ReadPosRankSum=1.169;SC=CCGGCGAGCCACTGCTTCAGG;SOR=1.189;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=27;WE=127872610;WS=127872592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr3	127983495	rs2811544	T	C	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=922;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CAACGAGAGATCCCTCGGGAC;SOR=0.950;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=61;WE=127983503;WS=127983485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,69:0.48:145
chr3	128060360	.	C	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=797;ReadPosRankSum=-2.271;SC=CTCCAGATAACTTTGACCAGG;SOR=0.798;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=47;WE=128060368;WS=128060350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,56:0.44:128
chr3	128081260	rs1735545	G	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=8;PP=203;SC=GCACACATGTGCCCGTGATCT;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=128081268;WS=128081250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	128127053	rs114096655	T	G	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1029;ReadPosRankSum=1.857;SC=AGCCTGACTTTCAAGCGTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=71;WE=128127061;WS=128127043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,86:0.47:184
chr3	128181777	rs2659690	A	G	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=63;PP=2284;ReadPosRankSum=-1.607;SC=CCAGGCCACCAAAAAACTCCC;SOR=0.590;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=265;TCF=153;TCR=112;TR=147;WE=128181785;WS=128181767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,173:0.56:310
chr3	128200806	rs11708606	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=799;ReadPosRankSum=0.903;SC=GCAAGGCAGCGTCAGCAGGCT;SOR=0.935;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=47;WE=128200814;WS=128200796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,57:0.52:109
chr3	128204877	rs34870876	C	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.152;SC=ACGCAGCCCCCGTGGTGCTAG;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=155;TCF=73;TCR=82;TR=73;WE=128204885;WS=128204867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,86:0.47:182
chr3	128205860	rs1573858	G	C	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=482;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GCGGCTGCTCGGGCGCCACCT;SOR=0.305;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=38;WE=128205868;WS=128205850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr3	128292213	rs2734046	A	G	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=46;PP=2060;SC=GCTGGAAACCAGAGCTTGATG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=108;WE=128292221;WS=128292203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	128340993	rs148392806	C	T	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=760;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AACTCTGTGACGCCCGACACT;SOR=0.618;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=53;WE=128341001;WS=128340983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr3	128584040	rs72990946	C	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=404;ReadPosRankSum=0.036;SC=TGGGCCAGAGCAGAAGAGCCT;SOR=1.580;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=21;WE=128584048;WS=128584030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr3	128584270	rs9842450	T	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.96;MQRankSum=2.689;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	128612659	rs1680780	G	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=286;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AAGTGTTCTCGGGTCCTGTGC;SOR=0.985;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=21;WE=128612667;WS=128612649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
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chr3	128624880	rs1683777	T	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=-0.999;SC=CCCAAGCCCGTGTGCCTCCCA;SOR=0.425;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=128624888;WS=128624870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	128626952	rs1683786	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=762;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AGTGGCCGGCTCTACCCAGCA;SOR=1.349;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=38;WE=128626960;WS=128626942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr3	128627021	rs1683787	A	G	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=41;PP=1499;ReadPosRankSum=1.975;SC=TACACTACTGACCACAGGGAA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=118;TCR=86;TR=99;WE=128627029;WS=128627011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,126:0.48:264
chr3	128627753	rs876754	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=546;ReadPosRankSum=1.229;SC=GAATGGGCCATGTTGCTGGAC;SOR=0.515;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=45;WE=128627761;WS=128627743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr3	128627967	rs61300654	C	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=872;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CAGGCATACCCCCTATTTCAA;SOR=0.987;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=64;WE=128627975;WS=128627957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,71:0.39:184
chr3	128629116	rs73862593	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=397;ReadPosRankSum=2.457;SC=TTCACCATGCGGTGGCCGTGG;SOR=0.792;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=26;WE=128629124;WS=128629106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr3	128631481	rs9830739	G	A	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.068;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1119;ReadPosRankSum=2.148;SC=GCTACCGCCCGCCCCTACCCA;SOR=0.602;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=71;WE=128631489;WS=128631471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr3	128653952	rs883602	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=309;ReadPosRankSum=0.374;SC=ACCACATGCGAGCTGCCACTG;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=18;WE=128653960;WS=128653942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr3	128711995	.	C	T	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.451;SC=TGCTGCTGCACGGGCGGTCAG;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=65;WE=128712003;WS=128711985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr3	128720487	rs1871951	A	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr3	128755814	rs3732429	T	C	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=63;PP=2663;SC=CCCCTTCTCTTCCCAGGCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=125;WE=128755822;WS=128755804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	128755953	rs3732430	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=562;ReadPosRankSum=-1.483;SC=CAGAGGCTCCGGGACCTGGTA;SOR=1.075;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=29;WE=128755961;WS=128755943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr3	128755971	rs3732431	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=359;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GTAGGCTCACGGGAGAGCTGC;SOR=0.922;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=18;WE=128755979;WS=128755961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	128757560	rs2306529	C	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGGGGAGGAGCTTTATCTGTC;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=8;WE=128757568;WS=128757550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr3	128853622	rs7646403	C	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=933;SC=TTTCAAAGGACACAACAGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=128853630;WS=128853612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	128859202	rs10664499	C	CTTAG	7753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=28;PP=2974;SC=CTGTCACAAACTTACTTACGT;SOR=2.359;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=88;TCR=34;TR=109;WE=128859210;WS=128859192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	128864520	rs9842978	C	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=482;SC=CTGTATCAAGCGACTACTATG;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=128864528;WS=128864510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	128864540	rs9880527	A	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=13;PP=668;SC=GGCAAGAATGAGCTGGGAACT;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=128864548;WS=128864530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	128877521	rs4452346	C	T	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=36;PP=988;SC=CATTCATATACAAATATTGTA;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=128877529;WS=128877511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	128890350	rs4303883	G	A	7259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=106;PP=2965;SC=GATAACAAATGTCTGGAAGAG;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=210;WE=128890370;WS=128890340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr3	128986715	rs61128088	A	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=1.540;SC=TAATGAAGCCATGCAGGATCC;SOR=0.446;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=5;WE=128986723;WS=128986705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	128987730	rs10934875	G	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=905;ReadPosRankSum=-1.703;SC=ACACTGCCCCGTGACTCCAGC;SOR=0.738;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=59;WE=128987738;WS=128987720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr3	128987899	rs10934876	T	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=1.196;SC=CCTCAGGGGGTTCAAGAGTAA;SOR=0.945;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=26;WE=128987907;WS=128987889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr3	128990998	rs6771809	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=470;ReadPosRankSum=0.295;SC=CCTTGGTCAATAGGAAAGAGG;SOR=0.885;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=27;WE=128991006;WS=128990988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
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chr3	129034758	rs6795995	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=268;ReadPosRankSum=0.990;SC=TAGCAAGAGGATTGGTGGCGG;SOR=0.445;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=21;WE=129034766;WS=129034748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
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chr3	129147418	rs3796391	G	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1307;ReadPosRankSum=1.753;SC=CGGGGTATCAGATAAACCGTA;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=48;TCR=92;TR=75;WE=129147426;WS=129147408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,90:0.54:166
chr3	129152144	rs140695	T	C	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=1017;SC=GCTGATTTCATGTTCAAGTAG;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=129152152;WS=129152134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	129185641	rs6770233	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=186;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TCACTGCACCTGGCCCCCAGG;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=129185649;WS=129185631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	129185661	rs6805886	C	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=563;SC=GGGCTCCTTGCCAGGATTTTA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=129185669;WS=129185651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	129210977	rs2285354	G	C	2929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=-0.864;NF=57;NR=51;PP=1711;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TTATTTCTTCGCCACAGGCCT;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=144;TCR=128;TR=108;WE=129210985;WS=129210967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,138:0.43:320
chr3	129247551	rs7984	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=427;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGGAGCAGCCACGGGTCAGCC;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=30;WE=129247559;WS=129247541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr3	129261971	rs71620056	T	TG	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ATTGGAGTGGTGGGGGTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=6;WE=129261979;WS=129261961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr3	129267727	rs73863109	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-2.795;SC=CCTGCCTCTCACTGCCTGTGG;SOR=1.421;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=129267735;WS=129267717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr3	129267915	rs60616647	T	C	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1185;ReadPosRankSum=-1.830;SC=GGAGAGCGGGTGAGGCCAAGG;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=158;TCF=80;TCR=78;TR=86;WE=129267923;WS=129267905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,104:0.54:191
chr3	129269742	rs56690036	T	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=0.718;SC=GGAAGGGTCATCCAGGGATGG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=129269750;WS=129269732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	129270029	rs59415528	A	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=660;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CAGGGGCCAAACACCAAGGCT;SOR=0.402;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=46;WE=129270037;WS=129270019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr3	129270271	rs113329769	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=1.281;SC=TCATTGTAAGCTATTTATCAA;SOR=0.141;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=15;WE=129270279;WS=129270261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr3	129274215	rs112382780	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	129275206	rs11920311	C	T	2458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=63;PP=1493;ReadPosRankSum=1.381;SC=AAGCCACCACCTGCTCAAACT;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=90;TCR=156;TR=100;WE=129275214;WS=129275196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,121:0.41:298
chr3	129275403	rs11920368	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=316;ReadPosRankSum=0.734;SC=AGATGTGTGTCCTTGAGTAGG;SOR=1.409;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=20;WE=129275411;WS=129275393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr3	129275438	rs144919923	T	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=296;ReadPosRankSum=-0.458;SC=CGAGGGCAGGTGCCTCACCCT;SOR=0.378;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=23;WE=129275446;WS=129275428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr3	129275619	rs6801699	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TTGCACACAATCCCCAACTCC;SOR=0.745;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=22;WE=129275627;WS=129275609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr3	129276113	rs77878075	C	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=70;PP=1716;ReadPosRankSum=-2.070;SC=GGAGAAAGGACGGATCTGGTC;SOR=0.893;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=210;TCF=68;TCR=142;TR=101;WE=129276121;WS=129276103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,117:0.48:245
chr3	129277146	rs2285358	A	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TAGACCTGAGATCTTTTGGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=129277154;WS=129277141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	129278446	rs60442867	GC	G	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.152;NF=9;NR=6;PP=325;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AGTCCACACGGCCCCCCCACC;SOR=0.568;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=15;WE=129278454;WS=129278436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr3	129279570	rs2170774	T	C	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=0.624;SC=TCTTTCACTGTGAGAGGAAAA;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=35;WE=129279578;WS=129279560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr3	129279597	rs2713627	C	T	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=43;PP=2264;SC=TAAATAAACACGGGAGAGGAG;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=129279605;WS=129279587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	129279970	rs115393808	C	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=718;ReadPosRankSum=0.006;SC=CCCAGGCAGGCGGGGGTGGGT;SOR=0.485;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=78;TCF=14;TCR=64;TR=43;WE=129279978;WS=129279960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr3	129281980	rs2713625	C	T	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=38;PP=1873;SC=CCACTCCTCACTGAGTGTGTA;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=129281988;WS=129281970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	129282137	rs2713624	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=255;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CCAGCCCCCATGCTTTGGGCC;SOR=0.518;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=19;WE=129282145;WS=129282127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr3	129284637	.	A	G	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=53;QD=21.9428031368;SC=GGGGGTGTCAAGAGCCCCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=129284645;WS=129284627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	129285175	rs11925462	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=421;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCTGGCCTGCGGGGGCAGCAC;SOR=1.284;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=21;WE=129285183;WS=129285165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	129285577	rs2285363	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.338;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	129286413	rs2245285	G	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1242;ReadPosRankSum=0.625;SC=GCTCCTTGGTGAGATCTGTCA;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=106;TCR=66;TR=71;WE=129286421;WS=129286403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr3	129286531	rs2245281	C	A	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1636;ReadPosRankSum=-2.201;SC=GCAGGGTCCCCGCCCACTACC;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=241;TCF=117;TCR=124;TR=100;WE=129286539;WS=129286521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,121:0.41:292
chr3	129289752	rs2285365	C	T	5087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.877;SC=ACTCGTGACTCTGGAGCCCCA;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=433;TCF=208;TCR=225;TR=203;WE=129289760;WS=129289742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:265,240:0.48:505
chr3	129289831	rs2244962	A	G	3231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=80;PP=2183;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CGAGGCCCACAGCTGAGGCTG;SOR=0.619;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=268;TCF=105;TCR=163;TR=136;WE=129289839;WS=129289821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,149:0.50:300
chr3	129291499	rs2285368	G	A	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=983;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CCTGGAGCTCGGAGCCTACAT;SOR=0.842;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=62;WE=129291507;WS=129291489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr3	129291751	rs2244708	T	C	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1164;ReadPosRankSum=1.515;SC=CACCTGAGAGTGGTCCTGGGG;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=207;TCF=91;TCR=116;TR=101;WE=129291759;WS=129291741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,128:0.51:252
chr3	129293183	rs2625962	T	C	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=11;PP=748;SC=GCTTACCGCGTGGATCTCGGG;SOR=1.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=129293191;WS=129293173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	129293256	rs2255703	T	C	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=36;PP=1610;SC=TCACTCCACATGCACAGGTGA;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=90;WE=129293264;WS=129293246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	129294294	rs11919862	G	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=335;ReadPosRankSum=0.870;SC=GCCATGTGGGGCGGGTGGGGG;SOR=0.910;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=20;WE=129294302;WS=129294284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr3	129303197	rs2811463	T	C	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=47;PP=1644;SC=TCTGCCCCTCTGGGGCTGTGC;SOR=1.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=129303205;WS=129303187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	129308096	rs13079843	G	A	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	129324193	rs7619850	A	G	155.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=65;SC=GCTTGCGCTCACAGGCCGGTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=129324201;WS=129324183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	129546729	rs784689	T	C	6019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=79;PP=2965;SC=ATAGCAGAGCTGGTAGGTGCA;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=112;TCR=79;TR=191;WE=129546737;WS=129546719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	129694681	rs5658	C	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=332;ReadPosRankSum=0.157;SC=TTGGTTGCTGCTCGCTCTGGC;SOR=0.091;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=19;WE=129694689;WS=129694671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr3	129694934	rs784705	C	A	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=856;SC=GGAAACCTGCCGGCAAAGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=129694942;WS=129694924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	129695538	rs784704	C	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=970;SC=CTTTCCTTCCCCAGCGTCCCA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=39;WE=129695546;WS=129695528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	129695954	rs5662	T	C	3178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=57;PP=2219;SC=AAGCGGGCCTTCTGCTGGGGC;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=104;WE=129695962;WS=129695944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	129696041	rs5663	A	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=41;PP=1210;SC=CCTGGGTCAGAGAGCCCCTGG;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=129696049;WS=129696031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	129811073	rs13066399	T	C	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=11;NR=21;PP=481;SC=CAGGTCTGCATGACCACTGGG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=129811081;WS=129811063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	130114408	rs5852594	AC	A	2884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=55;PP=2345;SC=TATATTTAGAACCATATATTT;SOR=2.425;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=56;WE=130114416;WS=130114398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	130116696	rs12488457	A	C	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=30;PP=1576;ReadPosRankSum=1.366;SC=CAGTGGGCCAACTCATCTGAA;SOR=1.440;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=89;WE=130116704;WS=130116686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr3	130122409	rs5852595	TG	T	1323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.261;NF=6;NR=30;PP=456;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTGACTTTATTGGGGGGGGGT;SOR=0.974;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=15;TCR=73;TR=36;WE=130122417;WS=130122399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,61:0.39:156
chr3	130122552	rs148970927	TACACAC	T	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=842;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ACACACACTGTACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=130122565;WS=130122542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	130124270	rs1497313	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=474;ReadPosRankSum=0.444;SC=AAAAACAGACATAAATGAGTG;SOR=0.291;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=30;WE=130124278;WS=130124260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr3	130124491	rs10934940	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=0.024;SC=GTCCAGGGGCGTGGGGTCAGA;SOR=1.134;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=32;WE=130124499;WS=130124481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr3	130124989	rs4688761	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GTCATGGAGACGATGGGATTG;SOR=0.543;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=77;WE=130124997;WS=130124979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,97:0.57:171
chr3	130125116	rs1497312	G	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=635;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTTTAGGGCTGTCATGGATTT;SOR=1.284;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=35;WE=130125124;WS=130125106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr3	130132302	rs11717623	T	A	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=6.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.610;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr3	130132302	.	TAG	AAT	1954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=30;NR=30;PP=1954;QD=33.4577979144;SC=TACTTATGTCTAGCAGAGAAT;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=60;WE=130132312;WS=130132292;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:58,60:0.51:118
chr3	130132304	rs11713542	G	T	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=7.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.817;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,75:0.51:148
chr3	130132509	rs2219026	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=-1.885;SC=AATCATATCAATGAGCATTTT;SOR=0.425;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=130132517;WS=130132499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	130132773	rs75550503	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-0.318;SC=AGTCTAGAACTGTAAAATCCT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=12;WE=130132781;WS=130132763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	130132851	rs10512767	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=864;ReadPosRankSum=-0.344;SC=ATAGTATGAAAAGAAAATCTA;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=46;WE=130132859;WS=130132841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr3	130134492	rs16827497	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=352;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ACTAAAGGGGTCACAGGGAAA;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=28;WE=130134500;WS=130134482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr3	130134563	rs7628563	G	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=468;ReadPosRankSum=1.141;SC=TGAGTGACTCGGAGACATTAG;SOR=0.982;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=32;WE=130134571;WS=130134553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
chr3	130135456	rs6439233	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=0.398;SC=TGCCATCTGCTTCTCTCCTCC;SOR=0.709;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=11;WE=130135464;WS=130135446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	130135575	rs4688798	A	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=566;ReadPosRankSum=1.174;SC=CGGTGCCAACATTTTAGTCTC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=45;WE=130135583;WS=130135565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr3	130137866	rs13062453	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CCCAATTATGGGGGGCATGAA;SOR=0.743;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=130137874;WS=130137856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	130142587	rs35980322	AT	A	386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=25.78;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	130144984	rs1874599	G	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=143;SC=TTTTTGTTTTGTCTTGTTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=130144992;WS=130144974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	130158343	rs2403340	C	T	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=36;PP=2310;SC=AGCAAACATGCGTTCACTTCT;SOR=1.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=115;WE=130158351;WS=130158333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	130162380	.	G	A	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.193;SC=ATCAATTTAGGAGGAGAGAAT;SOR=0.774;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=65;TCR=94;TR=83;WE=130162388;WS=130162370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,105:0.54:194
chr3	130162395	rs9883988	A	G	4810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=93;PP=2915;SC=GAGAATATTCAAAATGATGGT;SOR=1.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=54;TCR=93;TR=147;WE=130162403;WS=130162385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	130174334	rs819085	G	A	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=34;PP=2188;SC=TTTTTGGGAGGTAATGGCTTC;SOR=1.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=102;WE=130174342;WS=130174324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	130187817	rs322113	T	C	3704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=52;PP=2124;SC=ACTTTCACATTGCCCCCACTC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=130187825;WS=130187807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	130189918	rs10668406	T	TTG	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;MQRankSum=0.795;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.956;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr3	130190630	rs322117	G	A	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=54;PP=2786;SC=AATCATAGTAGTGGTTCTGAG;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=130190638;WS=130190620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	130190720	rs11355796	AT	A	5191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=75;PP=2965;SC=GAAAAAGCACATTTAGAAGAA;SOR=0.883;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=29;TCR=81;TR=100;WE=130190728;WS=130190710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	130190777	rs322118	G	A	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=72;PP=2500;SC=GAAGGTAATCGTGAGTACCAT;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=120;WE=130190785;WS=130190767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	130284284	rs9830253	G	A	7152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=122;PP=2965;SC=CATAGAGGGCGCCAGCGACAC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=97;TCR=122;TR=218;WE=130284292;WS=130284274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr3	130286886	rs9836961	T	C	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=13;PP=860;SC=GTTTTTCCTATGCAGCTTGCA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=130286894;WS=130286876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	130289617	rs10934949	T	C	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=48;PP=2965;SC=TCCCATGCTGTCCAAAGCTAA;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=119;TCR=48;TR=167;WE=130289625;WS=130289607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	130300650	rs6439249	T	C	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=63;PP=2578;SC=ACTGAATAGCTTGAAGGATAT;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=122;WE=130300658;WS=130300640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	130308702	rs4515022	A	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=591;SC=GTTTGTTTACATGTGTTTTAT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=130308710;WS=130308692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	130313017	rs1467015	T	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=AAATAGCCTTTGTAGAAAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=130313025;WS=130313007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	130317341	rs4336088	G	A	5133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=102;PP=2965;SC=TTGGTAGAATGTGAAATGCTT;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=69;TCR=102;TR=171;WE=130317349;WS=130317331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr3	130569557	rs1316658	T	G	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=27;PP=1697;SC=GGAGGGAAGTTGTCGAGCTAC;SOR=1.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=130569565;WS=130569547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	130674022	rs218494	A	G	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=75;SC=ATTGAGAGCAATATTTTATTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=130674030;WS=130674012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	130748733	rs9864242	A	G	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=61;PP=1814;SC=GTAAGTAAAAATGCTTCCTAT;SOR=2.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=78;WE=130748741;WS=130748723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	130828790	rs9850655	G	A	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=0.246;SC=TACTGGGGGAGCATGATATAT;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=25;WE=130828798;WS=130828780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr3	130851196	rs6769160	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=328;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TCATCAACAACGTTATTATTT;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=22;WE=130851204;WS=130851186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr3	130851686	rs6772241	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=-1.604;SC=TTCCAAAAACGCAGAACAGTA;SOR=0.988;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=23;WE=130851694;WS=130851676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr3	130852185	rs2674613	T	C	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.13;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	130852185	.	TG	CA,CG	467	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8,21;NR=13,31;PP=249,467;QD=14.4032321363;SC=GGAATAAAAGTGTGCAACTAG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=21,52;WE=130852194;WS=130852175;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:53
chr3	130852186	rs2674612	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.178;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr3	130873723	rs1400013	T	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=389;ReadPosRankSum=0.722;SC=AAGCTACATGTAATTTTACAT;SOR=1.445;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=21;WE=130873731;WS=130873713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr3	130881409	rs1913898	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=831;ReadPosRankSum=-0.371;SC=TGCTCGGGACTACTTCTCAGG;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=54;WE=130881417;WS=130881399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr3	130884169	rs959072	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTCTAATCCCCCAGTCAGTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=130884177;WS=130884159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	130947435	rs3738000	A	T	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=43;PP=1779;SC=TCCTATTGTGAAGAGAGTGAT;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=93;WE=130947443;WS=130947425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	130962181	rs150346681	AT	A	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-0.550;SC=TTGGAACCAGATTTTTTTTTC;SOR=1.781;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=16;WE=130962189;WS=130962171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr3	131186893	.	CA	C	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5103;HP=15;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=58.7;NF=6;NR=0;PP=64;QD=11.6666666667;SC=GAGTAAGAAACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=131186901;WS=131186883;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	131188377	rs3830301	TAC	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=0.851;SC=AACTAGAGTGTACACACACAC;SOR=0.022;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=2;WE=131188386;WS=131188367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	131261662	rs10716194	TG	T	3730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=63;PP=1486;SC=CCCATGATGATGGGGGGGGGT;SOR=1.161;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=74;WE=131261670;WS=131261652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	131404572	rs6439314	A	C	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=1280;SC=TTGCAGTGAGACGAGACTGCG;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=131404580;WS=131404562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	131404625	rs113276957	A	AAC	1764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.072;NF=16;NR=22;PP=1439;ReadPosRankSum=0.636;SC=ACTCCACCTCAACACACACAC;SOR=0.538;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=38;WE=131404633;WS=131404615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr3	131624097	rs3749262	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=54;ReadPosRankSum=-0.814;SC=CATTTCATTGGACATGCCTAC;SOR=1.262;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=8;WE=131624105;WS=131624087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr3	131756241	rs2141570	T	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=3;PP=1068;SC=AGAATTTACTTCCACCTCTTA;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=40;WE=131756249;WS=131756231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	131756349	rs1569282	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=709;ReadPosRankSum=1.046;SC=CCCGCCAGCCACAGTCCCCTC;SOR=0.819;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=53;WE=131756357;WS=131756339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,73:0.41:176
chr3	131756375	rs1569281	A	G	4983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=83;PP=2965;SC=TTGTAACATCAAAATCCCCTT;SOR=0.831;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=155;WE=131756383;WS=131756365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	132063914	rs972774	A	T	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=65;PP=2243;SC=GTAAGTATTAAAAAATGAGAG;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=111;WE=132063922;WS=132063904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	132063977	rs972773	T	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=462;ReadPosRankSum=2.049;SC=TTCCCTCCACTAATCAACTGT;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=30;WE=132063985;WS=132063967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr3	132068831	rs2228402	C	T	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=23;PP=1006;SC=ACAAAAAACTCATCATGTATT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=132068839;WS=132068821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	132068876	rs2290542	G	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=29;PP=1210;SC=TTTAACATATGTTTGTTCAAG;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=132068884;WS=132068866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	132068925	rs2290541	A	T	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=33;PP=1117;SC=ATCTTTTTTTAATCTTCATTT;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=132068933;WS=132068915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	132069028	rs3217658	CAAG	C	427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=348;SC=TCTAAACTAACAAGAAGACAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=132069038;WS=132069018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	132071452	rs17242113	G	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=345;ReadPosRankSum=0.880;SC=AAGTCATTGTGGGCGTATGGG;SOR=1.143;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=18;WE=132071460;WS=132071442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	132075554	rs3181784	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=248;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AGATGTACTATCGGAATGAGA;SOR=0.126;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=132075562;WS=132075544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	132075707	rs2071505	A	G	4300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=78;PP=2805;SC=AAGGTACTGAAGACAGTACAG;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=136;WE=132075715;WS=132075697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	132075743	rs7625966	G	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr3	132075746	rs1042330	G	A	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=73;PP=1973;SC=CTCTGTAGAAGGAGTAGCTGC;SOR=1.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=109;WE=132075767;WS=132075733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	132075759	rs73215937	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GTAGCTGCCCTTTCTCAGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=41;WE=132075767;WS=132075733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr3	132077229	.	G	T	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=593;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CTTTAATGCCGATATCTTCAG;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=39;WE=132077237;WS=132077219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr3	132107747	rs10935007	G	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=340;ReadPosRankSum=0.025;SC=GGATTTTCCTGTTGGAAACAA;SOR=0.320;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=25;WE=132107755;WS=132107737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr3	132153333	rs10662251	T	TAG	3021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=1855;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CTTGGAAAGATTAAAGATATA;SOR=0.438;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=44;WE=132153341;WS=132153323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
chr3	132182443	rs11328911	TG	T	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=772;ReadPosRankSum=0.114;SC=ACATACTGAATGTTTTTTTCA;SOR=1.306;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=20;WE=132182451;WS=132182433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr3	132192129	rs9829140	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=1.023;SC=ATGAGAGGCATCATGACACGT;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=24;WE=132192137;WS=132192119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr3	132196816	rs2369796	A	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=543;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TTTTTTTTTTAAAATCTAGGT;SOR=0.606;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=32;WE=132196824;WS=132196805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr3	132196983	rs141952333	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=1.266;SC=ATGTTAGAGAGGGTAAGGATA;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=21;WE=132196991;WS=132196973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr3	132218196	rs2088712	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=284;ReadPosRankSum=-0.927;SC=CCAGTTTACACACATTATATG;SOR=1.604;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=20;WE=132218204;WS=132218186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr3	132218441	rs3834794	A	AT	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=1.883;SC=TTTACTATTTATTAACAAATG;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=132218449;WS=132218431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	132218623	rs3762672	G	T	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CTTGACTCGTGCTAGTAAACC;SOR=0.942;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=78;WE=132218631;WS=132218613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,96:0.48:202
chr3	132221076	rs11293788	CT	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQRankSum=0.921;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	132244406	rs754993	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=579;ReadPosRankSum=0.357;SC=GATATTTAGGGCTGTATGAGT;SOR=0.471;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=41;WE=132244414;WS=132244396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr3	132319361	rs61748105	A	C	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.702;NF=39;NR=48;PP=1544;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GAGAATTTGCAAAAGTTTTCC;SOR=0.965;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=187;TCF=91;TCR=96;TR=87;WE=132319369;WS=132319351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,101:0.46:218
chr3	132321988	.	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.699;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=657;ReadPosRankSum=1.724;SC=TGAAACTGATCACTATGTATC;SOR=0.180;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=83;TCF=64;TCR=19;TR=45;WE=132321996;WS=132321978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr3	132360883	rs821572	C	T	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=46;PP=2275;SC=ATTCAAGGAACGTAACTGAGC;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=112;WE=132360891;WS=132360873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	132361596	rs9877018	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=319;ReadPosRankSum=0.627;SC=GCTTGGGAACGGGGAATCCAA;SOR=0.533;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=23;WE=132361604;WS=132361586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr3	132402473	rs200443262	G	GA	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=1.383;SC=AATTTTGAGGGAAAAAAATCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=132402481;WS=132402463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	132436901	rs35348816	AT	A	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.981;NF=2;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CCCGGCCTTCATTTTTTTTCC;SOR=0.465;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=12;WE=132436909;WS=132436891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr3	133099245	rs1197314	G	A	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=61;PP=1677;ReadPosRankSum=1.801;SC=CTGTGGAACCGGAGCCCTCTA;SOR=0.778;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=93;TCR=109;TR=111;WE=133099253;WS=133099235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,135:0.56:243
chr3	133108978	rs1197296	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=239;ReadPosRankSum=-1.491;SC=CCCAGGCACCATCCTTGCTGC;SOR=0.417;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=21;WE=133108986;WS=133108968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr3	133114893	rs1197300	C	T	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=6;PP=128;SC=TATACAAATACATATATTATA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=133114901;WS=133114883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	133166403	rs7644197	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=429;SC=CCTCCTTGTAAACATAAAGTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=133166411;WS=133166393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	133185848	rs10563564	ACT	A	874.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=599;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GCTAATTTTAACTCTCTACTG;SOR=1.246;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=15;WE=133185857;WS=133185838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr3	133191093	rs899458	A	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=9;PP=614;SC=GGAATAGTCCAGGCTACCACC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=133191101;WS=133191083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	133342218	rs4854738	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=816;ReadPosRankSum=2.153;SC=GGCCATCTTGCACTGCGCTGA;SOR=0.601;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=55;WE=133342226;WS=133342208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,67:0.39:171
chr3	133374030	rs7639941	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=22;SC=GCCTGGGCAATAGAGCAAGAC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=133374038;WS=133374020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	133375785	rs2718801	G	A	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=53;PP=1520;SC=AATACATTTTGCTGTTGACAG;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=133375793;WS=133375775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	133377782	rs2718804	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=331;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TTTATAATCCGCAAAGAATGT;SOR=0.910;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=21;WE=133377790;WS=133377772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr3	133380130	rs2718805	T	C	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=140;SC=TTCTAAGAAATCCTGGAACTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=133380138;WS=133380120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	133465283	rs1130459	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=566;ReadPosRankSum=-2.000;SC=CGCACCCGGAAGATGAGGCTC;SOR=0.894;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=38;WE=133465291;WS=133465273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,45:0.41:110
chr3	133474147	rs8177225	T	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=0.927;SC=GGTGGGGTGATGCCATTGGCT;SOR=0.202;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=9;WE=133474155;WS=133474137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr3	133483696	rs1880669	T	C	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=1049;ReadPosRankSum=1.226;SC=TTAATGCCTTTTTCATTTTCT;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=56;WE=133483704;WS=133483686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr3	133485133	rs2692696	A	G	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=71;PP=2965;SC=GTATTTTGCTATAGCAGTGGT;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=165;WE=133485141;WS=133485123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	133485371	rs1525891	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=0.046;SC=GGTGCTGTGGGCTCTGGTTCT;SOR=0.346;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=13;WE=133485379;WS=133485361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	133486958	rs8649	G	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=588;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GCCTAAACCTGTGTGAACCCA;SOR=0.732;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=34;WE=133486966;WS=133486948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr3	133489583	rs1525890	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=0.627;SC=ACCTGAGTGCGCAGAATGATC;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=133489591;WS=133489573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	133493705	rs35736766	GT	G	313.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5947;FS=5.464;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.560;NF=11;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=-1.596;SC=GAATGGGTGAGTTTTTTTTTT;SOR=3.500;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=133493713;WS=133493695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr3	133493827	rs2715626	T	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr3	133524717	rs1107413	G	C	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=37;PP=1749;ReadPosRankSum=-1.910;SC=CTCGCGCCGGGTGGCAGATGG;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=212;TCF=126;TCR=86;TR=98;WE=133524725;WS=133524707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,113:0.46:244
chr3	133546599	.	C	CCG	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.4999;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=63.51;NF=2;NR=0;PP=31;QD=17.0;SC=CACCCCCCCCCCCCCCCGCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=133546607;WS=133546589;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr3	133553527	rs2280672	C	T	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=33;PP=946;SC=CAACCCTGGCCCTCCCCTCTG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=133553535;WS=133553517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	133556964	rs139009223	ACCGTGCCGGGCC	A	3462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=12;PP=2965;SC=ACAGGGCTACACCGTGCCGGG;SOR=2.362;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=26;WE=133556983;WS=133556954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	133560005	rs201380383	CGCACACACATGCGTGT	C	1185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=14.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.32;ReadPosRankSum=2.953;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr3	133583647	rs3811645	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=317;ReadPosRankSum=-1.349;SC=TAGGGACCCCGTGGTGAGGCC;SOR=0.247;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=18;WE=133583655;WS=133583637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
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chr3	133692837	rs13063838	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=0.708;SC=AGAGAGCTTCACAAGGGGCAA;SOR=0.204;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=133692845;WS=133692827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr3	133698280	rs4640563	C	G	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=19;PP=1056;ReadPosRankSum=0.037;SC=TTGTGGTCAGCGTGGTGCACA;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=93;TCR=46;TR=63;WE=133698288;WS=133698270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr3	133877113	rs56088702	A	G	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=830;ReadPosRankSum=-1.051;SC=GCAAATCTGCAGAGTGACAAA;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=59;WE=133877121;WS=133877103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,70:0.43:164
chr3	133969437	.	A	AG	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=98;SC=CGGGGCCCTCAGCCGCGGGCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=133969445;WS=133969427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	133969487	.	G	GC	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=53;QD=43.0;SC=CAGCCGCGCCGCCCACGCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=133969495;WS=133969477;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	134077470	rs1353776	C	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=610;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CTGGGGGGCCCTCAGTCTGGG;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=39;WE=134077478;WS=134077460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr3	134080661	rs1077718	A	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=32;PP=1240;SC=TGTAGGGAGAAAGAGGCTTGA;SOR=0.966;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=134080669;WS=134080651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	134085070	rs67655717	GAAGT	G	1603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.100;NF=11;NR=9;PP=905;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TAGAACAAAAGAAGTAAGTCC;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=20;WE=134085081;WS=134085060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr3	134214042	rs62269547	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=332;SC=TTTTTCATTATTATGTATGCT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=134214050;WS=134214032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	134225969	rs9827878	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=769;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TGACATCTTGTGAAGCAGAAC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=51;WE=134225977;WS=134225959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr3	134226159	rs6766818	C	T	3046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=68;PP=1964;SC=TTCTTTTTGACATTTTTATCT;SOR=1.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=92;WE=134226167;WS=134226149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	134256159	rs12634127	A	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=798;ReadPosRankSum=0.298;SC=GGTTTTGATCAAGTTTGAACT;SOR=0.519;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=39;WE=134256167;WS=134256149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr3	134264859	rs1357762	A	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=311;SC=CGTAACTTATAGTCTGACTTC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=134264867;WS=134264849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	134266148	rs12632372	G	C	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=38;PP=2230;SC=AGATAAAGGCGTTAACAATCA;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=134266156;WS=134266138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	134266403	.	T	TA	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=1.286;SC=ATAGTCATAGTAAAAAAAATA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=134266411;WS=134266393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	134270886	rs9821505	A	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-1.369;SC=TTTTTCTACTATCCAAGCCTT;SOR=0.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=16;WE=134270894;WS=134270876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	134280395	rs6777283	T	A	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=48;PP=1484;SC=AAAAAATCACTATCTTGGAAA;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=134280403;WS=134280385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	134293619	rs4586863	A	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.78;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	134322742	rs2293293	A	G	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=85;PP=2965;SC=CACAGCATACAAGGTAATTAA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=161;WE=134322750;WS=134322732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	134323156	rs4955535	A	G	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=70;PP=2647;SC=TGCCCTTGGCAAAGATCTGCA;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=133;WE=134323164;WS=134323146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	134331874	rs7626611	T	C	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=744;ReadPosRankSum=0.676;SC=CTGCCTAGAATGTCTGTGCAT;SOR=1.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=41;WE=134331882;WS=134331864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr3	134331980	rs9838119	C	T	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=39;PP=1325;SC=ACTGATTTAGCGGCGCTGTGG;SOR=1.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=67;WE=134331988;WS=134331970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	134332150	rs74601883	G	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GTCCTAGGCCGTGTGCCCAGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=134332158;WS=134332140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	134514579	rs9852662	T	C	10403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=207;PP=2965;SC=CCGGCCGCCTTGGGACTGCTG;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=347;TCF=140;TCR=207;TR=347;WE=134514587;WS=134514569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
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chr3	134825512	rs3732567	G	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=406;ReadPosRankSum=-1.211;SC=GGTGGGTCTGGGGCAAGGAAG;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=31;WE=134825520;WS=134825502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
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chr3	134967368	rs11717042	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=52;PP=1375;ReadPosRankSum=0.587;SC=CTAGTGAAACGGTGATCCCTA;SOR=0.954;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=82;WE=134967376;WS=134967358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr3	134968429	rs115906433	C	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.678;SC=CTGGCCTCATCCCTGGAGCTC;SOR=0.830;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=16;WE=134968437;WS=134968419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	134968465	rs4243397	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=423;SC=CAGGCCTGGATGGGGAGCACC;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=134968473;WS=134968455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	135720540	rs9814557	A	G	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.791;SC=AAAGATGCAGATCTGAACTCT;SOR=0.825;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=59;WE=135720548;WS=135720530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr3	135720673	rs9872542	T	C	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1167;ReadPosRankSum=0.004;SC=ACTTAAAGGATATTGCAGGAG;SOR=0.727;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=73;WE=135720681;WS=135720663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,88:0.50:175
chr3	135722264	rs17197552	A	G	3487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=75;PP=2502;ReadPosRankSum=-2.770;SC=AGTCTGTAGAAGTCCTGTTGG;SOR=0.548;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=267;TCF=118;TCR=149;TR=140;WE=135722272;WS=135722254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,156:0.49:317
chr3	135768232	rs67039922	T	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=1084;ReadPosRankSum=-2.328;SC=TGAAAATGGGTTCTAATTTTG;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=48;TCR=95;TR=67;WE=135768240;WS=135768222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr3	135824901	rs6792630	C	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TAGAAAATTACCTTAGGAGTT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=135824909;WS=135824891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr3	135913665	rs1992952	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=381;SC=AAAGTCCCTCAGCAAGTTTCA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=135913673;WS=135913660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	136035737	rs9833162	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=702;ReadPosRankSum=0.323;SC=TACATCTTATACTTGTCTTTA;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=34;WE=136035745;WS=136035727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr3	136059537	rs503973	G	C	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=74;PP=2334;SC=TTCTAACCAAGTGAAGTATAC;SOR=1.761;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=106;WE=136059545;WS=136059527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	136088038	rs9860801	G	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=619;ReadPosRankSum=1.902;SC=TATCTGGATTGAACACCAAAG;SOR=0.692;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=41;WE=136088046;WS=136088028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr3	136139878	rs9819496	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CTCTCAAAGTGTTGGGGTTAC;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=136139886;WS=136139868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	136170773	.	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=1.035;SC=ACTTTATAAGAAACAGACTTG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=136170781;WS=136170769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	136196028	rs16843991	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=0.416;SC=AATTTCCACATGATTACAACT;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=16;WE=136196036;WS=136196018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr3	136196071	rs1394092	C	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=280;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TTTTGATTCCCAGCATTTTAG;SOR=0.541;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=20;WE=136196079;WS=136196061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr3	136240366	rs13092193	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=25;SC=AAAGCAGTTATAGAAAGAAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=136240374;WS=136240356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	136573289	rs9865545	G	A	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=26;PP=1688;SC=AAATAGAATTGATTATCTGAA;SOR=1.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=83;WE=136573297;WS=136573279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	136573440	rs9827648	A	G	6122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=69;PP=2965;SC=AAGGCTATGGAAATTTTATGG;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=105;TCR=69;TR=174;WE=136573448;WS=136573430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	136574501	rs1052618	A	G	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=41;PP=1174;SC=AATTTAAGAAAGCAGGACTAC;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=136574509;WS=136574491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	136574521	rs1052620	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=0.754;SC=CCAGGAAATACTAGACTCTCC;SOR=2.144;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=21;WE=136574529;WS=136574511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr3	136574578	rs3076229	T	TTAA	359.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=239;SC=TGTTCAGTTATTATGTATACT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=136574586;WS=136574568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	136649463	rs7648817	C	T	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=38;PP=1059;SC=ATTAAATCCACTGTTTTCTTG;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=136649471;WS=136649453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	137781923	rs329388	A	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=194;SC=AAATGGGGACAAATGCAGACT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=137781931;WS=137781913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	137783700	rs179282	T	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=552;SC=CCAGTGTGGATAGAGGGAATG;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=137783708;WS=137783690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	137786442	rs442800	T	C	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=31;PP=1322;SC=CAGTCATCCTTGGGCCGGGGC;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=137786450;WS=137786432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	137787041	rs115489792	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr3	137787047	rs374045	C	T	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.20;SOR=1.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	137787192	rs446644	T	C	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=65;PP=2127;ReadPosRankSum=0.725;SC=GTGACCAGTGTGCTCTGCTGG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=124;WE=137787200;WS=137787182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,146:0.99:148
chr3	137787282	rs419075	T	C	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=55;PP=1446;SC=AGGGAGAAAGTGGCTCCAACA;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=74;WE=137787290;WS=137787272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	137787355	rs446847	T	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=530;SC=TTCATGACTGTTGCCAAATCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=137787363;WS=137787345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	137787935	rs382629	G	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=634;SC=CCACTTATACGTGGATTTTCT;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=137787943;WS=137787925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	137787963	rs445025	T	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=16;PP=684;SC=CTGCCACCCGTGAGACAGCAA;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=137787971;WS=137787953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	137788123	rs425938	T	G	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=143;SC=TTCTTTTCTCTAGCTTACTTT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=137788131;WS=137788113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	137788141	rs407009	T	A	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=79;SC=TTTATTGTAATAATACAGCTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=137788149;WS=137788131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	137799291	rs384828	A	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=673;SC=ATGTCCTTAGATCCCTCCACT;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=137799299;WS=137799281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	137799498	rs405602	T	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=706;SC=GCACCAGTGCTCTGGACCCCA;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=137799506;WS=137799488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	137800656	rs2622711	A	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=44;PP=1271;SC=GAACATTGTGAGAACTCTGCT;SOR=1.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=137800664;WS=137800646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	137807259	rs2724693	G	A	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=16;PP=761;SC=TGAAGCTCCCGTGCCTGCCGA;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=137807267;WS=137807249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	137816817	rs7629243	A	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=797;SC=AATTTAATTTACTGAGCAAGG;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=137816825;WS=137816807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	137843018	rs1564496	G	C	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=5;PP=857;SC=TGCCCACCCCGCCAAGAGACA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=137843026;WS=137843008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	137843106	rs2170309	T	C	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=45;PP=1825;SC=AGTGTTAGCTTTATTTGTTAC;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=100;WE=137843114;WS=137843096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	137843476	rs2246945	G	T	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=75;PP=2965;SC=GCCCCAAATGGCTGAATTATA;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=141;WE=137843484;WS=137843466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	137849888	rs79791762	C	T	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.225;SC=GCAGACTCTACGGAACAGGAG;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=79;TCR=89;TR=78;WE=137849896;WS=137849878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,106:0.50:210
chr3	137850003	rs2724691	A	G	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=80;PP=2810;SC=AAGAAGGCAAACAGAAGAGGC;SOR=1.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=133;WE=137850011;WS=137849993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	137880695	rs9851548	A	G	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=980;SC=TCTCAAAAAAACAAAACAAAC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=137880703;WS=137880685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	137880743	rs2622736	G	A	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=33;PP=2463;ReadPosRankSum=-2.034;SC=AAGCTGCATCGTCATCATCAT;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=106;WE=137880751;WS=137880730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,128:0.96:134
chr3	137881265	rs3732839	T	A	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=77;PP=2965;SC=AAAATTCAGTTGTCTGAGGAT;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=52;TCR=77;TR=129;WE=137881273;WS=137881255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	137882377	rs2622734	G	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=369;SC=ATATATATTTGTAACAGTCTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=137882385;WS=137882367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	137882752	rs2622733	A	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=50;PP=1496;SC=AACCACAGGTAATTCTTCATA;SOR=1.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=137882760;WS=137882742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	137958438	rs6778511	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.644;SC=AGTATTGATACTCATATTTCA;SOR=0.307;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=8;WE=137958446;WS=137958428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	137981439	.	TA	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQRankSum=3.303;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.835;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr3	137982718	rs939453	T	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.907;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=663;ReadPosRankSum=2.266;SC=TTAACCTGTTTCCTTTCTGGT;SOR=1.200;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=42;WE=137982726;WS=137982708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr3	138006398	rs148609121	A	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=578;ReadPosRankSum=1.644;SC=AGTATATACAAGCTCATTTAT;SOR=1.251;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=15;WE=138006420;WS=138006388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr3	138006412	.	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=969;ReadPosRankSum=0.514;SC=CATTTATTCAACAAATATTGA;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=25;WE=138006420;WS=138006388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr3	138020275	rs7637162	A	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=528;SC=TCAAACTCCTAATCTCAGGTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=138020283;WS=138020265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	138020677	rs6801411	C	T	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=333;SC=AGTCCTGATACGTGTTAGGGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=138020685;WS=138020667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	138025136	rs3856636	T	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=21;PP=1261;SC=CCCCTTAGAATTCATCTTTCT;SOR=1.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=138025144;WS=138025126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	138025396	rs9846480	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=1082;SC=AAACAATGCAACCTCTACACA;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=138025404;WS=138025386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	138033181	rs9289556	C	T	3812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=62;PP=2221;SC=CACCCATGTCCTCATCTTCAC;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=116;WE=138033189;WS=138033171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	138043535	.	TACACACAC	TAC,T	224	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=58.88;NF=1,1;NR=8,8;PP=175,224;QD=19.7777777778;SC=TCAAGCCAGATACACACACAC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9,9;WE=138043550;WS=138043525;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.43:21
chr3	138091701	rs1199333	G	T	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=80;SC=ATGTCTTGCTGCCGCAGGTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=138091709;WS=138091691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	138170788	rs13095961	T	G	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=25;PP=2444;SC=AGGGTTGAGGTGCAGCGCGTG;SOR=2.063;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=88;TCR=25;TR=112;WE=138170796;WS=138170778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	138171042	rs4678418	C	T	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=909;SC=CCTTGCCTGACGCGGGCAGGG;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=138171050;WS=138171032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	138173905	rs56236670	G	A	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=782;SC=AGGCAAGCAGGTGAGTGCTGC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=138173913;WS=138173895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	138176533	rs66644444	A	T	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=33;PP=1063;SC=CAGGGGACACAGTGGGAACAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=138176541;WS=138176523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	138179308	rs67037472	G	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=9;PP=1114;SC=CACCCTGGCAGAGGGTGCTCT;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=138179316;WS=138179298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	138179328	rs6763380	C	T	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=15;PP=1363;SC=TGCCTGCTTTCCTCCGAACCC;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=138179336;WS=138179318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	138187568	rs1679167	C	T	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=53;PP=2965;SC=CGGTGAGTGGCGACATGTCCA;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=96;TCR=53;TR=149;WE=138187576;WS=138187558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	138189031	rs2347469	T	C	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=746;SC=TAAGAGGTTTTTAAGCCAGGC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=138189039;WS=138189021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	138189658	rs3813264	A	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=15;PP=1413;SC=GGGCTCAGATACTAGTAGTGG;SOR=1.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=138189666;WS=138189648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	138191232	rs10935282	G	A	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=53;PP=2965;SC=ACGAGAGCTGGGGAGCCCATA;SOR=1.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=120;TCR=53;TR=173;WE=138191240;WS=138191222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	138191347	rs139504758	C	T	4161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=88;PP=2500;ReadPosRankSum=0.590;SC=ACAGATTTGCCATGTCCCCCA;SOR=0.787;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=327;TCF=158;TCR=169;TR=165;WE=138191355;WS=138191337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,194:0.51:377
chr3	138195529	rs1679169	C	T	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=871;SC=TGAACCCTGGCTGGCCAACTT;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=138195537;WS=138195519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	138195559	rs115810921	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=435;ReadPosRankSum=0.892;SC=CAGGTTCTGCTGGTCTTACAG;SOR=0.340;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=29;WE=138195567;WS=138195549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr3	138289163	rs1673608	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=951;SC=TCAGTACCTGTAAAGTTTTCT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=138289171;WS=138289153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	138289221	rs1673607	C	T	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=34;PP=1837;SC=GCAAGCCCTACTTAGTGATTC;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=92;WE=138289229;WS=138289211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	138329862	rs811322	G	A	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=50;PP=1824;SC=TGGTATCTCCGGACTCTGCCA;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=89;WE=138329870;WS=138329852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	138417989	rs361080	G	A	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=52;SC=ACACCACAGCGAACTTTCAGT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=138417997;WS=138417979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	138433568	rs497900	C	T	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=55;PP=2071;SC=GAACCTGTAACGAAGCAGACA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=138433576;WS=138433558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	138668233	rs5852928	C	CGT	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=1.742;SC=TATGCATGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=9;WE=138668242;WS=138668223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr3	138724757	rs11924188	C	G	7622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=126;PP=2965;SC=GCCCAGCAGACGAGTCGTCCT;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=108;TCR=126;TR=234;WE=138724765;WS=138724747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr3	138739617	rs1720230	A	G	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=3;PP=112;SC=GCTGGTTGGGACGAGCGGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=138739625;WS=138739607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr3	139068277	rs10935321	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.958;SC=CATTAATCAGGTGTGTATCAA;SOR=0.569;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=9;WE=139068285;WS=139068267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	139075644	rs9878548	C	A	59.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AATCTGAAAGCCCTTTTTAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=139075652;WS=139075634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	139075938	rs7833	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.464;SC=AAAAAATGGCCAGATTAAAAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=139075946;WS=139075928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	139081416	rs57549985	TTA	T	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.732;NF=0;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TATGTATGTTTTATATATATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=139081425;WS=139081406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	139088481	rs11717119	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTCAGTAATTATGCAAAAAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=139088489;WS=139088471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	139090736	rs7373116	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=38;PP=889;ReadPosRankSum=-1.683;SC=AGAAGTTAAGGAACAATAATT;SOR=1.376;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=44;WE=139090744;WS=139090726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr3	139098195	rs7649535	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=476;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CAGAAAATGGGAATAGAGATT;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=33;WE=139098203;WS=139098185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr3	139102120	rs7373302	C	A	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.918;SC=ATTTCTAATACAGTCCTGAAA;SOR=0.975;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=81;WE=139102128;WS=139102110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr3	139108250	rs3215032	C	CTG	736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=867;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TGGAATCAAACGACCAAGACC;SOR=1.893;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=19;WE=139108258;WS=139108245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr3	139173565	rs2233817	A	G	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=-0.898;NF=43;NR=30;PP=1152;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AGAACCCAGTACTTACCAGGT;SOR=0.887;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=73;WE=139173573;WS=139173555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,89:0.45:197
chr3	139180919	rs3046576	ATG	A	1527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=1163;ReadPosRankSum=1.496;SC=CTGGCACAGAATGTGTGAATG;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=29;WE=139180928;WS=139180909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr3	139236683	rs2071388	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=-0.097;SC=CTCTGCAGCACCCTACAGACA;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=25;WE=139236691;WS=139236673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr3	139246382	rs295493	A	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=7;PP=191;SC=GACCTTCCCCATGAAGGCTGA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=139246390;WS=139246372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	139257545	rs34662123	GC	G	1606.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=1553;SC=TCAGGCCCTTGCCCCCTCTCG;SOR=4.091;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=42;WE=139257553;WS=139257535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	139280328	rs35898558	G	GA	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=0.410;SC=GCTTTTCTTGGATGTATCGAG;SOR=0.293;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=3;WE=139280336;WS=139280318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr3	139318241	rs1846021	A	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.712;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=503;ReadPosRankSum=0.091;SC=ACTTTTGCCCATTTTCTTCTT;SOR=0.752;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=34;WE=139318249;WS=139318231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr3	139654444	rs9821708	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CGCAGCTTCTTTGGCCTCTGT;SOR=1.398;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=19;WE=139654452;WS=139654434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr3	139654466	rs9821843	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CGCCCTGGATTCCCGAAGTCA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=12;WE=139654474;WS=139654456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	140122341	rs4683494	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=216;SC=CTGCTGGCTCGTGGACCACAC;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=140122349;WS=140122331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	140167536	rs2081803	A	G	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=57;PP=1851;SC=AATCCCTTCAAAAGTTATGTG;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=94;WE=140167544;WS=140167526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	140178279	rs9836487	G	A	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=821;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AGTACACTGAGTAGTTCACCT;SOR=1.196;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=44;WE=140178287;WS=140178269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr3	140178485	rs7632885	G	A	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.565;SC=GGGTGCCAAAGTCCCCGATGG;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=224;TCF=119;TCR=105;TR=88;WE=140178493;WS=140178475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,96:0.38:256
chr3	140178638	rs10590825	CCCT	C	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.108;NF=2;NR=25;PP=1112;ReadPosRankSum=0.200;SC=GCCCTTCCACCCCTCCTACCC;SOR=0.603;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=6;TCR=73;TR=27;WE=140178648;WS=140178628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr3	140281723	rs11714465	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=1.075;SC=GTCCGGCTTCCCTTGAGGCCC;SOR=0.501;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=45;WE=140281731;WS=140281713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr3	140282084	rs4683509	C	G	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=532;SC=GGACACAGGTCGTCATTGTGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=140282092;WS=140282074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	140282718	rs74938120	T	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=375;ReadPosRankSum=0.117;SC=CTTTATCCTATGCACGGATGT;SOR=0.459;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=23;WE=140282726;WS=140282708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr3	140282861	rs10804675	C	T	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1307;ReadPosRankSum=0.758;SC=TTGTGTTTGTCGTGGCCATGG;SOR=0.817;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=89;WE=140282869;WS=140282851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,105:0.57:184
chr3	140285115	rs4683510	T	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=260;SC=GTCTGCTGCCTGGCCCACATG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=140285123;WS=140285105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	140401693	rs698673	A	G	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=73;PP=2965;SC=TGCCGCAACAAGCGCATCGCT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=147;WE=140401701;WS=140401683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	140406947	rs28594654	G	A	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=63;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.005;SC=AATAAACTACGTGCCCTTGGA;SOR=0.711;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=219;TCF=112;TCR=107;TR=117;WE=140406955;WS=140406937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,133:0.51:261
chr3	140407260	rs9876490	C	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=910;ReadPosRankSum=-1.533;SC=AGTGCTGGAGCAGACAGCCAG;SOR=0.725;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=54;WE=140407268;WS=140407250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr3	140419715	rs1540506	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=759;ReadPosRankSum=0.468;SC=CATGACTCTTCGCTTCTGATT;SOR=0.656;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=48;WE=140419723;WS=140419705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr3	140675313	rs3773837	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.743;SC=CTGGGCATATATACTAACTTA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=140675321;WS=140675303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	140675583	rs16850924	G	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=384;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GCGTTAGTGAGTTCCAGATGT;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=29;WE=140675591;WS=140675573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr3	140689627	rs3836424	G	GGATTTGTAAAA	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=47.35;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr3	140689662	rs73234803	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.645;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTAGTAGTTTATTTATATACA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=140689670;WS=140689652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	140692486	rs2555707	G	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	140695070	rs3773835	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.927;SC=AAAGATATCAGTAATGTTTAA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=140695078;WS=140695060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	140784929	rs6771494	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=1.661;SC=TGCAGCGGCCTCCTCCCCGCA;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=140784937;WS=140784919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	140785175	rs890529	C	A	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CACCTTCCACCGGCACCCCGT;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=81;TCR=90;TR=84;WE=140785183;WS=140785165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,92:0.48:193
chr3	140979184	rs1511378	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=258;SC=TATAAATGAATGATGAGGCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=140979192;WS=140979174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	140998214	rs13087169	G	A	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=32;PP=1922;SC=TGCTTCTCTCGCGCAGGTCAT;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=93;WE=140998222;WS=140998204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	141248515	rs79308158	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TATACGAAGCATGTTTTCTTA;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=12;WE=141248523;WS=141248505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	141277651	rs13084444	T	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TTGAATATTTTGCAGATGATC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=141277659;WS=141277641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	141289655	.	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=0.122;SC=ATACTAAGTTGACTTTTTTGG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=11;WE=141289663;WS=141289645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	141299405	.	C	CACACAT	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.524;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	141327474	rs295323	G	A	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1427;ReadPosRankSum=0.533;SC=CTGTGTATCTGAACGGAAATT;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=95;WE=141327482;WS=141327464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,117:0.56:208
chr3	141327593	rs2312266	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=370;ReadPosRankSum=0.200;SC=TATATCCATGCAATGTTAATA;SOR=1.398;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=20;WE=141327601;WS=141327583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr3	141331222	rs2172471	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=1.067;SC=AATTCATCATGTATTTTGTTC;SOR=0.947;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=8;WE=141331230;WS=141331212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr3	141595527	rs11539489	C	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=290;ReadPosRankSum=0.628;SC=TGTTCTCGGCCGTCCCACCCT;SOR=0.674;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=19;WE=141595535;WS=141595517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	141621075	rs5853057	TG	T	710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.730;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=520;ReadPosRankSum=2.420;SC=ACCTGGTAATTGGGGGGGAGG;SOR=1.344;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=24;WE=141621083;WS=141621065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr3	141622695	rs11710245	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=155;ReadPosRankSum=0.714;SC=ATGATCTTGGGTCACTGCAAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=141622703;WS=141622685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	141625999	rs7622417	G	C	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=16;PP=666;SC=TCCCTTTTATGTCTTTATAGG;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=141626007;WS=141625989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	141626123	rs3792411	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=282;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AAACGTGAGTATGTTTTCTTA;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=20;WE=141626131;WS=141626113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr3	141632797	rs2288636	G	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=1.776;SC=TATCATTTGGGGGGTAGCTTG;SOR=0.776;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=13;WE=141632805;WS=141632787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr3	141632816	rs2288635	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr3	141632822	rs2288634	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	141644274	rs1131029	G	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-2.428;SC=CTGGGCAACAGTCTCAAAAAG;SOR=0.032;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=141644282;WS=141644264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	141682825	rs3792409	C	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TCAATAAAAACAATATGGTCA;SOR=0.560;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=141682833;WS=141682815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr3	141688903	rs4683655	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=759;ReadPosRankSum=-1.819;SC=GAAAACATCTCGGTATCTTTA;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=52;WE=141688911;WS=141688893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr3	141689017	rs11569252	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr3	141689025	rs11569251	C	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr3	141707772	rs79006418	C	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.63;QD=28.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	141707791	rs76714911	T	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	141709083	rs6440055	A	G	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=26;PP=1227;SC=CTTAGCAGTGAGCATGAGGGA;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=141709091;WS=141709073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	141709185	rs146593055	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-1.604;SC=GGTGTGATCTTGGCTCACTGC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=20;WE=141709193;WS=141709175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	141709505	rs61397493	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CAAATTTTGACGTTATTTGGA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=141709513;WS=141709495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	141712485	rs3215194	AT	A	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.566;NF=0;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.204;SC=ATTTAATTTCATTAATACTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=141712493;WS=141712475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	141713823	rs11569201	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=505;ReadPosRankSum=1.487;SC=TCTAAACTTTTTTTAAGGTTT;SOR=0.738;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=28;WE=141713831;WS=141713813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr3	141721460	rs11712803	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.936;SC=TGAGGCTTTCTCTATAGCTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=141721468;WS=141721450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	141721713	rs78272662	G	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=0.224;SC=ATTTCTTATAGTTCTGGTGGC;SOR=0.685;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=21;WE=141721721;WS=141721703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr3	141812157	rs55884097	G	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=2;PP=50;SC=AAAAGGGGAAGAATATTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=141812165;WS=141812147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	141812759	rs9877817	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=239;ReadPosRankSum=0.284;SC=ATATAGCACAGGATTTGGCAC;SOR=0.724;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=19;WE=141812767;WS=141812749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr3	141904474	rs6785098	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=0.812;SC=AACTAAATACCACTCAGAATT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=141904482;WS=141904464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	141904977	rs6440065	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=364;ReadPosRankSum=1.435;SC=TTTTCCCCACGAAACAAAATG;SOR=0.292;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=26;WE=141904985;WS=141904967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr3	141923506	rs9830411	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=-0.094;SC=AAAAAACCAACAATATCCAAA;SOR=0.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=14;WE=141923514;WS=141923496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr3	141932258	rs145336346	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=991;ReadPosRankSum=0.037;SC=CTTAACCAAACGAAACTATTC;SOR=0.828;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=58;WE=141932266;WS=141932248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,60:0.61:99
chr3	141932356	rs6440072	G	A	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.079;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1415;ReadPosRankSum=-1.182;SC=GCTTATCACAGAATGTACTTA;SOR=0.926;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=224;TCF=118;TCR=106;TR=97;WE=141932364;WS=141932346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,117:0.43:272
chr3	142051147	rs4608715	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.312;SC=TAAAAGTACATGATTAAAAAG;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=4;WE=142051155;WS=142051137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	142083776	rs3214978	T	TTA	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATAAAAAGATTGTTTGTTCCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=142083784;WS=142083766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	142094816	rs113527448	G	GCACA	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=479;ReadPosRankSum=1.821;SC=GCGCACACGTGCACACACACA;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=12;WE=142094824;WS=142094806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	142122451	rs2306699	T	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CTGGTAAACATCCCAGCAGCT;SOR=1.739;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=142122459;WS=142122441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr3	142137624	rs143073824	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=460;ReadPosRankSum=0.165;SC=CTGTCAAAGTAGTAACATATC;SOR=0.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=27;WE=142137632;WS=142137614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr3	142168331	rs1802904	C	T	6071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.181;SC=CAGTAGCTTCCTGTATAAGGT;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=102;TCR=80;TR=180;WE=142168339;WS=142168319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,222:0.99:224
chr3	142215178	rs7620648	A	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.476;SC=ATATATATATATGATGACATT;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=142215186;WS=142215168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	142222074	rs11916455	C	T	173.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AATGTTGGTGCTTATCTCCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=142222082;WS=142222064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr3	142222284	rs2227931	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CTACACCATGATAATGAATGA;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=39;WE=142222292;WS=142222274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr3	142272275	rs142950892	A	AAC	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=480;ReadPosRankSum=0.185;SC=TGAATACACAAACACACACAC;SOR=1.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=11;WE=142272283;WS=142272265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr3	142272314	rs9869842	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=455;ReadPosRankSum=-1.551;SC=ACACACATATGTATCTCCAAT;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=19;WE=142272322;WS=142272304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	142275489	.	TAAGTA	T	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.104;NF=0;NR=10;PP=412;ReadPosRankSum=0.765;SC=TACATATATATAAGTAAAGTA;SOR=1.449;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=142275501;WS=142275479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	142277365	rs199661872	AAAAT	A	233.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.157;NF=2;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=1.534;SC=CTCCGTCTCAAAAATAAATAA;SOR=0.693;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=142277376;WS=142277355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr3	142277536	rs2227929	A	G	9140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=894;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=171;NR=157;PP=2962;ReadPosRankSum=1.881;SC=TTAAACAGCCATCATCAGAAT;SOR=0.540;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=681;TCF=370;TCR=311;TR=328;WE=142277544;WS=142277526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:428,449:0.51:877
chr3	142277575	rs2227930	A	T	8386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=823;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=168;PP=2962;ReadPosRankSum=0.060;SC=GTGAGAGCATACCACATAAAT;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=651;TCF=300;TCR=351;TR=309;WE=142277583;WS=142277565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:406,402:0.50:808
chr3	142281612	rs2227928	A	G	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=766;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGTAAGAACCATTAATAAAGT;SOR=0.477;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=51;WE=142281620;WS=142281602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr3	142388513	rs3836386	AATG	A	233.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=293;SC=ACTGCTTTAAAATGATGATGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=142388523;WS=142388503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	142405348	rs11714087	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=3.132;SC=GCTATCACCATTATCCATCTC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=142405356;WS=142405338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	142408606	rs6793735	G	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=27;PP=1003;SC=ACACATACCCGTGCCTGCACA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=142408614;WS=142408596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	142413407	rs6789958	C	T	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1488;SC=TTTTATTGTGCTTCAGCTTTA;SOR=1.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=142413415;WS=142413397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	142413600	rs13087943	C	T	57.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	142417070	rs3773504	G	A	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=167;SC=TAATAAATTTGAAGATGAAGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=142417078;WS=142417060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	142443441	rs78975236	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCTCTCGGGCGCCTCCTCCTC;SOR=0.468;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=17;WE=142443449;WS=142443431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr3	142467310	rs56246347	C	T	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.053;SC=CAGGTTAGAACATTAAACTTT;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=46;TCR=94;TR=62;WE=142467318;WS=142467300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr3	142503605	rs7621642	G	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1450;ReadPosRankSum=1.345;SC=GACAGATGTCGGGTTACCGAC;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=91;WE=142503613;WS=142503595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,105:0.54:196
chr3	142522753	rs56239979	A	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TTTGATATAAACAAATGATTC;SOR=0.035;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=142522761;WS=142522743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr3	142523349	rs3821647	G	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=735;ReadPosRankSum=0.559;SC=ACAAATGTACGTTACCTCCAC;SOR=0.771;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=50;WE=142523357;WS=142523339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,70:0.53:133
chr3	142523555	rs4259003	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TAAGTATGCAGGTTCCCTAAG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=142523563;WS=142523545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	142524858	rs1132030	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=621;ReadPosRankSum=-2.175;SC=AGGAATGGAGGAATTTGAAAC;SOR=0.535;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=40;WE=142524866;WS=142524848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr3	142537071	rs7772	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=339;ReadPosRankSum=-1.387;SC=CTTTCGGAATCCTCTTTCAGA;SOR=0.680;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=17;WE=142537079;WS=142537061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr3	142542244	rs45467800	C	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=1.292;SC=GGTGTATAGGCAAGTATTTTC;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=12;WE=142542252;WS=142542234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	142567327	rs893883	G	A	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=114;PP=2965;SC=GCCAAGAAAAGCGCCAATTAG;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=70;TCR=114;TR=184;WE=142567335;WS=142567317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	142607487	rs1457684	C	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=278;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CCCGAAGTCCCGGGCTTAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=16;WE=142607495;WS=142607477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr3	142607767	rs35783198	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.126;NF=7;NR=23;PP=545;ReadPosRankSum=-0.160;SC=GGTTTGCACCCCACGGCGCGC;SOR=0.707;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=30;WE=142607775;WS=142607757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr3	142607822	.	C	CGCTCACACTGGCAGCAGCGCTG	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.792;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	142669479	rs4683440	A	G	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=39;PP=2088;SC=CTATGGGGTAACTCAGAGAAT;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=102;WE=142669487;WS=142669469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	142670467	rs2270767	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=931;SC=AGAAGAATTACAGGAGTGGAC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=142670475;WS=142670457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	142670616	rs2270768	A	G	5428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=81;PP=2965;SC=CTTTGAGAAAATTGATGTCAG;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=176;WE=142670624;WS=142670606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	142720348	rs766360	G	A	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=105;SC=CCCTAAGGTCGCTATCTCGAC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=142720356;WS=142720346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	142729433	rs2173599	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=1.579;SC=CACTAGTGTTTATTATATTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=142729441;WS=142729423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	142730774	rs2124541	T	G	5835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.065;SC=TGAATCAGACTTGGGGATTTT;SOR=0.238;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=188;WE=142730782;WS=142730764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr3	142752293	rs1449869	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=131;SC=AGAATAAGAAGTACAGTCAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=142752301;WS=142752283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	142757185	rs16852915	T	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTGTGTCTAATGTATGCTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=142757193;WS=142757175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	142773738	rs10935479	C	T	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=839;SC=AATGAATACCCGATCCTTTGC;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=142773746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	142895298	.	T	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=1147;SC=TAGCGGGGGGTTCCCGGGAGG;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=142895306;WS=142895288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	142985100	rs1046706	G	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=413;SC=TAAATAGCTGGGCATTCCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=142985108;WS=142985090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	142985890	.	T	A	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=33;QD=13.5542425094;SC=AACTGCCCTGTCTGGCCTTGG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=142985898;WS=142985880;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr3	143214114	rs838598	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=410;ReadPosRankSum=0.398;SC=ACAGAATAATTCGTAAAAGTA;SOR=0.948;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=25;WE=143214122;WS=143214104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr3	143412268	rs12488981	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=0.872;SC=ATTGCCACCATCCTGCCAAAT;SOR=0.825;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=13;WE=143412276;WS=143412258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr3	143567207	rs11714060	A	G	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=79;PP=2333;SC=ACCTGGATAAAGGCTATTTTA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=29;TCR=79;TR=108;WE=143567215;WS=143567197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	143692018	rs2279856	C	G	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=35;PP=2014;SC=AGGGCGACCCCGCTGATGGAG;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=100;WE=143692026;WS=143692008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	145788467	rs6710	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=215;ReadPosRankSum=-1.219;SC=CAGTCATTCATCCAAAATAAA;SOR=0.465;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=16;WE=145788475;WS=145788457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr3	145788803	rs2305274	T	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=274;ReadPosRankSum=0.580;SC=TTTTGAAAAATCTAAAAACAC;SOR=1.371;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=16;WE=145788811;WS=145788793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
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chr3	145794776	rs142623177	CTTTA	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=144;ReadPosRankSum=1.579;SC=TAATTTCTATCTTTATATTTC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=145794787;WS=145794766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	145803138	rs1375583	T	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr3	145803142	rs1375582	T	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	145809750	rs3792341	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-0.073;SC=GGTTTCATTCTATAATCATCT;SOR=0.297;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=17;WE=145809758;WS=145809740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr3	145820684	rs3762691	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=-0.893;SC=TAAAATACGTGTGTGTGTGTC;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=21;WE=145820692;WS=145820674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr3	145824478	rs9289716	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=653;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TTCAAAGACCAAAACTGGTGT;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=39;WE=145824486;WS=145824468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr3	145824504	rs7614409	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=441;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TAATTTCACTGACCAGTTGAA;SOR=0.171;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=26;WE=145824512;WS=145824494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr3	145828256	rs3842573	G	GT	900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.379;NF=1;NR=19;PP=729;ReadPosRankSum=-0.064;SC=AGGAAAAAATGTGTTTTAAAA;SOR=0.083;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=20;WE=145828264;WS=145828246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr3	145838895	rs4681297	C	T	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GGTGTTTCTCCTACCATTCAG;SOR=0.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=110;TCR=69;TR=74;WE=145838903;WS=145838885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr3	145841294	rs10663012	A	AAAAC	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=-1.357;SC=CCTCTAAATGAAAACAAACAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=145841302;WS=145841284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	145841854	rs6802384	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=-1.251;SC=TTACAGATTGTACTGCTGTTA;SOR=1.897;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=145841862;WS=145841844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr3	145917761	rs1061409	T	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=41;PP=1240;SC=TCGGTTACAATGTAAACCATC;SOR=1.264;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=64;WE=145917769;WS=145917751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	145924632	rs3762688	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=104;SC=ATAGATCACACGACATCCACT;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=145924640;WS=145924622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	145938528	rs3762686	C	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=673;SC=TTAATTTGTTCGCTTAAAAAG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=145938536;WS=145938518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	145938619	rs3762685	T	C	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=40;PP=1944;SC=AAAATGAGAATTGTATTCAGG;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=145938627;WS=145938609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	145938782	rs9850144	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=643;SC=TATTCTTTTTCCTTTCTTATG;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=145938790;WS=145938772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	145939755	.	C	CA	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=19;MQ=61.34;NF=2;NR=3;PP=96;QD=22.0;SC=AAATGTTAAACAAAAAAAAAT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=145939763;WS=145939745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr3	145939776	rs3804647	T	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=4;PP=183;SC=CGAAATAAAGTCCCCCTTTAG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=145939784;WS=145939766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	145940051	rs9821768	A	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=ACGAGGCACTAATACAGATGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=145940059;WS=145940041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	146246288	rs2738909	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=1.717;SC=CTGTTAGCAGAAAATACAGTT;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=10;WE=146246296;WS=146246278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	146251430	rs2738905	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr3	146251433	rs2587024	T	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.610;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr3	146303750	rs342902	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=1.255;SC=ATGAAAAAGAGTTAGATAGCG;SOR=1.002;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=146303758;WS=146303740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	146307371	rs343288	G	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=918;ReadPosRankSum=0.209;SC=AAATGGGATAGGCTATATTGT;SOR=0.253;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=95;TCF=76;TCR=19;TR=49;WE=146307379;WS=146307361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr3	146307635	rs343289	C	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=640;ReadPosRankSum=1.148;SC=TTAAATTTGACAGTGAAAAAA;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=31;WE=146307643;WS=146307625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr3	147108756	rs17509456	C	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=643;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CCACCGCCGCCGAGGAGGCCA;SOR=0.310;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=44;WE=147108764;WS=147108746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr3	147121751	rs6766244	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=485;ReadPosRankSum=-0.929;SC=GTAGACTCACCTTTTCCCAGA;SOR=0.638;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=31;WE=147121759;WS=147121741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr3	148458689	rs187787586	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGAGTTACTACGTTTATGACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=148458697;WS=148458679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	148459395	rs5182	C	T	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1585;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ATTCAACCCTCCCGATAGGGC;SOR=0.543;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=95;WE=148459403;WS=148459384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,114:0.57:199
chr3	148459884	rs5183	A	G	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=66;PP=1976;ReadPosRankSum=0.334;SC=AGCCTGCACCATGTTTTGAGG;SOR=0.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=128;TCR=123;TR=132;WE=148459892;WS=148459874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,150:0.48:312
chr3	148575156	rs2331407	C	T	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=4;PP=1225;SC=TACTTACATGCTTTGAATGCC;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=148575164;WS=148575146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	148575441	rs1356259	C	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=587;SC=TGCCTCACAGCAAATTTTTCT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=26;WE=148575449;WS=148575431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	148597482	rs1032465	T	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=411;SC=ACAGGGGAAATAATTGCTTTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=148597490;WS=148597472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	148597612	rs12489516	C	T	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=63;PP=2961;SC=GCTATTTTTACGGATTGTGGC;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=86;TCR=63;TR=149;WE=148597620;WS=148597602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	148714841	rs151126996	TTG	T,TTGTGTGTG	402.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=7,7;PP=561,283;SC=CTGGGAAATATTGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7,7;WE=148714850;WS=148714831;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.71,0.29:14
chr3	148756825	rs6764352	G	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=1070;SC=AAAATTTACAGAACTACTTAC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=148756833;WS=148756815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	148786108	rs812249	C	T	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=35;PP=1205;SC=CTGCAATGGCCGTAAGAGTTT;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=148786116;WS=148786098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	148857714	rs17787099	A	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.666;SC=AGAATTCATTAATAGTACTCA;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=5;WE=148857722;WS=148857704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr3	148863151	rs11718908	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=270;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GTTCTCTTACATCTGATGGAA;SOR=1.101;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=18;WE=148863159;WS=148863141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr3	148863395	rs11715291	T	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=687;ReadPosRankSum=0.200;SC=TTGAGGTACTTCCTAAATCTG;SOR=0.381;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=44;WE=148863403;WS=148863385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr3	148872987	rs6440589	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=379;ReadPosRankSum=0.354;SC=CACCAGTGCAGCTGTACAAAG;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=30;WE=148872995;WS=148872977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr3	148879878	rs61615092	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	148879883	rs57943258	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	148880229	rs67649453	CAG	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=23;ReadPosRankSum=0.115;SC=ATTGAAAAAACAGACATACAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=148880238;WS=148880219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	148885066	rs57192685	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.389;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=1.307;SC=CTTGATCAGTGATAATCAGAT;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=16;WE=148885085;WS=148885056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr3	148885077	rs2681092	C	T	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=777;SC=ATAATCAGATCTGATAACCTC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=148885085;WS=148885056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	148885779	rs11426099	A	AT	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.261;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=0.151;SC=AGGTAAAATGATTTTTTTTTT;SOR=0.284;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=9;WE=148885787;WS=148885769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr3	148885851	rs2681096	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=298;SC=GTATTTTCATGTGATTCTCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=148885859;WS=148885841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	148890105	.	T	TCTCACACA	177	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5081;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=62.13;NF=0;NR=3;PP=177;QD=60.0;SC=ATTTTATATATCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=148890113;WS=148890095;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	148895531	rs17787768	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=-0.259;SC=ACTCTTTGCAGCTTTTTTTCA;SOR=1.051;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=148895547;WS=148895521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	148896430	rs16861582	A	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=803;ReadPosRankSum=-1.685;SC=TGGAAACAAGAAAAATCTTCA;SOR=0.806;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=51;WE=148896438;WS=148896420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr3	148897433	rs151304828	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr3	148901406	.	AC	A	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9998;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=82;QD=45.5;SC=AAAAAAAAAAACAACTAAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=148901414;WS=148901396;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	148916235	rs701753	T	A	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=48;PP=2002;SC=CTTTAGTGGGTTCCACAGCAG;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=148916243;WS=148916225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr3	149050925	rs1526786	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=-1.509;SC=TCATTACTTCTACTAGTTACA;SOR=1.230;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=14;WE=149050933;WS=149050915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr3	149051255	.	T	TTC	55	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=61.38;NF=0;NR=4;PP=55;QD=16.25;SC=GACCTTTTTTTTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=149051263;WS=149051245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,4:0.21:19
chr3	149087404	rs8479	T	C	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=120;SC=AGTCTGTAAATTACCCCCAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=149087412;WS=149087394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	149087714	rs6776940	T	C	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=85;SC=GGATAAATAATGATGACATTT;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=149087722;WS=149087704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	149093238	rs4771	A	G	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=16;PP=1049;SC=ACTGGCCCTCAGTGCTGGCAA;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=149093246;WS=149093228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	149192851	rs143312618	G	GC	2971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.119;NF=8;NR=52;PP=2459;ReadPosRankSum=0.359;SC=GAGTAGGGAAGCTTAAAATCC;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=17;TCR=115;TR=60;WE=149192859;WS=149192841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,99:0.48:208
chr3	149193684	rs1802837	T	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=758;ReadPosRankSum=0.702;SC=ACGAGGGCTGTGGGAAGCGAT;SOR=0.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=61;WE=149193692;WS=149193674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,73:0.42:172
chr3	149216629	rs9799030	C	T	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=58;PP=1388;ReadPosRankSum=0.462;SC=TGGTTCTCTGCGCCATCCAGG;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=56;TCR=106;TR=87;WE=149216637;WS=149216619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,106:0.54:195
chr3	149220517	rs12636725	C	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.321;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=554;ReadPosRankSum=0.593;SC=TACAGCATGACGACTACAATT;SOR=0.239;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=42;WE=149220525;WS=149220507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr3	149243694	rs9854499	G	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	149258970	rs5853413	CA	C	332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=325;SC=CTTTTCTCCCCAAAAATGTAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=149258978;WS=149258960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	149374873	rs1055153	G	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=985;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TCGAGGCCCCGGGTGGCCGCC;SOR=0.599;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=61;WE=149374881;WS=149374863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr3	149459341	rs7633238	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=651;ReadPosRankSum=-1.389;SC=TCCTACAGTGATTTGTCTTCA;SOR=0.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=39;WE=149459349;WS=149459331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr3	149468530	rs9843784	T	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=581;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TCACTCAGAATCGTTCTGATC;SOR=0.692;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=41;WE=149468538;WS=149468520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,53:0.37:142
chr3	149479301	rs954714	C	T	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1249;ReadPosRankSum=0.558;SC=AGTTTTCACACGCTGTCAGAC;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=101;TCR=102;TR=88;WE=149479309;WS=149479291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,91:0.40:228
chr3	149481974	rs4681189	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=1.649;SC=GTCATTTAGAGGGGTGCTCAG;SOR=0.352;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=149481982;WS=149481964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr3	149485293	rs7610425	T	C	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1822;ReadPosRankSum=-2.537;SC=GGTTTGCTGCTTGCAGTTTGT;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=89;WE=149485301;WS=149485283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,106:0.50:210
chr3	149485901	rs3839072	T	TG	1205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.034;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.909;NF=3;NR=27;PP=986;ReadPosRankSum=0.846;SC=GTGAAACAAGTGGGGAGGGGG;SOR=1.428;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=30;WE=149485909;WS=149485891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr3	149488309	rs7630033	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=374;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TAAAAATCACAGCACTTGCTA;SOR=1.164;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=53;TCR=6;TR=26;WE=149488317;WS=149488299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr3	149488442	rs7630153	A	G	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1474;ReadPosRankSum=1.614;SC=CATCCCAGACATCCAAGCGAA;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=240;TCF=120;TCR=120;TR=105;WE=149488450;WS=149488432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,123:0.41:299
chr3	149510262	rs4681554	A	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=511;SC=AGCCAGAGGCAGCTGTCACTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=149510270;WS=149510252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	149564075	rs6440641	A	G	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=454;SC=CTTGACATTGAGGTACCTTAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=149564083;WS=149564065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	149678534	rs6768054	C	T	5867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=53;PP=2965;SC=CAGCTTATCACTGCAAGTGTG;SOR=1.667;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=125;TCR=53;TR=178;WE=149678542;WS=149678524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr3	149679147	.	A	AT	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=-1.607;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	149686366	rs35842204	AAC	A	153.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=1.445;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.660;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	149686367	rs61268501	AC	A	214.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=-1.331;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.286;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	149700519	rs7630407	T	C	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.272;NF=45;NR=40;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.597;SC=AGCTTCTCCATTGACTCTGGT;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=85;WE=149700527;WS=149700509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,104:0.47:221
chr3	149701113	rs34404328	CG	C	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.744;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.453;SC=GCCAGAGAGCCGGCCCCGGTA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=149701121;WS=149701103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	150128154	rs61734437	T	C	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=992;ReadPosRankSum=-1.809;SC=TGTCCCTGCCTCCGCAGCCGG;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=77;TCR=60;TR=66;WE=150128162;WS=150128144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr3	150128392	rs879634	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=428;ReadPosRankSum=0.648;SC=CGGCCAGAATGCTTCCTCGGT;SOR=0.976;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=27;WE=150128400;WS=150128382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr3	150128484	rs3749400	C	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=739;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GCGGGCAGGTCGCGCCTTGTC;SOR=1.226;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=42;WE=150128492;WS=150128474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr3	150128994	rs34647320	T	G	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=70;PP=1956;ReadPosRankSum=0.051;SC=TGAAGCCGCCTGTTGCAGATT;SOR=0.588;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=267;TCF=140;TCR=127;TR=132;WE=150129002;WS=150128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,149:0.48:310
chr3	150129171	rs3840253	A	AT	1410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1627;SC=ACTTTGGGAGATTGTTGTCAA;SOR=5.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=38;WE=150129179;WS=150129161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	150264003	rs1130834	G	C	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=52;PP=920;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TGCGAGGCTCGGCTCGTGGTG;SOR=1.062;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=117;TCF=14;TCR=103;TR=57;WE=150264011;WS=150263993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr3	150270077	rs12330655	C	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=348;SC=TTTTAAAAAACACATTTGTGT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=150270085;WS=150270067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	150276151	rs200333608	A	AT	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ATTCATTTAAACCTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=150276161;WS=150276141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	150276153	.	C	T	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=10;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TCATTTAAACCTTTTTTTTTT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=150276161;WS=150276141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	150276391	rs6776252	A	G	62.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CTCTCGTTACACAAAATACCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=150276399;WS=150276381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	150280253	rs4343650	A	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=108;ReadPosRankSum=-1.729;SC=ATTTGAAAAGAGGTATGAATG;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=10;WE=150280261;WS=150280243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	150280445	rs1132979	C	G	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.507;NF=27;NR=46;PP=1086;ReadPosRankSum=0.374;SC=CAGCCTTACACTAGTAAGTAT;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=65;TCR=104;TR=73;WE=150280453;WS=150280435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,100:0.47:212
chr3	150280506	rs5853483	GA	G	873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.997;NF=2;NR=26;PP=791;ReadPosRankSum=-0.790;SC=TAGTGGGGGGGAAAAAGTTAT;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=28;WE=150280514;WS=150280496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr3	150283050	rs73001341	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=463;ReadPosRankSum=-0.362;SC=AGGTGATGTTCACTTCTTTTA;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=29;WE=150283058;WS=150283040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr3	150285520	rs2293151	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=-0.513;SC=AAATTAATGATTTTGTATTAT;SOR=0.468;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=19;WE=150285528;WS=150285510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr3	150285664	rs2293150	A	G	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=808;ReadPosRankSum=1.976;SC=AAAATTAAGTAATGATTTATG;SOR=1.345;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=44;WE=150285672;WS=150285654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr3	150286210	rs1915945	A	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-1.739;SC=TTAAGATAAAATTTTTCTTAA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=150286218;WS=150286200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	150321019	.	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=45;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CGCCGGGCCGCGCAGGCGCAT;SOR=0.055;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=150321027;WS=150321015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	150321123	rs41267887	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=492;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CTGTCTGAGGGCGGCCGAAGT;SOR=0.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=29;WE=150321131;WS=150321113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr3	150340114	rs2177148	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=2;PP=184;SC=TTAACTAACTACAAAATAAAT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=150340122;WS=150340104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	150342397	rs17440940	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=2.029;SC=CTCTCAAATTCTGTGTACATT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=150342405;WS=150342387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	150384807	rs6440691	T	G	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=63;PP=2050;SC=TATACCCTGGTCAGGAAGGAA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=95;WE=150384815;WS=150384797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	150420588	rs10663389	G	GTTAAA	2167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=18;PP=1419;SC=AGCACAGGATGTTAAACACAA;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=150420596;WS=150420578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	150420606	rs9824030	T	G	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=49.84;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	150420608	rs9879627	G	T	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.55;QD=43.91;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	150420676	rs10663390	A	AGTGT	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	150420781	rs71676608	CAG	C	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.05;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	150603248	rs57919280	G	GAAAAGC	13934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=129;PP=2980;SC=GAAAAGAAAAGCATGTTGGTC;SOR=0.880;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=175;TCF=34;TCR=141;TR=163;WE=150603256;WS=150603238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
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chr3	150804908	rs7653870	T	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=1.306;SC=GGCGCTGCGGTGGAAGAGGTC;SOR=1.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=150804916;WS=150804898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	150834015	rs4680158	G	A	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=509;SC=CCTTTCAAGAGTTCTCCTCTA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=150834023;WS=150834005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	150876464	rs55676007	TG	T	585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=545;ReadPosRankSum=3.432;SC=AATTTTTCTTTGTTCATTTAA;SOR=0.361;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=15;WE=150876472;WS=150876454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr3	150883600	rs2567322	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=861;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TATTTTTGGCCTCATTAACCA;SOR=0.603;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=56;WE=150883608;WS=150883590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,67:0.45:149
chr3	150883777	rs34434571	A	AT	1321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.148;NF=1;NR=47;PP=780;ReadPosRankSum=0.167;SC=GAGGTAGTTAATTTTTTTTTA;SOR=0.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=97;TCF=2;TCR=95;TR=48;WE=150883785;WS=150883767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr3	150910640	rs1231520	G	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=328;SC=TCTGTAAATTGGAACACTCCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=150910648;WS=150910630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	150917000	rs3773614	T	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=1071;ReadPosRankSum=0.146;SC=GGAAATCGGCTGTAAGCAAAT;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=63;WE=150917008;WS=150916990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,73:0.51:144
chr3	151012497	rs2242353	T	C	4123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=68;PP=2662;ReadPosRankSum=-1.458;SC=GACCATTTGTTAGGATGATGT;SOR=0.916;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=285;TCF=152;TCR=133;TR=154;WE=151012505;WS=151012487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,179:0.54:332
chr3	151045661	rs1491980	G	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=706;SC=TTCTGTACACGAGGATAATAA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=151045669;WS=151045658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	151046308	rs1466684	G	A	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=34;PP=1696;SC=GCTCAAGATCGTATTTGGCAG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=151046316;WS=151046298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	151046604	rs3732757	G	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TTTTGAGGTAGATGATGAAGG;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=79;TCR=97;TR=77;WE=151046612;WS=151046594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,92:0.46:199
chr3	151056598	rs6809699	A	C	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=79;PP=2742;SC=GACTGGTGTTACCAGGCGCAG;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=132;WE=151056606;WS=151056588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	151056616	rs6785930	G	A	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=910;ReadPosRankSum=1.792;SC=CAGAGGTGAGGTTGTCGACGG;SOR=0.814;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=58;WE=151056624;WS=151056606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,71:0.50:142
chr3	151073033	rs7615865	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=87;PP=2532;SC=CTCAGGTAGCTATTTAAAGCT;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=21;TCR=87;TR=108;WE=151073041;WS=151073023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	151073937	rs1994730	T	C	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=65;PP=1582;SC=CTTGTAATCCTGGCACTTTGG;SOR=2.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=84;WE=151073945;WS=151073927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	151074925	rs3732759	A	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=6;PP=1034;SC=CAGTATATCTATGGTTTATAA;SOR=3.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=151074933;WS=151074915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	151074941	rs3732760	A	C	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=10;PP=1243;SC=TATAAAAATAAATGTTTTCTC;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=151074949;WS=151074931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	151085578	rs3732764	C	A	6826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=101;PP=2965;SC=CATGAACATCCGTTGCTCTTT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=200;WE=151085586;WS=151085568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	151090424	rs3732765	G	A	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1511;ReadPosRankSum=-1.830;SC=AGAGGTTTGCGATGTGATGGG;SOR=0.409;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=188;TCF=109;TCR=79;TR=98;WE=151090432;WS=151090414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,108:0.49:219
chr3	151096112	rs12497065	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=-1.891;SC=CAAGGCTGTCTTATTCCTAAA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=151096120;WS=151096102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	151100677	rs3821663	T	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-1.417;SC=CTTCCCTGTTTCTAAAGCCTT;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=12;WE=151100685;WS=151100667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	151101691	rs10935841	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=806;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GTTTTTATCACTTCACATTGA;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=52;WE=151101699;WS=151101681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr3	151101746	rs12485508	C	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=1.061;SC=ATACTGATGGCGATTTCTGCC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=26;WE=151101754;WS=151101736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr3	151102852	.	A	T	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.003;SC=GAAAGTATTGACAAAGTTCGA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=76;WE=151102860;WS=151102842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,93:0.52:179
chr3	151108070	rs56194873	GT	G	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-3.044;SC=ACACAGAAATGTTTTTTGTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=151108078;WS=151108060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	151112568	rs3732768	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=551;ReadPosRankSum=2.550;SC=CAATCACATCGCAGCAGCAGT;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=43;WE=151112576;WS=151112558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr3	151131183	rs2276764	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=1.335;SC=TCAATTGCCAGATTCCAAGGA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=151131191;WS=151131173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	151143354	rs10653830	T	TTG	580.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.51;QD=32.26;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	151143447	rs6440742	G	T	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=33;PP=1438;SC=ATACCTGACAGTAGTAAGCTG;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=151143455;WS=151143437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	151154666	rs2172250	T	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=41;PP=1687;SC=GCATCTCCCATGTGATTTCTG;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=151154674;WS=151154656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	151155620	rs6781302	G	A	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=88;PP=2965;SC=TAACAGTTCTGTTTGTATACA;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=164;WE=151155628;WS=151155610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	151158184	rs937126	A	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=572;SC=ATTAGAGAAAATTTTTTTTTC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=151158192;WS=151158174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	151158265	rs937125	G	A	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=30;PP=2515;SC=CTAAAGGAAGGGAAACTGCCA;SOR=2.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=83;TCR=30;TR=113;WE=151158273;WS=151158255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	151158502	rs10663807	T	TAG	1487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=1413;SC=ATAATAATGATGTCTGAGTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=27;WE=151158510;WS=151158492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	151165678	rs9871952	T	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=37;PP=1842;SC=ATGTACGGAGTTGTGCACCTG;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=151165686;WS=151165668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	151166422	rs6798252	C	T	7067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=110;PP=2965;SC=AGTACTGGATCTGTAATGTAC;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=103;TCR=110;TR=213;WE=151166430;WS=151166412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr3	151171439	rs7619322	A	C	7241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=122;PP=2965;SC=TTGAGCCCATAAAAAACCTCT;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=93;TCR=122;TR=214;WE=151171447;WS=151171429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr3	151171542	rs7621591	A	G	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=52;PP=1520;SC=TTCGGACTTTATTATAGCTCA;SOR=2.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=70;WE=151171550;WS=151171532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	151283646	rs7631281	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	151283691	rs9842591	C	A	164.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=129;SC=ATGACCCTCTCACCTGATTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=151283699;WS=151283681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	151463421	rs1972977	G	T	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1171;ReadPosRankSum=0.660;SC=AATCTGCATTGCGGGAGACAG;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=69;WE=151463429;WS=151463411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,85:0.51:168
chr3	151531894	rs2293004	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=679;ReadPosRankSum=0.663;SC=ACTATTCAGGCATATCATGTA;SOR=0.907;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=54;WE=151531902;WS=151531884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,69:0.41:169
chr3	151542408	rs148745568	AAAAC	A	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=524;SC=CAGTCTAATCAAAACAAACAA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=151542419;WS=151542398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	151542737	rs13098550	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=608;SC=AGGAGATATTGATTTTTTGAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=151542760;WS=151542727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	151542749	rs151253803	CTATT	C	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=983;SC=TTTTTTGAAACTATTAAAGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=151542760;WS=151542727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	151545318	rs2410837	A	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=521;SC=GGGATATTTTATTGTTTTAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=151545331;WS=151545308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	151545321	rs11306821	GT	G	886.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=774;SC=ATATTTTATTGTTTTAAATGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=17;WE=151545331;WS=151545308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	151545323	rs62272918	T	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=525;SC=ATTTTATTGTTTTAAATGAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=21;WE=151545331;WS=151545308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	151545601	rs1803155	G	A	6739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=105;PP=2965;SC=CTTCAAATTTGTTAATTGGAG;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=200;WE=151545609;WS=151545591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr3	151546041	rs1042201	G	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=79;SC=GTCTTTCTTAGAATGGTCTAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=151546049;WS=151546031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	151597869	rs73168928	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=0.708;SC=GATATGTCTCTTTCACTTTCT;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=20;WE=151597877;WS=151597859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr3	151599393	rs13079080	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=1.896;SC=TACAGTTTGCCTTAACTCATA;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=151599401;WS=151599383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	152018223	rs17368446	T	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GACATACAGTTCTCTGCATAT;SOR=0.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=13;WE=152018231;WS=152018213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	153839866	rs12493885	G	C	5072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=74;PP=2965;SC=GCCCCACCAGGTTCTGGGCCG;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=149;WE=153839874;WS=153839856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	153839959	rs59508481	CT	TC	7077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=58;PP=2947;SC=AGGGACGCTCCTCGCAGCGCA;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=121;WE=153839968;WS=153839949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	153847582	rs1626280	T	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=813;SC=GATTTGGCTTTTGTTCTTTTC;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=153847590;WS=153847572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	153870511	rs1727956	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=136;SC=GCTATATTTAGTTCTTTAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=153870519;WS=153870501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	153912641	rs12330779	C	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=560;ReadPosRankSum=1.202;SC=TAGGTAGTTGCAAAACAAAAT;SOR=0.452;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=38;WE=153912649;WS=153912631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr3	153943770	rs74965475	C	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=811;ReadPosRankSum=0.572;SC=TTCTCTTTAACGATGTGCTCA;SOR=0.435;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=55;WE=153943778;WS=153943760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr3	153970796	rs355752	A	G	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=26;PP=2212;SC=ATACCTCTCTAGAGAATCTCT;SOR=1.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=100;WE=153970804;WS=153970786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	153972500	rs355749	T	C	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=30;PP=1293;SC=TGTCCTCTTTTGGCCTCAGCA;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=68;WE=153972508;WS=153972490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	153973408	rs3172332	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=231;SC=CAGGTTGTTCTGCTCTCTCAT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=153973416;WS=153973398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	153994502	rs355787	TG	CA	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=1812;SC=CTGACTTACATGTAGATTTAA;SOR=1.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=41;WE=153994511;WS=153994492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	154002357	rs200020002	A	AT	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.144;NF=5;NR=3;PP=86;ReadPosRankSum=0.176;SC=CCAGGACAAAATTTTTTTTTT;SOR=0.593;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=8;WE=154002365;WS=154002347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	154007682	rs355758	G	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=462;SC=TAGAACTGCAGAGAAAATACT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=154007690;WS=154007672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	154010515	rs146770800	AACACAC	A	716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5134;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.93;NF=0;NR=16;PP=1242;SC=AAAATGTTAAAACACACACAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=154010528;WS=154010505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	154018690	rs3732652	G	A	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=35;PP=2612;SC=CTTTAAGTACGTACAGATTCA;SOR=1.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=88;TCR=35;TR=123;WE=154018698;WS=154018680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	154021063	rs355756	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=311;SC=TTTGACATGAGAAAAGTGATA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=154021071;WS=154021053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	154801978	rs61762319	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=635;ReadPosRankSum=1.889;SC=AGAAAGTCAGATGGATATAAC;SOR=0.518;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=41;WE=154801986;WS=154801968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr3	154866453	rs1436633	T	C	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1106;ReadPosRankSum=0.149;SC=GTGCGTATATTCTCATTTCTA;SOR=0.711;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=72;WE=154866461;WS=154866443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,86:0.49:174
chr3	154866545	rs1436632	A	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=424;ReadPosRankSum=0.649;SC=AATATTAAAAAGTACAAAGTC;SOR=0.457;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=34;WE=154866553;WS=154866535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr3	154878158	rs35450782	GA	G	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=250;ReadPosRankSum=0.301;SC=CATTTGTAAAGAGTTCTTATG;SOR=0.641;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=7;WE=154878166;WS=154878148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr3	154890206	rs3816803	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=0.344;SC=TTTGAAGAGCGAATGGTTGAG;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=12;WE=154890214;WS=154890196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	154898407	rs701109	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=1.365;SC=ATTAGGTTGTCCTAGAAAGGG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=154898415;WS=154898397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	155205993	.	C	CT	556	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=13;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.27;NF=5;NR=28;PP=556;QD=17.1212121212;SC=GACTGTAGTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=33;WE=155206001;WS=155205983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:21,33:0.61:54
chr3	155212325	rs3214639	G	GA	2820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=58;PP=2059;SC=TTTTAATCGAGAAAAAAGGAA;SOR=1.931;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=62;WE=155212333;WS=155212315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	155241593	rs9840061	A	G	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=3;PP=1310;SC=CACAGCCACCATAATTGTGAG;SOR=4.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=58;WE=155241601;WS=155241583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	155241740	rs9840234	A	G	9495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=151;PP=2965;SC=TGTCCTCATCAGAAACTTCCC;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=298;TCF=147;TCR=151;TR=298;WE=155241748;WS=155241730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr3	155271825	rs359549	G	A	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=14;PP=1170;SC=TGCTCCATGCGGGAGGCTACC;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=155271833;WS=155271815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	155314034	rs359569	A	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=22;PP=1077;SC=TTGCCTTCTCACTCTTCCTAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=155314042;WS=155314024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	155314296	rs359570	A	G	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=AATTTGGTAGAGGTAATCTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=155314304;WS=155314286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	155481609	rs7653384	G	A	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=19;PP=822;SC=GAACTGTCCAGTAGATTTTAG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=37;WE=155481617;WS=155481599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	155485302	rs358733	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=7;PP=968;SC=GCTTACCTTACTCACCAGAAG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=155485324;WS=155485292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	155523375	rs10563990	GCGCA	G	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=672;SC=CGATGGGGTAGCGCACGCAAC;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=155523386;WS=155523365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	155547681	rs374910883	G	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=818;ReadPosRankSum=-1.416;SC=CATACATGCTGTACACTGTAA;SOR=0.984;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=42;WE=155547689;WS=155547671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr3	155611557	rs6441026	T	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=204;SC=TTATTAATTTTCTTGAGCACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=155611565;WS=155611547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	155654432	rs3772113	T	A	215.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=176;SC=CTTTTTTTTTTAAATTTTCAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=155654440;WS=155654422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	155991348	rs1160221	G	T	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=53;PP=1799;SC=GCACACAGATGCTCTTTCCAT;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=155991356;WS=155991338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	156175109	rs34093583	C	CTT	3751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=25;PP=2709;SC=CTTTCCCTCTCCACTAAAACT;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=156175117;WS=156175099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	156175167	rs2293194	GG	AA	7774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=64;PP=2947;SC=CCTAAAGACCGGTAGAGGACT;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=136;WE=156175176;WS=156175157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	156234268	rs4295133	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.877;SC=TGTGTTGTCCAGGCCAGTGGC;SOR=0.551;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=156234276;WS=156234258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	156249214	rs2280031	T	C	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=962;ReadPosRankSum=0.193;SC=GCCTGAGAAATGAAGGTGTGA;SOR=0.902;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=170;TCF=82;TCR=88;TR=84;WE=156249222;WS=156249204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,100:0.49:204
chr3	156261110	rs1983206	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.335;SC=ATTGGTTTTTTGAGAAAATAA;SOR=1.110;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=23;WE=156261118;WS=156261100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr3	156262232	rs6792998	C	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr3	156266642	rs6809188	C	T	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=45;PP=1629;SC=TCAAAAAATTCTCTTCAAAGT;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=80;WE=156266650;WS=156266632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	156266774	rs9296	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=1.090;SC=AAACAGCATCCTCCCTCTTCT;SOR=0.409;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=18;WE=156266782;WS=156266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr3	156271595	rs2292337	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=278;ReadPosRankSum=-0.540;SC=AAGGGGGAAGGGTACAAAAAG;SOR=0.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=10;WE=156271616;WS=156271585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr3	156271608	rs2292338	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=278;ReadPosRankSum=0.498;SC=ACAAAAAGAAGCAAAACATTA;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=10;WE=156271616;WS=156271585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr3	156271627	rs2292339	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.294;SC=TACAACCCCGCAACAAAAGCC;SOR=0.556;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=10;WE=156271635;WS=156271617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr3	156395329	rs345986	G	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=350;SC=ACTAAATATAGTATAAGAGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=156395337;WS=156395319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	156411732	rs193197	A	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=350;SC=TTAATGTCCAATGATATTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=156411740;WS=156411722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	156431750	rs61733487	A	G	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=24;PP=1020;SC=TGTGGACTAAATACCTTCTTG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=156431758;WS=156431740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	156544584	rs344071	C	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1266;ReadPosRankSum=-1.476;SC=GATGTGAACTCCCGCCTTCAC;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=69;TCR=95;TR=79;WE=156544592;WS=156544574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,98:0.49:199
chr3	156547013	rs344073	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=308;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GTTTATAAAGCATCTTAATTT;SOR=0.755;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=22;WE=156547021;WS=156547003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr3	156570521	rs111501048	T	TA	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=242;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TTTTCAGAATTAAAAAAATTT;SOR=0.602;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=11;WE=156570529;WS=156570511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	156570703	rs414683	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=374;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AGAGACTTCAAGAAAAGCTGC;SOR=0.619;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=22;WE=156570711;WS=156570693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr3	156638503	rs7609851	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=0.726;SC=AAGAACTGAAAATTATAAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=14;WE=156638511;WS=156638493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr3	156645196	.	A	AT	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5004;HP=13;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=28;QD=11.3333333333;SC=TTAAAATCCTATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=156645204;WS=156645186;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	156697090	rs10558622	TATAAC	T	1988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=1105;SC=TTAAACAACTTATAACAGTGC;SOR=1.280;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=156697102;WS=156697080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	156864398	rs370594663	TAAAAAA	T	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=18;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ACCTCGTCTCTAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=9;WE=156864411;WS=156864388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	156864419	.	TA	T	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.958;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	156864551	rs6783595	T	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CAGAAATATCTATTTATAATT;SOR=1.187;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=14;WE=156864559;WS=156864541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
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chr3	156870059	rs73154633	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.814;SC=AAACTCAATTCAGTATACTGG;SOR=1.295;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=21;WE=156870067;WS=156870049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr3	156870816	rs41272613	A	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1052;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TCTGTACTCTACAACTCACCT;SOR=0.748;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=66;WE=156870824;WS=156870806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,91:0.51:177
chr3	156876502	rs6441114	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=0.146;SC=ATTATTTTAAGTATCAGTGTT;SOR=0.136;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=156876510;WS=156876492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	156876574	rs6441115	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=359;ReadPosRankSum=1.044;SC=ATTCACTTGAAAGGAAAGATG;SOR=0.743;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=21;WE=156876582;WS=156876564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr3	156876803	rs6441116	T	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=501;ReadPosRankSum=0.723;SC=ATTGTTAGATTAAACTCACTT;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=30;WE=156876811;WS=156876793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr3	156877276	rs59715654	CAA	C	2157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.489;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.417;NF=2;NR=34;PP=1400;ReadPosRankSum=0.048;SC=CACCTGCAGACAAGAGAGGAG;SOR=1.302;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=36;WE=156877285;WS=156877266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr3	156877357	rs10936061	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.354;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=413;ReadPosRankSum=-1.640;SC=ATCGCTTCCCTTTCCCCTCCC;SOR=1.445;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=22;WE=156877365;WS=156877347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr3	156877530	rs12635088	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.251;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=0.458;SC=CGGCGTAGGGGACGGAGGAGA;SOR=2.419;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=19;WE=156877538;WS=156877528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr3	156978919	rs11398653	A	AT	3643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.974;NF=33;NR=36;PP=2752;ReadPosRankSum=0.557;SC=TGACTTATAAATCCCTACAGA;SOR=0.886;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=69;WE=156978927;WS=156978909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,118:0.51:231
chr3	156983273	rs3749214	A	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.804;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=775;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TGGAGATCAAAACCTTAAAAA;SOR=1.335;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=39;WE=156983281;WS=156983263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr3	156983414	rs7652298	T	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=52;PP=1448;ReadPosRankSum=0.444;SC=TCTCTTTAAGTTTTCCTTCTA;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=83;WE=156983422;WS=156983404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,97:0.54:179
chr3	157004323	rs4680353	A	C	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=872;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AATGGTTCTTAGCAGCAGGTA;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=72;WE=157004331;WS=157004313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr3	157081324	rs11918974	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=642;ReadPosRankSum=-1.511;SC=ACAGTTTCTGACAAATTCTCT;SOR=0.741;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=43;WE=157081332;WS=157081314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr3	157081604	rs55865575	A	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=442;ReadPosRankSum=2.066;SC=TTCACTGACAAGGAAAAGAAA;SOR=1.071;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=33;WE=157081612;WS=157081594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr3	157082082	rs3833585	C	CAA	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=588;ReadPosRankSum=-1.212;SC=ACAAACCAAACGAGTTATACC;SOR=3.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=13;WE=157082090;WS=157082072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr3	157146005	rs9289983	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=0.069;SC=AAAAAAATGGGCATTTGTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=157146013;WS=157146000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr3	157146307	rs1456099	A	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=770;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GGGAATGATGACTTTATCAGG;SOR=1.165;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=44;WE=157146315;WS=157146297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr3	157154861	rs2305619	A	G	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CCGTAAGTTCACTTTAACTGT;SOR=0.418;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=87;WE=157154869;WS=157154851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,106:0.50:211
chr3	157155314	rs3816527	C	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=506;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ACGCCGTGCGCCTGCGGTCAG;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=40;WE=157155322;WS=157155304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr3	157188045	rs1456113	A	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=365;SC=CAGACATCACAGGTTCACCTA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=157188053;WS=157188035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	157188378	rs1011060	C	T	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=42;PP=1164;SC=CTTCAAAGGACAAAATACTAA;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=157188386;WS=157188368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	157288885	rs16827846	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=0.547;SC=TGTACATCATTGGTTTTGTTT;SOR=0.046;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=16;WE=157288893;WS=157288875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr3	157817517	rs9833383	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=202;SC=GGTCCACTATATCATCTCAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=157817525;WS=157817507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	157820423	rs4462902	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=685;SC=CAACCCCAGGCTCTCTCTGCT;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=157820431;WS=157820413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr3	157841531	rs6789448	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-1.550;SC=ATTTATCTCTGTTTGCTTCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=157841539;WS=157841521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	157849957	rs1609526	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.651;SC=GTATTTTTGGCGGAGATGGGG;SOR=0.495;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=7;WE=157849965;WS=157849947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
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chr3	158300732	rs2566341	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=13;PP=373;SC=AAATAAACACATTTATTTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=158300740;WS=158300722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	158306627	rs1075551	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1214;ReadPosRankSum=-1.256;SC=TCATTTGAGGATGTTGTTTCT;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=84;WE=158306635;WS=158306617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,102:0.49:209
chr3	158308875	rs2566339	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.41;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	158310153	rs6771248	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=298;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATTATTTGTAATATTTACCTG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=19;WE=158310161;WS=158310143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr3	158310391	rs34234841	CAGTT	C	2716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.926;NF=4;NR=45;PP=2149;ReadPosRankSum=0.129;SC=TTTTTTAAGACAGTTAGTGAG;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=8;TCR=90;TR=49;WE=158310402;WS=158310381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,70:0.55:128
chr3	158310483	rs6780477	G	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=1.198;SC=TCTTGTTCTAGAAATCACTAT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=158310491;WS=158310473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	158314810	rs45471897	C	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=0.950;SC=CTTTCAAACACTTTTTTAACC;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=158314818;WS=158314800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr3	158314846	rs55999561	A	G	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=101;SC=GATACCTTACATGATTAACCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=158314854;WS=158314836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	158318015	rs2639656	C	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=211;SC=AAATAACAGCCGTACTTGATG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=158318023;WS=158318005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	158320597	rs4875	T	C	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=808;SC=TTGACATAGGTGATGCTCATG;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=158320605;WS=158320587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	158320703	rs15967	C	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=36;PP=1076;SC=CCATGAGAATCCTGGCTCCCG;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=158320711;WS=158320693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	158362391	rs28372852	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=688;SC=CCACCCGGCGCCACGGGACTT;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=158362399;WS=158362381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	158362441	rs1864507	T	C	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=14;PP=818;SC=TCCTGGGAGCTGCAGCCGTCG;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=158362449;WS=158362431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	158362526	rs1864506	A	G	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=43;PP=1936;SC=TAGAGAGGCTAAATCGGGACC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=158362534;WS=158362516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	158362588	rs1864505	C	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=53;PP=1654;SC=GTGACACCCCCTGGGTCCTCA;SOR=1.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=84;WE=158362596;WS=158362578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	158366900	rs2303909	G	A	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=743;SC=TAAAGGTATTGTAGATCTTAT;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=158366908;WS=158366890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	158367837	rs56167308	C	T	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=25;PP=925;SC=GAATTGGGATCGCAGGTCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=158367845;WS=158367827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	158369789	rs56362855	T	A	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	158369798	rs9810874	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.35;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	158372477	rs62286656	C	T	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=652;SC=TACTTCTAGGCTTTATTCCTA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=158372485;WS=158372467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	158372502	rs9884039	T	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=326;SC=AGAATGACTCTGACTTTTATG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=158372510;WS=158372492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	158384068	rs7628497	A	G	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.13;SOR=1.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	158384920	rs9875895	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=161;SC=GCAAAAATTACATTTAATTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=158384928;WS=158384910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	158386737	rs1492909	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=481;SC=ACAATACTTTCGATAAATATT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=158386745;WS=158386727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	158387487	rs6441215	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=439;SC=AAGCATAGGCTCCTAATGGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=158387495;WS=158387477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	158388721	rs56093991	C	CAAAGAAA	474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=395;SC=GACCCTGTCTCAAAGAAAAAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=158388729;WS=158388711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	158388780	rs8455	T	C	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=13;PP=700;SC=AAATTTAAGGTGATACTTATG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=158388788;WS=158388770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	158390395	rs9841	A	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=301;SC=TCCTTCAGTCAGTCTTCTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=158390403;WS=158390385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	158399757	rs11436468	A	AT	1152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.903;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.509;NF=23;NR=7;PP=601;ReadPosRankSum=-0.395;SC=ATAATGCTCCATTTTTTTTTT;SOR=3.716;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=30;WE=158399765;WS=158399747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr3	158408032	rs62288347	G	A	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.949;NF=63;NR=41;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.966;SC=TCAGGGACAAGTAATTGCAGG;SOR=0.974;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=188;TCF=107;TCR=81;TR=104;WE=158408040;WS=158408022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,121:0.53:228
chr3	158409093	rs145803239	C	CA	2484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=0.224;QD=30.68;ReadPosRankSum=1.647;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr3	158409262	rs1047355	C	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=42;PP=1249;SC=ACTAACTTTGCTTACTGTGAG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=158409270;WS=158409252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	158422506	rs4680457	G	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=565;SC=TTAGAAGTTCGCATGAATTCA;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=158422514;WS=158422496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	158428642	rs2307064	G	A	6382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=94;PP=2965;SC=TTACATTGATGGTTGGTCTGG;SOR=0.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=113;TCR=94;TR=207;WE=158428650;WS=158428632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr3	158431508	rs2279562	A	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=19;PP=2127;SC=ATCACTATATATTAAGATTCT;SOR=2.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=89;WE=158431516;WS=158431498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	158431702	rs2279561	A	T	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=60;PP=1786;SC=AAACATCCTCATATCCAGGAA;SOR=1.968;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=81;WE=158431710;WS=158431692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	158449965	rs6441223	T	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=21;PP=918;SC=CCAGCACTCGTAGCGCGCTGG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=158449973;WS=158449955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	158450178	rs6786423	A	G	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=43;PP=2134;SC=ACCAGGGAGCAGGCAGCCGTT;SOR=1.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=114;WE=158450186;WS=158450168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	158450417	rs6441224	T	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=318;SC=GGCTTAGTGCTAGGATGCGGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=158450425;WS=158450407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	158520011	rs28364680	C	T	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1201;ReadPosRankSum=0.981;SC=CAGAGGTGCCCCGGCCGCCCC;SOR=0.905;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=73;WE=158520019;WS=158520001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,86:0.61:141
chr3	158520483	rs2713736	A	G	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=82;PP=2425;SC=GTTCCTAAACAACTTTTGTTT;SOR=1.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=32;TCR=82;TR=114;WE=158520491;WS=158520473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	158522960	rs1381463	C	T	130.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9987;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TGACCATTTTCCTGGGCCAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=158522968;WS=158522954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr3	158531974	rs41272621	A	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=329;ReadPosRankSum=1.620;SC=TGTTGTCTCCATGGTTCTAAT;SOR=0.269;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=20;WE=158531982;WS=158531964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr3	158537415	rs146160361	CTTTTT	C	1589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=21;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=2;PP=604;SC=GTCTGTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=4.921;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=30;WE=158537451;WS=158537405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	158537443	rs3765083	A	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=16;PP=1986;SC=TTTAGGGGGTATAACGTGTAT;SOR=3.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=64;TCR=16;TR=79;WE=158537451;WS=158537405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	158539294	rs1548092	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=1.630;SC=GAAAGAAGCTGATTAAACTTG;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=11;WE=158539302;WS=158539284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr3	158539486	rs1548093	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=0.483;SC=CATGTGAAGTATGGGTCTTTA;SOR=1.128;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=7;WE=158539494;WS=158539476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	158539544	rs73158377	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-1.274;SC=ACCTAATATTTTTTAAGTGCG;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=158539552;WS=158539534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	158539961	rs6793618	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=473;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GGTGGGGTCAGGGCTTCAGCA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=31;WE=158539969;WS=158539951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr3	158545195	rs6792827	G	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.262;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=-1.061;SC=TCGTTTCAAGGTTTGGGCTTT;SOR=0.195;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=14;WE=158545203;WS=158545185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr3	158546552	rs75704067	ATATT	A	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.732;SC=AAACCTCAGAATATTAATTAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=158546563;WS=158546542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	158546849	rs78482130	G	GT	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=449;ReadPosRankSum=-0.528;SC=AAAATTTAGAGTTTAGTCATT;SOR=0.299;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=158546857;WS=158546839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	158963599	rs78239689	C	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=461;ReadPosRankSum=0.506;SC=TAGCTGGTGACAATTTGTAAG;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=33;WE=158963607;WS=158963589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr3	158970714	rs1020470	T	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=ATGTGCTGCATATTATTTCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=158970722;WS=158970704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	158991724	rs2621285	A	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=737;SC=TATTTTTACAAATGAAGAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=158991732;WS=158991714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	159557867	rs79601953	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=365;SC=GGGAGCCCCTGCCTTACCAGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=159557875;WS=159557857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	159584137	rs148163160	T	TA	1645.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.517;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.053;NF=1;NR=54;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ACTATTCTAATAAAAAAAAGC;SOR=4.073;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=55;WE=159584145;WS=159584127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,60:0.95:63
chr3	159733600	rs589545	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=0.619;SC=TTCTAAATCTGAAAAATTGCT;SOR=0.307;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=159733608;WS=159733597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	159733692	rs491966	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=107;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CTACACTTGATCCTGAGATCT;SOR=0.512;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=10;WE=159733700;WS=159733682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	159736893	rs2647930	T	C	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1256;ReadPosRankSum=0.408;SC=TTAAACATCCTAAGTGGTCAA;SOR=0.579;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=74;WE=159736901;WS=159736883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,88:0.52:168
chr3	159737076	rs2647931	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TCCTCTCGCCGCAAGCACATG;SOR=0.420;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=12;WE=159737084;WS=159737066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	159744277	rs2936300	C	T	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=410;SC=TCCACCACAGCGAAACCAGTT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=159744285;WS=159744267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	159744352	rs2279742	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=841;SC=CGAGACCTGACGGGAAGCGGG;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=159744360;WS=159744342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	159744438	rs2914119	C	T	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	159744438	.	CTC	TTT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=48;NR=39;PP=2947;QD=20;SC=AGGACAGGCACTCGCATGGGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=87;WE=159744448;WS=159744428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,87:0.97:90
chr3	159744440	rs2936301	C	T	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	159818741	rs111620918	C	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.069;NF=18;NR=8;PP=475;ReadPosRankSum=-1.579;SC=AACGAAGTCACCGAACTCTCC;SOR=0.889;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=26;WE=159818749;WS=159818731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr3	159818902	rs111583489	A	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.550;NF=10;NR=24;PP=482;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TAAGGAGGATAAAAAGAAGCG;SOR=0.663;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=34;WE=159818910;WS=159818892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,43:0.40:107
chr3	159976432	.	G	GA	328	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=61.78;NF=4;NR=13;PP=328;QD=20.0;SC=AGCTGCAATAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=17;WE=159976440;WS=159976422;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr3	159995356	rs3737214	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=699;ReadPosRankSum=1.060;SC=ATATGTAAACATTAATTACTT;SOR=0.830;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=49;WE=159995364;WS=159995346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr3	159997061	rs6778728	T	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=609;ReadPosRankSum=0.235;SC=GGATATGGTGTTATGCTGATG;SOR=0.560;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=50;WE=159997069;WS=159997051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,69:0.42:164
chr3	160018642	rs9637414	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.085;SC=TTTCATATTTGACAGGAAAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=160018650;WS=160018632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	160021681	rs4680576	G	A	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=943;SC=CCCAGATCCAGTAGTTAAACA;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=160021689;WS=160021671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	160025632	rs2275153	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.302;SC=ATTTAGATAAGTTAGCAAGAT;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=12;WE=160025640;WS=160025622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	160119631	rs58654032	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=0.268;SC=ATTAGTTCTCCGAACTAATTG;SOR=0.818;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=160119639;WS=160119621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	160130110	rs2305407	G	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=19;PP=1143;SC=TTTAATTTCTGTAGTTAAACA;SOR=1.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=160130118;WS=160130100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	160131347	rs33999879	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.965;SC=GAGAAGAGCAATATACTATCA;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=8;WE=160131355;WS=160131337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	160132026	rs73154587	GA	TT	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TTGGAATAAGGAGAGTTTTAG;SOR=0.855;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=58;WE=160132035;WS=160132016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr3	160135428	rs1451760	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=325;ReadPosRankSum=1.716;SC=TTTCTTAAATCGAATATAAAA;SOR=1.426;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=15;WE=160135436;WS=160135418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr3	160142618	rs11718121	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=0.958;SC=CTTTTCTGTCAATCTGAAATG;SOR=0.301;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=160142626;WS=160142608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	160142810	.	ATG	A	218.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=2.638;SC=GCATCCAGGTATGTGTGTGTG;SOR=2.541;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=160142821;WS=160142800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr3	160144022	rs41272959	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=0.355;SC=TTGGGGGGAAAAAAAAAACAG;SOR=1.096;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=18;WE=160144030;WS=160144012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr3	160148756	rs7631792	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=11;PP=530;SC=TCCTTCATCTCTGTAATGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=160148764;WS=160148746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	160150024	rs62272245	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=366;ReadPosRankSum=0.678;SC=CTAATTATCATATCAAATTTA;SOR=0.283;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=23;WE=160150032;WS=160150014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr3	160150859	rs61762668	G	A	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=938;ReadPosRankSum=2.183;SC=TCAACCTTTCGGGAGGAGAGA;SOR=1.058;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=59;WE=160150867;WS=160150849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr3	160156951	rs1141023	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GACAAGTTAACTCTTCCTCAA;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=13;WE=160156959;WS=160156941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	160223032	rs721022	C	T	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=248;SC=ATCTTAAAATCAACAACCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=160223040;WS=160223022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	160227606	rs2305401	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=220;ReadPosRankSum=0.232;SC=TCCTTCCACTAATTGTTAAGT;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=16;WE=160227614;WS=160227596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr3	160233154	rs56124988	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=0.143;SC=ATCAATATTACAGACATTTCT;SOR=0.754;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7;WE=160233162;WS=160233144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	160233406	rs112603907	CT	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.725;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=2.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr3	160245948	rs1551190	A	G	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=82;SC=TTAAAATATAACCTCATTAAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=160245956;WS=160245938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	160245980	rs4679890	C	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=GGAATAGCATCATTGGAAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=160245988;WS=160245970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	160283126	rs4621370	A	C	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=56;PP=1662;SC=GCCCCAACCAACGCGCCGCAC;SOR=2.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=160283134;WS=160283116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	160395093	rs1879797	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=1.706;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.477;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr3	160679422	rs7616249	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=1.741;SC=AGGGTTGGTTTCACAGTGCTT;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=6;WE=160679430;WS=160679412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr3	160679744	rs7629001	A	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=736;SC=TGCAAAAAAAATTCATTATAA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=160679752;WS=160679734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	160821929	rs7651087	T	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=756;SC=TCTTATCTGTTAGTAATAAAC;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=160821937;WS=160821919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	160821969	rs7617204	A	G	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=17;PP=1248;SC=ATACGCGTTCAGTAATTTGTG;SOR=1.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=160821977;WS=160821959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	160939732	rs148371722	A	AATCCCAAC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.10;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	160939746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=43.37;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	160939776	.	T	TAA	1191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.48;QD=47.67;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	160955879	.	G	T	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=81;QD=28.9428031368;SC=TATTTTCATAGGGCTTTTTTT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=160955891;WS=160955869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	160955882	.	CTT	C	48	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=15;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=48;QD=25.5;SC=TTTCATAGGGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=160955891;WS=160955869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr3	160964271	rs73026976	G	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=28;PP=1244;SC=CTGCCAATTAGGATTGCAAAT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=160964279;WS=160964261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	160967354	rs4290817	G	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=55;PP=1899;SC=GAAAGGTCTCGCTTTTCTTTA;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=160967362;WS=160967344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	160970437	rs6789388	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=10;PP=476;SC=AGTATTCTTAGTCATATCCCA;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=160970445;WS=160970427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	161064193	rs339101	A	T	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=35;PP=977;SC=ACATAGAATCACTTTAAAATT;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=161064201;WS=161064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	161090616	rs2054710	C	T	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=48;PP=1428;SC=GGCCGAGACGCTTTCTGCTCG;SOR=2.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=161090624;WS=161090606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	163889148	rs190745388	T	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=573;ReadPosRankSum=1.385;SC=AAGTAGCAACTATTAAACAAT;SOR=1.473;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=30;WE=163889156;WS=163889138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr3	163889384	rs10936412	T	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=521;ReadPosRankSum=1.355;SC=TACGTTCCCGTGAAGCTTTTG;SOR=0.992;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=45;WE=163889392;WS=163889374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr3	164714261	rs114497045	A	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=411;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CATGTACACTAAAGTATAATG;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=20;WE=164714269;WS=164714251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr3	164714532	rs4855271	C	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=438;SC=TTACATATGACATTCCAAACA;SOR=5.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=164714540;WS=164714522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr3	164760771	rs12381230	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=-0.565;SC=ATATACTCTATAGATTTAATT;SOR=0.773;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=8;WE=164760779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr3	164764719	rs9838509	C	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=891;ReadPosRankSum=0.652;SC=CTAACCAATGCGCAGCATGTC;SOR=0.644;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=58;WE=164764727;WS=164764709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr3	164766807	rs200218470	T	TAA	229.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.920;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr3	164766816	rs9821196	C	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=-2.045;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	164766835	rs9841237	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TATTTCCTAATTATGAATACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=164766843;WS=164766825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	164772957	rs9290256	C	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.712;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=0.057;SC=TTGACCAAAACCATTGGTTTA;SOR=0.313;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=20;WE=164772965;WS=164772947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr3	164773057	rs9290257	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=591;ReadPosRankSum=-0.935;SC=TGCAGTTTGGGTTAGTGAAAT;SOR=0.691;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=44;WE=164773065;WS=164773047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
chr3	164776913	rs60170840	C	CAT	2924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.868;NF=19;NR=40;PP=2713;ReadPosRankSum=0.295;SC=TTAACTTACACGTGTAAACAC;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=38;TCR=81;TR=59;WE=164776921;WS=164776903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,78:0.47:167
chr3	164777677	rs9290259	T	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=451;ReadPosRankSum=0.424;SC=CACGGACCCTTTATTCTACTT;SOR=1.198;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=29;WE=164777685;WS=164777667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr3	164781368	rs11718901	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TTTCAAATATGTTTAAAACAC;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=14;WE=164781376;WS=164781358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr3	164783165	rs9283633	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.321;SC=GGAAGACGGGTTGAGATCTGT;SOR=0.678;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=23;WE=164783173;WS=164783155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr3	164785338	rs9865476	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.328;SC=TAATATTCCAGTTCTGAATTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=164785346;WS=164785328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	164786382	rs9758479	C	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.002;NF=13;NR=1;PP=699;ReadPosRankSum=0.026;SC=AGGATGGTCTCCATCTCCTGA;SOR=0.157;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=14;WE=164786404;WS=164786372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	164786396	rs9754967	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.001;NF=17;NR=2;PP=699;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CTCCTGACCTTGTGATCCGCC;SOR=0.954;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=19;WE=164786404;WS=164786372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	164786413	rs9756068	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.036;NF=25;NR=3;PP=447;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CGCCCACGTCAGCTTCCCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=28;WE=164786421;WS=164786403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr3	164786629	rs11313475	TA	T	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=278;ReadPosRankSum=0.214;SC=CCTTAAAGAATAAAAAAAAGC;SOR=0.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=20;WE=164786637;WS=164786619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr3	164793758	rs9290264	C	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=1.265;SC=ACAAAAAGGACAATCAGAGAG;SOR=0.523;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=20;WE=164793766;WS=164793748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr3	165495400	rs2686409	G	A	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1146;SC=TCTGTGTGCAGGGGCAAAGCA;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=165495408;WS=165495390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	165495420	rs2686410	G	C	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=21;PP=1625;SC=AAATTTGCAAGTACAAATGTT;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=74;WE=165495428;WS=165495410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	165496622	rs2686411	A	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=TAAGATGTCCAGAAAACATTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=165496630;WS=165496612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	166960278	rs11923256	G	T	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=804;ReadPosRankSum=-1.565;SC=TAAATAAACTGCAGGCTTAAC;SOR=0.480;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=54;WE=166960286;WS=166960268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr3	167023738	rs13096767	G	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=9;PP=342;SC=TGAAGTTTCTGCTGTTAAAAA;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=167023746;WS=167023728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	167034814	rs13068132	T	C	4901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=63;PP=2947;SC=CGACTATCTTTAGAGATGGTT;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=140;WE=167034822;WS=167034804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	167035501	rs4580553	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=525;SC=TGATGAAACCGTAACTGTACC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=167035509;WS=167035491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	167051769	rs11923054	T	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=439;SC=TATTTGAGATTTTGCCTATTA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=167051777;WS=167051759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	167068256	rs4619784	T	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=27;PP=858;SC=TCTGGTGAACTTTAGCAAAGC;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=167068264;WS=167068246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	167077691	rs4257551	T	A	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=28;PP=888;SC=ACTGTCCACATACTTTCCCAT;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=167077699;WS=167077681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	167077840	rs11922241	A	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=1.645;SC=AAATTAATGAAACTATGCATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=167077848;WS=167077830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	167167100	rs6803996	C	T	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=38;PP=1498;ReadPosRankSum=0.737;SC=ATCATTCACCCTACCAGTTGA;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=119;TCR=74;TR=99;WE=167167108;WS=167167090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,111:0.46:240
chr3	167167186	rs6770577	T	A	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=58;PP=1388;ReadPosRankSum=0.829;SC=ACACTTCAGATGAATCTGGTT;SOR=0.820;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=181;TCF=63;TCR=118;TR=85;WE=167167194;WS=167167176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,97:0.46:213
chr3	167184878	rs9841174	T	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=760;ReadPosRankSum=1.207;SC=ACTTATCATCTCTGCACAAGC;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=50;WE=167184886;WS=167184868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr3	167189607	rs17246389	A	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=484;ReadPosRankSum=2.039;SC=AGACTCCACAAGAAGATTGTG;SOR=0.098;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=36;WE=167189615;WS=167189597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr3	167191652	rs4129073	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=230;ReadPosRankSum=0.032;SC=AGAATAAAAGCGATATGTTAA;SOR=2.027;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=15;WE=167191660;WS=167191642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr3	167217964	rs13060964	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=324;ReadPosRankSum=-1.969;SC=CGGGGCCTCCAGAATTTGGGG;SOR=0.857;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=26;WE=167217972;WS=167217954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr3	167218188	rs13061345	A	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=-1.197;SC=ACTTTTATAAATTTAACCTTC;SOR=0.350;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=27;WE=167218196;WS=167218178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr3	167218241	rs13061499	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=1.898;SC=GCAAACCCTACAAACACAGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=167218249;WS=167218231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	167254558	.	TAA	T	295	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=61.78;NF=7;NR=2;PP=295;QD=33.8888888889;SC=TATATATATATAAAACAACTG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=167254567;WS=167254548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	167351418	rs9845725	T	C	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=43;PP=1362;SC=TTGCTACAAATTCTTAGTTTT;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=167351426;WS=167351408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	167506937	rs33917740	C	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=425;ReadPosRankSum=-1.124;SC=TTGGACTCTTCTCTTTGCTGG;SOR=0.854;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=23;WE=167506945;WS=167506927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr3	167506967	rs34582040	A	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.131;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=550;ReadPosRankSum=-2.330;SC=GTATGGCTACAGGGGCCACTT;SOR=1.065;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=34;WE=167506975;WS=167506956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr3	167508062	.	T	C	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=20;QD=18.2570708491;SC=GGTGCCTGTTTGGTTAATCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=167508070;WS=167508057;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr3	167510472	rs2229697	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=746;ReadPosRankSum=0.061;SC=ACTGGAAGTCGCAGTTTAGGC;SOR=0.849;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=52;TCR=72;TR=54;WE=167510480;WS=167510462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,70:0.46:152
chr3	167727884	rs73037443	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=2.303;SC=TCTAGACCTACGTTATCAAAA;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=167727892;WS=167727874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	167728445	rs57405643	G	C	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=579;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CCACTGGTACGTATCCCAAAT;SOR=0.881;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=38;WE=167728453;WS=167728435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr3	167728696	rs56801598	G	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=-1.092;SC=ATCATTTAAAGACTTGCAATA;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=167728704;WS=167728686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	168538993	rs603638	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=605;ReadPosRankSum=1.497;SC=TGTCTCGAGGATGCCTACGGA;SOR=0.252;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=36;WE=168539001;WS=168538983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr3	168542454	.	T	TCACACA	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-1.496;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	168546914	rs678690	C	T	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1241;ReadPosRankSum=0.389;SC=CGGTCCAGCCCGATGAAGTAT;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=76;WE=168546922;WS=168546904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr3	168819788	rs9290358	A	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=174;SC=AAACAGCAAGACCTTTTGAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=168819796;WS=168819787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	168825911	rs4955639	T	C	76.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	168840571	rs3851380	A	T	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=35;PP=993;SC=AAACGGAACAACATTTTATTG;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=168840579;WS=168840561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	168840607	rs3851381	C	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=559;SC=ATTAAAGAAACAAGAAGGAAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=168840615;WS=168840597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	168867562	rs115546592	C	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=994;ReadPosRankSum=0.320;SC=ATGGAGAATTCATTGCATCAT;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=43;TCR=83;TR=63;WE=168867570;WS=168867552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,78:0.51:154
chr3	169098861	rs988398	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TTCTTAAAAACCTGTTGAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=13;WE=169098869;WS=169098851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr3	169504148	.	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=295;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TAGTCTACCTCAGGGGTTTAG;SOR=0.304;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=17;WE=169504156;WS=169504138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	169643757	rs1290671	G	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TTCAGCTATAGTACCCAGGAG;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=169643765;WS=169643747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	169643955	rs1290670	C	T	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1063;ReadPosRankSum=1.313;SC=TTGAGACTTGCAATGTCTAAT;SOR=0.722;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=68;WE=169643963;WS=169643945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,76:0.50:153
chr3	169654095	rs76313862	A	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=663;ReadPosRankSum=0.080;SC=AAAGACATTCAGACAGAGTTA;SOR=0.513;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=76;TCR=26;TR=51;WE=169654103;WS=169654085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr3	169710363	rs2160898	G	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=510;ReadPosRankSum=0.166;SC=CTCAATTAGAGAAATTTTTCT;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=34;WE=169710371;WS=169710353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr3	169801658	rs6444895	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	169802490	.	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=223;ReadPosRankSum=0.143;SC=CTTATCCAAGCTCATTGTCTG;SOR=0.765;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=19;WE=169802498;WS=169802480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr3	169889331	rs3772186	T	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=0.551;SC=ACAATAAATGTCAAAAGGCCT;SOR=0.573;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=24;WE=169889339;WS=169889321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr3	169894680	rs1386333	G	A	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=20;PP=713;SC=GAGGCTCAAGGGGATTATGTC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=169894688;WS=169894670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	169980956	.	CAA	C	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=51.73;NF=6;NR=0;PP=95;QD=16.3333333333;SC=AACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=169980965;WS=169980949;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,6:0.75:8
chr3	169988286	rs56257047	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=-1.039;SC=ACTGCAAACTCTTGGTTCATA;SOR=0.969;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=18;WE=169988294;WS=169988276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr3	170013846	rs2454763	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=0.783;SC=GGTCAGTAGCGGTTTGGGAAA;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=8;WE=170013854;WS=170013836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	170020693	rs115366686	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=-1.580;SC=GAAAATCTGGGGGATTAATCT;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=170020701;WS=170020683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	170078232	rs3772173	C	T	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1310;ReadPosRankSum=0.879;SC=GACATTCATGCAAATGGAAAA;SOR=0.857;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=168;TCF=81;TCR=87;TR=84;WE=170078240;WS=170078222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,94:0.52:182
chr3	170105233	rs6786374	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.325;NF=11;NR=1;PP=269;ReadPosRankSum=-0.203;SC=TGTGGCTTTTCATGTCTGGTC;SOR=1.096;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=12;WE=170105241;WS=170105223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr3	170105309	rs77658498	ACTT	A	1808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.079;NF=8;NR=19;PP=1230;ReadPosRankSum=-2.734;SC=ATGTACCAGTACTTCTTTTTA;SOR=0.982;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=27;WE=170105319;WS=170105299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr3	170105378	rs6786542	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=530;ReadPosRankSum=1.583;SC=CTTCGTCAGTCGGACATTTGC;SOR=0.408;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=38;WE=170105386;WS=170105368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr3	170197954	rs989997	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=0.505;SC=AACACAAGGGTCCATAGAACC;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=170197962;WS=170197944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	170198898	rs3732449	C	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=831;ReadPosRankSum=1.182;SC=CCAGGAACCCCGACACGATGC;SOR=0.796;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=55;WE=170198906;WS=170198888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,64:0.47:137
chr3	170198967	rs1861939	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TGGAGGGGCCGGGCAAGCAGA;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=15;WE=170198975;WS=170198957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr3	170425956	rs495979	G	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=211;ReadPosRankSum=-0.751;SC=GAATGGAATGGGAACGCCAAT;SOR=0.073;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=18;WE=170425964;WS=170425944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr3	170584064	rs35192046	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr3	170584074	rs35683888	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.055;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr3	170586057	rs3732927	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=0.636;SC=ACTCTGATTACAAAAATAAGC;SOR=1.093;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=18;WE=170586065;WS=170586047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr3	170727701	rs369506780	GGT	G	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=1.228;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.168;SOR=0.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	170732426	rs7637863	G	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1336;ReadPosRankSum=0.584;SC=TGAGATTGTGGGCAGTTCATC;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=66;TCR=89;TR=75;WE=170732434;WS=170732416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr3	170825905	rs6444960	C	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=37;PP=1314;SC=GTTTCACCTTCGCAGGCTCAT;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=170825913;WS=170825895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	170825920	rs2291900	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=476;ReadPosRankSum=0.186;SC=GCTCATGGGGGAGCACAGGTG;SOR=0.806;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=30;WE=170825928;WS=170825910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr3	170857167	.	G	GCACACACACA	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=0.405;SC=ACGCACGCGCGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=1;WE=170857175;WS=170857157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	170857240	rs6444965	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=385;ReadPosRankSum=-1.234;SC=GGTCAGCTGGTTCTTGGCTTT;SOR=0.280;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=27;WE=170857248;WS=170857230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr3	170858406	rs2292006	T	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=0.061;SC=TTTAATGAGATATGCCTAAAT;SOR=0.599;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=26;WE=170858414;WS=170858396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr3	170928797	rs6444972	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TGGGGGCTAATGGTTAAAGAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=170928805;WS=170928787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	171065031	.	G	C	905	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=56.19;NF=1;NR=29;PP=905;QD=31.3257070849;SC=AAAAAGAAAAGAAAAATGACA;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=30;WE=171065039;WS=171065021;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr3	171087469	rs3796295	G	A	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=99;PP=2965;SC=AGATCCCTGCGGGGTCCTGAA;SOR=1.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=41;TCR=99;TR=140;WE=171087477;WS=171087459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	171338237	rs9881788	T	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=253;ReadPosRankSum=0.591;SC=TAAGCTCAGTTACTAGGTTTC;SOR=0.704;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=17;WE=171338245;WS=171338227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr3	171395468	rs2124147	A	G	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=988;ReadPosRankSum=0.502;SC=TCTGTAAACTACGGATGGACC;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=55;TCR=81;TR=63;WE=171395476;WS=171395458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,82:0.49:169
chr3	171405384	.	A	T	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=101;QD=22.6285354245;SC=GCTGAGAAAAATTTTTTTTTA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=171405392;WS=171405374;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	171442635	rs7647840	C	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1140;ReadPosRankSum=0.956;SC=CCACTTAGCTCGTACAGCCTC;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=84;TCR=96;TR=81;WE=171442643;WS=171442625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,99:0.44:227
chr3	171442750	rs10710862	AG	A	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=709;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CGGGTACCCTAGAGGCGAACC;SOR=1.179;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=18;WE=171442758;WS=171442740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr3	171443607	rs4131284	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	171443955	rs4131283	T	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=0.652;SC=GCTGTGTGTATATACTGTTTG;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=4;WE=171443963;WS=171443945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr3	171844787	rs4894810	A	T	5065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=85;PP=2965;SC=ATGTGAATGCATTGGGAGGTG;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=151;WE=171844795;WS=171844777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	171969077	rs7652177	C	G	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=28;PP=1607;SC=GGAATGTCAACCTACATCACC;SOR=1.289;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=78;WE=171969085;WS=171969067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	172059121	rs570549	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.179;SC=ATGTATCTTGGTAATGCAACC;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=7;WE=172059129;WS=172059111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	172060700	rs606797	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=-0.235;SC=AACCCCTTTTCGGTAACATTT;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=18;WE=172060708;WS=172060690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	172064091	rs583550	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=407;ReadPosRankSum=-1.346;SC=ATATACATACGTGTGTGTGCG;SOR=1.277;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=28;WE=172064099;WS=172064081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr3	172162829	rs482204	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.93;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	172162837	rs477251	T	C	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	172166033	rs495225	G	A	7478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=124;PP=2965;SC=TGCCAGCGATGCCCACCACGA;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=121;TCR=124;TR=245;WE=172166041;WS=172166023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr3	172224303	rs1131532	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=26;PP=1314;SC=AAAAGGCCCCAAAAAAACTGG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=172224311;WS=172224293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	172224769	rs111284464	GC	G	4217.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=60;PP=2957;SC=AAAGCAAGGAGCTTTTTTGCA;SOR=2.448;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=3;TCR=71;TR=63;WE=172224779;WS=172224759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	172224771	rs17848019	T	A	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=61;PP=2049;SC=AGCAAGGAGCTTTTTTGCAGC;SOR=2.471;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=17;TCR=71;TR=76;WE=172224779;WS=172224759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	172227199	rs3815496	C	T	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=666;SC=AATCAGCCATCGTAAGCATAC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=172227207;WS=172227189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	172232905	rs142770957	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.214;SC=GGCATATTGAGTAAGTTCCTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=172232913;WS=172232895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	172365619	rs9865941	G	A	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=13;PP=989;SC=ACTCAGTTACGCATCTCCCCC;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=172365627;WS=172365609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr3	172428782	rs2276805	T	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=836;ReadPosRankSum=1.644;SC=CATCTTGCCCTGGCTCGGCTC;SOR=0.598;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=65;WE=172428790;WS=172428772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,72:0.45:161
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chr3	172480174	rs11313111	AC	A	163.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=0.732;SC=TTTAAGTTAAACTGGTTTTGG;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=172480182;WS=172480170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	172486964	rs35443668	C	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=312;ReadPosRankSum=-0.907;SC=AAAATGATTTCTGTTCCAGTG;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=19;WE=172486972;WS=172486954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr3	172520818	rs7644191	G	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=323;SC=ATTTTTGTAAGTTCCCTGAAT;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=172520826;WS=172520808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	172534428	rs10936738	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=358;ReadPosRankSum=0.035;SC=TAAATATTCTCATCAGCTGTA;SOR=1.911;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=19;WE=172534436;WS=172534418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr3	172537850	rs35236458	T	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=281;ReadPosRankSum=0.533;SC=TTGTAAAATGTAAAAATAATA;SOR=1.329;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=172537858;WS=172537840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	172766822	rs508508	G	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1109;ReadPosRankSum=1.318;SC=AACTTGCCACGCTTGCTATAT;SOR=0.583;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=73;WE=172766830;WS=172766812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr3	173322248	rs3844523	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=745;SC=ATCTGCTGTCTGAAGATCTTT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=173322256;WS=173322238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	173323508	rs10513714	G	A	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=899;SC=GGAATCTGATGAAGGCTGTCA;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=173323516;WS=173323498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	173507395	rs4499633	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.023;SC=GAGTTCAAACTAGAACCCAAG;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=173507403;WS=173507392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	173507744	rs2046722	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.064;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=409;ReadPosRankSum=0.714;SC=CAGAGCACAGTCCCTACCCTT;SOR=0.265;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=33;WE=173507752;WS=173507734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr3	174581888	rs6445184	T	C	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=69;PP=2965;SC=AAGGTGAGTCTGACCTAAATG;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=162;WE=174581896;WS=174581878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr3	174814738	rs9823911	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=770;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CCAGCTAGACGGTGCTGAGAA;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=47;WE=174814746;WS=174814728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr3	174814920	rs9836841	A	G	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1690;ReadPosRankSum=-1.658;SC=TCTTAAAAATACTTTGCACAG;SOR=0.513;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=197;TCF=84;TCR=113;TR=101;WE=174814928;WS=174814910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,115:0.51:227
chr3	174935828	rs34537026	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=173;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GAAAGTATTGCAGTGAATTTC;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=16;WE=174935836;WS=174935818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr3	174951756	rs4371530	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.069;NF=28;NR=22;PP=561;ReadPosRankSum=-1.438;SC=GAAGATGACATGGAAATTTCA;SOR=0.485;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=50;WE=174951764;WS=174951746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr3	175165079	rs6802937	C	T	5159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=71;PP=2920;SC=CATCTCTGCACCCCTCGTTGC;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=149;WE=175165087;WS=175165069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	175165201	rs2161041	T	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=36;PP=1019;SC=TACAGTTTTTTTAAAGACCAT;SOR=2.522;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=175165209;WS=175165191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	175189406	rs35213579	CT	C	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=8;PP=1030;SC=CAGATAGATCCTTTTTTTTTT;SOR=3.461;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=41;WE=175189425;WS=175189396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	175189417	rs79264590	G	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.997;NF=34;NR=7;PP=666;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTTTTTTTTTGTTATTTCAGG;SOR=0.898;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=41;WE=175189425;WS=175189396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr3	175189447	rs9290555	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.767;NF=43;NR=14;PP=975;ReadPosRankSum=0.072;SC=AGGTTCTTCAGAAAAATGTTG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=57;WE=175189455;WS=175189437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr3	175205148	rs7646041	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=0.872;SC=CAGGAGGACACTGAGGCATAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=11;WE=175205156;WS=175205138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr3	175345143	rs9866564	C	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=14;PP=516;SC=GAAATGGATCCCTCTTTCAAC;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=175345151;WS=175345133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	175473047	rs9826737	T	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=649;SC=GCCATGGCGTTACGCCTGCGG;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=175473055;WS=175473037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	176752202	rs1905503	A	T	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=100;SC=TATTATATGGACAGTCTAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=176752210;WS=176752192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	176756230	rs77478951	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTGCTGCAAAGGAACAAAGGT;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=15;WE=176756238;WS=176756220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr3	176765253	rs1201300	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=626;SC=AACAAAGTAAGAAGGAAAATG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=176765261;WS=176765243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	176765269	rs3749234	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=11;PP=574;SC=AAATGCTTCATTTACCATCTT;SOR=0.957;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=176765277;WS=176765259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	176767673	.	A	AGG	874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.60;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	176769608	rs1881979	G	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1035;SC=GAAAATCTTCGTTCCTAAAAA;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=176769616;WS=176769598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	176771861	.	TG	CG	348	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=1,0;NR=9,7;PP=147,348;QD=18.1771212547;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10,7;WE=176771869;WS=176771851;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	176771861	.	TG	TGCG	348	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=1,0;NR=9,7;PP=147,348;QD=18.1771212547;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10,7;WE=176771869;WS=176771851;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	176771861	rs55995541	T	C,TGC	287.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,5,7:0.38,0.54:13
chr3	178542417	rs9857119	A	C	143.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CCGCCTCGGCATCCGAAAGTG;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=178542425;WS=178542407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr3	178546026	rs9831934	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=643;ReadPosRankSum=0.486;SC=AAACATTTAATTGCTCCTTCA;SOR=0.799;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=43;WE=178546034;WS=178546016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr3	178560581	rs6443583	A	C	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=813;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TTATCCTAACAAAACTCTACA;SOR=1.289;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=51;WE=178560589;WS=178560571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr3	178785549	rs6772028	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=0.665;SC=ATTGGGTAGGGAAGCCTGGGG;SOR=0.260;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=16;WE=178785557;WS=178785539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr3	178921639	rs2699895	C	A	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=109;SC=CTTTTTCTTGCACTATACAGT;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=178921647;WS=178921629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	178922274	rs2699896	C	A	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=19;PP=1264;SC=TAGTATATACCTACTTTTTTC;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=178922282;WS=178922264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	178922430	rs3729679	A	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=29;PP=847;SC=GTTTAGCAGTATGATCCATAA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=178922438;WS=178922420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	178942431	rs2699889	C	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=768;SC=AAATAAATTTCAGGGTAAAAT;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=178942439;WS=178942421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	178943901	rs1356413	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=0.356;SC=ATTATAGAAGCATATAGAGGC;SOR=1.501;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=17;WE=178943909;WS=178943891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr3	178968529	rs200581491	A	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=312;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TCTGTTTCTTACCTGAGCATA;SOR=1.071;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=20;WE=178968537;WS=178968519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr3	178976591	rs56400023	T	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=362;ReadPosRankSum=0.521;SC=GAATGTACACTGATAACAAAT;SOR=1.251;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=19;WE=178976599;WS=178976581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr3	178976777	rs11720871	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=664;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTCAGACTTCCTGTGCACCAC;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=42;WE=178976785;WS=178976767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr3	178976821	rs11720935	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=488;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GACATGGTACGGTCTTCTTTG;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=26;WE=178976829;WS=178976811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr3	179085775	rs73043490	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TACCAGAAAACATATCTTGCT;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=4;WE=179085787;WS=179085765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	179085779	rs115622374	T	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=0.619;SC=AGAAAACATATCTTGCTACAT;SOR=0.307;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=4;WE=179085787;WS=179085765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	179092989	rs9865666	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=190;ReadPosRankSum=2.632;SC=TAATGTGTTACGGCTTGGGCC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=179092997;WS=179092979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	179096508	rs7637065	C	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=23;PP=1143;SC=ATTGTATTTCCTTTTTCCCTG;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=179096516;WS=179096498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	179103342	rs200984893	C	CTT	36.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.26;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	179109735	rs2287209	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=0.577;SC=TGACCTTTATAGTAATTAGAT;SOR=0.567;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=16;WE=179109743;WS=179109725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr3	179118998	rs3774225	C	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=910;ReadPosRankSum=0.873;SC=ATGTATGACACTGTTAATTCC;SOR=0.953;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=54;WE=179119006;WS=179118988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr3	179143941	rs1078749	A	G	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=951;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CCTGAATCTGATTCCGCAGTT;SOR=0.928;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=53;WE=179143949;WS=179143931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr3	179294352	.	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=674;ReadPosRankSum=1.205;SC=AGAGGAAATTCGTTCAAGGAA;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=43;WE=179294360;WS=179294342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr3	179298999	rs1132429	C	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GTGATATTGACATCAGACCAG;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=100;TCR=121;TR=89;WE=179299007;WS=179298989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,103:0.40:255
chr3	179305654	rs6443659	A	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=330;ReadPosRankSum=0.022;SC=AAAAAAAAAAATTTTTTAAGC;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=17;WE=179305662;WS=179305644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	179311533	.	CCA	C	1950.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=1557;ReadPosRankSum=0.836;SC=CTTAGAAGAGCCACAGTGTTA;SOR=0.705;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=35;WE=179311542;WS=179311523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr3	179399570	rs13080037	C	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=671;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TGCCAGGCCTCGTCTTCAGCG;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=45;WE=179399578;WS=179399560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,46:0.42:109
chr3	179448066	rs11309768	AT	A	697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.378;NF=1;NR=19;PP=328;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CCAGATTTGTATTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=20;WE=179448074;WS=179448056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr3	179448383	rs3213761	C	T	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=33;PP=1757;SC=CTTTTTGTTTCTGTTTCTCTG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=179448391;WS=179448373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	179463076	rs58527921	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	179463081	rs59131484	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	179469995	rs2239639	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=-1.402;SC=TGCCTCAGACAAAGTTGATAT;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=19;WE=179470003;WS=179469985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr3	179472674	rs2287240	C	T	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=65;PP=2222;SC=ATATGCGCTACCCTCCCACCC;SOR=1.197;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=179472682;WS=179472664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	179481971	rs71917525	CTG	C,CTGTG	725.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.076;NF=0,0;NR=17,17;PP=273,595;ReadPosRankSum=0.753;SC=GCATGAGAGACTGTGTGTGTG;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=17,17;WE=179481982;WS=179481961;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.42:33
chr3	179501981	.	C	CA	152	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5033;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=60.9;NF=0;NR=11;PP=152;QD=14.6363636364;SC=TTTAATTTGCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=11;WE=179501989;WS=179501971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,11:0.46:24
chr3	179526234	rs71182519	GA	G	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=84;ReadPosRankSum=0.148;SC=AGCTACAAGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=9;WE=179526242;WS=179526224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr3	179527459	rs111620765	G	GA	310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=12;PP=220;SC=CTAAGCACCTGAAAAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=179527467;WS=179527449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	179533826	rs17690759	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=-2.766;SC=GCATGAGCCATTGATTTCTCT;SOR=0.592;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=32;WE=179533834;WS=179533816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr3	179537828	rs1001668	T	C	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=799;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGTGTTTTTCTTCCCCCCCTA;SOR=0.434;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=42;WE=179537836;WS=179537818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr3	179592053	rs1609981	G	A	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=13;PP=1581;SC=TGAAAATAAAGCATTTATGCT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=72;WE=179592061;WS=179592043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	179592240	rs2339914	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=647;ReadPosRankSum=-0.263;SC=GGAAATTAAACGTACACTAGA;SOR=0.700;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=44;WE=179592248;WS=179592230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr3	179593072	rs55664665	T	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=0.535;SC=GACTTAACTCTTTGGCTATTT;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=179593080;WS=179593062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr3	179593352	rs2302743	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-1.722;SC=GAGGGTGGAGCGTGTGGTGCA;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=17;WE=179593360;WS=179593342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr3	179689173	rs3774255	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CCATCATTCTTACATACAAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=179689181;WS=179689163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	179689264	rs3774256	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=442;ReadPosRankSum=-1.561;SC=AATCTTGTTATGCAGGCTTTA;SOR=0.748;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=33;WE=179689272;WS=179689254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr3	179689365	rs3774257	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=665;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AGAAAATGTACGTAAGTATTC;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=45;WE=179689373;WS=179689355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr3	179691094	rs12054457	G	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1206;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TTGCTGACCAGAGAACCACAG;SOR=1.121;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=72;WE=179691102;WS=179691084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,84:0.47:179
chr3	180688997	rs11368900	C	CA	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=562;ReadPosRankSum=0.808;SC=AAAAAAATGTCTATGTCTGCT;SOR=1.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=14;WE=180689005;WS=180688987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr3	182546017	rs9814205	C	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=461;ReadPosRankSum=-0.953;SC=ATTACTCAATCTTAAGTTTGT;SOR=0.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=31;WE=182546025;WS=182546007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr3	182575631	rs661774	G	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr3	182576923	rs645597	T	A	89.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATTTTTTCTTTTCAAACAATT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=182576931;WS=182576913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	182590354	rs771156	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=364;ReadPosRankSum=-2.249;SC=AAAAATATTACTTTTCTCTCA;SOR=0.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=20;WE=182590362;WS=182590344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr3	182598863	rs796406	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=1.249;SC=ATTAAAGTACAGTATCAAATT;SOR=0.877;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=182598871;WS=182598853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	182623765	rs6768094	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=181;ReadPosRankSum=0.955;SC=TGCTTGGGGGGCATGTCATGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=182623773;WS=182623755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	182631792	rs11925959	C	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=475;ReadPosRankSum=0.522;SC=GGTGTGAAATCTCTCTAAGTA;SOR=0.663;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=29;WE=182631800;WS=182631782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	182735182	rs6786878	C	A	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=65;PP=1954;SC=TAGATATGTTCATCTGCTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=83;WE=182735190;WS=182735172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	182735211	rs2292056	T	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=540;ReadPosRankSum=-0.493;SC=ACCATTTTACTGTCTATATAT;SOR=0.346;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=28;WE=182735219;WS=182735201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr3	182755209	rs2270968	T	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=366;ReadPosRankSum=1.562;SC=AATGTTGGTGTGCAGTCCAAC;SOR=0.384;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=25;WE=182755217;WS=182755199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr3	182757084	rs2270967	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAGGTTCAGAGGGCTTTGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=18;WE=182757092;WS=182757074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	182790249	rs7622479	G	A	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=37;PP=1574;SC=TGTTTTCTGAGAGAAAACCGC;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=182790257;WS=182790239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	182804385	rs6806083	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=21;PP=1729;SC=TAAAGATCTTGGGAAAGGCTA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=182804393;WS=182804375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	182810144	rs3732604	T	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=16;PP=1395;SC=ACGAAAATACTGACACAGTAA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=182810152;WS=182810134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	182817328	rs937652	C	G	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=72;PP=2240;SC=TGACCCCCGCCGGCCACCGTC;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=118;WE=182817343;WS=182817318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	182853670	rs482912	T	C	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=62;PP=2430;SC=CCTTGGTAAATTGTCTCTGAA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=112;WE=182853678;WS=182853660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	182858287	rs522235	C	T	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=69;PP=2965;SC=ACAGAAACAGCGTCATGGCTG;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=161;WE=182858295;WS=182858277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr3	182858461	rs831256	A	G	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=50;PP=1424;SC=ACTTTGTTTAAGATTCCAGCT;SOR=4.332;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=182858469;WS=182858451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	182870082	rs682396	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=431;SC=CTGAAGTGTGGGGTTGCACCA;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=182870090;WS=182870072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	182870436	rs514636	G	A	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=219;SC=AACACCTCTCGTTTTCAAACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=182870444;WS=182870426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	182871962	rs653316	C	T	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=56;PP=2379;SC=TTTTTGTAGTCGCTGGGGTAG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=118;WE=182871970;WS=182871952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	182880480	rs3811729	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=615;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CGTGCGGCGAAGTCCGGGCAG;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=44;WE=182880488;WS=182880470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,52:0.35:148
chr3	182880629	rs602762	A	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	182880629	.	AG	CA,CG	179	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0,2;NR=10,18;PP=179,159;QD=23.2467874862;SC=CCTACGGAGCAGGGAGGGGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10,20;WE=182880638;WS=182880619;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:20
chr3	182880630	rs3811731	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.083;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	182913092	rs577136	T	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=351;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TAAGCTAATTTGAATTGATTT;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=20;WE=182913100;WS=182913082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr3	182925404	rs6804951	T	C	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=17;PP=1279;SC=ACCTTCATGGTCTTCTTGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=182925412;WS=182925394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	182946002	rs6803121	A	G	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=41;PP=2719;SC=TAGACCATTGATGTTTCCATT;SOR=1.414;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=121;WE=182946010;WS=182945992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	182947413	rs1122143	C	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=432;SC=CCACCCTTCTCTTACTCTCCA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=182947421;WS=182947403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	182987515	rs3811732	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TACGAAACACGAAGTTCTATG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=182987523;WS=182987505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	182990883	rs200947833	AAAG	A	298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=-1.334;SC=ACCTTTTAAAAAAGAAGGAAA;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=6;WE=182990893;WS=182990873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr3	183007136	.	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TGAGCTGCTGCGTTGATTTCC;SOR=1.371;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=183007144;WS=183007126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	183027542	rs7639705	T	G	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=992;ReadPosRankSum=0.760;SC=TCCTTAAGAATCTGCTCCACG;SOR=0.574;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=62;WE=183027550;WS=183027532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr3	183028303	rs57067370	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	183028331	rs56662557	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=0.637;SC=CATGCCTGTAATTCCAGCTAC;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=183028339;WS=183028321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	183028450	rs60284418	CA	C	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.230;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GACCCTGTTTCAAAAAAAAAA;SOR=0.549;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=16;WE=183028458;WS=183028440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr3	183028600	rs1105132	A	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=241;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AGAAAGCTGGATTAGGGAAAA;SOR=0.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=16;WE=183028608;WS=183028590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr3	183029331	rs3732595	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=394;ReadPosRankSum=0.894;SC=TCCTTGGCCCCACCAAGACCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=18;WE=183029339;WS=183029321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr3	183211906	rs1520101	A	G	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AGGTCTCCACATTGTTGATTC;SOR=1.026;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=83;WE=183211914;WS=183211896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr3	183212026	rs2256061	C	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=817;ReadPosRankSum=-0.648;SC=ACTTGTTGATCGAAGAATTAT;SOR=1.092;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=49;WE=183212034;WS=183212016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr3	183439972	rs3841649	A	AG	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=412;ReadPosRankSum=-0.940;SC=GAAGGGAACTATATTTACTAA;SOR=2.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=183439980;WS=183439962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	183476685	rs262993	G	A	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=857;ReadPosRankSum=0.669;SC=GGCTTCTCAGGTCTCCCAAGG;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=67;WE=183476693;WS=183476675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,78:0.40:194
chr3	183480108	rs3830564	ATGT	A	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=1.441;SC=CATGTAAATGATGTTGTTTGC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=183480118;WS=183480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr3	183491340	rs262961	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AAAATAAGAATTTATTGCCTT;SOR=0.465;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=11;WE=183491348;WS=183491330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	183491720	rs262960	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TAGCATTTGCTCAGATGGATT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=183491728;WS=183491710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	183493743	rs146705467	CGGA	C	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.281;NF=2;NR=3;PP=162;ReadPosRankSum=0.871;SC=GGAGTGGTGCCGGAGGAGGAG;SOR=0.818;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=5;WE=183493753;WS=183493733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	183493991	rs2606220	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TTACCTTTACGGCTCTGGGAT;SOR=0.045;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=14;WE=183493999;WS=183493981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	183510782	rs263022	T	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=294;ReadPosRankSum=0.440;SC=AACTTGAAAGTTCAGTTTTGT;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=183510790;WS=183510772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr3	183521133	rs263042	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=314;ReadPosRankSum=-0.612;SC=GGTAACCCACATCTGCCTGTC;SOR=0.683;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=27;WE=183521141;WS=183521123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr3	183524193	rs263034	T	C	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=871;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CCTGATTAGGTTTTGTATAAA;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=62;WE=183524201;WS=183524183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,80:0.54:148
chr3	183524349	rs263033	C	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-0.551;SC=AAAATCAGGTCAGTCCTTAAT;SOR=0.963;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=183524357;WS=183524339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr3	183524379	rs263032	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=-2.319;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	183524948	rs263031	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=0.042;SC=GACGTTCAGCTTCACAGACCC;SOR=0.191;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=13;WE=183524956;WS=183524938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr3	183528442	rs263024	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.913;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=-1.644;SC=CCCTGCTGCTCGGGAAGGAGG;SOR=0.211;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=25;WE=183528450;WS=183528432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr3	183535094	rs2582091	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=0.440;SC=GTCCTGAGGCCGCTCCCCAGC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=183535102;WS=183535084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	183535763	rs897604	A	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=6.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=941;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CACCCCTGCTACACCAGCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=74;TCR=12;TR=43;WE=183535771;WS=183535753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr3	183536063	rs894000	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-1.681;SC=GCAAGGCAAGTGCACTCCCGT;SOR=0.242;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=12;WE=183536071;WS=183536053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr3	183543291	rs263006	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.826;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.184;SC=GCTGGTTCCAGCGCCGCGCCA;SOR=0.349;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=13;WE=183543299;WS=183543281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr3	183585883	rs953419	A	G	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=946;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GAAACACAGTAGCGTCTTGCA;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=24;TCR=77;TR=55;WE=183585891;WS=183585873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr3	183604723	rs1829515	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=1.973;SC=TAGCGGTAGCATGTCAAGGAA;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=39;WE=183604731;WS=183604713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr3	183660585	rs3749442	G	A	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1254;ReadPosRankSum=1.847;SC=TCTTTAGGACGAGAGGGAGGT;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=58;TCR=110;TR=83;WE=183660593;WS=183660575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,101:0.49:208
chr3	183663833	rs2292998	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=560;ReadPosRankSum=-0.669;SC=ACTGAGCACATGCAGCAGCTG;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=37;WE=183663841;WS=183663823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr3	183679532	rs6443924	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=526;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TCTACAGGAGACGAGTTAAGC;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=29;WE=183679540;WS=183679522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr3	183682897	rs1879257	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	183683124	rs28365027	G	A	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1308;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CATCTCACGCGGCCAAGATGG;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=81;WE=183683132;WS=183683114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,87:0.46:189
chr3	183685534	rs939336	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=938;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CCACACTGCCACAGATTCCAA;SOR=0.734;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=63;WE=183685542;WS=183685524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,69:0.41:168
chr3	183696402	rs1132776	A	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=458;ReadPosRankSum=1.195;SC=GGAAGTACCCAGCTTTTTCCA;SOR=0.417;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=36;WE=183696410;WS=183696392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr3	183706630	rs6443926	A	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=-2.788;SC=GTCTCCCCAGATGATCTAATC;SOR=0.177;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=10;WE=183706638;WS=183706620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr3	183753777	rs36092077	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=321;ReadPosRankSum=-1.823;SC=CACCATGCCCGGCCTTGGCAC;SOR=2.243;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=17;WE=183753785;WS=183753767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr3	183755822	rs1000952	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=548;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GCCATCAGGCGCAGGTGCAGG;SOR=1.621;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=33;WE=183755830;WS=183755812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr3	183756426	rs6799766	T	C	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-6.193;NF=17;NR=14;PP=438;ReadPosRankSum=-1.764;SC=AGGGAAGTCATACTTCCTCTT;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=31;WE=183756434;WS=183756416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr3	183756702	rs6789754	G	A	4158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.867;NF=92;NR=62;PP=2246;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CTGCTCTTCCGCCTCTACCTG;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=294;TCF=174;TCR=120;TR=154;WE=183756710;WS=183756692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,199:0.56:357
chr3	183756780	rs6765152	A	C	4446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.085;NF=61;NR=92;PP=2427;ReadPosRankSum=0.549;SC=GCTCACCTGCAAACTTCAGTC;SOR=0.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=303;TCF=118;TCR=185;TR=153;WE=183756788;WS=183756770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,200:0.55:365
chr3	183756808	rs6789882	G	A	4906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,129:0.54:239
chr3	183756813	rs6789682	C	T	4752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,121:0.54:225
chr3	183756836	rs11274156	A	AT	3366.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=21.58;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr3	183756837	.	G	T	2380	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=59.91;NF=4;NR=28;PP=2380;QD=75.4616003921;SC=CAGGCTCTCAGTCAGCCTTGT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=115;TCF=22;TCR=93;TR=32;WE=183756845;WS=183756826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:83,32:0.28:115
chr3	183756837	rs66883074	G	GTCAGTCCAAATT	3324.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,70:0.48:146
chr3	183818416	rs7627615	G	A	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1142;ReadPosRankSum=0.858;SC=CATCTCCTTCGCGATGTCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=74;WE=183818424;WS=183818406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr3	183819155	rs7432211	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=556;ReadPosRankSum=0.077;SC=GAGCTTTTGTTCTGGATCACA;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=33;WE=183819163;WS=183819145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr3	183823576	rs4912524	T	C	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=12;PP=1276;SC=GCAGGCCCAGTCTCTATGTCA;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=183823584;WS=183823566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	183823863	rs150341032	G	GAAGA	1354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.157;NF=3;NR=23;PP=1287;ReadPosRankSum=0.574;SC=GATTGGAAGAGAAGAAATTCT;SOR=0.256;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=26;WE=183823871;WS=183823853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr3	183856549	rs6787322	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=225;ReadPosRankSum=-1.225;SC=TCAGCCTCCCAGGTTCAAGGG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=14;WE=183856557;WS=183856543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr3	183861750	rs843357	A	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.114;SC=ACAACTCCCAAGTCCCTCTGA;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=183861758;WS=183861740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr3	183899832	rs8478	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=870;ReadPosRankSum=0.114;SC=CTCAGAAGATCGAGGTGAGGA;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=51;WE=183899840;WS=183899822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr3	183900729	rs843365	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=607;ReadPosRankSum=-0.523;SC=TCCGATAAACTGCTGCACCTT;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=55;WE=183900737;WS=183900719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr3	183900836	rs843364	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=240;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TACTATTTGTGATGAGGCAAA;SOR=0.436;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=16;WE=183900844;WS=183900826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr3	183901281	rs2231224	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=330;ReadPosRankSum=-1.379;SC=TGCCATTCGCGCCCTCTGGCC;SOR=0.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=26;WE=183901289;WS=183901271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr3	183903937	rs60293594	G	GC	1592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.463;QD=15.62;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr3	183904226	rs56351888	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr3	183904232	rs1709624	T	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr3	183904520	rs55940723	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=1028;ReadPosRankSum=2.115;SC=GGGAGGAAGATCTGATGGCCA;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=66;WE=183904528;WS=183904510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr3	183906515	rs843345	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=373;ReadPosRankSum=0.851;SC=AGACTGCCCCTGCTTAGGCCA;SOR=1.142;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=27;WE=183906523;WS=183906505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr3	183907032	rs843344	G	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=565;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GCCATGTATTGTTTTTCATAG;SOR=0.867;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=36;WE=183907040;WS=183907022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr3	183908761	rs7614381	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=375;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AGTAATAAATCTAGTCTACCT;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=21;WE=183908769;WS=183908751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr3	183909143	rs28673709	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.026;SC=GACGAGGTCTGTGGAACAGGA;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=183909151;WS=183909133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	183948663	rs1687225	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=164;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CCGCGCTCTGGGCCCGGGGCT;SOR=0.343;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=11;WE=183948671;WS=183948653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	183951135	rs729377	C	T	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1231;ReadPosRankSum=1.539;SC=CCCCGCTGGCCCCGCCAGGCC;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=159;TCF=99;TCR=60;TR=84;WE=183951143;WS=183951125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,98:0.54:180
chr3	183951431	rs902417	C	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GCTGGCTGCCCCTCGGGACGT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=22;WE=183951439;WS=183951421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr3	183952773	rs9853525	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CTGATATAAACAGAAGACAGC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=183952781;WS=183952763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	183953972	rs1709657	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=314;ReadPosRankSum=2.049;SC=AGTCCCTCCCGCCCCAGACGC;SOR=1.068;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=19;WE=183953980;WS=183953962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr3	183954168	rs188099951	T	C	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=811;ReadPosRankSum=0.372;SC=ATTGAGACCCTGCAGGTTCCG;SOR=0.647;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=62;WE=183954176;WS=183954158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr3	183955109	rs843334	C	T	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=53;PP=1335;ReadPosRankSum=-1.212;SC=TGCTGACCCCCCGGGAGATCC;SOR=0.934;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=84;WE=183955117;WS=183955099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,102:0.46:223
chr3	183957095	rs843333	A	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	183957467	rs843332	G	T	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1192;ReadPosRankSum=1.410;SC=CTGCTGTCTTGCCTCCCCAGG;SOR=0.696;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=71;WE=183957475;WS=183957457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr3	183959508	rs28606531	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=0.352;SC=CTGAGGGGCCAGGCCAGGTGG;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=18;WE=183959516;WS=183959498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr3	183959961	rs2668195	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=135;ReadPosRankSum=1.898;SC=CTCCCTCCCTAGAGCCCTCTT;SOR=0.174;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=9;WE=183959969;WS=183959951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	183960252	rs706584	A	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=1.832;SC=GAGTCCAACCAACCCCAGGTC;SOR=1.828;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=16;WE=183960260;WS=183960242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	183975365	rs7633387	C	T	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=90;PP=2867;SC=GCAGGCTCGCCATGCCCATGT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=56;TCR=90;TR=146;WE=183975373;WS=183975355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	183976103	rs11546878	C	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=1246;ReadPosRankSum=1.057;SC=CCCTGGAGGCCGGTTTATCTC;SOR=0.660;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=32;WE=183976116;WS=183976093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr3	183976108	rs902415	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GAGGCCGGTTTATCTCAATGA;SOR=0.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=34;WE=183976116;WS=183976093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr3	183976241	rs6767237	A	G	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=865;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CAAGGGCGGGAAGCTCAGTGT;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=55;WE=183976256;WS=183976231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr3	183978846	rs843352	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=319;ReadPosRankSum=-0.188;SC=ACGGCAGCCGGGGGGCGCCCG;SOR=2.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=17;WE=183978854;WS=183978836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr3	183994536	rs843371	A	G	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=37;PP=1226;SC=AACAGACTCAAGGCTCAACTC;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=183994544;WS=183994526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	183995341	rs1001817	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=-0.603;SC=AGGCAGTGTCCATGAATGAGG;SOR=1.255;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=19;WE=183995349;WS=183995331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr3	183995854	rs2272471	G	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=444;ReadPosRankSum=0.888;SC=CCACTGAGCCGGTTGAGGGCA;SOR=0.486;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=31;WE=183995862;WS=183995844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr3	183996068	rs3752904	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=703;ReadPosRankSum=-0.495;SC=ACATCAGTGCCGACTCTAAGA;SOR=0.654;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=47;WE=183996076;WS=183996058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr3	183996213	rs843372	C	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=569;SC=CCCCTACCCCCGCTCGGGAAT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=183996221;WS=183996203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	183996484	rs140658066	CTTTCTTCT	C	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.927;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr3	183996511	rs1387976	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.884;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.045;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	184003194	rs1687230	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=1.601;SC=CTTGCATGTTCCTGGGGGCTG;SOR=0.465;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=184003202;WS=184003184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	184010048	rs3914188	G	C	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=75;PP=2476;SC=GGGAGAAATGGCCAGCTGTCA;SOR=1.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=29;TCR=75;TR=104;WE=184010056;WS=184010038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	184020100	rs71185698	C	CA	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=333;SC=TAAGTGAATTCATGGGGAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=184020108;WS=184020094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	184020542	rs11545169	G	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=432;ReadPosRankSum=0.153;SC=ATGTCGAGGAGTATGAGGACC;SOR=0.498;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=29;WE=184020550;WS=184020532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr3	184033408	rs73187631	A	T	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=878;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GTTGGTGGGGACAGGCTGTAT;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=49;WE=184033416;WS=184033398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr3	184037533	rs13319149	A	G	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=49;PP=2318;SC=CGTGGCCCCCACCCCAGTTTT;SOR=0.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=119;WE=184037541;WS=184037523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	184038969	rs4912537	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=1.014;SC=GAAGATGATGCGGGGTTATTA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=14;WE=184038977;WS=184038959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr3	184039666	rs2178403	A	G	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=68;PP=2082;SC=GACAGCATCAATGGCGCCCCC;SOR=1.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=92;WE=184039674;WS=184039656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	184044433	rs2293605	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=0.193;SC=GAGGCAGTGTCAGGAGCTGGG;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=18;WE=184044441;WS=184044423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	184045799	rs939317	A	G	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=68;PP=2163;SC=GGGTATGACCAGCTTCTCTGG;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=102;WE=184045807;WS=184045789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	184046355	rs1879244	C	T	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=15;PP=1126;SC=AGCCATGCCACGTTGCCCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=184046363;WS=184046345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	184046470	rs2230571	C	T	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=737;ReadPosRankSum=0.783;SC=ACATCCCCCACGTGTGGCTCT;SOR=1.040;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=47;WE=184046478;WS=184046460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr3	184056101	rs1881973	G	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=395;ReadPosRankSum=1.444;SC=GAAATGATACGGCAATACTGG;SOR=0.232;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=29;WE=184056109;WS=184056091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr3	184056275	rs115148262	G	T	3137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1891;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GCTGGAGCAGGTCCTCCCGCC;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=88;TCR=94;TR=105;WE=184056283;WS=184056265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,137:0.57:242
chr3	184062776	rs9839000	A	G	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=516;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CATGCCTGGCAGTGGCATGCA;SOR=0.493;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=40;WE=184062784;WS=184062766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr3	184070675	rs3749223	A	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=42;PP=1457;SC=AGGAAGACACAGGGAGAGGTA;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=78;WE=184070683;WS=184070665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	184071017	rs41266265	G	A	4112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,107:0.48:224
chr3	184071017	.	GTT	ATC	2943	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=43;NR=50;PP=2943;QD=20;SC=TTTAGGAAGCGTTTGTGGCTT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=185;TCF=87;TCR=98;TR=93;WE=184071027;WS=184071007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:92,93:0.50:185
chr3	184071019	rs11920716	T	C	4112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,107:0.48:223
chr3	184071063	rs9820367	G	C	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=89;PP=2952;SC=AGCCTCAGGGGTAGGGGGACC;SOR=1.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=62;TCR=89;TR=151;WE=184071071;WS=184071053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	184072459	rs73189624	G	A	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=937;ReadPosRankSum=1.562;SC=TCAGGGAGGGGGGTGGGAAGA;SOR=1.010;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=50;WE=184072467;WS=184072449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,66:0.63:104
chr3	184075958	rs41266271	C	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=906;ReadPosRankSum=-2.606;SC=CTCCCCTTCTCTTCTAACATA;SOR=0.548;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=54;WE=184075966;WS=184075948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr3	184090266	rs6141	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=310;ReadPosRankSum=0.511;SC=GAGCTGTACACGAGACAATGC;SOR=0.474;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=24;WE=184090274;WS=184090256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr3	184091149	rs6142	G	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=519;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GGTCTTCTAGGGGGACTGAGT;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=33;WE=184091157;WS=184091139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr3	184094183	rs956732	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=-2.583;SC=CCAAGGGTGAAGAATCTATCC;SOR=0.155;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=184094191;WS=184094173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	184098193	rs1920128	A	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.750;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr3	184098647	rs885650	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=646;ReadPosRankSum=0.070;SC=GCGCGGGCGTCGGAGTGGACT;SOR=0.562;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=34;WE=184098655;WS=184098637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr3	184099378	rs35929225	C	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1587;ReadPosRankSum=-2.337;SC=GGGAGCCAGGCGCTGAGGAGC;SOR=0.805;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=162;TCF=78;TCR=84;TR=96;WE=184099386;WS=184099368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,112:0.60:188
chr3	184100961	rs3833587	G	GT	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.956;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.268;NF=1;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GGTGAGGCGGGGGGGGGGCCT;SOR=2.424;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=184100969;WS=184100951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	184106025	.	GTCCA	G	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=57.3;NF=1;NR=2;PP=45;QD=16.6666666667;SC=CCATCCATCCGTCCATCCATC;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=3;WE=184106036;WS=184106015;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr3	184106217	rs1881972	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.693;NF=13;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CCATCCATCCATCCGTCCCTT;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=184106225;WS=184106207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	184293564	rs7640497	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=214;ReadPosRankSum=1.204;SC=CTGCGGAGGTCTGGTGTCTGC;SOR=0.264;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=13;WE=184293572;WS=184293554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	184293769	rs7652597	T	C	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.480;SC=ACAGTGCCTGTACCAGTGAGT;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=65;WE=184293777;WS=184293759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,82:0.57:144
chr3	184295008	rs7644069	C	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=573;ReadPosRankSum=0.302;SC=GCCTGGGTCACTTTCTCCTGG;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=37;WE=184295016;WS=184294998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr3	184295316	rs7644377	C	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1077;ReadPosRankSum=0.425;SC=AAATTACCCCCGGATCATGAT;SOR=0.917;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=147;TCF=51;TCR=96;TR=70;WE=184295324;WS=184295306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,72:0.45:161
chr3	184295828	rs4072650	C	A	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=647;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CCATGGGCCGCCTCGAACTGC;SOR=0.499;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=48;WE=184295836;WS=184295818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr3	184295921	rs4072651	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.399;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	184295921	.	CCA	TCG	676	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=5;NR=13;PP=676;QD=40.5259930479;SC=CCTCCTGGGGCCAGCCGTTGC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=18;WE=184295931;WS=184295911;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	184295923	rs4072652	A	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	184299068	rs9881589	G	A	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1663;ReadPosRankSum=1.435;SC=TGGACCGCACGGTCCCAGATT;SOR=0.603;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=207;TCF=94;TCR=113;TR=96;WE=184299079;WS=184299058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,110:0.46:237
chr3	184299167	rs1138510	T	C	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1658;ReadPosRankSum=0.424;SC=GGTTTGCATCTTTTGACCTGG;SOR=0.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=89;TCR=93;TR=98;WE=184299175;WS=184299157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,110:0.53:206
chr3	184299414	rs2230596	C	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=589;ReadPosRankSum=0.075;SC=GGTCTGACACCGGCTCCCACG;SOR=0.813;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=20;TCR=61;TR=35;WE=184299422;WS=184299404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr3	184402122	rs9290796	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-0.243;SC=ACCTGACTCTGGTGGCTCCTG;SOR=0.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=184402130;WS=184402112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	184428903	rs9872799	T	G	5642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=98;PP=2965;SC=GAATTCATATTCTGGTGGATT;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=67;TCR=98;TR=165;WE=184428911;WS=184428893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr3	184429133	rs10656187	A	ATCC	4307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.297;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.207;NF=24;NR=39;PP=2989;ReadPosRankSum=1.364;SC=CTCCTCCCAGATCCTCCTCCT;SOR=0.466;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=63;WE=184429141;WS=184429123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr3	184429414	rs10937187	C	A	5807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=116;PP=2965;SC=CTTGCCAAGGCTTTGGCCGCC;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=75;TCR=116;TR=191;WE=184429422;WS=184429404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	184550501	rs9830734	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=340;ReadPosRankSum=-0.041;SC=TGAGTCTTTTATTCTTGAGGA;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=21;WE=184550509;WS=184550491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr3	184560969	rs16859344	T	C	262.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.8374;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CTTCGAACTTTTGAACTGATT;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=11;WE=184560977;WS=184560959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr3	184561140	rs11384502	G	GA	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=0.555;SC=AATGCTTATTGAAAAAAACCC;SOR=0.301;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=184561148;WS=184561130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	184567039	rs2305240	C	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=594;ReadPosRankSum=0.606;SC=GATGAATTTACAAAAACTTAC;SOR=0.929;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=32;WE=184567047;WS=184567029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr3	184573555	rs6443999	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TACAAAATTACGTGAATCCCA;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=27;WE=184573563;WS=184573545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,29:0.28:105
chr3	184577917	rs7340698	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TCTATGATATATTAAAGCTAC;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=184577925;WS=184577907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	184580917	rs3733165	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GTATTTTGTTATAGTTGTTTT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=184580925;WS=184580907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	184588420	rs2305239	A	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.276;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=431;ReadPosRankSum=0.655;SC=AATTCTAATTATGTATTATTT;SOR=1.402;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=22;WE=184588428;WS=184588410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr3	184603954	rs149565833	C	T	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=644;ReadPosRankSum=2.099;SC=AGTGAGTATGCGTTGCCTGTC;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=44;WE=184603962;WS=184603944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr3	184616504	rs9845800	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=0.410;SC=TTCTCCTATTCTCCATTTGCT;SOR=0.116;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=184616512;WS=184616494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	184631103	rs9821657	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=1.248;SC=TCTATCTTAGGGTAGCTTATA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=184631111;WS=184631093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	184633247	rs4686879	A	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=1.092;SC=GAGAATTTCTAAATGTATTGG;SOR=0.982;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=20;WE=184633255;WS=184633237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr3	184647413	rs4643688	T	C	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=41;PP=1275;SC=ACCAATATGATAAAATTATTG;SOR=1.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=59;WE=184647421;WS=184647403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	184654166	rs6444004	A	G	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=41;PP=1335;SC=ATCTAGTGGAAAGACAATTAT;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=184654174;WS=184654156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	184675095	rs3732934	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=1.311;SC=TTACTGGTAGCTTTTAATTAT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=10;WE=184675103;WS=184675085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr3	184675147	rs3832240	CTTTTA	C	1042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.348;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.354;NF=18;NR=5;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.536;SC=TTCTCTTTATCTTTTATGTTT;SOR=1.426;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=23;WE=184675159;WS=184675137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr3	184675359	rs4501092	T	C	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=44;PP=1448;SC=CTTAACATTCTCCATTTGACA;SOR=2.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=184675367;WS=184675349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	184682214	rs6799328	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=3.522;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.175;SC=ACTCCACAAATAAGATTGGTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=184682222;WS=184682204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	184684313	rs4470487	G	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=427;SC=AAACAGAAGAGTTTACTTCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=184684321;WS=184684303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	184689600	rs137973639	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=-1.117;NF=18;NR=56;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TGGTGGCCCACGTCTGTAATC;SOR=0.994;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=170;TCF=50;TCR=120;TR=74;WE=184689608;WS=184689590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr3	184700356	rs4572747	A	C	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=26;PP=1516;SC=CATTATAGGCACTTTGGTTTC;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=184700364;WS=184700346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	184700426	rs11555405	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=773;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TCCTCATCTACACTCTGAAGG;SOR=0.998;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=52;WE=184700434;WS=184700416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr3	184714014	rs9860814	C	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=630;SC=TCAATTTTAGCTGTTGGTAGT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=184714022;WS=184714004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	184717703	rs2291737	T	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=592;SC=CCAATGTCATTTGGGCCTGGT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=184717711;WS=184717693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	184766148	rs3821748	A	G	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=785;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AGCTGGTAGCATGGATTGTTT;SOR=0.824;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=57;WE=184766156;WS=184766138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr3	184766186	rs3821749	A	C	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=25;PP=1378;ReadPosRankSum=0.688;SC=GCACCATGTTATGCTTCAGCA;SOR=0.654;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=77;WE=184766194;WS=184766176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,81:0.54:149
chr3	184766249	rs6779564	TC	CT	4439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=2944;ReadPosRankSum=0.183;SC=GTTAATCGTATCGGTTTTTAT;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=94;WE=184766258;WS=184766239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,115:0.50:228
chr3	184766392	rs3821751	G	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=857;ReadPosRankSum=-0.992;SC=CCTATTTATAGTTTACTGCTT;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=52;WE=184766400;WS=184766382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr3	184769856	.	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=0.305;SC=AGATGATCCCGAGGCAGCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=9;WE=184769864;WS=184769846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	184769911	rs2271257	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CCACCTCCCACGCTTCTGAGA;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=184769919;WS=184769901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	184801494	rs9845482	G	A	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=292;SC=ATTCAACATTGGTATAGTCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=184801502;WS=184801484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	184935807	rs35531967	A	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.809;NF=10;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=1.184;SC=CCCACCTCGGACTCCCAGAGT;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=13;WE=184935815;WS=184935797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	185046909	rs34308085	AT	A	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=332;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CAGTAGTTTTATTTTTTTTTA;SOR=1.508;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=23;WE=185046917;WS=185046899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr3	185046975	rs9863304	T	C	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=39;PP=1532;SC=ACAGGTCCCGTGTGCACGAAA;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=185046983;WS=185046965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	185146702	rs3732577	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AGAGCACAAGCGGAACTGAAG;SOR=0.536;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=73;WE=185146710;WS=185146692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
chr3	185155482	.	A	C	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=72;QD=26.6928031368;SC=ATATACACACAAGTTTCTGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=185155490;WS=185155472;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	185212593	rs6798873	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.480;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=519;ReadPosRankSum=-0.038;SC=AGAAAGGGTCTCCAGGTGTTG;SOR=0.975;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=37;WE=185212601;WS=185212583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,49:0.43:114
chr3	185229464	rs61730237	T	C	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=1024;ReadPosRankSum=1.859;SC=CTTGGTGATATTTCTGAAATG;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=64;WE=185229472;WS=185229454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,74:0.56:133
chr3	185232169	rs1837882	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=463;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GGGAAATAGCGCACTGCAAAC;SOR=0.620;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=36;WE=185232177;WS=185232159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr3	185270121	rs74286273	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.520;SC=TTAAGTTCACCGAAGGAAGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=185270129;WS=185270111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	185270397	rs79952553	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=-1.092;SC=AGTTCCCTAGGGACTGACTGC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=18;WE=185270405;WS=185270387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr3	185300589	rs17289918	T	C	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=64;PP=1432;ReadPosRankSum=0.981;SC=AGGCACCAACTGGCAGACAAG;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=85;TCR=119;TR=111;WE=185300597;WS=185300579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,137:0.55:247
chr3	185304018	rs17523471	T	C	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1415;ReadPosRankSum=0.541;SC=ACGTCAGGAGTGGTGGCGGGC;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=116;TCR=80;TR=97;WE=185304026;WS=185304008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,114:0.51:225
chr3	185307879	rs11924016	A	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	185316123	rs74466592	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=226;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ATTGAGAGAGGCTCTTTCCAA;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=185316131;WS=185316113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	185318804	rs13100034	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.289;SC=TGAACTTAGGGGTGTGTTATA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=185318812;WS=185318794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	185330304	rs62877061	TTGA	T	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=602;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GAGGAATGTCTTGATGTTGTG;SOR=0.307;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=14;WE=185330314;WS=185330294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr3	185331165	rs6762208	C	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=476;ReadPosRankSum=1.368;SC=GATACAGAGACGATGGTCGGA;SOR=0.540;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=35;WE=185331173;WS=185331155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr3	185335156	rs34765114	T	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=859;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TATATTTTTCTCAAGAGTCAG;SOR=1.421;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=185335170;WS=185335146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
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chr3	185341970	rs1823238	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=505;ReadPosRankSum=0.757;SC=CTCCCTGCATGCTTTTAAAGT;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=30;WE=185341978;WS=185341960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr3	185341987	rs5855069	CT	C	477.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=275;ReadPosRankSum=0.286;SC=AAGTACACATCTTTTTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=20;WE=185341995;WS=185341977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr3	185347459	rs6774871	A	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=750;ReadPosRankSum=-0.229;SC=AAATGTCAACACTTAGAAAAA;SOR=0.253;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=49;WE=185347467;WS=185347449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
chr3	185643454	rs2551372	A	G	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=32;PP=964;SC=ACTGAAAACAAATATTGTCTT;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=185643462;WS=185643444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	185655454	rs1862904	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=407;SC=CTATCCACAAAGGCTTTTTTT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=185655462;WS=185655445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	185766711	rs79060173	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=0.363;SC=CAGGGGAAGAGAACGAGGTAT;SOR=0.246;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=18;WE=185766719;WS=185766701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr3	185879296	rs13073156	T	C	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1152;SC=ACAGTCCCTGTGACTCTGAGA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=185879304;WS=185879286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	185882643	rs4686741	C	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=18;PP=1084;SC=AATGTGTACGCAGGCGGGGAG;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=185882651;WS=185882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	185960192	rs6799929	A	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=4;PP=173;SC=CCAAGTCCCCAGCGGCCCTGG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=185960200;WS=185960182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	185960414	rs12489063	G	A	5495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=79;PP=2944;SC=AGTGCAGTGCGGAGGGAAGGG;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=145;WE=185960422;WS=185960404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	185982955	rs3815620	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=191;ReadPosRankSum=-1.103;SC=ATGCTTTTCTGTAGAACCCAA;SOR=0.299;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=15;WE=185982963;WS=185982945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr3	185983273	rs11354963	CT	C	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=0.293;SC=ACCCCTATGACTTTTTCTAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=185983281;WS=185983263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	185990096	rs2193587	C	T	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=71;PP=2857;SC=AGGAATGTTTCTGGACACACA;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=135;WE=185990104;WS=185990086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	186006566	rs710443	T	C	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=892;ReadPosRankSum=-1.205;SC=CCTTCAGGTATACCACTGGGG;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=57;WE=186006574;WS=186006556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,74:0.53:139
chr3	186006618	rs1004588	G	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=731;ReadPosRankSum=-0.584;SC=TTCCAGGGGGGTCGCAGCCAC;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=49;WE=186006626;WS=186006608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr3	186287777	rs2889755	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=0.851;SC=ATACGCCCGATGATTTACCGA;SOR=0.138;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=10;WE=186287785;WS=186287767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr3	186287980	rs12330397	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.469;SC=CTTATGGAGTTGCTTGGAGAA;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=27;WE=186287988;WS=186287970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr3	186288565	rs3806714	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=567;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTGCGGACCAAGGAGACCCCC;SOR=0.872;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=24;WE=186288573;WS=186288555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr3	186288810	rs3733160	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.310;NF=16;NR=31;PP=689;ReadPosRankSum=3.106;SC=TTGCTGGGGGGTGGGAGGGGG;SOR=1.140;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=47;WE=186288818;WS=186288800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr3	186290143	rs374076917	TA	T	368.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr3	186290145	rs368298566	TTTA	T	367.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr3	186290155	rs2010555	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.49;ReadPosRankSum=-2.262;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	186293588	rs2280391	A	G	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=730;ReadPosRankSum=-0.559;SC=ACTGGATATTACCAACTCATG;SOR=0.414;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=43;WE=186293596;WS=186293578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr3	186295417	rs60278421	AT	A	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=0.224;SC=TAGAGTCTTGATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=186295425;WS=186295407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr3	186299107	rs11921733	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=245;ReadPosRankSum=-0.567;SC=ATTGAGGAAAGGAAAGGCTGT;SOR=0.352;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=17;WE=186299115;WS=186299097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr3	186299905	rs6784026	T	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=672;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TGTGATAACTTTTTGCTCTCT;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=47;WE=186299913;WS=186299895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
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chr3	186301703	rs8147	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=895;ReadPosRankSum=1.335;SC=AAATGTGACAATCTCATTAGT;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=58;WE=186301711;WS=186301693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr3	186301840	rs13326516	T	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=898;ReadPosRankSum=0.520;SC=TATCAGCTGTTTCAGTCATTG;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=62;WE=186301848;WS=186301830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr3	186302391	.	A	AGTGTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	1914.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.59;QD=35.46;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,20,34:0.37,0.63:54
chr3	186302424	rs112885079	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=-2.066;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr3	186333328	rs111917542	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=265;ReadPosRankSum=0.944;SC=AGAGCTAGACGGAGTTGCAGA;SOR=0.132;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=15;WE=186333336;WS=186333319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr3	186337713	rs4917	T	C	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=794;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GTGACCTGCATGGTGTTCCAA;SOR=0.882;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=60;WE=186337721;WS=186337703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr3	186337827	rs2518136	T	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=571;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TTTGCTCTCCTGTGCTTCTGA;SOR=0.137;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=44;WE=186337835;WS=186337817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr3	186338382	rs4918	G	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CAGCCCGTGAGCTCACAGCCC;SOR=0.551;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=15;WE=186338390;WS=186338372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr3	186338425	rs1071592	A	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=641;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CAGTCCCCACACCCGTGGTGG;SOR=0.646;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=36;WE=186338433;WS=186338415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr3	186370333	rs1131364	G	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=0.142;SC=AGAAGCTGGTGGTCCTGCCTT;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=20;WE=186370341;WS=186370323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr3	186386664	rs5855108	T	TA	414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=17;NR=0;PP=382;SC=CTTTAATACATAAAAAAAAAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=186386672;WS=186386654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	186390627	rs9898	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=648;ReadPosRankSum=1.072;SC=GCGGAACTGCCCCAGACACCA;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=45;WE=186390635;WS=186390617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr3	186393097	rs7428891	T	A	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.967;NF=1;NR=7;PP=287;ReadPosRankSum=2.515;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=186393105;WS=186393087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	186395113	rs2228243	A	G	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1234;ReadPosRankSum=-1.528;SC=GCCCAAAGACATTCTCATAAT;SOR=0.705;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=81;WE=186395121;WS=186395103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,95:0.55:173
chr3	186395180	rs7629680	T	C	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=79;PP=2362;SC=AGCATCCCCATGGACACCATC;SOR=0.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=138;WE=186395188;WS=186395170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr3	186395572	rs1042464	A	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1108;ReadPosRankSum=-1.286;SC=AAGCCAGACAATCAGCCCTTT;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=68;WE=186395580;WS=186395562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,83:0.52:161
chr3	186435370	rs1050274	G	A	4410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=64;PP=2583;SC=GCTCCAGGCTGCTACTAAGTT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=186435378;WS=186435360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr3	186438037	rs2304452	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1425;SC=GGCCTTCTGTTTTCTCCGTTG;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=186438045;WS=186438027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	186445052	rs2304456	T	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=864;ReadPosRankSum=-1.166;SC=ACTTTCGAATTACCTACTCAA;SOR=0.571;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=54;WE=186445060;WS=186445036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr3	186445186	rs3841557	G	GA	2544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=41;PP=2093;SC=TTTACATTTTGTGGTAACTAT;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=44;WE=186445194;WS=186445176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	186445237	rs5030025	A	C	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=573;SC=TTTAGATGACATTCAGCAATT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=186445245;WS=186445227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	186449582	rs1648698	G	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=790;SC=GTACCCCTTCGCTGCCCAGTT;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=186449590;WS=186449572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	186461349	rs5030095	G	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTCTGAGTTTGTCTTTCATTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=186461357;WS=186461340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	186504148	rs266718	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-0.998;SC=ATGTGTTTTGTTGTCGTTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=7;WE=186504156;WS=186504138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	186505706	rs12630327	A	C	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=836;ReadPosRankSum=0.308;SC=ATTGAAAAAAATTCATACGTT;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=45;WE=186505714;WS=186505696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr3	186506987	.	C	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.969;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CAAGAGGATTCTTCGTGACAT;SOR=0.278;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=19;WE=186506995;WS=186506977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
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chr3	186508247	rs2234751	T	TA	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.584;NF=1;NR=18;PP=744;ReadPosRankSum=-0.808;SC=AGACTAGACATACACTCTGCC;SOR=1.329;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=19;WE=186508255;WS=186508237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr3	186782284	rs201770337	A	AT	1163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.09;MQRankSum=1.146;NF=12;NR=25;PP=859;ReadPosRankSum=-1.464;SC=ACTGAAGCAGATTTTTTTCCC;SOR=0.787;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=37;WE=186782292;WS=186782274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr3	186791795	rs9821439	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TGGAAGAGAAACCTGTAGTCT;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=186791803;WS=186791785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	186793702	rs2239611	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=77;ReadPosRankSum=0.289;SC=TTTTACTCTAGGGGCCTCTGT;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=186793710;WS=186793692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	186915592	rs79843810	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=549;ReadPosRankSum=-1.606;SC=AGCCCAGGAAGGTGGATCCCT;SOR=0.851;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=31;WE=186915600;WS=186915582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr3	186917751	rs6764714	C	G	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1654;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GTCGCAGGACCAGACGGGCTC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=103;WE=186917759;WS=186917741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,115:0.55:210
chr3	186947410	rs850318	C	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=333;SC=TCCAGTCTAGCCGAGAACTCT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=186947418;WS=186947400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	186947483	rs72549162	C	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AATGAAGAAACCTTGGTCAGT;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=13;WE=186947491;WS=186947473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr3	186953808	rs850312	C	T	3811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=79;PP=2585;ReadPosRankSum=-0.461;SC=TGACATACTGCAGGACATCTG;SOR=0.585;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=287;TCF=129;TCR=158;TR=150;WE=186953816;WS=186953798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,170:0.51:333
chr3	186954285	rs710452	A	G	6672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GGAAGAGGCCAGGCTCAGCAT;SOR=0.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=105;TCR=106;TR=210;WE=186954293;WS=186954275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,247:1.00:248
chr3	186961478	rs710460	A	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=337;SC=TGATGGATCTATCTCATGCAG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=186961486;WS=186961468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	186969634	rs698092	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=-2.311;SC=ATGAAGGTGAATAAAACATGG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=4;WE=186969642;WS=186969624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr3	187003495	rs698105	A	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=169;SC=AATTCATACCATTGTGATGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=187003503;WS=187003485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	187086081	rs5855133	TCAGA	T	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=1172;SC=TTCTGTGTACTCAGACAGTCT;SOR=2.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=187086092;WS=187086071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	187086400	rs41268619	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=432;ReadPosRankSum=0.539;SC=TGTGGGTTTCCCAGGCAATAG;SOR=0.169;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=28;WE=187086408;WS=187086390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr3	187088656	rs1047584	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=648;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GAGCACTGGACATCCCAGGGT;SOR=0.716;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=45;WE=187088664;WS=187088646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr3	187088812	rs3821812	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=892;ReadPosRankSum=1.688;SC=GGAAATGGCACGAGGAAGTCT;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=54;WE=187088820;WS=187088802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr3	187088903	rs1533595	C	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=677;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CTTTGGGCATCTGTGGACAGG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=39;WE=187088911;WS=187088893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,47:0.41:114
chr3	187088926	rs1533594	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=44;PP=2245;SC=TTAAAAAGCTGCATGACAAAG;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=187088934;WS=187088916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	187089031	rs1003995	C	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=853;ReadPosRankSum=0.878;SC=AACCAGTCAGCTGAGGCAAAA;SOR=0.445;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=56;WE=187089039;WS=187089021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr3	187386909	.	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=687;ReadPosRankSum=2.599;SC=TTGCGTTCTCGGGGTGCCATA;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=40;WE=187386917;WS=187386899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr3	187388048	rs35603672	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=551;ReadPosRankSum=-1.729;SC=GGACAGCGCAGCCAGCGCGCA;SOR=1.401;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=36;WE=187388056;WS=187388038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr3	187416253	rs1523468	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=-0.340;SC=ACTCTCAAGCCCATGTGCCCT;SOR=0.904;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=9;WE=187416261;WS=187416243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr3	187416634	rs1973791	C	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.348;NF=12;NR=18;PP=554;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TGTTCTCCTCCAGCATGCTGG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=30;WE=187416642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,40:0.41:98
chr3	187416666	rs11927120	C	T	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.661;NF=13;NR=26;PP=731;ReadPosRankSum=1.194;SC=CGCGCCGTGCCGCACTCATAG;SOR=1.220;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=39;WE=187416674;WS=187416656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr3	187416719	rs11707167	T	C	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.849;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.136;NF=22;NR=16;PP=445;ReadPosRankSum=1.044;SC=GCCCGCCCGCTGGGCGCGGTC;SOR=0.400;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=38;WE=187416727;WS=187416709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr3	187419661	rs113681515	G	GCCTGCC	1183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=1024;SC=ACCAGAATAAGCCCGCGACTG;SOR=3.014;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=17;WE=187419669;WS=187419651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	187419816	rs61754877	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GGGCTTGAGGTTGGGGTCTAT;SOR=1.012;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=43;WE=187419824;WS=187419806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr3	187420445	rs4389470	C	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=567;SC=TAGCACAAACCGCTTGACCTG;SOR=2.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=187420453;WS=187420435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	187440506	rs1005099	C	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=207;ReadPosRankSum=1.244;SC=TCTTGCCTCTCCAAGGCCAGG;SOR=1.375;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=16;WE=187440514;WS=187440496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr3	187443213	rs9755700	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	187443249	.	TCGCC	T	481.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	187443254	.	TGCCCGCTCCGCTC	T	470.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr3	187443267	.	C	T	204	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=204;QD=19.8976010456;SC=CCGCTCCGCTCGCCTGCCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=187443275;WS=187443257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	187447032	rs1056932	G	A	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=44;PP=1440;ReadPosRankSum=0.196;SC=TGGCATTCTGGTTGAGGCTGT;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=238;TCF=133;TCR=105;TR=102;WE=187447051;WS=187447022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,123:0.44:279
chr3	187447926	rs1491997	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ACATAGGTGACGTGGCTCTGG;SOR=0.476;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=12;WE=187447934;WS=187447916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr3	187450128	rs4417855	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=363;ReadPosRankSum=0.766;SC=ATTGCATTTACACTTATTTTT;SOR=0.437;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=24;WE=187450136;WS=187450118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr3	187450393	.	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-1.113;SC=TGGGTTGCCAGAAGTGAGCCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=187450401;WS=187450383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	187451609	rs1880101	A	G	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=817;SC=GGTCCCTTGTATTTGATCTTT;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=187451617;WS=187451599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	187451701	rs1880100	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.705;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	187451709	rs1880099	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.175;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	187896912	rs13096262	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=476;SC=GAGGTTTTGAGAGCATTGATA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=187896920;WS=187896904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	187897059	rs13096615	G	A	5586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=77;PP=2965;SC=CCCTGTCTTCGCAGCGGAGCT;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=174;WE=187897067;WS=187897049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	187897424	rs4577458	A	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=833;SC=TCCTGCCAGGAATCCAGCCGT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=187897432;WS=187897414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	188202550	rs2067078	A	T	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=884;SC=TCATGTTTATAAGCCATCCTA;SOR=3.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=188202558;WS=188202540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	188202582	rs1559814	G	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=489;SC=AATTTCATGAGTGTTTCTGTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=188202590;WS=188202572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	188242669	rs200398269	TTCCTTCCTTCCGTCCG	T	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.607;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr3	188242701	rs138209867	T	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr3	188242705	rs144299808	T	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.70;ReadPosRankSum=0.827;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	188242729	rs371975262	TTCCTTC	T	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.716;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr3	188327461	rs1059380	C	T	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1601;ReadPosRankSum=2.855;SC=ATGACTCTGACCCTACCTATG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=188327469;WS=188327451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,89:0.98:91
chr3	188426256	rs9877192	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=630;ReadPosRankSum=0.603;SC=TGGAACTATTATCAGCTCCAC;SOR=0.401;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=47;WE=188426264;WS=188426246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr3	188478197	rs3841956	G	GGTGT	331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.192;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	188478235	rs9844854	T	C	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=275;SC=CGTGCGCGCATGTAAATTAGC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=188478243;WS=188478225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	188590344	rs113467956	C	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=786;ReadPosRankSum=-2.383;SC=TATACCGACTCTCAGTTTCCA;SOR=0.419;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=93;TCR=45;TR=57;WE=188590366;WS=188590334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,81:0.47:172
chr3	188590358	rs4687001	C	T	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=58;PP=2962;SC=GTTTCCACCTCTTCCTTTTAC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=94;TCR=58;TR=152;WE=188590366;WS=188590334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	188933213	rs3821734	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=368;ReadPosRankSum=-1.510;SC=GGAAATACAGCGTTTTCCTTG;SOR=0.848;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=29;WE=188933221;WS=188933203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,42:0.41:103
chr3	188937307	.	GAA	GAAA,G	133	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=15;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=59.4;NF=7,7;NR=2,2;PP=133,37;QD=15.1111111111;SC=TGGCCCTTCTGAAAAAAAAAA;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=9,9;WE=188937316;WS=188937297;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.35:26
chr3	188937622	rs114362584	T	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=1.278;SC=TAATTCTTGTTCTTCATCTTT;SOR=0.052;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=188937630;WS=188937612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	189033292	rs6773831	C	G	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.481;SC=TATGCAGAGACTACTGCTGGG;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=68;WE=189033300;WS=189033282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,79:0.55:144
chr3	189038648	rs1055152	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=1.443;SC=TCCACAGATATGTCACTTTGA;SOR=0.484;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=46;WE=189038656;WS=189038638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr3	189349247	rs28673064	A	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=9;PP=958;ReadPosRankSum=0.887;SC=ACACAGGTATATGTGTATATT;SOR=1.510;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=113;TCF=88;TCR=25;TR=53;WE=189349255;WS=189349237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
chr3	189507518	rs34201045	C	CAGAG	2952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=2367;ReadPosRankSum=0.610;SC=GTAAGGGTCTCGGGGTGGGGG;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=44;WE=189507526;WS=189507508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,70:0.52:135
chr3	189582241	rs17514215	T	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=530;SC=CTGTTCAACCTCCTTGAAGGT;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=189582249;WS=189582231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	189587274	rs6790167	A	G	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=910;SC=TCATCATCTCATTATCTGTGA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=189587282;WS=189587264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	189590824	rs9840359	G	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=31;PP=761;SC=GCATGAGTGAGGGTGACTTTA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=189590832;WS=189590814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	189604149	rs1554131	T	G	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=43;PP=2123;SC=TCAGTGTCCCTTGCTCACCAT;SOR=1.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=189604168;WS=189604139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	189604160	rs1345186	T	C	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=48;PP=2677;SC=TGCTCACCATTATTTCCATGT;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=124;WE=189604168;WS=189604139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	189688569	rs3732920	C	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=338;SC=TGAGCTAAAACATACTAAATA;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=189688577;WS=189688559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	189689904	rs710543	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=560;SC=GCAAATGGGCAGAGGCAGACA;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=189689912;WS=189689894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	189690816	rs71674435	G	GA	442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=13;PP=334;SC=TAACCAGACTGAAAAAAAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=15;WE=189690824;WS=189690806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	189690861	rs710545	T	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=427;SC=TCATTGGAGGTCGTAAGAAAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=189690869;WS=189690851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	189691499	rs1815171	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.42;NF=12;NR=1;PP=380;SC=ATTTTTAGTAGAGACGGGGTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=189691507;WS=189691489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	189692565	rs1985690	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=44;PP=1217;SC=TGCAATTCGAGTGAGTCCATT;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=189692573;WS=189692555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	189702200	rs710558	T	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=444;SC=GACCTGGATGTAGAGCTCCTA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=189702208;WS=189702190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	189702395	rs11311050	TA	T	751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.883;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=418;ReadPosRankSum=1.734;SC=TTGAATCGAGTAAAAAAAAAA;SOR=2.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=25;WE=189702403;WS=189702385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr3	189705542	rs3114672	A	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=30;PP=851;SC=CGTGTCTACAAAGGTCAGCAT;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=189705550;WS=189705532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	189712089	rs1719599	G	A	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=44.50;SOR=1.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	189712089	.	GG	AA	2114	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.56;NF=10;NR=35;PP=2114;QD=48.1659527747;SC=TGAAACAGACGGGAAAAAACA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=45;WE=189712102;WS=189712079;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,45:0.88:51
chr3	189712090	rs1719598	G	A	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=44.50;SOR=1.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	189712094	rs139834656	A	AAAAC	1071.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.093;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.505;NF=0;NR=25;PP=1056;ReadPosRankSum=1.106;SC=CAGACGGGAAAAAACAAACAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=25;WE=189712102;WS=189712079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,34:0.94:36
chr3	189713205	rs9821880	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=35;NR=49;PP=1584;SC=TGTGAGCTGCTTCCACTGCTT;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=84;WE=189713213;WS=189713195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	189837993	rs710596	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCAAGAGAGCGTGTGAGAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=11;WE=189838001;WS=189837983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	190030680	rs9869263	A	G	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=31;PP=1732;SC=GAAATATCGCACCCCCAATGA;SOR=1.266;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=190030688;WS=190030670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	190106071	rs368234054	AG	A	4609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.945;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=54;PP=2948;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGTGGGGCCAGGGCTGGTGT;SOR=0.721;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=142;TCF=42;TCR=100;TR=72;WE=190106082;WS=190106061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,118:0.52:227
chr3	190106074	rs3214506	G	C	4618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=0.146;SC=TGGGGCCAGGGCTGGTGTCTG;SOR=0.716;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=198;TCF=97;TCR=101;TR=99;WE=190106082;WS=190106061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,119:0.52:229
chr3	190106242	rs1491994	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=473;ReadPosRankSum=-1.611;SC=GGTAAGAAGATAGCAGCTTCT;SOR=0.905;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=26;WE=190106250;WS=190106232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr3	190106332	rs1491993	T	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CTAAGGCTAATGATACCAAAA;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=190106340;WS=190106322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	190157898	rs6767754	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=386;ReadPosRankSum=0.016;SC=ACTCTCCTCAGTGCAGGCCTT;SOR=0.509;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=22;WE=190157906;WS=190157888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr3	190158007	rs201009644	A	G	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=819;ReadPosRankSum=2.054;SC=ATCAAAAAAGAGTCCAGAAGC;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=53;WE=190158015;WS=190157997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,75:0.44:172
chr3	190165800	rs1346016	T	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GGTGGATTCTTAAGCTCAGCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=190165808;WS=190165790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	190282186	rs6764286	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=1923;ReadPosRankSum=-1.844;SC=GCAAGTCATGCGTAGGGTAAT;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=28;TCR=87;TR=54;WE=190282205;WS=190282176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr3	190282197	rs6764468	G	A	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=2274;ReadPosRankSum=0.595;SC=GTAGGGTAATGAGTCCACTCT;SOR=0.608;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=60;WE=190282205;WS=190282176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr3	190333162	rs35429399	TG	T	908.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.393;NF=2;NR=18;PP=749;ReadPosRankSum=0.407;SC=GTCCTTTTGTTGTTGCTTTTG;SOR=0.535;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=20;WE=190333170;WS=190333152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,33:0.35:95
chr3	190338039	.	C	CT	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.9965;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=58.31;NF=3;NR=0;PP=51;QD=18.6666666667;SC=AAAAAGTAAACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=190338047;WS=190338029;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	190338270	rs115290893	A	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=631;ReadPosRankSum=0.793;SC=CAAGCATGTGATCATCTTGTT;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=43;WE=190338278;WS=190338260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr3	190341241	rs4687160	C	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=783;ReadPosRankSum=0.487;SC=CACTTAGATTCTCTTAATTAC;SOR=1.083;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=47;WE=190341249;WS=190341231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr3	190341292	rs4687161	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=351;ReadPosRankSum=0.279;SC=AGAAAATAGACGACTGTTGTA;SOR=1.071;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=19;WE=190341300;WS=190341282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	190347391	rs7611887	C	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=35;PP=999;SC=GCACCTAGCCCGACGGCATCT;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=190347399;WS=190347381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	190362220	rs34590034	A	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=381;ReadPosRankSum=0.316;SC=AACCTCTTCTACTGTCATCTT;SOR=1.193;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=23;WE=190362228;WS=190362210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr3	190575590	rs75848819	A	G	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TTTCTTCAAGACATTTAACCA;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=55;WE=190575598;WS=190575580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr3	190576593	rs1393055	A	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=0.138;SC=CTTTGGACACACCAGTCACTT;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=14;WE=190576601;WS=190576583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr3	190577535	rs9855583	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=586;ReadPosRankSum=-0.112;SC=CATACTAACCAGGTCTACTTT;SOR=0.382;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=44;WE=190577543;WS=190577525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr3	190577763	rs7640070	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=-1.394;SC=ATTTAAGTGTGCTTTTAATAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=190577771;WS=190577753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	190580150	rs10630111	A	AG	448.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.121;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	190580151	.	A	C	129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=60.36;NF=10;NR=1;PP=129;QD=14.8882920497;SC=TAATAACAGAAAGAGAGAGAG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=11;WE=190580159;WS=190580147;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	190580151	.	A	AGAC	448.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.121;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.468;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	190580209	rs145134107	A	AAG	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.645;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr3	190594309	rs9880320	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.49;QD=27.98;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	190594334	rs9842242	A	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.55;QD=28.86;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	190594452	rs9842514	A	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.15;QD=34.34;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	190594452	.	ACC	CCC,CCT	156	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=58.23;NF=11,4;NR=12,6;PP=156,99;QD=8.29440054553;SC=TACCCACCCCACCTCGTGATC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23,10;WE=190594462;WS=190594442;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:23
chr3	190594454	rs9880346	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-0.520;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr3	190967779	rs2034771	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=487;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AATAATGATCAATAACTTGCC;SOR=0.238;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=36;WE=190967787;WS=190967769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr3	190980797	rs7644510	A	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=338;SC=ATCACATTACAGCATTGTTAC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=190980805;WS=190980787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	190986110	rs10804933	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=103;SC=TTTTATTCCACAGCAATAGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=190986118;WS=190986100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	190986388	rs6794154	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	190991384	rs9857697	G	A	4244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=76;PP=2506;SC=GTGCTGTGCTGCAAGCATTGG;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=130;WE=190991392;WS=190991374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	190991439	rs9877400	T	C	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=52;PP=1661;SC=AGATTTAGATTACAACTGTTA;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=79;WE=190991447;WS=190991429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	191047532	rs9847278	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=693;ReadPosRankSum=-2.532;SC=CCGGAGGGAGAGCGCGCGGGA;SOR=0.720;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=51;WE=191047540;WS=191047522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,67:0.48:140
chr3	191107192	rs436393	A	G	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=12;PP=1378;SC=TTCATTTCACAAGAAAATGTT;SOR=2.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=67;WE=191107200;WS=191107182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	191179193	rs293833	A	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1010;ReadPosRankSum=1.400;SC=AAGATGAATCAAACGCATCTG;SOR=0.618;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=64;WE=191179201;WS=191179183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr3	191179303	rs176823	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=471;ReadPosRankSum=1.962;SC=CTTGGTTCTGCCTCCATTTTA;SOR=0.924;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=29;WE=191179311;WS=191179293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr3	191888452	rs201475598	GAA	G	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.000;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.893;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr3	192125768	rs2249551	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=27;PP=1297;SC=GGAGGGAGAAAGAGGGCGTCC;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=192125776;WS=192125758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	192993762	rs13084990	C	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-1.080;SC=GCTATTTAAACAAACAGCATC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=14;WE=192993770;WS=192993752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	192994543	rs2271791	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=184;ReadPosRankSum=0.338;SC=CTTTACCTCTACAAAGAAAGC;SOR=2.147;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=14;WE=192994551;WS=192994533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr3	193016895	rs1878716	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=0.585;SC=AAAAACAATATAGTTTTCTTT;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=8;WE=193016903;WS=193016885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr3	193023255	rs10937578	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=1.791;SC=TCTGTTGCAGCATTTATCACT;SOR=1.508;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=15;WE=193023263;WS=193023245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr3	193024928	rs10804952	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-2.655;SC=CAGAAAGCATCGGAAGTGTCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=193024936;WS=193024918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	193031926	rs2280268	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=836;ReadPosRankSum=0.385;SC=ACTTGGCTGCCTGGAGGGATC;SOR=0.448;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=52;WE=193031934;WS=193031916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr3	193036794	rs6788770	G	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=364;ReadPosRankSum=-0.616;SC=CTAAGTGCTCGACTTCTGAAA;SOR=0.375;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=31;WE=193036802;WS=193036784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr3	193042776	rs11926955	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=634;ReadPosRankSum=0.754;SC=CAGCCTGGCCTGAGGCAAAGC;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=57;WE=193042784;WS=193042766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,68:0.38:177
chr3	193042964	rs11715170	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=147;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CCTTAGCCTGGTATTCAAAGT;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=193042972;WS=193042954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	193044923	rs1387700	T	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=-1.057;SC=AAAACCCAAGTTTCTAAGATA;SOR=0.173;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=24;WE=193044931;WS=193044913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr3	193051401	rs11718268	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGAACATTTCCGCTGTCTAAG;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=193051409;WS=193051391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr3	193062906	rs6444706	G	A	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=46;PP=1299;SC=GATAGTTCATGTTCTGAAAAC;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=193062914;WS=193062896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	193068800	rs1038719	G	A	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=7;PP=1173;SC=AATACCATGGGCTTTACTTCT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=193068808;WS=193068790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	193071888	rs11300573	CA	C	3471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=26;PP=1717;SC=TCTATTTTTTCAAAAAAAAAA;SOR=2.476;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=91;WE=193071896;WS=193071878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	193080414	rs6797429	C	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=50;PP=1604;SC=TTCTGCACTTCCATGCACCGC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=193080422;WS=193080404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	193081206	rs2367605	G	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=36;PP=1018;SC=AAATTCTCAAGTGTTATTCAG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=193081214;WS=193081196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	193081830	rs923496	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=849;SC=CCACAGAGTTATGCCACAGAG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=193081838;WS=193081820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	193081866	rs4386441	T	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=11;PP=1422;SC=CGATCATGGCTTTCAAAATAG;SOR=2.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=193081874;WS=193081856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	193082138	rs923494	T	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=648;ReadPosRankSum=0.293;SC=TTTCTTTCAATAAACCAAACT;SOR=0.728;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=35;WE=193082146;WS=193082128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr3	193090101	rs57458521	A	AGG,AAAGG	1290.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=597;SC=AAAAAAAAAAAGGGGGAAGTT;SOR=2.066;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=20;WE=193090109;WS=193090091;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:27
chr3	193090255	rs2171848	C	T	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.70;SOR=2.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	193090260	rs6444712	T	C	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=2.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	193096529	rs4687419	C	T	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=53;PP=1469;SC=ACTCAACCGGCGAGGATCTCT;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=193096537;WS=193096519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	193120359	rs142743757	GA	G	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=1.308;SC=GATGTTACAAGAGTCTCATTT;SOR=0.086;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=193120367;WS=193120349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	193128900	rs61401139	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=546;ReadPosRankSum=0.155;SC=TGAGAAATCAGAGTGAAAAAT;SOR=1.219;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=31;WE=193128908;WS=193128890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr3	193129807	rs6763501	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=300;ReadPosRankSum=0.229;SC=GCAAAGAACCGTGAAAATGAG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=193129815;WS=193129802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	193153562	rs1996735	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=487;ReadPosRankSum=-0.980;SC=GATAAAGACATGAAAGTAATG;SOR=1.393;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=36;WE=193153570;WS=193153552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
chr3	193174782	rs9879227	T	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=927;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CAAGTCAAGTTACAGACCTGT;SOR=0.851;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=55;WE=193174790;WS=193174772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr3	193180400	rs56312820	A	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1167;SC=TTGAAGAATTAAAGATGAGAA;SOR=4.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=193180408;WS=193180390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	193182715	rs12696666	T	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=18;PP=873;SC=AGAATAAGGATGAAACACACA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=193182723;WS=193182705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	193183039	rs7617230	T	C	100.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.57;QD=20.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	193183817	rs3796181	A	G	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=45;PP=1769;SC=AGCTTACCCCACTAAGCACAT;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=193183825;WS=193183807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	193201582	rs9842836	C	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=308;SC=AAAAAAAAAACTTAAGTTCCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=193201590;WS=193201576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	193209178	rs6788448	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=1482;SC=TAGGCCCACATATTAACCTCC;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=193209186;WS=193209168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	193210768	rs2130407	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=13;PP=531;SC=TGGCAGAACTAAGCCAGTCTT;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=193210776;WS=193210758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	193272417	rs9883845	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AAATTTTAGAAAAGTCTGTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=193272425;WS=193272407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	193334991	rs7624750	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=622;ReadPosRankSum=0.290;SC=GCCCTTCCTAGTTCAGAAGAC;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=43;WE=193334999;WS=193334981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr3	193336676	rs34307082	C	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=677;ReadPosRankSum=0.321;SC=GAAGAAACGGCGTTTAGAGCA;SOR=0.707;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=47;WE=193336684;WS=193336666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
chr3	193355074	rs166850	T	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=474;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GCCACGGGTATGTGAAAAATT;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=36;WE=193355082;WS=193355064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr3	193364872	rs78767626	A	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=850;ReadPosRankSum=0.078;SC=TGCTAAAGGCACACCAAGTGA;SOR=0.408;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=56;WE=193364880;WS=193364862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,60:0.54:111
chr3	193365749	rs113367640	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.079;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=652;ReadPosRankSum=0.075;SC=GGGTCATAGGCGCACTCTCAG;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=63;TCR=16;TR=37;WE=193365757;WS=193365739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr3	193365974	rs9831900	T	G	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=555;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTAATGTTGTTTGCTAACTAA;SOR=0.396;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=42;WE=193365982;WS=193365964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr3	193374964	rs9851685	T	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=808;ReadPosRankSum=0.534;SC=TTAAAGAGGCTGTTAAGGAAG;SOR=0.715;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=62;WE=193374972;WS=193374954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,76:0.57:133
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chr3	193385188	rs115528092	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=973;ReadPosRankSum=0.854;SC=GGCTGAGCACGGTGGCTCACG;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=46;WE=193385196;WS=193385178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr3	193385233	rs114568312	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=297;ReadPosRankSum=0.663;SC=GCCAAGATGGGTGGAAAACAA;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=15;WE=193385241;WS=193385223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr3	193386239	rs12494482	C	T	3254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.037;NF=65;NR=53;PP=2037;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CATGGAGTCCCTTTTACTGAG;SOR=0.711;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=223;TCF=121;TCR=102;TR=118;WE=193386247;WS=193386229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,144:0.52:276
chr3	193854620	.	C	T	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1166;ReadPosRankSum=0.840;SC=TTCTCCCAGGCGGGAGGGCCC;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=70;WE=193854628;WS=193854610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
chr3	194061906	rs4974538	TG	CA	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.585;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=1553;ReadPosRankSum=-1.407;SC=GGAGCCCTGCTGAGGAGAGAG;SOR=1.232;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=42;WE=194061915;WS=194061896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr3	194062565	rs3732476	C	T	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1581;ReadPosRankSum=-1.078;SC=CAACCAGGCACGGGGTGTGGG;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=109;WE=194062573;WS=194062555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,116:0.51:227
chr3	194063153	rs3732474	G	A	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1343;ReadPosRankSum=0.084;SC=GCAGCCCCCCGAAGGCATCCG;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=79;WE=194063161;WS=194063143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr3	194063300	rs62288099	T	C	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GGATGTCCAGTGGGACGGTGG;SOR=0.732;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=162;TCF=81;TCR=81;TR=74;WE=194063308;WS=194063290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,78:0.43:180
chr3	194118874	rs1223989	T	C	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1462;ReadPosRankSum=0.595;SC=TGGGCAGGCCTAGCGCGGAGA;SOR=0.516;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=94;WE=194118882;WS=194118864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,117:0.58:201
chr3	194119108	rs1538863	C	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=506;ReadPosRankSum=2.086;SC=AGGCACAATCCTTTCGCCAGA;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=27;WE=194119116;WS=194119098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr3	194219732	rs2002762	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-0.791;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr3	194309528	rs789837	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CTGTGTTTCTGGGACCTAAGG;SOR=1.765;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=13;WE=194309536;WS=194309518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr3	194313632	rs7373172	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=486;ReadPosRankSum=0.909;SC=GTGAGCCACCGCGCCTGGCCT;SOR=0.640;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=30;WE=194313640;WS=194313622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr3	194313832	rs1773184	T	C	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=38;PP=935;SC=ACAGAAAAAGTGTTGGACAGA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=194313840;WS=194313822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	194324939	rs6768028	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.943;SC=ACAGCTGCACAAGCCCCAAGG;SOR=2.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=15;WE=194324947;WS=194324929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	194324982	rs745171	C	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=497;ReadPosRankSum=1.684;SC=ACGATGGCACCCACGCACCCG;SOR=1.520;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=31;WE=194324990;WS=194324972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr3	194325006	rs732124	A	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.184;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=898;ReadPosRankSum=0.620;SC=AGCAGGCAACAGCCGTGTACC;SOR=0.340;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=27;WE=194325018;WS=194324996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr3	194325010	rs745168	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.260;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=1722;ReadPosRankSum=0.250;SC=GGCAACAGCCGTGTACCTCCA;SOR=1.480;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=46;WE=194325018;WS=194324996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr3	194325325	rs708632	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=362;SC=GGCCATCCAGCTCTCCCCAGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=194325333;WS=194325315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	194331875	rs789993	A	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.570;SC=TTTTAACGGCACGTCTCACTT;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=12;WE=194331883;WS=194331865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	194337708	rs10933663	T	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=-0.940;SC=ACCACTCCCTTACTGCTGGGA;SOR=1.447;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=8;WE=194337716;WS=194337698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	194337901	rs922282	T	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=13;PP=492;SC=CTCAGGGTGCTGGTCGTGGGC;SOR=1.121;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=33;WE=194337909;WS=194337891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	194338423	rs12695036	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=828;ReadPosRankSum=-1.317;SC=GCTGGGAGAACGTGAGGGAGA;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=47;WE=194338431;WS=194338413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr3	194344526	rs709011	G	C	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=909;ReadPosRankSum=-1.544;SC=ACATGATGCTGAAGCGGGTTC;SOR=0.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=55;WE=194344534;WS=194344516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr3	194346544	rs1773191	T	A	6104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.56;SOR=1.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	194346553	rs1773190	T	C	6556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.03;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr3	194349027	rs1318216	A	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=234;SC=CAACAAGACAAAAGCCACCAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=194349035;WS=194349017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr3	194353772	rs11273892	C	CCCGCCCGACAG	960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=2104;SC=CGCCCGTTTCCCCGCCCGACA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=194353780;WS=194353762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	194353875	rs1675955	G	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CAGACGCGGTGGCGGGCGAAG;SOR=0.558;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=16;WE=194353883;WS=194353865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr3	194362721	rs1060827	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=2;NR=1;PP=23;SC=GTCTTGGGACGGTTCCACAGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=194362729;WS=194362712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	194371496	rs1773206	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=1.097;SC=AACTTGTGCAGATCACTAGTA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=194371504;WS=194371490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	194373832	rs1675953	TG	CA	10088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=87;PP=2947;SC=TGTCCAAACTTGGTTGTGTTG;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=178;WE=194373841;WS=194373822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr3	194379567	rs1675948	A	G	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=546;SC=CAGCACACAGAGGAAAAACTC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=194379575;WS=194379557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	194379596	rs1705971	C	A	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=829;SC=ACAGATTTTCCATAAGAATAA;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=194379604;WS=194379586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	194379646	rs11438897	T	TC	3643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=34;PP=2694;SC=AAATCAAAATTCCCTCTTTGA;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=65;WE=194379654;WS=194379636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	194379905	rs11357453	TA	T	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=427;SC=TTCAAACAAGTAAAAAAATGA;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=194379913;WS=194379895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	194381530	rs1705969	A	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=14;PP=764;SC=CGTATAAGAAAGTACAGCAAT;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=194381538;WS=194381520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	194381680	rs1675947	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=27;PP=858;SC=CTCTGTGCTAGATGTTATAAA;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=194381688;WS=194381670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	194381716	rs1705968	G	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=443;SC=CCGCTGGGAGGACATAAGCTA;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=194381724;WS=194381706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	194381742	rs1705967	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=340;SC=GCATGACTACCTCACGGCAGA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=194381750;WS=194381732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	194386136	rs1705966	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=574;SC=ACAAAATATACGGTAGTATCA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=194386144;WS=194386126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	194386881	rs1675944	A	G	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=38;PP=1831;SC=CATGCCAAATATCTGAACTCA;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=194386889;WS=194386871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	194387300	rs1675943	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.272;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=702;ReadPosRankSum=0.234;SC=TATTAAGTTTCTCTGTTCAAA;SOR=0.272;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=41;WE=194387308;WS=194387290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr3	194390617	rs1773230	G	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=9;PP=1064;SC=CTGATATCACGCCACTGCACT;SOR=2.737;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=48;WE=194390625;WS=194390607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	194390713	rs1675926	C	A	5510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=67;PP=2965;SC=ACAGTCTCACCTGCACTCAGC;SOR=0.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=157;WE=194390721;WS=194390703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	194390869	rs36028600	G	GA	2617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.605;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.253;NF=4;NR=62;PP=1978;ReadPosRankSum=0.793;SC=GTGCAACTATGAAAAAACACA;SOR=1.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=66;WE=194390879;WS=194390859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr3	194392683	rs1773231	A	C	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=19;PP=1829;SC=TCATCCTTCAAAACCCGGCTG;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=83;WE=194392691;WS=194392673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	194408704	rs4677673	A	G	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=82;PP=2807;SC=GCCTGCTGTCAGGCGACAGCA;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=194408712;WS=194408694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	194790434	rs3796159	C	G	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.754;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=959;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GGGCAAGGCACGGGGAGCGCC;SOR=1.345;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=103;TCF=84;TCR=19;TR=47;WE=194790442;WS=194790424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr3	194842877	rs58370605	A	G	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=967;ReadPosRankSum=0.427;SC=AAGGGGTGACAGAGCTCTTCA;SOR=0.894;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=64;WE=194842885;WS=194842867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,70:0.52:135
chr3	194877126	rs59556963	G	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AAGAGAGAGGGTGAAGGGTGG;SOR=0.172;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=11;WE=194877134;WS=194877116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	194896233	rs201558663	T	TGA	1308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.584;SC=CTGTGTTGCATGTTGACTTTG;SOR=1.143;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=17;WE=194896248;WS=194896223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr3	194896236	rs71988963	TGA	T	1290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.340;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr3	194896240	rs200404095	T	TGTG	1333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GCATGTTGACTTTGCTGCACC;SOR=1.135;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=16;WE=194896248;WS=194896223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr3	194928138	rs12495970	A	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1179;ReadPosRankSum=0.196;SC=GAAAACAGTGACTTTATTCTA;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=72;WE=194928146;WS=194928128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,81:0.40:202
chr3	194991022	rs62285259	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=0.028;SC=ACTCTCCTGGGGGCTGCGCTT;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=14;WE=194991030;WS=194991012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr3	194991220	rs7640099	AA	GC	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=513;SC=CCGGGAGCGCAAACTGACCTC;SOR=1.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=12;WE=194991229;WS=194991210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	194999996	rs7610022	T	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=591;SC=AAAATTGTGATTTTTTAGCTG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=195000004;WS=194999986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	195013094	rs112375796	T	C	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=59;PP=1526;ReadPosRankSum=-1.110;SC=TTTAGGAAGGTTTTTTTCATA;SOR=0.685;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=70;TCR=123;TR=91;WE=195013102;WS=195013084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,107:0.48:225
chr3	195022534	rs2275519	G	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=0.147;SC=GTCCTCAACAGCTTTTACAAA;SOR=1.721;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=24;WE=195022542;WS=195022524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr3	195027362	rs372573388	T	C	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1117;ReadPosRankSum=0.620;SC=GGAAATAACATATTGTTTTCT;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=64;WE=195027370;WS=195027352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
chr3	195028183	rs13059843	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=-0.132;SC=TTAGAAACAGGGGTTATCAAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=195028191;WS=195028173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	195029738	rs10636354	G	GAAAGT	406.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=0;NR=8;PP=416;SC=GAAAACTACTGAAAGAACAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=195029746;WS=195029728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	195047507	rs79917977	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=-1.158;SC=TGCACAATTATTAGAACAACT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=14;WE=195047515;WS=195047497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr3	195053916	rs62287109	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	195065978	rs73206696	A	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=476;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CTTCACCGCAATTGACTTACT;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=36;WE=195065986;WS=195065968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr3	195076877	rs6437374	C	G	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=86;PP=2965;SC=CCCATGCGCTCGTAGCAACCA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=166;WE=195076885;WS=195076867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr3	195102787	rs2275518	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=263;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AGGTTGAAGATAGTTTTACAA;SOR=0.874;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=14;WE=195102795;WS=195102777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	195133474	rs57063250	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=707;ReadPosRankSum=0.109;SC=AATTAAAACCGTAACTGCCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=10;WE=195133483;WS=195133464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	195133475	rs10645683	T	TAAC	505.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=666;ReadPosRankSum=0.109;SC=ATTAAAACCGTAACTGCCTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=10;WE=195133483;WS=195133464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	195245805	rs17847362	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.87;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=510;ReadPosRankSum=0.902;SC=ACATTTTCCAGACATCTAACC;SOR=0.900;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=36;WE=195245813;WS=195245795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr3	195295661	rs7659	C	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=333;SC=GTTACATGTTCAGGTCAACTT;SOR=5.549;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=195295669;WS=195295651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	195295708	rs142189206	G	GGGGT	2007.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=22;NR=15;PP=1466;SC=TTTATGGGGGGGGGGTAGGGG;SOR=4.174;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=37;WE=195295716;WS=195295698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	195300676	rs1568566	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=4;PP=635;SC=GTCACTCTGCATCAGCACTCC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=195300684;WS=195300666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	195345953	rs145174488	C	T	12666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=315;PP=2965;SC=CAGAGAGCAGCGCCTCTTCCG;SOR=1.496;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=458;TCF=143;TCR=315;TR=458;WE=195345961;WS=195345943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,473:1.00:473
chr3	195346352	rs201553387	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	195346623	rs78469087	A	G	6962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=89;PP=2965;SC=TGATGCCACGATTGGGACCCC;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=116;TCR=89;TR=205;WE=195346631;WS=195346613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	195346665	rs73212302	G	A	8466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=125;PP=2965;SC=AGAAAGAGAAGTGACAGCACC;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=124;TCR=125;TR=248;WE=195346685;WS=195346655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr3	195346677	rs73214503	G	A	8090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=123;PP=2965;SC=GACAGCACCCGGGGCCACGAC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=120;TCR=123;TR=243;WE=195346685;WS=195346655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr3	195346861	rs116014205	T	C	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=52;PP=2695;SC=TACAGCCCCTTGGAAGCCGCC;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=81;TCR=52;TR=133;WE=195346869;WS=195346851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
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chr3	195395402	rs199554501	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=18.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQRankSum=-4.398;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.041;SOR=3.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,5:0.12:40
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chr3	195395549	rs58717446	C	CAT	4935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.769;NF=5;NR=81;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GCGTTCGGCTCGTGTGTCTTG;SOR=0.856;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=144;TCF=5;TCR=139;TR=86;WE=195395557;WS=195395539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,132:0.60:220
chr3	195395564	rs78351752	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.002;NF=16;NR=49;PP=1004;ReadPosRankSum=1.603;SC=GTCTTGTAAGCGTGTGGTGCC;SOR=1.117;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=201;TCF=69;TCR=132;TR=65;WE=195395572;WS=195395554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,55:0.32:171
chr3	195399599	rs2461859	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.256;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.943;NF=41;NR=25;PP=801;ReadPosRankSum=1.125;SC=GCTGGGACAATGGGGCCCATC;SOR=1.297;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=66;WE=195399607;WS=195399589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr3	195399620	rs9840981	C	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.386;NF=36;NR=32;PP=958;ReadPosRankSum=1.192;SC=TCGCAGTTGTCTCTTTAGATC;SOR=0.467;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=68;WE=195399628;WS=195399610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr3	195399678	rs9874761	G	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.742;NF=7;NR=33;PP=762;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TGTATTGTTTGCTAAATTGCA;SOR=0.113;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=40;WE=195399686;WS=195399668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr3	195400841	rs7615369	C	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=22.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.74;MQRankSum=-2.210;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=4.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,8:0.11:76
chr3	195400848	rs7635190	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=13.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQRankSum=0.377;QD=2.56;ReadPosRankSum=-1.653;SOR=2.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,10:0.14:73
chr3	195400918	rs55992531	C	CT	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.667;HP=15;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.929;NF=4;NR=8;PP=187;ReadPosRankSum=1.924;SC=AGTCTTTTTTCTTTTTTTTTG;SOR=0.048;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=12;WE=195400926;WS=195400908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr3	195412695	.	G	C	475	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=28;MQ=47.87;NF=4;NR=22;PP=475;QD=19.606585098;SC=CAAGGTCACTGTGGAATATAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=26;WE=195412703;WS=195412685;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:55,26:0.32:81
chr3	195412876	rs11185503	T	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.56;QD=23.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	195426490	rs3107775	A	G	3681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=95;PP=2590;ReadPosRankSum=-1.944;SC=TTTTTTCAATAAGTCAGCCTT;SOR=0.599;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=49;TCR=143;TR=128;WE=195426498;WS=195426480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,147:0.69:212
chr3	195447805	.	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.171;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.763;SC=CCCTCCTCCCTGGTTTGAGGA;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=195447813;WS=195447795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	195447886	rs7627924	G	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.125;NF=19;NR=10;PP=452;ReadPosRankSum=-0.485;SC=AGGATGGGCTGTCTCTGGGGT;SOR=0.927;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=29;WE=195447894;WS=195447876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr3	195451880	rs142096782	AG	GA	15854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.46;QD=44.79;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr3	195452005	rs145612981	C	T	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.60;QD=30.53;SOR=3.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	195452018	rs2688539	A	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.30;QD=126.35;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	195452689	rs141077164	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.04;MQRankSum=-1.039;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.297;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr3	195452770	rs2550231	G	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.58;MQRankSum=1.448;QD=24.23;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,39:0.91:43
chr3	195452799	rs2550232	C	T	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.620;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.77;MQRankSum=2.177;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.787;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,70:0.96:73
chr3	195452870	.	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=19.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-7.542;QD=3.70;ReadPosRankSum=-2.141;SOR=4.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,10:0.10:100
chr3	195452872	.	AG	CA	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=22.868;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-6.355;QD=4.40;ReadPosRankSum=-3.871;SOR=3.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,16:0.15:107
chr3	195452951	rs2688542	G	C	5079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.607;NF=109;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.056;SC=AGCTGCACCTGATGCCACGGT;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=316;TCF=182;TCR=134;TR=191;WE=195452959;WS=195452941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,224:0.61:365
chr3	195453017	rs144288174	GC	G	5084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.772;NF=27;NR=80;PP=2963;ReadPosRankSum=-1.588;SC=AGCACCCGGGGCCACGACCCT;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=70;TCR=206;TR=107;WE=195453025;WS=195453007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:312,178:0.36:490
chr3	195453064	rs2550233	T	G	9433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=169;PP=2965;SC=GGAATCCCCTTGAAGAAACCT;SOR=1.055;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=112;TCR=169;TR=281;WE=195453072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr3	195453385	rs201341084	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.97;MQRankSum=-1.524;NF=31;NR=47;PP=863;ReadPosRankSum=-1.093;SC=CCACGATGAAGCCCCCAACAG;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=266;TCF=106;TCR=160;TR=78;WE=195453393;WS=195453375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,99:0.30:331
chr3	195460236	rs712011	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=382;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CCAAGCCCCTGACCCCAGATG;SOR=0.646;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=19;WE=195460244;WS=195460226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr3	195461592	rs1809785	T	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.744;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.633;SC=ATACCTCACATTCAACATTTC;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=5;WE=195461600;WS=195461582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	195475989	rs7621695	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=530;ReadPosRankSum=1.409;SC=CACTAAATCAGTACCTTTTCA;SOR=0.775;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=162;TCF=77;TCR=85;TR=46;WE=195475997;WS=195475979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,52:0.27:193
chr3	195476085	rs2688497	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=30;PP=791;SC=TCAGATCAGCATGGTGGATAA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=195476093;WS=195476075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	195477713	rs2291654	G	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.91;QD=42.83;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	195477713	.	GCC	ACA	503	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=47.4;NF=10;NR=2;PP=503;QD=46.3723229052;SC=CTGTTTGCCCGCCCCCCGCAG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=195477723;WS=195477703;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	195477715	rs2291653	C	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.91;QD=42.83;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	195477791	rs2291652	G	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=14;PP=765;SC=CTTCCCCGGAGATGGGCTGGA;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=195477799;WS=195477781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	195478012	rs2291651	G	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=218;SC=GTGAGGGGGGGTGGGGGGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=195478020;WS=195478002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	195479237	rs67175307	C	T	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=641;ReadPosRankSum=0.273;SC=CGGCCTGCAGCACTGACCGAG;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=39;WE=195479245;WS=195479227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr3	195479256	rs2258447	T	C	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=31;PP=1825;SC=AGGCGTTGACTTCTGCCATGG;SOR=1.227;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=195479264;WS=195479246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	195484244	rs2550270	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=22;PP=899;SC=GAGACTCCTCGGCTCTGTGGT;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=195484252;WS=195484234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	195487737	rs2246771	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=1.240;SC=AGGCCTCCCCAGGCCTCGGGC;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=11;WE=195487745;WS=195487727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr3	195489009	rs2246901	C	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=708;ReadPosRankSum=-1.043;SC=CTGGCGGAGGCGTGGAGGATG;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=47;WE=195489017;WS=195488999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr3	195489067	rs2246980	C	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=836;ReadPosRankSum=-0.315;SC=CGAAGCTGGCCGAGACCTCAG;SOR=0.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=57;WE=195489075;WS=195489057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr3	195489669	rs2550263	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=644;ReadPosRankSum=-1.472;SC=ACGCGGCTTCCCGCCCACCTC;SOR=0.573;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=42;WE=195489677;WS=195489659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr3	195490284	rs2550261	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=130;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GCAGGGAGGTTCCCGGCACCC;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=9;WE=195490292;WS=195490274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr3	195490309	rs74507812	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=117;ReadPosRankSum=-1.239;SC=CTCACCGTGACGGGGCCCAGG;SOR=0.511;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=9;WE=195490317;WS=195490299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	195490838	rs377595393	ATCCAGAT	AAGAT,A	153.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.652;SC=CCTACTCCTTATCCAGATGCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=195490852;WS=195490828;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.57:7
chr3	195490842	rs34858176	AGATG	A	153.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	195492027	rs11926236	T	C	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=60;PP=1413;ReadPosRankSum=2.000;SC=AGGCCCAGGCTGGGGCTGCCA;SOR=0.559;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=89;WE=195492035;WS=195492017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr3	195495916	rs2550240	G	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=680;ReadPosRankSum=0.213;SC=TGAGCACCGGGTTGCCTGAGC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=43;WE=195495924;WS=195495906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr3	195496129	rs2688492	C	T	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=437;SC=ACGCACAGCACCTGTTCCTGG;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=195496137;WS=195496119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	195497174	rs2259102	C	G	3859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=62;PP=2493;SC=CGTTGTTTGTCATCTTTCTAA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=121;WE=195497182;WS=195497164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	195497743	rs2260685	T	C	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=978;ReadPosRankSum=0.020;SC=CTTGTTAGGATAGACCCCCTA;SOR=0.501;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=60;WE=195497751;WS=195497733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,82:0.48:172
chr3	195497809	rs2259153	T	C	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1428;SC=CCGTCACCTGTAGGTCTTCTC;SOR=1.819;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=63;WE=195497817;WS=195497799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	195501149	rs2259292	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=23;PP=775;SC=GTCCCCGGCGCCTGCCCCATA;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=43;WE=195501157;WS=195501139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	195501258	rs2259331	T	C	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=255;SC=GAGCGCTCCCTGCAGGCTGCC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=195501266;WS=195501248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	195505417	rs2259419	G	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=28;PP=971;SC=GCTGGAAGAGGGAGCTGGAAA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=195505425;WS=195505407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	195505664	rs2688513	G	A	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=29;PP=1477;SC=CAGCTACCTGGTGTTTCCATC;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=195505672;WS=195505654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	195505788	rs2550253	G	C	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.353;NF=12;NR=26;PP=697;ReadPosRankSum=2.240;SC=GAGGGGTGGCGTGACCTGTGG;SOR=1.542;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=38;WE=195505809;WS=195505778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,38:0.86:44
chr3	195505835	rs58500707	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=11.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.03;MQRankSum=0.223;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.802;SOR=2.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr3	195505838	rs59101491	G	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=16.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.06;MQRankSum=0.137;QD=13.59;ReadPosRankSum=-2.105;SOR=3.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	195512042	.	T	C	1624	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=53.57;NF=40;NR=31;PP=1624;QD=23.3629748246;SC=CCTGTGGATGTTGAGGAAGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=71;WE=195512050;WS=195512032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr3	195512103	rs437805	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=0.522;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.374;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr3	195512107	rs374495657	T	A	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.74;QD=33.60;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	195512186	rs202060675	T	C	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=42;PP=2441;SC=CCTGTGGATATTGAGGAAGCG;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=195512220;WS=195512171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	195512212	rs75588776	G	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQRankSum=-0.982;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.576;SOR=1.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr3	195515414	rs71180964	T	TGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATTCTGAGGAAGTGTC	618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=5.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=-5.316;QD=15.86;ReadPosRankSum=3.338;SOR=1.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr3	195515594	rs13095016	C	G	4849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=51;PP=2037;SC=GTGTGGGTCTCGGTTTGTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=195515602;WS=195515584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	195515617	rs2641776	G	C	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=52;PP=2309;SC=TGTAAGCCCAGTGGATGTGAT;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=195515625;WS=195515607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	195516630	rs3103954	G	T	5422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=79;PP=2965;SC=TAATTTGTTGGGATGTGTGTC;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=163;WE=195516638;WS=195516620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr3	195516878	rs2177336	T	C	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=46;PP=2164;SC=GTGCCAGCTGTCCCTGTAGAT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=95;WE=195516886;WS=195516868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	195517258	rs1106502	G	A	5030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=65;PP=2965;SC=GTCTCTGGAGGTTGGCATTCT;SOR=0.944;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=148;WE=195517266;WS=195517248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr3	195517321	rs1104760	G	A	6068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=90;PP=2965;SC=AGGGGATGAGGTGGTTGTTTC;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=102;TCR=90;TR=192;WE=195517329;WS=195517311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr3	195517553	rs882605	A	C	6814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=112;PP=2965;SC=TCTGGATCAAATGTTACTAAG;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=207;WE=195517561;WS=195517543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr3	195518112	rs142781032	T	TGTCTCCTGCGTAACA	8322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=61;PP=2461;SC=CTGGAGGAGCTGTCTCCATCA;SOR=1.026;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=106;TCF=21;TCR=85;TR=78;WE=195518120;WS=195518100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	195518330	rs3107764	C	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=33;PP=1005;SC=ACTGGGGCAGCAGTTTTACTT;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=195518338;WS=195518320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	195538501	rs143120396	TTC	T	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.637;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,10:0.13:76
chr3	195593677	rs73891160	G	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=346;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GGCCTGCGAGGTGTTGGGCTT;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=16;WE=195593685;WS=195593667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr3	195594151	rs10579442	CCT	C	2503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.945;NF=9;NR=31;PP=1678;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CACACCCACCCCTGTCAGCAC;SOR=0.591;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=40;WE=195594160;WS=195594141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr3	195594805	rs1056749	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=584;ReadPosRankSum=1.390;SC=GGGGAGGGGAAGCAGGTCCAG;SOR=0.996;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=36;WE=195594813;WS=195594795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr3	195594950	rs56260729	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=1049;ReadPosRankSum=0.351;SC=AGAGGGGGCCGGGGAGCCGGC;SOR=1.095;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=62;WE=195594958;WS=195594940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr3	195595054	rs7516	C	T	2712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.143;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=51;PP=1625;ReadPosRankSum=0.773;SC=CACCCTGGGGCGGGAGGAACA;SOR=0.783;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=223;TCF=113;TCR=110;TR=111;WE=195595062;WS=195595044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,130:0.50:260
chr3	195595632	rs13087251	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=523;ReadPosRankSum=-0.724;SC=AGGGTCTGGGACACGAGGGGA;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=27;WE=195595640;WS=195595622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr3	195595701	rs78292793	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.800;SC=CCCAACTCCCCCCGAGGTCTG;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=11;WE=195595709;WS=195595691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	195596501	rs71637188	T	TAG	2085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=1255;SC=GGGCAGAGTGTAGAGAGACGA;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=25;WE=195596509;WS=195596491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	195596636	rs13084875	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=9;PP=315;SC=TGGAGGAGGCCCCAGGCAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=195596644;WS=195596626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	195596907	rs2278034	T	C	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=55;PP=2610;SC=ACAGCAGCCTTAGGGTGGCCT;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=76;TCR=55;TR=131;WE=195596915;WS=195596897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr3	195597288	rs2278033	T	C	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=38;PP=997;SC=GACCCCAGGATGGAAAGCCTA;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=195597296;WS=195597278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr3	195603634	rs11185487	G	A	261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=7;PP=172;SC=AGGGCGGGGCGGGGCACACCC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=195603642;WS=195603624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195603652	rs9815549	T	G	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=7;PP=171;SC=CCCACAACCCTCCCAGGAGCA;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=195603660;WS=195603642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195612034	rs3747672	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=508;SC=TGCCAAACTGTCAGTGGGGCA;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=195612042;WS=195612024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	195615376	rs3747669	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=-2.182;SC=CGTTGAGGTCATCTCGGAGCC;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=31;WE=195615384;WS=195615366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr3	195619254	rs9863553	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-2.438;SC=ACCAGTCCCCAGCAGTCCAGC;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=11;WE=195619262;WS=195619244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr3	195686832	rs201549703	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.45;MQRankSum=-0.008;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	195686868	rs147286278	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.91;MQRankSum=-3.228;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr3	195686899	rs201656277	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQRankSum=-4.283;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr3	195690397	rs148308206	A	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=32.05;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	195701278	rs200131790	C	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=16.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQRankSum=-9.935;QD=4.45;ReadPosRankSum=-2.706;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,49:0.17:288
chr3	195701285	rs201085786	G	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=12.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.11;MQRankSum=-9.439;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.679;SOR=1.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,51:0.17:305
chr3	195701301	rs201657527	A	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=18.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQRankSum=-7.662;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.056;SOR=1.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,59:0.17:346
chr3	195701304	rs200047587	C	T	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=16.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQRankSum=-7.226;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.255;SOR=1.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,61:0.18:347
chr3	195701310	.	C	CAA	1768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=17.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQRankSum=-6.972;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.845;SOR=1.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,64:0.18:351
chr3	195701331	rs78212497	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=4.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQRankSum=-5.163;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.510;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,73:0.20:363
chr3	195701388	rs57251344	GC	AA	4435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.099;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.763;NF=38;NR=60;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CTCCCCACAGGCGTACAGGCC;SOR=0.355;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=194;TCF=63;TCR=131;TR=98;WE=195701397;WS=195701378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,114:0.53:216
chr3	195706589	rs146645407	T	C	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.01;QD=28.14;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	195711042	rs56383352	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-6.473;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,26:0.21:122
chr3	195778727	rs41298099	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=2.027;SC=TCAGGTTTTGTAGCCCTACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=9;WE=195778735;WS=195778717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr3	195789414	rs2239641	T	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=14;PP=787;SC=CAAAAAAGTTTACCTGAATTC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=195789436;WS=195789404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	195789428	rs507131	C	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=16;PP=707;SC=TGAATTCATACACAGCTAATG;SOR=1.105;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=40;WE=195789436;WS=195789404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	195789708	rs2239640	G	T	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=54;PP=2138;SC=AATATGGGAAGGGATGATAAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=195789716;WS=195789698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	195798258	rs480760	T	C	9545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=164;NR=131;PP=2965;SC=ACTGTTTTGCTTTACTTACAG;SOR=0.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=296;TCF=165;TCR=131;TR=295;WE=195798266;WS=195798248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr3	195800811	rs3817672	C	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=726;SC=TTGATGGTGCCGGTGAAGTCT;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=195800819;WS=195800801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	195801938	rs5021790	T	A	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=22;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=331;SC=AAAAAAAAAATAAGGTACAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=195801946;WS=195801928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	195926234	rs939892	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=6;PP=349;SC=CAAGAGCCTTTGCTGTCATGT;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=195926242;WS=195926232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	195926552	rs7630971	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.148;NF=1;NR=17;PP=348;ReadPosRankSum=0.709;SC=AGATGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=2.646;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=18;WE=195926560;WS=195926542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr3	195935207	rs12497404	C	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=454;SC=CTCTGCAGCCCCCTCCTTGGC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=195935215;WS=195935199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	195936446	rs4916502	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=246;SC=GCGGCGGGGGCAGCTCCACGG;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=195936454;WS=195936436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	195937678	rs12718059	G	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=353;SC=CCTGTGGCTTGCTCAGGTCAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=195937686;WS=195937668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	195937977	rs13079891	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=376;ReadPosRankSum=2.041;SC=CCTCCATCCTATCATCTTCTG;SOR=0.207;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=25;WE=195937985;WS=195937967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr3	195938177	rs1522394	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-1.212;SC=GCATCCGTTAAGAGTGTCATG;SOR=0.540;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=11;WE=195938185;WS=195938167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr3	195941216	rs7642243	C	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=548;ReadPosRankSum=-2.833;SC=TTCCGGCTTCCTGCACACAAA;SOR=0.945;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=41;WE=195941224;WS=195941206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,41:0.37:110
chr3	195953775	rs68119320	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=0.697;SC=ATCCGAGGAACAAGCCCAGGC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=195953783;WS=195953765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr3	195954069	rs147316733	A	ACGTCACTTC	1959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.733;NF=5;NR=24;PP=2954;ReadPosRankSum=0.291;SC=TAAACTCAGCACGTCACTTCG;SOR=1.126;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=90;TCF=13;TCR=77;TR=29;WE=195954077;WS=195954059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr3	195955178	rs72611184	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.632;SC=CCCCAGGAGCCGGGGAGCCTC;SOR=0.250;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=12;WE=195955186;WS=195955168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	195955762	rs939885	G	A	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=36;PP=1443;SC=CCTGTTTCTCGTCCCCGACGG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=195955770;WS=195955752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	195956675	rs60276076	C	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=1.242;SC=AGTGAGCTATCATTGCACCTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=195956683;WS=195956665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	195956827	rs17852687	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=282;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ACACTTTCCTTGGCGTGTCCA;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=20;WE=195956835;WS=195956817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr3	195956970	rs67261052	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=295;ReadPosRankSum=3.122;SC=GTTTCATAACCGAGCTACAGA;SOR=0.657;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=17;WE=195956978;WS=195956960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr3	195959859	rs56867360	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GCTCAACTCCCGTGCCCGGGC;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=195959867;WS=195959854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	195959924	rs1476331	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=0.670;SC=TATTTCACCCTACACTGCAGT;SOR=0.929;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=14;WE=195959932;WS=195959914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	195960225	rs9343	A	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.025;NF=3;NR=22;PP=491;ReadPosRankSum=-1.126;SC=ACAATGTTAGAATAAAATTGC;SOR=0.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=25;WE=195960233;WS=195960215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr3	195968281	rs57987393	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=0.355;SC=CTGGTCTCAAACTCCTGGCCT;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=195968289;WS=195968273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	195968643	rs1045075	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=739;ReadPosRankSum=0.369;SC=AGACCGTAACGGCAGAAACTG;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=36;WE=195968651;WS=195968633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr3	195969592	rs77653158	A	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	195975284	rs3772107	C	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=1.326;SC=ACTCTGTCACCCAGGCTGGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=195975292;WS=195975274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	195994049	.	C	CA	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=55.24;NF=1;NR=3;PP=44;QD=11.75;SC=GACTCAGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=4;WE=195994057;WS=195994039;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,4:0.18:22
chr3	196022750	rs2293160	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=-0.133;SC=AGTAAAATCATTTCATTCACA;SOR=0.257;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=196022758;WS=196022740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr3	196044894	rs2270769	G	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=521;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CCCCGCCACAGCCCGTCCTCT;SOR=0.445;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=36;WE=196044902;WS=196044884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr3	196054439	rs6785339	T	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=1.032;SC=TGAGCTTGCCTGCGTGCAGGG;SOR=0.188;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=25;WE=196054447;WS=196054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr3	196054488	rs6782336	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=-0.037;SC=AGGGAGTCGCAGCAGCTCTGC;SOR=0.375;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=196054496;WS=196054478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	196096451	rs9860931	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CCTTCTTATACACCAACATCA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=196096459;WS=196096441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	196118621	rs6583305	A	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.577;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=877;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GTAATTTTTTAAAAAAAGGCA;SOR=0.537;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=54;WE=196118629;WS=196118611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,49:0.41:120
chr3	196118868	rs6779332	A	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.022;NF=1;NR=5;PP=109;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AAAAAAAAAAACACAAACTTC;SOR=0.330;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=196118876;WS=196118858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	196158468	rs10532490	TCC	T	833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.674;NF=12;NR=3;PP=496;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CGCCATCGTCTCCGTCTTTAT;SOR=1.265;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=15;WE=196158477;WS=196158458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr3	196199204	rs3796129	G	T	5720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=93;PP=2965;SC=AGAAAAGCATGGATCCTTGAC;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=183;WE=196199212;WS=196199194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	196210590	rs7643192	A	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=473;SC=AACAGAAAACACTGGCATACA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=196210598;WS=196210580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	196210808	rs7646174	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=635;SC=GAGAGAACTTTATGATAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=196210816;WS=196210798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	196210894	rs7646273	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=114;SC=TCTGTACATCTCTTGAAGAAT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=196210902;WS=196210884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	196215451	rs62798260	CA	C	312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.06;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	196215660	rs11185543	G	A	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=325;SC=ATTAATAACTGCAGCAATATC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=196215668;WS=196215650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	196236244	rs6803596	T	C	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=0;PP=906;SC=CAAATTAATCTTTTTTTAAAA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=196236252;WS=196236234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	196281208	rs9311	T	C	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=104;PP=2965;SC=TATTTAGCTTTGGTAAAATGT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=110;TCR=104;TR=214;WE=196281216;WS=196281198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr3	196294104	rs9842616	C	G	4646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=87;PP=2763;SC=CTACAGGCTTCGGGTTTCTGA;SOR=1.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=59;TCR=87;TR=146;WE=196294112;WS=196294094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	196386964	rs1798631	C	G	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.355;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=968;ReadPosRankSum=-0.881;SC=ACATGGCAGCCCTCATGCTCC;SOR=1.042;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=60;WE=196386972;WS=196386954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,71:0.38:189
chr3	196388099	rs62623661	G	C	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1609;ReadPosRankSum=1.721;SC=CAGCTTTATGGCGTTGGACTT;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=94;WE=196388107;WS=196388089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,114:0.47:242
chr3	196434364	rs67479689	AGTCTG	A	602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.086;NF=11;NR=0;PP=509;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTCCAGAACCAGTCTGGTAAT;SOR=2.224;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=11;WE=196434376;WS=196434354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr3	196435331	rs55901490	CAG	C	1761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.958;NF=16;NR=14;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.048;SC=CAGTCCCTGACAGAGTCATGA;SOR=0.826;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=30;WE=196435340;WS=196435321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr3	196435534	rs6776064	T	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=42;PP=772;ReadPosRankSum=1.894;SC=ATCATTCCCATGTACATGTCC;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=60;WE=196435542;WS=196435524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr3	196443803	rs1906044	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=346;ReadPosRankSum=1.768;SC=GTAAGTTGCCTGTTGATTTCT;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=23;WE=196443811;WS=196443793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr3	196443826	rs1906045	A	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=373;ReadPosRankSum=-1.633;SC=TTCTATTAAAATAATGTGTCA;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=21;WE=196443834;WS=196443816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr3	196448103	rs9864896	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=258;ReadPosRankSum=-1.442;SC=GCCATGGAGGCGGTTCCTTTT;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=18;WE=196448111;WS=196448093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr3	196453427	rs1976847	C	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=893;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TAATATTGCTCCTGTACTCTA;SOR=1.157;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=133;TCF=96;TCR=37;TR=55;WE=196453435;WS=196453417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,59:0.43:137
chr3	196453467	rs1568603	A	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1500;ReadPosRankSum=0.143;SC=TAATATGATGAATGATTTGGA;SOR=0.834;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=194;TCF=120;TCR=74;TR=91;WE=196453475;WS=196453457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,101:0.47:216
chr3	196453654	rs12637375	C	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=684;ReadPosRankSum=-1.943;SC=TTAGTACATACAGTTTCTACT;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=38;WE=196453662;WS=196453644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr3	196541580	rs11185455	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=492;ReadPosRankSum=2.287;SC=CTCCATCTCCGTGCCATTTCA;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=26;WE=196541588;WS=196541570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr3	196613683	rs150375675	A	AG	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=200;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TAAACCAGTTAGTCTGCTTGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=196613691;WS=196613673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	196626689	rs9842002	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=222;ReadPosRankSum=2.218;SC=AAAATTTTTGGCATATATGAC;SOR=0.465;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=14;WE=196626697;WS=196626679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	196627088	rs9825635	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=-1.433;SC=TTTGATTACTATTGGCAGTAA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=196627096;WS=196627078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	196627335	rs6764463	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=0.012;SC=TGTATTAAAATGAGTAGTTTT;SOR=0.321;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=21;WE=196627343;WS=196627325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr3	196627356	rs9810317	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=6.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.59;ReadPosRankSum=-1.425;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr3	196627361	rs6772870	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.21;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=0.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr3	196656772	rs1602	G	A	102.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AAGTGTGGGTGTCATCCATGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=196656780;WS=196656762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
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chr3	196666059	rs553783	A	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=754;ReadPosRankSum=-0.788;SC=AGGGACGCTTATGAGCTACCA;SOR=0.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=83;TCR=34;TR=47;WE=196666067;WS=196666049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr3	196669488	rs3214858	C	CA	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.720;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=381;ReadPosRankSum=0.615;SC=CCGAGGGCGGCGTGTCGTCAT;SOR=1.760;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=12;WE=196669496;WS=196669478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr3	196669912	rs335824	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=-0.948;SC=GGGCCGAGGCCGCTTGCTTTT;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=20;WE=196669920;WS=196669902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr3	196674749	rs4916589	C	T	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GACTTGCAGCCGTTGCCACGC;SOR=0.749;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=67;WE=196674757;WS=196674739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr3	196674879	rs12636891	A	G	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=61;PP=1865;ReadPosRankSum=0.085;SC=TTGTAGTGCAAGAAGTTGACA;SOR=0.547;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=274;TCF=147;TCR=127;TR=126;WE=196674887;WS=196674869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,151:0.47:324
chr3	196674916	rs1147240	A	C	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=1478;ReadPosRankSum=1.578;SC=TCCTGGATGTAGCGGGGCTGG;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=122;WE=196674924;WS=196674906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,140:0.46:307
chr3	196674972	rs574365	CT	TC	3852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.372;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=2944;ReadPosRankSum=-2.193;SC=GCTGTGAGGGCTGCCCCAGGG;SOR=0.525;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=188;TCF=74;TCR=114;TR=85;WE=196674981;WS=196674962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,102:0.47:216
chr3	196735808	rs41284045	G	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=770;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TCACGGGCACGCAGCTGGCAT;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=54;WE=196735816;WS=196735798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr3	196736575	rs41284047	A	G	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1019;ReadPosRankSum=1.107;SC=AGGGCTGCCGAAACCGGCGTG;SOR=0.758;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=69;WE=196736583;WS=196736565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,91:0.54:170
chr3	196742290	rs9855410	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=459;ReadPosRankSum=-0.276;SC=ACTGGATCTCTGGCTTGAGCC;SOR=0.351;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=40;WE=196742298;WS=196742280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr3	196742395	rs41284049	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=763;ReadPosRankSum=-1.562;SC=GCCCTGGGGTGGGGCAAGCAA;SOR=0.588;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=46;WE=196742403;WS=196742385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr3	196743130	rs6779362	T	C	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=850;ReadPosRankSum=1.615;SC=CATAGGTCTGTGTGGCGATGG;SOR=1.108;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=150;TCF=101;TCR=49;TR=57;WE=196743138;WS=196743120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,66:0.38:172
chr3	196746629	rs1056664	T	C	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1002;ReadPosRankSum=0.063;SC=ACTCGCCTTCTTCCTCCTCAG;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=60;WE=196746637;WS=196746619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr3	196749798	rs2288766	T	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=10;PP=602;SC=CTCCCTGCCCTCGGCCCCTCC;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=196749806;WS=196749788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	196750016	rs2288765	A	G	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=878;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GTCACTCAGCAGAACTTTCTT;SOR=0.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=49;WE=196750024;WS=196750006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr3	196750841	rs2280294	C	A	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=55;PP=2129;SC=ACACAGTGACCTGCGCCCGGT;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=196750849;WS=196750831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	196751474	rs2280296	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=1.014;SC=GCTGTACACACGGATGTGTGC;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=196751482;WS=196751464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	196754519	rs2276789	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=377;ReadPosRankSum=0.313;SC=CCTATCGGCCGGGCCTGGCAG;SOR=1.565;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=23;WE=196754527;WS=196754509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr3	196754819	rs2276788	C	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=1.254;SC=CTCCCCCGCCCTGCCCAGCCC;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=6;WE=196754827;WS=196754809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	196754856	rs12637442	C	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTGGCTCCAGCAGTTCTGTGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=196754864;WS=196754846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	196778438	rs7629533	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1311;ReadPosRankSum=1.570;SC=TGTTACAACACGGTTCCAACC;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=215;TCF=120;TCR=95;TR=86;WE=196778446;WS=196778428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,100:0.39:257
chr3	196795720	rs6804448	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=-0.127;SC=ATAAAGCTAATGATAATTTAG;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=11;WE=196795728;WS=196795710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	196795879	rs57032552	A	ACT	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CACAAATAATATTTTTATTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=196795887;WS=196795869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	196803647	rs12632559	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=0.872;SC=AGCTGACTCCTATGACCACAG;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=196803655;WS=196803637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	196869688	rs7628652	A	G	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=35;PP=1339;SC=TGTAAAATCCAAAATGGCAAG;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=196869696;WS=196869678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	196869820	rs9866550	T	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-1.732;SC=CAAATGTGATTAATGAGTTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=196869828;WS=196869810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	197020630	rs364644	G	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=15;PP=995;SC=ATAACTCACTGCGGCCTAAAC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=197020638;WS=197020620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	197020718	rs434681	T	C	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=51;PP=1884;SC=AAGACCCCTGTTCTCCTTTAA;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=197020726;WS=197020708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	197020780	rs3836429	G	GA	2171.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1801;SC=CTTACTGAGAGAAAAAACCTT;SOR=1.394;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=52;WE=197020788;WS=197020770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	197020871	rs450891	G	A	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.49;NF=5;NR=16;PP=438;SC=GCTTAGGGCAGTTTACAAGCT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=197020879;WS=197020861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	197249693	rs3828369	C	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=960;ReadPosRankSum=0.221;SC=CCTTCCTTCCCACCCTGAGGC;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=54;WE=197249701;WS=197249683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr3	197361995	rs56411292	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=3.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQRankSum=-6.116;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.020;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,27:0.14:194
chr3	197362030	rs2451791	C	T	3451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.681;NF=99;NR=53;PP=2098;ReadPosRankSum=0.321;SC=CTTCATCTCACGATAAAGACA;SOR=0.814;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=281;TCF=179;TCR=102;TR=152;WE=197362038;WS=197362020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,163:0.53:307
chr3	197362080	rs9815968	T	A	3279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.629;NF=75;NR=67;PP=1989;ReadPosRankSum=0.886;SC=CAGAAGAAGATGAAGATGAAG;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=369;TCF=189;TCR=180;TR=142;WE=197362088;WS=197362070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,166:0.40:420
chr3	197362184	rs9867990	C	T	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.90;MQRankSum=-6.773;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.523;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr3	197362187	rs9867993	C	T	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.86;MQRankSum=-6.403;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.744;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,60:0.48:124
chr3	197482760	rs13068986	C	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.620;NF=14;NR=11;PP=363;ReadPosRankSum=1.091;SC=GGAAAATGGACGCTTCTGCGA;SOR=0.986;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=25;WE=197482768;WS=197482750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr3	197483279	rs6794391	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=790;ReadPosRankSum=1.855;SC=AAAATAATTGACATTTCCTCT;SOR=0.537;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=115;TCF=86;TCR=29;TR=51;WE=197483287;WS=197483269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr3	197495334	rs3205525	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=537;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AGTCTGAATCGTAGAGGAAGA;SOR=0.532;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=41;WE=197495342;WS=197495324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr3	197496984	rs1708460	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GATTAACATAATTTCTTGCCT;SOR=0.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=8;WE=197496992;WS=197496974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	197500394	rs3830497	T	TTTTG	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=768;ReadPosRankSum=1.519;SC=TTGGCAGTGTTTTTGTTTGTT;SOR=0.917;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=20;WE=197500410;WS=197500384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,43:0.41:106
chr3	197544201	rs1273552	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-1.257;SC=ATTGTCCAACATGTGTGTGTG;SOR=0.169;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=197544209;WS=197544191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	197544213	rs376394506	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	197544214	rs369081077	TG	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	197544217	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr3	197566084	rs4857594	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CTATTAAAATGTTTTTTAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=197566092;WS=197566074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	197566254	rs17850206	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=359;ReadPosRankSum=1.149;SC=TGAGAAGATATTTACATCAAA;SOR=1.051;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=22;WE=197566262;WS=197566244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr3	197574248	rs73089359	T	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=376;ReadPosRankSum=-1.056;SC=TATCAAAGAGTTTTTTTCTTT;SOR=0.678;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=24;WE=197574256;WS=197574238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr3	197574960	rs77727730	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=-0.219;SC=GGTCAGGCCCGTTGGTTTTTA;SOR=0.269;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=13;WE=197574968;WS=197574950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	197579466	rs36078463	C	T	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=57;PP=1348;ReadPosRankSum=-1.396;SC=AAACAGCACCCGCTCCTAGAT;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=194;TCF=76;TCR=118;TR=90;WE=197579474;WS=197579456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,111:0.46:240
chr3	197597194	rs11185486	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=0.348;SC=TATTACTGCTATAGATCATAA;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=18;WE=197597202;WS=197597184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	197639381	rs9809736	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.703;SC=TTACAGCTATATAAGATATCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=197639389;WS=197639380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	197653029	rs374393205	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-0.252;SC=CAAAACTTACGTGCACAAGGA;SOR=0.960;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=20;WE=197653037;WS=197653019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
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chr3	197672589	rs148926939	TA	T	839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=889;ReadPosRankSum=0.738;SC=GAGATTAGTTTATGGGCGTCT;SOR=0.473;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=22;WE=197672597;WS=197672579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr3	197687433	rs113060473	G	GA	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=0.221;SC=GGCAGAGCCTGACTCTTACAG;SOR=1.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=197687441;WS=197687423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr3	197710959	rs77196201	T	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=58;PP=1374;ReadPosRankSum=0.360;SC=CATGCCTTGATTTTCTGCTTA;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=63;TCR=120;TR=86;WE=197710967;WS=197710949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,101:0.48:212
chr3	197717568	rs74683446	T	C	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=70;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCAGACTTCATGTCTCATGAG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=91;TCR=147;TR=113;WE=197717576;WS=197717558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,143:0.49:289
chr3	197717643	rs150387425	A	ATATT	1387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=1324;ReadPosRankSum=-2.019;SC=AGAACTTATAATTAGAGCCTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=26;WE=197717651;WS=197717633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr4	53428	rs2859214	G	A	13080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=329;PP=2965;SC=GGGAGGCCTCGTCGGAACCGG;SOR=2.526;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=419;TCF=90;TCR=329;TR=419;WE=53436;WS=53406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,446:1.00:446
chr4	60210	rs3908749	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,25:0.15:165
chr4	60335	rs2780400	A	T	3972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=82;PP=2371;ReadPosRankSum=-1.128;SC=TTGCTTTTAGAGACATAGGAG;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=201;TCF=87;TCR=114;TR=146;WE=60343;WS=60325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,172:0.71:241
chr4	60367	rs79951480	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.26;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,20:0.11:182
chr4	60400	rs3864128	G	A	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=56;PP=1410;ReadPosRankSum=0.441;SC=TATTATTTTCGCATCATGCCT;SOR=1.480;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=73;WE=60408;WS=60390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,77:0.68:113
chr4	85995	rs61336127	C	CA	4316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=36;PP=2946;SC=AGAAACCCTACAATGTGAAAA;SOR=0.750;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=52;WE=86003;WS=85985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	86016	rs57253237	G	GC	4015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.90;QD=46.16;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	86022	rs74490941	C	A	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.48;QD=46.37;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	86022	.	CAG	ATA	1009	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MMLQ=28;MQ=45.59;NF=1;NR=3;PP=1009;QD=268.116968716;SC=CAAAGCTTTACAGGGTCCACA;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=4;WE=86052;WS=86006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,4:0.17:24
chr4	86023	rs78362263	A	T	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.29;QD=48.82;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	86024	rs77715101	G	A	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.35;QD=48.18;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	86031	rs367720730	CA	C	3157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.94;QD=45.11;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	86032	.	AAT	A	531	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MMLQ=28;MQ=44.78;NF=1;NR=3;PP=531;QD=139.5;SC=CAGGGTCCACAATCCACTGAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=86052;WS=86006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	86034	rs57594632	TC	T	3246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.86;QD=47.75;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	86040	rs17853557	G	T	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.08;QD=47.76;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	86042	rs17857099	A	G	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.94;QD=47.19;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	86044	rs17857100	G	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.86;QD=45.23;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	86101	rs58319295	G	GC	4810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=34;PP=2957;SC=ATGTGGCAAAGCTTTAGACGG;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=68;WE=86109;WS=86091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	86738	rs2353625	A	G	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=61;PP=2883;SC=TCCATTCTGGACAAAAACCTT;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=132;WE=86746;WS=86728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	87277	rs2006764	G	C	6413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=83;PP=2965;SC=TGTGGCAAAGGTTTTAATCGG;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=183;WE=87285;WS=87267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr4	87313	rs60154095	G	GA	9687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=109;PP=2957;SC=GTACACAAGCGATTCATACTG;SOR=0.831;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=30;TCR=110;TR=135;WE=87321;WS=87303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr4	135694	rs12504142	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.593;SC=GTTATTTTCAGTGCATGTTTT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=135702;WS=135684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr4	135903	rs147846103	T	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=458;ReadPosRankSum=0.080;SC=CCTCCACATTTTTGGAACTGT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=30;WE=135911;WS=135893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr4	263968	.	C	CTATGTACATAAAGGTTTCCGGACTGTCTAAAGGCTTTGCCACATT	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.041;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	264941	rs11731285	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=-1.666;SC=TATGAGGACCACTTAAAGGCT;SOR=1.281;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=26;WE=264949;WS=264931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
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chr4	331693	rs5855672	G	GC	6835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=62;PP=2957;SC=TTCGGCCACAGCTCAGCCTCC;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=106;WE=331701;WS=331683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
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chr4	338205	rs80052234	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=8.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-5.641;QD=5.12;ReadPosRankSum=4.456;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,27:0.19:145
chr4	338246	rs79348421	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=6.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-5.341;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,22:0.21:107
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chr4	338258	rs80241916	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-3.637;QD=7.29;ReadPosRankSum=-3.234;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,17:0.19:91
chr4	338260	rs76915575	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-3.138;QD=5.17;ReadPosRankSum=-2.955;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,15:0.17:89
chr4	338266	rs74323716	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-3.876;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,13:0.16:80
chr4	343795	rs3037605	C	CTGCT	3894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;NF=29;NR=28;PP=2957;SC=AGTCACAGGGCTCAGGAGCAC;SOR=1.286;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=57;WE=343803;WS=343785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	376888	rs6854214	C	A	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=33;PP=1561;SC=TTTCAGAATTCTTCCATCTCT;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=376896;WS=376878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	420688	rs2280250	C	T	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=63;PP=2609;SC=GGTATGAGTTCCTCTACTTCG;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=118;WE=420696;WS=420678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	429720	rs894534	T	C	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=94;PP=2730;SC=GATAATGAGATGCTGATGAGT;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=160;WE=429728;WS=429710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr4	499439	rs57099085	T	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=137;SC=AAAAAAAAAATCTTCAGTGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=499447;WS=499430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	500500	rs17721401	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=708;SC=GACAGCTCTATTGGGGGCTGA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=500508;WS=500490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	500631	rs4690182	A	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=43;PP=1464;SC=CAGCTTCATCATCCTGCTGGT;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=500639;WS=500621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	628693	rs72613106	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=0.759;NF=0;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TTCTGTGCTGCGCATCCACCT;SOR=1.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=8;WE=628701;WS=628683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr4	647503	rs28569875	G	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=-2.038;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr4	647506	rs9992641	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.74;ReadPosRankSum=-1.670;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	648643	rs10902758	G	A	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=84;PP=2897;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GATCGACTACGTCCTCCACGG;SOR=0.442;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=53;TCR=85;TR=137;WE=648651;WS=648633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr4	648709	rs10027549	G	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.995;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=404;ReadPosRankSum=-2.167;SC=AAGCGTCCCCGGGGGAGGGAC;SOR=1.560;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=28;WE=648717;WS=648699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr4	649639	rs28742899	C	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=256;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GCCCCTCTCACCCCTGCACAC;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=19;WE=649647;WS=649629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr4	649876	rs28630797	C	T	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=1113;ReadPosRankSum=0.800;SC=GTCTCTGCCACGTCCCGCCCT;SOR=0.584;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=177;TCF=67;TCR=110;TR=76;WE=649884;WS=649866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,84:0.42:198
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chr4	658089	rs7436737	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=0.055;SC=TAACCCTGCAGCCCTCCCCAG;SOR=2.742;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=15;WE=658097;WS=658079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
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chr4	680599	rs76995815	G	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=0.125;SC=GGGACACAGCGAGCTGGACAC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=680607;WS=680589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr4	738512	rs6841958	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.579;NF=5;NR=26;PP=672;ReadPosRankSum=0.125;SC=AGTGTTAGTGTTCGCCGTGGA;SOR=0.078;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=31;WE=738520;WS=738502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr4	755210	rs2242235	A	G	5794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.391;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=1.071;SC=ACGAGGTAACAGTTGATCCCT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=321;TCF=138;TCR=183;TR=212;WE=755218;WS=755200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,258:0.66:388
chr4	759709	rs6810428	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.224;SC=GCAGCCCTGCATGTGGACTGT;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=30;WE=759741;WS=759699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr4	759721	rs62294078	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GTGGACTGTGCCTCACGGGAC;SOR=0.848;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=36;WE=759741;WS=759699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr4	759733	rs6816483	T	C	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=21;PP=1763;SC=TCACGGGACGTGATTCCTCAG;SOR=1.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=759741;WS=759699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	759872	rs73058482	T	C	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=59;PP=1263;ReadPosRankSum=0.623;SC=CTGTGAATGGTGCCACACAGC;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=66;TCR=97;TR=101;WE=759880;WS=759862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,112:0.57:197
chr4	780286	rs10794536	C	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=29;PP=1947;SC=GTCCCGCGCGCGGCTACTTCT;SOR=1.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=94;WE=780294;WS=780276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	780549	rs13128363	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=-2.309;SC=CGCAGCCTCCCTGCGCCAGGG;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=12;WE=780557;WS=780539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr4	786401	rs2306251	T	C	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=1346;ReadPosRankSum=0.583;SC=TGGCCCCTGGTACAGAAGTTG;SOR=0.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=43;TCR=76;TR=79;WE=786409;WS=786391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,96:0.64:149
chr4	786508	rs2306250	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=13;PP=408;SC=CTCCATCCACTCGACCCTCTG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=786516;WS=786498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	818440	rs2276906	G	A	8201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=133;PP=2965;SC=CCCCTGCCTGGCCTTCCCCAG;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=127;TCR=133;TR=260;WE=818448;WS=818430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr4	843622	rs33919242	AC	A	6694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.126;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.05;MQRankSum=0.536;NF=23;NR=79;PP=2985;ReadPosRankSum=1.507;SC=GCGGGGCAGGACCCCCCCCCC;SOR=0.201;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=164;TCF=28;TCR=136;TR=102;WE=843638;WS=843612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,167:0.78:213
chr4	843627	.	C	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=12.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.500;QD=2.68;ReadPosRankSum=-1.450;SOR=1.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,46:0.21:222
chr4	843630	.	C	T	6811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=12.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.522;QD=30.68;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,176:0.79:222
chr4	843695	rs8093	A	G	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=88;PP=2965;SC=CGGGGTGCACAGCCAGCACCG;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=68;TCR=88;TR=156;WE=843703;WS=843685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	844781	rs75072999	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=652;ReadPosRankSum=0.070;SC=TCTCTGCAATGGTCTTTGGCC;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=49;WE=844789;WS=844771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,53:0.31:169
chr4	845772	rs10031922	T	C	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=69;PP=1595;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CCTGTGGAGATGGAGATCGGA;SOR=0.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=99;WE=845780;WS=845762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr4	845841	rs17165087	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CAGAGCACCACGTATATTGGA;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=20;WE=845849;WS=845831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
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chr4	858874	rs3214922	T	TC	5325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=47;PP=2954;SC=CAGCTGCACGTCTGGGAGCCC;SOR=0.790;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=74;WE=858882;WS=858856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
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chr4	871675	rs1564280	A	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=32;PP=1011;SC=TTTCGAATAGAAGTTTTTCAT;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=871683;WS=871654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	875671	rs45486093	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=341;ReadPosRankSum=1.145;SC=AGCTGTCCCCTGTCCCCGGAG;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=21;WE=875679;WS=875661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr4	875887	rs2279186	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=0.276;SC=AAGGGCTCGCGGGGTCCTCGG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=17;WE=875895;WS=875877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr4	876318	rs3736087	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=2.625;SC=GGCCATCTGTCATCTGTCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=876326;WS=876308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	877709	rs3736083	T	C	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=1;PP=388;SC=CCTGTGAGTCTGTGGCCACAG;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=877717;WS=877699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	878048	rs899387	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-0.790;SC=CGGCTGTGTGCGTGCTGTGGA;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=12;WE=878056;WS=878038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr4	887513	rs33951409	AC	A	559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.86;NF=13;NR=5;PP=346;SC=CTCTCTGGAAACCCCCCCCCC;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=18;WE=887521;WS=887504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	892082	rs3830209	TGCA	T	1439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=1426;SC=GCCGGGTGCCTGCAGCACCTC;SOR=3.193;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=29;WE=892092;WS=892072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	906131	rs11248057	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=0.768;SC=ACGAGAGGGGCGGCTGAGAAG;SOR=0.242;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=906139;WS=906121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr4	906647	rs2279178	A	G	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=90;PP=2965;SC=CACCCGATGCATCATCTCAGA;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=65;TCR=90;TR=155;WE=906655;WS=906637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr4	942006	rs2290403	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=0.722;SC=CCCGAGGCTCGACCTGGCACA;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=33;WE=942014;WS=941996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr4	944210	rs34884217	A	C	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GTATTCCAGCAGTTCGACAGA;SOR=0.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=94;WE=944218;WS=944200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,111:0.51:216
chr4	946226	rs11552301	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=134;ReadPosRankSum=-0.813;SC=TGATCGCCATTGGGGTCGTGC;SOR=0.861;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=16;WE=946234;WS=946216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr4	946974	rs2290405	G	A	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=40;PP=1365;ReadPosRankSum=-2.545;SC=TGCTTTTCCCGCAGGCACTGA;SOR=0.547;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=161;TCF=97;TCR=64;TR=94;WE=946982;WS=946964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr4	951947	rs34311866	T	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=724;ReadPosRankSum=-1.360;SC=CAGCTGGCCATGTGGACCACG;SOR=0.781;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=54;WE=951955;WS=951937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr4	954247	rs3733345	G	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=141;ReadPosRankSum=0.382;SC=GGATGAGGGCGGGTCCCGCTC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=954255;WS=954237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	954275	rs3733346	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr4	954275	.	TGT	CGC	184	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=11;NR=4;PP=184;QD=15.8311916575;SC=GGGAAGATGCTGTGGTCAGGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=15;WE=954285;WS=954265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,15:0.43:35
chr4	954277	rs3733347	T	C	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=342;SC=GAAGATGCTGTGGTCAGGGCT;SOR=1.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=36;WE=954285;WS=954265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	954311	rs3733349	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=496;ReadPosRankSum=-1.063;SC=ACCACAGGGCCGGCCACTGTG;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=29;WE=954319;WS=954301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
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chr4	960081	rs4690324	G	A	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=95;PP=2965;SC=TCTGCAGCTCGAGGCCTCCCT;SOR=1.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=35;TCR=95;TR=130;WE=960089;WS=960071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
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chr4	994414	rs3755955	G	A	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.224;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=791;ReadPosRankSum=0.562;SC=TCCACTGGACGGGGCCTGAGC;SOR=1.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=44;WE=994422;WS=994404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
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chr4	995459	rs6848974	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1188;ReadPosRankSum=1.635;SC=AGTGCTCCCCCGGCCCAGGCT;SOR=0.437;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=66;WE=995467;WS=995449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,76:0.59:128
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chr4	996165	rs6831280	G	A	3669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=84;PP=2182;ReadPosRankSum=0.578;SC=GCACCCCTTCGCGCAGCGCAC;SOR=0.703;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=255;TCF=110;TCR=145;TR=150;WE=996173;WS=996155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,168:0.56:299
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chr4	996690	rs73066479	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=833;ReadPosRankSum=1.732;SC=CAACCGCAGCGTCGCGGTGAC;SOR=0.490;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=47;WE=996698;WS=996680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr4	996768	rs115134980	T	C	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=1.291;SC=CTGGCCCCGCTGGGGCTCTGG;SOR=0.630;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=66;WE=996776;WS=996758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr4	996888	rs115929690	C	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=629;ReadPosRankSum=1.873;SC=AGTGGCGGCGCCTGGGCCGGC;SOR=0.703;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=43;WE=996896;WS=996878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr4	997095	rs1131853	T	C	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=91;SC=CGTCCCCAGCTCCCCTGGAGA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=997103;WS=997085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	997485	rs2305488	T	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=1023;ReadPosRankSum=0.447;SC=CCTTCACCCATGCGGTCACTC;SOR=0.619;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=36;TCR=86;TR=67;WE=997493;WS=997475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,77:0.57:135
chr4	1006333	rs4647942	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=673;ReadPosRankSum=0.465;SC=GGGCCTTCCCGCCGGCCGCCG;SOR=0.969;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=102;TCF=30;TCR=72;TR=45;WE=1006354;WS=1006323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr4	1016279	rs4647934	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=0.046;SC=TCGCTGCTGCGGTCAGAGGTC;SOR=0.372;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=16;WE=1016287;WS=1016269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr4	1050437	rs7680608	C	G	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=159;SC=TCATAATTTTCGAAATTCACA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=1050445;WS=1050427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	1050653	rs3816474	G	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=780;SC=AGCAGGCTGGGGATGCTGATG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=1050661;WS=1050643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	1050849	rs10003009	GT	AC	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=857;ReadPosRankSum=1.391;SC=TGGTGACACGGTAGTTACAGC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=23;WE=1050858;WS=1050839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr4	1050909	rs9992925	A	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CATCTCTGAGAACCTCGGAGC;SOR=0.602;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=12;WE=1050917;WS=1050899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	1052009	rs13114658	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=-2.260;SC=TTTCCTTTAAAACGCTGTGAA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=1052017;WS=1052002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	1052046	.	TGTGAAGAAGGTGCTTGCGGGGGTTAGAACGCA	T	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.80;ReadPosRankSum=-2.052;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr4	1052078	.	A	T	319	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=13;NR=5;PP=319;QD=19.6539562526;SC=GTTAGAACGCAGTGAAGAAGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=18;WE=1052086;WS=1052068;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr4	1052125	rs11724371	T	C	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=543;ReadPosRankSum=0.604;SC=GGCTTTCCCATGCTCCTCTGA;SOR=0.984;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=38;WE=1052133;WS=1052115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr4	1052166	rs2248083	A	C	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=615;ReadPosRankSum=1.372;SC=CTCGGGGCCCAGGGAGGAGAC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=53;WE=1052174;WS=1052156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr4	1052206	rs2045069	T	C	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.74;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr4	1052212	rs2045068	G	A	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr4	1052355	rs2045067	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=1.297;SC=AGGTTGCGGGCAGCCCTGGTG;SOR=2.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=9;WE=1052363;WS=1052345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr4	1067267	rs2290408	G	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.180;SC=CCCATGCACCGGGTGGAAGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=1067275;WS=1067262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	1067638	rs6852155	T	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=514;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GTGGTAGAGGTGGTGTGGGTG;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=25;WE=1067646;WS=1067628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr4	1084582	.	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=1.255;SC=TTTCTCTATAGAAGGCTAACA;SOR=1.038;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=20;WE=1084590;WS=1084572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr4	1084723	rs658846	G	C	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=19;PP=615;SC=ACTCTCAGGAGAGCTCACAGT;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=1084731;WS=1084713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	1087168	rs61648964	A	AAT	1998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,56:0.28:199
chr4	1087171	rs59985183	G	T	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,60:0.29:206
chr4	1087265	rs1670534	T	C	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=4.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,105:0.32:329
chr4	1087327	rs138488801	G	GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	2866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=3.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.988;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,72:0.29:245
chr4	1087329	rs118112880	C	T	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.412;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,68:0.28:246
chr4	1087338	rs11725984	C	T	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,67:0.29:230
chr4	1087799	.	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=1.303;SC=GAAAGCCTGAGATACTGTGGG;SOR=0.289;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=20;WE=1087807;WS=1087789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr4	1087901	rs13106356	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-1.349;SC=AAGCCCATGAAGGAGAGTGCC;SOR=0.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=1087909;WS=1087891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr4	1090625	rs4045481	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,81:0.25:319
chr4	1102050	rs4974644	C	T	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=19;PP=1138;SC=TTAGACACCACAAATGACTAA;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=1102058;WS=1102040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	1102195	rs78238785	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=0.057;SC=CTTTTTACCTATAAAATAAAA;SOR=1.236;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=22;WE=1102203;WS=1102185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr4	1161480	rs17164384	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=373;ReadPosRankSum=-1.352;SC=GGTGAACGCTCGCGTGAAGAG;SOR=0.901;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=29;WE=1161488;WS=1161470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,31:0.30:104
chr4	1164059	rs73067775	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=-0.677;SC=AAATCTTCTAGGCACCATCTT;SOR=1.139;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=16;WE=1164067;WS=1164049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr4	1164277	rs2279279	C	G	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.192;NF=43;NR=35;PP=1692;ReadPosRankSum=-1.582;SC=CGCAGCCGCACCAGTGTCACC;SOR=0.902;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=78;WE=1164285;WS=1164267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,83:0.59:140
chr4	1164378	rs140283251	AGAG	A	4164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.369;NF=21;NR=46;PP=2536;ReadPosRankSum=1.779;SC=GGGAGGAAGAAGAGGAGGTTG;SOR=0.625;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=189;TCF=70;TCR=119;TR=67;WE=1164388;WS=1164368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,116:0.39:300
chr4	1164461	rs73067776	G	A	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.213;NF=52;NR=46;PP=1178;ReadPosRankSum=-1.189;SC=CGTCCAGCGTGCCCTCTGCAC;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=254;TCF=128;TCR=126;TR=98;WE=1164469;WS=1164451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,116:0.37:312
chr4	1164552	rs13115935	A	G	5915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=100;PP=2965;SC=AGGAAGGGGCAGCCTCCTCGG;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=182;WE=1164560;WS=1164542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr4	1165130	rs11247975	G	T	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=941;ReadPosRankSum=0.118;SC=CGAAAACACCGCGTGCACGCT;SOR=0.660;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=46;WE=1165138;WS=1165120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,57:0.66:87
chr4	1165741	rs922697	A	G	6782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.45;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr4	1165741	.	AGGGCTCT	GGGGCTCC,GGGGCTCT	1556	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=18,66;NR=33,93;PP=585,1556;QD=12.5189779385;SC=GTATTTGGCCAGGGCTCTGGC;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=51,159;WE=1165756;WS=1165731;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.32:159
chr4	1165748	rs6836335	T	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=3.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,68:0.36:190
chr4	1194586	rs77049343	T	A	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1466;ReadPosRankSum=0.333;SC=CTGCCTTTGCTGTGAGCAAGT;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=121;TCR=113;TR=94;WE=1194594;WS=1194576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,109:0.40:270
chr4	1194630	rs56401136	T	C	4205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=72;PP=2680;ReadPosRankSum=0.141;SC=TGGGGCCAAGTCTGCAGTGTC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=285;TCF=155;TCR=130;TR=158;WE=1194638;WS=1194620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,191:0.55:346
chr4	1207517	rs11247979	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=109;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CCCACGGCCCTGCTCTGCTCG;SOR=0.073;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=1207525;WS=1207507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	1217056	rs2004531	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=0.692;SC=GGGCAGAGGTGTGAGGAACAG;SOR=0.743;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=18;WE=1217064;WS=1217046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr4	1243329	rs79746330	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=0.367;SC=AGCTGCCGCCCTCCCGCGCTC;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=16;WE=1243337;WS=1243319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr4	1243404	rs1680033	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=369;ReadPosRankSum=0.444;SC=AGGCCGCGGGCCCCCCATCGC;SOR=0.960;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=24;WE=1243412;WS=1243394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr4	1243573	rs1680032	T	C	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=72;PP=2780;SC=GGAGAACCCCTTCCCCGACCC;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=133;WE=1243581;WS=1243563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	1243617	rs3755920	T	C	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=1152;ReadPosRankSum=1.065;SC=GGTTTGTAGCTAACCAACGTC;SOR=0.477;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=65;WE=1243625;WS=1243607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,74:0.71:104
chr4	1244416	rs1732115	A	G	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=39;PP=2020;SC=CTGTCTGCTCAGCATGGACAG;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=97;WE=1244424;WS=1244406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	1283608	rs17164589	G	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=392;ReadPosRankSum=1.135;SC=GCATCGGCCCGCCCCCATCCT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=23;WE=1283616;WS=1283598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr4	1291640	rs2293633	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=529;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TGGCCTGTGCTCTCATCTGGC;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=26;WE=1291648;WS=1291630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr4	1291711	rs2293634	T	G	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1159;ReadPosRankSum=0.641;SC=TGTAGCCCCATCCCCTGCCCT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=68;WE=1291719;WS=1291701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,81:0.59:137
chr4	1291969	rs11723894	CC	TT	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=611;ReadPosRankSum=0.465;SC=TGTGCTCTGCCCGCGGCTTGG;SOR=0.602;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=1291978;WS=1291959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr4	1292014	rs11729031	T	C	321.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.22;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	1309068	rs77610549	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=332;ReadPosRankSum=0.642;SC=TTTTTTCTGTCCCGTAATCCC;SOR=0.503;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=20;WE=1309076;WS=1309058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr4	1309416	rs2272481	C	T	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=53;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GCAGGCACAGCGCCCCAGCTG;SOR=0.568;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=68;WE=1309424;WS=1309406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,75:0.68:111
chr4	1317192	rs2141656	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=0.675;SC=ACTTTTCTGTCTTCTAAACTG;SOR=0.048;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=1317200;WS=1317188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr4	1321577	rs140065352	TCCTGGGACGTCC	T	1831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.506;NF=2;NR=37;PP=2970;ReadPosRankSum=0.639;SC=GTGGTCTGGGTCCTGGGACGT;SOR=0.746;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=39;WE=1321596;WS=1321567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
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chr4	1346796	rs17164682	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=15;PP=858;ReadPosRankSum=0.305;SC=CGCAGCAAACAGGTGTCTTGA;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=111;TCR=36;TR=62;WE=1346804;WS=1346786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,64:0.41:157
chr4	1348691	rs33989352	T	TG	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=342;ReadPosRankSum=2.451;SC=GTGCCATGCATGGGGGGGGTC;SOR=0.933;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=19;WE=1348699;WS=1348681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr4	1348806	rs3903127	A	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=514;ReadPosRankSum=0.978;SC=TGTGCCAGGGACCCCCCGGGC;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=26;WE=1348814;WS=1348796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr4	1349029	rs2276904	G	A	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=998;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GGGGAAAGGCGCAGGGTGAGT;SOR=0.612;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=71;TCR=114;TR=74;WE=1349037;WS=1349019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,88:0.43:203
chr4	1369025	rs73793392	C	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=-0.291;SC=ATAGCAGGCACCCACCTCGGG;SOR=0.512;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=1369033;WS=1369015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	1369093	rs11941200	CT	GG	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=11;PP=2947;SC=CCGGTCTTGCCTGATGTGCCT;SOR=2.985;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=67;TCR=14;TR=69;WE=1369102;WS=1369083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	1369885	rs11724369	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=916;ReadPosRankSum=-1.644;SC=GGGCCCGGGCGCCTGTGGTGC;SOR=1.199;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=56;WE=1369893;WS=1369875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr4	1373699	rs112142388	C	CTTT	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=655;SC=TGACCGTGTTCTCCCTGGGTG;SOR=2.419;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=1373709;WS=1373693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	1373701	rs56108910	C	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=330;SC=ACCGTGTTCTCCCTGGGTGCT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=1373709;WS=1373693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	1373751	rs35735964	G	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=501;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GTGGTGTTTGGCCTTCCCCTG;SOR=0.345;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=29;WE=1373759;WS=1373741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr4	1374695	rs28614045	C	A	5748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=121;PP=2965;SC=GATTGTTCCACGGGACGACGA;SOR=1.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=57;TCR=121;TR=178;WE=1374703;WS=1374685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr4	1374774	rs28522910	C	T	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=52;PP=1508;SC=CAGGAGCGCCCGGGTAGGTCT;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=72;WE=1374782;WS=1374764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	1374789	rs28733902	A	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=47;PP=1383;SC=AGGTCTGGGCAAGGCGGTCAC;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=1374797;WS=1374779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	1377615	rs9996817	A	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=787;ReadPosRankSum=0.392;SC=ATCTCGGCTCATCCAGGTACA;SOR=0.546;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=59;WE=1377623;WS=1377605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr4	1388252	.	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-1.111;SC=AGCCAGGAAACCCAGTTTTTA;SOR=0.859;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=27;WE=1388260;WS=1388242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr4	1388413	rs78309237	T	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-3.003;NF=32;NR=18;PP=760;ReadPosRankSum=-0.894;SC=CTCACACATGTCGATGCGGAG;SOR=0.733;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=50;WE=1388421;WS=1388403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,53:0.24:217
chr4	1388429	rs79298048	G	A	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.531;HP=5;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.785;NF=34;NR=16;PP=501;ReadPosRankSum=-2.172;SC=CGGAGTGCCCGCCTGCTCACA;SOR=0.460;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=50;WE=1388437;WS=1388419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,61:0.27:225
chr4	1388583	.	A	G	2510	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=57.22;NF=64;NR=67;PP=2510;QD=20;SC=GTGGAGTGCCACCTGCTCACA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=131;WE=1388591;WS=1388573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr4	1389101	.	A	G	629	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=17;MQ=46.59;NF=18;NR=25;PP=629;QD=15.4365398267;SC=GCCCATGTGGAGTGCCCGCCT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=43;WE=1389109;WS=1389100;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr4	1389156	.	TGTGGA	CGTGGA,CGTGGG	536	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=21;MQ=49.29;NF=33,19;NR=34,15;PP=440,536;QD=7.0861375007;SC=CATGTGCCGATGTGGAGTGCC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=67,34;WE=1389169;WS=1389146;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:69
chr4	1397297	rs11945310	T	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=756;SC=CGGTGGGCCCTGGGCAACGGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=1397305;WS=1397287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	1397611	rs13133264	A	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=540;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CGTCTGCGGGAGGGAGGGACA;SOR=0.331;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=41;WE=1397619;WS=1397601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr4	1619865	rs11722375	T	C	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=68;PP=2045;SC=GGCAGGTGAGTGCTGCCTCTT;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=115;WE=1619873;WS=1619855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	1659128	rs56214302	T	C	5068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=37;PP=2965;SC=GCTCCTAAAGTGCTCACCGTT;SOR=2.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=116;TCR=37;TR=153;WE=1659136;WS=1659118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr4	1698183	rs798719	C	T	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=60;PP=1658;SC=TTAAATATTACAGATCACCAG;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=67;WE=1698191;WS=1698173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	1713586	rs62285070	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=441;SC=CCCGACCCCCGGGTCCCGCGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=1713594;WS=1713576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	1714161	rs812821	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=11;PP=220;SC=CACTCAGCTGTGCGCGCCTCG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=1714169;WS=1714151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	1718870	rs2236788	G	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=7;PP=547;SC=TGTGGCTTTGGGGGGAGACAC;SOR=2.468;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=1718878;WS=1718860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	1719508	rs62285073	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=38;PP=1220;SC=GGACCAACCAGGAGAGATGGC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=1719516;WS=1719498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	1719572	rs798751	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=557;SC=TGGGCACGGGACGGACCTAGG;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=1719580;WS=1719562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	1720346	rs11552262	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=16;PP=482;SC=ACATGCCCACATAGTAGCCTG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=1720354;WS=1720336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	1720757	rs798754	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=546;SC=CCAGAGCTGAAAAGTTATGTG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=1720765;WS=1720750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	1720824	rs798755	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=17;PP=1321;SC=ACACGGAGCCAGCTTCAGGGC;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=1720832;WS=1720814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	1725651	rs3099555	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=801;SC=TGTCCGATGGTTCTTGCAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=1725659;WS=1725641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	1729347	rs1793997	AT	GA	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=1160;ReadPosRankSum=2.139;SC=TGGTGTGAGAATGTTAAACCT;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=30;WE=1729356;WS=1729337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chr4	1729425	rs2592828	C	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=724;ReadPosRankSum=0.872;SC=GATTAAGTCTCTTTTAAAAGC;SOR=0.889;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=199;TCF=107;TCR=92;TR=59;WE=1729433;WS=1729415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,69:0.30:227
chr4	1729533	.	C	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.608;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=891;ReadPosRankSum=1.648;SC=GCAAGCCCAGCCTTTGGGAGT;SOR=0.662;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=55;WE=1729541;WS=1729523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,60:0.32:186
chr4	1729660	rs1063742	C	T	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1796;ReadPosRankSum=-2.022;SC=TGTCTGGCAGCCCTGAGCAAG;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=285;TCF=165;TCR=120;TR=114;WE=1729668;WS=1729650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,141:0.42:337
chr4	1729953	rs17132047	G	A	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1546;ReadPosRankSum=-1.119;SC=GCCCTGGGCTGCCCTGCGGGT;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=128;TCR=145;TR=107;WE=1729961;WS=1729943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,126:0.39:319
chr4	1729988	rs1063743	G	A	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1434;ReadPosRankSum=1.160;SC=GCCAGCAGATGGCACTCAGAC;SOR=0.597;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=225;TCF=106;TCR=119;TR=90;WE=1729996;WS=1729978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,103:0.41:253
chr4	1730299	rs798759	A	G	7482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=106;PP=2965;SC=GGAGCGGAGCAGGAGAGGACC;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=124;TCR=106;TR=230;WE=1730307;WS=1730289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr4	1732410	rs17680831	C	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=884;ReadPosRankSum=0.641;SC=AGGCAAGGCGCGTGTTTTCCT;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=63;WE=1732418;WS=1732400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,67:0.40:166
chr4	1732734	rs10516159	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=563;ReadPosRankSum=2.538;SC=GCCTGGTCGTGTAGAAGAGTA;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=55;WE=1732742;WS=1732724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,64:0.33:194
chr4	1732978	rs17680881	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.668;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=890;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CATCAGCAGGGGCAGCCTGCC;SOR=1.045;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=149;TCF=53;TCR=96;TR=53;WE=1732986;WS=1732968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,63:0.34:183
chr4	1737062	rs3752746	A	G	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GGTAGGTACCAGGCAATTCCG;SOR=0.366;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=73;TCR=103;TR=174;WE=1737070;WS=1737052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr4	1737109	rs3752748	G	A	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=77;PP=2307;SC=GAGCAGCCACGGCAGGTCTTG;SOR=2.242;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=21;TCR=78;TR=98;WE=1737117;WS=1737099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	1737404	rs34859791	C	CCT	6316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=46;PP=2973;SC=CCTTAGCCCCCGTGTGTGTTA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=1737412;WS=1737394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	1737585	rs11729657	T	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=21;PP=537;SC=CCCTCCCTCATGCATGAAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=1737593;WS=1737575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	1739196	rs3816352	C	T	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=36;PP=1196;SC=GTTCCCTCGCCGCACTGTCTC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=1739204;WS=1739186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	1739252	rs41286677	T	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=12;PP=693;SC=TGTGGGCCTTTCCTCCCTCAC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=1739260;WS=1739242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	1739592	rs2305188	A	G	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=84;PP=2812;SC=GCCTGTCACTACTGCCCAGGT;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=134;WE=1739600;WS=1739582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	1741325	rs2077363	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=368;SC=CCTCTGGGACATTGCTCCAGG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=1741333;WS=1741315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	1741533	rs140089579	CCGTCCCCATCCCCCTCGCCATCCT	C	3037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=21;PP=2973;SC=CCTGTCCTCCCCGTCCCCATC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=46;WE=1741564;WS=1741523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	1741740	rs2249143	G	A	13168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=180;NR=239;PP=2965;SC=GTGAGTGCCCGGGCCACCGAG;SOR=0.977;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=419;TCF=180;TCR=239;TR=419;WE=1741748;WS=1741730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,492:1.00:492
chr4	1742400	rs4865463	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=3;PP=174;SC=TAGAAGATCCTGGGTGGAGGG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=1742408;WS=1742394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	1746844	rs8389	A	T	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.785;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1379;ReadPosRankSum=0.383;SC=CAACTTTTTTAAAAACTAGAT;SOR=1.879;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=56;WE=1746852;WS=1746833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,66:0.96:69
chr4	1795321	rs4450996	C	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5167;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=188;ReadPosRankSum=-1.187;SC=CTTCCCGCTCCGGAAAGTTTG;SOR=0.538;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=13;WE=1795329;WS=1795311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr4	1805296	rs3135883	G	A	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=719;SC=CAAGTTGGCGGTGGCTGAGGA;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=1805304;WS=1805288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	1806017	rs200683551	G	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=339;ReadPosRankSum=0.860;SC=CCCCGTGGGGGGGGGGGCCAG;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=29;WE=1806025;WS=1806002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr4	1806834	rs4865476	G	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=203;SC=GTTCTGTGGAGATGCTCCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=1806842;WS=1806824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	1807894	rs7688609	G	A	11007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=195;PP=2965;SC=ACAAGAAGACGACCAACGTGA;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=343;TCF=148;TCR=195;TR=343;WE=1807902;WS=1807884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr4	1809127	rs34562534	CGT	C	1920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.65;QD=35.57;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	1818594	rs9328763	C	T	5948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=105;PP=2965;SC=CTTCCACGTACTTTTCTTCAC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=73;TCR=105;TR=178;WE=1818602;WS=1818584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	1954945	rs489550	A	G	9341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=114;PP=2965;SC=CTTTAGCAGCATGGCTGCCTC;SOR=1.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=193;TCR=114;TR=307;WE=1954953;WS=1954935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr4	1961137	rs474235	G	A	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=28;PP=1986;SC=AGTGGTGGGTGTGCAAGGGTA;SOR=1.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=94;WE=1961145;WS=1961127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	1986542	rs2234570	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=857;ReadPosRankSum=-0.149;SC=CACCTGGGGGCGTCTCGGAGC;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=53;WE=1986550;WS=1986532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,60:0.56:108
chr4	1994102	rs1116585	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=707;ReadPosRankSum=0.210;SC=CGTGGAGGAAGCAGGCGCACC;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=50;WE=1994110;WS=1994092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,55:0.42:130
chr4	2009095	rs382441	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=450;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTTACAAGAGCACAAAAGCTA;SOR=0.108;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=65;TCF=8;TCR=57;TR=28;WE=2009103;WS=2009085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr4	2010831	rs231189	G	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=200;ReadPosRankSum=1.806;SC=GGGGCTTCCCGGGAGAGCGCT;SOR=0.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=20;WE=2010839;WS=2010821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr4	2044128	rs570712	C	T	894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=19;NR=13;PP=497;SC=CCGCCGCCGCCGCTGCTGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=32;WE=2044136;WS=2044118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	2044311	rs7654492	C	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=0.908;SC=CGCCTTTGTTCCCGGGAGCGG;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=5;WE=2044319;WS=2044301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	2158102	.	CT	C	376	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=15;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=15;NR=4;PP=376;QD=19.9473684211;SC=GAATTTAGAGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=19;WE=2158125;WS=2158092;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,19:0.37:51
chr4	2158273	rs3216822	GGA	G	2002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.462;NF=3;NR=34;PP=1368;ReadPosRankSum=0.666;SC=CCTGCACACTGGAGTGCATGG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=37;WE=2158282;WS=2158263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr4	2158352	rs137954994	TCTC	T	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.393;NF=4;NR=10;PP=118;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TCTGTCTTGTTCTCCTGCTAT;SOR=0.507;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=14;WE=2158362;WS=2158342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr4	2158408	rs428361	C	T	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=12;PP=1586;SC=AGTATGAAGTCCCCTCTTGGA;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=66;WE=2158416;WS=2158398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	2172443	rs146650604	G	A	4467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=73;PP=2393;ReadPosRankSum=0.594;SC=CTGCAACCCCGTTCTGGGGAG;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=228;TCF=119;TCR=109;TR=156;WE=2172451;WS=2172433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,202:0.69:292
chr4	2175733	rs2022302	A	G	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1305;ReadPosRankSum=0.668;SC=CCTGAATGGCATGGCTTTCCA;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=263;TCF=110;TCR=153;TR=101;WE=2175741;WS=2175723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,125:0.38:332
chr4	2175791	rs2022343	TC	CG	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=1966;ReadPosRankSum=0.775;SC=ATTAATGTATTCTTTTTACTA;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=36;TCR=110;TR=57;WE=2175800;WS=2175781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,71:0.41:173
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chr4	2176454	rs9328764	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=689;ReadPosRankSum=0.324;SC=TCCAAAGTACGAAATAGTTGC;SOR=1.236;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=46;WE=2176462;WS=2176444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,50:0.35:143
chr4	2176506	rs6822665	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=249;ReadPosRankSum=0.278;SC=ATAACATCAACGTCAATTTAA;SOR=1.421;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=19;WE=2176514;WS=2176496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr4	2178108	rs6599411	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=-0.968;SC=AACTTGGTGGCAGTGCTCACC;SOR=0.869;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=16;WE=2178116;WS=2178098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr4	2178127	rs6599412	T	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=1.039;SC=CCACAGTCTGTAACTGACATG;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=11;WE=2178135;WS=2178117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr4	2178149	rs6599413	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=0.669;SC=CTTGAAAAATGTTTCCTAGTA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=2178157;WS=2178139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	2179074	rs6810845	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=60.06;MQRankSum=-0.742;NF=28;NR=23;PP=1596;ReadPosRankSum=1.905;SC=GTTCTCTGAGAGTCTTACCAT;SOR=0.733;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=51;WE=2179094;WS=2179064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,62:0.36:171
chr4	2179086	rs6816862	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQ=60.06;MQRankSum=-0.769;NF=28;NR=28;PP=1596;ReadPosRankSum=1.842;SC=TCTTACCATATCCCTGCTGCT;SOR=0.450;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=56;WE=2179094;WS=2179064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr4	2181016	rs35787308	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=431;ReadPosRankSum=-0.997;SC=TTGATAAAACTTTATCTTAAA;SOR=0.297;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=20;WE=2181024;WS=2181006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr4	2181080	rs6830513	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=460;ReadPosRankSum=2.335;SC=TCACTTTAACTGTAATGGATT;SOR=0.393;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=40;WE=2181088;WS=2181070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,40:0.38:104
chr4	2181276	rs35024704	G	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=337;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AAGTTCAAACGAATAGTAGTA;SOR=0.963;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=19;WE=2181284;WS=2181266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr4	2181313	rs6820291	C	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=-0.955;SC=AAATTATAGACCTAAGGACCA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=10;WE=2181321;WS=2181303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr4	2194901	rs10015921	A	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=595;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GAAGAGTTAAATTATAGAGAG;SOR=0.689;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=39;WE=2194909;WS=2194891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,41:0.37:111
chr4	2194946	rs10011549	C	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr4	2194953	rs10002583	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr4	2195024	rs10018786	T	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=229;ReadPosRankSum=-0.178;SC=TTACATTTCATTGTTTGAAAT;SOR=0.699;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=20;WE=2195032;WS=2195014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr4	2195089	rs10018882	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.74;ReadPosRankSum=-3.694;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	2233709	rs11937432	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=314;ReadPosRankSum=2.115;SC=ATTCTCCACAATATCTTTCAG;SOR=0.861;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=26;WE=2233717;WS=2233699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr4	2251893	rs61789367	G	A	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=848;ReadPosRankSum=-1.488;SC=CTGGGATCCAGGGTTGGGGTC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=56;WE=2251901;WS=2251883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,70:0.46:152
chr4	2252845	rs2233042	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=249;ReadPosRankSum=-1.292;SC=CAGCAGAGCCCGTGCTATCTG;SOR=0.585;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=20;WE=2252853;WS=2252835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr4	2252980	rs2071658	T	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=-2.659;SC=GTTTCTGGGGTCGAGGGGGGC;SOR=0.807;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=25;WE=2252988;WS=2252970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr4	2256798	rs2236999	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=0.076;SC=CAAAGAACGCTGGTGGCACAG;SOR=0.869;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=10;WE=2256806;WS=2256788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr4	2260564	rs76474103	G	A	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=762;ReadPosRankSum=1.621;SC=CTGCCCTGGAGGCCCGGGCTC;SOR=0.504;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=44;WE=2260572;WS=2260554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr4	2260812	rs28619238	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=209;ReadPosRankSum=0.440;SC=GAGCTCAGACTGCCTCGGGGC;SOR=1.085;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=2260820;WS=2260802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr4	2262191	rs2269487	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=370;ReadPosRankSum=-2.241;SC=TCAGCTTTGGATTCTCCATGC;SOR=0.992;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=23;WE=2262199;WS=2262181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr4	2275145	rs736455	G	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=593;SC=AGATCAGTCAGGGAGGGAGGA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=2275153;WS=2275135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	2275718	rs2182682	G	A	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=37;PP=2435;SC=TACACGCCCCGCCTGACCTCC;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=79;TCR=37;TR=116;WE=2275726;WS=2275708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr4	2276047	rs11248093	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=676;SC=TCGCAGACGCTCACCCCACAG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=2276055;WS=2276037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	2306053	rs661301	A	G	4550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TCGTGAGCCGAGGGGCTCCCA;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=137;WE=2306061;WS=2306041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr4	2306212	.	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=529;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTGGAGGCATCTTCTGAGGGT;SOR=0.906;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=149;TCF=62;TCR=87;TR=45;WE=2306220;WS=2306202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,63:0.32:197
chr4	2307121	rs61742112	G	A	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.310;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GGCCCCTCAGGGGGGAGAGGG;SOR=0.759;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=216;TCF=109;TCR=107;TR=102;WE=2307129;WS=2307111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,109:0.47:234
chr4	2330923	rs60473075	G	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.866;SC=AGAATCTGTAGATCACTTTAT;SOR=0.703;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=174;TCF=67;TCR=107;TR=95;WE=2330931;WS=2330913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,120:0.55:217
chr4	2332799	rs1887364	C	T	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=566;SC=CAGGGGTAGACGCTGGGATGG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=2332807;WS=2332789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	2357689	rs4974651	C	A	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=995;ReadPosRankSum=1.445;SC=GCGCACAGTTCGAATGCGCTG;SOR=0.469;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=61;TCR=79;TR=67;WE=2357697;WS=2357679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,82:0.48:172
chr4	2428041	.	C	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr4	2438492	rs1203763	T	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=214;SC=ACAGGCCCTTTGCAGCCCCGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=2438500;WS=2438485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	2439670	rs1203762	A	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=3;PP=1266;SC=TCAGGTGGGCACCAATAGGGT;SOR=4.139;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=2439678;WS=2439660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	2439701	rs1881185	G	A	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=853;ReadPosRankSum=-2.155;SC=CTGTGGCTGCGTGCCCTGACA;SOR=0.743;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=52;WE=2439709;WS=2439691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr4	2439756	rs5855731	C	CT	4421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.807;NF=28;NR=46;PP=2920;ReadPosRankSum=1.220;SC=CCTGGTGCCCCGTGACGTCCC;SOR=0.686;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=159;TCF=68;TCR=91;TR=74;WE=2439764;WS=2439746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,132:0.48:274
chr4	2439932	rs1308702	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=804;ReadPosRankSum=0.599;SC=CGAGGCCCACGGGTGAGGTCC;SOR=0.641;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=45;WE=2439940;WS=2439922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr4	2444931	rs1203814	A	G	3508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=60;PP=2019;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TCTACGAGCCAGCCCACGTGA;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=136;WE=2444939;WS=2444921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,166:0.60:277
chr4	2446720	rs3849664	G	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTCGTGAAGTGAGGCCGTCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=2446733;WS=2446713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	2446725	rs11734990	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GAAGTGAGGCCGTCCATCCCA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=2446733;WS=2446713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	2451694	rs3108494	T	C	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1057;ReadPosRankSum=-1.443;SC=CGAGGAACTGTGCTGCGCCAT;SOR=1.174;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=201;TCF=129;TCR=72;TR=75;WE=2451702;WS=2451684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,96:0.41:232
chr4	2452791	rs5855732	AC	A	2034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.033;NF=7;NR=40;PP=1498;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CTGGGCACCCACCCCTCCAGA;SOR=0.583;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=15;TCR=86;TR=47;WE=2452799;WS=2452781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr4	2452933	rs3888113	T	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=569;ReadPosRankSum=-2.796;SC=AGGATGGGCATTTGCTGCTCC;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=32;WE=2452941;WS=2452923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr4	2460803	rs704346	A	G	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=13;PP=956;SC=GCCACCCACCAGCCACCTCAG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=2460811;WS=2460793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	2460955	rs80041146	G	A	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1441;ReadPosRankSum=1.233;SC=CACAGCCCACGCGCAAGGGCA;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=99;WE=2460963;WS=2460945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,111:0.58:192
chr4	2461888	rs3135152	A	G	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=73;PP=2696;SC=CAGGGCAAGCACACCAAGAGC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=138;WE=2461896;WS=2461878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	2461995	rs58090809	C	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=495;ReadPosRankSum=0.667;SC=GGGGAGGGTGCCTCTGGGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=27;WE=2462003;WS=2461985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr4	2464179	rs3135150	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GGTGGGAGGAAAAGAAGGCCC;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=9;WE=2464187;WS=2464169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
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chr4	2502637	rs1203863	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=1.876;SC=GTAACAATAATAATAACAAAG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=2502645;WS=2502627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr4	2513620	.	GTTTA	ATTTA,ATTTG	674	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=39,16;NR=44,18;PP=674,507;QD=8.53941219936;SC=AAATGGCTTCGTTTATCACTT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=83,34;WE=2513632;WS=2513610;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:84
chr4	2513624	rs4974709	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
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chr4	2717690	rs2295499	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=491;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGATTTCTTCCGTTCTGATAA;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=21;WE=2717698;WS=2717680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr4	2721811	rs556203	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=168;ReadPosRankSum=-1.843;SC=TGTGAGCCCCCGCACCCAGCT;SOR=0.914;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=12;WE=2721819;WS=2721801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr4	2743999	rs232712	A	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=199;SC=GGCAGCACTCAGCCACATGCC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=2744007;WS=2743989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	2744087	rs2269495	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=229;ReadPosRankSum=0.388;SC=GCCTCTCTGGGCCGCGCCAGG;SOR=1.018;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=15;WE=2744095;WS=2744077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr4	2746285	rs13145281	A	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GAAGCGCCCCACCAGGCTTCT;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=37;WE=2746293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,47:0.34:138
chr4	2746307	rs11728346	A	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=53;PP=1485;SC=CCACCCCCACAGTGACCACTG;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=2746315;WS=2746297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	2820169	rs28507721	C	G	136.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5727;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CGCGAGCTTCCGGCTCTGGAC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=8;WE=2820177;WS=2820159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	2822289	rs2239727	C	A	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=637;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CCTGGCTCAGCCATCTCCTGC;SOR=0.355;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=48;WE=2822297;WS=2822273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr4	2822307	rs56323343	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=818;ReadPosRankSum=1.805;SC=TGCCTGACCGTAGCTGAGCCA;SOR=0.855;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=49;WE=2822315;WS=2822297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr4	2822467	rs231402	G	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=516;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GTACCCAGCTGCAGCTGCTGA;SOR=1.127;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=31;WE=2822475;WS=2822457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr4	2824848	rs41264713	T	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-1.113;SC=GCCTGCCCCTTATTCCCGCCC;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=15;WE=2824856;WS=2824838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr4	2826218	rs34274570	C	CA	1011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=970;SC=AGGGCCCACCCGATCTGCCCT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=2826226;WS=2826208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	2826400	rs3213501	T	C	5267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=80;PP=2965;SC=AGATCATCCATATCAGCAAGA;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=158;WE=2826408;WS=2826390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr4	2828771	rs1794395	T	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=-1.688;SC=TCTGTCAGCGTATCCGTGTGT;SOR=0.613;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=18;WE=2828779;WS=2828761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr4	2829077	rs2269485	T	C	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=36;PP=930;SC=ACTGCCCGTTTGCCTCTCCCC;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=2829085;WS=2829067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	2829478	rs13137906	G	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=647;SC=GAGCCCCTCCGAGGCTGGGGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=2829486;WS=2829468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	2831383	rs231399	T	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=488;ReadPosRankSum=0.753;SC=TTGGCCTGGCTGCTGAGGACT;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=38;WE=2831391;WS=2831373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr4	2833226	rs231397	G	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=446;ReadPosRankSum=-1.903;SC=GTGGAGTGGGGAGGGGAGCAG;SOR=0.916;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=23;WE=2833234;WS=2833216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr4	2833957	.	C	T	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=2561;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AGACCTACAACAGCGAGAGGA;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=61;WE=2833974;WS=2833947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr4	2833966	rs231396	G	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=2466;ReadPosRankSum=0.894;SC=ACAGCGAGAGGACAGAAAGCC;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=68;WE=2833974;WS=2833947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
chr4	2916931	rs16843589	G	A	41.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr4	2928125	rs1263345	C	T	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=35;PP=1058;SC=CTCCTCGTGCCGTGTTGTCAT;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=2928133;WS=2928115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr4	2933031	rs55754437	C	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=716;ReadPosRankSum=-1.848;SC=AGGTGCCCGTCAGCCCAGGGG;SOR=0.782;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=46;WE=2933039;WS=2933021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
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chr4	2955465	rs1475975	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CACACAGTGATCACTCAGTTG;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=23;WE=2955473;WS=2955455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr4	2965611	rs13120295	G	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=529;ReadPosRankSum=-1.404;SC=AGGGCCTGCGGAGGCGGCGGC;SOR=2.335;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=27;WE=2965619;WS=2965601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr4	2965676	rs16843684	C	T	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=813;ReadPosRankSum=2.347;SC=GGATCGTGTCCGGAGCTCGAG;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=54;WE=2965684;WS=2965666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,60:0.69:87
chr4	2965695	rs10021191	G	A	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=984;ReadPosRankSum=1.582;SC=AGGAGAGGGTGGTGCCCGGCG;SOR=0.462;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=60;WE=2965703;WS=2965685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,69:0.66:105
chr4	2965914	rs10030130	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.253;NF=0;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GGAACCCTGGCCCCCCTGAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=2965922;WS=2965904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
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chr4	2988752	rs2471324	G	T	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=18;PP=1233;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TTAATATATTGAGTTGTGAAA;SOR=1.280;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=67;WE=2988760;WS=2988742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr4	2990338	rs2051556	G	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.186;NF=21;NR=0;PP=461;ReadPosRankSum=0.598;SC=AAAATAATACGGCAAATACTG;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=21;WE=2990346;WS=2990331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr4	2990375	rs2051555	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.170;NF=35;NR=4;PP=824;ReadPosRankSum=0.763;SC=TATCGAGTGAGAACTGTAAGG;SOR=0.310;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=39;WE=2990383;WS=2990365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr4	2990499	rs2960306	G	T	5001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.703;SC=ATAGGAAGACGTCTCTTCAGG;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=327;TCF=181;TCR=146;TR=182;WE=2990507;WS=2990489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,228:0.55:411
chr4	2993980	rs2515941	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=557;ReadPosRankSum=1.540;SC=ACCGAAGTGATTGTGGACTGT;SOR=0.913;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=35;WE=2993988;WS=2993970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr4	2994002	rs142478577	A	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=0.670;SC=AATCTTAGATAGATTCTTCAA;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=29;WE=2994010;WS=2993992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr4	2994107	rs2471338	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=1.314;SC=ACGTAACATATGTTAAAAGCT;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=2994115;WS=2994097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	3006043	rs1024323	C	T	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=916;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TCCAAAAAAGCCTTTGAGGAA;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=70;WE=3006051;WS=3006033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr4	3024044	rs2471325	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=311;ReadPosRankSum=0.036;SC=TGTTTTGCCGCGCTAGCCCTT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=3024052;WS=3024034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr4	3029588	rs2857844	G	A	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=23;PP=1252;SC=TTGTTGTTACGGTGTCATTAC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=3029596;WS=3029578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	3039150	rs1801058	T	C	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=727;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CAGTTCTCGGTGGTGAAAGGG;SOR=1.042;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=60;WE=3039158;WS=3039140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr4	3076603	rs374076986	CCAGCAG	C,CCAGCAGCAGCAG	232.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.036;NF=0,0;NR=6,6;PP=282,498;ReadPosRankSum=-1.534;SC=TCAAGTCCTTCCAGCAGCAGC;SOR=0.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6,6;WE=3076616;WS=3076593;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.70:10
chr4	3118116	rs2071655	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=1.855;SC=GCGCTGCTCGTTTCCAACCCT;SOR=0.160;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=3118124;WS=3118106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr4	3162056	rs363099	C	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1116;ReadPosRankSum=0.099;SC=GAGGGTTTCTCCGCTCAGCCT;SOR=0.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=75;WE=3162064;WS=3162046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr4	3174496	rs11276773	TGATTCACA	T	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=2354;ReadPosRankSum=-1.580;SC=GTATTAATAGTGATTCACAGG;SOR=1.002;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=13;WE=3174511;WS=3174486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr4	3180021	rs363096	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=342;ReadPosRankSum=-0.072;SC=GTTTTTGTTTTTAGGGAATCA;SOR=0.288;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=17;WE=3180029;WS=3180011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr4	3211728	.	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.031;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=339;ReadPosRankSum=1.566;SC=TTGTGACTTCCAAGTGGGATT;SOR=0.826;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=26;WE=3211736;WS=3211718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr4	3213832	rs362336	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=745;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TGCCTGCAGAGCCGGCGGCCT;SOR=0.896;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=41;WE=3213840;WS=3213822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr4	3215835	rs362331	T	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=967;ReadPosRankSum=-0.174;SC=CTCCCTCATCTACTGTGTGCA;SOR=0.926;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=58;WE=3215843;WS=3215825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr4	3216815	rs916171	C	G	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=638;ReadPosRankSum=-0.456;SC=AAATTCTTCTCTTTGTTCTGT;SOR=1.258;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=35;WE=3216823;WS=3216805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr4	3219613	rs2857790	A	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=45;PP=1529;SC=CGCCATTGCTAAGGAACATCA;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=61;WE=3219621;WS=3219603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	3219640	.	C	CTGAGGTGTGACTGAATTAAACACCTGGTGGTTGCAATATCAAATTAAAT	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.463;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr4	3225371	rs82334	A	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=41;PP=1208;SC=AGCAGCTTCAACCAGGCCGTT;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=3225379;WS=3225361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	3225389	rs82333	A	G	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=772;SC=GTTTTCCTTCATTGCTAGAAT;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=3225397;WS=3225379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	3227419	rs362273	A	G	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=25;PP=982;SC=AGCTGCTGCTACAGATCAACC;SOR=0.790;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=3227427;WS=3227409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	3227592	rs2276882	T	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=352;SC=TCCTTTTTTTTAAAAAAAAAT;SOR=1.284;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=3227600;WS=3227582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	3234980	rs362272	G	A	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=39;PP=2086;SC=CCTGCACGGCGTCCTCTATGT;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=107;WE=3234988;WS=3234970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	3235184	rs3216820	GC	G	1041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.910;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=917;ReadPosRankSum=1.561;SC=CAGATGGCAGGCCAGGTATCA;SOR=2.546;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=3235192;WS=3235174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr4	3235241	rs362314	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=282;SC=GAGACGCAAGAGCACAGGTGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=3235249;WS=3235231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	3240159	rs2071704	C	T	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=716;SC=CTCTGACCTGCGTCCCTCCTC;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=3240167;WS=3240149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	3240526	rs2858081	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=225;SC=ACACTCAGGCACCTGCTTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=3240534;WS=3240516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	3255258	rs2798227	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=37;PP=1129;SC=CTCAGCCCCCACCATTTAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=3255266;WS=3255248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	3257373	rs3135173	T	C	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=6;NR=2;PP=147;SC=CCAGTAGGATTGTCGGGAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=3257381;WS=3257363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	3257593	rs362287	C	T	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=18;PP=657;SC=AGGTGCGCCGCGTGCTGGACC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=3257601;WS=3257583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	3263138	rs3095073	G	A	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=37;PP=1152;SC=CCAGTTGCTCGGGCAGGACGT;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=3263146;WS=3263128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	3265479	rs3095078	C	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=17;PP=906;SC=CTTGTGTACACTAGTGAGTTT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=3265487;WS=3265469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	3265710	rs3095077	C	T	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1179;SC=GTGGATGTGTCGGGCCCGCTC;SOR=1.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=3265718;WS=3265700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	3443993	rs28720738	C	G	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=274;SC=AAAGCTGGCCCTCACAGGGCA;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=3444001;WS=3443983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	3444593	rs2073504	G	A	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=51;PP=1710;SC=GGGGGCTCCCGCCCCCGCCCA;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=3444601;WS=3444583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	3445745	rs4690097	C	T	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=35;PP=1164;SC=GCCCCTCACACCCCCTCCCGC;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=3445753;WS=3445735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	3446091	rs3748034	G	T	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=88;PP=2949;SC=CGACCGCTGGGCCCGCGTGCG;SOR=1.013;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=65;TCR=88;TR=153;WE=3446099;WS=3446081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr4	3446132	rs1987546	C	G	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=72;PP=2341;SC=GCGAGTGCTTCGGGGGCCGGA;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=108;WE=3446140;WS=3446122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	3446751	rs3752439	T	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=23;PP=674;SC=GGCCGCCGCATGCGGGGCAGG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=3446759;WS=3446741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	3446820	rs3752441	C	T	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=9;PP=570;SC=GGGCCAGCTCCGTCCAGACAG;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=3446828;WS=3446810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	3447243	rs16844383	C	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=13;PP=361;SC=TGGGTCGGTACTGGGGTCACA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=3447251;WS=3447233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	3449886	rs28468427	G	A	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=36;PP=1256;SC=CCCTGCGGGAGGCCCTGGTCC;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=3449894;WS=3449876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	3475107	rs2344208	G	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=436;SC=GTTGGCTGGCGTCCCTGACGG;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=3475115;WS=3475097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	3475252	rs4325970	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=21;PP=781;SC=CTACGAGGGCTTGGTCCACAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=3475260;WS=3475242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	3475390	rs77051823	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr4	3478020	rs114112298	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.37;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	3478051	rs2699425	T	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=13;PP=883;SC=GATGCCCTCTTGCCCCGCCTG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=3478059;WS=3478041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	3478323	rs2699426	T	C	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=23;PP=550;SC=CCACTTCCCCTGAGAACTGCT;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=3478331;WS=3478313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	3487151	rs916189	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=386;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGGGCCAGGCAGGGTGTCATT;SOR=0.822;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=32;WE=3487159;WS=3487141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr4	3487237	rs2006791	A	G	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1062;ReadPosRankSum=1.261;SC=CTCGGGCCAGACTGACCTGTC;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=71;WE=3487245;WS=3487227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,82:0.54:153
chr4	3494449	rs34230391	AC	A	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=427;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AGACCCCTGTACCCCCACAAC;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=16;WE=3494457;WS=3494439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr4	3494600	rs6811423	A	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=815;ReadPosRankSum=1.104;SC=AGCACGTCACAGGAGGGGCCT;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=58;WE=3494608;WS=3494590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,74:0.45:164
chr4	3494826	rs6811856	A	C	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1259;ReadPosRankSum=0.576;SC=AACTGGGCTCACTGCTCAGCC;SOR=0.832;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=71;WE=3494834;WS=3494816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,75:0.56:133
chr4	3494847	rs6831659	G	A	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1289;ReadPosRankSum=0.396;SC=TGCCAGCAGCGGGGGCCCCCG;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=75;WE=3494855;WS=3494837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,79:0.59:133
chr4	3494898	rs6850908	C	T	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1302;ReadPosRankSum=0.021;SC=CAGTCGAGTACCAGGTGCCCA;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=76;WE=3494906;WS=3494888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr4	3498448	rs3135164	T	C	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=37;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CCAGCCTGTGTCACTCTTGGG;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=180;TCF=111;TCR=69;TR=99;WE=3498456;WS=3498424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,107:0.52:204
chr4	3501835	rs2858035	C	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=404;ReadPosRankSum=0.816;SC=CGGTCAGGAACATGGAGCGGG;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=11;WE=3501857;WS=3501825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr4	3501873	rs2699408	T	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=350;ReadPosRankSum=0.613;SC=AGAGGCGGAGTGGGGAGGAGG;SOR=0.765;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=23;WE=3501881;WS=3501863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr4	3501924	rs2858036	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=703;ReadPosRankSum=0.209;SC=ACAATCTTTGAGATCTGTGCC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=46;WE=3501932;WS=3501914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr4	3502163	rs2858037	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=1.123;SC=GGCACTGACAATTGGGGGCTG;SOR=1.218;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=21;WE=3502171;WS=3502153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr4	3502386	rs2071701	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=464;ReadPosRankSum=-0.471;SC=TGGCTCGGGGCGCAGGCTGCC;SOR=0.644;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=31;WE=3502394;WS=3502376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr4	3514938	rs1741553	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.658;SC=GCAGCTCAGTACTAACTAGAA;SOR=0.175;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=3514946;WS=3514928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	3516448	rs2285088	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=0.432;SC=AGGGGAACTGTGGCCTCCCCG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=12;WE=3516456;WS=3516438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
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chr4	3516742	rs1794442	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=525;ReadPosRankSum=-0.558;SC=AGGACGCCAAAGGACGGCGCC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=25;WE=3516750;WS=3516732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
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chr4	3589846	rs7672828	T	C	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.294;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=72;PP=1873;ReadPosRankSum=1.105;SC=CTGGTGAGAATCCCTTGAGCA;SOR=1.006;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=214;TCF=80;TCR=134;TR=111;WE=3589854;WS=3589836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
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chr4	3590549	rs73793633	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=586;ReadPosRankSum=-1.067;SC=TGGGGAGGGCGCCAAGCAGTG;SOR=0.136;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=16;WE=3590557;WS=3590533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr4	3590577	rs73793634	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=1091;ReadPosRankSum=1.517;SC=GGGTTGGGGCGTCAGCCAAGC;SOR=0.953;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=24;WE=3590596;WS=3590567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr4	3590588	rs73199385	A	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.092;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=1091;ReadPosRankSum=2.684;SC=TCAGCCAAGCATCAGCCCCTA;SOR=2.620;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=25;WE=3590596;WS=3590567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr4	3590683	rs62272966	T	G	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1229;ReadPosRankSum=0.615;SC=AAACGTTCCCTGAACATGCCA;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=89;WE=3590691;WS=3590673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,119:0.46:260
chr4	3590711	rs62272967	G	T	4804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1405;ReadPosRankSum=1.759;SC=AGGATGCTGGGTATCAGGCTA;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=92;WE=3590719;WS=3590701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,124:0.48:259
chr4	3590730	rs62272968	G	A	4488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.017;NF=39;NR=53;PP=1519;ReadPosRankSum=0.365;SC=TACCTTTGCTGGACAGCTCCA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=188;TCF=81;TCR=107;TR=92;WE=3590750;WS=3590720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,119:0.50:240
chr4	3590817	rs62272969	T	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.025;NF=31;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=1.164;SC=CACACACACATGCACAGACAC;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=59;WE=3590836;WS=3590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr4	3590823	rs72180705	GACAC	G,GAC	4450.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.63;QD=36.48;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,98,24:0.80,0.20:122
chr4	3590878	rs62272970	C	T	3576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.360;NF=73;NR=44;PP=1847;ReadPosRankSum=0.521;SC=CACAGACACACACACACAGAG;SOR=0.571;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=247;TCF=158;TCR=89;TR=117;WE=3590886;WS=3590862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,131:0.46:284
chr4	3590911	rs34447251	A	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=11.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.543;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:316,81:0.20:397
chr4	3591015	rs62272971	A	C	5411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=646;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.433;SC=CTGTGTATAAATTCTTTCCTT;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=562;TCF=316;TCR=246;TR=226;WE=3591023;WS=3591005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:373,261:0.41:634
chr4	3591049	rs62272972	C	T	9856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=687;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=2.127;SC=TAGATGATTTCCCCCAGCTTA;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=576;TCF=283;TCR=293;TR=233;WE=3591057;WS=3591025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:400,273:0.41:673
chr4	3591069	rs62272973	C	T	10094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=679;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=0.688;SC=ACCTTGAGGACTTTCGAGCAA;SOR=0.595;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=569;TCF=257;TCR=312;TR=239;WE=3591077;WS=3591058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:382,282:0.42:664
chr4	3769789	rs11269124	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	1286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;QD=45.95;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	4190792	rs2920255	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.753;SC=TGGGAGCTGAACCTAATGCAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=4190800;WS=4190782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	4198948	rs112623841	GCGTTGC	G	1765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.562;NF=16;NR=15;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.956;SC=TTTTCTCTTGGCGTTGCCCTG;SOR=0.476;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=31;WE=4198961;WS=4198938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr4	4204299	rs2920182	T	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.361;NF=5;NR=16;PP=438;ReadPosRankSum=-0.682;SC=AGTGGATCACTCCAAACCTGA;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=21;WE=4204307;WS=4204289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr4	4228029	rs36055674	A	AAAG	633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.168;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr4	4239516	rs62286913	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.628;NF=24;NR=11;PP=419;ReadPosRankSum=-1.028;SC=ATTTTTCAAACGAGTTCATTT;SOR=0.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=35;WE=4239524;WS=4239506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
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chr4	4239702	rs369592566	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.388;NF=5;NR=21;PP=373;ReadPosRankSum=-0.997;SC=AACTCCAATATGCATCAATAT;SOR=1.270;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=26;WE=4239710;WS=4239687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
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chr4	4315010	rs28458962	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ATGTGACACACGAGAGAATAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=4315018;WS=4315000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr4	4411235	rs7686577	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.179;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=370;ReadPosRankSum=1.012;SC=CCTTCGTGTGCGGGTGTGTGT;SOR=0.030;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=21;WE=4411243;WS=4411225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr4	4411559	rs7655690	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=456;ReadPosRankSum=1.484;SC=AGTGTCCCTGTGGAAGGCCCA;SOR=1.038;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=28;WE=4411567;WS=4411549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr4	4417899	rs7678778	G	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=570;ReadPosRankSum=-0.584;SC=ACCTGAGATTGAGAGAGAAAA;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=31;WE=4417907;WS=4417889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr4	4422558	rs34931639	A	C	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=827;ReadPosRankSum=0.435;SC=GTGCTGCGCCACGTCGCACCT;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=99;TCR=32;TR=52;WE=4422566;WS=4422548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,58:0.39:147
chr4	4425422	rs10675705	C	CAG	710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=555;SC=GTGGGAGAGACAGGGGGCACA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=4425430;WS=4425412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	4436436	rs6825715	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=242;ReadPosRankSum=0.853;SC=AGTTTCTCCTTAGTGAAACAG;SOR=0.515;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=19;WE=4436444;WS=4436426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr4	4463587	rs10004136	G	C	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GAAAGCATGGGGTGTGCATAT;SOR=0.899;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=77;WE=4463595;WS=4463577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,88:0.56:158
chr4	4473216	rs6816884	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=0.338;SC=AGAGCCTTTTGCTTTGAGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=11;WE=4473224;WS=4473206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	4862125	rs149370601	AGGGGGCCGGGT	A	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=2373;ReadPosRankSum=2.287;SC=GCGCAGAGGGAGGGGGCCGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=4862143;WS=4862115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	5016841	rs6847131	G	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=424;SC=TGACATAACTGTAGTTCTCTT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=5016849;WS=5016831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	5017146	rs67449859	A	AT	370.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.02;QD=37.07;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	5017150	rs34659865	C	CATTTCA	370.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=41.19;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	5018702	rs11724788	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=764;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CTGGGAGTGGGCAATGGGGAG;SOR=1.219;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=42;WE=5018710;WS=5018692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr4	5019029	rs28652843	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.109;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	5019052	rs28722021	T	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.955;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr4	5019052	.	TC	AT	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=28;QD=40.7339374311;SC=CTTTCTTGTGTCATACGTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=2;WE=5019061;WS=5019042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr4	5019053	rs28635618	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.955;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr4	5020940	rs372627440	CT	C	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=2.296;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
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chr4	5418485	rs2301857	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=873;ReadPosRankSum=0.002;SC=GTTTTCTTCACGGTATCTCAC;SOR=0.656;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=56;WE=5418493;WS=5418475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,64:0.40:162
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chr4	5469810	rs2301855	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=1.322;SC=AAGTCCTTCATACTGTCCCCC;SOR=1.628;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=20;WE=5469818;WS=5469800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr4	5500511	rs13116133	A	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=380;SC=CCATCTGGCTACAGTGCACAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=5500519;WS=5500501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	5527008	rs2267655	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=1.911;SC=ACACAAAAGACAGAGATAAGA;SOR=0.818;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=5527016;WS=5526998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	5527115	rs11426893	A	AT	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=4.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.725;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr4	5527249	rs2267654	A	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.177;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=393;ReadPosRankSum=0.127;SC=TTCTTCCATCATTTATTAGGC;SOR=0.323;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=30;WE=5527257;WS=5527239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr4	5528115	rs3078935	ATT	A	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.151;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	5544739	rs10937650	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=0.984;SC=TAAGTGATGCGGGCAGAGCAG;SOR=0.395;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=5544747;WS=5544729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr4	5570104	rs12508361	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=129;SC=CCCATGACCTTGAGGACTCAT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=5570112;WS=5570094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	5570221	rs12511039	G	A	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=160;SC=TCTCAGCTGCGTGGTCCACAT;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=5570229;WS=5570211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	5577884	rs6840591	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=631;SC=CAGGTGGGTATGGGTGGGCTG;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=5577892;WS=5577874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	5617295	rs10025164	T	C	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=50;PP=1266;SC=GGGGAAGACGTGGGTAAGAAG;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=5617303;WS=5617285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	5617369	rs10032860	G	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=635;SC=AGTTTCTGCAGCTCCCAGAAC;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=5617377;WS=5617359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	5624670	rs730469	T	C	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=61;PP=2141;SC=TCCTCAACCGTTCGGAAGGCC;SOR=1.198;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=5624678;WS=5624652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	5630470	rs35103377	TA	T	361.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=12;PP=213;SC=TCCTGTCAATTAAAAAAAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=5630478;WS=5630460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	5642161	rs751841	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=1.379;SC=AGGCAAATGGACAGATGAGTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=5642169;WS=5642155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	5642274	rs13131655	T	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=894;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ACTCTTCTGCTTCCTCCATTG;SOR=0.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=54;WE=5642282;WS=5642264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr4	5687281	rs960055	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.258;SC=ACACCCCAGACACATCCTGGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=5687289;WS=5687271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	5690902	rs4689278	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AACTTCTTGCTAAAAGCCTGG;SOR=0.860;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=71;WE=5690910;WS=5690892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,84:0.46:184
chr4	5731074	rs16837598	C	T	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=717;ReadPosRankSum=-0.493;SC=ACAGCATTCGCCCTGAAGGCC;SOR=0.647;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=56;WE=5731082;WS=5731063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,71:0.36:196
chr4	5732982	rs28718969	T	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=-1.889;SC=GCTGTCGATGTGGCAGAACCT;SOR=0.069;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=5732990;WS=5732979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr4	5733068	rs1871586	G	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=330;ReadPosRankSum=-1.008;SC=AGCGGCTAGCGTGAATCACTG;SOR=0.360;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=22;WE=5733076;WS=5733058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr4	5733136	rs113571700	C	T	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=677;ReadPosRankSum=-0.877;SC=GAGTGTGACTCCTACTGCCAC;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=48;WE=5733144;WS=5733126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,57:0.37:153
chr4	5734882	rs73795032	C	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-1.158;SC=TCTCTTATGGCCATTAGTGGG;SOR=2.041;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=10;WE=5734890;WS=5734872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
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chr4	5749804	rs4689311	G	A	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=17;PP=961;ReadPosRankSum=0.797;SC=TGTAATTCCCGAGCACGCACC;SOR=0.426;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=116;TCF=89;TCR=27;TR=61;WE=5749812;WS=5749794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr4	5749904	rs4688963	T	C	2822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=65;PP=1830;ReadPosRankSum=1.505;SC=AGATGGCAAATATCCAGCACT;SOR=0.724;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=294;TCF=149;TCR=145;TR=118;WE=5749912;WS=5749894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,141:0.39:361
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chr4	5750003	rs33929747	A	G	2809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=76;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CCGAAGGGCTATTGTGCGATT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=43;TCR=107;TR=106;WE=5750011;WS=5749993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,117:0.69:169
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chr4	5755373	rs7660793	G	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=0.385;SC=AAACCCAGGTGTGTCACCAGC;SOR=0.287;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=5755381;WS=5755363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr4	5755542	rs2302075	C	A	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=47;PP=1849;SC=GACCTGGTCACGGCGTCTCTG;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=5755550;WS=5755532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
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chr4	5757944	rs4642178	A	C	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.540;NF=24;NR=22;PP=1347;ReadPosRankSum=1.859;SC=AAAAAAAAAAAAAACCCTGCA;SOR=0.765;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=46;WE=5757952;WS=5757922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,62:0.76:82
chr4	5759607	rs12505053	G	A	97.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.8326;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TGGAGGTTAGGGCTTCAACCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=5759615;WS=5759606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
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chr4	5785442	rs1383180	G	A	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=50;PP=1466;ReadPosRankSum=0.756;SC=AATCGCTTCCGGAGGCAGCAG;SOR=0.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=76;WE=5785450;WS=5785432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,81:0.58:140
chr4	5803669	rs1031919	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CTTCCTTTCTTCCCTCAGAGG;SOR=0.534;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=16;WE=5803677;WS=5803659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr4	5803904	rs1031918	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=336;ReadPosRankSum=-1.813;SC=ATGTCAGATACTGTGAATTTT;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=22;TCR=73;TR=27;WE=5803912;WS=5803894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr4	5812195	rs2279250	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=672;ReadPosRankSum=0.073;SC=TGGGCCCCGGACCTGTTGCCT;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=7;TCR=67;TR=34;WE=5812203;WS=5812185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr4	5812778	rs2291151	G	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-0.043;SC=AAGACCAGTCGGTGGGACAAG;SOR=0.544;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=19;WE=5812786;WS=5812768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
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chr4	5837871	rs3815264	A	G	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=38;PP=1067;SC=GAGGAGGGGCAGCTGGGCACA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=5837879;WS=5837861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr4	5838513	rs12331	C	G	8895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=131;PP=2965;SC=CCCAGACGACCGTCATCCGCT;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=151;TCR=131;TR=282;WE=5838521;WS=5838503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr4	5841350	rs16837723	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=703;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TGCTCCAGTAATGGGTGCCAT;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=49;WE=5841358;WS=5841340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr4	5841423	rs71640227	T	TAAAC	4887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=39;PP=2918;SC=GGGGAAAACATAAGCCTGGTT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=63;WE=5841431;WS=5841413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	5843196	rs2286283	T	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=674;ReadPosRankSum=1.591;SC=GGAAGGCTGGTGTAACAGCTA;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=46;WE=5843204;WS=5843186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,46:0.38:122
chr4	5843266	rs2286282	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=255;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CTCCATTGAATGAGAAGGACA;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=22;WE=5843274;WS=5843256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr4	5843328	rs2286280	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.159;SC=GGGTGGAGCATTGGTCTCACG;SOR=0.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=5843336;WS=5843318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	5863032	rs13130069	G	A	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=58;PP=1740;SC=AAACATTTCTGAGCCAGGCCC;SOR=2.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=72;WE=5863040;WS=5863022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	5925186	rs4348041	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=469;SC=CTTTTGTGGCGGGGGCGGCTG;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=5925194;WS=5925176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	5966574	rs4996083	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=160;ReadPosRankSum=0.195;SC=AATTAGATCATAGAAGGAGAC;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=10;WE=5966582;WS=5966571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr4	5966618	rs6828891	A	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=823;SC=TCGGGAGTCGATTGTGTTCTA;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=5966626;WS=5966608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	5966665	rs7442168	G	A	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.186;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=740;ReadPosRankSum=1.093;SC=GGTGTATATCGCTTGGATAAT;SOR=0.208;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=43;WE=5966673;WS=5966655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr4	5966801	rs6839295	T	C	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1533;ReadPosRankSum=1.063;SC=GGCTCGGGAATAGGCCAGGAC;SOR=0.482;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=86;WE=5966809;WS=5966791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,101:0.66:153
chr4	5966905	rs6857900	C	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.635;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=972;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AAGCCTCCACCCAGGAACCTA;SOR=1.366;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=58;WE=5966913;WS=5966895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,62:0.65:96
chr4	5966943	rs6839512	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=561;ReadPosRankSum=1.350;SC=TGTCTGAGCCTTGTCATAACC;SOR=0.588;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=32;WE=5966951;WS=5966933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr4	5967001	rs11415729	C	CG	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=314;ReadPosRankSum=0.949;SC=TTCCATGCCCCGGGGCAGAGG;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=9;WE=5967009;WS=5966991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	5969113	rs9997727	G	A	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=42;PP=1751;SC=GAGCACACAGGCTTTTCCTGA;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=5969121;WS=5969103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	5969235	rs7690750	A	G	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=45;PP=1452;SC=GGCACTGGAGAGACAGCCTTG;SOR=1.248;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=72;WE=5969243;WS=5969225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	5969252	rs7690889	A	G	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=40;PP=1269;SC=CTTGCACAGAAGACTGCAATT;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=5969260;WS=5969242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	5969292	rs6446420	C	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=805;SC=CCCCTCCCCGCAAAAAACCGC;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=5969311;WS=5969282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	5969303	rs6446421	T	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=20;PP=599;SC=AAAAAACCGCTTTCTGTGTAG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=5969311;WS=5969282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	5969364	rs6446422	T	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=74;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=153;SC=CTCTCCAGGATGCTCAAAGGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=5969372;WS=5969354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	5982108	rs6821688	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=388;ReadPosRankSum=-1.688;SC=AGGTTATCCTTCAAGCAATTT;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=32;WE=5982116;WS=5982098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr4	5982135	rs6838551	G	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=275;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GCCAACAAACGGTACCCGTTT;SOR=1.252;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=20;WE=5982143;WS=5982125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr4	5982158	rs58696068	GT	G	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr4	5990339	rs6845455	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1002;ReadPosRankSum=2.191;SC=ACAGGCTCTTGAAAGCAGCTG;SOR=0.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=73;WE=5990347;WS=5990329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,92:0.40:229
chr4	5990599	rs751240	T	C	6094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=84;PP=2965;SC=CCGAGATCAGTGTCTGGAGCT;SOR=0.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=185;WE=5990607;WS=5990589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr4	5990791	rs2016083	A	G	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1390;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GTAAATATTGATCCAGTTCTT;SOR=0.872;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=336;TCF=170;TCR=166;TR=101;WE=5990811;WS=5990781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:291,121:0.29:412
chr4	5991384	rs4234711	T	C	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1073;ReadPosRankSum=0.440;SC=GCACACCTGTTGTGTCCTTTG;SOR=0.616;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=280;TCF=133;TCR=147;TR=90;WE=5991392;WS=5991374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,104:0.31:340
chr4	5991476	rs4266238	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=838;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TGGCAAACCTGTCTCTCCTGC;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=62;TCR=118;TR=63;WE=5991484;WS=5991466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,72:0.35:207
chr4	6031632	rs10461053	T	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GGCAGCCTGATGAGCTCTGAT;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=6031640;WS=6031622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	6050759	rs60586285	T	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=59.95;MQRankSum=-1.577;NF=8;NR=23;PP=423;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TGTTTTATTATGTTTGTTTGT;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=31;WE=6050767;WS=6050749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,31:0.27:116
chr4	6051695	.	C	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.067;SC=CAAGACACCGCGCTCTTTCTT;SOR=0.399;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=165;TCF=43;TCR=122;TR=71;WE=6051703;WS=6051685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,84:0.42:200
chr4	6087371	rs73196084	G	A	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=56;PP=1783;SC=AAAGGAGAAAGAATAAGCAGT;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=6087379;WS=6087361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	6114420	rs1543965	GCC	TAA	7009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.626;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=48;PP=2934;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TTGCAGCCCAGCCGCTGCTGA;SOR=1.140;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=234;TCF=134;TCR=100;TR=128;WE=6114430;WS=6114410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,172:0.62:279
chr4	6279047	rs10937714	C	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=26;NR=9;PP=695;SC=TACTGAGTGTCAGCGAGATCC;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=6279055;WS=6279037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	6291003	rs4689394	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=0.188;SC=TGGTGGCCTTCTCATTTTAGA;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=6291011;WS=6290993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	6292751	.	G	GTGGCAGGGGCA	1483	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=61.34;NF=4;NR=0;PP=1483;QD=381.5;SC=GAGAGTGGGCGTGGCGCGATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=6292766;WS=6292746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr4	6292755	rs55640037	C	CAGGGGCATG	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.342;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	6292758	.	G	A	514	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=61.11;NF=8;NR=0;PP=514;QD=68.5964015684;SC=GGCGTGGCGCGATGTCCTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=6292766;WS=6292746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,8:0.38:21
chr4	6292758	rs56102017	G	GCA	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=1.575;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	6292799	rs5018647	A	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.466;NF=18;NR=2;PP=321;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTTCCCTGGTAACCAAGTCCT;SOR=1.089;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=20;WE=6292807;WS=6292789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr4	6292818	rs5018648	C	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.647;NF=23;NR=4;PP=495;ReadPosRankSum=1.798;SC=CTGACACCTTCTATGAGTCTC;SOR=1.218;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=27;WE=6292826;WS=6292808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr4	6292909	rs9998519	C	T	4667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,119:0.55:215
chr4	6292915	rs10010131	A	G	4735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=2.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,124:0.56:223
chr4	6293446	rs13101355	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=350;ReadPosRankSum=1.036;SC=CGCTACGTGGTGCTGAGTCCA;SOR=0.407;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=21;WE=6293454;WS=6293436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr4	6293474	rs13147655	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=525;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TACTGGAGGTACAGAGGTGTG;SOR=0.193;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=29;WE=6293482;WS=6293464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr4	6293696	rs1801213	C	G	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.654;SC=AGCAGAGGCGCATGCTGGAGC;SOR=0.654;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=78;WE=6293704;WS=6293686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,99:0.61:161
chr4	6302519	rs1801212	G	A	6901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=0.650;SC=CTTCTTCATCGTCAGCAACCT;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=396;TCF=216;TCR=180;TR=249;WE=6302527;WS=6302509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,294:0.63:468
chr4	6302707	rs1801206	C	T	6696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.799;SC=AGGCCGAGGTCAACTTCGGCT;SOR=0.783;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=405;TCF=210;TCR=195;TR=242;WE=6302715;WS=6302697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,299:0.61:493
chr4	6303022	rs1801214	C	T	6099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=1.018;SC=TCGTCCTCAACGTCAGCGTCC;SOR=0.720;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=334;TCF=165;TCR=169;TR=213;WE=6303030;WS=6303012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,261:0.64:406
chr4	6303354	rs734312	G	A	4997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.077;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CTGCTGTTGCGCTGGTGGACC;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=286;TCF=164;TCR=122;TR=189;WE=6303362;WS=6303344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,218:0.65:337
chr4	6303955	rs1046314	G	A	5014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.587;SC=GCGAGTTCAAGAGCGTGCTGC;SOR=0.885;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=282;TCF=123;TCR=159;TR=187;WE=6303963;WS=6303945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,206:0.67:309
chr4	6304087	rs1046316	A	G	3946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=78;PP=2397;ReadPosRankSum=0.262;SC=CCCAGCTCTCACCCACCAGGC;SOR=0.581;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=234;TCF=106;TCR=128;TR=146;WE=6304095;WS=6304077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,176:0.64:277
chr4	6304242	rs1046317	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.321;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=615;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCATGAGGCCTTTCCCCAGTG;SOR=0.136;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=31;WE=6304250;WS=6304232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr4	6335186	rs4689405	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=547;ReadPosRankSum=-0.707;SC=ACCTACATACCGGGCATATGA;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=30;WE=6335194;WS=6335176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr4	6335492	rs73204090	G	A	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1329;ReadPosRankSum=1.012;SC=CCGTCACTGCGCTGCTCCCGC;SOR=0.539;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=47;TCR=90;TR=86;WE=6335500;WS=6335482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,101:0.62:162
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chr4	6377530	rs4688997	C	G	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.76;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	6377534	rs4688998	A	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	6377713	rs4234738	G	C	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=31;PP=1145;SC=CCGGATGGAAGAGAAGATCCA;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=6377721;WS=6377703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	6384349	.	TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	T	501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=2.582;QD=27.87;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr4	6415558	rs4689437	CC	AG	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=2565;ReadPosRankSum=1.720;SC=TGCCGGGGCTCCCACTCAGGG;SOR=0.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=68;WE=6415567;WS=6415548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,78:0.70:111
chr4	6415585	rs10213664	T	C	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=34;PP=1474;ReadPosRankSum=0.646;SC=AGCTCCACGATGGGGACCCTC;SOR=0.566;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=99;TCR=47;TR=100;WE=6415593;WS=6415575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,106:0.66:160
chr4	6415618	rs4689000	G	A	3359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=48;PP=1995;ReadPosRankSum=-2.203;SC=ATGCCCCACAGCCCCTGCTCA;SOR=0.541;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=183;TCF=115;TCR=68;TR=124;WE=6415626;WS=6415608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,146:0.68:215
chr4	6415803	rs71599889	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.381;NF=2;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-2.633;SC=TTGCCTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=2.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=19;WE=6415811;WS=6415793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr4	6536979	rs13141184	G	A	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=682;ReadPosRankSum=-0.960;SC=CTGCCCGGCTGTGAGAACGGG;SOR=0.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=44;WE=6536987;WS=6536969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr4	6578487	rs4689485	A	G	6023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=105;PP=2965;SC=TTGGCCCAGTATCCTGGCAAA;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=187;WE=6578495;WS=6578477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr4	6580284	.	TG	T	734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.040;NF=2;NR=18;PP=668;ReadPosRankSum=0.330;SC=GGCTGGGACATGGTATCAGAA;SOR=0.379;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=20;WE=6580292;WS=6580274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr4	6594827	rs10937747	A	G	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=183;NR=91;PP=2965;SC=CTGGGAGAACATGGCACTTGG;SOR=1.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=183;TCR=91;TR=274;WE=6594835;WS=6594817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr4	6596360	rs2301795	G	A	5203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=121;PP=2965;SC=CGGTGTCTCGGTGCAGTATGC;SOR=1.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=49;TCR=121;TR=170;WE=6596368;WS=6596350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	6619052	rs4689488	A	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=412;SC=TAGACCAGGGACATTGGGGTT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=6619060;WS=6619044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	6619165	rs4689489	A	G	4990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=40;PP=2965;SC=TCTACCACCTATATGAAGTGG;SOR=1.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=102;TCR=40;TR=142;WE=6619173;WS=6619155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr4	6619204	rs4689490	G	A	7591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=91;PP=2965;SC=CTCAGCCAGTGACAGTGAATC;SOR=1.150;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=146;TCR=91;TR=237;WE=6619212;WS=6619194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr4	6623032	rs4234768	G	T	8915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=135;PP=2965;SC=AGATGCCCCGGCCCCAGGGCT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=261;WE=6623051;WS=6623022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr4	6676030	rs150335747	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=0.736;SC=CCGCGAGAACCTGGCCTCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=8;WE=6676038;WS=6676020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	6698500	rs113431497	C	CTGAGCCTGAA	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=2978;SC=GGCCCTGGCCCTGACAGCAAA;SOR=3.442;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=6698508;WS=6698492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	6698667	rs11734898	T	C	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=76;NR=78;PP=2795;SC=AGGACCTGGATGCCAATGGAG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=154;WE=6698675;WS=6698657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr4	6698706	rs11733989	A	C	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=81;NR=82;PP=2811;SC=GTGAGTTCATAGTGTTCGTGG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=81;TCR=82;TR=163;WE=6698714;WS=6698696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr4	6862754	.	T	A	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1511;ReadPosRankSum=2.036;SC=CCCCACCAGCTAGCACAGATA;SOR=0.733;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=92;WE=6862762;WS=6862743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr4	6925009	rs41516949	A	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-1.332;SC=TTCTCCCTTAAGTGAGATCAG;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13;WE=6925017;WS=6924999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	6955922	rs4484301	C	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=341;ReadPosRankSum=-1.215;SC=CCGAGTGCACCCATGGAGTTT;SOR=0.487;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=21;WE=6955930;WS=6955912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr4	6956059	rs11732887	T	C	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1054;ReadPosRankSum=1.495;SC=CTCCTGTTCATGGACAGGTTT;SOR=0.769;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=232;TCF=126;TCR=106;TR=88;WE=6956067;WS=6956049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,104:0.38:274
chr4	6956134	rs11732898	T	C	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=123;PP=2965;SC=GAGTCTTTCCTGCGTGTAGCT;SOR=1.404;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=64;TCR=123;TR=187;WE=6956142;WS=6956124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr4	6968942	rs9291126	C	T	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=1022;SC=CAGAGGAAAGCTGACTTGTTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=6968950;WS=6968932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	7002803	rs2301817	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=9;PP=664;SC=TGGTTCGGGGCTAGGCACGCA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=7002811;WS=7002793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	7027041	rs6834102	C	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=498;SC=GCAAGTGGCGCGACTCAGGAA;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=7027049;WS=7027031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	7044357	rs871133	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=141;SC=CCTCAGCCCCAACCTCGGCCG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=7044365;WS=7044347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	7044380	rs871134	C	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=6;PP=332;SC=TCTTCGGGCTCGGGCTGGGGC;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=7044388;WS=7044370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	7044600	rs2359010	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=643;ReadPosRankSum=2.554;SC=ACGGCCGCGCGGCCAGGCTTT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=47;WE=7044608;WS=7044590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,58:0.41:142
chr4	7045657	rs6842659	C	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=1.002;SC=GCGCAGGCAGCGCTGGACCTG;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=4;WE=7045665;WS=7045647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr4	7064003	rs11422620	A	AC	1343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=1;PP=1510;SC=CAACAGCTGGACCCCCCACCC;SOR=6.184;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=43;WE=7064011;WS=7063993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	7064214	rs9291128	T	G	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.93;SOR=2.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	7064219	rs28636568	A	T	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.53;SOR=2.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	7066052	rs2359011	TA	GC	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=1511;SC=AACTATTTACTATTACTTGGG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=7066061;WS=7066042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	7069606	rs2276969	G	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=6;PP=526;SC=CGGGGCCGAGGCCGGGAAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=7069614;WS=7069596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	7069804	rs3822270	C	A	8666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.367;SC=ACCAAGCGTGCGTGCAGGCAG;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=272;TCF=161;TCR=111;TR=271;WE=7069812;WS=7069794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,315:1.00:316
chr4	7069901	rs3822269	T	C	6127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=133;PP=2965;SC=TCACCAATAATTGTGGGTCAC;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=70;TCR=133;TR=203;WE=7069909;WS=7069891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr4	7312145	rs11942816	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GCTTTAAAAATGGCATTTATT;SOR=0.455;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=27;WE=7312153;WS=7312135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr4	7435009	rs59409649	G	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=1335;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CATGGGCCTCGCTAGCAGGCT;SOR=0.347;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=35;WE=7435021;WS=7434999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr4	7435013	rs11721763	G	A	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=1510;ReadPosRankSum=1.306;SC=GGCCTCGCTAGCAGGCTCTGG;SOR=1.206;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=47;WE=7435021;WS=7434999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr4	7435058	rs60816800	C	T	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=880;ReadPosRankSum=0.546;SC=TGTTCCCCAGCGTGGAGGTGC;SOR=0.570;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=59;WE=7435066;WS=7435048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr4	7435379	rs4689746	A	G	5524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=96;PP=2965;SC=TTGCTCTCCAAGTTGTGGGAG;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=174;WE=7435387;WS=7435369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr4	7435443	rs6843370	G	A	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1370;ReadPosRankSum=1.467;SC=GGTTCTCCGCGTCCCACTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=155;TCF=89;TCR=66;TR=80;WE=7435451;WS=7435433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr4	7435721	rs6850206	C	T	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1797;ReadPosRankSum=2.554;SC=TTCATGCACACCTCACAGGTC;SOR=0.794;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=101;WE=7435729;WS=7435711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,114:0.45:254
chr4	7436073	rs61740031	C	T	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1313;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CTCCTTCAGGCGCCTGGCGGG;SOR=0.506;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=86;WE=7436081;WS=7436063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,103:0.49:210
chr4	7436239	rs56402179	C	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1264;ReadPosRankSum=1.272;SC=CGGGGCCCCACGGAGCATGCT;SOR=0.924;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=154;TCF=94;TCR=60;TR=79;WE=7436247;WS=7436229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr4	7461769	rs12512664	A	G	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=-1.030;NF=32;NR=42;PP=1253;ReadPosRankSum=-1.734;SC=CATTTAGGGTAACTGAGCTGC;SOR=0.849;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=74;WE=7461777;WS=7461759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,90:0.52:173
chr4	7461826	rs10655902	C	CCCA	6921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=61;PP=2970;SC=CCCAGCAGTCCCTCCCCCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=86;WE=7461834;WS=7461816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	7461915	rs12498272	T	A	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=55;PP=1818;SC=GCGTGCCAGCTAGTAGAATCC;SOR=1.072;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=7461923;WS=7461905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	7462058	rs34961985	A	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GGCACTAACCAGCCAACCCCA;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=7462066;WS=7462048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	7655693	rs6826370	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=0.878;SC=TCCTGGAGGCGGTGGGGTTTG;SOR=0.139;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=12;WE=7655701;WS=7655683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
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chr4	7663167	rs2285788	A	T	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1100;ReadPosRankSum=0.747;SC=TGTGGGGAGCAGCTGGGGGAC;SOR=0.709;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=68;WE=7663175;WS=7663157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,73:0.53:139
chr4	7666007	.	C	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=-1.781;SC=AAGATGGAGTCCAGCACATGT;SOR=0.197;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=7;WE=7666015;WS=7665997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr4	7684641	rs4689820	C	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=195;SC=TCACATCACACACCATCCTTG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=7684649;WS=7684631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	7684661	rs4689821	CT	AC	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=237;SC=GGCGTGGATGCTAGATATAAC;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=7684670;WS=7684651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	7714490	rs4689833	T	C	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=29;PP=1048;SC=TCCGCTCCGATTGGGAGCTGG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=7714498;WS=7714480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	7716932	rs6816604	T	C	4491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=62;PP=2705;SC=TGAGCGCTCCTCCTCCTCAGA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=137;WE=7716940;WS=7716922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	7717012	rs2285781	G	A	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=70;PP=2257;SC=ACTGTGCCCTGGGCCAGACCT;SOR=1.114;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=111;WE=7717020;WS=7717002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr4	7731310	rs1544402	G	A	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=701;SC=AACTCTCCCCGCAGGAGACCA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=7731318;WS=7731300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	7731560	rs1076226	T	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=465;SC=TCGCTGCATCTCAGTCTGACT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=7731568;WS=7731550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	7736455	rs6843811	G	A	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=857;SC=TAAGCAGTGTGCCCAAGGTAA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=7736463;WS=7736445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	7738730	rs6840685	A	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=7;PP=628;SC=GGCCAGCGGAAGGCTCCAGGG;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=7738738;WS=7738720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	7741851	rs12501485	A	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=415;SC=GCCTGAGGCCACGACCGTGTC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=7741859;WS=7741841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	7780582	rs41264705	C	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=38;PP=1177;SC=TTAGACGCCACGGGGGGCTTT;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=7780590;WS=7780572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	7783163	rs28542374	G	A	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=12;PP=800;SC=CAGACTGAGCGGAGGCAGGGT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=7783171;WS=7783153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	7802292	rs11728778	G	A	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=34;PP=1162;SC=TCTTCAGGTCGGTCCTGTCCT;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=7802305;WS=7802282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	7817698	rs35907552	GT	G	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=24.99;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	7820727	rs4447865	T	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=135;SC=TTCTCAGAGATTGTTATCAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=7820735;WS=7820717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	7820795	rs35726835	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=377;SC=CAAGAGCAGCGCCCTTACCTT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=7820803;WS=7820785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	7870518	rs34570748	G	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1322;SC=GCATCTATCAGTTCCTGAACC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=7870526;WS=7870508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	7968888	rs16841504	T	C	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=33;PP=1116;SC=AGGGACACCATTGGGCAGTTT;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=7968896;WS=7968878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	7968936	rs13137347	G	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=547;SC=ATTGCATTGAGGATGGGGTGG;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=7968944;WS=7968926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	7968953	rs28409515	G	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=18;PP=494;SC=GTGGCCCTCAGCGTGCTCGGC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=7968961;WS=7968943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	8006928	rs11939078	C	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=5;PP=282;SC=TGCGCTCGCTCTGTCGGCGTC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=8006936;WS=8006918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	8009759	rs17180256	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=636;SC=TGCACATCACGGCTCCTTCTT;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=8009767;WS=8009749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	8021417	rs34477140	A	G	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.94;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	8021478	rs34327175	T	C	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=35;PP=921;SC=TACAGCTTTTTGTAAGCAACA;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=8021486;WS=8021468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	8021592	rs13131680	A	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=173;SC=TGCCACCCTCATCTGCAGGAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=8021600;WS=8021582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	8031471	rs2385904	A	G	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=27;PP=1071;SC=TGGAGGTCCGACACTGCTTGT;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=8031479;WS=8031461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	8062638	rs6853485	A	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=17;PP=944;SC=GTGTGTGGACATCGAAGAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=8062646;WS=8062628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	8062689	rs6811028	TG	CA	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=26;PP=2198;SC=CATTTTAATTTGTACCTTGAA;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=51;WE=8062698;WS=8062679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	8062871	rs6853901	A	C	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=59;SC=GCATGCCCTGAGCACAGGTAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8062879;WS=8062861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	8090028	rs11722016	C	T	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=48;PP=1611;SC=CAAGAGAGCTCGTTACCAGCC;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=8090036;WS=8090018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	8129382	rs13143332	A	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=364;SC=AGGATCGGGCAGGAGTGGACC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=8129390;WS=8129372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	8207083	rs2677605	A	G	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=7;PP=225;SC=CCAAGGCGCCAGTGAGAGGCG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=8207091;WS=8207073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	8211624	rs1712316	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=417;SC=TCCAAGAGTCCAACCCAGGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=8211632;WS=8211614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	8214636	rs1712287	T	C	59.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=38;SC=TGTCTGAGACTGGGGACACAG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=8214644;WS=8214626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	8216099	rs2291069	G	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=0;PP=1034;SC=GTCCCCCGCCGGGGCCACATC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=8216107;WS=8216089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	8216391	rs1618403	C	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=44;PP=1262;SC=AGATTACAAACTGGTGCTTTG;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=8216399;WS=8216381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	8221058	rs4696782	G	A	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=55;PP=2505;SC=GCTTTCTTCCGCAGCTGTGGG;SOR=1.036;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=132;WE=8221066;WS=8221048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	8224414	rs113477900	T	TGTC	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	8227044	rs2279196	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-1.639;SC=CATTGGGTGCGGCTGTCACCC;SOR=2.303;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=8227052;WS=8227034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	8228627	rs1678299	G	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.071;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr4	8228632	rs1678300	A	C	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.92;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	8228731	rs1281145	T	C	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=45;PP=1985;SC=TGCCTGAGCCTGGAGCCACAG;SOR=0.966;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=108;WE=8228739;WS=8228721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	8228894	rs1292647	T	C	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=54;PP=2177;SC=AAGCCGAGGATGACTGGGAGG;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=8228902;WS=8228884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr4	8228948	rs55642964	T	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=819;ReadPosRankSum=1.000;SC=TGAACGCCCCTGGGTACAAGG;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=66;WE=8228956;WS=8228938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,78:0.48:164
chr4	8229218	rs1281146	A	G	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=45;PP=2361;SC=ACCTGTTCCTAGTGGTGGCTG;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=111;WE=8229226;WS=8229208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	8229326	rs1281147	T	C	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.07;NF=54;NR=62;PP=2169;SC=TGGGGACGCCTGACCACATCT;SOR=0.838;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=116;WE=8229334;WS=8229316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	8229713	rs1281148	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=890;ReadPosRankSum=0.342;SC=TCCCTGCCCAAACTTCCCACT;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=58;WE=8229721;WS=8229703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr4	8229774	rs1281149	C	T	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=940;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CCAGGCGCTGCGCGGCCCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=70;WE=8229782;WS=8229764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr4	8230070	rs1281150	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=0.811;SC=GGCAGGCAGCTGAGAGCTACT;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=33;WE=8230078;WS=8230060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr4	8230235	rs1281151	T	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=390;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GGCTGCCCCTTGGGGAGTGTG;SOR=0.929;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=38;WE=8230243;WS=8230225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr4	8234381	rs3775905	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=299;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TTGGCTCTCCTGGAGCATCCT;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=25;WE=8234389;WS=8234371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr4	8237096	rs1678260	G	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=795;SC=GGGGGAGTCCGACCTGGGTGG;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=8237104;WS=8237086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	8238151	rs11603	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=412;ReadPosRankSum=-1.503;SC=TCAGCATCACCCTGGGTAAGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=40;WE=8238159;WS=8238141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr4	8242466	rs1281103	A	G	5199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=69;PP=2965;SC=TGGCGCTGGCAGCCGCCGTGG;SOR=0.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=164;WE=8242474;WS=8242456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr4	8242740	rs8153	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TGCCTCTCCTGGTGTCGCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=8242748;WS=8242730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr4	8368869	rs827000	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=-1.032;SC=GATTCCTAGACGGCTGAGTGT;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=21;WE=8368877;WS=8368859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
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chr4	8391049	rs2242483	A	G	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.600;SC=GGTGGAAGACAGGAACCCAAA;SOR=1.074;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=67;WE=8391057;WS=8391039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,79:0.57:138
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chr4	8415982	rs2245515	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=284;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GTCTCATATGCTCCAAACTCA;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=17;WE=8415990;WS=8415972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr4	8451656	.	A	ATTTTCTTTTC	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=0.967;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr4	8456701	rs2002860	C	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=495;ReadPosRankSum=0.157;SC=GAAAAAGAGACATGAAACTAG;SOR=0.994;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=26;WE=8456709;WS=8456691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr4	8473050	rs2631768	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=1.589;SC=AGCAAGTTCCGCGGTGCCCCA;SOR=1.329;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=11;WE=8473058;WS=8473040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr4	8582742	rs17844776	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=609;ReadPosRankSum=0.290;SC=TGGCGGGTCTCCTGGTGATGG;SOR=0.522;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=43;WE=8582750;WS=8582732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr4	8582856	rs17844777	T	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=983;ReadPosRankSum=-1.837;SC=TGAATCTGTCTCTGGGCCACC;SOR=0.839;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=64;WE=8582864;WS=8582846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,79:0.59:133
chr4	8583312	rs17844778	A	C	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1218;ReadPosRankSum=0.284;SC=TGGCACGCAGACACTGCCAGC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=72;WE=8583320;WS=8583302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,95:0.50:191
chr4	8584448	rs6824455	T	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=55;PP=1305;ReadPosRankSum=0.478;SC=CCTCTGAGGTTTCCCAGCAAG;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=150;TCF=40;TCR=110;TR=73;WE=8584456;WS=8584438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr4	8584493	rs6857501	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=685;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GAGGACCCTCCTCCACACCTG;SOR=0.433;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=36;WE=8584501;WS=8584483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr4	8584511	rs6857510	C	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CTGACGGGCTCAGGGCTGTGC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=27;WE=8584519;WS=8584501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr4	8594574	rs2302583	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.41;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	8594574	.	TGCC	CGCC,CGCT	149	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=14,5;NR=11,6;PP=149,142;QD=7.35084850189;SC=CCGCCCCCGCTGCCGCTGCTG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=25,11;WE=8594585;WS=8594564;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.96:26
chr4	8594577	rs34964084	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr4	8594683	rs2302582	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=512;ReadPosRankSum=1.550;SC=CTCCACCCTCCACCCTGCAAC;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=35;WE=8594691;WS=8594673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr4	8594815	rs4411969	T	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=397;SC=GGACTGGTAGTGTGACCTCTC;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=8594823;WS=8594805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	8601298	rs11723641	G	A	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1347;ReadPosRankSum=0.879;SC=AGCTGAATCCGTGATTTCAGA;SOR=0.680;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=90;WE=8601306;WS=8601288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,110:0.59:186
chr4	8601381	rs7671320	A	G	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=997;ReadPosRankSum=0.962;SC=AAAATTAGACATAACAAAAAA;SOR=1.230;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=62;WE=8601389;WS=8601371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr4	8602793	rs4299567	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	8602793	.	TGCGTG	CGCGTC,CGCGTG	179	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7,15;NR=1,2;PP=130,179;QD=22.9334843578;SC=AAATGTCTGATGCGTGACGGT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8,17;WE=8602806;WS=8602783;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:17
chr4	8602798	rs2241069	G	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr4	8602816	rs4594711	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=653;SC=GGGCCACTGCAGGAGGGACTG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=8602824;WS=8602806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr4	8602935	rs4431213	A	G	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=54;PP=2540;SC=AGCACCGGTCATGGGAGGTGG;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=82;TCR=54;TR=136;WE=8602943;WS=8602925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr4	8605818	rs6852001	C	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=688;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CCTCCCGCTGCGCCCACGTGG;SOR=0.409;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=42;WE=8605826;WS=8605808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr4	8605933	rs41266531	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=1.117;SC=CCCTTGGGAGAGCCTGGCCTG;SOR=0.346;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=9;WE=8605941;WS=8605923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	8607587	rs4696703	G	A	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.588;SC=ATATACAGAGGTTCTTGAGTC;SOR=4.565;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=8607595;WS=8607577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr4	8608934	rs2302579	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.115;SC=AAGCCCAGGGCATGGCTGCGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=6;WE=8608942;WS=8608924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr4	8609195	rs12643627	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GAGACAGTGTGCGCGGTCCCC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=32;WE=8609203;WS=8609185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr4	8612722	rs72237922	TTCACTCATTCAC	T	241.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.549;NF=6;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CACTCACTCTTTCACTCATTC;SOR=1.085;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=7;WE=8612749;WS=8612712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr4	8612734	rs201465210	CTCACTCAT	C	141.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.549;NF=6;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CACTCATTCACTCACTCATTC;SOR=0.412;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=7;WE=8612749;WS=8612712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	8612911	rs41266535	A	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=595;ReadPosRankSum=1.168;SC=TCCTCAGCACAGACCTGTCCT;SOR=0.813;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=47;WE=8612919;WS=8612901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr4	8613026	rs3796727	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr4	8613035	rs41266537	A	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr4	8613912	rs145520245	C	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.461;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	8613916	.	G	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=32.97;ReadPosRankSum=0.637;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	8613917	rs12511563	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.637;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	8616054	rs2302572	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GCGGCTGACACCCCTGACGTC;SOR=0.793;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=10;WE=8616062;WS=8616044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr4	8616070	rs2302571	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr4	8616096	rs1131140	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=279;ReadPosRankSum=-2.963;SC=GCATGTCCGATTTCAACTACC;SOR=0.874;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=22;WE=8616104;WS=8616086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr4	8616179	rs7378066	T	C	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=53;PP=2224;SC=GCCCTGTACATACTCTGGCAG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=8616187;WS=8616169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr4	8620023	rs6447885	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=528;ReadPosRankSum=0.482;SC=GCGAGGGCTGGCAGAGTGGGG;SOR=0.556;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=26;WE=8620031;WS=8620017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr4	8620045	rs4444816	A	G	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=7;PP=1550;SC=TCTGTGGGGTAGTTCCCCCTA;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=8620053;WS=8620035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	8620103	rs7670383	C	T	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=16;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.308;SC=ACGGCCTCCACGCTCAGCAGG;SOR=0.347;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=135;TCF=108;TCR=27;TR=70;WE=8620111;WS=8620093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr4	8620153	rs12650877	C	T	2855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=50;PP=1920;ReadPosRankSum=-1.698;SC=TTGGTCTCTTCAGGTGCACCG;SOR=0.924;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=225;TCF=130;TCR=95;TR=123;WE=8620161;WS=8620143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,128:0.52:248
chr4	8620325	rs4696872	A	G	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=69;PP=2151;SC=GGCAGCCGGCACCCTCAGGCA;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=84;WE=8620333;WS=8620315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	8621194	rs28514374	A	G	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=79;PP=2818;SC=CCCACGACCCACTGGGAGGTG;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=145;WE=8621202;WS=8621184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr4	8621392	rs1050465	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-1.096;SC=GCCCATCTCCGCATCCCGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=11;WE=8621400;WS=8621382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr4	8869587	rs13303225	T	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=0;PP=221;SC=CAGCGGCGGCTGCGGCCGGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=8869595;WS=8869577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	9370908	rs11938651	C	T	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=183;SC=CTAGTGCCTACCCCCCAAAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=9370916;WS=9370898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	9784631	rs6283	C	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=14;PP=622;SC=GTGGACACCCCGAAGGCCCTC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=31;WE=9784639;WS=9784621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	9785134	rs1967551	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=376;SC=CGCACAGACATTGACAAGCAC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=9785142;WS=9785124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	9909923	rs2280205	G	A	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=28;PP=1223;SC=GATCTTTGCCGGAGGGATCCC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=9909931;WS=9909913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	9982191	rs13115193	C	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=496;SC=AGAGCAGATGCGGTTGACCAG;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=9982199;WS=9982181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	9982330	rs13125646	A	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=36;PP=1503;SC=AGATCTCACTAAGGTACATGG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=9982338;WS=9982320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	9998440	rs10939650	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=9;PP=462;SC=TCACAATTAACGTCCCCACAA;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=9998448;WS=9998430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	9998493	rs13113918	A	G	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=18;PP=977;SC=GACCAGAGCAAAGTCAGAGTG;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=9998501;WS=9998483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	9998605	rs28592748	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=20;PP=649;SC=CCTTCTGTTCTCTCCTGCTGC;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=9998613;WS=9998595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	10020564	rs2240721	G	A	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=148;SC=CCGCAGGGCCGCAGCGCCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=10020572;WS=10020554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	10020757	rs2240722	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=285;SC=GGCCGAGGGAAGACCTGGAAC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=10020765;WS=10020747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	10022981	rs2276961	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=390;SC=CCTGGAGGCCCGGCGTGGCTG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=10022989;WS=10022971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	10080462	rs2241469	A	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=21;PP=976;SC=CACTGTCCCCAAATCACCCAG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=10080470;WS=10080452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	10086015	rs2241474	T	C	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=21;PP=841;SC=GAACAGGAAATTCCCCCCTAG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=10086023;WS=10086005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	10086188	rs2241475	T	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=884;SC=GGTAAGCTGATGACACACTGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=10086196;WS=10086178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	10090178	rs4235349	T	C	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=35;PP=1554;SC=GGGAGGGCGATGTCTAAGTTC;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=10090186;WS=10090168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	10444650	rs3217	C	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=226;SC=GTCTGTATTTCTTCTACTGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=10444658;WS=10444644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	10446385	rs9291410	C	T	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=41;PP=1643;SC=CTGCTGTGAGCTACTGTGTAA;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=10446393;WS=10446375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	10446906	rs10016022	A	G	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=54;PP=1725;SC=CAACCTTCACATCTATCAACT;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=10446914;WS=10446896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	10447985	rs35177766	AT	A	959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=806;SC=GCCAACTAAAATTCAGAAAGT;SOR=1.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=10447993;WS=10447975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	10502937	rs2903960	T	G	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=16;PP=1234;SC=CCAGGAAGCGTATTTTTACAT;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=10502945;WS=10502927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	10509699	rs2868941	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=595;SC=TTAGGGTCAATGGGAAGTATG;SOR=2.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=30;WE=10509707;WS=10509689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	10525711	rs148908322	A	AGAG	661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.36;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	10527342	rs2108878	C	T	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=282;SC=TCTTGAGCCTCATTATTGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=10527350;WS=10527332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	10542058	rs1962796	C	G	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.35;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	10586384	rs12640119	G	T	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=91;SC=GACAGTCACAGATCAGGCTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=10586392;WS=10586374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	10599670	rs75741253	G	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=255;SC=TCTTTCTATTGCCCCTGGGAT;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=10599678;WS=10599660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	10669522	rs13136927	A	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=28;PP=1187;SC=GGTAAGAGGGATCTTCAATTC;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=10669530;WS=10669512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	13462419	.	G	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=9;PP=382;SC=TCAAAGCTTTGATAATTTGTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=13462427;WS=13462409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	13548796	rs2080023	T	G	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=50;PP=1939;SC=GAGGTGGTTGTATGCCCAGAG;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=13548804;WS=13548786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	13548911	rs73231543	C	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=22;PP=619;SC=CGCGACCGCGCGGGCGTGCCT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=13548919;WS=13548901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	13571867	rs17806666	C	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=410;SC=AAGAGAAAAACCCAGTAACAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=13571875;WS=13571857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	13578405	rs2052159	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=367;SC=ACCCAGAGCAATTTTCAGATG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=13578413;WS=13578395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	13583838	rs17806907	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=663;SC=TGTGAACAAACAAATACGAAA;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=13583846;WS=13583828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	13584108	rs17745075	A	G	106.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=GCACACTTTGAGTATAGCAGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=13584116;WS=13584099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	13593336	rs758975	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=84;SC=AAAGTTCTTTATCAGTGGGTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=13593344;WS=13593326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	13604182	rs17745676	T	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TATTTTTCTGTATTCAGGCCT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=44;WE=13604190;WS=13604172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr4	13604418	rs17745712	G	C	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=47;PP=1942;SC=AGCCTGGTGAGCTTCTGGAAT;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=101;WE=13604426;WS=13604408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	13606576	rs1971278	A	T	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=31;PP=1313;SC=TCTCTTTCTAATTTGGATTCA;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=13606584;WS=13606566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	13612486	rs1491251	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=161;SC=CACATCAGTACCTTGCAGATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=13612494;WS=13612476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	13615174	rs2035820	G	A	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=26;PP=1256;SC=GCTATCAGACGTTACAACTTC;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=13615182;WS=13615164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	13615293	rs2109917	C	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=32;PP=998;SC=AATCTTCAAGCGGAAAATAAA;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=13615301;WS=13615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	13629721	rs12499127	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=412;SC=ATAGACATTTGTAATGCGAAC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=13629729;WS=13629711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	15004655	rs7435318	G	A	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=42;PP=1557;SC=GAAACTCCCCGACCACCACCC;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=15004663;WS=15004645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	15005604	rs112476821	G	A	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=15;PP=799;SC=GGCTCGCTCAGCGCCATGCCG;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=15005612;WS=15005594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	15009232	rs1874207	C	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=367;SC=ATGTAAATGACCTTATCTCTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=15009240;WS=15009222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	15059987	rs987399	AA	GG	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	15443685	rs13108125	T	G	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	15480225	rs9993580	A	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=164;SC=ACTGTCCCCCAACTCACACTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=15480233;WS=15480215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	15482477	rs10000250	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=533;SC=CCATTCAGCTACTGCTTGTTA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=15482485;WS=15482467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	15482809	rs6810461	G	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=214;SC=TTCTTGCTCTGTTCACTCACA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=15482817;WS=15482799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	15513147	rs1058412	C	T	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=335;SC=AACCTGCCACCACCAGGAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=15513155;WS=15513137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	15530124	rs4698395	C	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=396;SC=GATGCTTGAACATCCGTTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=15530132;WS=15530114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	15538744	rs1558572	T	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=426;SC=GGCCAGGAAGTGTCTGGGAGG;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=15538752;WS=15538734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	15539498	rs1861044	A	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=28;PP=1542;SC=CCTGTTTGATATCATGTTGCC;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=15539506;WS=15539488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	15569018	rs73125627	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=7;PP=614;SC=AGCAGCCGTCGAGGTCTTCAA;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=15569026;WS=15569008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	15575751	rs4280724	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=302;SC=AGGATGTTTACCAAGTCATAT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=15575759;WS=15575741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	15587897	rs6832789	A	T	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=58;PP=1747;SC=ACAGATTTAGAAACTTGAGCT;SOR=1.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=88;WE=15587905;WS=15587887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	15589345	rs28419165	C	T	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=161;SC=CACTTCAAGACACTAACCTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=15589353;WS=15589335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	15602773	rs80080596	C	CTTA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=127;SC=ATCCAGAACACTTATCTTAAT;SOR=1.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=15602781;WS=15602763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	15689928	rs4235380	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=15;PP=500;SC=AATGAACTGAGTTTAAAACTA;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=15689936;WS=15689918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	15690233	rs6449160	C	A	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=19;PP=977;SC=TGCTTTTCGACACCCTGAATC;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=15690241;WS=15690223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	15717321	rs3213710	G	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=408;SC=TTCAAGAAATGTTTCTCAGTT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=15717329;WS=15717311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	15737882	rs4698413	C	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=41;PP=1199;SC=CTGAGTGCATCGTCCTCTTGC;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=15737890;WS=15737872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	15739488	rs4283655	A	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=12;PP=395;SC=CTCCCACAGCAAGGAAGCCGA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=15739496;WS=15739478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	15937526	rs1042510	G	A	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=31;PP=1818;SC=CATCTCTTAAGGGAACCCGTT;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=15937534;WS=15937516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	15937731	rs2072313	T	C	5253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=63;PP=2965;SC=TCTCTTTGCCTTTGATGTGCT;SOR=1.088;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=158;WE=15937749;WS=15937721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	15964040	rs2286460	G	A	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=20;PP=1427;SC=CTCTGTATATGAGTAAAGGAA;SOR=1.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=15964048;WS=15964030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	15964501	rs2286459	G	A	4943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=63;PP=2908;SC=GGTCAGCAGCGAAAGCCTGGC;SOR=0.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=87;TCR=64;TR=150;WE=15964509;WS=15964491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	15964573	rs758328	A	G	5651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=92;PP=2965;SC=GGCAGTCGACACGAAGCCAGA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=183;WE=15964581;WS=15964563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr4	15964763	rs4698432	C	T	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=36;PP=1047;SC=GGCGATACTCCGATAAACTTG;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=15964771;WS=15964753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	15972904	.	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=452;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TAAAAACAGCATAGAAGATAA;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=24;WE=15972912;WS=15972894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr4	15977572	rs11734657	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=265;SC=ACCCTTGGAGTTCTACTATAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=15977580;WS=15977562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	15982163	rs34269395	A	AG	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.489;NF=0;NR=17;PP=496;ReadPosRankSum=-2.852;SC=AACAAATTCTAGGAAAAAAAA;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=17;WE=15982171;WS=15982153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr4	15985984	rs3815344	G	C	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=43;PP=875;ReadPosRankSum=1.183;SC=CTGATCTAGGGGGGTGGAAAC;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=50;TCR=71;TR=74;WE=15985992;WS=15985974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,81:0.60:135
chr4	15986042	rs7675574	G	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1550;SC=GGAATGAGACGTGCCATTTAC;SOR=1.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=15986050;WS=15986032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	15986113	rs7659341	T	C	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=429;SC=CCCCAACTCCTGGGTCACAGA;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=15986121;WS=15986103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.12;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	1206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=70.98;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	15989191	rs2191004	C	T	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=13;PP=774;SC=CTTTTTTTTTCAACTTAAAGT;SOR=2.794;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=59;WE=15989199;WS=15989180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	15991275	rs2240685	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=709;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGCATGTGTCGTGAGGCTAAA;SOR=0.354;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=48;WE=15991283;WS=15991265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr4	15992783	rs17387037	A	C	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.824;NF=35;NR=31;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CTTCCCTAAGAATGGTACTGA;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=66;WE=15992791;WS=15992773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,78:0.41:190
chr4	16002050	rs6449212	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=826;SC=CTTAAAGTAATGCACAATATA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=16002058;WS=16002040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	16005061	rs6825026	T	C	3413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=75;PP=2127;ReadPosRankSum=-2.641;SC=CTGCTTTCCATAACCTCAGAA;SOR=0.572;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=219;TCF=89;TCR=130;TR=128;WE=16005069;WS=16005051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,152:0.59:259
chr4	16014736	rs16892775	C	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=450;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TTGTTTTTAACTGTCCGAATG;SOR=0.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=25;WE=16014744;WS=16014726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr4	16024885	rs2013854	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=-0.377;SC=AAGAGTGAGCAAGCCTGCCAA;SOR=0.454;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=31;WE=16024899;WS=16024875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr4	16025837	rs17478336	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=272;ReadPosRankSum=1.293;SC=CTTTCACGTACGTCATTTCTT;SOR=0.052;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=18;WE=16025845;WS=16025827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr4	16168512	rs11724423	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=-0.238;SC=GGTGGGGGGGCATGGGACGGT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=16168520;WS=16168502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	16172181	rs1662654	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CTGGCATAGACTGGGAGTAGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=16172189;WS=16172171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	16189991	rs75841626	A	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr4	16190073	rs28645901	T	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.623;SC=AGATCTGTGTTTTAAATCCTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=16190081;WS=16190063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	16192413	rs7666361	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=402;ReadPosRankSum=-1.438;SC=GATTTTCATACGCTGAATGCT;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=28;WE=16192421;WS=16192403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr4	16192837	.	A	G	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1120;ReadPosRankSum=0.526;SC=GTTTAAGAAGAGCCCCCAAGT;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=68;WE=16192845;WS=16192827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,80:0.53:152
chr4	16198370	.	G	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=2.840;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,28:0.25:112
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chr4	16753863	rs283027	A	C	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=156;SC=TCAGTGAACAAGATACAGAGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=16753871;WS=16753853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr4	17489003	rs2597767	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=336;ReadPosRankSum=0.889;SC=CTGGGCGCCATGGCTCACACC;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=33;WE=17489011;WS=17488993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr4	17492145	rs731437	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=79;ReadPosRankSum=-2.067;SC=TGATGTGCAATGCATCCTCAG;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=8;WE=17492153;WS=17492135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
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chr4	17503544	rs2597776	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=631;ReadPosRankSum=-1.024;SC=GTGAGCTCAACTCATGCAGCC;SOR=1.038;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=18;WE=17503554;WS=17503534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr4	17503546	rs3733571	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=1579;ReadPosRankSum=0.016;SC=GAGCTCAACTCATGCAGCCCC;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=39;WE=17503554;WS=17503534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr4	17506042	rs12645938	G	A	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1339;ReadPosRankSum=0.277;SC=CTCCAGCAACGCAAAGAATTG;SOR=0.448;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=85;WE=17506050;WS=17506032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,101:0.64:159
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chr4	17511634	rs10030250	G	A	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.874;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=175;ReadPosRankSum=-2.242;SC=TAAATAGGGGGAAAAAATAAG;SOR=0.233;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=18;WE=17511642;WS=17511624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr4	17513458	rs2244804	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=283;ReadPosRankSum=-2.090;SC=AAGCAACACGAGTCAGGGGGT;SOR=1.199;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=17;WE=17513466;WS=17513448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr4	17513498	rs3217604	GC	G	974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=728;ReadPosRankSum=0.439;SC=CCTCTAGACTGCCCCCCGCCG;SOR=0.804;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=28;WE=17513506;WS=17513488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr4	17513724	rs2244788	G	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=142;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GCCTCGAGCCGGAGCGCCGCG;SOR=0.653;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=15;WE=17513732;WS=17513714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr4	17513757	rs67496406	CG	C	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=163;ReadPosRankSum=1.677;SC=CGGCCAACCCCGCCAAGAGGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=17513765;WS=17513747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr4	17581617	rs10939736	T	A	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.078;NF=28;NR=59;PP=1581;ReadPosRankSum=1.690;SC=CGAAACAGTATTTTTTCTTTC;SOR=0.537;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=39;TCR=92;TR=87;WE=17581625;WS=17581607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,104:0.64:163
chr4	17581643	rs35153429	CAG	C	2155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.542;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.033;NF=5;NR=36;PP=1865;ReadPosRankSum=0.983;SC=TTTTTTGAAACAGAGTCTTGC;SOR=0.361;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=41;WE=17581652;WS=17581633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr4	17583200	rs5856433	TAA	T	183.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;MQRankSum=0.140;QD=20.39;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr4	17586703	rs3733576	T	C	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1080;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCAGATTTGCTGAAATTATTG;SOR=0.857;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=79;WE=17586711;WS=17586693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,85:0.62:137
chr4	17590671	rs17499929	G	A	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.851;NF=14;NR=45;PP=1126;ReadPosRankSum=0.369;SC=CTTGGTTATAGGGTTTTTTGG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=23;TCR=73;TR=59;WE=17590679;WS=17590661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr4	17590686	rs35467396	AT	A	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.058;QD=9.67;ReadPosRankSum=2.342;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	17599894	rs3775927	G	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GGTGCTGGGGGATTATTAAAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=17599902;WS=17599891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	17608620	rs4698628	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=1.858;SC=CAAAATAGCTATTTTCAATTT;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=25;WE=17608628;WS=17608610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr4	17608884	rs4698629	C	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=660;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TATTCTGAAACTGATATGTGG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=28;WE=17608892;WS=17608874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr4	17625209	rs11733730	G	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=479;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CTTAGTCCATGACTTTCATCT;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=24;WE=17625217;WS=17625207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr4	17627294	rs2315552	A	G	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=33;PP=1496;ReadPosRankSum=0.131;SC=TTACTGGGTGATGAATAATCC;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=76;TCR=45;TR=89;WE=17627302;WS=17627284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,103:0.71:145
chr4	17627332	rs2315553	T	C	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=51;PP=1950;ReadPosRankSum=1.424;SC=GCTGCTAACTTTTTCAGGGAG;SOR=0.695;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=86;TCR=70;TR=111;WE=17627340;WS=17627322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,131:0.69:190
chr4	17634213	rs6825562	A	G	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=73;PP=2853;SC=TTTCTGCTGGACTTCTTTGGC;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=139;WE=17634221;WS=17634203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	17634255	rs6847966	G	A	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=2541;ReadPosRankSum=-1.301;SC=GGTCCTAAAAGCAAAAAAAGG;SOR=0.837;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=57;WE=17634264;WS=17634245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr4	17634256	rs142873186	C	CAA	2489.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=2555;ReadPosRankSum=-1.494;SC=GTCCTAAAAGCAAAAAAAGGT;SOR=0.868;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=19;TCR=69;TR=46;WE=17634264;WS=17634245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
chr4	17635556	rs140729140	CAAAAT	C	1193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.784;NF=1;NR=16;PP=728;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATGCAAAAAACAAAATAAAGC;SOR=0.591;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=17635568;WS=17635546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr4	17636507	rs3214318	G	GT	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.779;SC=AAACAAGTGGGTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=17636515;WS=17636497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	17640858	rs6811887	C	T	3727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=65;PP=2039;ReadPosRankSum=0.004;SC=CCCTGGGGCCCGAGGCCTCAC;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=108;TCR=110;TR=131;WE=17640866;WS=17640848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,167:0.62:270
chr4	17643620	rs28501187	G	A	86.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr4	17643848	rs2286771	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=318;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GGGCCGCCCCGCTCCTGAGGA;SOR=0.970;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=20;WE=17643856;WS=17643838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr4	17649233	rs3733577	T	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GGAGGGGTATTGCTGGTGCAA;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=17;WE=17649241;WS=17649223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr4	17649494	rs6813374	T	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.03;ReadPosRankSum=-0.471;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr4	17649499	rs6813375	T	G	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.64;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr4	17654648	rs3815413	T	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=541;ReadPosRankSum=-2.484;SC=AAAGTGGGCATGAGGGTGGGA;SOR=0.484;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=49;WE=17654656;WS=17654638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr4	17659936	rs10939742	G	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.486;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1231;ReadPosRankSum=0.986;SC=CCTAGCAGGTGCCCGGCACAG;SOR=1.043;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=74;WE=17659944;WS=17659926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,87:0.65:133
chr4	17660082	rs1860596	C	T	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=59;PP=1510;ReadPosRankSum=0.016;SC=CTGGAGCTCACGCTGCAGCTT;SOR=1.095;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=146;TCF=56;TCR=90;TR=91;WE=17660090;WS=17660072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,104:0.65:161
chr4	17660237	rs2302391	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TTTCCTGGGATGTTTTCTTCA;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=17660245;WS=17660227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr4	17689901	rs11306510	AT	A	142.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.282;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr4	17689974	rs4698646	T	C	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=784;SC=CAGCATGTGTTACTGGGGACA;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=17689982;WS=17689964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	17694880	rs6449324	G	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=617;ReadPosRankSum=0.766;SC=AAGCTCCCAGGGACCAGAAAC;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=37;WE=17694888;WS=17694870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr4	17694916	rs3822235	A	G	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=25;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GCATTTGGTCAGGGCTCACCT;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=139;TCF=96;TCR=43;TR=86;WE=17694924;WS=17694906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,102:0.63:163
chr4	17694943	rs3733579	A	G	2902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.422;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.05;MQRankSum=0.828;NF=71;NR=30;PP=2027;ReadPosRankSum=1.249;SC=GAGAATTCTGAAGCTTCACAT;SOR=1.208;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=168;TCF=110;TCR=58;TR=101;WE=17694951;WS=17694933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,121:0.60:202
chr4	17695206	rs3733581	C	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-1.369;SC=CACGTGTTAACGTCACAACAC;SOR=0.653;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=12;WE=17695214;WS=17695196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr4	17706928	rs13139898	T	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=141;ReadPosRankSum=0.841;SC=GTTTATACACTGTTTTTACAG;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=12;WE=17706936;WS=17706918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr4	17707361	rs57570581	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=8;PP=994;ReadPosRankSum=1.269;SC=CCCCAGGGCTGGGTCAGACAC;SOR=0.738;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=72;TCR=14;TR=53;WE=17707369;WS=17707351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr4	17707627	rs62295656	C	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TCCAACATCCCCTGTGTAATT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=20;WE=17707635;WS=17707617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr4	17711076	rs3733583	T	C	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=59;PP=2345;SC=TCAGCCTCTTTTGCAGCTCCA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=17711084;WS=17711066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr4	17812615	rs2074974	A	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=16;PP=969;SC=ATAGAAGACTACTCGGAGAGC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=17812623;WS=17812605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	17818885	rs2302212	T	C	5873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=73;PP=2965;SC=ACTCAATAGATGCTGTGAAAC;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=176;WE=17818893;WS=17818875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr4	17876551	rs11728692	G	A	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1147;ReadPosRankSum=0.573;SC=GGAGCAGAGCGTTTCTATAAA;SOR=0.553;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=70;WE=17876559;WS=17876541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,78:0.67:116
chr4	17885296	rs139656197	A	AAC	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=0.546;QD=25.03;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr4	20256722	rs1323066	G	A	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=61;PP=1730;SC=TCGCGGTTGCGTGTGGGCCGG;SOR=2.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=79;WE=20256730;WS=20256712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	20259621	rs139749288	A	AT	944.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=591;SC=AAAATACTTAAATTTCAAGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=20259630;WS=20259611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	20259622	rs61790829	A	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=416;SC=AAATACTTAAATTTCAAGCAT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=20259630;WS=20259611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	20490710	rs543593	T	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=384;SC=TCACTAATGTTCAATTGTGCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=20490718;WS=20490700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	20492380	rs485909	A	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=342;ReadPosRankSum=-0.685;SC=ACAGTTCGTTACTAACCACTT;SOR=0.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=22;WE=20492388;WS=20492370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr4	20492417	rs7695303	G	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=24;PP=1380;ReadPosRankSum=0.463;SC=TTTCCTTTCTGTTTTCTAGAT;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=77;WE=20492425;WS=20492407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr4	20520993	rs519813	T	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=14;PP=986;SC=TCATTTAAAATATTTTTTTCA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=20521001;WS=20520983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	20526985	rs146437952	C	CAT	460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=410;SC=TGATGTTAAACATATATTATT;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=20526993;WS=20526975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	20533700	rs3215198	A	AT	750.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.836;NF=2;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=0.462;SC=CTTGTTAGCTATTTTTTTTAT;SOR=0.337;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=20;WE=20533708;WS=20533690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr4	20535460	rs74466092	T	TTC	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CTCTTTCACATTCTCTGTTAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=20535468;WS=20535450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	20541005	rs35993588	AG	A	8431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=38;PP=2951;SC=ATCCTCAGATAGGCAAAATTG;SOR=2.368;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=117;WE=20541016;WS=20540995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	20541008	rs3842004	C	A	8441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=44;PP=2965;SC=CTCAGATAGGCAAAATTGATT;SOR=2.147;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=193;TCF=139;TCR=54;TR=173;WE=20541016;WS=20540995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	20544184	rs7690492	C	T	2367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.981;SC=TGGATACAGTCGTCCGATGTA;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=323;TCF=156;TCR=167;TR=112;WE=20544192;WS=20544174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,131:0.34:388
chr4	20547532	rs12501787	C	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TGGAACACGACATCTTAAAGC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=20547540;WS=20547522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr4	20547578	rs12501870	G	C	530.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.9848;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=409;ReadPosRankSum=-0.826;SC=TCAGTTAAGAGTGAAGTACTG;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=20547586;WS=20547568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr4	20552510	rs17542486	A	C	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ATCTTTCTGCATTATCACATC;SOR=0.869;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=83;WE=20552518;WS=20552500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,97:0.63:154
chr4	20569099	rs2290750	A	G	4259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=89;PP=2807;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TGTATGTGCCAAGAACTACTT;SOR=0.805;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=237;TCF=102;TCR=135;TR=152;WE=20569107;WS=20569089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,183:0.63:290
chr4	20569254	rs12506323	A	G	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,76:0.69:110
chr4	20569259	rs2290751	C	T	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,71:0.68:104
chr4	20570787	rs17620615	G	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=158;SC=CTTAAAGATAGTTTCAGCTAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=20570795;WS=20570777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	20599758	rs3775833	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=1.051;SC=ATTTCAGCATCGTTTTCTCAT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=20599766;WS=20599752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	20599783	rs67622693	CAT	C	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=1182;ReadPosRankSum=0.194;SC=ATCAGGAAAACATAAACCATA;SOR=1.382;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=20599804;WS=20599773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr4	20599796	rs12507257	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AAACCATAGTAAAACCTGTTC;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=20;WE=20599804;WS=20599773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr4	20611818	rs35891001	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr4	20620683	rs1379659	G	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=52;PP=1414;SC=CTTCTTGACCGTGTGGGACTA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=67;WE=20620691;WS=20620673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	20709238	rs35495469	G	GA	1372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=1;PP=1530;SC=ATCGTTAGGGGAAAAAGAGAT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=41;WE=20709246;WS=20709228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	20709303	rs73805127	A	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.482;NF=26;NR=18;PP=583;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GTTTTTCTCAACTGTGTTGCT;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=44;WE=20709311;WS=20709293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,50:0.34:145
chr4	20714642	rs3764964	T	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=474;SC=TCCCTCCATATTATATGCAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=20714650;WS=20714632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	20714924	rs12331966	A	G	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1354;SC=TTTGTTGACTATCTTCTGATT;SOR=4.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=20714932;WS=20714914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	20715244	rs62410126	A	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=331;ReadPosRankSum=1.468;SC=ACAATTTCAAATCTTCAACTC;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=19;WE=20715252;WS=20715234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr4	20726537	rs10654905	C	CTT	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=0;NR=9;PP=137;SC=TTCCTTAAGTCTTTTTTTTTA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=20726545;WS=20726527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	20733708	rs111474115	C	CA	1941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=997;SC=AGGAAGAAAACAAAAATTGTA;SOR=0.933;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=35;WE=20733716;WS=20733698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	20734171	rs6812257	G	A	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.04;SOR=3.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	20734176	rs6811933	C	G	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=3.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	20736416	rs112956417	A	AAAAC	1245.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=1219;SC=AAAAACAAAAAAAACAAATGA;SOR=5.353;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=22;WE=20736424;WS=20736406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	20751278	rs2322688	A	G	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=15;PP=778;SC=AATAATCCAGAGCTTACCTCG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=20751286;WS=20751268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	20760644	rs57740160	A	G	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=52;PP=1504;SC=CCATTATTACAAAGGGAATAA;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=20760652;WS=20760634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	20760683	rs17623902	A	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=674;SC=TGTTTGTTCCAGTTCTCACAA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=20760691;WS=20760673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	20852166	rs3765121	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=0.104;SC=AAGTTCTTACATTCTTAAATC;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=6;WE=20852174;WS=20852156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr4	20852244	rs3765122	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CAAGGGCTTCAGGCCGATGCC;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=11;WE=20852252;WS=20852234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr4	20884482	rs57696441	G	GA,GAA	340.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.63;QD=28.39;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,5:0.58,0.42:12
chr4	21764761	rs717531	C	T	6989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=126;PP=2965;SC=AATTCCTTCACTGTGGTTGAA;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=96;TCR=126;TR=222;WE=21764769;WS=21764751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr4	21950259	rs6448102	A	G	7334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=118;PP=2965;SC=ATTCATGTCTAGGGACGCAGG;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=112;TCR=118;TR=230;WE=21950267;WS=21950249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr4	22416133	rs7658234	C	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=363;ReadPosRankSum=1.071;SC=AACAATTAACCATCTAAAAAC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=21;WE=22416141;WS=22416123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr4	22416195	rs13106386	C	G	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=711;ReadPosRankSum=0.216;SC=CTTCTAACCTCTCTTCTTCTA;SOR=0.596;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=44;WE=22416203;WS=22416185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,48:0.70:69
chr4	22439914	rs6823735	A	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.908;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-1.616;SC=CCCTCTCTGGAGGACAGTACT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=22439922;WS=22439904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr4	22457478	rs16872669	C	T	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.965;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=68;PP=1866;ReadPosRankSum=0.126;SC=GGACTTAGCCCTATGCAAGAA;SOR=1.120;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=181;TCF=78;TCR=103;TR=111;WE=22457486;WS=22457461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,128:0.61:211
chr4	22517355	rs186892593	G	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr4	23815522	rs3755863	C	T	5988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.836;SC=AATAGGATTGCGTGCCATCCC;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=315;TCF=171;TCR=144;TR=219;WE=23815530;WS=23815512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,250:0.67:374
chr4	23815662	rs8192678	C	T	5302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CTCAGTTCACCGGTCTTGTCT;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=317;TCF=132;TCR=185;TR=199;WE=23815670;WS=23815652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,229:0.61:373
chr4	23815924	rs2970847	T	C	3247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=76;PP=1831;ReadPosRankSum=0.856;SC=TGAGTATTTCTGTTTTGGAAT;SOR=0.886;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=191;TCF=80;TCR=111;TR=126;WE=23815932;WS=23815914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,148:0.65:227
chr4	23886323	rs2946385	G	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=686;ReadPosRankSum=1.652;SC=CATGTTAGTCGGGCCCAAGCC;SOR=0.516;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=33;WE=23886331;WS=23886313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr4	24534687	rs3828558	T	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.370;SC=TCTAAAAAGGTAGAAGGCGGG;SOR=0.630;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=170;TCF=75;TCR=95;TR=72;WE=24534695;WS=24534677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,79:0.41:195
chr4	24538573	rs4697063	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.875;SC=GGTTTCTAATATAAGTTGTCA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=24538581;WS=24538563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr4	24550580	rs33972724	G	A	3053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=57;PP=1742;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGATTTTAATGTCACCAACTT;SOR=0.774;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=107;WE=24550588;WS=24550570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,135:0.62:216
chr4	24801315	rs2536512	G	A	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=142;PP=2965;SC=CGACGACGGCGCGCTCCACGC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=108;TCR=142;TR=250;WE=24801323;WS=24801305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr4	24801949	rs2695232	C	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=6;PP=245;SC=AACAGACACCCTCCACTCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=24801957;WS=24801939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	24809884	rs1019229	T	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=1;PP=517;SC=ACAGGATCAGTGCGTTTTCTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=24809892;WS=24809875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	25001439	rs7689760	T	C	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=54;PP=2547;SC=CCAGTGTGCTTCCTGAAGGCT;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=124;WE=25001447;WS=25001429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	25001576	rs7665497	C	T	7281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	25001576	.	CTC	TTT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=58;NR=74;PP=2947;QD=20;SC=CCTCAACATCCTCCCCATAGC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=61;TCR=75;TR=132;WE=25001586;WS=25001566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,132:0.97:136
chr4	25001578	rs7665498	C	T	7281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	25001632	rs7690185	T	A	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=54;PP=1665;SC=TCCTCCTTAGTACAACAGAAA;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=25001640;WS=25001622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	25001685	rs7670138	A	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=677;SC=TGGGGCCTTGAATGTAAAAAG;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=25001693;WS=25001675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	25005023	rs2232029	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=0.860;SC=TCTTGGTCCTCTTTTGTGAGA;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=25005031;WS=25005013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	25005193	rs2232028	G	A	5189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=73;PP=2809;SC=GCGCCTGCACGTAAATCTCCT;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=146;WE=25005201;WS=25005183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	25005454	rs2232025	G	A	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CAGCCAGTACGTCCTCCATGT;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=97;WE=25005462;WS=25005444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,110:0.65:169
chr4	25028592	rs73250693	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=-1.994;SC=CCAATGGAGAGATGTAAAACT;SOR=1.255;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=20;WE=25028600;WS=25028582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr4	25032354	.	C	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=192;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CGACCCCCACCGCCGCGCCGC;SOR=1.038;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=12;WE=25032362;WS=25032344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr4	25236017	rs313549	T	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=11;PP=306;SC=CCGGAGTTCGTCCGCCGAGCT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=25236025;WS=25236007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	25253995	rs313567	C	T	10240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=153;NR=148;PP=2965;SC=CAGAATTTGCCGATATTATGC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=301;TCF=153;TCR=148;TR=301;WE=25254003;WS=25253985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr4	25316815	rs12508686	T	C	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=624;SC=TTTTGTTTTCTCCTGAAATGA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=25316823;WS=25316805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	25335426	rs146318399	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=1.651;SC=TTTCATTGAAATATCATAAAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=25335434;WS=25335416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr4	25382216	rs315676	C	G	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=158;SC=ATAAATATCACTTTGGGAACT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=25382224;WS=25382206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr4	25391584	rs186408	G	A	110.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=0;PP=119;SC=AAAAAGGAATGAGCCTGATGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=25391592;WS=25391574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr4	25394078	rs2292408	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=0.515;SC=GTGAATATTTATTATCGGCTT;SOR=0.165;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=14;WE=25394086;WS=25394068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr4	25395674	rs17605267	C	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TCAGATTTGCCAAAAGGGCTC;SOR=0.195;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=25395682;WS=25395664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr4	25396001	rs140671016	TAAACTC	T	1246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.101;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.276;NF=5;NR=14;PP=933;ReadPosRankSum=0.994;SC=AGCAAGGTAATAAACTCAGAT;SOR=0.690;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=19;WE=25396014;WS=25395991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr4	25404553	rs10023139	C	T	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=29;PP=1194;SC=ATCCCCCACACACTAATCTTA;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=25404561;WS=25404543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	25408516	rs3214034	T	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=584;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AGGTAAGAAGTTGATATTTCT;SOR=0.363;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=43;WE=25408524;WS=25408506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr4	25408724	rs28616687	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=-0.907;SC=ACTGCCACTCACAGCTCTCTT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=25408732;WS=25408714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr4	25408838	rs34811474	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.975;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=595;ReadPosRankSum=-1.704;SC=CTTTATAATCGAAAAGGAAAA;SOR=0.188;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=37;WE=25408846;WS=25408828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr4	25411532	rs41267449	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=494;ReadPosRankSum=0.511;SC=GTTTATTAGACTTATATTTAT;SOR=0.240;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=31;WE=25411540;WS=25411522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr4	25417244	rs3816587	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=552;SC=GACTCAGTTACGGTGGTAATA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=25417252;WS=25417234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	25419283	rs9174	T	C	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=76;PP=2965;SC=CCATGCATTTTGAGAAGCACT;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=169;WE=25419291;WS=25419273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr4	25674905	.	TCACA	T	381.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=461;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CTTGTAGGCCTCACATGTAGT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=25674921;WS=25674895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=572;SC=GGCCTCACATGTAGTCACTGC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=25674921;WS=25674895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	25674913	rs62409436	A	G	390.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTCACATGTAGTCACTGCAT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=25674921;WS=25674895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr4	25678199	rs6448389	A	G	6179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=110;PP=2965;SC=TTGCTGTGTGACTGCCCCAAG;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=85;TCR=110;TR=195;WE=25678207;WS=25678189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	25678396	rs3733545	G	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TGTCAGGGATGGGGGGATGGT;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=26;WE=25678404;WS=25678386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr4	25750261	rs3822215	C	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.781;SC=CACCTAGAGACTCTGGCAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=9;WE=25750269;WS=25750251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr4	25758580	rs4401441	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=405;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CAGTTTCTTAGGCTTTTTAAA;SOR=0.430;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=12;TCR=77;TR=26;WE=25758588;WS=25758570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,28:0.29:97
chr4	25767183	rs4697616	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-1.068;SC=ACATCTTTATGTTTCCCTGAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=25767191;WS=25767173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	25769129	rs2290575	CC	GG	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=2189;ReadPosRankSum=-1.976;SC=CAATTTTGCACCGTTTTTCTA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=123;TCR=56;TR=58;WE=25769138;WS=25769119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,72:0.36:202
chr4	25769319	rs2290578	T	C	3832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,111:0.34:322
chr4	25769327	rs2290579	A	G	3819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,105:0.35:297
chr4	25780599	rs13121073	C	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=439;SC=CATGCATGTACAACTGGTAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=25780607;WS=25780589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	25780891	rs4697619	A	G	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=46;PP=1371;SC=AGACAAGGTGATGAGATGCTT;SOR=2.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=25780899;WS=25780881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	25915648	rs2305669	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=370;ReadPosRankSum=1.161;SC=TCCAACGCCAGCGCCCGGCCC;SOR=0.780;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=39;WE=25915656;WS=25915638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,39:0.25:154
chr4	25915826	rs6448414	G	A	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=47;PP=1786;ReadPosRankSum=-0.154;SC=AGGCCCGGAAGCGAAAGCCTC;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=113;WE=25915834;WS=25915816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,132:0.63:209
chr4	26097294	rs142549871	GAAGGAAGGAAGGAAGGA	G	2759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.88;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,69:0.70:99
chr4	26122858	rs6825116	G	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.405;SC=AAGCCAGTGGGCTGCCCTGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=26122866;WS=26122848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	26274274	rs7680528	T	A	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=19;PP=1254;ReadPosRankSum=0.062;SC=GCATTTTGTCTTCATTTTTTC;SOR=0.572;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=87;TCR=30;TR=72;WE=26274282;WS=26274264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,88:0.61:145
chr4	26322759	rs113697915	C	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=484;ReadPosRankSum=1.710;SC=GGGGCCGCGGCGCGCTTGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=23;WE=26322767;WS=26322749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr4	26364300	rs13116873	C	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=384;ReadPosRankSum=-0.612;SC=ATAGAATGAACACTCATGATT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=24;WE=26364308;WS=26364290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr4	26387959	rs56122711	AT	A	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=10.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr4	26407681	rs3109839	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TGTTTTTAAGATTTGCTTATT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=26407689;WS=26407671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	26417136	rs2270226	T	C	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=556;ReadPosRankSum=0.853;SC=TTATGGGCAGTGGATGGAAGA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=36;WE=26417144;WS=26417126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr4	26483208	rs17846984	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=-1.537;SC=TCCGTTCTTTCTTCTCTGCCT;SOR=0.459;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=25;WE=26483216;WS=26483198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr4	26483839	rs56270760	C	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=780;ReadPosRankSum=0.273;SC=GGGTCATGCCCGGTAGAAGGC;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=36;TCR=85;TR=43;WE=26483847;WS=26483829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,50:0.34:146
chr4	26491111	rs1800857	A	G	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,74:0.37:198
chr4	26491117	rs1800855	A	T	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,76:0.39:193
chr4	26585881	rs4692549	C	T	3367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=69;PP=2032;ReadPosRankSum=0.098;SC=TCAAGGGCTCCAATTTGTACT;SOR=0.596;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=75;TCR=105;TR=121;WE=26585889;WS=26585871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,146:0.68:214
chr4	26615982	rs260954	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=457;SC=TGTATGTTTACTTAAAAACTA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=26615990;WS=26615972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	26673761	rs9997999	T	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.66;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	26673787	rs7691219	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=11;PP=560;SC=TTGAAAATGAACATGTACGTA;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=26673795;WS=26673777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	26721578	rs4590010	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTTCATATCATGAAATGACAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=26721586;WS=26721568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	26737063	.	C	CT	204	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=60.44;NF=8;NR=4;PP=204;QD=17.75;SC=AAAGAAATACCTTTTTTTTTT;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=12;WE=26737071;WS=26737053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,12:0.46:26
chr4	26862546	.	CTT	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=7.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.563;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.236;SOR=3.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	26862754	rs114264770	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=360;ReadPosRankSum=1.592;SC=GCTGCGCTTTCACCCGGCTTC;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=23;WE=26862762;WS=26862744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr4	26862782	rs75058604	C	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=393;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CGCCTTCATCCCGCCTCGACT;SOR=0.972;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=32;WE=26862790;WS=26862772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr4	27004011	rs10028164	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=563;SC=TGGACTTACAGGAGAGGTAAG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=27004019;WS=27004001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	27004490	rs5856961	T	TA	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr4	27022800	rs10031905	A	G	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=292;SC=CCTACCGTAAACTTGCCACTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=27022808;WS=27022790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	27023347	rs6853163	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=229;ReadPosRankSum=-0.269;SC=ATTAGGAAGCCGTTGCAATCA;SOR=1.002;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=14;WE=27023355;WS=27023337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr4	30132766	rs34540632	ATG	A	2069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.219;NF=23;NR=28;PP=1623;ReadPosRankSum=0.612;SC=TAACATATATATGTGTGTGTG;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=51;WE=30132777;WS=30132756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,86:0.62:139
chr4	30222329	.	T	TATAG	351	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=26;MQ=58.29;NF=7;NR=1;PP=351;QD=44.25;SC=TGTGTGTGTGTAGACATATAT;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=8;WE=30222337;WS=30222319;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr4	30279664	rs111907846	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.539;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr4	30279692	rs375167758	CAT	C	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=5.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=1.272;QD=1.70;ReadPosRankSum=-2.474;SOR=1.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,9:0.13:67
chr4	30279696	.	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=6.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=1.291;QD=1.20;ReadPosRankSum=-1.686;SOR=1.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,7:0.10:68
chr4	30279742	rs199704978	T	C	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.20;QD=43.24;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	30279742	.	TACG	CACA,CACG	622	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=15;MQ=47.78;NF=24,30;NR=20,37;PP=622,316;QD=15.3515426105;SC=GATACCTATATACGCACGCGT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=44,67;WE=30279753;WS=30279732;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.64:69
chr4	30279745	rs61794114	G	A	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.05;QD=44.11;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	30279789	rs61794115	A	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=965;SC=GTACGGATACATATACACGCA;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=51;WE=30279797;WS=30279779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	30279815	rs79831746	A	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.12;QD=43.59;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	30341558	rs76600313	A	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=484;ReadPosRankSum=0.729;SC=TGTGTGTGTGAGAGTGTGAGT;SOR=0.454;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=38;WE=30341566;WS=30341548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr4	30480934	rs7655003	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=425;ReadPosRankSum=0.195;SC=ACATATGTGCATATGTGTATA;SOR=0.553;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=36;WE=30480942;WS=30480924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr4	30725696	rs1047012	G	A	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=63;PP=1977;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TCATTGGCGTGGTTGCTGGCA;SOR=0.548;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=210;TCF=90;TCR=120;TR=116;WE=30725704;WS=30725686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,134:0.53:254
chr4	30725987	rs977931	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=950;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GGCGATACAGGTCCGTTAATG;SOR=0.720;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=52;WE=30725995;WS=30725977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr4	30732274	rs3756025	G	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=338;ReadPosRankSum=1.994;SC=TCTTAGCTCCGAAATCTCTAC;SOR=0.201;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=30732282;WS=30732264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr4	30976765	.	TTGTGTG	T,TTGTGTGTGTGTG	201	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.4042,0.5958;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=60.6;NF=1,1;NR=1,1;PP=5,201;QD=4.0;SC=TTCCCTTTCATTGTGTGTGTG;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=2,2;WE=30976778;WS=30976755;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.14:14
chr4	31031755	rs139430988	T	TTGTGTGTGTGCA	1949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.43;QD=47.55;SOR=3.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	31099222	rs369939473	ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	A	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.11;MQRankSum=1.504;QD=29.22;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr4	31099260	rs58379331	A	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.94;MQRankSum=1.649;QD=27.99;ReadPosRankSum=2.520;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr4	31107765	rs4580617	G	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=118;ReadPosRankSum=1.219;SC=AAAATTCAAAGTATGTTTAAG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=12;WE=31107773;WS=31107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr4	31116254	rs71190493	A	AACAC	215.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.12;QD=35.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	31116375	rs10006845	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.330;SC=AGAGAGGTGAACATATACAGC;SOR=1.022;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=7;WE=31116383;WS=31116365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	31129723	rs142112056	A	ATG	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=5;PP=221;ReadPosRankSum=0.719;SC=ATATGTATATATGTGTATATA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=31129731;WS=31129713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	36081878	rs4833069	C	T	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=88;PP=2965;SC=CGTCTGAGTTCGTGAACTATC;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=176;WE=36081886;WS=36081868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr4	36109409	rs7688562	C	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=263;SC=CATTTGAAAACATCTGTAGGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=36109417;WS=36109399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	36123024	rs1397423	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=860;SC=CAGTTTATCAATTTTTAAACA;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=36123032;WS=36123014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	36130099	rs6148397	T	TACAC,TAC	917.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=15,15;NR=0,0;PP=555,51;SC=GTCTATATTATACACACACAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=15,15;WE=36130107;WS=36130089;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:19
chr4	36130375	rs5857473	TA	T	949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=30;PP=519;SC=AACCTTTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.855;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=30;WE=36130383;WS=36130365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	36149025	rs1567483	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=32;PP=1291;SC=TTAAAACACTGTAATAAACAC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=36149033;WS=36149015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	36149113	rs1567484	C	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=16;PP=1370;SC=AAGGCTATCACTATTGTATGC;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=36149121;WS=36149103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	36152584	rs13148785	G	T	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=24;PP=1189;SC=TGATATTAATGGTGCCATTAG;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=36152592;WS=36152574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	36214744	rs114642723	G	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=256;SC=TTGCTGACTGGAAATTTCAAT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=36214752;WS=36214734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	36258197	rs7686575	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=17;PP=811;SC=CTCACTTCCTTGCTTGTTCGC;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=36258205;WS=36258187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	36292018	rs1995319	T	A	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=42;PP=1802;SC=CTGAGTGATGTTACTGGCCCC;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=36292026;WS=36292008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	36340753	rs9654132	G	A	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=40;PP=1918;SC=TTAATCAACCGTCCACAGAGT;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=94;WE=36340761;WS=36340743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	36340812	rs17460427	C	G	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=56;PP=1968;SC=TTTGCTTTGTCATCATTATAG;SOR=0.868;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=101;WE=36340820;WS=36340802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	36428048	rs6841938	G	A	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=22;PP=1089;SC=TTGCTCATCCGTAAGAAACAA;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=36428056;WS=36428038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	37243756	rs144889108	TA	T	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=210;ReadPosRankSum=1.842;SC=TAATCGGATATAAAAAAAACA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=37243764;WS=37243746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr4	37246639	rs892826	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=-1.608;SC=GGCAGGAACCCGAGGAGCAGG;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=9;WE=37246647;WS=37246629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	37247021	rs892825	C	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=8;PP=209;SC=CCCTCGCTGGCCGGTTTTGCC;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=37247029;WS=37247011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	37327583	rs73130327	A	C	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=674;ReadPosRankSum=2.702;SC=GACAGGCGCTAAGAGAAAATG;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=43;WE=37327591;WS=37327573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr4	37357982	rs143844592	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=554;ReadPosRankSum=0.883;SC=ATCCATCTGTCCCCAGGTCAT;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=37;WE=37357990;WS=37357972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr4	37432416	rs2973217	A	C	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=79;PP=2630;SC=CCTTTCCCTCAAGCCTATGGA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=136;WE=37432424;WS=37432406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	37445587	rs78505176	T	C	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1593;ReadPosRankSum=0.213;SC=AACTGGTCTCTAGGGCTCTTG;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=86;WE=37445595;WS=37445577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,102:0.58:176
chr4	37445885	rs11724784	T	C	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GCACACCATCTTAGCAGATTA;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=65;WE=37445893;WS=37445875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,80:0.59:136
chr4	37445941	rs139020189	T	C	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.678;SC=CCTTCTGCCTTGAGGACCCCT;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=65;WE=37445949;WS=37445931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr4	37446874	rs76049455	C	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.420;SC=ATCTGCTGTACGGATGGCCGC;SOR=0.721;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=67;WE=37446882;WS=37446864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,80:0.46:174
chr4	37447621	rs141690387	C	T	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1201;ReadPosRankSum=1.015;SC=TGGATGGATCCGATTGTGTTC;SOR=0.916;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=73;WE=37447629;WS=37447611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
chr4	37448299	rs17422084	C	T	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1411;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TGGTTCACGCCTCTGGGATCA;SOR=0.577;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=76;WE=37448307;WS=37448289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,92:0.51:179
chr4	37592674	rs937941	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr4	37592679	rs937942	T	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr4	37636750	rs2276943	T	G	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=78;PP=2264;SC=ACGGGGCTAATGTGGGGAGGA;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=15;TCR=78;TR=93;WE=37636758;WS=37636740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	37651155	rs2292298	A	G	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=201;SC=TGCATTAGATATCTGTCCAGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=37651163;WS=37651145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	37666995	rs1221653	T	C	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=59;PP=1944;SC=CAGAAGTTTCTAGTTTGCAAA;SOR=1.423;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=88;WE=37667003;WS=37666985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	37828175	rs2059484	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=264;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TCCCACCCCCTGCAGCGCACC;SOR=0.175;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=9;WE=37828194;WS=37828172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr4	37828186	rs2059483	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=264;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GCAGCGCACCCGCAAACGGCA;SOR=0.301;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=37828194;WS=37828172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr4	37836302	rs3752683	T	C	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1303;ReadPosRankSum=1.670;SC=TCGTGATCAGTTTTGACGCCC;SOR=0.676;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=77;WE=37836310;WS=37836292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,96:0.44:220
chr4	37839366	rs62300673	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=1.165;SC=CATGTATGAGACATTTCCTTC;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=18;WE=37839374;WS=37839356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr4	37841430	rs2261414	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=348;ReadPosRankSum=0.071;SC=TGGTTATTTTCGTTAAAAACT;SOR=0.970;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=18;WE=37841438;WS=37841420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr4	37841942	rs2714559	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=605;ReadPosRankSum=0.441;SC=CAAATTCTATTAGTGTTTGTG;SOR=0.732;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=28;WE=37841950;WS=37841932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr4	37848530	rs6814767	T	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=387;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GAATGGTGGTTGTTGTTTTTT;SOR=1.092;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=25;WE=37848538;WS=37848520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
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chr4	37863045	rs3832307	AT	A	731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=637;ReadPosRankSum=0.127;SC=TTATATTTTCATTGTCACTTG;SOR=0.193;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=20;WE=37863053;WS=37863035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr4	37873692	rs28714373	T	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.044;NF=18;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=-0.079;SC=ACACAGAAAGTCAAATACTGC;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=31;WE=37873700;WS=37873682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr4	37903669	rs2279028	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=356;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GATCCAAAACAGAAAAACAGT;SOR=1.308;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=24;WE=37903677;WS=37903659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr4	37903756	rs2279027	T	C	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=777;ReadPosRankSum=0.522;SC=ACATCTGCTTTCTAACGAGGT;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=48;WE=37903764;WS=37903746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr4	37904082	rs2279026	T	C	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,100:0.47:215
chr4	37904089	rs35859249	C	T	3556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=4.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.269;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,94:0.45:208
chr4	37904228	rs11931763	T	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-1.684;SC=CTGAAATGAATAAGGAATTAA;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=7;WE=37904236;WS=37904218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr4	37922307	rs2925957	G	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=32;PP=1377;SC=TTAATATCCCGGGAGCAAGGA;SOR=1.065;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=37922315;WS=37922297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	37962186	rs6811863	G	C	4641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=61;PP=2965;SC=GTTTTAACACGACGTTTTGGC;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=140;WE=37962194;WS=37962176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	37962608	rs200376306	CAT	C	2542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=1858;ReadPosRankSum=1.492;SC=CTCCTTCAAGCATTCTGTCGA;SOR=0.670;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=45;WE=37962617;WS=37962598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,68:0.43:159
chr4	38016395	rs10501	T	G	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=648;ReadPosRankSum=0.915;SC=CAGGAGCCTGTGCGCAGGCCC;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=46;WE=38016403;WS=38016385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr4	38019867	rs74971654	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=-1.204;SC=TGATTTCTACGATGATAGAGT;SOR=0.512;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=38019875;WS=38019857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	38053788	.	CTGTGTG	C	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.492;NF=1;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=-0.119;SC=AGCAGAGCCACTGTGTGTGTG;SOR=0.027;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=15;WE=38053801;WS=38053778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr4	38053815	.	T	TGC	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.78;MQRankSum=-1.302;NF=1;NR=14;PP=373;ReadPosRankSum=1.032;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGT;SOR=2.494;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=38053823;WS=38053805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	38062263	rs16994165	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=838;ReadPosRankSum=-2.519;SC=GATCGCCATCGTTGGCCTGTA;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=51;WE=38062271;WS=38062253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr4	38138856	rs13110318	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GAACTGGAGCGGTCGGCCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=7;WE=38138864;WS=38138846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	38628540	rs168086	A	G	159.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=3;PP=121;SC=AGGTGCGAGCAGGAACCGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=38628548;WS=38628530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	38628725	rs62294474	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=7;PP=214;SC=ACCGGCGCTGCGCTCGATTTC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=38628733;WS=38628715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	38774785	rs10776482	A	G	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=995;ReadPosRankSum=1.106;SC=TTTATAGACAATCTGTTCTCA;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=59;WE=38774793;WS=38774775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr4	38774889	rs4129009	T	C	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1461;ReadPosRankSum=0.718;SC=TTAACATTAATAGCAGCTCGA;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=83;WE=38774897;WS=38774879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,109:0.57:190
chr4	38775040	rs10776483	A	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1045;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TAAGAATTATATGATCAGAAT;SOR=1.148;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=129;TCF=58;TCR=71;TR=68;WE=38775048;WS=38775030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr4	38776107	rs11096955	T	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=929;ReadPosRankSum=0.117;SC=GGCAGTTGGATAGTTCTTTTA;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=54;WE=38776115;WS=38776097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
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chr4	38798935	rs5743614	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=7.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.76;MQRankSum=-6.468;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.531;SOR=1.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
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chr4	38830350	rs5743810	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=556;ReadPosRankSum=0.680;SC=AGTAAGGTTGAACCTCTGGTG;SOR=0.206;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=30;WE=38830358;WS=38830340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr4	38910317	.	G	A	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1501;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GGACCAAGACGCTCATGGAGA;SOR=0.998;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=95;WE=38910325;WS=38910307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,109:0.51:213
chr4	38916465	rs4563504	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.177;SC=CAGTCCTCCCAACCTCCCCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=38916473;WS=38916455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr4	38972693	rs148909241	T	C	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1556;ReadPosRankSum=-1.888;SC=AAGTAACTTATAGTTCTGGAA;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=104;WE=38972701;WS=38972683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,129:0.45:284
chr4	38987965	rs75988651	C	T	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CCTGAAAGAACCTGCACATTC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=72;WE=38987973;WS=38987955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,86:0.43:198
chr4	38990334	rs3821986	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=261;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GTTTTATCTACGTTTTTATTC;SOR=0.136;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=14;WE=38990342;WS=38990324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr4	38995310	rs11721954	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=0.072;SC=AATTTTACATATCTATATCGG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=14;WE=38995318;WS=38995300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr4	38995374	rs10212770	T	C	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=36;PP=2183;SC=TATCCATCTCTAGGTGCAAAG;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=106;WE=38995382;WS=38995364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	39000305	rs11542133	A	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=604;ReadPosRankSum=-1.585;SC=TTTCCTTTAGACTCACAAACC;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=37;WE=39000313;WS=39000295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,49:0.41:120
chr4	39000569	rs73236699	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=426;SC=TACTGTAAAGCTTTGAGTTTT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=39000577;WS=39000559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	39034119	.	T	TAAAA	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=59.92;NF=0;NR=3;PP=56;QD=21.6666666667;SC=CACTTCCCATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=39034127;WS=39034109;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr4	39046586	rs111344840	CA	C	820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=8;PP=497;SC=GCTGCCCGGACAGGGTCTAGG;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=39046594;WS=39046576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	39046651	rs76308346	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=135;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CCCCCGCCTCCCCCGCTCCTC;SOR=0.673;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=12;WE=39046659;WS=39046641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr4	39064126	rs2711942	G	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=469;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AGTAATTGTAGATATATATAT;SOR=0.836;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=26;WE=39064134;WS=39064116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr4	39064162	rs2711941	A	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=809;ReadPosRankSum=-0.173;SC=TCCTTTACATATTTTTGTTGT;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=41;WE=39064170;WS=39064152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr4	39065091	rs2711940	G	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr4	39094738	rs2566149	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=858;ReadPosRankSum=0.133;SC=CCATCAACTGGTGAATGGATA;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=56;WE=39094746;WS=39094728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr4	39104837	rs35745478	CTG	C	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.524;NF=6;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=0.232;SC=ATTTTTGTATCTGTAATTTCA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=39104846;WS=39104827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	39109399	rs12508577	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=1.799;SC=CACCAAATTTATTAAGCTATA;SOR=0.760;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=9;WE=39109407;WS=39109389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr4	39114929	rs3796510	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.085;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr4	39116775	rs10026775	A	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=410;ReadPosRankSum=-0.639;SC=AAATTTTCTTACAGATATGAT;SOR=1.355;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=24;WE=39116783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr4	39116911	rs3733276	T	C	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1150;ReadPosRankSum=-1.792;SC=ACCTTAATACTGTGGAGGCTT;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=85;WE=39116919;WS=39116901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,110:0.52:212
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chr4	39122697	rs3733275	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=79;ReadPosRankSum=0.517;SC=TTTAGTGCCCCGTTTTCTACA;SOR=1.524;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=8;WE=39122705;WS=39122687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr4	39128101	rs7694760	A	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCGTATTGACAGATGTGGGTA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=39128109;WS=39128095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	39187521	rs111449236	TG	T	779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.02;QD=28.88;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	39205365	rs1451817	C	T	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=116;PP=2965;SC=ATCAAATCCACGTGCAAATCA;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=62;TCR=116;TR=178;WE=39205373;WS=39205355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr4	39207318	rs17584431	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=881;ReadPosRankSum=-1.452;SC=TTGCAGTATCACAGACTCTTA;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=48;WE=39207326;WS=39207308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr4	39216221	rs2167494	C	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=522;SC=TGTTTTTCAGCATTAAAATCC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=39216229;WS=39216211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	39216463	.	G	C	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=40;QD=18.6928031368;SC=CATGATCTCTGCTCACTGCAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=39216471;WS=39216453;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr4	39233977	rs11729098	G	A	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=827;SC=GGGTGCAGCCGCTCACGCCTC;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=39233985;WS=39233967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	39257615	rs11272440	G	GCAGGAATAATTGTAGGAAATATACGTAAATGC	1358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;QD=46.85;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	39257671	.	T	C	230	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=59.64;NF=8;NR=15;PP=230;QD=11.5117918499;SC=AGGAAATATATGTAAATGCCA;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=23;WE=39257679;WS=39257661;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,23:0.66:35
chr4	39259190	rs11096987	A	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=750;SC=TACGCTTTCAATGAAACTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=39259198;WS=39259180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	39271541	rs3733280	A	G	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=27;PP=2382;SC=GGGTCCATAGAATGTCCTCAG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=76;TCR=27;TR=103;WE=39271549;WS=39271531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	39276623	rs11096989	A	AG	1704.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=1577;SC=TATTTCTCAAAGTATTTCCAA;SOR=1.659;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=39276631;WS=39276613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	39279724	rs12648082	T	C	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=23;PP=2149;SC=TAAAGATGAATTTAACTCTTA;SOR=1.835;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=94;WE=39279732;WS=39279714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	39297200	rs2306597	G	A	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=26;PP=1450;SC=ACACCAAATCGATAAAATACC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=39297208;WS=39297190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	39301605	rs2066788	G	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=7;PP=755;SC=CTTAGTAAAAGCAGAGCCTGC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=39301613;WS=39301595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	39308187	rs2066789	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	39318706	rs2066790	A	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=35;PP=1006;SC=TTTAAAATACATATCTAGAAA;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=39318714;WS=39318696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	39329102	rs11096992	G	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=11;PP=650;SC=TAGTGAATGGGTATAAATCCT;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=39329110;WS=39329092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	39353122	rs4975007	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=12;PP=471;SC=AGGAGATTCACGAATAAACAT;SOR=0.811;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=25;WE=39353130;WS=39353112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	39368083	rs3736168	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=561;SC=CGAGGGCAGGCGGGCCGCTGA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=39368091;WS=39368073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	39409416	rs900563	C	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=571;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CTAGCTTCTTCTTATAGCTTC;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=42;WE=39409424;WS=39409406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr4	39439264	rs4975015	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.6341;FS=13.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=584;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CAATATGCTGTCCTCTGGCAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=24;WE=39439272;WS=39439254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr4	39448542	rs7685429	C	G	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1470;ReadPosRankSum=1.241;SC=AGTTCAGGCCCTCACAGCGCG;SOR=0.331;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=163;TCF=70;TCR=93;TR=96;WE=39448550;WS=39448532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,107:0.57:189
chr4	39450403	rs112327399	TGA	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=136;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AAAGACAATCTGAGATACAGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=39450412;WS=39450393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	39460352	rs11550000	C	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=-0.960;SC=AAAAAGCCCACAACAGGATTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=39460360;WS=39460344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr4	39466639	rs76534325	A	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=650;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TGTCTATTTCATTTAAATTGT;SOR=0.432;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=47;WE=39466647;WS=39466629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
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chr4	39507457	rs6832089	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=448;ReadPosRankSum=0.452;SC=GTGAGTGCTATTGTACAAATA;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=27;WE=39507465;WS=39507447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr4	39510175	rs6815780	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=785;ReadPosRankSum=-1.523;SC=ATTACCTATAGAGATTAATAC;SOR=1.265;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=48;WE=39510183;WS=39510165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr4	39510264	rs1129052	A	G	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CCTTTTGGAAACAGCTCCCAC;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=83;WE=39510272;WS=39510254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,98:0.50:196
chr4	39511359	rs6531722	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=315;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CTCTTTCTACTAGAGAAAAAT;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=29;WE=39511367;WS=39511349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,34:0.33:103
chr4	39512347	rs11544855	T	C	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.453;SC=CTGCCCGCACTGGAACTGTGC;SOR=0.500;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=104;WE=39512355;WS=39512337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,119:0.53:223
chr4	39515630	rs77592699	CT	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=0.755;SC=AATGGATTTACTATTAAAGTA;SOR=0.169;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=2;WE=39515638;WS=39515620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	39515646	rs10019428	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	39515655	rs10021786	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr4	39515806	rs151116497	TAAAAAGA	T	914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.768;NF=3;NR=13;PP=614;ReadPosRankSum=0.915;SC=TAGTCCTGGCTAAAAAGAAAA;SOR=0.435;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=16;WE=39515820;WS=39515796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr4	39528752	rs4975020	G	A	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=28;PP=901;SC=AAGCCCCAAAGAGACGAAGGT;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=39528760;WS=39528742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	39757480	rs11389468	A	AT	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=205;ReadPosRankSum=-1.516;SC=CAGTAACTTTAAAAGTCTCTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=39757488;WS=39757470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr4	39776616	rs463918	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr4	39779233	rs3839129	AT	A	1330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.337;NF=30;NR=6;PP=1165;ReadPosRankSum=0.556;SC=ATTGTAGGCGATTAAGAGCTG;SOR=1.366;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=102;TCF=77;TCR=25;TR=36;WE=39779241;WS=39779223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,47:0.36:129
chr4	39871117	rs34039605	G	GA	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=168;ReadPosRankSum=1.028;SC=CTATTAGCATGAAAAAAAAAA;SOR=0.665;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=13;WE=39871125;WS=39871107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr4	39910172	rs35396203	GA	G	681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=402;ReadPosRankSum=-1.589;SC=TGTAATAAGAGAAAAAAAACT;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=26;WE=39910180;WS=39910162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr4	39915454	rs11725674	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.409;SC=GCTTATAACTGTGAGAAGTTT;SOR=0.200;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=7;WE=39915462;WS=39915444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr4	39918636	rs10001599	A	T	214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.48;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	39918656	.	G	A	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=26;QD=15.1928031368;SC=AAAGAAAACTGGTCAATCTTA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=4;WE=39918664;WS=39918646;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,4:0.22:18
chr4	39921942	rs28449663	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=1.954;SC=TACATACATTAGCAATGCATG;SOR=0.549;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=17;WE=39921950;WS=39921932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr4	39929902	rs36101858	TCA	T	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=438;ReadPosRankSum=-0.201;SC=ACCAGACAGTTCACAGTCAAC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=11;WE=39929911;WS=39929892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	39978005	rs35426579	A	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=956;ReadPosRankSum=1.954;SC=GGGTAGCAGTATCACAGGAGA;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=59;WE=39978013;WS=39977995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
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chr4	40119501	rs1128372	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.765;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=258;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GTAACATTCATGGGGTAAGCA;SOR=1.880;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=18;WE=40119509;WS=40119491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
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chr4	40122453	rs78417585	C	T	3349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=2029;ReadPosRankSum=1.936;SC=TTTAAGTGAGCCCAACCTAGA;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=98;TCR=112;TR=125;WE=40122461;WS=40122443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,147:0.60:243
chr4	40245573	.	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,29:0.22:129
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chr4	40356422	rs10009228	A	G	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=59;PP=2053;SC=AAGGCCACCAATTCCAAGGGG;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=40356430;WS=40356412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	40427990	rs2292039	G	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=561;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GAGGTATGTAGCCTGCGTATC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=36;WE=40427998;WS=40427980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr4	40428010	rs278981	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=489;ReadPosRankSum=-3.340;SC=CCTCCATACATGGCGGCCGCG;SOR=0.546;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=38;WE=40428018;WS=40428000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr4	40438576	rs2307046	A	G	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=77;PP=2594;SC=ATATACCACGACCAGCAGAAT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=125;WE=40438584;WS=40438566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr4	40438957	rs56769284	CG	C	471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=179;SC=CCCTCCCCCCCGCCAAAAAAA;SOR=1.244;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=40438969;WS=40438947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	40440854	rs1052153	G	C	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=65;PP=1501;SC=GCACCTTGGCGGAGGACCCGG;SOR=2.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=81;WE=40440862;WS=40440844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	40778146	rs2465570	C	T	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=24;PP=962;SC=TCAATACAGGCTCATGGTACA;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=40778154;WS=40778136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	40778162	rs2437323	T	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=27;PP=1017;SC=GTACACAGTTTCCCACATGTC;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=40778170;WS=40778152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	40788210	rs2437314	T	C	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.891;NF=14;NR=45;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.865;SC=TATTCTGGGTTTGGACTGTGC;SOR=1.057;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=59;WE=40788218;WS=40788200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr4	40788544	rs2953325	A	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=519;SC=CAAGATTTGAAGAACTCATTG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=40788552;WS=40788534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr4	40810747	rs2261167	A	G	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=75;PP=2965;SC=GAAACCCATCAAGATTGTTCT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=161;WE=40810755;WS=40810737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr4	40825819	rs3841555	TA	T	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.360;NF=0;NR=10;PP=405;ReadPosRankSum=1.897;SC=TAAAGCCACTTACCACACTCA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=10;WE=40825827;WS=40825809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr4	40832363	rs2437343	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AACAATCTGCCTACTTCTCCC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=40832371;WS=40832357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	40844199	rs1865605	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=570;ReadPosRankSum=0.719;SC=GGAACGCAGATGCAATTCCAG;SOR=0.339;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=39;WE=40844207;WS=40844189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr4	40895552	rs6447505	G	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.209;NF=1;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=0.727;SC=GCTTCATTATGTTCAATCATC;SOR=0.481;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=40895560;WS=40895542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr4	41015823	rs2292234	G	T	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.613;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1243;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GCAGCAAATCGCCATTCCCAA;SOR=0.907;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=81;WE=41015831;WS=41015813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,94:0.44:216
chr4	41015899	rs4861358	C	T	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1002;ReadPosRankSum=-1.663;SC=GTGATTGCCTCGGTTCTGCTC;SOR=0.476;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=157;TCF=67;TCR=90;TR=70;WE=41015907;WS=41015889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
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chr4	41526503	rs4266323	C	T	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=48;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CTGGTGAGTACGTGGAATTGA;SOR=0.458;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=38;TCR=106;TR=66;WE=41526511;WS=41526493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
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chr4	41611575	rs1105886	A	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=968;ReadPosRankSum=0.488;SC=AATGTTGAGCAGTAAAAGAGA;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=66;WE=41611583;WS=41611565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,73:0.44:167
chr4	41615249	.	A	AT	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=61.29;NF=0;NR=4;PP=42;QD=15.75;SC=TTATTTGGGGATTTTTTTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=4;WE=41615257;WS=41615239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr4	41615690	rs13146318	T	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TAGGTTGGAGTCTTAATAAAC;SOR=0.334;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=22;WE=41615698;WS=41615680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr4	41629036	rs5857808	G	GGTGT	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.560;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=1.993;SC=AGGTGTGCATGGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=7;WE=41629045;WS=41629026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr4	41640878	rs6836918	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=570;ReadPosRankSum=0.786;SC=CCGGCAGTTTCTATTTCCAGC;SOR=0.947;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=37;WE=41640886;WS=41640868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr4	41646651	rs2304647	G	C	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=78;PP=2855;SC=GATGTGAGTTGTGGCCAAGGC;SOR=0.956;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=136;WE=41646659;WS=41646641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr4	41646758	rs13101981	T	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=0.830;SC=CCCTAGAGGGTTTCAAAAGGT;SOR=1.284;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=14;WE=41646766;WS=41646748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr4	41652293	rs2289338	C	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=113;SC=CCTCTTCCTTCATTGGACTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=41652301;WS=41652283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	41663621	rs17528897	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=36;PP=1088;SC=TGAGCCACAGGAAAGTAGTAA;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=41663629;WS=41663611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	41663935	rs78605481	TAAA	T	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=505;ReadPosRankSum=2.121;SC=TAAAAATGAATAAAATAGTGC;SOR=0.456;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=14;WE=41663945;WS=41663925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr4	41664786	rs75228450	A	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=667;ReadPosRankSum=0.880;SC=GGTCCTATAGATATTTGATTT;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=47;WE=41664794;WS=41664776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr4	41668465	rs17444537	C	A	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=0;PP=989;SC=TAAATGTTAACTGTTTGAACT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=41668473;WS=41668455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	41672759	rs2289342	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=634;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GCCAGTGTTCCGCTTAGAGTT;SOR=0.668;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=47;WE=41672767;WS=41672749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr4	41672989	rs2289343	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=1.273;SC=TGGGGGTAGGAGGAGAGGAAT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=41672997;WS=41672979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr4	41673604	rs11734372	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=18;PP=608;SC=TCACCTGTTATGACACCTGTA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=41673612;WS=41673594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	41678566	rs2304650	T	C	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.155;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=48;PP=1012;ReadPosRankSum=-2.133;SC=GCACAGGAAATGAATGGAATC;SOR=0.190;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=60;WE=41678574;WS=41678556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,60:0.63:95
chr4	41684580	rs61271673	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=-0.656;SC=CATTCAGCTTCGAAATGAATG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=41684588;WS=41684570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr4	41687911	rs2304652	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=1.024;SC=GTTAGAAGGGAGAAGAATGAA;SOR=0.504;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=17;WE=41687919;WS=41687901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr4	41689974	rs1371297	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=304;ReadPosRankSum=1.632;SC=CTGCTTTGTTATGACTAGAGC;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=21;WE=41689982;WS=41689964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr4	41748511	rs2196822	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CGCTTCTTATTGCTGTGCATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=41748519;WS=41748501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	41749265	rs28647582	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.711;SC=TAGGTCCTTCTCACTCGAGGC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=41749273;WS=41749256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	41749668	rs6811325	C	T	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.979;SC=TACCTACACCCGCGCGAGAGA;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=69;TCR=105;TR=92;WE=41749676;WS=41749658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,109:0.52:209
chr4	41983787	rs2174728	C	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=661;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TTTCCTGTCACGAGGAACATT;SOR=0.485;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=40;WE=41983795;WS=41983777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr4	41984118	rs2660320	C	T	7970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=130;PP=2965;SC=GCATCATCAGCCTGCGAACTC;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=123;TCR=130;TR=253;WE=41984138;WS=41984108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr4	41985101	rs2660332	A	G	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=966;SC=CGTGTTGTATATAGATCGCAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=41985109;WS=41985091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	41992677	rs2581434	C	G	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=45;PP=1455;SC=GGATGTTACCCGGCTTGGCCG;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=83;WE=41992685;WS=41992667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	42003671	rs1047626	A	G	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=53;PP=2328;SC=CTTTTCAAACATGGTTCCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=128;WE=42003679;WS=42003661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	42003835	rs2581453	C	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=636;SC=TTTCTGTATACTGGAATAGTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=42003843;WS=42003825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	42020142	rs2581423	A	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=20;NR=19;PP=754;SC=AGGTATAGGCACAGAACTCAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=42020150;WS=42020132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	42020347	rs2581422	A	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=264;SC=ATTCTCTTACATATAAACTAA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=42020355;WS=42020337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	42020517	.	ATCCAGGTAGAGTTTGGCCGTTATTGTCTGACTTTATTT	A	1135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.578;NF=1;NR=11;PP=2902;ReadPosRankSum=1.406;SC=GCTTATTCAAATCCAGGTAGA;SOR=1.425;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=12;WE=42020562;WS=42020507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr4	42022464	rs15857	C	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=14;PP=499;SC=GGGAGTATGGCTCAAAGTACA;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=42022472;WS=42022454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	42024982	rs13107768	A	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=17;PP=521;SC=AAAAGTGCAAACCAAATTTTG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=42024990;WS=42024972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	42025049	rs3213766	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=294;SC=CTTTTTAAAAACAATATTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=42025057;WS=42025039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	42025207	rs3213767	A	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=258;SC=ATGTTTCTCCAAAAGCACCTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=42025215;WS=42025197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	42040947	rs12641900	C	T	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=41;PP=2248;SC=CCACCAGTTACAGTGCTTCTC;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=107;WE=42040955;WS=42040937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	42051257	rs7684837	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=233;SC=TGTTGGCATTATAGGTGTGAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=42051265;WS=42051247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	42051608	rs4241696	T	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=235;SC=GCTTGTGGGATAAAATAAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=42051616;WS=42051598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	42064918	.	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ATATTGTTAGTCTTTTTCATT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=42064926;WS=42064908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	42065269	rs3804190	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=245;SC=GTAGGGTTATATATCTATAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=42065277;WS=42065259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	42069005	rs76632475	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=335;ReadPosRankSum=1.746;SC=CTTAACTTATATCTTGATTTT;SOR=2.093;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=16;WE=42069013;WS=42068995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr4	42069029	rs12643893	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=801;SC=TGGATACTTATTAAAATGTTA;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=42069037;WS=42069019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	42069331	rs11409064	C	CA	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=202;SC=ATGTTAATTCCTACTAATCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=42069339;WS=42069321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	42402992	rs66671329	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=274;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GGAGATCCTCATCTGAGCATC;SOR=0.341;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=22;WE=42403000;WS=42402982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr4	42425852	rs4324577	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=1.636;SC=AACTCTGAATTCGAACTTATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=42425860;WS=42425842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr4	42448789	rs35005173	T	TA	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.076;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	42466641	rs12647640	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=2.113;SC=GAAAACGTCTCCATAAAGAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=42466649;WS=42466631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr4	42571074	rs6845603	A	T	187.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	42580428	rs41265697	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=389;ReadPosRankSum=-1.669;SC=CAGGAAGAACGTCATTTACAG;SOR=0.913;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=26;WE=42580436;WS=42580418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr4	42580461	rs41265699	C	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-1.385;SC=TTTGCATTGACCCCAAATTAG;SOR=0.306;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=17;WE=42580469;WS=42580451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr4	42582047	rs6447171	A	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=377;SC=ATGATTTAGCAATCTATACTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=42582055;WS=42582037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	42592935	.	C	CA	192	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=61.46;NF=0;NR=13;PP=192;QD=15.4615384615;SC=TTAAAATGGCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=42592943;WS=42592925;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,13:0.81:16
chr4	42596461	rs77305935	TAC	T	185.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=207;SC=AAGCATAGAATACACAGTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=42596470;WS=42596451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	42602606	rs6819419	A	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=652;SC=ATGAAATAATAATTTTAAACG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=42602614;WS=42602596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	42618021	rs113477520	T	TA	776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=680;ReadPosRankSum=0.056;SC=GTTTGACAAATATGAGAAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=16;WE=42618029;WS=42618011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr4	42618138	rs10033628	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-0.895;SC=AAATGTGAATAAGATTACTAA;SOR=0.879;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=15;WE=42618146;WS=42618128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	42626659	rs11306052	GA	G	127.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=7;PP=78;SC=TTGCTGTTTGGAAAAAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=8;WE=42626667;WS=42626649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	42627805	rs1460358	A	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=199;SC=TCTGTTACTAACATATAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=42627813;WS=42627795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	42639186	rs898500	A	G	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=569;ReadPosRankSum=0.012;SC=TTTTCTGATCAACATGGAATG;SOR=0.562;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=42;WE=42639194;WS=42639176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr4	42658902	rs112235862	C	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=811;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GCGGCGGCGGCTGCAGGTGGG;SOR=1.059;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=52;WE=42658910;WS=42658892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr4	42659028	rs12503784	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=16;PP=366;SC=AGGGCAGAGCTGCCGCCGGGC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=42659036;WS=42659018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	42965159	rs10213360	A	C	5260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=110;PP=2965;SC=GGGGTAAGTAAGCTGCCCAGG;SOR=1.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=63;TCR=110;TR=173;WE=42965167;WS=42965149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr4	43032612	rs4861050	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=197;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CAATACTTTGGTTTATATATA;SOR=1.194;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=16;WE=43032620;WS=43032602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr4	44652187	rs1113098	C	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=291;SC=TATTTACAAACATCAAATGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=44652195;WS=44652177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	44682465	rs6447368	T	C	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=12;PP=916;SC=TAGGAAAAACTTGACATGTCT;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=44682473;WS=44682455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	44684455	rs13117025	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=761;SC=AACAGTGTTGCTATTTCACTT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=44684463;WS=44684445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	44684507	rs9291245	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=212;SC=TTGTACTATTCATTATATGAG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=44684515;WS=44684497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	44685224	rs112232487	T	TA	781.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.96;QD=43.43;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	44685225	rs58659516	T	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=69.02;QD=41.62;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	44685225	.	TC	AC	577	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000,1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=67.62;NF=16,12;NR=1,2;PP=313,577;QD=20.4571301498;SC=TTATTATACTTCACATAATGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=17,14;WE=44685244;WS=44685215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr4	44685225	.	TC	TAC	577	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000,1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=67.62;NF=16,12;NR=1,2;PP=313,577;QD=20.4571301498;SC=TTATTATACTTCACATAATGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=17,14;WE=44685244;WS=44685215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,14:1.00:14
chr4	44690320	rs1491304	A	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=372;SC=GTTTATAATTACATATGTGTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=44690328;WS=44690310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	44691795	.	T	TA	158	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.8583;HP=14;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=60.83;NF=8;NR=5;PP=158;QD=12.4615384615;SC=ATATGTTCATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=13;WE=44691803;WS=44691785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,13:0.29:45
chr4	44696311	rs3830340	CAT	C	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.464;SC=TTGATGGAAACATATCTCTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=44696320;WS=44696301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	44696538	rs12641137	C	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=829;SC=CAAGTAAGTTCAATAGAAACT;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=44696546;WS=44696528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	44699484	rs6851576	T	G	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=21;PP=711;SC=TTGTATTTATTCTACTTTATA;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=44699492;WS=44699474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	44699506	rs6821295	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=486;SC=CTTTTATGGGCTTTAAATCAA;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=44699514;WS=44699496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr4	44713235	rs1124828	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=404;SC=GAACAAAAAAAAAATCACCTT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=44713243;WS=44713225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	44719048	rs1873522	A	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=289;SC=TACATTACACAATGGGAAGAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=44719056;WS=44719038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	44720248	rs3792705	T	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=508;SC=CAAATATACTTGTATTCTAAA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=44720256;WS=44720238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	46042945	rs6447493	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GTTACTGAAGCACAAAAGATT;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=15;WE=46042953;WS=46042935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr4	46086060	rs976156	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=13;PP=462;SC=TTTCAATTACTGTGGGCCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=46086068;WS=46086050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	46263862	rs35496835	A	AG	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=803;ReadPosRankSum=0.111;SC=CTTTAATGTCAGTTTTTAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=12;WE=46263872;WS=46263852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr4	46263864	rs10938435	T	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=811;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TTAATGTCAGTTTTTAGAAAC;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=17;WE=46263872;WS=46263852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr4	46314593	rs279858	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=559;ReadPosRankSum=-0.942;SC=CTACTGATTTTTTCCCATTGT;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=33;WE=46314601;WS=46314583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr4	46334494	rs11503016	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.431;SC=AACATCTTTAACTATCCATGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=46334502;WS=46334484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	46334702	rs279827	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=234;ReadPosRankSum=0.837;SC=AATACTGTCTAATATGAGAAA;SOR=0.612;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=13;WE=46334710;WS=46334692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	46967279	rs2055943	C	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=776;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GACAAAACACCTTACCATCAT;SOR=1.108;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=49;WE=46967287;WS=46967269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr4	46979742	.	T	TA	40.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5209;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=62.13;MQRankSum=0.319;NF=0;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTCATGCTCATAAAAAAATAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=46979750;WS=46979732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr4	46994972	rs3215202	GA	G,GAA	916.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.377;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,32,13:0.68,0.28:47
chr4	46995366	rs2229940	G	T	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=915;ReadPosRankSum=0.532;SC=CAAACCGCCAGGCACAGGAAG;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=53;WE=46995374;WS=46995356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,64:0.61:105
chr4	47033770	rs72416056	TCG	T	1902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=1697;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TTGTTGAATCTCGCTCTCTCT;SOR=0.587;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=98;TCF=11;TCR=87;TR=34;WE=47033781;WS=47033760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr4	47034075	rs45460902	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=1.464;SC=CTCCTTTTCTGTCAAAGATAA;SOR=0.355;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=12;WE=47034083;WS=47034065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr4	47034104	.	G	A	134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=56.36;NF=0;NR=8;PP=134;QD=21.0964015684;SC=AAAAAAAAAAGAAAAGGCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=47034112;WS=47034094;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,8:0.36:22
chr4	47034144	.	G	GACACAC	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=60;QD=38.5417500769;SC=CTATACCCTGGGCACACACAC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=47034153;WS=47034134;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr4	47034145	.	G	A	118	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=118;QD=76.3856062736;SC=TATACCCTGGGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=2;WE=47034153;WS=47034134;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr4	47034626	rs41309288	C	G	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CACTCCGCACCCGCTCCCCGC;SOR=0.427;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=80;WE=47034634;WS=47034616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,97:0.56:173
chr4	47322190	rs4482737	T	C	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.428;SC=AAGATATCCATTGGATGAGCA;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=83;WE=47322198;WS=47322180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,97:0.62:156
chr4	47322219	rs6284	C	A	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1567;ReadPosRankSum=0.180;SC=CCCTGGAGATCGAAAGTTGTG;SOR=0.619;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=92;WE=47322227;WS=47322209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,112:0.64:176
chr4	47405322	rs199730245	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=292;ReadPosRankSum=2.469;SC=CGTGCTGTTTTTATTGGTTTC;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=16;WE=47405330;WS=47405312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
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chr4	47524932	rs4475121	T	A	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=652;SC=ACTTAATATATACTTTAAATT;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=47524940;WS=47524922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr4	47562820	rs73237101	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CCAGGTGGTGTGAGGATATGG;SOR=0.641;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=16;WE=47562828;WS=47562810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr4	47582387	rs2351791	A	C	9681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=135;PP=2965;SC=TAATCTTACTACCTCCCCGTT;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=153;TCR=135;TR=288;WE=47582395;WS=47582377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr4	47589299	rs2351790	C	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=0.360;SC=TACACTACTACGAATGGTTGG;SOR=0.978;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=19;WE=47589307;WS=47589289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr4	47592997	rs71199986	G	GT	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=10;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=0.341;SC=AGTATTTGGGGGGGGGGGTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=47593016;WS=47592987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	47593008	rs1316781	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=1.415;SC=GGGGGGGTTCTGTAATGCATT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=47593016;WS=47592987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	47593283	rs4145944	G	C	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1166;ReadPosRankSum=0.620;SC=AAGTCAGCAAGTTCCTGTGCT;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=67;WE=47593291;WS=47593273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,79:0.56:142
chr4	47625811	rs3215139	TA	T	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.463;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=645;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CAAACCTTGCTAAATGCTTAG;SOR=1.658;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=20;WE=47625819;WS=47625801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr4	47626034	rs1344122	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=-0.351;SC=AACACTTTACCAGTGAAATAC;SOR=0.681;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=25;WE=47626042;WS=47626024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr4	47666981	rs17462881	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=-1.641;SC=TCCAAACTCAACTAAGTCTTC;SOR=0.954;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=16;WE=47666989;WS=47666971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr4	47667064	rs11934749	T	C	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=35;PP=2074;SC=AGGAGGGATATGCTCGCCTGT;SOR=1.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=107;WE=47667072;WS=47667054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	47682174	rs10517195	A	G	7908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TGACCTCGTCAGACTTATCCA;SOR=0.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=135;TCR=121;TR=255;WE=47682182;WS=47682164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,302:1.00:303
chr4	47839929	rs2289433	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=25;PP=969;SC=GGCTCTGCGGCAGCGCTCTTC;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=47839937;WS=47839919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	47853843	rs6822668	T	C	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=73;NR=39;PP=2421;SC=AGGCCACTAGTCTTTAAAATG;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=112;WE=47853851;WS=47853833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	47857040	rs7690499	T	C	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=187;SC=AAACAACTTATATAGAAAAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=47857048;WS=47857030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr4	47887536	rs2053404	T	C	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=63;PP=2965;SC=GCTTTATTAATGCTTGATCAT;SOR=1.427;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=123;TCR=63;TR=186;WE=47887544;WS=47887526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr4	47887991	rs6818556	G	A	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=54;PP=1717;SC=TCACATCTACGGTTTCTGGGC;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=47887999;WS=47887981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	47888137	rs11940441	T	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=196;SC=ATGAAGAAACTACAACAACAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=47888145;WS=47888127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	47898491	rs6447592	C	T	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=17;PP=1141;SC=TCATTTGATACATTATGATAG;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=57;WE=47898499;WS=47898481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	47905158	rs2119204	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=11;PP=602;SC=TGACAAGAGCAAAACTCCATC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=47905166;WS=47905148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	47916346	rs6826122	C	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=81;SC=TGCAGGGCGGCGACCGGGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=47916354;WS=47916336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	47945455	rs6819506	C	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=407;SC=ATATATCTGTCACATAATCAC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=47945463;WS=47945445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	47951945	rs1972883	G	A	6171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=105;PP=2965;SC=TGAAATCACAGTAGTCACCAT;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=181;WE=47951953;WS=47951935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr4	47953515	rs3845160	A	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=715;SC=CAGAGAGAGAAGAGTTAATGT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=47953523;WS=47953505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	47973234	rs7677851	T	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	48069696	rs2230594	G	C	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=82;PP=2179;SC=GCAGCAGCTCGGCAAATGTAG;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=131;WE=48069704;WS=48069686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	48069725	rs9996535	G	A	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=61;PP=1903;SC=TCAGGTTTCTGGAAAAGGGAA;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=83;WE=48069733;WS=48069715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	48073501	rs906486	G	T	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=42;PP=2041;SC=TGCTGGGACTGCCAACCTTCA;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=95;WE=48073509;WS=48073491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	48081896	rs11358014	CA	C	1070.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=6;PP=639;SC=AGGTATGATACAAAAAAAAAA;SOR=3.417;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=35;WE=48081905;WS=48081886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	48082208	rs2352590	T	C	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=1080;SC=TGTTTGAACATAACTGGTAGT;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=48082216;WS=48082198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	48088446	rs6858664	A	G	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=21;PP=1753;SC=ACACCAGGGCATGGTATGATA;SOR=2.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=90;WE=48088454;WS=48088436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	48107096	rs6825925	T	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=AGTGTTTTTTTAAATTCAGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=48107104;WS=48107086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	48115264	rs7658300	C	T	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=82;PP=2564;SC=CGGCCTGCGACGCTGGGTGTA;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=129;WE=48115272;WS=48115254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	48139565	rs2661529	C	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=52;PP=1552;SC=ATCCATTCCACAAAACCTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=48139573;WS=48139555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	48140814	rs141499442	C	T	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TTCTGCCTTCCGTGAATACTT;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=91;TCR=78;TR=89;WE=48140822;WS=48140804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,102:0.54:190
chr4	48143201	rs17470892	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=297;SC=TAACAGGCTATACTACCACCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=48143209;WS=48143191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	48147309	rs17574371	T	C	4322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=55;PP=2920;SC=GGTGTGTCAGTTTCCTGGGAA;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=128;WE=48147317;WS=48147299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	48147612	rs2661547	T	G	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=903;SC=GGACAGAAAGTGAAAGTGTTC;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=48147620;WS=48147602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	48148435	rs3749503	G	A	6201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=117;PP=2965;SC=CAAAGAAAGCGTTGCAGTCAA;SOR=1.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=84;TCR=117;TR=201;WE=48148443;WS=48148425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr4	48158524	rs882715	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=254;SC=CTAGAAACTGGATTTGTCAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=48158532;WS=48158514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	48165888	rs139950746	CTTA	C	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=463;SC=TTGCTTAAAGCTTATTATAAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=48165898;WS=48165878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	48169769	rs7689953	A	G	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=45;PP=2464;SC=CCCACTGCATATCACACACAT;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=48169777;WS=48169759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	48170669	rs2243840	A	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=37;PP=1149;SC=ACAAAAACAGATTAAAATGCT;SOR=1.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=48170677;WS=48170659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	48372085	rs1466631	T	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=1.665;SC=ATATTGAGCATTGTGTTTTTA;SOR=0.165;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=48372093;WS=48372075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	48384499	rs6816010	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CTTTGAATTTTTCAGTGATAA;SOR=1.721;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=12;WE=48384507;WS=48384489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	48396496	rs4694894	C	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.135;SC=TTCTTTGATACATTTTTAAGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=48396504;WS=48396487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	48486193	rs6845250	C	G	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=1780;ReadPosRankSum=0.753;SC=ATTCCTTGGGCATCTGTCTCA;SOR=0.548;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=220;TCF=92;TCR=128;TR=112;WE=48486201;WS=48486183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,138:0.51:270
chr4	48487297	rs7676578	T	A	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=2.122;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr4	48492769	rs74929644	A	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=89;ReadPosRankSum=2.047;SC=TTCTCCCAGCAGCCATCCCGT;SOR=0.384;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=10;WE=48492777;WS=48492759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
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chr4	48537603	rs3838234	T	TACAC,TACACAC	853.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=16,16;NR=0,0;PP=214,327;SC=TATATACACATACACACACAC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=16,16;WE=48537611;WS=48537593;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.63,0.37:19
chr4	48537633	rs3838233	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.632;NF=15;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=1.882;SC=CACACACACATATATATATAG;SOR=1.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=17;WE=48537641;WS=48537623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr4	48547041	rs952289	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=331;ReadPosRankSum=0.351;SC=TAAATAGGTCACAGTCTACTA;SOR=0.617;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=16;WE=48547049;WS=48547031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
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chr4	48565101	rs13138269	A	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GCTTATAGGCATCTATCTTCT;SOR=0.148;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=48565109;WS=48565091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	48573028	rs1507865	T	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=581;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TCTGGGCTCATTGAAGTTATT;SOR=0.334;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=28;WE=48573036;WS=48573018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr4	48577121	rs28558226	C	T	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=66;PP=2802;SC=AAAAAATGTACGAACATAGTT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=128;WE=48577129;WS=48577111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	48582836	rs4695390	A	T	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=33;PP=1865;SC=TGTGTCTGTCATAAGTCTCAA;SOR=1.295;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=48582844;WS=48582826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	48582909	rs4695391	G	A	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=834;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GATGTATGAAGCTCTCAAGAA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=60;WE=48582917;WS=48582899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr4	48588742	rs34558821	C	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.779;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=469;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GTTTTCTTTCCCCCCTGAAAA;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=41;WE=48588750;WS=48588732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr4	48596195	rs78630567	TTATAAG	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAATACATGATTATAAGTATA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=48596208;WS=48596185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	48607938	rs2940319	T	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=174;SC=GAACACTCTGTCATTTTACCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=48607946;WS=48607928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	48611149	rs2354348	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.005;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	48611153	rs776603	A	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.65;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	48625213	rs776579	C	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=101;SC=TTAAAAAAAACAAACATTAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=48625221;WS=48625202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	48655635	rs776580	T	A	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=691;SC=AACAGCTTTTTATCTATTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=48655643;WS=48655625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	48655824	rs141132438	AAGCAGC	A	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.654;NF=0;NR=8;PP=355;ReadPosRankSum=0.693;SC=TCAGCTGCAAAAGCAGCAGCA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=48655837;WS=48655814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr4	48851937	rs3761729	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=773;ReadPosRankSum=1.252;SC=CATTCAGTTACACTTTTTGTT;SOR=0.978;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=92;TCR=10;TR=41;WE=48851945;WS=48851927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
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chr4	48988450	rs3747690	C	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=605;ReadPosRankSum=0.355;SC=CGCGGCGATGCCCTCGCTGTG;SOR=0.289;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=41;WE=48988458;WS=48988440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr4	48988705	rs2572344	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=228;SC=TCTGCGAGGCGCCCGCGAGAG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=48988713;WS=48988695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	48990476	rs10537617	CT	C	725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=4;PP=269;SC=CTCTCTTTAACTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=19;WE=48990497;WS=48990466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	48994138	rs28678278	G	T	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=54;PP=1657;SC=TTTTCTCTTTGCAGAGCTTAC;SOR=1.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=48994146;WS=48994128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	49019232	rs28610228	T	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.371;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=100;ReadPosRankSum=0.786;SC=TTATTTATTTTAAAAAAACCC;SOR=0.728;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=8;WE=49019240;WS=49019222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	49063872	rs1051447	C	A	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=21;NR=9;PP=520;SC=AAACAACCATCATTTTCATAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=49063880;WS=49063862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	52729913	rs201327644	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=571;ReadPosRankSum=0.561;SC=TTTTAAATAGCTTCTTAATAT;SOR=0.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=41;WE=52729921;WS=52729903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr4	52896050	rs225170	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=0.806;SC=ACACAAGTCCACTGTTGGTAG;SOR=0.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=17;WE=52896058;WS=52896040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr4	52927113	rs999634	C	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=690;ReadPosRankSum=-0.251;SC=TGAGATAAAACGAATCAGAAA;SOR=1.088;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=34;WE=52927121;WS=52927103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr4	52927229	rs784944	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	52928622	.	G	A	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=49;QD=16.7542425094;SC=TAATATGATTGTGTGTGTGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=52928630;WS=52928612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr4	52938243	rs3860707	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=968;ReadPosRankSum=-1.486;SC=AGAAGCCATGTCCGATTATAA;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=60;WE=52938251;WS=52938233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr4	52942779	rs55839120	G	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGAAGTCTGGTACCAGATGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=52942787;WS=52942772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	52945799	rs7689145	C	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=438;SC=CTTTAACTTGCTTTGGCTCAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=52945807;WS=52945789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	52946161	rs7657148	A	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=621;SC=AAACAATTTAAGGAAAAGAAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=52946169;WS=52946151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	52948834	rs35414474	C	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	52960908	rs3214049	T	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=569;ReadPosRankSum=0.470;SC=GCAGGTCCCATGGGTCATGTA;SOR=1.246;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=33;WE=52960916;WS=52960898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr4	52960968	rs34763682	G	A	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=863;ReadPosRankSum=0.058;SC=TAGATTAACCGCCTCTTTCAT;SOR=0.991;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=58;WE=52960976;WS=52960958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
chr4	53463763	rs7676586	G	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=381;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TGACAGTGCTGTGAACATTCT;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=27;WE=53463771;WS=53463753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr4	53492522	rs73248669	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=72;ReadPosRankSum=0.842;SC=ATGGAGTCTCGCTGTGTCGCC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=53492530;WS=53492512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	53495992	rs12509591	T	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=776;ReadPosRankSum=-1.221;SC=ACTTTACAGATGGGGAAATGG;SOR=0.979;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=53;WE=53496000;WS=53495982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr4	53610272	rs61731317	C	T	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=75;PP=2164;ReadPosRankSum=3.556;SC=AATCAAGTAACGGTACATTCT;SOR=0.747;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=291;TCF=144;TCR=147;TR=139;WE=53610280;WS=53610262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,158:0.49:324
chr4	53611309	.	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=636;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TTATTTTCTACGCAAAGAGAA;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=39;WE=53611317;WS=53611299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr4	53611668	rs3733504	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=731;ReadPosRankSum=0.012;SC=AAGCAGGGCATAGTTTGAAAG;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=43;WE=53611676;WS=53611658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr4	53611701	rs3733503	G	C	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=600;ReadPosRankSum=-1.493;SC=GGAGGAACAGGCTAGATTAAA;SOR=1.721;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=32;WE=53611709;WS=53611691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr4	53786861	rs3833975	TAGA	T	764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.332;NF=12;NR=4;PP=524;ReadPosRankSum=1.091;SC=TACAACAGATTAGAAGGTTAC;SOR=1.000;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=16;WE=53786871;WS=53786851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr4	53814492	rs2930105	C	T	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr4	53814500	rs2930106	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
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chr4	54011424	rs4864727	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=442;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CCTCCTCTTCCCAAAACAGTA;SOR=0.364;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=24;WE=54011432;WS=54011414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr4	54011576	rs79628372	T	C	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1327;ReadPosRankSum=-2.555;SC=TGACTTTTTCTTCTGCTTCAC;SOR=0.469;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=83;WE=54011584;WS=54011566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,92:0.54:169
chr4	54245476	rs1471596	A	T	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=106;SC=GGTTGTGTGAAACAATGGTTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=54245484;WS=54245466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	54248418	rs56007140	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=232;ReadPosRankSum=0.149;SC=AATGCCTGACATGTATACTTA;SOR=0.688;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=21;WE=54248426;WS=54248408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr4	54250189	rs10012853	T	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=143;SC=TCATCATGAATATACTTCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=54250197;WS=54250179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	54257865	rs62325162	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTATTATACTAACAAATGCCG;SOR=0.067;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=16;WE=54257873;WS=54257855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr4	54294395	rs73250963	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=536;ReadPosRankSum=-1.351;SC=AAAATAGCTTGCGAGTGTTTT;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=30;WE=54294403;WS=54294385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr4	54310188	rs11722866	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=169;ReadPosRankSum=0.672;SC=TGTACCAGACATAAAAATATA;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=15;WE=54310196;WS=54310178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr4	54310281	rs11723755	T	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=317;ReadPosRankSum=0.241;SC=GTAAGTAGTATTATTTAGATG;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=28;WE=54310289;WS=54310271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr4	54310340	rs59279367	TA	T	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=434;ReadPosRankSum=-1.227;SC=TTTAAAGCAATAAAAACGTGT;SOR=0.355;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=15;WE=54310348;WS=54310330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr4	54327032	rs34823651	C	CTAT	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=516;ReadPosRankSum=0.497;SC=ACTTCTTAGCCTATTTGTGAT;SOR=0.321;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=12;WE=54327040;WS=54327022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr4	54327235	rs3811785	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=60;ReadPosRankSum=0.641;SC=AAACAAGATATGATTAGTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=54327243;WS=54327225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	54327584	rs3765158	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=306;ReadPosRankSum=0.585;SC=AGTATTTTTGATTAGTCATTA;SOR=0.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=15;WE=54327592;WS=54327574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr4	54362150	rs6836800	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=0.674;SC=GCTCATGTCCGGGGTTTCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=54362158;WS=54362140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	54362676	rs2271559	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CTGCTCTCCCACCTCATCCTG;SOR=0.986;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=54362684;WS=54362666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	54364673	rs2292578	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CAGAGAGTCATAAAATGATAG;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=5;WE=54364681;WS=54364663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	54364990	rs35082655	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=437;ReadPosRankSum=1.072;SC=TCTGGAATCAGGTGGTACAAC;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=24;WE=54364998;WS=54364980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr4	54876132	rs4437313	C	A	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.07;QD=25.12;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	54966667	rs3194383	C	T	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=110;PP=2965;SC=GCTGCCCGTCCCGCAAGAGCG;SOR=1.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=76;TCR=110;TR=186;WE=54966675;WS=54966657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr4	54966830	rs13144341	G	A	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=38;PP=1620;SC=TCTGCTTAAGGGCCAGTTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=54966838;WS=54966820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	54966919	rs1132998	T	C	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=38;PP=1994;SC=AGCACCACCATCACCATCATC;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=54966927;WS=54966909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	54967214	rs6554148	C	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=269;SC=TTAGTGTAACCGTAGAGTCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=54967222;WS=54967204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	54967709	rs2278142	C	A	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=18;PP=1061;SC=AGCACCTTGCCCGAGCCTTAC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=54967717;WS=54967699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	55130078	rs2229307	T	C	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=54;PP=1380;SC=TCCCATTTAATGTTTATGCTT;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=80;WE=55130086;WS=55130068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	55130154	rs2307049	G	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=14;PP=345;SC=CATAAGGTGCGTGTAGGATTT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=55130162;WS=55130144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	55131001	.	TA	T	57	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=59.39;NF=6;NR=0;PP=57;QD=10.0;SC=AGGGTTTTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=55131009;WS=55130991;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,6:0.40:15
chr4	55133726	rs4358459	T	G	6307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=90;PP=2965;SC=CAGAGAAAGGTTTCATTGAAA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=95;TCR=90;TR=185;WE=55133734;WS=55133716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr4	55133936	rs28489067	C	T	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=27;PP=820;SC=CCAAGTATGCCTTTTTTTAGT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=55133944;WS=55133926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	55133959	rs28650939	C	T	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=518;SC=GCATCAGAGGCGGACTGAGGT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=55133967;WS=55133949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	55139771	rs35597368	T	C	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=63;PP=2226;SC=GGAGATCCACTCCCGAGACAG;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=115;WE=55139779;WS=55139761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	55141055	rs1873778	A	G	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=95;PP=2965;SC=CAATCAGCCCAGATGGACATG;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=103;TCR=95;TR=198;WE=55141063;WS=55141045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr4	55143577	rs10028020	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=29;PP=2070;SC=GGTCTGGAGCGTTTGGGAAGG;SOR=1.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=95;WE=55143585;WS=55143567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	55146406	rs6148442	T	TTGTAGGTCCCCCAG	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=2900;SC=ACCTGGCACATAATCATCATC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=55146414;WS=55146405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	55146754	rs1547905	C	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=542;SC=GTGAACCTGGCAGCCCACGTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=55146762;WS=55146744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	55151711	rs2412559	C	A	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=81;PP=2531;SC=GGAGTGTGGACGGAGATGCTA;SOR=1.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=115;WE=55151719;WS=55151701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	55152040	rs2228230	C	T	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=26;PP=1775;SC=CTCGCAACGTCCTCCTGGCAC;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=55152048;WS=55152030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	55153837	rs7695657	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=31;PP=929;SC=TGCTGCAGCCACCTCAAACCA;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=55153845;WS=55153827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	55154891	rs55732997	T	C	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=39;PP=2077;SC=TTTCTAACAGTGTTCTATCAT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=105;WE=55154899;WS=55154881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	55156380	rs4864506	G	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=612;SC=GTAGTTTGGAGATATGTACAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=55156388;WS=55156370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	55161391	rs7685117	T	C	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=49;PP=1480;SC=ACATGATGGATGACATCGGCA;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=55161399;WS=55161381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	55524304	rs999020	T	C	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=807;ReadPosRankSum=-2.230;SC=AGCCTGTGCCTGGGAGGGTGG;SOR=0.774;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=41;TCR=83;TR=62;WE=55524312;WS=55524294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr4	55599436	rs1008658	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=35;PP=1035;SC=TTTCCTGTGATTTTCATAATG;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=55599444;WS=55599426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	55946081	rs4421048	A	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=570;SC=TGTGATGTCCAGGAGTTGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=55946089;WS=55946071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	55946354	rs10006115	G	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GGCAAACAAAGGAGTTGGCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=55946362;WS=55946344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	55948068	rs150001331	G	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=262;ReadPosRankSum=0.413;SC=AAAGTCCTAAGTTCCTTCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=15;WE=55948076;WS=55948058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr4	55948108	rs2412617	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=16;PP=1039;SC=TCTTTTTAATATGGCTGAGTC;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=55948116;WS=55948098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	55955232	rs1531289	T	C	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=33;PP=862;SC=TGTAAAGAGCTGACGAGGTGA;SOR=1.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=51;WE=55955240;WS=55955222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	55955737	rs3217703	A	AT	624.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=4;NR=16;PP=408;SC=CTATGTATCTATTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=20;WE=55955745;WS=55955727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	55968053	rs7655964	A	C	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=22;PP=1376;SC=ATTTTTTTTTATCCCACTGAC;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=69;WE=55968061;WS=55968043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	55970680	rs13109660	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=5;PP=818;SC=AAGGACTTTCGGTGAAGAAGT;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=55970688;WS=55970670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	55971846	rs2305945	G	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=570;SC=CTGAGAAGTTGTAATTTATGA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=55971854;WS=55971836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	55974070	rs192508718	G	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=985;ReadPosRankSum=0.161;SC=ACTGAAGATGGGAAAAACAAC;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=61;WE=55974078;WS=55974060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,71:0.58:123
chr4	55976451	rs3828550	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=914;SC=ACTTTTGTACGCAGGCCCAGC;SOR=4.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=55976459;WS=55976442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	55980202	rs150106382	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=-1.979;SC=TACATTTTATCTGGCCAAAGA;SOR=1.008;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=22;WE=55980210;WS=55980192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
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chr4	56262374	rs1128141	A	G	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=35;PP=2196;SC=CCGCGGCTCCAGGGAACGGCC;SOR=1.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=88;TCR=35;TR=123;WE=56262382;WS=56262364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
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chr4	56290558	rs11732723	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=510;ReadPosRankSum=2.120;SC=CATTACACCTCTCATAAATTT;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=26;WE=56290566;WS=56290548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr4	56290573	rs6810483	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=571;ReadPosRankSum=2.035;SC=AAATTTATTATACACCTGCAT;SOR=1.175;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=32;WE=56290581;WS=56290563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr4	56291479	rs7677952	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=667;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCTCCCTTTTCATTTTGTACA;SOR=0.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=45;WE=56291487;WS=56291469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr4	56291528	rs7660517	T	C	1742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.877;SC=TTGACTTTTTTTCTCTCTCTT;SOR=0.764;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=67;WE=56291536;WS=56291518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr4	56291620	rs35154686	CAA	C	1650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=1087;ReadPosRankSum=-3.318;SC=TGGTTTTTAACAAGCTGTTTG;SOR=1.177;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=29;WE=56291629;WS=56291610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr4	56309992	rs3736544	A	G	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=834;SC=GTTGCTGGATATTAGATGAAT;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=56310000;WS=56309982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	56319088	rs4864996	A	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.135;SC=ATAAGTAGTAAAGTATAATCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=56319096;WS=56319078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	56319105	rs2412647	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=354;SC=ATCACATCCCCGTTATAAGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=56319113;WS=56319095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	56319350	rs11240	C	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=521;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GTTTAAAATACTGCACAGCTG;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=32;WE=56319358;WS=56319340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr4	56322244	rs10529254	TG	T	276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=178;SC=AAATAAACTTTGGGGGGGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=10;WE=56322252;WS=56322234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	56329773	rs1522112	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=107;ReadPosRankSum=0.462;SC=TAAAGAAGTCTGTATTTTTCA;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=56329781;WS=56329763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr4	56337041	rs3805151	T	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=0.876;SC=AAATAAAAATTTGAGATAAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=56337049;WS=56337031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	56342326	rs9312661	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=0.467;SC=GATGACAACCGTAGGCATTAA;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=10;WE=56342334;WS=56342316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr4	56428820	rs2279458	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=1.505;SC=AATAAATGGGCTACTCATCTC;SOR=0.591;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=8;WE=56428828;WS=56428810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr4	56447146	rs34437483	GA	G	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TCAATGTCTAGAAAAAAACCG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=56447154;WS=56447136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	56458302	rs73817207	C	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=583;ReadPosRankSum=0.574;SC=CCCTCAAGAGCCCGCGTCGTC;SOR=0.993;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=41;WE=56458310;WS=56458292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr4	56465418	rs1387198	T	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=27;PP=1105;SC=AGAAACAGATTGATGATTTAG;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=56465426;WS=56465408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	56471551	rs3805382	A	G	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1034;ReadPosRankSum=0.770;SC=GAATAAGTGCATGGCTTCTCA;SOR=0.568;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=72;WE=56471559;WS=56471541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,82:0.55:150
chr4	56502094	rs35772728	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.84;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	56874517	rs3214045	A	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=322;ReadPosRankSum=-1.846;SC=TCAAATGAAGATAATGATCTC;SOR=1.431;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=20;WE=56874525;WS=56874507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr4	56878193	rs11724411	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=0.040;SC=ATTTAGTGAAACAGAAAACAT;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=18;WE=56878201;WS=56878183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr4	56890930	rs79684519	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=-0.632;SC=TCTTGGTGATAGTAGTTATGT;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=56890938;WS=56890920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr4	57176710	rs13123803	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.016;SC=CTGGCTCTCTGAGGCCAGCTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=57176718;WS=57176700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	57176965	rs5858374	T	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=12.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.51;MQRankSum=3.977;QD=15.21;ReadPosRankSum=2.582;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
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chr4	57181632	rs7672073	G	C	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=61;PP=2881;SC=GCTAAGCCCCGCCAGGAGTCT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=57181640;WS=57181622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr4	57194329	rs11733474	G	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=0.942;SC=GCCAACCTTTGGTAATGGTTT;SOR=0.129;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=57194337;WS=57194320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	57194525	rs6834736	C	G	3318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.338;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=1812;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CTGTGCCCATCTTAGTTTTCA;SOR=0.558;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=248;TCF=129;TCR=119;TR=132;WE=57194533;WS=57194515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,160:0.54:295
chr4	57204777	rs8340	A	C	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=56;PP=1392;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CTGCCATTGTAGTTATGGAAA;SOR=1.210;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=90;WE=57204785;WS=57204767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,107:0.52:207
chr4	57211352	rs12498340	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=988;ReadPosRankSum=2.092;SC=AGTCCTGTGGTTGGATCCATG;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=60;WE=57211360;WS=57211342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr4	57219592	rs6554348	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=327;ReadPosRankSum=-0.015;SC=ATGGTAGAGAGTCGATCAATA;SOR=0.451;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=23;WE=57219600;WS=57219582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr4	57219613	rs17086696	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=314;ReadPosRankSum=1.375;SC=CAAGCTCATCCGGGACTGCAT;SOR=0.617;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=23;WE=57219621;WS=57219603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr4	57248591	rs12645138	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	57261372	.	G	GA	173	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=13;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=58.37;NF=16;NR=0;PP=173;QD=11.1875;SC=ATCCTTTTCAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=16;WE=57261380;WS=57261362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,16:0.46:35
chr4	57267124	rs2271925	A	T	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=691;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TTAGCATGATATAACAGTGTT;SOR=1.222;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=44;WE=57267132;WS=57267114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
chr4	57269579	rs56066795	A	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=-2.034;SC=TATATAGAAAAAAAGAGAAGT;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=23;WE=57269587;WS=57269569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr4	57269646	rs112538106	A	AAAAG	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=351;ReadPosRankSum=2.096;SC=AACCATAATGAAAATAAGGCA;SOR=0.883;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=57269654;WS=57269636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr4	57270197	rs7661712	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=195;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AGACTGGTACTAGTCCCTAGC;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=12;WE=57270205;WS=57270187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr4	57312387	rs6816268	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=179;ReadPosRankSum=-0.472;SC=ATGTTGTACATTCATCCCATT;SOR=0.382;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=13;WE=57312395;WS=57312377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	57325476	rs58975286	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=508;ReadPosRankSum=1.843;SC=AATTTTTTGTAAGGTTGTATT;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=29;WE=57325484;WS=57325466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr4	57333822	rs12513091	G	T	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1364;ReadPosRankSum=-1.489;SC=GCGGCAGCGGGGGGGTGTCAG;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=80;WE=57333830;WS=57333812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,88:0.60:146
chr4	57338188	rs4340842	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-1.267;SC=ACAGTTGCATATATAATGTGC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=57338196;WS=57338178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	57340109	rs4615235	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=310;ReadPosRankSum=1.659;SC=TGATTGTTCATGTTATGCTGA;SOR=1.270;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=18;WE=57340117;WS=57340099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr4	57340592	rs11610	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GTAAATATAACGTGCATATAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=57340600;WS=57340582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr4	57356972	rs17086883	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=0.949;SC=ATCAGTGTGACTGAAAAATGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=57356980;WS=57356962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	57368200	rs10051	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.832;NF=2;NR=12;PP=216;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TAGTGAGATATGGCCTACTGG;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=14;WE=57368208;WS=57368190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr4	57397050	rs28550555	A	C	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=1481;ReadPosRankSum=2.607;SC=GCAAGACCAGAGAGACGAGTC;SOR=0.791;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=202;TCF=97;TCR=105;TR=112;WE=57397058;WS=57397040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,132:0.53:250
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chr4	57425520	rs76480778	A	AT	1266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=32;NR=5;PP=888;SC=CTAGCAATCAATTTTTTTTTA;SOR=2.737;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=37;WE=57425528;WS=57425510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr4	57521972	rs144818228	GGCTCAGCC	G	1295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.940;NF=17;NR=7;PP=2939;ReadPosRankSum=1.002;SC=GCCGCGAGAAGGCTCAGCCCA;SOR=0.729;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=24;WE=57521987;WS=57521962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr4	57522220	rs4626270	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CGAGGCGTGGAGCGGGCGGGA;SOR=0.372;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=19;WE=57522228;WS=57522210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr4	57523869	rs7693834	T	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=793;ReadPosRankSum=1.056;SC=GAAACACTTCTTCTTCTGTGT;SOR=0.450;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=44;WE=57523877;WS=57523859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr4	57524124	rs6857396	T	C	118.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=0.366;SC=CATTGCCATTTTGAATGGGCA;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=6;WE=57524132;WS=57524114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr4	57785786	rs10866440	A	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=1.076;SC=TCTGAAATAAATAACTTACAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=57785794;WS=57785776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	57793751	rs1105434	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=469;ReadPosRankSum=1.055;SC=GTCAATTTCCGTTTTTCTACT;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=27;WE=57793759;WS=57793741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr4	57830501	rs9996331	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=455;ReadPosRankSum=-1.015;SC=ACAAAGTGCTGGGATTACAGG;SOR=0.259;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=25;WE=57830509;WS=57830491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr4	57834747	rs13146090	C	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TTATGATTTACCCGTAAAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=57834755;WS=57834737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	57843320	rs4865167	A	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=37;PP=1468;SC=GCTCTGCCCCACAGCCCGAGC;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=57843328;WS=57843310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr4	57861117	rs1713951	G	A	255.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	57873296	rs67541678	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=0.419;SC=TACTGGGTGCCGGGTGTGGTG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=57873304;WS=57873286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr4	57881870	.	A	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.541;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=-0.492;SC=ATTGAGATAGAATTTACATAC;SOR=0.036;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=57881878;WS=57881860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr4	57883175	rs1718866	G	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=0.783;SC=TAAAATACTTGAGGAAGTAGA;SOR=0.350;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=57883183;WS=57883165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr4	57887252	rs13146153	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=230;ReadPosRankSum=0.149;SC=GTTTAACTACGCCGCACTCCA;SOR=0.327;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=57887260;WS=57887242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr4	57889332	rs1718862	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	57889677	rs1056364	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TCAGAACTAGCGAGACGGGCA;SOR=0.618;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=79;WE=57889685;WS=57889667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,94:0.51:183
chr4	57891200	rs41554513	GT	G	298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.727;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=135;ReadPosRankSum=-0.463;SC=TTTGCCACTTGTTTTTTTTTG;SOR=0.094;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=57891208;WS=57891190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr4	57899602	rs2271808	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CCCAGCATTTCACTGAACTAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=57899610;WS=57899592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	57906986	rs3755906	A	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=0.139;SC=TCTGTGCCACAGACCTTGTTC;SOR=1.096;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=15;WE=57906994;WS=57906976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr4	57976487	rs11573021	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=148;ReadPosRankSum=-2.413;SC=GCGGCGCCGAGGAGCAGGGCG;SOR=1.061;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=9;WE=57976495;WS=57976477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	62382943	rs335311	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=291;SC=GGCGGCAGAGAGCAGCCTTGG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=62382951;WS=62382933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr4	62599289	rs9312082	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=540;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TCAACCTTTTGTGGTACTCTT;SOR=0.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=29;WE=62599297;WS=62599279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr4	62758251	rs7691112	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=469;SC=ATCAGGTTGAAGACTTCTAGA;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=62758259;WS=62758241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	62778315	rs12503398	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TTTCTTCTGAAAAGTAGTGAA;SOR=0.077;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=62778323;WS=62778305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	62800554	rs2305339	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=33;PP=1364;SC=TCATCCTCTTGTAGGCAATGG;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=62800562;WS=62800544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	62800728	rs734644	T	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=24;PP=809;SC=TCAGGGAGAATACAGACAATA;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=62800736;WS=62800718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	62845388	rs1397547	G	C	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=25;PP=1482;SC=GCTTTTTCCGGGGGCTCCAGA;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=70;WE=62845396;WS=62845378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	62845490	rs1397548	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1007;ReadPosRankSum=0.266;SC=CTGACCAACCAGTAAGCAACC;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=72;WE=62845498;WS=62845480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,90:0.57:158
chr4	62861941	rs17226398	G	C	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CTCTGTCACAGGTTCACTCTT;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=96;WE=62861949;WS=62861931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,118:0.61:195
chr4	62861964	rs56038622	A	T	2819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.849;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1661;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGTATGTCCCATACCCAGTCC;SOR=0.448;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=101;WE=62861972;WS=62861954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,127:0.60:212
chr4	65142710	rs1483713	C	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=604;SC=TTAATATTGACAACAAGATGG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=65142718;WS=65142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	65142835	rs1483712	G	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=531;SC=CTTTAACTAAGGTATGTCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=65142843;WS=65142825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	65145955	rs1483711	T	G	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=14;PP=484;SC=TTCTTTCTTATTTCTATGAAA;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=65145974;WS=65145945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	65145966	rs5858871	T	TAA	964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=581;SC=TTCTATGAAATGTTATATTAG;SOR=1.708;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=65145974;WS=65145945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	65146700	rs10012755	A	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=344;SC=TTTTCTCAGAAACCATTTATC;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=65146719;WS=65146690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	65146711	rs1483709	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=434;SC=ACCATTTATCTTAAAGATGCA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=65146719;WS=65146690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	65147404	rs10001161	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=GTATTTATAGTAACCTATTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=65147412;WS=65147394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	65165660	rs190339457	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=2.154;SOR=0.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr4	65165661	rs11935568	G	A	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=312;SC=AAATTAGAGCGTGAATAGCAA;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=32;WE=65165669;WS=65165650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	65165849	rs13139627	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=0.283;SC=CAATAGAACTGTCTAGTATGT;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=7;WE=65165857;WS=65165839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr4	65180308	rs35642943	GGTGTGTGTGTGT	G	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.054;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=2.408;NF=5;NR=1;PP=1121;ReadPosRankSum=1.668;SC=TAACGTGTATGGTGTGTGTGT;SOR=2.985;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=6;WE=65180327;WS=65180298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr4	65240822	rs7683730	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	65240967	rs72614757	A	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr4	65241100	rs13117957	T	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=23;SC=AAGCTTGAAATGTTGCAATCA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=65241108;WS=65241090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	66189755	rs77062137	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=627;ReadPosRankSum=0.456;SC=TTTTCCCCCTTTTTTTGTTAA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=34;WE=66189763;WS=66189745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr4	66197804	rs7349683	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.464;SC=ATCTGTAGGCCCCAGATCCTA;SOR=0.875;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=166;TCF=68;TCR=98;TR=70;WE=66197812;WS=66197794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,86:0.43:198
chr4	66214043	rs2290254	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=268;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GTTTGACAGCGCGCAGTGTCT;SOR=0.239;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=16;WE=66214051;WS=66214033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr4	66218728	rs3792649	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=0.519;SC=ATAAATAACACCTTGAATAAC;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=11;WE=66218736;WS=66218718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr4	66233029	rs2198104	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=430;ReadPosRankSum=-0.030;SC=ATAACAATAAAGTGTCCCCTA;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=22;WE=66233037;WS=66233019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr4	66286088	rs6551921	G	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=311;SC=TCTTCTGCAAGTTGGATAATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=66286108;WS=66286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	66286100	rs6551922	T	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=0;PP=318;SC=TGGATAATTGTAGTTGCTAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=66286108;WS=66286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	66286414	rs6551923	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=169;SC=ATTTTAGTTTTTCTATATAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=66286422;WS=66286404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	66468046	rs5858973	TA	T	388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=259;SC=AATAGAAAGATAAAAAAAATT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=66468054;WS=66468036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	66535284	rs55860557	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=22;PP=1032;SC=CCCTACCTTCGTTGCTGGGGC;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=66535292;WS=66535274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	67142620	rs73239138	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GGACTGAGCCGTGCTACTGGC;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=14;WE=67142628;WS=67142610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr4	67142691	rs67857601	G	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=0.431;SC=CATAATCATGGGAGCCCATTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=67142711;WS=67142681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	67142703	.	G	C	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=77;QD=55.8856062736;SC=AGCCCATTCCGCTAATAAATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=67142711;WS=67142681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr4	68214270	.	G	GAGGAAGGAAGGA	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.46;QD=44.45;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	68357814	rs1497430	A	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	68358331	rs2254659	G	A	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=78;SC=CATAGCTTGGGCATAGGAATG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=68358339;WS=68358321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	68360955	rs2646282	A	G	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=19;PP=613;SC=AGATAATATCATAAGAAATGA;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=68360963;WS=68360945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	68374597	rs1056789	C	T	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=43;PP=1666;SC=GCTCACTCAGCGAACATCTGG;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=68374605;WS=68374587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	68376708	rs190255	T	C	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=24;PP=1387;SC=TGTTTATGTATTCATCTGCCA;SOR=1.248;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=68376716;WS=68376698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	68380215	rs11250	G	A	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=19;PP=992;SC=CTACCTTGAAGGAGTGCAGTG;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=68380223;WS=68380205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	68384008	rs355510	C	T	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=3;PP=49;SC=CTTGTCCTTCCGATGTTTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=68384016;WS=68383998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	68384861	rs355507	G	T	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=133;SC=AATATAACAAGATTGAATTAC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=68384869;WS=68384851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	68396525	rs355477	G	C	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=18;PP=1496;SC=CATGGAGATGGCACCAACCTG;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=68396533;WS=68396515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	68490019	rs10454253	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=-1.119;SC=TAAAACTATCCGTGATTTTAA;SOR=0.426;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=14;WE=68490027;WS=68490009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr4	68490044	rs10454252	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ATCTATTCAACTTTCACGTTT;SOR=1.284;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=10;WE=68490052;WS=68490034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr4	68490097	rs4860854	T	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TATGGGACTATAGTAATATAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=3;WE=68490105;WS=68490087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	68490650	rs12508337	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=-2.325;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr4	68492060	rs34742870	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.263;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AAACATTTTTATAAAGATTTT;SOR=3.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=68492068;WS=68492050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr4	68492244	rs35602179	T	TAA	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.003;NF=0;NR=8;PP=316;ReadPosRankSum=1.102;SC=TTCCTGCATCTGTTTGGTTAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=68492252;WS=68492234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	68492301	rs12506872	A	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=0.598;SC=TTTTCTCTATATATTTTGATC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=68492309;WS=68492291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	68496080	rs354866	G	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=555;SC=ATCAAAAAGAGTGATTCTTAT;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=68496088;WS=68496070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr4	68514739	rs3849642	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=312;ReadPosRankSum=1.127;SC=ATGTAACACATTCCATTTCAC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=23;WE=68514747;WS=68514729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
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chr4	68562236	rs10573467	TAC	T	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.965;NF=5;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=0.466;SC=CATATATACATACACACACAC;SOR=0.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=9;WE=68562245;WS=68562226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr4	68562365	rs17572160	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=1.022;SC=ATTCTTACCTATACAATGCAT;SOR=0.792;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=19;WE=68562373;WS=68562355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr4	68566878	rs377196781	A	AG	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=4;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=1050;ReadPosRankSum=0.870;SC=GAAGGTAGGAAGGGGCGGGAC;SOR=1.176;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=18;WE=68566899;WS=68566868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr4	68566891	rs34378415	TG	T	665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=8;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=1055;ReadPosRankSum=0.985;SC=GGCGGGACCGTGGGGGGGTCA;SOR=1.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=14;WE=68566899;WS=68566868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr4	68586315	rs13124793	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CCTGCACACAGAGCAGCAGAT;SOR=0.086;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=68586323;WS=68586305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr4	68586335	rs72643632	TA	CG	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=164;ReadPosRankSum=1.251;SC=TGCTTCAATGTAAAGGTCATT;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=68586344;WS=68586325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	68700956	rs6824984	A	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=13;PP=396;SC=TGGGGTTGGGAGGTGGTCCTC;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=68700964;WS=68700946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	68777000	rs28648375	T	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=499;ReadPosRankSum=0.535;SC=CACTAAATAGTTGAATTCTCA;SOR=0.262;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=26;WE=68777008;WS=68776990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr4	68777054	rs12646286	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=608;ReadPosRankSum=1.002;SC=TAACTTTTATCGTGAATTAGA;SOR=0.450;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=42;WE=68777062;WS=68777044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr4	68780253	rs1371933	G	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=510;ReadPosRankSum=0.929;SC=AATATATTCTGAGCCAGATAC;SOR=0.021;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=30;WE=68780261;WS=68780243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr4	68780399	rs1371932	A	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGCAGACATCATCACTTATGA;SOR=0.891;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=76;WE=68780407;WS=68780389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,93:0.42:219
chr4	68780512	rs10025303	C	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GTGAAGTGAGCAGACTTTCCT;SOR=0.286;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=26;WE=68780520;WS=68780502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr4	68784774	rs353163	T	C	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=106;PP=2965;SC=CAAACAAATCTGGCGTATGTC;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=180;WE=68784782;WS=68784764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr4	68788694	rs353159	G	A	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=41;PP=1262;SC=TGTAATTACAGGAAATGACCC;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=68788702;WS=68788684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	68788719	rs2119382	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=192;ReadPosRankSum=1.465;SC=CTTACTTGCCTGAAGACATTT;SOR=0.092;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=18;WE=68788727;WS=68788709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr4	68789693	rs149179048	GT	G	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=1.192;SC=CAGTCCATGAGTTAGAAAAAA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=5;WE=68789701;WS=68789683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	68789778	rs6839279	G	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=427;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GCAAGTATGAGCAAATATTTG;SOR=1.685;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=24;WE=68789786;WS=68789768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr4	68795815	rs17578509	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=-1.099;SC=ATTGTCCTTCAGTCTTACCTG;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=25;WE=68795823;WS=68795805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr4	68795859	rs11929790	G	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CTCAGTTGCTGAGAGTGTCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=68795867;WS=68795849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	68797827	rs73823321	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=0.104;SC=TATTTTATAATAGGAATATAT;SOR=0.267;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=31;WE=68797835;WS=68797817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr4	68812283	rs11930532	C	T	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=69;PP=2219;SC=TGCCAAATCCCACTGTCCTGA;SOR=1.089;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=114;WE=68812291;WS=68812273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	68812444	.	T	TAA	64	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=64;QD=23.3333333333;SC=GAAGATGTGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=68812452;WS=68812434;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr4	68829207	rs6552134	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=992;SC=AGAAGTCTACGGCTCAAAGAA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=38;WE=68829215;WS=68829197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	68904637	rs6552141	A	C	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.37;QD=29.76;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	68904834	rs9999589	T	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=37;PP=1488;SC=TTGACAACCTTTTTATTGACA;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=68904842;WS=68904824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	68919617	rs10018943	G	A	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=23;PP=1431;SC=TAACTCATGGGCAATCCACAC;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=68919625;WS=68919607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	68928740	rs1837215	G	A	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=70;PP=2012;SC=TTTCTGACACGCTCATTTGGG;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=106;WE=68928748;WS=68928730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	68934306	rs10004522	G	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=521;SC=ACTGTGAAAAGAAGGCTCACA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=68934314;WS=68934296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	68956422	rs57121360	T	A	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=29;PP=984;SC=GTCCCCTACGTCTTGCCCACA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=68956430;WS=68956412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	68956498	rs13115830	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=481;SC=GAAGACACTTCTCAAATACTC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=68956506;WS=68956488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	69057073	rs4860284	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=896;SC=TCAAATTCCAGTACTTATATT;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=69057081;WS=69057063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	69078113	rs4463136	T	C	4335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=61;PP=2965;SC=AGACCAATAGTTATTCCAAAG;SOR=1.060;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=145;WE=69078121;WS=69078103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	69083563	rs10008636	C	T	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=11;PP=524;SC=GGGAGTCATACTGGGGAGATA;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=69083571;WS=69083553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	69094507	rs2319797	T	A	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=1666;SC=CATAACATTGTATCAGTCACA;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=69094515;WS=69094497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	69094575	rs2319796	T	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=35;PP=1033;SC=CTTCAAAAAGTCTTCTTGAAG;SOR=2.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=69094583;WS=69094565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	69094926	rs63181060	TTAAA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=393;SC=GATTGATTGATTAAATAGTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=69094937;WS=69094916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	69095197	rs12331141	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=736;SC=TTTACTACAATTCCAAAGTTG;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=69095205;WS=69095187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	69096810	rs10024748	G	T	83.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=63;SC=CTATGTGATTGTAAATTTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=69096818;WS=69096800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	69097150	rs5859125	TA	T	935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=511;SC=TTACGCATTATAAAAAAATAT;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=19;WE=69097158;WS=69097140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	69416353	rs62316988	T	A	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=18;PP=1495;SC=GTTGACAAAATAATTTGTAAG;SOR=2.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=69416361;WS=69416343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	69417570	rs28374627	A	G	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=230;SC=GTAACCACTTATACAGTCGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=69417578;WS=69417560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	69434217	rs28672900	G	A	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=41;PP=1309;SC=GTCTTATGCAGTGCTTCTTTT;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=69434225;WS=69434207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	69886151	rs11730623	A	T	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=47;PP=1351;SC=TATACAGAGAAAAATCAATCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=69886159;WS=69886141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	69972779	rs4257713	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=1.405;SC=TAGTCTTTGAGTAGTTCTTAT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=69972787;WS=69972769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr4	70079838	rs4694697	T	C	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=26;PP=2224;SC=TTTGATCACTTAATTTTGACA;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=70079846;WS=70079828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	70146704	rs7689398	G	A	4544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=71;PP=2648;SC=TGCTGGCTGCGCTACTTAACA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=144;WE=70146712;WS=70146694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	70283908	rs2642841	T	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=20;PP=637;SC=AGCTTATTGATTATTTGTTAT;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=70283916;WS=70283898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	70288954	rs2736507	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.03;QD=26.07;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	70288981	rs2736505	C	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.83;QD=29.20;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	70346564	rs13142440	GA	TT	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=2037;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AAGACTGCTCGATCAAGGGGC;SOR=0.752;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=53;WE=70346573;WS=70346554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr4	70346680	rs28419590	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=682;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AATTTGGCCAGGCACGGAGGC;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=46;WE=70346688;WS=70346670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
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chr4	70352266	rs1826690	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TTTCATGATAACTATTAACAC;SOR=1.164;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=19;WE=70352274;WS=70352256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr4	70355211	rs1845555	T	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=9;PP=358;SC=TTTCTTCTGATGTGTTACTGA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=70355219;WS=70355201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	70360752	rs13104687	C	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=810;ReadPosRankSum=-1.410;SC=TTGATAAATTCATTACAAAAA;SOR=0.926;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=44;WE=70360760;WS=70360742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr4	70391344	rs10021990	G	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=0.151;SC=ATCTACTCAGGTATCTATGCA;SOR=0.869;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=9;WE=70391352;WS=70391334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr4	70391429	rs11732968	G	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=458;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GATGAGACATGTAAGAGAGCA;SOR=0.997;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=31;WE=70391437;WS=70391419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr4	70391454	rs11732996	G	A	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=449;ReadPosRankSum=2.051;SC=ACATTATGATGTAGTCCCTGT;SOR=0.723;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=31;WE=70391462;WS=70391444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr4	70391536	rs66653481	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.664;SC=GAAAGGGCTCCAGGCTGGGCG;SOR=0.928;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=20;WE=70391544;WS=70391526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr4	70391561	rs68096061	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=276;ReadPosRankSum=1.422;SC=GGCTCACACCGTTAATCCCAG;SOR=2.566;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=14;WE=70391569;WS=70391551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr4	70455478	rs2288741	G	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=413;SC=ATAGTTACGTGGAGAAAATAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=70455486;WS=70455468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	70460328	rs4148304	C	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=703;ReadPosRankSum=0.254;SC=AACATGGGAACTCCCACCATA;SOR=0.916;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=39;WE=70460336;WS=70460318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr4	70465153	rs3775782	A	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.414;SC=AAATTAGCTTATATGTTTGCT;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=36;TCR=88;TR=64;WE=70465161;WS=70465143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr4	70501451	rs6811810	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=1.221;SC=AGGCTGAGGCGGGAGAATCGC;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=70501459;WS=70501441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	70512773	rs41292307	A	G	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1506;ReadPosRankSum=0.269;SC=GAGTTCTGATAAAACAGCAGG;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=92;WE=70512781;WS=70512763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,106:0.55:191
chr4	70512801	rs55864295	A	G	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1671;ReadPosRankSum=0.045;SC=GAAGGAGGGTATGGTACCTTC;SOR=0.687;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=177;TCF=89;TCR=88;TR=96;WE=70512809;WS=70512791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,110:0.56:196
chr4	70513139	rs1347046	C	T	4507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.572;SC=AAAGGGCACCCTATATATTTC;SOR=0.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=61;TCR=79;TR=138;WE=70513147;WS=70513126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr4	70592790	rs2292092	G	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=653;ReadPosRankSum=1.560;SC=TTCTTCAGATGTGTGATTTAG;SOR=0.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=41;WE=70592798;WS=70592780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr4	70599073	rs1847366	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=521;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CAAATATCAACCCTTTTACAG;SOR=0.536;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=31;WE=70599081;WS=70599063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr4	70615308	rs1503723	G	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TACGTACAACGTGAGTGGGTA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=70615316;WS=70615298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr4	70620708	rs2134668	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=383;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ATTTAGAATGGTAATGATTTT;SOR=0.437;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=23;WE=70620716;WS=70620698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr4	70707945	rs1220724	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=265;SC=CTCAATTTTAAGAATCAAATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=70707953;WS=70707935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	70802218	rs962689	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=390;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TCAATGAAATTTAAATTATGT;SOR=1.765;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=21;WE=70802226;WS=70802208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr4	70805833	.	A	T	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.72;NF=0;NR=2;PP=40;QD=37.3856062736;SC=TTACTTTCACACACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=2;WE=70805841;WS=70805819;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
chr4	70807747	rs62305467	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=250;ReadPosRankSum=-0.496;SC=TAAAACAGAATGTTTTCTCCT;SOR=0.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=20;WE=70807755;WS=70807737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
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chr4	70865621	rs17698678	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	70898953	rs1136515	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=411;ReadPosRankSum=1.377;SC=TCAGTAATCACGGGGCATGAT;SOR=0.506;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=32;WE=70898961;WS=70898943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
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chr4	70921337	rs2271644	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.666;SC=GACTCTAGTTGCTTGTCTTTC;SOR=0.437;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=14;WE=70921345;WS=70921327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr4	70934964	rs4694266	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=352;SC=CTTTTAGTCTATGATCAATGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=70934972;WS=70934954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	70936305	rs17644242	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=0.680;SC=ATTGCTTGAACGTATGGGGAG;SOR=0.947;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=7;WE=70936313;WS=70936295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr4	70938311	rs72651138	G	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-1.457;SC=ATATTTGATTGACAATATGTA;SOR=1.207;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=7;WE=70938319;WS=70938301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr4	70944452	rs1399812	G	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=15;PP=495;SC=AAGATGTCTTGTCTTTTCTTT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=70944460;WS=70944442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	70947318	rs2063819	C	T	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=39;PP=1218;SC=GTTTGCCCTTCTAAAAATATA;SOR=1.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=52;WE=70947326;WS=70947308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	70947376	rs2063820	T	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=394;SC=AAATGAAATTTAAAAAAGAAT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=70947384;WS=70947366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	70948533	rs7675265	T	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=581;SC=TTAAATACTTTAGATAAATTC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=70948541;WS=70948523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	71008313	rs777398	G	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=481;SC=ATAGTTATCTGTTGTGCTAAA;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=71008321;WS=71008303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	71008375	rs777399	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=158;SC=CAAGTAGAAGTTGAAACAAAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=71008383;WS=71008365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	71009033	rs777400	A	G	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=159;SC=TCATATTTTCATTTATAAAGT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=71009041;WS=71009023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	71020205	rs1709273	C	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=664;SC=TGTTTATAGGCATTTGTGCTT;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=71020213;WS=71020195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	71020283	rs79174243	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=0.431;SC=GATTTGTAGTGTCAGACTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=71020291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	71021888	rs1709274	C	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=81;SC=TACAGTGAAACTTAATGACTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=71021896;WS=71021878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	71024010	rs111347259	T	TACAA	883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=900;SC=ACAGGACAAATACAATCAACT;SOR=3.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=15;WE=71024018;WS=71024000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	71027213	rs62305548	G	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=509;ReadPosRankSum=0.896;SC=TCTCAGAGAAGAAAGGTTATT;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=37;WE=71027221;WS=71027203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr4	71062384	.	A	AT	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=-1.498;SC=ACTATTTCTGATTTTTTTTTC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=15;WE=71062392;WS=71062374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr4	71065943	rs34093806	GA	G	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=0.524;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	71067317	rs4694273	C	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=0.885;SC=TGACCAGGAGCGCACCTCTAA;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=15;WE=71067325;WS=71067307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr4	71114956	rs1048152	G	T	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=1859;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GTGGTACGTCGCCCAAACCTG;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=236;TCF=130;TCR=106;TR=119;WE=71114964;WS=71114946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,134:0.49:276
chr4	71201388	rs1351419	C	T	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=73;PP=2965;SC=ACTGATTCCACTATTCCTGAG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=144;WE=71201396;WS=71201378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	71201943	rs13039	A	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=1091;ReadPosRankSum=0.680;SC=TTCATGATTTAAAAGCAACAA;SOR=0.415;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=60;WE=71201951;WS=71201933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,72:0.61:118
chr4	71227802	rs1842478	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQRankSum=1.167;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.322;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr4	71227998	rs1842477	A	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.342;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr4	71228001	rs1842476	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=19;PP=311;SC=ACTATTAACCGTTGATGAAAC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=71228009;WS=71227988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	71232430	rs10024123	T	C	6804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=86;PP=2965;SC=TCCTCCACCATGTTTTCCTTT;SOR=1.019;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=210;WE=71232438;WS=71232420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr4	71232701	rs6853742	C	T	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=64;PP=2624;SC=CTCCCTACTCCTGCACCCTAA;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=122;WE=71232709;WS=71232691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	71250308	rs2233586	T	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.08;QD=27.99;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	71250399	rs7676909	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=701;SC=ATTAATCATCAATGAAACACT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=71250407;WS=71250389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	71255370	rs7674958	A	T	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=16;PP=1564;SC=TTTACTTCTTATTTCCACAGC;SOR=2.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=70;WE=71255378;WS=71255360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	71255593	rs2988	G	A	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=64;PP=2246;SC=TGATGCCCCAGGTTATCCACA;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=105;WE=71255601;WS=71255583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	71255767	rs3733493	A	G	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=46;PP=1844;SC=TACTGCTTCTACTACCCAAAA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=71255775;WS=71255757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	71275012	rs1352689	T	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=572;SC=AGTAGATATATTAATACATAG;SOR=3.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=71275020;WS=71275002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	71384488	rs28674149	C	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=482;ReadPosRankSum=0.082;SC=AGGTAGCAATCTGAAACATGA;SOR=0.762;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=32;WE=71384496;WS=71384478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr4	71384579	rs35692424	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=729;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TTATATGCCAGCCAGTTTCAA;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=50;WE=71384594;WS=71384569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,60:0.39:154
chr4	71388379	rs28754427	A	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=384;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TAAAAGATAGACATGTTTGCA;SOR=0.903;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=25;WE=71388387;WS=71388369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr4	71388394	rs4123809	T	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=509;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TTTGCATTGGTGGCAACCTGG;SOR=0.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=29;WE=71388402;WS=71388384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr4	71390795	rs17733287	C	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=0.637;SC=TATTAACTGACGAATGTTCTG;SOR=0.362;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=25;WE=71390803;WS=71390785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr4	71396989	rs17676820	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CACATGCCATCGAGGAAGCCA;SOR=0.318;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=24;WE=71396997;WS=71396979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr4	71398064	rs3852099	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-0.484;SC=ACTAAAGAATGATATGGATGC;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=8;WE=71398072;WS=71398054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr4	71467697	rs79200974	T	C	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=849;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGGTCTTTTTTGGTATTGGA;SOR=1.054;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=45;WE=71467705;WS=71467687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr4	71468345	rs141384720	CAGG	C	871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.957;NF=3;NR=13;PP=624;ReadPosRankSum=1.087;SC=ATATAGCTCCCAGGAGTAGAT;SOR=0.648;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=16;WE=71468355;WS=71468335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr4	71468583	rs142022847	AT	A	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=573;ReadPosRankSum=0.738;SC=AGACACTTCTATTTTTTATTT;SOR=0.485;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=21;WE=71468591;WS=71468573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr4	71469529	rs7439194	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=557;ReadPosRankSum=0.240;SC=TAACTTTTAACTTTGTCTTGA;SOR=1.127;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=28;WE=71469537;WS=71469519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr4	71469556	rs7439191	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=747;ReadPosRankSum=-2.445;SC=AAGAAGGTAGCTGGTTCGTAA;SOR=0.442;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=44;WE=71469564;WS=71469546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr4	71469604	rs7439186	C	T	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1224;ReadPosRankSum=1.006;SC=AATGCCCCTGCCAGACTTGGC;SOR=0.448;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=130;TCF=76;TCR=54;TR=77;WE=71469612;WS=71469594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,98:0.61:161
chr4	71588498	rs28435678	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=-1.659;SC=GCTAGTATTTCACCAGCATCC;SOR=0.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=22;WE=71588506;WS=71588488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr4	71639349	rs28750133	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TTCCTTTGGTGGTACTTAAAG;SOR=1.460;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=12;WE=71639357;WS=71639339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	71644171	rs16845439	G	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTGGAAATGCTTTGATTGA;SOR=1.251;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=9;WE=71644179;WS=71644161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr4	71649010	.	CTTTTT	C	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.921;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr4	71649011	.	T	A	364	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=364;QD=99.6928031368;SC=TCAAGCACACTTTTTATTTAG;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=4;WE=71649036;WS=71649001;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr4	71649012	.	TTTTATTTAGACTCCATG	T	2459	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=2459;QD=829.666666667;SC=CAAGCACACTTTTTATTTAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=71649036;WS=71649001;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr4	71649017	.	TTTAGACTCCATG	T	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.148;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr4	71656836	rs201456019	AT	A	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	71659634	rs59183938	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.930;SC=GAAGAGGGGGTAGCTTGAGCT;SOR=1.501;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=7;WE=71659642;WS=71659624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr4	71665656	rs6815690	A	G	73.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=6.990;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TTTGAAAATCATTTGTCACAA;SOR=3.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=71665664;WS=71665649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	71665679	rs55821023	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=1.068;SC=TGTCAGAATAATTAAGAAACT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=71665687;WS=71665669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	71668583	rs138591218	ATGTT	A	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=547;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TTTGAAAAAAATGTTTGTATT;SOR=0.737;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=13;WE=71668594;WS=71668573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr4	71668749	rs115699850	G	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=720;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TATGAAGTTGGTTGTACCGTG;SOR=1.167;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=49;WE=71668757;WS=71668739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,59:0.39:152
chr4	71691743	rs6814981	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=780;SC=AACGCAGAAACACTATATTTT;SOR=3.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=32;WE=71691751;WS=71691733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	71697427	rs199993413	C	CT	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.196;NF=1;NR=15;PP=404;ReadPosRankSum=-2.811;SC=TACTAGCAGGCTTTTTTATCC;SOR=0.998;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=16;WE=71697435;WS=71697417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr4	71698183	rs4694081	C	A	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=78;PP=2313;SC=AAGAAAAAACCCAACAGGGAT;SOR=1.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=28;TCR=78;TR=106;WE=71698191;WS=71698173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	71704965	rs3775728	C	T	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=70;PP=2928;SC=CGACCAGAGACTCGAGGCGAG;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=150;WE=71704973;WS=71704955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	71704996	rs115486640	C	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;ReadPosRankSum=1.557;SC=GCAGAAGACCCGACGCCTGGG;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=69;WE=71705004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,81:0.46:176
chr4	71705262	rs6813092	A	G	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=27;PP=1149;SC=CGGAGGGCAGAGTAGGACGCG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=71705270;WS=71705252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	71705291	.	G	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=311;ReadPosRankSum=0.994;SC=GGCCGCGGCAGAGGTGGCCAC;SOR=1.322;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=21;WE=71705299;WS=71705281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr4	71768079	rs1871048	C	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=27;NR=14;PP=733;SC=CGCCCCCTCCCCCTGCCATTG;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=71768087;WS=71768069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	71835822	rs7674402	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CTGACCATATGATTTTTCTAC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=12;WE=71835830;WS=71835812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	71859680	rs9997790	G	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1006;ReadPosRankSum=-1.901;SC=GCAAGGCTGGGGTGTCGCGGC;SOR=0.623;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=204;TCF=82;TCR=122;TR=93;WE=71859688;WS=71859670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,101:0.44:229
chr4	71892513	rs1486271	A	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.094;SC=TGTTTTTTCTAAAAAAGTGTA;SOR=0.877;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=10;WE=71892521;WS=71892503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr4	72120854	rs4694387	C	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TAGACATTTTCTTCTGATCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=72120862;WS=72120844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	72121163	rs4694388	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TCACTCCCACATCTTTGAGAA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=18;WE=72121171;WS=72121153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr4	72222757	.	C	G	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TGAGACAGGCCTATTGAAACC;SOR=0.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=94;WE=72222765;WS=72222747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,117:0.53:220
chr4	72316822	rs10022349	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=291;SC=ACTCCATCTCCCCATTAGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=72316830;WS=72316812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	72397710	rs3775162	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GTTCTTCATTCAGTTCAAACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=72397718;WS=72397700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr4	72397964	rs10446504	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=315;ReadPosRankSum=1.299;SC=TAATTTATTGTGTTTCTCTTT;SOR=1.300;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=24;WE=72397972;WS=72397954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr4	72411967	rs4694097	A	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=258;SC=CAAGCAAAGCAAGTCAGTTTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=72411975;WS=72411957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr4	72423624	rs1453474	C	T	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=77;PP=2426;SC=TTTAATTGAACGTACCTGTGA;SOR=1.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=134;WE=72423632;WS=72423614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	72425863	rs1453458	C	T	3715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=55;NR=59;PP=2158;SC=TCTCCCAGCACGACCTCAGCT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=72425871;WS=72425853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	72429433	rs6812916	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=287;ReadPosRankSum=0.408;SC=TATAGAAAACGGTTTGATCGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=72429441;WS=72429423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr4	72429452	rs2290397	G	A	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=889;SC=GATGCTAGGAGATAGGAAGGG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=72429460;WS=72429442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	72432991	rs965606	A	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=CCTAGTTACTATTACAAATAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=72432999;WS=72432981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	72433545	rs1062677	A	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr4	72433759	rs1453453	C	T	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=105;SC=CTTGCATAGACACAATCAAGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=72433767;WS=72433749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	72618296	rs9016	T	C	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=39;PP=1321;SC=AAAGTCTGAGTGCTTGTTAAC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=72618304;WS=72618286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	72618334	rs7041	A	C	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=46;PP=1628;SC=TGGGTGTGGCATCAGGCAATT;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=72618342;WS=72618324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	72620865	rs71673486	C	CTATT	223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;QD=44.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	72622403	rs222033	A	C	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=24;PP=2215;SC=AAAATGGGAAAACGTTTTCAC;SOR=2.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=74;TCR=24;TR=98;WE=72622411;WS=72622393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	72634975	rs222016	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=584;ReadPosRankSum=0.211;SC=TCCATGCTGAGTCAAAGTTAC;SOR=0.660;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=38;WE=72634983;WS=72634965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
chr4	72934539	.	A	C	50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=99;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=1;NR=1;PP=50;QD=42.3856062736;SC=TAGAATATGAATGCCTGAGGT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=72934547;WS=72934529;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	72934632	rs9884478	C	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=2;PP=167;SC=ATTTCCAGGTCTCCTCAGTTG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=72934640;WS=72934622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	73154640	.	TAC	T	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=96;QD=49.5;SC=ACCATGCACATACACACACAC;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=2;WE=73154649;WS=73154630;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr4	73175093	rs10024487	C	T	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=19;PP=1351;SC=AATACTAAATCCATGAGAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=73175101;WS=73175083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	73414286	rs788908	C	T	4785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=73;NR=61;PP=2751;SC=AGGCTCTGTTCTCCGGATTCT;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=134;WE=73414294;WS=73414276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr4	73433122	rs33925079	GA	G	3727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=45;PP=2975;SC=TACCAGCCTGGAAAGGAGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=73;WE=73433130;WS=73433112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	73433315	rs6830556	G	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=33;PP=1004;SC=TTGGGGAAGGGAGTTGTTTGC;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=73433323;WS=73433305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	73434379	rs5859330	GT	G	2482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.617;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.210;NF=15;NR=32;PP=890;SC=TTGGGTTTGAGTTTTTTTTTA;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=47;WE=73434387;WS=73434369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr4	73434535	.	CA	C	179	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.93;NF=0;NR=6;PP=179;QD=34.8333333333;SC=AGAGCAAACCCACCCCCCCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=73434543;WS=73434525;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	73615956	rs1350836	C	T	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=66;PP=2455;SC=GGGATATTAACCAAGACCCAG;SOR=0.998;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=113;WE=73615964;WS=73615946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr4	73930552	rs3762883	G	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=613;ReadPosRankSum=-1.894;SC=AAGTGGAGTCGGGTGCAGTGA;SOR=0.643;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=40;WE=73930560;WS=73930542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr4	73930892	.	T	TG	207.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.66;QD=25.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	73930893	.	T	G	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=23;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=56.77;NF=10;NR=0;PP=73;QD=10.7771212547;SC=AGTATGCTTTTTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=73930901;WS=73930883;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	73931170	rs2306057	T	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=406;ReadPosRankSum=0.468;SC=AAAGAGAAAATGTCATCTAAG;SOR=0.360;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=31;WE=73931178;WS=73931160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr4	73933671	rs68113340	ATGTGTG	A,ATGTG	1455.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.191;QD=29.11;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=2.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,17,32:0.34,0.64:50
chr4	73956736	rs6855349	G	A	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.343;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=53;PP=1250;ReadPosRankSum=0.984;SC=GATTGACACTGAGGACTGCAA;SOR=0.959;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=188;TCF=69;TCR=119;TR=78;WE=73956744;WS=73956715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,88:0.44:201
chr4	73991006	rs6822576	T	C	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=68;PP=1617;SC=CAAGTGTTAGTGCCGTGTCAT;SOR=1.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=93;WE=73991014;WS=73990996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	74007870	rs12500051	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=0.813;SC=TTAGAACAAAAAAAAACCCTA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=74007878;WS=74007860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
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chr4	74274864	rs113884088	G	GCACA,GCA	557.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;NF=2,2;NR=7,7;PP=280,112;SC=AACCATTTATGCACACACACA;SOR=0.859;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9,9;WE=74274872;WS=74274854;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr4	74285758	rs2236766	G	T	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=17;PP=1151;SC=ACTTAAAATTGCCCTTTATGG;SOR=1.574;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=74285766;WS=74285748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	74285823	rs2236767	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=29;PP=1150;SC=GTGAGCTTCCGTCCAGAGATT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=74285831;WS=74285813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	74302800	rs41265655	A	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=296;ReadPosRankSum=0.172;SC=CTGAAACACAAACATTCATAT;SOR=0.973;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=21;WE=74302808;WS=74302790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr4	74302870	rs16849384	T	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=32;PP=1132;SC=TTTATTTTGCTTTCCAGCTTC;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=74302878;WS=74302860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	74304118	rs6446932	T	A	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=452;SC=AATGCATTTATATATTTGAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=74304126;WS=74304108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	74313169	rs7667494	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=9;PP=582;SC=CTTTATTTTCTCTGTTGCAGG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=74313177;WS=74313159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	74318330	rs4235117	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=707;SC=CGCTGCAAACAATGAAGCAAG;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=74318338;WS=74318320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	74349867	rs11939341	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=353;ReadPosRankSum=0.048;SC=TATAGCCATTACAATAGATAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=74349875;WS=74349866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr4	74350157	.	C	CTCTT	89.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.65;QD=29.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	74352590	rs149807908	C	CTCCCT	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=304;ReadPosRankSum=1.040;SC=CCATCTTACCCTCCCTTCCCT;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=6;WE=74352598;WS=74352588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr4	74352916	rs2071098	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=389;ReadPosRankSum=0.644;SC=CTTACCATATATGATGTTCTC;SOR=0.241;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=26;WE=74352924;WS=74352906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr4	74353383	rs6851809	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=434;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TGACTAAAAAATAAGAGAATA;SOR=0.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=22;WE=74353391;WS=74353373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr4	74354632	rs13107306	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAAACATTTTTATAAATAAAC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=74354640;WS=74354622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	74357851	rs11733262	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=-1.191;SC=AAAGAAACTTATAAGATTTGA;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=17;WE=74357859;WS=74357841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr4	74361254	rs10212657	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=0.161;SC=GAAAATGTGATTGGCTAATCT;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=35;WE=74361262;WS=74361244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr4	74363282	rs1158101	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.015;SC=ACCATAGAAATAAGAAATGCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=74363290;WS=74363272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	74364992	rs67050083	CT	C	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.294;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.574;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	74365007	rs11947028	T	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=0.813;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr4	74367706	rs1159624	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=1.465;SC=CAGAACCCTGCAGGACACTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=74367714;WS=74367696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	74447417	rs1247669	C	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=741;SC=TTCCTTTTCTCCTACCCATTC;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=31;WE=74447425;WS=74447407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	74447452	rs1247670	C	T	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=17;PP=1083;SC=CAGAATGAGGCAAACTGTTCT;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=52;WE=74447460;WS=74447442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	74447492	rs2272427	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=435;ReadPosRankSum=0.382;SC=GCAAACTGTAGCACTCTAGAG;SOR=1.415;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=31;WE=74447500;WS=74447482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr4	74447510	rs1247671	A	C	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=39;PP=1619;SC=GAGTCAGGTAAAAAGTGTGAT;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=74447518;WS=74447500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	74447865	rs145144201	TATATA	T	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=0.627;SC=AGTTGAATTATATATAATATA;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=4;WE=74447877;WS=74447855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	74464285	rs10632092	T	TTG	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=423;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TCTTCCAGAATTGTGTGTGTG;SOR=0.193;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=10;WE=74464293;WS=74464275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	74464443	rs11368217	TA	T	816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=546;SC=TCCCTAAAAATAAAAAAAAAT;SOR=2.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=26;WE=74464451;WS=74464433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	74486052	rs1247591	C	G	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1162;SC=CATCGTTGTTCGGCTGAACTT;SOR=1.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=74486060;WS=74486042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr4	74714003	rs6815457	A	G	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=19;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GCCACTAATAAATCACATTTT;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=100;TCR=32;TR=78;WE=74714011;WS=74713993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,82:0.55:148
chr4	74714084	rs16850078	T	C	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.955;SC=AGTCAGCCTCTGGAATTCATC;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=242;TCF=116;TCR=126;TR=141;WE=74714106;WS=74714074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,164:0.58:282
chr4	74714098	rs2367288	G	A	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.923;SC=ATTCATCCCAGCAACATCATC;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=232;TCF=110;TCR=122;TR=104;WE=74714106;WS=74714074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,121:0.44:276
chr4	74718941	rs941758	C	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=529;ReadPosRankSum=1.121;SC=CGCTGTCCACCCCAGGCTTCC;SOR=0.366;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=37;WE=74718949;WS=74718931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr4	74719681	rs2233653	T	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.695;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.533;NF=13;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-1.951;SC=CCTCTGCCCATCCCTCCCCCT;SOR=4.565;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=13;WE=74719689;WS=74719671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr4	74719729	rs2233654	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.263;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.656;NF=30;NR=7;PP=612;ReadPosRankSum=0.265;SC=TGAAAGTCACGTCTCTTCTCT;SOR=1.454;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=37;WE=74719737;WS=74719719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr4	74719925	rs11723868	G	A	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=47;PP=1374;SC=TTATATTAACGAAATAAATCA;SOR=3.477;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=53;WE=74719933;WS=74719915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	74736144	rs4074	A	G	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=988;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TGCATTCGGAAAACTCTAGAG;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=67;WE=74736152;WS=74736134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,89:0.46:192
chr4	74736180	rs56078309	G	A	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1153;ReadPosRankSum=0.022;SC=CAGGAGAAGAGTGTTGTGCAA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=77;WE=74736188;WS=74736170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,92:0.52:178
chr4	74847292	rs352007	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr4	74863443	rs74505573	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-1.466;SC=TGTCAAAACTCAGCGTTTATG;SOR=1.721;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=19;WE=74863451;WS=74863433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr4	74863997	rs425535	T	C	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1564;ReadPosRankSum=2.045;SC=GATGAACTCCTTGCGTGGTCT;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=204;TCF=103;TCR=101;TR=94;WE=74864005;WS=74863987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,110:0.47:232
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chr4	75023709	rs2289443	C	T	8149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=132;PP=2965;SC=CCGCTCTTTACCCCACTCTGC;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=111;TCR=132;TR=243;WE=75023717;WS=75023699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr4	75040944	rs13116686	T	G	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=41;PP=2578;SC=ACACTATTGATGAAAAACCAT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=114;WE=75040952;WS=75040934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	75046310	rs4694183	A	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=757;SC=GTTTCCATGCATCTCATTTGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=75046318;WS=75046300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	75046372	rs561583	A	G	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=31;PP=2035;SC=TGGTACTGGGACTGTCACAAG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=91;WE=75046380;WS=75046362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	75046465	rs561844	C	G	4864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=76;PP=2651;SC=CAGGCTTGCTCTTTGTCCAGT;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=135;WE=75046473;WS=75046455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	75107255	rs4694184	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=26;PP=942;SC=CACACCACCATGCGTAGCTAA;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=75107263;WS=75107245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	75673363	rs4585380	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=403;ReadPosRankSum=0.335;SC=AAGAGGGCTTGGAAAATACGT;SOR=0.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=28;WE=75673371;WS=75673353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr4	75673455	rs7699847	T	A	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.99;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	75673533	rs62316277	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-1.668;SC=CCGAGGCAGGTGGATCACAAG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=75673541;WS=75673523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	75675706	rs35926103	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=-0.509;SC=GAGAATGTAAAGAGGAAGAAA;SOR=0.910;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=13;WE=75675714;WS=75675696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	75675841	rs11938093	A	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1122;ReadPosRankSum=0.142;SC=ACTGCTATCAAACAAATCACC;SOR=0.458;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=202;TCF=125;TCR=77;TR=78;WE=75675849;WS=75675831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,94:0.41:229
chr4	75719761	rs2278862	T	C	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=554;SC=GCCTCCTATTTATCCCCCCTC;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=75719769;WS=75719751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	75937971	rs3822109	C	T	2882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1839;ReadPosRankSum=0.646;SC=GAACACAGCTCGGGCACTCCT;SOR=0.471;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=115;WE=75937979;WS=75937961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,127:0.58:219
chr4	75938179	rs3775527	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1203;ReadPosRankSum=0.168;SC=CAGAGTCCCCGACAGAGGAGT;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=55;TCR=98;TR=78;WE=75938187;WS=75938169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,88:0.51:174
chr4	75938236	rs1062293	A	G	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=964;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CTGAGCCAGTACCCCAGGAGA;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=52;WE=75938244;WS=75938226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr4	75938373	rs919052	C	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=280;ReadPosRankSum=-2.687;SC=GAGTCTCTATCCAGTCCACTA;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=16;WE=75938381;WS=75938363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr4	76415693	rs200764232	G	GTA	1255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=586;SC=TGTCAAACCAGTATATATATA;SOR=4.804;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=24;WE=76415701;WS=76415683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	76415985	rs6833496	G	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=411;SC=AGAAGATGCAGGCTAACTGCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=76415993;WS=76415975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	76416779	rs2045863	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=683;SC=ACACAAAAAAGTCAAACATCT;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=76416787;WS=76416769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	76434352	rs2306177	T	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=580;SC=TAATACAGCTTTTAAAAAGAA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=76434360;WS=76434342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	76467577	rs11722735	A	G	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=21;PP=1150;SC=GCTGATCGCAATTTTCATAAA;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=76467585;WS=76467567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	76481628	rs62318656	A	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=-0.912;SC=AACAATATCCATCGTTATGGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=76481636;WS=76481618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	76488438	rs190465627	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQRankSum=-0.842;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	76488533	rs141320514	GCCAAAAT	G	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.997;SC=ACAGCGCCCGGCCAAAATCCG;SOR=0.582;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=3;WE=76488547;WS=76488523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	76489582	rs2306174	G	A	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1325;ReadPosRankSum=0.525;SC=TGGCCACACCGTTACCTTACT;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=90;TCR=103;TR=83;WE=76489590;WS=76489572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,106:0.43:248
chr4	76525648	rs67518748	AT	A	55.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	76649924	rs2280095	C	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GGGATTGGGGCCCAGGCCCTG;SOR=0.423;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=15;WE=76649932;WS=76649914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr4	76650176	rs7657871	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=257;ReadPosRankSum=-0.444;SC=ATGGAGGGGGCATCCACATGC;SOR=0.602;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=12;WE=76650184;WS=76650166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	76670180	rs3853184	T	C	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=69;PP=1949;ReadPosRankSum=-1.217;SC=CTCTTAAATTTAGGTCTTTCC;SOR=0.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=99;TCR=129;TR=120;WE=76670188;WS=76670170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,135:0.52:262
chr4	76678576	rs4859552	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=222;ReadPosRankSum=0.755;SC=TAAAATTGCTAAATAACTAAA;SOR=0.417;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=18;WE=76678584;WS=76678566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr4	76691828	rs324715	G	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GATCCACATGGATGTTTCAAG;SOR=1.402;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=9;WE=76691836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr4	76695810	rs10588680	TTCTC	T	601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=472;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CCACTAAACATTCTCTTTCTT;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=11;WE=76695821;WS=76695800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr4	76720885	rs13119659	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=614;ReadPosRankSum=0.297;SC=ATGTTCCATTTGTATCCTTTA;SOR=0.975;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=44;WE=76720893;WS=76720875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr4	76721414	rs13145290	C	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=537;ReadPosRankSum=-0.112;SC=CTTATGGGAACTCTTATGTGA;SOR=0.924;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=23;WE=76721422;WS=76721404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr4	76721459	rs4859409	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=715;ReadPosRankSum=0.927;SC=ATTGCAAAATGTACTAGATAT;SOR=0.468;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=46;WE=76721467;WS=76721449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr4	76721705	rs2271472	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=233;ReadPosRankSum=0.322;SC=ATTATGTAGACCAAGCTTTTA;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=16;WE=76721713;WS=76721695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr4	76722041	rs324727	G	A	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=711;SC=AGGTTATATGGTAACTCTAAA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=76722049;WS=76722031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	76722353	rs324726	G	A	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=1122;SC=TTCGAGAGCAGGTAAGTACTA;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=76722361;WS=76722343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	76722422	rs13133472	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=204;ReadPosRankSum=0.864;SC=GGGAGCCTTTTTTTCTGACAT;SOR=0.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=14;WE=76722430;WS=76722412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr4	76725245	rs381067	G	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=5;PP=880;SC=TAATGCTAACGAGTATGACTT;SOR=2.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=76725253;WS=76725235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	76727576	rs11312984	GT	G	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.628;SC=GTACAGTTCTGTTTTTTTTTC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=76727584;WS=76727566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	76730004	rs324687	G	C	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=159;SC=GATTTTAAAAGTAGGAGGTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=76730012;WS=76729994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	76730061	rs324688	T	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=582;SC=CCTTGATGAATTTAATACCAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=76730069;WS=76730051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	76730195	rs324689	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.762;NF=6;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=0.325;SC=TACAGAAAACAGAAGCGTTTG;SOR=1.519;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=20;WE=76730203;WS=76730185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr4	76730258	rs324690	T	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=22;PP=669;SC=GTTGATGTATTATTTCTTAGC;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=76730266;WS=76730248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	76730309	rs145662788	CTTTAGATTACTTACTAGCCGG	C	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=2967;SC=AGCACCTTCTCTTTAGATTAC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=76730337;WS=76730299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	76734343	rs17284996	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=350;ReadPosRankSum=0.159;SC=ATATTAAATACGTCTTTTTCC;SOR=0.773;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=26;WE=76734351;WS=76734333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr4	76785716	rs1394913	C	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	76785723	rs1394914	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	76785736	rs1394915	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=249;SC=TGTTCCAATATATAATTAACA;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=76785744;WS=76785706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	76787673	rs7654738	T	C	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=42;PP=1251;SC=GAAGCTAGGCTTGCCAGATAA;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=76787681;WS=76787663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	76788692	rs2135234	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=326;SC=GCTCAGTTTTCGAGGGAGAGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=76788700;WS=76788682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	76793228	rs1394916	A	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=44;PP=1642;SC=GATACTGCACAATATGTGGGG;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=76793236;WS=76793218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	76794345	rs6858658	T	G	4977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.605;SC=AGGAATTGCATGTTGTATTTT;SOR=0.335;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=148;WE=76794353;WS=76794335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr4	76797950	rs13132709	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=1.691;SC=CTCAAGCCCGGGAGTTCAAGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=76797958;WS=76797940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	76800729	rs13130621	A	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=4;PP=150;SC=TTTTTTTGTCAGATTCTTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=76800737;WS=76800719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	76800991	rs68095351	A	AT	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	76804067	rs4859564	A	G	4932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=53;PP=2938;ReadPosRankSum=0.272;SC=GTATTATTTCATTAACCACTA;SOR=1.523;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=113;TCR=54;TR=165;WE=76804075;WS=76804057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,189:0.99:191
chr4	76805902	rs1976518	C	T	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=33;PP=1405;SC=GTTCTGGCGACGGGAGGCCAT;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=73;WE=76805910;WS=76805892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	76805962	rs1976517	G	A	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=38;PP=1321;SC=GAAGGAAATAGGAAATCAGGT;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=76805970;WS=76805952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	76805978	rs1566975	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=37;PP=1185;SC=CAGGTTAAAACCAATAGGCAT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=76805986;WS=76805968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	76809319	rs7691712	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=714;SC=CAGGTAGAGCATTCTTCTTTG;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=76809327;WS=76809309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	76809386	rs7691755	A	G	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=28;PP=1340;SC=TGATCTCCTCACTGTAACAGG;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=76809394;WS=76809376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	76809569	rs2280100	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.104;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=318;ReadPosRankSum=0.149;SC=TAACAACCCCCATCACCTAAG;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=20;WE=76809577;WS=76809559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr4	76812673	rs13116688	C	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=85;SC=GCCATTTACTCCTCAGCCCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=76812681;WS=76812663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	76817412	rs11731367	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=321;ReadPosRankSum=2.820;SC=TTGGAAAGTGGGAAACACGTA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=21;WE=76817420;WS=76817402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr4	76836137	rs6823734	A	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=25;PP=882;SC=TAAATTGTGAAGCTGAAAATT;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=76836145;WS=76836127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr4	76878716	rs2242471	G	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=799;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CCTCTTCTGGGATTTCCCGGG;SOR=1.029;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=45;WE=76878724;WS=76878706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr4	76878956	rs2242473	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=542;ReadPosRankSum=-1.037;SC=AATAAATTACGTCTTAATAAA;SOR=1.405;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=33;WE=76878964;WS=76878946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr4	76878982	rs2242474	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=306;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GGTTATAAGATGAAATTTTCA;SOR=1.338;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=26;WE=76878990;WS=76878972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr4	76881401	rs4859577	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=199;ReadPosRankSum=-0.774;SC=ACCTTAATCATGAAAGGTAGT;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=14;WE=76881409;WS=76881391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr4	76903295	rs10021434	G	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=430;ReadPosRankSum=1.029;SC=CGATCACATGGAGAAAAAGAT;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=33;WE=76903303;WS=76903285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr4	76911752	rs34740469	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.187;SC=GGCATGTCCCGTCCCCAACCC;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=8;WE=76911760;WS=76911742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	76928428	rs2276886	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=-0.034;SC=TTATGACTGACCAAATATTAC;SOR=0.315;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=18;WE=76928436;WS=76928418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr4	76942943	rs3921	C	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=857;ReadPosRankSum=1.422;SC=TGGTGACCATCATTGGTCACC;SOR=0.569;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=47;WE=76942951;WS=76942933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
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chr4	76943235	rs4859586	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=195;ReadPosRankSum=1.020;SC=TTATGGATTATAGGGGTTGCT;SOR=0.030;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=76943243;WS=76943225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	76943677	rs4859588	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GGCATACGCAGTTCTGAAGTC;SOR=0.476;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=16;WE=76943685;WS=76943667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr4	76943764	rs11298565	CT	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=127;ReadPosRankSum=1.133;SC=CTTTACTGATCTTTTTTTATT;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=7;WE=76943772;WS=76943754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr4	76943947	rs11548618	G	A	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1103;ReadPosRankSum=0.131;SC=CAGGTACAGCGTACAGTTCTA;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=74;WE=76943955;WS=76943937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,90:0.66:137
chr4	76944491	rs4241578	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=0.796;SC=TATTTCTCATTTTACAAATTA;SOR=0.425;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=28;WE=76944499;WS=76944481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
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chr4	76956179	rs12649185	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.059;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr4	76956188	rs4241580	T	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.086;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
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chr4	76956528	rs4859415	A	G	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=608;ReadPosRankSum=0.033;SC=TTAGTAATGCATCTGATTGCA;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=40;WE=76956536;WS=76956518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr4	76957171	rs6819597	C	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=917;ReadPosRankSum=0.025;SC=GCTGGTGCTGCTGCTGCTACT;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=61;WE=76957179;WS=76957161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
chr4	76996958	rs6532172	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=407;ReadPosRankSum=1.070;SC=GAAAAAATACGCAGTGTCATC;SOR=0.281;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=21;WE=76996966;WS=76996948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr4	77065476	rs33962347	TA	T	775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=1.550;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr4	77134786	rs11547135	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=186;ReadPosRankSum=1.220;SC=CGTCGAAGACCCGGGACCCTT;SOR=0.078;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=12;WE=77134794;WS=77134776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr4	77189984	rs1876538	T	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=43;PP=1275;SC=AGTGGTAATATTTAAACCTAC;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=77189992;WS=77189974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	77190069	rs1876539	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=212;SC=TCCTCAAAGTCGTAAAGGAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=77190077;WS=77190059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	77192688	rs3733253	G	T	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=13;PP=1215;SC=TTCACCGATTGCCCTCAATTC;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=77192696;WS=77192678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	77192868	rs3733250	G	A	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=55;PP=1899;SC=TAAACTGCAGGAGACAGAGTT;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=77192876;WS=77192858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	77199414	rs964051	C	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=442;SC=ATCTGAGCTTCAGATGATCAC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=77199422;WS=77199404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	77201332	rs1036787	G	A	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=283;SC=TACTTTATAAGGAACTAAATG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=77201340;WS=77201322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	77201487	rs1036788	C	T	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=1115;ReadPosRankSum=-1.123;SC=GGCTACAGGACGCCACGTGTG;SOR=0.313;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=54;WE=77201495;WS=77201477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr4	77204500	rs1542096	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=12;PP=643;SC=GTTTTGTTTGCCAATCTAATG;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=77204508;WS=77204490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	77255243	.	C	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CCTCATTGATCACGCTTCTCA;SOR=0.622;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=22;WE=77255251;WS=77255233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr4	77274242	rs12504985	T	C	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=24;PP=2350;SC=ACTATTTAGTTGATAATTACT;SOR=2.137;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=77;TCR=24;TR=101;WE=77274250;WS=77274232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	77290561	rs72657825	G	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=703;SC=CGATGGCACAGCCTGTGCAGG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=77290569;WS=77290551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	77296600	rs1876535	T	C	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=23;PP=1453;SC=TGGCGGTGCATTGGCAGAACT;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=67;WE=77296608;WS=77296590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	77303898	rs6844174	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=830;SC=TGGTGATTGTCATTTGATACA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=77303906;WS=77303888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	77357129	rs78134132	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=390;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GATGGGACAACTTGTGCTGTA;SOR=1.199;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=22;WE=77357137;WS=77357119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr4	77637502	rs344122	A	C	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=46;PP=1903;ReadPosRankSum=0.078;SC=TTATTCCACGACTGAATATGA;SOR=0.471;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=201;TCF=121;TCR=80;TR=108;WE=77637510;WS=77637492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,134:0.56:240
chr4	77652219	rs344135	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=262;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CTCTATCCACTGCTTTTCTCA;SOR=0.770;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=16;WE=77652227;WS=77652209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr4	77660162	rs344140	G	C	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=1307;ReadPosRankSum=0.080;SC=GGCATCTCTGGCCGGGAGCGT;SOR=0.669;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=70;TCR=84;TR=82;WE=77660170;WS=77660152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,102:0.54:190
chr4	77660731	rs344141	C	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=483;ReadPosRankSum=1.128;SC=CAGCATCTACCCGGTACCTTC;SOR=0.701;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=36;WE=77660739;WS=77660721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr4	77662248	rs344142	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=998;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CCGAGGCGTCGGCCTCCGCCT;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=49;WE=77662256;WS=77662238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
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chr4	77663262	rs344144	T	C	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=46;PP=1148;ReadPosRankSum=2.019;SC=GGTTTCCTTATAAAGATATAG;SOR=1.005;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=15;TCR=78;TR=54;WE=77663270;WS=77663252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,60:0.56:108
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chr4	77818202	rs2645674	T	C	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=59;PP=1974;SC=AAGCCCTGCTTGTCGCAGCCT;SOR=0.960;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=106;WE=77818210;WS=77818192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
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chr4	77916865	rs6532758	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=0.240;SC=AAATCACCCAGTGATTTTACT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=10;WE=77916873;WS=77916855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr4	77917194	rs7356354	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=0.447;SC=TTTTTTCACTATGAGTTGACA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=77917202;WS=77917184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	77917458	rs7685131	A	G	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=600;ReadPosRankSum=0.448;SC=GCAGCTGTGGAGGGTCTCCTT;SOR=0.314;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=67;TCR=6;TR=32;WE=77917466;WS=77917448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr4	77987351	rs4241602	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=461;ReadPosRankSum=0.384;SC=GTATGGCAGTAGTATGTTTAT;SOR=0.294;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=27;WE=77987359;WS=77987341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr4	78081744	rs28648488	G	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=1.227;SC=TGTGGGTAAAGAGCCAGTACA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=78081752;WS=78081734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	78106123	rs28503908	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.328;SC=TTGGATGTAACAGTGAGACTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=78106131;WS=78106113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	78641624	rs376684662	C	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.769;NF=34;NR=45;PP=989;ReadPosRankSum=0.095;SC=TGACAAGAGGCAGGAGTGGAG;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=79;WE=78641632;WS=78641614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,63:0.40:156
chr4	78669454	rs6855336	A	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=20;PP=808;SC=AAGGAAGAATAAGAAAAACTA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=78669462;WS=78669444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	78697552	rs34417165	T	TA	83.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;MQRankSum=0.210;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr4	78740066	rs6811439	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=6;PP=251;SC=CCAGCCCCGCTGCCGCGCGTG;SOR=1.230;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=78740074;WS=78740056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	78740132	rs6828302	G	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=9;NR=11;PP=311;SC=TCTCACCTGCGAGGCTCGGGA;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=78740140;WS=78740122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	78740203	.	G	GACACACACAC	299.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=42.82;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	78830272	rs10551874	AAC	A	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=109;SC=AATGAATGTGAACACCAGGAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=78830281;WS=78830262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	78870940	rs4859513	T	A	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=27;PP=1970;SC=ATGTATATTATTTTCTTTCAG;SOR=1.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=91;WE=78870948;WS=78870930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	78979141	rs34237418	C	T	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=25;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CTGGGCTCCTCCATCGTGGGT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=73;WE=78979149;WS=78979131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr4	78979257	rs71661147	C	CGTGT,CGT	1605.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1,1;NR=41,41;PP=1773,1753;ReadPosRankSum=-0.677;SC=AGCGGTGCCGCGTGTGTGTGT;SOR=0.540;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=102;TCF=4;TCR=98;TR=42,42;WE=78979283;WS=78979247;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.49:96
chr4	78979273	.	TGC	T	1773	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=59.85;NF=1;NR=41;PP=1773;QD=42.4285714286;SC=TGTGTGTGTGTGCGTGTGCGT;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=42;WE=78979283;WS=78979247;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr4	78979275	.	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.759;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr4	78987157	rs4859905	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=855;ReadPosRankSum=0.388;SC=GTCTATCAGGATTCCTTGTTG;SOR=0.999;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=55;WE=78987165;WS=78987147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,72:0.51:140
chr4	79158843	rs10011303	G	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=251;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GATCATTTCAGACATCTGTTT;SOR=0.426;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=21;WE=79158851;WS=79158833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr4	79173515	rs34015316	C	CT	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.647;NF=12;NR=7;PP=207;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TGGCACTAACCTTTTTTTTTT;SOR=1.223;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=19;WE=79173523;WS=79173505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr4	79176325	rs1017647	C	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=374;SC=ACTGGCTGCACGCCCATGCAG;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=79176333;WS=79176315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr4	79187832	rs2008587	G	A	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=564;SC=TTTTCATAGAGGCTATTCCTA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=79187840;WS=79187822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr4	79188160	rs2008786	C	T	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=884;SC=CTTCTTATTCCGGTGTGTCCT;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=79188168;WS=79188150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	79204209	rs1378236	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=272;SC=TGCTTCTTTTCATTTTTATTT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=79204217;WS=79204199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	79238496	rs17457087	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=431;ReadPosRankSum=0.502;SC=GTCCCATGGCGTTCTCCCTCT;SOR=0.515;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=30;WE=79238504;WS=79238486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr4	79238649	rs345514	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=402;ReadPosRankSum=-2.526;SC=ACTCTGACCATGGAGTCTGCA;SOR=0.554;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=32;WE=79238657;WS=79238639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr4	79240196	rs11727404	C	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=0.375;SC=CTTGAGAGATCCTGTGAGGTG;SOR=0.132;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=79240204;WS=79240186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr4	79240473	rs345511	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=659;ReadPosRankSum=-1.701;SC=ATTTATTATTCCTTCTAATTT;SOR=1.961;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=32;WE=79240481;WS=79240463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr4	79284694	rs6835769	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=710;ReadPosRankSum=1.714;SC=CAGCACTGTGCAGCTGATCTC;SOR=1.187;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=43;WE=79284702;WS=79284684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr4	79295418	rs34889042	C	CTG	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.485;NF=1;NR=8;PP=338;ReadPosRankSum=-1.918;SC=AACTTGGAGACTGCTGATTAT;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=9;WE=79295426;WS=79295408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr4	79334264	rs1872268	T	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AGGCTTGTGGTTTCCACTTAG;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=16;WE=79334272;WS=79334254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr4	79340016	rs34936138	A	AT	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.002;NF=12;NR=3;PP=229;ReadPosRankSum=1.134;SC=GCCCAGAGCAATTTTTTTTTC;SOR=0.223;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=15;WE=79340024;WS=79340006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr4	79343111	rs78575519	G	A	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=48;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GCCCTCCCCCGGCAGCACCCC;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=86;WE=79343119;WS=79343101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,95:0.58:164
chr4	79350200	rs112867538	C	CTGTG	1011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.123;NF=9;NR=9;PP=778;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GTGCGTGTCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.382;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=18;WE=79350208;WS=79350190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr4	79371474	rs17003235	C	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=641;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GAAGTTTCACCCAGGCAGACA;SOR=0.432;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=38;WE=79371482;WS=79371464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr4	79372856	rs10026662	A	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1117;ReadPosRankSum=0.151;SC=AATTGAATTCACACCTCTTGC;SOR=0.596;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=95;TCR=37;TR=70;WE=79372864;WS=79372846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr4	79372930	rs753752	C	T	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1810;ReadPosRankSum=-1.047;SC=TTATAGGCCACGTAGAATATA;SOR=0.786;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=118;WE=79372938;WS=79372920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,138:0.53:260
chr4	79373254	rs753751	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=1.668;SC=ACCTTACTTCTTGGCACCAGG;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=79373262;WS=79373244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	79385803	rs11933507	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	79387442	rs7660664	C	T	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=47;PP=1479;ReadPosRankSum=0.339;SC=AGCATTTCCACCTCACCTCCA;SOR=0.622;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=102;WE=79387450;WS=79387425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,125:0.49:253
chr4	79387464	rs7684722	A	G	7029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=91;PP=2965;SC=CTTCACCATGAAAGATATCTA;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=201;WE=79387472;WS=79387454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr4	79387586	rs34840208	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=11.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
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chr4	79391036	rs1496602	T	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=1038;SC=TCTGAAGTGTTAGCAGACTTC;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=79391044;WS=79391026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr4	79409997	rs1496603	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.180;SC=CTTCCACTAATGGTGCGTCTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=79410005;WS=79409987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	79417863	rs7674053	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=1.064;SC=TGGACTTTTTGATGCAATAAA;SOR=1.179;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=6;WE=79417871;WS=79417853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr4	79420864	rs7677541	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	79420870	rs7695038	C	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	79421011	rs11933630	G	T	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=29;PP=1305;ReadPosRankSum=1.735;SC=GCAGCACGCGGGATGGCTCTG;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=78;WE=79421019;WS=79421001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr4	79428447	rs13141571	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=2.198;SC=CAGCCACTGCGTTTATAGAAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=79428455;WS=79428441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr4	79428796	rs28739412	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=1.125;SC=TGCTGTTTTACGTCTCAGTGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=79428804;WS=79428786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr4	79430211	rs146398969	GTTGTTCT	G	938.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=873;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GAGAACTGGTGTTGTTCTTTG;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=16;WE=79430225;WS=79430201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr4	79432455	rs3749488	A	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr4	79432782	rs11728758	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.373;SC=TGATGAATGCATCAGTAAAAG;SOR=2.093;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=79432790;WS=79432772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr4	79434389	rs17429718	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TATATGTATACCCCCTGTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=79434397;WS=79434383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	79434487	rs17469981	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=257;ReadPosRankSum=-0.138;SC=AAAGAAGTATGTCCTATTGAC;SOR=1.214;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=20;WE=79434495;WS=79434477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr4	79434685	rs35933858	T	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=1.483;SC=AGTTACCACCTATGACCTGAG;SOR=1.697;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=15;WE=79434693;WS=79434675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr4	79437178	rs74632598	C	T	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=1073;ReadPosRankSum=1.909;SC=GTAGGTGCCCCGGGGCTTGTC;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=53;TCR=89;TR=64;WE=79437186;WS=79437168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
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chr4	79440747	rs10518200	A	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=453;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TGTTATCCCGAAGACAAAGTG;SOR=2.147;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=22;WE=79440755;WS=79440737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr4	79442558	rs76957624	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=-0.882;SC=ATGTTATCTTGTTACATTCAA;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=13;WE=79442566;WS=79442548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr4	79442799	rs11360692	GT	G	362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=121;SC=TATCAATGCCGTTTTTTTTTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=79442807;WS=79442789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr4	79443837	rs931605	A	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=672;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CTCTCCCAGAAGTGAAATCTT;SOR=1.082;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=39;WE=79443858;WS=79443827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr4	79443850	rs931606	G	A	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=35;PP=2064;SC=GAAATCTTTCGTATTGACTCC;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=98;WE=79443858;WS=79443827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	79444029	rs1496598	G	A	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=41;PP=1404;SC=CAGGAGCTTGGGAAATAGTGC;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=79444051;WS=79444019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	79444043	rs11731315	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=598;ReadPosRankSum=-1.127;SC=ATAGTGCTTTCCTCTGAAGGC;SOR=1.524;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=28;WE=79444051;WS=79444019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr4	79455714	rs4975070	C	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=726;ReadPosRankSum=0.811;SC=TAATGGATCCCAATACATCTG;SOR=0.432;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=50;WE=79455722;WS=79455704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,58:0.39:148
chr4	79455733	rs4975139	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=604;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TGATATGTCACTAGCAGAAAT;SOR=0.294;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=44;WE=79455741;WS=79455723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,54:0.42:130
chr4	79455858	rs4975140	T	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=472;SC=TCTGCTCATATGCTCTCAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=79455866;WS=79455848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	79458112	rs17471104	A	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=11;PP=951;SC=CTTTCATCTTAAAGTCTGACC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=79458120;WS=79458102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	79460647	.	GAA	G	105	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=60.67;NF=0;NR=6;PP=105;QD=18.0;SC=TTTAAAGCTTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=79460656;WS=79460637;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,6:0.46:13
chr4	79462311	rs72659058	T	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=914;SC=TTTTCTAAAATCATTTTTATA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=79462319;WS=79462301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	79503230	rs1472365	T	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=484;SC=GATGGACATGTTTTGTCTGAT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=79503238;WS=79503220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	79512800	rs10003947	T	A	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=63;PP=2060;SC=TTTTTATTTTTTAACTCCCCA;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=97;WE=79512808;WS=79512790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	79531186	rs5944	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=276;ReadPosRankSum=-1.067;SC=TGTATTTGTTCTTCATTGATT;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=17;WE=79531194;WS=79531176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr4	79531308	rs4612	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=349;ReadPosRankSum=0.235;SC=GATGGGCTTTCCCAACAGCTC;SOR=0.954;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=22;WE=79531316;WS=79531298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr4	79697892	rs201253367	AGGCTC	A	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=162;ReadPosRankSum=1.221;SC=GCGCCCGGGGAGGCTCGGACA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=79697904;WS=79697882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	79786974	rs2288254	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=-1.539;SC=TATTGTAAAGTAGATAACATA;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=15;WE=79786982;WS=79786964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr4	79793707	rs1061400	C	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=1.302;SC=TAAATAGATGCAGTGCTGACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=79793715;WS=79793697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr4	79845007	rs13108247	C	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=258;ReadPosRankSum=0.829;SC=AAAGAGATACCTACCTGGAAA;SOR=0.809;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=22;WE=79845020;WS=79844997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,24:0.25:95
chr4	79854436	rs10857059	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=330;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TGAATGTAAATGGATCAAATC;SOR=0.404;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=22;WE=79854444;WS=79854426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr4	79856107	.	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.697;SC=AACATACTCTCATAAGAACAC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=79856115;WS=79856105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	80828668	rs10027070	A	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=426;ReadPosRankSum=-1.173;SC=GCCATTATTTAAAAAAGCATG;SOR=0.344;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=32;WE=80828676;WS=80828658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr4	80828740	rs6819294	T	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=269;SC=CCATGTTAACTTGAGACATGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=80828748;WS=80828730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	80898808	rs35798108	C	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=860;ReadPosRankSum=1.071;SC=TCAAAGAAACCCGGTCATACT;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=54;WE=80898816;WS=80898798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr4	80905833	rs28534734	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	80905851	rs28688624	A	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=1.386;SC=GATTTGTATAAATTAAAAAGT;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=80905859;WS=80905841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	80905990	rs12647691	C	G	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.50;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	80905990	.	CG	GG,GT	444	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=20,15;NR=24,17;PP=126,444;QD=3.65389119425;SC=GGTGCAGGGGCGGGTGGTGGT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=44,32;WE=80905999;WS=80905980;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.96:46
chr4	80905991	rs72653288	G	T	763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.238;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr4	80906131	rs4444771	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=284;SC=AAGTCCCTCACTGAAGCTTGC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=80906139;WS=80906121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	80929656	rs200250276	G	C	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=547;ReadPosRankSum=1.505;SC=AAGTAGAGTTGTAAATCCTTC;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=34;WE=80929664;WS=80929646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr4	80939979	rs4336166	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=0.957;SC=TATGCAACAACACCAAAGATC;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=7;WE=80939987;WS=80939969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr4	80975372	rs10745242	A	T	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=10;PP=1468;SC=CTTCTTATAGATTAAAAAAAT;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=64;WE=80975380;WS=80975362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	80976420	rs11730210	G	T	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.40;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	80977078	rs4594664	T	G	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=15;PP=770;SC=AAATGTAAAATAACTTACTAG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=80977086;WS=80977068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	81222286	rs13119149	T	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=291;SC=ACCCTACTCATGCAGCGCAGC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=81222294;WS=81222276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	81529380	rs2903671	T	C	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=23;PP=1002;SC=AATAGATAACTGATTCCAACA;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=81529401;WS=81529370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	81529518	rs2867782	T	C	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=39;PP=1529;SC=GCTGCTCATATCTTGAAGAAG;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=81529526;WS=81529508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	81884610	rs11452353	A	AT	1459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.62;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr4	81884722	rs1052325	G	A	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=69;PP=2453;SC=AGAACTCTACGTACAAGCTGT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=81884730;WS=81884712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	81967188	rs6831040	C	T	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=56;PP=2430;SC=TATCACTCAACTCTTGAGGAA;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=116;WE=81967196;WS=81967178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	81973224	rs12647814	A	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.73;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	81973260	rs1390318	C	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=24;NR=26;PP=1007;SC=ATGCTGGGAGCTTTAGGAGTT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=81973268;WS=81973250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	82065566	rs7687935	A	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=202;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CATAAAACACAAGCTGGTTAT;SOR=0.237;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=13;WE=82065574;WS=82065556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr4	82088478	rs3733551	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.117;SC=TTAAAAAATATAATGCACTTT;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=82088486;WS=82088468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	82092870	rs17005080	A	G	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1038;ReadPosRankSum=0.320;SC=TCCTTGTACAATTGTATAAAA;SOR=0.583;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=157;TCF=87;TCR=70;TR=71;WE=82092878;WS=82092860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,89:0.47:191
chr4	82092967	rs9992933	C	T	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=834;ReadPosRankSum=-1.448;SC=CTCTATCAAGCAGAATTTTAA;SOR=0.679;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=61;WE=82092975;WS=82092957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr4	83276386	rs34411705	G	A	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=1;PP=187;SC=ATTAAGCATTGTTTTATGAAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=83276394;WS=83276377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	83276430	rs3838641	C	CA	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=2;PP=250;SC=TTGTAAATGACAAAAAAAAAC;SOR=2.584;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=12;WE=83276438;WS=83276420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	83350954	rs2516817	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=25;ReadPosRankSum=1.559;SC=GGTCAGCAGTCCCGAGCAGAG;SOR=0.593;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=3;WE=83350962;WS=83350944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	83352177	rs10646358	C	CTT	2211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=46;PP=2401;SC=GGCGGTGTGGCTGCCTCTTGT;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=47;WE=83352185;WS=83352167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	83369287	rs4285076	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=641;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GATAGGGGATAGAAGTTGCAG;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=35;WE=83369295;WS=83369277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr4	83552809	rs3857138	A	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=948;SC=TTGGTTACTGACTCCAAAGGC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=83552817;WS=83552799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	83582064	rs3733228	G	T	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=49;PP=1952;SC=AGAGCACGCAGCATCAAGCAG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=83582072;WS=83582054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr4	83582211	rs3733227	C	G	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=36;PP=1043;SC=GCTCTTCCTTCTTTCTGGATG;SOR=1.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=83582219;WS=83582201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	83626382	rs1876218	C	A	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=634;SC=CCCCTCCTCCCATACTGCCAT;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=83626390;WS=83626372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	83626674	rs6853042	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=41;PP=1400;SC=GTGTCAGGGGGGAAAGCTGCA;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=83626682;WS=83626664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	83742336	rs4634209	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=223;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TCTCATTGCACTAAACCTTAT;SOR=0.475;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=15;WE=83742344;WS=83742326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr4	83772616	.	C	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=912;ReadPosRankSum=0.196;SC=AAAGCCAAGGCTGCAGCAATA;SOR=1.322;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=54;WE=83772624;WS=83772606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr4	83778378	rs4235054	A	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=1.169;SC=ATATATATACATGAATGGAGA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=83778386;WS=83778368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	83778839	rs7658703	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=470;ReadPosRankSum=-0.819;SC=AACAAGTACTTACCCCCACTG;SOR=0.667;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=28;WE=83778847;WS=83778829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr4	83784337	rs7666917	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=253;SC=AAGAAAAAGGGAAAAAACGCT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=83784345;WS=83784327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	83787845	rs7356522	G	A	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=482;SC=ATACCCACAAGTACATCTCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=83787853;WS=83787835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	83788139	rs2290739	C	A	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=465;SC=ATAACATAAGCATCCGACCAT;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=83788147;WS=83788129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	83788344	rs2045478	A	T	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=41;PP=2163;SC=CATCTGTGCTACCTCCCATGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=108;WE=83788352;WS=83788334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	83788562	rs2045479	T	C	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=844;SC=ACAAGTATAGTTAAATTGAAT;SOR=3.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=83788570;WS=83788552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	83791373	rs10015419	C	T	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=685;SC=TCCACATACTCTTCACATAGT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=83791381;WS=83791363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	83791649	rs3762902	G	T	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=948;SC=TTCTGCCTAGGTTTTGTAGAT;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=83791657;WS=83791639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	83792464	rs10548601	TACAC	T	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=2;PP=228;SC=TATACATGCATACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=83792475;WS=83792454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	83792498	rs7685043	G	T	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=142;SC=CACAAGTAACGTAGGTACAGT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=83792506;WS=83792488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	83792555	rs7686508	C	A	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=145;SC=TGCAGTAAGTCGTTACTTAAT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=83792563;WS=83792545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	83793243	rs4693525	A	C	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=29;PP=937;SC=AATGCATCTGAAGATAGTTAA;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=83793251;WS=83793233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	83793354	rs143845447	A	ATTTTG	399.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=0;NR=7;PP=366;SC=GCTGTGGCTTATTTTATTTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=83793376;WS=83793344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	83793368	rs11942312	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=167;SC=TATTTATGATCTATTTATTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=83793376;WS=83793344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	83795806	rs10025654	T	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=675;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GCTCATTTTTTCTAAGATCCC;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=36;WE=83795814;WS=83795796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr4	83801849	rs6820324	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GTTCTTGATGGTATTCCTTGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=83801857;WS=83801839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	83822334	rs982146	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=360;ReadPosRankSum=0.485;SC=GAAGTGAGGAGGCCGAAAGGG;SOR=0.202;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=22;WE=83822342;WS=83822324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr4	83827822	rs3214025	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.686;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=45;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AAAAATAGCTATTTTTCTGAG;SOR=1.523;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=94;TCF=20;TCR=74;TR=53;WE=83827830;WS=83827812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr4	83838217	rs1031639	G	A	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=76;PP=2965;SC=TAAAAAGTATGCCTCTCAAGC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=100;TCR=76;TR=176;WE=83838225;WS=83838207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	83838262	rs897945	G	T	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.529;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=2003;ReadPosRankSum=-1.412;SC=GTCACAGTTTGCAGGGGTTTA;SOR=0.856;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=112;WE=83838270;WS=83838252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,131:0.47:276
chr4	83839799	rs6535411	A	G	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=36;PP=1207;SC=TGGGCATATTAATCTTTTTGT;SOR=1.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=83839807;WS=83839789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	83849581	rs6535412	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-1.936;SC=GAGCATCACAATTTACACAGT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=83849589;WS=83849571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr4	83852065	rs985899	G	A	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=13;PP=1559;SC=TATTTGGGAAGTACTATAAAA;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=83852073;WS=83852055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	83857108	rs6535413	AT	GA	4644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.334;NF=57;NR=38;PP=2944;ReadPosRankSum=1.796;SC=TTTAAAAGATATTATTTTCCG;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=95;WE=83857117;WS=83857098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,116:0.62:188
chr4	83857402	rs6535415	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=533;SC=TGGATATTTCTGTCAGTTAAA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=83857410;WS=83857392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	83900043	rs6535422	A	G	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=45;PP=2606;SC=AACCTGCAATAACTGGTGGTG;SOR=1.304;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=126;WE=83900051;WS=83900033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	83900260	rs7674484	A	G	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=668;SC=ATGTAAAACCAGCTCACTTAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=83900268;WS=83900250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	83905258	rs9994716	C	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=479;ReadPosRankSum=-0.419;SC=AACTATGAATCAGTTAAATTT;SOR=2.019;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=23;WE=83905266;WS=83905248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
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chr4	83989516	rs2868747	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=340;SC=AACCAGAAGCTTTCTGTTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=83989524;WS=83989506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	83989571	rs5859858	G	GT	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.908;SC=GTTTCTGAGAGTTTTTTTTTC;SOR=1.259;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=7;WE=83989579;WS=83989561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr4	84188850	rs1129617	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=286;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CACTGAAGCCGCTGAGCCACG;SOR=0.776;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=21;WE=84188858;WS=84188840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr4	84189012	rs11448409	G	GT	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=45;ReadPosRankSum=2.189;SC=CAGATTTAGTGTTTTTTTGTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=84189020;WS=84189002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	84191031	rs6535454	A	G	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1356;ReadPosRankSum=-3.030;SC=CATAAATAGTATCATATATTA;SOR=1.021;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=87;TCR=58;TR=87;WE=84191039;WS=84191021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,101:0.59:171
chr4	84193366	rs6841889	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=-1.995;SC=ATTACCACTACCTCTTAGAAA;SOR=0.638;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=19;WE=84193374;WS=84193356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr4	84205618	rs13113787	A	C	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=24;PP=1177;SC=GCCGACTCGGAGGCTGCTACT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=84205626;WS=84205608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	84205872	rs6818847	C	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=448;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GCCAGTGCCACAGCCCGCAGG;SOR=0.573;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=27;WE=84205880;WS=84205862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr4	84223461	rs4285078	G	C	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=62;PP=1799;SC=AAAAATAGATGTTTACTTATG;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=83;WE=84223469;WS=84223451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	84230619	rs11099592	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=617;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AAAATCTTCCTTGGTAGCAGT;SOR=1.016;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=35;WE=84230627;WS=84230609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr4	84232104	rs6535455	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.550;SC=AGCAAACATATAGCAGTATTT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=84232112;WS=84232094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	84234190	rs6818355	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=1.160;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.821;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	84234229	rs6840520	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.300;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.260;NF=32;NR=9;PP=852;ReadPosRankSum=0.513;SC=GCTAGTGGGGGATCTCCTTAT;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=41;WE=84234237;WS=84234219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr4	84240654	rs12501123	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=242;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TAGAAGGTCTGTTTTCACAGT;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=18;WE=84240662;WS=84240644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr4	84240680	rs12501124	G	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-1.692;SC=GACTGAAATCGCATATATTTA;SOR=0.191;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=11;WE=84240688;WS=84240670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr4	84347363	rs4693624	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=0.585;SC=CAAGATAAATATATTTGTAAA;SOR=0.124;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=84347371;WS=84347353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	84352750	rs12645412	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.500;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr4	84362443	rs4693088	T	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=152;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGAATTTAAATGTTATCAATG;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=13;WE=84362451;WS=84362433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr4	84364751	rs7665103	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.910;SC=CACTCATACCAATAATTTGAG;SOR=1.670;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=7;WE=84364759;WS=84364741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr4	84364808	rs6535473	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	84367286	rs11099600	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=349;ReadPosRankSum=0.675;SC=TCTTCATATAGTGCTCATATA;SOR=0.779;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=28;WE=84367294;WS=84367276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr4	84368225	rs11272773	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=0;PP=370;ReadPosRankSum=-0.050;SC=AATTGGCCAGGCATTGTGGCC;SOR=1.426;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=1;WE=84368256;WS=84368215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	84369824	.	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQRankSum=-0.293;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	84370091	rs13141136	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=370;ReadPosRankSum=0.046;SC=ACAGAATTCAATGTTAAACAA;SOR=0.316;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=27;WE=84370099;WS=84370081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr4	84370124	rs10718573	TA	T	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TCTGTGGAATTAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=7;WE=84370132;WS=84370114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	84374480	rs1494961	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=436;ReadPosRankSum=0.426;SC=GATGACTCAACTGTTTTCTTA;SOR=1.015;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=30;WE=84374488;WS=84374470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
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chr4	84382058	rs34734728	CA	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr4	84397620	rs17352824	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=0.272;SC=AGAAAGAACTGCTAGGGTTGA;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=84397628;WS=84397610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	84397667	rs187233187	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=0.401;SC=TTTAAAAAAAACTTTCCATTC;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=84397675;WS=84397657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	84403491	rs35608460	A	AG	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.956;NF=0;NR=10;PP=376;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TATGTATACAATATGTGCTAC;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=84403499;WS=84403481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	84458001	rs55833887	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=0.134;SC=AGTGGTCGCGAGTCAGGGGTG;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=19;WE=84458009;WS=84457991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr4	84458028	rs56139069	C	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.907;SC=CGCGCGTGTGCATGCGTGCGT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=12;WE=84458036;WS=84458018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr4	84465613	rs10516690	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.737;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=416;ReadPosRankSum=0.622;SC=AATTTCACTTCTGTATAATCA;SOR=1.639;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=22;WE=84465621;WS=84465603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr4	84465855	rs28360718	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=-0.769;SC=AGTGTGTTCTATAGGGTTTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=84465863;WS=84465845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	84509465	rs11394944	T	TG	6768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=67;PP=2936;SC=GAGTATCTGCTCCAATGTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=97;WE=84509473;WS=84509455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	84525973	rs35602893	CT	C	1909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=50;PP=1251;ReadPosRankSum=0.261;SC=AATGGAATGGCTTTTTTTGTT;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=9;TCR=110;TR=54;WE=84525981;WS=84525963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr4	85166020	rs348700	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=451;ReadPosRankSum=1.294;SC=CCAAGGCCTTCCCTGGCATGT;SOR=0.417;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=27;WE=85166028;WS=85166010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr4	85414741	rs13123447	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=477;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GAGGCAAGGGCGAGGAATTAA;SOR=0.324;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=28;WE=85414749;WS=85414731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr4	85416797	rs2278671	T	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=0.963;SC=GCGGTACCTATCCCTCCAGGT;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=85416805;WS=85416787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	85465390	.	ATT	A,AT	1491.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.291;QD=27.12;ReadPosRankSum=1.417;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,33,20:0.60,0.36:55
chr4	85530796	rs17009168	A	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.455;SC=GTCACAGAATATTTAGTTCCT;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=85530804;WS=85530786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr4	85555196	rs13102661	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TGTACTGTTTGTTGTTCTTAT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=85555204;WS=85555186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	85556386	rs7683338	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=0.524;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	85612737	rs3747680	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=711;ReadPosRankSum=0.900;SC=GGATAGCCAGACCACAAAAGA;SOR=0.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=44;WE=85612745;WS=85612727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr4	85625701	rs1838039	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TGATAACTGTAACACTAAATG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=85625709;WS=85625691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr4	85634488	rs13108722	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=2.935;SC=ATTTTCATAGTTGCGTCTACC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=10;WE=85634496;WS=85634478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr4	85656350	rs6838727	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TTGAAATTAATGCTAAATAAT;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=85656358;WS=85656340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr4	85699579	rs12502409	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.230;SC=CATTTTAGAGATAAAATAGTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=85699587;WS=85699569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr4	85710824	rs13137042	C	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.33;QD=23.90;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr4	85765541	rs2869216	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=0.121;SC=AAAACAATATTAGAACTCACA;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=11;WE=85765549;WS=85765531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr4	86844835	rs6824722	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=589;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CAAATCATGAAAGCTACCTCC;SOR=0.727;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=38;WE=86844843;WS=86844825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr4	86852207	rs60002814	AT	A	2111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=33;PP=1616;SC=TAGGTAGATAATATGTTCATG;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=36;WE=86852215;WS=86852197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	86863467	rs11097083	T	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=438;SC=ACTGAGAAATTCAGACTCAAC;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=86863475;WS=86863457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	86915848	rs10003909	T	C	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=66;PP=2285;SC=GCAACAACAATGAAATTCAGA;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=125;WE=86915856;WS=86915838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	86915923	rs11547776	G	A	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=51;PP=2314;SC=GCCCTAGTAGGCAGTGCTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=104;WE=86915931;WS=86915913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	86921612	rs12505097	C	G	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=5.471;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,86:0.97:89
chr4	87019904	rs4133139	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=0.344;SC=TCAAACCAGCGCTATGCTATT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=10;WE=87019912;WS=87019894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr4	87024228	.	C	CTGTGTG,CTGTG	286.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.15;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5,5;NR=1,1;PP=71,129;SC=GATTTCAACTCTGTGTGTGTG;SOR=4.407;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6,6;WE=87024236;WS=87024218;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
chr4	87024409	rs28529458	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=0.132;SC=TGAAAGAGAGTGGAAGGGACA;SOR=0.640;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=30;WE=87024417;WS=87024399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr4	87671889	.	C	G	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=906;ReadPosRankSum=0.118;SC=ATACCATGATCTCAGTCAGGC;SOR=0.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=59;WE=87671897;WS=87671879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,68:0.39:174
chr4	87679513	rs71605616	G	C	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1357;ReadPosRankSum=0.501;SC=GTAAGTCACCGTGAGATTCTT;SOR=0.922;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=84;WE=87679521;WS=87679503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,110:0.46:241
chr4	87679642	rs1420624	A	C	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=44;PP=1343;SC=AAGCCCATCAACCTACCCGCC;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=87679650;WS=87679632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	87684031	rs710832	A	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=27;PP=1225;SC=CCTTTGGGCCATCTGGGGGCC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=87684039;WS=87684021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	87706506	rs989902	T	G	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=883;ReadPosRankSum=0.372;SC=TGCAGCAGGATACTCCTGTGG;SOR=1.076;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=50;WE=87706514;WS=87706496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,64:0.39:166
chr4	87769929	rs13106574	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=494;ReadPosRankSum=2.344;SC=AAGGTGAAAATGTTAGAGATG;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=37;WE=87769937;WS=87769919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr4	87808810	rs3035472	G	GCA	1240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=893;ReadPosRankSum=-0.427;SC=CCACCAGTGGGCATTCAAATA;SOR=0.708;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=23;WE=87808818;WS=87808800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr4	87809020	rs72613147	C	G	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=809;ReadPosRankSum=-0.462;SC=AGACGCTTCACTTCATACTCC;SOR=0.441;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=37;TCR=79;TR=57;WE=87809028;WS=87809010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr4	87809387	rs1550931	G	T	6991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=111;PP=2965;SC=TAGGTTTGTGGACCAGGTCTT;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=101;TCR=111;TR=212;WE=87809395;WS=87809377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr4	87811360	.	G	GAGGAAGGA	142	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.57;QD=35.50;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	87812564	rs10011798	G	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.422;NF=26;NR=16;PP=596;ReadPosRankSum=-0.222;SC=ACTCCCCACCGCAGTCAATGC;SOR=0.488;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=42;WE=87812572;WS=87812554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr4	87812586	rs55723875	TA	T	3689.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=45;PP=1690;SC=TACCCTGATTTAAAAAAAAAA;SOR=0.793;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=73;WE=87812596;WS=87812576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	87812588	rs114349215	A	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=11;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.876;NF=15;NR=18;PP=501;ReadPosRankSum=2.025;SC=CCCTGATTTAAAAAAAAAAAA;SOR=0.798;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=33;WE=87812596;WS=87812576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr4	87812810	rs35305216	G	GA	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.211;NF=0;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CCAAATAATAGAAAAAAATTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=87812818;WS=87812800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	87957989	rs340629	T	C	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.11;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr4	88005203	rs236996	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=478;ReadPosRankSum=1.721;SC=CATTAATACAGTCATCCACCA;SOR=0.439;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=28;WE=88005211;WS=88005193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
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chr4	88048315	rs112686186	GC	G	1344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.60;ReadPosRankSum=-2.260;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
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chr4	88048863	rs62306540	T	C	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.762;SC=ATGGTTAGTATTGGCCCTTTA;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=65;WE=88048871;WS=88048853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,84:0.50:167
chr4	88052219	rs342467	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=422;ReadPosRankSum=-1.058;SC=ACAATGACCATGTTCTTCTCC;SOR=0.890;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=37;WE=88052227;WS=88052209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr4	88053085	rs342466	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=0.162;SC=CAAAAAGATTCTGAAATTTGT;SOR=0.635;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=9;WE=88053093;WS=88053075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr4	88056719	rs56703224	GT	G	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.042;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
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chr4	88116518	rs74604071	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=1.364;SC=CATAAAATCGAAGAAGAGAAC;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=10;WE=88116526;WS=88116508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr4	88226231	rs11735092	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TTAATCTTGTTCGTTTGACTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=88226239;WS=88226221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	88226480	rs6850131	A	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-2.284;SC=AAAGAAAAAAAAATTGAAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=88226488;WS=88226470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr4	88231429	rs62305723	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=0.676;SC=ATATACGATGGAACAAAAATC;SOR=0.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=19;WE=88231437;WS=88231419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr4	88234874	rs7698974	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=280;SC=ATTTTTCCTTCTTCATTTTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=88234882;WS=88234864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	88236701	rs138932958	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=450;ReadPosRankSum=0.997;SC=CCACTGTGACGATGTGGCCAT;SOR=0.821;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=29;WE=88236709;WS=88236691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr4	88238448	rs6531975	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=543;SC=ATATAATCCAAAGATGAGAGT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=88238456;WS=88238438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	88258483	rs9991501	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=21;PP=463;SC=ACTGATTTTTTGTTTTAAAAC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=88258491;WS=88258473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	88293745	rs6849846	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=-1.444;SC=CTCAATAATAAACTGGAAAAC;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=88293753;WS=88293735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr4	88293887	rs6531985	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=665;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AGGGGACCGAGACATGTCCAG;SOR=0.750;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=46;WE=88293895;WS=88293877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,55:0.39:141
chr4	88293992	rs11375790	G	GA	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=0.228;SC=TATTAAAAGAGAAAAAATACT;SOR=0.555;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=14;WE=88294000;WS=88293982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr4	88295786	rs62319101	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=336;ReadPosRankSum=0.556;SC=TATGTCTGCTAAAAGCCCCAC;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=26;WE=88295794;WS=88295776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr4	88362904	rs13104303	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=433;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CTTATGTTCTCTTCTTTTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=24;WE=88362912;WS=88362894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr4	88401616	rs9933	A	G	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.17;NF=47;NR=52;PP=1939;SC=TTAAGAGAAGATCAATGGGAT;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=99;WE=88401624;WS=88401606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr4	88401735	rs34452129	CTA	C	2019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=1321;SC=TTGTCACTTGCTATAAACTTT;SOR=1.659;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=29;WE=88401744;WS=88401725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	88403823	rs6857504	T	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=194;SC=CTTTCTCAGGTCCCCATTATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=88403831;WS=88403813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	88415636	rs1049544	G	C	6016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=89;PP=2965;SC=ACACTTAAGTGACCATCACTG;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=182;WE=88415644;WS=88415626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr4	88416188	rs13051	G	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=36;PP=1573;SC=ATTTTCTTCAGCTTCAGCCCT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=88416196;WS=88416178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	88416223	rs8342	A	G	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=39;PP=1499;SC=CAGTGTTGTCAGGTGCTACCG;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=88416231;WS=88416213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	88416371	rs17012705	C	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.475;SC=TTATTAGTAGCAATATACTTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=88416379;WS=88416361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	88532182	.	A	AGTGTGT,AGT,AGTGT	424.25	.	AC=2,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=5,5;PP=75,145;ReadPosRankSum=-1.411;SC=TACAAAATGTAGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5,5;WE=88532190;WS=88532172;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.83:12
chr4	88535826	rs200839637	G	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=953;ReadPosRankSum=-2.569;SC=AGTAGTGACAGCAGTGATAGC;SOR=1.140;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=61;WE=88535834;WS=88535816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,85:0.50:171
chr4	88537737	rs2615489	G	A	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=89;PP=2559;SC=AGAAAAACCCGTAAGATTCCT;SOR=1.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=30;TCR=89;TR=119;WE=88537745;WS=88537727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	88577573	rs2615480	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=793;ReadPosRankSum=-0.150;SC=AAAAGTTGAAACTACTTTATT;SOR=0.478;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=44;WE=88577581;WS=88577563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr4	88578310	rs2615479	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=2.287;SC=CATTGCAAATATTGAAACTGC;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=88578318;WS=88578300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	88584148	rs2615498	C	T	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=2389;ReadPosRankSum=0.782;SC=AAGCAGACAGCGAATCCAGTG;SOR=0.664;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=66;WE=88584168;WS=88584138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr4	88584160	rs2615497	G	A	3083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=2389;ReadPosRankSum=0.343;SC=AATCCAGTGAGAGCCTCAACT;SOR=0.397;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=69;WE=88584168;WS=88584138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr4	88584507	rs2627724	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GTCACATAAAGGAGTCTTAGG;SOR=1.312;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=20;WE=88584515;WS=88584497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr4	88732453	rs4693183	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=1.451;SC=CATGAAATGACGGCCTTAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=88732461;WS=88732443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr4	88732531	rs4693878	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.876;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=136;ReadPosRankSum=-0.967;SC=ATATAACAAATAAAGCTACAA;SOR=0.193;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=88732539;WS=88732521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	88732692	rs1054627	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=416;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AGCAGCGGAGGAGACAATGGA;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=28;WE=88732700;WS=88732682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chr4	88732746	rs13144371	A	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=679;ReadPosRankSum=0.278;SC=AATGCAGAAGACACCACAGAG;SOR=0.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=41;WE=88732754;WS=88732736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,43:0.36:121
chr4	88732918	rs1054629	A	T	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1286;ReadPosRankSum=0.433;SC=GCGCCAATGAATACGACAATG;SOR=0.856;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=79;WE=88732926;WS=88732908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,90:0.43:208
chr4	88755828	rs7698623	T	C	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=48;PP=2001;SC=CAATGCTTTGTGGTAAGATAT;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=112;WE=88755836;WS=88755818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	88759690	rs6835632	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.852;SC=ATAATACAACTCAGTGAGAGA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=88759698;WS=88759680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	88767008	rs17013285	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=988;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GGCAGATGCTGTTGATGTCAG;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=60;WE=88767016;WS=88766998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr4	88812956	rs72490258	A	ACATTGCTC	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=473;ReadPosRankSum=-0.951;SC=AAGCAAGCTCACATTGCTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=7;WE=88812964;WS=88812946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr4	88813100	rs3811816	G	A	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.157;NF=51;NR=29;PP=1141;ReadPosRankSum=0.768;SC=CTATTCCAACGAGGAGATTTT;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=105;TCR=60;TR=80;WE=88813108;WS=88813090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,82:0.44:186
chr4	88813126	rs3811817	C	A	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.898;NF=50;NR=40;PP=1462;ReadPosRankSum=0.383;SC=AGGAGTTGATCTCTAATGCTT;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=101;TCR=81;TR=90;WE=88813134;WS=88813116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,98:0.48:206
chr4	88813269	rs71594826	G	GC	3853.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=1.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.708;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,102:0.45:226
chr4	88813270	.	C	CCAAT	2970	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.58;NF=18;NR=42;PP=2970;QD=20;SC=CAGGCATTGGCATGACCAAAG;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=44;TCR=108;TR=60;WE=88813279;WS=88813260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:92,60:0.39:152
chr4	88813271	.	A	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.62;NF=35;NR=42;PP=2962;QD=20;SC=AGGCATTGGCATGACCAAAGC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=95;TCR=106;TR=77;WE=88813279;WS=88813260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:124,77:0.38:201
chr4	88813271	rs35753589	A	AATT	3853.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.780;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,102:0.44:232
chr4	88813503	rs6532031	T	C	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=94;PP=2965;SC=TGCATGCTGATCATGGTGAGC;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=178;WE=88813511;WS=88813493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	88813583	rs3828551	G	A	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.523;NF=23;NR=40;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GAAGAGAGGCGGGTCAAAGAA;SOR=1.157;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=63;WE=88813591;WS=88813573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,76:0.51:149
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chr4	88813872	rs3828553	T	A	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.592;SC=CCAGAAACCATGATGACATCA;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=237;TCF=138;TCR=99;TR=121;WE=88813883;WS=88813862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,143:0.51:279
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chr4	88814048	rs3811818	A	C	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.107;NF=47;NR=64;PP=1930;ReadPosRankSum=-0.479;SC=AAAAAGAACAACATCAAACTG;SOR=0.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=89;TCR=121;TR=111;WE=88814056;WS=88814038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,130:0.54:241
chr4	88814125	rs3811819	C	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.844;NF=23;NR=38;PP=1028;ReadPosRankSum=-1.794;SC=CAATTTTATCCATGGTGTGGT;SOR=0.819;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=61;WE=88814133;WS=88814115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,72:0.43:169
chr4	88814207	rs62315861	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.016;NF=3;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=0.762;SC=AAAGTCATTCGCAAAAACATT;SOR=1.545;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=24;WE=88814215;WS=88814197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr4	88814362	rs3811821	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CTGCTGCGCTGTCACACCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=88814370;WS=88814352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr4	88814665	rs17008718	A	C	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.373;NF=44;NR=27;PP=1173;ReadPosRankSum=-1.669;SC=GAAAGCAAGGAAAAGTTTGAG;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=71;WE=88814673;WS=88814655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,87:0.51:172
chr4	88814683	rs55724168	G	T	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.439;NF=45;NR=30;PP=1098;ReadPosRankSum=0.657;SC=GAGAACCTCTGCAAGCTCATG;SOR=0.980;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=75;WE=88814691;WS=88814673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,94:0.49:190
chr4	88814989	rs2904176	C	T	3450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.150;NF=70;NR=49;PP=2018;ReadPosRankSum=1.909;SC=CTGCTATCTTCGGGCTTTTCC;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=246;TCF=148;TCR=98;TR=119;WE=88814997;WS=88814979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,157:0.51:305
chr4	88815148	rs56105763	G	A	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.924;NF=58;NR=65;PP=2018;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GATGCGTCTCGCATGGAAGAA;SOR=0.934;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=247;TCF=120;TCR=127;TR=123;WE=88815156;WS=88815138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,104:0.48:217
chr4	88815163	rs3061166	A	ATTAGG	9914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=106;PP=2912;SC=GAAGAAGTCGATTAGGAGTTC;SOR=0.702;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=191;TCF=61;TCR=130;TR=162;WE=88815171;WS=88815153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr4	88815439	.	CAAAAA	C	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5006;HP=18;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=19;MQ=55.03;NF=0;NR=3;PP=54;QD=19.0;SC=CGTTTTTATACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=3;WE=88815451;WS=88815429;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr4	88898941	rs11728697	C	T	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=76;PP=2619;SC=AGAATAAAGGCCAAAATAGAG;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=128;WE=88898949;WS=88898931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	88928968	rs1805044	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=0.347;SC=GACCCGGGCCGGCTGATGGCT;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=12;WE=88928976;WS=88928958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr4	88957562	rs17786456	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TTCATTTGGCTTCATCATTTC;SOR=0.337;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=25;WE=88957570;WS=88957552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr4	88959381	rs2725221	G	A	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=24;PP=1887;SC=AACTTTTTCAGAGATGTTTCC;SOR=1.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=88959389;WS=88959371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	89015857	rs2231164	C	T	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=45;PP=1278;SC=TTTTAAATTTCAAGAAGTTTC;SOR=1.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=89015865;WS=89015847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	89016782	rs2231162	A	G	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=40;PP=1221;SC=CAAATACTAAAAGTCAGGCCT;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=89016790;WS=89016772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	89018565	rs2231157	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=370;ReadPosRankSum=0.217;SC=ATGAAGGAAAAAAACAATTCC;SOR=0.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=28;WE=89018573;WS=89018555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,32:0.35:92
chr4	89022362	rs2231153	C	T	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=10;PP=1106;SC=GCCCCGTTCCCAGAACAAAGA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=89022370;WS=89022352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	89028478	rs2231148	T	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=0.685;SC=TAAAAACTTATACACACCATT;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=8;WE=89028486;WS=89028468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	89036384	.	G	GTCTCTCTCTCTCTCTGTC	319	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=64.64;NF=0;NR=7;PP=319;QD=46.1428571429;SC=TATATATTCAGTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=89036392;WS=89036374;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,7:0.47:15
chr4	89300241	rs61978650	C	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=666;ReadPosRankSum=-0.224;SC=GTCAGCTGGGCCGCAGGGGCG;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=47;WE=89300249;WS=89300231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr4	89345594	.	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.251;SC=TTATGCCCCTGCACTCCAGCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=4;WE=89345602;WS=89345584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr4	89378760	rs150387057	C	CG	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=188;ReadPosRankSum=1.611;SC=GGCGGGCAGCCGGGGGTCCGC;SOR=0.813;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=89378768;WS=89378750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr4	89397091	rs7699006	A	G	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=57;PP=1434;ReadPosRankSum=-1.655;SC=AGAATGTCCTATGATGCATAT;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=71;TCR=111;TR=91;WE=89397099;WS=89397081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,102:0.49:208
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chr4	89571260	rs2860420	A	G	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=237;SC=TTTCCTTTGCACCACTCCTGT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=89571268;WS=89571250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	89575324	rs2860427	T	A	5303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=81;PP=2834;SC=GCTGGGGATATGATGGGTGAT;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=140;WE=89575332;WS=89575314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	89576581	rs2282593	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GCATGCACGCCTATGGTGAAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=89576589;WS=89576571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	89577214	rs2972040	A	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=660;SC=TGGAATTTAAAGGTATTTTAA;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=89577222;WS=89577204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	89585235	rs2972018	A	G	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=14;PP=1504;SC=TTACTTTATTATTGATGCTTA;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=89585243;WS=89585225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	89588689	rs3017921	C	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=295;SC=ATTTTTGTATCGATGAATTCA;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=89588697;WS=89588679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	89599421	rs2604227	A	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=378;SC=TTAATCACCTACTTTTGTCAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=89599429;WS=89599411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	89601410	rs17014449	A	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-1.434;SC=TGTCACAATTAAACAGATGGA;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=89601418;WS=89601400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	89607905	rs3737488	A	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=629;ReadPosRankSum=0.777;SC=AAGAGCTTTTAGATTACCCCG;SOR=0.539;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=46;WE=89607913;WS=89607895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,58:0.44:133
chr4	89607932	rs7698491	G	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=876;ReadPosRankSum=0.012;SC=ATGTGGAGGAGACTTTCTGCC;SOR=1.246;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=57;WE=89607940;WS=89607922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr4	89618837	rs710834	T	C	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=1138;ReadPosRankSum=0.544;SC=TTACCTCCTCTGCCGCTGCCT;SOR=1.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=62;WE=89618845;WS=89618827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr4	89625427	rs1804080	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=608;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGAAGAACTGGAAGAGGTAAG;SOR=1.358;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=34;WE=89625435;WS=89625417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr4	89628242	rs2924934	G	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=0.674;SC=TACTGAGCCTGGTTGATGTGT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=89628250;WS=89628232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	89649659	rs9224	A	G	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=10;PP=909;SC=CGCAGCTGCCAGCCCCCTGTG;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=89649667;WS=89649649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	89653257	rs1801915	G	A	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CTTCGAATTGGTCCAGAAAGC;SOR=0.718;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=77;WE=89653265;WS=89653247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,95:0.54:175
chr4	89668210	rs2278877	G	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AGGAAAATGTGTGTGAACATT;SOR=0.296;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=24;WE=89668218;WS=89668200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr4	89668859	rs7657817	C	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=799;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GTGGCTTCAACACTGGGCTTT;SOR=0.642;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=56;WE=89668867;WS=89668849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr4	89669110	rs7658690	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	89669115	rs7658214	A	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	89670155	rs3756050	C	T	5554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=77;PP=2965;SC=TCAGAACCTCCGGATTGGCTG;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=166;WE=89670163;WS=89670145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr4	89671810	rs3217628	A	AGG	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1309;SC=GGGCAGTAAGATCAGGACTGT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=26;WE=89671818;WS=89671800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	89688529	rs17014526	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=0.356;SC=AGGAAAATAATGGAGCTCTTA;SOR=1.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=14;WE=89688537;WS=89688519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr4	89711849	rs2290782	T	C	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=824;ReadPosRankSum=0.491;SC=ACATGTGAAGTGGATCGCAGG;SOR=0.961;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=62;WE=89711857;WS=89711839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
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chr4	89726283	rs2276936	A	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=1.113;SC=TTCTACCTGTAAAAAATGTTG;SOR=0.039;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=89726291;WS=89726273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr4	90756550	rs7681440	C	G	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=738;SC=ATTCACCTACCTACACATACC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=90756558;WS=90756540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr4	90874095	rs3832297	A	AC	828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=754;SC=ATAAGGAAAGAAAAATAAGAT;SOR=2.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=19;WE=90874103;WS=90874085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	91234250	rs1466391	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=0.724;SC=TCTATATCCGACATGTTCATG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=91234258;WS=91234240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr4	91246905	rs9284586	C	G	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=556;SC=TTATTTTATACTTATTTTATG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=91246924;WS=91246895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	91246916	rs9284587	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=437;SC=TTATTTTATGGTGTTGAAATT;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=91246924;WS=91246895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	91321314	rs28572332	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=743;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TATCATACAACTCCTACCCTG;SOR=0.774;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=43;WE=91321322;WS=91321304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr4	91584811	rs6842658	A	T	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=167;SC=ATACTTTATTATTCTTCACAA;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=91584819;WS=91584801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	91584992	rs6842926	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=20;PP=732;SC=ATTGTTACTTATAGGTTCACT;SOR=1.096;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=91585000;WS=91584982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	91585060	rs6843110	A	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=15;PP=557;SC=TTCTAGTTGTATGAAAGTGAA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=91585068;WS=91585050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	91645179	rs62314447	A	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.184;NF=8;NR=21;PP=479;ReadPosRankSum=0.561;SC=TTATAAAAATATTAGGATAGT;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=29;WE=91645187;WS=91645169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr4	91645275	.	G	GT	153	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=23;MQ=61.64;NF=0;NR=7;PP=153;QD=24.8571428571;SC=TCTTAAAATCGTTTTTTTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=91645283;WS=91645265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	91701720	rs2271592	C	T	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=32;PP=1037;SC=AAGACTCTTTCCATCCAGTTC;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=91701728;WS=91701710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	91737018	rs3796673	C	T	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.438;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=2642;ReadPosRankSum=0.569;SC=CAATGCTTGGCCCACGAGTGT;SOR=0.973;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=77;WE=91737030;WS=91737008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,113:0.48:234
chr4	91737022	rs17187511	C	T	2458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.364;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GCTTGGCCCACGAGTGTACTT;SOR=0.436;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=171;TCF=77;TCR=94;TR=95;WE=91737030;WS=91737008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,119:0.52:231
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chr4	91737150	rs17017647	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GTCATGAAAACTATAGATCTT;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=17;WE=91737158;WS=91737140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
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chr4	94180159	rs7687990	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=-1.229;SC=AAGTCAGGAAAATGAGTCTTC;SOR=0.781;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=26;WE=94180167;WS=94180149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr4	94316763	rs1385405	T	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1281;ReadPosRankSum=2.351;SC=TTCAGCTTGGTTGCTGGAATC;SOR=0.645;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=87;WE=94316771;WS=94316753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,96:0.47:205
chr4	94376675	rs6819866	A	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TAAGAAGTCTATGCAGTGTTT;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=13;WE=94376683;WS=94376665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr4	94547357	rs11726506	C	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.050;SC=TTCATCCTGTCTATGTAAATT;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=11;WE=94547365;WS=94547347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr4	95134165	rs10433970	C	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=26;PP=1047;SC=TCCTTTTTTTCTTTGACTTTT;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=95134173;WS=95134155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	95161996	rs2306803	C	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=412;SC=CTTTGTTTTACATTAAATTGA;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=95162004;WS=95161986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	95169587	.	T	G	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1255;ReadPosRankSum=0.168;SC=CTCAGCTGGTTGTTGTCCATC;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=79;WE=95169595;WS=95169577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr4	95169682	rs10034781	G	T	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=70;PP=2742;SC=TTTTGAAATGGTTTCTCCAGA;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=118;WE=95169690;WS=95169672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	95169772	rs7435106	T	A	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=48;PP=1359;SC=TAGGCTTTATTCCATGTTAGC;SOR=1.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=66;WE=95169780;WS=95169762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	95170839	rs11722476	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.48;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	95173779	rs7439869	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=249;SC=ATGCAATATGTATCACAAAGT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=95173787;WS=95173769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	95186055	rs2306802	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=31;PP=824;SC=TTCTAAACCAAAGGTAATCTT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=95186063;WS=95186045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	95197520	rs6823404	C	T	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=56;PP=2896;SC=GTTCTGATGACCGTAGTCTGT;SOR=1.120;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=143;WE=95197528;WS=95197510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr4	95199479	rs35670996	C	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=318;SC=AACTCAGACTCTAATGAGGGA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=95199487;WS=95199469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	95201723	.	G	GTGTTT	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr4	95202492	rs35361491	G	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=341;SC=TAAAGAAGCAGTTTATCACAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=95202500;WS=95202482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	95206252	rs67631469	TTATC	T	3576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=40;PP=2514;SC=ACTTCAATATTTATCTATATG;SOR=1.124;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=45;WE=95206263;WS=95206242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	95255637	rs2289186	T	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TTTATTATTTTTGCTACTTAC;SOR=0.072;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=7;WE=95255645;WS=95255627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	95498617	.	G	GAT	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=33;QD=41.0;SC=CTAAAGTTCTGATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=1;WE=95498625;WS=95498607;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,1:0.11:9
chr4	95503670	rs3857212	G	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=224;SC=TTCATTTTTTGGTCTGTGTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=95503678;WS=95503664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	95503902	rs5013417	T	C	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=53;PP=1746;SC=TAACCAATGATTCACTTTGTA;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=95503910;WS=95503892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	95505975	rs12639887	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=50;SC=ATCTGTGTTTCGTATGGCATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=95505983;WS=95505967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	95508128	rs200385092	G	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr4	95508130	.	A	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=1.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr4	95529430	rs10033359	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=265;SC=GATTACAGAACGGACATCATT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=95529452;WS=95529420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	95529444	rs9307146	C	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=190;SC=CATCATTAACCTATAGACAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=95529452;WS=95529420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	95531417	rs10017461	A	G	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=47;PP=1600;SC=TGAGCAGCGCAGCTGCTACTG;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=95531425;WS=95531407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	95531562	rs10007050	T	C	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=137;SC=ATAGCTCTATTGTGAGCTCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=95531570;WS=95531552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	95539267	rs966845	G	A	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=60;PP=1950;SC=CAGCCTCACAGCTGCAGCTGC;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=95539275;WS=95539257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr4	95561459	rs7690296	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=22;PP=1217;SC=AAACAGCGCTACTTACTCAGG;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=95561467;WS=95561449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	95578588	rs13107595	G	A	5570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=64;PP=2965;SC=GAAGTCATCAGTGCGTTGAAA;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=166;WE=95578596;WS=95578578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr4	96035796	rs10622489	G	GAC	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.941;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=688;ReadPosRankSum=1.220;SC=TTTTCCCCTAGACACACACAC;SOR=2.613;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=14;WE=96035804;WS=96035786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr4	96073956	rs1365691	A	T	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=70;PP=2348;SC=TGGCTGTGACAGACTTCTAAA;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=122;WE=96073964;WS=96073946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	96075965	rs1434536	C	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=641;SC=GACCTCACCTCTCAGGGAGCG;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=96075973;WS=96075955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	96091250	rs2241744	G	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=420;SC=AATAGTTATCGGTCCTGGAGG;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=96091258;WS=96091240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	96091524	rs2241743	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=707;SC=TTATTTCTGAGGACAAAAGCA;SOR=1.312;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=96091532;WS=96091514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	96106322	rs2289043	A	G	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=42;PP=1379;SC=CTGTCCTCCCATCTGTCTCTC;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=96106330;WS=96106312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	96123981	rs3733212	C	T	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=53;PP=1919;SC=TGAGGCGCTTCGCAGCCGCTT;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=96123989;WS=96123971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	96127869	rs2276322	T	G	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=34;PP=1301;SC=TGAGGACGACTGGGCGGGTGA;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=78;WE=96127877;WS=96127859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	96137512	rs995062	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=561;SC=CCTTCCTCATTGGCCTCCTTA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=96137520;WS=96137502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	96166270	rs35120448	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=445;ReadPosRankSum=2.384;SC=CAGACCACTCCGTCCAGGTGG;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=27;WE=96166278;WS=96166260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr4	96169733	rs13118653	G	T	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1401;ReadPosRankSum=0.035;SC=GACAGGACTAGCAGAGTGATC;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=84;WE=96169741;WS=96169723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,97:0.47:208
chr4	96256673	rs1843018	G	A	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=49;PP=2025;SC=ACAGGTTCACGGGCTTATTCT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=96256681;WS=96256663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr4	96469708	rs4699431	A	T	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.14;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	98893437	rs783960	A	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=23;PP=1288;SC=TTACCTGATAATCAGCAGGTC;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=98893445;WS=98893427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	98893476	rs783959	C	T	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=42;PP=1688;SC=CTTTCTGAACCGAGAAGAAAG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=98893484;WS=98893466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	99218108	rs34325900	G	GA	594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=310;ReadPosRankSum=-0.737;SC=ACCATAAAGTGTGCCATACAG;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=9;WE=99218116;WS=99218098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr4	99337881	rs10516430	C	T	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=10;PP=1119;SC=TTATTTTGTTCACGTTGTTCT;SOR=2.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=99337902;WS=99337871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	99399748	rs4303985	G	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=720;SC=TAAGAAGAGGGTTCAACCAAA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=99399756;WS=99399738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	99408106	rs6838913	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=22;PP=601;SC=TAAAGATTATTGCATTTGTCC;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=99408114;WS=99408096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	99579160	rs13111424	C	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=348;ReadPosRankSum=1.345;SC=GCTGGAAAGGCGGAAGGCGAA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=17;WE=99579168;WS=99579150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr4	99802395	rs11729285	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	99808254	rs62323192	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=2.521;SC=AGCGATCGAGGTCACTTCGTC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=99808262;WS=99808244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr4	99824665	rs34445885	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=0.286;SC=GCTAATTCTTTTTTATTTTTA;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=11;WE=99824673;WS=99824655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
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chr4	99918661	rs10035037	A	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=0.047;SC=GGGACCTGAAATTAAGAAACA;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=28;WE=99918669;WS=99918651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
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chr4	99996252	rs28730627	GAAC	G	1223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.391;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.170;NF=0;NR=20;PP=788;ReadPosRankSum=-1.000;SC=ATTTTCCTGAGAACAACTGCT;SOR=1.248;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=20;WE=99996262;WS=99996242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr4	100000911	rs35123946	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-1.446;SC=CAAGGAGTTAGGTTATCTCCT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=100000919;WS=100000905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr4	100001247	rs1154412	T	C	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=265;SC=ATATTTACAGTAAGAGACACT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=100001255;WS=100001237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr4	100003333	rs28730595	A	G	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=818;ReadPosRankSum=0.333;SC=TACAGATACAAGAAAAGTCAT;SOR=0.353;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=58;WE=100003341;WS=100003323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr4	100006645	rs1154410	A	G	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=539;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GCATATGCAAAAGCAGGTTAA;SOR=0.812;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=36;WE=100006653;WS=100006635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,56:0.58:96
chr4	100009738	rs1154401	G	C	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=24;PP=1381;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GCCAGATCCCGTCTTGGGCGC;SOR=0.999;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=188;TCF=123;TCR=65;TR=79;WE=100009746;WS=100009728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,106:0.43:246
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chr4	100021253	rs2851278	G	C	95.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGATTATGCAGTAAACATAGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=100021261;WS=100021243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	100045500	rs1042365	T	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TTGTTTAAACTCATGGCTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=100045508;WS=100045490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	100045574	rs1042364	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=-1.110;SC=GATAGTATTCTGAATTGCTCC;SOR=1.127;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=20;WE=100045582;WS=100045564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr4	100045616	rs1126673	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=314;ReadPosRankSum=0.313;SC=ATTGTTCGGACGCTGTTAATA;SOR=0.556;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=23;WE=100045624;WS=100045606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr4	100045647	rs2602894	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=301;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ATTAATAAGTATAATTTTCAT;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=21;WE=100045655;WS=100045637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr4	100047812	rs1126672	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=389;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TGGGTCACCAGTGCATCCAGA;SOR=0.542;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=30;WE=100047820;WS=100047802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,32:0.35:91
chr4	100048327	rs9307234	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=10;PP=1271;SC=ACTAGGAAAAGAATTTAAAGC;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=100048335;WS=100048317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	100048414	rs1126671	T	C	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TCTGGAAAAATAGTCAATCCT;SOR=0.786;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=70;WE=100048422;WS=100048404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,88:0.51:172
chr4	100048506	rs6836440	G	A	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.36;SOR=1.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	100048506	.	GCAT	ACAC,ACAT	755	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9,25;NR=28,60;PP=714,755;QD=20.7423749963;SC=CTGTGATGGAGCATAAAAGAA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=37,85;WE=100048517;WS=100048496;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:85
chr4	100048509	rs6813415	T	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.750;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr4	100052733	rs1126670	C	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.772;NF=15;NR=7;PP=291;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CTTCCTGGATCGGTTTATGTA;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=22;WE=100052741;WS=100052723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr4	100052963	rs35019093	C	CT	587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.057;NF=1;NR=14;PP=411;ReadPosRankSum=0.080;SC=GCCAGTCCCACTTTTTTTCTT;SOR=0.509;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=15;WE=100052971;WS=100052953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
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chr4	100064166	rs5860566	G	GA	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=1.645;SC=TTTATTTCTTGAAAAAAAAAC;SOR=0.223;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=100064174;WS=100064156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr4	100064247	rs2032348	G	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=846;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ATAGATTTATGGAGTTTGAAT;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=22;WE=100064255;WS=100064223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr4	100064305	rs4699715	C	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=21;PP=1358;SC=TTTGAAATCACCTCTGAATTA;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=57;WE=100064313;WS=100064295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	100064326	rs3919370	A	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=238;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CCTGAGTCAGATAATTGCTGG;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=21;WE=100064334;WS=100064316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr4	100065509	rs1800759	T	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TCCAATCACTTCCTTTTCTCC;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=14;WE=100065517;WS=100065499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr4	100128753	rs4147545	T	C	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=46;PP=1520;SC=TAGAAAGTGATGCAATACAGT;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=100128761;WS=100128743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	100131163	rs6833176	G	C	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=11;PP=1707;SC=TATGATAAGAGATGACAAAGA;SOR=2.891;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=72;WE=100131171;WS=100131153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	100134713	rs5860571	A	AT	3662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=29;PP=2521;SC=CATTTTCTCGAGTTGGTTCCA;SOR=1.280;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=54;WE=100134721;WS=100134703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	100140306	rs4699735	A	T	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=60;PP=2567;SC=CCTGTAGTACACATGCTGATT;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=124;WE=100140314;WS=100140296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	100200509	rs3819197	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=569;SC=CATCCTTCCACCTTTTCATTT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=100200517;WS=100200499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	100231342	rs10033960	G	A	307.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=-1.348;SC=GAAAATGTAAGACAAACATTT;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=100231350;WS=100231332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr4	100235053	rs1789882	A	G	10169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=203;PP=2965;SC=GCACTTCCTGAATGGGTTTCT;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=370;TCF=167;TCR=203;TR=370;WE=100235061;WS=100235043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr4	100235140	rs2018417	C	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.366;NF=51;NR=66;PP=1914;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TGATGTCCACCGCAATGATTC;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=284;TCF=118;TCR=166;TR=117;WE=100235148;WS=100235130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,89:0.32:280
chr4	100239319	rs1229984	T	C	7103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=91;PP=2965;SC=GTCATCTGTGTGACAGATTCC;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=122;TCR=91;TR=213;WE=100239327;WS=100239309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr4	100240064	rs55963727	A	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=363;ReadPosRankSum=0.881;SC=AAACAGAGAGATGGTGACAGT;SOR=0.931;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=28;WE=100240072;WS=100240054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr4	100258007	rs1612735	T	C	4826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=86;PP=2898;ReadPosRankSum=-2.272;SC=GTCCAAGGAGTATTTGAGGTG;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=365;TCF=196;TCR=169;TR=176;WE=100258015;WS=100257997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,224:0.50:445
chr4	100258054	rs1693453	C	A	9381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=170;PP=2965;SC=CAGCCACTCCCTTCCCATCCC;SOR=1.126;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=113;TCR=170;TR=283;WE=100258062;WS=100258044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr4	100258155	rs1614972	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=718;ReadPosRankSum=0.202;SC=TCAAAACCTCCTGAGTATGCC;SOR=2.529;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=33;WE=100258163;WS=100258145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr4	100260669	rs5860576	GCCC	G	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=-2.015;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.895;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	100260681	rs1975438	C	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.923;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;MQRankSum=-1.195;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.340;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr4	100260789	rs698	T	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.383;NF=44;NR=24;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AAAGGTAAAATATTTGTTATT;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=68;WE=100260797;WS=100260779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,87:0.62:141
chr4	100263834	rs1693481	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=478;ReadPosRankSum=2.061;SC=AAAAAGATGACGGGAAATTTC;SOR=0.501;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=24;WE=100263842;WS=100263824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
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chr4	100266112	rs1693425	C	T	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.213;NF=29;NR=60;PP=1610;ReadPosRankSum=0.046;SC=CAATTTTGGCCACTGCATTCT;SOR=1.021;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=185;TCF=67;TCR=118;TR=89;WE=100266120;WS=100266102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,99:0.47:211
chr4	100266133	rs2241894	T	C	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.029;NF=24;NR=53;PP=1193;ReadPosRankSum=0.989;SC=CATCCACCACTGTGTACTGGG;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=148;TCF=48;TCR=100;TR=77;WE=100266141;WS=100266123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr4	100266330	rs1693426	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=651;ReadPosRankSum=2.241;SC=AGCATCAGAAACTTACTCATT;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=39;WE=100266338;WS=100266320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr4	100266371	rs1789915	A	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.034;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=567;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CTGGGTTTTTACAAATTCTGC;SOR=0.424;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=35;WE=100266379;WS=100266361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr4	100266583	rs1662053	A	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.967;SC=CTGCCAAGGCATTGTTTTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=100266591;WS=100266573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	100268190	rs283413	A	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1241;SC=ACCCCTTCTCAAACACTTTCC;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=100268198;WS=100268180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	100269202	rs1789921	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-1.331;SC=AAGATAAACAGAGTTAAGTAC;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=100269210;WS=100269192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	100334271	.	C	T	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1679;ReadPosRankSum=2.714;SC=CTCCAGTTCACCATGACAACA;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=102;WE=100334279;WS=100334261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,123:0.56:220
chr4	100341643	rs1154460	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=447;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CCTTGTGCATGTCTAATAACT;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=29;WE=100341651;WS=100341633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr4	100356179	rs1154469	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=697;ReadPosRankSum=1.700;SC=CTATTTCCAACTTACCCCTGC;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=47;WE=100356190;WS=100356169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr4	100356337	rs1154470	G	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=961;ReadPosRankSum=-0.569;SC=ACATCATTAGGTCATGATGAG;SOR=0.717;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=55;WE=100356345;WS=100356327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr4	100443561	rs13142939	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=-0.116;SC=ATTTAATGATATTTGGTTGGG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=100443569;WS=100443551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	100443720	rs13143848	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=311;ReadPosRankSum=0.350;SC=ACATTGTGGGGAGTTGGCCAG;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=25;WE=100443728;WS=100443710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr4	100443782	rs13119384	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr4	100443782	.	TCC	CCG	498	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=9;PP=498;QD=36.7645249908;SC=CAGTTACCCCTCCAGCACTGC;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=15;WE=100443792;WS=100443772;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,15:0.34:44
chr4	100443784	rs61732380	C	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr4	100443800	rs17029087	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TGCAGTCCAGGAGAGCCCTGT;SOR=0.484;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=14;WE=100443808;WS=100443790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr4	100445589	rs35080520	T	TC	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.586;SC=AGAAACACTCTATCTATTTCA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=100445597;WS=100445579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr4	100445763	rs61598233	GCTAT	G	1030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=747;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GCTATTTACTGCTATCTATTT;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=14;WE=100445774;WS=100445753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr4	100451127	rs45440196	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=51;PP=1248;ReadPosRankSum=1.096;SC=TAAGTATCAGGTTTATCAAAT;SOR=0.763;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=23;TCR=88;TR=65;WE=100451135;WS=100451117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr4	100451197	rs2089079	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=193;ReadPosRankSum=0.487;SC=ATCCTTAAAACTCTTAAATGA;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=100451205;WS=100451187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr4	100457117	rs111869659	A	ACAGT	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TTTTCTTCTAACAGGCCACTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=3;WE=100457125;WS=100457107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	100457344	rs10019266	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GGAGGTATTACCGGGTCAGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=100457352;WS=100457334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	100478624	rs3817083	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=476;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TGTCTATGGCCATTCTATGAT;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=29;WE=100478632;WS=100478614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr4	100485244	rs11944749	G	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.029;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=786;ReadPosRankSum=1.111;SC=CGGCCATTTCGAACCCGCAAT;SOR=1.518;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=16;WE=100485263;WS=100485234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr4	100485255	rs11944752	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=786;ReadPosRankSum=0.645;SC=AACCCGCAATGGAAGAAAGGG;SOR=1.301;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=17;WE=100485263;WS=100485234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr4	100491772	rs11933337	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=297;ReadPosRankSum=-1.040;SC=CCAGAACCTGTGATAGTCTAA;SOR=0.730;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=15;WE=100491780;WS=100491762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr4	100495817	rs1800804	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGTTTCCTCATTGGGTGAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=100495825;WS=100495807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	100504664	rs3816873	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.773;SC=CTTCATCTAATCCATGGAAAG;SOR=0.913;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=67;WE=100504672;WS=100504654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,75:0.52:143
chr4	100513027	rs148536190	TTG	T	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.125;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
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chr4	100543745	rs2255119	A	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=1019;ReadPosRankSum=0.394;SC=TGGAACAGAAACTTCAAGTAC;SOR=0.625;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=48;WE=100543753;WS=100543735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr4	100570681	rs4699384	T	A	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=716;ReadPosRankSum=0.493;SC=TCTGCCACCATTGGGGAGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=47;WE=100570689;WS=100570671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,55:0.43:129
chr4	100757051	.	TAAA	T	562.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.898;NF=0;NR=9;PP=644;ReadPosRankSum=-1.637;SC=GATGAGGGTGTAAAACAACAT;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=100757063;WS=100757041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr4	100757055	.	A	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.43;MQRankSum=0.898;NF=2;NR=9;PP=643;ReadPosRankSum=-1.277;SC=AGGGTGTAAAACAACATTCCT;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=100757063;WS=100757041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr4	101337130	rs13122163	A	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.832;SC=TTTGAAAAAAAAAACATGAAA;SOR=0.490;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=12;WE=101337138;WS=101337120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr4	101337150	rs4699401	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=0.266;SC=ATTAACACCACAGTAATCAGC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=12;WE=101337158;WS=101337140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr4	101338217	rs3733437	T	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=630;ReadPosRankSum=-0.850;SC=AGAGTAACAATAATTTTCACT;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=40;WE=101338225;WS=101338207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr4	101368559	rs13111099	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TTTCTAAACATTTTATTTGTG;SOR=1.589;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=12;WE=101368567;WS=101368549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr4	101368633	rs34694128	T	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=248;ReadPosRankSum=-0.413;SC=ATTTGTTTTATTCTTGAGATT;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=18;WE=101368641;WS=101368623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr4	101368661	rs1157180	A	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=200;ReadPosRankSum=0.237;SC=TGAAAATACTAAGAGAGAGAC;SOR=0.857;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=14;WE=101368669;WS=101368651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr4	101401015	rs34509011	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTGATGTATATACATACTACT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=101401023;WS=101401005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	101953322	rs2851060	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=411;ReadPosRankSum=0.822;SC=GAAGAAGAACCGAAGACCAAG;SOR=0.903;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=24;WE=101953330;WS=101953312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr4	102092507	.	C	CA	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=62.13;NF=0;NR=4;PP=60;QD=15.75;SC=ACAATTCTTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=102092515;WS=102092497;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr4	102171591	rs2583404	T	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=658;SC=ATTTAATAGATTATTGTTATG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=102171599;WS=102171581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	102171606	rs2850958	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=356;SC=GTTATGTTACATAGAAAGGAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=102171614;WS=102171596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	102267821	rs2850327	AA	CG	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GGAGGGGAGGAAAGGCGAGGC;SOR=1.390;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=42;WE=102267830;WS=102267811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr4	102642453	rs10856962	T	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=2;PP=1141;SC=TTGAATTTTTTAATTGTCTTA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=102642461;WS=102642443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	102642526	rs12506517	T	C	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=35;PP=1982;SC=TACAGTAGTCTCTGCTTATCC;SOR=1.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=102642534;WS=102642516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	102791905	rs10516483	C	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=311;ReadPosRankSum=-1.590;SC=GATTGAATAACAGTGAATTAC;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=16;WE=102791913;WS=102791895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
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chr4	103458888	rs3830689	TCA	T	535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=549;SC=GAGCCCTCTTTCACAGTTTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=103458897;WS=103458880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	103505784	rs10711129	CA	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.776;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.730;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr4	103514741	rs4648050	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=0.074;SC=AAAATACTTATTCTTCCTAAA;SOR=1.473;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=12;WE=103514749;WS=103514731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr4	103533821	rs4648110	T	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=0.065;SC=TGTTAACATCTCTGGCCAGGG;SOR=0.765;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=103533829;WS=103533811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr4	103534560	rs3817685	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GAACATGCTCCTCCTTCCTTT;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=12;WE=103534568;WS=103534550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr4	103553447	rs5860729	GA	G	921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=2;NR=25;PP=478;SC=GCCTGAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.949;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=103553455;WS=103553436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	103553543	rs735403	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	103555992	rs2272697	A	G	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=10;PP=1206;SC=GGTGAGGACAAGAAGTGGTAG;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=103556000;WS=103555982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	103556316	rs909349	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.28;NF=7;NR=31;PP=746;SC=TAAGAGACTATGAAACCTGAG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=103556324;WS=103556306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	103556367	rs11436517	G	GT	443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=11;PP=457;SC=ATGTGACTAAGTAACTTCTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=103556375;WS=103556357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	103557077	rs2866413	G	A	5214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=67;PP=2918;SC=GATATAGAACGTGTTTTCATT;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=152;WE=103557085;WS=103557067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr4	103557192	rs4547797	C	T	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=79;PP=2729;SC=TGTCAGGAGACGGCAAGGTCA;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=137;WE=103557200;WS=103557182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	103557219	rs2866414	C	T	3342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=67;PP=2188;SC=CAGAGAGGCACTGTCCAATGG;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=104;WE=103557227;WS=103557209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	103557251	rs10027437	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=46;PP=1442;SC=GTGGCTCATCGGGGTTCTAAG;SOR=1.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=67;WE=103557259;WS=103557241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	103557311	rs4496586	G	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=683;SC=CCATGTTTGTGAAGCGCTCTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=103557319;WS=103557301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	103571871	rs34754408	G	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.616;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=45;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.232;SC=TTCAAATAAAGAATAAGAATT;SOR=1.085;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=114;TCF=28;TCR=86;TR=56;WE=103571879;WS=103571861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr4	103610872	rs227365	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TCACTCTAATATGTCATATTT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=24;WE=103610880;WS=103610862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr4	103645082	rs6857760	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=412;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TTTTTGAAACCGTATCCACTC;SOR=0.573;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=34;WE=103645090;WS=103645072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr4	103719893	rs223437	G	A	341.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=238;SC=TTGCCATGCAGTACTTTCAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=103719914;WS=103719883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	103719906	rs223436	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=370;SC=CTTTCAAGCAATAACGGCTAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=103719914;WS=103719883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	103722873	rs57915035	CCT	C	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACCACAACCCCCTGCCTCCTC;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=103722882;WS=103722863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr4	103730179	.	T	TA	66	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=57.98;NF=2;NR=3;PP=66;QD=13.8;SC=CTTAGCAAGTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=5;WE=103730187;WS=103730169;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,5:0.42:12
chr4	103732704	rs201561589	T	TG	146.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=51;SC=CCACGCATAGTGCACACGCCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=103732712;WS=103732698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	103732845	rs223414	A	C	546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	103732866	rs223413	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=159;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GCTGAACGTACTCATATACAA;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=10;WE=103732874;WS=103732856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr4	103747541	rs2023532	G	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.405;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1475;ReadPosRankSum=1.517;SC=TGATCCAAGAGGTATTTTCAG;SOR=0.980;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=89;WE=103747549;WS=103747531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,105:0.54:193
chr4	103789782	rs2198199	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=0.841;SC=ATACTCATGGGCGAGTATGCA;SOR=0.096;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=103789790;WS=103789772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr4	103789810	rs223333	C	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=611;SC=GGCCACAGCACCCAAACTGTA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=103789818;WS=103789800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	103790186	rs223332	G	T	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=4;PP=602;SC=GCGCAGGCGCGGCAGCTTGGC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=103790194;WS=103790176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	103806308	rs35282200	CTA	C	3892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=19;PP=2801;SC=AAGGATGAAACTAGACATGCT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=56;WE=103806317;WS=103806298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	103833295	.	GAA	G	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=18;MQ=43.01;NF=0;NR=2;PP=33;QD=19.0;SC=ACCTCCAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=103833304;WS=103833285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	103866480	rs3974494	G	A	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=68;PP=2322;SC=CTCAAAGCCTGAAACACAAAA;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=103866488;WS=103866470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	103911069	rs2715591	C	A	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=10;PP=413;SC=TAGTTTCTTCCTGTGCAGTAT;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=22;WE=103911077;WS=103911059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	103911159	rs7672319	A	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=13;PP=412;SC=TATGAATGAAATAAACCACCA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=103911167;WS=103911149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	103911222	rs6533051	C	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=172;SC=ATCACAGATACAAAAGAAGAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=103911230;WS=103911212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	103964529	rs2276976	A	C	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1106;ReadPosRankSum=0.872;SC=AGGGAAACCAAAATGCACACT;SOR=0.725;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=70;WE=103964537;WS=103964519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr4	104000973	rs12504262	G	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=373;ReadPosRankSum=-1.075;SC=GCTGTATTTTGAAATTTTCCT;SOR=1.035;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=25;WE=104000981;WS=104000963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr4	104003148	rs2306478	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.328;SC=ATATATGCCACAAACTCTCTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=104003156;WS=104003141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	104003993	rs56412006	A	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=785;ReadPosRankSum=0.120;SC=ATTTATTAACAAAAGGTTTAA;SOR=0.888;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=101;TCF=77;TCR=24;TR=48;WE=104004001;WS=104003983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr4	104013040	rs12506157	G	C	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=686;ReadPosRankSum=0.575;SC=ACAAGTGTCTGAACATCTCAG;SOR=0.375;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=37;WE=104013048;WS=104013030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr4	104013796	rs1054707	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=251;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CTCAACTTCATTGGCAAACTG;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=16;WE=104013804;WS=104013786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr4	104016200	rs7668568	C	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=232;ReadPosRankSum=0.215;SC=AGATTTTTGTCTATAGGTTCA;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=16;WE=104016208;WS=104016190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr4	104017293	rs56173334	G	A	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=726;ReadPosRankSum=0.194;SC=AATTCAATATGTCAAGAGTTA;SOR=1.512;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=48;WE=104017301;WS=104017283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr4	104061266	rs7686105	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=2;PP=21;SC=AAGTTAGAATGTAAGCAGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=104061274;WS=104061256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	104061845	rs3052340	CTTA	C	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.623;NF=6;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CAGATAGTGCCTTATTATTGG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=104061855;WS=104061835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	104061993	rs1381657	C	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=400;ReadPosRankSum=0.882;SC=TTCTTGCAGGCTTTCCTTGAG;SOR=0.809;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=27;WE=104062001;WS=104061983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr4	104062223	rs1381658	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.447;SC=CTTTTTTTAACGTAATAAGTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=104062231;WS=104062213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr4	104066890	rs2169508	T	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=1.287;SC=TATAACTATTTTGTTGTAATT;SOR=0.864;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=7;WE=104066898;WS=104066880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
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chr4	104104239	rs3765086	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.361;SC=AATCATATGTATAAGTTTTTG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=104104247;WS=104104229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	104510766	rs2765	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=-1.423;SC=GACAGGACTGGTAAATAGGAG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=104510774;WS=104510756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr4	106154990	rs71971966	TATAGATAG	T	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=284;ReadPosRankSum=-0.923;SC=TTAGTATTTTTATAGATAGAT;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=4;WE=106155005;WS=106154980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr4	106196951	rs2454206	A	G	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.311;SC=ACCTTCTCACATAATCCATAA;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=172;TCF=73;TCR=99;TR=94;WE=106196959;WS=106196941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,101:0.55:184
chr4	106290829	rs16345	A	ACTTGGGGAAAAAGAGT	4243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.130;NF=12;NR=28;PP=2954;ReadPosRankSum=0.020;SC=TGTCTCTAGCACTTGGAGTCC;SOR=0.508;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=40;WE=106290837;WS=106290819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,101:0.44:228
chr4	106292121	rs2726526	G	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=263;SC=AATTATAGAAGAAAGTTTACA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=106292129;WS=106292111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	106317370	rs145622118	T	TATAAA	86.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=197;SC=TACCAATTAATATAACATTAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=106317378;WS=106317360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	106317429	rs13787	C	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=200;SC=CTCCATTACACTTCTTCATAA;SOR=1.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=11;WE=106317437;WS=106317419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	106317498	rs34331553	CCAAA	C	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=8;PP=808;SC=AAGCCTAGCTCCAAACAAACA;SOR=1.255;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=16;WE=106317509;WS=106317488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	106320399	rs1490593	G	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=397;SC=TTGGACTGAGGGAGCCAGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=106320407;WS=106320389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	106320446	rs1490594	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=302;SC=ACAATTGATTGTGATACCTAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=106320454;WS=106320436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	106359209	rs2713862	T	A	632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=654;SC=ATTTTTTTTTTAAAAAAAAGC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=106359217;WS=106359199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	106377533	rs113587818	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=0.685;SC=ATCCACAAACGTTAGCTGATT;SOR=1.432;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=13;WE=106377541;WS=106377523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr4	106395181	rs4699179	G	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=674;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GGGCACCCGTGCGCAGCAGCC;SOR=0.288;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=99;TCF=18;TCR=81;TR=42;WE=106395189;WS=106395171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr4	106474078	rs10032241	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=0.922;SC=CCTTGAGGAGGAGCCAATCTG;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=19;WE=106474086;WS=106474068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr4	106474096	rs6533206	T	C	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=796;SC=CTGACAGGACTGAATACAACC;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=106474104;WS=106474086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	106510470	rs2276970	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=641;ReadPosRankSum=1.149;SC=AGAGCATCATATGAAGAGGAT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=45;WE=106510478;WS=106510460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr4	106848314	rs4546247	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=494;SC=ACATACATAACACATGTGTGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=106848322;WS=106848313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	106848703	rs10856978	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=294;SC=TGTGAGCTGCCATTTTGCTGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=106848711;WS=106848693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	106859549	rs35132891	G	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=0.443;SC=CTGGCCTGCAGCTGGCTCCTG;SOR=2.631;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=14;WE=106859557;WS=106859539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr4	106861557	rs4627867	A	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=22;PP=917;SC=ATCTGCCAATATTATGTAGAT;SOR=1.547;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=34;WE=106861565;WS=106861553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	106861730	rs4340795	A	G	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=57;PP=2524;SC=ATGTTATAACATACGTGGGTC;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=129;WE=106861738;WS=106861720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	106888263	rs4597836	A	C	30.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr4	106891531	rs6817700	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.298;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=340;ReadPosRankSum=0.540;SC=ATTTTCTGCTATTTTTGCCAG;SOR=0.213;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=25;WE=106891539;WS=106891521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr4	106892210	rs4449421	T	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=355;SC=TTTCTTCATGTTAAAGGTATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=106892218;WS=106892200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	106924931	rs17258724	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=337;ReadPosRankSum=-0.172;SC=ACAAGGTGTAGTTCTCCATGT;SOR=0.470;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=23;WE=106924939;WS=106924921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr4	107154273	rs13138528	T	C	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=769;SC=TAATCAGCAATAAACCCTTAA;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=107154281;WS=107154263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	107156365	rs7668276	C	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=14;PP=1429;SC=GGAAAGCACTCTCCTTCTCCA;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=107156373;WS=107156355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	107157795	.	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTAATAAACCAAAACCTCAGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=107157803;WS=107157785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	107165685	.	TA	T	91	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=91;QD=16.1666666667;SC=ACAACCAATTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=107165693;WS=107165675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,6:0.67:9
chr4	107168431	rs3775091	G	C	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=65;PP=2244;SC=TTCATTAATTGATCTGGGGTT;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=100;WE=107168439;WS=107168421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	107172377	rs13113845	C	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=877;SC=ATTAACTGTACATATACCACA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=107172385;WS=107172367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	107845794	rs17037102	C	T	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=733;ReadPosRankSum=-0.574;SC=ATCTCTGTGCCGAGTACCATC;SOR=0.619;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=50;WE=107845802;WS=107845784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,51:0.45:113
chr4	107956446	rs73837553	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=0.212;SC=GAATGTTGCAAGATGCAATGG;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=19;WE=107956454;WS=107956436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr4	108048977	rs2158182	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=260;ReadPosRankSum=0.569;SC=GCAAGATGTAAGGCTGAAGGC;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=21;WE=108048985;WS=108048967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr4	108535335	rs9569	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=118;ReadPosRankSum=-2.647;SC=CAAAGAAATGCCAACAGAGAC;SOR=0.792;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=11;WE=108535343;WS=108535325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr4	108535641	rs5860872	GA	G	151.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CAAACTTAATGAAAAAAAAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=108535649;WS=108535631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	108553048	rs3756270	G	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=0.578;SC=AGGTAACTTTGCTTTTATGAC;SOR=0.976;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=27;WE=108553056;WS=108553038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr4	108575989	rs3733633	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=619;ReadPosRankSum=-1.190;SC=CTGTACAGCCGTCCAGCCTCT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=48;WE=108575997;WS=108575979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr4	108581002	rs11291153	GC	G	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=371;SC=CAACATCTTTGCCCCCCCAGC;SOR=1.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=14;WE=108581010;WS=108580992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	108608100	rs45502094	CTCTAACACT	C	1472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=2965;SC=CTCCAAGTCACTCTAACACTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=20;WE=108608116;WS=108608090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	108615226	rs371693146	CT	C	1826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=53;PP=1086;SC=TGTAGTAATACTTTTTTTTTC;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=54;WE=108615234;WS=108615216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	108622241	rs17510783	C	T	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=32;PP=2118;SC=GAACAGAGCTCAAAATTTAAA;SOR=1.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=108622249;WS=108622231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	108622475	rs13110240	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=37;PP=994;SC=TTCTAGTTTACATGAGTCCTT;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=108622483;WS=108622465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	108641169	rs2074372	C	G	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=6;PP=978;SC=CCTCCGCGCTCCTGGAAGGAT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=108641177;WS=108641159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	108641300	rs973126	T	C	5240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=73;PP=2965;SC=TATTGCTCAGTTTGACTTTCT;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=149;WE=108641308;WS=108641290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	108641317	rs1127006	G	A	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=77;PP=2750;SC=TTCTTGCACAGGCTCCCGGGG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=145;WE=108641325;WS=108641307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr4	108641437	rs2074374	C	G	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=726;SC=GGGGCCTCCTCGCGTCGGAGC;SOR=3.442;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=108641445;WS=108641427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	108641464	rs1319253	AA	GC	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=609;SC=GCGCTGACTTAAGCACGCGCC;SOR=2.419;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=108641473;WS=108641454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	108866188	.	C	G	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=817;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TCATTCAACTCTTCGTCATTT;SOR=0.583;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=54;WE=108866196;WS=108866178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr4	108926170	rs3775973	T	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=455;SC=ATGTTTATTTTATACTGTAAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=108926178;WS=108926160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	108931039	rs4956145	T	C	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=68;PP=2251;SC=GCAGAAAACCTTAAGGTAATT;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=113;WE=108931047;WS=108931029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr4	108935770	rs7677408	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=25;PP=415;SC=ACAATCTTCTTTTTTTTTTTT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=41;WE=108935778;WS=108935758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	108935871	rs4956147	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=134;SC=ATATTGTGTAGTGGTGAAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=108935879;WS=108935861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	108944579	rs4956032	C	T	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=26;PP=1665;SC=ACCATTCTACCGAAGTTGCTT;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=108944587;WS=108944569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	108944821	rs4956033	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=793;SC=AAAGAAGGAGCATTGTATACT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=108944829;WS=108944811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	108944846	rs4956034	A	G	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=520;SC=GCTTGTCCACATGCTGTAAAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=108944854;WS=108944836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	108969590	rs4245927	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=635;SC=CGCAGATATGAGGGGAGAAAA;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=108969598;WS=108969580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	108985388	rs4613638	A	G	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=37;PP=2386;SC=AAAGCATCATAAGTTACAGTC;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=108;WE=108985396;WS=108985378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	108991979	rs2276335	C	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=796;SC=ATAGCAATAGCATATTTTATG;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=108991987;WS=108991969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	108999300	rs4956156	G	T	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=14;PP=1944;SC=ACCTGATATGGGATTAAATTG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=71;TCR=14;TR=85;WE=108999308;WS=108999290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	108999366	rs4956157	G	A	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=67;PP=2965;SC=CACATGACTCGGCTACTTACC;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=106;TCR=67;TR=173;WE=108999374;WS=108999356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr4	109000536	rs6819640	T	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=306;SC=CAGAGGTGCATTGAGTTTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=109000544;WS=109000526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	109002986	rs7681524	T	C	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=134;SC=TCCCCTTCCTTACCCTCCACC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=109002994;WS=109002976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	109010207	rs16996935	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=13;NR=4;PP=372;SC=GGCATCTGGAAGGTCACTCAG;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=109010215;WS=109010197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	109461985	rs17583662	A	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=867;ReadPosRankSum=-0.050;SC=AAGGCAGAGAAATAAAATGTC;SOR=0.372;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=51;WE=109461993;WS=109461975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr4	109478108	rs11731416	C	G	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1138;ReadPosRankSum=1.858;SC=TATTCATTTTCATTGATGGCT;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=60;WE=109478116;WS=109478098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,85:0.59:143
chr4	109541499	rs7677415	C	T	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.049;NF=27;NR=34;PP=899;ReadPosRankSum=-0.044;SC=GCGTTTGTTTCCACAGCGATT;SOR=0.872;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=61;WE=109541507;WS=109541489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr4	109541603	rs3796936	T	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-2.898;SC=AACGTGGTGGTTCCCTGCATC;SOR=0.446;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=9;WE=109541624;WS=109541593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr4	109541616	rs3796935	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=269;ReadPosRankSum=-1.631;SC=CCTGCATCTCTGCCCACGTCG;SOR=0.551;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=8;WE=109541624;WS=109541593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr4	109541661	rs3796934	T	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=0.417;SC=ACACGGATACTCTCTCTCTGA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=109541669;WS=109541651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	109576843	rs2851380	G	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=41;PP=1334;SC=ATGATTTGGTGGTGGGAAAGA;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=73;WE=109576851;WS=109576833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	109588238	rs2851374	G	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=201;SC=GGTGAGGGGGGCAAAATATGA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=109588246;WS=109588228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	109664819	rs6533381	T	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=434;SC=CAACAATAAGTGAACCTAATA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=109664827;WS=109664809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	109683422	rs72666462	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GGAGAGCAAGTTGGGTAAGAG;SOR=2.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=14;WE=109683430;WS=109683412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr4	109735133	rs2305436	T	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=25;PP=643;SC=TTAGTAGTCTTGAATTAAAAT;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=109735154;WS=109735123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	109735146	rs2305435	T	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.61;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	109735209	rs11733727	T	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=153;SC=GCCAACTGACTGGCTATCAAT;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=109735217;WS=109735199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	109748227	rs13104307	C	T	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=37;PP=1612;SC=AAGGGTTAACCGTGTCAGTGA;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=82;WE=109748235;WS=109748217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	109759469	rs4956063	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=690;SC=TTGTCTTGCACGAAACATTAA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=109759477;WS=109759459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	109762918	rs11942576	C	A	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=35;PP=1132;SC=GAATTGATTCCCTGTTTCCCA;SOR=1.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=109762926;WS=109762908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	109766177	rs10015534	G	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=468;SC=TATACTTTGTGTATCACTGTG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=109766185;WS=109766173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	109766290	rs11098004	T	G	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=42;PP=2153;SC=GTAAGTAACATGTCAGTGTGT;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=107;WE=109766298;WS=109766280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	109767453	rs5860952	C	CA	6882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.206;NF=11;NR=101;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.836;SC=AACAGAATTCCGATCAATTTC;SOR=1.227;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=13;TCR=104;TR=112;WE=109767461;WS=109767443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,173:0.99:174
chr4	109769844	rs13130308	C	T	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=747;SC=GACATTTTGGCTTCAAACCTA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=109769852;WS=109769834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	109769899	rs13135591	C	T	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=22;PP=1547;SC=TAATAGTATACATCTTTGAAA;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=72;WE=109769907;WS=109769889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	109782249	rs13133634	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=286;SC=TGAAAAACAACAGCAACCACC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=109782257;WS=109782239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	109790373	rs142515007	TAAATA	T	430.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=-0.917;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	109790377	rs72533223	TA	T	207.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.187;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.496;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr4	109811003	rs12641411	T	C	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=41;PP=1054;SC=ATGACTAATGTGCCTAACTAC;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=109811011;WS=109810993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	109817962	rs10856995	C	T	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=39;PP=1231;SC=ATGAACACTACATATTAAAAT;SOR=2.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=109817970;WS=109817952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	109820141	rs144167011	A	ATATATCTC	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=931;SC=ATCTATATCTATATATCTATA;SOR=3.611;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=15;WE=109820149;WS=109820131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	109820167	rs6853028	A	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=8;PP=649;SC=ATATATCTATATACCTACCTA;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=34;WE=109820175;WS=109820157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	109820195	rs6853368	C	A	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.99;QD=46.66;SOR=1.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	109820202	rs6853372	C	T	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=42.72;SOR=1.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	109820446	rs6830868	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=436;SC=ATGCATGACATTTTCTATTTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=109820454;WS=109820436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	109841889	rs5860955	G	GA	175.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.126;NF=1;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.674;SC=CATATATCAGGAAAAAAAAAG;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=10;WE=109841897;WS=109841879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr4	109842038	rs2030844	T	A	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=164;SC=ATTGTTTTTTTAAAAAATACC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=109842046;WS=109842028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	109895718	rs70949061	GA	G	625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=18;PP=511;SC=GGAGGGCCCTGAAAAAAAGAA;SOR=2.400;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=109895726;WS=109895708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	109971378	rs1863291	T	C	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=660;SC=TTTAATTCTTTTTCCTGGTTC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=109971386;WS=109971368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	110354973	rs72896632	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CCCGCCTTCCCTTCCCTCCGC;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=6;WE=110354981;WS=110354963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	110370867	rs13123618	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TCATGGTGGTCCTGCCTTCAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=110370875;WS=110370857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	110384047	rs70949082	G	GCTTTT	4043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=29;PP=2957;SC=GTAAATACTTGCTTTTTCAGG;SOR=1.270;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=59;WE=110384055;WS=110384037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	110384938	rs10002595	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGCTTTTTGTAGCACCTCTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=110384946;WS=110384928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	110409933	rs77639117	A	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=1.142;SC=TGGAATCCTCATTCGATTGGT;SOR=0.790;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=7;WE=110409941;WS=110409923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	110445835	rs34224638	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TTATCATAGGGAATCTGCACC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=110445843;WS=110445830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr4	110446136	rs76068205	C	T	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=608;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TTTAAATGAACATTTTTAATG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=35;WE=110446144;WS=110446126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
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chr4	110448374	.	CA	C	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.7330;HP=14;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=38;QD=21.0;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=110448382;WS=110448364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
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chr4	110454039	rs35940980	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
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chr4	110581324	rs34754720	A	AT	767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.377;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.472;NF=15;NR=11;PP=399;ReadPosRankSum=0.130;SC=AAATTTACTCATTTTTTTTTC;SOR=0.038;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=26;WE=110581332;WS=110581314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr4	110581363	rs4698744	T	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.313;NF=38;NR=22;PP=930;ReadPosRankSum=1.031;SC=ATAACAGTTATTTATAGACAT;SOR=0.301;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=60;WE=110581371;WS=110581353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr4	110602430	rs4698780	T	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=17;PP=1280;ReadPosRankSum=0.358;SC=AAGGAAAAGGTCCTTGAGTCT;SOR=0.660;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=117;TCF=88;TCR=29;TR=65;WE=110602438;WS=110602420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr4	110603784	rs3733611	T	C	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=28;PP=1436;ReadPosRankSum=1.864;SC=ACATGAAATCTTTGGTTCACA;SOR=0.972;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=167;TCF=107;TCR=60;TR=85;WE=110603792;WS=110603774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr4	110608536	rs13151303	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=415;ReadPosRankSum=1.143;SC=ATATATATTTCAGCCATTTGC;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=19;WE=110608544;WS=110608526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr4	110619534	rs2301717	T	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=553;SC=AATTATTTTTTACTTATGGCA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=110619542;WS=110619524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	110638810	rs2285714	C	T	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=882;ReadPosRankSum=0.032;SC=TGCCACAGGTCTCATAGCACC;SOR=0.546;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=99;TCR=47;TR=58;WE=110638818;WS=110638800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr4	110661937	rs551	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=929;SC=AAAATATCCAGTGAGATTTGC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=110661945;WS=110661927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	110670807	rs7441380	G	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=648;SC=ACCCATTAGCGTTTTTAACAC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=110670815;WS=110670797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	110678925	rs11098044	T	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=645;SC=TTACCTTGAGTCACAGATGCA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=110678933;WS=110678915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	110678979	rs146158558	T	TTTTAA	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=10;PP=945;SC=AAAGGATAATTTTTGGAAAAA;SOR=0.874;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=16;WE=110678987;WS=110678969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	110679002	rs7437142	G	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=11;PP=478;SC=GCACACTATAGCAATATACTA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=110679010;WS=110678992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	110681618	rs4382037	C	T	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=53;PP=2441;SC=AGTAAAGTTGCTTTTCCTCTT;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=107;WE=110681626;WS=110681608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	110737389	rs2276326	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=17;NR=9;PP=522;SC=TCAACCGAGGTGGCAGCAGCA;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=110737397;WS=110737379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	110737549	rs6828254	G	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=28;PP=977;SC=GCAGTCTTCAGTATTTAGCTT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=110737557;WS=110737539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	110745095	rs13109228	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=-1.958;SC=AATACTTTGCGTTATTATTTA;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=10;WE=110745103;WS=110745085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr4	110745425	rs3188897	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=-1.361;SC=GAAAAATAAAGGTGTAATATG;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=13;WE=110745433;WS=110745415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	110754499	rs12513108	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=615;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TTGGAGATCATTGGAATGAAA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=41;WE=110754507;WS=110754489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr4	110758551	rs4698750	G	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=-2.186;SC=CCCCACTTAGGACATTAAATG;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=110758559;WS=110758541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr4	110758769	rs4698795	A	G	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.025;SC=AAGGTAAGAGATCAAAATCCT;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=67;WE=110758777;WS=110758759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr4	110765361	rs7681770	T	G	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=82;PP=2754;SC=TGAAATAAGATAAAAGGACAC;SOR=1.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=31;TCR=82;TR=113;WE=110765380;WS=110765351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	110765372	rs7657133	A	G	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=39;PP=866;ReadPosRankSum=1.839;SC=AAAAGGACACACTATCAAAAC;SOR=0.589;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=20;TCR=82;TR=48;WE=110765380;WS=110765351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,59:0.52:114
chr4	110773067	rs4698797	G	A	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1114;ReadPosRankSum=0.872;SC=TTCCTGGAGAGCTGGACTCAT;SOR=0.869;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=74;WE=110773075;WS=110773057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,102:0.54:188
chr4	110786290	rs7679048	C	T	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1052;ReadPosRankSum=0.055;SC=TAGAACGTTACGGCTGTAAAA;SOR=0.975;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=66;WE=110786298;WS=110786280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,70:0.50:140
chr4	110786517	rs7679303	A	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=-1.243;SC=ACTAATACGTACAATAATGAC;SOR=0.272;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=21;WE=110786525;WS=110786507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr4	110788739	rs2347130	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=318;ReadPosRankSum=0.777;SC=CAAGAGGCAGGATGTAAACTG;SOR=0.990;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=20;WE=110788747;WS=110788729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr4	110790911	rs764205	A	T	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.226;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=32;PP=1511;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TCTGGCTGGGATGTCAGAAGC;SOR=1.105;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=88;WE=110790919;WS=110790901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr4	110791361	rs2347131	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.202;SC=GACAAATGCCGCAATAGAAAA;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=76;WE=110791369;WS=110791351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr4	110791413	rs2347132	C	T	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1198;ReadPosRankSum=1.195;SC=GTGACATTGACGTGGAATATG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=72;WE=110791421;WS=110791403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,83:0.48:174
chr4	110791543	rs2347133	C	T	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=871;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GCTTGGAACCCGGTGGGCAAT;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=45;WE=110791551;WS=110791533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr4	110865271	rs10470911	T	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-1.515;SC=TCATTTGAAGTCCACAAGATA;SOR=0.784;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=110865279;WS=110865261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr4	110866178	rs4698755	A	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=249;ReadPosRankSum=-0.178;SC=TTCTAATAAGACAAGGAACAA;SOR=0.395;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=14;WE=110866186;WS=110866168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr4	110866442	rs4698756	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=0.283;SC=GTGAGTCATCGTTGACCTTGC;SOR=1.059;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=21;WE=110866450;WS=110866432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr4	110866508	rs4698800	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GACAATGAGGCGTTGTAGGGG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=110866516;WS=110866498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr4	110880364	rs2067004	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=579;ReadPosRankSum=-0.997;SC=GATGCAGCTGTAGACGTTGTA;SOR=0.626;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=35;WE=110880372;WS=110880354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr4	110884396	rs11568953	A	G	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1037;ReadPosRankSum=0.733;SC=TATCCTGGGAATGTGATTGCT;SOR=0.639;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=62;WE=110884404;WS=110884386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr4	110896050	rs10002971	A	C	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=0.731;SC=ACCAGAAACCAAGAAAATCCA;SOR=1.157;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=37;WE=110896058;WS=110896040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr4	110897315	rs11568993	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=705;ReadPosRankSum=1.414;SC=TGTACTGGTGCGATGCCAAGC;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=48;WE=110897323;WS=110897305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,58:0.59:99
chr4	110901198	rs2237051	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=1066;ReadPosRankSum=0.015;SC=CATCAGTAATGAGAGTAAACA;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=100;TCR=63;TR=63;WE=110901206;WS=110901188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,70:0.39:181
chr4	110914427	rs4698803	A	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=15;PP=609;SC=CAACTGGGGGAGCACAGCTGT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=110914435;WS=110914417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	111398208	rs10004516	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=19;PP=576;SC=GAGAACGGACAAGTCAAGTAA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=111398216;WS=111398198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	111398252	rs11734805	C	A	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=197;SC=CTTAAGCTCACATATCTGCTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=111398260;WS=111398242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	111409705	rs1126483	T	C	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=55;PP=2243;SC=AGGAGCATAGTGGCCACCGAT;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=111409713;WS=111409695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr4	111437103	rs2348432	C	T	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=564;SC=ACTGGTTCCACCATAAGAGTC;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=111437111;WS=111437093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	111437127	rs2348433	A	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=13;PP=382;SC=GCCTCACGATATCATCTAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=111437135;WS=111437117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	111454153	rs671841	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=1068;SC=CTGGTAAAAGACATAATAAGA;SOR=1.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=111454161;WS=111454143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	111781650	rs10213399	C	T	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=11;PP=418;SC=TGTGGTCTGTCGTTGACTGGA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=111781658;WS=111781640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	113066831	rs10002700	G	A	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=7;PP=201;SC=GCAGGGACCGGGTGGGATCCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=113066839;WS=113066821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	113178894	rs147158310	ATTTGT	A	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr4	113199075	rs701759	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=1.973;SC=AGCAGAGCGAATAAGTGCCAT;SOR=0.272;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=23;WE=113199083;WS=113199065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
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chr4	113344826	rs1989925	A	G	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=708;ReadPosRankSum=1.717;SC=TACTCCTCAAACCCTGCTCTA;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=48;WE=113344834;WS=113344816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr4	113344925	rs1989926	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=502;ReadPosRankSum=-1.191;SC=AAAACTTCATCTTTCTTTTCA;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=25;WE=113344933;WS=113344915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr4	113346714	rs916868	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.573;SC=ACGAGATTGTTTCTCAAAATG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=113346722;WS=113346704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	113347496	rs9994944	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.668;NF=8;NR=2;PP=142;ReadPosRankSum=0.689;SC=ATCTAAGCCTAAGTTTTCCTA;SOR=0.946;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=10;WE=113347504;WS=113347486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr4	113347609	rs35182774	C	CT	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=14.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=3.595;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=3.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr4	113349020	rs4834277	C	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AGCACTGTAACAGACACTCAG;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=113349028;WS=113349010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	113351822	rs61747381	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=642;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GGGAGACAGGGACGGTCCATG;SOR=1.033;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=37;WE=113351830;WS=113351812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr4	113352397	rs2074388	G	A	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=46;PP=2240;SC=TACAGCAATGGTGAGGGAGCT;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=113352405;WS=113352387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	113352628	rs13148353	A	G	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=36;PP=1510;SC=CATTCATTGCATTCACAGCTT;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=77;WE=113352636;WS=113352618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	113352899	rs2074379	G	A	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=56;PP=2674;SC=CCAAGAATATGGGCACACATC;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=122;WE=113352907;WS=113352889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	113353285	rs11726117	T	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=53;PP=2136;SC=CTCGACAGCATGGATGTTCCC;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=113353293;WS=113353275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	113353842	rs6841595	A	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=542;SC=AAGGTATAGAACCCTGGTATG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=113353850;WS=113353832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	113356259	rs3815071	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=412;ReadPosRankSum=1.071;SC=TGAATTGTAACGTCCTTTTGA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=21;WE=113356267;WS=113356249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr4	113356495	rs11098156	G	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=590;ReadPosRankSum=-1.374;SC=AATGTAAGATGAGCTAACCTT;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=37;WE=113356503;WS=113356485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr4	113359563	rs75453787	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.224;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=-1.533;SC=GCATATGTCTTTTGATCTCCT;SOR=0.214;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=16;WE=113359571;WS=113359553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr4	113359703	rs231247	A	G	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=64;PP=2965;SC=ATGTGGAGCGACAGATGACCG;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=148;WE=113359711;WS=113359693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	113359883	rs231248	A	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-1.735;SC=GGTTCCACATAATCAGGCTAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=113359891;WS=113359873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr4	113362316	rs1486868	A	G	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=58;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.989;SC=GATGCTCTCAAATATCTGGTG;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=222;TCF=102;TCR=120;TR=106;WE=113362324;WS=113362306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,134:0.48:282
chr4	113436044	rs901474	T	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=35;PP=1320;SC=CGGCGCTGGCTCCTCCCGGGC;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=113436052;WS=113436034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	113483446	rs6838559	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=1.069;SC=CATTTATATACTGTACTTTTA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=113483454;WS=113483439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	113539969	rs7696816	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=716;ReadPosRankSum=-1.356;SC=ACTGCTTTCATTGAATGAAGG;SOR=0.728;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=41;WE=113539977;WS=113539959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr4	113545165	rs6853745	T	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=-1.668;SC=GAACTTGGATTTGAAAATTCA;SOR=0.020;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=113545173;WS=113545155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	113549989	rs12054518	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.290;SC=ATATCTACAAGATTTTAAAGA;SOR=0.144;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=18;WE=113549997;WS=113549979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr4	113552958	rs114375228	A	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.244;SC=GATCATTTGAAAATCTGTTTT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=113552966;WS=113552948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr4	113554385	rs13104310	A	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=2.248;SC=GAAATATTCAACTATTTATAC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=17;WE=113554393;WS=113554375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr4	113569135	rs13136737	G	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=902;ReadPosRankSum=0.105;SC=GGGCGTTAACGCAATTGCTGA;SOR=0.718;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=61;WE=113569143;WS=113569125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr4	113570639	rs4513633	C	A	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=2;PP=104;SC=AGATATTTCCCTATTTACTTT;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=113570647;WS=113570629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	114028168	rs13134980	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=282;SC=GGTGATTGTTCTTTGTTGTGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=114028176;WS=114028158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	114067233	rs3112981	G	A	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=484;SC=TCATTGGTCAGACCTCTAAAC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=114067241;WS=114067223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	114081490	rs436855	A	G	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=18;PP=1034;SC=TCAAAGTGCTAGGATTACAGG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=114081498;WS=114081480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	114171154	rs362495	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-1.678;SC=GAATAGGAATATGTATCAAAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=114171162;WS=114171144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	114214588	rs139893914	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=622;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CTTTCACTCTCTCTTCAGAAT;SOR=1.276;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=38;WE=114214596;WS=114214578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr4	114257201	rs3736575	C	T	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=22;PP=652;SC=AGCGGATCCGCGTAGGCCTGC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=114257209;WS=114257191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	114260492	rs2272231	G	T	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=61;PP=1879;SC=TCGTTATATAGCACAGAAAAG;SOR=1.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=93;WE=114260500;WS=114260482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	114260538	rs2272230	C	T	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=45;PP=1282;SC=AAAAACTGCCCTTTGTTTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=114260546;WS=114260528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	114267023	rs9968405	G	A	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=54;PP=2854;SC=CAAATCAAATGTGGGTGAAGC;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=97;TCR=54;TR=151;WE=114267031;WS=114267013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr4	114269509	rs2272234	G	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=757;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TGTCATTGCTGTAACCACTAA;SOR=1.058;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=50;WE=114269517;WS=114269499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr4	114269552	rs2272235	G	A	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=53;PP=1768;SC=GTTCTTAGACGGGGTAGGCGG;SOR=1.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=84;WE=114269560;WS=114269542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	114275243	rs33966911	C	T	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=52;PP=2451;ReadPosRankSum=-1.534;SC=CAGGGTCTCCCTCCCCTAAAA;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=263;TCF=162;TCR=101;TR=142;WE=114275251;WS=114275233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,165:0.53:309
chr4	114275942	rs3796928	C	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=717;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GCCAGAGACTCCCGGTAACGG;SOR=0.637;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=43;WE=114275950;WS=114275932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,61:0.42:145
chr4	114276880	rs28377576	T	C	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.375;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr4	114276884	rs3733615	A	G	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.25;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	114278277	rs3733617	C	T	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1433;ReadPosRankSum=0.651;SC=AGCAGAATCTCCACAAGCAGA;SOR=0.799;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=86;WE=114278285;WS=114278267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr4	114279422	rs10013743	A	G	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.164;SC=CTACAAAAGAAGCTGTTAGTG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=76;WE=114279430;WS=114279412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr4	114284645	rs35728190	C	T	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1301;ReadPosRankSum=-1.458;SC=GAACTATATGCATATTGGGCT;SOR=0.877;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=195;TCF=89;TCR=106;TR=85;WE=114284653;WS=114284635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,109:0.48:229
chr4	114286357	.	A	ATGTGTG	759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.000;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr4	114294308	rs2293324	T	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=68;PP=2463;SC=TTGATGAGCATGGACACACCG;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=114294316;WS=114294298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr4	114299187	rs34564840	ATTGT	A	1313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.981;NF=16;NR=8;PP=1029;ReadPosRankSum=0.684;SC=AAAGCAATAGATTGTTTGAAA;SOR=0.495;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=24;WE=114299198;WS=114299177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr4	114299347	rs17483231	A	C	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=800;ReadPosRankSum=0.737;SC=GGTTTGGGTTAGCATGGGGTG;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=57;WE=114299355;WS=114299337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr4	114309839	rs6533681	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=0.597;SC=ACTTTTCTTCCGGAAAAAATT;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=18;WE=114309847;WS=114309829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr4	114421712	rs17446453	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=133;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CAATGAATAGCTTGATTTCCT;SOR=0.782;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=11;WE=114421720;WS=114421702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr4	114426077	rs5861139	CA	C	684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=19;NR=4;PP=329;SC=AGAGAAACCACAAAAAAAAAA;SOR=2.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=23;WE=114426085;WS=114426067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	114426315	rs4834348	G	T	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=39;PP=1095;SC=AGATGAACGTGAAAGACATGG;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=114426323;WS=114426305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	114429407	rs11098193	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=0.020;SC=TCTGAACACTCGAACTGGACT;SOR=1.078;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=26;WE=114429415;WS=114429397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr4	114458402	rs734348	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=261;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TTAGGATGAAGTTTTCCATTT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=17;WE=114458410;WS=114458392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr4	114472984	rs2285704	T	C	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	115544714	rs6851610	A	G	5252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=74;PP=2965;SC=ACCTGCTGCCAGAGAAGTCCA;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=159;WE=115544722;WS=115544704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	115577997	rs34115976	C	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=457;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CTTCATTTCCCCATATCTACT;SOR=1.015;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=26;WE=115578005;WS=115577987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr4	115585407	rs77858164	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=1.025;SC=TTAGCAAGATGCCCTTGACTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=115585415;WS=115585397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr4	115586696	rs4833463	A	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=ATTTGCTGTTACCAAAGCATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=115586704;WS=115586686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	115589159	rs6831964	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=692;SC=TACTGTAGTGCCGATTTTTAA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=115589167;WS=115589149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	115589302	rs11098261	A	G	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=59;PP=2591;SC=TTGAAACTATATATCATGGTG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=128;WE=115589310;WS=115589292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	115749005	rs6843860	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=0.964;SC=GTCTCAGCCACGATGGCAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=9;WE=115749013;WS=115748995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr4	115751064	rs12648047	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=649;ReadPosRankSum=1.641;SC=GTACATAAAACATAATGATTA;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=43;WE=115751072;WS=115751054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr4	115763964	rs112804787	C	CA	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=0.417;SC=TAAAAAAAAACAAAAAAGCAA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=3;WE=115763972;WS=115763954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr4	115769330	rs10022934	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=68;ReadPosRankSum=0.147;SC=GTGATTGAGCATGTGTTAATA;SOR=1.863;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=115769338;WS=115769320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	115792154	rs17047425	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=0.302;SC=TGCTTAAGCTTAAAAGTAGCA;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=15;WE=115792162;WS=115792144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr4	115997164	rs570741	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=248;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ATATTTTATCGGTACCATATT;SOR=1.123;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=15;WE=115997172;WS=115997154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr4	118976252	rs75853426	G	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TTTACTAAAAGATTGAGTGTG;SOR=0.460;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=10;WE=118976260;WS=118976242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr4	119035948	rs5861378	T	TC	5599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.218;NF=45;NR=84;PP=2979;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GGATAATATTTCCCCCCCTAA;SOR=0.916;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=139;TCF=51;TCR=88;TR=129;WE=119035962;WS=119035938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,216:0.99:218
chr4	119064668	rs3749506	G	A	188.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=-0.887;SC=AAATTGATTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=119064676;WS=119064658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr4	119154201	rs13138385	T	C	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=567;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TGGTTATGCATCCTTCCATCC;SOR=0.994;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=39;WE=119154209;WS=119154191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr4	119161619	rs641962	A	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=368;SC=ACAAAGATTGATTTTTAATTA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=119161627;WS=119161609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	119161795	rs617430	G	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=670;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GTTTGGTCCCGGGGTGGTATG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=36;WE=119161803;WS=119161785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr4	119174563	rs609512	T	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.598;SC=TATGTATTGGTCACTATATCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=119174571;WS=119174553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	119174640	rs5861382	CT	C	463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=4;PP=213;SC=TGTGTGTATTCTTTTTTTTTT;SOR=2.419;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=13;WE=119174648;WS=119174630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	119200274	rs658642	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CCCCGAGAACCGTCAGTTTGA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=119200282;WS=119200264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	119200317	rs17594468	G	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=139;ReadPosRankSum=0.313;SC=GTAGCAGTTTGGTTGCTGGTT;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=13;WE=119200325;WS=119200307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr4	119203479	rs71608358	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=71;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GTAATAGTTATGAAAATAAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=8;WE=119203487;WS=119203469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr4	119217114	rs788665	C	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=45;PP=1319;SC=ATGTCAAAATCCCTTTTCTCT;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=119217122;WS=119217104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr4	119259199	rs17516526	C	G	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=140;SC=CTTTATAGCTCTTTTGTGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=119259207;WS=119259189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	119273948	rs115419931	G	C	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=30;PP=669;SC=GGAGGGGGCGGGGGCGGGGCT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=119273956;WS=119273938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	119401424	rs7659489	T	A	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=10;PP=1373;SC=TTTCTGTTTCTTCTGCTTTAG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=119401432;WS=119401414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	119409225	.	C	T	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=41.87;NF=7;NR=0;PP=76;QD=15.8244589353;SC=ATTACCAGACCCCCTCAAGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=7;WE=119409233;WS=119409215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr4	119414828	rs145087150	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.74;QD=31.85;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	119427957	rs28580297	C	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.17;QD=27.75;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	119428006	rs201753340	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.44;QD=26.38;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	119431067	rs138515225	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.060;NF=30;NR=16;PP=621;ReadPosRankSum=0.112;SC=AGGAAGGCACATCTTCATCTG;SOR=0.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=46;WE=119431075;WS=119431057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr4	119434892	rs200608654	G	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.54;QD=29.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	119435061	rs147652632	C	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.99;QD=27.47;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	119435614	rs200273909	T	TA	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQRankSum=-4.645;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr4	119435997	rs201367422	C	T	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.29;QD=27.38;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	119436130	rs72551018	G	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.73;QD=27.45;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	119436487	rs2728182	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	119444456	rs28720014	G	A	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=22;PP=1754;SC=AAACATACCCGTCTATGTACT;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=84;WE=119444464;WS=119444446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	119461446	rs200079270	G	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.556;NF=28;NR=32;PP=911;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CAAAACACCAGAAGGAAACAA;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=60;WE=119461454;WS=119461436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr4	119475430	rs2787272	G	A	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.51;QD=29.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	119606518	rs17323034	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=1.743;SC=GGACTTCCGGGCCAAGCGAGC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=10;WE=119606526;WS=119606508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr4	119608944	rs58763837	TTG	T	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.754;NF=7;NR=2;PP=367;ReadPosRankSum=0.721;SC=ATTCATTGTTTTGTGTGTGTG;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=119608953;WS=119608934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr4	119609039	rs9968326	G	A	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=13;PP=1361;SC=AGGCTATCCAGTGCATTGCAA;SOR=1.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=119609047;WS=119609029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	119613045	rs6821350	T	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=352;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TTGATTGCATTTTATATCACC;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=16;WE=119613053;WS=119613035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr4	119615543	rs13111664	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-0.282;SC=ATTACTGATATTAACTTCAGT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=12;WE=119615551;WS=119615533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr4	119625273	rs298995	G	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=18;PP=451;SC=CCAAATAACTGTATACTGTTT;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=119625281;WS=119625263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	119631160	rs11931194	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=668;ReadPosRankSum=-1.056;SC=CAGGCTGGCTCACAGTTGGAC;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=47;WE=119631168;WS=119631150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,59:0.42:141
chr4	119653822	rs2046779	G	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=1.069;SC=TATAACATACGGGAAAGCACA;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=119653830;WS=119653812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	119659284	rs7653962	T	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-1.503;SC=GCATTCTTAATCTTCTCAGCT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=119659292;WS=119659274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	119665345	rs28627331	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=1.679;SC=AAAGAAAAAATAAAAATTACA;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=119665353;WS=119665335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	119674051	rs71595318	G	GA	399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.423;NF=3;NR=18;PP=306;ReadPosRankSum=0.101;SC=TCCCTGTAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.385;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=9;TCR=60;TR=21;WE=119674059;WS=119674041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr4	119736176	rs114639588	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=449;ReadPosRankSum=0.897;SC=GTGAGAAGAGTACTTACTGGG;SOR=0.856;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=28;WE=119736184;WS=119736166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr4	119736427	rs114155681	A	G	70.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr4	119736598	.	CGCCTTACCCTGCTGC	TGCCTTACCCTGCTGC,TGCCTTACCTTGCTGT	532	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17,10;NR=4,3;PP=404,532;QD=20.8938672642;SC=GCACCCTGTCCGCCTTACCCT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21,13;WE=119736621;WS=119736588;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:21
chr4	119736607	rs114611353	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr4	119736613	rs115118317	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.17;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr4	119736796	rs2389688	A	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=876;ReadPosRankSum=0.058;SC=GCAAAATGGAAGGCTGTGGAG;SOR=0.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=62;WE=119736804;WS=119736786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr4	119736953	rs143650969	AC	A	1364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.345;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.552;NF=1;NR=30;PP=1983;ReadPosRankSum=-0.295;SC=AAAGTACATGACAGAGATGTT;SOR=1.255;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=31;WE=119736975;WS=119736943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr4	119736967	rs115576008	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.497;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=1992;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AGATGTTTGTTTTCCTGACAT;SOR=1.900;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=34;WE=119736975;WS=119736943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr4	119754635	rs115446044	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=1.131;SC=CATTATATAATGATCATTCAA;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=12;WE=119754643;WS=119754625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr4	119754918	rs114724233	T	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=0.065;SC=AAGAAACATGTTACCAAGACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=119754926;WS=119754908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr4	119944611	rs1459058	G	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=681;ReadPosRankSum=-1.084;SC=AAGCCTCTGGGTCTGGGCTCT;SOR=0.591;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=46;WE=119944619;WS=119944601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr4	119947961	rs70944826	AAAG	A	4095.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.050;NF=18;NR=53;PP=2964;ReadPosRankSum=-2.790;SC=GCTGAGAACCAAAGAAGTGGT;SOR=0.884;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=144;TCF=41;TCR=103;TR=71;WE=119947971;WS=119947951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,107:0.48:223
chr4	119947985	rs12645298	G	C	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=1930;ReadPosRankSum=-1.800;SC=GACTGTGCAGGCAGCTTGAAA;SOR=0.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=91;TCR=104;TR=103;WE=119947993;WS=119947975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,109:0.49:224
chr4	119948046	rs17263971	A	C	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CTGACTCCCAAAGAGGACGCG;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=72;WE=119948054;WS=119948036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,84:0.44:189
chr4	119951647	rs7698598	A	G	9335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=190;NR=102;PP=2965;SC=CTTCAGTGGGACATCTGAGAC;SOR=1.383;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=190;TCR=102;TR=292;WE=119951655;WS=119951637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr4	120071926	rs6853794	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=369;SC=TACTTATGATTATGCAATTAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=120071934;WS=120071916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	120072233	rs6828875	G	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	120072238	rs6828349	A	G	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.35;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	120079159	rs11721566	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=13;PP=1210;SC=AGCAGAGTTTACTTTTGATTA;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=120079167;WS=120079149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	120079387	rs11729978	G	A	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=1432;ReadPosRankSum=1.746;SC=AGCCTTTATTGAATAGTATTT;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=63;WE=120079395;WS=120079377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr4	120133712	rs6851130	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=0.301;SC=AGCCCGCTCCGAGGGGCGGGC;SOR=0.619;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=6;WE=120133720;WS=120133702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	120187611	rs11098499	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=0.510;SC=AGCAGCACTTCGTGTTGGTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=120187619;WS=120187601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	120194718	rs35610634	G	GT	3092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=56;PP=1592;ReadPosRankSum=1.660;SC=AACAAATGTTGTTTTTTTTTA;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=71;WE=120194726;WS=120194708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr4	120212207	rs35703931	T	TG	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=376;SC=AGAGATTACCTTTTATAGAAA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=120212215;WS=120212197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	120212425	rs34076547	AT	A	506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=328;SC=AGGTAACCATATTTTTTTTCC;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=15;WE=120212433;WS=120212415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	120214030	rs3749591	T	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.631;SC=CGAAGCACAGTTTAAGTACAG;SOR=0.768;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=69;WE=120214038;WS=120214020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,81:0.45:179
chr4	120220085	rs111948904	A	AAAAC	808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=750;SC=TCAGGTCATAAAAACACACAC;SOR=2.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=120220093;WS=120220075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	120225348	rs1397611	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	120240131	rs2964	T	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=432;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GTGAAATAAATAGTTCTGGTA;SOR=0.681;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=29;WE=120240139;WS=120240121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr4	120240238	rs1511025	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=0.521;SC=CTCCTTCATATACATAAGTCT;SOR=0.885;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=23;WE=120240246;WS=120240228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr4	120241849	rs4834770	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=291;ReadPosRankSum=1.097;SC=CGTCTGCTAGATTGTAATTAA;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=15;WE=120241857;WS=120241839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr4	120241902	rs1799883	T	C	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=776;SC=TTTCGAAAAGTGCTTGATTCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=120241910;WS=120241892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	120243336	rs5861422	TA	T	2196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=42;PP=1830;ReadPosRankSum=0.410;SC=TTTCTTATCTTAGAACCAACT;SOR=0.881;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=88;TCF=7;TCR=81;TR=44;WE=120243344;WS=120243326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr4	120243389	rs5861423	A	ACTACT	1012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=957;ReadPosRankSum=0.764;SC=AAATCACCTAACTATGTCAAG;SOR=0.929;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=20;WE=120243397;WS=120243379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr4	120243417	rs5861424	T	TTC	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=551;ReadPosRankSum=-0.109;SC=TTAATTCTTATTAATTAATTC;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=14;WE=120243427;WS=120243407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr4	120243419	rs1973598	A	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=540;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AATTCTTATTAATTAATTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=120243427;WS=120243407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	120265259	rs10028773	C	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-2.128;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	120275268	rs62320725	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQRankSum=0.862;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,7:0.16:43
chr4	120275344	rs62320726	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQRankSum=-6.150;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,14:0.16:88
chr4	120275499	rs3817230	A	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=190;ReadPosRankSum=-1.789;SC=ATTCATTGTGAAAATTGTATT;SOR=0.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=13;WE=120275507;WS=120275489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr4	120314664	rs13127114	T	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.067;NF=25;NR=15;PP=612;ReadPosRankSum=0.290;SC=ACCGCTCCATTGTGACGGCGG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=40;WE=120314672;WS=120314654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr4	120314741	rs13151285	C	A	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.967;NF=22;NR=27;PP=744;ReadPosRankSum=1.135;SC=ATGGCAGCACCCAATGCAGTG;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=49;WE=120314749;WS=120314731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr4	120314881	rs4309825	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=-1.377;SC=GTCTCAATTCATGGCATCCAA;SOR=0.879;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=29;WE=120314889;WS=120314871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr4	120316075	rs11098513	A	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.587;NF=11;NR=31;PP=720;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CACTGCCCCCACCAATGGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=42;WE=120316083;WS=120316065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr4	120423719	rs3733523	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr4	120423729	rs3733524	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.03;ReadPosRankSum=-2.774;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	120423935	rs12510138	G	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=-1.627;SC=GCAGCAGCTTGATACCCGAAG;SOR=0.355;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=14;WE=120423943;WS=120423925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	120425777	rs3775841	A	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=-1.470;SC=AAAGAAACCCAAAACTCCTAT;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=27;WE=120425785;WS=120425767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr4	120441971	rs3832309	TG	T	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=1.349;SC=ATTATGTAAGTGGCAGCAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=120441979;WS=120441961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr4	120446868	rs3832310	GA	G	1315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.137;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.31;MQRankSum=0.343;QD=23.50;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,54:0.96:56
chr4	120460306	rs1552095	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=208;ReadPosRankSum=0.294;SC=AAATCTTGTTTGCTGTTTTCT;SOR=1.721;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=15;WE=120460314;WS=120460296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr4	120463856	rs2622497	A	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=23;PP=700;SC=GACTTTAACAAACACACCCAA;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=120463864;WS=120463846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	120474859	rs11947234	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=-2.011;SC=TATTTTTGACATACTGAGCAT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=21;WE=120474867;WS=120474849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr4	120481431	rs34308924	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TAAAGACAAGTAGAGAATACG;SOR=1.194;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=16;WE=120481439;WS=120481421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr4	120486402	rs55825515	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=1.068;SC=AATCATCTGCATACATTACTT;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=120486410;WS=120486392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	120528327	rs3733526	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=488;ReadPosRankSum=0.070;SC=TGTTCCAGGGGCACTGTTATC;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=31;WE=120528335;WS=120528317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr4	120548074	rs3839163	A	AAAAAC	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TCCTTAGGAAAAAAACAAAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=5;WE=120548082;WS=120548064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr4	120550059	rs11342908	GC	G	2599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=38;PP=1317;SC=CAGCTGCTGCGCCCCCCCCAC;SOR=0.863;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=60;WE=120550067;WS=120550049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	120550125	rs10639733	A	AGGC	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=45;PP=680;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GGTTCCCAGGAGGCGGCGGCG;SOR=0.815;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=53;WE=120550133;WS=120550115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr4	120550141	rs140532689	GGCA	G	2021.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCGGCAG;SOR=0.711;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=46;WE=120550152;WS=120550131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr4	120550144	rs2953291	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=6.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.212;SOR=1.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr4	120983259	rs2908989	T	C	3512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=2168;ReadPosRankSum=-0.828;SC=ATCTGCAACATATAAAAAGGA;SOR=0.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=124;WE=120983269;WS=120983249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,154:0.59:260
chr4	121737767	rs2136998	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=578;SC=GGAAGAAATGGTGAAGACATA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=121737775;WS=121737757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	121774515	rs3115310	T	C	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=23;PP=1616;SC=AGTACAGTCATATATTAATTC;SOR=1.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=121774523;WS=121774505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	121828519	rs1901135	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.231;NF=6;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAAAACATTTCAATACTTAAA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=121828527;WS=121828509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	121843611	rs113037077	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GCAGGGCGACTCCGGGAGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=13;WE=121843619;WS=121843601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	121957734	rs1397645	T	C	4795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=68;PP=2965;SC=CCACGGTGGCTGAGGAACAGG;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=87;TCR=68;TR=155;WE=121957742;WS=121957724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	121958091	rs3733558	T	G	6609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=87;PP=2965;SC=TCCCATCTTTTAGCTCGACTG;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=110;TCR=87;TR=197;WE=121958099;WS=121958081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr4	121958187	rs3822230	A	G	6381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=105;PP=2965;SC=CCACAAATACATCAAAGTAGT;SOR=0.817;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=91;TCR=105;TR=196;WE=121958195;WS=121958177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr4	121958697	rs3733560	G	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1189;ReadPosRankSum=1.614;SC=GATATAAACCGGATGGGGAAC;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=96;TCR=87;TR=74;WE=121958705;WS=121958687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,77:0.36:212
chr4	121961295	.	A	AT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9998;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=30;QD=22.0;SC=TTTGGTTTTAATTTTTTTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=121961303;WS=121961285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr4	121966807	rs2276959	C	T	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=38;PP=2034;SC=GAGAATACCTCTTAGGTGTAT;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=97;WE=121966815;WS=121966797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	122137662	rs7663440	T	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=25;PP=756;SC=GAATCTAAAATAAAAAAATAT;SOR=0.884;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=122137670;WS=122137652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	122148787	rs2044970	A	G	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=233;SC=AAGATTCACAACCTATGTGAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=122148795;WS=122148777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	122255895	rs56351803	A	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=378;SC=TCACTTGAAAATTGATAAATA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=122255903;WS=122255885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	122257942	rs4558890	A	C	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	122257950	rs2302309	A	G	4897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.22;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	122261495	rs2276956	C	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=466;SC=AAATTATATTCCAATGCCTAC;SOR=2.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=122261503;WS=122261485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	122261785	rs2276955	C	T	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=53;PP=1661;SC=GGAAATAGGACAAATCATACA;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=122261793;WS=122261775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	122301351	rs111833066	A	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=10.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.80;MQRankSum=-0.311;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.835;SOR=4.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr4	122599249	rs3756281	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	122599755	rs3733649	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=1.856;SC=ATAATTATATTTGGTTAACAT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=122599763;WS=122599745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	122681373	rs4342205	T	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=400;ReadPosRankSum=0.909;SC=AGATCCACCATCATCTTCTTC;SOR=1.539;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=21;WE=122681381;WS=122681363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr4	122683007	rs4370153	G	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=581;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TAGTGCAACAGCCAAGATTGT;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=36;WE=122683015;WS=122682997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr4	122722920	.	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=674;ReadPosRankSum=0.029;SC=GCCAGACAAAAAGTAGTTGCT;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=33;WE=122722928;WS=122722910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr4	122723106	rs67772833	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=682;ReadPosRankSum=0.830;SC=ATACACATTCGGAAGGGAGAA;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=44;WE=122723114;WS=122723096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr4	122735225	rs141260260	C	CTTA	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.033;NF=0;NR=13;PP=536;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TTATGGCACACTTACTATATA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13;WE=122735233;WS=122735215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr4	122737278	rs3217780	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GCCTGGCTAATTTTTCTATTA;SOR=0.593;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=3;WE=122737286;WS=122737268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	122739121	rs3217773	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TGGCAGATTCATGAATAAGGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=122739129;WS=122739111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	122740162	rs2071486	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CCTTTGATAACGGCTCTGTAG;SOR=0.512;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=122740170;WS=122740152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	122740454	rs1396080	T	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CTAGGTTCCTTTACAAAGGAA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=122740462;WS=122740444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr4	122742217	rs769242	T	C	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=49;PP=1932;SC=TCTTCTAATATAATTGACATG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=93;WE=122742225;WS=122742207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	122749436	rs2706793	G	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=642;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TATTTAAAATGAAAAACAGAA;SOR=1.118;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=36;WE=122749444;WS=122749426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr4	122749541	rs1507994	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1394;ReadPosRankSum=-1.712;SC=CAGTCCACGACGACACATGTA;SOR=0.951;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=203;TCF=124;TCR=79;TR=93;WE=122749549;WS=122749531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,98:0.42:236
chr4	122769967	rs6824258	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=383;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TTGTTGACTCTTTCTTCAATT;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=25;WE=122769975;WS=122769957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr4	122782879	rs56159666	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=588;ReadPosRankSum=1.204;SC=TTACTTTATTGTGAGCATTTT;SOR=1.207;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=33;WE=122782887;WS=122782869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr4	122872719	rs1396082	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=305;ReadPosRankSum=2.330;SC=CGCCCCTCCAGCCCCGGCGGC;SOR=0.947;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=22;WE=122872727;WS=122872709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr4	123108762	rs7670081	G	A	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=186;SC=AAATTAAATAGTTTTGTGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=123108770;WS=123108752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	123122146	rs77249793	CTAACA	C	4125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.064;NF=23;NR=43;PP=2943;ReadPosRankSum=0.799;SC=TTACTTTTACCTAACATTTGT;SOR=0.621;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=66;WE=123122158;WS=123122136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,109:0.49:223
chr4	123128687	rs78292470	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-1.762;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.273;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	123140739	rs6534345	G	C	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=70;PP=2327;SC=GTTTACACATGAAAGTAGTCT;SOR=1.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=123140747;WS=123140729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	123179900	rs45510500	C	T	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=1056;ReadPosRankSum=0.728;SC=AACAGCTAACCGGCCTCCACC;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=71;WE=123179908;WS=123179890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,79:0.49:162
chr4	123185682	rs7664976	C	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=382;SC=TCTAGTGAGGCTATACCTTAC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=123185690;WS=123185672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	123283163	rs33976078	AAT	A	954.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=1021;SC=ACTCCTTAATAATAACTGTAA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=123283172;WS=123283153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	123377482	rs2069763	C	A	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=21;PP=953;SC=GTAAATCCAGCAGTAAATGCT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=123377490;WS=123377472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	123536963	rs4833837	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.042;SC=CCTTCTGAAAGCAGGAAAAAG;SOR=1.002;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=7;WE=123536971;WS=123536953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr4	123662997	rs309368	A	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=388;ReadPosRankSum=1.620;SC=ATAACTATGAATTATACTGAA;SOR=0.351;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=27;WE=123663005;WS=123662987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr4	123664204	rs309370	G	A	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1215;ReadPosRankSum=1.055;SC=GATAGCATGCGGCTTCAAGAA;SOR=0.581;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=155;TCF=90;TCR=65;TR=76;WE=123664212;WS=123664194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,98:0.48:203
chr4	123664427	rs13135766	G	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1088;ReadPosRankSum=1.261;SC=TTACACAAGTGAATGAAGATT;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=64;WE=123664435;WS=123664417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,67:0.36:184
chr4	123664446	rs13135778	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=2598;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TTGTGTGGGCGACGGGGTCTG;SOR=0.682;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=66;WE=123664465;WS=123664436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,75:0.40:187
chr4	123664457	rs13135445	C	T	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=2598;ReadPosRankSum=0.058;SC=ACGGGGTCTGCGTGACCTTCT;SOR=0.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=67;WE=123664465;WS=123664436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,78:0.40:195
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chr4	123748616	rs2922979	C	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=-0.445;SC=GACCCTAGCGCTCCGTGTGGT;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=27;WE=123748624;WS=123748606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr4	123838758	rs12648093	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=552;ReadPosRankSum=1.236;SC=TGGTGAAAGCAGAAGCCCAGG;SOR=0.984;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=34;WE=123838766;WS=123838748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr4	123843716	rs13134412	T	C	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=61;PP=1548;SC=CCCAGCTCAGTGGCTGCCGCA;SOR=2.359;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=78;WE=123843724;WS=123843706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	123843741	rs77088263	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CACGCCGCTTAATTCGTCCGT;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=19;WE=123843749;WS=123843731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr4	123854495	rs1563706	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=373;SC=ATTCTTTTGATTAAGTCTATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=123854503;WS=123854485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	123868279	rs11098682	G	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=272;SC=GGACTTAGTAGCCTGGACAGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=123868287;WS=123868272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	123949267	rs7665828	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTGTTAATGATATGTTTTTTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=123949275;WS=123949257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr4	123949556	rs1472949	G	A	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=47;PP=1360;SC=TAAAGGTAGGGTGTTAAATTT;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=123949564;WS=123949546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	124323738	rs300574	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=330;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TCCTGAACTTTTAGCTTTCAA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=21;WE=124323746;WS=124323728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr4	124323783	rs300575	G	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=4.771;HP=9;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=0.094;SC=TTTTGTTTTTGTTTTCTTTAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=124323791;WS=124323773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	126238924	rs6847454	A	T	3968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=75;PP=2300;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GCAGCAGTCCAGGCGCGCTCT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=262;TCF=123;TCR=139;TR=140;WE=126238932;WS=126238914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,180:0.56:323
chr4	126239986	rs1039808	C	T	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1705;ReadPosRankSum=0.081;SC=GAGAACGTGGCGCTGGGATAT;SOR=0.572;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=101;WE=126239994;WS=126239976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,123:0.49:252
chr4	126240510	rs2940779	T	C	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1309;ReadPosRankSum=1.453;SC=TAGTGTCATCTTAACAGTTTA;SOR=0.684;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=235;TCF=100;TCR=135;TR=82;WE=126240518;WS=126240500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,93:0.36:261
chr4	126241871	rs2710555	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1675;ReadPosRankSum=-0.849;SC=ACATTCCCATCGGTACATCTG;SOR=1.140;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=95;WE=126241879;WS=126241861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr4	126315034	rs925243	T	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=18;PP=1237;SC=ACCAGAGTTTTACTGCTCAGG;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=126315042;WS=126315024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	126315282	rs925242	A	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=187;SC=TGCAGAAAACATGGAAGTGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=126315290;WS=126315272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	126329789	rs958415	T	C	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=43;PP=1585;SC=GAGCAGAAGATGGTGGGGGAC;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=126329797;WS=126329779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	126335978	rs4605670	G	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=773;SC=AAAAGTTTTGGTATAGCTTGT;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=126335986;WS=126335968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	126336990	rs10010000	G	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=41;PP=1149;SC=AGCAAGTATTGTCTTAATTAT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=126336998;WS=126336980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	126337555	rs7675556	A	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=838;SC=TTATTTCATGAGATGCATTGT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=126337563;WS=126337545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	126355609	rs7656135	T	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=55;PP=1716;SC=GTAAAGTTTGTCTGTTTTCTC;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=126355617;WS=126355599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	126369872	rs988863	G	C	8706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=114;PP=2965;SC=TCCCTAAAGTGAGAGCCAAAG;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=242;WE=126369880;WS=126369862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr4	126372742	rs1567047	G	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=762;ReadPosRankSum=0.253;SC=AAACGGCCAGGCACTTTGGTG;SOR=0.576;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=51;WE=126372750;WS=126372732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr4	126373789	rs12650153	G	A	4486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=74;PP=2935;SC=CCTTGCCACAGTGGTGGAACC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=146;WE=126373797;WS=126373779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	126389627	rs6814158	A	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=9;PP=973;SC=TAAAATTTTCATGAAATTTTA;SOR=2.468;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=50;WE=126389635;WS=126389617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	126390010	rs35304021	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=476;ReadPosRankSum=-1.391;SC=TGTATATCCAACTGGATCTTC;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=12;WE=126390030;WS=126390000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr4	126390022	rs34927272	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=434;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TGGATCTTCAAATAAAGTATG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=126390030;WS=126390000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
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chr4	126400825	rs1506361	G	T	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=651;SC=TAATAAAAGTGTATATTGAGT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=126400833;WS=126400815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	126402890	rs6824160	G	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=1011;ReadPosRankSum=1.025;SC=ACACTACTGTGAAGGTGAGAT;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=126;TCF=40;TCR=86;TR=62;WE=126402898;WS=126402880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr4	126402921	rs11098815	T	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=718;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GGTGACTTCATTTGATTAGAC;SOR=0.510;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=91;TCF=20;TCR=71;TR=47;WE=126402929;WS=126402911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr4	126412575	rs1014866	A	G	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=42;PP=1739;SC=ATACTTCCAGAATGCCCAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=126412583;WS=126412565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	128544696	rs4834207	A	G	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=69;PP=2422;SC=CTTGCCCCGGAAATGTTGGCG;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=114;WE=128544704;WS=128544686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr4	128584580	rs4833380	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr4	128621272	rs12331481	A	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.556;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr4	128627050	rs7683627	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-0.047;SC=AGGGATGCAGCGGTAGGTAGG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=128627058;WS=128627040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	128635022	rs34240473	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=-0.827;SC=ATTCAGATTACTCTGTGAAAA;SOR=0.963;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=128635030;WS=128635012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	128665981	rs769293	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TTTACTTTTTTCTTCCAATAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=128665989;WS=128665971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	128688444	rs3214038	C	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=38;PP=793;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GTAATGTTTTCAGCAGATATG;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=44;WE=128688452;WS=128688434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr4	128689936	rs2305958	A	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr4	128723042	rs1380154	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=320;ReadPosRankSum=-1.175;SC=TATCAGGTCTTGGTTTGTGCT;SOR=1.388;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=28;WE=128723050;WS=128723032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr4	128803159	rs3811741	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.169;SC=GAAACTCCTTGTCTACTAGCC;SOR=1.802;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=128803167;WS=128803149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	128807219	rs3811740	T	A	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1301;ReadPosRankSum=-0.727;SC=TGAAATGCCATCTTTTTTGTC;SOR=0.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=86;WE=128807227;WS=128807209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,99:0.54:185
chr4	128814964	rs17012739	G	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1263;ReadPosRankSum=-2.392;SC=CAACGAGAGAGAGAGCATCTT;SOR=0.978;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=81;WE=128814972;WS=128814954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,90:0.42:213
chr4	128923001	rs35200534	GT	G	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	128995989	rs6534661	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=285;ReadPosRankSum=-1.534;SC=CTGAATATAAATGATTATTTA;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=18;WE=128995997;WS=128995979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr4	129012181	rs2306054	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=430;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GAGAAAAAAGGGATGATCAAG;SOR=1.093;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=29;WE=129012189;WS=129012171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr4	129012638	rs1064205	A	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=0.538;SC=TGGAAGAAGCATTGCTTAAAG;SOR=0.360;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=22;WE=129012646;WS=129012628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr4	129029009	rs34678812	G	GA	1171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.491;NF=19;NR=13;PP=784;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TCCCTCTTGGGAAAAAATGTG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=32;WE=129029017;WS=129028999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr4	129043204	rs12508837	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=0.479;SC=AAAAAACATCCTGGAGGAGAT;SOR=0.072;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=129043212;WS=129043194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	129043286	rs3733320	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=411;ReadPosRankSum=-0.516;SC=ATGGCTTATACTATTATGAAC;SOR=0.602;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=33;WE=129043294;WS=129043276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr4	129043601	rs3832282	T	TG	1868.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=1.740;QD=37.37;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,46:0.92:50
chr4	129043614	rs3733321	G	T	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=1.643;QD=36.98;ReadPosRankSum=2.422;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,51:0.89:57
chr4	129043617	rs3733322	T	G	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=1.616;QD=35.01;ReadPosRankSum=2.708;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,54:0.89:61
chr4	129043809	rs12509092	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=387;ReadPosRankSum=-0.463;SC=AGTCTATGGTGCATGATCTAA;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=22;WE=129043817;WS=129043799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
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chr4	129208957	rs371210722	A	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=1.794;SC=ACTGCCCGCCAGCGCCTTCCT;SOR=0.483;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=15;WE=129208965;WS=129208947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr4	129776983	rs76983300	C	CT	740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=574;SC=GTTGTTTTTACTTTTTTTTAA;SOR=3.690;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=24;WE=129776991;WS=129776973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	129857935	rs116133992	G	A	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=642;ReadPosRankSum=1.072;SC=TTCTATTACTGTCTTCCATCT;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=52;WE=129857943;WS=129857925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr4	129867280	rs10028124	T	A	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.330;SC=CTGTAATCACTCTCATTTCCT;SOR=0.559;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=139;TCF=64;TCR=75;TR=66;WE=129867288;WS=129867270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,74:0.43:174
chr4	129873433	rs10857134	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=713;ReadPosRankSum=0.046;SC=TTATTCTCCTATAAGCAAGGT;SOR=0.429;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=42;WE=129873441;WS=129873423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr4	129873636	rs72683673	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=721;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TTTCCCAGATAAACTCAGCAT;SOR=0.883;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=42;WE=129873644;WS=129873626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr4	129924977	rs3113487	C	A	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=64;PP=2473;SC=CCTCTGTGCCCAGGGGAAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=129924985;WS=129924967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	129961179	rs3113489	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=708;SC=GTGCTTCCTAAGCTAAAGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=129961187;WS=129961169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	129965026	rs1450727	T	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TCTTGTCAATTCAAGAACAAA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=129965034;WS=129965016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	130023759	rs1757935	A	T	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1460;SC=TCTTTTAGAGACTTCAGATGG;SOR=1.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=130023767;WS=130023749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	130030652	rs337277	A	G	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=46;PP=1963;SC=ATCGTTCAGAATGTCCAGAGG;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=130030660;WS=130030642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	133367588	rs1827132	T	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=753;SC=AGTCCTGAATTGCAGGTGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=133367596;WS=133367578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	133367655	rs1827133	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=21;PP=734;SC=TGGGCACTGGGGGAAGGAGAA;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=133367663;WS=133367645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	133368361	rs70948202	T	TC	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=508;SC=TGGGTAAGGCTTGAGACTTGC;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=133368369;WS=133368351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	139100372	rs4479754	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=260;SC=AATTCTTACCCGACATTATTC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=139100380;WS=139100362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	139103366	rs10016559	A	G	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=102;SC=AGAAAGTAAAATACTATCTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=139103374;WS=139103356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	139140388	rs10025342	G	A	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=49;PP=2530;SC=AATGAACTACGCAAACCACCA;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=121;WE=139140396;WS=139140378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	139965724	rs3805213	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=0.535;SC=TGAGTGATGCCAAACCTCCTG;SOR=0.665;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=9;WE=139965732;WS=139965714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr4	140005294	rs4863628	A	G	7939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=124;NR=106;PP=2965;SC=TACCGGCCCGAATGAGCAGAT;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=124;TCR=106;TR=230;WE=140005302;WS=140005284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr4	140039107	.	C	CA	235	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=59.38;NF=3;NR=3;PP=235;QD=40.0;SC=GATTCCACCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=6;WE=140039115;WS=140039097;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,6:0.33:18
chr4	140039162	rs34114214	CAACT	C	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TGATGGATACCAACTGTGATT;SOR=0.693;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=7;WE=140039173;WS=140039152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	140217010	rs71606834	G	C	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=816;ReadPosRankSum=-0.356;SC=CCACCTGGCGGCCGGAAGTGC;SOR=0.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=57;WE=140217018;WS=140217000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr4	140263849	rs11944434	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=495;SC=TGATCCACCCGCCTTAGCCTC;SOR=3.816;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=140263857;WS=140263839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	140282914	.	C	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=402;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GTTTGACTTTCATACATACTG;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=26;WE=140282922;WS=140282904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr4	140283102	rs3217605	CA	C	2763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.962;NF=5;NR=48;PP=2115;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GTATAATATTCAGAGTTCTTC;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=8;TCR=88;TR=53;WE=140283110;WS=140283092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,81:0.53:154
chr4	140308984	rs998310	C	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=426;SC=TAATAAATTCCCAGTAAGAAC;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=140308992;WS=140308974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	140375296	rs13128486	C	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=315;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GGCGTAATCTCTCAGCCTTTC;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=19;WE=140375304;WS=140375286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr4	140417471	rs4863655	G	T	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=16;PP=904;SC=GCCATTATCAGTAGGCAGAGT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=140417479;WS=140417461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	140417671	rs4863656	G	C	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=68;PP=1881;SC=TGATTCTTCTGGCCACTGAAA;SOR=1.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=140417679;WS=140417661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	140450077	rs72726570	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=2.293;SC=TAATAAACACGATTAAAGAGA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=140450085;WS=140450067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	140616462	rs2646077	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=436;ReadPosRankSum=0.201;SC=AATGATGACTGTGATGCTTAA;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=30;WE=140616470;WS=140616452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr4	140625323	rs925424	A	G	4415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=76;PP=2650;SC=TCCCTTTAATACTTGCAGAAG;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=135;WE=140625331;WS=140625313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	140651584	rs5862430	TCTG	T	8121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=65;PP=2993;SC=TCCGCCAAAATCTGCTGCTGC;SOR=1.058;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=132;TCF=47;TCR=85;TR=98;WE=140651597;WS=140651574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	140809656	rs6839194	C	A	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=30;PP=1436;SC=CAGGGTAGAACAAATGTTATA;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=140809664;WS=140809646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	140809710	rs3775241	C	G	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=45;PP=1511;SC=GATGAAGAGACTGAAAAGCTT;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=140809718;WS=140809700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	140810334	rs3733381	T	C	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=47;PP=2851;SC=CCTTTTCCATTTCTTAGGAGA;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=131;WE=140810342;WS=140810324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	140810637	rs11100342	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=1.976;SC=GTGGAGGTGGCGGCTGCTGCT;SOR=0.250;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=17;WE=140810645;WS=140810627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr4	140810700	rs11729794	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=412;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GCTGGATATACGGCATCAAGG;SOR=1.418;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=24;WE=140810708;WS=140810690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr4	140811063	.	TTGCTGCTGCTGC	T	2824	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=2824;QD=20;SC=TTGAGTGCTGTTGCTGCTGCT;Source=Platypus;TR=42;WE=140811104;WS=140811053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:60,42:0.41:102
chr4	140811083	rs373804063	GC	G	4377.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.05;QD=40.53;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	140811085	rs58287721	TGCTGCTGCTGC	T	4369.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.00;QD=40.09;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	140811096	.	C	T	2316	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=61.99;NF=45;NR=42;PP=2316;QD=27.0203587649;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=87;WE=140811104;WS=140811053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,87:0.88:99
chr4	140811135	rs3733382	T	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=75;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.901;NF=29;NR=23;PP=876;ReadPosRankSum=-1.054;SC=GCTGTTGCTGTTTCTGCTGCA;SOR=0.676;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=52;WE=140811143;WS=140811125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr4	141290574	rs2668577	C	T	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=27;PP=964;SC=GGAACATGTTCTGCAAATTAA;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=141290582;WS=141290564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	141294814	rs2271430	G	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=649;ReadPosRankSum=-1.163;SC=GTTGGTCCAAGTGTCCCGGCC;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=35;WE=141294822;WS=141294804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr4	141310226	rs3805317	T	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.156;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.009;SC=CTTTTTCCTCTGAAATGAAGG;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=141310234;WS=141310216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	141311960	rs358329	T	C	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=171;SC=ATACAATAAATGGGATTTATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=141311968;WS=141311950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	141321425	rs2252427	A	G	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=194;SC=TGGGGTACACATTTGTTTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=141321433;WS=141321415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	141372485	rs6536966	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	141377690	rs67200893	G	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=541;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TAATTACGTTGGATAGATAAT;SOR=0.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=34;WE=141377698;WS=141377680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr4	141382963	.	AATT	A	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=132;QD=39.75;SC=AGGAAGAAGAAATTATAGGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=141382973;WS=141382953;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr4	141383034	rs10644682	T	TAC	176.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AATTGGTGTATACACACACAC;SOR=2.093;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=9;WE=141383045;WS=141383024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr4	141383121	rs12505221	A	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=415;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GCATACAGCAACAAAATGCAA;SOR=0.619;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=32;WE=141383129;WS=141383111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr4	141395837	rs11933021	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.313;SC=TCCAAAAAAGGCATCTATGGG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=141395845;WS=141395827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	141400567	rs79807066	T	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr4	141400570	rs12502712	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr4	141419274	rs2270564	G	T	4539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.574;SC=AGGAGGGCCCGCCGCTTACTG;SOR=0.567;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=318;TCF=204;TCR=114;TR=171;WE=141419282;WS=141419264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,201:0.52:387
chr4	141446510	rs3833618	C	CTAAT	889.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=853;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GTTGTATAAACTTTTTAAATT;SOR=0.631;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=21;WE=141446518;WS=141446500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr4	141446767	rs3828535	G	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=608;ReadPosRankSum=0.678;SC=AAAGTTTAACGGAGTGTTTTT;SOR=0.390;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=33;WE=141446775;WS=141446757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr4	141458485	rs882930	T	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GCTTTCTAAATAGACATATGA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=141458493;WS=141458476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	141543997	rs1560440	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=862;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CTGCCGTGGCGTGGTACAGCT;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=55;WE=141544005;WS=141543987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr4	141549393	rs2291711	C	A	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1436;ReadPosRankSum=0.849;SC=ACACCTAAAACAGAGACTTCA;SOR=0.490;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=83;WE=141549401;WS=141549383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,101:0.50:204
chr4	141554949	rs10002459	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.836;SC=TAGAGGCAACGATTTATCCAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=141554957;WS=141554940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	141555062	rs6851737	G	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=443;ReadPosRankSum=1.539;SC=CACAACTCCAGCATCCCATCC;SOR=0.406;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=32;WE=141555070;WS=141555052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr4	141590135	rs61742550	C	T	3699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=55;PP=2438;SC=CCAGCTCCCGCGTTTTCTCTG;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=122;WE=141590143;WS=141590125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	141677006	rs70943501	A	AG	1065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=992;SC=CCTGCAGCCCAGGCCGCGGGC;SOR=3.477;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=24;WE=141677014;WS=141676996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	141771676	rs144576376	T	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=1.468;SC=TCATTAAAATTTTTTATTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=141771684;WS=141771666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	141771715	rs78877852	G	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-1.004;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr4	141832180	rs17338203	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=0.256;SC=TAACTGATGAACCTAGCAATG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=141832188;WS=141832170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr4	141847077	rs13138724	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=986;ReadPosRankSum=-1.331;SC=TCCCTGCTTTGAGGGCAACGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=64;WE=141847085;WS=141847067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr4	141847110	rs13120735	T	C	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=883;ReadPosRankSum=0.203;SC=ATTATAATGCTGTAGGCTGTG;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=70;WE=141847118;WS=141847100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,81:0.48:170
chr4	141847279	rs12503723	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=1.257;SC=GAGAATACCTGGTCCACCATG;SOR=0.120;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=14;WE=141847287;WS=141847269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr4	141866754	rs71584389	ATACATATATATAC	A	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=1;PP=44;SC=ATATACATATATACATATATA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=1;WE=141866774;WS=141866744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	141868736	rs2321687	G	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=439;SC=CCAGCAGGTCGGGGCCAGGGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=141868744;WS=141868726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	141869062	rs6857782	C	T	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=688;SC=CTTCCAACCTCTACTTCTTGT;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=141869070;WS=141869052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	141870648	rs4956494	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=327;SC=ATGAATGCTAGCAATGACGAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=141870656;WS=141870638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	141924720	rs200083054	TACACACACAC	T,TAC	1064.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=10,10;NR=4,4;PP=386,346;SC=CCCTAGCACGTACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=14,14;WE=141924739;WS=141924710;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.94:35
chr4	141927365	rs138771695	CATATATATACACATATATATGTGTATGTAT	C	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=564;SC=TATATACACACATATATATAC;SOR=1.765;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=141927402;WS=141927355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	141940074	rs4245936	T	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=17;PP=531;SC=TGAAATATTATACAGGTTTTT;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=141940082;WS=141940064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	141983473	rs28430438	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=-0.139;SC=ATAAACATGCATCTTATATAT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=141983481;WS=141983463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr4	142000000	.	CACAT	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=-2.450;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	142000004	.	T	C	98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=98;QD=22.1285354245;SC=CACACACACATACATACATAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=142000012;WS=141999994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,6:0.67:9
chr4	142640462	rs1493013	CC	TT	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=1702;SC=TTAATTCCCTCCCTTTCTTTT;SOR=3.202;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=38;WE=142640471;WS=142640452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	142640538	rs2254514	T	C	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=44;PP=1435;SC=TAGGAGGCATTGTGGATGGAT;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=91;WE=142640546;WS=142640528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	142640637	rs2857261	A	G	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1158;SC=TCGGTAAGAAAAAAAATAGAT;SOR=1.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=142640645;WS=142640627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	142651159	rs12510030	T	C	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=58;PP=2599;SC=AACAGTTGCTTAGAGTTGCAT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=121;WE=142651167;WS=142651149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	142651265	rs17007610	T	C	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=48;PP=1203;SC=AGTGGAGTGGTGTGCAAAAGT;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=142651273;WS=142651255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	143003155	rs11446749	G	GA	1451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=13;PP=995;SC=GACCTTAAAAGAAAAAAACTT;SOR=1.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=34;WE=143003163;WS=143003145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	143007197	rs336325	C	T	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=932;SC=TGACACCTGGCAACCCAAAGT;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=143007205;WS=143007187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	143007419	rs336324	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=17;PP=470;SC=TCTGAAGGGGAAAAAACAAAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=143007427;WS=143007409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	143007460	rs336323	T	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=114;SC=GTGTTCACATTAAGCTGCCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=143007468;WS=143007450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	143044666	rs2645786	A	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=382;SC=AGATTCGATTATCAGGTATGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=143044674;WS=143044656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	143130034	rs1907123	A	T	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=22;PP=1279;SC=GTAAGTAGAGAAATTGCTTCC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=143130042;WS=143130024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	143130219	rs1994217	T	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=384;SC=TATTTTTATCTTAAATCCATA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=143130227;WS=143130209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	143181748	rs1907111	T	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.41;QD=24.80;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	143192086	rs150117601	T	TTG	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-0.253;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.930;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	143226768	rs2627808	G	T	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=909;SC=CAAACAAAATGAGTCTTTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=143226776;WS=143226758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	143226784	rs2636640	G	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=19;PP=871;SC=TTAGAAGAATGAAATATTAAA;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=143226792;WS=143226774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	143268528	rs882004	T	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=0.859;SC=TCCAATTACCTGATTATTATT;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=19;WE=143268536;WS=143268518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr4	143305189	rs11944462	A	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.826;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=540;ReadPosRankSum=-1.643;SC=TGAACAGGTGACTGAGCAAGT;SOR=1.284;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=31;WE=143305197;WS=143305179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr4	143305343	rs11944503	A	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=1.048;SC=ATTCCAGTACATGTGGGTTAA;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=17;WE=143305351;WS=143305333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr4	143324036	rs1982965	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=313;ReadPosRankSum=0.107;SC=AAAAATCCAATCGTGTGGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=18;WE=143324044;WS=143324026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr4	143324094	rs1982966	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=819;ReadPosRankSum=0.952;SC=TACTTACGGTGTCATGAGACT;SOR=1.107;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=44;WE=143324102;WS=143324084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr4	143326271	.	T	G	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=12;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=16;MQ=58.31;NF=0;NR=4;PP=43;QD=19.4428031368;SC=GGGGCGGGGGTGGGGGGGAGG;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=4;WE=143326279;WS=143326261;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr4	143326312	rs138973882	AAGAG	A	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.891;NF=8;NR=4;PP=553;ReadPosRankSum=0.376;SC=GCGAGCCAGCAAGAGAGAGAG;SOR=1.371;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=12;WE=143326323;WS=143326302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr4	143344785	rs3775712	T	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=1.118;SC=ATTGTACCAGTACATATTGTT;SOR=0.191;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=14;WE=143344793;WS=143344775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr4	143348523	rs3775717	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=82;SC=GTTTCTTAGTATATTTTAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=143348531;WS=143348513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	143348680	rs3775718	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=1.042;SC=ACTTGGCTTTCTAAACAAACA;SOR=0.885;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=29;WE=143348688;WS=143348670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr4	143352425	rs138325014	C	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=511;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TCAACCTTCACAGTTTTAAAA;SOR=1.220;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=32;WE=143352433;WS=143352415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr4	144124492	rs4234886	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=411;SC=TTTGTGTTCTGTTTGTAGGCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=144124500;WS=144124482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	144130979	rs148666231	A	AT	107.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=108;SC=AAATATCTAGATTTTTTTTAT;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=144130987;WS=144130969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	144135718	rs4285045	G	A	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=62;PP=2366;SC=CTTATGCCAGGAATATCACAA;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=116;WE=144135726;WS=144135708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	144136193	rs10000911	T	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=486;SC=GAGTTTTTATTAAATTCTGAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=144136201;WS=144136183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	144264722	rs300919	T	C	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=936;ReadPosRankSum=-1.715;SC=AGGCCCACTCTCTGCCCTTAA;SOR=0.475;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=61;WE=144264730;WS=144264712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr4	144380399	rs13114896	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AACATTCATGGACCTCATTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=144380407;WS=144380389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	144381401	rs3795246	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-1.452;SC=ATGAATGATTATAAACATAAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=12;WE=144381409;WS=144381395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	144435355	.	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=372;ReadPosRankSum=1.202;SC=GTTTCTCTCTCTGCACCAGAC;SOR=1.371;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=21;WE=144435363;WS=144435345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr4	144442735	rs11541117	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=901;ReadPosRankSum=1.464;SC=GCAGAACTTACTATCCGTTGG;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=56;WE=144442743;WS=144442725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr4	144445789	rs6857360	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=-0.857;SC=GAGCATATTACAGGATAGTAG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=144445797;WS=144445779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	144447630	rs7694156	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=-0.908;SC=TTCTAGTATTTCATTACATTT;SOR=0.418;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=19;WE=144447638;WS=144447620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr4	144456124	rs6818251	A	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=52;PP=1690;SC=AATGGTATGTATTCTCAGATG;SOR=1.109;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=84;WE=144456132;WS=144456114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	144459637	rs4690724	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	144466050	rs7692376	A	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.821;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=525;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TGAAAATGTAATTTTTTTCAT;SOR=0.343;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=34;WE=144466058;WS=144466040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr4	144467104	rs13139128	T	C	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=41;PP=1656;SC=AGCTGCCTAATGCAGCACAGG;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=95;WE=144467125;WS=144467094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	144469383	rs2088415	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=385;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AAAAAAATCTATGAAGTAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=21;WE=144469391;WS=144469373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr4	144618610	rs1034494	G	C	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=31;PP=1980;SC=ACTCCCCGACGAAGACCTTGG;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=94;WE=144618618;WS=144618600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	144794616	rs66570349	C	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=25;PP=968;SC=AATTATGTTACCAATAACACA;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=144794624;WS=144794606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	144797848	rs6537203	G	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=662;SC=TAAACCCTCCGAGAGCTGTTC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=144797856;WS=144797838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	144799840	rs3775246	G	A	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=45;PP=1489;SC=CCTATAAAGCGAAATTTCAAT;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=74;WE=144799848;WS=144799830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	144801662	rs1132785	C	T,G	7695.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=23,83;NR=46,112;PP=1236,2962;SC=GCTCACAATTCCTGTATAAAA;SOR=1.121;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=264;TCF=106;TCR=158;TR=69,195;WE=144801670;WS=144801652;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.70,0.30:310
chr4	144801728	rs201075956	CA	TG	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.378;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQRankSum=-5.797;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,18:0.20:91
chr4	144802964	rs6824687	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=15;PP=861;SC=CTCTTTGAGATATTCAAATGA;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=144802972;WS=144802954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	144803130	rs6819885	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.27;QD=31.46;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	144809800	rs143390057	C	A	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=85;PP=2965;SC=TTGTCTTGGACAGAATTAACG;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=150;WE=144809808;WS=144809790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	144811428	rs4095436	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=493;SC=GCATATTCCAATCTGGTCACT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=144811436;WS=144811418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	144811470	rs4095435	A	G	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=45.66;NF=1;NR=8;PP=213;SC=AGAACAAAAGAGGATTTCACA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=144811478;WS=144811460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	144824194	rs138724961	T	C	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.927;NF=47;NR=32;PP=852;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CTGTCCTCTTTTCCCAGAATT;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=79;WE=144824202;WS=144824184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,101:0.32:318
chr4	144824269	rs1899967	C	T	8325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.69;QD=37.50;SOR=1.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr4	144824269	.	CTCCC	TTCCC,TTCCT	2016	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=49.43;NF=57,27;NR=126,82;PP=779,2016;QD=4.44683722703;SC=CAGAAAATAACTCCCTGCTAC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=57;TCR=126;TR=183,109;WE=144824281;WS=144824259;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:183
chr4	144824273	rs6818201	C	T	3182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=7.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQRankSum=10.080;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.136;SOR=1.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,134:0.65:206
chr4	144824308	rs202179013	TG	CC	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.900;NF=0;NR=26;PP=1252;ReadPosRankSum=-2.663;SC=TCGGCATTCATGTTTATCATC;SOR=0.564;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=8;TCR=85;TR=26;WE=144824317;WS=144824298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,32:0.32:99
chr4	144917514	rs1980037	A	C	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=44;PP=1603;SC=ATGAGCTAAGACTCCACTTCA;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=144917522;WS=144917504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	144918712	rs1132783	C	G	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=25;PP=1732;SC=TCGGCGAATACTGTAAGAAAT;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=78;WE=144918720;WS=144918702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	144918867	rs1473055	A	G	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=60;PP=1832;SC=TAACATCAGCATAACATCACC;SOR=1.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=82;WE=144918875;WS=144918857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	144918893	rs4835126	A	G	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.79;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	144918900	rs1849110	G	A	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.64;SOR=2.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	144920685	.	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.808;NF=8;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=2.932;SC=AACTGTTCTGCGGGTTTCCTT;SOR=0.680;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=24;WE=144920693;WS=144920675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr4	144921607	rs1849119	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=25;PP=678;SC=ATGAGCTGGACATGTGTCCCG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=144921615;WS=144921597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	144938033	rs5862681	A	AT	209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.14;QD=29.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	145035650	.	AAC	A	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=108;QD=41.0;SC=AACAAAACAAAACACTTTGTG;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=145035659;WS=145035645;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	145035788	rs6857303	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=398;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GTAACTCACTGGTTTGATTTT;SOR=0.959;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=30;WE=145035796;WS=145035778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr4	145039801	rs145195209	AT	A	1527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.910;NF=25;NR=15;PP=1463;ReadPosRankSum=0.420;SC=TTTCTTAGGCATTTGAAACAA;SOR=1.034;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=40;WE=145039809;WS=145039791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr4	145040962	rs6857144	CA	GT	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=25;PP=1532;SC=TGAGAAAGGGCACAAGAATGA;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=36;WE=145040971;WS=145040952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	145041686	rs4867	A	G	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=33;PP=1837;SC=CTGAAGAAGAAGTTGAAGTGT;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=145041694;WS=145041676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	145041741	rs4449373	T	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=33;PP=1215;SC=GCTCACAATTTCTGTATAAAA;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=145041749;WS=145041731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	145059464	rs60684024	A	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.918;NF=8;NR=39;PP=896;ReadPosRankSum=2.085;SC=TTTCTTAAGCAGCTTTCGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=47;WE=145059472;WS=145059454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr4	145061822	rs71590434	CA	C	1544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.297;NF=15;NR=32;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GAAGTTAGTGCAAAAAAACTA;SOR=0.888;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=47;WE=145061830;WS=145061812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,71:0.42:170
chr4	145573954	rs3215015	GA	G	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.026;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=267;ReadPosRankSum=0.259;SC=TTCCAGGTAAGAAAAAAAAAT;SOR=1.445;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=18;WE=145573962;WS=145573944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr4	145579907	rs6537301	G	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=358;ReadPosRankSum=0.041;SC=TATGACATTAGGTGCTTCTAA;SOR=0.588;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=22;WE=145579915;WS=145579897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr4	145580172	rs114633728	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=330;ReadPosRankSum=0.876;SC=TGACAGTGAATCAACTGTCTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=145580180;WS=145580162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr4	146002698	.	TAA	T	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr4	146046138	rs4835203	T	C	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=2;PP=269;SC=TTTTTTTCTCTTAGTCCTCAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=146046146;WS=146046128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	146048554	rs4148234	T	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr4	146048583	rs1378314	T	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=25;PP=1027;SC=AGGCACTGTTTTAAGCACAGC;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=146048591;WS=146048573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	146065006	rs9991890	C	T	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=852;SC=TATAAAATTTCGAAATTATTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=146065014;WS=146064996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	146086269	rs17726651	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=75;ReadPosRankSum=-1.987;SC=CCACTGGTTTCATTTTCTTTT;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=9;WE=146086277;WS=146086259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr4	146463966	rs1497126	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=1.550;SC=AAAAATAGAGTCCAATGTTAA;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=146463974;WS=146463956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	146572140	rs11721510	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=649;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AAGTAGAATGGAAATGGTCAA;SOR=0.841;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=33;WE=146572148;WS=146572130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr4	146572227	rs11721553	G	A	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1329;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TGGGTCAGTCGGAGTTTGCTG;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=83;WE=146572235;WS=146572217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,110:0.57:193
chr4	146601680	rs7683750	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=0.756;SC=CCCTGAGAGACTTCATAGACT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=146601688;WS=146601670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr4	146601701	rs7682360	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=-1.434;SC=TTAACCCTCTGTATTTTCTTT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=146601709;WS=146601691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr4	146653620	rs10008599	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=521;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TGGACGGTGCGATTCTGAAAG;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=33;WE=146653628;WS=146653610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr4	146686396	rs76846242	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=186;ReadPosRankSum=0.097;SC=AGCTCCTCCCCACTTCCTCCC;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=13;WE=146686404;WS=146686386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr4	146686414	rs79822587	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=1.408;SC=CCCGCCTCCTCCGACGCCTGA;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=146686422;WS=146686404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	146700781	rs9308196	A	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=-1.010;SC=AGTAATTGCAAATGAGTCTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=11;WE=146700789;WS=146700771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr4	146767313	rs34221205	C	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.892;SC=AGATCCTCCCCATCTTACTGG;SOR=0.204;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=146767321;WS=146767303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr4	146770389	rs71973224	GT	G	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.719;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr4	146806762	rs375112310	CAGAGAG	C	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQRankSum=0.935;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.007;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	147177822	rs28406249	A	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=510;ReadPosRankSum=2.023;SC=CTCTGGATACAAACAGATTTC;SOR=0.488;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=30;WE=147177830;WS=147177812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr4	147177868	rs34063596	T	TC	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=483;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CTTTGTCATTTCCCCTCCCAC;SOR=0.425;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=16;WE=147177876;WS=147177858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr4	147213912	rs4516736	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.431;SC=CCCTTTGTAATGTCTACAATT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=147213920;WS=147213903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	147364052	rs1344140	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-2.182;SC=TCATTCTCCCCTCCCCCACTA;SOR=0.569;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=6;WE=147364060;WS=147364042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr4	147425114	rs7439061	A	T	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=859;ReadPosRankSum=-1.897;SC=AAATAATTTTATAATCATAGA;SOR=1.449;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=43;WE=147425122;WS=147425104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr4	147560457	.	T	TGGC	1607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.713;NF=14;NR=23;PP=1678;ReadPosRankSum=2.484;SC=ACGCTGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.582;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=98;TCF=22;TCR=76;TR=37;WE=147560465;WS=147560447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,57:0.92:62
chr4	147560692	rs1504360	T	A	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=39;PP=1036;SC=TCCAACCAATTTTCCCCTCTC;SOR=4.514;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=147560700;WS=147560682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	148457005	rs113823592	CT	C	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=2.226;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr4	148463840	rs5335	G	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=54;PP=1753;SC=GCAACTGTGAGTCCGGGAATC;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=83;WE=148463848;WS=148463830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	148560357	rs2654935	C	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=297;SC=TAGTACTTGACAGAATGCTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=148560365;WS=148560347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	148589677	rs2718454	C	T	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=32;PP=1874;SC=TGAAAATGGACTAATACACTT;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=148589685;WS=148589667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	148591769	rs2036502	G	T	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=33;PP=1998;SC=TTAATCAGTTGTAAGTATTTT;SOR=1.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=96;WE=148591777;WS=148591759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	148601729	rs7666065	C	T	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=273;SC=CACTATTGAACAATCACCTTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=148601737;WS=148601719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	148778685	.	G	GT	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=61.19;NF=4;NR=1;PP=93;QD=21.0;SC=TTTAATCATAGTTTTTTTTTT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=148778693;WS=148778675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr4	148787669	rs4240341	G	A	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=190;SC=AGGGAAAAAAGCATCATTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=148787677;WS=148787665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	148796464	rs7663294	C	G	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=463;SC=TTAGGAGAAACACATTCCAGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=148796472;WS=148796454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	148800299	rs13147854	A	G	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=24;PP=1519;SC=CGTTTTAGACATTTCCTCTTT;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=148800307;WS=148800289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	148827697	rs35780665	T	TA	1551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.681;HP=10;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=772;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CAGATAAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.492;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=38;WE=148827705;WS=148827687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
chr4	148827747	rs12509618	A	C	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=37;PP=1613;SC=CTTGCCTTTTAGTGGCCAAGG;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=84;WE=148827755;WS=148827737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	148827973	rs11099672	A	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=351;SC=GTTCCCTTCTATAACAGGTAT;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=148827981;WS=148827963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr4	149002016	rs10708334	AT	A	852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=623;SC=ATCTGTATATATTTTTTTATT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=23;WE=149002024;WS=149002006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	149035449	rs1879829	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=580;ReadPosRankSum=-1.063;SC=ATTTCCAGGATGGAAAACAAC;SOR=1.038;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=39;WE=149035457;WS=149035439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr4	149073555	rs2272089	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=298;SC=TTAGAAATTACTGAAAGAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=149073563;WS=149073545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	149075928	rs151096115	A	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=0.184;SC=GTTCTTTTGCAGGAGCGATGT;SOR=0.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=22;WE=149075936;WS=149075918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr4	149116035	rs4835500	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=0.492;SC=AATAAAAAATAACTGTTAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=9;WE=149116043;WS=149116025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr4	149356516	rs5525	A	G	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=83;PP=2965;SC=AATAGCTCCCATCATCTGGTT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=153;WE=149356524;WS=149356506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	149357475	rs5522	C	T	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=71;PP=2965;SC=CTTTTAACAACGGCGCGCATG;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=149;WE=149357483;WS=149357465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr4	149358014	rs2070951	G	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=889;SC=GGTCTCCATCGCTAACAAATA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=149358022;WS=149358004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	151161470	rs11931842	A	G	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=866;ReadPosRankSum=-1.768;SC=TTTTCCTAACAAATAAAGGCA;SOR=0.982;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=58;WE=151161478;WS=151161460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
chr4	151161490	rs6838238	T	C	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=56;PP=2921;SC=AATACTCCAGTACCATGGAAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=88;TCR=56;TR=144;WE=151161510;WS=151161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	151161502	rs6813035	G	T	4977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=68;PP=2965;SC=CCATGGAAGGGTCTTGGGAGC;SOR=1.010;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=160;WE=151161510;WS=151161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr4	151177340	rs13152819	CC	TG	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=3;PP=271;SC=CACCCCCCACCCTCCTCCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=151177349;WS=151177330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	151177432	rs13101258	A	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=6;PP=139;SC=CGCCTGCTGCAGCCCAGGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=151177440;WS=151177422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	151199080	rs2290846	G	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=1017;ReadPosRankSum=0.368;SC=CTTGAGGTCCGACACCTGCCG;SOR=0.823;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=62;WE=151199088;WS=151199070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
chr4	151207127	rs3749574	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=492;ReadPosRankSum=-0.982;SC=GCACACACCGCAGCACATGTG;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=42;WE=151207135;WS=151207117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr4	151231371	rs1813134	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=1.572;SC=ATAAAGAAAATGAAAATTACC;SOR=0.657;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=17;WE=151231379;WS=151231361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr4	151231606	rs116243772	G	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=-0.722;SC=TGAGGGAGAAGAGGAGACACA;SOR=0.375;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=16;WE=151231614;WS=151231596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr4	151242312	rs11737450	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=968;ReadPosRankSum=1.326;SC=TCAGCAGTTACCATGCCTTAT;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=68;WE=151242320;WS=151242302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr4	151356900	rs2271043	G	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-1.817;SC=TGTTCCCTCAGGCATAAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=151356908;WS=151356890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr4	151357816	rs2292122	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.132;SC=TCTAATTTTTGCATATCCTTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=151357824;WS=151357806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr4	151408800	rs7674989	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=576;SC=TACAGATTAATGTTAATAAGA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=151408808;WS=151408790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	151505322	rs13105060	T	A	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=40;PP=1380;SC=CACACAACTCTGCTATAAACA;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=151505330;WS=151505312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	151511715	rs4401437	T	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=431;SC=AAGGAGAAACTGTAGAAGGGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=151511723;WS=151511713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	151656589	rs1993109	C	T	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1107;SC=TCACTGCTTACGGTGGAGAGG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=151656597;WS=151656579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	151719263	rs1129998	A	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=456;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CCAATTCCACAACTGAACTAC;SOR=0.618;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=31;WE=151719271;WS=151719253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr4	151738171	rs150259869	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=0.591;SC=TAAAAGTACAATGGTTTCTAA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=151738179;WS=151738161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr4	151765243	rs186080	G	A	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=57;PP=2274;SC=AAGACATATTGTAACTTACTA;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=119;WE=151765251;WS=151765233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	151829659	rs1201207	T	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=648;SC=TCAATGATTTTTTTTCCAAAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=151829667;WS=151829649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	152024326	rs4696658	T	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=484;SC=AAAGGTCTGTTGAAATCCTGT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=152024334;WS=152024316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	152048936	rs11099782	A	T	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=927;SC=AACATTTTTTAAAAAAAAACG;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=152048944;WS=152048926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	152053408	rs7664483	G	A	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1281;SC=ATATTCTCTTGAAAATTATGA;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=152053416;WS=152053398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	152069406	rs150487703	TACACACACACACACAC	T,TACACACACACAC	420.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=1,1;NR=7,7;PP=480,1924;SC=TGTCCTGTCTTACACACACAC;SOR=1.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8,8;WE=152069429;WS=152069396;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.82:11
chr4	152070633	rs3792611	T	A	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=56;PP=2242;SC=TTTCTCTAACTTTTCCCACAT;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=123;WE=152070641;WS=152070623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	152201018	rs148861921	G	GCAGGT	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.261;NF=3;NR=9;PP=636;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GCTGGCCTTGGCAGGTCAGCC;SOR=0.967;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=12;WE=152201026;WS=152201008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr4	152201053	rs36097019	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=432;ReadPosRankSum=0.404;SC=AACTTTATCTGTGGAGGTTCC;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=25;WE=152201061;WS=152201043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr4	152201204	rs1875308	A	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=231;SC=AAAGTGGTAAAATAGGCAGGG;SOR=2.494;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=10;WE=152201212;WS=152201194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	152203664	rs6849871	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.253;SC=AAATATTTTTCAACAAAACCA;SOR=0.307;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=152203672;WS=152203654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	152212486	rs13126069	C	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=796;ReadPosRankSum=1.996;SC=GGCTCTCCTGCGTCCCTCCTG;SOR=0.737;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=54;WE=152212494;WS=152212476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr4	152212540	.	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=718;ReadPosRankSum=-1.605;SC=CACTGTAGCTGAAGCTGTTGC;SOR=0.451;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=46;WE=152212548;WS=152212530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr4	152212603	rs2407221	T	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=35;PP=1158;SC=CAGGGGCAGATAACTCACAGG;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=152212611;WS=152212593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	152212704	rs13102005	T	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GGGGTTGGAATGTGAAGAGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=152212712;WS=152212694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	152583907	.	C	CT	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9999;HP=16;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=61.49;NF=3;NR=3;PP=73;QD=12.6666666667;SC=CTGCTGTTAGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=6;WE=152583915;WS=152583897;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,6:0.21:28
chr4	153252061	rs10033601	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=363;ReadPosRankSum=0.647;SC=CTTCACCAATAATAACAGTTA;SOR=0.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=19;WE=153252069;WS=153252051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr4	153267968	rs2714803	A	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=1;PP=706;SC=TGATTTCAAAATTCATCCACA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=153267976;WS=153267958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	153303509	rs75360200	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=740;ReadPosRankSum=0.772;SC=TCTTGGTTGACGAATACTCTC;SOR=0.119;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=45;WE=153303517;WS=153303499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr4	153332380	rs12644477	T	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=-0.374;SC=ATACAAAGACTGTGAGGAAAG;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=153332388;WS=153332370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	153410390	rs10021011	C	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=287;ReadPosRankSum=0.535;SC=GTGTTGCCCTCGAATTTGAAC;SOR=0.352;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=20;WE=153410398;WS=153410380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr4	153690842	rs4696354	T	C	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=62;PP=2636;SC=TTGGTGCATATGGAATCACCA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=133;WE=153690850;WS=153690832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	153750918	rs10010297	G	A	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=42;PP=1159;SC=AAGAATCATGGTAAGTCTTTA;SOR=2.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=49;WE=153750926;WS=153750908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	153793489	rs35670437	CT	C	337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=313;SC=TTGTGGGAACCTTTTTTTCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=153793497;WS=153793479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	153793528	rs28473137	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.967;NF=10;NR=6;PP=216;ReadPosRankSum=0.905;SC=TTTCAATTTGAACAATATCAG;SOR=0.437;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=16;WE=153793536;WS=153793518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	153870242	.	GTAATAATAATAATAATAA	G	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=1109;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CCTTGTCTCAGTAATAATAAT;SOR=1.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=5;WE=153870267;WS=153870232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr4	153870355	rs12651510	T	C	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=34;PP=1486;SC=GGACCAGGCATGGTGGCTGAA;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=153870363;WS=153870345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	153874666	rs61753649	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=318;ReadPosRankSum=-1.232;SC=TATTTTGGATGCAAAACGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=22;WE=153874674;WS=153874656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr4	153881835	rs3811834	C	T	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=805;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TTATTCTTCACGCAGTAAGAT;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=55;WE=153881843;WS=153881825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr4	153884092	.	G	GGT,GGTGTGT	728.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.929;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.259;NF=8,8;NR=7,7;PP=498,100;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TCTATCTAAAGGTGTGTGTGT;SOR=1.646;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=15,15;WE=153884100;WS=153884082;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.96:28
chr4	153896358	rs3811833	C	T	4673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=85;PP=2965;SC=CAGAGCTCGGCGCCAGGGCGT;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=146;WE=153896366;WS=153896348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr4	153896800	.	C	T	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.329;SC=CTGGACTGCTCAGAGGGAACC;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=98;WE=153896808;WS=153896790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,109:0.43:255
chr4	153897770	rs3811832	G	A	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=37;PP=1583;SC=GTGCCAACACGGAGGCCCCTC;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=153897778;WS=153897760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	154091111	rs34284701	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-1.184;SC=TAACTTCATCCGCATCTAAAG;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=154091119;WS=154091101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	154091282	rs147079859	GAGA	G	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=2.219;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr4	154178549	rs72727901	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=510;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CAGACGCTCAGTGAGAAAAAG;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=27;WE=154178557;WS=154178539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr4	154178697	rs12643843	A	G	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=951;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CTGTGCATGAACTGGCACATC;SOR=0.934;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=60;WE=154178705;WS=154178687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr4	154256251	rs111733088	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=197;ReadPosRankSum=0.686;SC=AGGTTATTTCTGAATGTAACA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=154256259;WS=154256241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr4	154478000	rs10639508	T	TAAATC	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=0.041;SC=ATAATACTGATAAGGGTGCAC;SOR=0.169;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=4;WE=154478008;WS=154477990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	154478222	rs10001845	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.502;SC=CGTATGGAGTCCTTTCCTATC;SOR=0.616;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=20;WE=154478230;WS=154478212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr4	154479430	rs6848033	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.355;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=931;ReadPosRankSum=1.031;SC=TTGGCACTCGTAGAATCTCTA;SOR=0.851;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=54;WE=154479438;WS=154479420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr4	154512437	rs17279148	A	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=33;PP=916;SC=TTTAGCTACCATTTCAAAGCC;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=154512445;WS=154512427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	154513531	rs1371158	A	G	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=437;SC=GTTACATGATATTTCCTCATG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=154513539;WS=154513521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	154513627	rs7669418	A	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=30;PP=1710;SC=TCACACCTAGATCAAGTACTT;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=154513635;WS=154513617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	154513722	rs7669741	C	T	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=65;PP=2309;SC=CCCTAGTGCACCTGCTCCACA;SOR=0.926;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=117;WE=154513730;WS=154513712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	154513856	rs893628	G	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=529;SC=AGTATTAACCGATTAGCTCAT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=154513864;WS=154513846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	154514847	rs13109887	T	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=828;SC=TGTGTGCAAATGTACTCACCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=154514855;WS=154514837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	154514918	rs17279217	T	C	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=29;PP=2064;SC=CAGATGTGAGTGCTGTTTTAA;SOR=1.757;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=102;WE=154514926;WS=154514908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	154514965	rs17370297	T	C	5276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=63;PP=2965;SC=GGCACTGATATGCAGATGATT;SOR=1.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=108;TCR=63;TR=171;WE=154514973;WS=154514955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	154517294	rs7690932	G	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=297;SC=TTGATTAGGAGGATCAAATCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=154517302;WS=154517284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	154519658	rs13118469	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	154519666	rs13118949	G	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	154519679	rs13145743	T	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=680;SC=TATTTAAATTTAAGTACATTG;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=154519687;WS=154519648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	154542161	rs3761657	C	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=AAATGTTTATCTCTTAAGATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=154542169;WS=154542151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	154542814	rs7663417	G	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;QD=30.03;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr4	154553833	rs41280471	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=667;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GGGCCAGGTGAGGATAGGGTG;SOR=0.538;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=43;WE=154553841;WS=154553823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
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chr4	154557383	rs142471814	ATG	A	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=558;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GTATTCGCTGATGTGTATTCA;SOR=0.301;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=154557392;WS=154557373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr4	154557405	rs3214684	CT	C	718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=327;ReadPosRankSum=-0.403;SC=CTTTCTAAGGCTTTTTTTTTT;SOR=0.927;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=25;WE=154557413;WS=154557395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr4	154624656	rs3804099	T	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=715;ReadPosRankSum=-1.065;SC=CAATTCAGAATGTAAGTCATC;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=57;TCR=98;TR=65;WE=154624664;WS=154624646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr4	154625409	rs3804100	T	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=47;PP=1614;ReadPosRankSum=-0.043;SC=GAATACACAGTGTAACAGGCT;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=226;TCF=128;TCR=98;TR=113;WE=154625417;WS=154625399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,133:0.51:263
chr4	154631543	rs2405432	A	T	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=64;PP=2965;SC=TAGTGAATAGATAATGCCTTG;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=148;WE=154631551;WS=154631533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr4	154633580	rs33952548	GA	G	856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=708;ReadPosRankSum=0.531;SC=TATATCCCCAGAAACATTCAA;SOR=0.386;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=20;WE=154633588;WS=154633570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr4	154644454	rs1456384	T	C	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=20;PP=1720;SC=CAGGTGAGTGTGCCAAGCAAG;SOR=1.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=154644462;WS=154644444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	154669733	rs62325093	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=474;ReadPosRankSum=0.311;SC=AACATGTCCTGGAAAAAAACA;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=29;WE=154669741;WS=154669723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr4	154709480	rs3810765	G	A	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=903;ReadPosRankSum=1.137;SC=AAGAGGGAAGGCTTACCTTCC;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=61;WE=154709488;WS=154709470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr4	154709856	rs6535952	A	C	4066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=69;PP=2268;SC=GCAGGTTGGCAGGGATGGGCT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=123;WE=154709864;WS=154709846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	155156207	rs7655799	G	A	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=80;PP=2965;SC=CTTTTCTAACGTCAGCCAGGA;SOR=0.964;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=111;TCR=80;TR=191;WE=155156215;WS=155156197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	155161666	rs6535989	C	T	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=21;PP=1682;SC=GCTTTGGTTTCGGCATCTCTT;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=155161674;WS=155161656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	155163784	rs138768083	TCA	T	1550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=938;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TGCCAAATTGTCACACTTACC;SOR=0.754;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=24;WE=155163793;WS=155163774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr4	155190927	rs11412936	T	TA	265.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=277;SC=TAGGCTAGCTTAAAAAATTCT;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=155190935;WS=155190917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	155225784	rs1352715	A	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=214;SC=CTGTCTTAAAAAAACAAACAA;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=155225792;WS=155225779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	155226421	rs12507663	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.560;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=0.359;SC=GCAATCATTTCTTTGAAATAC;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=155226429;WS=155226411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr4	155241438	rs11935503	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=382;ReadPosRankSum=0.673;SC=ACAATGTATTGTACACTTAAA;SOR=0.323;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=21;WE=155241446;WS=155241428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr4	155241572	rs11935573	G	A	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1572;ReadPosRankSum=2.334;SC=TTCATTTCCTGAGAGGATGCT;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=103;TCR=63;TR=86;WE=155241580;WS=155241562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,94:0.49:190
chr4	155242383	rs62331873	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-0.442;SC=ACCTGAAATACGAATAAAAGA;SOR=1.581;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=155242391;WS=155242373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr4	155243573	rs13109747	C	T	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=85;PP=2666;SC=TATAATCATACGAAAGTATTG;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=134;WE=155243581;WS=155243563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	155243604	rs1352714	T	C	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=64;PP=1974;SC=TATTTCACCATTGTTGGCGTC;SOR=1.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=87;WE=155243612;WS=155243594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	155244401	rs140019361	TTTTG	T	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=392;SC=CAGGTCAGGATTTTGTTTGTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=155244412;WS=155244391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	155244475	rs12500437	G	T	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	155252934	rs4696548	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=339;ReadPosRankSum=0.295;SC=CTCGAGCTATCTGAGTTTCAG;SOR=0.727;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=23;WE=155252956;WS=155252924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr4	155256177	rs6858157	A	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.337;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=51;PP=1319;ReadPosRankSum=0.672;SC=CTGTGAGCCCACCACCGTCTT;SOR=1.276;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=75;WE=155256185;WS=155256167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr4	155256205	rs6858712	G	A	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=68;PP=2128;SC=GACCATCAACGAAAGTGTGGT;SOR=1.241;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=109;WE=155256213;WS=155256195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	155287317	rs10005849	G	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr4	155287535	rs10017772	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-1.314;SC=AAACACAGGATGATTATCATT;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=20;WE=155287543;WS=155287525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr4	155295076	rs11721758	A	G	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=57;PP=1283;ReadPosRankSum=-4.245;SC=CCTTACCTTCACCAGGGCTAA;SOR=0.989;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=181;TCF=67;TCR=114;TR=84;WE=155295084;WS=155295066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,96:0.45:213
chr4	155305491	rs34927139	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.679;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=648;ReadPosRankSum=0.599;SC=TATGGCCCTCCTCCTCATGCA;SOR=2.000;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=29;WE=155305499;WS=155305481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr4	155407407	rs4346631	A	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=525;SC=AGGTCTCGTCAGGGCATGAGA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=155407415;WS=155407397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	155407569	rs12501998	T	C	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=52;PP=1563;SC=TTTTATCAGATGACATGGTAT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=93;WE=155407577;WS=155407559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	155407680	rs13151559	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=19;PP=781;SC=AAGCTGTAAAAGAGGAAAACT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=155407688;WS=155407670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	155410407	rs9999285	C	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=0.388;SC=ACAACCCTCTCCATCCCTTCC;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=16;WE=155410415;WS=155410397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr4	155410650	rs72731014	T	C	3873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1760;ReadPosRankSum=-0.656;SC=CGGTCTAGAGTCCGGATAGTG;SOR=0.707;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=90;WE=155410658;WS=155410640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,102:0.61:168
chr4	155410667	rs55810732	G	A	4126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1656;ReadPosRankSum=1.386;SC=AGTGCTGATCGCACCGCTTTC;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=94;WE=155410675;WS=155410657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,110:0.59:188
chr4	155410731	rs72731016	G	C	2857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1789;ReadPosRankSum=-0.670;SC=ATCTTTGATTGCAGGGAGCCG;SOR=0.597;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=191;TCF=105;TCR=86;TR=107;WE=155410739;WS=155410721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,127:0.55:230
chr4	155410822	rs4696593	G	A	3035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=51;PP=1998;ReadPosRankSum=0.792;SC=CATCGGAGGCGCTGACCCACA;SOR=1.000;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=122;WE=155410830;WS=155410812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,137:0.53:259
chr4	155411065	rs7656522	T	C	7822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=111;PP=2965;SC=GGCCGCCGGGTAGCAACGCGA;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=117;TCR=111;TR=228;WE=155411073;WS=155411055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr4	155411104	rs6536016	A	C	7846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=120;PP=2965;SC=CCAAGGACAGAGAGATGCTCC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=118;TCR=120;TR=238;WE=155411112;WS=155411094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr4	155411574	.	C	T	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.945;SC=ACCTCGGCGCCCGGCTGGGCG;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=100;WE=155411582;WS=155411564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,114:0.56:203
chr4	155411649	rs13130030	G	A	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TTCTCATCCAGCACGCGCAGC;SOR=0.851;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=197;TCF=90;TCR=107;TR=79;WE=155411657;WS=155411639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,104:0.41:252
chr4	155411939	rs17373874	A	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1403;ReadPosRankSum=0.632;SC=ATCGTGGGCAACTGGCAGGCG;SOR=0.775;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=78;WE=155411947;WS=155411929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,94:0.64:148
chr4	155412464	rs13149269	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=403;ReadPosRankSum=0.820;SC=CGGAGCCCGCCGCTGCTGACG;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=25;WE=155412472;WS=155412454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr4	155458728	rs7668014	C	T	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=35;PP=1000;SC=GGGAATACTACGGTTATAAAA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=155458736;WS=155458718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	155459194	rs7668818	A	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=12;PP=551;SC=AAAGATTTTGAATGAAACTTC;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=155459202;WS=155459184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	155460097	rs62330409	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=168;SC=AGCAAAATAGTGCATGAGGAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=155460105;WS=155460087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	155461113	rs7671792	T	C	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=35;PP=1783;SC=CTGTAATAATTTGTGGTTCTG;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=91;WE=155461121;WS=155461103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	155461687	rs62330410	A	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=613;SC=TGAAACCGAAAGTGCACCCTA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=155461695;WS=155461677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	155462148	rs7700005	A	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=910;SC=AATTTTAGAAACCTGATTATT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=155462156;WS=155462138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	155465500	.	C	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=303;ReadPosRankSum=0.116;SC=ACCAGCTTTTCATATTCACTC;SOR=1.165;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=16;WE=155465508;WS=155465490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr4	155465535	rs62330413	A	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=839;SC=TCTATTCTTCAGTGCTTGTCA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=155465543;WS=155465525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	155466869	rs62330417	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=734;SC=AGTTTTAGGGCTATGAAATAT;SOR=3.365;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=155466877;WS=155466859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	155466935	rs11935584	T	C	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=28;PP=1383;SC=GAGGGAAATATGGCAACATGT;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=155466943;WS=155466925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	155467187	rs11940724	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=1299;SC=GGAAAATGTCATATAATAGTT;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=155467195;WS=155467177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	155469959	rs11451354	G	GA	1063.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=13;NR=22;PP=676;SC=TTTAGCAATTGAAAAAAAAAA;SOR=0.850;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=35;WE=155469967;WS=155469949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	155505241	rs148317511	A	AGAAGACAGAGTGCTCCCATTCCCACTTC	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr4	155507164	rs200378626	C	T	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1499;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TTGTGACCATCAGGACCAATA;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=95;TCR=80;TR=90;WE=155507172;WS=155507154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,101:0.52:196
chr4	155507590	rs6050	T	C	4924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.411;SC=CAGCTTCCAGTACTTCCAGGT;SOR=0.737;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=296;TCF=156;TCR=140;TR=178;WE=155507598;WS=155507580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,222:0.61:364
chr4	155508627	rs2070018	G	A	6135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=76;PP=2965;SC=CCTCTACTCAGAAACAAGGAC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=187;WE=155508635;WS=155508617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr4	155510224	rs7656433	A	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=282;SC=TTCCTACCCTATCTCTTCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=155510232;WS=155510214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	155511897	rs2070011	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=161;ReadPosRankSum=-1.487;SC=AAAGGATTGCTGCCACTCCTA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=17;WE=155511905;WS=155511887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr4	155525276	rs2066865	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.921;SC=GTCAATAAAGGTACCATGTAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=155525284;WS=155525266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	155525970	rs1049636	G	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=551;SC=GTCAATAGAAGTTAGCAGTTA;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=155525978;WS=155525960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	155665881	rs139819099	G	T	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=1905;ReadPosRankSum=0.192;SC=CCAGAAAAAGGCACTGCTCAA;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=112;WE=155665889;WS=155665871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,138:0.51:270
chr4	155719919	rs33918255	AT	A	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.931;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.289;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr4	155720274	rs156502	T	C	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1513;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGCATCTTAATGGTCAGATTA;SOR=0.766;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=107;WE=155720282;WS=155720264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,127:0.53:241
chr4	156135676	rs1047214	C	T	5066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TTGAGATCATCCCGGACTTTG;SOR=0.280;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=159;WE=156135684;WS=156135666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr4	156136027	rs2880415	C	T	4574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=83;PP=2921;SC=TGTTCCACATCATCGCCATGT;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=68;TCR=83;TR=151;WE=156136035;WS=156136017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	156273768	rs2305050	T	C	4057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=76;PP=2435;SC=TCATATTCATTAATAGCTTGT;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=118;WE=156273776;WS=156273758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	156274606	rs33994283	CATT	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=149;SC=CTCTGATATTCATTATACTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=156274616;WS=156274596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	156276076	rs3775248	A	G	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=140;SC=AAATGTATAAAGTAAAACAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=156276084;WS=156276066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	156276096	rs3775249	G	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=246;SC=AAGTAAAACCGGAAATCATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=156276104;WS=156276086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	156276289	rs2341894	C	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=633;SC=CATGTAAATACACATTTTTCT;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=156276297;WS=156276279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	156276317	rs2880181	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=489;SC=CCACTCCTATAAGAACAAGAA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=156276325;WS=156276307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	156276433	rs2341893	C	T	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	156276742	rs34426198	ACT	A	398.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=427;SC=TTAAAAGGAAACTCTTTCTCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=156276751;WS=156276732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	156276788	rs6857158	G	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=548;SC=TTTCTATCAGGATTACTTTAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=156276796;WS=156276778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	156276841	rs6834126	T	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=12;PP=1089;SC=TCATTCTTCTTCTCTTAAAAA;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=156276849;WS=156276831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	156283302	rs6829123	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=379;SC=TCCTGTTTTCGCAAAAAAAAA;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=156283310;WS=156283292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	156289900	rs3733390	C	T	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=88;PP=2893;SC=TTTTCTTTTTCAACATACTCC;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=155;WE=156289908;WS=156289890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr4	156289917	rs3733391	G	A	4057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=82;PP=2606;SC=CTCCTTGGCCGAGGTGATGGT;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=132;WE=156289925;WS=156289907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	156632391	rs11944673	A	G	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=94;PP=2965;SC=ACTCTGTGAAAAAATCTTCAA;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=47;TCR=94;TR=141;WE=156632399;WS=156632381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr4	156643183	rs2306554	C	A	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=50;PP=1472;ReadPosRankSum=-1.813;SC=TTATTTTTTGCTTTCAGATGC;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=199;TCF=96;TCR=103;TR=93;WE=156643191;WS=156643173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,128:0.47:270
chr4	156680340	rs1459845	G	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=299;ReadPosRankSum=0.803;SC=ACCCCTCCTCGGCCGGCCTGG;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=20;WE=156680348;WS=156680330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr4	156706482	rs1459853	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=266;ReadPosRankSum=0.029;SC=GTGCTGCAATGTAAGAGTTTA;SOR=0.576;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=20;WE=156706490;WS=156706472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr4	156757789	rs113590442	G	GA	388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=0;PP=272;SC=TTTCAATAAAGAAAAAAAAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=14;WE=156757797;WS=156757779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	156757818	rs1399046	A	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=680;SC=ATTATCAATAATTTAAAAGGC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=156757826;WS=156757808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	156784970	rs932081	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=521;SC=TAATGCTATCCGTAAAAAAAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=156784978;WS=156784960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	156787214	rs1399044	A	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=171;SC=TATATTACTTATATTGTGTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=156787222;WS=156787208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	156787340	rs6848883	G	A	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=23;PP=1125;SC=TTTACTCACCGTTCTCAGCAT;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=156787348;WS=156787330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	156826166	rs2137778	C	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=204;SC=TACTAAAGTTCATAAAAACCA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=156826174;WS=156826156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	156832841	rs12502494	C	T	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=195;SC=TTCTCTTAACCTTTTCTCTTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=156832849;WS=156832831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	156838354	rs74842465	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=-0.391;SC=AACAAACACTGCAAGTTGAGT;SOR=0.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=15;WE=156838362;WS=156838351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr4	156839462	rs2292537	C	T	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=481;SC=TATACATTTGCTATCTAAAAA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=156839470;WS=156839452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	156847230	rs1543108	A	G	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1299;SC=TACCTAAGGGAAAAAAAAGGA;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=156847245;WS=156847220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	156847237	rs10714400	AG	A	1857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=37;PP=1711;SC=GGGAAAAAAAAGGAATTATTA;SOR=1.453;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=156847245;WS=156847220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	157563266	rs7658059	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=369;SC=TTGCCTGAGAAAGGCTAGACA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=157563274;WS=157563263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	157684248	rs3815861	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=959;SC=GCGGCTATCCTCCTGTGCTCC;SOR=1.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=42;WE=157684256;WS=157684238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	157700394	rs17035231	A	G	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=1274;SC=GAATTCATTCAAAAAGTTATC;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=157700402;WS=157700384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	158005876	rs7667450	G	A	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1270;ReadPosRankSum=1.741;SC=TACTAAGAAGGGTAGGTTACT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=64;WE=158005884;WS=158005866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr4	158041591	rs11932115	G	A	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=476;SC=AGAAGAAAAAGCCATACTATA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=158041599;WS=158041581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	158041896	rs3775724	G	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=TATTTTATATGTATATGCTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=158041904;WS=158041886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	158043559	rs41280501	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=300;SC=GGTAAGATTGCAATTAATTTA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=158043567;WS=158043549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	158065038	rs12507409	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=554;SC=ACGCCCCAACTCTGCTCATTG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=158065046;WS=158065028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	158238607	rs41279337	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=0.812;SC=ATTTATTAAGCGTTAATATGT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=158238615;WS=158238597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	158238830	rs4302506	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TTGGAAAACATGTTAAAGGGT;SOR=0.430;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=14;WE=158238838;WS=158238820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr4	159076679	rs6830475	C	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=413;SC=ATAAAAACTCCAGGTGCTGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=159076687;WS=159076669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	159076826	rs6830702	C	T	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=60;PP=2515;SC=CAGTACAACCCGATTCAGGCT;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=129;WE=159076834;WS=159076816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	159165436	rs200840917	T	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
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chr4	159590910	.	G	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.727;NF=9;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=0.110;SC=TTTGGTTAATGAAAAGGCTGC;SOR=0.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=25;WE=159590930;WS=159590900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr4	159601676	rs11559290	C	T	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=21;PP=1019;SC=CTATGTGCTACAAGATGGTCT;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=159601684;WS=159601666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	159620035	rs7679753	A	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.886;SC=CTTTTGAGTAAAAGAAATTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=159620043;WS=159620031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	159629814	rs17843966	A	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=0.227;SC=AAAATTTTATACTATATGTAA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=159629822;WS=159629804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr4	159630817	rs8396	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=1.380;SC=ATCATATTCATAGACAAAAAC;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=7;WE=159630825;WS=159630807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr4	159631991	rs9410	G	T	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=642;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GATGGGTCTAGTTCAAGAGCC;SOR=1.018;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=43;WE=159631999;WS=159631981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr4	159640565	rs7666472	G	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=291;SC=CCTGTTTGTCGCTCCCCACCC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=159640573;WS=159640555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	159644494	rs2070630	G	C	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr4	159644501	rs2070629	C	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr4	159858736	rs11737459	T	A	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=73;PP=2315;SC=CATCCAACTGTTTAATCAAGA;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=42;TCR=73;TR=115;WE=159858744;WS=159858726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	159894199	rs1820511	T	A	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=4;PP=953;SC=GAAAACAGTATACTATGAAAA;SOR=3.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=159894207;WS=159894189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	159894250	rs619128	C	T	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=32;PP=1705;SC=AAAGCCACTCCCCAGTCTTGA;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=159894258;WS=159894240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	159894305	rs662473	T	C	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=58;PP=2095;SC=CCAATTTCACTGACGTACTCA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=159894313;WS=159894295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	160107918	rs10014197	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TTGAAGCATGTAACAATTTAA;SOR=3.442;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=13;WE=160107926;WS=160107908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr4	160114277	rs6834634	G	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=504;SC=GACTGTATGTGTCATTTAAGG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=160114285;WS=160114267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	160162298	rs11930477	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=0.839;SC=TGTATCTAATATTAATAGGAA;SOR=0.551;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=9;WE=160162306;WS=160162288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr4	160162315	rs11944449	T	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGAAATGTTGTGTTTGGAGAA;SOR=1.270;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=15;WE=160162323;WS=160162305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr4	160251417	rs10692663	A	ATG,ATGTG	569.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.596;NF=9,9;NR=0,0;PP=264,169;ReadPosRankSum=-0.965;SC=GTATATGTATATGTGTGTGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9,9;WE=160251425;WS=160251407;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.44:18
chr4	162307312	rs3749598	C	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=974;ReadPosRankSum=-0.325;SC=CCTTTCACATCATTAATGCTG;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=60;WE=162307320;WS=162307302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr4	162459299	rs4691769	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=27;PP=1729;SC=TGTGTGCTGTTGGGTGGTTCT;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=84;WE=162459307;WS=162459289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	162841814	rs5863499	T	TA	1649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=1008;ReadPosRankSum=1.296;SC=CCTGAAGAATTAAAAAAAAAT;SOR=1.498;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=41;WE=162841822;WS=162841804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr4	164048199	rs4691895	G	C	4657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=60;PP=2642;SC=AAACCAAAAAGTTTGTGTGAC;SOR=1.001;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=144;WE=164048207;WS=164048189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr4	164085425	rs4691896	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=11;PP=884;SC=TCCTTCTCAATTTGTAAATCA;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=164085433;WS=164085415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	164087954	rs936562	A	T	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=36;PP=976;SC=CCAGAAATAGAAAAACAACTT;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=164087962;WS=164087944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	164477252	rs33943246	A	AT	941.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.014;NF=3;NR=30;PP=579;ReadPosRankSum=0.049;SC=ACATTATTAGATTTTTTTTCG;SOR=0.704;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=80;TCF=5;TCR=75;TR=33;WE=164477260;WS=164477242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr4	164507104	rs7435076	G	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=-0.748;SC=ACAGCAGCCAGTATGAGATCT;SOR=0.180;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=164507112;WS=164507094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	164533316	rs907431	A	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=498;SC=AAAAAGAACAATGTAAATAAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=164533324;WS=164533306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr4	165118796	rs2288674	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=897;ReadPosRankSum=1.348;SC=GTTGTCCAGGGCAAGTTCTTT;SOR=0.808;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=56;WE=165118804;WS=165118786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,63:0.52:120
chr4	165878609	rs3196673	T	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=688;ReadPosRankSum=-0.331;SC=GGTTTGGGTCTGCAGTGGGCT;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=37;WE=165878617;WS=165878599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr4	165891214	rs201160598	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQRankSum=-3.171;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
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chr4	165891236	.	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.50;MQRankSum=-3.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr4	165891247	rs201936482	A	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQRankSum=-2.679;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.947;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr4	165891270	.	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.67;MQRankSum=0.854;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr4	165891273	.	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.67;MQRankSum=0.854;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr4	165981142	rs6819917	A	G	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=869;ReadPosRankSum=0.247;SC=TTCCTCCCCAATATTCTGCTC;SOR=0.565;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=45;WE=165981150;WS=165981132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr4	165981670	rs17045936	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=1.097;SC=CAGATTCACAACCTCTCAGAA;SOR=0.623;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=22;WE=165981678;WS=165981660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr4	166021811	rs6536890	G	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=908;ReadPosRankSum=1.944;SC=CAAGTCTCTTGAGATGCCTTG;SOR=0.535;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=55;WE=166021819;WS=166021801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,77:0.53:146
chr4	166199345	rs55806488	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.170;NF=22;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=0.535;SC=TCAAACCGCTCCATCGTGACG;SOR=0.956;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=36;WE=166199353;WS=166199335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr4	166231868	rs28678193	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=0.333;SC=TAAATGGATTATTATACGCTG;SOR=0.622;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=15;WE=166231876;WS=166231858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr4	166239049	.	G	A	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GGCGTCAGTAGAATATTATAA;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=79;WE=166239057;WS=166239039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr4	166243082	rs60759634	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=-1.027;SC=TGATTTGTACAGTTCCTCCTG;SOR=0.382;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=18;WE=166243090;WS=166243072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr4	166307575	rs17624836	T	C	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=81;SC=ATTTCTCAAATAGGCAAAAAT;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=166307583;WS=166307565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	166960481	rs41280515	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=0.371;SC=TGCTTACCTCCATTTTGCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=25;WE=166960489;WS=166960471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr4	166978220	rs41280517	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	166978539	rs59089153	CT	C	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=237;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GTCTGTCTTCCTCTTTCTTTC;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=166978547;WS=166978529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	166981408	.	T	TA	124	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=20;MQ=60.44;NF=0;NR=8;PP=124;QD=16.25;SC=ACTGTGAAATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=166981416;WS=166981398;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,8:0.57:14
chr4	167012241	rs377180243	GTTT	G,GTT	1559.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=783;SC=TGAGTGATTTGTTTTTTTTTA;SOR=4.680;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=28;WE=167012258;WS=167012231;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:32
chr4	167012250	.	T	TAA	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.44;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	167012381	rs2654492	G	A	5840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=TTGGACGACTGTGTGGCAACA;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=165;WE=167012389;WS=167012371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	167012480	rs2646914	T	C	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=55;PP=1647;SC=GCTTTCAAGCTACACATTCTA;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=167012488;WS=167012470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	167012506	rs2254420	A	G	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=39;PP=1139;SC=CAGCAAATTCAAGTCATGCTT;SOR=2.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=167012514;WS=167012496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	167012543	rs2654493	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=576;SC=ATCCAGGTTTTTCTTCTGGTG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=167012551;WS=167012533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	167932327	rs2558141	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=408;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TAAAATATAATACAAATTGAG;SOR=0.744;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=30;WE=167932335;WS=167932317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr4	168155178	rs11557043	A	G	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TGTCATACTGAGAGATTGTGG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=88;WE=168155186;WS=168155168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,112:0.52:215
chr4	169049106	rs10002305	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=-1.261;SC=AACTCCTGACTTCAGGTGATC;SOR=0.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=169049114;WS=169049096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr4	169083694	rs6836994	A	C	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=22;PP=1507;SC=GATTGGGGATATGAGGGAGCA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=169083702;WS=169083684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	169086441	rs4405979	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=16;PP=550;SC=CAGAGACCTCAGGACACTTCA;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=169086449;WS=169086431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	169098914	rs477897	A	G	4045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=59;PP=2306;SC=AAGGATATACAGACCCTGCGA;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=128;WE=169098922;WS=169098904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	169105563	rs576690	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=567;SC=CAGGATCTGAACCACAGCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=169105571;WS=169105553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	169183789	rs6552581	A	G	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=522;SC=GTTTGTCAATATTATCATCCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=169183797;WS=169183779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	169279170	rs497151	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=145;SC=AGCAGAGCTGATATCTGAGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=169279178;WS=169279160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	169282112	rs2684346	C	T	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=103;SC=AAAAAAACAGCGTGACAGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=169282120;WS=169282102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	169282232	rs2684347	G	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=615;SC=CTTACACAAAGGAAGAGCTAT;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=169282240;WS=169282222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	169282355	rs2684348	T	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=15;NR=22;PP=676;SC=AGCTGTCCCATACGCATCCTA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=169282363;WS=169282345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	169292759	rs6829368	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=877;SC=ACCCATAAACTTACCCATTTT;SOR=2.608;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=169292767;WS=169292749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	169299676	rs10517990	T	G	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=34;PP=969;SC=TTGATTCCATTTATTTTCTGC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=169299684;WS=169299666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	169301059	rs1489232	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=293;SC=ATAGTACACATACATACTATA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=169301067;WS=169301049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	169311790	.	G	GT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=10;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=30;QD=21.0;SC=ATTATTGTCAGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=169311798;WS=169311780;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr4	169312798	.	A	AG	543	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=18;MQ=65.62;NF=4;NR=15;PP=543;QD=31.9392505511;SC=GTCACTACCTAGGAAAAAAAA;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=19;WE=169312806;WS=169312788;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,19:0.70:27
chr4	169312801	rs6840397	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.38;MQRankSum=1.493;QD=26.70;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr4	169315571	rs11337868	TA	T	1337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.28;NF=30;NR=1;PP=1299;SC=TTCAGCATCATAATATGCACA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=169315579;WS=169315561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	169315760	rs3749499	C	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=78;PP=2418;SC=GTAATACCCTCTCCAAAGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=169315768;WS=169315750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	169317081	rs1826028	C	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=594;SC=ACAACTGTAACGTATTATATT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=169317089;WS=169317071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	169321970	rs79585775	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TAAACATTAATACTTACATCC;SOR=0.919;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=21;WE=169321978;WS=169321960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr4	169336662	rs4692661	T	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=15;PP=489;SC=TCTCTCTCCATAGAGCACTAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=169336670;WS=169336652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	169337741	rs17054123	C	T	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=167;SC=TGAAAGTTATCATAGAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=169337749;WS=169337731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	169341435	rs2130145	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=44;PP=2269;SC=ACATTGTGACAATAATCTCTT;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=118;WE=169341443;WS=169341425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	169341614	.	TACAC	T	184	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=59.79;NF=0;NR=6;PP=184;QD=31.1666666667;SC=TCCATACACATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=169341625;WS=169341604;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr4	169362557	rs13151700	C	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=574;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GACTTTCCAACGTTAAATTCT;SOR=0.719;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=31;WE=169362565;WS=169362547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,43:0.36:118
chr4	169369820	rs2712113	T	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=302;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AGTAGAAGGCTATATTCTTTA;SOR=0.293;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=18;WE=169369828;WS=169369810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr4	169369853	rs2712114	A	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=410;ReadPosRankSum=-0.509;SC=CATACAAGTCAGAAACATGAT;SOR=0.511;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=27;WE=169369861;WS=169369843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr4	169369920	rs12507582	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GAAATATTCACACCACTTGTT;SOR=1.096;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=31;WE=169369928;WS=169369910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr4	169374487	rs2634953	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=334;ReadPosRankSum=-1.331;SC=GTGAAATGGCATTGAAATAGG;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=27;WE=169374495;WS=169374477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,29:0.33:88
chr4	169382822	rs5863935	A	AC	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=1.137;SC=AGAAATCAGGAAAAAAATGAG;SOR=0.569;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=169382830;WS=169382812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	169589214	rs2723705	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.002;SC=AACACTGACATTGTTTTTTTT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=169589222;WS=169589204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	169621111	rs139488523	T	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	169621191	rs6824965	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=0.763;SC=GTCTTTGTTCGAGTGAGATGC;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=8;WE=169621199;WS=169621181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr4	169799448	rs62333013	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=10;PP=367;SC=CTTCGGCCACAGCCAGACGCC;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=169799456;WS=169799438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	169812313	rs6827082	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=20;PP=621;SC=ACATCATCATTATTATTATTA;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=169812321;WS=169812303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	169835048	rs1532651	C	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=22;PP=1864;SC=TTTTAAATAGCAAATCATTTA;SOR=1.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=79;WE=169835056;WS=169835038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	169846255	rs3733656	T	C	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=24;PP=864;SC=TCTCATTTCATTGCGTTTACT;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=169846263;WS=169846245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	169846359	rs66895777	GCT	G	1993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=15;PP=1617;SC=AATTCATATTGCTCTCTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=31;WE=169846368;WS=169846349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	169847646	rs35375934	TA	T	315.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.707;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr4	169928842	rs2877380	G	T	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=17;PP=811;SC=TGTTTCTCCAGCTCTTCAAAT;SOR=1.118;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=43;WE=169928850;WS=169928832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	169931268	rs28371817	G	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	169931274	rs2279038	G	A	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.56;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	169931288	rs2279039	T	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=9;NR=27;PP=712;SC=TGGGAGCCCCTCTCCAGGTTC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=169931296;WS=169931258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	169931326	.	CA	C	58	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=19;MQ=59.82;NF=0;NR=4;PP=58;QD=15.5;SC=ACCGCGGTTCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=169931334;WS=169931316;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,4:0.36:11
chr4	170017860	rs1471172	G	A	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=914;ReadPosRankSum=0.029;SC=AGAGATTTTGGTTAAGGCGAT;SOR=0.791;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=53;WE=170017868;WS=170017850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr4	170037323	rs10017472	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=1.621;SC=TTGTTGAACAGTGAGTCCTCT;SOR=1.302;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=8;WE=170037331;WS=170037313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr4	170051395	rs59830873	TA	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	170077459	rs35455310	AT	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr4	170077540	rs10024401	A	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=492;ReadPosRankSum=-0.317;SC=GAAAACAAGCACATTCTACCT;SOR=1.396;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=36;WE=170077548;WS=170077530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
chr4	170077789	rs10518039	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=547;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CTTTTCCTTCATAGTTGTATA;SOR=1.370;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=32;WE=170077797;WS=170077779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr4	170315496	rs4692721	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=300;SC=AGAATCTTCACTGAAAAATGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=170315504;WS=170315486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	170354836	rs7680152	C	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=16;PP=501;SC=ATAAACGTAACGAGAGACATC;SOR=1.460;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=170354844;WS=170354826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	170354873	rs13139925	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=408;SC=CAAGAGAATATTGAATAAACT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=170354881;WS=170354863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	170428352	.	G	T	89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=53.22;NF=0;NR=4;PP=89;QD=30.9428031368;SC=TTTTTTTTTTGGGCCAGGTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=170428360;WS=170428342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr4	170483153	rs62952760	T	A	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.75;QD=20.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	170581570	rs4692739	G	A	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=35;PP=1819;SC=GGAGGAGACAGTATTCCCCTG;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=170581578;WS=170581560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	170610061	rs145328407	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TTGAAAATCTTAAATTTATAT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=170610069;WS=170610052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr4	170616918	rs2062609	G	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=245;SC=TTTCAGTTTTGTAGGTGATGT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=170616926;WS=170616908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	170623928	rs60812626	CAAAAAAAAAAAA	C	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=21;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=6;PP=2760;SC=CCCATCTCTACAAAAAAAAAA;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=12;WE=170623947;WS=170623918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	170628474	rs1566522	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=384;SC=GAAGAAAGGAAAGCAATAAGC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=170628482;WS=170628464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	170663235	rs1047642	C	T	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=973;SC=CGTTATTTCTCTAAGTTTTTT;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=170663243;WS=170663225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	170663321	rs6849004	C	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=501;SC=AAAGACCTTTCAAAGTTGAGC;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=170663329;WS=170663311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	170678993	rs11540095	T	C	3229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=40;PP=2064;SC=GCGGCCCCTCTCCGCCGGGCC;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=96;WE=170679001;WS=170678983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	170987636	rs1480544	A	G	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=775;ReadPosRankSum=-0.357;SC=AACCCTAGAAAAAGAAAACAA;SOR=0.688;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=47;WE=170987644;WS=170987626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,60:0.45:134
chr4	170989708	rs3214945	C	CA	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=-2.034;SC=AATCTGATTACAAAAAAAAAA;SOR=0.250;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=170989716;WS=170989698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	170991811	rs149355054	AGGTT	A	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=513;ReadPosRankSum=-0.681;SC=AAGCTAAAAAAGGTTGAAGTA;SOR=1.234;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=170991822;WS=170991801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr4	170994554	rs5864015	GT	G	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=2.086;QD=6.62;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	170999860	rs2622068	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=504;ReadPosRankSum=-0.689;SC=TTGTTTATAAGGGGCCAAACA;SOR=0.902;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=27;WE=170999868;WS=170999850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr4	172735897	rs3796654	C	G	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=33;PP=1103;SC=AAAGATCACACAAGGATTGGT;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=172735905;WS=172735887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	172973421	rs1505494	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=316;SC=AGAGCCTCAAGGCAGAGAGGA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=172973432;WS=172973411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	172973423	rs10572855	CAG	C	535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=498;SC=AGCCTCAAGGCAGAGAGGATA;SOR=2.833;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=11;WE=172973432;WS=172973411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	172973580	rs1505495	C	A	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=23;PP=1169;SC=TTTACCCCAACCCATTCACCA;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=172973588;WS=172973570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	173232679	rs2136033	A	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=710;SC=AATAGGCGATAATACACATTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=173232687;WS=173232669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	173232944	rs168011	G	T	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.79;SOR=1.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	173269638	rs333399	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=648;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AAGAGTTTTGTATTTGACACA;SOR=0.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=39;WE=173269646;WS=173269628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr4	173803914	rs6810619	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=647;ReadPosRankSum=0.606;SC=TCATAGTCCTTTAAAGATTAT;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=39;WE=173803922;WS=173803904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr4	173873170	rs11322401	TG	T	3649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=32;PP=2919;SC=ATGACATTTTTGTTTTCCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=173873178;WS=173873160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	173930479	rs4696042	A	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1032;SC=GGCAGTGGGAACCAGTCGGGG;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=173930487;WS=173930469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	174090004	rs3733477	G	A	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TGAAGATTGGGTTCATCTTAC;SOR=0.475;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=80;WE=174090026;WS=174089994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,100:0.49:203
chr4	174235092	rs75731353	A	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-1.451;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr4	174235094	rs73872552	A	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-1.451;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr4	174239704	rs34885736	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=478;ReadPosRankSum=0.529;SC=AATGGCAGTACTTCAAGGTAT;SOR=0.441;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=30;WE=174239712;WS=174239694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr4	174253422	rs73005356	T	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=635;ReadPosRankSum=1.793;SC=AAGCATCCGGTATCATTACTC;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=42;WE=174253430;WS=174253412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,50:0.38:131
chr4	174310777	rs4695833	A	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=214;SC=AGGTCTGGGGAGGAGTCCAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=174310785;WS=174310767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	174537063	rs4413383	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.011;NF=16;NR=1;PP=367;ReadPosRankSum=1.709;SC=TGGAGATCCAGACATAAGTGA;SOR=0.188;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=17;WE=174537071;WS=174537053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr4	175225452	rs4695918	G	A	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=66;NR=42;PP=2134;SC=ACCTCCTTTGGGCAATGAGAA;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=108;WE=175225460;WS=175225442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	175237208	rs4695922	C	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-1.219;SC=ATGCGGATAGCCATTTTTAAT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=175237216;WS=175237198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	175237408	rs1553669	T	C	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=59;PP=1680;SC=GAGCCTCTACTGTTAATTACT;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=175237416;WS=175237398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr4	175238508	rs17358230	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr4	175429213	rs3846298	C	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=16;PP=1135;SC=CCATGTTCTTCTTCTCTTTCT;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=175429221;WS=175429203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	175429370	rs5864277	GT	G	4692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=66;PP=2951;SC=TGATGTACGAGTTAAGGAATG;SOR=0.993;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=86;WE=175429378;WS=175429360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	175443156	rs1050145	C	T	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=594;ReadPosRankSum=0.350;SC=GAGGTTCAAACTGCTCATCCA;SOR=0.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=37;WE=175443164;WS=175443146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr4	175443261	rs45567139	G	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CGCAGCTCACGAAATAGACGG;SOR=1.092;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=29;WE=175443269;WS=175443251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr4	175565245	rs4235212	T	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=623;ReadPosRankSum=0.397;SC=CAAGGCCCTTTAATAATACAA;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=36;WE=175565253;WS=175565235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr4	175580119	rs6553802	T	C	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=0;PP=51;SC=TCCCAATTGCTTCTCTTTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=175580127;WS=175580109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	175580191	rs4365704	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=0.678;SC=AACCCAATACGTTTAATCACT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=15;WE=175580199;WS=175580181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr4	175598334	rs6812439	T	C	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=49;PP=1355;SC=TGATCCAGAATGAAACCCAGG;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=175598342;WS=175598324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	175649861	rs1872548	T	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=12;PP=267;SC=TATGATAAAATAATGAAAGAA;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=14;WE=175649869;WS=175649851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	175688138	rs7696263	A	G	3704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=3.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,98:0.44:221
chr4	175688141	rs12651268	G	A	3682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,98:0.44:223
chr4	175688274	rs143704640	TAC	T	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=240;ReadPosRankSum=0.880;SC=TATTCCATTTTACACACACAC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=6;WE=175688283;WS=175688264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr4	176733450	rs62338073	G	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=268;SC=GAAAAACTGGGGGTTTTTTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=176733460;WS=176733440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	176733451	.	GGT	G	231	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=53.71;NF=0;NR=11;PP=231;QD=23.8181818182;SC=AAAAACTGGGGGTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=176733460;WS=176733440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,11:0.79:14
chr4	176733452	rs113129787	G	T	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.69;QD=47.04;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	177049854	rs28698547	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=384;SC=TCATACAAAACTTGTTAAAAT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=177049862;WS=177049844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	177049880	rs28607147	T	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=482;SC=TTTTCCCTGATCTGACTAGAT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=177049888;WS=177049870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	177050057	rs78649239	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=194;SC=AAAATATTGTGTTTTCTATCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=177050081;WS=177050047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	177050062	rs71830098	CTATCAAATAAAA	C	335.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=834;SC=ATTGTGTTTTCTATCAAATAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=177050081;WS=177050047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	177052925	rs7699831	G	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=53;PP=1627;SC=ATACATAATAGTTTTTTGTGT;SOR=3.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=63;WE=177052933;WS=177052915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	177058580	rs9884643	A	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=262;SC=TCTGCAAATCACAGTTCTTAC;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=177058588;WS=177058570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	177063096	rs9995480	G	A	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=307;SC=TGTATTTAGAGTATTGTTTTT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=177063104;WS=177063086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	177073026	rs4690661	G	A	4574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=58;PP=2563;SC=TGGTGTACCTGCTAAAGAGGA;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=136;WE=177073034;WS=177073016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	177081358	rs9683850	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=665;ReadPosRankSum=-0.008;SC=ACTGGCTCACCCTTACATAAT;SOR=0.846;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=85;TCF=20;TCR=65;TR=38;WE=177081366;WS=177081348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr4	177082032	rs10520338	A	G	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=13;PP=779;SC=AATTAGCTAAAGAATAATTCA;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=177082040;WS=177082022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	177082069	rs7693453	G	C	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=22;PP=1334;SC=TAGGCTGCTTGTGAAGGAAAT;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=177082077;WS=177082059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	177083166	rs2877924	A	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=220;SC=AAAAAGTATTAGTTTGCTTTT;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=177083174;WS=177083156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	177087322	rs4388031	C	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=549;SC=TTTAAGAACACATTCCTTTAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=177087330;WS=177087312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	177093505	rs4538426	T	G	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=19;PP=887;SC=TAACATTGTTTTCAAATCAAT;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=177093513;WS=177093495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	177100644	rs11736872	G	A	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=64;PP=2504;SC=CGGGAAATCTGCTATCTCCTT;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=177100652;WS=177100634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	177113764	rs6857056	A	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=343;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CAGCTGTTTCAAAGGAAAACT;SOR=0.456;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=22;WE=177113772;WS=177113754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr4	177113779	rs12502935	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=335;ReadPosRankSum=-0.033;SC=AAAACTTACCTGGATTCAATT;SOR=0.770;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=26;WE=177113787;WS=177113769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr4	177116463	rs994252	C	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,50:0.44:114
chr4	177116779	rs4565028	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=1.658;SC=GGCGGCGCGGTCTCGTGGGGC;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=11;WE=177116787;WS=177116769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr4	177137988	rs6827525	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=460;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GAAGCAATATCCTTTCCACCA;SOR=1.839;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=26;WE=177137996;WS=177137978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr4	177142488	rs34466424	C	T	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=54;PP=1269;ReadPosRankSum=0.753;SC=ATCCACCCCACACACCTCACC;SOR=1.156;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=36;TCR=95;TR=72;WE=177142496;WS=177142478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr4	177142776	rs10032098	C	A	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.81;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	177142776	.	CA	AA,AC	731	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=35,18;NR=51,28;PP=471,731;QD=5.88106061101;SC=AATATCCAAACATAAGATTCA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86,46;WE=177142785;WS=177142766;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:86
chr4	177142777	rs13120838	A	C	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr4	177143417	rs13147229	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=0.368;SC=TGTTGGATTCCCTCCGTCAGT;SOR=0.994;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=15;WE=177143425;WS=177143407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr4	177143664	rs6553937	C	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=29;PP=858;SC=ATATTTTAGACATCAAAGAAT;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=177143672;WS=177143654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	177146627	rs10013975	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=1.166;SC=CAGATACTTATACTGTACATT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=177146635;WS=177146617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	177248446	rs13104798	A	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.799;SC=ATTCTTGGTCATTTTTTTACA;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=177248454;WS=177248436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	177249533	rs2278903	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=-1.823;SC=ATTGTATCTCATTAATCTCTT;SOR=0.116;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=9;WE=177249541;WS=177249523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr4	177605081	rs5864401	CTCA	C	7471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=50;PP=2969;SC=ACAATCTTAGCTCATCATTTG;SOR=1.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=104;WE=177605091;WS=177605071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	177608875	rs4529000	A	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=480;SC=TCACTTATTTAGAAGAATGAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=177608883;WS=177608865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	177609203	rs13136065	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=201;ReadPosRankSum=0.819;SC=AGAATTATGAGATAAAATGTG;SOR=0.616;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=14;WE=177609211;WS=177609193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr4	177609259	rs2877962	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=2.057;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	177609264	rs2333495	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	177650614	rs3836595	T	TA	330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=409;SC=ACACTGAAATTAAAGAACCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=177650622;WS=177650607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	178167074	rs2118922	G	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=244;SC=TAGTGCCAACGTTTCGTATTT;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=178167082;WS=178167064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	178167282	rs1347894	G	A	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=62;PP=2262;SC=GACCTAAACAGTCACTGAAAC;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=121;WE=178167290;WS=178167272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	178169500	rs3828517	G	A	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=72;PP=2612;SC=GGGGAGGTTTGTGATAGCAAT;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=138;WE=178169508;WS=178169490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	178256759	rs3215157	CA	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5265;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.842;SC=GCTTATAATCCAAAAAAAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=178256767;WS=178256749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	178257516	rs2271102	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=840;ReadPosRankSum=-3.101;SC=TTGATTTTTCGGTACTGTGAA;SOR=0.965;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=16;TCR=68;TR=45;WE=178257524;WS=178257506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr4	178272748	rs1054753	G	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=59;PP=1686;SC=TTCTAAGAGGGTTAATTATAC;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=78;WE=178272756;WS=178272738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr4	178274750	rs13112358	C	T	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=57;PP=2214;SC=ATAACTCAACCATCCAGCAAA;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=178274758;WS=178274740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	178274835	rs13112390	A	C	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=38;PP=1323;SC=AAACAGCCCAATACTCATCAC;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=178274843;WS=178274825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	178281754	rs1876268	G	A	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=55;PP=2162;SC=CCGAGTTGTGGGGAAGGATGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=178281762;WS=178281744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	178355668	rs4690521	C	G	4722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=86;PP=2965;SC=TAACAATTTACGGCAGGAAAT;SOR=1.080;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=56;TCR=87;TR=142;WE=178355676;WS=178355658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	178357566	rs71599314	A	ATAATTG	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=419;ReadPosRankSum=0.057;SC=ATATAACCAAATAATTGAGCA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=178357574;WS=178357556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr4	178359960	rs2228119	G	C	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=60;PP=2321;SC=TTGAGAAGCAGTGGTAGATAA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=178359968;WS=178359950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	178361414	rs34241758	A	C	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=640;ReadPosRankSum=-1.956;SC=TAGGACCTGAACGGTGTTCTT;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=45;WE=178361422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr4	178361621	rs3792607	T	A	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.97;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	178363378	rs11131799	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=537;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CGGCGCAGCCGCCCGCCCAGG;SOR=0.994;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=32;WE=178363386;WS=178363368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr4	178881982	rs13109967	G	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=294;ReadPosRankSum=-1.508;SC=TCTTTCCGGGGATCAAAAGAA;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=23;WE=178881990;WS=178881972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr4	178882120	rs9994032	A	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=355;SC=CCTGAAATGAAATATTTGAAT;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=178882128;WS=178882110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	178887795	rs113648256	T	TTTTC	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=9.558;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=376;ReadPosRankSum=0.415;SC=ATTCTCGTCATTTTCTTTCTT;SOR=0.027;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=10;WE=178887803;WS=178887785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr4	178887811	rs35244240	C	CTTTT	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=9.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.428;SOR=3.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr4	178887815	rs28409849	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.346;HP=9;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=-2.470;SC=TTCTTTCTTTCTTTTTTAATA;SOR=2.572;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=7;WE=178887823;WS=178887801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr4	178911873	rs17065497	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	183267728	.	TA	T	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=58.65;NF=2;NR=0;PP=51;QD=27.5;SC=AAGACATTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=2;WE=183267736;WS=183267718;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,2:0.18:11
chr4	183268148	rs11373586	C	CG	259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=163;SC=GTTGACTCCGCGGGGGGGGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=183268156;WS=183268138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	183268174	rs6552554	C	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.44;QD=27.35;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	183271186	rs10644033	G	GAA	215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=6;PP=136;SC=GTTTTTCCCAGAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=183271194;WS=183271176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	183370056	rs11721730	C	T	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=11;PP=934;SC=AGGGGTTAAGCGGCGCACCGC;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=183370064;WS=183370046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	183370244	rs35591339	AGCG	A	1893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=32;PP=1554;SC=AAGGTGGGTGAGCGGCGGCGG;SOR=2.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=32;WE=183370254;WS=183370234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	183594117	rs3749508	A	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr4	183601590	rs34738241	A	AG	669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.24;QD=29.12;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	183652175	rs10866256	T	C	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=66;PP=2883;SC=AAGAGAATGATATTCCCAGCT;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=129;WE=183652183;WS=183652165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	183659722	rs74988363	G	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=0.267;SC=ATAGATAACTGATGTTGTAAT;SOR=1.218;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=24;WE=183659730;WS=183659712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr4	183664593	rs7676674	G	A	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=48;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CCTAAATTTGGGCTTTTAACC;SOR=0.754;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=44;TCR=93;TR=69;WE=183664601;WS=183664583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr4	183665437	rs6835335	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CAGTATCACACATCATCGAAG;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=17;WE=183665445;WS=183665427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr4	183674597	rs71620945	A	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=667;ReadPosRankSum=0.323;SC=CTTCTCTCAAATACAGGAATG;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=38;WE=183674605;WS=183674587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
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chr4	183815688	rs4742	A	G	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1555;ReadPosRankSum=2.194;SC=GGAACAAGGCAACATACATAC;SOR=0.709;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=102;TCR=102;TR=97;WE=183815696;WS=183815678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,116:0.47:246
chr4	183836490	rs11730323	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=431;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AAACGCAGCACAAAAGGCAGA;SOR=0.700;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=27;WE=183836498;WS=183836480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr4	183838025	rs13114262	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=953;ReadPosRankSum=1.789;SC=AGAAACAGAGAGAACTGGAGC;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=126;TCF=55;TCR=71;TR=60;WE=183838033;WS=183838015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,70:0.47:150
chr4	183838103	rs4371655	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=454;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CGCTCGCAACCCCGTCAGCTC;SOR=0.407;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=22;WE=183838111;WS=183838093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr4	184019757	rs147927096	TG	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CCAGGAGCCCTGGCGGAGGCC;SOR=0.991;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=184019765;WS=184019747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	184020554	rs373223683	CG	C	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GCCCGCGTCGCGGGTTGGCAG;SOR=0.084;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=3;WE=184020562;WS=184020544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	184170025	rs907357	G	A	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=41;PP=1144;SC=TAAGTTATCTGTGCTGAAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=184170033;WS=184170015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	184171187	rs10020261	T	C	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=85;PP=2896;ReadPosRankSum=-0.258;SC=CTCAAACATTTTCTTTTCCAG;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=54;TCR=85;TR=139;WE=184171195;WS=184171177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr4	184180920	rs11132172	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=521;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GCTTTTCTCCGAATAGCATGT;SOR=0.413;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=38;WE=184180928;WS=184180910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr4	184181012	rs17074537	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=1.302;SC=TACTGTTTGAGTGATCAGATT;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=184181020;WS=184181002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	184190355	rs11407064	A	AC	2671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.765;NF=5;NR=44;PP=2023;ReadPosRankSum=0.272;SC=AATAGCACTTAGATTGGGTGG;SOR=0.257;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=10;TCR=82;TR=49;WE=184190363;WS=184190345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr4	184190535	rs6858486	G	A	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1077;ReadPosRankSum=0.326;SC=GTGATTTTCTGTAAAAGTTGC;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=66;WE=184190543;WS=184190525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,80:0.59:136
chr4	184202148	rs11132174	G	T	4284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=88;PP=2709;SC=ATTCCAGAATGATGGAATGCA;SOR=1.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=40;TCR=88;TR=128;WE=184202156;WS=184202138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	184203706	rs2871353	A	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=156;ReadPosRankSum=-1.500;SC=GGATTTTTTTAAATGAGACAT;SOR=0.268;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=184203714;WS=184203696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr4	184207092	rs138568650	A	AT	554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=-0.745;SC=ATATGCAGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=184207100;WS=184207082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr4	184242959	rs6839940	C	G	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=34;PP=1404;SC=GGTAGGGACACTGAGTTTGCA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=72;WE=184242967;WS=184242949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	184243528	rs7688467	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=389;ReadPosRankSum=1.953;SC=CATCCCAGGAGAGATAGTAAA;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=29;WE=184243536;WS=184243518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr4	184366629	rs11282266	T	TGCACA	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=305;ReadPosRankSum=0.352;SC=GCCTGTTTTTTGCACAAGTAG;SOR=0.260;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=6;WE=184366637;WS=184366619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	184366895	rs200057043	AT	A	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=310;ReadPosRankSum=0.621;SC=ATTGTTACTAATTTTTTTAAC;SOR=0.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=16;WE=184366903;WS=184366885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr4	184367558	rs147291711	TCTG	T	3395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=2608;ReadPosRankSum=0.720;SC=TAAACACGGTTCTGCATCATT;SOR=0.427;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=59;WE=184367568;WS=184367548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr4	184426387	rs8872	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=757;ReadPosRankSum=1.412;SC=ACTCGTCGGCCGCGCTCCTGA;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=54;WE=184426395;WS=184426377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,57:0.55:104
chr4	184426526	rs6552675	A	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=428;ReadPosRankSum=2.313;SC=TCAAGGTAGGAGCCGCGGGGC;SOR=0.196;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=27;WE=184426534;WS=184426516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr4	184427580	rs62358469	A	G	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=45;PP=1067;ReadPosRankSum=0.294;SC=TTAAGTGTGGAGGCGAAACCA;SOR=0.431;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=116;TCF=32;TCR=84;TR=65;WE=184427588;WS=184427570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,68:0.57:119
chr4	184577177	rs6838230	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=443;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TAGAGGGTCTTTACTTTCTCA;SOR=0.648;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=23;WE=184577185;WS=184577167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr4	184579883	rs9790356	A	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	184579914	rs9790628	G	C	149.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=68;ReadPosRankSum=0.489;SC=CGGACTCCTGGCCATTCACGC;SOR=0.330;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=184579922;WS=184579904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr4	184585269	rs72691592	A	G	57.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=1.150;SC=CTCTCTCTCTATGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=184585277;WS=184585259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr4	184587658	rs5864850	G	GTACC	1607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AGGCAATGGAGTACCGTTCAG;SOR=0.758;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=21;WE=184587666;WS=184587648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,44:0.40:111
chr4	184587701	rs9996255	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=338;ReadPosRankSum=0.243;SC=TTGACCTCCAGTGAATCTTGT;SOR=1.123;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=21;WE=184587709;WS=184587691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr4	184588121	rs4282227	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=1.368;SC=AATTTATCTTCGGTTGAATGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=184588129;WS=184588111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	184588408	rs62357986	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=0.599;SC=GTATGTTAACTTTAAAAAGCA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=184588416;WS=184588398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	184596446	rs7678174	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=-2.245;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr4	184600601	rs4241779	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=812;ReadPosRankSum=1.192;SC=TTGGAAGTGCAGAGCTGTCTT;SOR=0.482;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=56;WE=184600609;WS=184600591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr4	184600731	rs4862233	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-0.300;SC=ACTGAACCAGGTTTTTTGTCA;SOR=1.127;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=184600739;WS=184600721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	184601195	rs10022122	T	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-0.471;SC=TGAGGTTAAGTTTCCCAGGAT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=184601203;WS=184601185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	184605066	rs62358027	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=819;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CACATACAACGTTCATATGAA;SOR=1.133;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=45;WE=184605074;WS=184605056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr4	184606653	rs11132206	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=289;ReadPosRankSum=0.642;SC=TCAAGAAAGAGTTTTCAAAGT;SOR=0.544;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=17;WE=184606661;WS=184606643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr4	184607970	rs9312316	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=145;ReadPosRankSum=0.202;SC=CTAGATAAAATGAGCTTAGTG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=184607978;WS=184607960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr4	184614874	rs4862234	C	T	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=47;PP=1138;ReadPosRankSum=0.041;SC=TGAAGCTCACCGCTGGCTTAA;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=76;WE=184614882;WS=184614864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,85:0.47:181
chr4	184615117	rs62358032	A	C	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=902;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TCTTCATGGAACAGAACTGTG;SOR=0.617;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=88;TCR=49;TR=61;WE=184615125;WS=184615107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,77:0.44:176
chr4	184619017	rs12651215	C	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.156;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr4	184619029	rs147708886	TGC	T	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.311;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr4	184619034	rs62358033	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.174;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr4	184931818	rs4861597	G	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1040;ReadPosRankSum=0.798;SC=CTAGTGAGACGGTGCTCACGG;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=64;WE=184931826;WS=184931808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,69:0.43:159
chr4	184932609	rs4862282	G	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=42;PP=1683;SC=ACACACATGCGCCTAGCGGGG;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=184932617;WS=184932599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	185038274	rs4642291	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-1.063;SC=AATGATAGGAGAAAGGCTATC;SOR=0.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=5;WE=185038282;WS=185038264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	185074686	rs13147555	A	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=179;ReadPosRankSum=1.458;SC=TGAGATTTGGAATGGATGTTC;SOR=0.112;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=15;WE=185074694;WS=185074676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr4	185075033	rs35344477	A	AT	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=171;ReadPosRankSum=0.683;SC=AAAAAATCAGATTTTTTTTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=11;WE=185075041;WS=185075023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr4	185310218	rs1131553	C	T	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=57;PP=1896;SC=AGTGTGGCCGCCCCTTTCAAG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=86;WE=185310226;WS=185310208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr4	185578229	rs13108061	G	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TTTGTTGTTTGTTTTAGTAGT;SOR=0.126;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=11;WE=185578237;WS=185578219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr4	185583092	rs60624489	C	CTATT	4014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=48;PP=2897;SC=TTATTTCTATCCATCTCTTCA;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=50;WE=185583100;WS=185583082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	185587165	rs2463447	A	G	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=42;PP=1403;SC=AAATTCAGCCAGCATTTAATA;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=75;WE=185587173;WS=185587155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	185612953	rs2696035	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.094;SC=TCCAAATAGCATTGAAACCCA;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=185612961;WS=185612943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	185615567	rs139656616	G	GTATC	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=421;ReadPosRankSum=0.083;SC=ATTCACTTTAGTATCTGTCAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=185615575;WS=185615563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	185616438	rs13478	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=260;ReadPosRankSum=-1.064;SC=GTAGACTGCTCTTCTCATCCC;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=17;WE=185616446;WS=185616428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr4	185622046	rs11728389	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.176;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CTAAGTAACACAATCATTTGT;SOR=2.079;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=22;WE=185622054;WS=185622036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr4	185637418	rs2077205	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=103;ReadPosRankSum=0.940;SC=AAACAAACATCTTTATTACAT;SOR=1.402;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=185637426;WS=185637408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	185652147	rs3806796	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=1.265;SC=AAAAACACAAGAGTTAGGAAA;SOR=2.964;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=18;WE=185652155;WS=185652137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr4	185652201	rs7675046	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=16;PP=440;SC=GACCCTTTCCGCGCATTTTTA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=185652209;WS=185652191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	185655171	rs902174	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-0.062;SC=AGTACTTACCCCTCAGACCTG;SOR=0.941;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=23;WE=185655179;WS=185655161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,32:0.26:123
chr4	185655190	rs876840	C	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-1.796;SC=TGTGAGGCCGCGGCCGCCGCC;SOR=0.864;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=20;WE=185655198;WS=185655180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr4	185681475	rs6825554	G	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=16;PP=1905;SC=ATGGCAATGTGTATGCAGCAA;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=185681483;WS=185681465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	185683840	rs939040	A	G	333.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=297;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GGTCTGCGAGAGATCTCCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=14;WE=185683848;WS=185683830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr4	185686032	rs2292898	C	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=899;ReadPosRankSum=0.607;SC=CAGGCATGGTCAGGCAGCACC;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=59;WE=185686040;WS=185686022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,66:0.40:166
chr4	185686856	rs3792314	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-1.307;SC=TAATTAGCTTCATTTAGCCAT;SOR=1.574;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=14;WE=185686864;WS=185686846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr4	185694697	rs7691972	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=184;ReadPosRankSum=-0.356;SC=CACTTGAACCGCTTCCTTCTC;SOR=0.157;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=14;WE=185694705;WS=185694687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr4	185701549	rs1803898	G	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=432;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AGCCCTTCTGGATCAGTGCTG;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=26;WE=185701557;WS=185701539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr4	185701620	rs7680850	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=222;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AGAAGCAGCATTGGGCCCCAA;SOR=0.234;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=18;WE=185701628;WS=185701610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr4	185735054	rs7676928	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=381;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GAAACTGCACGCAGAGAAGGT;SOR=0.286;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=20;WE=185735062;WS=185735044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr4	185736113	rs2280297	G	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=639;ReadPosRankSum=1.309;SC=ACTCTCCTTAGTTCCTGACAA;SOR=0.851;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=41;WE=185736121;WS=185736103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,60:0.41:148
chr4	185772232	rs145931056	TCCTATGCCCTCC	T	8275.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=77;PP=2967;SC=ATCAACCCTCTCCTATGCCCT;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=26;TCR=78;TR=102;WE=185772251;WS=185772222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr4	185772384	rs1032299	A	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=943;SC=GAGACTAGTCACCAAGAGTCC;SOR=3.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=185772392;WS=185772374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	185859505	rs6821859	T	G	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=32;PP=1933;SC=TTCAGCTTTATGCATTCATCT;SOR=1.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=94;WE=185859513;WS=185859495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	185859682	rs10446837	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=531;ReadPosRankSum=2.120;SC=TGAAAATACTAAACTAAGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=26;WE=185859690;WS=185859672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr4	185940461	rs4862491	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=443;ReadPosRankSum=-2.381;SC=GGAGAGGCGGCTTGCACCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=23;WE=185940469;WS=185940451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr4	185941964	rs6841359	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=1.416;SC=CGCTTTGGGCGCTTTTAGGAG;SOR=2.020;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=17;WE=185941972;WS=185941954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr4	185999348	rs10023344	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.387;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=302;ReadPosRankSum=-0.534;SC=AAAACATGGGTGGGTTTCATG;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=16;WE=185999356;WS=185999338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr4	185999404	rs10033666	A	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=572;ReadPosRankSum=1.175;SC=CAGGAGGCATATGGGATGAAG;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=40;WE=185999412;WS=185999394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr4	185999543	rs6841061	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1168;ReadPosRankSum=-1.263;SC=CTCGAGGAATGAAATGGTCAA;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=71;WE=185999551;WS=185999533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,86:0.54:160
chr4	185999587	rs6818170	T	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=801;ReadPosRankSum=0.584;SC=TAAGCCTTGATCTACCCTATA;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=43;WE=185999595;WS=185999577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr4	186084196	rs5864930	G	GA	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=340;ReadPosRankSum=0.244;SC=TCTCGACTAGGATGCACTTCA;SOR=2.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=186084204;WS=186084186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr4	186091487	rs6820332	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=241;ReadPosRankSum=-1.238;SC=GTGACAGAGCGAGATAGTCTA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=16;WE=186091495;WS=186091477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr4	186097045	rs6855305	C	T	2784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1503;ReadPosRankSum=2.063;SC=TTTTGCTTCCCGGCTTTTCCG;SOR=0.694;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=192;TCF=97;TCR=95;TR=94;WE=186097053;WS=186097035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,131:0.54:244
chr4	186097219	.	C	CA	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=18;MQ=58.4;NF=0;NR=12;PP=138;QD=12.5;SC=CAGAAAAGAACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=186097227;WS=186097209;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,12:0.43:28
chr4	186111639	rs1133657	T	C	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CATTTTGGTGTAGTACTTGAA;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=61;WE=186111647;WS=186111629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr4	186112111	rs3108237	G	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.539;SC=CATTCTCTACGGGGTGTTCTG;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=55;TCR=90;TR=70;WE=186112119;WS=186112101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,77:0.45:172
chr4	186112369	rs34825796	G	GA	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.736;NF=0;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AAATATATCTGAAAAAAAAAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=186112377;WS=186112359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr4	186168387	rs3108252	T	G	32.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.967;SC=CTTTGATTTTTTTTTTTTATG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=186168395;WS=186168378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr4	186170358	rs3108229	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TTTTAACTTTGTAATAAATTA;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=12;WE=186170366;WS=186170348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr4	186208975	rs34265529	A	AG	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=1.960;SC=GGGCCTCAGAATGACTAGCGC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=186208983;WS=186208965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	186320079	rs76073842	T	C	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.193;SC=AAATGCACCATCTTACCTTAA;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=67;WE=186320087;WS=186320069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,92:0.57:162
chr4	186320666	rs11287696	TA	T	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=0.391;SC=TTGTAAGATATAAAAAAAAAG;SOR=0.454;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=10;WE=186320674;WS=186320656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr4	186321067	rs1053218	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.421;SC=ACTGGTTATACTTACCAGAGT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=5;WE=186321075;WS=186321057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr4	186323209	rs3733645	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CACTGTTTCTACAAGGCAGGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=186323217;WS=186323199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr4	186324841	rs13126680	T	A	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=68;PP=1987;SC=TCAATTTAAATAGACAGATTA;SOR=2.486;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=85;WE=186324849;WS=186324831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	186336583	rs10032989	G	A	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=161;SC=TATATCCTTAGTATAGTAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=186336591;WS=186336573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	186339584	rs10003160	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=7;PP=434;SC=GAAGACAGATAGTTTGCTTAC;SOR=0.990;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=186339592;WS=186339574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	186346870	rs79698659	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=535;ReadPosRankSum=0.770;SC=GAGACAGGCGAACTGGAGAGC;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=28;WE=186346878;WS=186346860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr4	186347055	rs2289720	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.791;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=848;ReadPosRankSum=0.407;SC=GGGCGCTGACGCCTGCCCAAA;SOR=0.386;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=150;TCF=60;TCR=90;TR=69;WE=186347063;WS=186347045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr4	186347073	rs11132303	G	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.159;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=621;ReadPosRankSum=1.270;SC=AAAAGTTCCGGGGGCCGGCCC;SOR=0.449;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=135;TCF=46;TCR=89;TR=60;WE=186347081;WS=186347063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,62:0.42:146
chr4	186347092	rs10866275	T	C	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=72;PP=1727;SC=CCTGAAGTGGTGTCACCGCAC;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=19;TCR=72;TR=91;WE=186347100;WS=186347082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	186357523	rs7697970	C	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=412;SC=GGTAAAAAATCTGTTTTGAAT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=186357531;WS=186357513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	186361876	rs4476640	A	G	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=38;PP=1241;SC=GTAAAAAGGTAAGTTTACAAT;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=186361884;WS=186361866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	186365998	rs12650364	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=1.214;SC=GAATTAAACAGTATCATTTTC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=14;WE=186366006;WS=186365988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	186366101	rs79997875	C	T	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=776;ReadPosRankSum=-0.350;SC=ATTAAGTTGTCTCGTTTTTCT;SOR=0.537;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=53;WE=186366109;WS=186366091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,74:0.58:128
chr4	186366181	rs74560263	G	A	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1092;ReadPosRankSum=-2.681;SC=CCCTTATGTGGCTAAATTGGC;SOR=0.454;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=78;WE=186366189;WS=186366171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,115:0.57:202
chr4	186366315	rs2120414	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=784;SC=GCTTACAAACTAAGAAAAAAT;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=186366323;WS=186366305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	186366615	rs11737048	G	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=171;ReadPosRankSum=0.494;SC=ATTAACATTGGCTATTTCTCG;SOR=0.703;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=14;WE=186366623;WS=186366605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr4	186366809	rs6833872	C	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=CCAGGTTTTGCATACTCTCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=186366817;WS=186366799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	186370846	rs73873453	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=-1.639;SC=GAGTAATTCACTATCAAGAGC;SOR=0.654;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=18;WE=186370854;WS=186370836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr4	186378541	rs11722096	C	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=485;ReadPosRankSum=2.030;SC=TCTAAGCTCACTCTCTCCTGT;SOR=0.287;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=37;WE=186378549;WS=186378531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr4	186378790	rs4279261	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=0.145;SC=AAATATATACTTAATTCCAAT;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=186378798;WS=186378780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr4	186379104	rs7664578	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr4	186379371	rs7687202	G	A	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=41;PP=1615;SC=TTCTTGAAATGTAAGTTGTTT;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=77;WE=186379379;WS=186379361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	186379899	rs35596415	G	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CTTTTAGCTGGATTATCTCTA;SOR=0.527;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=6;WE=186379907;WS=186379889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr4	186380243	rs59319722	A	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=95;ReadPosRankSum=-2.249;SC=TCTTTGCTGTATTCTTCTGTT;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=6;WE=186380251;WS=186380233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr4	186380295	rs36007437	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=0.973;SC=CTTCAACCAGATTCTTAAGTT;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=18;WE=186380303;WS=186380285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr4	186380515	rs11132306	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CTCATTTTCAGATATTATTGA;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=19;WE=186380523;WS=186380505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr4	186380846	rs7698680	A	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=559;ReadPosRankSum=0.306;SC=TTACCGTCCAAGTTTTCTTCC;SOR=0.590;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=37;WE=186380854;WS=186380836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr4	186381115	rs7699687	G	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=2.367;SC=CATCACATTTGGAGGTGCAGT;SOR=0.554;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=18;WE=186381123;WS=186381105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr4	186381165	rs7699724	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=347;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TCTTCAAGATGTCAGAATTTT;SOR=0.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=21;WE=186381173;WS=186381155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr4	186382206	rs11132309	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=406;ReadPosRankSum=0.063;SC=AACATACCAAATCCTTTTCAA;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=30;WE=186382214;WS=186382196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr4	186423637	rs4635850	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=416;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CCACAGCACCGCTGTTGGGGA;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=33;WE=186423645;WS=186423627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr4	186423677	rs10866276	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=-1.214;SC=AAAAACCACAGAGCAAAAATA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=22;WE=186423685;WS=186423667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr4	186427735	rs62347360	G	A	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1145;ReadPosRankSum=1.559;SC=GCGAGGCTGTGTGGGCTCATT;SOR=0.783;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=83;WE=186427744;WS=186427725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,112:0.46:243
chr4	186427841	rs2306705	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=274;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CATCGTCAGGTGCTGGGAGGC;SOR=0.906;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=22;WE=186427849;WS=186427831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr4	186427871	rs2306706	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-2.299;SC=GCAAGAGGCCAGAGACATCAA;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=14;WE=186427879;WS=186427861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr4	186444698	rs4862543	A	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	186444704	rs4861669	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	186456617	rs4862545	A	G	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=59;PP=1713;SC=ACCGGGCTCTAAGTGTCCCCG;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=68;WE=186456625;WS=186456607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	186528433	rs13144963	T	C	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=53;PP=1499;SC=GCCAGTTCCCTGGAGAGCTCC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=95;WE=186528441;WS=186528423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	186551624	rs1471794	T	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=257;SC=TACTCATTACTACTTCACTGA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=186551632;WS=186551614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	186570855	rs7663827	C	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=68;PP=2099;SC=AGAAGCAAATCACCTCTTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=98;WE=186570863;WS=186570845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	186572791	rs4862557	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=964;SC=TTGTTATGCACGCTCTGAGAA;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=186572799;WS=186572781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	186577594	.	C	CT	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=62.65;NF=3;NR=0;PP=45;QD=16.0;SC=CTTACCACGGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=186577602;WS=186577584;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr4	186578529	rs2306703	T	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=224;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CCGTCCTTTGTGGAGTCTGTG;SOR=0.399;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=16;WE=186578537;WS=186578519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr4	186611819	rs79427853	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=1.411;SC=AGAAAATATCATGAAAGTGTG;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=186611827;WS=186611809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr4	186997643	rs1568358	C	G	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=189;SC=TGGCATAAAACTATGAGTAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=186997651;WS=186997633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	187004217	rs3775290	C	T	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.046;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.718;SC=AAAATATTTTCGAAATCTATC;SOR=1.090;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=78;WE=187004225;WS=187004207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr4	187005376	rs6830345	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.652;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr4	187026395	rs73025977	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-1.334;SC=CGACCCTCCTCCGCGCCCTGG;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=14;WE=187026403;WS=187026385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr4	187072887	rs2276916	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.550;SC=CATTTCTCAGAAAGGTAACAG;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=187072895;WS=187072877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	187072932	rs2276914	A	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=9;PP=1056;SC=CAAAGCCACCATCTTTTTACC;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=187072940;WS=187072922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	187073000	rs2276913	A	G	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=45;PP=2103;SC=GCGTTGATCCAGAAGCCCGCA;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=187073008;WS=187072990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	187073030	rs2276912	T	C	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=55;PP=2191;SC=CTTGCAGTGTTGTAACCAAGT;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=187073038;WS=187073020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	187074833	rs4862650	A	G	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=602;SC=GCCCACTGACAAAGGCGTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=187074841;WS=187074823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	187075474	rs6552958	G	A	71.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TTTTAAGGACGTGAGTTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=187075482;WS=187075471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	187077027	rs55822915	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=1.207;SC=TAAAAAAGAACGATGCTGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=187077035;WS=187077017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	187077206	rs4862653	A	G	4857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=60;PP=2965;SC=GAAATGGCGCAAACTCGGACT;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=146;WE=187077214;WS=187077196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr4	187077393	rs7670550	T	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=43;PP=1269;SC=GTCCCTGTTCTTCGGCCCTGG;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=187077401;WS=187077383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	187077437	rs13114283	G	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=543;SC=GACCTAGAACGTGACCAGTGA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=187077445;WS=187077427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	187078785	rs2276924	A	G	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=81;PP=2697;SC=CTCGTTCCACACGCTCACGCC;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=133;WE=187078793;WS=187078775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	187078866	rs2276922	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=572;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CGTCTGAACCCGCCCCAGGTC;SOR=0.848;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=34;WE=187078874;WS=187078856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr4	187078922	rs2276921	G	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=0.386;SC=CTGTGTGTCTGTCACCTCAGT;SOR=0.243;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=187078930;WS=187078912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	187078938	rs2276920	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-1.652;SC=TCAGTTTGTCGTTCTGTTAAA;SOR=1.781;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=11;WE=187078946;WS=187078928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	187079017	rs1877321	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=0.978;SC=GGCTTTCCATGGTAACTTAAA;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=16;WE=187079025;WS=187079007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr4	187079047	rs2276919	A	G	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=13;PP=1400;SC=TCACAGTGTCACAATGCCTGG;SOR=2.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=187079055;WS=187079037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	187093018	rs4241814	G	T	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=10;PP=1144;SC=TTCTGAGTGGGTGCCTTTGTA;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=187093026;WS=187093008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	187113041	rs1055138	C	G	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=37;PP=1660;SC=GGCGAGTGCCCTTTCCCTGGC;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=90;WE=187113049;WS=187113031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	187115777	rs62350517	G	C	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=791;ReadPosRankSum=0.437;SC=GTGGGTACATGTGAATATGAT;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=50;WE=187115785;WS=187115767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr4	187118358	rs62350518	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CACACTCCACCGGGAAGGCAA;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=7;WE=187118366;WS=187118348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	187120211	rs13146272	C	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=653;ReadPosRankSum=1.889;SC=AAAGAGCCTTCAGATCCTACA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=40;WE=187120219;WS=187120201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,50:0.39:129
chr4	187122204	rs11730880	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTGAAATAGGCTTAGAAAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=187122212;WS=187122194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	187122319	rs3736455	T	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=477;ReadPosRankSum=-1.265;SC=AGGTCATCGCTGAACGGGCCA;SOR=0.622;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=32;WE=187122327;WS=187122309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr4	187126550	rs3216724	TC	T	3568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=74;PP=2915;SC=GCAGGAAGGCTCCCCCACGGG;SOR=2.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=2;TCR=84;TR=76;WE=187126558;WS=187126540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	187129995	rs2276917	A	G	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=28;PP=1488;SC=CTTTCAGGTCATCTTATCTAC;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=82;WE=187130003;WS=187129985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	187149540	rs1912826	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=562;ReadPosRankSum=-2.182;SC=TTCAGGACACGTGTCTATTTA;SOR=1.129;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=33;WE=187149548;WS=187149530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr4	187158034	rs3733402	G	A	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.397;SC=AGGTGCACCAGTAACATTCGC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=91;WE=187158042;WS=187158024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,117:0.51:228
chr4	187159282	rs4253256	G	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=1.106;SC=TAATAATGCAGACCCCTAACC;SOR=1.206;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=13;WE=187159290;WS=187159272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr4	187171355	rs4253299	A	G	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=55;PP=2744;SC=ATTTAGCCTCATGTCATTTCC;SOR=1.373;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=155;WE=187171363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr4	187178473	rs4253325	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=-0.275;SC=ATAACCCAACGGATGGTCTGT;SOR=0.561;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=13;WE=187178481;WS=187178463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr4	187178599	rs4253326	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=541;SC=TAGCATAATTCAATCATAGTT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=187178621;WS=187178589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	187178613	rs4253327	A	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=1.562;SC=CATAGTTTTTAAAAAAATTCA;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=187178621;WS=187178589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	187179210	rs925453	T	C	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=45;PP=1686;SC=GCAAACACAATGGAATGTGGC;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=94;WE=187179218;WS=187179200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	187518980	rs1280096	T	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=895;ReadPosRankSum=-0.500;SC=ATAAACCTCATGATCCTATTG;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=67;WE=187518988;WS=187518970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,74:0.50:148
chr4	187519206	rs1280097	C	G	5965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=87;PP=2965;SC=AGAGGCATGGCTTGGAGGAAC;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=191;WE=187519214;WS=187519196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
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chr4	187530313	rs4862722	C	T	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=19;PP=1250;SC=TTGTAAACAACGTAAATCAAC;SOR=1.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=187530321;WS=187530303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	187534286	rs188733415	A	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=532;ReadPosRankSum=1.961;SC=TGTGGCCTGCACTCTTGTCAG;SOR=0.611;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=30;WE=187534294;WS=187534276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr4	187534363	rs2249916	G	A	3267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=2631;ReadPosRankSum=-0.274;SC=ATTCGGGGGCGTTATCGTTCA;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=111;TCR=69;TR=77;WE=187534383;WS=187534353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,88:0.44:202
chr4	187534375	rs2249917	A	G	3258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=2631;ReadPosRankSum=0.396;SC=TATCGTTCACATCTTCTAGCG;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=81;WE=187534383;WS=187534353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,92:0.42:218
chr4	187534542	rs2249926	T	C	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=959;ReadPosRankSum=1.025;SC=AAGACGTGACTTGCAGTTGTA;SOR=0.498;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=58;WE=187534550;WS=187534532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr4	187535588	rs56242383	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.409;SC=TCATTCATCTTTGACCACAGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=187535596;WS=187535578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	187538133	rs1280100	A	G	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=35;PP=1403;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TTCATAACACACAAATGTAAG;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=110;TCR=60;TR=99;WE=187538141;WS=187538123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,120:0.59:203
chr4	187538330	rs1280099	G	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TAGTTTCAACGGCAAACTGTC;SOR=0.986;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=20;WE=187538338;WS=187538320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr4	187538942	rs1280098	T	G	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=879;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CACCCCACCTTGGGGGTCATC;SOR=0.480;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=60;WE=187538950;WS=187538932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,72:0.44:163
chr4	187541131	rs35389971	G	A	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TAGCCTGCACGTGGACCACAG;SOR=1.054;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=60;WE=187541139;WS=187541121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr4	187557893	rs328418	T	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=966;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GGCTATGACGTGATAGAGCGG;SOR=0.888;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=166;TCF=68;TCR=98;TR=75;WE=187557901;WS=187557883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr4	187561080	rs10001377	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.180;SC=TGGATTACTTAAGGTCAGGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=187561088;WS=187561070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	187584771	rs172903	C	G	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1438;SC=ATGACACCTACAGAGAAAAAA;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=187584779;WS=187584761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	187627792	rs11939575	T	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1215;ReadPosRankSum=0.492;SC=CCATCTCTTCTGGCGTCCTCA;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=83;WE=187627800;WS=187627782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr4	187628398	rs1877731	C	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.408;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=1154;ReadPosRankSum=1.132;SC=GTGTCTGTAACAATTGAGTAC;SOR=0.816;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=61;WE=187628406;WS=187628388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr4	187629140	rs367863	G	C	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1421;ReadPosRankSum=-2.569;SC=TTAAACTAAAGAAATCCAGTT;SOR=0.599;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=77;WE=187629148;WS=187629130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr4	187630590	rs3733415	G	A	3507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.458;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=2208;ReadPosRankSum=-1.137;SC=CTTTGTTCGCGCCTCCACATT;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=263;TCF=132;TCR=131;TR=143;WE=187630598;WS=187630580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,162:0.54:302
chr4	187630989	rs17077740	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=-0.159;SC=CATTGCTTAACTGTCGGGAAT;SOR=0.965;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=19;WE=187630997;WS=187630979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr4	189060610	rs11934889	G	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=234;SC=AACAACATAGGAACAGGTCAC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=189060618;WS=189060600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	189060623	rs62354295	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr4	189061106	rs13131525	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=562;ReadPosRankSum=1.202;SC=CAGCGAGGCTGAGGAGCATCA;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=41;WE=189061114;WS=189061096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr4	189061223	rs13131409	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.447;SC=TCACGAGGGCCCATCTGAGCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=189061231;WS=189061213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	189061823	rs62354297	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=530;ReadPosRankSum=-1.120;SC=ACCCCATAAGGGGGACTAAAG;SOR=0.905;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=32;WE=189061831;WS=189061813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr4	189063361	rs72525094	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C,CGTGTGTGTGT	1394.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=17,17;NR=6,6;PP=576,2755;SC=AACTTTATCTCGTGTGTGTGT;SOR=2.235;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=23,23;WE=189063384;WS=189063351;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.33:33
chr4	189063392	rs78828180	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.786;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr4	189064860	rs62351463	C	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=677;ReadPosRankSum=0.283;SC=TCTCTGCTCTCTGTGCTCCCA;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=45;WE=189064868;WS=189064850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr4	189064952	rs28463290	C	G	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1240;ReadPosRankSum=1.256;SC=GTGTTATGATCAAAGCGCACC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=71;WE=189064960;WS=189064942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,90:0.50:180
chr4	189065104	rs9784566	T	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=639;SC=TCTGCGCTGTTGCTGGGGGAG;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=24;WE=189065112;WS=189065094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	189065128	rs61075538	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=-0.850;SC=TGAGGTGGACTCTCCAGCTGG;SOR=3.033;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=10;WE=189065136;WS=189065118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr4	189065435	rs34012483	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	189065441	rs11940227	G	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	189660562	rs146686236	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.206;NF=15;NR=8;PP=294;ReadPosRankSum=0.011;SC=TATGCAAGGAGATTATCTACT;SOR=1.117;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=23;WE=189660570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr4	190329166	.	G	GCACACACACA,GCACACACA	160	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=61.34;NF=0,0;NR=10,10;PP=72,160;QD=7.8;SC=ACATGCACGTGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10,10;WE=190329174;WS=190329156;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.67:15
chr4	190394938	rs147390696	CAAGAAG	CAAG,C	1077.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003,0.4997;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12,12;NR=3,3;PP=782,21;SC=AGGATGGTGACAAGAAGAAGA;SOR=3.014;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=15,15;WE=190394951;WS=190394928;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:25
chr4	190876195	rs7684300	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=46.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=-12.317;QD=1.92;ReadPosRankSum=-5.716;SOR=4.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,31:0.11:273
chr4	190876204	rs3207892	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=51.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQRankSum=-15.136;QD=3.73;ReadPosRankSum=-6.161;SOR=3.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,50:0.17:297
chr4	190876242	rs1061653	G	A	3344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-6.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-15.010;NF=95;NR=95;PP=2284;ReadPosRankSum=1.419;SC=AATTCAGATGGACTTGTTGTT;SOR=0.711;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=359;TCF=162;TCR=197;TR=190;WE=190876264;WS=190876232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,136:0.41:334
chr4	190876268	.	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQRankSum=-5.082;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.686;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,23:0.08:295
chr4	190876272	rs202104107	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=2.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQRankSum=-4.955;QD=0.42;ReadPosRankSum=2.030;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,23:0.08:287
chr4	190876278	rs199978807	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=10.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.10;MQRankSum=-3.223;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.254;SOR=1.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,35:0.13:277
chr4	190876287	rs113079586	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.82;MQRankSum=-4.582;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.000;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,23:0.09:267
chr4	190876293	rs201142987	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=9.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.65;MQRankSum=-1.968;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.777;SOR=1.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,34:0.13:254
chr4	190876307	rs200854715	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQRankSum=-3.757;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,20:0.10:209
chr4	190876319	rs77450681	A	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=2.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQRankSum=-4.177;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,54:0.38:141
chr4	190876349	rs199599460	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.158;NF=0;NR=17;PP=300;ReadPosRankSum=-1.875;SC=GTCAGTTTAACAGAAAGTCTG;SOR=1.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=17;WE=190876357;WS=190876339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr4	190878452	rs372664630	TG	CA	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQRankSum=-1.770;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,9:0.13:69
chr4	190878463	rs62345288	T	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=12.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQRankSum=-6.794;QD=15.65;ReadPosRankSum=3.466;SOR=3.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr4	190878485	rs62345289	G	A	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQRankSum=-8.803;QD=11.26;ReadPosRankSum=3.561;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,43:0.41:106
chr4	190878506	rs12643923	C	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQRankSum=-10.453;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.706;SOR=1.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr4	190878538	rs34697501	A	AT	879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQRankSum=-9.030;QD=5.03;ReadPosRankSum=-2.151;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,42:0.24:175
chr4	190878563	rs137858630	C	A	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=62.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQRankSum=-5.592;QD=3.00;ReadPosRankSum=-2.640;SOR=3.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,64:0.20:327
chr4	190878597	rs62345290	C	T	4341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=594;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.784;NF=127;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.275;SC=TTATTAGATGCAATGAAGCAG;SOR=0.451;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=651;TCF=336;TCR=315;TR=275;WE=190878605;WS=190878575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:372,219:0.37:591
chr4	190878654	rs78653319	C	G	3351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=754;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.946;NF=120;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=2.034;SC=AAGAAATGATCAAGGTAATGA;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=780;TCF=341;TCR=439;TR=259;WE=190878669;WS=190878644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:532,220:0.29:752
chr4	190878661	rs62345291	A	T	4248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=741;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.831;NF=114;NR=181;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.611;SC=GATCAAGGTAATGATGACATT;SOR=0.850;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=764;TCF=329;TCR=435;TR=295;WE=190878669;WS=190878644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:481,258:0.35:739
chr4	190878729	rs201450141	A	G	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=87.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQRankSum=-11.485;QD=13.45;ReadPosRankSum=-5.890;SOR=7.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,64:0.39:165
chr4	190878731	rs201154783	GG	CA	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=74.878;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-11.512;QD=14.71;ReadPosRankSum=-4.886;SOR=6.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,52:0.34:151
chr4	190878750	rs113800771	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=9.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-8.079;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.364;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,10:0.15:67
chr4	190947451	rs140385360	C	T	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.90;QD=27.76;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr5	173200	rs6885136	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=302;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCGCCCGGTCCGATTGGGTGC;SOR=0.489;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=22;WE=173208;WS=173190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr5	173258	rs6893369	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=0.085;SC=TGTCTCACCTAAGGCCAGCAG;SOR=0.252;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=12;WE=173266;WS=173248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr5	174106	rs4956987	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=692;ReadPosRankSum=0.329;SC=CGCAGGCGGCGGAAATCTCAG;SOR=0.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=46;WE=174114;WS=174096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr5	174240	rs6875054	GC	AA	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=556;ReadPosRankSum=2.743;SC=CGCAGGGCCTGCCAGGCTCAG;SOR=0.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=174249;WS=174230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	174267	rs6862729	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=12;PP=303;SC=AGCTAGGGGCAGGGGTCGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=174275;WS=174257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	181660	rs7717970	T	G	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=608;ReadPosRankSum=0.095;SC=CATCCATGGGTATAGGCAACC;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=34;WE=181668;WS=181650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr5	181730	rs12519352	C	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=452;ReadPosRankSum=1.783;SC=GATAAGCGACCGGGCTCCCAA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=31;WE=181738;WS=181720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr5	181762	rs11133847	A	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=320;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TGAGCGACCGAGTCCCCGACA;SOR=0.204;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=26;WE=181770;WS=181752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr5	182077	rs4956924	T	A	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=1766;ReadPosRankSum=-0.229;SC=GCTGCACTTCTGGAGCGGAAG;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=118;TCR=101;TR=115;WE=182085;WS=182067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,130:0.49:264
chr5	192152	rs140234009	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=595;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CGTCACTGAGGGCAACTTCGA;SOR=0.506;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=41;WE=192160;WS=192142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr5	195507	rs13167067	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.361;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=511;ReadPosRankSum=1.942;SC=TGCATTTCAGCCTGCAGGTGC;SOR=1.402;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=25;WE=195515;WS=195497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr5	218598	rs2303740	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.198;NF=3;NR=2;PP=71;ReadPosRankSum=-0.046;SC=GAGCGGGACGGTCCCCAGCGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=5;WE=218606;WS=218588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	225768	rs12520059	G	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-1.624;SC=GGCGGATGTGGCAGCCAAAAG;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=11;WE=225776;WS=225758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr5	230980	rs2288461	A	G	4519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=76;PP=2965;SC=ACTGCTCTCTATTGTTTCCAG;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=230988;WS=230970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	231111	rs1126417	T	C	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.284;NF=23;NR=29;PP=899;ReadPosRankSum=1.538;SC=AGTTCCACCCTACAGGTAGGG;SOR=0.517;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=52;WE=231119;WS=231101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr5	256434	rs372662724	ACT	A	1342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=3.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-16.284;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,49:0.18:274
chr5	256472	rs6961	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=5.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-16.369;QD=1.66;ReadPosRankSum=5.324;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,53:0.19:277
chr5	256514	rs1042446	G	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-12.815;QD=2.96;ReadPosRankSum=-1.812;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,39:0.23:169
chr5	256548	rs1042476	TG	CA	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.402;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-9.551;QD=2.86;ReadPosRankSum=-3.055;SOR=1.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,13:0.14:93
chr5	311478	rs2244029	T	C	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=89;PP=1944;ReadPosRankSum=-1.835;SC=GGGGGCAGATTGCCTTCGACG;SOR=0.860;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=261;TCF=96;TCR=165;TR=136;WE=311486;WS=311468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,176:0.52:341
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chr5	314518	rs1574220	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=597;ReadPosRankSum=2.879;SC=TTTAAATGCCTGTTTTCTCCC;SOR=0.702;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=39;WE=314526;WS=314508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
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chr5	422955	rs2292596	C	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=641;ReadPosRankSum=1.438;SC=GTTTGGGCAGCCCCCGCCCTT;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=38;WE=422963;WS=422945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,42:0.41:103
chr5	423906	rs55932239	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=344;ReadPosRankSum=-1.381;SC=TGTGACACGTGTGTTTTGGCT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=25;WE=423914;WS=423896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr5	428166	rs143087196	GC	G	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.576;NF=3;NR=12;PP=418;ReadPosRankSum=-1.609;SC=CCTGCTGGCGGCCCCCACAAA;SOR=0.693;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=428174;WS=428156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr5	433952	rs2672724	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.949;SC=AAATGGGCCCCGTCTTTTCTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=433960;WS=433942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr5	434722	rs34453673	G	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=691;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GGAGCCCACAGACGGCCTTCC;SOR=0.965;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=39;WE=434730;WS=434712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr5	434981	rs2672725	G	C	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=440;SC=TCAGATCTGTGTGTCTACGCT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=434989;WS=434971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	435001	rs1058336	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-1.488;SC=TCAGATGCGTCGGTGGCTGGG;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=435009;WS=434991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	435021	rs1058337	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=0.388;SC=GCTGCCCTGCTCCTGGTCAGG;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=435029;WS=435011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr5	435055	rs2672779	G	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=33;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TAAGACACACGCTTTGCAGAG;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=435063;WS=435045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	442571	rs56146525	A	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTCCTCCAGGAAGCGACTCAG;SOR=0.591;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=9;WE=442579;WS=442561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr5	443059	rs77101200	G	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=1.254;SC=CCGCCCTGGGGAAGGGCGCAC;SOR=0.179;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=12;WE=443067;WS=443049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr5	453567	rs2672722	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TGGACCTGGAGTGCTCCCGGG;SOR=0.500;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=61;WE=453575;WS=453557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr5	456915	rs2721010	A	G	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1018;ReadPosRankSum=1.097;SC=GTGGACATTCATGTGTCAAGT;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=102;TCR=48;TR=76;WE=456923;WS=456905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,88:0.53:167
chr5	457955	rs2251843	A	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=337;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GGTAATTGGCATGACCCTCAG;SOR=0.316;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=23;WE=457963;WS=457945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr5	462465	rs890972	C	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=699;ReadPosRankSum=0.373;SC=GGGCCGAAGCCCAGTGCTTCC;SOR=0.566;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=36;TCR=80;TR=53;WE=462473;WS=462455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr5	462556	rs2081942	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=-1.780;SC=TTGCATTCCGGTCAGATCGCT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=462564;WS=462546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr5	465510	rs1035908	T	C	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=2;NR=8;PP=162;SC=GGGGGGAGCCTGGGTCCAGGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=465518;WS=465500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr5	473368	rs34674918	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=0.390;SC=GGGCGAGGCGGGGCTCGGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=18;WE=473376;WS=473358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr5	473580	rs10474783	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=229;ReadPosRankSum=-0.310;SC=CAGCTGTCCCCGAGCCCGGCG;SOR=0.160;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=15;WE=473588;WS=473570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr5	474909	.	AG	A	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=49.06;NF=2;NR=1;PP=95;QD=41.0;SC=TTAGGCGGGGAGGGAGAGAGA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=474917;WS=474899;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr5	474945	.	AG	A	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=3;PP=159;QD=23.625;SC=GGAGACCTGGAGGGAGAGGAG;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=8;WE=474953;WS=474935;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,8:0.40:20
chr5	475104	rs2247114	A	G	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=41;PP=1965;SC=ATCAGGCGGCAGAAGGTGCCG;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=475112;WS=475094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	475337	rs200907923	TGGAAAGTTAGGGTCACCG	T	448.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.610;NF=1;NR=11;PP=2020;ReadPosRankSum=-1.029;SC=CTGGGTGCCTTGGAAAGTTAG;SOR=2.224;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=12;WE=475362;WS=475327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr5	475346	rs2247107	A	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.397;NF=3;NR=11;PP=1048;ReadPosRankSum=0.737;SC=TTGGAAAGTTAGGGTCACCGG;SOR=0.195;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=14;WE=475362;WS=475327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr5	475621	rs55720119	T	TG	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=547;ReadPosRankSum=-0.568;SC=AGCTCCCTCCTGGGGCGGCAG;SOR=1.371;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=10;WE=475634;WS=475611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr5	475626	rs41282625	C	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=546;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CCTCCTGGGGCGGCAGGAGCC;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=13;WE=475634;WS=475611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr5	476353	rs2230437	C	T	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ACAGCTTGGCCGCCTTCTTGT;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=84;WE=476361;WS=476343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr5	476530	rs2244240	C	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=43;PP=1510;SC=GCTGTGCCCACCGCCGGACAT;SOR=1.281;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=476538;WS=476520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	476848	rs890976	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=466;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CTTGCGCGCCCCTCGCCTTCC;SOR=0.954;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=29;WE=476856;WS=476838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr5	476910	rs890977	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=283;SC=CGCCTTCCCATGGTGGGCACC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=476918;WS=476900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	477303	rs890980	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=1.332;SC=GGGCTTGTGGAAGGAGACACC;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=16;WE=477311;WS=477293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr5	477634	rs4334924	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=461;ReadPosRankSum=0.146;SC=GCCCTGGGGGGAAGCGCCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=477647;WS=477624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr5	477639	rs890981	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=415;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGGGGAAGCGCCCAGAGCTC;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=477647;WS=477624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	478571	.	TG	T	141	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=5;NR=3;PP=141;QD=20.25;SC=TGCCGTGGGGTGGGGGGGCGC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=8;WE=478589;WS=478563;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr5	478574	rs3832380	GGGGGCGCA	G	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.615;NF=4;NR=3;PP=263;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CGTGGGGTGGGGGGGCGCAGG;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=478589;WS=478563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	478598	rs3734140	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=6;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=-0.514;SC=AGAAAGCAGCCGCCCTGGGTG;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=478606;WS=478588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr5	478655	rs3734141	G	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=923;SC=CCAGGTGTGGGGACCCCCGCT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=478663;WS=478645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	479879	rs376525752	G	GC	944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=1092;SC=TCTCCTCACTGCCCCATGGCA;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=28;WE=479887;WS=479870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	479905	rs890986	A	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=7;PP=1256;SC=AGCCAGTGCCAGAGCCTGCTG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=479913;WS=479895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	481610	rs6872510	T	C	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=30;PP=1384;SC=TGGCTTCTGGTTCTTCCGAGT;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=75;WE=481618;WS=481600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	482186	rs9885312	C	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=3;PP=388;SC=CACTTACGCGCCCGTGCAGCT;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=482194;WS=482176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	482653	rs3777230	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=15;PP=1281;SC=CTGGCTGGGCTGGGCCTCACC;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=482661;WS=482643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	488310	rs2303737	C	T	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=2;PP=1922;SC=GGGACGCCCCCGGGAGGGGAG;SOR=6.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=66;TCR=2;TR=68;WE=488318;WS=488302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr5	619022	rs1617985	C	T	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=85;SC=GTTTCTACTCCATATCCAACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=619030;WS=619012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	619333	rs1709531	T	C	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=75;PP=2438;SC=TCTGCTTACATCTGTATACGG;SOR=1.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=106;WE=619341;WS=619323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	639231	rs12522955	C	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=681;ReadPosRankSum=0.904;SC=CTCGGCTCTACCCGGGAAGAA;SOR=0.615;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=47;WE=639239;WS=639221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,61:0.49:125
chr5	640404	rs141837757	CCCTA	C	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.54;MQRankSum=0.919;NF=7;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TTTCCCCTCTCCCTACCTGTC;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=640415;WS=640394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr5	640728	rs56325086	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-1.368;SC=TGGTGAGCCCGCCCTGGCGCT;SOR=0.627;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=17;WE=640736;WS=640718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr5	644552	rs4957080	G	T	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TAAGTTGATCGTGTATTTGGT;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=97;WE=644560;WS=644542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,121:0.49:246
chr5	665148	rs72707016	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.042;SC=ACAGGAATGTAATGAAGTGCG;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=665156;WS=665138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr5	665280	rs1697963	T	C	3178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=968;ReadPosRankSum=0.606;SC=ACACATAGCCTGACTCGTCCA;SOR=0.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=72;WE=665288;WS=665270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,86:0.45:192
chr5	665295	rs61731455	A	G	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1134;ReadPosRankSum=0.429;SC=CGTCCACCAGATCCACGCGGC;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=75;WE=665303;WS=665285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,89:0.46:194
chr5	666244	rs149807312	G	GGGGCACAGGCGACTTA	3147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.27;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr5	666270	rs11750269	G	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=711;ReadPosRankSum=0.608;SC=AGGGCTGGGCGCGGGCCGGCC;SOR=0.464;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=43;WE=666278;WS=666260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,70:0.52:135
chr5	666323	rs1697964	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=551;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AGAGCTGGACAGCCATGGCCC;SOR=0.428;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=29;WE=666331;WS=666313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr5	678062	rs450628	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=944;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CCCCCTCACCAGCACCCTCCG;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=27;TCR=64;TR=55;WE=678070;WS=678052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr5	711982	rs74987061	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-1.501;QD=0.37;ReadPosRankSum=-6.172;SOR=1.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:313,47:0.13:360
chr5	733767	rs55778145	T	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.304;NF=55;NR=19;PP=1145;ReadPosRankSum=2.452;SC=AGAGTGCTTCTATTCTGAATA;SOR=0.551;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=206;TCF=161;TCR=45;TR=74;WE=733775;WS=733757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,74:0.34:216
chr5	733998	rs4247710	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-6.938;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,30:0.20:153
chr5	734004	rs28498541	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-6.915;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,24:0.18:131
chr5	741736	rs61128505	G	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQRankSum=1.739;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr5	745306	rs172870	A	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=70.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.148;NF=55;NR=0;PP=1030;ReadPosRankSum=-3.230;SC=ACCTGGAGAAATCCTTTGTCC;SOR=6.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=166;TCF=127;TCR=39;TR=55;WE=745314;WS=745296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,44:0.26:172
chr5	745371	rs62332112	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=6.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQRankSum=-2.516;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.040;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,51:0.16:325
chr5	748477	rs3817066	A	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=8.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQRankSum=-8.071;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr5	748482	rs3817065	G	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=5.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQRankSum=-8.496;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=1.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,20:0.25:80
chr5	751191	.	G	A	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=48.67;NF=4;NR=0;PP=21;QD=13.9428031368;SC=CGATACTACCGCCCGGAAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=4;WE=751199;WS=751181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,4:0.21:19
chr5	756307	rs367198	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQRankSum=-1.884;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.480;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr5	766910	rs1809933	C	T	5468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.132;NF=87;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=1.145;SC=AGTCACCACCCGGAAGTAGTG;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=130;TCR=153;TR=189;WE=766918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,234:0.70:334
chr5	766939	rs4957103	G	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.163;NF=39;NR=45;PP=1211;ReadPosRankSum=1.957;SC=ACGACCAGCCGTTCACTCTGG;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=124;TCR=146;TR=84;WE=766947;WS=766929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,91:0.29:314
chr5	767033	rs1809932	A	C	5136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GCGGGTGTCCATCTGCAGGAC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=132;TCR=128;TR=192;WE=767041;WS=767022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,218:0.75:292
chr5	767200	rs115337100	G	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
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chr5	796047	rs33929417	CTG	C	15275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-2.911;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,383:0.61:628
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chr5	843723	rs3863148	C	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQRankSum=-7.074;QD=2.14;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,21:0.23:93
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chr5	843879	.	T	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	876161	rs72703144	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=604;SC=GGCTCTTCCCGCCAGCAGCAC;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=876169;WS=876151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	878525	rs508016	T	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=13.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-9.335;QD=2.33;ReadPosRankSum=1.865;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,27:0.21:128
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chr5	981019	rs10065177	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=525;SC=CAGAAGCTGATTGCTTTTAAA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=981027;WS=981009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	1009425	rs10060716	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=5;PP=304;SC=TGGAGCCAGCAGTGGGGGGAC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=1009433;WS=1009415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	1034246	rs4975576	A	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.732;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr5	1035399	rs147352169	T	TAATG	1865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=11;PP=1104;SC=ACCAGTGAGTTAATGAATGAA;SOR=1.552;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=21;WE=1035407;WS=1035389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	1035482	rs12657514	A	G	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=51;PP=1829;SC=GGGAGTGAGTAATGGCAGGAC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=98;WE=1035490;WS=1035472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	1036521	rs60180971	G	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=931;ReadPosRankSum=-0.192;SC=AGGCCACCCTGGGCGTGAGGC;SOR=0.352;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=61;WE=1036529;WS=1036511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,77:0.65:119
chr5	1036900	rs34309815	C	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=0.288;SC=TGTGGATGGCCGGCAGTGTGG;SOR=0.799;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=55;WE=1036908;WS=1036890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,68:0.45:151
chr5	1036962	rs34413936	C	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=698;ReadPosRankSum=0.843;SC=CAGACAGTGTCGACAGCAGGC;SOR=1.190;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=39;WE=1036970;WS=1036952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr5	1036989	.	AGGCAGTGTGGATGGCG	A	775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=1840;ReadPosRankSum=1.184;SC=GATGGCAGGCAGGCAGTGTGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=10;WE=1037012;WS=1036979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr5	1038526	rs3889678	A	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=974;SC=AGCACACCACAGCCCGCGACC;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=1038534;WS=1038516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	1052360	rs3810854	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=355;ReadPosRankSum=0.010;SC=GCAGCTTGGGCGGCATCACTG;SOR=0.563;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=25;WE=1052368;WS=1052350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr5	1052735	rs4046186	GGAGCA	G	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=161;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CAGGCGGGGAGGAGCAGGGCA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=1052747;WS=1052725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	1053341	rs2241602	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TAGCTCCCAGAGCCTGGGGCT;SOR=0.860;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=20;WE=1053349;WS=1053331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr5	1053396	rs2241603	C	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=775;ReadPosRankSum=0.086;SC=ACCCACAAACCCAGGTCTTAG;SOR=1.235;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=52;WE=1053404;WS=1053386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr5	1057615	rs2241606	A	G	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1246;ReadPosRankSum=-2.615;SC=CTTTGAAACCAGATAGGCTGG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=85;WE=1057623;WS=1057605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,98:0.46:214
chr5	1057782	rs12108965	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=743;SC=GCCCGGGACTTGGTGAGACCA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=1057790;WS=1057772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	1060379	rs35661060	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=108;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GTGGGCTGCAGGAGGGTCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=1060387;WS=1060369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr5	1060400	rs4975568	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=347;SC=GAAAAGACTCGGCGAAGTCGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=1060408;WS=1060390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	1060634	rs4246750	C	T	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=68;PP=2063;SC=AACACCAGCCCGGTACCCAGA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=107;WE=1060642;WS=1060624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	1060654	rs4246749	G	A	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=57;PP=1717;SC=AGACCGAGCCGCCCTGAGCGG;SOR=1.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=84;WE=1060662;WS=1060644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	1060685	rs2241608	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.057;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=293;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CACGCGTCCCGGGCCCCACAG;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=17;WE=1060693;WS=1060675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr5	1062900	rs13170649	C	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=233;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TCCTGGGGGACAGCGTGACAG;SOR=0.270;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=19;WE=1062908;WS=1062890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr5	1062995	rs62331173	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=487;ReadPosRankSum=0.678;SC=GCTGGGGTCACGGGAGCCGGA;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=41;WE=1063003;WS=1062985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr5	1063187	rs6863419	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=261;SC=GCCCACCAGATCCCCAGGATC;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=1063195;WS=1063177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	1063998	rs7722287	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=528;ReadPosRankSum=-2.427;SC=TGCGCAAGTGGTACAAGAACA;SOR=0.746;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=35;WE=1064006;WS=1063988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr5	1065276	.	A	AAGGGGACAGTG	2972	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=18;MQ=60.44;NF=35;NR=23;PP=2972;QD=20;SC=TGGGGACGAAAAGGGGACAGT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=58;WE=1065327;WS=1065266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,58:0.84:69
chr5	1065290	rs4362981	A	G	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.37;NF=55;NR=26;PP=2905;SC=GGACAGTGAGAGGACAGCGAG;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=81;WE=1065327;WS=1065266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	1065297	rs62331176	C	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=-1.180;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr5	1065298	rs55643147	GAGGGGACACTGAGGAGACACAC	G	1559.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.220;NF=32;NR=23;PP=2974;ReadPosRankSum=-1.167;SC=AGAGGACAGCGAGGGGACACT;SOR=0.605;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=55;WE=1065327;WS=1065266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr5	1065301	rs79273934	G	A	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQRankSum=-1.218;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr5	1065306	.	ACT	A	1974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQRankSum=-1.218;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr5	1065310	.	A	C	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=-1.680;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr5	1065311	.	GGAGACACAC	G	1973.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=-1.680;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr5	1065399	rs737154	C	T	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.614;NF=36;NR=37;PP=1123;ReadPosRankSum=1.025;SC=CATGCCTACCCACAAAGTTCT;SOR=0.571;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=73;WE=1065407;WS=1065389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,88:0.44:199
chr5	1065683	rs56078134	A	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr5	1065689	rs13186367	C	T	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	1073689	rs10780095	C	T	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=594;SC=TGCCAGGGCACGTTTCCTGTG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=1073697;WS=1073679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	1074560	rs12523242	A	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=782;ReadPosRankSum=-2.204;SC=TTCACACCCCAGACCTTGCCT;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=53;WE=1074568;WS=1074550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr5	1074921	rs7714914	G	A	156.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGAGGAGGGAGGCCTCCATGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=1074929;WS=1074911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr5	1076245	rs11951420	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=687;ReadPosRankSum=0.455;SC=CGTGCTGAGTGGCCTCACCAG;SOR=1.133;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=42;WE=1076253;WS=1076235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr5	1076459	rs11952124	G	T	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=51;PP=1495;SC=CCTGCGCCTTGTCTCCCCATG;SOR=2.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=62;WE=1076467;WS=1076449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	1076519	.	TCAGGTTCCAGC	T	588	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=58.55;NF=1;NR=2;PP=588;QD=204.666666667;SC=TCAGGCCCCCTCAGGTTCCAG;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=3;WE=1076537;WS=1076509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr5	1076521	.	A	ATCCTGTGACCACCT	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr5	1076524	.	T	TCCA	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.616;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr5	1076526	.	C	CCTGTGACCA	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr5	1078898	rs4975564	A	G	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=57;PP=1579;SC=AAGGAAAGGCAGGTCCGTGGG;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=66;WE=1078906;WS=1078888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	1081668	rs13176210	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=820;ReadPosRankSum=-1.727;SC=AAAGAGAAGGGGAAGCCTGGA;SOR=0.695;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=82;TCR=43;TR=49;WE=1081676;WS=1081658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,65:0.42:154
chr5	1081702	rs6865765	A	G	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CGGTCACGGAAGGGAAGTAGA;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=107;TCR=75;TR=83;WE=1081710;WS=1081692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,102:0.46:222
chr5	1081767	rs4526148	C	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=58;PP=1301;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TAGGGCAGTGCGCTGGCACGG;SOR=0.911;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=175;TCF=65;TCR=110;TR=88;WE=1081775;WS=1081757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,107:0.52:204
chr5	1085604	rs11133624	C	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=640;ReadPosRankSum=1.481;SC=GGAACAAGGCCGGTCGGGAGG;SOR=1.091;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=36;WE=1085612;WS=1085594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr5	1093609	rs56276350	G	GGGGCGGGGACT	1336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=4;PP=554;SC=CGGGACACACGGGGCGGGGAC;SOR=2.215;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=9;WE=1093617;WS=1093599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	1093860	rs6883411	CC	GT	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.092;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=648;ReadPosRankSum=0.689;SC=GGAGCTCAGGCCCTCCCCGGG;SOR=0.090;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=18;WE=1093869;WS=1093850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr5	1094389	rs4975552	T	A	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CAATTCAGAGTCAGCTTAGAA;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=167;TCF=76;TCR=91;TR=89;WE=1094397;WS=1094379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,103:0.52:197
chr5	1116066	rs6554618	C	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=18;PP=475;SC=TTTTTTTAAGCGTGGTGAGCC;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=1116074;WS=1116056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	1160464	rs77914620	T	TG	1695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=20;PP=1256;SC=CAGAGATGGGTGGAGGCAAGG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=30;WE=1160472;WS=1160454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	1208964	rs60992377	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GCAGCCTGGGTGTGTGGAGCT;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=20;WE=1208972;WS=1208954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr5	1209063	rs72709422	A	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=-0.520;SC=AAGCCGTTCCACCCGGGCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=1209071;WS=1209053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	1212178	rs4975632	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GTGCATGTGTGGGGTGTGCAG;SOR=0.704;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=9;WE=1212186;WS=1212168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr5	1212647	rs13180809	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=-0.594;SC=AGGGCGGGTGCGGGCAGCCCT;SOR=0.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=1212655;WS=1212637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr5	1213510	rs77928413	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr5	1214005	rs138649942	CCCT	C	908.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.868;NF=15;NR=2;PP=721;ReadPosRankSum=1.560;SC=TGGGAGCACACCCTCCCAGGT;SOR=1.688;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=17;WE=1214015;WS=1213995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr5	1214264	rs6554663	A	G	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=85;PP=2579;SC=GGTGGAAAGCACTCTGTGGCT;SOR=1.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=30;TCR=85;TR=115;WE=1214272;WS=1214254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	1216775	rs4975629	A	G	7891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=138;PP=2965;SC=TCCGCGCCACACAGCGCTACG;SOR=1.092;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=91;TCR=138;TR=229;WE=1216783;WS=1216765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr5	1219859	rs11746371	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=356;ReadPosRankSum=0.484;SC=AGGACCCGGGCTGTGTTCAGG;SOR=0.291;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=23;WE=1219867;WS=1219849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr5	1219874	rs6869718	G	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=41;PP=1249;SC=TTCAGGGTACGGAGGGAGAGT;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=1219882;WS=1219864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	1221126	.	G	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=273;ReadPosRankSum=0.838;SC=CCATGACCAGGAGGGAGGGAT;SOR=0.242;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=1221134;WS=1221116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr5	1221199	rs12513763	T	C	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=12;PP=1678;SC=TAGCAGAACGTACAGAAAGCT;SOR=2.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=69;WE=1221207;WS=1221189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	1225564	rs7728646	T	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=3;PP=331;SC=GCACCACCCTTGCCCTGAAGC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=1225572;WS=1225554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	1225613	rs7704058	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=814;SC=CCCCAGAACCGGACCCGGCCG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=1225634;WS=1225603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	1225626	rs7728667	T	A	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=991;ReadPosRankSum=-0.971;SC=CCCGGCCGCCTGCGACCTCGG;SOR=1.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=44;WE=1225634;WS=1225603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr5	1225687	rs7705355	CT	TC	4897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=35;PP=2947;SC=CTGAGCTGCACTGGGTTTGCC;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=81;WE=1225696;WS=1225677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	1225703	rs7724858	A	G	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=41;PP=1966;SC=TTGCCGTGGGACTGGGGAACA;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=96;WE=1225711;WS=1225693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	1225801	rs7704363	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=573;ReadPosRankSum=-2.143;SC=AGGGGAGGCCGTCTCCACCCT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=40;WE=1225809;WS=1225791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,58:0.59:99
chr5	1232491	rs4975623	G	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=1.134;SC=CACCGTCCTCGCTTGCCCTGA;SOR=1.096;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=22;WE=1232499;WS=1232481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr5	1232685	rs79143273	C	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=-0.432;SC=CCAGGACATCCCGGAAGGACC;SOR=1.802;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=1232693;WS=1232675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	1232775	rs6858999	T	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=1.041;SC=TGTGTTATTTTATGTTGTTAT;SOR=2.171;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=17;WE=1232783;WS=1232765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr5	1240757	rs7447815	C	G	3046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=76;PP=1944;ReadPosRankSum=0.371;SC=CTAATGACTACGAGCACTGCC;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=279;TCF=111;TCR=168;TR=124;WE=1240765;WS=1240747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,150:0.44:341
chr5	1240848	rs6554684	A	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=534;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GAGAATCCCAAGGCATGAGGA;SOR=1.364;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=33;WE=1240856;WS=1240838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr5	1243009	rs7721679	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=0.689;SC=GTAGCCAGGCAGGGCCGTCCA;SOR=2.035;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=22;WE=1243017;WS=1242999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr5	1244425	rs4073918	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=883;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GCCGCTTCCCCGAACCTGCTC;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=94;TCR=50;TR=59;WE=1244433;WS=1244415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr5	1246258	rs140436341	G	GCCCCGC	668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.347;NF=0;NR=11;PP=638;ReadPosRankSum=-2.507;SC=GGTGGGCGGGGCCCCGCCCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=1246266;WS=1246248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr5	1255520	rs33954691	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=839;ReadPosRankSum=0.081;SC=GCACACATGCGTGAAACCTGA;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=62;WE=1255528;WS=1255510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
chr5	1271524	rs11133719	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=274;SC=TGACACAGAATGTCTCCTCTG;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=1271532;WS=1271514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	1280128	rs7734992	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=0.448;SC=GCCACCTCACTGTGCGCACAA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=1280136;WS=1280118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	1293389	rs79662648	C	G	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=928;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CTGCATTCAGCTCTGGGGCCT;SOR=0.417;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=57;WE=1293397;WS=1293379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr5	1294086	rs2736098	C	T	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1612;ReadPosRankSum=0.336;SC=ATGGGGGGCCCGCGTGGTGCT;SOR=0.840;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=96;WE=1294094;WS=1294076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,107:0.52:207
chr5	1334507	rs5865369	GA	G	3674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=71;PP=1686;SC=CCCTGTCAAGGAAAAAAAAAC;SOR=0.983;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=84;WE=1334515;WS=1334497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	1393753	.	A	G	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=22;MQ=54.29;NF=2;NR=5;PP=53;QD=12.5387446496;SC=CCCTGCATGCATCCTGGGGTA;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=7;WE=1393761;WS=1393743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr5	1394815	rs1042098	A	G	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.325;SC=CTCCCATTGCAGGATGACTTC;SOR=1.042;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=153;TCF=61;TCR=92;TR=64;WE=1394823;WS=1394805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,74:0.40:183
chr5	1409127	rs429699	T	C	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=27;PP=1494;SC=TTGGCTGCCTTCCCCCGGACT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=72;WE=1409135;WS=1409117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	1409985	rs8179029	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=0.264;SC=AGCACAGGGTCGGGCTGCAGG;SOR=0.634;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=29;WE=1409993;WS=1409975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
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chr5	1411412	rs6347	T	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=659;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CGGCCCAGGCTGAGGACAGAG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=61;WE=1411420;WS=1411402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
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chr5	1470900	rs2277005	G	A	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TGACTGCACCGCCCTGTCCCC;SOR=0.807;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=81;WE=1470908;WS=1470890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
chr5	1471109	rs27054	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=309;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GGGTTTCCCATGGGTGCTGGT;SOR=1.143;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=20;WE=1471117;WS=1471099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr5	1479678	rs27059	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CCTGGTGTAAGCTCGTGTCTG;SOR=0.977;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=23;WE=1479686;WS=1479668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr5	1481148	rs2447846	A	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GGCCTGCACCAAGCACCTGCG;SOR=0.190;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=12;WE=1481156;WS=1481138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr5	1490019	rs72717531	C	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=474;ReadPosRankSum=0.617;SC=GCACGGCTCCCGCCAGGCAGG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=32;WE=1490027;WS=1490009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr5	1501542	rs1979397	C	A	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=148;SC=GTGACCCCCCCCCAGGAGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=1501550;WS=1501532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	1501695	rs17588991	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=422;ReadPosRankSum=-1.332;SC=GGACCGGGAAGAGCGTCAGTG;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=26;WE=1501703;WS=1501685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr5	1501790	rs1979396	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=-1.239;SC=CGGCAGAGGCTAGCCCAGGGG;SOR=0.382;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=20;WE=1501798;WS=1501780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr5	1594664	rs4246747	C	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=9;PP=283;SC=GGAACCGCGGCGGGTGGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=1594672;WS=1594654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	1708872	rs62338366	C	T	5299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=77;PP=2965;SC=ACTTGGAGCCCGCCCAGGGGC;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=158;WE=1708880;WS=1708862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	1708983	rs12523324	G	A	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=63;PP=1979;SC=CCTCGACCCAGAGCCAGACAA;SOR=1.365;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=98;WE=1708991;WS=1708973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	1801426	rs13176353	G	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=1159;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CGCGCTCCCCGCCCCCAGGGC;SOR=0.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=20;WE=1801440;WS=1801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr5	1801427	rs34372448	C	CG	754.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=1167;ReadPosRankSum=-1.398;SC=GCGCTCCCCGCCCCCAGGGCG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=14;WE=1801440;WS=1801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
chr5	1801432	rs11745573	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=5;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CCCCGCCCCCAGGGCGAAATA;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=24;WE=1801440;WS=1801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr5	1801689	rs2242412	A	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=1.109;SC=TACAGGATGCACCTTCCTCCA;SOR=0.930;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=37;WE=1801697;WS=1801679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr5	1814395	rs36074605	TTGTA	T	1420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.974;NF=19;NR=6;PP=1142;ReadPosRankSum=-1.586;SC=GTGGGTTAAATTGTATGTAGT;SOR=1.035;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=25;WE=1814406;WS=1814385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr5	1814757	rs147303089	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=600;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CATAGAGCCGCCTGTCCGAAA;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=41;WE=1814765;WS=1814747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,51:0.43:118
chr5	1814783	rs4147773	T	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=664;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CTTTCAACTGTGAAGTGGTGG;SOR=0.385;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=48;WE=1814791;WS=1814773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr5	1878021	rs2279588	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=1.282;SC=GAAACTCAGTGAAAAGAGTCG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=1878029;WS=1878011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	1880865	rs4975753	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=888;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GGCCCAGAGCTGGCTCGTAAG;SOR=1.024;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=57;WE=1880873;WS=1880855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr5	1881916	rs2307118	A	C	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GGGATGCCCCACTTACCAGCG;SOR=0.854;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=176;TCF=108;TCR=68;TR=77;WE=1881924;WS=1881906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,95:0.46:208
chr5	1882129	rs2232374	T	G	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=56;PP=1522;ReadPosRankSum=1.107;SC=GCGTGCGGCCTCCGGACTCGC;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=187;TCF=77;TCR=110;TR=93;WE=1882137;WS=1882119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,113:0.53:215
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chr5	1882280	rs2232373	C	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=0.370;SC=CGAGTACCCCCGGGCCTCCCG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=15;WE=1882288;WS=1882270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr5	1882900	rs6876836	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=246;SC=AGTCCATCCCCGCGCTCCGCA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=1882908;WS=1882890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	2755031	rs62333234	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=0.375;SC=AACCCAGGCGATGGGGGCAGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=2755039;WS=2755021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	2755485	rs62333235	C	T	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=71;PP=1818;ReadPosRankSum=0.286;SC=CGAGGCATTTCAATAAAACCT;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=90;TCR=125;TR=120;WE=2755493;WS=2755475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,136:0.54:254
chr5	3599320	rs861185	A	G	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=990;ReadPosRankSum=0.374;SC=TCCTCGATGGATCTGCCCTGT;SOR=0.951;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=63;WE=3599328;WS=3599310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr5	3600136	rs61746094	G	A	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1421;ReadPosRankSum=0.666;SC=CCGCCTTCCTGCCTAGCCACG;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=207;TCF=118;TCR=89;TR=98;WE=3600152;WS=3600126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,119:0.48:250
chr5	3600334	rs844154	T	C	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=62;PP=1738;SC=GGGCACTCAATGGAGACAAGG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=3600342;WS=3600324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	3610658	rs1373997	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=322;SC=AGGAGTGGAGTGGGCCCAGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=3610666;WS=3610648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	4087485	rs6869319	G	T	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.66;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	4095408	.	T	TATATGTATACATATATTTGTATACATATGTGTATAC	1048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-1.960;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr5	4095642	rs72043926	T	TCTTTC	36.93	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.25;QD=18.46;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,2:1.00:2
chr5	4095679	.	T	TTTTCTTTTCTTTTCTTTC	169.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.43;QD=33.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	4420188	rs140931368	G	GTGTA	6403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=90;PP=2974;SC=TGCCTGGCATGTGTATGTGTG;SOR=1.905;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=114;TCF=6;TCR=108;TR=96;WE=4420196;WS=4420178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	4702337	.	GT	G	226.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr5	4702339	.	GTGTGTGTGTGTGT	G	226.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr5	4702352	.	T	G	149	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=98;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=6;PP=149;QD=18.3771212547;SC=TGTGTGTGTGTGCTCAGGCCC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=10;WE=4702360;WS=4702342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr5	4702461	rs4315900	C	T	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=165;SC=TTTTGTTAATCTTTGGTCTAT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=4702469;WS=4702451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	4930051	rs27416	G	T	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=575;SC=GTGATATATAGATGTATCCCT;SOR=4.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=4930059;WS=4930041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	4930067	.	A	ATG	589	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=19;NR=8;PP=589;QD=22.037037037;SC=TCCCTCACATATGTGTGTGTG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=27;WE=4930075;WS=4930057;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,27:0.84:32
chr5	4930086	.	T	TGTGA	565	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23;NR=11;PP=565;QD=16.7941176471;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=34;WE=4930095;WS=4930076;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr5	4930087	rs147939241	G	GTGAA	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=344;ReadPosRankSum=3.062;SC=GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAG;SOR=1.828;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=34;WE=4930095;WS=4930076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,42:0.79:53
chr5	4930144	rs35167763	AAG	A	2350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.101;NF=5;NR=36;PP=1563;ReadPosRankSum=0.290;SC=CAGAGAAAGAAAGAGAGGAAT;SOR=0.664;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=41;WE=4930153;WS=4930134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr5	4930181	rs560366	C	T	5177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=65;PP=2372;SC=CTCATGCAATCGTGGGAGCTG;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=124;WE=4930189;WS=4930171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	4930303	rs1452032	G	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=311;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CTCAGGCAGGGTTCCTCTGTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=4930311;WS=4930293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr5	5140632	rs270208	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=268;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GTGGATGCTGTTGGCGCAGGT;SOR=1.030;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=16;WE=5140640;WS=5140622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr5	5140958	rs270207	T	A	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.917;NF=9;NR=21;PP=1038;ReadPosRankSum=0.696;SC=TATTAGGTGCTGTGAATGTTC;SOR=1.148;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=30;WE=5140978;WS=5140948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr5	5140970	rs270206	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.942;NF=7;NR=18;PP=1038;ReadPosRankSum=1.243;SC=TGAATGTTCACGACTCTGTGG;SOR=1.291;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=25;WE=5140978;WS=5140948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr5	5141009	rs59628659	CT	C	302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=14;PP=194;SC=CTGTTGTGAACTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14;WE=5141017;WS=5140999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	5146200	rs1863969	A	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=859;ReadPosRankSum=0.050;SC=TTCTTCTCGGAATTCCGAAAT;SOR=0.356;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=118;TCF=89;TCR=29;TR=57;WE=5146208;WS=5146190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr5	5146223	rs1871468	G	C	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=49;PP=2965;SC=CTCAGCCTCTGCTCACTCTTT;SOR=1.363;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=94;TCR=49;TR=143;WE=5146231;WS=5146213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	5146335	rs2086310	C	G	6480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=111;PP=2965;SC=AAGAGCAGTGCCCGTGTCCGA;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=81;TCR=112;TR=192;WE=5146343;WS=5146325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	5146377	rs1019747	T	C	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=50;PP=1315;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GCTGAAAGGCTCCAGGCACGA;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=61;TCR=90;TR=81;WE=5146385;WS=5146367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,93:0.54:171
chr5	5146395	rs1863968	A	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CGACTTCCACATGGATCTGAG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=66;WE=5146403;WS=5146385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr5	5186414	.	G	GGGGT	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.200;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	5187776	rs1863972	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1148;ReadPosRankSum=0.124;SC=TTCTAGGCCCGCTAGTAAGTA;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=68;WE=5187784;WS=5187766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,81:0.49:166
chr5	5189950	rs6859975	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=188;SC=AAATACACGCGTTAGCTTATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=5189958;WS=5189940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	5189978	rs72647746	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.368;SC=CAGATCCAGCCATGTATTTGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=5189986;WS=5189968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr5	5200220	rs58639468	A	ATC	1268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=2379;ReadPosRankSum=1.004;SC=TGAAAGAACCATCTCTCTCTC;SOR=1.432;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=28;WE=5200242;WS=5200210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr5	5200234	rs1896622	C	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=1289;ReadPosRankSum=0.555;SC=CTCTCTCTCTCTCTCTCATAG;SOR=0.386;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=31;WE=5200242;WS=5200210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr5	5200281	rs6555335	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=842;ReadPosRankSum=0.829;SC=GGAACATGTGCAAAAAGTCCG;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=58;WE=5200289;WS=5200271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr5	5200430	rs16875038	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=0.402;SC=GCCTTTGATGCTCACTGCCTG;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=15;WE=5200438;WS=5200420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr5	5200490	rs17762877	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.967;SC=CCTGATGTGGTTCCCTTTGAA;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=5200498;WS=5200480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	5223073	rs12652968	A	G	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=77;PP=2256;SC=CTCCTCTTGCATAGGTATTTT;SOR=2.163;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=22;TCR=77;TR=99;WE=5223081;WS=5223063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	5232346	rs2913623	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=822;ReadPosRankSum=-0.082;SC=ATTAGGTGCTGCTTGAGTGTA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=5232365;WS=5232336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr5	5232356	rs150710468	AGG	A	659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=826;ReadPosRankSum=0.145;SC=GCTTGAGTGTAGGGGGAGGCT;SOR=0.846;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=14;WE=5232365;WS=5232336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr5	5232398	rs2913624	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=381;ReadPosRankSum=0.998;SC=ATTCCCCACTGCTCAGCCTTA;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=24;WE=5232406;WS=5232388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr5	5235028	rs2913630	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.748;NF=4;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=1.003;SC=TAATTACCCATTCTAACACTC;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=5235036;WS=5235018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	5235096	rs2913631	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=466;ReadPosRankSum=-0.959;SC=ACTAAAATATAAAAATTCTAA;SOR=0.702;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=30;WE=5235104;WS=5235086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr5	5239921	rs11742341	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=-0.421;SC=GGCACTGGACCGTGGACTGGC;SOR=0.995;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=34;WE=5239929;WS=5239911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr5	5240002	rs11742370	C	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=1.436;SC=AGAACTTAATCGCTACTGGAC;SOR=1.375;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=27;WE=5240010;WS=5239992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,32:0.35:92
chr5	5318581	rs6885895	A	C	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=294;SC=ATGATGCCCCAGGACAACATA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=5318589;WS=5318571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	5436609	rs2578552	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=449;ReadPosRankSum=0.717;SC=TTTGCATGTCGTTTGGCAGAA;SOR=0.704;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=36;WE=5436617;WS=5436599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr5	5437380	rs2578550	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=-0.149;SC=AGTAAACAGACAGTCCTTTTA;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=19;WE=5437388;WS=5437370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr5	5443179	rs2578554	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=221;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TCTGCCTAATGTCTGTTTATT;SOR=1.314;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=13;WE=5443187;WS=5443169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
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chr5	5460619	rs2619844	G	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=251;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TCTGCTGAGTGTGTTTCAGAA;SOR=0.746;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=17;WE=5460627;WS=5460609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
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chr5	5476250	rs11416699	T	TG	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.994;NF=1;NR=9;PP=270;ReadPosRankSum=0.493;SC=GGTGGAAGGCTGGGGGGTTAA;SOR=0.818;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=5476258;WS=5476240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr5	6020374	rs464221	A	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=52;PP=1730;SC=TCATCCAACCATAATTGTCTA;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=89;WE=6020382;WS=6020364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	6020418	rs457263	T	G	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=37;PP=1176;SC=ATCCAACCCTTTAAGCCAGCA;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=6020426;WS=6020408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	6020488	rs412953	C	T	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=412;SC=CTCCTCAAGTCGGCATTCCTT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=6020496;WS=6020478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	6312844	rs370741234	CCACACA	C	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=1.383;SC=AGTGTTCTCACCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=3;WE=6312857;WS=6312834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	6312879	rs2168655	C	G	107.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=57.15;NF=2;NR=4;PP=130;SC=CACACACACACAGAGAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=6312887;WS=6312869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:0,5:1.00:5
chr5	6372585	rs9451	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=10;PP=512;SC=TCGCAGTCCCAGGGGATCTTC;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=6372593;WS=6372575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	6372888	rs115385688	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=21;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GCAACATATGCAAAAGGAAGC;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=6372896;WS=6372878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr5	6378614	rs7723985	G	C	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=89;PP=2965;SC=GCCCGTCCCCGACCCACACAG;SOR=1.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=56;TCR=90;TR=144;WE=6378622;WS=6378604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	6491532	rs3733778	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=0.771;SC=ATCTCCTCAATGCTGTGCATC;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=4;WE=6491540;WS=6491522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr5	6600492	.	G	GT	182.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=68;SC=CATTTCATCTGGATCCGAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=6600500;WS=6600482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	6602544	rs2303711	T	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=14;PP=1351;SC=AAGGCGTGTGTGTCTAAGGGC;SOR=2.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=6602552;WS=6602534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	6604205	rs2303709	A	G	5458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=75;PP=2965;SC=TGCTGGCCTTATAAAGGGAAT;SOR=0.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=177;WE=6604213;WS=6604195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	6604787	rs13181449	C	T	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=47;PP=2404;SC=CTTTGATCCCCGTGTTAATAA;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=114;WE=6604795;WS=6604777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	6604931	rs6889694	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=35;PP=1024;SC=CCGAGAAACCCCGGTTAAGAA;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=6604939;WS=6604921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	6604970	rs6888601	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=520;SC=TTGTGATTACGTCGTTTGGAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=6604978;WS=6604960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	6605532	rs2303707	C	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1383;SC=CTGTACATAACAACATTGTTG;SOR=1.320;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=6605540;WS=6605522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	6607125	rs3217325	GAAC	G	4490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=58;PP=2948;SC=GTGCAACATGGAACGGTTTGC;SOR=1.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=61;WE=6607135;WS=6607115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	6611757	rs10454287	A	T	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1398;SC=AGTTACTCACACGTGAATGCT;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=6611765;WS=6611747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	6611983	rs3733776	C	A	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=43;PP=1165;SC=GTGAAAAAAACCAGACACAGA;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=6611991;WS=6611973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	6617011	rs6887702	C	A	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=44;PP=1572;SC=CAAATGTATCCATGAAGTGCA;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=6617019;WS=6617001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	6618186	rs10475338	T	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=42;PP=1131;SC=GGTGGATGACTGCACTTTAAC;SOR=2.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=6618194;WS=6618176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	6623432	.	G	GA	71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=61.34;NF=0;NR=5;PP=71;QD=15.2;SC=CAACAATTAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=6623440;WS=6623422;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr5	6748518	rs274682	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=0.956;SC=GAGAAGATCCAAAACATGTGG;SOR=0.371;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=22;WE=6748526;WS=6748508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr5	6748659	rs274681	T	C	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1447;ReadPosRankSum=-1.889;SC=TCAGCCATGCTGTGTCACCGC;SOR=0.610;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=221;TCF=119;TCR=102;TR=114;WE=6748667;WS=6748649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,126:0.49:258
chr5	7306615	rs11955700	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-3.521;NF=8;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=0.201;SC=AATCCGATGCATTTTACCTTT;SOR=0.644;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=18;WE=7306623;WS=7306605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr5	7520881	rs13166360	G	T	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1557;ReadPosRankSum=-2.057;SC=CATCTTCGTGGTGTACACCAT;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=105;TCR=109;TR=101;WE=7520889;WS=7520871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,128:0.46:279
chr5	7690754	rs2914289	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=133;ReadPosRankSum=0.349;SC=ATTTGGTCATCCCCCGAGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=9;WE=7690762;WS=7690744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr5	7826680	rs6887726	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.135;SC=CTTTTTTTCTTGTGGATTACT;SOR=1.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=9;WE=7826688;WS=7826670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr5	7835616	rs34574678	G	GA	1497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.593;NF=8;NR=30;PP=693;ReadPosRankSum=0.666;SC=TCCTGTCTAGGAAAAAAAAGA;SOR=0.741;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=22;TCR=74;TR=38;WE=7835624;WS=7835606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr5	7835685	rs179044	G	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=462;ReadPosRankSum=-3.019;SC=GGAGCACAGAGGCCAGTTCTT;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=30;WE=7835693;WS=7835675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr5	7850898	.	TGCCCAGCCGCCCAGCC	T	129.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.87;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr5	7859523	rs1046012	A	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=11;PP=822;SC=AAGTTCTTCCATTGTTTGAGT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=7859531;WS=7859513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	7862926	rs3733784	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=581;SC=AAACTCCTTATACTACTTACC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=7862934;WS=7862916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	7865891	rs16879258	C	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=435;ReadPosRankSum=0.814;SC=CTGGTGGCAACTGACTCCAAG;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=21;WE=7865899;WS=7865881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr5	7866106	rs17184211	A	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=881;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CCTGAAACAGAAAGCATCCCA;SOR=0.599;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=64;WE=7866114;WS=7866096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr5	7866967	rs162030	G	C	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=67;PP=2575;SC=GTTCCATTAAGGCAGAAATCT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=133;WE=7866975;WS=7866957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	7868030	rs2966952	T	C	7281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=103;PP=2965;SC=ATGATGGAATTTGACCCCGAA;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=201;WE=7868038;WS=7868020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr5	7869455	rs34828626	TC	T	1015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=651;SC=CCCTTCGGCCTCCGGGGGTCG;SOR=1.460;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=7869463;WS=7869445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	7870973	rs1801394	A	G	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1132;ReadPosRankSum=-2.052;SC=CAGAAGAAATATGTGAGCAAG;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=72;WE=7870981;WS=7870963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr5	7875307	rs2303079	C	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=741;ReadPosRankSum=1.343;SC=ATTTTATTTACCTAGTCTTTG;SOR=1.187;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=38;WE=7875315;WS=7875297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr5	7878179	rs1532268	C	T	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=43;PP=2376;SC=CCTGCATCCTCGAGGACAGAC;SOR=1.253;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=118;WE=7878187;WS=7878169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	7885794	rs11398509	T	TC	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr5	7886585	rs35035568	TG	T	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=1.229;SC=GGAATTTTTTTGGCTGAATAA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=11;WE=7886593;WS=7886575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr5	7893121	rs162049	G	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=692;SC=ATTCATTACTGTCATAAGAAA;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=7893129;WS=7893111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	7897319	rs1802059	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=41;PP=1335;SC=AGCAGGTGGCGAGAATCCTCC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=7897327;WS=7897309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	8461166	rs341899	T	C	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=39;PP=1161;SC=GTTTCTAAGTTTATTATTAAA;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=8461174;WS=8461156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	9043142	rs3834271	T	TA	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=14;PP=316;SC=GAAAATATATTAAAAAAAAAC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=9043150;WS=9043132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	9050410	rs257098	C	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=674;SC=TGACTTTCTCCGGTTTTTCAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=9050418;WS=9050400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr5	9066802	rs786846	G	A	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=71;PP=2284;SC=GGGGTAAACAGAGCAACCTCA;SOR=1.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=105;WE=9066810;WS=9066792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	9136487	rs6883525	A	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GAGAGAGCACAGACTGGGTTT;SOR=0.976;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=9136495;WS=9136480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	9154659	rs1806151	G	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=215;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GCTCCCGCAGGCCCACGAACA;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=14;WE=9154667;WS=9154649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr5	9197434	rs3216958	A	AGAG	1029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=42.91;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	9202419	rs1805974	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=-1.509;SC=TCTTGCCTGCTCAGTATTTCA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=9202427;WS=9202409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr5	9280841	rs55821543	G	A	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1272;ReadPosRankSum=0.035;SC=TTACATGGAGGACTCTCAAGT;SOR=0.830;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=73;WE=9280849;WS=9280831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,90:0.51:178
chr5	9280957	rs6555597	C	A	4200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=89;PP=2753;SC=TAAAATGTAACGTTTTAGCAA;SOR=1.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=126;WE=9280965;WS=9280947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	9380118	rs3026309	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TCTTCTTCTCCTCATGTGTGG;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=9380126;WS=9380108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr5	9629529	rs2234233	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=751;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CTCATTTGCCGGGTGTGCCTC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=43;WE=9629537;WS=9629519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr5	10227548	rs2136197	C	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=589;ReadPosRankSum=-0.958;SC=CACTCCCAGTCAAGTTTATGC;SOR=1.118;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=43;WE=10227556;WS=10227538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr5	10227823	rs3080459	C	CCT	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=0.464;SC=CCCAAAATTTCCTGTTTTTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=10227831;WS=10227813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	10236856	rs11133605	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=511;ReadPosRankSum=-1.009;SC=CTAAGACATCATTTTAAAATG;SOR=0.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=27;WE=10236864;WS=10236846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr5	10236927	rs2292263	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=621;ReadPosRankSum=0.401;SC=AACTTAGTTTCCTTGATTGGT;SOR=1.005;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=37;WE=10236935;WS=10236917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr5	10237155	rs6876650	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=329;ReadPosRankSum=-0.650;SC=AAAATAACCTGTCAATGAAAA;SOR=1.532;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=20;WE=10237163;WS=10237145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr5	10239278	rs2252505	C	T	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=1198;ReadPosRankSum=2.913;SC=CAGGTACAAACGGCAAACAGA;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=80;WE=10239286;WS=10239268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,88:0.49:178
chr5	10250042	.	AAAAAC	A	242	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=24;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=59.67;NF=5;NR=6;PP=242;QD=22.2727272727;SC=AAAAAAAAAAAAAAACCGGAA;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=11;WE=10250054;WS=10250032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr5	10250047	rs2607301	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=3.373;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr5	10250430	rs2548546	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=1600;ReadPosRankSum=0.786;SC=CGGTTGGGGGGAAGTAATTCC;SOR=0.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=51;WE=10250451;WS=10250420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,65:0.41:158
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chr5	10254817	rs2578617	A	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=722;ReadPosRankSum=-0.340;SC=ATAAGGATGGAGATGTGACTG;SOR=0.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=42;WE=10254825;WS=10254807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr5	10255021	rs2607294	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=164;ReadPosRankSum=-0.406;SC=ACATGCCTGCTGAGATTGTTG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=16;WE=10255029;WS=10255011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr5	10255083	rs2578616	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=1.133;SC=AAAACATGCTACAAAACAAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=10255091;WS=10255073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	10256161	rs1042392	T	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=475;ReadPosRankSum=1.785;SC=AGGCTGCTCGTGTTGCTATTG;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=46;WE=10256169;WS=10256151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr5	10258125	rs2457156	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=236;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TCAAAACATCGTTTGATTTAT;SOR=0.445;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=21;WE=10258133;WS=10258115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr5	10261065	rs12516390	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=842;ReadPosRankSum=0.172;SC=AGTAGGGGTTCATCTTATGTG;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=57;WE=10261073;WS=10261055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr5	10261542	rs2607327	C	T	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=4;PP=1732;SC=GGAGATGTCTCGGTCAAAGTG;SOR=5.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=66;WE=10261550;WS=10261532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	10261966	rs2244717	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=0.755;SC=AAAAATAATCGTGGTTCTCAA;SOR=0.836;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=11;WE=10261974;WS=10261956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr5	10262740	rs2578642	C	A	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1132;ReadPosRankSum=-1.208;SC=GGTAAGGGATCTGTGCAGACT;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=84;WE=10262748;WS=10262730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,108:0.40:273
chr5	10263453	rs147103051	GA	G	1070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.75;MQRankSum=2.674;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr5	10263457	rs58620077	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr5	10263461	rs370306096	GGGA	G	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr5	10264962	rs544	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=-0.337;SC=CTCGTGATGCATCTACAGTTA;SOR=0.179;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=21;WE=10264970;WS=10264952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr5	10282396	rs10067744	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=412;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AATCCTTGACAATGCCTGAAA;SOR=0.463;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=31;WE=10282404;WS=10282386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr5	10282479	rs10052785	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=1.919;SC=CCGCATGATCCCCACACTCAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=10282487;WS=10282469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr5	10414636	.	C	T	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=1032;ReadPosRankSum=-2.202;SC=TGCTAGCCTTCAGCTAATAGC;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=66;WE=10414644;WS=10414626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr5	10417589	rs2967956	G	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=499;SC=GCCAGGCATGGGGCTTACGCC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=10417597;WS=10417579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	10442496	rs2567577	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=678;SC=ACCAGGGGCCTTACGCGGCAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=10442504;WS=10442486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	10448247	rs1976360	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=247;SC=ACATAAGCCCGGGATGTTGGT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=10448255;WS=10448237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	10505467	rs62362463	A	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=504;SC=GGAGGACACAATTCAATCCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=10505475;WS=10505457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	10505585	rs17816571	A	G	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=43;PP=2900;SC=TTATTTCAAGACTGATTATTC;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=89;TCR=43;TR=131;WE=10505593;WS=10505575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	10505851	rs373652829	TAAA	T	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=14;PP=274;SC=TTATGTCTGATAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=18;WE=10505861;WS=10505839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	10509069	rs1392005	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=353;SC=GAACCAGTGGCGGCCAGTGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=10509077;WS=10509059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	10564846	rs814576	C	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=16;NR=25;PP=739;SC=CGGCGACCCTCCTGCGCGCCG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=10564854;WS=10564836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	10565027	rs1103749	C	G	191.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=78;SC=CGCCTCCCAGCTCCTGGCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=10565035;WS=10565017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	10624866	rs10062687	T	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1185;ReadPosRankSum=0.830;SC=GGGCATAGTTTCCTTAGACAC;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=39;TCR=92;TR=70;WE=10624874;WS=10624856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,79:0.53:150
chr5	10624887	rs1531839	T	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=73;PP=2157;SC=TGGCTCCCAATCTTGCGCCTC;SOR=2.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=94;WE=10624895;WS=10624877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	10638180	rs11745612	T	C	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=24;PP=912;SC=ACTATTTCCCTGGTCTTGACC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=10638188;WS=10638170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	10638364	rs6889196	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=360;SC=GAGATTAATCACTCCCATAGA;SOR=2.030;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=10638372;WS=10638354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	10649784	rs113222960	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=1.562;SC=TCCTGGCGGCGCGGGCTGCAC;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=9;WE=10649792;WS=10649774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr5	10650150	rs56969869	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.846;NF=25;NR=26;PP=750;ReadPosRankSum=-0.459;SC=AGAGGAAGGCAGAGGAGGCCG;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=51;WE=10650158;WS=10650140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr5	10650251	rs140897444	CGGGGCT	C	914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.550;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.587;NF=1;NR=17;PP=797;ReadPosRankSum=1.495;SC=GCGCTGGGGCCGGGGCTGGGG;SOR=0.193;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=18;WE=10650264;WS=10650241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr5	10650324	rs13354827	T	G	346.90	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=0.126;QD=34.69;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=3.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr5	10650324	.	TT	GG	276	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=24;MQ=61.07;NF=1;NR=6;PP=276;QD=47.066839266;SC=ATCGCACCACTTCCGCTCCAT;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=10650333;WS=10650314;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,7:0.88:8
chr5	10650325	rs13354828	T	G	346.90	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=0.126;QD=34.69;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=3.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr5	10664999	rs111384023	C	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=238;ReadPosRankSum=1.044;SC=GCTCGGGGCCCGTGGCGGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=15;WE=10665007;WS=10664989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
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chr5	10680997	rs5745297	G	A	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1633;ReadPosRankSum=2.067;SC=GTTTGGGCTGGAGCTGTTTCT;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=219;TCF=105;TCR=114;TR=96;WE=10681005;WS=10680987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,103:0.41:252
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chr5	10748462	rs267943	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=758;SC=TGGAAAGGTTCTGGTTGCTCA;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=10748470;WS=10748452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	10761009	rs11740244	C	G	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=232;SC=GGCATCAAGGCCCGGAACCCG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=10761017;WS=10760999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	10761182	rs267927	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=21;PP=708;SC=CGAAGACATGACGCGGCGGGG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=10761190;WS=10761172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	10986684	rs12515637	G	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=333;ReadPosRankSum=0.683;SC=CAGATTCACAGCTTTCTTTGT;SOR=0.336;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=17;WE=10986692;WS=10986674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr5	10986722	rs36031475	A	AG	1746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=4;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=1377;ReadPosRankSum=0.121;SC=GCAACATGTAAGGGGAAACAG;SOR=0.615;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=18;WE=10986735;WS=10986712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr5	10986727	rs35210570	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=4;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.571;SC=ATGTAAGGGGAAACAGTGAAT;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=28;WE=10986735;WS=10986712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr5	10986772	rs9312749	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=572;ReadPosRankSum=0.852;SC=TAATGAGTTAGGTTCTCCCGT;SOR=0.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=30;WE=10986780;WS=10986762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr5	10986947	rs10434650	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=-0.457;SC=GGGGTAAATGCATTTGCTATT;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=11;WE=10986955;WS=10986937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr5	10988172	rs879353	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=0.582;SC=CTCTGCCTTGTCGCGGGTCAA;SOR=0.188;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=22;WE=10988180;WS=10988162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr5	11082762	rs2277053	T	C	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.826;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1546;ReadPosRankSum=1.728;SC=CTAGAGAAAATATTTTCACTT;SOR=0.279;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=152;TCF=93;TCR=59;TR=93;WE=11082770;WS=11082752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,105:0.60:174
chr5	11084189	rs1024621	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=301;ReadPosRankSum=0.476;SC=CTACTTTGTATCTCAAGCTCT;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=17;WE=11084197;WS=11084179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr5	11159657	rs1990003	T	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=719;SC=GGGAAGATGGTGGGAGGAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=11159665;WS=11159647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	11412302	rs31750	C	T	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=32;PP=1042;SC=TTTCCTTTCACTTCTTACTAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=11412310;WS=11412292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	13692279	rs2166337	A	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=1.526;SC=ACTTGGTGAAATTTCCACTTT;SOR=1.398;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=27;WE=13692287;WS=13692269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr5	13701327	rs3734112	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=431;ReadPosRankSum=2.172;SC=CTTTAAAACTATAATGATGGA;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=29;WE=13701335;WS=13701317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr5	13701525	rs3734111	T	C	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=1418;ReadPosRankSum=-1.401;SC=AGAAACCCAGTGTACTAGAAA;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=50;WE=13701544;WS=13701515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr5	13701536	rs3734110	T	C	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.985;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=1418;ReadPosRankSum=0.169;SC=GTACTAGAAATCCAAGAAGCC;SOR=1.064;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=42;WE=13701544;WS=13701515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr5	13701617	rs61338089	GA	G	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	13701654	rs13162313	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.210;SC=TTCACTTTTATAATGAAAAAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=13701662;WS=13701644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	13714740	rs30175	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=250;ReadPosRankSum=0.765;SC=CTGAACAACAGACACCCCAGA;SOR=0.509;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=16;WE=13714748;WS=13714730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr5	13719022	rs30169	T	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=643;ReadPosRankSum=0.187;SC=CTGCCCGGAGTCCTTGTGGAG;SOR=0.318;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=43;WE=13719030;WS=13719012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr5	13719089	rs30168	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1389;ReadPosRankSum=1.167;SC=CTGCTTATGAGCCTCGGTGGT;SOR=0.498;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=174;TCF=110;TCR=64;TR=90;WE=13719097;WS=13719079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr5	13729714	rs3777093	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=351;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TTCCTTCACTATAAAACAATC;SOR=0.284;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=23;WE=13729722;WS=13729704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr5	13735892	rs3734109	T	C	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=646;ReadPosRankSum=-0.863;SC=TGCACAGATATAGAATTCAGC;SOR=0.900;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=40;WE=13735900;WS=13735882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr5	13737700	rs2401811	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TGAAGCTCCCATACTGTATTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=13737708;WS=13737690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr5	13810149	rs35732567	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTTCCGTCTGGACGGGCAGGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=13810157;WS=13810139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	13810441	rs35058767	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GTTTCAATGGGAACAGTAAAC;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=21;WE=13810449;WS=13810431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr5	13810529	rs31238	C	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=274;SC=AAGAACTGATCTCTGAGAATA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=13810537;WS=13810519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	13811775	rs10078391	T	C	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=52;PP=1731;ReadPosRankSum=-1.756;SC=AATCAGGCCTTGAAGCATGTT;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=120;WE=13811783;WS=13811765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,135:0.56:239
chr5	13814682	rs56046501	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=718;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TGTTTTCCTTTTTAATTATAC;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=36;WE=13814690;WS=13814672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr5	13815049	rs6890413	AG	CT	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=241;ReadPosRankSum=0.899;SC=CTATTATATTAGATGTAATTT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=13815058;WS=13815039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	13817881	rs6889720	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=764;ReadPosRankSum=0.384;SC=ACTAATTTGTGGTGTACTGTC;SOR=0.547;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=35;WE=13817889;WS=13817871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr5	13820656	rs6554817	G	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=434;ReadPosRankSum=-0.986;SC=AATGATGGCCGGACACGGTGG;SOR=1.338;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=23;WE=13820664;WS=13820646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr5	13823262	rs10035657	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=2.098;SC=TCACTGTTGTTATTTTTGCTG;SOR=0.288;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=13823270;WS=13823252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr5	13829608	rs1348691	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=-1.309;SC=AAGACCTCCAGGATGACACAC;SOR=0.017;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=9;WE=13829616;WS=13829598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr5	13829799	rs1348689	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=842;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CCTGCCGTCCGGCATAGCCAG;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=53;WE=13829807;WS=13829789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr5	13829933	rs16902790	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=255;ReadPosRankSum=-1.001;SC=ACTCATTTACGTATCTCAATC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=13829941;WS=13829923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr5	13830048	rs10474996	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	13839695	rs9312849	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=0.682;SC=TAAATATACACGTTATTAGCA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=13839703;WS=13839685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr5	13842052	.	A	T	160	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=52.65;NF=0;NR=9;PP=160;QD=21.6412458386;SC=AAAAAGCTATAGTCATATAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=13842060;WS=13842042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	13844874	rs16902837	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=294;ReadPosRankSum=1.467;SC=ACCCGTTTTCGAAGAGCTACT;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=18;WE=13844882;WS=13844864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr5	13845045	rs10041113	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=42;PP=1351;ReadPosRankSum=0.936;SC=TCTCTAGAAGGGCAGGATCTG;SOR=0.910;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=70;WE=13845053;WS=13845035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,86:0.60:144
chr5	13845107	rs4429853	A	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=729;ReadPosRankSum=-0.589;SC=AAGTACCTACAAGGAGAGGAA;SOR=1.035;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=46;WE=13845115;WS=13845097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr5	13845151	rs10041099	C	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=494;ReadPosRankSum=-1.088;SC=CAAAGCTGGTCGTTCAAGGAA;SOR=1.199;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=29;WE=13845159;WS=13845141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr5	13850651	rs795528	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=1.668;SC=CAGCTTTATATATAAATTCAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=13850659;WS=13850641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	13850750	rs6554820	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=297;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TCAAAGAGCCAGTGAACTTAC;SOR=1.035;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=22;WE=13850758;WS=13850740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr5	13851016	rs795526	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=1.366;SC=GAGGCTAGAGCTTTAACCAGT;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=13851024;WS=13851006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	13859743	rs1502043	G	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=1.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
chr5	13859807	rs1867677	G	T	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=32;PP=953;SC=ATTTTTAACCGCTTTCTTTAC;SOR=4.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=13859815;WS=13859797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	13862600	rs7724453	T	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=428;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TCATTAATTTTAAATGTTTGC;SOR=1.341;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=24;WE=13862608;WS=13862590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr5	13862616	rs7704417	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=457;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TTTGCTATTACGGTTCTCAAA;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=32;WE=13862624;WS=13862606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr5	13864728	rs6554827	C	A	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1194;ReadPosRankSum=0.002;SC=CCTTCAAGGCCCGGGGAAGCT;SOR=0.578;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=73;WE=13864736;WS=13864718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,81:0.56:145
chr5	13864885	rs6554828	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=1.691;SC=CTTGCAGGCTGTCTGTTCATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=13864893;WS=13864875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	13865717	rs7720415	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=1.555;SC=TTGGCTGCCTATCAAAGAGGA;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=12;WE=13865725;WS=13865707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr5	13865980	rs7703349	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.170;SC=CTCCAGTATATGTGATGTATT;SOR=1.048;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=9;WE=13865988;WS=13865970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr5	13866450	rs11748811	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=460;ReadPosRankSum=-0.969;SC=AATTTCATGAACTCAATCCAT;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=29;WE=13866458;WS=13866440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr5	13867819	rs1445810	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.232;SC=TTTTAGACAACTACATTTTGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=13867827;WS=13867809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr5	13868103	rs35398031	TA	T	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.808;NF=1;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=0.459;SC=ATAAGATTCCTAAAAAAAAAT;SOR=0.507;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=13868111;WS=13868093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr5	13871925	rs10513159	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=0.694;SC=TGAAAGGCACAATGATATAAG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=13871933;WS=13871915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	13876664	rs1445804	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=-1.354;SC=GCTGAGCACATACAAGATGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=13876672;WS=13876654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr5	13882841	rs10057007	A	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=741;ReadPosRankSum=-1.240;SC=ATTTACCTTGAAGTTCATTTT;SOR=0.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=35;WE=13882849;WS=13882831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr5	13894894	rs4701997	T	A	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=94;PP=2965;SC=GCAGCAGGTATTTTTGACTTC;SOR=1.050;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=62;TCR=94;TR=156;WE=13894902;WS=13894884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	13901339	rs150480592	G	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=913;ReadPosRankSum=-1.240;SC=ACAATGGGAAGAGTATAAATT;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=77;TCR=76;TR=59;WE=13901347;WS=13901329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,81:0.43:190
chr5	13928085	rs12659700	T	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=22;PP=1561;SC=CACACACGCATCTCCCTCCCG;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=13928093;WS=13928075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	13931205	rs1530497	G	C	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.725;SC=AGTGAGAAGTGAAACGCATCC;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=98;TCR=59;TR=87;WE=13931213;WS=13931195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,106:0.55:194
chr5	13931340	rs1530496	C	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=818;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TTCCTTCTCTCCCTTCAGTCT;SOR=1.306;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=87;TCF=17;TCR=70;TR=43;WE=13931348;WS=13931330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr5	13944512	rs339445	A	C	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=35;PP=1815;SC=GAGTGACGCTATGCTTCCAGA;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=13944520;WS=13944502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	14183866	rs354302	T	C	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.19;NF=7;NR=2;PP=153;SC=AGGGAAGGCATGCGGCCGCAG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=14183874;WS=14183856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	14183979	rs71597901	CAG	C	1543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=9;PP=1066;SC=TAACCTTTGGCAGATAGTGAC;SOR=1.739;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=23;WE=14183988;WS=14183969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	14184022	rs354301	G	A	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=25;PP=1168;SC=CGTGGTAACCGTTTTTTAAAA;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=14184030;WS=14184012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	14184079	rs354300	G	A	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=39;PP=1585;SC=GTAAGGATGTGTCCCAGACTT;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=14184087;WS=14184069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	14184211	rs354299	T	C	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=520;SC=ACAGAGAATGTTGTGTGTTTG;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=14184219;WS=14184201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	14184254	rs354298	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=241;SC=TAAAAATCCAACCGGCTAGTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=14184262;WS=14184244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	14290805	rs30629	G	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=12;PP=1113;ReadPosRankSum=1.758;SC=CTTCTCATACGTGATTTTTTT;SOR=1.231;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=110;TCF=84;TCR=26;TR=59;WE=14290813;WS=14290795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr5	14364726	rs114634082	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-1.561;SC=GAAGTGCTAGCTGAATTCTAG;SOR=0.555;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=8;WE=14364734;WS=14364716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr5	14366840	rs30784	T	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=650;SC=TTTAGGATGATGAAGGCATCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=14366848;WS=14366830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	14377962	rs30769	A	C	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=221;SC=GAGGTCTGGTAGACATGCTCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=14377970;WS=14377954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	14378068	rs30770	T	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=21;PP=1635;SC=AATTTCGCGGTTGTTTTAATT;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=14378076;WS=14378058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr5	14378269	rs147151301	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GCCTCCCCCTAAACTCCCGTG;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=13;WE=14378277;WS=14378259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr5	14387489	rs30794	G	C	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.811;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=1051;ReadPosRankSum=0.776;SC=CACTGTGTTTGAGGTTTCTGG;SOR=1.163;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=57;WE=14387497;WS=14387479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,63:0.56:112
chr5	14388636	rs16903453	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.895;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=475;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TTTTAGACCCACTCTGTTATT;SOR=1.946;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=99;TCF=77;TCR=22;TR=34;WE=14388644;WS=14388626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr5	14388686	rs11949756	C	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TAAGCTGCACCCTGACTGTAC;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=83;WE=14388694;WS=14388676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,89:0.42:210
chr5	14389469	rs7715916	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=944;ReadPosRankSum=-1.091;SC=AACTCATCATCTTCGGAAACA;SOR=0.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=63;WE=14389477;WS=14389459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr5	14397238	rs30774	T	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=539;ReadPosRankSum=-1.634;SC=GAGCCAATGATGCCATGCACC;SOR=1.056;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=42;WE=14397246;WS=14397228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr5	14405843	rs60279876	TAA	T	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.703;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=300;ReadPosRankSum=0.351;SC=GCTTTTCTGCTAAAAAGTCAT;SOR=2.358;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=10;WE=14405852;WS=14405833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr5	14420027	rs30612	A	C	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=59;PP=2445;SC=TGGTGCGGACAACTGACCGCT;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=106;WE=14420035;WS=14420017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	14420150	rs56207939	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=0.749;SC=AGTGGGGCATGGGTGGCAGAC;SOR=0.418;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=34;WE=14420163;WS=14420140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr5	14471666	rs27091	T	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=187;SC=CAGCTCTGAATTACCGAGATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=14471674;WS=14471656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	14472626	rs26186	T	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=699;SC=GGAGTCCATCTTGACCAGGAG;SOR=3.383;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=14472634;WS=14472616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	14479938	rs26173	G	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=15;PP=941;SC=TTTACTGCCAGTGTTGTAGTC;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=14479946;WS=14479928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	14610184	rs25960	C	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=795;SC=ACACTTCCCCCCACCGTGGCG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=14610192;WS=14610174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	14664821	rs250435	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=545;SC=CGCTCTGCGGGCCCTCGGAAA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=14664829;WS=14664811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	14678996	rs31930	G	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=282;SC=TATAGACGTTGTTATTGGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=14679004;WS=14678986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	14751399	rs697570	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=-1.531;SC=CGGGAACCGACTGACAGAAGC;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=6;WE=14751407;WS=14751389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	14871620	rs139106733	AGGGGCGAC	A	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.230;NF=0;NR=7;PP=2241;ReadPosRankSum=-1.464;SC=CGGGGAGGCGAGGGGCGACGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=14871635;WS=14871610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	15616319	.	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.642;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr5	15927927	rs66504704	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.807;NF=17;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=0.060;SC=GAAAGAAACCAGTGCTTTTGC;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=18;WE=15927935;WS=15927917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr5	16091242	rs11389357	G	GA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=1.738;SC=AATTAAAAAAGAAAAAAAAAC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=16091250;WS=16091232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	16177807	rs2582666	A	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=468;ReadPosRankSum=-0.590;SC=AAATTATTTCAGGAAAAATAA;SOR=0.293;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=32;WE=16177815;WS=16177797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr5	16179125	rs342550	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=1.980;SC=CACCGGCTGCCTCGGGGTCTC;SOR=0.267;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=14;WE=16179133;WS=16179115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr5	16477751	rs162850	C	A	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=911;SC=AAATAAATGTCTCCAGAAATA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=16477759;WS=16477741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	16478120	rs162849	A	G	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=22;PP=965;SC=ACAGGAACAAATTGAAAACTA;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=16478128;WS=16478110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	16478200	rs162848	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=28;PP=830;SC=TTTTTTCTTTGTCTGCTTCTG;SOR=1.077;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=16478208;WS=16478190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	16479151	rs6883888	A	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=675;SC=AAGGCTACGTACATTTCAGTA;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=16479159;WS=16479141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	16479220	rs33692	A	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=215;SC=GGGAAATGCCATTGTGAAATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=16479228;WS=16479210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr5	16508898	rs33684	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
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chr5	16667003	rs26743	C	T	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=43;PP=1224;SC=CTCCCGTAGCCTTCCATGCTA;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=16667011;WS=16666993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	16667065	rs33273	C	G	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=277;SC=CTTTCACCTTCCTCATCAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=16667073;WS=16667055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	16670618	rs27431	C	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=297;SC=CCCCAACACACGGCAGCCAGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=16670626;WS=16670608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	16704585	rs185483934	C	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=366;ReadPosRankSum=0.634;SC=ACCTGAGGCTCCCCTCAATTC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=18;WE=16704593;WS=16704580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr5	16762646	rs31511	T	C	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=26;PP=1499;SC=TTGCAGGTTTTGACATACCGC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=16762654;WS=16762636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	16763908	rs39900	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=1.309;SC=GTGTACTCACGATTATATAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=16763916;WS=16763898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	16764255	rs375881422	CA	C	575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=18;NR=3;PP=362;SC=GACTCCTTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=21;WE=16764264;WS=16764245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	16764334	rs250341	C	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=800;ReadPosRankSum=-0.264;SC=AGAGAATTCACGTGCTGCACT;SOR=0.477;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=62;WE=16764342;WS=16764324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,80:0.41:193
chr5	16766093	rs2561232	C	T	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=29;PP=1926;SC=ATTACAGTTACAACTGTTATT;SOR=1.456;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=16766101;WS=16766083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	16769273	rs11750538	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=549;ReadPosRankSum=0.692;SC=GACACTTCCCGAACTTCCTCC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=34;WE=16769281;WS=16769263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr5	16783711	rs4702172	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=132;ReadPosRankSum=-0.434;SC=AAAATGCCTGTTTCCAAAGAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=16783719;WS=16783701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	16794916	rs396514	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.207;NF=23;NR=21;PP=660;ReadPosRankSum=-1.908;SC=AGGGGTTCACGGAGGCCAGGA;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=44;WE=16794924;WS=16794906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr5	16795027	rs35681033	CA	C	1396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.002;NF=2;NR=25;PP=977;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GAGTGTGCGCCAGGGGGAAAG;SOR=0.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=27;WE=16795035;WS=16795017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr5	16818363	rs12188582	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=2.094;SC=ATACAATCTCAGTATAATTTC;SOR=0.169;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=10;WE=16818371;WS=16818353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr5	16877701	rs7710976	C	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=14;PP=1127;SC=TGGGAAGCTGCAGGGACTTGT;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=16877709;WS=16877691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	16916071	.	GAA	G	225	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=21;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=60.88;NF=14;NR=2;PP=225;QD=14.25;SC=ACGTCAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=16;WE=16916081;WS=16916061;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,16:0.59:27
chr5	17276053	rs59080603	CCT	C	336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=9;PP=430;SC=AAAACAATCTCCTCTCTCTCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=17276062;WS=17276043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	19473917	rs770303	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=1.146;SC=TTTCCCATTCGTCATTAACCA;SOR=1.096;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=16;WE=19473925;WS=19473907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr5	19520932	rs441865	T	C	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=858;ReadPosRankSum=1.042;SC=ATGCACACTTTAGAGGCTCGG;SOR=1.230;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=50;WE=19520940;WS=19520922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr5	19721490	rs12187552	T	C	5779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=95;PP=2965;SC=AGGGTTGTCCTTGGAGAATGC;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=176;WE=19721498;WS=19721480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr5	21751715	rs10657805	C	CAGAA	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-0.000;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	21751717	.	G	GAA	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.000;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr5	21751720	rs55879862	T	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr5	21751741	rs59633526	T	TTGTGTG	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.01;MQRankSum=-0.615;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr5	21751760	.	T	TGTGTGTGTGTGA	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.642;NF=17;NR=7;PP=1908;ReadPosRankSum=2.480;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGATT;SOR=1.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=24;WE=21751768;WS=21751750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
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chr5	21752056	rs6451993	A	G	7660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
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chr5	24498690	rs3815909	T	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=467;ReadPosRankSum=-0.151;SC=ATTTAATTTATATAGGCATCT;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=23;WE=24498698;WS=24498680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr5	24509947	rs3797171	C	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=2.144;SC=AAAAATAAATCATCAAATTAG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=24509955;WS=24509937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr5	24535140	rs41271089	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=0.672;SC=CAATTGCTTTTTCTTTTCTTT;SOR=0.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=11;WE=24535148;WS=24535130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr5	25190672	rs55966917	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=193;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CCGAAAGAGGCGGCCAAGCCT;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=25190680;WS=25190662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr5	26886200	rs41271091	C	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.244;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=-0.887;SC=CAACTGAAACCAAAATTAATT;SOR=1.436;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=32;WE=26886208;WS=26886190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr5	26889902	rs13190383	A	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TGACTTTGTAAAGAGAAAATA;SOR=0.693;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=26889910;WS=26889892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr5	26905920	rs5866810	GT	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr5	31305265	rs2287581	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=719;ReadPosRankSum=1.324;SC=CTTCTTCCCCCACCCCCAACC;SOR=0.420;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=47;WE=31305273;WS=31305255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr5	31317494	rs2302904	C	T	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1350;ReadPosRankSum=0.618;SC=GATTCAGACCCTGCATGCTGT;SOR=0.799;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=79;WE=31317502;WS=31317484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
chr5	31317529	rs2302903	A	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1298;ReadPosRankSum=0.063;SC=CTTATAGTGGACACCAATTTT;SOR=0.623;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=82;WE=31317537;WS=31317519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,96:0.40:239
chr5	31317952	rs2229575	T	C	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=806;ReadPosRankSum=0.491;SC=AATCCTGCCATGCGGAGGCGC;SOR=0.313;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=63;WE=31317960;WS=31317942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,77:0.47:164
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chr5	31323452	rs147369653	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.943;SC=CGACACTGAAATATGTGAAGT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=31323460;WS=31323442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
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chr5	31467952	rs17408716	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=283;ReadPosRankSum=0.902;SC=CTTAATTTTTAAAAAGGAAAC;SOR=0.065;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=15;WE=31467960;WS=31467942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr5	31472087	rs6885959	T	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=913;ReadPosRankSum=-1.086;SC=ACTTTTAAAATGTGCTGTTAC;SOR=0.598;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=54;WE=31472095;WS=31472077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
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chr5	31483596	rs10052174	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=26;PP=1500;SC=AGACTGAAAGGAAAATGGCAA;SOR=1.154;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=75;WE=31483604;WS=31483586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	31485230	rs7712436	T	C	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=83;SC=TAGTTTCAGATGGAAATGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=31485238;WS=31485220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	31486540	rs7735863	A	G	4909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=56;PP=2965;SC=TTAAAATAGTAGTATGGAACA;SOR=1.026;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=139;WE=31486548;WS=31486530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	31508933	rs56327412	G	GT	598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.832;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.81;MQRankSum=0.592;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr5	31511106	rs13183642	G	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=649;ReadPosRankSum=1.775;SC=AGCTATAATCGCAAGGGTCTC;SOR=0.349;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=42;WE=31511114;WS=31511096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr5	31515373	rs7730136	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=320;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TACTCTTCCACTGTAAAAACT;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=17;WE=31515381;WS=31515363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr5	31515657	rs55656741	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=254;ReadPosRankSum=-1.047;SC=AGGAACAACCGATAAACCGTA;SOR=0.704;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=17;WE=31515665;WS=31515647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr5	31529299	rs6859527	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.62;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	31529306	rs6450850	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	31532429	rs2291109	A	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=32;NR=9;PP=866;SC=GCTGGCCGGGATGAGGCGCCG;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=31532437;WS=31532419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	31538692	rs17410000	A	C	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1664;ReadPosRankSum=0.934;SC=TGCTGCCAGCACTGGGGAAAT;SOR=0.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=74;TCR=117;TR=95;WE=31538700;WS=31538682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,112:0.51:219
chr5	31541142	rs17410035	G	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.097;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=428;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GTTTCTTTGGGGTTTTATTCA;SOR=1.408;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=25;WE=31541150;WS=31541132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr5	32000483	rs10054504	T	C	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=49;PP=1417;SC=TGTGCACTTGTACGTTTGCCT;SOR=4.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=32000491;WS=32000473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	32057651	rs161545	G	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=298;SC=GTTATTTTATGTGGTAGTAAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=32057659;WS=32057641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	32058115	rs151861	A	G	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=86;PP=2965;SC=GGGGAGCCTCAGCGGGAGGTT;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=150;WE=32058123;WS=32058105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	32060985	rs35665699	T	TATC	812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=849;SC=CGGGAAAAGATATGAGCTTCT;SOR=3.500;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=32060993;WS=32060975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	32069910	rs6862076	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=5;PP=142;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CTCTTGGCTGTTAGTTTTGAT;SOR=0.375;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=32069918;WS=32069900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	32071325	rs56223765	G	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=14;PP=951;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GATCAGGTACGCAGGTAGACT;SOR=1.101;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=55;WE=32071333;WS=32071315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,58:0.61:95
chr5	32074392	rs2291114	G	A	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1635;ReadPosRankSum=0.561;SC=CCAACCTCACGGACTCTGCAG;SOR=0.599;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=196;TCF=111;TCR=85;TR=95;WE=32074400;WS=32074382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,102:0.47:219
chr5	32087228	rs157494	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=394;ReadPosRankSum=1.844;SC=GTTTACGTTCCCCACGTAGAA;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=23;WE=32087236;WS=32087218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr5	32087253	rs157495	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=378;ReadPosRankSum=1.360;SC=ACAGCTCCTCAGACCTCATCT;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=29;WE=32087261;WS=32087243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr5	32087374	rs157496	A	G	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=24;PP=1116;ReadPosRankSum=-1.523;SC=GCCCAGGGTCACCAAGTGCAA;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=73;WE=32087382;WS=32087364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr5	32087802	rs157497	A	G	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.998;SC=ACTGCTGCCCAGGGGGGAGTA;SOR=0.682;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=72;WE=32087810;WS=32087792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,82:0.57:145
chr5	32101168	rs2279232	A	T	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=914;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TGGCATGATGAACAACCCTGT;SOR=0.657;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=61;WE=32101176;WS=32101158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr5	32135599	rs161539	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=0.527;SC=GCTATTTTGTGTAGGTTCCTT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=17;WE=32135607;WS=32135589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr5	32248077	rs11960898	C	T	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=963;ReadPosRankSum=1.038;SC=CCCCATATAACACAAAAGTTT;SOR=0.644;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=74;WE=32248085;WS=32248067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,87:0.46:189
chr5	32263099	rs61418287	G	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=495;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTTTTTGGGAGGATGAAAATG;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=23;WE=32263107;WS=32263089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
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chr5	32272120	rs144654016	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=0.056;SC=ATGGGGGGCCGGGTGCAGTGG;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=32272128;WS=32272110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr5	32379210	rs1862636	G	A	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=885;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ATACAGTTACGTACTACTTAC;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=59;WE=32379218;WS=32379200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr5	32388471	rs889318	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=0.242;SC=TTAAAACACATAGAACTCACA;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=32388479;WS=32388461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr5	32403346	rs4867440	C	T	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GACGTTGCAACTGATGACGTA;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=94;WE=32403354;WS=32403336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,109:0.44:247
chr5	32415360	rs5867145	TA	T	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=409;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CCAGTATCCTTAAAAAGCTGG;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=32415368;WS=32415350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr5	32417694	rs178935	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=764;ReadPosRankSum=-0.300;SC=TTCATTAAACGCAGTAAGTCA;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=46;WE=32417702;WS=32417684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr5	32419849	rs324428	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=261;ReadPosRankSum=0.796;SC=TGAGAAGCAATGGCTAGGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=23;WE=32419857;WS=32419839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr5	32444199	rs2922295	C	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-1.922;SC=GAGAGGCCGCCGGGCTGGGCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=32444207;WS=32444197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	32444286	rs183443	A	G	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=459;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CAGGATCCGGACCGAGGGGAG;SOR=0.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=35;WE=32444294;WS=32444276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr5	32523114	rs681162	T	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.987;NF=14;NR=12;PP=407;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GAGGAAGCTCTTTCTGGGGCT;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=26;WE=32523122;WS=32523104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr5	32523298	rs687659	T	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.195;NF=35;NR=24;PP=1067;ReadPosRankSum=-1.545;SC=CTCCTATATCTGTCCTGAGGA;SOR=0.957;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=59;WE=32523306;WS=32523288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr5	32523343	rs2457151	C	T	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=68;PP=2902;SC=TAAGAATGCTCGGACTGTCAC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=138;WE=32523351;WS=32523333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	32716474	.	C	CT	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=17;MQ=60.15;NF=5;NR=2;PP=73;QD=11.2857142857;SC=TAACATGCTACTTTTTTTTTT;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=7;WE=32716482;WS=32716464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr5	32716589	rs10057069	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.885;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr5	32725072	rs1147224	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=646;SC=GAATCATGTCTTTTGCAGCAA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=32725080;WS=32725062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	32775047	rs1173743	G	T	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=45;PP=1290;SC=CCTTTCCAGCGTCTTGCTTTT;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=32775055;WS=32775037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	32784776	rs2246427	A	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=592;ReadPosRankSum=-0.444;SC=CCCTTAGAAAATATTTCTGAA;SOR=1.218;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=30;WE=32784784;WS=32784766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr5	32786389	rs2270915	A	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=749;ReadPosRankSum=1.451;SC=AGAAGAAAGTAACCTTGGAAA;SOR=0.871;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=46;WE=32786397;WS=32786379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr5	32789852	rs1173756	T	C	8052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=127;PP=2965;SC=CAGTCAACAATGAGATGAAGG;SOR=0.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=254;WE=32789860;WS=32789842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr5	33441124	rs2304621	C	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=436;ReadPosRankSum=0.071;SC=GCCCACCTCCCACCCGCCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=29;WE=33441132;WS=33441114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr5	33448962	rs5867190	A	AT	700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=908;SC=AATCTGTTTAATTTGCCTACT;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=33448970;WS=33448952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	33452643	rs73074385	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GTGCTCTGATATTTCATCACT;SOR=1.022;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=15;WE=33452651;WS=33452633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	33455616	rs6880623	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TCCAAATACTATTTCCAAATG;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=33455624;WS=33455606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	33456210	rs3765144	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=376;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TCTGGTATGTATGTCATTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=22;WE=33456218;WS=33456200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr5	33457535	rs2270903	T	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=697;ReadPosRankSum=-2.396;SC=TGATGTGTCTTGACTGAGTTT;SOR=0.451;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=45;WE=33457543;WS=33457525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr5	33457618	rs1003000	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=273;ReadPosRankSum=0.915;SC=GAGATGTTGTGGCTTTTTAGT;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=33457626;WS=33457608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr5	33458636	rs3765145	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=991;ReadPosRankSum=1.529;SC=TATACGTGACGTACATAAACA;SOR=0.552;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=100;TCR=48;TR=72;WE=33458644;WS=33458626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,84:0.49:171
chr5	33458833	rs3765146	T	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=1.956;SC=TTAAATAAGGTCTACTAAAAG;SOR=0.118;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=16;WE=33458841;WS=33458823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr5	33460949	rs58771215	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=-1.855;SC=AATTAAATATAGCATTACAGA;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=6;WE=33460957;WS=33460939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr5	33461226	rs2270904	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=472;ReadPosRankSum=0.114;SC=GTCAAGGAAAATAACTACTGT;SOR=0.751;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=32;WE=33461234;WS=33461216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr5	33535060	rs25754	G	A	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=724;SC=ACATTGGACAGTCCTCTTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=33535068;WS=33535050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	33546113	.	TA	T	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.6710;HP=14;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=58.19;NF=1;NR=7;PP=95;QD=12.375;SC=CTTAAAGTATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=8;WE=33546122;WS=33546103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,8:0.57:14
chr5	33546432	rs29967	A	G	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=136;SC=TATCTGTATTAGAATTTATAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=33546440;WS=33546422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	33549559	rs462629	C	A	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=729;ReadPosRankSum=1.262;SC=TCCCCTCAGCCGTGGAGGCGC;SOR=0.392;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=44;WE=33549567;WS=33549549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr5	33561028	.	GA	G	357	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5263;HP=19;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.67;NF=9;NR=12;PP=357;QD=17.1904761905;SC=TTAAGAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=21;WE=33561036;WS=33561017;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr5	33595996	rs10461924	C	T	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=936;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TCAGACATCACTGTAGGCAGA;SOR=0.816;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=56;WE=33596004;WS=33595986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr5	33596193	rs10461925	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=1.246;SC=AGATTCACACATATTGAATCC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=9;WE=33596201;WS=33596183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr5	33596224	rs10461703	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=1.020;SC=TGCTCATGGTCAGGTGAGGTA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=33596232;WS=33596214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr5	33596243	rs10461704	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=0.652;SC=TACCTGACCACGTCAACGATC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=33596251;WS=33596233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	33616311	rs4078398	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=506;SC=CCACTGGAATTGGCAGAAGCA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=33616319;WS=33616301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	33637596	rs4076945	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=344;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TAAGCTTTGTGTGGATCACAG;SOR=0.557;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=20;WE=33637604;WS=33637586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	33637891	rs4076946	C	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr5	33637899	rs4076947	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr5	33642163	rs60892887	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=0.579;SC=CAAGCAAGCCGGCTTTCTACA;SOR=0.678;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=9;WE=33642171;WS=33642153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr5	33643395	rs10066043	A	T	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=129;SC=TCCCTTAGAGAGAGTTGCCCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=33643403;WS=33643386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	33643617	rs4866409	C	T	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=62;PP=2115;SC=TCAAAACCTGCCACAAAGCAT;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=113;WE=33643625;WS=33643607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	33648842	rs34079160	GTT	G	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=310;SC=TGGATGTTCAGTTATTTCCAA;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=33648851;WS=33648839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	33648906	rs6870538	G	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=609;SC=CCTGCATATAGCCACCAAGAG;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=33648914;WS=33648896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	33649220	rs4866353	A	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=324;SC=TAGGCCCATCATGGGAGTTAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=33649228;WS=33649210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	33649637	rs4242082	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=491;SC=AGGTGAGGGCGTCATGAGACA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=33649645;WS=33649627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	33649807	rs4504387	C	A	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=23;PP=1034;SC=CCGAAGCTGGCAGGGAAGAAC;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=33649815;WS=33649797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	33649905	rs4621563	G	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=797;SC=AGACAGCCACGTTTGTACAGA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=33649913;WS=33649895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	33751389	rs5867210	T	TA	435.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.560;NF=14;NR=2;PP=289;ReadPosRankSum=0.905;SC=ATGAAGATATTAAAAAAAAAA;SOR=1.708;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=16;WE=33751397;WS=33751379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr5	33751454	rs1530507	A	T	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=35;PP=2017;SC=TTAATAAAACAACCAAAAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=97;WE=33751462;WS=33751444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	33951693	rs16891982	C	G	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=30;PP=1594;SC=AGTTGATGCACAAGCCCCAAC;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=80;WE=33951701;WS=33951683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	33954511	rs2287949	T	C	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=63;PP=1905;SC=ACAGGAAGGCTGTCCATCCAA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=33954519;WS=33954501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	33963731	rs141348470	AAAC	A	906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=669;SC=ACAATTAAAAAAACAACAACA;SOR=3.912;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=14;WE=33963741;WS=33963721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	33964210	rs183671	T	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=18;PP=564;SC=GTGGGAAAACTCCCTGAAGAC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=33964218;WS=33964200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	33964241	rs6451048	A	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=437;SC=ACCTGGATATAATTGGAAAAG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=33964249;WS=33964231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	33968890	rs7718382	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=0.643;SC=GGCATCAGGTGTGTGGCTTGG;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=18;WE=33968898;WS=33968880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr5	33969170	.	C	CTGTGTGTGTG	654	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=16;MQ=52.9;NF=0;NR=6;PP=654;QD=109.5;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=33969178;WS=33969160;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	33989518	rs2278008	C	T	6035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=109;PP=2965;SC=TTCGTCTTCTCTGCAAATACA;SOR=1.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=70;TCR=109;TR=179;WE=33989526;WS=33989508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr5	33994116	rs10472909	A	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=688;SC=TTTTCAGATTATTTTTGTCCT;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=33994124;WS=33994106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	33994316	rs11742345	G	A	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=381;SC=ACAGAGTCTCGCTCTGTCACC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=33994324;WS=33994306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	33998883	rs2287939	A	G	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=60;PP=2339;SC=CCACAGACTCAATTTCTGAGT;SOR=0.928;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=105;WE=33998891;WS=33998873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	34004707	rs10941112	C	T	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=49;PP=2074;SC=CTGACCCTTGCCAGTGCGTGT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=92;WE=34004715;WS=34004697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	34008100	rs3195676	C	T	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=81;PP=2669;SC=GACAGCTCCACGACCGAGATG;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=132;WE=34008108;WS=34008090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	34008206	rs3217251	CCGGCGCCACGCCCCCAGCCG	C	1342.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=19;PP=2966;SC=CTCCCAATCCCCGGCGCCACG;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=19;WE=34008233;WS=34008196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	34687911	rs2279604	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=512;ReadPosRankSum=1.070;SC=TTGCTTTGCCGTGAATTATAT;SOR=0.543;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=31;WE=34687919;WS=34687901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr5	34688210	rs142375133	CGACAAA	C	3191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.553;NF=19;NR=31;PP=2541;ReadPosRankSum=-0.004;SC=AAAGAGACTTCGACAAAGACA;SOR=0.669;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=50;WE=34688223;WS=34688200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,85:0.46:186
chr5	34795981	rs6897719	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=896;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GGGGGAAACTCTGTTGGAGAT;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=134;TCF=86;TCR=48;TR=60;WE=34795989;WS=34795971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
chr5	34807928	rs6895634	C	T	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1096;ReadPosRankSum=1.256;SC=CCGAAAGTGTCGACAGCTCTG;SOR=0.912;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=72;WE=34807936;WS=34807918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr5	34808652	rs111951383	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=1.673;SC=GAATAACTGTGTGATTGGCTG;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=35;WE=34808660;WS=34808642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr5	34808797	rs113312119	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=1.276;SC=GAGGTAGACATTGGTTTCTAG;SOR=0.292;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=23;WE=34808805;WS=34808787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr5	34810971	rs111531050	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=-0.268;SC=ACTCTATAGGGGTACAGAATA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=13;WE=34810979;WS=34810961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	34811131	rs35607113	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=2044;ReadPosRankSum=2.041;SC=GGAATATACCGCTGCTTCTTG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=56;WE=34811145;WS=34811121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr5	34811137	rs2271522	T	G	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=2208;ReadPosRankSum=-2.547;SC=TACCGCTGCTTCTTGCTGTAC;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=62;WE=34811145;WS=34811121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr5	34811794	rs114935797	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=364;ReadPosRankSum=0.222;SC=CTTTTCTCTTTTTTTAAGACA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=20;WE=34811802;WS=34811784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr5	34812408	rs112990724	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.608;SC=TAGTAAAGTAATAAAGACTAT;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=15;WE=34812416;WS=34812398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr5	34812489	rs111847320	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.699;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr5	34814900	rs17522675	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=1.647;SC=CCTTTTCACCATGAAGTACCC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=34814908;WS=34814890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	34818976	rs3884194	GT	G,GTT	613.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=4.357;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.371;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,17,12:0.57,0.40:30
chr5	34821825	rs10461947	C	T	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=778;ReadPosRankSum=0.414;SC=AAATGGCTTTCTCTTTCCCAA;SOR=1.032;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=52;WE=34821833;WS=34821815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr5	34822926	rs7730728	T	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=50.03;NF=13;NR=2;PP=302;SC=GTAGCTGGGATCACAGGCGCC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=34822934;WS=34822916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	34824555	rs1048944	G	T	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=48;PP=1548;SC=GAAAAGATACGCTGAGAGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=34824563;WS=34824545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	34830788	rs17523026	C	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=768;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GTTTGAATATCCTAGGGCCAG;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=49;WE=34830796;WS=34830778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr5	34840841	rs6451173	A	G	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1330;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTCTGCTTCCATATGTAAGTA;SOR=0.541;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=58;TCR=95;TR=83;WE=34840849;WS=34840831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,101:0.57:177
chr5	34845473	rs336486	C	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=581;SC=TTATTCCTTCCGGTTTATGTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=34845481;WS=34845463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	34863220	rs3846632	G	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=289;SC=ATGCCAGATGGGTCATCTCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=34863228;WS=34863210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	34945812	rs6868348	A	G	160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.08;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	34954588	rs37437	T	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=1;PP=939;SC=TTAATCTTGATATTAAAACCT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=34954596;WS=34954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	35003683	.	C	CT	106	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5209;HP=12;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=18;MQ=57.42;NF=6;NR=0;PP=106;QD=18.6666666667;SC=CTGTCTCCGCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=35003691;WS=35003676;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr5	35010138	rs466067	A	G	4823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=69;PP=2965;SC=CTATCATGAGACCTTTGCCTC;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=35010146;WS=35010128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	35026683	rs344513	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=9;NR=27;PP=879;SC=ATATTTAGAAACATGGGGAAA;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=35026691;WS=35026673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	35032769	rs237252	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTCAGGGATGGGTCTGCCTTT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=35032777;WS=35032759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	35033047	rs2291698	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=829;ReadPosRankSum=-0.546;SC=CTCATTCTTCCCCCACTTAAG;SOR=0.880;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=48;WE=35033055;WS=35033037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr5	35033526	rs2291701	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=426;ReadPosRankSum=0.243;SC=ACATACCCAGCAGTCTTTAAA;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=31;WE=35033534;WS=35033516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr5	35033605	rs180749	G	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=39;PP=1190;SC=CATCTTGTAGGTCCCTACGTT;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=35033613;WS=35033595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	35033706	rs2291702	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=111;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CCTGGTCCACTGAGTAGGACA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=35033714;WS=35033696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr5	35035579	rs344156	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TAACCACAGTATGAATTCCAT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=35035587;WS=35035569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr5	35036997	rs37368	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GAGCATCATACCTTTTTTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=28;WE=35037014;WS=35036986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr5	35037006	rs171081	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=979;ReadPosRankSum=1.604;SC=ACCTTTTTTTTTCCCCCATAA;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=26;WE=35037014;WS=35036986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr5	35039437	rs2279651	A	G	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=18;PP=961;SC=ACGGGTGGCAATGGCCAACAC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=35039445;WS=35039427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	35039486	rs37370	C	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=28;PP=1267;SC=CAGGTATCTGCTTCCTTCAGC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=35039494;WS=35039476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	35047807	rs10223180	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TAAGACCTCACCCAGGTCTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=35047815;WS=35047797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	35700598	rs6451206	T	C	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=22;PP=1801;SC=TTCAATTTAGTGAGATACCTG;SOR=1.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=35700606;WS=35700588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	35702209	rs35297265	G	A	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=426;SC=TAAGCCAAGGGAGGACAAATC;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=35702220;WS=35702199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	35702212	rs11357084	GA	G	1074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=6;PP=737;SC=GCCAAGGGAGGACAAATCTTC;SOR=1.893;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=35702220;WS=35702199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	35702306	rs6874120	A	G	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=26;PP=1187;SC=GTTGGGTGCAACATGCAGTTC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=35702314;WS=35702296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	35704584	rs7448971	C	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=353;SC=GCATCTTTCACCAGTATATTT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=35704592;WS=35704574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	35704892	rs10058349	G	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=280;SC=GGTAAAAGAAGACTAAGTAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=35704900;WS=35704882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	35709095	rs13170082	C	T	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=21;PP=1362;SC=AAAGCAGCAGCTTCCCTGGCT;SOR=1.367;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=35709103;WS=35709085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	35709184	rs13170390	G	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=46;PP=1458;SC=AAGCCATGTGGCTTCAAAAAC;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=35709192;WS=35709174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	35712780	rs10078803	A	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=708;SC=TCAAAGTAAAAACCTGAGCCA;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=35712788;WS=35712770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	35713007	rs10073537	T	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=57;PP=1935;SC=GATAAAAATATATATAATTAC;SOR=1.845;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=80;WE=35713015;WS=35712997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	35739960	rs10043875	A	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=291;SC=TTCTTTTGACACTATTATTCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=35739968;WS=35739950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	35753715	rs11957963	T	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=640;SC=ATGCCTGTTTTTTCTGTTCAG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=35753723;WS=35753705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	35763877	rs11298650	AG	A	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=1262;SC=ATATGCTATAAGTGGAAAATT;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=35763885;WS=35763867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	35763895	rs6876874	T	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=578;SC=ATTGACACAATGCTCTCAAGC;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=35763903;WS=35763885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	35763916	rs6895801	A	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=450;SC=ACTGTAGAAAATTGTACCTTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=35763924;WS=35763906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	35764587	rs4869466	G	A	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=931;SC=CACACCATGGGGAAGATACAC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=35764595;WS=35764577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	35764603	rs4869467	A	G	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=12;PP=1278;SC=TACACACAGAATTTAACTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=35764611;WS=35764593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	35764696	rs4242258	C	T	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=48;PP=2461;SC=AAGCCTTCTTCGAGTTTCCAT;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=111;WE=35764704;WS=35764686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	35792356	rs7730148	A	C	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=120;SC=AGAGAGTTTTAAAATACTCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=35792364;WS=35792346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	35795738	rs716971	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=377;SC=TCAGTCTCTGTGGCTTTTAGA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=35795746;WS=35795728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	35807070	rs36093359	T	C	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1099;SC=TTAAATTATTTTGAAAAAAGT;SOR=1.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=35807078;WS=35807060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	35807455	rs7736291	T	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=63;PP=2244;SC=AAAGAAGCTGTACTCTGCCAG;SOR=1.315;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=99;WE=35807463;WS=35807445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	35857177	rs1353252	G	C	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=73;PP=2766;SC=TCATTTCTAAGTTTTCTTATG;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=127;WE=35857185;WS=35857167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	35857235	rs1494561	C	G	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=49;PP=1649;SC=AGTTCCCTAACAGACCTGAGT;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=35857243;WS=35857225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	35857262	rs1353250	A	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=46;PP=1317;SC=CTGGGTTTGAATGCAGTTTGA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=35857270;WS=35857252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	35857308	rs5867289	T	TC	1352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=1154;SC=TTTTTAATGTTTAACCACCAT;SOR=3.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=28;WE=35857316;WS=35857298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	35861068	rs1494558	T	C	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=82;PP=2900;SC=GATGTCAACATCACCAATCTG;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=148;WE=35861076;WS=35861058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	35871190	rs1494555	G	A	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=34;PP=1373;SC=CCTGAGTGTCGTCTATCGGGA;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=35871198;WS=35871180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	35875593	rs987106	A	T	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=57;PP=2965;SC=CACTTCATCTATCAATGTTCT;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=102;TCR=57;TR=159;WE=35875601;WS=35875583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	35876274	rs3194051	A	G	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=38;PP=1507;SC=GGATGTAGTCATCACTCCAGA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=35876282;WS=35876264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	35904614	rs1833907	G	T	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=45;PP=1725;SC=GAGCCACATGGCTGTCCCAGG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=90;WE=35904622;WS=35904604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	35921069	rs6859892	T	C	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=78;PP=2965;SC=TCCCTGCCACTTGTAGCTGGG;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=175;WE=35921077;WS=35921059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	35921266	rs3734107	G	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=588;SC=AGGCCTCGCCGCTGCCTCTGG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=35921274;WS=35921256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	36037778	rs2247611	G	A	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=698;SC=CCCATGTCCTGGAAAATACAG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=36037786;WS=36037768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	36049677	rs1287273	C	A	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=52;SC=TACCCTCTGCCATAATTATCC;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=36049685;WS=36049667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	36051830	.	ATCCATCCG	A	406.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=0.806;SC=CTATCAATCCATCCATCCGTC;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=10;WE=36051845;WS=36051820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	36051834	rs72303780	ATCCG	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=173;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CAATCCATCCATCCGTCCATC;SOR=1.112;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=10;WE=36051845;WS=36051820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr5	36111167	rs43189	A	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=76;SC=AGATTAAAAAATATTCACAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=36111175;WS=36111157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	36124514	rs13177876	A	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=115;SC=GTTCTTAAGAACACAAGTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=36124522;WS=36124504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	36136675	rs267758	C	T	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=80;PP=2312;SC=AGATAAAATGCGACTGCATAA;SOR=2.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=18;TCR=80;TR=98;WE=36136683;WS=36136665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	36137620	rs267759	A	G	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=242;SC=CCAGAAATATATGAATCTCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=36137628;WS=36137610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	36141386	rs13156321	T	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1017;SC=GTGGCCAAGTTAATTTACATT;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=36141405;WS=36141376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	36142589	rs267764	T	A	2418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1697;SC=ATATTTTTTTTAAAAAAGGAA;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=36142597;WS=36142579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	36142648	rs12658867	A	G	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=61;PP=2727;SC=TAATGTTGCTATTCTCAGGAG;SOR=0.944;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=36142656;WS=36142638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	36143392	rs267766	C	T	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=63;PP=2185;SC=ATCGATGAAGCAGAAATAATG;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=106;WE=36143400;WS=36143382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	36168582	rs7736391	T	C	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=64;PP=1647;SC=CAAAGGCAGTTGATTTTATGT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=97;WE=36168590;WS=36168572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	36176874	rs40030	G	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=327;SC=TTTCTTTTTCGGATGATTCTC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=36176882;WS=36176864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	36195448	rs11952882	A	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=56;PP=1752;SC=TTTAATCCTGAATTTTAACCT;SOR=2.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=36195456;WS=36195438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	36201336	rs7705396	C	T	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=527;SC=GAATAACCTACTTAAAATATA;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=36201344;WS=36201326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	36207424	rs2303163	G	T	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=67;PP=1924;SC=GTAAATAAGAGAGTCTTCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=86;WE=36207432;WS=36207414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	36217764	rs111441491	G	GTTAATCA	3300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=2805;SC=CTAAAAACAAGTAAATTATTA;SOR=2.269;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=41;WE=36217772;WS=36217754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	36241922	rs62356073	G	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=26;NR=22;PP=832;SC=CCGCGGCCGCGGGCTTGGGCT;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=36241930;WS=36241912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	36241988	rs34888491	G	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=432;SC=CGCGCCGCCCGGGCCTCTAAC;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=36241996;WS=36241978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	36253937	rs4869473	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=59;PP=2011;SC=CAGTTGACACGGAGGAATTTA;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=85;WE=36253945;WS=36253927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	36260976	rs6881086	T	A	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1005;SC=TCTAAGAAAATGAAATAAGCA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=36260984;WS=36260966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	36268218	rs6869599	A	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=10;PP=1300;SC=TGATCGCTAAAAAAGAAAAGT;SOR=2.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=36268226;WS=36268208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	36269551	rs1035480	G	C	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=67;PP=2402;SC=TACACGCTTTGTTGGAAAACC;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=112;WE=36269559;WS=36269541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	36271491	rs5867310	CT	C	358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=235;SC=TATTTGAAGACTTTTTTTTTT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=36271500;WS=36271481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	36301362	rs10941287	T	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	36301369	rs884692	T	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr5	36301420	rs884694	G	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=421;ReadPosRankSum=1.580;SC=TGAGCTGGACGGACTCACCTT;SOR=0.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=26;WE=36301428;WS=36301410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr5	36613053	rs7728680	A	G	464.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=428;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CTGAAAGCCCACTGGTGAGAC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=18;WE=36613061;WS=36613043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr5	36680713	rs3733811	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=875;ReadPosRankSum=-1.135;SC=GAGTTCTATACACCCTTTCTT;SOR=1.096;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=52;WE=36680721;WS=36680703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr5	36683888	rs11748249	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=256;ReadPosRankSum=0.476;SC=CATCGGCACCGTGCGTATTTT;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=18;WE=36683896;WS=36683878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr5	36686404	rs2229894	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TTGAGCACCAGGTGTTAAAAA;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=23;WE=36686412;WS=36686394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr5	37007629	rs159753	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TGATTAAGTCTAGTATAACCT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=37007637;WS=37007619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr5	37019354	rs300060	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
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chr5	37318295	rs217797	G	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=-2.333;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
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chr5	37341352	rs13172306	T	C	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=673;ReadPosRankSum=0.456;SC=CACCTGAAGATGGGGTAAAAT;SOR=0.388;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=60;WE=37341360;WS=37341342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr5	37364443	rs217852	C	T	5263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=98;PP=2965;SC=CAGGTCCTTGCAAAGGATAAT;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=66;TCR=98;TR=164;WE=37364451;WS=37364433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	37516809	rs13176408	A	T	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=29.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr5	37516814	rs1967541	C	T	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.83;QD=43.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	37605122	rs150300664	CT	C	54.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr5	37724932	rs3214462	CATT	C	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=0.247;SC=TCAAGACTGTCATTATGACTT;SOR=2.376;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=9;WE=37724942;WS=37724922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr5	37724990	rs7444391	G	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=15;PP=738;SC=TTTTGGATGGGAAGGTTATTG;SOR=1.105;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=38;WE=37724998;WS=37724980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	37752460	rs1549251	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.56;NF=11;NR=1;PP=300;SC=AGTTTAATGATTTATATTTAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=37752468;WS=37752450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr5	38407273	rs111320305	A	AT	1173.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=909;SC=GAGAGGAAGAAGTGGTGATGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=38407281;WS=38407263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	38407888	rs2961882	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=768;SC=TCTTTTGTGTTGTCTTTTTTC;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=38407896;WS=38407878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr5	38418035	rs56070719	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=0.651;SC=AAGGTCTTAAAGATAAATACA;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=38418043;WS=38418027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr5	38425008	rs3812046	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=495;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TGGGGTCAGCGCCACTGTGTT;SOR=1.270;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=27;WE=38425016;WS=38424998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
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chr5	38438264	rs2561828	A	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
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chr5	38528951	.	GACAC	G,GAC	828.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.98;QD=31.87;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,17:0.35,0.65:26
chr5	38530485	rs11293177	CA	C	303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=0;PP=167;SC=AAAAAGATGACAAAAAAAATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=38530493;WS=38530475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr5	38820802	rs542867	A	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.086;NF=1;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-0.248;SC=ATATGTATACATATGTATATA;SOR=1.426;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=15;WE=38820810;WS=38820792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr5	38820823	rs113106049	C	CAT	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.206;NF=0;NR=8;PP=376;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TGAATATACACATATGTATAC;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=38820831;WS=38820813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr5	38820839	rs640966	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TATACCTATGCATATATGAAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=38820847;WS=38820829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	38822040	rs413278	A	G	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	38823254	rs369886	C	T	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=16;PP=927;SC=TAAGTGTGTACATGTATACAT;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=38823262;WS=38823244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	38823318	rs142353288	G	GTGCA	1660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.597;NF=8;NR=15;PP=1060;ReadPosRankSum=1.445;SC=GTGTATACGTGTACATACATG;SOR=0.495;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=23;WE=38823326;WS=38823308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr5	38823358	rs581668	C	A	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.014;NF=40;NR=31;ReadPosRankSum=3.363;SC=GCATACATACCTGGGTACGTG;SOR=0.612;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=71;WE=38823366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,78:0.78:100
chr5	38876573	rs357271	T	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=171;SC=GTTTTGGAAATATATTAGCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=38876581;WS=38876563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	38881603	rs2278324	G	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=1.222;SC=CTGCAATGGGGTCTTAGGTTT;SOR=1.051;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=15;WE=38881611;WS=38881593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	38904363	rs1239334	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=161;SC=ATTTGCTGTGCTCTGGTTTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=38904371;WS=38904353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	38917574	rs357260	G	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=636;SC=GTCCTTGACCGTCCTAGAAAA;SOR=3.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=38917582;WS=38917564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	38917904	rs357262	G	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=174;SC=TTTGATAGCTGATGCAACTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=38917912;WS=38917894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	38923171	rs357293	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=502;SC=AGCCAACGTGTCATGCCTTTT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=38923179;WS=38923161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	38931919	rs357277	G	A	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=10;PP=1037;SC=TCATAAACTTGTATTTATTCC;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=38931927;WS=38931909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	38932466	rs357278	A	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=382;ReadPosRankSum=0.594;SC=ATAAGTTACAACGCAAGGATT;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=23;WE=38932474;WS=38932456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr5	38950776	rs2115949	G	A	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=64;PP=2283;SC=GGAAAAATGTGCTAGTAGAGC;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=109;WE=38950784;WS=38950766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	38953427	rs2115948	T	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=170;SC=ACACTTATATTGGCAGGAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=38953435;WS=38953417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	38953447	rs2115947	T	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=241;SC=AATCCAGTCTTAAATATTAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=38953455;WS=38953437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	38953665	rs33912683	G	GA	358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=11;PP=228;SC=TCTGGAGAAAGAAAAAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=38953673;WS=38953655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	38954994	rs9292726	T	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=7;NR=19;PP=517;SC=ACTATATCTCTTGGCTAATTT;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=38955002;WS=38954984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	38955796	rs2043112	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=847;ReadPosRankSum=1.857;SC=AACATATTTGGAGTTGTATTC;SOR=0.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=55;WE=38955804;WS=38955786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,64:0.43:150
chr5	38958968	rs6868591	A	C	343.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=15.441;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=333;ReadPosRankSum=1.321;SC=AAAAAAAAAAAAACTTCAGCA;SOR=3.746;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=13;WE=38958976;WS=38958958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr5	38959794	rs2115946	T	C	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=181;SC=ACCAAACACATGTACACAGAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=38959802;WS=38959784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	38962543	rs7729745	A	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.83;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	38971912	rs7732615	T	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.39;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	38990957	.	T	TATGAGATATATGATATATATATGATAG	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=94.07;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	39021181	.	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=311;ReadPosRankSum=0.681;SC=TCTCATATTTGATACTCCCTG;SOR=0.314;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=24;WE=39021189;WS=39021171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
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chr5	39107353	rs404122	T	A	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=79;SC=GTCTTCTGAGTTAACAATTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=39107361;WS=39107343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	39108309	rs377022	A	G	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=15;NR=13;PP=499;SC=ACTGTTCTCTAGGGTGGTACT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=39108330;WS=39108299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	39108322	rs430630	A	G	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=12;NR=15;PP=431;SC=GTGGTACTACATAAGACTTAC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=39108330;WS=39108299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	39119723	rs379707	C	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=13;PP=689;SC=GCTTTTCCAACATTAGTTCCT;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=39119731;WS=39119713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	39285139	rs261738	T	A	244.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	39342308	rs476569	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-0.982;SC=ACTAAGATAACAGAACATCCC;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=22;WE=39342316;WS=39342298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr5	39364339	rs700231	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=348;ReadPosRankSum=1.289;SC=GCACCCTATGTATTTTCTTAT;SOR=0.582;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=17;WE=39364347;WS=39364329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr5	39364358	rs700232	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=427;ReadPosRankSum=-1.107;SC=ATCTCTTTTCGAAGTTTAGAT;SOR=0.530;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=24;WE=39364366;WS=39364348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr5	39364554	rs700233	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=893;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GCAAAGCTCCGGCAGGCTGAC;SOR=0.909;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=39;TCR=73;TR=52;WE=39364562;WS=39364544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,58:0.45:130
chr5	39375082	rs2686162	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=238;ReadPosRankSum=0.136;SC=TCACAAAAACCCCTGAGACAG;SOR=0.282;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=13;WE=39375090;WS=39375072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr5	39377418	rs2738238	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CTTATCAGGAGTCAAGCTTGA;SOR=1.355;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=20;WE=39377426;WS=39377408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr5	39390061	rs2855512	C	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=778;SC=CACTGTTATCCGTATTTTAAT;SOR=2.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=34;WE=39390069;WS=39390051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	39394493	rs1050903	G	C	164.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6705;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=0.887;SC=CGATGGAGAAGTCTCAAATAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=39394501;WS=39394483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr5	40716153	rs10737963	C	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=337;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TACAACCAGGCGTTCTCCTAT;SOR=1.931;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=17;WE=40716161;WS=40716143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr5	40716236	rs72747957	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=521;ReadPosRankSum=-1.337;SC=AATAATCCTATGCATACTGCT;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=38;WE=40716244;WS=40716226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr5	40763227	rs72747972	A	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-1.377;SC=CTGGCCAGCTATCAAGAGCAC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=40763235;WS=40763217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	40772071	rs837103	C	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=439;SC=AAAATCTTCCCAATGAACTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=40772079;WS=40772061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	40834864	rs3816959	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=-2.081;SC=CAGAGACCACTACCCGCATTT;SOR=0.074;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=21;WE=40834872;WS=40834854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr5	40852451	rs188934	C	G	5652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=69;PP=2965;SC=GAGATGTGACCGCTAGGGATT;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=95;TCR=69;TR=164;WE=40852459;WS=40852441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr5	40853048	rs16870407	C	T	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=43;PP=1849;ReadPosRankSum=-0.332;SC=ATCTAGAAAGCTTTTGGACTC;SOR=0.753;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=126;TCR=78;TR=110;WE=40853056;WS=40853038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,128:0.50:254
chr5	40854682	rs1697938	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.138;SC=TATACATGACTGAATTGGATA;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=40854690;WS=40854672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	40928574	rs2443040	A	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=1.242;SC=ATTGAGAAATAATAACATCAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=40928582;WS=40928564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	40928792	rs2459467	T	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AATGTTTTAGTAATTCTTTAG;SOR=0.120;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=19;WE=40928800;WS=40928782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr5	40931357	rs2271709	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TTTGAAAACTATGTTTGTAAT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=40931365;WS=40931347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr5	40949997	rs1450656	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=184;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TTTACATTTTCTCCCCTAGAT;SOR=0.586;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=13;WE=40950005;WS=40949987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
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chr5	40964852	rs13157656	A	C	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=19;PP=1219;ReadPosRankSum=0.048;SC=GGATGAAGGTACAATGTTTCC;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=85;TCR=33;TR=65;WE=40964860;WS=40964842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,79:0.56:141
chr5	40972017	rs11747673	A	G	31.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr5	40981375	rs3749519	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
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chr5	40998196	rs704040	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=858;ReadPosRankSum=0.654;SC=TCAGGAGGGTTTGCAAAGCAG;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=48;WE=40998204;WS=40998186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr5	40998235	rs722575	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CACTAATACACGGATCTTGAC;SOR=1.368;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=38;WE=40998243;WS=40998225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr5	40998814	rs2876850	T	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=735;ReadPosRankSum=-0.647;SC=ACTGATTTCATTATAGAGGAA;SOR=0.923;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=43;WE=40998822;WS=40998804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr5	40998851	rs2329435	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=507;ReadPosRankSum=1.791;SC=TAGCAGGTTAGACTCTGCACC;SOR=0.363;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=30;WE=40998859;WS=40998841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr5	40999754	rs78370485	G	A	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=803;ReadPosRankSum=0.477;SC=ACATATCTGGGTAGGAAATGG;SOR=0.697;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=57;WE=40999762;WS=40999744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr5	40999900	rs1376175	T	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=366;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GATGTGAATTTCAAAGAGGGC;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=22;WE=40999908;WS=40999890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr5	41000243	rs1376177	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GAAATTCCTTGCTACATTGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=41000251;WS=41000233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr5	41000343	rs1001420	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=621;ReadPosRankSum=1.529;SC=AGAATTGCCTGTAGAAATCCC;SOR=0.526;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=39;WE=41000351;WS=41000333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr5	41001023	rs2167229	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=166;ReadPosRankSum=0.308;SC=CACCCTTCCCGCTTCAGCAAA;SOR=0.122;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=41001031;WS=41001013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	41004396	rs7712140	G	T	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.52;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	41004396	.	GTTTCTGTTCA	TTTTCTGTTCA,TTTTCTGTTCT	757	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=59,28;NR=22,9;PP=756,757;QD=9.76260756231;SC=ACCTAAACCTGTTTCTGTTCA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=81,37;WE=41004414;WS=41004386;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:81
chr5	41004406	rs7711722	A	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr5	41004807	rs2305314	C	T	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	41005516	.	C	G	148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.5;NF=4;NR=0;PP=148;QD=45.6928031368;SC=CTCTATGAAACCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=41005535;WS=41005506;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	41005527	.	C	CCCTCCT	272	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=26;MQ=62.89;NF=5;NR=1;PP=272;QD=46.3333333333;SC=CCCCCCCCCCCTTGAAGTCTC;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=41005535;WS=41005506;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr5	41005791	rs10941529	T	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=507;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TACTAAACAATGGAGGAAATC;SOR=0.927;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=43;WE=41005799;WS=41005781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr5	41008780	rs2271704	A	G	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=35;PP=1824;SC=GGGACAAGTGAGCATCTTCTG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=41008788;WS=41008770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	41009899	rs1878290	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.413;SC=CAATTGTTAAATTGTTATTCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=41009907;WS=41009889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	41012615	rs6876879	AA	GC	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=497;ReadPosRankSum=-0.520;SC=ACAAACAGAGAAAGTGGCTGA;SOR=0.935;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=14;WE=41012624;WS=41012605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr5	41018452	rs10054110	A	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.616;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CCTCAATATCATTTGTCAGCA;SOR=0.891;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=76;WE=41018460;WS=41018442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,83:0.51:163
chr5	41019229	rs896118	A	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.830;SC=CTAACGTGTCACATTTTCTGA;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=41019237;WS=41019219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr5	41032998	rs325831	A	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=956;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CAACCTCATCAGACCATTGGG;SOR=1.428;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=52;WE=41033006;WS=41032988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr5	41033112	rs4957367	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GAATACTCAGGGCCTTTCTTA;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=146;TCF=94;TCR=52;TR=74;WE=41033120;WS=41033102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr5	41033883	.	T	TTATCTATC	517.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=1283;SC=CAGGGGGGCATTATCTATCTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=41033891;WS=41033874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	41033931	rs10434576	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-3.311;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr5	41034181	rs325833	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=372;ReadPosRankSum=0.939;SC=TCCCCCAGGTAAGTCATGAGT;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=18;WE=41034189;WS=41034171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr5	41039000	rs325849	A	G	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1002;ReadPosRankSum=-1.446;SC=TCTGAAGACCAGGAAAGGGAG;SOR=0.754;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=68;WE=41039008;WS=41038990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,81:0.53:154
chr5	41039430	rs7700901	G	C	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=168;SC=GGACAGTTCTGACCTGGAATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=41039438;WS=41039420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	41042284	rs325854	G	T	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=30;PP=1125;SC=ATGCTAAGGTGGTTCCCAAGG;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=55;WE=41042292;WS=41042274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	41045730	rs11297360	CT	C	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=27;NR=8;PP=621;SC=AGAGGGAACTCTTTTTTTTTT;SOR=3.467;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=35;WE=41045738;WS=41045720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	41045768	rs325860	G	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=17;PP=1458;SC=CTTTGATTGTGATACAGACAA;SOR=2.517;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=69;WE=41045776;WS=41045758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	41045835	rs6864243	C	G	4350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=82;NR=61;PP=2965;SC=TTCCCCTCAGCTGAAAAACCA;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=143;WE=41045843;WS=41045825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	41048533	rs13173930	C	T	6546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=104;PP=2965;SC=ACCAGCCCCACGTAACTCCCC;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=209;WE=41048541;WS=41048523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr5	41049389	rs325863	T	C	6106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.01;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	41049397	rs325864	C	T	5915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	41050999	rs325866	C	T	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=8;PP=1140;SC=GGAGAACAAACTCATGTCTTT;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=41051007;WS=41050989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	41057562	rs618334	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=573;SC=AAAACAAGCTTCTCATCTTCC;SOR=2.468;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=41057570;WS=41057552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	41061716	rs865093	A	G	3818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=43;PP=2300;SC=ATTATATACCAGAACAGCATG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=118;WE=41061724;WS=41061706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	41061871	rs587412	T	C	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=93;PP=2342;SC=AATATAAGGATGGGGCAGACG;SOR=1.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=43;TCR=93;TR=136;WE=41061879;WS=41061861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	41069734	rs10512757	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=7;PP=692;SC=AAAATATATACGAAATGTTGC;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=41069742;WS=41069724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	41069852	rs13174484	T	C	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.12;NF=36;NR=42;PP=1573;SC=TCCCCAAACATCTCTAAAACG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=78;WE=41069860;WS=41069842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	41069952	rs35526955	CCTCT	C	716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=832;SC=ATTCATTTATCCTCTCTCTCT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=16;WE=41069963;WS=41069942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	41070840	rs1423391	C	T	5084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=56;PP=2965;SC=AATGACGCGCCACTCCCAGCC;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=105;TCR=56;TR=161;WE=41070848;WS=41070830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	41154150	rs4957374	A	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=33;PP=999;SC=GAATAAACAAAAAATTTAGGC;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=41154158;WS=41154140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	41158671	rs10075985	T	C	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=4;PP=1326;SC=TTAAAGTCAATAGGAGATTAT;SOR=3.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=41158679;WS=41158661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	41158863	rs6866352	G	A	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=113;PP=2965;SC=TCATTTCTTCGTCATCATTGA;SOR=1.195;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=72;TCR=113;TR=185;WE=41158871;WS=41158853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	41158981	rs41271069	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.513;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=1136;ReadPosRankSum=2.549;SC=GTACACATTGCATACATATAT;SOR=0.117;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=24;WE=41158994;WS=41158971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr5	41158986	rs41271071	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=492;ReadPosRankSum=-2.787;SC=CATTGCATACATATATGTATT;SOR=1.488;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=10;WE=41158994;WS=41158971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr5	41199752	rs147869807	C	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCATTCCACTCTGCTTAAAAT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=41199760;WS=41199745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr5	41739684	rs33967331	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CAAGTTCGACGAGGTCGGGTG;SOR=0.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=15;WE=41739692;WS=41739674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr5	41805575	rs16871955	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=1.832;SC=CCATAGACTAGAGATGACTCA;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=18;WE=41805583;WS=41805565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr5	41842746	rs13164201	T	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=772;ReadPosRankSum=-2.172;SC=GTTGCTGATATGCACGAGTGT;SOR=1.013;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=55;WE=41842754;WS=41842736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr5	41843797	rs4957430	C	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=639;ReadPosRankSum=-0.753;SC=TCATCCCTACCGCACCCCCTA;SOR=1.106;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=49;WE=41843805;WS=41843787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr5	41927423	rs277414	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-0.625;SC=ATCCAAGTTAATCCTGACCCT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=41927431;WS=41927413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	42565843	rs12521020	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=468;ReadPosRankSum=1.424;SC=AAAGACTTACCAGGATTCCTT;SOR=0.704;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=25;WE=42565851;WS=42565833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr5	42566166	rs10941579	A	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=25;ReadPosRankSum=0.502;SC=TAGCAGCAAAAAGGAAACTTG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=5;WE=42566174;WS=42566156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr5	42646260	rs11415813	C	CT	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=-2.185;SC=TTTTACTAAACTTTTAGAACA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=42646268;WS=42646250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	42700044	rs6179	A	G	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=48;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.824;SC=TTCAGAAAGGATGGATGGTTC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=78;WE=42700052;WS=42700034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,88:0.47:189
chr5	42713472	rs33972388	TG	T	914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=731;ReadPosRankSum=1.334;SC=GAAAGGGAAATGTAAACTGTG;SOR=0.635;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=20;WE=42713480;WS=42713462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr5	42718335	rs76362844	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.325;SC=ATTTTCTTGTGTCTCTTCTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=42718343;WS=42718325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	42719239	rs6180	A	C	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1194;ReadPosRankSum=0.117;SC=CAAAAAGTGCATCCCTGTGGC;SOR=0.864;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=66;WE=42719247;WS=42719229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr5	42769844	rs1109882	G	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=-1.178;SC=GTTTTTACATGGTTGATAATA;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=20;WE=42769852;WS=42769834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr5	42779686	rs11427149	G	GA	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=9;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.055;NF=1;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-2.912;SC=TTCAAATTAGGAAAAAAAAAG;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=13;WE=42779694;WS=42779676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr5	42779736	rs1423656	T	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	42779821	rs33987951	GT	G	43.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=43;SC=AGTTTTAAGAGTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=42779829;WS=42779811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	42799719	rs4041462	T	TTTA	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=321;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TGTACTAAATTTTATTTCTGA;SOR=0.307;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=8;WE=42799727;WS=42799709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr5	42800724	rs6413428	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=0.478;SC=GCACAAATCTAATTTCTATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=42800732;WS=42800714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	42801268	rs3877899	C	T	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGAGTAGGAGCATTTGGTGCT;SOR=1.166;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=75;WE=42801276;WS=42801258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr5	42804895	rs202162289	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=955;ReadPosRankSum=-0.378;SC=AGGACAAATACAATGTCACTA;SOR=0.812;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=150;TCF=55;TCR=95;TR=65;WE=42804903;WS=42804885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,72:0.44:162
chr5	43039793	rs1054428	T	C	6954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=109;PP=2965;SC=GGGAAGCTGCTGGAGCCTGAG;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=129;TCR=109;TR=237;WE=43039801;WS=43039783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr5	43066774	rs316408	T	C	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=36;PP=1918;SC=ATGGCGGTGCTGGGACCCTAA;SOR=1.295;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=97;WE=43066782;WS=43066764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	43161317	rs55714804	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=769;SC=GATCTTCTTATAGATTTTTTA;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=43161325;WS=43161307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr5	43292483	rs113830463	C	CTTACTATGAA	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=2190;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TCCCAGAGCCCTTACTCTTCT;SOR=0.317;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=43292491;WS=43292473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr5	43292908	rs55794239	C	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.963;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr5	43297144	rs3733769	A	G	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGTAGACAGAATAGCAGCGGT;SOR=0.596;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=188;TCF=90;TCR=98;TR=101;WE=43297152;WS=43297134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,117:0.54:216
chr5	43298557	rs35239179	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=1.335;SC=AAAGTGTCATCTGGGTCTATT;SOR=2.093;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=16;WE=43298565;WS=43298547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr5	43487874	rs3776423	T	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=272;SC=AATTACAATCTTAGGTATTTG;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=43487882;WS=43487864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	43492265	rs6876588	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=571;SC=GCTTATTCTCTGTTAGTTAAA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=43492273;WS=43492255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	43492978	rs10039298	G	A	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=80;PP=2552;SC=TATTGCTATCGTTTATCCCAG;SOR=0.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=141;WE=43492986;WS=43492968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	43493592	rs7732089	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=358;SC=AGTATGGATATAAACAATAAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=43493600;WS=43493582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	43505993	rs7710628	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=42;PP=2020;SC=TGCTGATTTTATTATGAAAAT;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=90;WE=43506001;WS=43505983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	43509348	rs6872851	T	A	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=46;PP=1888;SC=AAAAATTCAGTGCCACAGGGA;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=91;WE=43509356;WS=43509338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	43509462	rs11415989	T	TC	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1219;SC=GGATAAGATATCTTCTAAGTC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=26;WE=43509470;WS=43509452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	43527673	rs4318791	C	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=322;SC=CCTAGACTGACTTATAATAGA;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=43527681;WS=43527663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	43530035	rs6866325	G	C	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=57;PP=2176;SC=CACATGAAATGACCAATCACC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=102;WE=43530043;WS=43530025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	43533992	rs11741521	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=232;SC=GTCTGCACCTAATAATGCAAG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=43534000;WS=43533982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	43535754	rs6869933	G	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=6;PP=332;SC=TAAAAAAGCAGGTGTCAGTAA;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=43535762;WS=43535744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	43609272	rs12187908	T	C	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1547;ReadPosRankSum=0.021;SC=AACTGGGGAGTCAGAAAATTG;SOR=0.504;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=91;WE=43609280;WS=43609262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,94:0.53:176
chr5	43609343	rs10057103	C	T	5953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=99;PP=2965;SC=CTCGTGTCCTCTACTTAGCAA;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=82;TCR=99;TR=180;WE=43609351;WS=43609333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	43612984	rs139409541	T	TA	1214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=12;PP=1061;SC=CAAATATATATTTTTTTTGCC;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=41;WE=43612992;WS=43612974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	49698180	rs13172025	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.597;NF=11;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=0.629;SC=GAATTTGACTGTGAAGTTGGT;SOR=1.552;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=37;WE=49698188;WS=49698170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr5	49698986	rs13154223	C	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.91;MQRankSum=4.919;QD=1.01;ReadPosRankSum=-3.206;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,8:0.14:56
chr5	49701519	rs34041280	CTGT	C	1126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.700;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.271;NF=13;NR=6;PP=780;ReadPosRankSum=1.632;SC=TAAATGTTTTCTGTTGTTGTT;SOR=0.023;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=19;WE=49701529;WS=49701509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr5	49701755	rs2271236	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.527;NF=0;NR=11;PP=171;ReadPosRankSum=0.478;SC=TAAATGTGCAAATATTGTCTC;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=11;WE=49701763;WS=49701745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr5	50040778	rs282561	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=337;SC=TTAAGCTTTGTTCTTTCCACG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=50040786;WS=50040768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	50045967	rs2442107	G	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=377;ReadPosRankSum=-1.684;SC=AGCCTTTTTTGTTTGTTTGTT;SOR=0.904;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=23;WE=50045975;WS=50045957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr5	50046139	rs282553	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=82;SC=TGGTAGAGGAAGCCTTAAAGC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=50046147;WS=50046129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	50052800	rs282551	T	C	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=396;SC=GCATAACGTCTTCCATGTTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=50052808;WS=50052795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr5	50057729	rs282547	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=0.481;SC=ATTACGGAGGGCAGGTAAGGA;SOR=0.992;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=21;WE=50057737;WS=50057719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr5	50084508	rs10683094	C	CCTT	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=146;ReadPosRankSum=0.191;SC=CAAACAAAAACCTATTCAGTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=50084516;WS=50084498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	50683655	rs2288468	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=2.262;SC=CCACAACAACTATGGTAGCTA;SOR=0.990;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=13;WE=50683663;WS=50683645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr5	50685505	rs2303751	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=485;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CCAGGCAGCCAGCCCTGCGGC;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=39;WE=50685526;WS=50685495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr5	52084365	rs10067659	G	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=604;ReadPosRankSum=1.417;SC=ATCCACTTTCGGGCATTCCAG;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=45;WE=52084373;WS=52084355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr5	52084441	rs2897351	C	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=276;ReadPosRankSum=0.326;SC=AATTAGTTTTCGTGTCTCTCC;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=18;WE=52084449;WS=52084431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr5	52096889	rs1499280	C	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=781;ReadPosRankSum=1.936;SC=CTGCGACTACCTGTTTCAACA;SOR=0.810;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=50;WE=52096897;WS=52096879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,60:0.42:143
chr5	52157374	rs2447867	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=673;ReadPosRankSum=0.684;SC=CATTACCTTGTGTAAAGTTGG;SOR=0.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=49;WE=52157382;WS=52157364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr5	52161416	.	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTACTTTGGAGAACATCAGTT;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=13;WE=52161424;WS=52161406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr5	52161500	rs11427012	G	GC	3178.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=26;PP=1374;SC=TTCCAAATTTGACAATTGACT;SOR=1.193;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=48;WE=52161508;WS=52161490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	52193414	rs377107895	C	CA	5111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.33;NF=17;NR=78;PP=2972;SC=CTTCCCTTCCCAAACCAACAT;SOR=1.112;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=95;WE=52193422;WS=52193404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	52204943	rs1478441	C	T	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=589;SC=TAATAAATTCCAATTTTTCAC;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=52204951;WS=52204933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	52223350	rs923837	A	G	5134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=62;PP=2965;SC=GAAAATTCTGAAAGAACACGT;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=52223358;WS=52223340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	52235802	rs1904165	T	G	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1041;SC=TCTATGCACTTATTGAATAAT;SOR=2.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=52235810;WS=52235792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	52235854	rs2447874	T	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=465;SC=TGCAAGGCACTGTGCTGCTTT;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=52235862;WS=52235844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	52243059	rs3764924	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ATGTTTTCTCATTATATAGTA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=52243067;WS=52243049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr5	52243361	rs3764923	A	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=-1.660;SC=AAGCTCTGATATATTCAGACT;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=15;TCR=66;TR=38;WE=52243369;WS=52243351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr5	52248291	rs1054085	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=-1.573;SC=AAATATTTTATGAAAGAAAAT;SOR=0.948;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=12;WE=52248299;WS=52248281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr5	52285117	rs28095	T	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=3;PP=637;SC=AGGGGCGGGCTGGGGCGGGCC;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=52285125;WS=52285107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	52285187	.	AG	A	2415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.870;NF=31;NR=17;PP=1814;ReadPosRankSum=-0.919;SC=GGGGGAGAGAAGCCCTCTGGA;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=48;WE=52285195;WS=52285177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr5	52337908	rs3212441	C	T	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=37;PP=2839;SC=CTATACTTAACACTTTGTGTC;SOR=1.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=95;TCR=37;TR=132;WE=52337916;WS=52337898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	52338083	rs1363192	T	G	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=73;PP=2250;SC=AGGCATGTGATTTGTCTTAGA;SOR=1.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=104;WE=52338091;WS=52338073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	52341064	rs1421937	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=746;SC=TGGCTATCCAATGTTGAATAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=52341072;WS=52341054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	52344079	.	CAATTATTAGTATCTTAGAAAAGAGTAGAGATGATTTCTGAGCTCCAT	C	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=2.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.295;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr5	52344610	rs1421933	A	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=31;PP=917;SC=GGTATGGCTAACAGAAATGCA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=52344618;WS=52344600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	52347369	rs1126643	C	T	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=86;PP=2831;SC=CAAACACATTCGGAGCAATTC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=56;TCR=86;TR=142;WE=52347377;WS=52347359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	52351413	rs1062535	G	A	5753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=58;PP=2965;SC=GAAGTGCTACGAAAGTAATGG;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=117;TCR=58;TR=174;WE=52351421;WS=52351403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	52351746	rs3212522	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=52;SC=TTCAAAATAGGCTAGAATGTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=52351754;WS=52351736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	52354103	rs996765	A	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=48;PP=1367;SC=AATTTGAAGGATAATAATGTC;SOR=2.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=52354111;WS=52354093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	52355854	rs2303127	T	C	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=38;PP=1316;SC=TAAGGCATGGTAATAATTGGC;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=52355862;WS=52355844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	52366138	rs2112290	G	A	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=59;PP=1936;SC=TCCTAAAGACGAGAGAGTGGT;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=89;WE=52366146;WS=52366128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	52367666	rs2287872	A	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=10;PP=852;SC=ACTGTGCTCTAAATTGTAAAC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=52367674;WS=52367656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	52367706	rs2287871	T	C	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=26;PP=1704;SC=TGTTTTAATGTTGCTATGCTC;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=52367714;WS=52367696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	52368922	rs984966	T	A	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=10;PP=1258;SC=TAATGGCTTTTCCCCCCTCCT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=54;WE=52368930;WS=52368912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	52370174	rs3212591	G	A	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=43;PP=2527;SC=CACAAATGTTGTATGCCAATT;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=121;WE=52370182;WS=52370164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	52374527	rs3212605	TTAAA	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TATAAGATACTTAAATAAAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=52374538;WS=52374517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	52379277	rs2303122	C	T	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=67;PP=2467;SC=ACGGGACTTTCGCATCAGTAA;SOR=0.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=120;WE=52379285;WS=52379267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	52396439	rs3214755	GA	G	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=0.055;SC=CTAGACAGATGAAAAAAAATC;SOR=1.387;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=52396447;WS=52396429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr5	52404312	rs153602	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.158;NF=36;NR=11;PP=771;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TTGAAAATATCTAAGTGTTAC;SOR=1.318;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=47;WE=52404320;WS=52404302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr5	52405432	rs62359375	T	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=449;ReadPosRankSum=1.793;SC=GGTTGGGGGCTAGTGGGGAGG;SOR=0.518;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=34;WE=52405440;WS=52405422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr5	52781376	rs33951575	GTT	G	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.524;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr5	52781597	rs722910	A	T	639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=604;ReadPosRankSum=-0.706;SC=CTTTAAAAAAATTTTTTTAAC;SOR=0.507;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=37;WE=52781605;WS=52781587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr5	52856504	rs2279516	G	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=547;ReadPosRankSum=2.975;SC=TGGCGGCGGTGTCAATGTCAG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=33;WE=52856512;WS=52856494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr5	52856716	rs1532163	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	52869553	rs72750147	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.662;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr5	52942083	rs31304	A	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=16;PP=2166;SC=CTTTAACTGGAGTTCCAGAAG;SOR=2.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=78;TCR=16;TR=94;WE=52942091;WS=52942073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	52942197	rs31303	A	G	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=67;PP=1953;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TTGATACCAGAGAGCGATGGG;SOR=0.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=258;TCF=121;TCR=137;TR=124;WE=52942205;WS=52942187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,147:0.47:312
chr5	52978776	rs3085740	GGATT	G	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-2.334;SC=TTCTCACAGAGGATTGATTAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=52978787;WS=52978770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	52979097	rs567	G	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=644;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AAAGTCAGCTGTGCAGTATTT;SOR=1.041;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=33;WE=52979105;WS=52979087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr5	53247360	rs375983171	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=-1.902;SC=AGGTATTCTTTGTGTTCTTTA;SOR=1.296;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=15;WE=53247368;WS=53247350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr5	53371315	rs70986658	C	CT	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.000;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.943;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr5	53371333	rs156384	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.936;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr5	53450542	rs157072	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=0.917;SC=ATGCTCAAATTGTCTCTTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=22;WE=53450550;WS=53450532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr5	53606295	rs35941	T	C	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=55;PP=2091;SC=CCTCAGTTATTCGGAGATCAG;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=53606303;WS=53606285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	53751901	rs7699	G	A	3991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=71;PP=2427;ReadPosRankSum=-0.017;SC=AAGGCTGGCTGCTGATAAAAG;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=295;TCF=164;TCR=131;TR=152;WE=53751909;WS=53751891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,186:0.52:355
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chr5	53815066	rs2548613	C	A	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AGAGCAAGATCGACGGCTTCA;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=66;WE=53815074;WS=53815056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,74:0.58:128
chr5	53815495	rs2548612	A	C	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1644;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGGTTTCAGAATCATATTCTA;SOR=0.810;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=73;TCR=102;TR=95;WE=53815503;WS=53815485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,108:0.54:200
chr5	53815560	rs13162502	A	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=876;ReadPosRankSum=1.590;SC=CTAGAGTGTAAGTTGGATTGC;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=66;WE=53815568;WS=53815550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,77:0.46:169
chr5	53815722	rs2565014	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TGAGACGAGGGTAGAATTAGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=53815730;WS=53815712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	54153803	rs10040872	C	T	3440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=59;PP=2311;SC=GTACATACTGCGGGAAAGCCT;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=106;WE=54153811;WS=54153793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	54154209	rs3916738	G	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.392;NF=32;NR=33;PP=984;ReadPosRankSum=0.074;SC=GAAACCTTTCGTATGTAAAGA;SOR=0.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=65;WE=54154217;WS=54154199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr5	54154328	rs4242050	C	T	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=929;SC=TTTAGCCCATCGGTTGCCATC;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=54154336;WS=54154318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	54252345	rs6877572	T	C	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=79;PP=1953;SC=TCAAATCTAATGTGGCCTGCA;SOR=1.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=111;WE=54252353;WS=54252335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	54252463	rs6893219	C	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=324;SC=CCCAGCACACCTCCTGTCTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=54252471;WS=54252453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	54253339	rs2897761	T	C	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=158;SC=ATCCTTCTGATTGGGGCAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=54253347;WS=54253329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	54253555	rs3815922	A	G	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=27;PP=1315;SC=GCTGGGAGCAAGATGGCTGCC;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=54253563;WS=54253545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	54253581	rs3815923	A	G	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=24;PP=1167;SC=ACCCAAGCACAACTATATCCA;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=54253589;WS=54253571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	54253754	rs6883914	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=324;SC=GGAGATGCATTAGGCTTTATC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=54253762;WS=54253744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	54403957	rs3104233	T	C	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=29;PP=1570;SC=CAACAGCTGATGGAAAAAGCA;SOR=1.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=80;WE=54403965;WS=54403947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	54404015	rs1875506	C	T	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=58;PP=2696;SC=AAAAGGGGGACGATGTGAAAC;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=83;TCR=59;TR=141;WE=54404023;WS=54404005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	54410120	rs3104230	A	C	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=48;PP=1491;SC=GGACTCAAAGACAGGTGCAGC;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=54410128;WS=54410110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	54433393	rs336081	G	A	5043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=66;PP=2965;SC=GTATTCAGAGGGCCTCTCAAT;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=150;WE=54433401;WS=54433377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	54433540	.	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=530;ReadPosRankSum=-1.387;SC=TCCTCTGCCTCCTATTTTCAA;SOR=0.294;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=27;WE=54433548;WS=54433530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr5	54436068	rs114595843	T	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=-1.138;SC=ATAATATATTTTAAGATTAGG;SOR=0.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=15;WE=54436076;WS=54436058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr5	54439466	rs1021580	G	A	3545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=70;PP=2239;SC=TGTTCTTTGCGGGATCCTACA;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=44;TCR=70;TR=114;WE=54439474;WS=54439456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	54459961	rs381852	A	G	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=55;PP=2104;SC=AAGTTCTGGAAGCCAGAGGAG;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=118;WE=54459969;WS=54459951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	54468124	rs35770269	A	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=1.466;SC=TGCAACTAGCAACTGTTAAAA;SOR=0.613;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=30;WE=54468132;WS=54468114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr5	54468921	rs336115	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=270;SC=GACGCCTAATCGTCAAACCCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=54468929;WS=54468911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	54516521	rs6879219	G	A	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=78;PP=2684;SC=CCACTTCCGCGCAATCCTGCC;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=140;WE=54516529;WS=54516511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	54516752	rs3111181	C	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=556;SC=TCTCCTCTCCCGGGCCCCCAC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=54516760;WS=54516742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	54517102	rs34101652	C	CT	527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=15;PP=316;SC=AATCAATTTACTTTTTTTTTA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=54517110;WS=54517092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	54518660	rs7730048	G	A	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=616;SC=ATGAGTTGCTGGAGAGTCGTT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=54518668;WS=54518650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	54557438	rs400437	T	C	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=725;SC=CATTTTAAGCTCAGAGTATTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=54557446;WS=54557428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	54563775	rs143912964	TTTA	T	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=312;SC=TTTTCAATATTTTATTATGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=54563785;WS=54563765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	54693374	rs230802	G	A	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=48;PP=1374;SC=AATTTCATAAGTTAAGTATAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=63;WE=54693382;WS=54693364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	54693402	rs230801	G	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=27;PP=772;SC=GTAAATACAGGTAGTGTTTAT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=54693410;WS=54693392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	54706325	rs139320115	T	TTTTAAA	5121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=22;PP=1750;SC=TATTCTGACATTTTATTCTTT;SOR=2.014;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=60;WE=54706333;WS=54706315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	54709943	rs230766	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=607;SC=TTGTTAAAACGGGTAGTGTGA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=54709951;WS=54709933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	54718618	rs230753	G	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=257;SC=ATTAATTATCGTGTGTTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=54718626;WS=54718608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	54721619	rs3217330	A	AT	800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.667;HP=10;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=354;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GATTTTTTGGATTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=30;WE=54721627;WS=54721609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr5	54721642	rs230750	A	C	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.34;QD=26.42;SOR=1.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	54737538	rs2278258	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=9;PP=1129;SC=TACTTCTCAGTATGAAACTTA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=54737546;WS=54737528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	54737791	rs2278257	G	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=36;PP=1099;SC=CAAAAGTATTGTTGATTTCAT;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=54737799;WS=54737781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	54771380	rs6870449	A	G	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=213;SC=TGCATTTGCCATGAAAATAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=54771388;WS=54771370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	54804621	rs7707766	C	T	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=30;PP=1838;SC=GAAGTGAAGACCCAGGTGTAC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=89;WE=54804629;WS=54804611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	54830295	rs2292280	T	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=425;SC=GCCCCACAGCTGCGCACGCGT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=54830303;WS=54830285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	54830380	rs11745331	A	G	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=30;PP=1338;SC=CGCCCCTCGGACCCGGCGGCG;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=70;WE=54830388;WS=54830370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	54941810	rs6450329	TG	CA	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=1210;SC=AAAAATCAGTTGTCACTGTTT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=54941819;WS=54941800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	54944945	rs35843566	TA	T	236.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=159;SC=ATGCTCAGCATAAAAAAAAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=54944953;WS=54944935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	54944976	rs11738633	G	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=369;SC=TTTTAGAATAGCATATGACAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=54944984;WS=54944966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	54948586	rs138550751	C	CA	1020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=621;SC=AAGAAGATGACAAAAAACAAA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=21;WE=54948606;WS=54948576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	54948598	rs11424790	C	CA	1020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.53;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	54952688	rs11397177	C	CTT	110	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=27.50;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	54960609	rs4865614	A	G	4882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=62;PP=2857;SC=CCAAGGAGAAAAGGAGACTCG;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=77;TCR=62;TR=139;WE=54960617;WS=54960599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	54960673	rs4865615	C	G	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=72;PP=2145;SC=ATATTCCCAGCTAGTGGTATC;SOR=1.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=107;WE=54960695;WS=54960663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	54960687	rs4865616	C	T	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=65;PP=1913;SC=TGGTATCCAACGAAACTAGAT;SOR=1.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=90;WE=54960695;WS=54960663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	54964974	rs7737254	A	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=18;PP=1274;SC=ACACACATGTAGCATATACAC;SOR=1.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=54964982;WS=54964964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	54965513	rs11749883	C	T	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=853;SC=TTAATTGAGACAAAAATTTAA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=54965521;WS=54965503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	54965854	rs2408031	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=327;SC=GTGCAGTGACGCGATCTCGGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=54965862;WS=54965844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	54986963	rs3846505	A	G	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=72;PP=2569;SC=AGAGCACCTGAAATGTTCTCA;SOR=0.868;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=132;WE=54986971;WS=54986953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr5	54990005	rs7728664	C	T	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;QD=22.14;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	54993829	rs3761766	A	G	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=1165;SC=TCCTACACAAAGAAGATAAAT;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=54993837;WS=54993819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr5	55155402	rs1009639	C	T	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=34;PP=2001;SC=GGATGCTCCCCTCACTCTGCA;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=90;WE=55155410;WS=55155392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	55168328	rs71602921	C	CCTT	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.842;NF=0;NR=3;PP=75;ReadPosRankSum=-0.816;SC=ATGTTTACCTCCTTCTCTGTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=55168336;WS=55168318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	55179052	rs10940491	A	T	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=973;ReadPosRankSum=-0.948;SC=ATAATATTCCAATTAGAGGCC;SOR=0.878;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=58;WE=55179060;WS=55179042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr5	55196023	rs1148039	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=272;ReadPosRankSum=-1.162;SC=AGGAGCAGTCCCTGTGCTCTC;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=55196031;WS=55196013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr5	55206444	rs161704	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.475;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=1067;ReadPosRankSum=0.468;SC=GTCATGGCCAGCACCAGTGCT;SOR=0.453;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=66;WE=55206452;WS=55206434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,77:0.64:120
chr5	55212446	rs16884641	T	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=286;ReadPosRankSum=-1.274;SC=AAATGACCACTTGGGATGTCC;SOR=0.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=21;WE=55212454;WS=55212436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr5	55213023	rs161699	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=584;SC=AGACTCGGCACGCAGCGCTTG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=55213031;WS=55213013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	55246001	rs4865999	A	G	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=34;PP=1633;SC=CGAGGGAGGGAAAATGTATTT;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=55246009;WS=55245991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	55251828	rs3729962	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=797;ReadPosRankSum=0.409;SC=ACCCAAGAGTCAGGCTCCATC;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=46;WE=55251836;WS=55251818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr5	55251931	rs2228043	G	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=661;ReadPosRankSum=0.779;SC=AGGGTTGCTAGATAGCGATCA;SOR=0.866;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=43;WE=55251939;WS=55251921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,53:0.40:133
chr5	55255565	rs1373998	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=1.255;SC=GATCTAAGGTGTAGTTTGCTA;SOR=0.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=12;WE=55255573;WS=55255555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr5	55264153	rs2228044	C	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=903;ReadPosRankSum=0.689;SC=TCCCTTCCACCATCCCACTCA;SOR=0.900;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=60;WE=55264161;WS=55264143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr5	55398269	rs318818	G	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=20;PP=1657;SC=TTAGTTGTGTGTAGATATGTT;SOR=1.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=69;WE=55398277;WS=55398259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	55422681	rs321768	C	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=167;SC=TTAAACATCTCCTTTATTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=55422689;WS=55422671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	55466689	rs3846521	C	A	3005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr5	55466693	rs3857293	C	T	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,78:0.47:167
chr5	55479223	rs6885745	G	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.765;SC=CTGCACATAGGCACAGTATCA;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=55479231;WS=55479213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	55528572	rs142447793	A	AAC,AACAC	481.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=8,8;NR=2,2;PP=210,205;SC=CACGCACATGAACACACACAC;SOR=2.985;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10,10;WE=55528580;WS=55528562;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.43,0.57:14
chr5	55528815	rs149489	T	C	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=752;ReadPosRankSum=0.198;SC=ACTGTCAACATGACAGTCAGA;SOR=0.277;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=138;TCF=48;TCR=90;TR=62;WE=55528823;WS=55528805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,83:0.49:170
chr5	55753652	rs16877004	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=190;ReadPosRankSum=0.658;SC=GGGAGCTCTGCGCAGTTTTGT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=55753660;WS=55753642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	55753822	rs148833159	C	CA	1043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=756;ReadPosRankSum=1.372;SC=TTCATGTCAACAGGTTCACTG;SOR=0.967;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=20;WE=55753830;WS=55753812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr5	55759715	rs157851	T	C	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.42;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	55759715	.	TTATCG	CTATCA,CTATCG	194	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10,17;NR=0,2;PP=194,107;QD=24.7467874862;SC=AACTCTCTCATTATCGGTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10,19;WE=55759728;WS=55759705;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:19
chr5	55759720	rs4081705	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=8.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr5	55807370	rs464605	C	T	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=12;PP=1015;SC=GATGTAGCTGCCATTGTGTCT;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=55807378;WS=55807360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	55828785	rs30365	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=0.847;SC=AAGAATAAATGCATGGGCTTC;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=55828793;WS=55828775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr5	55830865	rs39837	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=8;PP=370;SC=CATGCCTCACCGCATTGTCTC;SOR=1.101;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=55830873;WS=55830855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	55851796	.	C	CA	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.6684;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=21;MQ=57.53;NF=3;NR=0;PP=35;QD=13.6666666667;SC=GACTCCGTCACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=55851804;WS=55851786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr5	56111751	rs28710284	G	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=20;PP=689;SC=ACGGAGCCGCGAGCCGCGGCG;SOR=1.005;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=56111759;WS=56111741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	56111927	rs7731700	C	T	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=133;SC=GGAGAGCGGGCAGAGGGCAAT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=56111935;WS=56111917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	56152416	rs832567	C	A	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=14;PP=959;SC=TTGTTTCTGCCTGCATTTTAG;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=56152424;WS=56152406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	56161787	rs832575	G	A	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=78;PP=2462;SC=GTACTTCTACGTCTAGTTCAG;SOR=1.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=56161795;WS=56161777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	56168712	rs2229882	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=632;ReadPosRankSum=1.127;SC=AGCAGCAAACCGTACAGCAGC;SOR=0.542;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=43;WE=56168720;WS=56168702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,58:0.40:144
chr5	56170813	rs16886448	C	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=404;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GCTCTGGGTCCATAAGCTTTT;SOR=1.478;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=25;WE=56170821;WS=56170803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr5	56176446	rs9687226	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=240;ReadPosRankSum=1.049;SC=ATTATTTCTCCACTTTTTCAC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=56176454;WS=56176436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr5	56177443	rs702689	G	A	6101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=66;PP=2965;SC=GCAGTCCATTGATAATTCCCA;SOR=1.259;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=116;TCR=66;TR=182;WE=56177451;WS=56177433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	56177743	rs832582	G	A	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=61;PP=2965;SC=TGAGTGCACAGTCCATTTAGA;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=102;TCR=61;TR=163;WE=56177751;WS=56177733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr5	56177848	rs5868032	TCAA	T	16899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=166;PP=2992;SC=ACCTTCTAGTTCAACAACAAC;SOR=0.839;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=267;TCF=71;TCR=196;TR=223;WE=56177861;WS=56177838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr5	56178111	rs3822625	A	G	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.299;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1407;ReadPosRankSum=-2.856;SC=TTTCTCTACAATTCCACAGAA;SOR=0.706;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=215;TCF=104;TCR=111;TR=85;WE=56178119;WS=56178101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,100:0.39:259
chr5	56178217	rs832583	A	C	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=83;PP=2508;SC=AAAGCCATCTAGACCTACCCC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=131;WE=56178225;WS=56178207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	56205643	rs252924	A	G	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=95;PP=2787;SC=GGCGGGACGCAAAGCGGAGAG;SOR=2.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=122;WE=56205651;WS=56205633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	56205662	rs252923	T	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=678;ReadPosRankSum=-0.078;SC=AGCCTGAGGCTGACTGCCGGC;SOR=0.638;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=38;WE=56205670;WS=56205652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr5	56206073	rs33321	G	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=412;ReadPosRankSum=-2.031;SC=GAAAAGCCAAGCCAGGGTTTA;SOR=0.995;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=26;WE=56206081;WS=56206063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr5	56207123	rs2257505	T	A	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=36;PP=2202;SC=AGAAATCTTGTCTATGCTTCC;SOR=1.189;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=56207131;WS=56207113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	56209609	.	G	A	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=15;MQ=57.65;NF=5;NR=0;PP=24;QD=11.7542425094;SC=TTTTTTTTAAGAAAAAATGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=56209617;WS=56209603;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,5:0.42:12
chr5	56210923	rs331499	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGATTTTTATGTTCACACCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=56210931;WS=56210913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	56212595	rs832536	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=389;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AAAATATGAGCTTATATTTGT;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=23;WE=56212603;WS=56212585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr5	56219698	rs74865790	T	C	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=57;PP=1483;ReadPosRankSum=1.795;SC=GACTATATATTACAGTTAAAA;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=74;TCR=118;TR=92;WE=56219706;WS=56219688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,103:0.46:223
chr5	56221328	rs702679	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-1.008;SC=ACACAAGACCATTTACATTAG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=56221336;WS=56221318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr5	56224485	.	T	TTGGC	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=62;QD=48.5;SC=TGAAATGCTATAAGGGAACAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=2;WE=56224493;WS=56224475;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr5	56224714	rs252893	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=617;ReadPosRankSum=2.509;SC=AAATAAAATTTATGGGCCCCC;SOR=1.352;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=17;WE=56224728;WS=56224704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr5	56224720	rs61154548	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=304;ReadPosRankSum=-1.007;SC=AATTTATGGGCCCCCAAATTT;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=10;WE=56224728;WS=56224704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr5	56226410	rs252890	T	C	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=36;PP=1514;ReadPosRankSum=1.372;SC=GATTGCTCTGTCCCTTAGGAT;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=196;TCF=118;TCR=78;TR=94;WE=56226418;WS=56226400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,110:0.48:231
chr5	56229288	rs832529	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=0.419;SC=TGTACACAAACAATTCTTTGT;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=56229296;WS=56229278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr5	56233541	rs2591968	G	A	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,85:0.54:156
chr5	56233551	rs2591967	C	G	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,75:0.56:135
chr5	56242774	rs2034244	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CTTCAATTTCTGAACTGAAGT;SOR=0.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=15;WE=56242782;WS=56242764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr5	56246276	rs34804097	A	AAAC	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=1.341;SC=ATGCAAGAGAAAACAAAGAAC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=56246284;WS=56246266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr5	56246610	rs2662040	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACGTAGCTTCACTCGAATCGC;SOR=2.179;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=56246618;WS=56246600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	56255367	rs111894536	AT	A	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=8.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=2.132;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,14:0.17:82
chr5	56526565	rs1544737	G	T	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=748;SC=GCAATATGTTGTTCTTAATCA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=56526573;WS=56526555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	56526783	rs1130203	G	A	6288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=108;PP=2965;SC=CTGCTATTGGGCGTCCTAATG;SOR=0.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=87;TCR=108;TR=195;WE=56526791;WS=56526773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	56527224	rs1862172	T	C	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=474;SC=CCTCAGCCTCTCCAGTATCTG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=56527232;WS=56527214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	56527247	rs1862173	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=409;SC=ATTACAGGCATCCACCACCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=56527255;WS=56527237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	56531761	rs13170141	A	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=412;ReadPosRankSum=1.895;SC=TTATTTTTAAAATGTGAAATG;SOR=0.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=27;WE=56531769;WS=56531751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr5	56546749	.	C	CT	126	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=26;MQ=61.31;NF=8;NR=0;PP=126;QD=16.25;SC=AGAACTCATTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=56546757;WS=56546739;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,8:0.73:11
chr5	56547059	rs6893468	G	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=481;SC=AGGTTTATTGGAATACAACTT;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=56547067;WS=56547049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	57753456	rs702723	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=-1.926;SC=TATTCCACTACTTAAACTTGG;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=11;WE=57753464;WS=57753446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr5	57754004	rs697135	C	T	5820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=90;PP=2965;SC=GTTCCCTAGACGATAAACAAA;SOR=0.769;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=193;WE=57754012;WS=57753994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	57754132	rs697134	G	C	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=57;PP=2253;SC=TTGCAGACACGAGATCCCAAT;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=95;WE=57754140;WS=57754122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	57754808	rs697133	G	A	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.249;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1704;ReadPosRankSum=-0.995;SC=AGAGTCATACGCACCTTTTCC;SOR=0.422;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=104;WE=57754816;WS=57754798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,116:0.50:233
chr5	57754851	rs702722	A	G	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=1952;ReadPosRankSum=0.866;SC=TGCTGTGAGGAATAATTTTTG;SOR=1.030;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=211;TCF=97;TCR=114;TR=104;WE=57754859;WS=57754841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,115:0.49:233
chr5	57755843	rs15915	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GTCACACGTCCGAGCCGGCCG;SOR=0.409;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=6;WE=57755851;WS=57755833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr5	57790337	rs7704785	T	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=633;ReadPosRankSum=1.303;SC=TAACACCAAATCACTAAACAG;SOR=0.388;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=47;WE=57790345;WS=57790327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr5	57842049	rs6870990	C	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.143;SC=ACTTGCTCCCCATGACTGGAC;SOR=0.914;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=65;WE=57842057;WS=57842039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr5	57913379	rs2279980	A	G	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=50;PP=2457;SC=GTTTCTGGCAAGGCCAATAAT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=117;WE=57913387;WS=57913369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	58120753	rs11384049	G	GT	245.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=-1.171;SC=TGGACATCGTGTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=58120761;WS=58120743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr5	58271713	.	T	TA	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=61.34;NF=1;NR=6;PP=89;QD=14.0;SC=TCCTTTTTTTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=58271721;WS=58271703;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,7:0.33:21
chr5	58271781	.	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=62.13;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TACACGTAGTGTAAGATTTAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=58271789;WS=58271771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr5	58284208	rs3805557	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CACATATATACACATCTCAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=58284216;WS=58284198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr5	58286625	rs1553114	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,82:0.46:177
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chr5	58386812	rs10075104	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGGGTGCTCAGAAATGCTGTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=58386820;WS=58386802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	58475985	rs9292194	G	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=112;SC=GTACAATGTTGCTTCCTACAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=58475993;WS=58475978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	58476117	rs9292195	T	C	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=21;NR=14;PP=684;SC=GAATGGGAAGTGACTTGAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=58476125;WS=58476107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr5	58489384	rs27175	G	A	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=71;PP=2366;SC=ACCAAATCCCGCATTAGAAAT;SOR=1.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=118;WE=58489392;WS=58489374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	58511501	rs6450512	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr5	58882102	rs1035321	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-1.146;SC=GTACCTGTCACGGAATTTGAT;SOR=2.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=6;WE=58882110;WS=58882092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	59725671	rs789390	T	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
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chr5	59940502	rs6877561	A	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=643;SC=AAGGGTCAGAAAGGAGCTGAT;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=59940510;WS=59940492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	59941486	rs3797209	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=619;ReadPosRankSum=0.249;SC=GAAGGAGAAACGGTAGAAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=37;WE=59941494;WS=59941472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr5	59982754	rs75885088	A	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=800;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CATCTCCCCAATTCCTCACCT;SOR=0.560;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=44;WE=59982762;WS=59982744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
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chr5	59995820	rs9942410	G	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=41;PP=1866;SC=CGCGCGCTGAGTGGGGGCTCG;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=59995828;WS=59995810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
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chr5	60083275	rs10072745	C	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TAAAATAAAACAGAAATGAGT;SOR=0.791;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=35;WE=60083283;WS=60083265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr5	60170605	rs4647150	T	C	32.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr5	60186618	rs2306350	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GGATTAAAAGCATAACTCCTC;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=60186626;WS=60186608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr5	60199363	rs4647102	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=9;PP=360;SC=TCTCAACAACCAGCACAAAGT;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=60199371;WS=60199353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr5	60982841	rs16893687	G	A	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1606;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GGATCTGACCGCTGAAGTTTA;SOR=0.509;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=192;TCF=93;TCR=99;TR=113;WE=60982849;WS=60982831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,134:0.58:230
chr5	61604204	rs4700006	C	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTGGGTGCACAGCAACACCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=61604212;WS=61604201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	61604456	rs4441833	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.104;SC=TACCACAACATAGATGGACCT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=61604464;WS=61604446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	61642937	rs3213940	T	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=240;ReadPosRankSum=0.606;SC=TTTTAAGGTGTATACTTTATT;SOR=1.596;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=16;WE=61642945;WS=61642927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr5	61643816	rs3776615	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=541;ReadPosRankSum=0.972;SC=TACTTGAAAAGTAAAAGGTTA;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=33;WE=61643824;WS=61643806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr5	61649347	rs6886044	T	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=1.409;SC=AGGAATAATATAAACTCTTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=61649355;WS=61649337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	61650843	rs2289883	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	61654187	rs35009	G	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=0.237;SC=TCAGCACCTTGAAATTTACAT;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=18;WE=61654195;WS=61654177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr5	61657228	rs247265	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=699;ReadPosRankSum=0.707;SC=CTTAATTCTGTGAACTAAATT;SOR=0.970;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=42;WE=61657236;WS=61657218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr5	61657377	rs247266	A	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=0.132;SC=TTTTTCCATAAAATTTGGAAT;SOR=0.631;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=5;WE=61657385;WS=61657367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	61673670	rs464058	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-1.303;SC=ATATCACACTATTCCTTAAAA;SOR=0.784;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=61673678;WS=61673660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr5	61676902	rs247253	G	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr5	61676911	rs247254	T	G	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr5	61684882	rs35130331	GA	G	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=208;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GTAGCAATCTGAAAAAAGAAA;SOR=0.706;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=9;WE=61684890;WS=61684872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr5	61688892	rs35014	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=0.442;SC=GTATTATTTTGTCTTTTAATA;SOR=0.184;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=61688900;WS=61688882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr5	61689740	rs3215345	CT	C	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=288;ReadPosRankSum=-0.531;SC=CCCGCCTGGACTTTTTTTTCC;SOR=0.871;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=19;WE=61689748;WS=61689730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr5	61690542	rs2067202	GATTAT	G	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=-1.216;SC=ATTGGCAGCTGATTATAAGGT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=61690554;WS=61690532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr5	61694379	rs247264	T	C	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=43;PP=2281;SC=AGACAAAAGGTGAAGAGATCT;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=122;WE=61694387;WS=61694369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
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chr5	61699231	rs27693	A	C	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1515;ReadPosRankSum=0.344;SC=ATTAGGCAGTACCAGAGAAGA;SOR=1.096;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=183;TCF=82;TCR=101;TR=85;WE=61699239;WS=61699221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,99:0.48:207
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chr5	61699465	rs45623332	G	A	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CCCCAGGCTAGGTCCTGCCGG;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=84;WE=61699473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,101:0.63:160
chr5	61733348	rs153857	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=1.264;SC=AATAGATTCAGATGTTTGGCT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=61733356;WS=61733338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	61745737	rs11329383	CT	C	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.001;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr5	61781127	rs26640	C	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=284;SC=GTTCCCAAGGCTTTGCTCTTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=61781135;WS=61781117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	61785936	rs26644	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TAAATTTTCTTCTCAGTGTAT;SOR=0.243;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=18;WE=61785944;WS=61785926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr5	61826663	rs32179	G	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AACCATAATTGGGAGGCATTG;SOR=1.106;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=7;WE=61826671;WS=61826653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr5	61847103	rs61748228	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=272;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GAGTTCTACTACAAAACACTA;SOR=1.034;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=18;WE=61847111;WS=61847093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr5	62073118	rs1845526	G	C	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=78;PP=2652;SC=CCCGGTGCCTGGGGCCGGAGG;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=75;TCR=79;TR=153;WE=62073126;WS=62073108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	62597278	.	GTT	G	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=64;MMLQ=15;MQ=53.02;NF=3;NR=0;PP=45;QD=16.0;SC=ATGGGTCTTAGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=62597287;WS=62597268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr5	63802636	rs36025131	C	CT	66.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.431;NF=2;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AACTGCGCCTCTTTTTTTTTT;SOR=0.941;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=63802644;WS=63802626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr5	63890387	rs4700641	C	T	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=49;SC=CATGTATATACCTAATTATTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=63890395;WS=63890377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	63905068	rs889248	A	G	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1018;ReadPosRankSum=0.304;SC=GTGTTGTCTCATCTCAAGCTA;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=73;WE=63905076;WS=63905058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,88:0.43:205
chr5	63991512	rs275830	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TCTATTATTTGTTACCAATTA;SOR=0.235;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=18;WE=63991520;WS=63991502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr5	64070617	rs140062546	A	AAATTATGAC	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TTTGGAAGGTATGTTGACTTT;SOR=0.653;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=8;WE=64070625;WS=64070607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr5	64077647	rs55793256	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	64084746	rs11340181	CT	C	69	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	64096046	rs79929128	CT	C	1052.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.314;NF=8;NR=13;PP=773;ReadPosRankSum=-2.245;SC=TATTTCCCCCCTCATGATTAT;SOR=0.936;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=21;WE=64096054;WS=64096036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr5	64096170	rs6449760	G	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TCCATTGTTGGTATGATCCTA;SOR=0.551;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=13;WE=64096178;WS=64096160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr5	64097145	rs7735338	C	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=-0.267;SC=AGGTGATGCACCAGATTTAGT;SOR=0.617;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=5;WE=64097153;WS=64097135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr5	64103714	rs1870437	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=372;ReadPosRankSum=0.941;SC=ATTTTATTTCCTGTCCCTACC;SOR=0.164;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=20;WE=64103722;WS=64103704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr5	64273018	rs1309581	G	A	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1346;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TTGCTGAAACGCCTGAAAATG;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=93;WE=64273026;WS=64273008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,116:0.53:220
chr5	64313879	rs2910769	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=183;ReadPosRankSum=-0.646;SC=AACCCATCTTGGTGTTCTGTA;SOR=0.393;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=15;WE=64313887;WS=64313869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr5	64447777	rs17206779	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=491;ReadPosRankSum=0.458;SC=TGCACTCTAACGAATGGGGGC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=37;WE=64447785;WS=64447767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,43:0.32:136
chr5	64556640	rs10940023	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ATGCTGGTGATTGTTAGCAAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=64556648;WS=64556630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	64569405	rs1423424	T	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AGCATCGCAGTTGAGGATTTT;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=64569413;WS=64569395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr5	64569420	rs1423425	G	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.415;SC=GATTTTGGAGGAGGTTTTTAT;SOR=1.085;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=64569428;WS=64569410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr5	64766519	rs181517355	A	T	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=24.47;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	64766523	rs114290460	T	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	64766558	rs34345975	AATT	A	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=308;ReadPosRankSum=0.378;SC=TACATTGCAAAATTCTTATTT;SOR=1.562;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=64766568;WS=64766548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr5	64814188	rs3050538	AAGATGGC	A	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=723;ReadPosRankSum=1.130;SC=CAATAAAAGTAAGATGGCCTA;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=14;WE=64814202;WS=64814178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr5	64825102	rs1017576	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=1.915;SC=CAAATTTACACAGTGGTCCAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=64825110;WS=64825092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	64847543	rs6893491	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.032;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr5	64848442	rs3213938	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr5	64857424	rs10560318	AACAC	A	1635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.18;MQRankSum=0.324;NF=0;NR=31;PP=1544;ReadPosRankSum=1.468;SC=GTTTAATTAAAACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=31;WE=64857435;WS=64857414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr5	64859592	rs261252	T	A	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=24;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CATTTTCCTATTCTTATGTGT;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=110;TCR=44;TR=85;WE=64859600;WS=64859582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,89:0.53:167
chr5	64859884	rs35326591	CTG	C	808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=732;SC=AACCCGAAGTCTGTGGTTTTG;SOR=4.514;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=16;WE=64859893;WS=64859874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	64863285	rs3756301	A	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=382;ReadPosRankSum=1.170;SC=AATACAAAATAGTATTTGGTT;SOR=1.247;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=23;WE=64863293;WS=64863275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr5	64863320	rs56227785	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=681;ReadPosRankSum=0.353;SC=AGATCTTATACTTTACTTTTT;SOR=0.626;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=41;WE=64863328;WS=64863310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr5	64863484	rs35529383	T	TA	226.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.8301;FS=4.301;HP=13;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.333;NF=0;NR=12;PP=140;ReadPosRankSum=0.585;SC=TGAGTTTATTTAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=64863492;WS=64863474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr5	64864657	rs152063	A	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=144;SC=GTCTCAAGTTATCAGTGTGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=64864665;WS=64864647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	64865405	rs149208	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=562;SC=TGGGAATACTAAGTGATTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=64865413;WS=64865395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	64865658	rs3752673	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=673;ReadPosRankSum=0.399;SC=TGCACACTTATTTTACTGTTA;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=34;WE=64865666;WS=64865648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr5	64881936	rs27141	A	G	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=56;PP=1825;SC=ATGACAGGCCATACACACTCA;SOR=0.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=98;WE=64881944;WS=64881926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	64886374	.	TA	T	61	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=18;MQ=56.4;NF=0;NR=5;PP=61;QD=13.4;SC=ATCAGAACATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=64886382;WS=64886364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	64890479	rs36135	A	C	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=31;NR=49;PP=1521;SC=ACAGCTACCCAAAAAAAAATA;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=64890487;WS=64890469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	64906617	rs37330	T	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=656;SC=TGCCCATTAATTACTTAGTAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=64906625;WS=64906607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	64909487	rs16894099	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=303;ReadPosRankSum=2.730;SC=CTATAACAGTAACAATTCCCT;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=19;WE=64909495;WS=64909477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr5	64919991	rs154854	G	A	6281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=73;PP=2965;SC=GAGGCCGATGGTGGAGAATAG;SOR=1.326;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=132;TCR=73;TR=205;WE=64919999;WS=64919981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr5	64920803	rs37254	C	T	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=3;PP=1004;SC=TTTGGTTTTGCCAAACGCGAG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=64920811;WS=64920793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	64933505	rs11741124	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=391;ReadPosRankSum=0.817;SC=CTGCCTAAATACTTATTTTAT;SOR=1.165;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=18;WE=64933513;WS=64933495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr5	64942799	rs154955	A	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=252;SC=TTATTCCCCTATTCTTTCCAC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=64942807;WS=64942789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	64946836	rs154853	G	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=11;PP=397;SC=ATTTTTGAATGTGTCATATGA;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=64946844;WS=64946826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	64954159	rs28084	A	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=554;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTTAAATGCCACCACACCTTG;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=45;WE=64954167;WS=64954149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr5	64956428	rs37349	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.703;SC=TTGGAGGGTACATCATCCAGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=64956436;WS=64956425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	64957686	rs37347	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=388;SC=CAGGTCTGCCAGGCTATTCCA;SOR=4.294;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=64957694;WS=64957676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	64957718	rs37346	T	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=867;SC=TGCAAAAGAATTTAAAATGAG;SOR=3.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=64957726;WS=64957708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	64960311	rs36031543	A	ATCTC,ATC	2850.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.4978,0.5022;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=7,7;NR=35,35;PP=8,1839;SC=ACTTAGACTCATCTCTCTCTC;SOR=1.292;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=42,42;WE=64960319;WS=64960301;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:64
chr5	64968170	rs5868414	AT	A	1014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=501;SC=CTTAGCAAAGATTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=27;WE=64968178;WS=64968160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	65008946	rs3833969	GT	G	1456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=49;PP=919;SC=AAAGAAACAAGTTTTTTTTTT;SOR=4.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=49;WE=65008954;WS=65008936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	65016452	rs9291846	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TTATGTTACAATAGATCATCA;SOR=2.973;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=14;WE=65016460;WS=65016442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr5	65018126	rs2548786	C	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=-1.644;SC=CCCGGGCGCCCAGGCGCTGCC;SOR=0.418;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=21;WE=65018134;WS=65018116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr5	65018321	rs2548785	C	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=596;ReadPosRankSum=0.877;SC=CCCGGACCCACCCCTTCCCGA;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=38;WE=65018329;WS=65018311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr5	65073224	rs34979	C	A	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=32;PP=2125;SC=CTGTTTCAACCGAAATGGTTT;SOR=1.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=105;WE=65073232;WS=65073214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	65075858	rs252648	A	G	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=143;SC=TCACCATGTTAGCCAGGCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=65075866;WS=65075848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	65105622	rs2561196	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=634;SC=TTCATTTTAAGTGGTATCCCA;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=65105630;WS=65105612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	65108215	rs2254485	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=478;SC=TAATGAATCCAGAGGTATAGT;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=65108223;WS=65108205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	65288791	rs27132	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=327;SC=ATCTAGAAATATGATATTCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=65288799;WS=65288781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	65308055	rs706678	C	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=269;SC=TTATATCAATCTTAAGTCTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=65308063;WS=65308045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	65316997	.	TA	T	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=52;QD=39.0;SC=ATCTGACTTTTAAAATTTTTT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=65317005;WS=65316992;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	65317181	rs706679	C	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=10;PP=357;SC=GCTGGAAAGACTGGATTTGGG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=65317189;WS=65317171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	65364692	rs1160930	CCT	C	1438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.052;SC=AAATCTATCCCCTCTTTATTC;SOR=1.464;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=33;WE=65364701;WS=65364681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr5	65454530	.	TTTTTTC	T	637.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.156;NF=13;NR=1;PP=634;ReadPosRankSum=-1.679;SC=CACATATTTGTTTTTTCTTTT;SOR=0.504;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=14;WE=65454543;WS=65454520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr5	65892448	rs4502771	C	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.77;ReadPosRankSum=-2.389;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr5	65892767	rs200514960	T	TGCC	704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=586;ReadPosRankSum=1.577;SC=GTCCTTGCGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.754;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=14;WE=65892775;WS=65892757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr5	66085489	rs1982329	A	G	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=40;PP=1845;SC=GGCCCATCACATCCATCTGCC;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=105;WE=66085497;WS=66085479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	66195701	rs458115	C	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.53;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	66212985	rs37567	C	G	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=1204;SC=ATCTTATTACCCCTGGTCATT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=66212993;WS=66212975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	66300721	rs66551443	A	AT	1136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=584;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GATAATTGGGATTTTTTTTTT;SOR=0.816;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=43;WE=66300729;WS=66300711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr5	66386181	rs113710101	C	G	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	66429329	rs2371882	G	T	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=46;PP=2525;SC=TTACATGTCCGTCTGCCTCAT;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=125;WE=66429337;WS=66429319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	66459878	rs1705399	G	C	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=94;PP=2946;SC=TCGGATGGCCGGGTGCCTGCG;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=50;TCR=94;TR=144;WE=66459886;WS=66459868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	66480004	rs1697144	T	C	7809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=126;PP=2965;SC=CTTTGGAAGATCGTTGAATCA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=125;TCR=128;TR=250;WE=66480012;WS=66479994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr5	67569391	rs2302974	A	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=945;ReadPosRankSum=-3.555;SC=TTGTGCATTCATTAAGTAAAT;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=49;WE=67569399;WS=67569381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr5	67569479	rs2302975	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=-0.605;SC=AAAATGTCTCAGTCTATAATT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=67569487;WS=67569469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr5	67575344	rs16897620	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.625;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.912;NF=11;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=1.836;SC=TTTTTGTCACATGTGAGTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=67575352;WS=67575327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr5	68411010	rs240809	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TATTTAACGACTGACTGTTGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=68411018;WS=68411000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr5	68412048	rs34215592	A	AT	768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.832;NF=2;NR=15;PP=716;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TTGTGTAAGCATTCCCCCCTT;SOR=0.506;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=17;WE=68412056;WS=68412038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr5	68413042	rs3840519	CT	C	735.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=303;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ATACTCCTCCCTTTTTTTTTG;SOR=0.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=23;WE=68413050;WS=68413032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr5	68415932	rs164391	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTGTCCACCAGTGAAAAAAGT;SOR=0.446;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=68415940;WS=68415922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	68417643	rs164578	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCCATTCACACCATATGCATG;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=31;WE=68417651;WS=68417633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr5	68417755	rs164577	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=0.589;SC=CCTACTTTTCAACTGTGTTCT;SOR=0.069;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=68417763;WS=68417745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	68419054	rs164572	A	T	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=969;ReadPosRankSum=0.530;SC=TGGCAGATACACTTGGCAGCA;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=149;TCF=89;TCR=60;TR=67;WE=68419062;WS=68419044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,82:0.45:184
chr5	68463606	rs163442	G	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=274;SC=TGGGACCCATGTTTTCCCTCG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=68463614;WS=68463602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	68464234	rs163443	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=842;SC=TCACTGATACATGCAAGAGCA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=68464242;WS=68464224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	68470559	rs426392	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=0;PP=786;SC=AGAAATAAACTGACTTTTTCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=68470567;WS=68470549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	68470599	rs3087334	C	CATTA	2290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=2;PP=2465;SC=GATATGGTGTCATTAAGATTT;SOR=4.977;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=43;WE=68470607;WS=68470589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	68485366	rs648489	C	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=16;PP=940;SC=GGGCGGGGCCCTCGGGCCTTT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=68485374;WS=68485356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	68491714	rs11283275	T	TAGTCAAG	1124.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=566;SC=CTGAGTGAATTAGTCAAGCAC;SOR=1.136;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=68491722;WS=68491704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	68513572	rs2242351	C	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=13;PP=1605;SC=CGTGACGTCCCGGGAAGCACC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=75;WE=68513580;WS=68513562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	68525027	rs2932777	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=367;SC=TTATTTTTTCCTTTTCAGCGT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=68525035;WS=68525017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	68531253	rs2972388	C	T	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=31;PP=1210;SC=GAGATAAGAACACCAACCAAA;SOR=0.747;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=65;WE=68531261;WS=68531243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	68546706	rs2972367	A	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=32;PP=931;SC=CAGGGGCTCTATAGTGAGCAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=68546714;WS=68546696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	68550631	rs2054975	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.51;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	68550635	rs2054976	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.05;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	68551507	rs2291519	T	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=33;PP=1265;SC=AAAGGATCTCTAGTTATTTTC;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=68551515;WS=68551497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	68558282	rs34449359	G	C	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=113;SC=GATCACTTGAGGTCAGGAGTT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=68558290;WS=68558272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	68572668	rs4077460	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=200;SC=GAGACTGTGCCGTTTTAGGTA;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=68572676;WS=68572658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	68596068	rs28704183	C	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=311;SC=CTACCCACAACATCGGGCTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=68596076;WS=68596058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	68602746	rs6881767	G	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=13;PP=491;SC=AAAGAAAATAGTACCTTCATG;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=68602754;WS=68602736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	68609885	rs11749723	G	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=902;SC=TTGGGAGGGAGGAGAAAAGAA;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=68609893;WS=68609875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	68610009	rs28462372	A	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=233;SC=TTATAATAGAACACCAGGTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=68610017;WS=68609999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	68688608	rs299080	T	C	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1637;SC=TGAATGGAATTCGTATTCTTT;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=68688616;WS=68688598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	68695940	rs1045051	T	G	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=86;SC=GCTTTATGCCTCCAAACTCAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=68695948;WS=68695930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	68706252	rs10940223	G	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=272;SC=CATCTTTTCAGGTGCTTATTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=68706260;WS=68706242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	68706438	rs6871685	G	A	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=807;SC=AATATGTTCAGTATGAATCAA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=68706446;WS=68706428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	68715310	rs1185246	C	T	7768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=111;PP=2965;SC=ACCCACCCAACTCTTCATGAC;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=124;TCR=111;TR=235;WE=68715318;WS=68715300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr5	68862361	rs375045774	TG	T	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.88;MQRankSum=-2.189;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.180;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	68862365	rs201465285	G	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.01;MQRankSum=-2.189;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	70751818	rs3748043	T	G	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=973;ReadPosRankSum=0.884;SC=GGCCGCCGGATCCTGCCACGG;SOR=0.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=60;WE=70751826;WS=70751808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr5	70786726	rs35267960	G	GAC	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=310;ReadPosRankSum=0.403;SC=TGTAGGAAAAGAGTGTTATAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=70786734;WS=70786716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	70800538	rs3761967	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=548;ReadPosRankSum=1.372;SC=TTTTCAAAATGTGCAGCCAGA;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=34;WE=70800546;WS=70800528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr5	70805272	rs36098798	GC	G	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.63;MQRankSum=0.674;NF=6;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-1.787;SC=TTGATTGTGTGCCCCCTTTTT;SOR=0.180;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=70805280;WS=70805262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr5	70806457	rs715748	G	A	3880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.281;SC=TGGAAGAGAGGGTTCCTCAAG;SOR=0.987;SbPval=0.7;Source=Platypus;TCR=180;TR=156;WE=70806465;WS=70806447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,168:0.49:343
chr5	70806649	rs1961760	T	A	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GCTAGCAGAGTTCAGTGCTAT;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=65;TCR=84;TR=79;WE=70806666;WS=70806639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,93:0.54:173
chr5	70806711	rs715747	C	G	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1447;ReadPosRankSum=1.311;SC=ACATTCCCATCATGGAGAAAG;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=70;WE=70806719;WS=70806701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,76:0.47:160
chr5	70806958	rs6886336	G	A	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=51;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CTTCAGTGCTGTGCCTTCACT;SOR=0.808;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=149;TCF=42;TCR=107;TR=68;WE=70806966;WS=70806948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,88:0.47:187
chr5	70807991	rs418738	G	A	73.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTAGAATTTAGTAGACTTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=70807999;WS=70807981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr5	70809169	rs1698063	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=-0.415;SC=ATCAGAAACCAAGAAAATGGA;SOR=0.399;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=70809177;WS=70809159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr5	70811821	rs279322	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CAAATTTTACATTTTTACATT;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=70811829;WS=70811811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr5	70819926	rs34727932	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.669;SC=AAAACGAGTTCGGGGTAAGAC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=71;WE=70819934;WS=70819916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,78:0.50:155
chr5	70834703	rs276591	A	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=1.242;SC=TAAATTGTTTATGTTCTTGCT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=70834711;WS=70834693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	70834833	rs276590	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=393;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GTTTGGGGAAGTATTTTAAGA;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=23;WE=70834841;WS=70834823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr5	70837295	rs6453014	A	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-0.499;SC=AGTATGTATAATTCCTCATGT;SOR=1.445;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=70837303;WS=70837285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr5	70840233	rs182190	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=555;ReadPosRankSum=-0.144;SC=ATAAAAACCTCGGACCAGTTA;SOR=0.409;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=36;WE=70840241;WS=70840223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
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chr5	70849021	rs469039	G	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=-2.313;SC=CTAAAAAGCCGCCTGATAATT;SOR=0.859;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=7;WE=70849029;WS=70849011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr5	70952506	rs7443786	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=0.347;SC=ATTTCTGCACATGGAGAGTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=14;WE=70952514;WS=70952496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
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chr5	71412373	rs1466343	A	G	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=43;PP=1323;SC=CTGGCGCTGGAGATGTATTCA;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=71412381;WS=71412363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	71488904	rs7736611	C	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=345;SC=GGGGAACGAACTTGGCCAAAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=71488912;WS=71488894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr5	71495041	rs3805452	T	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=793;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CTGAAGAGGGTGGGTACTCAT;SOR=0.668;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=54;WE=71495049;WS=71495031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr5	71519664	rs3209157	C	T	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=72;PP=2137;SC=CAGCACTGCACCCAGCACATC;SOR=2.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=19;TCR=72;TR=91;WE=71519672;WS=71519654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	71522125	rs9293821	A	T	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=371;SC=ACCTGGCAGCACTAGAAATAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=71522133;WS=71522115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	71524163	rs10942927	A	T	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=108;PP=2965;SC=CTGGAAGCAAAAGGGATGCAC;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=91;TCR=108;TR=199;WE=71524171;WS=71524153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	71528110	rs3213894	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=260;SC=AACCTCCAATTCCATTTGTTA;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=71528118;WS=71528100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	71648432	.	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=2.040;SC=GACACTCACTCAGTCTTGGTT;SOR=3.442;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=71648440;WS=71648422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	71739546	rs4267851	C	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=0.359;SC=GAACTGCCTCCTTCTCATTTT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=11;WE=71739554;WS=71739536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr5	71743024	rs10043295	G	C	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=572;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GCTCCCATTTGTTGTCCACTG;SOR=0.899;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=30;WE=71743032;WS=71743014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr5	71756102	rs7721922	G	A	2915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1960;ReadPosRankSum=-2.518;SC=TGGTTCTGCAGCTGGCTCGGG;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=106;TCR=103;TR=121;WE=71756110;WS=71756092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,130:0.54:241
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chr5	72112421	rs34648	T	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.94;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr5	72147269	rs34655	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=383;ReadPosRankSum=1.105;SC=GATGTGGGATAAACAGTCTTA;SOR=0.947;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=25;WE=72147277;WS=72147259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr5	72151858	rs34660	T	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=2.308;SC=TTAAATTGTGTTGGGGAAACT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=72151866;WS=72151848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr5	72174553	rs266436	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=0.908;SC=ACTTTGTAATGCCACTTTAAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=72174561;WS=72174543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	72182857	rs4704045	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=1.441;SC=ATAAGTAATAAGAGGTTAATG;SOR=1.802;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=72182865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	72184098	rs17606	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=586;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GCATCCTGGACAGCAACAAGA;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=45;WE=72184106;WS=72184088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr5	72348272	rs185435	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=507;ReadPosRankSum=-0.746;SC=ACATCACACAATGGCTTCTTT;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=37;WE=72348280;WS=72348262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr5	72364673	rs470926	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.491;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr5	72419267	rs638333	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=501;ReadPosRankSum=-0.975;SC=CAAACTCATCTTCTGCTTCTT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=32;WE=72419275;WS=72419257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr5	72419410	rs7731777	A	G	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=47;PP=2654;SC=CCGTGGTTGGACTTGGGGCTG;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=111;WE=72419418;WS=72419400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	72742882	rs2972191	T	C	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=40;PP=919;SC=ACGAGGAGACTGAGGAGGCGG;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=72742890;WS=72742872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	72798502	rs200370518	GTT	G	334.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.47;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	72800408	rs703882	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=1.471;SC=GACTTGACTTGGCTTGTTTCT;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=10;WE=72800416;WS=72800398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr5	72849375	.	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.093;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TCTGTTATTGGCTCATGTACA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=72849383;WS=72849365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr5	72850282	rs343104	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=501;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ATGCTGCTGTAAGAAGTTTTA;SOR=1.908;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=25;WE=72850290;WS=72850272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr5	72872766	rs1220622	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=0.082;SC=AAAGCTTTTCCTTTTTATTAG;SOR=0.330;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=23;WE=72872774;WS=72872756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr5	72873925	rs7443182	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=379;ReadPosRankSum=-1.258;SC=AGTTCACATGGCACTTTATTT;SOR=0.426;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=24;WE=72873933;WS=72873915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr5	72874801	rs12652195	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=864;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TTTTTTTTGTGCTGTTTTGTC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=51;WE=72874809;WS=72874791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr5	72980869	rs10755296	G	C	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=655;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TGCATGGAGCGTTTTAAAACT;SOR=1.381;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=32;WE=72980877;WS=72980859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr5	73048867	rs191563093	G	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=511;ReadPosRankSum=0.259;SC=TGCTGGTGACGCAGGCCAATC;SOR=0.482;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=40;WE=73048875;WS=73048857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr5	73069581	rs4704097	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	73072354	rs7714670	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=547;ReadPosRankSum=0.330;SC=TCAGGGCAGATGGTCCCCAAG;SOR=0.536;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=42;WE=73072362;WS=73072344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,49:0.42:116
chr5	73076457	rs11949860	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=292;ReadPosRankSum=2.313;SC=ACCTCAAATGGTTTTCTGTGC;SOR=0.473;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=21;WE=73076465;WS=73076447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr5	73076474	rs35525194	GT	G	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr5	73076511	rs6453022	C	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.461;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr5	73090089	rs12653477	T	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.666;NF=25;NR=13;PP=544;ReadPosRankSum=0.746;SC=GAGAGCTGATTTTTAAGAGGC;SOR=1.038;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=38;WE=73090097;WS=73090079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr5	73090165	rs10683146	A	AGTT	2272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.026;NF=13;NR=24;PP=1669;ReadPosRankSum=1.501;SC=GTCAGCTAGTAGTTGTTGTTC;SOR=0.636;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=37;WE=73090173;WS=73090155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr5	73090261	rs7716253	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.947;NF=12;NR=22;PP=546;ReadPosRankSum=1.311;SC=GATCAGCAGCTGAAAAGGAAG;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=34;WE=73090269;WS=73090251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
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chr5	73142296	rs2973571	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.281;SC=AATCTACAGTCGAAGGTATTC;SOR=0.938;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=19;WE=73142304;WS=73142286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr5	73144845	rs2973568	A	G	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=641;ReadPosRankSum=-0.363;SC=ATTCTTGCTCATCACCCAAAA;SOR=1.103;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=55;WE=73144853;WS=73144835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr5	73148481	rs2973566	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=352;ReadPosRankSum=-1.010;SC=GTAGAGCAAAGAGCTTACAGC;SOR=1.158;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=25;WE=73148489;WS=73148471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr5	73153389	rs10543482	TACAC	T	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.506;SC=CATATATGTGTACACACACAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=73153400;WS=73153379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr5	73160730	rs1014550	G	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=941;ReadPosRankSum=2.113;SC=ATATATATGTGGCATGGTTGC;SOR=1.175;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=53;WE=73160738;WS=73160720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr5	73160775	rs1979551	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=591;ReadPosRankSum=-1.889;SC=ACTCTTTTTTATTACCATCTA;SOR=0.903;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=36;WE=73160783;WS=73160765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr5	73163831	rs2931423	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=317;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GTGTTCCAGGCACCACCTTGG;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=19;WE=73163839;WS=73163821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr5	73163861	rs2931422	C	T	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=24;PP=1177;SC=GCTGAGTGTGCTTTTACATAT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=73163869;WS=73163851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	73163965	rs2973558	C	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGAGAGTGACCATAACAGCTG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=23;WE=73163973;WS=73163955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr5	73189145	rs2973529	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=415;ReadPosRankSum=-1.403;SC=CTCCCTGGTCGTGGTGTTCTC;SOR=0.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=30;WE=73189153;WS=73189135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr5	73190119	rs2973530	T	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.803;SC=CTTGGAGGTCTTACTGCTTGC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=10;WE=73190127;WS=73190110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr5	73190312	rs146562116	C	T	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1158;ReadPosRankSum=0.626;SC=GATTTGAGGACGTCCATCTAG;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=75;WE=73190320;WS=73190302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,97:0.49:197
chr5	73197185	rs434065	A	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=265;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CTGGTCTGTCACGGCAGTCAG;SOR=0.757;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=18;WE=73197193;WS=73197175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr5	73197200	rs384927	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AGTCAGTGGGGCAAAGGTGCT;SOR=1.051;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=19;WE=73197208;WS=73197190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr5	73218954	rs423333	C	T	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=1593;ReadPosRankSum=-2.776;SC=ACATCTCCCCCGGGACTGTGG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=85;TCR=103;TR=100;WE=73218962;WS=73218944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,115:0.53:217
chr5	73219109	rs3833638	T	TA	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=248;ReadPosRankSum=-1.243;SC=TAAAGCATGGTAAAAAAAAAT;SOR=0.598;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=16;WE=73219117;WS=73219099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr5	73219159	rs2973532	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CTTTCTCTGATGAGCTGGCTA;SOR=0.204;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=73219167;WS=73219149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	73339114	rs285599	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=854;ReadPosRankSum=2.314;SC=AAGTGATCTACATCCTTGGTC;SOR=0.837;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=58;WE=73339122;WS=73339104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,74:0.41:182
chr5	73930442	rs300240	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=325;ReadPosRankSum=1.325;SC=CAGATCTCACCCCATGTACTG;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=15;WE=73930450;WS=73930432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr5	73930751	rs300239	C	T	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1517;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CATCTCCCACCTTGGTCCACT;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=95;WE=73930759;WS=73930741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,107:0.54:200
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chr5	73932315	rs9176	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=0.098;SC=TGACATTTTGTTTCCACTCCT;SOR=0.604;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=28;WE=73932323;WS=73932305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
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chr5	74021846	rs5868753	TACTCAA	T	1351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.772;NF=4;NR=21;PP=1160;ReadPosRankSum=0.353;SC=ACTTTCAGCATACTCAAACTC;SOR=0.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=25;WE=74021859;WS=74021836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr5	74028752	rs10572369	GACACAC	G,GACACACACAC	818.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;NF=10,10;NR=1,1;PP=861,660;SC=TAATGTTTTAGACACACACAC;SOR=4.091;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=11,11;WE=74028767;WS=74028742;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.46:24
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chr5	74037386	rs16872235	T	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=337;ReadPosRankSum=0.311;SC=AAATTCTCACTAAATTCTTCT;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=24;WE=74037394;WS=74037376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr5	74041786	rs150747026	A	AT	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AATGTCTATTATCACCATTAC;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=74041794;WS=74041776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr5	74054595	rs10515191	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=358;ReadPosRankSum=-0.560;SC=AAGGTGTGTAAGTTGACTTGT;SOR=0.381;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=23;WE=74054603;WS=74054585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr5	74054792	rs59475923	AG	A	415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.212;NF=0;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GGAAAAAATAAGGTAAACTTT;SOR=1.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=74054800;WS=74054782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	74055209	rs957680	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=539;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TATGGGAGGATTGATGATGGA;SOR=1.135;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=38;WE=74055217;WS=74055199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr5	74063154	rs1043968	C	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=941;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CGCACTCCAGCGGCTGCTCCT;SOR=0.460;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=59;WE=74063162;WS=74063144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr5	74063250	rs116165962	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1136;ReadPosRankSum=0.327;SC=ACCTGAGGACTCTGGGGCGCT;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=71;WE=74063258;WS=74063240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr5	74063268	rs79669494	G	T	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=988;ReadPosRankSum=1.061;SC=GCTGGGGTAGGGGGTGAGCGG;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=64;WE=74063276;WS=74063258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,82:0.50:164
chr5	74066386	rs1164694	A	G	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=504;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TTGTACAACTAAAACATATTT;SOR=0.723;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=31;WE=74066394;WS=74066376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr5	74069863	rs6874609	A	G	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=1610;ReadPosRankSum=0.186;SC=GCCTTGTGACACAAGGAGGCA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=93;TCR=107;TR=108;WE=74069871;WS=74069853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,122:0.53:230
chr5	74072339	rs58655773	G	GA	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr5	74077155	rs139333387	TAGTA	T	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=-0.647;SC=AAAAACTGCATAGTAAGTAAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=74077166;WS=74077151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	74134654	rs57202395	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=516;ReadPosRankSum=-1.522;SC=CTGGCTTCATCGTAAGAATGA;SOR=1.961;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=25;WE=74134662;WS=74134644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr5	74134742	rs16872323	T	C	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=37;PP=1672;ReadPosRankSum=0.838;SC=CAGGAAACACTGTGAAATGGC;SOR=0.985;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=232;TCF=150;TCR=82;TR=111;WE=74134750;WS=74134732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,125:0.45:276
chr5	74444531	.	T	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=503;ReadPosRankSum=1.185;SC=ACCAGTCCTTTGCCACGAGAA;SOR=0.414;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=33;WE=74444539;WS=74444521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr5	74988369	rs888789	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=653;ReadPosRankSum=-1.268;SC=TTAAAATAACAGCAATTGGTA;SOR=0.620;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=39;WE=74988377;WS=74988359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr5	75427518	rs1423099	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=433;ReadPosRankSum=-0.073;SC=AGAGCTGAACCACTGAAAGGA;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=21;WE=75427526;WS=75427508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr5	75427935	rs10070440	G	A	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1283;ReadPosRankSum=0.340;SC=ACAAGGACCGGCGGGAGCTGG;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=81;WE=75427943;WS=75427925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,86:0.55:157
chr5	75470086	rs10805899	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.427;NF=2;NR=26;PP=457;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CGTCGCCCCGTGCTCCCCGCG;SOR=1.734;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=28;WE=75470094;WS=75470076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr5	75648938	rs142457579	TA	T	359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=6;PP=231;SC=GCTAATTTTTTAATTTTTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=75648946;WS=75648928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	75884734	rs1131232	G	A	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=664;ReadPosRankSum=0.454;SC=CTTTCAGTTTGTATCTGTTCA;SOR=0.933;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=47;WE=75884742;WS=75884724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr5	75886168	rs2270907	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-1.902;SC=CACAGGGTCAATGCAACTGTC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=75886176;WS=75886159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	75888788	rs3736394	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TGATATTTCCGTAAGATACAG;SOR=1.017;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=26;WE=75888796;WS=75888778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr5	75904811	rs3822529	C	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.351;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=445;ReadPosRankSum=-1.043;SC=AGCAATCTTTCTTCAAATAGG;SOR=3.023;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=20;WE=75904819;WS=75904801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr5	75906851	rs7722711	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=793;ReadPosRankSum=-0.383;SC=CTAGGAGTTGTAGCTGTAGGG;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=69;TCR=28;TR=48;WE=75906859;WS=75906841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr5	75907065	rs3797390	A	G	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.695;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr5	75923294	rs2431352	T	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.426;SC=CCGTCGATGATGCCAACGTGG;SOR=0.708;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=70;WE=75923315;WS=75923284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr5	75923307	rs2909888	A	G	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=67;PP=2962;SC=CAACGTGGACAAGGACAGAGC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=146;WE=75923315;WS=75923284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	75924469	rs3822541	G	T	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GTTGTATCAGGTCAGAGAAGG;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=72;WE=75924477;WS=75924459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr5	75927606	rs3797409	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.154;SC=ATTCCTAAAACGTTGAATTAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=75927614;WS=75927596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	75927635	rs3797410	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=152;ReadPosRankSum=-1.398;SC=ATGCCTTGAAGTAAGTGGAAG;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=14;WE=75927643;WS=75927625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr5	75927954	rs3797412	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-1.483;SC=TCAAATTAACATTTCTGTAAT;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=75927962;WS=75927944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr5	75960818	rs11449450	T	TA	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=215;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GTATGAGAATTAAAAAGGAGT;SOR=0.512;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=7;WE=75960833;WS=75960808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr5	75960825	rs253092	G	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=645;SC=AATTAAAAAGGAGTAATCTCA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=75960833;WS=75960808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	75960865	rs253093	T	C	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=906;SC=TAATTTCACATAGTAAAAAGC;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=75960873;WS=75960855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	75961154	rs253094	A	G	189.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TGCTTTACATACATTATCTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=75961162;WS=75961144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr5	75989044	rs10514070	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=1.161;SC=GTGAATATCCGCAAGAATGTT;SOR=1.708;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=18;WE=75989052;WS=75989034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr5	75998516	rs145804823	A	AGAAAACCAGTGCCAGCCTTATTTGCC	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.081;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr5	76003254	rs463188	A	T	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.40;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	76003258	rs464494	C	T	283.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	76114963	rs1529505	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=492;SC=TTCGAATCGGCGGCGGCGGAT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=76114971;WS=76114953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	76128521	rs616235	G	A	3832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=42;PP=2409;SC=ACAGGAACCAGTAGATCCTCT;SOR=1.381;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=123;WE=76128529;WS=76128511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	76129053	rs631465	T	C	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=56;PP=2486;SC=TGGTCACCATTCCTTTGTATG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=76129061;WS=76129043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	76171252	rs1320308	A	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=36;PP=1720;SC=TCTGGCAAGGAAAGGAAGAGA;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=76171260;WS=76171242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	76249536	rs1715771	C	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=503;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CGAGGCTGCCCGGCTCGCGGG;SOR=1.863;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=24;WE=76249544;WS=76249526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr5	76330401	rs1428355	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=33;PP=966;SC=TCATGCTAATGTTGCGTTTTC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=76330409;WS=76330391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	76343999	rs13155212	T	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=521;SC=AAGACAAAATTTGGCCCCCAT;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=76344007;WS=76343989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr5	76621612	rs4133658	A	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=495;SC=TAAAACGAATATCATTTATAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=76621620;WS=76621602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	76645529	rs2306343	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=0.862;SC=AAATGAGTTCGTTTTTAAGTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=9;WE=76645537;WS=76645519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	76703335	rs7705337	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=732;ReadPosRankSum=1.076;SC=CACACAGGGCCGTGCTCTGAA;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=44;WE=76703343;WS=76703325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr5	76704849	rs186753	T	C	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=50;PP=1873;SC=ATGAAGATCCTCACACCAGTG;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=85;WE=76704857;WS=76704839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	76707575	rs200925235	G	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=981;ReadPosRankSum=0.776;SC=ACTTGTTAGTGTAACCTGTCT;SOR=0.557;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=62;WE=76707583;WS=76707565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr5	76708987	rs335614	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=664;ReadPosRankSum=-2.525;SC=GAGTATGTGAATTTTTAAACT;SOR=0.889;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=43;WE=76708995;WS=76708977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr5	76709249	rs335615	A	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=2.655;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	76709268	rs335616	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	76715759	rs16874252	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=421;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GTACATTTCCATAAGAGCCTG;SOR=0.491;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=29;WE=76715767;WS=76715749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr5	76717531	rs57912585	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CTGCCTTCGCCGAGTCCCAGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=76717539;WS=76717521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	76722443	rs40594	G	A	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=768;SC=TAGCGTAAACGAGAGGCCTTC;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=76722451;WS=76722433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	76729193	rs462581	G	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=380;SC=ATGTGCGTGTGAGATATGTGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=76729201;WS=76729183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	76733110	.	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=702;ReadPosRankSum=0.777;SC=CTGCCTTTCACGTGAGAAAAA;SOR=0.768;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=45;WE=76733118;WS=76733100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr5	76733379	rs919224	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=546;SC=TGACAAAAATCACAATTTAGC;SOR=3.180;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=76733387;WS=76733369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	76734084	rs33204	C	T	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=55;PP=2134;SC=AGTCTGGCAACGTGCAGGACA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=76734092;WS=76734074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	76736907	rs2560076	G	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=203;SC=TAGTAATGCCGTATAAAACCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=76736915;WS=76736897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	76747087	rs335609	T	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=544;SC=TCGTTCAAAATACACAAAAAG;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=76747095;WS=76747077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	76758803	rs426381	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=412;SC=AGAACAAAAATCATTTTTGCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=76758811;WS=76758793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	76760495	rs410620	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1250;SC=CAGTGATATGTAAATGTATCC;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=76760503;WS=76760485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	76760657	rs11433376	G	GA	2274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.613;NF=5;NR=49;PP=1139;ReadPosRankSum=0.138;SC=AAAGGGTCAAGAAAAAAAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=54;WE=76760665;WS=76760647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,85:0.97:88
chr5	76785407	rs75709452	A	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=0.792;QD=17.40;ReadPosRankSum=3.221;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr5	76787919	rs42764	C	G	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=35;PP=1921;SC=GGTCGGAACCCAGGAAGGCCG;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=101;WE=76787927;WS=76787909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	76916335	rs5868876	G	GC	5084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=62;PP=2957;SC=TGAACAATTAGCTTCATGCAT;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=76;WE=76916343;WS=76916325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	76926578	rs13357072	T	C	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=69;PP=2965;SC=TGGTCGTCTTTTTGCGCTTCT;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=135;WE=76926586;WS=76926568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	76926651	rs62362480	A	C	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=918;ReadPosRankSum=1.869;SC=ACAGACAGGGAGCTATTAGCC;SOR=0.415;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=66;WE=76926659;WS=76926641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr5	76926748	rs77572607	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=0.100;SC=AAGTGCCGTAGGCCCGACAAG;SOR=3.682;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=76926756;WS=76926738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr5	77071835	rs352575	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=103;ReadPosRankSum=0.787;SC=GGGAAGCGGCGTGCGAGGCTG;SOR=0.273;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=77071843;WS=77071825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr5	77524091	rs4499809	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.14;MQRankSum=1.026;NF=7;NR=31;PP=741;ReadPosRankSum=-1.471;SC=TTTATTCATAACCAGAGTGAA;SOR=1.195;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=38;WE=77524099;WS=77524081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
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chr5	78251347	rs6870443	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=-0.539;SC=GTTTGTGCAAACCAGTTAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=78251355;WS=78251337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr5	78324352	rs1805074	A	G	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=1896;ReadPosRankSum=2.139;SC=AGATCTTCAGAGGTCAGTTTC;SOR=0.419;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=230;TCF=139;TCR=91;TR=120;WE=78324360;WS=78324342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,133:0.52:254
chr5	78324482	rs2303129	T	C	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=943;ReadPosRankSum=-1.375;SC=ATCTGCGTTTTAGTCATGAAC;SOR=0.619;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=55;WE=78324490;WS=78324472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr5	78326750	rs1805073	G	C	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=848;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GTCAGTTACCGCTACTCTTTG;SOR=0.644;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=60;WE=78326758;WS=78326740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,78:0.41:188
chr5	78326922	rs140713637	CGGGCAGCGGGGAGTG	C	880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.100;NF=0;NR=13;PP=2930;ReadPosRankSum=-1.420;SC=GAAAATCCTACGGGCAGCGGG;SOR=0.839;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=13;WE=78326944;WS=78326912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr5	78328560	rs1805072	G	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1386;ReadPosRankSum=1.102;SC=GCTGCTCCCAGCCAGCATGGA;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=102;TCR=95;TR=99;WE=78328568;WS=78328550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,127:0.51:250
chr5	78340062	rs248384	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=294;ReadPosRankSum=0.023;SC=ACAGCCATCCTCCAGCCATGG;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=24;WE=78340070;WS=78340052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,24:0.28:87
chr5	78340257	rs248385	C	G	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=54;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GGAGCACAGGCAGTTCTCGTT;SOR=0.521;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=193;TCF=74;TCR=119;TR=94;WE=78340265;WS=78340247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,109:0.46:239
chr5	78340286	rs532964	A	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=932;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TTCACTTCAGATATAGTCGAT;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=51;TCR=94;TR=69;WE=78340294;WS=78340276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,77:0.44:177
chr5	78340411	rs531982	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=1.899;SC=TGTCAGCCCATATATAAACAC;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=78340419;WS=78340401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr5	78373431	rs682985	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AACACCCAGACGCAGGTTGGT;SOR=1.532;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=18;WE=78373439;WS=78373421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr5	78416973	rs112263466	CA	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=14.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=1.142;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.162;SOR=3.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr5	78421780	rs694290	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=195;ReadPosRankSum=0.167;SC=AATGAAAAAAGAACTTCCTGA;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=12;WE=78421788;WS=78421770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	78421959	rs3733890	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=880;ReadPosRankSum=-1.902;SC=GAGGCTGCCCGACTGAAAGCT;SOR=0.933;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=54;WE=78421967;WS=78421949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,67:0.48:141
chr5	78573790	rs13182512	A	T	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=77;PP=2965;SC=CTTGTATCAGATGGAGGATGA;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=93;TCR=77;TR=170;WE=78573798;WS=78573780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr5	78573970	rs16876598	T	C	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=21;PP=451;SC=TGAAAGGCCATGCGTTATCCA;SOR=2.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=25;WE=78573978;WS=78573960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	78573993	.	TAA	T	70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=70;QD=10.4285714286;SC=AGAGGAACTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=78574002;WS=78573983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,7:0.54:13
chr5	78586914	rs10043008	G	T	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=19;PP=1291;SC=GTATTAAGTTGTTATTTGTCT;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=78586922;WS=78586904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	78596044	rs10514159	T	C	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=71;PP=2574;SC=ATTATTATGATCTGCAACTTC;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=50;TCR=71;TR=121;WE=78596052;WS=78596034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	78608354	.	CT	C	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.9996;HP=21;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=61.26;NF=1;NR=1;PP=24;QD=13.5;SC=TATTGTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=2;WE=78608362;WS=78608344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,2:0.15:13
chr5	78742980	rs6862358	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=310;ReadPosRankSum=1.023;SC=TGAATGTATAGAGACTACATA;SOR=1.292;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=15;WE=78742988;WS=78742970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr5	78746699	rs13356332	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.883;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.869;SC=ACTGCTGTTTCGAGAATATTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=78746707;WS=78746689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	78752802	rs35944172	T	C	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TTGGGTCAATTTGGAAGACAT;SOR=0.549;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=81;WE=78752810;WS=78752792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,95:0.50:190
chr5	78944371	rs72768817	G	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=1.224;SC=CATTAATTTAGTTATTAGGAA;SOR=0.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=9;WE=78944379;WS=78944361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr5	78964887	rs36079132	A	ATG	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.015;NF=0;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=0.058;SC=GTTCACTTATATGTGTGTGTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=11;WE=78964895;WS=78964877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr5	79024734	rs1541813	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=454;ReadPosRankSum=1.961;SC=GTTATTTGCTATAGGTTATCA;SOR=0.430;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=26;WE=79024742;WS=79024724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr5	79028472	rs4704585	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=824;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GGACCTGAGGCTTTATCAGCA;SOR=0.462;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=46;WE=79028480;WS=79028462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr5	79028726	rs13158477	A	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=960;ReadPosRankSum=-2.042;SC=TTCATCTCTTATCACTCCTGT;SOR=0.824;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=62;WE=79028734;WS=79028716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,67:0.43:156
chr5	79029594	rs1019762	T	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GATTCTGTTTTAGAAAAAGGC;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=75;WE=79029602;WS=79029584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,88:0.44:199
chr5	79030045	rs4639193	A	G	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1497;ReadPosRankSum=0.328;SC=ACCTCCTTGTAGAACAAAAAA;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=88;WE=79030053;WS=79030035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,93:0.51:182
chr5	79039828	rs13155412	T	C	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1430;ReadPosRankSum=1.179;SC=GGGATCTGACTTGGGGATTTT;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=84;WE=79039836;WS=79039818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,97:0.46:210
chr5	79058817	rs259128	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=207;ReadPosRankSum=1.069;SC=TGGAAGATCACGTGCTTCTCA;SOR=0.313;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=11;WE=79058825;WS=79058807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr5	79086649	rs259096	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=386;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CATGAGTGAAGTTTTCAGCTG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=22;WE=79086657;WS=79086639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr5	79086883	rs1129770	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1013;ReadPosRankSum=1.228;SC=GAGAGGAGACGGCTGACGGAG;SOR=0.480;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=156;TCF=50;TCR=106;TR=68;WE=79086891;WS=79086873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,76:0.45:169
chr5	79095119	rs3749682	T	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=627;SC=GAATTGGTTATTCCCAAGTGA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=79095127;WS=79095109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	79172136	rs265005	A	G	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=91;PP=2965;SC=GGACTATAAAATTCTCCAGGG;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=173;WE=79172144;WS=79172126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
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chr5	79282544	rs2291524	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=497;SC=GAAGAAGAAACGTAAAAATCC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=79282552;WS=79282534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr5	79354647	rs432267	C	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=652;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GAAAAGCCCTCGTCTTCTTAG;SOR=0.682;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=37;WE=79354655;WS=79354637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr5	79354702	rs411943	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=0.108;SC=TGCCCAGGCACGGGGGCAGCC;SOR=0.465;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=18;WE=79354710;WS=79354692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr5	79355192	rs2434302	T	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=627;ReadPosRankSum=1.463;SC=TAGCTCCACATGGATTCTTTC;SOR=1.506;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=28;WE=79355200;WS=79355182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr5	79361265	rs1866389	G	C	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1188;ReadPosRankSum=1.955;SC=TCGAAATGGAGCGTGCGTTCC;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=69;WE=79361273;WS=79361255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr5	79366080	rs256439	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GCCACCAGCTTCCTGCCAGGC;SOR=2.110;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=10;WE=79366088;WS=79366070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
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chr5	79368016	rs256437	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=4;PP=896;SC=CAGGCAGAAGTGACTCACCAT;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=79368024;WS=79368006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	79443169	rs7712447	A	G	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=57;PP=2108;SC=CCTCAGCAAGACAACAGTAAC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=100;WE=79443177;WS=79443159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	79473059	rs11429938	C	CT	1696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=1725;SC=ATCAGAGGTACTTGGACTGCG;SOR=3.657;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=42;WE=79473067;WS=79473049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr5	79595404	rs33987570	CA	C	50.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=29;SC=ACTCCAGCCACAAAAAAAACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=79595412;WS=79595397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	79596274	rs35486429	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=-1.546;SC=GTCATCTTCTCGCAGTTGTCC;SOR=0.874;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=25;WE=79596282;WS=79596264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr5	79616083	rs1862136	G	C	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=22;PP=1431;SC=CTCCAAAACCGTTAACCCTAC;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=79616091;WS=79616073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
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chr5	79731608	rs2544599	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=123;ReadPosRankSum=0.369;SC=TGCTCAGGCTGGTCTTGAACT;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=10;WE=79731616;WS=79731598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr5	79733079	rs2544600	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=662;ReadPosRankSum=1.059;SC=CAGAATGATATCAGTTCTGAA;SOR=0.919;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=40;WE=79733087;WS=79733069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr5	79734297	rs259028	T	C	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=38;PP=1895;SC=ATTTGTGAAATAGTTGATAAA;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=81;WE=79734305;WS=79734287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	79734409	rs259029	G	A	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=58;PP=2965;SC=ATCAATTATCGGTCTCTGATA;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=79734417;WS=79734399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr5	79735858	rs168939	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=-1.137;SC=AAAGGTGAGTATTAACTTGAT;SOR=0.883;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=12;WE=79735866;WS=79735848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr5	79809658	rs249011	A	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=520;SC=TATTTTTTTTAATGTTATCCA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=79809666;WS=79809648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	79815658	rs369998	T	C	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=59;PP=1432;ReadPosRankSum=0.547;SC=GACACCGTGATATCCTTCTTT;SOR=0.827;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=208;TCF=80;TCR=128;TR=93;WE=79815666;WS=79815648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,121:0.46:264
chr5	79817898	rs2431224	A	G	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1055;ReadPosRankSum=0.760;SC=TCCCTGTCAGAGCAGCATTAG;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=70;WE=79817906;WS=79817888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,102:0.43:239
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chr5	79855876	rs187262	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=145;ReadPosRankSum=-1.648;SC=TTATCAAAGATGGCAAAGACC;SOR=1.154;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=16;WE=79855884;WS=79855866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr5	79945711	rs836821	C	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=272;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TGGTTTTGCTCTACATTGTTT;SOR=0.283;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=19;WE=79945719;WS=79945701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr5	79950389	rs151182735	GC	G	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TGGCCGCCCCGCCCCCCTCGT;SOR=0.892;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=79950411;WS=79950379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr5	79950403	rs10168	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=377;ReadPosRankSum=-1.356;SC=CCCTCGTCCCCATTTGTGCAG;SOR=0.836;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=10;WE=79950411;WS=79950379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr5	79950497	rs2250063	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=721;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CGGCCGCGGGCTCGCGCTCCT;SOR=0.572;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=80;TCF=68;TCR=12;TR=42;WE=79950505;WS=79950487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr5	79950512	rs1105524	A	G	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=23;PP=2377;SC=GCTCCTCGCCAGGCCCTGCCG;SOR=2.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=95;TCR=23;TR=118;WE=79950520;WS=79950502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	79950699	rs201874762	TGCAGCGGCTGCAGCGGCC	T	3937.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=2443;ReadPosRankSum=0.078;SC=ACCCTGGCGCTGCAGCGGCTG;SOR=0.597;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=4;TCR=108;TR=34;WE=79950724;WS=79950689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,109:0.60:183
chr5	79950741	rs144629981	GCCCCCAGCT	G	2243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.685;HP=6;HapScore=3;MGOF=117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=856;ReadPosRankSum=4.359;SC=CGCCCCCAGCGCCCCCAGCTC;SOR=1.785;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=35;WE=79950757;WS=79950723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,57:0.80:71
chr5	79950781	rs1650697	A	G	768.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=452;ReadPosRankSum=0.291;SC=GCCGCCGCACATAGTAGGTTC;SOR=3.682;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=30;WE=79950789;WS=79950771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,29:0.91:32
chr5	79952154	rs1382539	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=295;ReadPosRankSum=0.570;SC=TCAGTTGTAAGGTTTAAATTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=79952173;WS=79952144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	79952165	rs1382540	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=295;ReadPosRankSum=0.270;SC=GTTTAAATTGCTTCACATACG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=79952173;WS=79952144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	79952390	rs1643639	T	C	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=49;PP=1255;ReadPosRankSum=0.209;SC=CAGTCATGGCTCTGGTATTCT;SOR=0.985;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=142;TCF=53;TCR=89;TR=73;WE=79952398;WS=79952380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,87:0.54:161
chr5	79952426	rs1650694	G	C	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=979;ReadPosRankSum=-1.892;SC=GCAGAAGAGCGTATTAGAATT;SOR=0.766;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=52;WE=79952434;WS=79952416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
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chr5	79960955	rs1382543	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=1.441;SC=CTTATTTGCTGCCTAAGAGCC;SOR=1.783;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=20;WE=79960963;WS=79960945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
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chr5	79968271	rs1677653	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.629;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=2023;ReadPosRankSum=-2.250;SC=GTAGGCTTCAATTGGTTTAGA;SOR=1.221;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=54;WE=79968279;WS=79968248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
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chr5	79974646	rs836807	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=256;SC=TACATACTCCTGAGTGTATCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=79974654;WS=79974636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	79974983	rs836806	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=0.778;SC=CTGATACTTATTAAAGTTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=79974991;WS=79974973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	80021193	rs245016	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=239;ReadPosRankSum=0.615;SC=TTTTTTTTTCCTCTTCTGGCC;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=19;WE=80021201;WS=80021171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr5	80149981	rs184967	A	G	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=35;PP=2001;SC=TATAAAGGACAGAGTACATTT;SOR=1.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=106;WE=80149989;WS=80149971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	80160610	rs1805353	T	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=869;ReadPosRankSum=0.114;SC=GAAATAACATTTATTCTGTCT;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=56;WE=80160618;WS=80160600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr5	80168937	rs26279	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=888;ReadPosRankSum=0.025;SC=TTTCACAGGCGCAGCAGAACA;SOR=0.702;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=59;WE=80168945;WS=80168927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,74:0.48:154
chr5	80366202	rs11745040	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=920;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TAAAAAGTGGGTGTTTCCTGA;SOR=0.467;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=118;TCF=84;TCR=34;TR=59;WE=80366210;WS=80366192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr5	80376142	rs27650	T	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=453;ReadPosRankSum=0.666;SC=AGCTTCTGTATCCCGGGACCC;SOR=0.516;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=31;WE=80376150;WS=80376132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr5	80382806	rs7733625	G	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GCGACCTGATGCGCTGTGCGG;SOR=0.495;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=18;WE=80382814;WS=80382796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr5	80388554	rs2592094	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TGTTTATTGCCGTGGACATGG;SOR=2.472;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=13;WE=80388562;WS=80388544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr5	80390225	rs505748	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.569;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=0.519;SC=GAATTAGAGGCGGGAGAGAGA;SOR=1.086;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=6;WE=80390233;WS=80390215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	80390290	rs498119	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	80512974	rs6868762	G	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=881;SC=TAGTAAAGCAGGGGCTGTCAT;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=80512982;WS=80512964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	80552871	rs2270823	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=955;SC=ATGTTTTTGAGATCACCTGCT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=80552879;WS=80552861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	80552960	rs10525993	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	A	237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=954;SC=CTACTTGGAAAGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=80552985;WS=80552950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	80562120	rs545	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=61;PP=1845;SC=CTGCTGGTACGACAGACATAA;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=82;WE=80562128;WS=80562110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	80604430	rs1055383	C	T	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=19;PP=1171;SC=ATTGCCCCGCCGCCCTTGAAA;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=80604438;WS=80604420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	80631511	rs6452399	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=1.258;SC=GGACGATGGAGATGGACTTCA;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=15;WE=80631519;WS=80631501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr5	80631642	rs10371	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=761;ReadPosRankSum=-0.265;SC=AGACGATAAGCCAAATGTGCT;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=57;WE=80631650;WS=80631632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,73:0.41:177
chr5	80640919	rs147835552	TGCACACCGCTGCCACCTCCTC	T	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.390;NF=0;NR=7;PP=358;ReadPosRankSum=-1.755;SC=AGGCCCTCCTTGCACACCGCT;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=80640947;WS=80640909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr5	80744758	rs3764986	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=136;ReadPosRankSum=-1.671;SC=TCACAAAGTATAGTAAAGGAT;SOR=0.061;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=80744766;WS=80744748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr5	82499307	rs2662238	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-0.009;SC=TGATTATTAGGCTGAATTATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=82499315;WS=82499297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr5	82789647	rs4470745	A	G	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=1079;ReadPosRankSum=0.227;SC=CTCCCAGAGTAGGCTGTTATG;SOR=0.573;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=67;WE=82789655;WS=82789637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,96:0.50:191
chr5	82833145	rs2548541	G	A	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CACCTTCTCAGAATTTCTCGG;SOR=0.625;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=188;TCF=108;TCR=80;TR=99;WE=82833153;WS=82833135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,118:0.54:220
chr5	82833369	rs309559	A	G	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1683;ReadPosRankSum=1.031;SC=GGAACAGCCAAAAAAGGGGCA;SOR=0.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=94;WE=82833377;WS=82833359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,118:0.50:237
chr5	82834299	rs188703	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=554;ReadPosRankSum=1.425;SC=ACTCTCCCACGTAGTCCTGCC;SOR=0.511;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=43;WE=82834307;WS=82834289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr5	82834630	rs309557	T	C	2836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=61;PP=1749;ReadPosRankSum=0.141;SC=ATTTCAGTGGTGACTTTAGAG;SOR=0.533;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=252;TCF=120;TCR=132;TR=121;WE=82834638;WS=82834620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,133:0.48:279
chr5	82835545	rs160279	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=938;ReadPosRankSum=2.240;SC=AAGGCATGAGACCAACAATTC;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=60;WE=82835553;WS=82835535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,76:0.43:175
chr5	82835724	rs160278	T	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=1020;ReadPosRankSum=0.961;SC=ATTGAAGACTTTAACAGAATG;SOR=0.881;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=60;WE=82835732;WS=82835714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,72:0.53:137
chr5	82837631	rs160277	G	T	3649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=69;PP=2452;ReadPosRankSum=1.083;SC=AAACAAAACCGATGGTCAAGT;SOR=0.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=318;TCF=172;TCR=146;TR=153;WE=82837639;WS=82837621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,170:0.47:358
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chr5	82849120	rs6873404	T	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=273;ReadPosRankSum=2.020;SC=TAACACTTGGTTGGGGGTGCC;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=21;WE=82849128;WS=82849110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr5	82850631	rs2290673	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.718;SC=AAGGTAGACTAGGAGAGATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=82850639;WS=82850630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	82868173	rs309585	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=597;ReadPosRankSum=1.337;SC=ATATAATACCGTCGTTGCTCT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=42;WE=82868181;WS=82868163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr5	82875800	rs308365	C	T	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=29;PP=2265;SC=TTCCTTTAGTCGCTTGCGGCC;SOR=1.883;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=77;TCR=29;TR=106;WE=82875808;WS=82875790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
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chr5	82940510	rs1457081	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.308;SC=AGCAAGGAGTTGTTAGAAGCC;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=82940518;WS=82940500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	83402456	rs55742505	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=543;ReadPosRankSum=1.020;SC=TTGTCCCATCCCATCTGTTAC;SOR=0.418;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=29;WE=83402464;WS=83402446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr5	83433002	.	TACAC	T,TAC	2866.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;NF=37;NR=11;PP=2216;SC=TGTGTATACATACACACACAC;SOR=3.287;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=48;WE=83433014;WS=83432992;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.17,0.83:77
chr5	83433006	rs200843007	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.895;NF=29;NR=5;PP=755;ReadPosRankSum=0.653;SC=TATACATACACACACACACAC;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=78;TCR=13;TR=34;WE=83433014;WS=83432992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr5	83476194	rs163715	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=365;ReadPosRankSum=0.687;SC=AAAGTACAATGACTATGAATA;SOR=0.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=21;WE=83476202;WS=83476184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr5	83525582	rs72776563	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-1.911;SC=TTCTGGTTGAAATCTGAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=83525590;WS=83525572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	85582712	rs2964837	T	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=-6.164;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr5	85586579	rs10066606	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.051;NF=9;NR=2;PP=508;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CAGGGATGGGTGTTCCGGGAT;SOR=1.781;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=85586592;WS=85586569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr5	85586584	rs10038100	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.335;NF=7;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=0.414;SC=ATGGGTGTTCCGGGATTACTT;SOR=0.307;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=85586592;WS=85586569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr5	86564995	rs3734000	T	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=871;ReadPosRankSum=0.067;SC=ACCTGGCGTCTTCCTACATTT;SOR=1.151;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=43;WE=86565003;WS=86564985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr5	86627138	rs13157168	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=509;ReadPosRankSum=0.533;SC=TATTTATATTGTAATATCTTC;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=35;WE=86627146;WS=86627128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr5	86633973	rs3752862	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GATCTTGTCCGTAATCAGAGA;SOR=2.027;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=11;WE=86633981;WS=86633963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr5	86667856	rs35014912	G	GA	658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.251;NF=15;NR=8;PP=454;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TGTTGAATTTGAAAAAAAAAA;SOR=0.582;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=23;WE=86667864;WS=86667846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr5	86669966	rs36000817	T	A	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	86695274	rs2230641	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=772;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CAGAACAGCAACTTCTTCAGA;SOR=0.457;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=50;WE=86695282;WS=86695264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr5	87497977	rs358289	C	T	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=18;PP=623;SC=AGTTAAATAACCTGCCTCAAA;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=87497985;WS=87497967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	87498027	rs3099436	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-1.744;SC=GTTTGAACCAGTTCTGTCTGA;SOR=0.593;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=8;WE=87498035;WS=87498017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	87498069	rs3098676	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=1.655;SC=TTCTACAAGGCTAACAGATCA;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=3;WE=87498077;WS=87498059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr5	87498849	rs3097146	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=0.574;SC=ACCCAGAGCAGAACCATAAAT;SOR=1.090;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=22;WE=87498857;WS=87498839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr5	87502217	rs78706065	G	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr5	87503087	rs34534189	GACT	G	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=378;ReadPosRankSum=1.202;SC=AATAAAATTTGACTACAACAT;SOR=0.400;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=87503097;WS=87503077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr5	87963272	rs5869431	G	GA	2441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=1388;SC=TAGGCACCATGGCTTTTTACC;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=33;WE=87963280;WS=87963262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	87968864	rs6882046	A	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=7.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr5	88025845	rs34297769	CA	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	88416255	rs139453030	A	AAC	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=40;ReadPosRankSum=0.781;SC=TACATACACAAACACACACAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=2;WE=88416263;WS=88416245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr5	88416354	rs9293511	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=268;ReadPosRankSum=2.036;SC=ACTGGAAGAGCGCTTACTATT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=19;WE=88416362;WS=88416344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr5	89705390	rs10041922	T	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=504;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CCAAACGTCCTCCCTTCCACA;SOR=0.951;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=34;WE=89705398;WS=89705380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr5	89705752	.	GC	G	34	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.9998;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=34;QD=28.0;SC=ACCTCCTAACGCCCCCCCGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=89705760;WS=89705745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr5	89769647	rs3763072	G	A	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1686;ReadPosRankSum=0.405;SC=GCCCGCGGGGGCCCATTACCA;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=229;TCF=123;TCR=106;TR=114;WE=89769655;WS=89769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,125:0.50:251
chr5	89769728	rs2162986	T	C	6907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=108;PP=2965;SC=GGGCTGGGCGTCCGCACCACC;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=88;TCR=108;TR=196;WE=89769736;WS=89769718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr5	89781594	rs2115500	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=279;ReadPosRankSum=1.100;SC=ATGATTATAGCATCCTCAAGT;SOR=0.376;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=21;WE=89781602;WS=89781584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr5	89924976	rs2366771	C	A	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=243;SC=AGAGTTTGATCATCTCAGATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=89924984;WS=89924966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	89938587	rs2366773	C	T	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=45;PP=2135;SC=AAAGTAAGTACGAAAAAAACT;SOR=1.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=108;WE=89938595;WS=89938577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	89943571	rs2366777	G	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=42;PP=1179;SC=TAATCCTCTTGAATTCAACAG;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=89943579;WS=89943561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	89954184	rs11958484	T	C	193.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=133;SC=TTGGTAAGATTGGTTGCGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=89954192;WS=89954174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	89968626	rs1028191	A	T	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=46;PP=1352;SC=GCAGCTTTTGATTGAAGTGTC;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=89968634;WS=89968616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	89979380	rs4916683	T	C	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.69;SOR=1.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	89979589	rs4916684	G	A	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=73;PP=2477;SC=CTCTGTGTCAGTCCTCAGTGT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=49;TCR=73;TR=122;WE=89979597;WS=89979579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	89979698	rs4916685	C	T	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=39;PP=2141;SC=AAAAACAGACCTGTTAAAGTT;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=89979706;WS=89979688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	89985882	rs10037067	A	G	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=67;PP=2146;SC=GATGACCCCTATGGATTATTT;SOR=2.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=91;WE=89985890;WS=89985872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	89988412	rs10040165	G	A	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=10;PP=1136;SC=AGTTTTCACTGTATTTTTAGG;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=89988420;WS=89988402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	89988504	rs2366926	A	G	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=55;PP=2869;SC=ATTCCTGCCAATGATGATCCT;SOR=1.199;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=144;WE=89988512;WS=89988494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	89989779	rs16876822	G	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=14;PP=962;SC=TGGCAATGGAGGAAGGTCAAG;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=89989787;WS=89989769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	89990324	rs1878878	A	G	8153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=126;PP=2965;SC=GTGATCTACAATATTAGTCCC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=115;TCR=126;TR=241;WE=89990332;WS=89990314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr5	89990545	rs10068473	C	A	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=65;PP=2068;SC=AATGAATTTCCGTTGCCCCAG;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=97;WE=89990553;WS=89990535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	89993045	rs10942604	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=887;SC=AACTTGATAGTTTTTCCCTTT;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=89993053;WS=89993035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	90001988	rs1160121	G	T	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=9;PP=1493;SC=AAATTCACAAGGGGATATTAT;SOR=3.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=90001996;WS=90001978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	90002220	.	C	CT	385	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=60.8;NF=2;NR=22;PP=385;QD=16.2916666667;SC=AGGTAAAACTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=24;WE=90002228;WS=90002210;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:27,24:0.47:51
chr5	90004776	rs41308850	A	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=926;ReadPosRankSum=-0.186;SC=AAATGAAATGAAGAAACTTCA;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=35;TCR=70;TR=57;WE=90004784;WS=90004766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
chr5	90007196	rs7732169	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=709;SC=AATCATTATTCCTTGAGAATT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=90007204;WS=90007186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	90012614	rs10067181	A	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=165;SC=TTTCTCTTAGATGAGCACTCA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=90012622;WS=90012604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	90015792	rs6881412	C	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=680;SC=CAGAAATGTTCAGTAGATTTC;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=90015800;WS=90015782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	90016129	rs6452906	A	G	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=GGAAATTGATATCTGATTATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=90016137;WS=90016119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	90020868	rs7723259	A	C	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=18;PP=968;SC=TTAGATGTATAATGAATAACT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=90020876;WS=90020858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	90020923	rs16869042	T	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=21;PP=964;SC=TAGAAAATCCTAAAACTTGTG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=90020931;WS=90020913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	90021499	rs4916815	G	T	232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.62;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=6;PP=120;SC=AATGAAGTGGGTTTTTTTTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=90021507;WS=90021489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	90024735	rs2366928	G	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=687;SC=AATATTTGCCGAAAATGTCTT;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=90024743;WS=90024725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr5	90052289	rs10062026	G	A	5038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.147;NF=82;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=0.391;SC=TCCTGAATTGGAGGAAGGATT;SOR=0.265;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=154;WE=90052297;WS=90052279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
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chr5	90107108	rs2438374	A	G	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=72;PP=2589;SC=ATTGTGGAGGAGAAGGATGAT;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=140;WE=90107116;WS=90107098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr5	90119324	rs2438378	G	A	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=51;PP=1938;SC=GGTAAACCTGGTGGAGGAACT;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=90119332;WS=90119314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr5	90669400	rs6452952	A	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=104;SC=TGTTCTGTTAACATGATAATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=90669408;WS=90669392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr5	93388777	rs148770534	T	TATAG	672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=346;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTGCATATACTATAGATAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=6;WE=93388785;WS=93388767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr5	93410244	rs7732578	C	T	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=540;SC=ACTTTAGGTACTTATATTCTT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=93410252;WS=93410234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	93731985	rs308207	A	G	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.553;SC=ATCTGTCAAGAGAGGCACCTG;SOR=0.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=155;WE=93731993;WS=93731975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr5	93732334	rs308206	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.737;SC=GATCAAGTGCCTGACATATTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=93732342;WS=93732324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	93753017	rs29910	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=547;ReadPosRankSum=1.633;SC=TTAAAGATGGCTTCCATCAAG;SOR=0.938;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=37;WE=93753025;WS=93753007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr5	93788638	rs17326194	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=-1.268;SC=AGAATTATAGATAGTATGGCA;SOR=0.498;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=11;WE=93788646;WS=93788628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr5	93812719	rs17083735	A	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTTTGTAGCAAAGGGTAAAAC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=93812727;WS=93812709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr5	93999713	.	C	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TTTCCCTGTTCAGTGTTTTTT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=16;WE=93999721;WS=93999703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
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chr5	94025047	rs71641023	A	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=152;ReadPosRankSum=0.585;SC=AAAATTAGAAAGCAGTAAAGA;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=12;WE=94025055;WS=94025037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	94043353	rs7735924	G	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=610;ReadPosRankSum=-0.598;SC=AATGAGAGACGGTGCTTGGGG;SOR=0.663;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=36;WE=94043361;WS=94043343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr5	94046387	rs306573	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=-1.426;SC=ATTTTTAACCAACCTGTCTCT;SOR=0.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=94046395;WS=94046377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	94050447	rs2638	C	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=766;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CCTTATCCCACAGAAGAATGG;SOR=0.741;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=55;WE=94050455;WS=94050437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
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chr5	94114594	rs255372	T	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=354;SC=TTGTTTGTTCTTGGCAGAAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=94114602;WS=94114584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr5	94670706	rs148964669	T	TTTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCC	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.640;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr5	94741668	rs6898354	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=1.097;SC=ACTGCTCCAATTCCTTACCAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=94741676;WS=94741662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr5	94741741	rs253714	C	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=150;ReadPosRankSum=1.792;SC=TGACATTTCACGGAGTCAGAA;SOR=0.273;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=10;WE=94741749;WS=94741731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr5	94741837	rs253715	A	G	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=27;PP=1328;SC=CTCCCAAGCTATCTCTTGTCC;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=60;WE=94741845;WS=94741827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	94741973	rs253716	T	G	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=34;PP=1194;SC=GGAAGGGAAATGAATGGAACT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=94741981;WS=94741963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr5	94749903	rs11418250	C	CT	1909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.752;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.127;NF=4;NR=40;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.150;SC=AGGTAGTTCTCTTTTTGTTTT;SOR=0.950;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=110;TCF=8;TCR=102;TR=44;WE=94749911;WS=94749893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr5	94749969	rs6556866	C	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.777;SC=TATCAACCATCAGTGTCATTT;SOR=0.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=18;WE=94749977;WS=94749959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr5	94759802	rs17084711	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=382;ReadPosRankSum=-1.089;SC=GCTGAAGTGCGACAGGCTGAG;SOR=0.849;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=29;WE=94759810;WS=94759792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr5	94772540	rs6878669	C	T	6780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=100;PP=2965;SC=AACTGCCAGTCCTGAGCAAAC;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=99;TCR=100;TR=199;WE=94772548;WS=94772530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr5	94845231	rs2560257	C	T	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=907;ReadPosRankSum=-0.418;SC=ACAGGCCAGTCAGAGATTCTC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=56;WE=94845239;WS=94845221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr5	94891009	.	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=1.744;SC=TGTCGGTGGTCGCAGCCTTGG;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=6;WE=94891017;WS=94890999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr5	94956496	.	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.609;SC=GCTGCTGGCACTGCTGCTGGC;SOR=1.948;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=5;WE=94956504;WS=94956486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr5	95011426	rs2548125	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=-0.549;SC=ACTGACTACTATATAACTACA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=95011434;WS=95011416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
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chr5	95119408	rs888808	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.405;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=328;ReadPosRankSum=1.518;SC=CAGCATGTTTTTTTAATTGTT;SOR=0.147;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=24;WE=95119416;WS=95119398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr5	95124328	rs3822753	T	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=321;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TGTCACAGTATACTGAAAGCT;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=19;WE=95124336;WS=95124318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
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chr5	95194686	rs17366761	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=0.517;SC=AGTGGGTCTGCGCGCACCCCG;SOR=0.354;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=29;WE=95194694;WS=95194676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr5	95414786	rs5869706	T	TTAAAA	971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=965;ReadPosRankSum=-1.914;SC=ACCCATGCACTTAAAGTTAAA;SOR=0.606;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=19;WE=95414794;WS=95414776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr5	95728898	rs6235	C	G	3941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=74;PP=2346;ReadPosRankSum=0.536;SC=GAGCTTTGCACTTGGGGACTT;SOR=0.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=291;TCF=141;TCR=150;TR=146;WE=95728906;WS=95728888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,181:0.50:359
chr5	95728974	rs6234	G	C	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=61;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.861;SC=AGCATGGCCTGGGAAGGGGCT;SOR=0.866;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=61;TCR=117;TR=89;WE=95728982;WS=95728964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,105:0.50:210
chr5	95732986	rs271920	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=599;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TTAAAAGTGCTTCAAAATGTT;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=32;WE=95732994;WS=95732976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr5	95733112	rs6233	A	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1260;ReadPosRankSum=-2.119;SC=TGAAGTCCCAATTCTTAAAGC;SOR=0.831;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=83;WE=95733120;WS=95733102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,95:0.49:194
chr5	95746355	rs156020	T	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-0.262;SC=AAGTGTGAGTTCTCCCAACTG;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=95746363;WS=95746345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr5	95747963	rs35364611	TCTC	T	911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.655;NF=9;NR=8;PP=686;ReadPosRankSum=0.180;SC=GTTCTTTCCTTCTCCTCATAT;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=17;WE=95747973;WS=95747953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr5	95865500	rs13186522	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TTGCTGGGCATTCATTCTGTC;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=95865508;WS=95865496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr5	95865526	rs13161802	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-1.688;SC=CCACCCTGTGGAGAGGTGCCT;SOR=1.038;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=95865534;WS=95865516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	95998357	rs146973537	G	GGCAGGTGGCT	231.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=849;SC=GCCGCTGCCAGGCAGGTGGCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=95998365;WS=95998347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	96031569	rs9667	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=444;ReadPosRankSum=0.453;SC=GCAGCAGTCAATCCTCCAGAA;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=29;WE=96031577;WS=96031559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr5	96064633	rs27531	A	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	96064715	rs28042	A	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	96066652	rs151904	C	T	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=57;PP=1853;SC=AACCTATCATCTGGCAAAACT;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=98;WE=96066660;WS=96066642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	96078309	rs26503	G	A	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=28;PP=1543;SC=TGGATTGTTCGGGCTCCAGAG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=96078317;WS=96078299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	96079387	rs26505	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=379;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CAGTGTGGCACGATAAGCTTT;SOR=0.715;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=30;WE=96079395;WS=96079377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr5	96079402	rs26506	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=427;ReadPosRankSum=1.391;SC=AGCTTTGTGACGGTGAACGCA;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=33;WE=96079410;WS=96079392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr5	96089658	rs27583	G	A	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=804;SC=AAAAGATAGCGTGTGCCTTTT;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=96089666;WS=96089648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	96089976	rs27772	A	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=435;SC=AAACATGACCAGCTGGCTTTT;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=96089984;WS=96089966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	96093222	rs27654	G	A	5298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=63;PP=2965;SC=TTTTCTCTGAGGATATCTTTT;SOR=1.090;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=158;WE=96093230;WS=96093212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	96093441	rs27969	C	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=5;PP=102;SC=GTCATCCAGGCGGGAGTACAG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=96093449;WS=96093431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	96097848	rs17086651	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=0.189;SC=AATTATATGTTATTATGAGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=96097856;WS=96097845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	96097895	rs27980	T	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=428;SC=TTAAGCTATCTTTAAGAGTTA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=96097903;WS=96097885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	96098214	rs27582	G	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=26;PP=743;SC=CAGAAGAGCCGAGACTGATGA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=96098222;WS=96098204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	96101066	rs11399505	T	TA	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=739;SC=AATTCACTAATAGTGAAATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=17;WE=96101074;WS=96101056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	96101944	rs27524	A	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=59;PP=1871;SC=CTCCTTTACAATAGCATAAAA;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=96101952;WS=96101934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	96107202	rs27689	G	T	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=13;PP=1415;SC=TCACAATATTGTGGCCAGATG;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=61;WE=96107210;WS=96107192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	96116940	rs27042	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=1.078;SC=GCAATGAATAGGTGATGAAAC;SOR=0.610;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=12;WE=96116948;WS=96116930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr5	96117300	rs27043	G	A	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=851;SC=AGCAGGATAGGCAATTCCTGG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=96117308;WS=96117290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	96118852	rs27044	G	C	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=82;PP=2881;SC=AGTAGTAGTTGACTCCGCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=37;TCR=82;TR=119;WE=96118860;WS=96118842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	96119579	rs70981840	A	ACT	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=422;SC=AATGATTAACACTTTTTAACA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=96119587;WS=96119569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	96121370	rs11386832	T	TA	1261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=1458;SC=TAGAAGAACTTAAAGGAAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=36;WE=96121378;WS=96121360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	96121406	rs469876	A	G	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.13;NF=61;NR=13;PP=1548;SC=GTTATCAATCAATCATTTTTG;SOR=2.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=74;WE=96121414;WS=96121396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	96121524	rs469783	C	T	5945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=95;PP=2965;SC=TAATGAGACTCGCCCGATCAT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=93;TCR=95;TR=188;WE=96121532;WS=96121514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	96121715	rs469758	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=0.880;SC=ATTTGCTCCCCTGCCTGAAGA;SOR=0.484;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=12;WE=96121723;WS=96121705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr5	96122260	rs30379	T	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=535;SC=GTACCTAAAATAAAGGAGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=96122268;WS=96122250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	96122281	rs30380	A	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=474;SC=TGGATTGTTCATTTGTTGATT;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=96122289;WS=96122271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	96124330	rs30187	T	C	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=31;PP=1689;SC=GGGAAAACCCTTCTGCAGTGT;SOR=1.119;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=79;WE=96124338;WS=96124320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	96124447	rs30186	G	C	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=47;PP=1595;SC=TAAGAAAAGAGAGAACACCAG;SOR=1.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=96124455;WS=96124437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	96125910	rs26510	C	T	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=14;PP=1730;SC=TAATCAAGGACCTCAGAAAGT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=72;WE=96125918;WS=96125900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	96126197	rs27710	A	G	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=75;PP=2948;SC=ATGCAGAGATATTCAAAAACA;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=137;WE=96126205;WS=96126187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	96126308	rs27529	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=36;PP=1109;SC=ATGCGTCAGCACTAAGATACT;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=96126316;WS=96126298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	96127905	rs27640	T	C	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=64;PP=2226;SC=CCTATTGAGATAGAAAAAAGA;SOR=1.397;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=96;WE=96127913;WS=96127895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	96129512	rs27434	A	G	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=19;PP=1561;SC=ATACCTGGTGAGCCAGTTCAT;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=69;WE=96129520;WS=96129502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	96130836	rs26618	T	C	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=56;PP=2864;SC=CTGCTTGATTTATCTTGTCTG;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=96130844;WS=96130826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	96139250	rs26653	C	G	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=54;PP=2511;SC=TTGCTCCTGACGGGGGTGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=96139258;WS=96139240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	96219738	rs113814029	T	TTATC	183.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.79;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	96249251	rs113350557	T	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TCTCAAAGCATATAAATAATA;SOR=0.169;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=96249259;WS=96249241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	96253104	rs1363908	T	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=597;SC=GGATTACAGGTGTGAACCACC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=96253112;WS=96253094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	96322419	rs38034	C	T	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TCACAAGAGGCTCAGAGGACC;SOR=1.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=139;WE=96322427;WS=96322409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
chr5	96329857	rs27304	G	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=282;SC=GATGTTTGACGTTACAGGTTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=96329865;WS=96329847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	96498783	rs8654	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=361;ReadPosRankSum=-1.469;SC=CCCAAAAGCTGGCTGCTTCCA;SOR=1.352;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=24;WE=96498791;WS=96498773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr5	96503523	rs160632	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1186;ReadPosRankSum=-1.118;SC=TTTTCTGACCCGTAAACCTCT;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=107;TCR=101;TR=76;WE=96503531;WS=96503513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,86:0.35:247
chr5	96506959	rs33996030	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=0.756;SC=AAATCAATCATGGTGATATGG;SOR=1.646;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=15;WE=96506967;WS=96506949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr5	96507204	rs2432090	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	96512865	rs2548319	T	A	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.01;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	96512871	rs2544772	T	A	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.92;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	96513471	rs2544773	G	C	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1053;ReadPosRankSum=0.608;SC=GTTTCCAACAGACTCAACTAC;SOR=0.668;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=67;WE=96513479;WS=96513461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr5	96518792	rs3734010	T	G	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1464;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TCACACAGTGTTAAGGGGAAG;SOR=0.428;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=80;WE=96518800;WS=96518782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,90:0.48:188
chr5	96519094	rs3806945	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=222;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GTCTTATGAAACACATAGTAT;SOR=0.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=12;WE=96519102;WS=96519084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr5	98109838	rs2662263	A	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=32;PP=930;SC=GCAGCGCCGCAGCCCCGGGCT;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=98109846;WS=98109828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	98109985	rs2545730	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=112;SC=AGGTCTCGAAGGCGCTCGCCG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=98109993;WS=98109975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	98210690	rs7718898	A	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=1.660;SC=TTAACAAAGTAGCTAAACTGA;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=16;WE=98210698;WS=98210680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr5	98236831	rs7702352	T	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=679;ReadPosRankSum=-1.276;SC=TGAGAAACTATATACAAAAAG;SOR=0.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=38;WE=98236839;WS=98236821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr5	99921841	rs2370612	G	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=0.663;SC=TTTTAAAATTGTTCTAGAAAG;SOR=0.704;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=16;WE=99921849;WS=99921831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr5	99922081	.	G	A	21	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=21;QD=27.8856062736;SC=GAAGTACTCTGTTAATGGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=99922089;WS=99922071;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	101585209	rs10067502	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.675;SC=TTCAGCTGGAGACATCATGGG;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=101585217;WS=101585199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	101592742	rs174414	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TTTCTCACCATTTAAGAAAAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=101592750;WS=101592732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	101592809	rs261101	T	A	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=14;PP=1101;SC=AAGCACTGAATTGTATTTACC;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=101592817;WS=101592799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	101593486	rs398228	CT	AG	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=354;SC=CTATGCTCGGCTAATTTTTAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=101593495;WS=101593476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	101593522	rs11746537	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CAGGGTTTCACCATGTTGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=101593530;WS=101593512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	101595792	rs113859065	GTA	G	472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=399;ReadPosRankSum=1.485;SC=GGTTGTATTTGTATATATATA;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=101595801;WS=101595782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr5	101595885	rs148885155	T	TGA	2405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=1686;SC=TGTATGAGACTGAGAGAGAGA;SOR=1.010;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=101595893;WS=101595875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	101606518	rs33922930	G	GA	814.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.152;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.764;NF=0;NR=28;PP=564;ReadPosRankSum=-0.344;SC=TGTCTTTGTGGAAAAAAAAAT;SOR=3.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=28;WE=101606526;WS=101606508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr5	101627027	rs841929	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=640;ReadPosRankSum=0.072;SC=AAAACAAACATAAACACAATA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=34;WE=101627035;WS=101627017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr5	101627411	rs2600824	C	T	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	101631518	rs76523033	A	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	101631526	rs3114660	C	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	101631592	rs3114659	A	G	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=8;PP=921;SC=CCCGAGCCTCAAGCGGGCGCT;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=101631600;WS=101631582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	101631790	rs10479190	T	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1463;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GAGATGGCTCTGGTGACTTCT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=90;WE=101631798;WS=101631780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,111:0.50:220
chr5	101724448	rs10055840	G	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=345;ReadPosRankSum=1.124;SC=ACAACGTCCTGTGTGTCCACA;SOR=1.768;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=21;WE=101724456;WS=101724438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr5	101726648	rs6874612	C	A	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=721;SC=TATCAAAAAACATTTTGATGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=101726656;WS=101726638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	101726770	rs10073892	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=411;ReadPosRankSum=-0.038;SC=ATAGCAATGATATAATCAGCA;SOR=0.458;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=28;WE=101726778;WS=101726760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr5	101726851	rs1452065	A	G	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=8;PP=218;SC=TGGTGCATCAATTGTACTAAG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=101726859;WS=101726841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	101748741	rs10073333	G	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.228;SC=GCAAAGCAGGGAGAAAAATAT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=4;WE=101748749;WS=101748731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr5	101774455	rs17150488	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CACTGGATTCTTCATCAGAAT;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=11;WE=101774463;WS=101774445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	101794063	rs10045929	T	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=162;ReadPosRankSum=2.054;SC=GTTGGATTGTTCAAGTAAAAT;SOR=0.432;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=11;WE=101794071;WS=101794053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr5	101795490	rs11746217	A	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TGCTTTAATAAAGAAAAGTGA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=57;WE=101795498;WS=101795480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr5	101795556	rs11749193	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=0.252;SC=CAAACAGAGTGGAGAAAGTGA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=101795564;WS=101795546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr5	101811346	rs4703232	T	C	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=387;SC=CTATGGTAGCTATTTAGTAAG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=101811354;WS=101811336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	101816169	rs17151033	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=0.331;SC=GAGAAAACAACGATATGCATT;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=24;WE=101816177;WS=101816159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr5	101816228	rs10041652	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-1.206;SC=ATTACATGATGTAAGTTTATT;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=14;WE=101816236;WS=101816218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr5	101834596	rs10038730	T	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TGCTCTCGGCTGCCCGTCCTG;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=15;WE=101834604;WS=101834586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr5	102310166	rs3733939	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=621;ReadPosRankSum=-0.796;SC=CTTTTAAGCAGTAAAGTGTGA;SOR=0.966;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=45;WE=102310174;WS=102310156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr5	102360747	rs17296280	A	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	102363858	rs26433	C	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=9;PP=1071;SC=GACTGGGACTCATTTTGAAAT;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=102363866;WS=102363848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	102364542	rs2067133	A	AAT	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=1510;SC=AAGGTAACAGACATTGCTGCA;SOR=2.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=102364550;WS=102364532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	102512570	rs11408825	C	CA	1892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=1282;SC=GTTTAAAGACCATGATTCTCA;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=102512578;WS=102512560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	102537200	rs154290	T	G	281.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=1.619;SC=ATAGTTTTTTTTTTTTGTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=102537208;WS=102537190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr5	102886512	rs58006145	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=318;ReadPosRankSum=0.401;SC=ACTTGAGGAATGAGTGTTATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=17;WE=102886520;WS=102886502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr5	102890560	rs11373550	G	GA	648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=11;PP=282;SC=TGGATCTGTTGAAAAAAAAAA;SOR=1.426;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=14;WE=102890568;WS=102890550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	102891695	rs10045774	A	G	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=68;PP=2965;SC=TTTAAACATAATCTCTTATAG;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=108;TCR=68;TR=176;WE=102891703;WS=102891685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	102894447	rs3734087	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=558;SC=AACTTTAAGAAGTTTCTGATG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=102894455;WS=102894437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	102894977	rs7734923	T	C	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.987;SC=CAGAATTATTTCTCTTTTCAC;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=59;TCR=87;TR=71;WE=102894985;WS=102894967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr5	102895124	rs7723689	G	A	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=743;ReadPosRankSum=1.287;SC=ATACAGCAATGTCCAGTGCAG;SOR=0.442;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=51;WE=102895132;WS=102895114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,60:0.61:98
chr5	102895209	rs11312358	AG	A	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=584;ReadPosRankSum=0.521;SC=AAAGTAAAATAGGAAGTAAAC;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=102895217;WS=102895199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr5	102895241	rs7725090	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATTTATTTCACTAAAATATTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=102895249;WS=102895231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr5	103978775	.	AGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG	A	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;QD=37.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	103978969	rs33818	T	C	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=736;SC=AGTGGGGATGTCTTAATCAGA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=103978977;WS=103978959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	103979119	rs161879	C	T	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.909;NF=61;NR=41;PP=1422;ReadPosRankSum=0.941;SC=CTTTTTTGTGCGTACTGGCTT;SOR=0.615;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=133;TCR=87;TR=102;WE=103979127;WS=103979109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,106:0.46:232
chr5	104434339	.	G	GGAAA	613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.92;MQRankSum=3.479;QD=55.79;ReadPosRankSum=0.475;SOR=4.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr5	106723107	rs11377163	C	CT	834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=641;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TCCTTTTTTTCTTTTTTTATG;SOR=0.968;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=20;WE=106723115;WS=106723097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr5	107006446	rs35553	T	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=880;SC=AAAATGAAAGTGGGCGAGAAA;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=107006454;WS=107006436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	107560101	rs2044710	A	G	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=40;PP=1103;SC=TTTAAAAGTCATCTCTTGACC;SOR=4.271;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=107560109;WS=107560091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr5	107703446	rs34546708	CAAG	C	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=1332;SC=TCTTAAAAAACAAGAAGACAG;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=28;WE=107703456;WS=107703436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	108206968	rs7709144	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=0.544;SC=TACATTTCAACATTACATTTC;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=108206976;WS=108206958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr5	108386985	rs2416195	A	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.19;MQRankSum=-1.809;NF=10;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CACAAGTGAGAGGAATCTTGA;SOR=0.772;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=12;WE=108386993;WS=108386975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr5	108387169	rs115715653	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=7.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.155;NF=21;NR=28;PP=842;ReadPosRankSum=-0.730;SC=AAGGCTGTGCGTGGGAGTTAG;SOR=1.211;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=49;WE=108387177;WS=108387159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,40:0.25:158
chr5	108387229	rs113844089	AG	A	1380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.212;NF=9;NR=28;PP=1266;ReadPosRankSum=2.127;SC=CACTGTAATTAGCCCAGTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=29;TCR=84;TR=37;WE=108387237;WS=108387219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,48:0.28:171
chr5	108436014	rs3816024	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TGCTCTGTCAAATATTCCTAA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=108436022;WS=108436004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr5	108516629	rs6594349	A	G	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=17;NR=38;PP=1217;SC=TTTTTTTTTTAATGGTAAAAA;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=108516637;WS=108516619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	108679870	rs142828555	T	TTTAA	2069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.99;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	108680647	rs441798	C	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=48;SC=TGCTTTAGTCCTTTGCTCCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=108680655;WS=108680637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	108691738	rs2431253	A	T	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=58;PP=1723;SC=CTGAAAAAAAAAAAAAATAAC;SOR=1.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=108691746;WS=108691728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	108713970	rs10042721	C	T	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=52;PP=2142;SC=TGTTATCCACCTCTTGCCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=108713990;WS=108713960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	108713982	rs12523186	T	C	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=51;PP=1975;SC=CTTGCCTTCCTGCTGTGGCTC;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=113;WE=108713990;WS=108713960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	108714298	rs1045706	T	C	6545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=129;PP=2965;SC=ATTGGTATTTTGTTCACTACA;SOR=1.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=87;TCR=129;TR=216;WE=108714306;WS=108714288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr5	108717157	rs2288531	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=242;SC=ATAAGATCAATTCCTATATAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=108717165;WS=108717151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	108719151	rs1045704	G	A	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=58;PP=2138;SC=CAGCGTCTGTGTGACCAGTTC;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=108719159;WS=108719141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	109864483	rs17132193	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=311;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTACATTTGATGAAATATTTG;SOR=0.532;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=24;WE=109864491;WS=109864473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr5	109940707	rs6897672	G	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTTAAAATTAGTTGCTATTTC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=109940715;WS=109940697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	109946411	rs4277958	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.425;SC=GAGGACTGACGACTTCGAACA;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=109946419;WS=109946401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	109963430	rs6886702	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.345;SC=GTCTGAGCTTATCAAAATATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=109963438;WS=109963420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	110091058	rs3213937	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr5	110407507	rs2289276	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=509;ReadPosRankSum=2.653;SC=AGCACTGGCCCCTAAGGCAGG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=32;WE=110407515;WS=110407497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr5	110408705	rs11466741	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=0.279;SC=TATCCTGCTACGTGCAGAACT;SOR=0.880;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=17;WE=110408713;WS=110408695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr5	110409067	rs2289277	C	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=169;ReadPosRankSum=-1.473;SC=CTACTCAACCCTGACCTCTTC;SOR=1.051;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=110409075;WS=110409057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr5	110409148	rs2289278	C	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=578;ReadPosRankSum=0.300;SC=TCAATTCTCACCAACTCTTTC;SOR=1.090;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=34;WE=110409156;WS=110409138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
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chr5	110436450	rs10038177	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.599;SC=AATAATATAGCTGTCACCTTA;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=13;WE=110436458;WS=110436440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
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chr5	110446741	rs13161853	C	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.534;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=514;ReadPosRankSum=-1.134;SC=AAATCAGACTCTTTAATAAAG;SOR=0.277;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=28;WE=110446749;WS=110446731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr5	110448753	rs59359951	T	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.20;QD=23.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr5	110456704	rs13186912	A	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=374;ReadPosRankSum=0.860;SC=ATGTAGAAGTATCAGAAGAAA;SOR=0.804;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=24;WE=110456712;WS=110456694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr5	110679657	rs446176	C	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=937;SC=CACTTATTTTCAAGCTTTCCC;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=110679665;WS=110679647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	110710360	rs306067	G	C	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=795;SC=CTGGCTGTATGTTACGTCAGA;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=110710368;WS=110710350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	110710699	rs5870446	A	AG	2048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.248;NF=4;NR=47;PP=2159;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GATAATGAGAAGGGATTCTCC;SOR=1.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=51;WE=110710707;WS=110710689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,73:0.97:75
chr5	110712491	rs306129	A	G	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=958;SC=TAGCCATAGTATTAGCTATTT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=110712499;WS=110712481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	110712773	rs3797754	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=1.111;SC=TAAAAAAAGTCTTAAGAAGAA;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=17;WE=110712781;WS=110712763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr5	110730557	rs523389	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=41;PP=1116;SC=AAGAAATGCGCATCTGTGATA;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=110730565;WS=110730547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	110782634	rs34007984	T	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=410;SC=TTGGAAGTTTTTGCTCTTTCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=110782642;WS=110782624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	110784822	rs2116824	A	G	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=50;PP=2036;SC=TTCTTGTGTTATTAGCTGATT;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=110784830;WS=110784812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	110818421	rs3733995	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-5.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=536;ReadPosRankSum=-1.145;SC=AGTTTGTAAGCTGAGGGCAAG;SOR=0.275;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=27;WE=110818429;WS=110818411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr5	110819753	rs25925	G	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=731;SC=TGGCCTCTTCGCGCCTGGGAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=110819761;WS=110819743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	111013695	rs10478063	G	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=690;ReadPosRankSum=0.904;SC=CTCCATGAAAGGGGACAGAGA;SOR=1.067;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=47;WE=111013703;WS=111013685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr5	111013858	rs26042	G	A	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=870;SC=ACATACACATGCTACAAAATC;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=111013866;WS=111013848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	111479750	rs62372418	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=1.310;SC=ATAAACTGCCTTCAGAAACAG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=19;WE=111479758;WS=111479740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr5	111497358	rs3816657	T	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=748;ReadPosRankSum=0.473;SC=CTGCTAGCCTTAAGTGTATGG;SOR=0.563;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=51;WE=111497366;WS=111497348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr5	111500637	rs181507476	C	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=551;ReadPosRankSum=-1.431;SC=TTCAAAAGTACCAGTGGCGCA;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=36;WE=111500645;WS=111500627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr5	111500816	rs145708081	C	CTAAAA	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=1748;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CATTTCTTCTCTAAAATATAT;SOR=0.341;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=26;WE=111500832;WS=111500806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr5	111500822	.	T	TAAA	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.422;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr5	111500824	.	T	C	320	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=15;PP=320;QD=20.8688948557;SC=CTCTAAAATATATTTGAAAAA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=17;WE=111500832;WS=111500806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,17:0.50:34
chr5	111500824	rs33929905	T	TAC	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.956;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr5	111504479	rs7703522	C	T	2422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1232;ReadPosRankSum=1.922;SC=ATCCGAAGAACGGGTCACCGG;SOR=0.575;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=88;WE=111504487;WS=111504469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,120:0.49:244
chr5	111505885	rs1560052	T	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.475;SC=CCTAGTTTTGTTTAAAATGTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=111505893;WS=111505875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr5	111519740	rs1560058	T	C	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1484;ReadPosRankSum=1.170;SC=GGATCGCCTGTTGTTGGGGTC;SOR=0.762;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=199;TCF=100;TCR=99;TR=83;WE=111519759;WS=111519730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,96:0.44:218
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chr5	111540950	rs12658467	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-0.407;SC=ATTTCCACTTCAGAAATCCCA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=13;WE=111540958;WS=111540940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr5	111540968	rs373807306	T	TC	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.313;NF=13;NR=2;PP=499;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CCAGCCCCTCTCCCCTGGGTC;SOR=0.504;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=15;WE=111540976;WS=111540958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr5	111595745	rs28620667	C	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=-0.050;SC=TATAATTGACCATACAAATAT;SOR=1.338;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=18;WE=111595753;WS=111595735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr5	112162854	rs2229992	T	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=990;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GTGAAATGTATGGGCTTACTA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=73;WE=112162862;WS=112162844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,81:0.53:154
chr5	112164561	rs351771	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=759;ReadPosRankSum=-0.168;SC=AGGTTATTGCGAGTGTTTTGA;SOR=0.999;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=49;WE=112164569;WS=112164551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr5	112164747	rs62364023	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=0.306;SC=TAGCCATGAGATTTCCTAATT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=112164755;WS=112164737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	112175770	rs41115	G	A	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1890;ReadPosRankSum=0.153;SC=ATTTTGCCACGGAAAGTACTC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=113;TCR=100;TR=110;WE=112175778;WS=112175760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,130:0.53:245
chr5	112176325	rs42427	G	A	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=816;ReadPosRankSum=0.053;SC=TTAGAGGAGGGGCACAGTCAG;SOR=0.732;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=37;WE=112176333;WS=112176315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr5	112176559	rs866006	T	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CATCTGCGTCTTCTTCTGCAC;SOR=0.966;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=85;WE=112176567;WS=112176549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,97:0.46:209
chr5	112176756	rs459552	T	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=558;ReadPosRankSum=-2.316;SC=AATTCCAAGGTCTTCAATGAT;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=38;WE=112176764;WS=112176746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr5	112177171	rs465899	G	A	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=1017;ReadPosRankSum=0.129;SC=AAAATACTCCGGTTTGCTTTT;SOR=0.471;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=61;WE=112177179;WS=112177161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,67:0.46:145
chr5	112196949	rs460137	A	C	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=40;PP=2047;SC=GCGGACGCGGAACCATTTCTT;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=99;WE=112196957;WS=112196939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	112197986	rs431287	A	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=237;SC=TCAATCAGAAAGAGGAGTAGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=112197994;WS=112197979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	112198015	rs372492	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=352;SC=CAGTCTGATTAGTTGCTCGAG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=112198023;WS=112198005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	112198071	rs112093457	AAGG	A	1961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=14;PP=1310;SC=CACGCAGAAAAAGGAGGGGTT;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=28;WE=112198081;WS=112198061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	112200098	rs351767	A	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=143;SC=ACCCAACACTATGGCAGTGTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=112200106;WS=112200088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	112257242	rs33570	G	C	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	112312528	rs33556	T	C	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TGCCGCGGCTTCCTCGGCTGC;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=68;WE=112312536;WS=112312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,78:0.56:139
chr5	112312676	rs33555	T	C	8172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=140;PP=2965;SC=CCTGGACGATTTCTGCAGGTA;SOR=0.908;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=108;TCR=141;TR=248;WE=112312684;WS=112312666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr5	112312736	rs33554	G	C	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=908;ReadPosRankSum=1.721;SC=TCAGTTTCGCGGACCCCCAGA;SOR=0.441;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=73;WE=112312744;WS=112312726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,84:0.59:142
chr5	112321488	rs33543	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=571;ReadPosRankSum=1.073;SC=ATAAATCGTTATAGTTTGTAA;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=32;WE=112321496;WS=112321478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr5	112328377	rs3733969	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=803;ReadPosRankSum=0.126;SC=AGGTACTACTAGTTCAGGGGT;SOR=0.798;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=51;WE=112328385;WS=112328367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr5	112349070	rs9326869	T	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=692;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TAGAACATGCTGAGGGACAGC;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=57;WE=112349078;WS=112349060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
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chr5	112379289	rs2227948	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=895;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TCCTGAGTTCGGCTAGGGACA;SOR=0.484;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=59;WE=112379297;WS=112379279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr5	112379434	rs4705755	T	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.212;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GGCAGCAGTGTGGGCACCGGG;SOR=0.035;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=17;WE=112379442;WS=112379424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr5	112384725	rs113825892	GGTCACTGGGCA	G	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=2983;ReadPosRankSum=0.457;SC=TGTGGCCAGTGGTCACTGGGC;SOR=0.784;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=11;WE=112384743;WS=112384715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr5	112384802	rs6594664	G	A	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=43;PP=1815;SC=TGCCAGGTTTGTCTTTGCTGC;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=99;WE=112384810;WS=112384792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	112385004	rs7726296	CA	GC	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.595;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=1778;ReadPosRankSum=0.395;SC=CTCCTACAGACAAAGGAGCAC;SOR=0.762;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=50;WE=112385013;WS=112384994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr5	112385035	rs7708603	T	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=636;ReadPosRankSum=-0.483;SC=AGGCATGCCCTATCTGAGAGC;SOR=0.852;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=43;WE=112385043;WS=112385025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr5	112389747	rs4705536	C	G	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=20;PP=515;SC=TCCACATTCCCTCTCCCCAGT;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=112389755;WS=112389737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	112399791	rs2227947	G	A	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=46;PP=1836;SC=CCTTGGCAGCGTTCTCAGCTG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=94;WE=112399799;WS=112399781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	112403779	rs35269015	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=427;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ACACTTACCAGGGGAGGACCC;SOR=0.848;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=37;WE=112403787;WS=112403769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,47:0.36:129
chr5	112406718	rs4705771	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=315;SC=CCTATTTCCTACTTTTATTCT;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=112406726;WS=112406708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	112439941	rs6594681	T	C	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=36;PP=1449;SC=CTCAATGTGCTTGTCCACCTC;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=112439949;WS=112439931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	112479004	rs2227949	T	C	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=76;PP=2333;SC=CATAGCGAAGTGTCGTTCGCT;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=112479012;WS=112478994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	112487137	rs1947026	A	C	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=77;PP=1944;SC=GACAGAAAGGAGGAGATTAGA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=18;TCR=77;TR=95;WE=112487145;WS=112487127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	112629887	rs485210	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=-1.225;SC=AGAAAATCTACTAATCTTCAA;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=112629895;WS=112629877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr5	112676191	rs10900684	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=557;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CGAAATATGTATTCCATGAAC;SOR=0.931;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=35;WE=112676199;WS=112676181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr5	112770027	rs26980	T	G	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TCTTGCTTAATGCCATTCGAC;SOR=0.369;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=75;WE=112770035;WS=112770017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr5	112823998	rs348943	C	T	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=2.439;NF=53;NR=57;PP=1487;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCCGCATCCTCTCCTCCTCGC;SOR=0.690;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=215;TCF=101;TCR=114;TR=110;WE=112824006;WS=112823988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,139:0.51:274
chr5	112824039	rs348942	T	C	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.615;NF=21;NR=44;PP=2204;ReadPosRankSum=1.292;SC=CTGCTGCTGCTGCTGCCGCTG;SOR=0.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=48;TCR=93;TR=65;WE=112824056;WS=112824029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr5	112824048	.	T	TGCC	1736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.604;NF=1;NR=28;PP=2227;ReadPosRankSum=0.744;SC=CTGCTGCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.695;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=95;TCF=8;TCR=87;TR=29;WE=112824056;WS=112824029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr5	112850963	rs1035409	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TTTTTTTTCCGTGTAGAAATG;SOR=0.627;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=112850971;WS=112850953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	112851121	rs1035408	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5346;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=231;ReadPosRankSum=1.456;SC=AAGGGAGAAACGTTTCTGAGT;SOR=1.244;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=14;WE=112851129;WS=112851111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr5	112884197	rs4444963	C	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=414;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GTTTGAAGTACTTTGGAAATT;SOR=0.892;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=23;WE=112884205;WS=112884187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr5	112884728	rs4639215	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=0.666;SC=GTAAAACTTTGTACTATTTTA;SOR=0.586;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=24;WE=112884736;WS=112884718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr5	112899250	rs6886199	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=0.409;SC=AAACTAAAAGGAAATATGTCT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=13;WE=112899258;WS=112899240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr5	112901494	rs3763139	G	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=518;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GCAAATTCACGTCGAGGAATT;SOR=0.889;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=28;WE=112901502;WS=112901484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr5	112926982	rs2303717	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=266;ReadPosRankSum=0.454;SC=TGTTCTGGCTATAGGTTAAAT;SOR=1.424;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=17;WE=112926990;WS=112926972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr5	112927888	rs11344649	AT	A	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.103;NF=1;NR=20;PP=240;ReadPosRankSum=2.299;SC=ATACAATGGCATTTTTTTTTT;SOR=0.660;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=21;WE=112927896;WS=112927878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr5	112929013	rs1132528	T	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=587;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CTAGAACCTCTGGTTGGTGAA;SOR=0.324;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=33;WE=112929021;WS=112929003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr5	113698544	rs40179	G	C	6867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=95;PP=2965;SC=GCCGGAACCTGCACGAGATGG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=104;TCR=95;TR=199;WE=113698552;WS=113698534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr5	113698631	rs111266015	T	TGCC	6075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=58;PP=2982;SC=CTGCAGCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=26;TCR=77;TR=76;WE=113698639;WS=113698621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	113822197	rs72801872	G	A	260.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.182;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr5	113822205	rs12719181	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.86;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	113829121	rs1841251	A	G	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=53;PP=2114;SC=TAAAAATGGAACAGAGGAAAC;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=113829129;WS=113829111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	114462355	rs2974617	C	T	5233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=86;PP=2965;SC=TCATAGAAATCTACTTTGCCT;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=158;WE=114462363;WS=114462345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	114462589	rs2921623	A	C	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=49;PP=1466;SC=TATCTTCAACAATAGATCTAA;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=62;WE=114462597;WS=114462579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	114462630	rs2974528	T	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=725;SC=CAGGATAATATACATTGATGT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=114462638;WS=114462620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	114566874	rs2303001	A	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	114573873	rs7706217	A	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=161;SC=TGTATGTCTCAATATGAATAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=114573881;WS=114573863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	114605323	rs76812913	A	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=1.634;SC=ATATAAAGGAAATAGATTTGA;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=14;WE=114605331;WS=114605313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr5	114611356	rs267295	A	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=201;SC=ATTAACCCTTAATTTTCCATC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=114611364;WS=114611346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	114632012	rs78780834	C	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=115;ReadPosRankSum=-0.533;SC=AGGCCCCGAGCAGGGGAGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=114632020;WS=114632002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	115176589	rs26536	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=640;ReadPosRankSum=0.941;SC=TTCATTCTGCATAAGAATTTG;SOR=0.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=46;WE=115176597;WS=115176579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr5	115177668	rs144226661	G	GAGATTACGAGGC	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.804;NF=4;NR=1;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GCGAGATTACGAGGCGAGGCT;SOR=1.154;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=5;WE=115177676;WS=115177664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr5	115188660	rs152368	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=0.208;SC=GTGACCATATATTCTCATTTC;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=26;WE=115188668;WS=115188650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,39:0.41:95
chr5	115298232	rs9326980	G	C	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=44;PP=1552;SC=GGCAGGGGTCGCAGCACTGAA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=115298240;WS=115298222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	115298378	rs10062297	C	T	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=20;PP=905;SC=GCTGGCTGGGCTGGTAGCCGC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=115298386;WS=115298368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	115298475	rs12520255	T	C	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=37;PP=1984;SC=CTCAGGGACTTGGAAGCCGAG;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=104;WE=115298483;WS=115298465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	115298518	rs12522632	A	G	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=56;PP=2585;SC=AGCCGACGCCAACCCCGAAAC;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=135;WE=115298526;WS=115298508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr5	115298977	rs1445708	C	T	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=676;ReadPosRankSum=-1.938;SC=AGGGACTCTTCCTCAACGTCT;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=42;WE=115298985;WS=115298967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr5	115298998	.	G	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=45;PP=950;ReadPosRankSum=-0.343;SC=ACACCGACCAGGGCGAGCGCA;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=57;WE=115299006;WS=115298988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr5	115320508	rs72802763	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.288;SC=TCCCCAAATCGCTTCCTAGTT;SOR=0.622;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=12;WE=115320516;WS=115320498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr5	115323691	rs35321827	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=1.099;SC=TGGGCCCTTGGTTGAGGCCTC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=9;WE=115323699;WS=115323681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr5	115336862	rs7712021	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TCACTTTAAATGTGTCTACTG;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=81;WE=115336870;WS=115336852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,88:0.51:171
chr5	115339086	rs6594929	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AGGTAAGGTTACTTTTGATAC;SOR=1.675;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=5;WE=115339094;WS=115339076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	115341611	rs10078748	G	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=705;ReadPosRankSum=-0.004;SC=TTCTGCAGGCGATTCCTGTTA;SOR=0.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=53;WE=115341619;WS=115341601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr5	115341638	rs10078759	G	C	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=604;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GACTGCAGTTGATTGATGATG;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=41;WE=115341646;WS=115341628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,49:0.41:119
chr5	115346245	rs17138646	T	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=732;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AAGTACCAAATTGAAATGGAA;SOR=0.659;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=49;WE=115346253;WS=115346235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr5	115351150	rs10214076	T	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=201;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AAAGTTTCTGTTATAGGAATT;SOR=0.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=13;WE=115351158;WS=115351140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	115351224	rs17138667	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=253;ReadPosRankSum=0.990;SC=GCGTATTTGTGCTTCACTACC;SOR=0.859;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=13;WE=115351232;WS=115351214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	115351498	rs17485148	C	T	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=80;PP=2643;SC=TTCATTTAGGCCACTGGTTTG;SOR=1.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=37;TCR=80;TR=117;WE=115351506;WS=115351488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	115387421	rs1541801	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=524;SC=CCCACTGCTCACTGCGGGCTG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=115387429;WS=115387411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	115389626	rs954763	A	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=828;SC=TTTATGGTGAAAGTTACAGAA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=115389634;WS=115389616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	115389946	rs2662472	A	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.09;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	115394357	rs6860908	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=269;SC=TGATTGTACATTAATTTATTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=115394365;WS=115394352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	115394396	rs6880121	C	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=530;SC=GCACTGTCATCTTAATGTCAT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=115394404;WS=115394386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	115394626	rs6880759	G	A	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=37;PP=1250;SC=GCACGCTGCCGTTTAATGTTC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=115394634;WS=115394616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	115426746	rs10065554	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=651;SC=GAATATGTGCTAATATAATAG;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=115426754;WS=115426736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	115428334	rs1129494	G	T	6619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=94;PP=2965;SC=TTGTCAATACGTGGTCTTCTA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=105;TCR=94;TR=199;WE=115428342;WS=115428324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr5	115428439	rs6894046	T	A	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=65;PP=2105;SC=CAATAACATATGGCATAAATT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=84;WE=115428447;WS=115428429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	115469773	rs1129496	C	T	5899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=81;PP=2965;SC=AGCTAGAGACCGTTGGATGGC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=170;WE=115469781;WS=115469763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	115784843	rs1968362	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=1.671;SC=ACACATCACAGTTGTCAGATC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=115784851;WS=115784833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	115803578	rs10551961	AGTG	A	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=260;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GACACGGCTTAGTGGTGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=115803588;WS=115803568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr5	115811220	rs423834	T	C	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1068;ReadPosRankSum=0.589;SC=AAGATAAAAATGGATAAAAGA;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=121;TCR=78;TR=81;WE=115811228;WS=115811210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,94:0.40:236
chr5	115813726	rs34966	A	G	8030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=101;PP=2965;SC=CACTTCCCATATCGTTCACAC;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=132;TCR=101;TR=233;WE=115813734;WS=115813716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr5	115814496	rs40102	C	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=723;ReadPosRankSum=0.435;SC=ACAGCTGCGACATAGCCTTCT;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=36;WE=115814504;WS=115814486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr5	115827356	rs154599	C	T	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=28;PP=1738;SC=TGTGACTCCACGAATCCTCTA;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=115827364;WS=115827346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	115827407	rs154600	G	A	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=49;PP=2261;SC=GCAAAAGCAAGTGCAACGAGG;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=115827415;WS=115827397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	115831092	rs32972	C	T	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=53;PP=2038;SC=TGGTTCCAACCGACAAATAGC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=101;WE=115831100;WS=115831082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	115837772	rs154466	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=12;PP=1009;SC=TGCTTGATAAGTTAAAGGAGG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=115837780;WS=115837762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr5	117329051	rs5870786	T	TAG,TAGACAC	3585.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=8,8;NR=45,45;PP=673,1383;SC=ATATTATATATACACACACAC;SOR=1.263;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=53,53;WE=117329059;WS=117329041;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.39:69
chr5	117329138	rs4404718	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.862;NF=0;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-1.207;SC=ACATATATACGCATATATATA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=117329146;WS=117329128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	117896625	.	GTA	G	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=43;QD=17.3333333333;SC=ATATGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=3;WE=117896634;WS=117896615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,3:0.19:16
chr5	117938634	rs147234228	CACAT	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.776;NF=12;NR=3;PP=458;ReadPosRankSum=0.416;SC=CACACACACACACATATATAT;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=15;WE=117938645;WS=117938624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	118176842	rs3813297	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=352;ReadPosRankSum=-0.218;SC=ATTCTATCTATATTTTTCATT;SOR=0.465;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=76;TCF=12;TCR=64;TR=20;WE=118176850;WS=118176832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr5	118280395	rs191289705	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	118480316	rs4895362	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=1.989;SC=GGCAAAGACAGCATTTTATCT;SOR=0.910;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=24;WE=118480324;WS=118480306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr5	118484804	rs7734532	G	A	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GGGTCCTTGAGCAGACAATTC;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=83;WE=118484812;WS=118484794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,100:0.46:219
chr5	118490205	rs78020394	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=0.120;SC=AAGGCTGTAACTCGTCTTAAT;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=17;WE=118490213;WS=118490195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr5	118513246	rs34139050	C	CTG	1351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.059;SC=AGTAGAAAGACTTTTAGTTTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=26;WE=118513254;WS=118513236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr5	118532034	rs6595178	A	C	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=32;PP=1801;SC=CTATAGAAATAGTTAACAGAT;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=118532042;WS=118532024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	118542406	rs3797335	C	T	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=190;SC=AGAATAGTAACTCCATATAAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=118542414;WS=118542396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	118556350	rs2271059	C	T	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=48;PP=1344;SC=ATTTACTGAACTAAAACTTTC;SOR=3.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=54;WE=118556358;WS=118556340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	118690998	rs3813309	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=394;ReadPosRankSum=-1.882;SC=AACTGCAGCAATGAGTGCCCG;SOR=0.982;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=23;WE=118691006;WS=118690988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr5	118691693	rs3797339	C	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=1.171;SC=CTTTTATTTTCCGTCGTGTGC;SOR=1.765;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=11;WE=118691701;WS=118691683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr5	118691929	rs6595185	A	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=659;SC=CTTTGTCCGCATGCCCTGCGC;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=25;WE=118691939;WS=118691919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	118727224	rs3733855	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=49;PP=1384;SC=GGAGGCTGAGATGGGCAGATC;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=118727232;WS=118727214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	118825051	rs12653702	G	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=574;ReadPosRankSum=0.742;SC=TGTACCAGTGGACATCACTTG;SOR=0.546;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=31;WE=118825059;WS=118825041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr5	118845139	rs32664	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CCCAATGTGAGGATGATGAGG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=5;WE=118845147;WS=118845129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr5	118860938	rs11539471	T	C	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=747;ReadPosRankSum=2.474;SC=CAGTGGAGACTGGAATCCCTT;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=65;WE=118860946;WS=118860928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr5	118861713	rs11205	A	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=572;ReadPosRankSum=-0.058;SC=ATTCAAGGCAATTAAGGTAAA;SOR=0.555;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=39;WE=118861721;WS=118861703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr5	118862971	rs2636961	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TTCCATCTTACCATTTTTTTT;SOR=0.117;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=16;WE=118862979;WS=118862961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr5	118877410	.	C	CT	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=33;QD=25.0;SC=AATGATTTTTCTTTTTTTTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=118877418;WS=118877400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	118965609	rs2431372	C	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.960;NF=6;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTTTTTGAGACGGAGTCTCGC;SOR=1.129;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=31;WE=118965631;WS=118965599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
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chr5	118968423	rs328698	T	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=800;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ATATCTCTGTTCCCTTCATAC;SOR=0.845;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=47;WE=118968431;WS=118968413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,62:0.43:145
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chr5	118969960	rs328694	C	T	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.037;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1148;ReadPosRankSum=0.853;SC=AGGTACTCCCCCCTCTGATGT;SOR=0.677;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=70;WE=118969968;WS=118969950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,85:0.49:175
chr5	118970770	rs2434600	C	T	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=64;PP=1915;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GTGTGGCCTTCTCTTGCAAGA;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=194;TCF=78;TCR=116;TR=106;WE=118970778;WS=118970760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,129:0.57:225
chr5	120021819	rs1158194	G	A	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=43;PP=2181;SC=CAGCACACCCGTCTGCTATCC;SOR=0.928;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=101;WE=120021827;WS=120021809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	121330223	rs6595336	C	T	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=604;SC=TCTTAAGATACGGAAAGGAAC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=121330231;WS=121330213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	121488506	rs35262183	C	G	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1626;ReadPosRankSum=-0.622;SC=AATGCACAGTCCAGCCAAGCG;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=96;WE=121488514;WS=121488496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,111:0.50:220
chr5	121726714	rs1946649	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TTGTTTAAATGTAGACATTAT;SOR=0.830;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=14;WE=121726722;WS=121726704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr5	121761021	rs2242224	G	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=876;ReadPosRankSum=0.649;SC=ATTGACTTGGGTTTTCTAATC;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=59;WE=121761029;WS=121761011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr5	121767643	rs77615391	C	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr5	121776301	rs2290987	T	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=806;ReadPosRankSum=0.188;SC=TTACATGAATTCCAACTGTCT;SOR=0.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=47;WE=121776309;WS=121776291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr5	121779390	rs3811879	G	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=435;ReadPosRankSum=-0.914;SC=GGTATGAAGAGAAAAAGTCCG;SOR=0.839;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=29;WE=121779398;WS=121779380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr5	121785398	rs2737092	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.531;SC=TTTCTGAACCTGTAAGGATGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=121785406;WS=121785388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr5	122012270	rs17132683	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=564;ReadPosRankSum=-0.126;SC=ATCTCTCACCCACAAGGTACC;SOR=1.066;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=37;WE=122012278;WS=122012260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,38:0.43:89
chr5	122012354	rs2407398	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=543;ReadPosRankSum=1.585;SC=CACAAACCTGACCCAGTATGA;SOR=0.761;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=28;WE=122012362;WS=122012344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr5	122131082	rs2161391	A	G	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=792;ReadPosRankSum=0.488;SC=TTTGCAGGTAATTGTCATGTA;SOR=0.744;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=36;TCR=91;TR=52;WE=122131090;WS=122131072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,67:0.43:156
chr5	122137708	rs965821	A	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=527;SC=TCATACATCAATATAGTATTA;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=122137716;WS=122137698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	122152520	rs148883473	A	AG	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr5	122161638	rs3213794	A	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=294;SC=ATTAGAATAGAACTTAAATAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=122161646;WS=122161628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	122161961	rs3217227	A	AT	87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=117;SC=ATTTTTCATAATTTTTTGTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=122161969;WS=122161951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	122163345	rs201650860	A	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=221;ReadPosRankSum=0.343;SC=ACAACAGGTAAGCCATTTTTG;SOR=1.371;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=19;WE=122163353;WS=122163335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr5	122163401	rs725638	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.546;SC=TACTTTCTTATTTTAAAAAGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=122163409;WS=122163391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr5	122165209	rs6885464	T	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=0.084;SC=TTATGTAGATTTTTTTTTAAT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=122165217;WS=122165199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	122165465	.	TTA	T	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.893;SOR=0.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr5	122165470	rs56262450	TACACAC	T	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=2.742;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr5	122181225	rs2303048	G	A	42.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr5	122189640	rs7713253	C	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=0.407;SC=TTTAAGAATTCTTAAAAAACT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=122189648;WS=122189630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr5	122267456	rs246314	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	122272641	rs30042	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=583;SC=CTTTTATCATAAAGTAAATTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=122272649;WS=122272631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	122281709	.	G	GT	182	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=16;MQ=59.97;NF=9;NR=0;PP=182;QD=21.2222222222;SC=AGACATCTCTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=122281717;WS=122281699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,9:0.56:16
chr5	122301079	rs30055	T	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=30;PP=1190;SC=GTTTAAAGAGTCAGGGACTTC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=122301087;WS=122301069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	122359502	rs70988555	A	AAC	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	122359839	rs144851383	G	GAC	722.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=535;SC=TGACTACTAAGCGTTTTTTAT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=122359854;WS=122359829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	122359840	rs374638812	CGTTTTTT	C	722.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=656;SC=GACTACTAAGCGTTTTTTATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=122359854;WS=122359829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	122372402	rs28373879	G	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=941;SC=TGACGGGACTGCCGGCCGGCT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=122372410;WS=122372392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	122425832	rs13182369	G	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=521;ReadPosRankSum=-0.467;SC=GCGGCGCCGCGGGTCTCCTGA;SOR=0.433;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=41;WE=122425840;WS=122425822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr5	122425849	.	C	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=589;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTGAGCGCGCCGCAGCCTCTT;SOR=0.901;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=39;WE=122425857;WS=122425839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr5	122425971	rs199942027	A	ACCTCCGCCT	432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=1739;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTCCTCTTCCACCTCCGCCTC;SOR=0.855;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=6;WE=122425979;WS=122425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr5	122426334	rs72373561	GGGCGCC	G	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=242;ReadPosRankSum=2.395;SC=CTCTCTCCCGGGGCGCCGGCG;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=122426347;WS=122426324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr5	122435627	rs1008058	G	A	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1218;ReadPosRankSum=-1.663;SC=GCAGGCAGGCGCCGTGAGGAA;SOR=0.851;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=78;WE=122435635;WS=122435617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,103:0.64:160
chr5	122682154	rs2303719	T	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=0;PP=1155;SC=ACTTTTGAGGTTTTTACAAAG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=122682162;WS=122682144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	122682348	rs1047438	A	G	9446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=167;PP=2965;SC=TCAAATAATCATCCAAACCTT;SOR=0.858;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=142;TCR=167;TR=309;WE=122682356;WS=122682338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr5	122685727	rs1047437	C	G	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=974;ReadPosRankSum=-1.319;SC=GTAGTCTCATCTGTTCCAATT;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=59;WE=122685735;WS=122685717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,82:0.52:157
chr5	122685801	rs485847	G	A	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.08;NF=34;NR=61;PP=1940;SC=GAAACAAAGAGACAAGTCATA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=95;WE=122685809;WS=122685791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	122685906	rs35423173	CT	C	206.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=145;SC=ACTGCCAATTCTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=122685914;WS=122685896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	122713989	rs79535450	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=507;ReadPosRankSum=1.086;SC=TGCAATAAACCCCTCTATGCT;SOR=0.883;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=35;WE=122713997;WS=122713979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,47:0.32:145
chr5	122718341	rs56006955	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.559;SC=AAGGTACCTACAGAACATAGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=122718349;WS=122718331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	122718736	rs6595440	G	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=639;ReadPosRankSum=1.046;SC=TAATCTTCTAGAGTCACTGTG;SOR=0.471;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=38;WE=122718744;WS=122718726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr5	122722370	rs3893854	T	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-0.746;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr5	122726783	rs17408604	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=236;ReadPosRankSum=0.104;SC=GCCAGGGGAATGAAGGAGGGC;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=18;WE=122726791;WS=122726773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr5	122727026	rs6876883	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=276;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CACAGCAGAGGTGAATCTAAT;SOR=0.785;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=26;WE=122727034;WS=122727016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr5	122728913	rs35574017	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.755;SC=AGTTTAGGTACTAAACTCTCG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=11;WE=122728921;WS=122728903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr5	122729230	rs17408694	T	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=1.247;SC=TATTACTTTCTAAACTACTGA;SOR=0.446;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=11;WE=122729238;WS=122729220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr5	122739421	rs7715577	G	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=374;ReadPosRankSum=1.713;SC=CGTGGCATCTGTTCGATGATA;SOR=0.755;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=24;WE=122739429;WS=122739411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr5	122758268	rs6882791	G	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=567;ReadPosRankSum=0.160;SC=ATCGCAGGAAGCCTGTATTCA;SOR=0.869;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=39;WE=122758276;WS=122758258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr5	123966143	.	AGTGTGTGTGT	A,AGT	619.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.33;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=3,3;NR=9,9;PP=327,240;SC=TGAAGAGCAGAGTGTGTGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=12,12;WE=123966160;WS=123966133;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.38:16
chr5	123973735	rs12655148	C	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=749;SC=CCTCTGCCTCCTGGGTTCAAG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=29;WE=123973743;WS=123973725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	123974608	rs4371750	T	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=911;SC=TCTAAAAAACTAATCAGTTAA;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=123974616;WS=123974598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	123974673	rs62370761	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=19;PP=492;SC=AAGTTGCATGTGAAGCAACTT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=123974681;WS=123974663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	123983915	rs6862252	G	T	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=16;PP=983;SC=TTTGCAGTTGGTAGCTTTTTT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=123983923;WS=123983905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	123984763	rs7708070	C	T	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=71;PP=2746;SC=CAGCAGACCTCGCTCTCTTCC;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=54;TCR=71;TR=125;WE=123984771;WS=123984753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	123985484	rs11422549	C	CA	565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=464;SC=TTTTTGCCAGCAAGTTCTATT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=123985492;WS=123985474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	125696140	rs11241887	G	A	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=70;PP=2100;SC=CAGTGGGTCCGGACCTGGAAC;SOR=3.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=75;WE=125696148;WS=125696130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	125802027	rs62394179	G	A	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=57;PP=1424;ReadPosRankSum=-2.405;SC=TCAGGACCAAGAGTAAGTCTT;SOR=1.151;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=199;TCF=78;TCR=121;TR=84;WE=125802035;WS=125802017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,101:0.43:234
chr5	125821287	rs56343611	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CTGGGAACAATTACCTCTCTC;SOR=0.662;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=10;WE=125821295;WS=125821277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr5	125828803	rs4358517	A	G	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=594;SC=CAGGAAAGTGAGGAGGGAAAT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=125828811;WS=125828793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	125886071	rs1038381	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=-0.097;SC=CTGAAGTGTACCAGTATAATT;SOR=0.358;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=24;WE=125886079;WS=125886061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr5	125891500	rs62391521	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=588;ReadPosRankSum=1.146;SC=AGCCTAATAACCTGCTTCATG;SOR=0.841;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=36;WE=125891508;WS=125891490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr5	125904208	rs3734174	A	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.518;SC=TGAGAAGGAAAAAAGTTTTTC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=125904216;WS=125904198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	125906344	rs6897789	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=0.067;SC=ACAAAGTCCATAATAATAATG;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=125906352;WS=125906334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	125929000	rs57146066	A	AACACACACACAC	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.566;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.180;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr5	125929746	rs72789715	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TTACATAACATCCTCCTATAA;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=125929754;WS=125929736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr5	125944219	rs112502491	G	GTGTTTT	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=965;SC=TGTTTATCCTGTGTTTTTGTT;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=15;WE=125944227;WS=125944209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	125967404	rs6862980	T	A	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=841;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TTTAGATGAGTATTCCATCCA;SOR=0.313;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=51;WE=125967412;WS=125967394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,60:0.61:98
chr5	125967653	rs12655861	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=-2.323;SC=ATGTGTGCAGGGAAAGCAAAT;SOR=0.495;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=10;WE=125967661;WS=125967643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr5	125971699	rs7705714	C	T	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=802;ReadPosRankSum=1.470;SC=TGATGTGATACACAGAAGATT;SOR=0.844;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=47;WE=125971707;WS=125971689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr5	126113173	.	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CTCGCGGCCTCGCCGCCCCGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=126113181;WS=126113163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	126145771	rs2271354	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=173;SC=AACAGGAGGAAGTTCGTGTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=126145779;WS=126145761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	126156538	rs6867254	T	G	433.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=278;ReadPosRankSum=1.873;SC=TTTGTTTTTTTTTTTTTTAAG;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=15;WE=126156546;WS=126156521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	126161690	rs36105360	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=297;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ATTTGGGCTGCAAACGCTGGT;SOR=0.756;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=19;WE=126161698;WS=126161680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr5	126168563	rs5871235	TG	T	218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=123;SC=ACCAAGAGTGTGGTTGGGTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=126168571;WS=126168553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	126171999	rs1051643	T	C	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=37;PP=1075;SC=TATGGTAATCTTTACCTGTAT;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=126172007;WS=126171989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	126206303	rs34150806	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=1.216;SC=ATGAATCAAACAACCAACCAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=126206311;WS=126206293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	126387694	rs2240800	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=500;ReadPosRankSum=0.983;SC=TGATGTAACAACTGCAGTGAT;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=36;WE=126387702;WS=126387684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr5	126732399	rs3812055	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=945;ReadPosRankSum=0.589;SC=AGAGATGCCAGTGCCAGAATG;SOR=0.971;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=60;WE=126732407;WS=126732389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
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chr5	126734267	rs6595767	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CAATTATTGAACACAGAAAGC;SOR=0.141;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=126734275;WS=126734257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr5	126734295	rs6595768	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TTTTGGGGACCCTGGGTACAG;SOR=0.903;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=9;WE=126734303;WS=126734285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr5	126734365	rs6595769	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=310;ReadPosRankSum=0.212;SC=GTTAATCCCTCAGCTGTGAGG;SOR=0.850;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=22;WE=126734373;WS=126734355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr5	126746277	rs31483	C	T	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=41;PP=1261;SC=TCCCTGCCACCTGGAAAACAC;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=126746285;WS=126746267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	126758645	rs118151260	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=0.839;SC=TTGTTGATTTGTGTAGGGGCA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=9;WE=126758653;WS=126758635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr5	126759947	rs78113757	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=1.583;SC=ATGCCAGCACCATACAGTTTT;SOR=1.088;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=15;WE=126759955;WS=126759937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr5	126774225	rs35591368	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=472;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AATGTAAATGCACTCCTGGCT;SOR=1.067;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=30;WE=126774233;WS=126774215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr5	126778850	rs7737871	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TGTAGCACTGCAGTATTGTGT;SOR=0.699;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=43;WE=126778858;WS=126778840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr5	126781446	rs2270933	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=1.706;SC=ATTCGGGTTCTTTAAAACTGG;SOR=2.461;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=20;WE=126781454;WS=126781436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr5	126790093	rs41298322	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=1.441;SC=TTTAATTCTAGGCACTGGGGA;SOR=0.056;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=9;WE=126790101;WS=126790083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	126791229	rs17164938	G	A	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1045;ReadPosRankSum=1.070;SC=TGAAATCGCCGGCACGAAGAG;SOR=0.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=60;WE=126791237;WS=126791219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
chr5	126791282	rs17164935	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=575;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TCAGCCAACAGGAATGTCTAT;SOR=0.933;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=35;WE=126791290;WS=126791272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr5	126792974	rs3812052	T	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.907;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=837;ReadPosRankSum=-1.561;SC=AGGACAGTGGTGGTAGCAGCA;SOR=1.255;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=115;TCF=41;TCR=74;TR=51;WE=126792982;WS=126792964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr5	126860145	rs7733544	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTTGCAAGAAGAAAGTAATTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=126860153;WS=126860135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	126860223	rs61736664	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=377;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TTTTTTCTAGCGGCAACCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=26;WE=126860231;WS=126860213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr5	126869270	rs233039	T	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=350;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TATGAGAATTTCATTATTTTA;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=19;WE=126869278;WS=126869260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr5	126874845	.	TTA	T	2887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.077;NF=8;NR=40;PP=1930;ReadPosRankSum=0.109;SC=AGTAAGTGTATTATGTTTCTC;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=100;TCF=15;TCR=85;TR=48;WE=126874854;WS=126874835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr5	126887569	rs7522	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=475;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GAGCGATAGCGGGCATGTATA;SOR=1.047;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=27;WE=126887577;WS=126887559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr5	126889370	rs435795	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=309;SC=ATAAGGAAATCTTACAGATTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=126889378;WS=126889360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	126889640	rs418657	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.877;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=546;ReadPosRankSum=-0.365;SC=TGGAAGAGAGAAATACATGAA;SOR=0.231;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=37;WE=126889648;WS=126889630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr5	126993249	rs45074	G	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.187;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=2223;ReadPosRankSum=0.412;SC=CATCCCTAGTGCCCCTTGGGA;SOR=1.051;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=56;WE=126993271;WS=126993239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr5	126993263	rs248709	A	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=2223;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CTTGGGAACGAATCAGCAGAT;SOR=0.964;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=69;WE=126993271;WS=126993239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr5	127485599	rs2617618	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=328;SC=TGGGGTGTTACGTTGTTATCT;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=127485607;WS=127485589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	127597518	rs10070365	G	A	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1636;ReadPosRankSum=-0.177;SC=ATGCTTCTGGGGACAGAGCAT;SOR=0.567;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=193;TCF=93;TCR=100;TR=97;WE=127597526;WS=127597508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,99:0.48:208
chr5	127607934	rs10038028	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=-0.353;SC=ACATGACACATAGAGAGGCTG;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=127607942;WS=127607924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr5	127609633	rs2291628	G	A	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=516;ReadPosRankSum=0.509;SC=TCCACAAAGCGAAGGTTGAGA;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=39;WE=127609641;WS=127609623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,50:0.39:129
chr5	127613791	rs426987	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=-0.023;SC=ATGGAGATGACATAACTAACT;SOR=0.409;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=17;WE=127613799;WS=127613781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr5	127614472	rs190450	A	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=742;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GATTGCGACTACTGGATGCCA;SOR=0.947;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=43;WE=127614480;WS=127614462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr5	127616014	rs28763927	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=-1.225;SC=TTTCATCTTTAGAAAAACAAA;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=27;WE=127616022;WS=127616004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr5	127625569	rs200608284	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=393;ReadPosRankSum=0.196;SC=TATATCAAAGCGTACCTTCAC;SOR=0.879;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=30;WE=127625577;WS=127625559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr5	127636485	rs28763934	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=421;ReadPosRankSum=0.285;SC=TACTAGTGGGCCTCAGAATAA;SOR=0.313;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=27;WE=127636493;WS=127636475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr5	127637362	rs2307110	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CATAAGGATCATATAATTAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=127637370;WS=127637352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr5	127638759	rs11955288	A	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=813;ReadPosRankSum=-1.274;SC=TTCCACATGGATGCCGCTCGC;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=48;WE=127638767;WS=127638749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr5	127640783	rs27713	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=532;ReadPosRankSum=-0.004;SC=ATCTAAAACAGAAAAAAATAA;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=36;WE=127640791;WS=127640773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr5	127646859	rs3215046	GA	G	95.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.17;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	127654769	.	G	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=0.815;SC=TAACATTAGCGCATTTTTCTG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=127654777;WS=127654759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr5	127685135	rs154001	C	T	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=29;PP=1086;SC=TTTGGACAAACGCCAGGGAAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=127685143;WS=127685125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	127685624	rs255690	C	A	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=35;PP=1815;SC=TGTATAGTATCTTCCAAGGAA;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=91;WE=127685632;WS=127685614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	127685734	rs28763947	G	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=475;ReadPosRankSum=0.134;SC=CTTCATTATAGAATAAAATAC;SOR=0.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=30;WE=127685742;WS=127685724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr5	127697281	rs3215047	AT	A	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=0.388;SC=AAACTGGCAGATTAGCTAAAT;SOR=1.071;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=8;WE=127697289;WS=127697271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr5	127777997	rs13180243	G	A	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1092;ReadPosRankSum=0.638;SC=GAATGTTAACGAAGGTATAGT;SOR=0.728;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=74;WE=127778005;WS=127777987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr5	127855152	rs140146961	GTTAAA	G	1450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=992;ReadPosRankSum=0.376;SC=AGGATCTTATGTTAAATTATA;SOR=0.518;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=22;WE=127855164;WS=127855142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr5	128301824	rs2526246	T	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CTGGCCCAGTTGCCCCCATGC;SOR=0.296;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=128301832;WS=128301814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr5	128301885	rs2526247	T	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=557;ReadPosRankSum=1.143;SC=CCTGCACTTCTTGCAGAAACT;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=42;WE=128301893;WS=128301875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr5	128301971	rs2577541	T	C	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1380;ReadPosRankSum=0.246;SC=TGAAGAAGTATGAAAAGAGAG;SOR=0.509;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=216;TCF=131;TCR=85;TR=98;WE=128301979;WS=128301961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,113:0.46:246
chr5	128302368	rs147696009	CCT	C	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=515;ReadPosRankSum=1.172;SC=GCTTTCATACCCTTTTTTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=16;WE=128302377;WS=128302358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr5	128359247	rs31271	T	C	159.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AAATTGCTTGTACAAGTAACT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=128359255;WS=128359237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr5	128362830	rs2304578	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=517;ReadPosRankSum=0.144;SC=TTGCAGGAGAACCTGGACTTC;SOR=1.085;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=38;WE=128362838;WS=128362820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,42:0.35:121
chr5	128365238	rs2289214	T	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.387;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.775;SC=ATTTGGTACTTAAAAATGACT;SOR=1.765;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=10;WE=128365246;WS=128365228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr5	128442644	rs3734161	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=720;ReadPosRankSum=-1.683;SC=ACTAGACTCATGTGTGCATCC;SOR=0.935;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=50;WE=128442652;WS=128442634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,56:0.39:142
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chr5	128863471	rs6595908	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=10;PP=576;SC=CAAGAGTCTGAGTGTGCAGGT;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=128863479;WS=128863461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	129015452	rs30645	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGAACCTCTTTATAGCTCTCC;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=14;WE=129015460;WS=129015442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr5	129015668	rs246443	T	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=559;SC=TGGCAAGGAATATTCCCAGTG;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=129015676;WS=129015658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	129072943	rs1465686	G	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=621;SC=CACAGCTCTTGGCAATTACAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=129072951;WS=129072933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	129100819	rs35674869	AC	A	633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=374;SC=AACATTTGAAACCCCCCCCAC;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=17;WE=129100827;WS=129100809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	129240972	rs33917	G	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=54;NR=30;PP=1512;SC=ACGGCCGGCCGGGGAGTAGCC;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=129240980;WS=129240962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	129244122	rs32234	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=594;ReadPosRankSum=0.535;SC=TCTAGGGCAGCGATTCTATTC;SOR=0.257;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=30;WE=129244141;WS=129244112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr5	129244133	rs2431206	A	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=30;PP=1026;SC=GATTCTATTCATTCTCTCTGT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=129244141;WS=129244112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	129519874	rs10066410	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=282;SC=TTTCTTTTTAGATAAATCTTT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=129519882;WS=129519864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	129521126	rs2015018	A	G	4480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=72;PP=2724;SC=CCCACTGATGATTACTTCATA;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=131;WE=129521134;WS=129521116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	130500751	rs2278060	A	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GACGATACCCACCTCAGCAGG;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=59;WE=130500759;WS=130500741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr5	130515811	rs113642581	G	A	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=752;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTAAAACACTGCACAGGACCA;SOR=0.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=55;WE=130515819;WS=130515801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr5	130517770	rs72803764	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=-1.074;SC=AAGAGACTTCATTAATAAATT;SOR=0.301;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=130517778;WS=130517760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	130726599	rs147277736	TAAAATTCTGGG	T	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=1454;ReadPosRankSum=1.063;SC=GCAGCCCAAATAAAATTCTGG;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=5;WE=130726617;WS=130726589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr5	130766662	rs1291602	T	C	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=69;PP=2677;SC=CAATACTCTCTGTTTAACTGT;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=132;WE=130766670;WS=130766652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	130776053	rs1422081	C	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=366;ReadPosRankSum=0.390;SC=GTACCTCAAACTTAGCAATGC;SOR=0.877;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=22;WE=130776061;WS=130776043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr5	130788642	rs12656936	A	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.715;SC=AGCACTTTGTACAGCACACAT;SOR=1.485;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=16;WE=130788650;WS=130788632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr5	130788698	rs10054168	C	T	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=912;ReadPosRankSum=-2.083;SC=TTAATTATTACATCACCCTTG;SOR=0.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=61;WE=130788706;WS=130788688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr5	130805475	rs56228197	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=103;ReadPosRankSum=0.168;SC=TAGAATACTACAGTCTTTAAG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=10;WE=130805483;WS=130805465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr5	130808198	rs31241	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=250;ReadPosRankSum=0.243;SC=CAAGTAACTCTAGCACTTGCT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=15;WE=130808206;WS=130808188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr5	130831365	rs40400	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.361;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=420;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TGTGGAAACATAAAAGAGGCA;SOR=1.151;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=26;WE=130831373;WS=130831355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr5	130867733	rs1029472	G	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=678;SC=CTCATTTACAGTTCAAAATAA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=130867741;WS=130867723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	130982768	rs26006	A	G	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.972;SC=GCCAAAAAAGAAACCATTAAC;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=192;TCF=115;TCR=77;TR=86;WE=130982776;WS=130982758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,108:0.46:235
chr5	131006082	rs27450	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=0.104;SC=GACCAAAAATATAAGGCAATT;SOR=0.392;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=11;WE=131006090;WS=131006072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
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chr5	131008194	rs26008	T	C	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=105;PP=2965;SC=AGAAATCATCTGGCACTCATC;SOR=0.796;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=96;TCR=106;TR=201;WE=131008202;WS=131008184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr5	131066577	rs7729787	A	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=431;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGAATAAATAAATGACATCAA;SOR=0.199;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=23;WE=131066585;WS=131066567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr5	131066725	rs7730228	C	A	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=59;PP=2144;SC=GCATCACTGCCGAGTTTCTGA;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=88;WE=131066733;WS=131066715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	131283376	rs683749	C	T	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=47;PP=1245;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGAAGTGAATCAGAAATGGTC;SOR=0.985;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=78;WE=131283384;WS=131283366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,103:0.58:177
chr5	131283541	.	GA	G	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=27;QD=16.0;SC=GGGCTGTTGTGAAAAAAATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=131283549;WS=131283531;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr5	131312238	rs11743803	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.451;HP=12;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.255;NF=16;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=2.128;SC=TTATATCAAGAAAAAAAAAAA;SOR=4.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=16;WE=131312258;WS=131312227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr5	131312327	rs370652	G	T	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=93;PP=2965;SC=CAACAGTAATGCTACTTTATT;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=114;TCR=93;TR=207;WE=131312335;WS=131312317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr5	131320942	rs422291	A	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.526;NF=10;NR=6;PP=269;ReadPosRankSum=0.165;SC=TATGCAGGGCACTGGGAGGTG;SOR=0.252;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=16;WE=131320950;WS=131320932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr5	131320959	rs67060241	GT	G	716.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.38;MQRankSum=6.116;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.745;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr5	131320960	.	TC	GC	809	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=64.45;NF=11,7;NR=5,5;PP=800,809;QD=52.1732007842;SC=GTGCAGGAGGTCACCCAGTGT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=16,12;WE=131320968;WS=131320950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr5	131320960	.	TC	T	809	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=64.45;NF=11,7;NR=5,5;PP=800,809;QD=52.1732007842;SC=GTGCAGGAGGTCACCCAGTGT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=16,12;WE=131320968;WS=131320950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr5	131320961	rs115222986	C	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.10;MQRankSum=6.069;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.714;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr5	131321159	rs11740791	G	C	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=629;ReadPosRankSum=1.775;SC=GGGCTGCAGGGGTGAGAAGAG;SOR=0.424;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=49;WE=131321167;WS=131321149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr5	131322494	rs77938	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=735;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TCAATAAAGACCTGCAGGTGA;SOR=0.525;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=47;WE=131322502;WS=131322484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr5	131322666	rs67212057	CCACACACTCACA	C	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=1624;ReadPosRankSum=-1.654;SC=ACACACATACCCACACACTCA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=131322685;WS=131322656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr5	131324119	rs71970	T	G	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=703;ReadPosRankSum=0.085;SC=CAGAAGGCCATGGAACCTCCT;SOR=0.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=38;WE=131324127;WS=131324109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr5	131324250	rs3043838	C	CTG	3803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=52;PP=2723;ReadPosRankSum=-1.140;SC=GGGCTGTACCCTGTGTGGAGG;SOR=0.956;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=130;TCF=24;TCR=106;TR=61;WE=131324258;WS=131324240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,106:0.52:203
chr5	131325888	rs422130	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=558;ReadPosRankSum=0.526;SC=CTTGTGTCAGAGAGGGGTCAG;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=40;WE=131325896;WS=131325878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr5	131326522	rs5871439	AC	A	1841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.293;NF=19;NR=19;PP=701;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GCCCCTCCACACCCCCCCCCA;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=38;WE=131326530;WS=131326511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr5	131330054	rs253944	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=1.630;SC=GGCAGGCCCTCGGGGAGTTGG;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=131330062;WS=131330044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	131347520	rs4705908	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	131396478	rs40401	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=380;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CCAGACAACGCCCTTGAAGAC;SOR=1.936;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=23;WE=131396486;WS=131396468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr5	131411460	rs25882	T	C	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=882;ReadPosRankSum=0.926;SC=GCAACCCAGATTATCACCTTT;SOR=0.723;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=59;WE=131411468;WS=131411450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr5	131534499	rs3749756	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=264;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GGCTGAAATGCTCCTAGAAGC;SOR=0.665;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=18;WE=131534507;WS=131534489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr5	131540053	rs159903	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-0.367;SC=GCAATCAGTTCCTGGCTATTG;SOR=0.283;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=131540061;WS=131540043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	131546280	rs154483	A	G	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=66;PP=1964;SC=AGAGATTCCCACTTCAAGGAA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=92;WE=131546288;WS=131546270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	131553340	rs2301579	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.748;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=2.853;SC=CCCCACATCACCCTCTCAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=131553348;WS=131553330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr5	131553427	rs188406019	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.083;NF=21;NR=10;PP=1401;ReadPosRankSum=-1.525;SC=ACTAAGGATGGTTGGGGACTT;SOR=1.255;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=31;WE=131553436;WS=131553417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
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chr5	131553665	rs154485	A	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=13;PP=429;SC=CAGCTCTCTGAGGATTATGGG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=131553673;WS=131553655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	131593363	.	GGCT	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.59;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	131593373	.	GCGGCGGCTC	G	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;QD=42.13;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	131602166	rs1007602	T	C	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=60;PP=2379;SC=GGCCTGAGGGTAGGAGCTGGC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=111;WE=131602174;WS=131602156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	131606936	rs2292260	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=296;ReadPosRankSum=1.242;SC=CAGACCCCAAGTCCACAGGGT;SOR=0.151;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=17;WE=131606944;WS=131606926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr5	131607080	rs270619	A	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=555;ReadPosRankSum=-0.515;SC=TGCGGGAGCCAGCCGAGCCCG;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=38;WE=131607088;WS=131607070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr5	131607297	rs162886	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=1953;ReadPosRankSum=-0.332;SC=CCCTTGCTACAACCTTGCTAC;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=48;WE=131607308;WS=131607287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,51:0.40:127
chr5	131607300	rs55722650	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=2586;ReadPosRankSum=0.430;SC=TTGCTACAACCTTGCTACGCC;SOR=0.841;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=63;WE=131607308;WS=131607287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,77:0.60:129
chr5	131607402	rs10479000	T	C	3529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.03;MQRankSum=-1.006;NF=79;NR=56;PP=2189;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CGATGGCCCGTCTGGCGCCCA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=259;TCF=154;TCR=105;TR=135;WE=131607410;WS=131607392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,163:0.51:322
chr5	131607588	rs4877	G	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1086;ReadPosRankSum=0.018;SC=CACGCGCTGCGGCCACGGCAT;SOR=1.164;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=57;WE=131607596;WS=131607578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr5	131607942	rs9895	G	C	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CTGCTCCCACGCCTGCTTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=81;TCR=119;TR=89;WE=131607950;WS=131607932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,107:0.46:233
chr5	131630852	rs35260072	A	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=681;ReadPosRankSum=2.351;SC=TGTGCACCCCAAGAAAGAATA;SOR=0.641;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=41;WE=131630860;WS=131630842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr5	131649186	rs270607	A	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=156;SC=GATGTGACAGAGAAAAAAGTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=131649194;WS=131649176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	131649222	rs2073838	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=281;ReadPosRankSum=0.017;SC=AAAACACTAAGTCTGCATTGA;SOR=1.814;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=16;WE=131649230;WS=131649212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr5	131658085	rs270600	T	C	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=711;SC=CCCTCTGCTGTGGGTCAGCAC;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=131658093;WS=131658075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	131660119	rs273915	G	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=263;SC=CCTGCTCACTGTGCCCTAAGG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=131660127;WS=131660109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	131660431	rs273914	A	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=0.688;SC=TCAGTATGAGACAAGCTCTCC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=8;WE=131660439;WS=131660421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	131663062	rs272893	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=873;ReadPosRankSum=0.618;SC=ATGAACAACATAGCTGTACCA;SOR=0.830;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=70;WE=131663070;WS=131663052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr5	131667548	rs2304081	G	A	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GCTATGGTAAGTAATAAGTGA;SOR=0.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=47;TCR=91;TR=66;WE=131667556;WS=131667538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr5	131670546	rs272879	C	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=407;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TATTGCGAACCCTGCCCAGGC;SOR=0.038;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=31;WE=131670554;WS=131670536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr5	131671769	rs272878	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=12;PP=272;SC=ATTGTGAAAATGTCAAATAGC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=131671777;WS=131671759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	131676320	rs1050152	C	T	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GATTGGAATCCTCACCCTTTT;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=74;WE=131676328;WS=131676310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,89:0.52:172
chr5	131701279	rs367805	T	C	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=45;PP=1105;SC=ACTGGACAGATGCTCTGAATC;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=73;WE=131701287;WS=131701269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	131705949	rs2631365	T	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.307;NF=35;NR=21;PP=831;ReadPosRankSum=0.288;SC=TCTCGGCGCTTGGGCTGGAGC;SOR=1.176;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=56;WE=131705957;WS=131705939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr5	131713774	rs2073642	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=0.556;SC=TAGGAGCAAGCGTTAGAGGCC;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=131713782;WS=131713764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	131719689	rs71583486	G	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=463;ReadPosRankSum=-1.963;SC=CATGGGCACTGTGAGACCGAG;SOR=1.409;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=28;WE=131719697;WS=131719679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr5	131719999	rs4551059	A	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=31;PP=1279;SC=CCTGGGTATGACCATCAGGTT;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=131720007;WS=131719989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	131720070	rs274559	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=1.526;SC=TCTGGAGACAACTGTGATGTC;SOR=0.668;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=13;WE=131720078;WS=131720060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	131721174	rs274558	A	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1313;ReadPosRankSum=0.059;SC=CGGGGGTGCTATGCGTGGCAC;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=79;WE=131721182;WS=131721164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,88:0.58:153
chr5	131721204	rs274557	T	C	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GAGTGTGACCTTGTGCCCCAT;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=85;WE=131721212;WS=131721194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,98:0.59:166
chr5	131722951	rs274555	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	131730052	rs60522531	CA	C	2959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=64;PP=2570;SC=CCTTCAGTGACAAAAGGCCTT;SOR=2.354;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=66;WE=131730060;WS=131730042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	131755477	rs4451042	G	T	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.25;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	131755651	rs1003533	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=548;ReadPosRankSum=-0.559;SC=AGAGCCTGACCGGAGTTTTTC;SOR=0.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=38;WE=131755672;WS=131755641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr5	131796498	rs2522048	T	C	5359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=91;PP=2965;SC=AACAAAACCATCAGCCCTGCT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=70;TCR=91;TR=161;WE=131796506;WS=131796488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	131796573	rs2522049	T	C	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=63;PP=1555;SC=CCTGTAATGGTGGTTGTGAGG;SOR=1.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=97;WE=131796581;WS=131796563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	131796609	rs2522050	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=387;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CAGCCACACACGCCAGTTCCC;SOR=0.575;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=26;WE=131796617;WS=131796599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr5	131805591	rs2522063	G	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr5	131805735	rs2706379	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=243;ReadPosRankSum=0.320;SC=TCTCTAGCCCCGAACAGCACA;SOR=0.731;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=27;WE=131805743;WS=131805725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr5	131819798	rs2070731	T	C	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=2.383;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr5	131819798	.	TAG	CAA	973	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10;NR=17;PP=973;QD=38.0173286986;SC=TGTATGAGGGTAGGGGACGGT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=27;WE=131819808;WS=131819788;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,27:0.40:67
chr5	131819800	rs2070730	G	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=2.002;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr5	131819921	rs2070729	C	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GCATGGCAGCCGTAGCTAATT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=10;WE=131819929;WS=131819911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr5	131819970	rs7701588	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.844;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr5	131819977	rs2070728	C	T	795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.41;ReadPosRankSum=1.624;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr5	131821188	rs17848418	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr5	131821246	rs10068129	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GACAATGCAAGCAGCCAGGTG;SOR=0.297;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=18;WE=131821254;WS=131821236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr5	131821520	.	GAC	G	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=36;QD=41.0;SC=CTGTCTCTCTGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=1;WE=131821529;WS=131821510;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,1:0.33:3
chr5	131821738	rs2070726	C	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.623;SC=CCTCCTCTCACCAGCCCCCAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=131821746;WS=131821730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	131821788	rs2070725	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=267;ReadPosRankSum=0.143;SC=CTAGTGTCCCCGTCGCTTGCC;SOR=0.905;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=16;WE=131821796;WS=131821778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr5	131821866	rs10214312	T	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=647;ReadPosRankSum=-1.735;SC=GGAGTTCTGATCATCTTTTCT;SOR=0.484;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=44;WE=131821874;WS=131821856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr5	131822055	rs9282762	T	C	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=973;ReadPosRankSum=0.568;SC=TGACAGCACATGGCGACAGTG;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=101;TCR=61;TR=77;WE=131822063;WS=131822045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,98:0.48:206
chr5	131822072	rs2070724	A	G	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1399;ReadPosRankSum=1.160;SC=AGTGCTGGGGAACAGCAGAAG;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=108;TCR=74;TR=85;WE=131822080;WS=131822062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr5	131822133	rs9282763	T	C	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1788;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TCGAGCGCCCTCCGACCAACC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=107;TCR=110;TR=109;WE=131822141;WS=131822123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,123:0.48:255
chr5	131822224	rs9282761	T	C	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=53;PP=1779;ReadPosRankSum=2.864;SC=CTGTGGGGTCTCCTGCCAGAC;SOR=0.541;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=199;TCF=97;TCR=102;TR=108;WE=131822232;WS=131822214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,122:0.53:229
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chr5	131892357	rs2706335	C	T	4920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=79;PP=2750;SC=AGTTTTGACACGAACTGACCC;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=139;WE=131892365;WS=131892347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	131892979	rs4526098	G	A	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=32;PP=2267;SC=GCCTTTGTGGGCTCCAGGTCC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=108;WE=131892987;WS=131892969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	131915213	rs17166050	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-2.047;SC=CCCTTAAATAGACTTTGTAGT;SOR=1.508;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=131915221;WS=131915203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr5	131973663	rs2074369	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-2.100;SC=ATTGTTTTCCTCTGGTAATGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=131973671;WS=131973660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	131995843	rs1295686	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=2.182;SC=GTTCTACTCATGTGCTGACCT;SOR=0.545;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=24;WE=131995851;WS=131995833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr5	131995964	rs20541	A	G	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CGCGAGGGACAGTTCAACTGA;SOR=1.032;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=87;WE=131995972;WS=131995954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,102:0.41:250
chr5	132036252	rs1468216	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=802;ReadPosRankSum=0.244;SC=TACTGGACCATGTTCCTCCCC;SOR=0.876;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=61;WE=132036260;WS=132036242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr5	132038199	rs3213639	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.391;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=857;ReadPosRankSum=0.550;SC=AAAGAACTCCCTTTTAAAAAA;SOR=0.201;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=51;WE=132038207;WS=132038189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr5	132039132	rs2285700	C	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=387;ReadPosRankSum=1.586;SC=ATCATGAATTCATCTCAATTC;SOR=0.263;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=25;WE=132039140;WS=132039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr5	132046789	rs11740584	G	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.565;SC=TATCCTGTACGAAGTCATTAG;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=62;WE=132046797;WS=132046779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,67:0.63:107
chr5	132056147	rs2074529	C	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=357;ReadPosRankSum=0.582;SC=TTTCATTCATCTATGCTCTCT;SOR=1.402;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=21;WE=132056155;WS=132056137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr5	132070242	rs7732520	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=109;SC=AATTTATAAACTTTAAAAGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=132070250;WS=132070232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	132083458	rs803056	G	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=352;ReadPosRankSum=0.150;SC=AACCGCAGACGCGGTCCCCGC;SOR=1.046;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=21;WE=132083466;WS=132083448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr5	132084229	rs72799426	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=386;ReadPosRankSum=0.137;SC=TTTGCTCCCCATTCCTGCTTG;SOR=1.101;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=20;WE=132084237;WS=132084219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr5	132084956	rs803055	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=575;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TCAAAAAAGTGTATAAAAGAA;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=38;WE=132084964;WS=132084946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr5	132086817	rs708461	G	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GTGAGGTGACGCACAAGGCTC;SOR=1.460;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=15;WE=132086825;WS=132086807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr5	132093994	rs42403	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=0.750;SC=GACGCTGGTGCCAAAATAAAT;SOR=0.430;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=11;WE=132094002;WS=132093984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr5	132098242	rs30510	A	G	6743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=90;PP=2965;SC=TCTGGACCCCATTGCTGACCA;SOR=0.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=113;TCR=90;TR=203;WE=132098250;WS=132098232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr5	132098420	rs30509	A	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-0.391;SC=ATATGGATAGACATGCCCAGG;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=16;WE=132098428;WS=132098410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr5	132099999	rs30507	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1110;ReadPosRankSum=0.115;SC=CCTGGAGGTCATAGGTCTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=154;TCF=100;TCR=54;TR=77;WE=132100007;WS=132099989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,87:0.48:181
chr5	132149684	rs40274	G	C	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=40;PP=1478;SC=CCCTTGGTCCGGGTGCCGCGG;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=80;WE=132149692;WS=132149674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	132150024	rs4266393	C	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=204;ReadPosRankSum=0.530;SC=CGGAGGAGCCCGGCCTGCGCC;SOR=0.722;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=14;WE=132150032;WS=132150014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr5	132150132	rs115553646	C	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=0.169;SC=TGGGCCCGGGCCGCTCCCCGC;SOR=1.473;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=10;WE=132150140;WS=132150122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr5	132150948	rs40470	T	G	6242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=113;PP=2965;SC=TGCCCAGTTTTCCTCCAACAA;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=195;WE=132150956;WS=132150938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr5	132151071	rs757537	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTCTGTTTCCAGCTTTGTCCA;SOR=0.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=19;WE=132151079;WS=132151061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr5	132159134	rs4705870	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=380;ReadPosRankSum=0.224;SC=GCCTGGCCCACGCTTGTGCCT;SOR=0.792;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=29;WE=132159142;WS=132159124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr5	132159520	rs66542366	T	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1125;ReadPosRankSum=0.054;SC=AGTGTCCAGATTCCCTAGTAC;SOR=0.838;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=77;WE=132159528;WS=132159510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,104:0.53:197
chr5	132160057	rs35534543	C	T	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=55;PP=1384;ReadPosRankSum=1.023;SC=GGACTGTAACCTGGCCAGTTC;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=65;TCR=109;TR=88;WE=132160065;WS=132160047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,101:0.50:200
chr5	132161294	rs2292030	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=758;ReadPosRankSum=0.769;SC=GTGAGTCGCCGGGGGCCGCGC;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=48;WE=132161302;WS=132161284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr5	132198199	rs254286	G	A	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1113;ReadPosRankSum=0.533;SC=AGTGTTCAACGGTAGTAATGC;SOR=0.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=63;WE=132198207;WS=132198189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,74:0.61:122
chr5	132198287	rs254285	C	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=735;SC=GCTTGAAAATCAGTCAACACA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=132198295;WS=132198277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	132209164	rs142228782	ATCAC	A	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.734;QD=7.18;ReadPosRankSum=-1.878;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr5	132220941	rs3835017	CGTGTGT	C	297.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=240;SC=CACCAAAATACGTGTGTGTGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=132220954;WS=132220931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	132227677	rs6596093	A	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=503;SC=CTGACTTACCACCTTCACAGT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=132227685;WS=132227667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	132232315	rs739863	G	A	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=881;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TATTGCTCTCGGGGTACTTAG;SOR=0.721;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=56;WE=132232323;WS=132232305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,67:0.55:121
chr5	132234152	rs34099243	C	CG	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=568;SC=ACATCCAAATCGACAACCAAC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=132234160;WS=132234142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	132234702	rs66732439	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=606;ReadPosRankSum=1.313;SC=TATCAAAATTAATATTTACTT;SOR=0.454;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=33;WE=132234710;WS=132234692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr5	132239939	.	C	G	249	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=58.96;NF=7;NR=5;PP=249;QD=23.6476010456;SC=AAAAAGAAAACAAAAATGAAA;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=12;WE=132239947;WS=132239929;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr5	132240151	rs12517073	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=232;ReadPosRankSum=0.372;SC=GAAAGATTAGTGAAAAATGCT;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=19;WE=132240159;WS=132240141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr5	132267850	rs56817345	A	AT	616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.050;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=540;ReadPosRankSum=0.540;SC=AATTGAAATGATTTTTTTTAA;SOR=1.931;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=15;WE=132267867;WS=132267840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr5	132267859	rs56157864	A	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=522;ReadPosRankSum=0.567;SC=GATTTTTTTTAAAAAACTTAC;SOR=1.380;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=21;WE=132267867;WS=132267840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr5	132388068	rs76836760	T	G	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=837;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GGGCCGGGCCTGCCGCGTGCA;SOR=0.587;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=53;WE=132388076;WS=132388058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr5	132403057	rs11448270	T	TA	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=-0.641;SC=GCTGTTGAAATAAAAAAAAAA;SOR=0.760;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=8;WE=132403065;WS=132403047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr5	132403341	rs6596098	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=477;ReadPosRankSum=-1.656;SC=TGTCAGATTGCAATGAAAATG;SOR=0.191;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=26;WE=132403349;WS=132403331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr5	132403359	rs6596099	T	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=-0.203;SC=ATGCTTACAGTTGCTTAGGGA;SOR=0.063;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=132403367;WS=132403349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr5	132409074	rs56121115	A	G	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=945;ReadPosRankSum=-1.216;SC=GAAGATTGTGAAATTTTAAAA;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=55;WE=132409082;WS=132409064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
chr5	132409650	rs62375234	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=192;ReadPosRankSum=0.128;SC=TTTACTTAGACGTTATTTTTA;SOR=1.058;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=14;WE=132409658;WS=132409640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr5	132409867	rs62375235	T	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.551;SC=ATGGTAATTATGAAATTTTGA;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=11;WE=132409875;WS=132409857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr5	132412299	rs11747001	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=257;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CATCTGTTTCAAAATCGATTG;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=18;WE=132412307;WS=132412289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr5	132428503	rs12055249	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=1.144;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.714;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr5	132435488	rs4301229	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=0.366;SC=GACTTAGGCTCATTATCATTC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=132435496;WS=132435478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
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chr5	132559950	rs2303671	T	G	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=787;ReadPosRankSum=0.551;SC=TGTGATGGAGTCAAGGAAAAA;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=51;WE=132559958;WS=132559940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,63:0.57:111
chr5	132561277	rs2241583	G	A	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=23;PP=1999;SC=TATACCTCTCGTTTCCATTCC;SOR=1.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=92;WE=132561285;WS=132561267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	132569260	rs35758896	GCCT	G	1156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.048;NF=2;NR=17;PP=822;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GATGAGACTGGCCTCTTTATT;SOR=1.230;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=19;WE=132569270;WS=132569250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr5	132918994	rs256266	G	A	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=25;PP=867;SC=GAGCCAAGATGGCCGAATAGG;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=132919002;WS=132918984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	133316707	.	C	CT	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQRankSum=1.545;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	133451557	rs56319840	GC	TT	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=3;HapScore=4;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=2503;ReadPosRankSum=2.598;SC=AGTCCCAGCCGCTGCCAGGGC;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=41;WE=133451572;WS=133451542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr5	133451564	rs115535840	G	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=2952;ReadPosRankSum=-1.716;SC=GCCGCTGCCAGGGCTGGTGTG;SOR=0.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=63;WE=133451572;WS=133451542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr5	133459347	rs17167273	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=283;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GTGCGGTGAGACTGGAGAAGA;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=15;WE=133459355;WS=133459337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	133459573	rs17167274	A	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=810;ReadPosRankSum=0.857;SC=GAACTCGAACAGAGCCAAGGG;SOR=1.255;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=42;WE=133459581;WS=133459563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr5	133473635	rs75401751	CT	C	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=61.53;MQRankSum=1.047;NF=10;NR=0;PP=340;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TCGCTGAGGCCTGTGGTTTTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=133473643;WS=133473631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr5	133473697	rs249610	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.240;NF=22;NR=11;PP=510;ReadPosRankSum=1.088;SC=CATCCCAGTGTCTTCCTCCCT;SOR=0.196;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=33;WE=133473705;WS=133473687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr5	133474591	rs891896	A	G	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.997;SC=AACTGCTGATATGGCCTGCCA;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=70;WE=133474599;WS=133474581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,84:0.45:186
chr5	133477711	rs6876997	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=143;ReadPosRankSum=1.179;SC=TGCTGGGAGCAGGTATTTGTA;SOR=0.352;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=12;WE=133477719;WS=133477701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr5	133478341	rs152402	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=0.614;SC=CTAGGCCCACGCTAGAGGAGG;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=133478349;WS=133478331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr5	133478359	rs152401	A	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=1.199;SC=AGGAGGCTGCAATTAGGTGGG;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=17;WE=133478367;WS=133478349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr5	133509294	rs17167353	A	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=1.732;SC=TTTTCCAAAGACCTTAATTTC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=133509302;WS=133509284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	133509736	rs3815506	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=310;ReadPosRankSum=-1.081;SC=GACATTAAATATAAAATTTAA;SOR=0.721;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=23;WE=133509744;WS=133509726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr5	133509752	rs73791514	A	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=0.926;SC=TTTAAGAGAGAGAGTTCTACA;SOR=0.898;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=21;WE=133509760;WS=133509742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr5	133560024	rs148015801	T	C	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=976;ReadPosRankSum=0.654;SC=CAACAGATGATGTGCCACCTC;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=86;WE=133560032;WS=133560014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,106:0.55:192
chr5	133561339	rs3895755	A	G	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=7;PP=1285;SC=GGTCTCGGAGACTCGGGGGGC;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=133561347;WS=133561329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	133638156	rs6871362	T	G	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=231;SC=TCTGTTTCTTTAGTTCAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=133638164;WS=133638146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	133702282	rs10463917	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=604;SC=AACGTTTATACTTTTATTTAT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=133702290;WS=133702272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	133747354	rs141449831	C	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AGAGGGAGAGCAGCTGGTCCA;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=24;WE=133747362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr5	133873572	rs329126	A	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=415;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TTTCTCCCTCATGAACATTCT;SOR=0.879;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=22;WE=133873580;WS=133873562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr5	133896744	rs2589404	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=499;SC=TGTGGACAGAAGCCCTTAAGA;SOR=2.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=133896752;WS=133896734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	133897829	rs329304	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=697;ReadPosRankSum=0.170;SC=ATGCAGCTGACTGCTGACCAG;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=50;WE=133897837;WS=133897819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,62:0.42:149
chr5	133900111	rs329311	A	C	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=37;PP=1736;SC=CAGCAGACAAACCCCCATTTT;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=90;WE=133900119;WS=133900101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	133909475	rs329322	G	A	6230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=105;PP=2965;SC=CCCACCTGCCGCCGCCACCTC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=83;TCR=105;TR=188;WE=133909483;WS=133909465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	134015523	rs10042142	C	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=185;SC=TTATTTACCTCTAGTCAATCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=134015531;WS=134015513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	134033777	rs246341	G	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=40;PP=1151;SC=GCGTAGGACTGAATAATATTT;SOR=3.564;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=134033785;WS=134033767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	134113558	rs254713	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=425;SC=TACTTTTTCTGAGTACCAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=134113566;WS=134113548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	134117053	rs75589259	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=1.364;SC=CCAGAATTGAGAGACATTCTT;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=17;WE=134117061;WS=134117043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr5	134331822	rs299363	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.297;SC=AGCGTGTGCTGTGTGCCAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=134331830;WS=134331817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr5	134331921	rs299364	T	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=663;ReadPosRankSum=1.641;SC=TCTAGGGCTGTGCAGCTCGAT;SOR=0.654;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=41;WE=134331929;WS=134331911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr5	134343661	rs10044000	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=431;ReadPosRankSum=1.050;SC=TGATCACCGCCGTGGGGCAGA;SOR=0.776;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=24;WE=134343669;WS=134343651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr5	134343799	rs177252	A	G	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=718;ReadPosRankSum=-1.291;SC=ACCTGGCTGCAGCTTTTTTCA;SOR=0.470;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=46;WE=134343807;WS=134343789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr5	134344497	rs299376	T	C	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1083;SC=CCACTGGGTCTGGGCCCTCAG;SOR=2.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=53;WE=134344505;WS=134344487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	134344902	rs299377	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=-1.873;SC=AAGAAGCCTCTGCAGCTACAG;SOR=0.859;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=19;WE=134344910;WS=134344892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr5	134344929	rs299378	C	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=5;PP=990;SC=GCTTGAGTGGCGGCTGGCCCT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=134344937;WS=134344919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	134345259	rs143819145	T	TGGTGCCTGTGTAGAGAGCAGGTGGCCTCAGGCATCTGCAGC	156.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=78.46;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,2:1.00:2
chr5	134346304	rs877812	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AGTGAAGGGGGTGATGACTGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=134346312;WS=134346294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	134364406	rs71660434	TCCGCGC	T	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=2.389;SC=GCGTGCGTCCTCCGCGCCCGC;SOR=0.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=4;WE=134364419;WS=134364396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	134364518	rs479632	C	G	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=855;ReadPosRankSum=0.450;SC=GCCCTGCAGGCCGCCGTAGCC;SOR=0.506;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=58;WE=134364526;WS=134364508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr5	134365091	rs474853	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=0.766;SC=GCCTGGAGCCTTCCGTCGGCC;SOR=1.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=134365099;WS=134365081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr5	134368721	rs10716861	CA	C	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.137;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.798;NF=0;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=-1.056;SC=CCAGCTCGGACAAAAAAAGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=134368729;WS=134368711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr5	134870640	rs11960442	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=256;ReadPosRankSum=-1.102;SC=CTAGGGGAGGGGGAAAGTAAC;SOR=0.881;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=21;WE=134870648;WS=134870630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr5	134870913	rs8192559	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=980;ReadPosRankSum=-1.022;SC=CACCGCCTCCGGGCAGCCCTT;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=64;WE=134870921;WS=134870903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr5	134986006	rs801560	G	A	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=302;SC=TCCTTGACTGGTACACTCCAA;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=134986014;WS=134985996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	134986196	rs10045717	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=0.562;SC=AGGATGACTCCAGGACAAGGG;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=17;WE=134986204;WS=134986186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr5	134986256	rs149152270	A	AAAC	961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;QD=43.72;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	135138782	rs11738183	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=231;SC=TAATATCCTATGGAGGTATTA;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=135138790;WS=135138772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	135178124	rs2304075	T	C	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=27;PP=1171;SC=GTGTCATCGTTGGCCACCCTC;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=135178132;WS=135178114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	135186075	rs2304077	A	G	4920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=73;PP=2965;SC=GGCTATGAATAACCTCTGCGC;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=143;WE=135186083;WS=135186065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	135188214	rs2304078	G	C	6066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=54;PP=2965;SC=ACGGCAGCCCGGGGTCCTCAC;SOR=1.482;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=122;TCR=54;TR=176;WE=135188222;WS=135188204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	135258105	rs39604	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=309;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GTTGAAGATTGGGGTGTCTGT;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=19;WE=135258113;WS=135258095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr5	135276201	rs1160982	AGTT	A	2536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=11;PP=2172;SC=CAGCACTTACAGTTGTTTTTA;SOR=2.872;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=44;WE=135276211;WS=135276191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	135276314	rs40986	C	T	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=64;PP=2250;SC=CTAAGACTCCCAAAGATGAGT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=135276322;WS=135276304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	135276701	rs31548	T	C	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=15;PP=1191;SC=TGAGAATTTTTCCCAACTTCC;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=135276709;WS=135276691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	135276814	rs2066913	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=846;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TCTCAAGCGAGACTCATGTTA;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=55;WE=135276822;WS=135276804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
chr5	135276847	rs31547	T	C	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=46;PP=2246;SC=TTCGAATTGATGTTGTGAGTG;SOR=0.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=109;WE=135276855;WS=135276837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	135277394	rs11376205	G	GT	1114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=28;PP=821;SC=TGTTGTTGTTGTTTTTTTAAT;SOR=2.774;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=28;WE=135277402;WS=135277384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	135283222	rs977691	T	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TATCTGGGCTTCAGTAATCTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=135283230;WS=135283212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	135287029	rs31517	T	C	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=88;PP=2213;SC=GAGCACAAGATGTCCACACCC;SOR=1.451;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=45;TCR=88;TR=133;WE=135287037;WS=135287019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	135365006	rs4976361	A	G	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.23;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	135379612	rs4976464	A	G	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=829;SC=CTTAGCAAATAACTCCTAAGA;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=39;WE=135379620;WS=135379602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	135385316	rs17169753	T	C	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=85;PP=2618;SC=TGCAGCTAGATTGAGCCCAAG;SOR=1.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=32;TCR=85;TR=117;WE=135385324;WS=135385306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	135388663	rs1054124	A	G	6717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=126;PP=2965;SC=GGCTGTCTGTAGAGACCCTGG;SOR=1.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=81;TCR=126;TR=207;WE=135388671;WS=135388653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	135391326	rs6860369	A	G	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=51;PP=2332;SC=CCCCTCGTGGAAGTATAACCA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=112;WE=135391334;WS=135391316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	135391374	rs1133170	C	T	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=55;PP=2233;SC=TGCAGAGCCTCTGCATTGAGA;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=135391382;WS=135391364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	135392426	rs4669	T	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=26;PP=1099;SC=ACACAGTCTTTGCTCCCACAA;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=135392434;WS=135392416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	135392507	rs2072239	G	A	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=34;PP=1032;SC=TTAAGTACACGTCTCCATTTT;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=135392515;WS=135392497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	135396452	rs13168506	A	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=111;SC=CACTTGCTGAATGAATAAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=135396460;WS=135396442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	135396468	rs13188659	T	A	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	135396669	rs6880837	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=16;PP=768;SC=GTCCTTTTCTTCATGTGGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=135396677;WS=135396659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	135513085	rs55765823	T	TC	3296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=36;PP=2204;SC=GGATTGAGATTATCTTCATGG;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=49;WE=135513093;WS=135513075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	135552017	.	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=730;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TGCAGAGGCAGCCTGCGTGGT;SOR=1.284;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=43;WE=135552025;WS=135552007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr5	135561133	rs3734123	C	T	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=35;PP=1031;SC=TATCCATATACGGGGCTGTCT;SOR=1.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=50;WE=135561141;WS=135561123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	136315200	rs3217011	AT	A	5525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=72;PP=2967;SC=AGACATGCAGATGATACTCGG;SOR=0.949;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=90;WE=136315208;WS=136315190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	136320758	rs17521219	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=979;ReadPosRankSum=-1.661;SC=AACCATTGCCATGCTGATCAT;SOR=0.621;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=97;TCR=42;TR=70;WE=136320766;WS=136320748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,78:0.50:157
chr5	136328367	rs3777224	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.704;SC=GGCAAAGCCACGTTCAAAGCA;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=136328375;WS=136328357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr5	136602543	rs17171235	A	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=666;SC=CAATTTGATAAAATAATTTCT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=29;WE=136602551;WS=136602533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	136833955	.	C	CCA	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	136961400	rs2074344	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=643;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CCCCAGTGTGTTGGAGGCCTC;SOR=1.981;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=15;WE=136961421;WS=136961390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
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chr5	136969793	rs2301708	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=279;ReadPosRankSum=1.735;SC=GGTTGTACTGCTCCACAGTGC;SOR=0.352;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=20;WE=136969801;WS=136969783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr5	137027953	rs2301710	A	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=0.166;SC=GAGGAGGTGCAGCAGTCCGGC;SOR=0.116;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=137027961;WS=137027943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	137028029	rs2905608	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=179;ReadPosRankSum=-1.794;SC=CATCTGCAAATGCACGGATGC;SOR=0.546;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=15;WE=137028037;WS=137028019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr5	137056006	rs11741787	A	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr5	137056027	rs6887727	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGAACTCAAGTGACTAAGAAT;SOR=0.219;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=11;WE=137056035;WS=137056017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr5	137206560	rs6890689	A	C	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=68;PP=2744;SC=TGCTTCTCCCAAGCAGCATGC;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=137206568;WS=137206550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	137241856	rs700605	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=534;ReadPosRankSum=1.343;SC=ATATAAATGCTTGAAATGAAC;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=34;WE=137241864;WS=137241846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr5	137244517	rs1880458	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=297;ReadPosRankSum=-2.233;SC=GTCCCGTTGTGTTAAAGACAT;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=21;WE=137244525;WS=137244507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr5	137257288	rs4304074	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=769;SC=GTATGTACATAAAGGTATATA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=137257296;WS=137257278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	137259179	rs12187140	T	C	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=13;PP=541;SC=GGCAGAAGGCTAGATTTTGAA;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=137259187;WS=137259169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	137259251	rs13188503	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=13;PP=483;SC=CTAAGACAAACCTCATATAGT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=137259259;WS=137259241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	137271968	rs7701617	T	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=260;SC=ACATGAAAGTTTATTACTGAC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=137271976;WS=137271958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	137281708	rs1125979	A	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=713;ReadPosRankSum=-1.154;SC=AAAAAAAGAAATTGTCTAGTC;SOR=1.225;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=43;WE=137281716;WS=137281698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr5	137292133	rs3836896	C	CA	1698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.720;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.660;NF=12;NR=29;PP=892;ReadPosRankSum=1.896;SC=CCATAAAAGGCAAAAAAACTA;SOR=0.280;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=41;WE=137292141;WS=137292123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,73:0.42:172
chr5	137295823	rs9327802	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=139;ReadPosRankSum=1.834;SC=TAGGCAAGTTTTTAAAGACTA;SOR=0.665;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=8;WE=137295831;WS=137295813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr5	137297923	rs4835738	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=1.006;SC=CAAATCCAAACATTTATGGGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=137297931;WS=137297921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	137323117	rs7714536	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-1.446;SC=CAATTTTATAACATTTAATAA;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=137323125;WS=137323107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr5	137342589	rs3756686	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-1.389;SC=CTTTCACATATAGTTACAGTT;SOR=0.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=137342597;WS=137342579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr5	137347403	rs12187885	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=258;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CACCGTGCCCGGCCTCACATA;SOR=0.682;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=19;WE=137347411;WS=137347393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr5	137347498	rs10064910	G	A	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=47;PP=1827;SC=AAGAATTTGCGGACCAAATTT;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=89;WE=137347506;WS=137347488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	137354851	rs66908638	CA	C	71.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;MQRankSum=0.210;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr5	137372207	rs6596419	A	T	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=79;PP=2965;SC=CTCTGAGCAGATCCATTGAAG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=164;WE=137372215;WS=137372197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr5	137420376	rs4835762	T	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=44;PP=1092;SC=GTGAATGGAGTGGGGCTTGCA;SOR=1.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=137420384;WS=137420366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	137426447	rs6596422	G	A	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1421;ReadPosRankSum=1.254;SC=GCGCAGAGGCGGAACTGATCT;SOR=0.702;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=190;TCF=93;TCR=97;TR=84;WE=137426455;WS=137426437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,100:0.45:220
chr5	137427274	rs3860103	G	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TAGAGTGTTGGATTTTTTATC;SOR=0.264;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=137427282;WS=137427264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	137454358	rs6878575	C	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=305;SC=ATTTTTAGTACAGACGGGGTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=137454366;WS=137454348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	137476416	rs412051	T	C	4234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=62;PP=2312;SC=CAGGACTTCTTGCCGCATCTC;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=127;WE=137476424;WS=137476406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	137485292	rs217270	C	T	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=408;SC=AACAGAAGTACGAATCTTAAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=137485300;WS=137485282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	137507104	.	TAA	T	256	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=59.77;NF=0;NR=21;PP=256;QD=12.3333333333;SC=ACAATGCTATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=21;WE=137507114;WS=137507094;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:31,21:0.40:52
chr5	137513369	rs368834620	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.29;MQRankSum=5.593;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr5	137517354	rs1048957	T	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.040;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=-1.064;SC=CCAAGGACTCTTTTGCCCTGA;SOR=2.161;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=19;WE=137517362;WS=137517344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr5	137527917	rs2231478	C	G	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=18;PP=1294;SC=AAGTTATTAGCCCTTCCCATA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=137527925;WS=137527907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	137622388	rs10515500	C	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTAGAAATGACTGAGACGCCA;SOR=0.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=18;WE=137622396;WS=137622378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr5	137717265	rs6865472	G	A	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=24;PP=1037;SC=GGATAATTCAGCGCCTCAAAG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=137717273;WS=137717255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	137780336	rs4835794	T	C	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=14;PP=1629;SC=CCAAAGTGACTTGGCAGGGCT;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=137780344;WS=137780326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	137801632	.	A	ACAG	1864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.628;NF=6;NR=25;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.187;SC=AGCGGCAGCAACAGCAGCAGC;SOR=0.381;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=104;TCF=14;TCR=90;TR=31;WE=137801640;WS=137801622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr5	137844274	rs2242599	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=0.598;SC=TAAGCACCTCACCGGAAGCAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=137844282;WS=137844264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	137846155	rs4835685	A	G	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=28;PP=1607;SC=CAATTAGTATAAGGTTTGGTT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=80;WE=137846163;WS=137846145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	137847078	.	TACACACACAC	T	125.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=615;ReadPosRankSum=0.705;SC=ATCACGTACATACACACACAC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=2;WE=137847100;WS=137847068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	137847082	rs35404194	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.003;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	137847092	rs11738208	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	137849526	rs10077407	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=-0.735;SC=AAACCTTCTACGGAATAATTT;SOR=0.257;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=17;WE=137849534;WS=137849516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr5	137892170	rs10117	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=181;ReadPosRankSum=-0.155;SC=AACAGCTTCAGTGATGCCTGC;SOR=0.657;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=13;WE=137892178;WS=137892160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr5	137896597	.	A	AT	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5002;HP=14;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=26;MQ=59.16;NF=2;NR=1;PP=35;QD=13.0;SC=TTCCAGGTTCATTTTTTTTTT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=3;WE=137896605;WS=137896587;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr5	137896879	.	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATTACCAAGGTTTTATGTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=137896887;WS=137896869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr5	137897589	rs256007	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=1.542;SC=TGCAAAACCAAAGGGAGGGTG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=137897597;WS=137897579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr5	137902868	rs71574426	GA	G	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.611;SC=AATGATTTGTGAAAAAAAAAA;SOR=0.551;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=137902876;WS=137902858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr5	137909674	rs41294566	GAGA	G	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.018;NF=3;NR=10;PP=436;ReadPosRankSum=-0.580;SC=AATAATTACAGAGAAGAATAA;SOR=1.880;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=13;WE=137909684;WS=137909664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr5	138117938	rs700626	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=470;ReadPosRankSum=-2.211;SC=TAACGGGTCCATGGTATGTAG;SOR=1.321;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=34;WE=138117946;WS=138117928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr5	138147943	rs11552054	A	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=893;ReadPosRankSum=-0.165;SC=ATAAAGCCCTAAAACCTGAAG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=52;WE=138147951;WS=138147933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
chr5	138148064	rs13154573	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=551;ReadPosRankSum=0.397;SC=ATTCTGTGTGTTTTCTGAAAG;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=34;WE=138148072;WS=138148054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr5	138216625	.	G	GA	96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=60.74;NF=9;NR=0;PP=96;QD=11.6666666667;SC=ATATGGCAAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=9;WE=138216633;WS=138216615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,9:0.38:24
chr5	138221989	rs288028	G	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=382;ReadPosRankSum=0.956;SC=CAGGTAATCTGGATGAAAGTG;SOR=0.696;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=28;WE=138221997;WS=138221979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr5	138266546	rs1059110	G	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=679;ReadPosRankSum=2.655;SC=AAAATACATCGGATGTCATCA;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=48;WE=138266554;WS=138266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,54:0.40:135
chr5	138356756	rs10077896	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	138356775	rs10077796	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATGTCAGTAGCAACAGGCACA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=138356783;WS=138356765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr5	138456994	rs11750382	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CTGGACACTCGCAATTCCTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=138457002;WS=138456984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	138473077	rs11431215	C	CA	3118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=35;PP=1904;SC=AGTTTGGCCCCAAAGCCATGC;SOR=0.714;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=45;WE=138473085;WS=138473067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	138642997	rs112107315	A	AT	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=2.260;SC=TGGCGTTACCATTTTTGAAGC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=138643005;WS=138642987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	138643062	rs12153162	T	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr5	138713959	rs6596474	A	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=16;PP=412;SC=GGGAGCGAGGAGAAGAGGGCC;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=138713967;WS=138713949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	138714482	.	C	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=817;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CTGCAGCTATCAGCTGTAGCA;SOR=1.550;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=85;TCF=21;TCR=64;TR=45;WE=138714490;WS=138714472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,58:0.57:102
chr5	138718476	rs11242461	T	C	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=224;SC=TCTCCCACTTTGCATTGCTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=138718484;WS=138718466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	138720108	rs11242462	C	T	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=33;PP=1919;SC=GCACCGCTCTCCAGCTGGGCA;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=138720116;WS=138720098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	138720336	rs6596476	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=466;SC=CCCCTGCAGATACGGCTCCAT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=138720344;WS=138720326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	138723112	rs138480317	C	CTCCA	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.92;NF=8;NR=1;PP=488;SC=GAACACTGCACTCCAGCCTGG;SOR=3.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=138723120;WS=138723102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	138724126	rs33937093	TG	T	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=739;SC=AGGAGGGAGGTGGGGGGCAGG;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=23;WE=138724134;WS=138724116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	138724457	rs9327846	A	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=215;SC=TGGGATGGGGATGGGGGATGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=138724465;WS=138724447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	138728483	rs10078623	A	G	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=40;PP=2166;SC=CTGGGCCTCTACATCCCTGTT;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=103;WE=138728491;WS=138728473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	138728533	rs10063870	C	T	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=55;PP=2423;SC=GCGAGGTTACCTCGGGCCGGC;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=122;WE=138728541;WS=138728523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	138730037	rs11748963	T	C	2938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=45;PP=1565;SC=CGCGGCGGCCTGCAGGGGGCC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=138730045;WS=138730027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	138730407	rs73255289	C	T	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1624;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CCGGAGCAGCCGAACAGGGGT;SOR=0.782;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=204;TCF=103;TCR=101;TR=104;WE=138730415;WS=138730397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,130:0.51:257
chr5	138754741	rs4835728	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=484;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GCACTGTGACTGAAGAGCTAA;SOR=0.614;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=39;WE=138754749;WS=138754731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr5	138773090	rs10900864	A	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=763;ReadPosRankSum=0.670;SC=GTTCCTCACTATACGTGGAGT;SOR=0.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=52;WE=138773098;WS=138773080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr5	138775173	rs3923059	T	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=619;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GCCTCCCCCGTGCCCGAGGCT;SOR=1.427;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=42;WE=138775181;WS=138775163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr5	138852369	rs13153461	G	A	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GCCAGATGGTGGCATCTACCT;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=65;WE=138852377;WS=138852359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr5	138856982	rs7380824	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=801;ReadPosRankSum=2.447;SC=CTCAAGTGTCCGGCAGAAGAG;SOR=0.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=54;WE=138856990;WS=138856972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,63:0.56:112
chr5	138857919	rs1131769	T	C	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.11;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	138857919	.	TGGTCAC	CGGTCAC,CGGTCAG	591	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=32,19;NR=24,13;PP=308,591;QD=6.12091450977;SC=GATGCCAGCATGGTCACCGGT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56,32;WE=138857933;WS=138857909;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:56
chr5	138857925	rs78233829	C	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr5	138861078	rs11554776	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=895;ReadPosRankSum=0.842;SC=GTGGATGTGGCGCAGCTCCTC;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=58;WE=138861086;WS=138861068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,62:0.45:138
chr5	138861146	rs7447927	C	G	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=959;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CTAGGTGGAGCACCAGGTACC;SOR=0.323;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=63;WE=138861154;WS=138861136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,68:0.42:161
chr5	139061148	rs57638253	CT	C	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=837;SC=GGGATGCCCCCTCCCAGTCCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=139061156;WS=139061138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	139201382	rs7701014	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=409;ReadPosRankSum=-2.563;SC=CTGGAGCCCTGGCCCCCTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=20;WE=139201390;WS=139201372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr5	139202400	rs35306338	A	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=45;PP=1270;SC=GGGGTGTCGCATGTCCTCTCA;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=139202408;WS=139202390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	139213452	rs4912884	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=23;PP=666;SC=TGTGCCTCGTAAAATCCTGGC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=139213460;WS=139213442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr5	139216901	rs11440487	A	AG	2415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=42;PP=2013;SC=GGCACCCCGAAGCCCCAGGCA;SOR=1.644;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=139216909;WS=139216891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	139239306	rs146239901	A	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=210;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TCTCCTGCTAAATCAACGTAG;SOR=0.078;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=139239314;WS=139239296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr5	139251469	rs1800953	T	G	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.013;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.048;SC=ACTGAGACTATCCCTAGGCCC;SOR=0.851;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=86;WE=139251477;WS=139251459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,95:0.48:198
chr5	139260377	.	G	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=467;ReadPosRankSum=-1.241;SC=CCAAGGGCTGGGGGGCCACTG;SOR=1.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=21;WE=139260385;WS=139260367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr5	139260428	rs889022	T	C	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=790;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TCCCTCTGTCTGGGCCCACCT;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=49;WE=139260436;WS=139260418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr5	139641896	rs6867870	C	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CATTTCTTTCCGAGTAAAAGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=139641904;WS=139641886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	139661279	rs6893253	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTAAACCTTCTTGGCTGAGAA;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=139661287;WS=139661269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	139722345	rs2074611	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=719;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTCTTTTCCCGTGCTCCTCCT;SOR=0.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=50;WE=139722353;WS=139722335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr5	139741370	rs717097	C	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=927;ReadPosRankSum=-2.460;SC=TGGTCTTAATCACTGCATAAT;SOR=0.642;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=60;WE=139741378;WS=139741360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,70:0.49:142
chr5	139745154	rs6860077	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=240;ReadPosRankSum=0.009;SC=GAGACGACATTGTAAGCATGG;SOR=0.659;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=24;WE=139745162;WS=139745144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr5	139912224	rs62384164	A	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=0.455;SC=ATGTTCTAAAATTGATGTGGT;SOR=2.049;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=13;WE=139912232;WS=139912215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr5	139921961	rs9324644	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.761;SC=TGCAAGAGAGGACCATCCTTA;SOR=0.124;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=139921969;WS=139921951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr5	139931628	rs3085220	A	AGT,AGTC	1337.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=1216;ReadPosRankSum=1.177;SC=ATCCTCCATCACAGCCTCAGA;SOR=0.863;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=16;WE=139931637;WS=139931618;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.33:108
chr5	139931629	.	C	G	1217	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=16;NR=11;PP=1217;QD=46.361896761;SC=TCCTCCATCACAGCCTCAGAC;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=27;WE=139931637;WS=139931618;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr5	139931629	rs5871740	C	CG	1337.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.441;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr5	139931776	rs60236323	AGG	A	1080.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=961;ReadPosRankSum=0.809;SC=GGGACTGAAAAGGTACAGCAG;SOR=0.451;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=15;WE=139931787;WS=139931766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr5	139931779	rs10589076	T	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=960;ReadPosRankSum=1.009;SC=ACTGAAAAGGTACAGCAGGAT;SOR=0.420;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=24;WE=139931787;WS=139931766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr5	139936680	rs143712554	ACCC	A	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=34.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-0.927;QD=7.22;ReadPosRankSum=3.735;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr5	139936760	rs250426	G	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=930;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GGGGTGCGGCGACCCTCTTGG;SOR=1.474;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=54;WE=139936768;WS=139936750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr5	139936980	rs250427	A	G	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=50;PP=1220;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CCGGGGCGACAACCTAGTGCC;SOR=0.780;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=80;WE=139936988;WS=139936970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,94:0.49:193
chr5	139937146	rs2249213	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.842;SC=ATCCGTGGAGGATGGATGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=139937154;WS=139937136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr5	139940233	rs250431	G	A	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1409;ReadPosRankSum=0.684;SC=CCTGAATGGGGTGTGCAGTCA;SOR=0.618;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=95;WE=139940241;WS=139940223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,120:0.55:220
chr5	139941228	rs250430	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=883;ReadPosRankSum=0.902;SC=ACATCACAGCAAAACACATGG;SOR=0.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=59;WE=139941236;WS=139941218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,65:0.44:148
chr5	139941318	rs171632	A	G	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.379;SC=CTGGGGTAGAAGCTGGTTAGA;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=66;WE=139941326;WS=139941308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,76:0.50:152
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chr5	140024042	rs753280	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=0.536;SC=TGAGAACATGTATGTAGAAGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=140024050;WS=140024032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	140024432	rs702399	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=0.392;SC=CCTGGCTAACCTATATAGGTT;SOR=1.885;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=140024440;WS=140024422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr5	140024491	rs702398	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=268;ReadPosRankSum=0.061;SC=CCTCTGGAGTAGGCTGACCCA;SOR=0.519;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=14;WE=140024499;WS=140024481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr5	140027216	rs778593	T	C	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=997;ReadPosRankSum=1.418;SC=GGCCAAGTGCTCCGGTCTGAC;SOR=1.040;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=54;WE=140027224;WS=140027206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr5	140027304	rs778594	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=420;ReadPosRankSum=-0.880;SC=GATATAAAAGTATTGTAGGAC;SOR=0.861;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=20;WE=140027312;WS=140027294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr5	140031537	rs1583005	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=0.907;SC=ACAAATATTGGTGTGGATTTC;SOR=2.814;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=19;WE=140031545;WS=140031527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr5	140035710	rs5871748	TC	T	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=134;ReadPosRankSum=0.414;SC=CTCAACTGAATCCATTCACTT;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=140035718;WS=140035700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	140037272	rs778596	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=323;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AGAGAGAGAAGCCTTACCCAC;SOR=0.914;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=30;WE=140037280;WS=140037262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr5	140041960	rs4801	T	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=-1.930;SC=TGCTCCCCACTGTTTTCTTTC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=140041968;WS=140041950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr5	140048209	rs2251860	T	C	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=960;ReadPosRankSum=1.134;SC=CCCCCATCAATAGTCTTCTGC;SOR=0.936;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=63;WE=140048217;WS=140048199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,76:0.43:178
chr5	140048267	rs2530245	T	C	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=2009;ReadPosRankSum=0.244;SC=AGGTGGTATCTGTCTCTGGGA;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=117;WE=140048275;WS=140048257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr5	140051983	rs2530243	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=147;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TATAAAGTGCCGGGCAGAACG;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=12;WE=140051991;WS=140051973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr5	140052271	rs2563333	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GCCGCAGCGGATGGTTGTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7;WE=140052279;WS=140052261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	140054485	rs2530241	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=504;ReadPosRankSum=0.673;SC=AAGCTGGCACCCTGTTCTTAG;SOR=0.831;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=29;WE=140054493;WS=140054475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr5	140057216	rs811382	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.124;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=336;ReadPosRankSum=0.165;SC=TCTGGGAAAAGAAGTCAAGTA;SOR=1.660;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=24;WE=140057224;WS=140057206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr5	140062547	rs2530239	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.299;SC=TTCTTGTCCCCCTTCTTATTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=140062555;WS=140062545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	140075011	rs112793807	C	CAGTTGATAT	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=1956;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GGATGAGATCCAGGCCCAGTC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=7;WE=140075019;WS=140075005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr5	140077699	rs2530234	A	G	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=49;PP=1356;SC=GGGACGAAGTATTTCTGCCTT;SOR=3.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=140077707;WS=140077689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	140080298	rs801168	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	140081791	rs809635	A	G	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=616;ReadPosRankSum=-0.108;SC=AGGAAGTGTTAAGGAAGGTCC;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=34;WE=140081799;WS=140081781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr5	140167463	rs3733710	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.229;NF=19;NR=15;PP=600;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GGAGCTGGAGCTGCTGCAGTT;SOR=0.245;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=34;WE=140167471;WS=140167453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr5	140168070	rs2240696	A	G	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=1132;ReadPosRankSum=0.563;SC=GAGGGTGCGTATGTGCCGGGC;SOR=0.835;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=64;WE=140168078;WS=140168060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,72:0.55:132
chr5	140168151	rs2240695	G	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=1080;ReadPosRankSum=-2.893;SC=CAGAGGGTGTGCTCTAGCGAG;SOR=0.591;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=69;WE=140168159;WS=140168141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr5	140174622	rs9686540	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=378;ReadPosRankSum=0.289;SC=CGCAGCCTGGGAGGTGGGGAG;SOR=1.291;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=27;WE=140174630;WS=140174612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr5	140174865	rs11167600	G	C	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=992;ReadPosRankSum=0.096;SC=TAGCATCCACGTGGAGGTGAT;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=64;WE=140174873;WS=140174855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,68:0.54:126
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chr5	140181648	rs3733709	T	C	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=37;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TCAGCAGATATTCTGTCAAAA;SOR=0.587;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=202;TCF=123;TCR=79;TR=93;WE=140181656;WS=140181638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,102:0.47:219
chr5	140181734	rs3733708	A	G	4181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=79;PP=2586;ReadPosRankSum=1.889;SC=GTCATATGAAATCCAGGTAGA;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=304;TCF=158;TCR=146;TR=161;WE=140181742;WS=140181724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,191:0.52:367
chr5	140181892	rs3733707	T	C	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.313;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.002;SC=CAGTCATCGCTCTGATCAGCG;SOR=0.363;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=137;TCF=41;TCR=96;TR=71;WE=140181900;WS=140181882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr5	140182101	rs7701755	G	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=-0.744;SC=GCCACGGCCAGCGTGTCCGTG;SOR=0.821;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=36;WE=140182109;WS=140182091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr5	140183058	rs2240694	G	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1279;ReadPosRankSum=-1.098;SC=CAGAGGGTGTGCTCTGGAGAG;SOR=0.734;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=82;WE=140183066;WS=140183048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,93:0.43:214
chr5	140186438	rs3756337	G	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=380;ReadPosRankSum=-1.174;SC=CAATCAATCAGTGGTACAATG;SOR=0.238;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=27;WE=140186446;WS=140186428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr5	140186657	rs4151680	A	G	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=1178;ReadPosRankSum=0.443;SC=GGAACCATATACACTCTTTGG;SOR=0.514;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=63;WE=140186665;WS=140186647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,67:0.54:124
chr5	140186937	rs11167605	G	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.634;NF=1;NR=4;PP=92;ReadPosRankSum=1.151;SC=TGGGACTGGAGCTGGCGGAGC;SOR=0.784;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=5;WE=140186945;WS=140186927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr5	140187048	rs3822349	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-7.122;NF=14;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=0.680;SC=GGATCGACCGGGAGGAGCTGT;SOR=2.934;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=15;WE=140187056;WS=140187038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr5	140187102	rs3822347	A	G	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.823;NF=30;NR=10;PP=698;ReadPosRankSum=-2.749;SC=AGGTGATCGTAGACAGGCCGC;SOR=1.116;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=40;WE=140187110;WS=140187092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr5	140187322	rs3822346	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=919;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GGAAAAACCACCTGATGACGA;SOR=1.231;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=58;WE=140187330;WS=140187312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,65:0.34:189
chr5	140188383	rs2337987	T	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.393;NF=20;NR=10;PP=443;ReadPosRankSum=0.120;SC=AGGTGACCGCTCGCGATGCCG;SOR=0.838;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=30;WE=140188391;WS=140188373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr5	140188401	rs2879086	A	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.398;NF=27;NR=14;PP=583;ReadPosRankSum=0.183;SC=CCGGCGTGCCACCTCTGGGCA;SOR=0.426;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=41;WE=140188409;WS=140188391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr5	140188575	rs2879087	G	C	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=763;ReadPosRankSum=-1.282;SC=ATGCTGACTCGGGCTACAACG;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=61;WE=140188583;WS=140188565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,68:0.41:166
chr5	140201264	rs4151682	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=369;ReadPosRankSum=1.581;SC=CTCAGAAAGGCGATAATATAA;SOR=0.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=25;WE=140201272;WS=140201254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr5	140201420	rs11958868	T	C	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1117;ReadPosRankSum=0.219;SC=GGCTTCTCCTTGCCTACTGGA;SOR=0.549;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=199;TCF=82;TCR=117;TR=88;WE=140201428;WS=140201410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,99:0.43:232
chr5	140203432	rs4141841	C	T	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1021;ReadPosRankSum=1.317;SC=CCCGAGGCTGCCCTGGTGGAT;SOR=0.491;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=151;TCF=55;TCR=96;TR=65;WE=140203440;WS=140203422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr5	140208438	rs677408	T	C	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.996;NF=41;NR=25;PP=861;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TATTCGAAAATGCAGACAACG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=99;TCR=60;TR=66;WE=140208446;WS=140208428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,74:0.42:175
chr5	140209467	rs7710794	T	G	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=59;PP=1706;ReadPosRankSum=0.630;SC=TGCGCGCAGTTGACGCCGACT;SOR=0.948;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=226;TCF=105;TCR=121;TR=103;WE=140209475;WS=140209457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,114:0.44:257
chr5	140214381	rs10067182	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.062;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.564;NF=24;NR=66;PP=1516;ReadPosRankSum=-3.772;SC=GCGACACAAAGGAATCTGTTC;SOR=1.649;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=224;TCF=93;TCR=131;TR=90;WE=140214389;WS=140214371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,92:0.37:247
chr5	140222157	rs3733705	A	C	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.856;NF=14;NR=50;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.940;SC=ACCGCGAGAGAGTGTCGGCCT;SOR=1.474;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=128;TCF=37;TCR=91;TR=64;WE=140222165;WS=140222147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr5	140222641	rs6580012	A	G	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1079;ReadPosRankSum=1.276;SC=CGCAGCGAGCAAGCTGGTGCC;SOR=0.885;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=75;WE=140222649;WS=140222631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,88:0.51:172
chr5	140228164	rs251353	C	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=56;PP=1785;SC=TGGTGGGGAGCGGCCAGCTCC;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=78;WE=140228172;WS=140228154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	140228410	rs17844322	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQRankSum=-8.970;QD=5.41;ReadPosRankSum=-2.600;SOR=0.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,24:0.18:132
chr5	140228413	rs17844323	C	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQRankSum=-9.125;QD=5.41;ReadPosRankSum=-3.169;SOR=0.431;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,26:0.20:132
chr5	140229086	rs251354	C	G	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=25;PP=1764;SC=TCATTGTACACTTCTTGTGGA;SOR=1.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=140229094;WS=140229076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	140230370	rs369636	AA	CC	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=62;PP=2947;SC=TGGCGAGGGTAAGCAGAAGAC;SOR=0.930;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=109;WE=140230379;WS=140230360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	140237387	rs251364	T	G	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=71;PP=2965;SC=CGGTCGGTGGTTGCGGGTCAC;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=148;WE=140237395;WS=140237377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	140237548	rs630162	A	G	10703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=149;PP=2965;SC=TCTGGATGAGACTGACTCGCC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=177;TCR=149;TR=326;WE=140237556;WS=140237538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr5	140242451	rs11321479	GC	G	2505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=1993;SC=ATGTGACGCTGCCAGGTATTA;SOR=1.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=46;WE=140242459;WS=140242441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	140242479	rs251369	T	A	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1806;SC=AACGACAACTTTGTCTGCGCT;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=140242487;WS=140242469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	140248539	rs192231	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=309;SC=GTGAGGCACTCCCATACAAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=140248547;WS=140248529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	140255792	rs251377	C	A	7304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=100;PP=2965;SC=TTGATAAGCCCAGCTATAAAG;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=112;TCR=100;TR=212;WE=140255800;WS=140255782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr5	140263290	rs251380	T	G	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=52;PP=1809;SC=CGGTGTCTGCTCAGGACGCGG;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=89;WE=140263298;WS=140263280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	140346590	.	A	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=652;ReadPosRankSum=2.320;SC=TTGCGCATCAACCATCTGGGT;SOR=0.834;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=39;WE=140346598;WS=140346580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr5	140431878	rs149445112	A	C	3993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=72;PP=2411;ReadPosRankSum=0.457;SC=GGGCACCAACAAAGCGATAAC;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=304;TCF=167;TCR=137;TR=151;WE=140431886;WS=140431868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,180:0.51:351
chr5	140517174	rs400562	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=8;PP=518;SC=CAGGGCGGCCTCGGTCGGTCG;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=140517182;WS=140517164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	140559914	rs2740583	T	C	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=42;PP=1414;SC=TGAGTTCCAGTTCCTGAAACC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=140559922;WS=140559904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	140561983	rs2204704	A	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=501;SC=CCTGGAAGCAAAAGAATAGCT;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=140561991;WS=140561980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	140566952	rs998793	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.422;NF=5;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TTTTTCTTTTCTGGGGAGTGT;SOR=0.916;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=14;WE=140566960;WS=140566942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr5	140567608	rs11167743	C	T	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=64;PP=2965;SC=AATGACAATGCCCCACAGTTT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=149;WE=140567616;WS=140567598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	140568034	rs33974901	C	CA	7670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=98;PP=2957;SC=AATGGAAAGACATTTGCTATG;SOR=0.814;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=36;TCR=101;TR=134;WE=140568042;WS=140568024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	140682757	rs3749780	C	T	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.023;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=25;PP=1445;ReadPosRankSum=-2.465;SC=GGGAACACGACAAGCCACAGG;SOR=0.994;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=179;TCF=121;TCR=58;TR=90;WE=140682765;WS=140682747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,112:0.51:219
chr5	140683265	rs11952797	G	A	3997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=98;PP=2793;ReadPosRankSum=-0.928;SC=GACCCACTTGGGCGTATGTCT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=362;TCF=152;TCR=210;TR=172;WE=140683273;WS=140683255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,187:0.47:402
chr5	140699540	.	A	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=584;ReadPosRankSum=-1.429;SC=CAGTAGAGGCATATTCTGGAG;SOR=0.207;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=42;WE=140699548;WS=140699530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr5	140710705	rs2472647	G	A	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=36;PP=1435;SC=AGGTACCAGAGTCTCATTGCC;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=140710713;WS=140710695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	140719090	rs6861047	G	A	5085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.422;SC=ACGTGCGAAGGGGAGCTGATG;SOR=0.791;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=393;TCF=200;TCR=193;TR=199;WE=140719098;WS=140719080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,235:0.51:462
chr5	140725828	rs7736541	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.133;NF=31;NR=21;PP=871;ReadPosRankSum=1.630;SC=TTTGTGGGCGCGGACGGGGTT;SOR=0.948;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=52;WE=140725836;WS=140725818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr5	140750044	rs6860609	T	C	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=52;PP=2392;SC=TTAGACCAGGTTCTCTCCGAA;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=115;WE=140750052;WS=140750034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	140751128	rs2240697	C	G	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1690;ReadPosRankSum=-0.753;SC=TAAAAGGAAACTTCCCCTTTA;SOR=0.698;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=207;TCF=104;TCR=103;TR=105;WE=140751136;WS=140751118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,115:0.50:230
chr5	140755698	rs200974904	A	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQRankSum=1.223;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr5	140763029	rs2072315	A	G	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1638;ReadPosRankSum=1.760;SC=GGAGACGATGAAACTAAGTAC;SOR=0.743;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=209;TCF=102;TCR=107;TR=98;WE=140763037;WS=140763019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,110:0.45:243
chr5	140772427	rs726684	T	G	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=1659;ReadPosRankSum=1.379;SC=CTGATCCTGCTGTGCGCGCTG;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=102;TCR=104;TR=114;WE=140772435;WS=140772417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,128:0.55:232
chr5	140774288	rs4912749	T	C	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=18;PP=2965;SC=TGGACAGAGATGCGCTCAAGC;SOR=4.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=110;TCR=18;TR=128;WE=140774296;WS=140774287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	140783596	rs1363448	C	T	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=68;PP=1813;ReadPosRankSum=1.549;SC=TGAGAGAAGACGCACCTCAGG;SOR=0.905;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=249;TCF=112;TCR=137;TR=119;WE=140783604;WS=140783586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,133:0.47:286
chr5	140793007	rs4912751	A	G	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1183;ReadPosRankSum=3.641;SC=CGGCAGCTTGATCACCGCGGG;SOR=0.496;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=84;WE=140793015;WS=140792997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,111:0.52:213
chr5	140795128	rs11575963	T	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=660;ReadPosRankSum=0.562;SC=CGATCCTTTGTCTTTGTTAGA;SOR=0.460;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=42;WE=140795136;WS=140795118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr5	140797630	rs2015825	G	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;ReadPosRankSum=0.232;SC=AGCTGCGAGTGAGCGCGGAGA;SOR=0.765;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=43;WE=140797638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr5	140798639	rs17208397	G	C	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1787;ReadPosRankSum=0.403;SC=CTACAAGCTAGTAACAGATGA;SOR=0.699;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=188;TCF=93;TCR=95;TR=93;WE=140798647;WS=140798629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,118:0.51:230
chr5	140856265	rs2075661	G	C	4734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=117;PP=2708;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CCAAGTACGCGGAGCTGGTGT;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=398;TCF=166;TCR=232;TR=205;WE=140856273;WS=140856255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,230:0.51:451
chr5	140857798	rs1423148	T	C	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1325;ReadPosRankSum=0.604;SC=CTGTGGGGTTTGTGGTCACAG;SOR=0.466;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=84;WE=140857806;WS=140857788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,92:0.56:163
chr5	140868658	rs148910315	T	TAAG	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	140869003	rs1002519	T	C	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=31;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GCGGCTGCAATTGGGCTCTGA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=107;TCR=58;TR=88;WE=140869011;WS=140868993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,99:0.52:189
chr5	140870516	rs2074912	A	G	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1378;ReadPosRankSum=1.500;SC=CCACGGCCAGACTGGGAACAC;SOR=0.617;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=86;WE=140870524;WS=140870506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,100:0.52:193
chr5	140870949	rs918558	G	T	3019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=1719;ReadPosRankSum=0.455;SC=TTCTGTCAGCGAAGTGCCTTC;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=223;TCF=98;TCR=125;TR=112;WE=140870957;WS=140870939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,140:0.52:269
chr5	140871425	rs17208425	A	G	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1199;ReadPosRankSum=-1.325;SC=CGTTTGCGCGAAACCAGAGTG;SOR=0.461;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=181;TCF=73;TCR=108;TR=79;WE=140871433;WS=140871409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr5	140871538	rs62379205	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GGCCGGGGCCTCCTTCGAGCT;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=140871546;WS=140871528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr5	140898604	rs6878257	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=614;ReadPosRankSum=0.637;SC=CTGACTGACAGCCACAGGACT;SOR=0.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=45;WE=140898612;WS=140898594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr5	140915703	rs79832875	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.746;SC=CCTGTCTCTATAAAAAAAGTT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=140915711;WS=140915693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	140955777	rs2302103	C	T	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1922;SC=AAACACATGTCTTTGGTCTCT;SOR=1.104;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=140955785;WS=140955767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	140998351	rs2074913	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=825;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GAGCGGGATGGGAGGGACACT;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=61;WE=140998359;WS=140998341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr5	141005687	rs2547547	A	G	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.750;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=714;ReadPosRankSum=0.837;SC=GGGCTGAAGGACCCATGTGGC;SOR=1.025;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=52;WE=141005695;WS=141005677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
chr5	141009719	rs148704546	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CAAGTTGGAACCCTCCTGCCT;SOR=0.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=10;WE=141009727;WS=141009709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr5	141014494	rs2530223	T	C	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=33;PP=1035;SC=ACATGTCATGTTGGGAGGCCT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=141014502;WS=141014484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	141016276	rs32954	T	C	15175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=142;PP=2965;SC=GTGTCCCAACTCCTCATGCAT;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=135;TCR=142;TR=277;WE=141016296;WS=141016266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr5	141016288	rs1421896	T	G	15073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=148;PP=2965;SC=CTCATGCATATCCCTGTTTCC;SOR=0.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=127;TCR=148;TR=275;WE=141016296;WS=141016266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr5	141019110	rs14251	C	A	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=35;PP=1052;SC=AGCCCCTTGCCTCCATTGCAG;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=141019118;WS=141019100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	141019569	rs17855844	G	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=241;ReadPosRankSum=0.610;SC=CTGGGGCTCTGGTGGGGGACA;SOR=0.861;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=19;WE=141019577;WS=141019559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr5	141019830	rs11742646	C	G	2609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1667;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGCAAATGGGCAGCCAAGCAA;SOR=0.720;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=222;TCF=112;TCR=110;TR=111;WE=141019838;WS=141019820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,125:0.49:254
chr5	141019881	rs32956	G	C	2882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;PP=1710;ReadPosRankSum=-1.093;SC=ACACAGCCGGGACTGCACTGG;SOR=0.571;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=104;WE=141019889;WS=141019871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,128:0.53:243
chr5	141020100	rs41098	C	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.427;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=433;ReadPosRankSum=0.439;SC=CTGAACCCCCCGAGTAAACTG;SOR=1.432;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=24;WE=141020108;WS=141020090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr5	141021096	rs32957	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=275;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GCCAGGATCCGGGGCTTTAGC;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=16;WE=141021104;WS=141021086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr5	141022113	rs111256073	AAG	A	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=1400;ReadPosRankSum=-1.822;SC=ACATTTAAAAAAGAAAAAAAG;SOR=1.038;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=40;WE=141022122;WS=141022102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr5	141022544	rs702380	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=152;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TAGCCTCCCAAGGCTCCCAGT;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=12;WE=141022552;WS=141022534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr5	141022848	rs702379	T	C	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=3;PP=37;SC=ATGTTTACTATGTCTCAAGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=141022856;WS=141022838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	141024048	rs469522	A	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.929;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=964;ReadPosRankSum=0.104;SC=GGTGGGTAGCAGTGCCCCAGG;SOR=0.736;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=69;WE=141024056;WS=141024038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr5	141024136	rs469074	T	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=619;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TTTCCCTTTCTTACCTGTGGG;SOR=0.450;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=46;WE=141024144;WS=141024126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr5	141025162	rs456998	G	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TAATAAAAATGTACTGAGGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=141025170;WS=141025155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	141025767	rs74910284	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr5	141025929	rs7711960	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=194;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AAGTCCAGAGAGGTTAAGTCA;SOR=0.352;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=14;WE=141025937;WS=141025919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	141026884	rs251177	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=-1.340;SC=AAAAGGACAATGTGTGAAGCA;SOR=1.479;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=12;WE=141026892;WS=141026874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr5	141027399	rs468968	T	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.36;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	141027399	.	TG	CC,CG	250	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10,20;NR=3,4;PP=250,159;QD=23.3436826817;SC=AGAACCAGAGTGCATGTATGT;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=13,24;WE=141027408;WS=141027389;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.54:24
chr5	141027400	rs468222	G	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr5	141027462	rs3763121	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=633;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CACTGTCATGGGGATCAAGAA;SOR=0.999;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=33;WE=141027470;WS=141027452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr5	141030453	rs67641160	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGGCCAGGCCTAGGGTGAGG;SOR=0.317;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=14;WE=141030461;WS=141030443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr5	141030846	rs73285828	G	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,89:0.57:155
chr5	141034123	rs6580194	T	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=355;SC=CATGTATGATTCTGGAACAAC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=141034131;WS=141034113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	141035174	rs79464052	G	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=351;ReadPosRankSum=0.352;SC=TTGGGGCAGGGTGGGGTGCCT;SOR=0.184;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=19;WE=141035182;WS=141035164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr5	141035248	rs2306340	A	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=755;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TAGGCAGCAAAGGCATAGTGC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=45;WE=141035256;WS=141035238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr5	141035374	rs7715559	G	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=840;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AAGGCACTGAGGAGGACAGCT;SOR=1.281;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=52;WE=141035382;WS=141035364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr5	141035955	rs2306339	G	A	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=893;ReadPosRankSum=-0.651;SC=AGAAGTCGGGGGCAGGGAAGC;SOR=0.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=49;WE=141035963;WS=141035945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr5	141036337	rs7703648	A	G	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=947;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AGAGCAGGGAAGCTGAGCAGG;SOR=0.421;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=59;WE=141036345;WS=141036327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr5	141041148	rs6891143	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=474;ReadPosRankSum=1.279;SC=CTTAACAACTGTTTGTGGAAT;SOR=1.402;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=22;WE=141041156;WS=141041138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr5	141041435	rs3749759	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=440;SC=GGATTTTTAGGCACAAATGCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=141041443;WS=141041425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	141044472	rs2306337	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=179;ReadPosRankSum=-1.195;SC=GCTCAGTACCAGCCAGTGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=13;WE=141044480;WS=141044462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr5	141049407	rs3763120	G	A	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=56;PP=2666;SC=CAGGGAGGAGGATGGGACCAA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=121;WE=141049415;WS=141049397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	141049656	rs73285857	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=1.007;SC=ATAGTCAGGGAGCAGCAGACC;SOR=0.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=23;WE=141049664;WS=141049646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr5	141052416	rs1057371	G	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=493;ReadPosRankSum=2.367;SC=GGGGTGGTTGGGGGGGCCGGG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=30;WE=141052424;WS=141052406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr5	141052870	rs440279	G	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.62;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	141052870	.	GCCCACACACACA	CCCCACAAACAAT,CCCCACACACACA	960	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=7;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6,16;NR=4,8;PP=638,960;QD=71.1467874862;SC=TCACTGCCCCGCCCACACACA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=10,24;WE=141052890;WS=141052860;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:26
chr5	141052877	rs181774350	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr5	141052881	.	CA	AT	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr5	141059649	rs417503	A	G	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=98;PP=2965;SC=GGAGAGGAGGAGGCCTTGGGC;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=182;WE=141059657;WS=141059639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr5	141059868	rs11167756	T	C	6146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=94;PP=2965;SC=TGCCTGTCTGTAGCAGGCGTA;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=178;WE=141059876;WS=141059858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	141243646	rs3797054	A	G	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AGATCAGCTCAGCATTGACAC;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=81;WE=141243654;WS=141243636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,85:0.52:165
chr5	141248963	rs12515587	T	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=525;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GTGCCTCAGGTGCTCCATCCT;SOR=0.429;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=32;WE=141248971;WS=141248953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr5	141249022	rs115194019	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=860;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GCAAAACAGAGGCCATGAGCT;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=86;TCR=59;TR=63;WE=141249030;WS=141249012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr5	141304314	rs6580206	T	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=0.873;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.515;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr5	141309824	rs351260	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=343;ReadPosRankSum=1.511;SC=TGTTTCCATCGCTTTCAACTT;SOR=0.859;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=24;WE=141309832;WS=141309814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr5	141324955	rs5871792	C	CCTGCTGCTG	3537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.549;NF=12;NR=26;PP=2984;ReadPosRankSum=0.862;SC=TTCACAGGCACCTGCTGCTGC;SOR=0.549;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=38;WE=141324963;WS=141324945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,88:0.49:180
chr5	141325249	rs105633	T	C	4864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=96;PP=2910;SC=GGAAGGTCCTTGGCTCCTCCG;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=61;TCR=96;TR=157;WE=141325257;WS=141325239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	141331023	.	C	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=370;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CCAGTAGGGGCCTTGAGATGC;SOR=1.402;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=19;WE=141331031;WS=141331013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr5	141335241	rs164073	A	G	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=47;PP=1524;ReadPosRankSum=1.909;SC=AAGATGCCCAACAGTACAGCC;SOR=0.489;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=100;WE=141335249;WS=141335231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,119:0.44:268
chr5	141335284	rs164074	G	A	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.709;SC=ACATGCTCAAGGCCCCAGGCT;SOR=0.568;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=103;WE=141335292;WS=141335274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,119:0.44:271
chr5	141335498	rs164515	C	T	4050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=86;PP=2364;ReadPosRankSum=1.134;SC=TTCATTTCCACTGCGGATGCT;SOR=0.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=307;TCF=149;TCR=158;TR=157;WE=141335506;WS=141335488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,187:0.52:359
chr5	141335674	rs116711399	C	G	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1444;ReadPosRankSum=0.857;SC=TGGAGGCATTCACAAGCACGG;SOR=1.018;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=79;WE=141335682;WS=141335664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,97:0.50:194
chr5	141336264	rs164075	G	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=818;ReadPosRankSum=-2.189;SC=AAACCATTGTGTCCTGAATCC;SOR=0.451;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=53;WE=141336272;WS=141336254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr5	141337126	rs164076	C	T	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=78;PP=2035;ReadPosRankSum=0.273;SC=ACTGTCGGCACAGCTGCTCTC;SOR=0.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=279;TCF=120;TCR=159;TR=138;WE=141337134;WS=141337116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,162:0.51:319
chr5	141337225	rs164077	A	G	5614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=106;PP=2965;SC=CCTGGAAGGCAGCCCCAGCTT;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=77;TCR=106;TR=183;WE=141337233;WS=141337215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	141357719	rs66768569	TTGTA	T	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=653;SC=TTGTACTGTTTTGTATGTAGC;SOR=3.767;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=141357730;WS=141357709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	141364511	rs252099	A	G	7444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=117;PP=2965;SC=ATGTATACACAGAATTCCTCA;SOR=0.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=225;TCF=107;TCR=118;TR=224;WE=141364519;WS=141364501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr5	141364637	rs252100	C	T	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=46;PP=1271;SC=AAGGAATTTTCATATTATTTT;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=54;WE=141364645;WS=141364627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	141367202	rs374840	GA	TT	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=572;ReadPosRankSum=0.140;SC=GATGTACAAAGATGTTATAAG;SOR=0.969;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=18;WE=141367211;WS=141367192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr5	141371607	rs145472390	G	A	91.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=-0.431;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
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chr5	141387336	rs2232196	G	C	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=704;ReadPosRankSum=0.442;SC=CTAGAATCAGGAAAGAACCTT;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=46;WE=141387344;WS=141387326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr5	141387520	rs2232195	A	G	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=451;SC=CTGGAAGCCCAGAGGGTTCAC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=141387528;WS=141387510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	141533062	rs449454	A	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=813;ReadPosRankSum=-1.857;SC=TGACATTTCAATGATCCCTCT;SOR=0.843;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=53;WE=141533070;WS=141533052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr5	141975067	rs34003	A	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=0.099;SC=GATAAAACCAAAAGAGAGTAG;SOR=0.705;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=20;WE=141975075;WS=141975057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,27:0.32:85
chr5	141980820	rs34009	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CTGCACAGGGGTGCCTTTTAA;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=141980828;WS=141980810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	142254679	rs185200	A	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=7;PP=789;SC=TTCCAGCAAGATCTTTGCAGG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=142254687;WS=142254669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	142259083	rs27779	C	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=50;PP=1558;SC=TTCTTTAAAACAAAGTCTTCA;SOR=1.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=142259091;WS=142259073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	142287159	rs36220244	AAGGGT	A	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AACATAGTTTAAGGGTAGGGT;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=2;WE=142287171;WS=142287149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr5	142311442	rs712176	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=863;SC=AATTTGGGCCATCCTTTCTGA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=142311450;WS=142311432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	142311509	rs712177	T	C	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=41;PP=2083;SC=GTTGTTAACCTTAGCAGCCAC;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=142311517;WS=142311499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	142393562	rs3822397	G	A	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=944;ReadPosRankSum=-1.119;SC=ACTAGGGAAAGTGAGGAAGAT;SOR=0.785;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=56;WE=142393570;WS=142393552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,58:0.40:144
chr5	142416741	rs192194	T	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=785;ReadPosRankSum=-1.033;SC=AACTTGACTGTCCTTCTCTTG;SOR=0.493;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=77;TCR=34;TR=46;WE=142416749;WS=142416731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr5	142421415	rs2270068	T	G	6196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=103;PP=2965;SC=GAATTGTGGGTGTCAACTCCA;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=93;TCR=103;TR=196;WE=142421423;WS=142421405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr5	142435569	rs77988459	C	T	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=784;ReadPosRankSum=-0.388;SC=ATTAAGCTGACTAGCCTATCT;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=54;WE=142435577;WS=142435559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr5	142435748	rs6580266	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.917;NF=3;NR=10;PP=227;ReadPosRankSum=2.532;SC=CTAACCCTTCGTATTCTGCAC;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=13;WE=142435756;WS=142435738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr5	142593652	rs258819	C	T	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=928;SC=TCTTCGATAACGGTGAGTTTC;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=142593660;WS=142593642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	142601811	.	TACACAC	TAC,T	134	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=58.31;NF=5,5;NR=1,1;PP=134,59;QD=22.8333333333;SC=GCTTCCTTCATACACACACAC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6,6;WE=142601824;WS=142601801;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.67:9
chr5	142661490	rs6196	A	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=379;ReadPosRankSum=-2.733;SC=TGATATTTCCATTTGAATATT;SOR=0.182;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=31;WE=142661498;WS=142661480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr5	142671092	rs150299999	A	ATTACTTTTCTTTAGCCTAAG	939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=7.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.586;SOR=1.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr5	142680344	rs6188	C	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=220;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGTATTTAAACAAATACATAG;SOR=0.914;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=142680352;WS=142680334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	143059433	rs2042253	T	C	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=893;ReadPosRankSum=1.008;SC=TGTATGGGATTCCACAGACAA;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=52;WE=143059441;WS=143059423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr5	145144419	rs338887	G	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=714;ReadPosRankSum=-1.389;SC=CAGGGAGGCTGCTGTAGAATA;SOR=0.886;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=45;WE=145144427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr5	145176221	rs338898	C	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=505;SC=AAAATAATATCCTTAATAATT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=145176229;WS=145176211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	145197411	rs6870210	C	T	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.835;NF=47;NR=26;PP=1134;ReadPosRankSum=-1.525;SC=ACTCATGTGTCCATCCCTGCA;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=172;TCF=106;TCR=66;TR=73;WE=145197419;WS=145197401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,92:0.42:221
chr5	145198805	rs624380	T	C	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=17;PP=1164;SC=GAATCTCTCTTGGGTTGAAAC;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=145198813;WS=145198795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	145199430	rs11293460	AG	A	1444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.28;NF=31;NR=4;PP=1501;SC=CCTTTACATCAGAAAATGCTG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=35;WE=145199438;WS=145199420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	145202461	rs6898776	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.62;ReadPosRankSum=-1.776;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr5	145439647	rs2962525	T	C	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=81;PP=2818;SC=CAGTGAGGCCTGGATCCACTC;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=173;WE=145439655;WS=145439637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	145442203	rs1056149	G	C	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=66;PP=2292;SC=TCAGCTCTTGGCAAGGCCACA;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=145442211;WS=145442193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	145477657	rs72820451	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=413;ReadPosRankSum=-0.138;SC=AGGTTTTCCACTCACTGATGT;SOR=0.704;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=30;WE=145477665;WS=145477647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr5	145478009	rs6892928	C	T	224.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TCCCTCCTCCCCCTCCATCAT;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=10;WE=145478017;WS=145477999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr5	145483679	rs12188066	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTCCCTGGTTCCTTATAAG;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=145483687;WS=145483669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	145500101	rs17104250	G	C	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1036;ReadPosRankSum=0.737;SC=TGTTTAACTTGAATACTGCTG;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=64;WE=145500109;WS=145500091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr5	145506100	rs11540216	G	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=577;ReadPosRankSum=-0.899;SC=GCAGTTTTCCGTTATTGGCCT;SOR=1.516;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=33;WE=145506108;WS=145506090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr5	145509728	rs17104268	A	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=712;ReadPosRankSum=0.614;SC=CGGCCTATAAAATTTGAAATT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=46;WE=145509736;WS=145509718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr5	145515379	rs2963919	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.751;SC=AATTTTAGAGCGGTGAAAACT;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=145515387;WS=145515369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr5	145522912	rs2962504	A	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=31;PP=1713;SC=ATTTAAATACATAAATCAAAT;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=91;WE=145522934;WS=145522902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	145522926	rs17104276	A	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=871;ReadPosRankSum=0.447;SC=ATCAAATATCACAACTCTTAC;SOR=0.436;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=50;WE=145522934;WS=145522902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr5	145532646	rs190538173	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-1.073;SC=ATACTCCACCAATTAATTTTG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=14;WE=145532654;WS=145532636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr5	145532859	rs17500483	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=-2.735;SC=AGAGAAGCAATCTCCAAAGTT;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=19;WE=145532867;WS=145532849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr5	145533232	rs150034157	G	GTTCA	1698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=1053;ReadPosRankSum=3.140;SC=CCACAGCGTAGTTCAGCAGCA;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=23;WE=145533240;WS=145533222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr5	145543820	rs140904487	T	TAAAAAAGCACATAC	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.949;NF=3;NR=1;PP=641;ReadPosRankSum=0.230;SC=CAAAGCACAATAAAAAAGCAC;SOR=0.136;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=145543828;WS=145543810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr5	145547839	rs72822293	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=607;ReadPosRankSum=0.057;SC=CTACAACGAATATTAGAGATA;SOR=0.988;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=34;WE=145547847;WS=145547829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr5	145557398	.	C	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.224;SC=CGCGGTGGCTCATGCGTGTAA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=145557406;WS=145557388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr5	145559279	.	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=1.207;SC=CTTCCCATCTCAGCCTCCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=145559287;WS=145559269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	145602934	rs17104322	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TTTTTGTTTGCGCAATATGTA;SOR=0.559;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=14;WE=145602942;WS=145602924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr5	145609540	rs72806103	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=23;ReadPosRankSum=0.498;SC=AGGGGTGCAAGAAATTCTCTT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=4;WE=145609548;WS=145609530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr5	145643048	rs7729098	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=546;ReadPosRankSum=-2.116;SC=CATTTTGTATGTGCAGATGAT;SOR=0.441;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=37;WE=145643056;WS=145643038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr5	145650597	rs17104362	A	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=950;ReadPosRankSum=0.240;SC=AATTACGGAAAAAACTCAGTC;SOR=0.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=69;TCR=77;TR=63;WE=145650605;WS=145650587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr5	145650932	rs4631229	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-0.674;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	145665354	.	C	CTT	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9748;HP=14;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=18;MQ=57.99;NF=4;NR=0;PP=62;QD=16.5;SC=ATATTTTGGGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=145665362;WS=145665344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	145718765	rs28994879	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=994;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GCTCCGAGGCCATGCGCCGAG;SOR=1.176;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=132;TCF=56;TCR=76;TR=62;WE=145718773;WS=145718755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,72:0.46:156
chr5	145838440	rs11743333	G	A	7126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=85;PP=2965;SC=TTTTGCTTCCGCTGCAGGTTT;SOR=1.326;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=152;TCR=85;TR=237;WE=145838448;WS=145838430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr5	145850459	rs11463725	G	GT	176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=107;SC=TCTTAATTCAGTTTTTTCTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=145850467;WS=145850449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	145890028	rs4705103	A	G	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=20;PP=1462;SC=TCCAAGAATCAGATCAGCACC;SOR=1.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=80;WE=145890036;WS=145890018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	146030055	rs6866598	C	T	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=32;PP=2152;ReadPosRankSum=1.134;SC=AGCCCACTCGCACCTGAATAC;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=96;WE=146030063;WS=146030045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr5	146434047	rs5872003	TA	T	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=9;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=701;ReadPosRankSum=1.130;SC=TGTCCAACTGTAAAAAAAAAG;SOR=0.170;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=146434068;WS=146434037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr5	146434060	rs2400241	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=680;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AAAAAAAGTCCATGAGATATC;SOR=0.291;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=24;WE=146434068;WS=146434037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr5	146434146	rs720305	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=790;ReadPosRankSum=-3.571;SC=CCTGAAGGTACGGATAAAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=54;WE=146434154;WS=146434136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr5	146435163	rs11958187	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=411;SC=AGCAGAACCCGTGGGAAGTCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=146435171;WS=146435153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	146619206	rs4705132	G	C	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=936;ReadPosRankSum=-0.289;SC=CCATGGGAGCGAACACTTCAA;SOR=0.690;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=54;WE=146619214;WS=146619196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr5	146658874	rs35852718	A	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=578;ReadPosRankSum=2.151;SC=AATAAACAAAAGTGCGTGGAG;SOR=0.493;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=41;WE=146658882;WS=146658864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr5	146722890	rs6884181	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=0.369;SC=CACAACTTTTCAGTGTTAGCT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=146722898;WS=146722880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr5	146728147	rs62377744	T	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.782;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr5	146728147	.	TAC	CAG	268	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=16;NR=4;PP=268;QD=16.0733937431;SC=TACATGAGCATACATAATCTT;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=20;WE=146728157;WS=146728137;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,20:0.45:44
chr5	146728149	rs10072514	C	G	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.76;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	146753004	rs4235731	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=75;ReadPosRankSum=1.612;SC=AATTGAGACATGCACAGGGTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=146753012;WS=146752994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr5	146775377	rs2288807	G	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=205;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TACAGTGTGTGGTGGGAGCTA;SOR=1.457;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=17;WE=146775385;WS=146775367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr5	146777188	rs2304045	A	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=462;ReadPosRankSum=-0.480;SC=TGAGTGGAACACAAAGCTCCT;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=34;WE=146777196;WS=146777178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr5	146777447	rs74828553	A	ATAGAAAGAG	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.792;NF=1;NR=3;PP=1060;ReadPosRankSum=1.465;SC=CAGTAAGGGTAGAGAAAGAGG;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=146777455;WS=146777437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	146778867	rs17550470	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=-2.209;SC=TATATATCAATTCAGGGCTTC;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=10;WE=146778875;WS=146778857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr5	146780273	rs10515587	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=534;ReadPosRankSum=1.293;SC=TGTCCCAGATGACAGACATCC;SOR=1.220;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=39;WE=146780281;WS=146780263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,46:0.38:122
chr5	146781440	rs3816013	A	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-1.111;SC=AAATGTGACCAAGTTTGTATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=146781448;WS=146781430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	146971253	rs7449194	C	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=44;PP=1235;SC=GGTTACTCTGCAAAACAGAGG;SOR=1.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=146971261;WS=146971243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	146971279	rs77301397	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr5	146981164	rs111740872	TCAAAACAAAACAAAA	T	189.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=2;PP=827;SC=AGACTCTGTCTCAAAACAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=3;WE=146981186;WS=146981162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	146997720	rs34116637	TTGATATCTGGTGTGGGAG	T	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.455;NF=0;NR=8;PP=2791;ReadPosRankSum=1.220;SC=GAACTTGGCATTGATATCTGG;SOR=0.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=146997745;WS=146997710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr5	147003436	rs56384964	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.228;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-0.841;SC=ATCTCGCTCCGTTGCCCAGGC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=8;WE=147003444;WS=147003426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr5	147012186	rs3763093	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=491;ReadPosRankSum=-1.021;SC=CCTCAATGTGCTCTGTGCATG;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=29;WE=147012194;WS=147012176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr5	147012291	rs3763094	G	A	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1108;ReadPosRankSum=1.260;SC=GGTCTCTGGCGTCCTGTAGTT;SOR=0.545;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=74;WE=147012299;WS=147012281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,87:0.49:178
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chr5	147019335	rs79801275	GA	G	995.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.204;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=659;ReadPosRankSum=1.180;SC=TTGAGGTTAAGAAAAAAAGCC;SOR=1.094;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=30;WE=147019343;WS=147019325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
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chr5	147020443	rs1529685	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=0.599;SC=GAAAGTTGAACGTTAAAATAC;SOR=0.593;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=6;WE=147020451;WS=147020433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr5	147021086	rs3765006	T	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=312;ReadPosRankSum=0.807;SC=ATTTACAACATAATCATTTTT;SOR=1.264;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=18;WE=147021094;WS=147021076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr5	147024509	rs2116765	C	T	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1574;ReadPosRankSum=2.007;SC=GGCACTTGTTCCTTTCCAGGA;SOR=0.426;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=97;WE=147024531;WS=147024499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,113:0.57:197
chr5	147162133	rs79156986	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=0.589;SC=TGGCTGCCGGTTTTTTTTTTC;SOR=0.162;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=10;WE=147162141;WS=147162123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr5	147204192	rs11319	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=898;ReadPosRankSum=0.437;SC=CAGGCCTCGCGGTGACCTGAT;SOR=0.656;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=59;WE=147204200;WS=147204182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr5	147258162	rs1368408	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CAAATTGTTTGGTGAGAAAAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=147258170;WS=147258157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	147258495	rs2278376	C	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=390;ReadPosRankSum=0.512;SC=AACTAGTAAGCCTTGCCTCAC;SOR=1.124;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=25;WE=147258503;WS=147258485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr5	147258535	rs3217372	AT	A	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=0.619;SC=TAGGAATTGTATTTTTTTTTA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=147258543;WS=147258525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	147261484	rs3910207	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=1.093;SC=TTTTGTTTCCCCATCAGTAAA;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=147261492;WS=147261474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr5	147261812	rs3843496	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=0.182;SC=GTATCCAGATTAGTTTTCCCT;SOR=0.435;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=15;WE=147261820;WS=147261802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr5	147286054	rs2250145	G	A	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GCGAAGTACTGAGACAGCCAT;SOR=0.799;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=68;WE=147286062;WS=147286044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr5	147478785	rs1422991	C	T	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=809;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CTTCTTTTTCCCTCTTATTCA;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=50;WE=147478793;WS=147478775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr5	147478981	rs11168021	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CCCAGAATATCTTAACTCTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=147478989;WS=147478971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	147479991	rs2303061	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.719;NF=33;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=0.632;SC=AAATATATGGCCAACTTACTT;SOR=0.966;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=55;WE=147479999;WS=147479981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,62:0.35:178
chr5	147480007	rs2303062	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.750;NF=28;NR=29;PP=737;ReadPosRankSum=0.325;SC=TACTTCTTCTATCTCGGCAGG;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=57;WE=147480015;WS=147479997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,65:0.37:177
chr5	147480027	rs2303063	G	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.789;NF=28;NR=32;PP=741;ReadPosRankSum=1.938;SC=GAGCTTTGCAGTGAATATCGA;SOR=0.687;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=60;WE=147480035;WS=147480017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,71:0.39:182
chr5	147480112	rs2303065	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=484;ReadPosRankSum=0.178;SC=GGAAAGTGCATGGCAACACCT;SOR=0.740;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=39;WE=147480120;WS=147480102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr5	147480868	rs2303066	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.867;SC=CACTTCTAATGTGGCGATTCT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=147480876;WS=147480858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr5	147480955	rs2303067	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=619;ReadPosRankSum=1.494;SC=GAAGGAAGGTAAATCAAGAAA;SOR=1.312;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=32;WE=147480963;WS=147480945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr5	147481018	rs2303068	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=742;ReadPosRankSum=-0.146;SC=ATATCCTCCAGCAACTCAGAG;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=52;WE=147481026;WS=147481008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
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chr5	147484465	rs34473560	GA	G	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=-0.587;SC=TCTCAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=17;WE=147484473;WS=147484455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
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chr5	147488367	rs2303071	C	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=491;ReadPosRankSum=2.195;SC=AAGGGAAAGTCGAGGCTGAAA;SOR=0.707;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=35;WE=147488375;WS=147488357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr5	147493871	rs3815735	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=-1.617;SC=TAGGAACCCAGTAAACTAATT;SOR=0.184;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=147493879;WS=147493861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	147497871	rs6891892	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.489;SC=TGAGCCACCGTACCCGGCAAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=147497879;WS=147497861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	147497932	rs3777135	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=0.130;SC=CTCAGACTGTTAAAACAATTT;SOR=0.518;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=12;WE=147497940;WS=147497922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr5	147498019	rs3777134	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=793;ReadPosRankSum=-1.548;SC=GCTGAGTATCGGGAACAAATG;SOR=0.769;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=46;WE=147498027;WS=147498009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr5	147498523	rs3764926	T	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=630;ReadPosRankSum=0.554;SC=GTTAACAAGATGAATATTCAC;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=42;WE=147498531;WS=147498513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr5	147498652	rs9325073	C	G	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1665;ReadPosRankSum=0.965;SC=TGGCAAGAATCGTCTTTCTGT;SOR=0.521;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=209;TCF=95;TCR=114;TR=107;WE=147498660;WS=147498642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,125:0.50:250
chr5	147498669	rs9325074	G	A	4357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=6.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,116:0.51:227
chr5	147498672	rs12518996	G	A	4378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=4.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr5	147498763	rs9325075	C	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=590;ReadPosRankSum=0.964;SC=ATCAGTGACTCTCACTGATAA;SOR=1.248;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=31;WE=147498771;WS=147498753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr5	147499616	rs17704908	C	T	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=846;ReadPosRankSum=0.562;SC=ATGGAAAACTCATCTGCACTC;SOR=1.163;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=53;WE=147499624;WS=147499606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr5	147499670	rs33920397	C	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AGACACATGGCAATAAGTGTA;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=70;WE=147499678;WS=147499660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr5	147504305	.	C	CT	121	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=21;MQ=60.63;NF=2;NR=1;PP=121;QD=45.0;SC=ATTACCCTATCTTTTTTTTTA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=3;WE=147504323;WS=147504295;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr5	147504315	.	A	T	100	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=9;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.57;NF=2;NR=1;PP=100;QD=44.9237375157;SC=CTTTTTTTTTAATTATTCTGC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=3;WE=147504323;WS=147504295;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr5	147504557	rs2052536	T	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	147505116	rs3764930	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=806;ReadPosRankSum=0.019;SC=AGAATGAAGCGGAGGATGCAA;SOR=0.379;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=52;WE=147505124;WS=147505106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
chr5	147505227	rs2112767	G	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=24;PP=1353;ReadPosRankSum=1.005;SC=CAAGTTTGAAGAAATCACTAA;SOR=0.926;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=87;TCR=45;TR=73;WE=147505235;WS=147505217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr5	147510776	rs6895434	T	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=553;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CCACCCCTCTTCTTGAATGCC;SOR=1.269;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=29;WE=147510784;WS=147510766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr5	147510866	rs2400478	T	C	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1535;ReadPosRankSum=-2.027;SC=CCAGGATAGGTTATCTTTGTC;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=98;WE=147510874;WS=147510856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,118:0.45:263
chr5	147516470	rs4334874	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=707;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GATTAAGATGCAGCTATAAAT;SOR=0.488;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=40;WE=147516478;WS=147516460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr5	147516598	rs4349706	T	C	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1805;ReadPosRankSum=0.299;SC=TAAACCCCAGTTCTGAATCAC;SOR=0.544;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=97;WE=147516606;WS=147516588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,110:0.57:194
chr5	147516762	rs3088193	C	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=1.786;SC=ATAAAGACATCTCCACCAAGT;SOR=0.119;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=147516770;WS=147516752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr5	147549163	rs4269285	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=521;ReadPosRankSum=0.824;SC=ATACAATGGGTGGAGTAGAGA;SOR=0.280;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=30;WE=147549171;WS=147549153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr5	147554889	rs10052031	A	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=1.026;SC=TTACTAAATGAAATGTTTATT;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=147554897;WS=147554879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	147554997	rs147123556	TTTTTTCC	T	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.936;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr5	147555029	rs10074328	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=1.609;SC=CTCCCTCTTGCGCTTTTTACA;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=22;WE=147555037;WS=147555019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr5	147585797	.	C	CTCATT	859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=622;SC=TTTAAAAGAACCTAACCACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=147585814;WS=147585787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	147585799	.	TAAC	T	1085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	147585805	.	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	147585806	.	AC	A	861.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.27;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=407;SC=ACCTAACCACACATTCTCATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=147585814;WS=147585787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	147593497	rs12186491	C	A	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=79;PP=2965;SC=GTTCCAGGACCCCAAGGTCTA;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=156;WE=147593505;WS=147593487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr5	147693829	rs141068480	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=385;ReadPosRankSum=1.460;SC=GGAGTCAGTGCTCTCTACTAC;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=25;WE=147693837;WS=147693819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr5	147928130	rs13171326	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=186;ReadPosRankSum=1.215;SC=CTCTCTGAGATTCATTTCTTC;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=11;WE=147928138;WS=147928120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	148042230	rs7720668	G	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=765;ReadPosRankSum=1.059;SC=ATTCACCCTGGATGATCATGG;SOR=0.585;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=60;WE=148042238;WS=148042220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr5	148045282	rs1820076	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-1.434;SC=GAAGGCAGCCCGGGGCATAAA;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=148045290;WS=148045272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	148206375	.	C	T	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=26;QD=20.2570708491;SC=CCAGTGCGCTCACCTGCCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=148206383;WS=148206365;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	148206440	rs1042713	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=-0.481;SC=GGCACCCAATGGAAGCCATGC;SOR=0.978;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=18;WE=148206448;WS=148206430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr5	148206473	rs1042714	G	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=451;ReadPosRankSum=0.079;SC=CGTCACGCAGGAAAGGGACGA;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=31;WE=148206481;WS=148206463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr5	148207659	rs372621803	AC	A	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-0.463;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr5	148383345	rs1432798	C	G	71.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GCCCCGGAGTCTGAGGTCGCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=148383353;WS=148383335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr5	148384559	rs1432799	G	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.804;QD=2.60;ReadPosRankSum=-3.947;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr5	148386525	rs6871030	T	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=633;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TCTGCAGCCATGGTGGACAGA;SOR=1.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=33;WE=148386533;WS=148386515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr5	148389763	rs1025476	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=385;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GACTCAGGCCGAAGTCCAGCC;SOR=0.898;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=25;WE=148389771;WS=148389753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr5	148392362	rs11954893	A	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=792;ReadPosRankSum=0.237;SC=CACTCAGCACAGGATGAAACA;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=58;WE=148392370;WS=148392352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr5	148407708	rs1432794	A	C	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=874;ReadPosRankSum=1.080;SC=GGAAGCAGAGACGGGCATGGG;SOR=0.363;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=42;WE=148407716;WS=148407698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr5	148407893	rs6875902	C	A	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=58;PP=2178;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AATATGGGGGCGAAGTTCTCA;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=131;WE=148407901;WS=148407883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,148:0.56:266
chr5	148408101	rs1432793	A	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1104;ReadPosRankSum=-2.089;SC=CCTCCTTGAAACCTTCAGGCT;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=64;WE=148408109;WS=148408091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr5	148425518	rs250676	A	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=684;ReadPosRankSum=-1.998;SC=TGGTTTTTTTATAATACCTAA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=54;WE=148425534;WS=148425508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,60:0.40:149
chr5	148521799	rs11744532	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CCCCAGGCTCTTTTTTGGTGC;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=148521807;WS=148521789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	148562890	rs6886262	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=317;ReadPosRankSum=-0.789;SC=ATGAATTGAAGATACTTTGCA;SOR=0.770;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=21;WE=148562898;WS=148562880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr5	148562981	rs6887628	C	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=717;ReadPosRankSum=0.955;SC=AGAATCAGGGCCTCTGGATAG;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=49;WE=148562989;WS=148562971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,57:0.38:152
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chr5	148578827	.	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=1.225;SC=AGAGTATATACGTATTTTTTA;SOR=0.534;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=13;WE=148578835;WS=148578817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
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chr5	148586451	rs5872113	A	AG	992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=904;SC=TTCCAGTGTCAGGTGGGAGCA;SOR=2.226;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=21;WE=148586459;WS=148586441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	148590423	rs2918281	T	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=0.304;SC=GGCAGGGTGATCTGTGCCTCC;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=25;WE=148590431;WS=148590413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr5	148596693	rs3839234	TG	T	1400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.538;NF=2;NR=23;PP=848;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AGTGTTATCTTGGCTTCAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=25;WE=148596701;WS=148596683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr5	148610276	rs2918265	C	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=608;ReadPosRankSum=2.128;SC=TAAAGGTAAGCAAGCTAGTAG;SOR=0.464;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=39;WE=148610284;WS=148610266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr5	148618708	rs58203769	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=0.045;SC=ACTGCTGCAAACCCTCTCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=12;WE=148618716;WS=148618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr5	148618749	rs59032271	C	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.938;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr5	148618752	rs59757169	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.272;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr5	148618964	rs34180939	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=1.427;SC=AAGCAGGGAAGTGCTGGAGAG;SOR=1.519;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=19;WE=148618972;WS=148618954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr5	148619189	rs11326264	AG	A	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=0.875;SC=CTCAGGGAGGAGGGGGGTCTC;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=148619197;WS=148619179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	148620224	rs3797315	T	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.355;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=791;ReadPosRankSum=0.326;SC=GGCGACCACTTCCTGCGTGCT;SOR=1.235;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=53;WE=148620232;WS=148620214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,60:0.41:148
chr5	148625972	rs34340554	TA	T	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr5	148627252	rs9325136	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=624;ReadPosRankSum=0.206;SC=AGGCTGCTATGGAGGATGTGA;SOR=0.541;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=37;WE=148627260;WS=148627242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr5	148627503	rs2304609	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=0.129;SC=GTAAGCATGGCTCTGGAAGCC;SOR=1.700;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=148627511;WS=148627493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr5	148630191	rs1808828	C	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=394;ReadPosRankSum=1.127;SC=GGTTAACTGACACAACTGTAT;SOR=1.206;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=23;WE=148630199;WS=148630181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr5	148639062	rs1438688	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=464;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CATACCATACCCCCGCCAGTC;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=30;WE=148639070;WS=148639052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr5	148651711	rs12054749	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.806;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=0.235;SC=AAAGGTGCCTTCGGCTGCCGG;SOR=0.098;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=14;WE=148651719;WS=148651701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr5	148678994	rs7715371	G	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CCCAACTCTAGGTGGTGGGGG;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=148679002;WS=148678985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr5	148680020	rs77005424	A	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=0.770;SC=ACATCGCATCATTAAGTCGCT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=18;WE=148680028;WS=148680010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr5	148687152	rs17854053	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=244;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AGCAGCTGACGGTCATCAGGG;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=13;WE=148687160;WS=148687142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	148699951	rs17642594	T	C	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.930;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1237;ReadPosRankSum=-1.070;SC=TTTTATTTTCTAGATATGCAA;SOR=0.591;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=82;WE=148699959;WS=148699941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,102:0.51:199
chr5	148712150	rs2270682	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.812;SC=CAAGACTGGGGGCTGGAAGGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=148712158;WS=148712140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr5	148725199	rs352347	A	G	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=21;PP=654;SC=GCAGGCGGGGAGTCGGGAGCG;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=148725207;WS=148725189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr5	148742693	rs1693917	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=395;SC=TCCACATGCTAGTGCTTGCCA;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=148742701;WS=148742683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr5	148753803	rs115498474	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=394;ReadPosRankSum=0.324;SC=TTTTGACTTCGAAGCCACAAA;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=26;WE=148753811;WS=148753793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr5	148909077	rs12163992	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=409;SC=AACTAAATCTGTCTAAAGAGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=148909085;WS=148909067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	148977613	rs7709875	C	T	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=650;SC=GCAAGCTTGACAGAAAGGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=148977621;WS=148977603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	148997686	rs6579750	A	G	6670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=73;PP=2965;SC=CGTGACATCCACTTTCCTGAG;SOR=1.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=132;TCR=73;TR=205;WE=148997694;WS=148997676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	148999881	rs11409449	G	GC	1702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=1707;SC=GCCATGACAGGCATGATTGGA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=148999889;WS=148999871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr5	149001551	rs4629585	A	C	5818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=104;PP=2965;SC=GGGCCAGATCATGTGCACATT;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=78;TCR=104;TR=182;WE=149001559;WS=149001541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	149210489	rs45550434	G	A	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=947;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GGTGTCTGTTGGGGCTGCAGC;SOR=0.543;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=62;WE=149210497;WS=149210479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
chr5	149212430	rs45520937	G	A	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=1028;ReadPosRankSum=1.054;SC=GCCTCTCCCCGGGACTCCCTA;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=69;WE=149212438;WS=149212420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr5	149212614	rs115557257	G	T	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=953;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TCAGATCCCGGCCCTGGTCCC;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=64;WE=149212622;WS=149212604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr5	149213060	rs140114166	C	A	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=793;ReadPosRankSum=-1.414;SC=TCTGTGTGCCCCGTGCGGCGT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=52;WE=149213068;WS=149213050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr5	149213456	rs32576	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=2.465;SC=AAAGTGTTATATGGGTTTGGA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=14;WE=149213464;WS=149213446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr5	149214701	rs45623445	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CTCTAACAGCCGGGATGGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=13;WE=149214709;WS=149214691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr5	149216256	rs45588534	C	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=931;ReadPosRankSum=0.111;SC=GTGATGCTGGCGCCCCACCCA;SOR=0.616;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=61;WE=149216264;WS=149216246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr5	149216304	rs45543631	C	T	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.777;SC=AGATCCGTGCCAGCCTCACCA;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=73;WE=149216312;WS=149216294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,84:0.44:192
chr5	149221788	rs26127	G	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=295;SC=AGGCAATGACGGAGTCTCTCT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=149221796;WS=149221778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	149222033	rs41287086	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=1.408;SC=CAAGATTTGTGAAATGAATCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=8;WE=149222041;WS=149222023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr5	149227267	.	T	TA	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5225;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.111;NF=0;NR=8;PP=77;ReadPosRankSum=1.133;SC=TGCTGTCCTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=149227275;WS=149227257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr5	149240571	rs10045293	A	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=847;ReadPosRankSum=0.541;SC=ACCAGGTGACAAGAGGCTGCA;SOR=0.814;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=51;WE=149240579;WS=149240561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr5	149242788	rs4705390	G	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=809;ReadPosRankSum=-0.521;SC=TGGTGATCCCGTCCAACATTG;SOR=0.625;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=53;WE=149242796;WS=149242778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,60:0.45:134
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chr5	149245754	rs17110644	A	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=487;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGGTGCAAACAAAGTCAATGA;SOR=0.438;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=35;WE=149245762;WS=149245744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
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chr5	149247738	rs6864267	C	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=614;ReadPosRankSum=1.149;SC=ACACAGGACACCCTCTATCAG;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=45;WE=149247746;WS=149247728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr5	149265875	rs61733360	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=881;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TGTCATGGCAGAAAGCAGCAG;SOR=0.826;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=55;WE=149265883;WS=149265865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr5	149276567	rs30818	T	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ATGCTTCTGATCTTCAGTTTC;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=9;WE=149276575;WS=149276557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr5	149278258	rs30819	A	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=0.349;SC=CACACTGTACATAAAGCACTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=149278266;WS=149278248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	149283406	rs251346	C	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=0.673;SC=AGACAGTTTTCAATTATTCAC;SOR=1.101;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=16;WE=149283414;WS=149283396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr5	149360877	rs30832	T	C	4166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=72;PP=2891;SC=AACCTTCAGATTAAGCCAGGC;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=132;WE=149360885;WS=149360867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	149374879	rs3832324	CT	C	6964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=88;PP=2969;SC=TCCACCTCTTCTTGATCCTCA;SOR=0.758;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=35;TCR=94;TR=122;WE=149374887;WS=149374869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	149374932	rs10875553	T	C	3645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=74;PP=2463;SC=AAGGTGGCTCTGGTACAGTAC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=127;WE=149374940;WS=149374922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	149379994	rs41287090	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.343;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=362;ReadPosRankSum=2.049;SC=AGGTGAGGCGGGGCCTAGATC;SOR=0.205;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=22;WE=149380002;WS=149379984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr5	149380158	rs3812008	C	T	2818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,139:0.48:288
chr5	149380158	.	CG	TC	1413	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=57;NR=41;PP=1413;QD=14.9639579068;SC=TTACTAGACCCGCTCCAAGCC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=98;WE=149380167;WS=149380148;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:119,98:0.45:217
chr5	149380159	rs3812009	G	C	10410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.78;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr5	149389968	rs142114383	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=537;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TGCTGTACAGGAGATTGCCAC;SOR=0.925;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=32;WE=149389976;WS=149389958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr5	149404179	rs35341726	G	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=980;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TGGAGCAGACGTACCAACACC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=53;WE=149404187;WS=149404169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr5	149406271	rs6579767	C	T	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=78;PP=2965;SC=CTTTTCAGAGCTGACCTGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=159;WE=149406279;WS=149406261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	149406733	rs2304069	G	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=110;SC=CTGCTTCCATGTAATGTATCA;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=149406741;WS=149406723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	149424966	rs2276983	G	A	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=752;SC=GACGGGGTAGGCTGTTGTGTT;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=149424974;WS=149424956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	149427387	rs2043284	T	G	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=63;PP=2269;SC=ACTTTTTAGGTCAGGGATATG;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=149427395;WS=149427377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	149428395	rs216125	C	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=22;PP=621;SC=GTGCTACCCCCTGGGCTAGGG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=149428403;WS=149428385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	149428424	rs216126	G	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=325;SC=TGGGTCTTCTGTCAGTATTTT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=149428432;WS=149428414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	149431178	rs7718213	T	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=1.066;SC=CAGTACATGGTGATGTTAGGA;SOR=0.489;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=6;WE=149431186;WS=149431168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr5	149431223	rs216131	G	A	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=9;PP=990;SC=GAGTGTTCTCGTCACCAGATG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=149431231;WS=149431213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	149431259	rs216132	A	G	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=28;PP=1882;SC=ATTCCTTCTTATCAAAATGCA;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=93;WE=149431267;WS=149431249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	149433596	rs2066934	TG	GA	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=24;PP=2838;SC=TTGAAGTTTGTGGGAGGGGAG;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=64;WE=149433605;WS=149433586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	149433939	rs41287094	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=521;ReadPosRankSum=0.824;SC=AGATCTGCTGGAAGGTGGGTC;SOR=0.411;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=29;WE=149433947;WS=149433929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr5	149435759	rs216136	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.458;SC=CCCCAGCCTGGCCCAAGCCCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=77;WE=149435767;WS=149435749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,87:0.51:170
chr5	149437190	rs216138	C	G	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=43;PP=1277;SC=GCAGAGGTCACTCATCATCAC;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=149437198;WS=149437180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	149439458	rs3733671	T	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GTGAGGGAGGTGCTGAGTGCT;SOR=0.211;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=149439466;WS=149439448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr5	149440644	rs170037	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.637;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=286;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GCAGGGCATACCCCAAGACCC;SOR=1.688;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=13;WE=149440652;WS=149440634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr5	149441016	rs11286566	AC	A	722.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=495;ReadPosRankSum=0.520;SC=AGCATCTACCACCCCCCATCC;SOR=0.739;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=17;WE=149441024;WS=149441005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr5	149447628	rs216150	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=372;SC=CCAGCAGCTGACTCATGTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=149447636;WS=149447618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	149447771	rs34928010	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=452;ReadPosRankSum=1.423;SC=ACTCCGCTCCGGCTCACCTGC;SOR=0.898;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=25;WE=149447779;WS=149447761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr5	149456771	rs2855781	CT	AA	5415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=42;PP=2944;ReadPosRankSum=1.347;SC=CAGCTTCCTCCTCAAAACCCT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=117;TCR=74;TR=109;WE=149456780;WS=149456761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,135:0.60:224
chr5	149457678	rs2228422	G	A	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=70;PP=2867;SC=GACTGACCTTGGTGTTGTTGT;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=146;WE=149457686;WS=149457668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	149459574	rs13188584	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=522;ReadPosRankSum=1.219;SC=TCTCTGTCCCCACTCTTCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=30;WE=149459582;WS=149459564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr5	149460553	rs216123	A	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=883;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CGACCAGCTCAGGGACACTGG;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=59;WE=149460561;WS=149460543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr5	149495287	rs2229561	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=0.120;SC=GTGCTGGCAGGGGGGGAGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=149495295;WS=149495277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr5	149495395	rs246388	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=240;ReadPosRankSum=-1.518;SC=GTTCCAGCTCTGGCTCCGGCT;SOR=0.474;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=17;WE=149495403;WS=149495385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr5	149495600	rs138324883	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TGTCCACCCCTGCACCGTAGG;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=14;WE=149495608;WS=149495590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	149497099	.	GCGCGCGCGCACACA	G	284	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=57.17;NF=2;NR=0;PP=284;QD=146.0;SC=CAGCGCGCGCGCGCGCGCGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=2;WE=149497120;WS=149497089;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr5	149497177	rs246391	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.21;MQRankSum=0.911;NF=20;NR=7;PP=500;ReadPosRankSum=0.725;SC=GCCAGGGTGGTTACCTGGCTA;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=27;WE=149497185;WS=149497167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr5	149497228	rs2228440	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=60.14;MQRankSum=0.939;NF=23;NR=14;PP=487;ReadPosRankSum=-0.034;SC=CAGCAACCTCGGGTTTGGGGT;SOR=0.554;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=37;WE=149497236;WS=149497218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr5	149498223	rs150263966	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=467;ReadPosRankSum=0.433;SC=CCCCTAAATGCCAGCCCATCA;SOR=0.638;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=36;WE=149498231;WS=149498213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr5	149498497	rs5872159	C	CT	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=201;ReadPosRankSum=0.039;SC=AGGCTGCTGCCTCTCAGAACA;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=149498505;WS=149498487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr5	149501322	rs79566483	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.950;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr5	149504115	rs1077724	A	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.038;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=0.300;SC=GAGGCCAGGGAGAGGAACGCT;SOR=2.765;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=9;WE=149504123;WS=149504112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr5	149504158	rs1075846	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCGGGAGCAGTGCCTGCTGCA;SOR=2.093;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=10;WE=149504166;WS=149504148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr5	149505306	rs10072056	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=1.920;SC=CAAGGTCTTCGTGGGCTCGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=5;WE=149505314;WS=149505296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr5	149513072	rs2240780	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=0.429;SC=TCTCACCATCACTCTGCACCC;SOR=1.501;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=15;WE=149513080;WS=149513062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr5	149515074	rs740750	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=241;ReadPosRankSum=0.865;SC=GCCTCCAGTTGACAAGAGGGG;SOR=0.318;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=18;WE=149515082;WS=149515064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr5	149516480	rs2240781	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.404;SC=TGGTGCTTCACGCCCTGCCAC;SOR=0.340;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=5;WE=149516488;WS=149516470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	149546426	rs2302274	A	G	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=53;NR=54;PP=1863;SC=TGCGCGGGGGACCCCGCGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=107;WE=149546434;WS=149546416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	149546828	rs2302275	C	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=11;PP=438;SC=GCGCAGAGGCCGACGCCCTAC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=149546836;WS=149546818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	149576233	rs2270145	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=553;ReadPosRankSum=0.345;SC=TGGGCTTTTGGGGGAGCTGCC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=35;WE=149576241;WS=149576223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr5	149576273	rs2270146	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=977;ReadPosRankSum=-0.635;SC=ACCCCGCTCCCGGCAGGCGCC;SOR=0.395;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=64;WE=149576281;WS=149576263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,68:0.50:136
chr5	149578999	rs731376	T	A	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=632;SC=AAGGCAGGGCTTGGACTGAGC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=149579007;WS=149578989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	149580819	rs3733680	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=620;ReadPosRankSum=0.887;SC=CAGAGGGAGGGGCCAGGCCTG;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=39;WE=149580827;WS=149580809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr5	149582069	rs10875556	T	C	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GGAGAGTGGCTGGCCAGGGAG;SOR=0.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=78;WE=149582077;WS=149582059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,92:0.58:158
chr5	149582103	rs2240788	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1063;ReadPosRankSum=1.138;SC=GAAAGGAAGGCCCACTCACCC;SOR=0.789;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=69;WE=149582111;WS=149582093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,73:0.41:176
chr5	149583175	rs11749558	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=494;ReadPosRankSum=1.037;SC=CTGAGTGTGCGTATGGGAGCC;SOR=1.193;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=27;WE=149583183;WS=149583165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr5	149583300	rs2240793	T	C	8871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=100;PP=2965;SC=TCTGGTCCTTTCTCTTCTTCT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=85;TCR=100;TR=185;WE=149583308;WS=149583290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	149583336	rs2240794	T	C	7187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=81;PP=2476;SC=TCGGCCTAGATAGCCAGGTGA;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=132;WE=149583344;WS=149583326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	149583383	rs35380195	G	GGT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-0.256;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr5	149584197	rs17652561	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGTGTATGGTGAGAAGAGCCG;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=48;TCR=91;TR=77;WE=149584205;WS=149584187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr5	149584341	rs6878880	T	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=29;PP=1180;SC=GCTGCTGGCGTTTGTGGGGCC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=149584349;WS=149584331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	149584863	rs2342283	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.05;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	149584870	rs4423986	C	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.86;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	149584881	rs5024534	G	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	149584881	.	GTT	TTC	933	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=91;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=1;PP=933;QD=58.0275220507;SC=CCACTTCAGGGTTCGGTACAG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=149584891;WS=149584853;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	149584883	rs5024533	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	149584969	rs11428067	A	AG	5046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=38;PP=2933;SC=TCGGGCCTTAAGCAGTTTAGA;SOR=1.059;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=63;WE=149584989;WS=149584959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	149584981	rs4705425	A	G	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.843;NF=39;NR=25;PP=936;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CAGTTTAGACAAAAGCCCGCA;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=64;WE=149584989;WS=149584959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,83:0.59:140
chr5	149585025	rs4705426	A	C	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=79;PP=2965;SC=GCAGGCCCTCATGGTGTATAG;SOR=0.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=175;WE=149585033;WS=149585015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	149589213	rs10078509	G	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=635;ReadPosRankSum=0.905;SC=CCCTGCCCGGGACCTCACAGT;SOR=1.134;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=36;WE=149589221;WS=149589203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr5	149596955	rs980272	C	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=321;SC=TAGTAGTGCCCTCAGTGGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=149596963;WS=149596945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	149597160	rs882354	A	G	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=56;PP=2078;SC=TCTGCCACGTACATCCGGAGC;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=97;WE=149597168;WS=149597150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	149597304	rs5872169	G	GT	890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=762;SC=CTAGCCCAGGGACGGGGGAGG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=18;WE=149597312;WS=149597294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	149602280	rs55976097	T	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=42;PP=1235;SC=CCCTCAGCTGTAAGACACACA;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=149602288;WS=149602270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	149602608	rs2241694	A	G	6844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=124;NR=93;PP=2965;SC=GCCATTTGCCATCCCGGCGGT;SOR=0.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=124;TCR=94;TR=217;WE=149602616;WS=149602598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr5	149610967	rs139987809	AAATAAT	A	233.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=355;SC=GGGGACACAGAAATAATAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=5;WE=149610980;WS=149610957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	149627423	rs7711562	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=859;ReadPosRankSum=1.328;SC=GCCGGAGTGAAGGGACCCAGG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=55;WE=149627431;WS=149627413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr5	149629683	rs4958452	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=0.311;SC=TAAATGCTTATTGAATCAATG;SOR=1.038;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=11;WE=149629691;WS=149629673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr5	149631413	rs2288799	A	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;ReadPosRankSum=0.004;SC=GACCCCTGGAAAGAGGACCAG;SOR=0.458;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=43;WE=149631421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
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chr5	149737221	rs4565199	T	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=587;SC=GCCGGAAGTGTGGCGCGCGAG;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=149737229;WS=149737211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr5	149776232	rs15251	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=828;ReadPosRankSum=-1.381;SC=AAGGGGAAAGCAAAGAGAGAC;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=58;WE=149776240;WS=149776222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr5	149823785	rs2070844	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=-1.615;SC=AGGAGAGAAGGCTGGAGTTGA;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=149823793;WS=149823783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	149824067	rs2073472	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=434;ReadPosRankSum=0.935;SC=GAACATGAAGTGGCCCCATCT;SOR=0.476;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=26;WE=149824075;WS=149824057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr5	149824223	rs2070842	T	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.195;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.803;NF=27;NR=35;PP=875;ReadPosRankSum=-1.380;SC=AAAAACCCTTTTAGACAGGGT;SOR=0.706;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=62;WE=149824231;WS=149824213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr5	149824308	rs36146597	G	GC	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.325;NF=0;NR=14;PP=488;ReadPosRankSum=-0.932;SC=AAGGCTGGGCGCGGTGGCTCA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=14;WE=149824316;WS=149824298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr5	149826526	rs4841	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1142;ReadPosRankSum=0.003;SC=AGATGGTTTCCCTGGGGACAA;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=68;WE=149826534;WS=149826516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,80:0.47:172
chr5	149826572	rs13183077	G	A	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=0.447;SC=CCAACAAGGAGTGCTTACGAT;SOR=0.970;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=43;WE=149826580;WS=149826562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
chr5	149901373	rs10075355	G	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=-1.080;SC=AGCCCCCTCTGCAGCTCAGTG;SOR=0.133;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=149901381;WS=149901363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr5	149907533	rs2273235	T	G	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=986;ReadPosRankSum=-1.105;SC=ACTGGACGGTTTTCCAGTCAA;SOR=0.790;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=194;TCF=116;TCR=78;TR=64;WE=149907541;WS=149907523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,81:0.34:241
chr5	149907602	rs2273234	A	G	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.693;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=975;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AGTCCATCCCACACCTGGGCG;SOR=0.959;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=209;TCF=109;TCR=100;TR=73;WE=149907610;WS=149907592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,79:0.33:236
chr5	149914401	rs2545341	T	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=428;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GCCCAGTGGGTGGTTCTGAGC;SOR=0.758;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=25;WE=149914409;WS=149914391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr5	149919739	rs1290147	G	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.776;SC=ACTCCTGGACGAACCTCCGGC;SOR=0.858;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=68;WE=149919747;WS=149919729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,70:0.49:143
chr5	149919778	rs61732050	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=516;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TGCAGTTGGCGCAGAAGTACT;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=39;WE=149919786;WS=149919768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr5	149921251	rs2304063	G	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=655;ReadPosRankSum=1.314;SC=GCTCTTGACCGAGCTTCCCCA;SOR=0.879;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=35;WE=149921259;WS=149921241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr5	149931222	rs6579792	T	G	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=184;SC=GATTCCCTGGTCTCTGCCATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=149931230;WS=149931216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	150051958	rs194134	T	C	6652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=128;NR=87;PP=2965;SC=CACCGCCATCTCCAAGGGCTA;SOR=1.107;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=128;TCR=87;TR=215;WE=150051966;WS=150051948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
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chr5	150072693	rs33410	A	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=528;SC=GTAGAGCGGCAACATGAACCA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=150072701;WS=150072683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	150078956	rs252161	A	G	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=967;ReadPosRankSum=0.111;SC=TAGAGAGAGAAAAACAGCAAC;SOR=0.686;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=62;WE=150078964;WS=150078946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr5	150098028	rs41290555	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.480;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=564;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TACCATCCCCGCCATTACTCC;SOR=1.220;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=36;WE=150098036;WS=150098018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr5	150311622	rs12656542	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=346;ReadPosRankSum=0.940;SC=TATTTTTCCAAATATATTATA;SOR=1.358;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=17;WE=150311630;WS=150311612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr5	150311678	rs11167525	A	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=601;ReadPosRankSum=-2.714;SC=TGATGACTACAACTTGCCTGA;SOR=0.314;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=40;WE=150311686;WS=150311668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr5	150311773	rs7727919	T	C	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.903;SC=GAATGACCCCTTGTAATACTT;SOR=0.837;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=57;WE=150311781;WS=150311763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr5	150311857	rs10719367	CT	C	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=396;ReadPosRankSum=0.261;SC=CTCTCTCTGTCTGAAAAAAAA;SOR=0.683;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=11;WE=150311865;WS=150311847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr5	150323530	rs112582282	GTGGGAGAAGGTCGTGA	G	641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=2962;ReadPosRankSum=1.319;SC=AGGCCATCCTGTGGGAGAAGG;SOR=0.560;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=150323553;WS=150323520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr5	150407456	rs8177447	T	C	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=43;PP=2176;SC=ACACTCCTCTTATCCCTGCTC;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=109;WE=150407464;WS=150407446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	150410135	rs3924	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=272;SC=AGGGACTGGTGTACAAGCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=150410143;WS=150410125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	150413406	rs2233305	A	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=660;SC=ACAGGCTGCAAAGGACACCCA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=150413414;WS=150413396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	150415338	rs2287720	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1009;SC=CAGGCCCAGACTCCCATGCCT;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=150415346;WS=150415328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	150425467	rs2233299	G	A	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=55;PP=2012;SC=TCTCGGCTGCGCCCAAGGCCA;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=150425475;WS=150425457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	150429563	rs2233294	A	C	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TAAGAAACCTACAGGGCTCCT;SOR=0.578;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=41;TCR=69;TR=64;WE=150429571;WS=150429553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,73:0.55:133
chr5	150436503	rs2233290	G	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=538;ReadPosRankSum=0.341;SC=TCCTCACGGGGCAGGGGGCCC;SOR=0.280;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=29;WE=150436511;WS=150436493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr5	150440097	rs2233287	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=0.950;SC=CATCTCACATGAGATCACAAA;SOR=0.430;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=31;WE=150440105;WS=150440087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr5	150480520	rs11960458	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=545;ReadPosRankSum=0.227;SC=TACTCTAGCGCGGCCTGGATG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=34;WE=150480528;WS=150480510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr5	150480902	rs1054389	C	A	69.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	150483095	rs4958892	A	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=28;PP=1400;SC=TCTGACACTCACCCGCTTCCT;SOR=1.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=150483103;WS=150483085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	150484889	rs868531	G	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=973;ReadPosRankSum=0.852;SC=AGAGAGATGCGGGGAACGTGG;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=121;TCF=32;TCR=89;TR=59;WE=150484897;WS=150484879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr5	150489390	rs1133202	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=564;ReadPosRankSum=-2.468;SC=TGTCTCCACTAGGTGTGTCTG;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=41;WE=150489398;WS=150489380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr5	150498981	rs2303022	C	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=346;ReadPosRankSum=-2.027;SC=ATGATCTCAGCCATAGTTCTG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=26;WE=150498989;WS=150498971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr5	150499080	rs2303023	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GACATGGCCCTCAGGCCCAAG;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=150499088;WS=150499070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr5	150499102	rs2303024	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-1.732;SC=CCTTGGCACAACCAAGGCTGA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=150499110;WS=150499092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	150503784	rs2303027	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=0.586;SC=TGCCAGCCCACGGCCAAACCC;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=150503792;WS=150503774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr5	150504097	rs56708608	TGAGAGAGAGA	T	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.525;NF=2;NR=14;PP=2872;ReadPosRankSum=-1.801;SC=GCACGAGAGCTGAGAGAGAGA;SOR=1.194;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=16;WE=150504114;WS=150504087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr5	150516887	rs2303034	G	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=396;SC=AATGCCCTGGGGGTAGAAAAA;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=150516895;WS=150516877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	150518358	rs3213802	AG	GA	6210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=69;PP=2947;SC=AGGTCCTGGCAGGTGGGGAAG;SOR=1.154;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=119;WE=150518367;WS=150518348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	150518435	rs3213804	T	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AATGAGCACTTACTCTGGCAG;SOR=0.711;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=19;WE=150518443;WS=150518425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr5	150518892	rs3214444	GC	G	1481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=1106;ReadPosRankSum=1.978;SC=CACCCCATGGGCCCTCCGGTT;SOR=0.377;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=32;WE=150518900;WS=150518882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr5	150518988	rs2228458	G	A	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=779;ReadPosRankSum=0.189;SC=ATTATGTCCAGTATGGCCTCC;SOR=0.778;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=60;WE=150518996;WS=150518978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
chr5	150519670	rs10040510	T	A	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=817;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTGTGTCTACTTTTGGGGGAT;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=56;WE=150519678;WS=150519660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr5	150527631	rs74469831	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=545;ReadPosRankSum=0.361;SC=CTCAAGGCCAATCACATTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=30;WE=150527639;WS=150527621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr5	150562696	rs60344552	CT	C	4091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.737;NF=17;NR=57;PP=2799;ReadPosRankSum=0.123;SC=CAGACTGCCCCTGGGAAAGCC;SOR=0.676;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=144;TCF=35;TCR=109;TR=74;WE=150562704;WS=150562686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,121:0.50:241
chr5	150564975	rs248428	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=399;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CCACTCCCAGTCACAGACCAC;SOR=1.091;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=25;WE=150564983;WS=150564965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr5	150565008	rs248427	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=507;ReadPosRankSum=0.912;SC=GATCAGCCGCCTGTCCAGCTC;SOR=0.943;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=30;WE=150565016;WS=150564998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr5	150565724	rs248426	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=716;ReadPosRankSum=0.118;SC=CAAAGCCTGCCTCATAAATGC;SOR=0.702;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=44;WE=150565732;WS=150565714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr5	150565770	rs193728	G	A	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=35;PP=1143;SC=GAGGGAGAACGGTTTTGGGTT;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=150565778;WS=150565760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	150567049	rs35221501	CA	C	4737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=52;PP=2880;SC=TCCATAAGCTCAAGACACTTC;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=70;WE=150567057;WS=150567039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	150567074	rs36036156	T	TG	1624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=1115;ReadPosRankSum=-1.489;SC=CAAAGCCTTCTGCAGGCCCCT;SOR=0.726;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=63;WE=150567082;WS=150567064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr5	150567145	rs454130	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=195;ReadPosRankSum=0.336;SC=GTCTAGGAACGGTCTTATTCA;SOR=0.435;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=12;WE=150567153;WS=150567135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr5	150578574	rs3734038	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=902;ReadPosRankSum=0.655;SC=GGGCCTCTTCATTCTTTCCTT;SOR=0.544;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=63;WE=150578582;WS=150578564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,74:0.58:128
chr5	150595073	rs979453	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GGCAGGGCAGAGGCAGTTTGA;SOR=1.112;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=150595081;WS=150595063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	150639409	rs153477	A	G	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=879;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TGACCCCATCATCGTTCCTGG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=161;TCF=98;TCR=63;TR=67;WE=150639417;WS=150639399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,84:0.42:200
chr5	150639439	rs153478	A	G	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CCTCAGTGTCATGGGCAGCAC;SOR=0.777;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=77;WE=150639447;WS=150639429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,102:0.47:216
chr5	150647239	rs989	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-2.220;SC=AGCCCAGGGCATCTGCTGGGC;SOR=1.051;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=150647247;WS=150647229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr5	150666933	rs375396	C	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=732;ReadPosRankSum=0.499;SC=GCAGGATTATCAGCATGTAGA;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=50;WE=150666941;WS=150666923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr5	150696447	rs369907	C	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-1.442;NF=30;NR=28;PP=769;ReadPosRankSum=0.267;SC=CGTCCAGGGCCTGGTAGGTCC;SOR=0.462;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=58;WE=150696455;WS=150696437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr5	150696540	rs431240	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.480;NF=15;NR=17;PP=510;ReadPosRankSum=-2.246;SC=CTGAGTAGAACGTGGTGACCT;SOR=0.326;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=32;WE=150696548;WS=150696530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr5	150704758	rs246496	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.967;SC=TCTAGACCTCAGTTTCCCAGC;SOR=1.863;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=150704766;WS=150704748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	150723806	rs192192	G	A	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=878;ReadPosRankSum=1.094;SC=CCTTTCACCAGGTGAATCAAG;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=63;WE=150723814;WS=150723796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr5	150838284	rs35256722	C	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr5	150838293	rs35074529	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.99;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	150838603	rs56026426	A	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=388;ReadPosRankSum=-2.132;SC=TTACAGATGAAGGTCAGCAGT;SOR=0.338;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=31;WE=150838611;WS=150838593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr5	150838636	rs6891599	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=254;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CGAGTGACTGCGCTGAGATTT;SOR=0.864;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=15;WE=150838644;WS=150838626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr5	150843996	rs415426	T	C	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=30;PP=1256;SC=TAATCCTTTGTGAACTGAGTA;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=150844004;WS=150843986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	150846663	rs78066852	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=1.981;SC=GTACTCCCTAAATCTATTAAA;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=150846671;WS=150846653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	150846706	rs76799041	AGCATT	A	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=332;ReadPosRankSum=-0.047;SC=CCCTTCTGGGAGCATTGCATT;SOR=1.179;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=8;WE=150846718;WS=150846696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr5	150846882	.	C	A	327	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=53.38;NF=0;NR=12;PP=327;QD=30.1476010456;SC=AAAAAAAAAACCAGAGCGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=150846890;WS=150846872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr5	150846935	rs357619	A	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.328;SC=ATTTTTTCCAAATCAGCTTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=150846943;WS=150846925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	150847505	rs441652	T	C	5841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=1.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	150847509	rs394736	A	G	5751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=45.29;SOR=1.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	150847554	rs357621	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=45;PP=1142;SC=TGGTAGCTCATGCCTGTAATC;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=150847562;WS=150847544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	150847574	rs13357451	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.743;NF=2;NR=19;PP=313;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CCCAGCACTTTGGGAGGTGGG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=21;WE=150847582;WS=150847564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr5	150847604	rs189615	A	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=452;SC=ATCACCTGAGATCAGGAGTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=150847612;WS=150847594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	150848653	rs10709981	TA	T	1872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.295;NF=36;NR=18;PP=917;ReadPosRankSum=0.388;SC=AAGCATAACTTAAAAAAAAAA;SOR=1.109;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=54;WE=150848662;WS=150848643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr5	150848701	rs357624	A	G	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.288;NF=62;NR=44;PP=2106;ReadPosRankSum=0.010;SC=TCATCAGTACATATTCATTAA;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=106;WE=150848709;WS=150848691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,125:0.98:127
chr5	150848874	rs357625	A	G	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=52;PP=1468;SC=TTTTGTTTTCATTTTTGAAAC;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=67;WE=150848882;WS=150848864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	150848903	rs357626	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TTAAAGTTACATGTTCATCTA;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=21;WE=150848911;WS=150848893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr5	150853193	rs11279332	CTTTTGCTTTG	C	1853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=13;PP=2987;SC=TCTGTATAGCCTTTTGCTTTG;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=26;WE=150853210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	150853412	rs152722	G	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GAATGCTGAGGAAACATTGTT;SOR=1.049;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=25;WE=150853420;WS=150853402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr5	150856107	rs165352	T	G	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.769;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=37;PP=1861;ReadPosRankSum=1.423;SC=CATTAACTTTTCTTTTTTCTG;SOR=0.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=102;WE=150856115;WS=150856097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,112:0.95:118
chr5	150858725	rs165357	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=1.843;SC=TATCTGTGAGGTAAATTTCTA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=4;WE=150858733;WS=150858715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr5	150886616	rs7723079	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=287;ReadPosRankSum=1.044;SC=GGTTGGATGCGTGGTAGCTAA;SOR=0.048;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=19;WE=150886624;WS=150886606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr5	150886725	rs7723266	G	A	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=812;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CCATCTCCTCGCTGGACCAGG;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=67;WE=150886733;WS=150886715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,75:0.43:173
chr5	150886882	rs1105168	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=875;ReadPosRankSum=1.518;SC=GCTGGGTTCCGGTTGGTTGAG;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=49;WE=150886890;WS=150886872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr5	150887184	rs75548276	G	GAGA	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.666;NF=0;NR=10;PP=381;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TGCGGAGACAGAGTAGTCAGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=150887192;WS=150887174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr5	150914184	rs1432643	A	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=791;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GGTCTAGGGCAGTGAGTGTGG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=49;WE=150914192;WS=150914174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr5	150921805	rs6579879	G	A	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=422;SC=GATGTTTTTCGATACATTCCA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=150921813;WS=150921795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	150923405	rs6892335	A	G	3882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=61;PP=2551;SC=GCTGTTAATGAAGAAGTGCCT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=113;WE=150923413;WS=150923395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	150925144	rs3797875	A	G	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=49;PP=2175;SC=CAAATAATACAGGGCTTCCTT;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=150925152;WS=150925134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	150930166	rs34635112	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=801;ReadPosRankSum=0.970;SC=CTGTCAGTGTGTGCTGGGAGG;SOR=0.607;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=50;WE=150930174;WS=150930156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr5	150942919	rs6872614	A	G	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=19;PP=1287;SC=AATCCCATGTAGTTCCCACTG;SOR=1.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=150942927;WS=150942909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	150942969	rs2304053	G	A	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=25;PP=1484;SC=GCTGGAGTCTGGGTCCCAGGC;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=71;WE=150942977;WS=150942959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	150943085	rs2304054	G	A	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=65;PP=2595;SC=CCGTAACCTCGATGTAGACTT;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=150943093;WS=150943075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	150945483	rs3734055	C	T	7138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=92;PP=2965;SC=GGCCTCCCACCATCACTGGCC;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=122;TCR=92;TR=214;WE=150945491;WS=150945473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr5	150945699	rs10085060	G	A	5410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=77;NR=83;PP=2965;SC=GGAACCTTCAGCCTGTTGTGT;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=160;WE=150945707;WS=150945689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	150945862	rs3734057	A	G	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=81;PP=2965;SC=GGTGTCCTGTAACAACCAGTT;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=189;WE=150945870;WS=150945852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr5	150945931	rs3734058	C	T	8188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=128;PP=2965;SC=TGTAGCGAACCCTGCCATTGT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=114;TCR=128;TR=242;WE=150945939;WS=150945921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr5	150946132	rs3734059	G	A	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=62;PP=2661;SC=TTACATTGAGGATGTAGAAAT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=128;WE=150946140;WS=150946122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	150946436	rs9324700	A	G	7169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=98;PP=2965;SC=AAGCCCAATAAAGTGGAGGAT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=110;TCR=98;TR=208;WE=150946444;WS=150946426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr5	150946773	rs1432862	G	A	5739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.37;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	150946773	.	GGATAGAC	AGATAGAA,AGATAGAC	1581	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27,67;NR=25,71;PP=678,1581;QD=14.0666899012;SC=CAGTCTTGGCGGATAGACCCT;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=52,138;WE=150946788;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:138
chr5	150946780	rs35225143	C	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=5.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,70:0.42:168
chr5	150946966	rs1465690	G	A	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=78;PP=2965;SC=TCCCCAGGTAGGGGTCAATAG;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=91;TCR=78;TR=169;WE=150946974;WS=150946956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr5	150947719	rs3734060	C	T	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=47;PP=1704;SC=TCACCACCACCGAAGCAATGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=150947727;WS=150947709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	150948537	rs1469680	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=213;SC=AAAGACAGGGTGCAAGTTAGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=150948545;WS=150948527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	151049404	rs7719521	A	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=878;ReadPosRankSum=0.810;SC=GCTGATACCAATATCCTTGTC;SOR=0.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=49;WE=151049412;WS=151049394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,66:0.44:150
chr5	151052659	rs1978707	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=658;ReadPosRankSum=1.676;SC=AGGGCAGCTTGGATGTGCCAA;SOR=0.512;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=43;WE=151052667;WS=151052649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,44:0.40:109
chr5	151054155	.	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=784;ReadPosRankSum=0.977;SC=TAAGGGGCTGCGGTCACTGCC;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=58;WE=151054174;WS=151054145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr5	151131354	.	AG	A	596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=506;ReadPosRankSum=1.123;SC=AAACAAACACAGGGGGACCAT;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=18;WE=151131362;WS=151131344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr5	151138211	rs1549921	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=0.597;SC=GAGAGTGCGCACTAGAGGCCT;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=30;WE=151138219;WS=151138201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr5	151167259	rs57723600	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.363;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr5	151167380	rs7719617	A	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=1636;ReadPosRankSum=1.407;SC=TTATGAATGTATTCAATATGA;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=23;WE=151167431;WS=151167370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr5	151167387	rs201380366	A	AC	911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=1461;ReadPosRankSum=1.119;SC=TGTATTCAATATGAATATTTT;SOR=0.602;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=7;WE=151167431;WS=151167370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr5	151167389	.	GAATATTTTCAATTCATAAAATAAAATTTATGAAT	G	880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=2970;ReadPosRankSum=1.834;SC=TATTCAATATGAATATTTTCA;SOR=0.730;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=9;WE=151167431;WS=151167370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr5	151171614	rs142557386	T	G	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.098;SC=AGGTTCATCTTGCACTGTTCC;SOR=0.796;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=76;WE=151171622;WS=151171604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr5	151174605	rs2964569	C	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.12;MQRankSum=-0.589;NF=0;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=-1.719;SC=TTGGGAGGCCCAGGCGGGCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=151174613;WS=151174595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr5	151175139	rs10074267	A	T	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=940;ReadPosRankSum=-0.676;SC=GTTGTCAGGTAAGAAGATTTT;SOR=0.662;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=67;WE=151175147;WS=151175129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr5	151175202	rs10059511	G	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=893;ReadPosRankSum=1.184;SC=CTTTCCCTTTGTTGGAGGGCA;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=51;WE=151175210;WS=151175192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
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chr5	151236117	rs7711609	T	C	71.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TCTCTCTTTGTGGCCCAGGCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=151236125;WS=151236107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr5	151239290	rs7729026	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=0.953;SC=TGCCCAGAAGGTAGTGGGGCA;SOR=1.460;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=11;WE=151239298;WS=151239280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr5	151239306	rs6870491	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=248;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GGGCAAGACATGTTCTGAGCA;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=16;WE=151239314;WS=151239296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr5	151771817	rs1363422	C	T	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=21;PP=1129;SC=GAGAGGGCTGCTGGGAGGTGA;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=56;WE=151771825;WS=151771807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	152871721	rs3828595	G	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.032;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=504;ReadPosRankSum=-1.299;SC=GTGTGTTTGAGGGGGGATGTG;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=23;WE=152871729;WS=152871711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr5	152873649	rs17515380	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=541;ReadPosRankSum=-1.849;SC=TCTATTTCTGAGATGTCTTTC;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=34;WE=152873657;WS=152873639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr5	153029852	rs35033669	ACTGT	A	799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.818;NF=7;NR=7;PP=622;ReadPosRankSum=0.060;SC=ACAAATCCTGACTGTCTGTCA;SOR=0.603;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=14;WE=153029863;WS=153029842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr5	153029960	rs707176	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.546;NF=20;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=0.348;SC=CAGTCAACATTTTGACAACCA;SOR=0.750;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=37;WE=153029968;WS=153029950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr5	153035525	rs2963944	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=439;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGAACTGAGTAGGTGGAAGGG;SOR=1.547;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=25;WE=153035533;WS=153035515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr5	153372525	rs1057772	G	A	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=42;PP=2347;SC=AGGTCAAAACGTCTCCATTCT;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=120;WE=153372533;WS=153372515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	153372743	rs6866471	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=737;SC=TAAGGCAACAGGGGAACAGAT;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=153372751;WS=153372733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	153382072	rs35082504	GTCT	G	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=697;SC=AATAAAGAGTGTCTTCTTCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=153382082;WS=153382062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	153406644	rs9324765	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=631;SC=AAAACATACACTTCATCTTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=153406652;WS=153406642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	153406987	rs6889563	G	C	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=524;SC=AGACAGGTTAGAGTACAGAGG;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=153406995;WS=153406977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	153413390	rs2578377	C	T	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=34;PP=1114;SC=TCACTGGGACCAGGGATTCCA;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=153413398;WS=153413380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	153414545	rs34907432	C	CA	977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=26;PP=658;SC=AATGAAAGCCCAAAAAAAATT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=26;WE=153414553;WS=153414535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	153429459	rs690592	T	C	5803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=93;PP=2965;SC=CGGATGATGATGTCATCATAG;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=99;TCR=94;TR=191;WE=153429467;WS=153429449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr5	153432450	rs11451300	A	AT	3155.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.205;NF=39;NR=34;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.477;SC=TTTTGCTATAATTTTTTTTTC;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=73;WE=153432458;WS=153432440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr5	153432733	rs2578386	T	C	5972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=91;PP=2965;SC=CTGAGAAGGCTATCAATGAGT;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=179;WE=153432741;WS=153432723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr5	153432970	rs2255493	C	T	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=103;PP=2965;SC=TGCGAGTGGACGACCCTGATG;SOR=1.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=55;TCR=103;TR=158;WE=153432978;WS=153432960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	153570667	rs113838947	GC	G	1511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.221;NF=5;NR=28;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TCCACCTTCTGCTGTCTGCCT;SOR=0.983;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=33;WE=153570675;WS=153570657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
chr5	153674536	rs139016870	TTGTG	T	499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.003;NF=0;NR=14;PP=612;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GCACATATGCTTGTGTGTGTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=14;WE=153674547;WS=153674526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr5	153677361	.	TGA	T,TTCCCCGA	214.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=669;ReadPosRankSum=0.056;SC=CTCTTTGTACTGAGCAAAAAC;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=153677371;WS=153677351;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.30:20
chr5	153677362	.	GA	CT	638	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=638;QD=138.293574972;SC=TCTTTGTACTGAGCAAAAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=153677371;WS=153677351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr5	153677363	.	A	ATCCCCCT	214.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.869;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr5	153709043	rs1004976	G	A	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.668;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=9;PP=937;ReadPosRankSum=-1.978;SC=AGGAAGTGGGGTTTGCAGTTA;SOR=0.251;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=102;TCF=89;TCR=13;TR=52;WE=153709051;WS=153709033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr5	153783587	rs4958733	A	G	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=46;PP=2589;SC=TGCTGAGTGCACTAAGGGATG;SOR=1.350;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=84;TCR=46;TR=130;WE=153783595;WS=153783577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	153788991	rs2112605	G	C	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=54;PP=2605;SC=ATTTTTGATGGAACATAAAAT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=117;WE=153788999;WS=153788981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	153795274	rs11321246	TA	T	2510.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.24;NF=27;NR=27;PP=1225;SC=TTCCATAATTTAAAAAAAATG;SOR=1.338;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=54;WE=153795282;WS=153795264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	153835378	rs1007404	C	G	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=5;PP=642;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CAAACAACTCCATTCGCTTCT;SOR=1.216;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=113;TCF=92;TCR=21;TR=44;WE=153835386;WS=153835368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr5	153856974	rs1846966	C	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=699;ReadPosRankSum=-1.269;SC=TGGCCTGAGGCTGCTCACCGC;SOR=0.170;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=45;WE=153856982;WS=153856964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr5	154065382	rs33982250	TA	T	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.099;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.249;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr5	154065496	rs4958759	G	C	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1249;ReadPosRankSum=-1.622;SC=TCGTGATTCGGTTAATCCTCC;SOR=0.845;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=80;WE=154065504;WS=154065486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,98:0.48:203
chr5	154193735	rs863649	A	G	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=39;PP=1219;SC=AGTCCCAGGAAAGGGGACAAT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=51;WE=154193743;WS=154193725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	154203121	rs17641488	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=297;ReadPosRankSum=-1.394;SC=AAGAACTGTGCGGATAGACTG;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=24;WE=154203129;WS=154203111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr5	154247297	rs35471086	TAA	T	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=245;ReadPosRankSum=-1.987;SC=TTGCTTGAGCTAAAAGACATA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=9;WE=154247306;WS=154247287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr5	154268902	rs816739	C	T	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=65;PP=2150;SC=CAGGAAATTTCGCCATTCTCT;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=116;WE=154268910;WS=154268892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	154271391	rs702743	A	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=38;PP=1211;SC=TTTCTTATCAACCAAGAAGCA;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=154271399;WS=154271381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	154271948	rs816736	G	A	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=68;PP=2965;SC=GTCACTTACCGTCAGGGAGAA;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=161;WE=154271956;WS=154271938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	154278888	rs816740	C	T	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=38;PP=1162;SC=CAAGAACAGACCCTTTAGCCA;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=154278896;WS=154278878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	154282551	rs10515726	T	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=893;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CATTATAATATCACAGGATGA;SOR=1.473;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=98;TCF=74;TCR=24;TR=50;WE=154282559;WS=154282541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr5	154287016	rs76813157	T	TGAAAAAAAA	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=53.88;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	154287115	rs6580119	T	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=37;PP=1531;SC=GACACGACCATGAAATCCTAG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=154287123;WS=154287105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	154291219	rs6580121	A	G	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=865;SC=TTCCTTGCTCAATCCTGATCA;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=154291227;WS=154291209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	154291409	rs1974777	C	T	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=86;PP=2662;SC=CAGTCGACCTCGATGTCCTCG;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=137;WE=154291417;WS=154291399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	154291496	rs1974776	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=826;SC=GACATTTTCTGGTTATTCTAT;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=154291504;WS=154291486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	154296795	rs348735	A	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=2.070;SC=TACAAGTTACAATGCAAATAG;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=154296803;WS=154296785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr5	154300940	rs348739	A	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=36;PP=1233;SC=CCCAGGCTAAAGTATATACAG;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=154300948;WS=154300930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	154306972	rs2258437	T	C	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=14;PP=1309;SC=TAGAAAGTAATAGCTGTTTGT;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=154306980;WS=154306962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	154308282	rs2644743	C	T	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=39;PP=1097;SC=ATGAAGTCACCGGTGGTTCAT;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=154308290;WS=154308272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	154308307	rs1035368	G	A	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=825;SC=CACAGTCTGCGCTGTAAAAGC;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=154308315;WS=154308297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	154311235	rs2644744	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=633;SC=AGCTATCTCTTTCATAGGTCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=154311243;WS=154311225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	154311576	rs2544866	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	155771773	rs4434364	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=295;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GAAAAGTGATATTATTACAGT;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=18;WE=155771781;WS=155771763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
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chr5	156074654	rs141437738	TAAATTGA	T	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=-0.373;SC=CGTGAATACATAAATTGAAAG;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=3;WE=156074668;WS=156074644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr5	156184457	rs3215118	G	GT	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=1.515;SC=ACTTGACCAGGTTGTAAAGCA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=156184465;WS=156184447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	156278078	rs62619239	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.335;NF=53;NR=29;PP=1325;ReadPosRankSum=0.981;SC=ACATGATGATGATGAAGATGA;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=164;TCF=104;TCR=60;TR=82;WE=156278086;WS=156278068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr5	156349362	rs11134456	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=1.446;SC=CAAAAATCTCTGAAAACCCAA;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=156349370;WS=156349352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	156376703	rs6873053	A	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=22;PP=932;SC=AGTAGACTCAACACTACTCCA;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=156376711;WS=156376693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	156381370	rs7724832	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=0.917;SC=TGATCCCATTGTCCATTAACC;SOR=0.193;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=156381378;WS=156381360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr5	156390297	rs6882076	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=46;PP=1169;ReadPosRankSum=0.228;SC=GGTGGGACTCTTTAGTTTCAT;SOR=0.519;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=136;TCF=41;TCR=95;TR=70;WE=156390305;WS=156390287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr5	156459856	rs34670839	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=347;ReadPosRankSum=0.024;SC=GAAATATTTTCGAGCTTACCT;SOR=0.614;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=21;WE=156459864;WS=156459846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr5	156464212	rs4704837	T	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=15;PP=1086;SC=CAGGCAATTTTGCTGTACATC;SOR=1.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=156464220;WS=156464202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	156464242	rs2036402	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=434;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TTAGGAACAATCTCGAAATGA;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=29;WE=156464250;WS=156464232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr5	156469783	rs2270926	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.057;SC=ACCTTCTGGCGATGAAAAGTT;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=156469791;WS=156469773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr5	156469808	rs13173581	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=-1.550;SC=GATAATATGACCAAATTCTGC;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=156469816;WS=156469798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr5	156479323	rs1553318	G	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=321;ReadPosRankSum=-1.332;SC=TGGATGGTCCGCAGCTCCTCA;SOR=1.519;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=17;WE=156479331;WS=156479313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr5	156479424	rs1553317	A	C	7658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.64;SOR=1.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr5	156479424	.	AGT	CGC,CGT	1932	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=57,130;NR=23,58;PP=1427,1932;QD=18.5058484358;SC=AGGTAGAGACAGTTGTTGTCA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=192;TCF=133;TCR=59;TR=80,188;WE=156479434;WS=156479414;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.42:192
chr5	156479426	rs12522248	T	C	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,99:0.46:216
chr5	156479443	rs45439103	CTTG	C	5586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=2975;ReadPosRankSum=1.063;SC=CACTGGAACACTTGTTGTTGT;SOR=0.694;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=189;TCF=91;TCR=98;TR=88;WE=156479453;WS=156479433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,145:0.55:265
chr5	156479509	rs1553316	A	G	11537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=64;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=200;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=0.371;SC=CATTGTCGTCAGAACAGTCGT;SOR=0.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=382;TCF=201;TCR=181;TR=380;WE=156479517;WS=156479499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,433:1.00:434
chr5	156479557	rs141023871	GTTGGAACAGTCGTCA	G	2963.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=167;PP=2930;ReadPosRankSum=0.683;SC=AACAGTTGTCGTTGGAACAGT;SOR=0.785;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=232;TCF=39;TCR=193;TR=202;WE=156479579;WS=156479547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,151:0.43:349
chr5	156479568	rs139041445	C	CGTT	7387.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=165;PP=2964;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TTGGAACAGTCGTCATTGGAA;SOR=0.612;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=239;TCF=41;TCR=198;TR=202;WE=156479579;WS=156479547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,193:0.56:346
chr5	156482099	rs2270925	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr5	156482099	.	TTA	CTT	576	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=3;PP=576;QD=48.4206057586;SC=GAACAAGAGTTTATTTAAAAA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=13;WE=156482109;WS=156482089;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,13:0.72:18
chr5	156482101	rs2270924	A	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr5	156482459	rs1809941	G	T	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=37;PP=1463;SC=TCCAGCACATGGATGTGACAG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=156482467;WS=156482449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	156531561	rs2902306	C	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=158;SC=TTCAGGTGCACGGAGATATCC;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=156531569;WS=156531551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	156531736	rs1036199	C	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=19;PP=730;SC=GTCTCTCTGCCGAGTCGGTGC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=156531744;WS=156531726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	156531865	rs1036200	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=9;PP=256;SC=CAATTAAGAAAGAGAAATACA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=156531873;WS=156531855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	156640563	rs143962660	C	CT	474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=6;NR=9;PP=286;SC=TAACTTTTTTCTTTTTTTTTG;SOR=1.739;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=15;WE=156640571;WS=156640553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	156644775	rs5872504	T	TC	3045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=38;PP=2077;SC=TCTGTTGTTTTCCTGGGCCCT;SOR=0.812;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=49;WE=156644783;WS=156644765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	156644939	rs246747	G	A	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=27;PP=801;SC=CGCTAGCTCCGGGTGCAGGTG;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=156644947;WS=156644929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	156721863	rs5872508	T	TC	4973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=48;PP=2974;SC=CCCGGGCCATTCCCAGGTGAG;SOR=1.017;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=80;WE=156721871;WS=156721853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	156721986	rs7724099	C	A	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=59;PP=1792;SC=TAAAGCAGGTCCTCTTATCCA;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=85;WE=156721994;WS=156721976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	156723913	rs1600014	T	C	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=GCCCTACACATCCCTGGGTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=156723921;WS=156723903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	156734632	rs529619	G	A	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=204;SC=AATATAATGTGTGTCTCTACA;SOR=2.147;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=13;WE=156734640;WS=156734622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	156734644	rs144622623	G	GGTGTGTGTGT	501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;QD=50.17;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	156734665	.	A	ATG	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.309;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.637;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	156736617	rs151185381	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	156738830	rs393178	G	C	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.335;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=62;PP=1467;ReadPosRankSum=0.959;SC=CGTGGGCCCAGGGCCAGAAGG;SOR=2.440;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=75;WE=156738838;WS=156738820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr5	156803746	rs146807661	AGCACCCACTTATGCAAACCTT	A	1445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=2957;SC=CACCCTGAGAAGCACCCACTT;SOR=3.258;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=156803774;WS=156803736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	156898899	rs4704869	G	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=469;SC=AAAAGGTCAGGTTGGGTTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=156898907;WS=156898889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	156899869	rs4704870	T	C	4644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=74;PP=2687;SC=AACCCACTGTTATTAGACTGG;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=138;WE=156899877;WS=156899859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	157002552	rs6556092	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=21;PP=853;SC=CGGACCCGCAAGGCTACTCCC;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=157002560;WS=157002542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	157075943	rs72284585	TAC	T	721.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.027;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.754;NF=0;NR=19;PP=762;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TAATGTGCCATACACACACAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=19;WE=157075952;WS=157075933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr5	157078402	rs41275269	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=486;ReadPosRankSum=-1.165;SC=GACGCGGGCTCCGCGCCGAGC;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=27;WE=157078410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr5	157094771	.	TACAC	T,TAC	2415.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.19;QD=32.65;SOR=2.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,46,28:0.62,0.38:74
chr5	157094779	.	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=11.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.943;QD=9.48;ReadPosRankSum=2.618;SOR=2.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr5	157102063	rs10051782	G	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=569;ReadPosRankSum=2.178;SC=GGCCCCAACCGTCTGTAACCT;SOR=0.203;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=42;WE=157102071;WS=157102053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr5	157102159	rs10051838	G	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=556;ReadPosRankSum=0.739;SC=CATTTATCTCGGGTGATTATT;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=38;WE=157102167;WS=157102149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr5	157102185	rs6884959	A	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=2.180;SC=TAACCGCATCACACAACGAAT;SOR=0.582;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=29;WE=157102193;WS=157102175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr5	157106785	rs6556177	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=499;ReadPosRankSum=1.473;SC=TGCCCTGCTGCGAAGTAATCC;SOR=0.537;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=31;WE=157106793;WS=157106775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr5	157158326	rs2270821	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=0.665;SC=CATCCTCTTTGCCTGGGAGGT;SOR=0.301;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=157158334;WS=157158318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	157158372	rs2270820	T	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=320;ReadPosRankSum=-1.996;SC=AGACTATGACTGCCCTACGGC;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=16;WE=157158380;WS=157158362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr5	157158414	rs2270819	C	A	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=909;ReadPosRankSum=-0.296;SC=ACTTCCGGGGCGGGGCTATCT;SOR=0.849;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=48;WE=157158422;WS=157158404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr5	157158439	rs2270818	C	A	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.089;SC=CTTTCCTTTCCGCGTGTAGAA;SOR=0.820;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=66;WE=157158447;WS=157158429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr5	157164889	rs2270813	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=623;ReadPosRankSum=0.964;SC=ATTTTTATTTTCTCAGGGAAC;SOR=1.460;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=33;WE=157164897;WS=157164879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
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chr5	157170986	rs2279771	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
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chr5	157241367	rs140043015	TA	T	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GGTAAATGGTTAAAAAAAATA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=157241375;WS=157241357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr5	157247160	rs254673	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=-0.777;SC=AGATCTATTAGAAGTTATTTT;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=15;WE=157247168;WS=157247150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr5	158140222	rs3734105	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=-1.390;SC=CCATTTTTTCGGTGCCAGGTA;SOR=1.539;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=19;WE=158140230;WS=158140212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr5	158522577	rs12659540	C	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=327;SC=TCTTGACTGCCCTGAATTTTG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=158522585;WS=158522567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	158523584	rs6556385	T	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=390;SC=CTCCGCCCCCTGTTCCTGACT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=158523592;WS=158523574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	158526534	rs5872586	TA	T	265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.85;MQRankSum=1.682;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr5	158588633	rs139682876	GAAAAA	G	618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.316;NF=3;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=1.100;SC=CCCAGAACCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.646;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=12;WE=158588645;WS=158588617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr5	158588749	rs17056583	G	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=1.898;SC=CAAATATACAGAAGAGTATCC;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=6;WE=158588757;WS=158588739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr5	158596989	rs17719770	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ATTAATAATTTAACCATCTTA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=158596997;WS=158596979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	158697481	rs3734104	C	G	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=10;PP=727;SC=TAGAAGTAATCAGTTGTCATG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=158697489;WS=158697471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	158710419	rs1433046	C	T	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=399;SC=CATCAGTGACCCCAGTATATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=158710427;WS=158710409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	159478089	.	GT	G	36	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=16;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=36;QD=13.0;SC=AAAGGTTTTGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=159478097;WS=159478079;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr5	159505208	rs4360078	C	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=0.437;SC=AAGAAAATGTCGTTAAGCACA;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=25;WE=159505216;WS=159505198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr5	159516431	rs4441910	G	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTTGCCCAGAGTGGTCTCGAA;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=159516439;WS=159516421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	159640652	rs6556482	G	A	248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=2;PP=216;SC=GCTGCTATGAGGAGCTCTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=159640660;WS=159640642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	159659273	rs1130435	C	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=784;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GGGGGCAAGACGTTCAAGGTG;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=44;WE=159659281;WS=159659251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr5	159661723	rs2421775	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CATAAGCCACCGTGCCTGGCC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=159661731;WS=159661713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	159665523	rs10071756	C	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.29;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	159665527	rs10056227	G	A	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	159665534	rs10079413	A	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	159665599	rs2277954	G	A	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=27;PP=1615;SC=CTCTGTCCCGGCTGCTTCTTT;SOR=1.434;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=159665607;WS=159665589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	159665726	rs10071871	C	T	7927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	159665733	rs2277953	C	T	7956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.20;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	159707993	rs59603436	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.310;NF=5;NR=15;PP=244;ReadPosRankSum=-0.341;SC=TTCCTTCCCATGGGAAAGGTT;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=20;WE=159708001;WS=159707983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr5	159781724	rs62377486	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=394;ReadPosRankSum=-1.430;SC=CCCCACATGCCGGATGCTGTC;SOR=1.158;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=22;WE=159781732;WS=159781714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr5	159820931	rs10515808	C	A	3102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=68;PP=2166;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TTTGGAAATGCTGTGAATTGG;SOR=0.580;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=277;TCF=135;TCR=142;TR=138;WE=159820939;WS=159820921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,145:0.46:317
chr5	159831664	rs2961939	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=0.981;SC=ACCCAGGAGGCGGAAGTTGCA;SOR=0.039;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=14;WE=159831672;WS=159831654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	159831803	rs2961940	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1004;ReadPosRankSum=0.803;SC=AGGACAAATGATTATCAACTT;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=62;WE=159831811;WS=159831793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr5	159832250	rs2910182	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=-0.540;SC=GTAATTTGGGAGAAAAATTAT;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=28;WE=159832258;WS=159832240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr5	159835658	rs2961944	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=1.362;SC=ATGTATTACCATCTGAGAATT;SOR=0.665;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=20;WE=159835666;WS=159835648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr5	159840688	rs2961949	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=372;ReadPosRankSum=-0.284;SC=GAAAACTTCATACAACTTTTA;SOR=0.796;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=16;WE=159840696;WS=159840678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr5	159841493	rs79791419	A	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.886;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr5	159842465	rs2910190	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCCCCTCCTCAAGGTCTCTAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=159842473;WS=159842455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	159849586	rs1895320	A	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=1022;ReadPosRankSum=0.599;SC=TATTAGGCCTATCATAGCCAT;SOR=0.649;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=45;WE=159849594;WS=159849576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr5	159849991	rs2910200	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=663;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGCTTTCTTCCCTCTGAGTAG;SOR=1.556;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=30;WE=159849999;WS=159849981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr5	159851211	rs2910203	G	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=319;SC=GACTTCCACTGTCACTAACCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=159851219;WS=159851201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	159901408	rs2961918	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.366;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.718;SC=GCTGCTGAATCTTCAGAAAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=159901416;WS=159901398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	159912418	rs2910164	C	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr5	160043108	rs113179038	A	AT	220.80	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=23;SC=CTTCTCAAAGACTTTTTTTTA;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=160043117;WS=160043098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	160043109	rs17052845	C	T	229.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=87;SC=TTCTCAAAGACTTTTTTTTAA;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=160043117;WS=160043098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	160044855	rs1363199	G	A	5704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=AGCACGCTTGGAGGAATTGTT;SOR=0.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=160044876;WS=160044845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr5	160047265	rs6862674	C	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=170;SC=CCAGGTGACACTACAACTTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=160047273;WS=160047261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	160049355	rs2032804	C	T	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=440;SC=GCCTTCTACTCCTCTACCTCC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=160049363;WS=160049345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	160097429	rs3828604	T	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=20;PP=1250;SC=CTTGCATCCTTTCTATGACTT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=160097437;WS=160097419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	160097453	rs1990888	A	C	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=24;PP=1487;SC=CATTGAAGATATTAGAAAGAG;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=160097461;WS=160097443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	160097496	rs958912	A	G	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=43;PP=1577;SC=TTCACGACACATCTTTGCTTG;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=80;WE=160097504;WS=160097486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	160097632	rs958911	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=26;PP=753;SC=AGTCTCCCACGCGCACATCCT;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=160097640;WS=160097622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	160886759	.	C	G	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1211;ReadPosRankSum=-1.954;SC=GTCTGCCACTCTGTTGTCCAG;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=84;WE=160886767;WS=160886749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr5	161113004	rs13188991	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GGATGGCGTCGTCTCTGCCCT;SOR=1.030;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=25;WE=161113012;WS=161112994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr5	161114522	rs4454083	T	C	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=721;ReadPosRankSum=0.198;SC=CTGGGGACTCTGTTCCAGGTA;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=65;WE=161114530;WS=161114512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,74:0.38:195
chr5	161116903	rs4921402	C	A	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=826;SC=TGCTGTTTTGCAGTGATGAGT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=161116911;WS=161116893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	161119071	rs12522663	G	T	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=66;PP=2890;SC=TCTTCTCTGCGCTTATCGAGT;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=126;WE=161119079;WS=161119061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	161119125	rs13184586	C	G	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.338;SC=CACAGAAGGCCAAAAGGAAGG;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=67;WE=161119133;WS=161119115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr5	161128761	rs4277944	C	G	4998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=95;PP=2965;SC=CAATGGAAGTCAGTAGCAGTG;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=56;TCR=95;TR=151;WE=161128769;WS=161128751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr5	161322889	rs2279020	G	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=1143;SC=ATGCTTTAATGGTCACTGTAG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=161322897;WS=161322879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	161528280	rs211037	C	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AATTGCACAACTTTCCAATGG;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=145;TCF=90;TCR=55;TR=79;WE=161528288;WS=161528270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,90:0.53:170
chr5	161569430	rs12520992	A	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.578;SC=CTGCAATTGCATAGAAATACC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=161569438;WS=161569420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	161576418	rs211014	C	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=393;ReadPosRankSum=-1.407;SC=GCAGTTTGGGCTCCAAGATGA;SOR=0.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=20;WE=161576426;WS=161576408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr5	161579441	rs211013	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=261;ReadPosRankSum=0.731;SC=GTCTAGCAGGAAATTTGACAA;SOR=0.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=22;WE=161579449;WS=161579431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr5	162887650	rs2303076	G	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=1.555;SC=TCCGCATTCAGTTGTCGAGGA;SOR=0.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=29;WE=162887658;WS=162887640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr5	162890953	rs380101	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=10;PP=242;SC=GATTTAAACAGCAAAAAGGTA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=162890961;WS=162890943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	162891894	rs3756648	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AATGGGTTAAGTGTATGAATC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=4;WE=162891902;WS=162891884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr5	162905580	rs13183712	G	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=0.621;SC=GTAATGCAGTGGTGAAGATAT;SOR=0.188;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=162905588;WS=162905571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr5	162938940	rs11307015	GT	G	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=464;ReadPosRankSum=0.590;SC=AACAACGATGGTGCCTAATAT;SOR=1.385;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=13;WE=162938948;WS=162938930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	162940739	rs964945	G	A	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=39;PP=1356;SC=TAGAAATTAAGGTTTTGTAGA;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=162940747;WS=162940729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	162944709	rs7733775	A	G	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=52;PP=1230;ReadPosRankSum=-1.203;SC=AAACCTTTAGATCCATTGCTA;SOR=0.951;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=178;TCF=62;TCR=116;TR=77;WE=162944717;WS=162944699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,88:0.43:204
chr5	167182055	rs1862875	G	A	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=803;SC=CCCAGCTTACGCCGATGGTGA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=167182063;WS=167182045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	167420255	rs17069526	T	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=0.221;SC=CATGGACTTGTGAATCTAGAG;SOR=1.781;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=167420263;WS=167420245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr5	167489049	.	C	CT	70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.9991;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=61.19;NF=5;NR=0;PP=70;QD=15.2;SC=CTGTTTATTCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=167489057;WS=167489039;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr5	167553880	rs10055910	C	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=778;ReadPosRankSum=0.242;SC=GCATTGAGCACGGGACCTGTA;SOR=0.672;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=61;WE=167553888;WS=167553870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,75:0.39:190
chr5	167566600	rs1432822	T	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=0.495;SC=CTCCATTTGGTTAATGAGGGC;SOR=0.896;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=15;WE=167566608;WS=167566590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr5	167576239	rs10040595	A	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	167576513	rs35438448	T	TG	1380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.024;NF=5;NR=22;PP=927;ReadPosRankSum=-2.672;SC=CCGAGGCATGTTAGGAAAACA;SOR=0.517;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=27;WE=167576521;WS=167576503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr5	167589932	rs1560649	G	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=218;ReadPosRankSum=2.219;SC=TGCCAGGGGGGATCTCTGGGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=167589940;WS=167589922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr5	167622107	rs1472355	G	T	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=17;PP=1308;SC=TGAGGATGAGGGAGCAGAGGC;SOR=1.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=167622115;WS=167622097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	167653364	rs3733985	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=24;PP=735;SC=TGGGAGGACTTCCAGAGACCC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=167653372;WS=167653354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	167653394	rs3733986	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=330;SC=CTAGCTTTCTATTTTATTCAA;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=167653402;WS=167653384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	167674370	rs3733988	C	T	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=57;PP=2266;SC=TCAACCAGATCATCACCACTG;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=104;WE=167674378;WS=167674360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	167675392	rs12189266	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=26;PP=784;SC=GATTCTGCCACCAAAGGTGGG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=167675400;WS=167675382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	167689296	rs17632540	C	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=761;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TGCTGAACAACGCCTACTACC;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=57;WE=167689304;WS=167689286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr5	167798585	rs2287703	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=186;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TTCATCCCTCCACCTCCAAGC;SOR=0.877;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=167798593;WS=167798575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr5	167824840	rs10064053	T	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=671;ReadPosRankSum=0.792;SC=GTGCTAGTGATTGGGGCCACT;SOR=0.600;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=41;WE=167824848;WS=167824830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
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chr5	167836809	rs73392739	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=0.664;SC=CCCAGTCACCGGGGGCTATTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=167836817;WS=167836799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	167837017	rs113311252	TA	T	1985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.017;NF=10;NR=25;PP=1457;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GGGCTGGGGCTAGGGGCGGGA;SOR=0.621;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=35;WE=167837025;WS=167837007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr5	167837104	rs17070132	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=454;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TCTTCTTTAATCCTCACAAAG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=28;WE=167837112;WS=167837094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr5	167837202	rs888888	C	T	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=187;SC=CTTCACAAGACAGAGAGTGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=167837210;WS=167837192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	167850748	rs12054944	A	G	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1694;ReadPosRankSum=0.270;SC=TCCGGCCCTCAGGCTGCATCA;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=115;TCR=111;TR=111;WE=167850756;WS=167850738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,125:0.50:248
chr5	167851168	rs4976606	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=-0.642;SC=GTCGATATTTACTGACTGCTT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=16;WE=167851176;WS=167851158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr5	167855197	rs7735281	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=364;ReadPosRankSum=0.036;SC=CCATGAACTCTGAATATCCAG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=24;WE=167855205;WS=167855187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr5	167858462	rs376809293	TCTGGCTGG	T	1004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=2997;ReadPosRankSum=1.523;SC=AAGGGCCGTGTCTGGCTGGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=27;WE=167858477;WS=167858452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr5	167868779	rs3733981	A	G	3348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=59;PP=2138;SC=ACTTGAAGAAACAGAGCAGGG;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=167868787;WS=167868769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	167868809	rs3733980	C	T	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=52;PP=1632;SC=CAGTGGGAGTCATGGCCCCTG;SOR=1.240;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=81;WE=167868817;WS=167868799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	167868930	rs3948557	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=271;SC=GTGATCAGGCGTCATGAGAGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=167868938;WS=167868920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	167881029	rs111457550	TGGA	T	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.72;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr5	167913510	rs244903	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=567;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GAGGATGGACGTACTGGTGTC;SOR=0.651;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=48;WE=167913518;WS=167913500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,54:0.38:144
chr5	167913603	rs193466	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=0.552;SC=CAGGCTCTGACTCCTGCCCAA;SOR=0.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=26;WE=167913611;WS=167913593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr5	167913661	rs35439881	CAG	C	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=321;ReadPosRankSum=0.942;SC=CTGGTCCTCTCAGAGTGGAGC;SOR=0.199;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=9;WE=167913670;WS=167913651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr5	167919623	rs184957	T	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TGATGATGGTTTTACGTACAT;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=167919631;WS=167919613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr5	167921047	rs2432642	C	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=1.364;SC=TTGTATTGAACATGAGTCCTT;SOR=1.296;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=167921055;WS=167921037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr5	167933673	.	C	CT	114	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=18;MQ=60.3;NF=8;NR=2;PP=114;QD=12.3;SC=AGCCTTAAGTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=10;WE=167933681;WS=167933663;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr5	167943827	rs653568	G	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=761;ReadPosRankSum=1.956;SC=CATCCGTTGCGTATGGCTGCA;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=46;WE=167943835;WS=167943817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr5	168098463	rs292486	A	G	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1062;ReadPosRankSum=0.437;SC=GGCGCAAGGCAGAGAGGCCGG;SOR=0.418;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=148;TCF=52;TCR=96;TR=72;WE=168098471;WS=168098453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,81:0.50:163
chr5	168179922	rs10039601	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=263;ReadPosRankSum=0.163;SC=CAGAGTGGGATCCCAGAGTCC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=15;WE=168179930;WS=168179912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr5	168180081	rs10036727	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=944;ReadPosRankSum=1.735;SC=CTCACACAGCCGATCAAGTTA;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=65;WE=168180089;WS=168180071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr5	168212951	rs891921	A	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=615;ReadPosRankSum=0.032;SC=CAGTCCCTTGACAATCTCGGT;SOR=1.089;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=37;WE=168212959;WS=168212941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr5	168216489	rs2247645	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=0.587;SC=CACCTCCTGAGAAATATGGTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=168216497;WS=168216479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr5	168620720	rs79192318	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=0.998;SC=TCCCTGTTGGCGGGGCTTAGA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=168620728;WS=168620710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr5	168690612	rs62376934	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=579;ReadPosRankSum=-0.510;SC=ACATTGTTACAGCAGCCCTAG;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=43;WE=168690620;WS=168690602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr5	168690664	rs140379047	C	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=761;ReadPosRankSum=1.140;SC=CTGGGCGTATCTGTGTGCTAG;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=51;WE=168690672;WS=168690654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr5	169021610	rs4493692	C	T	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=818;ReadPosRankSum=0.136;SC=AACGTCAGCTCATCAGTATGA;SOR=0.900;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=47;WE=169021618;WS=169021600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr5	169025499	rs143453400	A	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=631;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GACAGTATGGAATCTAAGCCT;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=42;WE=169025507;WS=169025489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr5	169028481	rs3797713	T	C	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1602;ReadPosRankSum=0.163;SC=AGTTTCTATATACACACCAGT;SOR=0.676;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=93;TCR=93;TR=95;WE=169028489;WS=169028471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,113:0.51:221
chr5	169031150	rs3777084	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=364;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TGTAAGAAATTACACCCTATT;SOR=0.967;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=17;WE=169031158;WS=169031140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr5	169031218	rs2042248	G	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=212;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GTAAAGACTTGTCTTTAATAA;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=16;WE=169031226;WS=169031208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr5	169097474	rs2306564	G	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=672;SC=TTATAAAGACGTAGGGTCATT;SOR=3.477;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=169097482;WS=169097464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	169097505	rs111473735	T	TTTTTA	962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.191;NF=13;NR=2;PP=531;ReadPosRankSum=0.182;SC=GTGATATATCTTTTTATTTTA;SOR=0.892;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=15;WE=169097513;WS=169097495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr5	169097940	rs2306565	G	A	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=1053;SC=GCATAATGTAGTTGGTGTGGC;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=169097948;WS=169097930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	169098265	rs12656761	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=1.983;SC=TTGAGTCAGGCAGGTGGAGGT;SOR=2.015;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=169098273;WS=169098255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr5	169101599	rs2244445	C	T	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=51;PP=1410;SC=GCTTGCGTGCCGTTGTTACCA;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=169101607;WS=169101589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	169111137	rs147838293	TTGCTCTAAGTGG	T	1178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.140;NF=14;NR=5;PP=2934;ReadPosRankSum=0.071;SC=TATCTCTCTGTTGCTCTAAGT;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=19;WE=169111156;WS=169111127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
chr5	169111345	rs78243868	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=650;ReadPosRankSum=-0.650;SC=AACAAGCAAACGGTCATAAGG;SOR=0.936;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=34;WE=169111353;WS=169111335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr5	169126326	rs264847	A	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=385;SC=GATTCATGGGACCCCTTGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=169126334;WS=169126316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	169126552	rs2112704	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TGAACCCTGGGATACTTAGCT;SOR=0.295;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=29;WE=169126560;WS=169126542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr5	169127276	rs264845	A	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=204;SC=TGAAGGTAACAACTAAAAATG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=169127284;WS=169127266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	169145605	rs79390718	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=0.555;SC=ATTTACTGAGCAAACTAATTA;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=17;WE=169145613;WS=169145595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr5	169267589	rs113470914	C	CGAT	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=1.465;SC=GGAGATATGGCGATGATGATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=169267597;WS=169267585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr5	169310213	rs17646221	A	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=688;ReadPosRankSum=2.346;SC=GTATGGAGTTACTTACTTCAG;SOR=0.675;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=38;WE=169310221;WS=169310203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr5	169422920	rs2059110	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AACAGCCCCGAGTCTAGAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=169422928;WS=169422910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	169483706	rs17647491	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=-0.417;SC=AATCCAACTACGTGCAAAGGT;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=30;WE=169483714;WS=169483696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr5	169496051	rs6868503	T	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=-1.102;SC=CCTTGCCCCTTTCAAATTGAA;SOR=0.456;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=22;WE=169496059;WS=169496041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr5	169504743	rs1045168	T	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1072;ReadPosRankSum=0.408;SC=GAGTGGGCCGTCCCAGGTCTA;SOR=0.681;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=74;WE=169504751;WS=169504733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,90:0.48:187
chr5	169504944	rs79354516	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr5	169507067	rs9885452	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=600;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CATAGAAACCATGCCACGCCC;SOR=0.769;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=105;TCF=80;TCR=25;TR=48;WE=169507075;WS=169507057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr5	169509091	.	C	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-1.550;SC=CATATGTGGTCATTCCTAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=6;WE=169509099;WS=169509081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	169509929	rs55803405	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=0.978;SC=AAAGCCATGCGTGGAACATCG;SOR=0.412;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=19;WE=169509937;WS=169509919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr5	169535522	rs10063424	T	C	5610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=82;PP=2965;SC=TGCTCAGCTATGGAGGATCTG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=165;WE=169535530;WS=169535512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	169661994	rs957998	G	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=343;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GGTAAGAAGCGTGTTACTGAT;SOR=0.313;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=20;WE=169662002;WS=169661984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr5	169675693	rs80044664	AT	A	2621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.346;NF=30;NR=28;PP=2322;ReadPosRankSum=0.627;SC=TTGCTCGGCTATAACTTGCTA;SOR=0.535;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=58;WE=169675701;WS=169675683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr5	169679354	rs1546451	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=549;ReadPosRankSum=-1.724;SC=AATTCCTAGCCTGTAATTGGT;SOR=0.992;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=32;WE=169679362;WS=169679344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr5	169679947	rs6880961	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=1.115;SC=TCTGAAAGAACGCCAAGGGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=169679955;WS=169679937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr5	169685163	rs315717	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=-0.280;SC=GCAAAGGTCTCTGATGCACTG;SOR=0.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=33;WE=169685171;WS=169685153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr5	169685708	rs1702380	G	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TCCATTTTACGATAGTTATGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=169685716;WS=169685698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr5	169686007	rs432621	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-2.057;SC=CAGTTATACATCTTCATAATA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=169686015;WS=169685997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	169689604	rs395407	G	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=381;SC=GCCGGCCACTGTGAGTGACAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=169689612;WS=169689594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	169702390	rs2271146	C	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=27;PP=824;SC=TAATGGTCTTCTCGATTTAAG;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=169702398;WS=169702380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	169715038	rs315721	A	G	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=35;PP=1082;SC=GAAGACACATATGGCAGGCAG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=169715046;WS=169715028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	169720178	rs189520247	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=329;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GAGAGAGGGGGCCCTACCAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=13;WE=169720186;WS=169720168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr5	169810796	rs11739136	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=734;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CCCTTCAGCTCCTCCTGGTCC;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=45;WE=169810804;WS=169810786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr5	169810966	rs703507	A	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=23;PP=636;SC=CAGGACTGGGATCCTCATCTT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=169810974;WS=169810956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	169910084	rs4867968	G	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=630;ReadPosRankSum=-1.447;SC=AAGTGGAACTGGGGCCCGCAG;SOR=0.736;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=38;WE=169910092;WS=169910074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr5	170149573	rs2277952	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.159;SC=GAGCTCTTCACAGAGCATAGC;SOR=0.193;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=6;WE=170149581;WS=170149564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr5	170149674	rs12514966	A	T	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=789;ReadPosRankSum=0.593;SC=ACACTGTCTGATGGCTTGATG;SOR=1.249;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=50;WE=170149682;WS=170149664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr5	170159997	rs17650650	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TGTGTCCAACCCTGTACTAAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=170160005;WS=170159987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	170160749	rs4868018	G	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=531;ReadPosRankSum=0.663;SC=GCTCCAGCTCGTTACTCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=37;WE=170160757;WS=170160739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr5	170162666	rs1363712	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=409;ReadPosRankSum=0.145;SC=GTTTTCTCCATATAGGAAACC;SOR=1.236;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=25;WE=170162674;WS=170162656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr5	170215490	rs4868028	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GAAAATGCTGTACCGACCACC;SOR=0.741;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=10;WE=170215498;WS=170215480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr5	170221185	rs6884917	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=445;ReadPosRankSum=0.408;SC=TATAGTATTAAGACAGCTCAT;SOR=0.189;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=29;WE=170221193;WS=170221175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr5	170237090	rs6555921	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=1.468;SC=TTGCAAGTTTTATATTAATAT;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=170237098;WS=170237080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr5	170238904	rs3805458	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=691;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TCATTACCTACTTATTTATTT;SOR=1.099;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=37;WE=170238912;WS=170238894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr5	170239112	rs1063310	C	A	4077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=93;PP=2662;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GCGACAAGTTCAAGTTTGTCT;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=341;TCF=150;TCR=191;TR=164;WE=170239120;WS=170239102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,189:0.47:405
chr5	170288922	rs11749349	A	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=144;SC=GCTGCGAAGGACGAGCGGCGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=170288930;WS=170288912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	170289221	rs10475962	T	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=1.025;SC=ACCGGGACACTGGTCTGGGCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=170289229;WS=170289211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	170323258	rs2287893	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TTGTGTGTGTATCTGTTTTAT;SOR=0.074;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=20;WE=170323266;WS=170323248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr5	170336614	rs1833596	G	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=1.308;SC=GTAAATTTTGGTTTGCTTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=170336622;WS=170336604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	170341326	rs34458065	TTA	T	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=271;ReadPosRankSum=-0.514;SC=AAAATTCTGTTTATATATTCA;SOR=0.250;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=170341335;WS=170341316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr5	170343353	.	G	A	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=76;QD=27.6928031368;SC=ATTATAATGCGTTATATTCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=170343361;WS=170343343;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	170380523	rs930891	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=517;ReadPosRankSum=0.980;SC=TCATTGTGCTGATTTTGGAAT;SOR=1.058;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=25;WE=170380531;WS=170380513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr5	170395512	rs2879366	A	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=239;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAATTGGTGATGAAGTGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=11;WE=170395520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr5	170395820	rs11134672	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.689;SC=TGTGTCCTTAGGAGACTGCAT;SOR=0.504;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=11;WE=170395828;WS=170395810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr5	170395885	rs2446049	T	C	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=247;SC=TTAGCATCAGTAAGTTAAGAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=170395893;WS=170395875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	170610273	rs6555936	G	A	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=33;PP=2439;SC=AACATTTTACGAATAGTTGAG;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=77;TCR=33;TR=110;WE=170610281;WS=170610263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	170640827	rs4867648	C	A	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=47;PP=1317;SC=TGGTTTGTGTCTTTCCAAGGT;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=56;WE=170640835;WS=170640817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	170720755	rs2914330	T	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=566;SC=CAGAGTCTAGTCCGTTTGTCC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=170720763;WS=170720745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	170815125	rs2071276	G	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr5	170818897	rs3830032	A	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.06;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr5	170818906	rs3830033	T	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.92;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr5	170818964	rs138910433	G	GGT	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=219;ReadPosRankSum=0.755;SC=TTTGGGGCGGGGGGGAGAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=170818977;WS=170818954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	170818969	rs3830034	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GGCGGGGGGGAGAGGAAATCT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=170818977;WS=170818954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr5	170819887	rs3830035	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.262;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=1.855;SC=AACAGCTCTTGTTCATGAGTA;SOR=0.339;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=29;WE=170819895;WS=170819877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr5	170827115	rs6555952	C	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,52:0.36:143
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chr5	170847555	rs6555955	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=7;PP=159;SC=TCCTGGGCGCTGAGCCCAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=170847563;WS=170847545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	171200659	rs27947	T	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=364;ReadPosRankSum=0.419;SC=TCAAGCCAGATGCCCTCAAGA;SOR=0.211;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=19;WE=171200667;WS=171200649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr5	171200997	rs26400	C	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.919;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=353;ReadPosRankSum=0.594;SC=TTGTGCATTTCTTGTGTGTGC;SOR=2.689;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=19;WE=171201005;WS=171200987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr5	171201499	rs12153230	G	C	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1133;ReadPosRankSum=0.556;SC=ACCTCGGATGGCCGAGGGGAT;SOR=0.459;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=78;WE=171201507;WS=171201489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,90:0.58:156
chr5	171217371	rs11950253	G	A	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.566;NF=55;NR=44;PP=1573;ReadPosRankSum=-1.320;SC=ATGTTAAGGGGACCTCCATAA;SOR=0.691;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=94;TCR=77;TR=99;WE=171217379;WS=171217361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,112:0.55:203
chr5	171472417	rs4867662	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=2;PP=542;SC=TTTTTTTTTCAAAATACACAT;SOR=4.003;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=171472425;WS=171472407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	171472575	rs4868136	G	A	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=102;PP=2965;SC=GTGGGACCAAGGCCTTCTGTA;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=111;TCR=102;TR=213;WE=171472583;WS=171472565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr5	171480055	rs4569891	G	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=30;PP=1132;SC=TTCTGGAACAGATTCCAGGCA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=171480063;WS=171480045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	171481606	rs10155597	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=29;PP=1331;SC=TGTTGCTCTCACACTGCGCCA;SOR=1.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=71;WE=171481614;WS=171481596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	171509644	rs11741056	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=44;ReadPosRankSum=-0.316;SC=ACCCCGTTGCTGTGTGACCTG;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=171509652;WS=171509634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr5	171510180	rs10516093	T	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=-2.538;SC=GGTTGGATCATGGAGCAAAAT;SOR=0.728;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=29;WE=171510188;WS=171510170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr5	171533629	rs2306963	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CTCACCACTTAGAGGGCGTGA;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=14;WE=171533637;WS=171533619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr5	171533656	rs2306962	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=482;ReadPosRankSum=0.867;SC=TGGGAGGGTCCGACTTGGCGA;SOR=0.562;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=28;WE=171533664;WS=171533646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr5	171533782	rs2306961	T	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.959;SC=AGGGCGTGTCTTTCATGGTCT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=61;WE=171533790;WS=171533772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr5	171534682	rs3836825	T	TGCCCACAGGCTGACCGGGC	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GCAGGGCGTGTAGCCCTTGTC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=3;WE=171534690;WS=171534672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr5	171554473	rs2279514	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1019;ReadPosRankSum=0.048;SC=CTGCCCAGCCGTCGAGACGGG;SOR=0.485;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=57;WE=171554481;WS=171554463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr5	171554516	rs2029523	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=332;ReadPosRankSum=1.435;SC=GGGTCCACCCATGCCCAATGC;SOR=1.071;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=21;WE=171554524;WS=171554506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr5	171583610	rs41275267	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=503;ReadPosRankSum=-1.262;SC=GCTGGGACAGACAGGGCGGCA;SOR=0.688;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=24;WE=171583618;WS=171583600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr5	171583809	rs2306960	C	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=0.632;SC=AGAGGAGATACAGGAGGTCAA;SOR=1.265;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=23;WE=171583817;WS=171583799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr5	171627773	rs2306959	G	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=385;ReadPosRankSum=-1.384;SC=AATGTGGCATGTGTGTGGCAG;SOR=2.200;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=18;WE=171627781;WS=171627763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr5	171630197	rs201583078	T	TTTTC	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.526;SC=AATTTTTCTTTCCCCCCCACC;SOR=1.663;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=10;WE=171630216;WS=171630187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr5	171630204	rs372914830	CACCCT	C	757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CTTTCCCCCCCACCCTAACCA;SOR=1.712;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=9;WE=171630216;WS=171630187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr5	171760569	rs12033	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=441;ReadPosRankSum=0.088;SC=GAAAGAAGTCAAATGGTAAAG;SOR=0.127;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=27;WE=171760577;WS=171760559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr5	171777619	.	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=-1.820;SC=AGGATGCTGTCAAACTGCTCC;SOR=0.997;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=22;WE=171777627;WS=171777609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
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chr5	171881423	rs139600850	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=559;ReadPosRankSum=-2.440;SC=GGAGCGCTGGGGGCGCGCCGC;SOR=0.349;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=33;WE=171881431;WS=171881413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr5	172113235	rs747829	C	T	3740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=64;PP=2180;ReadPosRankSum=-1.585;SC=GCTCCCAGGACGATAGTGATT;SOR=0.593;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=294;TCF=174;TCR=120;TR=151;WE=172113243;WS=172113225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,179:0.51:350
chr5	172196711	rs2431663	G	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=44;PP=1389;SC=TCAAGGCAGTGATGCCCAAGG;SOR=1.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=172196719;WS=172196701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	172261462	rs35566639	G	A	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1178;ReadPosRankSum=0.847;SC=CCGGCCAGTCGGGAGTTCCCT;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=77;WE=172261470;WS=172261452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,85:0.71:119
chr5	172261489	rs35768025	C	A	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=974;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GCAGAGGGAGCGCCCCGGCAC;SOR=1.341;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=57;WE=172261497;WS=172261479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,65:0.75:87
chr5	172261538	rs78078909	C	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=2.083;SC=AAAGCGGCTCCCCGCCCTGTG;SOR=2.804;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=20;WE=172261546;WS=172261528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr5	172261583	rs111773832	GC	G	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.640;HP=9;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=0.652;SC=CCCCAGGCGAGCCCCCCCCCT;SOR=2.807;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=172261601;WS=172261573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	172261593	rs63376061	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.640;HP=9;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=83;ReadPosRankSum=-1.074;SC=GCCCCCCCCCTGCCGCACACG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=2;WE=172261601;WS=172261573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	172294194	rs793027	G	T	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=65;PP=2624;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GACCTTTATCGTGCTACCTGG;SOR=0.351;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=123;WE=172294202;WS=172294184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr5	172315872	rs4868227	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.729;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr5	172324128	rs13154777	A	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=1.027;SC=GGGACCCCAGACAAGAAGAGG;SOR=0.463;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=24;WE=172324136;WS=172324118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr5	172336616	rs2302957	C	T	6372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=86;PP=2965;SC=TCCCCCGCAGCTGAGATCTTT;SOR=0.913;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=112;TCR=86;TR=197;WE=172336624;WS=172336606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr5	172341917	rs17716949	T	C	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.056;NF=39;NR=61;PP=1280;ReadPosRankSum=0.295;SC=AAACTGGTTGTGGAGGCACTC;SOR=1.004;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=214;TCF=92;TCR=122;TR=100;WE=172341925;WS=172341907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,114:0.48:239
chr5	172342029	rs35941893	G	GT	2191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.768;NF=11;NR=39;PP=1709;ReadPosRankSum=0.063;SC=GCTCCCTGGGGTTTTAAGCCC;SOR=0.413;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=92;TCF=17;TCR=75;TR=50;WE=172342037;WS=172342019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,83:0.57:146
chr5	172347440	rs13187960	G	A	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=56;PP=1609;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GAGACCCCACGGTGACCTCGT;SOR=0.970;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=197;TCF=80;TCR=117;TR=89;WE=172347448;WS=172347430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,106:0.46:231
chr5	172350818	.	C	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TGCCCCCATTCTGCAGATGAG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=172350826;WS=172350808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	172381973	rs80167678	A	AGGT	2814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=2376;ReadPosRankSum=0.324;SC=TTCCCTGGGAAGTTGCGGAAG;SOR=0.581;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=45;WE=172381981;WS=172381963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr5	172395664	rs11749686	T	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=63;PP=1990;SC=TTCAAAGTTATTGGTGTTTTG;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=99;WE=172395672;WS=172395654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	172396394	rs505788	C	T	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=61;PP=2579;SC=GAAATAAAGACCTGTTTTCTC;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=129;WE=172396402;WS=172396384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	172447762	rs17075508	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=734;ReadPosRankSum=1.782;SC=GGACAGAACCGTTCCTGTGAT;SOR=0.570;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=44;WE=172447770;WS=172447752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr5	172512686	rs671387	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=208;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TCCCAAAGTGCTGGGATTACA;SOR=0.275;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=13;WE=172512694;WS=172512676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr5	172573767	rs29798	T	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=310;ReadPosRankSum=0.054;SC=ATAGTTAGTATGTTAATATTA;SOR=0.544;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=20;WE=172573775;WS=172573757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr5	172585927	rs5745160	TC	T	2642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.815;NF=4;NR=55;PP=2171;ReadPosRankSum=-2.912;SC=CCTCTTGTTTTCAGCTTGGTG;SOR=0.820;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=8;TCR=120;TR=59;WE=172585935;WS=172585917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,85:0.44:194
chr5	172588027	rs255303	G	T	174.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TGGACAAAAGGAGAAAGCATG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=172588035;WS=172588017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr5	172662024	rs2277923	T	C	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=865;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GCTGCTGCTGTTCCAGGTTTA;SOR=0.679;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=58;WE=172662032;WS=172662014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,65:0.46:142
chr5	172745269	.	AAGAGAG	A,AAGAGAGAGAGAG	1217.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.96;QD=34.79;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,16,19:0.46,0.54:35
chr5	173043416	.	C	CCCG	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.931;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=1.782;SC=CGCCAGTTCCCCCGCCGCCGC;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=173043424;WS=173043406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	173316729	rs359467	G	A	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=51;PP=2849;SC=TGCTCCTAAAGATAATAAATG;SOR=1.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=87;TCR=51;TR=138;WE=173316737;WS=173316719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	173380346	rs969518	C	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=773;SC=AATATTAGAACGGGAGCATTT;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=173380354;WS=173380336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	173383194	rs1564823	C	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=279;SC=CTCTTCTGTTCATTCTGACCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=173383202;WS=173383184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	174152100	rs2048152	G	A	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=47;PP=1511;SC=GGAGCGGGGGGCGGGTGTTCC;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=174152108;WS=174152090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	174156168	rs4242182	T	C	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=50;PP=2521;SC=CTAGGACATATGAGCCCTACC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=174156176;WS=174156158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	174178535	rs1108172	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=412;ReadPosRankSum=-1.208;SC=CACAAAAGCTTCATATATTCT;SOR=0.957;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=20;WE=174178543;WS=174178525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr5	174178774	rs7709117	G	A	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=836;ReadPosRankSum=-0.716;SC=GCTCTTGGGCGGCCGCGTTTC;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=54;WE=174178782;WS=174178764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,65:0.39:165
chr5	174178896	rs11749398	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=349;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TGCTCCCCTCTGTTCGGCAGG;SOR=1.148;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=25;WE=174178904;WS=174178886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr5	174868700	rs686	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TTAATAGCAAGCCCCAGAGCA;SOR=0.787;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=15;WE=174868708;WS=174868690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr5	174868840	rs155417	T	C	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=55;PP=2111;SC=CCAATATGACTGATAGGGCTG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=113;WE=174868848;WS=174868830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	174870150	rs4532	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CTCAAGTTCCCAAGCAGGGAA;SOR=0.968;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=22;WE=174870158;WS=174870140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr5	174935916	rs2662168	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=752;ReadPosRankSum=-2.906;SC=GGGATTACAGACGTAAGCCAC;SOR=0.484;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=45;WE=174935924;WS=174935906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr5	174936038	rs35420613	A	G	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1349;ReadPosRankSum=-1.606;SC=TTCTTAGGCAAGGAATTGTTC;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=84;WE=174936046;WS=174936028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,101:0.47:216
chr5	174943551	rs3215174	GA	G	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=1.136;SC=TCAAATGGTTGAAAAAAAAAG;SOR=0.551;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=11;WE=174943559;WS=174943541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr5	175307256	rs3822674	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=42;PP=1393;SC=CCCAAGTAGCTTGAAAAAGGG;SOR=1.046;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=175307264;WS=175307246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	175307373	rs11747985	G	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=253;SC=CTGCCAGGAGGACCACTGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=175307381;WS=175307363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	175511992	rs62389230	C	T	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.633;NF=62;NR=37;PP=1440;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GTTGTTGCCTCGAAGGTATGT;SOR=0.888;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=189;TCF=116;TCR=73;TR=99;WE=175512000;WS=175511982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,107:0.53:203
chr5	175792605	rs2303667	G	C	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=55;PP=2416;SC=TGCTGGCGCTGGGCGGCGCCG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=139;WE=175792613;WS=175792595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	175793717	rs3815898	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=719;SC=CACCGCTCTCCGGGGCACAGG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=175793725;WS=175793707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	175811094	rs56989856	C	CGT	6454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.249;NF=39;NR=116;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GGAGTGTGCACGTGTGTGTAA;SOR=0.962;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=190;TCF=46;TCR=144;TR=155;WE=175811102;WS=175811083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,232:0.99:234
chr5	175843140	rs79333895	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=398;ReadPosRankSum=1.164;SC=CCCCGGGTGCGCGCCCTGAGC;SOR=0.171;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=23;WE=175843148;WS=175843130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr5	175843461	rs33956988	CG	C	943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=30;PP=1085;SC=ACCCGAGCCGCGGGGGAGCCG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=30;WE=175843469;WS=175843451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	175915835	rs2963667	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=640;SC=AGGAACTGTACTTTAGAGGAA;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=175915843;WS=175915825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	175923431	rs2963670	G	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=222;SC=AAAGTCTAAGGGTTGATCTTT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=175923439;WS=175923426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	175933691	rs113700453	TGTGTGTGC	T	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=1497;SC=ACTTCAGAGTTGTGTGTGCGT;SOR=3.056;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=12;WE=175933706;WS=175933681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	175956271	rs890835	A	C	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=65;PP=2644;SC=ACCCAGGAGCAGACCTGGGCA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=135;WE=175956279;WS=175956261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	175956516	rs2241585	G	A	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=86;PP=2965;SC=GTGGGGCAGGGTACTCACAGC;SOR=0.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=161;WE=175956524;WS=175956506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	175992258	rs6556275	A	G	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=25;PP=1432;SC=GGGTGGGCTCAGGTCAGACCC;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=78;WE=175992266;WS=175992248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	175992519	rs4523018	T	A	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=953;SC=GGGCCAGCCCTGTGCTTGGCT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=175992527;WS=175992509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	175994173	.	C	CT	100	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=19;MQ=60.69;NF=0;NR=8;PP=100;QD=13.0;SC=GTGCACAGGACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=8;WE=175994181;WS=175994163;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,8:0.30:27
chr5	175995935	rs10056130	C	T	7060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=96;PP=2965;SC=GGCTCACCACCGGCCCCTTCT;SOR=0.915;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=125;TCR=96;TR=221;WE=175995943;WS=175995925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr5	176001975	rs1078450	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=2;PP=323;SC=CTGGTGCCAGTGGCGTGACTG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=176001983;WS=176001965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	176002144	rs4242200	A	C	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=73;PP=2855;SC=ATGGCTCCATAGTCCTCAATG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=152;WE=176002152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr5	176002873	rs3762969	C	T	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=63;PP=2665;SC=CTGTCAGAACCCTGCTCTCTA;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=130;WE=176002881;WS=176002863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	176002926	rs3762968	C	A	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=67;PP=2965;SC=TGGCTCTCTGCCCTCTGCCCT;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=176002934;WS=176002916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	176004312	rs11749537	A	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=4;PP=501;SC=CGGGCGGGGCATCCAGAGATA;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=176004320;WS=176004302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	176004476	rs11134982	T	C	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=50;PP=2018;SC=GAGCGGGCAGTGGGCTCAGCC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=100;WE=176004484;WS=176004466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	176004846	rs1565149	C	T	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=61;PP=1997;SC=AGCAAGCGGGCGTGCATGTGT;SOR=1.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=176004854;WS=176004836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	176004866	rs35146200	A	AGT	2135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.254;NF=6;NR=31;PP=1921;ReadPosRankSum=1.435;SC=TGAGTGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=1.460;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=37;WE=176004874;WS=176004856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
chr5	176004903	rs11747451	T	C	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=26;PP=922;SC=GGGGTGGCCATGAGTGAATCT;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=176004911;WS=176004893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	176005175	rs1565150	A	C	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	176005184	rs1565151	G	A	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	176005477	rs2358747	C	T	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=62;PP=2952;SC=AGGCCACAGACGGCGGGAACC;SOR=0.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=142;WE=176005485;WS=176005467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	176008238	rs4867840	G	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=652;SC=CAGGCCTGATGACTGCCTGCG;SOR=2.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=176008246;WS=176008228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	176011264	rs752139	T	C	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=62;PP=1709;SC=GATCCAGGTATGTGCTCCCTG;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=176011272;WS=176011254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	176011889	rs4868660	G	A	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=102;PP=2965;SC=TCTCAGTGGCGGCCAACGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=165;WE=176011897;WS=176011879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	176017549	rs4868662	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=14;PP=771;SC=TTCCCTCACACTCATCTTTCT;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=176017557;WS=176017539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	176018545	rs11134984	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=46;PP=1360;SC=AGTGACGGTGGTGGTGGTGAT;SOR=2.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=176018553;WS=176018535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	176024880	rs4868663	C	T	4445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=56;PP=2965;SC=CCCCTGCTTCCCCTGGTGCTG;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=127;WE=176024888;WS=176024870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	176025938	rs6556276	T	C	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=51;PP=2251;SC=TCCAAGGGCATGGGATCTGCC;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=176025946;WS=176025928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	176053336	rs72322414	GGTGT	G	966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=6;PP=869;SC=TTGTGTGCCTGGTGTGTGTGT;SOR=2.030;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=176053347;WS=176053326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	176053645	rs2291441	C	G	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=36;PP=1844;SC=GAGTCTCCCCCGCCCCCGCCC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=176053653;WS=176053635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	176056529	rs4868669	A	G	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=28;PP=1694;SC=CCCGCCCCTTACCCACCGACG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=80;WE=176056537;WS=176056519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	176069831	rs901740	G	A	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=30;PP=773;SC=TCTACCCCCAGTGCACCATGG;SOR=2.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=176069839;WS=176069821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	176081856	rs13183320	A	G	4479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=53;PP=2965;SC=GGCTCCTGGGATGGGCCTGGC;SOR=1.261;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=88;TCR=53;TR=141;WE=176081864;WS=176081846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	176083175	rs6878977	T	G	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=41;PP=1270;SC=GGGTACTGGGTTGGGTATGAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=176083183;WS=176083165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	176083997	rs4868677	G	A	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=86;PP=2482;SC=CCTGGCCTACGCAGGCCTCTG;SOR=1.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=123;WE=176084005;WS=176083987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	176304399	rs2304517	A	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=23;PP=1285;SC=GGAAAGAGCTATGCCTAAGCC;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=176304407;WS=176304389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	176305466	rs2304516	T	A	8794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=140;PP=2965;SC=CCTCTCTGCATCCCCATCAGG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=129;TCR=140;TR=269;WE=176305474;WS=176305456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr5	176305678	rs478253	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=383;ReadPosRankSum=-2.792;SC=GTGACGTGCTCCCACTACCAA;SOR=1.484;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=22;WE=176305686;WS=176305668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr5	176306676	rs2292257	G	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=11;PP=780;SC=AGGAGGTGTCGGCTGGGGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=176306684;WS=176306666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	176314434	rs2278493	C	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=53;PP=2181;SC=CGGTCCCACACTCAGGCCAGG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=110;WE=176314442;WS=176314424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	176314459	rs2278492	G	A	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=53;PP=2092;SC=TACCGCTGCCGTCAGGGGTGG;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=176314467;WS=176314449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	176314639	rs6875296	G	A	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=75;PP=2965;SC=GGGCAGCCACGGCAGTCACCA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=152;WE=176314647;WS=176314629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	176315299	rs4976662	C	T	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=40;PP=2309;SC=CGTGTTCATGCCAACTAATCA;SOR=1.153;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=108;WE=176315307;WS=176315289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	176488952	rs148941289	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=0.132;SC=AACCTCACCTCGCCTCACCTG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=176488960;WS=176488942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	176516631	rs1966265	G	A	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.420;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=742;ReadPosRankSum=1.362;SC=CCTGTTGGGGGTCCTGCTGAG;SOR=0.976;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=55;WE=176516639;WS=176516621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,62:0.54:114
chr5	176516953	rs434434	A	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=1005;SC=TGAGCTCCTTACCTGGGTGTG;SOR=1.791;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=46;WE=176516961;WS=176516943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	176517136	rs59390048	C	CGTGT,CGT	1751.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=28,28;NR=8,8;PP=148,1089;SC=TGTGTGTATGCGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=36,36;WE=176517144;WS=176517126;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:35
chr5	176517170	rs387598	G	A	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-5.538;NF=60;NR=24;PP=1707;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GGCCACTGTCGTGTGCACTAA;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=84;WE=176517178;WS=176517160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr5	176517292	rs442856	A	G	6341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=101;PP=2965;SC=CATGCGTTGCAAAGTGCTTGT;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=185;WE=176517300;WS=176517282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr5	176517326	rs422421	T	C	5091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=83;PP=2965;SC=GGTGTGTTCTTTGTACACAGG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=153;WE=176517334;WS=176517316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	176517461	rs446382	T	G	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=40;PP=2019;SC=AGCCTGTGCGTCTGTGCTGTG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=176517469;WS=176517451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	176517797	rs376618	C	T	12497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=189;PP=2965;SC=CATAGGGACCCCTCGAATAGG;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=377;TCF=188;TCR=189;TR=377;WE=176517805;WS=176517787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,451:1.00:451
chr5	176518784	rs452885	C	T	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=50;PP=1882;SC=GCAGCATCCGCTATAACTACC;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=176518792;WS=176518774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	176519287	rs393923	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=244;SC=TATGGGTGCCGGTGGTCAGGG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=176519295;WS=176519277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	176522728	rs42409	C	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=267;SC=CCGGAAGGTACAGGCGCTAGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=176522736;WS=176522718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	176523562	rs31777	C	A	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=43;PP=2330;SC=CCCCGGTCGTCGGGAGGGCGC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=176523570;WS=176523552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	176523597	rs31776	A	G	4463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=67;PP=2965;SC=CCCTGGCCCTACCTCCAGGTG;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=145;WE=176523605;WS=176523587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	176630984	rs7721671	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.578;SC=GTATGATCTATTCTAGGTTGT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=176630992;WS=176630974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr5	176728878	rs80237806	T	C	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1154;ReadPosRankSum=0.611;SC=AGGGGCTAGATGCTGTGGGCC;SOR=0.872;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=76;WE=176728886;WS=176728868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr5	176729736	rs58443060	AC	A	1458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=12.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=3.108;QD=10.57;ReadPosRankSum=4.133;SOR=1.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
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chr5	176733116	rs4631	A	G	3658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.87;NF=51;NR=61;PP=2272;SC=GTCTTGCCCGATTCAAAAGCA;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=176733124;WS=176733106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	176733341	rs4073745	A	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=694;ReadPosRankSum=-0.492;SC=CCTGGCCCAGAGGAGATTGGT;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=43;WE=176733349;WS=176733331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr5	176733616	rs9834	T	C	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=64;PP=2237;SC=AGGCTTAGCCTCTCTGCCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=176733624;WS=176733606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	176734855	rs4568379	G	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=276;ReadPosRankSum=1.513;SC=GCTCCCGCTCGGCCGCCCCTG;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=26;WE=176734863;WS=176734845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr5	176737720	rs13190036	A	G	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=57;PP=1879;SC=AGAGAGGATGAGGTGAAGGGG;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=176737728;WS=176737710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	176738538	rs62397242	C	A	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=715;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CTGGTCCCAGCGGCAGCCCCA;SOR=0.584;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=50;WE=176738546;WS=176738528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr5	176761535	rs11738681	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.693;SC=AGCACTGCCCAGCCGGCTAGG;SOR=0.385;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=15;WE=176761543;WS=176761525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr5	176765395	rs11748912	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGGTCCCCACGAGCCACAGGC;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=11;WE=176765403;WS=176765385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr5	176798040	rs56235845	T	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=414;ReadPosRankSum=0.979;SC=CGGGTGAGCTTCCGGGCCGCG;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=25;WE=176798048;WS=176798030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr5	176798065	.	GGGGCC	G	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr5	176798306	rs11746443	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=923;ReadPosRankSum=-1.508;SC=GAGGAAGGGGGTCCAGGTGGG;SOR=0.834;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=63;WE=176798314;WS=176798296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr5	176813404	rs3812036	C	T	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1350;ReadPosRankSum=0.712;SC=CCTTGGACAACGCTGGCTCAT;SOR=0.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=85;WE=176813412;WS=176813394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,93:0.49:190
chr5	176814656	rs33921462	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=564;ReadPosRankSum=0.045;SC=AGCATGGCAGGAGCGGCCACT;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=31;WE=176814664;WS=176814646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr5	176815124	rs5030873	T	C	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=942;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TCAACATCCATGGTGGCCGTG;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=75;WE=176815132;WS=176815114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,94:0.51:183
chr5	176830451	rs17876048	C	T	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCCAAGCTCTCTTCCCGTCCC;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=80;WE=176830459;WS=176830441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,89:0.45:198
chr5	176830627	rs17876032	G	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=469;SC=GCCTGCGGGGGGGGTAGGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=176830635;WS=176830617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	176831119	rs17876031	A	G	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=75;PP=2956;SC=CTGAGGACGGAGAGCCCGCGG;SOR=1.273;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=49;TCR=75;TR=123;WE=176831127;WS=176831109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	176831177	rs35966430	TC	T	3920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.08;NF=28;NR=59;PP=1706;SC=GGCTCCTCCTTCCCCCCCCCA;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=87;WE=176831194;WS=176831167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	176831826	rs17876030	C	G	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=694;SC=TCGCAGAAGGCTCCGGTGTAG;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=176831834;WS=176831816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	176831980	rs17876029	T	C	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=42;PP=1788;SC=CTCTCCTTCCTGGCACACCAC;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=96;WE=176831988;WS=176831970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	176836532	rs1801020	A	G	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=82;PP=2763;SC=CCCTCATGGCATCCGTCCGTT;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=135;WE=176836540;WS=176836522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	176858049	rs867755	C	T	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=894;SC=GACCTTGCCCCGGAGCAGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=176858057;WS=176858039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	176859848	rs2731664	C	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=0.322;SC=TTATGCCCAGCGGAGGGGGCT;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=39;WE=176859856;WS=176859838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr5	176862963	rs4976695	T	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=6;PP=255;SC=AGGTCCCCCCTGGCCAGCGGG;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=176862971;WS=176862953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	176863519	rs1130857	G	C	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=32;PP=1214;SC=TGGAGCCGCCGTTCAAGCCTG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=64;WE=176863527;WS=176863509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	176867943	rs335435	A	G	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=56;PP=2483;SC=AGTGCTTCCAAGAGCTGAATG;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=176867951;WS=176867933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	176885178	rs28538572	A	G	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=34;PP=1715;SC=GCAGCCAGGGACTCCCCTTCC;SOR=0.959;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=78;WE=176885186;WS=176885168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	176885499	rs2544809	T	C	6523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=115;PP=2965;SC=GCATCGTGGATCTCCGTGGCG;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=85;TCR=115;TR=200;WE=176885507;WS=176885489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr5	176886539	rs385981	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=3;PP=423;SC=GGAGTGAGGGCGGGGGGCTGC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=176886547;WS=176886529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	176894756	rs2545794	C	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=34;PP=1599;SC=GGAAGAACTCCGCCACCTTAG;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=176894764;WS=176894746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	176895817	rs446104	GC	AA	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=50;PP=2947;SC=GGTGGAGAAGGCGGCGAGGGA;SOR=0.966;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=120;WE=176895826;WS=176895807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	176916516	rs335462	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=836;ReadPosRankSum=1.920;SC=TGGGCGTGGCCGGCTGGCTGT;SOR=0.860;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=54;WE=176916524;WS=176916506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr5	176917078	rs734825	T	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=1181;SC=GCTCCTGGGGTTCCCCTCATG;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=176917086;WS=176917068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	176929974	rs2544814	G	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=660;SC=TGAGCTGGAAGGAGGTGGCGG;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=176929982;WS=176929964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	176930135	rs28376231	G	A	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=48;PP=2384;SC=GCTTGCGTGCGTGGCTGGCTC;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=110;WE=176930143;WS=176930125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	176930171	rs138153794	AGAG	A	3558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=2482;ReadPosRankSum=1.347;SC=GAGCAGGAGCAGAGGAGGGAA;SOR=0.837;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=59;WE=176930181;WS=176930161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,91:0.55:166
chr5	176931706	rs179810	G	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=42;PP=1946;SC=AGGGTCCAGGGTGTCAGCCCC;SOR=0.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=94;WE=176931714;WS=176931696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	176935215	rs55761704	GC	G	687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=519;SC=CAGCCCAATCGCCCCCCTGCT;SOR=3.352;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=16;WE=176935223;WS=176935205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	176935547	rs61749658	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=257;ReadPosRankSum=0.942;SC=AGCACTTCTGCGGGAGGGGAG;SOR=0.382;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=16;WE=176935555;WS=176935537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr5	176936650	rs28565502	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=49;PP=1946;SC=TCCCTCCGTCTAGAGACAGCT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=176936658;WS=176936640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	176938681	rs28695578	C	T	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=14;PP=2140;SC=CCTGGCCCATCCCAGGCCAGC;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=75;TCR=14;TR=89;WE=176938689;WS=176938671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	176939688	rs28544348	C	T	4515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=59;PP=2965;SC=CACCATGGGACAGGGGAGTGG;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=143;WE=176939696;WS=176939678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	176939735	rs335436	A	G	6451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=87;PP=2965;SC=TAGGTAAAGCACTGCTACTGC;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=124;TCR=87;TR=211;WE=176939743;WS=176939725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	176940871	rs335439	G	C	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=80;PP=2769;SC=GAGAGACCCTGAGGTTGGGGC;SOR=1.202;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=130;WE=176940879;WS=176940861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	176950794	rs28723606	A	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=3;PP=620;SC=GTGGGTTTTCAGCAGGCAGGC;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=176950802;WS=176950784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	176950879	rs28688891	T	C	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=35;PP=2398;SC=TTTCTGAGGCTTGAGGCACAA;SOR=1.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=85;TCR=36;TR=120;WE=176950887;WS=176950869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	176951276	rs337382	A	G	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=81;PP=2965;SC=GCTGGGCCTGAGGGCTGCACA;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=155;WE=176951284;WS=176951266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	176959296	rs2246566	T	G	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=33;PP=1490;SC=GCTGTGAGGATCAAGCGAGCA;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=176959304;WS=176959286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	176963349	rs335460	G	A	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=21;PP=906;SC=CCTTCATGCAGCACACTTACC;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=176963357;WS=176963339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr5	177027076	rs145156383	G	GCGGCGGACC	141.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=763;SC=CGCGGCCGGAGCGGCGGACCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=177027084;WS=177027075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	177027110	rs28707336	C	T	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=135;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=48;SC=GCGGGGCGGACAGGCCTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=177027118;WS=177027100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	177031348	rs11537644	T	C	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=37;PP=1374;SC=GCCCTCCCCGTGCCTGCCCCC;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=177031356;WS=177031338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	177031602	rs28499092	C	G	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=36;PP=1033;SC=GCTTCTCAGGCCCTGTGAGAG;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=177031610;WS=177031592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	177031948	rs55763804	G	A	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.361;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=1032;ReadPosRankSum=0.663;SC=CCCACAGTCTGGCGTTATCCT;SOR=1.432;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=25;WE=177031975;WS=177031938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr5	177031954	rs28742937	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=623;ReadPosRankSum=0.806;SC=GTCTGGCGTTATCCTAAAATC;SOR=0.654;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=19;WE=177031975;WS=177031938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr5	177031967	rs28698736	T	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=1291;ReadPosRankSum=-1.987;SC=CTAAAATCCCTGCCCTTACCA;SOR=1.532;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=51;WE=177031975;WS=177031938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr5	177032050	rs28473516	C	G	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CTCTAGGTAACTCCCACTGGA;SOR=1.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=72;WE=177032058;WS=177032040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,78:0.51:153
chr5	177035488	.	GC	G	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,18:0.23:78
chr5	177035964	rs729459	T	C	5980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=80;PP=2816;SC=GCCACCTGCATGACCCAGCCT;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=167;WE=177035972;WS=177035954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr5	177036043	rs6600953	A	G	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=64;PP=2035;SC=CATTGGGGACAGATAGGTGGT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=105;WE=177036051;WS=177036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	177053334	rs5013573	T	C	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=808;SC=CCTCGGCCTCTGAAAATGCTG;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=177053342;WS=177053324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	177054672	rs7728458	T	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=14;PP=320;SC=TTTTTTGAGATGGAGTCTCGC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=177054680;WS=177054662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	177058655	rs6876792	A	G	4281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=77;PP=2961;SC=GGCATGTCACAGTTCTGTACA;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=177058663;WS=177058645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	177058766	rs2334991	G	A	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.41;QD=29.36;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	177161891	rs140979906	A	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.95;QD=31.54;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	177180236	rs76556918	G	A	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=57;PP=1625;SC=ACTAAGCTGCGTTTACTGCCA;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=67;WE=177180244;WS=177180226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	177302646	.	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.05;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	177305797	rs201185054	G	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.41;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	177310717	rs139876295	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.63;QD=29.91;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	177344152	rs76284623	G	T	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.39;QD=24.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	177347910	rs200509090	G	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	177348037	.	C	CTTTG	761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.48;QD=42.32;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	177348098	rs4958970	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.85;QD=43.97;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	177348106	rs4958971	A	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.85;QD=43.97;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	177348150	rs4958972	C	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.39;QD=42.57;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	177348155	rs4958973	A	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.49;QD=43.19;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	177422823	rs4072924	C	T	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=13;PP=1219;SC=GACGGTCACTCACCCACCGTG;SOR=2.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=177422831;WS=177422813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	177422876	rs7445271	T	C	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=42;PP=2157;SC=AGGCAACAGGTTGCTGCCGAC;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106;WE=177422884;WS=177422866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	177482472	rs3088218	T	C	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=225;SC=GGACCAGCACTGGCACCGGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=177482480;WS=177482464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	177483154	rs9687038	T	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=34;PP=938;SC=GAAGGAGGAGTTCATCAAGAC;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=177483162;WS=177483144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	177547247	rs7719667	T	C	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=45;PP=2086;SC=CCATGCAAAGTCTGGCGTCCC;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=177547255;WS=177547237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	177562183	.	C	CTG	259	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=259;QD=58.8;SC=GGGTCTCACTCTTGCTCAGGC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=177562191;WS=177562173;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr5	177562251	rs10060446	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=249;SC=GGCTCAAGCAGTCCTCCGTCC;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=177562259;WS=177562241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	177570759	rs6601218	T	C	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=43;PP=1404;SC=GCCAGCAGCATTCTGCTTCGA;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=177570767;WS=177570749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	177574901	rs7380934	C	G	7836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=116;PP=2965;SC=TCCCCGTGCTCTACTCCACCT;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=246;WE=177574909;WS=177574891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr5	177614387	rs6886332	A	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=25;PP=731;SC=TTCCCCGAGCACAGGTGCCTA;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=177614395;WS=177614377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	177634401	rs7705458	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=GAAAGACTTCTCAGGCTGGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=177634409;WS=177634391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	177658883	rs2973729	C	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=578;SC=ATGGGATGGGCCAGGGCACCA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=177658891;WS=177658873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	177659624	rs140358085	C	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=9;PP=326;SC=TCCAAGGCCCCGCTCCGGGCC;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=177659632;WS=177659614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	177665486	rs1544925	T	C	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=79;SC=GGCCCAAGGGTGCCCCTCAGG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=177665494;WS=177665476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	177665554	rs58562702	T	C	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=4;PP=145;SC=GCCGGTGGCTTTGGGGCTGGG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=177665562;WS=177665544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	177665731	rs10061163	C	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=382;SC=CTGAAGGTGACGAGGAGCCCG;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=177665739;WS=177665721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	177668927	rs72819011	C	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=20;PP=1101;SC=AAGGCCAGTGCGTGACCAGTG;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=177668935;WS=177668917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	177673360	rs6872383	C	G	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=58;PP=2165;SC=GGAATTAACACCTTTGGGACA;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=177673368;WS=177673350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	177674686	rs10036819	T	C	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=26;PP=1607;SC=AAGCCCGCTCTCTCCTGGGTC;SOR=1.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=71;WE=177674694;WS=177674676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	177675217	rs2913851	C	T	4563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=57;PP=2584;SC=GGCTGTCAGACGCCGACTCCC;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=138;WE=177675225;WS=177675207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	177675465	rs6894255	C	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=762;SC=CAGCCGCACACATTGTTTTCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=177675473;WS=177675455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	177679680	rs2973751	T	C	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=530;SC=CCACCTGGAATCAAGTCCCCG;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=177679688;WS=177679670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	177679728	rs12652833	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=189;SC=CCTTGGGGACTGCTTCTTCCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=177679736;WS=177679718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	177683029	rs890804	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=132;SC=CAGGATCAGGCATACGACAAA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=177683037;WS=177683019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	177683185	rs890803	T	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=351;SC=CAAAAAAGCATGTACTCTGGA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=177683193;WS=177683175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	177715452	rs6892747	C	T	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=33;PP=1127;SC=CGCCCCCCGACAGCTGGTTGG;SOR=1.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=177715473;WS=177715442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	177715465	rs6860225	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=33;PP=1155;SC=CTGGTTGGTGACTTCCTCTGC;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=177715473;WS=177715442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	177715581	rs2913832	T	C	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.632;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=498;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TCATCGGGGCTCCGGGCACAG;SOR=0.773;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=23;WE=177715589;WS=177715571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr5	177715797	rs11399497	C	CG	225.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=145;SC=CCAGGAATATCGGGGGGCGTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=177715805;WS=177715787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	178039477	.	C	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TGATGTTCATCATCATACGTT;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=68;WE=178039485;WS=178039467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr5	178040919	rs560842	G	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=41;PP=1129;SC=CTAAAGCATAGTCTTAATTAC;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=178040927;WS=178040909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	178049444	rs34183525	C	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=517;SC=ATCTGGTAAACAGTCCCAATG;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=178049452;WS=178049434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	178139442	rs1132338	T	G	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=48;PP=2069;SC=GAATGAGAGCTGAACTCTGTC;SOR=0.734;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=93;WE=178139450;WS=178139432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	178140090	rs1132336	C	T	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=45;PP=1859;SC=CTCCAGTATGCGTTATTTGAT;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=83;WE=178140098;WS=178140080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	178153317	.	C	CT	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=15;MQ=61.05;NF=1;NR=8;PP=157;QD=18.1111111111;SC=TACTACGTGGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=178153325;WS=178153307;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,9:0.50:18
chr5	178154174	rs56185007	C	T	7392.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.04;QD=44.00;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	178154174	.	CA	TG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=52.55;NF=39;NR=107;PP=2947;QD=20;SC=CCTCACAGAGCAGAGGGGGCG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=39;TCR=108;TR=146;WE=178154197;WS=178154164;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr5	178154175	rs56328282	A	G	7392.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.04;QD=44.00;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
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chr5	178391860	rs6867221	G	A	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1167;ReadPosRankSum=-1.073;SC=TCACAGGAATGTGATGAATCC;SOR=0.733;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=76;WE=178391868;WS=178391850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,94:0.58:162
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chr5	178401552	rs4700991	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=1325;ReadPosRankSum=1.038;SC=ATCTCCTGACCTCGTGATCCA;SOR=1.532;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=29;WE=178401563;WS=178401542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr5	178401555	rs7728828	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=981;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TCCTGACCTCGTGATCCACCT;SOR=0.313;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=23;WE=178401563;WS=178401542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr5	178401610	rs11740252	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=881;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TGAGCCACCGCGCCCGGCCTC;SOR=0.396;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=55;WE=178401618;WS=178401600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr5	178401703	rs11740277	C	G	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TGCATTGTTCCTACATTATGC;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=81;WE=178401711;WS=178401693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,104:0.50:210
chr5	178407292	rs2856351	C	T	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=56;PP=2965;SC=GGACATAAAACTCCATAACTT;SOR=1.122;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=138;WE=178407300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr5	178409927	rs17078874	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=489;ReadPosRankSum=0.453;SC=AGCTGACTGGGCAGTGCCAAA;SOR=0.442;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=26;WE=178409935;WS=178409917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr5	178410151	rs2071247	C	T	3624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=73;PP=2334;ReadPosRankSum=0.186;SC=CGGGGTCCACCGTCCGCTGTT;SOR=0.685;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=315;TCF=156;TCR=159;TR=150;WE=178410159;WS=178410141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,168:0.46:364
chr5	178410738	rs903988	C	T	4048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=52;PP=2707;SC=CCGAGGAGTACTGGAGTCTGT;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=129;WE=178410746;WS=178410728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	178410839	rs2856348	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1121;ReadPosRankSum=0.027;SC=GAACAGGAACGAAGCCACCTG;SOR=0.546;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=135;TCF=49;TCR=86;TR=73;WE=178410847;WS=178410829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,81:0.53:154
chr5	178411290	rs11279361	AGCACGCCTC	A	1526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.082;NF=10;NR=17;PP=2974;ReadPosRankSum=0.433;SC=GGAGCGAGCGAGCACGCCTCA;SOR=0.843;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=27;WE=178411306;WS=178411280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr5	178411315	rs2645341	C	T	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=104;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=37;PP=1665;SC=GAACGGACTCCTGCAAAATAA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=178411323;WS=178411305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	178411438	rs79995611	C	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=0.544;SC=TGCCATTTTGCAGCCCGTCAT;SOR=0.816;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=17;WE=178411446;WS=178411428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr5	178412273	rs35715923	T	C	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1076;ReadPosRankSum=0.082;SC=TTCACTGTTGTACAGAAAGAT;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=57;TCR=72;TR=69;WE=178412281;WS=178412263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr5	178412405	rs10716144	TA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.158;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	178412592	rs6880010	T	C	178.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.66;QD=22.35;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	178412631	rs138093440	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQRankSum=-2.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	178412636	rs141019077	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQRankSum=-2.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	178413816	rs2256966	T	C	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=85;PP=2965;SC=CATGCCCACCTGGGGCTCGGT;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=191;WE=178413824;WS=178413806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr5	178413947	rs11746675	T	C	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=92;PP=2965;SC=CGGGCGCATCTCCGTTCTCGT;SOR=0.949;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=160;WE=178413955;WS=178413937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr5	178414532	rs10464074	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CCTGGAGGACATGATGCTCGG;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=32;WE=178414540;WS=178414522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr5	178414565	rs2645340	C	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=495;ReadPosRankSum=-0.343;SC=GTCACACATGCGCAAATACCG;SOR=1.136;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=31;WE=178414573;WS=178414555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr5	178415937	rs2067011	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-1.867;SC=CCCACTCACCATTGAAGCGGA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=15;WE=178415945;WS=178415927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	178415982	rs4701014	A	G	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=18;PP=1543;SC=TCCGCCCATCAGTGGGTTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=78;WE=178415990;WS=178415972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	178416063	rs2645339	G	A	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1435;ReadPosRankSum=0.168;SC=GGGCAATGGCGTACACCGCAT;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=97;WE=178416071;WS=178416053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,115:0.51:225
chr5	178416203	rs143495088	CCCCTCCCCA	C	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.362;NF=1;NR=9;PP=993;ReadPosRankSum=0.923;SC=TCCCGCCTTCCCCCTCCCCAC;SOR=1.981;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=178416219;WS=178416193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr5	178416288	rs2071246	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=372;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GGGTGGAATCGTCTGACTGGG;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=22;WE=178416296;WS=178416278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr5	178416348	rs17839804	G	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=563;ReadPosRankSum=0.030;SC=AGAACTCGGCGAACCAGATGT;SOR=1.077;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=41;WE=178416356;WS=178416338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr5	178419279	rs11283410	G	GGGCAAGGTCT	5500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=37;PP=2967;SC=TGGAAGCTGTGGTGTTTTGCG;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=63;WE=178419296;WS=178419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	178419288	rs2645335	C	T	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=46;PP=2031;SC=TGGTGTTTTGCGAGTGGGCCT;SOR=0.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=104;WE=178419296;WS=178419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	178419396	rs11449973	A	AC	4605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=72;PP=2969;SC=CTGAACAAGGACCCCCAGCAG;SOR=1.037;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=23;TCR=73;TR=92;WE=178419404;WS=178419386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	178421351	rs2645330	T	C	148.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=74;SC=GGAGACTCTTTCAGAAGAAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=178421359;WS=178421341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	178421770	rs2645329	T	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=0.320;SC=CTTCTTCAGCTGCCCGCACGC;SOR=0.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=13;WE=178421778;WS=178421760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	178555045	rs2303644	G	A	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1079;ReadPosRankSum=0.520;SC=CGTTGTTGTCGTCGACATTCA;SOR=0.908;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=81;WE=178555053;WS=178555035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,99:0.52:192
chr5	178557142	rs2251105	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=950;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GTCACCCAAGAGCAGGACCCA;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=54;WE=178557157;WS=178557132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr5	178562834	rs3822595	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=0.930;SC=GCCAATACCCCGAAAAGGGGG;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=6;WE=178562842;WS=178562826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	178562967	rs1972715	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=627;ReadPosRankSum=-0.766;SC=AGCGCGTCCCGTCATGCACCA;SOR=1.008;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=45;WE=178562975;WS=178562957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr5	178563125	rs1549603	A	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=696;ReadPosRankSum=0.359;SC=AAGCAGGAGAAATTTCCACAA;SOR=1.082;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=45;WE=178563133;WS=178563115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr5	178565001	rs2303639	C	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=447;ReadPosRankSum=-2.421;SC=AGGCAGCACCCGGGTGCCCTT;SOR=0.678;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=31;WE=178565009;WS=178564991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr5	178608341	rs11749583	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CTCCAGGCTGCCACCACCACC;SOR=0.042;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=178608349;WS=178608331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr5	178634619	rs423552	C	T	7168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=118;PP=2965;SC=AGTCATCGTCCGCAGCATGCC;SOR=0.854;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=98;TCR=118;TR=216;WE=178634627;WS=178634609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr5	178634672	rs398829	C	T	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=77;PP=2484;SC=TCCTCTAGGACGCCCAGGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=118;WE=178634691;WS=178634662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	178634683	rs11750821	C	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=567;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GCCCAGGGCGCGGCTGAGGCT;SOR=0.596;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=41;WE=178634691;WS=178634662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr5	178768401	rs76429249	G	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=1.161;SC=AGAGAAAGAGGACAAGCGAAA;SOR=0.711;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=10;WE=178768409;WS=178768391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr5	178770718	rs2271214	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=296;ReadPosRankSum=0.838;SC=CTTTTCCAAAACCCAGGCGAG;SOR=0.207;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=22;WE=178770726;WS=178770708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr5	178770759	rs2271213	C	G	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=586;ReadPosRankSum=0.096;SC=TAGAGAAGTGCGTACTCACCA;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=42;WE=178770767;WS=178770749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,49:0.43:114
chr5	178770981	rs2271212	A	G	4357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=81;PP=2543;ReadPosRankSum=0.882;SC=AGAAGAGGTGACTGCCAGGCT;SOR=0.699;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=357;TCF=185;TCR=172;TR=171;WE=178770989;WS=178770971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,209:0.48:438
chr5	178772229	.	G	GGCGGCGGCGGCGGCGGCAGGA	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=53.24;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,1:0.33:3
chr5	178772259	.	G	GGCA	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=2.342;SC=GAGCGGCGGCGGCAGCAGCAG;SOR=2.093;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=3;WE=178772267;WS=178772249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr5	178949499	rs28689892	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=29.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	178949560	rs28413987	AG	GT	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=23;PP=2947;SC=AGTGTTATTGAGACAGAGCTG;SOR=1.775;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=82;WE=178949569;WS=178949550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	178949781	rs28420183	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=24.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.25;MQRankSum=-6.225;QD=2.85;ReadPosRankSum=-3.506;SOR=3.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,15:0.18:82
chr5	178951598	rs4701188	G	A	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=96;PP=2965;SC=GGCCACCTGCGAGCACCCTAT;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=203;WE=178951606;WS=178951588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	178952039	rs35678620	G	T	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.650;NF=32;NR=47;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CCACATGCAGGCAGATGGAGG;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=169;TCF=69;TCR=100;TR=79;WE=178952047;WS=178952029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,100:0.48:209
chr5	178986978	rs7704349	C	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=953;SC=AGTCTGACCTCCCCACGCTCA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=178986986;WS=178986968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	179021982	rs28685239	G	A	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1217;ReadPosRankSum=0.147;SC=CTTCCCCCTGGCAGATATTCT;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=58;TCR=113;TR=75;WE=179021990;WS=179021972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr5	179025550	rs4701136	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=0.954;SC=GTGACCCTGGAGGAGAGGGAA;SOR=0.914;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=12;WE=179025558;WS=179025540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr5	179032755	rs6877888	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=843;SC=TAACAACTCACGTTCTGGGTC;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=179032763;WS=179032745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	179036268	rs60104959	A	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	179036433	rs17355294	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=769;ReadPosRankSum=-0.108;SC=GCAACGAGCTGGCCCTGCCCT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=46;WE=179036441;WS=179036423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr5	179036608	rs8087	T	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.264;SC=TTCCCAAGAGTATCAAAGGAA;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=179036616;WS=179036598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	179042400	rs61408162	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	179043075	rs4515257	T	C	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=41;PP=1929;SC=AGTACAGTAATGAACAGGCTT;SOR=1.323;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=111;WE=179043083;WS=179043065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	179043982	rs34734159	C	CAA	3235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.941;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.654;NF=17;NR=39;PP=2212;ReadPosRankSum=1.687;SC=AAAAGGCATACAAGGTTAGCT;SOR=0.623;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=45;TCR=88;TR=56;WE=179043990;WS=179043972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,86:0.43:202
chr5	179049138	rs4301193	C	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=80;SC=ACTGCAAAAACACTTCCCTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=179049146;WS=179049128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	179069309	rs6887611	G	C	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.383;NF=73;NR=29;PP=2209;ReadPosRankSum=1.310;SC=TGTGGGGTGCGCAGATGAGGG;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=179069317;WS=179069299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr5	179069551	rs12519906	G	A	2695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=72;PP=1798;ReadPosRankSum=1.018;SC=GGAACTGTGAGGAGGTGCAGT;SOR=1.056;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=181;TCF=62;TCR=119;TR=104;WE=179069559;WS=179069541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,119:0.56:214
chr5	179071724	rs2411400	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=50.233;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.315;NF=31;NR=2;ReadPosRankSum=-2.788;SC=GCGCCTCTGGCTGATGTGGAA;SOR=5.067;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=33;WE=179071732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,30:0.28:107
chr5	179071836	rs4990391	C	T	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=3.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-0.844;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,101:0.27:379
chr5	179071947	rs4645306	A	G	5027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.731;NF=62;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.039;SC=GCTCTGTACCAATAACACTGT;SOR=0.853;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=292;TCF=109;TCR=183;TR=178;WE=179071966;WS=179071937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,215:0.66:328
chr5	179072006	rs13153811	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-3.538;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,32:0.25:126
chr5	179072040	rs4557391	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQRankSum=-5.434;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.679;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr5	179078378	rs55837909	C	T	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.637;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=1210;ReadPosRankSum=0.941;SC=TCTTCCCTCCCGTGTCCTCCT;SOR=0.326;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=33;WE=179078399;WS=179078368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
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chr5	179078940	rs6882398	T	C	4897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=70;PP=2965;SC=TCAGCTCCTCTCAGCCACCAG;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=146;WE=179078948;WS=179078930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	179079104	rs113370076	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.24;MQRankSum=-2.323;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr5	179105533	rs75628693	G	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=766;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CGCTGGGGCAGTGGCAGACCC;SOR=0.991;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=49;WE=179105541;WS=179105523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr5	179125678	rs17079630	C	G	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=62;PP=1537;ReadPosRankSum=3.176;SC=GCCTGTTAAACCAGCCCCGCC;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=52;TCR=111;TR=92;WE=179125686;WS=179125668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,104:0.54:191
chr5	179126090	rs1134924	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=-1.297;SC=CCCGCGGTCCCCGGGAGGCTA;SOR=0.811;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=27;WE=179126098;WS=179126080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr5	179136138	rs6601068	A	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=48;PP=1440;SC=GGCCGGGTGCAGTGGCTCACG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=59;WE=179136146;WS=179136128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	179147641	rs59666900	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=1.511;SC=GTAAGGCTGCCAGGTTGGTCA;SOR=1.404;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=23;WE=179147649;WS=179147631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr5	179267949	rs248248	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=334;ReadPosRankSum=-0.909;SC=ACGGTGCTCCTGCTCCACTTC;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=26;WE=179267957;WS=179267939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr5	179291279	rs172056	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=1.253;SC=CCCATCTCACAGATCAGGACA;SOR=0.252;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=15;WE=179291287;WS=179291269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr5	179294796	.	C	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=430;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GAGCTGTCCTCTGTGAAATAA;SOR=1.016;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=28;WE=179294804;WS=179294786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr5	179334857	rs185073	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GGCCCGCGAGACGGAAGCGCC;SOR=0.580;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=10;WE=179334865;WS=179334847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr5	179405025	rs9654545	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CCCGCACCTGCTGAACAGCAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=179405033;WS=179405015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	179405399	rs27019	C	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=219;ReadPosRankSum=0.802;SC=GTGTTATAAACTGAAAAATGA;SOR=0.387;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=179405407;WS=179405389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr5	179407229	rs28011	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=46;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AAAACAGATACTAAGTGTAAG;SOR=0.376;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=105;TCF=24;TCR=81;TR=61;WE=179407237;WS=179407219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,70:0.60:116
chr5	179440358	rs10516141	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-1.398;SC=TTAAAACTTATGGAAACATCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=9;WE=179440366;WS=179440348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr5	179442479	.	GGGAAAGGAGTA	G	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=1.533;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.634;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	179498595	rs3749821	C	T	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=1314;ReadPosRankSum=0.537;SC=TGATGAGCGCCGTGTAGTACT;SOR=0.744;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=222;TCF=98;TCR=124;TR=100;WE=179498603;WS=179498585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,122:0.43:286
chr5	179498658	rs3828698	G	T	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=811;ReadPosRankSum=1.612;SC=TCAGCAGGGCGAGCGCGGCGA;SOR=0.567;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=67;WE=179498666;WS=179498648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr5	179528351	rs67139455	TG	T	722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=2;PP=468;SC=ATGGCCACTGTGGGGGGGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=179528367;WS=179528348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	179528359	rs113499659	G	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.29;ReadPosRankSum=1.652;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr5	179529124	rs7725201	G	A	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=57;NR=61;PP=1940;SC=TCTCACTTTCGTAAGAAGCCA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=118;WE=179529132;WS=179529114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	179542290	rs4700873	T	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-2.173;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.701;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr5	179542473	rs35177368	TCACTC	T	2216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.859;NF=3;NR=34;PP=1864;ReadPosRankSum=1.261;SC=CCCAGACTCTTCACTCCTGAC;SOR=0.495;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=37;WE=179542485;WS=179542463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr5	179548343	rs13160214	C	T	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=307;SC=AGACGGAGTCCCGCTCTGTCG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=179548351;WS=179548333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	179563359	rs55638756	C	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=1013;ReadPosRankSum=1.851;SC=GGTGACGCGACCCCCGCCCAG;SOR=0.745;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=66;WE=179563367;WS=179563349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr5	179563532	rs2890346	G	C	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=54;PP=994;ReadPosRankSum=0.171;SC=GCAAGCGAGGGGCACCGCGCT;SOR=0.826;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=29;TCR=89;TR=72;WE=179563540;WS=179563522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,77:0.59:130
chr5	179565071	rs4700878	G	C	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=34;PP=1132;SC=GCAATGGCAAGGAGCAGTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=179565079;WS=179565061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	179565136	rs4700715	C	A	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=35;PP=966;SC=GCTGCTGGTCCCGGGGCTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=179565144;WS=179565126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	179665201	rs56333381	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=1;PP=260;SC=ACCCAGGAGGCGGAGGTTGCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=179665209;WS=179665191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	179728707	rs4700931	T	C	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=573;ReadPosRankSum=0.557;SC=AAGAGACAGATGTTCACCATG;SOR=1.065;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=43;WE=179728715;WS=179728697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr5	179729519	rs1035411	A	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=886;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GGGGCAGCTCAATTGTCTTAT;SOR=1.204;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=67;WE=179729527;WS=179729509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,83:0.46:180
chr5	179729625	rs2303005	A	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=789;ReadPosRankSum=-1.241;SC=ACCCTCTCTGAAAGAAGCTAT;SOR=0.931;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=48;WE=179729633;WS=179729615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr5	179734139	rs11741142	T	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=904;SC=CCTGTGCCTGTCCTCCGTGGG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=179734165;WS=179734129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	179734145	rs72363427	GTGGGGGTGGGGGC	G	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=2392;SC=CCTGTCCTCCGTGGGGGTGGG;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=179734165;WS=179734129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr5	179734312	rs3763131	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=626;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CTCTGGGCCATGCACGGAGCA;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=51;WE=179734320;WS=179734302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr5	179740827	rs2303007	T	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=367;ReadPosRankSum=-1.812;SC=GCCACGCCGATCTCCGGCCCT;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=24;WE=179740835;WS=179740817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr5	179743731	rs2303008	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=2.260;SC=CTAGACTGCCGTCGACTTCCC;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=179743739;WS=179743721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	179751111	rs3828686	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=299;ReadPosRankSum=1.530;SC=GGAAGGATGAATAAGAACCGG;SOR=0.502;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=20;WE=179751119;WS=179751101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr5	179757675	rs76058413	T	G	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=22;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AGGAATGAGTTAGACAGATGG;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=77;WE=179757683;WS=179757665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,92:0.62:149
chr5	179763398	rs6891083	T	G	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1044;SC=AGAATCTCCATTCTCCGGCGC;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=179763406;WS=179763388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	179765467	rs55946431	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=-2.551;SC=GGTCCCCAGCCACGAGGCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=10;WE=179765475;WS=179765457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr5	179780292	rs199818683	CCTCCGTGGG	C	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.184;NF=2;NR=21;PP=2695;ReadPosRankSum=0.092;SC=TCCGTGGGCTCCTCCGTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=23;WE=179780308;WS=179780282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr5	179780340	rs5873687	GT	G	1051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=1688;SC=TCCAGCTCCCGTCCGCTCGGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=179780348;WS=179780330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	179780382	.	A	AG	225	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=93;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=225;QD=25.8;SC=GCCCTCCGAGAGGGCGGGGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=179780390;WS=179780372;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	179996111	rs6877400	C	T	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=47;PP=2070;SC=CTAATGTAGCCGGAAAGCCAC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=179996119;WS=179996101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	180017399	rs450383	T	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.770;SC=CGCGGGGCCATCTCCGCCTTC;SOR=0.155;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=8;WE=180017407;WS=180017389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr5	180038248	rs35683852	T	TC	6956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.200;NF=55;NR=93;PP=2966;ReadPosRankSum=0.790;SC=GATTTGCTTTTCCCCGATGAC;SOR=0.973;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=170;TCF=70;TCR=100;TR=148;WE=180038258;WS=180038238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,256:0.99:258
chr5	180039606	rs1130379	C	T	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=53;PP=1258;ReadPosRankSum=-1.418;SC=CAGCATGATGCGGCGTCTGCA;SOR=0.846;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=159;TCF=56;TCR=103;TR=80;WE=180039614;WS=180039596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,85:0.49:173
chr5	180041001	rs421662	G	C	6337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.95;SOR=1.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	180041008	rs366388	T	C	6881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.21;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	180041208	rs659268	T	C	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=31;NR=98;PP=2247;SC=GCTTGTCCCGTGGTGGATGGG;SOR=2.169;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=31;TCR=98;TR=129;WE=180041216;WS=180041198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	180045700	rs3214903	G	GGGTTACCCTA	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=1718;SC=ACCCCAGGCTGGGGTGCCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=27;WE=180045708;WS=180045690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	180046209	rs446003	C	T	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.80;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	180046344	rs448012	G	C	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=80;PP=2712;SC=TCAGCGCGCGGTGCTCGCTGG;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=138;WE=180046352;WS=180046334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	180046426	rs70973949	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	2937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=2900;SC=TTCCCCGCCACCCGGCGCTTT;SOR=1.217;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=17;WE=180046434;WS=180046416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	180046492	rs201407038	CAG	C	3284.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=26;PP=2107;SC=CCCACTGAGGCAGAGGGGGTT;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=45;WE=180046501;WS=180046482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	180047412	rs382266	T	C	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=46;PP=1605;SC=TCCTGCGGGGTTCTCAGTCAA;SOR=1.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=180047420;WS=180047402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	180047863	rs423086	C	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=14;PP=693;SC=AGGGGTGCAGCCTGAGGCCAG;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=30;WE=180047871;WS=180047853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	180048986	rs10635355	G	GCCTC	880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=16;PP=932;SC=GTCTCCTCCTGCCTCCCTCCC;SOR=2.093;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=180048994;WS=180048976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	180049928	rs307828	A	C	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.30;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	180053307	rs402647	A	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=31;PP=954;SC=AGATCCCACCACAGCCCCAAC;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=180053315;WS=180053297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	180053387	rs4700964	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=247;SC=CAGGGTAGGACGGGGAACACT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=180053395;WS=180053377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	180055862	rs383985	T	G	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.10;SOR=3.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	180055862	.	TGG	GGA,GGG	691	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=28,53;NR=5,9;PP=691,609;QD=22.5596325716;SC=GCGGGGTCGGTGGGGAGCCAG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=60;TCR=9;TR=33,62;WE=180055872;WS=180055852;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.48:69
chr5	180055864	rs438464	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr5	180056192	rs399108	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=682;ReadPosRankSum=0.732;SC=TCCTGAGTGCTCAAGGGCACC;SOR=1.423;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=36;WE=180056200;WS=180056182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr5	180056620	rs414348	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=690;SC=CATCCTCCACGCGGAGGCCCA;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=180056628;WS=180056610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	180057293	rs34221241	T	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.170;NF=31;NR=25;PP=705;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TCCTTCCTGTTGACCAAGAGC;SOR=0.851;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=56;WE=180057301;WS=180057283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,73:0.43:171
chr5	180165983	rs2054696	G	C	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.43;NF=8;NR=0;PP=195;SC=TGTTCCCCCCGCCACCAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=180165991;WS=180165973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	180166461	rs10464105	C	G	4661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=69;PP=2965;SC=ACTCGGGCCACAAACATCTTG;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=180166469;WS=180166451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	180218668	rs634501	A	G	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=31;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CTCCCACGTCAGTGGGGGCGC;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=138;TCR=70;TR=92;WE=180218676;WS=180218658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,122:0.46:264
chr5	180218820	rs2070925	C	A	3475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.053;SC=ACTGCACCCGCACCTCCCCCA;SOR=0.617;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=270;TCF=108;TCR=162;TR=151;WE=180218839;WS=180218810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,165:0.54:308
chr5	180218831	rs2070924	G	A	3150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.779;SC=ACCTCCCCCAGCTCCTTCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=98;TCR=154;TR=138;WE=180218839;WS=180218810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,148:0.53:281
chr5	180219304	rs7726005	C	T	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1826;ReadPosRankSum=-0.251;SC=ATAGGTGGCCCGAAAGTACTC;SOR=0.699;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=108;WE=180219312;WS=180219294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,129:0.61:212
chr5	180219985	rs72549456	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=1.533;SC=GGCCCCCACCGGGGAGGGCAG;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=11;WE=180219993;WS=180219975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr5	180276402	rs168726	C	T	4985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=62;PP=2965;SC=ATGGGGTGTCCTGCCAGGGTG;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=149;WE=180276410;WS=180276392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	180278393	rs705441	C	G	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TAGATTCAGGCATAGGATCCT;SOR=0.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=66;TCR=95;TR=67;WE=180278401;WS=180278383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,93:0.47:200
chr5	180278533	rs112485824	T	TA	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.787;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.161;NF=2;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TTCACTCTCTTAAAAAAAAAC;SOR=0.063;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=180278541;WS=180278523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr5	180288239	rs2121117	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.790;SC=GGCGCCGCGGGAACCCGGCCG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=19;WE=180288247;WS=180288229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr5	180326571	rs2619738	T	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CCGTGATCGTTGACGGGGACA;SOR=0.957;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=19;WE=180326579;WS=180326561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr5	180329359	rs7735361	T	C	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=751;ReadPosRankSum=1.284;SC=CTCCTCAAGATCGAATGAAGT;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=49;WE=180329367;WS=180329349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr5	180329458	rs7712020	C	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.324;NF=32;NR=29;PP=896;ReadPosRankSum=0.460;SC=GAATGTTTCCCCCTGATGCAC;SOR=0.705;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=61;WE=180329466;WS=180329448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,72:0.43:168
chr5	180329536	rs7712185	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-4.068;NF=10;NR=23;PP=466;ReadPosRankSum=0.891;SC=TTTGTTTTTGCTTTTATACTT;SOR=0.207;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=33;WE=180329544;WS=180329526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr5	180338300	rs2276994	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GCTTTGGGATGTGATCTTTGC;SOR=0.382;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=5;WE=180338308;WS=180338290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr5	180374484	rs3733755	C	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=792;ReadPosRankSum=-0.509;SC=TCACCAATAACTAAAATGTCT;SOR=0.353;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=53;WE=180374492;WS=180374474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr5	180374534	rs3733756	G	A	2286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.716;SC=AGCCTATATCGTGGCACCTGG;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=85;WE=180374542;WS=180374524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,102:0.60:171
chr5	180374898	rs7711990	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr5	180409217	rs73815148	G	A	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1301;SC=AAGGCGGCGCGGGACACCCAC;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=180409225;WS=180409207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	180409595	rs4397092	A	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=57;PP=2086;SC=CTTGTTGCTAACAAGCTGGCT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=180409603;WS=180409585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	180430797	rs72494581	T	C	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.829;NF=36;NR=24;PP=999;ReadPosRankSum=-1.433;SC=GGAGCCAGCGTCGTGTTTGTA;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=60;WE=180430805;WS=180430787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr5	180430996	rs114244788	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.954;NF=0;NR=10;PP=287;ReadPosRankSum=-2.139;SC=CAGGTGGAGGGGAGCAGCTGC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=10;WE=180431017;WS=180430986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr5	180431009	.	A	G	287	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=51.55;NF=0;NR=4;PP=287;QD=80.4428031368;SC=GCAGCTGCTCACTCTCTCCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=4;WE=180431017;WS=180430986;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,4:0.17:24
chr5	180432416	rs7726150	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.217;NF=14;NR=3;PP=303;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GAAAAGCTCCCCAGGAGGTGC;SOR=0.586;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=17;WE=180432424;WS=180432406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr5	180472498	rs28677846	C	T	6112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=83;PP=2965;SC=AGATGGTGGACCTCTCAGTCT;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=183;WE=180472506;WS=180472488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr5	180472513	rs6894087	A	G	6400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=95;PP=2965;SC=CAGTCTCCCCAGACTCCTTGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=97;TCR=95;TR=192;WE=180472521;WS=180472503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr5	180474814	rs13359580	CA	TG	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=588;SC=TAGAGTATCTCACCTTTCTTG;SOR=1.371;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=15;WE=180474823;WS=180474804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	180477449	rs7702426	C	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=25;PP=732;SC=TCTATAAAGACACAATGGTAC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=180477457;WS=180477439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	180481151	.	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.130;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr5	180482795	rs3885614	A	T	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=38;PP=2408;SC=ATTTCTCCTCATTCATCATTT;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=180482803;WS=180482785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	180482899	rs3885615	C	T	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=74;PP=2520;SC=GTGGGGGGTGCGGGACAGGGT;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=125;WE=180482907;WS=180482889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	180486224	rs7379015	T	G	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=14;PP=922;SC=ACTAACGCTGTGGCTCTGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=180486232;WS=180486214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	180486247	rs6601166	G	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=18;PP=1137;SC=TGGATGTGACGCTGGACCCGG;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=180486255;WS=180486237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	180552412	rs7724668	G	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=438;SC=TGCTCTGAGAGATGCAGGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=180552420;WS=180552402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	180622615	rs254460	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.707;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=453;ReadPosRankSum=0.603;SC=AGGCGCACGCCCTTAAGATCC;SOR=0.959;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=34;WE=180622623;WS=180622605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,45:0.36:126
chr5	180625254	rs254458	G	A	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=994;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GTGCATGAGCGACACGGGAGA;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=57;WE=180625262;WS=180625244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr5	180626927	rs416574	A	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=730;ReadPosRankSum=-1.308;SC=GGTGATCTCAACCCCGAGCTG;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=49;WE=180626935;WS=180626917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr5	180631817	rs2545112	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=646;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GCGTGGCCACTGCCGCCAGCT;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=18;WE=180631836;WS=180631807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr5	180631828	rs2770945	G	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=646;ReadPosRankSum=-1.112;SC=GCCGCCAGCTGCCGGTTGGGC;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=16;WE=180631836;WS=180631807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr5	180649526	rs59521877	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=471;ReadPosRankSum=-2.239;SC=GAGACGGCCGGGATAGCTCTA;SOR=1.489;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=26;WE=180649534;WS=180649516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr5	180659796	rs35719413	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=706;ReadPosRankSum=2.223;SC=CGGGAGCCGCGGCTAGTCGCC;SOR=0.696;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=42;WE=180659804;WS=180659786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr5	180660447	rs55928464	G	C	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=844;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TGTGTTCCCAGTCTTTGCCCT;SOR=0.723;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=59;WE=180660455;WS=180660437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,68:0.56:121
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chr5	180661465	rs373653459	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=443;ReadPosRankSum=0.862;SC=GCCAGCTCCTCGCGCCATCAC;SOR=1.083;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=33;WE=180661473;WS=180661455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr5	180662148	rs71963223	CTT	C	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=269;ReadPosRankSum=0.819;SC=TCTTCAACCTCTTTATCAGTT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=8;WE=180662157;WS=180662138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr5	180664759	rs34681418	CA	C	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=119;ReadPosRankSum=0.626;SC=ACTTACCAATCAAGAGAGTCT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=180664767;WS=180664749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	180668964	rs2241370	T	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.619;SC=ACTCAGAACTTTTGCACCTGG;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=180668972;WS=180668954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	180669370	rs2287715	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.712;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=599;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ACAGAAGAAAAATCAGTGAGG;SOR=0.885;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=39;WE=180669378;WS=180669360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,41:0.40:102
chr5	180669440	rs58171665	TAAC	T	1729.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=1112;ReadPosRankSum=0.457;SC=ATGAGTGGGTTAACAACAACT;SOR=0.635;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=27;WE=180669450;WS=180669430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr5	180670251	rs1279738	C	G	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=1488;ReadPosRankSum=0.913;SC=AGTAGGCCGACACTTGAGCCA;SOR=0.665;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=222;TCF=141;TCR=81;TR=95;WE=180670259;WS=180670241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,108:0.42:257
chr5	180670858	rs2241369	G	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.724;SC=ATGGCTTAGAGAAACTAGCAC;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=180670866;WS=180670848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr5	180687212	rs918388	C	T	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=1262;ReadPosRankSum=0.002;SC=CCATGTTGGCCAGCTGCAAGT;SOR=0.574;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=79;WE=180687220;WS=180687202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr5	180687428	rs200454506	CTCT	C	2268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.153;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.841;NF=16;NR=25;PP=1578;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CCTGATCTTCCTCTTCTTCTT;SOR=0.984;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=122;TCF=36;TCR=86;TR=41;WE=180687438;WS=180687418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,65:0.39:167
chr6	292694	rs3832447	GC	G	1315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GGGAGGGGCGGCGCGCCTGGG;SOR=0.525;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=31;WE=292702;WS=292684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr6	312029	rs150517961	TAATG	T	2191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.802;NF=1;NR=35;PP=1603;ReadPosRankSum=0.629;SC=CCTACGACGTTAATGAAGGCA;SOR=1.164;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=36;WE=312040;WS=312019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr6	335175	rs2671431	A	T	3670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=46;PP=2463;SC=TAAGTTTCTTATTTCTGTATT;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=116;WE=335183;WS=335165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	335251	rs3757305	T	C	3816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,99:0.49:204
chr6	335251	.	TGT	CGC	2750	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=39;NR=37;PP=2750;QD=20;SC=ACTGTGAAGTTGTCAGAGCTC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=76;WE=335261;WS=335241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:91,76:0.46:167
chr6	335253	rs3757306	T	C	3816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,100:0.49:204
chr6	335268	rs4959733	C	T	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1257;ReadPosRankSum=1.403;SC=GCTCACGGGACCCTTGCTGAC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=76;WE=335276;WS=335258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,93:0.48:193
chr6	346429	rs10642379	G	GACACAC	2880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.620;NF=2;NR=57;PP=2327;ReadPosRankSum=0.501;SC=ATTTTGTGTAGACACACACAC;SOR=0.565;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=195;TCF=10;TCR=185;TR=59;WE=346438;WS=346419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,100:0.44:226
chr6	346457	rs56384452	C	G	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.264;NF=24;NR=65;PP=1512;ReadPosRankSum=2.612;SC=CACACACACACAGTGAAAAGA;SOR=0.924;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=239;TCF=70;TCR=169;TR=89;WE=346465;WS=346447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,90:0.37:244
chr6	348051	rs1877172	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=744;ReadPosRankSum=-1.753;SC=TTGGGCGATGAACCCGGAGAT;SOR=0.189;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=33;WE=348059;WS=348041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr6	348080	rs2797333	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=18;PP=1555;SC=GCCCTCACACATGTGCTTCTC;SOR=2.484;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=79;WE=348088;WS=348070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	348906	rs11242812	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=818;ReadPosRankSum=0.991;SC=GCAGTTTTCCGGCACTGGCTC;SOR=0.383;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=49;WE=348914;WS=348896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
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chr6	367243	rs7776416	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=230;ReadPosRankSum=-1.066;SC=CTCAACCCTCTTCTTTGTTTT;SOR=0.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=17;WE=367251;WS=367233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
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chr6	601244	.	A	G	473	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=56.33;NF=5;NR=13;PP=473;QD=28.2095118082;SC=CACCCCGTGTACGAATCCACA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=601252;WS=601234;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	1053816	rs12194400	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.459;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,37:0.25:150
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chr6	1312998	rs148598230	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=236;ReadPosRankSum=-2.318;SC=GGCAGTGACCTGGAGGGCGCG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=26;WE=1313006;WS=1312988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,29:0.34:86
chr6	1313117	rs9502889	A	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.79;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr6	1313952	rs992327	A	G	101.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.98;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	1313980	rs147255181	C	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCGCGCCGCCCCTCCTGCTTG;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=1313988;WS=1313970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	1391085	rs147426137	G	GGGC	1025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.74;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	1394928	.	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=226;ReadPosRankSum=2.307;SC=TTTCTTCTTTCAGTGGGACTG;SOR=0.506;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=21;WE=1394936;WS=1394918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,22:0.22:99
chr6	1611802	.	G	GGGC	253.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr6	1624512	rs11759759	T	C	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TGCCACTCTCTCCTGGTGACA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=61;WE=1624520;WS=1624502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,73:0.75:97
chr6	1742794	rs3734739	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,27:0.23:119
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chr6	2623820	rs6902511	G	A	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=927;ReadPosRankSum=-0.215;SC=GACAGCAACCGCAGTGGGGAG;SOR=0.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=53;WE=2623828;WS=2623810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,69:0.81:85
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chr6	2749381	rs2296356	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=220;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TCATTATGTCCAGATCTTGAA;SOR=0.180;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=18;WE=2749389;WS=2749371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr6	2749661	rs2296355	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
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chr6	2768905	rs3734500	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-2.636;SC=TTCAAACTCCATGTATGTCAT;SOR=1.066;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=13;WE=2768913;WS=2768895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,13:0.22:59
chr6	2784797	rs3734499	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.62;ReadPosRankSum=0.388;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,8:0.14:56
chr6	2834265	rs386915	C	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=45;PP=1302;SC=AAAAATGAGGCGAAAGAGGAA;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=2834273;WS=2834255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	2834371	rs3215397	CA	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TGTTTTGTGCCAAAACAGATT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=2834379;WS=2834361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	2836266	rs385955	T	A	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TTCTGAACAGTTTTAAAAAAT;SOR=0.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=79;WE=2836274;WS=2836256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,96:0.78:123
chr6	2838046	rs316339	A	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=614;SC=AACTGCAGGTAGGGAAGGCGG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=2838054;WS=2838036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	2838248	rs316341	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=487;SC=TAAAAAAAAGGAAAAGGAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=2838256;WS=2838238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	2948965	rs318426	C	T	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=53;PP=1724;SC=CTTTAAGACCCAGGGTGCTGC;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=2948973;WS=2948955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	2953445	rs3818276	A	G	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=1071;SC=TCAAGACCGCATTAGATAGGG;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=2953453;WS=2953435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	2953496	rs12209811	C	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=549;SC=CGGCTGGGGCCTTCTCCTTCA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=2953504;WS=2953486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	2966463	rs7775025	T	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=25;SC=ATTACTGAATTCTTTTGTGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=2966471;WS=2966453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	3010390	rs1143684	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TGCCATGAACCTTGAGCCGAG;SOR=0.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=26;WE=3010398;WS=3010380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr6	3010459	rs2475208	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr6	3012725	rs11351160	TG	T	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.711;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,11:0.18:61
chr6	3015790	rs1049115	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,22:0.23:94
chr6	3019654	rs4149370	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr6	3077041	rs45541234	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=0.027;SC=CCATTTTGGGCGTTCTTGAGC;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=23;WE=3077049;WS=3077031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr6	3077141	rs2272990	T	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=20;PP=547;SC=GCGGAGGCTTTGGGAAGGTGT;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=3077149;WS=3077131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	3106311	rs9501920	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=-0.193;SC=ATAGTCACAAGCTTGTCTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=26;WE=3106319;WS=3106301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr6	3118947	rs2231355	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=30;PP=1145;SC=GCGCATGCGCACTCCCGGCAG;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=3118955;WS=3118937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr6	3157809	rs909965	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=210;SC=GTCTTTTATACCCGGGGACCC;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=3157817;WS=3157788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	3255163	rs11242830	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=0.053;SC=TTCAGCCATTCTCTCACTGGG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=3255171;WS=3255153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	3255204	rs67473937	ATGTGGC	A	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.857;NF=4;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AGAGCATGTGATGTGGCTGTG;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=6;WE=3255217;WS=3255194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr6	3255327	rs9503497	G	A	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=48;PP=1827;SC=TAAGAAGTTGGCTGCATAGGA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=3255348;WS=3255317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	3255340	rs9503498	A	C	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=47;PP=1900;SC=GCATAGGAGCACAACATCACC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=3255348;WS=3255317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	3255441	rs115916766	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr6	3259463	rs9501962	G	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr6	3264101	rs4959785	A	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=637;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GCTAAGAACCATCACCTCATT;SOR=0.478;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=39;WE=3264109;WS=3264091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,47:0.77:61
chr6	3264487	rs4959786	T	C	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=956;ReadPosRankSum=1.127;SC=TGGCGTAGAGTGGGGATTAAG;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=73;WE=3264495;WS=3264477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr6	3264502	rs4959787	G	C	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1023;ReadPosRankSum=2.650;SC=ATTAAGCAAAGGTCATGAGGC;SOR=0.661;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=80;WE=3264510;WS=3264492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,89:0.73:122
chr6	3264526	rs4959788	CT	TC	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=2448;ReadPosRankSum=-1.096;SC=ATGCTCCACTCTTCCCACACC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=74;WE=3264539;WS=3264516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,87:0.78:111
chr6	3264582	rs11757564	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=807;ReadPosRankSum=0.139;SC=TGTGCTCTGCGACCCCCAGCC;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=50;WE=3264590;WS=3264572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr6	3264671	rs13193012	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=-1.399;SC=CAGCTGCTTCTGCTCTGGAGT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=12;WE=3264679;WS=3264661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	3273457	rs9503518	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.332;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,46:0.18:260
chr6	3282462	rs78034964	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.570;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr6	3285286	rs10793841	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.106;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=44;PP=1141;ReadPosRankSum=-1.540;SC=GAGACGAGGAAGCACAGCCCA;SOR=0.394;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=66;WE=3285294;WS=3285276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,78:0.71:110
chr6	3287118	rs6910086	T	C	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=21;PP=1417;SC=GCTGCAGGAGTGAGGCCAGGG;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=3287126;WS=3287108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	3298568	rs72839355	C	T	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=268;SC=TCTCCAGACACGCATCAGCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3298576;WS=3298558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	3438650	rs13208786	G	A	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=738;SC=GATCCATCAGGCTTGCTGCCT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=3438658;WS=3438640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	3438738	rs12197689	G	A	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=26;PP=1501;SC=GGCCTCCAGCGCTTGGTGTCT;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=3438746;WS=3438728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	3439510	rs9503595	T	C	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=15;NR=9;PP=400;SC=TGCCGAATGTTCTCTGGGAGC;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=3439518;WS=3439500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	3439637	rs9502003	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.94;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	3439646	rs13213989	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	3439697	rs17136561	T	G	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=134;SC=CTACCTAAAGTTCTGAACAGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=3439705;WS=3439687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr6	3727811	rs226959	C	G	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=946;ReadPosRankSum=-1.482;SC=CCACGCCCAGCTGCTGGTCTC;SOR=0.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=57;WE=3727819;WS=3727801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
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chr6	4069685	rs639905	C	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=941;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AAGTCTAGAGCACTGAAAGGA;SOR=0.858;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=54;WE=4069693;WS=4069675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,69:0.69:100
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chr6	4115758	rs617790	C	T	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1442;ReadPosRankSum=-1.068;SC=ATTCAGTCAGCCACTGTTTGT;SOR=0.297;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=77;WE=4115766;WS=4115748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,89:0.75:118
chr6	4116262	rs7166	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=771;ReadPosRankSum=0.164;SC=AATTCTCAAGGCCTGGAAAAA;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=42;WE=4116270;WS=4116252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,48:0.79:61
chr6	4119516	rs2326408	A	G	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=686;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TTGCCTGCAGAGGCAGGAGAG;SOR=1.106;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=40;WE=4119524;WS=4119506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,45:0.78:58
chr6	4122249	rs643232	C	A	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1710;ReadPosRankSum=-0.260;SC=AACTGAGAAACCTGCCAACAA;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=109;WE=4122257;WS=4122239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,116:0.80:145
chr6	4125655	rs659305	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.956;SC=CAGCATGACTAAAGCATGGGC;SOR=0.661;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=62;WE=4125663;WS=4125645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,67:0.68:99
chr6	4125941	rs660560	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=366;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CAATATCACAACAAGTGGGAA;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=18;WE=4125949;WS=4125931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr6	4126097	rs661404	G	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.193;SC=CTCTGCCTCAGTGCAAGATAA;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=68;WE=4126105;WS=4126087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,80:0.77:104
chr6	4133855	rs3177253	C	T	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=29;PP=1454;ReadPosRankSum=0.242;SC=TCACTTGATTCATTGAATTTT;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=85;WE=4133863;WS=4133845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,95:0.74:128
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chr6	4135262	rs45529732	T	C	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=403;ReadPosRankSum=-0.911;SC=GCCGTTACTCTGTACCCGGCC;SOR=0.267;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=29;WE=4135270;WS=4135252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
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chr6	4937742	.	C	CT	1741	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=15;PP=1741;QD=58.9333333333;SC=AAAAAAAATGCTTTAAGATTT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=30;WE=4937755;WS=4937718;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,30:0.79:38
chr6	4937747	.	A	G	1638	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=26;NR=18;PP=1638;QD=38.0175275579;SC=AAATGCTTTAAGATTTTAAAC;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=44;WE=4937755;WS=4937718;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,44:0.85:52
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chr6	5086070	rs667752	A	G	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=15;PP=745;SC=CGGAGGACGCACAGCTCGGCC;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=5086078;WS=5086060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	5086211	rs584962	G	C	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=50;PP=2182;SC=TCTCGCGCCTGCGAAGCTTCC;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=112;WE=5086219;WS=5086201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	5086558	rs436556	C	A	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=50;PP=2157;SC=CCAGAGGCACCGTCTGGGGCC;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=104;WE=5086566;WS=5086548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	5109592	rs9606	T	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=324;SC=GGAGCCCCCATCTCAAACAGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=5109600;WS=5109582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	5138809	rs11301112	GT	G	159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=121;SC=AATAATGACTGTTTTTTTTAT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=5138817;WS=5138799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	5139012	rs463054	C	A	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=834;SC=GTTAAGAGTACCAGTTAACAG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=5139020;WS=5139002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	5217010	rs41302851	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=216;ReadPosRankSum=0.076;SC=AAGGTGTCAGCGTGTCTGAGG;SOR=0.340;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=15;WE=5217018;WS=5217000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr6	5431960	rs10900967	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,38:0.25:153
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chr6	6003513	rs3792947	A	C	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=788;ReadPosRankSum=0.048;SC=TGGTCTGGAGAGGAGAAGGCC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=46;WE=6003521;WS=6003503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,48:0.84:57
chr6	6003820	rs3838670	GGGA	G	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GCTGAGCGGCGGGAGGAGGAG;SOR=0.250;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=8;WE=6003830;WS=6003810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	6003985	rs3805789	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=493;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CTGAGGCCGACGAACCCGGCT;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=34;WE=6003993;WS=6003975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr6	6145726	rs1050782	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=1.014;SC=TCCACTCTGGAGCCCTCTGCA;SOR=0.326;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=10;WE=6145734;WS=6145716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr6	6167621	rs435048	G	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=409;SC=ATACAAGCACGCATATGCACA;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=6167629;WS=6167611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	6174786	rs380058	G	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=329;SC=GCGAGTCTCAGAAAGAACCAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=6174794;WS=6174776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr6	6305458	rs7745910	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.466;SC=TCAGGGGCTGGATGTCATTCC;SOR=1.371;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=6305466;WS=6305448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr6	6320808	rs2815822	T	G	3597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=27;PP=2719;SC=GGGTGCAGGGTCGGTGGCTTA;SOR=2.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=110;WE=6320816;WS=6320798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	6321128	rs1024231	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=-4.275;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr6	6588881	rs977785	A	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=399;SC=CTGAACATCCAACTGCCTTGG;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=6588889;WS=6588871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	6588965	.	A	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=752;ReadPosRankSum=0.174;SC=ACAGGCCCCCACCATGAAGGG;SOR=1.456;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=42;WE=6588973;WS=6588955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr6	6589192	rs112924538	G	GGA	664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=602;SC=AGTTGGGGTGGGAGGGGAGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=6589200;WS=6589182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	6649974	rs3062400	A	AAGG	701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=4;PP=506;SC=AGAAGGCTAGAAGGAGGGAAA;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=6649982;WS=6649964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	7211818	rs1334576	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,14:0.15:92
chr6	7230680	rs9502564	G	T	6849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=89;PP=2965;SC=CTGGGCGGGGGCCACAAGGGC;SOR=1.034;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=125;TCR=89;TR=214;WE=7230688;WS=7230670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr6	7231770	rs34561875	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=0.733;SC=AGCAGGGCCCAGCGGGCACGT;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=16;WE=7231778;WS=7231760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,16:0.25:63
chr6	7247248	rs2256596	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.723;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr6	7289957	rs16740	CCA	C	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.372;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,8:0.14:58
chr6	7290200	rs78141528	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=6.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,23:0.23:100
chr6	7290215	rs3799511	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,15:0.21:70
chr6	7290282	rs9505117	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=1.571;SC=CATGGGTGAACACCATCTAAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=7290290;WS=7290272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr6	7295755	.	G	A	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=29;QD=15.9428031368;SC=AAGGAGTTCCGTTACACCATT;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=4;WE=7295763;WS=7295745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,4:0.24:17
chr6	7310259	rs10004	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,26:0.17:153
chr6	7329873	rs2764095	T	C	241.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GGGGATGGTGTGAAGGAGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=7329881;WS=7329863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr6	7330169	rs9379089	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=1.419;SC=AAGGGGGGACTGAAATAGTGA;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=6;WE=7330177;WS=7330159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	7330194	rs11381590	T	TG	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.122;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	7373249	rs11243160	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.674;SC=TACGCATCACTAGACCACTAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=7373257;WS=7373239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	7386000	rs9505189	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=1.007;SC=TGCATATTGCTAACAAGTAGA;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=11;WE=7386008;WS=7385990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr6	7390369	rs2296358	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.53;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	7390369	.	TG	CG,CT	1095	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41,13;NR=56,16;PP=1095,248;QD=11.6471259025;SC=CCCCTTGGGGTGTGGACTCTT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=97,29;WE=7390378;WS=7390359;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:98
chr6	7390370	rs6911944	G	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr6	7393452	rs2274212	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1139;ReadPosRankSum=0.399;SC=AGGGTTATGACGATGATGATG;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=69;WE=7393460;WS=7393442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,71:0.77:92
chr6	7395497	rs6899625	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=363;SC=CTGTAATCCCGGCACTTTGGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=7395505;WS=7395487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	7396836	rs12212766	G	A	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=6;PP=301;SC=TTTAGAAAGTGTAGAAGAGAA;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=7396844;WS=7396826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	7396887	rs12212772	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=268;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CTCTGTTAATGTCTTTTCGTC;SOR=0.474;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=18;WE=7396895;WS=7396877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr6	7397081	rs76896401	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	7398832	rs2296359	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=293;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TAGAGAAACTACCTACTTAGG;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=15;WE=7398840;WS=7398822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
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chr6	7414657	rs4960314	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=448;SC=TTTTCTTTAGTGTGGGAGCAC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=7414665;WS=7414647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr6	7563983	rs2806234	T	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=22;PP=1027;SC=AGAAATCTGCTATCTACCAGT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=52;WE=7563991;WS=7563973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	7564139	rs1358903	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=5.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.796;SOR=2.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
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chr6	7567970	rs2076296	C	T	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=20;PP=813;SC=TGAAATTGCTCATTGAGTTGC;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=7567978;WS=7567960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	7571874	rs926411	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=6;PP=285;SC=TTAAAAAGAAGGGAGTTTGCA;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=7571882;WS=7571864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	7572026	rs2076303	T	A	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=26;PP=1793;SC=CCTAGCACCTTGATACCTAGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=7572034;WS=7572016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	7572262	rs2076304	A	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=29;PP=820;SC=CAGACCAGGGATCTTCTCACC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=7572270;WS=7572252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	7574805	rs2259208	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=0.415;SC=GACGTTGTTCCCTTTCATTAC;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=7574813;WS=7574795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	7576527	rs1016835	G	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=16;PP=1079;SC=TTCCCCCCAGGTTATGGGACC;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=7576535;WS=7576517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	7577079	rs2260359	G	A	85.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.524;SC=ACAAGTACATGTAGTAATAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=7577087;WS=7577069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr6	7577354	rs2064218	C	A	437.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=353;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TGTTGTAAAGCGTATACACTT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=7577362;WS=7577344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr6	7578189	rs6942260	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=126;ReadPosRankSum=0.276;SC=CCTGTCTCCTGCCTCTTCCCT;SOR=1.215;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=12;WE=7578197;WS=7578179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr6	7578819	rs2806229	T	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	7578823	rs2842691	G	A	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.71;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	7579363	rs2806227	A	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=79;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=221;SC=TTTCTTGAATATTTGCCTAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=7579371;WS=7579353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	7579393	rs2744379	CA	TG	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=401;SC=CATGTATGTCCATGTGTGTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=7579402;WS=7579383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	7579412	rs2806225	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=293;SC=AAAGAGAAATAAGAATGCACA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=7579420;WS=7579402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	7584617	rs2076300	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.226;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=842;ReadPosRankSum=2.128;SC=AGATCGCAACCGGGGGGATCA;SOR=1.107;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=47;WE=7584625;WS=7584607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,61:0.72:85
chr6	7585967	rs2744380	G	C	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=39;PP=2134;SC=CGGCTCCGGGGTCCCGCTCCG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=87;WE=7585975;WS=7585957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	7590624	rs2757594	C	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=684;ReadPosRankSum=1.457;SC=AGTCTGGATCCCGGGGAAGAG;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=39;WE=7590632;WS=7590614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr6	7590653	rs2744384	A	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=749;ReadPosRankSum=-1.284;SC=GGAGGTGAGGAGCGCGGCCGC;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=41;WE=7590661;WS=7590643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr6	7590802	rs2744385	G	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.038;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr6	7590807	rs2744386	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.40;ReadPosRankSum=-1.212;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr6	7606255	rs2757597	G	A	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1150;ReadPosRankSum=-1.716;SC=ATTCTTTTCTGTGTTTTAGGA;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=70;WE=7606263;WS=7606245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,81:0.67:121
chr6	7862631	rs17557	G	C	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=630;ReadPosRankSum=0.698;SC=TGAGTGAGGTGCACGTGCGCA;SOR=0.704;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=37;WE=7862639;WS=7862621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
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chr6	7889088	rs1225944	A	G	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=987;ReadPosRankSum=1.104;SC=CCACCTGGCCAAGACACGGGC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=60;WE=7889096;WS=7889078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,79:0.69:115
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chr6	8417521	rs6905235	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=299;SC=GGCATGTTATGTTAAAGGAGG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=8417529;WS=8417511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr6	8428137	rs3215958	A	AAGT	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=357;ReadPosRankSum=0.640;SC=CAACTAATATAGAAATATCAA;SOR=1.516;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=10;WE=8428145;WS=8428127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
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chr6	8435454	rs6597317	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr6	9616231	rs143324041	A	AGAAGAAGAAGAG	2616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.67;MQRankSum=3.502;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,70:0.76:92
chr6	9705636	rs12215551	T	C	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1255;ReadPosRankSum=0.289;SC=GTGAGGAAGTTGGGTAGCAAA;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=83;WE=9705644;WS=9705626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,100:0.75:134
chr6	9707874	rs143425289	AAAT	A	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=495;ReadPosRankSum=0.780;SC=TTGTCTTTTCAAATAATCTCT;SOR=2.147;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=9707884;WS=9707864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	9707900	rs12216536	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=351;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TTAGGTTGTACGGTAAATTGA;SOR=1.508;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=17;WE=9707908;WS=9707890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr6	9750430	rs10949284	T	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.089;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=647;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CTACAGAGGGTAAAAAGGACA;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=38;WE=9750438;WS=9750420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr6	9750730	rs375191856	GTAATAATAA	G	133.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=1615;SC=CCTCCTCTATGTAATAATAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=9750746;WS=9750720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	9769187	rs147413800	C	T	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GGTGTTCCTCCAGTTCCTCCA;SOR=0.919;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=72;WE=9769195;WS=9769177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,98:0.76:129
chr6	9776194	rs9370818	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GTAAGCTTACACTGCTGAAAT;SOR=0.264;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=9;WE=9776202;WS=9776184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr6	9795472	.	A	AAGG	501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.44;QD=38.59;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	9795507	.	A	AGAGGAGGAGGAGGAAGAG	513.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.06;MQRankSum=-0.204;QD=36.71;ReadPosRankSum=0.999;SOR=2.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr6	9795586	.	G	GGAAGAAGAAGAAGAA	904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.20;QD=56.55;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	9860514	.	C	CA	65	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=20;MQ=54.19;NF=3;NR=1;PP=65;QD=17.5;SC=TACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=9860522;WS=9860504;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr6	9900599	rs59046538	T	TGAG	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,15:0.17:89
chr6	9922006	rs1925775	A	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=252;SC=ATGTTATTGTAGTGGTCTAGA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=9922014;WS=9921996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	10398982	rs303048	A	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=0.763;SC=AGGCTCCACTATGGGCAGCAC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=10398990;WS=10398972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	10402438	rs111396056	C	CAG	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=107;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TTAAAGGAGACAAACTTGGAG;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=6;WE=10402446;WS=10402428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr6	10430171	rs303061	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=402;ReadPosRankSum=-1.822;SC=TGGTAGAAAGTACCAGAGACA;SOR=0.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=23;WE=10430179;WS=10430161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
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chr6	10587056	rs71548508	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,42:0.28:148
chr6	10634042	.	T	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=56.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.346;SOR=6.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr6	10707894	rs116316806	G	C	184.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTAAAATTAGGGTTCCCAGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=10707902;WS=10707884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr6	10724943	rs4711068	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=22;PP=1122;SC=GAAAAGAACCTTAAGAGTAGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=10724951;WS=10724933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	10729020	rs2153073	C	T	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=49;PP=1803;SC=CCCAGGATACCTTATGCATTC;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=10729028;WS=10729010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	10764727	rs126405	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=18;PP=660;SC=CTGTCCTCCCATGCACTGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=10764735;WS=10764717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	10775446	rs478791	T	C	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=12;PP=1126;SC=TGGAAAACCTTTGTGTATCTC;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=10775454;WS=10775436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	10785011	rs113945134	C	CCAGA	5660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=36;PP=2918;SC=ATTTCTGATACCAGTATGTGA;SOR=1.217;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=65;WE=10785019;WS=10785001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	10785263	rs6936890	C	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=482;SC=TACAATTTCCCGTCACCCTAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=10785271;WS=10785253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	10791859	rs518954	A	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.518;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr6	10792197	rs521802	T	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=308;SC=GTTCCATACATGTAAGGGCAT;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=10792205;WS=10792187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	10802045	rs569418	C	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=398;SC=TGAGAATAGACCTGCCTTTGT;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=10802053;WS=10802035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	10802101	rs4712966	G	A	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=730;ReadPosRankSum=0.242;SC=ATTTTTAAAGGTCTAACAGGA;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=38;WE=10802109;WS=10802091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,48:0.81:59
chr6	10814091	rs6909367	A	G	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=53;PP=1396;ReadPosRankSum=1.185;SC=ATAGATTTATACTCTTAAAGC;SOR=0.921;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=69;WE=10814099;WS=10814081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,77:0.84:92
chr6	10882100	rs2153156	G	A	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=15;PP=466;SC=CGCCAGGTGGGTTTTTTTTCT;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=10882108;WS=10882090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	10887251	rs9366663	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.918;SOR=0.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr6	10887251	.	TCG	CCC	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=2;PP=45;QD=12.3084843578;SC=CAGGGCTCTTTCGGCAGCGCC;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=8;WE=10887261;WS=10887241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,8:0.27:30
chr6	10887253	rs9358956	G	C	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=423;SC=GGGCTCTTTCGGCAGCGCCCC;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=10887261;WS=10887241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	10887276	rs9348724	C	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=15;PP=944;SC=GCGGGCGGGGCTCTTGGGCGG;SOR=1.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=10887284;WS=10887266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	10891781	rs1538441	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=29;NR=21;PP=781;SC=TTAAGGAAGACAGGACTGGGA;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=10891789;WS=10891771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	10891838	.	ATCTC	A	543	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=64.96;NF=2;NR=20;PP=543;QD=25.7727272727;SC=TTCTTTTATAATCTCTCTCTG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=22;WE=10891879;WS=10891828;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr6	10891842	.	CTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	1466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=2.616;NF=2;NR=20;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TTTATAATCTCTCTCTGTGTG;SOR=1.308;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=22;WE=10891879;WS=10891828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr6	10891892	rs12523744	G	A	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.98;MQRankSum=1.999;QD=42.41;ReadPosRankSum=1.202;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr6	10894255	rs9368453	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=1861;ReadPosRankSum=0.009;SC=GGTTTGCTTTGTGACCAAAAT;SOR=1.017;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=50;WE=10894276;WS=10894245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr6	10894268	rs6456745	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=1852;ReadPosRankSum=1.666;SC=ACCAAAATACAAATGTATAAT;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=48;WE=10894276;WS=10894245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,57:0.65:88
chr6	10911282	rs4713044	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
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chr6	10955408	rs1225746	C	T	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=53;PP=2588;SC=AGAGGTTGCTCCGGGATCCCC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=123;WE=10955416;WS=10955398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr6	10955594	rs1225747	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=648;SC=TTTGTGCTTTTGGAGACAAAT;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=10955602;WS=10955584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr6	10983971	rs4532436	C	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
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chr6	11005842	rs2295602	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.461;SC=TGCTCCTGTTTAGTCATCAGT;SOR=0.056;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=9;WE=11005850;WS=11005832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr6	11011074	rs9380025	T	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=64;ReadPosRankSum=-1.601;SC=GATTTAAGTGTTTTTTTCTTC;SOR=0.180;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=7;WE=11011082;WS=11011064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	11094681	rs2273884	G	T	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.876;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=277;ReadPosRankSum=0.258;SC=ATCTGCTGGGGTTTTTTTTGT;SOR=2.104;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=22;WE=11094689;WS=11094671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr6	11185257	rs10601	A	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=275;SC=CTGAAAGTTGACTGACCCATA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=11185265;WS=11185247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	11185533	rs1050775	G	A	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=37;PP=1867;SC=CCATGACTATGGTCTTGAGCT;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=11185541;WS=11185523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	11185967	rs6456968	T	C	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=170;SC=GGAAATTCACTAGGCCTTGGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=11185975;WS=11185957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	11190626	rs941982	A	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=40;PP=1584;SC=GGGAGTCTTCAACTCGTTGCA;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=11190634;WS=11190616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	11192522	rs5874310	C	CT	1164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=1183;SC=CTGCACCCCCCGACACACAGA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=11192530;WS=11192512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	11192575	rs1465131	C	T	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=22;PP=1358;SC=GTCACTCACTCACCCCTTTTG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=63;WE=11192583;WS=11192565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	11192829	rs112090949	C	CTT,CT	214.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.4991,0.5009;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;NF=0,0;NR=9,9;PP=8,82;SC=GATTTATTGCCTTTTTTTTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9,9;WE=11192837;WS=11192819;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:4
chr6	11200393	rs34571072	GAAC	G	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.180;SC=GGGTAAGGGGGAACATTGGAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=11200403;WS=11200383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr6	11200421	rs2078599	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=326;SC=CTCACCAAGGCAGGGACCCCA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=11200429;WS=11200411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	11200574	rs726230	A	C	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=636;ReadPosRankSum=0.561;SC=ATGCTTGCCTATGAGGCTGGC;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=42;WE=11200582;WS=11200564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr6	11201135	rs3798733	C	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=873;ReadPosRankSum=-0.278;SC=AGATATTTATCCAAGAGAAAG;SOR=1.349;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=39;WE=11201143;WS=11201125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr6	11201157	rs3798734	C	T	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=14;PP=1345;ReadPosRankSum=1.523;SC=CGGCAAGCCTCCAAACTCAGG;SOR=1.120;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=67;WE=11201165;WS=11201147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,72:0.80:90
chr6	11201437	rs9368610	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=349;SC=GGCAGAGCAGCGGCAGCAGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=11201445;WS=11201427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	11213468	rs12215094	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=523;ReadPosRankSum=0.443;SC=GTGTAATGGGAAAAAAAAATA;SOR=0.474;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=27;WE=11213476;WS=11213458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr6	11213832	rs3734404	T	C	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1539;ReadPosRankSum=-1.516;SC=GACCGTGTAATGAGCACAGCC;SOR=0.422;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=107;WE=11213840;WS=11213822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,136:0.76:180
chr6	11214705	rs1009667	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=33;PP=1383;SC=CTCCCCTTTCGTCACCTACTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=11214713;WS=11214695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	11306153	rs16871236	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=329;ReadPosRankSum=-0.134;SC=ATTATTATTGCAGAGAATTTA;SOR=0.473;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=24;WE=11306161;WS=11306143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr6	11714639	.	G	GA	94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=61.34;NF=5;NR=1;PP=94;QD=16.3333333333;SC=CCCTCCACCAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=11714647;WS=11714629;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,6:0.40:15
chr6	11714806	rs3734273	G	A	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=24;PP=857;SC=GGGTATTTTTGTTGTGGGTAG;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=11714814;WS=11714796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr6	12294258	rs5369	A	G	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=961;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CAGACCGTGAAAATAGATGCC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=53;WE=12294266;WS=12294248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,64:0.74:87
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chr6	13273318	rs202054	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=328;ReadPosRankSum=-1.444;SC=ACCTCCCCAAAGAGAAGGCAA;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=15;WE=13273326;WS=13273308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr6	13278648	rs3817735	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CAGTGGCCTCACCGCTGCCTG;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=13278656;WS=13278638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr6	13281412	rs3846903	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1127;ReadPosRankSum=0.186;SC=GACATTAGTAAAATCCAGGTC;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=69;WE=13281420;WS=13281402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,82:0.62:132
chr6	13288535	rs202040	C	T	385.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GGGAGCGTGACTGTGGGTGTG;SOR=1.127;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=13;WE=13288543;WS=13288525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr6	13288578	rs202039	G	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=500;ReadPosRankSum=0.664;SC=TAGGGTGTGCGATGAGGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=31;WE=13288586;WS=13288568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr6	13288648	rs202038	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=773;ReadPosRankSum=0.120;SC=GATTTCCTTCATAACAGAGCT;SOR=0.596;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=57;WE=13288656;WS=13288638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,60:0.73:82
chr6	13288679	rs67298859	GCT	G	2285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=1555;ReadPosRankSum=0.884;SC=CAGTTGCAGAGCTCTCTCACC;SOR=0.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=36;WE=13288688;WS=13288669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,60:0.76:79
chr6	13288737	rs202036	T	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=508;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GTGGTGGAACTCTCCACCACA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=33;WE=13288745;WS=13288727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr6	13294866	rs6910418	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
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chr6	13361088	rs2496162	A	G	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=37;PP=1155;SC=CCTGGCAAGAACAGGAGGTGC;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=13361096;WS=13361078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	13365913	rs9367440	C	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=50;PP=1595;SC=GGGAGGAAGACAGCGGTCAGC;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=13365921;WS=13365903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr6	13711279	rs6905991	A	G	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CCGGGTAGAGACGCTTCAGCC;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=84;WE=13711287;WS=13711269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,93:0.70:132
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chr6	13794110	rs4715568	C	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=673;SC=AGAAAAATCACAGTCTTGTTT;SOR=1.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=13794118;WS=13794100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	13800626	rs3215484	TAA	T	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=492;SC=TAAAAACACATAAAAAAAAAG;SOR=1.308;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=22;WE=13800635;WS=13800616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	13801615	rs3180196	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr6	13814340	rs1204145	T	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=15;PP=377;SC=CTCCACGCGCTGCTGCGCCCG;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=13814348;WS=13814330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	15373652	rs11757092	T	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,22:0.24:91
chr6	15374508	rs9383050	A	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=30;PP=972;SC=GGAATATCTCATTGGAATGTA;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=15374516;WS=15374498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	15374544	rs2072820	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=338;ReadPosRankSum=1.327;SC=TGGACTTGTTCCTGAATTGGA;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=20;WE=15374552;WS=15374534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr6	15468722	.	AGGGTGAG	A	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=62.89;NF=3;NR=1;PP=130;QD=39.25;SC=CCTTCTGGAAAGGGTGAGGGT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=15468736;WS=15468712;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	15468876	rs7768621	C	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,14:0.18:78
chr6	15497422	rs9349979	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=418;ReadPosRankSum=-1.107;SC=GCGGGGGGTCAGGGGGTGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=20;WE=15497430;WS=15497412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr6	15501726	rs41267698	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.301;SC=TGCACTGGACGGTGTGTTCTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=15501734;WS=15501716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr6	15504589	rs760659	T	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=672;SC=CTTCCTTCTCTGCCTGTCATT;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=15504597;WS=15504579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	15511409	rs35360051	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=4.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr6	15511429	rs55742636	C	CCCAT	1402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=1641;SC=CAGAGCCTCTCGTGTGCTCGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=15511437;WS=15511419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	15513482	rs2235258	G	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=664;SC=ATACAGAGCTGCGGCAGCGCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=15513490;WS=15513472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	15513664	rs201516733	C	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,30:0.23:128
chr6	15513665	rs202086939	T	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.574;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,30:0.23:128
chr6	15513668	.	CCCTGCCGGCG	C	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,30:0.25:122
chr6	15513744	rs9396589	G	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=81;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=0.240;SC=GGCGCTCTCTGCCCAGGAGAC;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=17;WE=15513752;WS=15513734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr6	15520920	rs112303618	G	GCA	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=2.479;NF=5;NR=4;PP=265;ReadPosRankSum=-1.226;SC=AGACACACGCGCACACACACA;SOR=0.919;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=9;WE=15520929;WS=15520910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr6	15533951	rs4236167	C	T	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=970;ReadPosRankSum=-1.241;SC=CTTCTCAGGTCGTCCTTCTAC;SOR=0.255;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=64;WE=15533959;WS=15533941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,77:0.73:105
chr6	15586009	rs6926401	G	T	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=47;PP=1596;SC=GAGACCTGAAGGAGTGAACAG;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=15586017;WS=15585999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	15593240	rs7758659	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr6	15663118	rs11558324	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=5.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=1.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,25:0.22:115
chr6	16141801	.	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=-1.735;SC=TAAGTAGGCTGAGATTGATGT;SOR=0.754;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=30;WE=16141809;WS=16141791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,30:0.25:119
chr6	16143897	rs2072783	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-1.071;SC=CACTCCTTCTAGATCTGCTTT;SOR=1.402;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=7;WE=16143905;WS=16143887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr6	16145325	rs9370867	A	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.510;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,28:0.22:129
chr6	16274791	rs9396661	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.466;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=658;ReadPosRankSum=1.447;SC=GGGGCTTGCGGGGACTGCAGA;SOR=0.099;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=34;WE=16274799;WS=16274781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,37:0.82:45
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chr6	17282415	rs1108512	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
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chr6	17600619	rs6919110	A	G	190.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=95;SC=CAGGTATCCCAGAGGGTGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=17600627;WS=17600609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr6	17606413	rs1969830	C	T	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=240;SC=TTTTACAGTACACATTTTCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=17606421;WS=17606403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr6	17629616	rs942467	G	A	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=36;PP=1725;SC=ACCCAGAATCGGATGACACAC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=17629624;WS=17629606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	17633061	rs2274136	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=0.852;SC=CTACTTGAAGCAGGTACTGAA;SOR=0.399;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=8;WE=17633069;WS=17633051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr6	17665479	rs6906499	G	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.186;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=645;ReadPosRankSum=-0.292;SC=CACTGCACTTGTTATCTATTC;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=30;WE=17665487;WS=17665469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr6	17675246	rs2228375	T	C	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=43;NR=67;PP=2257;SC=GTTTTAAGGATTGAAGAATTC;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=110;WE=17675254;WS=17675236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	17688693	rs16879902	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.825;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,22:0.21:106
chr6	17706493	rs13219933	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr6	17764530	rs9371018	C	T	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=728;ReadPosRankSum=-0.391;SC=AATCTTTTCCCTCTGACACTC;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=44;WE=17764538;WS=17764520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
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chr6	17785948	rs4716186	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=28;PP=765;SC=AATAGATTTCAGCCTGGGCAA;SOR=2.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=17785956;WS=17785938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	17790191	rs2147211	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=1.900;SC=TTTTCAAACCACATACAGGGA;SOR=0.671;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=11;WE=17790199;WS=17790181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr6	17794433	rs77012093	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.73;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr6	17794494	rs3734234	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=822;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TAACTGTCCAGCCCTCTTTGG;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=57;WE=17794502;WS=17794484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,67:0.83:81
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chr6	17800131	rs41267716	G	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.725;SC=TTGTAAAATGGTTTTGCATGA;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=63;WE=17800139;WS=17800121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,76:0.74:103
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chr6	17817519	rs41267720	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=0.572;SC=AACAAGCATTCATGCCAGGCA;SOR=1.368;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=8;WE=17817527;WS=17817509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr6	17821965	rs12205910	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-2.641;SC=AATCAGCAGCACTGCTAAAAA;SOR=2.331;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=16;WE=17821973;WS=17821955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr6	17831531	rs77510670	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.132;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,11:0.15:71
chr6	17834213	rs4716190	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=0.662;SC=CTTCTGTTTTTCTCAGCTTCT;SOR=0.416;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=22;WE=17834221;WS=17834203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
chr6	17837586	rs76101669	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGGAATTAGAATAACTGTCAT;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=5;WE=17837594;WS=17837576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr6	17837663	rs78248894	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=469;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CTGGAATAGCCAATTTTTAGT;SOR=1.081;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=30;WE=17837671;WS=17837653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,33:0.34:98
chr6	17849586	rs56400999	G	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.03;ReadPosRankSum=-2.773;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,20:0.22:93
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chr6	17855864	rs624105	G	C	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=39;PP=1173;SC=GAACAGCAAGGAAAAAGAAGA;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=53;WE=17855872;WS=17855854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	17873560	rs41267728	A	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=540;ReadPosRankSum=0.445;SC=ACTCAATGGAAGAAGAGGCCA;SOR=1.077;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=40;WE=17873568;WS=17873550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,52:0.74:70
chr6	17882140	rs7757737	A	T	192.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=4.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.718;SC=GGCATGAGAAATGCTTGAACC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=17882148;WS=17882130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr6	18122506	rs10949483	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=2.048;SC=GAGGGCTCCGGGGGCGCTGGG;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=25;WE=18122514;WS=18122496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr6	18122526	rs115931931	A	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=405;ReadPosRankSum=-1.566;SC=GGGCGGCGCGATGGGCGGCCG;SOR=1.024;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=24;WE=18122534;WS=18122516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr6	18130918	rs1142345	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=0.086;SC=TGTAAGTAGATATAACTTTTC;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=18130926;WS=18130908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr6	18132495	rs78846846	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=409;ReadPosRankSum=2.646;SC=CCAAATAGGTGATGATGTGGC;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=21;WE=18132503;WS=18132485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr6	18134008	.	G	GA	37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9999;HP=16;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=19;MQ=58.88;NF=0;NR=2;PP=37;QD=21.5;SC=ACTGGTAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=2;WE=18134016;WS=18133998;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,2:0.17:12
chr6	18139214	rs2842934	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=25;NR=17;PP=871;SC=CACCTGGATTGATGGCAACTA;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=18139236;WS=18139204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	18139228	rs1800460	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=531;ReadPosRankSum=0.863;SC=GCAACTAATGCTCCTCTATCC;SOR=1.096;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=36;WE=18139236;WS=18139204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr6	18139802	rs12201199	A	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GTTACACAGGAGGAAGAGAGT;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=9;WE=18139810;WS=18139792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	18139964	rs375276814	GA	G	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=0.831;SC=ATGAAATAATGAAAAAAAAAT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=18139982;WS=18139954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr6	18139973	.	ATT	A	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr6	18147958	rs17839845	C	A	64.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTGTGTATTTCCTGAAAATGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=18147966;WS=18147957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr6	18148019	rs4449636	G	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=319;SC=CATCATTAAGGCAAGATAATT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=18148027;WS=18148009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	18148247	rs12529220	T	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=188;SC=TAATAAGCAGTTACTATTAAT;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=18148255;WS=18148237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	18149526	rs3930696	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=96;SC=TTTTTTATTTCTGGTTTTATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=18149534;WS=18149516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	18166802	rs912528	T	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=264;SC=TAGGCTGGGTTTGGTGGCTCA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=18166810;WS=18166792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	18171477	rs1011620	G	A	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=914;SC=ATGCAAGGAGGAGAAAAAATA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=18171485;WS=18171467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	18187916	rs372534	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=714;SC=AAAAGCATAGCGGGTTAAGGA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=18187924;WS=18187906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	18188091	rs429158	T	C	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=65;PP=1843;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGAAAGACAGTGTGGCAGCGC;SOR=0.530;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=159;TCF=68;TCR=91;TR=117;WE=18188099;WS=18188081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,131:0.72:183
chr6	18201961	rs214612	T	C	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=650;SC=GCAGTGGCATTGTTCATTTGC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=18201969;WS=18201951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	18207876	rs214598	G	C	594.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=451;ReadPosRankSum=0.330;SC=CCAGGGTCTAGAAGTACTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=20;WE=18207884;WS=18207866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr6	18208319	rs214596	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=816;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CCTGGATCACGTGGTTCCATC;SOR=0.360;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=44;WE=18208327;WS=18208309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,57:0.81:70
chr6	18212794	rs41267732	A	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,34:0.25:136
chr6	18213988	rs6903583	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=753;ReadPosRankSum=0.538;SC=GGCTTTTTGCCGTGTTCTATG;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=42;WE=18213996;WS=18213978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,50:0.85:59
chr6	18215166	rs66551414	C	CA	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.33;ReadPosRankSum=1.478;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,13:0.15:86
chr6	18215303	rs214585	T	C	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=49;PP=1322;SC=GGACCCTGGATGACAAACAGG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=77;WE=18215311;WS=18215293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	18222102	rs140834	C	CTT	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.847;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.291;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,22:0.23:95
chr6	18226213	rs7740259	C	G	200.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CAGGTCTTATCACTAACTGTT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=18226221;WS=18226203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr6	18244746	.	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=213;ReadPosRankSum=1.140;SC=TACCTATGATTTATAGGCAGC;SOR=0.926;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=18;WE=18244754;WS=18244736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr6	18256224	.	CT	C	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9998;HP=19;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=57.71;NF=0;NR=2;PP=27;QD=16.0;SC=AATCTTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=18256232;WS=18256214;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,2:0.22:9
chr6	18256625	rs17336208	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=293;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TTTATATTGGACACTTCCTTT;SOR=1.171;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=22;WE=18256633;WS=18256615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr6	18258516	rs172520	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,22:0.19:115
chr6	18387768	rs140710411	CTCCTG	C	2313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.657;NF=23;NR=17;PP=1979;ReadPosRankSum=1.244;SC=AATGGAAGAGCTCCTGTCCGG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=40;WE=18387780;WS=18387758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,58:0.72:81
chr6	18399750	rs2296198	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=721;SC=GACTGAAGAATGCTGAAGACA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=18399758;WS=18399740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	18406387	rs6925570	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=0.283;SC=TCAACTTTTCGTATGAGACAT;SOR=0.533;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=25;WE=18406395;WS=18406377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr6	18439739	rs2277081	T	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GGAGTGGGGATGACTTGAAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=18439747;WS=18439729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	18463633	rs9371061	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=236;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TTATAGGGAGCGTGACATAAA;SOR=0.699;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=21;WE=18463641;WS=18463623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr6	18572233	rs9396886	A	C	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=54;PP=1570;ReadPosRankSum=0.317;SC=CACTATGCAGAAGCTAAGAGC;SOR=1.012;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=74;WE=18572241;WS=18572223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,82:0.77:106
chr6	20115611	rs76188572	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=192;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ACACCTATCATTAGCTTTAAA;SOR=0.968;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=16;WE=20115619;WS=20115601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
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chr6	22570064	rs2076506	C	T	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=75;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AACAACCCCACGGTCCAGGCC;SOR=0.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=228;TCF=75;TCR=153;TR=114;WE=22570072;WS=22570054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,125:0.50:251
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chr6	24302087	rs807703	G	A	5840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=91;PP=2965;SC=GGAAAACAGGGGGCAAACCTT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=179;WE=24302095;WS=24302077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
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chr6	24415380	rs3761788	G	A	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1069;ReadPosRankSum=1.633;SC=TTTTACTACAGAATGGCAAAA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=64;WE=24415388;WS=24415370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,80:0.53:152
chr6	24418348	rs2793422	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=251;ReadPosRankSum=0.248;SC=ATGCAGAAGAGATGGAGTTGC;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=16;WE=24418356;WS=24418338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr6	24418502	rs3736798	A	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr6	24437611	rs12194966	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=0.108;SC=CTGATCACTCGGGATCCTACA;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=22;WE=24437619;WS=24437601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr6	24445718	rs793714	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=285;SC=CCAATACGACATGTACAAGCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=24445726;WS=24445708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	24448459	rs13191455	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=581;ReadPosRankSum=1.523;SC=AAACAGCAGATAGACATGAGG;SOR=1.093;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=33;WE=24448467;WS=24448449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
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chr6	24467633	rs2793445	C	T	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=823;SC=TTACATGCACCAGTTATTTAA;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=24467641;WS=24467623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	24474018	rs35864956	G	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=569;ReadPosRankSum=-1.407;SC=ACGCATAATAGACTCAATTTT;SOR=0.179;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=34;WE=24474026;WS=24474008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
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chr6	24476553	rs760904	G	A	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=75;PP=2510;SC=AAAAGTTGGAGAGTCTCAATC;SOR=1.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=120;WE=24476561;WS=24476543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	24480025	rs5874986	CAT	C	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.54;MQRankSum=1.279;NF=6;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=1.409;SC=ATTGTACACACATATATATAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=24480034;WS=24480015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr6	24489741	rs2076316	A	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=466;ReadPosRankSum=-0.284;SC=AGCAGACATGATCTCATTGCC;SOR=0.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=25;WE=24489749;WS=24489731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr6	24503590	rs2760118	C	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=51;PP=1242;ReadPosRankSum=0.211;SC=AGACATTATCCACACCCCGGC;SOR=0.887;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=77;WE=24503598;WS=24503580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,84:0.51:164
chr6	24505030	rs2744583	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=-0.355;SC=ACTTCCCAACATGCCTTCCTT;SOR=0.497;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=25;WE=24505038;WS=24505020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr6	24505221	rs2817220	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=487;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GAGGTGAGCCGCTCTCCCTGT;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=36;WE=24505229;WS=24505211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr6	24505354	rs2744584	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=0.832;SC=ATCTACTGGTGATTACTTTAA;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=11;WE=24505362;WS=24505344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr6	24528131	rs4646848	GA	G	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.003;NF=10;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTGAAAAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=24528139;WS=24528121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr6	24559433	rs3903801	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GATGGTGACTACCATGACACG;SOR=0.243;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=7;WE=24559441;WS=24559423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	24588884	rs4504469	C	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=631;ReadPosRankSum=1.433;SC=GAGGGGGCTGCGCTAGTGGGA;SOR=0.633;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=45;WE=24588892;WS=24588874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr6	24596478	rs4576240	T	G	8276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=118;PP=2965;SC=CCTAGAAAGGTCAAGTCCTTT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=120;TCR=118;TR=238;WE=24596486;WS=24596468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr6	24651320	rs3181245	C	G	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=486;SC=AGAATACTCTCTAAGATACAC;SOR=1.609;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=22;WE=24651328;WS=24651310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	24653273	rs2294689	G	C	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1419;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GGAGCCTCTTGCATTTTCTTT;SOR=0.399;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=85;WE=24653281;WS=24653263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,107:0.46:231
chr6	24653376	rs1129644	G	A	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=52;PP=1719;SC=TTCCTGACACGTTCACCTGCA;SOR=1.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=24653384;WS=24653366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	24657964	rs3212231	T	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	24666194	rs3756815	G	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=-1.205;SC=AGTTTGATAGGCCTGGAACCT;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=24666202;WS=24666184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr6	24667205	rs17243164	T	TCC	1846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=1619;SC=GGAAATGCGCTGCTCTCGGAA;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=32;WE=24667213;WS=24667195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	24667281	.	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATGCGCGCTTCGTCACAAGGG;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=24667289;WS=24667271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	24687765	rs926529	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=22;PP=1181;SC=GTGTAAAGTCATCTTTATGGA;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=63;WE=24687773;WS=24687755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	24806594	rs9358799	C	T	5608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=71;PP=2965;SC=AGGCAGTTAACCTGTAATTAA;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=168;WE=24806602;WS=24806584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr6	24806739	rs5875006	C	CTT	3404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=49;PP=2364;SC=CCAATTCAAACAACGTTTTTA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=52;WE=24806760;WS=24806729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	24806752	rs4074420	A	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=47;PP=1460;SC=CGTTTTTATTAATTACTCAAA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=58;WE=24806760;WS=24806729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	24806777	rs9379689	T	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=874;SC=CATAGTGCCATTTGTTTAGGG;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=24806785;WS=24806767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	24809771	rs9379692	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=558;SC=GGGGTGAGATAGACACTGATC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=24809779;WS=24809761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	24809853	rs9393587	C	T	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=27;PP=2277;SC=CATGAAACTTCTCCTTACTGG;SOR=2.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=107;WE=24809861;WS=24809843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr6	24809881	rs9358801	T	A	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=50;PP=2965;SC=AACATCTAAATGGGAACATCC;SOR=1.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=93;TCR=50;TR=143;WE=24809889;WS=24809871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr6	24825511	rs9358804	A	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=13;PP=908;SC=TCACAGCCTCACTAACTTCGT;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=24825519;WS=24825501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	24828318	rs35374726	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=285;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GCAGAGATAACGCCAAATTGA;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=15;WE=24828326;WS=24828308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr6	24828490	rs9461073	C	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.924;NF=33;NR=38;PP=1024;ReadPosRankSum=0.481;SC=AGGCTCAGCCCGGTCCAGAAT;SOR=0.767;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=71;WE=24828498;WS=24828480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
chr6	24828560	rs45437991	A	G	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.08;MQRankSum=1.008;NF=21;NR=40;PP=2243;ReadPosRankSum=-1.225;SC=AGCTTTAGATAGATGACCATT;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=61;WE=24828577;WS=24828550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr6	24828566	rs72205632	CCATT	C	1337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.977;NF=0;NR=27;PP=2266;ReadPosRankSum=-1.805;SC=AGATAGATGACCATTCATTCA;SOR=0.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=1;TCR=75;TR=27;WE=24828577;WS=24828550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr6	24830680	rs79868980	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GACCCCCACCCCAATGCCCAC;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=24830688;WS=24830670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr6	24836161	rs6901565	C	A	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=253;SC=AGGTCAAGTCCACATGGTTTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=24836169;WS=24836151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	24850715	rs7761191	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=0.711;SC=CTTGTGCAGAAAAGTCTGTGG;SOR=1.302;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=12;WE=24850723;WS=24850705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr6	24850752	rs114950400	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=0.936;SC=GCAGGGGTCACGGGTAAGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=20;WE=24850760;WS=24850742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr6	24871031	rs112061020	C	T	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1450;ReadPosRankSum=1.679;SC=CGTGAGCCACCGTGCCCAGCA;SOR=0.604;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=191;TCF=122;TCR=69;TR=91;WE=24871039;WS=24871021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,103:0.48:215
chr6	25082105	rs303010	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=-1.513;SC=TGGTTTTGCATTCCTGTGAAA;SOR=1.051;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=21;WE=25082113;WS=25082095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr6	25082262	rs12197057	T	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GAATGTGAACTGGAATATGAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=25082270;WS=25082252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	25084691	rs303007	C	T	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=15;PP=1101;SC=CTCCCAAACCCACAGGATATT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=25084699;WS=25084681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	25084718	rs303006	A	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=24;PP=1424;SC=TTGCAAAATCACAGGCCCATT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=25084726;WS=25084708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	25086968	rs895673	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=1.575;SC=TATCCACAGCGTCCTCAGCAA;SOR=0.096;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=20;WE=25086976;WS=25086958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr6	25092031	rs9654585	T	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=429;ReadPosRankSum=0.490;SC=TCTAAAATTATAAGTTTATTT;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=22;WE=25092039;WS=25092021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
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chr6	25108991	rs79916468	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=2236;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TCTTGAACACCCATAGTTTGA;SOR=0.471;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=46;WE=25108999;WS=25108979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,53:0.65:82
chr6	25110097	rs302990	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.466;SC=TGACCCATTTTTTCCTTAATC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=25110105;WS=25110087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	25115176	rs57247838	CGTTTTT	C	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=607;ReadPosRankSum=0.724;SC=ATCTTGGTCACGTTTTTGTTT;SOR=1.380;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=13;WE=25115189;WS=25115166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr6	25115397	rs302982	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.947;SC=ACTGAAATAGGAATGCATGGT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=25115405;WS=25115387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr6	25279208	rs6908902	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=1.201;SC=GGACAAGGAAATGGAAAGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=25279216;WS=25279198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	25279839	rs377675604	CT	C	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.775;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	25280119	rs6914799	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=6.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr6	25420344	rs913455	C	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=956;ReadPosRankSum=-1.387;SC=TCTTACAGGTCCTTACATCAT;SOR=0.502;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=67;WE=25420352;WS=25420334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,76:0.58:132
chr6	25426640	.	ATT	A	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.000;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.582;SOR=3.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	25450026	rs9295661	C	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTGAAGTGACCCTCATCTTTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=25450034;WS=25450016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	25452223	.	T	C	202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=57.18;NF=11;NR=1;PP=202;QD=19.7309343789;SC=TGCCCCCCCCTCCCCCCCCCA;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=12;WE=25452231;WS=25452213;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,12:0.67:18
chr6	25472787	rs9393646	G	A	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=811;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TGCCAGAATTGTAAGAGGATT;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=53;WE=25472795;WS=25472777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr6	25492296	rs1034051	C	T	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=67;PP=2131;SC=GAAGTGTCTTCTTCTGAGAAA;SOR=1.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=95;WE=25492304;WS=25492286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	25492364	rs1034050	A	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=622;SC=GAAAGAAGGCAGCCTTAAGCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=25492372;WS=25492354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	25509976	rs4568443	T	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=31;PP=1143;SC=GTAAGTCAGATATTGAAAAGA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=25509984;WS=25509966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	25510051	rs3915740	A	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.87;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	25510058	rs4559085	G	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.91;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	25510648	rs7453991	TA	CG	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=169;SC=CATCCAACTATATGTCACCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=25510657;WS=25510638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	25511008	rs34965228	C	CAT	1569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=1373;SC=TTATGTTAAACTTTTTACTAA;SOR=3.086;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=25511016;WS=25510998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	25516126	rs301379	C	T	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=219;SC=GAGCAGATTCCGAACAGCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=25516134;WS=25516116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	25516158	rs301378	G	A	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=6;PP=139;SC=TGCTGGGCCCGAGGGGACCTG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=25516166;WS=25516148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	25528913	rs485567	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TGGCAGGATGTGTATATTCAC;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=25528921;WS=25528903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr6	25554180	rs214049	C	G	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1113;ReadPosRankSum=-2.695;SC=AAGGGTGGATCATTTTCCCCT;SOR=1.139;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=58;WE=25554188;WS=25554170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
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chr6	25605091	rs1012899	G	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=728;ReadPosRankSum=-1.179;SC=AGCTTTGAGCGGCGTAGAACG;SOR=0.841;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=44;WE=25605099;WS=25605081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
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chr6	25726621	rs9467583	C	T	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1685;ReadPosRankSum=-1.349;SC=GTGCGCCTGCCCCTATCCGCT;SOR=0.650;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=240;TCF=122;TCR=118;TR=101;WE=25726629;WS=25726611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,127:0.45:285
chr6	25726675	rs9358871	G	A	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=76;PP=2180;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TCCGGCCTACGGGAAACTGCA;SOR=0.873;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=232;TCF=108;TCR=124;TR=138;WE=25726683;WS=25726665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,151:0.54:279
chr6	25726774	rs4711095	A	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=681;ReadPosRankSum=-0.667;SC=ATCAAATTGCAGCAACACGAG;SOR=0.718;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=56;WE=25726782;WS=25726764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr6	25727054	rs4711096	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.124;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
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chr6	25727265	rs4712960	C	T	3054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=77;PP=2101;ReadPosRankSum=-1.894;SC=CTATTTACATCTACAAAGTGC;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=247;TCF=95;TCR=152;TR=126;WE=25727273;WS=25727255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,138:0.50:275
chr6	25727334	rs4712961	C	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1084;ReadPosRankSum=0.966;SC=TTATGAATTCCTTCGTCACTG;SOR=0.985;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=137;TCF=48;TCR=89;TR=62;WE=25727342;WS=25727324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,63:0.42:150
chr6	25727517	rs9358872	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CCAGCTCCAAGTAAGCCTGCT;SOR=1.101;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=11;WE=25727525;WS=25727507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr6	25769349	rs1892251	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=849;ReadPosRankSum=0.662;SC=AGCCCAATGCTTCCACAGAAC;SOR=0.370;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=50;WE=25769357;WS=25769339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,61:0.41:148
chr6	25770239	rs2328893	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=667;ReadPosRankSum=0.035;SC=AGTCCTCACAATGAAAACTGT;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=38;WE=25770247;WS=25770229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr6	25770707	rs4712970	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.237;NF=4;NR=25;PP=487;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CAGGTAACTGGTACCCTAAAC;SOR=1.340;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=29;WE=25770715;WS=25770697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
chr6	25798932	rs1165215	G	A	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=14;PP=938;SC=ATTCCTTCTCGTCTGAGGAGT;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=25798940;WS=25798922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	25801057	rs1165210	T	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=9;PP=460;SC=TTTTCATATGTGTAATCTTTC;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=25801065;WS=25801047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	25813150	rs1165196	G	A	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=68;PP=2965;SC=AAAACTACCAGTGGAAATAGC;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=104;TCR=68;TR=172;WE=25813158;WS=25813140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr6	25849620	rs942379	A	G	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=34;PP=2171;SC=GAAGAAATCCACTGACAGTGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=76;TCR=34;TR=110;WE=25849628;WS=25849610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
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chr6	25862466	rs1165165	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=693;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CTTACCTTTGCAGGAAGACTC;SOR=0.986;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=44;WE=25862474;WS=25862456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
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chr6	25925823	rs7770139	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=1.076;SC=TTAATTTCTCACAGATGATTT;SOR=0.821;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=10;WE=25925831;WS=25925813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr6	25925987	rs3734523	G	A	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=743;ReadPosRankSum=1.786;SC=AACAAGAGCAGTGGCTTTACC;SOR=0.601;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=45;WE=25925995;WS=25925977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr6	25967068	rs2009610	C	T	3416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=2045;ReadPosRankSum=-1.256;SC=TCTGCGAAGACGAGGGGCAGC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=269;TCF=140;TCR=129;TR=128;WE=25967076;WS=25967058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,157:0.49:319
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chr6	26017361	.	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=395;ReadPosRankSum=0.930;SC=TCTTTGGCTTCGTCACCCTAG;SOR=0.327;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=29;WE=26017369;WS=26017351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
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chr6	26021872	rs41266779	C	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=15;PP=1300;ReadPosRankSum=0.850;SC=GTTTCCTATTCTCTCACTTGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=98;TCR=29;TR=67;WE=26021880;WS=26021862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,75:0.51:148
chr6	26022244	rs3734528	A	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=908;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CACAGCTTGCATTTCTGAACC;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=61;WE=26022252;WS=26022234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr6	26022392	rs75397441	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=100;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TCCAAGTTTGCCCTCCACTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=26022400;WS=26022382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr6	26027433	rs3752419	G	A	3879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=84;PP=2291;ReadPosRankSum=0.259;SC=GGTGACGCTTGGCACCTCCCT;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=276;TCF=115;TCR=161;TR=145;WE=26027441;WS=26027423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,179:0.56:322
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chr6	26031868	rs2213284	G	A	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=60;PP=2200;SC=ATGAAAAAGTGACTTTACATT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=121;WE=26031876;WS=26031858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	26033506	rs2230655	G	A	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=65;PP=2329;SC=CACGCCCCAAGAGTTTATTAA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=118;WE=26033514;WS=26033496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	26033809	rs3842706	T	TAAG	2592.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=117;PP=1625;ReadPosRankSum=0.181;SC=CTACTTCTGATAAGGGAAAAT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=25;TCR=131;TR=139;WE=26033818;WS=26033799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,119:0.48:248
chr6	26033810	rs33919743	A	AAGT	2722.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=117;PP=1454;ReadPosRankSum=0.965;SC=TACTTCTGATAAGGGAAAATC;SOR=0.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=25;TCR=133;TR=139;WE=26033818;WS=26033799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,129:0.51:251
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chr6	26285683	rs2393593	T	C	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=58;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GACGCTTAGCTCCTCCCTTAC;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=256;TCF=125;TCR=131;TR=109;WE=26285691;WS=26285673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,136:0.45:304
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chr6	26365586	rs28362606	T	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=768;ReadPosRankSum=1.108;SC=AAGGGGTAAGTGCAGGAAATT;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=154;TCF=63;TCR=91;TR=62;WE=26365594;WS=26365576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,80:0.43:187
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chr6	26365702	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	2176	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=2176;QD=311.285714286;SC=GGTGCAGTGCCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=7;WE=26365729;WS=26365692;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,7:0.29:24
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chr6	26368938	rs76764747	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.982;NF=2;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=0.731;SC=AGGTGGTGAACGTGTATGCAG;SOR=0.641;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=21;WE=26368946;WS=26368928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr6	26370474	rs35307327	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=439;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CAAATCTGAGCCTGACATTGA;SOR=0.890;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=27;WE=26370482;WS=26370464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr6	26370572	rs34878490	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=992;ReadPosRankSum=0.340;SC=ATCTTCACGTCGAAGTGAAGG;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=65;WE=26370580;WS=26370562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,70:0.43:161
chr6	26370605	rs9379860	T	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1186;ReadPosRankSum=0.984;SC=GAGGGATCCATCTGGAGTGCA;SOR=0.781;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=68;WE=26370613;WS=26370595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr6	26370657	rs9358936	A	G	3922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.000;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,98:0.54:182
chr6	26370657	.	AAC	GAT	2754	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=59.91;NF=45;NR=35;PP=2754;QD=20;SC=ACAGTGGAGCAACGCCAAGGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=156;TCF=86;TCR=70;TR=80;WE=26370667;WS=26370647;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr6	26370659	rs9393711	C	T	3922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.000;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,102:0.55:187
chr6	26370707	rs9379862	T	C	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=43;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TGGTTGCAGATGGAGTGGGCC;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=116;TCR=84;TR=104;WE=26370715;WS=26370697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,120:0.51:236
chr6	26373086	rs12174623	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GGAGGCTGAGCGCACCAGCGC;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=26373099;WS=26373076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	26373091	.	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=268;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CTGAGCGCACCAGCGCCCATG;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=26373099;WS=26373076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	26373121	rs12174639	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TCTCCCCTTCGCAGACCCCTT;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=13;WE=26373129;WS=26373111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	26373150	rs12174631	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=318;ReadPosRankSum=0.593;SC=GCGCCCAGCCCTGGATCGCAG;SOR=1.167;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=18;WE=26373158;WS=26373140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr6	26373507	rs13216828	G	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=656;ReadPosRankSum=0.734;SC=TTTCCAGAGAGCCTCCAGGAG;SOR=0.988;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=33;WE=26373515;WS=26373497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr6	26373678	rs9393713	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=502;ReadPosRankSum=-0.006;SC=ATTCAAATCTGTTACTCTCTC;SOR=1.321;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=31;WE=26373686;WS=26373668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr6	26373740	rs9393714	G	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=224;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TTGAAAAGTGGTCTTGGATCC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=26373748;WS=26373730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	26374658	rs2073526	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=492;ReadPosRankSum=1.028;SC=ACTGTGACCCGTGGATGTTCT;SOR=0.699;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=32;WE=26374666;WS=26374648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr6	26385093	rs2072806	C	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=379;ReadPosRankSum=1.461;SC=CAGAAGGGTTCTCAGCCCAAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=17;WE=26385101;WS=26385083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr6	26390830	rs2076029	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=1.268;SC=ATAGAAAGGATGGTTCCTACG;SOR=3.111;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=20;WE=26390838;WS=26390820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr6	26392515	rs2072803	G	C	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ACCCCCTTCAGCTTTCTGAGA;SOR=0.486;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=48;WE=26392523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
chr6	26393021	rs1614887	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.638;NF=13;NR=10;PP=343;ReadPosRankSum=0.495;SC=GGGACAGATCGCACATCTACA;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=23;WE=26393029;WS=26393011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr6	26406255	rs3857550	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.331;NF=0;NR=22;PP=446;ReadPosRankSum=0.232;SC=TGAAGTGGGTGAGTTCCAGCC;SOR=4.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=22;WE=26406263;WS=26406245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr6	26409890	rs41266839	G	C	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACTCAGTTCAGAAAGAAAAAG;SOR=0.930;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=156;TCF=102;TCR=54;TR=74;WE=26409898;WS=26409880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,89:0.46:194
chr6	26422260	rs1796522	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.805;NF=38;NR=22;PP=843;ReadPosRankSum=1.670;SC=GAGAGGTTGGGCCCGACCAGC;SOR=0.794;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=60;WE=26422268;WS=26422250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,48:0.42:113
chr6	26423560	rs4320356	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=629;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TTGGGTAAAGCTTCTCTTCTA;SOR=0.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=31;WE=26423568;WS=26423550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
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chr6	26463574	rs13195401	GG	TT	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.654;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=14;PP=2724;ReadPosRankSum=-1.836;SC=CTCACAGTGTGGAGGGACCCC;SOR=1.181;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=128;TCF=92;TCR=36;TR=59;WE=26463583;WS=26463564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr6	26463660	rs13195509	G	A	4040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=75;PP=2305;ReadPosRankSum=1.287;SC=CACCACGGCTGTGATCATCAG;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=309;TCF=164;TCR=145;TR=161;WE=26463668;WS=26463650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,191:0.51:371
chr6	26466225	rs1977198	A	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=562;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TTCCTTAACTACATGTACAAT;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=37;WE=26466233;WS=26466215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr6	26468326	rs3734542	G	A	4199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=78;PP=2716;ReadPosRankSum=0.770;SC=GTCCTAGGCCGGGAGAGCTTC;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=299;TCF=149;TCR=150;TR=152;WE=26468334;WS=26468316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,186:0.52:359
chr6	26468545	rs3734543	G	C	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.854;NF=24;NR=39;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.605;SC=TGCCGGGTGGGCGTCTTCCTG;SOR=1.025;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=63;WE=26468553;WS=26468535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr6	26468660	rs3734544	G	A	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.994;NF=51;NR=23;PP=1331;ReadPosRankSum=-1.113;SC=CCTTCTTCAGGTTGGGGTGTG;SOR=0.922;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=99;TCR=53;TR=74;WE=26468668;WS=26468650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
chr6	26501471	rs3215660	AG	A	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=251;ReadPosRankSum=0.843;SC=GAAGCTCCTGAGGGGACTCAC;SOR=0.846;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=7;WE=26501479;WS=26501461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr6	26501768	rs2295593	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=528;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CGGTGTCTGTCCGTAGTTCCC;SOR=0.538;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=15;WE=26501785;WS=26501758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr6	26501777	rs2255070	C	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=501;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TCCGTAGTTCCCATCTCCACA;SOR=1.061;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=13;WE=26501785;WS=26501758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr6	26501897	rs1321479	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=613;ReadPosRankSum=1.191;SC=GTCGCCTGTCTCCGAACGCGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=47;WE=26501905;WS=26501887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr6	26505135	rs3736780	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=374;SC=ACATTAAGTCCAGATTCTCTC;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=26505143;WS=26505125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	26505362	rs3736781	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=662;ReadPosRankSum=-0.276;SC=AGACACTTCTGCGAAAAATGT;SOR=0.831;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=49;WE=26505370;WS=26505352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,60:0.43:138
chr6	26505403	rs3736782	C	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=675;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TCCTTCTTGGCCAGGAGAAGA;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=46;WE=26505411;WS=26505393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr6	26509330	rs9393728	C	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TGGGGGAGGACTCTGCCCCTA;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=26;WE=26509338;WS=26509320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr6	26509382	rs35555795	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CCCTACCCAACCCAGCCAAGG;SOR=0.182;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=5;WE=26509390;WS=26509372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr6	26545308	rs1884946	C	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=1.205;SC=CGTTTACATTCGTCAGTCTTT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=13;WE=26545316;WS=26545298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	26545632	rs4871	G	A	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=912;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GAAAGGATGGGAACAACCCTG;SOR=0.471;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=53;WE=26545640;WS=26545622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr6	26597333	rs3800302	A	G	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=33;PP=2476;SC=GCAGCAAGAAACGGGTAGTGC;SOR=1.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=106;WE=26597341;WS=26597323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	26598004	rs4634439	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TGCGATTTACAGTTCCCTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=26598012;WS=26597997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr6	26598188	rs3800303	A	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=834;ReadPosRankSum=-0.029;SC=CTGCCGGAGGAAAAAAGCGGT;SOR=0.562;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=52;WE=26598196;WS=26598178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,67:0.42:159
chr6	26637724	rs139332558	T	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.42;MQRankSum=-9.081;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,62:0.33:188
chr6	26638503	rs148210763	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.92;MQRankSum=-6.140;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr6	27216848	rs1234145	T	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=720;SC=GCATCTCACCTCCCCACCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=27216856;WS=27216838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr6	27278020	rs16897515	C	A	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.194;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=838;ReadPosRankSum=0.675;SC=TTCACTACACCAAAATCCAAA;SOR=1.067;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=56;WE=27278028;WS=27278010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
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chr6	27356527	rs13220817	T	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=365;SC=GCTGATACGTTGCTCAGTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=27356535;WS=27356519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	27356867	rs4713091	A	G	9506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=115;PP=2965;SC=GGGTGCTCTTAGAGGTTCTGG;SOR=1.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=286;TCF=171;TCR=115;TR=286;WE=27356875;WS=27356857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr6	27356902	rs10807020	A	G	10579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=168;NR=148;PP=2965;SC=GGTTCTTCGAAGGAAACGGGC;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=318;TCF=169;TCR=149;TR=316;WE=27356910;WS=27356892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr6	27356925	rs10807021	T	G	9993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=159;PP=2965;ReadPosRankSum=1.123;SC=AAGGGTCGCGTGTGGTTTGGC;SOR=0.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=303;TCF=143;TCR=160;TR=302;WE=27356933;WS=27356915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,370:1.00:371
chr6	27357308	rs6904883	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=568;SC=AGTACTTGCTTGGCCGGGCGC;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=27357316;WS=27357298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	27424443	rs764461	T	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.545;SC=ATTAGTGACATAACAAAGCAT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=27424451;WS=27424433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	27424960	rs10484398	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr6	27435707	rs2272814	G	A	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=35;PP=1350;SC=GATCTAGGGGGAGAAGCAGGA;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=27435715;WS=27435697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	27440004	rs7750795	A	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=68;PP=2923;SC=AGTATTTGATACTCCAGTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=135;WE=27440012;WS=27439994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr6	27775674	rs200484	A	G	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=935;ReadPosRankSum=0.661;SC=AGACTTGGCCAGCTCGGGCAT;SOR=1.251;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=55;WE=27775682;WS=27775664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr6	27775697	rs200485	G	C	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=841;ReadPosRankSum=0.444;SC=TGAAACAATAGTGGCAAAACC;SOR=0.841;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=49;WE=27775705;WS=27775687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr6	27782031	rs370155	T	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=653;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GTGTACTGTGTAGTGGTGAAG;SOR=0.424;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=34;WE=27782039;WS=27782021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr6	27782528	rs401763	T	C	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=7.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=-10.540;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.536;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,25:0.21:117
chr6	27782535	rs390764	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=5.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-10.748;QD=6.55;ReadPosRankSum=2.084;SOR=0.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,25:0.21:118
chr6	27782538	rs401754	T	A	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=4.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQRankSum=-10.389;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,26:0.22:116
chr6	27783204	rs45458699	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=667;ReadPosRankSum=0.860;SC=TCCAAGTGAGCCTCTCGCTGC;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=43;WE=27783212;WS=27783194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,43:0.35:122
chr6	27792221	rs200499	C	T	10175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.60;QD=44.24;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr6	27792228	rs200498	T	C	10263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.12;QD=44.63;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr6	27798887	rs67101035	C	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=-0.065;SC=ACAAACTCAGCAGGCGCGAAC;SOR=1.387;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=13;WE=27798895;WS=27798877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
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chr6	28059217	rs9393888	G	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CCGTATGAAGGTGTCTCCCAG;SOR=1.019;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=57;WE=28059225;WS=28059207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
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chr6	28104634	rs9380057	G	T	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=61;PP=1693;ReadPosRankSum=-0.201;SC=GCTAGAGGTCGCGAGAGAACT;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=219;TCF=86;TCR=133;TR=99;WE=28104642;WS=28104624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,116:0.44:266
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chr6	28198281	rs1233713	A	G	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CTATTCTTGTATGTGAGAGAC;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=89;WE=28198289;WS=28198271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
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chr6	28212748	rs13408	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=374;ReadPosRankSum=0.815;SC=ATAACTCATCGTCTCAGCCAG;SOR=0.435;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=28;WE=28212756;WS=28212738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr6	28214646	rs62401443	T	C	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1419;ReadPosRankSum=0.355;SC=TGATTCTGAATCCAAACATAA;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=62;TCR=100;TR=82;WE=28214654;WS=28214636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,96:0.50:193
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chr6	28219270	rs1736904	G	A	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.613;NF=35;NR=31;PP=819;ReadPosRankSum=1.310;SC=AATGCCCCTCGCTCCGATCTG;SOR=0.591;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=66;WE=28219278;WS=28219260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,85:0.45:191
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chr6	28255040	rs1150721	G	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=0.594;SC=ACTCATCATCGTGAGAGCCAT;SOR=0.515;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=7;WE=28255048;WS=28255030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr6	28268452	rs1936365	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TCATGTGTGAGAGAATATGAT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=28268460;WS=28268442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr6	28268824	rs33932084	A	G	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1300;ReadPosRankSum=0.395;SC=ATTAAACCCAATTTTCCAAGC;SOR=0.850;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=80;WE=28268832;WS=28268814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,103:0.49:211
chr6	28269663	rs1997660	A	G	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=47;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TGATTTCCGAATAGAAGAAAA;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=118;TCR=85;TR=107;WE=28269671;WS=28269653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,117:0.53:220
chr6	28294550	rs853684	T	C	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=715;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TCTTTGGAGTTTGCTATCCCC;SOR=0.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=46;WE=28294558;WS=28294540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr6	28297313	rs853678	T	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=612;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GGACCAGGAGTCTCTTGGTAA;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=44;WE=28297321;WS=28297303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr6	28331127	rs13201752	AA	GC	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=2488;ReadPosRankSum=0.462;SC=CAGAGAAGATAAAGTGGTAGC;SOR=1.042;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=59;WE=28331136;WS=28331117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,74:0.57:130
chr6	28331252	rs213228	A	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CCTCCACCCCAATCCTAGATC;SOR=0.795;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=17;WE=28331260;WS=28331242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr6	28334079	rs55924797	CAG	C	2901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.117;NF=12;NR=42;PP=2337;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CCATACATGCCAGAGTTGGTG;SOR=0.708;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=113;TCF=20;TCR=93;TR=54;WE=28334088;WS=28334069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr6	28358320	rs1361385	A	G	4341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CACTCTTTACATACATAGGTA;SOR=0.624;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=96;WE=28358328;WS=28358310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,120:0.41:296
chr6	28358335	rs1416918	G	C	4289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TAGGTACCACGTCTATTATGG;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=252;TCF=126;TCR=126;TR=98;WE=28358343;WS=28358325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,118:0.41:290
chr6	28359170	rs2859348	A	G	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=730;ReadPosRankSum=0.821;SC=TGTAGGGTCTATCTCCAGTAT;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=53;WE=28359178;WS=28359160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr6	28360659	rs2232426	G	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.058;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr6	28366151	rs2232423	A	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=587;ReadPosRankSum=-1.983;SC=ATCCTGGTCCATGTGGGCCTG;SOR=0.420;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=42;WE=28366159;WS=28366141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr6	28403225	rs2071965	C	T	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1098;ReadPosRankSum=0.943;SC=CTGAGGAAATCCTGATCCTCA;SOR=0.943;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=76;WE=28403233;WS=28403215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr6	28403603	rs11752919	T	C	3407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=73;PP=2255;ReadPosRankSum=0.499;SC=CTTGTTCTTATAGGTACAAAT;SOR=0.824;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=290;TCF=132;TCR=158;TR=128;WE=28403611;WS=28403593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,158:0.44:359
chr6	28473325	rs2071966	T	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=302;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TTTCCTCTACTTAAAGCTAAA;SOR=1.721;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=19;WE=28473334;WS=28473315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr6	28474218	rs974334	C	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=835;ReadPosRankSum=-1.578;SC=TGTAAGTGGACAATGAATAGC;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=53;WE=28474226;WS=28474208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,58:0.45:129
chr6	29855902	rs62389357	G	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=918;SC=GGAGGGGCCAGAGTATTGGGA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=29855910;WS=29855892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr6	29857502	rs3115605	A	C	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.88;QD=29.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr6	32547029	rs9281864	A	AGC	399.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=435;SC=CGCAGAGCACACCTTTTCTAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=32547037;WS=32547019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr6	32548122	rs4448132	C	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=62.65;NF=9;NR=6;PP=287;SC=TGTCCCAGCCCCAGATCTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=32548130;WS=32548112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	32548161	rs112461335	A	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.75;QD=25.41;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	32548170	.	A	AGGGCAGAAAG	480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=1086;SC=CACACCAACCAGGGCAGAAAG;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=32548178;WS=32548151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32548188	rs113128041	A	G	238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=127;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=88;SC=AAGGAGCAGAAACAGACCATG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=32548196;WS=32548178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr6	32549611	rs1071752	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.05;QD=44.09;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr6	32549627	rs199927008	AC	CA	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.61;QD=44.03;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	32549631	rs72500538	C	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.61;QD=44.03;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	32549638	rs72850244	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.92;QD=45.60;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	32549711	rs9269814	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=273;SC=CCAGGCTCTGGCCTTGACCAG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=32549719;WS=32549701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	32552029	rs17884945	A	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=487;SC=CACCGCCCGGAACTCCCCCAC;SOR=1.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=32552037;WS=32552019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	32552067	rs17882603	C	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.61;QD=25.81;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr6	32552080	rs3175105	T	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.12;QD=44.51;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	32552085	rs1059575	G	T	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.12;QD=44.51;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	32552091	.	G	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.12;QD=44.51;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr6	32552183	rs28986202	A	AC	292.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.16;QD=36.59;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr6	32552206	rs9269963	G	T	94.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.78;QD=23.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	32552237	rs9269966	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.89;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	32552240	rs28724111	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.89;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	32552251	rs9269968	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.78;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32552253	rs149553038	T	TG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.78;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32557435	rs9270299	A	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=13;PP=594;SC=GTGTCCCCAGACAAAGCCAGT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=32557443;WS=32557425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	32606597	rs34310302	AT	A	359.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=306;SC=GGAAGCACAGATTAATTATTT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=32606605;WS=32606587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	32606793	rs28437906	T	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.54;NF=12;NR=11;PP=409;SC=TGGAAGGTACTTTAAACTTTC;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=32606801;WS=32606783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	32606878	rs9272544	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=243;SC=TCTCCAGAGCGCTTGGCGTCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=32606886;WS=32606868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32609061	rs28654242	T	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=321;SC=TTCTCCGCCTTCCTGCTTGTC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=32609069;WS=32609051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	32609173	rs10093	C	G	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=1086;SC=TGGAGATGAGCAGTTCTACGT;SOR=1.421;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=32609181;WS=32609163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	32609371	rs4467816	T	C	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=51;PP=1529;SC=TTTACTTAAGTTATCCCTCCA;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=32609379;WS=32609361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	32610436	rs1048372	T	C	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.85;QD=30.13;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	32610461	rs9260	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=12;PP=873;SC=TGTGGGCCTCATGGGCATTGT;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=32610469;WS=32610451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	32610689	rs9272843	C	G	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=50;PP=1816;SC=GACACAGGAGCCCCCTCGGAC;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=91;WE=32610697;WS=32610679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	32610704	rs9272851	T	C	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=48;PP=1461;SC=TCGGACCCATTGATCTCATGT;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=32610712;WS=32610694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	32610757	rs8227	A	G	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=30;PP=1204;SC=GAGCAGAAGAATGGACTTGCT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=32610777;WS=32610747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	32610769	rs7600	A	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.197;NF=28;NR=25;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.980;SC=GGACTTGCTAAATGACCTAGC;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=53;WE=32610777;WS=32610747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr6	32610887	rs7143	C	T	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.98;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	32611054	rs28376734	T	C	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=113;SC=GTCAAATTTTTCCATCTTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=32611062;WS=32611044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	32627882	rs1071639	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=58.33;NF=15;NR=6;PP=336;SC=GACCTGGTGGCTGCGTGACAG;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=32627890;WS=32627872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	32627956	rs1063347	C	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;QD=44.29;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	32627956	.	CAT	GAC	1072	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=56;MMLQ=28;MQ=59.89;NF=14;NR=14;PP=1072;QD=40.1952812451;SC=TCTGGGCAGGCATAAGCAGGC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=28;WE=32627966;WS=32627946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,28:0.93:30
chr6	32627958	rs7656	T	C	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;QD=44.29;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	32627988	rs1049178	A	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.21;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	32627991	rs1049177	C	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	32628001	rs1049175	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	32628045	rs9273472	C	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=11;PP=352;SC=GAGAGAAGAGCATTGATCAGC;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=32628053;WS=32628035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	32628543	rs34736308	T	C	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=15;PP=554;SC=AAATAGGCCATGAACATGGAC;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=32628551;WS=32628533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	32628828	rs68081734	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=330;SC=AAATTGTCACTAGAAAGAAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=32628849;WS=32628818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32628841	rs9273546	A	G	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=251;SC=AAAGAAAGGAAGCTGAGGCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=32628849;WS=32628818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	32629129	rs1130432	T	C	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=162;SC=CTCACCTTTCTGACTCCTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=32629137;WS=32629119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	32629155	rs1130431	C	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=54.26;NF=12;NR=4;PP=280;SC=TGATAAGGCCCAGCCCAAGGA;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=32629163;WS=32629145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	32629240	rs9273671	G	A	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=634;SC=AGCCCCTAAAGAGCAGAACTG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=32629265;WS=32629230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	32629247	rs9279979	A	AC	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=14;PP=1100;SC=AAAGAGCAGAACTGAGTGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=32629265;WS=32629230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	32629257	rs9273677	T	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=15;PP=695;SC=ACTGAGTGTCTGTGTTTGTCC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=32629265;WS=32629230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	32629320	rs9273713	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=86;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=18;PP=589;SC=TGAGGTGCAGAAGGTGAAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=32629328;WS=32629310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	32629346	rs9273723	T	C	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=91;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=17;PP=527;SC=AGGAACCTAGTTCTCCATTCA;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=32629354;WS=32629336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	32629380	rs9273742	A	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.81;QD=43.24;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	32629385	rs71542428	C	A	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.63;QD=42.46;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	32629408	rs72844321	AA	GG	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=103;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=340;SC=GGATACAGTGAATAGGTGAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=32629417;WS=32629398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	32629603	rs9273852	T	C	179.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.32;QD=35.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	32629612	rs9273855	G	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.87;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32629612	.	GCA	ACT	292	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=26;MQ=44.83;NF=6;NR=0;PP=292;QD=57.5779791437;SC=TTGCCATGGAGCAAGAGGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=32629622;WS=32629602;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr6	32629614	rs9273857	A	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.87;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32629708	rs33980016	T	TG	3071.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=1670;SC=CTTTGTCTTGTGGGCCCATAG;SOR=1.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=39;WE=32629726;WS=32629698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	32629718	rs36233043	G	A	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=22;PP=1305;SC=TGGGCCCATAGTAACAGAAAC;SOR=1.488;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=32629726;WS=32629698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	32629737	rs9273912	C	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1548;SC=ACTCAATATCCCCTTACGCCA;SOR=1.264;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=76;WE=32629745;WS=32629727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	32629847	rs1049133	A	G	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=48;PP=1514;SC=GGATCTGGAAAGTCCAGTCAC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=81;WE=32629876;WS=32629837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	32629859	rs1049130	A	G	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.03;QD=42.94;SOR=1.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	32629868	rs1049088	A	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.69;QD=44.54;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	32629936	rs1049107	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=651;SC=TTGATCTGGCCTGGATAGAAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=32629944;WS=32629926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	32629963	rs1049100	C	T	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=362;SC=ACCGAGCAGACCAGCAGGTTG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=32629971;WS=32629953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	32630028	rs68027833	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.00;QD=23.48;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	32630055	rs9274045	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.98;QD=37.71;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32630066	rs71542429	T	C	365.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.45;QD=45.72;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	32630073	rs9274050	A	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.37;QD=47.40;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32630080	rs9274053	C	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.37;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32630087	rs71542430	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.37;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32630101	rs28724259	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.37;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32630112	rs9282139	G	GA	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.47;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	32632426	rs70996721	GC	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.13;QD=46.97;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	32632436	.	C	CT	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.84;QD=38.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	32632438	rs281862200	C	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.84;QD=47.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	32632446	rs28746788	G	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.28;QD=54.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	32632447	rs41263822	C	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.06;QD=44.71;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32632453	rs9274356	T	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.06;QD=40.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	32632470	rs9274359	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.78;QD=43.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	32632474	rs9274360	T	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.27;QD=43.34;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	32632483	rs9274361	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.09;QD=45.88;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	32632492	rs9274363	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.05;QD=43.72;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	32632493	.	CCT	C	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.05;QD=47.40;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	32632498	.	C	CAA	1108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.07;QD=48.21;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	32632515	rs41263824	G	A	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=51.59;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	32632523	rs9274369	A	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.80;QD=45.36;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	32632527	rs9274370	C	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.85;QD=44.41;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	32632529	rs71542465	G	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.85;QD=44.41;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	32632534	rs28746795	T	C	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.85;QD=46.62;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	32632542	rs74199853	G	C	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.06;QD=41.22;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	32632587	rs1130397	A	G	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=107;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=32;PP=1530;SC=CTCCTCTGCAAGATCCCGCGG;SOR=1.014;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=32632606;WS=32632577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	32632598	rs17412833	A	T	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=107;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=39;PP=1908;SC=GATCCCGCGGAACGCCACCTC;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=94;WE=32632606;WS=32632577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	32632628	rs1130392	G	C	5956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=44.45;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	32632635	rs9274384	A	C	6305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.52;QD=46.71;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr6	32632637	rs1130387	TC	GA	6460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.24;QD=46.48;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	32632647	rs1130390	T	C	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.15;QD=44.17;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr6	32632688	rs1071637	T	A	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=116;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=67;PP=2284;SC=GTACTCGGCATCAGGCCGCCC;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=134;WE=32632696;WS=32632678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	32632711	rs1049074	C	T	5503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.78;QD=43.68;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
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chr6	32632745	rs1063318	G	A	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=119;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=53;PP=1605;SC=GTCGAAGCGCGCGTACTCCTC;SOR=1.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=32632753;WS=32632735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	32632770	rs1049069	A	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=80;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=34;PP=909;SC=TTATAGATGTATCTGGTCACA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=39;WE=32632791;WS=32632760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	32632781	rs1049066	A	C	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.55;QD=43.14;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr6	32632783	rs1140310	A	C	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.52;QD=46.59;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	32632818	rs1130368	T	G	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.44;QD=29.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	32632832	rs9274407	A	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.01;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32632859	rs74186130	C	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32632864	rs9274409	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32634188	rs67955939	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	32634192	rs9274512	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	32634226	rs68033958	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=98;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=312;SC=AGCCCAAGGAGAGCCTGTTCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=32634234;WS=32634216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	32634263	rs66957194	GC	TT	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=1559;SC=GAGAGCAGCTGCCCTGCACTT;SOR=2.247;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=35;WE=32634272;WS=32634253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	32634302	rs1049062	AG	GA	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.18;QD=44.41;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	32634313	rs1049059	C	G	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.15;QD=44.15;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	32634369	rs1049056	C	A	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=87;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=27;PP=1027;SC=ATCCGCAAAGCCTTCTTCCAA;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=32634377;WS=32634359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	32634387	rs1049055	C	T	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=26;PP=952;SC=CAAGACATAACTGAGACGAAG;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=32634395;WS=32634377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	32634405	rs1049053	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=81;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=24;PP=830;SC=AAGGGAAAAGCAGTGGTAGTC;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=32634413;WS=32634395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	32634426	rs67147537	G	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=18;PP=733;SC=AACACAGCTCGGACCTGATGG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=32634434;WS=32634416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	32634485	rs9274526	A	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.80;QD=28.89;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	32634505	rs71542466	C	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.58;QD=43.12;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	32634508	rs9274528	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.58;QD=43.12;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	32634564	rs202167390	A	AT	137.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=108;SC=CTGGGCAGACATTTTTTTTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=32634572;WS=32634554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	33541719	rs513349	A	G	3098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=1722;ReadPosRankSum=2.347;SC=CAGAGAGGCTAGCAGAAGATA;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=115;WE=33541727;WS=33541709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,146:0.53:274
chr6	33542478	rs210137	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=0.443;SC=AAATCTACTCCGACACTGACT;SOR=0.540;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=22;WE=33542486;WS=33542468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr6	33553580	rs394199	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=-1.414;SC=GGGTGCAATACCAGCAGGTAC;SOR=0.836;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=33553588;WS=33553570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr6	33560896	rs210162	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=296;ReadPosRankSum=1.500;SC=CATCATCCGCAGGGTGGAGCG;SOR=0.532;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=26;WE=33560904;WS=33560886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
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chr6	33608379	rs4713647	T	C	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=59;PP=1792;SC=GCTGCAGGGTTCTGGACCTGC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=83;WE=33608387;WS=33608369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	33625600	rs3831079	GT	G	2044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=1899;SC=GACTGTGTGTGTGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=41;WE=33625608;WS=33625590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	33626717	rs2296343	T	C	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=29;PP=1358;SC=AAGGGCAGACTGAGACCAAAG;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=74;WE=33626725;WS=33626707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr6	33630846	rs9366827	A	G	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1384;SC=GTGTGCGGGAACATGTGTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=33630854;WS=33630836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	33631696	rs2296337	G	A	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=50;PP=1537;SC=GACTGGTGGTGCTCAGGGTGG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=33631704;WS=33631686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	33633527	rs6901411	A	G	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=840;SC=CATGAAAGCCATGTTTTGGGA;SOR=3.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=33633535;WS=33633517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	33636232	rs9380372	T	C	4649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=28;PP=2965;SC=GGGTGGGCTCTGTCCTTAGAG;SOR=2.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=114;TCR=28;TR=142;WE=33636240;WS=33636222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr6	33636660	rs2296336	C	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1031;SC=CCCGTGGTGGCTGGCACTGTG;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=33636668;WS=33636650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	33636907	rs2077163	C	T	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=83;PP=2319;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GCAACGCCCACGACGAGAATG;SOR=2.543;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=23;TCR=84;TR=105;WE=33636915;WS=33636897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr6	33638180	rs2229634	C	T	7757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.005;SC=AGCAGCTGGGCGTGGACCTGA;SOR=0.235;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=233;WE=33638188;WS=33638170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,284:1.00:285
chr6	33638657	rs2274198	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=26;PP=767;SC=CACTGGCCTCGGTCTTCACCC;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=33638665;WS=33638647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	33641379	rs1803831	T	C	5323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=75;PP=2654;SC=TCATCCTCAATGTCCGCCTGG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=158;WE=33641387;WS=33641369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr6	33641956	rs7769838	T	C	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=52;PP=2392;SC=GGGCCTACAATCTGCTTCCAT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=121;WE=33641964;WS=33641946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	33644768	rs2068236	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.90;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	33644773	rs4713652	T	A	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.79;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	33646328	rs2274195	T	C	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=16;PP=498;SC=GGGGTGAGGGTGCAGGGCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=33646336;WS=33646318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	33647594	rs4713653	C	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=588;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TGGTAAGCAACGGAGAGGAGA;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=38;WE=33647602;WS=33647584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr6	33647651	rs4713654	A	G	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.739;SC=GCCCCCTCCCACCCGCAGCTG;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=81;TCR=56;TR=74;WE=33647659;WS=33647641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,85:0.53:159
chr6	33648228	rs2229638	C	T	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1385;ReadPosRankSum=0.856;SC=TGGACATGGCCCGGGTCTGTC;SOR=0.972;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=196;TCF=91;TCR=105;TR=90;WE=33648236;WS=33648218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,114:0.46:250
chr6	33653111	rs942637	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=727;ReadPosRankSum=1.680;SC=GCTGAGGTTGTTCCCTGGCCA;SOR=0.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=43;WE=33653119;WS=33653101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
chr6	33653448	rs749338	C	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1232;ReadPosRankSum=0.195;SC=CGATACCTGGCTCCTCATCCC;SOR=1.094;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=72;WE=33653456;WS=33653438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr6	33654378	rs4640882	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=797;SC=TGTCAAGTGTACATAGTGGTG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=33654386;WS=33654368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	33654897	rs942642	T	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.086;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=767;ReadPosRankSum=0.836;SC=GCTGGGCAGGTGGGCAGGCGG;SOR=1.044;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=125;TCF=76;TCR=49;TR=52;WE=33654905;WS=33654887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr6	33656250	rs2296736	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.46;MQRankSum=0.436;NF=4;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=-1.110;SC=TCTGGAGCTGTTCACTGATGC;SOR=0.030;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=33656258;WS=33656240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	33656654	rs11759396	C	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.383;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=339;ReadPosRankSum=-1.400;SC=CCTCTGAGGGCACCAGATGCA;SOR=2.128;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=17;WE=33656662;WS=33656644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr6	33656969	rs2296739	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=375;ReadPosRankSum=0.658;SC=CTCTGGGGCCGTGGTGGGCTT;SOR=0.973;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=23;WE=33656977;WS=33656959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr6	33657246	rs3818521	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=821;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TGCATTCAGACGGCAAGCTGG;SOR=1.114;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=51;WE=33657254;WS=33657236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr6	33658066	rs764752	G	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.715;SC=GCACCAGTCTGTCTGTCCAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=33658074;WS=33658056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr6	33659472	rs2229642	C	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TGTCTCAGGGCTCTCGGTGCC;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=70;WE=33659480;WS=33659462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr6	33659536	rs2296740	A	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.421;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1188;ReadPosRankSum=0.453;SC=GTGGGGTAGGAGGAGCAGGCA;SOR=0.364;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=62;WE=33659544;WS=33659526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr6	33659557	rs2296741	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=909;ReadPosRankSum=1.211;SC=GCCCGGGCCTCAGCACACTCT;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=63;WE=33659565;WS=33659547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr6	33659793	rs2296742	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TTGGCCTCGCGTCAGATATTC;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=16;WE=33659801;WS=33659783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr6	33660411	rs653536	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.742;SC=GGCTGGGTCCTCAATATCACA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=33660419;WS=33660404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr6	33660695	rs3818524	G	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=0.364;SC=CTGCTCTGTGGAGGCCGCAGC;SOR=0.403;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=25;WE=33660703;WS=33660685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr6	33661222	rs3818530	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-0.087;SC=ATCCCGAGAACAAATGCCTCC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=33661230;WS=33661212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr6	33662721	.	C	T	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=898;ReadPosRankSum=0.860;SC=TGGACTGGTTCCCCCGGATGC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=62;WE=33662729;WS=33662711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,75:0.38:195
chr6	33665694	.	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=89;ReadPosRankSum=1.061;SC=ACAGGTAACAGAAGTGACCGC;SOR=1.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=7;WE=33665702;WS=33665684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr6	33668370	rs942643	A	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=591;ReadPosRankSum=1.377;SC=CATTTCACCTAGGCCCTGGGC;SOR=3.412;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=26;WE=33668378;WS=33668360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr6	33679596	rs2274458	A	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=758;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TTGTAGGCGCACCGCTACTCT;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=36;WE=33679604;WS=33679586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr6	33690796	rs4713668	CA	TG	8022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=96;PP=2944;ReadPosRankSum=1.452;SC=CTCCTAATGACAGAGAGGAGG;SOR=0.607;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=253;TCF=102;TCR=151;TR=164;WE=33690805;WS=33690786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,200:0.66:302
chr6	33703230	rs545787	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,34:0.23:149
chr6	33740382	rs2296744	G	A	6598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=89;PP=2965;SC=CAGGCTGACCGGGAACAAGTC;SOR=1.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=131;TCR=89;TR=219;WE=33740390;WS=33740372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr6	33740592	rs4711349	C	T	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=50;PP=1398;SC=CTGGCACTGCCGAGGTGAGCC;SOR=3.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=56;WE=33740600;WS=33740582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	33744711	rs2296746	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=381;SC=TCACACCCAGCGCCCCAGCCA;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=33744719;WS=33744701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	33744882	rs2296747	C	G	6089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=86;PP=2965;SC=TGGCTGGCGTCGGCAACCCTT;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=200;WE=33744890;WS=33744872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr6	33745071	rs2296748	C	T	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=67;PP=1997;SC=CAGTGGGTCTCACCATGGACA;SOR=2.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=84;WE=33745079;WS=33745061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	33748831	rs2182658	T	G	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=36;PP=2315;SC=CCCAGGAATGTATAAGCACTG;SOR=1.318;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=108;WE=33748839;WS=33748821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr6	33752013	rs943479	A	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=581;SC=ATGCCTTCTGAGAGACAACCA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=33752021;WS=33752003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	33754396	rs9394167	A	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=409;SC=ACTCTGGTACATTACAGGAAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=33754404;WS=33754388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	33754592	rs4711351	G	A	7261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=101;PP=2965;SC=TTAAGTGTGGGTTGAGAAAGG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=110;TCR=101;TR=211;WE=33754602;WS=33754582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr6	33756026	rs6457741	C	T	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=601;SC=GAAGGCAGGCCTGGAAATGAG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=33756034;WS=33756023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	33768897	rs2281820	A	G	7711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=111;PP=2965;SC=CATGGCAGCTACATGCACCAC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=105;TCR=111;TR=216;WE=33768905;WS=33768887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
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chr6	34003336	rs2451381	T	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=184;ReadPosRankSum=1.105;SC=GAATGAGGCATGAAAGAAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=11;WE=34003344;WS=34003326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr6	34003685	rs2228623	T	C	3110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=67;PP=1955;ReadPosRankSum=-1.799;SC=GGGGGTCGAGTGTCCGCTGGT;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=143;TCR=139;TR=135;WE=34003693;WS=34003675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,149:0.49:303
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chr6	34026938	rs2451359	C	T	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=54;PP=1750;SC=AGCCCAGCCGCGTCTGTCCAC;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=34026946;WS=34026928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	34069822	rs75813933	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=553;ReadPosRankSum=1.439;SC=CCAAAGCATGGCCCTGAAGTC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=42;WE=34069830;WS=34069798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr6	34078463	rs744102	G	A	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1649;ReadPosRankSum=-1.218;SC=CTCCAGGAGCGTGTGTCTGCC;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=77;TCR=118;TR=102;WE=34078471;WS=34078453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,131:0.53:248
chr6	34211341	rs35381162	GT	G	3404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=42;PP=2470;SC=GCTCTTTTGAGTTGAGGGTGT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=58;WE=34211349;WS=34211331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	34212743	rs2780219	A	G	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=6;PP=241;SC=CACCGCCCCCACCCCTTCCCC;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=34212751;WS=34212733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	34213296	rs1150783	T	C	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=56;PP=2069;SC=CCCCCTTCGGTTACAGGAAGG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=34213304;WS=34213286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	34214322	rs1150781	C	G	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=68;PP=2965;SC=ACCAGCCGCCCCCATCCCAGA;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=34214330;WS=34214312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	34214994	rs3997805	G	GTC	820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=644;SC=TGGCTGCCTCGTCTCCTCCCT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=13;WE=34215002;WS=34214984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	34622676	rs2252551	A	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=-1.171;SC=CTCCTGGTATACACGTCTTTA;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=4;WE=34622684;WS=34622666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr6	34664207	rs3800456	T	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=456;ReadPosRankSum=-0.701;SC=GCGCTGGCACTGCGGGGCCGG;SOR=0.819;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=28;WE=34664215;WS=34664197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr6	34725655	rs34594913	G	GTCA	1923.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.947;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.291;NF=6;NR=30;PP=2414;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CTCAGTGGTTGTCGTCTTTTT;SOR=1.279;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=36;WE=34725666;WS=34725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr6	34725658	rs28398813	G	T	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.962;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.308;NF=14;NR=30;PP=2412;ReadPosRankSum=-1.723;SC=AGTGGTTGTCGTCTTTTTCTC;SOR=1.268;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=44;WE=34725666;WS=34725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr6	34735676	.	C	CCTCAT	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=77;QD=41.2756880851;SC=TTTTCCTCACCCTCCAAAGCG;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=4;WE=34735684;WS=34735666;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr6	34735883	rs3736896	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TGTATGTAGATAGTAATATAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=34735891;WS=34735873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	34738203	rs2038841	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=717;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TTCTAGTTTGTTCCATTTAGT;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=45;WE=34738211;WS=34738193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr6	34741175	rs2236392	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=218;ReadPosRankSum=-1.053;SC=TCCCTAAATCGTATTTTCTGA;SOR=0.896;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=16;WE=34741183;WS=34741165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr6	34759881	rs13215181	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.362;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr6	34759884	rs6934662	G	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.81;ReadPosRankSum=1.909;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	34759903	rs10525938	T	TGGCGGCGGC	468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=2658;ReadPosRankSum=2.118;SC=GAAAGCGCCATGGCGGCGGCG;SOR=0.275;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=8;WE=34759911;WS=34759893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr6	34759954	rs6457791	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=418;ReadPosRankSum=-0.564;SC=AGGTGAGGGGACCGCCTCTTC;SOR=0.392;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=27;WE=34759962;WS=34759944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr6	34760162	rs7769961	G	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GGCCCAGTCTGCCTCTCTCCA;SOR=0.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=30;WE=34760170;WS=34760152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr6	34760228	rs7769820	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=2.743;SC=GGACAGCTTCCCCCCGCGCCC;SOR=2.093;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=12;WE=34760236;WS=34760218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr6	34791027	rs7774697	A	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.272;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=520;ReadPosRankSum=0.429;SC=CTTGACTTCTATTTCAGTGTC;SOR=0.342;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=37;WE=34791035;WS=34791017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
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chr6	34824636	rs11755393	A	G	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=467;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CCTGCCTTTCAGCCTCCAGCA;SOR=0.737;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=39;WE=34824644;WS=34824626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr6	34831866	rs3734264	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=380;ReadPosRankSum=0.700;SC=TGAAGAGGACGGTATCTCAAC;SOR=0.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=29;WE=34831874;WS=34831856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr6	34838577	rs3734262	C	T	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TATAAGGTGCCTAGAAGACTC;SOR=1.087;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=58;WE=34838585;WS=34838567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr6	34840325	rs80059263	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GGATGCCAGAGGGACTGGGGA;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=14;WE=34840333;WS=34840315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr6	34949451	rs3817473	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=731;ReadPosRankSum=2.060;SC=ATGTGATCTGCTTGTTAACCC;SOR=0.496;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=49;WE=34949459;WS=34949441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr6	34949607	rs2293242	C	T	3903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=76;PP=2433;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CAGCACTGTACGGGCGACTGG;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=288;TCF=150;TCR=138;TR=159;WE=34949615;WS=34949597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,183:0.52:350
chr6	34962019	rs11755713	G	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=554;SC=ATTTGTTCCAGACTGCCTGTC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=34962027;WS=34962009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	34962060	rs3823438	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=218;ReadPosRankSum=-1.600;SC=AAGATACACTGGATGTTTCTC;SOR=0.153;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=17;WE=34962068;WS=34962050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr6	34977813	rs12661991	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=879;ReadPosRankSum=-1.345;SC=AAATTTTTAAAAATTAGCTGG;SOR=0.759;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=53;WE=34977821;WS=34977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr6	35027814	rs820086	G	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=0.380;SC=TTGGCTGTTTGATGGTAATGA;SOR=0.901;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=9;WE=35027822;WS=35027804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr6	35027927	rs820085	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=28;PP=1112;SC=TCATCAGGTTTACGGACGCTG;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=35027935;WS=35027917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	35046154	rs820100	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=169;SC=CAGCTCTGCCTAGCTCCCCTG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=35046162;WS=35046144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	35047579	rs2762338	G	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=930;SC=CTGTCACCTCGCTGCTCCTCA;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=35047587;WS=35047569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	35047732	rs2689094	T	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=17;PP=656;SC=CAGAAAGGAATGTATGTTTGT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=38;WE=35047740;WS=35047722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	35050506	rs2177382	G	A	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=41;PP=2291;SC=TGCGGCCCCCGAGCCTGGCAG;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=35050514;WS=35050496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	35053383	rs66645129	CTAGGAAGAG	C	2048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=2941;SC=CAACAGAGACCTAGGAAGAGT;SOR=4.362;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=34;WE=35053399;WS=35053382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	35054983	rs71650764	GGCAGCGTAGACGCT	G	2967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=38;PP=2973;SC=TTGGGCGGGCGGCAGCGTAGA;SOR=3.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=35055004;WS=35054973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	35056443	rs2005	A	G	7186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=146;PP=2965;SC=ATAGGCTCCCACTGCCACCAC;SOR=1.400;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=78;TCR=146;TR=224;WE=35056451;WS=35056433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr6	35058117	rs707968	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=23;PP=629;SC=GCCACTGCGCACATGCTGGTG;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=35058125;WS=35058107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	35088956	rs2494096	A	G	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=752;SC=TTCAGAAGATAACATGTGGCC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=35088964;WS=35088946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	35104018	rs12661389	C	A	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=77;PP=2348;SC=AACAATGAGCCCATGCAAGTC;SOR=1.482;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=36;TCR=77;TR=113;WE=35104026;WS=35104008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	35107682	rs3777748	T	A	823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=750;ReadPosRankSum=1.470;SC=CAAATTTTTTTAAAAAGGAAT;SOR=3.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=35107690;WS=35107672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr6	35109032	rs142118879	CGCGGCCTG	C	1935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.92;NF=10;NR=16;PP=2978;SC=CGGTGGGCCTCGCGGCCTGGC;SOR=0.929;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=26;WE=35109047;WS=35109022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	35203203	rs13214290	T	G	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=23;PP=938;SC=CCTAAACAGCTTTTTTACAAT;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=35203211;WS=35203193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	35205541	rs1929849	T	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=680;SC=GAGCCTCCCTTGGCTTAATGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=35205549;WS=35205531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	35205881	rs734538	G	A	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=55;PP=1566;SC=ATTAGGGGATGACACCTCCTC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=76;WE=35205889;WS=35205871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	35216296	rs2071920	C	T	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=1024;SC=CCACCCCCGACGGTGAGGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=35216304;WS=35216286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	35258539	rs763157	C	A	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=38;PP=1149;SC=GGAGGGTTCTCGTTCTGTTTG;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=35258547;WS=35258529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	35259261	rs1894650	C	G	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=47;PP=2389;SC=GACCTGGAGCCCAGTGCCATC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=116;WE=35259269;WS=35259251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	35259646	rs9366883	G	C	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=69;PP=1708;SC=GCTGGTCTGGGGGTAGGGTAT;SOR=2.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=86;WE=35259654;WS=35259636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	35260503	rs1557567	C	T	5928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=108;PP=2965;SC=GCAGTGCCCACGGCGAGCTGG;SOR=1.087;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=73;TCR=109;TR=181;WE=35260511;WS=35260493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr6	35260530	rs1557568	C	T	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=81;PP=2965;SC=CGGAGGAGAGCGAGCAGGCCC;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=35260538;WS=35260520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr6	35285720	rs2395617	A	C	7308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=103;PP=2965;SC=AAGACAGCCAACCGCACGTAT;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=114;TCR=103;TR=217;WE=35285728;WS=35285710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr6	35378778	rs2016520	C	T	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1140;SC=ATGGGAACCACCCTGTAGAGG;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=35378786;WS=35378768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	35391787	rs2076167	C	T	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=32;PP=2489;SC=TGACTGCAAACGAGGGGAGCC;SOR=1.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=88;TCR=32;TR=119;WE=35391795;WS=35391777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	35423489	rs7757405	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=306;ReadPosRankSum=0.374;SC=CCTTCAGCCAAACACTTAACT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=22;WE=35423497;WS=35423479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr6	35423662	rs4713867	A	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=958;ReadPosRankSum=0.735;SC=CCCCTGACCCAGATGCCTGGC;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=74;WE=35423670;WS=35423652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,80:0.58:137
chr6	35424188	rs3800377	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=152;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGCTTTATCCATGGGGAAGGC;SOR=0.702;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=13;WE=35424196;WS=35424178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr6	35424268	rs4713868	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGTAGGGTTGAGGGAATGTAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=35424276;WS=35424258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	35425416	rs13214239	A	G	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=923;ReadPosRankSum=-0.965;SC=CCTTTCTTCCATCTTCTACCC;SOR=0.924;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=73;WE=35425424;WS=35425406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,80:0.42:190
chr6	35443573	rs2076170	T	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=-1.417;SC=AGGATCCATCTCTGGCACTCT;SOR=0.352;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=10;WE=35443581;WS=35443563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr6	35444349	rs34250016	TACA	T	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.78;MQRankSum=0.210;NF=0;NR=3;PP=117;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TGTGTCCTTGTACAGTGTACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=35444359;WS=35444339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	35448189	rs760782	T	C	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=62;PP=1621;ReadPosRankSum=-1.187;SC=GAGGAAAACATAGACAGTGAG;SOR=0.611;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=229;TCF=93;TCR=136;TR=107;WE=35448197;WS=35448179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,127:0.47:268
chr6	35473252	rs2395628	C	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=499;ReadPosRankSum=0.283;SC=TGCCCTGCTCCAAGTGAGGCC;SOR=1.445;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=25;WE=35473260;WS=35473242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr6	35474073	rs12215920	C	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=-0.844;SC=GCGGAGAGAACAGAGAGGCTG;SOR=0.086;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=12;WE=35474081;WS=35474063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr6	35477025	rs2064318	C	G	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=7.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=1.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr6	35477032	rs2064317	A	G	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.421;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr6	35477152	rs7752728	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=984;ReadPosRankSum=-1.093;SC=GTGCTTCCAACACCCATGTCT;SOR=0.809;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=68;WE=35477160;WS=35477142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,86:0.43:198
chr6	35477303	rs9296155	T	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=262;ReadPosRankSum=-0.815;SC=ACTCTAGACCTGGCAAACTCC;SOR=0.498;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=16;WE=35477311;WS=35477293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr6	35478612	rs2273001	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=661;ReadPosRankSum=-1.015;SC=TTCCCTGTGAGCTCTCTCAGC;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=48;WE=35478620;WS=35478602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,57:0.58:98
chr6	35479574	rs7764472	G	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=1.338;SC=CGGCCTCCCCGTCCGCCCAGC;SOR=0.299;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=14;WE=35479582;WS=35479564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr6	35480262	rs1540910	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.359;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=140;ReadPosRankSum=-2.091;SC=AAACCCCAAGTCCCCAAACAG;SOR=0.169;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=35480270;WS=35480252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	35610681	rs2143404	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-0.381;SC=ATCTTGAATGTCCCTGGGAAC;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=35610689;WS=35610671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr6	35705892	rs2817041	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=37;NR=38;PP=1191;SC=AGGATGAGTATGCCAAGAGCA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=35705900;WS=35705882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	35715303	rs2252881	G	C	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=88;PP=2965;SC=CTTCCTTGCTGAGGCCCAGAC;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=58;TCR=88;TR=146;WE=35715311;WS=35715293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	35744303	rs2766578	C	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=221;SC=CCTCCTCCGCCGGGGTGGCCT;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=35744311;WS=35744293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	35745655	rs2478467	C	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=12;PP=300;SC=GGGCAGGGATCGCATCATATT;SOR=1.071;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=35745663;WS=35745645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	35749059	rs2766579	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=762;SC=GGAGGTGAGCGGGCATGGGGG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=35749067;WS=35749049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	35755658	rs12211728	A	G	4864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TCTTTGGCCAATATAGAGCGT;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=276;TCF=160;TCR=116;TR=173;WE=35755666;WS=35755648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,208:0.64:326
chr6	35761336	rs6457853	T	C	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=949;ReadPosRankSum=1.252;SC=TGCTAAGGCATGTGGCAACCT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=80;WE=35761344;WS=35761326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,91:0.40:228
chr6	35763786	rs56279340	C	A	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.068;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=78;PP=1912;ReadPosRankSum=0.019;SC=CTGTGCCCCCCACCCACGTGA;SOR=0.318;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=132;TCF=21;TCR=111;TR=95;WE=35763794;WS=35763776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,96:0.72:133
chr6	35764943	rs3748051	T	C	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=90;PP=2965;SC=AGTCTTCATCTGGGGACTCAG;SOR=0.881;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=109;TCR=90;TR=198;WE=35764951;WS=35764933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr6	35765068	rs3748050	T	C	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=74;PP=2210;SC=TTCTCCATGGTGAGTGGGACA;SOR=1.519;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=110;WE=35765076;WS=35765058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr6	35765151	rs3748049	T	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;PP=843;SC=CCTCACGAGATCCACCTGCAT;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=35765159;WS=35765141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	35765177	rs3748048	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=690;SC=AGGGCTGGCCGTGGGCAGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=35765185;WS=35765167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	35803192	rs1049649	C	A	4476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=65;PP=2817;SC=CCTCTTCCTGCGACCACTCAT;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=145;WE=35803200;WS=35803182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr6	35803283	rs2859420	C	T	4209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=70;PP=2542;SC=GAAGACAGTACAGAAAAAGCC;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=128;WE=35803291;WS=35803273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr6	35810503	rs3213580	T	A	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=125;SC=ATAGATCATTTAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=35810511;WS=35810493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	35836705	rs9296168	T	C	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=20;PP=1620;SC=TACAGAATTATGGATGTTTTG;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=78;WE=35836713;WS=35836695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	35840584	rs34797772	TA	T	61	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=5;PP=68;SC=AACATGACATTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=35840592;WS=35840574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	35872860	rs9470167	A	G	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=295;SC=GGAGTTTGAGATTGCAGTGAC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=14;WE=35872868;WS=35872850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	35888067	rs662713	G	C	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=81;PP=2965;SC=GCCTGGCGTTGAGCAACAGCA;SOR=0.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=151;WE=35888075;WS=35888057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr6	35980121	rs743923	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=50;PP=1289;ReadPosRankSum=-1.973;SC=ATTGTAAGCACGCATCGTAGG;SOR=0.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=76;TCR=108;TR=84;WE=35980129;WS=35980111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,96:0.44:216
chr6	36041431	rs851010	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=367;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TGACAATAGAAGGTTGGAGGT;SOR=0.417;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=24;WE=36041445;WS=36041421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr6	36064036	rs851007	G	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=220;SC=GCATGCACAAGTGTGTTTTAT;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=36064044;WS=36064026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	36075219	rs9470219	A	C	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=41;PP=2242;SC=CTTCCTGTCTATGGTACTGAT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=36075227;WS=36075209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr6	36098333	rs12191295	T	C	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=18;PP=1328;SC=GCCGCCACGCTGGGGCCGCCG;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=72;WE=36098341;WS=36098323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	36098410	rs1059227	A	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,74:0.41:179
chr6	36103921	rs2252430	G	A	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=37;PP=1176;SC=TTGGAGGGAGGGGACACTGCC;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=36103929;WS=36103911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	36104803	rs2815812	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=247;ReadPosRankSum=-0.548;SC=AATAACTGTCTTTTTTTTCTT;SOR=0.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=18;WE=36104811;WS=36104793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr6	36168415	rs139217085	C	T	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1423;ReadPosRankSum=1.552;SC=CTGCTCCAAGCATGCATCTGG;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=187;TCF=92;TCR=95;TR=90;WE=36168423;WS=36168405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,115:0.49:236
chr6	36177857	rs2239798	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=211;ReadPosRankSum=-0.246;SC=CAGGCCAGGGTGGGCCAGGAC;SOR=0.340;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=21;WE=36177865;WS=36177847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr6	36185681	rs12525283	G	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=492;ReadPosRankSum=1.296;SC=CTCACTGTGTGTGTCCTTGGC;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=25;WE=36185689;WS=36185671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
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chr6	36193259	.	AG	GG	1047	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=62.28;NF=8,12;NR=8,19;PP=702,1047;QD=45.625;SC=TGTAGAGGGGAGGGGGGTTTT;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=16,31;WE=36193267;WS=36193249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr6	36193259	.	AG	AGG	1047	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=62.28;NF=8,12;NR=8,19;PP=702,1047;QD=45.625;SC=TGTAGAGGGGAGGGGGGTTTT;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=16,31;WE=36193267;WS=36193249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr6	36193303	rs59200830	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.700;NF=4;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TAGCAAGGCTCCCAGCTTGGA;SOR=0.569;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=22;WE=36193311;WS=36193293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr6	36198396	rs3833482	TG	T	1846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.046;NF=4;NR=34;PP=1336;ReadPosRankSum=-1.143;SC=AGGGCAGGGCTGGGCCTGCAT;SOR=0.846;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=38;WE=36198404;WS=36198386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr6	36198421	rs9470234	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=674;ReadPosRankSum=1.295;SC=TTGCCCTGCCTCCATCCCGCA;SOR=0.495;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=44;WE=36198429;WS=36198411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr6	36260914	rs2239796	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=796;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GTGAGTGCTTCGGCATGGTGA;SOR=0.619;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=55;WE=36260922;WS=36260904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr6	36261885	rs4713949	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=812;SC=CTGGTGCCATATCCCATGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=36261893;WS=36261875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	36262991	rs4713951	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=415;SC=TCTTAGCAGACAGTGAGGGAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=36262999;WS=36262988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	36269603	rs10947600	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=704;ReadPosRankSum=0.083;SC=CTGCTGCCAGGGCTGAGTAAC;SOR=0.750;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=41;WE=36269611;WS=36269593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr6	36270130	rs12199580	C	A	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1395;ReadPosRankSum=0.914;SC=CCCACTTCACCCAGGCCATCC;SOR=0.623;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=89;WE=36270138;WS=36270120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,110:0.52:210
chr6	36274153	rs12197079	C	T	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=75;PP=1947;ReadPosRankSum=-1.412;SC=CCTTATGTAACGTAAGTTTCC;SOR=0.591;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=199;TCF=67;TCR=132;TR=116;WE=36274161;WS=36274143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,135:0.56:243
chr6	36275458	rs4713956	T	C	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=65;PP=2465;SC=CCCAAGACATTCGGGATCCAA;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=36275466;WS=36275448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	36287312	rs743852	G	C	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1085;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TGGCTGCGCAGGGTGGCTACC;SOR=0.571;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=89;WE=36287320;WS=36287302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,111:0.56:200
chr6	36288879	rs112374394	G	GGTCTCAGCT	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=2900;SC=ATGGAACCCAGGTGGGTAGAT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=12;WE=36288887;WS=36288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	36289145	rs763018	A	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=35;PP=812;SC=TGATGGACCCAGACAATTCTT;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=36289153;WS=36289135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	36290030	rs12190546	C	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=336;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CCTGTGAACTCCATGTGGAAG;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=21;WE=36290038;WS=36290020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr6	36292007	rs7751928	G	A	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1326;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TTGGTGCTACGAAATCTCTTC;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=74;TCR=109;TR=86;WE=36292015;WS=36291997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr6	36294200	rs763020	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=1.610;SC=CAACGCAACCTTTAAAATGGT;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=36294208;WS=36294190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr6	36294864	rs41270098	A	G	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1004;ReadPosRankSum=-1.413;SC=TCTGAATGATAGCATCCTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=65;WE=36294872;WS=36294854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr6	36294915	rs6923009	T	A	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=65;PP=2695;SC=CTAAATGCACTGACAACTCCT;SOR=0.878;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=119;WE=36294923;WS=36294905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	36296623	rs12192390	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.077;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=627;ReadPosRankSum=2.116;SC=GCTGCAGCCCGCTCTAGGCTT;SOR=1.133;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=40;WE=36296631;WS=36296613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr6	36341294	rs3213530	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=339;ReadPosRankSum=-1.513;SC=CAAAAAAGGGCCCACACACCA;SOR=0.645;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=23;WE=36341302;WS=36341284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
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chr6	36483295	rs70975162	C	CCA	126.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.674;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr6	36492375	rs3752478	T	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.884;SC=ACATATGAAATCACCCCAGAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=36492383;WS=36492365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	36493265	rs605684	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=474;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TCCTCTGTTATTGAGCCAAAA;SOR=0.788;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=26;WE=36493273;WS=36493255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
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chr6	36651971	rs1801270	C	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1121;ReadPosRankSum=0.479;SC=AGCAGCTGAGCCGCGACTGTG;SOR=0.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=101;TCR=52;TR=68;WE=36651979;WS=36651961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,81:0.44:186
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chr6	36686272	rs236487	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=163;ReadPosRankSum=0.586;SC=CTCCACAGAGCGACTCTCGGG;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=11;WE=36686280;WS=36686262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr6	36686407	rs236486	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=458;ReadPosRankSum=1.292;SC=CCGAACAGGTCTTTAATATCT;SOR=0.525;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=31;WE=36686415;WS=36686397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr6	36689030	rs236478	A	C	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GGGACCAGCTACTGAGCAACT;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=222;TCF=92;TCR=130;TR=89;WE=36689038;WS=36689020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,116:0.42:276
chr6	36689630	rs236477	C	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=384;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CCACAACTGCCCTCACAGGAG;SOR=0.656;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=29;WE=36689638;WS=36689620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr6	36689961	rs183541	A	C	3190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=58;PP=1844;ReadPosRankSum=-1.648;SC=ACAAGAGGGCAGAGGTGGGCA;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=147;TCR=114;TR=131;WE=36689969;WS=36689951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,152:0.50:305
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chr6	36790639	rs4711470	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=1.501;SC=CTTCACAAGCGTGCAGGCTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=36790647;WS=36790629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr6	36853685	rs11461876	G	GC	963.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=7;PP=511;SC=ACAAGGCCTCGCCCAGGAGTG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=36853693;WS=36853675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	36853786	rs11461877	A	AG	2416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=23;PP=2046;SC=GAGGAGCCCGAGGGGCGCGAG;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=54;WE=36853794;WS=36853776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	36853857	rs5875560	T	TCGC	5449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=49;PP=2967;SC=TGTGACAGCCTCGCCGCGCCC;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=71;WE=36853865;WS=36853847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	36884490	rs2293394	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=0.140;SC=GTCTAGTTCTCCCCTCCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=36884498;WS=36884480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
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chr6	36930687	rs17624006	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CAGCACTCATGCCCGTTCTCG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=16;WE=36930695;WS=36930677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
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chr6	36944495	rs708007	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=0.060;SC=CCTGGCACCTACCCAGGGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=36944503;WS=36944485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr6	36949527	rs2293390	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=0.767;SC=ACACCTCTTGCCCCCTTTGCT;SOR=1.236;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=16;WE=36949535;WS=36949517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr6	36976637	rs831510	G	C	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=709;ReadPosRankSum=0.725;SC=CCAGAGGCCAGAGGCTAGAGG;SOR=0.240;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=38;WE=36976645;WS=36976627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr6	36976946	rs4714032	G	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=1.866;SC=TTCCCCAGGTGGGGGTATGGT;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=36976954;WS=36976936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr6	36978745	rs1724088	G	A	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=59;PP=1400;ReadPosRankSum=1.500;SC=CCAATCCTCCGCAGGAGCCAG;SOR=0.552;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=234;TCF=92;TCR=142;TR=101;WE=36978753;WS=36978735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,122:0.46:266
chr6	36978834	rs1753288	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=369;ReadPosRankSum=1.821;SC=CAGGCCAGTGACCAGGACACC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=24;WE=36978842;WS=36978824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr6	36978879	rs1724087	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.048;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-2.341;SC=TCTCCTCACCTCACCCCTTCT;SOR=3.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=36978887;WS=36978869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr6	36982947	rs831494	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=0.234;SC=CTGTCTTTTTCTGCTTTGGCA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=7;WE=36982955;WS=36982937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr6	36988364	rs831504	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=10;PP=519;SC=TCCTGGTGTCCGGGAAGCAGC;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=36988372;WS=36988354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	36988664	.	A	ATGTGTGTG,ATGTGTG	171.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.44;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=0;NR=2;PP=100;SC=GTATGTATGCATGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=36988672;WS=36988654;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr6	36989391	rs831502	G	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=56;PP=2168;SC=GTAAATGAAGGCTTTTTCATC;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=36989399;WS=36989381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	36990736	rs831499	T	C	5799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=80;PP=2965;SC=TTGCTGAAGGTACCCCTGAAG;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=89;TCR=80;TR=169;WE=36990744;WS=36990726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr6	37138023	rs59116171	GGCA	G	1663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=18;PP=1197;SC=CGGCGGGACCGGCAGCAGCAG;SOR=0.850;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=24;WE=37138033;WS=37138013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	37138220	rs262936	C	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=-1.376;SC=CAGCCGCAGCCACAGCCGCAA;SOR=0.246;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=37;WE=37138228;WS=37138210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr6	37139322	rs262938	T	C	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=843;ReadPosRankSum=-2.145;SC=CCCGGCCCAGTCCGGAGGCCT;SOR=0.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=52;WE=37139330;WS=37139312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr6	37180237	rs1224329	G	A	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=895;SC=AGGTAGTCATGAGTTCACTGC;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=37180245;WS=37180227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	37180355	rs1150789	G	A	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=52;PP=2890;SC=AAGTGCAGGAGCATGTGTGAG;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=131;WE=37180363;WS=37180345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	37180523	rs1150790	A	G	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=71;PP=2965;SC=ATACAATAAAAGAGGAAGCAG;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=126;WE=37180531;WS=37180513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	37250112	rs195753	A	G	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=55;PP=1943;SC=AATTCCGTCAACTTCTCTCCA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=90;WE=37250120;WS=37250102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr6	37252210	rs3818136	C	T	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=84;PP=2749;SC=ACTCTCGAAACGAGGAACATC;SOR=1.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=123;WE=37252218;WS=37252200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr6	37280844	rs149708	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=921;SC=CTAGGTCCAGAGGCTCCCAGC;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=37280852;WS=37280834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	37321738	rs144418963	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TCCAGGGCGGCCGCCGTCCTC;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=37321746;WS=37321734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	37348920	rs2284923	C	T	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=41;PP=2965;SC=CACATTCCTACTGTAGGCTGT;SOR=1.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=103;TCR=41;TR=144;WE=37348928;WS=37348910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
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chr6	37446061	rs3830396	TCA	T	1446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=871;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GCTGTGTGCCTCAGTTTCATC;SOR=0.771;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=21;WE=37446070;WS=37446051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr6	37446163	rs71569377	C	T	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CTCTCATGCACGTACCTTCTC;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=68;WE=37446171;WS=37446153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr6	37447075	rs2797790	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=2.179;SC=GCAGCCTCAAGTACTCCTGCA;SOR=0.879;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=25;WE=37447083;WS=37447065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr6	37447994	rs1874736	C	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GCCCACAGTGCTGGCTTCTTC;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=37448002;WS=37447984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr6	37450914	rs10692	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=820;ReadPosRankSum=0.372;SC=TTGATCCTGATCAAGGGGCCA;SOR=0.795;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=52;WE=37450922;WS=37450904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,60:0.50:119
chr6	37451107	rs13220464	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=815;ReadPosRankSum=2.054;SC=AGGCAGTTTAGGCCCGTCTGT;SOR=0.435;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=47;WE=37451115;WS=37451097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr6	37475274	rs13194564	A	T	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=761;SC=AAGTTATTAAAGTTATTGATT;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=37475282;WS=37475264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	37501866	rs1541227	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GACAAAATGTAAATTAACTCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=37501874;WS=37501856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr6	37501967	rs2797786	A	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=527;ReadPosRankSum=-0.881;SC=TTGAGTTACCAAGAGGTGTCC;SOR=0.456;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=38;WE=37501975;WS=37501957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr6	37502110	rs62406767	C	G	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=846;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GAGTCCTGGACAAATCAAGAT;SOR=0.831;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=48;WE=37502118;WS=37502100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr6	37502585	rs1317487	C	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	37522966	rs6942122	T	C	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=160;SC=AAGCTCTTCATTGGGCCATAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=37522974;WS=37522964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	37606305	rs3818020	G	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=679;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TGGGCCCTACGGACTCACCTG;SOR=0.935;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=44;WE=37606313;WS=37606295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr6	37611796	rs45511994	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=319;SC=TCTCTGCCTAGGCCTCTGCGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=37611804;WS=37611786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	37615258	rs6901281	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=9;PP=254;SC=GAACGTTGGGAGAAGAGGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=37615266;WS=37615248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	37620129	rs2273109	G	A	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=57;PP=1655;SC=GTGAGTGGATGGGGAGGGAAG;SOR=1.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=77;WE=37620137;WS=37620119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	37623566	rs3846874	C	T	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=102;PP=2965;SC=AGCGGGCAGGCGGGTTGGAGT;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=82;TCR=102;TR=184;WE=37623574;WS=37623556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr6	37631768	rs10947690	A	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=905;ReadPosRankSum=0.615;SC=CCCTGTTACAAGGCACTGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=58;WE=37631776;WS=37631758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr6	38147355	rs6458044	A	G	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=64;PP=1761;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CCCACAGCGCAGCTCCTGCCC;SOR=0.409;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=202;TCF=78;TCR=124;TR=111;WE=38147363;WS=38147345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,123:0.56:220
chr6	38455368	.	C	CGAGAGAGA	270	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=270;QD=54.6;SC=AGAGAGTCAGCGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=38455379;WS=38455358;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	38455460	rs70981556	G	GGAAAA	1734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.610;QD=16.68;ReadPosRankSum=-1.640;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr6	38472125	rs9380754	GG	CT	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AACTGATGATGGGCTATTATT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=38472134;WS=38472115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr6	38472176	rs73426901	A	G	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=7;PP=1370;SC=CACTACCCAAACTACAAAATT;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=38472184;WS=38472166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	38560215	rs2180106	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=0.285;SC=GGAAAGACATTCCATAGGCTA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=38560223;WS=38560205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	38650588	rs1130534	T	A	3341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=53;PP=1907;ReadPosRankSum=0.912;SC=ACTTACCGAATCCTCGAGGGT;SOR=0.579;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=270;TCF=163;TCR=107;TR=127;WE=38650596;WS=38650578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,157:0.47:333
chr6	38670837	rs1049346	G	A	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1942;ReadPosRankSum=-2.434;SC=CCATGGCTGCGCTGCAGTATC;SOR=0.574;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=227;TCF=109;TCR=118;TR=128;WE=38670845;WS=38670827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,159:0.56:282
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chr6	38746294	rs1738259	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=348;ReadPosRankSum=-1.716;SC=CTTTAAATCTAAAAATACAAT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=24;WE=38746302;WS=38746284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr6	38747770	rs1738254	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=-0.397;SC=TCCCTGTCTGGGATTAGAAAT;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=20;WE=38747778;WS=38747760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
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chr6	38754502	rs1678666	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=-0.283;SC=GCAGAAAGGAAATTCAGAATG;SOR=1.139;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=20;WE=38754510;WS=38754492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr6	38759379	rs1678674	G	A	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=861;ReadPosRankSum=0.603;SC=GAAGGAGATAGCCAAAACTGT;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=64;WE=38759387;WS=38759369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
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chr6	38773172	rs1678682	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=277;ReadPosRankSum=1.364;SC=TTAAAAAGGAACTTCCTAAGA;SOR=2.179;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=15;WE=38773180;WS=38773162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr6	38773293	rs874808	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=546;ReadPosRankSum=0.281;SC=AGTGAAACAGGAGAGGGTGAA;SOR=0.643;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=36;WE=38773301;WS=38773283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr6	38775336	rs1738229	T	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=282;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GGGGATGCTCTAGGTTTTTTG;SOR=0.929;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=22;WE=38775344;WS=38775326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
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chr6	38793812	rs1738208	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=475;ReadPosRankSum=-1.540;SC=AACCACATTTCAAGTGTTCAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=38793823;WS=38793802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	38793815	rs12197467	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=342;ReadPosRankSum=1.821;SC=CACATTTCAAGTGTTCAAAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=38793823;WS=38793802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr6	38800209	rs1678729	T	C	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=0.960;SC=AGCATATGAATTGGTAATTTA;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=38;WE=38800217;WS=38800199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr6	38810313	rs1678737	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TATAATGCCTGTCTTCTTAGG;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=6;WE=38810321;WS=38810303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr6	38820599	rs9380787	T	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
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chr6	38906072	rs2073037	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=456;ReadPosRankSum=1.613;SC=TCTTTTAGAAATTGCTTTTTC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=27;WE=38906080;WS=38906062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr6	38913177	rs522327	A	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=842;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TTATTATTTGAAAAGTACATT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=51;WE=38913185;WS=38913167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
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chr6	38952287	rs35676616	G	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=6;PP=186;SC=CCAGCAATTGGGCCAGGCATG;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=38952295;WS=38952277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	38957771	rs3737095	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=277;ReadPosRankSum=0.762;SC=ATTTCTTTTGTTTTCTCTCAC;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=16;WE=38957779;WS=38957761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr6	38957853	rs3737094	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=1077;ReadPosRankSum=1.142;SC=AAATCCCCTTATGCAAAACCT;SOR=1.047;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=62;WE=38957861;WS=38957843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,72:0.41:176
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chr6	38980081	rs10484847	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=839;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGTCATTTCAATACTCCGCAG;SOR=1.058;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=53;WE=38980089;WS=38980071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,65:0.57:115
chr6	39016636	rs10305420	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GCCCCCGGCCCGCTGCGCCTT;SOR=0.452;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=22;WE=39016644;WS=39016626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
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chr6	39033427	rs910162	A	T	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.92;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	39033593	rs3765468	G	A	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,80:0.46:175
chr6	39033602	rs6918287	A	G	6578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.26;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
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chr6	39033898	rs9296276	G	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.125;SC=CTCTGTCTCTGTGCCATGGGA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=39033906;WS=39033888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr6	39046644	rs742762	A	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=414;ReadPosRankSum=0.222;SC=CAACATGGCCATGTGCATTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=7;WE=39046663;WS=39046634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr6	39046655	rs742761	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=414;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TGTGCATTGGCGGCCTCTGTG;SOR=1.702;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=39046663;WS=39046634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr6	39047289	rs372644691	A	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=-0.495;SC=AGGGAAGAAGAGTCCATGGGA;SOR=0.257;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=14;WE=39047297;WS=39047279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr6	39048491	rs1126476	A	C	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=1035;SC=TGGTGGCCATATTATACTGCT;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=39048499;WS=39048481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	39077192	rs138538630	T	TTCC	1955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.534;NF=0;NR=25;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.783;SC=ATGTAGATACTTCCTCATCAA;SOR=0.555;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=7;TCR=66;TR=25;WE=39077200;WS=39077182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr6	39162206	rs2815098	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=1021;SC=CTAGAGGAGAAGCTAGCTGGG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=39162214;WS=39162196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	39268303	.	G	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=684;ReadPosRankSum=-1.055;SC=CAGCTTGCTGGAGCCAGGGGA;SOR=0.606;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=58;TCR=71;TR=49;WE=39268311;WS=39268293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,55:0.35:155
chr6	39271656	rs7451024	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=286;ReadPosRankSum=1.009;SC=CAGCAGGTGCGCCAGCTGCGG;SOR=0.705;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=20;WE=39271664;WS=39271646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
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chr6	39688367	rs10947834	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=0.391;SC=AAGAGCTGCGTTGCATTTTCC;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=39688375;WS=39688357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr6	39832111	rs2504787	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=257;ReadPosRankSum=0.529;SC=GGCAGAGCTGAGAAATGAATC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=19;WE=39832119;WS=39832101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr6	39832363	rs2504094	C	G	139.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.589;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr6	39832964	rs2504093	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=295;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TGGCCAACTCTGCCTCACCTG;SOR=0.400;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=21;WE=39832972;WS=39832954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
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chr6	39846137	rs2504086	A	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=435;ReadPosRankSum=2.381;SC=CATTACTCACATTCTCTCCTT;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=30;WE=39846145;WS=39846127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
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chr6	39865047	rs3004067	T	C	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=676;ReadPosRankSum=0.251;SC=TTCCAGAAGCTGCCAAAGTCA;SOR=0.899;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=122;TCF=53;TCR=69;TR=58;WE=39865055;WS=39865028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,68:0.44:155
chr6	39866805	rs3830992	A	AACAATGGGC	1862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.504;NF=4;NR=23;PP=2972;ReadPosRankSum=1.483;SC=AGGGGCAAAAAACAATGGGTA;SOR=0.893;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=27;WE=39866813;WS=39866795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr6	39869066	rs882559	G	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=624;ReadPosRankSum=2.053;SC=ATCCTGTTCTGTCCCTTGACA;SOR=0.822;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=41;WE=39869074;WS=39869056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,48:0.43:112
chr6	39895410	rs3008822	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=203;ReadPosRankSum=-2.216;SC=GTATTCAGCTTGGGGGTCGGG;SOR=0.184;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=18;WE=39895418;WS=39895400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr6	40360465	rs3734557	A	G	7590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=98;PP=2965;SC=TGCCGCCCAGAATCTGGCTGT;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=124;TCR=98;TR=222;WE=40360473;WS=40360455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr6	40360755	rs3734555	G	A	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.86;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr6	40399446	rs7775772	T	C	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=12;PP=1156;SC=CACAGCCGCTTGCTCACCTGT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=40399454;WS=40399436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	40996381	rs742492	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=457;ReadPosRankSum=0.445;SC=AGCAGGGAGGGGCTCCCCCCC;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=25;WE=40996389;WS=40996371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr6	40998141	rs736795	G	A	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=844;ReadPosRankSum=1.796;SC=TCTTCATGCCGCAAAGCCCCA;SOR=0.452;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=55;WE=40998149;WS=40998131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr6	40998344	rs9369256	G	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=242;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GGGTGCCAGGGTAGGAACCCA;SOR=1.535;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=12;WE=40998352;WS=40998334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr6	41010368	rs9369260	C	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=1.557;SC=CAGAAAAGCTCATCACCCGGG;SOR=0.397;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=14;WE=41010376;WS=41010358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr6	41011266	rs932399	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CCTCCTCCCACTGAATGTTTT;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=41011274;WS=41011256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr6	41029294	rs41273362	C	A	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1468;ReadPosRankSum=2.464;SC=TACAATGTCACCTGGTATGTG;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=91;WE=41029302;WS=41029284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,101:0.52:193
chr6	41052002	rs6908595	A	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=462;SC=ATTACAACCTATTTGATAATT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=41052010;WS=41051992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	41162060	rs13216201	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GCCACATTGGGTTCCTGGGGA;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=5;WE=41162068;WS=41162056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	41162518	rs3747742	T	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=930;ReadPosRankSum=-1.646;SC=ACAGTTCCACTCTTGAGGATG;SOR=0.568;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=64;WE=41162526;WS=41162508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,73:0.46:158
chr6	41169021	rs5875743	C	CA	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=857;SC=GGCCCCAAGCCGGGAGGACTC;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=41169029;WS=41169011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	41196034	rs6458202	T	C	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=43.40;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	41196040	rs6458203	T	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=44.91;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	41196041	rs6458204	C	T	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.30;QD=46.16;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	41196095	rs6458205	C	T	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=12;PP=1028;SC=TCAGACCCAGCGTCTGACTCC;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=41196112;WS=41196085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	41196104	rs10700462	C	CCTT	2946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=13;PP=1855;SC=GCGTCTGACTCCTCCTGAGAG;SOR=1.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=35;WE=41196112;WS=41196085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	41196156	rs2803496	C	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=26;PP=1056;SC=AGAAACAGATCTGGGCTGGAA;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=41196164;WS=41196146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	41196605	rs9369265	T	C	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=38;PP=2214;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CTCCAAGCCCTGGACAGCAGT;SOR=0.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=112;WE=41196613;WS=41196595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr6	41196727	rs2101269	C	T	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=96;PP=2965;SC=GAATCTACAACGCTTCCGAAA;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=164;WE=41196735;WS=41196717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr6	41197785	rs9296357	T	C	3818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=57;PP=2172;SC=ACTGTCTTCTTTGTGTCCTCT;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=98;WE=41197793;WS=41197775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	41197857	rs7769759	C	T	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=41;PP=1214;SC=GGCTCTGAGACCAGGTAGGTC;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=41197865;WS=41197847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	41198909	rs4337930	T	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=423;SC=TATTACAACATGATAATAATA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=41198917;WS=41198899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	41199973	rs1825409	C	T	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1631;SC=AACATCCCCACTGAAAACACT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=41199981;WS=41199963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	41200245	rs7746632	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=949;SC=ACTTGGAGGTAGGGGATGGTT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=41200253;WS=41200235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	41204005	rs9394775	C	G	31.29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.70;QD=10.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	41204049	rs9394776	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=349;SC=TGACTAGGTCCCCTCTCAGTC;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=41204057;WS=41204039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	41204092	rs9349185	C	T	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	41204092	.	CTC	TTG	674	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23;NR=10;PP=674;QD=22.0444810564;SC=CCCCACACCCCTCTGTCATCG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=41204102;WS=41204082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	41204094	rs9394777	C	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	41204329	rs9349186	A	T	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1538;SC=GAGTCCTGTTAGTGCTCCTGA;SOR=1.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=41204337;WS=41204319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	41243991	rs2234243	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=294;ReadPosRankSum=-0.380;SC=AGAGGCTGAACGCTACTGCTG;SOR=0.719;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=16;WE=41243999;WS=41243981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr6	41303592	rs9394782	T	C	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=86;PP=2843;SC=TCCCCTCCCATGAGCGCACAG;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=84;TCR=86;TR=170;WE=41303600;WS=41303582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr6	41309552	rs2236369	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=9;PP=409;SC=CACACAGACCTCCTGGACTCC;SOR=0.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=41309560;WS=41309542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	41309698	rs2236370	G	C	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=32;PP=1500;SC=AGCCACACAGGCCTGGGCGGG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=41309706;WS=41309688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	41318438	rs2273962	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=973;SC=GTGGAAAACCATGATGGAGCT;SOR=1.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=41318446;WS=41318428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	41486990	rs2496647	G	A	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=984;SC=ATGCAAAATTGGGATAATTAT;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=41486998;WS=41486980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	41533595	rs41273784	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=638;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CAGCAGCGGCGGGGCCACAGG;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=48;WE=41533603;WS=41533585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,52:0.40:130
chr6	41554993	rs11758591	G	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=903;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GTAGAAAGCCGAGTGTTCGTG;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=58;WE=41555001;WS=41554983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
chr6	41556216	rs55977799	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TGACGAGAAGGGAGAAGCCTT;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=41556224;WS=41556206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr6	41613772	rs7763699	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=513;ReadPosRankSum=1.266;SC=ATGAGGGTTCAGTGGGCATGC;SOR=0.895;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=37;WE=41613780;WS=41613762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr6	41617626	rs2073159	G	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=308;ReadPosRankSum=1.498;SC=CTCCAAAGCCGGGTTCCTCGA;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=24;WE=41617634;WS=41617616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr6	41617658	rs2281326	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=243;ReadPosRankSum=-0.701;SC=TGGGCCCACTGGAGCACCTTC;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=15;WE=41617666;WS=41617648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr6	41620975	rs2842657	A	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=10;PP=781;SC=CCGCTGCCGCAGGCCCCCACA;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=41620983;WS=41620965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	41621271	rs2230088	G	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=931;ReadPosRankSum=0.905;SC=CGGACTGCCTGGAGATCTGCA;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=58;WE=41621279;WS=41621261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,65:0.45:145
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chr6	41654110	rs1076727	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=1.183;SC=GGTGGAGGTGGCTGATCTCAG;SOR=0.593;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=6;WE=41654118;WS=41654100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr6	41721682	rs59644697	G	GT	1865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TGGAAAGGAGGTGTACTGGAT;SOR=0.674;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=36;WE=41721690;WS=41721672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
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chr6	41898096	rs2479726	A	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=475;SC=TGCCTGCATCACATACTAAAG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=41898104;WS=41898086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	41903782	rs1051130	A	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=35;PP=1178;SC=CTGGTCTGAGAGGCTTCCCTG;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=41903790;WS=41903772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr6	42025402	rs1134218	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=1.470;SC=TCACACCTGTAATCCCAGCAT;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=42025410;WS=42025392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr6	42036395	rs2492926	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=0.501;SC=ACTGTCGCACACTGCCCTCAG;SOR=0.129;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=42036403;WS=42036385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
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chr6	42074106	rs9394866	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=1005;ReadPosRankSum=0.574;SC=CAGGCTCAGGAGAGTCTCCTT;SOR=0.566;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=60;WE=42074114;WS=42074096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
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chr6	42176749	rs55788550	T	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.870;NF=1;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=0.205;SC=TTTTTGTTTTTTTTTTTGAGA;SOR=0.180;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=42176757;WS=42176733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	42181960	rs1884318	A	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=384;ReadPosRankSum=-2.049;SC=GAGAAACCTAAGTAAAATAGC;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=28;WE=42181968;WS=42181950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr6	42532102	rs3749897	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=684;ReadPosRankSum=0.434;SC=TCGACCGGAGCTTGCTGGAAT;SOR=0.622;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=51;WE=42532110;WS=42532092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr6	42583625	rs9381203	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=701;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GCAAGACACTGTCTCAAAAGT;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=41;WE=42583633;WS=42583615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr6	42600319	rs5014584	A	G	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=740;SC=AAGAAAACTTAATGAGCATTA;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=42600327;WS=42600309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	42608123	rs2747120	T	G	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=163;SC=ACCAGTAAGGTGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=42608131;WS=42608113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr6	42618019	.	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=806;ReadPosRankSum=1.003;SC=CTTTCTTTCACAGGAAACCTG;SOR=0.491;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=55;WE=42618027;WS=42618009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr6	42627258	.	TAC	T	223	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=60.33;NF=6;NR=1;PP=223;QD=32.2857142857;SC=TAAATATATATACACACACAC;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=42627267;WS=42627255;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr6	42630107	rs3736745	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.995;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=501;ReadPosRankSum=-0.747;SC=AAAAAAGGAAAAGAACTAAAA;SOR=0.228;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=27;WE=42630115;WS=42630097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr6	42641704	rs761537	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=0.444;SC=GCTTCTCTCAGTAATGAATTA;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11;WE=42641712;WS=42641694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	42650766	rs34240626	G	GT	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.463;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.69;MQRankSum=1.042;NF=15;NR=3;PP=592;ReadPosRankSum=0.867;SC=AGTGTTTTGTGTTTTTCCCCC;SOR=1.893;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=18;WE=42650774;WS=42650756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr6	42652667	rs434505	G	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=473;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TCTCTACAAAGAATTTGAAGG;SOR=0.865;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=32;WE=42652675;WS=42652657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
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chr6	42666145	rs425876	C	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CGGCACGCTCCTCTCCAGCAG;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=79;WE=42666153;WS=42666135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,100:0.48:208
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chr6	42689411	rs6928781	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=342;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CTGGGTGCGGGGAGAGGGGCT;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=21;WE=42689419;WS=42689401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr6	42689755	rs7764439	A	G	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=2148;ReadPosRankSum=-3.963;SC=TGTTGAAGAGAACACAGATAG;SOR=0.665;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=230;TCF=115;TCR=115;TR=118;WE=42689763;WS=42689745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,141:0.51:278
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chr6	42823570	rs145425403	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=866;ReadPosRankSum=0.008;SC=AAAGGGAATAATAAGAGGTTT;SOR=0.982;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=50;WE=42823578;WS=42823560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr6	42853842	rs2179719	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=9;PP=484;SC=CAGCTTAGGGATCAGCTGGGG;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=42853850;WS=42853832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	42897532	.	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=0.328;SC=GCGGAGCAGCGTCGGGGGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=42897540;WS=42897522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	42928758	rs2296805	T	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=514;ReadPosRankSum=0.207;SC=TCGGGGTCTGTCTCAGCCTGT;SOR=1.219;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=28;WE=42928766;WS=42928748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr6	42929839	rs7760250	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=406;ReadPosRankSum=0.287;SC=AGGAGGCAGAGGAACGGACTC;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=18;WE=42929847;WS=42929829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr6	42931204	rs4987175	TG	T	4753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.406;NF=38;NR=54;PP=2966;ReadPosRankSum=0.425;SC=CTTGGCTTAGTGGGGGTGAGG;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=78;TCR=106;TR=92;WE=42931223;WS=42931194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,124:0.51:245
chr6	42931215	rs4987174	C	T	4873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.032;SC=GGGGGTGAGGCGGTAGTTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=129;TCR=105;TR=126;WE=42931223;WS=42931194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,129:0.52:250
chr6	42931261	rs2296804	C	G	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=2414;ReadPosRankSum=-1.811;SC=GTTGCTGGGGCCTCTGTTACA;SOR=0.629;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=254;TCF=131;TCR=123;TR=143;WE=42931269;WS=42931251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,147:0.55:265
chr6	42932202	rs1129186	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.204;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=620;ReadPosRankSum=0.824;SC=AGCTACCTGGCTCCAGCCCTG;SOR=0.397;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=40;WE=42932210;WS=42932192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr6	42932715	rs2274517	C	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=852;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CCTCCTCCCTCGAAAGCCAGT;SOR=0.933;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=60;WE=42932723;WS=42932705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,71:0.42:171
chr6	42933464	rs35830695	G	A	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=68;PP=1719;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CCGGCTTGGGGCCAAAGAGTC;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=250;TCF=102;TCR=148;TR=111;WE=42933472;WS=42933454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,135:0.44:306
chr6	42934500	rs2274514	C	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1388;ReadPosRankSum=-1.701;SC=TCCGCCTTTCCGGTGCCCACG;SOR=0.944;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=90;WE=42934508;WS=42934490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,113:0.55:204
chr6	42934620	rs3818554	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=172;ReadPosRankSum=-1.846;SC=GGAAAGGACACATGAGCAGGG;SOR=0.213;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=12;WE=42934628;WS=42934610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr6	42935998	rs9471982	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=332;ReadPosRankSum=1.553;SC=GGCCCCCCCAGCTTTGAGAGG;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=21;WE=42936006;WS=42935988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr6	42936502	rs73432562	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=0.312;SC=GGGCTGAAGTGCTAGGGCCTG;SOR=1.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=15;WE=42936510;WS=42936492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr6	42936900	rs3805953	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=0.813;SC=ACACCACCTGCGGTGCTCTGG;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=13;WE=42936908;WS=42936890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
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chr6	42945878	rs111762254	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-0.434;SC=TCACCGCGCCCGGCTAGAAAC;SOR=0.784;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=8;WE=42945886;WS=42945868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr6	42976232	rs6458318	T	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=533;ReadPosRankSum=-2.482;SC=CCTTCCTCCTTATAATGTCCA;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=27;WE=42976240;WS=42976222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr6	42977092	rs114970216	T	C	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=605;ReadPosRankSum=-0.052;SC=ACTGGAACAATGAGTACATCA;SOR=0.740;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=53;WE=42977100;WS=42977082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
chr6	42978326	rs2236356	G	A	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=2269;ReadPosRankSum=0.675;SC=CTCTCTCCCCGGGAGACTTTC;SOR=0.533;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=264;TCF=124;TCR=140;TR=133;WE=42978334;WS=42978316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,153:0.50:307
chr6	42985973	rs6926418	T	C	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1393;ReadPosRankSum=1.089;SC=TTTCTTTTTTTTCCCAAATCC;SOR=0.540;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=83;WE=42985981;WS=42985963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,104:0.60:174
chr6	42986363	rs6904371	C	T	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.201;SC=CTTCCTCTCTCCTTCCAGTTG;SOR=0.844;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=56;WE=42986371;WS=42986353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr6	42988841	rs8540	C	T	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=39;PP=1502;ReadPosRankSum=0.228;SC=CTTTGCCTATCCCCTCCCCTC;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=114;TCR=71;TR=103;WE=42988849;WS=42988831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,128:0.56:230
chr6	42989057	rs9296409	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=441;SC=TTGTGGAATATGGTGGAGAAG;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=42989065;WS=42989047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	42989413	rs200886831	CGCCGGG	C	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.839;NF=0;NR=7;PP=301;ReadPosRankSum=1.420;SC=CTAACTACCGCGCCGGGGCCG;SOR=0.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=42989426;WS=42989403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr6	42992808	rs3749904	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1121;ReadPosRankSum=-2.434;SC=TAGCTGGAAATAGTCCTAAGA;SOR=0.525;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=67;WE=42992816;WS=42992798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr6	42992825	rs3749903	C	G	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.828;SC=AAGAAACAAGCTTCTAGACCA;SOR=0.576;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=85;TCR=65;TR=70;WE=42992833;WS=42992815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,81:0.46:175
chr6	42995211	rs1138141	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.104;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=520;ReadPosRankSum=0.365;SC=ACTTCCTGAAAAAATGTGAGT;SOR=1.995;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=25;WE=42995219;WS=42995201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr6	43008298	rs2273917	C	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=859;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CCTCCAGCTTCAGGAGTTCCT;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=58;WE=43008306;WS=43008288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,70:0.49:143
chr6	43014298	rs9394939	TT	CC	6393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=45;PP=2947;SC=TGTTGATGGGTTGGTGGGTTC;SOR=1.171;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=105;WE=43014307;WS=43014288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	43020188	rs4711738	G	A	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=830;ReadPosRankSum=1.073;SC=GGGACTTCACGTCGGTTTCCA;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=58;WE=43020196;WS=43020178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr6	43023096	.	C	T	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=54;QD=17.7542425094;SC=GACTCTGTCTCGAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=43023104;WS=43023086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr6	43023371	rs9471999	T	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=482;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGAAAGAAGCTGATTTGCCAC;SOR=0.444;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=45;WE=43023379;WS=43023361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr6	43026814	rs2050367	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=543;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TCTGCAAAGCACTTTCACCTT;SOR=0.396;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=35;WE=43026826;WS=43026804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr6	43040666	rs41274920	A	T	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=730;ReadPosRankSum=-1.615;SC=AATTCGAGGGAGGTGAAGATG;SOR=0.867;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=49;WE=43040674;WS=43040656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr6	43044620	rs73436429	A	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1144;ReadPosRankSum=-1.647;SC=TCTCGGGCCCAGATGGGGAGT;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=86;WE=43044628;WS=43044610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,101:0.48:209
chr6	43100537	rs78422682	T	G	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=48;PP=1217;ReadPosRankSum=-0.753;SC=TTCTGGGCCCTGCAGGCTTGG;SOR=0.982;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=148;TCF=57;TCR=91;TR=75;WE=43100545;WS=43100527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,83:0.49:170
chr6	43109751	rs6905948	G	A	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1175;ReadPosRankSum=1.254;SC=AGGCCCAGGGGGACCCCAAGC;SOR=0.953;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=79;WE=43109759;WS=43109741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,93:0.56:167
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chr6	43114211	rs60930750	C	CT	209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=200;SC=TCCCAGTGAACTTCCCCCTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=43114219;WS=43114201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr6	43273604	rs2242416	A	G	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=773;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CACATCGCCAATGTTCACACC;SOR=0.718;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=48;WE=43273612;WS=43273594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,68:0.50:135
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chr6	43307861	rs10948072	G	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1369;ReadPosRankSum=0.282;SC=GATACTTGGGGTCACCAATGA;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=97;TCR=108;TR=92;WE=43307869;WS=43307851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,99:0.41:244
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chr6	43414234	rs1214747	G	C	297.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=113;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TTAGTCCACCGCTCTCCCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=7;WE=43414242;WS=43414224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr6	43418691	rs1214748	G	A	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=1027;ReadPosRankSum=1.735;SC=CAAGCTCACAGGTCTTGCCAC;SOR=0.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=65;WE=43418699;WS=43418681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,81:0.49:165
chr6	43418733	rs1214749	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=904;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AGTCGAAGTCGTGGACACGGT;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=54;WE=43418741;WS=43418723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr6	43422698	rs72857275	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=150;ReadPosRankSum=0.586;SC=CAGGAGCCGACGAGGGAGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=43422706;WS=43422688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr6	43469519	.	C	G	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=7;PP=89;QD=15.4714015684;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTCTCTG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=43469527;WS=43469509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr6	43501580	rs11404474	C	CA	642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=650;SC=TAAAAAACAACAAAAAAGGGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=43501588;WS=43501570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	43608386	rs7106	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=445;ReadPosRankSum=0.887;SC=GGAAGCAACTCTCCTTCTGGT;SOR=1.121;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=22;WE=43608394;WS=43608376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr6	43738350	rs2010963	C	G	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=21;PP=1241;SC=GCAGCGAAAGCGACAGGGGCA;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=43738358;WS=43738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	43747371	rs3025007	C	T	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=15;PP=1307;SC=TGTCTGCCTCCAGTGCTGTGC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=61;WE=43747379;WS=43747361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	43747450	rs3025009	G	A	4766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=48;PP=2965;SC=CCAGAGCGAGGGGATGCGGAA;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=138;WE=43747458;WS=43747440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	43747577	rs3025010	T	C	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=55;PP=1601;ReadPosRankSum=0.355;SC=TCTCTTGGGCTTGGCAGGCAT;SOR=0.720;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=62;TCR=109;TR=87;WE=43747585;WS=43747567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr6	43748643	rs3025052	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=12;PP=426;SC=CCCCTGGTCCTTCCCTGGCTC;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=43748651;WS=43748633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	43749641	rs144542477	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.270;SOR=1.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr6	44081510	rs700006	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=347;ReadPosRankSum=0.428;SC=CTCCCAAGCTCCCTTAGCAAA;SOR=0.425;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=19;WE=44081518;WS=44081500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr6	44081718	rs6883	G	A	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=56;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TGTTGGAGTCGAATCTGGGGG;SOR=0.753;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=193;TCF=95;TCR=98;TR=104;WE=44081726;WS=44081708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,127:0.55:233
chr6	44081987	rs4711767	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.667;SC=CTGTATCTCTTATGGTCAGGG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=44081995;WS=44081977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	44102572	rs3841315	C	CT	2081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.952;NF=4;NR=40;PP=1735;ReadPosRankSum=0.096;SC=CCACCTGCCCCGGTTTCCCAG;SOR=0.824;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=90;TCF=12;TCR=78;TR=44;WE=44102580;WS=44102562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
chr6	44103019	rs59028814	G	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=359;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CTGTCCCCAGGGACTCTCCCC;SOR=1.546;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=20;WE=44103027;WS=44103009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr6	44107200	rs11967633	G	A	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=65;PP=2766;SC=CCGTATGGCTGCAGGGATGAT;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=143;WE=44107208;WS=44107190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr6	44107365	rs41282654	G	A	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=49;PP=2459;SC=GGGCCAGGACGGCTAGGGTGG;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=112;WE=44107373;WS=44107355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	44108150	rs7738970	T	C	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=40;PP=1747;SC=TTCCCTTCCCTTCCCTGCAGG;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=44108158;WS=44108140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	44116785	rs35937558	T	TC	877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.984;NF=1;NR=23;PP=845;ReadPosRankSum=-2.149;SC=TTCTGCTTGTTCCAACCCCGT;SOR=0.208;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=24;WE=44116793;WS=44116775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr6	44117727	rs4711768	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=872;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CTCACACCACACCTCGCTGTG;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=64;WE=44117735;WS=44117717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,77:0.47:164
chr6	44121270	rs1041523	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=-0.097;SC=CGCTGGGGCACGGGGCACTAT;SOR=0.412;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=4;WE=44121278;WS=44121260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	44122416	rs10537719	TCTC	T	1680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.09;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr6	44126736	.	A	G	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=59.55;NF=0;NR=5;PP=21;QD=11.1542425094;SC=ATCAGACTGGATGCCCCTTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=5;WE=44126744;WS=44126726;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr6	44134581	rs914503	C	T	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=53;PP=1553;SC=GACTGCAGACCCGTCGTGGCT;SOR=2.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=44134589;WS=44134571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	44136630	rs35949119	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.748;NF=4;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=1.550;SC=AATGCTGGGATTACAGGTGTG;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=44136638;WS=44136620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr6	44136911	rs112447145	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GCTGAAGAGATCCTCCCACCT;SOR=0.250;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=5;WE=44136919;WS=44136889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr6	44149153	rs143990221	CCA	C	213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.54;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr6	44151490	rs7761137	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=772;ReadPosRankSum=2.379;SC=ATTTGCTTGAGCCTGGAACAG;SOR=0.849;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=56;WE=44151498;WS=44151480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,75:0.42:178
chr6	44151765	rs13209117	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCAGCTCTCCGGTCTCTGCTG;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=23;WE=44151773;WS=44151755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr6	44185254	rs3734701	T	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.28;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	44185254	.	TGCCTGCTGCT	CGCCTGCTGCA,CGCCTGCTGCT	536	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=15,35;NR=5,16;PP=358,536;QD=20.5733937431;SC=GCTGCTGTCCTGCCTGCTGCT;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=20,51;WE=44185272;WS=44185244;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.39:51
chr6	44185264	rs79241016	T	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=5.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.350;SOR=1.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr6	44187386	rs66872347	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=386;ReadPosRankSum=1.161;SC=CCGGTCAGGCCCGGCGCGGGC;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=33;WE=44187394;WS=44187376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr6	44216544	rs112518852	GT	G	3706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.385;NF=21;NR=83;PP=1937;ReadPosRankSum=-0.641;SC=ATTTGGCATGGTTTTTTTTTT;SOR=0.404;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=124;TCF=21;TCR=103;TR=104;WE=44216553;WS=44216534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,147:0.98:150
chr6	44217374	rs34083426	T	G	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=1998;ReadPosRankSum=-1.445;SC=GTTTTTTGCTTCTTTAAAACT;SOR=0.661;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=206;TCF=104;TCR=102;TR=109;WE=44217382;WS=44217364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,119:0.53:226
chr6	44218120	rs13296	A	G	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=58;PP=2732;SC=ATGAAGAAAAACCCAAGATCG;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=44218128;WS=44218110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	44220076	rs504697	T	C	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=62;PP=1992;SC=CATGTTTCTATACAATTAGTG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=85;WE=44220084;WS=44220066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	44220889	rs150398983	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.712;NF=17;NR=25;PP=680;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CACTTCGGGACAACTCCACCA;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=42;WE=44220897;WS=44220879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr6	44221384	.	TG	T	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.934;ClippingRankSum=0.000;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-16.134;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:383,54:0.12:437
chr6	44222161	rs35131506	C	CTG	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=643;SC=GGAAGAGTAACTGGAACCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=14;WE=44222169;WS=44222151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	44223010	rs1875324	G	T	3373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=2079;ReadPosRankSum=-2.214;SC=TGGAGATGAGGGTGGCTGTCA;SOR=0.687;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=221;TCF=111;TCR=110;TR=121;WE=44223018;WS=44223000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,149:0.56:266
chr6	44224924	rs575034	C	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=2.093;SC=CTCCCCTCCACGATCCGGGAC;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=9;WE=44224932;WS=44224914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr6	44227751	rs12211448	C	A	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=980;ReadPosRankSum=0.571;SC=GTGTGCAAGGCCCTGGAGAGC;SOR=0.611;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=66;WE=44227759;WS=44227741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr6	44228162	rs2233437	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=-0.659;SC=GCCCTGGGCCGGGCAGTGCTT;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=32;WE=44228170;WS=44228152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr6	44240193	rs571770	C	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=310;ReadPosRankSum=-0.173;SC=ATCCAAAGGACGTGTTAGGCT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=15;WE=44240201;WS=44240183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr6	44240559	rs524533	C	T	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1385;ReadPosRankSum=0.566;SC=TCTCTGCACTCTCCTGTACTG;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=84;WE=44240567;WS=44240549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,96:0.56:171
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chr6	44245930	rs325018	C	T	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=423;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GCGGGGAGTGCGAGGGGCCCA;SOR=0.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=31;WE=44245938;WS=44245920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
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chr6	44250165	rs516582	A	G	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=76;PP=2373;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GCTTGGCAGCACCTCGTGCAC;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=282;TCF=140;TCR=142;TR=148;WE=44250173;WS=44250155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,164:0.51:321
chr6	44253617	rs324142	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=272;ReadPosRankSum=-0.976;SC=AGGAAGAAGGCAATAATAGAG;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=18;WE=44253625;WS=44253607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
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chr6	44253749	rs324143	A	G	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=40;PP=1807;SC=AGAGGCAGTCACGGTAGGTGA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=85;WE=44253757;WS=44253739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	44253765	rs2297336	A	G	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=980;ReadPosRankSum=0.710;SC=GGTGAAGAGGAAGAGATTCCA;SOR=0.568;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=52;WE=44253773;WS=44253755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr6	44255459	rs324146	G	A	3051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=65;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TGAGAGCTGTGGGCTTGTGCT;SOR=0.779;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=204;TCF=84;TCR=120;TR=107;WE=44255467;WS=44255449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,137:0.55:247
chr6	44268135	rs325009	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=357;SC=CCTTGTGTCACGTAGGCCCTG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=44268143;WS=44268128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	44268371	rs325008	T	C	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=69;PP=1899;SC=CCACCACTCGTGAGCCCCACG;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=114;WE=44268379;WS=44268361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	44269023	rs325007	T	C	7654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=108;PP=2965;SC=GAAAGACAGATGGTGAGCCCA;SOR=0.858;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=135;TCR=108;TR=243;WE=44269031;WS=44269013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr6	44269193	rs498512	C	T	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CCTGAGTTTTCTTTGCAGCCT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=40;TCR=75;TR=74;WE=44269201;WS=44269183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,78:0.61:127
chr6	44269640	rs325006	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=490;SC=TGGGGGAATGGCCTGGGTGAT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=44269648;WS=44269631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	44269664	rs10578812	CAGG	C	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=368;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TCTCAGCTGGCAGGAGAAGGA;SOR=0.064;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=44269688;WS=44269654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr6	44269680	rs325005	C	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=1117;SC=AAGGAAGCTGCCACCACCCCG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=44269688;WS=44269654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	44270365	rs325004	C	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=0.911;SC=AATCAAGGCACCAGCACCAAA;SOR=0.187;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=15;WE=44270373;WS=44270355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr6	44270768	rs325002	G	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=318;ReadPosRankSum=1.884;SC=AGGATCCGGGGCCCCTGGGCC;SOR=0.318;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=19;WE=44270776;WS=44270758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr6	44270936	rs325001	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=874;ReadPosRankSum=0.017;SC=GGGACAGGCCCGTTAACTGCC;SOR=1.159;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=51;WE=44270944;WS=44270926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,52:0.38:136
chr6	44273546	rs324137	A	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=448;ReadPosRankSum=1.612;SC=AAGACAAAGAATGTTGAGGAG;SOR=1.204;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=26;WE=44273554;WS=44273536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr6	44274797	rs7740535	T	C	5059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=93;PP=2965;SC=CAGACATGAATCCCCAGCGGC;SOR=1.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=58;TCR=93;TR=151;WE=44274805;WS=44274787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr6	44275011	rs324136	T	C	4943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=66;PP=2512;SC=CCAGGGAAGATGCCATCAGAG;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=142;WE=44275019;WS=44275001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr6	44278592	rs10807297	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=318;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TATTATCTATAAGGTGTTGAG;SOR=0.323;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=20;WE=44278600;WS=44278582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr6	44280812	rs167772	C	T	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=968;ReadPosRankSum=2.458;SC=ATGGTTCGGCCCTCACCTGGT;SOR=0.543;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=67;WE=44280820;WS=44280802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr6	44320548	rs4714783	T	A	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=77;PP=2841;SC=CCTCATCTTCTGTGGAAACAG;SOR=0.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=138;WE=44320556;WS=44320538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	44355423	rs2297333	C	T	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=11;PP=924;SC=CGCCCCCTCCCACCTTGCGCT;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=44355431;WS=44355413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	44355682	rs34753552	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=37;PP=1159;SC=GAGGTCGGGGGGGCGACGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=44355690;WS=44355672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	44355699	rs2297331	T	C	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=715;SC=GAGGAGACCCTGTGGGGTCTG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=44355707;WS=44355689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	44357884	rs6908640	T	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=189;SC=TTAACCTAGGTGGTGTGTATG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=44357892;WS=44357874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	44360680	rs6942323	A	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=407;SC=AGTAAACCCAAAGCTAAAGCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=44360688;WS=44360670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	44900253	rs3799986	A	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=113;SC=CAAGAGAATTATGCCACTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=44900261;WS=44900248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	44921320	rs10948187	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=282;SC=GTGAATGGACCTAGTCATGAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=44921328;WS=44921310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	44988149	rs1475534	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=201;SC=TCGTCCAAACCATGAAGACTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44988157;WS=44988143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	45390511	rs6921145	G	A	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTGCGGCGGCGGCGGCGGCTG;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=71;WE=45390519;WS=45390501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr6	45480190	rs11498194	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=527;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CACAGGGGTCGGGGGGAGTGG;SOR=0.505;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=40;WE=45480198;WS=45480180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr6	45922849	rs3734206	C	T	7271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=111;PP=2965;SC=AAACATACTCCTCATTTATGC;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=118;TCR=111;TR=229;WE=45922857;WS=45922839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr6	46047458	rs3734207	C	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=21;PP=933;SC=AGAGGTAAATCTCAGGGTTCA;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=46047466;WS=46047448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	46048000	rs1416165	T	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=68;PP=1886;SC=CCGAGAGATCTGTTTACAGGG;SOR=2.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=92;WE=46048008;WS=46047990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	46107312	rs11752816	G	A	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=15;PP=789;SC=GTCCTTCAACGTGTTCATTAT;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=46107320;WS=46107302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	46107752	rs7451713	C	G	7183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=130;PP=2965;SC=TACCCATTCACGATACCATCT;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=100;TCR=130;TR=230;WE=46107760;WS=46107742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr6	46108064	.	G	A	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1485;ReadPosRankSum=-1.052;SC=AGGACAGACTGATAAACCTGG;SOR=0.487;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=182;TCF=77;TCR=105;TR=94;WE=46108072;WS=46108054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,114:0.49:232
chr6	46129345	rs2235881	G	A	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=66;PP=2576;SC=GTGGCATGGCGGTGATATTGA;SOR=0.926;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=119;WE=46129353;WS=46129335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	46135489	rs6926570	T	C	6469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=94;PP=2965;SC=AACCATTCAATAATTTTGGCA;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=115;TCR=94;TR=209;WE=46135497;WS=46135479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr6	46135984	rs3806995	G	T	5928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=117;PP=2965;SC=GACACCAAGAGAAATTTCGAA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=69;TCR=117;TR=186;WE=46135992;WS=46135974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr6	46293328	rs2277121	G	A	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=130;SC=CCTTGCTCTGGGGACGGCTGG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=46293336;WS=46293318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	46609905	rs2277119	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=115;ReadPosRankSum=0.226;SC=TTTACCTGTACGATAAACGAT;SOR=1.232;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=11;WE=46609913;WS=46609895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr6	46621097	rs8427	T	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.248;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=724;ReadPosRankSum=-1.604;SC=TGGGGGAGGGTGCGCGGGCGG;SOR=0.117;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=37;WE=46621105;WS=46621087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr6	46623698	rs3757241	T	C	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=38;PP=1402;SC=TGCGCACAGCTCTAGGGATCA;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=46623706;WS=46623688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	46626353	rs953062	A	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=613;ReadPosRankSum=0.895;SC=GATAAGCAAGAAGAGTTAATT;SOR=0.504;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=35;WE=46626361;WS=46626343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr6	46630068	rs9381469	G	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=680;SC=TATAAAATTCGTGAAATTAAT;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=46630076;WS=46630058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	46649231	rs7740677	C	T	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=67;PP=2965;SC=GAATACATTACTTTCTTCTCT;SOR=1.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=183;WE=46649239;WS=46649221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr6	46656557	rs41273658	C	T	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.531;SC=TCGCGAGTCCCGCTCAAGCAA;SOR=0.625;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=227;TCF=118;TCR=109;TR=108;WE=46656565;WS=46656547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,130:0.49:268
chr6	46657057	rs3799277	A	G	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=65;PP=2690;SC=TGACCTGAAGACACTGATACT;SOR=1.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=111;WE=46657065;WS=46657047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	46658905	rs9381472	C	G	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1678;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TATTTTAGAACAGTTGTCATG;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=90;WE=46658913;WS=46658895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,105:0.60:174
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chr6	46672943	rs1051931	A	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=1101;SC=ATCAATAGCTACATTTGAATC;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=46672951;WS=46672933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr6	46726441	rs9395212	G	C	148.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=98;SC=AGTTCAGAAGGCTCTCTCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=46726449;WS=46726431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr6	46761495	rs2274656	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GAAATTACTTGAAACCCAGTG;SOR=1.402;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=46761503;WS=46761485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr6	46793175	rs6920863	G	A	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=65;PP=1708;ReadPosRankSum=-1.903;SC=TTATCGGACAGCGCCTGGATT;SOR=1.148;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=182;TCF=74;TCR=108;TR=100;WE=46793183;WS=46793165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,117:0.54:217
chr6	46794048	rs2297018	C	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=853;ReadPosRankSum=0.862;SC=TTTGGAATGACTATCTTTCAT;SOR=0.894;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=49;WE=46794056;WS=46794038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr6	46797329	rs2274657	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=353;ReadPosRankSum=0.381;SC=GCATTCACACGAGGAATGGAT;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=23;WE=46797337;WS=46797319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr6	46801071	rs2274658	G	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=830;ReadPosRankSum=-0.164;SC=TGGTTTTGGGGTAACTTTATA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=53;WE=46801079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr6	46803345	rs12196017	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GTGCATGCTTGCTCCTGGTAA;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=16;WE=46803353;WS=46803335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr6	46806809	rs1804211	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=400;ReadPosRankSum=-0.543;SC=ATCGGAGGCACGGCTGGCGTG;SOR=1.012;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=26;WE=46806817;WS=46806799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr6	46826508	rs613870	G	A	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=89;PP=2965;SC=AAGAAGTCCGGTTCTTGGTCA;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=178;WE=46826516;WS=46826498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr6	46826715	rs572248	T	A	8028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=109;PP=2965;SC=CACCTTCTTCTACATAGCACC;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=135;TCR=109;TR=244;WE=46826723;WS=46826705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr6	46826844	rs571247	T	C	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=100;NR=115;PP=2965;SC=ATGGCATAGTTGTATTGTGGC;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=100;TCR=115;TR=215;WE=46826852;WS=46826834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr6	46826910	rs611779	G	A	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;NF=101;NR=100;PP=2965;SC=GGATATCCTGGGCAAGGATGG;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=101;TCR=100;TR=201;WE=46826918;WS=46826900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr6	46827073	rs547499	A	G	5258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=78;NR=89;PP=2965;SC=CTTGATTACCATGCTGCTCAT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=167;WE=46827081;WS=46827063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr6	46827126	rs610856	C	T	5451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=82;PP=2965;SC=GGCTATCTCCCGACTGTAATG;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=154;WE=46827134;WS=46827116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr6	46828670	rs540727	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=551;SC=AAATTTACCAATCAATTCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=46828678;WS=46828660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	46831060	rs476374	C	T	5687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=113;PP=2965;SC=CTTTTCCTAACAGAATTTTAT;SOR=1.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=59;TCR=114;TR=172;WE=46831068;WS=46831050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr6	46832741	rs529201	T	C	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=17;PP=1858;SC=GTCCCTGCCCTGACTATAACA;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=63;TCR=17;TR=80;WE=46832749;WS=46832731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	46832813	rs614826	G	A	7765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=99;PP=2965;SC=ATGGGCTCCAGACTGAATTAT;SOR=0.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=126;TCR=99;TR=225;WE=46832821;WS=46832803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr6	46833043	rs141757792	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=0.261;SC=TCCCGAGGAATGTGCCACATT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=46833051;WS=46833033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	46834685	rs586024	G	A	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=52;PP=2965;SC=TGAGGAACCCGTATGGAAAGT;SOR=1.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=114;TCR=52;TR=166;WE=46834693;WS=46834675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
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chr6	46836995	rs515866	T	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=211;SC=TTGCTGCTCCTGGGCTTTACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=46837003;WS=46836985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr6	46867717	rs220702	C	T	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=13;PP=1561;SC=GCAACACATACCATTTGAGTC;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=46867725;WS=46867707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	46977475	rs73480725	A	G	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1521;ReadPosRankSum=-1.034;SC=AAGGAGGTCAAGTGAGTACAT;SOR=0.877;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=93;WE=46977483;WS=46977465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,103:0.51:203
chr6	47445927	rs9349406	T	A	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=960;SC=GAGCCACCACTGGAGGAGGAG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=47445935;WS=47445917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	47512590	rs6916578	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	47522357	rs9473132	G	A	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=919;SC=AGTTGTTTTTGCTTTTGAATT;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=47522365;WS=47522347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	47548672	rs1014001	C	A	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=21;PP=605;SC=TTGCTATTTTCCATTTTTTAA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=47548680;WS=47548662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	47549883	rs2275446	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=265;SC=CACACTGAGTTATTTACACTG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=47549891;WS=47549873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	47563692	rs2039503	C	T	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=46;PP=1670;SC=CAGTAATTTACTGAGATCTTC;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=47563700;WS=47563682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	47577064	rs9395287	G	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=468;SC=CTTTTCTCCTGTGAGTACTAC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=47577072;WS=47577054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	47591856	rs10948368	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=495;SC=CTTAATGACATAGAGTAAAAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=47591864;WS=47591846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	47624239	rs1485784	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=9;PP=620;SC=CTGACTGCCTATGGGAACCGC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=47624247;WS=47624229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	47624299	rs9369730	A	G	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=27;PP=1148;SC=ACTCTCATCCATACAAGAGCC;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=47624307;WS=47624289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	47626685	rs6935668	C	T	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=859;SC=TCCCGATGTACGATTGAAGCT;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=47626693;WS=47626675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	47626833	rs12201065	C	A	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=435;SC=CTGCCATCCCCTAATGCAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=47626841;WS=47626823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	47641307	rs1411049	G	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=1.710;SC=AACCAGCTTTGGGTTACCAGA;SOR=0.568;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=47641315;WS=47641297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr6	47646842	rs6907125	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=27;PP=816;SC=GACACCTGCCAGACTCTTAAT;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=47646850;WS=47646832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	47649222	rs8180544	T	G	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=31;PP=1300;SC=TCACTTTTTCTATGAGAATTA;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=60;WE=47649230;WS=47649212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	47649573	rs10807371	CA	TG	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=35;PP=2947;SC=GTAGGCCAAGCAAATTGTTTA;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=66;WE=47649582;WS=47649563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	47649694	rs9381594	A	G	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=23;PP=1056;SC=TTGCTTGTCCATTGAGGTCCT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=47649702;WS=47649684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	47653536	rs9381596	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=351;SC=AGCTTTTGAGAGTTGGACTGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=47653544;WS=47653526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	47653812	rs60074575	TA	T	391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=477;SC=TATTCCTAAATAAAAGGTCAT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=47653820;WS=47653802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	47653851	rs9296570	T	C	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=155;SC=AGATGCACCATGGACGGAGTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=47653859;WS=47653841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	47654591	rs10948376	G	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	47654662	rs10485315	A	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=439;SC=GGTAATAACTAAGAGTATGTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=47654670;WS=47654652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	47654742	rs9296573	A	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=16;PP=616;SC=TCTTCATCCTAGTGTTTGGAA;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=47654750;WS=47654732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	47654817	rs1556133	C	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=471;SC=TTATCAGTACCTGGCCATGTA;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=47654839;WS=47654807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	47654831	rs1556132	A	G	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=380;SC=CCATGTAAAGACTTGTAAAGG;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=47654839;WS=47654807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	47654864	rs1556131	T	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=158;SC=AAGCTTTCACTTCAGTCATTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=47654872;WS=47654854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	47661387	rs9395311	A	G	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=16;PP=1269;SC=AATAAATGCAATTTTACTTTG;SOR=1.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=47661395;WS=47661377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	47676150	rs9369737	C	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=271;SC=TCTGTGCTTACCAGTATTGAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=47676158;WS=47676140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	47678455	rs11356177	CT	C	2672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=29.05;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	47678678	rs944056	C	G	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=262;SC=AGAAAGTAGACACATTTTTAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=47678686;WS=47678668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	47681494	rs6916562	T	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=491;SC=TACAACAATGTGTAAATCCTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=47681502;WS=47681484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	47682604	rs9369738	A	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1269;SC=AGCCAGAGAAAGGCTACATGA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=47682612;WS=47682594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	47684591	rs1360157	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=23;PP=769;SC=AAGGTAATTTGAATTTGCTTC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=47684599;WS=47684581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	47686101	rs6914013	T	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=583;SC=TCATTACCACTACTGTTATTT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=47686109;WS=47686091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	47749728	rs7741473	T	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=9;PP=472;SC=TATGAAATGGTTCAAGCTGGC;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=47749736;WS=47749718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	47754498	rs1329543	A	G	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=836;SC=CGCTTCACAAATCAACTTTCA;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=47754506;WS=47754488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	47754538	rs6900985	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=21;PP=574;SC=TGGGGTGCTGTCCGGCTGACA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=47754546;WS=47754528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	47847179	rs3799276	A	G	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=67;PP=2642;SC=AGAGGATGACAACAAATGGCT;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=122;WE=47847187;WS=47847169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	47847401	rs2068006	A	G	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=53;PP=1909;SC=CTAGTTGGCCAGCAAAGACCA;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=47847409;WS=47847391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	47847683	rs9367307	A	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=382;SC=CTAATGTTTTAAAAAAAGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=47847691;WS=47847673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	49456545	rs2501965	G	A	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=206;SC=TTATGTTTACGCTATACTGTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=49456553;WS=49456535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	49459978	rs2501968	A	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=6;PP=162;SC=AAGAAACTGGATGCATCTTAA;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=49459986;WS=49459968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	49483578	rs113145900	A	ACTAT	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=647;SC=AGCTTACAACACTGTTTCACC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=49483586;WS=49483568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	49485266	rs9367358	C	A	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=53;PP=1715;SC=TTTTCAAATACAAGGTGAGGT;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=85;WE=49485274;WS=49485256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	49485384	rs2501969	C	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=328;SC=CTATACACACCTGTATGTATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=49485392;WS=49485374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	49518914	rs6919674	C	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=30;PP=1734;SC=CTTTCAACGACAAAAGCGAAT;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=49518922;WS=49518904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	49660418	rs12624	A	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=539;SC=TACAATTTCCACTGGTATGTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=49660426;WS=49660408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	49701439	rs1864312	C	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=18;PP=1052;SC=CCAACCACTGCGTTGGGAGTC;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=50;WE=49701447;WS=49701429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	49701523	rs495335	A	G	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=43;PP=1649;SC=CATGAGCTGGAGGCACTTGAC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=84;WE=49701531;WS=49701513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	49755030	rs28372930	G	C	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=172;SC=TCTCCTCACTGTCTCCAGCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=49755038;WS=49755020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	50712784	rs3765306	A	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=6;PP=1002;SC=AAGGTTGGATACTGGTGAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=50712792;WS=50712774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	50791584	rs71687472	CACAA	C	1771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=1168;SC=TCCAGGTAACCACAAACAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=23;WE=50791600;WS=50791574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	50791592	.	A	G	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	51483961	rs9381994	T	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=22;PP=940;SC=TTTCTTCTCTTGGGAAAGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=51483969;WS=51483951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	51491884	rs4715227	T	C	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=48;PP=1272;SC=ATTATTAGTCTGGGATTCAGG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=51491892;WS=51491874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	51586771	rs9349593	GC	AT	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=2776;SC=TCAGCTTCCTGCAGGCTCCTC;SOR=1.130;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=78;WE=51586780;WS=51586761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	51611470	rs2397060	T	C	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=224;SC=TTTGAAGAATTGCCAAGTACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=51611478;WS=51611460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	51618170	rs1326605	T	G	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=48;PP=1495;SC=ATAGGAGTTGTGGGAAAAAAA;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=51618181;WS=51618160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	51656236	rs7765455	G	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=254;SC=TTATTCTGGGGTTCTCCCAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=51656244;WS=51656226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	51695641	rs12529717	T	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=18;PP=912;SC=GATTCATCTCTTGGGTAGTTT;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=51695649;WS=51695631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	51695836	rs12527920	C	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=110;SC=GTGATAACTTCCAAATTCTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=51695844;WS=51695826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	51701090	rs12525711	T	C	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=969;SC=ACATATAAGCTTTAGGACTGA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=51701098;WS=51701080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	51701165	rs12523900	C	T	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=39;PP=1889;SC=GACATTCTGCCATACTAGACA;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=51701173;WS=51701155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	51701331	rs12523926	C	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1375;SC=AAGACAGTCACACGTGAGAAA;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=51701339;WS=51701321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	51732807	rs12210295	C	T	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=46;PP=1637;SC=CAGACAGAGACCCATCCAAGT;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=88;WE=51732815;WS=51732797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	51875250	rs2435322	A	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=794;SC=TCTCTTTCCAATTTAGGGCTG;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=51875258;WS=51875240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	51914898	rs9395759	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=81;SC=CCTGTGTCCCTCAAGGCCAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=51914906;WS=51914888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	51924774	rs1896976	A	G	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=50;PP=1738;SC=AAGCTTGGCTATCTGCCTGAA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=51924782;WS=51924764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	51930886	.	T	TA	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=59.58;NF=0;NR=3;PP=46;QD=16.6666666667;SC=CTGCAAGAGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=51930894;WS=51930876;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr6	51938242	rs9474140	A	G	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=37;PP=1611;SC=GTTAAACACAAAAACAAACAC;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=51938250;WS=51938232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	51947237	rs9474143	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=41;PP=1292;SC=CAGGAAAGACGTCACAGGGAA;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=51947245;WS=51947227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	52109408	rs3215541	GT	G	188.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=109;SC=GAATGCAGGGGTTTTTTTTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=52109416;WS=52109398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	52129484	rs2230240	C	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=26;PP=883;SC=AAGGGCTCTTCGCTGTCCCGG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=52129492;WS=52129474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	52131254	rs10807441	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=171;SC=CCAAAGTTTCCCCTGAAGCTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=52131262;WS=52131244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	52137313	rs12207056	C	T	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=764;SC=GGATTAGTGGCTTTGCCTCTC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=52137321;WS=52137303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	52142582	rs13191372	G	A	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=827;SC=AATACTTGAAGAGGGCCAGGC;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=52142590;WS=52142572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	52144081	rs2073036	T	C	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=185;SC=CTCTGGAATATGGCAAACTGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=52144089;WS=52144071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	52147692	rs2307322	T	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=17;PP=550;SC=AAAATTAGACTGGGCAGAACT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=52147700;WS=52147682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	52303399	rs9349626	A	G	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=51;PP=1475;SC=GGTATAGCATATATTTTTGAA;SOR=1.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=73;WE=52303407;WS=52303389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	52334371	rs62407897	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=CTGTCAGAGTTATGTGTTGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=52334379;WS=52334361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	52357071	rs17851770	A	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=39;PP=1383;SC=TCTGCAGTTAATCAGGATGTG;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=52357079;WS=52357061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	52367897	rs41273846	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=10;PP=628;SC=TTGAGACGGAGCATCACAGGC;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=52367905;WS=52367887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	52370775	rs45523335	G	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=602;SC=TCCGGGCCTCGGGGGAACCCC;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=52370783;WS=52370765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	52541811	rs13211066	G	A	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=1007;SC=CCATATAAGCGTATCATTTTT;SOR=2.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=52541819;WS=52541801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	52546789	rs2281484	C	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=601;SC=GCTAGATATACTAGAACATAT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=52546797;WS=52546779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	52617731	rs2180314	C	G	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=66;PP=2133;SC=CTCAGGTTGACTAAAGGGCAG;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=104;WE=52617739;WS=52617721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	52622814	rs2254050	C	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=346;SC=ATAATTGAAACGATAGAATCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=52622822;WS=52622804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	52657552	rs4715326	C	T	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=7;PP=449;SC=CACTGAAGGCCTGGAGAAGAC;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=52657560;WS=52657542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	52661253	rs70977384	CTATATATATATATATATATA	C	453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.6551;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=239;SC=GAAACAAAAACTATATATATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=52661280;WS=52661243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	52662263	rs2397106	C	T	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=433;SC=TAACCACTTTCTCCCTCTGCA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=52662271;WS=52662253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	52697576	rs4715344	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=517;SC=GGGGTCAAAACATGGTCAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=52697584;WS=52697566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	52697825	rs4715345	A	C	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.52;QD=43.21;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	52697834	rs4715346	C	A	3443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.56;QD=45.31;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	52701143	rs2397118	C	T	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=15;PP=995;SC=ACCATTGGTACTTGCTGGAAC;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=52701151;WS=52701133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	52702179	rs41273856	T	A	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=16;PP=1063;SC=CCTTTTAGCTTGGAGAGAGTT;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=52702187;WS=52702169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	52702324	rs4715350	T	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=49;PP=1925;SC=TACTAGAAACTCTCATCAGAG;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=52702332;WS=52702314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	52843131	rs367836	G	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=531;SC=AGATGATCTCGTTGACACAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=52843139;WS=52843121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	52843477	rs375887	A	G	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=104;SC=GCCCACCAAAATTTGTTCAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=52843485;WS=52843467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	52847551	rs316133	G	C	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=71;PP=2316;SC=CATGGAGAGAGTGATGAGGCT;SOR=1.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=100;WE=52847559;WS=52847541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	52849146	rs316128	G	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=437;SC=TTAGCGCTTAGGTTAGTTCAA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=52849154;WS=52849136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	52938468	.	ATT	A,AT	106.74	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.6253;FS=3.680;HP=13;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=14;PP=177;ReadPosRankSum=1.981;SC=AACAAATTACATTTTTTTTTT;SOR=0.636;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=15;WE=52938478;WS=52938458;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.71:7
chr6	52943841	rs35757290	TA	T	518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=593;SC=AGAAATTTTTTAATTAGGGAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=52943849;WS=52943831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	52957526	.	T	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-1.088;SC=AAAATTATTTTCATAGGCGTG;SOR=3.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=9;WE=52957534;WS=52957516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr6	52958479	rs2816350	A	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=449;SC=GCAATCATTCAGGGTCTTAGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=52958487;WS=52958469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	52962715	rs2744455	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.88;QD=29.84;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	52963071	rs2876	A	G	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=32;PP=1237;SC=GCATGGCATAATGTTTTTGCA;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=52963079;WS=52963061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	53365019	rs661346	G	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=48;PP=1685;SC=CACAGTGAGGGGTACTGTACA;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=53365027;WS=53365009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	53378861	rs11385177	A	AT	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=286;SC=ATATAACTTCATGTTTTTCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=53378869;WS=53378853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	53379405	rs3736729	A	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=83;SC=CAAATTAGTTATCTAAGACAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=53379413;WS=53379395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	53516876	rs6928338	T	G	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=32;PP=1368;SC=AGGCGTTGGCTATGTAGCCTC;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=53516884;WS=53516866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	53519062	rs10948758	A	G	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=70;PP=2744;SC=TCTCTATACAAGATGTCTCTG;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=138;WE=53519070;WS=53519052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr6	53519605	rs3799260	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=15;PP=727;SC=CACATCTTTACAAGAGTATGG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=53519613;WS=53519595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	53520088	rs2038939	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=398;SC=AATACACTGTTACAGGCAAGA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=53520096;WS=53520078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	53520124	rs2038940	A	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=230;SC=AAAAAAAAAAACATGGTTTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=53520132;WS=53520114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	53707098	rs4286781	C	T	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=39;PP=1145;SC=AATATAGCTACGAGTGAGAAC;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=53707106;WS=53707088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	53762293	rs71775183	GA	G	288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=167;SC=GGCACATTTGGAAAAAACATA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=53762301;WS=53762283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	53764829	rs71558840	T	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=2.189;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	53767652	rs79494319	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=244;SC=CATCCCAAAACGGTCTTACAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=53767660;WS=53767642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	53847528	rs9370250	G	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=700;SC=AATAAGAGGAGCTTGATAAAT;SOR=1.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=53847536;WS=53847518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	53847672	rs9370251	A	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=40;PP=1211;SC=ATACAGGCATAGATGGCTCCT;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=53847680;WS=53847662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	53883843	rs17625497	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=846;SC=CTTGAAAAGCGTGAAAAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=53883851;WS=53883833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	54002231	rs2754779	A	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=25;PP=1070;SC=GACCAAAAAGAAAAGCAGACC;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=54002239;WS=54002221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	54003184	rs2754780	A	G	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=5;PP=97;SC=TATTAATTGTACTCCTACAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=54003192;WS=54003174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	54013765	rs2145755	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=787;SC=TTGATAACGTATCATTTAACT;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=54013773;WS=54013755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	54054686	rs6934690	T	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=337;ReadPosRankSum=1.941;SC=CTCCTCACCATCTTCTACAGT;SOR=1.174;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=22;WE=54054694;WS=54054676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr6	54121968	rs9367556	G	A	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=279;SC=TTGAATCTTAGTGTTTATACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=54121976;WS=54121958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	54130643	rs12198031	T	A	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	54130697	rs12198070	T	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=172;SC=CAGGTGTATATTTTTAAATTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=54130705;WS=54130687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	54172879	rs1340660	T	G	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=44;PP=1353;SC=AGCCTGGATGTTCGTTTCAAT;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=54172887;WS=54172869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	54173413	rs2297980	A	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=28;PP=1465;SC=ATGGAGAAGCAGTATTTATCT;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=54173421;WS=54173403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	54734941	rs7765721	C	A	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=596;SC=CATTCTGTTACCGAATTTTAA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=54734949;WS=54734931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	54735122	rs1472679	A	G	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=47;PP=2198;SC=ACTACAAGGAATGGTATCGAG;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=101;WE=54735130;WS=54735112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	55113347	rs62416818	T	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	55113350	rs62416819	G	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.99;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	55113411	rs3122169	C	A	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=851;SC=TTGTTGAGTGCCTATTCCTTT;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=55113419;WS=55113401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	55113664	rs9396073	C	T	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=497;SC=AATGTTCAGCCATAGCGATGG;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=55113672;WS=55113654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	55142337	rs2653349	A	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=842;SC=GATGTTGATGATTGTGCTTTT;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=55142345;WS=55142327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	55196587	rs12199003	C	T	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=14;PP=541;SC=GCAATGCTTACGTGATGCAAA;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=31;WE=55196595;WS=55196577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	55215079	rs1032767	G	A	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=104;SC=ATAAAATGCAGCAAAATCATT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=55215087;WS=55215069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	55216005	rs870806	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=915;SC=TGTATGTACAGCTTTGTGTTT;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=55216013;WS=55215995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	55264362	rs6936510	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=282;SC=TTAAGACATATTAAATCAAGT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=55264370;WS=55264352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	55266625	rs9370418	T	C	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=14;PP=605;SC=AGATCCTTCATCGATCCAAAT;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=55266633;WS=55266615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	55266722	rs12529201	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.55;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	55300329	rs12332977	T	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=ATAATCTTTTTGAAAAGGATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=55300337;WS=55300323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	55300348	rs201664577	C	CT	267.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=138;SC=TCTCTTTTTTCCCACTCTTGT;SOR=4.174;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=55300356;WS=55300338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	55381262	rs6459082	G	A	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=10;PP=791;SC=TCTTTAAAACGATAAGAGGCC;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=55381270;WS=55381252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	55442033	rs147198216	GATAGAAAAA	G	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=2957;SC=ATTACGATAAGATAGAAAAAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=55442049;WS=55442023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	55639028	rs41271330	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=16;PP=518;SC=CAGATTTTACGTTGATACTGC;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=55639036;WS=55639018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	55730212	rs2021803	G	A	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=30;PP=1467;SC=ACCAAAGGTAGTATGAAAAGC;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=55730220;WS=55730202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	55739553	rs3734444	A	G	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=62;PP=2965;SC=TATAAATAAAACTGGAGTGAA;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=138;WE=55739561;WS=55739543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr6	56365814	rs4283892	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=15;PP=877;SC=AAATATATCCAAGAAATCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=56365822;WS=56365804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	56374754	rs9296849	C	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=511;SC=ACATTTTTTACAATTTAATGT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=56374762;WS=56374744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	56381912	rs4715626	G	A	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=14;PP=1056;SC=TGTGGATAACGGAGAAGTGTT;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=56381920;WS=56381902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	56394173	rs9357922	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=341;SC=CATAAAATTGTACAGAAATAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=56394181;WS=56394163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	56395051	rs6939305	C	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=225;SC=TCTAAGGTTACAATTTAAATC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=56395059;WS=56395041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	56417282	rs4715630	C	T	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=45;PP=1584;SC=CATTGCTTGCCATGAGGGCTT;SOR=1.151;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=56417290;WS=56417272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	56417545	rs4715631	T	C	4674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=76;PP=2965;SC=ACATCAGAGGTTCCCTTTGAG;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=140;WE=56417553;WS=56417535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr6	56425284	rs2067543	A	G	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=518;SC=CAATAATGATAGAGCATTATT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=56425292;WS=56425274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	56425971	rs1884286	A	G	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=133;SC=CACATTAAACAAAACTGTCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=56425979;WS=56425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	56426931	rs9367689	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=5;PP=330;SC=AAAATTAATACTCACCTTTAT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=56426939;WS=56426921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	56427095	rs79573569	C	CTGAGTGTTGAAA	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=2969;SC=ACAGTAATCACACATAAAACA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=56427103;WS=56427085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	56437465	rs1014309	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=813;SC=TTGCCAATTATAATTCTGGCA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=56437473;WS=56437455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	56437902	rs2144405	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=314;SC=TATTATGATGCTTATAAATAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56437910;WS=56437892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	56459082	rs116762675	A	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=264;SC=GACAGGTTTCAATGATCTACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=56459090;WS=56459072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	56467586	rs11751914	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=102;SC=ATAATCCTTTGTAGCCTTAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=56467594;WS=56467576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	56470690	rs13209548	G	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=24;PP=767;SC=CCATCTCATGGTTCAACAGAT;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=56470698;WS=56470680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	56471402	rs9382658	G	A	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=37;PP=1544;SC=GCTACCAACTGGTGCCCCCTG;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=56471410;WS=56471392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	56471615	rs45442999	G	A	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=59;PP=2779;SC=ATCAGTGTCTGTTCCTGTGTT;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=127;WE=56471623;WS=56471605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	56474219	rs191948657	T	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=793;SC=TTAGGTTTTTTAAAAAATAAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=56474227;WS=56474209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	56476182	.	T	TAAGTA	40	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=40;QD=64.0513761702;SC=ATTACTATATTAATTGTGATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=56476190;WS=56476172;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	56476262	rs7747060	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=137;SC=CTTTTAAGAATACTTCCCCAC;SOR=1.127;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=56476270;WS=56476252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	56480500	rs150191284	T	C	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=28;PP=1213;SC=TTTGTGGCAATGAGGACATCT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=56480508;WS=56480490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	56481632	rs115542549	T	C	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=54;PP=1996;SC=CTGCCTTCTCTGCCTCAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=56481640;WS=56481622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	56482801	rs6459166	C	G	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=18;PP=1143;SC=GGTGTCAAAACCTTCACCAGT;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=56482809;WS=56482791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	56484758	rs2230862	C	T	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=41;PP=1434;SC=CTGCTTTCTGCTTGTCATGTT;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=56484766;WS=56484748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	56489476	rs41271872	C	G	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=272;SC=GTTACTCTTACTAAGTTGAAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=56489484;WS=56489466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	56491892	rs41271876	A	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=215;SC=AAAAAGTTCAAATGAAGATTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=56491900;WS=56491882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	56493073	rs41271878	C	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=361;SC=AAGCACAAGACGGGTATGTAT;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=56493081;WS=56493063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	56494071	rs112640831	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=11;PP=534;SC=GCACATGAACATTTTGCCACC;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=56494079;WS=56494061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	56496257	rs45553042	G	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=200;SC=TAAACTAGTTGAAAAACACAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=56496265;WS=56496247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	56499189	rs6941626	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=802;SC=CTTGACAAAGTATTGATTGTT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=56499197;WS=56499179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	56499779	rs115872381	G	C	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=298;SC=TGAATTTTAAGAAGTAAAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=56499787;WS=56499769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	56505063	rs2144407	A	G	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=39;PP=1919;SC=ATCAACTTCAAAGTTTGCAAT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=56505071;WS=56505053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	56507135	rs1024195	T	C	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=775;SC=AAACATTATGTAAAAGTTTTA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=56507143;WS=56507125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	56507489	rs1024196	A	G	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=64;PP=2233;SC=ACAATGAACCAAGAGAAGATT;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=103;WE=56507497;WS=56507479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	56510526	rs7760503	G	A	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=109;SC=GAGTTTCTAGGTAAGAAAATG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=56510534;WS=56510516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	56513331	rs58487319	T	C	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=162;SC=GGTTTACAATTGAATCAATCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=56513339;WS=56513321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	56515787	rs41267673	G	A	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=38;PP=1368;SC=GAGATGACACGTAAGTTATTA;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=71;WE=56515795;WS=56515777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	56557344	rs13205013	G	C	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=38;PP=1939;SC=GGGTCTTCAGGAAACCCACTT;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=56557352;WS=56557334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	56557411	rs35637749	G	A	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=53;PP=2510;SC=CTGCCTTTCGGAAAGAAAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=108;WE=56557419;WS=56557401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	56557822	rs34724718	T	C	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=37;PP=1689;SC=CTCCAGTTTTTTTGATCGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=56557830;WS=56557812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	56566621	rs13206849	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.05;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	56566630	rs13191164	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.93;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	56569104	rs16888128	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=6;PP=354;SC=AGAACCTCTAAAAGAGAAATC;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=56569112;WS=56569094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	56818706	rs986245	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=227;SC=AGACCAGGGTTGGGAAAGCAC;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=56818714;WS=56818696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	56873069	rs6925819	T	C	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=37;PP=1278;SC=CGGGTCCTGGTGCTAGGAATC;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=56873077;WS=56873059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	57189265	rs116565677	A	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=54;SC=ATATTGAAAAAAATTCTATCG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=57189273;WS=57189255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	57191021	rs11381745	A	AG	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=156;SC=CTAGAAGAAAAGGACTCCTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=57191029;WS=57191011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	57244672	rs5011404	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-2.164;SC=TCAAATTTTTGTAACAGCTTA;SOR=0.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=10;WE=57244680;WS=57244662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr6	57244780	rs5011403	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=-2.539;SC=GTTGGGGTTCGAGTCCATTTA;SOR=0.748;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=25;WE=57244788;WS=57244770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr6	57244830	rs5011402	T	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=1.017;SC=TAGGTTTTGTTAAATATGTCG;SOR=0.668;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=15;WE=57244838;WS=57244820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr6	57244893	rs5011401	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CCTCTCATCATCACAGCTACT;SOR=0.070;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=57244901;WS=57244883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr6	57246708	rs6913779	G	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=0.695;SC=TAATCATTTTGATATTCTTTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=57246716;WS=57246698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr6	57246773	rs113849959	T	TAGG	1323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr6	57246785	rs62415470	A	C	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.975;NF=26;NR=11;PP=1179;ReadPosRankSum=0.029;SC=GGATTTCTTAATGACAGGTGC;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=37;WE=57246793;WS=57246763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr6	57246815	rs6936571	T	C	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.097;NF=34;NR=18;PP=878;ReadPosRankSum=0.817;SC=TTGCCTGTTTTACTCTTAATT;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=85;TCR=44;TR=52;WE=57246823;WS=57246805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,62:0.41:151
chr6	57246884	rs6913546	A	G	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.917;NF=51;NR=44;PP=1376;ReadPosRankSum=0.970;SC=TATTTGGAAGATGGCTTTGCT;SOR=0.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=95;WE=57246892;WS=57246874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,106:0.45:234
chr6	57246969	rs4256440	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTTTGGCAGTGAGTATTTTAC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=41;WE=57246990;WS=57246959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr6	57246982	rs4585567	G	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.179;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TATTTTACTTGATTTCTGTAT;SOR=0.392;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=33;WE=57246990;WS=57246959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr6	57247022	rs4382263	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=1.155;SC=AGTTATATACCCCTGGTAGTT;SOR=0.350;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=19;WE=57247030;WS=57247012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr6	57254789	rs2397264	A	G	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=662;ReadPosRankSum=1.427;SC=CAGCAAATCCATCAATATGCA;SOR=0.452;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=65;TCR=10;TR=41;WE=57254797;WS=57254779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
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chr6	57254825	rs10456742	T	C	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TATGCAAGCATAACATGCTTT;SOR=0.519;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=146;TCF=106;TCR=40;TR=74;WE=57254833;WS=57254801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,82:0.49:169
chr6	57254927	rs2397266	A	G	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.288;NF=33;NR=54;PP=1413;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AAGCCATGAGACTATTAGGAT;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=73;TCR=119;TR=87;WE=57254935;WS=57254917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,101:0.44:231
chr6	57254950	rs5876554	A	AT	2434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.429;NF=3;NR=42;PP=2844;ReadPosRankSum=-2.605;SC=TGCAAAAGTAATGTGGTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=112;TCF=4;TCR=108;TR=45;WE=57254963;WS=57254940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,68:0.41:166
chr6	57254955	rs2894842	G	A	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=2844;ReadPosRankSum=-2.168;SC=AAGTAATGTGGTTTTTTTCTT;SOR=0.668;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=36;TCR=99;TR=54;WE=57254963;WS=57254940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,62:0.40:156
chr6	57254986	rs2397267	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=521;ReadPosRankSum=1.138;SC=GGCAAAGACTGCAATTACTTT;SOR=1.185;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=15;TCR=71;TR=32;WE=57254994;WS=57254976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr6	57255001	rs2894843	C	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.628;SOR=1.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
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chr6	57255032	rs7769711	C	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=74;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=1.988;SC=AATCATTTTTCGGGGGAAAAT;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=57255040;WS=57255022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr6	57372104	rs2024986	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
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chr6	57372199	rs9382769	T	C	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=45;PP=2514;ReadPosRankSum=0.799;SC=GCCTCCCTATTTGCCCTTCAG;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=116;TCR=57;TR=138;WE=57372207;WS=57372189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,152:0.78:196
chr6	57372361	rs9382770	C	A	5866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,196:0.75:261
chr6	57372361	.	CTAAA	ATAAA,ATAAG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=67,23;NR=114,41;PP=2962,1131;QD=20;SC=CTCAGGTAATCTAAAGGCACA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=86;TCR=143;TR=181,64;WE=57372382;WS=57372351;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.79:229
chr6	57372365	rs9396315	A	G	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,74:0.29:251
chr6	57372374	rs68090917	CT	C	3017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=66;PP=2725;ReadPosRankSum=-0.039;SC=AAGGCACAGCCTTGTTATGCT;SOR=0.917;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=145;TCF=14;TCR=131;TR=70;WE=57372382;WS=57372351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,99:0.46:215
chr6	57372436	rs9382771	G	C	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=5.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,75:0.69:108
chr6	57372436	.	GC	CT	872	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=51;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=35;PP=872;QD=23.7299455093;SC=TGGTGAAACCGCTTCAATTAC;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=39;WE=57372445;WS=57372426;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:53,39:0.42:92
chr6	57372437	rs79221898	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr6	57372456	rs35141035	AT	A,ATT	573.74	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=15.717;HP=11;HapScore=3;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=38,38;PP=398,309;ReadPosRankSum=-2.211;SC=CTAAAAACTTATTTTTTTTTC;SOR=3.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=38,38;WE=57372464;WS=57372446;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.51:55
chr6	57372480	rs79601039	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=232;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CTTTCATTCCATTATTCAAAT;SOR=1.656;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=14;WE=57372488;WS=57372470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr6	57372502	rs9349872	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.324;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr6	57372502	.	GTACCATGTACTT	ATACCATGGACTC,ATACCATGTACTT	169	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=58;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1,1;NR=6,15;PP=169,73;QD=33.2096964089;SC=GAAGTTCTTAGTACCATGTAC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=7,16;WE=57372522;WS=57372492;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.30:23
chr6	57372510	rs77697887	T	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr6	57372514	rs77868044	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr6	57393029	rs77090024	T	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	57393034	rs75127850	G	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	57393040	rs74756458	A	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	57393054	rs75725892	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-1.586;SC=AATTTCCTTCGAAGGGATCAA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=57393062;WS=57393044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr6	57393074	rs73752376	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=5;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=266;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AAAGTATTTTATGAATCTGTT;SOR=0.404;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=19;WE=57393082;WS=57393064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr6	57393192	.	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.536;SC=TTGGTAAGTAGAACATTCTTT;SOR=0.449;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=11;WE=57393207;WS=57393182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr6	57393216	rs2397503	G	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.32;ReadPosRankSum=-1.957;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
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chr6	57398081	rs7753294	T	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.201;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.380;NF=29;NR=2;PP=718;ReadPosRankSum=-1.192;SC=TATTACAGGGTACCTGATAAG;SOR=1.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=31;WE=57398089;WS=57398071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr6	57398117	rs139574925	T	TA	206.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.19;MQRankSum=-0.604;NF=33;NR=13;PP=748;ReadPosRankSum=0.174;SC=AAAACTCTACTGTTTTTTCTT;SOR=1.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=46;WE=57398126;WS=57398107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,18:0.16:112
chr6	57398118	rs147643173	G	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=8.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.598;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.529;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,18:0.16:114
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chr6	57398157	rs9476080	A	G	4637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=4.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.168;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.448;SOR=1.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,115:0.60:192
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chr6	57398201	rs62398997	T	C	6539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.776;NF=84;NR=67;PP=2116;ReadPosRankSum=0.305;SC=TCACCATCTTTGTCATGGAGG;SOR=0.654;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=226;TCF=121;TCR=105;TR=151;WE=57398215;WS=57398191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,160:0.62:259
chr6	57398207	rs71214816	G	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=4.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.161;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,54:0.21:257
chr6	57398226	rs77436138	T	A	4797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.941;NF=47;NR=50;PP=1533;ReadPosRankSum=1.644;SC=ATGCAGTATGTCCTATTTCTG;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=109;TCR=116;TR=97;WE=57398234;WS=57398216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,135:0.59:228
chr6	57398264	rs62398998	A	G	6342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.378;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,183:0.73:251
chr6	57398270	rs62398999	C	T	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=2.366;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.372;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,113:0.48:237
chr6	57398335	rs4715745	A	T	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.303;HP=9;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=61;PP=1491;ReadPosRankSum=-1.488;SC=TGAAAAAAAAAATCAGAGTGG;SOR=0.280;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=25;TCR=87;TR=80;WE=57398343;WS=57398325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,87:0.74:118
chr6	57398412	rs6937166	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.276;SC=GCTCCCTGCAATGTAGTTGAA;SOR=0.069;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=57398420;WS=57398402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr6	57415121	rs7741368	G	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=1;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=1539;ReadPosRankSum=0.485;SC=TGCTGTTGTCGTAAAGACAGA;SOR=0.492;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=31;WE=57415149;WS=57415111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr6	57415133	rs201212509	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=4.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,21:0.22:94
chr6	57415141	rs11346545	TA	T	1632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.37;MQRankSum=2.350;NF=22;NR=11;PP=1543;ReadPosRankSum=1.260;SC=ACTTTTCATTTAAAAAGTATA;SOR=0.657;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=33;WE=57415149;WS=57415111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,48:0.43:112
chr6	57415161	rs493737	T	G	4206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.354;NF=70;NR=42;PP=2708;ReadPosRankSum=-0.330;SC=AATTGCTAAGTAATGTGTTTT;SOR=0.403;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=156;TCF=103;TCR=53;TR=112;WE=57415181;WS=57415151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,121:0.69:175
chr6	57415173	rs496135	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.355;NF=43;NR=31;PP=1406;ReadPosRankSum=0.368;SC=ATGTGTTTTCGTTCTTTCAGG;SOR=0.548;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=169;TCF=104;TCR=65;TR=74;WE=57415181;WS=57415151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,81:0.42:191
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chr6	57415231	rs7761558	T	C	4134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.202;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,109:0.46:239
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chr6	57467107	rs9885751	C	T	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
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chr6	57467317	rs4637646	G	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.817;SOR=1.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,40:0.23:173
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chr6	57472255	rs9296900	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.680;NF=38;NR=4;PP=931;ReadPosRankSum=0.124;SC=ATTAATAAGCCGTTAGACAAT;SOR=1.005;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=57;TCR=8;TR=42;WE=57472263;WS=57472245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr6	57472299	rs9396358	A	G	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=-0.595;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,47:0.27:174
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chr6	57472316	rs9382818	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.585;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,56:0.26:214
chr6	57472344	rs111230027	A	AT	3156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.716;HP=8;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.042;NF=36;NR=40;PP=2169;ReadPosRankSum=-1.018;SC=GTGCTGGCTTATTTTTTGTTG;SOR=1.058;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=159;TCF=63;TCR=96;TR=76;WE=57472352;WS=57472334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,127:0.48:263
chr6	57472476	rs9382819	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.797;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,31:0.19:163
chr6	57472488	rs9382820	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.528;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,28:0.20:139
chr6	57472495	rs62400219	C	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=46;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AGACAGATCTCTCGGTTTTAT;SOR=1.238;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=118;TCF=33;TCR=85;TR=61;WE=57472503;WS=57472466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr6	57472533	rs9367767	T	C	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.19;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr6	57472533	.	TT	CC	1123	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=26;PP=1123;QD=37.9505766085;SC=ATGCTGTGTATTACTTGTCAG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=31;WE=57472542;WS=57472523;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,31:0.47:66
chr6	57472534	rs74369127	T	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr6	57498894	rs3846934	G	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.33;ReadPosRankSum=0.291;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,42:0.82:51
chr6	57498894	.	GC	AC,AT	584	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=34,11;NR=6,0;PP=584,116;QD=15.4692803137;SC=AAGGCCAACAGCTGTGAGCTA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=40,11;WE=57498903;WS=57498884;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.82:49
chr6	57498895	.	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=7.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.207;SOR=2.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr6	57498944	rs3846935	G	C	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.810;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1465;ReadPosRankSum=0.135;SC=ATTTTTATTTGTCTTTTTCCT;SOR=0.242;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=82;WE=57498952;WS=57498934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,86:0.85:101
chr6	57499042	rs5876654	A	AT	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.970;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr6	57499171	rs3846936	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.988;SC=ATTAAGTAACTTACAGCATTT;SOR=0.211;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=57499179;WS=57499161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	57499188	rs2151627	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=229;ReadPosRankSum=1.636;SC=ATTTATTGAACGACCAGACAA;SOR=0.141;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=57499204;WS=57499178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr6	57499196	rs11423601	C	CA	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=200;ReadPosRankSum=1.001;SC=AACGACCAGACAACTAAGCTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=57499204;WS=57499178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr6	57512340	rs4364484	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	57512352	rs5001077	A	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.728;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr6	57512439	rs4294006	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,22:0.24:90
chr6	57512476	rs4307164	G	A	3208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=17;PP=2265;ReadPosRankSum=1.613;SC=TTACAGGTGGGTGATTGTGGC;SOR=0.953;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=166;TCF=136;TCR=30;TR=108;WE=57512484;WS=57512466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,124:0.67:185
chr6	57512510	rs4294007	T	G	10838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=85;PP=2965;SC=ATCCTAATCATTTCTTTTGTG;SOR=1.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=185;TCR=85;TR=270;WE=57512518;WS=57512500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr6	57512529	rs5001076	C	A	3670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=48;PP=2519;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TGAGAGCCAACGTATTCTAAA;SOR=0.917;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=335;TCF=213;TCR=122;TR=144;WE=57512537;WS=57512519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,167:0.44:381
chr6	57512565	rs4294008	T	C	9979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=597;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=217;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.521;SC=AAAGAAGGAATCTATCCAACC;SOR=0.854;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=495;TCF=303;TCR=192;TR=346;WE=57512573;WS=57512555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,420:0.72:587
chr6	57512678	rs4398719	G	A	8012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=190;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.368;SC=AAGGACTAGAGGATTACTTTA;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=398;TCF=129;TCR=269;TR=282;WE=57512686;WS=57512668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,328:0.73:450
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chr6	57512788	.	T	TTA	1090.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.726;QD=32.08;ReadPosRankSum=-2.142;SOR=2.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
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chr6	62390916	rs1204114	T	C	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=25;PP=886;SC=TGGCTGACCTTTGCGGTGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=62390924;WS=62390906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	62523887	rs35068148	T	TA	3032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1579;SC=TCCATGCCAGTAAAAAAAGCT;SOR=0.979;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=47;WE=62523895;WS=62523877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	62526443	rs1005815	C	T	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=105;SC=AAAAGGAGCACGACCCTGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=62526451;WS=62526433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	62757987	rs9346001	C	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=274;SC=TATAGGTTTTCCAAACTTTAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=62757995;WS=62757977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	62887031	rs9346218	C	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=190;SC=AATTAAAATACCGTCTTCTTT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=62887039;WS=62887021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	62887099	rs6921170	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=8;PP=253;SC=CCTTTGGATACTGCTTGACAG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=62887107;WS=62887089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	63921360	rs10943599	CA	AG	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=240;SC=TATGGGCAGGCAACGCGCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=63921369;WS=63921357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	64003459	rs9343928	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=103;SC=TCTGACTCCCGGGCTAGTATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=64003467;WS=64003449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	65016977	rs35395170	TGA	T	563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=7;PP=457;SC=TACAGGCATCTGAGAGAGAGA;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=10;WE=65016986;WS=65016967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	65098768	rs587278	A	G	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1186;SC=GTTTTAGTATAAGTCATATAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=65098776;WS=65098758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	65301504	rs624851	A	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=38;PP=1887;SC=GGTAGCAGATAAAGCAACAGT;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=65301512;WS=65301494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	65302915	rs11331907	GA	G	74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=64;SC=ATGTATCTCAGAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=65302923;WS=65302907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	65525121	rs1390272	C	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=819;SC=TTGCTGAAAACGTGAACTTGT;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=65525129;WS=65525111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	65596759	rs7743515	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=656;SC=GAGAAATGAGGAATAGCCATG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=65596767;WS=65596749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	65767633	rs142590049	G	GA	1170.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=22;PP=422;SC=TTGGAAAATAGGAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=22;WE=65767642;WS=65767623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	65767634	rs45628235	G	A	1321.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=24;PP=662;SC=TGGAAAATAGGAAAAAAAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=36;WE=65767642;WS=65767623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	66005740	rs35045551	G	GA	1458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=23;NR=18;PP=849;SC=AATTTATCAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.436;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=41;WE=66005748;WS=66005730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	66005888	rs9342464	C	T	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=39;PP=1462;SC=CTTTGCAGACCGCTACAGTTA;SOR=1.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=67;WE=66005896;WS=66005878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	66005970	rs9345601	G	A	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=28;PP=896;SC=AGTCAACATTGACAACACACA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=66005978;WS=66005960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	66044927	rs61753610	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=8;PP=462;SC=CTCATTTTCTTGATCATCAGT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=66044935;WS=66044917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	66045077	rs1502965	C	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=636;SC=TATGAATTCCCATCACTTACT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=66045085;WS=66045067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	66045118	rs1502964	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=179;SC=TGAGAGATCATGATAGATGCC;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=66045126;WS=66045108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	66063513	rs1936439	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=882;SC=CATACATACTGCAAAAAGGAA;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=66063521;WS=66063503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	68599166	rs9342670	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	68599169	rs9342671	A	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	69666183	.	T	TTA	115	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=64.48;NF=1;NR=3;PP=115;QD=33.25;SC=AAGATAATCATTATATATATA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=69666191;WS=69666173;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr6	69666195	rs28734080	G	A	82.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.12;MQRankSum=1.282;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
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chr6	69666684	rs1932618	A	G	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=21;PP=725;SC=AGAAGATGCAATGAGCAGCGA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=69666692;WS=69666674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr6	69724069	rs1336655	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=516;SC=CTAAATTAATGGCTTGCTATT;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=69724077;WS=69724059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	69728522	rs2785573	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	69759148	rs618372	A	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=388;SC=ATACTTCAAAATTTATTCTTT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=69759156;WS=69759138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	69772809	rs13207626	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=995;SC=CTTTTAATTATAATTACTCTG;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=69772817;WS=69772799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	69942506	rs701655	G	A	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=848;SC=AGTGAAGTGTGGAGTAGGAAG;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=69942514;WS=69942496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	69943418	rs3215840	A	AG	2107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1803;SC=GTTGCAGGGTACAAAATTGGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=40;WE=69943426;WS=69943408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	69944886	rs779461	A	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=17;PP=1428;SC=ATTTATTAAAAACCAATTTGT;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=69944894;WS=69944876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	70042994	rs113046536	AATTTTGTTATTG	A	3626.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=38;PP=2937;SC=CTCTGCCTTGAATTTTGTTAT;SOR=1.220;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=70043017;WS=70042984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	70043009	rs74971437	G	C	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=38;PP=1187;SC=TGTTATTGATGTACTAGTGTG;SOR=1.220;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=59;WE=70043017;WS=70042984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	70386320	rs3214021	C	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=29;PP=1280;SC=GGTCAAATCACGCGTGGGATA;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=70386328;WS=70386310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	70407465	rs12648	A	T	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=12;PP=577;SC=CTTCAGGAGCATCTGCATCAC;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=70407473;WS=70407455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	70411157	rs2445969	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	70423739	rs2305837	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=253;SC=ATCTTAATAAAGTACCCAGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=70423747;WS=70423729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	70447993	rs45559535	G	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=253;SC=AAGCTGAGCTGCTTACACATT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=70448001;WS=70447983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	70448033	rs12661224	C	T	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=104;SC=TATGTATTACCGTATTCTTGA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=70448041;WS=70448023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	70448098	rs62408997	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	70490511	rs9346353	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	70490528	rs9346354	A	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	70500451	rs2305838	C	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=834;SC=TAGCAGGAAACCTTATGTGAA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=70500471;WS=70500441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	70500463	rs2305839	T	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=791;SC=TTATGTGAAGTAAAGGTTATT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=70500471;WS=70500441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	70744264	rs7764390	G	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=40;PP=1218;SC=ACTTCTCATTGATACTGTTTA;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=70744272;WS=70744254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	70778297	rs7349861	G	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=11;PP=564;SC=ATTAACATGTGTCTCTTTTTC;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=70778305;WS=70778287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	70778378	rs2224513	GC	CT	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=19;PP=1491;SC=GGTAAGTAAAGCTGGAACAAC;SOR=0.884;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=40;WE=70778387;WS=70778368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	70812123	rs7772672	A	G	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=30;PP=1369;SC=CTGTGAGTAAACAATACAATG;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=70812131;WS=70812113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	70875976	rs802174	T	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=385;SC=AAAGATAAAATTCTTCTGAAT;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=70875984;WS=70875966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	70876046	rs802175	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=TTTGTTCTCCTTTTGGTTCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=70876054;WS=70876036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	70878156	rs62421668	A	G	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=151;SC=AACAACCACAATGAAAAACAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=70878164;WS=70878146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	70894894	rs2296006	C	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=300;SC=GTGTGTAGACCCCTGCAAATC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=70894902;WS=70894884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	70897967	rs3828775	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=272;SC=GTGCTAAGACGCTTTAGGGCT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=70897975;WS=70897957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	70909252	rs5877242	AT	A	113.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=1;PP=135;SC=GTATTTTGAAATTTTTTGACA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=70909260;WS=70909242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	70944465	rs12191701	A	G	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=13;PP=535;SC=GGAGTCTCCAAAGGGAAACCA;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=70944473;WS=70944455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	70948841	rs34540808	CA	C	151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.75;NF=4;NR=0;PP=77;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=70948849;WS=70948831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	70949019	rs9446213	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=8;PP=499;SC=TTATGTTAGAACAATGTATTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=70949027;WS=70949009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	70950355	rs6914511	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=1;PP=287;SC=TCAAAATTGGTAAAGCTTCAT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=70950363;WS=70950345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	70950596	rs11286026	GT	G	870.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=558;SC=GCTGTCAGTGGTTAGTCCCAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=70950606;WS=70950586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	70950598	.	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.32;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=388;SC=TGTCAGTGGTTAGTCCCAATC;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=15;WE=70950606;WS=70950586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	70950945	rs73749919	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=328;SC=CTTGTTAAAATAGTAAACAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=70950953;WS=70950941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	70951240	rs9455013	A	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=550;SC=GTGGGTGGATAAGCACAAGTA;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=70951248;WS=70951230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	70962044	rs519068	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=29;PP=802;SC=AACATCCAAAATAACTCATGC;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=70962052;WS=70962034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	70965125	rs633762	A	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=502;SC=TTAATACAAGAAAAAGTTACT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=70965133;WS=70965115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	70970251	.	CA	C	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=20;MQ=48.56;NF=2;NR=0;PP=22;QD=12.5;SC=AACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=70970259;WS=70970241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr6	70970299	rs2024730	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=8;PP=451;SC=TATGTTTAAACGGCCAAAATT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=70970307;WS=70970289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	70979125	rs551470	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=83;SC=AAAGATCATAAAAGAACAAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=70979133;WS=70979115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	70979193	rs550675	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=355;SC=AGTCCACTAGCGTTACAGACT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=70979201;WS=70979183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	70981827	rs77357454	G	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=394;SC=ATAGCTTGAGGTTTATACTTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=70981835;WS=70981817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	70984436	rs592121	A	G	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=972;SC=TGTCCCTTTGACCCAATGGAG;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=70984444;WS=70984426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	70984562	rs603304	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=407;SC=ATTTATTAATTGTCTACAGGA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=70984570;WS=70984552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	70989703	rs3806099	A	G	4321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=70;PP=2608;SC=CAGGGACAAAATCAAGGACTG;SOR=0.868;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=131;WE=70989711;WS=70989693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr6	70991080	rs117215769	G	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=689;SC=GTGGCCTGGAGATAGAAACTT;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=70991088;WS=70991070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	71009951	.	T	TA	1315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.904;HP=14;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.459;NF=5;NR=30;PP=644;ReadPosRankSum=1.635;SC=CTTTCCCAAATAAAAAAAAAA;SOR=0.199;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=35;WE=71009959;WS=71009941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr6	71011831	rs2242589	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=578;SC=AGATGGAAAACACTTCCATAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=71011839;WS=71011821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	71011911	.	T	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	71012575	rs2242588	T	C	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=20;PP=794;SC=GACCCCCAGCTCCATCTCCCC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=42;WE=71012583;WS=71012565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	71569090	rs576516	T	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=17;PP=463;SC=TACTGGCCAATGACAAGGTGG;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=71569098;WS=71569080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	71666146	rs1320315	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=28;PP=685;SC=GCACGCTCCCTGGCCTCTCGG;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=71666154;WS=71666136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	72091267	.	T	TTA	66	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=26;MQ=57.88;NF=0;NR=2;PP=66;QD=38.0;SC=TCTGATGAATTTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=72091275;WS=72091257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr6	72836421	rs2463696	A	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.17;QD=24.91;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	72889711	rs17725666	G	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=328;SC=CGAGGAATATGTGGAAGTAGT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=72889719;WS=72889701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	72892257	rs2463730	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=310;SC=ACCCGAACCTAGCTCGGTACC;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=72892265;WS=72892247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	72892383	rs114505309	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=16;PP=882;SC=CGGGCGCGGCGCTGCCGGAGG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=72892391;WS=72892373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	72945492	rs2807519	C	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=40;PP=1106;SC=CTGCATTCATCGGAGTTTCTG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=72945500;WS=72945482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	72945603	rs138366781	A	ATTTTC	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	72947774	rs2807525	C	T	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=104;SC=TTTTAATGCACGAATAAAGAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=72947782;WS=72947764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	72962352	rs9351902	A	G	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=65;SC=ATTAGTCTTCATAAGTTTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=72962360;WS=72962342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	72968609	rs6923891	C	T	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=452;SC=ATATTACTCTCAGTTCCTTCA;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=72968617;WS=72968599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	72984277	rs4504440	G	A	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=83;SC=AGCCAACTCTGGTAAAGCACC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=72984285;WS=72984267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	73332040	rs3734212	C	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=9;PP=377;SC=ATGTGGAGTCCGGCCGGGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=73332048;WS=73332030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	73332121	rs34821312	C	T	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=15;PP=711;SC=CGGCCACGCTCGGTGGCGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=73332129;WS=73332111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	73516397	rs9446758	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=372;SC=TTGGCCCAATATTCCTATTAT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=73516405;WS=73516387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	73821239	rs2000205	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=32;PP=1010;SC=TGTTCCTTTTTATAAAATGAA;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=73821247;WS=73821229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	73830423	rs1891404	A	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=10;PP=380;SC=GTTGCTCCTAAAGAGATTCAA;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=73830431;WS=73830413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	74072681	rs9446890	G	C	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=964;SC=CATACCCACAGCCCACATATT;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=74072689;WS=74072671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	74079041	rs497243	A	C	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=52;PP=2055;SC=TCCCTGAGTCAACTATGTCCA;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=74079049;WS=74079031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	74104495	rs3832419	C	CG	125.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5952;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.366;SC=AGAGCGTGGGCGGGGGGGCTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=74104503;WS=74104488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr6	74110212	rs3757106	T	G	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=133;SC=GTCTTAATGATTTTTTACTAT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=74110220;WS=74110202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	74114365	rs5877364	AT	A	1735.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=14;PP=1393;SC=CTAAGTATTCATGATGCTGTA;SOR=1.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=31;WE=74114373;WS=74114355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	74119084	rs4708053	T	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=352;SC=ACGTATATGCTTAATTACTGT;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=74119092;WS=74119074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	74123363	rs9442907	G	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=18;PP=1293;SC=GATGAACTATGTTCTTTGAAT;SOR=1.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=74123371;WS=74123353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	74135016	rs311678	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=468;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TCAGAAATTCCTTACTTCTTT;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=74135024;WS=74135006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr6	74155491	rs2985419	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=85;SC=GTAAAAATAGTACTGAAATAT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=74155499;WS=74155481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	74189574	rs7766570	G	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=26;PP=1155;SC=CTCGGTAAGGGCAAAATGTCA;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=74189582;WS=74189564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	74320391	rs1691343	T	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=263;SC=CTATATTGCCTGGAAGACTAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=74320399;WS=74320381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	74325257	rs628038	T	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=249;SC=GACCACCACTTGAAAGCAAAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=74325265;WS=74325247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	74331736	rs611580	G	C	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=43;PP=1397;SC=TTAATGCTTAGATCTGTACCG;SOR=1.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=74331744;WS=74331726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	74342104	rs16883979	C	G	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=141;SC=CGAAGTGTGTCGAGAAACAAC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=74342112;WS=74342094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	74345026	rs558839	A	C	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=114;SC=ATAGGAATATATATTTTTAAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=74345034;WS=74345016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	74345053	rs520589	C	T	270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=195;SC=TATCTTAATTCTGAAGAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=74345061;WS=74345043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	74354175	rs472294	C	T	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=12;PP=907;SC=GCTCTGGACACGCCTTGGAAG;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=74354183;WS=74354165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	74432923	rs56093139	C	T	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=15;PP=555;SC=TGTATTCTATCATCATATTCA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=74432931;WS=74432913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	74497102	rs35466124	G	A	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=35;PP=1498;SC=ACACATCTGGGAGAAATTCCT;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=74497110;WS=74497092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	74521947	rs2917862	C	T	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=48;PP=1478;SC=GTACAGCCAACGGCAGTTAAT;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=74521955;WS=74521937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	74528293	rs3005506	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=420;SC=TGTTGACAAAACCACTGTGTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=74528301;WS=74528283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	74530421	rs3005537	A	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=26;PP=837;SC=GGAGGCGGGGAGGCAGGAAGT;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=45;WE=74530429;WS=74530411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	74533192	rs2917887	T	G	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=21;PP=844;SC=GGAGACAGGCTGTGAGAAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=74533200;WS=74533182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	75795122	rs112607771	G	GCA,GCACA	613.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=3,3;NR=8,8;PP=373,101;SC=GATTTGGAAGGCACACACACA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11,11;WE=75795130;WS=75795112;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.31,0.69:16
chr6	75797302	rs970547	C	T	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=6;PP=436;SC=CCTGGATAGCCTTGCCCGTTG;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=75797310;WS=75797292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	75798722	rs672648	C	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.40;QD=26.61;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	75811880	rs556674	G	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=893;SC=CAGTGTAAGCGTTCAGAATGA;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=75811888;WS=75811870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	75827028	rs17186509	T	C	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=189;SC=ACAAAGGATATAGAATTGTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=75827036;WS=75827018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	75830974	rs499018	G	C	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=24;PP=1611;SC=CAAAGGAAAGGCAAGACATCA;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=75;WE=75830982;WS=75830964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	75833876	rs240722	C	A	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=1026;SC=AATTTTATATCGCATTGTTAT;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=75833884;WS=75833866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	75841722	rs594012	A	T	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=31;PP=1234;SC=CAGGTCCTGGAGCAGGGTCCC;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=75841730;WS=75841712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	75843845	rs1332778	T	C	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=142;SC=AAGTAGTGAATAAACGACACA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=75843853;WS=75843835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	75890933	.	T	TA	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9955;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=60.55;NF=0;NR=4;PP=47;QD=13.0;SC=GTAAGCTATTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=75890941;WS=75890923;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr6	75893457	rs36085827	TA	T	506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=349;SC=CGTGCTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=19;WE=75893465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	75901292	rs743003	C	T	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=144;SC=GTGCTCCTTCCAGATAAAGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=75901300;WS=75901282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	75904455	rs240433	A	T	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=14;PP=902;SC=TTCCTAAAGCACAGCTTCTTC;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=75904463;WS=75904445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	75950109	.	T	TA	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.7700;HP=16;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=58.53;NF=0;NR=3;PP=27;QD=10.0;SC=CTCCTAGATTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=3;WE=75950117;WS=75950099;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr6	75951719	rs240419	A	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=6;PP=173;SC=GAGTTCGAGAACAGCCTGAAC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=75951727;WS=75951709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	75966269	rs418485	A	G	182.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=167;SC=GTAGTTTCTCAGGTGCTTTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=75966277;WS=75966259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	75968720	rs147523	G	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=291;SC=GGAGTGGGGAGGGGATAAGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=75968728;WS=75968710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	75977311	rs2842448	T	A	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=681;SC=AGTATCAGTATTTTTTAAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=75977319;WS=75977301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	75977591	rs240395	T	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=49;SC=ACAAAAACTGTTTTTAAGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=75977599;WS=75977581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	76333486	rs655471	G	A	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=160;SC=TGCAAAGACTGTGGTTTGGCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=76333494;WS=76333476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	76369054	rs507662	A	G	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=47;PP=1788;SC=AACAGAAACGACACTGTAGTA;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=90;WE=76369062;WS=76369044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	76385511	rs2842535	A	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=25;PP=1110;SC=TTTCCTCACAATTTCCCCCAT;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=76385519;WS=76385501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	76538403	rs1280052	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=493;SC=ATTTTGTCACGCTTGAAATTG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=76538411;WS=76538393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	76554593	rs7760587	G	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=10;PP=522;SC=TGTTAATTATGTTTAATTTGT;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=76554601;WS=76554583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	76566734	rs3798439	T	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=652;SC=CTTCTCTGTGTGTATGTTTAG;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=76566742;WS=76566724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	76576527	rs6453845	G	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=272;SC=TAGTGGTGACGGCGTTGGACA;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=76576535;WS=76576517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	76583113	rs9443195	T	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=494;SC=ATTATCTTGATTATTTTACAG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=76583121;WS=76583103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	76596587	rs55662069	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=772;SC=AAGGTGGGCACACTGAAAAAA;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=76596595;WS=76596577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	76640803	rs10943299	G	A	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=39;NR=40;PP=1323;SC=TCCTCAGTCCGTTCGTTCTTT;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=79;WE=76640811;WS=76640793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	76782049	rs1320537	C	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=329;SC=CCCGTGAGATCAATTGGTAGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=76782057;WS=76782039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	78171941	rs6297	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=17;PP=885;SC=CCACTGCAAACGGCAAGTCAA;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=78171949;WS=78171931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	79424433	rs9352613	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=16;NR=16;PP=497;SC=CAGGAGATTCATGAAAACTTA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=79424441;WS=79424423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	79577644	rs9350789	A	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=31;PP=787;SC=AAGAGCCGGAAGACACAAAAG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=79577652;WS=79577634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	79595167	rs146020132	A	ACTTAT	2236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=1803;SC=AGAGGTATGTACTTAACAAAT;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=27;WE=79595175;WS=79595157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	79612800	rs9352675	G	A	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=62;PP=2235;SC=CACATCAAATGAACAAATACT;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=109;WE=79612808;WS=79612790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	79657391	rs1984195	G	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=11;NR=8;PP=392;SC=AAATAAGTCTGACATCTTTAC;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=79657399;WS=79657381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	79664440	rs9443632	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=276;SC=AAATAAACTATAATCATAAAA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=79664448;WS=79664430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	79664748	rs10455356	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=232;SC=ACTTTTAATGTAGTCTTAGAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=79664756;WS=79664738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	79679577	rs7742431	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=19;PP=700;SC=TGTATTTTGCATCATCAAATT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=79679585;WS=79679567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	79695029	rs1890229	C	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=8;PP=638;SC=TTTCTAAAGACTTTATATAAC;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=79695037;WS=79695019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	79707923	rs11752126	C	T	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=428;SC=GAGATTTAGGCTGTTTCAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=79707931;WS=79707913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	79708000	rs7747479	A	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=25;PP=1282;SC=ATTACTGATAACTGCTTCACC;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=79708008;WS=79707990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	79752792	rs9343863	T	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=400;SC=TTTTAAGAATTCACATACTCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=79752800;WS=79752782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	79918309	rs9341761	G	A	4396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=94;PP=2965;SC=AAGGGAATGGGAAAATATACA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=42;TCR=94;TR=136;WE=79918317;WS=79918285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr6	79944096	rs3076135	C	CAG	1835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=1532;SC=GTAGGGGGGACAGAGAGAGGA;SOR=4.271;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=33;WE=79944104;WS=79944086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	79944355	rs9361504	T	G	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=100;PP=2965;SC=TGCCTCTGCCTCTGCAGCTGC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=61;TCR=100;TR=161;WE=79944363;WS=79944345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr6	80228541	rs2655655	A	G	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=70;PP=2269;SC=AAAATCAGATAAGTAAGAATA;SOR=1.379;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=107;WE=80228549;WS=80228531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	80228673	rs2803195	T	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=180;SC=GAGGAGACTATGACAATACTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=80228681;WS=80228663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	80341320	rs6926093	CG	GC	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=541;SC=TGCGCTCAGCCGGTCCGCCCG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=80341329;WS=80341310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	80382916	rs1883878	G	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=412;SC=GAGAACTAAGGCACTCTGTCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=80382924;WS=80382906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	80513565	rs149560703	G	GCTCTCTGATATGCCATC	860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=2902;SC=TCCATCCTGAGCTGCAGGGCA;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=8;WE=80513573;WS=80513555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	80513740	rs45512496	C	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=137;SC=TTATAAAGATCTGGGATTCAA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=80513748;WS=80513730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	80517147	rs6915687	C	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=623;SC=TTTCTAACAACAAAGTATAAG;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=80517155;WS=80517137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	80517204	rs6915721	C	T	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=305;SC=TATTTAAAAACGATATATGGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=80517212;WS=80517194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	80580038	rs9361569	T	G	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=36;PP=1635;SC=CTTATGCTCATCAACGACTGT;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=80580046;WS=80580028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	80580120	rs10943668	G	A	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=41;PP=1279;SC=TGCGCCAGCCGATGAGGGATT;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=80580128;WS=80580110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	80631539	rs700483	T	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=16;PP=449;SC=GCGTGTTATATACACCAAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=80631547;WS=80631529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	80715838	rs240226	T	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=29;PP=1272;SC=GGCTACATGATGGCAGGGTTT;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=65;WE=80715846;WS=80715828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	80720487	.	GCAT	G,GTACAT	547.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=196;SC=TGGGTGGTGGGCATTTTACTG;SOR=3.442;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=80720499;WS=80720477;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr6	80720491	rs199573945	T	TAAAGA	547.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.79;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	80720733	rs151587	G	A	282.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.40;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	80720742	rs239556	A	T	282.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.40;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	80721045	rs239558	A	G	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	80723198	rs239563	T	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=161;SC=TCTCCAACAGTGTTCCACATA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=80723206;WS=80723188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	80724156	rs2295840	T	C	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=175;SC=TATGGGACTTTATTTGATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=80724164;WS=80724146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	80724312	rs239566	A	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=12;PP=444;SC=AGGTAAGAGTAACAAAATCAG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=80724320;WS=80724302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	80724462	rs239567	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	80741328	rs239584	G	A	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=133;SC=TAAACTTTCTGTTTTTTTGTC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=80741336;WS=80741318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	80750093	rs2295841	C	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=114;SC=AATTGGCTACCCTTTGTCAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=80750101;WS=80750083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	80750290	rs608962	C	T	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=359;SC=ATTTTTCTTACTGGTACTAGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=80750298;WS=80750280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	80751780	rs652752	G	A	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=214;SC=ATCTACTGATGTGACAGTACA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=80751788;WS=80751770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	80774236	rs7771228	C	T	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=41;SC=TGGCTATTTCCCGTGTGCTTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=80774244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	80837239	rs9448893	A	G	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=11;PP=1172;SC=AACACACGAAATGATTTTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=80837261;WS=80837229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	80837253	rs9448894	G	T	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=712;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TTTTTTTTTTGATTTTCACAG;SOR=0.410;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=55;WE=80837261;WS=80837229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,48:0.94:51
chr6	80878508	rs139630496	A	AAGGAAGGGAGGGAGGGAGGG	453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=56.72;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	80912746	rs3828753	C	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=741;SC=CTAATAGTGACATCAGCATTC;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=80912754;WS=80912736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	81053642	rs926733	G	A	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=34;PP=997;SC=GGTAAAGTTGGTAAAAGGCAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=81053650;WS=81053632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	82461727	.	ACCGCCGAAGTCGCCG	A	798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=8;PP=2011;SC=AGCTGCCGCCACCGCCGAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=11;WE=82461749;WS=82461717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	82883238	rs197245	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=232;SC=AGAGGAAGAATTGTAAACTCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=82883246;WS=82883228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	83075914	rs700494	G	A	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=29;PP=1135;SC=CCAGATTAACGAACCTCAGTT;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=83075922;WS=83075904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	83666936	rs293531	T	C	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	83666943	rs293532	G	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	83733785	rs4235816	C	T	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=12;PP=399;SC=AATTAAGACTCTCCCCAATAC;SOR=0.906;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=83733793;WS=83733775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	83752057	rs4612135	C	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=25;PP=800;SC=AATAACAAAGCCTCCAATAAA;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=83752065;WS=83752047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	83754094	rs4455637	T	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=294;SC=ATTGAAGAAGTCAGTATCTAA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=83754102;WS=83754084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	83754481	rs2027282	T	C	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=202;SC=AACCACAAGGTTTGCAATGCT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=83754489;WS=83754471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	83775201	rs6915334	C	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=7;PP=612;SC=AGTGGCGGAGCCGACTACAGG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=83775209;WS=83775191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	83822985	rs1925782	G	A	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=18;PP=1469;SC=TCACATTTTCGTGGCAAAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=67;WE=83822993;WS=83822975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	83828724	rs2148010	G	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=39;PP=1296;SC=TTTGATGTCTGTGGTCATGAT;SOR=0.881;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=83828732;WS=83828714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	83949261	rs1180230	T	C	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=30;PP=1500;SC=CAAATACCTCTCCAGCTCCTT;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=83949269;WS=83949251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	84055783	rs12215595	A	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=585;SC=GAGAAAGAGAACCAGACAAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=84055791;WS=84055779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	84108065	rs4706990	A	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=768;SC=CAAGTTGCATATAAAATAAAA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=84108073;WS=84108055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	84140772	rs28372716	TGGC	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=3;PP=170;SC=ACTGCAGCTGTGGCGGCGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4;WE=84140782;WS=84140762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	84894942	rs41271605	C	T	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=12;PP=1025;SC=AAATCGATCTCAAGTTTTTGC;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=47;WE=84894950;WS=84894932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	85473758	rs172562	C	T	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=53;PP=1815;SC=TCCACGGCCCCCGCCGCCTCT;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=85473773;WS=85473748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	86180926	rs10944129	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=473;SC=TTGTTAATAAATATCCATTTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=86180934;WS=86180916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	86199233	rs2229523	A	G	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=87;PP=2921;SC=CCTGAGACACACGGATGAAAT;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=86199241;WS=86199223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr6	86199329	rs9450284	G	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=30;PP=741;SC=TATGCTCCCAGGCCCAGCTCC;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=86199337;WS=86199319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	86224053	rs6454472	T	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=353;SC=CAATATTTTATTTGTAAACAC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=86224061;WS=86224043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	86240147	rs4640862	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=138;SC=TGGATCATTTGAGGTCAGGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=86240155;WS=86240137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	86246709	rs12193777	C	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=358;SC=TTATTGAAAACCATTATTAAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=86246724;WS=86246699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	86246716	rs59514276	T	TA	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=360;SC=AAACCATTATTAAAAAAAAGA;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=86246724;WS=86246699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	86248460	rs9294337	T	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=3;PP=202;SC=AATACCACAGTGTTCCATTTT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=86248468;WS=86248450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	87925826	.	GACACAC	G	530	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.9997;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=58.7;NF=0;NR=4;PP=530;QD=133.25;SC=AAAATACATAGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=4;WE=87925839;WS=87925816;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,4:0.18:22
chr6	88108048	rs67076383	AGAT	A	5734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=60;PP=2957;SC=GACAGAGAGAAGATGAGTGTT;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=14;TCR=60;TR=74;WE=88108058;WS=88108038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	88109304	rs1051550	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=9;PP=262;SC=GCTTGGGGGTGGGTTGGGGAT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=88109312;WS=88109294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	88366708	rs2307373	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=414;SC=AAGGTCAGGTCACTCTCTTCC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=88366716;WS=88366698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	88853635	rs1049353	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=23;PP=955;SC=CAATCTTGACCGTGCTCTTGA;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=88853643;WS=88853625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	89388023	rs11753513	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=13;PP=638;SC=TGATGGATTCTAGATAAGAGA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=89388031;WS=89388013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	89601490	rs9353633	C	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=245;SC=AAAATAAGAGCAAATTTTATT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=89601498;WS=89601480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	89650922	rs9451108	C	A	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=628;SC=GATAGGTAATCATTTCCATAA;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=89650930;WS=89650912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	89790559	rs66688820	CTTCA	C	2471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.03;NF=12;NR=20;PP=1766;SC=TCTTCACTGGCTTCATTCACC;SOR=1.302;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=32;WE=89790570;WS=89790549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	89790728	rs2231267	C	T	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=38;PP=1328;SC=GACCACGGCTCCGCCTCCTTT;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=89790736;WS=89790718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	89814711	rs9362618	T	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=25;SC=GGAGGTCAAGTCTACAGTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=89814719;WS=89814710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	89814830	rs7753709	A	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=10;PP=871;SC=CAGTCCTCTTATACTCACTCT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=89814838;WS=89814820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	89864679	rs4053639	A	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=25;PP=880;SC=GTGGGCTAGCACTGTTAGATT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=89864687;WS=89864669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	89864781	rs77520877	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=244;SC=AATTTTTACACGTTTCATTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=89864789;WS=89864771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	89868317	rs144858754	AG	A	200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=0;NR=7;PP=230;SC=CTTTATGGTTAGGGGAAAGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=89868325;WS=89868307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	89871759	rs2297309	G	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=15;PP=1057;SC=TGAGATACGGGTAGCTAACCT;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=89871767;WS=89871749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	89888744	rs1796743	C	T	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=689;SC=CGTCCAGCATCGCAGTGCGGG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=89888752;WS=89888734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	89894968	rs407206	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=13;NR=2;PP=339;SC=TATAATAGAGGGTGAACCTTG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=89894976;WS=89894958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	89895202	rs406462	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.70;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	89895207	rs364936	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.09;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	89907873	rs422751	G	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=29;PP=1031;SC=CCAGCCGGCCGTCAAACGTCA;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=89907881;WS=89907863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	89913218	rs4445034	T	A	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=44;PP=1724;SC=CCATGAACATTAAAAATAAAG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=89913226;WS=89913208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	89914477	rs1556432	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=308;SC=AATATTATTAGATAACTTTTT;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=89914485;WS=89914467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	89927094	rs111576870	G	A	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=619;SC=GGAAAAGATTGTTCTTTTTCT;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=89927102;WS=89927084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	89974063	rs723041	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=18;PP=636;SC=CTCTGCCCCCTGGCCCAGAAG;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=89974071;WS=89974053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	89977322	rs58233945	C	CT	1975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=18;PP=1581;SC=ACATATTTTCCTGGGGTTAAG;SOR=1.262;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=33;WE=89977330;WS=89977312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	89977906	rs4707535	T	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=CACAACTGAGTAGCTGCCTCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=89977914;WS=89977896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	89981413	rs282117	T	C	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=24;PP=1403;SC=TCTCCACCTGTACGTCCACGC;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=89981421;WS=89981403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	90039479	.	G	A	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=29;PP=1243;SC=AAGTCAGGATGACAATCAGTA;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=90039487;WS=90039469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	90090076	.	A	C	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=532;SC=CAGGGCTTCCATGTAATCATC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=90090084;WS=90090066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	90315789	rs3748085	A	G	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=27;PP=809;SC=CAAGCTGCTCATTAAAGCAGG;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=90315797;WS=90315779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	90326360	rs2273238	C	T	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=37;PP=1576;SC=GGAGCAGATACGACCATTGTT;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=82;WE=90326368;WS=90326350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	90327873	rs6909915	G	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=35;PP=1066;SC=ACCAGGCAGTGGAGGTATAGG;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=90327881;WS=90327863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	90333599	rs17292811	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=5;PP=255;SC=AGGTGTCAGCATTTTCTGACC;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=90333607;WS=90333589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	90334101	rs4487551	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=269;SC=ACACCCAAAATTTGGCCTATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=90334109;WS=90334091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	90340276	rs3210511	G	A	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=51;PP=2281;SC=AGGAGCTGTCGTCTTCTGACT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=111;WE=90340284;WS=90340266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	90360757	rs9359858	A	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=295;SC=CTTCCAGCTGAGGGTGGTGGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=90360765;WS=90360747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	90361811	rs761729	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=530;SC=GGTCCTTTTTGTTAAGGTAAT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=90361819;WS=90361801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	90362783	rs4707557	A	C	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=38;PP=1487;SC=CTGGTTTCTCATTTTCTGTCT;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=90362791;WS=90362773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	90366307	rs2273242	A	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=109;SC=ATGCAACAACAACAAAAAAAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=90366315;WS=90366297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	90371202	rs9444701	G	A	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=31;PP=1126;SC=CTTCACTGTCGAGGTTCAAGT;SOR=1.000;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=90371210;WS=90371192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	90371704	rs9294443	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=640;SC=GAGAGCAGTCGACGAACAGGG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=90371712;WS=90371694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	90371986	rs3818132	C	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=381;SC=AAAAAACAATCATCACACTCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=90371994;WS=90371976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	90374117	rs188816944	T	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=549;SC=CAAAAGATTATATTGGGTTCC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=90374125;WS=90374107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	90381849	rs7764076	A	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=169;SC=CGTGGAGGGAAGTAAAGCCCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=90381857;WS=90381839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	90385754	rs9451261	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=486;SC=CTGAGAATACAGCCCTGGGAT;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=90385762;WS=90385744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	90387233	rs6454769	C	T	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=906;SC=ACAAGGAGTTCTAAATTACTT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=90387241;WS=90387223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	90390443	rs9353689	C	A	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=36;PP=1256;SC=GAAGGAGCAGCGCCCTGACAC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=90390451;WS=90390433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	90396536	rs201936875	C	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=168;SC=GCGGGAGAAGCGGGAGCAGGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=90396544;WS=90396526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	90402482	rs9294445	G	A	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=50;PP=1989;SC=ATACTGCTGTGGAGTGAGGTG;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=90402490;WS=90402472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	90402840	rs9351212	C	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=27;PP=1195;SC=TTAAATTATCCAGCCGATCCA;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=90402848;WS=90402830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	90405306	rs9294446	T	A	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=25;PP=1337;SC=CCATGCTCCATACTCTTGCCT;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=90405314;WS=90405296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	90405993	rs9362672	C	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=84;SC=CTAGCCACTACAGAAGGAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=90406001;WS=90405989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	90411233	rs192795341	T	C	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=15;PP=716;SC=ACTTCAGAAGTAGTAGTCACA;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=90411241;WS=90411223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	90415764	rs7743484	A	G	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=22;PP=1061;SC=ATAAAACAAGATGCAGTTCCT;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=90415772;WS=90415754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	90418262	rs2026634	C	T	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=23;PP=941;SC=CAGGCTGGTCCGTTTGTGGGT;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=90418281;WS=90418252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	90422627	rs2013736	G	C	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=191;SC=ACTCTTCAATGAAAAACACAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=90422635;WS=90422617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	90426270	rs9342205	C	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=102;SC=TTAAGAAAAACAGTAGCTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=90426278;WS=90426260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	90428968	rs6454774	G	A	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=653;SC=ATAATGCAATGAAAACACAAA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=90428976;WS=90428958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	90432584	rs2016744	A	T	65.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=21.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	90432584	.	A	AT	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=70.0;NF=3;NR=0;PP=81;QD=28.0;SC=AAAAAAAAAAAAAGGCTTGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=90432592;WS=90432574;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	90432662	rs756363	C	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=348;SC=AAATACCAAGCGTGAAACTCA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=90432670;WS=90432652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	90437699	rs7767196	G	A	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=37;PP=1276;SC=GAAATGGAAAGAAGCCATTAT;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=90437707;WS=90437689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	90448092	rs4140446	C	T	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=50;PP=1829;SC=AAGATTATGACTGATGATCTG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=90448100;WS=90448082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	90450135	rs2180140	A	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=649;SC=AAGGGCTTATACAATCTTTCT;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=90450143;WS=90450125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	90452865	rs79585751	G	A	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=16;PP=743;SC=TCTCAGGCACGTACCTGTTGA;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=90452873;WS=90452855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	90453248	rs2273245	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=311;SC=CATGCACAGCTAACTGCAGTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=90453256;WS=90453238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	90453492	rs11358713	AC	A	2735.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=52;PP=1547;SC=ATCCATAAACACCCCCCCTCA;SOR=1.204;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=55;WE=90453500;WS=90453482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	90455084	rs9359861	A	G	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=1169;SC=TCCACACGATATGGCCAAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=90455092;WS=90455074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	90455429	rs9444704	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=144;SC=TATGAAACAATAGAAACTCTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=90455437;WS=90455419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	90459454	rs4053618	G	A	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=767;SC=CTTTTCTCATGGCATCAATAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=90459462;WS=90459444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	90463149	rs34799081	GA	G	483.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.368;HP=12;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=1.742;SC=AAAGTTATGTGAAAAAAAAAA;SOR=2.617;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=90463159;WS=90463139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr6	90463151	rs200648392	A	G	492.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.368;HP=11;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=1.740;SC=AGTTATGTGAAAAAAAAAAAA;SOR=2.617;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=90463159;WS=90463139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr6	90467905	rs112161015	A	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=779;SC=ACGCCACTGCACTCCAACCTG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=90467913;WS=90467895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	90468465	rs6937244	C	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=806;SC=ACAACAACAACAAAAAATCTC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=90468473;WS=90468455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	90497448	rs6923604	T	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=682;SC=TTAGACCTGTTATCACTTCCA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=90497456;WS=90497438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	90497814	rs4707570	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	90605836	rs7738845	T	A	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=215;SC=CTTAGAAAAATCTTATTATAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=90605844;WS=90605826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	91266350	rs45625637	A	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=34;PP=936;SC=TAAGCTGTTTAAAAAAAAACA;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=91266358;WS=91266340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	91296420	rs282070	C	G	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=5;PP=413;SC=TCAGAGCCGGCACCAGGCAGA;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=91296428;WS=91296410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	93956769	rs450238	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=11;PP=243;SC=CCAAATTTCCTGGTAGGCAAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=93956777;WS=93956759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	93964319	rs345736	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=373;SC=TAATACTGGCCATTAATGTAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=93964327;WS=93964309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	93967249	.	TA	T	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr6	93967851	rs345730	C	T	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=32;PP=1558;SC=GGACAACATTCGGGTGGTCAA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=93967859;WS=93967841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	93982124	rs345713	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=15;PP=531;SC=TCATTACTCCACTCACTTGCG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=93982132;WS=93982114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	94067981	rs164544	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=622;SC=CACTTGTGCACGCAACGTATG;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=94067989;WS=94067971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	95173764	rs1322420	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=8;PP=474;SC=CACTTGCTTACTAAAAAGTAT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=95173772;WS=95173754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	96034881	rs148967607	A	ATATG	1339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=1416;SC=ATATATATATATGTGTGTTTG;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=96034889;WS=96034871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	96650908	rs4307180	A	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=291;SC=AGGAAAATGCAGTTGATTACT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=96650916;WS=96650898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	96651740	rs3811069	A	G	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=29;PP=1238;SC=TACCATATCTACTTGTAAATT;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=96651748;WS=96651730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	96969917	rs77958363	C	T	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=26;PP=793;SC=GGCCCTGCATCCCGGGTCTTC;SOR=1.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=96969925;WS=96969907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	96973363	rs9400067	G	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	96974386	rs9320194	A	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=576;SC=TGGAAGGGGGAAAAAAAAATG;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=96974394;WS=96974376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	96988696	rs2475025	A	T	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=108;SC=GTTTTATATAATAAAATGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=96988704;WS=96988686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	96999220	rs2475024	G	C	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=176;SC=TTCCACTCAGGAACTTGTTAC;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=96999228;WS=96999210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	96999643	rs2255552	A	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=234;SC=TTACAAAACAATTGTTAAATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=96999651;WS=96999633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	96999725	rs1127175	C	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=673;SC=GCATAGAAGACTTTATTTCTT;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=96999733;WS=96999715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	97058553	rs2273621	A	G	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=30;PP=1313;SC=GTTCATGTCCAGAGACGACTA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=97058561;WS=97058543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	97063522	rs9373985	C	G	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=625;SC=TTCAAGACAGCCAGTGGCATA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=97063530;WS=97063512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	97063555	rs9398148	A	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=16;PP=859;SC=ACTGCGGGAAATGCTCTGTCT;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=97063563;WS=97063545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	97063724	rs9398152	T	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=212;SC=CGGTCTTATTTTTGACTTAAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=97063732;WS=97063714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	97339078	rs6684	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	97339088	rs11402	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	97339275	rs34213186	C	CA	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.6276;FS=6.166;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-1.532;SC=TACCTAGTATCAAAAAAAAAA;SOR=2.712;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=97339283;WS=97339265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr6	97599612	rs3822908	T	C	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=19;PP=1124;SC=TGGCTGGCAATAGTTTCCTTG;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=97599620;WS=97599602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	97726878	rs2388033	A	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=48;SC=ATACCTCTTTAATTTGGGGAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=97726886;WS=97726868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	99283376	rs195860	T	G	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=23;PP=1118;SC=AGCCGGCCGGTCTGCACCACC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=99283384;WS=99283366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	99572771	rs35787630	AT	A	203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=29.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	99817419	rs11437017	T	TC	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=435;SC=ATTGTACATTTTTGTATTTGA;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=99817427;WS=99817409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	99817601	rs4144164	A	G	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=474;SC=TTCACAGCATAAGCTGCATAG;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=99817609;WS=99817591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	99819379	rs6925344	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=19;PP=667;SC=GGTACAATACTTGCAATTTGC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=99819387;WS=99819369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	99825225	rs147407435	T	TC	2799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=22;PP=2157;SC=TTAATTTTTTTCTCCCAGTTA;SOR=1.379;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=47;WE=99825233;WS=99825215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	99841907	rs9389317	T	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=2;PP=300;SC=ACGCCAGCGCTCGCAATTGAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=99841915;WS=99841897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	99848256	rs1128347	A	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	99850350	rs67043839	GGTTA	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=225;SC=GATATTTTTAGGTTAGTTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=99850361;WS=99850340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	99852267	rs11154824	T	C	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=130;SC=AACAGCATGATTGCTAATTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=99852275;WS=99852257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	99853866	rs7744072	G	A	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=260;SC=AATTGCAAACGAAATAAATCC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=99853874;WS=99853856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	99860747	rs9321539	T	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TGAGGGAAATTAGAAAAATTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=99860755;WS=99860737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	99883515	rs13208607	G	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=299;SC=GGGAAGACTAGAAAGGCACAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=99883523;WS=99883505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	99883704	rs6570065	T	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=35;PP=1290;SC=TGCTGATTCATTATCAGCCGC;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=99883712;WS=99883694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	99883842	rs7745005	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=108;SC=ACCTGAGAAGCCTGTTTTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=99883850;WS=99883832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	99887911	rs141842420	C	CA	30.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=22;SC=ATTGTTACTGCAAAGATTATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=99887919;WS=99887901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	99891391	rs34401990	T	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=8;PP=240;SC=TAGGACTTAATGCTCTGTAAA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=99891404;WS=99891381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	99891395	rs140108249	CTG	C	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=547;SC=ACTTAATGCTCTGTAAAACAC;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=99891404;WS=99891381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	99893878	rs12203426	T	C	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=23;PP=1405;SC=GCTTCCCCTCTAAAAAACATA;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=99893886;WS=99893868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	99916182	rs10457650	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=82;SC=TAAAGGTATCGGTGTCAATCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=99916190;WS=99916172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	99923899	rs11154875	G	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=190;SC=CACTATGTTGGCTAGGCTGGT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=99923907;WS=99923889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	100060761	rs330843	C	T	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	100368759	rs4839764	G	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=330;SC=TGCCCTTTCTGATAATACCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=100368767;WS=100368749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	100395802	rs74531963	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=734;SC=AATCAGCCACAGCCAGGTTGC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=100395810;WS=100395792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	100868721	rs3734355	G	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=19;PP=703;SC=CCGGGATTTGGCCCCCTTTCT;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=100868729;WS=100868711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	100868779	rs3734354	G	T	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=17;PP=566;SC=GAGAAGGCTGGTTTGGAGGCT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=100868787;WS=100868769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	100895344	rs397662	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=653;SC=CTGGGACTGGCCCCAAATGCA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=100895352;WS=100895334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	100964147	rs240780	G	C	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=23;PP=1140;SC=TTCAGGAAGGGACTCGATGGA;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=100964155;WS=100964137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	101166095	rs41288423	G	A	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=54;PP=1849;SC=CAGACAGTCCGAGAATCCTTA;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=96;WE=101166103;WS=101166085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	101215223	rs11345864	TA	T	1115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=370;SC=CTGTCCGATCTAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=20;WE=101215231;WS=101215213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	101215244	rs7746961	A	G	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=16;PP=436;SC=GGCATCACCCATTATAAATAG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=101215252;WS=101215234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	101247503	rs3811078	T	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=458;SC=AGGTAATGCATACACCAAAAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=101247511;WS=101247493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	101253788	rs4839792	A	T	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=134;SC=AACAAACATCAGTTATCTCAA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=101253796;WS=101253778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	101312097	rs846791	C	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=8;PP=246;SC=TTATCTGAAACAGAGATTATA;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=101312105;WS=101312087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	102376517	rs2243355	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=551;SC=GGTAAGTTCTGCTGGTTACCT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=102376525;WS=102376507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	105228483	rs2124434	C	G	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=148;SC=GTGAGAGCAACTTGCCAATAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=105228491;WS=105228473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	105232204	rs2290515	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=8;PP=550;SC=TTGAATAGTACGAGAAATAGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=105232212;WS=105232194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	105232827	rs375598261	GA	G	1367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=16;PP=596;SC=ATCTATCAGAGAAAAAAAAAA;SOR=1.702;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=31;WE=105232835;WS=105232817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	105244526	rs6918700	A	T	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=20;PP=795;SC=CACAAATACAATACCATGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=105244534;WS=105244516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	105259122	rs147942742	CATAT	C	177.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=35.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	105259152	rs2168394	C	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=9;PP=618;SC=TATATATGAGCATATATAGCA;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=105259160;WS=105259142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	105388405	rs7766336	T	G	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.69;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	105405220	rs61701350	T	TC	53.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=88;SC=TCTTAGACCGTCCCCCCCTTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=105405228;WS=105405210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	105548850	rs221657	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=113;SC=CCTCCGACTCCACCAGTCTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=105548858;WS=105548847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	105577172	rs9404603	A	G	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=192;SC=TATGCTAGATACTTACTCTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=105577180;WS=105577162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	105577224	rs9404604	A	C	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=560;SC=CTTTAAAATCACTTCCTTATT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=105577232;WS=105577214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	105577401	rs4946656	C	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=43;PP=1322;SC=AAAGTTAACACGTTAGATAAT;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=105577409;WS=105577391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	105595261	rs1190274	G	A	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=1054;SC=TAAAGGTACTGTTTTATTTAG;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=105595269;WS=105595251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	105602108	rs1190280	T	G	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=443;SC=TATTTATGGCTTTTGTCAAAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=105602116;WS=105602098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	105614712	rs1190292	T	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=364;SC=GGGTTACATATTCAAGCATTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=105614720;WS=105614702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	105614743	.	TTG	T	221	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=61.19;NF=0;NR=5;PP=221;QD=44.8;SC=ACATAGATGGTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=105614752;WS=105614733;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr6	106899793	rs7763469	C	T	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=216;SC=CTAAGAAACACATACTTAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=106899801;WS=106899783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	106959961	rs4946759	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=34;PP=1104;SC=GTGCCGAAGAAGGCTCCCTGG;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=106959969;WS=106959951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	106959999	rs1340623	C	G	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=20;PP=808;SC=AGCCAGCCCCCCAAGGGCGCG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=106960007;WS=106959989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	106967778	rs3747787	T	C	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=49;PP=1941;SC=CAGTTTCCCATGCACTGATCT;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=106967786;WS=106967768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	106987161	rs783397	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=576;SC=ACCATTCATTATGTAGGTCCG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=106987169;WS=106987151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	106987370	rs783396	A	C	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=56;PP=2034;SC=GATACAGAAGAAGCGTACATT;SOR=1.069;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=96;WE=106987378;WS=106987360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	106989212	rs783392	G	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=36;PP=1248;SC=AAAAAAACTTGCTAGGTCAAA;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=106989220;WS=106989202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	106992464	rs1799693	A	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=887;SC=CATATGAGAAACCTGGATTTA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=106992472;WS=106992454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	106992592	rs2247335	A	T	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=20;PP=850;SC=GGACAAGCTAATGGCTAATAC;SOR=1.005;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=106992600;WS=106992582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	106992844	rs2066201	C	G	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=197;SC=TTTAAACATGCGTTTTACCTT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=106992852;WS=106992834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	106999658	rs1676010	A	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=453;SC=TGATACATAGATATCCAAATA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=106999666;WS=106999648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	107001456	rs1770731	A	T	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=37;PP=1332;SC=AGTGAAACAAAGGCCTGGCAG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=107001464;WS=107001446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	107001581	rs1770732	T	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=352;SC=TGCTTCGTGATATCTGAGTAC;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=107001589;WS=107001571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	107003810	rs2066202	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=38;PP=1003;SC=CAGAAATGTATGCCTCATATA;SOR=2.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=107003818;WS=107003800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	107006347	rs4946763	T	C	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=9;PP=1331;SC=AACATTGTTTTTGTTCCTCAA;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=107006355;WS=107006337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	107050867	rs6568446	A	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=10;PP=351;SC=GTTTTCAACAAATAACTGGTT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=107050875;WS=107050857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	107069232	rs1870868	G	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=688;SC=AAAAACACCAGTTATTTCAGA;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=107069240;WS=107069222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	107391396	rs3814073	G	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=31;PP=1305;SC=TGAAGAAGTCGTTCAGCTGGG;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=107391404;WS=107391386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	107420516	rs4946811	A	C	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1801;SC=TAAAAAGACAAAGACAATGTG;SOR=1.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=107420524;WS=107420506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	107566946	rs9373933	A	G	66.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=40;SC=AAAAAATGGGACTATGCACCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=107566954;WS=107566936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	107956095	rs9486659	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=15;PP=396;SC=GCGCGAGCCGAGCGCCGCGGA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=107956103;WS=107956085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	108026317	rs1546962	G	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=329;SC=GGAGAGTCTAGTTTGTGATGT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=108026325;WS=108026307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	108026402	rs1546961	A	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=16;PP=571;SC=TTTTTAAAAAAGTCAGAACTT;SOR=0.929;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=108026410;WS=108026392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	108026455	rs1546960	A	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=19;PP=611;SC=GTTTCAGTGCAGGTCCCAGCT;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=108026463;WS=108026445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	108041801	rs11751218	G	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=132;SC=TCTCCCAGCAGTCCCACGTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=108041809;WS=108041791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	108042213	rs846977	G	A	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=30;PP=973;SC=CAATAAGGCAGTACAGAGAAG;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=108042221;WS=108042203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	108042334	rs846978	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=261;SC=GAAATGAACCTCACAACATAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=108042342;WS=108042324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	108093328	rs9480798	G	A	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=133;SC=CCAAGTACCCGTGCCCCAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=108093336;WS=108093318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	108093657	rs17528372	A	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=47;SC=CAAGGCAAACATGATCCTGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=108093665;WS=108093647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	108193148	rs642954	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=7;PP=244;SC=ACAGCAATTACAAAGAAATAG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=108193156;WS=108193138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	108194241	rs579120	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=480;SC=AAAGTCCTAATAAATGTTACT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=108194249;WS=108194231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	108197998	rs570558	A	G	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=5;PP=103;SC=CAAAATAGGTATTCAAATGAA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=108198006;WS=108197988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	108219063	rs9373986	T	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.20;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	108243123	.	AAC	A	431	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=57.33;NF=0;NR=5;PP=431;QD=91.4;SC=CCTGGGGAAAAACAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=108243132;WS=108243113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,5:0.42:12
chr6	108277287	rs9486756	C	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=9;PP=300;SC=TCAAGACCAGCCTGGGTAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=108277295;WS=108277277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	108279290	rs2272884	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=511;SC=CCAACGCCCCGGCCCGAGTGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=108279298;WS=108279280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	108487877	rs127501	A	G	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=66;SC=GCTGGAGGGCAGCTGGAGAGC;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=108487885;WS=108487867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	108489462	rs383319	G	A	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=187;SC=CTGAGCCTCCGTTGCAAAAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=108489470;WS=108489452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	108495950	rs2233492	G	A	134.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=104;SC=GCAAGGTCGCGCCTCCACACC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=108495958;WS=108495940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	108498014	rs10563315	CTG	C	1676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=1073;SC=TTCTTCTGAGCTGTGTGATTG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=108498023;WS=108498004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	108677003	rs2135941	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=492;SC=GTGGGGAAACGCTACAAAATG;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=108677011;WS=108676993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	108840870	rs2274776	A	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=549;SC=TGTAAAGAGTAACACATTTAC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=108840878;WS=108840860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	109258284	rs2768558	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=681;SC=GTCTTTATGTTTTGAGTATAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=109258292;WS=109258274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	109330758	rs148473451	CG	C	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=60;SC=GCACGGACGGCGGGGGGGCGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=109330766;WS=109330748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	109575596	rs6919557	C	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=226;SC=TCCCGTCGCTCTGCTGGGCCC;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=109575604;WS=109575586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	109583186	rs1040285	A	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=31;PP=1027;SC=CAGAAACAAGACCAAGACTCT;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=57;WE=109583194;WS=109583176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	109586062	rs949882	C	T	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=23;PP=1242;SC=GTATCTGAGGCCTGTTCACTT;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=109586070;WS=109586052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	109586240	rs949881	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=145;SC=GTCACCATTCAACATGCAAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=109586248;WS=109586230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	109591208	rs9386784	C	A	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=596;SC=TTATGCAAGACATTCCTAATA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=109591216;WS=109591198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	109591433	rs9400262	T	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=17;PP=492;SC=CACCAGCTAATGTCAGGCTGC;SOR=1.121;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=109591441;WS=109591423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	109591586	rs9374072	A	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=115;SC=TCAATGTATGACCAAATCCTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=109591594;WS=109591576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	109615603	rs9487048	G	T	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=24;PP=1101;SC=TTCCTCAATTGATGGTTCATA;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=109615611;WS=109615593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	109616762	rs9400272	A	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=32;PP=1279;SC=GAACTCTACAACTGATAGCTC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=68;WE=109616770;WS=109616752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	109621494	rs6927569	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=15;PP=474;SC=CAAGACCCTATCCGGGTGGCC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=109621502;WS=109621484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	109629420	rs11153168	A	T	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=546;SC=TTTGATTTTGAGGCTGTAAAC;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=23;WE=109629428;WS=109629410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	109659589	rs57811946	TCACA	T	525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=37.55;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	109659612	rs80090825	C	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;MQRankSum=0.424;QD=31.36;ReadPosRankSum=1.390;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr6	109665129	rs10457190	C	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=132;SC=CCTCTTCCCCCCTTCTGCTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=109665137;WS=109665119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	109673933	rs1040284	T	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=833;SC=AAAATCAAAATAATCTAGGTT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=109673941;WS=109673923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	109674055	rs11153174	C	T	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=46;PP=1642;SC=CTCCCAGCAACGCTTTTTAAA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=109674063;WS=109674045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	109689431	rs974034	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=15;PP=474;SC=ATGACATAAGATGCTTTACAA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=109689439;WS=109689421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	109702646	rs3799840	A	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=19;PP=1247;SC=ATAAACATACAATGTCAGGAG;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=109702654;WS=109702636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	109703391	rs1885691	C	T	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=341;SC=GGGAAGCCCACAGGGCCCGCG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=109703399;WS=109703381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	109703683	rs2275652	G	C	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=21;PP=476;SC=GCTCCCCCGCGGGAGCGCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=109703691;WS=109703673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	109703727	rs1322816	C	A	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=294;SC=TTTCGGCGTGCGGGGGCGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=109703735;WS=109703717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	109726262	.	G	GA	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=15;MQ=61.54;NF=5;NR=1;PP=106;QD=19.1666666667;SC=CTCAAAAAAGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=109726270;WS=109726252;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	109761437	rs4945831	A	G	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=50;PP=1852;SC=TCCCTTTAAAAGTCGCCAAGT;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=109761445;WS=109761427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	109762236	rs1048203	G	A	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=8;PP=812;SC=GGAACGGTCTGGGGAGAAGGC;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=109762244;WS=109762226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	109764535	rs1476387	G	T	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=32;PP=1164;SC=ACCCTCACAGGGGCACCCCCC;SOR=0.920;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=109764543;WS=109764525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	109767631	rs6149743	T	TGTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG	2134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.19;NF=0;NR=8;PP=2965;SC=AAAGCCACCATGTGGAGTGAG;SOR=1.900;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=8;WE=109767639;WS=109767621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	109767930	rs9320288	GC	TT	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=1313;SC=GCTGCCTTCCGCTTTGTGGTC;SOR=1.418;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=29;WE=109767939;WS=109767920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	109768295	rs910730	G	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=13;NR=6;PP=289;SC=GGTGCTGCTCGTAGCCACCTG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=109768303;WS=109768285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	109769224	rs72092669	AACAG	A	346.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=354;SC=GTACTCTCAGAACAGACAGTC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=109769235;WS=109769214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	109769336	rs111385895	TCACACACACA	TCA,T	53.70	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=313;SC=TCTCCCTCTGTCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=109769353;WS=109769326;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:2
chr6	109770999	rs752262	G	C	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=41;PP=1441;SC=GAGGGGGTGAGGGTAAGGGGC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=109771007;WS=109770989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	109775436	rs2277113	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=20;PP=486;SC=TGGGCAGAGATGAGTGGCTGG;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=109775444;WS=109775426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	109786980	rs3734652	T	C	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=30;PP=1114;SC=GAGAGCCTGATTTCAAGCGTT;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=56;WE=109786988;WS=109786970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	109797304	rs2236084	A	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=15;PP=1412;SC=AGAACAATATAAACCTAATGT;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=109797312;WS=109797294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	109815351	rs7755941	T	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=715;SC=TGGTTTCTTTTCTTAGTGCCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=109815359;WS=109815341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	109815440	rs7773950	A	G	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=159;SC=ATATGGTTAGATGACCAGTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=109815448;WS=109815430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	109818529	.	TCA	T	168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.28;QD=24.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	109818563	.	ACACTCT	A	274	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5081;HP=2;HapScore=3;MGOF=33;MMLQ=18;MQ=59.62;NF=8;NR=4;PP=274;QD=23.0833333333;SC=ACACACACACACACTCTCTCT;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=12;WE=109818576;WS=109818553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,12:0.80:15
chr6	109818585	rs71018346	TCTCA	T	880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=5;PP=653;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACT;SOR=1.519;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=14;WE=109818596;WS=109818575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	109827716	rs2277114	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=33;PP=1000;SC=TTGACAGCTACAATTTGTGCA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=109827724;WS=109827706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	109830298	rs6912368	C	T	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=839;SC=CTTTAAGCCCCATGTAAGTGT;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=109830306;WS=109830288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	109837859	rs10872035	T	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=383;SC=AGGAAGAAAATATTCCCTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=109837867;WS=109837849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	109837879	rs7773915	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=273;SC=TACTATACATATAAAATATGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=109837887;WS=109837869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	109850199	rs72331392	AAC	A	179.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=180;SC=TGAAAAAAAAAACAAAACTAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=4;WE=109850208;WS=109850189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	109863238	rs9386812	A	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=920;SC=AATTCTATATAAATTAAGATA;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=109863246;WS=109863228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	109871163	rs9400294	G	A	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=372;SC=CACCGCGCCCGGCCTAGATAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=109871171;WS=109871153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	109885475	rs10499052	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=497;SC=GGAAACTCAGGTAGTACAACT;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=109885483;WS=109885465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	109886159	rs10872047	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=52;SC=ATATGAAATGCCTAATAGAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=109886167;WS=109886149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	109906329	rs71770197	GCTT	G	190.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=263;ReadPosRankSum=1.691;SC=ATTTTACCTTGCTTCTTCTTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=109906339;WS=109906319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr6	109940498	rs10499053	A	G	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=553;SC=TATTAAACACATTGTTCATCT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=109940506;WS=109940488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	109954054	.	TGA	T	457.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=41.61;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	109954055	.	GAC	CAT	149	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.9;NF=6;NR=0;PP=149;QD=33.7446458104;SC=ATAGATACATGACAGATAGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=109954072;WS=109954044;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,6:0.55:11
chr6	109954057	rs199707138	CAG	C	502.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=45.70;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	109954059	.	GATAGAC	G	178	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=61.07;NF=7;NR=0;PP=178;QD=28.8571428571;SC=ATACATGACAGATAGACATAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=109954072;WS=109954044;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr6	109954063	rs149315041	GAC	G	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=41.89;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	109954252	rs1406957	C	T	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=25;PP=915;SC=GTGGGTTCAACAAAAATGGTT;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=109954260;WS=109954242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	109962904	rs7744981	A	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=115;SC=ATGAGCCAAGACCATGCTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=109962912;WS=109962894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	109982160	rs2016207	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=719;SC=TCCTTTAGAACATGATGAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=109982168;WS=109982150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	109993291	rs12197838	G	A	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=679;SC=TGTAATCATAGTTACTTTGAA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=109993299;WS=109993281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	110048489	.	C	CT	109	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9999;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=61.53;NF=3;NR=4;PP=109;QD=16.8571428571;SC=TGGTAACTACCTTTTTTTTTT;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=7;WE=110048497;WS=110048479;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,7:0.33:21
chr6	110053721	rs11153215	T	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=25;SC=AGATATGGTTTGAATTCCTCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=110053729;WS=110053711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	110053824	.	G	GT	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.72;NF=3;NR=2;PP=82;QD=17.4;SC=AATGTACTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=110053832;WS=110053814;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr6	110059510	rs2273752	C	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=448;SC=TGGACTGATACAGACTTTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=110059518;WS=110059500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	110062873	rs1322124	T	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=247;SC=GAGAATACAGTTGCCTTTTAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=110062881;WS=110062863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	110086098	rs146520572	T	TTTTTTGTTTTTG	626.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=1;PP=2524;SC=CCCACAGACTTTTTTTGTTTT;SOR=3.767;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=110086106;WS=110086088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	110106234	rs10499054	A	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=9;PP=420;SC=TGATGAAGGTAGGTAACTGTT;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=110106242;WS=110106224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	110110943	rs9384723	G	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=183;SC=CTTGCAATATGATTTCCACCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=110110951;WS=110110933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	110146303	rs1127771	G	A	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=21;PP=1153;SC=CACCCATCTCGGCTTTCTCGC;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=57;WE=110146311;WS=110146293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	110643956	rs6908306	T	C	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=15;PP=608;SC=TTCTCTAACTTCTTTGAGCCT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=110643964;WS=110643946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	110644112	rs112341783	A	AG	784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=443;SC=TGTGTAAGGAAGAGGAACTGG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=110644120;WS=110644102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	110679002	.	G	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=52;SC=GATGCGACCCGTGGAGCCGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=110679010;WS=110678992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	110679062	rs4945854	T	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=6;PP=178;SC=GGAGGTCCCATCGAGGCGGCC;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=110679070;WS=110679052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	110679413	rs62435951	A	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=158;SC=ACAACAGCACAGCCCCGAGTA;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=110679421;WS=110679403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	110736610	rs9384742	T	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=611;SC=TCAGACACACTCCCAAACTCC;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=110736618;WS=110736600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	110745977	rs3778650	A	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=431;SC=TATTAAAAAGACATACAAACA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=110745985;WS=110745967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	110746526	rs7756222	T	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=21;PP=768;SC=CACCATGGAGTGCCTCCTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=110746534;WS=110746516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	110746545	rs9487402	T	G	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=23;PP=856;SC=AATTGCCAGCTACTGCCTGCA;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=110746553;WS=110746535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	110752289	rs1033572	G	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=648;SC=CTGGCTTTCAGTAAATAACAA;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=110752297;WS=110752279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	110778323	rs717567	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=ACATATACACGAATGGATAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=110778331;WS=110778313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	110797214	rs2428188	C	G	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=1001;SC=GTACCTGGCACGTATTAGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=110797222;WS=110797204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	110797563	rs2494551	A	C	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=10;NR=4;PP=181;SC=AAGCCCAGCTAGGGGCCGGCG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=110797571;WS=110797553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	110797605	rs2494552	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	110797612	rs6920997	A	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	110797703	rs150666553	CCGCGGG	C	4552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.08;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	110797713	.	C	CCACCCCT	4732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=36;PP=2966;SC=CCGCGGGGCCCCTCCCCCATA;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=110797721;WS=110797693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	110797821	rs11153236	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=22;PP=619;SC=AGCTCCGGGGACTGCGGGTAG;SOR=1.559;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=110797829;WS=110797811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	110797905	rs6922017	G	C	157.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	110953468	rs117132367	G	A	65.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=72;SC=TTAGAACCATGCAAGGTTGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=110953476;WS=110953458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	110988795	rs9386933	AC	TA	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.33;QD=43.75;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	110991916	rs2691185	T	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=24;PP=795;SC=GCTCTGTCAATATCTTGGTGC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=110991924;WS=110991906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	111281581	rs6910747	T	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=267;SC=TTTTTCTAATTATGTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=111281592;WS=111281571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	111281584	rs11354415	GT	G	232.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=1;PP=160;SC=TTCTAATTATGTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=111281592;WS=111281571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	111281880	rs71553315	A	ATAAATAT	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=1239;SC=CTTAAGCATAATAAATATCTC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=18;WE=111281888;WS=111281870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	111283592	rs9374227	C	T	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=555;SC=ATTTCTGTTCCAGCTGATACA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=111283600;WS=111283582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	111283718	rs9374228	A	C	3285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=54;PP=2048;SC=GGTTAGTTCCATTATTCTCTG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=111283726;WS=111283708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	111310382	rs67767509	TAC	T	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=94;SC=TAAAATTCCTTACAGTTATTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=111310391;WS=111310372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	111310405	rs3841734	C	CT	30.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=59;SC=ATTTTAATTTCTTTCTTTTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=111310413;WS=111310395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	111318193	rs3763193	T	C	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=78;SC=TTAGTAGAGATACGGTCTTAC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=111318201;WS=111318183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	111320794	rs3763195	G	A	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=10;PP=462;SC=ATATGTTTGCGGGGGTATAGG;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=111320802;WS=111320784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	111321037	rs3763196	A	G	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=265;SC=GCTTCTCTTGACCAGTAGTGA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=111321045;WS=111321027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	111543412	rs17072442	A	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=38;PP=1128;SC=TGGAATGTTCAAGAAAGAATC;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=111543420;WS=111543402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	111588188	rs17072508	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=41;PP=1886;SC=TAGAAGTAGTCTGACGGAGCC;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=111588196;WS=111588178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	111901453	rs1043730	G	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=22;PP=744;SC=GCCTCTCTTCGTGGTCCCAGG;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=111901461;WS=111901443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	112041359	rs706895	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=37;PP=852;SC=CAAGGCTCACTGTTGGCTATT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=112041367;WS=112041349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	112381052	rs117057249	G	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=5;PP=308;SC=CACATTCTTGGTGCAGGTATC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=112381060;WS=112381042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	112388358	rs9400518	T	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=301;SC=TTAAAGAGACTATTTCCTATG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=112388366;WS=112388348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	112438912	rs3216857	GA	G	2292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=18;PP=1653;SC=AGCATTTCATGACTCATATTT;SOR=1.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=38;WE=112438920;WS=112438902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	112443134	rs4945897	G	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=719;SC=AAGGAAAGATGGGAAAAAACG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=112443142;WS=112443124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	112450351	rs2157550	G	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=529;SC=TTATGGAAGTGAAAGAGCTTT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=112450359;WS=112450341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	112457390	rs2032567	C	T	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=38;PP=1782;SC=ACAGGGCCACCGCTGAATCCA;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=89;WE=112457398;WS=112457380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	112457471	rs2032568	G	A	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=50;PP=1465;SC=GGAGAGAAAGGAATTGTAAGA;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=112457479;WS=112457461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	112460648	rs2072020	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=AGAGGTATTTGTAGGTATGTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=112460656;WS=112460638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	112493872	rs1050348	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=9;PP=463;SC=TCCCTGACATAGTTAAGGGCC;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=112493880;WS=112493862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	112506375	rs9374309	G	A	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=16;PP=943;SC=TGACCAGCCAGCCTCACATCA;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=112506383;WS=112506365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	112506583	rs6908219	G	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=18;PP=530;SC=ATAGTCAATGGGCACACCAGG;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=112506591;WS=112506573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	112508035	rs9400521	C	T	169.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=3;PP=52;SC=ATATGGAGGGCCAACTGTATT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=112508043;WS=112508025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	112508769	rs9387061	TG	GT	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=1127;SC=CTAACCGCAGTGCATCAGTCA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=23;WE=112508778;WS=112508759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	112522852	rs11757455	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=800;SC=CAAATGCACCGAACAGCTCCA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=112522860;WS=112522842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	114178831	rs113531174	C	CGCT	796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=604;SC=TTGCCGCCGCCGCTGCTGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=13;WE=114178839;WS=114178821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	114181661	.	C	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=900;SC=GAGGAGCCCGCGGCCGCCGCA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=114181669;WS=114181651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	114277625	rs2475631	T	C	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=76;SC=TCATAAAACATAGAGGTTTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=114277633;WS=114277621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	114378970	rs2282237	C	T	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=60;PP=2522;SC=TTTCTGGAACCTCCTCTGTGA;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=114378978;WS=114378960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	116264354	rs550480	C	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=26;PP=752;SC=TCTACCTGTTCATGTATTAAG;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=116264362;WS=116264344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	116288912	.	T	TA	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=58.12;NF=0;NR=5;PP=85;QD=18.2;SC=GAGCAATTGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=116288920;WS=116288902;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr6	116439220	rs515745	A	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=430;SC=GATTTAATTTAAGCTTAAATA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=116439228;WS=116439210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	116441229	rs111661664	T	TGGG	1264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=8;PP=946;SC=ATTAGCTCTGTGTGTACTCAC;SOR=1.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=19;WE=116441237;WS=116441219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	116441646	rs2228547	C	G	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=51;PP=1814;SC=CCTGTTACCCCCTGGTTGGCA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=116441654;WS=116441636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	116446576	rs1064583	A	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=23;PP=1051;SC=GCCTGTGGGCATTTGGTATCG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=116446584;WS=116446566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	116560025	rs1204816	G	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=55;SC=TTCCTACAGGGTTTCAAAGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=116560033;WS=116560015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	116575083	rs2232470	C	A	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=49;PP=1671;SC=GCACTGGTCTCGGTCCGGATC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=116575091;WS=116575073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	116575344	rs910391	T	G	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=17;PP=1367;SC=CTCTGCGCGGTTGACTACGCT;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=116575352;WS=116575334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	116600465	rs78371471	T	TCAC	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=1407;SC=AGGCCTTCCTTCACCACCTCA;SOR=0.739;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=28;WE=116600473;WS=116600455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	116757557	rs560644	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1115;SC=ATCCCTACAATGGGACAAACT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=116757565;WS=116757547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	116784797	rs11544160	G	A	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=55;PP=1682;SC=CAGGTCTACTGAAGGAGATAC;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=84;WE=116784805;WS=116784787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	116901640	rs1321534	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=106;SC=TTACGAATCTGCTATGAATGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=116901648;WS=116901630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	116944260	rs113664376	CTTGTTTTGTT	C	326.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=1989;SC=TATTTTATAGCTTGTTTTGTT;SOR=1.863;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=116944277;WS=116944250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	116950833	rs784133	T	C	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=26;PP=798;SC=GAAGTGGGGCTTCCTCTTTTG;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=116950841;WS=116950823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	117037616	rs2243367	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=23;SC=TTGCACATATACAGTATTCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=117037624;WS=117037606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	117086265	rs641338	C	A	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=26;PP=2332;SC=CGCACCCTTGCGGCCGGGGAC;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=83;TCR=26;TR=108;WE=117086273;WS=117086255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr6	117113653	rs615199	T	C	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=15;PP=584;SC=TCTCCACAGCTGGTACATATT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=117113661;WS=117113643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	117114025	rs6901250	G	A	4605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=64;PP=2965;SC=CAAAGCTGAAGGCTAGCAAAA;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=145;WE=117114033;WS=117114015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	117114223	rs6924002	T	A	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=55;PP=2255;SC=TCACAACAGGTGTGTTCAGGT;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=117114231;WS=117114213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	117114403	rs6901971	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=358;SC=ATAAAAGGCAGTGAGGCATAT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=117114411;WS=117114393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	117121894	rs6917467	G	A	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=856;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TTAAATCCCCGTGAGCATCAA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=45;WE=117121902;WS=117121884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,52:0.96:54
chr6	117130704	rs2274911	G	A	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=60;PP=1840;SC=TTGACTCCAGGTAAGAGTGTT;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=91;WE=117130712;WS=117130694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr6	117237584	rs2184343	T	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=1;NR=11;PP=260;SC=TATGGCTGGATATACACTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=117237592;WS=117237574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	117240266	rs79696244	C	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=380;SC=CATTTTTTAACAATGAAGCAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=117240274;WS=117240256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	117246576	rs67292089	G	GA	1390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=850;SC=AGGAATGTGAGAAAAAATCTC;SOR=1.559;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=25;WE=117246584;WS=117246566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	117587054	rs433425	T	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=970;SC=GCGCCCCCCGTTTGCGGCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=117587062;WS=117587044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	117587074	rs439418	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=837;SC=CATGGCCTGTACGCCAAGGTC;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=117587082;WS=117587064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	117591619	rs13208901	G	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=9;PP=608;SC=TCTCTCGGGCGGGACGTGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=117591627;WS=117591609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	117591755	rs13194610	T	C	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=32;PP=1050;SC=CCTTCTGGAATAGCGCGTACC;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=117591763;WS=117591745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	117622184	rs619203	G	C	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.63;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	117622188	rs529156	T	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	117622233	rs529038	C	T	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=21;PP=1311;SC=TGAAGTTGGTCCTGAATTCTA;SOR=1.451;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=117622241;WS=117622223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	117631431	rs552183	T	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=12;PP=340;SC=AGGCAATTTCTAGCTGCCAGA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=117631439;WS=117631421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	117639266	rs498251	A	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=886;SC=TGATCCGTTAAGTCATGTCAT;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=117639274;WS=117639256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	117639419	rs497186	T	C	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=64;PP=2212;SC=TCAAAGTCTATACAACATAAA;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=115;WE=117639427;WS=117639409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	117641246	rs2243386	C	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=312;SC=ATAGGGTGTACAAGTTTGTGT;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=117641254;WS=117641236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	117641330	rs75236299	C	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=TTATGTGACACGGTGATGTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=117641338;WS=117641320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	117649988	rs581235	T	C	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=37;PP=1490;SC=TGGGAACACATTGCAAACTGT;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=117649996;WS=117649978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	117650131	rs574664	A	T	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=332;SC=ACCTTGCTAAAGCAAATTATC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=117650139;WS=117650121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	117658193	rs17079053	G	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TATATTTTCTGAATTTCTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=117658201;WS=117658187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	117662944	rs17632578	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=78;SC=CTTCTATAATCGTAGGTTAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=117662952;WS=117662934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	117663499	rs2243385	A	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=780;SC=AATAAACATCAACATACACAG;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=117663507;WS=117663489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	117678083	rs2243384	A	G	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1114;SC=AAGCGACTATAGAGGAAAAAA;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=117678105;WS=117678073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	117681436	rs150963992	G	GAC,GACAC	928.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.144;QD=35.72;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,6,19:0.23,0.73:26
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chr6	117862048	rs2071825	C	A	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=26;PP=1210;SC=CATTGTTACTCATGTGGTTTT;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=117862056;WS=117862038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	117864144	rs210619	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=351;SC=TTGCTTTCCAATATCAGTAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=117864152;WS=117864134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	117869491	rs210621	G	A	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=54;PP=2338;SC=CCGAAAGCGGGCACCCTGACT;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=117869499;WS=117869481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	117996818	rs9767451	T	C	99.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.16;QD=19.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	118556628	rs9489326	T	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=605;SC=CAATTTATTCTATTTCAGGAA;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=118556636;WS=118556618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	118800890	rs2187945	T	C	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=48;SC=AAGATTAATATTAAAGAATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=118800898;WS=118800880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	118973998	rs1936059	G	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=12;PP=358;SC=ACAGAAACATGAAAGACGAAT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=118974006;WS=118973988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	119149149	rs284921	C	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=18;PP=919;SC=AGCGTTCCGGCAATCACTCTG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=119149157;WS=119149139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	119177480	.	T	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=530;SC=CATTTTCCCCTAAGCATATAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=119177488;WS=119177470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	119300477	rs4946382	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=10;PP=654;SC=GAATTTAAAAAATGTTAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=119300485;WS=119300467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	119323987	rs3756940	A	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=388;SC=CAGTGAATTAACAGAGTTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=119323995;WS=119323977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	119327112	rs794262	G	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=437;SC=AATTGTTATCGGTTGAACTGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=119327120;WS=119327110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	119346912	rs6929403	G	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=370;SC=CCCCGGAAGCGAAAAGAAGTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=119346920;WS=119346902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	119501684	.	AT	A	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5025;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=38;QD=14.6666666667;SC=CAGATAAAACATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=119501692;WS=119501674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr6	119628029	rs195092	C	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=29;PP=1100;SC=GAGAAGTTATCGTCACTAAGA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=61;WE=119628037;WS=119628019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	119653287	rs195075	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=115;SC=TAGTATCTAATAGGAAGTGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=119653295;WS=119653277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	120336217	rs67803782	A	G	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.88;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	120336269	rs66780530	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=7;PP=220;SC=TCACTATCCAGCTTCCAAAAA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=120336277;WS=120336259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	120336327	rs68035463	C	A	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=9;PP=272;SC=CAGACTGAAACTACACTTTAA;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=120336335;WS=120336317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	120336384	rs67106263	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=145;SC=ATACCTGTTCGGTCTCTTTAA;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=120336392;WS=120336374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	121436422	rs7772508	G	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=189;SC=ATAAAGTGCAGAAAAGTTTGC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=121436430;WS=121436412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	121491472	rs1273749	G	A	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=423;SC=CATTAAACAAGCTATATCAAA;SOR=2.066;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=121491480;WS=121491462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	121526447	rs9320795	G	C	231.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=117;SC=TAAATAATAAGAAGAAGAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=121526473;WS=121526437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	121526459	rs35328788	G	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	121526465	rs35549991	G	T	185.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	121620608	rs9387944	G	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=10;PP=418;SC=CTTATATTTCGTTTCAAGAAG;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=121620616;WS=121620598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	121625774	rs150140922	G	GA	225.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9643;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.632;NF=1;NR=8;PP=77;ReadPosRankSum=-0.486;SC=ATACTTAGCTGAAAAAAAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=121625782;WS=121625764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr6	121629167	rs9398629	G	A	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=38;PP=1208;SC=TCAGTTTTTCGCAGAGAGTAG;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=121629175;WS=121629157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	121632008	rs9372653	T	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=559;SC=AACACAATTGTCAGGACATTC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=121632016;WS=121631998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	122720778	rs45504694	C	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=10;PP=688;SC=CCAAGATCTGCTGCGCCTGCG;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=122720786;WS=122720768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	122752550	rs149578348	T	TTA	150.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=82;SC=AAACAAGTACTTATATATATA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=122752558;WS=122752540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	122767817	rs79756345	TCA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=353;SC=TTGAAATATATCAGAGGATAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=122767826;WS=122767811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	122775195	rs499825	A	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.23;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	122793033	rs1267941	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=341;SC=AGGCCTGGGTAGGATAAAACA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=122793041;WS=122793023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	123022625	rs143459711	C	G	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=62;PP=2327;SC=CAGGCTGAACCTGACAGCATG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=123;WE=123022633;WS=123022615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	123038887	rs6920792	CT	GC	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=534;SC=TGAACATTTACTTCTGAATAG;SOR=1.127;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=123038896;WS=123038877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	123039201	rs34684181	T	G	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=108;SC=TAGTTAAAAGTGCTCAGTTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=123039209;WS=123039191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	123101348	rs2171068	G	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=169;SC=ACTTTAGAACGTGGATTCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=123101356;WS=123101342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	123101647	rs2243372	A	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=5;NR=14;PP=424;SC=GGATGGGGAGAGGGGAATAAA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=123101655;WS=123101637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	123122464	rs28385609	C	T	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=45;PP=1886;SC=GGATCAACTGCCTGTAGTCAC;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=98;WE=123122472;WS=123122454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	123127597	rs13192569	G	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=167;SC=AGTCATGTGAGATGTATTTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=123127605;WS=123127587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	123369910	rs6900862	T	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=32;PP=1028;SC=ATCCTTTCTCTTCCGCCATCC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=123369918;WS=123369900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	123539609	rs361509	C	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=205;SC=CCACCCTTTCCGTCCACACCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=123539617;WS=123539599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	123539684	rs361508	CT	TC	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=1458;SC=GCCTGAACTACTGTGGACAAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=30;WE=123539693;WS=123539674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	123539904	rs7754205	C	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=41;PP=1303;SC=CAGAGCATGACAGTTTGTTAA;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=123539912;WS=123539894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	123545159	.	GA	G	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;FR=0.9998;HP=14;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=26;QD=15.0;SC=GAATAGCTAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=123545167;WS=123545149;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr6	123576310	.	A	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	123592184	rs113318627	C	CTGTG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=126;SC=CAGTGAAGGGCTGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=123592192;WS=123592174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	123600100	rs143535631	CA	C	463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=1;PP=317;SC=GCAAAATATTCAACATGAAAT;SOR=2.985;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=9;WE=123600108;WS=123600090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	123687288	rs2873479	A	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=14;PP=651;SC=ACCTTTTTTAATTGAAACCGC;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=123687296;WS=123687264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	123687432	rs7769808	T	C	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=91;SC=ATGTTGCACATGAGAGCAAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=123687440;WS=123687422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	123699042	rs6901953	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=264;SC=TCTTTTCCTGTTCTGAAACAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=123699050;WS=123699032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	123714764	rs41284430	C	T	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=6;PP=249;SC=TGTTTTATTGCTTACCTTGTG;SOR=1.112;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=123714772;WS=123714754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	123819847	rs9320940	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=230;SC=TTTCTAGACATGAGATTGTTT;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=123819855;WS=123819837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	123833457	rs6902416	G	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=10;PP=374;SC=CCTTTCGCCAGTGTCTTTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=123833465;WS=123833447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	123851538	rs12196787	G	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=201;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=49;SC=AGTAAATTTAGTTATTTAATA;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=123851546;WS=123851528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	123851590	rs12198164	G	A	104.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=76;SC=ATTTTTTCTCGCATATGAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=123851598;WS=123851580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	123851610	rs12198167	G	A	128.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=64;SC=ACACAAAAATGTATATCTAAA;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=123851618;WS=123851600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	123892001	rs2145735	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=491;SC=AGCAGGAACTGGAGGGGACAC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=123892009;WS=123891991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	124759037	.	TC	T	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=18;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=15;MQ=59.19;NF=2;NR=0;PP=36;QD=19.5;SC=TTTTTTTTTTTCTTAACCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=2;WE=124759045;WS=124759027;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
chr6	124979689	rs1479039	T	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=650;SC=CAGGTTAAACTAAACCATCCT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=124979697;WS=124979679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	125229538	rs781733	T	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=16;PP=1041;SC=AAAGAAATCATGTATCTATTA;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=125229546;WS=125229528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	125229856	rs781734	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=7;PP=275;SC=ATTTTGCCTGCTATGAATAAT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=125229864;WS=125229846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	125230075	rs781735	A	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=19;PP=646;SC=TTTGCCAACCATTGTTATTAT;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=125230083;WS=125230065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	125230575	rs1577203	G	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=8;PP=390;SC=ATTTTAAGTTGATTTTTTTAT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=125230583;WS=125230565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	125230965	rs1761559	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=14;PP=551;SC=TTTGATAGGGATAGTAATGAA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=125230973;WS=125230955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	125231037	rs1761560	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=10;PP=354;SC=GTCCATGAACGTGATATATCT;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=125231045;WS=125231027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	125231246	rs1750578	T	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=362;SC=CGTATATTGATTTTTGTATTT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=125231254;WS=125231236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	125232072	rs699387	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=14;PP=829;SC=CACAATTTTATAGTTTTGGGG;SOR=1.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=125232080;WS=125232062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	125232368	rs781740	G	T	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=24;PP=968;SC=ACCAGGGAAGGGAGATCTGAG;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=125232376;WS=125232358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	125232594	rs781741	C	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=50;SC=CATGGTGAAACCCCATCTCTA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=125232602;WS=125232584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	125232766	.	C	CA	102	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.42;NF=3;NR=4;PP=102;QD=15.2857142857;SC=GAATCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=7;WE=125232774;WS=125232756;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,7:0.58:12
chr6	125232853	rs6569400	A	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=257;SC=TTCCATGGACAGGGTGGTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=125232861;WS=125232843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	125233518	rs781742	A	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=34;PP=1468;SC=AAACATAACCACCTTGAAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=125233526;WS=125233508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	125252731	rs4896596	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=354;SC=CAATGTAATACTTTAGTGCTC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=125252739;WS=125252721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	125284457	rs9401790	T	C	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=34;PP=1246;SC=GATCCCTATGTGCCCCTCATG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=125284465;WS=125284447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	125366289	rs34249175	CA	C	923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=8;PP=418;SC=ATACTGTATACAAAAAAAAAA;SOR=2.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=26;WE=125366297;WS=125366279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	125402711	rs492800	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=39;PP=1194;SC=AGAGAGAATACGAGTGTAAAT;SOR=1.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=125402719;WS=125402701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	125475139	rs2277111	G	A	4823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=61;PP=2965;SC=CGATCGCCCCGAGAGTCAGGT;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=155;WE=125475147;WS=125475129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	125573194	rs3799734	A	G	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=25;PP=1021;SC=TAAGCGCCACAGGGCTGCGTG;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=125573202;WS=125573184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	125573312	rs3799733	C	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=559;SC=AGACAGTTCCCGTGACCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=125573320;WS=125573302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	125623268	.	C	CTCCTCT	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=878;SC=ACTCCTCCTCCTCCTCCCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=15;WE=125623276;WS=125623258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	126072853	rs2875881	C	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TTGAACTGTGCAATCACTCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=126072861;WS=126072846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	126202138	rs2295955	A	G	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=12;PP=696;SC=GTAATCATGCACTGAACATGA;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=126202146;WS=126202128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	126242004	rs4563736	CG	GC	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=586;SC=TTTTCAAGCACGGGTGTCCCT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=126242013;WS=126241994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	126249914	rs1567	T	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=21;PP=730;SC=GGGCATTTGATTGAAATTCAG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=126249922;WS=126249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	126288023	rs3757212	T	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=8;PP=825;SC=ACAAATGTTTTTTCCTTTAGA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=126288031;WS=126288013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	126307962	rs6569448	A	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=109;SC=TCCGAGACCAAACCCCTCGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=126307970;WS=126307952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	126319881	rs6569449	T	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=9;NR=9;PP=231;SC=TGAAAGCTACTTATTAGGCCT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=126319889;WS=126319871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	126334041	rs2206941	G	A	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=24;PP=1295;SC=CTTGAGAAGAGGCATGTGGCT;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=126334049;WS=126334031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	126669479	rs9401876	C	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=5;PP=189;SC=AAGGTGATTTCCAATTTGGAA;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=126669487;WS=126669469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	127471533	rs9491699	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=3;PP=415;SC=GTTAAGAGAACATAATGCAAG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=127471541;WS=127471523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	127471791	rs3734626	C	T	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=860;SC=AAGTCCTTTGCCAAAAGAACT;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=127471799;WS=127471781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	127476361	rs41285262	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=252;SC=AGCCAGCTGAGTCTGTTTCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=127476369;WS=127476351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	127476516	rs1892172	G	A	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=44;PP=1667;SC=AGGGTAACCTGTGTCCCCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=88;WE=127476524;WS=127476506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr6	127640190	rs9285460	A	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=6;PP=364;SC=TTTAGATTACATAAAATTCCA;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=127640198;WS=127640180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	127768762	rs6902288	G	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=42;PP=1427;SC=GATTCTTCCTGTTTTTCTGTT;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=127768770;WS=127768752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	127768950	rs2236027	A	C	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=8;PP=205;SC=TCAAAAGCAAACATAGCTAAA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=127768958;WS=127768940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	127770923	rs3818135	A	C	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.81;SOR=2.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	127771452	rs3734447	T	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=536;SC=ATCTTAGCACTTTCATTGATA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=127771460;WS=127771442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	127796326	rs12194762	G	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=173;SC=GCCCTGAGCGGGGGCTTCCCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=127796334;WS=127796316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	128030957	rs490008	G	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=553;SC=TATATCATAGGTTTCTGTAAG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=128030965;WS=128030947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	128040839	rs675531	T	C	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=29;PP=1446;SC=GTACCTGCTATTGCTGTGGCC;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=128040847;WS=128040829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	128291199	rs3190930	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=550;SC=CTAATTCAGTCCTTTTTATTA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=128291207;WS=128291189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	128297986	rs4321844	G	T	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=14;PP=881;SC=CTAGTTAGGAGAGTATAAAGC;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=128297994;WS=128297976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	128304358	rs113581270	A	AC	1847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=1331;SC=AAAAATAAAAAAAAGTCCACT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=34;WE=128304366;WS=128304348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	128307155	rs34209700	T	TA	102.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=93;SC=TGCCTTTTCTTAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=128307163;WS=128307145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	128312033	rs12055782	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=235;SC=CATTTAACCTAAGTGACAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=128312041;WS=128312023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	128312324	rs9388612	T	C	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=234;SC=AACTAAAATGTTGTGCCTATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=128312332;WS=128312314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	128322437	rs34601789	T	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=401;SC=AATCAGTAAGTATTAGCATTA;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=128322445;WS=128322427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	128327031	rs45582334	A	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=263;SC=TAGGTGATAGATAAAGTTTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=128327039;WS=128327022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	128330249	rs9321104	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=10;PP=1091;SC=GGTAAGTGAGTGGGACAGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=128330257;WS=128330239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	128385998	rs4897241	A	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=315;SC=TTCCTGTTTCATAAACTATAA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=128386006;WS=128385988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	128388799	rs35030557	G	T	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=49;NR=43;PP=1664;SC=TTCCCGGGGGGAGTTCTGCAG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=92;WE=128388807;WS=128388789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	128388990	rs4897242	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=450;SC=ATATTTAGAGATTTAAGATAC;SOR=1.547;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=128388998;WS=128388980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	128389074	rs4897243	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=TAACCTGGTATACTCTTTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=128389082;WS=128389064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	128403745	rs17828130	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=562;SC=CAGCCACTGGAACTGCAGGAT;SOR=2.066;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=128403753;WS=128403735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	128643529	rs6931769	T	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=468;SC=AAAAATATGCTAATCCATTCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=128643537;WS=128643519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	128661989	rs72972098	T	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=222;SC=AATGTCATCATAATTTTTGTT;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=128661997;WS=128661979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	129381026	rs4404787	C	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=28;PP=758;SC=TGACAATTACCCTGGATTTAC;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=129381034;WS=129381016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	129612624	rs1015846	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=319;SC=CCTAACAGGGCACTTAACAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=129612632;WS=129612614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	129622055	rs902373	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=701;SC=AATTTTTTGGAGAGATTTTTG;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=29;WE=129622063;WS=129622045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	129802716	rs2571581	A	T	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=164;SC=AACATTCCATATTTCCATGCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=129802724;WS=129802706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	129807714	rs2229850	G	A	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=40;PP=1500;SC=GACCAGAGCCGAATCTGTTTC;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=129807722;WS=129807704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	129813346	rs1889891	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=9;PP=444;SC=GGATCTTCAACTTAGACTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=129813354;WS=129813336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	129835370	rs13196682	T	A	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=76;SC=TGTCAAGTTTTAAAATTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=129835378;WS=129835366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	129905249	rs12197456	A	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=23;PP=709;SC=CTCCCTGAGGAACGTCAGCCT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=129905257;WS=129905239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	130031215	rs3752536	T	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=16;PP=591;SC=TTCCCGACGGTCTGGTCCTTG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=130031223;WS=130031205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	130152479	rs7758540	T	C	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=17;PP=639;SC=CAAGCAATTTTGATATACCTA;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=130152487;WS=130152469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	130152520	rs7776426	A	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=20;PP=660;SC=GTCAAGGGGAATTCCAACATA;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=130152528;WS=130152510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	130154686	rs4629709	A	G	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=36;PP=1386;SC=GGAACAAAAAACAATCCACAA;SOR=0.928;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=65;WE=130154694;WS=130154676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	130164764	rs9321190	G	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=18;PP=640;SC=GATGTTATAAGTGAAAACAGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=130164772;WS=130164754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	130164856	rs9402185	C	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=272;SC=CTATGCGATTCACCCACATTG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=130164864;WS=130164846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	130167131	rs12189832	A	G	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=607;SC=GACCCATGGAATGGGAATGAC;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=130167139;WS=130167121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	130370404	rs75575024	C	CCT	2926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=17;PP=1850;SC=TTAAATTTTGCCTTTCTGCTG;SOR=1.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=41;WE=130370412;WS=130370394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	130370731	rs142539365	TTG	T	1822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=12;PP=1373;SC=ACTGTCTTCTTTGTCCTAATG;SOR=1.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=30;WE=130370740;WS=130370721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	130371055	rs3890746	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=194;SC=CTCTTTCTTCCCTAACCCATA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=130371063;WS=130371045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	130374102	rs9388768	C	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=41;PP=1623;SC=AAAGCTGACACCAAGGAGGAT;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=130374110;WS=130374092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	130381246	rs7451021	T	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1223;SC=GCGTGGATCCTGAGCATCAGT;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=130381254;WS=130381236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	130387431	.	G	GTATATATATA	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.12;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	130387773	rs9402214	T	C	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=84;SC=GATGAAACCATGTTTATTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=130387781;WS=130387763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	130407505	rs9402215	G	A	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=284;SC=AAAATCATAGGAATAAGCAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=130407513;WS=130407495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	130466413	rs4897369	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.05;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	130466676	rs4897370	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	130483222	rs9321214	G	A	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=187;SC=AGGAATCAGCGTAAATTAACC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=130483230;WS=130483212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	130530815	rs1932100	C	T	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=17;PP=629;SC=GATCTCACAGCAGCTCTGAAG;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=130530823;WS=130530805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	130535420	rs4897377	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=328;SC=CAAACGTCACGCTCTAGCCAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=130535428;WS=130535410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	130535447	.	G	GA	841.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.505;NF=17;NR=7;PP=507;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GAAAGCTTGGGAAAAAAAAAT;SOR=1.136;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=24;WE=130535455;WS=130535437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr6	130536494	rs34071457	AT	A	1737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=46;PP=902;SC=TTGTGCCTTAATTTTTTTTTT;SOR=2.129;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=48;WE=130536502;WS=130536484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	130537005	rs2326951	G	A	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=17;PP=644;SC=TTTTCCGTTAGCAAGAAGAGG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=130537013;WS=130536995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	130761798	rs3813360	T	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=62;PP=2337;SC=TAGGAATTGCTATGGCCGTTC;SOR=0.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=109;WE=130761806;WS=130761788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	130761957	rs3813359	A	G	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=35;PP=1501;SC=TGCTTGGCCCATTCACCATGG;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=79;WE=130761965;WS=130761947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	131481394	rs67922791	CA	C	332.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=275;SC=ATTTAAAGTACAACTAAATGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=131481402;WS=131481384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	131490472	rs1408027	T	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=37;PP=1105;SC=TTTTTTTCAATTTTGTAACAG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=131490480;WS=131490462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	131900144	rs56325116	GC	AT	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=225;SC=TTTTTCCTTTGCTTATACTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=131900153;WS=131900135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	131900290	rs147146526	A	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=19;PP=1003;SC=CCCTTTGCTGACATCCCTAAT;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=131900298;WS=131900280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	131903954	rs142782396	G	GAC	720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=17;PP=793;SC=TAAACATCAAGACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=131903962;WS=131903944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	131904704	rs60712846	G	GA	365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=409;SC=TCCTTGACCTGAAACCAAGTC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=131904712;WS=131904694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	131904719	rs17599586	C	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=5;PP=218;SC=CAAGTCCCAGCTGACACTTTC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=131904727;WS=131904709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	131926259	rs59558743	CT	C	186.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.34;NF=8;NR=0;PP=167;SC=ATAAAGCTAACTTTTTTTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=131926267;WS=131926251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	131958485	rs9375819	A	C	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1541;SC=AGGAGCACTAATTTATTCTGA;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=131958493;WS=131958475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	131979652	rs9483311	C	T	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=110;SC=ACTTTTAACGCTGGTGGTTTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=131979660;WS=131979642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	131995313	rs9493048	A	G	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=270;SC=GCTTGTATCCAGAGTCACATG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=131995321;WS=131995303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	131997798	rs2286453	A	C	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=213;SC=AAGATATTAAACTTTCTGAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=131997806;WS=131997788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	132007162	rs9493053	C	T	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=107;SC=GAATTTATTTCTAAACCTTCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=132007170;WS=132007152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	132014885	rs3213694	G	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=273;SC=GACATTTTCTGGCCTTTTTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=132014893;WS=132014875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	132022285	rs199675686	TG	AT	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	132022419	rs201739285	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.30;QD=29.20;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	132039779	rs73001219	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=178;SC=ATCAATATATTGATCAGTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=132039787;WS=132039769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	132043349	rs378697	A	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1030;SC=ACTTTGAACTAATTTTTTCAA;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=132043357;WS=132043339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	132271952	rs7451102	G	C	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	132271959	rs12206231	T	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	132271980	rs6934749	T	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=29;PP=892;SC=GCGGGTCGCATGGGTCGCGCT;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=132271988;WS=132271970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	132649394	rs192506527	T	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;SC=AAAATAAAAATGACTTAAAGA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=132649402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	132824833	rs2842885	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=78;SC=TAATCTAATAGAGTTGAAATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=132824841;WS=132824823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	132859609	rs2842899	T	A	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=41;PP=1594;SC=CCTTCACTTCTAACAACTGCA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=132859617;WS=132859599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	132860522	rs2842898	C	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=190;SC=TTAAGGTCAACTGCAAAAATA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=132860530;WS=132860512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	132910612	rs3813355	G	A	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=28;PP=1404;SC=GAGAGCAGCAGGAAGTTGGTG;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=132910620;WS=132910602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	133032759	rs3798792	A	G	246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=181;SC=AGAATTGATCATGGATCTATG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=133032767;WS=133032749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	133035098	rs2294757	G	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=718;SC=AACAGCTGCAGTGAAAGTGTC;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=133035106;WS=133035088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	133035325	rs4897612	A	C	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=113;SC=AAAAGACCCTACCTTATTGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=133035333;WS=133035315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	133045812	rs2294758	G	A	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=40;PP=1892;SC=GATCTCGTCTGTTCGCTTCTC;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=94;WE=133045820;WS=133045802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	133045902	rs2294759	A	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=45;PP=1688;SC=AAGCTTGGTGAAGGTAAACTC;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=133045910;WS=133045892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	133048213	rs9493417	G	A	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=GATGTGATCAGTTAAGTCTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=133048221;WS=133048203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	133052616	rs4895943	C	T	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=34;PP=1242;SC=TTCTGAATGACAGTGATAGCA;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=133052624;WS=133052606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	133055610	rs764262	G	T	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.15;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	133055610	.	GGG	TGC	2803	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23;NR=40;PP=2803;QD=20;SC=AAGTATAAAAGGGTAATACCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=63;WE=133055620;WS=133055600;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr6	133055612	rs764263	G	C	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=1.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	133070995	rs4895944	G	T	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=40;PP=1319;SC=CACTTCAGCAGTGTGCAGACC;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=133071003;WS=133070985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	133072650	rs1883617	A	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=830;SC=GTGCATAAATACCACTTCCTG;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=133072658;WS=133072640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	133074645	rs9493425	A	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=29;PP=864;SC=CAAAATTACCATAGAAATGTA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=133074653;WS=133074635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	133074663	rs9493426	T	C	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=813;SC=GTATTTAATTTCCCGATTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=133074671;WS=133074653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	133077063	rs1883613	T	C	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=22;PP=909;SC=TAGGAGGACATGTGGAGTCAC;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=133077071;WS=133077053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	133078759	rs117133724	C	T	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=52;PP=2094;SC=CGTCTTCCACCAGCTCCCATG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=133078767;WS=133078749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	133079136	rs3901670	A	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=283;SC=CTTTATCATCATTTTTCTTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=133079144;WS=133079126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	133092046	rs1128998	C	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=17;PP=853;SC=TCCTTGAATACTCCAGTAGAT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=133092054;WS=133092036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	133094016	rs9402453	G	T	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=185;SC=AAATCATGAAGATTTAACATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=133094024;WS=133094006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	133108763	rs5880140	CT	C	86.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.98;NF=0;NR=5;PP=59;SC=AGCTGGTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=133108771;WS=133108753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	133119757	rs12211701	C	G	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=76;SC=CCGGAGCTCCCCAAAGCCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=133119765;WS=133119747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	133135807	rs9493450	C	T	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=24;PP=1487;SC=TGGCTCGTTGCGTTCTTGCTG;SOR=1.451;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=133135815;WS=133135797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	133135886	rs9483504	A	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=52;PP=1791;SC=TCAAGATTCAACTTCACCCGT;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=93;WE=133135894;WS=133135876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	133136029	rs12202407	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=217;SC=AGCGCGTCTGTTGTACACTTA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=133136037;WS=133136019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	133137088	rs3778175	T	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=23;SC=GCGATTCTTCTGCCTCCCGAG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=133137096;WS=133137078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	133138010	rs9389034	T	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=37;PP=1157;SC=ACCCTTCTGATTACAGCCACC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=133138018;WS=133138000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	133138067	rs58545558	ATTTT	A	688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=10;PP=251;SC=TATTAATGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.739;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=133138078;WS=133138057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	133138333	rs12199381	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=483;SC=TGCATTTCAGGAAAAAAATAA;SOR=2.124;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=22;WE=133138341;WS=133138323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	133703325	rs2235485	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=TTACATACTAATGGAGTCCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=133703333;WS=133703315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	133782125	.	C	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=170;SC=CAGCTGTTTCCTTTTAGAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=133782133;WS=133782122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	133827148	rs6929656	T	C	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=502;SC=CATGCAGTCTTCTCCCTCTTC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=133827156;WS=133827138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	134494548	rs1743965	C	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=497;SC=AGGGAGAATACAAAAGAGGAC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=134494556;WS=134494538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	134495291	rs3215438	T	TC	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=201;SC=AAAGTGAGTTTCTGGCTCTAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=134495299;WS=134495281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	135260303	rs7754722	T	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=313;SC=ACAAAGCCCATGATGTCACTG;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=135260311;WS=135260293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	135307386	rs72972146	T	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=78;SC=AGATTCACCATTACCATAACT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=135307394;WS=135307376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	135639644	rs6914831	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=536;SC=TACGTATGCTCAAAAACATTT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=135639652;WS=135639634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	135752608	rs2614270	T	C	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=163;SC=AATCAAAATGTAACTCACAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=135752616;WS=135752598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	135763585	rs2614274	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=145;SC=ACTTTCTTTGTTTGAAGAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=135763593;WS=135763575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	135763866	rs2757645	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=241;SC=AAAAACATACGTTTAAAAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=135763874;WS=135763856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	136359280	rs34030857	C	CG	1444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=20;PP=1013;SC=GAGGATCTTACGGGGGTTCGC;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=27;WE=136359288;WS=136359270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr6	136582497	rs62431284	G	T	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=8.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-4.112;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.963;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,89:0.61:145
chr6	136582591	.	C	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=33.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-4.522;QD=0.80;ReadPosRankSum=-4.085;SOR=3.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,35:0.16:223
chr6	136590613	rs62431285	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-2.340;NF=18;NR=4;PP=278;ReadPosRankSum=-4.073;SC=TGTAATCTTTTGGAGTTTTTT;SOR=0.821;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=22;WE=136590621;WS=136590603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr6	136590640	rs62431286	A	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-3.816;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.932;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
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chr6	136590712	rs62431288	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.248;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.452;NF=12;NR=24;PP=1513;ReadPosRankSum=2.627;SC=CAATGTCATGCCGAAGGTCAG;SOR=1.290;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=36;WE=136590720;WS=136590688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr6	136597004	rs7762367	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.296;NF=14;NR=7;PP=255;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CAAGAGGAACAGGTGCCATTT;SOR=1.227;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=21;WE=136597012;WS=136596994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr6	136597262	rs1967444	T	C	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.420;NF=53;NR=40;PP=1694;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GCCTTTCCACTACATATCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=93;WE=136597270;WS=136597252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,106:0.70:152
chr6	136597281	rs1967445	A	T	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=8.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=0.530;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,97:0.67:145
chr6	136597288	rs1967446	A	C	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=6.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.397;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr6	136598895	rs58951987	T	TA	215.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=242;SC=AAGTCAAGAGTAAAAACCGCT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=136598903;WS=136598885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	136599393	rs6940018	G	C	4329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.004;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=0.195;SC=AATATCACCGGATGTGGCTGA;SOR=0.945;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=253;TCF=101;TCR=152;TR=159;WE=136599412;WS=136599383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,187:0.62:300
chr6	136599404	rs6919254	T	C	3719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=0.222;SC=ATGTGGCTGATGACTTATTAA;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=94;TCR=143;TR=150;WE=136599412;WS=136599383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,174:0.63:277
chr6	136599822	rs9942517	C	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.760;NF=6;NR=13;PP=1620;ReadPosRankSum=0.397;SC=TCGTCTCATTCCTCTATTATT;SOR=1.145;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=19;WE=136599850;WS=136599812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr6	136599836	rs9942518	G	A	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-2.824;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr6	136599842	rs9942519	G	A	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-2.824;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=1.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr6	136681291	.	CT	C	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=58.47;NF=0;NR=5;PP=60;QD=12.6;SC=ACAATATGCACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=136681299;WS=136681281;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr6	136682172	rs2076190	G	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=366;SC=GCCTCCTCCCGCTCGCGCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=136682180;WS=136682162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	136698697	rs2076192	C	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=0;PP=23;SC=GCCTGCCTGGCGTCTGGTGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=136698705;WS=136698689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	137026266	rs9321567	T	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=5;PP=367;SC=TCTGGCAAATTATTTCCTGAA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=137026274;WS=137026256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	137113137	rs55666429	G	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=659;SC=CGTTCCAGAAGCTGCCCGGCG;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=137113145;WS=137113127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	137143611	rs1321470	A	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=49;SC=TTCAGTTTGGATTCACCCAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=137143619;WS=137143605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	137143709	rs1321471	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=7;PP=352;SC=CACACTTCCGTCCGGTCTGCC;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=137143717;WS=137143699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	137143980	rs11283064	G	GGGGGCC	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=301;SC=AGGCGGAGGCGGGGGCCAGCC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=137143988;WS=137143970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	137166682	rs927181	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=434;SC=TCATTGTTATGTAACAAGAGA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=137166690;WS=137166672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	137167445	rs9321575	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=592;SC=TTCTTTTGTGTTCTTAAGACT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=137167453;WS=137167435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	137187641	rs1884940	G	A	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=533;SC=AAATAAGTCTGAAGGTGGCAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=137187649;WS=137187631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	137323213	rs1342642	G	A	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=39;PP=1547;SC=TGCTGGGTGAGAGAAGTACCT;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=137323221;WS=137323203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	137325847	rs1555498	C	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=537;SC=GTAATAGATACGGGCAAAACA;SOR=1.765;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=26;WE=137325855;WS=137325837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	137338276	rs433243	A	G	3071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=47;PP=1574;SC=AGGTCTTAGTAGCAGAAAAGG;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=137338284;WS=137338266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	137338352	rs451371	G	T	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.20;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	137338357	rs442663	A	G	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	137477823	rs2064501	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=327;SC=GAAATTTATACAATCTTGGTC;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=137477831;WS=137477813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	137814666	rs146880588	C	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=20;PP=803;SC=CCTTGAGTAGCGAGTGGGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=137814674;WS=137814656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	138195961	rs71670547	TCTC	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	138197331	rs661561	A	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=858;SC=ATTCACATCTATAACTAGACA;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=138197339;WS=138197321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	138417415	rs2484067	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=286;SC=TCACGGGTCTTCTTTGTGGAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=138417423;WS=138417405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	138753337	rs2039121	C	T	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=23;PP=909;SC=AGCTGCCACTCTTGCCTGGGA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=138753345;WS=138753327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	138754323	rs2327891	A	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=24;PP=1783;SC=AAGTGTCTCAACTCCTGGGAT;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=76;WE=138754331;WS=138754313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	138820271	.	G	GAC	343.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=408;ReadPosRankSum=1.480;SC=CACACACATGGACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=138820279;WS=138820261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr6	139114113	rs6570282	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=55;SC=GCTGTAATTCACCATAACTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=139114121;WS=139114103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	139183733	.	G	A	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=28;PP=1366;SC=AATATATGAGGAAACTAACGA;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=66;WE=139183741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	139197609	rs1529151	G	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=29;PP=1140;SC=CAATCTTCAGGAAAGAAATGT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=139197617;WS=139197599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	139206582	rs59052100	TG	T	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=7;PP=984;SC=GCTTGCTCAGTGGAACAGTGG;SOR=2.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=23;WE=139206590;WS=139206572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	139207910	rs1188831	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=160;SC=CTGTATCAAGCGCCATAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=139207918;WS=139207900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	139208118	rs7764840	T	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=23;PP=777;SC=TCCAGTCTTTTGCAAAAGGAG;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=139208126;WS=139208108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	139229695	rs1188867	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.38;NF=10;NR=1;PP=261;SC=GCCTCCCAAAATGCTGGGATT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=139229703;WS=139229685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	139229743	rs1188868	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=9;PP=563;SC=AGTTTGATTACTTTTAATTGT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=139229751;WS=139229733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	139229872	rs1044418	C	T	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=28;PP=1353;SC=TGTTCATCAACTTCTGGCCTT;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=139229880;WS=139229862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	139232579	rs3765191	C	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=243;SC=AGAATATGTACCAAATCAGAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=139232587;WS=139232569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	139241332	rs9495285	A	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=12;PP=607;SC=TTCAAATGGAAGATGTAATAC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=139241340;WS=139241322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	139264930	rs6899737	T	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=86;SC=ATGTCTTTGATATTATGAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=139264938;WS=139264920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	139265882	rs1188897	T	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=281;SC=TTTTCTGTTCTATTAGAAATT;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=139265890;WS=139265872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	139456761	rs185694700	T	C	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.64;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	139487394	rs7768941	T	C	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=7;NR=0;PP=159;SC=AAATCTGAAATCTGTTCTCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=139487402;WS=139487384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	139487836	rs3173082	T	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=47;PP=1627;SC=GGCCCCCAAATAAGCCCCAGA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=139487847;WS=139487826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	139591891	rs62441202	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=224;SC=TCTCTTCCTCTGGAAGTAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=139591899;WS=139591881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	139598061	rs66961117	TA	T	338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=235;SC=TTCTTTGCCTTAAAAAAAAAA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=139598069;WS=139598051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	139610124	rs55712380	G	T	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=64;SC=TCAATGGTAAGGATATCCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=139610132;WS=139610114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	141004964	rs5880480	G	GT	1542.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=889;SC=GTGTCCCCTGGCACGCTATTT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=21;WE=141004972;WS=141004954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	141005059	rs4535568	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=11;PP=436;SC=GCATATTTCCGTCACAAGTGG;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=141005067;WS=141005049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	142455130	rs225607	C	T	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=35;PP=1383;SC=GAGAAGTAAACCTCTTCTGTT;SOR=1.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=142455138;WS=142455120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	142455731	rs9376674	C	A	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=917;SC=CTTTATGCTGCATGTAAAAGC;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=142455739;WS=142455721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	142487263	rs225655	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=85;SC=TTTCTAAATTTACTTGAATTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=142487271;WS=142487255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	142487469	rs225656	C	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=215;SC=TGTAAGTTAACCACTGATCAT;SOR=0.990;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=142487477;WS=142487459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	142490211	rs11758623	A	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=188;SC=CGGCCGAGAGATATTATTTTA;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=142490219;WS=142490201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	142491463	rs11446143	C	CG	463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=5;PP=427;SC=TAAACTAGACCGCTCTCTTTT;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=142491471;WS=142491453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	142491584	rs225663	A	G	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=249;SC=TTATTGTCTTATTAGCTGAAG;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=142491592;WS=142491574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	142510676	rs3830800	GTATT	G	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=727;SC=ATAATGGTATGTATTTATTTA;SOR=1.127;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=142510687;WS=142510666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	142718801	rs989946	G	A	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=44;PP=1610;SC=ATACTAATTTGGAAGGAAAAA;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=81;WE=142718809;WS=142718791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	142758631	rs1262686	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=28;PP=1148;SC=CAGTGGCGGCAGCATCTCTGC;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=53;WE=142758639;WS=142758621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	143081847	rs197462	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=354;SC=AGATCCAAATATCAAGGTTAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=143081855;WS=143081837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	143091263	rs109836	A	G	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=23;PP=1197;SC=CTTGCTGGGCAGGAATGGCTC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=143091271;WS=143091253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	143382254	rs138059311	CGT	C	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.185;NF=3;NR=2;PP=186;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CCTGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=1.136;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=5;WE=143382263;WS=143382244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr6	143754938	rs3761999	G	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=466;SC=CGAATGGTACGATACATTAAC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=143754946;WS=143754928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	143766276	rs9373391	A	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=220;SC=AACTTTGGGGATTTAAAAAGT;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=143766284;WS=143766266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	143784031	rs3830767	AT	A	1681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=24;PP=972;SC=GACCTTTTTTATTTTTTTTGT;SOR=1.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=43;WE=143784039;WS=143784021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	143789181	rs161068	A	T	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	143792675	rs22908	T	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=352;SC=GGCTTTTAGGTTTGTTTTTTC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=143792683;WS=143792665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	144081768	rs2073215	C	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=21;PP=574;SC=AAACACGACCCGAGAGGCTGG;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=144081776;WS=144081758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	144093352	rs1018463	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=249;SC=CCAAGGGTTGCTCTGAGCTTC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=144093360;WS=144093342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	145051680	rs111517215	A	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=605;SC=CAAAAAACCCAAAATCAAGTA;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=145051688;WS=145051670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	145075960	rs377062269	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=20;PP=526;SC=CTGGACTGATCGCATTAATTG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=145075968;WS=145075950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	145992330	.	TA	T	365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=5;PP=215;SC=GCGAGCAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.371;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=13;WE=145992339;WS=145992320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	146007166	rs702322	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=109;SC=CCCAAGTGAGGCACTGCAGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=146007174;WS=146007156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	146012061	rs2142978	T	C	147.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	146056476	rs2235482	G	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=457;SC=GCTCCTGCAGGGCCAGGGCCC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=146056484;WS=146056466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	146056681	rs111332144	C	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=110;SC=TCCCCGCGGCCGGCAGGCGCG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=146056689;WS=146056671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	146112348	rs6931553	T	C	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=2;NR=4;PP=82;SC=GGCCTCCAGGTCTGTGACAGG;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=146112356;WS=146112338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	146234644	rs9497426	G	A	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=10;PP=467;SC=CACAGATTGGGCAAGGTTCTG;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=146234652;WS=146234634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	146243581	rs6917482	C	T	194.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=147;SC=TTTTTCTTTCCACTAGATATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=146243589;WS=146243571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	146244743	rs6923545	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=11;PP=633;SC=TGCTTTTAAAATTATGAGTAG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=146244751;WS=146244733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	146254100	rs55757353	T	TC	77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=74;SC=GGGGGAAAAATCCCCCCCCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=146254108;WS=146254098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	146262697	rs9285508	G	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=940;SC=ACTACTCAAGGTCCCCTAATT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=146262705;WS=146262687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	146268623	rs9386141	T	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=453;SC=TACTATACCCTCCTACCTCGG;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=146268631;WS=146268613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	146273769	rs9386142	C	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	146975456	rs71778473	TTA	T	162.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=118;SC=AGTTTTGGTATTATATATATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=146975465;WS=146975446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	146987930	rs9403802	C	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=20;PP=997;SC=CTACCTGTAACATTATGCATG;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=146987938;WS=146987920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	147042695	rs11273150	A	AGGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC	1575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.75;QD=43.77;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	147047341	rs3747754	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=35;PP=1195;SC=CCAGTAAGTATTTTTGCAACA;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=147047349;WS=147047331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	147049641	rs11155480	T	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=256;SC=TTTTAACAGATATTAATTTGT;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=147049649;WS=147049631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	147049899	rs1327669	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=473;SC=TGGGATACAATGTTCAGAAGA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=147049907;WS=147049889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	147054241	rs146394886	A	ATTAATGTAC	662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=1544;SC=TATAAAAAAAATTTATGTGTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=147054249;WS=147054231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	147054410	rs67991595	T	TA	912.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=723;SC=GAATTGTATATATTTAATCAA;SOR=1.358;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=147054418;WS=147054400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	147054450	rs3761782	A	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=366;SC=AAGGTAAATAATTTAAGAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=147054458;WS=147054440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	147054498	rs3761783	G	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=TGTGTGGACTGTCATGGAGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=147054506;WS=147054488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	147062220	rs1327666	C	T	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=187;SC=TAAGAATTCACATCAAGGGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=147062228;WS=147062210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	147066954	rs9647636	G	A	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=160;SC=CTTGGGACCTGTAGGTATATC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=147066962;WS=147066944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	147067093	rs9647637	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=28;PP=1111;SC=CATTTACAGGCGACACATATG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=147067101;WS=147067083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	147073639	rs140827988	TATA	T	1762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=1453;SC=CATACTTGCTTATAATGTTAA;SOR=2.419;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=147073649;WS=147073629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	147084985	rs7752601	T	C	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=104;SC=TAGTCAGTAATAACTATGTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=147084993;WS=147084975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	147103416	rs259405	C	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=297;SC=AGGACAAAACCGTGAAACATT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=147103424;WS=147103406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	147136212	rs1052444	A	T	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=18;PP=877;SC=ACATCCGGGAAGAGTACAGAA;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=147136220;WS=147136202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	147136244	rs259370	A	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=24;PP=993;SC=GAAGCTGAGCACCTAAAGCTG;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=147136252;WS=147136234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	147136444	rs1052449	A	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=84;SC=ATTAGGCCAAATGAAAATAGA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=147136452;WS=147136434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	147631201	rs6928919	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=603;SC=AATAATCTTAATATGTATTTT;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=147631209;WS=147631191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	147635318	rs5880705	T	TAC	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=162;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTGGATTATTTACACACACAC;SOR=0.160;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=4;WE=147635326;WS=147635308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr6	147635385	rs1039083	C	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=382;SC=TTTATACAGTCATCTTTTTTT;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=147635393;WS=147635375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	147635547	rs1039085	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=165;SC=TGTTAACTTACTGGACAGGTA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=147635555;WS=147635537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	147680359	rs9390459	A	G	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=39;PP=1453;SC=CCCCTTGTCTATGGGTTGGAA;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=147680367;WS=147680349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	148761456	rs2272998	G	C	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=952;SC=GAAGCCTGCTGCTCTGACCAC;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=148761464;WS=148761446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	148761603	rs9498038	C	A	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=130;SC=TAGGTCCATGCTGACGGAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=148761611;WS=148761593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	148829952	rs1147863	G	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=29;PP=1609;SC=GAGTGGGGAGGGGGGTGGGAG;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=148829960;WS=148829942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	148835436	rs145246370	CT	C	779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=487;SC=ACCTGATTAACTTTTTCCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=14;WE=148835444;WS=148835426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	148848919	rs2110198	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=202;SC=CTTTGGGCTGCTCAGCACCGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=148848927;WS=148848909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	149275131	rs10080254	T	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=455;SC=TTTCTTCTAATGAACAGTTAC;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=149275139;WS=149275121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	149285719	rs3734377	A	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=203;SC=GTCGCATGCAAAAGGCGGTCT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=149285727;WS=149285709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	149340390	rs2275423	G	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=45;PP=1610;SC=CTAAAGCAGGGTCATGGCATG;SOR=1.275;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=72;WE=149340398;WS=149340380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	149539773	rs2272901	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=649;SC=GAAGACTAATGCTCAGTGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=149539781;WS=149539763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	149700805	rs2031450	G	A	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=7;PP=159;SC=AGTATTATATGTATATACATT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=149700813;WS=149700795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	149903816	rs117938827	A	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=138;SC=GTTTTAGAATAGAAAATATAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=149903824;WS=149903806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	149953835	rs9322202	A	G	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=606;SC=CCTCCTCCTAAATATAATCAA;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=149953843;WS=149953825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	150064968	rs58509133	C	CT	439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=436;SC=AGCAAAGAGCCATGAGTGCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=150064976;WS=150064958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	150184722	rs187967019	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=18;PP=839;SC=GGGGCAGCTCCACCACGGCCA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=150184730;WS=150184712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	150211123	rs2151910	A	T	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=12;PP=621;SC=CTGGTGGCATATACCTTCTTC;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=150211131;WS=150211113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	150263186	rs4343924	A	C	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=96;PP=2965;SC=CAAGTCTCTCATCCCTAGCGC;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=91;TCR=96;TR=187;WE=150263194;WS=150263176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr6	150341990	rs9397120	A	G	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.15;QD=44.71;SOR=1.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	150341993	rs9384047	C	A	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.44;QD=43.40;SOR=1.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	150342396	rs9479414	G	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.96;QD=30.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	150343211	rs202055124	A	G	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.33;QD=27.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	150346740	rs1544123	A	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=358;SC=AGTCACCTCGATTCTGAAAAG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=150346748;WS=150346730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	150387302	rs669009	A	T	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.07;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	150387312	rs6935471	A	G	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	150390313	rs622317	G	C	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=24;PP=565;SC=GGCCCCGTCCGGTCCCGTCCC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=150390321;WS=150390303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	150713769	rs672766	C	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=135;SC=GGAGGAATTACGGAAGTTAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=150713777;WS=150713759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	150716696	rs612421	T	C	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=28;PP=704;SC=CTCACAAGGCTGCCCAGGTGC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=150716704;WS=150716686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	151219963	rs149723194	G	GATT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=91;SC=GTATAGGGAAGATTATTATTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=151219971;WS=151219953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	151220245	rs803419	A	G	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=161;SC=AATATCTTTGATATTTTCTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=151220253;WS=151220235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	151247439	rs803455	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=20;PP=610;SC=TGGGTAAGACACCATCTAACA;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=151247447;WS=151247429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	151258127	rs742830	G	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=449;SC=TGGGGGGAGAGAATTGTAAAA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=151258135;WS=151258117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	151259770	rs6933598	C	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=113;SC=TGTCCCTTGGCCTGTGTCCAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=151259778;WS=151259760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	151260002	rs3734416	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=446;SC=ATTAAGGCTCTGAAACCCCAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=151260010;WS=151259992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	151266504	rs803445	C	T	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=221;SC=CTAAATAGTTCGGTTATAAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=151266512;WS=151266494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	151266717	rs803444	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=189;SC=AGAAAATATCGTAGAAACGCA;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=151266725;WS=151266707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	151270369	rs803471	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=353;SC=ATCCTGTCCAGTGATCTTCCC;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=151270377;WS=151270359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	151281567	rs1771798	T	C	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=42;PP=1417;SC=TGTTTCCAACTCGGAAGCTTC;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=151281575;WS=151281557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	151281707	rs1771796	A	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=ATGTTTGCCTAACTGCTTCCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=151281715;WS=151281697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	151286224	rs1627462	A	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=44;PP=1412;SC=GGATTGCCACACAATGTGAAC;SOR=1.206;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=71;WE=151286232;WS=151286214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	151561921	.	TG	T	42	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=42;QD=28.0;SC=GGGGTGGGGGTGGGGGGGTCC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=151561929;WS=151561911;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	151626774	rs9397388	T	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=412;SC=AACTTCCTTTTCTCTGTATTT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=151626782;WS=151626764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	151665302	rs6941075	T	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=49;SC=TGGGTTTTTCTTGAAATCTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=151665310;WS=151665292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	151669459	.	CAAAA	C	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.6684;HP=19;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=57.92;NF=2;NR=1;PP=43;QD=15.3333333333;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=3;WE=151669470;WS=151669449;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr6	151669875	rs10872670	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=9;PP=540;SC=AGATGTGAGCAAAAGAGACTC;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=151669883;WS=151669865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	151670172	rs3734799	A	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=28;PP=1137;SC=TGGCGACCACAAGGACCCCAG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=151670180;WS=151670162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	151670897	rs900654	T	C	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=44;PP=1376;SC=CTCAGGAAGCTGAACCTGCCA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=151670905;WS=151670887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	151674116	rs3842128	T	TGAG	7525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=58;PP=2924;SC=GTGTAGCAATTGAGGATTTAG;SOR=1.096;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=103;WE=151674124;WS=151674106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	151674326	rs3823310	A	C	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=30;PP=1105;SC=AAGGAGAGGAACCTCAGGCCT;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=151674334;WS=151674316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	151686905	rs11155787	C	T	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=72;PP=2582;SC=GACTCCCTTCCTCAAATGTGC;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=118;WE=151686913;WS=151686895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	151742541	rs4870017	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=12;PP=243;SC=AAATCTGAAGTGGCATAATTT;SOR=1.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=151742549;WS=151742531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	151857370	rs1532401	T	C	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=16;PP=1185;SC=TGCTTCTGCCTTTAATCTGGC;SOR=1.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=151857378;WS=151857360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	151857594	rs6931664	A	G	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=45;PP=1327;SC=AAGATAATGCATTTCCAGCAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=67;WE=151857602;WS=151857584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	151859314	rs4870034	A	G	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=46;PP=1966;SC=GAGTTCAGGAACTAGAAGAAG;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=94;WE=151859322;WS=151859304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	151869725	rs3842129	A	AT	339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=183;SC=ACTGATTACGATTTTTTTTAT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=151869733;WS=151869715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	151894278	rs4242277	G	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=224;SC=ACTTCTAATGGTATTGTCTTC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=151894286;WS=151894268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	151894505	rs953767	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=27;PP=999;SC=AGCCAGTACTTCTCATTTAGG;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=151894513;WS=151894495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	152201875	rs4986934	T	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=18;PP=588;SC=GCCGGCTCCGTAAATGCTACG;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=152201883;WS=152201865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	152265282	rs55740371	A	AT	1585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=11;PP=756;SC=AAATAAACTAATTTTTTTTTC;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=36;WE=152265290;WS=152265272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	152265522	rs1801132	G	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=32;PP=1309;SC=CTGAGCCCCCGATACTCTATT;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=152265530;WS=152265512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	152382014	rs9322354	A	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=24;SC=TTTTTTGTTAAAGATTTAGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=152382022;WS=152382004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	152382311	rs2273206	G	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=388;SC=TTTATTTGTAGTTTTCAACCA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=152382319;WS=152382301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	152446316	rs2813561	C	T	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.72;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	152446320	rs2813562	C	T	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=1.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	152446487	rs2813563	C	T	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=43;PP=1521;SC=TGTCTAAAGCCTCTGGTCATA;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=152446495;WS=152446477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	152489037	rs997389	TT	GC	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=45;PP=2947;SC=ATTAACCTTTTTGTCCAGCTC;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=92;WE=152489046;WS=152489027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	152489294	rs998147	T	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=46;PP=1071;SC=TCCACACAGCTGTCCTCTGCC;SOR=2.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=152489302;WS=152489284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	152522812	rs2673776	T	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=587;SC=GCCATACAAGTTTCACCTGAG;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=152522820;WS=152522802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	152522926	rs2253512	G	A	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=44;PP=1425;SC=GAGGCACACAGGTGACGGTGA;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=152522934;WS=152522916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	152523143	rs2635441	G	A	151.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=139;SC=ACTGGGGGGGGAAAAGAAAAG;SOR=3.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=152523151;WS=152523133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	152540278	rs2147377	A	C	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=353;SC=TCATGGAGAAAAAAGAGGGAA;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=152540286;WS=152540268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	152629586	rs9371581	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=17;PP=698;SC=AATCAAGCCAGTTTCCTGCCC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=152629594;WS=152629576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	152629617	rs9383985	C	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=21;PP=763;SC=GCCTACATTCCTCTCACCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=152629625;WS=152629607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	152629772	.	GA	G	40	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=40;QD=14.6666666667;SC=AGCTTCCTTTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=152629780;WS=152629762;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr6	152629815	rs4112833	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=20;SC=TTTTTCTCTACCAATAACTAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=152629823;WS=152629805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	152631256	.	CA	C	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5048;HP=13;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=17;MQ=58.34;NF=0;NR=6;PP=94;QD=16.5;SC=AAACATTTTGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=152631264;WS=152631245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr6	152688567	rs7775637	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=508;SC=CAGAGACAAACTGCAAAGCTA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=152688575;WS=152688557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	152697706	rs214955	C	T	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=36;PP=1047;SC=GAAAAGGTGACGCAAAAATTT;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=152697714;WS=152697696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	152708310	rs214950	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=10;PP=693;SC=CCTGGACTTCGCAATTAGACG;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=152708318;WS=152708300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	152711395	rs214943	T	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=248;SC=TTAAACAAACTCTAAAAATAG;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=152711403;WS=152711385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	152717896	rs78034368	T	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=917;SC=TCTATGTTTGTTAAACTAACC;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=152717904;WS=152717886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	152719602	rs488673	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=522;SC=TTATCATGTTGTCTATTTCCT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=152719610;WS=152719592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	152721029	rs214951	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=309;SC=TTCACTATGGTACTGTTTTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=152721037;WS=152721019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	152722228	rs177330	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=417;SC=ACAGAACTACAATCACCATTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=152722236;WS=152722218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	152725253	rs28402070	C	T	32.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=30;SC=TATATATATACACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=152725261;WS=152725243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	152751426	rs554608	A	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=314;SC=AGAAAATGGCATACCTACCTT;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=152751434;WS=152751416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	152751558	rs553642	C	T	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=626;SC=ATTTATTGCACTTACCCACAA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=152751566;WS=152751548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	152768796	rs502268	T	G	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=30;PP=997;SC=ACAGTGCAATTGTGAAATCAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=152768804;WS=152768786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	152772264	rs214976	A	G	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=26;PP=977;SC=GCATTCTTCTACAGAGGCTAA;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=152772272;WS=152772254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	152774917	rs214973	A	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=15;PP=541;SC=CACCAGGCACAATCAGCCTCT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=152774925;WS=152774907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	152776750	rs214968	G	A	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=28;PP=835;SC=CAATCATAATGTGATGCTGCT;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=152776758;WS=152776740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	152777819	rs214967	G	A	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=15;PP=1026;SC=CTCCACCTCTGACTTGTAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=152777827;WS=152777809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	152779933	rs34610829	G	A	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=33;PP=1179;SC=TGTGCCTCACGCTCAAGAACT;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=152779941;WS=152779923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	152782628	rs506181	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=420;SC=ACAAAAGCATCGTTAACAAGT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=152782636;WS=152782618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	152782933	rs579464	G	A	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=556;SC=CTTAACTTCCGGATTCCACAG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=152782941;WS=152782923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	152793412	rs4523096	C	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=31;NR=16;PP=818;SC=AAGAGACTTCCTTTAAATGCA;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=152793420;WS=152793402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	152793572	rs4331993	T	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.48;QD=42.15;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	152793575	rs4343926	A	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.46;QD=41.76;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	152805889	rs9397512	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=4;PP=277;SC=TGTTGCCATACCACTGTGTAG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=152805897;WS=152805879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	152809527	rs9397106	A	T	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=449;SC=TCTCCATACAATACCTGATAT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=152809535;WS=152809517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	152847310	.	G	A	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=28;PP=1004;SC=GGAGGTTTCCGCTGTAAAAGC;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=152847318;WS=152847300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	153296541	rs2073260	G	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=39;PP=1909;SC=GTTTCAAGTTGTACAATCCTA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=153296549;WS=153296531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	153296772	rs9479472	A	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=114;SC=AAAAGAACATAACATTTACAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=153296780;WS=153296762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	153311001	rs3860814	A	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.33;QD=28.85;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	153315921	rs3799133	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=483;SC=AAAAGGAGATGAACATGGAGA;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=153315929;WS=153315911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	153323594	rs3818123	C	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=21;PP=666;SC=CCGCAGCTCCCGCTCCTTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=153323602;WS=153323584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	153323709	rs3818125	T	C	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.09;QD=26.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	153323896	rs3818127	T	C	174.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=5;PP=115;SC=ACACCCAGAATTTGGAGATAA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=153323904;WS=153323886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	153332926	rs34837755	AATAAT	A	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	153345647	rs2073259	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=17;PP=695;SC=GAGACAGAACGGGGCCGTGAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=34;WE=153345655;WS=153345637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	154360508	rs6912029	G	T	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=30;PP=1035;SC=CAGATGCTCAGCTCGGTCCCC;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=154360516;WS=154360498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	154361048	rs12209447	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=285;SC=TCCCAAGGCTCAATGTTGGGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=154361056;WS=154361038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	154414446	rs540825	A	T	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=21;PP=773;SC=CTCTAGAGCAAGGCTGCTTGG;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=154414454;WS=154414436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	154414563	rs675026	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.31;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	154414573	rs562859	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	154415434	rs660756	G	T	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=28;PP=1041;SC=AAGTGGAGTGGCGATTTGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=154415442;WS=154415424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	154428702	rs650245	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=17;PP=710;SC=AGTCTAGAGCATTAATTTTGA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=154428710;WS=154428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	154431393	rs497332	C	G	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=72;SC=AATCTATGTACCTTTGGGGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=154431401;WS=154431383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	154727825	rs12528985	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=476;SC=CAATCCCAGCCGGGCGTGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=154727833;WS=154727815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	154735973	rs13219628	C	T	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=159;SC=TTGCCTGTTACCCCAGCACTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=154735981;WS=154735963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	154749225	rs9384217	A	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=12;PP=1057;SC=CTGTTTAAACACACAACAGAT;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=154749233;WS=154749215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	154762394	rs9384219	A	G	388.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.31;MQRankSum=3.087;QD=20.45;ReadPosRankSum=2.210;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr6	154771277	rs9322467	A	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=474;SC=CCTGGTGTCCAATCCGTGTGA;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=154771285;WS=154771267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	154771449	rs4870285	T	C	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=38;PP=1005;SC=ACCCACCCCCTGCAAACTGCC;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=154771457;WS=154771439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	155152311	rs911191	C	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=174;SC=AAAGAGGTTGCCTCTCTGTAT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=155152319;WS=155152301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	155485535	rs1032140	G	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=16;PP=1069;SC=AATCACCTCTGTTTTTGCTTT;SOR=1.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=155485543;WS=155485525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	155485554	rs1032141	G	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=28;PP=1240;SC=TTAAGATCCAGCAATGGGAGC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=155485562;WS=155485544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	155561564	rs11751085	C	T	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=226;SC=CCTCTGAGATCCCTGCTGAGC;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=155561572;WS=155561554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	155561760	rs4259257	T	C	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=25;PP=1181;SC=TCCTCCGAGGTCTCTGGCCCG;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=155561768;WS=155561750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	155571113	rs3011902	A	G	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=52;PP=1643;SC=GGTCCGTGAGACATCTGCACC;SOR=1.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=155571121;WS=155571103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	155574207	rs2274824	T	C	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=31;PP=1052;SC=TCGTGCAGTATGATGCCAGAA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=155574215;WS=155574197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	155577823	rs1571766	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=23;PP=1081;SC=CAGATTTTGCCGACAATCTCA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=155577831;WS=155577813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	155579246	rs3734322	A	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=25;PP=856;SC=ACAGAAAAATAAGAATTTTAC;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=155579254;WS=155579236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	155581289	rs4869849	C	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=467;SC=CCGTCACAGGCCTGAACTAAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=155581297;WS=155581279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	155581619	rs912721	G	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=561;SC=TAAAACAGGAGGATGGGCTGT;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=155581627;WS=155581609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	155596901	rs927718	T	C	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=38;PP=1312;SC=TGGCCTTATCTGGGGTCTCTG;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=155596909;WS=155596891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	155606325	rs324356	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=32;PP=1361;SC=GTCCTGGAATCGTAAAGATGT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=155606333;WS=155606315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	155606531	rs324357	A	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=115;SC=ATTTGAAAAGAATGGGCTATC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=155606539;WS=155606521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	155635585	rs162981	A	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=382;SC=GCACCATCCAACCCTACCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=155635593;WS=155635575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	155635624	rs1334688	A	G	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=175;SC=GCTCCGAAAGAAACGCGCAGG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=155635645;WS=155635614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	155635637	rs1334687	A	C	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=91;SC=CGCGCAGGGGAGGAACCTGCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=155635645;WS=155635614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	155732616	rs35270935	C	CT	541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.651;NF=1;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAATAACATGCTTTTTTTTGT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=19;WE=155732624;WS=155732606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr6	155744013	rs1889503	C	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=14;PP=446;SC=AGGAATGCAGCCTATTTGACC;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=155744021;WS=155744003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	155750219	rs231955	G	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=25;PP=762;SC=CTTTGTCCTCGAAATAATAAA;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=155750227;WS=155750209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	155774608	rs34960420	C	T	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=50;PP=2130;SC=GCCTCCTCCACGGTCCTCTGC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=106;WE=155774616;WS=155774598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	155775980	rs12195525	G	T	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=19;PP=1150;SC=ATAAGGTTTCGACTGACAGGT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=155775988;WS=155775970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	155776854	rs6906426	T	G	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=18;PP=1455;SC=TCAATCTATATATTTAAAGTT;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=155776862;WS=155776844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	157101072	rs1261893	A	C	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=281;SC=GAACTTTCTCACACCTTTAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=157101080;WS=157101062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	157405761	rs3734440	G	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=11;PP=776;SC=TCATCCAAACGTGTCACTCTA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=157405769;WS=157405751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	157405930	rs3734441	G	A	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=35;PP=1492;SC=CCCCACATGCGTCCCCTCATC;SOR=0.887;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=77;WE=157405950;WS=157405920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	158014255	rs905924	C	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=283;SC=CCCTGCGCCACGGAACACTCA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=158014263;WS=158014245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	158066690	rs17165463	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=321;SC=GTGCCCGGGGGTGTTTCGGTT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=158066698;WS=158066680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	158068481	rs616538	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=739;SC=CCGCCCGCCCTGGTGGAATGG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=158068489;WS=158068471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	158074504	rs636169	A	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=18;PP=800;SC=GTGCTGCTGCATCTCTGGCTT;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=158074512;WS=158074494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	158361899	rs912879	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=858;SC=GATTGATGTTCTGATTTGGGT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=158361907;WS=158361889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	158475941	rs2296510	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=5;PP=460;SC=GGAAAAACCATGGCCTCCTTG;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=158475949;WS=158475931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	158487406	rs1009012	A	T	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=850;SC=AGGCAGCCTCATCTGTCTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=158487414;WS=158487396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	158487734	rs3215807	C	CT	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=624;SC=ACGCTTGACCCTTTAGTGGCC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=158487742;WS=158487724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	158490779	rs751873	C	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=310;SC=TTTGACTTCCCCCTCCTCCCC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=158490787;WS=158490769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	158497717	rs2296508	T	C	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=49;PP=1334;SC=AGTATGACGTTGGCTCAGCCG;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=158497725;WS=158497707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	158499097	rs3831094	G	GT	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=275;SC=ACGTGGGGTGGTTCGTGGCGC;SOR=2.448;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=158499105;WS=158499087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	158499302	rs2296507	G	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=598;SC=AGCTACAAGCGTCTGATCACA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=158499310;WS=158499292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	158502137	rs2256014	G	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=227;SC=TGTTCCTAACGCAGACCTGTG;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=158502145;WS=158502127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	158502590	rs173263	C	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=20;PP=605;SC=ATCAATCCCTCTTTTTATGTG;SOR=1.206;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=32;WE=158502598;WS=158502580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	158504981	rs2236401	C	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=31;PP=1597;SC=GAAGACTGAGCCTTTCCCCCT;SOR=1.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=80;WE=158504989;WS=158504971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	158505088	rs1744173	A	G	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=44;PP=1551;SC=ATCAGCCTGGAGTCTCGGACA;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=158505096;WS=158505078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	158509750	rs350289	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=28;PP=1161;SC=GCACCCATGGACAGTATTCAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=158509758;WS=158509740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	158517308	rs2502601	A	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=25;PP=906;SC=CCAGATCATGAACACAAAACC;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=158517316;WS=158517298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	158517451	rs2502600	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=384;SC=CTCCCTCTAGACATCCCTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=158517459;WS=158517441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	158535720	rs150169784	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=187.87;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr6	158536116	rs2502604	A	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=396;SC=CTTTCTTTTTAAAAAAAATGG;SOR=5.549;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=158536124;WS=158536106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	158924088	rs914690	T	C	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=28;PP=1208;SC=TGGGTGAGGATGTTTGGGTTC;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=158924096;WS=158924078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	158994577	rs4709217	T	G	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=53;PP=1709;SC=TTTTTACTCATTGAATCTTTT;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=91;WE=158994585;WS=158994567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	159129551	rs9456341	C	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=160;SC=GTGCCTGGAGCGGGTCACAAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=159129559;WS=159129541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	159166486	rs6914168	A	G	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=141;SC=GAAGTAACTTATTATATCTGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=159166494;WS=159166476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	159181885	rs3127155	G	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=209;SC=TCCTTTCTACGTCCCCGTGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=159181893;WS=159181875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	159183351	rs9347251	T	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=527;SC=TAACAACACATATTAAAGACC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=159183359;WS=159183341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	159184462	rs2291387	A	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=25;PP=1115;SC=TGAGGCAGTCAAGCTTGGAGT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=159184470;WS=159184452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	159185427	rs7775997	G	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=158;SC=ATGTGGACTTGAGGTGAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=159185435;WS=159185417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	159185563	rs3123101	T	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=14;PP=675;SC=GCATGCTCACTATCGAAGCTC;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=159185571;WS=159185553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	159188128	rs2242318	A	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=739;SC=ATTAAGCAGCATTGGTCTAGT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=159188136;WS=159188118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	159188282	rs9364994	T	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=674;SC=ACAGAGCCCCTTGGGCCTCAC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=159188290;WS=159188272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	159191788	rs3212308	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=465;SC=AGCCCCAGGGCGCCTGACCTC;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=159191796;WS=159191778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	159192045	rs1038537	A	G	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=167;SC=GGGCCACCCTAGCCTGCTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=159192053;WS=159192035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	159192575	rs3127181	A	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=194;SC=TCTCGGCACTAGGAATGTGCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=159192583;WS=159192565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	159197371	rs9346767	T	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=751;SC=ACAGTATAACTTGTCCGTTAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=159197379;WS=159197361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	159204426	rs7769862	T	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=233;SC=CTTTAAAAAGTTTCCTACTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=159204434;WS=159204416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	159204786	rs3123111	C	T	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=220;SC=TAAATTAAGGCGCCTTGTGTA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=159204794;WS=159204776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	159205632	rs9364995	C	T	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=11;PP=497;SC=CATGCTGGAGCGCACGGAGAT;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=159205640;WS=159205622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	159205668	rs3103003	G	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=873;SC=GCAGGGCACAGCACTCACTTG;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=159205676;WS=159205658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	159210662	rs140055516	TTTTC	T	1077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=754;SC=AGTTTTTCTCTTTTCTTTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=159210673;WS=159210652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	159291490	rs6455609	G	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=84;SC=AACACATCAGGAAACCTCAAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=159291498;WS=159291480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	159316430	rs9457507	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=457;SC=TGATGGAATACGTGGCATCCT;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=159316438;WS=159316420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	159590734	rs295332	T	C	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=4;PP=172;SC=GGCGGCGGCCTCAGGTACGCG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=159590742;WS=159590724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	159652931	rs420137	G	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=669;SC=GGCGGATGTTGAGCAGAACAC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=159652939;WS=159652921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	159653635	rs381639	C	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=20;PP=1297;SC=CCTCGCCGGCCCGGAGGACCC;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=159653643;WS=159653625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	159654487	rs404435	G	T	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=54;PP=1928;SC=CTGCTCGTCCGCCCGCAGCAC;SOR=1.077;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=93;WE=159654495;WS=159654477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	159654551	rs370434	C	G	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=41;PP=1505;SC=CCGGGCCCCACAACAGCAGCC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=159654559;WS=159654541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	159654994	rs402388	A	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=16;PP=1118;SC=GCGCCCGGGTACCCAGCAGGG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=159655002;WS=159654984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	159655084	rs420054	C	G	3370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=46;PP=1980;SC=CCGAGGACGACGAGGAGGAGG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=159655092;WS=159655074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	159655102	rs436743	A	G	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=51;PP=2089;SC=AGGACGCGGGATTTTTTAAAG;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=106;WE=159655110;WS=159655092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	159655326	rs3003174	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=16;PP=471;SC=CCTTCCCGACTGCCGCCTCGC;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=159655334;WS=159655316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	159655383	rs2501176	A	G	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=13;PP=906;SC=CCCTGGCCGCAGTACACCACG;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=159655391;WS=159655373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	159655402	rs2932988	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=16;PP=1066;SC=CGCGCGCCCCACCTGGCCACT;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=159655410;WS=159655392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	159655593	rs2501177	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=464;SC=TATTCTATTGCATTTAGCACC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=159655601;WS=159655583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	159657195	rs420339	G	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=535;SC=CCAACTTCCCGGGCATGTTGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=159657203;WS=159657185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	159659481	rs419836	C	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=134;SC=ACTCACATTACGGTTTCCTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=159659489;WS=159659471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	159659523	rs450538	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=580;SC=TACATATATAATTGGACTAAT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=159659531;WS=159659513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	159660779	rs141435210	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=5;PP=2226;SC=GCCCACCACTGCCACCACCCG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=159660804;WS=159660769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	159660879	rs386360	C	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.59;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	159669953	rs28487880	G	C	554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=379;SC=GTGTGTGTGTGTGTCTGTCTG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=159669961;WS=159669943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	159670276	rs294907	A	G	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=941;SC=TTGAAGAAAAACATTACTAAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=159670284;WS=159670266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	159670303	rs294906	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=532;SC=GCCTCGCCAAGGCAGTGCATT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=159670311;WS=159670293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	159672455	rs294899	C	T	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=51;PP=2093;SC=AGAAGAGTGACCTGCCTCCCC;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=110;WE=159672463;WS=159672445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	159677498	rs294890	C	T	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=476;SC=TGGGTTACATCTTGTGTGTGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=159677506;WS=159677488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	159682206	rs294883	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=16;PP=1096;SC=CAAAATATATCTTCTTCCAAC;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=159682214;WS=159682196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	159692321	rs409691	G	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=531;SC=TGGTTCAGGGGCCTCTGACGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=159692329;WS=159692311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	159692559	rs455162	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=GACAGCCAGCGTGCTCAGCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=159692567;WS=159692549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	160114168	rs5746094	T	C	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=15;PP=655;SC=GGGTCCCCTTTCTTCTCACCC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=160114176;WS=160114158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	160114311	rs5746092	G	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=11;PP=225;SC=AAGAAAGCGCGGGGAGCAGGG;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=160114319;WS=160114301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	160131758	.	C	CACTGCTCTGACCACCATAACCACCACTCAT	2313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;MQRankSum=-0.370;QD=35.60;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr6	160131801	.	T	A	1022	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=26;MQ=59.26;NF=37;NR=40;PP=1022;QD=13.7243014617;SC=TGCTCTGACCTCCATAACCAC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=77;WE=160131809;WS=160131791;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:66,77:0.54:143
chr6	160131817	.	A	AT	1622	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=58.71;NF=5;NR=20;PP=1622;QD=66.2;SC=ACCACCACTCAGCTGCTCTGA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=16;TCR=73;TR=25;WE=160131826;WS=160131807;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
chr6	160131818	.	G	A	1620	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=58.5;NF=15;NR=18;PP=1620;QD=50.1445821984;SC=CCACCACTCAGCTGCTCTGAC;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=33;WE=160131826;WS=160131807;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr6	160133957	rs752779	G	A	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=50;PP=1641;SC=ATTTAAAAAGGTCTCCCTGTA;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=160133965;WS=160133947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	160148410	rs111664512	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=260;SC=GGAGGCTGGCGGGAGGCGGGA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=160148418;WS=160148400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	160174456	rs1440	T	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=22;PP=1453;SC=GAGAGTTTTGTCTTCATTTTG;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=160174464;WS=160174446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	160182749	rs2277073	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=33;PP=974;SC=AAAAGCCCAAGACGTCAAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=160182757;WS=160182739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	160182845	rs2277072	A	G	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=192;SC=TCTGCCCGCAAGCCCAGACCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=160182853;WS=160182835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	160183325	rs2273819	G	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=175;SC=GAACCCTGCGGCTCCCGCGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=160183333;WS=160183315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	160196343	rs25683	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=29;PP=913;SC=TCAACTAGAAAAGGTGAGTAT;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=160196351;WS=160196333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	160198395	rs3465	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=25;PP=1150;SC=ATAAACGTGGGCTTACACCTT;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=160198403;WS=160198385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	160199453	rs67585961	GTT	G	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	160199687	rs15982	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=12;PP=771;SC=TTCTCCCCCGTTAGGTCAATA;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=160199695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	160201295	rs2295901	C	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=284;SC=TGTCTAGTCCCTGCAGAAGAG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=160201303;WS=160201285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	160201677	rs3818300	G	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=17;PP=494;SC=AGCATTTGTGGTAAAAGTGCT;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=160201685;WS=160201667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	160202167	rs2295899	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=578;SC=TGTAACCTGAGTTACCTTCTG;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=160202175;WS=160202157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	160205991	rs1547093	C	A	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=43;PP=1286;SC=TCTATTAAAGCAGCAAGCATT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=56;WE=160205999;WS=160205981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	160206631	rs3818299	T	C	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=34;PP=1279;SC=AGTAATAATATCCGTTCAGCC;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=160206639;WS=160206621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	160207049	rs2273828	T	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=24;PP=719;SC=AAACATTCACTGGTCTGAGTG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=160207057;WS=160207039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	160211485	rs2273823	T	C	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=558;SC=TCCGGGTCGGTGGCGTCTGGC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=160211493;WS=160211475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	160211554	rs1128661	T	G	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=25;PP=1636;SC=ATATGGCTGCTCCTGGCGAGC;SOR=1.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=160211562;WS=160211544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	160211636	rs1128670	G	A	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.226;NF=69;NR=70;PP=2704;ReadPosRankSum=1.400;SC=CTTCGGTCGCGGTTTTGGGGG;SOR=0.245;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=139;WE=160211655;WS=160211626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr6	160211645	rs58504486	GGTT	G	5887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=69;PP=2969;SC=CGGTTTTGGGGGTTGTTCTCG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=90;WE=160211655;WS=160211626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	160211728	rs11757681	T	G	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.255;NF=21;NR=45;PP=1341;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CACAGTACATTGGAACGTGCG;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=66;WE=160211736;WS=160211718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr6	160218605	rs3777423	A	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=562;SC=TCTTGGCATTAGATAACTTAC;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=160218613;WS=160218595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	160218957	rs2342479	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=0;PP=143;SC=TCTGAAAAACCGTTGTAGGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=160218965;WS=160218947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	160219337	rs4739	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=73;SC=CAAGAACTACGTTCTGCCCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=160219345;WS=160219327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	160221475	rs733319	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=13;PP=490;SC=GGCGAGCTTGAGGAGGGGGTG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=160221483;WS=160221465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	160221690	rs35229038	GCTT	G	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=8;PP=1023;SC=ACCTCACTTGGCTTCTTGAGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=21;WE=160221700;WS=160221680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	160221992	rs35619423	CTTT	C	537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.72;NF=8;NR=3;PP=423;SC=GAGGACCTTGCTTTTTTCTGT;SOR=2.147;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=11;WE=160222002;WS=160221982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	160224346	rs2146163	T	C	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=59;PP=1651;SC=CAAACAAGTATGTATCAAGAG;SOR=1.496;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=87;WE=160224354;WS=160224336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	160225012	rs35435543	T	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=21;PP=1035;SC=TAGCCCATTCTTGTAACTTCT;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=160225020;WS=160225002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	160225463	rs11757783	G	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=1132;SC=TGATCTAGACGAACTGGCTTA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=160225471;WS=160225453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	160225559	rs9364536	G	C	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=42;PP=1710;SC=TGTTCTGTTTGTTGTTCTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=83;WE=160225567;WS=160225549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	160229889	rs35872675	T	C	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.26;NF=27;NR=11;PP=819;SC=GGCTCCATTGTTTCTCTCTCA;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=160229897;WS=160229879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	160236976	rs7739963	T	C	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=26;PP=1491;SC=AAATTGTTTTTTATTCTATTT;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=160236984;WS=160236966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	160237489	rs2342480	T	C	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=28;NR=25;PP=813;SC=TTGTATGAGCTGCAGCCACTG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=160237497;WS=160237479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	160237662	.	CTT	C	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=28;QD=15.5;SC=AGGAAACTCACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=160237671;WS=160237652;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr6	160239461	rs41267791	G	A	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=717;SC=GACTTGTGAGGGCAGGAGGGA;SOR=3.675;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=160239469;WS=160239451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	160239712	rs5012271	C	T	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=60;PP=1954;SC=TTGGCCCCCTCGCCCCATTCA;SOR=1.315;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=96;WE=160239720;WS=160239702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	160239835	rs9347350	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=12;PP=677;SC=GTTTCTCCACTAAAGCCAACA;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=160239843;WS=160239825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	160328620	rs220721	C	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=26;PP=1325;SC=CCATCTTGGTCGTGAAGATCC;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=160328628;WS=160328610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	160465486	.	TTGTC	T	145	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=22;MQ=62.65;NF=2;NR=2;PP=145;QD=44.5;SC=AGTCACTTCTTTGTCTGCGTG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=160465497;WS=160465476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	160489215	rs8191867	CAG	C	4334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=29;PP=2701;SC=CGTTTCTAGACAGAGTGCCCA;SOR=1.426;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=56;WE=160489224;WS=160489205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	160494409	rs629849	A	G	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=78;PP=2671;SC=GCCTGAGGCCAGGCCAACCAA;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=140;WE=160494417;WS=160494399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr6	160494521	rs2282140	C	T	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=31;PP=900;SC=CAGATGGGCACGGGAGAAGTG;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=160494529;WS=160494511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	160505199	rs614754	C	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=25;PP=781;SC=CCTGGTCCCTCGTCCACAACG;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=160505207;WS=160505189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	160511250	rs1050026	T	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=355;SC=AACAAAAACCTTGGTCTAATT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=160511258;WS=160511240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	160551204	rs683369	G	C	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=23;PP=1189;SC=CGGGCTTCTTGTTTGGCTCTC;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=160551212;WS=160551194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	160557769	.	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=552;SC=GTGGAATACTCAGGTGGAAAA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=160557777;WS=160557759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	160560845	rs628031	A	G	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=31;PP=1208;SC=CCCCATGGCCATGTCAAATTT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=160560853;WS=160560835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	160560897	rs113569197	CTGGTAAGT	C	2124.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=2979;SC=TTTATCTCACCTGGTAAGTTG;SOR=0.963;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=27;WE=160560912;WS=160560887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	160575985	rs2297374	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=257;SC=TTTTGCAGCTCGGCAGTGGGC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=160575993;WS=160575975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	160645832	rs316003	C	T	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=38;PP=1359;SC=CCAAGCCAAGCACGCCTGAAA;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=160645840;WS=160645822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	160645921	rs3219197	C	CT	537.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.452;NF=0;NR=16;PP=343;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTGTTTAAAACTTTTTTTTAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=16;WE=160645929;WS=160645911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr6	160663230	rs17588242	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=413;SC=ACACTGTGTTTTGAAGGTAAG;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=160663238;WS=160663220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	160666660	rs11422119	A	AC	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=406;SC=ATAATTTCTTACCGTCCTGAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=160666668;WS=160666650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	160670282	rs316019	A	C	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=21;PP=1391;SC=TTGGGCAGAGAAACTGTGAAC;SOR=1.281;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=160670290;WS=160670272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	160670494	rs316018	A	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=498;SC=AAACTAGAACACCAACCTCAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=160670502;WS=160670484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	160670533	rs316017	C	T	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=247;SC=GAATATTCTACGCAACTCTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=160670541;WS=160670523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	160671500	rs316016	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=490;SC=GTCCCTTTTCTTGCATGCCGC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=160671508;WS=160671490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	160677614	rs2774230	G	C	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=19;PP=893;SC=CTTTGGGATTGTTTAAATTCC;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=160677622;WS=160677604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	160679400	rs624249	C	A	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=53;PP=2465;SC=ACGAGCCAGGCGTCTCGTACA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=112;WE=160679408;WS=160679390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	160769423	rs555754	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=404;SC=CCGAGGCGCGGGCTGCGGGCG;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=160769431;WS=160769413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	160769811	rs668871	C	T	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=21;NR=21;PP=725;SC=TCCCCAACCGCTCGGCTCCCC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=160769819;WS=160769801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	160868701	rs2457574	G	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=220;SC=CATGGGAGAGGGCCCAGCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=160868709;WS=160868691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	161136058	rs4252105	T	A	129.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5955;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=1.465;SC=ACGCCTGATGTTTTTAATTTC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=161136066;WS=161136048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr6	161137779	rs14224	T	C	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=42;PP=1262;SC=GGGAACTTTGTGACATCCCCC;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=161137787;WS=161137769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	161139480	rs1130656	C	T	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=38;PP=1088;SC=CAGAAAACTTCCCCTGCAAGT;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=161139488;WS=161139470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	161139502	rs2295368	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=874;SC=AGTCCCCTCCGGTCTCATTCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=161139510;WS=161139492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	161469455	rs9346846	T	A	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=AAATGGATAATTTTTTTTAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=161469463;WS=161469445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	161469774	rs4559074	G	A	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=56;NR=46;PP=1773;SC=GAGCGTGATCGTAAAAAAAAT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=161469782;WS=161469764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	161502094	rs9347479	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=412;SC=TGCTTCTGAACGCGACGCTCC;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=161502102;WS=161502084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	161509003	rs9355332	T	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=720;SC=CTCATCTCCATCTTTGCAGCA;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=161509011;WS=161508993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	161517964	rs2177587	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=380;SC=TATTTGTATATGTAATATTAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=161517972;WS=161517954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	161519350	rs5881391	CCTG	C	2390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=2108;SC=CCATGGCAGCCCTGCTGCTGC;SOR=3.180;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=36;WE=161519363;WS=161519340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	161531006	rs4709493	G	C	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=135;SC=GCCCGTGGGAGGTGCTCTGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=161531014;WS=161530996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	161532855	rs35961625	CT	C	5018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=70;PP=2974;SC=ACAACTACTTCTTTTCTTTTT;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=92;WE=161532863;WS=161532845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr6	161557703	rs6455706	A	G	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=718;SC=GGAGTAGCCCAAACAGACTAC;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=161557711;WS=161557693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	161771412	rs80033990	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=175;SC=TAAAGCACAATAGGGCAGCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=161771420;WS=161771402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	161790964	rs77600121	C	T	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=51;PP=1996;SC=CAAGGGTCATCGTGAGTAAGA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=161790972;WS=161790954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	161807855	rs1801582	C	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=27;PP=1698;SC=GCTTCAAATACGGCACTGCAC;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=161807863;WS=161807845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	161990255	.	G	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=389;SC=CATATCTCCAGCATGGTTTTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=161990263;WS=161990245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	162475283	rs41268561	G	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=412;SC=TTCCACTTATGTTATAAAATA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=162475291;WS=162475273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	163587146	rs1124951	C	G	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=25;PP=873;SC=GGCTGCAGGGCTTGGCGCGGG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=163587154;WS=163587136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	163587312	rs3064931	CAAA	C	3505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1549;SC=ACAACAACAACAAAAAAATGT;SOR=1.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=47;WE=163587322;WS=163587302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	163600225	rs742956	C	A	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=31;PP=1092;SC=CGCTGCTCCTCACATGTGCGT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=163600233;WS=163600215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	163611793	rs6907521	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=784;SC=TCTCTTATACCAAAAAGCCCA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=163611801;WS=163611783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	163612783	rs6937392	C	A	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=60;PP=2044;SC=AGAGCCATGACGTCCCTCTGC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=103;WE=163612791;WS=163612773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	165108670	rs13191120	C	T	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=62;PP=1953;SC=CTCATTTTCTCGTTTCCTCCA;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=96;WE=165108678;WS=165108660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	165108725	rs13220455	G	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=920;SC=GTTTTCTTCCGTTTTTTCATT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=165108733;WS=165108715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	165703633	rs5881641	CA	C	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=100;SC=GTATTATTAACAATATTATGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=165703641;WS=165703623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	165746439	rs571047	C	A	219.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=184;SC=CCACCCCCCCCAAAAAAAGGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=165746447;WS=165746429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	165801790	rs1511746	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=538;SC=GACTCACCTGGAGGATGGACA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=165801798;WS=165801780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	165808630	rs491522	A	C	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	165808634	rs491517	A	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	165827194	rs220749	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=638;SC=TGACAGAACCAAAAATAACAA;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=165827202;WS=165827184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	165863695	rs57550533	C	CA	1286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=12;PP=1029;SC=AATCTTTGCCCATTTTTTCTA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=165863703;WS=165863685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	165989776	rs1410479	C	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=809;SC=AAACAAAGTTCTCATCAATTG;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=165989784;WS=165989766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	166075362	rs6456003	G	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=273;SC=CACCCAGCAGGCCAAGCCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=166075370;WS=166075352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	166307718	rs6456029	T	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=13;PP=1001;SC=GAATATCATATGTCTGTCCTG;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=166307726;WS=166307708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	166308090	rs2140232	AT	TC	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=37;PP=2128;SC=TGTACTACATATCCCGAGGAA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=72;WE=166308099;WS=166308079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	166308286	.	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TTTGTTCAAAGCTGCAAGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=166308294;WS=166308276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	166401512	rs697475	T	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=409;SC=TTGGGGGTGCTTGTGCTCTCA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=166401520;WS=166401502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	166571935	rs35819705	C	T	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=71;PP=2529;SC=AGGAAGAGGGCGCCGAGACCG;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=134;WE=166571943;WS=166571925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr6	166574246	rs3127334	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=510;SC=AGGACTAAGGGCCTATGGGAA;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=166574254;WS=166574236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	166576161	rs2278678	T	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=350;SC=TCCCTCCATCTCTCCAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=166576169;WS=166576151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	166579270	rs2305089	C	T	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=879;SC=GCGCTGTGGACCCCCAACTCT;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=166579278;WS=166579260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	166581147	rs3099266	T	C	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=5;PP=80;SC=CCACCTTCCCTGCTCTTGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=166581155;WS=166581137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	166720806	rs911203	G	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=17;PP=1017;SC=CGGCAGCCGCGGACTCCACGC;SOR=1.355;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=166720814;WS=166720796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	166721211	rs13204594	G	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=30;PP=1232;SC=CGGCCTCGGGGGTGAGATTCA;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=166721232;WS=166721201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	166721224	rs7757150	C	G	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=32;PP=1263;SC=GAGATTCAGGCAGAAGCGCGC;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=166721232;WS=166721201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	166721424	rs13205770	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=4;PP=75;SC=GAGGGGCCGGCGGCTGCGTCC;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=166721432;WS=166721414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	166736235	rs35147403	CA	C	77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=66;SC=TAAAATCAACCAAAAAAAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=166736243;WS=166736225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	166736362	rs7088	C	T	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=7;PP=550;SC=ATGGGATGTACGACAGGCTAT;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=166736370;WS=166736352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	166737980	rs4710041	G	A	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=17;PP=1178;SC=TGCTCGTCACGTCTCAGGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=54;WE=166737988;WS=166737970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	166739684	rs10806847	G	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=608;SC=TAGATTATAAGTTTGAGATCC;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=166739692;WS=166739674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	166741921	rs9459653	T	A	98.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=4;PP=79;SC=ACTACTTTTTTAAAAAAGAAG;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=166741929;WS=166741911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	166743760	rs9348119	G	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=407;SC=GGAAAATTTAGAATATAGTCT;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=166743768;WS=166743750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	166755975	rs10862	T	C	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	166755979	rs11168	A	C	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	166796433	rs1546854	C	A	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=788;SC=AATGACACCCCGGCCAACCCC;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=166796441;WS=166796423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	166826255	rs909631	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=13;PP=673;SC=ACCCGCTACAGCCGCGTGGAC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=166826263;WS=166826245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	166826304	rs760670	T	C	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=29;PP=1052;SC=CCAGGTTGGATGACAGCACGG;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=166826312;WS=166826294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	166827436	rs2235295	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=31;PP=878;SC=GGGAAGGTCATGAGAGTCGGG;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=166827444;WS=166827426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr6	167411287	.	A	G	1455	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=77;MMLQ=28;MQ=55.68;NF=27;NR=15;PP=1455;QD=35.4707431559;SC=TCACAGACAGAAACACAGAGA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=42;WE=167411309;WS=167411277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,42:0.91:46
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chr6	167571048	rs6902566	T	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=12;PP=488;SC=CAGCAGGAAGTGCAGGGCCCA;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=167571056;WS=167571038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	167584353	rs201194115	C	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr6	167590574	rs2989541	G	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.66;QD=28.95;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	167592464	rs60509455	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=342;SC=CAGGGACCTTATGACAAGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=167592472;WS=167592454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	167592656	rs4710193	G	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=451;SC=CTGTAAAGTGGGGGGCTTTCT;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=167592664;WS=167592646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	167595183	rs377058325	T	C	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	167595449	rs139049693	A	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	167622105	rs28661326	A	G	158.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.72;QD=22.69;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	167622205	rs28588506	G	A	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.99;QD=24.15;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	167622284	rs35304076	C	T	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=1.522;NF=15;NR=18;PP=526;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CGCACAAAAACGTGCTGTACC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=167622292;WS=167622274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr6	167622347	rs9459922	A	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=9;NR=14;PP=332;SC=TGGCGAAGGCAGCTTCCTTGC;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=167622355;WS=167622337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	167622389	rs6931756	A	G	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=176;SC=AGAGAGCTGCAGAGGAGAGAG;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=167622397;WS=167622379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	167622419	rs6936429	T	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=50.52;NF=2;NR=4;PP=88;SC=AGCTCTGCCATGGGCCCCACA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=167622427;WS=167622409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	167721253	rs3817768	C	G	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=39;PP=1694;SC=GCGGTTTCCCCTCTGCACCCC;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=167721261;WS=167721243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	167728774	rs663606	T	C	60.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	167728900	.	TC	CG	102	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=52.74;NF=2;NR=1;PP=102;QD=51.8226249541;SC=CCAGGACAGGTCAACCAGGCA;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=3;WE=167728909;WS=167728890;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chr6	167752312	.	G	GTTCC	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=292;SC=AAGCCAGGTAGTTCCTTCCTT;SOR=0.941;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=167752320;WS=167752302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	167753691	rs877653	C	T	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=23;PP=1078;SC=TGGTGCAAAGCGTCCTCCTGG;SOR=0.950;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=53;WE=167753699;WS=167753681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	167754661	rs909545	A	G	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=43;PP=1834;SC=AAATGAGGGGAGAGAAGCCAG;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=84;WE=167754669;WS=167754650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	167754702	rs909546	C	T	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=45;PP=1591;SC=CCAACATCGACGCTGCAAAAA;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=167754710;WS=167754692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	167771426	rs4616972	G	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.82;QD=23.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	167907609	.	T	TAC	166.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=1;PP=285;SC=CAAATACACCTACACACATGC;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=167907617;WS=167907599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	167907677	.	T	TAC	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=614;SC=CACTGATACATACACACACAC;SOR=1.292;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=13;WE=167907685;WS=167907667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	168265102	rs2301530	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=14;PP=439;SC=ATCTCTCTACATTAGTCTCAG;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=168265110;WS=168265092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	168297757	rs11459878	C	CT	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=744;SC=TAATTACCGACTTGTATTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=168297765;WS=168297747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	168298875	rs9346511	C	T	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=15;PP=786;SC=TGGTTTCCTTCGGTTTCCAGT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=168298883;WS=168298865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	168316118	rs3213591	T	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=16;PP=549;SC=GTGCAGGTGATTGCTGGTGCC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=168316126;WS=168316108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	168317994	rs9364207	C	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=29;PP=975;SC=AAAGGAAATCCTATTTAATAC;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=168318002;WS=168317984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	168323664	rs2301533	A	G	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=1953;ReadPosRankSum=1.864;SC=GGTACCATGAAGTGAAATGGA;SOR=0.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=104;WE=168323672;WS=168323654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr6	168323754	rs639777	G	A	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=35;PP=939;SC=TTTTAAAATCGCTGTTAAATA;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=168323762;WS=168323744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	168343838	rs1132306	T	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=778;SC=TAGGAATCTATGTGAAGTCGG;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=168343846;WS=168343828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	168344880	rs9346632	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	168348401	rs9364210	T	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.34;NF=8;NR=0;PP=182;SC=TGCCTTGATTTTTTTTTTTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=168348409;WS=168348393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	168348504	rs35550837	CT	C	2164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.614;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.316;NF=30;NR=26;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.849;SC=TAATATTACACTTTTTTTTTT;SOR=1.666;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=56;WE=168348512;WS=168348494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr6	168349011	rs9364371	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=902;SC=CCTACCCCATCCCCACTCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=168349019;WS=168349001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	168377309	rs61743855	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=479;SC=TGTTGGGGGAGGAGAAGAAGG;SOR=1.519;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=25;WE=168377317;WS=168377299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	168431687	rs2257743	G	A	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=218;SC=ACTTGCATCCGTGGAGACTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=168431695;WS=168431677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	168476198	rs2306943	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=262;SC=CCATCAGAGCACCTGTGAGTG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=168476206;WS=168476188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	168482116	.	G	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=22;PP=761;SC=TGGACGGGCAGAGGCCGCGAG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=168482124;WS=168482106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	168695257	.	G	GTA	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=64;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=168695265;WS=168695247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	168708751	rs10945499	A	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=26;PP=1053;SC=GGGTGGACTCAGAACAGGAGC;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=168708759;WS=168708741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	168708793	rs10945500	C	G	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=18;PP=1340;SC=GGGCTGGCCTCCGCTGGAGCC;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=168708801;WS=168708783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	168708816	rs10945501	T	G	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=27;PP=1938;SC=CCCCTCCCTGTGGGCCAGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=168708824;WS=168708806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	168709385	rs6925614	T	C	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=44;PP=2064;SC=CTGTTCTCCCTCGCTACCCTT;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=55;TCR=44;TR=99;WE=168709393;WS=168709375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	168927213	rs12111003	G	A	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=115;SC=GAAGGCAGGTGGGGGGAGCCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=168927221;WS=168927203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	168928225	rs2224209	G	A	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=105;SC=AGCCACTGCCGCAGAAAGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=168928233;WS=168928215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	168928251	rs2609287	C	T	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=142;SC=GCCTCGCAGCCGTGAGGCGCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=168928259;WS=168928241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	168928519	rs2609286	C	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=331;SC=CCAGTTTGGCCGGCATTGTGA;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=168928527;WS=168928509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	169055891	rs34108025	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=244;SC=ACCAACCCTGCACCTGAGCTC;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=169055899;WS=169055881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	169065126	rs9364271	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=350;SC=TGTTGCCCAGGCTAGTTTCGA;SOR=2.200;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=18;WE=169065134;WS=169065116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	169646262	rs199901851	T	C	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=38;PP=2096;SC=CAAGCCAGTATATAAAATGCA;SOR=1.123;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=99;WE=169646270;WS=169646252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	170036309	rs7775504	A	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=172;SC=GTTTAAAATGAGTAGGATCTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=170036317;WS=170036304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	170043646	rs9295020	A	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=791;SC=AGATCTCAGTAAATCTAGTTT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=170043654;WS=170043636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	170049421	rs4145868	T	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=569;SC=GAGGTCTAAGTTTCTTAAGAG;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=170049429;WS=170049411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	170060970	rs4716373	TG	CA	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.700;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.006;NF=1;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=-2.261;SC=GAGTGGGGAGTGTGGGCGTTG;SOR=3.225;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=8;WE=170060979;WS=170060960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr6	170061035	.	G	A	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=26;MQ=49.38;NF=0;NR=7;PP=94;QD=18.3958875067;SC=AGTGGGGAGCGTGGGCGTTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=7;WE=170061043;WS=170061032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,7:0.37:19
chr6	170061053	.	G	A	145	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=51.97;NF=0;NR=9;PP=145;QD=19.9745791719;SC=TGGGCCCCACGTGCGCCCCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=9;WE=170061061;WS=170061043;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,9:0.50:18
chr6	170061098	.	C	T	83	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=55.37;NF=0;NR=7;PP=83;QD=16.8244589353;SC=GAGTGGGGAGCGTGGGCGTTG;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=7;WE=170061106;WS=170061088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr6	170067022	rs3800546	C	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	170068058	rs4509126	A	G	247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=182;SC=CGGGAACGCCATCCAGCGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=170068066;WS=170068048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	170068180	rs3823465	A	G	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=27;PP=1347;SC=GCTCGGCCCGAACAGCCTGAG;SOR=1.116;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=170068188;WS=170068170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	170070723	rs4236176	A	G	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=29;PP=1055;SC=ATGATCATCCAGGCTCAACTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=170070731;WS=170070713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	170102180	rs74900588	A	C	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=32;NR=22;PP=921;SC=CGACAGCTGGAGAAGCCTCGC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=170102188;WS=170102170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	170102267	rs4716383	A	G	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=33;PP=997;SC=GGATGTATAAAGCGCGGCCCC;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=170102275;WS=170102257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	170102316	rs200117070	G	GCACTGC	1052.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=933;SC=TGCCACAGCGGCCCTGCCCCT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=21;WE=170102324;WS=170102306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	170103996	rs17860603	C	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=191;SC=ATTTTAAGCTCATAATTTGCA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=170104004;WS=170103986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	170118085	rs7760142	C	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=139;SC=AAAACCTTGACTTTTTAAAGT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=170118093;WS=170118075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	170151583	rs200920810	C	CCT	2146.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=28;PP=1618;SC=ACGCCCACCGCCTCCCCTTCA;SOR=1.436;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=38;WE=170151591;WS=170151573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	170151766	rs3749882	C	T	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=813;SC=GGAGGTAGGGCGGGTGTAGGG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=170151774;WS=170151756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	170155331	rs6459658	A	T	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=1;PP=289;SC=ATTTTATATCATGTGATATGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=170155339;WS=170155321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	170159023	rs6459660	G	A	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=15;PP=1303;SC=GGTTTATTCAGTAATTCAGTA;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=170159031;WS=170159013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	170166587	rs77498508	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=139;SC=TGACATTCCTCTCATAGTGTT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=170166595;WS=170166577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	170176407	rs4716398	G	A	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=23;PP=890;SC=AACACTTGCCGCGTGTCACGG;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=170176415;WS=170176397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	170176467	rs4716345	A	G	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=24;PP=879;SC=GGCTCCCAGAAAGCCGCAGCC;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=170176475;WS=170176457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	170176647	rs4716399	CA	TG	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=25;PP=1915;SC=TCCGAAGCATCAGCGAACAGT;SOR=0.960;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=44;WE=170176656;WS=170176637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	170179507	rs3828738	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=243;SC=GTGGCCCCACCGCCATCTCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=170179515;WS=170179497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	170190200	rs3807067	G	A	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=21;PP=1390;SC=GGCAGCAGAAGTGCAGCTGAC;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=170190208;WS=170190190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	170594819	rs2255020	T	C	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=41;PP=1314;SC=CAGATGGACGTTGACTGTTGC;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=170594827;WS=170594809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	170595430	rs2747757	G	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=44;PP=1345;SC=CGCCAAGTACGTCCCAACAGG;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=170595439;WS=170595420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	170597276	rs2738822	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=9;PP=800;SC=TCCCTGCGCGCGGTCCGTGTT;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=170597284;WS=170597266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	170598227	rs2747756	T	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=14;PP=770;SC=CTCCGGGTGGTAGCGGTCGCG;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=170598235;WS=170598217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	170598352	rs2738821	C	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=35;PP=1074;SC=CGGAAATCTCCCGGGCGCGCT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=60;WE=170598360;WS=170598342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	170598368	rs67433119	TCTC	T	2161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=1409;SC=GCGCTCGGCCTCTCCTCCTCG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=29;WE=170598378;WS=170598358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	170627651	rs9460113	G	A	4949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=74;PP=2920;ReadPosRankSum=-1.088;SC=AAGTTCCCACGTGTACAGGCC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=147;WE=170627659;WS=170627641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,189:0.99:191
chr6	170704444	rs7738466	C	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=6;PP=503;SC=TGCGTTTTTTCATGACCCTCC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=170704452;WS=170704434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	170871013	.	A	ACAG	485	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5347;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=58.79;NF=6;NR=7;PP=485;QD=38.0;SC=AGCAACAACAACAGCAGCAGC;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=170871021;WS=170871003;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr6	170871037	.	GCAA	G	713	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=57.45;NF=6;NR=7;PP=713;QD=55.5384615385;SC=AGCAGCAGCAGCAACAGCAAC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=13;WE=170871060;WS=170871027;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,13:0.54:24
chr6	170871046	rs71813856	ACAGCAG	A	556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	170871052	.	G	A	728	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=57.84;NF=7;NR=8;PP=728;QD=50.8514141698;SC=AGCAACAGCAGCAGCAGCAGC;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=15;WE=170871060;WS=170871027;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,15:0.52:29
chr6	170876195	.	A	G	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=48;SC=TTAACATGTTATTATTGCTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=170876203;WS=170876185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	170878886	rs2235506	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=526;SC=GAAATGTATTATGATTGTTAT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=170878894;WS=170878876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	286468	.	G	GGACAGGTGAGCCCTTCCTTCCTCCCTCCATCCGC	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.013;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr7	286534	rs146778412	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=-0.016;SC=CCGGTGAGTGAGGCCGTCCTG;SOR=2.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=13;WE=286542;WS=286524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr7	295683	rs36173688	T	TG	351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=406;SC=CTGGGATTGATGGGGAACTGT;SOR=2.494;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=11;WE=295691;WS=295682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	296557	rs36164325	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=11;PP=811;SC=CTGCTCCTCATGGCACGCGCC;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=296565;WS=296547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	296739	rs36156504	G	A	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.998;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1315;ReadPosRankSum=1.416;SC=GGTACGTCCCGCAGGGGCACG;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=89;WE=296747;WS=296729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,118:0.54:220
chr7	298419	.	A	G	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5164;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=52.4;NF=4;NR=0;PP=65;QD=24.9428031368;SC=GATGGGTGGGATGGACCCACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=298427;WS=298415;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	299558	.	T	TTCTC	391.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=268;SC=CTCTGTCTTTTTCTCTCTGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=299566;WS=299548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	299642	rs36156024	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.339;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=571;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TCGCTTTCCCGTGGGCAGGCA;SOR=0.060;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=38;WE=299650;WS=299632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr7	299850	rs36170987	G	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=721;ReadPosRankSum=1.536;SC=TCCGCGTCGTGCTAAAGGCCG;SOR=0.476;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=46;WE=299858;WS=299840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr7	299881	rs36139924	A	G	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CGTGGAGAGGAACGGGCTCCA;SOR=0.809;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=58;WE=299889;WS=299871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,67:0.56:119
chr7	299976	rs36173075	G	A	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=713;ReadPosRankSum=1.072;SC=TGCCCGGGACGGAGACAGAGG;SOR=0.841;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=47;WE=299995;WS=299966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
chr7	299987	rs36138803	C	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=43;PP=1413;SC=GAGACAGAGGCGCCGGACCTC;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=299995;WS=299966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	330822	rs36180337	A	C	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=83;PP=1691;ReadPosRankSum=0.326;SC=CGGGTGTCCCAGCGTGGCGAC;SOR=0.479;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=202;TCF=48;TCR=154;TR=114;WE=330830;WS=330812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,118:0.56:209
chr7	330882	rs4077171	T	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr7	330882	.	TCA	GCG	1635	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=23;PP=1635;QD=51.1656931776;SC=CGCGGCGGCTTCAGGGAGGTC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=33;WE=330892;WS=330872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,33:0.49:67
chr7	330884	rs4077172	A	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.31;ReadPosRankSum=1.371;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr7	331086	rs36129019	G	A	3010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=64;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GTTCGCGGGCGGCTGCGAGTC;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=99;TCR=138;TR=110;WE=331094;WS=331076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,149:0.51:295
chr7	331219	rs139216305	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=2.082;SC=CCGTCCGAGCCGCCCGCCGCT;SOR=0.122;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=331227;WS=331209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr7	331427	rs141537626	C	A	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGCTGGAGAACGTGGGACTCC;SOR=0.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=80;WE=331435;WS=331417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr7	538277	rs34223855	G	C	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.58;ReadPosRankSum=-1.069;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,70:0.59:119
chr7	538284	rs35782510	T	C	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.811;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,67:0.58:115
chr7	538348	rs12720025	A	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=646;ReadPosRankSum=-1.158;SC=CAAGTTTTCAAGAAATTTCCA;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=43;WE=538356;WS=538338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr7	540518	rs2070958	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GAGACCTGAATCTCCTCTCCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=540526;WS=540508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr7	591206	rs77124414	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.60;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	618855	rs62431411	T	C	4383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=48;PP=2493;SC=CCTGCCCCAGTGCACACCCAG;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=135;WE=618877;WS=618845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	618869	rs62431412	G	A	5377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=62;PP=2965;SC=CACCCAGAGCGCCCACGTGGG;SOR=1.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=169;WE=618877;WS=618845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr7	618938	rs3211362	A	G	7156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=115;PP=2965;SC=CCTGGACCACAATTTTCTCTC;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=106;TCR=116;TR=221;WE=618946;WS=618928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr7	780687	rs62432212	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=56;PP=1394;SC=GGTGTCCCTTTGTCCCTGTGC;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=81;WE=780695;WS=780677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	780859	rs6943174	T	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	780980	rs6943337	T	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=0.616;SC=CTGTTGTGCCTCAGGCAGCTG;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=17;WE=780988;WS=780970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr7	794471	rs34761279	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=1.469;SC=AAGTGGCCGTATTCCAGTCGT;SOR=0.487;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=25;WE=794479;WS=794461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr7	794576	rs62432239	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCCTCACCCCCGGGCCGCAGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=794584;WS=794566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	801634	rs142752861	T	TTGAGCCCCAGGCCTCAAACATGTC	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CCCTCTGTGCTTGACCAGCAA;SOR=0.349;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=3;WE=801642;WS=801624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr7	803342	rs4495324	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=255;ReadPosRankSum=0.022;SC=GGCCCGGCCTGTGTGGTTCTT;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=15;WE=803350;WS=803332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr7	808588	rs6973614	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.703;SC=GACTCGTGCTCTGGCGGGAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=808596;WS=808578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	808810	rs6946758	C	G	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1413;ReadPosRankSum=0.340;SC=AGGGAGAAGGCTCACATCGCG;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=202;TCF=100;TCR=102;TR=103;WE=808818;WS=808800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,123:0.48:258
chr7	810219	rs4720951	T	C	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=536;ReadPosRankSum=0.538;SC=CTGTCCACCGTGCTGCTCAGA;SOR=0.589;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=48;WE=810227;WS=810209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr7	813618	rs4719279	T	C	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CATTCATCCCTAGTCTGAAAC;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=133;TCR=81;TR=107;WE=813626;WS=813608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,115:0.48:239
chr7	813650	rs62432869	G	A	3299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=54;PP=1920;ReadPosRankSum=0.499;SC=GCACCTGTCCGGTCTCCTCAT;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=268;TCF=153;TCR=115;TR=129;WE=813658;WS=813640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,156:0.49:319
chr7	813867	rs6973746	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=1.105;SC=CGGTGGACACCGGCCGGGGAC;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=14;WE=813875;WS=813857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr7	814612	rs34943122	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=175;ReadPosRankSum=0.404;SC=GGACAGATGTGAGTCACGTCG;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=814620;WS=814602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	814788	rs3922641	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=924;ReadPosRankSum=0.927;SC=AAACTCATCAGGATTTATCCT;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=56;WE=814796;WS=814778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,68:0.50:135
chr7	821798	rs4374882	C	T	3099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.241;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.059;NF=62;NR=40;PP=1333;ReadPosRankSum=1.156;SC=CGGATCTTCGCGGCGTGGCCG;SOR=0.282;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=102;WE=821806;WS=821788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,114:0.70:162
chr7	821869	rs6460945	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-3.670;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,52:0.21:251
chr7	821892	rs9648155	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=8.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-3.913;QD=1.83;ReadPosRankSum=-3.027;SOR=1.224;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,60:0.21:280
chr7	821902	rs201517437	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=4.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-3.320;QD=1.19;ReadPosRankSum=-4.525;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,48:0.19:255
chr7	822523	rs4719314	A	G	3327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.137;NF=67;NR=62;PP=2291;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CCCTCACACAACGTCAGAAAC;SOR=0.474;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=281;TCF=155;TCR=126;TR=129;WE=822531;WS=822513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,149:0.47:318
chr7	825114	rs67721251	T	C	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TGGTTTCATGTTTGTTTCTGG;SOR=0.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=79;WE=825122;WS=825104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,110:0.46:239
chr7	855720	rs76222665	C	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.313;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=502;ReadPosRankSum=0.378;SC=CGCCCTCCCCCAGATGCACAC;SOR=1.076;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=29;WE=855728;WS=855710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr7	855806	.	G	GCCCTCCGCGATGCAGACCCCTCCCCCAGGTGCAGAC	49.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;QD=24.75;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	855835	.	G	GTGCAGACCCCTCCGCGA	239	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=24;MQ=62.13;NF=0;NR=3;PP=239;QD=113.0;SC=CCTCCCCCAGGTGCAGACCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=855843;WS=855825;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	856320	rs6959154	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=376;SC=GGTGAGCTCCCGGCGGGCCGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=856328;WS=856310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	857352	rs4275123	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CTGTGGAGAAACACCGTGTGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=857360;WS=857342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	882892	rs111665519	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.153;SC=GTCCTTTTATCTTCATATACT;SOR=1.106;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=9;WE=882900;WS=882882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr7	888290	rs75133066	A	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TCCACCAATCACACTTTCGCA;SOR=1.858;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=5;WE=888298;WS=888280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	889169	rs74742245	A	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1488;ReadPosRankSum=1.503;SC=CATGCCAGTTACTATGGGAGA;SOR=0.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=97;WE=889177;WS=889159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,115:0.44:259
chr7	889358	rs12669325	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=180;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TCCTCACTGATGACGACGGGC;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=14;WE=889366;WS=889348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr7	891184	rs10628483	C	CGAT	1691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.813;NF=6;NR=21;PP=1131;ReadPosRankSum=-1.088;SC=CACCTGCACTCGATTTACCTA;SOR=0.532;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=27;WE=891192;WS=891174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr7	892902	rs4076072	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=0.848;SC=AAACCTGATACTCCGGGTTTC;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=892910;WS=892897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	897492	rs10950789	A	G	2775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr7	897496	rs59910530	G	A	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr7	905418	rs4721949	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=1.076;SC=GAAGCCATTGTAACTGGGGGG;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=905426;WS=905408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	905786	rs4721952	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CCACAGCTCCATGGAACTTCG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=905794;WS=905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	912720	rs59436529	T	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=463;ReadPosRankSum=1.226;SC=CAAGACTCTGTCTCAACAACA;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=24;WE=912728;WS=912710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr7	912755	rs4722034	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=788;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ATTTCCAACTCAGCTGCTTCC;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=47;WE=912763;WS=912745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr7	917828	rs58994882	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=191;ReadPosRankSum=0.483;SC=GGCTATGCTGGGTTAACTGCA;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=14;WE=917836;WS=917818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr7	917847	rs142798143	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=220;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CACGCCCCTCGGGACTGTGAC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=16;WE=917855;WS=917837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr7	925866	rs77660844	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=446;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GGCAACCTTGCGCTGCCCTGG;SOR=1.432;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=27;WE=925874;WS=925856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr7	926827	rs4722203	T	C	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=44;PP=2628;SC=CTCTGGGGCATATGGCGCTGG;SOR=1.294;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=121;WE=926835;WS=926817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	930689	rs13171	C	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TGTTCGTGGCCCAGGCCGTGC;SOR=0.265;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=33;WE=930697;WS=930679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr7	933234	rs35157448	T	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQ=57.24;NF=8;NR=1;PP=209;SC=GTGTTGGGCATGGGCGCGGTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=933248;WS=933224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	933240	rs34784960	C	CGGT	582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=8;NR=2;PP=500;SC=GGCATGGGCGCGGTGTGTGCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=933248;WS=933224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	939007	rs79698027	C	G	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=41;PP=1498;ReadPosRankSum=0.775;SC=ATCTGGCAACCCCAGCCAGTG;SOR=0.677;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=122;TCR=75;TR=106;WE=939015;WS=938997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,110:0.51:216
chr7	939630	rs34786986	G	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=646;ReadPosRankSum=-2.064;SC=GGACCCACCAGACACCAGTTT;SOR=1.030;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=40;WE=939638;WS=939620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr7	940181	rs10256887	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=546;ReadPosRankSum=1.072;SC=TCTGCGTCGCCGGCCCCTGGG;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=36;WE=940189;WS=940171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
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chr7	940258	rs113839920	G	GGGCAAAGGCA	883.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=407;ReadPosRankSum=1.982;SC=AATCTCCTAGGGGCAAAGGTG;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=23;WE=940275;WS=940247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr7	940267	rs3824079	T	C	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=31;PP=1021;SC=GGGGCAAAGGTGGGCACAGGC;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=940275;WS=940247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	940296	.	A	AGG,AGGGCTGGGGTCCCCACAGAG	182.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=20;PP=778;ReadPosRankSum=0.517;SC=AGGAGGCTGCAGCGCTGGGGT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=940306;WS=940286;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.40:15
chr7	940298	rs13224354	C	G,CTGGGGTCCCCACAGAGGG	1271.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=195;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=985;SC=GAGGCTGCAGCGCTGGGGTCC;SOR=3.126;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=40;WE=940306;WS=940286;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:15
chr7	940517	rs376307973	CGAA	C	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=481;ReadPosRankSum=0.855;SC=GCCGAAGGGCCGAAGGGCCGG;SOR=0.412;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=12;WE=940527;WS=940507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	940724	rs11765973	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=425;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TTGGAGCTGTGGCCCCTACCG;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=25;WE=940732;WS=940714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr7	943711	rs10282526	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=-1.142;SC=CACCCGGGCCTGAGGGCCCAC;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=12;WE=943719;WS=943701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr7	943998	rs3824077	C	T	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=679;SC=GTGCTGGCGGCGCACCTGCTG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=944006;WS=943988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	944683	rs1881121	C	T	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=26;PP=1261;SC=ACCCCACCCCCGTCTGTGACT;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=944691;WS=944673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	944874	rs10243781	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=1.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr7	944993	.	CAGGGAAAGGGAA	C	392	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=54.65;NF=3;NR=12;PP=392;QD=27.2666666667;SC=GGAAGATGGGCAGGGAAAGGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=945013;WS=944983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,15:1.00:15
chr7	960705	rs10250309	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=280;ReadPosRankSum=0.576;SC=CACCCCAAAATTCGGTCCCCG;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=15;WE=960713;WS=960695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr7	966926	rs3824074	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=426;ReadPosRankSum=0.360;SC=AGGCTGTCACGCACACTGTGC;SOR=0.483;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=24;WE=966934;WS=966916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr7	974905	rs71538121	A	G	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=1051;SC=GAGTAGCCCAAGGCTCCAGGG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=974913;WS=974895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	1023013	rs2272375	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=0.077;SC=GGACCGGTCCCTGATGGAGGT;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=7;WE=1023021;WS=1023003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	1023052	rs75358992	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=0.414;SC=AGCTCTTGCCGCTTGGACAGC;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=1023060;WS=1023042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	1023995	rs34743661	A	AG	1354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.048;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.344;NF=16;NR=9;PP=1532;ReadPosRankSum=0.255;SC=AGGGGACCTAAGGGGGGTCTT;SOR=1.127;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=25;WE=1024010;WS=1023985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,36:0.36:99
chr7	1024002	rs3735689	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.248;NF=27;NR=13;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.644;SC=CTAAGGGGGGTCTTGTGGGTG;SOR=0.915;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=40;WE=1024010;WS=1023985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,43:0.40:108
chr7	1024581	rs3824081	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=129;ReadPosRankSum=0.112;SC=TGTATCTGCCTACAGGCATCT;SOR=0.223;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=10;WE=1024589;WS=1024571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	1024855	rs3735684	G	A	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TATCACCTTCGCGCTCCTCTT;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=101;WE=1024863;WS=1024845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,119:0.56:213
chr7	1026685	.	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=-0.981;SC=GGGCTGGGTCTGTGGGGTGGG;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=15;WE=1026693;WS=1026675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr7	1062527	rs3735686	GC	AT	3730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=2300;ReadPosRankSum=-1.421;SC=GCTACAAAGCGCGGCGACGTC;SOR=0.940;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=66;WE=1062536;WS=1062517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,98:0.48:203
chr7	1094819	rs4720335	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=285;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GTCCAAGCACGGCCCCTCGTT;SOR=0.077;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=16;WE=1094827;WS=1094809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr7	1097952	rs6953080	C	T	3248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=46;PP=1938;ReadPosRankSum=0.765;SC=AGCCCGTGGACGCACACTACC;SOR=0.777;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=164;TCR=102;TR=122;WE=1097960;WS=1097942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,150:0.48:310
chr7	1131356	rs3802141	T	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.191;SC=AGCTGCACGGTGCAGAGACAT;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=74;WE=1131364;WS=1131346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,82:0.42:193
chr7	1131411	rs11544331	C	T	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=1695;ReadPosRankSum=-1.779;SC=GAGATGTACCCAGGCACCGCG;SOR=0.800;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=120;TCR=95;TR=103;WE=1131419;WS=1131401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,116:0.48:243
chr7	1132456	rs10246354	C	T	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1346;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CAGACAGCACCGAGCAGTCGG;SOR=0.535;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=78;WE=1132464;WS=1132446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,94:0.45:208
chr7	1132505	rs2070118	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.968;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=36;PP=1481;ReadPosRankSum=1.509;SC=AGCCTTGGCCGCATAGGCCCA;SOR=1.123;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=93;WE=1132513;WS=1132495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr7	1132748	rs10235056	G	A	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=63;PP=1988;ReadPosRankSum=2.482;SC=AAAGGCCAGCGGTGACCAGCC;SOR=0.852;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=209;TCF=94;TCR=115;TR=110;WE=1132756;WS=1132738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,126:0.52:240
chr7	1133305	rs1133043	C	G	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=56;PP=1384;ReadPosRankSum=-1.045;SC=ACTCCAGCACCTGTGGCTGAC;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=70;TCR=110;TR=91;WE=1133313;WS=1133295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr7	1197890	rs186844195	T	C	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.618;SC=GAGTTAAGTGTCACCTACAAG;SOR=0.619;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=87;TCR=112;TR=87;WE=1197898;WS=1197880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,111:0.45:245
chr7	1197994	rs12702435	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=339;ReadPosRankSum=0.240;SC=AAACGCACTGTGTGGGGAGCA;SOR=0.213;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=26;WE=1198002;WS=1197984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr7	1481919	rs4236408	C	A	4875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=43;PP=2965;SC=CTGAGGATTCCGCCAAGTTCC;SOR=1.541;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=97;TCR=43;TR=140;WE=1481927;WS=1481909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	1482009	rs61744261	G	C	3848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=61;PP=2374;ReadPosRankSum=-0.767;SC=TCCTCGAAGGGAGGCCAAGCA;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=295;TCF=165;TCR=130;TR=140;WE=1482017;WS=1481999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,171:0.49:352
chr7	1482134	rs4457225	C	G	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=73;PP=1627;ReadPosRankSum=1.797;SC=TAAGTAAAAGCGCAGGCATCA;SOR=0.717;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=188;TCF=50;TCR=138;TR=100;WE=1482142;WS=1482124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,111:0.53:210
chr7	1484572	rs10435184	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=17;PP=801;SC=GGGCTCCCCCACCCTGGGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=1484580;WS=1484562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	2784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=89.83;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	1574403	rs4720833	A	G	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1212;ReadPosRankSum=0.826;SC=AGCGAGCGGCAGCCCCGATGC;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=80;TCR=92;TR=85;WE=1574411;WS=1574393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,112:0.50:224
chr7	1574562	.	T	C	144	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=58.22;NF=0;NR=8;PP=144;QD=22.3464015684;SC=TCCTAAAAGATAAGGTCTTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=1574570;WS=1574552;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,8:0.50:16
chr7	1578920	rs181032349	G	A	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=55;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.819;SC=AAAGGCCCCCGGCCCGACAGC;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=165;TCF=55;TCR=110;TR=81;WE=1578928;WS=1578910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,90:0.51:178
chr7	1586653	rs112463195	A	AGCC	770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=704;ReadPosRankSum=3.092;SC=CTCCCGCCGGAGCCGCCGCTG;SOR=0.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=10;WE=1586670;WS=1586643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr7	1586662	rs3779607	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.615;NF=14;NR=8;PP=695;ReadPosRankSum=1.294;SC=GAGCCGCCGCTGGGGTGGGTG;SOR=0.665;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=22;WE=1586670;WS=1586643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr7	1586866	rs3824072	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GCACTCCAGCTCCCCGGACAA;SOR=0.250;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=1586874;WS=1586856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr7	1588391	rs3814481	A	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.392;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=910;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCCTAGAGCCACCGCCGCTGC;SOR=1.500;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=49;WE=1588399;WS=1588381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr7	1588549	rs3814482	G	A	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=571;ReadPosRankSum=-3.476;SC=CAGGGACGTGGCCGTTCTCCC;SOR=1.172;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=36;WE=1588557;WS=1588539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr7	1588768	rs1124871	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=0.340;SC=GGTGGGGTGCGCTGTGTGTGT;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=22;WE=1588776;WS=1588758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr7	1588912	rs3890492	C	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=2.352;SC=ACATGTGTCCCCGTGTGTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=1588920;WS=1588902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	1589056	rs4294092	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GGTGGACCTTGGTCCCCTTGG;SOR=1.222;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=12;WE=1589064;WS=1589046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr7	1589083	rs1865348	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=287;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGCCCTTAATGCCAAGAGTGC;SOR=1.358;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=20;WE=1589091;WS=1589073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr7	1589417	rs10237660	T	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=280;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TCCGCCTCGTTGGGCCCCACT;SOR=1.749;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=17;WE=1589425;WS=1589407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr7	1590368	rs6463921	A	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.26;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	1590368	.	ACTGGCCAT	GCTGGCCAC,GCTGGCCAT	352	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=18,34;NR=3,7;PP=341,352;QD=18.7841845172;SC=TGCCCTGGGGACTGGCCATGG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=21,41;WE=1590384;WS=1590358;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.51:41
chr7	1590376	rs2304360	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.109;SOR=1.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
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chr7	1733102	rs4720922	G	T	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1278;ReadPosRankSum=0.114;SC=GGTGCACCCAGACAGGTGCGT;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=79;WE=1733110;WS=1733092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,107:0.55:196
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chr7	1878377	rs3889573	A	G	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=46;PP=1939;SC=ATAGACTGTGATGATGGCTGC;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=1878385;WS=1878367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	1878453	rs1078112	T	A	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=56;PP=1918;SC=GACCACGGGGTGAACGTCCTG;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=95;WE=1878461;WS=1878443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	1886865	rs6954521	C	A	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.51;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr7	1886937	rs6954673	C	T	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=29;PP=1783;SC=CTGCAGGAGCCGCTGGATTAC;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=86;WE=1886945;WS=1886927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	1887362	rs6957894	G	A	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=92;PP=2965;SC=CCATCGCTTCGGCGTCCCTGG;SOR=1.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=67;TCR=92;TR=159;WE=1887370;WS=1887352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	1888185	rs59248873	A	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=230;SC=GGGATTCAAGACCCTACCAGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=1888193;WS=1888183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	1888294	rs4719320	C	G	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=14;PP=1108;SC=GAGAGCCCAGCGCTGAATCCT;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=1888302;WS=1888284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	1888683	.	TACACACACAC	T	2997	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=59.69;NF=0;NR=21;PP=2997;QD=20;SC=GGTGTACATGTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=21;WE=1888700;WS=1888673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,21:0.78:27
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chr7	1894116	rs7810038	T	C	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=94;PP=2255;ReadPosRankSum=0.490;SC=GCAGACTTGGTGTTTGGTGAT;SOR=1.595;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=40;TCR=95;TR=133;WE=1894124;WS=1894106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,162:0.99:164
chr7	1976457	rs1801368	C	T	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=45;PP=2633;SC=GTGGTCCTCGCGCAGGCGCTG;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=125;WE=1976465;WS=1976447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	1976556	rs2280550	G	A	6283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=114;PP=2965;SC=ACACAGCACAGGTCACCATGG;SOR=0.924;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=91;TCR=114;TR=205;WE=1976564;WS=1976546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr7	2020026	rs117395188	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ACACCTGGGCGTATCCGCCTC;SOR=0.664;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=9;WE=2020034;WS=2020016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr7	2041638	rs1107591	G	A	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=40;PP=2312;SC=GGGGACAGGCGTCCCTGCCCA;SOR=1.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=83;TCR=40;TR=123;WE=2041646;WS=2041628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	2041887	rs4721296	A	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=572;SC=AGGAGCTGGGAAGTGGGCAGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=2041895;WS=2041877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr7	2279851	rs6962067	T	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=586;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAACA;SOR=0.148;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=38;WE=2279859;WS=2279841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr7	2290314	rs12699806	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQRankSum=-0.840;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	2290317	rs60298419	T	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQRankSum=-1.300;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr7	2290319	rs373496719	TC	T	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQRankSum=-1.444;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
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chr7	2290336	rs10249180	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQRankSum=-0.408;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr7	2303986	rs2286206	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=436;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TGGCCCGCGATGCGATCCGCT;SOR=0.708;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=35;WE=2303994;WS=2303976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr7	2304191	rs2286205	A	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CACGGGAGACACAGCAGGTCC;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=8;WE=2304199;WS=2304181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	2309355	rs6947645	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=806;ReadPosRankSum=0.503;SC=ACTGTGGAGCGGGAGGTCGTC;SOR=2.103;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=6;TCR=56;TR=36;WE=2309363;WS=2309345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr7	2315008	rs2398667	G	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CCCTGTGACGGCTTCGTATAT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=2315016;WS=2314998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr7	2394746	rs9690787	T	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=7;PP=442;SC=CGGGCCGGAGTCCGAGGTGAG;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=2394754;WS=2394736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	2394991	rs11551167	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=790;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CGCTGGAGAACGGCGACGCGG;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=62;WE=2394999;WS=2394981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr7	2400306	rs953770	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=359;ReadPosRankSum=0.874;SC=AATGTTTTTCTTGGTAAAAAT;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=25;WE=2400314;WS=2400296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr7	2405885	rs2286204	C	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CGTGTTCTGGCCGCACAGACA;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=2405893;WS=2405881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr7	2409035	rs2301944	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=0.577;SC=ATGAGTTGTTCTATTCTCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=14;WE=2409043;WS=2409025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr7	2414142	rs886632	A	G	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.400;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=793;ReadPosRankSum=-1.472;SC=AGCTCGTGACAGGCGCGCTCT;SOR=0.339;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=52;WE=2414150;WS=2414132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr7	2414365	rs884565	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.360;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=462;ReadPosRankSum=-1.213;SC=GGGTTGCCCCAGTGTCAGTGG;SOR=1.223;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=30;WE=2414373;WS=2414355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr7	2416822	rs2240347	A	G	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=57;PP=1486;ReadPosRankSum=-0.920;SC=TAAAAACGTGACATTTGCAAG;SOR=0.898;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=37;TCR=89;TR=79;WE=2416830;WS=2416812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,90:0.63:143
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chr7	2434522	rs1978169	G	A	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=1027;ReadPosRankSum=2.203;SC=AAACACACCCGCCCAGCAAGA;SOR=0.867;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=54;WE=2434530;WS=2434512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr7	2515382	rs5881927	G	GC	8058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=81;PP=2969;SC=GGAAGGCATTGCCACCACAGT;SOR=1.134;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=141;TCF=55;TCR=86;TR=135;WE=2515390;WS=2515372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr7	2515470	rs144068420	G	A	3341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.594;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.342;NF=53;NR=77;PP=2249;ReadPosRankSum=-0.659;SC=AACCTGGGGCGGACATGGTGC;SOR=0.996;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=244;TCF=110;TCR=134;TR=130;WE=2515478;WS=2515460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,145:0.53:274
chr7	2515613	rs144605099	G	A	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.941;NF=9;NR=26;PP=518;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GGGCCAGGCCGCCCGCACAGA;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=35;WE=2515621;WS=2515603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr7	2517113	rs75052760	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.360;SC=ATTCTCCATTCTCACGTCTCC;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=2517121;WS=2517103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr7	2552881	rs34637446	A	AGATG	1915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=1137;ReadPosRankSum=1.044;SC=ACAGATGGACAGATGGATGGA;SOR=1.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=22;WE=2552889;WS=2552871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr7	2552986	rs286560	A	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=788;ReadPosRankSum=-2.720;SC=TCCTGGGGACATAACCTCCCC;SOR=0.454;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=51;WE=2552994;WS=2552976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr7	2557240	.	C	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=0.043;SC=GAAGCCCCATCCCCTGGCCTG;SOR=1.422;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=18;WE=2557248;WS=2557230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr7	2557266	rs755179	T	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=0.664;SC=TGTGGGGAGATGGACTCACAG;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=35;WE=2557274;WS=2557256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr7	2565268	rs893239	C	A	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=1004;ReadPosRankSum=1.361;SC=GGGGTGGGACCGTGAGGGGCA;SOR=0.526;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=61;WE=2565276;WS=2565258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr7	2577693	rs190232808	C	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=480;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTGGCAGACTCTGGTTCTGCT;SOR=0.826;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=29;WE=2577701;WS=2577683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr7	2578246	rs2917726	C	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1026;ReadPosRankSum=1.211;SC=CTCGGCTCGCCGCCTGCAGCA;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=66;WE=2578254;WS=2578236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr7	2582153	rs138295649	C	CCCCCAGCCTCCCGGGTGT	3847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=12;PP=2969;SC=GGATGGGGTGCCCCCAGGTGT;SOR=1.217;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=37;WE=2582161;WS=2582143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	2611878	rs2917751	T	C	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=130;PP=2965;SC=ATGCGTGGACTGGCGTCCCCG;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=73;TCR=130;TR=203;WE=2611886;WS=2611868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr7	2612294	rs2969042	TC	AA	3643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.777;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=2518;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TGATAAAAAGTCCAAGTCGCA;SOR=1.001;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=79;WE=2612303;WS=2612284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,96:0.45:213
chr7	2613042	rs2304540	G	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=977;SC=ATTTGTTTATGTTTCTCTAGG;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=2613050;WS=2613032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	2618070	rs3214664	C	CA	4920.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.513;NF=24;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CTGGGGGCTACACCGAAGGCC;SOR=0.639;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=190;TCF=56;TCR=134;TR=86;WE=2618078;WS=2618060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,162:0.47:346
chr7	2621567	rs7798469	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=55;SC=AGGATGGTCTTGATCTCCTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=2621575;WS=2621557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	2621731	rs117990618	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CCGCTGGAGCTGTTCTCCCTT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=10;WE=2621739;WS=2621721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr7	2622101	rs1550204	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GAGAGCACAGCGCTGGAGGGA;SOR=0.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=18;WE=2622109;WS=2622091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr7	2623351	rs13242369	G	A	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr7	2623359	rs141224272	C	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr7	2623801	rs73033665	G	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=11;PP=1123;ReadPosRankSum=-1.934;SC=CTGTGATGTTGGTCTTTTCAG;SOR=2.073;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=150;TCF=106;TCR=44;TR=61;WE=2623809;WS=2623791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,70:0.40:173
chr7	2625838	rs2257285	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=660;ReadPosRankSum=0.362;SC=TTTGGTTGTTCCAGGCCCCTG;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=42;WE=2625846;WS=2625828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr7	2626038	rs3217437	CCAGGGAATGG	C	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=2985;SC=AGGAGGGAGGCCAGGGAATGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=2626055;WS=2626028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	2627310	rs2917733	T	A	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=2;PP=889;SC=CAAAATTCTCTGGTAGCCAGG;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=2627318;WS=2627300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	2627578	rs150431779	CAG	C	1099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.929;NF=3;NR=20;PP=897;ReadPosRankSum=0.433;SC=GACGGGCTCACAGGGTGCGGA;SOR=0.735;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=23;WE=2627587;WS=2627568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr7	2632477	rs2917730	A	G	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=462;SC=GGGCAGGCAGAGCCCTGAGGT;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=2632485;WS=2632467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	2636522	rs73033691	T	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.11;MQRankSum=-0.968;NF=30;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=-0.395;SC=GCCAAGCAACTTGTTGCCACA;SOR=1.075;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=42;WE=2636530;WS=2636512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr7	2640897	rs2969057	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CCTCTCACTTTCGTCCTCCTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=2640905;WS=2640889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	2640985	rs4506100	G	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=366;SC=TTGGCTTGATGGACACCTGTT;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=2640993;WS=2640975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	2644519	rs2293404	C	T	7370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=132;NR=100;PP=2965;SC=TGACAGGCGGCTGTGGTGCTT;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=132;TCR=100;TR=232;WE=2644527;WS=2644509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr7	2644607	rs2293405	G	T	2443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=62;PP=1588;ReadPosRankSum=0.327;SC=CACCCAGCGTGCCAGGCCTCC;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=222;TCF=86;TCR=136;TR=103;WE=2644615;WS=2644597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,118:0.46:256
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chr7	2645526	rs10950797	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=310;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCTGTGCCCCGCGTTCCGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=25;WE=2645534;WS=2645516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr7	2645552	rs2293407	A	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=34;PP=1361;SC=CGCCCAGGCCACGGGCAGCCC;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=2645560;WS=2645542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	2646723	rs1464967	A	G	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=56;PP=2965;SC=ACTCTCTAAAAGCAGAATCAG;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=114;TCR=56;TR=170;WE=2646731;WS=2646713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	2646796	rs61729413	G	A	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1809;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GCTTCTACCAGGAGGAGATCG;SOR=0.534;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=110;WE=2646804;WS=2646786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,126:0.50:251
chr7	2646950	rs1056568	T	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=33;PP=994;SC=AAGCCCGGGCTGTGTCGGGAC;SOR=1.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=2646958;WS=2646940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	2647007	rs17833498	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.61;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=0.534;SC=ACTAAGCGTCGCCTTATGCCA;SOR=1.085;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=6;WE=2647015;WS=2646997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	2649673	rs3735108	T	C	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=51;PP=2965;SC=GGTTCATTTCTGCAGACCCCT;SOR=1.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=120;TCR=51;TR=171;WE=2649681;WS=2649663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	2649704	rs3735109	T	G	7428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=93;PP=2965;SC=GCCACAGGCCTTGGCACCTCT;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=144;TCR=93;TR=237;WE=2649712;WS=2649694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr7	2649819	rs3735110	C	T	8597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=140;PP=2965;SC=GTCTCCACGCCGTGATGGCAG;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=116;TCR=140;TR=256;WE=2649827;WS=2649809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr7	2649932	rs3735111	T	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=632;ReadPosRankSum=1.188;SC=TCGTGTCTCTTTGTGCTTTTG;SOR=1.058;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=37;WE=2649940;WS=2649922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr7	2672065	rs11976974	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=85;ReadPosRankSum=1.732;SC=TACCGGCCTCCTTCCTTCTCG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=7;WE=2672073;WS=2672055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr7	2686455	rs3801080	C	A	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=17;PP=1413;SC=TGGGGGTCCACCCCTCCAGCG;SOR=1.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=2686463;WS=2686445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	2686761	rs3801079	G	C	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=23;PP=1732;SC=CATCTCACGGGCCCGCCCTCT;SOR=1.705;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=82;WE=2686769;WS=2686751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	2689472	rs3801077	A	C	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=31;PP=1588;SC=ACTCCAGGGGACGGGTTCTAC;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=2689480;WS=2689462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	2691610	rs13225657	G	A	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=465;SC=ACCGGCACACGTGCACACGAA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=2691618;WS=2691600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	2691736	rs35868808	A	G	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=40;PP=1524;SC=TGCCCTGAAGATATGCGTGCA;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=2691744;WS=2691726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	2692806	rs6461505	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TGTTCCTCTTCCCTCCCCCAG;SOR=0.260;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=11;WE=2692814;WS=2692796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr7	2695617	rs2286690	G	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=4;PP=135;SC=TATCTCAGTCGAAGATTATGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=2695625;WS=2695607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	2697881	rs2302342	G	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=597;SC=GCTCCTTCCTGCTGGGGCCTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=2697889;WS=2697871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	2699687	rs56409742	C	CG	6735.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=98;PP=2936;SC=ACTGACCCACCGGTCCCCCAT;SOR=1.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=11;TCR=100;TR=108;WE=2699695;WS=2699677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr7	2749565	rs13224990	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=290;SC=GTCAACTGCCGGGTTCCAGGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=2749573;WS=2749555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	2752487	rs7776970	G	A	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.828;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=926;ReadPosRankSum=0.900;SC=TCGGCCCCCCGTCCCTGGGAT;SOR=0.500;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=62;WE=2752495;WS=2752477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr7	2771504	rs11772508	C	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.173;SC=CAGGTTGAACCAGAAACCAAA;SOR=0.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=2771512;WS=2771494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr7	2773035	rs34004158	C	CAT	4639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=25;PP=2965;SC=TCTCTGGACACGTTTTCTAAC;SOR=2.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=84;WE=2773043;WS=2773025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	2802173	rs17132665	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=743;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CCACCACGCCTTCTATTCTGG;SOR=0.771;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=71;TCR=21;TR=43;WE=2802181;WS=2802163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
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chr7	2854010	rs2644275	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=193;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TCCATCTGGTGTGCTTCCCGA;SOR=0.779;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=11;WE=2854018;WS=2854000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
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chr7	2968361	rs2527506	G	A	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.446;SC=ACACGTTACGGGTGCATAAAT;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=66;TCR=88;TR=79;WE=2968369;WS=2968351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
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chr7	2969680	rs1621509	G	A	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=621;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TAGGGCTGGCGTCCGTGCCTT;SOR=0.749;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=50;WE=2969688;WS=2969670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr7	2971977	rs5881948	T	TG	130.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=151;SC=TTTCAGCAGTTGGGCTCCTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=2971985;WS=2971974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	2972072	rs1636167	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=0.874;SC=CACGTTTACCACGCAGGATTG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=20;WE=2972080;WS=2972059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr7	2985361	rs113659658	GACAC	G,GAC	698.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=31.76;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,15:0.32,0.68:22
chr7	2987193	rs41400946	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CTCCCGCAAAGAGGTCCTAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=2987201;WS=2987183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr7	3179968	rs7779230	T	G	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,78:0.50:155
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chr7	3179991	rs7779245	T	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=710;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GTTCAAACTATCGGCAAGACA;SOR=0.478;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=46;WE=3179999;WS=3179981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr7	3180657	rs6964682	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=585;ReadPosRankSum=-0.899;SC=GAACTCCCCACGATGCACACC;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=40;WE=3180665;WS=3180647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr7	3187079	rs201147402	C	CT	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr7	3188513	rs7810868	C	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5209;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GAGATGTAGACGTCTTGCTAT;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=4;WE=3188521;WS=3188510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr7	3188549	rs10257432	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AGTCTGTTCTTGCAGTGCTGT;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=3188557;WS=3188539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	3188576	rs10257447	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=0.715;SC=CTACCTGAAATCAGGTAATTT;SOR=0.307;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=3188584;WS=3188566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	3188712	rs10254519	A	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=186;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TCTTACATGGACAGAGGAGAA;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=16;WE=3188720;WS=3188702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr7	3188738	rs34925290	G	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-0.901;SC=AGAAAGAACGGGGAGATGCTA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=3188746;WS=3188728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr7	3197867	rs4634530	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.246;SC=AGACATCCTCTGGTCCAGAAT;SOR=0.745;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=13;WE=3197875;WS=3197857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr7	3205581	rs7782623	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=6;PP=353;SC=AGCAACATAGCGAGACCTCAT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=3205589;WS=3205571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	3205635	rs7801306	A	G	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=543;SC=ACGGTGGCACACATGGCACGC;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=3205643;WS=3205625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr7	3205763	rs10951089	A	C	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=14;PP=552;SC=CAGAGCGAGAACCTGTCTCAA;SOR=1.220;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=3205771;WS=3205753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr7	3998752	rs144223370	TG	T	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.187;NF=0;NR=8;PP=209;ReadPosRankSum=-1.873;SC=TTGAGTGTGATGGCGAAGAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=3998760;WS=3998742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr7	4011331	rs6965800	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.713;SC=ACGGTATCTTCTGGTTGTGGG;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=10;WE=4011339;WS=4011321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	4014022	rs6977582	C	T	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=692;ReadPosRankSum=-1.398;SC=AGAAGGACAACGTGGCCCTGA;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=45;WE=4014030;WS=4014012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr7	4026944	rs7785899	C	G	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=53;PP=1573;SC=TCGTGGAGCTCTCTGAAAACA;SOR=2.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=68;WE=4026952;WS=4026934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	4050507	rs10259544	A	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=655;ReadPosRankSum=0.944;SC=TAAGCAAATGAGATGTTCCCT;SOR=0.973;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=41;WE=4050515;WS=4050497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr7	4089103	rs7794939	G	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1184;ReadPosRankSum=0.214;SC=AAGGTACGTGGCCTGGGTTCA;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=85;TCR=102;TR=83;WE=4089111;WS=4089093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,97:0.43:228
chr7	4107697	rs10226642	A	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=0.618;SC=GGAACTGAAAAGTCTTCCTGG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=21;WE=4107705;WS=4107687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr7	4150203	rs62438179	G	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.674;SC=GCCCTGCCCAGCTCACCAGGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=4150211;WS=4150202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	4152863	rs6956409	G	C	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=38;PP=1717;ReadPosRankSum=-1.156;SC=TTGTGGTTTCGTTCTTTTCCT;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=103;WE=4152871;WS=4152853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,116:0.55:210
chr7	4153824	rs2141076	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=1.447;SC=AGTGGATGGAATACGAGCTGC;SOR=0.680;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=19;WE=4153832;WS=4153814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr7	4171853	rs113599151	GT	G	9331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=58;PP=2965;SC=AGTGTAGCCTGTGGTAGTTAC;SOR=1.823;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=150;WE=4171861;WS=4171843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr7	4185592	rs608271	A	G	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=45;PP=1455;SC=TGTTGTGGGCACAGCTTCCTC;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=4185600;WS=4185582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	4189075	rs659182	G	C	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=73;PP=2655;SC=GCCATGAGGCGACAGCATGCG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=138;WE=4189083;WS=4189065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr7	4213877	rs601424	T	C	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=36;PP=1382;SC=AAAGCCTGAATGGCCTTCTTC;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=77;WE=4213885;WS=4213867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	4213940	rs671756	T	C	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=49;PP=1510;SC=GGTCAGGCACTGAGGCCAAGA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=83;WE=4213948;WS=4213930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	4213975	rs671694	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=41;PP=1264;SC=ATAGCTTTACATGCTGAGCTC;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=4213983;WS=4213965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	4214046	rs600537	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=652;SC=GGACCCTTGGTATCTGCTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=4214054;WS=4214036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	4215206	rs585150	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=381;ReadPosRankSum=0.953;SC=TGTTGTTTACGAGGAGGTGCG;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=19;WE=4215214;WS=4215205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr7	4217969	rs649494	T	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=643;SC=CCGGTCACAGTGGATGCAGGT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=4217977;WS=4217959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	4266887	rs142581792	CT	C	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=239;ReadPosRankSum=-2.093;SC=CCCTCATGTGCTGCTTGTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=4266895;WS=4266877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr7	4266952	rs74496648	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=365;ReadPosRankSum=2.439;SC=TTGTCAGCCCGGCTTCCCACC;SOR=0.476;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=18;WE=4266960;WS=4266942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr7	4267072	rs597636	T	A	1315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=766;ReadPosRankSum=0.683;SC=GTCTTTTTTTTAAATCAGATG;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=50;WE=4267080;WS=4267062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
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chr7	4308205	rs10227734	T	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
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chr7	4799300	rs11980294	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CCAAGGCAGCGCCATTGGCCT;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=22;WE=4799308;WS=4799290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr7	4802029	rs6976790	T	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	4802029	.	TGCTGTA	GGCTGTA,GGCTGTG	148	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9,3;NR=12,5;PP=148,81;QD=8.70339107368;SC=AGCCCAGTGGTGCTGTAACCA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21,8;WE=4802043;WS=4802019;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:21
chr7	4802035	rs1053753	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr7	4822889	.	GGGGAGCTGGTCTCTGGCACA	G	1576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TTCCGAAATGGGGGAGCTGGT;SOR=0.842;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=19;WE=4822916;WS=4822879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr7	4823209	rs78580507	G	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=612;ReadPosRankSum=0.518;SC=AGGCCCGAGGGTTTGGGACGC;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=38;WE=4823217;WS=4823199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr7	4823971	rs17135121	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=554;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGCTGCACAGCGGCCCCGAGG;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=39;WE=4823979;WS=4823961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr7	4829757	rs3031279	C	CCT	1346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.054;NF=15;NR=7;PP=906;ReadPosRankSum=0.876;SC=AGAACATTCCCGTCCTTCTTT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=22;WE=4829765;WS=4829747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr7	4839163	rs3736241	A	C	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1672;ReadPosRankSum=0.042;SC=ACCAGGGGAGACCCACAGGGT;SOR=1.165;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=95;WE=4839171;WS=4839153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,104:0.49:212
chr7	4841313	rs6966329	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=498;ReadPosRankSum=0.082;SC=GAGGCCGCTGAGTCCGTTCCT;SOR=0.562;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=29;WE=4841321;WS=4841303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr7	4841470	rs414035	T	C	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=57;PP=1650;SC=CCCCCACGGCTGGGTTGCCTT;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=97;WE=4841478;WS=4841460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	4841586	.	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=609;ReadPosRankSum=0.563;SC=GGGGCAGCTCGGGGCCTCCAG;SOR=0.682;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=35;WE=4841594;WS=4841576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr7	4841655	rs58207166	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=363;ReadPosRankSum=0.276;SC=ACAGCTCAGGTAGAGGAGTGG;SOR=0.744;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=28;WE=4841663;WS=4841645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr7	4841698	rs35507874	GC	G	824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=515;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CAACTGGGCAGCCTGCAGCAG;SOR=0.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=16;WE=4841706;WS=4841688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr7	4843171	rs138344435	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=4;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.433;NF=9;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=1.328;SC=CCCCCTCCCCGGGTACCTCGG;SOR=0.242;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=14;WE=4843179;WS=4843161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr7	4843213	.	C	CCTGCCAGGG	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=61.22;MQRankSum=2.334;NF=2;NR=8;PP=2973;ReadPosRankSum=0.274;SC=CACTGCCAGGCCTGCCAGGGC;SOR=0.201;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=10;WE=4843221;WS=4843203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr7	4845312	rs2306919	T	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=657;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CTGGGCTCAGTGCGGGGAACG;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=39;WE=4845320;WS=4845302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr7	4862259	rs3816852	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CTCTTTCTACATAAGGATGCG;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=8;WE=4862267;WS=4862249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr7	4899640	rs187115849	G	A	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1417;ReadPosRankSum=-1.041;SC=AGAAATGGCAGGCTGAGAGAC;SOR=0.919;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=88;WE=4899648;WS=4899630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,120:0.52:231
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chr7	4901465	rs3833677	G	GCACGTCCCCCACCACCGCGACCTT	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.37;ReadPosRankSum=2.638;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr7	4946973	rs10951715	A	G	185.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=121;SC=GTTAACGTTCACAGAAACGTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=4946981;WS=4946963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	4959789	rs932060	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GGTCCCCTCTGGGCGGGAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=12;WE=4959797;WS=4959779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr7	4959807	rs932061	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=447;ReadPosRankSum=-3.354;SC=GGCACCTGAGGTGGCTCTTCT;SOR=1.029;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=27;WE=4959815;WS=4959797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr7	4959909	rs149802923	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=924;ReadPosRankSum=1.506;SC=CCCAGTCATCGTCCGACAGGA;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=58;WE=4959917;WS=4959899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,66:0.46:145
chr7	5023420	rs6965043	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.72;QD=23.47;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	5026170	rs57714855	TA	T	663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.59;QD=30.17;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	5026348	rs12671595	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.728;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-1.482;SC=CTGGAGCGTCCGTATTATCAT;SOR=1.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=12;WE=5026356;WS=5026338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr7	5105133	rs12334144	C	T	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=38;PP=1545;SC=ATGAATGTAACGAGTGTGGGA;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=5105141;WS=5105123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	5112035	rs7780525	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=373;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GTTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=1.067;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=25;WE=5112043;WS=5112025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr7	5112057	rs182833256	C	G	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=466;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CCGGCCGCCCCGGTCCCCACC;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=34;WE=5112065;WS=5112047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr7	5112108	rs6862	G	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=307;ReadPosRankSum=0.715;SC=ACCCAGGAAGGCCTTCAGAAC;SOR=0.828;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=24;WE=5112116;WS=5112098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
chr7	5112554	rs1130329	A	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=289;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTTCCCCAGGAGTCGGGGCTG;SOR=0.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=23;WE=5112562;WS=5112544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr7	5161422	rs377350567	C	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	5161512	rs117992329	G	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=8;PP=847;SC=TTAAAGCACTGCCACACTGGT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=5161520;WS=5161502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	5161552	rs141496445	G	A	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=23;PP=1460;SC=TCCTGAAGGTGGAGTTTCAAG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=5161560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	5166683	rs62441988	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=296;SC=GCTTGGCAGGATAACTTCACG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=5166691;WS=5166673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	5172011	rs73057804	C	T	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=7;PP=275;SC=CAGCCTTTATCAGTCATGTTC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=5172019;WS=5172001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	5172045	rs200698976	T	TG	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=69;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=580;SC=AAATCCCTGCTAAAAAGGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=5172060;WS=5172035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	5172052	rs113343750	G	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;SC=TGCTAAAAAGGGCAGTAGAAA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=5172060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	5172088	rs80233906	A	G	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.42;QD=44.31;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	5172095	.	CTT	C	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.08;QD=45.39;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	5172099	.	T	TTG	932.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.78;QD=44.42;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	5172102	rs77898154	A	G	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.01;QD=42.70;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	5172115	rs73057805	A	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=10;PP=541;SC=CTGGAAAAGCAGACACCTGTG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=5172123;WS=5172078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	5172176	rs67170096	T	G	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=89;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=15;PP=662;SC=ACGCTTGCCCTTGGGCTCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=5172184;WS=5172166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	5172208	rs74491186	C	T	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=19;PP=764;SC=GGACCACCCCCGCCCTCTCCC;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=5172231;WS=5172198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	5172213	rs72125963	TCTCCCA	T	1821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=1384;SC=ACCCCCGCCCTCTCCCAGGCG;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=23;WE=5172231;WS=5172198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	5172223	rs77639783	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=16;PP=627;SC=TCTCCCAGGCGCAGGTGGGAG;SOR=0.902;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=35;WE=5172231;WS=5172198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	5172282	rs73057807	A	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=6;NR=19;PP=601;SC=CCCTCACCTTACAAATGTCAT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=5172303;WS=5172272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	5172295	rs73057808	A	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=499;SC=AATGTCATAGAGACTCAATCT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=5172303;WS=5172272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	5172316	rs66755282	T	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=90;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.47;NF=4;NR=17;PP=468;SC=TGTGAGGCCTTACTTGGATTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=5172324;WS=5172306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	5230230	rs10273502	C	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=542;ReadPosRankSum=0.764;SC=CTCGGCCTCCCCGCGGGCCAA;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=29;WE=5230238;WS=5230220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr7	5254227	rs4587243	C	G	6130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=71;PP=2965;SC=TGGCCATCGTCAGCCTTAAAG;SOR=1.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=117;TCR=71;TR=187;WE=5254235;WS=5254217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr7	5257490	rs7791896	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=952;SC=GGACCAAGTGTCAGCCCTGGG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=5257498;WS=5257480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	5257600	rs61736544	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=710;ReadPosRankSum=1.024;SC=TAGCGGCACTGGCCTTTGACG;SOR=0.440;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=40;WE=5257608;WS=5257590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr7	5262385	rs4720537	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.629;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr7	5265661	rs146435321	C	CA	1572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.116;NF=1;NR=24;PP=962;ReadPosRankSum=-1.923;SC=CACCCTCTGACATCGTTAGCC;SOR=0.680;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=25;WE=5265669;WS=5265651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
chr7	5267724	rs11763996	A	G	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1134;ReadPosRankSum=1.019;SC=GCTGCTCTTTATTCTCCCTAG;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=79;TCR=70;TR=80;WE=5267732;WS=5267714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr7	5267849	rs11760558	C	G	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=660;ReadPosRankSum=-0.783;SC=ACCGGTGAGTCTGCTCCGGCC;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=39;WE=5267857;WS=5267839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr7	5269424	rs7785898	A	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=922;SC=CCCGAGTGCTACTGCCTTCTG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=5269432;WS=5269414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	5331307	rs12667188	A	G	77.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.18;QD=19.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	5334469	rs4724524	G	T	4248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=31;PP=1704;SC=CCTCTGGGTTGTTCCTCTCTC;SOR=1.289;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=89;WE=5334480;WS=5334459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	5334472	rs10623123	C	CCT	4313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=31;PP=2488;SC=CTGGGTTGTTCCTCTCTCTCT;SOR=1.237;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=50;WE=5334480;WS=5334459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	5334636	rs11760864	A	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=383;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CTTCCCAGGGACTCCCCATGA;SOR=0.255;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=23;WE=5334644;WS=5334626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr7	5336558	.	GC	G	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.160;NF=3;NR=3;PP=129;ReadPosRankSum=0.086;SC=CACTGTGCACGCCCCCCAGGC;SOR=0.569;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=5336566;WS=5336548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	5336855	rs137903684	TCCCTTCTCTGTC	T	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;ReadPosRankSum=-1.745;SC=CCACCTCTGTTCCCTTCTCTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TCF=0;TR=4;WE=5336874;WS=5336845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	5336903	rs62441137	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr7	5338714	rs6950111	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=418;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGCGCTTTGATGTGCCGCGGC;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=32;WE=5338722;WS=5338704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr7	5342413	rs11979775	T	C	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=12;PP=645;SC=CCCCTCAGGCTGGTGTTGTCC;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=5342421;WS=5342403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	5342474	rs149588788	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=352;ReadPosRankSum=1.187;SC=CGCTGGGGTCCGCCGTGGCCT;SOR=0.981;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=25;WE=5342482;WS=5342464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr7	5347295	rs7794563	A	G	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=2;NR=6;PP=134;SC=GGTGGGCTCCATGCTAAGGGT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=5347303;WS=5347285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	5352659	rs138591330	G	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=9.477;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.82;ReadPosRankSum=3.600;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
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chr7	5353253	rs140781391	G	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.778;NF=2;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.935;SC=GGGGTGCTGGGGCCAGGGAGG;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=5353261;WS=5353243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr7	5396916	rs114527514	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=323;ReadPosRankSum=-1.826;SC=AGCTGGAGAGGGAAGGTGGGT;SOR=0.374;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=20;WE=5396924;WS=5396906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr7	5396955	rs7805732	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=2.323;SC=ACAAAACAGTATAGTGGGTTT;SOR=0.175;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=18;WE=5396963;WS=5396945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr7	5409937	rs58182076	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CTGGGCAACACAGCAAGACCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=5409945;WS=5409931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	5410904	rs61332709	C	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=1893;ReadPosRankSum=0.308;SC=CCAAGCCGTCCGCGTCGGCGG;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=58;WE=5410924;WS=5410894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr7	5410916	rs10215902	G	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=1893;ReadPosRankSum=1.481;SC=CGTCGGCGGCGGCCGTGGGCT;SOR=0.890;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=56;WE=5410924;WS=5410894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr7	5415874	rs11766794	T	C	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=911;ReadPosRankSum=0.249;SC=ACAGAGACAGTGCGCTGCACC;SOR=0.797;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=71;TCR=74;TR=71;WE=5415882;WS=5415864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,83:0.50:166
chr7	5427452	rs182202446	C	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=2.017;SC=GGCACCAGAGCCCTCGCGCCC;SOR=0.736;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=29;WE=5427460;WS=5427442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
chr7	5427652	rs4720623	G	A	2854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=1780;ReadPosRankSum=-1.215;SC=CAGGGCGCACGGCCACGGCGT;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=94;TCR=112;TR=112;WE=5427660;WS=5427642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,131:0.55:239
chr7	5427720	rs4724663	A	G	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=83;PP=2965;SC=GCCTCTCCAGACCCGTGGGCC;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=149;WE=5427728;WS=5427710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr7	5434135	rs4724668	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=272;ReadPosRankSum=-1.984;SC=GGGAGCGGAAAGACAGGTCAG;SOR=1.055;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=17;WE=5434143;WS=5434125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr7	5487423	rs72577279	C	G	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=959;ReadPosRankSum=0.586;SC=TCCTGAAGGTCGGGGGACAAG;SOR=0.549;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=61;WE=5487431;WS=5487413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr7	5487457	rs4724685	C	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr7	5487457	.	CT	AC	711	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13;NR=32;PP=711;QD=16.9881749969;SC=CCCAGCTCTGCTGGGGGCTCC;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=45;WE=5487466;WS=5487447;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,45:0.60:75
chr7	5487458	rs4236392	T	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.67;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	5528883	rs4724701	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=399;ReadPosRankSum=0.973;SC=TTAAAAATCAGATTACAAAAC;SOR=1.051;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=25;WE=5528891;WS=5528873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr7	5528991	rs11769725	C	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=-2.338;SC=GTTGGCCAGGCGTTGTGGCTC;SOR=0.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=28;WE=5528999;WS=5528981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr7	5529546	.	A	AG	477.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=657;ReadPosRankSum=1.356;SC=ACTGCACTCCAGCCTGGACGA;SOR=1.333;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=16;WE=5529554;WS=5529536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr7	5529758	rs28566736	G	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.956;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1240;ReadPosRankSum=1.695;SC=GGTTGTCGGCGCCCAGTGGCT;SOR=0.458;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=79;WE=5529766;WS=5529748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,98:0.49:200
chr7	5529922	rs4077245	A	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=515;SC=AGGAGCCCTGATCACTCCAGC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=5529930;WS=5529912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	5530782	rs10951957	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=573;ReadPosRankSum=0.798;SC=GGTAGGCACTCGGTGAAGGCT;SOR=0.371;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=37;WE=5530790;WS=5530772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr7	5530827	rs3801057	G	A	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TGATTTCTGCGGCCCCTGAAG;SOR=0.831;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=104;TCR=43;TR=64;WE=5530835;WS=5530817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,72:0.40:182
chr7	5530954	rs11975313	G	A	3054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=80;PP=1936;ReadPosRankSum=-0.061;SC=AGCGAGCCATGAAGGCCAGCA;SOR=1.077;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=230;TCF=90;TCR=140;TR=122;WE=5530962;WS=5530944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,144:0.53:271
chr7	5540769	rs6953642	A	C	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=43;SC=ACGCCACCAGAGTCTCCAGGA;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=80;WE=5540777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	5541009	rs12667381	C	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=994;ReadPosRankSum=-1.163;SC=AGGACTTGGGCAGCTGCAGGG;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=64;WE=5541017;WS=5540999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,71:0.39:180
chr7	5541657	rs4724704	G	A	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=34;PP=1097;SC=CTTTGTCCTCGCTCGCCTGCG;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=5541665;WS=5541647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr7	5633530	rs111844911	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=1.605;SC=TTGCGCCCCCGCTAGGCACGC;SOR=0.821;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=5633538;WS=5633520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr7	5643145	rs1640233	T	C	4048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.126;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=2353;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GCTGCTACTTTGACATCGAGT;SOR=0.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=133;WE=5643153;WS=5643135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr7	5643479	rs1725183	C	T	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=25;PP=1222;SC=ACTGACTCCCCTCTTTCTGGG;SOR=1.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=5643487;WS=5643469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	5751250	rs3735289	G	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=49;SC=CAAAGTACTCGTCCTCATTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=5751258;WS=5751240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	5760860	rs2302907	G	A	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=61;PP=1979;SC=AGGAACCTGGGCCAGCCATGT;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=101;WE=5760868;WS=5760850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	5760971	rs4720636	A	T	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=386;SC=TCTTACCATTAGCCAACCTAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=5760979;WS=5760961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	5770330	rs35732993	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQRankSum=-2.365;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr7	5779375	rs10233615	T	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=47;PP=1382;SC=CTCATGCCTATAATCGAAGCA;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=5779383;WS=5779365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	5800769	rs3857756	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=712;SC=TTTCAAAAGAACTGAAAAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=5800777;WS=5800759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	5879576	rs184045727	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQRankSum=-1.707;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.714;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr7	5880392	rs2240405	G	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.469;NF=22;NR=16;PP=476;ReadPosRankSum=1.875;SC=TCCCCAAGAGGGTGTCAAGTC;SOR=0.852;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=38;WE=5880400;WS=5880382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr7	5920394	rs201796201	T	TA	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5294;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.406;NF=7;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=1.004;SC=CGTCTTAATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=5920414;WS=5920384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	5920406	rs10235465	T	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=466;SC=AAAAAAAAAATAATCTAGACA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=5920414;WS=5920384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	5923682	rs7798766	G	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.449;NF=7;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=0.214;SC=GGAAGCATCCGTGAGGGCTTG;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=20;WE=5923690;WS=5923672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr7	5923738	rs3890913	A	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.178;NF=2;NR=3;PP=64;ReadPosRankSum=1.094;SC=CCTTTCTTAAACTTACCGAGC;SOR=0.010;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=5923746;WS=5923728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	5925875	rs114366092	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.234;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=0.849;SC=GTGAGGTCACGAGGGAGTCAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=5925883;WS=5925865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr7	5938326	rs117593220	C	T	82.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=53.07;NF=0;NR=3;PP=48;SC=CTGCGGCGAGCGCTTCCGGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=5938334;WS=5938318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	5942418	rs148245834	G	T	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.22;QD=28.42;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	5949726	rs1138495	T	C	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.70;QD=31.08;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	5949865	rs144098604	C	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.055;NF=1;NR=12;PP=395;ReadPosRankSum=-2.347;SC=TTTTGTCTTACTGTGATATTT;SOR=0.582;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=13;WE=5949884;WS=5949855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr7	5949876	rs147234259	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.986;NF=0;NR=8;PP=395;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TGTGATATTTGTGTCACTGTA;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=8;WE=5949884;WS=5949855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,2:0.07:27
chr7	5952345	rs117314112	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.247;NF=23;NR=2;PP=487;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TATTCTGATATGGTGTTTGCC;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=25;WE=5952353;WS=5952335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr7	5959485	rs200812052	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=9.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQRankSum=-5.983;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=1.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr7	5959661	rs199977794	C	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.06;QD=26.24;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	5965157	.	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.70;MQRankSum=-2.846;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.245;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr7	5965252	rs371339286	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.65;MQRankSum=-4.979;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.161;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,24:0.26:93
chr7	5968053	rs61032858	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=7.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.81;MQRankSum=-4.181;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr7	5983012	rs150999559	A	G	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.43;QD=30.29;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	5983063	rs148485394	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.74;MQRankSum=-0.777;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr7	5983195	rs138475267	C	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=533;SC=GTTTTTTTCCCAGACAGAGTC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=5983203;WS=5983185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	5983553	rs80120223	A	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.05;QD=25.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	6013049	rs1802683	C	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.06;MQRankSum=-0.048;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.712;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	6026775	rs2228006	T	C	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=62;PP=2181;SC=TCGTCAGTTTTAGGCGCTTTC;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=6026783;WS=6026765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	6026988	rs1805321	G	A	4317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=51;PP=2804;SC=TCTTTCTGAGGTCTCAGGACG;SOR=1.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=131;WE=6026996;WS=6026978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	6036980	rs1805319	G	C	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=25.69;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	6037057	rs60794673	GA	G	505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.443;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.01;MQRankSum=1.851;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.462;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,31:0.91:34
chr7	6038722	rs62456182	T	C	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=766;SC=GGCGTTGAAGTAACCGGCCAT;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=6038730;WS=6038712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	6063283	rs4560	C	T	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=59;PP=2583;SC=CTTGTGAAAACCTGGCTCCTT;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=130;WE=6063291;WS=6063273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	6065914	rs10253000	T	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=17;PP=1148;SC=CCGGCAGACATACAGACAGCC;SOR=1.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=53;WE=6065922;WS=6065904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	6066057	rs34019419	G	GC	6068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=68;PP=2936;SC=GCCCCAGGAAGTTTCCTACCG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=94;WE=6066065;WS=6066047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	6068511	.	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.104;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=944;ReadPosRankSum=1.048;SC=CATGTCTTTTGCTTATGCAAA;SOR=0.553;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=60;WE=6068519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr7	6071060	rs4724769	G	A	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=59;PP=2636;SC=ACAGTGCCAAGTCCCTGGAAG;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=131;WE=6071068;WS=6071050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	6071277	rs4724770	A	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=762;SC=GCTTAGAAAGAAGCATGATCT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=6071285;WS=6071267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	6075823	rs2302334	A	T	7054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=119;PP=2965;SC=TGCAGGAATCATGCTACCAGA;SOR=0.932;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=89;TCR=119;TR=208;WE=6075831;WS=6075813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr7	6078376	rs2302331	A	C	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=47;PP=1696;SC=AACAAATATTAATCTGCCTAT;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=6078384;WS=6078366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	6080853	rs34743814	GA	G	381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=1;NR=20;PP=308;SC=ATTGCTCTCTGAAAAAAAAAA;SOR=5.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=21;WE=6080862;WS=6080843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	6084310	rs511969	G	T	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=51;PP=1843;SC=AGAAATGGAAGTAGATCTGCC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=6084318;WS=6084300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	6088339	rs523254	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.38;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	6088349	rs523276	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.52;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	6088533	rs525090	C	T	136.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=3;PP=109;SC=GAATAAAGAACCTATCAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=6088541;WS=6088523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	6094290	.	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=533;ReadPosRankSum=1.066;SC=GGTTGGCTGTTGTAGGGGTTC;SOR=0.957;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=41;WE=6094298;WS=6094280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr7	6097667	rs558030	T	A	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=10;PP=836;SC=TTCACCTAGTTAGAGTCAATG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=6097675;WS=6097657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	6097868	rs559842	A	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=13;PP=402;SC=CAGCAAGACCACATCTCTGCA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=6097876;WS=6097858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	6178931	rs6973832	G	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=43;PP=1136;SC=ACACAGAACAGTGTTCACTTT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=51;WE=6178939;WS=6178921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	6180680	rs10216107	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=0.405;SC=AACTGTAGTTCATTTATAATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=6180688;WS=6180670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	6183682	rs10255598	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=1.981;SC=GTATATATTCGTCTTCTTATA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=6183690;WS=6183672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	6183836	rs3750063	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=183;ReadPosRankSum=0.421;SC=AGGTATGTGGATGATGTCATT;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=14;WE=6183844;WS=6183826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr7	6185194	rs10225119	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ATATGTCTCAACCCAACGGAG;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=75;WE=6185202;WS=6185184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,93:0.44:210
chr7	6185356	rs6944071	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.538;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=186;ReadPosRankSum=-0.818;SC=GCATTCTTGGGGTAGGGAGAG;SOR=0.078;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=14;WE=6185364;WS=6185346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr7	6189750	rs61750868	C	T	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=35;PP=1322;ReadPosRankSum=2.266;SC=GCCAAGATGCCGAAGATGAGG;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=189;TCF=113;TCR=76;TR=88;WE=6189758;WS=6189740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,103:0.46:222
chr7	6189780	rs3764814	T	C	6515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=86;PP=2965;SC=CGCACGAGCTTCAAGAACCCA;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=112;TCR=86;TR=198;WE=6189788;WS=6189770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr7	6193464	rs61732616	T	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=569;SC=GCCGAATCCCTGGAGGAGCCA;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=6193472;WS=6193454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	6193521	rs61729726	G	C	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=6;PP=1232;SC=CCGCCGCCCCGCGATCCCGGC;SOR=3.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=6193529;WS=6193511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr7	6194876	rs6964819	G	A	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=870;SC=GCTGTCAGCAGTGGGGCCTGT;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=6194884;WS=6194866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	6197045	rs10255918	T	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr7	6199265	rs10246266	C	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	6204693	rs2301911	C	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=790;ReadPosRankSum=0.641;SC=GGGTGACACACAGACCTCCCC;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=47;WE=6204701;WS=6204683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr7	6204999	rs2301910	A	C	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=84;PP=2965;SC=CGTCGGCCTCAGTCTTACAGG;SOR=0.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=195;WE=6205007;WS=6204989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr7	6212656	rs3793205	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=339;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CCGGCTGAGGCGACTCCCACC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=17;WE=6212664;WS=6212646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr7	6213396	rs17136059	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TTCAAACCTAATGTACATTAT;SOR=1.115;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=24;WE=6213404;WS=6213386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr7	6370144	rs1043965	G	A	6092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=75;PP=2965;SC=GCTTTAAACGGTCAAGGAAAA;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=112;TCR=75;TR=187;WE=6370152;WS=6370134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr7	6370194	rs6952125	C	T	7875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=108;PP=2965;SC=TCGGGATACACGTGCAGCGTT;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=133;TCR=108;TR=241;WE=6370202;WS=6370184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr7	6370305	rs3750039	C	G	7065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=121;PP=2965;SC=ATTTCCGGCACTTTTTGATGG;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=84;TCR=121;TR=205;WE=6370313;WS=6370295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr7	6370406	rs3750040	C	T	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=68;PP=2514;SC=CCAGTCTCGCCGCCCCAGAGC;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=114;WE=6370414;WS=6370396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	6370570	rs61996356	A	G	3174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.722;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr7	6370575	rs3750041	C	T	3270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.746;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
chr7	6414586	.	C	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=76;SC=GCCCGGGCGGCGCGTGCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=6414594;WS=6414576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	6426941	rs702483	C	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=508;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GGGAATTAACCTGTTTGTGTT;SOR=0.450;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=33;WE=6426949;WS=6426931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr7	6431690	rs836478	C	T	4501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=88;PP=2788;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TTGCAGCTGACTTTTAATGTG;SOR=0.657;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=391;TCF=192;TCR=199;TR=179;WE=6431698;WS=6431680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,219:0.45:482
chr7	6441799	rs836551	G	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=593;ReadPosRankSum=0.223;SC=GCAAGGCCCTGTGGGTCTTAA;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=31;WE=6441807;WS=6441789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr7	6450051	rs67893418	CCT	C	2192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=1469;ReadPosRankSum=1.028;SC=TGTCACTCACCCTCTGTCACC;SOR=0.605;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=33;WE=6450060;WS=6450041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr7	6450128	rs836561	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.020;SC=GAAACCCCGCTTGGAAGACTC;SOR=1.371;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=16;WE=6450136;WS=6450118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr7	6452793	rs836496	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=2.119;SC=TCTTCTCTAAAGGGAGGGTAG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=6452801;WS=6452783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	6456669	rs836508	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=0.070;SC=GGATCTGAGACTGCAGAATCA;SOR=0.195;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=6456677;WS=6456659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr7	6461348	rs836514	G	A	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.955;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=713;ReadPosRankSum=3.125;SC=ACACGAGTCCGCGCTCATACC;SOR=0.352;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=51;WE=6461356;WS=6461338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,71:0.44:162
chr7	6461424	rs836515	C	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1029;ReadPosRankSum=1.324;SC=CTGACAGGTCCGTAAGGACAT;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=67;WE=6461432;WS=6461414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,86:0.39:220
chr7	6465598	rs836524	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=333;ReadPosRankSum=1.258;SC=AGTGAAGAGCCGCTGTCTGCA;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=29;WE=6465606;WS=6465588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr7	6472354	rs836532	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.399;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr7	6502765	rs137999737	T	C	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GTGATGGTCTTTGGCACTTAT;SOR=0.641;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=70;WE=6502773;WS=6502755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
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chr7	6544630	rs78696194	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=0.051;SC=TCAGCTACACGTCCATAGTCC;SOR=0.214;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=28;WE=6544638;WS=6544620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
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chr7	6549867	rs74487555	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.345;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=0.411;SC=TGAGCCTGGGGTGGAGGGAAA;SOR=0.105;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=15;WE=6549875;WS=6549857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr7	6550403	rs34411495	A	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=37;PP=1327;ReadPosRankSum=0.107;SC=CAGAACCAACATGCCCCGCAG;SOR=0.994;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=164;TCF=93;TCR=71;TR=91;WE=6550413;WS=6550393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr7	6550494	rs12702520	G	A	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TTGCAGGTGGGAAAACTGAGC;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=76;TCR=102;TR=101;WE=6550502;WS=6550484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,113:0.56:200
chr7	6560531	rs10247242	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.642;SC=GGCATGCCTGTGGCCCGACAC;SOR=0.223;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=6560539;WS=6560521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	6566322	rs2881723	T	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=785;ReadPosRankSum=0.722;SC=GGGCCCGGCGTGCGCGGCACA;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=58;WE=6566330;WS=6566312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,65:0.46:142
chr7	6576411	rs201353483	C	CT	798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.929;NF=2;NR=18;PP=511;ReadPosRankSum=0.876;SC=AACTTTTTTCCTTTTTTCCCC;SOR=0.934;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=20;WE=6576419;WS=6576401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr7	6590670	rs9690195	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.191;SC=CTTGCGCCTGCGCTCTCGGTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=6590678;WS=6590660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	6590693	rs6463571	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=192;SC=CCGCGTCCGGGCGCTTGCGGC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=6590701;WS=6590683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	6591008	rs73059373	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=2.019;SC=AGCCACCTAGCCGGAAGCCAA;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=25;WE=6591016;WS=6590998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr7	6621277	rs11559146	G	A	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=44;PP=1315;SC=TCAGAGAGCCGTGCATGGATT;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=6621285;WS=6621267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	6628242	rs3088114	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=30;PP=1849;SC=TTTTCTCTGCTCCTAGTACCT;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=90;WE=6628250;WS=6628232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	6631414	rs10260097	G	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=995;ReadPosRankSum=1.393;SC=ATGACAGCCGGATGAGCTTGT;SOR=0.794;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=48;TCR=96;TR=59;WE=6631422;WS=6631404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,65:0.39:167
chr7	6641828	rs116626727	G	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=344;ReadPosRankSum=1.755;SC=GTGGAGGGAGGCAAGACAGGG;SOR=0.332;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=17;WE=6641836;WS=6641818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr7	6647738	rs4416743	T	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=10;PP=414;SC=TGCCCACGCATCCCGGCCACA;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=6647746;WS=6647728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	6655932	rs34060186	C	G	3439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=73;PP=2363;SC=TCTGCACGGGCCAGGGTGGAC;SOR=1.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=113;WE=6655940;WS=6655922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	6656830	rs2243563	G	A	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=48;PP=2260;SC=GCCGACTCCCGGGAATCGGGG;SOR=0.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=115;WE=6656838;WS=6656820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
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chr7	6854272	rs11769113	A	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=849;SC=GACATAAATAACACACTAAGA;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=6854280;WS=6854262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr7	6863132	rs117732208	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=1.435;SC=GTGCTGAAAAAAAGTGTTTGC;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=14;WE=6863140;WS=6863122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr7	7106497	rs139443474	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCAAGGGGGACGATGATACTA;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=7106505;WS=7106487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr7	7106600	rs6943868	T	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=850;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GCAGGGGGTGTACACCTTCTG;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=47;WE=7106608;WS=7106590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
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chr7	7273847	rs11976941	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=0.080;SC=TTAACTTTCCGTTATAGCTAA;SOR=1.068;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=22;WE=7273855;WS=7273837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr7	7277807	rs3807862	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=338;SC=AATTAGGACAGTGCTTTCTTC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=7277815;WS=7277797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	7398457	rs2348042	T	G	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.078;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=711;ReadPosRankSum=0.239;SC=AAAAGGAAAATGTGTCACGGA;SOR=0.435;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=91;TCF=16;TCR=75;TR=44;WE=7398465;WS=7398447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
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chr7	7412620	rs61399779	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=622;ReadPosRankSum=1.626;SC=GCCAGATAGCCTTCCTTACCT;SOR=0.872;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=31;WE=7412628;WS=7412610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
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chr7	7477250	rs5882126	T	TA	245.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=244;SC=GCATCTTTTGTAACCACTGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=7477258;WS=7477240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	7480382	rs16878052	A	G	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=51;PP=2601;SC=GACACAATACAAACTCCTCAA;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=136;WE=7480390;WS=7480372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	7483083	rs10234554	C	T	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=11;PP=1417;SC=GCTTCCAAGACAGTATTCATA;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=7483091;WS=7483073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	7491842	rs75641746	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=326;ReadPosRankSum=0.051;SC=AGCCCATTATGTAGAGTTAGA;SOR=0.826;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=20;WE=7491850;WS=7491832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr7	7491861	rs77154721	A	G	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.17;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	7491865	rs114477688	A	G	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=2.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	7491873	rs4720735	AG	CT	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	7491908	rs16878062	T	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=419;ReadPosRankSum=0.460;SC=TATATAATGTTACATAAAGTA;SOR=1.195;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=24;WE=7491916;WS=7491898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr7	7493097	rs17167927	C	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=521;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CCCTGTCCTGCGGGCCCTTGT;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=39;WE=7493105;WS=7493087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr7	7495735	rs55745506	T	C	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=51;NR=78;PP=2613;SC=CCACAGGTCCTATATCCCCCT;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=7495743;WS=7495725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	7514235	rs6952195	C	G	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=50;PP=2764;SC=ACAGTACCTTCTCCCCTTTGA;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=131;WE=7514243;WS=7514225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr7	7516683	rs17168103	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=1219;ReadPosRankSum=0.199;SC=ATTTTTAAAATTTGTAATTCA;SOR=0.392;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=36;WE=7516703;WS=7516673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,45:0.41:109
chr7	7516695	rs17168104	G	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.682;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=1219;ReadPosRankSum=1.371;SC=TGTAATTCACGAGCATGTAAG;SOR=0.355;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=40;WE=7516703;WS=7516673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,48:0.38:127
chr7	7516904	rs60977515	T	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=-2.031;SC=AGAGAATGGTTATATTTCAGT;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=21;WE=7516912;WS=7516894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr7	7516958	rs10226811	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=0.266;SC=GTACTAAACATGTACAGGCTT;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=7516966;WS=7516948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	7528951	rs6463696	C	T	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1365;SC=GACCATTTATCCTAAACAGAA;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=7528959;WS=7528941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	7545691	rs10486176	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=1033;ReadPosRankSum=-1.274;SC=TGGAGGTCCAGTAATTCCCTG;SOR=0.954;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=30;WE=7545702;WS=7545681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr7	7545694	.	A	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=1807;ReadPosRankSum=0.075;SC=AGGTCCAGTAATTCCCTGCTC;SOR=0.504;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=52;WE=7545702;WS=7545681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,66:0.62:107
chr7	7550825	rs200099162	A	ATGTT	408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=333;ReadPosRankSum=0.061;SC=ACTATTAAGAATGTTTGTTTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=7550833;WS=7550815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	7557297	rs1016028	T	C	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=14;PP=1371;SC=GATTGCCTTCTTGAGCCATCA;SOR=1.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=7557305;WS=7557287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
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chr7	7679885	rs3735460	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=487;ReadPosRankSum=1.737;SC=TTCATCCCCCGTTATCCAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=29;WE=7679893;WS=7679875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
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chr7	8126194	rs12847	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=581;SC=CCTCCACCCTATGTTCCATGG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=8126202;WS=8126184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr7	8196567	rs200840693	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	1032.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.29;MQRankSum=0.903;QD=21.07;ReadPosRankSum=2.137;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,43:0.88:49
chr7	8267649	rs3823817	T	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=0.635;SC=CAAAAATATATACATTATATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=8;WE=8267657;WS=8267639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	8267875	rs2080171	C	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.592;NF=15;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CCTTCTGTCTCTTATCTTAAA;SOR=0.936;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=22;WE=8267883;WS=8267865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr7	8267924	rs5882159	AT	A	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.429;NF=7;NR=11;PP=553;ReadPosRankSum=-0.066;SC=AGATAATCACATTAAAAAAAA;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=18;WE=8267932;WS=8267914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
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chr7	8268437	rs7781961	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=23;ReadPosRankSum=1.068;SC=TAGTGTTATGCGGTGTACTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=8268445;WS=8268427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr7	11151221	rs181145158	T	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CAGTACACCTTAAGAATATAT;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=20;WE=11151229;WS=11151211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr7	11208989	rs28394821	C	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=-1.001;SC=TCAAGTATAGCTGATAAATGC;SOR=1.244;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=11208997;WS=11208979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr7	11416378	rs2189351	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.308;SC=TATATGACCAATTTCTTTCAA;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=11416386;WS=11416368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr7	11418670	rs2189352	C	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.375;SC=AAAGGTTTCTCTTTCAACACT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=11418678;WS=11418660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr7	11418931	rs12670599	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=606;ReadPosRankSum=1.168;SC=AGAAGATTTATACTAGCCATG;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=41;WE=11418939;WS=11418921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr7	11418984	rs7781674	G	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=188;ReadPosRankSum=0.857;SC=TTGAAGAGAAGGCTTTAAACA;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=17;WE=11418992;WS=11418974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr7	11419104	rs2285757	G	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.311;SC=AGCAAGTGAAGTCAGGACTTT;SOR=0.395;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=14;WE=11419112;WS=11419094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr7	11419378	rs2107162	T	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=500;ReadPosRankSum=0.105;SC=AATAATATATTTTGCTATGAT;SOR=1.139;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=30;WE=11419386;WS=11419368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr7	11441700	rs1859225	G	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=1.471;SC=GGTATCCCAGGCACACATAAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=11441708;WS=11441690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	11446902	rs6956916	T	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=899;ReadPosRankSum=-1.658;SC=CCTTGACCAGTAGCCTAATAT;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=49;WE=11446910;WS=11446892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr7	11447159	rs6975407	G	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=293;ReadPosRankSum=0.484;SC=AGCCACATAAGAGAATAAAAT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=16;WE=11447167;WS=11447149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr7	11452204	rs2301743	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=0.355;SC=TAGAGATGAACTATACTGACA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=11452212;WS=11452194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr7	11464297	rs1859226	T	C	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.538;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=748;ReadPosRankSum=0.410;SC=TGTCTTGCTTTTCTGTATAAT;SOR=0.900;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=46;WE=11464305;WS=11464287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr7	11509438	rs56163655	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=154;ReadPosRankSum=1.850;SC=TTGCTAGGCCAGAAGACCTCA;SOR=0.283;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=14;WE=11509446;WS=11509428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr7	11509561	rs2285744	G	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=425;ReadPosRankSum=0.138;SC=TCACAATACAGTCCTTCTTAC;SOR=0.522;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=32;WE=11509569;WS=11509551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr7	11581121	rs47	T	C	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1329;ReadPosRankSum=1.237;SC=GGCTCGCAGTTTCCCAGTCTC;SOR=0.854;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=59;TCR=90;TR=72;WE=11581129;WS=11581111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr7	11633193	rs2354954	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=181;ReadPosRankSum=0.867;SC=TGTCTTCTACGCTCAAGAGTG;SOR=0.425;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=11;WE=11633201;WS=11633183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr7	11675662	rs2074600	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=0.992;SC=TGTGCCCCTACGTAATCCAGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=11675670;WS=11675652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	11675855	rs61996273	C	T	7392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=124;PP=2965;SC=GTCTGTTCTGCCTGTTTCTGT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=110;TCR=124;TR=234;WE=11675863;WS=11675845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	11676377	rs2074598	G	A	3194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=65;PP=2083;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TTGAAATCACGGGCTGACACT;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=266;TCF=132;TCR=134;TR=134;WE=11676385;WS=11676367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,149:0.49:305
chr7	12255434	rs6460901	C	T	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.53;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	12255511	rs6460902	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=160;SC=ATAATCCCCTGTGTGCTGCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=12255519;WS=12255501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	12257938	rs6415232	A	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=193;SC=CTTCTGCTGGATACTTTCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=12257946;WS=12257928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	12263799	rs11509137	TG	CA	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=26;PP=2947;SC=TCTAATGTTGTGTTATATAAT;SOR=2.176;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=93;TCR=32;TR=113;WE=12263808;WS=12263789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	12269213	rs13234238	A	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=1.036;SC=TTAATAAATGAAGCATAGCTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=12269221;WS=12269203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	12269260	rs3839691	A	ATGTT	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=4;PP=618;SC=ACATATTTGTATATTTTTAGC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=12269268;WS=12269250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	12269417	rs3173615	C	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=28;PP=1011;SC=AACAACATAACCATTATTGGT;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=12269425;WS=12269407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	12270565	rs3214372	A	AT	105	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=142;SC=AGTATAGAAAATTCTCAACCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=12270573;WS=12270555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	12270625	rs2302635	G	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=517;SC=TAAGATAGGAGGGAGAATTTT;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=12270633;WS=12270615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	12270770	rs2302634	T	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=21;PP=716;SC=TGAAAGAGATTTTGCTTGTTA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=12270778;WS=12270760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	12270815	rs2302633	C	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=14;PP=495;SC=TTATAATATACACAACATCTT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=12270823;WS=12270805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	12270967	rs2302632	A	G	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=168;SC=GGATGTCACAAGAGTTCAGGA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=12270975;WS=12270957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	12271452	rs3800842	A	G	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=39;PP=2485;SC=CCTCACTTACATTATTTTTAG;SOR=1.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=122;WE=12271460;WS=12271442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	12271666	rs1042946	G	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=452;ReadPosRankSum=-0.550;SC=TCAATGAAGAGGTATTTCCTA;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=26;WE=12271674;WS=12271656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr7	12370657	rs2253353	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	12370702	rs3217131	AT	A	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=0.371;SC=TCTTTAAGATATTTTTTGAAT;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=12370710;WS=12370692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr7	12370794	rs1059002	T	C	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=17;PP=918;SC=TTGTAATTCATATACTTGATG;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=12370802;WS=12370784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	12370952	rs6954265	C	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=21;PP=630;SC=TGCCACTAGACTCAATACTGT;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=12370960;WS=12370942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	12371001	rs6954555	G	A	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=411;SC=CATACTTAAGGTCCAAGCTGT;SOR=2.636;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=12371009;WS=12370991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	12371019	rs3815534	A	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=329;SC=TGTCATAACCAAATGGAGCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=12371027;WS=12371009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	12372999	rs6460928	T	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=458;SC=TTGGAAATAATAAAAAAACAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=12373007;WS=12372989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	12373082	rs6460929	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=21;PP=1623;SC=TCTTTAAACTCTGAAATACCT;SOR=1.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=77;WE=12373090;WS=12373072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	12373353	rs6460930	TG	CA	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=1382;SC=TATGTACTCTTGTCTTTCAGA;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=12373362;WS=12373343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	12375667	rs35608044	G	GA,GT	882.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=14,14;NR=6,6;PP=245,184;SC=GCATGCTGGAGTTTTTTCCCC;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=20,20;WE=12375675;WS=12375657;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.39:28
chr7	12376811	rs2192828	A	C	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=96;PP=2965;SC=ACTTTTTTGGAATCTCCTACC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=98;TCR=97;TR=194;WE=12376819;WS=12376801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr7	12382637	rs1440030	C	T	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=10;PP=1337;SC=GTTCATTTCACGTAGCATTAA;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=12382645;WS=12382627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	12383967	rs1440032	T	A	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=40;PP=1463;SC=CAAATACAATTTATCATGCAA;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=12383975;WS=12383957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	12391319	rs6967385	G	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=467;SC=GTAGTAAATTGATTTACAAAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=12391327;WS=12391309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	12393966	rs6944618	A	G	7593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.30;SOR=1.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	12393974	rs6944626	A	C	7921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.82;SOR=1.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	12394053	rs6945167	G	T	8523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=129;PP=2965;SC=ATTCAGGCATGCTACTCCCTC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=124;TCR=129;TR=253;WE=12394061;WS=12394043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
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chr7	12395813	rs2119141	T	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=18;PP=780;SC=AAGGGTTGGATTGGCACCCAC;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=12395821;WS=12395803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr7	12400857	rs151194396	T	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=285;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GATTACTGAATTTATAACCAT;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=18;WE=12400865;WS=12400847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr7	12406989	rs6460939	C	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=421;ReadPosRankSum=1.976;SC=ATACCTGTAGCTTAGTAACTT;SOR=0.646;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=22;WE=12406997;WS=12406979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr7	12417407	rs7793993	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=-0.910;SC=ATTACCTTGACCAATAGTTTT;SOR=1.136;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=12417415;WS=12417397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr7	12428493	rs138321554	ACACT	A	2818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.677;NF=18;NR=29;PP=2140;ReadPosRankSum=-0.473;SC=AATTTTTAACACACTCAATCA;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=47;WE=12428504;WS=12428483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,78:0.42:187
chr7	12428550	rs848019	G	A	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.611;NF=37;NR=41;PP=1225;ReadPosRankSum=0.195;SC=ATGCTTTCACGTGTGGGGGGA;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=82;TCR=97;TR=78;WE=12428558;WS=12428540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,86:0.44:196
chr7	12428582	rs848018	C	T	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.419;NF=30;NR=42;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TGGCAAAGAACCCTAAAGAAA;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=72;WE=12428590;WS=12428572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,77:0.50:153
chr7	12428608	rs6954047	C	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.507;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.308;NF=16;NR=39;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.598;SC=CCAATGTAAACAGAAATTTAG;SOR=1.095;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=55;WE=12428616;WS=12428587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr7	12428741	rs848017	G	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=950;ReadPosRankSum=0.411;SC=TGAATTACTGGTGTTTTCTTA;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=55;WE=12428749;WS=12428731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr7	12428803	rs848016	G	A	4955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=70;PP=2965;SC=TAAGTATACAGAAAAGTTCCC;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=12428811;WS=12428793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr7	12429112	rs848015	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=83;SC=TTATGGCTTGTACCTGTTCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=12429120;WS=12429102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	12433195	rs12669558	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	12433445	rs73052774	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=747;ReadPosRankSum=-0.548;SC=ATGTGTTTTGTTTGTTGACAT;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=47;WE=12433453;WS=12433435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr7	12609988	rs2240571	G	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=0.702;SC=CCAGAAATAAGAGGATTAGCG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=12609996;WS=12609978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr7	12610373	rs17149965	G	A	2914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TCCAAGATCAGCGATATCACG;SOR=0.557;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=217;TCF=115;TCR=102;TR=111;WE=12610381;WS=12610363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,139:0.54:257
chr7	12611179	rs12699405	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=657;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GGATTCTACCCGCACCATGCT;SOR=0.513;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=44;WE=12611187;WS=12611169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr7	12611252	rs6460967	T	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=0.964;SC=CAGATAGAAGTAAGAAAAAAA;SOR=0.620;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=20;WE=12611260;WS=12611242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr7	12617854	rs116948313	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GTAAGCAGCTCCCTCAGTTTC;SOR=1.276;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=19;WE=12617862;WS=12617844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr7	12636026	rs758111	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=617;ReadPosRankSum=2.271;SC=GCCTCCCTGATGTCTGCATTC;SOR=0.404;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=49;WE=12636034;WS=12636016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr7	12644334	rs849778	G	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.132;NF=23;NR=33;PP=2251;ReadPosRankSum=1.394;SC=ACTCCAACTCGTATGTGTCTG;SOR=0.666;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=56;WE=12644356;WS=12644324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,64:0.44:144
chr7	12644348	rs78612532	G	GGT	1297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.164;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.796;SOR=1.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr7	12684340	rs2691810	C	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=51;PP=1641;SC=TGTAAGTGTCCTTAAAAATAG;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=12684348;WS=12684330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	12691703	rs3736574	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=224;ReadPosRankSum=-1.035;SC=ATTTCCAAATGGGCACAAGAA;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=15;WE=12691711;WS=12691693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
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chr7	13946316	rs17167633	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=748;SC=TATGGTTAAACCACAATCAAC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=13946324;WS=13946306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	13947289	rs10950497	G	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=522;SC=CTGCAAGTATGTCATTGTTAG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=13947297;WS=13947279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	13978645	rs3801098	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.77;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr7	13978648	rs3801099	T	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.540;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
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chr7	14016939	rs2074670	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=225;ReadPosRankSum=1.463;SC=GTTAAAAAGGTGCTGGTACAA;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=19;WE=14016947;WS=14016929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
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chr7	14017126	rs5882424	T	TA	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=1.745;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr7	14025640	rs3801110	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GTCAATTTCAGCAAACATAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=14025648;WS=14025630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr7	14025719	rs79914975	T	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=1906;ReadPosRankSum=-0.114;SC=ACCCATAGATTTCCTAAGCAT;SOR=0.541;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=42;WE=14025735;WS=14025709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr7	14025727	rs3823704	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=1418;ReadPosRankSum=0.411;SC=ATTTCCTAAGCATTAGATACA;SOR=0.967;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=38;WE=14025735;WS=14025709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr7	14025766	rs10215655	T	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.833;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.686;SC=GTGAACAAGGTGGAAAGAAGA;SOR=1.092;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=64;WE=14025774;WS=14025756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr7	14026357	rs3213661	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=549;SC=CAAATCTTTAATCTTCATTAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=14026365;WS=14026347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	14027867	rs59844225	G	GCA	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=528;ReadPosRankSum=-1.660;SC=ACACGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=12;WE=14027875;WS=14027857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr7	14216442	rs17167945	A	G	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1118;ReadPosRankSum=1.413;SC=TTGACATAGCATATCAACTAC;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=88;WE=14216450;WS=14216432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,98:0.52:188
chr7	14216609	rs2286248	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=370;ReadPosRankSum=-1.847;SC=GATGAGACCAGGGAAGGCAAT;SOR=0.965;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=16;WE=14216617;WS=14216599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr7	14217673	rs6966154	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=356;ReadPosRankSum=-0.278;SC=CCACGCAGGAGCACTGAGCCA;SOR=0.544;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=23;WE=14217681;WS=14217663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr7	14217788	rs76810736	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=327;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TGAAAGAAAGTAGATGCCTTT;SOR=0.451;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=19;WE=14217796;WS=14217778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr7	14384832	rs2271267	T	C	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=186;SC=ATTGCTAATATATATTTCATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=14384840;WS=14384822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	14653054	rs1525088	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=1.744;SC=AGAAAAGTTATATACATGGAA;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=20;WE=14653062;WS=14653044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr7	14660925	rs1525075	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=1.748;SC=AATGTGTTGATAGCTGAACAT;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=24;WE=14660933;WS=14660915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr7	14712793	rs34768816	AG	A	645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.790;NF=1;NR=19;PP=683;ReadPosRankSum=0.616;SC=AGAGTCATAAAGGAATTCATA;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=20;WE=14712801;WS=14712783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr7	14722158	rs73272124	G	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=963;ReadPosRankSum=0.065;SC=GCTGGGATTTGTTTTCCAATT;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=59;WE=14722166;WS=14722148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,61:0.50:123
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chr7	14741261	rs73272155	G	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.740;SC=TTCTTCAGAAGAAAATCTTTG;SOR=0.787;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=8;WE=14741269;WS=14741251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
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chr7	15425281	rs11331867	AT	A	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.908;NF=0;NR=15;PP=235;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AGTATCTGCTATTTTTTTTAA;SOR=0.950;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=15;WE=15425289;WS=15425271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr7	15426956	rs4541808	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=380;ReadPosRankSum=1.362;SC=TGAAAACAGCGTATGTACAGG;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=24;WE=15426964;WS=15426946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
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chr7	15427176	rs58741316	T	TA	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CTAGAAACAATAAAAAAAGAG;SOR=0.504;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=16;WE=15427184;WS=15427166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
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chr7	15601449	rs61751892	G	C	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=53;PP=1425;ReadPosRankSum=1.370;SC=GAAACATCCTGCTGGGCTTCT;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=171;TCF=71;TCR=100;TR=86;WE=15601457;WS=15601439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,107:0.51:211
chr7	15666223	rs77215700	T	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.475;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr7	15725797	rs113582077	ATGG	A	1121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.281;NF=8;NR=11;PP=731;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GATGGTGGTGATGGTGGTGGT;SOR=1.162;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=19;WE=15725807;WS=15725787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr7	15726066	rs1050290	G	A	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQ=60.03;MQRankSum=1.333;NF=43;NR=47;PP=1141;ReadPosRankSum=1.302;SC=AGACTTCACGGCGGTTCCAAA;SOR=0.639;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=121;TCR=131;TR=90;WE=15726074;WS=15726056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,112:0.36:309
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chr7	16129153	rs28379235	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=1.042;SC=TATATATGTACGTACATACAT;SOR=1.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=16129161;WS=16129143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr7	16129172	rs9691136	A	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=375;SC=ATATATATGTATATACATGTA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=16129180;WS=16129162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	16131260	rs1528137	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=388;ReadPosRankSum=0.307;SC=AGCGGGGGCACAAAGCACAAT;SOR=0.935;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=28;WE=16131268;WS=16131250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
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chr7	16348091	rs13437646	A	C	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=995;ReadPosRankSum=-0.177;SC=AAATGTACACACACGCAAACA;SOR=0.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=60;WE=16348099;WS=16348081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
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chr7	16566391	rs6461263	T	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=422;ReadPosRankSum=-1.006;SC=GGCCACACGCTCAAACGTCAC;SOR=3.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=25;WE=16566399;WS=16566381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr7	16571973	rs1404173	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.083;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr7	16572051	rs1404171	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=491;ReadPosRankSum=0.654;SC=GTTATTGTTACTGACTGCAAG;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=26;WE=16572059;WS=16572041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr7	16572317	rs28558187	T	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	16577376	rs6961390	G	A	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TCTTAATTTTGTATTCCTAAT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=16577384;WS=16577366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	16597114	rs6951596	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-0.400;SC=AATTAAGTAATAACTTTCAAC;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=22;WE=16597122;WS=16597104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr7	16597174	rs6969347	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=1.129;SC=ATTTCTGTTGAAAATATATTA;SOR=0.818;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=16597182;WS=16597164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	16598655	rs6979816	G	A	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=43;PP=1310;SC=ATGGCCATAAGTTAAAATAGT;SOR=1.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=16598663;WS=16598645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	16605861	rs11463350	A	AT	827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=742;SC=GAATCTCTTAATTTTTTGTAT;SOR=3.180;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=23;WE=16605869;WS=16605851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	16606104	rs7795688	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CGAAGACTACCTTTGAAAATA;SOR=1.663;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=52;WE=16606112;WS=16606094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr7	16640358	rs543387	T	C	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=614;SC=AGGGTGAGGATCATCCACACT;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=16640366;WS=16640348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	16650427	rs572570	C	G	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.321;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=1033;ReadPosRankSum=0.162;SC=TTAAAGGAGACACTTGTTCAT;SOR=1.281;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=57;WE=16650435;WS=16650417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr7	16684247	rs3807505	G	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=746;ReadPosRankSum=0.413;SC=GCCCGGAGTCGCACGCATCAC;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=45;WE=16684255;WS=16684237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr7	16705132	rs113493607	T	TTG	1087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.440;NF=4;NR=17;PP=898;ReadPosRankSum=0.506;SC=AAGGGGTAGGTTGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=21;WE=16705140;WS=16705122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr7	16736479	rs7796792	C	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.271;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=786;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGGCAGCTAGCGGGGAGATGG;SOR=0.389;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=43;WE=16736487;WS=16736469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr7	16745589	rs1149510	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=450;SC=AGTATGCTGGTGCAATGGCAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=16745597;WS=16745579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	16793779	rs11405941	G	GC	1914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.337;NF=1;NR=37;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GGCTTCCCACGTCTGCGCGCC;SOR=1.460;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=38;WE=16793787;WS=16793769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr7	16823095	rs11491	G	A	3426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=69;PP=2022;ReadPosRankSum=0.053;SC=ACCCCCGCGCGAATCCTAGTG;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=254;TCF=120;TCR=134;TR=128;WE=16823103;WS=16823085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,167:0.52:322
chr7	16834444	rs2272246	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=356;ReadPosRankSum=-0.017;SC=AAACTGAGTCCGAGGCGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=18;WE=16834452;WS=16834434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr7	16834551	rs4719480	C	A	7481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=71;PP=2965;SC=AATTGAAGGTCACACTTACAC;SOR=1.280;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=128;TCR=71;TR=199;WE=16834559;WS=16834541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
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chr7	16840746	.	A	C	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=579;ReadPosRankSum=-0.154;SC=AAGCCTATAAAGGAAATCATA;SOR=0.595;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=51;WE=16840754;WS=16840736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr7	16872913	rs4719482	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=0.994;SC=GCTTGACTCAGCATCAGTGTA;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=18;WE=16872921;WS=16872903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr7	16899197	rs11798	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=264;ReadPosRankSum=3.262;SC=GGCTTTTTTCCATCATCTCTT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=20;WE=16899205;WS=16899187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr7	16901185	rs4236289	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=509;SC=TAATTCCATACAACTTTCTGT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=16901193;WS=16901175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	16901708	rs10242737	A	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=377;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CAAAATTGCCAGTTAGTTTTA;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=32;WE=16901716;WS=16901698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr7	16913394	rs10249749	A	G	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=20;PP=1797;SC=TGAGCTGAGAAGCATGTTACC;SOR=2.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=84;WE=16913402;WS=16913384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	16913457	rs55900499	A	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1020;ReadPosRankSum=-1.940;SC=AAGTGATGTCATCTCCCCATC;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=76;WE=16913465;WS=16913447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr7	16913520	rs4472406	G	A	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=75;PP=2518;SC=AGAAGAGCTCGGAAATGGGTA;SOR=1.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=113;WE=16913528;WS=16913510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	16913557	rs2892833	A	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=587;ReadPosRankSum=0.603;SC=CTACCTACAGATATTTAACTA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=37;WE=16913565;WS=16913547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr7	16913617	rs4389824	A	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=497;SC=CACAATTTTCACAAGATATGG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=16913625;WS=16913607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	17374743	rs147123367	CAT	C	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=187;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TACTTAGTAACATATCATTAT;SOR=0.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=6;WE=17374752;WS=17374733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr7	17836315	rs149689325	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=4.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=-0.523;SC=AAATGCCTAGTACAGTGCCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=17836323;WS=17836305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	17874271	rs4721660	T	C	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=205;SC=ATTGCCATAGTTTATCTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=17874279;WS=17874261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	17913083	rs5882635	A	AC	1491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=12;PP=1284;SC=GGGTCTTAAGACAAAAATTTT;SOR=1.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=27;WE=17913091;WS=17913073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	17979793	rs3800963	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=398;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CTCGGGCCCTGGAGCCCACGG;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=21;WE=17979801;WS=17979783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr7	17980144	rs78919391	G	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=0.260;SC=TGCAACGTGCGTTCCCATTGG;SOR=2.973;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=17980152;WS=17980134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	18066569	rs3800962	C	A	5071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=71;PP=2965;SC=GCTTCATCTTCTCATCTTGAG;SOR=0.857;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=156;WE=18066577;WS=18066559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	18067479	rs35708479	ACT	A	4776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=58;PP=2965;SC=TGAAGCACAGACTCTAATGGC;SOR=1.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=65;WE=18067488;WS=18067469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	18300132	rs13240203	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TTAGTAGAGACGGGGTTTCAC;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=18300140;WS=18300122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	18630208	rs1726610	A	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=-0.370;SC=AGACTCGTCAAAATTATCTGT;SOR=0.446;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=18630216;WS=18630198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr7	18631132	.	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=14.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-4.067;QD=0.52;ReadPosRankSum=-2.289;SOR=3.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,7:0.11:65
chr7	18674435	rs2285431	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CAAAGTGATATTTCTGAGTTG;SOR=1.445;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=20;WE=18674443;WS=18674425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr7	18684477	rs10243449	T	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=698;ReadPosRankSum=0.216;SC=ACAGGGGAACTCTCTTTCGTG;SOR=0.508;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=47;WE=18684485;WS=18684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
chr7	18688033	rs145105320	A	ATGTG	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.735;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
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chr7	18914251	rs2286213	C	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=384;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TTACGAAAGGCTCTGATATCA;SOR=1.065;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=26;WE=18914259;WS=18914241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
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chr7	20418678	rs3735619	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=126;ReadPosRankSum=-0.435;SC=AACTAGGAGCCGAAGCTAATT;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=20418686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr7	20420270	rs17142761	T	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=275;ReadPosRankSum=-0.759;SC=AACTTTACACTTCTTCTTTTC;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=18;WE=20420278;WS=20420260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr7	20421490	rs2230398	T	C	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=1165;ReadPosRankSum=0.235;SC=ACAACGTCTATGTCAAATCGA;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=64;TCR=98;TR=94;WE=20421498;WS=20421480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,104:0.58:180
chr7	20430900	rs10227623	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=338;SC=TAAATGTCTTCAGTAAAACCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=20430908;WS=20430890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	20430960	rs3779506	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=1.038;SC=TTTCTTCATATTAGATGTTTG;SOR=0.439;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=13;WE=20430968;WS=20430950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr7	20438743	rs6945675	C	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=353;SC=ATTTATACTTCAAGGAAACTT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=20438751;WS=20438733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	20444532	rs2074424	C	T	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=55;PP=1544;SC=TGTCCTTTTTCGTTCTGACTT;SOR=1.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=79;WE=20444540;WS=20444522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	20685508	rs11983326	T	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=622;ReadPosRankSum=-0.147;SC=TCAAAGGTCTTTCCTTTTAAA;SOR=1.020;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=37;WE=20685516;WS=20685498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr7	20685786	rs11769236	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=536;ReadPosRankSum=-0.508;SC=AGAACAAGGTGTCAGGCCTGG;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=38;WE=20685794;WS=20685776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr7	20687181	rs2893006	C	T	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=535;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TAATCCATAGCAGTTATTGCA;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=40;WE=20687189;WS=20687171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr7	20689553	rs2188595	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr7	20689807	rs11976848	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=439;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CAGTCCACCTAATGGAATCTG;SOR=0.880;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=25;WE=20689815;WS=20689797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr7	20689937	rs11973722	T	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=2.057;SC=ATTTAGAGCCTACTATGTGTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=20689945;WS=20689927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	20691013	rs3213623	C	T	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=41;PP=1790;ReadPosRankSum=-2.210;SC=TAAAAGGCATCACAACATGGT;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=204;TCF=135;TCR=69;TR=115;WE=20691021;WS=20691003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,127:0.56:225
chr7	20698270	rs2301641	A	G	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1332;ReadPosRankSum=0.393;SC=TTCAGAAAGCAAGTCAGCTGT;SOR=0.454;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=169;TCF=71;TCR=98;TR=85;WE=20698278;WS=20698260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,108:0.53:202
chr7	20706645	rs12535128	G	T	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TTAGGTCACAGGAATGATCTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=20706653;WS=20706635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	20739774	rs5882753	AT	A	849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=425;SC=TGATAAGTTGATTTTTTTTTT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=20739782;WS=20739764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr7	20762937	rs62453385	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=0.754;SC=TAACCATCTTTATGATATATT;SOR=0.301;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=17;WE=20762945;WS=20762927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr7	20766943	rs11976861	C	G	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=142;SC=TTGAGGGCAACCACAATTAGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=20766951;WS=20766933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	20768013	rs10254317	G	A	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=68;PP=2680;SC=TTGCCTATGCGGCAGGGTTTC;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=128;WE=20768021;WS=20768003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	20778646	rs6461515	G	A	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=1524;SC=GGCCATCGGAGAAACGCTCGT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=20778654;WS=20778636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	20778773	rs6461516	C	G	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=25;PP=794;SC=GTAAGCACAACTGTGATCTTA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=20778781;WS=20778763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	20778844	rs11380694	A	AG	483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=30.23;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	20782474	rs12669866	T	C	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=8;PP=599;SC=GTCATTCTTCTCAACTCTGTC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=20782482;WS=20782464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	20803107	rs55827389	T	TC	507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=529;SC=AGTCTGTTTTTCTTTAGTGTT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=20803115;WS=20803097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	21468869	rs141294478	TCC	T	795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=37.89;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	21470513	rs39304	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TCATAACAATTATTGCTTTTC;SOR=1.781;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=16;WE=21470521;WS=21470503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr7	21470536	rs40245	A	T	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=478;SC=TCCTAATTCTAAGGTTTGACG;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=21470544;WS=21470526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	21510615	rs57242666	CTT	C	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.894;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=398;ReadPosRankSum=-1.811;SC=GATGAATAGACTTTTGTCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=12;WE=21510624;WS=21510605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr7	21516627	rs3214203	AT	A	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=-0.678;SC=ATGCACATAGATTTTTTTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=12;WE=21516635;WS=21516617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	21582917	rs2285942	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=302;ReadPosRankSum=1.193;SC=AAGCCCCGACCCTTCGCCTAA;SOR=0.223;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=22;WE=21582925;WS=21582907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr7	21582963	rs2285943	GA	TT	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=1464;ReadPosRankSum=1.173;SC=GGGCGCTGTGGAGCTCGAGGA;SOR=0.484;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=38;WE=21582972;WS=21582953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr7	21583282	rs2285945	T	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=729;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GCCCAGTCGCTCCCCTTTGGA;SOR=0.621;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=37;WE=21583290;WS=21583272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr7	21583329	rs2285946	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TTTAACAAACTTGGCTTGAAG;SOR=0.297;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=8;WE=21583337;WS=21583319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr7	21584820	rs7781669	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=256;ReadPosRankSum=0.243;SC=ATGACATTTGAAATTATTTAG;SOR=1.284;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=17;WE=21584828;WS=21584810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr7	21599233	rs10950854	C	T	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=967;SC=CACCGTCAAACGAAAGGATAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=21599241;WS=21599223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	21600902	rs4374884	A	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=678;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GTGATTGCTCATGGCTCTTCT;SOR=2.133;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=32;WE=21600910;WS=21600892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr7	21609625	rs56832849	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=14;PP=1236;SC=GAAACAGAGACGGTTACAGGG;SOR=2.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=21609633;WS=21609615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	21611399	rs66476925	G	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=11;PP=701;SC=GTAGTGGAAAGGTCTTTACTG;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=21611407;WS=21611389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	21627909	rs3810897	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=276;SC=ATATCTAAAGATTAGATATAG;SOR=2.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=21627917;WS=21627899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	21628237	rs6963535	C	T	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=101;PP=2965;SC=GGTCAAACTTCGCATCTCTCC;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=83;TCR=101;TR=184;WE=21628245;WS=21628227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr7	21630982	rs4615458	A	G	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=54;PP=2311;SC=GGGTGAGGGCAGCCACGTCCG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=21630990;WS=21630972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	21639818	rs6461586	T	C	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=246;SC=TAGCTCATGCTGGGAATCCCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=21639826;WS=21639808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	21640405	rs10224537	A	G	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.054;SC=GGAGACCCACACTTACCTCTG;SOR=1.087;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=164;WE=21640413;WS=21640395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,195:0.99:197
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chr7	21659645	rs56029521	T	C	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.410;NF=34;NR=34;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GAACAGGCATTCCATTACTAA;SOR=0.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=68;WE=21659653;WS=21659635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,85:0.51:168
chr7	21695416	rs11769118	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=304;ReadPosRankSum=0.459;SC=TACAGTAAGAAATGTTCTTAT;SOR=0.678;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=16;WE=21695424;WS=21695406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr7	21695649	rs4385378	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.925;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=622;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTTTCAGCATGCTCTTAGAAG;SOR=0.330;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=119;TCF=39;TCR=80;TR=49;WE=21695657;WS=21695639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,57:0.42:135
chr7	21744039	rs2965401	T	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=441;ReadPosRankSum=-2.283;SC=TTATAAAATGTTTTTTTTTCT;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=35;WE=21744047;WS=21744029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr7	21745061	rs1023542	A	G	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.096;SC=ACCAGCAACCAGCTGTTTGCT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=85;WE=21745069;WS=21745051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,96:0.52:186
chr7	21757287	rs2965409	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=627;SC=AAACGTGTCCTTGAAGTGTTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=21757295;WS=21757282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	21757578	rs2240470	T	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=709;ReadPosRankSum=0.940;SC=ACGTTCTAGTTCTGATGCGGT;SOR=0.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=41;WE=21757586;WS=21757568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr7	21757636	rs2074760	G	A	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=881;SC=GCCCAAGAAAGTGAGAAGATT;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=21757644;WS=21757626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	21760554	rs2965416	T	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=473;ReadPosRankSum=0.722;SC=ACATGTGATCTGTACCTTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=37;WE=21760562;WS=21760544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr7	21765452	rs12536928	C	T	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=1717;ReadPosRankSum=-0.284;SC=AAGCTGACTTCAGTCGGTGGT;SOR=0.757;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=194;TCF=117;TCR=77;TR=104;WE=21765460;WS=21765442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,122:0.53:230
chr7	21765636	rs2965424	T	C	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=50;PP=1192;SC=TGTATTAGTCTGTTTTCATAT;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=52;WE=21765644;WS=21765626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	21775153	rs2072219	A	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=440;SC=GATTTCAATTATAAAGTGACT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=21775161;WS=21775143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	21775387	rs2072220	T	C	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1689;ReadPosRankSum=-0.442;SC=AGGTGACACATTGGCAAGTCT;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=110;WE=21775395;WS=21775377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,138:0.50:276
chr7	21775443	rs2072221	G	A	6195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=106;PP=2965;SC=ACTACTACACGACATCCACAG;SOR=0.834;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=198;WE=21775451;WS=21775433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr7	21778449	rs1109806	C	T	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=75;PP=2727;SC=TTCAGCCTCACACCCTGATCC;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=132;WE=21778457;WS=21778439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	21778529	rs940435	T	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=514;ReadPosRankSum=-0.570;SC=ATCTAATAATTATTATGGATA;SOR=0.894;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=27;WE=21778537;WS=21778519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr7	21779084	rs2906686	G	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=391;SC=GAGTGATTATGAAGATAAGGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=21779092;WS=21779074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr7	21779278	rs9639393	A	G	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1376;ReadPosRankSum=0.867;SC=TTCACCATCAATCCCAGGCTA;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=80;WE=21779286;WS=21779268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,97:0.60:161
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chr7	21856151	rs2214326	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=693;ReadPosRankSum=-0.129;SC=TACAATTGCCGCCTGGAATAA;SOR=0.486;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=48;WE=21856159;WS=21856141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr7	21856390	rs4141347	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=398;ReadPosRankSum=0.801;SC=TTATAAAGGCGTGATGTTTCT;SOR=0.875;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=25;WE=21856398;WS=21856380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr7	21858043	rs10277757	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=0.253;SC=CAAGCAGTCTATTGAAATCTT;SOR=0.136;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=21858051;WS=21858033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	21893993	rs4722064	G	T	6232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=86;PP=2965;SC=TTACAGACCAGTGGCAGCAAG;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=105;TCR=86;TR=191;WE=21894001;WS=21893983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr7	21901566	rs4722067	T	C	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=25;PP=894;SC=GCATCACCCATGCTGTCTTCC;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=21901574;WS=21901556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	21901740	.	C	CT	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.8060;HP=14;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=33;QD=12.3333333333;SC=ATATAATAGACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=21901748;WS=21901730;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	21906049	rs112319073	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=240;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GTAAAGTATCGTTCACACCAT;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=14;WE=21906057;WS=21906039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr7	21906356	.	C	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=0.457;SC=TTAGGAGGATCTGGTGGAAGT;SOR=1.781;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=23;WE=21906364;WS=21906346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr7	21907696	rs11773744	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=259;SC=CCTGCCCTTCTTTTCAGTTCA;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=21907704;WS=21907686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	21908353	rs111675915	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=175;ReadPosRankSum=-1.951;SC=AGTTTCTTTGGGATTCTTCAG;SOR=0.460;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=13;WE=21908361;WS=21908343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr7	21924014	rs6461613	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=15;PP=677;SC=AGAAGAATTCATGAATCCATC;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=21924022;WS=21924004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	21932031	rs72658822	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=839;ReadPosRankSum=0.284;SC=GACTTTTCCTTTGTGGTTCAA;SOR=0.906;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=19;WE=21932052;WS=21932021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr7	21932044	rs12537531	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=839;ReadPosRankSum=0.463;SC=TGGTTCAAGACTGAAGATGAA;SOR=1.115;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=24;WE=21932052;WS=21932021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr7	21932317	rs9639401	T	C	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=700;SC=TTCTTTTTCATTGAAGTATAA;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=21932325;WS=21932307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	21940557	rs10555456	AACTT	A	805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=708;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TGCATCAAACAACTTACTTGA;SOR=1.230;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=16;WE=21940568;WS=21940547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr7	21940823	rs77448980	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=591;ReadPosRankSum=-0.303;SC=AGCGAAGAGAAGACTGCAAAA;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=45;WE=21940831;WS=21940813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr7	21940891	rs74315164	C	CTAGCCTCTGCTGGAGTGCAGTGAGGATTTTCT	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=5.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.863;SOR=2.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	21941885	rs143520640	GC	TT	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=942;ReadPosRankSum=-2.015;SC=CCAATGGTATGCATGTCTTGT;SOR=0.393;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=25;WE=21941894;WS=21941875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr7	21941964	rs16891988	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=633;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CCAGCTCCTTTTGTAAGCTGG;SOR=0.871;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=35;WE=21941972;WS=21941954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr7	21943936	rs79163993	C	T	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1030;ReadPosRankSum=1.516;SC=CCAATGAGGCCAGATGCCACC;SOR=0.392;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=27;TCR=89;TR=58;WE=21943944;WS=21943926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr7	21945086	rs6953368	C	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=248;ReadPosRankSum=-1.175;SC=CCAATGCCTTCGACTCCCAAT;SOR=1.402;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=14;WE=21945094;WS=21945076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr7	21945113	rs78062914	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=506;ReadPosRankSum=0.818;SC=GACAATTAATGTATACTTTAC;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=30;WE=21945121;WS=21945103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr7	21945840	rs4445125	C	T	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=796;SC=GTGACAGTGACGTGCGTTCAC;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=21945848;WS=21945830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	21985347	rs1406706	G	A	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=45;PP=1854;SC=GGTGGCAAAGGGAAGTCAAAC;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=21985355;WS=21985337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	22197507	rs7809342	A	G	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=55;PP=1755;SC=TACAGTGCTGAAAGGAAAAAT;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=22197515;WS=22197497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	22202117	rs12592	G	A	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=65;PP=2697;SC=TACGCGGAACGTCTGAGTTTT;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=128;WE=22202125;WS=22202107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	22202196	rs1981600	T	A	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=48;PP=1445;SC=TTGTTGAAAATTTTAAAATAT;SOR=1.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=22202204;WS=22202186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	22202485	rs1981601	T	C	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=50;PP=2044;SC=ACAGTGACTCTAAGAAGAGAG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=22202493;WS=22202475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	22242370	rs4722110	G	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=593;SC=CAAATTAAACGGATATCCACC;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=22242378;WS=22242360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	22242535	rs4719687	T	C	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=1031;SC=CCTCAGTAAATAGAGGGCAGA;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=22242552;WS=22242525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	22330700	rs2302001	A	G	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=731;ReadPosRankSum=-1.330;SC=CACAGGGAAAATGTCTCTCTA;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=48;WE=22330708;WS=22330690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,60:0.51:118
chr7	22330953	rs2302002	T	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=58;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATAATGTCATTGTTATTATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=22330961;WS=22330943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	22347876	rs11974052	T	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=449;ReadPosRankSum=0.771;SC=ACAGTGATCTTAAAGAGCAGA;SOR=0.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=23;WE=22347884;WS=22347866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr7	22349761	rs55757213	CA	C	1104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.74;ReadPosRankSum=2.206;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr7	22349769	rs17146668	C	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.878;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr7	22355166	rs10607345	CTA	C	35.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=91;SC=CAATAGCATACTATATATATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=22355175;WS=22355156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	22357488	rs62447095	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=461;SC=TCACTGCAGCATCCCTGCAAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=22357496;WS=22357478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	22357716	rs10950897	T	G	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=174;SC=TACCAAAAAATGAAAACATAA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=22357724;WS=22357706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	22459324	rs2177142	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=508;ReadPosRankSum=0.613;SC=GTTCATTGTGGCAGAGGGAAA;SOR=0.836;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=29;WE=22459332;WS=22459314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr7	22478207	rs2528843	G	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=814;ReadPosRankSum=-1.570;SC=TTGAAGGGCTGGCTGCTGATA;SOR=0.953;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=48;WE=22478215;WS=22478197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr7	22532115	rs59026056	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQRankSum=-2.191;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr7	22532260	rs62447564	A	G	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.333;NF=81;NR=55;PP=1973;ReadPosRankSum=1.047;SC=CAGAGCCAGTATTGCCAGTCC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=157;TCR=111;TR=136;WE=22532268;WS=22532250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,121:0.50:240
chr7	22532336	rs149580813	T	C	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQRankSum=0.958;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr7	22532917	rs201851675	T	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-7.570;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.751;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,48:0.34:141
chr7	22532925	rs200208526	A	T	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=-8.584;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.263;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,55:0.36:153
chr7	22532928	rs117582436	T	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-8.586;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.496;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,58:0.36:163
chr7	22532986	rs16881812	C	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.234;NF=41;NR=39;PP=1091;ReadPosRankSum=0.302;SC=GTAGGATCGCCTCATTGCGTA;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=97;TCR=94;TR=80;WE=22532994;WS=22532976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,83:0.40:206
chr7	22533033	rs148687847	C	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.299;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.354;NF=24;NR=29;PP=799;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CAGCAAAAAACAAACTGAGAA;SOR=1.225;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=53;WE=22533041;WS=22533023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,49:0.29:169
chr7	22533182	rs62619777	T	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.920;NF=31;NR=19;PP=660;ReadPosRankSum=0.686;SC=ATGGAAACCATTGGCAAGACT;SOR=1.632;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=50;WE=22533190;WS=22533172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,29:0.18:163
chr7	22533235	rs62619778	T	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.106;NF=49;NR=33;PP=1190;ReadPosRankSum=0.174;SC=ATATTGTTGATGGGAAGTTGC;SOR=1.185;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=184;TCF=102;TCR=82;TR=82;WE=22533243;WS=22533225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,69:0.40:174
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chr7	22862127	rs113404974	C	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AGCGATAGAACGGGAACTCGA;SOR=1.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=10;WE=22862135;WS=22862120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	22862192	rs2270106	A	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=17;PP=1350;SC=CGTGCACGGCAGTGTCCCCTA;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=22862200;WS=22862182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	22896231	rs1608553	G	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.719;NF=36;NR=26;PP=965;ReadPosRankSum=1.386;SC=AATTGAAATTGTGGCCAAGGA;SOR=0.919;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=62;WE=22896239;WS=22896221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
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chr7	22985868	rs2286491	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	23000783	rs35493358	G	GCTCT	1086.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=773;SC=ACTATGAATGGCTCTCAATTT;SOR=2.303;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=13;WE=23000791;WS=23000773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	23015831	rs3735231	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=300;ReadPosRankSum=0.568;SC=TACTTTACCTTGAACAAATTT;SOR=0.618;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=24;WE=23015839;WS=23015821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr7	23016530	rs2078535	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=2.147;SC=CGAACATCATATATCTTAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=23016538;WS=23016520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr7	23016941	rs11972002	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=294;ReadPosRankSum=0.754;SC=TAAACTTACTGTGATAAAATG;SOR=0.841;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=21;WE=23016949;WS=23016931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr7	23145837	rs1005786	G	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=569;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TTCCCGGGGTGGAACCCCGCG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=40;WE=23145845;WS=23145827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr7	23163270	rs11982002	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AGAAATTCTGCGCTGGAAAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=23163278;WS=23163260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	23164526	rs2058275	C	G	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=37;SC=GGAAGAGTTTCAGTATCCTAT;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=23164534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	23180347	rs111594670	A	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=335;ReadPosRankSum=-1.106;SC=TGGTTTTTCTAAAAATGATTT;SOR=0.474;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=18;WE=23180355;WS=23180337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr7	23195555	rs141774430	CTTTAT	C	1493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=12;PP=1406;SC=ACTCTTAGCACTTTATTTTTA;SOR=0.941;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=24;WE=23195567;WS=23195545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	23286315	rs858239	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=0.762;SC=AGATCAGGCAGTGCCGCTTAA;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=23286323;WS=23286305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr7	23293098	rs199348	C	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=771;ReadPosRankSum=-2.017;SC=AAGATTCAAACCAAACACCTG;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=53;WE=23293106;WS=23293088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
chr7	23293746	rs199347	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=-1.288;SC=AACGAAAGGAAAAAGATGCTG;SOR=0.655;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=28;WE=23293754;WS=23293736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr7	23293772	rs199346	C	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=556;ReadPosRankSum=2.155;SC=TCGAGCCCCACTTTTTTATAC;SOR=0.527;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=38;WE=23293780;WS=23293762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr7	23296533	rs199355	G	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CTGCTGATCCGTATGTTTACA;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=75;WE=23296541;WS=23296523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,99:0.44:226
chr7	23296572	rs199354	C	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=965;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AGGACAGTGACGGGGAAAATG;SOR=0.799;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=61;WE=23296580;WS=23296562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,77:0.40:193
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chr7	23306020	rs156429	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CATAGTATAGTGTTCCTGATA;SOR=0.078;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=12;WE=23306028;WS=23306010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr7	23307475	rs156426	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=-1.046;SC=TGTATTTTGATGTGTTTTTCT;SOR=0.755;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=27;WE=23307483;WS=23307465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr7	23307634	rs2307783	ATGGG	A	1354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=955;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CGACAGAGGCATGGGTGGGTC;SOR=1.148;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=22;WE=23307645;WS=23307624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr7	23340618	rs156404	C	T	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1608;ReadPosRankSum=-0.461;SC=ATGCCATGGCCTTCTACGTTG;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=247;TCF=112;TCR=135;TR=94;WE=23340626;WS=23340608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,122:0.40:304
chr7	23352512	rs199653	C	A	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=36;PP=1075;SC=AGTTTTAAAACCTTACTTCCT;SOR=1.131;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=23352520;WS=23352502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	23353310	rs156419	T	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GTCATTCATGTATGAAATGGA;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=9;WE=23353318;WS=23353300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr7	23357154	rs156415	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=156;ReadPosRankSum=1.675;SC=AAGAATTTCCATTGACTCTTT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=15;WE=23357162;WS=23357144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	23357321	rs156414	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=417;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CTGGTGCTTCCGCTGGAGCAA;SOR=0.451;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=30;WE=23357329;WS=23357311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr7	23383639	rs274046	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=1.179;SC=ACGTAAATCCGAAACTGTAAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=23383647;WS=23383629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	23390952	rs274055	G	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.96;MQRankSum=-1.061;NF=21;NR=49;PP=1097;ReadPosRankSum=-2.182;SC=GTGATGTTCCGAATGGTGGCA;SOR=1.241;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=163;TCF=60;TCR=103;TR=70;WE=23390960;WS=23390942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,88:0.47:189
chr7	23624570	rs227933	G	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=0.872;SC=ATATAGAGAAGCAGCAGGAAG;SOR=0.883;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=6;WE=23624578;WS=23624560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr7	23724401	rs74659913	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TGTCCTTTATATAGTAGAGTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=23724409;WS=23724391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr7	23727944	rs7802834	T	C	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	23728931	rs35495590	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=168;ReadPosRankSum=1.054;SC=TCCTCAGCAGTGCCCCATTGA;SOR=0.745;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=12;WE=23728939;WS=23728921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr7	23737795	rs5029444	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=267;ReadPosRankSum=-0.894;SC=TTATTCTCCATGTATTGTTTT;SOR=1.193;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=28;WE=23737803;WS=23737785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr7	23751736	rs7779633	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=606;SC=GAATTGTTCAAATGGATGAAG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=23751744;WS=23751726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	23757011	rs138454658	TTTTAAG	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=0.976;SC=GCCTAAAATCTTTTAAGTTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=23757024;WS=23757001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	23757260	rs2058995	T	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=527;ReadPosRankSum=1.584;SC=GTGTCTTAGATATTTAGTTTT;SOR=1.150;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=26;WE=23757268;WS=23757250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr7	23766825	rs139647197	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=405;ReadPosRankSum=0.017;SC=CATGCTTTAAATGCCAAGTAA;SOR=1.578;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=20;WE=23766833;WS=23766815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr7	23793882	rs12532929	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=279;ReadPosRankSum=0.371;SC=CTTTTTCTCACACCAGCTTTC;SOR=0.303;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=20;WE=23793890;WS=23793872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr7	23802579	rs2193826	G	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.358;SC=ACGTTAAATTGTAAGTTTATT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=23802587;WS=23802569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	23810517	rs7785154	G	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=190;SC=AAATCACTGCGGAAATCTGTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=23810525;WS=23810515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	23810605	rs1469000	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=611;SC=TATAATTCTATGTGTGTGATT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=23810613;WS=23810595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	23810845	rs1469001	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TCAGTAAATTGTTATTACTAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=23810853;WS=23810835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	23811795	rs10263079	T	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
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chr7	23854838	rs5882915	G	GA	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TCTGGTATGTGACCTTTTTGA;SOR=0.745;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=13;WE=23854846;WS=23854828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr7	23872024	rs56362098	C	CTTTG	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.605;NF=0;NR=5;PP=197;ReadPosRankSum=0.792;SC=TTTTTAAAAACTTTGGTTTGG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=23872032;WS=23872014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	23872409	rs2214236	T	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=760;ReadPosRankSum=1.158;SC=TTCCTTCACCTTCCACCACAA;SOR=1.008;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=47;WE=23872417;WS=23872399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr7	23872506	rs11770131	T	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=0.191;SC=GTTTGTCTGTTAGCAGCATGA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=23872514;WS=23872496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	23943771	rs79068502	T	A	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=1080;ReadPosRankSum=1.206;SC=TCTGAGAATATGACATTTTTG;SOR=0.824;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=63;WE=23943779;WS=23943761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr7	24324759	rs16141	T	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=2.269;SC=GGGGGTCGCGTGTGGTAGCAG;SOR=1.082;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=12;WE=24324767;WS=24324749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr7	24324808	rs16140	C	G	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=690;ReadPosRankSum=1.312;SC=AGGTGCTGCGCGTGGGTGCTC;SOR=0.443;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=48;WE=24324816;WS=24324798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr7	24325009	rs5573	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=704;ReadPosRankSum=-1.104;SC=GATACTACTCGGCGCTGCGAC;SOR=0.737;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=54;WE=24325017;WS=24324999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,67:0.48:141
chr7	24329001	rs113179092	AT	A	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=-1.001;SC=CTTGTTACAGATGAACACCTG;SOR=0.144;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=10;WE=24329009;WS=24328991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr7	24329133	rs5574	C	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=840;ReadPosRankSum=0.622;SC=GAAAACGATCCAGCCCAGAGA;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=61;WE=24329141;WS=24329123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,64:0.39:163
chr7	24663628	rs139314379	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=152;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TAGTTTTGGCGTAATGCCTTT;SOR=0.754;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=15;WE=24663636;WS=24663618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr7	24663820	rs2711127	T	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=1.702;SC=TGAAATTTTGTTATTTGTTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=24663828;WS=24663810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr7	24703298	rs1053962	G	A	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=17;PP=687;SC=CCAAAGGAGAGATTCTTCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=24703306;WS=24703288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	24718710	rs722218	A	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=19;PP=1374;SC=TTATGCCCTAAAATTTCTTTG;SOR=1.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=66;WE=24718718;WS=24718700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	24719031	.	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.88;ReadPosRankSum=2.273;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr7	24742553	rs2240005	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=0.659;SC=GTACTTTCCCGCCAGCCAGGC;SOR=0.573;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=12;WE=24742561;WS=24742543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	24747158	.	C	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=381;ReadPosRankSum=0.837;SC=AGTGGCCCACCAACATATGTT;SOR=0.304;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=18;WE=24747166;WS=24747148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr7	24747910	rs2721809	G	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=640;SC=TCATGACTGCGATGCACATCT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=24747918;WS=24747900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	24758645	rs876307	G	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=442;SC=CATGAACGCAGGGCAGCCCGA;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=24758653;WS=24758635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	24758795	rs876305	T	C	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=37;PP=1344;SC=CATTCCTTCCTTCCAGCACCT;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=24758803;WS=24758785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	24784403	rs2521768	C	T	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=42;PP=1203;SC=CAGAGGAAGCCGATGATGATA;SOR=2.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=24784411;WS=24784393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	24789082	rs2521770	C	T	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.85;QD=24.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr7	24854765	rs1044956	G	A	5065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=80;PP=2965;SC=ACCTCTGCCCGCTTAAGATGT;SOR=0.894;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=144;WE=24854773;WS=24854755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
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chr7	24904868	rs2040689	T	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
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chr7	24904889	rs2040690	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=795;ReadPosRankSum=2.458;SC=CACAAATGAATCTGAAGTGTA;SOR=1.432;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=46;WE=24904897;WS=24904879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr7	24911526	rs10261181	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=576;ReadPosRankSum=0.228;SC=GGTGCTGAGTGGGGCAGTGTG;SOR=1.184;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=27;WE=24911534;WS=24911516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr7	25181912	rs2285738	T	C	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=704;ReadPosRankSum=0.718;SC=CATCTTTTCATGGTAATCATC;SOR=0.524;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=62;TCR=70;TR=64;WE=25181920;WS=25181902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr7	25182001	rs2285737	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=420;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CGAAGAACGACAGTTATATTA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=23;WE=25182009;WS=25181991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr7	25182172	rs2285736	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=337;ReadPosRankSum=-1.149;SC=AAAAGGCAAAAACATGAGAAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=25182180;WS=25182162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr7	25182405	rs11984293	G	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=861;ReadPosRankSum=-1.240;SC=GTAGAATACTGGCTTATTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=62;WE=25182413;WS=25182395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr7	25191044	rs12532548	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	25194506	rs12538022	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TGTGAACAAGTTTCCTGATCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=3;WE=25194514;WS=25194496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr7	25194618	rs2523073	G	A	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=23;PP=1152;SC=CTGATTCCAGGTCACATTTTA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=25194626;WS=25194608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	25194665	rs2523072	G	C	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=35;PP=1665;SC=ATAAGCCTTGGTTGGCACCGT;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=76;WE=25194673;WS=25194655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	25194753	rs12535348	C	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=0.354;SC=GGGAACATGGCGCCGCGACAG;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=30;WE=25194761;WS=25194743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr7	25194857	rs2717899	A	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=634;SC=GAACAGAAAGAAGTATGGTTG;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=25194865;WS=25194847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	25194918	rs2523071	A	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=234;SC=AATGGCAGAAACTGTTCTAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=25194926;WS=25194908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	25198089	rs2523066	C	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=487;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTGATTATAACAGAGAAGGAA;SOR=0.416;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=35;WE=25198097;WS=25198079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr7	25207849	rs2717859	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=517;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GACTCACAATGGAAGTAAAGA;SOR=0.490;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=33;WE=25207857;WS=25207839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr7	25207974	rs2717858	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=971;ReadPosRankSum=-1.142;SC=AGGAGGCTCATACTTTGGCCT;SOR=0.583;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=68;WE=25207982;WS=25207964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr7	25207994	rs2717857	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.164;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=827;ReadPosRankSum=0.725;SC=TGTGGTCCTCGGGGAGTGAAA;SOR=0.499;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=54;WE=25208002;WS=25207984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr7	25218661	.	A	AAAACAAACAAACAAAC	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=0.253;SC=CACCGTCTCAAAAACAAACAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=1;WE=25218669;WS=25218653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr7	25218891	rs11980216	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=507;ReadPosRankSum=1.345;SC=CCTTCAAGCTCCCTGCAACAG;SOR=0.608;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=30;WE=25218899;WS=25218881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr7	25264847	rs2717854	T	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr7	25267963	rs886354	G	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=13;PP=626;SC=GAAGATTGGAGATCACTAATT;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=25267971;WS=25267953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr7	25989520	rs6977848	T	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=8;PP=587;SC=ACTGGCGGCATCGGCGACCAC;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=25989528;WS=25989510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	25989732	rs111299611	GA	G	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.029;NF=1;NR=14;PP=500;ReadPosRankSum=0.892;SC=ACCGATAATGGAACGGGTCAT;SOR=1.071;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=25989740;WS=25989722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr7	26223294	rs12113404	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=0.499;SC=TTTATGTGAAAGATGCACTTT;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=14;WE=26223302;WS=26223284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	26224668	rs2074566	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.947;NF=24;NR=31;PP=854;ReadPosRankSum=1.210;SC=TAGGTTATTGCACTGACCATG;SOR=0.855;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=55;WE=26224676;WS=26224658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr7	26235413	rs75904946	G	A	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.768;SC=GTAAATATACGATATAGTTAA;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=58;WE=26235421;WS=26235403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,66:0.71:93
chr7	26236756	rs17153396	T	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=283;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGATATAAAATAGCTTTTAGG;SOR=0.105;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=14;WE=26236764;WS=26236746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr7	26404071	rs2253569	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=403;ReadPosRankSum=1.513;SC=TAGAGTGAATGTTGAGATCAT;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=23;WE=26404079;WS=26404061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr7	26576535	rs740182	T	C	4961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=88;PP=2965;SC=CTTCAAAGTATTTCTCGGTCC;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=57;TCR=88;TR=145;WE=26576543;WS=26576525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	26576671	rs76697123	A	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=4.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.505;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr7	26578105	rs17153822	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=763;ReadPosRankSum=-0.722;SC=ATCCGTCCCTATCAGTGCCAG;SOR=0.508;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=59;WE=26578113;WS=26578095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr7	26678856	rs57000259	A	G	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=42;PP=2250;SC=CAGAGACAAGACACATGAGGA;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=99;WE=26678864;WS=26678846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	26685934	rs12671270	T	C	3734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.235;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.908;SC=TCTCCGCATGTGGGACTCTCG;SOR=0.410;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=104;WE=26685942;WS=26685924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr7	26724279	rs212850	T	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=617;SC=CTTCCCTAGCTCTGTAAATCC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=26724287;WS=26724269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	26778406	rs10951145	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=724;ReadPosRankSum=1.420;SC=ATTGAACACCAACATTACCTT;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=49;WE=26778414;WS=26778396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr7	26778568	rs73077525	T	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=557;ReadPosRankSum=0.660;SC=ATATGATTTCTAAGATTCCTC;SOR=1.710;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=31;WE=26778576;WS=26778558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr7	26779620	rs10246483	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=417;ReadPosRankSum=0.876;SC=AAAAGCAGTGGGTAATCCATT;SOR=0.982;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=23;WE=26779628;WS=26779610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr7	27135313	rs368428758	GCGA	G	3910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=47;PP=2971;ReadPosRankSum=0.661;SC=GCTGGGGGTGGCGATGGTGGT;SOR=0.795;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=23;TCR=126;TR=54;WE=27135327;WS=27135303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,111:0.51:218
chr7	27135319	rs2074398	G	A	3931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGTGGCGATGGTGGTGGTGGT;SOR=0.824;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=199;TCF=76;TCR=123;TR=72;WE=27135327;WS=27135303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,109:0.52:210
chr7	27141267	rs706016	C	T	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=14;PP=879;SC=AGACCCCGTCCCCTCCATCTC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=27141275;WS=27141257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	27169093	rs2158218	T	G	6130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=71;PP=2965;SC=GGGTCAGGTATCGATTGAAGT;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=108;TCR=71;TR=179;WE=27169101;WS=27169083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr7	27169388	rs6957209	A	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=521;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GAAACACCCGAGAGCCATAAA;SOR=0.154;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=36;WE=27169396;WS=27169378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr7	27169617	rs6943542	T	C	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=28;PP=1168;SC=GCAGCCCGGGTCAGATGGGGG;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=27169625;WS=27169607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	27169934	rs10251056	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=6;PP=187;SC=GGGCGGCGGCAGCTGGGGCTG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=27169942;WS=27169924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr7	27185520	rs17500863	G	A	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=80;PP=2125;ReadPosRankSum=0.251;SC=GGCGCCCATGGCTCCCATACA;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=269;TCF=114;TCR=155;TR=143;WE=27185528;WS=27185510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,161:0.52:312
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chr7	27203139	rs7810502	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.622;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr7	27205159	rs113136669	C	CGG	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=1.878;SC=TTGGTGGCACCGGGGGGGAAG;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=27205167;WS=27205149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	27238691	rs2071265	C	G	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=23;PP=2552;SC=AGAACAGAAACGCACCCGGGA;SOR=2.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=82;TCR=23;TR=105;WE=27238699;WS=27238681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	27239193	rs34185333	C	T	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr7	27239201	rs34398255	G	T	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.19;ReadPosRankSum=-1.542;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr7	27239275	rs35599078	G	GGGCCCGCCT	348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr7	27239550	rs35042646	C	T	209.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9776;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=0.632;SC=CCCCGGCAGCCGCCGCCGCTG;SOR=2.093;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=9;WE=27239558;WS=27239540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr7	27279191	rs3801321	T	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TGGGGGCCTATGCCCGGCTTC;SOR=0.414;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=20;WE=27279199;WS=27279181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr7	27283964	rs17501829	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=-1.029;SC=CACAGAACTGTAGGAGTGGGT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=27283972;WS=27283954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr7	27284030	rs17472997	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=630;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TGGCAGCCAACGCCTTGTTGA;SOR=0.749;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=40;WE=27284038;WS=27284020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr7	27497389	rs56098493	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.934;NF=19;NR=21;PP=523;ReadPosRankSum=0.490;SC=AACTCCTGGAGTTGGGCCAGT;SOR=0.349;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=40;WE=27497397;WS=27497379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,45:0.37:123
chr7	27566053	rs12700813	G	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=847;SC=TGGAACTGTGGTTCCTTATGT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=27566061;WS=27566043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	27577886	rs141534210	A	AT	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=1.309;SC=CATGAATATCATTTTTTTAAC;SOR=0.204;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=27577894;WS=27577876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	27578167	rs9639553	C	G	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=24;PP=706;SC=TTCTCGAGTGCGGAAGAGAAC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=27578175;WS=27578157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	27581495	rs6462029	T	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=26;PP=814;SC=CATTTTATGCTCAATACTTGT;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=43;WE=27581503;WS=27581485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	27582783	rs978447	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=34;PP=986;SC=GTTTAGGCAGGTAATAAAATT;SOR=1.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=27582791;WS=27582773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	27668860	rs6415252	C	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=320;SC=ATCAGTTTGGCTTTATTTTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=27668868;WS=27668850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	27671899	rs7779990	T	C	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=8;PP=867;SC=AGTTCTAACATGTGAAATTCA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=27671907;WS=27671889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	27807441	rs7807729	G	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=12;PP=260;SC=TATAAAGAATGTGAAAATTGC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=27807458;WS=27807431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	27807589	rs7790914	T	C	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=14;NR=14;PP=449;SC=TTATCTGGGGTCCTGTTGACA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=27807597;WS=27807579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	27842733	rs13247833	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=193;ReadPosRankSum=0.457;SC=TTCAGCTTCAATTGGCAGAGA;SOR=0.207;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=16;WE=27842741;WS=27842723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
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chr7	27886011	rs141603370	C	CATATACGTATACGTGTAT	1035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=17.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.528;QD=13.28;ReadPosRankSum=-2.161;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,24:0.31:78
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chr7	28534501	rs3216916	C	CT	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=26.67;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr7	28858456	rs10951205	A	G	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=43;PP=1527;SC=AAAAAGACAAAATGGGGAAGT;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=28858464;WS=28858446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	28995807	rs115399412	C	T	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=52;PP=2021;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CAGGCGGAAGCGCGCGCCGCC;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=142;TCR=103;TR=123;WE=28995815;WS=28995797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,140:0.47:301
chr7	28995823	rs114444553	G	C	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=60;PP=2214;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CCGCCCAGCGGCCGGGGACTG;SOR=0.632;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=259;TCF=144;TCR=115;TR=131;WE=28995831;WS=28995813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,148:0.48:308
chr7	28996847	rs371401803	G	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=518;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AGCCCCAAAAGGCCTCAGGCG;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=35;WE=28996855;WS=28996837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
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chr7	28997596	rs5883174	G	GC	3898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=66;PP=2119;SC=CACGGGCTCGGCAGCGGCGGG;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=74;WE=28997604;WS=28997586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	29070209	rs7313	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.948;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=772;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GAAGTCACCCGCTTGCCGGAT;SOR=0.861;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=56;WE=29070217;WS=29070199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,73:0.43:170
chr7	29070320	rs1052200	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=821;ReadPosRankSum=1.177;SC=CATCAAGGAGCGCTCTGTCAG;SOR=0.527;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=61;WE=29070328;WS=29070310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
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chr7	29111620	rs317719	A	C	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=68;PP=2071;SC=AATTGTTAATATTGTGCTGGT;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=12;TCR=68;TR=80;WE=29111628;WS=29111610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr7	29186256	rs245880	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=441;ReadPosRankSum=0.250;SC=TCCTGGTCCCAGAAACCTGGC;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=32;WE=29186264;WS=29186246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
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chr7	29186576	rs245881	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=603;ReadPosRankSum=0.822;SC=CTGCACTAGCAGTAAGCTCGC;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=41;WE=29186584;WS=29186566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
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chr7	29552213	rs3750099	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=769;ReadPosRankSum=-0.797;SC=ATTTCATGAATGCAGAAAATC;SOR=0.933;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=73;WE=29552221;WS=29552203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,87:0.44:198
chr7	29552463	rs1420145	C	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=GCTAGAATTTCCTGGACTGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=29552471;WS=29552453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	29606288	rs10271996	C	T	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=870;ReadPosRankSum=-1.584;SC=GGGCAGGTCCCCGGAGGAGGC;SOR=1.411;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=46;WE=29606296;WS=29606278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
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chr7	29688915	rs1728643	G	A	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1202;ReadPosRankSum=0.955;SC=TGAGCTGCGCGCTGTGGGGGC;SOR=0.626;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=74;WE=29688923;WS=29688905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,84:0.47:178
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chr7	29689150	rs138188412	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=552;ReadPosRankSum=0.949;SC=GCGTGGAGGCGGGGGTGCCGC;SOR=1.003;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=30;WE=29689158;WS=29689140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr7	29689325	rs115785450	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=492;ReadPosRankSum=1.014;SC=CAGACCTCGCCGGACTGGGCT;SOR=0.296;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=37;WE=29689333;WS=29689315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr7	29720404	rs850108	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=6.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-4.233;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=1.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,25:0.22:115
chr7	29771533	rs147432542	TGAA	T	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=739;ReadPosRankSum=-1.197;SC=AACATTTCATTGAAGAAGAGA;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=16;WE=29771543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
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chr7	29924221	rs13310795	T	C	7595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=103;PP=2965;SC=TAAGGAGCGCTGCCTGGCCCA;SOR=1.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=141;TCR=103;TR=244;WE=29924229;WS=29924211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr7	29944062	rs4722959	A	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=589;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GCTTTCTCCTAAACAGCTTTA;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=39;WE=29944070;WS=29944052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr7	29954137	rs1056061	A	G	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=971;ReadPosRankSum=0.798;SC=CGGTGAGAAGACAGATGAAGC;SOR=1.232;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=57;WE=29954145;WS=29954127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,62:0.44:142
chr7	30029714	rs62446663	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=0.652;SC=AGCATCCTTTTGGCGCCTCTT;SOR=0.529;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=19;WE=30029722;WS=30029704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
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chr7	30058714	rs143268242	C	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=1032;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TATTAAATATCAGTGTACTTT;SOR=1.099;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=55;WE=30058722;WS=30058704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
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chr7	30101683	rs35889168	C	G	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=698;ReadPosRankSum=-0.254;SC=AAATCTAGCTCAAAAAAAATT;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=52;WE=30101691;WS=30101673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr7	30101716	rs17326411	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=568;ReadPosRankSum=0.168;SC=AATTGTTACACAAAGGAGACT;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=44;WE=30101724;WS=30101706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr7	30113617	.	A	AG	699	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=61.41;NF=20;NR=5;PP=699;QD=28.16;SC=AAAAAAAAAAAGTACATTATA;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=25;WE=30113625;WS=30113607;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,25:0.42:59
chr7	30113706	rs11977829	A	G	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.019;NF=70;NR=49;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.548;SC=ATGGTAAAACATTGCGGCAAC;SOR=0.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=156;TCR=108;TR=119;WE=30113714;WS=30113696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,136:0.46:298
chr7	30113862	.	T	TTGTGTGTGTGTG	708.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQRankSum=3.310;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr7	30118508	rs1109208	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=498;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ACCCCTTCACCTGGGGGGATG;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=25;WE=30118516;WS=30118498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr7	30157472	rs147327175	C	CAGATT	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=1.803;SC=ATATTAGAAACAGAAGTATAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=3;WE=30157480;WS=30157462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	30174773	rs73689406	C	G	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=42;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AGCAGCTGGCCGACGTTGCGG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=153;TCR=85;TR=120;WE=30174781;WS=30174763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,141:0.51:278
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chr7	30177278	rs6954379	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=976;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GGGAGTTTTCCTAGCCGGACC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=71;WE=30177286;WS=30177268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,93:0.57:163
chr7	30465374	rs5743371	T	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=853;ReadPosRankSum=1.541;SC=ATGTTAAGGATCCTCGCACAC;SOR=1.015;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=48;WE=30465382;WS=30465364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,52:0.42:124
chr7	30496309	rs5743337	G	GC	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=272;ReadPosRankSum=-0.782;SC=TCCACACAATGCCATGCCCGT;SOR=0.223;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=30496317;WS=30496299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	30496382	rs2075818	G	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=488;ReadPosRankSum=2.034;SC=CCGCATCTTCGGCCGAGAAGT;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=35;WE=30496390;WS=30496372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr7	30536874	rs38405	G	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr7	30537214	rs57379358	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=0.760;SC=TCGGTTACAACGCCAGAGGTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=30537222;WS=30537204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr7	30537277	rs73083615	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=501;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TGTTTAGCGGTACTTTCATAA;SOR=0.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=24;WE=30537285;WS=30537267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr7	30538651	rs38409	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=976;ReadPosRankSum=1.342;SC=GTGTATGGGATTAAACATTTA;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=54;WE=30538659;WS=30538641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr7	30540399	rs38410	G	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=194;SC=AATTAAAACAGTCAATAAACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=30540407;WS=30540389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	30544360	rs38414	G	A	7787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=143;PP=2965;SC=GCCTGAAGCAGAGTGTAAGGA;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=97;TCR=143;TR=239;WE=30544368;WS=30544350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr7	30634661	rs1049402	C	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.208;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=447;ReadPosRankSum=0.073;SC=GGCCTCCTGCCCCCCGATCTC;SOR=0.752;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=30;WE=30634669;WS=30634651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr7	30635600	rs10265589	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=684;ReadPosRankSum=-0.891;SC=ATATAGACCTCCTTTTCCTAG;SOR=0.867;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=38;WE=30635608;WS=30635590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr7	30651938	rs1986756	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-5.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=537;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CTGTTTTGAAGCAATTCTGCT;SOR=0.226;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=33;WE=30651946;WS=30651928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
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chr7	30662237	rs10249885	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=0.289;SC=TGGCATTATAGCCTGAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=30662245;WS=30662227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
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chr7	30728557	rs58682124	A	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=992;ReadPosRankSum=-2.602;SC=GCTGACTTCCATCGTGGGAGC;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=141;TCF=47;TCR=94;TR=66;WE=30728565;WS=30728547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,68:0.45:151
chr7	30728895	rs61749076	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=1582;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GGCTCTGCCCGGCTGCCTAGG;SOR=0.766;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=42;WE=30728916;WS=30728885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr7	30728908	rs255100	A	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=1001;ReadPosRankSum=0.365;SC=TGCCTAGGGGACAGCAAGGAT;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=29;WE=30728916;WS=30728885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr7	30739409	.	C	T	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=59.43;NF=2;NR=1;PP=28;QD=20.9237375157;SC=ACCCCCTCACCCAGGCACGGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=30739417;WS=30739399;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	30739525	rs255119	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=0.065;SC=TGCTCCTGGCGCCCCACCTCG;SOR=0.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=8;WE=30739533;WS=30739515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr7	30739691	rs107540	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=-0.047;SC=CCTGCTGCCCAGCACGGTGGT;SOR=0.525;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=9;WE=30739699;WS=30739681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	30795331	rs2302340	A	G	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1208;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CTGGAGAAAGAGGAGGTGGAG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=63;TCR=85;TR=79;WE=30795339;WS=30795321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,88:0.51:174
chr7	30795436	rs4720015	T	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=48;PP=1609;SC=GGGGTCTGCTTCATTGTGGCT;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=30795444;WS=30795426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	30805809	rs146676127	TCTCA	T	746.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=12.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.946;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr7	30805811	.	T	TCACACA	699.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=59.59;MQRankSum=-1.050;NF=11;NR=10;PP=2185;ReadPosRankSum=0.625;SC=ATATGATTTCTCACACACACA;SOR=2.187;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=21;WE=30805822;WS=30805799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr7	30805849	rs4582452	A	C	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=571;ReadPosRankSum=1.601;SC=ACACACACACACCTACCTTTC;SOR=0.502;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=34;WE=30805857;WS=30805839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr7	30818128	rs200053449	A	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=2179;ReadPosRankSum=-1.823;SC=ATGATCTTCGAAAGGTTTTGC;SOR=0.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=39;TCR=93;TR=61;WE=30818150;WS=30818118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,78:0.51:154
chr7	30818142	rs201946407	T	G	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=2179;ReadPosRankSum=-1.230;SC=GTTTTGCATCTTGAATTTCTC;SOR=0.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=27;TCR=80;TR=47;WE=30818150;WS=30818118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr7	30825229	rs2269921	C	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TTCATGATAACGCACTGGCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=30825237;WS=30825219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	30831082	rs12701034	C	T	2784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.74;ReadPosRankSum=2.740;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr7	30831088	rs35897481	G	A	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.655;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,75:0.48:156
chr7	30876432	rs10258097	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GAATGGATATAGATGGCGTGA;SOR=0.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=20;WE=30876440;WS=30876422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr7	30880413	rs34970833	G	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=770;ReadPosRankSum=0.449;SC=GTCCAAGGCTGTGTCCTACAG;SOR=0.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=53;WE=30880421;WS=30880403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr7	30898697	rs17159526	G	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-4.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=969;ReadPosRankSum=-1.273;SC=TCAGGTTGTTGCAATGTCCCA;SOR=0.547;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=65;WE=30898705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,85:0.54:156
chr7	30898861	rs138023075	T	TC	1199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.279;NF=3;NR=21;PP=768;ReadPosRankSum=0.604;SC=CATTTTTCTCTCCCCCTCCCA;SOR=0.934;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=24;WE=30898869;WS=30898851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
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chr7	30912007	rs3801324	C	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=0.481;SC=CCTCTTGCCCCAGAAAAAGAC;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=21;WE=30912015;WS=30911997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
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chr7	31013771	rs34790466	G	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-1.530;SC=CTGAGGGCGGGTTGGGCACCA;SOR=0.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=12;WE=31013779;WS=31013761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr7	31015565	rs2741	T	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=333;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CAATAAGCACTCATGACCTCA;SOR=0.669;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=24;WE=31015573;WS=31015555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr7	31016018	rs4988504	G	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=884;ReadPosRankSum=1.370;SC=CCAGTCTTGGGAGCCTAGGAT;SOR=0.945;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=82;TCR=41;TR=52;WE=31016026;WS=31016008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,56:0.40:141
chr7	31023502	rs28371570	G	A	143.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.157;SC=AGCTCAGCGAGCCGAAGGGGC;SOR=1.447;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=31023510;WS=31023492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr7	31102966	rs7807667	G	C	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=1817;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GGGAGCCCCAGGCTCACCTGA;SOR=0.865;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=61;WE=31102986;WS=31102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,88:0.47:189
chr7	31102978	rs73688749	T	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=1817;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CTCACCTGAGTCCCCGCTCCA;SOR=0.862;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=52;WE=31102986;WS=31102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,74:0.45:165
chr7	31104564	rs758995	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=0.046;SC=TGAGCGGGGCGGCAGGGAGCA;SOR=1.119;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=20;WE=31104572;WS=31104554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr7	31121501	rs2302475	T	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=CAGGTGACTTTTTTTCTCTGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=31121509;WS=31121491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	31125082	rs11410563	A	AG	1265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=1066;SC=CAGACCCATTAGGCTCTGCCG;SOR=2.012;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=25;WE=31125090;WS=31125072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	31125133	rs3214344	AT	A	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CAGGACGCACATTACCTGCCT;SOR=0.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=31125141;WS=31125123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	31127158	rs76824070	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=346;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TGTCGGGCACCCAGCTAGGCA;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=18;WE=31127166;WS=31127148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr7	31127398	rs55856551	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=411;ReadPosRankSum=1.188;SC=GAGTCCCCACACAACCTGACT;SOR=0.835;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=26;WE=31127406;WS=31127388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr7	31135471	rs2267734	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=293;ReadPosRankSum=1.921;SC=GGGCCTCTGCGGGGGGACGGT;SOR=0.257;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=14;WE=31135479;WS=31135461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr7	31592733	rs7811042	C	A	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=56;PP=1826;SC=AGCGCGTGGGCTCCGCTGGAT;SOR=1.489;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=31592741;WS=31592723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	31594166	rs2286710	C	T	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=61;PP=1953;SC=GTGTGCCTTACATGTTTCTCT;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=31594174;WS=31594156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	31594258	rs12155214	G	T	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=1015;SC=TTAATTGTACGTGAAGTATTA;SOR=1.480;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=31594266;WS=31594248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	31611758	rs67930674	G	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=994;ReadPosRankSum=-1.228;SC=TATCCAGAGGGACCAGTTTCA;SOR=0.779;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=66;WE=31611766;WS=31611748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,81:0.42:194
chr7	31617733	rs6945679	T	C	2884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1769;ReadPosRankSum=0.976;SC=AAGTTTTTGTTCCCTTTACAA;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=131;TCR=115;TR=115;WE=31617741;WS=31617723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,139:0.48:291
chr7	31618008	rs10252720	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AGCTTGTCTCATCTTGCAGGC;SOR=0.659;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=27;WE=31618016;WS=31617998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr7	31681765	rs10239388	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=107;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CCTTTAATAACCTCAAGACCT;SOR=0.813;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=9;WE=31681773;WS=31681755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr7	31682453	rs4141001	C	T	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1295;ReadPosRankSum=0.108;SC=AGCCAAGAAGCGAATGCCTTG;SOR=0.535;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=84;TCR=76;TR=84;WE=31682461;WS=31682443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,93:0.51:184
chr7	31682629	rs73686905	G	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=371;ReadPosRankSum=0.893;SC=AATGCCCCATGCTGAGTATGA;SOR=0.847;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=25;WE=31682637;WS=31682619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr7	31683410	rs10247620	G	A	7641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=121;PP=2965;SC=TGCATCTGCTGTCATCACCAC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=118;TCR=121;TR=239;WE=31683418;WS=31683400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr7	31683610	rs38398	G	A	4190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=93;PP=2833;SC=AGATGCACCCGTGATAAACAC;SOR=1.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=41;TCR=93;TR=134;WE=31683618;WS=31683600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	31691697	rs3735424	T	C	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=868;SC=TTTGACTATATCCAGCCTACC;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=31691705;WS=31691687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	31697913	rs35589779	C	CT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr7	31735263	rs34173	G	C	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=65;PP=2194;SC=CTGCACAGCTGTAAAGGAGAG;SOR=1.123;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=108;WE=31735271;WS=31735253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	31735297	rs34174	T	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=628;ReadPosRankSum=-1.341;SC=GGTTGCATTGTTCGTACACAT;SOR=1.242;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=36;WE=31735305;WS=31735287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr7	31848763	rs113385926	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TGTATGCAGCTGAGGGGGTTG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=27;WE=31848771;WS=31848753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr7	31855420	rs1860789	A	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=13;PP=1861;SC=AAGGAACTGGATGAGCAGGGA;SOR=2.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=63;TCR=13;TR=76;WE=31855428;WS=31855410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	31855578	rs1860790	G	A	10220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=167;PP=2965;SC=CGGCTTTGGAGTTTTTCCCAC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=327;TCF=160;TCR=167;TR=327;WE=31855586;WS=31855568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr7	31862574	rs59187276	G	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TCTAATATTCGGCAATTTGAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=31862582;WS=31862571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	31862901	rs191145475	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=429;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGAGAGTTAGTGTTTGGAAAA;SOR=0.132;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=39;WE=31862909;WS=31862891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr7	31876766	rs2270218	T	C	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=28;PP=1775;SC=ATGATGACAGTCCTGATGGAG;SOR=1.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=80;WE=31876774;WS=31876756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	31887438	rs200188922	GGTGAGA	G	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-0.517;SC=ACAAAGAGAGGGTGAGAGTGA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=31887451;WS=31887436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	31890106	rs917756	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=256;SC=TTGAAGCTGATCAGACTGATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=31890114;WS=31890096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	32110115	rs30598	C	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=464;SC=CGCGTTTGCCCGGCACTTTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=32110123;WS=32110105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	32209425	rs977625	A	G	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=75;PP=2866;SC=AAGACTTCTGAGCTATCCAGC;SOR=0.726;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=146;WE=32209433;WS=32209415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	32209459	rs977626	C	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=0.941;NF=23;NR=36;PP=964;ReadPosRankSum=0.142;SC=CAGCTAGGATCTCCTCTGGGG;SOR=0.789;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=59;WE=32209467;WS=32209449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr7	32248984	rs10951324	G	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=549;ReadPosRankSum=1.255;SC=GATATTTCCTGCATTACTATT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=38;WE=32248992;WS=32248974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr7	32249216	rs2240676	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=-1.218;SC=ATATGCCCCAATACAGCCAAT;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=17;WE=32249224;WS=32249206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr7	32338337	rs215607	G	A	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=92;PP=2811;SC=CCTGTTGCCGGCGTCCGTCAT;SOR=1.146;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=61;TCR=92;TR=153;WE=32338345;WS=32338327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr7	32527009	rs7800049	G	A	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=71;PP=2246;SC=TGCACTCCACGTTCCCATTTT;SOR=1.063;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=117;WE=32527017;WS=32526999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	32529936	rs1584614	G	C	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=135;PP=2965;SC=GATTACCTAAGGGCAGCAGCT;SOR=1.351;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=75;TCR=135;TR=210;WE=32529944;WS=32529926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr7	32588577	rs78930386	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=617;ReadPosRankSum=-1.006;SC=TTCATGGCAGATCTTTCTTTA;SOR=0.500;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=45;WE=32588585;WS=32588567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr7	32591158	rs3213973	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=1.541;SC=ATGTGAAAACGCATTTGCATT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=32591166;WS=32591148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	32598339	rs148470198	CCTTT	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr7	32598656	rs2290214	C	T	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=720;ReadPosRankSum=0.980;SC=TTTCTGCATCCACTGCTGATG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=55;WE=32598664;WS=32598646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,70:0.40:177
chr7	32599204	rs34973430	A	AT	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=366;ReadPosRankSum=1.933;SC=TGTAAAGTACAACCAAATACA;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=32599212;WS=32599194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr7	32609565	rs2305320	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=0.639;SC=CTGTTAGCTCACTAAGTTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=32609573;WS=32609555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr7	32609895	rs116088811	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.345;SC=CATGTATTCTAAGTATTTTAT;SOR=0.153;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=32609903;WS=32609885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	32615604	rs112504066	T	C	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=26;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.050;SC=GGACAACTTTTGTTACAGCAT;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=136;TCR=64;TR=84;WE=32615612;WS=32615594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,100:0.43:230
chr7	32620325	rs35499747	T	TTG	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=0.369;SC=AGAGTGACTATTGTGTGTGTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=10;WE=32620333;WS=32620315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	32623322	rs67384597	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.312;SOR=1.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr7	32660137	rs201339873	CCA	C	954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.406;NF=0;NR=13;PP=481;ReadPosRankSum=0.321;SC=GCTTCATATTCCACAGACATA;SOR=1.416;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=13;WE=32660146;WS=32660127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr7	32956941	rs139835645	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.34;MQRankSum=-3.645;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr7	33003171	rs3110942	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.882;NF=13;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=-0.916;SC=GGGATACAGCGGAGGATAAAG;SOR=1.504;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=17;WE=33003179;WS=33003161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,16:0.22:74
chr7	33016120	rs3750116	G	T	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=43;PP=1422;SC=TGGTAAGTCCGTCTCCTTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=33016128;WS=33016110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	33028487	rs35727868	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.949;SC=ACTACAGGCACGCACCACCAC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=33028495;WS=33028477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	33039652	rs61259431	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=265;ReadPosRankSum=0.187;SC=TAGAAGTGATGTGTTCTTCTC;SOR=0.295;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=15;WE=33039660;WS=33039642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr7	33059407	rs2392209	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTATTACAAAACATTCTTCCA;SOR=0.660;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=12;WE=33059415;WS=33059397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr7	33060946	rs3750117	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=305;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CAATAGCGTAATATTTTTCCT;SOR=0.727;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=18;WE=33060954;WS=33060936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr7	33063492	.	A	G	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=27;QD=20.5904041824;SC=ATAATATGGGAAAAAAAACCT;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=33063500;WS=33063482;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	33102462	rs13228639	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	33102514	rs13228827	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=83;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GCCAGGACGCGGCGGGAGGGG;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=6;WE=33102522;WS=33102504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	33136983	rs6462460	G	A	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=56;PP=1863;SC=ACCTAAAAACGAAAAGAGAAA;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=33136991;WS=33136973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	33139147	rs17472556	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=1.455;SC=CTGGGCTTCCGGTGCCAACAT;SOR=0.293;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=26;WE=33139155;WS=33139137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr7	33186082	rs1969575	C	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=748;ReadPosRankSum=1.054;SC=GGGAGGCCGACGTGGGCAGAT;SOR=0.432;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=39;WE=33186090;WS=33186072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr7	33282577	rs7793096	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1177;ReadPosRankSum=0.538;SC=TAAATCATTTGAACTTTCTTG;SOR=0.490;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=161;TCF=69;TCR=92;TR=81;WE=33282585;WS=33282567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,99:0.54:185
chr7	33385852	rs6974593	C	T	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=30;PP=2134;SC=CCAAGATATACAACCATGCAA;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=100;WE=33385860;WS=33385842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	33388618	rs9785054	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=412;SC=TAAGTAGTTACGATAGTCTAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=33388626;WS=33388608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	33644941	rs1050719	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr7	33644948	rs1050721	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr7	34091340	rs115681921	A	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=0.504;SC=GTCTGACCCAAGACTCTATTT;SOR=0.220;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=17;WE=34091348;WS=34091330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr7	34094687	rs17169636	A	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=661;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TGACACAGATAGTTATGAGTT;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=44;WE=34094695;WS=34094677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr7	34125420	rs77064045	G	T	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=57;PP=2965;SC=TGGCTGCGCCGCATCTCAAGG;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=148;WE=34125428;WS=34125410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr7	34192762	rs6968741	G	C	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=69;PP=2753;SC=GTATCAAGACGTGTGACAACT;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=128;WE=34192770;WS=34192752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	34685772	rs1582277	A	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=28;PP=891;SC=TGGAAAAACTAAAACGCTCAT;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=34685780;WS=34685762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	34698210	rs2530548	A	G	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=58;PP=1924;SC=CTGACTTATAACAATGAGACT;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=34698218;WS=34698200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	34698234	rs2530549	A	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=52;PP=1255;SC=GGAACTTAAGAGTGTCAATTG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=34698242;WS=34698224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	34698251	rs2530550	C	G	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=43;PP=1294;SC=ATTGAAGTATCATAGCCAGTA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=34698259;WS=34698241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	34698321	rs2530551	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.55;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	34698331	rs401256	G	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	34724373	rs11290993	CA	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr7	34725322	rs740623	T	A	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=18;PP=1423;SC=TAGCCATACATTGTTAGTAAC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=34725330;WS=34725312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	34867255	.	C	G	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5026;HP=12;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=53.07;NF=0;NR=5;PP=97;QD=26.3542425094;SC=GGGGGTGGGGCGGGGGGGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=34867263;WS=34867245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	34874209	rs17170017	C	G	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=3.265;SC=CAGACCAGACCCACCAAAGGC;SOR=0.446;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=37;WE=34874217;WS=34874199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr7	34888010	rs10270521	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=-1.854;SC=AAAGAACCTCTCAGGTAAAAG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=14;WE=34888018;WS=34888000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr7	34889182	rs6972158	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=981;ReadPosRankSum=1.314;SC=TCCAGGGAGCAAAGATCACAG;SOR=0.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=62;WE=34889190;WS=34889172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,73:0.54:134
chr7	34889222	rs10275028	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=519;ReadPosRankSum=-1.510;SC=GGGAGAGAACTGAGAGGCATG;SOR=1.168;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=40;WE=34889230;WS=34889212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr7	34979905	rs1637696	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CACAATAGCACCAGGATGTAC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=34979913;WS=34979895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	34989337	rs2021390	T	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=459;ReadPosRankSum=0.280;SC=GAGTCTGATATAAGAGGAGCA;SOR=0.409;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=25;WE=34989345;WS=34989327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr7	34989364	rs2021391	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=622;ReadPosRankSum=0.081;SC=ATGAAAAATGTATGGGCCAAA;SOR=0.511;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=38;WE=34989372;WS=34989354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr7	34995075	rs1637670	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.002;NF=2;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=1.796;SC=ATTCTCAAGTATCTAAAATTT;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=34995083;WS=34995065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr7	35029715	rs138939284	GATC	G	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=185;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TCCTCCAAAAGATCATTAGTC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=35029725;WS=35029705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	35050227	rs328939	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.085;NF=12;NR=16;PP=396;ReadPosRankSum=-1.412;SC=AATTACCTTACGTGTCTAGCA;SOR=0.542;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=28;WE=35050235;WS=35050217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr7	35053484	rs76882258	CTA	C	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.349;NF=0;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-1.083;SC=TGTGAAAAAACTATGTATTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=35053493;WS=35053474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr7	35057721	rs66718921	AT	A	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TAGTATCTATATTTTTTTCAC;SOR=0.180;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=35057729;WS=35057711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	35058349	rs6963995	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.057;SC=CCCAGGGCTACGTTTAAAATT;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=35058357;WS=35058339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	35121476	rs2286847	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.68;MQRankSum=0.432;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
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chr7	35145523	rs35243069	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.967;NF=7;NR=4;PP=140;ReadPosRankSum=0.782;SC=GAGAAGGATCGGCAGAAATTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=11;WE=35145531;WS=35145513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
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chr7	35180734	rs70978592	G	GA	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.779;NF=0;NR=29;PP=499;ReadPosRankSum=-1.658;SC=ACTGAAATCTGAAAAAAAAGA;SOR=1.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=0;TCR=76;TR=29;WE=35180742;WS=35180724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr7	35205405	rs35250698	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.630;NF=1;NR=15;PP=227;ReadPosRankSum=1.281;SC=AATCTGCTGGTGCCTTGATCT;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=16;WE=35205413;WS=35205395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr7	35271254	rs2075047	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.914;NF=8;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=1.365;SC=AAATCAGAAATAGTTTGTTCA;SOR=0.334;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=24;WE=35271262;WS=35271244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr7	35280404	rs2075048	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.15;MQRankSum=1.602;NF=6;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-0.875;SC=ATTTTGAGTACTGGGATATCT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=35280412;WS=35280400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	35280539	rs6950175	G	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.606;NF=28;NR=18;PP=613;ReadPosRankSum=1.820;SC=TTTCTGGAAAGATGAAAGTTC;SOR=0.627;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=46;WE=35280547;WS=35280529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr7	35289889	rs5883498	C	CA	1170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=1127;SC=ACAGCATAACCAAATGGTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=35289897;WS=35289879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	35289941	rs5883499	C	CA	622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=818;SC=AAACTCCAGGCAGGCTGTAGG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=35289949;WS=35289931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	35293193	rs336283	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=33;PP=1225;SC=CGTTGGCCCGAGAGGAGAGTT;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=35293201;WS=35293183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	35414769	rs2553113	C	T	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr7	35414772	rs2553114	C	T	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.62;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
chr7	35673799	rs2305333	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=307;SC=TATATGTTAGTTTTCTTTCAT;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=35673807;WS=35673794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	35673870	rs2305334	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=396;ReadPosRankSum=0.799;SC=GGTCCCATACCGTGCTGGGAA;SOR=1.123;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=19;WE=35673878;WS=35673860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr7	35678214	rs3816422	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=197;SC=AAAATACTTACTTTCAACGAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=35678222;WS=35678204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	35840898	rs59008252	G	GC	2431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=1299;SC=TCAGCTTCGGGTGCCGCGACT;SOR=1.197;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=29;WE=35840906;WS=35840888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	35919399	rs112736540	T	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.181;NF=25;NR=15;PP=605;ReadPosRankSum=1.079;SC=CCCAAACTGATCAATTCAGTC;SOR=1.048;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=40;WE=35919407;WS=35919389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr7	35923676	rs114919953	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=-1.813;SC=AAGTAGTACAGTATGCACACT;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=20;WE=35923684;WS=35923666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr7	35928551	rs6945909	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=408;ReadPosRankSum=0.042;SC=AGTGTTTATCATATCTCAGCT;SOR=0.704;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=32;WE=35928559;WS=35928541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr7	35928645	rs17172038	T	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.161;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=0.839;SC=ATGTTCCTTGTAAAGGGGATC;SOR=2.262;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=35928653;WS=35928635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	36124292	rs1986593	G	A	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=50;PP=2074;SC=CGGAGTTCACGTGGAGGACGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=36124300;WS=36124282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	36320821	rs196586	G	A	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=64;PP=2534;SC=AAGCCCTCGAGTCAGCTCCAG;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=127;WE=36320829;WS=36320811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	36324436	rs13232200	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=458;ReadPosRankSum=1.597;SC=CAAGGTACCCGCTCCACGCCG;SOR=0.730;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=30;WE=36324444;WS=36324426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr7	36338564	rs2241141	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=222;ReadPosRankSum=-0.933;SC=AGGACCTCCCGCACCCAACCC;SOR=0.264;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=14;WE=36338572;WS=36338554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr7	36338749	rs196613	T	C	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1351;ReadPosRankSum=-1.143;SC=GCAAGAAGGATGCCCCTCGGA;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=98;TCR=81;TR=99;WE=36338757;WS=36338739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,106:0.54:197
chr7	36338841	rs196614	T	C	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=708;ReadPosRankSum=-0.724;SC=GTGTCCACCCTGGGACCCAGG;SOR=0.585;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=54;WE=36338849;WS=36338831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr7	36370499	rs196659	C	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=659;SC=ACTAAAAATACTGTGAAGCTA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=36370507;WS=36370489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	36370555	rs196660	G	T	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=30;PP=1110;SC=GCTGATCTGGGGTGTTCGGGG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=36370563;WS=36370545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	36445855	rs61737563	AG	CA	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=2189;ReadPosRankSum=-2.058;SC=TTCCCCTCCCAGACCTCTGCT;SOR=0.546;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=54;WE=36445864;WS=36445845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr7	36447349	rs143969069	A	ACTT	1463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TCAGAAAGCTACTTCTCCAGT;SOR=0.783;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=26;WE=36447357;WS=36447339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr7	36447600	rs3801315	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=417;ReadPosRankSum=0.765;SC=TTATTGCTGATTATATTCAGG;SOR=0.397;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=27;WE=36447608;WS=36447590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr7	36455556	rs186408604	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.409;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=600;ReadPosRankSum=-2.207;SC=TGTGTGTTGATTTTGTATTCT;SOR=0.385;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=37;WE=36455564;WS=36455546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr7	36456870	rs78667831	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATAGAAGCACATATTCAAATT;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=21;WE=36456878;WS=36456860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr7	36458828	rs17170590	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAGTCACAGTGTCCACCTATT;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=36458836;WS=36458818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	36460419	rs56075305	CA	C	1344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.944;NF=4;NR=27;PP=1033;ReadPosRankSum=0.816;SC=TCTGTGAGGACAAAGGGCCCA;SOR=0.873;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=31;WE=36460427;WS=36460409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr7	36460467	rs56385393	T	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=453;ReadPosRankSum=0.143;SC=GCCAGAATAGTGTCTGATGCA;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=27;WE=36460475;WS=36460457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr7	36461442	rs79624523	T	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.763;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=661;ReadPosRankSum=0.045;SC=TGTATATTTTTTCTCCTCTCA;SOR=0.295;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=38;WE=36461450;WS=36461432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr7	36462205	rs2302526	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=491;ReadPosRankSum=0.701;SC=AAACAGTTACGATTTTAATAT;SOR=0.118;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=26;WE=36462213;WS=36462195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr7	36463335	rs2302527	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	36465192	.	TGC	T	127.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.55;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	36465194	.	C	CATTAAT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.55;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	36465570	rs6957214	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=115;ReadPosRankSum=0.241;SC=ATCTTTGTATTAAATAAGGGA;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=5;WE=36465578;WS=36465560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	36466655	rs3815484	C	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.911;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=790;ReadPosRankSum=0.829;SC=AACTTTATTTCTAAGGGTGTG;SOR=1.342;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=30;WE=36466677;WS=36466645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr7	36466669	rs3815485	T	G	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.45;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr7	36478677	rs75829944	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=TTTTGGCCATGTCTTTTATAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=36478685;WS=36478673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	36489477	rs3801304	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=759;ReadPosRankSum=1.764;SC=ATTTCTATCAACTAAGCAATT;SOR=0.521;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=43;WE=36489485;WS=36489467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr7	36492045	rs3801302	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=1012;ReadPosRankSum=0.314;SC=ATGGAATGGAGGGAGAAGAAT;SOR=0.427;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=120;TCF=90;TCR=30;TR=59;WE=36492053;WS=36492035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr7	36552656	rs7986	G	A	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1582;ReadPosRankSum=1.575;SC=CAGGAACAGCGGAAGGGTTAC;SOR=0.522;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=201;TCF=126;TCR=75;TR=101;WE=36552675;WS=36552646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,117:0.48:243
chr7	36552729	rs59476355	A	AT	8387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=110;PP=2936;SC=AGAGAAAGACATTTGCAAAGA;SOR=0.733;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=47;TCR=114;TR=157;WE=36552737;WS=36552719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr7	36552790	rs57543920	G	GT	6843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=95;PP=2936;SC=CCCCCATAGGGTTGTGGAATG;SOR=0.714;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=56;TCR=99;TR=151;WE=36552798;WS=36552780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr7	36561469	rs6462681	G	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=309;SC=ATTTCCCTATGGTCCCAAATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=36561477;WS=36561460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	36588405	rs5883561	A	AC	1231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=1152;SC=CCTCTTGGCAACTTTTTGCTA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=36588413;WS=36588395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	36588955	rs3735397	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=80;SC=TTTATGCTCAGTAAAAATGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=36588963;WS=36588945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	36656147	rs2727818	A	T	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=63;PP=1954;SC=GACTGGGTAGATATAAGAGCG;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=84;WE=36656155;WS=36656137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	36656205	rs13235549	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=0.835;SC=ACAGTAATGCATTACCACTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=16;WE=36656213;WS=36656195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr7	36660502	rs35645334	CATGA	C	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=351;ReadPosRankSum=1.333;SC=CAGTTTCATGCATGAATGAAT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=36660513;WS=36660492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	36661423	rs2727822	T	C	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=70;PP=2419;SC=GGGTTCAGCCTGCTTTGATGT;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=36661431;WS=36661413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	36662714	rs58016731	AGTCTT	A	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=835;ReadPosRankSum=-0.141;SC=AATGAAATTCAGTCTTGTCTT;SOR=0.646;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=16;WE=36662726;WS=36662704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr7	36671720	rs3832509	GA	G	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.949;NF=6;NR=37;PP=500;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TTTCTGGGGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.756;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=43;WE=36671728;WS=36671710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr7	36677456	.	C	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1145;ReadPosRankSum=1.067;SC=TTAGTGCTTACCAGAATCGGG;SOR=0.913;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=71;WE=36677464;WS=36677446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr7	36726476	rs35260531	CGT	C	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr7	36763560	rs6462703	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=507;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TGATTTATTACGCAAGCAAAG;SOR=1.493;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=31;WE=36763568;WS=36763550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr7	36763688	rs2228411	C	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=904;ReadPosRankSum=0.624;SC=CTGGAGAGGCCGAGGACTGAA;SOR=0.910;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=61;WE=36763696;WS=36763678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr7	36934448	rs6462722	A	G	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=24;PP=1239;SC=AGTCAATACTAGGTAACTTAC;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=36934456;WS=36934438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	37172931	.	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.119;SC=GAGTGAAGTGCTACAAGGTAA;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=18;WE=37172939;WS=37172921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr7	37355590	rs11383031	C	CT	1659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=30;PP=1432;SC=AAAGGAAATACTTGTTAGTTT;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=33;WE=37355598;WS=37355580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	37780799	rs61729279	C	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=647;ReadPosRankSum=-1.244;SC=ATAACGAAATCTTCTTGAGTG;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=42;WE=37780807;WS=37780789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,51:0.41:124
chr7	37889786	rs10271309	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=-0.502;SC=GTTTTAAAAGATGTTATTTGC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=37889794;WS=37889776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	37901581	rs2249451	G	A	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=61;PP=2657;SC=TTAGTTCTTGGTGTGTTCTCC;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=136;WE=37901589;WS=37901571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	37903853	rs3816419	A	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=10;PP=506;SC=CAATTAACTGATCATTAGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=37903861;WS=37903843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	37903904	rs3816418	C	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=20;NR=16;PP=676;SC=ATCCAGACTTCGTGCCAAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=37903912;WS=37903894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	37904065	rs3841582	TAAC	T	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=351;SC=AATTGCAAAATAACAACCTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=37904075;WS=37904055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	37904099	rs3816417	G	A	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=91;SC=AAAGACAAGCGTACCATTTAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=37904107;WS=37904089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	37907304	rs10250905	T	C	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=10;PP=1372;SC=TATTTTGTAGTGTGACTTCGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=54;WE=37907312;WS=37907294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	37923849	rs1993052	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TATGTATTGTGTACATAACCA;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=37923857;WS=37923839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	37924737	rs1530822	T	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=354;ReadPosRankSum=0.264;SC=TTTGTTTTCTTTTCTAATAGT;SOR=0.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=24;WE=37924745;WS=37924727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr7	37924879	rs2242027	A	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1114;ReadPosRankSum=0.378;SC=ATGGGTCACTATCTGTTTTCG;SOR=0.672;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=73;WE=37924887;WS=37924869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr7	37927779	rs2251179	T	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=299;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GATCTGGAATTATTTGCTGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=37927787;WS=37927769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	37933983	rs10260487	C	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=0.263;SC=ATTAAACTATCATTTTCCTTA;SOR=1.802;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10;WE=37933991;WS=37933973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	37934146	rs56128139	TA	CT	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CCTGAGCAAATAGAGAAAATT;SOR=0.864;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=9;WE=37934155;WS=37934136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr7	37934234	rs10261071	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.876;SOR=1.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	37936530	rs3213975	T	C	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=1395;ReadPosRankSum=1.271;SC=ATGGAGACGATTGATGGGCCC;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=98;TCR=48;TR=79;WE=37936538;WS=37936520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,87:0.51:171
chr7	37951726	rs1132553	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=10;PP=596;SC=CCTACCTTGAGCGCCACTCGT;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=37951734;WS=37951716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr7	37989775	rs1450851	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.838;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=231;ReadPosRankSum=-0.638;SC=CTTCTTTATTTAAAAGTCAAC;SOR=0.125;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=18;WE=37989783;WS=37989765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
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chr7	38299727	rs138027161	T	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=5.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQRankSum=-3.375;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr7	38356849	rs56794613	C	T	3003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1643;ReadPosRankSum=1.439;SC=TTATTCCAGACACCACACATT;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=106;TCR=119;TR=113;WE=38356857;WS=38356839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,145:0.51:286
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chr7	38388851	rs62445008	T	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.549;NF=15;NR=3;PP=390;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CAGAATACAGTAAATTTGGTG;SOR=1.781;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=18;WE=38388859;WS=38388841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr7	38393403	rs2017501	G	A	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1186;ReadPosRankSum=0.352;SC=TTGTGCTTCCGTAAGTATCAT;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=215;TCF=102;TCR=113;TR=88;WE=38393411;WS=38393393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,110:0.42:261
chr7	38397867	rs370983159	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQRankSum=0.114;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.713;SOR=1.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,18:0.22:83
chr7	38398019	rs2471878	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=41.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-5.828;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.979;SOR=3.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,11:0.15:73
chr7	38398564	rs1810377	AG	GC	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.380;NF=13;NR=41;PP=2219;ReadPosRankSum=0.377;SC=TAGAAGCACCAGTAGGGCCCA;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=33;TCR=106;TR=54;WE=38398573;WS=38398554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr7	38402496	rs2735118	A	G	3778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=54;PP=2464;ReadPosRankSum=1.642;SC=ATAGACCCCAAAGTCATTTTC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=151;TCR=98;TR=138;WE=38402504;WS=38402486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,166:0.55:302
chr7	38402781	rs2011898	A	G	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.256;NF=31;NR=21;PP=868;ReadPosRankSum=0.114;SC=ACTGGCTGCAATGGGAACAAC;SOR=0.999;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=52;WE=38402789;WS=38402771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,56:0.36:156
chr7	38424663	rs62446763	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=224;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GTGCTGTGCCGTGATCAATGG;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=38424671;WS=38424653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr7	38429370	rs6977263	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=750;ReadPosRankSum=0.380;SC=AAAAAATCAACGTAGCCCAAA;SOR=0.493;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=52;WE=38429378;WS=38429360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr7	38429552	rs36122520	T	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.652;SC=CAGCCAGATTTCAAGCAGACA;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=10;WE=38429560;WS=38429542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr7	38429572	rs35606872	GT	G	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=-0.368;SC=ACTCTTACAAGTCACTCTCCA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=38429592;WS=38429562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr7	38429584	rs34824107	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=298;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CACTCTCCAACCTGGATGAAA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=38429592;WS=38429562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	38431430	rs6949992	A	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=563;ReadPosRankSum=1.714;SC=TGGCTGGTGCAGAAGGCGTGG;SOR=0.637;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=39;WE=38431438;WS=38431420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr7	38431644	rs79759611	G	GC	1239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=802;SC=CCGTGGCGATGCCGGCAGGGC;SOR=1.371;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=38431652;WS=38431634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	38433726	rs35024632	T	G	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1051;ReadPosRankSum=1.625;SC=GACAGTGGCCTTCTCCGCCTC;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=68;WE=38433734;WS=38433716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr7	38457688	rs10247761	C	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=0.647;SC=TGGAGAAAAGCCCCCATTTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=11;WE=38457696;WS=38457678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr7	38460546	rs1019287	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.012;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=326;ReadPosRankSum=-0.753;SC=AAACACTGGGGCGTTTTCTTG;SOR=1.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=19;WE=38460554;WS=38460536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
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chr7	38468463	rs2267808	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=696;ReadPosRankSum=0.167;SC=TTTTCATTGGCGTTTGTACTT;SOR=1.183;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=45;WE=38468471;WS=38468453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr7	38468695	rs2392572	C	T	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=72;PP=2850;SC=GAGAATCTTCCATCTTCTGTT;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=132;WE=38468703;WS=38468685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr7	38469039	rs2215955	C	A	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1229;ReadPosRankSum=-1.534;SC=TCTTGGCTGACCCTGTCTGTA;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=83;WE=38469047;WS=38469029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,94:0.52:182
chr7	38471753	rs10232299	A	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=874;ReadPosRankSum=0.962;SC=TCTGGGGATCAAGATACATGA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=51;WE=38471761;WS=38471743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr7	38504905	rs722336	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GAAGGCCAGACATAAATGTAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=38504913;WS=38504895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	38505014	rs722335	A	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=410;ReadPosRankSum=-3.109;SC=CCACAGATTGAAGAAATTTTA;SOR=1.220;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=23;WE=38505033;WS=38505004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr7	38505025	rs722334	G	A	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=24;PP=1300;SC=AGAAATTTTAGCAAGCAGGAC;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=38505033;WS=38505004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	38514868	rs41279585	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=0.169;SC=ACAAGATAAGGGATATTCACT;SOR=0.586;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=13;WE=38514876;WS=38514858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr7	38530568	rs2043786	G	T	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=21;PP=2055;SC=TTGAGGACTTGTAATAATTCT;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=70;TCR=21;TR=91;WE=38530576;WS=38530558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	38530807	rs3837078	T	TA	2646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=66;PP=1989;SC=ACCAAACTTCTAAAAAAATCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=66;WE=38530815;WS=38530797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	38533972	rs3735089	A	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=-0.325;SC=AGAGCAAGTCAGGGGACAGGT;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=38533980;WS=38533962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	38543103	rs10225047	T	G	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=2.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	38543104	rs10268443	G	C,GC	2053.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=181;SC=GCGGGGGGGTGGGTGGTGGAA;SOR=2.948;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=12;WE=38543112;WS=38543093;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:40
chr7	38543371	rs6946268	C	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=46;PP=1406;SC=GTAAGAAGTGCTAAGTCTCAA;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=38543379;WS=38543361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	38725804	rs11980087	C	T	5322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=78;PP=2965;SC=GAAAAAGGCTCGCCATCAACT;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=90;TCR=78;TR=168;WE=38725812;WS=38725794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr7	38725883	rs12701651	C	A	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.352;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.347;SC=TCCTTGAGAACAGATTCGATG;SOR=0.713;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=77;WE=38725891;WS=38725873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,86:0.39:222
chr7	38726473	rs17508140	T	C	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=949;SC=GGCAGGAAGTTTGAGGAGTAA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=38726481;WS=38726463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	38780883	rs6951429	C	T	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=19;PP=660;SC=AACAACAGTCCGAATTTTTAA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=38780891;WS=38780873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	38780924	rs6975410	T	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=19;PP=551;SC=TCTATAGAAGTTACCAGCATC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=38780932;WS=38780914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	38781018	rs3779128	T	C	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=83;SC=ATGAAAATAATGAGTTCCACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=38781026;WS=38781008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	38782951	rs10254567	G	A	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=955;SC=GACATAACTGGTTACACTGAG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=38782959;WS=38782941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	38785062	rs28520398	G	A	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=9;PP=438;SC=TCTGTGTTACGTTGGTCTAAA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=38785070;WS=38785052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	38796748	rs2392599	C	T	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=49;SC=TAACTATACACGACCAATAAG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=38796756;WS=38796738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	38813711	rs976350	C	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=32;PP=2278;SC=TTCATATCTCCTACCTAAATG;SOR=1.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=38813719;WS=38813701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr7	39125413	rs1950001	T	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=11;PP=1339;SC=GCACTCTAAATCTGCCACTTT;SOR=2.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=61;WE=39125421;WS=39125403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr7	39243978	rs35489214	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=-1.074;SC=TGGTTTAACCATATAAATCAC;SOR=0.338;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=21;WE=39243986;WS=39243968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr7	39500352	rs885689	C	G	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=8;PP=248;SC=CTTCTAGCCGCCCTGGGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=39500360;WS=39500342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr7	39649275	rs4723884	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=727;ReadPosRankSum=0.561;SC=CCGGAGGTTGGGACGCAACTA;SOR=1.688;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=42;WE=39649283;WS=39649265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
chr7	39649456	rs4723885	G	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=655;ReadPosRankSum=0.861;SC=GCCACCGCCGGCGTTTCAGAC;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=41;WE=39649464;WS=39649446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr7	40108855	rs11760551	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=402;ReadPosRankSum=-1.621;SC=AATAAAACAACAAAACATAAA;SOR=0.903;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=21;WE=40108863;WS=40108845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr7	40314165	rs12669315	G	A	8283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=138;PP=2965;SC=CCACTGGCCTGTATGCATATG;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=127;TCR=138;TR=265;WE=40314173;WS=40314155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr7	40356315	rs10245165	A	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=554;ReadPosRankSum=0.722;SC=GAGTATAGATAAACTAGCTGT;SOR=0.454;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=30;WE=40356323;WS=40356305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr7	40535812	rs186533115	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TTTCAAAGAGGGCCACATGAT;SOR=0.576;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=15;WE=40535820;WS=40535802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr7	40899967	rs2010706	G	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=924;ReadPosRankSum=1.385;SC=GGCCGCCCCCGCTGCTCGGGC;SOR=1.019;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=57;WE=40899975;WS=40899957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr7	41368666	.	T	TGAAA,TGAAAGAAA	503.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.06;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=259;SC=GAAGCTCAATTGAAAGAAAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=41368674;WS=41368656;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.43:7
chr7	41533352	rs146112412	G	A	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.379;SC=ATCTTTGAGCGGCTCTATGCT;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=78;WE=41533360;WS=41533342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,95:0.43:222
chr7	41740067	.	A	AT	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.4998;HP=18;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=17;MQ=56.57;NF=1;NR=1;PP=20;QD=14.5;SC=GGATTTTTTTATTTTTTTTTT;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=2;WE=41740075;WS=41740057;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr7	42005678	rs929387	G	A	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=42;PP=1809;SC=GCCGTGGCCCGGCGCATCGTG;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=42005686;WS=42005668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	42006091	.	G	A	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1797;ReadPosRankSum=0.081;SC=AGCGGCGGCTGCTCAGGTAGG;SOR=0.821;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=235;TCF=139;TCR=96;TR=120;WE=42006099;WS=42006081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,145:0.52:278
chr7	42007071	rs4724083	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=79;ReadPosRankSum=0.013;SC=TAAACATTAACGGATGGTTAC;SOR=0.620;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=42007079;WS=42007061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	42064852	rs846273	C	G	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=25;PP=1519;SC=TGTGCGGCCTCGGTGTCCTAC;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=42064860;WS=42064842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	42084829	rs699493	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GCTTCTAGAAAACGAAGGGAA;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=16;WE=42084837;WS=42084819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr7	42088222	rs846266	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=0.090;SC=GAAGCAGCAGTGGGGTTCCGG;SOR=1.116;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=31;WE=42088230;WS=42088212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr7	42212189	rs62443803	T	C	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=-1.045;NF=35;NR=52;PP=1426;ReadPosRankSum=-2.320;SC=TCCAAGAGGATCTGTGGCTGA;SOR=0.944;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=87;WE=42212197;WS=42212179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,109:0.53:207
chr7	42262935	rs11266806	GA	G	113.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.282;NF=0;NR=8;PP=90;ReadPosRankSum=-1.221;SC=CAAAATGGTGGAAAAAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=42262943;WS=42262925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	42950640	rs643138	C	T	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=50;PP=1756;SC=TCTATGAACCCGGGCTTGTGT;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=85;WE=42950648;WS=42950630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	42951515	rs647117	G	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=534;SC=GCTCCTCACCGGCAGCGCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=42951523;WS=42951505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	42957465	rs71008875	ATT	A	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=85;SC=TACTTATATCATTGTTTATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=42957474;WS=42957455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	42970733	rs619664	C	T	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1862;SC=GTACAAGCTGCGGTTAGTTCA;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=42970741;WS=42970723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	42974827	rs601057	A	C	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=43;PP=1277;SC=ATAAATTATTATCAGATTATA;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=51;WE=42974835;WS=42974817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	42976789	rs630191	A	G	5518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=74;PP=2965;SC=AGGTGGAACTAGATGGTGTAT;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=42976797;WS=42976779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr7	42977091	rs631132	G	A	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=43;PP=1381;SC=TGCTGTACACGGGAGAGACAC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=42977099;WS=42977081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	43190479	rs12702015	T	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=-0.981;SC=TTCAGCATCTTTATCAGCGCC;SOR=1.047;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=21;WE=43190487;WS=43190469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr7	43485248	rs6960889	A	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.404;NF=7;NR=26;PP=1483;ReadPosRankSum=0.262;SC=AAAAACAAGAAGGGCGGGGGA;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=33;WE=43485267;WS=43485238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr7	43485259	.	TC	T	856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.001;NF=1;NR=20;PP=1474;ReadPosRankSum=0.496;SC=GGGCGGGGGATCGGTGTCAAA;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=21;WE=43485267;WS=43485238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr7	43495878	rs3214631	C	CT	792.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=795;ReadPosRankSum=0.494;SC=TTCTTTTTGCCTTTTTATTAA;SOR=0.831;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=25;WE=43495886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr7	43506015	rs2304330	C	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=791;ReadPosRankSum=0.927;SC=TTTCCCAATGCATTCTGTTGC;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=48;WE=43506023;WS=43506005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr7	43506059	rs2304329	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=839;ReadPosRankSum=0.738;SC=TAAGGAGAGAAGGGTCACTTT;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=54;WE=43506067;WS=43506049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr7	43506158	rs2304328	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=461;ReadPosRankSum=0.416;SC=CTGTGCTACATGCCAATTATG;SOR=0.941;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=35;WE=43506166;WS=43506148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr7	43591832	rs56111512	G	A	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=50;PP=2000;SC=TTGTAGACTCGAGGCTGGTGT;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=92;WE=43591840;WS=43591822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	43591955	rs4724220	A	G	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=29;PP=1136;SC=CAGGAGCTGTAATGATGCAAT;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=43591963;WS=43591945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	43622806	rs10251937	T	C	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=838;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CTGCTCGGAGTGAACAGGCGG;SOR=0.466;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=73;WE=43622814;WS=43622796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,82:0.55:148
chr7	43623123	rs2241738	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	43647879	rs11555026	C	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=640;ReadPosRankSum=-0.481;SC=AAATCTTTGACCAGTGTGTTG;SOR=0.799;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=46;WE=43647887;WS=43647869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr7	43664198	rs10233697	A	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.668;SC=TCAGGATGGAAAAGGCACTAG;SOR=0.682;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=76;WE=43664206;WS=43664188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,85:0.45:190
chr7	43664280	rs1044141	A	G	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=72;PP=2644;SC=ATCAGAAACCAAGGAATCCAT;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=43664288;WS=43664270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	43664477	rs15866	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GATTTCTACATTGAAAATGTT;SOR=0.156;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=9;WE=43664485;WS=43664467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr7	43679110	rs77224833	C	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GATGGGCCACCACCCCAGTGG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=43679118;WS=43679100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr7	43684803	rs2302031	C	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.210;SC=AGACTCTCCTCTCCTTCAGCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=43684811;WS=43684793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	43685150	rs10263142	T	C	94.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CTACTCTAAATTGTCCATTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=43685158;WS=43685140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	43686194	rs970134	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=792;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AGGGAGAAAGGCTGTCACACC;SOR=0.967;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=54;WE=43686202;WS=43686184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,65:0.46:140
chr7	43686224	rs970135	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=649;ReadPosRankSum=0.956;SC=AACCCTGACCCAAAAGTGCAC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=48;WE=43686232;WS=43686214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr7	43687074	rs143305109	TGGA	T	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=534;ReadPosRankSum=0.577;SC=TTTCCTCTGATGGAGGAGCAG;SOR=1.312;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=11;WE=43687084;WS=43687064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr7	43687296	rs2240516	C	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=912;SC=GGGATTTGCCCGGCTTGGACC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=43687304;WS=43687286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr7	43827373	rs17239537	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=1.782;SC=ATCCTGATGCTGTGGCTTCCT;SOR=1.222;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=13;WE=43827381;WS=43827363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
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chr7	43846603	rs7738	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=340;ReadPosRankSum=0.823;SC=AAGAAAAAGGACCTGGTCTAA;SOR=0.208;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=21;WE=43846611;WS=43846593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr7	43906513	rs670573	A	G	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.118;SC=AAGGTACCCCACATGAACTTG;SOR=0.826;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=238;TCF=112;TCR=126;TR=97;WE=43906521;WS=43906503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,114:0.41:280
chr7	43916199	rs28461223	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=300;ReadPosRankSum=1.180;SC=CAGCCCCACACGGGTGCCCCA;SOR=1.171;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=17;WE=43916207;WS=43916189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr7	43916727	rs2232108	T	G	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=48;PP=2320;ReadPosRankSum=0.219;SC=CTCAGTCCCATGAGCAGAGTG;SOR=1.007;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=200;TCF=108;TCR=92;TR=116;WE=43916735;WS=43916717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,126:0.55:230
chr7	43917013	rs2232105	G	A	3664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=81;PP=2286;ReadPosRankSum=2.364;SC=CCAGTCGGACGTGCAGCTCCT;SOR=0.821;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=273;TCF=124;TCR=149;TR=145;WE=43917021;WS=43917003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,169:0.52:323
chr7	43917274	rs2232103	A	G	7616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=148;PP=2965;SC=TGGTGCCCCCATGCTTTGGTC;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=99;TCR=148;TR=247;WE=43917282;WS=43917264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr7	43921477	rs73108120	A	G	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1545;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TCCCCAGTCCAATCTGTTGCC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=106;WE=43921485;WS=43921467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,128:0.49:260
chr7	43982482	rs2074727	A	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=673;ReadPosRankSum=2.187;SC=TGAGCGCACCACTCCAGTTTT;SOR=0.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=45;WE=43982490;WS=43982472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr7	44026069	.	G	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.12;MQRankSum=-1.345;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr7	44027348	rs2330943	A	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.176;NF=28;NR=34;PP=989;ReadPosRankSum=-1.743;SC=TATCATTGCCAACACGGAGGA;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=62;WE=44027356;WS=44027338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,70:0.55:127
chr7	44076350	rs28378571	T	C	3016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.204;NF=69;NR=55;PP=1816;ReadPosRankSum=0.644;SC=GCTGCCAAAGTTCTTTTCCTC;SOR=0.807;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=265;TCF=144;TCR=121;TR=124;WE=44076358;WS=44076340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,148:0.44:334
chr7	44081323	rs3099757	C	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.751;NF=25;NR=2;PP=579;ReadPosRankSum=-2.784;SC=AAAGGGCTCTCAATATGGAGA;SOR=0.798;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=27;WE=44081331;WS=44081313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr7	44081535	rs191907231	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=813;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TTTTGATTTGGTTCTAGGAGG;SOR=0.377;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=58;WE=44081543;WS=44081525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr7	44081569	rs10254823	G	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=498;ReadPosRankSum=-1.950;SC=GCGTTCTGTTGCCTGCTTCCA;SOR=0.264;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=24;WE=44081577;WS=44081559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr7	44084210	rs17553434	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GCTGGCCCCTACCATTTCCGC;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=44084218;WS=44084200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	44084486	rs6944386	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=209;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CTGGGGCGAGCGGGGGACTCG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=17;WE=44084494;WS=44084476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr7	44084526	rs6964599	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=21;ReadPosRankSum=-1.865;SC=CGCGGAGCGGTGCCCAGGCAG;SOR=1.300;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=4;WE=44084534;WS=44084516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr7	44089904	rs3812251	A	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=-1.110;SC=AAATGGACTCAGGGACACCAG;SOR=0.409;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=41;WE=44089912;WS=44089894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr7	44091343	rs17172569	A	G	30.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	44097696	rs6968228	T	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=450;ReadPosRankSum=-2.558;SC=AGTGGCAGCATAGGGCTGAGC;SOR=0.625;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=30;WE=44097704;WS=44097686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
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chr7	44118323	rs28382645	GC	G	2787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.490;NF=19;NR=36;PP=1841;ReadPosRankSum=0.520;SC=GTAGGTCCGAGCCCTGCCCTG;SOR=0.592;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=55;WE=44118331;WS=44118313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,96:0.48:201
chr7	44120037	rs28382637	T	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=693;ReadPosRankSum=-1.893;SC=CCGCTCGGAGTTGCTGTGTCA;SOR=0.921;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=50;WE=44120045;WS=44120027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr7	44144201	rs28362520	C	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr7	44145910	rs1558469	C	T	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1184;ReadPosRankSum=0.060;SC=GGGAACCCTACGCTCAGTCTT;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=79;TCR=111;TR=86;WE=44145918;WS=44145900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,102:0.45:225
chr7	44147485	rs2537188	C	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.718;NF=11;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CTGGCCAGAGCCCCCTGAGGA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=31;WE=44147493;WS=44147475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr7	44147567	rs58863562	C	CG	1975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=27;PP=1650;SC=GCCATGGCCACGGCGCTCTGG;SOR=1.047;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=38;WE=44147575;WS=44147557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	44148388	rs2075071	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.139;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr7	44148553	rs2595701	A	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=32;PP=2057;SC=AGCGCCAGACAGACGAAGAGA;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=44148561;WS=44148543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	44149374	rs11979310	T	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GTTCTCCAGATGGGGCAGCTG;SOR=0.826;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=79;WE=44149382;WS=44149364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
chr7	44151009	rs62460065	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=203;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GGGTCATGCCCGTCCCTCGCC;SOR=0.122;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=12;WE=44151017;WS=44151005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	44152119	rs11377645	A	AG	1376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=10;PP=1068;SC=TAGTGGCCGGAGCTGCAGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=24;WE=44152127;WS=44152109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	44152524	rs144604735	A	AG	1670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.735;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=1687;ReadPosRankSum=0.953;SC=TCAGCCTGGGAGGGGCTGTGG;SOR=0.933;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=52;WE=44152532;WS=44152514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,69:0.39:178
chr7	44152549	rs41279612	G	A	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1423;ReadPosRankSum=0.598;SC=GGCCTGGTCCGGAGAGGGGCT;SOR=0.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=117;TCR=77;TR=82;WE=44152557;WS=44152539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,93:0.42:220
chr7	44153082	rs67670401	G	GC	700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=816;SC=GGAGGGCGGTGCTGGGGGCGG;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=17;WE=44153090;WS=44153072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	44153115	rs34515254	G	GC	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=222;SC=GGAGGGCGGGGCTGGGGGCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=44153123;WS=44153105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	44153780	rs13928	A	G	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=7.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,105:0.57:183
chr7	44154865	rs5883885	A	AG	3262.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=35;PP=2840;SC=TCAGCAAATCAGCCTGGGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=63;WE=44154873;WS=44154855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	44156146	rs3087367	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-0.817;SC=AGGCCCAGGCGAGTCCCAGGC;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=15;WE=44156154;WS=44156136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr7	44157770	rs34484835	G	GC	532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=684;SC=CAGGGCCCTGGCCTTGCCAGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=44157778;WS=44157760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	44178626	rs1008384	A	G	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=882;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CTCCACCTGCAGGGGACACTG;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=54;WE=44178634;WS=44178616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr7	44180044	rs75267165	T	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.233;NF=24;NR=59;PP=1649;ReadPosRankSum=0.776;SC=GGGTGGGGCATGAGGTGCACA;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=83;WE=44180052;WS=44180034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,94:0.73:129
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chr7	44180226	rs55908146	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=257;ReadPosRankSum=2.026;SC=AGGGGAGCAGAGTCCTGTCCC;SOR=1.220;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=15;WE=44180234;WS=44180218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
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chr7	44259554	rs149624128	T	TG	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=376;SC=TTCCCAGGCATGGCTCTGCAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=44259569;WS=44259544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	44266184	rs35452727	C	T	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=544;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GAGGGGCCCTCGGCTTCTGGG;SOR=0.377;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=37;WE=44266192;WS=44266174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr7	44268785	rs917791	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CTTGAGCAGGAAAGTGGTCCA;SOR=1.061;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=23;WE=44268793;WS=44268775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr7	44272314	rs5883896	G	GC	410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=312;SC=GGCGGCCAGGGCATGGGACAT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=44272322;WS=44272304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr7	44281702	rs35663812	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=360;ReadPosRankSum=1.622;SC=AGGGGACCCAAGGGAGCTCTT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=19;WE=44281710;WS=44281693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr7	44282369	rs35452037	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.778;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=1.017;SC=ATTGGGGTCCTCAGCATTCCT;SOR=1.296;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=22;WE=44282377;WS=44282359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr7	44282868	rs11542228	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,22:0.33:67
chr7	44282877	rs11542227	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
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chr7	44284724	rs62459103	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=0.233;SC=ACCAGCAGTTCTTCCGAAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=13;WE=44284732;WS=44284714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr7	44294380	.	C	T	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5565;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=55.21;NF=0;NR=6;PP=138;QD=28.7952020912;SC=CCAACTACCACCATCACCAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=44294388;WS=44294370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	44364862	rs111242776	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=386;ReadPosRankSum=2.078;SC=GGCGCGCGGGCCCGCAGTGCG;SOR=1.697;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=19;WE=44364870;WS=44364852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr7	44442296	rs1473114	A	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=502;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CTGCTCCATGATCTGCACTGA;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=26;WE=44442304;WS=44442286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr7	44555617	.	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CAGGCAGGGCACAGGGCATCA;SOR=0.632;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=69;WE=44555625;WS=44555607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr7	44555699	rs52815063	A	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=982;ReadPosRankSum=0.485;SC=TCCCATAGAGATGGTGGCCTC;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=64;TCR=84;TR=69;WE=44555707;WS=44555689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,85:0.51:168
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chr7	44579180	rs2072183	G	C	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1750;ReadPosRankSum=1.226;SC=AGGTGGAGTCGAGGGCCTGGG;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=128;TCR=100;TR=109;WE=44579188;WS=44579170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,128:0.49:260
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chr7	44612229	rs2289057	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=503;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGTCAGCTTCGTCCACCACCA;SOR=0.586;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=32;WE=44612237;WS=44612219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr7	44612347	rs217374	G	C	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=48;PP=2486;SC=CACAGCTCTGGAGGTGGACAA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=119;WE=44612355;WS=44612337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	44612454	rs217373	C	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=831;ReadPosRankSum=-1.159;SC=CACTGTGTAGCTTCATTCAGG;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=49;WE=44612462;WS=44612444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr7	44612753	rs217372	T	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=562;SC=CAACACTACTTAGCAGTACTT;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=44612761;WS=44612743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	44613611	rs11308115	CG	C	6529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=100;PP=2967;SC=GAAGTGCTGGCGGCCTAGGCT;SOR=1.369;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=10;TCR=105;TR=110;WE=44613619;WS=44613601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	44619302	rs217361	T	C	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=55;PP=1826;SC=CTGCGTGTAATTACTCAACTC;SOR=1.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=44619310;WS=44619292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr7	44687175	rs113649447	C	CT	1006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.992;NF=22;NR=21;PP=594;ReadPosRankSum=-2.555;SC=TGTAATTTTACTTTTTTTTTA;SOR=0.559;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=43;WE=44687183;WS=44687165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,49:0.44:112
chr7	44802401	rs4720479	A	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=2;PP=296;SC=CTGACACACAACCCCCAGCAC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=44802409;WS=44802391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	44836314	rs6850	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.335;NF=9;NR=6;PP=239;ReadPosRankSum=-1.142;SC=AAAACCGTGTACTATTAGCCA;SOR=0.922;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=15;WE=44836322;WS=44836304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr7	44839616	rs6463247	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CATACATAAACGACAAATATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=44839624;WS=44839606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	44862641	rs2012932	T	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=821;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CAGGGTCCTCTCAAAGCCTTG;SOR=1.047;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=57;WE=44862649;WS=44862631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr7	44869537	rs1297837	C	T	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=3;PP=1519;SC=CAAGGAAAAGCGCTCTGAAAT;SOR=4.875;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=56;WE=44869545;WS=44869527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	44880684	rs138616116	CA	C	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.261;NF=3;NR=13;PP=509;ReadPosRankSum=1.577;SC=AAAGGCTGAACAATGTAAGCA;SOR=0.765;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=16;WE=44880692;WS=44880674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr7	44924627	rs6966024	A	C	9393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=139;NR=159;PP=2965;SC=CCTCGGCGCCAGCCGCCAGCT;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=298;TCF=139;TCR=159;TR=298;WE=44924635;WS=44924617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr7	45004063	rs7792760	T	C	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=59;PP=1730;SC=ATCTTTGTCCTGAAGTGTCTT;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=104;WE=45004071;WS=45004053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	45009325	rs3735484	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=273;ReadPosRankSum=-2.622;SC=TGTAGTGTAGGTGATGGCGGT;SOR=0.764;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=23;WE=45009333;WS=45009315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr7	45009341	rs3735485	A	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=23;PP=850;SC=GCGGTGGTGCATGTCCAGGGT;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=45009349;WS=45009331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr7	45010734	rs7789375	G	A	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=630;SC=CAAGAAGGAGGAAGGAAAGCA;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=45010742;WS=45010724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr7	45112902	rs10272243	T	C	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=97;SC=CCACCCTGCATGCCCAGTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=45112910;WS=45112892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr7	45119946	rs35199312	T	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGACACCAGATGGTGGTGAAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=45119954;WS=45119936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	45120453	rs10264280	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=738;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CCCTGCGAGGCCCTGGAGCCC;SOR=0.959;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=45;WE=45120461;WS=45120443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr7	45120704	rs2304692	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=993;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CCACCACAGCCGCCACCCAGA;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=74;WE=45120712;WS=45120694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr7	45122464	rs10243185	A	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1208;ReadPosRankSum=1.057;SC=CAGGAGGCGCATCGGGGACCT;SOR=0.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=68;WE=45122472;WS=45122454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,75:0.51:148
chr7	45122723	rs61740895	G	A	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1162;ReadPosRankSum=0.383;SC=AGTGGAATCCGCATCTTCCTG;SOR=0.512;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=86;WE=45122731;WS=45122713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr7	45124008	rs7777835	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.129;NF=17;NR=9;PP=412;ReadPosRankSum=1.791;SC=AGGTCCTCTTTAGCCTGCCTG;SOR=0.917;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=26;WE=45124016;WS=45123998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr7	45124286	rs3735494	A	G	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TCTGGTAGCCACCTCCACCTG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=90;TCR=104;TR=78;WE=45124294;WS=45124276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,87:0.42:205
chr7	45124465	rs3735495	A	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=703;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ACACAGTCCCATCCTGAGCCT;SOR=1.036;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=46;WE=45124473;WS=45124455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr7	45125775	rs9791417	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.369;SC=GGCCAGGCCCGGGGAGATGAA;SOR=0.145;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=17;WE=45125783;WS=45125765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr7	45142834	rs2289374	G	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=191;ReadPosRankSum=0.325;SC=GGCCCCTCCCGCCTCCACCTA;SOR=0.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=13;WE=45142842;WS=45142824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr7	45143108	rs2119056	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=88;ReadPosRankSum=0.735;SC=TCCTCCTGCCTGGCTCTGAGT;SOR=0.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=45143116;WS=45143098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr7	45143892	rs6973982	A	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=905;ReadPosRankSum=0.818;SC=TTAGCTGGAGAGAGTCAGCAA;SOR=0.575;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=61;WE=45143900;WS=45143882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,78:0.42:187
chr7	45144113	rs41280672	C	T	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCCCTCTCTCCACCGTTCTGT;SOR=0.745;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=216;TCF=109;TCR=107;TR=101;WE=45144121;WS=45144103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,117:0.44:264
chr7	45144494	rs2289376	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=1.204;SC=AGGGAACCCCTGGACCTGGAG;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=14;WE=45144502;WS=45144484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr7	45145487	.	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.836;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=364;ReadPosRankSum=0.901;SC=AAGACAGTATCAGTTCCCCAC;SOR=0.502;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=24;WE=45145495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr7	45148667	rs2304693	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=989;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CTTCTCCACCGGCTCCATCAA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=63;WE=45148675;WS=45148657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr7	45148773	rs2304694	C	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=920;ReadPosRankSum=0.317;SC=GGAGCCATGGCAGGGGCCTGA;SOR=0.930;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=60;WE=45148781;WS=45148763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr7	45197433	rs67477213	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=568;ReadPosRankSum=1.136;SC=CAGCCATGGAGACTGGAGCGC;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=39;WE=45197441;WS=45197423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr7	45216761	rs1294940	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=517;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GGTCAGGGTGGAGGGTGAAGG;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=27;WE=45216769;WS=45216751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr7	45216785	rs17172483	G	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=602;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CCGCTGGAACGGTCTCAGGCT;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=43;WE=45216793;WS=45216775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
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chr7	45225708	rs13222185	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.397;NF=31;NR=15;PP=823;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TGGAGGCAGCAATAGTGTGTG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=46;WE=45225716;WS=45225698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr7	45225788	rs11760627	C	A	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=820;ReadPosRankSum=-0.535;SC=ATTAATGTCTCATTTTGCAGA;SOR=0.844;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=58;WE=45225796;WS=45225778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,69:0.48:143
chr7	45225822	rs11760688	G	A	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=714;ReadPosRankSum=0.360;SC=GCTCAGAAATGTAAGGGGACT;SOR=0.876;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=48;WE=45225830;WS=45225812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,52:0.41:128
chr7	45225838	rs11767359	AA	CC	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=1555;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGACTTGCTGAAGAGTGGTCT;SOR=1.132;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=40;WE=45225847;WS=45225828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr7	45225854	rs11767365	A	G	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=-1.624;SC=GGTCTTTTATATTTTCCTGGC;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=34;WE=45225862;WS=45225844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr7	45697295	rs2461131	C	G	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.25;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	45697295	.	CCT	GCC	2177	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=34;NR=21;PP=2177;QD=40.5539613611;SC=CAAGGTGGGCCCTAGCCCCAC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=55;WE=45697305;WS=45697285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,55:0.95:58
chr7	45697297	rs2471231	T	C	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	45703971	rs1042009	G	A	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=51;PP=1572;SC=GACTGTGCACGTAGCTTCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=45703979;WS=45703961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	45724696	rs2461106	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=438;ReadPosRankSum=1.205;SC=TGGCATGCGCTGGGGCGGGAG;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=38;WE=45724704;WS=45724686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr7	45743128	rs2247685	T	G	5071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=59;PP=2965;SC=GCACTAGCCCTACACTGCTCT;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=108;TCR=59;TR=167;WE=45743136;WS=45743118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr7	45743403	rs2461114	G	A	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=59;PP=1819;SC=ATCCTGTTGCGTGGGCAGAGC;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=45743411;WS=45743393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	45954692	rs10255707	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=401;SC=ACAAGAGCCATGCGTGCCTAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=45954700;WS=45954682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	45957172	rs55719014	TA	T	417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=13;PP=468;SC=TTTTTTTTTTTAAAATACCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=45957180;WS=45957162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	45960645	rs2854746	G	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=433;ReadPosRankSum=-2.390;SC=ACCCAAGCCCGCCGAGCTCGC;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=25;WE=45960653;WS=45960635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr7	45961271	rs11765572	G	A	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=642;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AGCCGGTGTCGGGGAAACTGG;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=41;WE=45961279;WS=45961261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr7	46728937	rs1404727	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=378;ReadPosRankSum=-0.249;SC=GCAAAATCTCTTGTACTTTTG;SOR=1.034;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=26;WE=46728945;WS=46728927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr7	46732428	rs700747	A	G	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=28;PP=1689;SC=AGGAAGCAAAACAAGCAAGTC;SOR=1.361;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=80;WE=46732436;WS=46732418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	46732627	rs1917602	A	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CCCTTCTATGAAGTAAATAGG;SOR=0.058;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=10;WE=46732635;WS=46732617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	46736733	rs71003346	GA	G	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=439;SC=TTCAGAGGAGGAAAATGATGC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=46736741;WS=46736723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	47317510	rs3750163	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=410;ReadPosRankSum=-1.656;SC=TCACGGTGATGTTGTTTGTTC;SOR=0.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=29;WE=47317518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr7	47319723	rs4720590	C	T	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=10;PP=512;SC=AGTACAACTGCAGACAAGGAG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=47319731;WS=47319713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	47319852	rs6971754	C	T	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.704;SC=ATTAAGTACACTCCTTGCTCA;SOR=0.561;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=64;WE=47319860;WS=47319842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,76:0.59:128
chr7	47323456	rs3750164	A	G	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=70;PP=2524;SC=AGTACCACACATTGCAGGCTG;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=139;WE=47323464;WS=47323446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	47332238	rs884824	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.718;SC=CTGTCAGTGAAGTAGAATCTC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=47332246;WS=47332228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
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chr7	47408443	rs2293362	C	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=804;ReadPosRankSum=1.147;SC=CGAAGCTATACTGGTGAGCTA;SOR=0.497;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=53;WE=47408451;WS=47408433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
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chr7	47546375	rs334496	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=79;ReadPosRankSum=1.044;SC=ATACACCGTACCCCAGCCCTG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=47546383;WS=47546365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	47546547	rs334497	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=304;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TGCAGGCTGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=18;WE=47546555;WS=47546537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr7	47568718	rs10261525	C	T	2818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=63;PP=1793;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TTCTTAAAAGCGTGCAGACTC;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=197;TCF=78;TCR=119;TR=108;WE=47568726;WS=47568708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,131:0.53:247
chr7	47578772	rs334506	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=729;SC=CCAGGATTCATACTCTCTGGG;SOR=2.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=35;WE=47578780;WS=47578762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	47596534	rs6954946	G	A	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=221;SC=CAGCCAAGAGGCCCTACTCCC;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=47596542;WS=47596524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	47596775	rs615300	C	T	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=681;SC=TCAGAACAATCCTTAAGACCA;SOR=1.259;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=47596783;WS=47596765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	47698685	rs12531737	A	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=559;ReadPosRankSum=0.394;SC=AAGACACTGGATCTCACTGGC;SOR=0.839;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=35;WE=47698693;WS=47698675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr7	47835027	rs9719534	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=6;NR=24;PP=720;SC=GAGGCCTCCCAAGTCATGTGG;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=47835035;WS=47835017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	47840510	rs1466203	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=621;SC=GCACTGACCTTGTCACCTCTT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=47840518;WS=47840500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	47847679	rs1074780	G	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=196;SC=AAGCTCTTCAGGCCCTTCACT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=47847687;WS=47847669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	47853498	rs6463449	C	T	5104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=79;PP=2965;SC=TCCATTTATTCTTGGAAGCAA;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=157;WE=47853506;WS=47853488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr7	47859239	rs3757379	C	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=5;NR=23;PP=681;SC=CAATGCTCAGCAGAAAAAAAA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=47859247;WS=47859229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	47869751	rs6463451	C	T	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=615;SC=CAGTGGTCAGCCCCCTCTAAG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=47869759;WS=47869741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	47872845	rs921634	A	G	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=43;PP=1323;SC=TGGCTGATGCAGGTTGCTAGA;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=47872853;WS=47872835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	47884555	rs13237611	A	G	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=36;PP=2616;SC=TAAAACAAATAAAGTCTATGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=83;TCR=36;TR=119;WE=47884563;WS=47884545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	47898222	rs34177211	T	TG	1335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=1187;ReadPosRankSum=0.593;SC=GTTAACATCCTGGGATATGGA;SOR=0.646;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=35;WE=47898230;WS=47898212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr7	47905044	rs7782964	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=0.196;SC=CTGTTGTCTCTGGTTTTCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=47905052;WS=47905034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	47913459	rs62447062	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GAAATACAAATAATGGCTAGG;SOR=0.886;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=18;WE=47913467;WS=47913449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
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chr7	47913579	rs1470859	TG	CA	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=2168;ReadPosRankSum=0.484;SC=TTGGAGCCTTTGCCATCTGTG;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=68;WE=47913588;WS=47913569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,85:0.41:207
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chr7	47915890	rs4724656	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.292;SC=CATACACACACAGCTGAGCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=47915898;WS=47915880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	47916995	rs2348662	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GGAAGGACATTGCTGTCCATT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=47917003;WS=47916988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr7	47920298	rs17131896	G	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=601;ReadPosRankSum=-1.459;SC=CTCATCCTCTGATAAATGCAA;SOR=1.227;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=36;WE=47920306;WS=47920288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr7	47920345	rs62447081	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=560;ReadPosRankSum=-0.995;SC=CTTGCAGGACGTACGTCTCTC;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=40;WE=47920353;WS=47920335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr7	47920450	rs17131899	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=490;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AGTGGTCTCAAGGACAGAGGT;SOR=1.074;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=31;WE=47920458;WS=47920440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr7	47920482	rs78574665	AG	GT	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=672;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CTTGGAAATGAGTTCCACTCT;SOR=0.657;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=19;WE=47920491;WS=47920472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr7	47920499	rs62447082	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=5;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=1.196;SC=CTCTTCCCCCAGGGGTGAAAT;SOR=0.333;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=14;WE=47920507;WS=47920489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr7	47947863	rs1474283	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.537;SC=AAAATAAGAATGAACGGACAC;SOR=0.289;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=19;WE=47947871;WS=47947853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr7	47968927	rs2686817	C	A	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1306;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCCATATGAACACGGAATCCC;SOR=0.509;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=81;WE=47968935;WS=47968917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,99:0.52:191
chr7	47969061	.	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=533;ReadPosRankSum=-1.227;SC=GAGGATCTCAGAACCAGACTG;SOR=1.276;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=25;WE=47969069;WS=47969051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr7	47971575	rs885337	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=721;ReadPosRankSum=0.599;SC=TCCCAGTAGCACACAGCCGCC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=47;WE=47971583;WS=47971565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr7	47971626	rs885338	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=1016;ReadPosRankSum=-1.306;SC=AGGCCCTTGCGATTATAATGA;SOR=1.028;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=59;WE=47971634;WS=47971616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr7	47976287	rs2708878	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-2.355;SC=TCAGAACACCATTCTTTTTTC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=47976295;WS=47976277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	47979716	rs62447089	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=286;ReadPosRankSum=-2.352;SC=TGAAACATGGAGGTGCTTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=20;WE=47979724;WS=47979706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr7	47979922	rs2708913	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=11;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=440;ReadPosRankSum=1.753;SC=CCTCTAGAGAAAAAAAAAAAA;SOR=0.923;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=31;WE=47979930;WS=47979910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr7	48004962	rs1056663	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=703;ReadPosRankSum=-0.604;SC=GCTAGGACAGCGCAGGGATGA;SOR=0.935;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=43;WE=48004970;WS=48004952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,52:0.41:127
chr7	48005122	rs2037483	G	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TTCCCAGCCTGCACCTCCTGT;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=46;TCR=89;TR=64;WE=48005130;WS=48005112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,74:0.44:168
chr7	48008738	rs3176581	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=-0.295;SC=ACCTTTTTACATGAAGAGACC;SOR=0.693;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=48008746;WS=48008728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr7	48010978	rs2708864	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=6;PP=1126;SC=CATCCCCTCATATACCATCGG;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=48010986;WS=48010968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr7	48018455	rs2242479	T	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=361;ReadPosRankSum=0.795;SC=AAATGCACATTATGTATCCTA;SOR=0.784;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=25;WE=48018463;WS=48018445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr7	48035532	rs36076226	CTT	C	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTCAGACACTCTTATATTGCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=48035541;WS=48035525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr7	48086161	rs10233232	T	C	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1205;ReadPosRankSum=-2.040;SC=GACTTCGACATGAAAACAGTT;SOR=0.929;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=87;WE=48086169;WS=48086151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,101:0.51:199
chr7	48089394	rs909059	T	C	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=947;ReadPosRankSum=0.702;SC=AAGCTTTGTATCTTTGCTACC;SOR=0.401;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=59;WE=48089402;WS=48089384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr7	48089487	rs61749572	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=912;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CTGAGGCTACCGGCCATTGAC;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=57;WE=48089495;WS=48089477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,63:0.42:149
chr7	48089542	rs2686788	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=867;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GCCCTAAGAATCCTGCAGGAA;SOR=1.049;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=54;WE=48089550;WS=48089532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr7	48089571	rs2708890	C	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.856;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=609;ReadPosRankSum=-1.411;SC=TCCTTCCCCCCCGTGTAAGTG;SOR=1.429;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=37;WE=48089579;WS=48089561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr7	48092257	rs142301868	C	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=0.143;SC=TATCATTAACCCTTGTACTTA;SOR=0.646;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=24;WE=48092265;WS=48092247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr7	48092486	rs2686791	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=449;ReadPosRankSum=0.206;SC=GGCTCCAGGATGCAGAGGCTT;SOR=0.575;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=29;WE=48092494;WS=48092476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr7	48092847	rs2686792	C	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.619;SC=CAGATCCAAACAATGTTGACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=48092855;WS=48092837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	48211301	rs141832114	C	T	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=76;SC=AATCAAAACCCGTCCCAAGGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=48211309;WS=48211291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	48232530	.	AT	A	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr7	48237721	rs28637820	G	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=0.678;SC=TAAATTAATAGCAAGGTTAAT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=48237729;WS=48237711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr7	48237802	rs2188	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=899;ReadPosRankSum=1.804;SC=AGCAGGTATACGGACTCATTT;SOR=1.617;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=46;WE=48237810;WS=48237792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr7	48237824	rs17060	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=424;ReadPosRankSum=-1.039;SC=TTCTTTGCATCTATTTCTAGG;SOR=0.568;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=27;WE=48237832;WS=48237814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,37:0.34:108
chr7	48266842	rs150972279	A	AT	1013.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=560;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTTTTGGTGTATTTTTTTTCC;SOR=0.606;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=30;WE=48266850;WS=48266832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,46:0.42:109
chr7	48269679	rs60553397	G	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=844;SC=AAAAAAGTATGAATTGTTTCT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=48269687;WS=48269669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	48285485	rs1880738	C	T	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1676;ReadPosRankSum=-0.818;SC=GCTGTCTGCCCGAATGGTCGT;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=90;WE=48285493;WS=48285475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr7	48312674	rs1358066	G	A	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=42;PP=1855;SC=ATGTCAGTGTGTTCAACAAGT;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=48312682;WS=48312664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	48315796	rs1880736	C	A	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=23;PP=1017;SC=ATATCTAGAGCAGGCAATTTT;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=48315804;WS=48315786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	48318811	rs2222648	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=917;SC=TGTCAACTTACGGGAAGAAAT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=48318819;WS=48318801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr7	48336844	rs6583546	C	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=955;ReadPosRankSum=1.672;SC=CCAAAAGCCTCGAGGAAACTT;SOR=0.814;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=68;WE=48336852;WS=48336834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,83:0.43:193
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chr7	48443176	rs10240195	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=854;ReadPosRankSum=0.560;SC=ATATTTGTGGTTTATAACGAT;SOR=1.242;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=38;WE=48443184;WS=48443166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr7	48443570	rs6978753	G	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=42;PP=1336;SC=TTGTATCCCAGTGAGGCTACA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=48443578;WS=48443560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	48450157	rs17548783	T	C	8551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=140;PP=2965;SC=TGGATGAAGCTGAAGCGCTGA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=275;TCF=135;TCR=140;TR=275;WE=48450165;WS=48450147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr7	48451933	rs78680236	C	CT	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.149;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr7	48520780	rs4472462	A	T	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=54;PP=1285;ReadPosRankSum=1.326;SC=TTGGGTCTTTACTTGTTTGGA;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=44;TCR=123;TR=75;WE=48520788;WS=48520770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr7	48545976	rs6583448	A	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=48;PP=2297;SC=CTTGCTGAACAAGGACAAGAT;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=48545984;WS=48545966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	48559580	rs62447308	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-0.084;SC=ATTGGTATATATTATGAAAAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=4;WE=48559588;WS=48559570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr7	48559666	rs62447309	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=665;ReadPosRankSum=0.745;SC=ATGTCCTCAAGTGGGTCTTTA;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=42;WE=48559674;WS=48559656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr7	48559696	rs61378229	T	C	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=1028;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CTCAATTCTGTCTTGGTCAAG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=65;WE=48559704;WS=48559686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,75:0.57:131
chr7	48559905	rs34364517	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GTTCTGAAGGACTCATCCTCG;SOR=1.095;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=11;WE=48559913;WS=48559895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	48563752	rs11185607	A	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGATATCTTCAATTTTTTACA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=48563760;WS=48563742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr7	48563913	rs61705907	A	G	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1165;ReadPosRankSum=0.985;SC=AGGAAAAGAGAGTGTTTGAAG;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=71;WE=48563921;WS=48563903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,87:0.57:153
chr7	48654746	rs10255431	C	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=595;SC=GATTTGGTTACCATGAGATTT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=48654754;WS=48654736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	48654761	rs10243913	G	A	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=755;SC=AGATTTCTGTGTAAAAAAATT;SOR=3.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=48654769;WS=48654751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	48684240	.	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=0.837;SC=ATTAGAATATCATGTGCCAAA;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=11;WE=48684248;WS=48684230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr7	48886140	.	T	C	938	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=43.21;NF=35;NR=14;PP=938;QD=19.8524737255;SC=TGATTGTCTTTGCCTTTTCAG;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=49;WE=48886148;WS=48886130;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:104,49:0.32:153
chr7	48886193	rs3814470	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.90;MQRankSum=-7.151;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,31:0.19:159
chr7	48886383	rs146940015	G	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.63;QD=27.97;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	48886487	rs62454385	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.39;QD=28.48;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	48886607	rs28657654	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=5.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQRankSum=-4.409;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.335;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr7	48886648	rs71537796	G	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.97;QD=30.42;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	48886746	rs4320498	C	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=3.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.22;MQRankSum=-5.626;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.236;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr7	48887548	rs4404869	G	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.035;NF=18;NR=34;PP=661;ReadPosRankSum=-1.474;SC=CGTCGTCCTGGGGGTCCCAGC;SOR=0.947;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=52;WE=48887556;WS=48887538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr7	48964172	rs6945680	G	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=316;ReadPosRankSum=0.501;SC=TGGCCGCGGCGGCCTCCAGGA;SOR=1.018;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=22;WE=48964180;WS=48964162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
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chr7	48964234	rs13312555	C	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=392;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CACTGCTCGCCGCGCTGCTCT;SOR=1.279;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=20;WE=48964242;WS=48964224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
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chr7	48965000	rs10259692	G	A	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.430;NF=27;NR=28;PP=1036;ReadPosRankSum=1.295;SC=AACGCTTTACGGATGCTGGCT;SOR=0.469;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=55;WE=48965008;WS=48964990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr7	48965427	rs145470654	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=20.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQRankSum=-6.622;QD=1.33;ReadPosRankSum=-3.207;SOR=2.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,14:0.13:107
chr7	49815391	.	G	A	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CCCCGCAGGCGGAAGCCCTGG;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=65;WE=49815399;WS=49815381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr7	49951542	.	CAT	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	49951544	.	T	C	126	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=126;QD=22.9673160782;SC=CACACACACATATATATACTG;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=49951552;WS=49951534;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,7:0.64:11
chr7	50023122	rs988392	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=256;ReadPosRankSum=0.289;SC=TAGCCTAAAACATAAATACAA;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=16;WE=50023130;WS=50023112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	50097781	.	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=268;ReadPosRankSum=-1.022;SC=AATTACATGAGACAAGTACCA;SOR=0.776;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=15;WE=50097789;WS=50097771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr7	50121269	rs3807322	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.431;SC=AAAAAGAATTGAGGAAATAAC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=50121277;WS=50121259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	50144059	rs3034461	T	TTA	260.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=4;PP=162;SC=TTTCATTGTATTATATATATA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=50144067;WS=50144049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	50156916	rs6959792	C	G	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=44;PP=2069;SC=AGTAGCTAAGCCATATTTTAA;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=50156924;WS=50156906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	50169508	rs1456900	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=466;SC=GACATCAAACGCAGACATTTA;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=50169516;WS=50169498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	50169595	rs1456899	T	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=167;SC=AATAAAACCATAACAGAAAGT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=50169603;WS=50169585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	50173777	rs998928	A	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=799;ReadPosRankSum=0.982;SC=ATTGGAAAAAACCGCTGACCC;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=51;WE=50173785;WS=50173767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,58:0.45:130
chr7	50175654	rs12718244	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=559;ReadPosRankSum=-1.500;SC=AAATTATAACGTGCTCATTAA;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=43;WE=50175662;WS=50175644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr7	50175681	rs12672941	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=662;ReadPosRankSum=1.006;SC=TTGATTTTGACGATTATTTTT;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=45;WE=50175689;WS=50175671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr7	50179609	rs1993445	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAATCACAAACCTTTAAAGGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=50179617;WS=50179604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	50180972	rs1456908	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=857;ReadPosRankSum=0.125;SC=CCTCTTTATACAAACACAAGT;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=55;WE=50180980;WS=50180962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,75:0.52:144
chr7	50191216	rs10260654	G	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=954;ReadPosRankSum=0.649;SC=CCTAATTGTGGTTATTCCATT;SOR=0.261;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=94;TCF=14;TCR=80;TR=53;WE=50191224;WS=50191206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr7	50198626	rs4917120	T	C	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=43;PP=2148;SC=CTCCTTTTTTTCCCATCCTGC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=103;WE=50198634;WS=50198616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	50367656	rs36178128	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=225;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GCAGGAATATCAAATGTTATG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=50367664;WS=50367646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	50435777	rs12669559	T	G	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=34;PP=1735;SC=AGTATATGCCTTGCTTCTGGA;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=50435785;WS=50435767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	50436033	rs10899750	A	G	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=67;PP=2112;SC=GTTACTTCGCAGATGCTGCTG;SOR=1.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=99;WE=50436041;WS=50436023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	50450446	rs113962761	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=247;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CTGGGTGTCCCGGGATTCCTC;SOR=0.430;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=13;WE=50450454;WS=50450436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	50537983	rs3757472	A	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CTGGTGGCCAACCTGCTCCCA;SOR=0.945;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=26;WE=50537991;WS=50537973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
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chr7	50544314	rs4490786	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.193;NF=20;NR=16;PP=546;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GTGGAATCTCCCACTTACCCG;SOR=0.504;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=36;WE=50544322;WS=50544304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
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chr7	50660787	rs3807550	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=604;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TCTGCCCGTCGTCCTCGCACT;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=38;WE=50660795;WS=50660777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr7	50660901	.	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TTGATTCCAGAGGGACACACA;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=50660909;WS=50660891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	50663279	rs67197412	ATC	A	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=593;ReadPosRankSum=-1.053;SC=TCTGGAACTAATCACACACAC;SOR=0.216;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=14;WE=50663288;WS=50663269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr7	50663299	.	T	TAC	170	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=170;QD=24.7142857143;SC=CACACTCTCTTACACACACAC;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=50663307;WS=50663289;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,7:0.35:20
chr7	50671481	rs7456867	C	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=294;SC=TACAGATACACTCTGGGCAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=50671489;WS=50671475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	50672907	rs4947709	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.565;SC=CGCATAGAGCTGTTCCTCTGG;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=50672915;WS=50672899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	50673029	rs4947710	T	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=789;ReadPosRankSum=0.555;SC=TCTGGGCCTCTGCCGGATTCT;SOR=0.514;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=60;WE=50673037;WS=50673019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,77:0.48:161
chr7	50685602	rs11770199	T	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TTTTAATTTCTGGTTACTCTA;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=50685610;WS=50685592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr7	50685625	rs2240498	A	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=827;SC=CCCTCCCCCCAACCACCCCTC;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=50685633;WS=50685615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	50694457	rs1468450	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=-1.028;SC=TGGCAGCAGCAGTCTTCATTC;SOR=0.037;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=50694465;WS=50694454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr7	50737384	rs2072235	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=0.645;SC=TCTGGCATATCCCTCAGCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=10;WE=50737392;WS=50737374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr7	50742118	rs2715128	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=255;SC=CTCTGCCCATAAGGCCTGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=50742126;WS=50742108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	50742180	rs1800504	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=313;ReadPosRankSum=1.171;SC=CCCTCTGCCTCGGGGACACCT;SOR=0.525;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=19;WE=50742188;WS=50742170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr7	50799889	rs2074777	C	T	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=376;SC=AGAAACGATCCATGGCTGCTG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=50799897;WS=50799879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	50800169	rs2108350	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=532;SC=CAGCTCTTGGTCTTAGCTTGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=50800177;WS=50800159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	51085127	rs3214180	A	AT	3865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=45;PP=2862;SC=AACTGTGCGCATTTGGCCTGT;SOR=1.112;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=69;WE=51085135;WS=51085117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	51093013	rs2240087	A	T	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=599;SC=CCGAGCCCTGAGCAGAGAGTG;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=51093021;WS=51093003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	51097063	rs10230120	T	G	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=73;PP=2965;SC=CGCCAGGGAGTCTCTCCTGCT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=151;WE=51097071;WS=51097053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	51098567	rs142060269	GTCT	G	3723.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.22;MQRankSum=1.874;NF=8;NR=43;PP=2059;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CAATTAATAGGTCTTCTTCAT;SOR=0.584;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=14;TCR=90;TR=51;WE=51098577;WS=51098557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr7	51287410	rs73120437	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=784;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GTGAGTACAGCGACTCCTCCT;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=52;WE=51287418;WS=51287400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr7	51287470	rs801142	A	G	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=63;PP=2057;SC=TCTCCAGCCCACTAGGCAGGA;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=110;WE=51287478;WS=51287460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	53103425	rs10229800	C	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=767;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGCGGGAGAACCCCTGCTGCA;SOR=0.678;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=46;WE=53103433;WS=53103415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
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chr7	54621526	rs662136	T	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=952;ReadPosRankSum=-0.876;SC=ATATACTAAGTCATTCTCTAC;SOR=0.586;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=51;WE=54621534;WS=54621516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr7	54820186	rs6952793	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=389;SC=TTGAAATGCAATATGCTATAA;SOR=2.636;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=54820194;WS=54820176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	55002065	.	A	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=305;ReadPosRankSum=0.397;SC=CTTGTAGTGGAAACATCAGCA;SOR=0.845;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=21;WE=55002073;WS=55002055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr7	55002836	rs35747839	G	GA	1108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.410;NF=14;NR=7;PP=1312;ReadPosRankSum=0.579;SC=ATAAATAGTTGAAAATCCAAA;SOR=0.434;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=21;WE=55002849;WS=55002826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr7	55002841	rs2330916	T	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.491;NF=19;NR=7;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TAGTTGAAAATCCAAAGAAAA;SOR=0.467;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=26;WE=55002849;WS=55002826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr7	55004546	rs2005868	C	T	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.86;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=543;ReadPosRankSum=-0.251;SC=ATTTTAAAAACAATTGAAGCT;SOR=0.710;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=37;WE=55004554;WS=55004536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr7	55086780	rs712830	A	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TGAGCGCCCGACGCGGCCGAG;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=55086788;WS=55086770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr7	55221655	rs4947986	G	A	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=12;PP=1436;SC=CGTGTGTGGCGCTGAGTGTAC;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=55221663;WS=55221645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr7	55229255	rs2227983	G	A	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1232;ReadPosRankSum=0.676;SC=CCGGAGCCCAGGGACTGCGTC;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=101;TCR=46;TR=76;WE=55229263;WS=55229245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,92:0.52:178
chr7	55233863	rs9649769	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=0.191;SC=AAAACAAAAAAAAAAGCTACT;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=55233871;WS=55233853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	55237977	rs17336974	T	C	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=855;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CATATTGAAATGTACTTGTCC;SOR=1.213;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=62;WE=55237985;WS=55237967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr7	55238268	rs10228436	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=212;ReadPosRankSum=0.243;SC=TGTTCCCCCCGCTTTTCCTTT;SOR=0.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=15;WE=55238276;WS=55238258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr7	55238874	rs2227984	T	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=737;ReadPosRankSum=0.589;SC=ACAGATGCACTGGGCCAGGTC;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=46;WE=55238882;WS=55238864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr7	55239080	rs17290260	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CTGGTTCCACGTGGCTCCACG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=55239088;WS=55239070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	55240461	rs2241055	G	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=448;ReadPosRankSum=1.399;SC=ATGAGGAAAAGTGTGCCTGGT;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=26;WE=55240469;WS=55240451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr7	55242609	rs2017000	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GACCCTGCTCATCTCCACATC;SOR=0.314;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=55242617;WS=55242599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr7	55266417	rs1140475	T	C	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=72;PP=2538;SC=CAGGGGTGACTGTTTGGGAGT;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=55266425;WS=55266407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	55268916	rs2293347	C	T	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=54;PP=2103;SC=GTCCTACAGACTCCAACTTCT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=112;WE=55268924;WS=55268906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
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chr7	55433880	rs2272262	G	C	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
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chr7	55540791	rs712819	G	C	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=954;ReadPosRankSum=2.259;SC=CCATCACACCGCAAGTATGTG;SOR=0.479;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=56;WE=55540799;WS=55540781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr7	55605063	rs73139624	G	T	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=19;PP=1218;ReadPosRankSum=0.105;SC=CAACAAGTCAGACCACTGATT;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=105;TCR=37;TR=74;WE=55605071;WS=55605053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,83:0.52:161
chr7	55620398	rs73141718	C	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=453;ReadPosRankSum=2.124;SC=GGAGCCCCAGCCCCTCCGAAG;SOR=1.426;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=27;WE=55620406;WS=55620388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr7	55750390	rs11238374	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=86;PP=2965;SC=TAAATTCCTCAGCTGTGACCT;SOR=1.346;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=150;WE=55750398;WS=55750380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	55774755	rs112151645	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=-0.249;SC=GAAAATGCCAACTATAAATCA;SOR=0.112;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=13;WE=55774763;WS=55774752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr7	55779220	rs12536949	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.065;NF=7;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=0.590;SC=TAATGAGAAAAGGAAAAAGTT;SOR=1.055;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=28;WE=55779228;WS=55779210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr7	55780176	rs10267547	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.310;NF=22;NR=6;PP=459;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CTGCCATGAATGACAGGACTT;SOR=1.473;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=28;WE=55780184;WS=55780166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr7	55780845	rs77949648	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.670;NF=30;NR=17;PP=624;ReadPosRankSum=-1.385;SC=CTTCACGAAATGTCTCTCGTT;SOR=0.954;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=47;WE=55780853;WS=55780835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,32:0.25:128
chr7	55991292	rs2174460	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=279;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGTTACTCCTGTGAATAGGGT;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=22;WE=55991300;WS=55991282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr7	56022981	rs15892	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=0.911;SC=CTGTGGTGTTTATGAAATAGC;SOR=0.124;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=56022989;WS=56022971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr7	56047572	rs60160896	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=799;ReadPosRankSum=0.587;SC=CTTACAATCTCCATTCAGGTA;SOR=1.299;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=51;WE=56047580;WS=56047562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr7	56049720	rs6947109	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	56049990	rs66485869	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=-0.119;SC=ATATTGAAAAATGTTTACTTA;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=18;WE=56049998;WS=56049980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr7	56059591	rs10435504	G	C	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=49;PP=1922;SC=AGTATGTTTTGTTTGCCTACC;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=56059599;WS=56059581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr7	56079536	.	A	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.884;NF=22;NR=34;PP=826;ReadPosRankSum=0.134;SC=GCCTGATCACATTTCCTCCAA;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=56;WE=56079544;WS=56079526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,75:0.55:136
chr7	56119730	rs3735665	T	A	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=95;PP=2779;SC=GCCGCCGCGCTCCTGGCGGGC;SOR=1.413;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=50;TCR=95;TR=145;WE=56119738;WS=56119720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	56119836	rs7780755	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=102;ReadPosRankSum=1.915;SC=TAAGCCCCACCGTCCCGGCCA;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=56119844;WS=56119826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	56122058	rs6593297	A	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=53.13;NF=7;NR=2;PP=168;SC=TTTTCTACTTACAGCAAATTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=56122066;WS=56122051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	56126360	rs2230197	T	C	6879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=105;PP=2965;SC=AAGGCATAGTTGCTCTGCGCA;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=214;WE=56126368;WS=56126350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr7	56131910	rs62457279	C	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GTGGCGCAGCCTGCGCATGTG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=56131918;WS=56131900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr7	56136260	rs4245575	C	A	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=68;PP=2383;SC=GAGATGGTGACGGGCCTGTGC;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=109;WE=56136268;WS=56136250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	56142519	rs4948104	A	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.92;NF=8;NR=46;PP=1328;SC=GGCTGGGCGCAGTGGCTTATG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=54;WE=56142527;WS=56142509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr7	56146310	rs11765364	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=0.852;SC=CTGTGTGTGATGAGCTGGTCC;SOR=0.542;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=23;WE=56146318;WS=56146300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr7	56149362	rs11238393	C	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=322;ReadPosRankSum=0.296;SC=GCACTTCCTCCACCAAGTACT;SOR=0.171;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=21;WE=56149370;WS=56149352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr7	56149410	rs12538444	G	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=584;ReadPosRankSum=1.928;SC=CTTCCGCTGTGTAGCGGTTCT;SOR=0.458;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=33;WE=56149418;WS=56149400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr7	56149847	rs17172508	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=929;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CCTTTCCCGGCGCACTCACAT;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=62;WE=56149855;WS=56149837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr7	56151489	rs2242508	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=534;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GCTGCCTTCCACCCTGATACC;SOR=0.660;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=39;WE=56151497;WS=56151479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,52:0.42:124
chr7	56151533	rs62457291	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=1.008;SC=TCCGTGGAGAACCACAGTCTG;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=33;WE=56151541;WS=56151523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr7	56155219	rs6945795	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=317;ReadPosRankSum=0.295;SC=TGGGGCCACACTCCCTGGCTT;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=18;WE=56155227;WS=56155209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr7	56171760	rs6593298	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=1.168;SC=GGCCTAAGGCAGTAACTCAAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=56171768;WS=56171750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr7	56174115	rs10043	A	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=560;ReadPosRankSum=1.230;SC=ATCCTAGGTAAGCGACGGCTA;SOR=0.621;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=43;WE=56174123;WS=56174105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr7	56174140	rs816407	G	T	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=885;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TCCGGACGTGGGACAACCACC;SOR=0.968;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=60;WE=56174148;WS=56174130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,73:0.60:121
chr7	56717637	rs1906630	T	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=712;ReadPosRankSum=-1.576;SC=GGGATCCGTCTTTTGTGTCAT;SOR=0.339;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=45;WE=56717645;WS=56717627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr7	56717788	rs1849659	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.460;NF=7;NR=21;PP=585;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GAAAAAAATAACATGACTCTT;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=28;WE=56717796;WS=56717778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr7	57069935	rs1966122	G	C	156.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=132;SC=GGGCGGTGGGGGGAGCTCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=57069943;WS=57069925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	57071671	.	T	C	328	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=24;MQ=50.04;NF=9;NR=4;PP=328;QD=27.9054778882;SC=GCAGCAGCAGTGGCTCGGAGA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=57071679;WS=57071661;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	57071725	rs62463099	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=16;NR=16;PP=829;SC=ACGGGGGCTGCGGCGCCGGGG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=57071733;WS=57071706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	57188016	rs78588121	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.630;NF=27;NR=24;PP=822;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CCTATGTCTCATAAGGTTCGA;SOR=1.504;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=51;WE=57188024;WS=57188006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr7	57188144	.	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;MQRankSum=-0.710;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,10:0.14:71
chr7	57188148	.	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQRankSum=-0.635;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,10:0.14:70
chr7	57188718	rs62464802	T	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.611;NF=47;NR=55;PP=1652;ReadPosRankSum=0.062;SC=GTGCACCTCATATTCACCCAC;SOR=0.612;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=230;TCF=102;TCR=128;TR=102;WE=57188726;WS=57188708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,116:0.45:260
chr7	57233554	rs34820155	G	C	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=722;ReadPosRankSum=-1.645;SC=GATTAACATTGGTTAAGTCCA;SOR=0.548;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=61;WE=57233562;WS=57233544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr7	57245247	rs11763159	A	G	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=61;PP=2231;SC=TAGGGTGTGAAGATTGTGGTT;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=46;TCR=61;TR=107;WE=57245255;WS=57245237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	57528997	rs10272498	T	C	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=44;PP=2420;SC=CGTGGCAAAGTCTTTAGCCGC;SOR=0.827;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=95;WE=57529005;WS=57528987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	57529392	rs13235676	A	C	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=51;PP=2169;SC=GAAACCCTACAAATGTGAAGA;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=57529400;WS=57529382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	62910311	rs139704667	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=66.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQRankSum=-9.259;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=6.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,30:0.13:232
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chr7	63033167	.	T	TGAGGAG	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQRankSum=-1.236;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.818;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr7	63033229	.	T	TACGGCCCCCGGCGCC	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-4.719;QD=21.06;ReadPosRankSum=-1.454;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
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chr7	63033612	rs117248401	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=6.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=1.676;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.938;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,22:0.15:143
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chr7	63529956	rs4349869	G	A	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=50;PP=2187;SC=CTTGGAATGCGAGGAGACAGA;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=109;WE=63529964;WS=63529946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	63537638	rs34875861	CT	C	692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=24.74;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	63537815	rs191479252	T	C	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.976;NF=51;NR=45;PP=1596;ReadPosRankSum=1.267;SC=GAAAAGCAGTTATAATGGCAT;SOR=0.595;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=96;WE=63537823;WS=63537805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,126:0.51:248
chr7	63537849	rs4717170	G	A	7157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=103;PP=2965;SC=TCAGCTACCCGTAGCAAAACC;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=210;WE=63537857;WS=63537839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr7	63538924	rs28360698	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.136;NF=16;NR=34;PP=869;ReadPosRankSum=1.016;SC=TAAACATAAGGTAATTCATAC;SOR=1.063;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=50;WE=63538932;WS=63538914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,55:0.43:128
chr7	63673608	rs10252019	C	T	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=62;PP=1631;ReadPosRankSum=-1.086;SC=TGAGGTTAACCTCAATACATA;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=77;TCR=116;TR=103;WE=63673616;WS=63673598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,114:0.52:219
chr7	63680401	rs10258764	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.690;NF=35;NR=35;PP=1133;ReadPosRankSum=0.024;SC=GAGAGAAACCCTACACATGTG;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=70;WE=63680409;WS=63680391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,84:0.48:174
chr7	63721420	rs17767341	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=547;ReadPosRankSum=-2.064;SC=AAGAGTTTCTAAGAAGCCCGA;SOR=0.615;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=30;WE=63721428;WS=63721410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr7	63726645	rs1830035	T	C	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1566;ReadPosRankSum=0.047;SC=GGAGAATTCCTACCAATGTGA;SOR=0.516;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=227;TCF=106;TCR=121;TR=95;WE=63726653;WS=63726635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,111:0.42:262
chr7	63726678	rs1830036	T	A	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.077;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.276;SC=ACCCTTCAACTGCTCTTCAAC;SOR=0.506;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=189;TCF=77;TCR=112;TR=77;WE=63726686;WS=63726668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,94:0.42:223
chr7	63774584	rs812337	G	T	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GTTTGAATCCGGCCGGAACCG;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=81;WE=63774592;WS=63774574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,105:0.46:227
chr7	63796822	rs60337982	AT	A	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.743;NF=1;NR=24;PP=565;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TTTTCTTCTGATTTTTTTGGA;SOR=0.866;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=2;TCR=69;TR=25;WE=63796830;WS=63796812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr7	63797256	rs2086168	A	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.153;NF=17;NR=9;PP=421;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TTTTTTTCTAATAAAACAGGT;SOR=0.850;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=26;WE=63797264;WS=63797246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr7	64152353	rs4718101	A	G	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1633;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GTGAGAGTGAAAGTGAATACA;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=111;WE=64152361;WS=64152343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,141:0.52:270
chr7	64166642	rs35661712	T	TG	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=419;ReadPosRankSum=-1.893;SC=AGATTAGATTTTAAAGTACAT;SOR=1.387;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=64166650;WS=64166638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	64166802	rs73138709	G	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=749;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GTGAATATGAGAATTTACAGT;SOR=0.757;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=50;WE=64166810;WS=64166792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr7	64168806	rs4718103	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CAAACCTTACTACACATAAGA;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=52;WE=64168814;WS=64168796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr7	64169019	rs4717205	G	A	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=703;ReadPosRankSum=0.498;SC=ACAAATGTGAGTATGGCAAAA;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=44;WE=64169027;WS=64169009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr7	64169061	rs4717206	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=723;ReadPosRankSum=-1.024;SC=ACTACACATAGGAAAATTCAT;SOR=0.851;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=46;WE=64169069;WS=64169051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr7	64254791	rs10949938	G	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=32;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TCTTCCGGGAGGCGGCGGGGT;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=116;TCR=69;TR=89;WE=64254799;WS=64254781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,98:0.49:202
chr7	64254901	rs11983033	T	C	4109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=73;PP=2294;ReadPosRankSum=-1.182;SC=ATCTGGTTATTGGGAGATTCA;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=317;TCF=175;TCR=142;TR=159;WE=64254909;WS=64254891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,194:0.50:388
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chr7	64291267	rs6460194	A	T	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=21;PP=1321;SC=TTCTTGTTTCATCTTAATAGT;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=64291275;WS=64291257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	64291333	rs4483043	T	A	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=44;PP=1840;SC=GCATTTACCTTTGATCTCAGT;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=95;WE=64291341;WS=64291323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	64291976	rs10949946	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=955;ReadPosRankSum=-2.959;SC=GAGTGTAAGGGACACCAAGGA;SOR=0.904;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=63;WE=64291984;WS=64291966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,69:0.51:135
chr7	64291991	rs4236203	T	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=64;PP=2173;SC=CAAGGAGGTTTTAATGGACTT;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=102;WE=64291999;WS=64291981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	64312707	rs7804955	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=2.210;SC=TAGTCTTTAATTGAAGCGATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=64312715;WS=64312697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	64389089	rs2017252	A	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=638;ReadPosRankSum=1.005;SC=ACAAATGTGAAGAATGTGGCA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=50;WE=64389097;WS=64389079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr7	64437406	rs4607487	A	G	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=67;PP=2714;SC=GTTTGAGGATAAGTTAAAAGC;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=125;WE=64437414;WS=64437396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr7	64437648	rs10949955	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=1.171;SC=GGTCTGTAAGGTTTGAAGATC;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=16;WE=64437656;WS=64437638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr7	64438403	rs4718175	G	A	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=23;PP=1108;SC=TGTTTAGTAAGGGTTGAGAAA;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=64438411;WS=64438393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	64438667	rs1404453	G	A	4480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=57;PP=2965;SC=GTTGAAGATCGGTTAAAGGCT;SOR=0.944;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=131;WE=64438675;WS=64438657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	64439613	rs3807068	T	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=498;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TGCGACATTCTTTACATTTAA;SOR=0.350;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=30;WE=64439621;WS=64439603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr7	64439701	rs3807069	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=561;ReadPosRankSum=0.945;SC=ATATTTATTACATTGAAATAT;SOR=0.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=32;WE=64439709;WS=64439691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr7	64439938	rs1852016	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=497;SC=AAGTAACAAACTACTTCACTT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=64439946;WS=64439928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	64441632	rs74364613	A	AT	1167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.976;NF=30;NR=6;PP=1275;ReadPosRankSum=1.224;SC=TGAGAGAAAAATAAAAAAAAA;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=36;WE=64441640;WS=64441622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr7	64451558	rs11771269	G	A	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=1226;ReadPosRankSum=1.079;SC=TCCAAGGGATGAGAACCAACC;SOR=0.675;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=93;TCR=43;TR=72;WE=64451566;WS=64451548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr7	64451656	rs4718177	G	A	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1782;ReadPosRankSum=-1.382;SC=TTTCTTTGATGACCTTTCCTT;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=95;TCR=104;TR=106;WE=64451664;WS=64451646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,129:0.52:250
chr7	64451699	rs4717229	T	C	6077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=93;PP=2965;SC=GTTAGTAAGGTTGAACTTTCC;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=180;WE=64451707;WS=64451689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr7	64451963	rs4618579	T	C	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=55;PP=2484;SC=AGGCCATTCATTGTCCTTCCA;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=106;WE=64451971;WS=64451953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	64452738	rs67047829	G	A	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=973;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CCGCTGACTCGTGCCCCTAGC;SOR=0.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=61;WE=64452746;WS=64452728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr7	64452830	rs34639489	C	T	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1559;ReadPosRankSum=-1.564;SC=GCTTGTTTTACAATCTGGTTC;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=212;TCF=117;TCR=95;TR=105;WE=64452838;WS=64452820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,116:0.47:248
chr7	64453136	rs6460219	G	A	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=51;PP=1962;SC=TTCAAACCAGGTCCCAGGTGA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=96;WE=64453144;WS=64453126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr7	64535312	rs71533998	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr7	65157864	rs2671990	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.313;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.056;NF=0;NR=9;PP=96;ReadPosRankSum=-1.039;SC=TTATTTTGCATGGGGTAGGGG;SOR=4.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=9;WE=65157872;WS=65157854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
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chr7	65229721	rs6966573	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.550;NF=5;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=-1.306;SC=CTGGGGAGGTCGCTCTCGGTG;SOR=1.075;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=16;WE=65229729;WS=65229711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
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chr7	65439879	rs781143	G	C	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=669;SC=AAGCAGCCCCGACAAGGACCC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=65439887;WS=65439869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	65444359	rs139791587	T	TGA	1068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=996;SC=TGGGCCCCGCTGAGAGGATCC;SOR=3.014;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=20;WE=65444367;WS=65444349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr7	65541307	rs1144895	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=-0.331;SC=GGCAAACCCACCAACCCACAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=4;WE=65541315;WS=65541297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr7	65551931	rs313830	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=452;SC=AGCGGGGGACTCTGCATGGAG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=65551939;WS=65551921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	65552230	.	CGTGT	C	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=0.909;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr7	65552497	rs313829	A	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=579;SC=TTCATTGCCTATGGGCACTGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=65552505;WS=65552487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr7	65554385	rs2460432	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=285;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CACACTCAGGCAGGGCCCCAC;SOR=0.506;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=19;WE=65554393;WS=65554375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr7	65556936	rs1167406	G	C	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=518;ReadPosRankSum=1.371;SC=TCCTGGGCCTGGCAGCTTCAG;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=32;WE=65556944;WS=65556926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
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chr7	65599446	rs6958484	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=1.306;SC=ATTGATATTCGGCTGGGTTTG;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=65599454;WS=65599436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr7	65841981	rs6974355	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=182;ReadPosRankSum=1.412;SC=GGCCTAGAGAAGCCTTCGGGA;SOR=0.474;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=12;WE=65841989;WS=65841971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
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chr7	65842221	rs11765965	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=1.136;SC=GGGCCGCCGGAAAGCCGAAGG;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=8;WE=65842229;WS=65842211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr7	65842543	rs112115083	C	CAT	4106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.732;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.644;NF=17;NR=47;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.050;SC=ATCCAACACACGTGCTGTTCC;SOR=0.909;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=40;TCR=112;TR=64;WE=65842553;WS=65842533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,110:0.43:257
chr7	65842545	rs3815685	T	C	4115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.642;NF=34;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CCAACACACGTGCTGTTCCTG;SOR=0.911;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=206;TCF=99;TCR=107;TR=81;WE=65842553;WS=65842533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,111:0.43:259
chr7	65842744	rs73148625	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-1.662;SC=GCAGGATCTCGGCCTGTGGAG;SOR=0.425;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=6;WE=65842752;WS=65842734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	66094008	rs35526611	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr7	66098482	rs3764903	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=0.567;SC=GGTGATTAGCGTAGGCTTGAG;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=21;WE=66098490;WS=66098472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr7	66136372	rs148855688	G	GACC	1044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=612;ReadPosRankSum=1.053;SC=CATCTGTGTGGAGAGGAATAA;SOR=0.873;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=13;WE=66136380;WS=66136362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr7	66136549	rs2707832	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=0.053;SC=GACTGATATAGTGTTGTTCTC;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=6;WE=66136557;WS=66136539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	66147057	rs1882655	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=306;ReadPosRankSum=-2.369;SC=CCGGAAGTGATGTTTGCGCGC;SOR=1.306;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=23;WE=66147065;WS=66147047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr7	66147101	rs2420827	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.985;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr7	66147110	rs3800823	C	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.507;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr7	66147149	rs3800822	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=451;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GGACTGGGGAACCCAGACCTG;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=31;WE=66147157;WS=66147139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr7	66147178	rs3800820	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=431;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CGTGGGCGAGCGGTGACCTGG;SOR=0.617;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=30;WE=66147186;WS=66147168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr7	66147656	rs2003301	G	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.422;NF=17;NR=21;PP=579;ReadPosRankSum=1.133;SC=AACGCGCCGGGATGGGACGCT;SOR=0.568;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=38;WE=66147664;WS=66147646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr7	66147697	rs5884599	A	AG	2223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=33.19;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	66147746	rs2003300	C	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.156;NF=4;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AGAAGCGTCCCGGAGTTGGGA;SOR=0.705;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=19;WE=66147754;WS=66147736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr7	66409881	rs35111158	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=362;ReadPosRankSum=0.507;SC=CTGCGGTGCCACACTGGGGTC;SOR=0.970;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=25;WE=66409889;WS=66409871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr7	66463195	rs145124227	A	AT	1150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.667;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.316;NF=2;NR=30;PP=685;ReadPosRankSum=-1.478;SC=AAGTGGAGTTATTTTTTTTTT;SOR=1.714;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=32;WE=66463203;WS=66463185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr7	66520726	.	CAAA	C,CAA	945.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.09;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=1;PP=231;SC=AATAATTTAGCAAAAAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=14;WE=66520749;WS=66520716;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:20
chr7	66520740	.	AA	TT	207	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=14;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=56.31;NF=19;NR=1;PP=207;QD=13.0233937431;SC=AAAAAAAAAAAATTTTTGCTA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=20;WE=66520749;WS=66520716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,20:0.80:25
chr7	66520741	.	A	ATT	1236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.29;QD=42.65;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	66532235	rs2711910	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=19;PP=1457;SC=GTGCTTTGACAATTTTATTCA;SOR=2.239;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=76;WE=66532243;WS=66532225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	66582460	rs35171532	T	A	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.798;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.930;NF=47;NR=23;PP=974;ReadPosRankSum=0.738;SC=TTAAAAAAAATATTACTAAGG;SOR=0.244;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=70;WE=66582468;WS=66582449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr7	66648030	rs2948336	A	G	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=7;PP=1252;SC=GGTTCTCTGGATTGAAAAAGC;SOR=4.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=66648038;WS=66648020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	66648157	rs4145350	C	T	4978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=69;PP=2940;SC=AAGCATGGAACGTGGACGAGC;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=66648165;WS=66648147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr7	66648199	rs55756354	G	A	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=81;PP=2945;SC=TGTCCCTGGGGAATCCTGACT;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=151;WE=66648207;WS=66648189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	66660045	rs55921608	C	T	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=132;SC=CTGTAAAATACGGACTGGATT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=66660053;WS=66660035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	66660078	rs56035776	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=445;SC=CTCAAGAAGGTTTTCCGGCTC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=66660086;WS=66660068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	66660242	rs2949097	A	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.00;QD=38.11;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	66660247	rs55673383	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.30;QD=44.99;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	66660360	rs34574768	C	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=574;SC=TTCTGTTCCCCGACCCTGCTG;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=66660368;WS=66660350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	66660377	rs35290283	C	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=596;SC=GCTGTTCTTTCCTTCTCTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=66660385;WS=66660367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	66703238	rs201456718	A	AT	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.879;NF=13;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=1.863;SC=AAAAACATTCATTTTTTTTTT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=13;WE=66703246;WS=66703228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	66703328	rs139935023	G	A	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.38;QD=29.33;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr7	66770958	.	ATTT	A	3407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.892;NF=38;NR=17;PP=1019;ReadPosRankSum=1.837;SC=AGTCATCTGTATTTTTTTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=83;TCR=36;TR=55;WE=66770968;WS=66770948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,88:0.56:156
chr7	66773745	rs7791853	G	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=578;SC=TTAGAAGGTGGAGTTCAGTCT;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=66773753;WS=66773735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	66774157	rs2041575	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=460;SC=CGGACATTCTTCTGGGGATTT;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=66774165;WS=66774147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	66774604	rs1045513	G	C	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=41;PP=1791;SC=GAGTCTGCACGAAGATATCAA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=66774612;WS=66774594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	66785029	rs2537522	G	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=970;SC=CGGGTTCTTAGAATAGCAATG;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=66785037;WS=66785019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	66785137	rs9443	C	A	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=66;PP=2722;SC=ATGAGACATGCGATATGAGTT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=128;WE=66785145;WS=66785127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	69064698	.	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.492;SC=CGGTCGCAGCGAGACCGGGAG;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=69064706;WS=69064688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr7	70193932	rs4718987	T	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=24;ReadPosRankSum=1.465;SC=ATGTCTCCTCTCCTCCCAGTT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=70193940;WS=70193931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	70194024	rs4718988	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=539;ReadPosRankSum=0.466;SC=TAGCAGCCTGGGAGGAGCCAC;SOR=0.917;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=33;WE=70194032;WS=70194014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr7	70229595	rs1983487	T	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=0;PP=96;SC=GAAAGTGTGCTCGTACAGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=70229603;WS=70229585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	70229715	rs67892322	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.720;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr7	70238858	rs55838430	G	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=269;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CCTTGAGAAAGAGCATGTGTG;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=18;WE=70238866;WS=70238848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr7	70250468	rs146269802	TTG	T	1430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.312;NF=4;NR=23;PP=1033;ReadPosRankSum=1.573;SC=GGTGCATGCTTTGTGTGGCCT;SOR=0.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=27;WE=70250477;WS=70250458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,43:0.37:115
chr7	70251173	rs146678594	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.832;SC=CTTCACAGTGGGGTGAGGTGG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=70251181;WS=70251163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	70252185	rs2293500	A	G	7264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=94;PP=2965;SC=TCTCCACTTCACCATTTCAGC;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=135;TCR=94;TR=229;WE=70252193;WS=70252175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	70254674	rs941346	G	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=438;ReadPosRankSum=0.996;SC=GCAGCCCCTGGCCCGGCCGAC;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=26;WE=70254682;WS=70254664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr7	70597675	rs6957446	T	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=360;ReadPosRankSum=-1.286;SC=GAGCAGGGGCTTGGATCCCTG;SOR=0.114;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=19;WE=70597683;WS=70597665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr7	70598059	rs2903458	A	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=23;PP=763;SC=CCGGGGCTCGACGCGGGCGGG;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=70598067;WS=70598049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	70765503	rs7806503	C	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GTTATTTTCTCATCCTAATAA;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=26;WE=70765511;WS=70765493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr7	70772565	rs55690472	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.566;SC=GCAATCGAGGAAGACTTCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=70772573;WS=70772555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	70800407	rs13240200	T	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.087;SC=CTGAGTTGGATAAATTGAGGA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=70800415;WS=70800397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	70885883	rs11455717	C	CT	2341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GTCTATTTCTCTATGTTTCAG;SOR=0.412;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=37;WE=70885891;WS=70885873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr7	70886107	rs11455716	G	GC	1443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=1462;SC=TGGCTGGTGAGCCTGGCGGCC;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=33;WE=70886115;WS=70886097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	71036473	rs10277319	C	T	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=39;PP=1276;SC=ATTTAAAGCTCCTTACAGCTG;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=71036481;WS=71036463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	71142219	rs61740246	C	T	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=33;PP=1476;SC=AGGCAAAAGACGTCTGCTTGG;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=71142227;WS=71142209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	71176900	rs887584	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=291;ReadPosRankSum=0.379;SC=TTTTCTCTTTGTCATTTTCTC;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=19;WE=71176908;WS=71176890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr7	71176919	rs10256176	C	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr7	71177177	rs10226321	G	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5751;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=366;ReadPosRankSum=1.754;SC=GGACATGGCTGCTCCCCCCAA;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=18;WE=71177185;WS=71177167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr7	71571436	rs10950296	G	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.78;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	72081634	rs200419457	T	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.801;NF=44;NR=12;PP=717;ReadPosRankSum=-2.873;SC=GAACAGAAGATTCCATGTTTG;SOR=0.726;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=175;TCF=132;TCR=43;TR=56;WE=72081642;WS=72081624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,38:0.22:171
chr7	72081774	rs3015854	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=12.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-15.575;QD=1.58;ReadPosRankSum=-2.145;SOR=1.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,42:0.17:251
chr7	72304470	rs5884895	GT	G	3301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=48;PP=2366;SC=ACTGATCAAGGTCATAGAAAG;SOR=1.395;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=72304478;WS=72304460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	72395679	rs143666868	C	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.308;NF=25;NR=8;PP=533;ReadPosRankSum=0.911;SC=GCGGCTGCGGCGGCTGGAGCA;SOR=1.176;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=33;WE=72395687;WS=72395669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr7	72413423	rs71554686	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.789;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.524;NF=16;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=0.438;SC=CCATCATATCCGGGAGCCAAC;SOR=0.132;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=18;WE=72413431;WS=72413413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr7	72413443	rs62463429	G	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.612;NF=40;NR=3;PP=853;ReadPosRankSum=1.871;SC=CCCCCAGCCCGCATTTGGGGC;SOR=0.984;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=43;WE=72413451;WS=72413433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr7	72413581	rs71554687	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=42.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-15.902;QD=3.57;ReadPosRankSum=-4.926;SOR=2.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,57:0.22:264
chr7	72413593	rs71554688	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=34.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQRankSum=-15.497;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.931;SOR=2.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,40:0.16:243
chr7	72413874	rs199633193	T	C	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.60;QD=25.40;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	72416333	rs237934	C	G	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=14;PP=442;SC=TCTGAGGCCCCGTGAAGATCA;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=72416341;WS=72416323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	72418963	rs7056	T	C	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=54;PP=2081;SC=GCCCAGGGTCTTCCACGGAGA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=107;WE=72418971;WS=72418953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	72711986	rs62465077	G	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.52;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	72711991	rs62465078	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.52;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	72712121	rs62465079	T	C	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.30;QD=23.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	72738350	rs55963844	C	CG	2228.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=1286;SC=CTGGTCCCCGCGGCCTCTCCA;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=72738358;WS=72738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	72738749	rs28626137	A	G	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=55;PP=1682;SC=CACTGAAGCCAGTCCTCCAGC;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=83;WE=72738771;WS=72738739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	72738762	rs6980258	CA	TG	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=49;PP=2885;SC=CCTCCAGCTCCAGCAGGCTCA;SOR=1.949;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=58;WE=72738771;WS=72738739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	72750627	rs4717751	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=373;SC=TTTACAGCATGGGAATAGGCA;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=72750635;WS=72750617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	72861849	rs2237279	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GGAGGGAACCTGAATGTAAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=72861857;WS=72861839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	72891754	rs2074754	C	T	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1253;ReadPosRankSum=0.312;SC=AGGGGATTTCCGACAGCTTCA;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=74;WE=72891762;WS=72891744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,78:0.48:162
chr7	72936066	rs186853665	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=567;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GCCCCGGGCCGGGGATGCGCG;SOR=0.404;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=36;WE=72936074;WS=72936056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr7	73020301	rs799157	T	C	4200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=44;PP=2201;SC=AGAGAGTGTCTGAGATGTCGG;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=117;WE=73020309;WS=73020291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr7	73084175	rs36067105	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=189;ReadPosRankSum=0.351;SC=TAGGACGAGGAGCAGAAACTT;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=13;WE=73084183;WS=73084165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr7	73084309	rs7795181	G	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=871;ReadPosRankSum=0.257;SC=CAAGCCCGGGGCCCTGGCCTG;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=59;WE=73084317;WS=73084299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,70:0.53:133
chr7	73097238	rs1569062	G	A	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=79;PP=2746;SC=GTTGTTCCCCGTAGTGGGCCT;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=137;WE=73097246;WS=73097228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	73101137	rs11769825	A	G	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=49;PP=1915;SC=GTGTCTGGTCATGTCTTCCAG;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=101;WE=73101145;WS=73101127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	73105144	rs34951011	GT	G	629.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=707;SC=GGGAGGAGGGGTTTCTCTTGG;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=73105152;WS=73105134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	73107003	rs2293490	C	A	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=41;PP=2050;SC=CTGGGTGTGCCGGGGAGTTGG;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=98;WE=73107011;WS=73106993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	73108205	rs2293488	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=8;PP=386;SC=GTTCCTTCTCGTGGGACTGGA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=73108213;WS=73108195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	73108310	rs2293487	T	C	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=25;PP=917;SC=GAGTGCACTTTGGTTCCTGCA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=73108318;WS=73108300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	73117420	rs12539475	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=312;SC=GAAGGGGGCCTGAGGCTTCCT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=73117428;WS=73117410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	73118196	rs4363087	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=593;SC=CCAGCCCTCTTCGGGGAGTTC;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=73118204;WS=73118186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	73118398	rs7807316	T	C	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=72;SC=GCAGCAGCCTTGAGCCACGCA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=73118406;WS=73118388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	73118819	rs72555386	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.977;SC=ACCCGCACACCCAGCATCTAT;SOR=0.779;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=19;WE=73118827;WS=73118809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr7	73150511	rs1059779	T	C	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1087;ReadPosRankSum=0.124;SC=TCTGAGTCCTTCTGTGCCCAA;SOR=0.780;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=74;WE=73150519;WS=73150501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,87:0.45:195
chr7	73151195	rs3215356	AG	A	582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=455;ReadPosRankSum=-1.982;SC=CTCCCCTGGTAGGGTCCCCAG;SOR=0.442;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=13;WE=73151203;WS=73151185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr7	73151644	rs6460052	A	G	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.046;SC=TGGCTGCCACATAGGTTGCAA;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=200;TCF=96;TCR=104;TR=86;WE=73151652;WS=73151634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,109:0.44:245
chr7	73152578	rs367606949	AC	A	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=503;ReadPosRankSum=0.013;SC=GAGAAGCGGGACCCCCCCTGC;SOR=0.346;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=23;WE=73152586;WS=73152568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr7	73153228	rs3812318	G	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=0.056;SC=CTTGAGCCCCGCCCTCTCCCC;SOR=0.307;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=8;WE=73153236;WS=73153218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr7	73183979	rs139191328	G	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CCAGGACACCGGCACGAGGGT;SOR=1.065;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=68;WE=73183987;WS=73183969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,77:0.45:170
chr7	73184435	rs7084	G	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=487;ReadPosRankSum=0.410;SC=GGAGACGAGGGGCCGGGGCCG;SOR=0.685;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=39;WE=73184443;WS=73184425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr7	73243786	rs4717822	T	G	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=69;PP=2248;SC=CCCAGCATGGTTGGGAAGAGA;SOR=1.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=109;WE=73243794;WS=73243776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	73245519	rs8629	T	C	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=56;PP=1803;SC=TCAACTCCCGTGGACGCTGAA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=73245527;WS=73245509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	73249165	rs13246460	T	A	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=91;PP=2877;SC=GGATACCACCTCCAGCTCGGA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=63;TCR=91;TR=154;WE=73249173;WS=73249155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	73249299	rs13232463	G	C	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=679;SC=AAGGTTGGACGAGTTGGTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=73249307;WS=73249289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	73254464	rs73140869	G	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.93;ReadPosRankSum=2.126;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr7	73254812	rs13241921	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=37;PP=1253;SC=GCCGGGGGCCTGGGCCTGTTC;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=73254820;WS=73254802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	73254910	rs13242043	T	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=467;SC=TCAGTCATGGTTCACACCTGC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=73254918;WS=73254900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	73255647	rs4717823	G	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=46;PP=1164;SC=AAGCCTGGCTGGGGCTAGCGT;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=73255655;WS=73255637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	73275396	rs4324825	G	A	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=76;SC=GCAGTGGAGCGGCAGGAGCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=73275404;WS=73275386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	73275501	rs11770024	T	C	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=23;PP=770;SC=TTCTCCCAGCTGGAGTAGGTG;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=73275509;WS=73275491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	73275565	rs11770052	T	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=35;PP=1015;SC=CTTTTGGGGATCCTGTTGCAG;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=73275573;WS=73275555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	73275769	rs11767129	C	T	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=81;SC=AACTACAGTGCTGACATTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=73275777;WS=73275759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr7	73467650	.	CTGTG	C	192	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=58.16;NF=0;NR=5;PP=192;QD=39.0;SC=GTGAGCTGGGCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=5;WE=73467661;WS=73467640;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,5:0.19:26
chr7	73470782	rs2856728	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;ReadPosRankSum=-1.655;SC=CTTAGTCACACCTGGGGACAT;SOR=0.917;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=25;WE=73470790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
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chr7	73481028	rs3757587	C	T	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GTTTCCACCCCTACCAACCCA;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=98;WE=73481036;WS=73481018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,117:0.51:231
chr7	73510891	rs2527839	G	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=278;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GCCGAGGCAGGGGCCCAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=16;WE=73510899;WS=73510881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr7	73530046	rs149618	A	G	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=935;SC=GGCTGTCTACAGGTTGGCTTG;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=73530054;WS=73530036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	73530404	rs2285026	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=331;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CTTCAGTTACCCTGTGGGTCC;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=21;WE=73530412;WS=73530394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr7	73588949	rs12536906	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr7	73752699	rs574637	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.843;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=178;ReadPosRankSum=-0.271;SC=CCTCCCAACCCTAGACTCTGT;SOR=0.055;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=12;WE=73752707;WS=73752689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr7	73753250	rs539518	T	C	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CCGTGAAGACTGGCAACGAGT;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=102;TCR=96;TR=109;WE=73753258;WS=73753240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,128:0.55:231
chr7	73768065	rs504854	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=581;SC=CAATCATCCTTAGGTGTCTCT;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=73768073;WS=73768055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	73800711	rs10156213	C	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=525;SC=CCCAGCGAGACGGCTGGAGTG;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=73800719;WS=73800701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	73803644	rs35415684	T	A	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=494;SC=CCCTTGCTCCTCTTCTTGACA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=73803652;WS=73803634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	73814749	rs2522943	G	C	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=134;PP=2965;SC=CTCATCGACCGGTCCTCGGCG;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=91;TCR=134;TR=225;WE=73814757;WS=73814739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr7	73818404	rs2240436	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=1.407;SC=GGTACAGCCCCGGCCTGACCC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=3;WE=73818412;WS=73818394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	73950361	rs41272924	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=542;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CTGGACGTGGCGCCCACAAGG;SOR=0.058;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=33;WE=73950369;WS=73950351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr7	74114847	rs2301907	T	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.04;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	74167490	rs373607978	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.36;MQRankSum=0.272;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	74191707	rs145170670	C	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.395;NF=17;NR=37;PP=867;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AGTGTGGGGACGGAGGAGGGA;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=54;WE=74191715;WS=74191697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr7	74193668	rs17295741	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.739;NF=14;NR=11;PP=378;ReadPosRankSum=-0.234;SC=CGAGTACTGCGGCACGCTCAT;SOR=0.606;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=25;WE=74193676;WS=74193658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr7	74197598	.	T	A	135.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.04;MQRankSum=-1.465;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.465;SOR=3.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr7	74212048	rs707395	C	T	3231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.612;NF=66;NR=60;PP=1984;ReadPosRankSum=0.181;SC=TTTTCAGGCTCTTCTCAACAC;SOR=0.684;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=253;TCF=131;TCR=122;TR=126;WE=74212056;WS=74212038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,150:0.51:293
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chr7	74489486	rs6955671	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=274;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CGGGAGCGCCTGGCCGCCGTC;SOR=0.480;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=28;WE=74489494;WS=74489476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
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chr7	75051324	rs117499978	G	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.203;NF=8;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=-1.986;SC=CCGGGGCCGGGGCTGCAGAGT;SOR=1.066;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=25;WE=75051332;WS=75051314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr7	75051368	rs398003	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.003;HP=5;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.789;NF=2;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=1.490;SC=AAGCTGGGGGTAAGGGCTGGC;SOR=1.562;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=13;WE=75051383;WS=75051358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr7	75051375	rs398016	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.043;NF=7;NR=16;PP=669;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GGGTAAGGGCTGGCTTGGCGG;SOR=0.407;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=23;WE=75051383;WS=75051358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr7	75053925	rs200995270	AAAG	A	1328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.414;NF=0;NR=29;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CCAAAGAGAAAAAGAAGAAGT;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=29;WE=75053935;WS=75053915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr7	75055097	rs374900785	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.20;MQRankSum=-0.524;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	75071964	rs376646711	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.758;NF=12;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=1.633;SC=GCCGCTCGCCTGCTCCAGCCG;SOR=0.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=27;WE=75071972;WS=75071954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr7	75115201	rs186328613	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.825;NF=3;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GGGCTGCTGTCGCTGGCGCGC;SOR=1.270;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=10;WE=75115209;WS=75115191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	75145266	rs5884966	TA	T	1780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=44;PP=1888;SC=CATTTTTTTTTAACCTTATCA;SOR=3.171;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=75145274;WS=75145256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	75168562	rs1167835	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=355;ReadPosRankSum=-1.669;SC=TCCTTGTTCTGTTCCATTCTA;SOR=2.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=18;WE=75168570;WS=75168554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr7	75171422	rs1167793	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=0.899;SC=ACTGCATGAAAGTAACTGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=8;WE=75171430;WS=75171412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	75171438	rs11773745	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TGAGGGGGCCGGACAACGGTG;SOR=0.132;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=6;WE=75171446;WS=75171428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	75172270	rs1167794	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=761;ReadPosRankSum=0.998;SC=GGGCTAGGTTGGGGCTGTCCT;SOR=0.490;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=47;WE=75172278;WS=75172260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr7	75174299	rs139593228	A	AT	395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TAAGGGACAGATTTTTTTTTC;SOR=0.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=15;WE=75174307;WS=75174289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr7	75176196	rs1167800	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=415;SC=GTCTGTCACCGATGCCTCCTC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=75176204;WS=75176186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	75176300	rs1167801	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=842;ReadPosRankSum=0.723;SC=CCTGAATAGCTTGCATGAGGC;SOR=1.161;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=50;WE=75176308;WS=75176290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr7	75176385	rs1167802	A	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=800;ReadPosRankSum=-1.339;SC=GATCAATGAAAACGACGGTTC;SOR=0.991;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=52;WE=75176393;WS=75176375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr7	75183394	rs1167806	T	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.094;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr7	75183403	rs1167807	A	G	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.43;SOR=2.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	75185985	rs794368	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.770;NF=16;NR=2;PP=387;ReadPosRankSum=0.092;SC=AGAAGACTCTATCTCCAAAAA;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=18;WE=75185993;WS=75185975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
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chr7	75188991	rs34985543	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=1.219;SC=CTCTGCTGCCCGCGCCTGCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=75188999;WS=75188981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	75189017	.	G	C	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=59.73;NF=8;NR=0;PP=62;QD=12.0964015684;SC=GCCCGCCCCCGCCCCCACCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=8;WE=75189025;WS=75189007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,8:0.36:22
chr7	75210659	rs237240	C	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AGCCTGAGGCCGGTCTGTTAC;SOR=0.406;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=48;WE=75210667;WS=75210649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,62:0.58:107
chr7	75210763	rs237239	T	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.48;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	75210763	.	TG	CA,CG	56	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1,2;NR=5,10;PP=56,47;QD=18.2446458104;SC=GTCTTAGCCTTGTGGGTATTA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6,12;WE=75210772;WS=75210753;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:12
chr7	75210764	rs2696199	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	75211414	rs237238	A	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=738;ReadPosRankSum=0.164;SC=CACTTTCTCCAGCCTCGTCCA;SOR=0.550;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=53;WE=75211422;WS=75211404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr7	75211528	rs237237	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=1.234;SC=TCTCTCAGCCGGGCGTGGTGG;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=20;WE=75211536;WS=75211518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr7	75216202	rs1167787	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=489;ReadPosRankSum=-1.528;SC=CATAACAGTCAAGAGATCTGC;SOR=0.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=32;WE=75216210;WS=75216192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr7	75513062	rs42183	A	G	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=86;PP=2965;SC=AGCGAGTGGCACTGAAGCTCG;SOR=1.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=211;WE=75513072;WS=75513052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr7	75597545	rs10954724	C	T	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=7;PP=160;SC=TTCCTCCTGGCGGGGACCTGC;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=75597553;WS=75597535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	75608674	rs10225188	G	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=579;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GGGCGGCCTGGAGGGCCCCCG;SOR=0.159;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=34;WE=75608682;WS=75608664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr7	75608986	rs10239977	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=603;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AGGGGGAGGCCGGCAGGGAGT;SOR=3.084;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=30;WE=75608994;WS=75608976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr7	75610706	.	C	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=303;ReadPosRankSum=0.366;SC=GGGTTTATGTCGCTGGGTGCC;SOR=0.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=17;WE=75610714;WS=75610696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr7	75610763	rs2286819	G	A	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=23;PP=1526;SC=GGGTCGGGGCGTGCCTGGCAC;SOR=1.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=74;WE=75610771;WS=75610753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	75612770	rs13223707	C	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=893;SC=CAACCAGAAGCGTCCTTGGAG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=75612791;WS=75612760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	75612783	rs13240147	G	A	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=8;PP=1147;SC=CCTTGGAGACGGAGACTCAGA;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=75612791;WS=75612760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	75613998	rs4732514	C	T	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=585;SC=CACCTGTTGCCGCAGAGCTGG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=75614006;WS=75613988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	75614029	rs4732515	T	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=6;PP=974;SC=CACCCCCTCCTGCCGCAGCCA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=75614044;WS=75614019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	75614082	rs4732516	C	G	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=39;PP=2477;SC=TCCTGCCTGTCTCTTCCCTGC;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=120;WE=75614090;WS=75614072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	75614288	rs2286822	C	T	4479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,117:0.53:220
chr7	75614296	rs2286823	G	A	4469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=2.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,117:0.52:224
chr7	75614863	rs2302431	TG	CT	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=15;PP=2134;SC=AGGGCCTCGGTGTGGCGGTGG;SOR=1.917;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=53;WE=75614872;WS=75614853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	75614953	rs2228104	T	C	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=58;PP=2417;SC=AGACCAAGGCTGGCCGCATCA;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=75614961;WS=75614943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	75615287	rs1057870	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=621;ReadPosRankSum=0.015;SC=GCCGCCGCTCGGATGAGGACT;SOR=1.291;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=35;WE=75615295;WS=75615277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr7	75616778	rs11767816	A	T	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-1.403;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr7	75616778	.	AC	TA	1924	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=60.48;NF=34;NR=21;PP=1924;QD=35.9539613611;SC=TACTCAGAAGACCCAGTCCCT;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=55;WE=75616787;WS=75616768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr7	75616779	rs11766464	C	A	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=6.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-1.388;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,64:0.44:144
chr7	75616817	rs201142190	GGACA	G	6492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=61;PP=2979;SC=CGCAGAGGACGGACAGACAGA;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=89;WE=75616828;WS=75616807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	75617223	rs147613710	G	A	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1691;ReadPosRankSum=1.293;SC=GCTCAGCACAGACATCTGGGA;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=227;TCF=118;TCR=109;TR=110;WE=75617231;WS=75617213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,124:0.48:256
chr7	75621661	rs2286826	G	C	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=12;PP=397;SC=AGGGCAAACAGGGCCCAGAGA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=75621669;WS=75621651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	75621827	rs4732519	A	G	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=29;PP=1374;SC=CAATTGTTCTAAAGTTTGGTC;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=69;WE=75621835;WS=75621817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	75621979	rs6467956	T	C	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=17;PP=455;SC=CTGGGAGGGTTTCGCTCAGCG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=75621987;WS=75621969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	75628461	rs4728538	A	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	75629778	rs3801472	T	C	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=64;PP=2677;SC=AGTTAGGAGCTCCGAGTTCCG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=75629786;WS=75629768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	75630274	rs8565	T	C	7317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=88;PP=2965;SC=GGCTGATACCTTGGGTGGAAA;SOR=1.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=124;TCR=88;TR=212;WE=75630282;WS=75630264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr7	75633209	rs2058389	T	C	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=38;PP=1016;SC=TCAGGTGGAATGCAGAATGCA;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=75633217;WS=75633199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	75643313	rs7798794	C	T	796.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.212;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.127;NF=6;NR=21;PP=622;ReadPosRankSum=-0.492;SC=TATTTATTTTCTGAGACAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=27;WE=75643321;WS=75643303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr7	75658197	rs13240967	C	T	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=49;PP=1448;SC=AACCCCAGCACTTTGGAAGGC;SOR=3.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=54;WE=75658205;WS=75658187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	75659815	rs1044483	T	C	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=63;PP=1880;SC=AAAGCTCTGTTGGTTCACATA;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=49;TCR=63;TR=112;WE=75659823;WS=75659805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	75677430	rs10231092	C	G	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=32;PP=1329;SC=AGTCACTTCCCCGTCACCAGC;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=75677438;WS=75677420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	75694345	rs3214335	TC	T	1306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=1197;SC=TCAGGAGCTCTCCCTGGCCCT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=30;WE=75694353;WS=75694335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	75806299	rs12538908	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-3.804;NF=18;NR=7;PP=262;ReadPosRankSum=0.426;SC=TCAAGGTGCCATACTCCAAGT;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=25;WE=75806307;WS=75806289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
chr7	75877354	rs1859795	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=-1.515;SC=AGTGCTGAAGACCTGGCTTGA;SOR=1.765;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=12;WE=75877362;WS=75877349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	75889151	rs150272766	G	GC	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=0.199;SC=GCTAGGTCAGGCCCCCTGCGC;SOR=1.038;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=75889159;WS=75889143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr7	75889184	rs6950229	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=322;ReadPosRankSum=0.175;SC=TGAAGAAAAGTCGTCCCGAGA;SOR=1.358;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=19;WE=75889192;WS=75889174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr7	75894946	rs6465068	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=0.328;SC=CACTGCTGTAGTCTCAGCACT;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=15;WE=75894954;WS=75894936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	75896466	rs6955911	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGGCAGGTGGAGGGCTGCTCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=13;WE=75896474;WS=75896456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr7	75896535	rs6974346	C	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=541;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AAGCGGGTGTCCCACGCCGAC;SOR=0.635;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=40;WE=75896543;WS=75896525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr7	75912536	rs3839766	TG	T	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-0.879;SC=GGCACGGGGATGGGGGGGGGT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=75912544;WS=75912526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	75914934	rs75544239	G	GC	639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=4;PP=363;SC=TCCCGGCAGCGCCGCAAGCGT;SOR=1.292;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=9;WE=75914942;WS=75914924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	75959188	rs2072435	G	A	6212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=116;PP=2965;SC=AGGCCTTCTCGGAGGACTCCA;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=78;TCR=116;TR=194;WE=75959196;WS=75959178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr7	76019746	rs55920832	C	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=1.655;SC=AGGCCACTCCCAAGCTAGGTC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=76019754;WS=76019736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	76023029	rs10261314	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=724;ReadPosRankSum=1.585;SC=GTCGCAGCCGTCCACCTGCGG;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=38;WE=76023037;WS=76023019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr7	76023088	rs140509712	C	CG	3991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=48;PP=2717;SC=TGCCGGCTCCCGGCAGAGCCC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=76023096;WS=76023078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
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chr7	76024520	rs2286427	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=234;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AGTTCCCAGCCGCACCCACCA;SOR=0.426;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=14;WE=76024528;WS=76024510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
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chr7	76054372	rs2286428	G	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1663;ReadPosRankSum=0.629;SC=CTTGCAGGGTGGAGCCAGCCA;SOR=0.629;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=200;TCF=103;TCR=97;TR=100;WE=76054380;WS=76054362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,109:0.48:226
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chr7	76062434	.	G	GTTTGGT	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=0.000;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
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chr7	76069486	rs80209248	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=-1.803;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	76069629	rs73363163	G	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=0.549;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,48:0.27:175
chr7	76069811	rs2906999	T	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=5.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.202;NF=49;NR=66;PP=2172;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AGTGGAAGGCTCGGCTGACAT;SOR=0.885;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=217;TCF=96;TCR=121;TR=115;WE=76069819;WS=76069801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,107:0.48:221
chr7	76069902	rs1804905	G	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.900;NF=9;NR=29;PP=461;ReadPosRankSum=-0.957;SC=CAGTGGTCCAGGTCTGCTTCC;SOR=0.846;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=38;WE=76069910;WS=76069892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr7	76069937	rs2906996	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.988;NF=3;NR=14;PP=191;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TGGTATGTCACAGAATGGCCA;SOR=0.715;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=17;WE=76069945;WS=76069927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr7	76071003	rs78087397	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.590;NF=8;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-2.045;SC=TCACACCTGGCCGAGAAAGCT;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=76071011;WS=76070993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr7	76071228	rs143649134	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.84;MQRankSum=-2.056;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	76111831	rs150857694	T	C	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=521;ReadPosRankSum=0.771;SC=ATAGGCACCATGCGGGCTGTG;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=43;WE=76111839;WS=76111821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr7	76111994	rs1638075	C	G	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.597;NF=26;NR=26;PP=767;ReadPosRankSum=-1.545;SC=TGGACTTGGCCCCCCTGGGGT;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=52;WE=76112002;WS=76111984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,60:0.43:140
chr7	76112060	rs1638074	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.603;NF=23;NR=26;PP=719;ReadPosRankSum=1.052;SC=CTTCCAGCTTCTGCCGCAGCG;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=49;WE=76112068;WS=76112050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr7	76126737	rs145964625	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQRankSum=-3.322;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr7	76129959	rs142773011	G	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.34;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	76143232	rs189605703	G	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=434;ReadPosRankSum=1.841;SC=GGGTCGAGGGGCAGCCCCTCT;SOR=0.897;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=27;WE=76143240;WS=76143222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr7	76144455	rs1799125	A	C	6241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=111;PP=2965;SC=TCCCACCCAGAGAGGCCGCCA;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=88;TCR=111;TR=199;WE=76144463;WS=76144445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr7	76144560	rs1799126	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=50;PP=1148;SC=GATGGGGCGCTGGGAGTGAGT;SOR=3.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=56;WE=76144568;WS=76144550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	76239480	rs200882024	C	A	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.90;QD=26.39;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	76239503	rs140446540	G	GC	1556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.21;QD=31.77;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	76239703	rs150952334	T	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=306;SC=TGTGATGGCTTATGCCTGTAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=76239711;WS=76239693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	76240677	rs1799211	T	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=171;SC=TTTTAATGGATGACAAGGGAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=76240685;WS=76240667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr7	76240888	rs1134609	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.41;QD=26.76;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr7	76255032	rs2527936	A	G	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=70;PP=2079;SC=TAGCAGTAAGATATTTTAATT;SOR=1.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=106;WE=76255040;WS=76255022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	76255452	rs62476699	G	A	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=61;PP=2792;SC=AAGTACCCCCGGACAGGAATA;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=140;WE=76255460;WS=76255442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	76255491	rs71535586	C	T	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.04;QD=27.90;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	76255998	rs2006268	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=6;PP=192;SC=AGCCAAAGGATGATCTGGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=76256006;WS=76255988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	76607938	rs56083327	C	T	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=203;SC=GGGAAGATGGCCATGGCCCCA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=76607946;WS=76607928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	76608143	rs2245368	C	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=25;PP=840;SC=CCCTCGCTGGCCCGTTACATT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=76608151;WS=76608133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	76610095	rs62473742	C	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.272;NF=29;NR=31;PP=829;ReadPosRankSum=-1.224;SC=GCAACCAGCTCGTGGACTTGG;SOR=0.355;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=60;WE=76610103;WS=76610085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr7	76610299	rs62473743	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=29;PP=1081;SC=CTGGCCCTGTATCAGGCCGCT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=76610307;WS=76610289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	76610346	.	C	T	151	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=43.73;NF=4;NR=6;PP=151;QD=18.5771212547;SC=GCATACCCCGCCCCCCAGCAC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=10;WE=76610354;WS=76610336;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr7	76610407	rs62473744	A	G	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=25;PP=853;SC=CCTTTGCACCATACAACAAAC;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=76610415;WS=76610397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	76610621	rs6956966	T	C	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=21.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	76619795	rs149365700	G	A	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.10;QD=24.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	76624959	rs55895615	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQRankSum=-3.197;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr7	76629626	rs145082715	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQRankSum=-5.168;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr7	76632736	rs3748126	C	G	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=35;PP=1256;SC=GGACCATCCTCATAGTTTACA;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=76632744;WS=76632726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	76633640	rs79277119	C	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQRankSum=-4.104;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr7	76634237	rs377009367	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.89;MQRankSum=-0.751;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr7	76634269	rs77501390	G	A	336.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.25;QD=37.42;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	76634274	rs67390349	CTGCTGT	C	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.25;MQRankSum=-2.200;QD=27.86;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	76635003	rs76696965	A	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.47;QD=41.25;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	76635006	rs200111237	C	T	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.04;QD=43.16;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	76635139	rs62474189	CG	TA	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.36;MQRankSum=1.645;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	76723447	rs200343407	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	76723490	rs62474239	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.03;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	76742649	rs142960161	A	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.14;QD=27.67;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	76748903	rs139039802	AACTTCTAC	A	1834.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.338;NF=7;NR=31;PP=2939;ReadPosRankSum=1.046;SC=CAATACTTTGAACTTCTACAC;SOR=0.544;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=38;WE=76748918;WS=76748893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,52:0.34:152
chr7	76751068	rs71555938	G	C	94.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.80;MQRankSum=-0.253;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	76751252	rs3864642	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.717;NF=8;NR=6;PP=187;ReadPosRankSum=0.718;SC=CAGAGTTCGGCGCGCCGGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=14;WE=76751260;WS=76751242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr7	76751543	rs4412304	G	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.037;NF=26;NR=34;PP=927;ReadPosRankSum=0.570;SC=GGAGACGTAAGTCAGGGTTTG;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=60;WE=76751551;WS=76751533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr7	76751658	rs6962194	C	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CTGACCTGGACCCCTTGCCTA;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=15;WE=76751666;WS=76751648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
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chr7	76883685	rs3114318	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=6;PP=373;SC=TCAGGAAAGGTGTCATAAAGA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=76883693;WS=76883675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr7	76903784	rs3834862	GT	G	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=1.221;SC=TATTATCTGTGTTTTTTTTCA;SOR=0.160;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=76903792;WS=76903774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	76908199	rs3828947	A	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.292;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=447;ReadPosRankSum=-0.445;SC=AGGTGAGGGGAAAAAAACCTG;SOR=1.175;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=28;WE=76908207;WS=76908189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr7	76911827	rs11769500	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=155;ReadPosRankSum=0.775;SC=CTAGTAAAACGGTGGTCTCAA;SOR=1.214;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=10;WE=76911835;WS=76911817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr7	76922575	rs113826533	GCAA	G	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.307;NF=0;NR=11;PP=864;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TTGCATTCAGGCAACCCACAG;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=76922590;WS=76922565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr7	76922581	rs55803623	C	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.24;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr7	76922581	.	CA	GT	862	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=9;PP=862;QD=91.5467874862;SC=TCAGGCAACCCACAGTTATCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=10;WE=76922590;WS=76922565;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	76922582	rs59657581	A	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.24;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr7	76941547	rs35791980	C	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.559;NF=4;NR=19;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AAAAATGTAGCGAATACCACA;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=23;WE=76941557;WS=76941537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr7	76941549	rs148017002	A	AAT	890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.066;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.430;NF=0;NR=14;PP=1065;ReadPosRankSum=-2.130;SC=AAATGTAGCGAATACCACACA;SOR=1.300;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=14;WE=76941557;WS=76941537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr7	76942644	rs7790123	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GGAAACAGCTAACAGAGGGCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=76942652;WS=76942634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	76942959	rs2272316	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CATCTTGATAGGACATATCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=76942967;WS=76942949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	76950035	rs6950870	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=758;ReadPosRankSum=-1.123;SC=AAAGAGCCAACACTTACCAGG;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=50;WE=76950043;WS=76950025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr7	76958730	rs10274222	A	G	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1175;ReadPosRankSum=-1.828;SC=AACACGTCAGAAATGTGGAAG;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=62;TCR=70;TR=69;WE=76958738;WS=76958720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr7	76982109	rs10714796	AC	A	616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.050;NF=10;NR=5;PP=530;ReadPosRankSum=0.812;SC=ATTTGCTATTACTTTTCTGCC;SOR=0.163;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=15;WE=76982117;WS=76982099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr7	76982480	rs4729347	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	77006716	.	GC	G	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=20;MQ=55.45;NF=0;NR=4;PP=61;QD=21.75;SC=ACCTAAAAATGCAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=77006724;WS=77006706;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,4:0.31:13
chr7	77035392	rs6949654	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=-0.374;SC=ATTTAATACATGTAAGCTCTC;SOR=0.654;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=29;WE=77035400;WS=77035382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr7	77200392	rs17155183	A	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=168;ReadPosRankSum=0.175;SC=GTTGTATTTTAAGCGGTTAAG;SOR=0.951;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=12;WE=77200400;WS=77200382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr7	77227241	rs6955503	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=1.302;SC=CATTTATAGACTATCTGTAAG;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=22;WE=77227249;WS=77227231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr7	77240069	rs2302473	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr7	77255941	rs17467232	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=0.711;SC=GCTCTTAATATGCTACTCTTA;SOR=1.445;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=9;WE=77255949;WS=77255931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
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chr7	77365770	rs3764824	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.415;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
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chr7	77423152	rs1045463	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TTCACCAATCCTGTTTTATGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=77423160;WS=77423142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr7	77423574	rs7953	G	A	3272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=1942;ReadPosRankSum=-2.202;SC=AGACTGGAATGAATATGAGGA;SOR=0.634;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=277;TCF=142;TCR=135;TR=125;WE=77423582;WS=77423564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,159:0.46:342
chr7	77469486	rs17807802	C	T	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.001;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1190;ReadPosRankSum=0.835;SC=GTTCAGTCTCCTTTTGGAAGG;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=71;WE=77469494;WS=77469476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,82:0.56:147
chr7	77523521	rs10267180	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=-0.097;SC=ATGTAATCATATCTCTTATGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=77523529;WS=77523511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr7	77539744	rs711309	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.181;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=570;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TTTATTTAAGGTTTTATATGG;SOR=0.283;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=34;WE=77539752;WS=77539734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr7	77552127	rs848486	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GTATACATACGTATCTATTTT;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=16;WE=77552135;WS=77552117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	77708105	rs67657112	ATG	A	622.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;MQRankSum=0.447;QD=29.65;ReadPosRankSum=1.766;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr7	77756580	rs2074641	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=358;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGTAGTCCAGTAGGGGAGGCT;SOR=0.612;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=21;WE=77756588;WS=77756570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr7	77756724	rs7812015	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=856;ReadPosRankSum=2.395;SC=CTTTCACTTCCGACCTGTAAC;SOR=0.517;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=55;WE=77756732;WS=77756714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr7	77756815	rs9656109	G	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=0.825;SC=CCAGAGGTGGGCCAGCCATGA;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=21;WE=77756823;WS=77756805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr7	77756849	rs2074642	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=1.005;SC=CCACTCCTCTCGGTGGTCCTG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=77756857;WS=77756839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr7	77756865	rs2074643	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=155;ReadPosRankSum=0.445;SC=TCCTGTTGGATGCTCAGGATT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=77756873;WS=77756855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr7	77764591	rs767682	C	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=454;ReadPosRankSum=1.820;SC=GTCCCAGCCCCAAAGGAAACA;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=33;WE=77764599;WS=77764581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr7	78119199	rs1990577	A	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=37;PP=957;SC=ACATACTAAAAGGAATCAAGT;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=78119207;WS=78119189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	78119221	rs3086374	G	GAA	877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=20;PP=553;SC=TATTCCTTAAGAAAAAAAAAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=78119229;WS=78119211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	78130801	.	C	CT	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5296;HP=22;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.52;NF=3;NR=0;PP=28;QD=10.3333333333;SC=ATGTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=3;WE=78130809;WS=78130791;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr7	78256342	rs38116	C	T	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=672;ReadPosRankSum=0.012;SC=AAACCCAAAACAGCCCATTAG;SOR=0.498;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=45;WE=78256350;WS=78256332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr7	78256643	rs38117	G	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=237;SC=TGAATATTCAGTGCCACTTGT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=78256651;WS=78256633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	79082361	rs146012909	G	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=372;ReadPosRankSum=1.866;SC=TGAGCCGGAGGGGGTCCTTGC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=24;WE=79082369;WS=79082351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr7	80285850	rs3173798	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=287;ReadPosRankSum=-1.899;SC=ATTTTCTTTTTCATAGCAAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=14;WE=80285858;WS=80285840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	80290369	rs3211892	A	G	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=37;PP=2225;SC=GTTTACTGCTATTTCTTTAGA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=72;TCR=37;TR=109;WE=80290377;WS=80290359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
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chr7	80299113	rs3173803	G	A	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=414;SC=ATGCCTGGCCGGTTATTTCTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=80299121;WS=80299103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	80374342	rs1949971	A	G	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=64;PP=2282;SC=TGTCTTTGCAATATTGGTTAA;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=80374350;WS=80374332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	80374438	rs1949972	T	C	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=42;PP=1560;SC=CCCAGGTCCATGGGGACCATT;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=75;WE=80374446;WS=80374428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	80378148	rs1405743	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=7;PP=720;SC=TGAGCCTCGCTGAGGGACAGT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=80378156;WS=80378138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	80378175	rs2886793	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=15;PP=1154;SC=ATGTTCTCTCTGAAGCCCTGA;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=80378183;WS=80378165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	80378319	rs2272351	G	C	4348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=74;PP=2805;SC=CTCCATACTGGACAATTTCAG;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=133;WE=80378327;WS=80378309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	80387766	rs1058425	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=411;ReadPosRankSum=0.811;SC=GCAGAGATACCTGGGAAACCC;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=24;WE=80387774;WS=80387756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr7	80391070	rs10954319	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=0.575;SC=GAAGAAATCACTTTTCTTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=7;WE=80391078;WS=80391060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	80456841	rs4461841	C	T	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=32;PP=1070;SC=ATAATCTCACCTGGACATATG;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=80456849;WS=80456831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	80804928	rs1509912	G	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=704;ReadPosRankSum=-1.292;SC=TCCACAGACTGCTTCCTCCTT;SOR=0.972;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=35;WE=80804936;WS=80804918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr7	80805175	rs1509911	T	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=610;ReadPosRankSum=-0.537;SC=AAGCTCTTACTAGATGATCTT;SOR=1.699;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=38;WE=80805183;WS=80805165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr7	80805263	rs11972689	C	T	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CATAGCAAACCCTGCCCACTT;SOR=0.913;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=155;TCF=90;TCR=65;TR=92;WE=80805271;WS=80805253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,104:0.56:186
chr7	80805381	rs11976314	A	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=818;ReadPosRankSum=-0.660;SC=ATGTGGACTCAGAAAAATCTC;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=55;WE=80805389;WS=80805371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,61:0.55:111
chr7	80817269	rs327695	T	C	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=863;SC=GTGACAATTGTTAATATGCTT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=80817277;WS=80817259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	81339304	rs2074725	A	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CAGAGCTTACAGTCTGGCAAG;SOR=3.516;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=81339312;WS=81339294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr7	81346685	rs1800793	T	C	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=900;ReadPosRankSum=1.478;SC=GATATGACTGTGGAAACAACA;SOR=0.444;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=63;WE=81346693;WS=81346675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr7	81350208	rs12536657	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=0.851;SC=ATATCAAGGCAGATAAAACAA;SOR=1.670;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=81350216;WS=81350198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr7	81350223	rs10272030	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=1.232;SC=AAACAAAAAGGTTTTTTACAA;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=81350231;WS=81350213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	81355066	rs2887069	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=633;ReadPosRankSum=0.423;SC=GAAAAATCCAGCTTCAAACTT;SOR=0.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=64;TCR=6;TR=33;WE=81355074;WS=81355056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr7	81359116	rs5745686	CA	C	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.442;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.456;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr7	81366210	.	GGT	GGTGTGTGTGTGT,G	498.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.831;NF=0,0;NR=8,8;PP=148,527;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TGTGTAGAGGGGTGTGTGTGT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=8,8;WE=81366219;WS=81366200;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.52:23
chr7	81372156	rs5745676	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=0.041;SC=ATCAGCTATAAAGATTAGAGA;SOR=0.892;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=9;WE=81372164;WS=81372146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr7	81372452	rs2214826	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AATGTTTTCTATGGATGTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=3;WE=81372460;WS=81372442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	81374500	rs4732406	G	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=1172;SC=CACCACTGTTGCATTTAAAGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=81374508;WS=81374490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	81381326	rs5745646	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=509;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TGCATTTGCACGAACAACATA;SOR=0.469;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=29;WE=81381334;WS=81381316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr7	81591114	rs72063149	GTAATGATTATAACAGTATATACAATTTCT	G	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.615;NF=1;NR=1;PP=579;ReadPosRankSum=1.732;SC=AGTTTTTTCTGTAATGATTAT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=2;WE=81591150;WS=81591112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	81600197	rs37067	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr7	81603966	.	CA	C	91	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=91;QD=42.0;SC=TTATTAGCCACAAGACTTTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=81603974;WS=81603956;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	82544987	rs17156844	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1213;ReadPosRankSum=-2.504;SC=TCACATAACTATGCAATCTAG;SOR=0.547;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=77;WE=82544995;WS=82544977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,84:0.47:180
chr7	82581488	rs10630259	T	TTCA	7000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=61;PP=2969;SC=CAACGGGTTTTTCATCTTCTA;SOR=0.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=95;WE=82581496;WS=82581478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	82581859	rs976714	C	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=949;ReadPosRankSum=0.783;SC=GTGTAACTTGCACTAGCTGTG;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=62;WE=82581867;WS=82581849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr7	82582846	rs10954696	C	T	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=957;ReadPosRankSum=0.453;SC=ATTCTTGTAACAGGTAATCCA;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=68;WE=82582854;WS=82582836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,82:0.57:143
chr7	82586225	.	G	C	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=860;ReadPosRankSum=1.171;SC=GAGAACTTGAGGTGTCTGATT;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=64;WE=82586233;WS=82586215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr7	82764425	rs2877	C	G	2742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.288;SC=ATCAAATGGGCTGACTTTTTC;SOR=0.564;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=108;WE=82764433;WS=82764415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,123:0.57:217
chr7	82784017	rs6951239	G	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=8;PP=1247;SC=TTGTATAAGAGGATGATATGG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=82784025;WS=82784007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	82785097	rs61741659	T	C	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=83;PP=2965;SC=CCTTACTATGTCTGCCTGTTT;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=161;WE=82785105;WS=82785087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	83023587	.	TAC	T	2303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=0.000;QD=33.39;ReadPosRankSum=2.518;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,66:0.96:69
chr7	83026100	rs150931802	C	CAA	434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=224;SC=GTACGGTTTTCAAAAAAACCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=83026108;WS=83026090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	83029280	rs2255906	T	G	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	83029438	rs2722974	C	T	3009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=39;PP=2106;SC=CTGTTTTTACCAATATTGGTT;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=97;WE=83029446;WS=83029428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	83029639	rs2255820	A	T	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=50;PP=1346;SC=AATTATGAGAAGAATCAGAAA;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=83029647;WS=83029629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	83031907	rs2709930	T	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=693;SC=ACCAAAAGTATACTTAAAAAT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=83031915;WS=83031897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	83032187	rs2722976	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=319;SC=TCAAGTCTTTTGGGTAAAGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=83032195;WS=83032177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	83034754	rs2245441	T	A	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=21;PP=882;SC=ATTGACTGTATAAATTTCTCA;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=83034762;WS=83034744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	83034899	rs2709935	T	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=555;SC=CAAAGAAAATTTATTCACCTA;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=83034907;WS=83034889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	83035177	rs3735512	G	A	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=251;SC=TACACAGAAAGCAAGTTTCTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=83035185;WS=83035167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	83036367	rs2245312	C	G	4661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=50;PP=2688;SC=AAAGGCCTGACCATAAATTGT;SOR=1.213;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=83;TCR=50;TR=133;WE=83036375;WS=83036357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr7	83036602	rs2709941	T	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=369;SC=ATATTACAACTAAATGCTAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=83036610;WS=83036592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	83037751	rs2722985	C	A	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=53;PP=1902;SC=TGCGGAAGATCGCAGCGTCTC;SOR=1.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=83037759;WS=83037741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	83047583	rs2723033	T	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	83047583	.	TCA	CCC	459	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=459;QD=56.9408749847;SC=GCTTCGAGCATCAGAAAATAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=83047593;WS=83047573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr7	83047585	rs2713146	A	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	83047666	rs2713145	C	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1171;SC=TTTTAAAATCCTTATGACTAC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=83047674;WS=83047656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	83095968	rs2713180	C	A	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=73;PP=2278;SC=AAACATGTTTCGTCCTTTTTG;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=99;WE=83095976;WS=83095958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	83098428	rs3842170	A	AT	55.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	83098749	rs13225391	G	A	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=61.78;NF=0;NR=5;PP=116;SC=ATAAGATACAGTGGGTCTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=83098757;WS=83098739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr7	83606353	rs35361892	T	TGA	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=585;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TTAAGTATTCTGAGAGATGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=83606361;WS=83606343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	83606518	rs701320	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TGCGTCTGAAGCAATTACATT;SOR=1.055;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=28;WE=83606526;WS=83606508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr7	83823737	rs67227861	AG	A	946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.440;NF=20;NR=10;PP=413;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CAAGGAATTAAGGGGGGGGGC;SOR=1.066;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=30;WE=83823745;WS=83823727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr7	84628989	rs7800072	T	G	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.159;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1463;ReadPosRankSum=0.231;SC=TCCTTGACCTTCCCCTCCTCA;SOR=0.762;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=203;TCF=105;TCR=98;TR=89;WE=84628997;WS=84628979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,112:0.45:251
chr7	84644346	rs6468008	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=329;ReadPosRankSum=0.729;SC=AGAAAGGAAGCCTTTATATTA;SOR=1.379;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=19;WE=84644354;WS=84644336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr7	84644500	rs17559084	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1099;ReadPosRankSum=-1.523;SC=AGAGCTGAACCAATCCATCTC;SOR=0.456;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=71;WE=84644508;WS=84644490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,85:0.46:185
chr7	84644666	rs17639600	G	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CACTTGTACAGAAACATAATG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=84644674;WS=84644656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	84647477	rs7780132	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=252;ReadPosRankSum=0.958;SC=AAATTTAACTCCCAATTTCAA;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=16;WE=84647485;WS=84647467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr7	86274196	rs274623	T	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=573;ReadPosRankSum=0.485;SC=GAGGTAAGGGTCCCAGAGGAG;SOR=1.371;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=29;WE=86274204;WS=86274186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr7	86542455	rs35895874	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=492;ReadPosRankSum=1.441;SC=AGGACGCCACCCCATCAACTG;SOR=0.781;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=30;WE=86542463;WS=86542445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr7	86544248	rs1029367	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GTATATATTACAAATGTATTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=86544256;WS=86544238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr7	86571235	rs2373361	C	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=507;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TTTCTTAAAACGTTATGAAAG;SOR=0.856;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=25;WE=86571243;WS=86571225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr7	86574111	rs73196633	A	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	86577346	rs1557665	A	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=139;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TGCCACACTCAAACGAAAGCC;SOR=0.293;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=9;WE=86577354;WS=86577336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr7	86594379	rs6976741	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.174;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr7	86594383	rs6958716	T	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.047;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr7	86594423	rs6976877	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=0.605;SC=CCAAGCCCCTGTTTCCAAGCT;SOR=1.214;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=8;WE=86594431;WS=86594413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	86781423	rs2286267	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=442;SC=CGGCTCCCTCGGCTCGGAGCC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=86781431;WS=86781413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	86795947	rs3058402	TAG	T	3938.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.268;NF=9;NR=47;PP=2771;ReadPosRankSum=1.428;SC=TTAAGAGCCATAGAGTTCCCT;SOR=1.237;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=56;WE=86795956;WS=86795937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr7	86800351	rs3747807	A	G	5283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=81;PP=2965;SC=CCATGACTGCAACCACAGAAG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=80;TCR=81;TR=161;WE=86800359;WS=86800341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr7	86817622	.	G	GTGTTTGATCTTCAAGATTCCTTGC	2288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=12.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.476;SOR=1.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr7	86820459	rs1558050	G	A	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=607;SC=ATGAATGGTAGACTAAATCAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=86820467;WS=86820449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	86978347	rs802037	C	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=11;PP=495;SC=TGTGAGGGCTCTCTCTCTTTT;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=86978355;WS=86978337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	86983715	rs7808249	A	G	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=32;PP=1384;SC=GCTTGGATTTAACTGGACCTA;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=86983723;WS=86983705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	86998842	rs6966140	G	A	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=66;PP=1857;SC=GTCTTATGGTGTTGCTTGAAT;SOR=1.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=89;WE=86998850;WS=86998832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	86998936	rs35374737	AT	A	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=436;SC=TTAAAAAAAAATCTATTTGTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=86998944;WS=86998926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	87005287	.	C	CT	315	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=61.2;NF=2;NR=15;PP=315;QD=19.0588235294;SC=ACTACCTTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=17;WE=87005295;WS=87005277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,17:0.61:28
chr7	87006567	rs802042	G	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=3;PP=128;SC=TTTGGTTGACGTGAAGAGGAA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=87006575;WS=87006557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	87011349	rs31630	G	A	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=29;PP=1793;SC=TCTCCTAATAGTTCTATAGAT;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=80;WE=87011357;WS=87011339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	87022024	rs31644	G	C	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=59;PP=2965;SC=TTTCTAACCTGAGATTTGGGG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=104;TCR=59;TR=163;WE=87022032;WS=87022014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr7	87032613	rs31653	A	G	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=637;SC=AGTTAACCAAATTATAAATAT;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=87032621;WS=87032603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	87053150	rs31667	A	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=19;PP=1403;SC=GGAGCCAGTCAGTGAGGTTGG;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=87053158;WS=87053140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	87053206	rs31668	G	A	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=56;PP=2583;SC=CTGTTATGTGGTGTTTGCAAA;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=136;WE=87053214;WS=87053196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr7	87056260	rs111542896	A	AGTGT	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=43.30;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	87069758	rs31675	T	C	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=45;PP=1387;SC=ATTTAACCATTTAATAGCTGA;SOR=2.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=87069766;WS=87069748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	87082292	rs1202283	G	A	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1125;ReadPosRankSum=0.541;SC=CAGTGGTGTCGTTGATGTCAA;SOR=0.488;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=73;WE=87082300;WS=87082282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,89:0.52:171
chr7	87138511	rs2235048	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=0.407;SC=ACTTCTGGGAGACCAGCCCCT;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=10;WE=87138519;WS=87138501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr7	87138645	rs1045642	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CTGCCCTCACAATCTCTTCCT;SOR=0.716;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=69;WE=87138653;WS=87138635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr7	87160618	rs2032582	A	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=448;ReadPosRankSum=0.281;SC=ACCTTCCCAGAACCTTCTAGT;SOR=1.138;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=24;WE=87160626;WS=87160608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr7	87168749	rs4728699	C	T	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=1302;SC=AGCAGGAGATCAGACAAAGTC;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=87168757;WS=87168739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	87173667	rs1922242	A	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=58;SC=CACAAAAATTAGTAAAGGAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=87173675;WS=87173657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	87174066	rs2235046	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=535;ReadPosRankSum=-1.789;SC=CCACTCCTACTGTAGCCCTAG;SOR=1.127;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=32;WE=87174074;WS=87174056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr7	87178626	rs2235013	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=613;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TGTTCTTATGCTTATAAATCA;SOR=1.291;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=33;WE=87178634;WS=87178616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr7	87179143	rs2235033	A	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=675;ReadPosRankSum=-0.607;SC=ACCTCTAGAAAGGCAAAGGGC;SOR=0.822;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=46;WE=87179151;WS=87179133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,58:0.38:153
chr7	87179601	rs1128503	A	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TCAGGTTCAGACCCTTCAAGA;SOR=0.349;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=39;WE=87179609;WS=87179591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr7	87180198	rs10276036	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=968;ReadPosRankSum=1.393;SC=GAGATAGTGACAGCAATTTTT;SOR=0.935;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=56;WE=87180206;WS=87180188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr7	87192731	rs11975994	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=359;ReadPosRankSum=-0.168;SC=AATATCCTCAGCAAAATCCTG;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=26;WE=87192739;WS=87192721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr7	87215114	rs1211152	A	C	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=161;SC=ACTGATACCAACCTAGTCCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=87215122;WS=87215104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	87224948	rs2214103	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=1.110;SC=TAAGCTAAATCAAACCAATTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=7;WE=87224956;WS=87224938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	87225046	rs2235074	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=233;ReadPosRankSum=-1.508;SC=TCAAATTTCCGAAGTATTTTG;SOR=1.164;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=17;WE=87225054;WS=87225036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr7	87229501	rs2214102	T	C	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=37;PP=1371;SC=CAAGATCCATTCCGACCTGAA;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=87229509;WS=87229491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	87323145	rs17328880	C	T	328.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CTTAGTTGGGCTATTCAGTTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=12;WE=87323153;WS=87323135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr7	87323416	.	GTT	G	157.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.319;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	87517135	rs28627774	G	A	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=22;SC=CACACTGGGGGTTAAATTTCA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=87517143;WS=87517125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	87594188	rs1637500	T	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=396;SC=GGCAGATTTATGTCATACTGA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=87594196;WS=87594178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	87704799	rs3085476	G	GAGAA	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
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chr7	87844303	rs11760375	A	G	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=989;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TGACTGGAACACAACTTCTCT;SOR=0.789;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=172;TCF=88;TCR=84;TR=70;WE=87844311;WS=87844293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,79:0.39:201
chr7	87913361	rs1981529	C	T	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=31;PP=1409;SC=GATTATGATGCCAGACTTCTT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=65;WE=87913369;WS=87913351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	88847450	rs199973381	TA	T	1030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.531;SC=AACCAACATTTATGTATTTTT;SOR=0.844;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=14;WE=88847461;WS=88847440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr7	88847453	rs4140974	G	T	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.576;SC=CAACATTTATGTATTTTTTCT;SOR=0.730;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=21;WE=88847461;WS=88847440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr7	88956699	rs38971	A	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=14;PP=1244;ReadPosRankSum=-1.064;SC=CTCGAAATGTAGCTTCTAAGT;SOR=1.437;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=134;TCF=94;TCR=40;TR=62;WE=88956707;WS=88956689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr7	89792250	rs39286	A	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.574;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=313;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AATTTTAAAAATATCTCAGAT;SOR=2.683;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=17;WE=89792258;WS=89792240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr7	89797144	rs259136	G	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=0.652;SC=TATGGCCTATGAAGTGTGGAA;SOR=0.861;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=26;WE=89797152;WS=89797134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr7	89854446	rs194520	T	G	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=70;PP=2965;SC=AGTGAAACTTTTTTACCTAAT;SOR=1.104;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=176;WE=89854454;WS=89854436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr7	89856608	rs110360	C	T	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=90;PP=2965;SC=TAGTATACCTCGCAGGTCTTC;SOR=0.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=159;WE=89856616;WS=89856598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr7	89861832	rs194524	G	A	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=30;PP=1457;SC=TGTATAAGCCGAAAGCTAAAA;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=74;WE=89861840;WS=89861822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	89861890	rs194525	G	T	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=46;PP=1739;SC=AAGAAGGTATGGGAGGAACAA;SOR=0.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=89861898;WS=89861880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	89861942	rs194526	C	T	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=43;PP=1320;SC=AATGTGATGACAAATGGTGTT;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=89861950;WS=89861932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	89867446	rs35403811	T	TCTG	1843.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=1230;ReadPosRankSum=1.641;SC=CTAAAGAGTTTCTGCTGCTGC;SOR=0.593;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=25;WE=89867454;WS=89867436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,45:0.94:48
chr7	89887587	rs11771963	G	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=107;SC=CCATAAATTTGATGGCTTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=89887595;WS=89887577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	89901039	rs10280053	A	C	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=24;PP=996;SC=ACTTTTGTTTATGTCTAAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=89901047;WS=89901029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	89912301	rs1029365	G	A	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=66;PP=2516;SC=CCTGAGAGCCGTGGTCTACCT;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=126;WE=89912309;WS=89912291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	89927191	rs6465256	T	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=25;PP=849;SC=AATATGTCTATTAAAGGCCGT;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=46;WE=89927199;WS=89927181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	89929110	rs36006782	C	CT	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=1;PP=93;SC=GTGTTTCTCTCTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=89929118;WS=89929109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	89937027	.	CA	C	123	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=16;MQ=59.38;NF=8;NR=0;PP=123;QD=16.125;SC=GGTTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=89937035;WS=89937017;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,8:0.38:21
chr7	89938588	rs7803620	C	G	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=12;PP=875;SC=AAGCAAAAAGCCTTCAAGAAA;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=89938596;WS=89938578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	89938680	rs1134956	C	T	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=785;SC=CTTAACACAACGGTAAGATTC;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=89938688;WS=89938670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	89969831	rs42637	A	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=39;PP=1462;SC=GGTGGATTGCATATGAGGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=78;WE=89969839;WS=89969821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	89969878	rs2285399	A	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=38;PP=1233;SC=TGCTGCTGAAAGAAATCAAGG;SOR=1.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=63;WE=89969886;WS=89969868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	89971556	rs1557650	A	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=300;SC=TATTTATTTAAAGACAGTCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=89971564;WS=89971546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	89983808	rs42663	T	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1058;SC=GAAAAGACTGTGAAATCCCTG;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=89983816;WS=89983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	89984409	rs42664	A	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=10;PP=571;SC=GGAGAACTCAATAAAGAAAAT;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=89984417;WS=89984399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	90003694	rs11563547	A	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=417;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GTAAAACACTATATTAGAAGT;SOR=1.101;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=21;WE=90003702;WS=90003684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr7	90014111	rs9886362	G	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=394;SC=AAATGCTGGTGTTGGTTCCCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=90014119;WS=90014101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	90225928	rs7782773	T	C	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=56;PP=2512;SC=TTGTCGGGGCTCCGCGTCGCC;SOR=1.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=135;WE=90225936;WS=90225918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	90233618	rs6465273	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=18;PP=510;SC=ACCAGGTAAAGTCAGTAGCTG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=90233626;WS=90233608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	90356175	rs10240049	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGGAATAGCCTTCTTATGATA;SOR=0.651;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=25;WE=90356183;WS=90356165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr7	90547119	rs78194207	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=458;ReadPosRankSum=1.628;SC=ATTTGTTTAGGTGCACTTCTT;SOR=0.509;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=40;WE=90547127;WS=90547109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr7	90742168	rs373491068	GGA	G	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=1.076;SC=GTGTATGTGTGGAGAGAGAGA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=7;WE=90742177;WS=90742158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr7	90747315	rs803167	A	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.608;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	90894102	rs2232158	C	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GGAGGGCACCCGCGCAGAGGT;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=7;WE=90894110;WS=90894092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	90894459	rs139480179	A	ACCG	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=363;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CGGGGCAGCAACCGCCGCCGC;SOR=1.473;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=8;WE=90894467;WS=90894449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr7	91503228	rs10266424	C	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1391;ReadPosRankSum=0.212;SC=TTGATGTTTGCGTAGCTTCTT;SOR=0.409;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=79;WE=91503236;WS=91503218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,88:0.54:163
chr7	91570290	rs4727267	G	C	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=781;ReadPosRankSum=0.946;SC=GCGGGGGAGCGCCGGACCGAA;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=94;TCR=40;TR=57;WE=91570298;WS=91570280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,62:0.41:151
chr7	91599825	rs2188155	A	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=646;ReadPosRankSum=0.165;SC=TCAGACAGGTATGTGTTAGTG;SOR=0.351;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=34;WE=91599833;WS=91599815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr7	91622259	.	C	T	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CAGTCCGACTCATCTAGAGAT;SOR=0.679;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=71;WE=91622267;WS=91622249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,80:0.43:185
chr7	91630620	rs6964587	G	T	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TGGAGGAAATGAAAACACGGC;SOR=0.530;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=79;WE=91630628;WS=91630610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,88:0.45:194
chr7	91632306	rs1989779	C	T	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=36;PP=1608;SC=GAGTTGTGACCATGACAAGCA;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=73;WE=91632314;WS=91632296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	91641928	rs13245393	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=0.226;SC=ACCAGTTAGAACTACAGACTA;SOR=0.307;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=15;WE=91641936;WS=91641918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
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chr7	91713972	rs10228334	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=331;ReadPosRankSum=0.016;SC=AATTCCTGAGCTAGCACATTC;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=19;WE=91713980;WS=91713962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
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chr7	91726927	rs1063243	A	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=-1.232;SC=AACCAGTGATAGAACTAGAAA;SOR=1.546;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=14;WE=91726935;WS=91726917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
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chr7	91736794	rs7785971	T	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=608;ReadPosRankSum=0.554;SC=TTAACAGAGATAAATGGACAT;SOR=1.238;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=32;WE=91736802;WS=91736784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
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chr7	91761305	rs66673218	CA	C	159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=106;SC=AAAAAGTTACCAAAAAAAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=91761313;WS=91761295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	91779242	rs1978061	G	A	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=978;ReadPosRankSum=0.443;SC=TTTTGAGTCTGGCCACAATCT;SOR=0.687;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=134;TCF=77;TCR=57;TR=61;WE=91779250;WS=91779232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,85:0.48:177
chr7	91779971	rs6465353	T	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.427;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=0.727;SC=AGTGAAAAAATATTGTAGATA;SOR=1.432;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=23;WE=91779979;WS=91779961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
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chr7	91977226	rs2097810	G	A	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=387;SC=TATAGTAATCGTTCAATAAAT;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=91977234;WS=91977216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr7	92129161	.	CA	C	897	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=15;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=60.75;NF=0;NR=27;PP=897;QD=33.4444444444;SC=TACTGAGAAACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=27;WE=92129180;WS=92129146;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:51,27:0.35:78
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chr7	92132493	rs35996821	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=737;ReadPosRankSum=-1.106;SC=TAAACTCTTTTATCATATCAT;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=42;WE=92132501;WS=92132483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
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chr7	92136499	rs151002946	T	TA	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.091;NF=0;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=-0.487;SC=AATTTAGCTATAAAAAAATGC;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=92136507;WS=92136489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr7	92140397	rs2111200	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.095;SC=AGAGTTAGTACTGAAACAGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=92140405;WS=92140387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr7	92147584	rs38809	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=635;SC=AACCAACAGACGAAAAGATCA;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=92147592;WS=92147574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	92148203	.	C	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=4;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=703;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TCTTATAATTCAAAACCAACT;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=92148221;WS=92148193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr7	92148213	rs74720435	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=-1.581;SC=CAAAACCAACTCAGAATATAT;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=92148221;WS=92148193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr7	92199348	rs11971255	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TTTTAGAATGTCTAAAAAGTG;SOR=1.863;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=7;WE=92199356;WS=92199338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr7	92247539	rs3731373	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=-0.367;SC=AGAACCACACATGGACATAAG;SOR=1.325;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=19;WE=92247547;WS=92247529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr7	92300587	rs2301556	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CTGAGAAGGCGGTTTCAGGAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=92300595;WS=92300577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	92462440	.	C	T	2623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr7	92462443	.	C	T	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr7	92734451	rs6965201	A	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=470;ReadPosRankSum=1.683;SC=TAATCTGGAAATAATCATATT;SOR=1.071;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=32;WE=92734459;WS=92734438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr7	92735188	rs111780648	G	A	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1319;ReadPosRankSum=0.688;SC=GCTGTTTTCCGCAATTCTTTG;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=81;WE=92735196;WS=92735178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,105:0.50:208
chr7	92760502	rs4268	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-0.047;SC=ATAAATAAACGTATTTGAACT;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=12;WE=92760510;WS=92760492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr7	92761875	rs17165111	C	G	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1403;ReadPosRankSum=-2.824;SC=GTTTTTGTTCCCATCCAACCA;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=121;TCR=113;TR=95;WE=92761883;WS=92761865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,116:0.41:280
chr7	92762681	rs1029357	A	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TGGCACCAAAAGCTCTTTGTT;SOR=0.685;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=85;WE=92762689;WS=92762671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,105:0.51:204
chr7	92886812	rs722263	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=1.236;SC=CTTTAAGCTGAACAATATTTC;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=18;WE=92886820;WS=92886802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr7	92900516	rs12112676	T	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=0.338;SC=AAAACTGTTTTTTTTTTTTTT;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=10;WE=92900524;WS=92900506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
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chr7	92985252	rs2374639	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=226;ReadPosRankSum=1.632;SC=CCTGATGCAATTGGATTTTCA;SOR=1.154;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=12;WE=92985260;WS=92985242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
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chr7	93073147	rs2074123	C	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-0.434;SC=AATGTGAAAACAAGCCAAAGT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=93073155;WS=93073137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr7	93091238	rs1108233	G	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=398;SC=CACCATGTGAGAGCGTAAAAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=93091246;WS=93091228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	93091485	rs3802052	T	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.45;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	93091488	rs3802051	C	T	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.99;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	93098135	rs139734304	T	TAAACAAACAAAC	2747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=31;PP=2975;SC=CAACAAAAAGTAAACAAACAA;SOR=1.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=34;WE=93098143;WS=93098125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	93107093	rs2074120	A	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=34;PP=1018;SC=GTCATAACCAACCACATTTCA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=93107101;WS=93107083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	93116138	rs9691220	G	A	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=20;PP=946;SC=GGCTTCTGGAGACCAATGCCT;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=93116146;WS=93116128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	93116299	rs2301680	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=18;PP=529;SC=CTCATTTTTGATTTTTGAAGA;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=93116307;WS=93116289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	93116391	rs3214144	A	AT	148.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=144;SC=TTTCATTTTCATTTTTTCTAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=93116399;WS=93116381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	93125323	rs77297506	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=393;ReadPosRankSum=0.941;SC=TAAATCAATGATAATGATTGA;SOR=0.121;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=25;WE=93125331;WS=93125313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr7	93346095	rs2027984	C	A	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	93551428	rs4262	C	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=476;ReadPosRankSum=0.576;SC=AGAGCTAGCCCGAGCCCGGTT;SOR=1.368;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=23;WE=93551436;WS=93551418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr7	93555311	rs180233	A	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=1.242;SC=TTAAAAACTTATTGTATTCAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=93555319;WS=93555301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	93623458	rs2286845	A	G	58.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTTGAACACTAGGAATGTTTT;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=93623466;WS=93623448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	94030899	rs1800222	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=0.136;SC=CTCAGTATGATGGAAAAGGAG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=8;WE=94030907;WS=94030889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr7	94033800	rs406226	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.566;SC=AGTTGGTCATATCTGACCCCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=94033808;WS=94033790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	94034848	rs810687	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.371;SC=TTAATTTGTCACTCTGTGCTT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=8;WE=94034856;WS=94034838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	94035433	rs17073	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=410;ReadPosRankSum=1.407;SC=ACCTGGAACACTGGACTTCTT;SOR=1.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=19;WE=94035441;WS=94035423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr7	94037778	rs2293739	T	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	94038934	rs42518	C	T	3485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=64;PP=2205;SC=AGTATACCTGCGTAGCTAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=104;WE=94038942;WS=94038924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	94038966	rs28754326	G	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=592;ReadPosRankSum=-1.429;SC=GATTTTAAAGGCATTTAATGT;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=44;WE=94038974;WS=94038956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr7	94039032	rs42519	C	T	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=50;PP=1927;SC=TTTTCCTTCACAGGGCCTTCC;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=93;WE=94039040;WS=94039022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	94039900	rs42520	C	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=106;SC=TACCCCTTCACTGGGAATTGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=94039908;WS=94039890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr7	94040287	rs34026686	G	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=594;ReadPosRankSum=0.377;SC=CCTAGAAAGGGGCTTGCTGCT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=40;WE=94040295;WS=94040277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
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chr7	94045576	rs42526	G	A	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=167;SC=CTAGTGGAGAGATTAGGAACA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=94045584;WS=94045566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	94047903	rs3216182	AT	A	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=212;ReadPosRankSum=0.683;SC=TCGTACTTGGATTTTTTTTTT;SOR=1.112;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=17;WE=94047911;WS=94047893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr7	94055933	rs13240759	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=949;ReadPosRankSum=-1.846;SC=ATTGTTCCAGTATAGCCTATA;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=47;WE=94055941;WS=94055923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr7	94056006	rs400218	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.353;SC=GCTATTTCATACCAACATGAA;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=94056014;WS=94055996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	94058410	.	C	CT	67	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9999;HP=10;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=19;MQ=50.99;NF=8;NR=0;PP=67;QD=10.125;SC=TTCCTGAGATCTTTTTTTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=94058428;WS=94058400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	94146975	rs2301646	T	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=25;PP=897;SC=TCAGGTAACATTTCTTCATTT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=94146983;WS=94146965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	94157585	.	CT	C	87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=87;QD=15.3333333333;SC=AAAACATAGGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=94157593;WS=94157575;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,6:0.46:13
chr7	94174854	rs3793326	T	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=12;PP=671;SC=TCCTTTTCAATAGGTTTTATT;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=94174862;WS=94174844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	94175073	rs3793325	T	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=379;SC=GAAATTTCTTTGTAGTTGCTA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=94175081;WS=94175063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	94176627	rs6958243	G	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	94178749	rs10272136	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=775;SC=GACTCTTATATAATCCAAACT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=94178769;WS=94178739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	94178761	rs7801436	C	T	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=836;SC=ATCCAAACTTCAGAAAACTAT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=94178769;WS=94178739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	94182373	rs6465417	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=11;PP=558;SC=GCGTTGTACAACTTATGCAAT;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=94182381;WS=94182363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	94183993	rs10280843	G	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=323;SC=TATGAAAATCGGACGTACTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=94184001;WS=94183983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	94184691	rs10238176	T	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=383;SC=AATAAAATGGTTTTAGGAAAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=94184699;WS=94184681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	94227509	rs10232398	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.360;SC=CCTCACCCTTGTCTACTCCTT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=94227517;WS=94227499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr7	94247971	rs6465421	C	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=338;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CTTATTAAAACGAAAAATGCA;SOR=0.665;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=20;WE=94247979;WS=94247961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr7	94879225	rs12690919	A	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=0.191;SC=TCTCAAGTGGATTCAGTGATT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=94879233;WS=94879215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr7	94897801	rs854522	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=0.063;SC=TCAGTGTCTGTGGTCTCTTCA;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=94897809;WS=94897791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr7	94898811	rs854524	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=-1.440;SC=AAAATATTACGAGAAAAAGGT;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=29;WE=94898819;WS=94898801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr7	94937446	rs662	T	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=824;ReadPosRankSum=0.007;SC=CTCCCAGGATTGTAAGTAGGG;SOR=0.510;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=70;WE=94937454;WS=94937436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,99:0.48:208
chr7	94941038	rs1157745	G	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.266;SC=GAGAAGCATTGGTGATTGCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=94941046;WS=94941028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	94944923	rs854556	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GCCAGATGGCCACATAGGAAG;SOR=1.387;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=10;WE=94944931;WS=94944913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
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chr7	94953895	rs705379	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.186;SOR=1.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
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chr7	95019355	rs6977389	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=438;ReadPosRankSum=0.909;SC=TGGTTTACCCGGAGGTGGGAT;SOR=0.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=25;WE=95019363;WS=95019345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr7	95024046	rs11970910	A	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATAAAACCCAACCCTGGAAGT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=78;WE=95024054;WS=95024036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,83:0.47:175
chr7	95025600	rs13226149	G	A	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1338;ReadPosRankSum=1.675;SC=TAAACGCCAGGAACATCTCCC;SOR=0.922;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=171;TCF=78;TCR=93;TR=84;WE=95025608;WS=95025590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,105:0.50:211
chr7	95034775	rs7493	G	C	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=54;PP=1518;ReadPosRankSum=0.386;SC=AGGCTTCTCAGATAGAATGTT;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=83;WE=95034783;WS=95034765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,93:0.55:168
chr7	95035582	rs3735586	A	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=632;ReadPosRankSum=-0.240;SC=AAATTGTCAAAATCTAAATGA;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=36;WE=95035590;WS=95035572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr7	95039445	rs2286232	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=390;ReadPosRankSum=0.497;SC=TGAGAGGAAACAAAAGGCCTG;SOR=1.152;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=31;WE=95039453;WS=95039435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr7	95041016	rs12026	G	C	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=756;ReadPosRankSum=0.836;SC=AGAATTTTCTGCTTCTTCAAA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=42;WE=95041024;WS=95041006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr7	95041542	rs2068604	G	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.115;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=493;ReadPosRankSum=0.630;SC=TCTCTTCCTAGAAATATGATC;SOR=1.488;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=25;WE=95041550;WS=95041532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr7	95054007	rs12704795	T	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=83;SC=AAACACAGTTTAAGTCTAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=95054015;WS=95053997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	95216697	rs17626204	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=615;ReadPosRankSum=0.389;SC=AACTAGGTGGCTGAGATTAAT;SOR=0.970;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=40;WE=95216705;WS=95216687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr7	95614078	rs6967779	A	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TTTAATTGTCACTTTTTCTTC;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=17;WE=95614086;WS=95614068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr7	95616330	rs62467724	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=360;ReadPosRankSum=0.150;SC=CATAGAGAAAGAGCTCCATAT;SOR=2.030;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=18;WE=95616338;WS=95616320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr7	95727014	rs7794344	T	C	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=369;SC=ATTGCTGTGATATTTTGGGTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=95727022;WS=95727004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	95818475	rs6957286	G	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=399;SC=AAAATTTATCGAGAGTTTTGG;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=95818483;WS=95818465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	95838331	rs62467759	A	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=-0.339;SC=AAAGTAAATGAAGTTCTTTCT;SOR=1.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=16;WE=95838339;WS=95838321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr7	95864108	rs6957975	T	C	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=970;SC=GAAGCATGCTTCTTACCAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=95864116;WS=95864098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	95926165	rs77834136	G	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-1.176;SC=AAAAGTTATAGAACACAAATC;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=23;WE=95926173;WS=95926155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr7	96116813	rs10250692	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=439;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GGTGAGTGGCTGACTCGCCTC;SOR=1.136;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=28;WE=96116821;WS=96116803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr7	96125746	.	G	GC	38.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	96279746	rs6465531	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=699;ReadPosRankSum=0.319;SC=ACCTCGCCCAATGTGTCCTTC;SOR=1.781;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=41;WE=96279754;WS=96279736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr7	96279996	rs56144616	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr7	96280005	rs75928395	C	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr7	96338910	rs62470387	C	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=911;ReadPosRankSum=0.971;SC=CCCGCCGGTGCCCCCAGCTGG;SOR=0.832;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=53;WE=96338918;WS=96338900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr7	96338929	rs10250534	A	G	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=33;PP=2271;SC=GGGCCCGAGCACCCAAGCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=112;WE=96338937;WS=96338919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	96635420	.	A	AGCC	835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=6.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.413;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.246;SOR=2.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr7	96649884	rs3214218	A	AG	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.489;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.732;SC=CTGTAAAAAAAGGGGGGGTCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=96649892;WS=96649874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	97486213	rs2074891	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=19;PP=515;SC=TCACAAAGCTTTATGAATTAA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=97486221;WS=97486203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	97488569	rs1049674	A	T	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=26;PP=1378;SC=GTGCAGGGGTACATCCCGACA;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=97488577;WS=97488559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	97488733	rs7797354	T	C	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=56;PP=1729;SC=AATGATACCTTTATTCAAATT;SOR=1.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=97488741;WS=97488723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	97498535	rs6465630	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=1.413;SC=TCAATATCCAATCCAACTCTG;SOR=1.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=14;WE=97498543;WS=97498525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr7	97592929	rs200019779	CAG	C	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.215;NF=3;NR=9;PP=456;ReadPosRankSum=0.024;SC=TCAGATACTACAGAGTTATAG;SOR=0.674;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=12;WE=97592938;WS=97592919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr7	97593662	rs11982005	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=379;ReadPosRankSum=0.016;SC=TGATGTTATTCGGAATACCCT;SOR=0.620;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=30;WE=97593670;WS=97593652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr7	97599296	rs7784048	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.789;SC=ATAAAGCAAACAGGAAGAACT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=97599304;WS=97599286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr7	97846856	rs11471393	CGAG	C	3137.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=40;PP=2138;SC=CTCGGGGACTCGAGGATCCTG;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=44;WE=97846866;WS=97846846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	97847040	rs2279676	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=304;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CCTTGGGCTCGTGAGGCTGCA;SOR=1.445;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=20;WE=97847048;WS=97847030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr7	97847459	rs56009323	T	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.385;SC=CACTTCGGGGTTTGGGAAGCT;SOR=0.631;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=6;WE=97847467;WS=97847449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr7	97851109	rs4729416	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=557;SC=TTCTCCTCCTTGCATGGGCCA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=97851117;WS=97851099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	97852399	rs11762014	G	A	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=868;ReadPosRankSum=0.770;SC=CTCGGCACCCGGGCTCTCCGG;SOR=0.549;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=54;WE=97852407;WS=97852389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr7	97852586	rs11762703	G	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CAACCCCGGGGCGGGTAGAAA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=97852594;WS=97852576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	97852895	rs2270596	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr7	97852899	rs2270595	A	G	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.25;SOR=2.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	97853184	rs3816943	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=-1.027;SC=CACCACGCGCGGCTCTCAGGA;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=4;WE=97853192;WS=97853174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr7	97854393	rs2291745	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=1.885;SC=CGCTCCACATGTACCGGTCCG;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=12;WE=97854401;WS=97854383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr7	97858647	rs2270603	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=-0.802;SC=ATTAATCAACGCTAAAAAGAC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=15;WE=97858655;WS=97858637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	97860182	rs2270601	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=-0.424;SC=TTGACCCTGCGTGGACTCCAG;SOR=1.270;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=97860190;WS=97860172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	97860939	.	T	C	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=54.82;NF=3;NR=3;PP=54;QD=14.7952020912;SC=TGTACCCCCTTCCCCGGGCAC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=97860947;WS=97860938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	97863145	rs2291750	G	A	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=911;ReadPosRankSum=-1.501;SC=CTGGTCTCTCGACTTCCGAGG;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=53;WE=97863153;WS=97863135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,82:0.58:142
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chr7	97873994	rs1874344	G	A	4722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=81;PP=2785;SC=AGTCGATGGCGTACGTCCACC;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=140;WE=97874002;WS=97873984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
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chr7	98506441	rs35310331	C	T	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1254;ReadPosRankSum=1.295;SC=TCCAGCTCTTCGCCAAGAACA;SOR=0.985;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=184;TCF=102;TCR=82;TR=89;WE=98506449;WS=98506431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,107:0.50:212
chr7	98513283	rs73155624	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=142;ReadPosRankSum=0.587;SC=ACACTTTAGAGTCTGGAGGGT;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=98513291;WS=98513273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	98513300	rs1859662	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=165;ReadPosRankSum=0.835;SC=GGGTATAGACCCTCCTCATTT;SOR=1.051;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=12;WE=98513308;WS=98513290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr7	98522627	.	CA	C	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=0.032;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.574;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr7	98546155	rs75286284	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=446;ReadPosRankSum=0.636;SC=AGAAGAGGAAGTTGTGAGATG;SOR=0.337;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=25;WE=98546163;WS=98546145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr7	98550654	rs66469618	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	1314.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=2997;SC=TCATGTTACATTGTGTGTGTG;SOR=2.526;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=9;WE=98550693;WS=98550644;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.83,0.14:35
chr7	98553739	rs3214240	T	TC	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=583;SC=GCTCCCATGTTCCGGCGTGAT;SOR=3.383;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=98553747;WS=98553729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	98558880	rs160384	G	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=31;PP=1925;SC=GTTGTCCATTGCAGGAGCAGC;SOR=1.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=82;WE=98558888;WS=98558870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	98574511	rs199884954	GA	G	617.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=395;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TTTTAGGGGGGAAAAAAAGTC;SOR=0.406;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=18;WE=98574519;WS=98574501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr7	98574830	rs219842	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=234;ReadPosRankSum=0.466;SC=TGTCGCCCAGCCTGGAGTGCA;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=98574838;WS=98574820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr7	98579319	rs73155663	T	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=552;ReadPosRankSum=2.159;SC=AAAGTGATCTTTTTCCTGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=34;WE=98579327;WS=98579309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr7	98602990	rs219838	G	C	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=65;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.009;SC=GAGAGCCACAGCTCGCTGGGT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=66;TCR=135;TR=96;WE=98602998;WS=98602980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,106:0.45:237
chr7	98609575	rs73145605	T	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.966;SC=GTGCTGAAACTCGACTGGCCC;SOR=0.818;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=98609583;WS=98609565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	98645180	rs73145626	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TCCCTGAAACGCAGACATCAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=98645188;WS=98645170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr7	98648517	rs57957340	TG	T	1044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=6.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr7	98650051	rs219797	G	C	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=442;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TCCCAGGCCCGGAGTCTTCAT;SOR=0.917;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=35;WE=98650059;WS=98650041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr7	98655221	.	TTG	T	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=8.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.477;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.217;SOR=3.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr7	98655232	.	T	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-0.349;QD=41.89;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=2.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr7	98655240	.	T	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=-0.000;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	98659812	rs67817120	GGT	G	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	98659813	.	GTGA	G	55	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=0.9999;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=55;QD=53.264837301;SC=GAACTCCTGGGTGATTCAAGC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=98659825;WS=98659803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	98659816	rs11295323	AT	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	98659817	.	T	A	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=0.9999;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=26;QD=20.2570708491;SC=TCCTGGGTGATTCAAGCAATC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=98659825;WS=98659803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	98785818	rs12673020	A	G	252.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=3.886;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.976;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr7	98878714	rs116893421	G	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=0.519;SC=CGCCCCCTCAGCTTGGGGCCT;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=98878722;WS=98878704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	99128918	rs61735344	A	G	3181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=60;PP=2085;ReadPosRankSum=0.341;SC=AAGAGATACTAGGACAACCAT;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=222;TCF=106;TCR=116;TR=121;WE=99128926;WS=99128908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,139:0.53:263
chr7	99277605	rs28365095	C	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=491;ReadPosRankSum=0.034;SC=CTGGAGCTTCCCTGCCCTGCA;SOR=0.398;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=32;WE=99277613;WS=99277583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr7	99293475	rs2740565	T	A	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=59;PP=2338;SC=ACAAACTGAATCAGAAATCAG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=99293483;WS=99293465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	99293859	.	C	CT	190	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=20;MQ=61.31;NF=2;NR=11;PP=190;QD=15.0;SC=GAAAGGGTGACTTTTTTTTTT;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=13;WE=99293867;WS=99293849;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:26,13:0.33:39
chr7	99297601	rs2037500	A	C	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=53;PP=2523;SC=AGAGGAGCACAAGGCTGACAG;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=120;WE=99297609;WS=99297591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	99297804	rs2177180	C	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=440;SC=GAGAAGGAGGCGGGGCTGCAG;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=99297812;WS=99297794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	99302994	rs10211	C	T	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=19;PP=1714;SC=ACAGAATCCCCGATTATTTAT;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=76;WE=99303002;WS=99302984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	99303094	rs12360	G	A	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=72;PP=2443;SC=CAGCTTTCTTGAAGAGCAAAC;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=99303102;WS=99303084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	99306566	rs2687077	C	T	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=793;SC=GACAAGCAAACGATTGTACAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=99306574;WS=99306556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	99306685	rs2257401	C	G	5952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=81;PP=2965;SC=CTCAGGCTCTCTCCAGTACTT;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=178;WE=99306693;WS=99306675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	99314986	rs2687075	A	G	6890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=111;PP=2965;SC=GTGACATTGTATAATGAATTT;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=94;TCR=111;TR=205;WE=99314994;WS=99314976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr7	99365943	rs2687116	C	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=28;NR=22;PP=950;SC=TTTAAGAGAGCAAGATAAATA;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=99365951;WS=99365933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	99370493	rs2738258	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=949;SC=CAGGAGCCACTCAAGTCTTCA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=99370501;WS=99370483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	99457605	rs680055	C	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.281;SC=CGCAGTTTTACCCAATAAGGT;SOR=1.384;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=53;WE=99457613;WS=99457595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr7	99459256	rs17342647	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=790;ReadPosRankSum=1.268;SC=CCTACGATGCCCTGGTACAGA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=46;WE=99459264;WS=99459246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr7	99473624	rs1025576	T	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=454;SC=AAGGAAGCTATCTCCCTGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=99473632;WS=99473614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	99473858	rs17161997	G	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=860;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TTCTGCAATAGAGTGCACTGG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=53;WE=99473866;WS=99473848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr7	99474427	rs2572023	A	G	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=84;PP=2965;SC=CTTCAGGATGATTGTGGAGAC;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=141;WE=99474435;WS=99474417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	99474729	rs2572022	T	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=707;SC=TGGGGTCCAGTATACCCAAGG;SOR=2.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=99474737;WS=99474719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	99490501	rs6957718	T	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=91;ReadPosRankSum=0.466;SC=GCTGCCCAACTGATCCTCAGC;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=7;WE=99490509;WS=99490491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr7	99499872	rs2527913	A	T	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=826;SC=GGTTCTTTTTAGTTTGTTTGT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=99499880;WS=99499862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	99500899	rs2247762	T	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=926;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TCTTCACCTTTACAGCTTCAA;SOR=0.695;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=54;WE=99500919;WS=99500889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr7	99500911	rs2247761	A	G	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=54;PP=2338;SC=CAGCTTCAAGAGAATAGTTCA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=109;WE=99500919;WS=99500889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	99501313	rs2572003	A	T	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=72;PP=2406;SC=TGACGGTTGCATTTGCTCATG;SOR=1.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=114;WE=99501321;WS=99501303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr7	99514417	rs2571997	A	C	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=36;PP=1212;SC=AACAAAAAAAACGATCATATC;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=99514425;WS=99514407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr7	99702947	rs41280968	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=501;ReadPosRankSum=0.179;SC=CGAATCCTCCGCTTGCAACCA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=36;WE=99702955;WS=99702937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,40:0.38:104
chr7	99703958	rs2293479	T	C	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=955;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GGGGAGAGAGTGAGCTCAGCA;SOR=0.617;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=67;WE=99703966;WS=99703948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
chr7	99704827	rs1050542	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.615;SC=ACGTGTGTACATGTCTGCATG;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=99704835;WS=99704817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr7	99707950	rs4134917	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=479;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GGATGATTGACAGGGACCTAA;SOR=0.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=34;WE=99707958;WS=99707940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
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chr7	99711040	rs4134903	G	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=795;ReadPosRankSum=-1.619;SC=TGCAAGGAAGGCAGGTGTCAA;SOR=0.720;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=56;WE=99711048;WS=99711030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr7	99711461	rs34119670	AC	A	1627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.451;NF=21;NR=30;PP=716;ReadPosRankSum=1.023;SC=ATGGCGTCTCACCCCCCCCCC;SOR=0.887;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=51;WE=99711469;WS=99711451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,72:0.60:121
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chr7	99720640	rs1569055	C	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=23;PP=696;SC=GGGGAAGGGGCCAGAGTGAGG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=99720648;WS=99720630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	99722266	rs1880949	G	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=511;ReadPosRankSum=1.142;SC=TAAGCGTAAGGGTTGAACTCC;SOR=0.774;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=38;WE=99722274;WS=99722256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr7	99746444	rs58185311	CG	C	850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.238;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.981;NF=17;NR=5;PP=885;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GGTCTGACGACGTGGCCACTG;SOR=2.230;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=22;WE=99746452;WS=99746434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr7	99747130	rs12878	G	A	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1175;ReadPosRankSum=-1.777;SC=AGACTTCTGCGCTGACCCAGG;SOR=0.442;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=81;WE=99747138;WS=99747120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,110:0.52:211
chr7	99747378	rs7785392	G	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TGGAATCTTAGTCTCCTAACG;SOR=0.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=9;WE=99747386;WS=99747368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
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chr7	99751281	rs3736590	G	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=885;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GGGACTCCCTGGTATCAGAAT;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=59;WE=99751289;WS=99751271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
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chr7	99802812	rs2246713	G	C	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1313;ReadPosRankSum=0.158;SC=TGAGGGCCCAGTAGCCCCTTC;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=81;WE=99802820;WS=99802802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,93:0.46:201
chr7	99810643	rs1618851	T	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=417;ReadPosRankSum=-2.285;SC=ACTGGTGTCTTACAAACAGCA;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=23;WE=99810651;WS=99810633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr7	99811204	rs1623264	G	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=409;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GCCTGATCCTGGTGCCCACAC;SOR=0.158;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=26;WE=99811212;WS=99811194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr7	99811313	rs1624099	G	A	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1360;ReadPosRankSum=-1.216;SC=CGAAGTGACAGGAGTGTGTAA;SOR=1.000;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=75;WE=99811321;WS=99811303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr7	99811464	rs1727130	C	G	3328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=52;PP=2291;ReadPosRankSum=-0.784;SC=ATGTATCCTTCGGAAATGCTG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=134;TCR=93;TR=127;WE=99811472;WS=99811454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,141:0.55:258
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chr7	99816256	rs1727143	C	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.036;NF=11;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GAGAGTCTTCCGTTACTAGGT;SOR=0.651;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=30;WE=99816264;WS=99816246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,31:0.27:115
chr7	99816272	rs1636986	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-7.224;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,18:0.22:80
chr7	99816275	rs1636987	G	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-7.827;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr7	99816285	rs79649688	A	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-7.358;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr7	99817859	rs2906645	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=217;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GGGGGGCCCCAACGGTGCTGG;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=17;WE=99817867;WS=99817849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr7	99818137	rs2906646	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.129;NF=5;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CTCGGGAACTGGCCACCCATC;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=13;WE=99818145;WS=99818127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr7	99818927	rs705867	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.835;NF=10;NR=21;PP=404;ReadPosRankSum=0.561;SC=CTGGGTGTCACCCCCTTACTT;SOR=0.820;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=31;WE=99818935;WS=99818917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr7	99819004	rs141918023	CTCTG	C	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.600;NF=0;NR=11;PP=427;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CGGATGTGGTCTCTGTGTGTG;SOR=0.153;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=99819015;WS=99818994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	99821381	rs858508	C	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.125;NF=5;NR=13;PP=282;ReadPosRankSum=1.521;SC=AACCTCTCACCCTGAGACTCT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=18;WE=99821389;WS=99821371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr7	99821470	rs858509	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-5.292;NF=17;NR=6;PP=330;ReadPosRankSum=-1.500;SC=AGGCGGGCCCAAGTGTGCAAG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=23;WE=99821478;WS=99821460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr7	99821685	rs863450	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.929;NF=7;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=0.289;SC=TCAGGTGCTCCGAGGAGGGCA;SOR=0.624;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=26;WE=99821693;WS=99821675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr7	99956290	rs2906644	C	G	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.507;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.827;NF=34;NR=12;PP=746;ReadPosRankSum=-1.597;SC=GTCTCTCCCCCACTCACTCCC;SOR=1.288;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=46;WE=99956298;WS=99956280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
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chr7	100013457	rs5015756	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=1.512;SC=AAATTATTCTTTCGGCAGCAT;SOR=1.251;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=15;WE=100013465;WS=100013447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
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chr7	100175473	rs909152	T	C	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GTTCTCTGGGTCCCCGGGGCT;SOR=0.777;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=89;WE=100175481;WS=100175463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,112:0.47:240
chr7	100179857	rs11761260	G	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=614;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CCATCCTCTCGGGGTCACTGG;SOR=0.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=44;WE=100179865;WS=100179847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr7	100224354	.	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.238;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr7	100227188	rs7457868	A	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=-2.458;SC=TGGGTGCCTGAGGTCATTCTG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=100227196;WS=100227178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	100240771	rs1052897	A	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1012;ReadPosRankSum=0.281;SC=CATCACCATTAATGAGGACAA;SOR=0.490;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=130;TCF=89;TCR=41;TR=69;WE=100240779;WS=100240761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,91:0.56:163
chr7	100243936	.	G	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=491;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GCTGTTGCTGGCAATGAGTTT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=31;WE=100243944;WS=100243926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr7	100275110	rs78530908	C	G	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.311;SC=GGCGCTTCCCCTGCTCCGCAG;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=85;TCR=60;TR=88;WE=100275118;WS=100275100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,103:0.59:175
chr7	100280896	rs221793	A	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1156;ReadPosRankSum=1.434;SC=AGGGTTGTCCACCCAGCCAGC;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=74;WE=100280904;WS=100280886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr7	100281768	rs221794	T	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=746;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GCGCGCACTGTGGGAGCTGGC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=55;WE=100281776;WS=100281758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr7	100283261	rs221795	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	100284510	rs35436931	TG	T	662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.484;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.175;NF=2;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=-1.558;SC=CAAGAAACGTTGGGGGGGCCA;SOR=1.460;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=18;WE=100284518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr7	100284913	rs221796	C	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=675;ReadPosRankSum=0.746;SC=GCCCCCTCCCCGCCCCACCTG;SOR=0.439;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=45;WE=100284921;WS=100284903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr7	100285974	rs221797	A	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=474;ReadPosRankSum=-0.409;SC=ACGAAGGAGAACTTTAAAGCG;SOR=0.226;Source=Platypus;TCR=11;TR=30;WE=100285982;WS=100285964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr7	100371100	rs2734880	C	A	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=45;PP=1562;SC=ACTGACCCAGCGGGCTCCTAC;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=67;WE=100371122;WS=100371090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	100371114	rs314298	C	T	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=43;PP=1360;SC=CTCCTACCACCCGGTGAGAGG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=59;WE=100371122;WS=100371090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	100371417	rs12673041	G	A	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1558;ReadPosRankSum=-0.537;SC=AACATCACCTGCTTCCAGAGC;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=90;TCR=105;TR=98;WE=100371425;WS=100371407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,124:0.49:253
chr7	100371473	rs314299	C	T	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=48;PP=1140;ReadPosRankSum=0.179;SC=TGGGCTGCTCCGTTTCGGGCC;SOR=0.795;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=71;WE=100371481;WS=100371463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr7	100374087	rs314300	A	G	7335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=89;PP=2965;SC=GGGAACTTCAATGATGAGGAA;SOR=1.087;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=133;TCR=89;TR=221;WE=100374095;WS=100374077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr7	100374265	rs149853621	TCCCTC	T	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.26;QD=40.62;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	100376978	rs314303	T	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=13;PP=1634;SC=CCAGCCTGGGTGACAGAGCAA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=100376986;WS=100376968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	100383605	rs160602	T	A	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=25;PP=1507;SC=TTTCTCTTCCTGTAACTTCTA;SOR=1.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=100383613;WS=100383595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	100385561	rs72364644	GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT	G	6725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=42;PP=2908;SC=CACATTTGACGGCTTCAGCTA;SOR=1.279;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=52;WE=100385603;WS=100385551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	100386900	rs191137	T	C	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=34;PP=1365;SC=GGTCACCCTGTGGGGCCAACG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=69;WE=100386908;WS=100386890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	100391581	rs314339	T	C	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=63;PP=2322;SC=ATGCCTACAGTGGCACCCAGA;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=117;WE=100391589;WS=100391571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	100391644	rs314340	T	C	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=49;PP=1946;SC=CTACCAGGTCTGAGCTGGCAG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=102;WE=100391652;WS=100391634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr7	100393141	rs314343	C	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=ATTAATATATCTTGTATATTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=100393149;WS=100393131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	100395003	rs314344	G	C	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=36;PP=1926;SC=AACCTGGTGGGCGTCCTACTG;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=100395011;WS=100394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	100401270	rs314348	T	G	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=32;PP=979;SC=CGCTCTCCTCTCTTGGCTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=100401278;WS=100401260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	100410657	rs314358	A	G	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.121;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CTCCCGCTCCAGTGTGGCCCT;SOR=0.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=182;WE=100410665;WS=100410647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr7	100411278	rs314359	T	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=24;PP=1398;SC=ACCCACCATGTCCGATGAGAT;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=100411286;WS=100411268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	100416250	rs144173	A	G	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=87;PP=2965;SC=CCCGGATGTCAGACACTGCAG;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=172;WE=100416258;WS=100416240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr7	100416332	rs314364	T	A	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.48;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	100416354	rs314365	G	C	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=46;PP=1491;SC=AGACGGAGTCGTGCTCTATCA;SOR=1.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=100416362;WS=100416344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	100424586	rs35907339	CG	C	3166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=35;PP=2426;SC=CGCCCCCCCCCGCAAGGAAAC;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=53;WE=100424594;WS=100424576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	100453208	rs314370	T	C	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=5;PP=1539;SC=ATGAGTGACTTGGGCAAAGCC;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=58;WE=100453216;WS=100453198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	100456595	rs314373	G	A	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=39;PP=1715;SC=CCTCCTGGGGGTTTGGGGCTG;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=100456603;WS=100456585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	100456611	rs314374	G	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=40;PP=1889;SC=GGCTGCCACCGTGAGGGACCC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=87;WE=100456619;WS=100456601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	100458795	rs314378	T	C	8035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=120;PP=2965;SC=ACACACTGGCTGCTGTGGTCA;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=125;TCR=120;TR=244;WE=100458803;WS=100458785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr7	100465355	rs12705089	C	T	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=12;PP=839;SC=GGGGAACAGCCGCCTGCGCTC;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=100465363;WS=100465345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	100467975	rs10627414	C	CCT	1569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=11;PP=925;SC=GGACCGAGCCCGATTCCCACC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=100467983;WS=100467965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	100468284	rs1054391	A	G	6069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=90;PP=2965;SC=GCTGCTTTGTATGTTCTACAT;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=172;WE=100468292;WS=100468274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr7	100468398	rs7783543	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=42;PP=1146;SC=AGGGAGTCAGTGGCTGGATGC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=100468406;WS=100468388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	100481658	rs11310439	GT	G	4461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=46;PP=2966;SC=TCCAATAACTGTTTTGTCTTT;SOR=1.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=100481666;WS=100481648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	100482026	rs15624	T	C	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=68;PP=2639;SC=AGAATGATCTTCGCATCCTGG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=120;WE=100482034;WS=100482016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr7	100482526	rs6942607	C	G	4530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=66;PP=2632;SC=CTTGTCCCCTCTGCTGTGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=133;WE=100482534;WS=100482516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	100482720	rs3757868	G	A	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=24;PP=1141;SC=GAGGTGAGAGGTTGGCGACAT;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=100482728;WS=100482710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	100484169	rs17162528	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TCGCCTGCTCACTCATTTGCC;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=100484177;WS=100484159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr7	100484381	rs12705095	T	G	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=23;PP=1729;SC=TCTGAAGGTCTTCTCTGCCTT;SOR=2.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=89;WE=100484389;WS=100484371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	100484917	rs6954151	C	T	6306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.106;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.446;SC=TGCCAACCTTCCTTCCTCTGT;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=94;TCR=95;TR=187;WE=100484925;WS=100484897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,228:1.00:229
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chr7	100486656	rs13241786	T	G	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=61;PP=2142;SC=TGCCTGACCCTACGCAGACTC;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=104;WE=100486664;WS=100486646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
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chr7	100549650	rs73398716	A	G	4482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=71;PP=2765;ReadPosRankSum=0.541;SC=CACCTATGACACTCACTACCT;SOR=0.949;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=425;TCF=243;TCR=182;TR=187;WE=100549658;WS=100549640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:282,219:0.44:501
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chr7	100550338	rs75318416	GG	CA	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=5.418;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-4.852;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,55:0.21:262
chr7	100550342	rs74184351	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=7.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-4.559;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,58:0.23:255
chr7	100550347	rs74218792	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-4.008;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,27:0.11:248
chr7	100550354	rs74220905	C	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=6.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-5.127;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.215;SOR=1.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,44:0.18:251
chr7	100550358	rs74184446	C	T	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=12.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-3.013;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.138;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,65:0.26:253
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chr7	100551433	rs73398732	T	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1709;ReadPosRankSum=2.965;SC=AACCACAGACTTTCCCTCTAT;SOR=0.763;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=299;TCF=149;TCR=150;TR=111;WE=100551441;WS=100551423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,103:0.32:318
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chr7	100551473	rs79233494	G	C	5077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=4.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=-2.073;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,131:0.38:341
chr7	100551476	rs74460367	C	T	4851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=5.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.941;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,135:0.38:351
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chr7	100552094	rs62483698	G	C	3561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=81;PP=2741;ReadPosRankSum=0.977;SC=TCTATCACAGGCTTTCCTAGT;SOR=0.528;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=347;TCF=157;TCR=190;TR=156;WE=100552102;WS=100552084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,162:0.42:389
chr7	100552117	rs62483699	G	T	3691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=80;PP=2619;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CTCTTCCTCTGCAACTACCAG;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=329;TCF=162;TCR=167;TR=159;WE=100552125;WS=100552107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,172:0.45:380
chr7	100552135	rs62483700	T	C	3737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=76;PP=2586;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CAGCACTTCTTCAACCAGCTC;SOR=0.575;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=313;TCF=151;TCR=162;TR=157;WE=100552143;WS=100552125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,175:0.47:370
chr7	100552251	rs9691900	T	C	7687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=111;PP=2965;SC=TCCCTGCCTCTCCCACTGATC;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=117;TCR=111;TR=228;WE=100552259;WS=100552241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr7	100552311	rs12535515	C	T	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.034;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=1553;ReadPosRankSum=0.206;SC=CTCCCACCACCCCATTAACAG;SOR=0.845;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=227;TCF=111;TCR=116;TR=100;WE=100552319;WS=100552301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,111:0.43:257
chr7	100552338	rs73398798	C	T	3218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1409;ReadPosRankSum=-1.633;SC=CCTTTACTACCGAAATGGTCA;SOR=1.024;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=212;TCF=95;TCR=117;TR=90;WE=100552346;WS=100552328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,101:0.42:243
chr7	100552358	rs73714254	C	G	3474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.134;SC=ACCTGTCCTACCTCCATCAGT;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=208;TCF=91;TCR=117;TR=89;WE=100552398;WS=100552348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,98:0.40:246
chr7	100552371	rs73714255	C	G	3373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.134;SC=CCATCAGTATCCAAACTACTC;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=94;TCR=103;TR=79;WE=100552398;WS=100552348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,87:0.38:228
chr7	100552384	rs75597914	A	G	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,85:0.36:233
chr7	100552390	rs73714257	T	C	3089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,87:0.37:235
chr7	100552412	rs73714259	T	C	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1212;ReadPosRankSum=0.751;SC=TCTTCCATGATGCCAGAAAGT;SOR=0.838;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=193;TCF=94;TCR=99;TR=80;WE=100552420;WS=100552402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,88:0.39:228
chr7	100552435	rs76244845	TC	AT	3578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=6.264;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.565;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,94:0.39:242
chr7	100552440	rs80290400	C	T	3660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=5.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,101:0.40:253
chr7	100552535	rs73163758	GT	AC	6814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=57;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.405;SC=CTGAGCAACAGTTCTGTGATC;SOR=0.599;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=321;TCF=183;TCR=138;TR=136;WE=100552558;WS=100552525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,179:0.46:387
chr7	100552549	rs73163760	CT	AC	7038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=61;PP=2944;ReadPosRankSum=1.147;SC=TGTGATCCCCCTACCTCTTCC;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=188;TCR=140;TR=140;WE=100552558;WS=100552525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,185:0.45:411
chr7	100552644	rs2904850	C	A	7579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:401,267:0.40:668
chr7	100552657	rs75471530	A	G	9946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:426,262:0.38:688
chr7	100552657	.	ACT	GCC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=117;NR=103;PP=2944;QD=20;SC=CCCACCCACCACTAGGACTTC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=587;TCF=318;TCR=269;TR=220;WE=100552667;WS=100552634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:367,220:0.37:587
chr7	100552659	rs78182596	T	C	10150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:435,267:0.38:702
chr7	100552675	rs73163764	C	T	8654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=756;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.584;SC=TTCAGAGACACCAGTGGCCAC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=643;TCF=340;TCR=303;TR=262;WE=100552683;WS=100552665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:459,292:0.39:751
chr7	100552710	.	ATC	A	10412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:470,283:0.38:753
chr7	100552714	.	C	CGT	10761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DP=761;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:469,287:0.38:756
chr7	100552727	rs74529310	G	C	10088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=775;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=2.040;SC=AGGACAACTCGCATCACTTCT;SOR=0.640;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=641;TCF=329;TCR=312;TR=250;WE=100552747;WS=100552701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:479,286:0.37:765
chr7	100552738	rs79874934	CA	TG	10810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=780;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=119;PP=2944;ReadPosRankSum=2.044;SC=CATCACTTCTCAGATGACCAC;SOR=0.667;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=648;TCF=328;TCR=320;TR=238;WE=100552747;WS=100552701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:486,288:0.37:774
chr7	100552788	rs73398800	C	T	4858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=638;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GGACCTTCTGCCTCTCTGTTC;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=536;TCF=249;TCR=287;TR=201;WE=100552796;WS=100552778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:390,239:0.38:629
chr7	100552837	rs73714264	G	A	6814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=509;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=96;PP=2768;ReadPosRankSum=0.902;SC=TGTCACTGAGGTCAGGCTTTA;SOR=0.523;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=438;TCF=175;TCR=263;TR=167;WE=100552845;WS=100552827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:301,198:0.40:499
chr7	100552854	rs73714265	G	A	6891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=1.083;SC=TTTATCCTGAGCTTCCCTTTC;SOR=0.395;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=374;TCF=151;TCR=223;TR=152;WE=100552875;WS=100552844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,178:0.42:427
chr7	100552867	rs73714266	T	C	6404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=0.483;SC=TCCCTTTCTTTCTGTGTTTTC;SOR=0.306;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=329;TCF=133;TCR=196;TR=143;WE=100552875;WS=100552844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,168:0.44:378
chr7	100552915	rs2904852	A	C	14223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=162;PP=2965;SC=GGGAACAGGGACAGTGTGCTT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=311;TCF=149;TCR=162;TR=311;WE=100552923;WS=100552905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr7	100552978	rs73163765	T	C	6904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,181:0.47:382
chr7	100552984	rs73163766	T	C	7007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.221;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,181:0.48:380
chr7	100553002	rs68094465	A	G	6732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=84;PP=2288;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATGGCCTCAAATGCCAGTGCC;SOR=0.777;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=322;TCF=153;TCR=169;TR=155;WE=100553010;WS=100552992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,185:0.48:387
chr7	100553073	rs73714269	T	A	5515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.095;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,148:0.46:322
chr7	100553077	rs73714270	A	C	5308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,139:0.46:305
chr7	100553117	rs73400705	G	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=45;PP=1129;ReadPosRankSum=0.778;SC=GGGTGTCACTGACTCTCCCCA;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=141;TCF=42;TCR=99;TR=65;WE=100553125;WS=100553107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,80:0.47:171
chr7	100607640	.	G	GCT	2290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.027;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=1.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr7	100607642	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.01;NF=40;NR=7;PP=2962;QD=20;SC=TGACCTCTGCCCTCTTTCCCC;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=109;TCF=87;TCR=22;TR=47;WE=100607654;WS=100607632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr7	100607643	.	CTCT	C,CCT	2313.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.008;NF=30;NR=7;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GACCTCTGCCCTCTTTCCCCC;SOR=1.275;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=37;WE=100607654;WS=100607632;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:121
chr7	100607851	rs6960854	C	G	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=59;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.170;SC=AGGAGGGGCTCCAGAACGCCA;SOR=1.009;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=161;TCF=59;TCR=102;TR=89;WE=100607859;WS=100607841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,97:0.52:188
chr7	100607871	rs6960868	C	T	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1172;ReadPosRankSum=0.246;SC=AGCCAGGATGCGAACAGCTGC;SOR=1.132;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=65;WE=100607879;WS=100607861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr7	100607903	rs6961167	G	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=37;PP=890;ReadPosRankSum=-2.517;SC=GAGTGAGCCCGGGCTGGAGGG;SOR=0.996;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=19;TCR=70;TR=46;WE=100607911;WS=100607893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
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chr7	100608194	.	C	CGTCTGGG	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.770;SOR=1.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
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chr7	100608416	rs77070494	C	T	3761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=5.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=1.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,97:0.42:230
chr7	100608419	rs79505270	CT	GG	3683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=2.555;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.074;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,95:0.42:224
chr7	100608423	rs77841377	C	T	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,84:0.41:204
chr7	100608472	rs10251045	C	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.457;HP=4;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=671;ReadPosRankSum=0.502;SC=GAGACCTTTGCGGGAGGCAAG;SOR=0.148;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=35;WE=100608480;WS=100608462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr7	100608493	rs77278976	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr7	100608498	rs77518728	A	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr7	100608502	rs76981580	T	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr7	100608572	rs10251414	G	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=402;ReadPosRankSum=1.438;SC=GAGGGTGCTGGGGGTGGCCTC;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=22;WE=100608580;WS=100608562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr7	100608662	rs74929976	A	G	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAGAGGCACCATTATCAGGCC;SOR=0.436;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=167;TCF=119;TCR=48;TR=80;WE=100608670;WS=100608652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,96:0.49:197
chr7	100608710	rs62483706	A	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1678;ReadPosRankSum=1.959;SC=CTCTGTGCATACCCCTCCCCA;SOR=0.578;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=228;TCF=131;TCR=97;TR=99;WE=100608718;WS=100608700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,115:0.44:262
chr7	100608778	rs73163792	TC	CT	5228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.947;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=59;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TCTACTTCCCTCTGGTGGAGG;SOR=0.486;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=272;TCF=125;TCR=147;TR=118;WE=100608787;WS=100608768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,141:0.45:311
chr7	100608826	rs73163794	C	G	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1880;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GCACGTCGGGCGTGGACAACG;SOR=0.484;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=234;TCF=102;TCR=132;TR=117;WE=100608834;WS=100608816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,135:0.50:270
chr7	100608868	rs67377634	A	G	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=1328;ReadPosRankSum=0.626;SC=AGTGCGTTCTAGAGACGAGCG;SOR=0.666;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=58;TCR=108;TR=90;WE=100608876;WS=100608858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,98:0.53:184
chr7	100608884	rs73163797	G	A	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=51;PP=1134;ReadPosRankSum=1.669;SC=GAGCGGTCCCGCGTGTCGGTA;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=34;TCR=93;TR=71;WE=100608892;WS=100608874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
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chr7	100608920	rs2904863	T	C	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.136;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
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chr7	100610069	rs10258821	C	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1144;ReadPosRankSum=0.215;SC=TACAAATTTCCATGTGGCCTT;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=77;WE=100610077;WS=100610059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,85:0.44:194
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chr7	100612786	rs73168325	G	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.356;NF=19;NR=3;PP=1546;ReadPosRankSum=-1.948;SC=ACTTTGCTCTGCTTCAAGGCA;SOR=1.414;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=22;WE=100612794;WS=100612756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr7	100612839	rs76449674	A	G	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.689;QD=16.70;ReadPosRankSum=2.780;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr7	100612842	rs79514982	T	C	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.636;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.191;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,49:0.43:113
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chr7	100612869	rs74554402	G	A	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.709;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.973;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,60:0.41:146
chr7	100612875	rs75162633	C	T	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.700;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.388;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr7	100612898	rs73168327	T	C	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.796;NF=35;NR=29;PP=920;ReadPosRankSum=-0.959;SC=GCCCGTTCCCTGGGAGATGCT;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=64;WE=100612906;WS=100612888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,76:0.39:197
chr7	100612945	rs76619309	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.446;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,66:0.33:202
chr7	100612952	rs79881008	G	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.457;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,65:0.32:201
chr7	100612955	rs150485202	A	ACTG	2382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.451;NF=11;NR=26;PP=2964;ReadPosRankSum=0.385;SC=CGCGTCCGTTACTACAGTGAC;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=37;WE=100612977;WS=100612935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,66:0.33:203
chr7	100612961	rs78487486	G	C	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=5.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.200;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,63:0.32:196
chr7	100612969	rs73168328	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=5.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,61:0.32:189
chr7	100612996	rs76589634	A	G	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.223;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CTGATGCTCCAGGTCCAGTGC;SOR=1.171;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=48;WE=100613035;WS=100612986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,52:0.32:164
chr7	100613010	rs80354726	T	C	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,48:0.33:146
chr7	100613011	rs79331440	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=5.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=1.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,48:0.33:144
chr7	100613018	rs78041688	A	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=6.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr7	100613027	rs73168330	T	C	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=7.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.959;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr7	100613059	rs66842488	GCCT	G	874.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.115;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=900;ReadPosRankSum=1.801;SC=GCTGCAGGTGGCCTCCTCCCC;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=23;WE=100613069;WS=100613049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr7	100613107	rs73168333	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr7	100613112	rs75250895	G	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.15;ReadPosRankSum=-1.330;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	100613127	rs73168334	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.95;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
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chr7	100615311	rs79784813	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chr7	100615521	rs79951460	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
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chr7	100615533	rs75698243	C	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr7	100616095	.	G	GCAAC	559	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=28;MQ=58.4;NF=2;NR=0;PP=559;QD=301.0;SC=CCCAGCATCTGTAGCTTTTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=2;WE=100616111;WS=100616085;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
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chr7	100616185	rs79851456	CA	TG	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.358;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-1.693;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
chr7	100616195	rs77180957	GC	CT	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.456;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.367;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,12:0.19:63
chr7	100616199	rs78022349	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr7	100616227	rs75588135	A	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=2.205;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr7	100616227	.	AGG	TGC	775	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=73;MMLQ=27;MQ=59.95;NF=12;NR=11;PP=775;QD=36.0203423853;SC=TCATTTCCACAGGTCTGCAGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=23;WE=100616237;WS=100616217;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr7	100616229	rs78091742	G	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=8.27;ReadPosRankSum=2.404;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr7	100616245	rs79948354	C	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=2;HapScore=3;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=603;ReadPosRankSum=2.578;SC=AGGGGAGCTACGGTGCAGGAA;SOR=1.154;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=22;WE=100616266;WS=100616235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr7	100616258	rs73168346	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=603;ReadPosRankSum=0.582;SC=TGCAGGAATGCCCTGAAAGAT;SOR=0.728;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=19;WE=100616266;WS=100616235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr7	100616277	rs117288840	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=6.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=1.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr7	100616279	.	C	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=6.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr7	100616288	rs201235128	G	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=16.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.380;SOR=2.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr7	100616293	rs202012524	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=16.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.191;SOR=2.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr7	100616310	rs199943216	G	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=15.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=3.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
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chr7	100616338	.	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=12.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr7	100616344	.	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.036;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr7	100616362	.	TAA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=2.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,3:0.14:22
chr7	100616366	.	A	ACATGTTTGTTTATTTATT	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.158;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr7	100624718	rs4363124	G	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=471;ReadPosRankSum=1.142;SC=AGAGCCGAGGGCTTTAGCCTG;SOR=1.133;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=27;WE=100624726;WS=100624708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr7	100634476	rs6980143	C	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=371;ReadPosRankSum=0.305;SC=TCCCCTGGCACTACCACACCA;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=21;WE=100634484;WS=100634466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr7	100634640	rs1791	T	G	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ACTGTCCCCTTCCAGCTCTAC;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=107;TCR=71;TR=83;WE=100634648;WS=100634630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,101:0.48:210
chr7	100634964	rs4370452	C	A	3316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.668;NF=74;NR=39;PP=1969;ReadPosRankSum=-1.628;SC=AATGCACTTCCCTGAAAGCTC;SOR=0.871;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=184;TCF=113;TCR=71;TR=113;WE=100634972;WS=100634954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,142:0.65:220
chr7	100635375	rs10808115	A	C	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.91;MQRankSum=-0.615;NF=48;NR=76;PP=1845;ReadPosRankSum=0.607;SC=CTTACCTGCCAGCATGACAAG;SOR=0.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=178;TCF=67;TCR=111;TR=124;WE=100635383;WS=100635365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,156:0.72:217
chr7	100635591	rs10953312	C	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.145;NF=19;NR=10;PP=501;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CTTCCACAGCCGCCCAGGCTC;SOR=0.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=29;WE=100635599;WS=100635581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr7	100635661	rs10953313	T	C	3150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.490;NF=47;NR=23;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GAAGCATCTATGCCCGTCCAC;SOR=0.970;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=70;WE=100635669;WS=100635651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,77:0.56:138
chr7	100635679	rs10953314	C	G	3813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.590;NF=67;NR=29;PP=1729;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CACAGCAGCACCAGATCGCCA;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=108;TCR=50;TR=96;WE=100635687;WS=100635669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,113:0.58:194
chr7	100647819	rs11766024	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.575;NF=11;NR=5;PP=225;ReadPosRankSum=0.927;SC=TACCAGCTACCACAGCAGCCC;SOR=0.910;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=16;WE=100647827;WS=100647809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr7	100647875	rs11766048	C	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=514;ReadPosRankSum=-1.407;SC=CCACAACCTCCGGCCGTAGTG;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=34;WE=100647883;WS=100647865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr7	100647920	rs11772963	A	C	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=840;ReadPosRankSum=2.128;SC=GCCCAGATACAAATGGAATCA;SOR=0.915;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=43;WE=100647928;WS=100647910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr7	100648029	rs10953315	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1133;ReadPosRankSum=1.772;SC=AGCCAGCACTGCCACAACACC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=76;WE=100648037;WS=100648019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr7	100648117	rs11766125	C	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=1000;ReadPosRankSum=0.727;SC=GCCAGCATGACAAGCTCCAGC;SOR=0.886;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=58;WE=100648125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr7	100651855	rs12532750	A	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=715;ReadPosRankSum=1.667;SC=GAATGTATCAATCCTGGGGGA;SOR=0.285;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=40;WE=100651863;WS=100651845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr7	100652317	rs12540832	T	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=257;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TCAAGAAGGGTAACAGGAGAG;SOR=1.292;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=100652325;WS=100652307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr7	100656003	rs3924886	G	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=388;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CATTGGCCCAGGGGAGGGCAT;SOR=1.675;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=21;WE=100656011;WS=100655993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr7	100675976	rs56103274	G	A	4792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=92;PP=2822;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TGTGACCACTGCTAGTGAAGC;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=440;TCF=225;TCR=215;TR=191;WE=100675984;WS=100675966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,230:0.44:518
chr7	100679902	rs55974941	A	G	6241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=573;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.986;NF=125;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CAACTTCTGAAGGTACCAGCA;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=492;TCF=256;TCR=236;TR=240;WE=100679910;WS=100679892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:291,281:0.49:572
chr7	100681762	rs10953316	A	G	5732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.637;NF=129;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GTTTTGAAACAAGCACACTTT;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=492;TCF=272;TCR=220;TR=233;WE=100681770;WS=100681752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:287,269:0.48:556
chr7	100692341	rs4515470	C	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GGGCTGTTCCCTTGTTAGATG;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=100692349;WS=100692331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	100692680	rs10246021	T	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=295;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GTCTGGGCCCTTGGGAAGAGG;SOR=0.814;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=28;WE=100692688;WS=100692670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
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chr7	100695058	rs6966570	T	C	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.07;MQRankSum=-0.965;NF=28;NR=25;PP=952;ReadPosRankSum=0.670;SC=ATCACGGCTGTTCCCTGTCCC;SOR=0.701;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=53;WE=100695066;WS=100695048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,70:0.49:143
chr7	100731505	rs4524722	C	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGGCCAGGGCCGCAGCCGCCT;SOR=0.950;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=15;WE=100731513;WS=100731495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
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chr7	100775087	rs143613360	A	AAAC	378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=-1.067;SC=CTCCATCTCAAAACAACAACA;SOR=1.739;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=100775100;WS=100775077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr7	100776931	rs2227684	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=726;ReadPosRankSum=1.566;SC=TGCCATCAGCGAGAGCTGGAG;SOR=1.002;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=36;WE=100776939;WS=100776921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr7	100780176	rs2227694	A	G	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=4;PP=1271;SC=CTGCACTCCCACCTGGGCGAC;SOR=4.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=100780184;WS=100780166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	100781445	rs7242	T	G	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.330;SC=GAGGAAGAAATGTCAGATGCG;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=64;WE=100781453;WS=100781435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr7	100800131	rs4727481	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=16;PP=340;SC=ATGGTCGTCCTGTAGGTCAGG;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=100800139;WS=100800121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	100800635	rs2074686	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=397;SC=TTGTAGCGATGTCTCATGCGC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=100800643;WS=100800625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	100803614	rs2074683	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=524;SC=CTGGGGCTGGCCCTGGGAGGC;SOR=2.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=100803622;WS=100803604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	100804140	rs1048303	C	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=27;PP=924;SC=TGATGTCACCCCAGATGTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=100804148;WS=100804130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	100804240	rs113505007	T	TACCTCC	443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=4;PP=340;SC=TCCCATAACCTACCTCCACCC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=100804248;WS=100804230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	100815279	rs740103	G	A	3586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=39;PP=2339;SC=ACGCAGCGTCGGAAATGGCAG;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=112;WE=100815287;WS=100815269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	100815816	rs12540617	C	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=910;ReadPosRankSum=-1.941;SC=CGCCGCCTGCCTCGGACACGG;SOR=0.840;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=157;TCF=63;TCR=94;TR=64;WE=100815824;WS=100815806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr7	100816527	rs2009973	A	G	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=19;PP=782;SC=GGGTCTCCCCATATGCCCCAG;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=100816535;WS=100816517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	100818101	rs733965	A	G	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=64;PP=2149;SC=CCCTGCAGAAAAAAAGAGAAT;SOR=1.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=104;WE=100818109;WS=100818091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	100818193	rs2015923	G	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=521;SC=TACACAAATAGCCTTTCTTTT;SOR=2.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=100818201;WS=100818183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	100839475	rs139195256	G	A	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=724;ReadPosRankSum=0.941;SC=CACCCACAGTGGTGATGGGCA;SOR=0.884;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=48;WE=100839483;WS=100839465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr7	100841389	rs2158612	A	C	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=37;PP=1728;SC=CGGATCCCCCATGCAGGGACC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=100841397;WS=100841379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	100965096	rs11369267	A	AG	2868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=61;PP=2558;SC=AGAGGCCCGCAGGGCCGACGG;SOR=2.679;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=62;WE=100965104;WS=100965086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	101006216	rs4989271	G	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	101006223	rs4989270	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	101006230	rs4989269	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr7	101006233	rs4989268	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr7	101006376	rs4989267	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr7	101006382	rs4989266	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr7	101063403	rs11767330	G	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=0.160;SC=GGGCTAGGCTGCTCTGCCCTT;SOR=1.136;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=15;WE=101063411;WS=101063393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr7	101063487	rs11767356	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACAGACAAAGGCTGAGCATGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=101063495;WS=101063477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr7	101091166	rs62463425	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTTCCTTTCCTCCGTAGCTTG;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=101091174;WS=101091156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr7	101126511	.	C	T	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=16;MQ=56.62;NF=3;NR=8;PP=101;QD=12.3428375043;SC=CAGAGTCTCGCTCTGTCACCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=11;WE=101126519;WS=101126501;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
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chr7	101183040	rs79591881	A	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TCTCCCACTAAGGAGCGTGAC;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=101183048;WS=101183030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	101183108	rs6465817	T	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=225;ReadPosRankSum=-1.475;SC=CATGTCCCTGTGTGTCACGCA;SOR=0.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=22;WE=101183116;WS=101183098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr7	101187190	rs58676608	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=0.099;SC=CTGGGGGAACGTAGGCTGACA;SOR=2.179;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=16;WE=101187198;WS=101187180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr7	101188852	rs9886175	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TAAAGGATCCTGGGAAGTGGA;SOR=0.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=12;WE=101188860;WS=101188842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr7	101199257	rs4729728	G	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=788;SC=TCCCTCCCTTGCCCCTAGTCT;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=101199265;WS=101199247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	101200628	rs11768650	C	A	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.837;NF=52;NR=43;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TACCTCGAGTCCACCCTCCTG;SOR=0.796;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=211;TCF=108;TCR=103;TR=95;WE=101200636;WS=101200618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,110:0.46:240
chr7	101200669	rs36008849	A	AG	6669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=93;PP=2969;SC=GCCTCCCCAGAGGAGGTTCTG;SOR=0.863;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=123;TCF=27;TCR=96;TR=120;WE=101200677;WS=101200659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr7	101200727	rs17393069	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.993;SC=GAGGGGTGGCGCCCAACCCGA;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=63;WE=101200735;WS=101200717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr7	101200835	rs7809926	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=35;PP=1002;SC=AGGACACCCTATCCTGGCTAG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=101200843;WS=101200825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	101265350	rs4263675	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=23;PP=1677;SC=CTGCTGCCCCTCCAGGACTCC;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=82;WE=101265358;WS=101265340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	101266379	rs7794055	T	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=716;ReadPosRankSum=1.968;SC=TGCTAAGTAGTCACCTGCCCT;SOR=0.868;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=51;WE=101266387;WS=101266369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr7	101267435	rs876825	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=882;ReadPosRankSum=-0.571;SC=AACAGCCCCATGGGGCAGCAG;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=70;WE=101267443;WS=101267425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,87:0.53:165
chr7	101272465	rs848644	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=19;PP=678;SC=AGTGGTGAAGTGAAAAAGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=101272473;WS=101272455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	101459147	rs190979222	C	T	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=175;SC=TCGGGCTCGCCATGGCTGCGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=101459169;WS=101459137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	101459161	rs28650922	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=233;SC=GCTGCGGCGGTGCCGTGAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=101459169;WS=101459137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	101671585	rs448877	A	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=22;PP=706;SC=TCTGTGATGTAATTTTCCATT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=101671593;WS=101671575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	101713590	rs377612	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GCTCTTTGTTTTTCTTTTCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=101713598;WS=101713580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	101821958	rs41275215	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=1.414;SC=TGCGGGGCCCGGGGGTGGCCC;SOR=0.963;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=28;WE=101821966;WS=101821948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr7	101870599	rs430841	A	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=849;SC=TGGTCGTGGTAAAAGACAGCT;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=101870607;WS=101870589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	101892121	rs410825	G	A	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=3;PP=468;SC=GCTCCGCGCCGCCGCCCAGCA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=101892142;WS=101892111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	101892328	rs368214	C	T	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=62;PP=1970;SC=TCTGAGGGGCCGCGGCCCTGG;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=106;WE=101892336;WS=101892318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr7	101917521	rs803064	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=507;ReadPosRankSum=0.167;SC=GCAGGGTGCCGCTGAGCACCG;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=39;WE=101917529;WS=101917511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
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chr7	101917772	rs712840	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=0.290;SC=CTATAGTCCCAGCTACTTTGG;SOR=0.512;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6;WE=101917780;WS=101917762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	101923315	rs57030737	T	TC	2090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.725;NF=12;NR=31;PP=1493;ReadPosRankSum=0.836;SC=TCTCTTCCCCTCCTGTCTGTG;SOR=0.649;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=43;WE=101923323;WS=101923305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,75:0.41:185
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chr7	101925338	rs2257738	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=496;ReadPosRankSum=0.237;SC=CTAGCTTGCGACCATGCCTCT;SOR=0.484;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=26;WE=101925346;WS=101925328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr7	101926228	rs803070	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=0.077;SC=ATCCACTACCTCCTAGCCCCA;SOR=0.175;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=101926236;WS=101926218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	101928495	rs803074	G	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=838;ReadPosRankSum=-2.383;SC=ATCTCAGGACGCTCTCTGGCC;SOR=0.357;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=63;WE=101928503;WS=101928485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr7	101928585	rs803075	G	A	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1374;ReadPosRankSum=-1.565;SC=CCCCTCTCCCGGGAGGGTGGA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=188;TCF=88;TCR=100;TR=89;WE=101928593;WS=101928575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,98:0.48:206
chr7	101953534	rs809120	T	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=709;SC=GGAGGCAGAGTTTGCAGTGAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=101953542;WS=101953524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	101961132	rs75126175	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.170;SC=AAGCAGTCACGTCATAAGGAA;SOR=0.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=101961140;WS=101961122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	102036396	rs28366045	AC	A	1152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=851;ReadPosRankSum=1.653;SC=AAGCTCAGTGACATGTTTGCG;SOR=0.885;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=23;WE=102036404;WS=102036386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr7	102036545	rs6968325	C	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=400;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CTCGGTGGCACGAAGACGCCC;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=29;WE=102036553;WS=102036535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr7	102036769	rs56992893	CGGAGACTGCGTATGCG	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=1;PP=1842;ReadPosRankSum=0.944;SC=TTCCCCTCTGCGGAGACTGCG;SOR=0.184;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=3;WE=102036792;WS=102036759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr7	102036877	rs6951185	T	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=400;ReadPosRankSum=-0.130;SC=CCCAGCCGCCTCCTCGGTGCG;SOR=0.797;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=28;WE=102036885;WS=102036867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr7	102038153	rs67961431	CTGTG	C,CTG	3662.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.123;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.312;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,59,61:0.48,0.50:123
chr7	102046070	rs6971258	T	A	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=169;SC=AATTTTTTTTTAAAAAGCACC;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=102046078;WS=102046060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	102046328	rs10243209	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=709;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ATTTCTATAACGTAAAAATCC;SOR=0.934;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=40;WE=102046336;WS=102046318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr7	102046359	rs6955864	G	C	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1157;SC=ATTTGAAGAAGTCTTGGAAAG;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=102046367;WS=102046349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	102063363	rs143532608	GGAAACATCC	G	1381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=2983;SC=TCCAAAGTCTGGAAACATCCG;SOR=5.549;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=26;WE=102063379;WS=102063353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	102063527	rs7384395	G	C	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=70;PP=2232;SC=AACGAGTATTGTATTCATCAG;SOR=1.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=110;WE=102063535;WS=102063517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	102065322	rs1983476	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=1.643;SC=GGACTGGTGGACGTGAGGCAT;SOR=0.425;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=12;WE=102065330;WS=102065312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr7	102065651	rs1047998	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=213;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CGCAAGGACCCGCTGACCCGC;SOR=0.197;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=19;WE=102065659;WS=102065641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr7	102086891	rs12672132	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=-1.328;SC=CTCTGCCTGGCAGGTGGCCCT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=11;WE=102086899;WS=102086881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr7	102105566	rs79978502	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=766;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TGCAGCGCGGGCGCCCCAAGA;SOR=0.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=53;WE=102105574;WS=102105556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr7	102105984	rs10953368	T	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=362;SC=TTAAGTGGTGTGGAGTCGGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=102105992;WS=102105974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	102106306	rs11538919	A	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=978;ReadPosRankSum=0.362;SC=TGGACCCCAAACTCCTGTGCC;SOR=0.961;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=61;WE=102106314;WS=102106296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
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chr7	102108013	rs111931759	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.860;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=491;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GGCTGAGGGGCTGTGGGAGTG;SOR=1.215;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=27;WE=102108021;WS=102108003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr7	102108263	rs35310665	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCTGCCCACAAGCCCAGGGTG;SOR=1.064;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=27;WE=102108271;WS=102108253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr7	102108446	rs78815001	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=479;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GGGGTCCAGCCTGTGATGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=28;WE=102108454;WS=102108436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr7	102108686	rs113296404	T	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=0.103;SC=GCTGGGCAGCTGTGACCCTTC;SOR=0.732;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=47;WE=102108694;WS=102108676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr7	102112100	rs75312819	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=373;ReadPosRankSum=0.975;SC=GCTAGCCTCCGAGAGTCAGGT;SOR=0.297;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=20;WE=102112108;WS=102112090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr7	102112980	rs3800987	G	A	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1049;ReadPosRankSum=0.981;SC=GCCAGTCCACGGTGGCAGTGG;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=64;WE=102112988;WS=102112970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,70:0.52:135
chr7	102113093	rs3800988	T	C	4756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=69;PP=2965;SC=TCCCGCGGGCTTCCGGGAGCT;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=146;WE=102113101;WS=102113083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr7	102113563	rs61229695	TG	T	3118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=69;PP=1366;SC=CCGATGGGGGTGGGGGGGGGT;SOR=2.027;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=82;TCF=2;TCR=80;TR=70;WE=102113571;WS=102113553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	102114006	rs7950	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=409;ReadPosRankSum=1.761;SC=TGGCTGGGACCGGCCGCTCTC;SOR=1.863;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=24;WE=102114014;WS=102113996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr7	102114151	rs75106520	T	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=714;ReadPosRankSum=0.043;SC=AAGAAGGTGGTGGAGACTGAG;SOR=0.886;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=51;WE=102114159;WS=102114141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr7	102114205	rs370120347	TC	T	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=1.189;SC=ATGCCCAGCATCCCCCCCGCC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=13;WE=102114213;WS=102114195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr7	102120821	rs11767570	T	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.416;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.542;NF=0;NR=12;PP=467;ReadPosRankSum=1.032;SC=TGTTTGGAGCTCTCCAAGTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=12;WE=102120842;WS=102120811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr7	102120834	rs200864556	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.723;NF=0;NR=15;PP=811;ReadPosRankSum=-1.902;SC=CCAAGTTGAGAGTGCAGAGGA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=102120842;WS=102120811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr7	102136550	rs77782294	G	A	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.23;QD=29.66;SOR=2.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	102235708	rs200503327	T	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.592;NF=20;NR=12;PP=409;ReadPosRankSum=4.631;SC=TGAAGCTCAGTGTTGTCATTT;SOR=0.286;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=32;WE=102235716;WS=102235698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr7	102235769	rs144395384	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=6.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.71;MQRankSum=0.421;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.773;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,35:0.29:120
chr7	102246500	rs144574884	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.49;MQRankSum=-1.981;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	102319015	rs138714346	G	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQRankSum=0.124;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,77:0.24:318
chr7	102343967	rs4729850	A	G	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=38;PP=1096;SC=ATTTAGGAGTATCTTCACCTA;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=102343975;WS=102343957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	102389833	rs28695887	G	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=14;PP=386;SC=CCTGGCCCGGGGCGCCGAACT;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=102389841;WS=102389823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	102401989	.	TA	T	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=26;MQ=47.28;NF=0;NR=4;PP=32;QD=10.25;SC=ACCATCTTTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=102401997;WS=102401979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	102412901	rs2539288	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-16.022;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,63:0.21:301
chr7	102572433	rs55781834	A	C	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=620;ReadPosRankSum=0.254;SC=ATGTTTAAACAAAGTTTTTCT;SOR=1.061;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=35;WE=102572441;WS=102572423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr7	102574999	rs3832497	TGAA	T	11195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=103;PP=2973;SC=AGTTGTGTAATGAAGAAGAAA;SOR=0.890;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=177;TCF=62;TCR=115;TR=159;WE=102575009;WS=102574989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
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chr7	102616469	rs2228687	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=403;ReadPosRankSum=0.678;SC=GTAAACCCACGAGGCCATGCC;SOR=0.218;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=26;WE=102616477;WS=102616459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
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chr7	102722505	rs4729868	G	A	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=76;PP=2281;SC=AATTCTTTCCGTTCTAAAAAG;SOR=1.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=28;TCR=76;TR=104;WE=102722524;WS=102722495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	102722516	rs4729869	T	C	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=70;PP=2140;SC=TTCTAAAAAGTTGTGTTTTTA;SOR=2.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=88;WE=102722524;WS=102722495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	102724372	rs4729871	A	T	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=75;PP=2652;SC=TCAGACCCTCAATTTCCTCAT;SOR=1.232;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=122;WE=102724380;WS=102724362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	102738862	rs14029	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.92;MQRankSum=-1.663;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	102739043	rs4729879	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.18;MQRankSum=1.659;QD=23.85;ReadPosRankSum=2.320;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr7	102739085	.	A	G	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=28;MQ=49.54;NF=0;NR=6;PP=73;QD=17.9618687579;SC=CCCAGCTGCTAAATTTAAACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=102739093;WS=102739075;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr7	102755330	rs4729882	A	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=891;SC=TTCTGACTGTATATGTGTGTA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=102755338;WS=102755320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	102760722	rs1974715	A	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=357;SC=AAAAAGTATTATATCATCATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=102760730;WS=102760712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	102825871	rs4317507	T	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=27;NR=21;PP=1026;SC=AAGAAATACTTATCAGCTGCC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=102825879;WS=102825861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	102874366	rs3987883	C	T	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.08;QD=31.44;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	102948040	rs11489600	T	C	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=37;PP=2636;SC=TCTTTCAATTTAGGTGTTTCC;SOR=1.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=120;WE=102948048;WS=102948030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	102961209	rs72437079	CAT	C	181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=30.29;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	102961277	.	CTTTTTTTTTTT	C	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=21;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=4;PP=2319;SC=CTCAGCATGTCTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=7;WE=102961295;WS=102961267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	103007949	rs4520097	A	C	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1156;SC=TTTTGATCCTAGAGGCAATAT;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=103007957;WS=103007939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	103018016	rs10273883	A	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=16;PP=1626;SC=GCATAGAGGTATTAAATGACT;SOR=2.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=103018024;WS=103018006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	103019613	rs12705120	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=18;PP=903;SC=GTATATACAAAGGTATACTAG;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=103019621;WS=103019603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	103033573	rs13240456	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1014;SC=AAAAAAAACCTTGCGACTGCA;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=103033581;WS=103033563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	103132303	.	T	A	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=55.24;NF=4;NR=0;PP=21;QD=13.9428031368;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=103132311;WS=103132293;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr7	103138517	rs2711885	C	G	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=41;PP=2196;SC=ACAAAAAATTCACTTACTTTG;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=107;WE=103138525;WS=103138507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	103138727	rs79694224	TAAAA	T	2683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=42;PP=1607;SC=CAGATGTGGTTAAAAAAACAA;SOR=2.760;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=44;WE=103138738;WS=103138717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	103162370	rs10282605	C	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=10;PP=1155;SC=GGTAACTAACCCTGCATCTTG;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=103162378;WS=103162360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	103175965	rs362706	C	T	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=62;PP=1774;SC=GATATAAACACATATCTGCAG;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=103175973;WS=103175955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	103191428	rs362721	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=354;SC=GGAAATTTCCCCATGATAAAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=103191436;WS=103191418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	103198251	rs6964157	C	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TTAAGATAAACTTACATTAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=103198259;WS=103198241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	103205617	rs362725	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ACTTCCATGCATAATTATCAT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=103205625;WS=103205607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr7	103205728	.	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=949;ReadPosRankSum=0.583;SC=TTCTCACATGGTGGAGAGTGG;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=92;TCR=48;TR=61;WE=103205736;WS=103205718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,78:0.45:172
chr7	103207234	rs362726	T	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=896;ReadPosRankSum=-1.064;SC=AATCCAGTTATTTGGACACTT;SOR=0.470;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=59;WE=103207242;WS=103207224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr7	103251161	rs362691	G	C	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1549;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TGGGGAAGAAGCACTATGACT;SOR=0.528;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=195;TCF=113;TCR=82;TR=100;WE=103251169;WS=103251151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,123:0.50:245
chr7	103389954	rs607755	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TATTTCAGCTAAAAGAAAAAG;SOR=0.846;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=6;WE=103389962;WS=103389944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr7	103417134	rs262338	G	T	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr7	103417139	rs13243284	A	C	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.59;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=1.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr7	103417557	rs11496125	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=233;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CTATTCAAAGCTTTCATAATA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=17;WE=103417565;WS=103417547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr7	103557697	rs711443	A	G	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=36;PP=969;SC=TATTTCTGAAATGTTAGACAT;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=103557705;WS=103557687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	103824722	rs34556202	C	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=170;SC=GGAAATTTTACTTAACACATT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=103824732;WS=103824712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	103824724	rs11384924	T	TA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=201;SC=AAATTTTACTTAACACATTTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=103824732;WS=103824712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	103835732	rs2307400	C	T	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=732;SC=AAAGTAACTTCGCATTTAAAA;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=103835740;WS=103835722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	103838120	rs13238183	A	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=8;PP=571;SC=AACTTTTACAACACAATCCAT;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=103838128;WS=103838110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	103841422	rs2307406	A	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=0.935;SC=AACGAAAACCAAAACACTGTA;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=18;WE=103841430;WS=103841412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr7	103844557	rs2245659	T	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=171;SC=ACACTAAAAATGGCAAAGAAA;SOR=1.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=103844565;WS=103844547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	104110392	rs4727601	C	T	6838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=41;PP=2675;SC=ATAGCACAATCATAGAAAACT;SOR=1.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=126;WE=104110414;WS=104110382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	104110406	rs6949376	C	G	7638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=55;PP=2965;SC=GAAAACTGTACGGAAATAGGT;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=95;TCR=55;TR=150;WE=104110414;WS=104110382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	104110492	rs6949536	C	T	7220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=115;PP=2965;SC=CGGGTGTTTACTGCCTTGTGC;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=103;TCR=115;TR=218;WE=104110500;WS=104110482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr7	104110584	rs75804341	G	T	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1073;ReadPosRankSum=0.594;SC=GAAGAACATGGGTGTTGTTGG;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=64;WE=104110592;WS=104110560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,79:0.57:138
chr7	104110657	rs6949602	A	G	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=997;SC=AAATGGAAAAAAATGATCAGT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=104110665;WS=104110647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	104263404	rs1113933	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TTTTATTTTTATCTGTCATTT;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=104263412;WS=104263394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr7	104263425	rs1073012	T	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=491;SC=TTATTATAGCTATCCTGGAGG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=104263433;WS=104263415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	104377453	rs4236573	A	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-1.157;SC=GCTTCCCCTGAGGTTCTAATT;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=10;WE=104377461;WS=104377443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	104717319	rs377751459	TTGTGTGTGTGTG	T	973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=4;PP=2444;SC=GCCGTTAATTTTGTGTGTGTG;SOR=1.802;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=8;WE=104717338;WS=104717309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	104741842	rs10953468	A	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=511;SC=ATTGATATTTATGATGTCACT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=104741850;WS=104741832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	104745818	rs2299298	G	A	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=640;SC=TTCAAATCTGGTATTAGAATA;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=104745826;WS=104745808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	104767295	rs3815256	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=325;SC=CTGAGGGGGCATCAAACTCAA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=104767303;WS=104767285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	104785779	rs7780887	T	G	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=25;PP=980;SC=AAACAAAATCTGTATTTAGCA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=104785787;WS=104785769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	104800939	rs4730071	C	T	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1152;SC=TAGGGGCTGCCGTCAAAAGTC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=104800947;WS=104800929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	104844328	rs2240463	C	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=39;PP=1155;SC=AAAAATAAAACTTGTCACATA;SOR=1.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=104844336;WS=104844318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	104844416	rs34581245	CA	C	484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=14;NR=8;PP=294;SC=TAAGTCAGGCCAAAAAAAAAA;SOR=1.828;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=22;WE=104844424;WS=104844406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr7	105146593	rs11421080	A	AT	3728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=42;PP=2969;SC=AGGAAATGCTATTTTTATACA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=81;WE=105146601;WS=105146583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
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chr7	105250905	rs940370	G	A	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=33;PP=1600;SC=TCTGACCCCAGTGTCCAAACT;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=79;WE=105250913;WS=105250895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	105621512	rs193795	G	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=-1.044;SC=TCACAGACCTGCAAGTCCTGA;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=45;WE=105621520;WS=105621502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr7	105635244	.	C	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1191;ReadPosRankSum=-1.619;SC=CTGCTAATGGCACCCTCTTCT;SOR=0.894;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=72;WE=105635252;WS=105635234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,87:0.41:212
chr7	105658451	rs6967330	G	A	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=990;ReadPosRankSum=-1.356;SC=AAAGTGGACTGTGAAACAACC;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=64;WE=105658459;WS=105658441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,71:0.48:148
chr7	105662690	rs10258293	T	C	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1347;ReadPosRankSum=1.638;SC=CTGGTTCCAATGTCACACGCC;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=86;TCR=99;TR=97;WE=105662698;WS=105662680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,109:0.49:224
chr7	105672826	rs75850640	T	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=23;PP=1128;ReadPosRankSum=1.460;SC=TTGTTGTATTTTTTTTTCACT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=71;WE=105672834;WS=105672816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr7	105733619	rs176486	G	A	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=53;PP=1550;SC=ATAATGAACAGTTAATTTTAA;SOR=1.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=105733627;WS=105733609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	105738368	rs12705333	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GTATGAATTATTGGACTTTCC;SOR=0.242;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=105738376;WS=105738358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr7	105739546	rs12540052	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=0.483;SC=TGGAAATCTTAATGACTCACT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=105739554;WS=105739536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	105752555	rs2240473	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=0.095;SC=CCGAGCGGCAGGCGGGCCTGG;SOR=0.735;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=12;WE=105752563;WS=105752545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr7	105752820	rs176502	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=-1.577;SC=GAGCGGCGGCGGTTGAGCTGC;SOR=0.105;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=105752828;WS=105752810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr7	105903904	rs2302559	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.993;NF=28;NR=32;PP=805;ReadPosRankSum=0.070;SC=GTGTACTTCTTGATACTATTA;SOR=0.868;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=60;WE=105903912;WS=105903894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,67:0.42:161
chr7	105904150	rs4730153	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=525;ReadPosRankSum=1.049;SC=CATGTTTACTATACCAAACCA;SOR=0.754;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=27;WE=105904158;WS=105904140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr7	106508978	rs849389	A	G	8362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr7	106508987	rs849390	T	C	7985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	106510076	rs1526083	A	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACTCCATTCAGTTGTCATCA;SOR=0.836;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=106510084;WS=106510066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr7	106513011	rs1129293	C	T	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACCATGATAGCGCCCTTGCCA;SOR=0.782;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=85;WE=106513025;WS=106513001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,101:0.43:236
chr7	106519943	rs849370	T	C	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=48;PP=2965;SC=GTGTGGGGAATATGTGACTGC;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=93;TCR=48;TR=141;WE=106519951;WS=106519933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	106762258	.	A	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=58;SC=TGGGGGGTAGACTGCTTCTCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=106762266;WS=106762248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	106768839	rs34736852	G	GAC	1446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.086;NF=1;NR=25;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TTTGTAAGCTGATCACCCTGG;SOR=1.604;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=26;WE=106768847;WS=106768829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
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chr7	106787065	rs3729877	T	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=53;SC=CACTAAGACTTCACTAAGTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=106787073;WS=106787055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	106836242	rs3801964	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	106888867	rs35581984	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=803;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GATGCATGGTGATGATTATGG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=60;WE=106888875;WS=106888857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,67:0.45:149
chr7	106965009	rs62482495	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AAAAAAATGCATTTATTTTAA;SOR=1.449;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=15;WE=106965017;WS=106964999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr7	106965039	rs6466164	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=1.745;SC=ATGGGTAACACGTAACCTTGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=106965047;WS=106965029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	107002806	rs2269970	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=647;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TTGGTCCAGAATGAGGCACGC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=43;WE=107002814;WS=107002796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
chr7	107052797	rs143842303	CGAT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTTCCCTTAACGATGACCCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=107052807;WS=107052789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	107052927	rs10579767	AAC	A	2608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.254;NF=18;NR=23;PP=1709;ReadPosRankSum=0.898;SC=TACATTAAAAAACAGTCTTAT;SOR=0.389;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=41;WE=107052936;WS=107052917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr7	107114400	rs11453718	A	AT	328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=258;SC=CAATTGAAAGATTTTTTTTCT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=107114408;WS=107114390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	107188719	rs2066735	G	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ATTAAGAACAGTACCTATCAA;SOR=0.517;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=33;WE=107188727;WS=107188709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr7	107194911	rs2520270	C	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	107198405	rs2520272	A	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=729;ReadPosRankSum=-0.940;SC=ATAGGGACCCAGAAGATCAGA;SOR=0.906;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=36;WE=107198413;WS=107198395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr7	107208118	rs1468335	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=196;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TACCTCTCGATCATTTTTAAG;SOR=0.048;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=14;WE=107208126;WS=107208108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr7	107208250	rs1468336	T	C	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=755;ReadPosRankSum=0.195;SC=CCACTGTTCCTCACAGCAGCC;SOR=0.576;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=53;WE=107208258;WS=107208240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr7	107216738	rs10276604	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=1.945;SC=AGATGAAATACCATTTTAGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=107216746;WS=107216728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	107217068	rs3839819	TG	T	852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=379;ReadPosRankSum=1.426;SC=TTCTTTTAATTGGGGGGGGAA;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=27;WE=107217076;WS=107217058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr7	107218033	rs711442	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTTTAATATATACTTTTAGAC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=107218041;WS=107218023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr7	107255548	rs3801944	T	C	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=3;PP=785;ReadPosRankSum=0.685;SC=CAGTTTCTTATGGCCAGTGTC;SOR=0.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=73;TCR=5;TR=43;WE=107255556;WS=107255538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr7	107302025	.	C	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=295;ReadPosRankSum=-1.290;SC=CTCGCTCTTCCCCTCCGATCG;SOR=0.559;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=24;WE=107302033;WS=107302015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr7	107303622	rs2248464	A	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr7	107303628	rs2248465	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.482;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
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chr7	107414419	rs41669	A	G	6835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.053;SC=CTGAAAAGTCAAGAATGAGGC;SOR=0.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=113;TCR=101;TR=213;WE=107414427;WS=107414409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,258:1.00:259
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chr7	107542662	rs10250718	T	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=0;PP=268;SC=TGTGAAAACATAGCCCGAATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=107542670;WS=107542659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr7	107546937	rs10281520	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=0.492;SC=AAACACTTCTAGTAATAAAGA;SOR=0.965;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=12;WE=107546945;WS=107546927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr7	107559722	rs8721	A	T	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=495;ReadPosRankSum=0.372;SC=GATTATATATATTTTTTTCTG;SOR=0.177;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=16;WE=107559740;WS=107559712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr7	107559732	rs17154615	G	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=-0.957;SC=ATTTTTTTCTGAAATTTCCTG;SOR=1.819;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=4;WE=107559740;WS=107559712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr7	107564366	rs7561	T	G	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=27;PP=1512;SC=TTTTACCTTGTTCACCTCAGC;SOR=1.305;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=107564374;WS=107564356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr7	107580839	rs2158836	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=262;SC=TGATCTACTTAATCATGAACC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=107580847;WS=107580829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	107593989	rs20556	T	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=1271;SC=ACAGTCCTGCTGGAGGGCATC;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=107593997;WS=107593979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	107594185	rs61751041	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=687;ReadPosRankSum=0.442;SC=GAGGCACAGTCGTCACATCTG;SOR=0.472;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=41;WE=107594193;WS=107594175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,56:0.46:123
chr7	107599806	rs35710474	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=750;ReadPosRankSum=0.936;SC=CTTGGAAAGCCCCAGTGCCCA;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=52;WE=107599814;WS=107599796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr7	107603282	rs59832125	T	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr7	107613379	rs2701034	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=291;ReadPosRankSum=-1.174;SC=ACCCATTCCTGTAAGTCATGA;SOR=0.394;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=22;WE=107613387;WS=107613369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr7	107626770	rs25659	G	A	4078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=83;PP=2307;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TCCCAAAGTCGGACGATCGTT;SOR=0.612;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=288;TCF=117;TCR=171;TR=144;WE=107626778;WS=107626760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,189:0.54:353
chr7	107664429	rs1636944	G	A	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=930;ReadPosRankSum=-1.076;SC=AGCCCCAGGGGCTTGTACATC;SOR=0.549;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=62;WE=107664437;WS=107664419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr7	107664446	rs1616041	C	T	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.910;SC=CATCAGAAACCAGAAACAAAG;SOR=0.462;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=72;WE=107664454;WS=107664436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
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chr7	107667497	rs1732157	G	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=833;ReadPosRankSum=1.559;SC=TGGAAACAATGTGTGTATGAC;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=52;WE=107667505;WS=107667487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
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chr7	107791018	rs443552	G	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.618;SC=TGTGAATGGAGCATGATTTTG;SOR=2.115;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=9;WE=107791026;WS=107791008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr7	107808639	rs12537654	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=341;ReadPosRankSum=1.192;SC=AAGATGATCCATAGTAAATTC;SOR=0.408;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=25;WE=107808647;WS=107808629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr7	107815858	rs11983886	T	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1103;ReadPosRankSum=0.276;SC=AACACACCCATGAGCATGTAT;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=57;TCR=89;TR=73;WE=107815866;WS=107815848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,84:0.54:157
chr7	107818851	rs428459	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=627;ReadPosRankSum=1.361;SC=CAGTACTTGTTTGACGCATGA;SOR=0.489;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=37;WE=107818859;WS=107818841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,51:0.41:123
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chr7	107820909	.	GAG	AAT	1455	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=13;NR=27;PP=1455;QD=37.7116968716;SC=ATGCAGAAAGGAGCAAACAAG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=40;WE=107820919;WS=107820899;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:49,40:0.45:89
chr7	107820911	rs414077	G	T	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr7	107822198	rs2839850	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=512;ReadPosRankSum=-1.059;SC=CTCCTGTGGTATGCATGACAA;SOR=0.644;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=28;WE=107822206;WS=107822188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr7	107822396	rs2142325	G	A	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.313;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=924;ReadPosRankSum=-2.898;SC=GAAAAGGACAGGGAAGTGGTA;SOR=0.921;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=50;WE=107822404;WS=107822386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr7	107824678	rs6970656	A	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=727;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AAGGCATCATAGCTCACCTTC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=50;WE=107824686;WS=107824668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr7	107824889	rs401433	C	G	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.034;SC=ACTGCTCAGACGCCTCGCTGG;SOR=0.853;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=67;WE=107824897;WS=107824879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,87:0.56:154
chr7	107831780	.	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=152;ReadPosRankSum=1.212;SC=AATGGAAAGATACAAGATAGC;SOR=0.454;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=12;WE=107831788;WS=107831770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr7	107834613	rs6958498	G	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=2901;ReadPosRankSum=-0.315;SC=ATCCATGTAGGATCTGAAATG;SOR=0.599;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=71;WE=107834632;WS=107834603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,84:0.42:200
chr7	107834624	rs6978315	T	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=2901;ReadPosRankSum=-0.240;SC=ATCTGAAATGTAGAGTCATCG;SOR=0.774;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=168;TCF=77;TCR=91;TR=69;WE=107834632;WS=107834603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,80:0.41:197
chr7	107834734	rs404287	C	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=755;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTTCATTCTTCGCCATCCCTA;SOR=1.284;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=50;WE=107834742;WS=107834724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,66:0.39:168
chr7	107836064	rs34680676	G	GA	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-0.001;SC=TGTCTCACAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=107836072;WS=107836055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	107836117	rs35825013	GT	G	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=374;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TTCCCTGTTTGTTTTTTGAAT;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=15;WE=107836125;WS=107836107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr7	107838464	rs381318	G	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=760;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TGCACTGATAGACTGCACTTG;SOR=0.826;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=45;WE=107838472;WS=107838454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,59:0.52:114
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chr7	107849908	rs1269621	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=632;ReadPosRankSum=-1.659;SC=CTCCTAATGCGTTTTTTGCTA;SOR=0.420;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=45;WE=107849916;WS=107849898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,52:0.43:121
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chr7	110762899	rs9942557	A	G	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1694;ReadPosRankSum=0.147;SC=CAAGCTGTAGATAAAAAAGTG;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=95;WE=110762907;WS=110762889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,106:0.48:220
chr7	111032703	rs37675	A	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=582;SC=TAGCATCAGAATTTTTAGTGC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=111032711;WS=111032693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	111368491	rs12705795	C	T	2526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=41;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GGTAGCGGGACGGGGCGCCGC;SOR=0.901;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=176;TCF=98;TCR=78;TR=97;WE=111368499;WS=111368481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,113:0.55:204
chr7	111372095	rs10953696	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TGGCTGCGTTTGTGCAGGAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=111372103;WS=111372089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	111376840	rs2301678	T	C	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=32;PP=1836;SC=CATTAATCCCTTAAAGAGCAT;SOR=1.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=95;WE=111376848;WS=111376830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	111379397	.	C	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=1.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,20:0.17:120
chr7	111379634	rs10246451	C	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=797;SC=AAATTAGCAACAAAAAGTCCG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=111379642;WS=111379624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	111379706	rs2074116	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GAATTAATGAAAAGTCTGAGA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=111379714;WS=111379696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr7	111382272	rs3757649	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=598;ReadPosRankSum=-1.156;SC=ACTTTACTACGCATTTCGCTT;SOR=0.887;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=26;TCR=79;TR=38;WE=111382280;WS=111382262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr7	111382324	rs3757648	C	T	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=37;PP=1027;SC=GTAGGAACAGCTGTCACTTTA;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=111382332;WS=111382314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	111487026	rs10275038	G	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=424;ReadPosRankSum=1.418;SC=TTTGAAGGGAGCTATATACTA;SOR=0.758;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=23;WE=111487034;WS=111487016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr7	111503660	rs59559298	G	A	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=980;ReadPosRankSum=0.454;SC=TCCCAGATACGCCATGAGAAA;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=140;TCF=49;TCR=91;TR=67;WE=111503668;WS=111503650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,84:0.51:164
chr7	111512589	rs10257550	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=195;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TGTCTGGGTGGGTTCTCCATT;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=13;WE=111512597;WS=111512579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr7	111535497	rs2074131	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ATATGTTCTAAAATATAACCC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=111535505;WS=111535494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	111535863	rs2074132	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.549;SC=GAAATATAACTCATACACAAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=111535871;WS=111535853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	111629366	rs2074129	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CAAACTGTTCGCTCACTATCC;SOR=1.071;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=9;WE=111629374;WS=111629356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr7	111634067	rs566714	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=0.090;SC=GTTAATATCTATATCCCCAAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=111634075;WS=111634057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr7	111634368	rs847541	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=324;SC=AGATAACTAGAAAAGAAAGCT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=111634376;WS=111634358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr7	111640508	rs148172772	TAATA	T	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=741;ReadPosRankSum=1.194;SC=CTATCTTTCTTAATAAATTTC;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=10;WE=111640519;WS=111640494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
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chr7	112095782	rs6944364	T	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=315;ReadPosRankSum=0.916;SC=TATATGGCAATAAAATAATTT;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=21;WE=112095790;WS=112095772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr7	112096043	rs11773535	A	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=727;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TGGCTGTTTTATATTATTTCT;SOR=0.835;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=44;WE=112096051;WS=112096033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr7	112099136	rs34627083	TATA	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=142;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GTGGTGCGCCTATAGTACTGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=112099146;WS=112099126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	112102355	rs2253962	T	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=881;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GCCTCCTCTCTTGTGATGATG;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=55;WE=112102363;WS=112102345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr7	112107999	rs1024569	T	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=261;ReadPosRankSum=-0.781;SC=AAAAGAAAAATAATAATAAAG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=16;WE=112108007;WS=112107989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr7	112108291	rs1024570	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.461;SC=TCTCATTTTACGACCTAGCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=112108299;WS=112108281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	112112279	rs2074796	G	A	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GTTAGGAACGGGATTTTCCAA;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=162;TCF=97;TCR=65;TR=73;WE=112112287;WS=112112269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,89:0.48:187
chr7	112130009	rs11767398	A	C	6719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.541;SC=AACTAAAGGAATGATTTTCTG;SOR=0.515;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=98;TCR=116;TR=213;WE=112130017;WS=112129999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,248:1.00:249
chr7	112575149	rs10231221	A	C	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=4;PP=113;SC=ATTTATTTCAATGATCAGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=112575157;WS=112575139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	112724417	rs2256044	A	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=1152;ReadPosRankSum=0.576;SC=CGATAGCTAAATATCTGGTGA;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=92;TCR=50;TR=67;WE=112724425;WS=112724407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,77:0.47:165
chr7	112724525	rs1608890	A	G	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=1876;ReadPosRankSum=0.748;SC=TCCAGGTAGAACCATTTTTGA;SOR=0.501;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=255;TCF=142;TCR=113;TR=112;WE=112724533;WS=112724515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,129:0.45:286
chr7	112724795	rs1575012	G	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=711;ReadPosRankSum=-0.004;SC=GGAGGATAAGGATACAGCCTC;SOR=1.099;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=40;WE=112724803;WS=112724785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr7	113518502	rs2974938	A	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=42;PP=2101;SC=AACCTGCCTAAGATCTCTGTT;SOR=1.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=102;WE=113518510;WS=113518492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	113519719	rs2974944	A	T	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=52;PP=2207;SC=TTACTTCAATATTTTTAGCTC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=113519727;WS=113519709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	113519796	rs2974942	C	T	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=52;PP=2523;SC=GGTATTTGCACTGTGCCATTG;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=112;WE=113519804;WS=113519786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	114138751	rs2040658	G	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CCAAAAGAAAGATTTTAGTTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=114138759;WS=114138749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr7	114178279	rs78027924	T	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	114270077	rs10227893	T	G	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.06;MQRankSum=0.898;NF=32;NR=39;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TCCGGTTATCTCATTGATACA;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=71;WE=114270085;WS=114270067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,93:0.56:166
chr7	114293859	rs11765385	G	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=421;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TCCTCCTGACGCAGACTTTTA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=20;WE=114293867;WS=114293849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr7	114562833	rs35262508	G	GTT	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=2.655;SC=AACTTGCGCTGTAACAGTTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=114562841;WS=114562823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	114619598	rs2594449	C	A	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=33;PP=1804;SC=AGACTTCAGCCCAGGTGCCAA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=114619606;WS=114619588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	115580893	rs34298819	G	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1487;ReadPosRankSum=1.040;SC=GCTCAGGATGGCTCTGCTGTT;SOR=0.335;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=89;WE=115580901;WS=115580883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,92:0.57:162
chr7	115624288	rs4730703	T	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=904;ReadPosRankSum=0.267;SC=ACTGATGATATATTTTTATAA;SOR=0.477;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=57;WE=115624296;WS=115624278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr7	115850675	rs11549785	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=742;ReadPosRankSum=-1.569;SC=CGCAGGTTTCCCGTGTTCGCA;SOR=0.688;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=46;WE=115850683;WS=115850665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
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chr7	115874832	rs184726958	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=846;ReadPosRankSum=0.888;SC=AGTGTTCTGTCTTACTGTCAT;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=115874840;WS=115874807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	115890187	rs73222310	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.273;SC=GGCCAATCCCAGTTAACATTG;SOR=0.495;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=115890195;WS=115890177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr7	116140076	rs2535220	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=33;PP=974;SC=CCACCATTGCTACCGGGTCGG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=116140084;WS=116140066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	116140275	rs11767363	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1092;SC=GGCGTCAGGTTGGCTGACAGT;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=116140283;WS=116140265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	116145937	rs75396674	T	A	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=309;SC=AGTAAATGGGTCAGTATTTTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=116145945;WS=116145928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	116165360	rs1997623	A	C	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=71;PP=2267;SC=GAGGGGGCCTAGGGAGCCCCT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=131;WE=116165368;WS=116165350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	116165463	rs2742125	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=822;SC=GGATGCTCCCTTGTCGCGGGA;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=116165471;WS=116165453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	116364823	rs34822187	CA	C	933.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.887;NF=7;NR=11;PP=656;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TCTCCCTTTACAGGCAGAAAA;SOR=0.599;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=18;WE=116364831;WS=116364813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr7	116409675	rs72220100	CT	C	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=0.839;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	116435768	rs41736	C	T	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=16;PP=1081;SC=CTTATCCTGACGTAAACACCT;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=116435776;WS=116435758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	116436022	rs2023748	G	A	4444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=74;PP=2816;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GGATATCAGCGATCTTCTCTA;SOR=0.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=141;WE=116436030;WS=116436012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr7	116436097	rs41737	G	A	3859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=66;PP=2310;SC=GTGTCGCTCCGTATCCTTCTC;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=113;WE=116436105;WS=116436087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	116550456	rs2074025	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=215;SC=GTATATCATACACATTTCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=116550464;WS=116550446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	116596697	rs6960131	A	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=56;PP=1672;SC=TTCTGGAGTCATTCTTGGATA;SOR=1.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=82;WE=116596705;WS=116596687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	116598735	rs6466595	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=59;PP=1694;SC=GGCCACTGCAATAAAGTGAGT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=60;WE=116598743;WS=116598725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	116600049	rs10262671	A	T	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1032;SC=GACTCTTAATACTTAGTGAAT;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=116600057;WS=116600039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	116607501	rs10259502	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=647;SC=GTCAGGCAGCTTGTGCAGGTC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=116607509;WS=116607491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	116660464	rs5886844	AC	A	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=1239;SC=TTTCAATCACACCGGGAGAAA;SOR=3.312;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=32;WE=116660472;WS=116660454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	116660803	rs7788320	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=1.118;SC=TTTTGGCTCTAATTACAAAGG;SOR=0.612;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=16;WE=116660811;WS=116660793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr7	116838311	rs193573	G	A	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1446;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TACCTGCTCAGTACATGTTGG;SOR=0.753;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=181;TCF=88;TCR=93;TR=89;WE=116838319;WS=116838301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,101:0.45:225
chr7	116918060	rs6972479	G	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=5;PP=907;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CCATCCTGGGGCCCCCAGGGA;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=44;WE=116918068;WS=116918050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr7	116918085	rs2228946	C	T	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1184;ReadPosRankSum=0.075;SC=GAGGGGGCTTCCGTTGAGATA;SOR=0.163;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=121;TCF=91;TCR=30;TR=73;WE=116918093;WS=116918075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,78:0.61:127
chr7	116962933	rs34431449	T	TC	2152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.936;NF=24;NR=35;PP=1852;ReadPosRankSum=0.698;SC=ATCTCCAAAATCCCCCGCGCC;SOR=0.555;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=59;WE=116962945;WS=116962923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr7	117024820	rs1029396	T	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=289;ReadPosRankSum=-1.675;SC=ACTTGGCATCTTTCCATCTTT;SOR=1.059;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=19;WE=117024828;WS=117024810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr7	117062217	rs17139821	C	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=501;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GTTTTTTGCACTTTATATAAT;SOR=0.516;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=24;WE=117062225;WS=117062207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr7	117066718	rs7784156	C	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=429;SC=CAAATGCAAGCAGAGAGGAAG;SOR=5.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=117066726;WS=117066714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	117067040	rs10242827	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=0.597;SC=TTTTTGTTTCCACCTCATCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=18;WE=117067048;WS=117067030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr7	117120141	rs1800501	G	C	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=687;ReadPosRankSum=1.099;SC=CCCAGCGCCCGAGAGACCATG;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=46;WE=117120149;WS=117120131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,52:0.42:123
chr7	117176568	rs34543279	AGATT	A	1452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=9;PP=1094;SC=TTTTACTATTAGATTGATTGA;SOR=2.049;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=22;WE=117176579;WS=117176558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	117176738	rs1800503	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GTAAGTTGTTCCAATAATTTC;SOR=0.978;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=21;WE=117176746;WS=117176728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr7	117188660	rs3832534	A	ATG	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.010;NF=5;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=0.423;SC=TTTATTTTTGATGTGTGTGTG;SOR=0.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=8;WE=117188668;WS=117188650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	117188682	rs10229820	G	T	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.715;NF=11;NR=5;PP=301;ReadPosRankSum=0.139;SC=GTGTGTGTGTGTTTTTTTAAC;SOR=2.133;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=16;WE=117188690;WS=117188672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr7	117188736	rs4727853	C	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.95;MQRankSum=-0.259;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr7	117199457	rs34855237	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=15;PP=1563;SC=TGATAATTGGAGGCAAGTGAA;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=117199465;WS=117199447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	117199533	rs213950	G	A	4519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=64;PP=2965;SC=ACTTCTAATGGTGATTATGGG;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=145;WE=117199541;WS=117199523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	117235055	rs1042077	T	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=358;ReadPosRankSum=0.406;SC=GATATATTACTGTCCACAAGA;SOR=0.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=25;WE=117235063;WS=117235045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr7	117235196	rs4148712	CAT	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr7	117420784	rs17140422	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CATATATCAATTATTATGGAT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=117420792;WS=117420774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	117426484	rs149142354	AAAAC	A	1392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=907;ReadPosRankSum=0.334;SC=TATTTTCTTAAAAACAAACAA;SOR=0.443;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=21;WE=117426495;WS=117426474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr7	117431142	rs147505672	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=980;ReadPosRankSum=0.045;SC=GAAGAGAGGCCATATTCTTTA;SOR=0.466;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=56;WE=117431150;WS=117431132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr7	117451124	rs6973399	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=144;SC=TTTGTGATTATACTTCCAAAT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=117451132;WS=117451114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	117824239	rs2896242	G	C	7624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=158;NR=97;PP=2965;SC=GCTTGCTGTCGGCACCGCTGC;SOR=1.199;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=258;TCF=161;TCR=97;TR=255;WE=117824247;WS=117824229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr7	117825549	rs9655829	T	G	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=286;SC=CCTTGGCGTCTAAGAAACTTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=117825557;WS=117825541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	117825681	rs45604739	A	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=21;PP=821;SC=ATTCCCTAAGAAACACTTTCT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=117825689;WS=117825671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	117825834	rs2041527	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=371;SC=TCTAATGCCTAGACAGCACAT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=117825842;WS=117825824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	117832138	rs1061731	G	A	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=748;SC=GTTTTTATGAGTGTGTCACTG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=117832146;WS=117832128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	117867960	.	C	CT	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5110;HP=15;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=15;MQ=61.19;NF=6;NR=0;PP=64;QD=11.3333333333;SC=AGTATTATGTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=117867968;WS=117867950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	117876264	.	A	ATGTG	142.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=4;PP=128;SC=GTGTGTGCGTATGTGTGTGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=117876272;WS=117876254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	120428607	rs41622	G	A	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=6;PP=1203;SC=CACAAGTCCAGTAAAACAAGT;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=120428615;WS=120428597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	120428799	rs41623	C	A	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=88;PP=2922;SC=GGTCTGTCCCCGGCTCCCTTC;SOR=1.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=63;TCR=88;TR=151;WE=120428807;WS=120428789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	120450658	rs7805733	G	A	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.08;QD=26.20;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr7	120450678	rs112555207	T	TCA	973.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.812;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.564;NF=0;NR=37;PP=1832;ReadPosRankSum=0.724;SC=AGACACAGATTCACACACACA;SOR=4.125;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=37;WE=120450686;WS=120450668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,38:0.79:48
chr7	120590786	rs11408222	C	CG	696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=827;SC=AGGCAAGCGCCTCAGGCGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=120590794;WS=120590776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	120596377	rs147798192	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=1.829;SC=AAATTAAAGCAGAAAACACAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=120596385;WS=120596367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr7	120610632	rs2074576	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTTTAGCTTACACTTTAATTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=120610640;WS=120610622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr7	120613419	rs2721369	A	G	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=TATTAGTTATATTATGCTAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=120613427;WS=120613409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	120613450	rs2525726	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.842;SC=TCCTCTTCAAAATAGGGTAGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=120613458;WS=120613440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	120704289	rs2721375	C	T	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.526;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1139;ReadPosRankSum=1.450;SC=TCATTCCTTTCAGGCAAACAG;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=77;WE=120704297;WS=120704279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,92:0.53:172
chr7	120739962	rs199844199	GTT	G	622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.711;NF=12;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=0.540;SC=CGCTAACTATGTTTTTTTTTT;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=15;WE=120739971;WS=120739952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr7	120764573	rs798948	C	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.927;NF=2;NR=19;PP=411;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGAAAGAAAGCAACCTATCTT;SOR=3.105;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=21;WE=120764581;WS=120764563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr7	120768619	rs59228206	T	TC	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=220;ReadPosRankSum=1.418;SC=GATTTTGACATCAAACTAGAT;SOR=0.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=120768627;WS=120768609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	120770398	rs77265208	A	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCTCTAGTTTACAGATTGATT;SOR=0.826;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=17;WE=120770406;WS=120770388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr7	120773783	rs34385410	T	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=2.699;SC=AAAGTAACTGTGCCCATACAG;SOR=0.534;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=18;WE=120773791;WS=120773773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr7	120780793	rs3832520	CAGAAAA	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.006;SC=TCAAAGGAAACAGAAAAAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=120780806;WS=120780785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	120781884	rs11979314	G	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=297;SC=TATTTTCATAGTTTAGGTTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=120781892;WS=120781882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	120876835	rs35793694	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=708;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GACTACATTGAAGCCATTTTA;SOR=0.409;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=53;WE=120876843;WS=120876825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr7	120901695	rs10953934	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=461;ReadPosRankSum=-1.606;SC=GTTGGGTGTCGATGTCCAGAG;SOR=0.916;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=31;WE=120901703;WS=120901685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr7	120906699	rs57977421	C	A	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=987;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TGAGGCAGTGCAGTTACAATG;SOR=0.290;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=133;TCF=92;TCR=41;TR=64;WE=120906707;WS=120906689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr7	120906744	rs798918	T	C	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.733;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TGTGTTGTTTTTCTTTCTGAA;SOR=0.520;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=85;WE=120906752;WS=120906734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,99:0.48:207
chr7	120965464	rs10668066	G	GCACC	1623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=1147;SC=AGATGGAAAGGCACCCATGCA;SOR=1.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=23;WE=120965472;WS=120965454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	120969769	rs2908004	G	A	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=41;PP=1441;SC=TCAGGAGTGCGGGAGCCAGTT;SOR=1.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=120969777;WS=120969759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	120969969	rs142005327	G	GCT	286.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=259;SC=TGGTCCTGTAGCTCTCTAAGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=120969977;WS=120969959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	120979089	rs2707466	C	T	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1451;SC=TCAGACAAAACAAAGAGGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=120979097;WS=120979079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	121000021	rs3837124	A	AT	225.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=118;ReadPosRankSum=0.158;SC=TATGTTACAGATTTTTTTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=121000029;WS=121000011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr7	121080929	rs6961822	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=0.896;SC=CCTCTGGCATACTCGAACTTC;SOR=0.972;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=11;WE=121080937;WS=121080919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr7	121080957	rs7795121	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=287;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TGGAGCGGACGTAGGGTTTGG;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=22;WE=121080965;WS=121080947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr7	121081052	rs6962156	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=515;ReadPosRankSum=1.129;SC=AGGACGGTGCCGCAGACCTTG;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=35;WE=121081060;WS=121081042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr7	121081115	rs6466786	A	C	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=25;PP=918;SC=CCCACCCTGAAGATGTGGCTG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=121081123;WS=121081105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr7	121164363	rs2896305	C	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.721;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=10;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GAAAAGTCAACACCTGAGGGT;SOR=2.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=47;WE=121164371;WS=121164353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr7	121616250	rs4629793	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=18;PP=657;SC=GCTTTGATGCGGACCGATTTT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=121616258;WS=121616240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	121942832	rs10685687	G	GACA	7665.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=54;PP=2969;SC=AACCATGAGAGACATTTCCTG;SOR=1.262;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=101;WE=121942840;WS=121942822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	121942847	rs6968786	G	C	8317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.55;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr7	121942847	.	GCA	CCA,CCG	1427	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=102,48;NR=76,34;PP=1427,1168;QD=8.2121978233;SC=TTCCTGGTTTGCATACCTTTT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=105;TCR=76;TR=178,82;WE=121942857;WS=121942837;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:181
chr7	121942849	rs117528546	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,95:0.48:198
chr7	121943642	rs111662975	A	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.561;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	121944527	rs11761299	T	C	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=46;PP=1406;SC=CGGGGCTGGGTTGCGCCGTCC;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=60;WE=121944535;WS=121944517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	121960407	rs1348442	T	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=1.387;SC=AGAAAGAAGATAAAATTTGCT;SOR=0.157;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=9;WE=121960415;WS=121960397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr7	121960438	rs1443749	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-2.294;SC=AGATTATATGCGTGTACATAG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=121960446;WS=121960428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr7	121985541	rs798685	T	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=8;PP=488;SC=AAGGAGACTATGCTTTGCAAA;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=121985549;WS=121985531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	121985556	rs798684	C	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=791;SC=TGCAAACATACCATCAAAATT;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=121985564;WS=121985546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	122000900	rs45489900	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGAGATAATCATGAGAATTA;SOR=2.726;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=19;WE=122000908;WS=122000890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr7	122303321	rs2251761	C	T	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=16;PP=1568;SC=GCTGGTGTTCCAGTTTTTTAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=122303329;WS=122303311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	122635024	rs860170	C	T	5836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=70;PP=2965;SC=GGCAGTGAAGCGCGCTTTCAT;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=161;WE=122635032;WS=122635014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr7	122757505	rs28364221	A	AT	3235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=27;PP=2197;SC=ATTTGATAGTATTTTTTTCAG;SOR=1.915;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=75;WE=122757513;WS=122757495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	122769378	.	CTGTGTGTGTGTG	CTG,C	2770.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.638;NF=16,16;NR=22,22;PP=1813,161;ReadPosRankSum=-1.147;SC=TCTCTCTTCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.381;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=38,38;WE=122769397;WS=122769368;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.98:80
chr7	122809111	rs1880178	T	C	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=19;PP=1313;SC=CATGTATAGATGGTTAATTCA;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=122809119;WS=122809101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	123142588	rs11770523	A	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=294;ReadPosRankSum=0.372;SC=AAAGAGACACACTCGGAACAA;SOR=1.055;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=23;WE=123142596;WS=123142578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr7	123150236	rs4276609	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TGCTGTGCCCCAATGATAACA;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=123150244;WS=123150226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr7	123256427	rs6962756	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=0.477;SC=GGTCACATTCCTGAGCTCCAG;SOR=0.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=29;WE=123256435;WS=123256417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr7	123269118	rs4731112	G	C	4721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=95;PP=2922;ReadPosRankSum=1.320;SC=CTGTATTTTGGCGTTTCTAAT;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=312;TCF=140;TCR=172;TR=170;WE=123269126;WS=123269108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,213:0.55:384
chr7	123269976	rs3993666	G	GGC	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=-1.680;SC=TTATGTATATGATATTAAAAA;SOR=0.976;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=5;WE=123269984;WS=123269966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr7	123270253	rs78616976	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=0.525;SC=TCTTTGATACTTTTCCTATGC;SOR=1.302;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=123270261;WS=123270243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	123295964	rs7779099	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=324;ReadPosRankSum=0.115;SC=TGCTTCTGGCCGCCTTGAATG;SOR=0.559;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=26;WE=123295972;WS=123295954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr7	123334965	.	T	C	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=26;QD=20.2570708491;SC=TATATCCCAATTTAAAAAACA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=123334973;WS=123334955;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr7	123336804	rs10270793	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=1.557;SC=ATTAGGACCTGCAAATAAAAC;SOR=1.259;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=10;WE=123336812;WS=123336794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
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chr7	124387374	rs724356	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=1.101;SC=ATAAGGTGAAAGTGGTGACTC;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=124387382;WS=124387364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr7	124462661	rs17246404	C	T	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=64;PP=2372;SC=ATCATCAACACGGAAACACAC;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=117;WE=124462669;WS=124462651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	124465256	rs146966778	T	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=288;ReadPosRankSum=1.328;SC=TATATGTTAGTGCTATCTCAA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=19;WE=124465264;WS=124465246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr7	124467470	rs10244817	T	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=438;SC=TTTACTAAAATAACTCAAGAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=124467478;WS=124467460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	124475296	.	T	TAAACA	1767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=1202;SC=AAAAGTATAATAAACAAAACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=20;WE=124475304;WS=124475286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	124477182	rs7787804	A	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=24;PP=936;SC=ACATTTATTAAGTCTTTAACC;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=124477190;WS=124477172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	124486980	rs7794637	T	C	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=23;PP=808;SC=ATCTCAAAAATGATACATAGT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=124486988;WS=124486970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	124499002	rs6977407	AT	CA	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=1631;SC=TTTTCCTACTATACATCACCT;SOR=2.124;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=40;WE=124499011;WS=124498992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	124533680	rs4377885	C	T	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=56;PP=2746;SC=GAGAACGAGTCTGCTGATATC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=134;WE=124533688;WS=124533670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	124533740	rs10954048	C	T	5632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=89;PP=2965;SC=CCTGAATTTGCACATGCAACC;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=167;WE=124533748;WS=124533730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr7	124540841	rs4383910	A	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=8;PP=593;SC=GAACATCGGGACACTCCTGCC;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=124540849;WS=124540831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	124540872	rs7782354	C	T	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=14;PP=728;SC=GCTTTTCCAACGGTCTTAGCA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=124540880;WS=124540862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	124540969	rs7782525	C	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=25;PP=924;SC=ACAGCAGTCCCAGATTGAACT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=124540977;WS=124540959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	125588504	.	CAAGA	C	999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.41;QD=41.66;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	125588512	.	A	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.50;QD=47.31;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	125588526	.	GAAGAAAGAAAGA	G,GAAGAAAGA	880.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.48;QD=38.29;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,15,8:0.65,0.35:23
chr7	125753485	rs1419526	C	A	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=661;SC=AGGCTCTGTTCATGAATTTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=125753493;WS=125753475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	125753551	rs1419527	A	G	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;QD=45.75;SOR=1.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	125753556	rs5887285	A	AG	3906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=43.41;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	125753603	rs1419528	A	G	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=50;PP=2429;SC=AGAGAAGGAGATAAGATTTTA;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=116;WE=125753611;WS=125753593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	125753636	rs1419529	A	G	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=61;PP=2692;SC=AGAGTTACAAACATGAACCAA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=128;WE=125753644;WS=125753626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr7	125753737	rs4395830	A	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=50;PP=1442;SC=TGGGCATGACAAAGGTTTTGA;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=59;WE=125753745;WS=125753727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	126079144	rs712723	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=0.778;SC=CATATACCACATCTCTTCAGA;SOR=0.407;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=19;WE=126079152;WS=126079134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr7	126410171	rs35648111	G	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=1.469;SC=TCCAATAAAAGACAGCATTAG;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=126410179;WS=126410161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr7	126544012	rs769199	T	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.75;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	126544242	rs17685327	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=0.577;SC=ATTATGAATATTACAAGACCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=11;WE=126544250;WS=126544232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr7	127233977	rs3779536	G	T	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=881;ReadPosRankSum=2.956;SC=CATCAGCTGGGCAGGAACCTA;SOR=0.563;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=59;WE=127233985;WS=127233967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,80:0.58:137
chr7	127235875	rs142804912	G	A	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ATGCAAGTGCGGCCTGGAGGG;SOR=0.539;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=176;TCF=64;TCR=112;TR=80;WE=127235883;WS=127235865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,98:0.47:207
chr7	127236207	.	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.424;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GAGAAGGACAGAAAAGCATGG;SOR=1.970;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=9;WE=127236215;WS=127236197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr7	127236338	rs3735640	C	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=-0.593;SC=GAGGAGGGGCCGAGACTGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=16;WE=127236346;WS=127236328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr7	127250907	rs712700	T	C	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;PP=1134;SC=CTCTTAAGGCTAGTGTGAGAA;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=127250915;WS=127250897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	127251188	rs712701	T	G	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=22;PP=838;SC=ACTGGCCAGGTGACAGTGGGA;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=127251196;WS=127251178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	127251792	rs327518	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-1.743;SC=AGAGAACGCCGGGACCCCAGA;SOR=0.542;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=8;WE=127251800;WS=127251782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	127253714	rs3835004	A	AG	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=443;SC=GGCCACTCACACCTGCACCTC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=127253722;WS=127253704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	127254457	rs594141	G	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=8;PP=540;SC=ATCCAAGAAAGAACGAGAAAG;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=127254465;WS=127254447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	127255285	rs698406	C	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;SC=TCCAGCCTCACCTTTGAGGGC;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=127255293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	127255795	rs327516	C	G	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=688;SC=TTGCCCATACCCGCCAACTCT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=127255803;WS=127255785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	127347733	rs11972774	G	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=647;ReadPosRankSum=0.466;SC=GATATGCATAGTGGACATTGC;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=49;WE=127347741;WS=127347723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,58:0.42:138
chr7	127361269	rs918793	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=397;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CTGTGAGGGTGGTGGGCCTTG;SOR=1.247;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=25;WE=127361277;WS=127361259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr7	127447499	rs325440	A	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TTCATTTGATATTGTTCATTC;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=11;WE=127447507;WS=127447489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr7	127637816	rs17151639	A	G	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1440;ReadPosRankSum=0.855;SC=CTGGCAGTTCACCATATATAC;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=97;WE=127637824;WS=127637806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,123:0.54:229
chr7	127668769	rs117070316	G	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=427;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CTTGGTATGGGTCTGAATTAT;SOR=1.130;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=27;WE=127668777;WS=127668759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr7	127669857	rs3823994	A	T	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.340;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=999;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GGGGCAAAGAAGAGAGGTTAT;SOR=0.776;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=60;WE=127669865;WS=127669847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,71:0.59:121
chr7	127714491	rs225241	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TCCTCCCCACGGGCACAGCCC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=127714499;WS=127714488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	127721507	rs322825	T	C	5824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=86;PP=2710;SC=TGTTTGTGACTGAGATCACTG;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=71;TCR=86;TR=157;WE=127721515;WS=127721497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr7	127950724	rs141043380	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=858;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AGGGCACCTCCGAGCACAGTG;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=18;WE=127950733;WS=127950714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr7	127950725	rs12850	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=421;ReadPosRankSum=0.319;SC=GGGCACCTCCGAGCACAGTGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=10;WE=127950733;WS=127950714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr7	127957893	rs2290226	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=835;ReadPosRankSum=0.950;SC=CTTTTTTTTGTCCACTTGCCA;SOR=1.222;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=46;WE=127957901;WS=127957882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,50:0.38:131
chr7	127973133	rs359650	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GAAATCTAAATGAAAACGTGA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=127973141;WS=127973123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr7	127976119	rs359651	G	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=604;ReadPosRankSum=-0.160;SC=GTAAAGAAAGGAGGAATTCAT;SOR=0.602;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=34;WE=127976127;WS=127976109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr7	127977304	rs11496082	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=178;ReadPosRankSum=-1.602;SC=TTTAAAAACCCTACCTCTGTA;SOR=1.402;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=17;WE=127977312;WS=127977294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr7	127992437	rs1651945	C	G	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=56;PP=2344;SC=CGGGCGGGCACCGCCAGGGCA;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=127992445;WS=127992427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	128000091	rs359642	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=0.329;SC=GGACTCAGTTGTTCAGCAGCT;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=128000099;WS=128000081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	128035130	rs72624966	AC	A	1282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=626;ReadPosRankSum=1.694;SC=CACTAGTGCCACCCCCCCAGC;SOR=0.840;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=29;WE=128035138;WS=128035103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr7	128040699	rs2278294	C	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=469;SC=GAAGCCAGGACCCTCAGTGGG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=128040707;WS=128040689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	128049573	rs2288551	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=571;ReadPosRankSum=1.309;SC=CGACCTGTTCCCTCTCCTCCG;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=29;WE=128049581;WS=128049563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr7	128049590	rs2288552	C	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=399;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TCCGCTCCCCCGTGCAACGAA;SOR=0.559;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=20;WE=128049598;WS=128049580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr7	128095876	rs2732393	A	G	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.42;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	128095876	.	ACCC	GCCC,GCCG	611	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=59,30;NR=14,4;PP=611,491;QD=8.8461809938;SC=GCGTGCGCGTACCCTCCTGGG;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=73,34;WE=128095887;WS=128095866;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.96:76
chr7	128095879	rs2288555	C	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr7	128102508	rs10647404	C	CTCTT	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=465;SC=ACATATGGTGCTCTTGTGAGC;SOR=4.977;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=128102530;WS=128102498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	128102522	rs146061361	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.89;MQRankSum=-1.611;QD=17.97;ReadPosRankSum=2.100;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	128117010	.	G	GCCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.553;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.176;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr7	128117343	rs2288558	A	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=0.923;SC=CCTGATGCGGATCTCAGGAGT;SOR=0.428;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=20;WE=128117351;WS=128117333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr7	128128133	rs2732429	T	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.94;QD=30.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	128128286	rs140236081	AG	A	613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.068;NF=12;NR=15;PP=919;ReadPosRankSum=-0.969;SC=CTAAAAATCAAGGTCTCTGGC;SOR=0.238;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=27;WE=128128294;WS=128128276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr7	128133984	rs2562741	G	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=68;PP=2079;SC=TCTTTCAGCAGTTGTTCCAGA;SOR=2.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=90;WE=128133992;WS=128133974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	128140982	rs10257897	T	C	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.295;NF=43;NR=31;PP=945;ReadPosRankSum=0.615;SC=GAAATTTCTATGTGAGAGGTG;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=74;WE=128140990;WS=128140972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,81:0.53:153
chr7	128141083	rs10271878	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.064;NF=17;NR=35;PP=771;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTCAAGGCACATTCAGAAGGA;SOR=1.136;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=52;WE=128141091;WS=128141073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
chr7	128141136	rs3802007	T	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.553;NF=4;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=-1.453;SC=GCTGTTTCCTTCGGTTCCCCG;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=27;WE=128141144;WS=128141126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr7	128141865	rs1053124	T	C	6523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=71;PP=2965;SC=AAGTTCAGAATCTGGTGGACC;SOR=1.530;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=145;TCR=71;TR=216;WE=128141873;WS=128141855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr7	128142023	rs12539729	A	T	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.194;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=2.778;SC=GAGCTTTTTTAAAAAAAAATT;SOR=1.988;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=43;TCR=121;TR=163;WE=128142031;WS=128142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,150:0.98:153
chr7	128220111	rs139965573	G	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=9.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.42;MQRankSum=-0.767;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=1.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr7	128248198	rs201811442	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQRankSum=-1.803;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.141;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr7	128298600	rs73723614	T	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=313;ReadPosRankSum=0.199;SC=GCACTCCCTGTCCCACCTGGT;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=27;WE=128298608;WS=128298590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr7	128298920	rs114191334	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.350;NF=4;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CTTGGACCCACGGAAGTGGGG;SOR=0.259;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=12;WE=128298928;WS=128298910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	128312450	rs11769769	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TACCAAGAACCAATGAGTAAA;SOR=1.154;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=20;WE=128312471;WS=128312440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr7	128312463	rs74343948	C	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=901;ReadPosRankSum=-1.501;SC=TGAGTAAAATCAGGGGCCTCC;SOR=0.452;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=22;WE=128312471;WS=128312440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
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chr7	128315791	rs61738927	C	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=1051;ReadPosRankSum=0.296;SC=TCCTCGGGGTCACCTCCTCGG;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=61;WE=128315799;WS=128315781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr7	128315882	rs17169357	C	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=1.533;SC=CTGGAGCACACCTGGTGACGC;SOR=0.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=18;WE=128315890;WS=128315872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr7	128317658	rs6467210	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=1.042;SC=AATCTACGACCGGCTCCAGCG;SOR=0.785;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=13;WE=128317666;WS=128317648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr7	128317882	rs7797745	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.027;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQ=60.28;MQRankSum=-0.724;NF=5;NR=6;PP=214;ReadPosRankSum=1.426;SC=GTGGGCCTCCTTCCGGGACCT;SOR=0.061;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=11;WE=128317890;WS=128317872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr7	128317931	rs139645567	CTG	C	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.315;NF=1;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=-0.537;SC=ATGTAAGTGTCTGTGTATATA;SOR=0.586;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=4;WE=128317940;WS=128317921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	128318006	rs67602452	G	T	57.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	128319982	rs2290229	A	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=566;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TTAGGGTGTGAAACTCAACTG;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=41;WE=128319990;WS=128319972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr7	128322918	rs4554406	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=225;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GGTGTGAGCCACTGCACCCAG;SOR=0.228;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=17;WE=128322926;WS=128322908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr7	128323034	rs1109552	A	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=936;ReadPosRankSum=0.591;SC=TGACACTGCCATTGAAATAGA;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=71;WE=128323042;WS=128323024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr7	128358891	rs745229	C	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=673;ReadPosRankSum=0.022;SC=TCAGGATTCTCCCATTGAGGT;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=43;WE=128358899;WS=128358881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr7	128363287	rs6971091	G	A	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CCAGCCCAGCGAGAGTCTCAT;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=89;WE=128363295;WS=128363277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,108:0.50:214
chr7	128371206	rs339066	G	A	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1666;ReadPosRankSum=0.785;SC=TGCAAGCCTCGTCAACACCAC;SOR=0.624;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=107;WE=128371214;WS=128371196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,129:0.53:242
chr7	128388541	rs12538139	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=2.611;SC=CAAATTAATAGTTTAACTCGG;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=17;WE=128388549;WS=128388531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr7	128394606	rs2307040	C	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.064;SC=AAAATAGACGCGGATAAAGAT;SOR=0.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=71;WE=128394614;WS=128394596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr7	128399231	rs41274152	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=1.465;SC=TATATAAGTATTGGCCAGATT;SOR=1.179;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=128399239;WS=128399221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	128409225	rs1043550	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=1012;ReadPosRankSum=0.964;SC=GTTCTGAGCTACGGAGGAACC;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=44;TCR=73;TR=58;WE=128409233;WS=128409215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr7	128414484	rs17397588	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=-0.735;SC=ATCTTATGTTTCAGAGCACTC;SOR=1.473;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=12;WE=128414492;WS=128414471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr7	128415195	rs1799922	T	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=767;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CCAGTGACCATCCTGTAACCA;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=47;WE=128415203;WS=128415185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr7	128415290	rs17476081	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=1.606;SC=TCGGGTGGAGCAAGCACAGAG;SOR=0.627;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=13;WE=128415298;WS=128415280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	128415860	rs3807128	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=710;ReadPosRankSum=0.640;SC=CCCCACACCCCCCTCTGAGTC;SOR=0.730;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=42;WE=128415868;WS=128415850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr7	128450532	rs7799186	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=488;ReadPosRankSum=0.861;SC=CCAGGGGTAAGGATAAGGCAA;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=27;WE=128450540;WS=128450522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr7	128451353	rs111409895	C	CAGAGAGCCTGGGA	1236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=2971;ReadPosRankSum=0.359;SC=AAGCCAGGCCCAACATGCCCA;SOR=0.801;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=14;WE=128451361;WS=128451343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr7	128455767	rs4728137	C	G	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=22;PP=1113;SC=GGAAAAAAAGCAAGTGAAAGA;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=52;WE=128455775;WS=128455757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr7	128492825	rs12530507	G	A	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.452;SC=GGGGCCTCACGGGGACCTCAG;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=73;WE=128492833;WS=128492815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr7	128494922	rs201672146	G	A	2904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=72;PP=1685;ReadPosRankSum=-1.256;SC=TTTGAGGATCGCAAAGATGGC;SOR=0.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=89;TCR=160;TR=112;WE=128494930;WS=128494912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,139:0.46:301
chr7	128525349	rs185725369	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=999;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GGGCAGGGACGAGCTCGGAGG;SOR=0.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=62;WE=128525357;WS=128525339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,72:0.59:123
chr7	128530276	rs4731523	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=830;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TCCCAGCCTCGGGGCTTTTTC;SOR=0.882;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=44;WE=128530284;WS=128530266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr7	128533514	rs34061445	T	TC	2560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1807;SC=GATACTGGTGTCCTGGTACTC;SOR=1.340;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=42;WE=128533522;WS=128533504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	128533818	rs12706859	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=1.717;SC=TCTCTGCAGCCAAGGCCTGCC;SOR=0.252;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=14;WE=128533826;WS=128533808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr7	128548304	.	G	GAAGAAAGAAAGA,GAAGAAAGAAAGAAAGA	2015.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.98;QD=59.29;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,17,17:0.50,0.50:34
chr7	128550680	rs11335250	GC	G	1201.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.28;NF=5;NR=16;PP=740;SC=CAGCGCCAGGGCCCCCGAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=21;WE=128550688;WS=128550670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	128552732	.	G	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=272;ReadPosRankSum=0.344;SC=CCTTGACTTTGAAGGGGCTTC;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=17;WE=128552740;WS=128552722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr7	128553100	rs142966946	T	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.889;NF=17;NR=13;PP=342;ReadPosRankSum=1.263;SC=GTCACCACCTTGCTGGCATCT;SOR=0.378;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=30;WE=128553108;WS=128553090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr7	128610484	rs1691779	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=37;PP=1132;SC=GTGTGTGTGCACGCGTGGCTG;SOR=2.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=45;WE=128610492;WS=128610474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	128629993	rs41274158	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=486;ReadPosRankSum=0.275;SC=TAGAAGTGGCAGAGGAGAGAG;SOR=1.082;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=37;WE=128630001;WS=128629983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr7	128630227	rs1154329	C	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=843;ReadPosRankSum=-1.735;SC=CAGGCTGTGACGACACACAGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=52;WE=128630235;WS=128630217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr7	128694976	rs2242028	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=0.501;SC=GGGCAGAAGGCTCTCCGTGGA;SOR=1.302;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=18;WE=128694984;WS=128694966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	128766505	rs6952057	A	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQRankSum=-2.638;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.001;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	128766528	rs10464697	G	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-2.268;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	128766533	rs10464698	A	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-2.510;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.385;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	128766553	rs6952077	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-1.803;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.229;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr7	128767250	rs61740497	G	A	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.866;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.053;NF=33;NR=47;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CAACTCCTTCGTGGGCACGCG;SOR=0.949;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=193;TCF=86;TCR=107;TR=80;WE=128767258;WS=128767240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,96:0.45:214
chr7	128767410	rs10247566	A	G	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=-1.033;NF=45;NR=53;PP=1561;ReadPosRankSum=-1.659;SC=ATCTTTGGCCAGCCCGTGGTC;SOR=0.736;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=98;WE=128767418;WS=128767400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,119:0.48:248
chr7	128767490	rs7809681	T	C	4429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1838;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CAACAGCGGTTACGGGATGGA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=103;TCR=101;TR=109;WE=128767498;WS=128767480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,121:0.52:234
chr7	128767506	rs7809687	T	G	4410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1706;ReadPosRankSum=-1.202;SC=ATGGACAGCCTGCCCGCCATG;SOR=0.591;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=104;WE=128767514;WS=128767496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,119:0.52:230
chr7	128784723	rs13309419	A	G	77.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.26;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	128802526	rs2177950	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=449;ReadPosRankSum=0.715;SC=GGGTGGCCACCCCCAAGACAG;SOR=0.838;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=22;WE=128802534;WS=128802516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr7	128802936	rs919551	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=0.068;SC=TTTAAGATCATAAGGTGCTTT;SOR=3.228;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=16;WE=128802944;WS=128802926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr7	128804218	rs2566892	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=213;ReadPosRankSum=0.857;SC=GGCAGACTCAGTTAAGAAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=18;WE=128804226;WS=128804208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
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chr7	128807786	rs3173902	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=414;ReadPosRankSum=1.453;SC=GGTGCTGAAAGCAGCACCAAA;SOR=1.577;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=24;WE=128807794;WS=128807776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr7	128829066	rs41304185	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=2.038;SC=CTGCTGGGGGACCCGGGCCGG;SOR=0.766;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=13;WE=128829074;WS=128829056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr7	128843169	rs2566871	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-2.623;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
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chr7	128845277	rs2075777	G	C	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=31;PP=1378;SC=GGGCAGGCCCGGGGGGCCCTC;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=128845285;WS=128845267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	128845325	rs2566872	G	A	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=12;PP=2122;SC=GGGAAGGGGGGCAAAGAGGTC;SOR=3.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=68;TCR=12;TR=80;WE=128845333;WS=128845315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	128845907	rs2075779	T	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=738;SC=CCTCAGCAGCTGAGGGTCTGG;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=128845915;WS=128845897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	128846328	rs2228617	G	C	7718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=119;PP=2965;SC=CTGTGAGTGGGATTTGTTTTG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=109;TCR=119;TR=228;WE=128846336;WS=128846318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	128846469	rs2735842	A	G	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=37;PP=1080;SC=GCAACAAAATATACTGGGCAC;SOR=2.221;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=128846477;WS=128846459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	128865130	rs4731565	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=543;ReadPosRankSum=0.865;SC=GGCCCGCCGCCGCTCTCAGCC;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=35;WE=128865138;WS=128865120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr7	128923116	rs192396691	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=760;ReadPosRankSum=0.468;SC=GAAATATTCTCAAGGCAGTAA;SOR=0.469;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=52;WE=128923124;WS=128923106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr7	129015894	rs1559486	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=617;ReadPosRankSum=-1.011;SC=AGGTGAGCTACCCCTCTTTTA;SOR=0.501;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=41;WE=129015902;WS=129015884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr7	129019736	rs2303303	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.234;SC=CTAAAATGCTGGGTGGAATAT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=129019744;WS=129019726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr7	129028857	rs35404531	AT	A	879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.903;NF=23;NR=8;PP=338;ReadPosRankSum=0.632;SC=TAGAGGAAGCATTTTTTTTTT;SOR=0.763;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=31;WE=129028865;WS=129028847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr7	129029093	rs10954231	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CTTTTTGTCCATATTAATCCC;SOR=1.270;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=18;WE=129029101;WS=129029083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr7	129029391	rs1541711	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AGGATCTTAACTTAAGAAAAC;SOR=1.426;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=17;WE=129029399;WS=129029381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr7	129037029	rs17168750	G	C	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=858;ReadPosRankSum=1.231;SC=GTTTGGCCCAGGCTTGCTCAT;SOR=1.089;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=67;WE=129037037;WS=129037019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr7	129049507	rs6467244	A	G	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=757;SC=ATAGTAGCCCACAAAGCCAGC;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=129049515;WS=129049497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	129067053	rs4728164	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CCTGTGCCTGTAGTGTTGGCC;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=23;WE=129067061;WS=129067043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr7	129091302	rs4731578	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=0.501;SC=TCCTTTTCCCATACCTTATTC;SOR=0.093;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=129091310;WS=129091298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr7	129091615	rs59179950	GA	G	758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.350;NF=0;NR=20;PP=694;ReadPosRankSum=-1.691;SC=GCTAGCTTTAGAGGGGTGGAG;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=20;WE=129091623;WS=129091605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr7	129094195	rs581829	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=285;SC=AGAGACCATCTCTGAGGTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=129094203;WS=129094185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	129098313	rs3214796	AC	A	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=137;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGCATCAGGGACCCCTATGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=129098321;WS=129098303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr7	129122570	rs62489116	C	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=0.484;SC=ACCATAGATTCCTGAAAGCTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=129122578;WS=129122569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr7	129142775	rs610591	G	A	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=700;SC=CCCTGGGGTCGACCTCAACGC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=129142783;WS=129142765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	129330353	rs3735006	C	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=830;ReadPosRankSum=0.602;SC=TCACCATCGACGGAATTCCAG;SOR=0.843;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=59;WE=129330361;WS=129330343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr7	129350170	rs3736626	A	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=369;ReadPosRankSum=-0.231;SC=AAATAACCAAAGTTCTTTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=20;WE=129350178;WS=129350160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr7	129351444	rs1962038	C	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.357;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-1.568;SC=TCTGCATCTTCTTAAATACTT;SOR=0.169;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=20;WE=129351452;WS=129351434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr7	129356939	rs12154342	T	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=-0.545;SC=ATATTGCAGGTCATGTTAATT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=10;WE=129356947;WS=129356929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	129410144	rs4467881	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=1.808;SC=CCAGCAGTCCGGGACCTGAGT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=129410152;WS=129410134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	129410195	rs4541843	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=144;ReadPosRankSum=0.204;SC=CAGCATGGCCGGCCCTTCCCT;SOR=1.286;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=10;WE=129410203;WS=129410185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr7	129519555	rs62491504	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.28;ReadPosRankSum=-2.128;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	129658655	rs2242488	A	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=464;SC=AATGATCTGGATATGTCTAGG;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=129658663;WS=129658645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	129663496	rs11556924	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=598;ReadPosRankSum=1.210;SC=TGGCTCAGGACGGTCAACAGG;SOR=0.598;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=46;WE=129663504;WS=129663486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr7	129664312	rs1464890	T	C	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=52;PP=1962;SC=TGCGAACATGTTATCAGGGAG;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=96;WE=129664320;WS=129664302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	129680994	rs34409527	A	ATG	622.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.507;NF=0;NR=20;PP=890;ReadPosRankSum=0.332;SC=ATGTGTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=20;WE=129681002;WS=129680982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr7	129736880	rs12531444	G	A	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=688;ReadPosRankSum=0.649;SC=TCTGTGCTTCGTATGGGTTAA;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=46;WE=129736888;WS=129736870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,58:0.44:133
chr7	129806363	rs6467284	A	T	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=-2.390;SC=GAGAAAAAAAATTTTTATTAG;SOR=1.270;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=22;WE=129806371;WS=129806353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr7	129806441	rs4507710	C	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=385;SC=ACATGTTTAACTGATATTTAA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=129806449;WS=129806431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	129813738	rs3823482	T	C	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GATGTGGAGGTAATCTGGAAT;SOR=1.248;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=68;WE=129813746;WS=129813728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr7	129815212	rs4731667	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=1.714;SC=GAGCTGGGAGGAGCACTTGAG;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=129815220;WS=129815206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	129843689	rs35299461	G	GA	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=209;ReadPosRankSum=0.888;SC=TTCCAGTCCTGAAAAAAAATT;SOR=0.495;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=12;WE=129843697;WS=129843679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr7	129847482	rs2727837	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=186;SC=GAAAATATAGCATATACAAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=129847490;WS=129847480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	129906915	rs7788519	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=59;ReadPosRankSum=0.709;SC=TAGATTTGGGGATAAGTCAAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=6;WE=129906923;WS=129906905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr7	129910818	rs3816830	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	129913535	rs201177346	G	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-2.503;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	129916515	rs17590	T	C	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=963;ReadPosRankSum=1.833;SC=CCATTCTGGATGCCCTGGATA;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=67;WE=129916523;WS=129916505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
chr7	129938598	rs34587586	G	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.550;SC=ACCAAGTTTTGAGGATTAATG;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=76;WE=129938606;WS=129938588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
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chr7	129950879	rs901800	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=169;ReadPosRankSum=0.424;SC=CCCTCCTGGCGCTGCTAAGGT;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=129950887;WS=129950869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	129962360	rs1569133	A	G	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=56;PP=2420;SC=TCGACTGGGCATATGACAACG;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=135;WE=129962368;WS=129962350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr7	129987764	rs12532645	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TGTCCTGCCCCCCTTTATCCC;SOR=0.337;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=129987772;WS=129987754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr7	129989878	rs7808823	T	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=666;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TTCCTTTCTCTGAACTGAAAG;SOR=0.695;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=51;WE=129989886;WS=129989868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr7	130002317	rs1544705	T	C	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=69;PP=2520;SC=CCATCTGGATTGACACTGGAA;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=130002325;WS=130002307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr7	130007901	rs2241272	A	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=1803;ReadPosRankSum=0.155;SC=GGCAGTGCCAAGGATCTAGCT;SOR=0.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=51;WE=130007921;WS=130007891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr7	130007913	rs2241273	T	G	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=1803;ReadPosRankSum=-0.054;SC=GATCTAGCTGTGCTGGCCCAA;SOR=0.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=39;WE=130007921;WS=130007891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr7	130008159	rs2302823	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=404;ReadPosRankSum=-0.680;SC=TTTGGCTCCCAGGGCTCACTT;SOR=1.190;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=28;WE=130008167;WS=130008149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr7	130020569	rs7790688	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.570;SC=GCTGGCAGATAAGCAACCAGG;SOR=0.465;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=7;WE=130020577;WS=130020559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr7	130021488	rs1126899	G	C	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=26;PP=1295;ReadPosRankSum=0.095;SC=TCTGGCGGGGGCCTGCCCACC;SOR=0.548;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=167;TCF=118;TCR=49;TR=81;WE=130021496;WS=130021478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,89:0.48:185
chr7	130023179	rs6972781	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=430;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GGGCAGCAAGATGAGGCCTCA;SOR=1.573;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=24;WE=130023187;WS=130023169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr7	130024308	rs3043750	A	ACC	767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.543;NF=14;NR=5;PP=577;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CCTCTGAACCACCCCCCACCC;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=19;WE=130024316;WS=130024298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr7	130025895	rs2239606	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr7	130027633	rs10263705	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=489;ReadPosRankSum=1.436;SC=AAAGTGATTGACCCTTTCTCT;SOR=1.067;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=29;WE=130027641;WS=130027623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr7	130136107	rs3807348	G	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.921;SC=TACTGTTTTAGAAAACTAATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=130136115;WS=130136097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	130136902	rs2072573	G	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=0.978;SC=GGTCACAGTTGCTTGTTCTTT;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=15;WE=130136910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr7	130138155	rs6968284	A	G	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=89;PP=2965;SC=GATGCTAGGAAAGTACATTGT;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=203;WE=130138163;WS=130138145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr7	130140766	rs765205	C	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TTTCCAGAGACGTGTTTTTGT;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=25;WE=130140774;WS=130140756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr7	130147307	rs2302826	T	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=618;ReadPosRankSum=0.381;SC=GGTGGAAGGGTTTGTTGGTGA;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=40;WE=130147315;WS=130147297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr7	130148507	rs2072575	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=1.002;SC=GCAACTGGAGGAGAAGGGAGG;SOR=0.336;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=23;WE=130148515;WS=130148497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr7	130148562	rs58927323	T	TTCTTAGGAAGTG	1085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=2976;SC=TTTCCATCATTCCATCTGTAC;SOR=1.981;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=130148570;WS=130148552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr7	130148903	rs12706941	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.229;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=0.877;SC=CTGTGGTAAAAAGCATACAGA;SOR=3.912;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=13;WE=130148911;WS=130148893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr7	130292531	rs12706946	T	C	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=716;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GTGATTTTTGTAGAGTTTAAA;SOR=1.120;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=41;WE=130292539;WS=130292521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr7	130292802	rs35780462	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=828;ReadPosRankSum=0.362;SC=CACCACTCCCCAATATTTTCA;SOR=0.934;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=49;WE=130292810;WS=130292792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr7	130293022	rs6970543	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=466;ReadPosRankSum=0.098;SC=TAATATTCATCCTCAAGAGAT;SOR=1.385;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=23;WE=130293030;WS=130293012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr7	130295525	rs7800717	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=424;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GGATAATTCTTAATGTCCCTG;SOR=0.523;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=28;WE=130295533;WS=130295515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr7	130297119	rs34699820	GA	G	2790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=5;NR=84;PP=1585;SC=GCTAAATACAGAAAAAAAAAA;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=6;TCR=102;TR=89;WE=130297138;WS=130297108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	130298550	rs4731696	C	T	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=49;PP=1411;SC=GAAAAACATGCTTATGCAAAA;SOR=2.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=130298558;WS=130298540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	130351884	rs3804620	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.837;SC=ACATTGTCTATAGTTCTCAAT;SOR=0.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=130351892;WS=130351874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	130354106	rs10232683	G	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=77;PP=2408;SC=TAAAGGAGACGCACTTGGAGG;SOR=2.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=103;WE=130354114;WS=130354096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr7	130357518	rs2288080	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=525;ReadPosRankSum=2.220;SC=GAACCAGAAACGTGAATAGGG;SOR=0.883;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=31;WE=130357526;WS=130357508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr7	130418402	rs138225855	C	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=1.537;SC=GGGCAGCAGGCGCGCTTGGGA;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=11;WE=130418410;WS=130418392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr7	130418525	rs76603546	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=801;ReadPosRankSum=-1.919;SC=CGGAGAAGCCGGACGAGGCGC;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=49;WE=130418533;WS=130418515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr7	130418720	rs111359117	A	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=9;PP=741;SC=CGGACTCCGGATGCGCCGCAC;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=130418728;WS=130418710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	130827796	rs74965170	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TCTGGAGTCTTCATCAGAAGA;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=130827804;WS=130827786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	131060277	rs3823557	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=-1.107;SC=ATCCCTTAATGCTGTTTAGAA;SOR=1.244;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=22;WE=131060285;WS=131060267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr7	131060383	rs117033484	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.221;SC=TTTTTATTCTCTCTATTTTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=131060391;WS=131060373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	131155586	rs3213820	G	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr7	131155586	.	GTG	CTT	165	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=4;PP=165;QD=18.2056562385;SC=AATTATCCTTGTGTACATTTT;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=12;WE=131155596;WS=131155576;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,12:0.46:26
chr7	131155588	rs1733861	G	T	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=249;SC=TTATCCTTGTGTACATTTTCT;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=131155596;WS=131155576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	131155764	rs1684172	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=264;ReadPosRankSum=0.630;SC=TCCTAACTTATATTTAATGAT;SOR=1.833;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=131155772;WS=131155754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr7	131190554	rs7799613	C	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=226;ReadPosRankSum=0.739;SC=TTCTGCAACTCGGGAATCACG;SOR=1.061;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=13;WE=131190562;WS=131190544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr7	131190696	rs6651125	T	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=769;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GCAGGAATGATGCCATGCAGA;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=57;WE=131190704;WS=131190686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr7	131191536	rs3212303	A	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=488;ReadPosRankSum=0.993;SC=ACAGCAGCCTAGGCCTGTGGG;SOR=0.646;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=28;WE=131191544;WS=131191526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr7	131191554	rs56231781	TC	T	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=526;ReadPosRankSum=0.806;SC=GGGGCTGCCCTCCCAGCTAAG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=16;WE=131191562;WS=131191544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr7	131191609	rs11770771	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CTCCCTCTCTAGCCCCAGCTG;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=131191617;WS=131191599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr7	131193739	rs3212298	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=726;ReadPosRankSum=0.657;SC=AGGTTCAGGACGAGCTGCTTC;SOR=0.975;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=49;WE=131193747;WS=131193729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
chr7	131195535	rs3847113	G	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.787;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=106;ReadPosRankSum=0.630;SC=GAGCCATCACGCCTGGCCCTG;SOR=0.360;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=11;WE=131195543;WS=131195525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	131195712	rs12670788	G	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=659;ReadPosRankSum=1.074;SC=AGGATGCGTCGAAGTGGGTTG;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=41;WE=131195720;WS=131195702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,47:0.39:119
chr7	131195959	rs3735035	C	T	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1222;ReadPosRankSum=1.573;SC=TTGCCTGAGCCGCCTCCTCTA;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=189;TCF=84;TCR=105;TR=82;WE=131195967;WS=131195949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,95:0.43:220
chr7	131241029	.	G	GGGCGAC	1462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.163;NF=1;NR=15;PP=792;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CATTCTGGGAGGGCGACGGCG;SOR=0.887;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=16;WE=131241037;WS=131241019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr7	131815118	rs10954359	C	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=7;PP=462;SC=GAGAGAGAAACAGCGCTGCTC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=131815126;WS=131815108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	131815220	rs10954360	G	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=21;PP=1142;SC=CTCCAGGGCGGCCCTGGAAGG;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=131815228;WS=131815210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	131815310	rs2671103	A	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=38;PP=1234;SC=CACACTGGTCATCGTGGTCCA;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=131815318;WS=131815300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	131815343	rs10954361	G	A	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=39;PP=1395;SC=TCTGCGGAAGGGCCAAGAACA;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=131815351;WS=131815333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	131815360	.	T	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=249;ReadPosRankSum=2.076;SC=AACAGGGAGATTACTCATTTG;SOR=0.341;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=18;WE=131815368;WS=131815350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr7	131832627	rs1450882	A	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=9;PP=647;SC=CAGGACACCCAGGCCTCCCTA;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=131832635;WS=131832617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	131849204	rs896167	T	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=680;SC=CTTCTCTCCATCTCCTCATCC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=131849212;WS=131849194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	131859496	rs7808586	G	A	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=14;PP=1109;SC=TTGCCAACACGCTCCCCTGCT;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=131859504;WS=131859486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	131864249	rs57986525	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=-1.354;SC=CATATATACATACAGATGTGC;SOR=0.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=27;WE=131864257;WS=131864239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr7	131864379	rs57665981	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=685;ReadPosRankSum=-0.871;SC=ACATACACAGATGTGCATGCA;SOR=0.374;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=42;WE=131864387;WS=131864369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr7	131864407	rs3734990	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=833;ReadPosRankSum=-0.190;SC=ATGCACACACGCACACACACA;SOR=0.384;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=53;WE=131864415;WS=131864395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr7	131864591	rs3734989	T	C	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=64;PP=1711;SC=CGCCAGCCACTGCGATGCTGA;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=102;WE=131864599;WS=131864581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	131908468	rs2290232	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=249;ReadPosRankSum=0.729;SC=GGCTTGAGTCTCTATGGTCTA;SOR=0.606;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=16;WE=131908476;WS=131908458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr7	131913288	rs62464985	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=0.751;SC=GGGAGGGGCGGATGCTGAGGT;SOR=0.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=19;WE=131913296;WS=131913278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr7	131915507	rs1868781	A	G	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=72;PP=2325;SC=GAGAGCTGGTACGGGCTTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=105;WE=131915515;WS=131915497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	131926112	rs3925378	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ACATATGCATCCAGGGAGACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=131926120;WS=131926102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	132070014	rs183271681	G	A	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=970;ReadPosRankSum=1.114;SC=TCGGGGTCCCGTCTGTAGCTC;SOR=0.755;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=60;WE=132070022;WS=132070004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr7	132169720	rs17852615	T	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=507;ReadPosRankSum=1.037;SC=TGGGTCTCCCTCCACTCCAAT;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=36;WE=132169728;WS=132169710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr7	132169749	rs17852614	C	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GGGTGATTCCCCCTTGTGGAC;SOR=0.683;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=33;WE=132169757;WS=132169739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr7	132192231	rs156960	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=244;ReadPosRankSum=0.220;SC=CTACACTCCCAACCATCCCAG;SOR=0.303;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=19;WE=132192239;WS=132192221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr7	132192295	rs156961	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=777;ReadPosRankSum=0.180;SC=CCTTCACCTTGAGCCAGGCCA;SOR=1.015;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=48;WE=132192303;WS=132192285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,66:0.57:115
chr7	132192949	rs156962	T	C	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=913;ReadPosRankSum=1.010;SC=CTCCAAAGACTGAGCCGCTCT;SOR=0.685;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=67;WE=132192957;WS=132192939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr7	132409606	rs594208	T	C	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=18;PP=1550;SC=CAGGGGTGACTCCAACAGCAC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=132409614;WS=132409596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	132706981	rs17421819	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=-2.232;SC=CAAAATGTACGTACGTAGATG;SOR=0.160;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=5;WE=132706989;WS=132706971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	132709293	rs13235276	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCTCTGATACCACAAAACTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=132709301;WS=132709288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	132719349	rs78193687	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.328;NF=13;NR=6;PP=337;ReadPosRankSum=0.949;SC=CAGGCAGCTAGGTGATGGCAA;SOR=0.260;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=19;WE=132719357;WS=132719339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr7	132766584	rs11769814	C	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=784;ReadPosRankSum=0.516;SC=CCGAGTCCAACCACTGGCCCT;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=49;WE=132766592;WS=132766574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr7	132938039	rs10641096	C	CCCTT	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.006;NF=0;NR=8;PP=341;ReadPosRankSum=0.044;SC=ACCCTGCTCTCCCCTTTCCTC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=132938047;WS=132938029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	132990536	rs5887620	C	CT	230.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=222;SC=CGTAAGCTCCCTTTGTTAGTA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=132990544;WS=132990526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	133602538	rs73156934	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=456;ReadPosRankSum=0.505;SC=GGAGGAAGCACATCTGTTTAG;SOR=0.562;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=25;WE=133602546;WS=133602528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr7	133749164	rs6953296	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=836;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACCGCAGCCAGACTGGGGTGG;SOR=0.983;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=47;WE=133749172;WS=133749154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr7	133821642	rs73454662	T	G	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.183;SC=AGAATTTTTTTGGGGGTTGGT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=133821650;WS=133821632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	133824117	rs724812	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=47;ReadPosRankSum=1.030;SC=TTTCCATCAAGAGTTATTGCA;SOR=0.970;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=8;WE=133824125;WS=133824107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr7	133828021	rs17167492	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=1.197;SC=AAGATACAGAGGTAAGCAATG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=14;WE=133828029;WS=133828011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr7	133832887	rs10453020	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=1.602;SC=GTAATGAATTCTAACTCTACA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=133832895;WS=133832877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	133848076	rs17167551	A	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=0.966;SC=TCAGTATCCCAAATGAAAACT;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=13;WE=133848084;WS=133848066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr7	133848257	rs17167553	G	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=544;ReadPosRankSum=0.299;SC=AGAGAATCATGACCTCCTGGA;SOR=0.996;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=36;WE=133848265;WS=133848247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr7	133868368	rs1222420	C	T	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=853;SC=TATTCTTCTACGCAGGGTCTT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=133868376;WS=133868358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	133868439	rs55857809	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=840;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TTAATGTGCTGTCTCCCTGAC;SOR=1.268;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=51;WE=133868447;WS=133868429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr7	133868507	rs1222419	C	T	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=58;PP=2351;SC=GCCTGGATGCCCCTTATCCCA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=116;WE=133868515;WS=133868497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	133868667	rs6952909	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=1.265;SC=GAGGTATCAATAGTTGTAGTA;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=20;WE=133868675;WS=133868657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr7	133881919	rs10611703	ATG	A	377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.34;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	133906669	rs35149449	C	T	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=55;PP=1344;ReadPosRankSum=0.126;SC=AAAACACCAGCGGTAAGAGAG;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=76;TCR=127;TR=87;WE=133906677;WS=133906659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,107:0.43:248
chr7	133979545	rs2504	A	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	133979552	rs2505	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr7	133979795	rs1421484	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=298;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AGGCGCATTCTGTGGTGAGGA;SOR=1.454;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=28;WE=133979803;WS=133979785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
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chr7	133989816	rs2544217	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.997;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=0.058;SC=GCTCACGCCCGTAATCCCAGC;SOR=0.086;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=18;WE=133989824;WS=133989806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr7	134133291	rs2734653	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=-1.552;SC=GTGGCTACACGCTGATGGGAC;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=27;WE=134133299;WS=134133281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr7	134134338	rs71531826	CA	C	255.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=1.623;SC=GACCCCAACTCAAAAAAAAAA;SOR=1.061;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=11;WE=134134346;WS=134134328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr7	134135751	rs2734649	C	T	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=68;PP=2417;SC=AACCCATTTGCTTTACCATGA;SOR=1.161;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=114;WE=134135759;WS=134135741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	134136584	rs1732035	A	C	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=50;PP=1500;SC=AGCCACCGATACCTGCTGACC;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=63;WE=134136592;WS=134136574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	134143690	rs1424426	T	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=487;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CCCTCGCCAATACAGGCCGCG;SOR=0.656;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=29;WE=134143698;WS=134143680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr7	134143958	rs759853	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.933;SC=TGGTTGCGCTGGGGGTGCCGC;SOR=0.560;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=16;WE=134143966;WS=134143948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	134212741	rs2037005	A	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=481;ReadPosRankSum=0.181;SC=TAAATATGCAAATCTTTGCAC;SOR=0.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=32;WE=134212749;WS=134212731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr7	134215259	rs1722886	A	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=0.958;SC=GGTTGCTGAGAGTGGTGTAAT;SOR=0.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=134215267;WS=134215249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr7	134215403	rs1722883	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=740;ReadPosRankSum=-1.138;SC=AGTCTCCTCTTGGCAAAGTGA;SOR=0.526;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=52;WE=134215411;WS=134215393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,58:0.40:146
chr7	134217729	rs3735041	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=485;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TGCAGATTCCAGTAAACTTTT;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=37;WE=134217737;WS=134217719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr7	134221694	rs706159	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.156;NF=11;NR=4;PP=238;ReadPosRankSum=1.540;SC=ATCTCAGTGGGCAGGTGTTTG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=15;WE=134221702;WS=134221684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr7	134221980	rs189945249	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.688;NF=2;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGTAAATGTTGGTATGGGTCC;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=11;WE=134221988;WS=134221970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr7	134223127	rs4732035	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=145;ReadPosRankSum=-0.048;SC=CATTGTCTTTTGCCCCCTCCC;SOR=0.616;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=134223135;WS=134223117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr7	134225788	rs4732036	C	T	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=55;PP=1638;SC=GTTTTTTGTTCTTTCCTGCAG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=75;WE=134225796;WS=134225778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	134225827	rs4728329	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=34;PP=985;SC=CTATCCCTTCAATGCAGAATA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=134225835;WS=134225817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	134250322	rs4732038	A	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=687;ReadPosRankSum=-1.128;SC=TCTTTGCACAACTTTCTTCTC;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=46;WE=134250330;WS=134250312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr7	134254427	rs782538	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.229;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=328;ReadPosRankSum=0.550;SC=CCACATTAATGTTTTTATAAT;SOR=2.732;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=17;WE=134254435;WS=134254404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr7	134261097	rs2161803	C	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CTTTCTGCCCCTAGGGCCAAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=134261105;WS=134261087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
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chr7	134262441	rs10241998	T	C	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=12;PP=1223;ReadPosRankSum=0.470;SC=TGTATTGGAATTCTTTCCTTT;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=89;TCR=21;TR=64;WE=134262449;WS=134262431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr7	134264233	rs72495463	C	CT	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=8.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.46;MQRankSum=4.530;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.359;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
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chr7	134363870	rs73441994	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.243;SC=CTTTTTCCCCGATTTTCCAGA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=134363878;WS=134363860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	134552634	rs1452911	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=758;ReadPosRankSum=-0.753;SC=ATCCTTTTGAGAGGCCAAATG;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=45;WE=134552642;WS=134552624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr7	134576441	rs6953822	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CCTCATTTCGTCTCTTTGGTT;SOR=1.981;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=134576449;WS=134576431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	134612759	rs11438725	G	GT	2596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=17;PP=1607;SC=CAAAGTCCCGGTTGGTAGTGT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=38;WE=134612767;WS=134612749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	134618496	rs61757650	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.816;NF=9;NR=18;PP=473;ReadPosRankSum=1.996;SC=AAGGGCAGCAGAGGAGAGGCA;SOR=0.230;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=27;WE=134618504;WS=134618486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr7	134618710	rs6973420	A	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=748;ReadPosRankSum=0.125;SC=GAGAAAAAACATGCCATGCAA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=55;WE=134618718;WS=134618700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr7	134635040	rs7797991	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=0.316;SC=GCTGCCTCTCCAACTGTGCTC;SOR=0.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=9;WE=134635048;WS=134635030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr7	134673958	rs12671813	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr7	134678253	rs2348049	T	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=708;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GCTGACTCTTTTGGTGATCCC;SOR=0.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=39;WE=134678261;WS=134678243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr7	134678523	rs2252826	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	134694939	rs6958457	T	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=4;PP=122;SC=GCCACCACGCTCAGCTAATTT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=134694947;WS=134694929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	134701856	rs4236655	G	C	7819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=114;PP=2965;SC=CTTAGAAACGGAACCCCTTTA;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=124;TCR=114;TR=238;WE=134701864;WS=134701846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr7	134719551	rs9656447	C	G	5258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=87;PP=2965;SC=TACCCATGCTCAATCCAGATG;SOR=0.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=62;TCR=87;TR=149;WE=134719559;WS=134719541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	134730151	rs2348054	G	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=795;SC=TTTGTTTATAGTGTTTTGCAA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=134730159;WS=134730141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	134730441	rs2348055	A	G	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=47;SC=TTGGGGTTTTAGCACTTAATT;SOR=1.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=134730449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	134744060	rs146909058	CA	C	756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=500;ReadPosRankSum=-0.354;SC=AATAATCAGGCAAAAAAAATT;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=31;WE=134744068;WS=134744050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr7	134765148	rs10215144	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=47;ReadPosRankSum=1.105;SC=TTTCTTCCCTGCAGGACCTCA;SOR=0.204;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=134765156;WS=134765138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	134813853	rs2348282	G	A	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=844;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CTACTGGTCAGGTCAAAGAGC;SOR=1.057;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=52;WE=134813861;WS=134813843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,65:0.46:140
chr7	134833056	rs3735002	C	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=0.569;SC=CACAGCTTACCCAGACGTCTA;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=21;WE=134833064;WS=134833046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr7	134849213	rs3800592	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=14;PP=954;ReadPosRankSum=1.569;SC=CCAAGGCCTCGGTGGCGCGAC;SOR=0.441;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=110;TCF=86;TCR=24;TR=55;WE=134849221;WS=134849203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr7	134849280	rs292501	T	A	7887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=93;PP=2965;SC=GCCTGATGTTTTACGCTCTTC;SOR=1.175;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=246;TCF=153;TCR=93;TR=246;WE=134849288;WS=134849270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr7	134849577	rs2288237	A	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=725;ReadPosRankSum=0.335;SC=TGCTGCTGGCAGGCGGCCTGG;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=54;WE=134849585;WS=134849567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr7	134852399	rs2288238	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=256;ReadPosRankSum=0.894;SC=GGCAGAGGGCGTCTCTCTTAC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=134852407;WS=134852389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr7	134852432	rs292505	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=805;SC=AGGGTCTAGCCTCTGCCCATG;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=134852440;WS=134852422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr7	134871775	rs292557	C	T	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=19;PP=1100;SC=AATTTCCCTCCGAGTCAAAAG;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=134871783;WS=134871765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	134872003	rs292558	C	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=322;SC=ACCCACCCCACAGCAGAGGCT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=134872011;WS=134871993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	134873355	rs292564	G	A	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=40;PP=1251;SC=GAAGGAATCTGCCTGCAGCAG;SOR=2.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=134873363;WS=134873345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	134877935	rs292573	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=6;PP=1037;SC=CCAGGGGAATACAGAGTGTGT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=134877943;WS=134877925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	134879830	rs292575	G	A	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=41;PP=1319;SC=TCCCAGAGCAGTCCACTCTGA;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=134879838;WS=134879820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	134880884	rs292578	G	C	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=51;PP=2085;SC=CTTGGCCCCAGGCCCAACCCA;SOR=0.895;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=134880892;WS=134880874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	134882592	rs292581	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-0.931;SC=AATGATGAACCCAAATAACCA;SOR=0.276;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=134882600;WS=134882582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr7	134882680	rs292582	A	G	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=40;PP=2577;SC=AGAAGAGAAGACCCCCCACAG;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=119;WE=134882701;WS=134882670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	134882693	rs292583	T	C	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=53;PP=2953;SC=CCCCACAGTGTTCCTCAGTAG;SOR=1.222;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=140;WE=134882701;WS=134882670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	134889141	rs292592	G	A	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=55;PP=2080;SC=GCCCACACGAGGTGACTGGGA;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=97;WE=134889149;WS=134889131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	134890855	rs292593	T	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=40;PP=1325;SC=TCACCTAACCTTCCCTCTGCG;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=134890863;WS=134890845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	134895532	rs292601	T	C	5770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=70;PP=2965;SC=CTGCCTCTCATTGAAGTCAGT;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=101;TCR=70;TR=171;WE=134895540;WS=134895522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr7	134896383	rs292602	T	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=352;SC=CCGCACGCACTGGGCGACCAG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=134896391;WS=134896373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	134930169	rs113633449	A	AGAG	2700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.89;QD=43.56;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	134962043	rs10239950	C	G	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=49;PP=2024;SC=GGCCACTAGGCAGTTAGTTGG;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=101;WE=134962051;WS=134962033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	134968479	rs11762990	A	C	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=69;PP=1803;ReadPosRankSum=-2.520;SC=TGAAGGTGGAACTCAATTAAC;SOR=0.937;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=199;TCF=74;TCR=125;TR=106;WE=134968487;WS=134968469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,119:0.52:230
chr7	135047703	rs6969632	T	C	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=43;PP=1345;SC=GTCTGAAGGCTGTCTGAAAGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=135047711;WS=135047693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	135048033	rs2059367	G	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=472;SC=CAAAAGGAAAGACAGAAGAGA;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=135048041;WS=135048023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	135082751	rs3812281	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=195;SC=TAAACTATGCTCTATATATTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=135082759;WS=135082741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	135095270	rs2696877	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=13;PP=494;SC=CTTACGTATCATACCTCTGCA;SOR=0.957;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=135095278;WS=135095260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	135099901	rs73158933	G	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.317;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=684;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GGGAGGAAAAGCAAAAATCCC;SOR=0.640;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=49;WE=135099909;WS=135099891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,56:0.41:135
chr7	135242772	.	C	T	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=922;ReadPosRankSum=-1.483;SC=ACCAGGTCTTCATGGAGAGAC;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=62;WE=135242780;WS=135242762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr7	135242910	rs6961420	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=1.146;SC=GGCTCCAGCCCTCGAGTTGGG;SOR=0.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=135242918;WS=135242900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	135285579	rs146409284	C	A	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=615;ReadPosRankSum=-0.074;SC=CCACCTTGGTCTGTTTTATTG;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=42;WE=135285587;WS=135285569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr7	135285788	rs4296989	T	C	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=49;SC=CTATGTTATATATAAATTAAA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=135285796;WS=135285778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	135291001	rs73725182	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=0.351;SC=TGTGCATACACGCATTCTTTT;SOR=0.684;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=30;WE=135291009;WS=135290991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr7	135304273	rs7810767	G	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=22;PP=1313;SC=TGAACAGAAGGAAACATCAGT;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=135304281;WS=135304263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr7	135311164	rs113302711	G	GA	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=228;ReadPosRankSum=-1.080;SC=ATTATTAAGGGAAGAAAAAAT;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=14;WE=135311175;WS=135311154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr7	135311167	rs10234309	G	A	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=712;SC=ATTAAGGGAAGAAAAAATTCC;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=28;WE=135311175;WS=135311154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	135315054	rs10690915	C	CCT	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=887;ReadPosRankSum=-0.988;SC=TCTACTTCTACCTGTTTTTTC;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=22;WE=135315062;WS=135315044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr7	135322853	rs7799891	T	C	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.955;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=682;ReadPosRankSum=1.723;SC=TTTTGGAAAATGTTGATAAAA;SOR=0.290;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=54;WE=135322861;WS=135322843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr7	135323576	rs6948382	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AAAGTTGAGCGGGAGGTATTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=135323584;WS=135323566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr7	135327853	rs73725437	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TAAATTCTGGGGCATCCCTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=135327861;WS=135327843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	135328110	rs10260691	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=537;ReadPosRankSum=0.772;SC=AAAAGAGGTACGAATCTTATA;SOR=0.437;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=33;WE=135328118;WS=135328100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr7	135328168	rs138585928	A	ACTGGT	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=555;ReadPosRankSum=0.458;SC=AGGCCAGGGTACTCAGACTGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=135328176;WS=135328158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	135329690	rs12540688	T	C	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1837;ReadPosRankSum=1.156;SC=TCTCCACTGCTCAGAAATATG;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=106;WE=135329698;WS=135329680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,129:0.58:221
chr7	135330410	rs148753323	GT	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=74;ReadPosRankSum=0.896;SC=GCTAGTACCAGTTTTTTTTTA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=7;WE=135330418;WS=135330400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr7	135330829	rs62479523	C	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=533;ReadPosRankSum=0.445;SC=TGTTATTATTCATTGTCATCA;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=33;WE=135330837;WS=135330819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr7	135345319	rs10258155	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GGAAAGTGCCATAAGTTCCAC;SOR=0.768;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=33;WE=135345327;WS=135345309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr7	135347239	rs141207942	G	GC	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.536;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr7	135375921	rs56341417	C	A	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-3.371;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr7	135375925	rs35065926	A	C	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-3.011;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr7	135378854	rs3800763	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=402;ReadPosRankSum=1.997;SC=TTCTGCTGGAGAAGGAGGGAA;SOR=0.350;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=25;WE=135378862;WS=135378844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr7	135387473	rs3112345	A	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=607;ReadPosRankSum=-1.361;SC=CCTCACTGAAAGGAACTCTAA;SOR=0.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=36;WE=135387481;WS=135387463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr7	135387495	rs3112346	A	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=686;ReadPosRankSum=1.751;SC=GTGGATCTGTAGCTGTTGAAA;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=44;WE=135387503;WS=135387485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr7	135387656	rs3112347	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=723;ReadPosRankSum=-1.241;SC=GAGGACACAGGAGCCACGTCA;SOR=0.520;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=48;WE=135387664;WS=135387646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr7	135392876	rs3110800	T	C	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1474;ReadPosRankSum=0.073;SC=CCGGCTTGGCTCCGGCCATCA;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=96;TCR=66;TR=92;WE=135392884;WS=135392866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,104:0.55:190
chr7	135406176	rs4596594	A	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=670;ReadPosRankSum=-2.383;SC=AGAACGGGTAAAGGAAGGCCG;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=43;WE=135406184;WS=135406166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr7	135412273	rs3112369	T	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=382;ReadPosRankSum=-0.004;SC=AGCTCGTCCTTGGACCCCGCT;SOR=0.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=30;WE=135412281;WS=135412263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr7	135421790	rs4338044	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=274;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CAAAAAAGATAGAGAAAGTGC;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=21;WE=135421798;WS=135421780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr7	136588109	rs6963819	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.440;SC=TCAAAAGGAAGTCTTACTCTT;SOR=1.802;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=136588117;WS=136588099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	136939577	rs73162498	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr7	136939582	rs1162122	G	T	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.13;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	137076110	.	A	AG	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.033;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr7	137082039	rs2241443	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-2.484;SC=AAATTACCTATGATATGCTCT;SOR=0.027;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=137082047;WS=137082029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	137092745	rs3217275	CA	C	3510.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=66;PP=2840;SC=CTATTAGCTGCAAAGAGAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=5;TCR=69;TR=71;WE=137092753;WS=137092735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	137092781	rs7800454	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=45;PP=1385;SC=CAGGCAGAATTCGGAACAAGG;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=137092789;WS=137092771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	137097086	rs1731959	G	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=730;SC=ATATCTTGGTGAAGCAGACCG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=137097094;WS=137097076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	137154572	rs2293546	T	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=22;PP=480;SC=AAAATTAGCATGAGGTTTTTA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=137154580;WS=137154562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	137284709	rs62490469	T	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=776;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CAAGAATAACTGCTCATTTAA;SOR=0.437;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=42;WE=137284717;WS=137284699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr7	137304765	.	G	GCACA	128	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9999;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=61.19;NF=0;NR=3;PP=128;QD=43.6666666667;SC=ATGTACACACGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=137304773;WS=137304755;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr7	137531147	rs71815938	GT	G	7411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=59;PP=2951;SC=CCCTTGCTGGGTAGAAGAGTG;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=130;WE=137531155;WS=137531137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	137590369	rs273968	G	A	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=30;PP=1638;SC=AGTGCTGGCCGTTGGGAAGGC;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=137590377;WS=137590359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	137600690	rs273957	C	T	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=24;PP=1206;SC=TCGTCTGTAACTGGCTCTGTC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=137600698;WS=137600680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	137607217	.	C	T	315	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=26;MQ=58.36;NF=10;NR=1;PP=315;QD=31.7973829588;SC=TATATATATACACACATATAT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=137607225;WS=137607207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr7	137607233	.	C	T	359	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=58.84;NF=12;NR=2;PP=359;QD=28.1265151819;SC=TATATATATACACACACACAC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=14;WE=137607241;WS=137607223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,14:0.82:17
chr7	137612913	rs66593747	CTGG	C	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GAAGCTGTCACTGGTGGTAAT;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=8;WE=137612923;WS=137612903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr7	137773291	rs2120846	T	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=33;PP=1939;SC=GATTAATGATTATTAAAGGAA;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=137773299;WS=137773281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	137773563	rs2166188	T	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=285;SC=AAGGTTTCAGTTGTTCATTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=137773571;WS=137773553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	137773587	rs35802315	C	CGTGT	97.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=178;SC=ATTCATCTTCCGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=137773595;WS=137773577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	137776411	.	C	CA	415	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=62.75;NF=12;NR=13;PP=415;QD=16.84;SC=CCCCCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=25;WE=137776419;WS=137776401;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,25:0.61:41
chr7	137798593	rs2306847	A	T	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=78;PP=2287;SC=AAGGCTCATAAGAACCCTGAC;SOR=1.420;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=118;WE=137798601;WS=137798583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	137801413	rs1872929	A	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=48;PP=1502;SC=TACTGACTGCAGGGAGTTCCT;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=137801421;WS=137801403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	137801444	rs1872930	C	T	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=44;PP=1616;SC=TTCACTCCCACGAGTGCCAAG;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=137801452;WS=137801434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	138145778	rs112619223	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=1.349;SC=GGGGGAGGGGCGAGCAGGAGG;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=138145786;WS=138145768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	138188932	rs10488642	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=1.531;SC=TGAATTTAAAAAGAATGGACA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=15;WE=138188940;WS=138188930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr7	138189189	rs148040062	GCTC	G	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.486;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.993;NF=0;NR=12;PP=603;ReadPosRankSum=1.320;SC=TTGCCTGCCAGCTCTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=138189207;WS=138189179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	138189199	.	T	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.14;MQRankSum=2.166;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	138200117	rs3757381	A	T	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=53;PP=1516;SC=AATAAATGAGATCTTTGCATT;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=138200125;WS=138200107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	138229990	rs6959574	G	A	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=495;SC=TCTTCCTGGCGTGGAGGCACC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=138229998;WS=138229980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	138268563	rs3213902	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.144;SC=GAATTTAGCTATTTGTATTAT;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=7;WE=138268571;WS=138268553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr7	138279228	rs1439793	A	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=-0.472;SC=ATATGCCTTTAAAAAAAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=138279236;WS=138279218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	138281355	rs1659832	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=-0.064;SC=GAGAAAATACAGATTCACTTC;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=138281363;WS=138281345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	138281906	rs1659831	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1120;ReadPosRankSum=1.152;SC=TCTCATACTTTAGTTTCTCTT;SOR=0.891;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=66;WE=138281914;WS=138281896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,78:0.49:159
chr7	138305743	rs3734946	A	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=423;ReadPosRankSum=0.262;SC=GGTTCCTCTTACCCCCTCTCT;SOR=0.612;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=36;WE=138305751;WS=138305733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr7	138305782	rs3734945	T	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=414;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GCAGGGTCCTTGGCTGTACCT;SOR=0.579;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=34;WE=138305790;WS=138305772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr7	138305806	rs3734944	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=-1.555;SC=ATATAAATGGTGCCACCATTG;SOR=0.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=28;WE=138305814;WS=138305796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr7	138312122	rs2305816	A	C	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=51;PP=2701;SC=GAGGAGAAGGAAGAATAAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=83;TCR=51;TR=134;WE=138312130;WS=138312112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	138314822	rs149009334	G	A	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=914;ReadPosRankSum=-0.553;SC=AATGTGGTCCGTAAATATTTA;SOR=0.503;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=96;TCR=49;TR=62;WE=138314830;WS=138314812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr7	138333933	rs58569190	GA	G	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.146;NF=0;NR=19;PP=209;ReadPosRankSum=2.428;SC=TTATGACAATGAAAAAAAAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=19;WE=138333941;WS=138333923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr7	138356659	rs5887893	AG	A	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	138356662	rs5011821	G	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	138356663	rs5011820	G	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	138356664	rs5887894	C	CA	547.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	138356730	rs202122915	T	TG	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	138356732	.	CTG	GCT	2249	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28;NR=5;PP=2249;QD=70.0747840867;SC=CCCTCAGTTGCTGTGTTCACG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=33;WE=138356742;WS=138356722;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,33:0.89:37
chr7	138356733	rs5887896	TG	T	1750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	138363767	rs10250576	A	G	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=31;PP=1481;SC=GGATCGTGACAGGCTCTGTTG;SOR=1.139;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=80;WE=138363775;WS=138363757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	138363896	rs12535253	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=35;PP=1030;SC=TGCCAGGCACACTACACACAA;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=138363904;WS=138363886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	138391596	rs12707394	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=568;SC=TGGCCACGGCAGGCACCCAGG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=138391604;WS=138391586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	138394695	rs141195167	G	GCAAT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	138417718	rs3807154	A	G	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=37;PP=1892;SC=GCTGAGATACATGGACGTCAA;SOR=1.411;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=108;WE=138417726;WS=138417708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	138418910	rs1026435	G	A	8646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=117;PP=2965;SC=GGATGACACCGAAAACCATCT;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=150;TCR=117;TR=267;WE=138418918;WS=138418900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr7	138419085	rs1037692	A	G	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=43;PP=1285;SC=AACTTTCCCTAAGCAAACCGC;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=138419093;WS=138419075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	138429823	rs55843107	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TCACTGAGGCCACCTGGATGG;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=138429831;WS=138429813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	138429851	rs6467797	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=1.610;SC=CTACACCATCTCTGTCTGTCA;SOR=0.175;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=9;WE=138429859;WS=138429841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr7	138440607	rs296911	G	A	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1496;ReadPosRankSum=1.038;SC=CTAAGACATCGTTTGCTGACT;SOR=0.636;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=104;WE=138440615;WS=138440597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,124:0.58:214
chr7	138441083	rs11764089	A	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=528;ReadPosRankSum=0.407;SC=TTATGTGAGAAAGTTATTCTA;SOR=0.711;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=32;WE=138441091;WS=138441073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr7	138441124	rs296910	A	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=939;ReadPosRankSum=-1.020;SC=AGCCACAGTCATGTGCATTTG;SOR=0.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=67;WE=138441132;WS=138441114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,77:0.54:143
chr7	138444737	rs7810721	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-1.061;SC=ACTCTGTGAGCAGGAGGGACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=6;WE=138444745;WS=138444727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	138453892	rs200396435	GAAA	G	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=0.053;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.407;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr7	138455988	rs10258719	A	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=859;ReadPosRankSum=0.604;SC=AAACACAGACACCATCTTGGC;SOR=0.699;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=54;WE=138455996;WS=138455978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
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chr7	138588538	.	AGTGTGTGTGT	A,AGT	176	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=19;MQ=54.67;NF=0,0;NR=13,13;PP=176,136;QD=13.7692307692;SC=GTAAAAAAACAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=13,13;WE=138588555;WS=138588528;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.27:48
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chr7	138740224	rs2297239	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.494;SC=ATCATGTCTTTTAAAAATGCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=138740232;WS=138740214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr7	138793677	rs1839606	G	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=369;ReadPosRankSum=0.857;SC=GCGGGGTCCCGGCGAAGCCGT;SOR=1.911;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=18;WE=138793685;WS=138793667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr7	138822504	rs10674402	T	TGTTC	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=543;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GATTGCCTGTTGTCAGTAACC;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=138822512;WS=138822494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	138853315	.	C	CA	141	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=21;MQ=58.03;NF=0;NR=10;PP=141;QD=14.7;SC=TATTTAGAGACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=10;WE=138853323;WS=138853305;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,10:0.34:29
chr7	138957240	rs142378700	T	TTATGTATGTATG	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.675;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr7	138960761	rs74719948	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-1.409;SC=CTACTGAAAATTAAATTACTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=138960769;WS=138960751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr7	138967814	rs61995684	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=664;ReadPosRankSum=0.768;SC=CATCCCTGGTGGCTTCGGTTA;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=46;WE=138967822;WS=138967804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr7	138978499	rs12334279	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=339;ReadPosRankSum=-0.428;SC=AGTAAATTTTCAAAAACGTGC;SOR=2.726;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=138978507;WS=138978489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr7	139415723	rs10224408	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=603;ReadPosRankSum=0.978;SC=CCTTGTGGACGGTCTTACCTG;SOR=1.074;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=34;WE=139415731;WS=139415713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr7	139415775	rs7456421	G	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=937;ReadPosRankSum=-1.550;SC=CAGCCTTGGAGACGTGGCTGG;SOR=0.514;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=57;WE=139415783;WS=139415765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,70:0.58:120
chr7	139415943	rs4074826	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=799;ReadPosRankSum=0.988;SC=TGTATTTGAGGGGCAAGGGGC;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=40;WE=139415951;WS=139415933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr7	139416939	rs10278124	C	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CACTTGAAAACAAGGTTGAAA;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=139416947;WS=139416929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr7	139478175	rs1860509	T	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=435;ReadPosRankSum=2.014;SC=GTGCGAGGGTTCGCGCGTGTG;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=31;WE=139478183;WS=139478165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr7	139605869	rs35857550	CT	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.493;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.590;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr7	139613072	rs6464448	A	G	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=693;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CCGTCTGTCAAGAAACTGATT;SOR=0.813;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=44;WE=139613080;WS=139613062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
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chr7	139724169	rs13760	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CTTCTGGTTAATCCACTAGTG;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=139724177;WS=139724159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr7	139754451	rs2362460	T	C	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=29;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.560;SC=AAGGAGCCTCTTCCAACTTAC;SOR=0.359;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=172;TCF=123;TCR=49;TR=90;WE=139754459;WS=139754441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,105:0.53:198
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chr7	139813249	rs138557624	TGTGGCATAAAACACA	T	1491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=2962;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTCCTAATCTTGTGGCATAAA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=23;WE=139813271;WS=139813239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,42:0.35:120
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chr7	140044811	rs61024048	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AATAGGGACCGCTTCTGTCAC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=140044819;WS=140044807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr7	140051091	rs12703775	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=521;ReadPosRankSum=0.220;SC=CTCCAGGAAGGCAACATGCCT;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=34;WE=140051099;WS=140051081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr7	140051848	rs12665885	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=411;ReadPosRankSum=0.776;SC=ATAGAAGGGGCGGCTTCTCCT;SOR=1.118;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=36;WE=140051856;WS=140051838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr7	140069361	rs4448174	G	C	3965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=44;PP=2247;SC=TTTTTCTTTAGCTTTAAGCCC;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=117;WE=140069369;WS=140069351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr7	140080087	rs62490396	C	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=826;ReadPosRankSum=0.248;SC=CTTACCTCCACAGGCAGCTCA;SOR=0.831;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=158;TCF=80;TCR=78;TR=57;WE=140080095;WS=140080077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,67:0.36:186
chr7	140082363	rs6968618	G	A	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=74;PP=2613;SC=TTGACCTTAAGGTTTGGATGA;SOR=1.452;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=39;TCR=74;TR=113;WE=140082371;WS=140082353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	140110677	rs2971690	G	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=515;ReadPosRankSum=0.353;SC=GTGAGAGGCTGTGTGAATTGG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=32;WE=140110685;WS=140110667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr7	140111486	rs2948389	A	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=1.006;SC=TCCCCAACCAAGGAGGATATC;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=140111494;WS=140111476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	140111509	rs2971688	G	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.189;SC=AGTCATCCAGGGAGCAACTGA;SOR=0.991;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=140111517;WS=140111499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	140125750	rs2948386	T	C	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1693;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGCTGAGAAGTACGGCCTCCT;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=108;TCR=97;TR=98;WE=140125758;WS=140125740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,120:0.48:252
chr7	140158851	rs2272095	C	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=-1.048;NF=36;NR=57;PP=1429;ReadPosRankSum=0.544;SC=GGATGCAGGACCTGCAGCCCA;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=74;TCR=118;TR=93;WE=140158859;WS=140158841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,102:0.47:216
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chr7	140173170	rs79453306	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=734;ReadPosRankSum=-2.468;SC=GAATCCCCCTACTGCTGTGCC;SOR=0.997;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=46;WE=140173178;WS=140173153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr7	140218464	rs6852	C	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=780;ReadPosRankSum=-2.093;SC=GTTTTTAAAGCATAGGGCTGC;SOR=0.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=46;WE=140218472;WS=140218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr7	140225750	rs2252397	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=0.264;SC=GTAGCCACAGGTAATGAAGAG;SOR=1.085;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=14;WE=140225758;WS=140225740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr7	140244560	rs2293177	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=318;ReadPosRankSum=1.136;SC=CGGCACAGTTCGATCACCTGC;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=23;WE=140244568;WS=140244550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr7	140244627	rs2293176	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.678;SC=GGCCTCTCACGGGTGTCGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=13;WE=140244635;WS=140244617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	140255623	rs4342501	T	C	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=49;PP=1290;ReadPosRankSum=1.446;SC=CCACATATCATAGCTCTGGAA;SOR=1.046;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=141;TCF=55;TCR=86;TR=76;WE=140255631;WS=140255613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,82:0.55:150
chr7	140255657	rs11763409	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=707;ReadPosRankSum=0.471;SC=AAGTTGTTATCCCATTGTGTT;SOR=0.549;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=40;WE=140255665;WS=140255647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr7	140257841	rs10252031	A	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=237;SC=GTGCCTCATCAGGGAATCTCA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=140257849;WS=140257831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	140257907	rs12704002	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=487;ReadPosRankSum=0.014;SC=AGGAAGTCCACGAGGCTCTTG;SOR=0.418;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=28;WE=140257915;WS=140257897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr7	140258000	rs12704003	T	C	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1062;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TTAAGACAAATGAGAATGTTT;SOR=0.677;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=85;WE=140258008;WS=140257990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,98:0.53:184
chr7	140269625	rs587373	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=0.998;SC=TCTCCTAGGACGATGGAGGGC;SOR=0.317;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=140269633;WS=140269615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	140301731	rs269243	G	T	10581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=160;PP=2965;SC=CACGGAGAGGGGATCGTTCTG;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=321;TCF=161;TCR=160;TR=321;WE=140301739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr7	140373326	rs2968558	A	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1287;ReadPosRankSum=0.734;SC=TGACGTTCTGAGTCGGCGAAG;SOR=0.700;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=70;WE=140373334;WS=140373316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr7	140374049	rs1140034	T	C	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=970;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CAACCTCATCTCCGTGGCAGT;SOR=0.942;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=52;WE=140374057;WS=140374039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr7	140390656	rs12375245	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.458;NF=11;NR=17;PP=479;ReadPosRankSum=0.970;SC=AAGGTGGGACGGGGCAGGGAG;SOR=0.337;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=28;WE=140390664;WS=140390646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr7	140390720	rs144837217	T	TTTG	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.69;MQRankSum=1.164;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	140394587	rs1046515	C	T	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=46;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CTCACGGGCCCAGTGTGCCCC;SOR=0.784;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=55;WE=140394595;WS=140394577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr7	140396472	rs57717083	C	CG	1161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=1006;SC=ACGGGAGGCGCGGGCGGAGCG;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=25;WE=140396480;WS=140396462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	140397307	.	GGGGTGCGAGGTAGGGAGC	G	1143	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=1143;QD=293.5;SC=CGGAGGGCTGGGGGTGCGAGG;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=4;WE=140397332;WS=140397297;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,4:0.19:21
chr7	140397792	rs1267673	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=0.053;SC=GCCACTGCGCTTGGTCTCACT;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=16;WE=140397800;WS=140397782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr7	140404778	rs375211204	A	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=945;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GTGTGCTCCAAATTTCTTTAT;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=26;TCR=62;TR=53;WE=140404786;WS=140404768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr7	140426257	rs3829814	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=643;ReadPosRankSum=0.037;SC=CGAACACAAGACTTAAGAAAT;SOR=0.453;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=46;WE=140426265;WS=140426247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr7	140449150	rs9648696	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.881;NF=10;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-0.525;SC=ACAGAACAATTCCAAATGCAT;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=140449158;WS=140449140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr7	140453136	rs113488022	A	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=0.037;SC=TCGAGATTTCACTGTAGCTAG;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=21;WE=140453144;WS=140453126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr7	140774467	rs477223	C	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=637;ReadPosRankSum=-1.573;SC=GCTTCGACCCCGAGATCGCCG;SOR=1.032;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=41;WE=140774475;WS=140774457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
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chr7	141137554	rs1727491	A	G	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr7	141137554	.	ACG	GCA	1395	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=18;NR=24;PP=1395;QD=34.4873303539;SC=AGGTAAGGCTACGGGCTCGGC;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=42;WE=141137564;WS=141137544;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr7	141137556	rs1619668	G	A	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr7	141293162	.	C	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=753;ReadPosRankSum=-0.004;SC=AGGAAGTTAACCATCTGGTGA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=49;WE=141293170;WS=141293152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr7	141321434	rs142576028	ATG	A	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=116;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GAGAGAGAATATGTGTGTGTG;SOR=0.840;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=4;WE=141321443;WS=141321424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr7	141362431	rs6949729	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=460;SC=CCACGTGAAGTGGCTCCCAGT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=141362439;WS=141362421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	141363842	rs12534759	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=335;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GTAAGGAGCCCGGCTCTAAGT;SOR=0.193;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=18;WE=141363850;WS=141363832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr7	141364712	rs2286150	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=627;ReadPosRankSum=0.331;SC=ACCTCTGCTCGTTGAGCCGGC;SOR=0.881;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=48;WE=141364720;WS=141364702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr7	141365128	rs2286151	T	C	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=1418;ReadPosRankSum=0.783;SC=ACTGTGGGGATAGAGGAGGTG;SOR=0.527;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=155;TCF=58;TCR=97;TR=89;WE=141365136;WS=141365118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,102:0.59:173
chr7	141386264	rs35707772	AC	A	742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=747;ReadPosRankSum=0.253;SC=TACACACAGCACACGAAGACC;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=20;WE=141386272;WS=141386254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr7	141442213	rs2301924	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=CTGAGCCCCTGTTCTCCTTAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=141442221;WS=141442203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	141463914	rs765007	T	C	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=6;PP=1171;SC=GGAGATTCTATGTATCAACAG;SOR=3.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=50;WE=141463922;WS=141463904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	141464348	rs144467469	G	A	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1523;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CTAGGGTGATGGTATGGATGC;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=72;TCR=95;TR=82;WE=141464356;WS=141464338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,93:0.48:193
chr7	141464765	rs2270009	C	T	5331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=76;PP=2965;SC=AGATGATTGGCGAAGTAATGA;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=168;WE=141464773;WS=141464755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr7	141478308	rs2233998	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=372;SC=TTATTCTATTTCTCTGCTATT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=141478316;WS=141478298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	141478574	rs2234001	G	C	5844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=85;PP=2965;SC=CTCGAGCAGTGTCTGGTTTGT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=168;WE=141478582;WS=141478564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	141478800	rs2234002	G	A	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=65;PP=2852;SC=TTTAATATCAGTGAGGGCATC;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=136;WE=141478808;WS=141478790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr7	141490107	rs2234012	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=202;SC=GTGTGTTATCACTACCAGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=141490115;WS=141490101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	141490238	rs2227264	G	T	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=35;PP=2092;SC=GGAAATGGAAGCCTGGTGGTC;SOR=1.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=141490246;WS=141490228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	141536351	rs10657416	C	CAG	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=424;ReadPosRankSum=-1.392;SC=GGAGATCATGCAGAGAGAGAG;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=11;WE=141536359;WS=141536341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr7	141536855	rs7806186	C	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=1722;ReadPosRankSum=1.505;SC=CATCAAGAGTCAATAGTTAAC;SOR=0.479;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=37;WE=141536874;WS=141536845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr7	141536866	rs7806190	C	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=1722;ReadPosRankSum=0.163;SC=AATAGTTAACCGGGCATATGC;SOR=0.408;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=46;WE=141536874;WS=141536845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr7	141537116	rs7805542	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=382;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CTGACCACCAGCCTCTATTTC;SOR=0.454;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=24;WE=141537124;WS=141537106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr7	141537169	rs7806657	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;ReadPosRankSum=-0.110;SC=ATAAGGAATGCGACAAAGGAG;SOR=1.302;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=23;WE=141537177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr7	141537237	rs7806797	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=667;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AAAGGCTTTACGTCTCTTTAA;SOR=1.033;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=42;WE=141537245;WS=141537227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr7	141537297	rs3823668	T	G	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1328;ReadPosRankSum=1.751;SC=CTAAATGACCTGAGGCAATTC;SOR=0.979;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=87;WE=141537305;WS=141537287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,104:0.53:198
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chr7	141537735	rs12669721	T	G	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=35;PP=2146;SC=GTGGCGAGGGTAAGGGGCTGG;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=103;WE=141537743;WS=141537725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	141537942	rs145160047	T	TCAA	3636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.571;NF=6;NR=53;PP=2846;ReadPosRankSum=0.347;SC=GAAGTAATCATCATCATCATC;SOR=0.816;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=123;TCF=21;TCR=102;TR=59;WE=141537950;WS=141537932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,100:0.54:184
chr7	141537968	rs11765575	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.662;NF=22;NR=48;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CATTGCTAAGATACTGAATGT;SOR=1.076;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=70;WE=141537976;WS=141537958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,80:0.53:152
chr7	141538089	rs75612846	TG	T	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.512;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.586;NF=0;NR=20;PP=627;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CATGAATTAATGGGGGCACAT;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=20;WE=141538097;WS=141538079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr7	141538741	rs73171695	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr7	141538865	rs12703412	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=11;PP=534;SC=ATAACATGTAACACAGGGTTC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=141538873;WS=141538855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	141539075	rs62478495	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=305;ReadPosRankSum=-0.693;SC=ACCCTTATATGAGAACCACTG;SOR=0.723;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=18;WE=141539083;WS=141539065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr7	141540680	rs10454323	G	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=509;ReadPosRankSum=-1.692;SC=GATGGAGTCTGAGAGGCAGGA;SOR=0.346;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=29;WE=141540688;WS=141540670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr7	141540741	rs10454324	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1044;ReadPosRankSum=1.647;SC=TGCACCCTTCGCAATCCTGCC;SOR=0.499;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=66;WE=141540749;WS=141540731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr7	141540774	rs10454325	A	C	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1267;ReadPosRankSum=-1.852;SC=CATCCATTAAACTGTGCCTTA;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=76;WE=141540782;WS=141540764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,90:0.53:170
chr7	141635534	rs200523567	T	TC	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=12;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=0.689;SC=CCATCCCCACTCCCCCAAGTT;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=15;WE=141635546;WS=141635524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	141635538	rs5888023	C	CA	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.51;MQRankSum=1.005;NF=12;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=0.114;SC=CCCCACTCCCCCAAGTTTCTA;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=15;WE=141635546;WS=141635524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr7	141672604	rs10246939	T	C	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1127;ReadPosRankSum=-3.095;SC=GAGATCAGGATGGCTGCATGC;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=81;WE=141672612;WS=141672594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,92:0.43:214
chr7	141672705	rs1726866	G	A	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1341;ReadPosRankSum=0.860;SC=GATGAAGGCAGCACAGGATGA;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=92;WE=141672713;WS=141672695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr7	141673345	rs713598	C	G	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1802;ReadPosRankSum=0.917;SC=TTGCTCAGTGCCTGCCTCTTC;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=121;TCR=91;TR=98;WE=141673353;WS=141673335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,109:0.46:236
chr7	141705489	.	G	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=357;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CTCTCCATATGTTGTTTTTAT;SOR=1.026;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=24;WE=141705497;WS=141705479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr7	141733994	rs10693852	T	TTG	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=414;ReadPosRankSum=-1.912;SC=TCATTTCGGATTGTGATAGTC;SOR=1.995;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=11;WE=141734002;WS=141733984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr7	141736249	rs13245455	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=1.709;SC=GCTGTATCATCGAAATGCCCA;SOR=0.465;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=10;WE=141736257;WS=141736239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	141736798	rs4132774	T	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=692;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CTAACCTCCTTAAATTTTATT;SOR=0.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=46;WE=141736806;WS=141736788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr7	141738504	rs8180874	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=41;PP=1294;SC=TCCAAACTCACTTCTGACATC;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=141738512;WS=141738494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	141740077	rs2960753	G	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=442;ReadPosRankSum=-0.989;SC=CTGAGGAGTAGTTTTTAGTGT;SOR=0.293;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=26;WE=141740085;WS=141740067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr7	141740409	rs10215116	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=4;PP=335;SC=TGGCTAGACCATAATTCAGCT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=141740417;WS=141740399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	141747499	rs62477571	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=431;ReadPosRankSum=-2.027;SC=AACTTTTCCAATTTGAAATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=20;WE=141747507;WS=141747489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
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chr7	141750316	rs6948116	C	T	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=221;SC=TTTTTATGATCGTTTTAAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=141750324;WS=141750307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr7	141760293	rs2961073	TG	GC	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AACACTTAGGTGATGTGTCTT;SOR=0.653;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=35;WE=141760302;WS=141760283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr7	141794263	rs3087322	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.439;NF=33;NR=22;PP=786;ReadPosRankSum=-2.438;SC=GAGACAACACAGCCGCGTGGG;SOR=0.982;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=55;WE=141794271;WS=141794253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr7	141794763	rs138070479	ATT	A	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=38.48;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	141794790	rs4259331	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=629;SC=TTTGAGACAAAGACTCATTCT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=141794798;WS=141794780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr7	141796081	rs7807635	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.23;MQRankSum=-1.656;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr7	141796131	rs6975672	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.32;MQRankSum=-2.915;QD=11.02;ReadPosRankSum=2.548;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr7	141796250	rs6976953	C	T	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=40;PP=1112;SC=GGGAGGATCCCAGCTGTGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=141796258;WS=141796240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	141796289	rs36061384	C	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.021;NF=2;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=0.174;SC=GAGAAGAGGCCTGAGCTGGTG;SOR=0.053;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=17;WE=141796297;WS=141796279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	141805522	rs36052135	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=19;PP=1090;ReadPosRankSum=-1.415;SC=AGTATTAGGGGGTTATTTGGA;SOR=0.866;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=86;TCR=40;TR=63;WE=141805530;WS=141805512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,69:0.49:142
chr7	141844888	rs12154456	C	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=48;PP=1478;SC=GCCGAAGTCTCTGCAGCAGTG;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=141844896;WS=141844878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	141853951	rs73158444	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=-0.361;SC=ATGGTCTATCCCCACTATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=22;WE=141853959;WS=141853941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr7	141854436	rs61281471	A	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=0.605;SC=ATGATGTGACAAAGAGGTTCT;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=4;WE=141854444;WS=141854426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	141854659	rs11770705	A	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=691;ReadPosRankSum=-1.111;SC=AGGTCACCAAAAGAAGTGATG;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=44;WE=141854667;WS=141854649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr7	141857846	rs7811706	A	G	3870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=72;PP=2526;SC=CTTTTCTACCATGCTCACACC;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=125;WE=141857854;WS=141857836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	141860199	rs60403744	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=0.296;SC=TCCTTTCAAAATTGATCCAAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=141860207;WS=141860189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	141860861	rs34106041	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.826;SC=GGGATGAAGGTGGCTGGTTTC;SOR=1.002;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=11;WE=141860869;WS=141860851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr7	141861072	rs12703440	C	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=0.371;SC=GAAAATTAGTCATCATAGGCT;SOR=0.202;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=5;WE=141861080;WS=141861062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr7	141871115	.	C	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=957;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TGACATGTTTCTCTCCATTTC;SOR=0.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=62;WE=141871123;WS=141871105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
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chr7	141897595	rs3110843	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=539;ReadPosRankSum=-1.114;SC=AAAAGCATTTTAAAGATCATC;SOR=1.067;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=28;WE=141897603;WS=141897585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
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chr7	142001030	rs56095598	A	G	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=70;PP=2914;SC=GTGATCTTGCACTGTGTCCCC;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=142001038;WS=142001020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	142008403	rs376053846	C	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.552;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,5:0.10:52
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chr7	142008440	.	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.601;SOR=1.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,13:0.16:82
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chr7	142008469	.	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=1.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,23:0.17:138
chr7	142008477	.	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,23:0.15:154
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chr7	142008577	rs369645839	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,31:0.15:213
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chr7	142008593	rs368999058	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.410;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,27:0.14:198
chr7	142008628	.	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,25:0.14:183
chr7	142008634	.	ACG	A	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.584;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,24:0.13:183
chr7	142008638	.	C	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.733;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.214;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,24:0.13:178
chr7	142008639	.	A	AGG	485.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.868;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,24:0.14:175
chr7	142008644	.	CA	TC	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=1.849;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,23:0.14:166
chr7	142008653	rs370721246	T	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=4.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,23:0.15:151
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chr7	142008675	rs376217909	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=8.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.316;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,19:0.15:124
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chr7	142008884	.	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,20:0.24:84
chr7	142008887	.	T	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,20:0.24:83
chr7	142008932	rs375535167	GC	G	229.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=718;ReadPosRankSum=0.128;SC=CCAGGAAGCTGCAGGGCAGCG;SOR=0.522;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=7;WE=142008949;WS=142008922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr7	142008934	.	A	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr7	142008939	.	A	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr7	142008941	.	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.414;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr7	142008959	.	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=0.446;SC=CCTGCACCCAGGGCTCCAGTC;SOR=0.088;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=6;WE=142008967;WS=142008949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr7	142013384	rs361401	G	C	9551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=165;PP=2965;SC=GAAAGTGTGCGAAGTCGCTTC;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=119;TCR=165;TR=284;WE=142013392;WS=142013374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr7	142021521	rs72430962	TCA	T	743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=626;ReadPosRankSum=-3.481;SC=TTTCTGCAACTCAGGGCTGGG;SOR=0.272;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=142021530;WS=142021511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr7	142028108	rs361428	A	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.65;QD=44.20;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	142028118	rs361429	C	A	1704.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=5.553;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.25;MQRankSum=6.856;QD=36.26;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr7	142028472	.	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;ClippingRankSum=0.000;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-15.291;QD=1.29;ReadPosRankSum=-2.361;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,24:0.09:259
chr7	142028474	.	TC	GG	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=2.676;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-15.076;QD=1.63;ReadPosRankSum=-2.406;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,26:0.10:262
chr7	142028485	.	C	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;ClippingRankSum=0.000;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-15.318;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.173;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,37:0.13:289
chr7	142028490	.	A	C	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.626;ClippingRankSum=0.000;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-15.304;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.699;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,39:0.14:286
chr7	142028500	.	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;ClippingRankSum=0.000;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-15.756;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,43:0.14:307
chr7	142028506	.	CA	TG	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=0.000;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=2.039;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-15.995;QD=3.00;ReadPosRankSum=2.029;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,43:0.14:316
chr7	142028533	.	C	A	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.238;ClippingRankSum=0.000;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=2.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-15.421;QD=3.61;ReadPosRankSum=4.194;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,45:0.15:301
chr7	142028538	.	G	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;ClippingRankSum=0.000;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=2.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-15.394;QD=3.53;ReadPosRankSum=3.822;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,45:0.15:300
chr7	142028540	.	G	A	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.246;ClippingRankSum=0.000;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=0.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-15.376;QD=3.55;ReadPosRankSum=4.313;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,43:0.14:302
chr7	142028542	.	G	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-15.323;QD=3.31;ReadPosRankSum=3.976;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,43:0.14:300
chr7	142028546	.	TC	CT	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.621;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-14.960;QD=3.46;ReadPosRankSum=3.156;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,42:0.15:288
chr7	142028551	.	CA	GG	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-14.645;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.926;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,41:0.15:278
chr7	142028555	.	C	T	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-14.450;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,41:0.15:271
chr7	142028578	.	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-12.818;QD=0.97;ReadPosRankSum=-4.271;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,34:0.15:226
chr7	142032115	rs10567930	CTG	C	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=301;ReadPosRankSum=1.255;SC=AAGCAGTCTCCTGTGTGTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=142032124;WS=142032105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr7	142032613	.	TG	CA	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.03;ReadPosRankSum=3.606;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,35:0.21:170
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chr7	142032729	.	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=92;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=1.653;SC=GAGAATACTTAAAATGTACTC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=10;WE=142032737;WS=142032719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr7	142045446	rs56060483	G	C	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.121;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,31:0.27:115
chr7	142045449	rs371824542	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.896;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,31:0.28:112
chr7	142045518	.	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.344;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=663;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CTTTCCCCCCGCAGTCCCCAT;SOR=0.434;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=40;WE=142045526;WS=142045508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,42:0.32:132
chr7	142045613	.	G	T	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1387;ReadPosRankSum=0.016;SC=AACATCTGGGGCATAACGCTA;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=317;TCF=192;TCR=125;TR=100;WE=142045621;WS=142045603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:258,118:0.31:376
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chr7	142045690	rs61750021	A	G	5603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:325,155:0.32:480
chr7	142045692	rs61750022	AC	GT	5612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.183;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:324,155:0.32:479
chr7	142045802	rs2855871	T	C	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.667;NF=26;NR=48;PP=937;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TGTATCTCTGTGCCAGCAGCC;SOR=0.921;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=198;TCF=80;TCR=118;TR=74;WE=142045810;WS=142045792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,79:0.36:218
chr7	142045848	rs17225	T	C	5225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=93;PP=2965;SC=CTTTCCTGTGTAGAAACCTTA;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=61;TCR=93;TR=154;WE=142045856;WS=142045838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr7	142045897	rs361402	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.93;MQRankSum=1.748;NF=33;NR=46;PP=2403;ReadPosRankSum=0.150;SC=CCAAAGCCTTCGATGAACATT;SOR=0.609;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=145;TCF=55;TCR=90;TR=79;WE=142045932;WS=142045887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr7	142045899	rs2974900	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.554;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,41:0.23:175
chr7	142045912	rs374368376	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.639;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,39:0.22:175
chr7	142045924	rs1811089	A	G	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.883;NF=40;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AAGAGCCCCGACAGAAGATTC;SOR=0.567;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=106;WE=142045932;WS=142045887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,127:0.80:158
chr7	142099425	.	A	G	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=15.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-6.777;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.241;SOR=0.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,50:0.34:145
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chr7	142099484	.	G	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=7.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-9.222;QD=2.16;ReadPosRankSum=2.866;SOR=1.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:283,70:0.20:353
chr7	142099512	rs373830246	T	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-13.544;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:364,66:0.15:430
chr7	142099533	.	T	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-16.274;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.342;SOR=1.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:403,68:0.14:471
chr7	142099537	.	G	T	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=6.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-16.673;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.905;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:411,66:0.14:477
chr7	142099541	.	T	C	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.335;ClippingRankSum=0.000;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=5.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-16.991;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.190;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,64:0.13:478
chr7	142099548	.	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=5.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-17.468;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,59:0.12:473
chr7	142119831	rs361390	G	A	4358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=12.450;NF=112;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=0.381;SC=CTAAGCTGCTGGCACAGCGAT;SOR=0.719;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=160;TCF=125;TCR=35;TR=147;WE=142119839;WS=142119821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr7	142119873	.	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.748;ClippingRankSum=0.000;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=6.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-17.350;QD=1.08;ReadPosRankSum=-3.658;SOR=1.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:275,28:0.09:303
chr7	142119876	.	CG	C	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-17.915;QD=2.05;ReadPosRankSum=-3.279;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,30:0.09:323
chr7	142119879	.	C	CCA	862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-18.093;QD=2.60;ReadPosRankSum=-4.581;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,38:0.11:332
chr7	142119881	.	GA	G	831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-18.574;QD=2.39;ReadPosRankSum=-4.400;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,43:0.12:348
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chr7	142119935	.	C	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-20.271;QD=2.04;ReadPosRankSum=4.554;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:366,48:0.12:414
chr7	142119942	.	G	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=2.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-20.321;QD=2.01;ReadPosRankSum=3.383;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:368,48:0.12:416
chr7	142119946	.	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-20.296;QD=2.07;ReadPosRankSum=2.275;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:367,48:0.12:415
chr7	142119959	.	AA	TC	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=5.698;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-19.724;QD=2.21;ReadPosRankSum=-1.567;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:347,45:0.11:392
chr7	142119962	.	T	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=3.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-19.580;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.648;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:345,41:0.11:386
chr7	142120168	.	TCA	T,TCACA	926.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13,13;NR=10,10;PP=1020,522;ReadPosRankSum=1.147;SC=TGTAGTCATCTCACACACACA;SOR=1.670;Source=Platypus;TR=23,23;WE=142120177;WS=142120146;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.43,0.52:40
chr7	142124170	rs361452	C	T	6092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=62;PP=2965;SC=CACAGATGTCCGGGAGGGAGC;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=124;TCR=62;TR=186;WE=142124178;WS=142124160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr7	142124424	rs361449	T	G	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=66;PP=2965;SC=CAGCATTCACTGGACCTGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=161;WE=142124432;WS=142124414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr7	142131779	rs370810757	A	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-11.836;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,66:0.21:310
chr7	142131832	rs371240412	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-9.709;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,37:0.18:205
chr7	142131836	rs375356148	C	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-9.905;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,35:0.17:200
chr7	142131858	rs367836940	C	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-9.903;QD=4.32;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,27:0.17:159
chr7	142131868	rs374575972	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-9.998;QD=4.82;ReadPosRankSum=-2.665;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,24:0.17:142
chr7	142131872	rs368030585	G	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-9.922;QD=4.44;ReadPosRankSum=-3.217;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,24:0.17:140
chr7	142131885	.	A	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-9.998;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.538;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,13:0.12:111
chr7	142131889	.	A	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-9.650;QD=1.38;ReadPosRankSum=-2.497;SOR=1.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,11:0.10:105
chr7	142131894	.	AA	CG	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=9.560;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-9.512;QD=1.38;ReadPosRankSum=-3.480;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,10:0.11:92
chr7	142139259	rs361374	G	A	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=7.334;NF=60;NR=9;PP=2962;ReadPosRankSum=4.257;SC=CAGGAAGGAGGCGACTATGCC;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=80;TCR=12;TR=69;WE=142139280;WS=142139238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,75:0.88:85
chr7	142139271	rs146977487	TG	CA	3968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.758;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=8.185;NF=66;NR=12;PP=2944;ReadPosRankSum=2.251;SC=GACTATGCCATGCTGTGGCTA;SOR=2.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=97;TCR=18;TR=78;WE=142139280;WS=142139238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,95:0.87:109
chr7	142139296	rs374460258	C	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=13.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-10.516;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.946;SOR=0.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,21:0.13:167
chr7	142139315	.	G	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=15.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-12.458;QD=1.25;ReadPosRankSum=3.834;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,23:0.10:231
chr7	142139334	.	CG	C	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=7.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-13.704;QD=0.39;ReadPosRankSum=2.983;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,23:0.08:282
chr7	142139337	.	C	CCA	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=7.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-13.800;QD=0.17;ReadPosRankSum=3.422;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,22:0.08:291
chr7	142139348	rs73742284	C	T	8405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=156;NR=109;PP=2965;SC=AGAGTGGAGACGGATCCCTCA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=176;TCR=125;TR=265;WE=142139356;WS=142139338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr7	142143639	rs377139967	T	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-6.424;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.950;SOR=0.237;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,19:0.21:90
chr7	142143646	rs369634458	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-7.445;QD=4.33;ReadPosRankSum=2.634;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,18:0.16:110
chr7	142143804	rs73742281	A	C	8489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=146;PP=2965;SC=AGTAGTAAATAAGCCTCAGCC;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=104;TCR=146;TR=250;WE=142143812;WS=142143794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr7	142143879	rs376540425	A	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=65.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-13.291;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=4.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,34:0.18:193
chr7	142143906	.	GT	CC	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=35.060;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-13.543;NF=45;NR=12;PP=1899;ReadPosRankSum=0.256;SC=TCTTCAGGACGTGGAATTTTG;SOR=2.373;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=201;TCF=121;TCR=80;TR=57;WE=142143915;WS=142143896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,68:0.31:218
chr7	142143941	rs368607254	T	C	4068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.210;HP=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.499;NF=90;NR=35;ReadPosRankSum=0.008;SC=CCAGCATTCATTGGACCTGCA;SOR=1.517;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=275;TCF=174;TCR=101;TR=125;WS=142143931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,140:0.45:309
chr7	142143953	rs371156869	G	A	4712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.777;HP=2;HapScore=3;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.061;NF=102;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.382;SC=GGACCTGCAGGGAAGGACAAA;SOR=1.348;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=313;TCF=193;TCR=120;TR=146;WE=142143961;WS=142143931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,165:0.47:350
chr7	142143993	rs374220425	C	A	5029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.888;HP=4;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.879;NF=98;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.178;SC=TGGAAAGGGGCTGGGCCTTGA;SOR=0.687;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=359;TCF=181;TCR=178;TR=178;WE=142144012;WS=142143983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,210:0.51:414
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chr7	142148963	rs371195527	C	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=21.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-15.777;QD=3.85;ReadPosRankSum=3.497;SOR=1.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,60:0.15:388
chr7	142148969	.	AA	TC	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=19.503;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-15.685;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.995;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:335,60:0.15:395
chr7	142149001	rs367985593	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=29.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-14.097;QD=0.45;ReadPosRankSum=-6.318;SOR=2.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:350,39:0.10:389
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chr7	142149349	rs140504979	A	C	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=68;PP=2275;SC=CTCACCTGCTACCAGGAGACA;SOR=1.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=101;WE=142149357;WS=142149339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr7	142162001	rs73742263	A	C	7825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=104;PP=2965;SC=AGCGGGAAATACTCTGTGGTT;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=129;TCR=104;TR=233;WE=142162009;WS=142161991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr7	142162148	rs71877	C	T	4998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=83;PP=2965;SC=ATATCCTGGGCACACTGCAGT;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=156;WE=142162156;WS=142162138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr7	142162278	rs361443	C	T	6955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=118;PP=2965;SC=GGGGCTGGGCCTTGAAATCTA;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=101;TCR=118;TR=219;WE=142162286;WS=142162268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr7	142162306	rs361442	A	G	5695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=114;PP=2965;SC=GGCCCTGTCCAGGACCCACCT;SOR=1.120;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=76;TCR=114;TR=190;WE=142162314;WS=142162296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr7	142168348	.	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=24.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-10.792;QD=6.06;ReadPosRankSum=2.630;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,23:0.19:119
chr7	142168351	.	T	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.258;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=27.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-11.102;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.749;SOR=4.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,26:0.21:126
chr7	142168362	.	A	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=34.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-12.354;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.525;SOR=5.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,33:0.21:156
chr7	142168365	.	C	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.752;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=39.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQRankSum=-12.323;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.694;SOR=5.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,34:0.21:161
chr7	142168371	.	C	T	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.214;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=31.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=-12.452;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.566;SOR=3.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,39:0.22:181
chr7	142168414	rs374005717	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=89.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-11.642;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=4.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,67:0.21:315
chr7	142168429	rs55634899	A	G	15295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=155;PP=2965;SC=GCTCCAAGGCATTCACATTCA;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=321;TCF=166;TCR=155;TR=319;WE=142168437;WS=142168419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr7	142168452	rs361355	C	A	14986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=163;PP=2965;SC=TCAGAGCTATCATTAGGGAAC;SOR=1.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=153;TCR=163;TR=316;WE=142168482;WS=142168442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr7	142168662	rs73742240	CG	TC	5063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.027;NF=52;NR=44;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GTGACTCCAGCGTCCACTGAG;SOR=0.469;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=96;WE=142168671;WS=142168652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,119:0.98:122
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chr7	142168819	rs361350	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.328;NF=16;NR=34;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.366;SC=ACAAAGCAGCGCCCAGCAGAG;SOR=0.598;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=50;WE=142168847;WS=142168808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,54:0.87:62
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chr7	142168839	.	G	T	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQRankSum=-0.839;QD=1.78;ReadPosRankSum=2.444;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,7:0.12:56
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chr7	142180618	.	TG	CA	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.967;ClippingRankSum=0.000;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=15.272;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-17.647;QD=4.26;ReadPosRankSum=-4.993;SOR=1.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:500,95:0.16:595
chr7	142180625	.	T	C	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.034;ClippingRankSum=0.000;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=14.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-16.456;QD=5.08;ReadPosRankSum=-5.342;SOR=1.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:495,108:0.18:603
chr7	142180633	.	G	T	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=11.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-16.175;QD=5.43;ReadPosRankSum=-3.454;SOR=1.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:500,115:0.19:615
chr7	142180635	.	T	G	3466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.401;ClippingRankSum=0.000;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=13.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-16.004;QD=5.64;ReadPosRankSum=-3.062;SOR=1.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:498,117:0.19:615
chr7	142180640	.	GA	TG	3481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=15.237;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-15.306;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=1.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:499,118:0.19:617
chr7	142180646	.	AG	CT	3577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=11.363;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-14.790;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.545;SOR=1.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,122:0.20:614
chr7	142180704	rs368420989	G	T	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-5.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.573;NF=58;NR=72;PP=2165;ReadPosRankSum=2.811;SC=TCGATACCAGGACATGTATTC;SOR=0.362;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=390;TCF=155;TCR=235;TR=130;WE=142180712;WS=142180694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:298,165:0.36:463
chr7	142180737	rs372013265	T	A	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.321;NF=26;NR=81;PP=2056;ReadPosRankSum=1.903;SC=CTGGGCACACTGCAGTGTCAT;SOR=0.893;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=318;TCF=112;TCR=206;TR=107;WE=142180745;WS=142180727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,106:0.32:334
chr7	142180770	rs375278683	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=6.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-5.842;QD=2.64;ReadPosRankSum=-2.021;SOR=1.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,58:0.21:277
chr7	142197606	rs373222208	T	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-2.047;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr7	142197613	rs376535639	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-2.350;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr7	142197835	rs17280	C	T	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=67;PP=2657;SC=ATCTTATATCCGGGAGACTGG;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=132;WE=142197843;WS=142197825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr7	142197897	rs17279	C	T	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.295;SC=AATTTGAAAACAGAAGGAAAT;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=66;WE=142197905;WS=142197887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr7	142197986	rs148941368	T	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=44;PP=1518;SC=GAGGGCCGCCTAGCAGAGGAG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=142197994;WS=142197976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	142206473	rs11764626	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.384;NF=25;NR=7;PP=321;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TCTAACTGCCGTTTCCGTGCA;SOR=1.234;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=32;WE=142206485;WS=142206438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr7	142211193	rs6977669	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CTGGGTCACCCTCCCACCGCT;SOR=0.795;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=19;WE=142211201;WS=142211183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr7	142223942	rs368751965	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=2.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-9.399;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.496;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,26:0.14:192
chr7	142223948	.	TAC	T	548.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=2.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-9.890;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.665;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,27:0.13:204
chr7	142223951	.	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=2.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-9.864;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.721;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,27:0.13:203
chr7	142223953	.	T	TTC	545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-9.995;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.906;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,27:0.13:208
chr7	142223959	.	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-10.202;QD=2.44;ReadPosRankSum=2.345;SOR=1.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,27:0.12:216
chr7	142223962	.	G	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=2.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-10.120;QD=2.13;ReadPosRankSum=2.795;SOR=1.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,26:0.12:220
chr7	142223964	.	A	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=2.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-10.170;QD=2.09;ReadPosRankSum=2.732;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,26:0.12:222
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chr7	142223971	.	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-10.562;QD=2.14;ReadPosRankSum=2.807;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,24:0.11:219
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chr7	142231780	.	C	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=16.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-4.072;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=2.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,27:0.20:137
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chr7	142231788	.	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-3.121;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.116;SOR=2.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,10:0.08:127
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chr7	142231805	.	C	CTG	312.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.944;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=13.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-4.220;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=2.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,15:0.15:103
chr7	142231806	.	C	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=15.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-3.592;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.906;SOR=3.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,13:0.13:97
chr7	142231808	.	GCC	G	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=15.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-3.592;QD=2.57;ReadPosRankSum=-1.119;SOR=3.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,13:0.13:97
chr7	142231826	.	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=8.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-3.837;QD=1.95;ReadPosRankSum=-2.428;SOR=2.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,8:0.12:67
chr7	142232163	rs144354683	T	C	109.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	142239679	rs17208	C	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=577;ReadPosRankSum=-0.893;SC=CATTATAATACTGAATGAGGA;SOR=0.897;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=41;WE=142239687;WS=142239669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr7	142239946	rs17209	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=340;ReadPosRankSum=0.590;SC=GACTTTCAAGTTGTGCCCAGG;SOR=0.477;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=24;WE=142239954;WS=142239936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr7	142242352	rs2734112	C	T	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1610;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CTCAGAGCAACAGTCATGGAA;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=106;WE=142242360;WS=142242342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,131:0.52:252
chr7	142242670	rs17219	T	G	6435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=100;PP=2965;SC=ATCTGAGAATTGGGCTGCTGT;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=84;TCR=100;TR=184;WE=142242678;WS=142242660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr7	142247125	rs361365	A	G	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr7	142247133	rs361364	A	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.592;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr7	142247134	rs361363	T	C	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.00;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	142247148	rs361361	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.843;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr7	142247213	rs361360	G	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AGAACCGATCGTTGGGCAGCC;SOR=0.711;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=91;WE=142247221;WS=142247203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,110:0.54:204
chr7	142247263	.	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-7.843;QD=0.82;ReadPosRankSum=-4.427;SOR=1.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,21:0.09:232
chr7	142247270	rs375846702	TG	CA	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=7.505;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-7.769;QD=0.81;ReadPosRankSum=-2.660;SOR=1.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,21:0.09:228
chr7	142247288	.	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=9.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.947;QD=0.34;ReadPosRankSum=-8.293;SOR=1.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,31:0.13:245
chr7	142247347	rs361359	A	C	4777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-3.055;QD=20.51;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,154:0.66:233
chr7	142247347	.	AT	CC,CT	1444	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=64;MMLQ=27;MQ=59.09;NF=30,68;NR=40,88;PP=1444,1249;QD=21.3923982123;SC=AGCTCTACATATTTTCCCTTC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=226;TCF=99;TCR=127;TR=70,156;WE=142247356;WS=142247337;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:226
chr7	142247348	rs371674308	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=6.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-6.660;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,65:0.28:234
chr7	142247380	.	T	A	1131	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=66;MMLQ=27;MQ=59.54;NF=19;NR=42;PP=1131;QD=19.1110034844;SC=TTACTGGGGGTCTGGGAGACT;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=180;TCF=68;TCR=112;TR=61;WE=142247388;WS=142247370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:119,61:0.34:180
chr7	142247396	.	A	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=43;MMLQ=28;MQ=59.29;NF=10;NR=36;PP=2962;QD=20;SC=AGACTCCAGCACCTGTGTGAT;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=157;TCF=52;TCR=105;TR=46;WE=142247440;WS=142247386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:111,46:0.29:157
chr7	142247417	.	AC	A	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MMLQ=28;MQ=58.94;NF=5;NR=37;PP=2964;QD=20;SC=CTGCGGAGACACAAGTTGAGA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=101;TCF=16;TCR=85;TR=42;WE=142247440;WS=142247386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr7	142247455	rs57923366	T	TCACACA	1297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.924;NF=4;NR=20;PP=1251;ReadPosRankSum=0.795;SC=GTTGTACTCATCACACACACA;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=24;WE=142247463;WS=142247445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr7	142247529	.	GGC	G	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-7.050;QD=5.19;ReadPosRankSum=-2.937;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr7	142247535	.	G	GAA	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-7.365;QD=6.01;ReadPosRankSum=-2.292;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,14:0.20:70
chr7	142247539	.	TG	CA	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=10.210;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-7.424;QD=8.58;ReadPosRankSum=-2.460;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,17:0.24:70
chr7	142247546	.	C	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQRankSum=-7.978;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.868;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr7	142247567	rs372792593	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=6.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQRankSum=-8.220;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr7	142247571	rs376050671	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=6.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-8.101;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr7	142247605	rs370122363	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.154;NF=20;NR=17;PP=544;ReadPosRankSum=0.447;SC=CCAGATCAGGGTCACTGTGAG;SOR=0.460;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=37;WE=142247613;WS=142247595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr7	142250938	rs361439	T	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=697;ReadPosRankSum=-0.184;SC=AGTGTCATGCTCCGTCCTGCT;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=50;WE=142250946;WS=142250928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr7	142250988	rs361437	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=579;ReadPosRankSum=1.718;SC=GATCCCAGCAGTCACTGGACC;SOR=0.617;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=43;WE=142250996;WS=142250978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr7	142251132	rs361436	G	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=402;ReadPosRankSum=0.998;SC=GGAGCCTGATGCTCATGGCAG;SOR=1.040;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=26;WE=142251140;WS=142251122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr7	142326607	rs17260	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=524;ReadPosRankSum=0.714;SC=GGTCCTTTGTCTCCTGGGAGC;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=33;WE=142326615;WS=142326597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr7	142326783	rs17262	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=785;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CTCAGTCCCCAAAGTACCTGT;SOR=0.794;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=76;TCR=69;TR=57;WE=142326791;WS=142326773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,74:0.44:169
chr7	142326909	rs76454382	C	G	4829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=80;PP=2965;SC=ACTACTCACACATAGTAAATG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=142;WE=142326917;WS=142326899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	142334648	rs17210	A	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-1.526;SC=ACATCCGAGCAGGGTTATCTG;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=16;WE=142334656;WS=142334638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr7	142334744	rs17211	C	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1142;ReadPosRankSum=1.268;SC=GTTCCCGAAACAGAGTCTCAT;SOR=0.550;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=77;WE=142334752;WS=142334734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr7	142353577	.	C	CTTTGTTTTGT	2184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=6.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.043;QD=26.01;ReadPosRankSum=0.416;SOR=1.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr7	142378633	rs17243	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=521;ReadPosRankSum=0.344;SC=CCTCTGCTACGTGGGCTTTTA;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=34;WE=142378641;WS=142378623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr7	142378708	rs361418	T	G	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.354;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1992;ReadPosRankSum=-0.807;SC=TAATTCCTCTTTGTTGGGTTT;SOR=0.502;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=192;TCF=102;TCR=90;TR=115;WE=142378716;WS=142378698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,137:0.59:233
chr7	142378831	rs76429157	C	G	6901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=104;PP=2965;SC=TTGTTATAGGCACAGGAAAGA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=100;TCR=104;TR=204;WE=142378839;WS=142378821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr7	142423161	rs112325538	A	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=259;SC=AGGTGGAGACATTACAGAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=142423169;WS=142423151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	142423562	rs62001054	C	T	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=31;PP=1483;SC=AATGTTGAGGCGACTGATAAG;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=142423577;WS=142423552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	142428611	rs361326	C	T	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=43;PP=2610;SC=CCTACTATTTCGAGGTCTTTT;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=107;WE=142428619;WS=142428601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	142428626	rs361327	A	C	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=48;PP=2965;SC=TCTTTTATACAAAGCTCTTTT;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=124;WE=142428634;WS=142428616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	142429001	rs17213	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=0.255;SC=GCAGCACAGCCGCATCCTCTC;SOR=0.631;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=6;WE=142429009;WS=142428991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr7	142458661	.	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=16.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-4.438;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.943;SOR=3.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,4:0.12:33
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chr7	142458737	rs370066365	C	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQRankSum=-4.630;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=1.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
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chr7	142458841	rs375181092	AT	A	2235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.221;NF=6;NR=25;PP=2954;ReadPosRankSum=0.863;SC=GCAGGCAAGTATCTTTTGCTG;SOR=0.558;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=31;WE=142458849;WS=142458819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,61:0.37:163
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chr7	142458884	rs370405149	C	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=16.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-9.926;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=1.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,39:0.26:148
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chr7	142458987	rs375094420	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-3.873;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.656;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
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chr7	142460671	rs377695327	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-4.658;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.284;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
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chr7	142460752	rs140793689	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=9.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-8.176;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,12:0.11:106
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chr7	142468213	.	A	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=-9.700;QD=13.16;ReadPosRankSum=3.045;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
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chr7	142468228	.	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-10.223;QD=9.93;ReadPosRankSum=2.318;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,38:0.30:127
chr7	142468232	.	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=15.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-8.069;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.182;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,21:0.17:120
chr7	142468241	.	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=16.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-8.575;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.427;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,19:0.14:135
chr7	142468244	.	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=16.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-8.766;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=1.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,19:0.13:141
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chr7	142478771	rs201689354	A	AC	2824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=29;PP=2253;SC=CCTCACAGACACTCCTCTCTG;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=48;WE=142478779;WS=142478761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
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chr7	142478897	rs73742442	T	C	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=47;PP=1944;SC=TCATGCCCTGTCTCAGGCCCC;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=142478905;WS=142478887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	142478905	.	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-9.297;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,15:0.13:113
chr7	142478913	.	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-9.260;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,14:0.12:114
chr7	142478914	.	C	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-9.303;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,14:0.12:115
chr7	142479915	rs377017470	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=33.060;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.262;NF=17;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CCAGTTGCTGTCCCCTTTGAT;SOR=5.337;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=17;WE=142479923;WS=142479905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr7	142479940	rs58649169	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.287;HP=1;HapScore=3;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.060;NF=18;NR=21;PP=1447;ReadPosRankSum=2.036;SC=ATGACAAGATCGTTGGGGGCT;SOR=0.222;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=39;WE=142479962;WS=142479930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr7	142479954	rs201779716	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.015;HP=1;HapScore=3;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.020;NF=37;NR=17;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGGGGCTACACCTGTGAGGAG;SOR=1.346;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=54;WE=142479962;WS=142479930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,67:0.56:119
chr7	142480002	rs199512312	C	A	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.917;NF=35;NR=33;PP=2305;ReadPosRankSum=2.576;SC=AATTCTGGCTCCCACTTCTGC;SOR=0.547;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=68;WE=142480020;WS=142479992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,92:0.60:153
chr7	142480012	rs56146961	C	T	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.874;HP=3;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.199;NF=26;NR=22;PP=1889;ReadPosRankSum=-2.236;SC=CCCACTTCTGCGGTGGCTCCC;SOR=0.777;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=48;WE=142480020;WS=142479992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr7	142480034	rs10808019	C	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.877;NF=24;NR=19;PP=721;ReadPosRankSum=0.640;SC=CATCAGCGAACAGTGGGTGGT;SOR=0.728;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=43;WE=142480042;WS=142480024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,58:0.38:151
chr7	142480067	rs201659809	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=4.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQRankSum=-5.740;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=1.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr7	142480079	rs371397657	T	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=10.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQRankSum=-6.463;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=1.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr7	142480083	.	A	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=10.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-6.848;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.493;SOR=1.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr7	142480095	rs374574556	G	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=26.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQRankSum=-7.128;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.084;SOR=5.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr7	142480126	rs374398930	C	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.374;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.312;NF=0;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-2.675;SC=GAGAGCTTGGCTTCAGCCCAG;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=10;WE=142480156;WS=142480116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr7	142480137	rs57353422	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.80;QD=43.82;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	142480137	.	AGAACTACTGAG	GGAAGTACTGAC,GGAAGTACTGAG	703	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=52.31;NF=2,3;NR=15,20;PP=703,102;QD=45.0863455801;SC=TTCAGCCCAGAGAACTACTGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=17,23;WE=142480156;WS=142480116;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.74:23
chr7	142480141	rs55775033	C	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.80;QD=43.82;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	142480148	rs10808021	G	C	789.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.06;MQRankSum=4.588;QD=39.49;ReadPosRankSum=2.481;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr7	142481234	rs57725689	T	C	7948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=102;PP=2965;SC=AACAGGATTATTCTGAACAAT;SOR=0.831;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=238;TCF=132;TCR=106;TR=234;WE=142481242;WS=142481224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr7	142481376	rs73740310	T	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=51;PP=1531;SC=CCCTGAGCTCTGGGGGTGAGT;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=142481384;WS=142481366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	142481789	rs374686280	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=8.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-8.756;QD=0.61;ReadPosRankSum=-4.311;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,13:0.15:86
chr7	142481807	rs4726591	C	T	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=33;PP=1847;SC=AGTGCCTGGACGCTCCTGTGC;SOR=1.080;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=79;WE=142481815;WS=142481797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	142481867	rs59320698	C	G	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=47;PP=2670;SC=TTACCAGCAACATGTTCTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=116;WE=142481875;WS=142481857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	142482184	rs73740312	A	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=479;SC=TCCATCTCTCAATAAAACTTG;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=142482192;WS=142482174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	142498673	.	G	A	1573	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=58.99;NF=27;NR=2;PP=1573;QD=55.4403866396;SC=CCCCTACCAGGACCAGACAGC;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=29;WE=142498725;WS=142498663;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:60,29:0.33:89
chr7	142498687	rs1799887	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=2257;ReadPosRankSum=-3.869;SC=AGACAGCTCTTAGAGCAACCC;SOR=1.329;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=106;TCF=83;TCR=23;TR=36;WE=142498725;WS=142498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,17:0.18:93
chr7	142498699	.	A	G	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.854;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr7	142498702	.	C	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,45:0.32:140
chr7	142498705	.	ATT	A	1661.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,47:0.31:150
chr7	142498708	.	A	ACC	1664.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,47:0.32:147
chr7	142498735	rs377360215	A	C	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.496;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,93:0.40:231
chr7	142498738	rs370415932	C	G	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=2.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,96:0.40:243
chr7	142498833	.	A	T	4571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,123:0.41:302
chr7	142498837	rs1042957	C	T	4501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.16;ReadPosRankSum=-2.080;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,124:0.42:297
chr7	142498897	rs1042959	A	G	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1730;ReadPosRankSum=0.664;SC=GGGTCAGCACAGACCCGCAGC;SOR=0.717;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=107;WE=142498905;WS=142498887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,124:0.42:298
chr7	142499071	rs1042960	T	C	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.866;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=911;ReadPosRankSum=-0.756;SC=GGGCCAAACCTGTCACCCAGA;SOR=0.347;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=160;TCF=49;TCR=111;TR=72;WE=142499079;WS=142499061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,86:0.48:181
chr7	142499729	rs3114480	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=540;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GACACAGGGGTGTGAGGGAGG;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=33;WE=142499737;WS=142499719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr7	142499762	rs706	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=540;ReadPosRankSum=0.604;SC=GTGCACAGGTACCTACATGCT;SOR=0.253;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=28;WE=142499770;WS=142499752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr7	142500409	rs11327	T	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=0.389;SC=AATAAAAAATTGTGTGTTGGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=142500417;WS=142500399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	142510174	rs17270	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=0.586;SC=AAATATCCTCCACCCAGTCCC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=142510182;WS=142510164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	142510309	rs17269	A	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1134;ReadPosRankSum=0.493;SC=AGTCACTGAGAAGGAGCTTCT;SOR=0.703;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=64;WE=142510317;WS=142510299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr7	142510350	rs17268	G	A	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1187;ReadPosRankSum=0.018;SC=CGGTCCTGGGGTCTGGAGGCT;SOR=0.500;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=83;WE=142510358;WS=142510340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,92:0.53:172
chr7	142510446	rs17267	G	A	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GCAGCCTGTCGGTACCAGTAT;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=68;WE=142510454;WS=142510436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,84:0.51:165
chr7	142511035	rs12540839	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-1.589;SC=CTGGGCCAGTGATGTGGTCAG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=15;WE=142511043;WS=142511025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
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chr7	142583330	rs17881456	A	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=39;PP=1214;SC=AGCCTTGGGGACACATCAGCC;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=142583338;WS=142583320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	142610003	rs199884521	GATCT	G	233.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=268;SC=TTCTATCTCTGATCTATCTAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=142610014;WS=142609993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	142625417	rs4252416	A	C	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=790;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CAGTTGCCCAACCCTTGAGAC;SOR=0.583;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=41;WE=142625425;WS=142625407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr7	142626549	rs4236480	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=765;ReadPosRankSum=0.440;SC=GCGGGGACTACGGCGGAAGGC;SOR=0.755;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=80;TCR=14;TR=43;WE=142626557;WS=142626539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr7	142626773	rs4236481	A	C	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=669;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TGCTAGACTTATGCCCTGGGC;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=21;TCR=79;TR=37;WE=142626781;WS=142626763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr7	142627138	rs4252402	G	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.680;SC=TTGAATTACCGTGTAGGCTCC;SOR=0.603;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=71;WE=142627146;WS=142627128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr7	142627580	rs4252400	G	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=661;ReadPosRankSum=0.305;SC=GAGACAGTCAGAGCAGAATGA;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=44;WE=142627588;WS=142627570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,54:0.62:87
chr7	142639321	.	T	C	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=21;QD=18.5904041824;SC=GGGTGCTGAATTAGGTAGAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=3;WE=142639329;WS=142639319;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,3:0.18:17
chr7	142961279	rs201569197	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=0.785;SC=GGAGGGTCGGGGCAGGGGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=26;WE=142961287;WS=142961269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr7	142983699	rs61737885	G	A	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=54;PP=1482;ReadPosRankSum=0.401;SC=GAACAGAGGCGAATGGCCTCA;SOR=0.472;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=173;TCF=61;TCR=112;TR=87;WE=142983707;WS=142983689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,95:0.51:186
chr7	143013285	rs34904831	C	T	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=17;PP=1001;ReadPosRankSum=-1.113;SC=AAGGCCTGGCCGGGGCTCGGG;SOR=0.775;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=81;TCR=35;TR=61;WE=143013293;WS=143013275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr7	143017807	rs10282312	G	T	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=27;PP=1191;SC=AGGGGAAGACGGGATCTTTCT;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=143017815;WS=143017797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	143028536	rs2242493	G	A	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=1073;SC=GGGGATGTGGGCAGATAGGAA;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=143028544;WS=143028526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	143029371	rs2367941	G	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=571;SC=TCAAATATTGGTTTTTTGTGT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=143029379;WS=143029361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	143036318	rs2272253	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=709;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GAGTTGAAAGGGTATTCCAAC;SOR=0.850;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=41;WE=143036326;WS=143036308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr7	143036337	rs2272252	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=784;ReadPosRankSum=-0.776;SC=ACGCTTCTTTCTACTCCAGTT;SOR=1.059;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=50;WE=143036345;WS=143036327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr7	143036548	rs6464542	T	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=1134;ReadPosRankSum=-1.668;SC=TTCTGAAAACTGAGAGCAAGG;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=61;WE=143036556;WS=143036538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr7	143039311	rs940864	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=633;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CTGAGCTTAGAGTTAAAGTTT;SOR=1.015;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=33;WE=143039319;WS=143039301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr7	143042552	rs10952548	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=202;ReadPosRankSum=1.662;SC=TCAGGAGTGCGGAGCGCGGTG;SOR=0.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=11;WE=143042560;WS=143042542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr7	143042837	rs2272251	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=768;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AGGACGAAGACCTCTCTGGCA;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=52;WE=143042845;WS=143042827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr7	143043240	rs13438232	C	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=624;ReadPosRankSum=1.123;SC=CAGCTTCCTCCTTCCCTTGCT;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=46;WE=143043248;WS=143043230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,57:0.39:146
chr7	143043377	rs56680997	C	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=-0.094;SC=CCCAACTCACCCCTTGTGGGT;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=13;WE=143043385;WS=143043367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	143043607	rs2242492	G	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=398;ReadPosRankSum=2.445;SC=TTAGGCACTGGGTGGGGCCCC;SOR=0.432;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=23;WE=143043615;WS=143043597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr7	143053723	rs17854363	C	T	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.784;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CGGCTGAGAGCGGTAGACATC;SOR=0.850;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=225;TCF=116;TCR=109;TR=100;WE=143053731;WS=143053713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,118:0.45:260
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chr7	143088823	rs1804527	T	C	6640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=98;NR=110;PP=2965;SC=CGGTTCGATATGGGATCCCAT;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=98;TCR=110;TR=208;WE=143088831;WS=143088813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr7	143088867	rs6967117	T	C	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=93;PP=2965;SC=CGAAGAGTCATCCTGTGGGAC;SOR=1.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=159;WE=143088875;WS=143088857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	143088897	rs62472724	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=852;ReadPosRankSum=0.358;SC=TCAGTCACAGCGGGTACATGG;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=38;TCR=74;TR=54;WE=143088905;WS=143088887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr7	143093538	rs10952549	G	A	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=30;PP=1456;SC=GTAAAGTCCAGGGCTCCCTGT;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=143093546;WS=143093528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	143094635	rs45497499	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=476;ReadPosRankSum=1.842;SC=GTGGTTGGGGAGGGGGCAGGA;SOR=0.455;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=26;WE=143094643;WS=143094620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr7	143095256	rs35251323	A	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=0.350;SC=GGGGCTGGAGAGCAGAATGGT;SOR=0.364;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=12;WE=143095264;WS=143095246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr7	143097100	rs4725617	A	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=50;PP=1886;SC=GGAGCCAGACACAAGGTCTCG;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=95;WE=143097108;WS=143097090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	143105830	rs12703524	C	A	136.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.81;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	143141475	rs4595035	T	C	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=28;PP=831;SC=TGAAGAGTCGTCGTTCCTCAA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=143141483;WS=143141465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	143175154	rs1404635	G	A	6236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.156;SC=TGGTTGGGACGGTGCACAACT;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=116;TCR=91;TR=205;WE=143175162;WS=143175144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr7	143175345	rs10278721	C	T	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=66;PP=2270;SC=TGGAGGTTCCCAGGGTGGGTG;SOR=1.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=93;WE=143175353;WS=143175335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	143400301	rs80035595	A	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.12;QD=26.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	143747481	rs79781351	AC	A	1478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.933;SC=CAACGCAGGTACTGTCACAAG;SOR=0.881;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=27;WE=143747489;WS=143747471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr7	143748364	rs4407791	T	C	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=997;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CCTTGATCTATAGCCTGAGGA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=63;WE=143748372;WS=143748354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr7	143771408	rs59319753	G	C	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=51;PP=1301;ReadPosRankSum=0.886;SC=TCTTCTCCCTGTTCTACATCT;SOR=0.489;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=155;TCF=47;TCR=108;TR=77;WE=143771416;WS=143771398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,82:0.49:168
chr7	143771536	rs6951485	G	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=851;ReadPosRankSum=1.318;SC=TGTGCTTGCAGCACGGTGCCC;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=103;TCF=81;TCR=22;TR=47;WE=143771544;WS=143771526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr7	143771937	rs2961135	G	C	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1165;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GCTGGTGGGAGCCTTCTTTTC;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=72;WE=143771945;WS=143771927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,85:0.61:140
chr7	143807515	rs2961149	T	G	4656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-6.709;QD=21.86;ReadPosRankSum=-1.322;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,118:0.55:213
chr7	143807518	rs2951315	T	C	4633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-6.526;QD=21.55;ReadPosRankSum=-1.283;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,119:0.55:215
chr7	143807569	rs117883393	C	T	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.636;NF=46;NR=56;PP=1378;ReadPosRankSum=-0.188;SC=AGTTGAAGGGCGCCCTCCACA;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=98;TCR=118;TR=102;WE=143807577;WS=143807559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,120:0.47:254
chr7	143807674	rs2961150	T	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=909;ReadPosRankSum=0.015;SC=ATATATTTTGTAGAAGAAGTT;SOR=0.375;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=51;WE=143807682;WS=143807664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
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chr7	143827198	rs34308692	CT	C	274.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=170;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TAGAAGTTGGCTTTTTTTTTT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=14;WE=143827206;WS=143827188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr7	143839408	rs1919954	C	T	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=75;PP=2043;ReadPosRankSum=2.578;SC=GACCTATTTGCATTTCTCTTT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=285;TCF=129;TCR=156;TR=136;WE=143839416;WS=143839398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,165:0.49:337
chr7	143839605	rs1919953	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.440;NF=29;NR=10;PP=690;ReadPosRankSum=-1.138;SC=TGCCGTTCTGTGGGCCCCGGG;SOR=0.783;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=39;WE=143839613;WS=143839595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr7	144015434	rs141871720	A	G	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.56;QD=47.87;SOR=2.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	144015437	rs150229766	C	T	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.48;QD=43.00;SOR=2.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	144068163	rs146660641	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.28;MQRankSum=-0.568;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	144075749	rs1635079	A	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=13;PP=1772;SC=AACAGCCCAAATCTGTCTCTA;SOR=2.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=72;WE=144075757;WS=144075739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	144095600	rs2699503	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=39;PP=1208;SC=GAGAACTGGAAGGGTCCTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=144095608;WS=144095590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	144095730	rs11979528	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=7;PP=158;SC=GGGAGCTCCCCGTTCCTACCA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=144095738;WS=144095720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	144096456	rs11769787	C	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=29;PP=1056;SC=TCTTTAGTTGCCATTTTCCCC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=144096464;WS=144096446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	144096598	rs11769847	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=683;SC=AGAATGAAGACTGTAGCTTTG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=144096606;WS=144096588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	144096839	rs757388	A	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=23;PP=1404;SC=AGAAAGAGGAAGAATTCTGAC;SOR=1.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=144096847;WS=144096829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	144098896	rs727712	T	C	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=22;PP=1835;SC=TTGAAAAATGTAGACAAATTT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=78;WE=144098904;WS=144098886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	144098992	rs727714	G	A	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=70;PP=2668;SC=CCAGACACCAGGGGTATGAGT;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=126;WE=144099000;WS=144098973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	144100874	rs375024030	ACGGGC	A	1245.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=1255;SC=TGCAGCCCGCACGGGCCGGGC;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=24;WE=144100886;WS=144100864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	144245543	rs111498606	GA	G	2360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=26.53;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	144462951	rs3779087	C	T	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=18;PP=913;SC=AGCAAAGAAACAGAAATGCTA;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=144462959;WS=144462941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	144532829	rs111798915	A	AG	780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=640;SC=TCCGGGACCCAGGAGCCAGCT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=144532837;WS=144532819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	144703301	rs7778697	G	A	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=526;SC=CAGGGAAGGCGGAACCCACTC;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=144703309;WS=144703291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	146805228	rs35167289	T	TG	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.950;NF=8;NR=1;PP=288;ReadPosRankSum=0.770;SC=TTATTTTTTTTTTTGTTTTAG;SOR=0.610;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=9;WE=146805236;WS=146805218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr7	146997203	rs2692185	T	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=25;PP=2013;SC=AATTTTAAGATAAAAATGACT;SOR=1.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=96;WE=146997211;WS=146997193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	147074998	rs6945709	G	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=549;ReadPosRankSum=-1.526;SC=TTATAAAAATGTTTAATTGGG;SOR=0.880;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=32;WE=147075006;WS=147074988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr7	147092615	rs700308	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=1.069;SC=GATGTGATGGCTGTGGCCAGG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=147092623;WS=147092605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr7	147092861	rs34592169	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=893;ReadPosRankSum=-0.457;SC=ACATGTGTGCGATCATAGACA;SOR=0.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=62;WE=147092869;WS=147092851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,76:0.59:129
chr7	147183278	rs4015951	CAAA	C	212.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.59;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	147259374	rs2074715	A	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TTTATGTTTTATGAAGATGCT;SOR=0.902;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=21;WE=147259382;WS=147259364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr7	147335933	.	C	CT	96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=13;HapScore=3;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=58.38;NF=3;NR=6;PP=96;QD=11.2222222222;SC=GATACAAAAGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=9;WE=147335941;WS=147335923;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
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chr7	147600913	rs17170742	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=1.083;SC=TATAATAATACGATAATAGGG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=147600921;WS=147600903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	147926888	rs3779032	A	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=879;ReadPosRankSum=0.598;SC=ATACATGTACATATAAATTAC;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=47;TCR=87;TR=57;WE=147926896;WS=147926878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,65:0.42:153
chr7	147963925	rs3801974	C	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.114;SC=CACTTACCATCCTCAGATTTT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=147963933;WS=147963915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	147963983	rs10248273	G	C	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=17;PP=1399;SC=TTTTCTCGGGGTGGTGTTTTA;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=64;WE=147963991;WS=147963973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	147964016	rs3801975	A	G	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=599;ReadPosRankSum=0.349;SC=ATGAAATAAGATATCAGAAAA;SOR=0.436;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=38;WE=147964024;WS=147964006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr7	147964091	rs3801976	G	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=955;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GTAGAGACGTGCTTCTAAAAG;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=103;TCR=69;TR=70;WE=147964099;WS=147964081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,88:0.40:218
chr7	148080647	rs1637841	T	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=770;SC=GAAACCTAAATGTAAGCTTTG;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=148080655;WS=148080637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	148106465	.	C	CTCTT	2977	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=49;NR=31;PP=2977;QD=20;SC=TGACACTTGACTCTTTCTTTC;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=80;WE=148106498;WS=148106455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,80:0.78:102
chr7	148106475	rs72268642	C	CTT	7297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.19;SOR=1.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	148106477	.	C	G	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=101;NR=50;PP=2965;QD=20;SC=CTTTCTTTCTCTACAGCCAGT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=101;TCR=50;TR=151;WE=148106498;WS=148106455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr7	148106477	.	C	CTG	7705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.27;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	148106490	rs9648691	G	A	8577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=65;PP=2965;SC=CAGCCAGTGCGGATTTTCCAT;SOR=1.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=118;TCR=65;TR=183;WE=148106498;WS=148106455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr7	148106651	rs117098826	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=854;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AGGAAAAAAAGTTTTCTAGGT;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=18;TCR=77;TR=43;WE=148106659;WS=148106641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr7	148131742	rs2108673	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GAAACCAACCGGCTGTCCTCC;SOR=0.898;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=30;WE=148131750;WS=148131732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr7	148143136	rs2530301	A	G	6824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=117;PP=2965;SC=CCTGGGCCTCACGCCAGGGTC;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=94;TCR=117;TR=211;WE=148143144;WS=148143126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr7	148311115	rs11434056	G	GT	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=534;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CAATTTGTTTGTTTGTTTGTT;SOR=0.252;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=15;WE=148311123;WS=148311105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr7	148312382	rs6962115	T	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=986;ReadPosRankSum=0.975;SC=AGGTAAATCATCCTGAGATAA;SOR=0.427;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=145;TCF=88;TCR=57;TR=68;WE=148312390;WS=148312372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,79:0.47:169
chr7	148312520	rs6962292	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=567;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AAGAGTCACATCTCTAAATTT;SOR=0.425;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=38;WE=148312528;WS=148312510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr7	148463860	rs1014095	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=1.011;SC=TAATTATCTGTAGTTTTGATA;SOR=1.127;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=148463868;WS=148463850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr7	148464675	rs6956231	T	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=484;ReadPosRankSum=1.471;SC=TGCAAAATTTTTTTCAGTGCA;SOR=1.063;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=25;WE=148464683;WS=148464665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr7	148480990	rs10271133	C	T	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=856;ReadPosRankSum=-0.407;SC=AAGGTAGGTGCGTGAGGGTTG;SOR=0.803;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=51;WE=148480998;WS=148480980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr7	148483760	rs2072406	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-1.626;SC=AATGTTATTTGTAGATGGCCT;SOR=0.299;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=16;WE=148483768;WS=148483750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr7	148487329	rs933436	G	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=396;ReadPosRankSum=0.078;SC=TGGAACAGTGGGCTTTACTTA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=25;WE=148487337;WS=148487319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr7	148487395	rs2007404	T	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=739;ReadPosRankSum=1.367;SC=GCTGTCCTTTTATCTAGTTGG;SOR=0.279;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=47;WE=148487403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr7	148504716	rs3217095	AG	A	1012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=566;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GTTTCAGAGGAGGGGGGAGGA;SOR=0.562;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=21;WE=148504724;WS=148504706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr7	148504854	rs55877618	A	AGACTT	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.185;NF=1;NR=11;PP=682;ReadPosRankSum=-0.312;SC=ACATGTGCTGAGACTTAACAC;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=12;WE=148504862;WS=148504844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr7	148506064	rs740949	A	G	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=37;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.502;SC=AAAGTGACCCATCAAAAGAAG;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=110;TCR=74;TR=91;WE=148506072;WS=148506054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,98:0.49:200
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chr7	148543753	rs28723387	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-1.411;SC=ATGTATAACACCTGTAAAGCA;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=148543761;WS=148543743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	148638572	rs2035216	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=325;ReadPosRankSum=0.715;SC=AGACTCACAGGATAACACAGT;SOR=1.220;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=23;WE=148638580;WS=148638562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr7	148705221	rs2306172	A	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=17;PP=1199;SC=CGGGGTGTCCAGGGCTGGCAT;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=148705229;WS=148705211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	148778355	rs34939910	C	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=441;SC=TGGTGAAACCCCACCTCTACT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=148778363;WS=148778345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	148801091	rs11525060	G	A	9065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=148;PP=2965;SC=GGCTTTTCAGGTTTCCCTTGA;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=289;TCF=141;TCR=148;TR=289;WE=148801099;WS=148801081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr7	148801658	rs1137432	C	T	6616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=81;PP=2965;SC=TCCCAATGTGCTGCAGCCCGT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=115;TCR=81;TR=196;WE=148801666;WS=148801648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr7	148809451	rs6464938	T	C	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=81;PP=2324;SC=TTTGGCCGGGTGTGGTGGCTC;SOR=1.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=29;TCR=81;TR=110;WE=148809459;WS=148809441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	148823366	rs10251621	A	G	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=64;PP=1863;SC=GCCCCAACCCAACTCCCAGGT;SOR=1.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=88;WE=148823374;WS=148823356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	148848257	rs917122	T	C	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=48;PP=2855;SC=TTAGAAACCATTGGTATGTGG;SOR=1.304;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=136;WE=148848265;WS=148848247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr7	148848358	rs917123	G	A	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=83;PP=2914;SC=ATTCAAGGCCGGAGGTTAGCT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=148848366;WS=148848348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	148851213	rs917124	G	A	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=41;PP=1656;SC=TCCTACACCTGGAAGGTCGGA;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=76;WE=148851221;WS=148851203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	148863414	rs71990250	CAGCTCCA	C	6595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=76;PP=2969;SC=GAAGTGACAGCAGCTCCAAGA;SOR=2.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=4;TCR=79;TR=80;WE=148863428;WS=148863404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	148873497	rs1568944	T	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=16;PP=1689;SC=GCAAACCAACTTGATTATCTT;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=148873505;WS=148873487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	148875632	rs1202461	T	A	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=181;SC=CCTTCTGCTGTATTTCTGATC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=148875640;WS=148875627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	148903984	rs12537763	G	A	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=39;PP=1127;SC=ATTTGTCCACGTTAGCACCGC;SOR=2.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=148903992;WS=148903974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	148904293	rs147860582	C	CAAGGTTCTTCATAAG	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=2957;SC=GACTCGTTTTCAGATTACCCG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=148904301;WS=148904283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	148904343	rs6464946	A	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=16;PP=764;SC=GACACCCAGGAGGAGAGGGGG;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=148904351;WS=148904333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	148904624	rs7784122	C	T	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1054;SC=GCCGGCTTTCCGCACACTGCT;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=148904632;WS=148904614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	148907849	rs10952805	G	A	5004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=93;PP=2807;SC=AGGGGAGAGGGTTAGCATGGT;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=143;WE=148907857;WS=148907839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	148909687	rs1202425	C	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=81;SC=ATTTTTTGTTCTTTGAGACGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=148909695;WS=148909677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	148921732	rs11547158	G	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=591;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CCTCCTGAGCGAGACTAGGGC;SOR=0.435;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=36;WE=148921740;WS=148921722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr7	148936762	rs111428978	A	ACGG,ACGGCGGCGG	1123.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3,3;NR=14,14;PP=485,446;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TGGCATCAACACGGCGGCGGC;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=17,17;WE=148936774;WS=148936758;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.37,0.57:35
chr7	148936878	rs11548535	G	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=379;ReadPosRankSum=2.030;SC=CCATGGCGGAGTCGGCGCCTG;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=28;WE=148936886;WS=148936868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
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chr7	148959496	rs150778176	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=91;ReadPosRankSum=-1.137;SC=AGGCCGCCGCCGCGTGAGCCC;SOR=0.525;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=9;WE=148959504;WS=148959486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	148979323	rs61735518	C	T	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1297;ReadPosRankSum=0.882;SC=ACCACCTGGCCGTGCACATGC;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=61;TCR=110;TR=89;WE=148979331;WS=148979313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,116:0.53:219
chr7	148982455	rs34979431	G	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GTCCGTGCGGGGAAAGCAGGG;SOR=0.148;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=6;WE=148982463;WS=148982445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr7	148985897	rs17630156	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=832;ReadPosRankSum=0.091;SC=TCCTGCCCTTCGCGTGGTGCC;SOR=0.428;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=57;WE=148985916;WS=148985887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,66:0.63:104
chr7	148991712	rs13236978	A	G	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=562;ReadPosRankSum=1.103;SC=AGCTTCGGCCAGAAGGAGCTC;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=42;WE=148991720;WS=148991702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr7	149148319	rs4727071	T	C	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=67;PP=1603;SC=GAGACCACAATGGAAAACCGC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=86;WE=149148327;WS=149148309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	149152770	rs3735319	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=44;NR=47;PP=2051;SC=GAGAAGGGAGACTTCTTGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=91;WE=149152778;WS=149152760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	149152906	rs3735318	G	A	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=66;PP=2556;SC=TGTGGCATCCGGCCAGAAGTC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=128;WE=149152914;WS=149152896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	149174542	rs4727073	G	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=784;SC=TTCTAAAGTTGTCAGGCCGGA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=149174550;WS=149174532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	149190098	rs13311996	T	C	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=56;PP=2324;SC=TTTGCCACGTTCCAGTCAAAG;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=149190106;WS=149190088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	149191460	rs112293204	G	A	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=36;PP=1566;SC=CGAACTCCACGGCTGTCTTCT;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=149191468;WS=149191450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	149426305	rs11424737	G	GC	2614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=21;PP=1828;SC=CTGCGAGTCAGCCGTCTCGGG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=43;WE=149426313;WS=149426295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	149427409	rs709065	T	G	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=55;PP=2965;SC=CAGAGCCTGATCTCTGGAAGC;SOR=1.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=98;TCR=55;TR=152;WE=149427417;WS=149427399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	149461487	rs73168053	T	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=390;ReadPosRankSum=1.104;SC=TTTAAGTACATAAATAACCAC;SOR=0.380;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=23;WE=149461495;WS=149461477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr7	149462642	rs61742446	G	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CTTTGGTGCCGCACCAAGTGC;SOR=0.603;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=65;WE=149462650;WS=149462632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr7	149476666	rs57553723	G	GC	3970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=58;PP=2966;SC=GGCTGTGACAGCCCCTGGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=75;WE=149476674;WS=149476656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	149484798	rs62490656	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=420;ReadPosRankSum=1.216;SC=CGCTGTGGGGCGCTGCTGCAG;SOR=0.887;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=31;WE=149484806;WS=149484788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
chr7	149486574	rs855694	G	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=549;SC=TCACCTCCCCGCTCCTTTGCC;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=149486582;WS=149486564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	149498990	rs189214453	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1015;ReadPosRankSum=0.534;SC=TCTGCTGAGCGGCGCTGTGAC;SOR=0.944;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=64;WE=149498998;WS=149498980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,72:0.45:159
chr7	149499284	.	C	T	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=22;QD=28.3856062736;SC=TTTGTGCAGGCCTGCCCAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=149499292;WS=149499274;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	149500013	rs2074693	C	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=381;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CTGGTGGACCCACATGCTACC;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=28;WE=149500021;WS=149500003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr7	149500472	rs10952229	A	G	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=61;PP=2375;SC=GGACTGTGGGATGCCCACACA;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=106;WE=149500480;WS=149500462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	149500992	rs4725830	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=14;PP=601;SC=GCGATAGTGGAAAGATGGTGG;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=149501000;WS=149500982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	149502827	rs12668484	G	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=735;SC=CCCAGCCATCGCGCAGGAAGC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=149502835;WS=149502819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	149503843	rs10260959	T	G	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=83;PP=2965;SC=AGAGAACATGTTGTTCCGCTC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=76;TCR=83;TR=159;WE=149503851;WS=149503833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	149503916	rs72359812	GGATA	G	5363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=67;PP=2973;SC=CAGGGCCCCGGGATAGATAGA;SOR=1.010;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=21;TCR=72;TR=83;WE=149503927;WS=149503906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr7	149506071	.	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=245;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GGTGGGAGGAGGAGAAGGTGG;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=14;WE=149506079;WS=149506061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr7	149506211	rs71194663	G	GC	4573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=50;PP=2974;SC=CGAGGCAGCAGCTGCGCAGCC;SOR=0.810;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=77;WE=149506219;WS=149506201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	149506471	rs6953743	C	T	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=17;PP=746;SC=ATTTCTATGTCCCCAGGGCCA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=149506479;WS=149506461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	149507861	rs55866915	A	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=1100;SC=AGGAGGGCAGAGGGGAGAGCT;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=149507869;WS=149507851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	149507964	rs55776327	C	T	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=68;PP=2905;SC=AGGCCCAGCCCATCTGGAGCC;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=149507972;WS=149507954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr7	149509807	rs740110	C	T	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.06;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	149509817	rs740111	G	T	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=3.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	149511509	rs79503371	G	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=49;PP=1828;SC=GGGGGGCCTGGGACCGGGCAA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=149511517;WS=149511499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	149511985	rs10952230	A	G	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=72;PP=2689;SC=TGCCCTGGGAACCACACGCAG;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=120;WE=149511993;WS=149511975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	149512177	rs11979187	C	T	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=18;PP=1123;SC=GTGGCGGGTCCGAATGGGCGC;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=149512185;WS=149512167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	149512911	rs2074695	A	G	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=55;PP=2600;SC=GGCGCATAGAACCCAGGAGGG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=127;WE=149512919;WS=149512901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	149513152	rs7791767	C	T	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.817;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=1991;ReadPosRankSum=1.153;SC=GCCAGAGCCGCACATGCAGCA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=101;WE=149513160;WS=149513142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr7	149513288	rs7778489	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=497;SC=CCACCTGTCCTCCAGTGCCCT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=149513296;WS=149513278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	149513395	rs7795784	G	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=271;SC=CAGGTGAAAGGCACTCCCTGA;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=149513403;WS=149513385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	149513560	rs12674102	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=25;PP=916;SC=GCTGCTTCTCTGAGGGCTGCG;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=149513568;WS=149513550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	149513780	rs2074688	A	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=189;SC=TGACAGCGTCAGGGGCAGGCA;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=149513788;WS=149513770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	149514651	rs77636271	C	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=366;SC=CGCACAGCCCCGGGTGGGTGG;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=149514659;WS=149514641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	149515103	rs10250401	C	T	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=54;PP=1492;SC=GAGGGCTGGGCACCCGTACCC;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=76;WE=149515111;WS=149515093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	149515188	rs60594151	TA	T	786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=539;SC=GGACCTCGAGTAACTGCCCCA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=149515196;WS=149515178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	149515754	rs740113	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=9;PP=405;SC=GCTGGGGCCCATGGTCCTCCT;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=149515762;WS=149515744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	149515775	rs1557955	C	G	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=615;SC=GGTCCCCCTGCTCCAGAAGCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=149515783;WS=149515765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	149515796	rs1557956	C	T	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=823;SC=GCACGGACCCCGCTCGCCCTG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=149515804;WS=149515786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	149516486	rs6464034	A	G	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=73;PP=2845;SC=GCAGCTGCGGAGTGGGCCAGC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=151;WE=149516494;WS=149516476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr7	149516881	rs1005603	G	T	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=13;PP=960;SC=TCCCTGAGAAGCCGCAGCTGC;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=149516889;WS=149516871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	149517885	rs76151600	A	G	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GTGCTGCCCTATCCTTCAGGA;SOR=0.661;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=65;WE=149517893;WS=149517875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr7	149518148	rs10233245	A	G	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=50;PP=1590;SC=GCCTGGAGCCACTGGTCGGCC;SOR=1.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=149518156;WS=149518138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	149518532	rs11353848	TC	T	1426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=18;PP=1099;SC=GGAGGAGCAGTCCCAGAGCCA;SOR=0.741;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=28;WE=149518540;WS=149518522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	149518961	rs1008335	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=21;PP=1370;SC=TGCCTGAGGCTTGGACGCTGT;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=149518969;WS=149518951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	149519184	rs1008336	C	T	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=39;PP=1889;SC=CCTGGCCTCTCGCTCTGGGTC;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=149519192;WS=149519174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	149521183	rs4389841	G	A	5964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=108;PP=2965;SC=AGTGAATGCCGGCGTGGGGAG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=90;TCR=108;TR=198;WE=149521191;WS=149521173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr7	149521544	rs12673475	C	T	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=48;PP=2182;SC=TGCCGCCCAGCGCCCTGGCCC;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=110;WE=149521552;WS=149521534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	149522162	rs62617122	G	T	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=44;PP=2192;SC=GGAGGAGGCTGCCGGGAGCCA;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=98;WE=149522170;WS=149522152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	149522366	rs2074697	T	G	5837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=82;PP=2965;SC=GTCGTCAGGTTAGAGCTGCGA;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=95;TCR=82;TR=177;WE=149522374;WS=149522356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr7	149523277	rs1004200	A	G	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=94;PP=2965;SC=ATGGAGCGACATCGGACTTGT;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=168;WE=149523285;WS=149523267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr7	149528262	rs10261977	C	T	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=49;PP=2812;SC=CACGGAGCTTCGAAACTTCAC;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=138;WE=149528270;WS=149528252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr7	149528392	rs10262226	C	T	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=69;PP=2164;SC=AGGGGAATCACGTTGGCCAGT;SOR=1.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=97;WE=149528400;WS=149528382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	149530894	rs6960187	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=56;PP=2680;SC=CGTGTCCCCTGGGAGGTGACT;SOR=0.937;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=128;WE=149530902;WS=149530884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	149544681	rs10569456	GGTGTGTGTGT	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=1076;SC=AGAAAATTCAGGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=149544698;WS=149544674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	149556518	rs4725833	C	T	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=35;PP=1961;SC=CAGGACCTGCCGCTGCCAAGC;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=149556526;WS=149556508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	149558409	rs2240361	G	C	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=68;PP=2693;SC=CGCAGCTGCTGCCTGTCCACT;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=124;WE=149558417;WS=149558399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr7	149559273	rs2074700	C	T	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=54;PP=2965;SC=TCTCCATGCTCTGCAAAAACG;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=149559281;WS=149559263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	149559465	rs2074701	C	T	10155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=186;PP=2965;SC=CTGTGAACGGCGTGGCCGTCA;SOR=1.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=119;TCR=186;TR=305;WE=149559473;WS=149559455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr7	149561049	rs3857764	C	G	246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=163;SC=AACAGAGTAGCAACAGATGAG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=149561057;WS=149561039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	149572842	rs10240203	G	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=61;PP=2119;SC=AATGCCTCTTGAAAGGCTGAA;SOR=1.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=149572850;WS=149572832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	149575707	rs6946997	C	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=709;SC=ACCGAGGCCTCCCCTGGGTGT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=149575715;WS=149575697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	149575725	rs6947011	C	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=10;PP=856;SC=TGTGGGAGGACCCTCCTGTGC;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=149575733;WS=149575715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	149575747	rs5888369	TG	T	2979.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=23;PP=2147;SC=AGGCTCACCATGCTTTGCTGT;SOR=1.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=47;WE=149575755;WS=149575737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	149575884	rs10246226	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=38;PP=1206;SC=ACCCAGGTACTGTGTGGGCGA;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=149575892;WS=149575874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	149576818	rs7785847	A	G	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=53;PP=1837;SC=CGGGGGAGTCAGTGCCCAGTC;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=149576826;WS=149576808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	149588429	rs4725317	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.84;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	149589343	rs2626759	G	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.35;QD=29.22;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	149589496	rs11428600	A	AC	3225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=3.455;NF=8;NR=57;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.459;SC=ACCTTAAAAAAACACACACAC;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=8;TCR=57;TR=65;WE=149589504;WS=149589486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr7	149589599	rs4725318	C	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=15;PP=381;SC=TGTTAGGGCTCCATGTGGGGT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=149589607;WS=149589589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	149744835	rs141816877	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.790;NF=11;NR=6;PP=244;ReadPosRankSum=0.572;SC=CCTGCGCCGCCGTCCTCCTCG;SOR=0.392;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=17;WE=149744843;WS=149744825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr7	149744897	rs190438755	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.983;NF=17;NR=15;PP=432;ReadPosRankSum=1.536;SC=GGGGAAGGACCTCGAGGTGTT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=32;WE=149744905;WS=149744887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr7	149981830	rs4725334	T	G	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.29;QD=30.41;SOR=2.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	149990080	rs149246619	C	T	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQRankSum=-6.628;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.488;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,33:0.30:111
chr7	150020489	rs3735174	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=0.150;SC=GCCAACAAGTTGGGTGGTGGG;SOR=1.140;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=8;WE=150020497;WS=150020479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr7	150020526	rs3735173	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=1.766;SC=CAGGGGCCGCCAGGCGGCGGG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=11;WE=150020534;WS=150020516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
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chr7	150035500	rs1047575	C	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GGTTACCACCCGCAGCGGTCC;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=34;WE=150035508;WS=150035490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr7	150035526	rs4721	T	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=534;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GCACCACGCATCTCTAGACAA;SOR=0.491;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=34;WE=150035534;WS=150035516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr7	150037660	rs1047207	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=-0.064;SC=CGCCCACCGCACCCAGCCACA;SOR=0.579;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=32;WE=150037668;WS=150037650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr7	150067679	rs3757424	C	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.538;SC=AAGCTATAGACACCTTTTTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=150067687;WS=150067669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr7	150067714	rs3757423	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=128;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AACCCAGGCGCTTTAGAGGAA;SOR=1.942;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=11;WE=150067722;WS=150067704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr7	150068371	rs3735165	T	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.837;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1058;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCCATGGGCCTGGCCCAGCCC;SOR=0.830;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=215;TCF=109;TCR=106;TR=88;WE=150068379;WS=150068361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,113:0.44:258
chr7	150068605	rs17173702	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=700;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GAGTGTGGCCGTCGCTTTCGC;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=51;WE=150068613;WS=150068595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,55:0.37:149
chr7	150068620	rs17173703	C	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=641;ReadPosRankSum=0.260;SC=TTTCGCCATGCCCCCTTCTTA;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=46;WE=150068628;WS=150068610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,50:0.34:146
chr7	150068933	rs6722	T	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=885;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TGCACGTAGCTGAGGCCCTGG;SOR=0.586;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=58;WE=150068941;WS=150068923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,63:0.43:146
chr7	150093701	rs940453	A	C	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=28;PP=1747;SC=AGGAGAACATATTTCAGCAGC;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=150093709;WS=150093691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	150094851	rs13225910	A	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=1918;ReadPosRankSum=1.030;SC=GGCCCGGGACACGCTGTGGGG;SOR=1.072;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=53;WE=150094861;WS=150094841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr7	150094853	rs7780011	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=1932;ReadPosRankSum=-0.851;SC=CCCGGGACACGCTGTGGGGCC;SOR=0.428;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=76;TCR=36;TR=57;WE=150094861;WS=150094841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr7	150095271	rs7393	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=338;ReadPosRankSum=0.895;SC=TTGCTGGCTCTTAGAACCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=18;WE=150095279;WS=150095261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr7	150163837	rs2140595	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=467;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TCCTCCTGGGAAAATGCCGCT;SOR=0.086;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=25;WE=150163845;WS=150163827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr7	150167856	.	TCA	T	336	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=46;MMLQ=22;MQ=58.53;NF=5;NR=1;PP=336;QD=56.5;SC=TTTTTTTTTTTCAGTTTGTGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=6;WE=150167865;WS=150167846;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr7	150168058	rs111800874	A	AGAAT	1971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.149;NF=0;NR=27;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CATATAAACCAGAAAATTCAC;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=3;TCR=73;TR=27;WE=150168066;WS=150168048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr7	150171710	rs60114833	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=371;ReadPosRankSum=-0.671;SC=ACAAGCATTGTGTTTTCAGAG;SOR=0.622;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=37;WE=150171718;WS=150171700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr7	150217248	rs3735081	A	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=980;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TTCTTGTTGTAGACACTCCAG;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=60;WE=150217256;WS=150217238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr7	150269160	rs7806724	G	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=-0.505;SC=CTCTGCAGGGGAATCTATTAG;SOR=0.698;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=25;WE=150269168;WS=150269150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
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chr7	150384048	.	A	AAAAG	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.95;QD=34.44;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr7	150440243	rs10361	G	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=1.039;SC=CGTGGTCTATGGAGCATGCTG;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=14;WE=150440251;WS=150440233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
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chr7	150446936	rs2058447	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=1000;ReadPosRankSum=0.838;SC=CTCACTGAAAATCTGAGAAGC;SOR=0.858;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=62;WE=150446944;WS=150446926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr7	150447027	rs28505524	T	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=0.195;SC=CTGTAATGGATTCACAATTTG;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=17;WE=150447035;WS=150447017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr7	150488616	rs2302479	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=215;ReadPosRankSum=0.369;SC=GGTCTTTGGCAGCTCACAGGA;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=17;WE=150488624;WS=150488606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr7	150488840	rs141812679	C	CA	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.417;NF=0;NR=10;PP=111;ReadPosRankSum=0.538;SC=GCAGATCAGGCAAAAAAAAAA;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=150488848;WS=150488830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	150490075	rs10215370	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=1.210;SC=CAGCATGAAGTCCAAGCTCAA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=150490083;WS=150490065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr7	150490130	rs10215721	A	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=415;ReadPosRankSum=-1.385;SC=TCCCTGGGAAAAAAGAGCTGT;SOR=0.856;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=24;WE=150490138;WS=150490120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr7	150490238	rs17256042	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=574;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TGACTTCGCCGCATCCATCTG;SOR=0.726;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=44;WE=150490246;WS=150490228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
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chr7	150490424	rs10215381	T	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.444;SOR=1.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr7	150490431	rs2072442	C	G	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.85;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	150490475	rs10215382	T	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=375;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCGCCTCAAATCCCTCTCCTC;SOR=1.555;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=19;WE=150490483;WS=150490465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr7	150490497	rs10215385	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=237;ReadPosRankSum=-2.166;SC=TCCCCAGCCCTTGTCCAGGAA;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=15;WE=150490505;WS=150490487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr7	150490797	rs72471023	GGACA	G	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.951;NF=0;NR=10;PP=441;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGGATCCCAGGGACAGACAAA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=150490808;WS=150490787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	150491084	rs3173833	T	G	5990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=62;PP=2965;SC=CCTGAGGCACTCAGCACAGTC;SOR=1.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=140;TCR=62;TR=202;WE=150491092;WS=150491074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
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chr7	150491995	rs145375921	CCACACACA	C	501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=16.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=1.620;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
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chr7	150498836	rs2075079	C	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=599;SC=CCTGCCTCGTCGGGCGGCGGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=150498844;WS=150498826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	150499164	.	T	TTTCTC	764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=1.629;QD=21.24;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr7	150499267	rs12668797	C	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=1529;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGCAGGTCCACCTAGGAGCCG;SOR=0.546;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=91;WE=150499275;WS=150499257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,102:0.53:191
chr7	150500356	rs741068	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=17;PP=987;SC=TATCTTACCATGGATAATAAA;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=150500364;WS=150500346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	150500455	rs741067	A	G	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=52;PP=2104;SC=CATTTCCTGTACTAAGCCTGC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=101;WE=150500463;WS=150500445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	150500520	rs741066	C	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=489;ReadPosRankSum=0.304;SC=CCTTCATTTACGAGAAACGGG;SOR=1.223;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=31;WE=150500528;WS=150500510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr7	150500576	rs741065	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=0.796;SC=GGAGGGGACCAGGTTCAGGCT;SOR=0.120;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=24;WE=150500584;WS=150500566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr7	150500729	rs741064	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=1120;SC=GACTCTGCTAACGCTGGCAGC;SOR=1.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=150500737;WS=150500719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	150501516	rs9088	A	G	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=62;PP=2571;SC=GGCATCTCTGACCCCTCTGTG;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=134;WE=150501524;WS=150501506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	150501635	rs12112782	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=517;ReadPosRankSum=0.541;SC=GGACAGTGGACAGTTTGGGGA;SOR=1.261;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=30;WE=150501643;WS=150501625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr7	150554887	rs2071514	G	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ACTTCTATGCGGGGCTGAAGG;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=80;WE=150554895;WS=150554877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,95:0.56:169
chr7	150555915	rs10893	A	G	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=744;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CCTGGAGCCCAAGACACCGCG;SOR=0.864;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=51;WE=150555923;WS=150555905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr7	150556002	rs1049748	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=645;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGAAGCTGCCTAAGTACCTGC;SOR=0.881;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=39;WE=150556010;WS=150555992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr7	150556055	rs6943147	CG	GC	5708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=51;PP=2947;SC=CACAAGCGCACGTACCGCCTG;SOR=0.971;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=90;WE=150556064;WS=150556045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	150556992	rs10952294	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.648;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=0.057;SC=GTGTGCTGGGCGCAGGAGCTC;SOR=2.212;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=13;WE=150557000;WS=150556982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	150557471	rs2071515	G	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=401;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CAGATGATCTGTCATCTTGGG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=29;WE=150557479;WS=150557461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr7	150557622	rs12179	G	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=874;ReadPosRankSum=-0.079;SC=ACCGGGAGTCGGAGCTGTGCA;SOR=0.696;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=59;WE=150557630;WS=150557612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr7	150557665	rs1049793	C	G	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=840;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CGACCCCTGGCACCCGCCCGT;SOR=1.067;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=54;WE=150557673;WS=150557655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,76:0.44:174
chr7	150557748	rs3735076	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=0.407;SC=AGCCCTGCCCGGTGCTGGCCC;SOR=0.669;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=26;WE=150557756;WS=150557738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr7	150558399	rs2071517	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.028;NF=5;NR=28;PP=623;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TGCTTCTTGCGGGGAGGCACA;SOR=0.372;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=33;WE=150558407;WS=150558389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr7	150558444	rs34090933	G	GCA	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.071;NF=1;NR=9;PP=411;ReadPosRankSum=0.299;SC=GAACAGACGTGCACACACACA;SOR=0.324;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=10;WE=150558452;WS=150558434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr7	150642752	rs41313071	C	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=0.915;SC=CTGGAGGGGACAAGAGCCAAG;SOR=0.885;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=19;WE=150642760;WS=150642742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
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chr7	150645682	rs2968860	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=749;ReadPosRankSum=0.576;SC=CTGCCCCACCGGGGTCAGGCC;SOR=0.256;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=108;TCF=34;TCR=74;TR=48;WE=150645690;WS=150645672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
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chr7	150648789	rs1805121	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=879;ReadPosRankSum=-1.304;SC=AGATGCAGGCTAGCCAGTGCG;SOR=0.768;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=53;WE=150648797;WS=150648779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
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chr7	150649531	rs1805120	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=874;ReadPosRankSum=0.760;SC=AGCCAGAGCCGAAGATGAGCA;SOR=0.306;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=117;TCF=85;TCR=32;TR=58;WE=150649539;WS=150649521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,69:0.51:134
chr7	150649603	rs740952	G	A	4310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=55;PP=2511;ReadPosRankSum=1.482;SC=AGTGGACGGCGATGCGGCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=313;TCF=205;TCR=108;TR=161;WE=150649611;WS=150649593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,198:0.52:383
chr7	150652286	rs887586	C	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.319;SC=GTCCCAGCAACGGAAACTCTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=150652294;WS=150652276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	150654622	rs11462566	A	AG	633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=674;SC=TCAGGCCAGCAGCCCAGGGCC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=150654630;WS=150654612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	150655624	rs758891	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=190;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GTCGTGGGGATCGCGAGCAGC;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=15;WE=150655632;WS=150655614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr7	150655643	rs758890	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=200;ReadPosRankSum=0.142;SC=GCCCCGGAGCGGGCAAGGCCT;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=12;WE=150655651;WS=150655633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr7	150672162	rs11410979	T	TC	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=581;SC=GGGACTGGGGTCCCAGCAGGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=150672170;WS=150672152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	150692444	rs1800781	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=498;ReadPosRankSum=0.065;SC=CCAGGGAAAGGGTGGGTAAGG;SOR=0.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=28;WE=150692452;WS=150692434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr7	150695726	rs1549758	T	C	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=35;PP=1032;SC=GGCAGCAGGATGGCTCTGTGC;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=150695734;WS=150695716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	150696111	rs1799983	T	G	4047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.343;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=2602;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CCCCAGATGATCCCCCAGAAC;SOR=0.487;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=130;WE=150696119;WS=150696101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr7	150698349	rs150935488	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=434;ReadPosRankSum=0.025;SC=GGACCACCACGCCGCCACGGC;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=34;WE=150698357;WS=150698339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr7	150698879	rs1800780	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=373;ReadPosRankSum=1.013;SC=CTGTGCACCCAGGACACCCTC;SOR=1.115;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=28;WE=150698887;WS=150698869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr7	150699250	rs1800782	G	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.319;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=380;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGCCTCCGGGGGCCACAGCAC;SOR=1.860;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=22;WE=150699258;WS=150699240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr7	150700515	rs2566508	T	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=130;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CACCTGGCCCTCAGTATCTTA;SOR=0.264;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=13;WE=150700523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr7	150700637	rs73167652	A	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=814;ReadPosRankSum=0.056;SC=TTTTTTTAGCATAAAGGTGTA;SOR=0.301;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=52;WE=150700645;WS=150700627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,66:0.63:105
chr7	150703915	rs2853796	G	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=1.130;SC=TGGGGCTGGGGCTGGGCCTAG;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=18;WE=150703923;WS=150703905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr7	150704250	rs2566514	C	G	7177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=118;PP=2965;SC=TTGCTCGTGCCGTGGACACAC;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=222;WE=150704258;WS=150704240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	150706383	rs753482	C	A	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.209;NF=32;NR=46;PP=1434;ReadPosRankSum=0.075;SC=ACCGCCCCCCCACCCCTGTCC;SOR=0.434;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=78;WE=150706391;WS=150706373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr7	150706436	rs142498418	G	GC	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=12;PP=613;SC=ACATTCTCCCGCCCCCACCCC;SOR=1.371;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=17;WE=150706444;WS=150706426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	150707488	rs743507	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=353;SC=TTCTCCTGGCCGACATGCACT;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=150707496;WS=150707478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr7	150708850	rs2256314	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=673;SC=CTGACCTCACGATCCTCCCAC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=150708858;WS=150708840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr7	150748771	rs58134191	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=1.624;SC=GGAGTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=150748779;WS=150748768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr7	150748869	rs10255526	C	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=491;ReadPosRankSum=0.489;SC=GGTGGCCAGCCCACATTTGAG;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=35;WE=150748877;WS=150748859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr7	150751590	rs2069459	C	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=656;ReadPosRankSum=0.684;SC=GAAAGGGCCACAGCTGCATCT;SOR=0.426;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=44;WE=150751598;WS=150751580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
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chr7	150760076	rs34403003	G	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CGCCCTTGGAGATCCCGATGC;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=14;WE=150760084;WS=150760066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	150761150	rs6464122	C	G	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=268;SC=CTGCTGGGGGCATATAGAGCC;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=150761158;WS=150761140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr7	150761548	rs2303930	A	G	223.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
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chr7	150773072	rs2303939	G	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=395;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TAGGGAGGAAGCTGGGCTCAC;SOR=1.382;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=21;WE=150773080;WS=150773062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr7	150773807	rs7262	A	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCCCACATCAACCCCTCAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=9;WE=150773815;WS=150773797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	150775306	rs2303942	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=0.873;SC=CAGTCCCTCCGGCCTCACAGT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=150775314;WS=150775296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
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chr7	150812493	rs6971966	G	C	221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.18;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr7	150883603	rs139505650	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=1.574;SC=GCACAGGCCTCGTGCAGGGCG;SOR=0.750;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=38;WE=150883611;WS=150883593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr7	150884266	rs372716545	CAG	C	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=3.000;QD=0.48;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,15:0.10:148
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chr7	150915102	rs79537035	C	T	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=834;ReadPosRankSum=1.092;SC=CTGCATCACTCCCCTCTTCCT;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=54;WE=150915110;WS=150915092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr7	150915948	rs7782699	C	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=938;ReadPosRankSum=-1.241;SC=GACCAAACCTCGCAATGTAGT;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=66;WE=150915956;WS=150915938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,84:0.41:207
chr7	150916114	rs35656219	CAGG	C	999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=996;ReadPosRankSum=-0.300;SC=TTCTTTCAGACAGGAGGCCAT;SOR=2.494;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=24;WE=150916124;WS=150916104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr7	150916228	rs6949587	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=285;ReadPosRankSum=-1.912;SC=GCGTCTTCACGTACTGATCAT;SOR=0.491;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=20;WE=150916236;WS=150916218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
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chr7	150919829	rs7812088	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=227;ReadPosRankSum=-0.972;SC=ATCAATTTTAGGCTCTATACC;SOR=0.223;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=14;WE=150919837;WS=150919819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr7	150921950	rs6464133	A	G	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=65;PP=2623;SC=CATGAAAGGTAAGTGAGAGGT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=123;WE=150921958;WS=150921940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	150931268	rs2608293	C	G	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.595;SC=ATCCAGATTCCAGAGCTCGGC;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=94;WE=150931276;WS=150931258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,117:0.52:223
chr7	150934162	rs2446065	G	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=150;ReadPosRankSum=0.423;SC=GAGTCCTTTGGGTGTAGGAGA;SOR=1.270;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=12;WE=150934170;WS=150934152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr7	150934975	rs2487154	C	G	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=60;PP=2222;ReadPosRankSum=-0.109;SC=TCCTCGAGGCCTTTGCAGCCA;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=257;TCF=138;TCR=119;TR=139;WE=150934983;WS=150934965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,160:0.55:292
chr7	150935977	rs193287414	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=0.825;SC=GAGTCGTCCCGAGGGACCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=7;WE=150935985;WS=150935967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	150937377	rs61667463	C	CG	1655.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=1557;SC=TGCCCCCATACGGCCCCAGGG;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=37;WE=150937385;WS=150937367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	150939193	rs4725398	A	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=547;ReadPosRankSum=-0.130;SC=GAGGGTGGCAATTCAAGGGCG;SOR=0.383;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=34;WE=150939201;WS=150939183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr7	150939359	rs219227	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=494;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGAACAGGGACGAGGTGGGAG;SOR=0.377;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=29;WE=150939367;WS=150939349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr7	150939396	rs219228	C	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=1.205;SC=AGTTGGCAGCCGACAGGGCAG;SOR=0.014;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=15;WE=150939404;WS=150939386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr7	150940657	rs122815	T	C	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=73;SC=GTGACTGTGATGCTGAAGCTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=150940665;WS=150940647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	150972141	rs10249260	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=1.365;SC=AGGGCTGGCCGACTCGCCATG;SOR=0.502;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=12;WE=150972149;WS=150972131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr7	150972189	rs2072298	G	A	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=733;ReadPosRankSum=1.571;SC=GGCAGGGGAGGAAGCACCTAC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=46;WE=150972197;WS=150972179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr7	151048484	rs449081	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=516;ReadPosRankSum=2.298;SC=ATTCAAGTACGTTTTACTTTG;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=29;WE=151048492;WS=151048474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr7	151049002	rs3838706	A	AACAC,ATCACACAC	384.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=22;NF=7,8;NR=2,2;PP=250,55;SC=CCATCTGTAAAACACACACAC;SOR=4.407;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=9,10;WE=151049010;WS=151048992;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.38:8
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chr7	151057396	rs3217033	AC	A	6667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=100;PP=2965;SC=TATACAGAACACCCTGCCATG;SOR=1.221;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=16;TCR=102;TR=116;WE=151057404;WS=151057386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr7	151064064	rs386956	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=9;PP=1076;SC=TGGATAACTACGCCGTCCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=151064072;WS=151064054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	151064305	rs367191	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=322;SC=GCCAGAAGGTAATTTCATTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=151064313;WS=151064295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	151064872	rs874607	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=301;ReadPosRankSum=1.325;SC=GACCAAGGGAATGACAGAGAT;SOR=0.497;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=20;WE=151064880;WS=151064862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr7	151073093	rs731995	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=765;ReadPosRankSum=2.000;SC=TGGGGTAACCCGGGTGAATCA;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=44;WE=151073101;WS=151073083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr7	151074015	rs2240629	G	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=138;ReadPosRankSum=0.867;SC=ACGTCACCGGGCCGGCCACCT;SOR=0.481;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=9;WE=151074023;WS=151074005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr7	151074296	rs2159158	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=0.298;SC=GGAAGTCAGCAACAAAGAAAA;SOR=1.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=16;WE=151074304;WS=151074286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr7	151078371	rs2286417	C	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CCGCCTGCAGCCCCTGAGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=151078379;WS=151078361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr7	151078719	rs4726019	C	A	385.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TGCTGAAGAGCCGCGAGAGGC;SOR=1.244;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=10;WE=151078727;WS=151078709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr7	151078735	rs4141455	A	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=235;SC=GAGGCTGCGCATGGGCGGAGG;SOR=1.508;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=151078743;WS=151078725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	151078845	rs4141454	G	A	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=14;PP=1510;SC=GCGGGCGCAGGGGCGGGCGTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=63;WE=151078853;WS=151078835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	151097323	rs11767693	A	G	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=1273;SC=CATAGCTTTCATGTCCTGCAG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=151097331;WS=151097313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	151254175	rs8961	T	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=760;ReadPosRankSum=-0.119;SC=AAATACCTATTGTTAAACCCT;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=61;WE=151254183;WS=151254165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr7	151254373	.	C	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GCAGGGTTCTCTACCCCAGGG;SOR=1.435;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=28;WE=151254381;WS=151254363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr7	151254445	rs764801	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=1.944;SC=AGGAGGGCGATGTGGGAAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=151254453;WS=151254435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	151254462	rs764800	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.903;SC=AGGAGCAGGTGGCCCAAGCTC;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=151254470;WS=151254452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	151292395	rs35348247	A	AT	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=616;ReadPosRankSum=0.559;SC=CCATCCAAAAAATACCAAAAA;SOR=1.002;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=17;WE=151292403;WS=151292385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr7	151432869	rs1547470	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=266;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TGATGTTATATCCCAGTTGGA;SOR=0.152;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=16;WE=151432877;WS=151432867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr7	151483445	rs12671980	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=452;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GTGCAAGCGGACATGCGGGTG;SOR=1.351;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=25;WE=151483453;WS=151483435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
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chr7	151504499	rs10257529	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=664;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TGTGGGTGACGGTCATACTTT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=39;WE=151504507;WS=151504489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr7	151668225	rs1919521	A	T	120.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=188;ReadPosRankSum=1.383;SC=GATAGATAGAAAGAAAACAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=151668233;WS=151668215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr7	151680072	rs6960270	T	C	5458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=83;PP=2965;SC=TGCCTGCAGGTGTCTTCAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=171;WE=151680080;WS=151680062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr7	151684168	rs4726127	C	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=454;SC=TTTAGGAATACGTCATAATGA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=151684176;WS=151684158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	151723022	rs72200904	TGCG	T	2931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=37;PP=1753;SC=CCTCGAGAGCTGCGGCGGCGG;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=37;WE=151723032;WS=151723012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	151818777	rs967093	T	C	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=61;PP=1421;SC=GATGCTGTGGTGGGAACGTTG;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=7;TCR=61;TR=68;WE=151818785;WS=151818767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	151945007	rs137949498	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-0.563;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,41:0.20:201
chr7	151945071	rs150073007	G	GT	2245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-1.052;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,88:0.27:330
chr7	151945204	rs4024453	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=88.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQRankSum=-9.223;QD=1.47;ReadPosRankSum=-2.200;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,30:0.14:218
chr7	151962176	rs62478356	T	A	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=987;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.48;MQRankSum=-17.153;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:747,240:0.24:987
chr7	151970856	rs10454320	T	A	11825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=672;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.977;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.497;NF=253;NR=321;PP=2962;ReadPosRankSum=1.571;SC=TCCTGAAAGGTGCCGGCTCCT;SOR=1.055;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=729;TCF=334;TCR=395;TR=574;WE=151970864;WS=151970846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,485:0.72:671
chr7	151970931	rs56850341	G	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=88.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQRankSum=-13.057;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.500;SOR=4.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,84:0.36:236
chr7	152511598	rs112910296	C	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.18;QD=31.49;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	152520388	rs151055592	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.609;NF=17;NR=5;PP=350;ReadPosRankSum=-0.513;SC=ACACTGGGCAGTTGTTAATGC;SOR=0.277;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=22;WE=152520396;WS=152520378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr7	152520731	rs3864524	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.224;NF=0;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=0.079;SC=CTGCATCCCCTGTGCAGTTTG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=152520739;WS=152520721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	152549107	rs6944646	C	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=597;ReadPosRankSum=0.036;SC=GCCGATGTGTCGTGCCCACAA;SOR=1.265;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=34;WE=152549115;WS=152549097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr7	152550499	rs4726215	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=20;PP=904;SC=TGGGTGCAGCTGTGGTCTCGT;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=152550507;WS=152550489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	152550549	rs76636878	G	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=595;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CTGTGGGTGTGGGGTAAGTGA;SOR=0.672;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=43;WE=152550557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr7	153749753	rs1974615	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GAGGAGCGGCCGCCGGCGCTG;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=4;WE=153749761;WS=153749751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	153749772	rs374262699	TTGC	T	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TGGGCTTGCCTTGCTGCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=153749782;WS=153749762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	153750019	.	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.199;NF=2;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.144;SC=AGGACGGCGGCGCAGGAGCCA;SOR=1.814;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=15;WE=153750027;WS=153750009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr7	153750319	.	G	GC	223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=59;SC=CGCGGTCACCGCGTCCCGGAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=153750327;WS=153750309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	154172154	rs3750042	G	A	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=774;ReadPosRankSum=-0.622;SC=ACAAGACATCGCTTCCCCATG;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=51;WE=154172162;WS=154172144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr7	154263904	rs182739977	T	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=376;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GCTTTAAAATTCTTTGTCTAT;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=25;WE=154263912;WS=154263894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr7	154429560	rs11243339	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=658;ReadPosRankSum=0.304;SC=CTGGATATTACGTCCTGAGCA;SOR=1.475;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=41;WE=154429568;WS=154429550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr7	154429657	rs6972501	T	C	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1031;ReadPosRankSum=0.666;SC=GGACGAGCTGTTTAACCCTTA;SOR=1.025;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=62;WE=154429665;WS=154429647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,74:0.68:109
chr7	154461112	rs3807218	A	G	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=2499;ReadPosRankSum=1.281;SC=GCAATGCAAAACTTCAGTATG;SOR=0.279;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=112;WE=154461120;WS=154461102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr7	154461248	rs35719981	TTGTG	T,TTG	754.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=34.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,11:0.50,0.50:22
chr7	154561188	rs56091483	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=325;ReadPosRankSum=0.000;SC=GACTCGCCTACGCCGCCATCA;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=25;WE=154561196;WS=154561178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr7	154587494	.	CA	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=8.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.067;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.106;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
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chr7	154672551	rs4960632	G	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=853;ReadPosRankSum=1.617;SC=AGACAAAGTGGCAGCAGGATG;SOR=0.418;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=56;WE=154672559;WS=154672541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr7	154672646	rs3817522	T	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=598;ReadPosRankSum=-0.597;SC=TGGCCGTGTTTGGGAAGGTGA;SOR=0.814;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=56;WE=154672654;WS=154672636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,64:0.44:146
chr7	154672679	rs3817520	A	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=684;ReadPosRankSum=1.140;SC=CTGGTCTGAAAACCCCTCAGT;SOR=0.424;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=45;WE=154672687;WS=154672669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr7	154672717	rs3817519	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=544;ReadPosRankSum=0.078;SC=CATTACCCACGTCTAATCCTG;SOR=0.430;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=40;WE=154672725;WS=154672707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr7	154672809	rs3817518	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=2.215;SC=GATTCCAGCCGTGGGAGGTTT;SOR=0.846;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=10;WE=154672817;WS=154672799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr7	154672839	rs3817517	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=1.990;SC=AGCTCATTTTCCTAAGTTTCT;SOR=0.092;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=8;WE=154672847;WS=154672829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	154679447	rs940378	G	A	5632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=86;PP=2965;SC=CATACGAGGTGTGTATGGGCA;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=154679455;WS=154679437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr7	154681363	rs13232266	A	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=0.253;SC=GTGGTCGGTGATGAGCAAGGT;SOR=0.031;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=19;WE=154681371;WS=154681353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr7	154684153	rs3734960	T	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=769;ReadPosRankSum=2.125;SC=GACAAACTGCTGACAGTCACA;SOR=0.934;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=53;TCR=91;TR=67;WE=154684161;WS=154684143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr7	154862508	rs3734967	A	G	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=18;PP=953;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CCCACTGGCCAGAGGTTGCAA;SOR=0.436;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=103;TCR=34;TR=68;WE=154862516;WS=154862498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,76:0.52:146
chr7	154862591	rs1800883	G	C	4211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=68;PP=2822;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GTACCCCAGGGCGGTCTCCTG;SOR=0.774;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=351;TCF=203;TCR=148;TR=168;WE=154862599;WS=154862581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,195:0.48:406
chr7	154862621	rs6320	T	A	5393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=2.907;SC=TGGATTTACCTGTGAACCTAA;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=429;TCF=245;TCR=184;TR=210;WE=154862629;WS=154862611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,249:0.50:498
chr7	154875780	rs1730208	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=455;ReadPosRankSum=0.116;SC=GTGGATGTGCGGAATCCAGGC;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=25;WE=154875788;WS=154875770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr7	154876342	rs980442	T	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=380;SC=TGCACTGGCCTCTTTTCCACC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=154876350;WS=154876332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	154989906	rs192003081	C	T	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=987;ReadPosRankSum=1.030;SC=AAAACTTAGGCTAAGACAGAT;SOR=0.738;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=142;TCF=88;TCR=54;TR=59;WE=154989914;WS=154989896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr7	154989982	rs28664023	G	A	5399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=89;PP=2965;SC=GGCTCACCCCGAATCACTCAG;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=75;TCR=89;TR=164;WE=154989990;WS=154989972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr7	155094172	rs9718441	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=0.836;SC=GCTTACTTAACTTTCATTAAA;SOR=0.396;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=31;WE=155094180;WS=155094162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr7	155094593	rs11772189	G	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=0.330;SC=TAAAACTTGCGTCTCTTTACC;SOR=0.254;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=15;WE=155094601;WS=155094583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr7	155099855	rs9769506	C	A	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=131;SC=AAGTGTCAATCTTTCCCATGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=155099863;WS=155099845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	155150472	rs3922604	G	A	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CTGTTTCCCCGCAGGGCTGCC;SOR=0.554;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=66;WE=155150480;WS=155150462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,77:0.58:132
chr7	155150560	rs6605563	A	G	2267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.999;SC=AAGGACTCCAAGGGAAATGTC;SOR=0.792;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=93;WE=155150568;WS=155150550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr7	155150602	rs6605562	T	C	2539.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=43;PP=1753;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GTGTACTTCCTCCGGGGCTGC;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=243;TCF=141;TCR=102;TR=105;WE=155150610;WS=155150592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,117:0.43:270
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chr7	155174774	rs1421324	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=294;ReadPosRankSum=1.016;SC=AGTGTGCATGCGGGTGTGAAT;SOR=2.120;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=155174782;WS=155174764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr7	155174801	rs147883222	ATGTGAG	A	849.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.26;MQRankSum=0.934;NF=11;NR=3;PP=699;ReadPosRankSum=0.815;SC=ATGTACACGAATGTGAGTGTG;SOR=1.371;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=14;WE=155174814;WS=155174791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr7	155251433	rs3735653	C	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=26;PP=1293;SC=CTCGGAGCAGCTCTTGGGCTC;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=155251441;WS=155251423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	155255332	rs2361689	T	C	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1541;ReadPosRankSum=-1.302;SC=GGCACAGGGCTTGTACAACCA;SOR=0.849;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=88;WE=155255340;WS=155255322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,98:0.51:193
chr7	155295804	rs35244674	GA	G	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=2.114;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.483;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr7	155295854	rs7804744	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.744;NF=1;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=1.247;SC=ACTCCAGCCCGTTAAGTCATT;SOR=1.232;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=26;WE=155295862;WS=155295844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr7	155301781	rs6947243	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=956;ReadPosRankSum=0.091;SC=CCTCCGACTGAGCTAGGGGGA;SOR=0.519;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=52;WE=155301789;WS=155301771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr7	155437475	rs7786826	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=202;SC=CCCTCCCTTCTCTGTCCTCCG;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=155437483;WS=155437465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	155465422	.	C	G	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=50.99;NF=3;NR=0;PP=52;QD=28.9237375157;SC=CTGGGCAACACGGTGAGGCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=155465430;WS=155465412;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	155503920	rs7800753	A	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=45;NR=35;PP=1665;SC=CTCCACCGCCACCGCCGCCTC;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=155503928;WS=155503910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	155556778	rs78278900	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=0.344;SC=GTGTTCAGACGTGCTCTAATT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=155556786;WS=155556768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	155593438	rs1233560	G	A	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=52;PP=1409;SC=GAGGCCCTGCGCCATCCACCT;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=155593446;WS=155593428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	155598879	rs1233554	A	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=885;SC=TCGCCCAGCGACCCTGCTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=155598887;WS=155598869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	155599300	rs1233555	C	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=24;PP=817;SC=GCCTGGGCAACCGCCACCCCT;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=155599308;WS=155599290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	155747907	rs7810074	T	C	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1221;ReadPosRankSum=0.297;SC=CACAGGGGAGTATGAAGCCGG;SOR=1.038;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=70;WE=155747915;WS=155747897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr7	155749951	rs35655547	C	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.734;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,41:0.26:156
chr7	155750033	rs10256182	A	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=43;PP=1417;SC=TGGCCACCTCAGATTTTAAAA;SOR=1.194;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=155750041;WS=155750023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	155755336	rs7807731	C	T	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=29;PP=1490;SC=TTTAGGAGCACGGGTACTACT;SOR=1.166;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=155755344;WS=155755326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	155755826	rs2007015	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=704;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CCAGATTCTCATGTAGGCTGG;SOR=0.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=50;WE=155755834;WS=155755816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,59:0.61:97
chr7	155757502	rs1551630	T	C	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=44;PP=1488;SC=TCGCTTGCTGTCACTGCCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=155757510;WS=155757492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	156439046	rs80119794	C	T	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=895;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TGGTTCCTGGCATTGCTTAGC;SOR=0.371;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=64;WE=156439054;WS=156439036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr7	156476683	rs3735186	T	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=1.291;SC=GGGGCCACGGTTGAATGGAAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=156476691;WS=156476673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr7	156516951	rs7793618	G	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=547;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TCTGAGAAATGATTGTGCATT;SOR=1.047;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=29;WE=156516959;WS=156516941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr7	156518195	rs59912051	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=825;ReadPosRankSum=0.302;SC=TATAGAAGCCGACAACAGAGG;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=50;WE=156518203;WS=156518185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr7	156521493	rs6459703	A	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.323;SC=AATCTGTTTTATACATAATTT;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=13;WE=156521501;WS=156521483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr7	156529062	rs10640672	C	CAGT	1030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=912;SC=AGCTTGCATTCATTATTTAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=156529070;WS=156529052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr7	156589149	rs112583005	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=0.650;SC=ATACAAATAAACAAAGGTTGG;SOR=1.115;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=7;WE=156589157;WS=156589139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
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chr7	156626596	rs75668861	A	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	156626602	.	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	156685519	rs200299453	G	GC	508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=410;SC=GGCGCGAGGCGAGGCCCGGAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=156685527;WS=156685509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	156685538	.	TCCGGGGA	T	556.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr7	156685540	.	C	CG	283.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=0.106;SC=GTGAGGGGTCCGGGGACCGGG;SOR=1.140;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=16;WE=156685553;WS=156685528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr7	156685545	.	A	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr7	156685590	rs117769123	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=655;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CGGGCACGCGGGACTGTCAGG;SOR=0.461;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=23;WE=156685600;WS=156685580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr7	156685592	rs117913319	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=3;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=806;ReadPosRankSum=1.104;SC=GGCACGCGGGACTGTCAGGGC;SOR=0.917;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=26;WE=156685600;WS=156685580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr7	156742501	rs6969990	C	G	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CCGCATGAAGCGCAGAGGCGG;SOR=0.466;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=69;WE=156742509;WS=156742491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,72:0.62:117
chr7	156742749	rs6969196	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=746;ReadPosRankSum=-1.525;SC=GCCCCGAACAGGGTCCCGGCC;SOR=1.182;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=44;WE=156742757;WS=156742739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,56:0.44:127
chr7	156742796	rs6952214	A	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.342;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=401;ReadPosRankSum=-0.072;SC=GCCAGCGGTCACCGGCAGGAC;SOR=1.206;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=25;WE=156742804;WS=156742786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr7	156742965	rs61734937	G	C	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=37;PP=1555;ReadPosRankSum=-2.146;SC=TTTTAGCGGCGAACGAGGAGG;SOR=0.705;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=214;TCF=130;TCR=84;TR=96;WE=156742973;WS=156742955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,115:0.47:244
chr7	156743264	rs61747373	C	A	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.879;SC=GAAGCAGAAGCGCAGAGCGAG;SOR=0.283;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=59;WE=156743272;WS=156743254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr7	156746701	rs61122657	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=459;ReadPosRankSum=-1.538;SC=AAATAGAATATATTGTTGGTA;SOR=0.902;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=21;WE=156746709;WS=156746691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr7	156746727	rs58846177	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=608;ReadPosRankSum=-0.932;SC=AACTCTTTAATTTTTTAAAAT;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=37;WE=156746735;WS=156746717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr7	156746890	rs61740447	C	T	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1230;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CCCTGACCTCCGCTCTCATGG;SOR=0.618;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=80;WE=156746898;WS=156746880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,88:0.47:188
chr7	156754975	rs77054396	A	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,57:0.46:125
chr7	156754981	rs3750131	T	C	4457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=76;PP=1168;SC=TTCAATTCTGTTTTGCTCAGA;SOR=1.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=107;WE=156754989;WS=156754965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	156755052	rs73506029	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=472;ReadPosRankSum=0.569;SC=TGCACGTCAGGGTGGTGTCTG;SOR=0.437;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=25;WE=156755060;WS=156755042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr7	156755350	rs12672076	T	C	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=57;PP=2216;SC=GCCTCCCTGTTGGAGTGAGTC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=124;WE=156755358;WS=156755340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr7	156931907	rs182166882	G	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.486;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr7	156932094	rs200844106	G	GGGACTCGGGGTT	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.73;ReadPosRankSum=2.129;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr7	156932105	rs59178327	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=48;PP=1988;ReadPosRankSum=1.090;SC=GGACTCGGGGCTGGACTCGGG;SOR=0.788;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=60;WE=156932113;WS=156932084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr7	156962874	rs6956046	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=0.385;SC=AGCAAGGACCGATAATGGTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=156962882;WS=156962864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	156971581	rs870745	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=356;ReadPosRankSum=1.101;SC=CTCAGCATCCTGATGGGGAGT;SOR=0.394;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=32;WE=156971589;WS=156971571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr7	157000176	rs2301914	T	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=738;ReadPosRankSum=1.385;SC=CACTCTTTTATCTTTTTAGCT;SOR=0.851;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=49;WE=157000184;WS=157000166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr7	157013464	.	C	T	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1216;ReadPosRankSum=1.284;SC=GCAGTCCACCCTGGACGGTGA;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=67;TCR=89;TR=81;WE=157013472;WS=157013454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,99:0.53:187
chr7	157041003	rs138201644	CTTTG	C	1175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.951;NF=8;NR=11;PP=841;ReadPosRankSum=-0.371;SC=GCATATGGCTCTTTGTTTGTA;SOR=1.002;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=19;WE=157041014;WS=157040993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr7	157049530	rs1182373	T	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=780;SC=TTTCCGTGGGTGTCTGGACCA;SOR=3.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=157049538;WS=157049520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	157151234	rs3802100	C	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=415;SC=CCTGTTTTTACTTGCAGGACC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=157151242;WS=157151224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	157156151	rs3802096	C	T	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=37;PP=991;SC=TAGGTAACCACGAGTGCTGGG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=157156159;WS=157156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	157159423	rs3779591	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=710;SC=GCATTTAAAAGTCTTTTACGA;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=157159431;WS=157159413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	157162068	rs9692250	T	C	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=53;PP=1787;SC=GGGCAGTGTTTGGGTTGAAGT;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=100;WE=157162076;WS=157162058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	157162103	rs12672981	A	G	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=57;PP=1769;SC=GGTGATTCTCATGGTGACCAA;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=157162111;WS=157162093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	157234117	rs60644045	C	T	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=86;PP=2554;SC=TTCTGGGCGGCGCCTGACGTA;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=131;WE=157234125;WS=157234107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	157234816	rs12698062	A	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.04;QD=26.71;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	157234912	rs12669046	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=12;PP=358;SC=GTGGTGGGCTATTCCACGCGG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=157234920;WS=157234902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	157234970	rs139606018	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=0.464;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	157234993	rs55928934	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=0.489;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	157235008	rs369732485	A	G	96.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.69;QD=19.40;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	157235229	rs6974109	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=14;PP=550;SC=TCGGGGCGGGTGCCTGATGTA;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=157235237;WS=157235219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	157261201	rs4716743	T	G	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=9;PP=1242;SC=CACCGTCACCTTCACGGGAGA;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=157261209;WS=157261191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	157261258	rs4716744	C	T	7377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=57;PP=2627;SC=GGGACCATCCCTCACCTTTGG;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=140;WE=157261266;WS=157261248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr7	157261275	rs4716745	C	T	8289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=69;PP=2924;SC=TTGGTTTGCCCGCGTTCTCAC;SOR=0.883;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=155;WE=157261283;WS=157261265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	157261292	rs4716746	A	G	8390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=81;PP=2965;SC=TCACACGGGGACAGCTGTTTA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=167;WE=157261300;WS=157261282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr7	157261945	rs2109830	A	G	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=11;PP=1191;SC=CAGCAGGGGCAGGACCCTCGG;SOR=2.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=157261961;WS=157261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	157261953	rs11449038	C	CG	3095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=2094;SC=GCAGGACCCTCGGCCTGGCCA;SOR=2.173;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=157261961;WS=157261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	157262170	rs7801907	T	C	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=50;PP=1371;SC=GAGTAGGGGGTGCAGACCCGG;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=157262178;WS=157262160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	157262226	rs7778458	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=598;SC=AGGACATGCCGGCATCGGAGG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=157262234;WS=157262216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	157262920	rs7806450	T	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=5;PP=195;SC=GCACTGGGTCTGCTCCCTGCA;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=157262928;WS=157262910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	157263370	.	T	C	441	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=57;MMLQ=16;MQ=56.99;NF=21;NR=10;PP=441;QD=15.3474584693;SC=TGGGTGTGTCTGTGTGTCCGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=157263378;WS=157263360;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	157263391	.	G	T	789	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=18;MQ=57.08;NF=28;NR=14;PP=789;QD=19.6136002987;SC=CGCTGGCCTGGGTTGGGTGTG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=42;WE=157263399;WS=157263381;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr7	157263410	.	C	T	981	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MMLQ=23;MQ=58.0;NF=33;NR=20;PP=981;QD=19.1654945764;SC=TGTCCGTGTGCCCGGTGCTGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=157263418;WS=157263400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	157263532	rs7785035	C	T	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=28;PP=863;SC=TTGAATCTCCCAACATCCAAC;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=157263540;WS=157263522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	157318438	.	G	C	464	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=56.63;NF=17;NR=8;PP=464;QD=19.9508485019;SC=GCCGTGTGCAGTGTCGCAGGG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=25;WE=157318446;WS=157318428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:50,25:0.33:75
chr7	157318712	rs62475320	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1455;ReadPosRankSum=0.253;SC=TCTGCACATCCCTATTCATTG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=85;WE=157318720;WS=157318702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,95:0.43:223
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chr7	157341556	rs3214337	GC	G	1030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.36;NF=27;NR=1;PP=1077;SC=ATTAAACCAGGCCCTCCCCGT;SOR=5.421;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=28;WE=157341564;WS=157341546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	157361734	rs221294	T	C	6334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=113;PP=2965;SC=TAGTGACAGTTCATTTCCTTC;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=184;WE=157361742;WS=157361724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr7	157369564	rs221301	C	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=932;SC=CACGTCTGACCAGAGAAGGGG;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=157369572;WS=157369554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	157370688	rs122004	C	G	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=10;PP=949;SC=GTGGGTCCTGCCCTGGGTGGC;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=157370696;WS=157370678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	157406673	rs147999231	C	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=0.282;SC=TGTGAGCTCACAGGGCTGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=24;WE=157406681;WS=157406663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr7	157462117	rs5888726	G	GCA	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.101;NF=20;NR=4;PP=954;ReadPosRankSum=0.134;SC=GTTTGCACGCGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=24;WE=157462125;WS=157462107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,28:0.90:31
chr7	157462425	rs755703	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=988;SC=CTTCTAAATGTGGAACAGTCT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=157462433;WS=157462415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	157462464	rs1079359	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=673;SC=GTAGGAAAAAAGCGGCCTCTC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=157462472;WS=157462454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	157691523	rs56112490	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=1013;ReadPosRankSum=1.262;SC=AAAATTTCAATTACATGACTG;SOR=1.276;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=56;WE=157691531;WS=157691513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr7	157800838	rs143545915	AGT	A	3751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=10;PP=2975;SC=CACATGTGTGAGTGTGTGTGG;SOR=3.234;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=68;WE=157800847;WS=157800828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	157800899	rs12666418	C	T	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=77;PP=2965;SC=TGGGCATGTGCATACACACTG;SOR=1.164;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=129;TCR=77;TR=206;WE=157800907;WS=157800889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr7	157873975	rs3800863	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=420;ReadPosRankSum=2.818;SC=TACGTGTGTGTGGAAACAGCC;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=26;WE=157873983;WS=157873965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr7	157926349	rs17847428	T	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=520;SC=CACAGGAGCTTAGCCAGGGCT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=157926357;WS=157926339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	157926543	rs189914559	G	A	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=45;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CTCCGAATGCGGCTGCTGCCC;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=217;TCF=129;TCR=88;TR=114;WE=157926551;WS=157926533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,123:0.52:238
chr7	157959636	rs1130498	G	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=658;SC=CGCCTGTGCTGGAGGGGTCTT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=157959644;WS=157959626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	157959911	rs1130495	A	G	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=53;PP=2475;SC=TGGGTCCGGGACCCGGGAGGG;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=157959919;WS=157959901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	157984992	rs3800856	G	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=419;SC=AGCCAACCCCGGCCCGGGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=157985000;WS=157984982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	157985149	rs3800855	C	G	8365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=97;PP=2965;SC=GCCCTCCCGACTGTACCTCCT;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=144;TCR=97;TR=240;WE=157985157;WS=157985139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr7	158055796	.	ACACACACACTG	A	2065	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12;NR=9;PP=2065;QD=99.1904761905;SC=CACACACTGCACACACACACT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=21;WE=158055822;WS=158055786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr7	158055802	.	ACAC	A	622.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr7	158055806	.	TGCACACAC	T	617.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr7	158055814	.	C	T	1570	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14;NR=3;PP=1570;QD=94.3983066204;SC=ACTGCACACACATACACATAT;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=17;WE=158055822;WS=158055786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr7	158055850	rs77811094	TCA	T	1471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CTGCACACAGTCACACATTCA;SOR=1.493;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=29;WE=158055859;WS=158055840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr7	158325310	rs55857496	C	CAA	1569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=5;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=1898;ReadPosRankSum=0.331;SC=AAGAAAAGACCAAAAACGTCA;SOR=0.824;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=28;WE=158325324;WS=158325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr7	158325316	rs34189096	C	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.540;NF=33;NR=13;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.726;SC=AGACCAAAAACGTCACTAAAC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=46;WE=158325324;WS=158325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
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chr7	158325572	rs4909238	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CAGACCATCTTGATGGCTCAG;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=14;WE=158325580;WS=158325562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
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chr7	158456710	rs10227735	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CTACAAAGGACATATAGCAAT;SOR=0.250;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=158456718;WS=158456700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr7	158473339	rs2305470	G	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=343;ReadPosRankSum=0.013;SC=ATTGTAATTTGGACTTAGAGT;SOR=0.117;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=25;WE=158473347;WS=158473329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr7	158476148	rs6969248	G	A	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.011;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1206;ReadPosRankSum=0.326;SC=CAAGCAGTGCGGCATTTGAGT;SOR=0.442;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=73;WE=158476156;WS=158476138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,83:0.58:142
chr7	158526975	rs76883081	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;ReadPosRankSum=-0.597;SC=AGGTGGTGACGGATACAGGAC;SOR=0.732;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=29;WE=158526983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr7	158527051	rs3750052	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=546;ReadPosRankSum=-1.099;SC=CACTACCCACTGGGCGGGGAA;SOR=0.939;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=35;WE=158527059;WS=158527041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
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chr7	158528170	rs7787974	G	A	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=31;PP=1604;SC=GCAGGAACTGGTTGAGGATTC;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=77;WE=158528178;WS=158528148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	158528233	rs3816462	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=566;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GGAAGCCGCCACTGTTCTTCA;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=40;WE=158528241;WS=158528223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr7	158528254	rs34974906	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=629;ReadPosRankSum=-1.932;SC=CGGCAACGTCGAGCGTTCTCC;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=39;WE=158528262;WS=158528244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
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chr7	158528357	rs35865957	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=454;ReadPosRankSum=1.377;SC=TTTCTTATAACTAAAAATGGC;SOR=0.541;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=29;WE=158528365;WS=158528347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr7	158528443	rs3816463	T	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CCTAATGTTTTAATCTGGCAT;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=158528451;WS=158528433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	158529560	rs6961811	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=1.765;SC=TTTAGAGCTTCTACATGAAGG;SOR=0.067;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=8;WE=158529568;WS=158529552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	158529704	rs6960873	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=930;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CACTTCAACCGGGCAGTCTAT;SOR=0.684;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=64;WE=158529712;WS=158529694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,77:0.39:195
chr7	158529889	rs2305467	T	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=-0.406;SC=ACAAACCAGATAAGACGAGGT;SOR=0.573;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=24;WE=158529897;WS=158529879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr7	158531641	rs7803766	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=261;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TCCTAAAGGCGGTGTCTACAT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=15;WE=158531649;WS=158531631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr7	158531888	rs7780879	G	A	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
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chr7	158534163	rs66689505	T	TG	274.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=273;SC=CAGCGTGGGGTGGGGGGCGCT;SOR=3.258;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=158534171;WS=158534153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr7	158536267	rs2305473	T	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.08;MQRankSum=-0.825;NF=22;NR=19;PP=513;ReadPosRankSum=1.850;SC=CCCGAGTTACTGAGCTGGAAG;SOR=0.448;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=41;WE=158536275;WS=158536257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
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chr7	158536376	rs2305476	A	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=1441;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TGACCTGCAAAACACAGGGTG;SOR=1.029;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=23;WE=158536437;WS=158536366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr7	158536388	rs2305477	A	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.997;SC=CACAGGGTGGAAACACTGGCA;SOR=1.414;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=22;WE=158536437;WS=158536366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr7	158536402	rs71547563	C	G	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.049;SOR=1.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
chr7	158536408	rs71547564	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.045;SOR=1.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr7	158536411	rs71547565	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=5.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.267;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr7	158536422	rs71547566	C	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.432;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
chr7	158536429	rs61362305	A	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr7	158536465	rs66795622	T	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-1.550;SC=TCCTCAGAGATAGGAACTTAG;SOR=0.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=17;WE=158536473;WS=158536455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr7	158552072	rs34089418	CAAG	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.776;NF=7;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GAAAACACAACAAGAAGAGAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=158552082;WS=158552062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr7	158552331	rs896859	C	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=555;ReadPosRankSum=-0.880;SC=GATACTATTTCTATCTGATTG;SOR=0.543;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=45;WE=158552339;WS=158552321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr7	158552398	rs896860	C	T	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=766;SC=ATCCATGCAACAGAGACAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=158552406;WS=158552388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	158555706	rs844521	C	T	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=21;PP=1551;SC=TTAAAACATACTTTTGATTAT;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=158555714;WS=158555696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	158560621	rs2602542	A	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=1.009;SC=TACAACCTGCATTTCAATTCT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=158560629;WS=158560611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr7	158566138	rs842447	T	C	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=55;PP=1647;SC=TTCCAATTATTGAATCAGGTG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=90;WE=158566146;WS=158566128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	158566217	rs842448	C	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=29;PP=840;SC=CTTCATCCTTCGTAATATACC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=158566225;WS=158566207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	158586138	rs2602552	T	C	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=192;SC=TTATTTAACATATTTTATGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=158586146;WS=158586136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	158590512	rs2788501	T	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.42;QD=26.06;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	158590547	.	G	GA	199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=16;MQ=56.76;NF=8;NR=3;PP=199;QD=18.5454545455;SC=TCCGTCTCAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=11;WE=158590555;WS=158590537;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,11:0.33:33
chr7	158590740	rs13233513	A	T	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=630;ReadPosRankSum=-0.078;SC=ATAAATTGGCAAATGAAAGGC;SOR=0.485;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=45;WE=158590748;WS=158590730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr7	158591589	rs13222407	G	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=532;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GAGGTCTTTGGGGACCAGAAG;SOR=0.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=41;WE=158591597;WS=158591579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr7	158591851	rs2709855	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=TCTCATCATACGTCCTATGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=158591859;WS=158591841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	158621637	rs4599756	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=167;ReadPosRankSum=1.993;SC=GGGTGGGTGGGGGACTACGAA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=12;WE=158621645;WS=158621628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
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chr7	158662250	rs712199	T	C	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=48;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.378;SC=ACAGAATATTTGTCCTTCCTC;SOR=0.615;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=86;WE=158662258;WS=158662240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,103:0.50:204
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chr7	158662698	rs842696	T	C	3612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.280;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.472;SC=ACTTTGGTTATGTGTGCCTCA;SOR=0.465;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=78;WE=158662706;WS=158662679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,91:0.65:141
chr7	158664074	rs145233696	TGAA	T	2343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.168;NF=6;NR=31;PP=1537;ReadPosRankSum=0.388;SC=AAAGAAAAGCTGAAGGAGAAA;SOR=0.821;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=90;TCF=26;TCR=64;TR=37;WE=158664084;WS=158664064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,63:0.43:147
chr7	158672476	rs2709859	C	G	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=79;NR=50;PP=2651;SC=ATCGAGACAACAAACACCGAG;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=158672484;WS=158672466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	158672619	rs2788478	A	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=947;ReadPosRankSum=-2.135;SC=GAGAGGCACCAAAGCAACGTG;SOR=0.915;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=57;WE=158672627;WS=158672598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr7	158694530	rs842703	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.543;SC=GTTAAAACTTTCCTTAGCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=18;WE=158694538;WS=158694520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr7	158715219	rs2730238	A	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=733;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GGCCACAGAAAGTTCTGATAT;SOR=0.175;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=40;WE=158715227;WS=158715209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr7	158718793	rs2527188	A	G	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=1041;SC=ACCCAGAAGCACCTCGTGTTT;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=158718813;WS=158718783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	158718805	rs2527189	T	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=465;ReadPosRankSum=1.804;SC=CTCGTGTTTGTCCCTGTGTGA;SOR=1.283;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=24;WE=158718813;WS=158718783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr7	158719084	rs2244789	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.102;SC=TTGTTTCTGTCTTCATCAGAA;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=13;WE=158719092;WS=158719074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr7	158723014	rs2730241	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GGATGCTGTGTATTGATTTGC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=158723022;WS=158723004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	158726798	rs34181207	T	TC	553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=322;ReadPosRankSum=2.059;SC=CATCTGTTCATTTTGTTACTT;SOR=0.502;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=12;WE=158726806;WS=158726788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr7	158727015	rs35962377	C	CT	749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=862;ReadPosRankSum=0.805;SC=TTACTCTTTTCTTTATAAAGT;SOR=0.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=23;WE=158727023;WS=158727005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr7	158727276	rs2657331	T	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=542;ReadPosRankSum=0.110;SC=CCAATTCTTCTTTTTTTGTTT;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=28;WE=158727284;WS=158727266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr7	158727303	rs2657332	G	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=0.099;SC=ACAGGGTCTTGCTCTGTCACC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=158727311;WS=158727293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	158738611	rs2527201	G	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACATGAATATGTCTTTGGTAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=158738619;WS=158738601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	158827401	rs1017033	A	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=685;SC=ACAGGTACAGAAGAATGAGCG;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=158827409;WS=158827391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	158829285	rs2730223	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=173;SC=ATGTGTTGTTTGTAGGAGCCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=158829293;WS=158829275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	158835631	rs2540353	A	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=15;PP=1232;SC=CCCTGACAGGAACCCTGCACC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=158835639;WS=158835621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr8	182949	rs3008280	C	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=970;SC=AATCGCCTCCCACTAGCGGTG;SOR=1.656;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=51;WE=182957;WS=182939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	194884	rs2906331	C	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=340;SC=GACAGGACAACTGTACAAACT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=194892;WS=194874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr8	280241	rs7388619	A	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=20;PP=1522;SC=ACAGCACACCACTCGCACACT;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=280249;WS=280231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	280391	rs4976858	T	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=818;ReadPosRankSum=0.398;SC=AAGATTATGTTCACATACGTG;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=47;WE=280399;WS=280381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr8	281022	rs11997640	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-0.577;SC=CAATCACTGCATTGCAGGAGA;SOR=1.013;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=17;WE=281030;WS=281012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
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chr8	400168	rs2290073	C	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TTATCTTTACCCAGTACACAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=400176;WS=400158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr8	413193	rs3735924	T	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=799;ReadPosRankSum=0.078;SC=GATTAAATTTTGGTGAAACAA;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=58;WE=413201;WS=413183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr8	413288	rs3735923	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TATTTTACCAAATATTGGGGT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=413296;WS=413278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr8	417533	rs874074	A	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=0.488;SC=TCTGATGAGAACTTGTTTGCT;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=417541;WS=417523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr8	417836	rs17745485	G	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=657;ReadPosRankSum=1.058;SC=GCCACTGCCCGGCTCGATTCC;SOR=0.368;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=42;WE=417844;WS=417826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr8	441457	rs1064416	C	T	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=796;SC=GCTCTCAAACCGGTCGTCGAT;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=441465;WS=441447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	442389	rs3779745	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=120;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CACTTGCCACGCAGCCCCCCT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=11;WE=442397;WS=442379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr8	442755	rs17813338	T	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=603;ReadPosRankSum=0.664;SC=CTATAGGAGATGAAAGAGTTA;SOR=0.849;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=50;WE=442763;WS=442745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr8	494658	rs71202629	GGGCGGC	G	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=298;ReadPosRankSum=1.470;SC=ACCTGCGCCTGGGCGGCGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=6;WE=494671;WS=494648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr8	494804	rs10105131	C	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=11;PP=393;SC=CGGGCTGTGGCTCCGCGTCCC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=494812;WS=494794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	565219	rs76308159	C	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=837;ReadPosRankSum=0.008;SC=AGCACCACAGCTGGTTAAGGC;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=52;WE=565240;WS=565209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr8	565232	rs1669694	C	G	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=64;PP=2962;SC=GTTAAGGCAGCCCCTCTCTCT;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=127;WE=565240;WS=565209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	566417	rs13276545	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=2;PP=230;SC=TGAGGCTGACCGAACCCCGCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=566440;WS=566407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr8	566432	rs13276566	C	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.17;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	608018	rs6993769	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=627;ReadPosRankSum=-1.876;SC=GGGCCCCACCCGATCCCCACG;SOR=0.748;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=42;WE=608026;WS=608008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr8	608034	rs10090260	T	C	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=44;PP=1711;SC=CCACGGACCATGTTTGAGAGA;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=93;WE=608042;WS=608024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	608279	rs1703925	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=280;SC=CTGGGGAGAGAGGCTGGTTCC;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=608287;WS=608269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	609833	.	C	G	374	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MMLQ=27;MQ=41.86;NF=17;NR=2;PP=374;QD=21.5142743446;SC=TGTGCACTGACCATCCTGGGG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=19;WE=609841;WS=609823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr8	609867	.	A	G	1803	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=56.7;NF=51;NR=21;PP=1803;QD=25.5246001743;SC=CGAGATCTCCAGTGTGCACTG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=609888;WS=609857;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	609879	.	AT	CC,GC	878	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=58.16;NF=27,32;NR=9,17;PP=631,878;QD=19.012996524;SC=TGTGCACTGAATATCCTGGGG;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=36,49;WE=609888;WS=609857;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:90
chr8	618728	rs2271263	A	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=51;PP=1528;SC=TGTGTGACGCAAGGCGGTCCA;SOR=2.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=60;WE=618736;WS=618718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	623156	rs6559065	G	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=351;SC=ACTTATATTAGTTGCCTTACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=623164;WS=623146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	623245	rs55680904	T	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=653;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AATAAACTTTTAAGTGGATGT;SOR=1.064;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=35;WE=623253;WS=623235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr8	623593	rs55783038	G	A	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1706;ReadPosRankSum=1.438;SC=CTTCCTCACTGGCGTCCGCAC;SOR=0.696;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=227;TCF=116;TCR=111;TR=108;WE=623601;WS=623583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,133:0.46:288
chr8	642357	rs1703896	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=648;SC=TATACAGTGTAACAACATGCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=642365;WS=642347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	642770	rs732195	A	G	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=215;SC=ACTGATTTTAATATGTCAAGT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=642778;WS=642760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	947863	rs34575802	CACAA	C	2217.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	948083	.	ACC	A	2218.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=1866;ReadPosRankSum=-0.225;SC=ATGTGCACACACCCGTGTCTG;SOR=0.726;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=23;TCR=63;TR=44;WE=948093;WS=948073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr8	948085	rs10093097	C	A	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=1639;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GTGCACACACCCGTGTCTGCA;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=61;WE=948093;WS=948073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr8	1496767	rs2906568	C	G	3273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=941;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TCCGGGTGTTCAATGCCGTTT;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=171;TCF=108;TCR=63;TR=70;WE=1496775;WS=1496757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,92:0.43:212
chr8	1496788	rs2906569	A	G	3421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1060;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTGTTTCCCCACAGACCCGCA;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=71;WE=1496796;WS=1496778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,100:0.43:234
chr8	1514009	rs2301963	C	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GCAATCCTACCAGAGCCGCTG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=17;WE=1514017;WS=1513999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr8	1728292	rs12546965	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.905;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GGGGAGGAAATTCTTTTGCTT;SOR=1.844;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=14;WE=1728300;WS=1728282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr8	1749388	rs7017381	C	T	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=39;PP=1614;SC=CACTCAGAAGCGGACTCCCTG;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=1749396;WS=1749378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	1749410	rs7003112	T	A	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=42;PP=1691;SC=CCTGCTAAACTACCCTTGAAA;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=1749418;WS=1749400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr8	1765425	rs61388742	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=539;ReadPosRankSum=-2.202;SC=CCTGCCCGGCTCCTCGGGAAC;SOR=0.962;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=32;WE=1765433;WS=1765415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
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chr8	1817640	rs111801715	C	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TTACTTATCCCAAGCAAACAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=1817648;WS=1817630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr8	1828124	rs187828490	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=419;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GTGCCACTGCAGACGCTGCCA;SOR=0.449;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=27;WE=1828132;WS=1828114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
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chr8	1830956	rs34599746	TG	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.623;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GACACGGGGTTGGGGGGGGCG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=1830964;WS=1830946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr8	1846562	rs755543	C	T	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=19;PP=1854;SC=GGCATGGCAGCCCTGCAGGGA;SOR=2.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=86;WE=1846570;WS=1846552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr8	1857548	rs2294038	T	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=884;ReadPosRankSum=-1.004;SC=CCATCGAGTATGGCAGCAGCG;SOR=0.982;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=72;WE=1857556;WS=1857538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr8	1857649	rs2294041	T	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=306;ReadPosRankSum=0.926;SC=AAGTGATGCTTTCTCTCACGT;SOR=0.826;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=20;WE=1857657;WS=1857639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr8	1871896	rs2272614	G	C	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TCACAGGATGGAGCACGTTTT;SOR=0.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=85;WS=1871886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,112:0.50:225
chr8	1900855	rs7832438	A	G	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1248;SC=GAAGCCACTCATGTCTTTCCG;SOR=1.810;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=70;WE=1900863;WS=1900845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	1901110	rs74808197	G	C	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=32;PP=933;SC=ATTATCTGTGGTTTTTCAGTG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=1901118;WS=1901100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	1901177	rs80299596	A	G	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=131;SC=ATATTTTTCCATTTTTTACCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=1901185;WS=1901167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	1905132	rs3735876	G	A	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1598;ReadPosRankSum=-1.069;SC=TGGGAGATTCGCTGGGATCGA;SOR=0.929;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=105;WE=1905140;WS=1905122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,130:0.50:260
chr8	1949720	.	AGGAGCCCGG	A	1648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.490;NF=3;NR=21;PP=2973;ReadPosRankSum=0.181;SC=GCGTCCCCCGAGGAGCCCGGG;SOR=0.617;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=24;WE=1949736;WS=1949710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr8	1949745	.	AC	A	1064	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=70;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=5;NR=18;PP=1064;QD=47.6086956522;SC=CCGCGCCCGTACCCCCGGGGT;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=23;WE=1949753;WS=1949735;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr8	2005414	rs7833424	C	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=213;SC=TCGGGGGCCACGTGGTTTTCT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=2005422;WS=2005404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	2005591	rs138240288	C	G	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1293;ReadPosRankSum=2.426;SC=GACAAATACGCCATTCAGCAG;SOR=0.732;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=192;TCF=125;TCR=67;TR=83;WE=2005599;WS=2005581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,90:0.39:228
chr8	2005675	rs3765207	CA	TG	4170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=2944;ReadPosRankSum=0.301;SC=GCATGGTGCTCAAGGGGCCGA;SOR=0.670;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=247;TCF=129;TCR=118;TR=94;WE=2005684;WS=2005665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,113:0.39:289
chr8	2006054	rs3779862	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTGAACGTTCACTTTAACTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=2006062;WS=2006044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr8	2007116	rs7461903	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ACCAGTGCGAACTCTGGGCCT;SOR=1.385;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=9;WE=2007124;WS=2007111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr8	2007230	rs6558591	A	C	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.195;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=20;PP=1205;ReadPosRankSum=1.667;SC=CACACACAAAATACAACTCTG;SOR=1.070;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=184;TCF=124;TCR=60;TR=74;WE=2007238;WS=2007220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,87:0.41:210
chr8	2020377	.	G	GATGCTCTCTGCCCTTCGGCCCTGAAAGCCTCCATCGTTTC	2577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=99.14;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	2021421	rs2272720	G	T	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=49;PP=2252;SC=TCTTTCAGACGTGCTGTTGAA;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=107;WE=2021429;WS=2021411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	2024207	rs7822836	A	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=4;PP=488;SC=TGCCTTTTCTATCCCTGCCCC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=2024215;WS=2024197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	2033653	rs77385556	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=281;SC=CGTGGCCCCCCACTGTTGTGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=2033661;WS=2033643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	2040104	rs2235121	C	T	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=30;PP=1731;SC=TGAAAAGGGCCGGAAGATCTC;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=88;WE=2040112;WS=2040094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	2040337	rs6420202	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=41;PP=1014;SC=ACAAGCCCATTGGATACAACA;SOR=2.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=2040345;WS=2040327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	2040401	rs2235123	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.656;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=1.709;SC=TAGCAAGACCGTTGAGGTCCC;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=12;WE=2040423;WS=2040391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr8	2040415	rs893877	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=540;SC=AGGTCCCTGTGGCCCTGGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=2040423;WS=2040391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	2042070	rs7828132	T	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=756;SC=TGAAGCCTCTTGGTTGGCTGC;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=2042078;WS=2042060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	2044363	rs7834633	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=1156;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACATTAGATAATTTGATACAG;SOR=0.278;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=20;WE=2044385;WS=2044353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr8	2044376	rs7815778	GG	AC	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=1;HapScore=3;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=1137;ReadPosRankSum=0.376;SC=TGATACAGACGGAAAAATGGA;SOR=0.230;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=16;WE=2044385;WS=2044353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr8	2044426	rs7820357	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TTTTGGAGCTCAAAAGATCCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=2044434;WS=2044416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr8	2046526	rs7817175	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=168;ReadPosRankSum=0.738;SC=TGCAGCTCGTTGGCCACATCG;SOR=0.132;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=2046534;WS=2046516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr8	2046604	rs192651012	A	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=633;ReadPosRankSum=1.576;SC=TTATTTCACAAGCCAGTTATA;SOR=0.512;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=49;WE=2046612;WS=2046594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr8	2046880	rs2294067	G	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.485;SC=GCCTCTGTGGGTGCGACTCTG;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=2046888;WS=2046870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr8	2048640	rs3779838	C	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=548;ReadPosRankSum=1.221;SC=ATGCGCGCAGCAACAAGGTGG;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=30;WE=2048648;WS=2048630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr8	2048811	rs4876227	A	C	7264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=135;PP=2965;SC=GGATCACTGTAAATCAGACGA;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=91;TCR=135;TR=226;WE=2048819;WS=2048801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr8	2050383	rs2294070	A	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=0.718;SC=CCCTATTCACAATAAAATGTG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=12;WE=2050391;WS=2050373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr8	2054012	rs12677887	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=619;SC=AGCCGCTCACCTCATACTCTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=2054020;WS=2054002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	2054171	rs3817705	C	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1288;ReadPosRankSum=0.446;SC=GGTTTAAAATCGAAACCGTGG;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=101;TCR=74;TR=83;WE=2054179;WS=2054161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,113:0.51:222
chr8	2054195	rs3817706	C	G	2724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=36;PP=1607;ReadPosRankSum=1.301;SC=ATCAGTAAGTCAGGCCTGGAA;SOR=0.930;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=203;TCF=118;TCR=85;TR=94;WE=2054203;WS=2054185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,125:0.49:255
chr8	2054476	rs33927116	GA	G	602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=511;SC=TACTTGCTTAGAAAAAAAGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=19;WE=2054484;WS=2054466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	2056569	rs1978898	C	T	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=988;ReadPosRankSum=-0.240;SC=ACTTTTTCTTCGTTTTAGAGC;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=66;WE=2056577;WS=2056559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr8	2057090	rs2280895	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.345;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr8	2063920	rs34379172	CAT	C	5146.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=69;PP=2965;SC=AATATTTCCACATGTCCATAC;SOR=1.397;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=16;TCR=73;TR=85;WE=2063929;WS=2063910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	2064121	rs12548396	C	T	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=46;PP=1498;SC=AAAGCAAAGACGATTGGAGTA;SOR=1.218;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=2064129;WS=2064111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	2065625	rs181555622	G	A	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=534;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ATATTTATTTGTTTACTTTTT;SOR=0.630;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=33;WE=2065633;WS=2065615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr8	2071002	rs6558607	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CGTCTGAGACTGTCTATAGTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=2071010;WS=2070996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr8	2071261	rs71270475	A	AGAC	2039.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.835;NF=8;NR=30;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.224;SC=GAGTAACACAAGAAAGCAAAA;SOR=0.565;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=38;WE=2071269;WS=2071251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
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chr8	2071309	rs6998712	A	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.068;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
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chr8	2112130	rs1036689	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=400;ReadPosRankSum=-0.716;SC=CCTCCTGTGGGCTACACCATG;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=29;WE=2112138;WS=2112120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr8	2148429	rs2618847	T	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr8	2148431	rs2618846	C	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.48;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr8	2148587	rs138518302	TATGTGTGTACATATGTAC	T	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.184;NF=1;NR=8;PP=2848;ReadPosRankSum=0.743;SC=TGCAGGTGTGTATGTGTGTAC;SOR=1.847;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=9;WE=2148612;WS=2148577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr8	2148771	rs7008255	C	T	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=23;PP=1083;SC=CATGTGTTTGCGTCTGTGTGC;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=2148779;WS=2148761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	2148832	rs12547598	A	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=303;ReadPosRankSum=1.237;SC=GTGGGGGCTAAACAAAGGATG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=24;WE=2148840;WS=2148822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr8	2796277	rs585000	C	T	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1157;ReadPosRankSum=1.367;SC=CTAAGGAAAACAGAAAACAAA;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=44;TCR=73;TR=70;WE=2796285;WS=2796267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr8	2796330	.	C	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=565;ReadPosRankSum=0.725;SC=GCAGCTGGGACTGTGTGCAGG;SOR=0.734;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=32;WE=2796338;WS=2796320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr8	2799981	rs6997981	G	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=682;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AACAGATGGTGTTTCTGCAGT;SOR=0.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=46;WE=2799989;WS=2799971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr8	2800096	rs11984691	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=499;ReadPosRankSum=-1.039;SC=GTGGTAATGACTGGAAGAGTC;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=34;WE=2800104;WS=2800086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr8	2806920	rs5741961	G	GAAAGA,GAAAGAAAAGA	2620.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=5,5;NR=22,22;PP=739,608;SC=TGACACATAGGAAAGAAAAGA;SOR=0.865;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=27,27;WE=2806928;WS=2806910;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.49,0.51:61
chr8	2807066	rs72288499	ATAGT	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=100;ReadPosRankSum=-0.439;SC=TGACACATTTATAGTTAAAGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=2807077;WS=2807056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr8	2807629	.	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=250;ReadPosRankSum=-1.519;SC=AGGGGCAGCTGAGTTTTCAAG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=15;WE=2807637;WS=2807619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr8	2807783	rs35043129	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.518;SC=TGTCATTTTCGAACTTGCTTA;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=74;WE=2807791;WS=2807773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,90:0.55:164
chr8	2807958	rs150154982	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=-0.567;SC=ACGGAGATGATAATATCATCG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=2807966;WS=2807948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr8	2813083	rs4875856	G	C	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=42;PP=2481;SC=CTTTGGAAAAGTATGCCACTC;SOR=1.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=122;WE=2813091;WS=2813073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
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chr8	2815196	rs10112014	G	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=605;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CTTGTGATGGGGGTGGAAGAA;SOR=0.706;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=20;WE=2815204;WS=2815174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr8	2820895	rs35515847	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=905;ReadPosRankSum=0.516;SC=TCTGCACCGGCGGCGGCTGAG;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=54;WE=2820903;WS=2820885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,65:0.54:120
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chr8	2831968	rs11784931	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=235;ReadPosRankSum=1.535;SC=TCGTAAGCCCCTCACCTGTGC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=17;WE=2831976;WS=2831958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr8	2836102	rs615578	C	G	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1176;SC=GCAGGGGTCTCTGCACAGAAA;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=2836110;WS=2836092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr8	2857701	rs79229511	A	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=0.263;SC=TGTCATTTATAAAAGTAGTAC;SOR=0.811;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=21;WE=2857709;WS=2857691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr8	2857763	rs7842047	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CGCAACATATTGAAATCTTTA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=2857771;WS=2857753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr8	2909992	rs6558702	G	A	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=7;PP=1002;SC=ACGCTTACACGTGGGCGGCTT;SOR=2.265;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=2910000;WS=2909982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	2910020	rs6558703	A	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=22;PP=1518;SC=TTACTCCACAACCCATCTTCT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=2910028;WS=2910010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	2910223	rs6420209	C	T	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=1087;SC=TATTTTCCAGCTATTAAAACC;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=2910231;WS=2910213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	2910289	rs7004774	A	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=307;SC=TGTGAATTATATTTCTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=2910297;WS=2910279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	2954348	rs3112	C	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=435;SC=GGTCACTGCTCTACAAAGATT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=2954356;WS=2954338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	2964003	rs10503192	T	C	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=20;PP=1443;SC=AATACAATTTTCCATGTTGAA;SOR=1.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=2964011;WS=2963993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	2965107	rs59028493	G	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=71;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.697;SC=TTTAAGGATAGTTTGTTCTTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=2965115;WS=2965097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr8	2965122	rs113534820	C	CTGTTTT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=499;SC=TTCTTTGTTTCTGTTTTTGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=2965130;WS=2965112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	2965209	rs1531351	A	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=19;PP=787;SC=GTCGTGCTGAATTCATGGTAT;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=2965217;WS=2965199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	2965244	rs3824271	T	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=26;PP=1123;SC=TATTACCTATTTCGAAATCAT;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=2965252;WS=2965234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	2966072	rs3802291	G	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=550;SC=AACACTGCAGGAAACACCACA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=2966080;WS=2966062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	2966328	rs3802292	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GTGAGATTTATGGAAACTTTG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=21;WE=2966336;WS=2966318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr8	2967609	rs898510	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=1.712;SC=TTGTATATAAGTGGCATATGT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=2967617;WS=2967599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr8	2967631	rs898511	G	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr8	2967639	rs898512	G	T	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.11;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	2967883	rs77652019	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=468;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGAAAAAACAAGCGCCATACA;SOR=0.898;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=34;WE=2967891;WS=2967873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr8	2967905	rs73183532	AG	GA	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.258;HP=2;HapScore=1;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=859;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CTGATTTTAGAGAGTAGAAAG;SOR=1.189;Source=Platypus;TCF=29;TR=26;WE=2967914;WS=2967895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr8	2975905	rs2045638	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=303;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GCCCCCATGCAAAGTGATGAA;SOR=1.254;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=21;WE=2975913;WS=2975895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr8	2999929	rs2406569	A	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=766;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTTAAATACAATTTACATGTA;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=49;WE=2999937;WS=2999919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr8	3015556	rs3802295	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=0.552;SC=TAAATGTTTGAGAATATCTGC;SOR=0.743;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=16;WE=3015564;WS=3015546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr8	3038525	rs259859	T	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=637;SC=TTTCACAGTTTTAGAAAAATA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=3038533;WS=3038515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	3059365	rs5888954	TA	T	601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=539;SC=AAGAATTTGGTAAAAAAATAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=20;WE=3059373;WS=3059355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr8	3165777	rs10091831	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=71;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.842;SC=ATGCAACATGGTGCAAGCACC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=3165785;WS=3165768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr8	3224825	rs35870800	CG	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=1.339;SC=CACGGGGCGGCGGGGGCAGAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=3224837;WS=3224815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr8	3224878	rs10096279	G	A	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=-0.967;SC=AGATGACAGAGATGGAGAGGA;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=3224886;WS=3224868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr8	3226741	rs6984292	A	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=452;ReadPosRankSum=0.453;SC=CTCATTTATTAGTCTGTATGT;SOR=0.924;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=24;WE=3226749;WS=3226731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr8	3226899	rs6984477	A	T	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=740;ReadPosRankSum=-1.569;SC=AGAGCTTAAAATAATAAAGAG;SOR=0.412;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=51;WE=3226907;WS=3226889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr8	3226919	rs270096	C	T	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=56;PP=1726;SC=GAGATGATTACAGCACTAAAG;SOR=1.431;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=3226927;WS=3226909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	3226994	rs6984628	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=390;ReadPosRankSum=-0.666;SC=AGGATTAACAAATTTAATGTC;SOR=0.965;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=19;WE=3227002;WS=3226984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr8	3253768	rs3802303	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=285;ReadPosRankSum=3.203;SC=CAGTGGTGAACAGCAGGTACA;SOR=0.283;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=23;WE=3253776;WS=3253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr8	3253939	rs3802304	A	G	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr8	3253997	rs3802306	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=301;SC=AGAAACCCATGTACGTTAACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3254005;WS=3253987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	3257106	rs13269697	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-0.926;SC=GGATATGCCATAACAATACCC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=17;WE=3257114;WS=3257096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr8	3263758	rs12543118	A	G	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.70;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr8	3265845	rs11775235	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=401;SC=CAATTCATGCCTGCAAATAGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=3265853;WS=3265835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	3267263	rs13274162	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=44;ReadPosRankSum=0.605;SC=TCTAAAGGATATTCAATTGAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=3267271;WS=3267253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr8	3351264	rs9314495	G	A	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=51;PP=1607;SC=TACAAGGTACGAAACAGTGAC;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=3351272;WS=3351254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	3443799	rs5888973	GA	G,GAA	729.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.69;MQRankSum=0.652;QD=16.58;ReadPosRankSum=2.210;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,25,14:0.57,0.32:44
chr8	3443840	rs34200940	GA	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=-1.650;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
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chr8	3566052	rs76274980	T	C	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
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chr8	3807319	rs2740867	C	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=265;SC=GCCTCTAACACATGGAAAGCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=3807327;WS=3807309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	3807667	rs2627515	C	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=26;PP=769;SC=CATTTATACACCAGCTGACTT;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=3807675;WS=3807657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	3855302	rs1863475	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=317;SC=AGAGCAAGGCGAAAAAAGGAA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=3855310;WS=3855292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	4277636	rs112873242	C	CA	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=0.151;SC=ATGAATTTGTCAAAAAAAGCT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=4277644;WS=4277626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr8	4494811	rs2617007	T	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=440;SC=CTAGATTTCATAATCTGTGTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=4494819;WS=4494801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	4495107	rs2617008	G	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=626;ReadPosRankSum=0.678;SC=ACACAAAAAAGCATATTATTC;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=33;WE=4495115;WS=4495097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr8	4495167	rs73506879	T	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=10;PP=159;ReadPosRankSum=0.046;SC=CTTTAGCCAATTTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=12;WE=4495175;WS=4495157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr8	4851787	rs3860871	C	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=520;ReadPosRankSum=1.283;SC=AAAACGCACACTCGCGTCCGC;SOR=0.444;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=30;WE=4851795;WS=4851777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr8	6264130	rs2305023	G	C	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=36;PP=2114;SC=CAGTGCCCGCGCGCGCCGCCA;SOR=1.411;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=107;WE=6264138;WS=6264120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	6264378	.	A	C	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=144;QD=29.7952020912;SC=TGCCTGTCCCACCAAAACCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=6264386;WS=6264368;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	6272185	rs2440437	G	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=310;SC=TCTGTCAGATGTTGAGAAACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=6272193;WS=6272177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	6272399	rs2305022	G	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1313;ReadPosRankSum=0.363;SC=TGCTCTGGGTGGAAAAGTAAG;SOR=1.574;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=60;WE=6272407;WS=6272388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr8	6272477	rs2515415	A	G	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	6272481	rs2442545	C	G	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	6272532	rs2515417	T	A	132.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=50;SC=TTACCTCACCTAGTAATTTGA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=6272540;WS=6272522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	6272540	rs3214738	TG	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	6272543	rs55687318	A	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	6288879	rs2251956	A	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=168;SC=TTGTATTTGCAGTTGTATTTA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=6288887;WS=6288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	6296550	rs2442513	G	T	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=30;PP=1358;SC=TTAATAGTAGGCACCACAGCG;SOR=0.995;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=6296558;WS=6296540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	6299532	rs2053618	A	G	3987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.07;NF=95;NR=35;PP=2703;SC=TGCTGGCTTCATCTGCTAAGA;SOR=1.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=95;TCR=35;TR=130;WE=6299540;WS=6299522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	6302183	rs930557	G	C	4818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=60;PP=2965;SC=AGTCACCCCTGACCAAAAGCA;SOR=0.991;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=139;WE=6302191;WS=6302173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr8	6302418	rs2515569	A	G	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=75;PP=2965;SC=AGGTCGGAAGACAGGCTGCAG;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=143;WE=6302426;WS=6302408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	6312880	rs2515575	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=197;SC=GTCTTTTATTCTAAAAAATTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=6312888;WS=6312870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	6335072	rs41311412	T	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr8	6366338	rs2515416	G	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=747;SC=GTGTGTCTACGTATGAAATTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=6366346;WS=6366335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	6371303	rs17063434	A	G	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=86;PP=2965;SC=AGCGTTGCTGATTAGTCAGTT;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=165;WE=6371311;WS=6371293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr8	6377330	rs2442622	A	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=11;PP=1332;SC=TTCCTCACTCACTAAAGTGGC;SOR=2.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=6377338;WS=6377320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr8	6378585	rs2515443	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=127;SC=GATATTTCATATGAAATATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=6378593;WS=6378575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr8	6500751	rs2433149	C	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr8	6681256	rs9772979	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CTCACCCCTGAAAGGGAAGCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=6681264;WS=6681246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr8	6735300	rs2293958	T	A	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=46;PP=2243;SC=GGGAAACTCTTGCAGGTACCA;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=109;WE=6735308;WS=6735290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	6735399	rs11362	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=685;ReadPosRankSum=-0.588;SC=CAGGCAACACCCAGGATTTCA;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=45;WE=6735407;WS=6735389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
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chr8	8643725	rs2271341	T	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=2.182;SC=TCAGGCAACTTATGTCCCCAC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=8643733;WS=8643715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr8	8747537	rs399123	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=326;ReadPosRankSum=1.206;SC=TCTTACAGCATACCACAGAAG;SOR=0.866;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=26;WE=8747545;WS=8747527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
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chr8	8999187	rs330924	G	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=454;ReadPosRankSum=0.763;SC=GGCTAGAACCGTGGAAAGGGA;SOR=0.905;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=32;WE=8999195;WS=8999177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
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chr8	9537635	rs12114182	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=AAATCTTTATGTACTTTATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=9537643;WS=9537625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	9563797	rs11343041	CT	C	347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=3;PP=83;SC=GCATCATTTACTTTTTTTTTT;SOR=1.244;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=6;WE=9563818;WS=9563787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	9564437	rs7006985	A	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=752;ReadPosRankSum=-2.061;SC=CTGATCCTACATTAGTCAACT;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=50;WE=9564445;WS=9564427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr8	9564600	rs12542457	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr8	9577804	rs5025210	C	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=4;PP=387;SC=ATTTTTTTTTCATAAGAATGT;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=9577812;WS=9577784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr8	10102863	rs4841293	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=1.176;SC=TATTATTTGTATATATATACT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=10102871;WS=10102853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr8	10210990	rs111889058	ACCGGAGGC	A	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=774;ReadPosRankSum=0.133;SC=TGTATTTGGTACCGGAGGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=5;WE=10211005;WS=10210980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr8	10285825	rs10903326	T	G	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=67;PP=2336;SC=AAAAATAATTTCTCCCCACAT;SOR=1.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=106;WE=10285833;WS=10285815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr8	10467207	rs4840498	C	A	5680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.556;SC=AGCCACTCTGCCTCTCGCTGG;SOR=0.349;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=92;TCR=82;TR=173;WE=10467215;WS=10467197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr8	10467576	rs4840499	T	C	5353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.568;NF=64;NR=75;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CTTCTCCTTCTGTTTCTTTAG;SOR=0.934;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=347;TCF=169;TCR=178;TR=139;WE=10467588;WS=10467566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,164:0.45:366
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chr8	10467629	rs146656804	T	TTTC	1352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-2.103;QD=4.57;ReadPosRankSum=-3.846;SOR=2.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,44:0.15:296
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chr8	10468172	rs4840502	G	A	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=50;PP=2153;ReadPosRankSum=0.221;SC=TCCTGGTACCGAGGGGAGTCT;SOR=0.932;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=241;TCF=137;TCR=104;TR=125;WE=10468180;WS=10468162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,140:0.53:266
chr8	10469233	rs35602868	A	G	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=780;ReadPosRankSum=1.478;SC=CTCTTCCCCCAGGCTGGCAGC;SOR=0.905;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=55;WE=10469241;WS=10469223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr8	10469817	rs6996950	G	A	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1537;ReadPosRankSum=0.271;SC=CCTGCTCGGTGCCCTGTCCTT;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=93;TCR=77;TR=99;WE=10469825;WS=10469807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,108:0.57:191
chr8	10470068	rs74990397	C	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=683;ReadPosRankSum=1.202;SC=TGCTCTGGGCCGCCCAGCCCT;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=46;WE=10470076;WS=10470058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,53:0.36:149
chr8	10470915	rs11773913	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=456;ReadPosRankSum=1.214;SC=TGGGGGCAGCATCAGGATAAA;SOR=1.139;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=36;WE=10470923;WS=10470905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr8	10470941	rs4840503	C	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1468;SC=AAAACAGTCACGAGCCTCCCA;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=10470949;WS=10470931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	10474042	rs4388421	T	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=-1.946;SC=GAAGGCCTCATGCCCGGCACA;SOR=0.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=37;WE=10474050;WS=10474032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,45:0.37:123
chr8	10530037	rs11250057	G	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=259;SC=CAGGCCCAGCGCATCGCAGGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=10530045;WS=10530035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	10530218	rs11250058	C	T	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=40;PP=1729;SC=AGTCTTCCAACTTCAGGTGAA;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=91;WE=10530226;WS=10530208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	10532355	rs4841419	T	C	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=55;PP=1689;SC=AAAGGTATGGTGTGTCCAGGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=83;WE=10532363;WS=10532345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr8	10689142	rs7004998	G	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=714;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AAACATATTTGCATTGAGAAC;SOR=0.630;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=50;WE=10689150;WS=10689132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr8	10690244	rs2292371	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CTCTGAGTTATAGTGCCATGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=10690252;WS=10690235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr8	10690319	rs2292370	G	A	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=740;ReadPosRankSum=0.898;SC=ATGGTCAGAAGCAGATGAACC;SOR=0.530;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=51;WE=10690327;WS=10690309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr8	10690543	rs3062483	CAGA	C	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=671;ReadPosRankSum=0.419;SC=CACTGATACTCAGAAGCAGAG;SOR=0.404;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=17;WE=10690553;WS=10690533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr8	10691277	.	A	C	397	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21;NR=6;PP=397;QD=15.9915263906;SC=AGGCTGGAGAAAAACGACGAC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=27;WE=10691285;WS=10691267;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr8	10691318	.	T	C	920	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=35;NR=22;PP=920;QD=16.75037215;SC=GGCGGAGGAATCAAGCATGAC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=57;WE=10691326;WS=10691305;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:92,57:0.38:149
chr8	10691334	.	G	C	2179	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=39;NR=33;PP=2179;QD=30.7468223965;SC=ATGACTGTCAGGTTTCTGGCT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=72;WE=10691356;WS=10691324;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:98,72:0.42:170
chr8	10691348	.	G	T	2179	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=41;NR=32;PP=2179;QD=30.3256330486;SC=TCTGGCTTGTGTAAGTGGCAG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=73;WE=10691356;WS=10691324;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:104,73:0.41:177
chr8	10691410	.	G	A	1047	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=25;NR=44;PP=1047;QD=15.6778436601;SC=ATATTTGGGGGAATCAAGAGT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=69;WE=10691418;WS=10691400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:74,69:0.48:143
chr8	10691489	rs11996727	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=-0.932;SC=ATTGAATTTACAAATCTAGAG;SOR=0.377;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=15;WE=10691497;WS=10691479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr8	10692158	rs2271355	C	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=824;ReadPosRankSum=0.859;SC=GATTTTTTTCCGCTTTTCTCC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=62;WE=10692166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr8	10692359	rs1549796	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=865;ReadPosRankSum=0.253;SC=TACACATGCACAACTTTGTGT;SOR=0.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=54;TCR=82;TR=56;WE=10692367;WS=10692349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr8	10782442	rs4841459	A	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCATCCCCCCAACTCCCTATG;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=11;WE=10782450;WS=10782432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr8	10920326	rs6601555	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=612;ReadPosRankSum=-1.435;SC=CCAGCCTCCTCGGCAATCAGC;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=37;WE=10920334;WS=10920316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr8	10981586	rs17152884	C	T	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=740;ReadPosRankSum=1.691;SC=CTCTCTAGCACGATTTCCTAC;SOR=0.972;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=45;WE=10981594;WS=10981576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr8	10986486	rs73547414	A	G	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=40;PP=925;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AAGAATTAAGATTTTTGGTTT;SOR=1.251;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=45;WE=10986494;WS=10986476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
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chr8	11105077	rs2572431	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-0.874;SC=TCTCTGCAGACATGATGGCAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=11105085;WS=11105067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr8	11162496	rs2164272	A	C	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=47;PP=1190;ReadPosRankSum=0.676;SC=TCCCAGTACTAAGCTATTACC;SOR=1.353;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=120;TCF=33;TCR=87;TR=60;WE=11162516;WS=11162486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr8	11162602	rs2256016	C	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr8	11162609	rs2060465	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr8	11164012	rs17797443	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.626;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.987;SC=TCAAATTAACTTCTGCATTAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=11164020;WS=11164002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr8	11167233	rs7009857	G	A	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=621;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GCGAAACATGGCGCTGCTAAC;SOR=0.475;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=36;WE=11167241;WS=11167223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr8	11174484	rs11784572	G	C	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=59;PP=1827;SC=CCTAGGAGACGACGATTTGGA;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=84;WE=11174492;WS=11174474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	11177410	rs2293855	G	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=459;ReadPosRankSum=0.884;SC=GCCTGTGAGTGTGTGCTGTTG;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=36;WE=11177418;WS=11177400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr8	11177447	rs2293856	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=314;ReadPosRankSum=-0.268;SC=GTGAGCTGGACGTGGCCCTCA;SOR=0.418;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=23;WE=11177455;WS=11177437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr8	11204165	rs2572387	C	T	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=39;PP=1395;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CAAAACGAGACAGATTTCACA;SOR=0.918;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=109;TCR=83;TR=94;WE=11204173;WS=11204155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,114:0.47:241
chr8	11204184	rs11784458	G	A	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1652;ReadPosRankSum=-1.062;SC=CAAAATCACAGATTGTTAATG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=208;TCF=109;TCR=99;TR=107;WE=11204192;WS=11204174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,131:0.50:262
chr8	11204755	rs11777746	T	C	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=36;PP=1823;ReadPosRankSum=0.348;SC=CTCAAGGTCTTCCAACACCCG;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=146;TCR=79;TR=104;WE=11204763;WS=11204745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,120:0.47:258
chr8	11301753	rs3021513	A	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=31;PP=1136;SC=AGGGCCAGGTATGCTCCTCCA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=11301761;WS=11301743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	11400628	rs12386974	C	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CACTTCCACCCCACCTTTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=11;WE=11400636;WS=11400618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr8	11400680	rs2245250	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=497;ReadPosRankSum=0.498;SC=TCTGTGCAGAGGATCTGAGGC;SOR=0.321;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=32;WE=11400688;WS=11400670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr8	11400944	rs2245232	G	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=879;ReadPosRankSum=1.212;SC=TATAGCAAAAGTGCCTTCCTG;SOR=0.685;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=51;WE=11400952;WS=11400934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr8	11403769	rs2244931	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=1.528;SC=CCTCTTGGGGCGTCTCTTCAG;SOR=0.339;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=12;WE=11403777;WS=11403759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr8	11405437	rs6994605	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=7;PP=877;SC=CATTTCCATCGTGGGCAAGCA;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=11405445;WS=11405427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr8	11407690	rs73663163	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=542;ReadPosRankSum=-0.258;SC=ATCACAGGGTCGGAAGGAGGC;SOR=1.119;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=37;WE=11407698;WS=11407680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
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chr8	11416428	rs6988443	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=630;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TACCCAGTAGCGCCGCTGCAG;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=46;WE=11416436;WS=11416418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr8	11416635	rs11785333	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.553;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
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chr8	11418385	rs2898289	G	A	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=618;ReadPosRankSum=0.015;SC=CTTCCCGAGGGCCTCCAGCTC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=46;WE=11418393;WS=11418375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr8	11418773	rs4841561	C	T	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=970;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGCGTGGAGGCCCCCAGGCTG;SOR=0.559;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=63;WE=11418781;WS=11418763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,68:0.43:160
chr8	11421321	rs13248757	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=147;ReadPosRankSum=2.393;SC=GTCCCTTGCCTGGGCCCACTG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=11421329;WS=11421311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr8	11421358	rs10097005	C	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=288;ReadPosRankSum=0.911;SC=CAGGGCCCCCCACCCACCGAG;SOR=0.370;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=21;WE=11421366;WS=11421348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr8	11421384	rs10097015	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=407;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CAGCCCCTCACCCCCGCTTGC;SOR=0.560;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=31;WE=11421392;WS=11421374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr8	11421793	rs1042689	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=603;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TCACCGACTGCACCCCCGGGC;SOR=0.315;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=33;WE=11421801;WS=11421783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr8	11422045	rs1042701	G	A	3426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.890;NF=73;NR=64;PP=2141;ReadPosRankSum=1.463;SC=AGCAGGGGCAGCCCCAGCCTA;SOR=0.481;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=252;TCF=142;TCR=110;TR=137;WE=11422053;WS=11422035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,159:0.56:283
chr8	11422130	rs7843987	T	C	3130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=72;PP=1682;ReadPosRankSum=-1.172;SC=TCGTTACCTGTGACAAGCTGG;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=132;TCR=151;TR=137;WE=11422138;WS=11422120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,154:0.48:323
chr8	11422170	rs7840433	A	G	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=63;PP=1463;ReadPosRankSum=0.831;SC=CACGGGGCGCAGGCGTGGCGC;SOR=0.656;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=202;TCF=67;TCR=135;TR=96;WE=11422178;WS=11422160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,106:0.47:226
chr8	11606312	rs3735819	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.149;SC=TGGTCTTCTCTTTCCAAGGAA;SOR=0.657;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=10;WE=11606320;WS=11606308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr8	11612698	rs804280	C	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=446;ReadPosRankSum=1.794;SC=CTCAGAGTGCCTAAGAATCAT;SOR=1.285;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=24;WE=11612706;WS=11612688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr8	11614305	rs13250578	A	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.295;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr8	11614313	rs3729852	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.698;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr8	11614316	rs3729853	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=608;SC=GATAAGGACCTCTGCTGCTGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=11614324;WS=11614295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	11618998	rs804285	G	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=80;SC=CCCAGCTACTGGGGAAGCGGA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=11619006;WS=11618988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr8	11619635	rs2645455	T	A	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=50;PP=1400;SC=AGAAAAAATCTTCAAAGCGAA;SOR=1.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=11619643;WS=11619625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr8	11629241	rs804267	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-1.062;SC=TCAGTCTCACGTGTCTCAGCC;SOR=0.541;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=12;WE=11629249;WS=11629231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr8	11640784	rs8191642	A	G	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1038;ReadPosRankSum=0.490;SC=GCTCTTCCCCAGTGGTCACAC;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=69;WE=11640792;WS=11640774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,77:0.59:130
chr8	11643459	rs8191663	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=239;ReadPosRankSum=1.796;SC=TACCTTCCCCCGCTTTATTTC;SOR=0.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=21;WE=11643467;WS=11643449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr8	11643803	rs1534862	C	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.667;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.776;NF=7;NR=21;PP=1360;ReadPosRankSum=0.517;SC=GTGCTCCTCACGGAACCTTGC;SOR=0.269;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=28;WE=11643823;WS=11643793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr8	11643815	rs112384557	GC	G	1071.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.900;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.667;NF=2;NR=18;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.875;SC=GAACCTTGCCGCTTGGGGAAC;SOR=0.078;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=20;WE=11643823;WS=11643793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr8	11643915	rs804292	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=TATAATATTCGTCTCCCTGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=11643923;WS=11643905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr8	11660764	rs2280922	G	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=473;ReadPosRankSum=-1.166;SC=ACACATCTGAGGCAATGTGGG;SOR=0.994;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=41;WE=11660772;WS=11660754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr8	11660916	rs2252567	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=1.128;SC=CGCCTTGCTGCCTTCCATCGC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=18;WE=11660924;WS=11660906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr8	11665959	rs1032577	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=-1.133;SC=CCGTCCCGCCCCTCGTCGGGC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=4;WE=11665967;WS=11665949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	11666218	rs71711801	GTCCCAC	G	6431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=59;PP=2990;SC=GCCTGCCCCAGTCCCACTCCC;SOR=0.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=93;WE=11666231;WS=11666208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	11666451	rs1616534	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=771;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TGTCCGGGACCTTTGAGTGTG;SOR=0.674;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=41;WE=11666459;WS=11666441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr8	11667179	rs8417	C	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=671;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TTTACAGCAACGCAGTGTGCA;SOR=0.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=46;WE=11667187;WS=11667169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr8	11683653	rs904011	T	C	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=54;PP=1818;SC=GGGCCTGTTTTTGCAGAAAAC;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=11683661;WS=11683643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	11687938	rs1293313	G	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=486;SC=AGGTAGGGAAGGGGGCTCCTC;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=11687946;WS=11687928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	11687959	rs2294137	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.647;SC=TGGGTGGATACGGGGCTAAAG;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=11687967;WS=11687949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr8	11689119	rs9205	G	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=559;ReadPosRankSum=-1.825;SC=CAGTGACCCTGATGATGGATG;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=40;WE=11689127;WS=11689109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr8	11689228	rs2409836	T	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=-1.308;SC=CTTTTATGATTTAGTAATGTC;SOR=0.782;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=13;WE=11689236;WS=11689218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr8	11695872	rs10903343	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=531;ReadPosRankSum=-1.033;SC=ATAGCACTTATCATTTTTTCC;SOR=0.900;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=32;WE=11695880;WS=11695862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr8	11702594	rs709821	G	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=1.649;SC=TTTCTACCCCGATCTCGCCCC;SOR=0.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=17;WE=11702602;WS=11702584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
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chr8	11703048	rs1692811	C	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=296;ReadPosRankSum=-0.201;SC=AGGAGGAGCTCACAGCCTGGC;SOR=1.688;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=18;WE=11703056;WS=11703038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
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chr8	11705380	rs149445749	A	AAGCCCCAGCTGGGCGAGGC	3651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=2967;SC=CCCCACGGAGAAGACCTGGGG;SOR=1.788;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=28;WE=11705388;WS=11705370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	11705442	rs2294139	G	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=2;HapScore=4;MGOF=209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.453;NF=0;NR=12;PP=505;ReadPosRankSum=1.128;SC=CCTGCCAGAGGCCTGTGCACC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=12;WE=11705456;WS=11705432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr8	11705448	rs1692819	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.039;NF=1;NR=7;PP=408;ReadPosRankSum=0.652;SC=AGAGGCCTGTGCACCTGGCTA;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=11705456;WS=11705432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr8	11705677	rs2294140	C	G	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=914;ReadPosRankSum=-1.535;SC=AAGACAGCCTCTAATGAAAAC;SOR=0.963;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=58;WE=11705685;WS=11705667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr8	11705870	rs1736089	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CCCCACCCCTGCCCACAAAGA;SOR=0.428;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=23;WE=11705878;WS=11705860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr8	11706581	rs13332	T	G	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=46;PP=1794;SC=TGCCACAGCATGTGAGCAGGT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=11706589;WS=11706571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	11708355	rs2272766	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=0.759;SC=GCGCTTCCCCGCCAGCCAGCA;SOR=0.061;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=11708363;WS=11708345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr8	11710301	rs1293291	A	G	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1150;SC=AAAACCAGAGACCCTACCCAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=11710309;WS=11710291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	11710888	rs12338	G	C	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.958;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=47;PP=927;ReadPosRankSum=0.884;SC=TCATCCGACAGGGGATGGAAA;SOR=1.063;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=78;WE=11710896;WS=11710878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,97:0.48:202
chr8	11711059	rs2272767	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.486;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr8	11831661	rs35283519	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=396;ReadPosRankSum=0.699;SC=AAAGAAAAATCAATCTTAATG;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=24;WE=11831669;WS=11831651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr8	11831948	rs7461062	T	C	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=647;ReadPosRankSum=0.179;SC=GGTGGCCCATTTGATATTGGT;SOR=0.684;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=44;WE=11831956;WS=11831938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr8	11832079	rs10108075	A	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.688;SC=TCACCAGGAAAAAGAGTAATG;SOR=0.825;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=49;TCR=76;TR=63;WE=11832087;WS=11832069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr8	11851496	.	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1014;ReadPosRankSum=0.836;SC=ATGTCAGGGTGCAGGATTTCC;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=75;TCR=79;TR=70;WE=11851504;WS=11851486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr8	11853596	rs11250186	A	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=863;ReadPosRankSum=0.569;SC=GCTTTTTTCTAGCTTGAAAAT;SOR=0.456;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=135;TCF=83;TCR=52;TR=57;WE=11853604;WS=11853586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,67:0.45:149
chr8	11872723	rs11784716	A	G	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=114;SC=TGGCTCTCTGACGCCCTCTGC;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=11872731;WS=11872713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	12516857	rs1808161	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=0.524;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr8	12516977	.	TCGGGGCGGGCG	T	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=24;MQ=58.7;NF=1;NR=1;PP=108;QD=75.5;SC=GAGCTGGGCATCGGGGCGGGC;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=2;WE=12516995;WS=12516967;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr8	12517016	.	TCTCTGGCGCC	T	652	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=27;MMLQ=24;MQ=57.56;NF=0;NR=2;PP=652;QD=339.0;SC=CGCTCCTGGCTCTCTGGCGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=2;WE=12517057;WS=12517006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,2:0.18:11
chr8	12517027	rs2002368	C	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr8	12576728	rs370283283	GCA	G	1112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.245;NF=7;NR=12;PP=793;ReadPosRankSum=0.651;SC=ACATCTAATAGCACAGAGTGT;SOR=0.993;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=19;WE=12576737;WS=12576718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr8	12584659	rs10095845	C	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=5;NR=2;PP=152;SC=AGCATCTGCTCTGCACCCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=12584667;WS=12584649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr8	12592956	rs13251315	C	A	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=39;PP=1309;SC=AAACTATCCACTGAAAAGCTT;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=12592964;WS=12592946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr8	12878807	rs3739310	T	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=970;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TAAAGAGCAGTGTGGTTCAAA;SOR=1.083;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=48;WE=12878815;WS=12878797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,50:0.37:135
chr8	12878830	rs3739309	C	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GGTCCCACAGCGTGGGCTATG;SOR=1.143;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=61;WE=12878838;WS=12878820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,64:0.39:166
chr8	12879062	rs503550	T	C	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1509;ReadPosRankSum=-0.627;SC=ACACTCTAGTTTAGACTTTGA;SOR=0.940;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=89;WE=12879070;WS=12879052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,104:0.43:241
chr8	12879099	rs502882	G	A	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=1811;ReadPosRankSum=0.095;SC=TCAACAAAAGGGCAAAGTTTA;SOR=0.943;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=253;TCF=146;TCR=107;TR=104;WE=12879107;WS=12879089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,120:0.41:291
chr8	12879198	rs34995506	A	T	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=69;PP=1913;ReadPosRankSum=0.134;SC=AATGGAGACCATCAAGGGGAA;SOR=0.955;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=249;TCF=119;TCR=130;TR=124;WE=12879206;WS=12879188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,134:0.48:278
chr8	12879334	rs608909	T	C	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TTTCTGCAGTTGATTCCACAG;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=130;TCR=109;TR=99;WE=12879342;WS=12879324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,117:0.42:279
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chr8	12879600	rs498852	C	T	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=47;PP=1411;SC=CACATTCTTTCCTCTTGGTTT;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=12879608;WS=12879590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	12888908	rs7826836	T	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=875;ReadPosRankSum=-1.169;SC=GGGTCATGTCTCGGCTTCATT;SOR=0.537;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=56;WE=12888916;WS=12888898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr8	12888997	rs573652	T	C	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=40;PP=1242;SC=CTCTCTCAGCTTTCTCTGAGA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=12889005;WS=12888987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr8	12948951	rs609020	A	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=609;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CCTAGGTAGAAGAAATACAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=37;WE=12948959;WS=12948941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
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chr8	12957475	rs532841	C	T	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1436;ReadPosRankSum=-1.274;SC=TTCTGCTCCACCACGTTGTTA;SOR=0.432;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=219;TCF=98;TCR=121;TR=95;WE=12957483;WS=12957465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,117:0.45:258
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chr8	12972946	rs35858677	C	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TTGTTTTCAGCGGTGGGGGTC;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=8;WE=12972954;WS=12972936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
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chr8	13251235	rs17805176	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GTATGAAGGACATGTGAATGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=13251243;WS=13251225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr8	13258936	rs289583	T	A	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr8	13356802	rs3816747	G	A	7203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=104;PP=2965;SC=TGTGCAAGGAGTATCCAAGAA;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=110;TCR=104;TR=214;WE=13356810;WS=13356792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr8	13356818	rs11203494	TT	CG	11290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=101;PP=2947;SC=AAGAACTCATTTTGTACTACA;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=105;TCR=105;TR=204;WE=13356827;WS=13356808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr8	13357587	rs1383942	G	A	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=967;SC=ACATGTCATCGTAGTTTAACA;SOR=1.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=13357595;WS=13357577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	13424583	rs13273355	C	T	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=50;PP=2506;SC=TTGAAGAACTCTACTGATGAG;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=117;WE=13424591;WS=13424573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	13425353	rs11203497	T	A	6173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=115;PP=2965;SC=AGAGCAGAAGTTGCAGCGAGA;SOR=1.205;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=70;TCR=115;TR=185;WE=13425361;WS=13425343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr8	13947941	rs73213896	A	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=195;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TGTGAGGAGAAATCAGTCACT;SOR=1.044;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=16;WE=13947949;WS=13947931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr8	13959749	rs1973167	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-0.605;SC=ACCTAATATTACTTTCCTAAG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=13959757;WS=13959739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr8	13965569	rs117754749	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=0.768;SC=TTTTAAGTATATTGGGAGAAA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=10;WE=13965589;WS=13965559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr8	13965581	rs11336839	AT	A	1403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=12;PP=1087;SC=TGGGAGAAACATTTGTCTAGT;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=24;WE=13965589;WS=13965559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	14022296	rs6993740	A	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=1.427;SC=CTAGAAATGCATATATTATTT;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=25;WE=14022304;WS=14022286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr8	14094993	rs35279380	A	AAAC	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=1303;ReadPosRankSum=1.103;SC=CTCTGTCTCAAAACAACAACA;SOR=0.616;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=54;WE=14095001;WS=14094983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr8	14095008	rs144265627	C	CAACA	2124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.65;MQRankSum=4.284;QD=17.71;ReadPosRankSum=-1.348;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr8	14095199	rs13269000	T	C	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=47;PP=799;ReadPosRankSum=-1.892;SC=CTGGGAAACATGTATAAAATA;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=38;TCR=110;TR=63;WE=14095207;WS=14095189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,75:0.44:172
chr8	14095250	.	AT	TT	799	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0,5;NR=19,35;PP=508,799;QD=27.8421052632;SC=TTACAAAAAAATATACTGCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=19,40;WE=14095258;WS=14095240;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr8	14095250	.	AT	ATT	799	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0,5;NR=19,35;PP=508,799;QD=27.8421052632;SC=TTACAAAAAAATATACTGCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=19,40;WE=14095258;WS=14095240;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr8	14095250	rs1478030	A	T,AT	1911.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=30.34;SOR=3.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,41,22:0.65,0.35:63
chr8	15095085	rs4831331	C	G	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=37;PP=1769;SC=CGCCCGGACCCGCACGTACCT;SOR=1.198;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=98;WE=15095093;WS=15095075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	15095296	rs11782187	A	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=280;SC=GGTTAAAAATAAGGAAAATAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=15095304;WS=15095286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	15095332	rs11782191	A	G	164.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=129;SC=AATTCACTTTATTTTACTTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=15095340;WS=15095322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr8	15590866	rs2111752	T	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.52;ReadPosRankSum=2.263;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr8	16859304	.	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-3.368;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,3:0.08:39
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chr8	16859341	.	C	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-4.321;QD=2.45;ReadPosRankSum=-3.161;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,5:0.14:35
chr8	16859347	.	G	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-5.743;QD=1.16;ReadPosRankSum=-1.743;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,2:0.06:35
chr8	16859398	rs10448135	C	G	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=17;PP=898;SC=GCCCGCCGCGCGCGCTCCGCT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=16859406;WS=16859388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	17042129	rs75130109	C	CCT	1139.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.37;NF=17;NR=1;PP=975;SC=TTTCCTGCACCCTCTCCACAC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=17042137;WS=17042119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	17055248	rs3752613	C	A	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=52;PP=1510;SC=TCCTGATTATCTTCTCCATAT;SOR=3.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=61;WE=17055256;WS=17055238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	17063335	rs2904674	A	G	56.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AATAGATAATATAGGCTTTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=17063343;WS=17063325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr8	17068013	rs1548350	T	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=0.827;SC=TTTTTTCATTTTACTTTCAAA;SOR=0.234;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=28;WE=17068021;WS=17068003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr8	17074640	rs3213600	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=290;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CCTATTTGTTCAAAAGCAACC;SOR=1.003;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=18;WE=17074648;WS=17074630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr8	17092164	rs2959606	G	T	8086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=98;PP=2965;SC=GCCTAGGCTCGCATGACAGTC;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=146;TCR=98;TR=244;WE=17092172;WS=17092154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr8	17100357	rs2904701	C	T	104.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.15;QD=17.48;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr8	17129449	rs73200951	C	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.026;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=0.686;SC=GAAATCTCATCTTTCATATTT;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=17;WE=17129457;WS=17129439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr8	17133727	rs3750251	C	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=-0.799;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.567;SOR=0.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr8	17157259	rs6992513	G	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=470;SC=CTGCATTAAAGTAGTTCTCAA;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=17157267;WS=17157249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	17157677	rs3764796	T	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=919;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TGGGCTCACTTTGCTTACTCT;SOR=0.711;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=63;WE=17157685;WS=17157667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
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chr8	17163301	rs146868565	G	A	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.746;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=784;ReadPosRankSum=0.761;SC=TGTTACATAGGAAGTTTCCAA;SOR=0.335;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=124;TCF=85;TCR=39;TR=58;WE=17163309;WS=17163291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
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chr8	17270770	rs75437306	T	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
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chr8	17270837	rs72607374	G	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=0.158;SC=GGGCGGGCGCGGCCTCACGCA;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=21;WE=17270845;WS=17270827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr8	17401364	rs368416506	CCTT	C	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=1117;SC=GAAAATGTCTCCTTCTAATTA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=23;WE=17401374;WS=17401354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr8	17406183	rs737039	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=666;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CCCTTTTTCCATAGGTCTTTT;SOR=0.572;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=46;WE=17406191;WS=17406173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr8	17406367	rs11373918	GT	G	1218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.14;NF=2;NR=34;PP=639;SC=AATATTTGAGGTTTTTTTTTT;SOR=2.511;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=36;WE=17406375;WS=17406357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	17412333	rs2301539	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=417;ReadPosRankSum=0.498;SC=TTTTTTGTGAGTGTTTCCTAT;SOR=1.198;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=19;WE=17412341;WS=17412331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr8	17421279	rs2588173	T	C	5177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=101;PP=2941;SC=GAGAGAAACATGCCCTCTCCC;SOR=1.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=67;TCR=101;TR=168;WE=17421294;WS=17421269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	17478527	rs28411922	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=313;ReadPosRankSum=1.344;SC=CCAGGTCTGACTTGCTTTGAG;SOR=1.325;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=20;WE=17478535;WS=17478517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr8	17486282	rs2229084	T	C	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=50;PP=1252;SC=AGCTGCTCTATGTGGCGGGTA;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=17486290;WS=17486272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	17500223	rs4705	T	C	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=38;PP=2111;SC=TGGAAGACTTTGAGACGATTG;SOR=1.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=17500231;WS=17500213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	17503431	rs1043883	G	C	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=97;SC=ACTTTGGGGAGGTGTCATCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=17503439;WS=17503421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	17532573	rs2269698	T	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=339;SC=GCCCAGATACTAGACAGGGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=17532581;WS=17532563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	17532619	rs2269699	C	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=994;SC=CCAGCCACAACGCAGACAGGA;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=17532627;WS=17532609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	17533568	rs2301541	A	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=205;SC=TAAAAAAAAAATGAAGAATTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=17533576;WS=17533563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	17533633	rs2301542	A	G	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=8;PP=796;SC=AGCTCCCACCACATCCTGATC;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=17533641;WS=17533623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	17541999	rs2979792	T	C	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=55;PP=1518;SC=CATCGGGAGCTGTCTGTGGCT;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=91;WE=17542007;WS=17541989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	17579135	rs6982255	C	T	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=3;PP=915;SC=GTTACAAAAACAGAAGTCAAG;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=17579143;WS=17579125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	17581700	rs2904724	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.777;SC=CAAATTGATACGACCCCCCAT;SOR=0.512;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=12;WE=17581708;WS=17581690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr8	17611886	rs2979788	G	A	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=83;PP=2965;SC=TTCCTAAACTGGGTTTACACA;SOR=0.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=92;TCR=83;TR=175;WE=17611894;WS=17611876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
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chr8	17919031	rs61108931	C	T	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=988;ReadPosRankSum=-1.671;SC=AGTCAGGACCCGGAAGAGGCT;SOR=0.603;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=58;WE=17919039;WS=17919021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr8	17920567	rs7387930	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=423;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TTAGTAGAGACGGGGTTTCAC;SOR=0.143;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=22;WE=17920575;WS=17920557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr8	17920623	rs6586683	C	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=617;ReadPosRankSum=0.617;SC=GTGATCCACCCGTGTCAGCCT;SOR=0.453;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=33;WE=17920631;WS=17920613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr8	17920807	rs7824644	A	G	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.514;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.376;NF=9;NR=36;PP=2733;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TGGACAATTAATTTTGATTAA;SOR=0.353;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=45;WE=17920829;WS=17920797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr8	17920817	rs200910951	ATTAAT	A	887.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=2.636;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.420;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr8	17920820	rs7824650	A	T	713.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=-2.260;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr8	17921921	rs2073574	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=228;ReadPosRankSum=1.047;SC=GATTTTTCTTTATGTAGTGCT;SOR=0.822;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=16;WE=17921929;WS=17921911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr8	17924609	.	T	TGCACCTGTGCTGTATATCTAAGACATACA	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr8	17924612	rs138234399	ACCTGTGCTGTATATCTAAGACATACAGCAC	A	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.671;NF=17;NR=6;PP=2736;ReadPosRankSum=-0.236;SC=AGACCTGTGCACCTGTGCTGT;SOR=2.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=23;WE=17924653;WS=17924602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr8	17924645	rs115973081	G	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=6.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=-0.709;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.054;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr8	17924696	rs138677135	CT	C	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.773;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr8	17924849	rs12675283	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.269;SC=AACATAATAACAATAAAAAAT;SOR=0.122;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=17924857;WS=17924839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr8	17927184	rs2427746	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=1.836;SC=ACAGTGAGCTAGATTCATGCA;SOR=1.071;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=6;WE=17927192;WS=17927174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr8	17927248	rs4921567	A	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TAAATAAATAACAGCGCATTT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=14;WE=17927256;WS=17927238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr8	17927280	rs2106037	G	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=3;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=594;ReadPosRankSum=-0.467;SC=AACATTTATTGTGAGAAATAA;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=17;WE=17927302;WS=17927270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
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chr8	17927327	rs1049874	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=361;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ACCTGCATAATTTTTCCACTT;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=24;WE=17927335;WS=17927317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr8	17928811	rs1071645	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.948;NF=24;NR=4;PP=411;ReadPosRankSum=0.167;SC=TAGCATACCACTGGTGCCTTG;SOR=0.714;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=28;WE=17928819;WS=17928801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
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chr8	18656888	rs3214999	AG	A	1879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.017;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.780;NF=5;NR=33;PP=1576;ReadPosRankSum=2.565;SC=AAGAAAAAAAAGCATGAATTC;SOR=0.298;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=38;WE=18656896;WS=18656878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,56:0.64:88
chr8	18658750	rs1386692	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTGATATAAAAAAGAAATTCA;SOR=0.340;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=18658758;WS=18658740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
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chr8	18658950	rs11774165	T	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.362;SC=TCACACTCTTTCATAGTTAAA;SOR=1.721;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=18658958;WS=18658940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr8	18659019	rs1386690	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=81;SC=ATGAAGTTATCTCCCCCCAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=18659027;WS=18659009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	18659765	rs2638646	A	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=12;PP=810;SC=TAGGAAGTGTATCAAAAACCA;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=18659773;WS=18659755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	18659780	rs2632848	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.361;NF=13;NR=5;PP=313;ReadPosRankSum=-1.322;SC=AAACCACACATTAATCTACTC;SOR=1.299;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=18;WE=18659788;WS=18659770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr8	18659882	rs3837206	GA	G	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.055;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr8	18659928	rs2632847	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=857;SC=ACTATGGTAAAAAACATACCA;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=18659936;WS=18659918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr8	18661932	rs60951997	TAA	T,TA	568.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11,11;NR=6,6;PP=196,93;ReadPosRankSum=2.211;SC=CATGGAGGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=17,17;WE=18661941;WS=18661922;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.90:20
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chr8	18793697	rs10092681	T	A	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=53;PP=1635;SC=AATACATCATTAAAAAACACA;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=18793705;WS=18793687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	18941575	rs9657494	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=367;ReadPosRankSum=-0.985;SC=GGAAGGCTGCGGCTCGTGGGT;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=17;WE=18941583;WS=18941572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr8	19230955	.	GTA	G	151	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=151;QD=39.25;SC=ATGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=19230964;WS=19230945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr8	19277817	rs6999786	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=1040;SC=GAGGGCTGGGGGCCACCTGAG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=19277825;WS=19277807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	19297583	rs13278459	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=764;SC=GGGAATCCAGAACCTTTCTGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=19297591;WS=19297573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	19315034	rs10888163	G	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=TGAGGCAGGAGAATTACCTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=19315042;WS=19315024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	19316086	rs12155539	G	A	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1419;ReadPosRankSum=0.832;SC=GTTTGAATTCGTGTTTGTGGT;SOR=0.685;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=91;TCR=109;TR=95;WE=19316094;WS=19316076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,107:0.46:232
chr8	19362768	rs7017776	C	T	4882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=44;PP=2965;SC=CTCTGCAGGACTGTTCAGGGT;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=103;TCR=44;TR=147;WE=19362776;WS=19362758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	19363425	rs6984644	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=0.751;SC=CTGGGCTAGACCACAGGAAGC;SOR=1.811;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=19;WE=19363433;WS=19363415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr8	19456473	rs4244454	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=581;ReadPosRankSum=0.887;SC=CAGGAACACACTACCATTGAG;SOR=0.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=40;WE=19456481;WS=19456463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,45:0.41:110
chr8	19674954	.	T	TGGCGGC	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=306;ReadPosRankSum=0.968;SC=TCCCCCGCGGTGGCGGCGGCG;SOR=1.112;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=19674962;WS=19674950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr8	19680722	rs73204749	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=-1.393;SC=TTAGATACTACATCAAATGAA;SOR=0.399;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=19680744;WS=19680712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr8	19680736	rs12547934	T	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=540;SC=AAATGAACTCTGAAAGCTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=19680744;WS=19680712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	19680979	rs4464983	C	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=395;SC=TGTACTTTTACTTAAATAGGC;SOR=2.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=19680987;WS=19680969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr8	19681647	rs2410612	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-1.307;SC=GTAATGCGTAGGTATAGTTTT;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=19681655;WS=19681637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
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chr8	19682592	rs7018076	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=29;PP=827;SC=ACTGTGGGGCAGTACCAGTCC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=19682600;WS=19682582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	19683832	rs111442910	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=286;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGCTCAGGCAATCCTCCTGCC;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=18;WE=19683840;WS=19683822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr8	19689633	rs4434638	T	C	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=30;PP=1423;SC=TAGAGTATTATACATATTTTA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=19689641;WS=19689623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr8	19699191	rs34564004	G	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=302;ReadPosRankSum=0.249;SC=CGTGCTTCTGGAAGGTGTATA;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=20;WE=19699199;WS=19699181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
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chr8	20036018	.	G	GAA	102	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=33;MMLQ=16;MQ=59.34;NF=1;NR=8;PP=102;QD=12.3333333333;SC=AAAGGGAATTGAAAAAAAAAA;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=9;WE=20036026;WS=20036008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,9:0.36:25
chr8	20036043	rs1908809	C	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.88;NF=6;NR=19;PP=572;SC=ACAATTCCAACAGGCACTCAC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=20036051;WS=20036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	20036095	rs2279708	G	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=300;SC=GAGCAGAAATGCAGCTATTTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=20036103;WS=20036085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	20036521	rs1390937	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=381;SC=GACTCCCCTGAGGAATCATAC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=20036529;WS=20036511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	20036713	rs1390938	A	G	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=46;PP=2145;SC=GACCCGGGTAATCTCTTCCTC;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=20036721;WS=20036703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	20036827	rs2270637	C	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=542;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGCTATTCCACTAGGTACGCT;SOR=0.360;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=38;WE=20036835;WS=20036817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr8	20037017	rs2270638	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=135;ReadPosRankSum=-1.100;SC=AGAGGACAGGTGATGGGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=20037025;WS=20037007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr8	20038466	rs2270641	T	G	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=947;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TCCAGAATGGTCCGGAGCATG;SOR=0.342;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=53;WE=20038474;WS=20038456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr8	20061477	rs17092154	A	C	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=1197;ReadPosRankSum=2.374;SC=CAGGCTATACAATTTCTCCAA;SOR=0.578;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=162;TCF=68;TCR=94;TR=75;WE=20061485;WS=20061467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,86:0.46:186
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chr8	20068619	rs9325865	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=438;ReadPosRankSum=1.474;SC=TTAATTTGATATGATATCTAA;SOR=1.066;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=24;WE=20068627;WS=20068609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr8	20069273	rs142952762	A	AAGTT	1710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.602;NF=0;NR=25;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GTGTAAGTAGAATTTTTGTTT;SOR=0.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=25;WE=20069281;WS=20069263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr8	20107143	rs904003	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=445;SC=GCGTCTCTCAAAGGGGTCTGA;SOR=2.419;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=19;WE=20107151;WS=20107133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr8	21550768	rs15881	A	C	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.275;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=26;PP=2339;ReadPosRankSum=0.105;SC=TTTCAAAAATATTCTGACTCG;SOR=2.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=77;TCR=27;TR=102;WE=21550776;WS=21550758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr8	21550800	rs1128397	A	T	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=60;PP=2965;SC=CTACAAGGCCAGTTTCAGCAT;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=150;WE=21550808;WS=21550790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	21562681	rs113957442	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=0.580;SC=GGTACGGTGGGGCCTTCCCCT;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=15;WE=21562689;WS=21562671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr8	21824547	rs4872191	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-0.460;SC=AAAGGATAACAGGCGCTTCGG;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=15;WE=21824555;WS=21824537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
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chr8	21842023	rs1872220	TT	GA	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=596;SC=TCTTCCTTGGTTAAAAGTAAT;SOR=2.948;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=21842032;WS=21842013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	21842063	rs13248727	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=1.327;SC=CAGTCAGAAATGGTGGCTAAG;SOR=0.560;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=13;WE=21842071;WS=21842053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr8	21845428	rs2306645	T	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=672;ReadPosRankSum=2.148;SC=AACTGTAAAATGTGATCTTGG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=51;WE=21845436;WS=21845418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr8	21846586	rs2306646	G	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=806;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TCAATGACCTGTCCATTGGAT;SOR=0.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=56;WE=21846594;WS=21846576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,68:0.41:166
chr8	21857267	rs17616085	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=286;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TCTTGCCCCAGTGTCCAAAAA;SOR=0.252;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=22;WE=21857275;WS=21857257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr8	21861663	rs10866837	G	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=0.552;SC=GCAATGCAATGCAATAGAAAA;SOR=0.090;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=21861671;WS=21861653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr8	21862551	rs1058486	A	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=704;ReadPosRankSum=-1.724;SC=TCAACGACTCAATGAAGAATT;SOR=1.427;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=43;WE=21862559;WS=21862541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr8	21890581	rs1947985	T	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=885;SC=TGCCTGAGGCTAGTCCCCGAG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=21890589;WS=21890571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	21891939	rs10089142	G	A	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=24;PP=1514;SC=GGAGCTCAGCGGGGACCTTGT;SOR=1.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=21891947;WS=21891929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	21891968	rs4871915	C	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=34;PP=1633;SC=GGAATCTGTTCTGGCTCTGGA;SOR=1.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=21891976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	21895146	rs11992609	A	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=43;PP=1281;SC=CACACAGATGAGCCCTACACT;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=21895154;WS=21895136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr8	21904212	rs1078363	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=39;PP=922;SC=TAGGGCATCATGCTCCCCTCT;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=21904220;WS=21904202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	21924297	rs9657287	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=8;PP=244;SC=AAGCGCGCAGCGCCCAGCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=21924305;WS=21924287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	21924743	rs11135821	G	A	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=43;PP=1322;SC=GGCTGCTAGCGTGCCTTCCCG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=21924751;WS=21924733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	21924778	rs11135822	T	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=28;PP=929;SC=TGGTGGTCCCTCCGGTGCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=21924786;WS=21924768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	21924944	rs11135823	A	G	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=35;PP=2252;SC=ATGGCGGTCCATTTTCTTGGT;SOR=1.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=119;WE=21924952;WS=21924934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	21925214	rs6997244	C	G	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=50;PP=1574;SC=TCCTCTTGGGCAGGACTCCGG;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=21925222;WS=21925204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	21927137	rs12680100	G	A	6501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=133;PP=2965;SC=CTCGCCTCAGGGCTAAGTAGG;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=70;TCR=133;TR=203;WE=21927145;WS=21927127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr8	21927211	rs12681799	C	G	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=46;SC=CTCCCCCAGCCGGAAAAGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=21927219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr8	21930068	rs3824336	A	G	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=369;SC=CTCCGCTCCCAGGTTCAAGTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=21930076;WS=21930058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	21931170	rs199820139	AAAAAAAAAAGAG	A	1812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.75;QD=40.28;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr8	21937870	rs7835670	G	A	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=91;PP=2965;SC=AAAGTGAAGGGGACCAAAGGT;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=104;TCR=91;TR=195;WE=21937878;WS=21937860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr8	21939435	rs6557782	C	T	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=59;PP=2565;SC=GCACTGCAGCCTCCTGCTCCT;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=128;WE=21939443;WS=21939425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr8	21946664	rs7829160	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=9;NR=5;PP=217;SC=GGGCCCCGCCCCCCTCGTCGC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=21946672;WS=21946654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	21952226	rs1456	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=507;ReadPosRankSum=1.457;SC=ATGATTTAGCTGCCGGTCCCA;SOR=0.725;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=34;WE=21952234;WS=21952216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr8	21954973	.	G	T	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=53.68;NF=4;NR=1;PP=72;QD=21.3542425094;SC=TACCCGCCAGGCATGCGGCAG;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=21954981;WS=21954963;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr8	21955116	rs11352	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.806;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=302;ReadPosRankSum=-1.971;SC=ACCTCAGCGTCCACAGGCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=22;WE=21955124;WS=21955106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr8	21955552	rs1973254	T	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=521;ReadPosRankSum=0.142;SC=CCCCACCAGGTCTGGCCTCAT;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=27;WE=21955560;WS=21955542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr8	21956108	rs35497596	A	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=885;ReadPosRankSum=-0.825;SC=AGACATTGCCACCTTAGAGGG;SOR=0.855;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=65;TCR=89;TR=59;WE=21956116;WS=21956098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,61:0.36:168
chr8	21958333	rs1552283	T	C	9259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=133;PP=2965;SC=ACTGGTGCCGTACTGCTCTGC;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=146;TCR=133;TR=279;WE=21958341;WS=21958323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr8	21958831	rs1968870	C	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=261;SC=ACCGTGCCTGCCCTGAGTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=21958851;WS=21958828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	21958843	rs71544853	C	CTCTT	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=604;SC=CTGAGTTTTACTCTTTGGCCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=21958851;WS=21958828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	21959191	rs6557810	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=32;PP=2212;SC=CCCCAGGCCCACTGCCTCTAC;SOR=1.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WS=21959181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	21959638	rs13267096	AC	GT	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.929;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=1752;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GTGCAAAAATACTCACCAGCC;SOR=1.122;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=46;WE=21959647;WS=21959628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr8	21959877	rs7812435	T	G	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=945;SC=GGAGGGGACATCAGGGAAAGG;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=21959885;WS=21959867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	21960096	rs117802113	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=795;ReadPosRankSum=-0.581;SC=AGGCAAGCTGCTCCTGGTGCG;SOR=0.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=51;WE=21960104;WS=21960086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr8	21964802	rs1552286	C	T	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=19;PP=1403;SC=TGTCACCTCCCCCACCTCTCT;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=21964810;WS=21964792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	21965113	rs3739435	T	C	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1205;ReadPosRankSum=1.908;SC=CTCTGCTCCATAGGGTCGAGG;SOR=0.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=66;WE=21965121;WS=21965103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
chr8	21966700	rs57316099	GC	G	1661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=13;PP=835;SC=TTCTTCCGCAGCCCGCACGGG;SOR=0.984;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=21966715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	21966707	rs58343576	CG	C	1731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=13;PP=869;SC=GCAGCCCGCACGGGGCGCCGG;SOR=1.151;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=23;WE=21966715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	21966891	rs149177341	C	CCCGCTCCCAGTCCCTGCGGAGA	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=3.558;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr8	21967075	rs7830885	G	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.193;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=518;ReadPosRankSum=1.084;SC=TGGAACTGGGGGGGCACGGGT;SOR=0.885;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=33;WE=21967083;WS=21967065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr8	21967304	rs7844781	C	T	4325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.710;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,118:0.45:262
chr8	21967309	rs7817171	A	C	4221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.945;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,111:0.44:252
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chr8	21974032	rs6557830	A	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TCTAATGACAACCACCCCCGA;SOR=0.659;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=18;WE=21974040;WS=21974022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
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chr8	22021037	rs4715	C	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=682;ReadPosRankSum=0.408;SC=GAGGCTCTCACTAGAAAAGTC;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=52;WE=22021045;WS=22021027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
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chr8	22021739	rs3216166	G	GA	2941.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=2162;ReadPosRankSum=1.343;SC=CCACTCCCCTGATTCTCTCTG;SOR=0.591;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=52;WE=22021747;WS=22021729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,96:0.46:208
chr8	22021883	rs7592	G	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.749;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=514;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GCAGGGACAAGCCCTGGAGAA;SOR=0.459;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=37;WE=22021891;WS=22021873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr8	22021934	rs1139547	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.304;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=209;ReadPosRankSum=-0.373;SC=CAGAGGTGGCGCCCAGGGGCC;SOR=0.210;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=18;WE=22021942;WS=22021924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr8	22035248	rs377158841	A	AG	2100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.895;NF=9;NR=39;PP=1669;ReadPosRankSum=0.397;SC=ACCCTCAGGTAGGGGGACTCT;SOR=0.500;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=48;WE=22035256;WS=22035238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,80:0.56:142
chr8	22053123	rs4075478	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr8	22054167	rs371342006	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=0.140;SC=TCCCCGCAGACGATGCCACCT;SOR=1.244;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=8;WE=22054175;WS=22054157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr8	22064277	rs34328929	AG	A	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.001;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
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chr8	22081708	rs4075536	G	A	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=34;PP=2121;SC=GGAGAGGCCCGGCGGGTCCAG;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=103;WE=22081716;WS=22081698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	22084653	rs4871975	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=325;SC=TGAGCAGGACCAATCTTGAGG;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=22084661;WS=22084643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	22085260	rs10100426	T	C	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=73;PP=2283;SC=GCAAAAGGGCTCCGCCCCGAC;SOR=2.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=23;TCR=73;TR=96;WE=22085268;WS=22085250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	22102519	rs200301891	G	A	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1232;ReadPosRankSum=1.182;SC=TCCCGACTCCGGGAAGAACCG;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=150;TCF=80;TCR=70;TR=80;WE=22102527;WS=22102509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr8	22104691	rs34392777	G	T	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=43;PP=2578;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GTACTTTGGGGTCAGAACCTA;SOR=0.525;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=126;WE=22104699;WS=22104681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr8	22105502	rs1126677	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=29;PP=958;SC=AGGGCCCAGCTGAAATGATGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=22105510;WS=22105492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr8	22162271	rs75282394	T	G	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1650;ReadPosRankSum=0.342;SC=CTTCTGAAATTTTTTCCTGCC;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=234;TCF=142;TCR=92;TR=111;WE=22162279;WS=22162261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,125:0.47:266
chr8	22163331	rs12543697	C	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=383;SC=CTCCTTAGTGCGCAAGGTATA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=22163339;WS=22163321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	22167286	rs4486204	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=337;SC=AATTTTACCTATATAAATGTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=22167294;WS=22167276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	22172702	rs4397403	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=472;SC=CCAGAGAATCCTCCAAGCTGT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=22172710;WS=22172692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	22211756	rs66554545	T	A	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=20;PP=1592;SC=ATCCGACCATTTCACTGATTT;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=73;WE=22211764;WS=22211746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	22262098	rs896375	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GGAGCAGAGAAGCAGAGACTG;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=10;WE=22262106;WS=22262088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr8	22262142	rs896376	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=534;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGTGTGGCGGGCGGGCCTGGC;SOR=1.102;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=33;WE=22262150;WS=22262132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr8	22262183	rs896377	G	C	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=964;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGAGGCCTCAGCTTCACCTGC;SOR=0.832;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=59;WE=22262191;WS=22262173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr8	22262228	rs111662782	AGCTGCT	A	3328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=2819;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GTCACCATGAAGCTGCTGCTG;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=53;WE=22262241;WS=22262218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,88:0.47:189
chr8	22262321	rs896378	T	C	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.462;SC=GCTTCATCCCTGGGTGCACCA;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=99;WE=22262329;WS=22262311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,119:0.50:237
chr8	22262379	rs33999442	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1204;ReadPosRankSum=0.618;SC=ATCGGTATGGCGAGGGTGACA;SOR=0.907;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=78;WE=22262387;WS=22262369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,96:0.49:195
chr8	22262418	rs2293144	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=917;ReadPosRankSum=-2.241;SC=TGAAGGCCCTACTCAACCACC;SOR=0.747;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=58;WE=22262426;WS=22262408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr8	22277040	rs10101909	G	A	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1449;ReadPosRankSum=1.080;SC=AATTGCAGCTGTGTTGTTTCT;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=100;WE=22277048;WS=22277030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,120:0.49:245
chr8	22385061	rs17733133	T	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=662;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GTCTCATCAGTTGTTTGGTGA;SOR=0.350;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=110;TCF=33;TCR=77;TR=48;WE=22385069;WS=22385051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr8	22389900	rs2449340	T	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.237;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=480;ReadPosRankSum=0.747;SC=AGTTTTTTTATAATTGGAATG;SOR=1.410;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=26;WE=22389908;WS=22389890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr8	22390385	rs143257473	G	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=563;ReadPosRankSum=0.438;SC=TTAAGTTGCTGAATGGAGAGT;SOR=0.325;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=32;WE=22390393;WS=22390375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr8	22396781	rs5890041	TC	T	125.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=154;SC=TTAGAAACTCTCCCCCACCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=22396789;WS=22396771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	22398414	rs7430	G	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=1.354;SC=CAACTTCAACGTGGAGGTGCA;SOR=0.340;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=22398422;WS=22398404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr8	22419191	rs2469764	T	C	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=497;SC=ATGTAGTAAATGTCGTAAAGC;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=22419199;WS=22419185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	22419555	rs34995301	G	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=493;SC=AGCCCAGCCAGGAGTGGGGTC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=22419563;WS=22419545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	22422923	rs960509	G	A	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=665;SC=GGGTCGGGGCGAGCCGGGAGC;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=22422931;WS=22422913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	22424489	rs11779261	A	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=6;PP=355;SC=GGGGTGAGAGAACTGGGGTGT;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=22424497;WS=22424479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	22426650	rs3830695	TC	T	3763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=46;PP=2741;SC=TCATGACCTTTCTTCATGCAG;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=61;WE=22426658;WS=22426640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	22428658	rs2449331	T	C	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=51;PP=1953;SC=GCTGACCCCATCGACTTGGGG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=96;WE=22428666;WS=22428648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
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chr8	22436681	rs11545016	C	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=17;NR=25;PP=712;SC=TGGCGTCTCCCCGCCTTCCCT;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=22436689;WS=22436671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr8	22863191	rs2430812	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=353;SC=GATTGAGTTCCAGCTCTGTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=22863199;WS=22863181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	22864622	rs2466178	T	C	10246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=140;PP=2965;SC=TCTCCACCTCTTCCTCCAAGT;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=307;TCF=167;TCR=140;TR=307;WE=22864630;WS=22864612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
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chr8	22880162	rs1047275	G	C	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GGGAAGGTCTGACTTCCTGAA;SOR=0.581;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=68;WE=22880170;WS=22880152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr8	22881852	rs6557609	T	C	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=69;PP=2749;SC=ACCAGCCAGCTCTGAGACCTG;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=22881860;WS=22881842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr8	22885109	rs1105944	A	G	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=820;SC=AGCCCAGAGCACCCAGGCCAC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=22885117;WS=22885099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr8	22886020	rs13265018	A	G	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=55;PP=2074;SC=CACAGCTGGGACTTCCCCACT;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=98;WE=22886028;WS=22886010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	22886130	rs2293399	A	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=616;SC=GTACACACACAGAGGGAGAGG;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=22886138;WS=22886120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	22887013	rs6420148	C	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=530;SC=GCAGCCACAGCCTCAAGGATG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=22887021;WS=22887003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	22888407	rs10866818	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=445;SC=GAGAAAAGCCGGTGAATGAAA;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=22888415;WS=22888397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	22926313	rs1129424	G	A	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=66;PP=2965;SC=GGGGACCCGGGGCCCAGGCCT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=133;WE=22926321;WS=22926303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	22960704	rs6557616	G	C	3011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=81;PP=1778;ReadPosRankSum=0.552;SC=AGTGAGTCCCGGCCGCGGTCC;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=298;TCF=124;TCR=174;TR=136;WE=22960712;WS=22960694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,149:0.47:318
chr8	22969091	rs10111172	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=0.499;SC=AACACAGGTATGAAAGAATGA;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=22969099;WS=22969081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr8	22974450	.	T	C	1036	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=57.24;NF=29;NR=30;PP=1036;QD=18.1486646194;SC=GAGACAATGATCACCAGCCCG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=59;WE=22974458;WS=22974440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:54,59:0.52:113
chr8	22990193	rs138383437	TTGTGTG	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.871;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr8	23001988	rs1133782	A	G	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=850;ReadPosRankSum=0.804;SC=CTCCTCTGGCAACTCTACAGT;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=65;WE=23001996;WS=23001978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,75:0.50:151
chr8	23002107	rs35763670	C	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TGTCCTCCGCCCCAGGAACTC;SOR=0.352;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=75;WE=23002115;WS=23002097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,82:0.55:150
chr8	23012437	rs137870102	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=624;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CTGTGGGGCCACTGTCTGCTG;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=48;WE=23012445;WS=23012427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,52:0.37:140
chr8	23021256	rs61760054	C	T	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.216;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=41;PP=1858;ReadPosRankSum=1.335;SC=CTCCCGGCGCCAGGTGCGCTC;SOR=0.377;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=181;TCF=124;TCR=57;TR=111;WE=23021264;WS=23021246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,123:0.58:212
chr8	23021346	rs11135703	G	A	3940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.861;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=63;PP=2555;ReadPosRankSum=-0.556;SC=AGGATCTTGGGGTCCAGGAGC;SOR=1.053;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=334;TCF=182;TCR=152;TR=157;WE=23021354;WS=23021336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,186:0.48:388
chr8	23049292	rs2230229	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=650;ReadPosRankSum=0.786;SC=AATCTTCTCTCTTGCATGTCT;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=50;WE=23049300;WS=23049282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr8	23054779	rs3824218	T	C	5379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=86;PP=2965;SC=TAGTACTGACTCTGACCATCA;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=69;TCR=86;TR=155;WE=23054787;WS=23054769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	23059265	rs11294851	TC	T	3668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=24;PP=2422;SC=TTTTTAGGGTTCCTTGCTTCT;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=23059273;WS=23059255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	23059280	rs4872078	G	T	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=29;PP=1658;SC=GCTTCTGTGGGTTCTTTGAGG;SOR=1.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=23059288;WS=23059270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	23059324	rs20575	C	G	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=49;PP=2020;SC=GTCTCACCCTCTGCTGCACTT;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=103;WE=23059332;WS=23059314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	23060256	rs17620	T	C	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=43;PP=994;SC=GGCTCCAGGATGTTCTGATCT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=23060264;WS=23060246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	23112662	rs3736025	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=440;SC=TTCCCGGGTGCTTGCCTTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=23112670;WS=23112652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	23113908	rs4439140	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr8	23115646	rs3736022	G	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=932;SC=CAGGCCTGGAGCAATGCCCAG;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=23115654;WS=23115636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	23116392	rs4581063	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GGTGACAGAGGACAGATTTGA;SOR=0.556;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=17;WE=23116400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr8	23116431	rs4872098	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=334;ReadPosRankSum=2.622;SC=TTAACGAAACCTGACTTGTGA;SOR=0.138;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=21;WE=23116439;WS=23116421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr8	23145320	rs11777755	A	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=823;SC=CCAACATGGAAGAAAAAAAGA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=23145328;WS=23145310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr8	23167353	rs1063582	T	G	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=75;PP=2965;SC=CACTGCAGCATGAACATGGGC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=160;WE=23167361;WS=23167343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr8	23167560	rs12548642	T	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=976;SC=TCCTCAAGGTTACCTTCTTGT;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=23167568;WS=23167550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	23174425	rs3824213	T	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=529;SC=CTGGTCCCCTTGGGAGCCCGG;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=23174433;WS=23174415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	23174748	rs13250587	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=32;PP=1033;SC=TTCAGATCGAAACAGCACGGA;SOR=2.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=23174756;WS=23174738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	23177619	rs13254579	C	A	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=62;PP=1697;SC=GAGCTTCCCCCCTACGCTGCC;SOR=3.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=72;WE=23177627;WS=23177609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	23185977	rs143228403	G	A	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=833;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CCGACACCAGGTCCCACTTGT;SOR=0.800;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=64;WE=23185985;WS=23185967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,82:0.56:147
chr8	23186007	rs1051146	T	C	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=61;PP=2266;SC=CGGTCCCCCATTCTCCATTTT;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=116;WE=23186015;WS=23185997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr8	23186222	.	A	ATG	62	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=0.9997;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=62;QD=32.5;SC=TGATGTATGGATGTGTGTGTG;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=2;WE=23186230;WS=23186212;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,2:0.20:10
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chr8	23243323	rs10095723	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=511;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TTTTATTTGATGCAATATATT;SOR=0.818;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=32;WE=23243331;WS=23243313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr8	23243350	rs150315839	AC	A	1959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.984;NF=23;NR=18;PP=1523;ReadPosRankSum=0.232;SC=TGGAATCAATACAAAAATTAT;SOR=0.653;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=41;WE=23243358;WS=23243340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr8	23291835	rs1142283	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=-1.541;SC=CCTACCTTAATGGTAGAAAGC;SOR=0.515;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=38;WE=23291849;WS=23291825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr8	23292044	rs139348326	GCA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,8:0.15:55
chr8	23294392	rs2272643	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.905;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=1044;ReadPosRankSum=0.157;SC=AACCCGTCACCGTCCACACTG;SOR=1.739;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=67;TCR=15;TR=48;WE=23294400;WS=23294382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr8	23294412	rs2272642	A	G	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.452;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=16;PP=1359;ReadPosRankSum=0.471;SC=GGTCTCTCAAAAGCATGCAGA;SOR=1.388;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=68;WE=23294420;WS=23294402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr8	23299163	rs113598172	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=542;ReadPosRankSum=-0.029;SC=CGAGAATGCCCGCTGTCCTTT;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=38;WE=23299171;WS=23299153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr8	23307253	rs2293936	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.089;SC=ATGCATTAAAATACCTCACTG;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=23307261;WS=23307243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr8	23423669	rs2942194	A	G	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GTACACAAGTATCTACGGAGC;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=68;WE=23423677;WS=23423659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,71:0.44:160
chr8	23423758	rs10992	G	A	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1743;ReadPosRankSum=0.880;SC=GTGCAGGGCCGGCCCATGCCA;SOR=0.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=95;WE=23423766;WS=23423748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,105:0.48:217
chr8	23431045	rs1810193	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=418;ReadPosRankSum=0.224;SC=TGGTGCATCTTACCGAGGAGG;SOR=0.612;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=25;WE=23431053;WS=23431035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr8	23432326	rs1398232	T	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.39;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	23432326	.	TTTGCAC	ATTGCAC,ATTGCAT	271	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4,3;NR=26,10;PP=271,143;QD=10.1923737516;SC=CAGTGTAACCTTTGCACGTAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30,13;WE=23432340;WS=23432316;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:30
chr8	23432332	rs8534	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr8	23540417	rs11781886	C	T	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=39;PP=1055;SC=GCGGCCCCGCCTTGGCCTGAA;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=23540425;WS=23540407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr8	23560648	rs35373423	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=502;SC=TCACCTGAGCGGTTCCTACTT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=23560656;WS=23560638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr8	24200474	rs62498247	C	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=495;ReadPosRankSum=1.305;SC=CAACAGAGCCCGTCTCTGTTT;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=28;WE=24200482;WS=24200464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr8	24200774	rs11987905	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CTAAAGGAATATTTTCAGCTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=24200782;WS=24200764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr8	24208847	rs7009516	G	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=840;ReadPosRankSum=0.483;SC=TCTGGGCTGTGATTACCATGG;SOR=0.642;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=47;WE=24208855;WS=24208837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,52:0.41:126
chr8	24208934	rs5012230	C	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.910;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=568;ReadPosRankSum=0.516;SC=TTTGCAGTAACACATTCAGAA;SOR=1.762;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=32;WE=24208942;WS=24208924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr8	24211278	rs7815643	C	T	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=49;PP=1915;SC=TTATAATTAACGTAGCATAAA;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=24211286;WS=24211268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	24211331	rs7814768	G	A	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=62;PP=2097;SC=GGATAATCCAGTGTCTACACC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=111;WE=24211339;WS=24211321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	24211884	rs10694022	A	ATGTC	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=15;PP=1511;SC=TTTAGAAGTTATGTCTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=24211892;WS=24211874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr8	24359068	rs13277171	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=638;ReadPosRankSum=-0.646;SC=AGCCAATCCTGCCAGAAATTC;SOR=0.572;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=44;WE=24359076;WS=24359058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,59:0.41:145
chr8	24359125	rs3071035	ATT	A	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.163;QD=11.38;ReadPosRankSum=2.005;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
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chr8	24774683	rs196864	C	A	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=46;PP=1967;SC=GATTCAGAAACCCAAGGTGGA;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=99;WE=24774691;WS=24774673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	24811064	rs11300136	AG	A	1370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=14;PP=903;SC=TCTCCTTCAGAGGGGGGGCTC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=31;WE=24811072;WS=24811054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr8	25158026	rs2709639	G	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.817;NF=31;NR=27;PP=906;ReadPosRankSum=-2.215;SC=AGTCTATACTGAGGGTAGCCT;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=58;WE=25158034;WS=25158016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr8	25158072	rs5890219	AT	A	1503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.801;NF=10;NR=31;PP=591;ReadPosRankSum=3.221;SC=ATTAAGAGCAATTTTTTTTTC;SOR=0.596;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=41;WE=25158080;WS=25158062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
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chr8	25160084	rs2709638	CA	TG	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TGCCCTGCTTCAAAACAATCA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=25160093;WS=25160074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr8	25202915	rs2468901	A	G	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=12;PP=1139;SC=CTGGTCGAGGAAGAGTTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=25202923;WS=25202905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr8	25225804	rs2257081	C	T	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=81;PP=2534;SC=ATCACAACCTCTGAGTGATAA;SOR=1.273;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=127;WE=25225812;WS=25225794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr8	25227255	rs2659578	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=162;SC=TGAGTAGTCTCAGAGTCACTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=25227263;WS=25227245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr8	25246481	rs2709602	G	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=196;SC=TAGATTTTCAGTGAGAACTTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=25246489;WS=25246471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr8	25249545	rs6991928	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=-2.033;SC=ACGGGCTGAGCACGGTGGCTC;SOR=0.472;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=23;WE=25249553;WS=25249535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr8	25250423	rs6557840	A	G	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=54;PP=1352;ReadPosRankSum=1.319;SC=ATTGGCATTTAGAAAAAAACT;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=41;TCR=96;TR=76;WE=25250431;WS=25250413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,90:0.58:155
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chr8	25258442	rs3750194	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=537;ReadPosRankSum=-1.170;SC=CCCTTCTTTCCAGATGCCCCT;SOR=0.578;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=31;WE=25258450;WS=25258432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
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chr8	25268511	.	G	A	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=74;QD=21.7542425094;SC=ACGCACGCACGCACGCACGCG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=25268519;WS=25268505;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,5:0.45:11
chr8	25280666	rs2709608	A	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=21;PP=1499;SC=TAAATTGAATAAAATCACTAT;SOR=1.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=25280674;WS=25280656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	25287397	rs1812594	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=0.654;SC=GTGACATGTGTAGTGGTGTCA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=11;WE=25287405;WS=25287387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
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chr8	26441562	rs408753	A	G	220.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.831;SC=AAATAAGTCTATTGTTTGATT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=26441570;WS=26441552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr8	26481771	rs327222	T	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=38;PP=1064;SC=TGGACATCAGTGAGTGGCATA;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=26481779;WS=26481761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr8	26906433	rs150141473	TTAAAG	T	1430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.550;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.078;NF=26;NR=4;PP=1209;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CGTAAAGTAATTAAAGTAATG;SOR=1.257;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=30;WE=26906445;WS=26906423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,42:0.32:131
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chr8	27147716	rs12386801	A	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=44;PP=1680;SC=AAAAATAAAAAAATAACACAG;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=27147724;WS=27147706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr8	27204857	rs4629818	A	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=15;PP=1138;SC=AGATCCACCCACCTCGGCCTC;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=27204865;WS=27204847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr8	27297696	rs2241657	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1262;SC=CGATGGTGCTTCTGGGTGGGA;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=27297704;WS=27297686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr8	27308585	rs751019	A	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.565;SC=ATGAATGATAAGTCCCCATTG;SOR=0.487;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=22;WE=27308593;WS=27308575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr8	27310546	rs3735758	A	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=128;SC=GTAGAGGGGAAGGGGCTCATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=27310554;WS=27310536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	27311703	rs1879184	T	C	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=41;PP=1359;SC=TGGACCGGACTGATGACCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=27311711;WS=27311693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr8	27315726	rs1879183	T	C	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=6;PP=467;SC=TTGGCCAGCATGCAGGTGGAC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=27315734;WS=27315716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr8	27315900	rs1879181	A	G	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=45;PP=1749;SC=TGACCTCCCTAAGTGAGGAGT;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=83;WE=27315908;WS=27315890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	27321597	rs3735757	G	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=468;SC=AGGGGAACCCGAAGAACCAAG;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=27321605;WS=27321587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr8	27614138	rs2280884	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr8	27630152	rs7842666	G	A	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=441;SC=CCTGGCCCCCGGAACTCCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=27630160;WS=27630142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr8	27650428	rs4732754	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.484;SC=ATTAATGACACTCTTCCTACT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=12;WE=27650436;WS=27650418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
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chr8	27661066	rs144484866	T	TAC	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=220;SC=CTCACACTCATACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=27661074;WS=27661056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr8	27667719	rs1052874	C	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=463;ReadPosRankSum=-2.675;SC=CTATGGTCCTCAAATATGCCA;SOR=0.112;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=26;WE=27667727;WS=27667709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
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chr8	27679981	rs3779620	T	C	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.260;SC=ACTGCCATCATTGGCTTCAGT;SOR=1.110;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=61;WE=27679989;WS=27679971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,67:0.60:111
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chr8	27743535	rs2685381	T	C	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=51;PP=1585;SC=TACCATGCATTGAGCAAAGTC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=88;WE=27743543;WS=27743525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr8	27767066	rs17058204	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=261;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CGTTTGAGGCGGAGTTGATTG;SOR=0.916;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=20;WE=27767074;WS=27767056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr8	27767231	rs17058207	C	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=375;ReadPosRankSum=0.494;SC=TTTCCTTCATCCCCCTGATCA;SOR=0.394;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=25;WE=27767239;WS=27767221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr8	27767276	rs58646328	C	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=339;ReadPosRankSum=1.239;SC=AAGGCAAAAACAGCACTGAGG;SOR=0.340;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=22;WE=27767284;WS=27767266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
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chr8	27779545	rs10103504	C	T	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1159;ReadPosRankSum=0.025;SC=GCAGCCCCCACAGCGCGCCCT;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=80;WE=27779553;WS=27779535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,87:0.62:140
chr8	27779811	rs4732613	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=937;ReadPosRankSum=-1.476;SC=GGAGGAAGGCCCCGGGTGACA;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=104;TCF=19;TCR=85;TR=52;WE=27779819;WS=27779801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
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chr8	27880692	.	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
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chr8	27886700	rs9644134	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=-0.912;SC=AATGCCTACTATGCCTTCCAC;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=11;WE=27886708;WS=27886690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
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chr8	27887047	rs11786995	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=1.573;SC=GGGCAGATCAGCTGAGGTCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=10;WE=27887055;WS=27887037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
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chr8	28210613	rs6558057	G	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=2;PP=205;SC=AGGGTCCCCTGCTCTCCACGG;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=28210621;WS=28210603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	28286124	rs62001909	C	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=244;ReadPosRankSum=2.605;SC=GCTTGGGGCCCAGGGTGCCTG;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=18;WE=28286132;WS=28286114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
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chr8	28341058	rs7843764	A	G	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=36;PP=1026;SC=AATACCAGCCAGGCACGATGG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=28341066;WS=28341048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr8	28384712	rs2241802	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=49;PP=2902;SC=ATCTGAATTTAGCTGGAGAAC;SOR=1.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=128;WE=28384720;WS=28384702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr8	28633098	rs241203	A	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=467;SC=CGAACTCCTGACCTCAAGTGA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=28633106;WS=28633096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	28633124	rs7462400	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=753;SC=CCACCTTGGCTGCCCAAAGTG;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=28633132;WS=28633114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	28638223	rs241196	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=134;SC=TACAGTAGAACAATGTTTGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=28638231;WS=28638213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	28645271	rs241187	C	T	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=20;PP=1337;SC=TTTCATCTAACGACCTGCTGT;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=28645279;WS=28645261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	28651298	.	AAA	CAC	854	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=14;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=59.72;NF=27;NR=11;PP=854;QD=23.880733549;SC=AAAATTCACAAAAAAAAAAAA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=38;WE=28651308;WS=28651288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,38:0.90:42
chr8	28692783	rs28522383	C	T	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=41;PP=1865;SC=TACAGTCTCTCGGTAAGAGAG;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=93;WE=28692791;WS=28692773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	28821252	.	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=0.334;SC=TGCTGTCCATCAGTTACATAA;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=28821260;WS=28821242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr8	28970865	rs1466627	C	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=294;SC=AAAATCTATACCTTCCCTAAA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=28970873;WS=28970861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	28979949	rs4732905	C	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1095;SC=TATGACACACCAATCAGTCCG;SOR=1.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=28979957;WS=28979939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	28984042	rs3793435	T	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=32;PP=1094;SC=AAAGAAAATATACATTACAAA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=28984050;WS=28984032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	28984572	rs3763566	G	A	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=330;SC=AGTTTCGTACGGGTTCCAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=28984580;WS=28984562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	28991405	rs3750265	A	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=235;SC=AGGAGTATAGATGCATTGACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=28991413;WS=28991399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	29005093	rs6986672	A	G	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=80;PP=2592;SC=TGTTGTTCTAAGCTGTTTAAT;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=131;WE=29005101;WS=29005083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr8	29005128	rs13263819	A	G	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=68;PP=1930;SC=ATCTAAACACATTTTTAAAAA;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=95;WE=29005136;WS=29005118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	29023421	.	T	TTCGATTGTAGATCGAAGTACC	754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.93;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	29033422	rs6558098	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=479;SC=AAAAAACCTACGTTTATTCCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=29033430;WS=29033412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	29053761	rs10547393	TA	T	1019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=2;NR=40;PP=524;SC=AAAGAAAAGTTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=42;WE=29053770;WS=29053751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	29107388	rs2954794	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=654;SC=ATGGTCAACTGGCATTAAAGT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=29107396;WS=29107378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	29886613	rs10098255	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.866;NF=3;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=1.118;SC=TTATTGTTCCTCTAAGTGGAT;SOR=0.297;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=10;WE=29886621;WS=29886603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr8	29923732	rs2271367	G	A	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=774;SC=TTCCTAAACTGTCAGAAAAAA;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=29923740;WS=29923722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	29927300	rs6468093	C	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=42;PP=2153;SC=AGACTACAAACGCGATCCCAA;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=29927308;WS=29927290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	29927321	rs6468094	A	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=43;PP=2088;SC=GGAGTACCACAATGGTAATCA;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=101;WE=29927329;WS=29927311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	29931375	rs986636	T	C	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=24;PP=1458;SC=AGACTGCCATTACTGTAGTGG;SOR=1.305;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=29931383;WS=29931365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	29940271	rs13279112	A	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=176;SC=AGGCTCCGGGAAGACGGCGCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=29940279;WS=29940261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	29953256	rs56969689	C	T	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=4;PP=700;SC=GGCTTCGCCCCGCAGCCCCCA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=29953264;WS=29953246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	29989399	rs13272159	G	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=713;ReadPosRankSum=0.307;SC=TTATCGATGCGTCATCTGGCA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=41;WE=29989407;WS=29989389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr8	29989564	rs7844812	A	G	7611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=136;PP=2965;SC=GAGAGGAGAGACTCCTGACCT;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=107;TCR=136;TR=243;WE=29989572;WS=29989554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr8	29990467	.	TTC	T	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=57;QD=37.5;SC=TCTGTATTTATTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=29990476;WS=29990457;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr8	29996158	rs4733141	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=708;ReadPosRankSum=1.025;SC=CTTGCTGAGGAGCCAGGGAAC;SOR=0.957;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=30;WE=29996166;WS=29996147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr8	29996256	rs7813902	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=205;SC=CCTCCTCCAGTCAGGAGAAAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=29996264;WS=29996246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	30001915	rs12546113	T	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=639;SC=GCCTCCCAAATTGCAGGGATT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=30001923;WS=30001905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	30013759	rs7012749	A	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=50;SC=ACGCGACGCAAACAAGAGTCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=30013767;WS=30013749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	30021437	rs13249436	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=148;ReadPosRankSum=1.062;SC=AGGCTGGTGTCGAACTCCTGA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=11;WE=30021445;WS=30021427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr8	30021461	rs71521373	C	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=0.541;SC=CAGGTGATCCCCCCACCTCGG;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=14;WE=30021469;WS=30021451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr8	30210274	rs4349946	T	C	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.768;NF=39;NR=48;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TGCTGACCTCTGCAAGTTGGC;SOR=0.741;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=87;WE=30210296;WS=30210264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr8	30210416	rs117064690	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.656;NF=2;NR=18;PP=328;ReadPosRankSum=-1.185;SC=GATGCCAAGAGCATGATGGCT;SOR=2.275;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=20;WE=30210424;WS=30210406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
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chr8	30394968	rs2979511	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=0.553;SC=AAATAGTGGAGTGGGGAGACG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=30394976;WS=30394967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr8	30541915	rs1465477	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=-0.933;SC=ACACCTGTAACCCCAGAACTT;SOR=2.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=14;WE=30541923;WS=30541905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr8	30546636	rs2551715	T	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=278;ReadPosRankSum=0.286;SC=ATAAGACTCCTAGTAGATTCA;SOR=0.466;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=19;WE=30546644;WS=30546626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr8	30554006	rs8190996	G	A	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=860;ReadPosRankSum=1.578;SC=GCTGAGACGCGAGCAGAGGGT;SOR=0.444;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=58;WE=30554014;WS=30553996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,71:0.51:139
chr8	30560887	rs3779647	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=166;ReadPosRankSum=1.311;SC=CACAATTCTCCGTTTTTCAAG;SOR=0.260;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=13;WE=30560895;WS=30560877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr8	30601610	rs3217273	TC	T	355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=336;SC=ATTGACCCTCTCCCAGCCGGC;SOR=2.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=30601618;WS=30601605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	30601805	rs2278092	C	T	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=73;PP=2635;SC=GTAAGTGTGACTTTTTCCCTT;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=130;WE=30601813;WS=30601795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	30608773	rs1991111	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=112;SC=GCTCATGCCTATAATCCTAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=30608781;WS=30608763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	30608976	rs2911690	C	T	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=56;PP=1998;SC=CTTACTTTAACTATTTCTGTG;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=105;WE=30608984;WS=30608966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr8	30609061	rs2911689	T	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=833;SC=ATTCTACCCTTTTATACCATT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=30609069;WS=30609051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	30609078	rs2911688	A	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=578;SC=CATTCTACTCAAATTTATTTA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=30609086;WS=30609068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	30620840	rs11388922	G	GT	2726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=1770;SC=TGAGGAGAAGGTTTTGAAGTC;SOR=0.815;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=42;WE=30620848;WS=30620830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	30620964	rs2956010	T	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=32;PP=1032;SC=GTCATCTGCATCTCCCATCAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=30620972;WS=30620954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	30623996	rs2956016	T	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=355;SC=CAAATCACACTATACCTTGAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=30624004;WS=30623986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	30695226	rs2720593	C	T	9081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=144;PP=2965;SC=TCTGCAAAAGCGTCCCATGGT;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=145;TCR=144;TR=289;WE=30695234;WS=30695216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr8	30702991	rs1362912	A	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=407;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TTAGTTTCTCATCTGAGTGGT;SOR=0.313;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=28;WE=30702999;WS=30702981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr8	30703431	rs323346	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=-1.950;SC=TTGCATATTATTGCATATGAT;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=34;WE=30703439;WS=30703421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr8	30706224	rs323347	A	G	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=51;PP=1435;ReadPosRankSum=-0.807;SC=AGAACAGCACAATCACCAGGG;SOR=0.875;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=81;WE=30706232;WS=30706214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,86:0.52:166
chr8	30725122	rs323368	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-1.809;SC=AGAGAAGTAGCGATATTCAGA;SOR=0.299;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=30725130;WS=30725112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr8	30732494	rs929917	C	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=893;ReadPosRankSum=-0.003;SC=CATTGTGAACCAGTTTTGTAT;SOR=0.440;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=62;WE=30732502;WS=30732484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,76:0.58:132
chr8	30854033	rs2725371	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=259;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CTGAGGCCTTACATTCATGAT;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=14;WE=30854041;WS=30854023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr8	30916085	rs2737316	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=20;PP=468;SC=ACTATTCTTTTGGGTGAGAAA;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=30916093;WS=30916075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	30916702	rs139775895	C	G	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=997;ReadPosRankSum=-0.521;SC=TGAAGATGACCTCCCCTTCTT;SOR=0.720;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=72;WE=30916710;WS=30916692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,88:0.44:199
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chr8	30924557	rs1800389	C	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=956;ReadPosRankSum=0.152;SC=AGCTGAAATGCACAGAGACCT;SOR=0.195;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=63;WE=30924565;WS=30924547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,68:0.56:121
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chr8	30999280	rs1801195	G	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CAAAGAAGTTGCTTCTGCCTA;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=24;WE=30999288;WS=30999270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr8	30999394	rs2725363	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr8	31000243	rs2725365	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=0.545;SC=ATTGTTCTGATTTATTTCATT;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=25;WE=31000251;WS=31000233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr8	31005017	rs3087415	T	TC	3307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=42;PP=2335;SC=GCATGTGTTCTATTTATTTCC;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=49;WE=31005025;WS=31005007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr8	31497672	rs113317778	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=222;ReadPosRankSum=-1.833;SC=GGCTCCCGCGGGGGCCTCGGT;SOR=1.049;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=16;WE=31497680;WS=31497662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr8	32406148	rs7834206	C	A	6041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=81;PP=2965;SC=CGCTCTCCCCCTCGAGGGACA;SOR=1.002;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=110;TCR=81;TR=191;WE=32406156;WS=32406138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr8	32406382	rs73234136	T	C	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=752;SC=ACGATCCTCCTCCTGCTCCTC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=32406390;WS=32406372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr8	32585423	rs3735775	G	A	902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=1580;ReadPosRankSum=1.772;SC=TTAGAAGGGGGAAAAAAAGTC;SOR=1.125;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=40;WE=32585442;WS=32585413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr8	32585434	rs3735776	C	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=1580;ReadPosRankSum=1.580;SC=AAAAAAAGTCCATGTTAACCT;SOR=1.008;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=44;WE=32585442;WS=32585413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
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chr8	33311091	rs7009689	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.124;SC=ACATCTCTCATTAATCTTGAT;SOR=0.016;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=13;WE=33311099;WS=33311081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr8	33313329	rs2732315	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GATAAAGGCCGCTGATCATTG;SOR=0.836;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=10;WE=33313337;WS=33313319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr8	33347907	rs2732274	T	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TTTCTGGGGGTCTCTTATAGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=23;WE=33347915;WS=33347897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
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chr8	35093427	rs10694226	C	CAGCT	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.637;NF=1;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=0.580;SC=GCGGAGCGGGCAGCTGGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=35093435;WS=35093417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
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chr8	36662680	rs16885430	G	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=0.654;SC=TAAAAATGTTGATCTTCACAA;SOR=0.534;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=15;WE=36662688;WS=36662670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr8	36664713	rs1079679	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=0.115;SC=CTTAGGTTACAACAGCGTCAG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=36664721;WS=36664703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
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chr8	36691109	rs186130705	T	C	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=1746;ReadPosRankSum=0.924;SC=CATATTTAAATGCTACTTGGC;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=125;TCR=109;TR=135;WE=36691117;WS=36691099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,169:0.57:295
chr8	36691189	rs10089594	C	T	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=66;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TAAGATCTAGCTGTTTTTGTT;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=65;TCR=119;TR=103;WE=36691197;WS=36691179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,121:0.55:222
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chr8	36767085	rs62490754	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.570;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=-0.949;SC=GTTAATATTTATAAGGATTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=36767093;WS=36767075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr8	36780209	rs1010669	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=79;ReadPosRankSum=1.006;SC=GTGAACAGGTAGTATAAGGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=36780217;WS=36780199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr8	37706057	rs11777510	A	T	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=26;PP=2208;SC=GAGCCACAGCACCTGGCCTAG;SOR=2.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=73;TCR=26;TR=99;WE=37706065;WS=37706047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	37706267	rs12541064	C	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=241;ReadPosRankSum=-1.627;SC=AAATTCAAATCATTGAGCATC;SOR=0.582;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=14;WE=37706275;WS=37706257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
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chr8	37728017	.	ATT	GTG	1167	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=17;PP=1167;QD=48.8187149945;SC=CTTGGTGGCCATTGCATTCAT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=25;WE=37728027;WS=37728007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr8	37728019	rs7820872	T	G	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr8	37730569	rs137855682	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=577;ReadPosRankSum=0.040;SC=CTGTGTGTCTGCACCATGTCC;SOR=1.793;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=32;WE=37730577;WS=37730559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr8	37888017	rs3750243	C	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=12;NR=5;PP=333;SC=GGCGGGGCGGCACGGGGCGAG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=37888025;WS=37888007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	37985897	rs2843740	A	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=31;PP=1867;SC=GAGTACGGAAAGGTGCCTGGT;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=89;WE=37985905;WS=37985887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
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chr8	38029708	rs2843738	G	C	107.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=1.383;SC=GCACAGCAACGCGGATTTAGA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=38029716;WS=38029698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr8	38033989	rs2270376	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GCCGCCGGGGGCTGCCGGAAG;SOR=0.242;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=14;WE=38033997;WS=38033979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
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chr8	38103239	rs7006757	T	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=812;ReadPosRankSum=-1.816;SC=TTCCTGCTTATATTATTTTTC;SOR=0.963;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=51;WE=38103247;WS=38103229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
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chr8	38178767	rs2234555	C	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=-1.472;SC=GATATGACCACATTCCTTGCT;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=28;WE=38178775;WS=38178757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr8	38262233	rs7001340	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.489;NF=1;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=1.345;SC=CACAGTGGCTTACGCCTGTAA;SOR=0.307;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=38262241;WS=38262223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr8	38271466	rs56341011	C	T	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1173;ReadPosRankSum=0.341;SC=CGATGCGGTCCAGGTCTTCCA;SOR=0.598;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=74;WE=38271474;WS=38271456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr8	38281658	rs3925	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CGTAACTCAGGACACAGGGCT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=38281666;WS=38281648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr8	38286811	rs2304000	C	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=489;ReadPosRankSum=0.709;SC=CTGTTCAGGGCCTCTAATCAC;SOR=0.904;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=27;WE=38286819;WS=38286801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr8	38369831	rs4733951	A	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=225;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GAGAGGAATAAGAAGGAATTC;SOR=0.252;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=17;WE=38369839;WS=38369821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr8	38370200	rs146268311	GAGACACAGAC	G	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.294;NF=0;NR=7;PP=2040;ReadPosRankSum=-0.305;SC=ACATGCAGTGGAGACACAGAC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=38370217;WS=38370190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr8	38385795	rs2445020	T	C	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=3;PP=1169;SC=ATTACACACATGGAATGACTC;SOR=3.872;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=38385803;WS=38385785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	38385914	rs1378332	C	T	3047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=1971;ReadPosRankSum=0.737;SC=CTCTCGCCAGCGGCGTCTGCA;SOR=0.500;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=281;TCF=157;TCR=124;TR=131;WE=38385922;WS=38385904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,146:0.47:313
chr8	38458371	rs3802323	G	T	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GGAAGCCCCCGGTATCACCAA;SOR=0.851;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=81;WE=38458379;WS=38458361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,102:0.49:209
chr8	38458552	.	G	GTCT	6830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=64;PP=2970;SC=TTCTGGCCGTGCCAGCCACTG;SOR=0.895;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=83;WE=38458560;WS=38458542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	38458659	rs327934	C	T	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=46;PP=1391;SC=TCGCGCCCGCCCCGCCCCGCT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=38458667;WS=38458649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	38458802	rs327935	A	C	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.42;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	38603081	rs11782157	A	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=13;PP=297;SC=TTGTTTTTTGAGATGGAATCT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=38603089;WS=38603071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	38677932	rs2013586	A	G	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=88;PP=2965;SC=GTCAGTGGGAAAGCCCCAGCT;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=168;WE=38677940;WS=38677922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr8	38684853	rs2037204	T	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=32;PP=1581;SC=CCAATGTTCCTGTGTCTACCA;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=73;WE=38684861;WS=38684843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	38697649	rs13262797	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=327;SC=TGTCAGTGTATGTTAATGTGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=38697657;WS=38697639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	38709451	rs112953621	TTGAC	T	1866.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=1543;SC=CCAAAAAGGTTTGACTGGCCT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=38709462;WS=38709441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	38793682	rs4633027	T	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=1.579;SC=TGCATGGTGTTGAAATGCTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=38793690;WS=38793672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr8	38803551	rs62504403	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=0.049;SC=CTCATCTCACTCCCTCAAACA;SOR=2.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=16;WE=38803559;WS=38803541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr8	38809663	rs6984871	A	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=961;SC=AGGCGCTGATACTGACACTGT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=38809671;WS=38809653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr8	39022522	rs10088854	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=275;ReadPosRankSum=1.055;SC=TATTAATTATGCATGTATTTA;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=18;WE=39022530;WS=39022512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
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chr8	39080632	rs7845771	C	G	3848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=60;PP=2248;SC=TGTAATGGAACCTCACCAGAA;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=39080640;WS=39080622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	39080824	rs4476978	T	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=334;SC=GATAATGGGGTATATTTTCAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=39080832;WS=39080814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	39091526	rs4515515	T	C	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=844;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TATGCATAACTGTAGACTACA;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=74;WE=39091534;WS=39091516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,91:0.44:205
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chr8	39128387	rs4733994	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=510;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TTTTCAATTTCTTTTTAGATC;SOR=0.583;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=38;WE=39128395;WS=39128377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr8	39128510	rs11347842	AT	A	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=216;ReadPosRankSum=0.348;SC=TTTATTTCCAATTTTTTTTTG;SOR=0.411;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=39128518;WS=39128500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr8	39133206	rs4733913	C	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=399;ReadPosRankSum=-0.020;SC=ATTTAGTAGTCTTTTGAAATT;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=27;WE=39133214;WS=39133196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr8	39142264	rs7008808	A	G	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=27;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GTGGGAGGGAATTTGCTGTCA;SOR=1.088;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=176;TCF=113;TCR=63;TR=84;WE=39142272;WS=39142254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr8	39142550	rs4551318	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=-1.045;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr8	39311600	rs7813010	C	T	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=7;PP=306;SC=CTGTTACTACCGCTGTCTTCT;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=39311608;WS=39311590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	39311677	rs7834545	T	C	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=9;PP=320;SC=TCAAGAAAAGTTTAAAAAGCT;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=39311685;WS=39311667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	39312886	rs10097769	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=263;SC=ACTTTGCTCCGAAATCTCTTC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=39312894;WS=39312876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	39442292	rs7007924	T	G	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=63;PP=1966;SC=ACCCTCCCCCTCTCCCTTCTG;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=39442300;WS=39442282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	39463063	rs4236751	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	39463823	rs13268577	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=452;ReadPosRankSum=-2.101;SC=TGTTTTATTTTAGATGATTTA;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=31;WE=39463831;WS=39463813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr8	39487022	rs3735881	C	T	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=41;PP=1508;SC=AAGAACTTTCCTTCTTGCATT;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=76;WE=39487030;WS=39487012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	39495325	rs3824144	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=540;SC=AGCCCCTTTGGAAGTGTTTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=39495333;WS=39495315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	39496029	rs12708194	T	C	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=36;PP=1168;SC=TTCCTGGCACTGTATGCAATA;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=39496037;WS=39496019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr8	39503079	rs6474161	G	A	145.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=5;PP=99;SC=TTTATATTCGGCACCACATCA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=39503087;WS=39503069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr8	39871036	rs2955897	A	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=326;SC=AAAATATACCATTACCTCCCT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=39871044;WS=39871026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	39872668	rs2955902	C	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=621;SC=AGCAAGATCTCATCTAGAGAA;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=25;WE=39872684;WS=39872658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr8	39873188	rs2981162	C	T	128.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=63;SC=GAATGAGGGTCAGGGTTCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=39873196;WS=39873178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	40011079	rs6474226	G	A	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=20;PP=1517;SC=CCACCAAGCCGTCATCATGTC;SOR=1.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=40011087;WS=40011069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	40389842	rs1429966	T	C	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=68;PP=2350;SC=CCCCTGTCTCTCTTCTACTTC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=112;WE=40389850;WS=40389832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
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chr8	41548003	rs10093583	T	C	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=955;ReadPosRankSum=1.167;SC=TTTACAGGCATGGCCAGACGG;SOR=0.757;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=188;TCF=75;TCR=113;TR=73;WE=41548011;WS=41547993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,95:0.41:231
chr8	41548207	rs6987255	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	41548207	.	CAC	TAT	786	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=14;PP=786;QD=59.9619910616;SC=CTCTCCAAGACACACCCTGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=41548217;WS=41548197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	41548209	rs6987261	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	41550466	rs113547907	GC	G	1346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.021;NF=9;NR=26;PP=1196;ReadPosRankSum=0.851;SC=GACGGGAGCAGCCCGTGAGCC;SOR=0.872;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=35;WE=41550474;WS=41550456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr8	41551728	rs13438835	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=-0.398;SC=ACGGGGTCCCGCCCTGCTGTT;SOR=1.051;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=20;WE=41551736;WS=41551718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr8	41553835	rs2304883	G	A	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=648;SC=CGTGGCCTCCGTGGCACAGGG;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=41553843;WS=41553825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	41555740	rs492008	A	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=628;SC=TTTCCACTCCAGAGCCTGACT;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=41555748;WS=41555730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	41562081	rs72638993	C	T	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=759;SC=AAAGAGAGAACGGACAGGGAG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=41562089;WS=41562071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	41574736	rs575817	A	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=830;SC=TGTGTGCATGAGCATGTATGT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=41574744;WS=41574726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	41577121	rs7823698	C	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=492;ReadPosRankSum=1.807;SC=TGCCTCTCTGCTCCTGCCCCC;SOR=1.198;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=26;WE=41577129;WS=41577111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr8	41585384	rs2304872	T	G	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=49;PP=2096;SC=GAACCACCTGTGGAAAGGCAA;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=108;WE=41585392;WS=41585374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	41585571	rs1872877	C	T	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=28;PP=780;SC=CCACTGGGCCCGCTACGGGAC;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=41585579;WS=41585561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	41615429	rs486223	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=560;SC=CCACAGGCAGGAGCCCTGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=41615437;WS=41615419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	41685814	rs12708213	A	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CCTCCACACCAAGCAGCCGCC;SOR=1.089;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=18;WE=41685822;WS=41685804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr8	41685845	rs13438989	T	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=493;ReadPosRankSum=-0.907;SC=TTCCTTCGTCTGTGCGTGCAG;SOR=1.288;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=33;WE=41685853;WS=41685835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr8	41686017	rs13439740	C	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=833;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCTGCCACCTCCTCCGAGAGG;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=51;WE=41686025;WS=41686007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr8	42013563	rs150778126	T	TATG	10823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=103;PP=2973;SC=AAAACGTAAGTATAAGTCCCA;SOR=0.862;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=24;TCR=109;TR=126;WE=42013571;WS=42013553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr8	42037924	rs2020922	T	A	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=50;PP=2366;SC=TTAGAATGCTTTTTTTGCTGT;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=42037932;WS=42037914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	42044954	rs1058720	G	A	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=46;PP=1515;SC=GCCTGATGGCGTCTGGCCTCC;SOR=1.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=42044962;WS=42044944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	42045655	rs2070713	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=356;SC=GTGGAACACGCGTATACCAGT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=42045663;WS=42045645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	42172017	rs7814513	C	G	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=14;NR=87;PP=2702;SC=TCTTGGCTGGCCGTGGTGGCT;SOR=3.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=101;WE=42172025;WS=42172007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	42175303	rs2294100	A	T	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=68;PP=2246;SC=AGAATTTGTTATGTTTTGTTT;SOR=1.187;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=109;WE=42175311;WS=42175293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	42186579	rs2272732	T	C	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1232;SC=TATTTTAAAATAGCAGTGTTA;SOR=3.180;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=42186587;WS=42186569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	42188550	rs1057741	A	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=37;PP=1031;SC=GGCCTTGTGCAGTGGGGGGAC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=42188558;WS=42188540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	42196441	rs3136717	C	T	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=24;PP=1620;SC=GTCACTGTCTCTTAGAGGCTG;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=42196449;WS=42196431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	42209959	.	C	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=227;ReadPosRankSum=0.306;SC=AATAGCAGCTCTTCTTACTAT;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=17;WE=42209967;WS=42209949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr8	42404040	rs2974349	C	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=442;SC=CTTAGTACTTCTTTCAGATGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=42404048;WS=42404030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	42552633	rs4950	G	A	6983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=111;PP=2965;SC=CCCTTTTCCAGTGGAAATGCT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=118;TCR=111;TR=229;WE=42552641;WS=42552623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr8	42587796	rs4954	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=272;SC=TAAATGTGACGTTATATAAGA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=42587804;WS=42587786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr8	42868455	rs5891200	CT	C	171.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=6;NR=1;PP=112;SC=TTTACATGTGCTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=7;WE=42868463;WS=42868445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr8	42911818	.	A	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.44;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
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chr8	43054553	rs1126058	T	C	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=33;PP=1246;SC=TTCTGGTATATGTCGGCCACG;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=43054561;WS=43054543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	47759712	rs3849804	T	G	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=58;PP=1883;SC=ACTATTTGAGTCTATACCCAG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=92;WE=47759720;WS=47759702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	48320563	rs34569190	AT	A	2131.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1749;SC=GTGTAAAAAAATATTTTAGTT;SOR=2.262;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=40;WE=48320571;WS=48320553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	48614647	rs369245708	TCTCTCTCTCTCTTACACACA	T	536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.61;QD=41.29;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	48697592	rs62539156	C	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=407;ReadPosRankSum=1.471;SC=ATCCCAGTATCACTATTCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=20;WE=48697600;WS=48697582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr8	48710684	rs45507799	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=257;ReadPosRankSum=1.271;SC=ATTCACAGCTGGCTGGGAAAA;SOR=0.340;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=48710692;WS=48710674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr8	48805816	rs11411516	A	AG	4834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=58;PP=2936;SC=TGGCCCCCGAAGTACAAGAGG;SOR=0.724;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=83;WE=48805824;WS=48805806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	48846519	rs1231202	T	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=244;SC=CAATGGTAAATGTTACCATCA;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=48846527;WS=48846509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	48866788	rs1231203	T	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=114;SC=CAGCAAAAAGTATTCGACTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=48866796;WS=48866787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	48885436	rs762679	T	A	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=27;PP=1234;SC=GATCTTCCTCTTGCTGGACCC;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=48885444;WS=48885426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	49641784	rs1482261	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=0.311;SC=TCAAGTGTTAATTTAAAAAAA;SOR=1.047;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=18;WE=49641792;WS=49641774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr8	49642465	rs74669650	C	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=-1.119;SC=GAATTTGATGCTATCAGTAAG;SOR=2.786;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=49642473;WS=49642455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr8	49643243	rs966703	A	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=51;PP=1659;SC=TGTCCTGCATAATAACTCTCA;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=49643251;WS=49643233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	49985188	rs3735973	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr8	49987910	rs6984804	G	A	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=688;SC=TAAGAAGACAGAAATGTGTCT;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=49987918;WS=49987900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	51306704	rs7015950	A	G	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=13;PP=731;SC=GATTTCCTCCACTATATTAGT;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=51306712;WS=51306694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	51362462	rs1481475	A	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=27;PP=888;SC=CTCCTGTGGGAGAGGACTTCT;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=51362470;WS=51362452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	51363078	rs7817955	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=212;SC=ATAACAAAAACAGTCAATGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=51363086;WS=51363068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	51363430	rs12542191	A	T	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=78;SC=TGTTCTCTTAATTTTTTTTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=51363438;WS=51363420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr8	51571370	rs1911831	G	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=414;SC=AAAATAAACTGGACAAAAAAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=51571378;WS=51571360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr8	52233408	rs7827446	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=552;ReadPosRankSum=1.452;SC=TGGAACCCCTCTAACATCTGT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=34;WE=52233416;WS=52233398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
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chr8	52252320	rs16916011	A	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1029;ReadPosRankSum=0.474;SC=TTGCCTATTTATAACAAGAAG;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=31;TCR=86;TR=65;WE=52252328;WS=52252310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
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chr8	52284654	rs5891410	C	CA	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.674;NF=1;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=0.937;SC=GGTAGTCAACCAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=52284662;WS=52284644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr8	52321243	rs2977020	T	C	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TCCGTGGCCATCCTGTTGTGT;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=84;WE=52321251;WS=52321233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,101:0.56:179
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chr8	52366200	rs6473599	G	A	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=36;PP=1486;SC=ACGTTGCCACGTGCCTGGATC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=77;WE=52366208;WS=52366190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	52385000	rs191039217	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TTTACCCGGTAATACATGTAC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=52385008;WS=52384990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr8	52733050	rs12335014	T	A	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=31;PP=1223;SC=CTCTTCTTTGTTATCCTCTTC;SOR=0.832;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=69;WE=52733058;WS=52733040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr8	52733228	rs73592211	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=5.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.84;MQRankSum=-3.480;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=1.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr8	52733231	rs75748152	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=6.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQRankSum=-3.336;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
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chr8	55542540	rs61739567	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.333;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=0.265;SC=GAAAGGTTTTGTATGAATTTC;SOR=0.831;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=34;WE=55542548;WS=55542530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr8	55565241	rs417969	G	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.306;SC=TCTTCTTAATGAATTGACCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=55565249;WS=55565240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr8	56185702	.	CTGTGTGTGTG	C,CTGTG	221	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0,0;NR=6,6;PP=164,221;QD=27.8333333333;SC=GAAAAGAGGACTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6,6;WE=56185719;WS=56185692;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.33:18
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chr8	56792685	rs167999	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=508;ReadPosRankSum=-2.664;SC=CGCGAGCCCAGGGGTGGGCGC;SOR=0.720;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=36;WE=56792693;WS=56792675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
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chr8	56864488	rs73682022	G	A	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1171;ReadPosRankSum=1.546;SC=TCTTATTTGTGAGATATAAAC;SOR=0.886;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=143;TCF=95;TCR=48;TR=73;WE=56864496;WS=56864478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,81:0.50:161
chr8	56882183	rs1027987	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=430;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TTTTGTGGGGAGTTCCCCTGT;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=21;WE=56882191;WS=56882173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr8	56882471	rs1027986	A	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=574;ReadPosRankSum=-1.545;SC=TCCCAGCAGCAGTTATGAGAA;SOR=0.311;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=41;WE=56882479;WS=56882461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr8	56911861	rs2175487	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=307;SC=CCTGGGTGACAAGAGTGAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=56911869;WS=56911851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	56986737	rs2976044	A	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1038;ReadPosRankSum=0.727;SC=AGATACATGAAAAAGAACAAT;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=69;WE=56986745;WS=56986727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,75:0.41:184
chr8	56986808	rs73592343	C	T	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1184;ReadPosRankSum=0.051;SC=CCCGCGTTTCCCCACCATTTC;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=86;WE=56986816;WS=56986798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,100:0.40:247
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chr8	57294501	rs10216893	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=190;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CAAAGATTACTTTAAGAGTTA;SOR=0.794;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=15;WE=57294509;WS=57294491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr8	57294571	rs10216409	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=235;ReadPosRankSum=-0.944;SC=CACGATGGTGCTTTTAACTTC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=17;WE=57294579;WS=57294561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
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chr8	59347184	rs1993453	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=290;ReadPosRankSum=0.842;SC=TATTAAATAAATGGTTGCTGG;SOR=0.275;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=19;WE=59347192;WS=59347174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr8	59411042	rs2162459	G	A	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=61;PP=1530;ReadPosRankSum=1.410;SC=TCAGACACAAGTGTATGATAG;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=83;TCR=121;TR=102;WE=59411050;WS=59411032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,125:0.52:240
chr8	59484899	rs7827910	T	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr8	59498614	rs6995115	A	G	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=592;ReadPosRankSum=-1.619;SC=TGTGGTTTACATTATTCTGGA;SOR=1.169;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=38;WE=59498622;WS=59498604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr8	59498685	rs12679938	T	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.577;SC=TCCTTGTACTTAAGCAATGAC;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=59498693;WS=59498675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr8	59499237	rs3816846	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=1.414;SC=CTCTAGTCTGGTTCAAATATG;SOR=0.169;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=13;WE=59499245;WS=59499227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr8	59512334	rs2680903	G	A	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=58;PP=2741;SC=GAAGCTCCACGTCGTCAACCA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=142;WE=59512342;WS=59512324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	59514773	rs17265530	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.230;SC=AAATATACACATTTACTTCCA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=59514781;WS=59514763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr8	59515756	rs2255834	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=833;ReadPosRankSum=1.464;SC=AGAATTCCACGTGTGGCAGTT;SOR=0.824;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=53;WE=59515764;WS=59515746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,67:0.60:111
chr8	59518611	rs144708345	A	AAAATAATAAAAT	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=2759;ReadPosRankSum=-0.132;SC=ATTCAAAAAGAAAATAATAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=7;WE=59518619;WS=59518601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr8	59535859	.	ATT	A	418.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.85;MQRankSum=4.854;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.813;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr8	59535860	.	TT	CG	626	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=64.32;NF=13;NR=0;PP=626;QD=52.2667596048;SC=AAAAAAAGTATTTATAAGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=13;WE=59535869;WS=59535850;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,13:0.38:34
chr8	59535861	.	T	TCGAA,TAA	418.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.854;NF=8;NR=0;PP=665;ReadPosRankSum=0.744;SC=AAAAAAGTATTTATAAGTATT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=8;WE=59535869;WS=59535850;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.43:28
chr8	59720604	rs2726600	G	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=11;PP=831;SC=GGAAACAAGAGAACGATCAAC;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=59720612;WS=59720594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	59739333	rs4737522	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=777;ReadPosRankSum=1.261;SC=TCAAAGTCTGCGCCGAGATGG;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=61;WE=59739341;WS=59739323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr8	61139280	rs12549573	C	T	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=175;SC=TGCTTTTTGACCTATTTCTTT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=61139288;WS=61139270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	61139319	rs12549574	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=471;SC=ACCACAAGGACAGCAGCTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=61139327;WS=61139309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	61484788	rs3735825	C	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CACTGACTTCCTGCAGCCATG;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=61484796;WS=61484778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr8	61488824	rs2981277	T	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=1.292;SC=ACGTTGCCCCTGGTTTCTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=50;WE=61488832;WS=61488814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,64:0.52:124
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chr8	61655690	rs7836586	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=524;SC=CTGCATTGCAGTGTGAAATTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=61655698;WS=61655680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	61707725	rs4540437	G	A	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=49;PP=1681;SC=TTGGTTATTTGGCATGGGTAA;SOR=1.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=61707733;WS=61707715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	61713126	rs5891777	A	ATGGACT	4250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=2862;SC=CATTTTAAAGATGGACTAGAA;SOR=0.947;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=42;WE=61713134;WS=61713116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	61713231	rs3890803	C	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=1.176;SC=ATGGGAAATTCGTTGTTTAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=61713239;WS=61713221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr8	61714245	rs10448027	A	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.18;SOR=3.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr8	61734295	rs4509369	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=483;ReadPosRankSum=-1.697;SC=ATATATGTATATGTATGTATG;SOR=0.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=28;WE=61734303;WS=61734285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr8	61748893	rs7005873	C	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=494;SC=AATTACCTTCCCAGGGGTCCA;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=61748901;WS=61748883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	61750860	rs7844902	A	G	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=77;PP=2367;SC=GAAGCATGACAGAGTTCATGT;SOR=1.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=116;WE=61750868;WS=61750850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	61764076	rs4342642	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=215;SC=TAGGATAACTATTTCTTTGAT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=61764084;WS=61764066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	61851407	rs138749865	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.256;NF=7;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TAGTCCTGAGCCATCTTTTGT;SOR=0.714;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=17;WE=61851415;WS=61851397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr8	61878921	rs35585682	T	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=348;ReadPosRankSum=-0.970;SC=ATGACAAGAATCACCCCAGGA;SOR=1.893;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=23;WE=61878929;WS=61878911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr8	62003453	rs1367972	A	G	5491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=100;NR=65;PP=2965;SC=TGAAGCTGTAATGAGTTAAGA;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=62003461;WS=62003443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr8	62003547	rs35220668	G	GC	3391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=68;PP=2218;SC=AATGACCCATGCCCCCCCACC;SOR=1.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=75;WE=62003555;WS=62003537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	62289060	rs10957192	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=259;ReadPosRankSum=-0.242;SC=ACCCTCCAGGCGGGGTTCATG;SOR=0.324;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=14;WE=62289068;WS=62289053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr8	62371122	.	G	GC	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.197;NF=3;NR=24;PP=328;ReadPosRankSum=-1.607;SC=GGTTATCAGAGCCCCCCCCCC;SOR=0.918;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=74;TCF=13;TCR=61;TR=27;WE=62371130;WS=62371112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr8	62371260	rs2291607	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=1.996;SC=AAACTGAAAACAAATGGGGCT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=62371268;WS=62371250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr8	62411925	rs71559334	G	GAAAT	1705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=1352;ReadPosRankSum=2.001;SC=ATTAAAAAGAGAAATATAAAA;SOR=1.128;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=28;WE=62411933;WS=62411915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr8	62416074	rs7005617	G	A	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=19;PP=697;SC=AGGTCCTGCAGCAGAAAGACA;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=62416082;WS=62416064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	62438530	rs4738904	A	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=700;SC=GAAGTCAGAAACTCACCTTGC;SOR=2.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=62438538;WS=62438520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	62460886	rs10113272	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr8	62460894	rs16927479	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr8	62465580	rs4289805	T	C	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=655;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GAAATTCATATACCCATTACC;SOR=0.827;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=43;WE=62465588;WS=62465570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr8	62465795	rs4291265	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.272;SC=CAGAAAAATATATCTCCATAT;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=62465803;WS=62465785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	62475160	rs3802287	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr8	62475276	rs3802286	C	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=1079;SC=CTTAATTTGACGTAGTTAATA;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=62475284;WS=62475266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	62475518	rs3824269	G	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=-0.053;SC=TAAGTCATGAGAGACTATTCA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=62475526;WS=62475508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr8	62479934	rs10090754	C	T	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=790;ReadPosRankSum=-1.837;SC=TTTGTAATTACCCAAAATATT;SOR=0.406;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=46;WE=62479942;WS=62479924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
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chr8	63161829	rs5020321	C	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CTCCCCACCGCCTGGCTGGGC;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=63161837;WS=63161819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr8	63948185	rs199816014	TAA	T	1923.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=3.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.00;ReadPosRankSum=4.268;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
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chr8	66439551	rs7825011	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=212;ReadPosRankSum=1.075;SC=TGAGCCACCATGCCCAGCCCT;SOR=0.866;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=17;WE=66439559;WS=66439541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
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chr8	66988806	rs16932468	A	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.054;SC=GCTAATAAAGAATATACAAAT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=66988814;WS=66988798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr8	67066238	rs34117579	CT	C	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.706;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr8	67380677	rs13682	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TTCATCTTTGCGCATAACTTA;SOR=1.255;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=22;WE=67380685;WS=67380667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
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chr8	67973984	rs7812572	C	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=378;ReadPosRankSum=-1.399;SC=CTGTCCCCCTCCCAGTCGGTG;SOR=1.002;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=27;WE=67973992;WS=67973974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
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chr8	68929993	rs12549702	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CTTTGGTTTGTTGTAAAGAAA;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=68930001;WS=68929983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr8	68931680	rs6984225	G	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.198;SC=TGGGAGGAAGGCATGGATGTA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=68931688;WS=68931679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr8	68939640	rs10957414	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=258;ReadPosRankSum=1.058;SC=ATTATTTTAATGAGTCTGATA;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=18;WE=68939648;WS=68939630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
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chr8	68968185	rs201801050	C	T	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.699;SC=AAACTGACTACGTTCCCTAAA;SOR=0.483;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=193;TCF=91;TCR=102;TR=109;WE=68968193;WS=68968156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,125:0.56:222
chr8	68972780	rs13256105	C	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=445;ReadPosRankSum=-0.956;SC=AAAAAATAATCTGTTGAAATG;SOR=0.126;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=20;WE=68972788;WS=68972770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
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chr8	69217174	rs2692030	T	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=588;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CTATTCTACATCACAGTGAGT;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=38;WE=69217182;WS=69217164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr8	69243745	rs2676639	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=985;ReadPosRankSum=-2.138;SC=GGCCAGGTGTCCTGGAACGCG;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=58;WE=69243753;WS=69243735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr8	69351982	rs2591004	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TAGATAGTTACCAAAGGTTTC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=69351990;WS=69351972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
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chr8	69442819	rs56048834	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=433;ReadPosRankSum=1.838;SC=TTGTTACATTGTTTCTCAGTT;SOR=0.702;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=34;WE=69442827;WS=69442809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr8	69688772	rs7833828	G	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.992;SC=CCATCTACTTGTAGGGTTTCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=69688780;WS=69688762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr8	70498501	rs2241882	G	A	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=455;SC=TTGTTTTACCGTCTCTTTTTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=70498509;WS=70498491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	70505272	rs4737996	A	G	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=90;PP=2965;SC=AATTCATGTGATTGTTTGAAG;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=163;WE=70505280;WS=70505262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr8	70513855	rs752040	A	G	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=16;PP=1757;SC=TACCAGCACAATTGATTCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=75;WE=70513863;WS=70513845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	70514116	rs1155965	A	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=319;SC=AAGTGTGTCTAAGATAATTCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=70514124;WS=70514106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	70516940	.	G	T	129	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=129;QD=23.3958875067;SC=TAAAGAATGTGGAGTCATGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=70516948;WS=70516930;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	70516969	rs4737284	G	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=251;SC=AAAAAAAAAAGGGGGCAGGAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=70516977;WS=70516959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	70539661	.	CA	C,CAA	138.70	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0,0;NR=14,14;PP=164,73;ReadPosRankSum=0.820;SC=TGAAAAAATACAAAAAAAAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14,14;WE=70539669;WS=70539651;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.67:12
chr8	70539911	rs4738002	G	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=345;SC=ATGAATAGCTGTTATTACAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=70539919;WS=70539908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	70540216	rs3802275	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=491;ReadPosRankSum=-0.463;SC=TCATAGAGTACGATAACCTAA;SOR=0.196;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=30;WE=70540224;WS=70540206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr8	70554689	rs7814130	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=274;ReadPosRankSum=2.265;SC=ACTGTCCTCAATCTGCCCCAC;SOR=2.093;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=15;WE=70554697;WS=70554679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr8	70571313	rs3802278	G	A	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=1017;ReadPosRankSum=1.724;SC=CAGCCCATTCGCAGGCACCCG;SOR=1.185;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=62;WE=70571321;WS=70571303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr8	70571531	rs6990375	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=734;ReadPosRankSum=-0.135;SC=AGAAGGCAGCGCCTCCTCTTC;SOR=0.865;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=48;WE=70571539;WS=70571521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,63:0.60:105
chr8	70674223	rs73684303	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=0.792;SC=CAGTTAACTTCCAAAAACGGA;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=23;WE=70674231;WS=70674213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
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chr8	71082718	rs2958370	A	G	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=311;SC=ATTCACACACAGATAGAAAAG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=71082726;WS=71082708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	71129120	rs71558586	A	AAC	892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=861;SC=ACCAGTAATTAACATTGTTTT;SOR=4.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=71129128;WS=71129110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	71486568	rs268566	G	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=24;PP=1062;SC=GTGTTGTAACGATTATTATGT;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=71486576;WS=71486558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	71506634	.	G	C	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=96;QD=16.3464015684;SC=GTTGAGGTAAGAAGAATGGAG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=71506642;WS=71506624;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	71510093	rs268626	A	G	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=22;PP=1427;SC=AATCTTAGATAAGGAAGGAGA;SOR=1.522;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=71510101;WS=71510083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	71512349	rs268592	A	T	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=33;PP=1699;SC=GATCAAGTCAATTTGTGACCC;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=71512357;WS=71512339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	71550058	rs268571	G	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=352;SC=ACCATTCTCTGAAAGCAAAAT;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=71550066;WS=71550048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	71550895	.	C	CT	140	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=62.13;NF=0;NR=7;PP=140;QD=22.0;SC=AAAAAAATTCCTTTTTTTTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=71550903;WS=71550885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,7:0.54:13
chr8	71573259	rs35863913	C	T	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=746;SC=AAGCAATCCACACACCTTGAC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=71573267;WS=71573249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	71574251	rs17760050	A	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=497;SC=TTTAACATGCACAAAAACCAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=71574259;WS=71574241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	71593425	rs6991329	G	A	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=38;PP=1778;SC=GTGCTTTAGCGTTAAGCTTTA;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=86;WE=71593433;WS=71593415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	71593663	rs71560435	CTTA	C	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=236;SC=ACAAAGATCCCTTATTTGCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=71593673;WS=71593653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	72111599	rs10103397	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=424;ReadPosRankSum=0.350;SC=GTTCCAAGGCATGGTGCAGGG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=32;WE=72111607;WS=72111589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr8	72111678	rs10090382	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=436;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CACACATACATGTGAGGACAG;SOR=0.919;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=39;WE=72111686;WS=72111668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,41:0.33:125
chr8	72111710	rs10103644	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=509;ReadPosRankSum=0.143;SC=CCAGCCCTGCCAGCTTTTTTG;SOR=0.746;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=38;WE=72111718;WS=72111693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,40:0.32:124
chr8	72111739	rs10103852	G	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.908;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=0.667;SC=CTCCCATGCTGACCCCCATTT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=34;WE=72111747;WS=72111729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,36:0.29:124
chr8	72127764	rs3735935	C	A	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=44;PP=1702;ReadPosRankSum=0.616;SC=AAAAAGAAAACAAAGACTGTT;SOR=0.581;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=104;WE=72127772;WS=72127754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,120:0.61:196
chr8	72128874	rs4737312	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=587;ReadPosRankSum=0.569;SC=AGTACTTTTGGAATTGTATCT;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=28;WE=72128882;WS=72128864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr8	72137261	rs13262002	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.248;SC=TACATCAAGTGTAGGCTCCGT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=72137269;WS=72137251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr8	72211178	rs17783968	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=0.226;SC=CTTGCCAAAAGCTGCCAAAAT;SOR=1.659;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=10;WE=72211186;WS=72211168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr8	72755040	rs7812453	A	C	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=2062;ReadPosRankSum=1.216;SC=AAACCGAAACAGCTCTCCTAC;SOR=0.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=108;WE=72755048;WS=72755030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr8	72935039	rs10085964	C	T	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	72935045	rs10086177	G	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.08;SOR=3.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	72935944	rs959975	T	C	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=76;SC=TAAAGCAAGATAATATATAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=72935952;WS=72935934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	72936237	rs1384001	C	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=998;SC=CCACTGGTACCAATATGCATA;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=72936245;WS=72936227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	72938357	rs2305018	A	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=916;SC=TAGTATATGGAATTTTTATAT;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=72938365;WS=72938347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	72942210	rs3824151	G	T	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=91;PP=2965;SC=CCAATCTGAAGTATGACACAA;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=152;WE=72942218;WS=72942200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	72962985	rs2120474	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=453;SC=GCATAAACCCGGGAAGAATTT;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=72962993;WS=72962975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	72963258	rs1025928	T	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=104;SC=GGAACCAACATGTAAAGCAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=72963266;WS=72963248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	72963296	rs1025929	A	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=21;SC=ATCCTTGCCCATTAATGGACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=72963304;WS=72963286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	72965973	rs3735942	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=9;PP=371;SC=TAAGCATGAGGACCGCAGTAC;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=72965981;WS=72965963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	72966002	rs3735943	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=12;PP=439;SC=TCTTCATCCAGGCGATCTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=72966010;WS=72965992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	72966124	rs3735944	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=218;SC=TTAAGAAAAGATGTGTGCATA;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=72966132;WS=72966114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	72971570	rs9298198	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	72971579	rs28736596	A	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	72975619	rs34929058	GA	G	966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=8;PP=434;SC=CATCTCAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=25;WE=72975627;WS=72975609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	72975801	rs7819749	T	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=813;SC=TAGCTCCTTTTTTAAGCTGGA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=72975809;WS=72975791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	72981327	rs1811457	A	G	3539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=57;PP=2301;SC=AGTTTCGGAGATTTGGGTTTG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=111;WE=72981335;WS=72981317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	72981584	rs1373297	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=161;SC=TCAGTTCTAACGAAACATTTA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=72981592;WS=72981574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	72987369	rs2278654	C	T	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=952;SC=AAAGCAGGCGCTGTGTGGGCG;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=72987377;WS=72987359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	72987384	rs2278653	A	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=15;PP=1084;SC=TGGGCGCGTCATTAGTAGGGT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=72987392;WS=72987374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	73117525	rs1842716	T	G	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.471;NF=41;NR=30;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GGGGAGGCACTGCACTTACCT;SOR=0.611;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=141;TCF=86;TCR=55;TR=71;WE=73117533;WS=73117515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr8	73142382	rs12541758	C	T	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.790;NF=30;NR=28;PP=855;ReadPosRankSum=2.163;SC=AGGTCCCCTTCATTCAGAAGC;SOR=0.663;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=58;WE=73142390;WS=73142372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr8	73146170	rs375770708	A	AT	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=267;ReadPosRankSum=-0.022;SC=TAATCATATGATTTTTTCAAC;SOR=0.420;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=10;WE=73146178;WS=73146160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr8	73152837	rs4559286	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=0.304;SC=GCTTTTGTAAATAATAATAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=73152845;WS=73152827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr8	73156976	rs2017235	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.097;SC=TATCATTTGACCTGGAAGCTC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=73156984;WS=73156967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr8	73850203	rs11782118	G	A	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1159;ReadPosRankSum=0.516;SC=ACCATGCTGTGAGTGAAGTCA;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=72;WE=73850211;WS=73850193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr8	73921534	rs113373855	G	GGAGGTCGGGAGA	2238.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=2972;SC=CGTCGCCGAGGGAGGGGCTGC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=20;WE=73921542;WS=73921524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	73993200	rs10087744	T	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=519;ReadPosRankSum=-0.986;SC=TAGGATGAAGTGGTCAAAAAG;SOR=0.642;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=34;WE=73993208;WS=73993190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr8	74005337	.	AC	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-1.230;SC=GACGCGACAGACCCCCGGGGC;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=74005345;WS=74005327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr8	74203576	rs4394387	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=456;SC=GCTGTGAGATGAAAACATAAC;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=74203584;WS=74203566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	74205710	rs140937357	GT	G	262.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=256;SC=GTCACACAGCGTTCACAATCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=74205718;WS=74205700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	74233349	rs3830704	T	TA	3437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=60;PP=2965;SC=ATAAAAAGAATATGTTGGGAG;SOR=2.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=5;TCR=68;TR=64;WE=74233357;WS=74233339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	74332207	rs6998213	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=915;SC=AATCATTAAAAACAACCCTAG;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=74332215;WS=74332197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	74334947	rs150343947	AAAAC	A	2508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=1764;SC=CCTAAAAATGAAAACAAACAG;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=74334958;WS=74334937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	74335014	rs60338415	T	TAGAAAGAC	996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1439;SC=AAAGCTGAGATAGAAAGACTC;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=74335022;WS=74335004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	74440125	rs143916422	T	TCAGGAAAATTCAAATAATTTA	4050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=2965;SC=GGTCTAGATTTCACAGAACAC;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=30;WE=74440133;WS=74440115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	74463089	rs3088139	T	G	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=45;PP=1422;SC=TTCGGTGAAGTGAAAAAAAAA;SOR=0.954;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=79;WE=74463097;WS=74463079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	74463797	rs10112019	T	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=20;PP=961;SC=ATACTAGCAATAGAATGCAAA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=45;WE=74463805;WS=74463787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	74473951	rs12546339	C	T	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=65;PP=1956;SC=TACCTGCAAACGGCTCACAAT;SOR=1.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=88;WE=74473959;WS=74473941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr8	74525859	rs73330848	C	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=480;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GTCCTGCCCTCATTTCAGGAC;SOR=0.465;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=28;WE=74525867;WS=74525849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr8	74527996	rs949493	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=25;PP=934;SC=TCATCATCCACATCCTTTCCT;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=74528004;WS=74527986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	74581290	rs11419133	A	AG	7973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=74;PP=2957;SC=CAAGGAAAAGACATCTCCTTG;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=119;WE=74581298;WS=74581280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	74744721	rs7842946	T	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=841;SC=ATTAAAAAAATAGCTTTGAAG;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=74744729;WS=74744711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	74917084	rs6472812	A	G	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=54;PP=2155;SC=AGAATTGAAAAGATCCAAAGG;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=74917092;WS=74917074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	75262798	rs7828201	G	C	5697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=98;PP=2965;SC=GGACGCATTCGTTCAGCTCTC;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=184;WE=75262806;WS=75262788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr8	75262841	rs4321999	G	A	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=89;PP=2965;SC=GGCGGAGGGTGGCGCGGATCG;SOR=1.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=140;WE=75262849;WS=75262831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr8	75272287	rs3780014	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-1.470;SC=ATGTTAATGATGAGTGGATAG;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=75272295;WS=75272281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr8	75274141	rs11554166	T	G	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=980;ReadPosRankSum=-1.482;SC=ACACAGAGTCTGAGCTGAAGA;SOR=0.842;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=70;WE=75274149;WS=75274131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,92:0.46:198
chr8	75275312	rs4463412	C	T	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=35;PP=1265;SC=TATATTCTTTCTCTCTTTTCA;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=75275320;WS=75275302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	75898571	rs144069052	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=308;ReadPosRankSum=-1.407;SC=ATCATTTATTTTATATGAAGT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=75898579;WS=75898561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr8	75924820	rs12115090	A	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TTTATGAAAAAATAAGTGTTT;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=26;WE=75924828;WS=75924810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr8	75926436	rs151047325	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=204;ReadPosRankSum=0.345;SC=TGTGTATCACTGAAGTGTATT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=13;WE=75926444;WS=75926426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr8	75944409	rs10714892	AT	A	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.883;NF=6;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=1.052;SC=CTTTTCATATATTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=8;WE=75944417;WS=75944399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr8	75944617	.	TAAAC	T	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=92;QD=39.3333333333;SC=TAAATCTTGATAAACAAAGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=75944628;WS=75944607;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr8	77745635	rs2733733	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1129;ReadPosRankSum=0.516;SC=AGTTGAGATCGACCTCAGGTA;SOR=0.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=133;TCF=55;TCR=78;TR=67;WE=77745643;WS=77745625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,92:0.52:176
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chr8	79598666	rs142222654	GTTTA	G,GTTTATTTA	1541.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=2,2;NR=16,16;PP=952,55;SC=GATACTGTTTGTTTATTTATT;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18,18;WE=79598677;WS=79598656;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.83,0.17:41
chr8	79601420	rs1872072	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.610;SC=TTTCAAGTACTATGCTATTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=79601428;WS=79601410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr8	80575954	rs13266097	T	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ATCTTAAAATTTCAATTCAAT;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=8;WE=80575962;WS=80575944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr8	80576923	rs375568053	C	CCTCT	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.611;SC=CCCATATTTTCCTTCTGAAAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=80576931;WS=80576913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr8	80576942	rs34059899	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=0.434;SC=ATGGGAAAAATTCATAAAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=5;WE=80576950;WS=80576932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr8	80678427	rs2440624	T	C	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1466;ReadPosRankSum=0.171;SC=TGGAGAGACATACACACAGAC;SOR=0.656;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=198;TCF=110;TCR=88;TR=88;WE=80678435;WS=80678417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,123:0.47:264
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chr8	80965039	rs3824267	T	A	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=44;PP=1161;SC=TGAGAATCTTTTGATACCTAC;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=80965047;WS=80965029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	80965070	rs3780010	C	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.23;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	80965739	rs2303446	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=482;SC=CACAGAACTACATCCAAAATT;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=80965747;WS=80965729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	81032301	rs4740118	A	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=163;SC=AAGTTAAAAGACAAGTGACAG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=81032309;WS=81032291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	81083598	rs201086010	AAAGCCCGAGTCC	A	961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.010;NF=0;NR=15;PP=2934;ReadPosRankSum=1.362;SC=GCGCCGAGCCAAAGCCCGAGT;SOR=1.758;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=15;WE=81083617;WS=81083588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr8	81426293	rs147305104	T	TA	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.697;NF=0;NR=8;PP=245;ReadPosRankSum=0.366;SC=TGGGAAGTGTTACATCTTACC;SOR=2.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=81426301;WS=81426283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr8	82437083	rs140527597	A	AT	69.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=0;PP=68;SC=CCAGCCTTGCATTGAACAGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=82437091;WS=82437077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	82437397	rs73275471	T	G	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=589;SC=GTATAGTTAGTGAAATTAACA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=82437405;WS=82437387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	82437457	rs11994340	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=247;SC=TCCTTAAAAATATTGAAAGAG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=82437465;WS=82437447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	82439099	rs11995518	T	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=103;SC=TTTTATATAATGCTTACGATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=82439119;WS=82439089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	82439111	rs11995519	T	A	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=516;SC=CTTACGATTATACATTTATCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=82439119;WS=82439089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	82441532	rs3842190	T	TG	1435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=1038;SC=TATCTTCACATTGACATCCTT;SOR=3.258;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=25;WE=82441540;WS=82441522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	82443387	rs11985337	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=390;SC=ATTAGGGAGTTCAAGATTAAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=82443395;WS=82443377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	82583121	rs80087492	T	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=18;PP=1289;SC=AAAAGGTGTGTGCACACACAC;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=82583129;WS=82583111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	82590822	rs2932222	C	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=24;SC=ACCTACTTGGCAGGCTGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=82590830;WS=82590812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	82591292	rs74841350	A	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=327;SC=CATGTTCCTAAATAGAGTATC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=82591300;WS=82591282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	82593864	rs147457857	ATAGT	A	3805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=31;PP=2318;SC=TAATTATAGAATAGTTAGTTC;SOR=1.127;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=46;WE=82593875;WS=82593854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	82607148	rs75101336	C	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=19;PP=531;SC=GCGATGACATCCTTGCTTCTT;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=82607156;WS=82607138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	82621132	rs149732910	GC	G	823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=847;SC=AAAAACTAGAGCCACAAAACT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=21;WE=82621140;WS=82621122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	82621181	rs78070409	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=197;SC=AATTTGATTCGAAATGTGAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=82621189;WS=82621171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	82626146	rs75348453	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=25;PP=1093;SC=AAATCTCTAAGACCAACCTGT;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=82626154;WS=82626136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	82627395	rs58900840	A	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=64;PP=2011;SC=CAGACCTAAAACAAATCAATG;SOR=2.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=86;WE=82627403;WS=82627385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	82627435	rs146444702	TA	T	1550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=62.08;NF=1;NR=42;PP=1753;SC=GTATTCATTTTATTTTTGCTT;SOR=4.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=43;WE=82627443;WS=82627425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	82629447	rs62512330	G	A	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=17;PP=926;SC=ACATAAATACGAATACATTTT;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=82629455;WS=82629437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	82665476	rs137960856	TGTGA	T	3476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=53;PP=2868;SC=CATGAAAACATGTGAGTGACT;SOR=2.215;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=55;WE=82665487;WS=82665466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	82670771	rs35094336	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=15;PP=498;SC=GGCAGCTTGGGCTACCTAAAC;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=82670779;WS=82670761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	82741576	rs34550849	C	CA	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.705;SC=GAATTTGACTCATTAACAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=5;WE=82741584;WS=82741566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr8	85441856	rs13248532	T	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr8	85716963	rs11784597	C	A	104.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.47;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	86048000	rs36102162	AT	A	333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=23.84;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	86089787	rs12926	C	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=12;PP=676;SC=TCGGGGGCGCCGGGGGCGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=86089795;WS=86089777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	86114525	rs3217409	T	TTTA	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=412;SC=TTCTGAAACCTTTTTTCTTCT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=86114533;WS=86114515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	86121311	rs3808538	G	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=450;SC=CTGTCTTATTGTACTGTCTTA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=86121319;WS=86121301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	86126827	rs112611553	C	CAACATT	2063.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=1580;SC=GTAGCTTCATCAACTGGTTTG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=23;WE=86126835;WS=86126817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	86134784	rs12550160	C	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=609;SC=ACCAACCAACCGTGTGATCTT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=86134792;WS=86134774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	86135096	rs2132589	A	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=707;SC=CAATGAGAGCAACACACACAA;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=86135104;WS=86135086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	86135132	rs1021583	A	G	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=351;SC=CAGACCAGAGAACTCTGATGC;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=86135140;WS=86135122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	86158217	rs34150174	TTAAAC	T	2450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1960;SC=CGGTTCCTCTTTAAACTAAGC;SOR=2.262;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=37;WE=86158229;WS=86158207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	86158249	rs17740658	C	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=677;SC=GAGCCCAGTGCGAGAAGCGGA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=86158257;WS=86158239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	86171786	rs4739698	T	C	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=30;PP=988;SC=ATAAGACATATCTGTGATTCA;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=86171794;WS=86171776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	86171816	rs4739699	A	G	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=1012;SC=CACATGGTGGAATTTAAGGGG;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=86171824;WS=86171806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	86180944	rs2006767	A	G	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=8;PP=201;SC=CTTAATTTCTACTGTGTTTTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=86180952;WS=86180934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	86244914	rs1995058	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	86250709	rs4740049	T	C	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=83;PP=2617;SC=AAAATCAATGTCTTATCAAAT;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=117;WE=86250717;WS=86250699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	86253982	rs1496532	C	T	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=890;SC=TAGAAACTTACTTGCTTTTAA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=86253990;WS=86253972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr8	87125925	rs117082993	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=520;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ATTGGGGTTTCATTTAATTTC;SOR=2.030;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=26;WE=87125933;WS=87125915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr8	87151606	rs2466326	G	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TGTACCTAAAGAGTGTGTGTT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=87151614;WS=87151596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr8	87155094	rs1483779	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=238;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TATGATCTTTTTTCTTTTTAA;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=16;WE=87155102;WS=87155084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr8	87165011	rs10504820	T	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=668;ReadPosRankSum=2.209;SC=TCCAAATAAGTTGATGATCTG;SOR=0.205;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=35;WE=87165019;WS=87165001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr8	87452766	rs4961191	A	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=346;SC=GCCCCTTGTAAGAACCTTATT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=87452774;WS=87452756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	87453030	rs10092164	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTATCTTTGCACTTTTCCATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=87453038;WS=87453020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr8	87480730	rs72690412	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=441;ReadPosRankSum=0.460;SC=AAAAGGACTGCGTATACCATA;SOR=1.232;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=26;WE=87480738;WS=87480720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr8	87482324	rs6471352	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TATAGAATCACGGCCATTTTC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=87482332;WS=87482314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr8	87484640	rs72690413	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=602;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TAAAAAGCCATCCAGCAGAAT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=40;WE=87484648;WS=87484630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,63:0.53:119
chr8	87519315	rs6980476	T	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=672;ReadPosRankSum=0.385;SC=AAAGGCCTCTTTTGAAAGTTC;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=43;WE=87519323;WS=87519305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr8	87540872	rs10956871	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=-0.287;SC=TATGTGTGTTGTTTTTGAATA;SOR=0.247;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=24;WE=87540880;WS=87540862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
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chr8	87544832	rs72690457	A	G	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=666;ReadPosRankSum=0.731;SC=GCAGATTTCAAAAAGGTTGTC;SOR=0.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=44;WE=87544840;WS=87544822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
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chr8	87557153	rs17609515	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TAGCATCAAACGGTTTACTAT;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=17;WE=87557161;WS=87557143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr8	87567031	rs2304790	G	A	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=18;PP=1888;SC=TAAACACATTGTGCTTGAGAA;SOR=2.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=81;WE=87567039;WS=87567021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	87567305	rs3816240	A	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=28;PP=757;SC=CATAATACAAAGTCAGGGCAA;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=87567313;WS=87567295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	87568644	rs2304787	T	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1465;SC=AGGCAGTTGATTAGGTGTGCA;SOR=1.216;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=87568652;WS=87568634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	87570665	rs1062850	A	C	5196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=90;PP=2965;SC=CTTTTGTGTTATGTGGAGCAA;SOR=1.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=142;WE=87570673;WS=87570655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr8	87570728	rs1062851	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=39;PP=1237;SC=CTTTTTACCCCCAGCATTTAT;SOR=1.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=87570736;WS=87570718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	87581682	rs10660354	T	TCA	1615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.688;NF=1;NR=34;PP=1531;ReadPosRankSum=0.343;SC=ACATGCACACTCACACACACC;SOR=2.461;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=35;WE=87581690;WS=87581672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr8	87588519	rs974279	T	C	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=130;SC=TATCATTTGATGAAGTTTCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=87588527;WS=87588509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	87666251	rs4961206	T	G	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=49;PP=1851;SC=TGAAATTTTGTAGAAGTCCTG;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=97;WE=87666259;WS=87666241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	87679098	rs3735967	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=223;SC=ACTTTTTGTAGCCCAATTAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=87679106;WS=87679088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	87679303	rs6471482	A	C	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=37;PP=1880;SC=GTGGTATAAAACAGCAGTTCC;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=87679311;WS=87679293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	87680112	rs7815125	T	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=7;PP=1150;SC=TGCAGGTTATTTAATTTAAAT;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=87680120;WS=87680102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	87683465	rs1441242	C	T	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=47;SC=ACAATTCAAACATTAGGTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=87683473;WS=87683455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	87755599	rs112055920	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=433;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TAAGCCCGACACAGTACATGT;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=26;WE=87755607;WS=87755589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr8	87878846	rs2453451	T	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=922;ReadPosRankSum=-1.910;SC=CTTATTCACCTACCATTGTTT;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=56;WE=87878854;WS=87878836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr8	87951714	rs4644279	A	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=201;SC=TCTGAAAATGACAAATTTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=87951722;WS=87951704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	88363893	rs62526808	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=1.184;SC=TGTGAAATGAACTATCTCTCT;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=23;WE=88363901;WS=88363883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr8	88366043	rs62526810	A	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-1.168;SC=TTTAACTGTTATACCATTTTA;SOR=0.210;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=14;WE=88366051;WS=88366033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr8	88440715	.	C	CTATCTTTT	1450	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=19;NR=1;PP=1450;QD=74.05;SC=AGCAATTGCTCTTTTTATGAA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=88440725;WS=88440705;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr8	88440716	.	T	TA	1605.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.88;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	88440717	.	T	A	509	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=21;NR=1;PP=509;QD=24.7168732976;SC=CAATTGCTCTTTTTATGAAGA;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=22;WE=88440725;WS=88440705;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,22:0.73:30
chr8	88440717	.	T	TCTTTTTA	1605.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.88;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	88622001	rs9692781	C	T	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=22;PP=1016;SC=TCTTCAACACCGAAAATTCTA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=88622009;WS=88621991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	88622043	rs9694259	T	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=26;PP=979;SC=TCAGATTGCATCATGGACAAA;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=88622051;WS=88622033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	88622592	rs72670872	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=291;SC=CATGAATTTCAGAAGCCTTTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=88622600;WS=88622582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	89068596	rs2616495	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	89081541	rs2664347	A	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=249;SC=TTTGGTGTTTACGAATGCAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=89081549;WS=89081531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	89081730	rs2616490	T	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=65;PP=2632;SC=TCTTGGATTATAGATAGAGTG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=126;WE=89081738;WS=89081720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	89339993	.	GCA	G	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.9983;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=75;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.606;NF=9;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=0.264;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=89340002;WS=89339987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr8	89340162	rs16892543	G	C	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1169;ReadPosRankSum=1.633;SC=CCCGCGACAAGGGCCCTGGTT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=93;WE=89340170;WS=89340152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,114:0.54:210
chr8	90770609	rs39499	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr8	90777510	rs431264	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=1.995;SC=CTTTCTAAGTGTGAAACATAG;SOR=1.134;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=15;WE=90777518;WS=90777500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr8	90781953	rs40377	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=219;ReadPosRankSum=-1.735;SC=GACTTTTGGACTTTTTAAAGA;SOR=0.301;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=18;WE=90781961;WS=90781943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
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chr8	90926472	rs28507172	T	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=1.623;SC=ATTTAAAAAATTTTTTTATGC;SOR=0.622;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=15;WE=90926480;WS=90926462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
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chr8	91963466	rs34782158	CT	C	1767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.897;NF=2;NR=28;PP=1889;ReadPosRankSum=0.095;SC=CTTCTGTGTCCTTTTGTATTT;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=30;WE=91963480;WS=91963456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
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chr8	91967658	rs2677572	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=410;SC=GCACCTTGAATGTTCTTTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=91967666;WS=91967648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	91971072	rs3830308	A	ATTCT	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=0.293;SC=TGATTAGAAAATTCTTTATAT;SOR=0.283;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=91971080;WS=91971062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
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chr8	92021036	rs2054805	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GTAAAATAAACAAAGAGAGGA;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=19;WE=92021044;WS=92021026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr8	92030571	rs186670086	A	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=567;ReadPosRankSum=-1.246;SC=AATCTGTAAGATCATGACCTA;SOR=0.631;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=31;WE=92030579;WS=92030561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
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chr8	92033502	rs34503257	T	C	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=779;ReadPosRankSum=0.706;SC=CATTGCAAACTGTGCACTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=79;TCR=37;TR=54;WE=92033510;WS=92033492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,55:0.45:122
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chr8	92090573	rs11786324	G	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.340;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=861;ReadPosRankSum=0.707;SC=CATGCATTCTGCTTTTCTTAG;SOR=0.199;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=55;WE=92090581;WS=92090563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
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chr8	93328993	rs200192945	C	CGAA	739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.91;MQRankSum=2.212;NF=0;NR=16;PP=668;ReadPosRankSum=-0.015;SC=AAGACGAAGACGAAGAAGAAG;SOR=0.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=16;WE=93329001;WS=93328983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
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chr8	94715965	rs6997642	C	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=-1.769;SC=CTGGCAAAGACTATGAGGTTT;SOR=1.112;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=10;WE=94715973;WS=94715955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr8	94739345	rs2914959	A	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=543;ReadPosRankSum=0.611;SC=ATAAAATTCTATTTACAAAAG;SOR=0.590;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=40;WE=94739353;WS=94739335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr8	94740320	rs77899597	CA	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=123;ReadPosRankSum=1.467;SC=ATGACATGGACATTTTTTTGA;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=94740328;WS=94740310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr8	94752754	rs3813853	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=598;ReadPosRankSum=0.097;SC=ACTGCCCCCAGATCTAACTGA;SOR=0.540;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=31;WE=94752762;WS=94752744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
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chr8	94808165	rs3134031	A	G	7079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=89;PP=2965;SC=GCCAATGCCAATTCAGGAAGA;SOR=1.039;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=130;TCR=89;TR=219;WE=94808173;WS=94808155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr8	94928208	rs4236818	A	C	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=16;PP=1630;ReadPosRankSum=1.450;SC=TTTACCACAGACAATACCAAT;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=66;WE=94928216;WS=94928198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr8	94935937	rs4735258	T	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=626;SC=TCAAATGATATACATTTAAAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=94935945;WS=94935927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr8	95143186	rs1051623	C	G	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=2343;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TCTCCTCAAACTCTGTGTGCC;SOR=0.934;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=54;WE=95143194;WS=95143162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
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chr8	95272605	rs2170363	G	C	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=804;ReadPosRankSum=0.939;SC=TGGCGGTTGCGGTGGCTGTAC;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=54;WE=95272613;WS=95272595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr8	95549219	rs368523841	GA	G	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr8	95651303	rs12679585	G	A	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=735;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CCTGGGCCCAGCAGAGCTGAG;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=42;WE=95651311;WS=95651293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr8	95651573	rs13268847	C	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.568;NF=27;NR=38;PP=1041;ReadPosRankSum=1.880;SC=AAGTTCAGGACAGGGAAGCAC;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=65;WE=95651581;WS=95651563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr8	95651590	rs5893292	C	CT	2073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.506;NF=3;NR=31;PP=2253;ReadPosRankSum=-1.782;SC=GCACCCACCTCTGGAACTCAA;SOR=0.822;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=34;WE=95651607;WS=95651580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
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chr8	95654043	rs62523409	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GCACCGGAACCGATGGCGAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=95654051;WS=95654042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr8	95655415	rs2303451	T	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CCAGCACCGGTGTCACCCATC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=95655423;WS=95655408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr8	95655596	rs72676907	T	C	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=581;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TCTGTACTGATGGGCAGCTTC;SOR=0.897;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=51;WE=95655604;WS=95655586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr8	95658287	rs149099719	A	AT	120.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=133;SC=TAAATTTTAAATTTTTCCATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=95658295;WS=95658278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr8	95658562	rs57602858	A	AAAAT	1291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=1268;SC=GTTCCAGAAAAGGTAATTCAA;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=21;WE=95658570;WS=95658552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr8	95673945	rs7820441	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.517;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.063;SC=GTCTAGAACTAGCATCTGCTG;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=95673953;WS=95673935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr8	95674432	rs2303453	G	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CTTGGTATAGGTTTAATTTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=95674440;WS=95674422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr8	95676785	rs17717009	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=1.226;SC=GAGGTTATAAGGAAAATCAAG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=13;WE=95676793;WS=95676775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
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chr8	95793515	rs4398879	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=326;SC=AAACTCAGGCGTTTTAGGGAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=95793523;WS=95793505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	95796177	rs4236830	T	A	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=99;SC=AAAAACCTTTTTAATTAATAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=95796185;WS=95796167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	95853708	rs11996455	G	A	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=21;PP=1577;SC=AACTTTATGTGTGTGTTCTAG;SOR=1.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=95853716;WS=95853698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	95853907	rs13271375	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1050;SC=CAAATTTCCTATGGCTCTGTG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=95853915;WS=95853897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	95853948	rs13271644	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=505;SC=ATATAAGGGAAATTAACATAG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=95853956;WS=95853938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	95871666	rs186645694	G	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-0.330;SC=GTTGAAATCTGAGCAAGTATT;SOR=0.627;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=6;WE=95871674;WS=95871656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr8	95877787	rs713113	T	C	6528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=88;PP=2965;SC=CTAAAGAAAGTAGACGGACTG;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=115;TCR=88;TR=203;WE=95877795;WS=95877777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr8	95886551	rs10956928	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.11;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	95888307	rs1129152	C	T	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=197;SC=TGTAGGTGGCCATTTTATGTC;SOR=1.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=95888315;WS=95888297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	95902645	.	C	G	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=706;ReadPosRankSum=0.607;SC=TAACATACCTCTAAAAGCCAG;SOR=0.916;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=42;WE=95902653;WS=95902635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr8	95906554	rs2466431	C	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=321;SC=CGCTGATTCGCAGGTGAAAGC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=95906562;WS=95906544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	95951807	rs2013597	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=131;SC=GTTATTTTTTGTACAGACGGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=95951815;WS=95951797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	95951916	rs5893310	GTGAC	G	1517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=896;SC=GTGAGACACTGTGACTGGTCA;SOR=0.869;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=16;WE=95951927;WS=95951906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	95952477	rs2956210	A	G	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=49;PP=1471;SC=TGCAGTCCACATGTGTTGTTG;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=66;WE=95952485;WS=95952467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	96046094	rs2678823	G	A	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1502;SC=AGGGGCGCATGGGAGGAGATT;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=96046102;WS=96046084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	96047806	rs34960210	T	TA	506.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=301;ReadPosRankSum=0.401;SC=CTATGGAAGGTAAAAAAAAAA;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=21;WE=96047814;WS=96047796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr8	96053782	rs79118993	GCT	G	2230.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=1830;SC=AACTTATAATGCTCTTTGTTT;SOR=1.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=96053791;WS=96053772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	96054000	rs7818382	C	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=313;SC=TCATACTTTACCCTTGCATGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=96054008;WS=96053990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	96070181	rs2678832	T	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=29;PP=941;SC=TTTCATGGCATTGATGTTAAT;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=96070189;WS=96070171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	96085317	rs4641029	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GCTTATATGGCTGCGGGGACC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=96085325;WS=96085307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr8	97172403	rs2466129	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=201;ReadPosRankSum=0.318;SC=AAAAGTAAAAAGGAAGTGTCC;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=11;WE=97172411;WS=97172393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
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chr8	97847358	rs1864384	G	T	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=34;PP=903;SC=CTGCCAAGGTGGGGGCTTTGG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=97847366;WS=97847348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	98289986	rs28669903	C	T	7184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=106;PP=2965;SC=GGGCGTCGTCCGGAGCAGGGC;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=98;TCR=106;TR=204;WE=98289994;WS=98289976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr8	98943545	rs2290471	A	G	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=871;ReadPosRankSum=-1.554;SC=TGATCGTGACAGATGGGAGAC;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=59;WE=98943553;WS=98943535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,69:0.41:169
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chr8	98954272	rs3018906	T	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=136;ReadPosRankSum=0.819;SC=GTTTGGTATTTTCTGTTGACC;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=9;WE=98954280;WS=98954262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr8	98973560	rs62523561	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=309;ReadPosRankSum=0.537;SC=CTGGAGTTCCCTGTTGCCTCA;SOR=0.163;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=23;WE=98973568;WS=98973550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
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chr8	99030280	rs2248014	T	C	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGAACAGTGATGACTCATACA;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=81;TCR=86;TR=100;WE=99030288;WS=99030270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,116:0.57:203
chr8	99033328	rs6987112	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.364;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=402;ReadPosRankSum=0.377;SC=AGAGAGGTGTATTTTCTTTAA;SOR=3.007;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=18;WE=99033336;WS=99033318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr8	99057526	rs812	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=534;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CCCTGGCCAAGACATCTCTCC;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=34;WE=99057534;WS=99057516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
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chr8	99121038	rs34397714	A	AG	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=1.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr8	99140544	rs2447508	G	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=538;SC=TTATTCTCCAGTGTTAATTCA;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=99140552;WS=99140534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr8	99152170	rs28549107	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=3;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=1304;ReadPosRankSum=0.666;SC=ATAGTGGCAACTTCCCTGGTT;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=30;WE=99152191;WS=99152160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
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chr8	101225241	rs11280812	C	CCCGCGGCCT	861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.977;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=1808;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GTCCTGCACCCCCGCGGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=9;WE=101225249;WS=101225231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr8	101225298	rs3098659	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1040;ReadPosRankSum=0.453;SC=CCCTCACTTCCCGCATCCACT;SOR=0.862;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=66;WE=101225306;WS=101225288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,80:0.56:142
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chr8	101225708	rs1660352	C	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=279;ReadPosRankSum=1.377;SC=TGCGGTTCACCCGACCTCCGG;SOR=0.772;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=21;WE=101225716;WS=101225698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
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chr8	101721817	rs201076736	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-6.578;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.269;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,46:0.16:290
chr8	101721839	rs202074479	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=4.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQRankSum=-4.154;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,32:0.13:252
chr8	101937370	rs964919	A	T	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.53;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	101937370	.	AAACA	TAACA,TAACG	290	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11,6;NR=22,14;PP=168,290;QD=6.1445821984;SC=TATAAAACTTAAACACCCAGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33,20;WE=101937382;WS=101937360;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:33
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chr8	101937455	rs964917	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GGCAGCAATATTTTAAGTTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=101937463;WS=101937445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr8	102585806	rs548564	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=0.852;SC=ATTGGTTAATGTTCATGTGAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=102585814;WS=102585796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr8	102656243	rs117815057	G	T	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=940;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGTAGATCCAGTTACGGAGCA;SOR=0.663;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=234;TCF=150;TCR=84;TR=75;WE=102656251;WS=102656233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,86:0.32:266
chr8	102676566	rs3029400	T	TGAA	1232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=1118;ReadPosRankSum=0.028;SC=GACTCATGAGTGAAGAGCACT;SOR=1.259;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=22;WE=102676574;WS=102676556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
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chr8	102678972	rs3735713	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=0.598;SC=CTCTCAGTGCGTTCCTCCCTG;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=27;WE=102678980;WS=102678962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
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chr8	103301932	rs184961135	A	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=402;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TGAGCTGAGAATTCTTAGAAA;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=20;WE=103301940;WS=103301922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr8	103306033	rs16869352	T	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=490;ReadPosRankSum=1.533;SC=ATGCTTGGAATACACGCTTGC;SOR=0.916;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=32;WE=103306041;WS=103306023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,38:0.30:125
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chr8	103311153	rs61752302	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=812;ReadPosRankSum=0.678;SC=AATGAGCATTCGCCTTTCGAT;SOR=0.774;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=189;TCF=95;TCR=94;TR=60;WE=103311161;WS=103311143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,73:0.31:233
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chr8	103316494	rs2925787	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-0.238;SC=ATATTTAGTATTCTAATTCAC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=103316502;WS=103316484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr8	103317265	rs3018537	A	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=1.305;SC=CATTTTCAAAATTGCCTAAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=103317273;WS=103317255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr8	103323901	rs35340325	CT	C	1158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.760;NF=20;NR=13;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.216;SC=GCCAGACCCCCTAACCTCACA;SOR=0.673;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=33;WE=103323909;WS=103323891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,41:0.29:143
chr8	103326234	rs718165	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=-0.983;SC=AGACTATCTTTAAAGGGATAC;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=17;WE=103326242;WS=103326224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr8	103327127	rs71518855	A	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=267;ReadPosRankSum=0.373;SC=TAAATGAAATAATGGAAACTA;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=19;WE=103327135;WS=103327117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr8	103338627	rs117766015	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=428;ReadPosRankSum=0.351;SC=TATTACTCTACTGAATGAAGG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=21;WE=103338635;WS=103338617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
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chr8	104709594	rs1176674	A	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=550;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GTTAGAGAGTATGTTAATTCA;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=30;WE=104709602;WS=104709584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
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chr8	104973363	rs201192656	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=2.309;SC=TAGTATCAGGTAAGAATTTTA;SOR=0.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=18;WE=104973371;WS=104973353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
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chr8	105440462	rs2246815	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5982;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AGTCAGAAAAATCCAATGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=16;WE=105440470;WS=105440452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr8	105459793	rs7821992	C	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=0.173;SC=TAATTTCAACCTTCTCTAAAA;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=17;WE=105459801;WS=105459783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr8	105463690	rs2669429	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=1.798;SC=TAAGTCATTTATCATCTTGAA;SOR=1.170;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=27;WE=105463698;WS=105463680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr8	105479149	rs2959023	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GCGCCGCCATAGCGAGGGGCG;SOR=0.180;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=20;WE=105479157;WS=105479139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr8	105503818	.	T	TA	115	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.9957;HP=16;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=15;MQ=57.51;NF=0;NR=8;PP=115;QD=14.75;SC=GGTACTAAGATAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=8;WE=105503826;WS=105503808;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,8:0.24:33
chr8	105601198	.	A	ACGCCGCCGC	1897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.920;NF=0;NR=26;PP=2528;ReadPosRankSum=-2.011;SC=GACGACGCCGACGCCGCCGCC;SOR=1.568;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=3;TCR=85;TR=26;WE=105601206;WS=105601188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr8	105845706	rs145596017	T	TTTTTTTTC	1522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=899;SC=AATTTTTTCCTTTTTTTTCTA;SOR=0.941;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=16;WE=105845714;WS=105845696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	105907461	rs2290865	G	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAAAAGAAAAGTAGCTGCAGG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=105907469;WS=105907454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr8	105907786	rs3214884	GT	G	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.448;NF=1;NR=27;PP=874;ReadPosRankSum=-0.271;SC=ATGGAAAACAGTTAATTTTAA;SOR=0.641;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=4;TCR=82;TR=28;WE=105907794;WS=105907776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,41:0.33:125
chr8	105907833	rs2290866	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=315;ReadPosRankSum=0.314;SC=AAATAAAAGACCCAGAAATCA;SOR=1.426;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=19;WE=105907841;WS=105907823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr8	106430676	rs1383592	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TTAATGTAGCGCACCTCACTC;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=13;WE=106430684;WS=106430666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr8	106431029	rs11783971	AT	GC	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TCTTTACCAGATAGTTAATTC;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=38;WE=106431038;WS=106431019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,42:0.34:125
chr8	106431290	rs3214948	CA	C	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.516;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=265;ReadPosRankSum=0.381;SC=ACCACTGTAACAAAAAAAGGC;SOR=0.213;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=17;WE=106431298;WS=106431280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,17:0.25:69
chr8	106431589	rs112841122	T	TA	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=1.604;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr8	106456683	rs11990012	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=41;ReadPosRankSum=0.441;SC=TTTCTTGAACATCAGTTAGCT;SOR=0.175;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=6;WE=106456691;WS=106456673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
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chr8	109094747	rs10955475	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=944;ReadPosRankSum=0.075;SC=AAGCCCACCACGCACCTTTGG;SOR=0.336;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=92;TCF=71;TCR=21;TR=56;WE=109094755;WS=109094737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,58:0.60:96
chr8	109215368	rs630492	T	C	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=82;PP=2965;SC=CACAGGGAAATTGATCCTATA;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=176;WE=109215384;WS=109215358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr8	109215441	rs72205512	TGCACTGTATAGAGATGACAATA	T	2743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=39;PP=2954;ReadPosRankSum=0.899;SC=CATATTTTAATGCACTGTATA;SOR=1.024;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=45;WE=109215470;WS=109215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,69:0.64:108
chr8	109229529	rs11358208	TA	T	334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=5;PP=179;SC=CTTAGGTATTTAAAAAAAAAA;SOR=0.976;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=9;WE=109229537;WS=109229519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	109245991	rs612744	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=434;SC=TCTCTTGAGCGCAAGAGTTCA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=109245999;WS=109245981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	109246032	rs587340	C	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=336;SC=GGCACCACTGCACTCTTACCT;SOR=2.448;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=109246040;WS=109246022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	109252471	rs16877534	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GTCCCCGATCCCTAATTTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=109252479;WS=109252461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr8	109254262	rs615233	C	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=9;PP=333;SC=TACGATAAACCATTAACATTC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=109254270;WS=109254252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	109254677	rs627392	C	T	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=45;PP=1252;SC=CAAATAGATACATATACACAA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=109254685;WS=109254667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	109260776	rs4735053	A	G	7121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=81;PP=2965;SC=TACAGACACCACCTTTCGGCC;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=137;TCR=81;TR=218;WE=109260784;WS=109260766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr8	109455802	rs3737501	G	A	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1323;ReadPosRankSum=0.284;SC=ATGAGAAAAAGCTACGTAACT;SOR=0.468;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=108;TCF=79;TCR=29;TR=74;WE=109455810;WS=109455792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr8	109455863	rs3737502	C	T	3223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.126;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=53;PP=2185;ReadPosRankSum=2.724;SC=GCCCTCTCACCCCGCTGCCTC;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=131;WE=109455871;WS=109455853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,138:0.65:213
chr8	109462791	rs4540386	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GACTTAATGTATGGCTTATAT;SOR=0.512;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=26;WE=109462799;WS=109462781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr8	109468230	rs10646253	T	TAGAA	421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.919;NF=0;NR=9;PP=482;ReadPosRankSum=1.006;SC=GAGGAAATAATAGATACATAA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=109468238;WS=109468220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr8	109488937	rs1871685	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=602;ReadPosRankSum=1.029;SC=CTGAATGCCTATGGTATGATG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=27;WE=109488945;WS=109488927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
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chr8	109498656	rs10111934	T	G	94.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CAATGTTAAGTTTCATTAACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=109498664;WS=109498646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr8	110420245	rs16879470	T	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=680;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TATTAGTTAATGTCTACAAAT;SOR=0.218;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=41;WE=110420253;WS=110420235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr8	110420384	rs13254245	T	C	5238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TCACACTGAATTGGGATGGGA;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=307;TCF=150;TCR=157;TR=188;WE=110420392;WS=110420374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,231:0.62:370
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chr8	110424563	rs145408242	C	T	5218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=2.319;SC=CCTGAAAAACCCAGCTGTTCT;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=135;TCR=171;TR=200;WE=110424571;WS=110424553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,226:0.65:348
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chr8	110473907	rs1026439	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=307;ReadPosRankSum=-0.990;SC=TGAGATCATATGTGAATCAAA;SOR=0.076;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=18;WE=110473915;WS=110473897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
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chr8	110476993	rs1673398	A	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.017;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1320;ReadPosRankSum=0.671;SC=CAGTGCCTGCACCTGCAATAT;SOR=0.506;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=81;WE=110477001;WS=110476983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,86:0.36:238
chr8	110489620	rs1783148	A	T	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=1491;ReadPosRankSum=0.822;SC=GACCAGCCACATATAAGTACA;SOR=0.851;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=291;TCF=129;TCR=162;TR=105;WE=110489628;WS=110489610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,120:0.35:345
chr8	110491840	rs1783147	C	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=157;ReadPosRankSum=0.234;SC=CTGTACCTCACCCAGGGGCAA;SOR=1.000;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=18;WE=110491848;WS=110491830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr8	110491877	rs1630942	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=223;ReadPosRankSum=-0.690;SC=AGGTAAATGCGTAAACACAAA;SOR=0.822;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=23;WE=110491885;WS=110491867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr8	110491964	rs1630134	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-0.790;SC=ACACCTTTCCAAAAGAGCAAG;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=15;WE=110491972;WS=110491954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr8	110492949	rs1026437	G	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=526;ReadPosRankSum=1.476;SC=CTATTAAGCAGCATTAAAATA;SOR=1.133;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=113;TCF=20;TCR=93;TR=31;WE=110492957;WS=110492939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,32:0.25:127
chr8	110495192	rs2844254	T	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=314;ReadPosRankSum=-1.842;SC=GGTGAATAAGTAGGAGTGTGC;SOR=0.727;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=24;WE=110495200;WS=110495182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr8	110499063	rs17375750	T	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=580;ReadPosRankSum=0.880;SC=TGGTATCAATTCAGTTTATTT;SOR=0.470;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=34;TCR=94;TR=40;WE=110499071;WS=110499053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,44:0.31:141
chr8	110504088	rs56235913	CTTT	C	1626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=14;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.343;NF=10;NR=18;PP=695;ReadPosRankSum=-1.242;SC=TTCTTTTTTTCTTTTTTTAAA;SOR=0.555;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=28;WE=110504098;WS=110504078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,46:0.36:127
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chr8	110516527	rs720139	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TTAGAGAAAATAATCACTTAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=5;WE=110516535;WS=110516517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
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chr8	110523207	rs72669109	A	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=230;ReadPosRankSum=1.932;SC=GATTATTTGCATGTTATTTCT;SOR=1.570;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=15;WE=110523215;WS=110523197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,16:0.25:65
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chr8	110587975	rs61734661	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,52:0.26:200
chr8	110620037	.	T	TCACACACA	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.70;QD=50.87;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr8	113241088	rs1592624	T	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=333;ReadPosRankSum=0.257;SC=TGAGGTTGATTTGAAGAATTT;SOR=0.942;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=25;WE=113241096;WS=113241078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr8	113253954	rs61753736	A	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=716;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CTAACCACTTAGCTTTGGGCT;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=50;WE=113253962;WS=113253944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr8	113254070	rs371891542	TGC	T	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=1.096;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.864;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr8	113254071	.	GCGCA	G	351	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=26;MQ=58.98;NF=2;NR=9;PP=351;QD=34.2727272727;SC=ACATACACATGCGCACACACA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=11;WE=113254095;WS=113254061;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,11:0.41:27
chr8	113254085	.	ACG	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-1.572;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.235;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr8	113254087	rs28698529	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=1.446;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr8	113259132	rs1895014	A	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.662;SC=AATATGTTTTATAATCTAAAA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=113259140;WS=113259122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr8	113266343	rs7830950	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=306;ReadPosRankSum=0.904;SC=CACTCTTTTGCTGTCTGTTAC;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=17;WE=113266351;WS=113266333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr8	113301548	rs1861755	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.681;SC=TACTACTAACAATAATGTAAT;SOR=1.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=7;WE=113301556;WS=113301538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr8	113308243	rs4876462	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=133;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CCGCTGAAATACGTTATAAAG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=9;WE=113308251;WS=113308233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr8	113332270	.	C	CA	1784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.247;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=43;PP=1114;ReadPosRankSum=0.443;SC=TTCACATATGCAAAAAAACAA;SOR=1.047;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=44;WE=113332278;WS=113332260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,68:0.75:91
chr8	113363350	rs7003308	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=1.177;SC=CTTTATAGTCTTTTTTTTTAC;SOR=0.760;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=7;WE=113363358;WS=113363340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr8	113363511	rs7003500	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TACACATACATAAAAAGTTTA;SOR=0.320;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=16;WE=113363519;WS=113363501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr8	113364574	rs11775013	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=45;ReadPosRankSum=0.751;SC=CCGTGGCTTATCAATCATTGA;SOR=0.434;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=7;WE=113364582;WS=113364564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr8	113364696	rs11778209	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=212;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CTCCAACCATATATCTGTCTC;SOR=0.917;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=18;WE=113364704;WS=113364686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr8	113396054	rs16883506	A	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=102;ReadPosRankSum=1.698;SC=CCATTATTGCACTGGCTTACA;SOR=0.275;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=11;WE=113396062;WS=113396044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr8	113420495	rs35988509	TG	T	3601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=28;PP=2772;SC=GAATACATCATGGGAAAATTA;SOR=1.825;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=68;WE=113420503;WS=113420485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	113484935	rs12155677	C	T	2854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=70;PP=1760;ReadPosRankSum=-1.593;SC=TTCCACAGGGCGCTAGGAAAA;SOR=0.812;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=57;TCR=115;TR=103;WE=113484943;WS=113484925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,124:0.62:201
chr8	113485014	rs11783041	A	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=0.193;SC=TCTTCATATAAAAAATATATG;SOR=0.265;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=20;WE=113485022;WS=113485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr8	113516209	rs10955625	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,6:0.15:40
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chr8	113655596	rs10505169	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=477;ReadPosRankSum=2.033;SC=AGGTTAGACTATATTACCTTG;SOR=2.059;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=20;WE=113655604;WS=113655586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
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chr8	113842114	rs140103189	GCACACACA	G	127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=5;PP=776;SC=TTGTCTCTCTGCACACACACA;SOR=1.609;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=113842129;WS=113842104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	114111250	rs2030506	G	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,30:0.29:105
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chr8	116635688	rs2737219	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.354;SC=CTCCCCTAGCGAGTCGTAAGT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=116635696;WS=116635678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr8	116635872	rs35329862	T	TA	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=535;ReadPosRankSum=1.209;SC=CATGTGGCTTTAGAGTGCTTT;SOR=0.748;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=15;WE=116635880;WS=116635862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr8	116635942	rs2721939	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=139;ReadPosRankSum=0.586;SC=TCTTAGAAGACGCTCAGAAGA;SOR=1.362;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=12;WE=116635950;WS=116635932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr8	117782385	rs4514005	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=3;PP=1127;SC=TTTTTTACACCTTATGTAAAC;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=117782393;WS=117782375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	117791733	rs979866	T	C	8745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=108;PP=2965;SC=GGATCTCTGCTAGCTTACTAA;SOR=1.087;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=161;TCR=108;TR=269;WE=117791741;WS=117791723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr8	117799012	rs1867840	A	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=533;SC=TTTTTACTTGAATTATTTTAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=117799020;WS=117799002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	117887608	rs10094918	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=715;ReadPosRankSum=-0.810;SC=AATTTCTTATCTTAAAAGACT;SOR=0.363;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=42;WE=117887616;WS=117887598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr8	117950768	rs16889283	G	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GAGCTGGACGGGCGTTGAGGC;SOR=0.286;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=18;WE=117950776;WS=117950758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr8	117955005	rs4629901	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,19:0.19:98
chr8	118533382	rs7015216	T	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=246;ReadPosRankSum=0.482;SC=GTGGATGTCATCGGGGCTGCC;SOR=0.706;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=19;WE=118533390;WS=118533372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr8	118540863	rs72672136	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.109;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=725;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TTACTTGATATTTTTATTCTT;SOR=1.073;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=145;TCF=99;TCR=46;TR=45;WE=118540871;WS=118540853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,56:0.33:169
chr8	118830820	rs10955837	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=291;ReadPosRankSum=2.059;SC=TATTTATGTATGCCTCCAACC;SOR=0.660;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=30;WE=118830828;WS=118830810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr8	118830894	rs4876757	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.317;SC=GACAAAACGGCAGACATCAAA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=118830902;WS=118830884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr8	118834952	rs4355803	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TCTACCCTCCCTCCCACTTTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=118834960;WS=118834942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr8	119391791	rs5020517	T	C	10584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=170;PP=2965;SC=CAGGAAGCAATAGGGTACCTT;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=135;TCR=170;TR=305;WE=119391799;WS=119391781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
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chr8	120429024	rs2279112	G	A	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=1341;ReadPosRankSum=3.346;SC=TGCCCGGGCCGGTGCCCTGCG;SOR=0.592;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=263;TCF=100;TCR=163;TR=89;WE=120429032;WS=120429014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,99:0.33:302
chr8	120429282	rs7834596	G	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=774;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CTTCTCTTTTGTATTCCCCTT;SOR=0.736;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=52;WE=120429290;WS=120429272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr8	120575184	rs1058913	G	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=331;ReadPosRankSum=0.337;SC=CAGGCTGAGTGAAATCCAGAC;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=30;WE=120575192;WS=120575174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr8	120580546	rs200158900	T	TA	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.037;NF=1;NR=13;PP=188;ReadPosRankSum=0.514;SC=CTATATCAGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=120580554;WS=120580536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr8	120582871	rs16892786	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=0.078;SC=AAAATTCTGTTAAGCAAGGAA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=120582879;WS=120582862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr8	120596023	rs10283100	A	G	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=39;PP=2956;SC=TTAAATGTTGAGCCATAACCT;SOR=1.562;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=127;WE=120596031;WS=120596013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	120602908	rs935359	C	T	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=31;PP=1049;SC=TCAGGCAAGACTAAAACGAAA;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=120602916;WS=120602898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	120631657	.	CA	C	145	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=58.31;NF=0;NR=14;PP=145;QD=10.5714285714;SC=TGGGATATAACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=120631665;WS=120631647;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,14:0.58:24
chr8	120754645	rs4871569	A	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=441;SC=AGCTCAATGTATTACAAGAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=120754653;WS=120754635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	120790304	rs1509348	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.795;SOR=1.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,14:0.25:56
chr8	120790378	rs35033415	G	GA	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,19:0.23:81
chr8	120793296	rs7002501	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=0.583;SC=ACTGTACCTTCTGTAGAAAAT;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=120793304;WS=120793286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr8	120795607	rs13268676	G	A	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=855;ReadPosRankSum=-2.276;SC=CCTTTATGCTGTATATAATCT;SOR=0.510;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=168;TCF=123;TCR=45;TR=61;WE=120795615;WS=120795597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,82:0.38:213
chr8	120801805	rs6469846	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=747;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CTTCCCCACTCTGTTGAACTG;SOR=0.585;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=60;WE=120801813;WS=120801795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,70:0.34:208
chr8	120803637	rs9297605	C	G	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=33;PP=1259;SC=CTGAAACATACTGTAGTATTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=120803645;WS=120803627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	120803654	rs11996390	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr8	120805749	rs72688294	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=400;ReadPosRankSum=0.236;SC=TTTTTTTACATACCAAATTTT;SOR=1.092;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=23;WE=120805757;WS=120805739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr8	120814020	rs7813438	A	G	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=785;ReadPosRankSum=-1.816;SC=TAAGAGAGGAAAGCTCTGACT;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=97;TCR=55;TR=60;WE=120814028;WS=120814010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,74:0.40:183
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chr8	120818713	rs112763903	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=1.836;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
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chr8	120867693	rs55889147	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CTAACTGGACGGCCCACCGGA;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=120867701;WS=120867690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr8	120886370	rs7840728	T	A	987.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5014;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=752;ReadPosRankSum=0.269;SC=CGCGCTTAGCTGCTGCAGCCT;SOR=0.726;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=33;WE=120886378;WS=120886360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,34:0.87:39
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chr8	121180667	rs2198751	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=59;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CCACTTGGCACGTGACCTTTC;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=121180675;WS=121180657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr8	121210069	rs2305598	T	C	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.336;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,84:0.28:295
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chr8	121211847	rs2326483	C	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1021;ReadPosRankSum=0.848;SC=AGGGCATAGACCCACAACCAC;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=206;TCF=76;TCR=130;TR=73;WE=121211855;WS=121211837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,81:0.36:226
chr8	121215991	rs2305600	T	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=11.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,27:0.25:108
chr8	121220395	rs3765062	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=0.517;SC=TTTGCTGGACGTATTTTCGCT;SOR=1.123;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=12;WE=121220403;WS=121220385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr8	121228679	rs4870723	A	C	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=66;PP=1692;ReadPosRankSum=0.017;SC=AAGACAGATCAATGGTTATCG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=351;TCF=164;TCR=187;TR=124;WE=121228687;WS=121228669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:286,142:0.33:428
chr8	121240812	rs2305602	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr8	121256150	rs2305603	T	C	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.05;MQRankSum=-0.729;NF=35;NR=39;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACAACCTCCTTCTGAAGCCTC;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=88;TCR=107;TR=74;WE=121256158;WS=121256140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,78:0.35:221
chr8	121259862	rs2305605	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.834;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=638;ReadPosRankSum=1.655;SC=TACCATCCTCGGGGCCCCAGA;SOR=1.093;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=48;WE=121259870;WS=121259852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,57:0.34:169
chr8	121262775	rs2305607	A	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=366;ReadPosRankSum=-0.957;SC=AAAAGCAGTCAAGTGAATACA;SOR=0.229;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=26;WE=121262783;WS=121262765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr8	121267617	rs993823	C	T	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=535;ReadPosRankSum=1.418;SC=CCATCACTTACGTTTTTGTCA;SOR=0.935;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=30;TCR=81;TR=34;WE=121267625;WS=121267607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,39:0.32:120
chr8	121290573	rs2305609	T	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TTTAAAGATTTTTTTTTTCAT;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=15;WE=121290581;WS=121290563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
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chr8	121292805	rs1869832	G	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.051;SC=TGAAACCACAGAAAACCATAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=6;WE=121292813;WS=121292795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
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chr8	121326122	rs3217653	CAG	C	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=614;ReadPosRankSum=1.196;SC=TTCTAGATGTCAGAGAGTCTA;SOR=1.128;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=16;WE=121326131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr8	121326427	rs10505379	G	T	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=196;SC=AGCCATTTTTGTGTCCAATGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=121326435;WS=121326417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	121327673	rs7844334	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=-1.940;SC=AGTGCAAACGCGATTTACTGT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=14;WE=121327681;WS=121327663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr8	121328383	rs78746650	A	AT	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.790;NF=0;NR=9;PP=302;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CCTATCCTGCACTATTTCCCT;SOR=0.590;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=9;WE=121328391;WS=121328373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr8	121383048	rs4463470	T	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=26;PP=947;SC=TCCCTGCTCTTCCCTGGTGAT;SOR=1.036;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=121383056;WS=121383038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	121383082	rs6469922	A	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=677;SC=GAGATTTTTTAAAAAAATTTC;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=121383090;WS=121383072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	121408195	rs6650	T	C	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=30;PP=2231;SC=TGAAGGACTATACCTTCCTGA;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=104;WE=121408203;WS=121408185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	121426425	rs68086071	AGT	A	444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=427;SC=ATACTTCATAAGTGTTAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=121426434;WS=121426415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	121455558	.	G	GA	153	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=19;MQ=58.95;NF=0;NR=11;PP=153;QD=14.2727272727;SC=GCTTGGGGGGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=11;WE=121455566;WS=121455548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:32,11:0.26:43
chr8	121468925	rs373413929	C	G	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.947;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=56;PP=1538;ReadPosRankSum=-0.029;SC=ATGGATTATTCACAGTTTGCC;SOR=1.375;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=87;WE=121468933;WS=121468915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,94:0.68:139
chr8	121471361	rs6984090	A	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=201;SC=TTATACATGGATTTCCCCTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=121471369;WS=121471351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	121483019	rs7832491	C	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=0.875;SC=AAGAATGAATCTCAATGTGCA;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=19;WE=121483027;WS=121483009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr8	121483196	rs13248998	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=37;PP=1157;SC=TACATGTTTCGGTTGTTTTAA;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=121483204;WS=121483186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	121509825	rs35918868	C	CTTT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=495;SC=AATTTTAGTTCGTGTGTGTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=121509833;WS=121509815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	121530061	rs13258768	C	T	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=8;PP=2048;SC=GCTTAATCTACGTTCTTGATT;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=74;TCR=8;TR=82;WE=121530069;WS=121530051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	121530190	rs13258848	A	G	9135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=128;NR=127;PP=2965;SC=CACAAACAGAACGGTCCTTAC;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=128;TCR=127;TR=255;WE=121530198;WS=121530180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr8	121530384	rs34340354	CTT	C	1736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=1199;SC=CATAGGAAGACTTTTTAAATT;SOR=3.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=31;WE=121530393;WS=121530374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	121531154	rs13269481	G	A	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=58;PP=1578;SC=TACTGAGAGCGTATACTTGCT;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=64;WE=121531162;WS=121531144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	121587165	rs6984991	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GGCCATAAATGATCATTAATC;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=121587173;WS=121587155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr8	124027628	rs7159	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=7;PP=1080;SC=AGTTGTTAAGTGCACCCAGCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=124027636;WS=124027618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	124042733	rs2891672	T	C	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=629;SC=ATTTACTATCTTTATGCAGTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=124042741;WS=124042732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	124085716	rs12541131	C	G	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=82;PP=2167;ReadPosRankSum=0.248;SC=TGGGGGGCTTCTAGTACGGCC;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=86;TCR=126;TR=138;WE=124085724;WS=124085706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,143:0.64:225
chr8	124212174	rs186730545	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=0.032;SC=GCTGCCCAGCCCACTCTCCAA;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=13;WE=124212182;WS=124212164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
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chr8	124440336	rs10628888	A	AAAG	1149.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=1523;SC=TAAAAAAAAAAAAGCTAAATA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=30;WE=124440344;WS=124440326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
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chr8	124658404	rs11786734	A	G	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.38;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	124659329	rs11991744	C	A	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=49;PP=1527;SC=GTAGTAATTACGAGGGTGAAC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=124659337;WS=124659319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	124663769	rs10109736	A	T	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=35;PP=2199;SC=GGTGTGTCCAAGCACACATAC;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=124663777;WS=124663759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	124664130	rs11780509	C	T	10959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=136;PP=2965;SC=GACCAGACTCCTCCCTGAGCT;SOR=1.050;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=331;TCF=195;TCR=136;TR=331;WE=124664138;WS=124664120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr8	124664167	rs11784192	T	C	10877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=165;PP=2965;SC=AGCACATAGATGCTGCGGTGC;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=340;TCF=175;TCR=165;TR=340;WE=124664175;WS=124664157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr8	124664792	rs7387544	C	T	8615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=161;PP=2965;SC=TCTGCAAGTACGAGGAGCAGG;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=109;TCR=161;TR=270;WE=124664800;WS=124664782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr8	124664873	rs7387792	AT	GC	9782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=103;PP=2947;SC=CAGTGGCAATATGTGCCTCCC;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=87;TCR=108;TR=188;WE=124664882;WS=124664863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr8	124665211	rs7387855	C	T	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=35;PP=971;SC=AAGAGTCAAACCTTTCTCAGC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=124665219;WS=124665201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	124693410	rs4471017	G	C	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=589;SC=AGTCTCATTTGCAAGTTTGAT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=124693418;WS=124693400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	124693444	rs3739283	C	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=9;PP=1031;SC=TTGACAAAGGCGGTTCCACCC;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=124693452;WS=124693434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	124693641	rs4314634	G	A	7256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=143;PP=2965;SC=AACGTTTATGGTGTGTTCACA;SOR=1.205;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=88;TCR=143;TR=231;WE=124693649;WS=124693631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr8	124696867	rs2294015	C	T	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=1954;SC=CTGGTCACGACTATGCGAATC;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=124696875;WS=124696857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
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chr8	124749651	rs11331268	TC	T	8596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=148;PP=2975;SC=ACAACAGTTTTCCCCCCGGAC;SOR=1.174;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=183;TCF=21;TCR=162;TR=169;WE=124749659;WS=124749641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr8	124796926	rs17259760	G	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CATGTGGGGAGATCATACCAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=124796934;WS=124796916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr8	124824826	rs1946586	G	A	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=51;PP=2080;SC=CAGTCATCGTGTGCTGACATG;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=94;WE=124824834;WS=124824816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr8	124987478	rs7465584	T	C	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1321;ReadPosRankSum=0.079;SC=GTGACATCAGTGTCATGGGAA;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=82;WE=124987486;WS=124987468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,108:0.70:155
chr8	124992568	rs138227457	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.582;SC=AGATGGCAATCGTTGTCTTTT;SOR=0.072;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=124992576;WS=124992558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr8	125022733	rs7844981	T	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=951;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TCATCATGCCTCCCGAGTCCT;SOR=0.436;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=61;WE=125022741;WS=125022723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,66:0.69:95
chr8	125022985	rs114927246	G	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=555;ReadPosRankSum=0.378;SC=ATGGATTAGAGAATTGGGAAG;SOR=0.379;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=21;WE=125022993;WS=125022975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr8	125033678	rs7820272	G	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=713;SC=AACAGTCCACGTGAGTGACTC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=125033686;WS=125033668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	125035533	rs4521739	G	A	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=765;SC=TGATGGCATAGATGTTTCAGT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=125035541;WS=125035523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	125035788	rs4358790	G	C	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=67;PP=1948;SC=CCCCTGTCGCGGGGCAGATGG;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=107;WE=125035796;WS=125035778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	125047370	rs4871451	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=53;SC=GGGGCCATTGTCTTTATTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=125047378;WS=125047360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	125051966	rs4269524	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=8;PP=1481;SC=TTTCTTCAGGACTTCCATTCC;SOR=3.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=125051974;WS=125051956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	125052018	rs4389914	T	C	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=35;PP=2607;SC=TCTCCTTTTGTCTGTCTGTGG;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=78;TCR=35;TR=113;WE=125052026;WS=125052008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	125061895	rs4870887	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=780;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CTGTTGTGAAGCTGGCTGACC;SOR=1.276;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=44;WE=125061903;WS=125061885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr8	125072426	rs4483140	T	C	6955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=105;PP=2965;SC=GGTAGGTTCCTCCTTCTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=107;TCR=105;TR=212;WE=125072434;WS=125072416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr8	125076589	rs7012186	T	G	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=28;PP=1514;SC=TCATTTCAGATATTTCAGATT;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=125076597;WS=125076579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	125076988	rs4871460	T	C	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=750;SC=AGCTTTGTTATAGGATCAGAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=125076996;WS=125076978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	125088636	rs9643188	A	G	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=133;PP=2965;SC=CTGTGGGGATAGTGCGTGTAT;SOR=1.491;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=66;TCR=133;TR=199;WE=125088644;WS=125088626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr8	125094847	rs10956163	C	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=329;SC=ATCAGCAGAGCTGGCTTGGGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=125094855;WS=125094837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	125107201	rs6470219	G	A	9065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr8	125107207	rs6470220	C	T	9112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr8	125109337	rs59036344	C	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.83;QD=28.35;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	125110258	rs10956164	C	T	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=96;PP=2887;SC=TTAAGGCCACCTTCTTTGTCT;SOR=1.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=43;TCR=96;TR=139;WE=125110266;WS=125110248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr8	125130966	rs13438814	G	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=413;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TCAAAATAAAGCAGCGGGATA;SOR=0.409;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=31;WE=125130974;WS=125130956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr8	125384436	rs7841552	C	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=83;SC=GGCCGTCCGGCAAGGCGGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=125384444;WS=125384426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	125463083	rs3812473	G	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=533;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GGCATGGCCGGGTGAGCTGCA;SOR=1.919;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=26;WE=125463091;WS=125463073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr8	125463098	rs3812474	A	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=8;PP=1028;SC=GCTGCAGGCTACCTTATTTAA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=125463106;WS=125463088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	125463250	rs3812475	T	C	6156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=83;PP=2965;SC=GACTGAGCCTTGGTTTACCCA;SOR=0.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=187;WE=125463258;WS=125463240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr8	125463544	rs11556913	T	C	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GTCAGCCGAGTTGGAGGCTGA;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=254;TCF=137;TCR=117;TR=82;WE=125463552;WS=125463534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,99:0.33:298
chr8	125498547	rs3812471	C	T	6423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=86;PP=2965;SC=ATCGAATTTACGGATTACAGT;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=211;WE=125498555;WS=125498537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr8	125501033	rs6997089	A	G	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=37;PP=1095;SC=AAATATTGGCACACCTTTAAT;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=125501041;WS=125501023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	125501064	rs146994194	T	TTAAG	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=861;SC=TTAACAGTTATTAAGTTTTTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=125501072;WS=125501054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	125507538	rs3812470	A	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=217;SC=AATCATTTGCATATGTTTTTC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=125507546;WS=125507528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	125528102	rs72713086	C	T	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=32;PP=1112;SC=AACAATGTCACTCTAAGAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=125528110;WS=125528092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	125551567	rs7010411	C	T	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=140;PP=2965;SC=AGGTGACCCTCGGGGCCCCAT;SOR=2.315;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=42;TCR=140;TR=182;WE=125551575;WS=125551557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	125562029	rs10195	C	T	4167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=51;PP=2634;SC=GGAAACGCCACCTGGTGGTCC;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=132;WE=125562037;WS=125562019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	125565328	rs3829037	T	C	5547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=61;PP=2965;SC=CCTTGTGGAGTATCCCTTGGG;SOR=1.313;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=110;TCR=61;TR=171;WE=125565336;WS=125565318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr8	125568175	rs3793395	T	C	7459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=133;NR=103;PP=2965;SC=AATACACAGGTTGCTTTAGGG;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=133;TCR=103;TR=236;WE=125568183;WS=125568165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr8	125570144	rs4870903	G	A	2013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.15;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	125571185	.	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=2.109;SC=GGGCACACACAGAGAGAAAGA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=16;WE=125571193;WS=125571175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr8	125575013	rs4007921	G	A	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=81;PP=2965;SC=GGAGCCAAGGGCACCCTTACC;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=132;TCR=81;TR=213;WE=125575021;WS=125575003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr8	125579788	rs3857944	G	A	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=4;PP=1219;SC=TAGCTTCAATGGATGACACGA;SOR=3.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=125579796;WS=125579778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	125579973	rs6470251	C	T	8716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=100;PP=2965;SC=AAGTTGGGACCACGGGCCGGG;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=181;WE=125579981;WS=125579963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	125579990	rs6470252	C	T	8694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=87;PP=2965;SC=CGGGCTAGAACGATCCATGGA;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=178;WE=125579998;WS=125579980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr8	125580075	rs13251109	G	C	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=78;PP=2810;SC=TGGTACCTTCGAATCAGCTTC;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=61;TCR=78;TR=139;WE=125580083;WS=125580065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr8	125580928	rs2288664	A	G	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=71;PP=2075;SC=GATTTAAGGCAGCTGTTTTTC;SOR=1.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=97;WE=125580936;WS=125580918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	125601780	rs12682032	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=611;ReadPosRankSum=-0.021;SC=ATAAACCTAGCAGAGGGGCCA;SOR=0.978;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=33;WE=125601788;WS=125601770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr8	125601964	rs74948302	C	T	4480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=109;PP=2751;ReadPosRankSum=2.396;SC=TTTTACCAAGCGGGGGGGAAA;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=86;TCR=152;TR=171;WE=125601972;WS=125601954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,196:0.70:282
chr8	125603298	rs11994203	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-1.087;SC=CAGACAGATTGTGGGGATTTA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=125603306;WS=125603291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr8	125711670	rs11358821	TG	T	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=341;ReadPosRankSum=-0.782;SC=AGCTCAGCTCTGATAACTTAA;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=9;WE=125711678;WS=125711660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr8	125711882	rs72714775	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1089;ReadPosRankSum=0.224;SC=GAATGTCTCTCCCTAGCAAAT;SOR=1.157;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=210;TCF=88;TCR=122;TR=74;WE=125711890;WS=125711872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,83:0.33:255
chr8	125739749	rs891542	A	G	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=44;PP=2428;SC=CCGTGCCCGGAGGAATCAGGT;SOR=1.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=125739757;WS=125739739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	125740204	rs78566090	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1320;ReadPosRankSum=0.832;SC=CATTTTCCCGGCTCCGGCAGG;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=332;TCF=153;TCR=179;TR=105;WE=125740212;WS=125740194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:286,123:0.30:409
chr8	125877486	rs11994907	G	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=48;NR=49;PP=1629;SC=ACTGTGTACCGTGTTCTCCCT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=97;WE=125877494;WS=125877476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	125877536	rs72072035	CCT	C	3791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.61;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	126015400	rs3083763	C	CT	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.236;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,14:0.17:82
chr8	126023638	rs3750234	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.118;SC=ATAATTAGTTCTTGATTTATC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=11;WE=126023646;WS=126023628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr8	126030809	rs966946	T	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=1.895;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr8	126033096	rs6989548	T	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=0.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,94:0.28:330
chr8	126034052	rs2293985	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=800;ReadPosRankSum=0.333;SC=CAATCTATGCCGTGTATTTTT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=123;TCR=88;TR=68;WE=126034060;WS=126034042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,72:0.31:231
chr8	126049443	rs2272682	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TCTGTTGGTATTGTTACTCAT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=126049451;WS=126049433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr8	126056215	rs11370883	G	GC	8082.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=76;PP=2974;SC=CCCGCCTCAGGTAGTTTCAGG;SOR=0.775;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=109;WE=126056223;WS=126056205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr8	126067646	rs33981879	CAG	C	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.175;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.707;SOR=0.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr8	126067985	rs2303529	A	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr8	126069142	rs2303521	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.844;SC=GCCTAATTTGTCTATATAGGG;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=126069150;WS=126069132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr8	126070020	rs3834883	G	GCAACAACCACCGAATCTCATCAATAT	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=1436;ReadPosRankSum=1.659;SC=CCAACAGAGGGCATTAATAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=2;WE=126070028;WS=126070010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr8	126071380	rs3765214	A	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.694;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=727;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AAAAGGATAAAATCCTGGGCT;SOR=1.777;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=128;TCF=101;TCR=27;TR=42;WE=126071388;WS=126071370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,47:0.31:151
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chr8	126093882	rs7817303	G	A	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1043;ReadPosRankSum=-1.110;SC=TTTCGGAAGTGTAGTCCTAGC;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=126;TCR=88;TR=80;WE=126093890;WS=126093872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,98:0.37:264
chr8	126094614	rs2384917	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
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chr8	126095503	rs16900368	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=434;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TCTGGACCCTGAGAAAAAAAA;SOR=0.659;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=36;WE=126095511;WS=126095493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,38:0.29:133
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chr8	126443348	rs2385113	C	T	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=32;PP=1257;SC=CGCCCTGCAGCCCGCAGCCCC;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=126443356;WS=126443338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	126443534	rs3750182	G	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.809;SC=GACCCGGCTGGGGTCGGGGGC;SOR=0.419;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=11;WE=126443542;WS=126443524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr8	126445505	rs13277396	G	C	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=935;ReadPosRankSum=1.711;SC=CAGGGGTTTGGGAGGCTGCCT;SOR=1.140;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=46;WE=126445513;WS=126445495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
chr8	126445537	rs2235110	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=6.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,45:0.32:139
chr8	126445544	rs2235109	C	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,51:0.33:153
chr8	126448789	rs2235108	G	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=54;PP=1500;SC=GCCCTTTGGCGTGGTACCAAC;SOR=3.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=126448797;WS=126448779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr8	128099457	rs61262194	CGTG	C	3745.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=46;PP=2983;SC=AGTCCTTCGTCGTGGTGGTGG;SOR=1.005;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=68;WE=128099467;WS=128099447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	128428061	rs4871789	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=-0.772;SC=ATGAAAAGTAACATAATTGCT;SOR=1.270;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=8;WE=128428069;WS=128428051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr8	128428795	rs6998254	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.389;NF=5;NR=6;PP=146;ReadPosRankSum=0.603;SC=CCCTCATGCAGGCCCGAAAGA;SOR=0.416;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=11;WE=128428803;WS=128428785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr8	128428823	rs7002225	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.401;NF=8;NR=5;PP=164;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AACCAGTATCGAGAACCGAGT;SOR=0.382;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=13;WE=128428831;WS=128428813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,13:0.22:59
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chr8	129021000	rs1863562	A	G	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.54;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr8	129162433	rs2648841	G	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=874;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CCACTGTGGTGGGGGGGAGTG;SOR=0.699;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=60;WE=129162441;WS=129162423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,63:0.37:169
chr8	130760952	rs149748731	G	A	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=71;PP=2059;ReadPosRankSum=-0.094;SC=AATGCTCCAGGGGTATCTGAA;SOR=0.566;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=71;TCR=113;TR=119;WE=130760960;WS=130760942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,144:0.67:216
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chr8	131020729	rs4733757	T	C	3612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=72;PP=2161;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CTCCAAGCTGTTCAGGCCTCA;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=90;TCR=111;TR=129;WE=131020737;WS=131020719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,158:0.65:243
chr8	131020798	rs72720360	C	T	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=54;PP=1224;ReadPosRankSum=1.101;SC=GGATCCATCACGGGGCCTAGC;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=69;WE=131020806;WS=131020788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,76:0.72:106
chr8	131066848	rs11781272	C	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=433;ReadPosRankSum=-0.319;SC=ATTATATCCCCCTCCTGAGGT;SOR=0.427;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=30;WE=131066856;WS=131066838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr8	131066928	rs11781294	C	A	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1388;ReadPosRankSum=0.796;SC=TACATGAAGGCAGCAGTCTTG;SOR=0.873;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=82;WE=131066936;WS=131066918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,96:0.63:152
chr8	131092026	rs6415509	T	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=20;PP=1806;SC=TGTTGTGGCCTGCCCCACTTG;SOR=2.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=131092034;WS=131092016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	131136173	.	C	CA	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.6666;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=58.91;NF=5;NR=2;PP=76;QD=11.5714285714;SC=TGCACCCAGCCAAAAAAAAAA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=7;WE=131136181;WS=131136163;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,7:0.26:27
chr8	131172791	rs34161158	GT	G	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=220;ReadPosRankSum=0.006;SC=AGTGAAAAGTGTTATGATGTC;SOR=0.293;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=131172799;WS=131172781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr8	131172968	rs10089819	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=737;ReadPosRankSum=-1.620;SC=AACTGCAGAACGAGAACATGG;SOR=0.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=43;WE=131172976;WS=131172958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr8	131173179	rs62524650	G	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=222;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GATAATACCAGAAAACACATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=131173187;WS=131173169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr8	131192905	rs28495072	G	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=960;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TAATCAAACAGAGTCTGCCTT;SOR=0.682;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=48;WE=131192913;WS=131192895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr8	131193153	rs71572332	T	TA	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.250;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.395;NF=0;NR=27;PP=347;ReadPosRankSum=0.307;SC=TGTCATTATTTAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=27;WE=131193161;WS=131193143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr8	131353139	rs13265869	T	C	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:344,165:0.32:509
chr8	131373887	rs10091130	C	G	5988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=55;PP=2965;SC=TCTGCAATTACAATTTCAAAG;SOR=1.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=120;TCR=55;TR=174;WE=131373895;WS=131373877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr8	131812899	rs263237	G	T	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=41;PP=1198;SC=CACACATGTGGGTACACACGT;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=131812907;WS=131812889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr8	131861945	rs147278965	C	T	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GCAAGTTTTCCGGAGGATGAG;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=66;TCR=88;TR=95;WE=131861953;WS=131861935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,131:0.65:200
chr8	131897082	rs4128982	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=46;PP=1389;SC=AATGTTTTTAAATCATGTTGC;SOR=2.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=57;WE=131897090;WS=131897072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	132002576	rs1329803	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=339;ReadPosRankSum=0.165;SC=TAAAACAGTAGCTCCATATAA;SOR=0.927;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=23;WE=132002584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr8	132936266	rs142533670	ATCAGTAAGTCC	A	1587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=2972;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCAGGGACTTATCAGTAAGTC;SOR=1.460;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=16;WE=132936292;WS=132936256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
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chr8	132947529	rs4736523	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TTGTTTCCTTATTTATTTAGG;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=132947537;WS=132947527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
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chr8	133048619	rs7461611	T	C	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=7.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.923;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,90:0.29:310
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chr8	133058325	rs6998359	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=0.981;SC=GGCTGAGGTAACCCTGATGTC;SOR=0.144;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=14;WE=133058333;WS=133058315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
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chr8	133089975	rs2280851	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=536;ReadPosRankSum=0.140;SC=TCTCTTACCCAAGGTAGGGCT;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=40;WE=133089983;WS=133089965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,40:0.30:135
chr8	133091905	rs11778661	C	T	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=15;PP=1543;SC=TATATGTGAGCCTAGAGGTAA;SOR=2.599;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=73;WE=133091913;WS=133091895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	133092138	rs2403730	G	A	8510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=123;PP=2965;SC=CCAGTGTCCGGGGCTTGTACT;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=133;TCR=123;TR=256;WE=133092146;WS=133092128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr8	133101818	rs6471038	G	A	7524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=152;PP=2965;SC=TAGAATTGCCGATGATATCTA;SOR=1.256;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=88;TCR=152;TR=240;WE=133101826;WS=133101808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
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chr8	133107893	rs10956634	A	G	4954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=75;PP=2965;SC=CACACAGACCAGCCCTGCAAC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=160;WE=133107901;WS=133107883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
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chr8	133146798	rs111447844	TGAGGA	T	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr8	133150103	rs2469515	C	T	2902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=36;PP=1698;ReadPosRankSum=0.527;SC=TTGAGGGGAGCGCAGTCCCTC;SOR=1.103;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=102;WE=133150111;WS=133150093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,126:0.74:171
chr8	133175971	rs893391	G	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=278;SC=TTTTCAGCCAGTCATTCATTC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=133175979;WS=133175961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	133459549	rs72721077	A	G	2681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=64;PP=1976;ReadPosRankSum=1.852;SC=AGCAGGGCAGAATGGGCAGAC;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=53;TCR=99;TR=98;WE=133459557;WS=133459539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,110:0.62:176
chr8	133740259	.	AGT	A	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=72;QD=37.5;SC=GTTCAGTGTGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=2;WE=133740268;WS=133740249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr8	133759051	rs2739024	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.221;SC=AGAACTTTAAGTGAATTTTAA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=133759059;WS=133759050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr8	133769554	rs138117721	TGA	T	2743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.500;QD=9.66;ReadPosRankSum=-2.795;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,88:0.31:284
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chr8	133836206	rs10102374	A	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=248;ReadPosRankSum=-1.245;SC=CATACTTTTAAGTTTTTCTGA;SOR=1.480;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=15;WE=133836214;WS=133836196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr8	133836432	rs235441	C	T	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=63;PP=1892;SC=GTTTTAGTTCCTACTAGTGTT;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=23;TCR=63;TR=86;WE=133836440;WS=133836422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	133844508	rs16904746	C	T	6500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=83;PP=2965;SC=ACAGTTCCCTCGAATTTTTGG;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=120;TCR=83;TR=203;WE=133844516;WS=133844498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	133858009	rs756201	C	T	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=32;PP=2615;SC=ATTTGTTTATCTTCTTCTCTC;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=116;WE=133858017;WS=133857999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	133880334	rs180203	T	C	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=18;PP=1435;SC=ACACTCTTCTTTGATGAACCA;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=133880342;WS=133880324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	133900252	rs180223	T	G	8509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=86;PP=2965;SC=TCAATTACAGTCTGAGCAAGC;SOR=1.517;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=177;TCR=86;TR=263;WE=133900260;WS=133900242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr8	133900386	rs2069550	T	C	9775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=188;PP=2965;SC=ATGGGCCTCCTGAGCAGGTCT;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=314;TCF=126;TCR=188;TR=314;WE=133900394;WS=133900376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr8	133900840	rs10699743	A	ATG	125.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=104;SC=GAAGAGTTAAATGTGTGTGTG;SOR=1.022;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=2;WE=133900848;WS=133900830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	133909847	rs10088696	C	T	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1507;ReadPosRankSum=0.556;SC=ACAGAGCCCACACAGAGCAGG;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=99;WE=133909855;WS=133909837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,120:0.62:193
chr8	133909974	rs853326	A	G	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=67;PP=2028;SC=GGGCCCCTACATGCCACAGTG;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=107;WE=133909982;WS=133909964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr8	133910388	rs16904782	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=619;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CAATTCCTGAATGTTCTCCCC;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=43;WE=133910396;WS=133910378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr8	133910962	rs853324	T	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=202;SC=TCATGACCCTTAAAGGTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=133910970;WS=133910955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	133913525	rs853322	A	G	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=22;PP=1725;SC=GTGGGTGGTGAGGAGGGTGAT;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=78;WE=133913533;WS=133913515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	133920321	rs866468	A	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=1057;SC=GGCAGTGCTTATGTGTTTTGA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=133920329;WS=133920311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	133920411	rs2261147	T	C	5057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=45;PP=2965;SC=CCTCTGCTGATCTCTGGTGCT;SOR=1.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=115;TCR=45;TR=160;WE=133920419;WS=133920401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr8	133920518	rs2069556	A	G	8983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=158;PP=2965;SC=GACTACGCGGATTTGCTGCAG;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=114;TCR=158;TR=272;WE=133920526;WS=133920508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr8	133920624	rs853318	C	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=50;PP=1468;SC=GGCTTGGACTCAACTCAGGGT;SOR=3.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=133920632;WS=133920614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	133920641	rs76906432	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GGGTTACGGTGTCAGAAAACC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=29;WE=133920649;WS=133920631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr8	133925209	rs2687824	T	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CTGGATATTCTAGGCATCTCT;SOR=1.167;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=19;WE=133925217;WS=133925199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr8	133931748	rs853304	T	C	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=46;PP=1718;SC=CCATTTCTGCTGGAGCTTTCA;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=133931756;WS=133931738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	133935499	rs7011493	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=364;ReadPosRankSum=0.691;SC=TTGGACACCTTGTCAATGACC;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=18;WE=133935507;WS=133935489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr8	133941626	rs853296	T	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=0.502;SC=AGTTGACAGTTTATCTACTGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=133941634;WS=133941616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr8	133945753	rs72727428	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=734;ReadPosRankSum=0.059;SC=TCTGCTCTGCCCTCAGCATCC;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=35;WE=133945761;WS=133945743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr8	133947836	rs2739061	T	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=4;PP=206;SC=CTAACACTCCTGGCTGCAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=133947844;WS=133947826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	133947859	rs2739062	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=5;PP=299;SC=CTGCTTACACATCTGTCTCCT;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=133947867;WS=133947849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	133960991	rs2246624	C	T	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=441;SC=CTCCATCACACTGACCTCTCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=133960999;WS=133960981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	133961237	rs2246611	G	C	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=115;PP=2965;SC=CTCTTCACACGAGCAAGGCCC;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=70;TCR=115;TR=185;WE=133961245;WS=133961227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr8	133961279	rs2246608	C	T	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=72;PP=2115;SC=CTCCTTGTGGCCTGAGGAGCT;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=84;WE=133961287;WS=133961269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	133961299	rs144296671	GAA	G,GA	256.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=20,20;PP=216,64;ReadPosRankSum=1.755;SC=TTATACTTCTGAAAAAAAAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=20,20;WE=133961308;WS=133961288;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.59:17
chr8	133975283	rs2069561	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=-0.932;SC=ATGTAGAAAAGACACAGTGCC;SOR=0.611;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=37;WE=133975291;WS=133975273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,42:0.33:127
chr8	133975406	rs2687814	C	T	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,58:0.28:209
chr8	133978701	rs141752476	GTC	G	601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.75;MQRankSum=1.931;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr8	133979872	rs2249869	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.933;SC=AGAACCCCAGCGTTTTTGCAT;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=133979880;WS=133979866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr8	133983955	rs72727453	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=3;PP=799;SC=TCCCCAAAGCAAGAATGACTA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=133983963;WS=133983945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	133984814	.	G	GT	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=56.46;NF=2;NR=3;PP=27;QD=10.4;SC=CCTGATTGTGGTTTTTTGTTT;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=133984829;WS=133984804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,5:0.33:15
chr8	133985019	rs1403488	G	A	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=54;PP=1661;SC=CTATATGGACGTCTTTAGTTA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=79;WE=133985027;WS=133985009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	133985059	rs1403487	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=37;PP=1119;SC=TTAGGACAATATTCTTGGATT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=133985067;WS=133985049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	133985115	rs1403486	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=368;SC=CAACAGAAATAGATTCTGTTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=133985123;WS=133985105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	133995475	rs10105779	A	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=11;PP=1348;SC=GGTTGGGACAATCTGTCTGCC;SOR=2.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=133995483;WS=133995465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	134006813	rs1533909	C	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TAGTATGTTACAAGTGGCTAG;SOR=1.368;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=13;WE=134006821;WS=134006803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
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chr8	134025781	rs10105991	A	T	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=1.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr8	134144113	rs2294024	C	T	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.810;SC=ACCCAGCCTACGAGGGGCAGT;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=77;WE=134144121;WS=134144103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,87:0.70:124
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chr8	134225396	rs55733525	T	TC	6242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=88;PP=2967;SC=CGTAAGTGAGTCCTCCATACC;SOR=1.043;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=24;TCR=90;TR=112;WE=134225404;WS=134225386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
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chr8	134237635	rs35513885	G	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.080;SC=ACACACAGATGCTGTGGGTGA;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=68;WE=134237643;WS=134237625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,79:0.68:116
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chr8	134251449	rs2929976	T	C	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=41;PP=1178;SC=ACATGCTCTTTTACGTGCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=134251457;WS=134251439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr8	134262532	rs2272648	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTGTCCTTCCTGGGGACACCT;SOR=0.215;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=19;WE=134262540;WS=134262522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
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chr8	134274226	rs2233324	C	G	9830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=184;NR=128;PP=2965;SC=GAGCAAAGCACCTGAACCCCT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=312;TCF=184;TCR=128;TR=312;WE=134274234;WS=134274216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
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chr8	134292516	rs2272653	A	G	5582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=0.257;SC=ATGGTCTGTGAAAAGACAAAA;SOR=0.419;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=69;TCR=107;TR=175;WE=134292524;WS=134292506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
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chr8	135545058	rs28621035	T	G	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=20;PP=1261;ReadPosRankSum=0.771;SC=GGGCCCCAGCTCGCTGGCCCC;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=83;TCR=29;TR=75;WE=135545066;WS=135545048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,87:0.69:127
chr8	135577530	rs6999469	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=8.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,37:0.26:141
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chr8	135612595	rs894343	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=615;ReadPosRankSum=1.142;SC=GACCTGCAGCAGAGACACCTA;SOR=1.319;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=76;TCF=60;TCR=16;TR=39;WE=135612603;WS=135612585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
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chr8	135649548	rs17698962	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=-0.587;SC=ACTTACGGTAATAGTCATCAT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=135649556;WS=135649544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr8	136657198	rs4243846	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=337;ReadPosRankSum=-0.060;SC=ATTTTCAGTCTTGCCCTTCAT;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15;WE=136657206;WS=136657188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr8	136657233	rs6984897	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=0.951;SC=TTTTACAATACGTTATTGAAT;SOR=1.460;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=12;WE=136657241;WS=136657223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr8	136657534	rs4373553	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=1.892;SC=ATAAATATTTGAAGAGGACTA;SOR=1.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=12;WE=136657542;WS=136657524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
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chr8	136659426	rs3184618	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=39;PP=946;ReadPosRankSum=1.631;SC=AAATAAATCAGAATGCTTAAA;SOR=0.920;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=43;WE=136659434;WS=136659416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,48:0.75:64
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chr8	139165068	rs3763590	C	T	4116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=66;PP=2858;SC=TGTAGGTCAGCACTGGGGCCT;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=128;WE=139165076;WS=139165058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	139165272	rs7835712	TG	CA	19307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=174;PP=2947;SC=CATTCTCACCTGGCTCTGGAC;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=353;TCF=172;TCR=181;TR=344;WE=139165281;WS=139165262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr8	139165289	rs7835830	T	C	10996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=181;PP=2965;SC=GGACACCTTATAACTTCTTCA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=340;TCF=159;TCR=181;TR=340;WE=139165297;WS=139165279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr8	139165463	rs11311519	CA	C	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=24;PP=463;SC=TTATGCCCTACAAAAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=25;WE=139165471;WS=139165453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	139189502	rs6985633	T	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=618;ReadPosRankSum=-1.342;SC=TCTCCTTCACTTCCAGTGAGA;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=42;WE=139189510;WS=139189492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,46:0.38:122
chr8	139190943	rs66488273	C	CA	743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.735;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.352;NF=1;NR=16;PP=823;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TCTGGAGAGGCAAAAAAGGTG;SOR=0.984;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=17;WE=139190965;WS=139190933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr8	139190957	rs4909747	T	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=814;ReadPosRankSum=0.021;SC=AAAGGTGGTATTCAAGGCTCC;SOR=0.486;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=24;WE=139190965;WS=139190933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr8	139263328	rs4909765	A	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=1.123;SC=GCATGTCTGTATTAAGCCTCT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=139263336;WS=139263318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr8	139269052	rs1512403	A	G	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=61;PP=1739;ReadPosRankSum=-0.211;SC=ATCTTGTCCAAATGAAATACT;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=51;TCR=95;TR=93;WE=139269060;WS=139269042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,103:0.64:162
chr8	139321179	rs6577909	A	G	8168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=105;PP=2965;SC=CCCTGAGAGCAGGTTCCTCAA;SOR=1.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=159;TCR=105;TR=264;WE=139321187;WS=139321169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr8	139323246	rs56096441	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=27;PP=771;SC=TAATCCTGAAAGCCATAGGAA;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=139323254;WS=139323236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	139614436	rs4394401	G	A	4694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.578;SC=TCATTGCCCCGGGCCCTCTGC;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=63;TCR=93;TR=154;WE=139614444;WS=139614426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr8	139614582	rs6993225	C	T	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=306;SC=GCACACTGTGCCTTCTCTCCT;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=139614590;WS=139614572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	139617046	rs12546923	A	C	4544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=63;PP=2511;SC=GTGGCTCTGCAGCATCAGCCC;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=80;TCR=63;TR=143;WE=139617054;WS=139617036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr8	139618754	rs4471041	T	C	6419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=126;PP=2965;SC=CAAGCAGATTTGGAAACCTTG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=87;TCR=126;TR=213;WE=139618762;WS=139618744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr8	139620049	rs12681582	T	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=587;SC=TCCAACCTATTTCTACCACTC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=139620057;WS=139620039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	139620267	rs11166829	G	A	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=70;PP=2719;SC=ATCCTGCCAGGGCATCAAAGA;SOR=0.794;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=131;WE=139620275;WS=139620257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr8	139626176	rs7000261	C	G	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=32;PP=1239;SC=GGAACAAAGACAGAGAGATGG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=139626184;WS=139626166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	139631650	rs7009396	A	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=760;SC=AGAGCCATGTAGCTGATGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=139631658;WS=139631640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr8	139635920	rs7839790	T	A	4902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=68;PP=2846;SC=AGTAGTTGTTTTTGACATGTA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=152;WE=139635928;WS=139635910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
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chr8	139675869	rs11166835	G	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=837;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGTTTTTGGTGCTTCCCATTT;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=41;WE=139675877;WS=139675859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr8	139676082	rs4410946	A	G	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=82;PP=2717;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CAGTTGTCCTAGGAGGAGTCA;SOR=1.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=121;WE=139676090;WS=139676072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,147:0.99:149
chr8	139688697	.	A	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGG	3457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.64;MQRankSum=1.867;QD=29.06;ReadPosRankSum=-1.488;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr8	139696635	rs4506262	T	C	7346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=106;PP=2965;SC=CGGCAACTCGTGGCACCCACA;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=220;WE=139696643;WS=139696625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr8	139697286	rs11787153	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TGGCCAGCAGTCCATGAGGTT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=139697294;WS=139697276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr8	139697478	rs9644500	T	C	7197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=131;NR=108;PP=2965;SC=CTTTTCCGGGTGGCCCAGGGA;SOR=0.878;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=239;WE=139697486;WS=139697468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
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chr8	139706888	rs10109299	G	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=784;ReadPosRankSum=0.377;SC=GTTGCAATGGGTATAATTTGA;SOR=0.642;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=92;TCR=112;TR=61;WE=139706896;WS=139706878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,67:0.29:230
chr8	139707019	rs62527938	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=295;ReadPosRankSum=1.810;SC=TTTGGAGTCCGGGTCTCCAGG;SOR=0.617;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=18;WE=139707027;WS=139707009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
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chr8	139712346	rs4909836	A	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=842;ReadPosRankSum=0.800;SC=AGGCACCGCTACTACTTACGG;SOR=0.584;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=178;TCF=129;TCR=49;TR=56;WE=139712354;WS=139712336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,68:0.29:233
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chr8	139734242	rs4319142	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=520;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CTGTGTTTTGGGTTCCCAAAC;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=33;WE=139734250;WS=139734232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,35:0.30:117
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chr8	139736649	rs28726333	C	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=467;SC=GCCAGGGCACCCAGGGAGCCT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=139736657;WS=139736641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr8	139823922	rs2318332	C	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=381;SC=AGGGTGCTGTCAGCTGACAGC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=139823930;WS=139823912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	139824057	rs10101430	G	A	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=23;PP=656;SC=CTCCAGCTGGGCAGGAGCAGT;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=139824065;WS=139824047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	139825393	rs6577951	A	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=36;PP=986;SC=AGTCCACCCCAGGATACCCCT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=139825401;WS=139825383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	139838912	rs2292927	T	C	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=27;PP=1616;SC=TGTGGGATGCTGTACTGGTCG;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=139838920;WS=139838902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	139845520	rs6993839	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=36;PP=1029;SC=TCGGGAGGGAGTTGTTCAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=139845528;WS=139845510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	139889972	rs4736255	A	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=16;PP=968;SC=GAGGGGCCGCATGGGGCCCGG;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=139889980;WS=139889962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	140898188	rs372226318	G	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=0.056;SC=TTCCACACTCGCCTCGCCACT;SOR=0.348;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=41;WE=140898196;WS=140898178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,46:0.32:146
chr8	140944699	rs2233236	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.662;NF=20;NR=42;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCTGACCTGACTCCTGGGGTA;SOR=1.426;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=62;WE=140944707;WS=140944689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,73:0.68:107
chr8	141034189	rs9792174	A	T	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=4.246;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.15;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,307:0.98:312
chr8	141297613	rs6999767	T	C	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=657;ReadPosRankSum=1.757;SC=TGGTTAGGACTGGCATGACGG;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=34;WE=141297621;WS=141297603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr8	141297704	rs143344848	T	C	3523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=54;PP=2267;ReadPosRankSum=0.416;SC=GGACTCTCCTTACCGTTCACA;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=113;TCR=82;TR=127;WE=141297712;WS=141297694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,152:0.66:232
chr8	141461062	rs3735803	G	A	4845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.122;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.540;SC=AGTCCTCGTAGTTGGGGTAGA;SOR=0.427;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=277;TCF=148;TCR=129;TR=183;WE=141461070;WS=141461052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,216:0.67:323
chr8	141461185	rs3735802	A	G	5613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=1.111;SC=GGAACTTCTCAAAGGTCTGTG;SOR=1.008;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=330;TCF=184;TCR=146;TR=212;WE=141461193;WS=141461175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,253:0.64:393
chr8	141461266	rs3735801	A	G	6297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.212;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.846;SC=TCTGGAAGTCACCCCACTCGT;SOR=0.840;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=331;TCF=173;TCR=158;TR=232;WE=141461274;WS=141461256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,269:0.69:391
chr8	141525327	rs2231524	A	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1282;ReadPosRankSum=0.569;SC=GAAAGTGACCATGATGAAGCT;SOR=0.561;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=87;TCR=79;TR=94;WE=141525335;WS=141525317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,112:0.59:189
chr8	141525465	rs2231527	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=287;ReadPosRankSum=0.536;SC=AGTTCCAGTGTGTGGTATTCT;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=19;WE=141525473;WS=141525455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr8	141545722	.	C	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=45;PP=1111;ReadPosRankSum=1.198;SC=CAGAGCCAAGCAGGCGGGCCA;SOR=1.325;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=54;WE=141545730;WS=141545712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr8	141549346	rs35387146	CT	C	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=515;ReadPosRankSum=-0.206;SC=AGCAGGTTCTCTTGTGAGTGT;SOR=0.846;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=17;WE=141549354;WS=141549336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr8	141557497	rs2292782	T	C	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=11;PP=1571;SC=CCCTGCATACTGCACCCCACC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=71;WE=141557505;WS=141557487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	141559358	rs2292781	G	A	3926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=71;PP=2435;ReadPosRankSum=1.705;SC=TGGGCATGCCGGCGTCTCTCG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=145;WE=141559366;WS=141559348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,172:0.70:247
chr8	141561357	rs2292780	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=1.273;SC=AGCTGCCCATCGGGCAGCACC;SOR=0.976;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=8;WE=141561365;WS=141561347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr8	141561393	rs2292779	G	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=17;PP=1143;SC=CTGCCTGTGGGGGGCTTACTT;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=141561401;WS=141561383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	141565892	rs4961270	A	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=-0.803;SC=ATTCTCCTGCATGGAACACAG;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=141565900;WS=141565887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr8	141566311	rs2271738	C	T	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=47;PP=1790;ReadPosRankSum=0.634;SC=ACCTAGCAGTCGCTCTGATCA;SOR=0.768;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=105;WE=141566319;WS=141566301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,125:0.68:183
chr8	141566487	rs2271736	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-1.631;SC=GCTTGGGACCGTCTCTGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=12;WE=141566495;WS=141566477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr8	141568622	rs2292778	G	A	9109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=143;PP=2965;SC=CATTGCAGACGCGGTACTTCC;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=131;TCR=143;TR=274;WE=141568630;WS=141568612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr8	141568699	rs2292777	A	G	5444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=114;PP=2965;SC=AGGCATCGGCATCGGGGCTGT;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=49;TCR=114;TR=163;WE=141568707;WS=141568689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	141568725	rs2292776	G	A	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=82;PP=2680;SC=CCTGAGTGCAGGCGCCACTTG;SOR=2.187;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=25;TCR=82;TR=107;WE=141568733;WS=141568715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	141569652	rs3830525	G	GGCCTAA	1546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=2.790;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.271;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,46:0.35:133
chr8	141572497	rs2292774	GG	AA	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=646;ReadPosRankSum=0.228;SC=CCCTGCGGGGGGCCCTCGGAG;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=14;WE=141572506;WS=141572488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr8	141669818	rs3835176	AT	A	2114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=54;PP=1095;SC=GTTTTCAGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.795;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=60;WE=141669827;WS=141669808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	141670907	rs9324530	C	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr8	141684170	rs3639	T	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=21;PP=1290;ReadPosRankSum=0.483;SC=TAAAATCTATTACACTGAGAG;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=72;WE=141684178;WS=141684160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,82:0.72:114
chr8	141685641	rs6998337	C	A	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=51;PP=1633;SC=GGTATATACACTTGGGCAATG;SOR=1.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=79;WE=141685649;WS=141685631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	141744917	rs45613837	G	A	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=79;PP=2661;SC=GGTGGCAAAGGTCAGGAAAGG;SOR=1.431;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=42;TCR=79;TR=121;WE=141744925;WS=141744907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr8	141749052	rs11464275	A	AT	702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=4;PP=426;SC=AAAAGAGATAATTTTTTTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=141749060;WS=141749042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	141762558	rs6578132	G	A	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=482;SC=GAATGAGAGGGATACTTAAAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=141762566;WS=141762548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	141774282	rs7840381	A	C	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=19;PP=1099;SC=TTTTAAATGCAAGGAGGCATC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=141774290;WS=141774272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	141774576	rs4378011	A	G	146.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=3;PP=41;SC=ATCATTGTCCAATACGTTATA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=141774584;WS=141774566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	141779826	rs10875458	C	A	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=34;PP=1002;SC=AAATAAAAAACAATTACCCCC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=141779834;WS=141779816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	141840645	rs4246127	G	A	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=38;PP=1138;SC=AAAAAGAAGCGTATTAACAAA;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=141840653;WS=141840635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	141840739	rs4246128	G	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=294;SC=ATATTATTTAGGAAGGAAACA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=141840747;WS=141840729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	141994297	rs4961311	A	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=177;SC=AGCATTACATAATCATGTAGT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=141994305;WS=141994287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	142138860	rs3739232	C	G	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=31;PP=2059;SC=TGCTGGAGCTCTGCGCGCTGC;SOR=1.365;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=93;WE=142138868;WS=142138850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	142146708	rs307772	T	C	9019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=150;PP=2965;SC=GACAGTCAAATGGCCGGTGCC;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=140;TCR=150;TR=290;WE=142146716;WS=142146698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr8	142166214	rs555399	C	T	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=46;PP=1302;SC=ATTTTGTTTTCTGAGATTGAG;SOR=4.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=142166222;WS=142166204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	142170884	rs2289001	C	T	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=53;PP=1853;SC=TGAGCATCTTCAGGTACGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=142170892;WS=142170874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	142173356	rs428300	C	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=541;SC=CTAACCATTTCTCTGCTACTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=142173364;WS=142173346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	142176507	rs412706	T	C	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=36;PP=957;SC=TGCCCCCCACTGTGGTGCTGT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=142176515;WS=142176497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	142200205	rs144741369	T	TCATGTTTG	1732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=1992;SC=CATGTTATTATCATGTTTGCA;SOR=5.031;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=25;WE=142200213;WS=142200195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	142200467	rs1045303	G	A	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=92;PP=2879;SC=TCCAGCTGCCGCGAGGTGGCC;SOR=1.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=39;TCR=93;TR=131;WE=142200475;WS=142200457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	142202856	rs6990186	C	T	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=65;PP=2965;SC=CGCACGCCCTCGTGCCCTCCT;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=142202864;WS=142202846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
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chr8	142222445	rs3739238	T	C	5041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=62;PP=2965;SC=TCTGACACGTTGGGATAGATC;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=94;TCR=62;TR=156;WE=142222453;WS=142222435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr8	142225990	rs2288998	G	A	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=943;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CGGCTGTGCCGACAGAGAAGC;SOR=0.873;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=229;TCF=109;TCR=120;TR=73;WE=142225998;WS=142225980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,89:0.32:274
chr8	142226108	rs892364	C	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=47;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AGTGGGCAGGCGGCTGGCTCC;SOR=0.882;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=60;WE=142226116;WS=142226098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,67:0.74:90
chr8	142227083	rs7813723	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=287;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CAGAAGTCAGTGCGACTGATG;SOR=0.475;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=23;WE=142227091;WS=142227073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr8	142228077	rs3842198	AGAGCGGCCCCGCTCCGGT	A	3303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=16;PP=2973;SC=GTGGGCAGAGAGAGCGGCCCC;SOR=2.211;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=39;WE=142228102;WS=142228067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	142228149	rs12679446	G	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=1;HapScore=1;MGOF=97;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.710;NF=32;NR=20;PP=636;ReadPosRankSum=-0.356;SC=CCATGAAGTCGGTGTAGAACA;SOR=0.888;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=152;TCF=87;TCR=65;TR=52;WE=142228157;WS=142228139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,59:0.34:176
chr8	142228686	rs3739237	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=936;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TGGTCTTGGCGAGCTCCTGGC;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=78;TCR=124;TR=63;WE=142228694;WS=142228676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,75:0.33:228
chr8	142228809	rs753779	T	C	6631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=108;NR=92;PP=2965;SC=GCACGTGCAATGCCGAGTCGC;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=108;TCR=92;TR=200;WE=142228817;WS=142228799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr8	142228909	rs753778	G	A	6380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=1.169;SC=GACGCCGTGCGGCTCGCCCCC;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=350;TCF=207;TCR=143;TR=239;WE=142228917;WS=142228899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,275:0.67:409
chr8	142229145	rs3739235	A	G	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=86;PP=2508;SC=GGGAGGAAGCAGCAGCCGGTG;SOR=2.474;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=20;TCR=86;TR=106;WE=142229153;WS=142229135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	142229178	rs3739234	G	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=6;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=866;ReadPosRankSum=0.786;SC=CAGGCCACAGGGGGGGAAGCT;SOR=1.018;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=44;WE=142229186;WS=142229168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr8	142229834	rs2304280	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=964;ReadPosRankSum=1.005;SC=TGGGCCCCTCGGTGGCATCGG;SOR=0.531;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=222;TCF=102;TCR=120;TR=74;WE=142229842;WS=142229824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,85:0.32:263
chr8	142229891	rs2304279	A	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=82;PP=2544;SC=GCACGATGCCAATGGGCTGCC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=122;WE=142229899;WS=142229881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	142229946	rs4961256	G	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=42;PP=1226;SC=GAGCACACGGGAGGGCGGTCA;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=142229954;WS=142229936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	142231636	rs7004350	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=0.998;SC=CAGGACCCCGTCTGTGTTGTG;SOR=1.162;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=15;WE=142231644;WS=142231626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr8	142231944	rs6983780	GC	AG	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=1199;SC=CCCGCGACAGGCAGGTGCCTC;SOR=3.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=142231953;WS=142231934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	142266691	rs7002500	A	C	5515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=81;PP=2965;SC=CCTGGCTCTTACGTCCCAGCT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=173;WE=142266699;WS=142266681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr8	142266818	rs150546085	G	A	3617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=68;PP=2085;ReadPosRankSum=2.024;SC=CCTGAACGTCGCTACGATTCC;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=127;WE=142266826;WS=142266808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,160:0.62:256
chr8	142367335	rs10875472	T	C	10387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=195;PP=2965;SC=GCGACCCTGGTGGAGCAGACC;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=140;TCR=195;TR=335;WE=142367343;WS=142367325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr8	142367400	rs11167054	G	A	8548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=150;PP=2965;SC=TGACCAGCAGGGGCAGCAGGA;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=109;TCR=150;TR=259;WE=142367408;WS=142367390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr8	142367559	rs11785629	G	A	7784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=106;PP=2965;SC=GGGAGCCTTCGGGCCGCACGA;SOR=0.923;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=139;TCR=106;TR=243;WE=142367567;WS=142367549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr8	142368150	rs7388121	T	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.49;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	142368156	rs7388122	T	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	142444240	rs28490954	G	T	196.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr8	142444526	rs10104447	G	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=398;ReadPosRankSum=-1.762;SC=ATGCTGGGTAGGGGGGGCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=25;WE=142444534;WS=142444516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
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chr8	142445062	rs35650977	T	TG	787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.877;NF=4;NR=20;PP=783;ReadPosRankSum=0.814;SC=TGGGACGGGCTGGGGGCCCTG;SOR=0.656;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=24;WE=142445070;WS=142445052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr8	142445108	rs111874351	C	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=330;ReadPosRankSum=0.185;SC=GTTTGCCTTGCCCAGCCCCTG;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=17;WE=142445116;WS=142445098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr8	142445506	rs113190242	A	T	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.111;SC=CGACCCTGGCAACAGCACCTG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=77;WE=142445514;WS=142445496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr8	142445659	rs79988544	G	A	5648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.510;SC=GTGCTGCCACGGCAGGCAGGG;SOR=0.949;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=328;TCF=210;TCR=118;TR=211;WE=142445667;WS=142445649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,241:0.65:371
chr8	142445680	rs11784911	A	T	6533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CACAGTCCATATTCACACAAG;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=385;TCF=215;TCR=170;TR=255;WE=142445688;WS=142445670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,293:0.66:446
chr8	142446937	rs78448370	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=470;ReadPosRankSum=1.549;SC=GAGCAAGGGCCGCAGCTGTCC;SOR=0.908;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=36;WE=142446945;WS=142446927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr8	142451705	rs368228751	G	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=0.917;SC=CCTGAAGCAGGCTGCCTCGAC;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=23;WE=142451713;WS=142451695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr8	142459814	rs7003306	C	T	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=75;PP=2267;SC=CGTGGGCTGCCCAGCCCCCAG;SOR=2.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=25;TCR=75;TR=100;WE=142459822;WS=142459804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	142476424	rs28710266	G	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.19;ReadPosRankSum=-1.281;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr8	142476424	.	GCG	ACA	1404	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=26;NR=3;PP=1404;QD=50.2575129263;SC=GTGGGCCATGGCGGGGGCAGA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=29;WE=142476434;WS=142476414;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,29:0.64:45
chr8	142476426	rs28663233	G	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.28;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr8	142476474	rs28525328	T	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1003;ReadPosRankSum=1.584;SC=GGGGAGAGGATGGGGAGTGGG;SOR=0.652;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=68;WE=142476482;WS=142476464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,77:0.74:104
chr8	142476555	rs28439396	A	G	3174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=62;PP=1851;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ACCAGCTCACAGGTGTGGCTC;SOR=0.576;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=119;WE=142476563;WS=142476545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,145:0.65:222
chr8	142476611	rs28504323	G	A	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=57;PP=1667;ReadPosRankSum=1.002;SC=CTTGGCTTGCGGGATGTGGAC;SOR=0.815;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=161;TCF=72;TCR=89;TR=100;WE=142476619;WS=142476601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,119:0.60:197
chr8	142477453	.	CCCTGGCCCTT	C	1829	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=3;PP=1829;QD=307.0;SC=GCCCTCCGCCCCCTGGCCCTT;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=142477470;WS=142477443;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr8	142477468	rs377007139	GCCC	G	733.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr8	142477472	rs370101118	TTCCTGGC	T	751.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr8	142477479	.	C	T	598	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=95;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=11;NR=3;PP=598;QD=45.1979437534;SC=CCCTTCCTGGCCCAGCCCCAG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=14;WE=142477498;WS=142477469;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr8	142477490	rs73713679	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=2;HapScore=4;MGOF=95;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=598;ReadPosRankSum=0.977;SC=CCAGCCCCAGCGCCCTCACGA;SOR=1.139;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=17;WE=142477498;WS=142477469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr8	142477517	rs79788097	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.548;HP=4;HapScore=2;MGOF=77;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=587;ReadPosRankSum=0.046;SC=GCTTGGCCCCGTGCTCCTGGA;SOR=1.483;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=29;WE=142477525;WS=142477507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr8	142477553	rs73713680	T	C	3282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.97;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,76:0.72:106
chr8	142477563	rs73713681	C	T	3927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.21;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=1.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,92:0.71:130
chr8	142477588	rs74908317	C	T	6308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.483;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,151:0.74:204
chr8	142477592	rs76586547	G	A	6341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.77;ReadPosRankSum=0.778;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,154:0.72:213
chr8	142477614	rs72685432	C	T	6554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=62;PP=2259;ReadPosRankSum=0.934;SC=GATGAGGTCGCTCAACTCTGC;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=205;TCF=118;TCR=87;TR=144;WE=142477622;WS=142477604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,174:0.72:241
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chr8	142477771	rs72685433	C	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=1.906;SC=CTGAGCATATCTGGCCTCCTA;SOR=0.184;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=26;WE=142477779;WS=142477761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
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chr8	142488662	rs2613643	C	T	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=18;PP=1514;SC=GTCCGGGACTCGGTCTTGGTG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=65;WE=142488670;WS=142488652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr8	142490079	rs2613641	G	A	8954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCGTGGCACCGTTTTTTTCAG;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=130;TCR=153;TR=280;WE=142490087;WS=142490068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,341:0.99:343
chr8	142490120	rs2748416	G	T	4283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.064;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=102;PP=2650;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TAGGTAAACAGGAAGGCCTGT;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=248;TCF=93;TCR=155;TR=155;WE=142490128;WS=142490103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,189:0.63:300
chr8	142490139	rs7838090	C	A	3438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=3;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=86;PP=2287;ReadPosRankSum=0.710;SC=GTGGGAAGGGCAGCATCTTAT;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=213;TCF=78;TCR=135;TR=132;WE=142490147;WS=142490129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,151:0.60:251
chr8	142490166	rs7838192	C	T	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=7;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=60;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CTTGACCCCCCCCAAGGTGGC;SOR=0.978;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=85;WE=142490174;WS=142490156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,97:0.61:158
chr8	142500345	rs75295956	C	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=717;ReadPosRankSum=0.722;SC=CAGCATGTTGCTGGCCGCGTC;SOR=1.063;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=145;TCF=49;TCR=96;TR=54;WE=142500353;WS=142500335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,55:0.32:174
chr8	142505038	rs6578193	T	C	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=116;PP=2965;SC=TGCTGGAGATTTGTGGATGGC;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=87;TCR=116;TR=203;WE=142505046;WS=142505028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	142505056	rs2246587	TG	CT	6406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=73;PP=2944;ReadPosRankSum=1.623;SC=GGCAGAGCAATGGTGGCTTGG;SOR=0.768;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=189;TCF=79;TCR=110;TR=120;WE=142505065;WS=142505046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,161:0.69:234
chr8	142505578	rs2748404	C	A	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.083;SC=ATCTTGAAGCCGGTGGCTAAG;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=63;WE=142505599;WS=142505568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,72:0.66:109
chr8	142506401	rs2748400	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=-2.266;SC=GCCTGTCTGAGCCCAGGGCTG;SOR=0.737;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=9;WE=142506409;WS=142506391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr8	142506461	rs2613637	A	G	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=1270;ReadPosRankSum=-2.317;SC=GTGCTCCTGTAGCATCAGTGT;SOR=0.620;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=69;TCR=30;TR=71;WE=142506469;WS=142506451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,77:0.72:107
chr8	142517130	rs11355664	TG	T	3768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.574;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1592;ReadPosRankSum=1.692;SC=TGAGTACCGGTGGGGGGGGGT;SOR=1.340;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=80;WE=142517138;WS=142517120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr8	142517222	rs2748421	A	G	11319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.04;QD=44.74;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr8	142517227	rs2613648	C	T	11367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.04;QD=44.75;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	143310815	rs11167136	G	A	3531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=57;PP=2428;ReadPosRankSum=0.757;SC=GATGGTGTACGGGTAGGTGGG;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=119;TCR=81;TR=141;WE=143310823;WS=143310805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,153:0.68:225
chr8	143352978	rs11777062	T	G	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=17;PP=1396;SC=AGGGGGTCAGTTTCAGGCAGG;SOR=1.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=143352986;WS=143352968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
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chr8	143365913	rs5895710	GT	G	3649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=70;PP=2951;SC=GCACCTGAAAGTTTCCCATGG;SOR=2.086;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=74;WE=143365921;WS=143365903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr8	143427178	rs33970858	C	G	6449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.898;SC=CCCCACACAGCGGTTCTGCAG;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=410;TCF=210;TCR=200;TR=244;WE=143427186;WS=143427168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,294:0.60:492
chr8	143436034	rs7814359	A	G	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GGTCCCCCGAAAGGGCCACGG;SOR=0.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=83;WE=143436042;WS=143436024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,106:0.63:168
chr8	143447503	rs7388487	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.115;NF=1;NR=18;PP=398;ReadPosRankSum=0.701;SC=GTTCATGCCACTCTCCAGCCT;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=19;WE=143447511;WS=143447493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr8	143546381	.	TGGGCAGACAGGGGAGGC	T	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.710;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
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chr8	143560555	rs13252518	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=666;ReadPosRankSum=1.075;SC=TGCCCCACATTCCTGGGTCCC;SOR=0.934;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=33;WE=143560563;WS=143560545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr8	143560895	rs12682337	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.817;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.826;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr8	143560898	rs12680973	T	C	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.817;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr8	143560996	rs66517676	AGCCAGCT	A	3601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.155;NF=16;NR=32;PP=2756;ReadPosRankSum=1.450;SC=CACCTTCCAGAGCCAGCTGCC;SOR=0.666;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=48;WE=143561010;WS=143560986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,92:0.61:152
chr8	143561206	rs4509377	G	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=45;PP=1187;ReadPosRankSum=0.594;SC=CTGTCCTCACGGTGATGCCCA;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=69;WE=143561214;WS=143561196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,77:0.73:105
chr8	143563087	rs11782438	C	G	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=79;PP=2017;ReadPosRankSum=-1.028;SC=GCTCCCCGAGCGGCATTTTGG;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=189;TCF=61;TCR=128;TR=114;WE=143563095;WS=143563077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,127:0.59:215
chr8	143563161	rs11776057	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=609;ReadPosRankSum=1.182;SC=CCCCAACCCTGGCCACAGCCC;SOR=1.132;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=29;WE=143563169;WS=143563151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr8	143570281	rs73714305	G	A	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=2;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GGCCCTGGACGCGACCTTGAA;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=73;TCR=3;TR=56;WE=143570289;WS=143570271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,60:0.75:80
chr8	143570921	rs7825551	A	G	6130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=147;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TTCGAGAGCTACTTTTATCCC;SOR=0.694;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=343;TCF=124;TCR=219;TR=234;WE=143570929;WS=143570911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,264:0.64:412
chr8	143599631	rs13281622	A	G	13004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=1.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr8	143599634	rs13254098	T	G	12930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.53;SOR=1.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
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chr8	143599665	rs13254123	T	C	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=125;PP=2965;SC=GCCTCTTCCCTTGAAGGTCAC;SOR=2.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=32;TCR=125;TR=157;WE=143599673;WS=143599641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
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chr8	143620570	rs7387853	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=547;SC=ACAGGCAGGTACATGGGGAGG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=143620578;WS=143620560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	143620822	rs7388198	T	C	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=108;PP=2946;SC=GCCCCCTGCATGGCCCCACTC;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=54;TCR=108;TR=162;WE=143620830;WS=143620812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
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chr8	143762135	rs2920279	A	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=0.962;SC=TCCTCCAGGGAAGCTCTTGGC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=14;WE=143762143;WS=143762125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr8	143762932	rs2976392	G	A	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=64;PP=1711;ReadPosRankSum=1.059;SC=GTCCGCATCTGTGTGCTGTTT;SOR=0.844;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=72;TCR=100;TR=108;WE=143762940;WS=143762922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,133:0.60:220
chr8	143763043	rs2920298	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=0.647;SC=TCCTCCACTCATCTGTCCCTC;SOR=1.112;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=23;WE=143763051;WS=143763033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
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chr8	143784102	rs35386446	A	G	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.734;NF=20;NR=39;PP=1194;ReadPosRankSum=1.211;SC=TGGTCATGAGACAAGACCCCC;SOR=1.032;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=59;WE=143784115;WS=143784092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
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chr8	143845953	rs2717554	T	C	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.30;SOR=2.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr8	143846593	rs12541206	T	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=47;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CACAAACGGATGGGAGGCAGG;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=66;WE=143846601;WS=143846583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,69:0.80:86
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chr8	143856967	rs2304398	C	G	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=971;ReadPosRankSum=0.990;SC=AGAACCTCCCCTTCGTGCTCC;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=78;TCR=27;TR=64;WE=143856975;WS=143856957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr8	143857096	rs34798388	G	A	5000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.071;SC=CACACACGTGGCAGTCCAAGG;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=304;TCF=146;TCR=158;TR=197;WE=143857104;WS=143857086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,225:0.64:353
chr8	143857265	rs2585125	G	T	7496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=113;PP=2965;SC=CTTCCCTACTGTCAGCCCATC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=118;TCR=113;TR=231;WE=143857273;WS=143857255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr8	143857441	rs3214637	A	AGG	2220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=33;PP=1579;SC=GATCCAACTCAGGTGGCGCAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=33;WE=143857449;WS=143857431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr8	143959174	rs75717953	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-2.849;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.561;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,28:0.19:150
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chr8	143993315	rs3097	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=535;ReadPosRankSum=-0.869;SC=AAGCTGTGCACGTGGGAGAGA;SOR=0.784;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=28;WE=143993323;WS=143993305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
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chr8	143994944	rs13252628	T	G	9632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=112;NR=205;PP=2965;SC=CAGGACAACCTCCCTCTGAGG;SOR=1.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=317;TCF=112;TCR=205;TR=317;WE=143994952;WS=143994934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr8	143994978	.	CAAA	C,CAA	8389.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=111;PP=2969;SC=ATGCCCTGAGCAAAAACAGAG;SOR=2.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=3;TCR=123;TR=114;WE=143994990;WS=143994968;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:188
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chr8	143994982	.	A	ACG	8389.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=44.16;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr8	143995761	rs4536	C	T	6238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=88;PP=2965;SC=ACAGGAGCTCCGCCACGATGC;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=195;WE=143995769;WS=143995751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr8	143997309	rs13257680	C	T	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=56;PP=2402;SC=TATTTATGTCCAGCTGGCTGC;SOR=1.048;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=143997317;WS=143997299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	143997795	rs11781816	C	T	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.99;NF=69;NR=53;PP=2153;SC=CATCCTCATCCAGTCCTTCCC;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=122;WE=143997803;WS=143997785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	143998426	rs13268153	C	T	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=7;PP=1350;SC=CCCCTACACCCAGGCTGCCCA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=143998434;WS=143998416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	143998662	rs13276226	G	A	12855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=240;PP=2965;SC=CCTGCTGGACGGGGTCATGTC;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=391;TCF=151;TCR=240;TR=391;WE=143998670;WS=143998652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,452:1.00:452
chr8	144097333	rs62525085	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=769;ReadPosRankSum=0.474;SC=AGTGCTGCTACGTAAGAAGGA;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=60;WE=144097341;WS=144097323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,69:0.31:223
chr8	144097377	rs62525087	C	G	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=820;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GGCATTCGGCCCGGTCAGGAC;SOR=0.604;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=64;WE=144097385;WS=144097367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,70:0.33:215
chr8	144097453	rs13279735	A	G	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=726;ReadPosRankSum=-0.335;SC=CTCCCCTTTCACCTGCCCCAA;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=38;WE=144097461;WS=144097443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr8	144102493	rs11136286	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=819;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GAGCAGACGCCCCAGGGGTCC;SOR=0.711;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=48;WE=144102501;WS=144102483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr8	144105026	rs147881012	TCCCGGTGTTCGGGC	T	3098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.998;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=2932;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGGACAGAGATCCCGGTGTTC;SOR=1.442;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=44;WE=144105047;WS=144105016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,78:0.62:125
chr8	144105342	rs7823963	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=-0.928;SC=ACGGGGGCGCAGTCATCCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=11;WE=144105350;WS=144105332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr8	144124609	rs11136300	T	C	8290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=117;PP=2965;SC=CAGGGGCTGCTGGCTGCCAGG;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=138;TCR=118;TR=255;WE=144124617;WS=144124599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr8	144125727	rs6997455	T	A	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=50;PP=1398;SC=GCAGCTGGCGTTGGGAGGCTA;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=59;WE=144125735;WS=144125717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	144126244	rs4612316	T	C	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=36;PP=888;SC=GGTGGGTGACTGCAGCACATG;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=144126252;WS=144126234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	144130550	rs12677862	C	G	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=32;PP=2425;SC=GGATGTCCCACACCCTGTCAT;SOR=1.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=73;TCR=32;TR=104;WE=144130558;WS=144130540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	144162364	rs6993880	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=798;SC=GGGGGGTGCGCCCTGAGTAAA;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=144162372;WS=144162354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	144239660	rs7007949	G	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=669;ReadPosRankSum=1.030;SC=GTGGGAAGGAGGAGACATCAG;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=90;TCR=22;TR=41;WE=144239668;WS=144239650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,42:0.36:118
chr8	144239859	rs10109061	A	G	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,133:0.30:438
chr8	144240257	rs9694368	C	G	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=990;ReadPosRankSum=-0.509;SC=TGGCACACACCGTGTCGGACG;SOR=0.898;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=249;TCF=97;TCR=152;TR=75;WE=144240265;WS=144240247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,87:0.30:292
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chr8	144398396	rs2293926	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=0.454;SC=CAGCCCCTTCCACTCACACAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=28;WE=144398404;WS=144398386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr8	144399856	rs3215410	TC	T	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.647;HP=7;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=316;ReadPosRankSum=0.712;SC=GGGGCCGTGCTCCCCCCGCGC;SOR=2.494;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=13;WE=144399864;WS=144399846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr8	144400021	rs139312718	T	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=3.008;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,66:0.27:249
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chr8	144425247	rs7837655	C	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=761;ReadPosRankSum=-0.949;SC=CTTATTTCACCATAAAATCTT;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=33;WE=144425255;WS=144425237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,34:0.83:41
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chr8	144459329	rs901760	C	T	3252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.576;NF=78;NR=41;PP=1966;ReadPosRankSum=0.867;SC=TGTGTGCGCGCGCATGTGTGT;SOR=0.464;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=170;TCF=115;TCR=55;TR=119;WE=144459337;WS=144459319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,142:0.71:199
chr8	144460569	rs901762	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr8	144463267	rs13275994	C	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=4;PP=964;SC=CAGAGGGGGCCGTGTGTTCAG;SOR=3.365;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=144463275;WS=144463257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr8	144511389	rs7386685	C	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=260;SC=AGACTTGGCACCGGGGCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=144511397;WS=144511385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	144511953	rs141816879	ATGG	A	2164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=31;PP=1539;SC=CCGCGCCGCCATGGTGGTGGT;SOR=1.473;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=32;WE=144511963;WS=144511943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	144511995	rs1872900	A	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=36;PP=926;SC=CGGCGTGGTGATGGTGGGCGG;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=144512003;WS=144511985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	144522386	.	T	TGAG	2377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.227;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.474;NF=9;NR=23;PP=1551;ReadPosRankSum=-1.839;SC=CGGGAGGGGATGAGGAGGAGG;SOR=0.609;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=32;WE=144522394;WS=144522376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,60:0.66:91
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chr8	144618379	rs11774857	A	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=292;SC=AGCATATCCCATCAGGCAGGC;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=144618387;WS=144618369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	144620183	rs4874147	T	C	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=94;NR=50;PP=2813;SC=CTTGTGCTGCTGCGTCTCCGG;SOR=1.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=95;TCR=50;TR=144;WE=144620191;WS=144620173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	144620334	rs145312531	C	G	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.066;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=2063;ReadPosRankSum=-2.517;SC=AGGCATGGTCCTTGCTGCTGG;SOR=0.510;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=96;TCR=112;TR=66;WE=144620350;WS=144620324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,79:0.32:244
chr8	144620342	rs1318196	T	C	3263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=3.111;SC=TCCTTGCTGCTGGCCTCCGAC;SOR=0.823;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=127;WE=144620350;WS=144620324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,147:0.67:220
chr8	144620855	rs4873802	C	A	7012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.326;SC=GGGAAGCTCGCCTTGACGGCA;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=331;TCF=191;TCR=140;TR=250;WE=144620863;WS=144620845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,290:0.76:381
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chr8	144640506	rs80346174	G	C	4261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=55;PP=2182;ReadPosRankSum=0.467;SC=GGCGGGCCCTGCGTCAGGTTG;SOR=0.583;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=207;TCF=126;TCR=81;TR=136;WE=144640514;WS=144640496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,191:0.68:280
chr8	144641159	rs59789236	G	GGTGA	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.98;ReadPosRankSum=3.005;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr8	144641161	.	A	G	772	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=20;NR=26;PP=772;QD=17.5385046206;SC=GGGTCCCTGCACCACGCTCAG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=46;WE=144641169;WS=144641151;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr8	144641161	.	A	ACTCTGGCTGGGTTTTGCAGTGGGTCCCTGCG	1319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.20;ReadPosRankSum=2.870;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,69:0.69:100
chr8	144641313	rs7840166	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-1.694;SC=GGAGAACACTGTAATTCTGTG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=144641321;WS=144641303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr8	144641753	rs4874151	A	C	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=3.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,78:0.29:273
chr8	144642178	rs11774948	T	C	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=42;PP=1236;SC=GGGCCCCACCTACCCCAAGCA;SOR=2.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=144642186;WS=144642168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	144642244	rs73375262	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=1.687;SC=AGGTTTTGCTATCTCGGCCAG;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=144642252;WS=144642234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr8	144642490	rs73375263	G	A	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1902;ReadPosRankSum=-2.485;SC=CCTAAGGACCGGACTGAGCCC;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=108;WE=144642498;WS=144642480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,123:0.68:180
chr8	144642596	rs7835865	T	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;ReadPosRankSum=1.024;SC=AGTCCACCTTTCCTCATGGGG;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=59;WE=144642604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,66:0.35:188
chr8	144642626	rs7831485	A	G	4665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=77;PP=2965;SC=CGTGGGGAGCACACGGAGAGG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=151;WE=144642634;WS=144642616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	144642854	rs11551202	G	A	3706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=2139;ReadPosRankSum=-1.303;SC=CTGAGGTGCTGCAGACACAGA;SOR=0.499;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=206;TCF=97;TCR=109;TR=136;WE=144642862;WS=144642835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,164:0.67:245
chr8	144642944	rs141790883	G	A	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1346;ReadPosRankSum=-0.925;SC=GCTTGCAGGTGTGTAGCCAGC;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=85;WE=144642952;WS=144642934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,106:0.73:146
chr8	144642986	rs11136298	T	C	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=53;PP=1399;SC=CACGTGGGCATGCGGCGGCGG;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=80;WE=144642994;WS=144642976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	144643321	rs12541790	A	G	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=106;PP=2965;SC=TGGCAGAGAAACAGGGAGGCC;SOR=1.989;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=39;TCR=106;TR=145;WE=144643329;WS=144643311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	144643603	rs2290414	G	A	3860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=62;PP=2325;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGTGAGAGCCGAGAGCCCCCA;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=207;TCF=115;TCR=92;TR=138;WE=144643611;WS=144643593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,171:0.67:254
chr8	144644583	rs1349806	G	C	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=738;SC=CCCGGTGGGCGTTCAGAAACC;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=144644591;WS=144644573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	144644787	rs1377663	T	A	9364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=146;NR=133;PP=2965;SC=AGGCACAAGATGCCCAGATTT;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=146;TCR=133;TR=279;WE=144644795;WS=144644777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr8	144649550	rs7010602	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=12;PP=857;SC=AGCCCCGGGCACGGGCCAGCA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=144649558;WS=144649540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	144649601	rs13268196	A	G	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=34;PP=1265;SC=CCGCGGCCACAGCCGGCTTGG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=144649609;WS=144649591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	144649625	rs10097556	T	C	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=37;PP=1334;SC=CGCTCTGCAGTCGCCCTAGGT;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=144649633;WS=144649615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	144649690	rs13254590	C	T	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=32;PP=1210;SC=AGTGCCCGGGCCCCTGGCCCT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=144649698;WS=144649680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr8	144650503	rs13271361	G	A	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=2256;ReadPosRankSum=0.005;SC=GGGAAGAGGGGGAGCAAGGGC;SOR=1.042;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=68;WE=144650518;WS=144650493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,80:0.75:106
chr8	144650510	rs11136301	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=665;ReadPosRankSum=0.426;SC=GGGGGAGCAAGGGCATCGGGT;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=23;WE=144650518;WS=144650493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,25:0.24:103
chr8	144650547	rs11136302	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=7.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr8	144650550	rs10101426	T	C	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=43;SC=GGCAGGAGACTGGATTGATTC;SOR=1.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=144650558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	144650925	rs13279011	A	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=0.706;SC=AGGCGGAGACAGAGAGGGGCT;SOR=0.631;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=5;WE=144650933;WS=144650915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr8	144651576	rs7013931	C	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	144652281	rs11990325	T	A	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1349;ReadPosRankSum=-1.343;SC=TGGCGGCCTTTCTCCTCGAGA;SOR=0.385;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=78;WE=144652289;WS=144652271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,98:0.70:140
chr8	144652595	rs200070927	G	GGCAGTGGGA	4487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=2897;ReadPosRankSum=1.595;SC=GAGCTGAGAGGGTGACAGCAT;SOR=0.627;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=134;TCF=42;TCR=92;TR=48;WE=144652608;WS=144652577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,109:0.50:218
chr8	144652599	.	A	AGAGGG	4819.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=2954;ReadPosRankSum=1.269;SC=TGAGAGGGTGACAGCATGCTG;SOR=0.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=35;TCR=77;TR=45;WE=144652608;WS=144652577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,111:0.50:221
chr8	144652600	.	C	G	4785.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GAGAGGGTGACAGCATGCTGG;SOR=0.702;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=69;WE=144652608;WS=144652577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,123:0.53:233
chr8	144653011	rs11777527	C	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.14;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	144653218	rs4874152	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=233;SC=GTGTCCAGGGAATGTAGGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=144653226;WS=144653208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	144654249	rs10866911	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=1.060;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,37:0.28:132
chr8	144654255	rs4874153	A	G	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,44:0.30:147
chr8	144654582	rs4874154	C	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.062;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr8	144654586	rs4874155	G	C	5021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=41;PP=2727;SC=TCCCTCCCCCGTCACCTGGTG;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=82;TCR=41;TR=122;WE=144654602;WS=144654572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	144654594	rs4873803	G	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=4.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.097;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,58:0.38:152
chr8	144654693	rs4873804	G	C	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=625;ReadPosRankSum=0.890;SC=CTGCCTCAGAGGGGGCGGTGA;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=88;TCR=95;TR=56;WE=144654701;WS=144654683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,65:0.31:213
chr8	144657269	rs2290417	G	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=341;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CACAGCTGCAGGGAGGAGGTA;SOR=0.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=37;WE=144657277;WS=144657259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,51:0.35:147
chr8	144657801	rs9771743	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=819;ReadPosRankSum=2.229;SC=CCTTATAGACGCCACCCAGGG;SOR=0.912;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=53;WE=144657809;WS=144657791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr8	144658711	rs872935	G	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1333;ReadPosRankSum=0.131;SC=CCCAGGGCCAGGGCGACTGCT;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=263;TCF=119;TCR=144;TR=95;WE=144658719;WS=144658701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,103:0.35:295
chr8	144659608	rs12678314	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.433;SC=CAGGGTGAGGATCACTAGGCC;SOR=0.093;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=5;WE=144659616;WS=144659598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr8	144660046	rs896954	G	A	3891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=71;PP=2388;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AGCAGTCGAGGGCCCGAAGGT;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=124;TCR=124;TR=141;WE=144660054;WS=144660036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,174:0.58:301
chr8	144660189	rs896953	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=341;ReadPosRankSum=0.514;SC=CCACGGGGGGACAAGGACTTC;SOR=1.159;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=24;WE=144660197;WS=144660179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,21:0.28:75
chr8	144660523	rs4475500	A	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=26;PP=671;SC=CCCCGCCCCGACCCCGTGACG;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=144660531;WS=144660513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	144662353	rs1062391	G	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=32;NR=43;PP=1337;SC=CCTCCAGCTGGGCCATGTCCG;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=144662361;WS=144662343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	144668590	rs11780087	T	C	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=73;SC=AACGAGAGCTTGGCGGGCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=144668598;WS=144668580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	144671244	rs4874160	C	A	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=32;PP=2895;SC=ACCAGGCCACCCGCAGGGCCT;SOR=2.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=105;TCR=32;TR=137;WE=144671252;WS=144671234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	144671685	rs6985081	G	C	7458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=90;PP=2965;SC=TGCGGCTGCCGTCGGGGGCCA;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=134;TCR=90;TR=224;WE=144671693;WS=144671675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr8	144671922	rs3812448	G	A	10458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=178;PP=2965;SC=CCAGCCACACGCGTTCGGCCG;SOR=0.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=131;TCR=178;TR=309;WE=144671930;WS=144671912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr8	144672541	rs751932	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=216;SC=ATGAACAATATATAATTTTGT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=144672549;WS=144672531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr8	144688736	rs2242090	C	G	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=66;PP=2196;SC=GCTGCAGGAGCTTGGTCTCGC;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=126;WE=144688744;WS=144688726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr8	144689686	rs4874169	A	G	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=62;PP=2238;SC=GCACAAACACATGCACACACA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=134;WE=144689694;WS=144689676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr8	144689914	rs11136305	C	T	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=18;PP=1847;SC=CACAAGCGCACGTGCAAACGC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=144689922;WS=144689904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	144689932	rs34360518	CACAT	C	4002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=15;PP=2974;SC=CGCACATGAGCACATACATAC;SOR=3.019;Source=Platypus;TR=80;WE=144689943;WS=144689922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	144690014	rs4874170	T	C	9953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=199;NR=101;PP=2965;SC=CACTCACACATGCATACACAC;SOR=1.386;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=302;TCF=199;TCR=103;TR=300;WE=144690022;WS=144690004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr8	144690886	rs10097337	A	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=800;SC=GTGGCAGCCAAACACACCAGT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=144690894;WS=144690876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	144695176	rs2242087	C	T	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=54;PP=1047;ReadPosRankSum=2.384;SC=CAGGGAGGGTCGGGGCCGCAT;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=269;TCF=87;TCR=182;TR=82;WE=144695184;WS=144695166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,87:0.29:296
chr8	144695499	rs2242086	C	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=887;ReadPosRankSum=2.397;SC=GCGAGAAGAGCACCTCCACCC;SOR=0.615;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=95;TCR=133;TR=69;WE=144695507;WS=144695489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,77:0.29:265
chr8	144695867	rs6558377	A	G	5198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=69;PP=2965;SC=TCCCAGGACAACCTTGGATCC;SOR=0.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=152;WE=144695875;WS=144695857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr8	144696203	rs4634659	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=21;PP=1104;SC=TGGCTCCTCTTGGAGCTCAGC;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=144696211;WS=144696198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	144697041	rs1049832	A	G	4339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=97;PP=2668;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CGCCCACCTCAAAGGCCGAGT;SOR=0.834;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=237;TCF=97;TCR=140;TR=160;WE=144697049;WS=144697031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,187:0.68:276
chr8	144732026	rs3750203	G	A	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=13;PP=1599;SC=ATCCCCATCTGTTAAGTAAGG;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=144732034;WS=144732016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	144732363	rs4875017	T	C	9569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.03;NF=160;NR=143;PP=2965;SC=ATATTCTGAATTCAGACCTTC;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=160;TCR=143;TR=303;WE=144732371;WS=144732353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr8	144732418	rs4874084	A	G	8955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=119;NR=162;PP=2965;SC=CAATCCTTGCAATATCTGTGG;SOR=0.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=119;TCR=162;TR=281;WE=144732426;WS=144732408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr8	144772151	rs35228840	TG	T	5444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=60;PP=2975;SC=ATTTGCTGAGTGGGGGGGCTC;SOR=1.334;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=107;WE=144772159;WS=144772141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr8	144774079	rs11136313	G	T	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	144774089	rs11136314	A	C	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	144774233	rs11785723	T	C	5466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=74;PP=2956;SC=GTGATGGCCATGTGGGGTCCC;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=93;TCR=74;TR=167;WE=144774241;WS=144774223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr8	144775870	.	C	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:309,130:0.30:439
chr8	144775871	rs6987308	C	A	14503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=207;NR=157;PP=2962;SC=CCCAAGAGACCTTGTGATCAT;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=366;TCF=208;TCR=158;TR=364;WE=144775879;WS=144775860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr8	144776109	rs11786757	A	G	6489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=130;PP=2965;SC=TAGAGCTGTCATTCATCTGCG;SOR=1.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=74;TCR=130;TR=204;WE=144776117;WS=144776099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr8	144776713	rs7464270	A	C	7949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=178;PP=2965;SC=GCGCCCGAAGAGTGGGGTGCT;SOR=1.532;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=88;TCR=178;TR=266;WE=144776721;WS=144776703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr8	144800004	rs12543136	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=792;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TGGGGGCAGGGAGGGGCAGCC;SOR=0.840;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=153;TCF=58;TCR=95;TR=54;WE=144800012;WS=144799984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,59:0.33:179
chr8	144800552	rs6997797	C	T	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=63;PP=1819;SC=TGCGTGTCCCCCTGCGTGTCC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=75;WE=144800560;WS=144800542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	144801243	rs12678428	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.173;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=0.803;SC=GCGACCTCCCCGAGGGGCCTG;SOR=0.385;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=45;WE=144801251;WS=144801233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,53:0.33:161
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chr8	144801681	rs11778657	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=1.352;SC=GCTGGGCACCGGGAATGCTGC;SOR=0.829;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=5;WE=144801689;WS=144801671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
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chr8	144887656	rs7830442	A	G	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=976;ReadPosRankSum=3.264;SC=CGCCACAGACAGCCACGTGCT;SOR=0.869;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=60;WE=144887664;WS=144887646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,64:0.72:89
chr8	144889172	rs10866915	A	G	8264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=120;PP=2965;SC=GCCGCAGGATAGTGAGGGTCA;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=131;TCR=120;TR=251;WE=144889180;WS=144889162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
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chr8	144940230	.	G	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.6;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MMLQ=23;MQ=52.43;NF=260;NR=36;PP=2962;QD=20;SC=AGAAGCTGCAGGTACGTGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=484;TCF=356;TCR=128;TR=296;WE=144940238;WS=144940220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:188,296:0.61:484
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chr8	144942903	rs6558399	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=7.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,64:0.29:221
chr8	144944161	rs35221054	C	T	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=758;ReadPosRankSum=0.449;SC=CCTGGCCGTCCGGTGTGGGGA;SOR=0.837;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=56;WE=144944169;WS=144944151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,62:0.34:185
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chr8	144946252	rs11136330	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=682;ReadPosRankSum=0.946;SC=GCCGCAGTGCCAGTGGCCTGT;SOR=0.927;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=150;TCF=85;TCR=65;TR=53;WE=144946260;WS=144946242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,57:0.35:164
chr8	144946345	rs34753358	G	A	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=711;ReadPosRankSum=0.256;SC=CGGCCTGCTCGGCCACCAGGA;SOR=0.950;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=53;WE=144946353;WS=144946335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,63:0.28:222
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chr8	144992361	rs7822511	T	C	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=809;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CGTCCGACAGTGGCAGGAGCA;SOR=0.605;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=68;WE=144992369;WS=144992351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,77:0.35:220
chr8	144992862	rs7819099	A	G	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=975;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CTTTCTTGAGAGCCTGGTAGA;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=262;TCF=151;TCR=111;TR=76;WE=144992870;WS=144992852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,95:0.32:301
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chr8	145002283	rs11993233	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCTGGGGGTCAGCTGACCCTG;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=13;WE=145002291;WS=145002273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
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chr8	145011204	rs6993938	A	G	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1249;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GGTTGCCGTCAGCGATGTCAT;SOR=0.829;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=310;TCF=161;TCR=149;TR=101;WE=145011212;WS=145011194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,116:0.32:361
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chr8	145012777	rs7823393	C	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=872;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CCCTGTGACACGCACCAGCAT;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=134;TCR=81;TR=63;WE=145012785;WS=145012767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,72:0.30:243
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chr8	145020636	rs12549853	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-1.028;SC=AGGGGTGGGAGGCAGAGGGAG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=22;WE=145020644;WS=145020626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr8	145047697	.	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=84;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GCGGCCACTCTGTCCCCGCGG;SOR=0.132;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=145047705;WS=145047687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr8	145057868	rs11544989	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=567;ReadPosRankSum=-1.322;SC=CCCTGGGGTCACCTCCTCCTC;SOR=0.483;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=45;WE=145057876;WS=145057858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,56:0.33:172
chr8	145058037	rs11989052	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=278;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GTTGGAATGGATGAAAGATGG;SOR=0.560;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=20;WE=145058045;WS=145058027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr8	145058986	rs11136343	A	G	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1331;ReadPosRankSum=2.143;SC=CTCCTGCCCCAGCAACCCCTT;SOR=0.771;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=285;TCF=160;TCR=125;TR=98;WE=145058994;WS=145058976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,116:0.35:327
chr8	145059425	rs11136344	T	C	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=781;ReadPosRankSum=0.321;SC=GGCTCCAGGATGTCGTAGTGG;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=122;TCR=96;TR=69;WE=145059433;WS=145059415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,74:0.30:249
chr8	145060112	rs11136345	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=5.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,44:0.24:180
chr8	145066004	rs67714660	C	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GCGGTGGGGGCTGTGGCTCCC;SOR=0.588;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=288;TCF=156;TCR=132;TR=91;WE=145066012;WS=145065994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,99:0.31:320
chr8	145066853	rs56261297	C	T	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1452;ReadPosRankSum=0.794;SC=TGTGCTGTCACCTCCAGTTCC;SOR=0.957;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=299;TCF=159;TCR=140;TR=91;WE=145066861;WS=145066843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,106:0.32:329
chr8	145066886	rs13277282	A	G	13275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=220;NR=166;PP=2965;SC=CCCAGCTGCTACTGGGGAACA;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=386;TCF=220;TCR=166;TR=386;WE=145066894;WS=145066876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,453:1.00:453
chr8	145095577	rs147284549	C	T	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=86;PP=2108;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GCCATGGGCACACCTGCTCCC;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=187;TCF=61;TCR=126;TR=126;WE=145095585;WS=145095567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,149:0.67:222
chr8	145101866	rs374089373	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.453;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,29:0.26:111
chr8	145106938	rs60949781	GCC	G	7581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=64;PP=2976;SC=TGCCCCCCGAGCCCCCCGCCG;SOR=1.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=106;WE=145106947;WS=145106928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	145107795	rs11136253	G	A	5761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=55;PP=2965;SC=AGTCAAACACGGCGCTGCCCT;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=111;TCR=55;TR=166;WE=145107803;WS=145107785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr8	145107940	rs186192116	G	A	8323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=163;PP=2962;ReadPosRankSum=0.727;SC=CGTCCATGTGGTCTTCCGAGG;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=431;TCF=207;TCR=224;TR=315;WE=145107948;WS=145107930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,358:0.70:511
chr8	145110585	rs114884224	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=644;ReadPosRankSum=1.846;SC=CCGCCCCGTCGCCAGGGGGTC;SOR=0.412;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=40;WE=145110593;WS=145110575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr8	145149823	rs13256214	G	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=22;SC=GCGTGGGGAGGCAGGCGGTGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=145149831;WS=145149822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	145149860	rs6984764	A	G	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=84;SC=CGCGACCGGGACCAGCGCGCT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=145149868;WS=145149850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	145150101	rs11541475	T	G	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=35;PP=1310;SC=GCAGCGCGCGTCCCGGGCAGC;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=145150109;WS=145150091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	145150832	rs7820984	A	G	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=89;NR=70;PP=2745;SC=GGGGCTGGCCATGGCTCTGCA;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=159;WE=145150840;WS=145150822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr8	145151144	rs35973351	G	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=982;ReadPosRankSum=0.311;SC=CTAAGGAGCTGGCTGCGGAGG;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=243;TCF=124;TCR=119;TR=79;WE=145151152;WS=145151134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,91:0.33:275
chr8	145151665	rs200379271	TGGCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC	TCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC,T	8652.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=61;PP=2918;SC=GCCTCCAGTCTGGCAGTGGGC;SOR=1.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=68;WE=145151701;WS=145151655;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:192
chr8	145151668	.	CAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCCA	C	8636.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=1.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr8	145151693	.	A	C	2280	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24;NR=60;PP=2280;QD=27.5568001494;SC=ATACTTCTCCACTACCCCCAG;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=107;TCF=24;TCR=83;TR=84;WE=145151701;WS=145151655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:23,84:0.79:107
chr8	145158446	rs12549149	C	T	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=13;PP=686;SC=CGCCCTCCGCCCCCACTCACC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=145158454;WS=145158436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	145158503	rs11136254	G	T	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=25;PP=1259;SC=CGCCCAGGCCGCTCAGGGTCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=61;WE=145158511;WS=145158493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	145160646	rs11136256	T	C	5868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=88;PP=2965;SC=CTGTGGAGACTGGAGATGCCC;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=109;TCR=88;TR=197;WE=145160654;WS=145160636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr8	145161823	rs11546144	G	A	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.058;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=42;PP=2468;ReadPosRankSum=0.785;SC=AAGCAGAAGCGGGGGCAGTGG;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=116;WE=145161831;WS=145161813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr8	145161896	rs13263342	T	C	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=77;PP=2965;SC=ACCCGGGTCCTTGAAGCCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=158;WE=145161904;WS=145161886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	145162598	rs10091401	G	C	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=26;PP=2868;SC=CTGCCGCTGCGGGCCGTGACC;SOR=2.349;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=107;TCR=26;TR=132;WE=145162606;WS=145162588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	145163414	rs4977196	C	G	6041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=90;PP=2965;SC=GGCGCCTGTCCGGCTTACGGG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=193;WE=145163422;WS=145163404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr8	145163647	rs4977195	T	C	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=40;PP=1681;SC=GGCAGTTCCGTTCAGGTGGTC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=84;WE=145163655;WS=145163637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	145164518	rs34324679	C	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,38:0.25:150
chr8	145164617	rs13281660	G	T	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=54;PP=2322;SC=TCCTGTCGGCGGCCACCGGGC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=145164625;WS=145164607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	145164847	rs13250446	A	G	11074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=185;NR=130;PP=2965;SC=ACGGATCTCGAAGGCGCCTTC;SOR=0.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=185;TCR=130;TR=315;WE=145164855;WS=145164837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chr8	145168298	rs5895787	T	TG	1710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=1520;SC=GTGTCCAGGCTGGGGAATCCA;SOR=2.628;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=38;WE=145168306;WS=145168288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	145168611	rs7463214	A	G	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=82;PP=2965;SC=GCCATCCCAAACCCAGTGGCA;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=139;WE=145168619;WS=145168601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	145168824	rs7836836	T	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=70;PP=2542;SC=CCACGGGAGGTGGGCTTACAC;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=135;WE=145168832;WS=145168814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr8	145170440	rs12543080	A	C	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=48;PP=1665;SC=CTGGCACCCAAGCGCAGCTGG;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=88;WE=145170448;WS=145170430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	145170704	rs13278106	A	T	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=76;PP=2690;SC=CACCCGCCAGAGCCCTACACG;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=126;WE=145170712;WS=145170694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	145171003	rs4977193	G	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=5;PP=684;SC=GGCCCCATGCGGTCCCGGCTC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=145171011;WS=145170993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr8	145223191	rs6982878	G	A	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=525;SC=AGGCTTTGTCGCTGCAGAGCT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=145223199;WS=145223181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr8	145245944	rs10108542	A	G	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=66;PP=2054;SC=TTGCATTGGCAAGCAGAGGTG;SOR=2.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=80;WE=145245952;WS=145245934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	145254159	rs7464776	T	C	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=85;PP=2234;SC=ACAGGGTCACTGCCTGCTGTA;SOR=1.517;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=39;TCR=86;TR=124;WE=145254167;WS=145254149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	145255553	rs6558320	C	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1468;SC=GCTTTGAATTCTCTAGAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=145255561;WS=145255543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	145536169	rs35680822	C	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,9:0.18:51
chr8	145536497	rs34053540	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=93;ReadPosRankSum=0.971;SC=GCATGAGCGTCGGGCCTGGGC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=8;WE=145536505;WS=145536487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr8	145550338	rs6599571	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=8;PP=230;SC=AGCGTGGGCCTGCCGGGTTCG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=145550346;WS=145550328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	145557497	rs7013127	A	C	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=37;NR=18;PP=896;SC=GCGGCGGCAGAGCCGGCATTG;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=145557505;WS=145557487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	145577824	rs880701	C	G	5907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.26;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,154:0.61:254
chr8	145577829	rs880702	A	C	5715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=8.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.33;ReadPosRankSum=2.266;SOR=1.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,143:0.58:245
chr8	145577999	rs2272664	T	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.270;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=833;ReadPosRankSum=0.745;SC=AGACTGGGGGTGGCGCGGCGC;SOR=0.294;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=46;WE=145578007;WS=145577989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,62:0.76:82
chr8	145578296	rs2272663	A	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=14;PP=906;ReadPosRankSum=-2.566;SC=CCTGCTGCACAAATGGGTAGA;SOR=0.978;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=58;WE=145578304;WS=145578286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,71:0.64:111
chr8	145579949	.	G	GGCCGCT	1695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=31.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.685;SOR=1.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,43:0.35:124
chr8	145579951	.	A	ACC	1737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=16.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.065;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,44:0.34:128
chr8	145579954	.	G	GGCACGGCACAAGGGCCCCCACACCTCACGTGCCTGGCCACAACCCAGAACAA	3423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=10.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr8	145580984	rs2272666	A	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=887;ReadPosRankSum=1.934;SC=CAGGCAGGCAAGCAGACATCC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=45;WE=145580992;WS=145580974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,49:0.74:66
chr8	145581557	rs2280840	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=509;ReadPosRankSum=-2.904;SC=CCAACTGGGCGCCTAAGGGGC;SOR=2.376;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=23;WE=145581565;WS=145581548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr8	145581946	.	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GGGGCCGGGCGGGGCCGGGTT;SOR=0.984;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=12;WE=145581954;WS=145581936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr8	145582839	rs3817681	T	C	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1267;ReadPosRankSum=0.255;SC=TCTGTTTCTTTCAAGCTAGAA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=67;WE=145582847;WS=145582829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,70:0.71:99
chr8	145603114	rs6599528	A	C	4108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=92;PP=2719;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TGCTGCACAGAAGGCAGAAGC;SOR=0.476;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=223;TCF=82;TCR=141;TR=151;WE=145603122;WS=145603104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,175:0.68:259
chr8	145608244	rs199589796	G	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=269;ReadPosRankSum=-0.151;SC=AGCTGAATGTGGGGGGCGGCG;SOR=0.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=25;WE=145608252;WS=145608234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,27:0.28:96
chr8	145615776	rs1383095	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=279;ReadPosRankSum=1.239;SC=AGGGCTGGCCGGGGTGAGGCT;SOR=2.110;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=145615784;WS=145615767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr8	145617534	rs148509143	TGGGGGTGCAAGGTGA	T	1452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.940;NF=9;NR=9;PP=2966;ReadPosRankSum=0.753;SC=GCAGCCGCACTGGGGGTGCAA;SOR=0.441;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=18;WE=145617556;WS=145617524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr8	145618309	rs1052951	G	A	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.208;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr8	145618312	rs1052952	G	A	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.10;ReadPosRankSum=2.454;SOR=1.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr8	145618862	rs2272661	C	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr8	145620296	rs2280837	C	G	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1919;ReadPosRankSum=1.094;SC=ACCCCACCCCCGCCGGCCCAG;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=109;WE=145620304;WS=145620286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,122:0.72:170
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chr8	145623098	rs2977834	T	C	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=66;PP=1863;ReadPosRankSum=0.901;SC=TGGACTGCTGTGGGGAGAGGG;SOR=0.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=132;WE=145623106;WS=145623088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,151:0.69:219
chr8	145623378	.	CCCCACCACCGTCCCCACCCACCTACCTCCTTCCAGCAGGCGGATG	C	1055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=1.104;QD=23.46;ReadPosRankSum=1.346;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr8	145623382	.	A	AGGGCCCAACCACCTCCCCG	2971	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=58.74;NF=3;NR=6;PP=2971;QD=20;SC=GCGCCTCCCCACCACCGTCCC;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=9;WE=145623390;WS=145623372;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr8	145623446	rs56293142	C	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQRankSum=3.216;QD=35.47;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr8	145623622	.	C	A	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5340;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=44.7;NF=4;NR=1;PP=68;QD=20.5542425094;SC=CCACCTCCCCCCCACCGTCCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=145623630;WS=145623612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,5:0.83:6
chr8	145623881	rs141269368	C	CCCCAGGT	8665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.270;NF=31;NR=71;PP=2979;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GGGACCCCAGCCCCAGGTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=206;TCF=61;TCR=145;TR=102;WE=145623889;WS=145623871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,209:0.65:320
chr8	145623963	rs4317614	G	A	6973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.027;NF=126;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=1.793;SC=GTCTGCGGCCGTCGTCGTCTG;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=384;TCF=177;TCR=207;TR=261;WE=145623971;WS=145623953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,302:0.66:460
chr8	145624640	rs2293963	C	T	4211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.705;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=77;PP=2430;ReadPosRankSum=0.886;SC=CTGGCTGGGACGGGGGCCCTG;SOR=0.486;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=258;TCF=143;TCR=115;TR=165;WE=145624648;WS=145624630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,195:0.64:304
chr8	145625283	rs2291135	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=515;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AATTCTGAGTTGGGGATGGGG;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=51;WE=145625291;WS=145625273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr8	145639320	rs736676	G	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=598;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CACCCGCCGGGTACCTTCCCA;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=104;TCR=64;TR=48;WE=145639328;WS=145639310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,56:0.29:194
chr8	145639521	rs4992316	T	C	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=42;PP=1198;SC=GGTCCCAGGGTGCCTCCCACC;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=145639529;WS=145639511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	145639600	rs111355160	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=-1.399;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr8	145639726	rs2272662	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=-1.797;SC=ATGTAGTGGGTGACCCCCCTG;SOR=0.842;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=35;WE=145639734;WS=145639716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,37:0.28:134
chr8	145640411	rs2977838	A	G	6147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=95;PP=2965;SC=ACAGGGTCCCAGCTGCTGGCT;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=184;WE=145640419;WS=145640401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr8	145641328	rs17855765	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=688;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CCAGCCCGAGCGTCCTCACAG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=91;TCR=72;TR=59;WE=145641336;WS=145641318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,66:0.35:190
chr8	145641564	rs2280839	T	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=735;ReadPosRankSum=-1.083;SC=AGGGCCTGTTTCCCTTTCAAG;SOR=0.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=100;TCR=99;TR=57;WE=145641572;WS=145641554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,68:0.28:241
chr8	145642002	rs2280838	C	T	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=28;PP=1426;SC=GGCCCGTTGGCGCAGTGCACA;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=70;WE=145642010;WS=145641992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	145651262	rs2272658	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-2.380;SC=GCCCACCTCTTGCTCCATCCT;SOR=0.348;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=25;WE=145651270;WS=145651252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr8	145652408	rs139513541	G	GGT	1243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=0.014;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,36:0.33:109
chr8	145652412	rs3929255	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.352;NF=6;NR=20;PP=1442;ReadPosRankSum=-0.007;SC=AAGCCAGGCGCTGGCTCACAC;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=26;WE=145652420;WS=145652398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
chr8	145654794	rs3862193	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AGGCTCCAGGGAACAAACTCG;SOR=0.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=9;WE=145654802;WS=145654784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr8	145657840	rs146566654	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=0.690;SC=CAGGTGCTCAGCATCTGCACC;SOR=1.453;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=21;WE=145657848;WS=145657830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr8	145660833	rs1010427	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=441;ReadPosRankSum=1.501;SC=GGTGGGCTGCGGGGTAGGGCA;SOR=0.591;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=38;WE=145660841;WS=145660823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,46:0.30:151
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chr8	145661675	rs7830832	G	A	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1757;ReadPosRankSum=1.884;SC=CCTGACATGGGCCTGAGAGGC;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=97;WE=145661683;WS=145661665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,108:0.71:152
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chr8	145665699	rs2721188	C	T	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.794;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1176;ReadPosRankSum=1.682;SC=CTGGGCTCACCGGGGAGCCAG;SOR=0.524;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=66;WE=145665707;WS=145665689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,83:0.73:114
chr8	145665761	rs2229313	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=452;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GGGCCTGCTGGGCACAGCTGA;SOR=0.806;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=38;WE=145665769;WS=145665751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,44:0.34:131
chr8	145667405	rs2242264	C	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=9;PP=1289;SC=GCCCCATTCGCACCCCCAGGC;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=145667413;WS=145667395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	145668042	rs741969	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=0.423;SC=TCCCTCCTGGGGCGGGGCAGG;SOR=0.682;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=44;WE=145668050;WS=145668032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,60:0.35:173
chr8	145668443	rs760477	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=4;PP=1073;ReadPosRankSum=-1.825;SC=GATTGCCCAAGGAGGCTGCGG;SOR=1.247;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=78;TCR=8;TR=50;WE=145668459;WS=145668433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr8	145668481	rs2242263	C	T	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=34;PP=2324;ReadPosRankSum=1.299;SC=CTCTTCGGCCCGAAGTTCAGG;SOR=0.918;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=143;TCR=57;TR=126;WE=145668489;WS=145668471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,143:0.63:228
chr8	145677469	rs2245052	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=983;SC=CCTTGCAGGGATGGTGAAGCC;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=145677477;WS=145677459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	145677973	rs2256094	C	T	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=81;PP=2436;SC=GCAGGTACATCACTCACAGAC;SOR=1.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=113;WE=145677981;WS=145677963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	145678020	rs1871538	C	T	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=42;PP=1196;SC=AGCTGTCCTCCCATATGGCTT;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=145678028;WS=145678010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	145689915	rs2721167	G	A	6135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=115;PP=2965;SC=GGCAGTCTTCGTGTGTGCTCA;SOR=0.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=83;TCR=115;TR=198;WE=145689923;WS=145689905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr8	145690308	rs2721166	C	T	9111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=112;PP=2965;SC=GCAGTATGTACGAGGACACAG;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=165;TCR=112;TR=277;WE=145690316;WS=145690298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr8	145690348	rs2620644	G	A	11245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=171;PP=2965;SC=GGAGAGGAAGGAAGCGCAGAA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=335;TCF=164;TCR=171;TR=335;WE=145690356;WS=145690338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr8	145690396	rs2620645	A	C	9058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=130;NR=167;PP=2965;SC=CACTCTAGTAAGCCCAGGTTC;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=130;TCR=167;TR=297;WE=145690404;WS=145690386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr8	145691915	rs112422823	G	C	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=135;PP=2965;SC=AGCGGGGCTGGCCGTGCAGCC;SOR=1.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=60;TCR=135;TR=195;WE=145691923;WS=145691905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr8	145692110	rs2306388	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=290;SC=CTGCCTGCCCCCCTCCTCAGG;SOR=2.448;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=145692118;WS=145692100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	145692296	rs2250895	A	C	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=62;PP=2906;SC=GGCCTGGCTCAAGCACGTGAC;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=145692304;WS=145692286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr8	145692385	rs2250891	C	T	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=66;PP=2673;SC=CAGCCGAGGGCCGCGCGGCCG;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=125;WE=145692393;WS=145692375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	145692762	rs2291133	G	T	8907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=114;PP=2965;SC=GAACTCTGGAGGGAGCAAATC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=175;TCR=114;TR=288;WE=145692770;WS=145692752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr8	145692812	rs2250779	C	T	12252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=240;NR=168;PP=2965;SC=GGGTCATGTTCCGGAAGATTT;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=408;TCF=240;TCR=168;TR=408;WE=145692820;WS=145692802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,440:1.00:440
chr8	145693720	rs2250657	A	G	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=96;PP=2965;SC=AGGAGGAGGCAGAGGCATTGC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=67;TCR=96;TR=163;WE=145693728;WS=145693697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
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chr8	145697244	rs4925823	G	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=16;PP=1231;SC=ACCTGCCTTCGTGGCACTCCC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=145697252;WS=145697234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr8	145737636	rs4925828	A	G	10606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=166;PP=2965;SC=TCAGCGGTCAAGTCCCCCGGG;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=158;TCR=166;TR=324;WE=145737644;WS=145737626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr8	145738669	rs34293591	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.285;NF=22;NR=16;PP=512;ReadPosRankSum=-1.427;SC=ACGGCCTGCACGTAGCTCTCG;SOR=0.490;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=38;WE=145738677;WS=145738659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,37:0.34:108
chr8	145738767	rs11342077	CG	C	8339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=97;PP=2951;SC=CACCACCACCCGGCAACTGGC;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=52;TCR=97;TR=147;WE=145738775;WS=145738757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr8	145739112	rs35334991	T	C	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.235;NF=34;NR=75;PP=1519;ReadPosRankSum=0.135;SC=GAGGAGCGGTTGGCGTGGGCA;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=50;TCR=109;TR=109;WE=145739120;WS=145739102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,126:0.67:188
chr8	145739165	.	GAGGGGTCGGCGTGGGGAGTGAGGAGGGGTCGGCGTGGGCGGTGGGGAGTGAGA	G	548.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=16.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-0.231;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.746;SOR=4.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr8	145739175	.	C	CGTGGGCG	649	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=18;MMLQ=23;MQ=56.38;NF=1;NR=13;PP=649;QD=49.4285714286;SC=GAGGGGTCGGCGTGGGGAGTG;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=14;WE=145739183;WS=145739162;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,14:0.40:35
chr8	145739218	rs13267993	A	T,G	132.77	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=31.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.517;NF=0;NR=5;PP=110;ReadPosRankSum=-1.027;SC=GGGGAGTGAGAAGGGGTCGGC;SOR=1.122;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=145739226;WS=145739208;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.29:31
chr8	145742514	rs2721190	A	G	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=67;PP=2206;SC=CCTGGCGTAGACTGTGGACTC;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=99;WE=145742522;WS=145742504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	145742716	rs2721189	C	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=6;PP=874;SC=TGCCCCACGGCGGCCTGGCCG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=145742724;WS=145742706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	145745182	rs2721172	T	C	10139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=199;NR=133;PP=2965;SC=GGCCCTGCCCTTGCTGCCACG;SOR=1.097;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=332;TCF=199;TCR=133;TR=332;WE=145745190;WS=145745172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr8	145746298	rs143938732	C	A	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=36;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.905;SC=CCTGTAGCACCCTGCAGAGCC;SOR=0.542;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=163;TCF=105;TCR=58;TR=96;WE=145746314;WS=145746288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,124:0.62:199
chr8	145756170	rs873884	G	A	3619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=54;PP=1955;SC=CCTCGGGGCTGTCGTAGTGCG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=145756178;WS=145756160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	145757843	rs117567558	T	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=296;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TGATTCCGCCTGGACACTCCC;SOR=0.489;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=27;WE=145757851;WS=145757833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr8	145806681	rs2620647	A	G	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=748;SC=GACAGGGTTAAGGCGGCTGGA;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=145806689;WS=145806671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	145830757	rs4541972	A	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=12;PP=1220;SC=TGAGGGCTGCACTGTGCACAG;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=145830765;WS=145830747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	145830894	rs5895822	CT	C	9958.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=107;PP=2951;SC=GCCCGGGCAGCTTCCGCAGGT;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=54;TCR=112;TR=159;WE=145830902;WS=145830884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr8	145924242	rs117267360	C	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=715;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GACTCAGAAGCCTTCTTGCAA;SOR=0.457;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=40;WE=145924250;WS=145924232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,56:0.67:84
chr8	146000095	rs2958493	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.605;SC=TCATCTCCAAAGTCCCAACAG;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=146000103;WS=146000085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr8	146003567	rs2294120	A	G	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=58;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GACAGGGACTACTGCAGCCCA;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=94;WE=146003575;WS=146003557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,102:0.66:154
chr8	146028061	rs2958527	A	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=718;SC=GTGAGAGCCAAAAAACATTGG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=146028069;WS=146028051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	146032842	rs62531506	G	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=940;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CTACAGGTGCGTGTGCGGCAA;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=268;TCF=165;TCR=103;TR=78;WE=146032850;WS=146032832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,86:0.28:303
chr8	146033347	rs2976653	T	C	5003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=69;PP=2965;SC=GACGGCGGCGTGGGGCAGGGC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=156;WE=146033355;WS=146033337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	146036234	rs2958511	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=522;SC=TCCAGACGTCAGCACCCAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=146036242;WS=146036224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr8	146062982	rs1735165	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.994;SC=TGGGTGAGTCGCGGGGGCTAC;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=146062990;WS=146062972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
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chr8	146115367	rs2735906	A	G	4594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.135;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=69;PP=2848;ReadPosRankSum=1.010;SC=TTCTGTAGAGACCCCTCTGAG;SOR=0.983;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=259;TCF=142;TCR=117;TR=167;WE=146115375;WS=146115357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,202:0.65:310
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chr8	146221823	rs2978409	A	T	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=2;PP=962;SC=AGTTGTTGCAAGTATCTTCTT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=146221831;WS=146221813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	154795	rs2785333	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=11;NR=7;PP=329;SC=AAGCAACTTGTCTAAAATAGC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=154803;WS=154785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	271638	rs506121	C	T	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=14;PP=746;SC=TATTCTTCAGCGGAAATAAGG;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=271646;WS=271628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	286593	rs529208	C	A	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=25;PP=1234;SC=GGTGTTCACGCCAAAGGAATG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=286601;WS=286583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	325811	rs3831138	T	TC	1202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=987;SC=TGTTTTTAAATTTCTTTGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=24;WE=325825;WS=325801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	325817	rs2360277	T	C	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=517;SC=TAAATTTCTTTGCAGCAAGAA;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=325825;WS=325801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	327938	rs2296825	G	C	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=202;SC=AAATTTCTCTGTGGTGTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=327946;WS=327928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	327957	rs2296826	T	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=313;SC=TTACTCCTTTTTAACATGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=327965;WS=327947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	328006	rs2296828	T	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=814;SC=TATTTCACTTTGCTGCTCATT;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=328014;WS=327996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	368128	rs17673268	C	T	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=30;PP=1248;SC=GCTAGCAATGCGATGCCGGTA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=368136;WS=368118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	376929	rs7020921	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=9;PP=739;SC=TCCACTGGTGAACATTGATGG;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=376937;WS=376919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	379965	rs10758420	T	C	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=27;PP=694;SC=GGGACTCTGGTGGGCGGGGCA;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=379973;WS=379955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	421032	rs2297079	C	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=30;PP=972;SC=AGGCTTTGCTCCGTGGGGAAG;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=421040;WS=421022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	421980	rs2297081	T	A	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=18;PP=1343;SC=GAGCTTGTTATGAACTTCTGG;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=421988;WS=421970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	422157	rs10217719	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=32;PP=778;SC=GGCAACTTTCTGCTACTTTTA;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=422165;WS=422147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	429719	rs7854035	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=11;PP=318;SC=ACTTACTCTTTGAAGAGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=429727;WS=429709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	432081	rs1329377	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=145;SC=GAGGAGTTGTTTGTGTCTGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=432089;WS=432071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	432140	rs34439675	CTT	C	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5105;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.577;NF=8;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=0.457;SC=TTTACTTCATCTTTTTTTTTT;SOR=2.200;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=432149;WS=432130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr9	432330	rs7036567	C	G	3586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=59;PP=2011;SC=CCCAGGTACACCGAAGCACAT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=98;WE=432338;WS=432320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	432503	rs7046598	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=113;SC=AATACATCCATCACTGTCCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=432511;WS=432493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	433697	rs7020380	T	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=159;SC=TCTCATAAACTCCTGGGCTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=433716;WS=433687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	433708	rs7041371	C	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=190;SC=CCTGGGCTGGCGAAGATGAAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=433716;WS=433687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr9	439453	rs10758598	G	C	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=84;SC=GGGGTGCTGGGAACACCTGGT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=439461;WS=439443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr9	441952	rs1887957	G	A	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=32;PP=1420;SC=ATGAACAGGAGTTTGTCTACA;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=441960;WS=441942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	446352	rs10814952	G	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=20;PP=1281;SC=TTCTCCCTCCGTGCCTTTTCC;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=446360;WS=446342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	712060	rs4465020	G	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=18;PP=715;SC=GACACTTGTTGAGATGAGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=712068;WS=712050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	712599	rs11789987	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=18;PP=886;SC=AGTCTGTGAACGACCTCACAC;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=712607;WS=712589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	732302	rs10815562	T	C	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=109;SC=AATTAGCAAATCCCTTCATAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=732310;WS=732292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	732779	rs10815563	A	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=84;SC=GCAGAGTATTACAACTCTTAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=732787;WS=732769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	734665	rs142267604	C	CA	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=324;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.712;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=16;WE=734687;WS=734655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	734679	rs10429625	G	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;SC=AAAAAAATTAGATATTTGGGT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=734687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	735654	rs7872783	C	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=11;NR=10;PP=274;SC=AACTATGCATCTACTTTAAAT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=735662;WS=735644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	738238	rs2296052	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=369;SC=CTAGGTCTCAGAAAGTCTATA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=738246;WS=738228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	740769	rs368007873	CTTTTTT	C	1763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=5;PP=424;SC=TCCTAAGAGACTTTTTTTTTT;SOR=2.613;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=15;WE=740783;WS=740759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	740972	rs7032867	G	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=663;SC=GAATGCACCCGTAACCAGCAG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=740980;WS=740962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	741001	rs7027152	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=350;SC=GCGGTGGCCATTCTGGCAGAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=741009;WS=740991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	742342	rs10733535	A	G	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=37;PP=1141;SC=GCGAGCACGGACACGTGGAGA;SOR=1.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=56;WE=742350;WS=742332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	967981	rs279895	G	C	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=18;PP=756;SC=ACCTCACTTCGCAGTATTCTC;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=967989;WS=967971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	977312	rs148355218	T	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=16;PP=441;SC=GGGGACGCCGTCGCCGCCCCG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=977320;WS=977302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	977556	rs279891	C	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=412;SC=AGTTTTGGGACGTGGGCCTGT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=977564;WS=977546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	989943	rs6477419	T	C	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=22;PP=1202;SC=GAGATGCATTTGCTCTTCCAA;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=61;WE=989951;WS=989933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	2029392	rs12378503	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=46;SC=TATTAAAAACGCATATTGTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=2029400;WS=2029382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	2039776	.	ACAG	A	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=84;QD=44.5;SC=AGCAGCAGCAACAGCAGCAGC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=2;WE=2039786;WS=2039766;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,2:0.18:11
chr9	2160736	rs149515618	TGA	T	854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=691;SC=TTATTTTGTGTGAGAGAGCAA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=2160745;WS=2160726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	2161949	rs2274095	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=33;PP=907;SC=ACCAAGACGCCGAGTGGCGCT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=2161957;WS=2161939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	2170512	rs3793511	G	C	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=23;PP=919;SC=CTAAATACAGGTATCCCTCGT;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=2170520;WS=2170502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	2182062	rs2281786	A	G	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=229;SC=AGGGAAAATCAGGCTTTGTTA;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=2182070;WS=2182052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	2622121	rs12379259	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=293;SC=TTTCGGAAGGACTGGTAACTT;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=14;WE=2622162;WS=2622111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	2622134	rs34881325	C	T	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=8;PP=427;SC=GGTAACTTGTCGTGCGGAGCG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=2622162;WS=2622111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	2622146	rs369552432	ACGGCGGCGG	A	998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=2993;SC=TGCGGAGCGAACGGCGGCGGC;SOR=0.963;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=10;WE=2622162;WS=2622111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	2622278	rs2219143	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=193;SC=ACCGGTGAGTGAGGACGCGCC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=2622286;WS=2622268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	2644954	rs11789583	C	T	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=42;PP=1800;SC=ATTTCCCTCCCAGATATTGAT;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=2644962;WS=2644944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	2645109	rs11793899	G	A	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=848;SC=TGGTATGGCTGTTGTACCTTT;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=2645117;WS=2645099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	2645557	rs6144	A	T	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=589;SC=TAAGTAACCCAGACTTCCATC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=2645565;WS=2645547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	2645773	rs35847091	T	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=17;PP=694;SC=TTGTGGTGTCTTGACATAAGT;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=2645781;WS=2645763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	2647760	rs6475888	A	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=174;SC=TGGTGGATTAACAAATTACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=2647768;WS=2647750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	2648773	rs6148	A	G	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=52;PP=1614;SC=ATGATGCCCAAGACATCATTG;SOR=1.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=83;WE=2648781;WS=2648763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	2650264	rs35730767	T	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=82;SC=GTAGACAAGTTTAAGCTCTTG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=2650272;WS=2650254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	2651340	rs35769682	A	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=477;SC=AACCTTTTACATGGCTTGTCT;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=2651348;WS=2651330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	2651962	rs6145	G	T	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=327;SC=TCTGTAAGTAGATTTCCTACA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=2651970;WS=2651952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	2811505	rs2270888	G	A	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=41;PP=1485;SC=CTTCTTGGGCGTGTTCTTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=2811513;WS=2811495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	2828765	rs2173904	C	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=14;PP=458;SC=GTCCAGAGTTCGGTGATCTGC;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=2828773;WS=2828755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	2831149	rs2292000	A	C	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=488;SC=GGAGAAGACAAACCTAAACAA;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=2831157;WS=2831139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	2833267	rs10217194	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=5;PP=142;SC=GAAACAATGATAAGATCATCT;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=2833275;WS=2833257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	3228700	rs643429	A	C	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=105;SC=TGGAGAAATAATGAAAAGACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=3228708;WS=3228690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	3263224	rs633893	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=55;SC=TGAGAGAGTTTACTTGTAAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=3263232;WS=3263214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	3829212	rs7029652	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=5;PP=473;SC=GATGCGGTCATGTGCTTGGTC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=3829220;WS=3829202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	3879693	rs4740742	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=312;SC=GAGGGGCTTGCTTGTTTTTCT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=3879701;WS=3879683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	3898509	rs10758532	A	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=245;SC=TTATGAGAAAAAACAATCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=3898517;WS=3898499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	3932521	rs587571	T	C	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=39;PP=1243;SC=ATAAAGGTAATTGGGGAATGT;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=3932529;WS=3932511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	4118111	rs6415788	G	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.136;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=355;ReadPosRankSum=0.111;SC=TGGGGGGCCTGGGGGCGGCGG;SOR=0.209;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=28;WE=4118119;WS=4118101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr9	4118208	rs806052	A	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=18;PP=864;SC=AGGCCGGCCGACTGGCTGTCG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=4118218;WS=4118198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	4119049	rs13301186	C	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=CCAAGGCTTCCAGTTCCAGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=4119057;WS=4119039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	4285986	rs10758591	G	C	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=28;PP=1352;SC=AATGGGATGGGGGAGAAAAAA;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=4285994;WS=4285976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	4490880	rs12002726	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=501;SC=GCAGGGTCCCTCGATGCCCCC;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=4490888;WS=4490870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	4564432	rs2228622	G	A	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=20;PP=871;SC=AAGTCAGTACGGTGGATGCCA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=4564440;WS=4564422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	4566210	rs7022772	A	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1290;SC=GCAGGAAGTAAACCTGTGACT;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=4566218;WS=4566200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	4572480	rs3780412	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=467;SC=TGTCAACTGATGAAGCTAGAG;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=4572488;WS=4572470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	4582960	rs201180584	G	A	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=20;PP=1387;SC=GGGACTAAGCGGGAGTAACCA;SOR=1.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=4582968;WS=4582950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	4661752	rs62543897	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	4662065	rs301488	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=23;PP=827;SC=AACAAACAAGGGAGAGAAAAC;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=4662073;WS=4662055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	4662369	rs301487	A	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=5;PP=141;SC=CCGGGCCGCCAGCTGCGATGC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=4662377;WS=4662359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	4666069	rs60279350	A	ATCTT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=3;PP=305;SC=AATATGGAGAAAAAGACAAAG;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=4666077;WS=4666059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	4666398	rs57032514	C	A	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=159;SC=ACCGTCCCCCCCAGCCCAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=4666406;WS=4666388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	4679906	rs2295964	A	G	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=46;PP=1587;SC=CCAGGTGAGAAGGGGCCTGCG;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=80;WE=4679914;WS=4679896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	4680014	rs2295965	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=281;SC=CCTCACTGCCAGGGGCCGGGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=4680022;WS=4680004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	4688797	rs2181340	A	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=TAATTGACAGAGCAAACCAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=4688805;WS=4688787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	4706214	rs2181341	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=498;SC=TATTTTTGTTCGGTTTTTGAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=4706222;WS=4706204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	4718667	rs465514	A	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=AACTTTTAAAAAAATGGAATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=4718675;WS=4718657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	4719360	rs56685905	TG	T	223.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=6;PP=196;SC=AAGTATGGGGTGGGGGTGGGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=4719368;WS=4719350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	4793254	rs841990	G	A	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.89;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	4833436	rs463578	GC	AT	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=280;SC=CAGTGATGTTGCACTTCTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=4833445;WS=4833426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	4834034	rs466547	A	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=144;SC=TGGAAGAGCTATGCCTTGTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=4834042;WS=4834024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	4844507	rs295259	G	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=21;PP=857;SC=CTCAGTGTTTGTGCCTTTGTA;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=4844515;WS=4844497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	4850421	rs455864	C	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=321;SC=GGGCTATGCACCCTTGGGCCA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=4850429;WS=4850411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	4850436	rs462480	G	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=166;SC=GGGCCATGGCGTTGGGGGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=4850444;WS=4850426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	4860300	rs15583	A	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=740;SC=TAAGGCCCCAATGCCTACAGA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=4860308;WS=4860290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	5069276	.	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	5300255	rs61738986	C	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=961;SC=TTGTCTATTGCGAATAAGTTT;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=5300263;WS=5300245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	5335639	rs2146074	C	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=300;SC=GGCGTATTCACGTCAAAGAGC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=5335647;WS=5335629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	5557672	rs7854303	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=998;SC=TTCATCCCCTTCTGCATCATT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=5557680;WS=5557662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	5557708	rs7854413	T	C	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=27;PP=1219;SC=GCCACAGTGATAGCCCTAAGA;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=61;WE=5557716;WS=5557698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	5569860	rs7852996	T	A	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=295;SC=TGAACTTTTTTAAAAAAATTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=5569868;WS=5569850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	5720172	rs10758700	C	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=17;PP=1328;SC=TTAATTGATTCTACCTACAGT;SOR=1.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=5720180;WS=5720162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	5732483	rs7850299	T	C	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=56;PP=1708;SC=GTGTGAGGTATAATTGATGTA;SOR=1.396;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=5732491;WS=5732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	5732532	rs76581785	GT	G	710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=21;PP=350;SC=AAAAATACTGGTTTTTTTTTT;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=22;WE=5732540;WS=5732522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	5929167	rs7029054	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=559;SC=TCCCTAAAAATAATGTTTAAA;SOR=3.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=5929175;WS=5929157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	5968416	rs3739649	A	G	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=34;PP=1618;SC=CACCTGGACTAAGAGGCTCTC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=5968424;WS=5968406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	5969517	rs7030731	C	T	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.40;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	5969525	rs10815326	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	5988333	rs2291055	C	T	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1141;SC=GAATTTTTTTCTTAACATTTA;SOR=2.001;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=52;WE=5988341;WS=5988323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	6012734	rs106033	A	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=15;PP=740;SC=CTTTTACCAGAAGTGGAACAG;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=6012742;WS=6012724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	6254694	rs7857724	A	C	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=83;SC=AAGCACAATCACTTACTACAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=6254702;WS=6254684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	6255881	rs1332290	T	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=529;SC=TAAATAAGTATTCCCCTTTAG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=6255889;WS=6255871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	6328947	rs3847262	T	C	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=21;PP=735;SC=GTCGGCCACATTCAGATCTTT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=6328955;WS=6328937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	6330915	rs1037885	G	A	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=132;SC=TCTCAACTCCGTAAAAGTAGT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=6330923;WS=6330905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	6498287	rs41281765	C	T	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=161;SC=GGAATAAGATCATGCAAATAG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=6498295;WS=6498277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	6554844	rs2274874	G	C	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=50;PP=1517;SC=CCAGTGTGAAGGCCATGGCTG;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=6554852;WS=6554834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	6620483	.	CA	C	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9999;HP=13;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=44;QD=12.25;SC=TGCGACATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=6620491;WS=6620473;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr9	6645251	rs12341698	C	T	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=12;PP=535;SC=TTACCGCCAGCCCCAAGGTCT;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=6645259;WS=6645241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	6720831	rs7040131	T	C	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=132;SC=AGAAGCTTAATCAAGGACAAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=6720839;WS=6720821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	6984236	rs2296067	G	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=20;PP=793;SC=AGATGAAGTCGATGGGGCAGA;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=6984244;WS=6984226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	6984479	rs2296068	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=263;SC=ATGGATGTTCACTATGACAAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=6984487;WS=6984469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	7016001	rs818883	G	T	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=38;PP=1128;SC=TTAAGTCTAGGGAAAAGATAA;SOR=1.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=7016009;WS=7015991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	7046901	rs1407856	C	G	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=24;PP=861;SC=TGCTCTTAAGCAAACGAAGAA;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=7046909;WS=7046891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	7076371	rs1570511	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=438;SC=CCCATGCTATTTTCACTATAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=7076379;WS=7076361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	7076463	rs1570512	G	A	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=34;PP=1476;SC=CACAGCAACAGTAACAACAAC;SOR=0.969;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=7076471;WS=7076453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	7076586	rs1570513	G	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=966;SC=AGCCAGCATCGTGTTTAGGAT;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=7076594;WS=7076576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	7105548	rs10758825	G	C	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=32;PP=1173;SC=TAAGTTCAGAGAGGTTTAATT;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=7105556;WS=7105538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	7105651	rs1407863	C	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=14;PP=433;SC=ATTCCAAACCCCAAACCTCAA;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=7105659;WS=7105641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	7170006	rs7022348	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=8;PP=322;SC=TCTAAAAAAAGCCAATGCAAC;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=7170014;WS=7169996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	7798435	rs1254	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=341;SC=CGATTTTCTTCTCAGTCTTGT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=7798443;WS=7798425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	7798518	rs4742410	G	C	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=13;PP=622;SC=CATGCCTGCTGTGTGTGTCAC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=7798526;WS=7798508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	7799606	rs14059	C	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=147;SC=AGGTCTTCAACAGGCGGTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=7799614;WS=7799596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	7799653	rs1127430	G	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=188;SC=GTAGCTGGGGGCGCAGGTTTG;SOR=1.473;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=7799661;WS=7799643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	8338847	rs143960430	C	CAGAGAGAGAGAGAG,CAGAGAGAGAGAGAGAG	772.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=5,5;NR=2,2;PP=73,97;SC=GTGCTTCTCCCAGAGAGAGAG;SOR=1.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7,7;WE=8338855;WS=8338837;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.43,0.57:14
chr9	8340168	rs4742483	C	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=135;SC=TAAATTTAAACACTTGATGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8340176;WS=8340165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	8375886	rs117865820	G	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=139;SC=TCCAATGAGAGTCAATTTAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8375894;WS=8375876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	8436703	rs1359118	C	G	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=952;SC=TTGAAAAAAGCAAAGAAGAAA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=8436711;WS=8436693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	8451755	rs10977117	T	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=12;PP=586;SC=TTGGCAAGGATGCATTTCTTT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=8451763;WS=8451745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	8451816	rs4742505	TT	AC	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=23;PP=1687;SC=TCCCTTCCCATTGTGGCTCTG;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=48;WE=8451825;WS=8451806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	8454413	rs10977121	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=559;SC=TTTTCCCCAGAATCATCTTAA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=8454421;WS=8454403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	12704725	rs2733832	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=401;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TTTCATATGCCTTTTGCATGC;SOR=0.848;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=32;WE=12704733;WS=12704715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,38:0.35:109
chr9	12708910	rs2733834	C	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=342;ReadPosRankSum=0.472;SC=TAAATTTCATCTGTCCACTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=16;WE=12708918;WS=12708900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr9	12708958	rs147565972	T	TA	1139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.701;NF=13;NR=13;PP=1014;ReadPosRankSum=0.173;SC=TTTTTATTTTTATCTTCCTTT;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=26;WE=12708966;WS=12708948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr9	12775861	rs139315731	T	TGGCGGCGGC	3186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=1949;SC=GCGGTGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.957;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=29;WE=12775869;WS=12775851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	12775889	rs3750501	A	G	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=103;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=38;PP=1316;SC=CTGCAGTAGCAGCAGCAGCTA;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=12775897;WS=12775879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	13109111	rs10732331	C	T	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=9;PP=214;SC=AAAAACTATACATATATGTTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=13109119;WS=13109101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	13112116	rs10809904	A	G	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=58;PP=2082;SC=CTCCTCCAGCAATGCTGATTC;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=92;WE=13112124;WS=13112106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	13125201	rs2297003	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CTCTCATGAGTCCAGAGGCCT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=13125209;WS=13125191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr9	13126470	rs10738323	C	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TAATCATGCCCAAGGATGGGC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=11;WE=13126478;WS=13126460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr9	13143644	.	A	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=2.630;SC=GTACATACCGATTTAAAGAAC;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=16;WE=13143652;WS=13143634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr9	13147723	rs7024892	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=295;ReadPosRankSum=0.936;SC=TGTGTGGATATGGAGTTTTAG;SOR=1.053;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=21;WE=13147731;WS=13147713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr9	13150531	rs10756457	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=518;ReadPosRankSum=0.895;SC=TATCTCCAGGTTTCAAGGTTC;SOR=0.953;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=33;WE=13150539;WS=13150521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr9	13165218	rs10960959	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=1.335;SC=TATGTTCTTACTTAAACAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=13165226;WS=13165208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr9	13175715	rs3831219	TGAG	T	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=489;ReadPosRankSum=1.074;SC=TCAAGGGGGTTGAGGAGTAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=13;WE=13175725;WS=13175705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr9	13175987	rs1331674	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTTGCAAGAACCTGCAACCAA;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=18;WE=13175995;WS=13175977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr9	13176312	rs2274856	C	T	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=905;ReadPosRankSum=0.015;SC=TTATGTCCACCGAAGGTGTAT;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=63;WE=13176320;WS=13176302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,72:0.56:128
chr9	13192320	rs1331676	C	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=43;PP=1305;SC=CATTGTCCAACAAACAACACT;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=13192328;WS=13192310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	13927980	rs35960404	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.273;NF=11;NR=8;PP=255;ReadPosRankSum=1.856;SC=TCTCAAAAGGCCACATGTAGA;SOR=0.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=19;WE=13927988;WS=13927970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr9	13928028	rs2382427	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.216;NF=9;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-2.545;SC=AATCTTCTAATATTTTAAATG;SOR=0.776;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=20;WE=13928036;WS=13928018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr9	13928080	rs147030758	TATTC	T	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.266;NF=0;NR=9;PP=346;ReadPosRankSum=0.836;SC=ATTTAAAACATATTCAATTTG;SOR=0.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=9;WE=13928091;WS=13928070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr9	14120655	rs6474818	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=785;SC=AGATTGACTCATCAGCTGGTT;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=14120663;WS=14120645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	14155769	rs12349255	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=416;SC=GTTCAAAATATAAAGTATTTT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=14155777;WS=14155759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	14306944	rs4741362	A	G	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=471;SC=GGAGATTTGTAGGCGGTGTTT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=14306952;WS=14306934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	14313712	rs2273933	T	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=382;SC=GCGTGCTAGATTTCCAGGGGT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=14313720;WS=14313702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	14618856	rs3802482	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=532;ReadPosRankSum=0.852;SC=ATGCCTAAGACTGGTGGGTGG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=30;WE=14618864;WS=14618846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr9	14619168	rs10810187	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr9	14640055	rs6474849	C	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=657;SC=GAGTTGCTTACATTGCTTACA;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=14640063;WS=14640045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	14672981	.	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.475;SC=AACATTTTATCAACAATCATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=14672989;WS=14672971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr9	14690419	rs10961672	T	C	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=616;SC=AATCAGAAGCTTGGTTGACAT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=14690427;WS=14690409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr9	14693270	rs71476227	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=2;PP=208;SC=TCTCCCGACCGCCAGCAGCTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=14693278;WS=14693260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr9	14747157	rs2270530	A	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=1099;ReadPosRankSum=2.045;SC=TGTGTTGGGTAAACTATCCCC;SOR=0.464;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=54;WE=14747165;WS=14747147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr9	14756318	rs57793294	C	CA	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=404;ReadPosRankSum=-1.032;SC=GACATGCCTACAAAAAAAAAC;SOR=0.439;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=25;WE=14756326;WS=14756308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
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chr9	14774329	rs7018782	T	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=293;SC=AGTTGTAGGCTTTAAGAGAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=14774337;WS=14774319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr9	14776140	rs10961700	C	T	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1694;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GCTCTGTCCACAGTCTCCAGT;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=209;TCF=106;TCR=103;TR=99;WE=14776148;WS=14776130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,113:0.46:245
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chr9	14801710	rs35870000	C	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=814;ReadPosRankSum=1.000;SC=TGAGGGTTGGCTGGCTGCTTA;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=57;WE=14801718;WS=14801700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
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chr9	14813072	rs117608184	G	A	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=927;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTAGGCAATGGAAAAAATGC;SOR=1.008;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=131;TCF=47;TCR=84;TR=53;WE=14813080;WS=14813062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,65:0.40:161
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chr9	14819370	rs7023244	G	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=858;ReadPosRankSum=0.269;SC=ATCTGCATCAGAAATTAGAAT;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=56;WE=14819378;WS=14819360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr9	14824799	rs12236053	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=332;ReadPosRankSum=1.420;SC=GATACCTGTGGCTGAAGGAGA;SOR=1.101;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=18;WE=14824807;WS=14824789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr9	14841387	rs1552896	C	G	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=27;PP=1937;SC=AACCACATCTCCTAGAATTGA;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=84;WE=14841395;WS=14841377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr9	14846122	rs2642404	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GTGTTGGTATCATAGACTGGA;SOR=0.053;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=14846130;WS=14846112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr9	14868653	rs7856810	A	T	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=17;PP=1398;SC=GAGGGGAGACATTTTACATCT;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=14868661;WS=14868643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	15000551	rs7029527	T	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=17;PP=863;SC=TAAAGGATCTTTTCTTTGCCT;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=15000559;WS=15000541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	15017223	rs2222456	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=105;SC=ATTACTACCCGAGGTGGCACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=15017231;WS=15017213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	15017273	rs10961831	C	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=256;SC=GAAAAACCCTCTTTGTAGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=15017281;WS=15017263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	15183532	rs2057478	C	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=7;PP=303;SC=TTCCATAGACCTGGAGAAAGA;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=15183540;WS=15183522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	15188106	rs1407977	T	C	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=56;PP=1611;SC=TGAACTGAAATGCATTTTTGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=86;WE=15188114;WS=15188096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	15190494	rs475932	A	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=797;SC=CAGGTGTAACACACCATGTCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=15190502;WS=15190484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	15190775	rs7848147	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TCATATATTACGCTGTGGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=14;WE=15190783;WS=15190765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr9	15192720	rs566820	A	G	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=84;PP=2433;SC=AAGTGACAGCATAAGTTGACC;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=30;TCR=84;TR=114;WE=15192728;WS=15192710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	15267981	rs552693	G	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=435;ReadPosRankSum=-0.364;SC=AGTTTCTCAAGAATTCTCAAT;SOR=0.596;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=30;WE=15267989;WS=15267971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr9	15447361	rs3830477	A	AACT	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.091;NF=0;NR=8;PP=272;ReadPosRankSum=-1.315;SC=GATTCCATCAAACTACACTAT;SOR=1.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=15447369;WS=15447351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr9	15457853	rs10756669	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=273;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AAAATTGAAAGTATCTATTTT;SOR=0.171;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=15457861;WS=15457843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr9	15468174	rs2795124	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=-3.094;SC=TCTGTTCAGGGTAACTCAGCA;SOR=0.631;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=10;WE=15468182;WS=15468164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr9	15469132	rs145855578	CA	C	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.867;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=-0.387;SC=AGATCGTTTCCAAAAAAAAAG;SOR=0.155;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=18;WE=15469140;WS=15469122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr9	15478331	rs16933311	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=0.707;SC=ACAAAATTTTCCCAGTTTTTC;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=15478339;WS=15478321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr9	15486958	rs2737828	A	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=215;SC=ATTAATTTCAAAAAATAAGTT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=15486966;WS=15486948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	15510019	rs148022076	A	AG	892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.403;NF=8;NR=6;PP=494;ReadPosRankSum=0.311;SC=AGCGAGGGAGAGAAAGGACAG;SOR=0.428;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=14;WE=15510027;WS=15510009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr9	15591372	rs4741510	T	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-1.237;SC=AGCACAGAATTCAGAACTTCA;SOR=0.784;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=14;WE=15591380;WS=15591362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr9	15623461	.	ATG	A	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=7.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.89;MQRankSum=1.600;QD=18.20;ReadPosRankSum=2.028;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr9	15623473	.	GCA	G,GCACACACACACA	304.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.47;QD=30.47;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,4:0.60,0.40:10
chr9	15678995	rs7037893	C	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=420;SC=TAATAGTATGCAAGTTATTTT;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=15679003;WS=15678985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	15695418	rs1355172	G	A	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=55;PP=1663;SC=GATGCCTCTTGTAGTCCCTCA;SOR=1.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=78;WE=15695426;WS=15695408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	15723547	rs10810436	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=0.551;SC=TTAATTACTATTGAAAAATTT;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=15723555;WS=15723537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr9	15784496	rs2382540	C	G	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=865;ReadPosRankSum=0.156;SC=CCCCTCTCCTCCTTTTTACAG;SOR=0.915;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=52;WE=15784505;WS=15784486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
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chr9	16431230	rs9298764	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.492;SC=CAATGATAAGAAATATTAGGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=16431238;WS=16431220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr9	16436647	rs117470554	T	C	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=705;ReadPosRankSum=1.632;SC=TGGCAGCTCCTGAGGTGGCCC;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=48;WE=16436655;WS=16436637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr9	16437605	rs41268967	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=407;ReadPosRankSum=0.108;SC=ACTGAAGGTGCTCTGTGTGCT;SOR=0.456;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=30;WE=16437613;WS=16437595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr9	16582890	rs35366915	G	GACAC	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.42;MQRankSum=-0.100;QD=34.90;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
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chr9	16699287	rs10738447	C	T	7821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr9	16699292	rs10738448	C	T	7738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=1.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	16727698	rs1360285	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=110;SC=ATTTTAAAAAGTATTTAGAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=16727706;WS=16727688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	16738269	rs7858914	G	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=979;SC=GTGGCAGAAAGAAGAGGTGAG;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=16738277;WS=16738259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	16738307	rs7858709	A	C	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=44.63;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	16738312	rs7858712	A	G	3548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;QD=43.81;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	16738338	rs35475650	GA	G	2507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=42;PP=1261;SC=CTTAAAGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=65;WE=16738346;WS=16738328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	16738556	rs4007684	C	CTTTT	661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=528;SC=TACATCAAAACTTTAAGAAAT;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=16738564;WS=16738546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	17135115	rs41306071	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=344;ReadPosRankSum=1.530;SC=AGCGCGACAGCTGGGCCCCAG;SOR=0.706;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=23;WE=17135123;WS=17135105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr9	17135434	rs12003380	G	C	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.348;SOR=1.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr9	17135443	rs111496959	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr9	17235642	rs67017076	AT	A	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=-0.483;SC=AGTAATTTAAATTTTTTTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=8;WE=17235650;WS=17235632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr9	17309336	rs10756860	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=380;SC=AAAATTTAAATATATTTGCAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=17309344;WS=17309326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	17309374	rs6475126	T	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=172;SC=GTGTGCAGATTGTTTTGCATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=17309382;WS=17309364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	17332484	rs3084508	ATT	A	795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.144;NF=19;NR=2;PP=297;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TCCATGCAGGATTTTTTTTTT;SOR=3.690;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=21;WE=17332506;WS=17332474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr9	17342383	rs1442527	C	T	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=48;PP=1931;SC=AAGATTCTGACGCTGTGTGGA;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=17342391;WS=17342373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	17342517	rs10756869	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=647;SC=AAAAGCTATTAAAGAAACACT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=17342525;WS=17342507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	17366568	rs4961548	A	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=139;SC=TGATTTTTTTAAATAAAACAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=17366576;WS=17366558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	17394536	rs7035276	C	T	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=235;SC=CTTTAGGTCACTGAGTTGGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=17394544;WS=17394526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr9	17395108	rs3739488	C	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=43;PP=1249;SC=GGGGACACTGCGCATATGTAA;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=17395116;WS=17395098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	17409366	rs2780211	G	A	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=40;PP=1971;SC=TAAGTCCTACGGAAGATGGAA;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=17409374;WS=17409356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	17409556	rs2584549	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=417;SC=AATGTTACTACTGATTTAATT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=17409564;WS=17409546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr9	17464402	rs1442532	G	C	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=160;SC=CATTTAAAAAGTAACAGTAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=17464410;WS=17464392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr9	17494866	.	A	G	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=57.45;NF=2;NR=0;PP=23;QD=28.8856062736;SC=TGTATTTACTATACCATACTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=17494874;WS=17494856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	17579190	rs4961573	C	G	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr9	17747279	rs2031456	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=1.317;SC=TTTCATGTATGTTTTAAAACA;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=17747287;WS=17747269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	17761379	rs1886589	C	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=565;ReadPosRankSum=-0.158;SC=AACCAAAAACCGGTATTCTAA;SOR=1.047;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=37;WE=17761387;WS=17761369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,46:0.35:133
chr9	17775367	rs2209429	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=436;ReadPosRankSum=0.434;SC=AGTGGGAAAACAGAGAAAAAA;SOR=0.819;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=30;WE=17775375;WS=17775357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr9	17781818	rs2224955	C	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=760;ReadPosRankSum=-1.083;SC=AAGCCCAGCTCGAGCATCATC;SOR=0.724;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=51;WE=17781826;WS=17781808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,65:0.37:175
chr9	17781935	rs2209431	G	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=-1.654;SC=CTGCCTCACAGCAGTGAGTGA;SOR=0.422;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=21;WE=17781943;WS=17781925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr9	18504916	rs2277160	T	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=0.779;SC=CCTGCGGGGGTGGGGCCTCCT;SOR=0.482;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=28;WE=18504924;WS=18504906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr9	18573360	rs13299349	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=38;PP=1928;SC=TGTTAGAATAGGGGCAATAAC;SOR=1.043;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=91;WE=18573368;WS=18573350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	18573918	rs13300372	G	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=632;SC=ATCATGACCAGGACATTTGTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=18573926;WS=18573908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	18574406	rs1341069	G	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=473;SC=GAAAATTAAGGTATGATTTCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=18574414;WS=18574396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	18681696	rs66675938	G	GTGTTGGGA	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=2;PP=340;SC=GTCCTCGTGTGGGGGGGGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=18681704;WS=18681686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	18681821	rs13293151	A	G	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=43;PP=1946;SC=GCACAGTGACATGTGGCCAGG;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=18681829;WS=18681811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	18717903	rs530120	G	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=243;SC=CAAAGTTGGAGTGTTGGCACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=18717911;WS=18717893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	18718139	rs532101	C	G	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=40;PP=2116;SC=TTTTGACCTTCTTCCTTCCCT;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=18718147;WS=18718129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	18721748	rs539785	T	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=26;PP=887;SC=GTAACACTTATTTGTTACTCA;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=18721756;WS=18721738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	18776740	rs1549985	A	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.93;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	18776840	rs1549986	A	C	3870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=40;PP=2546;SC=AGGTCTACATACAGACTCGCA;SOR=1.273;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=114;WE=18776848;WS=18776830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	18777368	rs7033684	T	C	8537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=131;PP=2965;SC=CGCAGGACTCTGCGGAAAGGA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=124;TCR=131;TR=255;WE=18777376;WS=18777358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr9	18817246	rs1433809	A	C	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=81;PP=2965;SC=GTGAGAAATTAATGTTCATTT;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=131;WE=18817254;WS=18817236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr9	18817372	rs7873880	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=701;SC=ACCTCAGTCGCTCTGAAAGTA;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=18817380;WS=18817362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr9	18826500	rs934469	T	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=699;SC=CTGCACCCTGTTGGGAGTGAC;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=18826508;WS=18826490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr9	18887753	rs731370	C	A	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=570;SC=TAGAGCCACACAGACAGTAAA;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=18887761;WS=18887743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	18890446	rs7026374	A	G	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=14;PP=1627;SC=GCACTGGTGCAGTGCTGAGAG;SOR=2.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=63;TCR=14;TR=77;WE=18890454;WS=18890436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr9	18907049	rs5896821	A	AT	6456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=107;PP=2936;SC=GGAGTTGAGCATTTCAGTGGG;SOR=1.366;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=20;TCR=114;TR=125;WE=18907057;WS=18907039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr9	18907122	rs1327506	T	C	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=53;PP=1474;SC=AGGGCTTCCATGATCTCCATC;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=80;WE=18907130;WS=18907112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	18950787	rs6475273	G	A	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=39;PP=1535;SC=ATTGGTATAGGCCCTTTCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=18950795;WS=18950777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	18950895	rs7021572	T	C	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=889;SC=TTCTCTGTTTTATCATAAATC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=18950903;WS=18950885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	18950980	rs6475274	A	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=260;SC=TTGGGAGAAAAAAACCCAATT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=18950988;WS=18950970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	19033058	rs10963922	C	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=1.774;SC=GGCCCTTTTGCAATGTCCTGT;SOR=0.089;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=19033066;WS=19033048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr9	19058598	rs138881912	C	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.68;MQRankSum=0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr9	19063108	rs13302748	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.053;NF=4;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=1.021;SC=CAACATCTGATAATGGAGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=5;WE=19063116;WS=19063098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr9	19076673	rs13286328	G	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=238;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CAAACGAAAGGGGAGACATTG;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=20;WE=19076681;WS=19076663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr9	19123745	rs10963972	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.754;NF=2;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=2.979;SC=TGGGCTGGGCACGGTGGCTCA;SOR=0.746;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=11;WE=19123753;WS=19123735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr9	19295941	rs10757051	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=437;ReadPosRankSum=2.200;SC=TGTAATAAGAAAAAAAGAGAA;SOR=2.093;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=20;WE=19295949;WS=19295931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr9	19299362	rs10738535	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=-1.356;SC=GATTAGTATATTATTAATATA;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=19299370;WS=19299352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	19326053	rs2256093	G	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.357;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GAAAAATAATGATTTTCAGGT;SOR=0.328;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=59;WE=19326061;WS=19326043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,72:0.65:110
chr9	19341045	rs928128	A	G	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=39;PP=1426;SC=AGGATGATGCAGAAATTCATG;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=19341053;WS=19341035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	19347204	rs2666801	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.998;SC=GTGGCATGATTTTGGCTGTCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=19347212;WS=19347194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr9	19350980	.	C	G	148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=9;PP=148;QD=18.2771212547;SC=AGGCTGGTCTCGAACTCCTGG;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=19350988;WS=19350970;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr9	19357276	rs10667709	C	CTTA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=399;SC=TACATCTTAACTTATTACCAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=19357284;WS=19357266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	19369778	rs10964112	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.253;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	19372275	rs41270105	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=416;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TGAATACGGAATTGAAGTAAC;SOR=0.954;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=24;WE=19372283;WS=19372265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr9	19435158	rs141912034	C	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=45;PP=1195;ReadPosRankSum=0.648;SC=TCTTTGCTGTCCTGTAGCAGA;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=61;WE=19435166;WS=19435148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr9	19573284	rs2148951	G	C	2965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=30;PP=1933;SC=TATAGGGTCTGTGCTGCCACG;SOR=1.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=94;WE=19573292;WS=19573274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	19573306	rs2148952	G	A	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=49;PP=2574;SC=TAGGATATCAGTTAAGAACAA;SOR=1.222;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=131;WE=19573314;WS=19573296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	19573483	rs149743267	AACACACACACACACACACACACACAC	A	191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.35;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr9	20456864	rs3906160	T	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=-1.318;SC=AAAAATCCCATTCTACCATCT;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=20456872;WS=20456854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
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chr9	20885240	rs2383156	G	A	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=65;PP=2132;SC=GTAGGTTCCCGTGTCCTCTTC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=107;WE=20885248;WS=20885230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	20916828	rs4977812	A	C	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=629;SC=AATTGATGAAAAAGAGAAAGG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=20916836;WS=20916818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	20923518	rs7044425	C	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=163;SC=TGGCCTAACACAACAAACAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=20923526;WS=20923514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	20923579	rs7044452	C	T	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=391;SC=TTTGACTTCACCTGCCCTCCT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=20923587;WS=20923569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	20923618	rs7044447	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=18;PP=799;SC=CTTCTGGTTAATACCAAAGTT;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=20923626;WS=20923608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	20946952	rs7851042	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=34;PP=989;SC=CTAACTATTCTCTTTTCTCAC;SOR=4.461;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=20946960;WS=20946942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	20976298	rs10119918	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=596;SC=AAGCGTTGATCGCAATTGAAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=20976306;WS=20976297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	20978312	rs4977616	A	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=11;PP=867;SC=CTATATATTCAATTCTTTTCC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=20978320;WS=20978302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	20982503	rs4304410	T	G	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=73;PP=2296;SC=TACGATTGAATAATTGATTTC;SOR=1.898;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=102;WE=20982511;WS=20982493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	20988426	rs4977881	A	G	6795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=132;PP=2965;SC=GGCTCTTGACAAGGTAAAATC;SOR=1.361;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=73;TCR=132;TR=205;WE=20988434;WS=20988416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr9	21007935	rs7041474	A	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=142;SC=TCCCATGTTTACCAACCTGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=21007943;WS=21007925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	21029330	rs2298260	T	C	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=799;SC=GTCATATTTGTAAATATCCAA;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=21029338;WS=21029320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	21077716	rs1051922	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=927;ReadPosRankSum=0.302;SC=CCTTGAGGCAGTATTCAAGCC;SOR=1.032;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=54;WE=21077724;WS=21077706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr9	21304913	rs41298198	G	A	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1589;ReadPosRankSum=0.455;SC=TCATTCAGCTGCTGGTAAAGT;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=105;WE=21304921;WS=21304903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,117:0.52:223
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chr9	21440416	rs28383793	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.130;NF=26;NR=3;PP=447;ReadPosRankSum=0.793;SC=TATTTAAGGCATTTGCAGGAA;SOR=1.479;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=29;WE=21440424;WS=21440406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr9	21440994	rs33965070	C	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQRankSum=-1.315;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr9	21816573	rs7023680	G	A	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=50;SC=TGATTATATTGATAATCAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=21816581;WS=21816563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	21816637	rs10114559	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	21816646	rs7023474	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=204;SC=GTTGTGGTTGAACAATTATAA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=21816654;WS=21816636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	21816758	rs7023954	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=0.081;SC=TGTTGATTGCGTCCTCCTTGC;SOR=0.722;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=9;WE=21816766;WS=21816748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr9	21818310	rs3928894	C	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=404;SC=GCCACAGACTCGCTTGCTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=21818318;WS=21818300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	21855038	rs3802393	G	A	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=204;SC=AAAGATCAAAGGAAAGAAAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=21855046;WS=21855028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	21861903	rs67222036	T	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.206;HP=10;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TCAAAATCTGTTTTTTTTTTT;SOR=1.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=62;WE=21861911;WS=21861893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr9	21968159	rs3088440	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=11;NR=7;PP=313;SC=GGGCAGTTGTGGCCCTGTAGG;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=21968167;WS=21968149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	21968199	rs11515	C	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=10;PP=347;SC=CTAAGTTTCCCGAGGTTTCTC;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=19;WE=21968207;WS=21968189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	22029445	rs10965215	G	A	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=33;PP=1716;SC=TATTTGCCACGACATTTCAAA;SOR=1.119;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=22029453;WS=22029435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	22452041	rs56665855	GTT	G	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.755;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr9	23701276	rs62539994	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.591;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=378;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACAACACTGACAAAAGCAAAC;SOR=0.184;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=26;WE=23701284;WS=23701266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr9	24545695	rs2772579	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=0.852;SC=CTGGCAACTAGTTCACTTAGT;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=5;WE=24545703;WS=24545685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	24545957	rs2772578	G	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.494;SC=TCTGTGCAGGGAGATGTCTCA;SOR=0.168;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=15;WE=24545965;WS=24545947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr9	25677698	rs72631815	A	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.665;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=380;ReadPosRankSum=1.561;SC=CAGGGCCCAGAGGGCTCCGAG;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=24;WE=25677706;WS=25677688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr9	25677933	rs35110225	T	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=878;ReadPosRankSum=0.321;SC=GGACCCGGCGTGCCTCCGCGG;SOR=0.360;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=57;WE=25677941;WS=25677923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr9	25677953	rs34498078	T	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=57;PP=2237;SC=GGCGTCCCGTTGCCGCCTTCG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=25677961;WS=25677943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	25678122	rs72631814	G	C	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=696;ReadPosRankSum=-1.580;SC=CCGCCAGGTCGGCAAACCGCT;SOR=0.695;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=58;WE=25678130;WS=25678112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,76:0.55:138
chr9	26116016	rs10116592	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=26;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.641;SC=ATTCCATAATGCTCAGGAGAC;SOR=0.816;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=187;TCF=124;TCR=63;TR=84;WE=26116024;WS=26116006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,95:0.45:213
chr9	26116150	rs7019716	G	T	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=71;PP=1902;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ATTGCCCAGAGTCAAAGGACA;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=229;TCF=88;TCR=141;TR=118;WE=26116158;WS=26116140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,128:0.48:268
chr9	26885990	rs79875827	A	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.272;SC=CTCTTCAACAACAACCCAATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=26885998;WS=26885980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr9	26905361	rs113069791	TTC	T	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AAAATTTTATTTCTGTTTCCC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=26905370;WS=26905351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr9	26919593	rs41271173	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=66;SC=ATGACATATACAACATAACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=26919601;WS=26919583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	26980413	rs10967638	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=361;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CTAAGGTATTAGTTCTCTTTT;SOR=0.379;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=22;WE=26980421;WS=26980403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr9	26982270	rs57511456	CT	C	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=0.391;SC=AGCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.813;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=6;WE=26982278;WS=26982260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr9	26988571	rs10967645	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GTTACTACTCATTATTTGTAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=26988579;WS=26988561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	26995787	rs41272237	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=427;ReadPosRankSum=-1.162;SC=AAGTGAAGTCGTCAGTACAGT;SOR=0.566;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=25;WE=26995795;WS=26995777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
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chr9	26995927	rs41272239	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=1.324;SC=TATCCTAATTCTCCTCAATAT;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=13;WE=26995935;WS=26995917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
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chr9	27168315	rs10511802	G	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=423;SC=CAGATTCTTAGAAAGGTACAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=27168323;WS=27168305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	27168433	rs12349832	A	G	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=34;PP=1418;SC=TCAAAGCTCAATTGCTCCTGG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=27168441;WS=27168423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	27172838	rs3739542	C	A	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=1004;SC=TGGGAATGGACGCTAAATGGC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=27172846;WS=27172828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	27173080	rs3824409	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.410;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr9	27173080	.	GTA	ATG	424	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=1;PP=424;QD=53.0519860958;SC=GGCCATAAGGGTATGTTCATC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=27173090;WS=27173070;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,9:0.45:20
chr9	27173082	rs3824408	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr9	27173180	rs666478	C	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=954;ReadPosRankSum=-1.466;SC=CAAGGGGTTGCATATTTGACT;SOR=0.865;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=61;WE=27173188;WS=27173170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr9	27173429	rs41314569	T	C	63.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr9	27183463	rs682632	A	C	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=39;PP=2049;SC=TCAGGCATACAGAGGATGACC;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=105;WE=27183471;WS=27183453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	27190655	rs1334811	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1416;ReadPosRankSum=0.899;SC=ATACAAACCCGTTAATCACTA;SOR=0.542;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=87;WE=27190663;WS=27190645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,103:0.52:197
chr9	27192330	rs2252883	G	A	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=3;PP=1300;SC=TCCTCATATTGGGAAGGATGA;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=49;WE=27192338;WS=27192320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	27197486	rs35030851	G	T	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=61;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CTTGACTTCGGTGCTACTTAA;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=188;TCF=74;TCR=114;TR=99;WE=27197494;WS=27197476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,122:0.52:233
chr9	27203002	rs45563539	G	A	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1633;ReadPosRankSum=0.852;SC=CTCAGTATCAGCTCAAGGGCC;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=92;WE=27203010;WS=27202992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,105:0.56:187
chr9	27206669	rs55789591	G	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.713;SC=TTTATCCAGTGCTTGACTGGA;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=66;WE=27206677;WS=27206659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,75:0.40:187
chr9	27217516	rs5897224	CTGTT	C	867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=1192;ReadPosRankSum=1.465;SC=AGGACTTATACTGTTTGTTTG;SOR=1.721;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=16;WE=27217530;WS=27217506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr9	27217522	rs5004610	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=1147;ReadPosRankSum=0.549;SC=TATACTGTTTGTTTGCATGTT;SOR=1.811;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=20;WE=27217530;WS=27217506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr9	27217791	rs1923331	T	TC	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=162;ReadPosRankSum=-1.945;SC=GGATTTTTTTTCCCTCCCAGA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=27217799;WS=27217781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr9	27217822	.	G	A	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=25;QD=19.9237375157;SC=TTTGACAGAGGTTTTAAAAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=27217830;WS=27217812;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr9	27218726	rs667250	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=590;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GGAAAATGAGCGGTGACTCTG;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=34;WE=27218734;WS=27218716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr9	27228022	rs2273717	A	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=380;SC=TAAATCTATGAGGAGTTGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=27228030;WS=27228014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr9	27289812	rs1980661	T	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=501;SC=TGTATAATTATAGTACCCAGT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=27289820;WS=27289802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr9	27290984	rs2383724	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=852;SC=AAAACCAAAATGTTTCCCAAG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=27290992;WS=27290974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	27296595	rs7044345	C	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=203;SC=CATTTCTATTCACTTTAAAGA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=27296603;WS=27296585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	27296705	rs3824406	A	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=14;PP=609;SC=GCTTATTAACATCTTCATTTA;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=27296713;WS=27296695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	27297260	rs7875090	A	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=184;SC=GTTTTTAGTTATTTTTTAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=27297268;WS=27297250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	27330514	rs3739530	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=-1.226;SC=AGCCAGGGTGGTCCACCTCCT;SOR=4.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=14;WE=27330522;WS=27330504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr9	27330772	rs10555560	CTGTT	C	1486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.936;NF=1;NR=23;PP=1099;ReadPosRankSum=0.372;SC=TATGTTCCATCTGTTTGTTCT;SOR=0.716;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=24;WE=27330783;WS=27330762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr9	27378301	rs1330920	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=439;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GAATGAGGTCATAAGGATGGA;SOR=0.828;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=31;WE=27378309;WS=27378291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr9	27455095	rs12379154	G	C	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=30;PP=1529;SC=AGATTGTGCAGGTGACAAAAA;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=27455103;WS=27455085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	27455585	rs10757661	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=539;SC=TGCAGGAAGCGAAAAGGCACC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=27455593;WS=27455575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	27524731	rs700785	A	G	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=84;PP=2965;SC=GGAGGAAGACAAGAATGAAAA;SOR=0.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=151;WE=27524739;WS=27524721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr9	27561465	rs3063748	A	ATGT	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=5;PP=494;SC=CAAATACGTAATGTCCCTAGA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=10;WE=27561473;WS=27561455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	27562352	rs2589050	T	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=255;SC=ACTCATAAAGTGTATAATTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=27562360;WS=27562342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	27567145	rs10757668	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=570;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TCACATTATCCAAATGCTCCG;SOR=0.590;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=38;WE=27567153;WS=27567135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr9	28863459	rs13285849	A	T	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=10;PP=1442;SC=TGTTTGACACAGGTTTGATCA;SOR=3.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=60;WE=28863467;WS=28863449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	28889060	rs7043805	C	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=534;SC=CAGCAGCTTGCCTGGTGCTTG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=28889068;WS=28889050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	32384843	rs913762	A	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr9	32408496	rs10123372	C	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTGCATTATTCTCTTTCTTCT;SOR=0.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=74;WE=32408504;WS=32408486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,88:0.51:172
chr9	32418237	rs2026739	G	T	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=52;PP=2170;SC=TTTCTTTGTAGGCAGGGTACG;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=110;WE=32418245;WS=32418227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
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chr9	32427592	rs72561746	C	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr9	32427600	rs2375965	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	32431931	rs10970975	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr9	32435978	rs2068116	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=923;ReadPosRankSum=-1.637;SC=CTTTTTTAGACTTCCTTCTTA;SOR=1.240;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=117;TCF=95;TCR=22;TR=49;WE=32435986;WS=32435968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr9	32436014	rs7022554	A	G	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=21;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TTGAAAGACAATTAACCCAGG;SOR=0.908;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=177;TCF=125;TCR=52;TR=84;WE=32436022;WS=32436004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,108:0.49:222
chr9	32448745	rs10813817	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=1.382;SC=CAGAAATCACTCGCCTTCTGT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=32448753;WS=32448735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
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chr9	32466190	rs56377445	T	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.469;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=579;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TGTTGTAATATAACACTCTAA;SOR=0.140;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=38;WE=32466198;WS=32466180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
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chr9	33001441	rs10813920	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr9	33026572	rs20583	T	C	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=929;ReadPosRankSum=0.139;SC=GGAAACTGGCTTTGAAGTACC;SOR=0.750;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=58;WE=33026580;WS=33026562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr9	33062319	rs62542142	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=553;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CCATCCAAACATAAAGTAATC;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=38;WE=33062327;WS=33062309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr9	33069062	rs10971383	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=724;ReadPosRankSum=0.523;SC=TTAAAGAAGGGATTAGTTGAA;SOR=1.168;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=37;WE=33069070;WS=33069052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr9	33113322	rs7019909	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=-1.471;SC=GGAAAGCCATCTGAATGATGA;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=33113330;WS=33113318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr9	33116238	rs34433922	AT	A	796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.56;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	33120706	rs3818593	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=0.600;SC=TCACTAGGAAACTCTTGGGCC;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=14;WE=33120714;WS=33120696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr9	33135085	rs913214	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=797;ReadPosRankSum=-0.762;SC=AGTGCCAGGTGTCTGTGAAAT;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=47;WE=33135093;WS=33135075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr9	33264540	rs1071545	C	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=39;PP=1147;SC=GGTGGACGCCCAGAGGGAGGC;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=33264548;WS=33264530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr9	33270748	rs831271	G	T	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=34;PP=1149;SC=GTTATTTCATGTATTTATTCT;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=33270756;WS=33270738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr9	33442986	rs2231231	A	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=0.912;SC=CAGATTAGACACACAGTGAGT;SOR=0.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=26;WE=33442994;WS=33442976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr9	33447306	rs517210	C	G	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=750;ReadPosRankSum=1.642;SC=GTGGGGGTCACAGCTGGGGAG;SOR=0.442;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=45;WE=33447314;WS=33447296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
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chr9	33447579	rs17553719	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.142;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=296;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CGGGAGGCGGTGGCGCAGCGA;SOR=0.059;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=31;WE=33447587;WS=33447569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
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chr9	33465651	rs560833	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=249;ReadPosRankSum=0.277;SC=ATCTGGCCCCTGGAGAGACAG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=16;WE=33465659;WS=33465641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr9	33465928	rs3739680	T	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=598;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GAGAAGGATGTGTCAGCCCAG;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=52;WE=33465936;WS=33465918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr9	33466844	rs148429248	T	TGAG	962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.735;NF=9;NR=7;PP=716;ReadPosRankSum=0.271;SC=TGGCCAAGGCTGAGAGGACTC;SOR=0.372;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=16;WE=33466852;WS=33466834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr9	33467595	rs3860990	C	T	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=976;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TAGCTAGAAACGCCTAGCTGG;SOR=0.992;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=56;WE=33467603;WS=33467585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,68:0.54:126
chr9	33467983	rs679644	G	A	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=18;PP=1015;SC=CTGTAGCCCCGAAGAGACAGG;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=33467991;WS=33467973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	33469427	rs10813983	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=546;ReadPosRankSum=0.032;SC=TGAGGCCTCCGTGCCTCTGTG;SOR=0.317;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=36;WE=33469435;WS=33469417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr9	33473893	rs2777744	T	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.157;SC=GGTCTATACCTCATAGCTTCC;SOR=0.913;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=63;WE=33473901;WS=33473883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,72:0.50:145
chr9	33524684	rs3843933	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=143;ReadPosRankSum=1.352;SC=GTCCGCGACAGAAAAGACAGG;SOR=0.668;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=15;WE=33524692;WS=33524674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr9	33524725	rs3843934	G	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=67;ReadPosRankSum=0.506;SC=GTGGGAGGGGGCCCCCAGGCC;SOR=0.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=10;WE=33524733;WS=33524715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr9	33558025	rs34748833	T	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=6;PP=968;SC=TCTTAAAAATTCTTGACTTAC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=33558033;WS=33558015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	33568789	rs10971566	T	G	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=37;PP=1363;SC=TTGAAAATCTTAATAGTATAG;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=33568797;WS=33568779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	33573160	rs1807130	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.905;SC=ATTTTCTCTGCGGCAACCCTA;SOR=0.576;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=6;WE=33573168;WS=33573150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr9	33573212	rs12378940	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.188;NF=13;NR=4;PP=221;ReadPosRankSum=-1.962;SC=GAGCCACCGAGGAAGCACAGG;SOR=1.136;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=17;WE=33573220;WS=33573202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr9	33573377	rs597219	T	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.83;QD=30.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	33617691	rs147881110	TGGATGTAACACG	T	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=1224;ReadPosRankSum=0.978;SC=GGCAGAGAGATGGATGTAACA;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=33617710;WS=33617681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr9	33618028	rs855511	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GAGAGCCGCCAGTCAGAGGAG;SOR=0.396;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=32;WE=33618036;WS=33618018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr9	33618358	rs855512	A	G	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1228;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GCTGATGGCAACTTCCAATGA;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=77;WE=33618366;WS=33618348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,102:0.59:173
chr9	33618460	rs966447	A	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=630;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GACAGTGACCAGTGCCCATCC;SOR=0.857;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=40;WE=33618468;WS=33618450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr9	33618497	rs2380835	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=428;ReadPosRankSum=0.705;SC=TACATCTGCAGTGCTAGAGAC;SOR=1.755;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=22;WE=33618505;WS=33618487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr9	33625185	rs36079164	C	T	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.052;NF=45;NR=56;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.261;SC=AAAATTAGGTCTGAATTCAAG;SOR=0.906;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=186;TCF=86;TCR=100;TR=101;WE=33625193;WS=33625175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,122:0.54:226
chr9	33649383	rs855547	C	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.709;NF=10;NR=24;PP=601;ReadPosRankSum=-0.926;SC=ATTATGCTGGCATGTTCTCAG;SOR=1.193;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=34;WE=33649391;WS=33649373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr9	33662181	.	TCTGTAGCCCCAA	TTGTAGCCCCAA,T	1792.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.377;NF=17;NR=6;PP=2962;ReadPosRankSum=0.084;SC=GGAGACATCCTCTGTAGCCCC;SOR=0.635;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=23;WE=33662202;WS=33662171;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.65:71
chr9	33662183	.	TGTAGCCCCAAC	T	1769.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.670;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr9	33662194	.	C	T	2365	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=59.91;NF=24;NR=6;PP=2365;QD=79.9923737516;SC=GTAGCCCCAACTGTGCCATGA;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=30;WE=33662202;WS=33662171;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr9	33662389	rs1832325	A	G	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1829;ReadPosRankSum=0.135;SC=AAGGAAGCTGAAATCTACCAG;SOR=0.746;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=197;TCF=94;TCR=103;TR=100;WE=33662397;WS=33662379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,116:0.50:233
chr9	33662424	rs41313962	G	A	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;PP=1663;ReadPosRankSum=0.020;SC=TGTTATAGGGGCAGGAAAGAA;SOR=0.766;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=184;TCF=95;TCR=89;TR=96;WE=33662432;WS=33662414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,112:0.51:218
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chr9	33662593	rs16933245	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.757;NF=18;NR=48;PP=1123;ReadPosRankSum=1.461;SC=AGGATAGAGCGTTTTCCCCTG;SOR=0.999;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=35;TCR=85;TR=66;WE=33662601;WS=33662583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
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chr9	33750453	rs113217588	A	ACACAG	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=320;SC=CTCCTGAAGCACACAGCCTAG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=33750461;WS=33750443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	33750845	rs855551	G	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=622;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GGACCTGCGGGGGAGGGTACG;SOR=0.644;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=51;WE=33750853;WS=33750835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr9	33794797	.	TGA	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-6.075;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,13:0.08:154
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chr9	33794877	.	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-8.015;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.200;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,19:0.15:128
chr9	33794890	.	T	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQRankSum=-7.664;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,22:0.20:112
chr9	33794894	.	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-7.820;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,30:0.28:106
chr9	33794906	.	TTGAAACA	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=5.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-3.593;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=1.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,8:0.09:89
chr9	33794915	.	TTCC	T	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-3.597;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=1.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,8:0.10:83
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chr9	33794926	.	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-3.901;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.470;SOR=1.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,8:0.11:72
chr9	33794927	.	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-5.616;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,9:0.13:69
chr9	33794929	.	A	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-3.744;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.393;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,7:0.10:69
chr9	33795415	.	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.537;NF=4;NR=4;PP=394;ReadPosRankSum=0.593;SC=GTGGCCAAACGTAGCCGAGCT;SOR=0.105;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=8;WE=33795430;WS=33795405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr9	33795417	rs373360400	AGCCGAG	A	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-6.503;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr9	33795437	rs372175402	C	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-7.838;QD=1.49;ReadPosRankSum=2.298;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,7:0.11:63
chr9	33795439	.	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-7.902;QD=1.37;ReadPosRankSum=2.335;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,7:0.11:64
chr9	33795441	.	C	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-7.902;QD=1.37;ReadPosRankSum=2.336;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,7:0.11:64
chr9	33795579	.	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.634;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=33.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-11.158;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.863;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,12:0.10:126
chr9	33795581	.	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=32.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-11.109;QD=1.66;ReadPosRankSum=-2.939;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,13:0.10:125
chr9	33795583	.	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=25.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-11.106;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.891;SOR=3.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,14:0.11:125
chr9	33795593	rs201140357	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=9.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-11.763;QD=6.45;ReadPosRankSum=-2.870;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,24:0.17:141
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chr9	33795603	.	G	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-12.301;QD=7.98;ReadPosRankSum=-2.945;SOR=1.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,37:0.24:156
chr9	33795613	.	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-12.677;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,41:0.25:166
chr9	33795622	.	T	C	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=5.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-13.423;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.415;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,46:0.25:186
chr9	33795624	.	A	C	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=4.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=-13.606;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.800;SOR=1.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,51:0.27:192
chr9	33795638	.	C	T	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=5.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQRankSum=-13.843;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.872;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,61:0.30:201
chr9	33795640	.	ACCC	A	2168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=5.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-13.956;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.209;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,61:0.30:204
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chr9	33795652	.	T	C	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQRankSum=-14.175;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.753;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,71:0.33:213
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chr9	33796889	.	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=-3.103;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr9	33796896	.	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.900;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=-3.054;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr9	33796898	.	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-3.664;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
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chr9	33797881	rs372122039	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=23.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-18.029;QD=4.15;ReadPosRankSum=-3.951;SOR=2.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,60:0.18:330
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chr9	33797928	.	G	GCC	5710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=4.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQRankSum=-20.850;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.269;SOR=1.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:409,178:0.30:587
chr9	33797930	.	GAC	G	7261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.019;ClippingRankSum=0.000;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=10.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQRankSum=-21.893;QD=12.14;ReadPosRankSum=-2.068;SOR=1.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,184:0.31:598
chr9	33797951	rs150316320	A	C	8169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=645;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-22.728;NF=126;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=0.932;SC=CAATGACATCATGCTGATCAA;SOR=1.075;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=582;TCF=306;TCR=276;TR=216;WE=33797970;WS=33797907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:422,219:0.34:641
chr9	33797962	rs374178684	A	G	8877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=642;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-22.254;NF=126;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.706;SC=TGCTGATCAAACTCTCCTCAC;SOR=0.815;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=577;TCF=286;TCR=291;TR=234;WE=33797970;WS=33797907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:398,240:0.38:638
chr9	33797969	rs149664918	T	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=-10.182;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:585,63:0.10:648
chr9	33797978	rs145485932	G	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=7.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQRankSum=-9.990;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.965;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:574,70:0.11:644
chr9	33797987	rs137945391	G	T	6806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-5.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=643;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-15.132;NF=84;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=1.019;SC=CGTCATCAATGCCCGCGTGTC;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=580;TCF=252;TCR=328;TR=191;WE=33798007;WS=33797977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:447,192:0.30:639
chr9	33797991	rs146966861	GC	AT	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=4.005;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQRankSum=-10.291;QD=2.86;ReadPosRankSum=2.799;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:541,83:0.13:624
chr9	33797999	rs142141488	A	G	5944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=569;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=4;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.354;NF=62;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=1.245;SC=CCGCGTGTCCACCATCTCTCT;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=510;TCF=199;TCR=311;TR=165;WE=33798007;WS=33797977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:404,161:0.28:565
chr9	33798016	.	C	T	4646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQRankSum=-10.601;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:339,128:0.27:467
chr9	33798016	.	CA	TG	1710	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=76;MMLQ=27;MQ=52.06;NF=37;NR=90;PP=1710;QD=13.8855738178;SC=CTCTGCCCACCACCCCTCCAG;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=428;TCF=144;TCR=284;TR=127;WE=33798025;WS=33798006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:301,127:0.30:428
chr9	33798017	rs855581	A	G	11387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.346;HP=6;HapScore=1;MGOF=79;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=9.737;NF=103;NR=226;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.456;SC=TCTGCCCACCACCCCTCCAGC;SOR=1.362;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=415;TCF=142;TCR=273;TR=329;WE=33798025;WS=33798006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,355:0.79:448
chr9	33798037	.	T	C	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.000;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=12.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-9.557;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.911;SOR=1.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,87:0.25:343
chr9	33798042	rs141382822	G	C	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=12.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQRankSum=-8.840;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=1.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,79:0.24:323
chr9	33798052	rs377380263	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=-7.093;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.656;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,65:0.24:266
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chr9	33798075	.	T	C	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.568;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=8.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-9.233;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,89:0.48:186
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chr9	33799245	.	G	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-8.256;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,11:0.16:70
chr9	33799246	.	G	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=7.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-6.590;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.591;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,8:0.12:69
chr9	33799251	.	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-7.751;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,11:0.18:62
chr9	33799267	.	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-5.341;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.233;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,6:0.14:44
chr9	33799285	rs369146161	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-4.615;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr9	33799304	.	G	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-4.186;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
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chr9	33912102	rs148101204	GT	G	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.883;NF=0;NR=13;PP=154;ReadPosRankSum=1.894;SC=ATTAGGTAAGGTTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=13;WE=33912110;WS=33912092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr9	33917348	rs141897963	AAC	A	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=0.967;SC=CGGGTGGGGAAACACACACAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=33917357;WS=33917338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr9	33924312	rs10971794	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=614;ReadPosRankSum=0.048;SC=CTTGATCAGCGACTGGCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=44;WE=33924320;WS=33924302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
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chr9	33928074	rs147678695	A	AC	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=260;ReadPosRankSum=0.903;SC=GCTTGGGCCCAAGTCTCAAGG;SOR=0.275;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=33928082;WS=33928064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
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chr9	33934271	rs56274755	T	C	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=745;ReadPosRankSum=1.357;SC=TCAGAAAGGATGTGGAGACAC;SOR=0.425;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=62;WE=33934279;WS=33934261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
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chr9	33939062	rs2307692	TCC	T	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=-1.637;SC=CATGGAAAGCTCCCCATTTTA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=33939071;WS=33939052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
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chr9	34242192	rs10972015	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1232;ReadPosRankSum=1.477;SC=TGATTTTTTTCGAGACAGGGT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=34;TCR=74;TR=66;WE=34242200;WS=34242182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,77:0.58:132
chr9	34269386	rs141274403	ACTT	A	1297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.193;NF=0;NR=24;PP=892;ReadPosRankSum=-1.061;SC=AGCAGGAGTGACTTCTGTGAA;SOR=1.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=24;WE=34269396;WS=34269376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,38:0.39:97
chr9	34286486	rs6476442	G	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TTTACAGATGGGAAGTGGTGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=34286494;WS=34286476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr9	34306410	rs17350674	C	A	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1362;ReadPosRankSum=0.383;SC=CATCTCAGTCCAAGGATTCTG;SOR=1.274;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=76;WE=34306418;WS=34306400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,90:0.48:186
chr9	34310927	rs10972048	T	C	3687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=72;PP=1947;ReadPosRankSum=0.004;SC=TCTGGTAGCATGTGTTCTAGC;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=287;TCF=145;TCR=142;TR=141;WE=34310935;WS=34310917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,176:0.51:344
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chr9	34500595	rs4878575	G	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.383;SC=ATAGGTAGTAGTATTATTCCC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=34500603;WS=34500585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr9	34500821	rs11793196	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=1.632;SC=GCGCCTGTCCGTCACTGCCCT;SOR=1.040;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=21;WE=34500829;WS=34500811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr9	34500879	rs10814116	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=2.009;SC=CCCTGAGTGCCCTCTACATCC;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=16;WE=34500887;WS=34500869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr9	34552437	rs2274592	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=23;SC=GTACTGCCTCCCCCATCAGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=34552445;WS=34552427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr9	34615896	.	C	CA	160	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=59.76;NF=4;NR=6;PP=160;QD=16.3;SC=CGACTCTGTCCAAAAAAAAAA;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=10;WE=34615904;WS=34615886;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,10:0.29:35
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chr9	34622389	rs3808869	A	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=743;ReadPosRankSum=0.894;SC=GGGGGCATGCAAGGTCGAGGT;SOR=0.425;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=44;WE=34622397;WS=34622379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr9	34623718	rs10814129	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=537;ReadPosRankSum=0.930;SC=GTACCTAGGGGCGGACAGCGG;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=36;WE=34623726;WS=34623708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr9	34635598	rs4879809	T	C	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=12;PP=1383;SC=CGCTCCTGTCTATCCGCAGGT;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=34635606;WS=34635588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	34637690	rs1800866	T	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=290;ReadPosRankSum=1.103;SC=CACGGCCCACTGCATCCCGGC;SOR=1.002;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=20;WE=34637698;WS=34637680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr9	34655436	rs2812357	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=238;ReadPosRankSum=-1.428;SC=ACCTGGGTCCTCTCTCTACCC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=13;WE=34655444;WS=34655426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr9	34657663	rs1104748	T	C	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=263;SC=ACTCCCAGAGTTCCCAGTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=34657671;WS=34657653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	34723181	rs2297132	G	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=436;SC=GGCTCTGCATGTTCTCCTTGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=34723189;WS=34723171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	34723744	rs4878588	C	A	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.92;NF=45;NR=33;PP=1727;SC=CCCTGTGAAGCCTGGGGCAAC;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=34723752;WS=34723734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	34723935	rs2297134	C	T	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.07;QD=28.03;SOR=1.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr9	34724241	rs3739881	C	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=39;PP=1728;SC=CATGTCCCCACTGGGCTGTGA;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=87;WE=34724249;WS=34724231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	34724786	rs72617336	G	A	6199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.14;QD=42.46;SOR=0.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr9	34724796	rs150496452	T	A	5829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.99;QD=45.19;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	34725047	rs78716275	C	T	6087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=135;PP=2965;SC=GATGCAGGTCCGGGTCACTTG;SOR=1.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=78;TCR=135;TR=213;WE=34725055;WS=34725037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr9	34725742	rs62547039	T	C	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=96;PP=2965;SC=GATGGAGACATCCAGTTTGGG;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=182;WE=34725750;WS=34725732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr9	34834494	rs77822083	C	T	3533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.207;NF=85;NR=86;PP=2685;ReadPosRankSum=0.229;SC=CCAGCGATGGCGAATCGACTG;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=368;TCF=185;TCR=183;TR=171;WE=34834502;WS=34834484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,175:0.46:380
chr9	34835273	rs521552	A	C	3881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.724;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.715;NF=72;NR=94;PP=2838;ReadPosRankSum=3.559;SC=GAGAAGTATTATTCAGGTTGA;SOR=0.930;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=314;TCF=145;TCR=169;TR=166;WE=34835281;WS=34835263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,177:0.50:353
chr9	35042296	rs61742471	G	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=547;ReadPosRankSum=-1.309;SC=AGGGGGATATGGGGCTTCTCT;SOR=0.554;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=41;WE=35042304;WS=35042286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr9	35043291	rs615474	G	T	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=53;PP=2851;SC=CCTCTGAAGTGGTCTGTTTGT;SOR=1.258;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=88;TCR=53;TR=140;WE=35043299;WS=35043281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	35060302	rs684562	T	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=1139;ReadPosRankSum=1.898;SC=CAGCCTATTGTAGCTCACCTT;SOR=0.278;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=50;WE=35060310;WS=35060292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr9	35060746	rs562381	A	G	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=15;PP=923;SC=GATCACCCAGATCAATTACAA;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=35060754;WS=35060736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	35060955	rs2258240	T	C	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=36;PP=1644;SC=ATGAGACTTATCAAGGGAGGG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=35060963;WS=35060945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	35061693	rs11272867	G	GACAGTACACAA	2939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=2900;SC=CGACCTGTGGGACAGTACACA;SOR=1.341;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=28;WE=35061701;WS=35061683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	35062972	rs514492	C	T	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=63;PP=2284;SC=CCAAATATCTCACCATTGATC;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=118;WE=35062980;WS=35062962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	35074917	rs587118	T	C	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=36;PP=1659;SC=CATGCAAGTATACATACCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=35074925;WS=35074907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	35077441	rs554098	T	C	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=51;PP=1851;SC=TACAACCTCCTCGTCTTCTCC;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=88;WE=35077449;WS=35077431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	35079361	rs504082	G	T	7772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=102;PP=2965;SC=CCTCCCCATCGGTTGGGGTAA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=127;TCR=102;TR=229;WE=35079369;WS=35079351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr9	35089048	rs556766	A	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=341;SC=CACTGTTCTCAAGCACTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=35089056;WS=35089038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	35090782	rs505297	A	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=294;SC=TACACACTCAAATGCCTATCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=35090790;WS=35090772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	35093020	rs568300	T	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=917;SC=CCAGCCCGCTTACCTACCTGC;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=35093028;WS=35093010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	35100002	rs664357	T	C	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=25;PP=1529;SC=GCTTCCTTGTTCCCAGACTCC;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=35100010;WS=35099992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	35100569	rs586017	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=404;SC=CCAGTGCTCTATGCTGGGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=35100577;WS=35100559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	35101383	rs34240345	GCA	G	2053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=1596;SC=TGGTACTGGAGCACCCTGAGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=36;WE=35101392;WS=35101373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	35101870	rs693325	C	G	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=38;PP=1762;SC=GAGGGCAACTCAAAAGGCTGG;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=75;WE=35101878;WS=35101860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	35107765	rs13287211	C	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1313;ReadPosRankSum=0.249;SC=CCCCCAGGGACCCCTGTCCCC;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=91;TCR=102;TR=90;WE=35107773;WS=35107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,102:0.44:234
chr9	35107858	rs7039828	C	T	4751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=81;PP=2965;SC=TCCAGGCCCCCGAAGTCCAAG;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=148;WE=35107866;WS=35107848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr9	35295984	rs661712	T	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=37;PP=1355;SC=CATGATGCAATTGGCAAGAAG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=35295992;WS=35295974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	35546735	rs1535422	A	G	7156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=105;PP=2965;SC=CCTGCACTCTACTCCAGGAGG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=215;WE=35546743;WS=35546725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr9	35555823	rs946483	T	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=733;SC=CATCCCTCCCTCAGCATCTGT;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=35555831;WS=35555813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	35556250	rs870978	G	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=13;PP=1000;SC=CACTGAACTGGCCTGGAACTC;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=35556258;WS=35556240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	35556527	rs150786704	A	ACCTCTAAGTGCTGGCTGGGC	541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=2570;SC=CCAGTCTGAAACCTCTAAGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=35556535;WS=35556517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr9	35610523	rs71940749	CCCCTGCTCTGAGT	C	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr9	35650458	rs2297880	G	A	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=57;PP=2965;SC=CTCGGTAAGAGAGAACTCTCA;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=138;WE=35650466;WS=35650448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr9	35658331	rs113382889	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.718;SC=CCAATGCCGGACCGCTTCGGC;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=8;WE=35658339;WS=35658321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr9	35660901	rs2275420	C	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.962;SC=GACAAAGTCTCTGAAACTGGA;SOR=1.037;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=64;WE=35660909;WS=35660891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,74:0.45:166
chr9	35660990	rs1339374	A	G	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=81;PP=2871;SC=CGAGGAGGAGATTGGTGACAG;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=35660998;WS=35660980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr9	35661057	rs10441685	C	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=861;ReadPosRankSum=0.783;SC=CTAGCTACTTCCTGGGAGGTG;SOR=0.847;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=58;WE=35661065;WS=35661047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr9	35661088	rs10441686	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=846;ReadPosRankSum=0.912;SC=TACGGAGAAGGTGCAGCCAGG;SOR=0.786;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=54;WE=35661096;WS=35661078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr9	35661243	rs35234337	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=-0.443;SC=ATACTAGGTGCCTAAGGACAA;SOR=0.602;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=28;WE=35661251;WS=35661233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr9	35662251	rs2297879	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=774;ReadPosRankSum=2.385;SC=TAGCTTCTCATGAGGGAAGGA;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=54;WE=35662259;WS=35662241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr9	35664134	rs12351182	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTGGAGTGAGGGAGAAAGGAT;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=58;WE=35664142;WS=35664124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,66:0.56:117
chr9	35664624	rs1361338	C	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=1.644;SC=ATGCTAAGGCCCTGGGCCAAG;SOR=2.093;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=35664632;WS=35664614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	35674101	rs12553173	T	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=1020;ReadPosRankSum=0.537;SC=GGATTCCCCCTTGGGAGGAGG;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=65;WE=35674109;WS=35674091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr9	35674190	rs201260414	CGGAGAGGAGGATCTACCT	C	1181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=4.304;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.230;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr9	35674347	rs77984049	A	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TAATGCCCACAGGGACAAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=18;WE=35674355;WS=35674337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
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chr9	35675961	rs2301371	G	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1060;ReadPosRankSum=0.722;SC=ACTTGGGGATGGGGCGGGGCG;SOR=0.502;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=68;WE=35675969;WS=35675951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr9	35677702	rs2857801	T	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=416;SC=ATGGGAGAGGTCTATGGGAAC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=35677710;WS=35677692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	35679061	rs2857802	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=262;ReadPosRankSum=0.192;SC=CTGCACTTAGCGAAGAAGTGG;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=16;WE=35679069;WS=35679051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr9	35682296	rs11998	T	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TCAGGGCCCCTTGGCAGGGAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=35682304;WS=35682286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr9	35683240	rs149115565	T	TG,TGG	2913.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.07;MQRankSum=0.000;QD=24.90;ReadPosRankSum=1.313;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,68,45:0.58,0.38:117
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chr9	35807401	rs112946422	AGCTGGGGCC	A	2255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.041;NF=4;NR=34;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.202;SC=ACAAGGTGAGAGCTGGGGCCG;SOR=1.053;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=11;TCR=69;TR=38;WE=35807417;WS=35807391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
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chr9	35811485	rs141090907	ACCAGGACCAGAG	A	602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
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chr9	35826058	rs13294256	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=-1.340;SC=TTCAGAGATATGGTTCTCCTG;SOR=0.526;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=29;WE=35826066;WS=35826048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr9	35829390	rs2381409	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=0.605;SC=GAGCCGCGGGCCAGCTCTGCG;SOR=1.075;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=6;WE=35829398;WS=35829380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr9	35842301	rs2236294	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=329;ReadPosRankSum=0.332;SC=CACTCTTTGCGAAATCCTGTC;SOR=0.086;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=25;WE=35842309;WS=35842291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
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chr9	35852670	rs12346647	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=0.686;SC=TTCTCAGGATTTGGGGAGTCA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=35852678;WS=35852663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr9	35906598	.	ACCC	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.36;MQRankSum=0.319;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr9	35906607	rs201684694	G	A	262.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.319;NF=3;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CACCCCCACCGCCACCATCCC;SOR=0.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=35906615;WS=35906588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr9	35910801	rs10814296	G	A	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=562;SC=TTCCCCTCCAGTAACCTGTGA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=35910809;WS=35910791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	35957355	rs2233568	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CGATCACCACGGTGAGGTGGG;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=15;WE=35957363;WS=35957345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr9	35957669	rs2233564	T	C	3413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=1678;ReadPosRankSum=0.926;SC=GCCATGGGCATGTAGGCAGCC;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=236;TCF=113;TCR=123;TR=128;WE=35957677;WS=35957659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,163:0.55:299
chr9	35958047	rs2233558	T	C	3078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=73;PP=1977;ReadPosRankSum=0.414;SC=GCAGAGAGCCTCAGGAGAACG;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=81;TCR=124;TR=120;WE=35958055;WS=35958037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,141:0.58:245
chr9	36063688	rs10814326	A	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=469;SC=CAGTTTTCTTATGGACAGCTG;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=36063696;WS=36063678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	36063743	rs942478	C	G	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=919;SC=CATGCTATCTCTTTTTATTGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=36063751;WS=36063733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	36105264	rs11788747	A	G	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=65;PP=2282;SC=CCTGTCTTCCATACTTTTGTG;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=36105272;WS=36105254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	36109947	rs10972726	C	A	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=54;PP=2290;SC=CTTTCTGTTTCTGTCAGGTCA;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=122;WE=36109955;WS=36109937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr9	36110063	rs10972727	T	A	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=48;PP=1561;SC=AAGATGACCGTCGTACCTTCA;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=36110071;WS=36110053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	36110137	rs10972728	C	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=277;SC=CACATTTTTCCCTTCAAGGCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=36110145;WS=36110127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	36141739	rs140474889	C	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CAGCCTCGATCTCCTGGGCTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=36141747;WS=36141729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr9	36163002	rs11588	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=236;ReadPosRankSum=0.896;SC=CACATAAATACAAAGCAGCTT;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=18;WE=36163010;WS=36162992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr9	36169494	rs3739610	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=599;ReadPosRankSum=-1.115;SC=GCCGACAAGAGGCACCATGAA;SOR=0.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=37;WE=36169502;WS=36169484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr9	36169598	rs3739609	T	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=843;ReadPosRankSum=-1.434;SC=TGGCCCTGAGTGTGGACAACC;SOR=0.974;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=57;WE=36169606;WS=36169588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr9	36216351	.	TAGACG	T	194.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-0.319;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr9	36216358	.	A	T	206.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-0.180;QD=29.54;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr9	36218377	rs2296817	C	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=48;PP=1472;SC=GGAAAGCAAGCCCCTACATGG;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=36218385;WS=36218367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	36263435	rs62541786	T	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=22;NR=14;PP=672;SC=GGGCCCGGATTACAGGTATGA;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=36263443;WS=36263425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	36276857	rs7875447	A	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=25;PP=1689;SC=TGCAATTTCAATAATAAAGCT;SOR=1.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=78;WE=36276865;WS=36276847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	36369646	rs59794829	CAA	C,CA	1257.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=27.95;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,28,17:0.62,0.38:45
chr9	36372737	rs12001805	C	A	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=188;SC=TTTCAAAGAACTCAAAGCTAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=36372745;WS=36372727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	36643131	rs9298970	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.971;NF=3;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.932;SC=TGTAATCCAAACACTTTGGGA;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=13;WE=36643139;WS=36643121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr9	36669228	rs3780133	C	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=408;SC=AATGTGATACCTGCATTATTA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=36669236;WS=36669218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	36674842	rs2274473	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=13;PP=1050;SC=TTCACTATAACGTGACTACAA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=36674850;WS=36674832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	36840623	rs3780135	G	A	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=29;PP=1617;SC=CGCTATAATAGTAGGGGGAGC;SOR=1.261;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=81;WE=36840631;WS=36840613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	36864119	rs4289895	A	G	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=20;NR=12;PP=559;SC=CCGCCCCCCCAATAAAAGTGC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=36864127;WS=36864101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	36864379	rs72735606	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.956;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr9	37026453	rs13289473	G	A	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=22;PP=1084;ReadPosRankSum=0.789;SC=TCCGGCCTTAGTACCTGACCC;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=103;TCR=43;TR=76;WE=37026461;WS=37026443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr9	37302155	rs10814518	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-1.745;SC=AAAAGTGCCACGGTTAAGTAA;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=24;WE=37302163;WS=37302145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr9	37304168	rs11422051	A	AT	2539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.777;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.222;NF=52;NR=17;PP=1471;ReadPosRankSum=-1.391;SC=TTAATTCTTGATTTTTTTTTC;SOR=2.435;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=69;WE=37304176;WS=37304158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr9	37305829	rs3837244	GATAT	G	1698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=1410;SC=TACTCCGTGAGATATATATAT;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=26;WE=37305840;WS=37305819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	37305852	rs3780333	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=-0.078;SC=ATATATAGTCATGTCCATTTT;SOR=0.184;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=13;WE=37305860;WS=37305842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr9	37426524	rs2736664	C	T	6307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=93;PP=2965;SC=CACCAGATGTCTGATTCGTAG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=184;WE=37426532;WS=37426514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr9	37429661	rs309459	A	G	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=32;NR=22;PP=997;SC=CCGCTGTTCCAGAAATGCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=37429669;WS=37429651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	37429814	rs309458	A	G	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=1168;SC=AGGAAGCAGCAGAATTCCAGG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=37429822;WS=37429804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	37432264	rs309455	T	C	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1135;SC=ACACCAGGGATCGTAAATGTT;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=37432272;WS=37432254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	37441808	rs309450	A	G	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=68;PP=2965;SC=CAGTCATTCCATCAGCTTTAG;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=158;WE=37441816;WS=37441798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr9	37486916	rs913278	G	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=365;SC=AGCAAATGGAGCTTTGAAGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=37486924;WS=37486906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr9	37489298	rs3758223	T	C	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=911;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TTGTATTATTTCTTCTTTATT;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=52;WE=37489306;WS=37489288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
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chr9	37493548	rs10814567	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=704;ReadPosRankSum=-0.929;SC=GGTTTATCTCATAAACAGATG;SOR=0.850;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=50;WE=37493556;WS=37493538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr9	37493588	rs10758434	C	T	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1030;ReadPosRankSum=0.112;SC=TTGGTACCACCAAACAGAAGC;SOR=0.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=67;WE=37493596;WS=37493578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,82:0.53:155
chr9	37498295	rs10973374	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GATGAGTTCTGATGAGAGAAG;SOR=0.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=37498303;WS=37498285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr9	37498334	rs6476635	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CAAGTCTTTACTGTCAACTGT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=37498342;WS=37498324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr9	37503087	rs10814571	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=325;ReadPosRankSum=1.704;SC=TCCAAAAGAAGGGTGTCTGTG;SOR=0.750;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=22;WE=37503095;WS=37503077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr9	37503124	rs7047823	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=17;PP=605;SC=AAGATCACAAGCTGGGCACCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=37503132;WS=37503114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	37512734	rs10973387	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=248;ReadPosRankSum=0.915;SC=GGTGCAAAACGAAAGTCAGTG;SOR=0.430;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=14;WE=37512742;WS=37512724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr9	37515877	rs60064941	GT	G	3610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.046;NF=32;NR=44;PP=2673;ReadPosRankSum=0.830;SC=TAGAGGACTCGTTCAGGCAAC;SOR=0.641;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=68;TCR=89;TR=76;WE=37515885;WS=37515867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,118:0.48:245
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chr9	37536998	rs927930	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=492;SC=GTCAAGCGTGCGTGAATAAGT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=37537006;WS=37536988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	37592143	rs73441369	A	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=0.307;SC=GGTGTGAGCCAACGCGCCCGG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=37592151;WS=37592135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	37592452	rs7021977	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=725;ReadPosRankSum=1.168;SC=TCCGTATGGAGGAGATCACAT;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=38;WE=37592460;WS=37592442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr9	37707392	rs2296557	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=293;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TTCTCTTTTTTACATACTCCT;SOR=1.565;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=15;WE=37707400;WS=37707382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr9	37708307	rs2296555	A	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TGGGAACTGGATCAGGGTGCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=37708315;WS=37708304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr9	37708572	rs2296554	A	G	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=958;ReadPosRankSum=-1.099;SC=CAGGAATGGCATAACTGATCC;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=67;WE=37708580;WS=37708562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,75:0.67:112
chr9	37715574	rs1952126	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=0.036;SC=CTGCTGCTTTGTGATGAATTA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=11;WE=37715582;WS=37715564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr9	37740637	rs2281872	T	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=648;ReadPosRankSum=0.375;SC=GCAGCCACGCTGACTACTACA;SOR=1.307;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=50;WE=37740645;WS=37740627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,54:0.41:132
chr9	37763575	.	AATATTCCTCTGGTTTT	A	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=2966;ReadPosRankSum=1.581;SC=TTTCTTATATAATATTCCTCT;SOR=0.362;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=11;WE=37763598;WS=37763566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
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chr9	37800526	rs79282860	C	A	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1712;ReadPosRankSum=0.626;SC=ACATACTCAGCCTCACAGGAC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=131;TCR=90;TR=119;WE=37800534;WS=37800516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,130:0.52:251
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chr9	38015327	rs2183130	C	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.409;SC=TGCTCCAAGTCTTGTATTATC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=38015335;WS=38015317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr9	38016247	rs7037371	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.747;SC=AGGCAGGAACTAAAGCCGGCG;SOR=2.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=8;WE=38016255;WS=38016237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr9	38395928	rs2073477	C	T	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.019;SC=ACCCTACCACCGGGGAGGTCA;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=92;TCR=114;TR=112;WE=38395948;WS=38395918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,128:0.53:240
chr9	38395940	rs2228094	T	C	8303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=109;PP=2962;SC=GGGAGGTCATTGGGCACGTGG;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=85;TCR=109;TR=194;WE=38395948;WS=38395918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr9	38396002	rs2228093	C	T	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1787;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GCCCGGGAAGCCTTCCGCCTG;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=210;TCF=114;TCR=96;TR=109;WE=38396010;WS=38395992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,127:0.52:244
chr9	38396065	rs2073478	G	T	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=1857;ReadPosRankSum=0.855;SC=CTGCTGAACCGCCTGGCAGAC;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=230;TCF=127;TCR=103;TR=115;WE=38396073;WS=38396055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,137:0.51:270
chr9	38396372	rs145426005	G	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=921;ReadPosRankSum=-0.361;SC=TGGTTATGAAGGTGGCAGAGC;SOR=0.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=60;TCR=87;TR=58;WE=38396380;WS=38396362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,63:0.39:161
chr9	38396502	rs4878199	G	A	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=46;PP=2965;SC=CGCCCAGCACGTGGATGTTGA;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=89;TCR=46;TR=135;WE=38396510;WS=38396492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	38396905	rs201408956	GC	G	4740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.883;NF=26;NR=71;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CTCCTCTGTGGCGGAGAGCGT;SOR=0.751;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=202;TCF=61;TCR=141;TR=97;WE=38396913;WS=38396895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,147:0.46:319
chr9	38397355	rs3043	G	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=662;SC=CCACCTTGACGAATGCTTGCC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=38397363;WS=38397345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	38411345	rs12377125	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=0.117;SC=CAAATATCTCATAACATGGGT;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=24;WE=38411353;WS=38411335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr9	38413159	rs7018644	T	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=557;ReadPosRankSum=2.651;SC=CTTTGAAACATGTAATGTGTT;SOR=0.483;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=37;WE=38413167;WS=38413149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr9	38414022	rs72447808	CCT	C	804.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.026;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.446;NF=37;NR=9;PP=1031;ReadPosRankSum=0.892;SC=TCTGTTTCTCCCTCTTTCTCA;SOR=1.736;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=46;WE=38414038;WS=38414012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr9	38414030	rs5897733	T	TCACA,TCACACACACA	2695.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=16,16;NR=11,11;PP=861,2025;SC=TCCCTCTTTCTCACACACACA;SOR=2.560;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=27,27;WE=38414038;WS=38414012;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:57
chr9	38414067	rs12375529	G	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.414;NF=30;NR=25;PP=764;ReadPosRankSum=-3.359;SC=CACACGAGATGCATGAGTTCT;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=55;WE=38414075;WS=38414057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,76:0.43:175
chr9	38423826	rs7039990	T	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=3;PP=1524;SC=AGGAGAGATATGAAATACTGC;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=56;WE=38423834;WS=38423816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	38424344	rs35134904	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=7.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr9	38571214	rs3045002	T	TACA	933.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.972;NF=2;NR=8;PP=467;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GCAGAGAAAATACATTAGTTT;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=10;WE=38571222;WS=38571204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr9	38571976	rs140529454	T	TTAAA	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-3.407;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr9	38571986	rs55960030	C	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-2.803;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.543;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr9	38573141	rs1974262	T	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	38586130	rs1415581	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.164;NF=7;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=1.834;SC=CTGTACCTCTTACACATGTAA;SOR=0.090;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=38586138;WS=38586120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr9	38595886	rs2996347	T	C	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.577;NF=72;NR=54;PP=2098;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TTTTAAGGTATTGAACTTCAC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=253;TCF=139;TCR=114;TR=126;WE=38595894;WS=38595876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,123:0.47:262
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chr9	66457003	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQRankSum=-0.850;QD=0.66;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,9:0.15:62
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chr9	66457041	.	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.37;MQRankSum=-3.122;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,6:0.07:90
chr9	66457042	.	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-3.048;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,6:0.07:92
chr9	66457051	rs79307166	G	C	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQRankSum=-8.040;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr9	66457052	.	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQRankSum=-5.160;QD=5.62;ReadPosRankSum=2.231;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,25:0.23:108
chr9	66457076	rs76994164	T	C	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.074;HP=3;HapScore=1;MGOF=77;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.679;NF=39;NR=14;PP=798;ReadPosRankSum=-0.487;SC=AATAAAGCCCTTCCTTCTACA;SOR=1.336;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=153;TCF=99;TCR=54;TR=53;WE=66457085;WS=66457066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,55:0.39:142
chr9	66457096	.	CTGA	C	2954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=96;MMLQ=24;MQ=44.23;NF=23;NR=13;PP=2954;QD=20;SC=AACTCGGTGTCTGAGGGGTTC;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=36;WE=66457147;WS=66457086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:92,36:0.28:128
chr9	66457099	.	AG	A	1686	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=96;MMLQ=27;MQ=44.44;NF=27;NR=16;PP=1686;QD=40.0;SC=TCGGTGTCTGAGGGGTTCTGT;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=134;TCF=66;TCR=68;TR=43;WE=66457147;WS=66457086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:91,43:0.32:134
chr9	66457106	.	C	T	813	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=96;MMLQ=28;MQ=45.95;NF=28;NR=24;PP=813;QD=16.303292549;SC=CTGAGGGGTTCTGTCTGCAGC;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=177;TCF=108;TCR=69;TR=52;WE=66457147;WS=66457086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:125,52:0.29:177
chr9	66457112	rs113087405	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=7.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=-7.302;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,28:0.21:134
chr9	66457126	.	TGC	T	1047.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=9.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-7.705;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.536;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,33:0.24:138
chr9	66457127	.	G	A	1972	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=96;MMLQ=27;MQ=45.93;NF=51;NR=40;PP=1972;QD=22.0524309071;SC=TCCTCCTGCTGCAGAAGGAGA;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=191;TCF=115;TCR=76;TR=91;WE=66457147;WS=66457086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:100,91:0.48:191
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chr9	66457173	rs199759715	GGAGAGAGAGAGACAGCGATAGAGAGA	G	417.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQRankSum=1.800;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.747;SOR=1.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,19:0.15:131
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chr9	66457192	rs148663514	TAGAGAGAG	TAGAGAG,T	476.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=2;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.807;NF=48;NR=63;PP=2991;ReadPosRankSum=0.421;SC=GAGACAGCGATAGAGAGAGAG;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=111;WE=66457249;WS=66457141;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.24:87
chr9	66457206	.	G	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=13.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQRankSum=-2.214;QD=5.17;ReadPosRankSum=2.112;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,20:0.19:106
chr9	66457211	.	ACAGAAAAGGGGGGAGGAGAGAGAG	A	372.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=8.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQRankSum=-0.546;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.814;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,20:0.13:155
chr9	66457216	rs150998016	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQRankSum=-2.545;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr9	66457231	rs140644333	G	GAC	1469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQRankSum=-1.610;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.884;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,41:0.31:134
chr9	66457241	rs113933538	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=4.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQRankSum=-1.318;QD=1.00;ReadPosRankSum=3.602;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,25:0.15:164
chr9	66457253	rs73447820	A	G	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.999;NF=56;NR=53;PP=1500;ReadPosRankSum=3.834;SC=AAGAGAGAGCACCACAGTAGA;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=143;TCR=131;TR=109;WE=66457275;WS=66457243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
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chr9	66457399	rs78461570	T	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=6.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.880;NF=68;NR=44;PP=2646;ReadPosRankSum=2.817;SC=GGTGGAGGGTTCTTGGGCCGG;SOR=1.458;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=188;TCR=124;TR=112;WE=66457407;WS=66457378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,36:0.15:245
chr9	66457440	rs79030992	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQRankSum=-8.654;QD=0.98;ReadPosRankSum=-2.298;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:347,32:0.08:379
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chr9	66457460	rs75525313	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQRankSum=-8.779;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:345,39:0.10:384
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chr9	66457549	rs77706622	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-6.652;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,55:0.18:305
chr9	66457562	rs79475537	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-3.307;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,45:0.17:265
chr9	66457565	.	G	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-3.209;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,42:0.17:252
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chr9	68415388	rs4928837	A	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.615;NF=14;NR=35;PP=1842;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TGGGAGGAGGATGAAATATTA;SOR=0.947;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=49;WE=68415396;WS=68415342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr9	68427750	rs78840873	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.88;MQRankSum=-0.916;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,22:0.21:104
chr9	68427786	rs4300101	C	T	4928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.793;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.408;NF=120;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TCAAGAACTCCGTAAAAGCAT;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=213;TCF=138;TCR=75;TR=187;WE=68427808;WS=68427776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,185:0.87:213
chr9	68427800	rs77055654	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQRankSum=-0.493;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,42:0.16:258
chr9	68427818	rs111699417	G	GA	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQRankSum=-3.907;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.162;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,38:0.13:282
chr9	68427877	rs4568707	G	A	6160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.932;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.582;NF=93;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.797;SC=AGTATCTGTCGGCTTTCAATT;SOR=0.969;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=291;TCF=125;TCR=166;TR=231;WE=68427885;WS=68427867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,256:0.81:318
chr9	68427938	rs113084687	CAT	C	895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=1.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=0.034;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,33:0.19:172
chr9	68427956	rs4316243	T	C	2939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.928;NF=30;NR=76;PP=1978;ReadPosRankSum=2.264;SC=ATATATTCAATTGCTACTAAA;SOR=0.840;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=35;TCR=90;TR=106;WE=68427964;WS=68427928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,108:0.82:131
chr9	68428005	rs77542827	G	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.958;NF=0;NR=12;PP=178;ReadPosRankSum=1.386;SC=ATTTTGGTTAGTGTATTACCA;SOR=0.057;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=12;WE=68428013;WS=68427995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr9	68433462	rs111392331	T	C	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQRankSum=-2.429;QD=7.34;ReadPosRankSum=3.588;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,179:0.37:484
chr9	68433464	rs79004307	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=6.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.06;MQRankSum=-1.063;QD=2.08;ReadPosRankSum=4.103;SOR=1.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:412,70:0.15:482
chr9	68433468	rs75281072	G	C	4560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.102;NF=77;NR=76;PP=2032;ReadPosRankSum=-3.041;SC=TCATTACCTTGATCATTTCTT;SOR=0.619;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=441;TCF=226;TCR=215;TR=153;WE=68433489;WS=68433452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,148:0.32:458
chr9	68433481	rs112175502	T	TCTC	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=44.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQRankSum=-8.034;QD=0.69;ReadPosRankSum=-4.056;SOR=5.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:382,38:0.09:420
chr9	68433510	rs75661796	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQRankSum=-3.312;QD=0.11;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,43:0.13:324
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chr9	71478986	rs10869434	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TATATGTACAGATGTGAATAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=71478994;WS=71478976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	71504120	rs145571244	G	GT	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.228;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TTTTTCTGTTGTTTTTTTCAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=71504128;WS=71504110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr9	71534678	rs11144305	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.362;SC=TATACTGTATATATTTCTGCT;SOR=1.022;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=5;WE=71534686;WS=71534668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	71538069	rs2027208	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=16;PP=941;SC=CCTGGGCCCCACGGGCTACAG;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=71538077;WS=71538059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	71538356	rs11144351	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TTCATTATGTATCTTTGCAAG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=71538364;WS=71538346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr9	71555492	rs10746973	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=302;ReadPosRankSum=2.163;SC=GACTCATTTCAATTATTATAG;SOR=0.351;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=22;WE=71555500;WS=71555482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr9	71555522	rs10746974	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=505;ReadPosRankSum=0.921;SC=CTGCATTTATCCTTGAGATTC;SOR=0.320;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=34;WE=71555530;WS=71555512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr9	71628207	rs3730386	G	C	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CGCAGCAGATGCTTGAGGTCA;SOR=0.612;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=220;TCF=106;TCR=114;TR=97;WE=71628215;WS=71628197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,107:0.44:244
chr9	71650752	rs2481598	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=470;SC=CACCCAGCCCAGCCCAGGCCC;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=71650760;WS=71650742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr9	71667986	rs7865353	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-0.393;SC=AATAACAAATGTATAAATTTG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=71667994;WS=71667976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr9	71831398	rs2498417	T	C	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=798;SC=CCTCCCTCGCTCCGCAGCCCC;SOR=2.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=33;WE=71831406;WS=71831388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	71843023	rs2309428	C	A	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=41;PP=1646;SC=ACCAAGAGGACCCCCCAGGTG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=78;WE=71843031;WS=71843013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr9	71850853	rs2275431	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=348;ReadPosRankSum=-1.506;SC=GAAGGTAAAGGGGAGATCAGA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=18;WE=71850861;WS=71850843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr9	71854737	rs72187140	TAAAC	T	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=671;ReadPosRankSum=-1.283;SC=CCCAAATAAGTAAACAAACAA;SOR=3.417;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=13;WE=71854748;WS=71854727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr9	71854769	rs2993823	C	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=805;ReadPosRankSum=-0.163;SC=ATATCTCATACAGCCTTTACT;SOR=0.386;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=39;WE=71854777;WS=71854759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr9	71862817	rs41308892	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.998;SC=CCTTCCCTGGCGAGCACATCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=71862825;WS=71862814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	71863235	rs77236826	A	G	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1415;ReadPosRankSum=0.891;SC=TGTGGAAGGCATTCCTAAGGG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=83;TCR=106;TR=101;WE=71863243;WS=71863225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,118:0.51:232
chr9	71863363	rs11793527	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=383;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GTCAGCACTCCGCACACCCAT;SOR=0.163;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=21;WE=71863371;WS=71863353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr9	71865932	rs2282335	G	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=44;PP=1706;ReadPosRankSum=0.998;SC=GGGTGAAAACGTGTCATTGCT;SOR=1.003;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=111;WE=71865940;WS=71865922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,120:0.53:227
chr9	71986315	rs1034239	TG	CA	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=1632;SC=TTTAAAAAAATGTTCTCTTGG;SOR=3.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=35;WE=71986324;WS=71986305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	71990645	rs4351475	C	T	4622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=96;NR=51;PP=2956;SC=ACCTTTCCTCCGTTAAGGTGG;SOR=1.357;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=147;WE=71990653;WS=71990635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr9	72003036	rs867366	T	C	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=56;PP=2598;SC=TCAAAAGGGGTTGGCCAATGG;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=72003044;WS=72003026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	72064749	rs2781532	T	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=30;PP=729;SC=CCTCCATCAGTGACCATCTGG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=72064757;WS=72064739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	72132199	rs11139063	G	A	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=165;SC=CACTGGGCTGGAAAAACAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=72132207;WS=72132189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	72338180	rs11139996	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=376;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TAACTAACACTTTCTGCAGCT;SOR=0.919;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=20;WE=72338188;WS=72338170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr9	72338610	rs11139997	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=153;ReadPosRankSum=1.417;SC=TCTCCATTATTGCCTCTGATT;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=11;WE=72338618;WS=72338600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr9	72373624	rs10735564	A	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=32;NR=53;PP=1504;SC=TCATCACCTTAGAGGAAAAGA;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=85;WE=72373632;WS=72373614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	72374677	rs2274745	T	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr9	72374702	rs3831183	T	TGGACGCTTG	1381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=2897;ReadPosRankSum=0.354;SC=CGAGGTCGGGTGGACGCTTGG;SOR=0.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=14;WE=72374710;WS=72374692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr9	72374969	rs2252130	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	72472746	rs35585376	TA	T	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.084;NF=15;NR=1;PP=558;ReadPosRankSum=1.129;SC=GCCCAGCCCCTAAATTAGTTT;SOR=0.610;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=16;WE=72472754;WS=72472736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr9	72473053	rs1133275	TG	CA	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.539;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TCCTTTCACATGCACAACATT;SOR=2.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=7;WE=72473062;WS=72473043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr9	72501698	rs4407955	G	T	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=11;PP=1152;SC=CAATAAAAATGTAAAATATTT;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=72501706;WS=72501688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	72501962	rs4548246	T	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=468;SC=ATTGGAATCATGACAATGTTT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=72501970;WS=72501952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	72740974	rs1927112	A	G	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=16;PP=1005;SC=CACCATTCCCACTGGATTATT;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=72740982;WS=72740964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	72741312	rs1998972	G	A	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=566;SC=GTCGAGTTCAGTGCTCCTTAC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=72741320;WS=72741302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	72783608	rs10780871	T	C	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=35;PP=2280;SC=TTTATTTTTATGAATTTCAGG;SOR=1.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=119;WE=72783616;WS=72783598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	72785653	rs4744587	T	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=250;SC=CTTGTGTCTATAATGAAATGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=72785661;WS=72785643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	72882642	rs7027209	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=314;SC=ACCTAATATTATTATTGTTGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=72882650;WS=72882632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	72893298	rs10714271	GT	G	327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=282;SC=TATCTCAAATGTTTTTTTTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=72893306;WS=72893288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	72897434	rs1180116	G	A	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=51;PP=1892;SC=GCAGATTCCTGTAACATGTCG;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=98;WE=72897442;WS=72897424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	72901096	rs1180123	T	C	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=70;NR=70;PP=2840;SC=TCCCCCCCTCTCCCCGGTTTA;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=140;WE=72901104;WS=72901086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr9	72929503	rs10868801	T	C	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=193;SC=TACAGTATTATCACAGTAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=72929511;WS=72929493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	72933958	rs7025228	G	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=862;SC=AATAACAACAGCATTTCCACA;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=72933966;WS=72933948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	72965438	rs1536957	A	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=381;SC=ATCTCCTGTGACATAATCATA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=72965446;WS=72965428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	73002648	rs7020167	C	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=27;PP=1510;SC=GAGTACTTTTCTCCTTTCGGG;SOR=1.218;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=73002656;WS=73002638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	73150873	rs17535963	T	G	2974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1621;ReadPosRankSum=0.063;SC=GAAGGTTTAGTTGTGCTTGCT;SOR=0.345;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=217;TCF=125;TCR=92;TR=99;WE=73150881;WS=73150863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,135:0.51:267
chr9	73150918	rs41287373	C	T	2797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1558;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TCTGGACAGTCTCCTCATGGA;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=220;TCF=112;TCR=108;TR=97;WE=73150926;WS=73150908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,129:0.48:267
chr9	73150984	rs6560142	C	T	3692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=76;PP=2470;ReadPosRankSum=0.439;SC=GAAGGGATTTCGCAGGCTTGC;SOR=0.823;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=251;TCF=122;TCR=129;TR=142;WE=73150992;WS=73150974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,162:0.55:294
chr9	73151715	rs7033976	C	T	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=63;PP=2965;SC=TTGGCTCGCCCAGCCCAAGGA;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=145;WE=73151723;WS=73151705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr9	73151970	rs3739776	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=994;ReadPosRankSum=0.067;SC=TCATATTGACCGAATAGAAAG;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=57;WE=73151978;WS=73151960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,68:0.38:177
chr9	73164611	rs1889914	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.824;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr9	73164712	rs1889915	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=1.094;SC=AGATTCCTTGTTAAGTCTCAA;SOR=0.668;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=23;WE=73164720;WS=73164702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr9	73234066	rs7849400	G	A	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=968;SC=GACTTATAAGGTAAAAGTGGA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=73234074;WS=73234056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	73234884	rs3829095	G	C	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=10;PP=1384;SC=GCATCACTGGGGTGATACTGA;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=73234892;WS=73234874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	73240312	rs7035025	C	G	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=35;PP=1143;SC=AGGGATTCTACTTCACGTATT;SOR=1.371;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=55;WE=73240320;WS=73240302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	73250037	rs4322073	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=504;SC=GACAGGAATACTCTGGCAGCT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=73250045;WS=73250027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	73255337	rs1538670	A	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=1110;ReadPosRankSum=-1.278;SC=GGAGCTCAGGATACAGACTTT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=73255345;WS=73255327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,49:0.96:51
chr9	73255432	rs1538669	G	C	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=62;PP=2605;SC=AATACCCTTGGCCAACCAAAG;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=132;WE=73255440;WS=73255422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	73391409	rs34030044	C	CA	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.521;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TTGAGCTAGTCAAAAAATGAT;SOR=0.164;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=73391417;WS=73391399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr9	73408518	rs10868890	T	G	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=24;PP=1571;SC=TGATCAAACATTCCTCTTCCC;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=73408526;WS=73408508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	73442724	rs1034538	C	T	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=40;PP=2194;SC=TTCAGCATACCTCCTACGAGC;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=94;WE=73442732;WS=73442714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	73457832	rs1337031	G	A	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=13;PP=1139;SC=ATACTATAATGTGCACATTTT;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=73457840;WS=73457822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	73457861	rs1337030	A	G	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=24;PP=1672;SC=ATTTTATTATACTTTTCTGAT;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=73457869;WS=73457851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	73458045	rs3833697	T	TA	1064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.798;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.354;NF=6;NR=27;PP=722;ReadPosRankSum=1.050;SC=GAATAACACCTAAAAAAAAAA;SOR=2.159;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=33;WE=73458053;WS=73458035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
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chr9	73461558	rs10868907	G	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=11;PP=279;SC=ACTGGCTGAGGCTGGTTATCT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=73461566;WS=73461548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	73479213	rs10780981	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=305;ReadPosRankSum=-1.381;SC=ATAAGATTGCCTCAAAGATGT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=19;WE=73479221;WS=73479203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr9	74300640	rs2310021	A	G	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=27;PP=1676;SC=GAACTTCATGAAATAATACAA;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=68;WE=74300648;WS=74300630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	74314210	rs4263836	A	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	74326961	rs3739781	A	G	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=965;SC=TCCTTTTTTCACCATAGTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=74326969;WS=74326951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	74331267	.	GA	G	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=26;QD=17.5;SC=AATTAATCCAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=74331275;WS=74331257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr9	74331376	rs4745117	A	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=11;PP=769;SC=CAGAAAAAAAAATCAAGGGTT;SOR=1.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=37;WE=74331384;WS=74331366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	74349917	rs71353514	CAA	C	696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.607;HP=14;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=406;ReadPosRankSum=-0.560;SC=ACGCCTAAACCAAAAAAAAAA;SOR=4.798;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=22;WE=74349928;WS=74349907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr9	74477617	rs10573097	TAAGA	T	1435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=1150;SC=AAATCACTCTTAAGATTTTGT;SOR=2.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=74477628;WS=74477607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	74526540	rs4744647	T	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=9;PP=1223;SC=AGGCTGCGTTTGTTTCTTCCG;SOR=2.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=74526548;WS=74526530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	74526978	rs10580392	GCA	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=3;PP=109;SC=TTAACTAATTGCACAGAGTGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=74526987;WS=74526968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	74561883	rs10120169	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=15;PP=933;SC=GCTGGCTCACGCGTGAAATTC;SOR=1.559;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=74561891;WS=74561873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	74586309	rs7866397	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=GAAATTGAAACCTAGGAATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=74586317;WS=74586299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	74622941	rs11143055	G	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.887;NF=2;NR=4;PP=80;ReadPosRankSum=0.703;SC=TGCCCTCAGGGGACAGGGAGG;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=6;WE=74622949;WS=74622931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	74671719	rs13295099	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.368;NF=12;NR=10;PP=268;ReadPosRankSum=0.056;SC=GGACCTCTTCTTTCCAGTACT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=22;WE=74671727;WS=74671709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr9	74674427	rs7047632	A	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AAAATAAGGTACCTGTCTTTA;SOR=0.512;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=74674435;WS=74674417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr9	74675343	rs10869090	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=165;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GATAGTTAATACTTATTAAAA;SOR=0.268;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=12;WE=74675351;WS=74675333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr9	74675604	rs12345527	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=-0.186;SC=ACTTGAACACTCTGATCTGTT;SOR=0.976;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=74675612;WS=74675594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	74764627	rs3802506	C	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=618;ReadPosRankSum=1.248;SC=GAGCGCACTCCGACGGGCGGG;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=46;WE=74764635;WS=74764617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,72:0.41:175
chr9	74974534	rs3012505	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=587;SC=TAGAATATTTCCAAAATGAGC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=74974542;WS=74974524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	74975136	rs2809270	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.66;NF=18;NR=15;PP=697;SC=CACTAGCTGTTCCTATTTAAA;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=74975144;WS=74975126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr9	75242814	rs36038786	AT	A	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
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chr9	77257346	rs2273975	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=0.016;SC=AGTTTGGGAGGATGTCCAAGA;SOR=0.938;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=19;WE=77257354;WS=77257336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr9	77352133	rs10682495	A	ACT	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=537;ReadPosRankSum=1.171;SC=ATATAATTCAACTGTGAGCAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=13;WE=77352141;WS=77352123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr9	77376647	rs2274924	T	C	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=1838;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TTCTTTTTCTTTGACAGTCTC;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=123;TCR=78;TR=104;WE=77376655;WS=77376637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,114:0.50:226
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chr9	77703431	rs73544571	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=401;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GGGCGGAGCACTCGGCGGAGC;SOR=0.675;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=27;WE=77703439;WS=77703421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr9	77745424	rs2295861	T	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=349;ReadPosRankSum=-0.716;SC=CCCTAGGAGCTAGATAATTTG;SOR=1.151;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=20;WE=77745432;WS=77745414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr9	77752675	rs2025159	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=383;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GTATCATGGAATAGTTATGAT;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=21;WE=77752683;WS=77752665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr9	78506145	rs7020560	G	A	2589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=36;PP=1716;ReadPosRankSum=1.821;SC=TGGACCTGCTGTGCGTGCTGG;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=132;TCR=68;TR=110;WE=78506153;WS=78506135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,116:0.54:215
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chr9	78600898	rs4322070	C	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TAAGGAATCTCTGAGCACTTA;SOR=1.302;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=16;WE=78600906;WS=78600888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
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chr9	78790182	rs62556619	G	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=1.452;QD=8.06;ReadPosRankSum=-2.245;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr9	78790187	rs10118321	G	C	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=0.629;QD=6.32;ReadPosRankSum=-3.037;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr9	78799566	rs1537183	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=15;PP=902;SC=AACTGATTTACAACTTTCTCT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=78799574;WS=78799556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	78803466	rs7046850	T	C	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=21;PP=1190;SC=CAACAGTCTGTTTGAAGCTCC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=78803474;WS=78803456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr9	78809822	rs7019429	A	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=968;SC=GAGGAATACTATCAACATGGA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=78809830;WS=78809812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	78819998	rs10869732	T	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=20;PP=1413;ReadPosRankSum=0.750;SC=CTTTCCACACTCTCACCATAT;SOR=0.917;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=101;TCR=39;TR=78;WE=78820019;WS=78819988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,83:0.57:145
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chr9	78820211	rs17776998	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.644;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=578;ReadPosRankSum=2.319;SC=ATGAAGACCCGCCTATGCTGT;SOR=1.527;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=32;WE=78820219;WS=78820201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr9	78820270	rs10781345	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-2.076;SC=TCGCAGACCATAGAGGGCCCT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=78820278;WS=78820260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr9	78842380	rs1390141	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=585;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CAGGCTTGCCATGTAGAAATG;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=40;WE=78842388;WS=78842370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr9	78848542	rs903545	C	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=557;SC=CCGTCTTCTGCACCCCAAACC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=78848550;WS=78848532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	78853916	rs17062264	G	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=612;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GGGAGAGTGTGGAGATAGCTG;SOR=0.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=46;WE=78853924;WS=78853906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr9	78917015	rs11451259	T	TA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.974;SC=CTTTTTGCATTAAAAAAAAAC;SOR=2.584;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=78917023;WS=78917005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	78925814	rs2257775	C	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=463;SC=TCACTCTCCTCTGGTACTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=78925822;WS=78925804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	78936564	rs11144829	G	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=52;PP=1284;ReadPosRankSum=1.120;SC=AGGTACCTAGGAGCTTCCCAC;SOR=0.865;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=64;TCR=96;TR=84;WE=78936572;WS=78936554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr9	78937901	rs55903217	T	C	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.081;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.535;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr9	78937901	.	TAC	CAT	1058	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.36;NF=21;NR=1;PP=1058;QD=50.5212670392;SC=GGAGCTAGCCTACTGCAGACA;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=22;WE=78937911;WS=78937891;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,22:0.44:50
chr9	78937903	rs55805812	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.081;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.535;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr9	78937929	rs56332566	AC	A	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=6;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.249;NF=15;NR=10;PP=665;ReadPosRankSum=1.223;SC=CCTTTCTCCTACCCCCCGGGG;SOR=1.171;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=25;WE=78937937;WS=78937919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
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chr9	78938043	rs2495207	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=865;ReadPosRankSum=0.445;SC=GCAGACTCGCGCCACTGTGTC;SOR=0.718;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=56;WE=78938051;WS=78938033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
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chr9	79003440	rs2501924	G	A	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=361;SC=AGCAGTAGTAGTATTTAAGAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=79003448;WS=79003435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr9	79318375	rs11267615	GGTGACAGCCTGCAAC	G	2150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.503;NF=9;NR=26;PP=2930;ReadPosRankSum=1.221;SC=CATTGTCATGGGTGACAGCCT;SOR=0.778;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=24;TCR=79;TR=35;WE=79318397;WS=79318365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr9	79318471	rs560094	C	T	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=927;ReadPosRankSum=2.432;SC=CCTCTAGTGCCAAAGATTCTA;SOR=0.629;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=58;WE=79318479;WS=79318461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr9	79318677	rs561970	T	C	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1470;ReadPosRankSum=-1.437;SC=CTCGTATCGCTTTTAGAAGAC;SOR=0.914;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=201;TCF=107;TCR=94;TR=95;WE=79318685;WS=79318667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,112:0.47:237
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chr9	79320095	rs3739524	T	G	3135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=2149;ReadPosRankSum=0.149;SC=GCTCTCTCAGTAAATCTTCAT;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=247;TCF=131;TCR=116;TR=124;WE=79320103;WS=79320085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,142:0.49:289
chr9	79320640	rs512110	C	T	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=56;PP=1330;ReadPosRankSum=0.135;SC=TTATGAGAGGCGGGCTGAGAG;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=45;TCR=102;TR=82;WE=79320648;WS=79320630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr9	79320847	rs2077181	G	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=457;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TCAGTCTCTTGCTTTGCTTCA;SOR=1.670;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=25;WE=79320855;WS=79320837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr9	79321276	rs517634	T	C	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1104;ReadPosRankSum=2.083;SC=GTAAAGGCTGTGTCCGGATGA;SOR=0.696;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=80;WE=79321284;WS=79321266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr9	79322674	rs680775	A	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1021;ReadPosRankSum=0.893;SC=ATCTCAGAACATGTGCTGCTG;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=66;WE=79322682;WS=79322664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
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chr9	79324439	rs12238013	A	G	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1794;ReadPosRankSum=-1.069;SC=GGTTCCAGGAATCTACCTTTT;SOR=0.649;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=246;TCF=126;TCR=120;TR=114;WE=79324447;WS=79324429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,136:0.47:287
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chr9	79814799	rs12552898	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=0.814;SC=TGAAGCATACATATTAACTTT;SOR=0.180;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=79814807;WS=79814789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr9	79820141	.	C	CT	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=311;ReadPosRankSum=0.587;SC=ATTATCTCTTCAATGCCTGAC;SOR=0.223;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=9;WE=79820149;WS=79820131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr9	79827964	rs17723908	G	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TACTGTGTTTGTCAACTCATG;SOR=1.158;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=21;WE=79827972;WS=79827954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr9	79835101	rs3802497	TT	CA	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.020;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=552;ReadPosRankSum=1.326;SC=TATGGTAGCATTTCCCTAAAA;SOR=1.893;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=12;WE=79835110;WS=79835091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr9	79835293	.	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=378;ReadPosRankSum=-1.649;SC=CACCATGCCAGAGAATGGTAA;SOR=0.317;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=22;WE=79835301;WS=79835283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr9	79862319	rs41289961	C	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=-0.943;SC=AAGGTATATACTAATAATATT;SOR=0.696;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=27;WE=79862327;WS=79862309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr9	79867082	rs17337881	A	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=6;PP=891;ReadPosRankSum=0.626;SC=GTGACTATGAAGTATTAATAG;SOR=1.319;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=71;TCR=13;TR=48;WE=79867090;WS=79867072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
chr9	79888146	rs17063468	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=272;ReadPosRankSum=-0.951;SC=TTGAATAAGCGGTGAATAAAC;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=19;WE=79888154;WS=79888136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr9	79895012	rs17423029	T	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.484;SC=TTAATAAGATTGCTTGCATTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=79895020;WS=79895002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr9	79910414	rs1317304	G	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=206;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TTAATAAGTCGTATTTATTAA;SOR=0.298;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=16;WE=79910422;WS=79910404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr9	79922839	rs2275549	A	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GCTAAAAAGAACAAATCTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13;WE=79922847;WS=79922829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr9	79946961	rs17424026	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=236;ReadPosRankSum=-1.248;SC=TGTCTGTTTACGAAGGGGATA;SOR=0.489;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=15;WE=79946969;WS=79946951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr9	79968293	.	G	GT	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5296;HP=15;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=16;MQ=58.25;NF=2;NR=1;PP=28;QD=10.3333333333;SC=TAATTTTTTGGTTTTTTTTTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=79968301;WS=79968283;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr9	79968611	.	G	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.017;SC=TAATTGTTAAGAAATTGTTAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=79968619;WS=79968601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr9	79974399	rs7043232	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TTTAAATGTTGGACAAGTCAA;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=79974407;WS=79974389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr9	80018376	rs12352196	G	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=8.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=1.437;SC=AGCCTAACTCGCTAAACATTA;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=80018384;WS=80018366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr9	80022415	rs2025846	A	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=264;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CAACCAGATTATCTTTTTAAT;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=16;WE=80022423;WS=80022405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
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chr9	80049298	rs1801258	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=484;ReadPosRankSum=-2.643;SC=TGGCAGAGTCCGACAGCTGGT;SOR=0.406;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=32;WE=80049306;WS=80049288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
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chr9	80868354	rs3824547	G	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=2.170;SC=CACAGTATAGGCGTGTGGATA;SOR=1.347;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=80868362;WS=80868344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr9	80912115	rs2277148	G	C	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=806;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TCACCGCCCTGGCCGCCGCAC;SOR=0.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=48;WE=80912123;WS=80912105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,62:0.67:92
chr9	80919756	rs3739474	T	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=-0.113;SC=GAAGGTGTGCTGACTATGTGG;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=15;WE=80919764;WS=80919746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr9	80921446	rs944513	G	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=271;ReadPosRankSum=0.455;SC=CTGACTCGGTGTCTGCAGGGA;SOR=0.489;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=19;WE=80921454;WS=80921436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr9	80923609	rs2039323	CA	TG	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=437;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CGGTGGCTCACACCTGTAATC;SOR=0.914;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=80923618;WS=80923599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr9	80932574	rs3780194	T	A	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=240;ReadPosRankSum=2.423;SC=ACGGATTTTTTAAAAATCTTC;SOR=0.598;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=20;WE=80932582;WS=80932564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr9	82006446	rs11138190	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.005;NF=15;NR=5;PP=341;ReadPosRankSum=-1.275;SC=GGCACACACAGGGTCACGCCG;SOR=1.088;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=20;WE=82006454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr9	82187750	rs1934610	A	G	12968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=189;NR=220;PP=2965;SC=CCAGACACCCAGTGAGTGCGG;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=409;TCF=189;TCR=220;TR=409;WE=82187758;WS=82187740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,496:1.00:496
chr9	82189914	rs2791566	T	C	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=65;PP=2180;SC=AACAAGAATATGTTTAAATTG;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=82189922;WS=82189904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	84202837	.	G	GTGTGTCATCCCGCC	1431.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.23;MQRankSum=-0.570;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,46:0.92:50
chr9	84207898	rs7023704	C	G	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=822;ReadPosRankSum=1.377;SC=ATTGAATCTCCAGGGAGAAAT;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=60;WE=84207906;WS=84207888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr9	84215034	rs2777781	A	T	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=52;PP=1673;SC=CAAGGCTCCTAAACAGGACAA;SOR=1.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=88;WE=84215042;WS=84215024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	84235255	rs55712377	G	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr9	84235728	rs59790457	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=514;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GTGCTTCTGTCCTATTTACTG;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=39;WE=84235736;WS=84235718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,51:0.36:143
chr9	84248203	rs113273526	CGTGTGTGTGTGT	C	287.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.140;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr9	84267021	.	T	TAC,TACAC	393.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.18;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=6,6;NR=4,4;PP=273,156;SC=AACGTTAAGATACACACACAC;SOR=1.371;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=10,10;WE=84267029;WS=84267011;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:17
chr9	84267147	rs2228173	T	C	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=42;PP=1774;SC=TGGCATTCAATTCTGCCATGG;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=86;WE=84267155;WS=84267137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	84268716	rs144566392	TAC	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TCACCATTTCTACAGTGTGCC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=84268725;WS=84268706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	84275014	rs2627002	C	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=493;SC=AGCTTTCTACCTAAAAGCCTT;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=84275022;WS=84275004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	84275095	rs2796450	C	T	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=34;PP=1680;SC=ATTTCTTTGCCGTACCTCCCC;SOR=1.157;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=88;WE=84275103;WS=84275085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	84300493	rs141894076	AC	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=0.528;SC=TAGCATACAAACCCCCACCCC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=84300501;WS=84300483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	84302499	rs72749007	A	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=287;ReadPosRankSum=0.254;SC=GCCCTTCACTATGGGGAGGGG;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=23;WE=84302507;WS=84302489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr9	84302920	rs72749008	G	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=1.465;SC=CGGTATAGACGTCAAGTAGGA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=84302928;WS=84302910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr9	84302950	rs72749010	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=1.485;SC=AAGGGAGGGAGAAAATTAAGA;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=84302958;WS=84302940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr9	84303026	rs2279353	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=357;ReadPosRankSum=1.236;SC=CACCGCTGAGGGCGAGAAGGT;SOR=0.839;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=28;WE=84303034;WS=84303016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr9	84604599	rs145158256	TAATG	T	1411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=1130;ReadPosRankSum=0.524;SC=TATTCTTGTATAATGAATGAA;SOR=1.056;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=25;WE=84604610;WS=84604589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr9	84606647	rs112107496	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.157;NF=11;NR=7;PP=343;ReadPosRankSum=0.272;SC=CAAGTCAAAAAAAGGGGTGAT;SOR=1.127;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=18;WE=84606655;WS=84606637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr9	84607758	rs10867826	T	A	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.532;NF=22;NR=44;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.740;SC=GTCCGGAGACTTCTTCAGACA;SOR=1.009;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=66;WE=84607766;WS=84607748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr9	85597720	rs66792515	CAGAG	C	3195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=62;PP=2951;SC=TAGAGAGAGACAGAGAGAGAG;SOR=3.973;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=93;TCF=6;TCR=87;TR=64;WE=85597733;WS=85597710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	85619330	.	T	TTTTATTCTATTA	1163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=1443;SC=TATTCTATTATTTTAATCCAC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=85619338;WS=85619319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	85619351	rs141850659	ATTTAC	A	1980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=11;PP=696;SC=CTCCAAGGAAATTTACTTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=85619363;WS=85619341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	85627408	rs4146960	G	A	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=36;PP=1275;SC=TGACTTACGCGTTTTGATTGT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=85627416;WS=85627398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	85627540	rs10121395	A	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=264;SC=CCAATTTTCAACATTATGCAA;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=85627562;WS=85627530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	85627554	rs4146961	C	T	319.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=242;SC=TATGCAACTTCATAAATCATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=85627562;WS=85627530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	85630621	rs1976455	C	T	3491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=28;PP=2351;SC=CTGATCTATCCGCCACTTCAA;SOR=1.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=106;WE=85630629;WS=85630611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	85677254	rs142099428	AGG	A	2964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=15;PP=1066;SC=AGAGAAGACTAGGGGGGGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=49;WE=85677263;WS=85677244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	85905666	rs942283	A	G	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=35;PP=1135;SC=CAAGCCAGACAGAGTTGGTTT;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=50;WE=85905674;WS=85905656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	85905737	rs942282	C	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=440;SC=TTTGTGTCTACAGGGAACTAC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=85905745;WS=85905727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	85905786	rs942281	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=77;SC=TAAAGATGACGTAACATTCAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=85905794;WS=85905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	85913590	rs11140011	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=635;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TCACTACACAAAGGGATGTTA;SOR=0.629;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=41;WE=85913598;WS=85913580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr9	85914243	rs1359168	A	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TGTGCACACAAAATATAAGAA;SOR=0.551;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=11;WE=85914251;WS=85914233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr9	85924600	rs374884095	GT	G	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.489;NF=0;NR=4;PP=135;ReadPosRankSum=1.345;SC=TTTTCCATGGGTTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=85924619;WS=85924590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	85924611	rs1535749	T	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.489;QD=20.22;ReadPosRankSum=2.369;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	85925309	rs11140018	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=664;ReadPosRankSum=0.507;SC=GTCATGGTCTTTGGCGACTAC;SOR=1.055;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=35;WE=85925317;WS=85925299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr9	85946923	rs17402202	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=0.662;SC=TCTGGCAAATCCAAGTTTCTG;SOR=0.634;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=11;WE=85946931;WS=85946913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr9	85987879	rs57558822	GA	G	1375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.619;NF=8;NR=44;PP=712;ReadPosRankSum=1.127;SC=TGCTAGGGAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.914;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=52;WE=85987888;WS=85987869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
chr9	85987935	rs3739657	T	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=43;PP=1305;SC=AACGAATACCTAATAACTAAA;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=85987943;WS=85987925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	85987997	.	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.368;NF=1;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.091;SC=CAGAATTCCACACTCTGAAGA;SOR=0.743;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=85988005;WS=85987987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr9	86004993	rs7853850	C	T	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=35;PP=1862;SC=ACACATACAACGGCCTAACTG;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=92;WE=86005001;WS=86004983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	86153159	rs4529536	T	G	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=615;ReadPosRankSum=-0.350;SC=ACCGCGGCCGTGGGGAGCGAG;SOR=0.729;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=41;WE=86153167;WS=86153149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,41:0.39:105
chr9	86238086	rs2811903	T	C	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=41;PP=1762;SC=GAGCTTGGGTTATGGCGGCGC;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=86238094;WS=86238076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	86241489	rs2780977	A	G	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=161;SC=GCACCACCACACCCAGCTAAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=86241497;WS=86241479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr9	86354511	rs4750	G	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr9	86403646	.	C	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.544;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.151;SC=ATCACATGAGCAAAATAACCA;SOR=1.627;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=16;WE=86403654;WS=86403636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr9	86468715	rs295274	A	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.159;NF=20;NR=48;PP=1105;ReadPosRankSum=0.039;SC=CCAAAGCTTCAATCCCTTCTT;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=39;TCR=98;TR=68;WE=86468723;WS=86468705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,74:0.51:144
chr9	86474115	rs55654273	T	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.327;NF=34;NR=35;PP=1024;ReadPosRankSum=2.220;SC=TCATCCACATTGTGTCTGCGT;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=69;WE=86474123;WS=86474105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr9	86474411	rs11999592	T	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.120;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.646;NF=0;NR=27;PP=613;ReadPosRankSum=-0.179;SC=ATTATTGTTTTCTCCCATGGA;SOR=4.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=27;WE=86474419;WS=86474401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr9	86503542	rs11140284	C	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.276;NF=14;NR=27;PP=698;ReadPosRankSum=-2.473;SC=CTTATTTGTTCGTGTTTTCTA;SOR=0.281;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=41;WE=86503550;WS=86503532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
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chr9	86909399	rs7030202	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTGTCTTCTATGGTGAGCTT;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=86909407;WS=86909389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr9	86917301	rs10868138	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=-2.333;SC=CATAACCAGATAACCTGTCCA;SOR=0.314;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=17;WE=86917309;WS=86917291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr9	86920236	rs7867504	T	C	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=908;ReadPosRankSum=2.069;SC=AACCACATACTGTGTCATACC;SOR=1.067;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=76;WE=86920244;WS=86920226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,90:0.52:173
chr9	87285915	rs1187326	C	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=50;PP=1595;SC=CTCCTTGCCCCTAGGGCCCGA;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=66;WE=87285923;WS=87285905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr9	87360106	rs144586764	ACACCT	A	2192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=37;PP=2302;SC=TAGGGTGTTAACACCTAGGTT;SOR=3.442;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=38;WE=87360118;WS=87360096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr9	88401021	rs11141102	A	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.140;NF=27;NR=13;PP=726;ReadPosRankSum=0.201;SC=TTTAGATCATAAGGCTGGAGA;SOR=0.444;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=40;WE=88401029;WS=88401011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
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chr9	88667582	rs10780743	T	G	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=69;PP=2135;SC=TACAAACCAATGATGGGGCCT;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=106;WE=88667590;WS=88667572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	88667628	rs11794444	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=671;ReadPosRankSum=0.773;SC=GGAAGGAGCTCGCACTCAGCG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=38;WE=88667636;WS=88667618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr9	88842230	.	T	TTTTA	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=59.16;NF=2;NR=0;PP=32;QD=20.0;SC=CTCAGCTAATTTTTATTTATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=2;WE=88842238;WS=88842220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
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chr9	88924985	.	CT	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr9	88941549	rs791312	C	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=0.899;SC=ACAATGTCACCACTGTAAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=28;WE=88941557;WS=88941539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr9	88943171	rs791314	T	C	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1027;ReadPosRankSum=0.800;SC=GTAAAGATAGTTAAGGAAAGA;SOR=0.492;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=126;TCF=91;TCR=35;TR=63;WE=88943179;WS=88943161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr9	88952313	rs10512175	A	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=478;ReadPosRankSum=0.337;SC=CAGATATATAAGCAAAAAAAA;SOR=0.393;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=37;WE=88952321;WS=88952303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr9	88959938	rs791323	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=705;ReadPosRankSum=-1.351;SC=GTTTAATTTCCAGCCTCTGTT;SOR=0.801;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=44;WE=88959946;WS=88959928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr9	89763851	rs458983	C	G	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=64;PP=2083;SC=TCATGGGCCCCGGCTTTACAA;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=108;WE=89763859;WS=89763841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	90256827	rs3118846	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=636;SC=AAATTGTCATATAACACATTT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=90256835;WS=90256817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	90258248	rs3793657	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CTGCCTTTTTCCTCCCCGCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=90258270;WS=90258238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr9	90258262	rs10630837	C	CT	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=0.626;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr9	90258412	rs10561388	CTT	C	2639.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=2359;ReadPosRankSum=-1.207;SC=CCTGGTGCTCCTTTCTTAGCA;SOR=0.529;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=10;TCR=83;TR=38;WE=90258423;WS=90258402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
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chr9	90474105	rs146503815	GGGAAGGCCTCAC	G	842.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=2934;ReadPosRankSum=0.308;SC=CCAGCCAGCTGGGAAGGCCTC;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=14;WE=90474124;WS=90474087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
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chr9	90559129	rs7027067	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CTGGCAGCCCGGAGAGGAAGG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=8;WE=90559137;WS=90559119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr9	92011763	rs13283585	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=687;ReadPosRankSum=-0.541;SC=GCAGGGAAGAGAAATGCACCA;SOR=0.907;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=41;WE=92011771;WS=92011753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
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chr9	92785610	rs586750	G	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.465;SC=AGTGATACCTGGACTCACTCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=92785618;WS=92785600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr9	93624755	rs914928	T	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=410;SC=AGGCCAGCAGTAGCTCTGGAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=93624763;WS=93624745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	93629347	rs1760124	G	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=409;SC=GTAGCATGTCGTGGAAGGGAT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=93629355;WS=93629337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	93629789	rs965892	C	G	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=59;PP=1981;SC=TTATCATGTCCGAAAATCTTT;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=98;WE=93629797;WS=93629779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	93636431	rs290228	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=651;ReadPosRankSum=-0.496;SC=ATGCAGATCAACTTAACAGTT;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=39;WE=93636439;WS=93636421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr9	93636664	rs290227	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=0.694;SC=TCCACACCACGTCCGTGATTG;SOR=0.970;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=17;WE=93636672;WS=93636654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr9	93637282	rs290226	G	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=0.456;SC=TAATGAAAGCGTCCATTACCT;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=93637290;WS=93637272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr9	93639803	rs1760132	A	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=20;PP=1470;SC=AGATTATCTAAAAGTGAGGCA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=93639811;WS=93639793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	93639846	rs290223	C	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=781;ReadPosRankSum=1.092;SC=TATGATTTCTCTTGCAGAGTT;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=54;WE=93639854;WS=93639836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr9	94087622	rs7874056	T	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=767;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TCACTGCTCTTATTTTGGAGA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=46;WE=94087630;WS=94087612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr9	94118106	rs7019926	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=267;ReadPosRankSum=0.046;SC=GGAAAACAGATTACTATTGAG;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=16;WE=94118114;WS=94118096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr9	94172975	rs33973463	C	T	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.338;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=68;PP=1821;ReadPosRankSum=1.066;SC=CATCAAGAGACGCCTGCTCCT;SOR=0.884;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=193;TCF=79;TCR=114;TR=112;WE=94172983;WS=94172965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,125:0.56:222
chr9	94456490	rs923772	A	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=363;SC=CCCTATCTCCATCAACAGGAA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=94456498;WS=94456480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	94456643	rs923771	G	C	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=22;PP=826;SC=CCCAGGGTCTGTCATGCGGTT;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=94456651;WS=94456633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	94456705	rs923770	T	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	94456714	rs923769	C	T	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.45;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	94484928	rs1135169	A	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=513;ReadPosRankSum=-1.333;SC=GGATTTACAAATAGGACCAAC;SOR=0.543;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=39;WE=94484936;WS=94484918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,53:0.37:144
chr9	94485928	rs2230578	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=729;SC=CCCCGAACCCCGGGCCCTGGT;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=94485936;WS=94485918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	94486321	rs10761129	C	T	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=41;PP=1610;SC=TTGACGGGGACGTAGAGCTGC;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=94486329;WS=94486311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	94486622	rs2230577	G	A	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1355;ReadPosRankSum=1.031;SC=ACACCCAGGCGGGACAGTCAT;SOR=0.499;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=153;TCF=85;TCR=68;TR=77;WE=94486630;WS=94486612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,88:0.49:178
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chr9	94985485	.	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.875;SC=AGAAAAGCCTGTGGTTGCTCC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=94985493;WS=94985475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr9	95219597	rs4744132	G	A	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=31;PP=1384;SC=CAAGCTGAACGCTCATTCTGC;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=95219605;WS=95219587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr9	95256519	rs331380	C	T	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=55;PP=1919;SC=TGCTGACTCACCTTATTCAGT;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=88;WE=95256527;WS=95256509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr9	95766471	rs6479445	A	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.063;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=-1.599;SC=TCTCTAGACCAGGGTTCATGT;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=28;WE=95766479;WS=95766461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr9	95780465	rs7048975	A	G	6280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=114;PP=2965;SC=TCATCATAACAGGAAGAAAAA;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=98;TCR=114;TR=211;WE=95780473;WS=95780455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr9	95784485	rs10821054	A	T	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr9	95797999	rs4073460	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=23;PP=624;SC=GCTCAGGACACTTGGCTTTGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=95798007;WS=95797989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	95838036	rs147788846	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	95838070	rs1131768	G	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=305;ReadPosRankSum=0.789;SC=CCCCAGGCACGTGCGCTAAGC;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=17;WE=95838078;WS=95838060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr9	95872744	rs3819011	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=2;PP=1102;SC=GGTGTCCTGACACCCAACAGG;SOR=4.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=95872752;WS=95872737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	95872885	rs17593496	C	T	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1645;ReadPosRankSum=0.434;SC=GTGTGCGGCTCTGTGACCTCC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=226;TCF=103;TCR=123;TR=110;WE=95872893;WS=95872875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,118:0.45:264
chr9	95874070	rs2027585	G	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=488;SC=GGCCCCAGGAGGCAGCAGCAA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=95874078;WS=95874060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	95874428	rs10821071	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=1.981;SC=ACTCCCCTGCGCAGCCCCCAG;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=95874436;WS=95874418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr9	95875447	rs12003264	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=878;ReadPosRankSum=0.260;SC=CGAGCCGGCCCGCCAAGGGGA;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=60;WE=95875455;WS=95875437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr9	95875556	rs2298242	G	A	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=560;SC=TAAATGTTCAGGTTCTCTCAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=95875564;WS=95875546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	95875575	rs2298243	G	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=213;SC=AGCCTGCCTCGTTCCTCAGTC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=95875583;WS=95875565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	95887108	rs13299270	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=-2.026;SC=GCCAGGGACTCACCACACTGC;SOR=0.452;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=17;WE=95887116;WS=95887098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr9	95887154	rs13298119	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=738;ReadPosRankSum=0.527;SC=CAGGACTGCAGGCCTCGCGCC;SOR=1.417;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=39;WE=95887162;WS=95887144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr9	95887320	rs2275848	G	T	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=75;PP=2170;ReadPosRankSum=1.358;SC=GGCGTGCTTGGCCGGGTTGTT;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=102;TCR=144;TR=127;WE=95887328;WS=95887310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,150:0.50:302
chr9	95888667	rs12235416	T	C	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=31;PP=1625;ReadPosRankSum=-1.717;SC=GCAGGTGGCCTGGCTGCCCCC;SOR=0.937;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=211;TCF=138;TCR=73;TR=101;WE=95888675;WS=95888657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,123:0.50:245
chr9	95947478	rs141292063	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CGGAGCGCGCCCGCGGACGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=95947486;WS=95947468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	95991895	rs7874101	T	C	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=14;PP=950;ReadPosRankSum=-1.005;SC=GGTCCTACTGTGTGGCGCTGC;SOR=0.873;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=128;TCF=95;TCR=33;TR=60;WE=95991903;WS=95991885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
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chr9	95993326	rs11787888	T	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=0.629;SC=CAACTGGGTCTGTGAAGATTG;SOR=0.786;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=33;WE=95993334;WS=95993316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
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chr9	96024859	rs1936403	A	G	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=27;PP=1803;SC=GGGCTGAGGAAGTGGGGAGGG;SOR=1.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=96024867;WS=96024849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr9	96025052	rs7857220	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=419;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GGCGCAGGCCTGTACAGCCAC;SOR=1.345;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=26;WE=96025060;WS=96025042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr9	96025717	rs10649709	C	CAG	1616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=26;NR=5;PP=1546;SC=TCGCACAGGACGGGCTGCCTC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=31;WE=96025725;WS=96025707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	96025771	rs6479467	G	A	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=28;PP=1384;SC=GACTGTTCCAGATAAGCTGAC;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=67;WE=96025779;WS=96025761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	96026122	.	T	TG	256	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=256;QD=47.0;SC=GGGGGAGGGGTACTTGGGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=96026130;WS=96026112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr9	96030230	rs7856268	T	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=68;PP=2429;SC=TGGGAGGTGGTGAGAGTGCAG;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=118;WE=96030238;WS=96030220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	96031262	rs1936401	T	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=48;PP=1489;SC=CCCCACCAAGTAGGTGGCTCG;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=96031270;WS=96031252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	96051521	rs2169756	A	G	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=16;PP=1123;SC=CCTTGGGTCAACCTGCTCCCC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=96051529;WS=96051511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	96052179	rs2306183	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=282;ReadPosRankSum=1.079;SC=TGAGATGAGGGGAGTGGATTT;SOR=1.352;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=19;WE=96052187;WS=96052169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr9	96080699	rs36081907	C	T	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=812;ReadPosRankSum=1.518;SC=GGCTGAGAGACGGCGGGACGC;SOR=0.580;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=53;WE=96080707;WS=96080689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr9	96082752	rs6479474	G	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=461;ReadPosRankSum=1.485;SC=TGCTCCTCCTGTCCAGTTCAC;SOR=1.054;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=34;WE=96082760;WS=96082742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr9	96082919	rs13293217	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.175;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GGGATGTGACAGGGGTGGGGG;SOR=0.587;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=96082927;WS=96082909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr9	96097662	rs4744219	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=6.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.71;MQRankSum=-1.582;QD=11.93;ReadPosRankSum=2.242;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr9	96097747	rs78436873	C	T	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.40;QD=26.28;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
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chr9	96210931	rs189322509	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.586;SC=ATGGAGTCTCGCTCTGTTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=4;WE=96210939;WS=96210921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr9	96398508	rs2398851	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=0.186;SC=AGGTCGAGGTAGGGGGTTGAC;SOR=0.257;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=16;WE=96398516;WS=96398498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
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chr9	96420390	rs3763605	A	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=369;ReadPosRankSum=-1.129;SC=TGTGGGCAGCAGGCACCCACC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=30;WE=96420398;WS=96420380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
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chr9	96425138	rs3750358	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-0.423;SC=TCAAGAGAGTTCCACCAGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=96425146;WS=96425128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	96425363	rs3750359	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=845;ReadPosRankSum=1.817;SC=GTGAGTGTGAGCAGAGGTGAA;SOR=0.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=55;WE=96425371;WS=96425353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr9	96425777	rs7036592	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=-1.246;SC=GGCTCAGGGACGGCCCTGGTC;SOR=0.141;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=96425785;WS=96425767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr9	96439004	rs149736720	C	CCCTGCCTCCACCACA	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.576;NF=2;NR=8;PP=1388;ReadPosRankSum=-1.072;SC=CCTCTACCACCCCGGCCTCCA;SOR=0.790;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=10;WE=96439012;WS=96438994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr9	96581606	.	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=0.491;SC=CTCCACTGTGGAGGTGCCACA;SOR=0.435;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=11;WE=96581614;WS=96581596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr9	96581893	rs4743934	A	G	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=193;SC=CACCAGCCCCACCAAGCACAG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=96581901;WS=96581883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	96714491	rs11793856	C	G	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GCACCTCCGCCGGTTTCTCTG;SOR=0.900;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=98;TCR=67;TR=83;WE=96714499;WS=96714481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,96:0.47:204
chr9	96714981	rs12684081	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=791;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CCAGGAAGCTGAGGGGTGGGA;SOR=0.960;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=48;WE=96714989;WS=96714971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,50:0.41:122
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chr9	97221434	rs9409765	G	A	4155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=52;PP=2536;SC=TGTTTTCCACGTTCAACAGGG;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=123;WE=97221442;WS=97221424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
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chr9	97329737	rs10657369	C	CAG	2520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.781;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=1581;ReadPosRankSum=0.258;SC=AGCCAGGAAACAAGCCAACCG;SOR=0.357;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=39;WE=97329745;WS=97329727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,65:0.54:120
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chr9	97369149	rs1769259	C	T	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=27;PP=1668;SC=GTCAAAGTCCCTGGCGTAGCC;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=97369157;WS=97369139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	97372172	rs3739747	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=6.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=352;ReadPosRankSum=2.356;SC=AGACACCAGCCAAGCCCCCAG;SOR=2.833;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=17;WE=97372180;WS=97372162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr9	97419969	rs189264778	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=0.816;SC=TTTCACATGTCTATACCCATG;SOR=1.066;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=23;WE=97419977;WS=97419959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
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chr9	97426330	.	TA	T	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.94;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
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chr9	97572147	rs356126	C	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=0.426;SC=GTGCCCTGGGCTCCCTTCAGC;SOR=0.327;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=16;WE=97572155;WS=97572137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr9	97768286	rs10761364	T	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=1.541;SC=ACCTAGACTTTAAATTGGAGT;SOR=0.549;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=32;WE=97768307;WS=97768276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr9	97822941	rs1888944	T	C	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=77;PP=2583;SC=ATCAACTGAATGGCATTTTCA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=159;WE=97822949;WS=97822931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	97849090	rs4657	A	G	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=19;PP=861;SC=CCCTGTTCACATCTTGGTGCT;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=97849098;WS=97849080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	98218474	rs5899258	G	GC	4826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=36;PP=2957;SC=CAGGGAGAATGCAAGGTTCCC;SOR=1.646;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=88;WE=98218482;WS=98218464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	98221861	rs2236406	T	C	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=174;SC=TTCCCAGACCTCCCGATAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=98221869;WS=98221851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	98224360	rs2274692	C	G	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=45;PP=1366;SC=GCTGAGGAGACTGAGCAGGGC;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=98224368;WS=98224350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	98229297	rs2274693	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=478;SC=ACACGTCAGTGTTACATTCTA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=98229305;WS=98229287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	98229389	rs2066829	C	G	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=26;PP=2338;SC=GCCTCCCACGCCGTCTTACCC;SOR=2.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=101;WE=98229397;WS=98229379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	98230924	rs35352942	AT	A	640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=4;PP=280;SC=CTTAAACGAAATTTTTTTTTT;SOR=3.180;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=19;WE=98230932;WS=98230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	98238358	rs2066836	G	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=20;PP=1254;SC=GGATTAACGCGGCCATGAAGA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=98238366;WS=98238348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	98240120	rs2297086	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=10;PP=294;SC=TACATCAAGGGCGTCACATAA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=98240128;WS=98240110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	98242112	rs2274694	A	G	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=571;SC=ATTTCTTAATATTCTATGACG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=98242120;WS=98242102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	98242925	rs2297087	A	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=38;PP=1101;SC=AACGCATCGTAAAGTAACACG;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=98242933;WS=98242915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	98242984	rs2297088	G	A	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=243;SC=CAATGCTGCAGTTCTGGGACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=98242992;WS=98242974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	98270320	rs148507954	AGTGAGTGT	A	537.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.889;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.957;NF=14;NR=2;PP=780;ReadPosRankSum=-0.997;SC=GAGAGGTGTGAGTGAGTGTGT;SOR=4.294;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=16;WE=98270337;WS=98270310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr9	98270646	.	T	TGCC	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=3;PP=152;SC=GAGGCCATGTTGCCGCCGCCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=98270654;WS=98270636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	98278644	rs28591501	C	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=3;PP=594;SC=GCTCGCTCCTCCGTCCGCCGC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=98278652;WS=98278634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	98638288	rs690528	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=401;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CGGGTGTTACATGCAGCCGGG;SOR=1.092;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=32;WE=98638296;WS=98638278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr9	98638437	rs117599634	T	C	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.025;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1065;ReadPosRankSum=1.578;SC=TTCTTGCCGGTGCCCTTCGGG;SOR=0.920;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=83;WE=98638445;WS=98638427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,113:0.51:220
chr9	98678164	rs683829	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=166;ReadPosRankSum=-0.307;SC=AGCTGAATACGGTCTTGTTTG;SOR=0.275;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=98678172;WS=98678154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr9	98694641	rs10760675	T	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr9	98703621	.	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TTACTTTGATGAAATTAATGC;SOR=1.688;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=16;WE=98703629;WS=98703611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr9	98997910	rs8190570	ATCTTTGTGG	A	2406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.008;NF=2;NR=35;PP=2971;ReadPosRankSum=0.828;SC=ACCTCAGTTCATCTTTGTGGT;SOR=0.574;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=6;TCR=85;TR=37;WE=98997926;WS=98997900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr9	99003264	rs2066485	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-0.589;SC=AACACTCAAGCCCCCATCCCA;SOR=0.795;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=21;WE=99003272;WS=99003254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr9	99013663	rs408876	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=375;ReadPosRankSum=1.310;SC=CAGAACCTGGATAAGAGGAAT;SOR=0.957;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=21;WE=99013671;WS=99013653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
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chr9	99060882	rs3925451	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=464;SC=TCCAGCCCACGCCCTTGAAGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=99060890;WS=99060872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr9	100054705	rs2615143	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=0.405;SC=GCCTTGTAAGTGTAAAGCATG;SOR=0.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=100054713;WS=100054695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr9	100074446	rs3747504	C	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=627;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AGAACACCATCGCTGCCCGAG;SOR=0.887;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=48;WE=100074454;WS=100074436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
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chr9	100092968	rs113264216	A	AGAGGAG	1073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=2.665;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.735;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr9	100105442	rs13286510	T	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCCAGATTTTTGTGTAGAACT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=100105450;WS=100105433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr9	100105735	rs1947717	T	C	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1707;ReadPosRankSum=-1.316;SC=AAGAGCATTGTAGGAAGTCCC;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=203;TCF=97;TCR=106;TR=97;WE=100105743;WS=100105725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,103:0.42:243
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chr9	100116833	rs10125198	G	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=709;ReadPosRankSum=-1.236;SC=GCTTTTATTTGTCTTTGATTA;SOR=0.955;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=39;WE=100116841;WS=100116823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,43:0.42:103
chr9	100117342	rs2306094	C	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=488;ReadPosRankSum=2.365;SC=CACCTGCACACCAGGCACTGT;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=26;WE=100117350;WS=100117332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr9	100122291	rs3747495	T	C	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=767;ReadPosRankSum=-1.476;SC=ACTCCTCAGCTTCGTCCAAAC;SOR=0.437;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=50;WE=100122299;WS=100122281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
chr9	100124787	rs3802471	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=-0.555;SC=AGGCAGGAGATGACCTATGGC;SOR=0.073;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=100124795;WS=100124777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr9	100132194	rs2169456	C	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=1.192;SC=CTTACCCGCACTTCTGGCAGA;SOR=1.863;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=9;WE=100132202;WS=100132184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
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chr9	100133093	rs2306092	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CAGTCCAGGCATGCTCCAAAT;SOR=0.502;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=5;WE=100133101;WS=100133083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr9	100194406	rs2045732	T	C	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=69;PP=2965;SC=GGAAACTCTGTTGGAGTTAAG;SOR=1.195;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=111;TCR=70;TR=180;WE=100194414;WS=100194396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
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chr9	100204202	rs17332899	C	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=0.540;SC=CCTCCCTGCCCAACTTTGAGA;SOR=0.963;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=19;WE=100204210;WS=100204192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr9	100227423	rs4743099	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-0.838;SC=ATAATTAAATGTAGTTTTCAA;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=100227431;WS=100227413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr9	100234545	rs12002057	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=407;ReadPosRankSum=0.272;SC=TTCTAATTAAGTAGAAATTAA;SOR=0.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=30;WE=100234553;WS=100234535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr9	100234756	rs41281938	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=526;ReadPosRankSum=1.889;SC=TATGTGACAAGTCACTAGAGG;SOR=0.879;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=34;WE=100234764;WS=100234746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr9	100237817	rs146681272	G	GT	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr9	100361864	rs958346	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=929;ReadPosRankSum=-0.058;SC=ACAGTGCTGGCCCCTGGTCTA;SOR=0.872;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=58;WE=100361872;WS=100361854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,71:0.50:142
chr9	100366953	rs2805779	A	G	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=900;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TTTCTAGAATAGTGAACTGAC;SOR=0.514;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=58;WE=100366961;WS=100366943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr9	100388197	rs2773347	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=646;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GAATAGCTGCCGACAGCATTT;SOR=1.391;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=37;WE=100388205;WS=100388187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr9	100407561	.	C	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=38;PP=827;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TTACTGAATCCTGGTACTTCC;SOR=1.463;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=98;TCF=20;TCR=78;TR=44;WE=100407569;WS=100407551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr9	100428977	rs10116536	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.849;SC=AAATTACAAAAGTTGAAAGAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=100428985;WS=100428967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr9	100433233	rs2805837	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=0.989;SC=GGGGTCCATTGTTCCTATCAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=100433241;WS=100433223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr9	100459578	rs1800975	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=282;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CCGCCATCTCTGGCCCACTCC;SOR=0.749;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=28;WE=100459586;WS=100459568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr9	100616066	rs1867280	G	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=157;SC=CTGGGCTCTCGGGGCCAGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=100616074;WS=100616058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	100616583	rs3021523	T	C	7461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=156;PP=2965;SC=ACTGGGCGCTTGACCCCAACG;SOR=1.456;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=73;TCR=156;TR=229;WE=100616591;WS=100616573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr9	100616700	rs71369530	AGCCGCC	A	418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=394;SC=CGGCTGCCGCAGCCGCCGCCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=7;WE=100616713;WS=100616690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	100617021	rs3021526	C	T	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=23;PP=956;SC=CCAACCCCTCCGCCTATGCGG;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=100617029;WS=100617011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	100617375	rs7046645	T	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=778;SC=TTCCCCGCAATCTGAGAACGA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=100617383;WS=100617365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr9	100675944	rs2120263	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-1.327;SC=CACAAATTAACAGAAATCATG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=100675952;WS=100675934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr9	100819192	rs3739670	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=810;ReadPosRankSum=1.617;SC=GCGACCTGGACGTAGCCAAGC;SOR=0.835;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=51;WE=100819200;WS=100819182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
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chr9	100823084	rs13049	T	C	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=46;PP=1815;SC=CTGATTGTGCTAAGTTCCAGA;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=95;WE=100823092;WS=100823074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	100823135	rs1058446	G	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=-0.978;SC=AAGCCTTGGAGAGGCCATACA;SOR=1.206;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=29;WE=100823143;WS=100823125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr9	100843417	rs4237190	A	G	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=66;PP=2298;SC=GAAAAAGGATAGGCTGGCCTG;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=118;WE=100843425;WS=100843407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	100849500	rs1059273	G	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=428;ReadPosRankSum=1.300;SC=TTAAAGTAGTGTAAGTGATGG;SOR=0.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=28;WE=100849508;WS=100849490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr9	100854765	rs10818475	C	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=10;PP=725;SC=ATTGGGGCCGCAGCTCACTCA;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=100854773;WS=100854755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	100854920	rs4743163	C	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1217;SC=GTTCGGCCTACATATTTTTCT;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=100854928;WS=100854910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	100881525	rs2761063	C	G	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=31;PP=1070;SC=CCAAGGGAAACCGAAACCTCG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=100881533;WS=100881515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	100963653	rs3739668	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=575;SC=GTTCAACAGCTCTGACAAGTA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=100963661;WS=100963648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	100965472	rs3739667	C	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=30;PP=1582;SC=AATGGAAGCCCGAGAGATTCC;SOR=1.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=83;WE=100965480;WS=100965462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	100970881	rs10985441	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=338;SC=GCCTGTCCACAGTCTGAGGGT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=100970889;WS=100970872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	100971348	rs3739666	T	C	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=76;PP=2161;SC=GTGACTCCAATGCCTGGATCT;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=130;WE=100971356;WS=100971338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	100973178	rs3832623	A	AGAGGCCT	1445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.202;NF=0;NR=24;PP=1475;ReadPosRankSum=0.404;SC=GGGCCGCCCCAGAGGCCTGAG;SOR=1.364;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=24;WE=100973186;WS=100973168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr9	100975694	rs7854249	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=0.317;SC=GCATGATGTGGTAAAGGGACC;SOR=0.859;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=15;WE=100975702;WS=100975684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr9	100983566	rs7855855	C	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=829;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CTGGGCGCCACAGTGGGGTAT;SOR=0.365;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=46;WE=100983574;WS=100983556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr9	101006443	rs10818669	T	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=311;ReadPosRankSum=-1.244;SC=ATCCATCAGCTGGGTCACTGC;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=31;WE=101006451;WS=101006433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr9	101052858	rs2304391	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=-1.425;SC=GGCCCAGGCCTCCCACCCTTA;SOR=0.986;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=16;WE=101052866;WS=101052848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr9	101243021	rs2779547	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=2;PP=539;SC=TCCTCGATGATGGTATTGTTC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=101243029;WS=101243012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr9	101258881	rs1000440	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=16;PP=467;SC=GGGAAGTCAATTGGGCAAAGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=101258889;WS=101258871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr9	101539601	rs4742741	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=797;SC=TACAAAGACAGACAAACACCT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=101539609;WS=101539591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	101544627	rs7020056	A	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=7;PP=374;SC=GACACTTGAGAGTGACTTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=101544635;WS=101544617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	101552955	rs7027771	T	C	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=59;PP=1973;SC=TATGTCATCCTTAATTGGCAT;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=101552963;WS=101552945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	101553014	rs7038640	G	T	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=37;PP=1089;SC=TTATTCTGGCGCCAGGCACTG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=101553022;WS=101553004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	101585444	rs2295922	G	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=694;SC=GTCCCCTTCCGCAGGGGACCA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=101585452;WS=101585434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr9	101748356	rs2075663	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=0.717;SC=TGGAATCTTCATGGGCAATGC;SOR=0.785;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=24;WE=101748364;WS=101748346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr9	101749498	rs2075664	C	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.927;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TCTCCATTGCCAAAACAATCA;SOR=1.239;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=61;WE=101749506;WS=101749488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
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chr9	101763294	rs3831245	C	CT	932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=775;ReadPosRankSum=1.059;SC=TTATTTCAAACTTGGTGATGA;SOR=0.576;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=21;WE=101763302;WS=101763284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
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chr9	101767382	rs41316954	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.752;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr9	101767385	rs41305481	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr9	101778346	rs35529307	C	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=431;ReadPosRankSum=-1.356;SC=AGCCCTCCCCCTGATGGGCCA;SOR=0.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=33;WE=101778354;WS=101778336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
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chr9	101810339	rs869776	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=24;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TGAGAGAGTGTGGGGTCCACA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=3;WE=101810347;WS=101810329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	101814626	rs4142986	C	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GCAAACACCACGGCAGAGCTT;SOR=0.416;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=18;WE=101814634;WS=101814616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr9	102068058	rs184437	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=0.612;SC=GCTTACATGAACAAGGCAGAA;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=102068066;WS=102068048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr9	102068832	rs170462	G	A	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=22;PP=959;SC=GTGGTTGTGAGGAAGATCGAG;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=102068840;WS=102068822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr9	102595685	rs10988904	C	T	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TGATGAATGCCCTTGTCCGAG;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=84;WE=102595693;WS=102595675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,98:0.46:213
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chr9	102691042	rs145402404	CTTCT	C	994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=645;ReadPosRankSum=2.173;SC=TAATACCTCCCTTCTTTCTTT;SOR=0.655;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=14;WE=102691053;WS=102691032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
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chr9	103015184	rs2245216	T	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=28;PP=2282;SC=TTTGTGCTTTTCCAGGTGGAG;SOR=1.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=99;WE=103015192;WS=103015174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	103054941	rs76868679	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.892;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,31:0.30:103
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chr9	103108941	rs2151131	C	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=23;PP=1429;ReadPosRankSum=0.234;SC=TTCAATACAGCAAAACTGTGT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=114;TCR=46;TR=82;WE=103108949;WS=103108931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
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chr9	103204577	rs35438121	C	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=43;PP=1033;ReadPosRankSum=-1.401;SC=CGGAGCAGCTCTACTTCCTGC;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=71;WE=103204585;WS=103204567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,84:0.44:191
chr9	103207654	rs73655549	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=467;ReadPosRankSum=0.120;SC=GAGGCTCATAGGCACTTGAAA;SOR=0.339;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=25;WE=103207662;WS=103207644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr9	103235853	rs77849433	G	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.900;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=380;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTGAGGCGCCGCTCCGGCTGC;SOR=1.398;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=27;WE=103235861;WS=103235843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
chr9	103260966	.	T	TAC	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.206;NF=7;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=1.447;SC=GACTTTTTCATACACACACAC;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=103260974;WS=103260956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr9	103312290	rs2274882	C	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=465;ReadPosRankSum=1.436;SC=TTAAGAAGAACTTGGAATAAT;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=22;WE=103312298;WS=103312280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
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chr9	104238142	rs15889	A	C	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1103;ReadPosRankSum=0.591;SC=GGCCAACTTCAGAAAGGCATC;SOR=0.679;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=172;TCF=104;TCR=68;TR=81;WE=104238150;WS=104238132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,96:0.45:214
chr9	104335682	rs3739722	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=510;ReadPosRankSum=-1.646;SC=CTGGTGGATCCGGATGCCCAG;SOR=1.101;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=32;WE=104335690;WS=104335672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr9	104449063	rs2506354	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=42;PP=1930;SC=GAGCAATGAGCCCTAAGGGCA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=104449071;WS=104449053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr9	105405214	rs34690795	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr9	107266774	rs1949755	C	G	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=986;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CCTCTTCTGCCCTCTCTCCAA;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=61;WE=107266782;WS=107266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr9	107266844	rs1403812	A	G	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=794;ReadPosRankSum=1.051;SC=CGCCACTCAGATGTACCTCTC;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=43;WE=107266852;WS=107266834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr9	107266909	rs41277751	G	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.95;MQRankSum=-1.063;NF=25;NR=19;PP=735;ReadPosRankSum=-1.797;SC=CATATGACCGGTATGTGGCCA;SOR=0.823;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=44;WE=107266917;WS=107266899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr9	107266943	rs1403811	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=839;ReadPosRankSum=1.093;SC=GAGATACCCTGTCATCATGAA;SOR=1.007;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=50;WE=107266951;WS=107266933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr9	107267304	rs7030820	C	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=51;PP=1371;ReadPosRankSum=0.665;SC=TTCTATGGGACGGCTCTCTCC;SOR=1.295;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=178;TCF=75;TCR=103;TR=78;WE=107267312;WS=107267294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,87:0.44:196
chr9	107331504	rs7026705	C	A	5164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=55;PP=2965;SC=GGGCTTTCTGCCCACCCAAAG;SOR=1.485;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=110;TCR=55;TR=165;WE=107331512;WS=107331494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr9	107360922	rs1851724	A	G	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=76;PP=2713;SC=CTTCATGTACATGAGGAAGAT;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=138;WE=107360930;WS=107360912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	107361312	rs1851723	T	C	8612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.589;NF=125;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TCTCAGAGGGTTGCAGATAGC;SOR=0.317;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=125;TCR=157;TR=281;WE=107361320;WS=107361302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,298:1.00:299
chr9	107361439	rs4629933	G	C	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.35;QD=41.28;SOR=1.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	107361449	rs146576115	T	C	5679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.21;QD=46.56;SOR=2.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	107361451	rs201540433	GC	AG	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.87;QD=45.51;SOR=2.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	107361460	rs116283639	G	A	4909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.24;QD=45.04;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	107361490	rs7042502	A	T	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.49;MQRankSum=1.829;QD=29.84;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr9	107361642	rs1851722	G	A	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=48;PP=2084;SC=TGGGTGACCAGAAAGTCCCTT;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=116;WE=107361650;WS=107361632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	107367132	rs10820679	G	A	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=68;PP=2740;SC=TGGGCTTCATGTACATGAAGA;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=136;WE=107367140;WS=107367122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	107368000	rs13289190	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=606;SC=ATGAATATGTATCATAATCCC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=107368008;WS=107367990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	107379895	rs10761054	G	T	7657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=102;PP=2965;SC=CAAGCATGAGGAACTCATTGC;SOR=0.951;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=133;TCR=102;TR=235;WE=107379903;WS=107379885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr9	107380396	rs36091517	T	G	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=54;PP=2658;SC=TTATGAAGATTAGCACAAAAA;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=126;WE=107380404;WS=107380386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	107456933	rs12347076	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.672;NF=29;NR=13;PP=732;ReadPosRankSum=-1.253;SC=ATAGCCTCCTCATTATCATCA;SOR=0.948;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=42;WE=107456941;WS=107456923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr9	107457532	rs10761073	C	T	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1187;ReadPosRankSum=0.828;SC=TCAGCGCACTCGATTGTGGTC;SOR=0.852;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=77;WE=107457540;WS=107457522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,101:0.46:219
chr9	107457725	rs12338899	G	A	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=-1.675;SC=GCAGACATCTGCATTTATTGA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=31;WE=107457733;WS=107457715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr9	107510145	rs3753024	G	C	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=39;PP=1290;SC=TACCGGCCACGGGGGTACCCA;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=107510153;WS=107510135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	107510178	rs147856422	AGGGGC	A	3697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=39;PP=2089;SC=ACGGGAGGGGAGGGGCGGGGC;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=107510190;WS=107510168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr9	107531152	rs10761084	G	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=625;ReadPosRankSum=-1.204;SC=AGATAATTTTGCTCATCGAGC;SOR=0.420;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=35;WE=107531160;WS=107531142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr9	107531361	rs2472478	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=-1.549;SC=AGACCTAAAGTTATAAAGAGT;SOR=0.737;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=15;WE=107531369;WS=107531351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
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chr9	107548493	rs2740485	G	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=512;SC=TTCCCTTTATGTTAGAGGCAC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=107548501;WS=107548483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	107562804	rs2230808	T	C	3583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=31;PP=2447;SC=GACATTATTTTTGGTGTCCAG;SOR=1.629;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=102;WE=107562812;WS=107562794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	107566877	rs2777801	C	A	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=36;PP=1954;SC=AGTAATAATACGGCAGGGGCC;SOR=1.104;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=107566885;WS=107566867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	107581749	rs2254884	A	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=1.383;SC=CTCTTCTGTGATAACAGAAGA;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=107581757;WS=107581739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr9	107585016	rs3818689	G	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=174;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AAGGACACAGGGCACTGCGCT;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=15;WE=107585024;WS=107585006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr9	107586753	rs2066714	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=351;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TACTTTCTGATATTCTCTTCT;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=26;WE=107586761;WS=107586743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr9	107588033	rs2066715	C	T	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=420;ReadPosRankSum=-0.327;SC=ATCATGGAGACCGAAGTGGTG;SOR=0.764;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=32;WE=107588041;WS=107588023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr9	107591272	rs2853579	G	T	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=743;ReadPosRankSum=-0.264;SC=TAAACCAGAGGATGCTGTTGT;SOR=0.455;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=50;WE=107591280;WS=107591262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr9	107593182	rs4743763	A	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=181;ReadPosRankSum=-0.256;SC=ACTGGTTAAAAACAGTGGCTT;SOR=0.960;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=13;WE=107593190;WS=107593172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr9	107599390	rs2297399	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.420;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GGAGTCAGGTGGGGAGCCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=107599398;WS=107599380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr9	107599438	rs4149346	G	GC	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.008;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-0.592;SC=GACAATGAGCGTTTGGCTCCT;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=107599446;WS=107599428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr9	107602813	rs2067484	A	AT	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=355;ReadPosRankSum=-1.023;SC=GGCGTCAGGGATGGGGACAGA;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=107602821;WS=107602803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr9	107620867	rs2230806	C	T	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=1063;ReadPosRankSum=1.107;SC=CAGTTTCTCCCTTGGTAGGCC;SOR=0.575;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=60;WE=107620875;WS=107620857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr9	107621140	rs2243313	A	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-0.924;SC=CTTTACTGAAACTCAGAATGT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=107621148;WS=107621130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr9	107624029	rs2230805	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=-1.706;SC=GGTTGTGATACAGGAACCCAG;SOR=0.231;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=17;WE=107624037;WS=107624019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr9	107624123	.	CA	C	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5003;HP=15;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=29;QD=10.6666666667;SC=GTAAGTAACTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=107624131;WS=107624113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	107651526	rs2275545	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=0.542;SC=TAATATGGATATCCAATGCCA;SOR=1.340;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=28;WE=107651534;WS=107651516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,36:0.38:96
chr9	107665739	rs2575876	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=-0.032;SC=TGCCATATCCGGACCACACAG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=16;WE=107665747;WS=107665729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr9	108060515	rs2036876	G	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=20;PP=657;SC=CTAGGAACAAGATGAAAATGC;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=108060523;WS=108060505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr9	108152199	rs2771040	G	A	5730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=81;PP=2965;SC=AGTAATGCTGGGAGGAATAAA;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=184;WE=108152207;WS=108152189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
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chr9	110047316	rs10739234	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.935;SC=TACATCTTTAATTTTTTAAGA;SOR=0.765;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=110047324;WS=110047306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr9	110084328	rs1805329	C	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=907;ReadPosRankSum=0.330;SC=AGTACTGGGGCTCCTCAGTCT;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=56;WE=110084336;WS=110084318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr9	110086149	rs1805334	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=577;ReadPosRankSum=0.256;SC=CTTTTGTTTAGAAATGTTTAT;SOR=0.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=27;WE=110086157;WS=110086139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr9	110093970	rs3056494	CA	C,CAA	698.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.040;HP=15;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18,18;NR=25,25;PP=473,365;ReadPosRankSum=0.798;SC=AAACTGGAAACAAAAAAAAAA;SOR=0.604;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=43,43;WE=110093978;WS=110093956;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.61:57
chr9	111616818	rs3750466	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=2.000;SC=GACTCCCCCCTACCCTCTGCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=111616826;WS=111616808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr9	111625913	rs4978370	A	G	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1535;ReadPosRankSum=0.052;SC=GCTTCTGAACAGCGACGAGGA;SOR=0.566;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=63;TCR=112;TR=102;WE=111625921;WS=111625903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,124:0.57:218
chr9	111631647	rs3763644	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=0.996;SC=CTGGAGGCCCCGCCCTGAGAG;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=13;WE=111631655;WS=111631637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
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chr9	111641627	rs2275496	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-1.863;SC=ATTCTCCCCACTCCCACTACA;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=111641635;WS=111641617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	111642535	rs7874280	T	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.572;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=584;ReadPosRankSum=0.543;SC=AGGGTTAAAATTCAGCAAAAA;SOR=1.282;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=34;WE=111642543;WS=111642525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr9	111644243	rs7046977	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=2.139;SC=CAAGAATGATAAAAATGATTT;SOR=1.329;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=14;WE=111644251;WS=111644233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr9	111653574	rs1063110	C	G	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TGCCACATGTCAGAAAGGCTG;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=69;WE=111653582;WS=111653564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr9	111661150	rs4978760	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.584;SC=ATGCCAAGCTGCTATCACTGG;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=7;WE=111661158;WS=111661140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	111665719	rs17792422	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TAAAGCTTAGGGTTTTCCAGG;SOR=0.031;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=5;WE=111665727;WS=111665712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr9	111670707	rs838824	T	C	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=102;PP=2965;SC=AATGCAAATATTATCATCGTA;SOR=1.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=41;TCR=102;TR=143;WE=111670715;WS=111670697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr9	111673580	rs11791215	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=0.638;SC=TAACTTTCAATGTTTTTCTCA;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=111673588;WS=111673570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr9	111678428	rs1772046	T	A	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1051;SC=CCCATACCTGTCTACTTTCAA;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=111678436;WS=111678418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	111679964	rs56125645	C	CA	1664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=1369;ReadPosRankSum=0.746;SC=AAAGCAAACTCAGAGTGTTAC;SOR=0.815;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=34;WE=111679972;WS=111679954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr9	111688767	rs2275635	C	T	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1332;ReadPosRankSum=0.398;SC=TGGGAAGAAACGTAGGTCACA;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=88;WE=111688775;WS=111688757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,96:0.50:193
chr9	111712910	rs2780334	G	C	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=40;PP=1666;SC=ACGAGCACAGGATCCCTCACT;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=111712918;WS=111712900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	111746607	rs838838	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=194;ReadPosRankSum=0.651;SC=TATTACACAGTAAAACCAAAA;SOR=0.454;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=15;WE=111746615;WS=111746597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr9	111754288	rs838836	T	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=877;SC=AATTTTGTAGTTGTGGATAAT;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=111754296;WS=111754278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	111775547	rs10538092	AAGG	A	3574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.546;NF=23;NR=30;PP=2188;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CCGCGGCGGGAAGGAGAAGAG;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=53;WE=111775557;WS=111775537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr9	111775767	rs7032236	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CCGCGGCGAGCCTGCCGCCAG;SOR=1.828;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=16;WE=111775775;WS=111775757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr9	111782670	rs10816767	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=494;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GAAGGGCAGAGGGCCACAGCT;SOR=0.207;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=32;WE=111782678;WS=111782660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr9	111782867	rs11791093	G	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=0.396;SC=GCCCTAATGAGATTATATAGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=111782875;WS=111782857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr9	111795561	rs7866253	C	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr9	111795565	rs7852550	T	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.062;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr9	111798751	rs2256253	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=331;ReadPosRankSum=-1.360;SC=TCCTCAACAACTTCCAACAAA;SOR=1.688;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=18;WE=111798759;WS=111798741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr9	111800196	rs672973	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CCAAAAAATTTAGTTTTTTAA;SOR=0.188;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=111800204;WS=111800189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr9	111800234	rs534286	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=513;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TTTCCTAGATGTATGTAAAAT;SOR=0.733;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=27;WE=111800242;WS=111800224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr9	111800267	rs7029890	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=800;ReadPosRankSum=-0.782;SC=CTTAAATAGCGAATAGTGGAA;SOR=0.372;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=50;WE=111800275;WS=111800257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr9	111812825	rs614253	C	T	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=92;PP=2965;SC=GGAAATATGACGTGTACTTAT;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=188;WE=111812833;WS=111812815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr9	111835614	rs11792149	T	C	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=805;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ATCTCTCTTCTTTTTCAAAAC;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=49;WE=111835622;WS=111835604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,62:0.42:148
chr9	111843055	rs497196	A	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=451;SC=GCTAGCTTTTAATCCAGACTA;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=111843063;WS=111843045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	111848470	rs7031485	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TAAAATCAACGGAATGTAGTA;SOR=2.517;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=18;WE=111848478;WS=111848460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr9	111868698	rs7871742	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=0.998;SC=TTTTAAATAGATTCAAAGCTG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=111868706;WS=111868688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr9	111881927	rs6825	T	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=992;ReadPosRankSum=-1.529;SC=AAGTGCCGCATAGCACGGCCC;SOR=0.681;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=58;WE=111881935;WS=111881917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,75:0.52:144
chr9	111882167	rs12001627	G	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=295;ReadPosRankSum=0.087;SC=GGCTTGGCGCGTCCTTAGGGC;SOR=0.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=20;WE=111882175;WS=111882157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr9	111882355	rs10710804	GA	G	573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=386;SC=TCCCGAAGGGGAAATGGGGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=111882363;WS=111882345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr9	111903890	rs11421991	G	GA	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.151;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=3.690;NF=1;NR=10;PP=102;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AAATGATTGAGAAAAAAAAAA;SOR=1.796;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=11;WE=111903898;WS=111903880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
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chr9	111929420	rs10979723	CG	GC	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=3;PP=125;SC=CCGCGCCATCCGTGCGCACAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=111929429;WS=111929410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	111936732	rs10733569	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=616;SC=TGGGCGAACAGAGCACACACT;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=111936740;WS=111936722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	111936788	rs10979727	C	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=21;PP=1216;SC=AGAAAGAAGACGGACAGAAGG;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=111936796;WS=111936778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr9	111945166	rs10122682	A	G	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=76;PP=2630;SC=AAATGGAACCAAAGGATTCAG;SOR=1.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=117;WE=111945174;WS=111945156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	111956599	rs3750447	G	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=19;PP=739;SC=CTTGTGTGGCGGCCGTTGTGG;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=111956607;WS=111956589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	112020668	rs745388	T	C	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=824;ReadPosRankSum=0.083;SC=TGCATCATTATAAAGCACAGC;SOR=0.530;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=48;WE=112020676;WS=112020658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr9	112020713	rs893917	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=33;PP=1101;SC=TCCTTTCGGGAAGACTTAACT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=112020721;WS=112020703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	112025473	rs1982226	C	A	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=187;SC=AAAGGTAGCGCTATTTAGATA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=112025481;WS=112025463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr9	112042298	rs10979794	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=-1.408;SC=TAAATTGCATACATGTCAGCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=112042306;WS=112042288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr9	112069477	rs13290752	T	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.710;SC=TACAATCCTTTCCCTTTTAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=112069485;WS=112069467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr9	112069507	rs200080250	CT	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.169;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chr9	112151349	rs1371787	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGGGCTGAGCCTCCCGTCACT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=112151357;WS=112151344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr9	112170701	rs35463120	T	TAAAC	1266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.041;NF=0;NR=26;PP=955;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TTTTTTAAGTTAAACAAACAA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=26;WE=112170709;WS=112170691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr9	112172477	rs2275699	T	G	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=907;ReadPosRankSum=0.150;SC=GCCCTGGGTGTGTGGATCACC;SOR=1.131;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=52;WE=112172485;WS=112172467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr9	112199105	rs13284236	T	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=574;ReadPosRankSum=-3.198;SC=TTTTTCAAACTCTCAGAGATT;SOR=0.783;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=41;WE=112199113;WS=112199095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr9	112199146	rs4978809	A	G	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=26;PP=1163;ReadPosRankSum=0.641;SC=GAGCCAAGACATAACAAGAAT;SOR=0.874;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=158;TCF=105;TCR=53;TR=82;WE=112199154;WS=112199136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,98:0.53:186
chr9	112199408	rs10979864	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=245;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CTACTAAAGCAAGTTTTTATT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=112199416;WS=112199398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr9	112219474	rs3793524	C	G	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.860;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.295;SC=TTCCTGATGGCTTTGCTTGCT;SOR=0.475;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=86;WE=112219482;WS=112219464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,110:0.51:215
chr9	112225531	rs62576448	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=-1.429;SC=CTATTTGTTAGGAGCATTAAT;SOR=2.066;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=112225539;WS=112225521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr9	112225774	rs2274786	T	C	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=723;ReadPosRankSum=-1.042;SC=ATATGCGAATTGTCAGTTACT;SOR=0.734;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=59;WE=112225782;WS=112225764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
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chr9	112629397	rs7044189	G	A	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=41;PP=1266;SC=GGATTGAGACGTTTTTATTCT;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=67;WE=112629405;WS=112629387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr9	112778444	rs10116779	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTCTCTACTCACTGAGGTCTT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=112778452;WS=112778434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr9	112778461	rs12685739	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.558;SC=TCTTAGGGAGGCAACCGTACA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=112778469;WS=112778451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr9	112852530	rs10759388	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=1.599;SC=CCCCTGAAATCCTGTGACCTG;SOR=2.517;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=112852538;WS=112852523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr9	112898327	rs1475612	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=523;SC=CTTCCTCTTAATTATGAGTCA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=112898335;WS=112898317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	112899361	rs4978872	A	C	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=730;ReadPosRankSum=0.675;SC=GCTGCTGCAGAAGCAGTTACA;SOR=0.359;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=48;WE=112899369;WS=112899351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr9	112900341	rs150402481	G	GGAAGCT	1664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CGACTGTAGAGGAAGCTGAAG;SOR=1.105;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=21;WE=112900349;WS=112900331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
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chr9	112918531	rs10759392	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=0.679;SC=TTTATTTGCCAGTTTTCTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=13;WE=112918539;WS=112918521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr9	112918581	rs7862044	T	C	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=406;ReadPosRankSum=0.509;SC=AAAGGGTATTTTCTTCGTGTT;SOR=0.773;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=27;WE=112918589;WS=112918571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr9	112924558	rs2148989	A	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-1.889;SC=CTGTTCTGAAATATGGGACTG;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=112924566;WS=112924548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr9	112963504	rs10120707	A	G	7166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=112;PP=2965;SC=GGAGCCTTTGATCAGATCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=112;TCR=112;TR=224;WE=112963512;WS=112963494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr9	113006420	rs5843	A	G	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=26;PP=2043;SC=GGCTGGTTATATTTTCAGAAA;SOR=1.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=71;TCR=26;TR=97;WE=113006428;WS=113006410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	113006579	.	T	TTATATATATACATATACATATG	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.52;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	113007289	rs4135220	T	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=63;PP=1907;SC=TATAATGGCATTACAAAAGCC;SOR=2.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=78;WE=113007297;WS=113007279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	113007319	rs4135219	TGAA	T	1628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=33;PP=1697;SC=ATATTCTCAATGAAGAAGTTT;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=33;WE=113007329;WS=113007309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr9	113086123	rs73526779	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=219;ReadPosRankSum=0.251;SC=TTCCCAAATTCAAATCCAGTG;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=17;WE=113086131;WS=113086113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr9	113091653	rs10980325	A	C	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=114;SC=TCAGTAGAAAAGAAAATTGAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=113091661;WS=113091643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	113132221	rs17204533	G	A	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=45;PP=1889;SC=GTTATGTCCCGTCCAAGAAGA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=102;WE=113132229;WS=113132211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	113192655	rs2986671	T	G	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=27;PP=1834;SC=AAATGTGACTTCGGCACCTAC;SOR=1.361;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=84;WE=113192663;WS=113192645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	113192785	rs3739447	A	T	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=64;PP=1941;SC=AACCATGCAAAGTCTCACAGC;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=99;WE=113192793;WS=113192775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	113207962	rs7847560	A	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=520;SC=TACGTTCTTAAAGAACTTGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=113207970;WS=113207959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr9	113213726	rs4421419	A	G	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=137;PP=2965;SC=AACTTGACAGAACTTTAAGAC;SOR=1.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=86;TCR=137;TR=223;WE=113213734;WS=113213716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
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chr9	113233720	rs10980402	G	A	7571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=132;PP=2965;SC=AATTGCTGTCGGCTATAAGTA;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=90;TCR=132;TR=222;WE=113233728;WS=113233710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr9	113233956	rs7860284	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=274;SC=TTTTACCAAACAGAAATACTT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=113233964;WS=113233946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	113243820	rs3818766	G	A	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=406;SC=CCTGTCTATCGCTATTTCTAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=113243828;WS=113243810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	113261483	rs872665	C	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GATATGATGACATCTTTGGGC;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=56;WE=113261491;WS=113261473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr9	113276356	rs3818764	C	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=-2.754;SC=TCCTGGTGAGCCTTCAGGTTT;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=28;WE=113276364;WS=113276346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr9	113308284	rs2991363	A	T	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=6;PP=1164;SC=TGTGCCACTGACCCCACACAC;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=113308292;WS=113308274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	113445108	rs75001517	A	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=501;ReadPosRankSum=0.769;SC=TAATTTTTTTAAATTTTTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=24;WE=113445116;WS=113445098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr9	113449271	rs7869057	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.591;SC=TTATTCAGAAGTCACTCAAGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=113449279;WS=113449269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr9	113457726	rs10980531	G	A	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=760;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AAATAATAGAGGGATTAAAAG;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=47;WE=113457734;WS=113457716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr9	113490776	rs10817087	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=0.191;SC=TGTCATTTAACAGTTTGCTTT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=113490784;WS=113490766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	113538347	rs11349092	AT	A	374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=15;PP=237;SC=GGCATTTCTAATTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=16;WE=113538355;WS=113538337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	113547001	rs572189	A	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=1;PP=927;SC=TAAATATATTATTATCATGAA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=113547009;WS=113546991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	113547322	rs484010	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=639;SC=CAGCTAACCATGTGTAGTAAT;SOR=4.548;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=29;WE=113547330;WS=113547312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	114090279	rs314452	A	G	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=70;PP=2965;SC=AGGAGACCGTAGCCATCCGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=141;WE=114090287;WS=114090269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	114124456	rs3837272	GA	G	92.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.180;NF=0;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=1.465;SC=GATTCTGCATGAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=114124464;WS=114124446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr9	114125835	rs2297524	A	G	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=19;PP=928;SC=ACATGGCTTTATGGTCCCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=114125843;WS=114125825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	114128759	rs41312224	C	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=684;ReadPosRankSum=-1.879;SC=TAAAATGCTGCGGGGAGGAAC;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=51;WE=114128767;WS=114128749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,54:0.42:130
chr9	114301585	rs10441737	C	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=12;PP=884;SC=CTATTTATTACGCATTAAATT;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=114301593;WS=114301575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	114311918	rs76345666	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=177;ReadPosRankSum=0.528;SC=GGCAGCGGTCGTGGTGGTGGT;SOR=0.530;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=16;WE=114311926;WS=114311908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr9	114341033	rs17320021	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=160;ReadPosRankSum=-0.644;SC=CTTTATATAGTACTTCCATAA;SOR=0.049;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=12;WE=114341041;WS=114341023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr9	114348513	rs2273786	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=372;ReadPosRankSum=-2.397;SC=GAGTCAGGATGCTGTGTGGTT;SOR=3.357;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=19;WE=114348521;WS=114348503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr9	114356659	rs3739703	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=0.537;SC=GTTGAGAAACCACCCATGAGG;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=21;WE=114356667;WS=114356649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr9	114359624	rs1053959	C	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=365;ReadPosRankSum=0.586;SC=GGGAGCTCAGCTGTCTTCAAC;SOR=0.789;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=24;WE=114359632;WS=114359614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr9	114423879	rs2273792	G	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CCGCCCGGCCGGGCCCAGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=12;WE=114423887;WS=114423869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr9	114454544	rs7869279	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=404;ReadPosRankSum=-0.334;SC=ACTTGAGATTTCTTTTAGTTC;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=27;WE=114454552;WS=114454534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr9	114454580	rs1475110	A	G	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=26;PP=927;SC=GTCATTCAAAATGGTGGTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=114454588;WS=114454570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	114456322	.	T	TTAAG	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=65;QD=49.012834791;SC=AGAAAAGAGTTTAATAGTCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=114456330;WS=114456312;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr9	114462322	rs6477845	A	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=22;PP=561;SC=TTCTGTAAGCAGATACCTACA;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=114462330;WS=114462312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	114464487	rs1407390	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=701;SC=TGCCTTCTCATAATTCAATTC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=114464495;WS=114464477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	114467448	.	T	TACACAC	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=408;SC=TCAGAATATATATACACACAC;SOR=3.611;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=8;WE=114467458;WS=114467438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	114467450	rs28406980	T	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=251;SC=AGAATATATATACACACACAC;SOR=2.985;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=114467458;WS=114467438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	114469078	rs10125413	T	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=511;SC=GTTATTATTTTGTTGAACTAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=114469086;WS=114469068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	114470127	rs12683681	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=511;ReadPosRankSum=2.167;SC=GAAGGAATGAATTTTTACCCC;SOR=0.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=35;WE=114470135;WS=114470117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr9	114475262	rs6477846	T	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=557;SC=ATACGCTTTCTAAGGGTGAAT;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=114475270;WS=114475252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	114480602	rs2418174	C	A	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=47;PP=1418;SC=AAAACATAGACTATACATTAC;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=59;WE=114480610;WS=114480592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	114484682	rs1337581	T	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=589;SC=CTTTTATTTGTACTCACCTTG;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=114484690;WS=114484672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	114484837	rs62569959	G	T	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=961;ReadPosRankSum=0.864;SC=CTGCTGCTTCGAGGAGGCAAA;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=63;WE=114484845;WS=114484827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,86:0.51:167
chr9	114489887	rs953536	C	T	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=578;SC=ACCATATCTACGGCAAAATAT;SOR=2.910;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=114489895;WS=114489877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	114490308	rs7470491	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=23;PP=571;SC=AGGTGAAGAATGACTTTTATG;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=114490316;WS=114490298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	114537978	rs440164	A	T	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.11;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	114543400	rs2786632	A	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=831;SC=ATCTTTATTTATTCACAAATG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=114543408;WS=114543390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	114659643	rs3780520	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.131;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=542;ReadPosRankSum=-2.204;SC=CGGGCCTCGGAGACAGGCGAG;SOR=1.156;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=29;WE=114659651;WS=114659633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr9	114687164	rs80084467	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.177;SC=AAGAGGTGAGGTTTTTTTCTT;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=13;WE=114687172;WS=114687154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr9	114811154	rs1980739	C	T	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=21;PP=1913;SC=GAGGAGAAAGCATGGGCCATA;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=84;WE=114811162;WS=114811144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	114861016	rs3739697	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=230;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATTAGCAAAATGGAGTTAAAA;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=19;WE=114861024;WS=114861006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr9	114919707	rs700105	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=9;PP=732;ReadPosRankSum=-2.129;SC=CCCCAAGGACATCAACTCTTT;SOR=0.876;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=139;TCF=110;TCR=29;TR=53;WE=114919715;WS=114919697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,61:0.41:150
chr9	114986021	rs34621641	C	CAGAA	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=1081;SC=ATATCAAACTCAGAGTTATTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=18;WE=114986029;WS=114986014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	114994281	rs3983403	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr9	114994286	rs372535742	G	A	172.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.80;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr9	114994290	rs370701025	AG	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr9	114994291	rs80175589	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	114994294	.	GAGAAGAAAAGA	G	31.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr9	114994295	rs374007410	AG	A	70.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	114994299	.	GAAAAGA	G	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	115014799	rs10659246	G	GA	46.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=0;PP=51;SC=TTTTAGCTTAGAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=115014807;WS=115014789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	115051546	rs11792085	A	G	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=30;PP=980;SC=CATATACCTTAGAGCACTGAC;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=115051554;WS=115051536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	115060205	rs10981348	C	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=27;PP=834;SC=CGCTGAAAAGCAAAACCAATG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=115060213;WS=115060195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	115060682	rs3808881	G	A	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=186;SC=GATCTTTAATGCAGACTATTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=115060690;WS=115060672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	115092577	rs2418204	G	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=195;SC=AAAATCCAAAGTTACCTCAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=115092585;WS=115092567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	115092624	rs2900539	T	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=245;SC=ATTAAAGACTTTTACACAATA;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=115092632;WS=115092614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	115095743	rs7040447	T	C	4395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=54;PP=2677;SC=CGCCGCCTAGTACTTACCCAT;SOR=1.102;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=134;WE=115095751;WS=115095733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr9	115142330	rs35979933	CG	C	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=190;SC=GCACAGGCATCGGGGGGGGCA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=9;WE=115142338;WS=115142320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	115142507	rs7867831	A	G	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=52;PP=1620;SC=CGGGCGAAGGACGCGTCTCGG;SOR=1.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=80;WE=115142515;WS=115142497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	115216222	rs10538330	GATTA	G	3116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=10;PP=2290;SC=CTGTCCTGCTGATTAATTAAT;SOR=2.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=45;WE=115216233;WS=115216212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	115249262	rs6477940	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=287;SC=CACTTACCTTTGGTGCCCGGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=115249270;WS=115249252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	115249433	rs7031191	T	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=51;NR=61;PP=1622;SC=CGGGGACGAGTGCGCCGACGC;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=115249441;WS=115249423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	115249508	rs190321439	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=290;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TCTGCTTCCCCGTCAGCGGCC;SOR=0.551;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=18;WE=115249516;WS=115249498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr9	115450093	rs786970	C	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=398;SC=TGGCTGGGCGCGGTGGCTCAC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=115450101;WS=115450083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	115567015	rs139599865	A	ATG	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.920;NF=6;NR=5;PP=377;ReadPosRankSum=-1.478;SC=ACTCTCCAGTATGTTTTCATT;SOR=0.368;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=11;WE=115567023;WS=115567005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr9	115567184	rs1891402	T	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=606;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TCGTTATAGTTGATGATCCCA;SOR=0.639;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=48;WE=115567192;WS=115567174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr9	115580008	rs10117709	G	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=679;ReadPosRankSum=0.446;SC=AGTTTGACCTGCCAGAATATT;SOR=0.957;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=43;WE=115580016;WS=115579998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr9	115598447	rs6477961	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TAGTCCTGCCCATGTGAGTGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=115598455;WS=115598442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr9	115600848	rs7023478	T	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=466;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GTGAGCTGGCTGAACCCCTGG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=36;WE=115600856;WS=115600838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr9	115642201	rs56011620	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=326;ReadPosRankSum=2.588;SC=CAGGCTTTAGGCAAAATCATA;SOR=0.379;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=19;WE=115642209;WS=115642191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr9	115652836	rs3802492	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=636;ReadPosRankSum=2.692;SC=CCTTCACCACGAGGAGTAGCC;SOR=0.968;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=40;WE=115652844;WS=115652826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr9	115652881	rs3802491	G	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CCTGGGACGAGGCCACCACGG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=26;WE=115652889;WS=115652871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr9	115760586	rs75939690	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=540;ReadPosRankSum=1.676;SC=TCATTTTTGTCGGTATGTAAT;SOR=0.486;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=31;WE=115760594;WS=115760576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr9	115811835	rs2274761	G	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=826;ReadPosRankSum=-1.241;SC=AAATGAAGCCGCAGCATTTGT;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=49;WE=115811843;WS=115811825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr9	115818949	rs2282076	A	T	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=62;PP=1767;SC=CAGAATCTGGACGCCGCTGGA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=80;WE=115818957;WS=115818939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	115874078	.	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.375;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=585;ReadPosRankSum=0.575;SC=CTGAATAGTATCTCCTCTTAG;SOR=1.292;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=26;WE=115874086;WS=115874068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr9	115875312	rs62576060	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr9	115918220	rs10817447	C	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GACTACTATTCTTTACTATCT;SOR=0.610;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=15;WE=115918228;WS=115918210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
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chr9	115931703	rs3810910	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=2487;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GTCAGGGACAGTCTTGTGGAG;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=60;WE=115931711;WS=115931682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,64:0.44:147
chr9	115932299	rs7865125	T	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=-0.845;SC=ACACTACTGGTCATGTAGTTT;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=20;WE=115932307;WS=115932289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr9	115934022	rs5900041	A	AACCTGGATT	1155.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=2900;SC=TGGCCTCAGGAACCAGGTGAA;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=115934030;WS=115934012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	115936903	rs3827673	A	G	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=1185;SC=TAGCTTGTTAACAGAGAATAA;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=115936911;WS=115936893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	115946500	rs10817454	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=400;ReadPosRankSum=1.218;SC=GAGGTGTTAAAGAGTAGTACC;SOR=0.120;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=25;WE=115946508;WS=115946490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr9	115946892	rs10118429	T	A	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=29;PP=1465;ReadPosRankSum=-1.367;SC=ATGCAGGAAATCAAAGAAGAG;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=105;TCR=50;TR=85;WE=115946900;WS=115946882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,101:0.55:182
chr9	115950706	rs10435864	A	C	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=549;ReadPosRankSum=-1.615;SC=GATGGGCCGGATGAAGAGAGG;SOR=0.555;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=37;WE=115950714;WS=115950696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr9	115952895	rs12684417	T	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=878;ReadPosRankSum=-1.263;SC=TCACTGTGATTAAAGCTCATC;SOR=0.576;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=52;WE=115952903;WS=115952885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr9	115968609	rs4281172	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=354;SC=TTTGTTTTAACGCACAATAGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=115968617;WS=115968599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	115968951	rs3935547	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=56;ReadPosRankSum=1.721;SC=GGAACAACAGTCATTCAGCCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=6;WE=115968959;WS=115968941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr9	115969433	rs5900043	T	TAGA	3145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=11;PP=2484;SC=CGAGAAAAAGTAGCTTAACTG;SOR=2.899;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=54;WE=115969441;WS=115969423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	116022860	.	TAC	T	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=59.02;NF=0;NR=3;PP=73;QD=25.3333333333;SC=TTTGTGCACGTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=3;WE=116022869;WS=116022850;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr9	116050358	rs41276785	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=150;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTTAGCCTCTCGTGTTGTACA;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=116050366;WS=116050348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr9	116091342	rs3810921	T	C	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=799;ReadPosRankSum=-1.907;SC=ACTCCCTCTCTGCTCAGGAAC;SOR=0.523;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=51;TCR=98;TR=70;WE=116091350;WS=116091332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,81:0.46:178
chr9	116116483	rs10981762	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.941;SC=GCTCAGGTACATGGACCAAGA;SOR=1.445;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=116116491;WS=116116473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr9	116116626	rs10981763	C	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=484;ReadPosRankSum=1.150;SC=GTGGTAATTCCTCTTCTTTCC;SOR=0.958;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=29;WE=116116634;WS=116116616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr9	116122954	rs752757	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=357;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CGCTGCAGAAACTTGACACCA;SOR=0.803;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=24;WE=116122962;WS=116122944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr9	116124454	rs58536514	GGTGTGT	G	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.623;NF=4;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=1.102;SC=ATGTGTTATGGGTGTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=4;WE=116124467;WS=116124444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr9	116131873	rs3827661	A	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=-1.120;NF=40;NR=12;PP=873;ReadPosRankSum=0.171;SC=GCCCTCGGCAACTCTGAGAAT;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=90;TCR=26;TR=52;WE=116131881;WS=116131863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
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chr9	116356529	rs10817493	C	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.328;SC=GACCAATCTGCGGCCCCAAGG;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=88;WE=116356537;WS=116356506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,112:0.51:221
chr9	116357408	rs884992	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.833;SC=GGGCTGAGCCCAAGCTGAGGC;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=11;WE=116357416;WS=116357398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr9	116764832	rs148995274	TTTTGCAC	T	2351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.337;NF=9;NR=22;PP=1579;ReadPosRankSum=0.217;SC=CCATGTTCTCTTTTGCACTTG;SOR=0.670;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=31;WE=116764846;WS=116764822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr9	116769515	rs4979321	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=605;ReadPosRankSum=1.519;SC=TTCCTCCCTCCGCTAGCCAGA;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=40;WE=116769523;WS=116769505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr9	116778269	rs4979324	A	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=419;ReadPosRankSum=-0.984;SC=AAGAGTGGGGACCAGGGCACC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=27;WE=116778277;WS=116778259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr9	116791161	rs7030167	T	C	4979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=85;PP=2939;SC=TGGTCCGATGTGCCACCCTCT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=154;WE=116791169;WS=116791151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr9	116794784	rs2116407	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=-0.509;SC=TCCTGGGGAGATCTGGCTTGA;SOR=2.232;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=15;WE=116794792;WS=116794774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr9	116795061	rs41277651	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=168;ReadPosRankSum=0.088;SC=GCTTCGCCCGCTCCCCCCTGG;SOR=0.687;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=13;WE=116795069;WS=116795051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr9	116810204	rs12378906	G	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=966;ReadPosRankSum=0.839;SC=CCTCCAACCAGTCCCGATCGC;SOR=0.962;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=59;WE=116810212;WS=116810194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr9	116812084	rs7856141	C	T	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1624;ReadPosRankSum=-1.368;SC=AGCTCATCAACGAGGTGAAGG;SOR=0.696;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=231;TCF=115;TCR=116;TR=105;WE=116812092;WS=116812074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,136:0.46:293
chr9	116822610	rs2269456	A	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=46;PP=1474;SC=GGGAAGGGAAAGCAGCTGTCG;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=75;WE=116822618;WS=116822600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	116837355	rs79644634	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=305;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CACTCCTGGTAGAGATCATGG;SOR=0.230;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=22;WE=116837363;WS=116837345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr9	116840204	rs2251680	A	G	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=912;SC=CAGCCAAGAGACCCACGGAAT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=116840212;WS=116840194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	116840338	rs2285056	C	T	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1646;ReadPosRankSum=0.090;SC=TCCCCATCACCACATCCACCC;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=109;WE=116840346;WS=116840328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,128:0.52:246
chr9	116854183	rs117751044	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=-1.230;SC=GTGCGCCCTCACTGCAGGGTG;SOR=0.598;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=17;WE=116854191;WS=116854173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
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chr9	116857656	rs7036734	T	C	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=43;PP=1381;SC=ATCACTTGCCTAGGGCCATCA;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=116857664;WS=116857646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr9	116860761	.	C	T	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=21;QD=18.5904041824;SC=GGCGGGGCACCCTGGAGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=116860769;WS=116860751;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr9	116967263	rs2567719	T	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=29;PP=1421;SC=GAGTGCACACTCCATCCCGGA;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=116967271;WS=116967253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	116967952	rs2567720	T	C	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=28;PP=1360;SC=TCTTTATTCATTGTCAGCCCC;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=116967960;WS=116967942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	116980052	rs10982110	C	T	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=61;PP=1874;SC=CCTACCAGGTCCTTCTACCCC;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=116980060;WS=116980042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	116997994	rs2015408	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=480;ReadPosRankSum=0.370;SC=TCCCCTGGTCTTGGCTTCCTT;SOR=0.532;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=38;WE=116998002;WS=116997984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr9	117002517	rs2014134	C	T	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CAGGAGACATCGGCCCCCCTG;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=69;WE=117002525;WS=117002507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,86:0.55:157
chr9	117026581	rs4978576	C	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=24;NR=11;PP=549;SC=CCTGGTTCTCCGCCCGAGGGA;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=117026589;WS=117026571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	117027165	rs41312228	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=-1.728;SC=GGTCCTCCCAAGCACCCTCTC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=16;WE=117027173;WS=117027155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr9	117033022	rs4143245	T	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=885;ReadPosRankSum=0.805;SC=AGCCAGGCCTTGAGGGTGACA;SOR=0.605;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=49;WE=117033030;WS=117033012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr9	117033096	rs2636866	C	T	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=64;PP=2566;SC=CTGGGGACCCCGGCAGGGCAT;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=120;WE=117033104;WS=117033086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	117033219	rs10118121	T	C	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=39;PP=1120;SC=GTCAGCAGTGTCCAGCAGCCA;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=117033227;WS=117033209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	117037820	rs10513241	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=441;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GGAACTATCGAGAATCTAGGG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=18;WE=117037828;WS=117037810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr9	117044538	rs2636879	G	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=587;ReadPosRankSum=1.578;SC=CTCTTGCTCTGTCCCTCCTCT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=38;WE=117044546;WS=117044528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr9	117044654	rs62555441	G	A	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=878;ReadPosRankSum=0.488;SC=TCCCTCCCCCGCATCCCTTCC;SOR=0.774;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=60;WE=117044662;WS=117044644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
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chr9	117051586	rs72762675	C	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=452;ReadPosRankSum=1.101;SC=GTAAGAGGGCCGGGGGTTCAG;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=34;WE=117051594;WS=117051576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr9	117051659	rs72764529	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=-0.545;SC=AACCAAACGCAGGCTGCAGAG;SOR=0.459;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=29;WE=117051667;WS=117051649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr9	117052738	rs11386651	G	GT	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=-0.252;SC=ACATCCAGAAGTTCTCTGGGG;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=4;WE=117052746;WS=117052728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr9	117053273	rs1249737	T	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=435;ReadPosRankSum=-0.050;SC=TTCCGACCCTTTGGGCACCCA;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=34;WE=117053281;WS=117053263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,41:0.40:102
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chr9	117073006	rs1249756	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=304;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTAGGCCTCACGGAGGAGGGA;SOR=1.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=17;WE=117073014;WS=117072996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr9	117085526	rs147960186	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.46;QD=26.52;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr9	117085811	.	A	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQRankSum=0.166;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.312;SOR=3.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr9	117086226	rs1111796	A	G	5129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=74;PP=2965;SC=CTCTTGCCCCAGGACTGTGAT;SOR=1.197;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=174;WE=117086234;WS=117086216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	117092570	rs139871678	G	A	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	117092582	rs143118548	A	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	117092701	rs117654479	C	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.46;QD=29.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	117093029	rs17230081	C	T	5496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.95;NF=78;NR=80;PP=2965;SC=CACTTCTCCTCGATAACATTA;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=158;WE=117093037;WS=117093019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr9	117108122	rs3762054	C	T	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=903;SC=GCACCCATCCCGGCCCTCCCT;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=117108130;WS=117108112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	117121840	rs2787348	A	C	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=58;PP=2523;SC=TAGGGTGGAAACAAACATTCT;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=116;WE=117121848;WS=117121830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	117122202	rs3748177	C	T	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=86;PP=2965;SC=GGTAAACTTGCTCCATCTGCA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=90;TCR=86;TR=176;WE=117122210;WS=117122192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr9	117124519	rs2636901	A	T	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=1;PP=109;SC=GACTCAAATCACAGCTTTTGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=117124527;WS=117124509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	117124731	rs3748176	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=23;PP=975;SC=GCCGGCAAGCGGCTGGGCAGG;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=117124739;WS=117124721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	117127034	rs2787351	C	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=255;SC=AGCATGGAGACGTGGGTGCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=117127042;WS=117127024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	117138278	rs4979371	C	T	216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=6;NR=3;PP=84;SC=AGCCAGCCTCCACCCCAGGCC;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=117138286;WS=117138268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	117150302	rs1886377	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CATCGCTCCCCACCTCTCCCC;SOR=0.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=19;WE=117150310;WS=117150292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr9	117166206	rs2274158	G	T	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=795;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TGGGCCTCTCGTTCCGAGGCA;SOR=1.589;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=46;WE=117166214;WS=117166196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr9	117166246	rs2274159	A	G	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=44;PP=2186;SC=CTTGGTGGACACCGACTGCCT;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=105;WE=117166254;WS=117166236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	117166338	rs6478078	G	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=55;PP=2284;SC=TGTCCGAGAGGTGGGAGAGCG;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=117166346;WS=117166328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	117168551	rs10982200	C	A	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=737;SC=AGCTGGTCCCCCCCTTCACTG;SOR=4.548;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=30;WE=117168559;WS=117168541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr9	117186677	rs4979387	A	G	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=642;SC=AGACGCTGCCACCACGGTACT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=117186685;WS=117186667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr9	117188566	rs10817610	C	T	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=21;PP=992;SC=GGTGCGGGCACGGGGCAGCCT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=51;WE=117188574;WS=117188556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	117188714	rs2274163	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=657;ReadPosRankSum=-1.743;SC=CACCACACAATACAGTCACCT;SOR=0.497;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=35;WE=117188722;WS=117188704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr9	117266853	rs56204273	T	A	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1560;ReadPosRankSum=0.078;SC=ACGCGCAGGGTGCGCACCAGG;SOR=0.886;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=88;WE=117266861;WS=117266843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,116:0.59:198
chr9	117390300	rs7031094	C	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=632;SC=TCAGTAGTGTCTGAAAGGTGT;SOR=2.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=117390308;WS=117390290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	117428960	rs1055207	T	C	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1141;SC=GAATGGCCAGTGCTCCTGGCA;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=117428968;WS=117428950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	117430524	rs2296947	G	A	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=32;PP=1491;SC=GCTCTTTTTTGTCTGGATCAG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=117430532;WS=117430514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	117430611	rs1359992	A	T	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=55;PP=2008;SC=CTTCTGAAGCAGCAAATCTGG;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=117430619;WS=117430601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	117430743	rs2418316	A	T	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=472;SC=GTGGGGGTGTACCTGAAACTA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=117430751;WS=117430733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	117433685	rs2296948	C	T	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=21;PP=1049;SC=GCTTGTGCTCCTGGGTTTGAC;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=53;WE=117433693;WS=117433675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	117433811	rs3215861	C	CA	2709.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=31;PP=2461;SC=GAATGAGGGGCATGGGTTCCG;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=117433819;WS=117433801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	117692257	rs28495846	T	G	97.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TATATATATATAGAGAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=117692265;WS=117692253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	117782836	rs34490502	T	TA	103.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=1;PP=51;SC=TGCTTTTATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=117782844;WS=117782826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	117792583	rs13321	C	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=33;PP=1423;SC=TCCAGCGCCTCAGCCTTATCA;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=71;WE=117792591;WS=117792573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	117797359	rs3215885	A	AT	215.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=8;NR=0;PP=156;SC=GTCTCTACTAATTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=117797367;WS=117797349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	117803185	rs35141770	A	AACAC	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=580;ReadPosRankSum=-0.521;SC=GAAAAATAGTAACACACACAC;SOR=1.721;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=14;WE=117803193;WS=117803175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr9	117808785	rs2104772	T	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=551;ReadPosRankSum=1.328;SC=AGACCTGTTATGTCCCTGGTA;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=32;WE=117808793;WS=117808775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr9	117815273	rs11794797	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=435;ReadPosRankSum=0.165;SC=AAAGATTAGCGTGCCCAACTG;SOR=0.549;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=30;WE=117815281;WS=117815263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr9	117836188	rs2210108	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-1.622;SC=AGGCTGCAAGACAGGGCTGCT;SOR=1.136;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=15;WE=117836196;WS=117836178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr9	117846570	rs2274836	C	T	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=44;PP=2391;SC=CCACACCAGGCTCCAGCTCCT;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=116;WE=117846578;WS=117846560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	117848394	rs1757095	T	C	6760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=104;PP=2965;SC=ACAGCGACCCTGGCCATGGCA;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=207;WE=117848402;WS=117848384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr9	118054178	rs2285315	T	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.365;SOR=1.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr9	118054182	rs2285316	G	A	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.17;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	118163563	rs2269700	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=692;ReadPosRankSum=0.867;SC=GTATCTCTTGCCAGGCCCAAG;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=47;WE=118163571;WS=118163553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr9	118969686	rs11268296	T	TTATTTAAATAG	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=1464;ReadPosRankSum=1.470;SC=AGAGGGCCTGTTATCTTTTTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=3;WE=118969694;WS=118969676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr9	119106881	rs7020782	C	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.911;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GAGAATGCTTCTCTCAATTGC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=71;WE=119106889;WS=119106871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,82:0.56:146
chr9	119107024	rs56187073	C	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.837;SC=AGCCTCTCTGCAGCCCAGGGA;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=6;WE=119107032;WS=119107014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr9	119124897	rs142931748	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1084;ReadPosRankSum=-1.078;SC=TCATTCATTGCCGGAAAGATG;SOR=0.382;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=72;WE=119124905;WS=119124887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,80:0.47:172
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chr9	119199820	rs7018569	C	G	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=47;PP=1445;SC=GCGGCCCGGCCGCCTTTCCAG;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=119199828;WS=119199810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr9	119382768	rs2295741	A	G	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=54;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.505;SC=ACAACAGGGGAGAGATTGAGA;SOR=1.095;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=151;TCF=50;TCR=101;TR=77;WE=119382776;WS=119382758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,79:0.48:165
chr9	119462112	rs3019	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=1.121;SC=TCTAGAACTTCAGAAGCTCCA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=119462120;WS=119462102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr9	119495697	rs7863560	T	C	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=18;PP=966;SC=GTTGGAGGTCTGGAAGGGGCT;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=119495705;WS=119495687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	119582872	rs3765537	T	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=504;SC=ATGGGGCACCTGGGCCTTGGG;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=119582880;WS=119582862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	119770480	rs3761845	C	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=986;ReadPosRankSum=0.790;SC=AAAGCTTGGCCGGGTTTAACC;SOR=0.945;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=60;WE=119770488;WS=119770470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr9	119770551	rs7036098	G	A	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=77;PP=2472;SC=ATGGGTGAACGGAGAGACAGA;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=128;WE=119770559;WS=119770541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	119858178	rs13301858	C	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=644;ReadPosRankSum=-1.568;SC=ACCCATATAGCCAGGGCAACA;SOR=0.579;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=39;WE=119858186;WS=119858168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr9	119903807	rs57782747	A	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=31;PP=959;SC=CACCCTCAGCACCTAGAGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=119903815;WS=119903797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	119903827	rs13291457	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=481;SC=CTGGGGCTGAAGTTAGGGCTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=119903835;WS=119903817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	119977077	rs4543613	T	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=382;SC=AATCGAGGGCTGCAGGGGATT;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=119977085;WS=119977067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	120053776	rs7848630	T	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=39;PP=1240;SC=AGATGTCCGCTGCTGTGCCAG;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=67;WE=120053784;WS=120053766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	120466929	rs5900307	CA	C	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.261;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.709;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr9	120471058	rs2770148	G	A	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=62;PP=2103;SC=TCATTGTCCTGTCATTTCATT;SOR=1.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=120471066;WS=120471048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	122001000	rs2274157	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=17;PP=740;SC=GATTGTCATAGCTGTTACAGC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=122001008;WS=122000990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	122004545	rs3831067	GAGGACAGGGAT	G	956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=2967;SC=TTTCATGTGAGAGGACAGGGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=122004563;WS=122004535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	122257627	rs10984560	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=2.201;SC=CACAGAAACGCGGGCTACAGC;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=15;WE=122257635;WS=122257617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr9	122275247	rs10984573	A	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CAGAATTGCTACCGCAGGAAA;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=18;WE=122275255;WS=122275237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr9	123151679	rs4836820	A	G	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=683;ReadPosRankSum=0.173;SC=TGCTTTCAAAAACATAGTTTG;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=43;WE=123151687;WS=123151669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr9	123152099	rs2297457	C	G	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=551;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ATGATTAGGGCCATGGATATC;SOR=0.870;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=36;WE=123152107;WS=123152089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr9	123152241	rs2297456	A	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-1.279;SC=ACCCATCACAAACCCCAGGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=123152249;WS=123152231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr9	123156761	rs4410972	G	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=321;ReadPosRankSum=1.396;SC=AAGTGGTCAGGCATAGCGGCC;SOR=0.897;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=27;WE=123156769;WS=123156751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr9	123170733	rs4837768	C	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=395;ReadPosRankSum=0.888;SC=CTCAACTTCACCTCCTCCTGC;SOR=0.601;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=24;WE=123170741;WS=123170723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr9	123220829	rs2501727	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=599;ReadPosRankSum=1.731;SC=CCCCATCACAATCTGAAATCT;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=41;WE=123220837;WS=123220819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr9	123249744	rs2490594	A	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=521;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TTCTAAGGAAATTGTCATCAA;SOR=0.990;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=26;WE=123249752;WS=123249734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr9	123280950	rs2095064	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=252;ReadPosRankSum=-0.594;SC=AGAAGCAAGATGAGCTAATTT;SOR=1.037;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=21;WE=123280958;WS=123280940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr9	123290996	rs41305509	C	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=563;ReadPosRankSum=-0.011;SC=ATCTTCAATACATTTTTTAAA;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=30;WE=123291004;WS=123290986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr9	123291036	rs4836822	C	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=427;ReadPosRankSum=0.120;SC=ATCCTCTCTTCAAAGCTGTTT;SOR=0.461;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=28;WE=123291044;WS=123291026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr9	123301346	rs3750494	T	G	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=1788;ReadPosRankSum=2.412;SC=TTCTTTTAGTTAGGAGATCTT;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=93;TCR=107;TR=100;WE=123301354;WS=123301336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,137:0.53:257
chr9	123313246	rs954214	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=545;SC=AGATAGTACATACATTAGTCG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=123313254;WS=123313236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	123330813	rs4837782	T	C	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=36;PP=1122;SC=GATTTACTGATTTTGCTCCAG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=123330821;WS=123330803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	123342259	rs932975	C	A	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=56;PP=1707;SC=TCCATCATGGCTACAGAGGTG;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=82;WE=123342267;WS=123342249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	123342275	rs932974	A	G	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=48;PP=1423;SC=AGGTGGCGACAGCGTTGGTGT;SOR=1.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=123342283;WS=123342265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	123370345	rs991121	C	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=677;SC=ATTAAAAATGCAAAACAACTA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=123370353;WS=123370335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	123374639	rs2416760	T	C	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=26;PP=1635;SC=GATTTTTTTTTCCCTCTAAAA;SOR=1.389;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=78;WE=123374647;WS=123374629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	123476542	rs369989873	ACGGCGG	A	4836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=23;PP=2992;SC=GGCTGAGGCGACGGCGGCGGC;SOR=1.991;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=58;WE=123476555;WS=123476532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	123550027	rs7026635	G	A	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=24;PP=2038;SC=AACCCAAAAAGCAGTTTCAAC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=92;WE=123550035;WS=123550017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	123550141	rs13295390	T	C	3139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=54;PP=2144;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GGTCCTCCAGTTGCTTCATTC;SOR=0.520;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=244;TCF=143;TCR=101;TR=123;WE=123550149;WS=123550131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,139:0.51:272
chr9	123583192	rs1060817	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=45;PP=2416;SC=GCTCCAGTGGATCCCGAGATA;SOR=1.144;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=115;WE=123583200;WS=123583182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	123586737	rs10760117	T	G	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=64;PP=2875;SC=TGTCAAAGATTAAGATATCCC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=130;WE=123586745;WS=123586727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr9	123631642	rs3753029	G	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=42;PP=1574;SC=TCAACCACCAGGTCCGGGTGG;SOR=0.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=86;WE=123631650;WS=123631632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	123632045	rs1056567	A	G	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=32;PP=1679;SC=TGGAGCTCAGACTCTGTGATG;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=123632053;WS=123632035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	123632829	rs4836833	G	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=59;PP=2077;SC=GAAAGAGAGGGCCTCGAGGGT;SOR=0.978;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=123632837;WS=123632819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	123636121	rs10985070	C	A	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=139;SC=ATCATCATCACAGGTGGGCTT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=123636129;WS=123636111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	123670505	rs7866003	A	T	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=103;SC=TATCTAAAAAATTTTTTAACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=123670513;WS=123670495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	123671520	rs2239657	G	A	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=487;SC=TGTTCCGGAAGGGCCACGGCA;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=123671528;WS=123671510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	123676396	rs2416804	G	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=11;PP=528;SC=TTAGTACAAAGGACATCCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=123676404;WS=123676386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	123676482	rs2416805	T	C	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=25;PP=1047;SC=CCATAGTGGATAGATCTCCTT;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=123676490;WS=123676472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	123676699	rs758959	C	T	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=135;SC=ACTTTGCACACTGCTGTTCCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=123676707;WS=123676689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	123751800	rs3764912	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=381;SC=TAAAAATATTAGTTTAGAATC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=123751808;WS=123751790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	123758425	rs10760134	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=582;SC=TTTTAGACAATTCACTTTCTG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=123758433;WS=123758415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	123760086	.	AT	A	29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.9999;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=29;QD=11.6666666667;SC=ATCAAAATACATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=123760094;WS=123760076;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr9	123769200	rs17611	C	T	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=36;PP=1309;SC=GAAATGCCAACGCCTTGAATT;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=123769208;WS=123769190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	123780005	rs25681	G	A	5904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=90;PP=2965;SC=CTGTGACGATGTAATAGACCA;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=173;WE=123780013;WS=123779995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr9	123787697	rs140753263	T	TACACACAC	496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.12;QD=55.19;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	123789634	rs2416811	C	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=103;SC=TTTGAAATTACGTAAAGCACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=123789642;WS=123789624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	123800094	rs10818499	T	A	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=135;SC=AGGACAGGGTTATGAAATGAG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=123800102;WS=123800084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	123850770	rs10818503	G	A	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=68;PP=2480;SC=GTGTGAGCAAGTTGAGATTGC;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=118;WE=123850778;WS=123850760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr9	123857085	rs10760146	C	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=189;SC=ATCAAACAGACCCTGATGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=123857093;WS=123857078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	123860689	rs10818504	C	T	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=36;PP=2353;SC=AAGTTGAAACCGCTTCAAGAT;SOR=1.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=109;WE=123860697;WS=123860679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	123888242	rs10760150	G	T	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=46;PP=1390;SC=CCTATTTTCCGTAGCTTCATA;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=123888250;WS=123888232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	123908345	rs7023214	G	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=768;SC=AAGGAAGTAAGTGATTTCATA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=123908353;WS=123908335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	123917020	rs3736855	T	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=628;SC=ATGGAAATGTTGAGAGTCTTA;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=123917028;WS=123917010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	123917355	rs10818512	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=860;SC=GTGAGAATTTATGCAAGTCAT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=123917363;WS=123917345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	123922729	rs35562325	A	ATGT	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=364;SC=AAGGAATATGATATTTTCTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=123922737;WS=123922719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	123923411	rs139754979	A	AGT	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=12;PP=1157;SC=AATGTGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=1.828;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=25;WE=123923419;WS=123923401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	123924667	rs10586591	CAT	C	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=687;SC=AACTTGGTATCATAATACATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=123924676;WS=123924657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	123927477	rs4836841	T	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=59;PP=1718;SC=ATGAGCATGGTGTTTCTTTCT;SOR=3.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=70;WE=123927485;WS=123927467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	123928486	rs2273988	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=20;PP=1053;SC=AATATTCTAGTAGTATACTGA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=123928494;WS=123928476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	123928569	rs1535655	G	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=888;SC=AGCAGATACCGTAGGGCCATT;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=123928577;WS=123928559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	123929710	rs10818513	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.569;SC=ATTGGCACTGACCACCTCTAG;SOR=1.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=123929718;WS=123929700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr9	123937601	rs3789310	T	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=36;PP=1087;SC=CTGGAGTGCATTGGTACCATC;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=123937609;WS=123937591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	123939336	rs3838267	T	TA	257.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=269;SC=TCCAAAGAGGTACTCAAATAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=123939344;WS=123939326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	123943884	rs2296078	C	T	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=40;PP=1177;SC=ATTGGAGAACCACAGTTTTCT;SOR=1.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=55;WE=123943892;WS=123943874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	123945505	rs3215744	C	CA	449.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-0.442;SC=AAAAAAAATGCAAAAAAAAAC;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=16;WE=123945513;WS=123945495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr9	123955756	rs10818516	G	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr9	124043867	rs10985200	C	T	7144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=108;PP=2965;SC=AGACACCTGTCGTCCTCTTAA;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=116;TCR=108;TR=224;WE=124043875;WS=124043857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr9	124073176	rs306785	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=499;SC=CCTGGTCTGATCAGGGACTTG;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=124073184;WS=124073166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	124088768	rs306769	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=10;PP=410;SC=GTCCCTGACTTGCTCTCCTGT;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=124088776;WS=124088758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	124089173	rs216784	C	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=495;SC=ACACTTTGCACAGTGGACAGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=124089181;WS=124089163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	124091135	rs306771	G	A	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=798;SC=GGGTGATGGCGTCCCTTGGCA;SOR=2.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=34;WE=124091143;WS=124091125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr9	124222267	rs2289068	A	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=619;SC=CTAATATGCTAAGGCTCTTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=124222275;WS=124222264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	124622502	rs4381015	C	A	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=158;SC=ATGTCTAGATCTGATGGCATC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=124622510;WS=124622496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr9	124633096	rs4370602	G	A	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=76;PP=2165;SC=GAGATTTACAGCCTCCTCGGG;SOR=1.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=106;WE=124633104;WS=124633086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	124736218	rs35609526	C	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=15;PP=1058;SC=CAAGAACTTACCTGCTTAGGA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=124736226;WS=124736208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr9	124801768	rs77550915	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=0.025;SC=CCTTATAATACGCATATGAGG;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=14;WE=124801776;WS=124801758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr9	124854880	rs10818624	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=-1.389;SC=CCTCGCCCGCCGACCTGACCT;SOR=0.160;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=124854888;WS=124854870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr9	124882247	rs76910889	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=766;ReadPosRankSum=0.430;SC=GCGCCATGACAAACCCAGGGA;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=57;WE=124882255;WS=124882237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr9	124895467	rs12380610	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=382;SC=CAGGTCCCTCCGATCCCAGAT;SOR=2.030;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=124895475;WS=124895457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	124895500	rs10985546	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=213;SC=ACCATTCTTGATTTCTGCTTT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=124895508;WS=124895490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	124906723	rs3818638	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=453;SC=TAACCATCAATGCGCCTCCTG;SOR=1.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=124906731;WS=124906713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	124910582	rs3793616	C	A	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=67;PP=2295;SC=GGGTTAGGGGCATCTCTTTGC;SOR=1.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=110;WE=124910590;WS=124910572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	124914613	rs4679	C	T	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=85;PP=2742;SC=AGAGCATAAACTCCTTGTTGG;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=58;TCR=85;TR=143;WE=124914621;WS=124914603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr9	124929006	rs2274747	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=214;ReadPosRankSum=0.484;SC=TGATCCTCCAGCTGTCACACA;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=15;WE=124929014;WS=124928996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr9	124929211	rs1411444	A	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=586;ReadPosRankSum=-0.396;SC=AGCTGGGGGGACGGATGCTGT;SOR=0.961;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=33;WE=124929219;WS=124929201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr9	124972042	rs989798	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=0.774;SC=AGGCTGCACACAGGATCCCAC;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=12;WE=124972050;WS=124972032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr9	124976475	rs62574050	C	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=11;PP=499;SC=CCGGGTCCGGCCCGAGGGGCG;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=124976483;WS=124976465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	124990773	rs113188211	C	CG	811.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=578;ReadPosRankSum=2.727;SC=CGACCCCCCCCCCCCGCTCGC;SOR=1.170;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=17;WE=124990781;WS=124990763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr9	125133479	rs1236913	T	C	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=79;PP=2469;SC=TCTCTTGCTCTGGTTCTTGCT;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=149;WE=125133487;WS=125133469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr9	125144145	rs1238420	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=394;SC=GGGAGTGGGAAGCTTGTGCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=125144153;WS=125144135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	125239253	rs1962091	T	C	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=708;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TCCCAAAGTGTTGAGATTACA;SOR=0.506;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=37;WE=125239261;WS=125239243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr9	125288840	rs151154516	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=798;ReadPosRankSum=0.149;SC=ACACAAACAACGCAGAGGTGG;SOR=1.077;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=56;WE=125288848;WS=125288830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr9	125289521	rs10818708	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=452;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TGCTCTGGAGGCGCTGATATT;SOR=0.948;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=30;WE=125289529;WS=125289511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr9	125315376	rs11412445	C	CT	2147.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=31.58;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	125315393	rs12684786	G	A	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=16;PP=2413;SC=TCCCAGCACAGTTCTGGCCAC;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=84;TCR=16;TR=100;WE=125315401;WS=125315383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	125315557	rs1831370	T	C	7189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=114;PP=2965;SC=ACTCTCTGAGTGGCCAGAGGA;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=119;TCR=114;TR=233;WE=125315565;WS=125315547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr9	125315778	rs1411271	G	C	5504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=94;PP=2965;SC=AGATCATCTCGTATTCTGGGT;SOR=0.935;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=169;WE=125315786;WS=125315768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr9	125316033	rs1341042	T	C	6525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=1.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	125316042	rs1341043	T	C	6773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=51;PP=2948;SC=ATTGTGATCCTAGTGCTCTCC;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=131;WE=125316050;WS=125316035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr9	125316179	rs1341044	T	G	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=86;PP=2965;SC=GCTGTGTTTGTCATCTCATCT;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=77;TCR=86;TR=163;WE=125316187;WS=125316169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr9	125316350	rs1411272	C	T	5853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.172;NF=78;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.163;SC=ATTATTCCCACGCTAAACCCA;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=79;TCR=104;TR=181;WE=125316358;WS=125316340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,212:0.99:214
chr9	125316567	.	T	TA	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=62.47;NF=0;NR=3;PP=46;QD=16.6666666667;SC=GTTAGGGATGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=125316575;WS=125316557;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,3:0.33:9
chr9	125317424	rs10733658	G	T	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=41;PP=1728;SC=AAAAAATGTTGCAGTGATAAC;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=91;WE=125317432;WS=125317414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	125317485	rs10760239	G	T	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=53;PP=1986;SC=AAGTTCATCCGGGGCCAAATT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=102;WE=125317493;WS=125317475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	125317661	rs1041355	A	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=198;SC=GAGACAACTAAGGAAACCAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=125317669;WS=125317651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	125330125	rs10739614	C	G	6308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=92;PP=2965;SC=GCAGAGAAAACGAGTCACCAA;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=95;TCR=92;TR=187;WE=125330133;WS=125330115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr9	125330678	rs10985704	T	G	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=50;PP=1813;SC=ACAAAGAGTGTCTTTTGGTCC;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=125330686;WS=125330668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	125330739	rs1999182	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=30;PP=1077;SC=CACTGCTGGTGTGGTTGATTC;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=125330747;WS=125330729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	125330859	rs1999183	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=301;SC=CTTCTGTTTGGTCACAATTAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=125330867;WS=125330849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	125377087	rs972925	A	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=975;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CCAGAAGAGCAAATCCCACTC;SOR=0.544;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=101;TCR=74;TR=71;WE=125377095;WS=125377077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,84:0.40:209
chr9	125377505	rs1329957	A	G	5077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=73;PP=2965;SC=CCTTTCTCATAGGCCAACTAA;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=161;WE=125377513;WS=125377495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr9	125378014	rs7470572	T	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=772;ReadPosRankSum=0.325;SC=AATAATGTTGTGCCTCACAGA;SOR=1.180;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=48;WE=125378022;WS=125378004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr9	125390874	rs1556189	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=109;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GTCTACCTTCACCCATTCAAG;SOR=0.582;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=125390882;WS=125390864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr9	125391026	rs1476858	A	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=733;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GGAAGTAGACACAAATGATGG;SOR=0.882;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=42;WE=125391034;WS=125391016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr9	125391369	rs1536929	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=605;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CACCCAGCTCAAGGCTAGTAA;SOR=0.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=43;WE=125391377;WS=125391359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr9	125391409	rs1536928	A	G	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=744;ReadPosRankSum=0.338;SC=TTCATTACCAAAGCATAGTGC;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=45;WE=125391417;WS=125391399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,53:0.43:122
chr9	125391770	rs11421222	C	CA	1233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=733;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ACCCAAGGAGCAAAAAAACCG;SOR=0.648;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=32;WE=125391778;WS=125391760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr9	125391917	rs1329951	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=274;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TTACGTTACTAAAGATCGTTA;SOR=0.257;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=14;WE=125391925;WS=125391907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr9	125391940	rs7037571	C	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=341;SC=GACCTAGATTCGAACTTGACC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=125391948;WS=125391930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	125424507	rs70156	A	C	3831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=2355;ReadPosRankSum=-0.550;SC=TCTGTGCCTCAAATGTCATCC;SOR=0.583;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=244;TCF=127;TCR=117;TR=143;WE=125424515;WS=125424497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,170:0.60:282
chr9	125486156	rs16912140	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=456;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CGAAGTATAATAGCAGTAAGA;SOR=1.449;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=23;WE=125486164;WS=125486146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,25:0.32:78
chr9	125486968	rs2215530	G	A	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=64;PP=2448;SC=CTCTGCAGCCGGGAAGTGGAA;SOR=0.983;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=111;WE=125486976;WS=125486958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	125512193	rs10760252	C	A	6506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=120;PP=2965;SC=TTCCAACCCTCAGCTGCAGAA;SOR=1.107;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=200;WE=125512201;WS=125512183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr9	125512575	rs4838012	G	A	9990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=171;PP=2965;SC=TTGGGTTCTTGCAGCATCTCC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=320;TCF=149;TCR=171;TR=320;WE=125512583;WS=125512565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr9	125512770	rs10985760	T	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.18;QD=29.98;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	125512788	rs10818740	G	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.90;QD=44.82;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	125512795	rs10818741	G	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.82;QD=42.62;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	125512826	rs28670025	G	A	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=30;PP=1240;SC=CTCTGCAGCCGGGAAGTGGAA;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=125512834;WS=125512816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	125588882	rs201646219	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=710;ReadPosRankSum=1.120;SC=CAGAGCCCAGGGTTTCTCAGT;SOR=1.162;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=36;WE=125588890;WS=125588872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr9	125620105	rs5900549	C	CA	363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=396;SC=CAAACCACTGCAAATATCCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=125620113;WS=125620095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	125637471	rs2596699	A	T	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=44;PP=2259;SC=TTCTCTAGGCACTTCAAGTGG;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=111;WE=125637491;WS=125637461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	125637648	rs2596698	T	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1602;SC=GGGGTTACACTTATGTAAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=125637656;WS=125637638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	125652489	rs369228436	C	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=419;ReadPosRankSum=-0.206;SC=AAGATTTGTACATATAAAGAC;SOR=0.503;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=26;WE=125652497;WS=125652479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr9	125659520	rs2793005	T	C	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=14;PP=1361;SC=ATAGTGATTATTTTTGCACCA;SOR=2.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=125659528;WS=125659510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	125673051	rs1147321	T	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=12;PP=1124;SC=TAATACAAACTTTATATAACA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=125673059;WS=125673041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	125747038	rs614274	G	T	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=51;PP=1654;SC=GAAGGTTATTGTTTTTAATAT;SOR=1.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=77;WE=125747046;WS=125747028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	125759861	rs138316961	TTTTC	T	840.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	125760863	rs587364	T	C	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=31;PP=2094;SC=AGCCTCTCTCTTTCTTTGTTT;SOR=1.549;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=101;WE=125760871;WS=125760853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	125761051	rs605546	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=1077;SC=AACAGGTACTGTATTTTTCTA;SOR=2.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=125761059;WS=125761041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	125797918	rs61634863	CGTGTGTGTGTGT	C	703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=12;PP=3000;SC=ACGGGGTTCCCGTGTGTGTGT;SOR=4.294;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=13;WE=125797937;WS=125797908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	125832879	rs803733	T	C	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=621;SC=GGAGGAGATATATGATGAGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=125832887;WS=125832869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	125861695	rs700080	T	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=512;SC=GCTTCCACTATGGAATTTATG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=125861703;WS=125861685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	125861888	rs700081	A	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=587;SC=TGGCTGTATAAACAGGTTTTG;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=125861896;WS=125861878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	125898643	rs72753292	T	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=920;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AAGGCTGGCTTGTGTCTGGGT;SOR=0.477;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=69;WE=125898651;WS=125898633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,83:0.48:172
chr9	125920376	rs803736	G	A	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1612;SC=TGTAAATCTGGCCAAAGGCTG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=125920384;WS=125920366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	125920807	rs142605162	GA	G	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.706;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr9	125922854	rs11437080	C	CA	444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=429;SC=ATCAGGCAAACAAAAAAATCA;SOR=4.174;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=125922862;WS=125922844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	125932152	rs147443012	C	CAT	785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.017;NF=5;NR=7;PP=453;ReadPosRankSum=1.026;SC=CAAATATATACATATATATAT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=12;WE=125932161;WS=125932142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr9	126028395	rs7863265	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=287;ReadPosRankSum=0.571;SC=CTGGTCTCTTCCAGTTTCACA;SOR=0.433;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=19;WE=126028403;WS=126028385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr9	126118517	rs72433015	AGCAGAGC	A	1835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=12;PP=1546;SC=ACAGCAGCCGAGCAGAGCGCA;SOR=1.954;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=26;WE=126118531;WS=126118507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	126125318	rs2808415	C	A	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=51;PP=2093;SC=CCAGATCCCACCGGCTTCCGC;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=126125326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	126131110	rs2488603	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=593;SC=GAGCTCTGCCTCCTCCCCACT;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=126131118;WS=126131100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	126132329	rs7034379	T	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=627;ReadPosRankSum=0.217;SC=AAGTTCTGGGTCAGTACTGTG;SOR=0.605;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=40;WE=126132337;WS=126132319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr9	126132919	rs33984675	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=879;ReadPosRankSum=-1.484;SC=TCCATCTAGCGACCCTGGAGC;SOR=0.771;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=57;WE=126132927;WS=126132909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,59:0.40:147
chr9	126133497	rs13290763	C	T	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=58;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CCAATGACTCCGCAGCTGGCC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=74;TCR=114;TR=96;WE=126133505;WS=126133487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr9	126133547	rs2488602	T	C	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=81;PP=2570;SC=CGGGCTGAGGTGCCGGGCAGT;SOR=1.304;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=46;TCR=81;TR=127;WE=126133555;WS=126133537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr9	126135715	rs2488601	A	G	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=20;PP=1568;SC=CCCGGCGGCCACCACCTCGCG;SOR=1.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=80;WE=126135723;WS=126135705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr9	126145907	rs2797946	C	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=15;PP=1092;SC=GGCCCCCGGCCGATACCCTCC;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=126145915;WS=126145888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	126146197	rs2808411	C	G	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=64;PP=2043;SC=TGCGGCCTGTCGGGGACAGAG;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=102;WE=126146205;WS=126146187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
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chr9	126439100	rs12377595	T	G	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=47;PP=1922;SC=CATGAAATATTAGTATGCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=126439108;WS=126439090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	126520068	rs9785285	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=826;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TGAGCACGAATGTGAAGTTCT;SOR=1.040;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=52;WE=126520076;WS=126520058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr9	126531755	rs1778890	T	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=308;ReadPosRankSum=-2.717;SC=GGTTTATTGATACTTTTTTTC;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=20;WE=126531763;WS=126531745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr9	126770250	rs10818907	C	G	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CCAAATCCGGCGTTTTCTCTG;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=69;WE=126770258;WS=126770240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr9	126783433	rs1042486	G	C	3495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=41;PP=2191;ReadPosRankSum=0.903;SC=AGCCATACCCGAGCAGCCAGA;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=262;TCF=175;TCR=87;TR=133;WE=126783441;WS=126783423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,154:0.50:305
chr9	126794648	rs28649641	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.527;SC=CAGTCGGGGGGATGCTCTGCC;SOR=0.307;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=10;WE=126794656;WS=126794638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr9	127032607	rs1045774	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=518;ReadPosRankSum=-0.989;SC=CTGAGTGTCCAAGAAGCCTCT;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=31;WE=127032615;WS=127032597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr9	127075021	rs2274780	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.050;SC=CTCTCCCCTCTTCTGTGAACG;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=127075029;WS=127075011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr9	127083725	rs10760352	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=717;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TCCCTCTTTCCCTCCTCATGC;SOR=0.828;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=51;WE=127083733;WS=127083715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr9	127089775	rs748741	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=742;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CCTGGTGACCATGCAGGGAGA;SOR=0.602;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=55;WE=127089783;WS=127089765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,56:0.58:96
chr9	127101924	rs10760354	C	T	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=117;PP=2965;SC=CATCTGGTCCCTGGGCTGTCT;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=116;TCR=117;TR=233;WE=127101932;WS=127101914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr9	127116102	rs10818946	T	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=0.479;SC=GACTGGAATCTTGGCTCTCCC;SOR=0.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=127116110;WS=127116092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr9	127177161	rs4574	A	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=539;ReadPosRankSum=-0.434;SC=AGTTTTCCGGACCTTTGGAAG;SOR=1.341;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=29;WE=127177169;WS=127177151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr9	127177736	rs2236386	G	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=314;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GGTCGGAGGCGGGTGCAAACA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=28;WE=127177744;WS=127177726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr9	127215167	rs59108500	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=0.150;SC=GACTCTTGGGCAGGGGAACTC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=127215175;WS=127215157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr9	127215344	rs7861556	A	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=507;ReadPosRankSum=-1.630;SC=CTGGTGTTCGACGAGAGGACG;SOR=0.772;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=32;WE=127215352;WS=127215334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
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chr9	127215778	rs67997410	C	T	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
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chr9	127230891	rs10760365	G	A	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=56;PP=1584;SC=GTGGAGGAAGGTGGTAGCTGT;SOR=1.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=82;WE=127230899;WS=127230881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	127231774	rs1570580	C	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=49;PP=1899;SC=CCGCCGTGCCCGCATGTTGAG;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=94;WE=127231782;WS=127231764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	127244955	rs915034	G	A	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=55;SC=TGAACCATGCGGAGCCAGCGG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=127244963;WS=127244945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	127255448	rs2297605	G	A	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=53;PP=1781;SC=AGAGGCACGCGGGGGGCCGGG;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=95;WE=127255456;WS=127255438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	127495508	rs10760374	C	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=16;PP=973;SC=TTATCAATGACACCTTAAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=127495516;WS=127495498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	127557152	rs7856071	G	T	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=11;PP=994;SC=CCACCCGCCTGGGCCTCCCAA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=127557160;WS=127557142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	127561559	rs2281923	C	T	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=36;PP=1931;SC=CTGCCCCCTCCGCAGAGCATC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=127561567;WS=127561549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	127563364	rs913231	G	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=64;PP=2350;SC=GTGAGCAGGTGGAGGAGGCTG;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=106;WE=127563372;WS=127563354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	127566378	rs7874348	A	G	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.983;SC=TGCAGACAACACCCTCCAGGG;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=69;WE=127566386;WS=127566368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,82:0.53:155
chr9	127572710	rs7020260	C	G	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=66;PP=1982;SC=CTGTGCTCCCCGGAGAGGGGC;SOR=2.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=82;WE=127572718;WS=127572700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	127615705	rs10986467	A	G	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=124;SC=CGCCCCGATTACCATGGAGAC;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=127615713;WS=127615701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	127615976	rs3814132	G	A	5239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=60;PP=2108;SC=TCTGGGCAGTGGCTCAGGACA;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=106;WE=127615984;WS=127615966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	127615995	rs3814131	A	G	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=62;PP=1849;SC=CATTGAGTCCAGAGTAGACTT;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=127616003;WS=127615985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	127616323	rs10760380	G	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=677;SC=TACGGGACTCGAGAGAGGGCC;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=127616331;WS=127616321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	127616537	rs12375547	A	G	7267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=120;PP=2965;SC=CAGGCTCAGAAGATGGCTGCG;SOR=0.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=91;TCR=120;TR=211;WE=127616545;WS=127616527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr9	127618776	rs2274970	A	G	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=26;PP=1290;SC=TCCACCGTACACATCTGGGAC;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=127618784;WS=127618766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	127618839	rs10760381	C	G	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=49;PP=2093;SC=GGACACAGTGCCAACATCAGC;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=127618847;WS=127618829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	127619625	rs35041146	G	GC	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=11;PP=757;SC=TTCCTGACATGCCCCCCTCCT;SOR=1.445;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=22;WE=127619633;WS=127619615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	127619922	rs944952	T	C	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=56;PP=1840;SC=CCAACCACCTTAGATGGTGCC;SOR=1.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=81;WE=127619930;WS=127619912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	127620480	rs10593927	CAT	C	761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=575;SC=GCAGGCCACACATGTCACTAA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=13;WE=127620489;WS=127620470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	127637215	rs581558	T	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=296;SC=GGCGGTGCCTTCGCAGCTCTG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=127637223;WS=127637205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	127643456	rs687434	T	C	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=66;PP=2965;SC=CTACCTTATATTCCAGAGTTT;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=94;TCR=66;TR=160;WE=127643464;WS=127643446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr9	127644882	rs596231	G	A	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=80;PP=2877;SC=AAAGCCAATCGTTAGATGCAT;SOR=0.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=144;WE=127644890;WS=127644872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	127652621	rs622280	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=338;SC=CCTGCTGCCTGTGGGACTGCA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=127652629;WS=127652611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	127661521	rs750884	T	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.99;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	127661526	rs750883	A	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.85;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	127661645	rs634710	G	A	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=49;PP=1833;SC=AGCTGCCCGCGTTCTCTCCAG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=98;WE=127661653;WS=127661635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	127674200	rs583134	A	C	4504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=71;PP=2632;SC=AGTTCTTGCAAGTGTTCTTCT;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=127674208;WS=127674190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr9	127818276	rs589292	C	T	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=88;PP=2716;SC=TCTTTAAGAGCAAATTCAGTC;SOR=1.398;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=45;TCR=88;TR=133;WE=127818284;WS=127818266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	127904740	rs974826	G	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=1;PP=394;SC=ATCGACTGTAGAGGTAGTAAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=127904748;WS=127904730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	127923013	rs4837010	TG	CT	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=300;SC=TTTAATATACTGAAATAGGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=127923022;WS=127923003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	127951863	rs466994	G	A	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=25;PP=1848;SC=CTGGAGAAAGGAAGGGCCGGC;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=88;WE=127951871;WS=127951853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	127962916	rs501963	G	A	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=21;PP=2066;SC=GGTCTATCACGGTCTCGGGCA;SOR=2.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=77;TCR=21;TR=98;WE=127962924;WS=127962906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	127969785	rs420423	G	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=846;SC=AATGGAAAGAGCACACTACTG;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=127969793;WS=127969775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	127975583	rs359588	T	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=730;SC=ATGACCCTCCTCAAGTGTGCC;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=37;WE=127975591;WS=127975573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	127982851	.	GC	G	3334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.343;NF=15;NR=44;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GAAGTGACCAGCCCCCCACCA;SOR=0.794;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=138;TCF=39;TCR=99;TR=59;WE=127982859;WS=127982841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,128:0.53:242
chr9	127995131	rs10986661	C	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=2.193;SC=CCGAGGCAGGCAGATCACGAG;SOR=1.302;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=127995139;WS=127995121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr9	127996046	rs599063	A	G	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=947;ReadPosRankSum=0.908;SC=GTATCATTCCATGGCCAGTGA;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=60;WE=127996054;WS=127996036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,74:0.53:140
chr9	128001119	rs430397	C	T	2868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=57;PP=1842;ReadPosRankSum=0.141;SC=AGAAAAAAGACATGGTTACTG;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=252;TCF=128;TCR=124;TR=120;WE=128001127;WS=128001109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,137:0.48:285
chr9	128074807	rs432757	T	C	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=55;PP=2378;SC=AAGAAACCATTCAGGAGGTGC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=109;WE=128074815;WS=128074797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	128201098	rs7864593	A	G	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=17;PP=1127;SC=CACCGGGTGGACTCTAGGGCA;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=128201106;WS=128201088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	128206717	rs907501	C	G	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=17;PP=1551;SC=GGCCATGCCGCAAACAGCCTG;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=128206725;WS=128206707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	128209870	rs10986761	G	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=692;SC=CTCGCTAGCAGCCCTGTTTCG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=128209878;WS=128209860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	128246786	rs2070113	G	A	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=23;PP=1673;SC=ACTTGTAATGGTGGCTGCTAA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=74;WE=128246795;WS=128246776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	128327891	rs545320	A	C	4980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=84;NR=74;PP=2965;SC=AGAAGCTGATATCTCTGAAAT;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=158;WE=128327899;WS=128327881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	128711809	rs13298715	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=440;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TATACTGTGTATATATATATA;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=25;WE=128711817;WS=128711799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr9	128724304	rs888230	A	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=645;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ACTTTTTCTCATCTCCCTGCC;SOR=0.637;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=35;WE=128724312;WS=128724294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr9	129097817	rs1230752	G	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=368;SC=CCTTGCTTGCGATTTGCCAGC;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=129097825;WS=129097807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	129143242	rs917778	A	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=366;SC=GGAGATCCCAAGCTGGTGTTA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=129143250;WS=129143232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	129143315	rs917777	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1286;SC=CCTTACCTGCAATCCTTTTCT;SOR=2.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=129143323;WS=129143305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	129158002	rs722538	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GGTGTCTTGCGTTGTCCTGTG;SOR=0.375;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=20;WE=129158010;WS=129157992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr9	129184309	rs887659	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=656;ReadPosRankSum=-1.247;SC=CTGTCTTCTCGTGGGATCTGT;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=35;WE=129184317;WS=129184299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr9	129246177	rs2286886	T	C	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=1062;ReadPosRankSum=-1.057;SC=GGTGTTACCATTGTCATGCAT;SOR=0.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=63;WE=129246185;WS=129246167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
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chr9	129265334	rs28641758	C	T	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=13;PP=1741;SC=CCAGCTGCGCCATGTCAAGAT;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=129265342;WS=129265324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr9	129377855	rs1336980	G	C	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1370;ReadPosRankSum=0.979;SC=AACAGTAAGCGCTTCTCGTCC;SOR=0.461;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=195;TCF=77;TCR=118;TR=87;WE=129377863;WS=129377845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,114:0.47:245
chr9	129595895	rs3118994	T	C	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TCTCAGCCACTGACAAGCTGT;SOR=0.652;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=208;TCF=110;TCR=98;TR=91;WE=129595903;WS=129595885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,101:0.43:236
chr9	129728012	rs10819257	T	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=423;ReadPosRankSum=0.104;SC=AGAAGCCATTTTTTATTGTAC;SOR=0.699;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=27;WE=129728020;WS=129728002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr9	129728336	rs480796	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=0.892;SC=TATATGCCCAGCAAGAGGGGA;SOR=0.126;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=129728344;WS=129728326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr9	129740101	rs10819259	G	T	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1242;ReadPosRankSum=0.129;SC=CTGTTAGAGTGTCTCAGTTTC;SOR=0.450;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=71;WE=129740109;WS=129740091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,88:0.55:160
chr9	129752239	rs10819260	C	T	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=60;PP=1660;ReadPosRankSum=0.320;SC=CCACATGACACGTTGCAGTTC;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=105;WE=129752247;WS=129752229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,131:0.53:249
chr9	129831659	rs1281158	T	A	7059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=120;PP=2965;SC=TTGGCTTATTTTTTTTTAAGA;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=82;TCR=120;TR=202;WE=129831667;WS=129831649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr9	129928600	rs946430	A	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=605;SC=ATTTTAATATATCGAGCATCA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=129928608;WS=129928590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	129961152	rs875382	C	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=536;SC=AGCAAAAACTCGAGTACGTTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=129961160;WS=129961142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	130075672	rs2779714	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=654;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CCATCTGTGGCTGGCAGGATC;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=33;WE=130075680;WS=130075662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr9	130094526	rs10987596	T	G	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TAAAATTAACTGTAACACCTT;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=93;WE=130094534;WS=130094516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,106:0.53:199
chr9	130117861	rs58473776	C	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGTTTAGTAGCCAACTAGGGA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=130117869;WS=130117851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr9	130149403	rs4837149	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=2.032;SC=TGCAGTGATGGCAGGAGGGCC;SOR=2.387;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=130149411;WS=130149393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr9	130155257	rs4074695	T	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	130155331	rs7864853	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=283;ReadPosRankSum=2.131;SC=GTACTCCCAAAGATCCTCTTA;SOR=0.859;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=16;WE=130155339;WS=130155321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr9	130160769	rs10987633	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TTTCATCCCTGGCTTCGGGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=130160777;WS=130160759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr9	130166382	rs10819287	C	G	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=64;PP=2690;SC=CCCCGCCATGCGGGGGAGGGC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=133;WE=130166390;WS=130166372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr9	130167338	rs41302651	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TGTGGCGGCTCCCGGCAGGTG;SOR=0.869;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=17;WE=130167346;WS=130167328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr9	130167390	rs3824413	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=1.648;SC=AAGTTCCAAGCTCTGCATTTC;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=130167398;WS=130167380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr9	130168326	rs10987637	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=494;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGCCTTCTCACGGATGGACTG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=31;WE=130168334;WS=130168316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr9	130169301	rs4075850	G	A	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=1;PP=92;SC=TCAGGGGACTGGACCCCCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=130169309;WS=130169291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	130169874	rs6635	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=780;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CTGGGCATTCAGTCGCTCCTC;SOR=1.535;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=41;WE=130169882;WS=130169864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr9	130191186	rs13292096	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=388;ReadPosRankSum=-1.175;SC=GGTCTCCTCACAGCTGGGCCC;SOR=0.523;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=31;WE=130191194;WS=130191176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr9	130197414	rs4504745	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=689;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TGCACAGGAAAGGTGGAGGTG;SOR=1.080;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=44;WE=130197422;WS=130197404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
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chr9	130212876	rs2247322	T	A	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=471;ReadPosRankSum=-1.714;SC=ACCTAGTACTTGTTCAGTGGC;SOR=0.491;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=34;WE=130212884;WS=130212866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr9	130213508	rs2244624	A	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=691;ReadPosRankSum=-0.992;SC=CACGCGCGGCAGGGCCGAGGG;SOR=0.694;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=48;WE=130213516;WS=130213498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr9	130216951	rs2244218	G	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CCTCCGCACTGCCCCCAACAA;SOR=0.653;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=9;WE=130216959;WS=130216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr9	130219669	rs2243906	C	T	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TGGCAACCATCAAGGTACTGG;SOR=0.636;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=157;TCF=57;TCR=100;TR=82;WE=130219677;WS=130219659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr9	130219743	rs2243903	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=599;ReadPosRankSum=0.582;SC=CGCCTGCTCCTTTTGGGCTGC;SOR=1.395;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=29;WE=130219751;WS=130219733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr9	130221388	rs2243767	T	C	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=903;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TCGGATGGCCTTAGTGAGACC;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=38;TCR=94;TR=57;WE=130221396;WS=130221378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr9	130236243	rs2250267	G	A	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=42;PP=965;ReadPosRankSum=0.534;SC=ACGCATACATGTGTGTGTGTG;SOR=0.866;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=16;TCR=68;TR=51;WE=130236251;WS=130236233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,58:0.62:94
chr9	130241374	rs56957982	G	GCA	1081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.352;NF=5;NR=16;PP=894;ReadPosRankSum=1.406;SC=CCTCTTACACGCAGTCTGCTG;SOR=0.625;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=21;WE=130241382;WS=130241364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr9	130241822	rs1539569	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-0.878;SC=CCTGGCTGCATCCCCCAGCCA;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=130241830;WS=130241812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	130242109	rs1539568	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=501;ReadPosRankSum=0.851;SC=CCCCTACCTCCGGCTGCAGGA;SOR=0.538;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=27;WE=130242117;WS=130242099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr9	130242166	rs1539567	A	G	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.935;SC=GCGCCACCTCAACGCAGAGCG;SOR=0.710;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=72;WE=130242174;WS=130242156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,87:0.44:199
chr9	130248133	.	G	A	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.881;SC=AGGAAGAGGAGTCCCAGGTGA;SOR=0.591;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=74;WE=130248141;WS=130248123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,81:0.51:160
chr9	130251512	rs2245677	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CTCAGGGTGCGATGCCGGAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=130251520;WS=130251502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	130253286	rs5900748	G	GA	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=256;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GCACGTCCATGCCCCAGGAAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=130253294;WS=130253280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr9	130255091	rs146106537	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=855;ReadPosRankSum=0.027;SC=GAGATGATCTCGGAGCAGCGC;SOR=0.917;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=57;WE=130255099;WS=130255081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,68:0.59:116
chr9	130258160	rs2249052	A	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=384;ReadPosRankSum=2.492;SC=TTATGTTATAAATATTCAAAC;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=22;WE=130258168;WS=130258150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr9	130258380	rs75171318	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=536;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CCAAGGTGGGCAGCAGCCGTC;SOR=0.514;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=36;WE=130258388;WS=130258370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr9	130259618	rs2248822	A	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=972;ReadPosRankSum=-0.389;SC=AGCCAGGTACAAGCACAGCTC;SOR=0.607;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=59;WE=130259626;WS=130259608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,72:0.55:131
chr9	130269786	rs2245051	A	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=1.341;SC=CTGCTCAAAGAAGACCCGTCT;SOR=0.128;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=25;WE=130269794;WS=130269776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr9	130286150	rs2251409	A	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=634;ReadPosRankSum=-2.147;SC=CCTGATGAGCAGCTGCCCTCT;SOR=0.409;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=43;WE=130286158;WS=130286140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr9	130287287	rs3765602	C	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=745;ReadPosRankSum=-1.229;SC=CCCTGGCCAGCTCCAGATGCC;SOR=0.884;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=96;TCF=75;TCR=21;TR=39;WE=130287295;WS=130287277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr9	130289615	rs2243558	C	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=532;ReadPosRankSum=0.195;SC=TGGGCAGGAGCGGGTGGGGAG;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=35;WE=130289623;WS=130289605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr9	130331257	rs151147273	CCCGCTCCCG	C	852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=2987;SC=CCCTGCTTCCCCCGCTCCCGC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=130331273;WS=130331247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	130341095	rs4240419	C	T	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=10;PP=952;SC=ATGATCATTCCGCTGCACTCC;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=130341103;WS=130341085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	130341253	rs4240420	A	G	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=76;PP=2694;SC=AGGGACCGGAACTGGCCCAGT;SOR=1.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=130341261;WS=130341243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	130413879	rs138763389	T	C	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1051;ReadPosRankSum=0.279;SC=TCTCCTTTTTTAGAGATTATG;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=67;WE=130413887;WS=130413869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,78:0.58:135
chr9	130486385	rs35761147	G	GC	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.125;NF=13;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CGTCTCCCACGCCCCCCCCGA;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=16;WE=130486393;WS=130486375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr9	130494957	rs538066	T	C	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=83;PP=2965;SC=TTGATCTGCTTGCCACCCGTG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=90;TCR=84;TR=172;WE=130494965;WS=130494947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr9	130504070	rs514024	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=928;ReadPosRankSum=-1.572;SC=TCAGTACCTGGGCCATGTCCA;SOR=0.669;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=65;WE=130504078;WS=130504060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr9	130524817	rs3962613	C	T	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=35;PP=1076;SC=GCCAAAAACCCTGTGGTCCTT;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=130524825;WS=130524807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	130536717	rs10760500	G	A	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.370;SC=AGGTTGGAGAGACTCCCAAAG;SOR=0.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=68;WE=130536725;WS=130536707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr9	130565267	rs10760502	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TGCGCGCGGCATAACGACCCA;SOR=0.743;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=10;WE=130565275;WS=130565257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr9	130565369	rs138322374	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-2.167;SC=GGGCCAGCGGGCCTGGGCGCG;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=9;WE=130565377;WS=130565359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr9	130587052	rs148063362	A	AGGGAGG	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=1.389;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.860;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr9	130630233	rs4226	G	T	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=22;PP=1043;SC=GGAGGACCTCGAATCAGGACG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=60;WE=130630241;WS=130630223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	130630639	rs913986	A	G	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=27;PP=1253;SC=AGGCGATGACAGGTTCTGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=130630647;WS=130630629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	130634944	rs743537	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=-0.563;SC=ATCCCCTGCCTCTCACCCCAC;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=16;WE=130634952;WS=130634934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr9	130635540	rs2767398	A	G	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=22;PP=1492;SC=GTCAGGGAAGAGAGGGTGCTC;SOR=1.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=130635548;WS=130635530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	130648680	rs913983	G	A	4079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=42;PP=2335;SC=CTGATTAACCGCATAGACTCC;SOR=1.398;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=120;WE=130648688;WS=130648670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	130649111	rs4837202	G	A	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=941;SC=GGTGAGCGCTGGCAGGGTCCT;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=130649119;WS=130649101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	130657020	rs5900777	GC	G	2394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=55;PP=2034;SC=CAGGCTCAGCGCCCCCACCTC;SOR=2.895;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=55;WE=130657028;WS=130657010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	130670652	rs1043012	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=357;SC=CGGCATGGCGACTGGCAGGAC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=130670660;WS=130670642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	130670903	rs10760511	C	A	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=59;PP=1739;SC=AGAACCCACTCGCCTCCGGCC;SOR=2.331;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=130670911;WS=130670893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	130672106	rs7026378	A	G	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=773;SC=TATCTGTGCTATGGTCACCCA;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=130672114;WS=130672096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	130672221	rs10739700	C	T	6179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=72;PP=2965;SC=CCGGCCTGGCCGGTCTGACCT;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=114;TCR=72;TR=185;WE=130672229;WS=130672211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr9	130690412	rs10760515	G	C	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=28;PP=1063;SC=CGGGGCCCAGGGCAGCCTGAT;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=130690420;WS=130690402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	130698029	rs7997	G	C	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=31;PP=1398;SC=CACTCTCTTGGTCTTCAGCAT;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=130698051;WS=130698019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	130698043	rs6781	A	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=34;PP=1440;SC=TCAGCATCACATAGGAGATGA;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=130698051;WS=130698019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	130699917	rs2274424	G	A	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=38;PP=1640;SC=AGATGGTAGAGGGCTGACTAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=130699925;WS=130699907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	130700251	rs6478802	T	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=410;SC=CGCCTCCTCTTCTTTGCATAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=130700259;WS=130700241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	130707081	rs2274426	A	G	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=70;PP=2875;SC=CATCTGTGAAATCCTGGCTCT;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=147;WE=130707089;WS=130707071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr9	130710726	rs4837212	A	G	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=81;PP=2544;SC=CTATGCCCTGACCACCCACAG;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=116;WE=130710734;WS=130710716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	130710791	rs4837213	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=747;SC=CAGAAGGGCTTGGATTCCAAT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=130710799;WS=130710781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	130715922	rs2417062	A	G	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=67;PP=2263;SC=AGTTGACTGCAGAATCCCAGG;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=116;WE=130715930;WS=130715912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	130829039	rs1539350	A	G	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=63;PP=2635;SC=GGCCACCGCCACCACTGCCAC;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=139;WE=130829047;WS=130829029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr9	130854127	rs10739712	A	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=232;SC=AGTCGCCATCAGAGGCGTTTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=130854135;WS=130854117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	130854461	rs34182859	TCA	T	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=0.226;SC=AAGGGAGAACTCACAACGTTA;SOR=0.859;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=130854470;WS=130854451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr9	130860866	rs947624	T	C	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=39;PP=2131;SC=TGTGCCTGTATGTGCCGGTCA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=114;WE=130860874;WS=130860856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	130861039	rs947623	A	G	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=61;PP=1741;SC=GGAGAGGCGCATTCAACCGGT;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=20;TCR=61;TR=81;WE=130861047;WS=130861029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	130864676	rs7859709	T	C	4882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=49;PP=2598;SC=CGATGACCATTGACTGGAACG;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=136;WE=130864684;WS=130864666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr9	130868312	rs7864867	G	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=15;PP=727;SC=GGCTCACCACGAGTTCCTTAC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=130868320;WS=130868302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	130868831	rs1418420	T	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=502;SC=TTTAGAAACCTCCTCCCAGCA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=130868839;WS=130868821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	130869499	rs4837239	A	T	5411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=81;PP=2965;SC=GGTCGGGGGGAGCGGACAGAA;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=166;WE=130869507;WS=130869489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr9	130883511	rs2040004	C	T	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=50;PP=2167;SC=GGTCATCGAACGCATCCAGCC;SOR=0.895;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=130883519;WS=130883501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	130884753	rs13283456	C	T	2721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=71;PP=1750;ReadPosRankSum=0.862;SC=GTCCTGGAGGCGGTGCCTGGG;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=74;TCR=137;TR=108;WE=130884761;WS=130884743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,124:0.53:235
chr9	130886906	rs4837241	A	G	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=42;PP=1275;SC=TTAACAAGACACTCTGGGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=130886914;WS=130886896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	130889571	rs4837242	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=499;SC=TTTTACACAAAAGAATACAGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=130889579;WS=130889561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	130889600	rs4837243	C	T	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=681;SC=AGACTTCAGACCAAGTCACTC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=130889608;WS=130889590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	130889705	rs4837244	G	A	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=57;PP=2207;SC=TCCCCGGCCGGGCCAGGCCTT;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=123;WE=130889713;WS=130889695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr9	130890449	rs11283643	A	AGGTGCGCGGC	8041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=29;PP=2900;SC=ACCCGGCACCAGGTGTTGCGG;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=69;WE=130890457;WS=130890439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	130913608	rs12006030	G	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.24;ReadPosRankSum=2.187;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr9	130914170	rs11794980	C	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=121;ReadPosRankSum=-1.031;SC=GACCCCTCACCGTCCACGCCT;SOR=0.902;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=12;WE=130914178;WS=130914160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr9	130914434	rs2232629	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=32;PP=1348;SC=GGTGTCTGCCAGCCACTCACT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=130914442;WS=130914424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	130922952	rs1539351	G	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1131;SC=CCCCGTGAGAGCTGCAGGTCA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=130922960;WS=130922942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	130928633	rs11549260	C	T	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=614;ReadPosRankSum=-1.537;SC=GATTGCGCACCGGCGGCTCAC;SOR=0.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=37;WE=130928641;WS=130928623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
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chr9	130940822	rs3892074	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=379;ReadPosRankSum=0.665;SC=CAAGAGCTGCCTTCTCCGTCC;SOR=1.093;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=22;WE=130940830;WS=130940812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr9	130941741	rs11788797	C	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CAAAGAGGCCCCAGGGGCTCC;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=27;WE=130941749;WS=130941731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr9	130942972	rs45585631	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=277;ReadPosRankSum=0.513;SC=CATGTCCCTCTGAAGGGCCAG;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=16;WE=130942980;WS=130942962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr9	130981064	rs3003602	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=-1.513;SC=TGGCCACGCACCTCTGCGTGC;SOR=0.829;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=19;WE=130981072;WS=130981054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr9	131015279	rs2267958	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=0.964;SC=CTCACAGCATGTGTGTGCACG;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=11;WE=131015287;WS=131015269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr9	131085373	rs3003601	G	C	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=75;PP=1926;SC=CTGCAGAAAGGGCTGTTGGCC;SOR=1.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=120;WE=131085381;WS=131085363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	131151803	.	G	T	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1034;ReadPosRankSum=1.934;SC=AGATTTGCAGGTTGAGGTATA;SOR=0.687;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=66;WE=131151811;WS=131151793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,78:0.57:136
chr9	131183382	rs62587135	GG	TC	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GGCACCGAGTGGGCACCTAAC;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=5;WE=131183391;WS=131183372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	131193665	rs1009850	A	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=476;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGAACGAGTGAGTGAATGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=39;WE=131193673;WS=131193655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr9	131218213	rs10819384	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=471;SC=GGCGAGACCCGGCCAGGCCCG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=131218221;WS=131218203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131222541	rs6478832	A	G	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=45;PP=1453;SC=CAGCCCTAAGAACCCTGGGGC;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=131222549;WS=131222531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	131235321	rs4512487	A	G	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=48;PP=1395;SC=AGCTGAAAACAGTAGGTGGCA;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=63;WE=131235329;WS=131235311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	131250084	rs372216616	AC	A	1925.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	131250086	rs148902913	AC	A	1925.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	131255236	rs62584804	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.301;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=339;ReadPosRankSum=0.569;SC=TCCACTCTACCCTGTGCCTCT;SOR=0.174;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=24;WE=131255244;WS=131255226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr9	131287352	rs10988014	C	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=827;SC=AGTATCAATTCGTTGAATGTG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=131287360;WS=131287342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	131300143	rs7048583	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=487;SC=CTGCCCTGTGGCAGGTGCTAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=131300151;WS=131300133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	131303630	rs10513496	C	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=1.385;SC=TTGGAGGTCCCTTAGTAGATT;SOR=1.402;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=14;WE=131303638;WS=131303620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr9	131331320	rs2152833	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=216;SC=AGAAGTTACCCGAATCCTGCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=131331328;WS=131331310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	131337389	rs2297768	C	T	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=6;PP=1138;SC=AACATGGCTCCGTCCCTAATG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=131337397;WS=131337379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	131337661	rs2297769	A	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=888;SC=TCACAACATTATTATGTTAAC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=131337669;WS=131337651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	131340306	rs4837280	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=5;PP=533;SC=ATTTGAGAACATAGAATTCAG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=131340314;WS=131340296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	131340639	rs1890103	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=745;SC=TCACAGGTGTTTCTCATCATG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=131340647;WS=131340629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	131344607	rs5900808	GA	G	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=487;SC=AAAGTTATGAGAAAAAATGTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=131344615;WS=131344601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	131346218	rs10760566	A	C	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=68;PP=2367;SC=AGAAACATGCACTGCTAGAGG;SOR=1.232;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=131346226;WS=131346208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	131346479	rs4240431	A	G	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=41;PP=2794;SC=TCAGGAATGGAAAAAAGACCT;SOR=1.456;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=129;WE=131346487;WS=131346469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	131347165	rs4836615	G	A	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	131347169	rs4837284	C	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	131350112	rs4837286	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=707;SC=CAGAGTTTAAAATAAGATTTA;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=131350120;WS=131350102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	131351322	rs62584843	G	C	106.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AAATGAGAAGGCTTAGAATTC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=131351330;WS=131351312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr9	131360750	rs2227864	C	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=24;PP=1152;SC=CTGAAGGTCTCATGGCAGAGG;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=131360758;WS=131360740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	131374165	rs7024498	C	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=47;PP=1556;SC=AGGAAGATGACCACCGTCACT;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=131374173;WS=131374155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	131375701	rs1415568	A	G	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=48;PP=1641;SC=GCAAAGACCTAGCTTCTGTGA;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=131375709;WS=131375691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	131379967	rs2227862	C	T	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=43;PP=1520;SC=GGGACCTAACCGGCGTGCAGA;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=131379975;WS=131379957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	131380149	rs3750332	C	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=498;SC=GTTCATGACCCCTCAGTCCAA;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=131380157;WS=131380139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	131380994	rs4837290	T	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=501;SC=GATCTCCTGATCTCGTGATCT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=131381002;WS=131380986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	131388643	rs3737308	C	T	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1231;SC=CTGGCGACTCCGCCAACTCAG;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=131388651;WS=131388633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	131389060	rs10694437	C	CAA	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=673;SC=CACGACAAGACGAGCAGGATG;SOR=1.493;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=131389068;WS=131389050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	131392553	rs7866175	G	A	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=36;PP=1311;SC=CTGAGCTCTCGGCCAGCTGGG;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=131392561;WS=131392543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	131397479	rs4837291	G	A	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=42;PP=1758;SC=CCTTCCCGTCGGTGGCCACAC;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=90;WE=131397487;WS=131397469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	131398343	rs947182	T	A	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=154;SC=CACAGCCCCCTGTCCTGGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=131398351;WS=131398333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	131398636	rs10760570	C	T	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=25;PP=937;SC=CGGCCGACGGCTGCTGGGGAC;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=131398644;WS=131398626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	131403096	rs2298045	A	G	5258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=98;PP=2965;SC=TGGGTATGTCATACTGGGACG;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=163;WE=131403104;WS=131403086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr9	131418828	rs4837292	A	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=13;PP=704;SC=ACCGTCTCCCAGCGGATGCCC;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=131418836;WS=131418818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	131452121	.	C	CG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	131452126	.	GCC	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	131452137	.	C	CG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=1;PP=68;SC=CCGCGGCGGCCGCGCTGCGAG;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=131452145;WS=131452127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	131453331	rs4837293	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=20;NR=21;PP=759;SC=TGGAACGCTTGCCTTTGTACT;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=131453339;WS=131453321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	131455760	rs10739728	C	T	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=747;SC=CTACCTGCTGCACAGTTTTAT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=131455768;WS=131455750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	131455903	rs4836618	C	T	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=66;PP=2209;SC=AAAGCTCTTCCGGTATTCATT;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=114;WE=131455911;WS=131455893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr9	131456385	rs10637043	G	GTA	1407.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.373;NF=1;NR=26;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ATTTTGGGGTGTATATATATA;SOR=0.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=27;WE=131456393;WS=131456375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,45:0.92:49
chr9	131465167	rs1572915	A	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=25;PP=948;SC=TGGCTGAGAGAAGGGCCCCAA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=131465175;WS=131465157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	131465284	rs3750321	G	T	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=223;SC=TCGCCCCGGAGCCCCGAACCG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=131465292;WS=131465274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	131468251	rs1572916	T	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=58;PP=1928;SC=GAGACACCATTCCAGCCTGCA;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=131468259;WS=131468241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	131475951	rs4837297	T	C	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=62;PP=1594;SC=TCTGACTTGGTGGGACCCTGG;SOR=2.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=20;TCR=62;TR=82;WE=131475959;WS=131475941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	131477544	rs7854055	G	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=44;PP=1746;SC=GGTATGGGACGGGATTGGGGG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=131477552;WS=131477534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr9	131482370	.	G	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=263;ReadPosRankSum=0.141;SC=TGGGACAGCAGACCCCCTGCC;SOR=1.130;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=15;WE=131482378;WS=131482360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr9	131482467	rs3750325	T	C	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=48;PP=2240;SC=AGTGAGCGCCTGTCCTATTGC;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=78;TCR=48;TR=126;WE=131482475;WS=131482457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	131483749	rs2900268	T	A	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=24;PP=1161;SC=CCGCAACCACTGACCCCAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=131483757;WS=131483739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	131484526	rs10988105	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=738;SC=GGACTGAGGGCGGCTGTGTAT;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=131484534;WS=131484516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr9	131502112	rs2298044	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=425;SC=GACCAGAAGGAAGGTGGGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=131502120;WS=131502111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	131502440	rs3818931	G	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=42;PP=1310;SC=CACTCCCCCAGTTTCTCTTCA;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=131502448;WS=131502430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	131502460	rs7027146	G	T	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=27;PP=835;SC=AGATACCAGCGGCAGGACCCC;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=131502468;WS=131502450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	131505092	rs10739731	A	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=39;PP=1264;SC=TCTAGGAACTATCTAGAGGTA;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=131505100;WS=131505082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	131515547	rs8507	G	T	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=63;PP=2642;SC=TGAGGAAGGCGGCGTCGCTCG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=135;WE=131515555;WS=131515537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr9	131550722	rs1891076	C	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=872;SC=GGTTTCCCTACAGCAGCCCTG;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=131550730;WS=131550712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	131553768	rs10760577	A	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=52;PP=1919;SC=TGCATGTGACAGAGCCAGTAC;SOR=1.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=81;WE=131553776;WS=131553758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	131566326	rs368513382	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=0.301;SC=ACTCGCAGTGTGGCATCACCT;SOR=0.886;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=22;WE=131566334;WS=131566316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr9	131568363	rs2417127	A	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=49;PP=1830;SC=AGACAGGAGGACCCTCCGCCC;SOR=0.992;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=86;WE=131568371;WS=131568353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	131570027	rs150344347	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=580;ReadPosRankSum=-0.986;SC=TCCCAGCAGGGAGGGTGTGGG;SOR=0.811;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=33;WE=131570035;WS=131570017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr9	131570178	rs45609236	T	C	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.79;SOR=1.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	131570183	rs7862546	C	G	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.30;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	131580998	rs2293969	C	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.90;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131580998	.	CGGGCGCG	TGGGCGCA,TGGGCGCG	91	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=6,11;NR=5,9;PP=91,47;QD=13.1334431693;SC=ACCCTGGCGTCGGGCGCGGGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=11,20;WE=131581013;WS=131580988;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.55:20
chr9	131581005	.	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr9	131583170	rs2280845	T	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=31;PP=742;SC=CCCACTCACCTGAGGCCCCTA;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=131583178;WS=131583160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	131585069	rs2280843	A	G	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=69;PP=2155;SC=ACCCGCCTGGATGAGGCCAGG;SOR=1.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=100;WE=131585077;WS=131585059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	131585205	rs2997919	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=357;SC=GCCCGAGACCTGGCCCACTGG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=131585224;WS=131585195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	131585216	rs2977994	G	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=331;SC=GGCCCACTGGGGTCCCCTGTC;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=131585224;WS=131585195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	131585994	rs2997918	T	C	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=14;PP=1115;SC=AAGGCCCCAGTGGCTGGCAGT;SOR=1.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=131586002;WS=131585984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	131586913	rs4836630	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	131586918	rs2997917	G	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	131587240	rs2293968	G	A	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=77;PP=2381;SC=CAGGGGTTGGGGAACCTTCCA;SOR=2.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=23;TCR=77;TR=100;WE=131587248;WS=131587230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
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chr9	131589234	rs2977991	C	G	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=4;PP=1475;SC=GTGGACGGGGCCATGGTGAAG;SOR=4.370;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=56;WE=131589242;WS=131589224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr9	131772389	rs3750340	T	G	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=55;PP=2455;SC=GGGTGGGCAGTGGGACTCACG;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=131772397;WS=131772379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	131804812	rs370004813	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=488;ReadPosRankSum=0.978;SC=GAGGTGGTGGGCATAGGCCTG;SOR=0.666;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=34;WE=131804820;WS=131804802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr9	131821267	rs17452603	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.736;SC=GCTGCCAGAAGTGGCTGGTGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=131821275;WS=131821263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	131846774	rs10988199	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=509;SC=ATCACGTATGGCTGTGACTGA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=131846782;WS=131846764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	131846957	rs11541836	T	C	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=80;PP=2081;SC=GTGATCTCTCTGGCCACCTCC;SOR=1.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=124;WE=131846965;WS=131846947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	131848382	rs7859344	T	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=7;PP=833;SC=TGTGTCTGACTGGCTCTCACA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=131848390;WS=131848372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	131860901	rs3118635	G	T	6869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=127;PP=2965;SC=AGGGGCACCAGGGGAGACCGC;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=89;TCR=127;TR=215;WE=131860909;WS=131860891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr9	131862073	rs3118638	G	A	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=28;PP=1715;SC=TTCTCTATAAGCTGGTCTATC;SOR=1.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=84;WE=131862081;WS=131862063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	131862730	rs10819462	C	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=915;SC=CAGGAAGTCCCGAGGCTGCAG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=131862738;WS=131862720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	131862781	rs10988204	G	A	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=14;PP=2057;SC=AAGCCCTGCCGGGCCTCACCT;SOR=2.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=78;WE=131862789;WS=131862771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	131863079	rs7866897	T	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=487;SC=CATTTGTACCTCTCTGGGATG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=131863087;WS=131863069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131864950	rs746873	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-1.117;SC=CACAGTGTCCCTGCTCCCACT;SOR=0.015;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=14;WE=131864958;WS=131864940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr9	131865493	rs3124498	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=1.268;SC=GAGGGGCCTGCGAGTCCCAGC;SOR=0.732;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=131865501;WS=131865483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr9	131871144	rs2768629	A	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=40;PP=1175;SC=CTACAAAGTGAGTGAGCAGAA;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=56;WE=131871152;WS=131871134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	131871249	rs2541163	A	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=8;PP=383;SC=GCTGTGGTGGAATCGGGGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=131871257;WS=131871239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	131871435	rs2541162	A	C	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=47;PP=2354;SC=GGGAGTCAGGACAAAAGGTAA;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=131871443;WS=131871425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	131872847	rs11278777	GCGCCGC	G	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=643;ReadPosRankSum=0.158;SC=GGCAAAGTCCGCGCCGCCGCC;SOR=1.027;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=13;WE=131872860;WS=131872837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr9	131873222	rs3814492	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=0.279;SC=AGGGCCGAGGGCGAGTCATTG;SOR=1.382;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=23;WE=131873230;WS=131873212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr9	131873256	rs3118625	A	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=335;ReadPosRankSum=0.008;SC=AGGAAGGAGGAGGTCACCGTC;SOR=0.788;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=21;WE=131873264;WS=131873246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
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chr9	131881492	rs10819466	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=67;ReadPosRankSum=-1.633;SC=TGGCCAGCCTGGTCTTGAACC;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=7;WE=131881500;WS=131881482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr9	131899846	rs3118631	T	C	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=18;PP=1017;SC=TGGTTCTGAATGCTGGGGCCC;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=131899854;WS=131899836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	131900180	rs2297112	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TTCTCCTTCAGTTTCTCCTGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=131900188;WS=131900170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr9	131904608	rs3124514	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.674;NF=5;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GCATTGTGTGCGTGTGCGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=131904625;WS=131904605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	131904617	rs57365080	T	TTG	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.39;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=529;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GCGTGTGCGTTTGTGTGTGTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=131904625;WS=131904605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr9	131905814	rs913272	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=160;SC=CGGGGAAGGGTGCCAGAGGCC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=131905822;WS=131905804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	131940019	rs184457	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr9	132377900	rs918165	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=493;ReadPosRankSum=-0.845;SC=AGCCTTGAGCCTGGGGACCTG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=35;WE=132377908;WS=132377890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr9	132381749	rs4240434	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=562;ReadPosRankSum=-1.099;SC=AAGAAGGAAAGAAATGCCCCT;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=30;WE=132381757;WS=132381739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr9	132382253	rs7467760	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=377;ReadPosRankSum=-1.525;SC=ATCCTTCTAGCCTGGGTGGTG;SOR=1.508;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=20;WE=132382261;WS=132382243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr9	132396281	rs10819551	G	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=25;PP=1648;SC=AGGAAGGGCCGCACGTGCGGT;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=77;WE=132396289;WS=132396271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr9	132400480	rs3739851	G	A	2818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=1771;ReadPosRankSum=1.565;SC=AGTTGTAGGCGGCTCCGGACT;SOR=0.558;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=104;WE=132400488;WS=132400470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,124:0.56:220
chr9	132401824	rs2302780	G	A	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=37;PP=1135;SC=GGTCCTATCTGTCCGCATTCT;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=132401832;WS=132401814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	132402908	rs2241247	C	G	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=40;PP=2285;SC=GGGCGTTGCTCACGCCTTCCT;SOR=1.117;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=104;WE=132402916;WS=132402898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr9	132404304	rs4837396	C	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=48;PP=1418;SC=GCAGCAGGGCCGTCGCGCTTT;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=132404312;WS=132404294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr9	132565726	rs151251684	GGGGGGCGC	G	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.964;NF=1;NR=22;PP=2984;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TCGGCGCTGCGGGGGGCGCGG;SOR=1.179;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=23;WE=132565741;WS=132565716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr9	132569442	rs2302820	G	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=-0.891;SC=TTCGCATCCTGTTTCTTCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=23;WE=132569450;WS=132569432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr9	132569553	rs1043178	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=957;ReadPosRankSum=0.320;SC=AATTGCACCCCGGGATCATTG;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=70;WE=132569561;WS=132569543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr9	132576512	rs72755217	G	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.784;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=0.737;SC=CTGGGAAGAAGAAACAAGGTG;SOR=1.692;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=23;WE=132576520;WS=132576502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr9	132586416	rs114150156	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=1.470;SC=GAACCGGTGCAGCCGCCAGAC;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=16;WE=132586424;WS=132586406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr9	132586552	rs72755223	T	A	185.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TCGGTTCTGCTCCGCCCCTGT;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=9;WE=132586560;WS=132586542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr9	132590352	rs1806988	AG	GT	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=264;ReadPosRankSum=0.352;SC=GATTACAGGCAGGAGCCACCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=11;WE=132590361;WS=132590342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr9	132590431	rs732074	C	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=1.143;SC=ACATCCCACTCTGCACAACTC;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=27;WE=132590439;WS=132590421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr9	132591272	rs55962905	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=213;ReadPosRankSum=2.145;SC=ATTCTCAGAGTAATCCTAACA;SOR=0.256;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=17;WE=132591280;WS=132591262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr9	132591372	rs7032945	T	G	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=771;ReadPosRankSum=2.118;SC=CTGGAACCCATATGCCCCGGC;SOR=1.124;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=48;WE=132591380;WS=132591362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,56:0.44:128
chr9	132591425	rs7047271	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=956;ReadPosRankSum=-2.414;SC=CATCCTGCCTCCATGGGTTCC;SOR=0.956;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=64;WE=132591433;WS=132591415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr9	132591509	rs3818553	A	G	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1064;ReadPosRankSum=2.158;SC=TCTCCGTGTCACCTACTCTCA;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=66;WE=132591517;WS=132591499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,78:0.53:146
chr9	132593982	rs2062801	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr9	132594362	rs2062800	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.589;SC=ATCCTATTTACAGTTGGCAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=132594370;WS=132594352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	132594378	rs2062799	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.842;SC=GCAAAAAAAAAAAAATGCCGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=132594386;WS=132594368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr9	132595664	rs72755238	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=523;ReadPosRankSum=-0.649;SC=AGCTCTCTGAGGGAACCTAGA;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=33;WE=132595672;WS=132595654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr9	132595685	rs45507500	C	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=723;ReadPosRankSum=0.953;SC=CCCAGGCAGCCGCTAAAGGTG;SOR=0.947;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=48;WE=132595693;WS=132595675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr9	132597021	rs3814547	C	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-0.386;SC=AGTTCTGTACCTCTCTGGTCT;SOR=0.562;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=19;WE=132597029;WS=132597011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr9	132597062	rs41278736	A	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=0.205;SC=AAAGAAGAAGAAGCAGCAATG;SOR=0.902;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=14;WE=132597070;WS=132597052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr9	132597621	rs11790613	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=1.239;SC=GCACGCACAGTCCGCGTGGCC;SOR=1.071;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=10;WE=132597629;WS=132597611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr9	132615077	rs2296786	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=290;ReadPosRankSum=0.593;SC=GGCCGCCTTCCGGAGGCTCTG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=17;WE=132615085;WS=132615067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr9	132618578	rs4836674	T	C	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=69;NR=40;PP=2268;SC=TCCTCTCAACTCACACAGGGA;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=109;WE=132618586;WS=132618568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	132618807	rs7862315	G	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=738;SC=CAAAGTCAGCGAATCCTGGGC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=132618815;WS=132618797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	132620224	rs2417150	A	G	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=32;PP=1824;SC=TGTGGCCCCTATTCAGGAGAG;SOR=1.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=85;WE=132620232;WS=132620214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	132620364	rs10819568	T	C	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=63;PP=1840;SC=GAGAATCCTTTGCTGACCACA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=103;WE=132620372;WS=132620354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	132620458	rs10819569	C	A	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.44;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	132620464	rs10760638	C	T	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	132620620	rs2174156	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=851;SC=AAGCAAAATTTGAGCTTCCGG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=132620628;WS=132620610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	132620707	rs2134601	T	C	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=45;PP=2519;SC=CTTGTTAGGCTAGAGTGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=115;WE=132620715;WS=132620697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	132620990	rs2174157	T	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1120;SC=GGTGTCTGTTTCTGGGTCAGT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=132620998;WS=132620980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	132623293	rs1503375	C	T	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=69;PP=2738;SC=AGTCAGAGGACGATGACCTGA;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=135;WE=132623301;WS=132623283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr9	132623868	rs10115249	T	C	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=96;PP=2736;SC=ACATGAACGCTGCCCTGCAGG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=54;TCR=96;TR=150;WE=132623876;WS=132623858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr9	132623917	rs10124224	C	A	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=57;PP=1917;SC=GTCCGAGGGCCGAGAGCTGTC;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=81;WE=132623925;WS=132623907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	132625417	rs4837419	CA	TG	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=6;PP=737;SC=TAAACTGCCGCATGCCTCATT;SOR=1.244;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=15;WE=132625426;WS=132625407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	132625602	rs2900279	T	C	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=46;PP=1453;SC=TCCCTAGCCTTGGGCGGTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=132625610;WS=132625592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	132627480	rs913319	C	T	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=15;PP=1094;SC=TGTCAGGAAACGCCACACTCT;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=132627488;WS=132627470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	132627723	rs913320	G	A	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=57;PP=1605;SC=TGACTTTGACGCCAAAACCAG;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=76;WE=132627731;WS=132627713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	132630231	rs913325	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=8;PP=1052;SC=GGCGCTGGAGACTGGTTCCTC;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=132630239;WS=132630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	132630664	rs10602985	TGAC	T	6556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=73;PP=2967;SC=TGGCTGCCCTTGACGACCAGC;SOR=1.248;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=11;TCR=80;TR=84;WE=132630674;WS=132630654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	132631680	rs6478920	T	C	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=81;PP=2452;SC=TTCTCAGCCTTGTGCAGTGTC;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=146;WE=132631688;WS=132631670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	132632162	rs5900871	G	GC	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=816;SC=CATGGGCTGGGCCTGTCCTGG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=20;WE=132632170;WS=132632152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	132635653	rs1809959	A	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=29;PP=2571;SC=ATGAGCCACCATGCCCAGCCA;SOR=2.267;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=94;TCR=29;TR=123;WE=132635661;WS=132635643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	132635944	rs2296787	C	G	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=88;PP=2965;SC=GCCCTGATGCCGGACACTGAT;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=164;WE=132635952;WS=132635934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr9	132636031	rs4332226	A	G	6702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	132636031	.	AGT	GGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=49;NR=74;PP=2947;QD=20;SC=GAGGTGAGCCAGTGGCCTCGG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=123;WE=132636041;WS=132636021;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,123:0.95:129
chr9	132636033	rs4415421	T	C	6702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.60;SOR=1.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	132637691	rs35071307	C	T	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=43;PP=1620;ReadPosRankSum=0.711;SC=GCGAGTGGCTCAACAAGTTCA;SOR=0.678;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=220;TCF=134;TCR=86;TR=105;WE=132637699;WS=132637681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,129:0.47:276
chr9	132652677	.	G	GGA	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=66;QD=38.5;SC=GGAGCATGCTGGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=132652685;WS=132652667;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr9	132652994	rs72757227	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=0.788;SC=ACCACAGGGCGGGTCTGAGAT;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=132653002;WS=132652984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr9	132658044	rs2047837	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=295;SC=GTAACAGTCATGGTTGTGGGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=132658052;WS=132658034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132662076	rs149093701	AGGAAGGGGAAGG	A	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.77;ReadPosRankSum=0.208;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr9	132662786	rs1023000	C	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=923;SC=CGCCTGCTCGCTGCGTGCTGG;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=132662794;WS=132662776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	132671065	rs190660924	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CTCTTGACCTCAGGTGATCCA;SOR=0.288;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=132671073;WS=132671055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr9	132671359	rs3215850	T	TG	646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=652;SC=CCTGCAGCCATGGGGGGTGCA;SOR=2.737;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=20;WE=132671367;WS=132671349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	132672319	rs7855720	G	A	5447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=55;PP=2965;SC=TCCCTTTTCAGAAGCAGCTGC;SOR=1.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=119;TCR=55;TR=174;WE=132672327;WS=132672309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr9	132677034	.	GTCTATATATATA	G	133	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	132677048	.	A	G	142.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	132678195	rs7867211	G	A	4596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=71;PP=2835;SC=TAAAAGACACGCCAGAAAACC;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=154;WE=132678203;WS=132678185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr9	132681277	.	C	CT	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9382;HP=19;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=63.93;NF=3;NR=0;PP=33;QD=12.0;SC=TTAGGCTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=132681285;WS=132681267;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr9	132681619	rs1054874	C	T	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=CAAAATCTTTCGGTCAACTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=132681627;WS=132681609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	132686186	rs4836680	A	G	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=39;PP=1540;SC=CGTTGAAGCGATGGGAGAGGG;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=86;WE=132686194;WS=132686176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	132689671	rs4837429	A	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=84;PP=2544;SC=ATTATTAAACAAAGTTGTTTT;SOR=2.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=21;TCR=84;TR=105;WE=132689679;WS=132689661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	132720720	rs11394970	G	GA	2320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=17;PP=1350;SC=CAAAAAAAAAGAAAAAAAAAT;SOR=2.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=60;WE=132720728;WS=132720710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	132720869	rs12115844	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=790;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TTAGTACCCTCTGCTTCTCTT;SOR=0.540;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=55;WE=132720877;WS=132720859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
chr9	132816398	rs5900882	T	TC	3331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=47;PP=2092;SC=CCGAGGCCACTCCCCGGGTTT;SOR=0.946;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=53;WE=132816406;WS=132816388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	132841808	rs6478942	G	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=0.329;SC=TGTAGAACATGATAAGGACTG;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=132841816;WS=132841798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	132841843	rs56026297	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=0.047;SC=AGGGCCTACACGCAGCGTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=132841851;WS=132841833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr9	132845751	rs570407	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=577;ReadPosRankSum=3.022;SC=TGATATTAGACAAGCTGAAGC;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=30;WE=132845759;WS=132845741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr9	132848653	rs11399718	C	CT	1937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=1742;SC=AATTAGCATGCTTCTATGCCG;SOR=2.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=41;WE=132848661;WS=132848643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	132848699	rs640343	G	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.098;NF=26;NR=12;PP=649;ReadPosRankSum=0.154;SC=GTCTTTTTAGGCCATGGGAGA;SOR=0.930;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=38;WE=132848707;WS=132848689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr9	132861672	rs2286792	G	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=23;NR=8;PP=478;ReadPosRankSum=-1.880;SC=CTAATGTCTGGAGCTTTGGCT;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=31;WE=132861680;WS=132861662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr9	132862830	rs10081664	AA	TC	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=662;ReadPosRankSum=0.630;SC=TAATTTCCCAAATGGGTCCAA;SOR=0.364;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=20;WE=132862839;WS=132862820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr9	132866883	rs7868997	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.096;SC=TCAAGCCCAATAGCTGAACTG;SOR=0.165;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=132866891;WS=132866873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr9	132866906	rs887536	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=0.857;SC=CATTCCCAAACTGATCTCAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=132866914;WS=132866896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	132871091	rs146664980	TAGGTTCTTTTCAGTGGCTTTAAGC	T	2291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.272;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,63:0.39:163
chr9	132872686	rs4837460	A	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1683;ReadPosRankSum=1.482;SC=GAGCGAATCTAAGAGCAGGAA;SOR=0.822;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=204;TCF=124;TCR=80;TR=100;WE=132872694;WS=132872676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,124:0.51:244
chr9	132887285	rs72759148	C	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TAAATAAAATCAATTCAAGGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=132887293;WS=132887275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	132891115	rs7853219	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=301;ReadPosRankSum=1.217;SC=GTGAATCGGGTCGGCTGCTCT;SOR=1.214;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=14;WE=132891123;WS=132891105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr9	132897231	rs1003416	G	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=887;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCTAATCACCGTGCTGTGGCA;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=60;WE=132897239;WS=132897221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,71:0.47:150
chr9	132962801	rs7037407	A	T	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=8;PP=1041;SC=AGCTCCCCCCACCCCCCCACA;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=132962809;WS=132962791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	132962816	rs7022964	T	C	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=13;PP=1124;SC=CCCACATAGGTGGGGCAGCCG;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=132962824;WS=132962806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	132963115	rs887534	T	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=18;PP=1009;SC=GAGCAGGCCGTTGCCCGGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=132963137;WS=132963105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	132963129	rs887535	G	A	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=818;SC=CCGGGGACATGGCCGTGGGGA;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=132963137;WS=132963105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	132963350	rs4837482	T	C	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=36;PP=1132;SC=GTCCAGCTGCTCAGGATGGGG;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=132963358;WS=132963340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr9	132985111	rs3829905	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=340;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GCCATGCTCCTGCCCAGGGTG;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=30;WE=132985119;WS=132985101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
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chr9	132988915	rs202190198	AGCTGGGAGGAGGAG	A	900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.077;NF=0;NR=14;PP=2954;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCAGGGACATAGCTGGGAGGA;SOR=1.453;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=132988936;WS=132988905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
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chr9	133260353	rs11244109	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=574;SC=ACGGGCCCCAGGAGCCTGGCT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=133260361;WS=133260343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	133263923	rs7849839	T	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=89;PP=2635;SC=ACAGGATGCCTGTGGGTGAGC;SOR=1.284;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=140;WE=133263931;WS=133263913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr9	133264059	rs35750041	GC	G	479.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=214;SC=GTGCCGTGTTGCCCCCCCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=133264067;WS=133264049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr9	133264096	rs11244127	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
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chr9	133266925	.	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=0.406;SC=CAACCCAGCCGGGGAGGACGC;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=19;WE=133266933;WS=133266915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr9	133270337	rs883982	A	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=109;ReadPosRankSum=0.478;SC=GGGTCCCTCGATGCATGAGAA;SOR=1.048;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=8;WE=133270345;WS=133270327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
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chr9	133274806	rs11244165	G	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=369;ReadPosRankSum=1.723;SC=GATACAGGAAGGGGAAATGGG;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=25;WE=133274814;WS=133274796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr9	133280580	rs1475732	C	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.949;SC=CGGGTACAGACAGCCAGAACT;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=14;WE=133280588;WS=133280570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr9	133281691	rs11244201	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=0.104;SC=GGTCTTCCAACGTGGCCCTAT;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=9;WE=133281699;WS=133281681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr9	133283255	rs10736862	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CTGAAGTCCAAGTTCTACTTC;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=133283263;WS=133283245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr9	133294244	rs13294886	G	A	4283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=69;PP=2507;SC=CCACTGGAGAGCCCACACCCA;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=80;TCR=70;TR=149;WE=133294252;WS=133294234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	133305012	rs59218805	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1026;ReadPosRankSum=0.141;SC=CACCCCAGGCGGTCACCGCTG;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=65;WE=133305020;WS=133305002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
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chr9	133307984	rs2282217	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-0.033;SC=TCAGGAAAAGCACATTTTTCA;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=133307992;WS=133307974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr9	133324502	rs10123082	A	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=826;SC=CAGATCGCTTAAGTCCAGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=133324510;WS=133324492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr9	133327439	rs1760275	T	C	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.461;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=875;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AGGTCAGGGTTCCCGGGGGTG;SOR=2.247;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=39;WE=133327447;WS=133327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
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chr9	133710722	.	G	GC	146	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=146;QD=43.0;SC=GGTGAGGGCGGCTGGCGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=133710730;WS=133710712;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr9	133710819	rs11433463	T	TC	3691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=24;PP=2567;SC=GCCCCCGACGTGCTGGCGCGG;SOR=1.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=133710827;WS=133710809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	133755636	rs35270714	A	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.873;SC=TCCTGGTGAAAGTTCACAGAC;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=133755644;WS=133755626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr9	133755754	rs12005009	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=237;ReadPosRankSum=-1.490;SC=GTTTCTCCGGTATCCACGTGC;SOR=0.476;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=12;WE=133755762;WS=133755744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
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chr9	133768727	rs7029748	C	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=296;ReadPosRankSum=0.055;SC=ATCTGGGTGTCGTGGTCTTTG;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=16;WE=133768735;WS=133768717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr9	133769169	rs3847193	G	A	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=914;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CCAGTAGAGGGAAGCAGGCGC;SOR=0.933;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=145;TCF=63;TCR=82;TR=65;WE=133769177;WS=133769159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
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chr9	133787348	rs7035155	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.693;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=153;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GGGCCCACCCCGCCCAGAGAC;SOR=1.209;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=10;WE=133787356;WS=133787338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr9	133884820	rs3739512	T	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=952;ReadPosRankSum=1.096;SC=CGGGGGCTCATTGCCAGCGCT;SOR=0.893;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=57;WE=133884828;WS=133884810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,64:0.43:148
chr9	133911598	rs2275132	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=654;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CCGACGTGGCAGGCCAGTTGG;SOR=0.607;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=50;WE=133911606;WS=133911588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,57:0.36:157
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chr9	133911821	rs2275130	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=0.373;SC=CTCCTGGGTACGCCCCGGGGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=133911829;WS=133911811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr9	133946774	rs4740409	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=236;ReadPosRankSum=0.851;SC=GAGAAGGGAACCCCCAGGGAG;SOR=0.172;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=133946782;WS=133946764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr9	133946849	rs34910694	C	CT	1241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=1045;ReadPosRankSum=2.009;SC=CCTCATACACCTTTTCTTCCT;SOR=0.639;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=30;WE=133946857;WS=133946839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
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chr9	133946915	rs10901345	C	G	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.782;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr9	133948049	rs2275140	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=141;ReadPosRankSum=-1.859;SC=GCAGATGATGAGCCTCGAGGG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=133948057;WS=133948039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr9	133948214	.	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=309;ReadPosRankSum=0.973;SC=TGCCATTCTCGCGTCTCTGGT;SOR=1.044;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=26;WE=133948222;WS=133948204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr9	133962853	rs4740411	C	T	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1743;ReadPosRankSum=1.699;SC=CACTGCCACCCATCCCATAGC;SOR=0.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=207;TCF=99;TCR=108;TR=117;WE=133962861;WS=133962843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,138:0.56:248
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chr9	133963101	rs4740413	A	G	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1475;ReadPosRankSum=0.611;SC=CCTCCCCCTGAAAGGTGGGTG;SOR=0.543;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=92;WE=133963109;WS=133963091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,109:0.52:210
chr9	133967295	rs710074	C	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=807;SC=TGTGAACTCGCCCCCGTGTGG;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=133967303;WS=133967285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	133967310	rs10696088	T	TCA	1147.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1182;SC=GTGTGGATAGTCACTCCCTGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=133967318;WS=133967300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	133972131	rs2478784	G	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1081;ReadPosRankSum=0.788;SC=GGGCGGGGACGGGGGCGCGTG;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=67;WE=133972139;WS=133972121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr9	133981629	rs2315075	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr9	133981721	rs2315076	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=168;ReadPosRankSum=-0.699;SC=GTCTGCTATGTGGAACCTACA;SOR=0.448;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=20;WE=133981729;WS=133981711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr9	133986836	rs353528	C	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=239;SC=CTCCAAGGGGCGACAGGAAGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=133986856;WS=133986826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	133986848	rs353527	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.645;SC=ACAGGAAGCCGGGGTGAACAA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=133986856;WS=133986826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	133986980	rs353526	T	G	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=55;PP=2286;SC=TCTCACCTCTTTAGGAGTTTC;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=133986988;WS=133986970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr9	133987060	rs353525	G	A	3867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=67;PP=2235;SC=GGTAAGCTGGGGCGGGCTGCC;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=108;WE=133987068;WS=133987050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr9	133996503	rs353510	T	A	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=25;PP=1553;SC=TTTAGGGAGGTTACTGAGGGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=133996511;WS=133996493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr9	134136677	rs352951	A	G	6475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=138;PP=2965;SC=AGTTCACCCCATCCGAGTCGC;SOR=1.414;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=76;TCR=138;TR=214;WE=134136685;WS=134136667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
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chr9	134165888	rs11244356	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=711;SC=GGAGGCAGCCTGGCCTGCCCA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=134165907;WS=134165878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	134165899	rs11244357	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GGCCTGCCCAACCCCACCCTG;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=12;WE=134165907;WS=134165878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr9	134183379	rs2966332	C	T	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1580;ReadPosRankSum=1.899;SC=CCGTACGAGACGAGCCCCAGC;SOR=0.539;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=97;WE=134183387;WS=134183369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,113:0.55:207
chr9	134183503	rs2986606	T	C	2819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1721;ReadPosRankSum=-1.395;SC=TGCCCCTGCGTGTGCTGCTGG;SOR=0.791;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=113;WE=134183511;WS=134183493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,126:0.57:222
chr9	134322324	rs2966340	G	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=881;SC=ATGAAATGGGGGAGATGGTGG;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=134322332;WS=134322314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	134323240	rs2994064	A	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=235;SC=CAAAGTCCATATGTACTTACC;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=134323248;WS=134323230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	134334588	rs34553878	A	G	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=894;ReadPosRankSum=1.920;SC=GCAGTTGTCAATGAGCTCTGC;SOR=0.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=56;WE=134334596;WS=134334578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr9	134346315	rs4310250	T	C	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=61;PP=2738;SC=TGGACCCACGTATCACGCCCA;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=135;WE=134346323;WS=134346305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr9	134348807	rs4276727	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=2;PP=570;SC=CAGGGTAACTGTTAACTTCTT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=134348826;WS=134348797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	134348818	rs5900941	TG	T	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=5;PP=905;SC=TTAACTTCTTTGGGCCTTTGG;SOR=2.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=22;WE=134348826;WS=134348797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	134350323	rs10736851	C	G	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=83;PP=2965;SC=ACGGGCAGGACCCGGAGGTCG;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=145;WE=134350331;WS=134350313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr9	134350458	rs10751478	C	T	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=62;PP=2549;SC=GAGCAGAGCCCCACGGCAGAA;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=125;WE=134350466;WS=134350448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	134350647	rs10793873	T	C	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=52;PP=1812;SC=GTTCCCCCCATGAAGAGAAAT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=96;WE=134350655;WS=134350637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	134351065	rs7858488	G	T	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=82;PP=2965;SC=CCAACAAGGGGTGCTCTGAGG;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=159;WE=134351073;WS=134351055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr9	134351343	rs11243403	C	T	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2477;ReadPosRankSum=-0.487;SC=GACAGCCGCGCGGAGGACAAG;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=274;TCF=135;TCR=139;TR=147;WE=134351351;WS=134351333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,173:0.53:326
chr9	134351730	rs199680662	T	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=810;ReadPosRankSum=-1.637;SC=GATGGTGGCCTGTCGGGGGCT;SOR=0.356;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=54;WE=134351738;WS=134351720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,59:0.56:106
chr9	134353724	rs4076428	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=126;ReadPosRankSum=1.066;SC=AGATCAGAGGCGGCCTGAGAA;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=10;WE=134353732;WS=134353714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr9	134358657	rs10901061	G	C	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=18;PP=1174;SC=TTTTGAGTCGGGGAAACTGCA;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=134358665;WS=134358647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	134359918	rs10751480	G	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=668;SC=ACACGGAGCTGTAGGTGCTTT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=134359926;WS=134359908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	134360015	rs10793874	G	T	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=29;PP=1311;SC=GGATGGGTTTGGGCAAAGCCA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=69;WE=134360023;WS=134360005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	134361318	rs3808829	C	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=20;PP=1295;SC=CGTGTGCTTCCGGCACACAGG;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=134361326;WS=134361308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	134361581	rs10793875	T	A	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=68;PP=2263;SC=TGACAGCAGCTAGCCAGGTGG;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=110;WE=134361589;WS=134361571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	134361627	rs10901062	G	A	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=49;PP=1399;SC=CCAGTGCAGGGCGGAATTGGC;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=61;WE=134361635;WS=134361617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	134362481	rs188172263	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.963;SC=AGAGGGGCAGGGGAGGTGGGA;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=134362489;WS=134362474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	134382673	rs6597501	C	T	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=21;PP=1593;SC=AACATGACGGCGCTATGTGAA;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=69;WE=134382681;WS=134382663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	134384277	rs11243404	T	C	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=22;PP=1812;SC=AAAATTGACATGTGTTTCCTC;SOR=1.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=134384285;WS=134384267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	134384500	rs11999204	C	T	4628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=81;PP=2393;SC=TTTTTTGTTTCGTTTTGTGAG;SOR=1.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=109;WE=134384521;WS=134384490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	134384513	rs28447664	A	G	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=63;PP=1830;SC=TTTGTGAGACAGTACCTTTTC;SOR=2.250;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=20;TCR=65;TR=83;WE=134384521;WS=134384490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	134385436	rs2296949	A	G	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=41;PP=1703;SC=GGGCAGATGCAGATGTCACAG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=85;WE=134385444;WS=134385426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	134385599	rs2018621	A	G	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=81;PP=2965;SC=AGAGGTGGGTACGCTTTTCCA;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=172;WE=134385607;WS=134385589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr9	134386659	rs34159422	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=287;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGGCCATCGGGAAGGCTGGCT;SOR=0.148;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=22;WE=134386667;WS=134386649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr9	134386675	rs4740163	T	G	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=12;PP=980;SC=TGGCTTAGGGTCATTTTTCTT;SOR=1.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=44;WE=134386683;WS=134386665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	134386744	rs10901065	T	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=35;PP=1470;SC=CTCGGATCACTCAGGGTCAGC;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=134386752;WS=134386734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	134386903	rs10901066	G	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=991;SC=TTATTTGCTCGTAGATTTGCT;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=134386911;WS=134386893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	134387315	rs10901068	C	G	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=909;SC=CCAGGCTGGTCTCAAACTCCT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=134387323;WS=134387305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	134387488	rs3739494	T	C	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=85;PP=2282;SC=CCTTCAAAGATGTCAATAACT;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=134387496;WS=134387478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr9	134394163	rs1547768	A	G	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=71;PP=2965;SC=CTTCCAACCCAAGTGGACACG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=146;WE=134394171;WS=134394153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr9	134394646	rs2010635	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=18;PP=1774;SC=GCTAAGTGGAATGATGCGGTT;SOR=2.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=79;WE=134394654;WS=134394636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	134395628	rs2277152	C	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=55;PP=1616;SC=CATCCTGTTTCTTGAGAATTC;SOR=2.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=74;WE=134395636;WS=134395618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	134395687	rs2277153	C	A	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=21;PP=599;SC=GGGTTTCTCCCAAGCTTTTCC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=134395695;WS=134395677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	134397624	rs4740165	C	T	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=78;PP=2200;SC=ACGGGGGCTGCGGAGACAGTG;SOR=1.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=108;WE=134397632;WS=134397614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	134398534	rs3739495	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=11;PP=376;SC=GGGGTCGGGATGAGGTTGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=134398542;WS=134398524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	134401335	rs2296957	C	T	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=42;PP=1658;SC=CCACTCCTCGCGGGATGATCA;SOR=0.909;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=134401343;WS=134401325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	134404199	rs4740260	A	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=534;SC=GTATGTGGCCATAATGAGCCA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=134404207;WS=134404189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	134404784	rs2296956	G	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AACCAACCGGGGGAGGCCTGC;SOR=0.699;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=20;WE=134404792;WS=134404774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr9	134406071	rs7867616	C	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=43;PP=1265;SC=TGGAACCGCTCGTCCTGTGAC;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=134406079;WS=134406061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	134406131	rs3904960	G	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=435;SC=CCCCTGGGGGGTATGCTCGGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=134406139;WS=134406121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	134406647	rs4740261	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr9	134431608	rs139300091	C	CG	850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.403;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=708;ReadPosRankSum=0.028;SC=GAGGTAGGTGCGGGGGCGGCC;SOR=1.736;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=22;WE=134431618;WS=134431598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
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chr9	134497450	rs7023385	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=417;ReadPosRankSum=1.670;SC=CCCCTCCCCCCATTCTTCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=20;WE=134497458;WS=134497440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr9	134505545	rs11243457	A	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=1.057;SC=TGCCCACCCCACCGGGCCCTA;SOR=0.976;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=134505553;WS=134505535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	134514011	rs41317002	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=466;ReadPosRankSum=1.036;SC=GTCTGGAACCTGCACCGGTAC;SOR=0.984;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=27;WE=134514019;WS=134514001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr9	134584987	.	G	GA	1338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=994;ReadPosRankSum=0.330;SC=TCCTGGAAAGGAAGCCCAGGG;SOR=1.002;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=28;WE=134584995;WS=134584977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr9	134615240	rs183326492	G	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGGCCGCCGCGGGGCGACAGG;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=6;WE=134615248;WS=134615230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	135102254	rs2149171	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=423;ReadPosRankSum=0.578;SC=GCAACCTGCACGCCAACCTGT;SOR=0.992;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=31;WE=135102262;WS=135102244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr9	135105964	rs4962173	A	G	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=33;PP=1851;SC=CACAGGTGCCACTGCAGGTTC;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=135105972;WS=135105954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	135106054	rs2274854	T	A	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=902;ReadPosRankSum=3.525;SC=TGGAAAAAGCTGGAGAGAAAA;SOR=0.665;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=57;TCR=88;TR=67;WE=135106062;WS=135106044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,91:0.49:186
chr9	135114396	rs59766488	C	T	4054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=63;PP=2844;ReadPosRankSum=1.491;SC=TTCCTCCGTCCCTGCATGACC;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=319;TCF=200;TCR=119;TR=169;WE=135114404;WS=135114386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,184:0.49:379
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chr9	135202829	rs543573	T	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=63;PP=1957;SC=GGTACAAATATGTCAGAATTC;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=99;WE=135202837;WS=135202819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	135203231	rs1183768	C	T	8265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=146;PP=2965;SC=CTATTCTGTCCTTTTTTGGCA;SOR=0.989;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=109;TCR=147;TR=254;WE=135203239;WS=135203221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr9	135203409	rs1185193	A	C	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=57;PP=2370;SC=TTCCCACAAGATCTCTCTTAT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=110;WE=135203417;WS=135203399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
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chr9	135206460	rs9411449	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=694;SC=TTTCAGGATTATAATTGTATA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=135206468;WS=135206450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	135211609	rs111938515	AAC	A	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=718;SC=CAGCCTGGGCAACAGAGTGAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=135211618;WS=135211599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	135221597	rs497650	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=573;SC=AATTCTTATGGTACTAAAATA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=135221605;WS=135221587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	135254264	.	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CCTACACGTTCATGCTTCATT;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=135254272;WS=135254254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr9	135263573	rs556386	G	T	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=90;PP=2943;SC=TGCCATAGTAGATACGCCGAC;SOR=1.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=48;TCR=90;TR=138;WE=135263581;WS=135263563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	135265876	rs471890	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=407;SC=CTAGACACGATTGTTCTTGAC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=135265884;WS=135265866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	135271987	rs1166321	T	C	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=82;PP=2108;SC=TATAACAACATGAACTATCCT;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=129;WE=135271995;WS=135271977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr9	135273507	rs569288	G	A	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=12;PP=1326;SC=ATGGTCAAAGGGTGATTGTTT;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=135273515;WS=135273497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	135273607	rs504525	C	G	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=67;PP=2965;SC=CCGTGTACAGCAGCTTGTCTG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=139;WE=135273615;WS=135273597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	135273759	rs5900976	G	GA	934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=1038;SC=TGTTAATAATGACAAAAGCAA;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=21;WE=135273767;WS=135273749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	135374764	rs7047726	G	A	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=861;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CTCAGCCATCGGACGCTGGAA;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=59;WE=135374772;WS=135374754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,78:0.57:137
chr9	135374898	rs562350	T	C	3096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1772;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GTCAGCTCAATGACATCCGCA;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=260;TCF=136;TCR=124;TR=128;WE=135374906;WS=135374888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,154:0.47:331
chr9	135388799	rs577416	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=1077;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CACAATCTGAGGCCCCTGTGC;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=27;TCR=88;TR=62;WE=135388807;WS=135388789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr9	135412913	rs13286286	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=1.169;SC=GGAGGCTCCCGGGGGCGGGCG;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=135412921;WS=135412903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	135470176	rs306549	C	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-1.894;SC=TTTTCACAAGCCTCCTCTGAC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=135470184;WS=135470166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	135470414	rs306547	T	C	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=644;ReadPosRankSum=0.240;SC=ACCTTGGCGATGTCGGCCTCC;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=49;WE=135470422;WS=135470404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr9	135507624	.	CGT	C	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=130;QD=41.25;SC=ATGCCCAGTACGTGTACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=135507633;WS=135507614;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr9	135522454	rs140712462	AAAGT	A	2664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.678;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=2107;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACCTTGGATAAAAGTAAGAAG;SOR=0.665;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=46;WE=135522465;WS=135522444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,71:0.43:164
chr9	135522573	rs3824573	A	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=348;ReadPosRankSum=0.397;SC=GGGTATCACCAAGTCCCAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=18;WE=135522581;WS=135522563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr9	135538807	rs2583805	G	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=271;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GCCTGATTGCGGATTACAGGC;SOR=1.561;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=135538815;WS=135538797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr9	135544857	rs373110082	T	TAA	775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.053;NF=10;NR=7;PP=269;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GTGGGCAAGATAAAAAAAAAA;SOR=0.392;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=17;WE=135544865;WS=135544847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr9	135601354	rs396819	T	C	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=138;SC=TGGCCTGGCCTGGAAGCAGGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=135601375;WS=135601344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	135601367	rs396801	G	C	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=145;SC=AAGCAGGGGAGAAAGGGACCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=135601375;WS=135601344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	135602727	rs1999121	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=168;SC=ATAATCGTCCTTCAGTGGTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=135602735;WS=135602722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	135603108	rs139398120	TCC	T	388.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=255;SC=AGAGCCTGTGTCCCCCCAACC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=135603117;WS=135603098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr9	135776845	rs7020175	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=486;ReadPosRankSum=0.940;SC=GACTATGGGGGCAGCAGAACC;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=26;WE=135776853;WS=135776835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
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chr9	135780006	rs67465842	TACACTGG	T	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=595;ReadPosRankSum=0.544;SC=AGGAGAAGCCTACACTGGACA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=135780020;WS=135779996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr9	135781563	rs10901220	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=109;ReadPosRankSum=-1.351;SC=AATGGCAGTCGGTATTCCACC;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8;WE=135781571;WS=135781553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr9	135782026	rs7870151	C	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=1.585;SC=AAGAAAAATCCAGCAAGCCTG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=135782034;WS=135782016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr9	135782221	rs7862221	T	C	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1147;ReadPosRankSum=-1.562;SC=CAGGTGGCTCTTCTGAAGAGA;SOR=0.919;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=76;WE=135782229;WS=135782211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,96:0.55:174
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chr9	135786112	rs6597586	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=-0.281;SC=ATATGAACACTGAGCCCAACT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=135786120;WS=135786102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	135786904	rs1073123	A	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=-1.576;SC=CTGCCCTGGCATATTTAACAA;SOR=0.862;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=13;WE=135786912;WS=135786894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr9	135802839	rs10901224	T	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CCTTCTTAATTTAATAATAAG;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=15;WE=135802847;WS=135802829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr9	135821099	rs56195815	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=-0.837;SC=AATACTAGGTCGGTGCAAAAG;SOR=0.919;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=35;WE=135821107;WS=135821089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr9	135861990	rs61469632	T	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=292;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TTCTGAGATATGGAGGGGTAT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=19;WE=135861998;WS=135861980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr9	135862563	rs56256724	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=511;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CGGCACGTGGCTGTCTCTCTG;SOR=1.124;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=24;WE=135862571;WS=135862553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr9	135862632	rs633153	C	T	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=37;PP=2066;SC=TCCCAGAAACCGTGGCTATTG;SOR=1.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=98;WE=135862640;WS=135862622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	135864436	rs60757417	C	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=594;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CACATGCTGCCCCTGCTCCCA;SOR=0.866;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=47;WE=135864444;WS=135864426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr9	135930735	rs645841	T	C	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=55;PP=1875;SC=AATCACCTGCTGAGGGAGTGG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=135930743;WS=135930725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	135937248	rs2735395	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.179;NF=6;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=-0.444;SC=CTGTGGGTTTGGGGAAAACTG;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=8;WE=135937256;WS=135937238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr9	135944286	rs142943621	A	G	57.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.60;MQRankSum=-0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr9	135946599	rs488087	C	T	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=124;PP=2965;SC=AGGCCACTCCCGTGCCCCCCA;SOR=1.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=48;TCR=124;TR=172;WE=135946607;WS=135946589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr9	135961787	rs10901232	A	G	8799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.04;QD=42.51;SOR=1.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr9	135961796	rs10901233	C	T	8156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.91;QD=45.07;SOR=2.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
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chr9	135976679	rs2519090	C	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=7;PP=758;ReadPosRankSum=1.104;SC=CCTACAGCACCGCCCCTTCAG;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=43;WE=135976687;WS=135976669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr9	135982088	rs2073822	A	C	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=76;PP=2588;SC=TCTGCAGGGCAGAGAGGATGG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=150;WE=135982096;WS=135982078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr9	135983504	rs2285375	T	C	4209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=77;PP=2554;ReadPosRankSum=0.792;SC=ATGGAACTGGTGCTGGAGCTG;SOR=0.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=143;WE=135983512;WS=135983494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr9	135983902	rs34479413	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=462;SC=CCCACAAAACGTGTACCAGGC;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=135983910;WS=135983892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	135985166	rs3747817	G	A	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=62;PP=1883;SC=AGGCCCAGGAGGGCAGGGATT;SOR=1.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=86;WE=135985182;WS=135985156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	136004770	rs34429998	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=46;PP=1289;SC=TGCTCGTCGCCTGCGTGCCCT;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=136004778;WS=136004760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	136030458	rs651453	C	T	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=10;PP=845;SC=CCGAGCCTCCCGGGTGCCCAG;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=136030466;WS=136030448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	136031346	rs2073927	A	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=376;ReadPosRankSum=0.568;SC=AGGACCAGTGATGGAGGAGAG;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=32;WE=136031354;WS=136031336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr9	136080746	rs1052517	A	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=14;PP=536;SC=CAGGTGGTCCAGGCTCTGTGT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=136080754;WS=136080736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	136081319	.	C	T	637	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=51.88;NF=22;NR=27;PP=637;QD=13.7096165826;SC=TGTTCGGGAACGCAGCTTCCT;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=49;WE=136081327;WS=136081309;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr9	136081391	.	G	A	1038	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=54.99;NF=21;NR=35;PP=1038;QD=19.1566287955;SC=AGACCCCATCGCAGCCCAGAG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=136081399;WS=136081381;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	136081466	.	C	T	273	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=47.73;NF=4;NR=11;PP=273;QD=20.5180808365;SC=CAGCCCAGAGCGCGGAGCCCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=136081474;WS=136081456;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	136081598	rs28507496	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=16;PP=965;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TCGGGGCACACGGGGAATGCG;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=61;WE=136081606;WS=136081579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr9	136081829	rs11244037	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=334;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCAGGTGAGCCGACGTGGGGA;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=23;WE=136081837;WS=136081819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr9	136083580	rs2073870	T	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=5;PP=150;SC=TGGATGCACCTATCCTCCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=136083588;WS=136083570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	136083801	rs4310274	A	G	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=17;PP=962;SC=CACCAGGTGGATCTGGGGAGG;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=136083809;WS=136083791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	136131289	rs8176748	C	T	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=1674;ReadPosRankSum=-0.267;SC=AGCCGCTGCACCTCTTGCACC;SOR=0.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=102;WE=136131297;WS=136131279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,118:0.52:225
chr9	136131347	rs8176745	G	A	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1463;ReadPosRankSum=-1.339;SC=CCTCGTCCTTGGGGATGTAGG;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=91;WE=136131355;WS=136131337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,108:0.48:225
chr9	136131437	rs8176742	C	T	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1477;ReadPosRankSum=0.235;SC=TGCCGAACAGCGGAGTCAGGA;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=95;WE=136131445;WS=136131427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr9	136131472	rs8176740	A	T	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TGGTCGCGGAACTCCATGTCC;SOR=0.620;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=101;WE=136131480;WS=136131462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,120:0.53:228
chr9	136131783	rs8176737	C	T	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=0.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,63:0.55:115
chr9	136131783	.	CGT	TGC	1550	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13;NR=29;PP=1550;QD=38.1778065443;SC=AGCCGCCGGCCGTGCACCCCT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=42;WE=136131793;WS=136131773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr9	136131785	rs8176736	T	C	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=4.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr9	136131846	rs7873416	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TTGGAAGGCTTAGAGCAGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=21;WE=136131854;WS=136131836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr9	136132608	rs8176726	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=-0.764;SC=ACCGACCTGGCGAGCCCACGA;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=11;WE=136132616;WS=136132605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr9	136132633	rs2073824	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=268;ReadPosRankSum=1.144;SC=ACGAGCCCACATGAGCTCAGT;SOR=0.249;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=17;WE=136132641;WS=136132623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
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chr9	136133506	rs512770	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.140;NF=16;NR=17;PP=518;ReadPosRankSum=-1.275;SC=AGCACCTTTGACTGGGGGTAG;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=33;WE=136133514;WS=136133496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr9	136133582	rs8176712	AG	A	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.056;NF=1;NR=12;PP=363;ReadPosRankSum=0.649;SC=GCAGGTAAGCAGGGGGTGTGC;SOR=0.947;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=136133590;WS=136133572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr9	136135137	.	GCTTCTGTCCACAC	G	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=2.071;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr9	136135195	rs549331	G	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.493;NF=16;NR=8;PP=359;ReadPosRankSum=-1.468;SC=GACATGGGAGGCACTGAAGGG;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=24;WE=136135203;WS=136135185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr9	136135237	rs549443	AT	GC	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.221;NF=20;NR=13;PP=1059;ReadPosRankSum=0.324;SC=GCAACGAGACATGCTGCAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=33;WE=136135246;WS=136135227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
chr9	136135365	rs624601	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AGTGGAAGGGACACAGCGTCA;SOR=0.365;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=21;WE=136135373;WS=136135355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr9	136135444	rs551322	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=1.817;SC=GATGGGCCTGGCGTGGGCCCG;SOR=0.016;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=11;WE=136135452;WS=136135434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr9	136136770	rs688976	A	C	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.462;SC=GGGCTTAGGAACCCGTAACTG;SOR=0.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=66;WE=136136778;WS=136136760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,91:0.54:169
chr9	136137646	rs8176694	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=396;ReadPosRankSum=-0.430;SC=TGTCCCGCCTTGTAATTCAGG;SOR=0.780;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=29;WE=136137654;WS=136137636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr9	136150466	rs616154	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=173;ReadPosRankSum=-2.008;SC=GCGGCCGGCCCGAAGCCTCGC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=13;WE=136150474;WS=136150456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr9	136150484	rs559723	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=172;ReadPosRankSum=-2.178;SC=CGCAGCCCTGAGCGCCCCCAC;SOR=1.274;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=15;WE=136150492;WS=136150474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr9	136185358	rs544622	T	C	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=200;SC=CTTCCCTTTCTCCACCCAGGA;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=136185366;WS=136185348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	136201470	rs563666	C	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=307;SC=GTTAAGTCCCCATCTCATGGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=136201478;WS=136201460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	136211248	rs9645009	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=0.357;SC=CTTGCCTACAAGTAGCTGATG;SOR=0.208;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=136211256;WS=136211238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr9	136213521	rs616836	T	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=46;PP=1214;SC=GGGCCATGGCTGAGCCTCAAG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=136213529;WS=136213511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	136214955	rs553877	A	G	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=15;PP=1226;SC=GCAGCCTCTCAGCCCCGCCTC;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=136214963;WS=136214945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	136215549	rs28496755	G	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GTGGTCTCGGGCTTAGCCTTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=136215557;WS=136215545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	136215642	rs7019683	T	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TGCTGGGGGGTTGCAGAAAGC;SOR=0.960;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=16;WE=136215650;WS=136215632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr9	136216882	rs7700	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=222;ReadPosRankSum=0.634;SC=ACGTCCCAACGAAGAGACCAC;SOR=1.106;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=14;WE=136216890;WS=136216872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr9	136217958	rs28693986	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-2.012;SC=AAATACTGTCATTCACAAATC;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=6;WE=136217966;WS=136217951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr9	136218081	rs71503185	G	A	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TCAGAAAACAGTAAGCCAAGC;SOR=0.875;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=80;WE=136218089;WS=136218071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,100:0.58:172
chr9	136218590	rs484248	CA	AG	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=0.610;SC=ATGTAACTTGCATATCAAGTT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=136218599;WS=136218583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr9	136223633	.	CAGGGGAG	C	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.557;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr9	136227260	rs12763	A	G	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=49;PP=1685;SC=CACTGATGAGAGCAGGAGAGA;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=75;WE=136227268;WS=136227250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr9	136228006	rs34939258	G	A	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=1821;ReadPosRankSum=0.510;SC=CCTGTAAACAGCCAGGTTAAT;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=227;TCF=100;TCR=127;TR=117;WE=136228014;WS=136227996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,142:0.52:275
chr9	136232746	rs28693733	T	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=697;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GCACTTCCTTTGAGCGTCATG;SOR=0.332;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=42;WE=136232754;WS=136232736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr9	136234124	rs1179033	A	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=25;PP=1417;SC=ACCACCCGCAAAGCCACTCAC;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=136234132;WS=136234114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	136237672	rs56343119	C	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=304;ReadPosRankSum=0.273;SC=CCCCTCCCCCCCATTAGAGAA;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=18;WE=136237680;WS=136237662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr9	136243270	rs28493251	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GGCGGGGAGGATCCCGCGGGT;SOR=0.092;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=136243278;WS=136243260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr9	136245903	rs7852803	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=500;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TTCCTTGCTGATAGGTTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=33;WE=136245911;WS=136245893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr9	136251358	rs34399743	G	A	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1242;ReadPosRankSum=-1.026;SC=GAAAGGCGTGGAGAGGCACTG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=88;WE=136251366;WS=136251348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,102:0.40:252
chr9	136256602	rs11340207	AG	A	1538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.500;NF=1;NR=36;PP=1100;ReadPosRankSum=0.782;SC=GTTGTGGGAGAGGGGGTTGGC;SOR=0.563;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=3;TCR=82;TR=37;WE=136256610;WS=136256592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr9	136256626	rs4962134	G	A	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=3.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.688;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr9	136256630	rs4962135	C	T	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.10;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr9	136260721	rs41297211	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=574;ReadPosRankSum=0.268;SC=TCCTCTCTCCGTGCAGGGCAC;SOR=0.556;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=31;WE=136260729;WS=136260711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr9	136261030	rs57394597	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=317;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CTGCACAGCTGGGCTTTGCCC;SOR=0.458;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=136261038;WS=136261020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr9	136266792	rs144943703	CTGTGAGCCT	C	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=712;ReadPosRankSum=-0.281;SC=ATCCCCCAGCCTGTGAGCCTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=4;WE=136266808;WS=136266782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	136267149	rs17474001	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GGCATTTGGCCGTCTTCATTT;SOR=2.925;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=14;WE=136267157;WS=136267139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr9	136267173	rs7025970	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.073;SC=CACCCCAAATGCTGGTCGCAT;SOR=0.078;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=136267181;WS=136267163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr9	136267869	rs4962139	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=250;ReadPosRankSum=-1.432;SC=TCAGGGCTCCATTGAGTGCAC;SOR=0.458;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=17;WE=136267877;WS=136267859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr9	136268038	rs3124748	C	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=871;ReadPosRankSum=-1.139;SC=AGCTGCAGAACGCTGGGCTGC;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=56;WE=136268046;WS=136268028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr9	136268084	rs3124747	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=435;ReadPosRankSum=0.265;SC=CAGCTCCCTCAAAAGCAGGGA;SOR=0.485;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=31;WE=136268092;WS=136268074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr9	136268897	rs36079470	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CCTACCCTGCGGATGGGGAAA;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=70;WE=136268905;WS=136268887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr9	136268912	rs28510482	A	G	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1023;ReadPosRankSum=-1.461;SC=GGGAAATGGCAGAAGCCAGCT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=65;WE=136268920;WS=136268902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr9	136268952	rs33919837	G	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.74;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
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chr9	136270293	rs35179461	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=2.284;SC=AGGGGGAATGTGACCCACTCT;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=136270301;WS=136270283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
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chr9	136270341	rs28449682	AC	GT	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.859;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=570;ReadPosRankSum=1.718;SC=CACAGGAAGGACTCTGGCCTC;SOR=0.342;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=17;WE=136270350;WS=136270331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr9	136270538	rs41302673	T	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.078;NF=17;NR=20;PP=542;ReadPosRankSum=1.491;SC=TCTGGGGGACTGGAATAGATG;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=37;WE=136270546;WS=136270528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr9	136272787	rs3214115	AT	A	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr9	136274058	rs7030175	G	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.31;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr9	136277381	rs2285485	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.241;SC=TCCAGTTACTACTTTCCCTTC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=136277389;WS=136277371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	136277480	rs2285486	A	G	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=37.05;SOR=1.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	136277480	.	AGT	GGC,GGT	698	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=59.92;NF=24,52;NR=14,22;PP=519,698;QD=15.0649440753;SC=TCACGGGCTCAGTTGGTTTGA;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=38,74;WE=136277490;WS=136277470;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.51:74
chr9	136277482	rs2285487	T	C	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.929;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr9	136277664	rs28513445	T	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=684;ReadPosRankSum=1.125;SC=GCCACAGGGCTCCAGGTCAGA;SOR=0.835;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=40;WE=136277672;WS=136277654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr9	136277796	rs28729896	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=468;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AGGTGCTTGCCTCATTCACCT;SOR=1.039;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=27;WE=136277804;WS=136277786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr9	136277854	rs2285488	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=0.251;SC=CGCCCTCCACGGCTAAGCATC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=55;WE=136277862;WS=136277844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr9	136279935	rs6597630	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=505;ReadPosRankSum=0.641;SC=TACTGGCGCCCTCCTGTCCAT;SOR=1.046;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=33;WE=136279943;WS=136279925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr9	136287582	rs34024143	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.102;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=418;ReadPosRankSum=0.647;SC=GCGTCACCCCCGGGCAAGATG;SOR=1.071;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=26;WE=136287590;WS=136287572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr9	136289393	rs35194094	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCTTTCCACTGCTTGCTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=136289401;WS=136289383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr9	136289423	rs35410697	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=1.415;SC=GCCCTCTGCTCTCCCTCTCCC;SOR=1.581;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=136289431;WS=136289413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr9	136290672	rs28571612	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=204;ReadPosRankSum=0.829;SC=TTCGGGACCCGTCCCTGGGGG;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=21;WE=136290680;WS=136290662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr9	136291063	rs3118667	C	T	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=47;PP=2965;SC=CGCAGGGTGCCCCAAATATCA;SOR=1.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=101;TCR=47;TR=147;WE=136291071;WS=136291053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	136291361	rs34054981	C	T	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=62;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.516;SC=AGGTGCGGGGCGTCACCCAGC;SOR=0.790;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=87;TCR=123;TR=103;WE=136291369;WS=136291351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,135:0.51:263
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chr9	136291539	rs3118668	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=413;SC=AGGTGGTCTTAGCAAGCAGTG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=136291547;WS=136291529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr9	136304497	rs3124768	A	G	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=693;ReadPosRankSum=-1.654;SC=AATATGTCACATTTCTGACAG;SOR=0.667;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=50;WE=136304505;WS=136304487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
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chr9	136328657	rs3124765	T	C	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CTCTGAACATTGCGGCCGGCG;SOR=0.587;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=78;TCR=107;TR=115;WE=136328665;WS=136328647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,134:0.61:219
chr9	136330428	rs41302667	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=292;ReadPosRankSum=-1.045;SC=CTCTTCTCCTGCCCTGGTCCC;SOR=1.494;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=23;WE=136330436;WS=136330418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr9	136338187	rs3124762	A	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=-0.610;SC=GGCCAGTCAGAGAGGGCCTAG;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=8;WE=136338195;WS=136338177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	136339181	rs28584627	C	T	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=650;ReadPosRankSum=0.006;SC=GCCGCACGGCCCCAACGATGG;SOR=0.510;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=43;WE=136339189;WS=136339171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,60:0.68:88
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chr9	136340325	rs28681345	C	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GTGTGGGAGACCTCCTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=11;WE=136340333;WS=136340315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
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chr9	136343587	rs34008151	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=561;ReadPosRankSum=2.737;SC=GTCCCTCCTCCAGGGACCATT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=33;WE=136343595;WS=136343577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
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chr9	136385437	rs9802272	A	G	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=74;PP=2337;ReadPosRankSum=0.998;SC=AGGTGGTCACAGCACAAAGAG;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=112;WE=136385445;WS=136385427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
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chr9	136409457	rs9802736	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.412;SC=GAGCTGAGCTACACAAGCGGG;SOR=0.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=136409465;WS=136409448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	136409529	rs11522325	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=550;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GTGGAGTGGGCGAGTGCCACC;SOR=0.483;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=33;WE=136409537;WS=136409519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr9	136409580	rs9802778	T	G	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=48;PP=2456;SC=ACTGTCATCCTTTTGCCTCCA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=86;TCR=48;TR=134;WE=136409588;WS=136409570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	136412041	rs11507719	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=305;ReadPosRankSum=-0.529;SC=TTTCCTGTCTCGGGAGCATTT;SOR=0.674;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=136412049;WS=136412031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr9	136412170	rs2073874	C	T	6130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=74;PP=2965;SC=CTCTTGCAGACGAAGCTGGCT;SOR=1.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=108;TCR=74;TR=182;WE=136412178;WS=136412160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr9	136412236	rs2073875	A	T	7123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=117;PP=2965;SC=TCAACATCGCAGGCACGGTGG;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=87;TCR=117;TR=204;WE=136412244;WS=136412226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr9	136412255	rs2073876	A	C	5980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=109;PP=2965;SC=GGTCAAGTACAGGCGGCCCAT;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=65;TCR=109;TR=174;WE=136412263;WS=136412245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr9	136412346	rs2073878	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=949;SC=GTACGTGTGCCGCAGGCCTTG;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=136412354;WS=136412336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	136412382	rs2073879	T	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=407;SC=CTGGGCACTGTTTCCCCAGAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=136412390;WS=136412372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	136505114	rs1108580	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=788;ReadPosRankSum=1.066;SC=ACCTCATTGAAGTAAGGGGTG;SOR=0.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=51;WE=136505122;WS=136505104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,61:0.39:156
chr9	136505241	rs1108581	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CAGCTATGACAGAGAGAAAGC;SOR=0.132;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=20;WE=136505249;WS=136505231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr9	136507301	rs1611120	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTGAGAGGGCGACCAGCTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=10;WE=136507309;WS=136507291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr9	136507473	rs5320	G	A	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1321;ReadPosRankSum=0.864;SC=GCCCTCAGACGCGTGCACCAT;SOR=0.425;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=98;WE=136507481;WS=136507463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,118:0.50:237
chr9	136509312	rs1611125	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=551;ReadPosRankSum=-0.826;SC=AGGACACACCCGTCTGTCTGA;SOR=0.097;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=30;WE=136509320;WS=136509302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr9	136518097	rs77905	A	G	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=930;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CGTACAACACAGAAGACCGGG;SOR=0.678;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=68;WE=136518105;WS=136518087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,74:0.46:161
chr9	136522187	rs1611131	A	G	2520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=43;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.317;SC=CCTTGTCCCCACCAGGTTCAA;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=129;TCR=92;TR=107;WE=136522195;WS=136522172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,124:0.50:250
chr9	136523669	rs129882	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	136532107	rs7854480	G	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=543;SC=CGTGGCTCCAGGCAGATAGGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=136532115;WS=136532097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	136536633	rs2797840	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=19;PP=800;SC=CCCCCGCCCCGTGCTGTCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=136536641;WS=136536623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	136536679	rs129932	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=25;PP=1284;SC=TCAGGGAGTCGATGGCGCGGT;SOR=1.164;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=63;WE=136536687;WS=136536669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	136536793	rs2519123	C	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=46;PP=1774;SC=CCAGCTCCCCCACAAAGGACA;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=136536801;WS=136536783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
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chr9	136559460	rs2073817	C	T	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=868;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GGTGCCCCCACGGTGGTTGAG;SOR=0.854;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=58;WE=136559468;WS=136559450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
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chr9	136573648	rs495464	A	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=600;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GGTCCCCTGCACCAGAGTCCC;SOR=0.422;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=33;WE=136573656;WS=136573638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr9	136578271	rs582326	G	C	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GAGAGGCCTGGAGTCCCTTTT;SOR=0.679;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=69;TCR=86;TR=82;WE=136578279;WS=136578261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,93:0.49:189
chr9	136583687	.	G	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=1.518;SC=CCCAGAAGCTGCCCGGGAAAC;SOR=1.051;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=15;WE=136583695;WS=136583677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr9	136584196	rs2027963	T	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=771;ReadPosRankSum=1.538;SC=CTTGGCATCATCCAGAACTGG;SOR=0.475;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=123;TCF=49;TCR=74;TR=52;WE=136584204;WS=136584186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,55:0.40:139
chr9	136590812	rs150689824	A	AAAAC	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.083;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr9	136594864	rs2427988	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=22;PP=1176;SC=AGACTGACACAGAACCCGGGG;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=61;WE=136594872;WS=136594854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	136596397	rs916619	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=-0.412;SC=GCTGGGAACAGGGGACCCAGA;SOR=0.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=14;WE=136596405;WS=136596387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr9	136599146	rs573904	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=519;ReadPosRankSum=0.937;SC=CCGAGGTGCCCTGTCCCTCCT;SOR=0.775;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=33;WE=136599154;WS=136599136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,45:0.43:105
chr9	136599315	rs2488553	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=579;SC=AGGCCTCAGCGAAACAGGGAG;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=136599323;WS=136599305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	136629256	rs66574029	CTG	C	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=629;ReadPosRankSum=-1.169;SC=AAGATCGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=15;WE=136629265;WS=136629246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr9	136629298	rs2797825	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=353;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GTGCATGTCTATGTTGGGGTG;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=23;WE=136629306;WS=136629288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr9	136629399	rs2797826	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GGGAGTAAGAGCAACCCAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=136629407;WS=136629389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	136635409	rs590614	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=258;ReadPosRankSum=0.487;SC=TCCTGGTCTGGGTCTGTGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=15;WE=136635417;WS=136635399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr9	136637177	.	A	ACACACGGCCCCGGCGGTCACTGCGTGAGGGC	2235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,78:0.55:143
chr9	136637198	.	C	T	906	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=17;NR=39;PP=906;QD=16.7994859383;SC=CGGCGGTCACCGCGTGAGGGC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=33;TCR=84;TR=56;WE=136637206;WS=136637188;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr9	136637242	rs2510244	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=152;ReadPosRankSum=0.025;SC=AGCCAGGCTCATTCTGTGTTT;SOR=1.525;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=11;WE=136637250;WS=136637232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr9	136640226	rs2488559	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CAGTGTCTGAGGGGTGCCCAG;SOR=0.425;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=136640234;WS=136640216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr9	136641313	rs2077065	G	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=295;ReadPosRankSum=0.562;SC=CTGCCCTGGAGGGGACTGTCT;SOR=0.811;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=26;WE=136641321;WS=136641303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,31:0.35:88
chr9	136643994	rs602990	T	C	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=795;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TAATTCTGCATGGCCACCATC;SOR=0.649;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=69;WE=136644002;WS=136643984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,97:0.51:192
chr9	136645746	rs56305812	TTCTGGCTCTGCGCACACAGGGA	T	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
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chr9	136648746	rs13283160	G	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=893;ReadPosRankSum=1.373;SC=TGAGGTCGAGGCTGGGGTCGG;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=58;WE=136648754;WS=136648736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,75:0.57:131
chr9	136654366	rs45607334	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=746;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GCCCACAACACGCGCCCTGCT;SOR=0.480;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=52;WE=136654374;WS=136654356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr9	136654497	rs2072059	G	A	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=62;PP=1980;SC=GTCAGCCGGGGCTGGAGCAGC;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=96;WE=136654505;WS=136654487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	136654553	rs10821524	A	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=748;SC=TCGTGCACCCAAGGGAACTCC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=136654561;WS=136654543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	136662928	rs7865299	A	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1250;ReadPosRankSum=-1.843;SC=CGTAGATCAGAAGCCTGGACG;SOR=0.937;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=82;WE=136662936;WS=136662918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr9	136672493	rs2510246	A	G	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=51;PP=1762;SC=GCTGTTGCCCACCCTCTCAAG;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=136672501;WS=136672483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	136672529	rs2428089	A	G	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=35;PP=1176;SC=GGAGGGTCCCAGGGCAGCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=136672537;WS=136672519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	136726399	.	G	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=320;ReadPosRankSum=0.107;SC=CACAGGCAGAGGGCATCTGCT;SOR=1.493;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=14;WE=136726407;WS=136726389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr9	136804211	rs2073886	G	A	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=1020;ReadPosRankSum=0.601;SC=AGGCTGGAGAGAGTGACTGCT;SOR=1.298;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=95;TCF=74;TCR=21;TR=53;WE=136804219;WS=136804201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr9	136898627	rs433402	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=357;ReadPosRankSum=-0.301;SC=ACCATGGAACAGAAGTAGTAA;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=29;WE=136898635;WS=136898617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr9	136905474	rs467379	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=251;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTGGAGGGGGCTTGGGGCGAT;SOR=0.430;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=14;WE=136905482;WS=136905464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr9	136907005	rs467387	G	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=849;ReadPosRankSum=1.163;SC=TGGGGGCCGCGGGGGCAGGCA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=59;WE=136907013;WS=136906995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr9	136907108	rs467317	G	A	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=693;ReadPosRankSum=0.343;SC=GAAGACATGGGTGCCCATGGG;SOR=0.510;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=52;WE=136907116;WS=136907098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr9	136913355	rs464826	T	C	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CGCAGTAGCGTAGGTGCTCCG;SOR=0.621;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=61;WE=136913363;WS=136913345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr9	136915508	rs2301576	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=387;ReadPosRankSum=0.653;SC=TGACGACAGGCGGCGTAGGAG;SOR=1.460;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=28;WE=136915516;WS=136915498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr9	137004907	rs28581991	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=3;PP=872;SC=ATATAGTTTGTTTCTTGGCTC;SOR=3.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=137004915;WS=137004897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	137005023	rs11556390	C	T	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=45;PP=2414;SC=AGAAGAAGCCCGAGACCGAGG;SOR=1.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=112;WE=137005031;WS=137005013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	137007298	rs28648812	G	A	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	137013582	rs28695913	G	A	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=45;PP=1363;SC=CTTAATTTCCGAAGCTTCTCT;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=61;WE=137013590;WS=137013572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	137017051	rs34873912	C	T	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=44;PP=1275;ReadPosRankSum=0.784;SC=CCCAGCAGCCCGCGTGAGATC;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=86;TCR=103;TR=82;WE=137017059;WS=137017041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,107:0.45:236
chr9	137019511	rs28703244	T	C	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=67;PP=2965;SC=ACGTGGGGGATGGGGAGCGGG;SOR=1.891;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=242;TCF=175;TCR=67;TR=242;WE=137019519;WS=137019501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr9	137021803	rs28522840	C	T	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=470;SC=CGTAGGGTGCCGTCGTCTTCC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=137021811;WS=137021793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr9	137271408	rs34133915	G	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=331;SC=TCGGCCTCATGGGGGGCTTGC;SOR=2.124;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=137271416;WS=137271398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr9	137299949	rs1805352	C	A	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.49;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	137309192	rs35862336	A	G	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CAGCCTGTGCAGGGGTGGGCA;SOR=0.561;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=192;TCF=90;TCR=102;TR=92;WE=137309200;WS=137309182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr9	137314208	rs115035866	C	T	2916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=68;PP=1803;ReadPosRankSum=-1.018;SC=ACACACTCCCCGCTACCGGGA;SOR=0.899;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=262;TCF=126;TCR=136;TR=121;WE=137314216;WS=137314198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,145:0.48:305
chr9	137320855	rs3118570	G	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=0.251;SC=AGGATGGGTCGGTGACATGCT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=13;WE=137320863;WS=137320845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr9	137321156	rs1536475	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=0.254;SC=GAGTTCAGCCACCTTGGCCCC;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=137321164;WS=137321146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr9	137325822	rs3132293	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CCAGCGGCATTCCTCCACCAC;SOR=1.112;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=5;WE=137325830;WS=137325815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr9	137592961	rs4341231	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=336;ReadPosRankSum=1.057;SC=GCAGCAAAATTGCTTGAGCTG;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=25;WE=137592969;WS=137592951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr9	137600265	.	C	CGG	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.210;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr9	137600270	rs4841925	T	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=295;SC=ACTCCCGGGGTGGGGGCTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=137600278;WS=137600255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	137600687	rs3128588	C	T	7009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=127;PP=2965;SC=TGGGCGGGGCCGTGCTCCCTC;SOR=1.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=90;TCR=127;TR=217;WE=137600695;WS=137600677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr9	137619195	rs3124299	C	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=518;ReadPosRankSum=0.528;SC=ACTGTGACACCGCAGTACCTG;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=35;WE=137619203;WS=137619185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr9	137619425	rs3109683	T	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=0.931;SC=CTGCCCAGAATGATAGGGTCA;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=137619433;WS=137619415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr9	137620474	rs3124302	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=930;ReadPosRankSum=1.628;SC=GGTCGCTCTGCGGGCTCCGCT;SOR=0.451;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=116;TCF=78;TCR=38;TR=64;WE=137620482;WS=137620464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr9	137622033	rs3124308	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr9	137622039	rs3128598	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=2.187;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr9	137622455	rs3128600	A	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GTTCCACCACACCCTGGCCCT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=137622463;WS=137622445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr9	137623555	rs3109675	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=786;SC=GGGGGGCTGGTGGGGCATCAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=137623563;WS=137623545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	137623601	rs3124310	C	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=234;SC=CAGGGGTGGGCCTCTACGGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=137623609;WS=137623591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	137630568	rs3109677	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=616;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTTCTAACTGCCCCAACTTTA;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=46;WE=137630576;WS=137630558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,53:0.34:158
chr9	137630587	rs3128612	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=619;ReadPosRankSum=0.144;SC=TATTTTTAATTCTAGGGTCTT;SOR=0.434;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=44;WE=137630595;WS=137630577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,54:0.36:151
chr9	137642478	rs12685946	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=773;ReadPosRankSum=0.194;SC=TACCCTTATCAGTCGGAGGTG;SOR=0.934;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=61;WE=137642486;WS=137642468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,72:0.39:184
chr9	137642577	rs12686426	T	C	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=964;ReadPosRankSum=0.912;SC=TCTCAGTCTGTGGTCTTGCCT;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=185;TCF=95;TCR=90;TR=78;WE=137642585;WS=137642567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,82:0.41:200
chr9	137644324	.	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.745;NF=8;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=0.203;SC=TCCTGTCCCTCCTCTGTCCAG;SOR=1.445;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=137644332;WS=137644314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr9	137645585	rs73558066	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5035;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=0.287;SC=GCTGAGCACCGTGGCCGAAGC;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=6;WE=137645593;WS=137645575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr9	137645662	rs73558067	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=568;ReadPosRankSum=1.628;SC=GTCCCCACCTCGAGCAGACAT;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=11;WE=137645670;WS=137645638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
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chr9	137660375	rs10776900	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=1.348;SC=ATAGGGCTGCAGGCCCAGGCT;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=20;WE=137660383;WS=137660365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr9	137672012	rs3124932	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=870;ReadPosRankSum=1.051;SC=TCCTTGCAGCCACGGGGCCCC;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=46;WE=137672020;WS=137672002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr9	137686906	rs4072883	C	T	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=35;PP=2965;SC=GAGTGACTGACCAGCCCCTTC;SOR=2.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=107;TCR=36;TR=142;WE=137686914;WS=137686896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr9	137687038	rs4072882	A	G	8448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=155;PP=2965;ReadPosRankSum=1.712;SC=AGCACGTGCCAGGGGCTGGGG;SOR=0.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=110;TCR=156;TR=265;WE=137687046;WS=137687028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,308:1.00:309
chr9	137688048	rs10776902	T	C	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=9;PP=1243;SC=CAGGCTTTGATAGCCACAGAT;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=137688056;WS=137688038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	137688577	rs3811161	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=762;SC=AGGAAAGGCCATGGGGGTGGG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=137688585;WS=137688567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	137688624	rs3811160	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=13;PP=1557;SC=CCACCGGCACAGGCAGGTCAG;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=77;WE=137688632;WS=137688614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	137688657	rs3811159	A	G	4322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=30;PP=2965;SC=CTCGGGAGAGACCTCTTGTCC;SOR=2.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=98;TCR=30;TR=128;WE=137688665;WS=137688647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	137688780	rs142676375	GCCTGTCCCCTCCAAAACCCA	G	5273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=62;PP=2927;SC=GGCCAGCACTGCCTGTCCCCT;SOR=1.667;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=7;TCR=91;TR=67;WE=137688807;WS=137688770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	137688863	rs72774465	G	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=142;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=38;PP=1288;SC=CACAGTGGCCGGTGGGTGGAG;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=137688871;WS=137688853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	137688926	rs7863390	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=1.649;SC=ACCCCCCCACCGCCAAGGCGG;SOR=0.044;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=137688934;WS=137688916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	137690318	rs4240707	A	T	4038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=77;PP=2265;SC=GTGAGTATCGAGGGTGCTGGG;SOR=1.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=120;WE=137690326;WS=137690308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	137694032	rs10858281	C	A	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=19;PP=543;SC=GGAGCAAGCACAGATGTGTTT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=137694040;WS=137694022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	137700999	rs11103535	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=766;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TTGGAGCCACGTTTGACCTGA;SOR=0.827;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=55;WE=137701007;WS=137700989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,69:0.56:123
chr9	137702059	rs3811152	G	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=1074;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGTCCAAACGGTTGTCAAGCT;SOR=0.853;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=66;WE=137702067;WS=137702049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr9	137702200	rs3827850	G	C	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.48;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	137702209	rs3827849	G	A	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=1.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	137707834	rs3827848	G	A	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1456;ReadPosRankSum=0.213;SC=CCGGGCAGACGGTGAGTCCAC;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=98;WE=137707842;WS=137707824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,120:0.50:241
chr9	137707942	rs4841934	T	C	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=63;PP=1587;SC=TAGTTGATATTGATTCCTTTA;SOR=1.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=95;WE=137707950;WS=137707932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	137708803	rs3811149	A	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=30;PP=1434;SC=TGAAATCGCCATGTGTTTTGC;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=79;WE=137708811;WS=137708793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	137708934	rs10858282	T	G	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=1082;SC=GGGTAAATAATCCTGCAGGCA;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=137708942;WS=137708924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr9	137708973	rs10858283	A	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=760;SC=CCTGCATGAAACACCCCCGCC;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=137708981;WS=137708950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	137709683	rs77176843	G	A	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1188;ReadPosRankSum=2.273;SC=CCAAGGTAACGTGTTTTGGAG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=75;WE=137709691;WS=137709673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,87:0.52:168
chr9	137709780	rs11792894	T	C	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=53;PP=1325;SC=CCATGGAGGCTGAGAGTGGCT;SOR=1.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=71;WE=137709788;WS=137709770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr9	137710961	rs10745388	G	A	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=38;PP=1194;SC=GTGGCCGTGGGTCTCAAACTC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=137710969;WS=137710951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	137711997	rs2228560	G	C	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=71;PP=2477;SC=TCGGTCCTCCGGGTGAACAGG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=137712005;WS=137711987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr9	137714027	rs9697186	T	C	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=26;PP=710;SC=TGGTCATTCCTGGGAGGGCAG;SOR=0.970;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=137714035;WS=137714017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	137717499	rs7855787	C	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=46;ReadPosRankSum=0.842;SC=TAAAGTAAACCCCAGAAAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=137717507;WS=137717489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	137717610	rs7868111	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=395;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGACTCTGCCTGCCTCCCTCC;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=33;WE=137717618;WS=137717600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr9	137741411	rs139588734	G	A	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=62;PP=2235;SC=ACCTCCCAGGGAGCACAGGAT;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=137741419;WS=137741401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	137741480	rs113454901	G	A	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.60;QD=33.29;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	137741585	.	A	G	633	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=41.23;NF=13;NR=23;PP=633;QD=18.5492003485;SC=CAGGAAGCACAGGATCACACC;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=36;WE=137741593;WS=137741575;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr9	137741585	.	A	AGGATCACACCTCCCAGGAAGCACG	1771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.53;QD=47.88;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	137741993	.	G	A	1134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=17;MQ=45.92;NF=45;NR=45;PP=1134;QD=12.9863468061;SC=CAGGGAGCACGGGATCACACC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=296;TCF=163;TCR=133;TR=90;WE=137742001;WS=137741983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:206,90:0.30:296
chr9	137742206	rs183486037	C	T	3615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.114;NF=77;NR=90;PP=2423;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TCCCAGTGAGCGTGGGATCAC;SOR=0.843;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=379;TCF=178;TCR=201;TR=167;WE=137742214;WS=137742196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,175:0.44:394
chr9	137742408	rs75482448	G	C	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-1.976;NF=59;NR=62;PP=2008;ReadPosRankSum=0.723;SC=CACGGGATCAGACCTCCCAGG;SOR=0.740;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=245;TCF=124;TCR=121;TR=121;WE=137742416;WS=137742398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,137:0.49:282
chr9	137742496	.	TGGGATCAGACCTCCCAGGGAGCACGGGATCACACCTCCCAGGAAAGCAC	T	2825.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.827;ClippingRankSum=0.000;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-4.140;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.454;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,81:0.32:250
chr9	137742597	rs72502717	A	G	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.687;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.45;MQRankSum=2.980;NF=55;NR=61;PP=1947;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CGAGTGTGGGATCACACCTCC;SOR=0.600;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=216;TCF=112;TCR=104;TR=116;WE=137742605;WS=137742587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,137:0.52:264
chr9	137742694	rs72502718	T	C	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.809;NF=52;NR=63;PP=1898;ReadPosRankSum=-0.560;SC=AAGCACAGGATCACACCTCCC;SOR=0.844;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=260;TCF=127;TCR=133;TR=115;WE=137742702;WS=137742684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,117:0.39:299
chr9	137772664	rs17514136	A	G	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AAAGACCAGAAGAGATGGAGC;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=79;WE=137772672;WS=137772654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,90:0.51:176
chr9	137772792	rs3128627	C	T	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=41;PP=1240;SC=GGGCCTCCTCCTGGAAACTTC;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=137772800;WS=137772782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	137775084	rs7024491	A	G	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=905;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CGCCAGCTCCAGGGTGGGCCC;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=59;WE=137775092;WS=137775074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr9	137775212	rs7037264	G	A	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.468;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=-0.280;SC=GTAAGGAGGGGACAAGAGTGA;SOR=1.670;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=35;WE=137775220;WS=137775202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr9	137779026	rs17549193	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=365;ReadPosRankSum=-0.120;SC=GATTCCCTGACGTTCCACAAC;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=26;WE=137779034;WS=137779016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr9	137779306	rs4521835	T	G	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=710;ReadPosRankSum=1.062;SC=CATAGTTGGTTGGGGGGTAGG;SOR=0.493;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=44;WE=137779314;WS=137779296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr9	137801314	rs2989734	A	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1237;ReadPosRankSum=-1.836;SC=TCTGCTAAATAAGGGTCCTGA;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=65;WE=137801322;WS=137801304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr9	137801416	rs2989735	T	C	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1583;ReadPosRankSum=-1.328;SC=GAAACACACATTGAAACTGGT;SOR=1.034;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=89;WE=137801424;WS=137801406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,112:0.50:223
chr9	137801800	rs1071583	T	C	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=47;PP=1708;ReadPosRankSum=0.883;SC=ACCAGGCTCCTTGGAACTTCT;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=213;TCF=121;TCR=92;TR=107;WE=137801808;WS=137801790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,125:0.50:248
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chr9	137804360	rs2274845	A	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.035;SC=GGATGTTGTCATTCCCCAGCC;SOR=0.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=71;WE=137804368;WS=137804350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr9	137804830	rs2070622	G	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.590;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=1.510;SC=GGGACTCCCAGGCTGACCGCC;SOR=0.582;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=137804838;WS=137804821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr9	137806329	rs11421281	T	TC	2324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.011;NF=3;NR=30;PP=2933;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GAAAGGCTGGTCCAGAGTGGG;SOR=0.911;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=33;WE=137806352;WS=137806319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr9	137806334	rs2989721	A	G	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.065;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr9	137806344	rs3012788	C	T	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.099;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr9	137806487	rs2989722	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=1.981;SC=CTCTGTTGCCGTGTCTCTCTG;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=9;WE=137806495;WS=137806485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr9	137806783	rs3012789	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=551;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GGTTCCAGGAGCTCTCAGAAT;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=43;WE=137806791;WS=137806773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,48:0.39:124
chr9	137808427	rs2382714	T	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=-1.208;SC=GAGGCGGAGATGTGATGGGGG;SOR=0.116;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=14;WE=137808435;WS=137808417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr9	137809685	rs10858293	C	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=0.496;SC=GGACAGCGAGCCCCCGGGCCA;SOR=0.615;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=25;WE=137809693;WS=137809675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr9	137809861	rs10117466	G	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GGAGGTATGAGGTCATCTCAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=137809869;WS=137809851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	137967701	rs730539	T	C	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=76;PP=1805;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GCCCGGCCCCTCGGGAGCCCC;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=233;TCF=77;TCR=156;TR=116;WE=137967709;WS=137967691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,132:0.48:274
chr9	137968919	rs61043559	G	GAA	5658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=2967;SC=CTCTAGGAGAGGTTTTCTTGG;SOR=0.740;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=84;WE=137968927;WS=137968909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	137978292	rs13289444	T	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr9	137982127	rs500461	T	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=2.165;NF=29;NR=24;PP=692;ReadPosRankSum=-1.523;SC=CAGTGGTCGCTCCACAGCAGA;SOR=0.684;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=53;WE=137982135;WS=137982117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
chr9	137982220	rs10628208	A	ATGTG	756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.550;NF=2;NR=12;PP=606;ReadPosRankSum=1.638;SC=GTGAGTTTGTATGTGTGTGTG;SOR=0.473;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=14;WE=137982228;WS=137982210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr9	137998709	rs35408956	T	A	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.208;SC=CGGGTGAGTGTCCCCTTATGT;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=40;TCR=90;TR=65;WE=137998717;WS=137998699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,71:0.50:143
chr9	138236031	rs914398	A	G	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=69;PP=2965;SC=CCGGACGCCCAGTCCTGGGCT;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=103;TCR=69;TR=172;WE=138236039;WS=138236021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr9	138236212	rs914397	T	G	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=91;PP=2755;SC=ACCGCCCCAATGGGGTTGGTT;SOR=2.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=30;TCR=91;TR=121;WE=138236220;WS=138236202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	138378856	rs2078266	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=0.393;SC=AGTGGACAGCAACGACAGCAT;SOR=1.402;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8;WE=138378864;WS=138378846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr9	138379002	rs1975518	T	G	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=27;PP=1707;SC=GGAAGGAGCCTGCCCCACCGC;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=87;WE=138379010;WS=138378992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	138392667	.	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=360;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GCGGGGACCCGATGGAGCGGC;SOR=0.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=20;WE=138392675;WS=138392657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr9	138439005	rs504061	A	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.337;NF=5;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CCGCTGCCCGAGTGTCTCCTG;SOR=0.777;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=9;WE=138439013;WS=138438995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr9	138439086	rs492193	T	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.846;NF=7;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=1.043;SC=CCTGGCAAATTCAGCGCCTGT;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=16;WE=138439094;WS=138439076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr9	138440525	rs2590500	C	G	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=46.33;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	138440525	.	CTT	GTC	2706	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.54;NF=51;NR=8;PP=2706;QD=20;SC=CTGTCCCCACCTTGGCTCACC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=59;WE=138440535;WS=138440515;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,59:0.87:68
chr9	138440527	rs2590501	T	C	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=43.76;SOR=3.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	138440641	rs2853652	T	C	9301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=123;PP=2965;SC=GACATTTTCATGCCCCTGCAG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=146;TCR=123;TR=269;WE=138440649;WS=138440631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr9	138440726	rs3827838	C	T	8129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=1.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr9	138440726	.	CCA	TCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=56;NR=95;PP=2947;QD=20;SC=CCCATGACCCCCATGTCCTCC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=56;TCR=100;TR=151;WE=138440736;WS=138440716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,151:0.97:156
chr9	138440728	rs3827839	A	G	8195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.57;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	138440756	rs3827841	G	A	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=87;PP=2430;SC=CGCATTCCCCGTGTGCCCCGA;SOR=2.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=19;TCR=87;TR=106;WE=138440764;WS=138440746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	138441081	rs2590502	C	T	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.66;QD=29.56;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	138453811	rs697448	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=11;PP=330;SC=GCGGGCAGGCAGGAAGCCCAG;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=138453819;WS=138453801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	138454301	rs3748206	C	T	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ATCATTGAGACGGGCTGGGCG;SOR=0.954;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=188;TCF=76;TCR=112;TR=95;WE=138454309;WS=138454291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,102:0.49:209
chr9	138454574	rs113678897	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTTGGACCCGGGGAAGTTCC;SOR=0.484;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=14;WE=138454582;WS=138454564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr9	138516346	rs34217442	CA	C	4456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.528;NF=17;NR=66;PP=2968;ReadPosRankSum=2.688;SC=GCCATCGAGCCACCACCTCTC;SOR=0.774;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=145;TCF=33;TCR=112;TR=83;WE=138516354;WS=138516336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,133:0.57:235
chr9	138516531	rs7466817	G	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=691;SC=GAAACACACAGTGGGGAAGAA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=138516539;WS=138516521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	138516570	rs58631066	CTTTTTTTTTTTTT	C	86.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.73;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr9	138517853	rs1333241	G	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.35;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr9	138518010	rs1333240	A	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=39;PP=1464;SC=CCCATAGGACAGGAGCGAGCC;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=138518018;WS=138518000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	138518114	rs11103106	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AGCAGGTGCCGAGCAGTAATG;SOR=0.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=19;WE=138518122;WS=138518104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr9	138523332	rs1333234	C	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.921;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TTCCTGGATACAAAGAGAAAA;SOR=0.789;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=79;WE=138523340;WS=138523322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,101:0.43:235
chr9	138523411	rs1333233	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=637;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TTTGGTGTTTCGTCAACATGC;SOR=0.811;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=44;WE=138523419;WS=138523401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr9	138555161	rs10776838	G	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1128;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AGGCGTCCACGGCAAAGATGG;SOR=0.451;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=150;TCF=98;TCR=52;TR=77;WE=138555169;WS=138555151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr9	138556232	rs117500460	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=1.195;SC=ACACACGCTCGCACACTCACT;SOR=0.061;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=17;WE=138556240;WS=138556222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr9	138557256	rs492708	C	T	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=42;PP=1151;SC=CTCTGAAGTCCGGCCCAACCC;SOR=2.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=138557264;WS=138557246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	138586198	rs572335	G	A	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=31;PP=1978;SC=GTGCTTACGCGGGGGGACCAG;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=95;WE=138586206;WS=138586188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	138586309	rs484524	A	G	5774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=1.702;SC=CAGACCTGGAAGCGACAAGCT;SOR=0.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=84;TCR=92;TR=175;WE=138586317;WS=138586299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,212:1.00:213
chr9	138586457	rs548911	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=623;SC=CGGGGAGAAATGCAGAGGCCA;SOR=3.334;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=138586465;WS=138586447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	138586966	rs3119932	GC	AA	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=1437;SC=ATGGCCAGGGGCCCAGCCTGG;SOR=1.900;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=39;WE=138586975;WS=138586956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	138587203	rs2769033	A	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=314;SC=GTCCACTCACACTGACCGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=138587211;WS=138587193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	138587220	rs2483364	T	C	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=290;SC=GAGCACCTGCTCTGCTGCCTG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=138587228;WS=138587210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	138590138	rs506498	T	C	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=30;PP=1467;SC=ATCACCGTGATGCCGGAGGAC;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=80;WE=138590146;WS=138590128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	138590347	rs529976	C	T	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=72;PP=2067;SC=GAAACAAATACCTCTGGGCCC;SOR=1.341;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=108;WE=138590355;WS=138590337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	138590680	rs474061	G	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TTCCCCAACAGGGCTTTTCTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=138590688;WS=138590670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr9	138594266	rs5901089	A	AC	1627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=1180;SC=CTAACCTAAGACCCCCAAGTT;SOR=0.981;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=31;WE=138594274;WS=138594256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr9	138606586	rs2385007	T	C	4473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=9;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=1.041;SC=GGGCGCGGGGTGGGGGCTGGG;SOR=0.619;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=56;TCR=120;TR=80;WE=138606594;WS=138606571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,111:0.53:210
chr9	138606729	.	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr9	138634454	rs60345996	CCCCCAG	C	662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.110;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.974;NF=13;NR=0;PP=572;ReadPosRankSum=-0.370;SC=AGGTCCGGGCCCCCCAGAGCC;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=13;WE=138634467;WS=138634444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr9	138642912	rs10122976	C	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr9	138644203	rs10735239	T	C	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1264;ReadPosRankSum=1.158;SC=CTCCTAAGAATGAACCTCCTG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=97;WE=138644211;WS=138644193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,103:0.53:193
chr9	138645716	rs12378616	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=966;ReadPosRankSum=1.881;SC=TGGAAGCCCTCGGGCAGCAAG;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=59;WE=138645724;WS=138645706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr9	138646881	rs4842032	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=327;ReadPosRankSum=0.608;SC=CCAGTGGAGGCCAATGGTTAT;SOR=1.814;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=19;WE=138646889;WS=138646871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr9	138648813	rs141511626	GTCCCCACCC	G	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.85;ReadPosRankSum=-1.811;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr9	138650121	.	A	ACAGGCTGCCCCGTGGGCCTCAGCCGAGACACAGGTGTGGCCAGGTGCAGGCTGCCCCATGGGCCTCAGCCGAGACACAGGTGTGGCCAGGTG	758	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=63.2;NF=14;NR=1;PP=758;QD=53.4;SC=GTGGCCAGGTACAGGCTGCCC;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=15;WE=138650130;WS=138650111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,15:0.33:45
chr9	138650122	.	C	T	914	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=64.32;NF=23;NR=1;PP=914;QD=39.5321338561;SC=TGGCCAGGTACAGGCTGCCCC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=24;WE=138650130;WS=138650111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,24:0.46:52
chr9	138651482	rs58690674	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.087;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=345;ReadPosRankSum=-0.023;SC=ACGGCCCCCCAGCTCCTGGGC;SOR=1.825;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=23;WE=138651490;WS=138651472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr9	138660879	rs11103179	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=-0.855;NF=11;NR=21;PP=508;ReadPosRankSum=0.418;SC=GCATGTGCACATGTGTGACGG;SOR=1.127;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=32;WE=138660887;WS=138660869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr9	138662309	rs10776844	A	G	5135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=107;PP=2965;SC=GCCGGGCTGCATCCACAGGGC;SOR=1.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=59;TCR=107;TR=166;WE=138662317;WS=138662299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	138662661	rs10858172	G	A	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=18;PP=1522;SC=GGGACAGGGCGGGTGAGCGGC;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=67;WE=138662669;WS=138662651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	138669261	rs914428	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1156;ReadPosRankSum=1.497;SC=CGGCAGAGACGGCCGGCAATG;SOR=0.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=173;TCF=66;TCR=107;TR=76;WE=138669269;WS=138669251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,92:0.44:211
chr9	138670699	rs113887396	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=474;ReadPosRankSum=0.263;SC=TCGGCTCTAAACCACCCCACA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=28;WE=138670707;WS=138670689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr9	138671425	rs880929	G	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-0.297;SC=GGCTCCTGCCGCCCTCCTGCT;SOR=1.519;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=19;WE=138671433;WS=138671415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr9	138675790	rs10776847	C	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=9;PP=1233;SC=GGTGCACACACAGTGCCCTCG;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=138675809;WS=138675780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	138675801	rs10776848	A	C	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=17;PP=1554;SC=AGTGCCCTCGACCCCGTGGCT;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=138675809;WS=138675780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	138678016	rs36221684	CGCCCT	C	4282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=32;PP=2620;SC=CACCCCTCCCCGCCCTGCCCT;SOR=1.449;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=53;WE=138678028;WS=138678006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	138679863	rs11103189	A	G	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=16;PP=1574;SC=GCACCCGCCCACTGTGCCGGC;SOR=2.484;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=74;WE=138679871;WS=138679853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr9	138683575	rs41299048	TG	CA	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.418;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=16;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.137;SC=CCCACACCTCTGGGCCCCTGC;SOR=0.441;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=114;TCR=34;TR=79;WE=138683584;WS=138683565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,99:0.62:160
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chr9	138837958	rs2297691	C	T	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=49;PP=1436;SC=CCCTCAGGCACATCAACAGGA;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=68;WE=138837966;WS=138837948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	138838140	rs7028495	T	C	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=25;PP=1495;SC=ACAATTCCACTGCATCTGGGT;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=76;WE=138838148;WS=138838130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	138838305	rs2297690	G	A	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=47;PP=1446;SC=TAGAACTCTTGATTCTGAGAG;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=138838313;WS=138838295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	138839888	rs2297689	C	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=37;PP=1150;SC=CCTTGATGAGCTGGGGGAGCC;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=138839896;WS=138839878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	138898893	rs4842070	C	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=14;PP=967;SC=CCATCCAAATCTTCAAGTCAA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=138898901;WS=138898883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	138899253	rs56162840	G	GCA	4429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.17;NF=3;NR=80;PP=2379;SC=ACACGCACGTGCACACAGACG;SOR=3.077;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=4;TCR=92;TR=83;WE=138899265;WS=138899243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	138899301	rs56188305	GCA	G	1079.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=943;SC=ACACACACGCGCACACAGACG;SOR=2.584;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=138899320;WS=138899291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	138899311	rs56102761	GCA	G	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=649;SC=GCACACAGACGCACACACACA;SOR=2.494;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=138899320;WS=138899291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	138903671	rs9626	A	G	5600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=97;PP=2965;SC=GTGCCGCGGCAGGCGGGAACT;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=188;WE=138903679;WS=138903661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr9	138905884	rs11103273	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=18;PP=322;SC=GGCGCACAGATGGGTGAGGGG;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=138905892;WS=138905874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	138927108	rs183405924	C	A	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.82;QD=28.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	138927183	rs149084098	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=28;PP=1527;SC=TGTGACGCACTGAGAAGGTTC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=82;WE=138927191;WS=138927173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	139008803	rs3739466	T	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=649;ReadPosRankSum=-2.709;SC=TCCAGGCGGCTGTTGGCGTAG;SOR=0.775;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=47;WE=139008811;WS=139008793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr9	139010319	rs1717447	A	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=24;ReadPosRankSum=0.524;SC=CGGGTCCCCGACCGCAGCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=139010327;WS=139010317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr9	139090465	rs3215774	T	TC,TCC	1099.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.55;QD=30.55;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,18,18:0.50,0.50:36
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chr9	139094805	rs2274116	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GGCGCAGGTCCGCCCTCCGCG;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=13;WE=139094813;WS=139094795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr9	139100805	rs9696116	T	C	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=1528;ReadPosRankSum=1.067;SC=GCAAGCTCTCTGGAAGGGCAG;SOR=0.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=106;TCR=148;TR=117;WE=139100813;WS=139100795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,140:0.47:298
chr9	139107230	rs10858247	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=31;PP=697;SC=GCTGCCTTCTTGACTGGGGGG;SOR=4.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=34;WE=139107238;WS=139107220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	139108359	rs55791344	G	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=731;SC=CCCGGGCCCCGAGCAGGGAGA;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=139108367;WS=139108349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	139110654	rs12684650	C	T	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=52;PP=1999;SC=ACAGCTTCGACCTAGGACGGG;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=139110662;WS=139110644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	139137626	rs79849109	C	T	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=49;NR=38;PP=1319;SC=GGCTGCGCGCCACCGCCGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=87;WE=139137634;WS=139137616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	139142710	rs62579871	G	A	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=39;PP=1924;SC=GCTCCCGGGCGAGGGGTGTCT;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=79;WE=139142718;WS=139142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	139142808	rs66470520	T	C	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=50;PP=1994;SC=GTAGAGGGCCTTGGCAGCTCC;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=139142816;WS=139142798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	139222174	rs28495820	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=6;PP=107;SC=GCCCCGCCCGTGGCCGACGAG;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=139222182;WS=139222164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	139230292	rs28447209	T	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=381;SC=ATCACCTCAGTGGTTGCAGGC;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=139230300;WS=139230282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	139230373	.	G	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=352;ReadPosRankSum=-2.274;SC=CCCGGGCCCAGAGGCCTGACC;SOR=0.275;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=30;WE=139230381;WS=139230363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr9	139235481	rs145729152	TC	T	1749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=8;NR=32;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GGGGTCTTGCTCCCCACAGGC;SOR=0.624;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=40;WE=139235489;WS=139235471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,63:0.51:124
chr9	139235606	rs78403475	G	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=397;ReadPosRankSum=-0.954;SC=CTCAGGGACAGCACAGGCCTG;SOR=0.641;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=24;WE=139235614;WS=139235596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr9	139243334	rs28429551	T	A	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=50;PP=1412;SC=TGGGAGATAATTGTGCCCTCC;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=139243342;WS=139243324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	139249991	rs28603210	T	C	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=279;SC=GGTGACACGTTCTGGGGGAGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=139249999;WS=139249987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr9	139252495	rs3812547	G	A	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=63;PP=2654;SC=AGCGCTGCCCGCCACCTGACG;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=141;WE=139252503;WS=139252485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	139256468	rs3812552	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-1.267;SC=CAGGAGTCAGCTCGGCTCCGT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=8;WE=139256476;WS=139256458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	139256541	rs3812554	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-1.945;SC=GATGTGGGGGCCCCTGCAGCC;SOR=0.569;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=8;WE=139256549;WS=139256531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
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chr9	139257422	rs45592338	C	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.819;SC=CTGGCCCAGCCCTGGGGTACA;SOR=0.824;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=49;WE=139257430;WS=139257401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,64:0.40:162
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chr9	139271919	rs11791262	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=575;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GCCCCCACCCCACTGCTCCAG;SOR=1.038;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=28;WE=139271927;WS=139271909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr9	139272058	rs10781507	A	G	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1464;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GTTCCAGCTCACTCAGGAGGT;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=98;TCR=107;TR=98;WE=139272066;WS=139272048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,110:0.46:237
chr9	139272502	rs3812565	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=348;ReadPosRankSum=-1.226;SC=CAGGCTGGGGTAGGGGCGGCT;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=21;WE=139272510;WS=139272492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr9	139273288	rs3829112	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=408;ReadPosRankSum=2.024;SC=GGGCTGTGCCCTCGGCCTCTG;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=27;WE=139273296;WS=139273278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr9	139273402	rs3812567	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=808;ReadPosRankSum=-1.309;SC=GTTTGGCTGCCGCGGGGGCCC;SOR=0.565;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=49;WE=139273410;WS=139273392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr9	139273790	rs3812568	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-0.977;SC=AAGCCCCAGGCATCTGGCCCA;SOR=1.843;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=17;WE=139273798;WS=139273780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr9	139275204	rs3812570	A	C	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1321;ReadPosRankSum=1.170;SC=GCAGAAGATGAACTGGTGGGT;SOR=0.923;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=176;TCF=105;TCR=71;TR=82;WE=139275212;WS=139275194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,84:0.45:188
chr9	139275294	rs3812571	G	C	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=56;PP=1487;ReadPosRankSum=-2.067;SC=CAGTATCGATGTGGAACAGCT;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=184;TCF=81;TCR=103;TR=96;WE=139275302;WS=139275284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,112:0.52:216
chr9	139276430	rs34850728	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.309;NF=11;NR=10;PP=322;ReadPosRankSum=-2.096;SC=GGGTGGCTCTGTGCCGTAGCC;SOR=0.389;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=21;WE=139276438;WS=139276420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr9	139276680	rs3812573	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=443;ReadPosRankSum=-0.558;SC=GTGGCGTGCGCGTGGGTGTCT;SOR=0.856;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=29;WE=139276688;WS=139276670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr9	139279173	rs10781510	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=502;ReadPosRankSum=0.682;SC=GCAACTTACCGACACCATATT;SOR=0.463;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=33;WE=139279181;WS=139279163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,42:0.36:116
chr9	139281847	rs78428995	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.529;SC=CGCTGGCCGCTGTCCCCCAGC;SOR=0.077;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=12;WE=139281855;WS=139281837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr9	139288682	rs141530587	C	CT	1854.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=2704;ReadPosRankSum=-1.249;SC=CCGTTTTTGACTTATGGTTTT;SOR=0.963;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=28;WE=139288700;WS=139288672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr9	139288688	rs76179734	G	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr9	139288692	rs11145863	T	C	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr9	139289825	rs4266763	A	G	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=41;PP=1637;ReadPosRankSum=0.449;SC=GGCTTTTGCCATCTTTCACCT;SOR=0.792;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=207;TCF=127;TCR=80;TR=109;WE=139289833;WS=139289815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,127:0.52:242
chr9	139290011	rs11145874	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=650;ReadPosRankSum=0.996;SC=GGGGGCTCTGGGGGTGGGGAG;SOR=1.154;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=34;WE=139290019;WS=139290001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr9	139290251	rs4498662	C	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=-1.581;SC=TGGCATGTGACGAGATGAGAC;SOR=1.262;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=28;WE=139290259;WS=139290241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
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chr9	139298593	rs1051957	A	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.139;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=1488;ReadPosRankSum=0.336;SC=TCAGGCTGGCACCCTGGCCGC;SOR=0.352;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=46;WE=139298601;WS=139298570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
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chr9	139307194	rs3841202	T	TA	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.614;NF=7;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=-1.040;SC=AAGTAGATTTTAAAAAAAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=10;WE=139307202;WS=139307184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr9	139309255	rs79265255	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=510;ReadPosRankSum=1.947;SC=AATAGCGCTGGGGCTGGGCAT;SOR=0.960;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=29;WE=139309263;WS=139309245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr9	139313403	rs4604565	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=978;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TCCTCAGTGCGGTTGCCTGTC;SOR=0.956;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=59;WE=139313411;WS=139313393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr9	139316601	rs10870165	C	T	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1178;ReadPosRankSum=-1.676;SC=GTCGTGGGGTCGCAGACCTGG;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=75;WE=139316609;WS=139316591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,89:0.54:164
chr9	139324029	rs35873563	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.562;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr9	139324737	rs33982662	C	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=822;ReadPosRankSum=0.981;SC=ACTTGTCTCGCCCCGGCCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=51;WE=139324745;WS=139324727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr9	139325641	rs68002978	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=0.847;SC=GCCCTCACCTCTCCTCATCTC;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=139325649;WS=139325631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr9	139327034	rs10870194	A	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.598;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=708;ReadPosRankSum=1.364;SC=CCTTCCCGTCACCTGCTGTGG;SOR=0.699;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=52;WE=139327042;WS=139327024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,60:0.34:178
chr9	139327062	rs34936112	G	A	2323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,63:0.38:168
chr9	139327062	.	GGA	AGG	2006	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=22;NR=31;PP=2006;QD=38.8578844314;SC=AATGGGGTAGGGACCACAGGG;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=53;WE=139327072;WS=139327052;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:90,53:0.37:143
chr9	139327064	rs34302850	A	G	2323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,65:0.38:172
chr9	139327143	rs35531907	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=770;ReadPosRankSum=2.108;SC=CCCCGGCAGACGCAACCCCAC;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=25;WE=139327162;WS=139327133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr9	139327154	rs34985258	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.636;HP=3;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=770;ReadPosRankSum=0.225;SC=GCAACCCCACCGGGCATCCGC;SOR=0.249;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=23;WE=139327162;WS=139327133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr9	139327277	rs34619169	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=389;ReadPosRankSum=0.083;SC=CTTAGCAAGCGTGGTGCCCAC;SOR=0.563;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=22;WE=139327285;WS=139327267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr9	139327439	rs10781542	A	G	3542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=76;PP=2187;ReadPosRankSum=0.119;SC=AGAGGAAGGAAGTGCCAAAAA;SOR=0.815;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=281;TCF=137;TCR=144;TR=140;WE=139327447;WS=139327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,168:0.50:339
chr9	139327599	rs71269007	G	GCGCCCACCCCTCCAGCCA	1608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.691;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=5.188;NF=8;NR=17;PP=2098;ReadPosRankSum=1.402;SC=CCCTCCAGCCGCGCCCACCTG;SOR=1.060;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=91;TCF=23;TCR=68;TR=25;WE=139327607;WS=139327589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr9	139328722	rs7851507	G	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=311;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CAAAAAGGGAGCTGCCCGGTC;SOR=0.678;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=24;WE=139328730;WS=139328712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr9	139333049	rs5901103	GCCCT	G	3032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=21;PP=2037;SC=CACCCGCCAGGCCCTCCCTAC;SOR=1.576;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=41;WE=139333060;WS=139333039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr9	139341529	rs3841203	CA	C	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.016;NF=3;NR=21;PP=327;ReadPosRankSum=0.867;SC=ACAGGCAAATCAAAAAAAAAA;SOR=0.882;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=24;WE=139341537;WS=139341519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
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chr9	139399490	rs368495371	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=827;ReadPosRankSum=0.615;SC=CGCACTCCGCGCTGTTGCAGC;SOR=1.008;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=51;WE=139399498;WS=139399480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
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chr9	139401233	rs61751543	C	T	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=949;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CTGGGTGCCACGGGCGTCGCA;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=64;WE=139401241;WS=139401223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,77:0.48:159
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chr9	139407452	rs3812608	C	T	352.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=0.566;SC=CCCTCCAGCACAGGCCCCACC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=139407460;WS=139407442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
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chr9	139410424	rs3125006	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.15;NF=40;NR=21;PP=1195;SC=GGTGGGCGCCAGCCCGCACCT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=139410432;WS=139410414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	139410589	rs4880099	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=485;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GTGCAACAGCACTATGGCCCT;SOR=1.096;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=30;WE=139410597;WS=139410579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr9	139410679	rs4880100	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.468;SC=CTCAGCCAGCTCCAGCTCTCC;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=12;WE=139410687;WS=139410669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr9	139411714	rs11145767	T	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=558;ReadPosRankSum=0.669;SC=GGGGCGGGGGTGGCCCTCACC;SOR=0.440;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=36;WE=139411722;WS=139411704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr9	139411880	rs9411254	G	A	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=933;ReadPosRankSum=0.714;SC=CGCGGCCCCAGTGCCCCACTG;SOR=0.851;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=64;WE=139411888;WS=139411870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,65:0.40:161
chr9	139412197	rs9411208	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=981;ReadPosRankSum=0.102;SC=GGCCCCGGCCGACGCACCGGG;SOR=0.579;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=69;WE=139412205;WS=139412187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,73:0.58:126
chr9	139418260	rs4489420	A	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=0.265;SC=TGAGGCAGGCATTGTCCAGGG;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=35;WE=139418268;WS=139418250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr9	139440845	rs3013306	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.545;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr9	139440852	rs3013307	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.793;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr9	139562993	rs4880118	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=966;ReadPosRankSum=0.165;SC=GGCTGACCCCCTCTCCACCCC;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=63;WE=139563001;WS=139562983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,84:0.54:155
chr9	139565150	rs4636297	A	G	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=955;ReadPosRankSum=0.050;SC=CGCATCGAAAACGCCGCTGAG;SOR=0.934;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=65;WE=139565158;WS=139565140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,81:0.47:173
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chr9	139565487	.	G	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=896;ReadPosRankSum=3.343;SC=GGTGGGGGGGGGGGGGGGCAG;SOR=1.027;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=30;WE=139565495;WS=139565464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,37:0.88:42
chr9	139566823	rs1051828	A	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=51;PP=1637;SC=GGGTCCAGAAACCACCTCGGG;SOR=2.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=68;WE=139566831;WS=139566813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	139569066	rs9411215	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=1.294;SC=CATTCGCCACATGGTCACCGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=11;WE=139569074;WS=139569056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr9	139572068	rs2236514	C	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=179;ReadPosRankSum=0.204;SC=GGCTGGGGCGCGAAGGCCTGG;SOR=0.332;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=19;WE=139572076;WS=139572058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr9	139616742	rs945384	A	G	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=25;NR=40;PP=1212;SC=GATGACCCTCAGCTTCCTCAA;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=139616750;WS=139616732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	139616840	rs3739939	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=0.216;SC=CATGCCCAGCGCAAAGGCACA;SOR=0.180;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=10;WE=139616848;WS=139616830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr9	139617379	rs11793962	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=346;ReadPosRankSum=1.653;SC=CATCAAATCAGCTGGCTTTTC;SOR=0.453;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=25;WE=139617387;WS=139617369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr9	139617626	rs7038042	G	A	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.133;SC=ACCTCACCGAGGGCGTGCCGC;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=62;WE=139617634;WS=139617616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr9	139617662	rs11849	T	C	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CGGCCGCCCTTCCACCCCTGT;SOR=0.853;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=56;WE=139617670;WS=139617652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr9	139618283	rs6873	A	G	115.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CCAGGGTCCAACCCTCCCTCA;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=6;WE=139618291;WS=139618273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr9	139620695	rs2275161	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GGACAGCATCCGCAGGGCAGC;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=16;WE=139620703;WS=139620685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr9	139621120	rs10781513	A	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=303;ReadPosRankSum=0.548;SC=CCAGCGCGAGAGTTAGAAAGC;SOR=0.896;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=15;WE=139621128;WS=139621110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr9	139621168	rs2275160	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=384;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AGATACCAGCGAAGGAAAACA;SOR=0.563;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=24;WE=139621176;WS=139621158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr9	139639532	rs145717467	CGGCCCACGCACCACACAGCTCCCAACGTGGGCCCCGAGT	C	1315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr9	139639540	.	G	T	199	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=27;MQ=59.4;NF=11;NR=1;PP=199;QD=19.4809343789;SC=AGCGGCCCACGCACCACACAG;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=12;WE=139639548;WS=139639530;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr9	139642961	rs2811728	G	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1243;ReadPosRankSum=0.269;SC=CTGCGCCGCAGGCCCAGGATG;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=80;WE=139642969;WS=139642951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,96:0.59:163
chr9	139642999	rs111432548	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=750;ReadPosRankSum=-1.320;SC=CTGGAGACCCGTTTATATGGC;SOR=0.775;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=52;WE=139643007;WS=139642989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,57:0.40:143
chr9	139649580	rs879467	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=-1.703;SC=TCGGGGGTCAGGCTCACCTCC;SOR=0.840;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=15;WE=139649588;WS=139649570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr9	139650060	rs2784068	C	A	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1379;ReadPosRankSum=-1.142;SC=ATCCTGCCCCCACCCAGTCCC;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=75;WE=139650068;WS=139650050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,82:0.45:181
chr9	139650595	.	T	G	1954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=19;MQ=58.33;NF=51;NR=65;PP=1954;QD=17.1445794185;SC=GAACAGCATGTGGAACAGCGC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=212;TCF=92;TCR=120;TR=116;WE=139650603;WS=139650585;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:96,116:0.55:212
chr9	139650619	.	A	G	1922	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=24;NF=53;NR=51;PP=1922;QD=18.815107813;SC=GAACAGCATGAGGAACAGTGC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=104;WE=139650627;WS=139650609;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:100,104:0.51:204
chr9	139651163	rs57411373	A	AG	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=322;ReadPosRankSum=0.332;SC=GGAGTATCCCAGGCCTGGAGC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=139651171;WS=139651153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr9	139651624	rs368695023	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=0.647;SC=CTCCAATCTAGAGAGATACGG;SOR=0.864;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=26;WE=139651632;WS=139651614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr9	139652338	rs9411272	C	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=536;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GGAGCCCCACCAACTAAGAAG;SOR=0.429;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=40;WE=139652346;WS=139652328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr9	139653055	rs11145867	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GCTTGCAGCCCGCCTGGCCTC;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=14;WE=139653063;WS=139653045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr9	139656319	rs113962430	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TGGGGAGGAAGACATCCGTGA;SOR=1.244;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=13;WE=139656327;WS=139656309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr9	139656618	rs2484658	T	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=144;SC=GGGCATGGGGTGGGCGGGGCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=139656626;WS=139656608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	139656670	rs2297722	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-0.856;SC=ATCATGTCCTTGGGGAGCCCC;SOR=1.085;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=15;WE=139656678;WS=139656660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr9	139656706	rs2297723	A	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=402;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TCCTGGAAGGACTTCAGAGCC;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=29;WE=139656714;WS=139656696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr9	139657834	rs9987876	G	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr9	139658051	rs4880070	G	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GGGAGGGCGGGCAGGGGGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=7;WE=139658059;WS=139658041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr9	139658576	rs4880140	G	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GAGTGGCCATGTCTTGGGTGT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=12;WE=139658584;WS=139658566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr9	139685672	rs2784044	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr9	139697061	rs2784100	C	T	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=14;PP=1014;SC=GATAAAAGCTCGGGGCAACTG;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=139697069;WS=139697051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	139699964	rs2811793	T	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=31;PP=962;SC=GCCTCTCACGTCTGGGTAATG;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=139699972;WS=139699954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	139700605	rs2811795	T	C	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=16;PP=1342;SC=CTGTGAGGAGTGGCGGGTGCA;SOR=1.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=139700613;WS=139700595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	139701108	rs2254143	A	C	6669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=119;PP=2965;SC=ATGGGCATTAACTTGCCTGCG;SOR=0.943;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=90;TCR=119;TR=209;WE=139701116;WS=139701098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr9	139701983	rs3739944	C	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=13;PP=1300;SC=CTGCGCCTAGCTGGGCTAGCC;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=139701991;WS=139701973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	139702908	rs7864908	C	T	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=6;PP=173;SC=GCCCGCCGGGCGCTCCGGGAG;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=139702916;WS=139702898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	139726239	rs2811748	A	G	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=50;PP=1984;SC=GCGTGCTGGGAAACTACCGGG;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=139726247;WS=139726229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	139730129	rs2811744	T	C	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=225;SC=ATTCAGGGGCTGTGGGGCTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=139730137;WS=139730119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	139731969	rs2811742	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.90;QD=26.60;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr9	139732462	rs2811740	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=333;ReadPosRankSum=-0.676;SC=AGCAGGACAGCGACAGGTGAG;SOR=0.520;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=28;WE=139732470;WS=139732452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr9	139739643	rs10870132	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.61;NF=8;NR=1;PP=219;SC=GGCCCCTGCCTGGGCCCCGGG;SOR=1.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=139739651;WS=139739633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	139744807	rs872463	A	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=10;PP=1959;SC=ACACCCCCAGACATGGCCGGC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=72;WE=139744815;WS=139744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	139746992	rs10123375	G	A	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=49;PP=1578;SC=GGCAGTGACGGACACCAGGGC;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=139747000;WS=139746982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	139749067	rs7869864	C	T	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=17;PP=1105;SC=GGAACCACCGCGCTGGTGGTC;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=139749075;WS=139749057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	139752899	rs2275156	T	G	7877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=147;PP=2965;SC=CCACCTGGCCTGGCCCGGCCT;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=104;TCR=147;TR=251;WE=139752907;WS=139752889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr9	139760830	rs76229681	CG	C	1929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=52;PP=1725;SC=TGGCTGCACGCGGGGGGCGGG;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=53;WE=139760838;WS=139760820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	139793030	rs117439227	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TGCGATTCTGCTTCTCTGAGT;SOR=0.793;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=139793038;WS=139793020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr9	139804274	rs4567138	G	A	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=5;PP=1154;SC=GTGCTCCTGCGGCCCCTCGGC;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=139804282;WS=139804264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	139804346	rs4448378	C	T	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=43;PP=2267;SC=CGTCCACCCTCACACTCCTGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=139804354;WS=139804336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
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chr9	139818169	rs17250631	CTT	C	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=512;SC=GGAAAAAAAACTTTTCTTTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=139818178;WS=139818159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr9	139863732	rs908829	G	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=2.011;SC=CAGCGCTCTGGAGCCTGCCCC;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=139863740;WS=139863722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr9	139863841	rs11787585	C	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=590;ReadPosRankSum=-0.770;SC=ACAGTGGACTCTCGCACGGTG;SOR=0.426;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=40;WE=139863849;WS=139863831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
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chr9	139864593	rs13301523	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=439;ReadPosRankSum=-0.122;SC=AGCATGGCCCTCATGGCCCTG;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=19;WE=139864601;WS=139864583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
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chr9	139872048	rs4880179	A	G	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=25;PP=1146;SC=CTCATCACACACTGTGGATGG;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=60;WE=139872056;WS=139872038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	139875318	rs146717258	C	CCATT,CCATTCATT	1467.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=2,2;NR=22,22;PP=442,505;SC=GTGAGCCACTCCATTCATTCA;SOR=2.910;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=24,24;WE=139875326;WS=139875308;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.52:29
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chr9	139878828	rs4880082	T	C	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=18;PP=1052;SC=CCATGTCCTCTAAGGATTGTG;SOR=1.263;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=54;WE=139878836;WS=139878818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr9	139902214	rs10870161	A	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=263;SC=CGCAGTGACCACAGGGCATGG;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=139902222;WS=139902204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr9	139902786	rs4880186	G	C	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=48;PP=1910;SC=GTTCTCCCCCGACCCCACCCG;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=139902805;WS=139902776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
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chr9	139903352	rs59031144	G	GC	2035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=32;PP=1209;SC=GCCTGGCAGCGCCCCCCCACC;SOR=1.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=41;WE=139903360;WS=139903342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	139904037	rs7048567	A	G	5776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=70;PP=2965;SC=TGATGAGGTCAAGGATGAGGT;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=108;TCR=70;TR=178;WE=139904045;WS=139904027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
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chr9	139906359	rs2271862	G	A	6617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=85;PP=2965;SC=CAAACTGCAGGTGCTTGGCCT;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=119;TCR=85;TR=204;WE=139906367;WS=139906349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr9	139906513	rs2271863	T	C	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=89;PP=2756;SC=GGGGCTGCAGTGCCCACCTGC;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=68;TCR=89;TR=157;WE=139906521;WS=139906503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr9	139906686	rs45540434	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=1.657;SC=GCTCCTCCCCGCCCCGCCCCG;SOR=1.402;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=8;WE=139906694;WS=139906676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr9	139907842	rs4880188	T	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=4;PP=230;SC=CTCGCCCGCCTGGCCCACCAA;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=139907850;WS=139907832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	139908139	rs10870162	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=479;SC=AGGAGACAGGACTCCCGGATG;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=139908147;WS=139908129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	139908265	rs10781531	T	C	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=32;PP=1538;SC=CCAGCACCCCTGTCCAGCCGG;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=84;WE=139908273;WS=139908255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	139910648	rs6560657	T	C	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=70;PP=2398;SC=GGCGGGGTCATGACCCCACGC;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=126;WE=139910656;WS=139910638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr9	139912178	rs879854	G	A	6384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=92;PP=2965;SC=GGCAGGCCCCGGGGAGGACGC;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=183;WE=139912186;WS=139912168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr9	139912484	rs908832	A	G	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=63;PP=2718;SC=GCTCCACCACATCGTGCCCCA;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=147;WE=139912492;WS=139912474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr9	139913239	rs908828	T	G	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=33;PP=1903;SC=CTCCTCGTCGTGGAAGCCCTT;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=99;WE=139913247;WS=139913229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	139923265	rs4880189	A	G	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=42;PP=2498;SC=GCTCGCCGTGAGCGGAGCAGG;SOR=1.241;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=114;WE=139923273;WS=139923255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	139923408	rs111884603	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=781;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GGGGCGCCCCGGGAGGTGGGG;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=40;WE=139923416;WS=139923398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr9	139926402	rs7469569	T	C	4923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=42;PP=2965;SC=TGTCCCCAGCTTGGGCCTCCC;SOR=1.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=99;TCR=42;TR=141;WE=139926410;WS=139926392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr9	139929152	rs41309978	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=751;ReadPosRankSum=0.087;SC=CACGCCTGCGGGTGACCCGGC;SOR=1.323;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=47;WE=139929160;WS=139929142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr9	139937795	rs10781535	T	C	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.07;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	139937799	rs10781536	G	A	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.68;SOR=1.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	139943549	rs7390981	G	A	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=28;PP=1367;SC=GCGGGACACCGTCAGGCAGGC;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=139943557;WS=139943539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	139944496	.	T	C	825	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=58.46;NF=17;NR=34;PP=825;QD=16.8582590696;SC=GAGCACCTGCTGCCACCCGCC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=139944517;WS=139944486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	139944509	.	T	C	765	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=56.22;NF=7;NR=25;PP=765;QD=24.9928503921;SC=CACCCGCCTGTCCCTACTCAC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=32;WE=139944517;WS=139944486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr9	139944548	.	T	C	242	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=27;MQ=43.49;NF=2;NR=9;PP=242;QD=25.1610193225;SC=CCGCCTGCCCTTACCCACGAC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=11;WE=139944556;WS=139944538;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,11:0.79:14
chr9	139944689	rs7869777	T	C	495.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.64;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.833;NF=17;NR=4;PP=422;ReadPosRankSum=-0.898;SC=CACCCGCCTGTCCCTACCCAC;SOR=2.469;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=21;WE=139944697;WS=139944679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr9	139945051	rs7869520	A	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=24;PP=816;SC=CCAGCCTGACAAACCTCCCAC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=139945059;WS=139945041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	139946804	rs2271867	C	G	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=71;PP=2283;SC=TGCCATACTGCGGGGGAGGGG;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=108;WE=139946812;WS=139946794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	139946905	rs34679600	C	CA	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=893;SC=CTCCCCCCCCCACCCAGTCAT;SOR=4.615;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=20;WE=139946924;WS=139946895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139946916	rs11145979	G	A	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=19;PP=507;SC=ACCCAGTCATGTGCCAAGCCT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=139946924;WS=139946895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139960178	rs2176674	A	G	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=62;PP=1989;SC=ACACGTCCACACATGCATGAG;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=139960186;WS=139960168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	139960894	rs72763246	C	T	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=23;PP=642;SC=TGAGGTGCAGCGGCCTCCACA;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=139960902;WS=139960884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	139973186	rs7390974	T	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=67;PP=2085;SC=GGGAGCGTAGTTGGGGGTCCA;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=75;WE=139973194;WS=139973176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	139973629	rs7390710	A	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=35;PP=1273;SC=GGCGCCCCGCACCCGAGGCTG;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=139973637;WS=139973619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	139973652	rs7390711	A	G	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=29;PP=992;SC=CCCGCCCCTCACGGAGCCCCG;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=139973660;WS=139973642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	139973820	rs7037849	C	T	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=58;PP=2189;SC=CAGCTACGTGCCTCCGACGGG;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=123;WE=139973828;WS=139973810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	139975108	rs9314874	T	C	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=35;PP=1966;SC=GCCTCTGTGCTGGGACGTGGG;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=101;WE=139975116;WS=139975098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	139975195	rs41302685	C	T	6083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=91;PP=2965;SC=CACTGAAGAACGCAGAGCCAG;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=98;TCR=91;TR=189;WE=139975203;WS=139975185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr9	139977195	rs4390039	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=14;PP=437;SC=GCCCAGACTGTCCCCAGACTC;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=139977203;WS=139977185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139981241	rs968732	GT	CG	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=25;PP=1376;SC=AGCTACGCTCGTAGCACACCT;SOR=2.362;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=33;WE=139981250;WS=139981231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	139981627	rs968733	A	G	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=53;PP=1920;SC=TTTGGCGAGAACTATGACAAC;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=139981635;WS=139981617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	139982868	rs3750518	C	T	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=66;PP=1986;SC=CTGATATGTCCAGCCTCCCTT;SOR=2.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=89;WE=139982876;WS=139982858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	139990906	rs4880199	T	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=470;SC=AAAACAAGATTGCGGAAACGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=139990914;WS=139990896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139994102	rs4880200	G	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=11;PP=607;SC=CTGTGCCGACGCCAGGACCAC;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=139994110;WS=139994092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	139996641	rs13298199	C	A	15250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=748;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=23.480;NF=253;NR=319;PP=2962;ReadPosRankSum=3.089;SC=GAGTACAGGTCGGTGGTGTTA;SOR=0.475;SbPval=0.56;Source=Platypus;TCF=342;TR=572;WS=139996631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:69,654:0.90:723
chr9	139996653	.	ACG	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=24;MQ=51.65;NF=43;NR=178;PP=2962;QD=20;SC=GTGGTGTTACACGTGCTGTTG;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=497;TCF=70;TCR=427;TR=221;WE=139996662;WS=139996631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:276,221:0.44:497
chr9	139996739	.	A	ACG	2954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MMLQ=24;MQ=50.94;NF=17;NR=176;PP=2954;QD=20;SC=ACACACATTCACTGTTGCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=300;TCF=58;TCR=242;TR=193;WE=139996757;WS=139996725;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:107,193:0.64:300
chr9	139996749	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=49;MMLQ=24;MQ=50.11;NF=54;NR=141;PP=2962;QD=20;SC=ACTGTTGCAGGCGTGCAGGTC;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=389;TCF=171;TCR=218;TR=195;WE=139996757;WS=139996725;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:194,195:0.50:389
chr9	139996764	.	G	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MMLQ=24;MQ=49.06;NF=31;NR=97;PP=2962;QD=20;SC=CAGGTCGGTGGTGTTACACAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=362;TCF=175;TCR=187;TR=128;WE=139996789;WS=139996754;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:234,128:0.35:362
chr9	139996768	.	T	TAC	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MMLQ=27;MQ=48.23;NF=10;NR=106;PP=2964;QD=20;SC=TCGGTGGTGTTACACATTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=261;TCF=76;TCR=185;TR=116;WE=139996789;WS=139996754;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:145,116:0.44:261
chr9	139996933	rs10118812	T	G	9349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=158;NR=139;PP=2965;SC=ACACATTCATTCTGTTGCAGG;SOR=0.795;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=299;TCF=160;TCR=139;TR=297;WE=139996941;WS=139996923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr9	139997133	.	CTG	C	2970	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=24;MQ=45.7;NF=97;NR=49;PP=2970;QD=20;SC=CACATTCACACTGTTGCAGAC;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=401;TCF=181;TCR=220;TR=146;WE=139997165;WS=139997116;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:255,146:0.36:401
chr9	139997167	.	CATTCAT	C	2968	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MMLQ=24;MQ=42.74;NF=98;NR=108;PP=2968;QD=20;SC=CTGTTACACACATTCATGCTG;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=532;TCF=229;TCR=303;TR=206;WE=139997180;WS=139997116;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:326,206:0.39:532
chr9	139997213	.	C	CTG	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.59;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MMLQ=23;MQ=40.1;NF=123;NR=252;PP=2964;QD=20;SC=TACATTCACACTTGCAGGCGT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=705;TCF=253;TCR=452;TR=375;WE=139997221;WS=139997183;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:330,375:0.53:705
chr9	139997750	.	ATT	A	2947	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MMLQ=18;MQ=50.53;NF=16;NR=83;PP=2947;QD=20;SC=TCGGTGGTACATTCATGCTGT;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=338;TCF=86;TCR=252;TR=99;WE=139997759;WS=139997737;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:239,99:0.29:338
chr9	139997791	.	T	C	2450	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=22;MQ=51.8;NF=44;NR=89;PP=2450;QD=18.6824903199;SC=GTGTTACACATTTTCACGCTG;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=423;TCF=180;TCR=243;TR=133;WE=139997799;WS=139997781;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:290,133:0.31:423
chr9	139997878	.	G	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MMLQ=23;MQ=51.94;NF=141;NR=57;PP=2962;QD=20;SC=ATTCACGCTGGTGCAGGCATG;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=460;TCF=264;TCR=196;TR=198;WE=139997886;WS=139997866;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:262,198:0.43:460
chr9	140001341	rs5901117	G	GAAC	2380.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=30;PP=1790;SC=ATGTCAAAAAGAACGAAATCC;SOR=1.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=35;WE=140001349;WS=140001331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	140002220	rs10117795	A	G	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=59;PP=2093;SC=TGTGACCTGGATCCGGGAGGG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=93;WE=140002228;WS=140002210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	140002501	rs6420280	T	C	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=114;SC=AGAGTGTCACTTCCTGGCTCT;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=140002509;WS=140002491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	140002989	rs4880091	T	C	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=86;PP=2965;SC=TCAGCCTGGATGCCTACGTGT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=184;WE=140002997;WS=140002979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr9	140003427	rs4567	A	G	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=75;PP=2862;SC=GAAGCCTCAGATGTCCCCAAT;SOR=1.076;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=127;WE=140003435;WS=140003417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	140003529	rs71803786	G	GC	1894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1624;SC=GATCCTCCTGGCCGCCCCGCA;SOR=1.739;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=39;WE=140003537;WS=140003519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	140006202	rs13631	G	A	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=69;PP=2391;SC=TGGCGGCTCTGAGATCTGCAA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=140006210;WS=140006192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr9	140006425	rs10747048	C	G	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=53;PP=2171;SC=AGGGCAGGTCCGGGAACATAT;SOR=0.766;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=113;WE=140006433;WS=140006415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	140008665	.	A	AC	179	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=179;QD=41.0;SC=GTGCCCCGCGACCCCGCCCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=140008673;WS=140008655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr9	140008750	rs10747049	G	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.13;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	140040156	rs10870196	G	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=10;PP=822;SC=ACCTCAGCCCGCCGTGCCCCC;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=140040164;WS=140040146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	140055876	rs10747050	G	A	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=32;NR=66;PP=1878;SC=CGGGTAGGCTGGACGGCGGGG;SOR=1.515;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=98;WE=140055884;WS=140055866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	140064315	rs7019671	C	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=347;ReadPosRankSum=0.102;SC=TGGCCGACACCTGGGCCCAGA;SOR=0.343;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=24;WE=140064323;WS=140064305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr9	140064376	rs77712801	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=2.133;SC=CCGAGGCCGCGACCAGGAAGG;SOR=0.841;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=26;WE=140064384;WS=140064366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr9	140076346	rs58384967	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=-1.592;SC=TGGCCCACAGTGTGGACACCC;SOR=0.631;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=15;WE=140076354;WS=140076336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr9	140108915	rs149701237	CTG	C	2869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=49;PP=2513;SC=GGCCGTGGGTCTGGGGTTCGG;SOR=2.765;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=54;WE=140108924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	140110274	rs7390663	T	C	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=74;PP=2965;SC=ACCCAGGGTCTCCGGGCAGGG;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=149;WE=140110282;WS=140110264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr9	140120396	rs6606566	C	T	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.56;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	140128085	rs28407527	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=573;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGGCCCCCAGTTGGACTCCGA;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=36;WE=140128093;WS=140128075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr9	140130606	rs28542318	A	T	5162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=82;PP=2965;SC=GGGGGCATGGAGCTGGCCGCT;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=158;WE=140130614;WS=140130596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	140130882	rs28591989	A	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=646;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GCAGTTGCTGAGCAGACCGCC;SOR=1.219;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=50;WE=140130890;WS=140130872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr9	140130945	rs371908040	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=0.346;SC=GGGGTCCCCGCGGCAGCTGAC;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=18;WE=140130953;WS=140130935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr9	140139757	rs9775264	G	A	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=32;PP=1410;SC=TCCCCTGGCTGCCTGGTGCTG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=67;WE=140139765;WS=140139747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	140142299	rs9330201	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=350;ReadPosRankSum=0.690;SC=CAGGCCACCTCGCTAACCCTG;SOR=1.467;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=20;WE=140142307;WS=140142289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr9	140147094	rs71387813	C	CCT	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.297;NF=9;NR=7;PP=634;ReadPosRankSum=-0.609;SC=CCCTGCAGCCCGTCTCCTACC;SOR=0.465;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=16;WE=140147102;WS=140147084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
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chr9	140148051	rs28631372	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.994;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=0.722;SC=TGCCCCTGAAAGGTGCTCTCT;SOR=3.019;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=14;WE=140148059;WS=140148041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
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chr9	140157460	rs13296455	T	C	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=864;ReadPosRankSum=0.927;SC=CAGGACGGTCTGGGGGCCTGA;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=90;TCR=47;TR=61;WE=140157468;WS=140157450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,72:0.44:163
chr9	140157701	rs56368095	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TCCTTCCCCCCTACCCTCCTG;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=28;WE=140157709;WS=140157691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr9	140158650	rs9695897	C	T	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=770;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GGTCTCTGGTCATCCTGGGAG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=56;WE=140158658;WS=140158640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr9	140158871	rs13295537	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-0.437;SC=GGTCTGCGCTTGCTGTGTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=140158879;WS=140158861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr9	140161334	rs9330192	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr9	140161631	.	TGTGGGGCTGAG	T	2101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=2101;QD=351.833333333;SC=CAGGGGTCGGTGTGGGGCTGA;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=6;WE=140161655;WS=140161621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,6:0.32:19
chr9	140161634	.	GGGGCT	G	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.515;SOR=1.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr9	140161641	.	AGGTGGG	A	668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.278;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr9	140161647	.	G	A	778	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=5;PP=778;QD=90.3079125052;SC=GCTGAGGTGGGGCTGAGGTGG;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=9;WE=140161655;WS=140161621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,9:0.36:25
chr9	140161871	rs9802270	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=1.461;SC=GCCCAGGGTGCGGGCCCCAGG;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=140161879;WS=140161861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr9	140161909	rs9802698	G	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGTCTCCCCAGCCCACCTCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=140161917;WS=140161899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	140167022	rs3204123	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=677;ReadPosRankSum=0.602;SC=GGGTGGCCCCGTCTAAGCTGG;SOR=0.656;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=49;WE=140167030;WS=140167012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr9	140201570	rs377043054	C	T	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=867;ReadPosRankSum=0.350;SC=CAGGTGTCCTCAGCACACCCA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=68;WE=140201578;WS=140201560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr9	140202194	rs13288421	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=578;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTGAGCACAGTCACCTCATGG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=37;WE=140202202;WS=140202184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr9	140218025	.	C	T	172	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=58.0;NF=10;NR=0;PP=172;QD=20.6771212547;SC=GAGGGATGCTCTGCCGACACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=10;WE=140218033;WS=140218015;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr9	140242726	rs58941960	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=0.820;SC=CCCACGGTCACCCCCCAGCCC;SOR=0.515;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=29;WE=140242734;WS=140242716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr9	140243844	rs28545754	C	T	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=1120;ReadPosRankSum=2.079;SC=CTGCTCCTCGCAGAGCGGCCT;SOR=0.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=65;WE=140243852;WS=140243834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,78:0.57:137
chr9	140243968	rs79140116	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=0.170;SC=GGGGCTGGCACGCTCGCCACC;SOR=0.399;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=24;WE=140243976;WS=140243958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr9	140246050	rs11534416	T	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=52;PP=1512;SC=AGCCTGGAGGTCCTGAGCAGC;SOR=3.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=61;WE=140246058;WS=140246040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	140247143	rs7020732	T	G	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=30;PP=1415;SC=GCAGCAAGAGTTCCATGGCAC;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=140247151;WS=140247133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	140249253	rs11537108	A	C	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.14;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	140249253	.	AG	CA,CG	346	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4,7;NR=11,24;PP=231,346;QD=18.9645249908;SC=CTCAGCACTGAGGGCTCAGGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=15,31;WE=140249262;WS=140249243;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:32
chr9	140249254	rs11562624	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=6.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr9	140250633	rs13293922	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr9	140250818	rs7389423	C	T	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=38;PP=1341;SC=CTCAGGGTACCGTCTGTGGGG;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=140250832;WS=140250808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	140262218	rs11533157	T	C	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=5;PP=635;SC=GGTCAGCCCATGAGGAGGATG;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=140262226;WS=140262208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	140262424	rs11507683	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GCTTCAACGTCGCGCCCAGCG;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=41;WE=140262434;WS=140262414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr9	140262426	rs11533158	C	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TTCAACGTCGCGCCCAGCGTG;SOR=0.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=39;WE=140262434;WS=140262414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
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chr9	140317999	rs112864733	C	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.284;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CTCTGGGGGACCTGGTGCGCG;SOR=0.469;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=26;WE=140318007;WS=140317989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr9	140320617	rs9414734	C	T	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=39;PP=2508;SC=AATTCCGTGGCCCTGTCACCC;SOR=1.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=92;TCR=39;TR=131;WE=140320625;WS=140320607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	140329618	rs28589413	A	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=57;PP=2066;SC=CGACCTGCCCACGCCCACGCC;SOR=1.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=140329626;WS=140329608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	140330976	rs13297080	T	C	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=31;PP=1898;SC=AGCTGACCTGTACCAGCCCCA;SOR=1.502;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=91;WE=140330984;WS=140330966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	140331548	rs28606499	G	A	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=1034;ReadPosRankSum=1.106;SC=TGCCTGCCACGCTGGCTGAGA;SOR=0.213;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=60;WE=140331556;WS=140331538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr9	140331833	rs9414731	A	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=417;SC=CCCCAAAGACATGACCACCTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=140331841;WS=140331823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	140332478	rs6606582	A	G	7935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=148;NR=111;PP=2965;SC=CTTGTTCGCCAGCCACTGATA;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=149;TCR=111;TR=259;WE=140332486;WS=140332468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr9	140344716	rs112888704	A	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1193;ReadPosRankSum=1.636;SC=CCCTGTAAGAAGCTGTGGTCA;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=84;WE=140344729;WS=140344706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,93:0.54:171
chr9	140348401	rs9410194	T	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=393;SC=CTAAGGCACATGAAGCAGACA;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=140348409;WS=140348391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr9	140357972	rs1891627	A	G	3732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=62;PP=2173;SC=CGCACGTACCACCACAGGGAG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=112;WE=140357980;WS=140357962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	140358034	rs371483346	G	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=501;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CTCCTCCTGGGTCCAGGGTTC;SOR=0.323;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=26;WE=140358042;WS=140358024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr9	140358556	rs4962238	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=750;ReadPosRankSum=-0.035;SC=AAGCGGCCGCCCTGCGCAGCA;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=46;WE=140358564;WS=140358546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
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chr9	140389613	rs13283256	C	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=907;ReadPosRankSum=1.251;SC=GGACAGGAGCCGGCTGCTGGG;SOR=1.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=53;WE=140389621;WS=140389603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr9	140392494	rs4962232	T	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=6;PP=1031;SC=ACGGTAACCGTGCTTTGCCCA;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=140392502;WS=140392484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	140400275	rs3750381	T	C	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=62;PP=1736;SC=CGCACAAGGGTGTGGTCAGGT;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=90;WE=140400283;WS=140400265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	140400464	rs74637847	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=907;ReadPosRankSum=-0.271;SC=CCGGGGTGCTCGTCCGAGTGC;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=55;WE=140400472;WS=140400454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
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chr9	140441177	rs2254149	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=0.133;SC=GACAGCACACACCAAGCACTG;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=140441185;WS=140441174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr9	140706127	rs11789684	G	A	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=44;PP=1278;SC=CGCCCAGAGAGACCGCTTGAC;SOR=1.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=140706135;WS=140706117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr9	140878566	rs41277871	A	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=996;ReadPosRankSum=-2.299;SC=CGGTGCACCCAAGGCTAATGC;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=86;TCR=48;TR=71;WE=140878574;WS=140878556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,99:0.51:193
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chr9	140881314	rs7034745	A	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=581;ReadPosRankSum=-3.389;SC=CAGGTAAGGCACCTGCTCTGC;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=46;WE=140881322;WS=140881304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
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chr9	140946701	rs140068697	C	CGTGTGTGCGTGTGT	776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=4.376;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr9	140948197	rs4876923	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=0.397;SC=CCCCCTCATCGTGGCTCCACC;SOR=0.090;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=8;WE=140948205;WS=140948187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr9	140997349	rs35796437	AG	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=0.412;SC=TCTCCCTTTCAGGGTGCCCGG;SOR=0.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=6;WE=140997357;WS=140997339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
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chr9	141015351	rs2278972	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=602;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GAATAGGTGGAGAGGTCAGGG;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=38;WE=141015359;WS=141015341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr9	141016262	rs2278973	T	G	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CTGAGGACACTCTCACTTTCG;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=66;WE=141016270;WS=141016252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr9	141069905	.	C	T	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=23;MQ=49.04;NF=3;NR=5;PP=66;QD=12.5964015684;SC=CATCAACGTGCACCACCACGA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=141069913;WS=141069895;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr9	141069927	.	C	A	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=24;MQ=50.86;NF=1;NR=4;PP=50;QD=16.9542425094;SC=GCCAGCGGTGCGACCCCCGTC;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=5;WE=141069935;WS=141069917;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr9	141069952	.	T	C	234	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=55.22;NF=4;NR=9;PP=234;QD=20.6747086575;SC=CCCCACCCAATGTGCACCACC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=141069960;WS=141069942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	141070283	rs7868693	T	C	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.051;NF=29;NR=28;PP=653;ReadPosRankSum=-1.892;SC=CCCTCCTATCTGCCGAGTCGA;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=57;WE=141070291;WS=141070273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,66:0.33:203
chr9	141070335	rs7868705	T	G	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.410;NF=24;NR=40;PP=1032;ReadPosRankSum=0.759;SC=CGGGAGGAAGTCCCGGGTGTC;SOR=0.601;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=64;WE=141070355;WS=141070325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr9	141070347	rs189844666	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQRankSum=-4.267;QD=2.08;ReadPosRankSum=-2.518;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,22:0.19:115
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chr10	95229	rs6560830	C	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.63;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	282897	rs4600135	C	T	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=87;PP=2651;SC=TCCCAAAACACATTTTACTAT;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=135;WE=282905;WS=282887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	285479	rs10655220	G	GTGT,GTGTT	1674.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.02;QD=28.39;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,41,18:0.69,0.31:59
chr10	288184	rs34123561	G	GAA	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.357;NF=0;NR=23;PP=399;ReadPosRankSum=0.275;SC=TTTTAAATTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=23;WE=288192;WS=288174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr10	292927	rs2303990	C	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=262;SC=AGTGTGTCTCCGGAAGGAAGT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=292935;WS=292917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	294165	rs10903752	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=1.068;SC=AACAGCAGTTTATTCTATGGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=294173;WS=294159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	294953	rs1017361	A	G	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=52;PP=1971;SC=AGTGTAAGGAAGAATTTGTAG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=98;WE=294961;WS=294943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	329182	rs66861796	TG	T	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=-0.820;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr10	329188	rs45445697	G	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.307;QD=22.26;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr10	329191	rs371065533	GC	G	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.04;MQRankSum=1.563;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr10	370977	rs3123241	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=633;SC=AGGCAAAGGAAGGCGGATCAT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=370985;WS=370967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	375570	rs3832678	GGGAGCTCAGCAAGGCT	G	1020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=4.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.365;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.350;SOR=1.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr10	387060	rs7904155	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=19;PP=1106;SC=GCAGTGCTTAGGTTGCCTGGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=387068;WS=387050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	394714	rs4880610	G	A	5939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=95;PP=2965;SC=TACACAAGGAGAGAAACATCA;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=181;WE=394722;WS=394704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr10	395266	rs4880611	T	C	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=27;PP=1636;SC=ACCCTGCGCCTGTACCTGGGG;SOR=1.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=87;WE=395274;WS=395256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	395463	rs4242754	G	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=40;PP=1296;SC=GAGCGCGCACGCGTCATACAA;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=55;WE=395471;WS=395453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	410825	rs10795053	G	A	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=652;SC=CCAATCAGCAGTAACTGATTA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=410833;WS=410815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	412449	rs1133113	A	G	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=38;PP=1137;SC=ACCAGTGAACAGGAATGGGGT;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=412457;WS=412439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	428503	rs4881200	A	G	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=17;PP=997;SC=CCTCAGCATCAACTGTTAGGA;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=428511;WS=428493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	429932	rs7092412	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=200;ReadPosRankSum=0.667;SC=CTCCACAGCCCGCCTGCCTCA;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=429940;WS=429922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr10	429977	rs10904083	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=588;ReadPosRankSum=2.011;SC=AGGGGTTCGCGCCGTCCGCCA;SOR=0.542;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=34;WE=429985;WS=429967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr10	435880	rs4881219	G	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CTTCGTGTCAGGTGTCCCGGT;SOR=0.443;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=16;WE=435888;WS=435870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr10	436848	rs10904093	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.293;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=599;ReadPosRankSum=-0.924;SC=GACCTGCCCCACTCCGCCCAG;SOR=1.845;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=33;WE=436856;WS=436838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr10	444997	rs6560836	C	T	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=914;ReadPosRankSum=0.673;SC=ATACAGCCACCGTGAAAGCCA;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=62;WE=445005;WS=444987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr10	445061	rs6560837	C	T	5168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=77;PP=2965;SC=TCCTGGTGAGCGGCACCTCGA;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=162;WE=445069;WS=445051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr10	459940	rs4881274	G	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=650;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CACCTCTGCAGTGCGGCCTCC;SOR=0.456;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=41;WE=459948;WS=459930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr10	468748	rs4881290	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=287;SC=AGAAAGACACCGTGAAGCGTG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=468756;WS=468738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	518547	rs10610683	ACT	A	2301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=1518;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GAGTCAGCAGACTCTAACAAA;SOR=0.632;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=38;WE=518556;WS=518537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr10	530644	rs1539231	G	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=531;SC=ACGTCTGTACGGGATGGCACT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=530652;WS=530634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	687569	rs1631975	C	T	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=31;PP=1419;SC=CACTGCCAGGCTACCCATGAG;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=78;WE=687577;WS=687559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	696237	rs10904535	G	A	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=36;PP=2332;SC=TCAGGGCCAGGGACCATGGTG;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=696245;WS=696227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	708192	rs3853289	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=58;PP=1740;SC=TCCTGAAGGTACTGTATGAGG;SOR=4.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=62;WE=708200;WS=708182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	1018585	rs4880745	T	G	5626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=92;PP=2965;SC=TCCATTTCTATGTAAGCCGTT;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=77;TCR=92;TR=169;WE=1018593;WS=1018575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr10	1041981	rs148276311	C	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.263;NF=33;NR=32;PP=1230;ReadPosRankSum=-1.433;SC=AAGTAAGGTACTTTTTTCTGT;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=65;WE=1041989;WS=1041971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr10	1042023	rs10665098	A	AAAC	6674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=2294;SC=AGTGGAAAAAATAATATTTTT;SOR=0.832;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=90;WE=1042031;WS=1042007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	1043058	rs1250887	T	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=3;PP=945;SC=AATATCACCATAGGCCTGGAC;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=1043066;WS=1043048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	1046712	rs2306409	G	A	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=49;PP=2803;SC=TCCGTGCTGCGGTCCTGTATG;SOR=1.288;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=86;TCR=49;TR=135;WE=1046720;WS=1046702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	1054276	rs10904595	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=19;NR=1;PP=519;SC=ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=1054284;WS=1054266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	1061625	.	GCTGAGCA	G	1093	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=62.12;NF=18;NR=1;PP=1093;QD=58.8947368421;SC=GGTCCTGAGCGCTGAGCACTG;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=19;WE=1061639;WS=1061615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,19:0.86:22
chr10	1065458	rs17851563	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=319;ReadPosRankSum=-0.683;SC=CCCTGCCTCTCACACTCTGTG;SOR=0.179;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=25;WE=1065466;WS=1065448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr10	1081791	rs146706331	G	GCCTGGCCCA	2203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.35;ReadPosRankSum=2.140;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,50:0.39:127
chr10	1087551	rs12768746	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=112;SC=GCAGTATAGTTTTAGGATTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=1087559;WS=1087541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	1089616	rs11250238	T	C	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=53;PP=1857;SC=TGAAGGCACATGCTTCCCTGC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=1089624;WS=1089606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	1093992	rs4880759	A	G	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=81;SC=GGGTCTTGCTATGTCTGTCGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=1094000;WS=1093982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	1094996	.	T	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=285;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TCGCCAAGCTTCGCCTGGTGG;SOR=0.911;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=20;WE=1095004;WS=1094986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr10	1142208	rs10794716	T	C	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=43;PP=1850;SC=TCCTTACCTGTGAATGTGTAG;SOR=0.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=1142216;WS=1142198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	1232500	rs7924253	G	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=602;ReadPosRankSum=-0.802;SC=ATGCCTCCTCGCAGATCAGCT;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=44;WE=1232508;WS=1232490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr10	1245893	rs1983028	A	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=0.164;SC=GCCCCCGGGAAGGGGGTTCTT;SOR=0.047;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=1245901;WS=1245883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr10	1262872	rs34113348	AG	A	1047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.202;NF=9;NR=11;PP=644;ReadPosRankSum=0.414;SC=CATCCTCGAGAGGAAGCCGTG;SOR=0.576;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=20;WE=1262880;WS=1262862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr10	1406228	rs11250463	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CGCCCCCAGGTCAGGCCTGAG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=13;WE=1406236;WS=1406218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr10	1421516	rs10794748	A	G	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=82;PP=2965;SC=AATATCTGACAGCATTTTATC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=162;WE=1421524;WS=1421506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	1598718	rs10903484	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=-1.573;SC=CTGTGCATTCGAATCACCTGG;SOR=0.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=12;WE=1598726;WS=1598708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	1779349	rs3750684	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=679;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GGCCATGGCCGAGACCCAGGC;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=47;WE=1779357;WS=1779339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr10	3124516	rs4881074	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=746;ReadPosRankSum=0.486;SC=GTCATGGGTAGTTAGTGGCAG;SOR=0.876;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=54;WE=3124524;WS=3124506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr10	3143643	rs4881080	A	C	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1544;ReadPosRankSum=0.627;SC=TGCTGCAGCGAGGCATCACCA;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=84;WE=3143651;WS=3143633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
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chr10	3147501	rs4881081	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr10	3150371	rs4881084	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=0.520;SC=AGGAATTTACGTAGCCCAGCC;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=14;WE=3150379;WS=3150361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr10	3150898	rs11251721	C	T	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1597;ReadPosRankSum=2.354;SC=TGCAGCTTGTCGTCACGCAGC;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=94;TCR=105;TR=106;WE=3150906;WS=3150888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,117:0.52:225
chr10	3154461	rs2306302	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1229;ReadPosRankSum=-1.462;SC=TTCAAGATGCGGTTCGACTCC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=44;TCR=75;TR=64;WE=3154469;WS=3154451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr10	3154534	rs2306304	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=0.106;SC=CCTCAGGCCCAGCCACTGCAA;SOR=0.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=21;WE=3154542;WS=3154524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr10	3155173	rs7896691	C	T	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=8;PP=1197;SC=GCACATGGAACCCTGGGGCCT;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=3155181;WS=3155163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	3155217	rs6602023	T	C	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=27;PP=2048;SC=GCAGACACATTGAGTGCTGGC;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=93;WE=3155225;WS=3155207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	3155237	rs6602024	A	G	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=43;PP=2709;SC=CAGATAAGCCACCTTTTCTCC;SOR=1.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=95;TCR=43;TR=138;WE=3155245;WS=3155227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	3155263	rs7906901	TG	CT	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=60;PP=2947;ReadPosRankSum=0.764;SC=AGCCCTGAGTTGTGTCCGGTA;SOR=1.277;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=160;WE=3155272;WS=3155253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,191:0.99:193
chr10	3155285	rs3816698	G	A	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.452;SC=TCTCGACTCCGGTCCAACGAC;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=101;WE=3155293;WS=3155275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,114:0.47:241
chr10	3155353	rs3816699	C	T	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.920;SC=GACTTGCCATCAAGCTGCCGG;SOR=0.599;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=78;WE=3155361;WS=3155343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,90:0.45:200
chr10	3155405	rs201205914	C	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=733;ReadPosRankSum=0.604;SC=TCCCGCGATGCCCCGACCTCT;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=43;WE=3155413;WS=3155395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr10	3155540	rs4881085	A	G	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=77;PP=2965;SC=GTGACCCAGCACTCACCTGCC;SOR=1.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=197;WE=3155548;WS=3155530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr10	3155698	rs4881086	C	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=64;PP=1824;SC=TTGACGGCTTCGCCAAGGGCC;SOR=2.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=3155706;WS=3155688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	3155753	rs4881087	G	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=775;SC=CACCCTGGCTGTGAGCACAGT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=3155761;WS=3155743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	3155770	rs4881088	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=64;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.754;NF=1;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=0.288;SC=CAGTGGACGTGGCGGCGGGGG;SOR=1.244;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=3155778;WS=3155760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr10	3160917	rs3829913	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=16;PP=1184;SC=CGTGGCGTCCTGCGGACCGCG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=3160925;WS=3160907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	3161131	rs3829914	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=758;ReadPosRankSum=-1.694;SC=AAACATTAAGCTACTTGTTGG;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=56;WE=3161139;WS=3161121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,63:0.46:136
chr10	3161148	rs3829915	G	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=672;ReadPosRankSum=1.476;SC=TTGGCTACTGGCCACGATCCG;SOR=0.198;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=52;WE=3161156;WS=3161138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr10	3161216	rs3829916	A	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=792;SC=GCAGGATAGCAGGTGGTAAGA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=3161224;WS=3161206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	3161236	rs17285851	C	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=1.377;SC=ACGTGGCCTACGAGTGGCCCA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=3161244;WS=3161226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr10	3161253	rs9423464	G	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=1.960;SC=CCCAGTTCCAGTAAAGCAACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=3161261;WS=3161243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	3162033	rs6602025	T	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=897;SC=AGCGAGACCCTCTCCTCCCCA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=3162041;WS=3162023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	3167465	rs3816703	A	G	4656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=96;PP=2965;SC=GTTTCCTCTCATTGCTTTTCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=61;TCR=96;TR=156;WE=3167473;WS=3167455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	3167591	rs147437896	A	AT	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=0.294;SC=ACAGGGTAAAATTTTTTTAGC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=3167599;WS=3167581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	3171995	rs2279211	G	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=13;PP=1639;SC=GTGACTGATCGCTTCTCTGTG;SOR=2.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=69;WE=3172003;WS=3171985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	3172121	rs1052333	C	T	8125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=128;PP=2965;SC=GGCTCGCGGCCGGAGCTGATG;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=127;TCR=128;TR=255;WE=3172129;WS=3172111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr10	3172145	rs1052337	C	T	7866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=130;PP=2965;SC=CATACATTTTCGAAGAGCCCT;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=124;TCR=130;TR=254;WE=3172153;WS=3172135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr10	3172267	rs4381274	A	G	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=61;PP=1882;SC=TTTGCTTTCCAAGGGGCATGG;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=23;TCR=61;TR=84;WE=3172275;WS=3172257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	3172299	rs4390256	T	C	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=36;PP=922;SC=CTACAGAACATGCCACGCTTG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=3172307;WS=3172289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	3175360	rs66787824	C	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=618;SC=GCCCACTGCACGCTAAACAAA;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=3175368;WS=3175350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	3175541	rs3740613	C	A	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=39;PP=1246;SC=CCACAAAGCCCCTGTCATGTG;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=3175549;WS=3175531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	3176611	rs200439920	TTTCTATTTA	T	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=3;PP=2282;SC=GAAATTGTCATTTCTATTTAA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=3176646;WS=3176601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	3176625	rs375079219	C	T	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	3176627	.	A	AC	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.26;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	3176629	.	G	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	3176630	.	TG	T	2077.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.17;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	3176634	.	A	G	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.34;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	3176638	rs147431012	T	TTAAATAGAA	2392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=2171;SC=AGTGTTACTGTATAACTGGTA;SOR=2.078;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=3176646;WS=3176601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	3177817	rs2306316	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=807;SC=CTTCCAGGCCGGGTTCAGCAT;SOR=2.419;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=3177825;WS=3177807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	3177876	rs2306317	C	G	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.85;SOR=1.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	3177876	.	CAC	GAT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=61;NR=28;PP=2947;QD=20;SC=TCTGCTCCCCCACCTGCCCAT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=89;WE=3177886;WS=3177866;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,89:0.94:95
chr10	3177878	rs2306318	C	T	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=1.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	3178814	rs1052929	T	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1095;SC=GTGGACTGTCTGTTTTTGTAA;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=3178822;WS=3178804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	3178905	rs7673	T	A	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=84;SC=CTGCCCCACCTGCTCCAGTGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=3178913;WS=3178895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	3178964	rs71497863	GAATT	G	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=87;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=75;SC=CATATGAGCAGAATTAATTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=3178975;WS=3178954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	3179618	rs138746278	ACT	A	917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.739;NF=12;NR=6;PP=729;ReadPosRankSum=1.418;SC=CCAAAAACAAACTCTGTTTGG;SOR=0.218;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=18;WE=3179627;WS=3179608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr10	3179703	rs4881107	C	T	5317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=45.07;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	3179708	rs4881108	A	G	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=44.35;SOR=1.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	3179968	rs9129	G	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=887;SC=ATTCTAGAATGAGGTAAAACG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=3179976;WS=3179958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	3180124	.	CAT	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=0.520;SC=CACTCAATGACATAATATTCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=3180133;WS=3180121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	3180175	rs12678	C	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=493;SC=ATATTCAGCTCGGAGGTGTAT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=3180183;WS=3180165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	3180227	rs6901	T	C	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=1128;SC=GGCTGCTCATTGGATGATCCA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=3180235;WS=3180217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	3180316	rs11414	T	C	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=48;PP=1871;SC=TGCCGAGGTATCTGAGAGGAA;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=3180324;WS=3180306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	3180343	rs2388559	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=2141;ReadPosRankSum=-0.548;SC=CGTGGTCAGCAAGGACTGGCT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=92;WE=3180351;WS=3180331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr10	3181003	rs2279217	A	G	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=33;PP=2965;SC=ACCAGAAGCTAGTGCTCCTGC;SOR=2.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=101;TCR=33;TR=134;WE=3181011;WS=3180993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	3181282	rs2279220	G	A	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=82;PP=2658;SC=CATTTTACCAGTGGACAAGTT;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=132;WE=3181290;WS=3181272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr10	3183747	rs7094698	A	G	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=43;PP=2093;SC=GAACAGGGCCAATTTCCTCTG;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=3183755;WS=3183737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	3185798	rs3736093	T	C	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=16;PP=2772;SC=TCCCACGCACTGCCCACGGCA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=91;TCR=16;TR=107;WE=3185806;WS=3185788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	3186701	rs150074614	A	AAAAAT	713.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=632;SC=AACGCTTAAAAAAAATAAAAA;SOR=4.294;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=3186709;WS=3186691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	3186723	rs9423496	G	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=291;SC=AGGCTGGGCAGAGTGGCTCAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=3186731;WS=3186713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	3187749	rs3758632	A	G	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=48;SC=TCTGGCACCCACCAGGCGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=3187757;WS=3187739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	3187924	rs3758631	T	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=8;PP=241;SC=TGAAAAATTATGTATACATAA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=3187932;WS=3187914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	3188071	rs3758630	T	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=144;SC=TCCCTGCTCTTCAGTGCTTCA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=3188079;WS=3188061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	3190013	rs10508248	G	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=43;PP=1421;SC=TAAGTTTTCAGAGTACTTTAA;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=61;WE=3190021;WS=3190003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	3190166	rs59486411	C	A	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=30;PP=2364;SC=ACAACTCTTGCAAATAAAGTT;SOR=1.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=104;WE=3190174;WS=3190156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	3191823	rs2388556	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=611;SC=TTGGTGAGGACGCTGCAGAAG;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=3191831;WS=3191813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	3193285	.	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	3193292	rs17287235	C	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=201;SC=GCAGAAGAATCGTGTAGAGCG;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=3193300;WS=3193280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	3199555	rs7086470	A	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=409;SC=AATATCAAAAAGCCAGTTAAG;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=3199563;WS=3199545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	3200292	rs3182535	G	A	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=41;PP=1594;SC=GTCTTTCTCCGCAATCCCTTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=3200300;WS=3200282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	3201010	rs3814592	C	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=550;SC=GTTCCAGACACTGTCAAGTGT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=3201018;WS=3201000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	3201097	rs3814594	T	C	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=25;PP=2309;SC=AATCTAATCATAAACTCACCC;SOR=1.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=77;TCR=25;TR=102;WE=3201105;WS=3201087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	3202065	rs4242746	T	C	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=53;PP=2436;SC=CTAACGCTGATGGTTGTTTGT;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=129;WE=3202073;WS=3202055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	3202140	rs4242747	C	T	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=75;PP=2965;SC=TGTAAAATGACGTGACGTTGT;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=78;TCR=75;TR=153;WE=3202148;WS=3202130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr10	3205851	rs6602034	C	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=600;SC=ATGCCATAAACTGTTAAGAAC;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=3205859;WS=3205841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	3206027	rs4609511	A	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=25;PP=811;SC=ACGTGTGGTCAGGAAGAAGTC;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=3206035;WS=3206017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	3207632	rs3814596	A	G	6041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=84;PP=2965;SC=TAAACATGGGAAAAAGGTGGC;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=176;WE=3207640;WS=3207622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr10	3208557	rs12359035	A	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=21;PP=665;SC=CCATGGGAGTAGTACGGAACT;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=38;WE=3208575;WS=3208547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	3208567	.	T	TGCACGCTAGGGAAGAGAGAGGAATG	2957	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.16;NF=0;NR=5;PP=2957;QD=20;SC=AGTACGGAACTGCACGCTAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=5;WE=3208575;WS=3208547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,5:0.21:24
chr10	3208581	rs58131139	G	GA	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;MQRankSum=0.000;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.668;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr10	3208583	.	A	AGAGGAATGGCACGCTAGGGAAGGC	647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=23.13;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	3209015	rs56658860	G	A	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=6;PP=1954;SC=TATTTTATGCGTGGCCTAAGA;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=75;WE=3209023;WS=3209005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	3209043	rs76699327	T	C	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=1181;ReadPosRankSum=0.016;SC=TCTTCTTCCATTGTGGCACAG;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=96;TCR=30;TR=63;WE=3209051;WS=3209033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr10	3209286	.	G	A	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=65;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.299;SC=AATGGCCTTTGAAATGGTTAT;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=49;TCR=119;TR=92;WE=3209294;WS=3209276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,97:0.52:188
chr10	3214369	rs4880599	A	G	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=17;PP=1361;SC=GCGCTGAACTATTACCTTATA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=64;WE=3214377;WS=3214359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	3214516	rs4881118	A	G	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=75;PP=2220;SC=GACTTTAAGTATGGGCTGTGG;SOR=1.164;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=120;WE=3214524;WS=3214506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	3214995	rs34460808	AC	A	6341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=84;PP=2974;SC=CTGGCGAGGAACCCCCTCTTA;SOR=0.811;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=29;TCR=89;TR=112;WE=3215003;WS=3214985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
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chr10	4868565	rs147185600	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=8.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.469;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
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chr10	4872887	rs3750739	C	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=280;ReadPosRankSum=0.489;SC=GGAAAGTGACCGAGGCAGTGA;SOR=0.361;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=23;WE=4872895;WS=4872877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr10	4872911	rs3750740	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=300;ReadPosRankSum=-1.222;SC=AGGCCATTGACGCAGGGTACC;SOR=0.428;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=21;WE=4872919;WS=4872901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr10	4872930	rs61745201	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=610;ReadPosRankSum=0.423;SC=CCGGCACTTCGACTGTGCTTA;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=36;WE=4872938;WS=4872920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr10	4875591	rs17133693	A	G	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=746;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GCATGCAGAAAGAGTCTCAAG;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=51;WE=4875599;WS=4875581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr10	4875664	rs41289263	G	A	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=583;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TCAAGGTACCGTTCAGTAGGT;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=40;WE=4875672;WS=4875654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr10	4877817	rs76184294	T	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr10	4877819	rs74993572	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr10	4877828	.	TG	T	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.614;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr10	4877831	.	TTTG	T	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr10	4878081	rs79922401	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AGCTGCTTGTGTTCAAAGACA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=4878089;WS=4878071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	4879465	rs2961584	T	C	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=196;SC=CCCAGCATCCTCTAGCCAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=4879473;WS=4879455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	4881823	rs2290350	C	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=581;ReadPosRankSum=0.591;SC=CCCATGGCTACTCGGTGACAG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=40;WE=4881831;WS=4881813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr10	4881846	rs34882719	C	T	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=693;ReadPosRankSum=-1.529;SC=AAGACTTTGACGCAGGTCTTC;SOR=0.819;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=49;WE=4881854;WS=4881836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,62:0.43:145
chr10	4881935	rs2290349	A	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=822;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGTGCCACCCATATCTTACTC;SOR=0.942;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=60;WE=4881943;WS=4881925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,66:0.45:147
chr10	4882095	rs2290348	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=1.399;SC=CTTGGGATGACTGAGGGAGGG;SOR=0.148;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=7;WE=4882103;WS=4882085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	4884076	rs2278869	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=414;ReadPosRankSum=-1.175;SC=GTTCTGAGCCAGGTGGGGTTC;SOR=0.141;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=25;WE=4884084;WS=4884066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr10	4884642	rs12573669	T	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=973;ReadPosRankSum=1.606;SC=TCCAGAGGAATGTGATAGTGA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=75;WE=4884650;WS=4884632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr10	4884721	rs12570011	G	A	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=54;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TCTTTTATTTGGCGGGTTTCA;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=214;TCF=98;TCR=116;TR=96;WE=4884729;WS=4884711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,127:0.49:260
chr10	4884784	rs2924269	T	C	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.07;NF=43;NR=84;PP=2344;SC=GCCTCAGGGTTGCGGAGCTTG;SOR=1.457;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=127;WE=4884792;WS=4884774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	4884800	rs2961592	A	G	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.133;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr10	4884808	rs12573690	T	C	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.137;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr10	4884844	rs34722294	T	TC	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.251;NF=1;NR=13;PP=436;ReadPosRankSum=0.371;SC=TGGTTGACCTTCCCTCAGCGA;SOR=0.569;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=14;WE=4884852;WS=4884834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr10	4887813	rs74698686	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=178;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GAGGAGCCACCGAGTGAGCAG;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=4887821;WS=4887803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	4887935	rs17133753	T	C	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=909;ReadPosRankSum=0.066;SC=ACGGGGACCTTGGGCCCAGCT;SOR=0.666;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=124;TCF=82;TCR=42;TR=62;WE=4887943;WS=4887925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr10	4888140	rs2397986	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr10	4888149	rs2397985	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.025;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr10	4889475	rs1869217	G	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=64;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CAGATTGAATGATTGGTGTCT;SOR=0.851;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=216;TCF=74;TCR=142;TR=96;WE=4889483;WS=4889465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,103:0.40:255
chr10	4889525	rs2961597	T	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=79;PP=2472;SC=TTAATTAAACTTTCTCATTAT;SOR=2.878;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=97;WE=4889533;WS=4889515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	4889640	rs1869216	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=530;ReadPosRankSum=1.741;SC=AAAATAATCATTCTTTGTTCC;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=32;WE=4889648;WS=4889630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr10	4889662	rs1869215	T	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=614;ReadPosRankSum=1.982;SC=ATTTTTGATTTGTTTTTCTGT;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=38;WE=4889670;WS=4889652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr10	4889726	rs34195821	C	CA	1545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=1;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=2613;ReadPosRankSum=1.228;SC=ATACTGAGGACGCTTCCCCTT;SOR=1.080;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=35;WE=4889740;WS=4889716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,49:0.38:130
chr10	4889732	rs74111762	C	T	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=2745;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AGGACGCTTCCCCTTCCTTGT;SOR=0.555;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=64;WE=4889740;WS=4889716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr10	4889770	rs1869214	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=689;ReadPosRankSum=-1.382;SC=GCACAGACACTATTGGCAATG;SOR=0.929;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=38;WE=4889778;WS=4889760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,40:0.36:112
chr10	4889806	rs12569410	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=287;ReadPosRankSum=0.936;SC=CATCACAGCGCCAGGGCAGCT;SOR=0.491;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=17;WE=4889814;WS=4889796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr10	5005549	rs7069696	G	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.118;NF=30;NR=7;PP=657;ReadPosRankSum=-2.015;SC=CCAGCAGACAGTGTGCTCAGG;SOR=0.906;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=37;WE=5005557;WS=5005539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr10	5008987	rs10562538	GAAGA	G	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.042;NF=3;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCATCACAAGAAGAGAGAGA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=5008998;WS=5008977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	5009347	rs4445550	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=300;ReadPosRankSum=0.684;SC=ATTATAACATAGAAGAAGAAT;SOR=0.321;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=21;WE=5009355;WS=5009337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr10	5009364	rs2904802	T	C	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=998;SC=GAATCCTAAATCTAACTCCTA;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=5009372;WS=5009354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	5009449	rs7076886	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=1.876;SC=AGTGCAGAACTCTCAAAGCCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=5009457;WS=5009439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	5010367	rs12250190	C	T	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.42;QD=26.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	5010572	rs1138600	A	G	62.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	5014264	rs6143754	CATTTTTGACAATA	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.03;MQRankSum=-4.046;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.200;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	5014545	rs67671072	T	TA	3521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.535;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.826;NF=13;NR=76;PP=2271;ReadPosRankSum=-1.386;SC=ACCGGTTTGATAAAAAAAATT;SOR=1.315;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=99;TCF=17;TCR=82;TR=89;WE=5014553;WS=5014535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr10	5019959	rs8483	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=11.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.14;MQRankSum=0.782;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.180;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr10	5032286	rs72638704	C	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.636;NF=30;NR=40;PP=943;ReadPosRankSum=0.781;SC=GTTACTAGCCCGTAGCGCAGT;SOR=0.431;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=70;WE=5032294;WS=5032276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr10	5038105	.	T	C	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=42.24;NF=0;NR=9;PP=132;QD=18.5301347275;SC=AAAAGTTACATTAATATTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=9;WE=5038113;WS=5038095;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,9:0.24:38
chr10	5038149	rs201332177	G	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=294;SC=ATAATGTAGAGCATTAAATTT;SOR=2.303;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=5038157;WS=5038139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	5040672	rs2854490	A	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=0.468;SC=AAGTAAGAGGACTCCATGCCC;SOR=0.420;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=13;WE=5040680;WS=5040662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr10	5041375	rs146001262	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.93;MQRankSum=0.464;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	5041594	rs11818926	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.996;NF=2;NR=22;PP=371;ReadPosRankSum=-0.900;SC=CCAGAGAGTGGTATGTACAAA;SOR=1.214;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=24;WE=5041602;WS=5041584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,19:0.29:66
chr10	5042664	rs2275929	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.928;NF=16;NR=20;PP=604;ReadPosRankSum=0.311;SC=TAAGAAAAAGCTTAGTTCAAA;SOR=0.479;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=36;WE=5042672;WS=5042654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr10	5042784	rs13945	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.306;NF=17;NR=13;PP=409;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GGTCAACATAGTCCAATTGAA;SOR=0.844;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=30;WE=5042792;WS=5042774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr10	5045700	rs148281619	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.62;MQRankSum=-3.346;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr10	5045834	rs150355670	T	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.30;MQRankSum=-2.433;QD=14.99;ReadPosRankSum=-1.361;SOR=1.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr10	5045862	rs67165977	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.74;MQRankSum=2.200;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr10	5120157	rs4881396	G	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=227;ReadPosRankSum=1.138;SC=CAAGAAGGATGCAAATATCAC;SOR=1.418;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=15;WE=5120165;WS=5120147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr10	5120332	rs7894134	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AAAATAATAATAAGTCAGGTG;SOR=0.086;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=5120340;WS=5120322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	5136651	rs12529	C	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=726;ReadPosRankSum=0.928;SC=ATTCCAAACACCAGTGTGTAA;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=44;WE=5136659;WS=5136641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr10	5139685	rs12387	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.131;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.310;SC=ACTCACTGAAGAAAGCTCAAT;SOR=0.495;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=76;WE=5139693;WS=5139675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,94:0.45:209
chr10	5141137	rs10508293	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=602;ReadPosRankSum=0.094;SC=TCCCAGGTTCAATAGGAAAGA;SOR=1.607;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=32;WE=5141145;WS=5141127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr10	5144318	rs139146411	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=408;ReadPosRankSum=0.533;SC=TATTTCAACCGGAGTAAATTG;SOR=0.576;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=27;WE=5144326;WS=5144308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr10	5144523	rs3750566	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.409;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AGAGAATTGCATTTCTGACGA;SOR=1.863;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=7;WE=5144531;WS=5144513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	5149438	.	ACGTGTT	A	55	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=55;QD=40.5;SC=TGTGTGTTTTACGTGTTAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=2;WE=5149451;WS=5149428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,2:0.17:12
chr10	5196273	rs1781930	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=2.109;SC=ATCAAATACTAAAATCCTCTC;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=5196281;WS=5196263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	5199934	rs1781935	G	C	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1149;ReadPosRankSum=0.724;SC=CCTGGGCTTCGACTGTGTTTC;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=75;WE=5199942;WS=5199924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,83:0.41:201
chr10	5200059	rs1761601	T	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=338;ReadPosRankSum=0.050;SC=ATCTACAGTGTGCTGCTCCTT;SOR=0.908;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=27;WE=5200067;WS=5200049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr10	5200638	rs1781937	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TGTTGGTGACGTTTAAGCTCA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=5200646;WS=5200628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr10	5200739	rs5782810	T	TAGG	1764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=1342;ReadPosRankSum=0.912;SC=TTCGCTTTAATAGTTTTTCAG;SOR=1.142;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=28;WE=5200747;WS=5200729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr10	5202076	rs148010840	G	A	952.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.6010;FS=6.792;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=562;ReadPosRankSum=0.642;SC=TGGGCTAAGGGCTCACCTGGT;SOR=1.935;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=31;WE=5202084;WS=5202066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,37:0.93:40
chr10	5202241	rs1761599	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.925;NF=11;NR=12;PP=285;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TGGCTTGAGACATGCAATAGT;SOR=0.666;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=23;WE=5202249;WS=5202231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,36:0.36:101
chr10	5203748	rs3750573	A	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=630;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CCAAGCTAGAATTAGATAATT;SOR=1.339;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=34;WE=5203756;WS=5203738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr10	5204676	rs7080497	A	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TCAGAGTAAGAAAGTCTTTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=5204684;WS=5204666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	5241971	rs61854739	T	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CAACGGGTCATAGTCCCACAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=5241979;WS=5241961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr10	5242164	rs17306779	A	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=981;ReadPosRankSum=0.206;SC=ACAGAGCTGTAGAGGTCACCA;SOR=0.910;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=64;WE=5242172;WS=5242154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,74:0.45:165
chr10	5242346	rs7099651	G	A	8452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=117;PP=2965;SC=ATGCACATGTGTTTAATGGGA;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=144;TCR=117;TR=261;WE=5242354;WS=5242336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr10	5244441	rs2151896	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TCCTTTTCCAATTTGGATTCC;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=13;WE=5244449;WS=5244431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr10	5246670	rs1413781	A	C	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=66;PP=2127;SC=AAAGCCTCTGATTCAAAAATT;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=92;WE=5246678;WS=5246660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	5246753	rs10600924	CACAGAT	C	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=264;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TTAGGATCTTCACAGATACAG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=5246766;WS=5246743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr10	5247631	rs3750568	G	A	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr10	5247634	rs3750567	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr10	5247701	rs7921838	G	A	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=921;ReadPosRankSum=0.475;SC=TGACACTAAAGTGACTGCTTC;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=63;WE=5247709;WS=5247691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr10	5247784	rs3829125	C	G	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1506;ReadPosRankSum=0.039;SC=GTGGATCTCTCTGCCACATGG;SOR=0.651;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=90;TCR=95;TR=96;WE=5247792;WS=5247774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,119:0.51:233
chr10	5254820	rs4098025	AC	CG	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=646;ReadPosRankSum=-1.364;SC=CTTATGAGATACCAGGTGATG;SOR=0.456;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=20;WE=5254829;WS=5254810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr10	5254847	rs1832007	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=490;ReadPosRankSum=-1.039;SC=CTGTTCAGGGACCTCACTTGA;SOR=0.529;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=34;WE=5254855;WS=5254837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr10	5255025	rs4880718	A	G	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.31;SOR=1.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	5258955	rs2050309	C	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=309;SC=GGGTCAGCATCGGTCAACCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=5258963;WS=5258945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	5260548	rs141745211	C	CAT	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.785;SC=TCATGAAAGACATTCTACAAA;SOR=0.412;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=4;WE=5260556;WS=5260538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	5260682	rs17134592	C	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=386;ReadPosRankSum=0.236;SC=TCTTTTCAGTCTTATGGACCA;SOR=0.688;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=30;WE=5260690;WS=5260672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr10	5260786	rs141695403	GTC	G	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=411;ReadPosRankSum=1.958;SC=TGCAGAGGATGTCTCTATGCT;SOR=0.503;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=9;WE=5260795;WS=5260776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr10	5260812	rs2398157	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=416;SC=CTGGACACACAGCCTCTGGTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=5260820;WS=5260802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	5415954	rs10904481	A	G	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=891;ReadPosRankSum=-0.972;SC=GGGTGGAGCCAGAGGCACCCG;SOR=0.883;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=69;WE=5415962;WS=5415944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,91:0.47:192
chr10	5416202	.	G	A	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5051;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=38;QD=24.2570708491;SC=CAGCGGGGTGGGGAGGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=5416210;WS=5416192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr10	5435918	rs7097775	G	A	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=48;PP=2213;SC=ACTCAAAGCAGGCAGTGGTGA;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=5435926;WS=5435908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	5436260	rs7910290	A	G	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=43;PP=1652;SC=GCTCTACCACAGCAGTGGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=78;WE=5436268;WS=5436250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	5436486	rs117686932	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.201;SOR=1.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr10	5436486	.	CA	TG	540	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7;NR=26;PP=540;QD=17.9838749958;SC=GTGAATTGGACAGTAGTGGCA;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=33;WE=5436495;WS=5436476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr10	5436487	rs6601957	A	G	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.00;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	5437365	rs11253156	A	G	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=62;PP=2452;SC=CGTAATTGTTAGCAGCATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=124;WE=5437373;WS=5437355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	5446632	rs10904491	G	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=5;PP=934;SC=AGAAACAAATGTTTCTTTACA;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=5446640;WS=5446622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	5446794	rs7477466	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=44;PP=1453;SC=GTAGTAATGACTGAGGAGCCT;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=5446802;WS=5446784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	5446942	rs4881435	C	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=267;SC=CTGAACAACCCGGGATAAAGT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=5446950;WS=5446932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	5446965	rs4881436	G	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=GTACACAGCTGCAGATGAACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=5446973;WS=5446955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	5454799	.	GGGAGGGCCGAACGGGAGGTGAGTGTAGGGGAGC	G	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.133;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	5471200	rs4604777	C	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=30;PP=1045;SC=AAGGTAAGCCCTGCTGCCCTG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=5471208;WS=5471190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	5495218	rs4567355	T	C	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=19;PP=1215;SC=GACAGGCCTATCATGACCCCA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=5495226;WS=5495208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	5498248	rs4242790	G	T	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=557;SC=TAAAATGCAGGCCTTCAATAA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=5498256;WS=5498238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	5541181	rs10904516	T	C	3635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,95:0.49:192
chr10	5541181	.	TTC	CTT	2560	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=46;NR=26;PP=2560;QD=20;SC=CCTGGCCTTCTTCGCCGCCGT;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=72;WE=5541191;WS=5541171;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:84,72:0.46:156
chr10	5541183	rs10904517	C	T	3635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,94:0.49:190
chr10	5558145	rs5782832	G	GC	3063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.693;NF=18;NR=41;PP=2456;ReadPosRankSum=0.717;SC=AATCAAACAGGCACCTGGGCA;SOR=0.641;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=59;WE=5558153;WS=5558135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,98:0.52:190
chr10	5558349	rs4072067	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=0.968;SC=GAGGCTTGACGGGGAAAGAAG;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=14;WE=5558357;WS=5558339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr10	5682641	rs7896492	C	T	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=23;PP=1172;SC=ACGGGGGCAGCCACGGTCCGG;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=5682649;WS=5682631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	5682855	rs4427479	T	C	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=667;ReadPosRankSum=-0.887;SC=ACACCTGCAATGGAACACAAA;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=51;WE=5682863;WS=5682845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr10	5684342	rs6602421	C	G	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=117;SC=TCTTGCGGGCCCAGGACGGAG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=5684350;WS=5684332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr10	5684553	rs12268809	A	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=0.810;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr10	5693379	rs6602483	A	G	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=88;PP=2922;SC=CACGCAACCCACTTTCCCATC;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=155;WE=5693387;WS=5693369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr10	5708360	rs75474563	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=166;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CCCGCCCACGGAGCCAGCGCG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=11;WE=5708368;WS=5708350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	5708420	rs6602613	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr10	5708420	.	TCA	CCT	797	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=10;NR=9;PP=797;QD=44.761467098;SC=GCGGCCGGCCTCAGGAGCCGG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=19;WE=5708442;WS=5708410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,19:0.54:35
chr10	5708422	rs76394459	A	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.566;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr10	5708434	rs56178329	C	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=816;ReadPosRankSum=0.233;SC=GAGCCGGCGCCGCTGCCTCGC;SOR=0.725;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=18;WE=5708442;WS=5708410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr10	5766337	rs10737018	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=-2.670;SC=CAAATTGACTGTAAGTACATA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=5766345;WS=5766327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	5772432	rs45549643	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=293;ReadPosRankSum=-1.329;SC=ATGTTTAATACGTGTGTATAT;SOR=1.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=14;WE=5772440;WS=5772422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr10	5781628	rs2254067	T	G	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=23;PP=1246;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TTCAAGAGGTTGTCAAGAAGA;SOR=1.155;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=77;WE=5781636;WS=5781618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr10	5781969	rs2797486	A	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=1121;ReadPosRankSum=0.491;SC=CAGACTTAACAGTTAGCCAAG;SOR=0.295;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=67;WE=5781977;WS=5781959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,78:0.55:141
chr10	5784509	rs2797488	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=552;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTGAATACCGTTAAATGTTG;SOR=1.023;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=28;WE=5784517;WS=5784499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr10	5788608	rs2797491	G	C	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=1851;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GCTGATGAACGTACAACCTTT;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=114;WE=5788616;WS=5788598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,145:0.54:268
chr10	5790420	rs2669142	T	C	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=95;PP=2965;SC=GCAGAGCCAGTGTTTCAAGCA;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=82;TCR=95;TR=177;WE=5790428;WS=5790410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr10	5804531	rs2797501	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=2.308;SC=TTTGAAAATAGTGGAATCCTT;SOR=1.276;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=7;WE=5804539;WS=5804521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr10	5804865	rs56352451	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=0.224;SC=TAACTTGGATCGTCAGTACAG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=5804873;WS=5804855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	5805087	rs139115917	AAC	A	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.035;NF=0;NR=11;PP=397;ReadPosRankSum=-1.158;SC=TACACATGTGAACAGTCTTAC;SOR=1.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=5805096;WS=5805077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	5810458	rs61836362	C	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.672;SC=AAACCATCCTCAAGTTCATAT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=5810466;WS=5810448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr10	5837038	rs10752110	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=0.086;SC=ATAAAGAACATTTACTAATAC;SOR=1.906;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=19;WE=5837046;WS=5837028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr10	5853767	rs1567706	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=224;ReadPosRankSum=0.434;SC=GAATATTCTCTAATAATTGCA;SOR=0.687;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=21;WE=5853775;WS=5853757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr10	5853817	rs1567707	G	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=326;ReadPosRankSum=-1.386;SC=AGAAAAACACGATTCTAATTC;SOR=0.946;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=22;WE=5853825;WS=5853807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr10	5853923	rs200241905	TA	T	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=0.566;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	5855225	rs3736460	G	A	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.507;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=905;ReadPosRankSum=1.789;SC=CATTCATGGCGGGGCAGGCGC;SOR=0.347;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=64;WE=5855233;WS=5855215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,83:0.60:138
chr10	5919947	rs2985043	C	T	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=649;SC=AACTCCTCAGCAGGAGTGGAA;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=5919955;WS=5919937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	5920121	rs1052420	T	C	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=78;PP=2855;SC=GCCAGAGCCCTGAAGGACATC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=153;WE=5920129;WS=5920111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr10	5922186	rs811561	T	A	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=194;SC=ATTAAAATCATTGTTTTAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=5922194;WS=5922176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	5924942	rs617165	C	G	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=68;PP=2965;SC=CAGGGAAGCTCGGACAACGTT;SOR=1.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=121;TCR=68;TR=189;WE=5924950;WS=5924932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr10	5925971	rs631947	C	A	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=79;PP=2965;SC=CGTCGATGTGCCCACACTGGA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=164;WE=5925979;WS=5925961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
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chr10	5926131	rs7919785	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=1.809;SC=GGTGAACTGCGTGTGTGCAAA;SOR=0.386;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=32;WE=5926139;WS=5926121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr10	5926154	rs7907053	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=-1.050;SC=ACCTGTGAGCATGGAGCTCTC;SOR=0.175;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=26;WE=5926162;WS=5926144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr10	5929783	rs74341195	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TGTGTGTACTGCTCACCTGCA;SOR=0.116;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=5929791;WS=5929773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	5932187	rs2253422	C	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.589;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	5932475	rs10905405	T	C	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=52;SC=GGCTCGGCCGTCCGGGCCGTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=5932483;WS=5932465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	5936425	rs12781700	C	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=890;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GTCAGGAGACCCGGGTTCTTG;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=56;WE=5936433;WS=5936415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr10	5948638	rs7082434	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TCTAAAAGCACGTAACTTTGC;SOR=1.115;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=20;WE=5948646;WS=5948628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr10	5951025	rs595923	T	C	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1726;ReadPosRankSum=1.278;SC=TACGGTGAGCTTTGCCTGTGC;SOR=0.514;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=192;TCF=90;TCR=102;TR=97;WE=5951033;WS=5951015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,106:0.49:215
chr10	5952854	rs7067928	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=202;ReadPosRankSum=-1.788;SC=TTCGTATTAACCATGGCCTGT;SOR=1.148;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=5952862;WS=5952844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	5957270	rs10508298	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GCTCTCAAGACAGAGGTGTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=5;WE=5957278;WS=5957260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	5960209	rs2387092	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=418;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TCCAGTGTGCCCTGGCTTAGC;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=21;WE=5960217;WS=5960199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr10	5966190	rs2274029	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	5966190	.	GCA	ACG	233	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=1;PP=233;QD=22.035990374;SC=CTGCTCTTGCGCAGCTGCTTA;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=5966200;WS=5966180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,13:0.59:22
chr10	5966192	rs2274030	A	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.47;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	5967158	rs2669126	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TTTTCTGTTCCCGACAGTTGT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=5967166;WS=5967152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	5967176	rs11255971	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=0.998;SC=TGTCTGTTCCCGACAGTTGTT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=5967184;WS=5967166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	5978411	rs646406	T	C	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=12;PP=1203;SC=TCGCTCTTTCTTTCTCAGGAG;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=5978419;WS=5978401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	5990899	rs4367845	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=1.803;SC=TTATACAAGGCACAATGTCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=5990907;WS=5990889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	6005674	rs3136614	G	A	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=43;PP=2024;SC=GGGAGGGAATGAATGTCCTCG;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=103;WE=6005682;WS=6005664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	6008030	rs3181148	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=-1.168;SC=TCCCTTGACCCCTGAGATGGG;SOR=1.659;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=6008038;WS=6008020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr10	6008172	rs2296139	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=948;ReadPosRankSum=0.849;SC=ACACGCACTCCGTCAGGCTGG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=65;WE=6008180;WS=6008162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,79:0.56:142
chr10	6042034	rs10795731	C	T	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.52;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	6054912	rs12722599	AT	A	2425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.740;NF=9;NR=44;PP=2007;ReadPosRankSum=2.626;SC=CACCAAAAAAATGTGGTCCTC;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=17;TCR=86;TR=53;WE=6054920;WS=6054902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr10	6054951	rs7076103	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.613;NF=13;NR=33;PP=807;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CGCCACCATGCCTGGCTAATT;SOR=0.340;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=85;TCF=20;TCR=65;TR=46;WE=6054959;WS=6054941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr10	6061277	rs7069976	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=572;SC=CAACCTACCAGTCAACCAACT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=6061285;WS=6061267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	6061479	rs28360490	A	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=45;PP=1644;SC=AAAAGAGATAAAGAGAGACAC;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=79;WE=6061487;WS=6061469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	6061499	rs28360489	C	T	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=45;PP=1375;SC=CTCCTGCTACCGTGACTTTAG;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=6061507;WS=6061489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	6061781	rs10752175	T	C	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=56;PP=2869;SC=CCTGGTCACCTCTGCCCTTTT;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=142;WE=6061789;WS=6061771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	6062051	rs9804284	T	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=352;SC=ATGCCACCCCTCATGGTTCCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=6062059;WS=6062041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	6063674	rs942200	T	C	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=33;PP=1074;SC=ATGGAAGGAATGCTCTGAAGG;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=6063682;WS=6063664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	6150828	rs374720400	GCTCTGTC	G	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.101;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr10	6150837	.	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	6150843	.	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	6150844	.	C	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	6150845	.	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	6150848	rs75593307	ACCTG	A	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	6152220	rs41295353	C	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=484;ReadPosRankSum=1.201;SC=CACACGGTACCTGCCTCAATC;SOR=0.259;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=26;WE=6152228;WS=6152210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr10	6156118	rs10795823	T	C	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=26;PP=1308;SC=GAAGTAAGAGTGTTTTCTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=6156126;WS=6156108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	6188338	rs7074082	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=0.230;SC=GTTGGGGTAGAGAGATGGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=15;WE=6188346;WS=6188328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr10	6188591	rs7074372	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=486;SC=TTGTCGATGTAGGCTCTGGTT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=6188599;WS=6188581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	6255817	rs2073629	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=395;ReadPosRankSum=-1.437;SC=CTCTGTCCCCTGGTCGGGGAG;SOR=1.234;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=28;WE=6255825;WS=6255807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr10	6255838	rs2794982	C	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.777;NF=4;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TCTGATCCTGCCTCCCATGCA;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=23;WE=6255846;WS=6255828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr10	6258015	rs2148293	T	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=7;PP=1434;SC=TGTCGGGGCGTGTCGGGAGTT;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=57;WE=6258023;WS=6258005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	6258052	rs2148294	G	A	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=35;PP=2572;SC=CGGATGCACCGGCGCTGACAT;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=89;TCR=35;TR=124;WE=6258060;WS=6258042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	6258300	rs2516622	A	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=660;SC=CTCAGGAAGGAGGATGTGGGG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=6258319;WS=6258290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	6258311	rs2516623	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=15;PP=372;SC=GGATGTGGGGTGGACTCAGGG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=6258319;WS=6258290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	6258796	rs2182412	T	C	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=61;PP=1924;SC=AGGAAAAGGCTTCAGGAAGCG;SOR=2.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=79;WE=6258804;WS=6258786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	6258840	rs5782881	GC	G	1533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=1527;SC=CCCTCCTGCTGCCCATGTTCC;SOR=3.160;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=34;WE=6258848;WS=6258830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	6258937	rs2765827	A	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=749;SC=CTTGGGGGCCATGGGGCGTTC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=6258945;WS=6258927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	6259239	rs2516624	G	A	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=36;PP=1038;SC=GACCGGGTCCGGCTCGGAAGC;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=6259247;WS=6259229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	6261704	rs1557111	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TGAGGGTTCTTACTGAATTCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=6261712;WS=6261694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	6266956	rs4747951	G	T	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=508;SC=GGGGTGGCGGGTGGGGAGGCG;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=6266964;WS=6266952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	6267175	rs4747952	C	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=858;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TTCTCTTAGACCGAGCGTGAC;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=55;TCR=76;TR=61;WE=6267183;WS=6267165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,82:0.49:166
chr10	6368721	rs7074209	G	T	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=2.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	6368724	rs7074211	G	T	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=2.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	6392848	rs744254	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=36;PP=1071;SC=AGCTGAACCAGATTGGTGTCA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=6392856;WS=6392838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	6472962	rs601150	T	G	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=62;PP=1832;SC=CATCAGGAGGTCGTGGTGCTT;SOR=3.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=71;WE=6472970;WS=6472952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	6498559	rs112802370	A	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=0.555;SC=AAACCTTCTGATTTTCAGGGG;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=15;WE=6498567;WS=6498549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr10	6504126	rs604663	T	C	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.73;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	6504136	rs678304	C	G	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.57;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	6506406	rs141007126	CATTTTT	C	3193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.018;NF=5;NR=54;PP=2642;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TATTTCATTTCATTTTTATTT;SOR=0.710;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=135;TCF=13;TCR=122;TR=59;WE=6506419;WS=6506396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,86:0.50:171
chr10	6527344	rs661891	A	C	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=201;SC=CATAGGGTCAACAAAGATCTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=6527352;WS=6527334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	6533877	rs3815975	A	G	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=83;PP=2517;SC=TAATGAAAACACTGGCATTGT;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=28;TCR=83;TR=111;WE=6533885;WS=6533867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	6533900	rs3815974	C	T	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=60;PP=1757;SC=GCATTTTAAACCATCATTGTC;SOR=2.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=77;WE=6533908;WS=6533890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	7205932	rs140120334	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=0.986;SC=ACACAGATGCGTCACAGCAGG;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=7205940;WS=7205922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr10	7230524	rs2462712	G	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=885;SC=AAGTGGCAAGGTTCAAAGTAG;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=7230532;WS=7230514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	7247631	rs17423681	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.483;SC=AAGATTAAGCGAGATCATGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=7247639;WS=7247621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	7285632	rs2248474	A	G	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=39;NR=55;PP=1727;SC=GTCTTAGGTCATCAATAGTCA;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=94;WE=7285640;WS=7285622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	7318724	rs7075434	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.150;SC=TCCTGATGTCGTGATCCGCCC;SOR=1.375;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=9;WE=7318732;WS=7318714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr10	7318803	rs7097601	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=456;ReadPosRankSum=-1.427;SC=ACTTTGTAGATGATTTTATTC;SOR=1.280;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=29;WE=7318811;WS=7318793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr10	7319078	rs4338435	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.173;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr10	7319088	rs4611096	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.011;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr10	7390147	rs1749362	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=419;ReadPosRankSum=0.843;SC=TTTCAAAGGGTTTGGGTTGGT;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=22;WE=7390155;WS=7390137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr10	7390214	rs1749361	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-0.740;SC=GTTTCATTTCGTGACGGTCTC;SOR=0.459;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=27;WE=7390222;WS=7390204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr10	7390300	rs1751658	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=329;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TCTCTACTACAAAAAAATAAT;SOR=1.362;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=18;WE=7390308;WS=7390290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr10	7423960	rs2254756	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=1.749;SC=ATCATATTGATTATATTCACT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=7423968;WS=7423950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr10	7423984	rs2254760	G	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	7605067	rs3824658	C	T	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=30;PP=1854;SC=GGACATTCCCCGGCCAAGTGT;SOR=1.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=7605085;WS=7605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	7605077	rs61199416	TC	T	3970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=37;PP=2965;SC=CGGCCAAGTGTCCATCCCTGT;SOR=1.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=71;WE=7605085;WS=7605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	7605101	rs10795551	A	G	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=47;PP=2332;SC=AAATGGATGGAATGCCAGGTA;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=111;WE=7605109;WS=7605091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr10	7605457	rs10737022	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=13;PP=369;SC=GCCACAGCCCGAGACTGGACT;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=7605465;WS=7605447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	7614918	rs11255194	T	C	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=622;SC=TTTTTGTATTTTTAGTAGAGA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=7614926;WS=7614917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	7614936	rs10737023	T	G	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=885;SC=AGACGAGGTTTCACCATGTTG;SOR=5.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=32;WE=7614944;WS=7614926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	7618380	rs3818783	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=3;PP=131;SC=CTCAGGCCCGCGTCCCCCACA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=7618388;WS=7618370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	7618501	rs2275068	A	G	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=25;PP=1670;SC=CCTCCAGGCCATCCATGCGTG;SOR=1.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=88;WE=7618509;WS=7618491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	7618686	rs2275069	T	G	8782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=144;PP=2965;SC=ATGTGGTTGGTGTCCCCCTCT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=121;TCR=144;TR=265;WE=7618696;WS=7618676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr10	7618993	rs10458802	G	A	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.46;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	7618997	rs10458803	G	A	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=1.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	7621578	rs11255201	C	A	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=1;PP=1255;SC=CATGGTGACACCTCCCATTGC;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=7621586;WS=7621577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	7621771	rs17431370	A	G	3437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=70;PP=2212;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GTGTGAGGCCACAGTTCTCCA;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=364;TCF=194;TCR=170;TR=151;WE=7621779;WS=7621761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,177:0.41:429
chr10	7629168	rs945149	C	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=497;SC=CAGGGATGCTCAGTGATAACA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=7629176;WS=7629158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr10	7629411	rs4747527	T	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr10	7629417	rs4747528	A	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr10	7683873	rs41382649	A	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=374;ReadPosRankSum=0.367;SC=TTCATCCCTGACCAGCGTGTC;SOR=1.241;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=18;WE=7683881;WS=7683863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
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chr10	7747034	rs113278189	TA	T	558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.966;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr10	7763661	rs7075296	A	G	5715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=77;PP=2965;SC=ATATGCCCTAACTGCCGGGAG;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=94;TCR=78;TR=171;WE=7763669;WS=7763651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	7769604	rs2277226	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=540;ReadPosRankSum=0.661;SC=CTGAATCCAGAATGGGATTTT;SOR=1.131;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=28;WE=7769612;WS=7769594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr10	7773976	rs7098319	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=555;ReadPosRankSum=2.088;SC=CCACTTATCCATTTATTCTAT;SOR=0.472;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=36;WE=7773984;WS=7773966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr10	7774317	rs41290291	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=443;ReadPosRankSum=-0.169;SC=ACGCAGTTAGTCTTGGAGACC;SOR=0.901;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=25;WE=7774325;WS=7774307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr10	7776831	rs1926937	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=693;ReadPosRankSum=0.577;SC=AGCTGACTTGCGCTCCCCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=36;WE=7776839;WS=7776821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr10	7785017	rs3736965	T	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=334;SC=ATATTTGTTCTGATTAAATTA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=7785025;WS=7785007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	7788495	rs7912419	T	C	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=19;PP=1299;SC=GAGTCAATAATGAGCCTCTTT;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=7788503;WS=7788485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	7797903	rs138937189	C	CAACT	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TTTAGCTGAACAACTATACAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=7797911;WS=7797893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	7804308	rs1980856	C	T	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=14;PP=964;SC=GCAGTTAATGCCGCCAAGACA;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=7804316;WS=7804298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	7807864	rs3736969	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AATTAATGATCTAATAGGAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=7807872;WS=7807854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	7808086	rs3736968	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=388;ReadPosRankSum=-0.669;SC=ACATAATGTCTTAAATTATCT;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=23;WE=7808094;WS=7808076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr10	7820704	rs111726843	A	AAACAAC	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=665;ReadPosRankSum=1.253;SC=TCCATCTCCAAAACAACAACA;SOR=1.098;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=14;WE=7820712;WS=7820694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr10	7830319	rs1475406	G	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=398;ReadPosRankSum=2.361;SC=GGGGGCAGATGTGGGGTCGCA;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=26;WE=7830327;WS=7830309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr10	7838208	rs1244418	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=363;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GCTTTAGCCCATTGTGTATTT;SOR=1.038;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=23;WE=7838216;WS=7838198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr10	7844195	rs932971	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=331;ReadPosRankSum=0.983;SC=CTATTCCTTCCATATAACTTG;SOR=0.129;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=16;WE=7844203;WS=7844185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr10	7844906	rs1244431	T	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.920;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=519;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TTTCGTTTTTTTCTTTTGAAG;SOR=0.241;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=28;WE=7844914;WS=7844896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr10	7846152	rs914609	T	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=89;PP=2395;SC=ACCCACAGAGTGCAGAATACT;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=150;WE=7846160;WS=7846142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	7849688	rs4655	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=233;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CCGAAGAAACTGTTCCTCCAT;SOR=0.454;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=22;WE=7849696;WS=7849678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr10	7866263	.	CT	C	2963	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28;NR=28;PP=2963;QD=20;SC=ATTTGATTTGCTTTTCACTTT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=56;WE=7866277;WS=7866253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:60,56:0.48:116
chr10	7866266	.	TTCA	T	3518.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,90:0.51:177
chr10	7866268	rs7070208	C	G	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,86:0.49:176
chr10	7866268	.	CA	GA,GG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=96,46;NR=58,28;PP=2962,2944;QD=20;SC=ATTTGCTTTTCACTTTGTTTC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=154,74;WE=7866277;WS=7866253;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.96:161
chr10	7866269	.	A	AGG	3518.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=0.000;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,90:0.51:177
chr10	7866557	rs1244471	T	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=36;PP=1069;SC=ATGTTAGTGATTATTTTAATG;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=7866565;WS=7866547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	7866576	rs1244472	A	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=359;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TGGATTTTTAATCCTCTTAGC;SOR=0.375;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=21;WE=7866584;WS=7866566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr10	8006519	rs17366712	G	C	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1406;ReadPosRankSum=0.851;SC=GCTACACTCAGTGAAAAAATC;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=79;WE=8006527;WS=8006509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,90:0.51:178
chr10	8006798	rs4747647	A	G	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1997;ReadPosRankSum=2.007;SC=TCCGCGAACAATTTCACAAAG;SOR=0.682;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=111;TCR=109;TR=118;WE=8006806;WS=8006788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,125:0.51:247
chr10	8007559	rs10795583	GT	CC	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=18.091;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr10	8093034	rs501764	G	T	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=24;PP=721;SC=CCGCGCCTCCGCTCTGCGCCA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=8093042;WS=8093024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	8093185	rs485411	T	C	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=17;PP=791;SC=CCCTACCGAGTGGAGAAAGTC;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=8093193;WS=8093175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	8111409	rs422628	C	T	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=81;NR=38;PP=2802;SC=GTTTTGATTTCACCCTCTCCT;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=119;WE=8111417;WS=8111399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	8111621	rs406103	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=432;ReadPosRankSum=0.038;SC=CAGCAAACAGCGTCACCACCA;SOR=0.256;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=27;WE=8111629;WS=8111611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr10	9449465	.	A	G	2962	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=57.9;NF=62;NR=93;PP=2962;QD=20;SC=GACACAGAGCACCTCAGCGGG;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=504;TCF=254;TCR=250;TR=155;WE=9449489;WS=9449445;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:349,155:0.31:504
chr10	9449628	.	A	G	2707	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=47.47;NF=55;NR=91;PP=2707;QD=20;SC=TGCAGAGCCCATCAGTGGGTT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=146;WE=9449636;WS=9449618;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr10	11047207	rs2773499	C	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=0.050;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	11299735	rs2277212	A	T	3597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=63;PP=2268;SC=TAGGAATGGTATCGAAGAAAT;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=124;WE=11299743;WS=11299725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	11308684	.	A	G	2213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=0.070;NF=36;NR=46;PP=1265;ReadPosRankSum=0.859;SC=TGTGCAAATGATGGGGAATGG;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=173;TCF=77;TCR=96;TR=82;WE=11308692;WS=11308674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,107:0.48:224
chr10	11308790	rs72051267	TTC	T	888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=35.55;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	11316813	rs67013685	TAGTG	T	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=703;SC=GCAGCAGTGTTAGTGAGTTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=11316824;WS=11316803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	11316909	rs2244576	G	C	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=24;PP=1604;SC=CATCAGTAGGGAGTAGCAACC;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=11316917;WS=11316899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	11316987	rs2244573	G	A	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=48;PP=2157;SC=TGCTCTCACCGTCTCCACTTT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=110;WE=11316995;WS=11316977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	11330525	rs2277214	G	A	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=70;PP=2189;SC=GGTGAGTGTGGGGGGTGCTCT;SOR=1.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=101;WE=11330533;WS=11330515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	11356093	rs5783207	T	TTTTG	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=901;SC=TCTGTTTTCCTTTTTTCAGTG;SOR=2.494;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=19;WE=11356101;WS=11356083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	11356160	rs2246449	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=736;ReadPosRankSum=0.439;SC=TGACCTCTCTCGGGACTCTGC;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=42;WE=11356168;WS=11356149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr10	11360673	rs2279809	A	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=717;ReadPosRankSum=0.729;SC=TTTGGCAAAAAGGAGAAAGAG;SOR=0.531;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=72;TCR=21;TR=38;WE=11360681;WS=11360663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr10	11367780	rs3832668	CT	C	2614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.061;NF=28;NR=43;PP=1061;ReadPosRankSum=0.363;SC=CTTACTCTGACTTTTTTTTTC;SOR=0.620;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=71;WE=11367788;WS=11367770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,118:0.55:216
chr10	11532758	rs882206	C	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=716;ReadPosRankSum=1.088;SC=GAAATGTGCCCACAGGGCCCT;SOR=0.623;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=50;WE=11532766;WS=11532748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr10	11543086	rs3781056	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=-0.339;SC=AACAAGTTAGCTTTAGCTACT;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=14;WE=11543094;WS=11543076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr10	11653772	rs145486773	C	CGCGGCCCCGG	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=643;ReadPosRankSum=0.103;SC=GCCATATTGGCGCGGCCCCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=3;WE=11653780;WS=11653762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	11784633	rs11558855	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=1.889;SC=GTGTCTCCGGCGCGGCCCCTG;SOR=0.511;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=8;WE=11784641;WS=11784623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr10	11789290	rs4750089	G	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=370;SC=GGAATCGCAGGGGTCCTCACT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=11789298;WS=11789280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	11789382	rs4750090	G	A	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=29;PP=1585;SC=GAAGAGGAACGCGTTGTCACT;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=11789390;WS=11789372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	11789405	rs4750091	G	A	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=39;PP=1951;SC=CAATGCTGAAGTCTCTCCAAA;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=102;WE=11789413;WS=11789395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	11789511	rs4750092	C	G	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=42;PP=1526;SC=GCAGTGCCCACAAGAGCTTTC;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=11789519;WS=11789501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	11791741	rs58243400	CCCAGCAAT	C	684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=2977;SC=GATCCTTTATCCCAGCAATCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=11791756;WS=11791731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	11797436	rs7899215	T	C	10389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=169;NR=155;PP=2965;SC=ACCACCCCGTTCCCGTCATTG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=325;TCF=170;TCR=155;TR=324;WE=11797444;WS=11797426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr10	11797467	rs7910140	G	A	9601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=154;PP=2965;SC=TGGCCTGGCCGCGGCTGCCGG;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=313;TCF=159;TCR=154;TR=313;WE=11797475;WS=11797457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr10	11797619	rs902892	C	G	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=64;PP=1941;SC=TAATTTAACTCCCCCCACCCA;SOR=1.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=89;WE=11797627;WS=11797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	11797675	rs3750695	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=0.967;SC=CAGTGCATGCGATGATTCAAG;SOR=1.385;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=19;WE=11797683;WS=11797665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr10	11805152	rs61844892	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=416;ReadPosRankSum=-1.849;SC=GTCATTGAGCCGAGGCGGGAC;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=30;WE=11805160;WS=11805142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr10	11805204	rs72781916	A	C	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=951;ReadPosRankSum=0.779;SC=CCTCAGTGACATCCCGTGTCT;SOR=1.093;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=125;TCF=76;TCR=49;TR=56;WE=11805212;WS=11805194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr10	11805249	rs61739577	T	C	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TCTTTACTGGTGAGCCCATTT;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=82;WE=11805257;WS=11805239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,96:0.54:179
chr10	11805354	rs12258196	A	G	2874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr10	11805357	rs10906011	G	A	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,76:0.45:170
chr10	11912431	rs12253600	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CAGTCCACCCCGTTTCTCCCC;SOR=0.575;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=31;WE=11912445;WS=11912421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr10	12021312	rs3740023	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=51;SC=CCATCATAAAGAAGTGTTTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=12021320;WS=12021302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	12068542	rs12415637	C	T	5714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=89;NR=96;PP=2954;SC=TACTGGTATTCCTCAAACCAT;SOR=0.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=185;WE=12068550;WS=12068532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr10	12111090	rs1279138	T	C	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=59;PP=1925;SC=TCTCCCTCTCTTCTGGCGTGG;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=110;WE=12111098;WS=12111080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	12123363	rs1722446	T	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=-0.706;SC=AATAAATAAATAAAAAGTAAG;SOR=0.092;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=12123371;WS=12123353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	12123666	rs10906066	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.120;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=837;ReadPosRankSum=0.478;SC=CGGAGCTGCACACCAGGCCAG;SOR=0.077;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=20;WE=12123675;WS=12123656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr10	12123667	rs1722445	A	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=674;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GGAGCTGCACACCAGGCCAGG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=14;WE=12123675;WS=12123656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr10	12126490	rs11257527	A	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=-1.109;SC=ACATCATGTTAAGGAACATGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=12126498;WS=12126480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr10	12131081	rs3740015	T	G	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1457;ReadPosRankSum=1.722;SC=TGTGGACCTGTACTTTGGGGC;SOR=0.876;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=94;WE=12131089;WS=12131071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,108:0.41:264
chr10	12140030	rs10906076	C	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=657;ReadPosRankSum=2.643;SC=TATTGCTTCTCCTTCCTGCTC;SOR=0.209;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=39;WE=12140038;WS=12140020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr10	12143105	rs2062988	C	G	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=839;ReadPosRankSum=0.947;SC=GGCATGCAATCGTGGTTTGCC;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=51;WE=12143113;WS=12143095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr10	12143320	rs73577257	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGGTGGATGAGGTGGGTCTGT;SOR=0.960;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=12143328;WS=12143310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr10	12148259	rs1701472	A	C	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=38;PP=1861;SC=GCAACAGCCCACTGTCAGAAG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=85;WE=12148267;WS=12148249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	12148286	rs1615510	T	C	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=48;PP=2006;SC=TCCTGGGATTTGAATATGGGA;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=102;WE=12148294;WS=12148276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	12149939	rs1722462	C	T	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=56;PP=2058;SC=AAAGCGGCATCGTCATCCTCC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=12149947;WS=12149929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	12159647	rs2399771	A	G	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=52;PP=2664;SC=TGCTTGCTGGATGTGTGGCCT;SOR=1.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=127;WE=12159655;WS=12159637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	12159845	rs142437056	ATCTCCCCTCTCCTATTTT	A	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=332;SC=GGTGATGCAGATCTCCCCTCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=12159870;WS=12159835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	12160602	rs11257543	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQRankSum=-1.343;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	12160606	rs11257544	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=-1.341;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr10	12160623	rs11257545	C	T	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1094;SC=CCTCGTGATCCGCCCGCCTTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=12160631;WS=12160613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	12175401	rs12768128	T	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=680;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CCTTCTCTGTTGGTAATTGGA;SOR=0.935;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=41;WE=12175409;WS=12175391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr10	12191933	rs10466280	C	T	6139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=125;PP=2965;SC=AAATGGGTGCCGGAATCTGTC;SOR=1.293;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=71;TCR=126;TR=196;WE=12191941;WS=12191923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr10	12195881	rs2895501	G	A	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=632;SC=TTTCATTCACGTGGTTAGTGT;SOR=2.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=12195889;WS=12195871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	12198019	rs3758376	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=272;SC=GCCTAGAGCCGTTCTGGTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=12198027;WS=12198009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	12199795	rs12770130	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=243;ReadPosRankSum=0.827;SC=CCCCTGTGCCCGGCCGGCATT;SOR=1.022;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=12199803;WS=12199785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	12200125	rs4750175	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=599;SC=TGTTTATTTACATTATTTATA;SOR=1.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=12200133;WS=12200115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	12202866	rs10906092	A	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=813;SC=GTTTGAAGTGACATGCAAATG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=12202874;WS=12202856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	12203197	rs2399784	C	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=352;SC=AGCACTTTGGCAGGCTGAGGC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=12203205;WS=12203187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	12209752	rs6686	T	C	6049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=91;PP=2965;SC=CATGTTTCAGTGCTAGAGCGT;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=104;TCR=91;TR=195;WE=12209760;WS=12209742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr10	12209936	rs71513318	GT	G	1027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=719;SC=TGGTGATAACGTTTTTTTTGG;SOR=3.855;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=32;WE=12209944;WS=12209926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	12215870	rs35088067	CT	C	304.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.535;NF=1;NR=11;PP=159;ReadPosRankSum=1.042;SC=TTAAACCCTCCTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=12;WE=12215878;WS=12215860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	12227067	rs2140660	C	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=526;SC=CAATAATCATCTTTCCTTCCC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=12227075;WS=12227057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	12240691	rs150891932	GT	G	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	12252217	rs2271804	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=0.985;SC=ATTTTTAGATGGAGCACTGCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=11;WE=12252225;WS=12252207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr10	12288302	rs36042706	A	G	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=877;ReadPosRankSum=0.872;SC=GACAGATACAATGTAAACCTT;SOR=0.449;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=56;WE=12288310;WS=12288292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,64:0.52:124
chr10	12292286	rs12779647	C	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GCTATTTTAACATCCCCTTGG;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=63;WE=12292294;WS=12292276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,73:0.42:173
chr10	12292344	rs10951	A	G	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=2482;ReadPosRankSum=-0.032;SC=TGATGAGCGTACTGGAACTGG;SOR=0.732;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=75;WE=12292356;WS=12292334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,95:0.47:201
chr10	12292348	rs12590	G	T	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=2657;ReadPosRankSum=0.393;SC=GAGCGTACTGGAACTGGAGAA;SOR=0.625;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=81;WE=12292356;WS=12292334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,102:0.52:197
chr10	12292454	rs1051055	A	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.427;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=572;ReadPosRankSum=0.080;SC=GACATCAGCCACTTTTTATAT;SOR=0.196;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=36;WE=12292462;WS=12292444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr10	12595037	rs2815629	G	C	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=0;PP=701;SC=CCACTGCGCCGGGCTGCCCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=12595045;WS=12595028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	12695177	rs7896283	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=30;PP=1160;SC=CTTCCTCTTAAAAAACCACCA;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=12695185;WS=12695167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	12856057	rs10795984	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=1.543;SC=CAAATTGCTGGGATTACCTGC;SOR=0.322;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=17;WE=12856065;WS=12856047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr10	12866356	rs2482023	A	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.52;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	12866356	.	ACGACTGAGCC	CCGACTGAGCC,CCGACTGAGCG	149	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12,5;NR=3,0;PP=149,54;QD=12.2514141698;SC=CACCCTGTCCACGACTGAGCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15,5;WE=12866374;WS=12866355;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:15
chr10	12866366	rs12768271	C	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr10	12867598	rs1757051	C	G	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1155;ReadPosRankSum=0.087;SC=CGGCCGTCGTCAGACATATGA;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=76;WE=12867606;WS=12867588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,95:0.53:178
chr10	12870642	.	G	GA	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=27;MQ=57.9;NF=4;NR=1;PP=49;QD=11.0;SC=TCCATCTCAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=12870650;WS=12870632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	12870659	.	G	GCC	161	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=21;MQ=59.17;NF=6;NR=1;PP=161;QD=26.4285714286;SC=AAAAAATTGGGCCCCCCCGCC;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=12870667;WS=12870649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,7:0.54:13
chr10	12870714	rs2482075	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=9;PP=752;SC=AGTGGGAAGCAGGGTGAGAAT;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=12870722;WS=12870704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	12940377	rs10752280	T	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=2;PP=411;SC=TCAATTACCGTCAGGATTGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=12940385;WS=12940367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	12940455	rs10906249	A	G	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=24;PP=1612;SC=GCCCCCGGGCATTGATGTGCG;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=12940463;WS=12940445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	13152504	rs34617995	GT	G	836.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-2.520;QD=34.85;ReadPosRankSum=2.101;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr10	13152515	rs79529484	T	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.873;NF=1;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=2.483;SC=TTTTTTTTTTTTCCCTTGACA;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=13152523;WS=13152494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr10	13158262	rs2244380	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=22;PP=1190;SC=TTTCTGTTTTCACAGGAAGGA;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=13158270;WS=13158252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	13164332	rs765884	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=-0.696;SC=ATAATTGCTATTTCTCTTAAA;SOR=1.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=13164340;WS=13164322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	13164596	rs489040	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=1.783;SC=TATAGAAATCATGTTGATATT;SOR=0.527;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=30;WE=13164604;WS=13164586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr10	13166076	rs523747	A	G	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=57;PP=1915;SC=AAAACTCAGCAAAGCTGAGCT;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=13166084;WS=13166066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	13167860	rs676302	G	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=9;PP=1078;SC=TTTTTCTACTGGAGTGTTCAG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=13167868;WS=13167850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	13175682	rs7086894	A	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=-0.662;SC=ATTCCAAATCAAGGCACCAAA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=13175690;WS=13175672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	13206233	rs7090944	A	T	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=67;PP=1750;ReadPosRankSum=-1.494;SC=GTTTTCTGTTACTCTGTTTCA;SOR=0.630;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=198;TCF=69;TCR=129;TR=105;WE=13206241;WS=13206223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,120:0.54:223
chr10	13212884	rs2147279	C	T	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=38;PP=2075;SC=TGGAATTAGCCGTGCTTATTC;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=98;WE=13212892;WS=13212874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	13214812	rs6602637	A	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=251;SC=GTATGTGTTTATGTGTGTGGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=13214820;WS=13214802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	13230837	rs6602641	A	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=13;PP=897;SC=GCTGTTTCCCAGCCTGTTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=45;WE=13230845;WS=13230827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	13231194	rs2296221	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=519;SC=TTTATCTTTCATAACTCACTA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=13231202;WS=13231184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	13237015	rs10796036	G	A	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=30;PP=1808;SC=CCCTGTTTGCGTATTTTGACT;SOR=1.413;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=88;WE=13237023;WS=13237005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	13239651	rs2274110	A	G	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=56;PP=2965;SC=TTAAGGGCAAAAGGCCAGGTT;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=88;TCR=56;TR=144;WE=13239659;WS=13239641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	13239917	rs35803060	AT	A	118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=72;SC=GGTGGAACTGATTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=13239925;WS=13239907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	13240887	rs4750317	G	C	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=36;NR=83;PP=2743;SC=GACCAAGAATGTGTTGTTTGT;SOR=1.645;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=36;TCR=83;TR=119;WE=13240895;WS=13240877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	13264151	.	G	A	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=967;ReadPosRankSum=1.721;SC=GGCCGTCATAGTGCCACTGGC;SOR=0.432;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=59;WE=13264159;WS=13264141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,68:0.60:114
chr10	13275437	rs41291315	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=0.076;SC=CTTCGTGCCCAGCTGCATCCT;SOR=1.516;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=7;WE=13275445;WS=13275427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr10	13275510	rs7893239	C	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr10	13275514	rs4750327	A	G	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.70;SOR=2.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	13275553	rs3829925	T	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=19;PP=965;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ACCTCATCTCTGGACTTGGGG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=64;WE=13275561;WS=13275543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,69:0.55:125
chr10	13275643	rs4750328	G	A	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TCTGAAACCCGGGAGAGGCCT;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=100;WE=13275651;WS=13275633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,110:0.51:216
chr10	13275676	rs3829926	T	C	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.475;SC=GTGGGGGTGCTGGGGCTGCTG;SOR=0.854;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=76;TCR=104;TR=88;WE=13275684;WS=13275666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,98:0.49:199
chr10	13276179	rs942418	A	G	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=36;PP=1292;SC=AACACCCTCCACCTTGACCCT;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=13276187;WS=13276169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	13276368	rs2399954	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.992;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr10	13320411	rs825625	A	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=39;PP=1234;SC=GCCCTCCATTAACCTTCAATT;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=13320419;WS=13320401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	13325946	rs648173	C	T	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=37;PP=1090;SC=AAGCATTTCTCTCTCCCAAGA;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=13325954;WS=13325936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	13330291	rs7900830	G	T	212.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=125;SC=AAACTCTTTAGAGGTACTGAT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=13330299;WS=13330283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	13334058	rs1408364	A	G	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=138;SC=TTGCAAACAAAGCATGAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=13334066;WS=13334048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	13337319	rs654536	A	C	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=169;SC=CAGAGTGAGAACCTTTCTCTA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=13337338;WS=13337309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	13337330	rs654553	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=138;SC=CCTTTCTCTATAAAAAATAAA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=13337338;WS=13337309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	13337588	rs1747682	G	A	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=34;PP=972;SC=GGGTTAGAACGTTATTATCCA;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=13337596;WS=13337578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	13341836	rs511959	G	C	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=140;SC=AGGCGGGGACGCGGCGCTGAG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=13341844;WS=13341827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	13341889	rs732704	C	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=0.764;SC=CCCGAGGCCTCCACCCGGACC;SOR=0.593;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=6;WE=13341908;WS=13341879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	13341900	rs512109	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=7;PP=448;SC=CACCCGGACCAGGGCCACCAC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=13341908;WS=13341879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	13344169	rs3758423	G	A	80.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AGCATCACCAGCCCCTTCCTG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=13344177;WS=13344159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	13350590	.	ATT	A	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=16;MQ=57.57;NF=1;NR=3;PP=60;QD=15.75;SC=ATTACAGATAATTTTTTTTTT;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=13350599;WS=13350580;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,4:0.40:10
chr10	13481427	rs12415754	T	A	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=53;PP=1534;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TTGTCTGAGGTGAGCTCTGCA;SOR=0.710;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=65;TCR=113;TR=85;WE=13481435;WS=13481417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr10	13494396	rs3832669	TAA	T	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=0.728;SC=AATAAGACTTTAAGAGAGCAA;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=13494405;WS=13494395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	13494594	rs2277222	T	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=702;ReadPosRankSum=0.195;SC=GTAGAATCTGTACCCAATCTC;SOR=1.128;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=45;WE=13494602;WS=13494584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,55:0.39:142
chr10	13534851	rs2251555	A	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.789;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=972;ReadPosRankSum=-2.436;SC=GGGAAATTGGAGGTTGTTGTC;SOR=0.996;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=145;TCF=49;TCR=96;TR=61;WE=13534859;WS=13534841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr10	13534912	.	T	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=719;ReadPosRankSum=0.026;SC=TACAGGCACGTGTGTCTGACT;SOR=0.527;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=34;WE=13534920;WS=13534902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr10	13541724	rs113234105	T	TAAAAC	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=477;ReadPosRankSum=0.467;SC=TATTTAGAAATAGAACAGTAC;SOR=1.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=10;WE=13541732;WS=13541714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr10	13570569	.	GGCGGCAGCGGCGGCA	G	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=7;PP=1820;SC=CTGAGGAGGCGGCGGCAGCGG;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=13570591;WS=13570559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	13570673	rs10906401	A	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=13;PP=332;SC=GGAGTCGGCGAGGGGAGGCCG;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=13570681;WS=13570663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	13633835	rs10906419	A	G	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=800;ReadPosRankSum=3.175;SC=CTTCAGGAAGACCGCCCTCTT;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=52;WE=13633843;WS=13633825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr10	13633929	rs10796097	T	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-0.961;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	13653490	rs2478121	C	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=-0.208;SC=AAATTCCATCCGATTTTTAAG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=13653498;WS=13653480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	13658335	rs2253308	G	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=854;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AATACTTTCAGTAAGAATTTG;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=55;WE=13658343;WS=13658325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr10	13693883	rs11258499	C	T	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1532;ReadPosRankSum=1.863;SC=GCAGTAGGAACAAAACTCCCC;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=88;TCR=113;TR=99;WE=13693891;WS=13693873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,140:0.48:289
chr10	13702231	rs74123100	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=1.694;SC=GATTTTGTCACCGTGGATGCT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=13;WE=13702239;WS=13702221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr10	13702668	rs10796105	T	C	62.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AACCCACACCTTCACCCCTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=13702676;WS=13702658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	13705298	rs10796108	G	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=923;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CCCAACCAAAGAGGTGAATAC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=15;WE=13705316;WS=13705288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr10	13705307	rs55876188	ACT	A	695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=995;ReadPosRankSum=-1.678;SC=AGAGGTGAATACTGGGAAATG;SOR=0.504;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=14;WE=13705316;WS=13705288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr10	13716800	rs77861426	A	G	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=958;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TTCTGTCAAAACGATCAAATG;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=90;TCR=35;TR=59;WE=13716808;WS=13716790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr10	13735587	rs737376	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	13735603	rs943090	G	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=383;SC=TTGCCATGGGGATTGTGAAAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=13735611;WS=13735593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	13743251	rs2296598	A	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=-1.323;SC=GGCAAGGGACATGGCGCCTCC;SOR=0.283;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=13743259;WS=13743241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	13743646	rs1541005	G	C	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=126;SC=TGCGCACACAGCTTACAGACA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=13743654;WS=13743636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	13749228	rs11258541	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-1.863;SC=AACAGAGACCGTAGTCTGTGC;SOR=0.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=13749236;WS=13749218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	13782109	rs11595190	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.023;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr10	13782110	rs11258567	A	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.52;ReadPosRankSum=2.154;SOR=0.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr10	13782124	rs10906462	A	G	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=19;PP=2054;SC=AGAAGAAAACATATAACGAGA;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=74;WE=13782132;WS=13782099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	13782605	rs6602679	G	A	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.953;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=1046;ReadPosRankSum=0.651;SC=GAATGCTGTTGTTGGAGTCTC;SOR=0.983;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=61;WE=13782613;WS=13782595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,71:0.48:147
chr10	13838329	rs3740123	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=421;ReadPosRankSum=0.555;SC=CTGCACCCTCGCACCCCGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=13838348;WS=13838319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	13838340	rs3740122	T	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=1;PP=421;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CACCCCGCCTTTCCATCTATG;SOR=1.347;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=13838348;WS=13838319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr10	13838659	rs7079138	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=545;ReadPosRankSum=-0.915;SC=TGAAGGTATATATGAAGCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=30;WE=13838667;WS=13838649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr10	13852967	rs77883999	A	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=783;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TTCCTAAAATATGCAATCTCA;SOR=0.855;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=44;WE=13852975;WS=13852957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr10	14425204	rs12780876	T	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CTTGCTTCAGTCAGGCTGTTC;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=31;WE=14425212;WS=14425194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr10	14478462	rs10906676	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.545;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=175;ReadPosRankSum=0.177;SC=CCAGAGTTAGAGGGAGCTGCC;SOR=0.160;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=15;WE=14478470;WS=14478452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	14572644	rs7922221	G	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=523;SC=CTGGGGCATCGCTGATAAATA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=14572652;WS=14572634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	14880394	rs45622935	GC	TT	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=762;ReadPosRankSum=-1.470;SC=TGCCGTCCCTGCTGCCTCATG;SOR=0.905;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=19;WE=14880403;WS=14880384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr10	14941055	rs7896464	T	G	93.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AATCAACCAGTTACAGTTAAT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=14941063;WS=14941045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	14941654	rs17353856	C	T	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=58;PP=1309;ReadPosRankSum=0.090;SC=CGGCTCGATACGGCAATGTGT;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=82;TCR=121;TR=97;WE=14941662;WS=14941644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,128:0.50:254
chr10	14950485	rs61749163	T	C	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=2168;ReadPosRankSum=-0.005;SC=ATAAATATTGTAAATGCTCTC;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=103;TCR=91;TR=121;WE=14950493;WS=14950475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,127:0.59:216
chr10	14974843	rs35927251	G	A	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=74;PP=2090;ReadPosRankSum=1.171;SC=GGAATCACTTGCACACGTACC;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=274;TCF=120;TCR=154;TR=139;WE=14974851;WS=14974833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,158:0.49:323
chr10	14974905	rs12768894	T	C	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=48;PP=1104;ReadPosRankSum=-1.414;SC=TGTGAGATGATGAAGGATCTC;SOR=0.543;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=146;TCF=48;TCR=98;TR=75;WE=14974913;WS=14974895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,78:0.48:162
chr10	14978451	rs12245497	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.917;SC=CCAGCCCCCTATTAATTTTAG;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=14978459;WS=14978441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr10	15014440	rs1935399	A	G	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=37;PP=2773;SC=CTTTTTAACTATTTGATAGTA;SOR=1.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=87;TCR=37;TR=124;WE=15014448;WS=15014430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr10	15014698	rs4418687	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.41;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	15014702	rs4295952	A	G	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.15;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	15057374	rs2007712	G	A	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=51;PP=2410;SC=TGTACCTTGGGGTGCCACCAT;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=15057382;WS=15057364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr10	15106441	rs10906818	A	G	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=51;PP=2111;SC=CACTAGGTCTAAAAGAAAACA;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=15106449;WS=15106431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	15154974	rs7072269	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=75;PP=2664;SC=TAGGAGCAAAAGTGCTGTCAG;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=49;TCR=75;TR=124;WE=15154982;WS=15154964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	15256194	rs3814165	G	A	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GCCTTTAAGGGAAAAACCTCC;SOR=0.727;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=66;WE=15256202;WS=15256184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr10	15263100	rs6602828	C	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=934;ReadPosRankSum=-1.586;SC=AAGCACACCACGCTCCTTTGT;SOR=0.497;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=62;WE=15263108;WS=15263090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr10	15296572	rs3824620	A	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=436;SC=ACAGTTTCAAAGCACTTGAAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=15296580;WS=15296564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	15413071	rs192904368	G	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.02;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	15573050	rs1041135	A	G	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=53;PP=2001;SC=GATACTCACTACTATGCTTCC;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=110;WE=15573058;WS=15573040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	15590372	rs9333229	G	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=290;SC=ATTAGAAATCGCTATGAAAAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=15590380;WS=15590362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	15600271	rs2277204	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=-1.327;SC=TTTAGCCTTGAACTCTAGGCA;SOR=0.306;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=23;WE=15600279;WS=15600261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr10	15648104	rs2282384	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CAAGAGGAAAGGCTTCCGAAA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=15648112;WS=15648095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	15648243	rs2282383	C	T	6143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=81;PP=2965;SC=CCCCAGAGAGCTTGCTTGAGA;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=181;WE=15648251;WS=15648233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr10	15650401	rs3041592	TAC	T	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=285;SC=TATTTCTAATTACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=15650410;WS=15650391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	15658596	rs7099530	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=695;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TGCGTGAATCGTATAGAAACA;SOR=0.296;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=45;WE=15658604;WS=15658586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr10	15658659	rs7083600	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=166;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TACATGCTGATGGTACGAGAG;SOR=0.157;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=13;WE=15658667;WS=15658649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr10	15685983	rs4748191	A	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=7;PP=1275;SC=AATGGACTCTATTTCAGGACG;SOR=3.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=15685991;WS=15685973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	15713507	rs7100228	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=0.950;SC=CCTTTGGTATAGCAAATAAAA;SOR=0.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=13;WE=15713515;WS=15713497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr10	15713541	rs6602051	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=601;ReadPosRankSum=-0.508;SC=AAAAACTTTATATGCCATTTT;SOR=0.383;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=39;WE=15713549;WS=15713531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr10	15713667	rs7100510	C	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=835;ReadPosRankSum=-1.176;SC=GAAAAAGAAACAAACTAATCA;SOR=0.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=53;TCR=88;TR=58;WE=15713675;WS=15713657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,61:0.40:154
chr10	15719709	rs3765585	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=700;ReadPosRankSum=-0.064;SC=GGTGATAAATTGTTGTTAATA;SOR=0.490;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=111;TCF=26;TCR=85;TR=55;WE=15719717;WS=15719699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr10	15719747	rs3765584	T	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=723;ReadPosRankSum=0.607;SC=TTGTTACACATAAAAAGCAAT;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=36;WE=15719755;WS=15719737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
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chr10	15729923	rs1954181	C	T	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.003;SC=CACAAGCCCACGGCTCATACT;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=73;WE=15729931;WS=15729913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,93:0.46:203
chr10	15760670	rs2298031	C	G	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=18;PP=1314;SC=ACAAGCTAAACGAGCAGCACA;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=15760678;WS=15760660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	15761770	rs11575600	TCTCC	T	1358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=1020;SC=CCGGGCGACATCTCCCTCCGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=15761781;WS=15761760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	15824085	rs11818243	A	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr10	15824092	rs7912258	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.537;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr10	15879441	rs7903095	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GTTTTGGGACGTTTCTAAATT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=15879449;WS=15879431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	15883377	rs7097118	A	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.843;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=425;ReadPosRankSum=-1.782;SC=AGATTCATTAAAACAAAGGAA;SOR=0.048;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=30;WE=15883385;WS=15883367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr10	15902303	rs2297882	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=780;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GGACATGATGAGGAACCGGCG;SOR=0.769;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=53;WE=15902311;WS=15902293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,68:0.42:162
chr10	16556710	rs7909832	T	C	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=122;PP=2965;SC=CACGCACCTATGTGAAACAGA;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=69;TCR=122;TR=191;WE=16556718;WS=16556700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr10	16562600	rs72772306	G	A	4242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=82;PP=2521;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TGGGGTCGTAGTGGTTTCCGA;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=344;TCF=189;TCR=155;TR=171;WE=16562608;WS=16562590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,205:0.50:413
chr10	16736977	rs3740173	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=256;ReadPosRankSum=0.076;SC=TTATAAATACTATAAAATCAC;SOR=0.866;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=21;WE=16736985;WS=16736967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr10	16737165	rs72451149	G	GAA	419.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.612;HP=9;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.811;NF=0;NR=23;PP=990;ReadPosRankSum=1.685;SC=CTGGGGGGGGGGAAAAAAAAA;SOR=1.758;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=23;WE=16737174;WS=16737155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr10	16737166	rs3837313	G	A	1017.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-0.739;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.530;SOR=1.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr10	16796919	rs1049632	C	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=27;NR=40;PP=1394;SC=AGTTGTTGTACGTCAAGTCCA;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=16796927;WS=16796909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	16806545	rs3765595	A	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=45;PP=1434;SC=GAATCTGGGAATGGAACTCCT;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=16806553;WS=16806535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	16876922	rs703060	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=231;SC=GAATCATATAATATTAGCAGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=16876930;WS=16876918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	16878204	rs703062	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=0.330;SC=GGCAGCTTTTTTGAATAAAAG;SOR=0.283;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=9;WE=16878212;WS=16878194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr10	16882518	rs703064	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=260;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TTGCATTGTATGTTCCACCAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=16;WE=16882526;WS=16882508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr10	16911605	rs703075	C	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=286;ReadPosRankSum=-0.913;SC=ACAGTCCTGACAAATAGATTT;SOR=1.402;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=16;WE=16911613;WS=16911595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr10	16918997	rs1801240	T	C	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=776;ReadPosRankSum=1.188;SC=AGCTGGCATCTCATCCCCACA;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=51;WE=16919005;WS=16918987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr10	16919052	rs1801239	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=316;ReadPosRankSum=0.623;SC=CCTCTGATAATGTGCACGCCA;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=26;WE=16919060;WS=16919042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr10	16943371	rs2796835	G	C	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=75;PP=2710;SC=CTCCAACAGCGAAGAGCAGTG;SOR=1.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=127;WE=16943379;WS=16943361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	16948177	rs780807	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=622;ReadPosRankSum=-1.496;SC=ATAAATGGGAAAACGCATTCT;SOR=1.857;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=28;WE=16948185;WS=16948167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr10	16967401	rs1276712	C	T	3537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=74;PP=2320;SC=GGGTGGAGAACAGATATCAGG;SOR=1.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=117;WE=16967409;WS=16967391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	16967445	rs1276713	T	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.026;NF=10;NR=29;PP=712;ReadPosRankSum=0.519;SC=AATTAAAATTTCATCAACTCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=39;WE=16967453;WS=16967435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr10	16967586	rs62619939	C	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr10	16975078	rs2271461	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=400;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TCTTTATAATGTTCTCACCAT;SOR=0.883;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=29;WE=16975086;WS=16975068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr10	16979661	rs1801234	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=726;ReadPosRankSum=2.999;SC=ATCCCTTCCCTGAGATTGAAG;SOR=0.734;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=51;WE=16979669;WS=16979651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr10	16982244	rs2271463	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GATCTGATTTGGGGAAAAAAA;SOR=1.071;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=9;WE=16982252;WS=16982234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr10	16989272	rs61841454	G	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1017;ReadPosRankSum=1.370;SC=GGGAACTGACGATGTTCCAGA;SOR=0.487;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=62;WE=16989280;WS=16989262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,70:0.50:140
chr10	16992296	rs61841459	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=1.949;SC=TTAAAAATAATTAAAAGAGTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=16992304;WS=16992286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	17024503	rs1801231	G	A	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=12;PP=1155;SC=GAGTCTTGTGGTTCAAGATCA;SOR=2.041;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=17024511;WS=17024493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	17024615	rs1801229	A	T	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=50;PP=1809;SC=TTGGAGAATGAATCTCTCCAC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=17024623;WS=17024605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	17026010	rs2291523	A	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=530;SC=ACTAAGTTATAAGTGTGTAGC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=17026018;WS=17026000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	17026384	rs3012494	A	G	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=110;SC=TATGATTATTAGAGATTGAAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=17026392;WS=17026374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	17032281	rs2291521	C	T	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=27;PP=1407;ReadPosRankSum=0.440;SC=GAGTGATTTCCTGTTCTACCC;SOR=0.694;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=120;TCR=63;TR=83;WE=17032289;WS=17032271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,103:0.48:214
chr10	17032559	rs925522	A	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.80;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	17032559	.	ACA	CCG	373	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=373;QD=85.2935749724;SC=GGGCAACAGCACATGGAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=17032569;WS=17032549;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,5:0.50:10
chr10	17032561	rs925523	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=67.46;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	17109974	rs79364985	AAC	A	318.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=303;SC=TGGTTTTCATAACACAACGTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=17109983;WS=17109964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	17110474	rs4747297	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=1;PP=427;SC=AGAAAATATACATTCTTTGTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=17110482;WS=17110464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	17110577	.	G	GA	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=3.474;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr10	17110595	rs10795440	G	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=37;PP=1523;SC=AAAGGGAACAGTCTCTTACCC;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=17110603;WS=17110585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	17141952	rs1033765	C	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=192;SC=TGATTAAGAACACTTAATAAC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=17141960;WS=17141942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	17146652	rs7068549	C	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=44;PP=1228;SC=TGGATAGACACTAAACTTTAA;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=17146660;WS=17146642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	17146667	rs4748353	C	T	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=36;PP=973;SC=CTTTAATCAACCCAAATAATA;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=17146675;WS=17146657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	17152855	rs12242395	G	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=390;SC=ACTAGATTCCGTATTCCTATG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=17152863;WS=17152845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	17152994	rs1801223	G	A	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=44;PP=1685;SC=AACAGCCGCCGTTATTTATCT;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=17153002;WS=17152984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	17156151	rs1801222	A	G	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=48;PP=1825;SC=GTTGGGTGAAAACATCCACCC;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=86;WE=17156159;WS=17156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	17157630	rs2295813	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=27;PP=1000;SC=TGTCAGGGCACGCGCTTTGGG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=17157638;WS=17157620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	17164760	.	A	AC	811	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=59.39;NF=11;NR=7;PP=811;QD=47.0;SC=TCAAAAATATACTGATATTTA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=17164768;WS=17164750;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	17171265	rs2281648	G	C	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=92;PP=2818;SC=TAATTCAAACGAGAGAATGCA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=46;TCR=93;TR=137;WE=17171273;WS=17171255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	17195428	rs2273736	G	C	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1341;ReadPosRankSum=0.073;SC=GTTTAGGCAAGTCCTAGACAC;SOR=0.543;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=183;TCF=118;TCR=65;TR=86;WE=17195436;WS=17195418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,101:0.47:213
chr10	17199419	rs2295810	C	G	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=55;PP=2965;SC=GATACAGGATCAATAGATCTT;SOR=1.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=122;TCR=55;TR=177;WE=17199427;WS=17199409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr10	17199830	rs7894268	A	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	17203356	rs3752950	G	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=0.374;SC=ATACTGATGAGTAAGACATTT;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=6;WE=17203364;WS=17203346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr10	17203598	rs151076824	AAAAGT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=118;ReadPosRankSum=-0.598;SC=ACTAAGAAGAAAAAGTAAAGA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=17203610;WS=17203588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	17204139	rs33993216	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=546;ReadPosRankSum=0.500;SC=TGAAAGGTAAGCTTGTACAGG;SOR=0.549;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=44;WE=17204147;WS=17204129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr10	17204187	rs11254413	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=496;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TCTAGAATATGTAAGAAGCTA;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=35;WE=17204195;WS=17204177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
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chr10	17216556	rs2273734	C	T	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1178;ReadPosRankSum=0.555;SC=TCACTTCAATCGTCTTGGCAA;SOR=0.556;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=76;WE=17216564;WS=17216546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr10	17243406	rs1885395	C	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=289;SC=GGGGTGGACACGGCGGCGCGC;SOR=2.419;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=17243414;WS=17243396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	17243443	rs11271712	G	GCCGCCCCACAGTGT	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=1135;ReadPosRankSum=1.147;SC=ACAACCGAGGGCCGCCCCACA;SOR=0.086;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=4;WE=17243451;WS=17243433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr10	17243480	rs1885394	T	A	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=27;PP=1406;SC=GTCCGCCCCTTGCGTCTCGCC;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=73;WE=17243488;WS=17243470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	17271400	rs3758410	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=1.501;SC=CGCCGCCCAGGCCATCGCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=17271408;WS=17271390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	17276066	rs57465155	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.357;SC=ATTGTGTTTGCCACCACAGCC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=17276074;WS=17276056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	17364962	rs10466289	A	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr10	17365012	rs7085734	TT	AA	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr10	17365044	rs7085750	T	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr10	17365169	rs12354751	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=1.986;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr10	17365230	rs7071297	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.19;MQRankSum=1.383;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	17365234	rs45476093	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.19;MQRankSum=1.383;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	17373617	rs2120716	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1011;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGCAGACCACGATGGACAATG;SOR=0.508;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=131;TCF=41;TCR=90;TR=65;WE=17373625;WS=17373607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr10	17636182	rs2272144	G	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCAAATCAAAGTACTAATAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=17636190;WS=17636172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	17636309	rs1053926	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.911;SC=TTCTTCACATGCGGCAAGGCA;SOR=0.504;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=21;WE=17636317;WS=17636299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr10	17645814	rs2252808	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=294;ReadPosRankSum=-1.113;SC=TCAACATTGGCATTCAGCAAA;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=20;WE=17645822;WS=17645804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr10	17659131	rs11254692	C	A	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=54;NR=50;PP=1780;SC=GTGGCCAAGACCCCCAGGCGC;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=104;WE=17659139;WS=17659121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	17659149	rs7895850	C	T	4968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=55;PP=1786;SC=CGCCTCCGCTCGCCGGGAGCC;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=17659157;WS=17659139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	17726648	rs11254724	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=732;ReadPosRankSum=0.890;SC=ATTATTAAGTAATTTTTACTT;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=79;TCF=66;TCR=13;TR=41;WE=17726656;WS=17726638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr10	17756596	rs12221	T	C	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1164;ReadPosRankSum=0.538;SC=CGCCAGTATATAGTCCTCCTC;SOR=0.534;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=67;WE=17756604;WS=17756586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr10	17840643	.	CTG	C	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	17891705	rs1926736	A	G	6469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=119;PP=2965;SC=GAAGGAAGGCAGTGACCTCGC;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=81;TCR=119;TR=200;WE=17891713;WS=17891695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr10	18087629	rs199734634	CTG	C	6468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.39;QD=44.31;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	18242304	rs691112	T	C	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.83;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	18242304	.	TAGCAGAA	CAGCAGAA,CAGCAGAG	725	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=43,17;NR=41,21;PP=725,601;QD=9.04489538747;SC=CAGCCCAGGATAGCAGAAGCC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84,38;WE=18242319;WS=18242294;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:84
chr10	18242311	rs10764176	A	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr10	18254606	rs691513	C	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=883;ReadPosRankSum=0.810;SC=GTACGAATACCCTCCGCCTAT;SOR=0.849;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=51;WE=18254614;WS=18254596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
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chr10	18267096	rs2437260	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=620;ReadPosRankSum=0.034;SC=AACTTAAAGAGTATTGTGTAT;SOR=1.154;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=36;WE=18267104;WS=18267086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr10	18270422	rs1926739	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=-0.622;SC=AGTAAGTTCTGGATCTTCCTT;SOR=0.636;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=13;WE=18270430;WS=18270412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr10	18276682	rs10508555	G	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=165;ReadPosRankSum=0.584;SC=TTCAAAGAGAGAGTATCGTGG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=18276690;WS=18276672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr10	18439747	.	C	T	30	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5051;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=58.07;NF=1;NR=1;PP=30;QD=32.3856062736;SC=ACTAGGCCTACATTCCTGTTA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=18439755;WS=18439737;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr10	18439808	rs74120235	T	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	18550450	rs951046	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-0.465;SC=GTTTTTATCTGTCTTTTGTGC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=18550458;WS=18550440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	18691018	rs3750592	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=474;ReadPosRankSum=0.595;SC=GTTGTGCTGTGCCCCTGATAG;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=30;WE=18691026;WS=18691008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr10	18787195	rs11014511	T	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=440;ReadPosRankSum=1.275;SC=ATTACAGTAGTTATTCAGTAT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=26;WE=18787203;WS=18787185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr10	18789724	rs4485000	T	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.382;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=941;ReadPosRankSum=1.878;SC=TTTTAATGCTTTTGATTTTGT;SOR=0.281;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=44;WE=18789732;WS=18789714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr10	18795596	rs10741088	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=530;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GATGTTAAAAGGAATCAGAAG;SOR=0.377;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=27;WE=18795604;WS=18795586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr10	18795612	rs200375169	A	AAC	876.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.552;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr10	18795613	.	TGC	ACT	1208	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=16;PP=1208;QD=79.4667421789;SC=GAAGTGAGCATGCCCTTTTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=16;WE=18795623;WS=18795603;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,16:0.53:30
chr10	18795613	.	TGC	T	854.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.322;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.14;ReadPosRankSum=0.789;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr10	18803338	rs12357063	A	G	3388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=2195;ReadPosRankSum=-0.934;SC=CACCTGCTCAACTGCACTGCG;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=294;TCF=147;TCR=147;TR=130;WE=18803346;WS=18803328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,159:0.44:358
chr10	18804094	rs7088091	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=569;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GCCTTTGCCATTGGCCATCCA;SOR=0.431;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=41;WE=18804102;WS=18804084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr10	18807115	rs111554381	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=0.372;SC=TCTTTGACTGGGTTTATGTAG;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=18807123;WS=18807105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr10	18828663	rs4747352	G	T	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=562;SC=AGTTTTGCCCGTTTGTGTTTT;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=26;WE=18828671;WS=18828653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	18836957	rs4747353	C	T	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=277;SC=TTTTACTTATCTCTTCGTTAA;SOR=2.448;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=18836965;WS=18836947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	18837285	rs3817494	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=50;PP=1203;SC=TGATGTTCTATGTGACAAGGA;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=18837293;WS=18837275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	18898701	rs4748493	T	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=333;SC=AATTTTAAAATATCCTAGATT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=18898709;WS=18898691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	18898960	rs4748494	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=578;SC=AAGATGCTCTATCTTTTTAAG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=18898968;WS=18898950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	18903281	rs11405681	C	CAA	483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=11.461;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;MQRankSum=0.612;QD=34.55;ReadPosRankSum=1.493;SOR=5.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr10	18903605	rs4636555	A	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=144;SC=CGTGAAAATTATTTGAGCTAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=18903613;WS=18903595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	18905039	rs45452100	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=700;ReadPosRankSum=2.436;SC=TAGTGACAAATCAATAAATTT;SOR=1.417;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=36;WE=18905047;WS=18905029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr10	18931512	rs7907153	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=193;ReadPosRankSum=0.407;SC=GATTATAAAGTAATCCATACA;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=13;WE=18931520;WS=18931502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr10	18937579	rs45468894	A	AAAG	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=477;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CACAATCTAAAAAGAAGTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=18937587;WS=18937569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	18940157	rs3740102	C	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=62.41;MQRankSum=-1.912;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.726;SC=AGTTCTCCACCAAGAGAAATG;SOR=1.643;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=6;WE=18940165;WS=18940147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr10	19492566	rs7902704	A	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=618;SC=ATACAGAAGCATAATAAGGTG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=19492574;WS=19492556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	19492832	rs7476259	A	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=54;PP=1863;SC=CAGGGACTCTACAACCACTGC;SOR=1.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=19492840;WS=19492822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	19493144	rs10827051	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=9.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGTTAGACAATGATCTTGCTC;SOR=3.596;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=19493152;WS=19493134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	19493415	rs2358348	C	G	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=746;SC=AGGCATACCTCTGCACTTATT;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=19493423;WS=19493405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	19494316	rs144770813	TTA	T	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=130;ReadPosRankSum=-1.630;SC=CTGATGAATGTTATGTGTGGT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=19494325;WS=19494306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	19498278	rs2358355	G	A	5356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.593;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.453;SC=TGGACCAGGAGCCAGGGTCCA;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=164;WE=19498286;WS=19498268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
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chr10	19546796	rs10763903	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=0.292;SC=AAATTTCCAATATGACCTTGC;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=17;WE=19546804;WS=19546786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr10	19571941	rs2499066	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.717;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=493;ReadPosRankSum=1.667;SC=GTTCTACCCCATCCAAGTTAT;SOR=1.176;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=40;WE=19571949;WS=19571931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,48:0.40:121
chr10	19572136	rs2484099	C	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=306;ReadPosRankSum=-2.581;SC=TTTTGAATATCTCTCTTGGGA;SOR=0.638;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=24;WE=19572144;WS=19572126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr10	19616735	rs1577289	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=173;ReadPosRankSum=0.143;SC=GTGGACACCATGCTTAACACT;SOR=0.197;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=19616743;WS=19616725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr10	19620407	rs7100382	A	C	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1238;ReadPosRankSum=-1.538;SC=AAGTGTACTGATCATGAATTC;SOR=0.702;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=167;TCF=81;TCR=86;TR=78;WE=19620415;WS=19620397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,81:0.47:174
chr10	19620439	rs7100403	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=902;ReadPosRankSum=-0.955;SC=TAAGCACTGCATTGCCAAAGA;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=65;WE=19620447;WS=19620429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr10	19620559	rs7082205	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=1.326;SC=AACTCCCACAGCCTTACTCAA;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=19620567;WS=19620549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr10	19636779	rs76551926	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=786;ReadPosRankSum=1.679;SC=TTGACTGGAACCTGAAAGCTA;SOR=0.743;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=50;WE=19636787;WS=19636769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr10	19636869	rs1609746	G	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1163;ReadPosRankSum=0.321;SC=TCTTTATAAAGAGTTTGTTTC;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=75;WE=19636877;WS=19636859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,83:0.48:173
chr10	19637088	rs1577307	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=0.728;SC=TATGTGAAGGGGGGAAAAAAT;SOR=0.287;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=19637096;WS=19637078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	19641035	rs10827306	T	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.540;SC=AACCTCACTGTAGAACAAGGC;SOR=0.500;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=77;WE=19641043;WS=19641025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,96:0.51:189
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chr10	19641239	rs10616221	CTG	C	1628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.745;NF=3;NR=26;PP=2264;ReadPosRankSum=2.448;SC=ACATTCTAATCTGTGTGTGTG;SOR=0.964;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=29;WE=19641248;WS=19641221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
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chr10	19678497	rs10763975	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=-2.221;SC=CTGGTATTTCGTATCTGCAAA;SOR=1.041;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=15;WE=19678505;WS=19678487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr10	19739459	rs6415957	T	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=730;SC=AAGCACATTTTTAATCTAGCC;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=19739467;WS=19739449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	19777907	rs112165212	C	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=802;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GAGGAGAAGGCGGGCTCCCAA;SOR=0.736;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=50;WE=19777915;WS=19777897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr10	19777982	rs72788548	G	A	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AGGGTGGAGGGGCGGCAGCGC;SOR=0.932;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=201;TCF=93;TCR=108;TR=82;WE=19777990;WS=19777972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,119:0.46:259
chr10	19778056	rs2151234	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=795;ReadPosRankSum=0.036;SC=CTCTGCTGAAGGGGCCGCCAC;SOR=0.539;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=39;TCR=74;TR=48;WE=19778064;WS=19778046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr10	19778072	rs2184035	A	G	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=56;PP=1944;SC=GCCACAGGAAAAGCCTAACAG;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=19778080;WS=19778062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	19787418	rs12256835	T	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=987;ReadPosRankSum=-1.229;SC=CCCCAGCACATTATACAAGCA;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=62;WE=19787426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr10	19884264	rs10827628	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=865;ReadPosRankSum=0.914;SC=TGTCCTCTCAGCCCCACCCCT;SOR=0.624;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=50;WE=19884272;WS=19884254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr10	19896830	rs7909976	C	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=472;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CCAGCTGCTCCGGTACCCCAT;SOR=0.733;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=33;WE=19896838;WS=19896820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr10	19904870	rs10580913	ATT	A	1034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=746;ReadPosRankSum=1.374;SC=GCATTGTTTAATTTTTTTTTT;SOR=0.657;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=17;WE=19904887;WS=19904860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr10	19904879	rs62881061	T	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.749;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr10	20105936	rs989767	T	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=4;PP=1028;SC=GGCCCGGTCGTGCCTATTGCA;SOR=3.417;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=20105944;WS=20105926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	20105996	rs63234960	TGGC	T	5030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=32;PP=2978;SC=GGTAGGGAGGTGGCGGCGGCG;SOR=1.961;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=77;WE=20106006;WS=20105986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	20336112	.	G	T	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=61;QD=47.8856062736;SC=AATTTAGATTGATTACTGCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=20336122;WS=20336102;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr10	20336114	rs6482079	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TTTAGATTGATTACTGCATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=20336122;WS=20336102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	20436838	rs4626974	G	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=928;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AGAAGTAAGTGATGCGTTGAT;SOR=1.078;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=50;WE=20436846;WS=20436828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,55:0.43:128
chr10	20500710	rs12259741	G	A	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=972;ReadPosRankSum=0.929;SC=TCATATACATGTGTTTTAACT;SOR=0.581;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=63;WE=20500718;WS=20500700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr10	20506326	rs12783379	T	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=623;ReadPosRankSum=0.181;SC=GATCACTCCATTTGTTTTCCT;SOR=1.081;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=39;WE=20506334;WS=20506316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr10	20506418	rs3817405	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=986;ReadPosRankSum=0.118;SC=CACCACAACCGTAGGAGCGAC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=65;TCR=95;TR=77;WE=20506426;WS=20506408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,93:0.46:202
chr10	20507790	rs11011879	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AAATCTTGACATTACAATCTC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=20507798;WS=20507789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	20534333	rs2778979	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=765;SC=TGGCCTCATCATTGGAATCCT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=20534341;WS=20534323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	20568524	rs2681949	T	C	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=8;PP=1077;SC=GATAATTTAATGTGTTAATTA;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=20568532;WS=20568514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	20841150	rs2496601	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATCCCGGCTACTCACCCTTGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=20841158;WS=20841140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	21074724	rs2296614	T	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=631;SC=CTGTTCTCCCTGTTCTCTGCA;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=21074732;WS=21074714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	21141469	rs703089	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=27;PP=1222;SC=CGGGCAAGTGTGTACCTGACT;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=21141477;WS=21141459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	21148584	rs4748729	C	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=6;PP=496;SC=ACAGTCGATTCTAAAAAAAAC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=21148592;WS=21148574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	21157492	rs2296609	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=382;SC=CTCTGTTTATTCTTGCAATTA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=21157500;WS=21157482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	21157763	.	CA	C	68	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=68;QD=14.4;SC=TGACATTAGCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=21157771;WS=21157753;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,5:0.45:11
chr10	21176945	rs703100	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=721;SC=TGATGAAAACGTTTTATTAAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=21176953;WS=21176935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	21177156	rs67288319	GA	G	1153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=34;PP=1099;SC=AAAAAAACAGGAAAAAAATAA;SOR=2.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=39;WE=21177164;WS=21177146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	21185821	rs788971	A	C	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=19;PP=1361;SC=CAGCTCTATGACTCTATAACA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=21185829;WS=21185811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	21805466	rs112207161	C	CCCTCCT	2807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=27;PP=1873;SC=CCCGCTGCCCCCCTCCTCCTC;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=43;WE=21805474;WS=21805456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	21901255	rs369797804	CT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr10	21962230	.	T	TC	99	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.7565;HP=7;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=55.53;NF=4;NR=0;PP=99;QD=30.0;SC=AATTTTTCTGTCCCCCCCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=21962246;WS=21962220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	21962238	.	A	C	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5130;HP=13;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=55.53;NF=4;NR=0;PP=41;QD=18.9428031368;SC=TGTCCCCCCCACCCCCCAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=21962246;WS=21962220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	22048330	rs9045	C	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=730;ReadPosRankSum=1.442;SC=GCTCCGGCTTCGCTGTAGCCT;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=57;WE=22048338;WS=22048320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr10	22193422	rs792455	T	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=456;SC=TTATATGACATTGTTAAAACA;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=22193430;WS=22193412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	22208630	rs2807978	T	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=212;SC=TGGCACATTATTAGTCTTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=22208638;WS=22208622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	22498749	rs2478476	A	T	7341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=129;PP=2965;SC=TTTTTCAATGACCTTAACATC;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=93;TCR=129;TR=222;WE=22498757;WS=22498739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr10	22618188	.	G	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.516;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=956;ReadPosRankSum=0.203;SC=ACTTGTAAAAGAATGAAGATC;SOR=1.257;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=63;WE=22618196;WS=22618178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,69:0.49:140
chr10	22635359	.	G	GTTC	304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=6;PP=347;SC=AGAGAAAATGGTTCTTCTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=6;WE=22635367;WS=22635349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	22826093	rs1053454	A	C	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=44;PP=2331;SC=ACCTCTGTCCATCCAATGTTC;SOR=1.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=22826101;WS=22826083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	22828833	.	AGAGAGAGG	A	1670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.78;QD=33.41;SOR=2.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	22830719	rs943192	G	C	11349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=169;PP=2965;SC=AGGGTCCACAGTAATCAAACT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=341;TCF=171;TCR=170;TR=340;WE=22830727;WS=22830709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,409:1.00:409
chr10	22839463	rs10047326	C	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=TCTGACTTCCCTAAGGTAGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=22839471;WS=22839462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	22896779	rs2765997	C	T	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=46;PP=2965;SC=GACAAAAATACAGATCCCAAT;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=109;TCR=46;TR=155;WE=22896787;WS=22896769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	23220883	rs12360508	T	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=0.339;SC=GAGAAATGTATGTGCAAATGT;SOR=0.965;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=13;WE=23220891;WS=23220873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr10	23295903	rs11013233	T	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CAACAGTAAATCTTACGTGTG;SOR=0.761;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=49;TCR=101;TR=71;WE=23295911;WS=23295893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,89:0.50:177
chr10	23297252	rs10828395	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=230;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GGTTATGGACGAAGTATTTCT;SOR=0.521;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=18;WE=23297260;WS=23297242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr10	23297301	rs11817610	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=213;ReadPosRankSum=0.627;SC=AAGAAAAGAACAAGTAAGAAA;SOR=0.939;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=14;WE=23297309;WS=23297291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr10	23297336	rs11819616	A	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=194;ReadPosRankSum=0.614;SC=GTATGCAAACAGCTTCCCCTT;SOR=0.742;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=14;WE=23297344;WS=23297326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr10	23297429	rs11013234	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-2.128;SC=CAATTGCATAATTGCCTTTTA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=23297437;WS=23297419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	23303092	rs72297783	A	AG	3465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.013;NF=16;NR=49;PP=2477;ReadPosRankSum=0.618;SC=TGTTGGCATGAGGAGAACACA;SOR=0.745;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=144;TCF=39;TCR=105;TR=65;WE=23303100;WS=23303082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,118:0.50:237
chr10	23303253	rs1054052	T	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=0.571;SC=TCAATGTGCGTCCCTTCTCTC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=23303261;WS=23303243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr10	23408139	rs2296468	A	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=31;PP=1125;SC=GAGTGGGAACAGATCCTGCTG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=23408147;WS=23408129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	23482635	rs7918487	T	C	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=953;SC=CTGTCCAGGGTCCCCCTCCCC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=23482643;WS=23482625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	23482850	rs10828415	G	A	7484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=143;PP=2965;SC=TCCCAGACTCGGCTGAAGATC;SOR=1.280;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=81;TCR=143;TR=224;WE=23482858;WS=23482840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr10	23556110	rs4382803	A	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=16;PP=714;SC=GAGAGAAAAAACTTAAATACA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=23556118;WS=23556100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	23570792	rs11013364	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=11;NR=4;PP=303;SC=CCATTTACATATGTTTATAAT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=23570800;WS=23570782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	23609897	rs11013386	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=327;SC=ACCCTGCAGCCGTTATGACAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=23609905;WS=23609887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	23611188	rs5783834	TATTA	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=72;SC=AAGCTCTGTGTATTAATTACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=23611199;WS=23611185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	23632970	rs11013408	T	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=322;SC=CCGCTCGCTCTCCTGAGTCGG;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=23632978;WS=23632960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	23633566	rs2036917	C	A	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=969;SC=CGCAGCAGACCCGCAGCTCGG;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=23633574;WS=23633556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	23682580	rs12049727	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=293;SC=TTTCTGTGAATACTCTCTTCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=23682588;WS=23682570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	23729361	rs141182498	CA	GT	7801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=76;PP=2944;ReadPosRankSum=2.395;SC=ACCGAGCTGTCAGCAAGACGG;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=332;TCF=181;TCR=151;TR=168;WE=23729370;WS=23729351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,200:0.52:387
chr10	24564831	rs10764458	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=575;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CCTTCTGGTCCTGATATTCCT;SOR=1.685;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=27;WE=24564839;WS=24564821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr10	24564859	rs17583862	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=2.647;SC=CTGTCTTTCCATACCCCTCCC;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=16;WE=24564867;WS=24564849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr10	24669877	rs17506606	C	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GAGACGTCCGCTGATTCTTTG;SOR=0.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=31;WE=24669885;WS=24669867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr10	24783384	rs3818673	T	C	2867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr10	24783393	rs3818672	C	A	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.330;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,85:0.48:177
chr10	24813282	rs2297329	G	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=552;ReadPosRankSum=0.098;SC=TGAAAGGCACGGACGCAGCCC;SOR=0.323;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=39;WE=24813290;WS=24813272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr10	24813327	rs2297328	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1116;ReadPosRankSum=-1.210;SC=AAAAGGCCACAGCCGCAGAAG;SOR=0.613;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=137;TCF=80;TCR=57;TR=67;WE=24813335;WS=24813317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
chr10	24831505	rs867040	G	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.454;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=424;ReadPosRankSum=1.710;SC=TGGTGTGTAAGAAATATGCGT;SOR=2.737;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=20;WE=24831513;WS=24831495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr10	24832885	rs3748218	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=571;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGGACGCGACCGATGACCAGT;SOR=0.821;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=33;WE=24832893;WS=24832875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr10	24873369	rs1127893	C	G	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=21;PP=1267;SC=CTCTGCTTTACTGCCTGGGGT;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=24873377;WS=24873359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	24878042	rs9663520	C	A	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=632;SC=ATCTAGTATTCTTCTTATCAT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=24878050;WS=24878032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	24878129	rs7478260	G	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=32;PP=1328;SC=ATGCATTTGTGTATCAACCAT;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=24878137;WS=24878119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	24879281	rs10734053	A	G	4249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=57;PP=2338;SC=AGAATCGGGGATTTCTGCAGA;SOR=0.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=131;WE=24879289;WS=24879271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	24880712	rs10828678	G	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=570;SC=CTTAGGGAAAGATATTACAAC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=24880720;WS=24880702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	24889901	rs3748221	T	G	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=68;PP=2156;SC=AATATTTGGCTAAATCTTTGT;SOR=1.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=95;WE=24889909;WS=24889891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	24908686	rs3748222	T	C	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=39;PP=1701;SC=TAAATCTTGATTCCTTTGACT;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=79;WE=24908694;WS=24908676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	24924104	rs146603146	ATT	A	458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=-1.335;SC=ATAAAATAGTATTTGAGAGAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=24924113;WS=24924094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr10	25140411	rs1326192	G	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;QD=23.63;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	25231171	rs3748223	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=575;SC=GCAGCTCAGGAATAGGGTCCT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=25231179;WS=25231161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	25465327	rs11014433	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GTGCACGTGTGAGGAAGGAAC;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=15;WE=25465335;WS=25465317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	25684997	.	A	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=31.003;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=215;ReadPosRankSum=-0.377;SC=ATATACTATTATTACGAAGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=21;WE=25685005;WS=25684987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr10	25701341	rs2480345	C	G	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=41;PP=1269;SC=TCCTTCCAAGCCCTGTGTATG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=25701349;WS=25701331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	25755732	rs67115852	CACAT	C	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.431;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	25877859	rs144466352	TAAAC	T	506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.266;NF=11;NR=1;PP=454;ReadPosRankSum=0.833;SC=TGTTGAATAATAAACAAAATG;SOR=1.588;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=12;WE=25877870;WS=25877849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr10	25888180	rs10828833	A	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GAAAGAAGAGATCTGGGATAG;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=66;WE=25888188;WS=25888170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr10	26244089	rs1546700	T	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	26244096	rs1546699	G	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.55;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	26310403	rs56077277	CA	TG	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TCACAAATTTCACCTTTTGAT;SOR=0.508;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=35;WE=26310412;WS=26310393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr10	26310470	rs35010955	C	T	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=1037;ReadPosRankSum=2.529;SC=CCACTTATGACGCCAGATGTG;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=63;WE=26310478;WS=26310460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr10	26310506	rs34067308	C	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=976;ReadPosRankSum=0.639;SC=GTATCACGGCCATTGAGCTGG;SOR=0.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=67;WE=26310514;WS=26310496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,79:0.54:146
chr10	26310597	rs56210104	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=-1.899;SC=CTAACATTGGGTCCAGTATCT;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=28;WE=26310605;WS=26310587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr10	26310679	rs17666079	A	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-1.030;SC=GATATATTCCAACAAGTTGGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=26310687;WS=26310669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	26355771	rs3824703	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.924;SC=ATATATTAGGCTATTTTCTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=26355779;WS=26355761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	26355862	rs3824702	G	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr10	26355872	rs3824701	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr10	26355906	rs3824700	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=555;ReadPosRankSum=-2.602;SC=CTCCACAGACGTGAACGTATT;SOR=0.523;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=36;WE=26355914;WS=26355896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr10	26355992	rs3824699	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=622;ReadPosRankSum=-0.389;SC=AACCCTAGAAATTTTGGATGA;SOR=0.547;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=43;WE=26356000;WS=26355982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr10	26356014	rs3824698	CA	TG	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GTAAGAATTTCAGTTTAATTA;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=31;WE=26356023;WS=26356004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr10	26356037	rs3824696	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=0.538;SC=CTTAGACATTCCAGATGTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=27;WE=26356045;WS=26356027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr10	26356066	rs3824695	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-0.850;SC=ATAGAAGACACGGGTATTGGT;SOR=1.714;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=17;WE=26356074;WS=26356056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr10	26357625	rs3817421	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CTGTTTATTATTGTTTACTTT;SOR=0.233;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=26357633;WS=26357615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	26357747	rs35379457	CG	TA	3410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=2136;ReadPosRankSum=-0.307;SC=ATCAGATCTACGTCTATGTGG;SOR=0.855;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=65;WE=26357756;WS=26357737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr10	26357820	rs3817419	C	T	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=947;ReadPosRankSum=-0.749;SC=AAAGGTATGTCGTATGGGGTG;SOR=0.496;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=61;WE=26357828;WS=26357810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr10	26359180	rs3758441	T	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.086;NF=16;NR=14;PP=433;ReadPosRankSum=-1.521;SC=AATTTACCTCTTAGTTACTTA;SOR=0.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=30;WE=26359188;WS=26359170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr10	26359200	rs3834403	T	TA	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.242;NF=7;NR=13;PP=693;ReadPosRankSum=0.170;SC=AAATGTCACTTAATTTTGAGG;SOR=0.472;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=20;WE=26359208;WS=26359190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr10	26434455	rs33947968	G	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.388;SC=TCACCATTATGCAGGAAAGGT;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=20;WE=26434463;WS=26434445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr10	26436287	rs2368158	G	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=514;ReadPosRankSum=0.744;SC=TGTTGTTGATGATGATGATGG;SOR=0.470;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=26;WE=26436295;WS=26436277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
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chr10	26446312	rs3758449	G	A	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=1896;ReadPosRankSum=-0.616;SC=AAACCAAATAGTGAGCGTCAG;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=120;TCR=107;TR=123;WE=26446320;WS=26446302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,141:0.53:265
chr10	26455090	rs34918608	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CGATAACTGGGCTCTTGGAAA;SOR=1.072;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=16;WE=26455098;WS=26455080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr10	26455233	rs139978372	GAAGTAAAGTTAT	G	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TACAATAGAGGAAGTAAAGTT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=26455252;WS=26455223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	26457585	rs75423842	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=-0.037;SC=AGCACAGCACATAACTGCTTC;SOR=0.551;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=5;WE=26457593;WS=26457575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	26463043	rs3740231	A	T	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=65;PP=2009;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CTTTAAAAAAACTTTGGAACC;SOR=0.810;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=244;TCF=119;TCR=125;TR=122;WE=26463051;WS=26463033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,133:0.51:263
chr10	26463130	rs1999240	C	A	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;PP=1704;ReadPosRankSum=0.532;SC=AGTTACCCAGCGTGCACCGAT;SOR=0.663;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=84;TCR=91;TR=90;WE=26463138;WS=26463120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,97:0.51:191
chr10	26463587	rs3758447	C	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-0.013;SC=GTTTTATCTGCGTTGATGGGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=26463595;WS=26463577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	26506999	rs41304609	G	A	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=61;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CGGGTCCGGCGCTGAGAGCCG;SOR=1.070;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=171;TCF=33;TCR=138;TR=74;WE=26507007;WS=26506989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,79:0.43:184
chr10	26507030	rs8190597	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.602;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=759;ReadPosRankSum=1.622;SC=TCGAGGTGGCAGCGGAGGCGG;SOR=0.239;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=101;TCF=7;TCR=94;TR=41;WE=26507038;WS=26507020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,42:0.40:104
chr10	26512638	.	A	ATG	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GTGTATGTGCATGTGTGTGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=2;WE=26512646;WS=26512628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	26518479	rs2839676	T	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=589;ReadPosRankSum=-2.113;SC=AGTCAATAGGTTTTTCTTCTG;SOR=1.152;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=30;WE=26518487;WS=26518469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr10	26534809	rs1805398	G	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=598;ReadPosRankSum=-1.899;SC=GATCTTGTCTGTATATGGAAC;SOR=1.810;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=69;TCF=60;TCR=9;TR=32;WE=26534817;WS=26534799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr10	26534937	rs2839677	C	T	3354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=78;PP=2071;ReadPosRankSum=-1.821;SC=GAGGTGAGCACGCATCGGCAA;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=248;TCF=111;TCR=137;TR=140;WE=26534945;WS=26534927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,157:0.55:284
chr10	26559571	rs1556234	G	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=445;ReadPosRankSum=1.294;SC=TCGCACAGGGGTTTGTTCCTT;SOR=0.600;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=33;WE=26559579;WS=26559561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr10	26569755	rs8190748	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	26575221	rs8190770	A	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=586;ReadPosRankSum=-0.996;SC=TTACCAATATAAATCTAATAA;SOR=0.336;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=32;WE=26575229;WS=26575211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr10	26781355	rs1775245	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=422;ReadPosRankSum=-1.206;SC=ACTGGCAAATTGGAAAACAAA;SOR=0.530;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=33;WE=26781363;WS=26781345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr10	26781388	rs1775246	G	A	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=932;SC=GAATTTCATTGTAATATGACA;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=26781396;WS=26781378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	26790136	rs812007	T	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=0.658;SC=AGTTGGTACATCCAAAGATCT;SOR=1.009;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=10;WE=26790144;WS=26790126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr10	26986932	rs2448114	T	C	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=818;SC=TGAGGGGTGCTCGCGGTGGGA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=26986940;WS=26986922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	26990849	rs1677726	T	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=18;PP=716;SC=AGCCACAGAGTCAGAGCCACC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=26990857;WS=26990839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	26991037	rs1677725	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=42.83;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	26991045	rs1780186	T	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=42.83;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	26991067	rs71403882	CG	C	452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=361;SC=TTGGATGTAACGTAACTTGTT;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=26991075;WS=26991057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	26991179	rs1780185	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=82;SC=AAGACTTTTGGGGACTGTTCG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=26991187;WS=26991169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr10	27031392	rs34974619	AGATT	A	1382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.610;NF=18;NR=6;PP=1015;ReadPosRankSum=0.652;SC=AGAAATAAATAGATTTTCTCA;SOR=1.703;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=24;WE=27031403;WS=27031382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
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chr10	27059608	rs1324637	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TGCATGAACACAAACTATAGA;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8;WE=27059616;WS=27059598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	27128592	.	A	AAT	258	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.67;NF=3;NR=0;PP=258;QD=87.0;SC=AAAAAAAAAAAAAACATGCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=27128604;WS=27128582;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr10	27128595	.	A	AT	265.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.674;QD=22.14;ReadPosRankSum=2.722;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	27128596	rs76565453	C	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.566;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.951;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	27128635	rs10829091	G	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.276;NF=8;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=0.332;SC=ATCCCAATGCGTTGGGAGGTC;SOR=0.363;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=14;WE=27128643;WS=27128625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr10	27128828	rs10829092	G	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=66;SC=CTAAGGCAAGGGAACTGCTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=27128836;WS=27128818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	27128861	rs10829093	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=3;PP=49;SC=TGGGACCACAGTGAGCTATGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=27128869;WS=27128851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	27128878	rs10829094	G	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=52;SC=ATGATCACACGACTGCACTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=27128886;WS=27128868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	27303605	rs2274741	A	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-1.318;SC=TATTCTCTCTAAACTGCTCTA;SOR=0.562;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=10;WE=27303613;WS=27303595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr10	27317840	rs10829163	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=588;ReadPosRankSum=0.532;SC=TGCTTTTTGACTGTAACTTTT;SOR=0.373;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=37;WE=27317848;WS=27317830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr10	27318370	rs10829164	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=260;ReadPosRankSum=1.601;SC=TAAACCTTATCGGAACACAGT;SOR=0.460;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=15;WE=27318378;WS=27318360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr10	27326014	rs11015469	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TAAAAATCCTCGACACTTTCC;SOR=1.445;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=27326022;WS=27326004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	27326999	rs7096505	T	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=312;SC=GTTAAATATGTTTATCTTAAA;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=27327007;WS=27326989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	27329167	rs10829167	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=0.842;SC=AACACACTGTGCACTATAACA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=27329175;WS=27329157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	27349201	rs7083739	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	27349249	rs7080104	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TCCTTCCAAGATTAAATATAT;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=13;WE=27349257;WS=27349239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	27350056	rs11015496	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=284;ReadPosRankSum=0.221;SC=ACAAAAATACGCATTTTTTTT;SOR=0.851;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=21;WE=27350064;WS=27350046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr10	27350201	rs11015497	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=1.061;SC=AAGCTTTCAATATTGTAATAT;SOR=1.022;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=7;WE=27350209;WS=27350191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr10	27356071	rs115864032	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=2.220;SC=TATTCAGAGATATCCACTAAC;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=6;WE=27356079;WS=27356061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr10	27368126	rs3737055	A	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=607;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GAGTGAATTCATTTCTTTAAA;SOR=0.282;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=37;WE=27368134;WS=27368116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr10	27371623	rs10829173	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=0.579;SC=CTGTTGGGACGACTATATGGA;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=17;WE=27371631;WS=27371613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr10	27371647	rs10829174	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=0.273;SC=GCACATAATATGGTGTCTACC;SOR=0.472;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=18;WE=27371655;WS=27371637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr10	27375290	rs73596349	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=2.109;SC=CATAAATATCTACATGTAACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=27375298;WS=27375280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr10	27375559	rs66853312	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.017;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr10	27400861	rs9833	G	A	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=40;PP=1475;SC=AATGCTACTTGTATTCTTGCA;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=27400869;WS=27400851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	27401056	rs11015538	C	T	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=835;ReadPosRankSum=-1.824;SC=AGTCCTGAAACAGAAAAGGAG;SOR=0.691;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=63;WE=27401064;WS=27401046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr10	27405096	rs2297152	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=430;ReadPosRankSum=-0.128;SC=ATTTTAAAACATATCTTTAAG;SOR=1.038;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=36;WE=27405104;WS=27405086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr10	27405310	rs2480718	C	G	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=36;PP=1087;SC=AAAAAATAAGCAAAGAGGCTG;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=27405318;WS=27405300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	27405331	rs7901976	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=0.993;SC=GGTGCGGTGGCTCACGCCTGA;SOR=0.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=18;WE=27405339;WS=27405321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr10	27405360	rs35804170	G	GC	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=1.842;SC=ACTTTGGCAGGCGAGGTGGGT;SOR=1.034;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=27405368;WS=27405350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr10	27409555	rs10829190	G	A	4793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=77;PP=2943;SC=CCCTAATGACGTGACTGGGAA;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=69;TCR=77;TR=146;WE=27409563;WS=27409545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr10	27412669	rs2274743	A	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=0.284;SC=AAGTATTTTTAAAAAATCCCT;SOR=0.437;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=24;WE=27412677;WS=27412659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr10	27423744	rs2275752	T	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=1.070;SC=ACACGGATGGTGTCAATTCAA;SOR=0.696;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=28;WE=27423752;WS=27423734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr10	27431288	rs41282208	T	C	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=302;ReadPosRankSum=1.504;SC=TATTTTTTTTTCCACAATTTA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=21;WE=27431296;WS=27431278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr10	27434483	rs2274634	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=507;ReadPosRankSum=0.061;SC=CCAATTTTTAGTTCAGATAAT;SOR=1.041;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=33;WE=27434491;WS=27434473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr10	27436295	rs3780926	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=0.009;SC=ACAAACAAAGAAACTAGACTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=27436303;WS=27436285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	27436566	rs62622019	T	C	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1869;ReadPosRankSum=-0.056;SC=TGAAACAATGTTAAGCTTCGT;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=104;TCR=112;TR=114;WE=27436574;WS=27436556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,136:0.50:272
chr10	27437994	rs10764675	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=595;ReadPosRankSum=0.094;SC=AAGTTAAAAACTAAGTAGTTT;SOR=0.430;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=43;WE=27438002;WS=27437984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr10	27442244	rs76009984	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=0.193;SC=TTAAAATGAGGGGGAGTAAAA;SOR=1.206;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=20;WE=27442252;WS=27442234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr10	27444303	rs3824593	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=1.335;SC=GTTGGCGGGAGTGGCTGCTCG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=27444311;WS=27444301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	27444328	rs7919803	CT	AC	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=1.229;SC=GGGGCAGTGTCTGCGGGGCCG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=27444337;WS=27444318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr10	27444578	rs41282218	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=524;ReadPosRankSum=1.032;SC=GGGGTTAGGCCCTTCGGCCCT;SOR=1.683;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=32;WE=27444586;WS=27444568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
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chr10	27454111	rs7068375	A	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1069;ReadPosRankSum=0.428;SC=TAAGTACTTGAGAAGAAAATT;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=79;WE=27454119;WS=27454101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,88:0.53:165
chr10	27456003	rs788238	G	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=27;PP=1735;SC=GCTGTAACATGGAATTCAATA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=27456011;WS=27455993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr10	27459746	rs3802526	C	G	2367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1641;ReadPosRankSum=0.389;SC=AAAGACCTCACCAAAAGGTGT;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=99;WE=27459754;WS=27459736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,111:0.47:238
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chr10	27475275	rs73598041	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=15;PP=1012;ReadPosRankSum=1.143;SC=TAGGTAATGATATCATACTGT;SOR=0.551;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=117;TCF=91;TCR=26;TR=59;WE=27475283;WS=27475265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr10	27475444	rs10741130	T	C	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=74;PP=1696;ReadPosRankSum=1.411;SC=AGCACCTGACTGTATCTGGAT;SOR=0.608;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=241;TCF=94;TCR=147;TR=125;WE=27475452;WS=27475434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,136:0.49:277
chr10	27475494	rs10764686	T	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=992;ReadPosRankSum=-1.507;SC=AGTCTAGCCTTGTGTTATAGA;SOR=0.691;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=119;TCF=25;TCR=94;TR=64;WE=27475502;WS=27475484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
chr10	27493989	rs111621130	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=CCAGGAGGCAGAGCTTGCAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=27493997;WS=27493987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	27497074	rs7919523	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=269;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CTAAAAAAATCAGTAAAATAC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=22;WE=27497082;WS=27497064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr10	27506854	rs1775355	C	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=30;PP=2158;SC=CCTATAATTACTAAAAGACTA;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=95;WE=27506862;WS=27506844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	27508837	rs788213	T	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=45;PP=1271;SC=TACAATAATGTCATAATTTCC;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=27508845;WS=27508827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	27529549	rs2797078	C	A	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CCTCCTCCCCCGGGGCGTGAC;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=101;WE=27529557;WS=27529539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,115:0.51:227
chr10	27529565	rs2489372	T	C	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=1853;ReadPosRankSum=0.525;SC=GTGACTAAGGTCACGAATCCG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=112;WE=27529573;WS=27529555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,123:0.47:260
chr10	27538797	rs16927663	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=586;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TGAATGTTCCGGAGATTGAGC;SOR=0.872;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=36;WE=27538805;WS=27538787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr10	27539507	rs7896532	C	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=8;PP=278;SC=GTTCACGCTCCGTAGGATGAC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=27539515;WS=27539497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	27551966	rs113074964	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=1.844;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr10	27551971	rs112088119	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=1.759;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr10	27570130	rs1252880	C	T	41.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.69;MQRankSum=-0.674;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	27577568	rs2780686	G	A	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=16;PP=804;SC=TCTCCACACTGTAGCTTACAT;SOR=1.390;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=27577576;WS=27577558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	27577615	rs11015640	T	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.344;NF=13;NR=17;PP=447;ReadPosRankSum=-1.789;SC=GGAAGAGTGCTGAAAAGATTG;SOR=0.759;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=30;WE=27577623;WS=27577605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr10	27577640	rs3818746	G	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.989;NF=9;NR=15;PP=403;ReadPosRankSum=-1.859;SC=AACTGTTAGCGATAGCTCCTC;SOR=1.071;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=24;WE=27577648;WS=27577630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr10	27595356	rs7085523	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=369;ReadPosRankSum=-1.521;SC=GACAAATTTTCGCAGTAAAAA;SOR=0.065;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=23;WE=27595364;WS=27595346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr10	27623140	rs7088108	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.119;NF=3;NR=30;PP=714;ReadPosRankSum=1.649;SC=CTTTTGTTTATATTCCAAAAG;SOR=1.545;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=33;WE=27623148;WS=27623130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr10	27687225	rs2505323	A	G	3867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=56;PP=2628;SC=CGTCGTAATTAGAATAACAAT;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=122;WE=27687233;WS=27687215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr10	27687775	rs1638630	T	C	6606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=78;PP=2965;SC=AAAACAAACTTATTGGATGGA;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=124;TCR=78;TR=202;WE=27687783;WS=27687765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr10	27687965	rs2505327	A	G	5376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=90;PP=2965;SC=TAACAGGGTCATTCCTGTATA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=77;TCR=90;TR=165;WE=27687973;WS=27687955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr10	27687994	rs2484173	A	G	5437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=93;PP=2965;SC=AACATTGTACAGACCTAAAAG;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=168;WE=27688002;WS=27687984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr10	27688109	rs2429485	T	C	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=56;PP=1736;SC=TCGTATGTCATCTGCAAGGTT;SOR=1.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=27688117;WS=27688099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	27688189	rs2484174	G	A	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.15;QD=28.06;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	27692062	rs2429491	T	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=319;SC=AGAGCCACCTTAATACAATTC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=27692070;WS=27692052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	27692099	rs2484179	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=540;SC=CCCCTACCCCACCACATACAC;SOR=2.546;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=27692107;WS=27692089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	27692279	rs2484180	A	C	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=72;PP=2305;SC=TTTCGTATGCAGTCAAACCTG;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=131;WE=27692287;WS=27692269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	27692360	rs183634324	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=577;ReadPosRankSum=0.427;SC=CTTGACTTGGACACCTAGTCA;SOR=0.735;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=34;WE=27692379;WS=27692350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr10	27692371	rs2484181	T	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1174;SC=CACCTAGTCATAAATCTCTAA;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=27692379;WS=27692350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	27692403	rs2505307	C	A	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=625;SC=CCACACATATCTGCTGGAGAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=27692411;WS=27692393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	27700887	rs2429499	G	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=16;PP=524;SC=CAGATAAATAGCTTTTAATTA;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=27700895;WS=27700877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	27702256	rs112067123	G	GC	8470.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=118;PP=2975;SC=TTCCTAGGCTGCCCCCCAAGA;SOR=0.832;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=33;TCR=130;TR=149;WE=27702264;WS=27702246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr10	27820475	.	G	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=794;ReadPosRankSum=0.728;SC=TGCATCAGCAGACTGCAAACT;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=59;WE=27820483;WS=27820465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr10	27822619	rs72264716	TTC	T	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=0.393;SC=ACGCCATTGCTTCTTTCTTTA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=27822628;WS=27822609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	27964470	rs2253230	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=833;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TATTGGATCCGTTTTCCAGAG;SOR=0.567;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=61;WE=27964478;WS=27964460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,65:0.44:148
chr10	28032136	rs2252651	C	T	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=648;SC=GCGGGCAGGGCCCCCAGGGGA;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=28032144;WS=28032126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	28142245	rs7898085	A	G	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=23;SC=GCAGTGAGCCAAGATCGTTGT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=28142253;WS=28142235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	28151604	rs34181914	AT	A	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=898;SC=ACATTTAGGCATTTTTTAAGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=27;WE=28151612;WS=28151594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	28225897	rs2297646	G	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=46;PP=1324;SC=CTAGTAGCTAGGAAACTTCTT;SOR=1.395;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=28225905;WS=28225887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	28228865	rs7893462	A	G	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=60;PP=2135;SC=GCAGCTGCTCATTCTCACTAT;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=118;WE=28228873;WS=28228855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	28233120	rs3824590	A	C	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=748;SC=GGCTGGCACTAGATGACGATG;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=28233128;WS=28233110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	28233469	rs3802517	T	A	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=229;SC=TAAGAAATCATTTCCATTCCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=28233477;WS=28233459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	28233931	rs34717952	G	A	8355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	28233931	.	GCA	ACG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=48;NR=95;PP=2947;QD=20;SC=AAGGAACACCGCATTCCCATA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=149;TCF=52;TCR=97;TR=143;WE=28233941;WS=28233921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,143:0.96:149
chr10	28233933	rs34084011	A	G	8355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.16;SOR=1.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr10	28247957	rs34350686	A	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=831;SC=GGACTCTCTTAATTCATCTTC;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=28247965;WS=28247947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	28259932	rs374041665	TAAATAAACAAAC	T	801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=69.56;QD=38.18;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	28276273	rs3808909	G	A	4363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=53;PP=2824;SC=CAGCAAGATTGTTTCTAAAAG;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=142;WE=28276281;WS=28276263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	28348815	rs1361922	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=406;SC=TAATAAAATACAGTAAGCTGT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=28348823;WS=28348805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	28378758	rs2997211	T	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.291;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=554;ReadPosRankSum=1.544;SC=ACGAAAACTTTTTCTAAAACC;SOR=2.376;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=27;WE=28378766;WS=28378748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr10	28436534	rs11006897	A	G	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1418;ReadPosRankSum=-1.108;SC=ATTTAGTAAGAGCATTGTGGG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=71;TCR=99;TR=89;WE=28436549;WS=28436524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr10	28438835	rs72381252	TCTGCA	T	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=474;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CACGCATCTGTCTGCACTAGG;SOR=0.616;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=28438847;WS=28438825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	28527425	rs56069980	C	CA	2570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=2039;ReadPosRankSum=1.972;SC=TTGCTTAAAGCATGCTGTATT;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=49;WE=28527433;WS=28527415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,81:0.58:139
chr10	28822373	rs12767429	A	C	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=55;SC=CTGGGAGCTGATGAGAGTCGC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=28822381;WS=28822363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	28827096	rs116949776	A	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=298;ReadPosRankSum=-1.395;SC=ATATTTAGTCATTATAATTTG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=18;WE=28827104;WS=28827086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr10	28899841	rs11371837	A	AT	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.14;MQRankSum=0.723;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr10	28903400	rs71391055	G	GTCTTCTTTAAAACA	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=2169;SC=GAACTTGACTGCCACATTTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=28903408;WS=28903390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	28905079	rs332176	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=432;ReadPosRankSum=2.015;SC=TAAACATACTACACATTCAAT;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=27;WE=28905087;WS=28905069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr10	29136129	rs813935	A	G	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=61;PP=2965;SC=CTGAGCTCAAATAGTCCTCCT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=87;TCR=61;TR=148;WE=29136137;WS=29136119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr10	29137085	rs787323	C	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=133;SC=CTCTTGTGCACGGGATGGGGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=29137093;WS=29137075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	29162324	rs35236571	TAC	T	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.35;QD=34.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	29577924	rs2768670	G	C	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=274;SC=TAGAATTCTAGCATCTCTAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=29577932;WS=29577917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	29578084	rs17851935	A	G	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=30;PP=1042;SC=TCACCGACTAAGTGGAGCAGT;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=29578092;WS=29578074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	29578180	.	A	ATGAAGCCAACTGTCTC	1927.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=1527;SC=AATTACTCTTATGAGAACCAG;SOR=1.071;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=4;WE=29578188;WS=29578170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	29578351	rs2768693	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.59;MQRankSum=2.799;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	29580735	rs2148901	C	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.52;QD=44.22;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	29580743	rs2148902	G	A	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.48;QD=42.71;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	29581309	rs1751955	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.868;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.147;NF=17;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GCCCCCTGGGCGCATGCCCGC;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=17;WE=29581317;WS=29581299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr10	29581440	rs3818550	C	T	3747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.676;NF=83;NR=58;PP=2202;ReadPosRankSum=0.007;SC=TGGCTTTCCCCCCTCCAGGGA;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=273;TCF=158;TCR=115;TR=141;WE=29581448;WS=29581430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,171:0.53:321
chr10	29581493	rs3818551	A	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.850;NF=68;NR=66;PP=1573;ReadPosRankSum=-1.456;SC=ACCACAGCCCAGACGGTCCTG;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=304;TCF=153;TCR=151;TR=134;WE=29581501;WS=29581483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,149:0.43:349
chr10	29598896	rs2796293	A	G	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=44;PP=2965;SC=TAATGAAAATAAGATTGTGGC;SOR=2.117;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=131;TCR=44;TR=175;WE=29598904;WS=29598886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr10	29779977	rs61848920	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQRankSum=-5.350;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.316;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,8:0.14:56
chr10	29783813	rs6481600	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=499;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GAGATTCTGAGAGCAAAGCCT;SOR=0.947;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=32;WE=29783821;WS=29783803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr10	29783885	rs1056782	A	G	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.191;NF=29;NR=29;PP=836;ReadPosRankSum=2.546;SC=AGCCTGTCCAACTTCAGGTCC;SOR=0.516;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=58;WE=29783893;WS=29783875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr10	29783908	rs78773460	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-0.204;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.744;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,25:0.17:145
chr10	29783984	rs3031505	GAAACT	G	2299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.107;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.029;NF=5;NR=37;PP=1889;ReadPosRankSum=-3.048;SC=CTTCTGATCAGAAACTGCTTG;SOR=2.291;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=42;WE=29783996;WS=29783974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr10	29784004	rs28427082	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.003;NF=14;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=3.449;SC=GGCGTGGCCGGGGCCTTGGCG;SOR=0.171;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=29;WE=29784012;WS=29783994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr10	29784072	rs2368406	G	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=12.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.40;MQRankSum=-1.173;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.690;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr10	29784114	rs6481601	T	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=309;SC=GCCAAACCTGTGGAACACACA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=29784122;WS=29784104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	29785191	rs11007625	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=261;ReadPosRankSum=0.579;SC=TTGATTGATGGTGTCAATAAA;SOR=0.349;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=19;WE=29785199;WS=29785181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr10	29822032	rs1247696	C	T	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=38;PP=2297;SC=GACTCGCAGACATGGAGAACT;SOR=1.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=114;WE=29822040;WS=29822022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	29891321	rs2505901	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CCCTCCCTTCTCTGCTGTGGG;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=15;WE=29891329;WS=29891311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr10	29932841	rs2488690	C	T	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=674;SC=GTGAACTTGCCAGGGGTGAGC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=29932849;WS=29932831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	29932918	rs2488689	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=33;PP=1491;SC=GCAACATCGCGTTCCTGGACA;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=29932926;WS=29932908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	30314880	rs73598338	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=547;ReadPosRankSum=-1.020;SC=ATAATTCTTCGAAAATGAGGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=30;WE=30314888;WS=30314870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr10	30316208	rs2185724	T	C	6330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=95;PP=2965;SC=TCCAGGTGTCTCTTCTCTGCA;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=105;TCR=95;TR=200;WE=30316216;WS=30316198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr10	30316872	rs3739996	T	C	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=1496;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CGGTAGGGAATGCTGTGTGCG;SOR=0.921;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=115;WE=30316880;WS=30316862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,134:0.49:274
chr10	30317826	rs7920682	A	G	11001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=108;PP=2965;SC=CGAAGCCGTCATAGGCAGTGA;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=119;TCR=108;TR=227;WE=30317846;WS=30317816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr10	30317838	rs7920686	A	G	10856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=106;PP=2965;SC=AGGCAGTGACAGGTCGGGGAT;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=220;WE=30317846;WS=30317816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr10	30611614	rs2484284	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=593;SC=AAATTAAACTCAAACCAAGAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=30611622;WS=30611604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	30615638	rs1029172	A	G	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=217;SC=TTTGTAAAAGAATGCTCTAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=30615646;WS=30615628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	30626003	rs12221163	C	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=125;SC=AAGTACAGGTCGCATAAAAAG;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=30626011;WS=30625993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	30629082	rs2689215	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=581;SC=GTAGCTTGAACATTTTACAGG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=30629090;WS=30629072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	30637995	rs10826783	C	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=9;PP=1280;SC=CCCGTGATCCCAGACTCCTCG;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=62;WE=30638003;WS=30637985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	30653561	rs7094285	C	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=404;SC=TTGGAGAGAGCGGGGCGGGGA;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=30653569;WS=30653551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	30728101	rs1042058	T	C	2486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=62;PP=1486;ReadPosRankSum=-2.011;SC=CAGTCAGATATGGAACTGTGG;SOR=0.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=231;TCF=109;TCR=122;TR=108;WE=30728109;WS=30728091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,120:0.46:261
chr10	30728250	rs2907	A	G	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1243;ReadPosRankSum=1.778;SC=CAGCTTTCCTACTGCAGCTTC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=92;TCR=114;TR=86;WE=30728258;WS=30728240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,109:0.44:250
chr10	30739058	rs303428	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-1.362;SC=TGGGCAGTCCATTTTCACACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=30739066;WS=30739048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	30747197	.	C	CG	317.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;QD=21.18;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	30749895	rs3034	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=216;SC=CCTGTGACCCGTGAATGTGCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=30749903;WS=30749885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	30901722	rs3832672	GC	G	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.591;NF=24;NR=0;PP=851;ReadPosRankSum=1.761;SC=GCCCATGACAGCCCAAGTCTT;SOR=2.786;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=24;WE=30901730;WS=30901712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr10	30901756	rs9954	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.053;NF=35;NR=4;PP=837;ReadPosRankSum=1.071;SC=CTTACCAATAGTTCATTCCTT;SOR=1.734;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=39;WE=30901764;WS=30901746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr10	30915637	rs3864847	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.433;NF=12;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=-2.080;SC=CAGGGAGTGTAGCCAGGACCT;SOR=0.144;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=15;WE=30915645;WS=30915627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr10	30918486	rs75095145	G	A	5563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-8.180;QD=17.33;ReadPosRankSum=4.111;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,146:0.45:321
chr10	30918492	rs76101300	G	T	5584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=0.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-8.334;QD=17.13;ReadPosRankSum=5.098;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,147:0.45:326
chr10	30918549	rs201069868	G	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.710;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.042;NF=30;NR=48;PP=1609;ReadPosRankSum=-1.180;SC=GGTGCCTGCCGCAGAGGCTGA;SOR=1.104;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=76;TCR=108;TR=78;WE=30918557;WS=30918539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,93:0.42:220
chr10	30918597	rs74551644	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=45.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQRankSum=-7.467;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.895;SOR=5.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,25:0.19:133
chr10	30964324	rs12779074	G	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.600;NF=8;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TCTGCGGTCAGGGAATGAGTT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=30964332;WS=30964320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	30974174	rs4749580	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.291;NF=17;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTTTCTCTTCTGTACATTTAT;SOR=1.681;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=22;WE=30974182;WS=30974164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr10	30978106	rs2368405	G	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=1.097;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.097;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr10	30978112	rs2887239	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQRankSum=0.900;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	30978114	rs4747722	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQRankSum=0.563;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr10	30982475	rs7084628	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.284;NF=16;NR=3;PP=246;ReadPosRankSum=-3.512;SC=CCCAAGCGCCAGGTTCAGGCC;SOR=2.117;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=19;WE=30982483;WS=30982465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,13:0.18:73
chr10	30982526	rs7068784	T	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.758;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.743;NF=27;NR=17;PP=703;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AGAGAAGATCTCCTTCAGGAA;SOR=1.682;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=44;WE=30982534;WS=30982516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,39:0.30:130
chr10	30985070	rs11008186	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CACGTAAGGAGTCCTGACTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=30985089;WS=30985060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	30985081	rs10826846	G	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=TCCTGACTGTGTAATTCATCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=30985089;WS=30985060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	30986240	rs138927815	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=42.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	30986242	rs11008188	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=42.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	30986244	rs11007616	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=45.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	30986253	rs4747726	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=37.70;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	30986296	rs4749587	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=7;PP=420;SC=GTGTCTGCCTCGTGTTCAGGA;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=30986304;WS=30986286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	30986348	rs4749588	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.831;NF=13;NR=10;PP=341;ReadPosRankSum=0.599;SC=CTCGAGCTTCGGCGCTCAATA;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=23;WE=30986356;WS=30986338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr10	30986364	rs7078530	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=0.396;SC=CAATAGTGGGGACTGCTTCCT;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=17;WE=30986372;WS=30986354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr10	30989188	rs10740829	G	C	6770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=126;PP=2965;SC=CCGCTTATCCGCAGGTACTAC;SOR=1.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=80;TCR=126;TR=206;WE=30989196;WS=30989178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr10	30993404	rs11008192	G	A	3059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=52;PP=2151;ReadPosRankSum=1.291;SC=TGCCCCAGACGACAGCAGGTG;SOR=0.964;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=237;TCF=123;TCR=114;TR=124;WE=30993412;WS=30993394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,140:0.47:295
chr10	30993448	rs10826848	G	A	7182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=122;PP=2965;SC=GGCTGTGGCTGTGGCCTGGTG;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=98;TCR=122;TR=220;WE=30993456;WS=30993438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr10	30998364	.	T	C	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=699;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GGAAGATCTATACAGCGTGCC;SOR=1.033;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=50;WE=30998372;WS=30998354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr10	31001494	rs1826619	A	C	9004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=137;PP=2965;SC=CAGGAAAAAAATCTCAAGAAG;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=129;TCR=137;TR=266;WE=31001502;WS=31001484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr10	31134214	rs3740236	A	G	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1323;ReadPosRankSum=-1.658;SC=TTGGACATGCATGTGATTCCT;SOR=0.980;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=197;TCF=104;TCR=93;TR=92;WE=31134222;WS=31134204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr10	31134557	rs17229657	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=1.396;SC=GCAATTGGAATCTTTCCTCTC;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=19;WE=31134565;WS=31134547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr10	31138817	rs10160116	G	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=1102;ReadPosRankSum=0.049;SC=AATGGACTGGGTTTGTACAGG;SOR=0.422;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=67;WE=31138825;WS=31138807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr10	31146615	rs16932010	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=901;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTACTATCCATAGGACTCTGA;SOR=0.427;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=62;WE=31146623;WS=31146603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,81:0.50:163
chr10	31146643	rs4237394	T	C	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1275;ReadPosRankSum=1.866;SC=AGAAAGGCTGTTGGATATTTG;SOR=0.983;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=76;WE=31146651;WS=31146633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,87:0.51:172
chr10	31166088	rs10763848	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GTTTTTTAAAGTTTGTTTTAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=31166096;WS=31166078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr10	31803516	rs220060	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=276;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TAAAATACCAGTTCTTTTCTT;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=19;WE=31803524;WS=31803506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr10	32103077	rs2799012	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.43;MQRankSum=0.772;NF=12;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=0.189;SC=CTGCACAGCCCTTTTGTAACA;SOR=0.399;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=15;WE=32103085;WS=32103067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	32106851	rs2778650	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GAGTATGGTCAGTTTGTGCTT;SOR=0.596;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=15;WE=32106859;WS=32106841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr10	32115133	rs2255544	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CACACTAGCTATAACTATAAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=32115141;WS=32115129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	32143208	rs2808090	A	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=0.606;SC=TCTAATAAATAAATTTTACTT;SOR=0.242;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=21;WE=32143216;WS=32143198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr10	32306872	rs211376	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=0.615;SC=AAATGGCTCAGGGTATAAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=32306880;WS=32306862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr10	32307534	rs11428920	T	TA	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=446;SC=TTTTATTCTGTATATTGTACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=32307544;WS=32307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	32307536	rs55938482	T	A	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=288;SC=TTATTCTGTATATTGTACTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=32307544;WS=32307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	32311969	rs176924	A	G	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=46;PP=1436;SC=AGGCTGCTGTAAGGAAAAAGT;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=32311977;WS=32311959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	32321495	rs398686	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.143;SC=TAAAAATTCACTTTATCCATG;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=7;WE=32321503;WS=32321485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	32323591	rs211277	G	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=283;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TTAACAAACTGAAGATGACAA;SOR=0.919;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=21;WE=32323599;WS=32323581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr10	32327779	rs45615333	C	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=0.706;SC=TAAAAAAACACCGATCAACTA;SOR=0.939;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=15;WE=32327787;WS=32327769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr10	32328389	rs41289023	A	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=-1.961;SC=AGACTTCTTAAATAAATTATA;SOR=0.732;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=18;WE=32328397;WS=32328379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr10	32337283	rs887492	A	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.843;SC=TCTGCAATTAACTTAGAAGAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=32337291;WS=32337273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr10	32575793	rs2986931	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.265;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=880;ReadPosRankSum=-0.786;SC=AATCCAAATTATTTAATTTTG;SOR=0.318;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=47;WE=32575801;WS=32575783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr10	32742234	rs2505335	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=-1.125;SC=ATTTTAAACTATTAAAGTATC;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=32742242;WS=32742224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	32742256	rs2490505	T	G	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=3;PP=221;SC=AATTGGCTTTTATTTTTTTTT;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=32742264;WS=32742246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	32745396	rs2244153	A	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=349;SC=GCATTGGAAAACATTATTTAT;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=32745404;WS=32745386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	32751901	rs2505380	G	A	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=35;PP=1346;SC=TGCAATTTAAGTAGTCACTAT;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=32751909;WS=32751891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	32759918	rs2460710	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TAATAAAGGAGATAATGAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=32759926;WS=32759912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr10	32763113	rs2002079	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TCTTAGTTAAGGATACGTGTT;SOR=3.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=4;WE=32763121;WS=32763103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	32781030	rs2990982	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	32806972	rs2990984	C	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=605;ReadPosRankSum=-1.809;SC=TAGAAATTGTCAGGATACATA;SOR=0.451;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=34;WE=32806980;WS=32806962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr10	32807550	rs3006708	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=0.527;SC=TTAATAATTCGTAGCAGCTAT;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=32807558;WS=32807540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr10	32832214	rs2990986	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=299;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TCTGGCTTATGTAAAATTATA;SOR=1.563;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=20;WE=32832222;WS=32832204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr10	32856746	rs12268559	A	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=425;ReadPosRankSum=0.178;SC=CCATTGGAGAAAGAAACAAGA;SOR=1.182;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=25;WE=32856754;WS=32856736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr10	32856937	rs12783494	T	G	65.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	32974969	rs1762526	A	G	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=40;PP=1348;SC=CAAATTACAAATAAAGAAACA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=32974982;WS=32974959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	32978136	rs1763784	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=1.244;SC=TTAAAAGTAAGTTCATCCGAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=32978144;WS=32978126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr10	33015782	rs928701	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=354;SC=AATTATAGATGACTTTAAATT;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=33015790;WS=33015772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	33015855	rs4145863	G	A	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=122;SC=ATTTTAGCATGTATTTTATGG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=33015863;WS=33015845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	33018351	rs1414548	G	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=346;SC=AATCTCAAACGAAGAAACTTC;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=18;WE=33018359;WS=33018341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr10	33123774	rs11009107	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=257;ReadPosRankSum=1.375;SC=AAGGTGTTAATGGAAAAGATA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=18;WE=33123782;WS=33123764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr10	33123824	rs4448627	G	C	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=27;PP=973;SC=AAGAGTCATGGAGGTAAGAAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=33123832;WS=33123814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	33134696	rs145287806	T	TAC	116.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=208;SC=CTTCCATAATTACACACACAC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=33134704;WS=33134686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	33137515	rs2488294	T	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr10	33137551	rs2504011	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=0.330;SC=AACAAAGATATGTCCGTACAA;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=29;WE=33137559;WS=33137541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr10	33143396	rs1418538	G	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=16;PP=696;SC=GACCAATACAGTTGGAAAACC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=33143404;WS=33143386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	33165226	rs2488305	G	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=243;SC=TATATCAACTGGAGTAAAATT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=33165234;WS=33165216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	33190567	rs2153875	C	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTTCACCCTACAACAAAAAAA;SOR=1.080;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=7;WE=33190575;WS=33190557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr10	33196108	rs80132666	GA	G	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=0.079;SC=GATTTCATCAGAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=33196116;WS=33196098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	33200468	rs17851763	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.583;NF=21;NR=7;PP=491;ReadPosRankSum=1.756;SC=CACCACACTCGCAGATGCCCC;SOR=0.462;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=28;WE=33200476;WS=33200458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr10	33201123	rs72784068	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.454;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=575;ReadPosRankSum=-2.192;SC=ATGGCCAAACAGGAACAGCTC;SOR=0.095;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=17;WE=33201136;WS=33201113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr10	33201128	rs2504020	C	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.363;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=870;ReadPosRankSum=1.982;SC=CAAACAGGAACAGCTCTAGTC;SOR=2.814;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=18;WE=33201136;WS=33201113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr10	33209266	rs2230396	G	T	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=34;PP=1247;SC=TTATTGTTACGCCTTCTGACA;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=33209274;WS=33209256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	33211440	rs2252752	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TAAAAATTAATATAAACCACT;SOR=0.842;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=8;WE=33211448;WS=33211430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	33219008	rs2256455	T	G	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=TAAATGAAAATTGTAATGGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=33219016;WS=33218998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	33469181	rs1048804	A	G	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CCCCCAGGGCACTCATGGCTA;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=82;TCR=104;TR=88;WE=33469189;WS=33469171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,103:0.46:223
chr10	33471761	rs148435065	GCA	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=250;ReadPosRankSum=-2.042;SC=TTAGGTACATGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=33471770;WS=33471751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	33481478	rs2243920	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TGAAAATTCCAGGAAAGCCAG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=33481486;WS=33481468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr10	33483561	rs2474726	T	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=273;ReadPosRankSum=1.114;SC=CCGCTCTAAGTTTTTGTATTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=33483569;WS=33483551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	33483837	rs149169549	CAT	C	780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.082;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=600;ReadPosRankSum=-0.044;SC=ATGAAACAAACATATAGGACT;SOR=2.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=15;WE=33483846;WS=33483827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr10	33484577	rs2474724	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.765;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=652;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TAGACCTGACCCCTGGCTTGA;SOR=0.108;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=35;WE=33484585;WS=33484567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr10	33486667	rs10827208	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.398;SC=ACATGCAAAAATAAGAAAACA;SOR=1.355;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=18;WE=33486675;WS=33486657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr10	33491552	rs11009288	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.136;SC=TTAGCCATGGGGAAATTCTTA;SOR=1.112;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=8;WE=33491560;WS=33491542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr10	33495267	rs11812166	C	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=884;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CATTCTTGGTCTGTGTTGATA;SOR=0.634;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=56;WE=33495275;WS=33495257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr10	33495304	rs11815912	A	G	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,59:0.41:144
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chr10	33495306	rs2474715	A	G	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.296;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
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chr10	33552696	rs7079053	A	G	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=50;PP=2082;SC=CATCTTTGGCACAAAGACAAT;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=105;WE=33552704;WS=33552686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	33619562	rs1411924	C	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=227;SC=TTGTACACACCGACTTCCCCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=33619570;WS=33619552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	34408636	rs11009651	T	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=933;ReadPosRankSum=0.224;SC=ACACCGAGTGTCGCCCGCTCT;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=57;WE=34408644;WS=34408626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr10	34408745	rs3004928	A	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=337;ReadPosRankSum=0.436;SC=CTCCATTTCGATTCTTATGAA;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=23;WE=34408753;WS=34408735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr10	34688287	rs2796011	G	A	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=58;PP=2267;SC=AAGGCACTACGTGGATTCCCA;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=111;WE=34688295;WS=34688277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	34739166	rs982687	T	C	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1031;ReadPosRankSum=0.988;SC=TCACCAGTGATTGAGATGGGA;SOR=0.389;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=69;WE=34739174;WS=34739156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr10	34985197	rs5784425	C	CA	2244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=6.682;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.19;MQRankSum=2.082;QD=20.98;ReadPosRankSum=-2.385;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,96:0.90:107
chr10	35324076	rs2244174	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=12;PP=1201;SC=GGAGGAAAACATTGCAGTTTC;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=35324084;WS=35324066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	35490261	.	A	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=483;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GGGGAAGAGGAAGGGAACTAA;SOR=0.799;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=34;WE=35490269;WS=35490251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,46:0.39:117
chr10	35857933	rs188336029	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=361;ReadPosRankSum=1.533;SC=GTGAGCAATGGACGCAGATAT;SOR=0.230;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=19;WE=35857941;WS=35857923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr10	35894666	rs627267	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=44;PP=1321;SC=TCAGTGTGCAAGCACCAAGCT;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=35894674;WS=35894656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	35894761	rs637881	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=299;SC=GAATGGTTCCGCGGTTCCTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=35894769;WS=35894751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	35928224	rs625858	C	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=266;SC=CTGCACTTGGCTCTCCTCGCC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=35928232;WS=35928214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	35929140	rs73270586	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TGGCCATGCCGAAGAAGTAGA;SOR=1.234;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=177;TCF=73;TCR=104;TR=74;WE=35929148;WS=35929130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,92:0.42:220
chr10	35930412	rs142623421	C	CG	195.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9229;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.447;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=2.362;SC=AGAGGGGTGCCGGGGGGGGGG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=35930420;WS=35930402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	36811687	.	G	GGT	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=67;QD=38.5;SC=CATACACAAAGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=36811695;WS=36811677;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr10	36813198	rs2503082	A	G	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=60;PP=1806;SC=GGGCTGGCCCAGCAGGGAAAG;SOR=1.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=83;WE=36813206;WS=36813188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	37421199	rs34042320	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.400;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=553;ReadPosRankSum=-0.688;SC=CTATCCATAACGAAAAGAAGT;SOR=1.036;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=43;WE=37421207;WS=37421189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr10	37425688	rs34201748	G	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=511;ReadPosRankSum=0.438;SC=AAAAAGCAATGTGTAAATAGC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=30;WE=37425696;WS=37425678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr10	37433853	.	T	C	125	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=27;MQ=55.83;NF=8;NR=2;PP=125;QD=15.9771212547;SC=TGAAAATAGATTTGTATATGT;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=10;WE=37433861;WS=37433843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,10:0.26:38
chr10	37434077	rs115413281	A	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=12.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=-4.256;QD=6.84;ReadPosRankSum=2.563;SOR=0.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr10	37434082	rs201494283	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=8.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-4.133;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.925;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	37434091	rs199688969	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-3.735;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.565;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	37453909	rs11011055	G	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AAGAACATATGGGCCACAGAG;SOR=0.027;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=10;WE=37453917;WS=37453907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr10	37488689	rs1209750	G	C	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.62;MQRankSum=-1.558;NF=35;NR=27;PP=900;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AACAAAAGAAGGTTGAAGAAA;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=62;WE=37488697;WS=37488679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,67:0.55:121
chr10	37505099	rs34285151	C	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=299;ReadPosRankSum=0.451;SC=GTATCTCCTCCTTGAGACAGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=15;WE=37505107;WS=37505089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr10	37505159	rs34552277	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=467;ReadPosRankSum=1.443;SC=TTGTGAAAGAGCAAGGGAACT;SOR=1.121;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=30;WE=37505167;WS=37505149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr10	37508450	rs1148259	A	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=572;ReadPosRankSum=0.854;SC=TCAATTATGCAGGAGATGCTC;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=43;WE=37508458;WS=37508440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr10	38246545	rs2799499	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=-0.617;SC=AGACATGTGAACTAGCTCTTA;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=38246553;WS=38246535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	38260558	rs4007126	AACAC	A,AAC	1304.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.52;QD=26.63;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,24,25:0.49,0.51:49
chr10	38299843	rs2293962	G	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGACGGCGGGGCTGCAGCGTG;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=15;WE=38299851;WS=38299833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr10	38306128	rs2738208	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.303;NF=9;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TTCCACTGGCAACTCGAAGCA;SOR=0.138;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=38306136;WS=38306118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr10	38344700	rs2505232	C	G	5314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=64;PP=2965;SC=ACACACAGGGCAGAAACCCTT;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=148;WE=38344708;WS=38344690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr10	38385316	rs2474572	A	G	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=711;SC=TACAGCATAAATTGTTTTTAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=38385324;WS=38385307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	38385441	rs2474573	G	A	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=52;PP=2465;SC=ATGTTTTGCCGGCTGCGAAGT;SOR=0.905;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=117;WE=38385449;WS=38385431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	38407519	rs176889	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=8;PP=384;SC=GTCAGAAGTCAGCCCTAATTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=38407527;WS=38407509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	38537070	rs1780145	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=403;SC=AAGAGAATATATAAACACACA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=38537078;WS=38537060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	38598955	rs12358852	T	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.502;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.521;NF=17;NR=3;PP=397;ReadPosRankSum=0.394;SC=TGTTTGTCTGTTTTTCAAAAT;SOR=1.919;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=38598963;WS=38598945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr10	38599101	rs34686283	C	CT	2143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.35;QD=34.58;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	38645403	rs72639552	T	C	5929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-1.570;NF=90;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.019;SC=TGGTTTTGATTACCGGGGCTA;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=91;TCR=102;TR=191;WE=38645411;WS=38645393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,217:0.99:219
chr10	38647171	rs2800473	C	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=369;SC=TTTTCTGAACCAGAGAGAAAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=38647179;WS=38647168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	38647463	rs35215821	A	AT	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.866;NF=1;NR=23;PP=328;ReadPosRankSum=-1.934;SC=TTGCTGATGGATTTTTTTTTT;SOR=0.639;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=4;TCR=76;TR=24;WE=38647471;WS=38647453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr10	38650104	rs2804643	A	G	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.98;QD=32.67;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	38654932	rs138689893	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQRankSum=1.611;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr10	38654940	rs2804645	T	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQRankSum=1.981;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.531;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	38667003	rs2804622	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.18;QD=31.58;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	38672144	rs3087759	A	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.294;NF=48;NR=26;PP=1179;ReadPosRankSum=0.475;SC=ATTCCTACTAATGGAACTCCA;SOR=1.095;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=74;WE=38672152;WS=38672134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr10	38740353	rs2754385	T	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=7;PP=256;SC=GTCCCGAAGTTGGCCTCTCCA;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=38740361;WS=38740343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	38740382	rs2754386	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8;NR=8;PP=244;SC=TCCGGCCTCCTGGCGGCCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=38740390;WS=38740372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	42905431	rs3004228	A	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=426;SC=TTTCTTCTTTAGAAAATACCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=42905439;WS=42905421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	42905510	rs2419684	A	C	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=29;PP=1430;SC=TCAGATGTTAAATTACTCCTC;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=42905518;WS=42905500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	42926170	rs66977053	TGG	T	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=698;SC=GTGATTGAGTTGGGGTGAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=18;WE=42926179;WS=42926160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	42928668	rs67090148	GGAGTCTATC	G	2509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.547;NF=25;NR=18;PP=2938;ReadPosRankSum=2.147;SC=TTTGAATGAAGGAGTCTATCC;SOR=0.243;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=43;WE=42928694;WS=42928645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,60:0.95:63
chr10	42928702	.	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=-3.291;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,8:0.10:80
chr10	42928709	.	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-4.832;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=1.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,10:0.11:87
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chr10	42949768	rs73251888	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-11.422;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.463;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,14:0.11:132
chr10	42949773	.	G	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-11.378;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,14:0.11:131
chr10	42949782	.	G	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-11.113;QD=1.01;ReadPosRankSum=1.572;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,12:0.10:125
chr10	42949787	.	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-10.977;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,12:0.10:122
chr10	42949789	.	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-10.932;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.872;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,11:0.09:121
chr10	42949797	.	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQRankSum=-10.654;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,11:0.10:115
chr10	42949811	.	C	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-9.977;QD=0.69;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,8:0.08:101
chr10	42949828	rs200497651	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=6.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-8.515;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,7:0.09:74
chr10	42965636	rs1255411	C	T	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.86;NF=34;NR=43;PP=1526;SC=TAAATCTCTCCGGGCTCTGGG;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=42965644;WS=42965626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	43075288	rs7921658	T	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=562;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AAATCGGCAGTCTGGAGTCTA;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=41;WE=43075296;WS=43075278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr10	43078525	rs41301639	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.544;NF=5;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=-1.142;SC=CAGCACTGCAAGGGTTTAATC;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=11;WE=43078533;WS=43078523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	43089156	rs7904627	C	T	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.502;NF=43;NR=26;PP=1185;ReadPosRankSum=-2.792;SC=ATGCATTACACTGATAGGGTT;SOR=1.240;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=144;TCF=80;TCR=64;TR=69;WE=43089164;WS=43089146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr10	43089965	rs210280	G	A	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=32;PP=1184;SC=CTCATTCCACGTGAGTCATAC;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=43089973;WS=43089955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	43119123	rs158377	G	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=25;PP=982;SC=CTGTTGGGAGGGGGGAATGAG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=50;WE=43119131;WS=43119113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	43119159	rs158378	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GGCAATACAGTTTCTGTTTGA;SOR=1.244;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=20;WE=43119167;WS=43119149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr10	43128395	rs209391	C	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=940;SC=AAATGGCCTGCTGCTGTCTTG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=43128403;WS=43128385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	43132232	rs209387	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=870;SC=ACAGAGATGGAGACACTGCGC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=43132240;WS=43132222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	43232450	rs702370	G	A	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=39;PP=2832;SC=ACCTTTTAATGTGAAAATGTG;SOR=1.541;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=132;WE=43232458;WS=43232440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr10	43280057	rs55869085	CTT	C	7545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=92;PP=2979;SC=TCCATTGATTCTTTTTTTAAA;SOR=1.006;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=15;TCR=101;TR=107;WE=43280066;WS=43280047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
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chr10	43607756	rs3026750	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=732;ReadPosRankSum=1.661;SC=CCAGCCTGGGGTGGCTCTCCC;SOR=0.154;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=43607767;WS=43607746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
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chr10	43613843	rs1800861	G	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=725;ReadPosRankSum=0.796;SC=CGAGTGAGCTGCGAGACCTGC;SOR=0.737;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=45;WE=43613851;WS=43613833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,59:0.45:132
chr10	43615505	rs2472737	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=360;ReadPosRankSum=0.721;SC=ATGGCCTGACGACTCGTGCTA;SOR=1.791;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=25;WE=43615513;WS=43615495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr10	43620551	rs2742236	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=1.521;SC=GGATTGTGCAGAGAGAGAGAG;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=43620559;WS=43620541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	43622217	rs2075912	T	C	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1353;ReadPosRankSum=-1.079;SC=GCTGTCCCCTTTGCACTATCC;SOR=0.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=83;WE=43622225;WS=43622207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr10	43623812	rs17028	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=44;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TCACATTGGCCGAGCCGTGTT;SOR=0.401;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=132;TCF=39;TCR=93;TR=66;WE=43623820;WS=43623802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr10	43657811	rs2257767	T	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=0.899;SC=ATGGCCAGGTTGGGTGGGGGT;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=43657819;WS=43657801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr10	43659536	rs2503865	C	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=646;ReadPosRankSum=0.051;SC=GAATTTAGAACGTTGTCAGCA;SOR=0.651;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=43;WE=43659544;WS=43659526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr10	43678796	rs2435381	C	T	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.995;NF=49;NR=37;PP=1223;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GACTCCGGTTCCTGGTCTTTT;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=86;WE=43678804;WS=43678786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,103:0.49:209
chr10	43691691	rs1254968	C	T	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1255;ReadPosRankSum=0.204;SC=CTGCATCCGCCTCAGGCTCTG;SOR=0.342;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=174;TCF=73;TCR=101;TR=83;WE=43691699;WS=43691681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,92:0.46:198
chr10	43694363	rs35825252	C	CA	1201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=858;ReadPosRankSum=1.725;SC=GCAGCTGTGACGGGGCTCAGG;SOR=0.363;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=23;WE=43694371;WS=43694353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr10	43695049	rs1254964	T	C	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=50;PP=2325;SC=CATCATCTAATTCCTGGGGCA;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=117;WE=43695057;WS=43695039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr10	43696086	rs1254963	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=1.119;SC=CAGCCCCCACCCCCAGTCAGG;SOR=1.061;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=43696094;WS=43696076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	43698240	rs1270015	G	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.519;SC=CCAACCCACAGCTCCAGCCCA;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=16;WE=43698248;WS=43698230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr10	43698980	rs1254961	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CCGCCGGTCCCGAGGCCATGC;SOR=1.255;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=20;WE=43698988;WS=43698970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr10	43883388	rs201660330	GA	G	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.807;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	43932479	rs2244396	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=781;SC=GGGAGCAGCAAGGCTTCCGGA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=43932487;WS=43932469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	43978087	rs3750890	A	G	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=61;PP=2293;SC=TACATCAGAGAATACATACTG;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=105;WE=43978095;WS=43978077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	43991255	rs9422519	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=51;SC=AGATTTTTTTCCCACAAATCA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=43991263;WS=43991245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	44052903	rs2230661	A	C	4665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=0.626;SC=CACTGACTACATTCGTATTGT;SOR=0.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=147;WE=44052911;WS=44052893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,162:0.98:165
chr10	44053013	rs2230660	G	C	6581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=83;PP=2965;SC=CTCTGTATGAGCTCTCTGCTG;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=120;TCR=83;TR=203;WE=44053021;WS=44053003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr10	44053585	rs2999278	C	T	2362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=51;PP=1510;SC=GTGTTTTCTGCTGAAGATTCT;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=44053593;WS=44053575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	44103923	rs3128239	G	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=830;SC=CACATCCCCTGAGCCCTCAGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=44103931;WS=44103913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	44104513	rs7342073	C	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=-1.793;SC=TGCCCCCTCCCTTTGCTTTAC;SOR=0.159;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=44104521;WS=44104503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr10	44793299	rs2505734	C	T	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=71;PP=2666;SC=TGTCCACTCTCGCTCAGCGTG;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=135;WE=44793307;WS=44793289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	44868856	rs266091	A	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=939;ReadPosRankSum=-2.144;SC=CCAGCTCCAGAAGGACAGCGG;SOR=0.456;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=55;WE=44868864;WS=44868846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr10	44874253	rs266085	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCCCCAACACCCATCTAGGGC;SOR=0.486;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=21;WE=44874261;WS=44874243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr10	45423282	rs10900131	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AGGAAGAAGACTCACTCCACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=45423290;WS=45423272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	45430462	rs17417442	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=600;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CCTCCCTCGCCGAAGGTCTGG;SOR=0.426;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=45;WE=45430470;WS=45430452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr10	45466726	rs4948938	G	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=224;SC=TACTCACAGGGCCATCACCTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=45466734;WS=45466724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	45467204	rs2274886	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=-1.359;SC=AGTACATGTGTGTCTTTCCCT;SOR=0.973;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=39;WE=45467212;WS=45467194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr10	45477895	rs41301599	C	T	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=25;PP=1160;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GTGTTCAGAGCATCCCATCCC;SOR=0.900;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=89;TCR=47;TR=75;WE=45477903;WS=45477885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr10	45478092	rs870957	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=521;ReadPosRankSum=-2.101;SC=ATGGATGCCCAGACGGCCTAG;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=28;WE=45478100;WS=45478082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr10	45479434	rs871043	G	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=610;ReadPosRankSum=0.097;SC=TTTCTCTGCCGGCAGCCATCT;SOR=0.393;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=35;WE=45479442;WS=45479424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr10	45495807	rs138221258	GA	G	1542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.496;NF=29;NR=12;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.607;SC=GGGAGTGGGGGAACACGGAGG;SOR=0.927;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=41;WE=45495815;WS=45495797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr10	45496126	rs41301609	G	A	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CAAAATTTGTGGAAAGTATGC;SOR=0.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=91;WE=45496134;WS=45496116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,108:0.45:239
chr10	45499009	rs3740093	A	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1171;ReadPosRankSum=-1.286;SC=AAAGAGTTTCAGTCAGAGTTC;SOR=0.922;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=74;WE=45499017;WS=45498999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,85:0.46:183
chr10	45499272	rs3740092	C	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1033;ReadPosRankSum=0.510;SC=GCCAGAGCTCCCACCTTATTC;SOR=0.889;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=62;WE=45499280;WS=45499262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr10	45869669	rs78137087	C	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=534;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GCGCTAGATGCGGACACCTGG;SOR=0.304;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=30;WE=45869677;WS=45869659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr10	45869700	rs72561472	G	C	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=2210;ReadPosRankSum=0.039;SC=CGAGGCTCCCGGCGCTCGCTG;SOR=0.463;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=60;WE=45869721;WS=45869690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr10	45869713	rs4987106	C	G	3128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.217;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=2210;ReadPosRankSum=0.945;SC=GCTCGCTGCTCCCGCGGCCCG;SOR=0.307;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=117;TCF=83;TCR=34;TR=65;WE=45869721;WS=45869690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,78:0.58:135
chr10	45869748	rs4987105	C	T	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1096;ReadPosRankSum=1.050;SC=ACACGGTCACCGTGGCCACTG;SOR=0.397;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=79;WE=45869756;WS=45869738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,95:0.49:194
chr10	45869895	rs111916157	A	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.736;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,45:0.38:120
chr10	45869903	rs111528152	A	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr10	45877899	rs28395865	C	T	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=24;PP=1583;ReadPosRankSum=-1.233;SC=CAGGAGACCACGCATGGCCTG;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=123;TCR=46;TR=88;WE=45877907;WS=45877889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,96:0.49:194
chr10	45891215	rs41526545	A	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.872;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=382;ReadPosRankSum=-1.105;SC=CGGCATGGGCAGGGCATCTGA;SOR=1.999;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=23;WE=45891223;WS=45891205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr10	45891484	rs2029253	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=693;ReadPosRankSum=1.323;SC=ATGGCCTGTCACTGCTGGAAA;SOR=0.931;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=35;WE=45891492;WS=45891474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr10	45924023	rs1565096	G	A	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=12;PP=738;SC=TTTTTGGTCCGTCTGCTGAGC;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=45924031;WS=45924013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	45924256	rs1565097	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=256;SC=CTCAGTCCTCTGCGATCCAGG;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=45924264;WS=45924246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	45935744	rs3780914	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-2.240;SC=TTACCCCCTCCAGGCTCTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=45935752;WS=45935734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr10	45938746	rs1051713	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;ReadPosRankSum=1.176;SC=GCCCCTCCACCGCTAGCGCTG;SOR=1.043;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=38;WE=45938754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr10	45939136	rs7900977	T	C	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=59;PP=2911;ReadPosRankSum=-0.505;SC=CCTGGGGTCCTCAGGGACTGG;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=139;WE=45939144;WS=45939125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
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chr10	45958856	rs2291428	G	C	6567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=105;PP=2965;SC=CCAGCTCATGGAACCTGTGCA;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=85;TCR=105;TR=190;WE=45958864;WS=45958846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
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chr10	46963738	rs3127783	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.488;NF=20;NR=2;PP=294;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GAGCTCGTACAGCTCCTTCTG;SOR=0.245;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=22;WE=46963746;WS=46963729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr10	46963951	rs55945664	G	A	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQRankSum=-4.252;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.262;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:396,144:0.27:540
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chr10	46965727	rs1889849	G	A	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1440;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CCAGGCTCTCGGCCTCCAGGT;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=101;WE=46965735;WS=46965717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,119:0.46:257
chr10	46965887	rs112965082	T	TG	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,39:0.24:160
chr10	46967672	rs2152530	C	T	4042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=2228;ReadPosRankSum=1.322;SC=TTTTGTCCTCCGGGAACTTGT;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=294;TCF=143;TCR=151;TR=136;WE=46967680;WS=46967662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,186:0.50:372
chr10	46968762	rs3127790	C	G	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1360;ReadPosRankSum=0.440;SC=GGTGGCAAGTCAATGGTGTGG;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=58;TCR=94;TR=77;WE=46968770;WS=46968752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr10	46968879	rs10588658	AAC	A	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	46968882	.	ACACACACACACACACG	A	739	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=58.97;NF=1;NR=6;PP=739;QD=106.714285714;SC=ACCAGGCAACACACACACACA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=46968905;WS=46968869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,7:0.39:18
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chr10	46969496	rs3127792	A	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=1019;ReadPosRankSum=0.765;SC=TGCCTGGGAAAGCCACTCTCC;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=42;TCR=84;TR=57;WE=46969504;WS=46969486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr10	46970573	rs6587511	C	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=215;ReadPosRankSum=1.905;SC=GCTGCTGGTGCCCAGCTGCGG;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=18;WE=46970581;WS=46970563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr10	46970654	rs915449	C	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=559;ReadPosRankSum=2.380;SC=CGCCCCAGCCCGTCCCTGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=37;WE=46970662;WS=46970644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr10	46970792	rs915450	G	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GGGCAGGGTGGGGTGAGAGTA;SOR=0.596;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=18;WE=46970800;WS=46970782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr10	46998719	rs201733825	GTCAC	G	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.495;NF=19;NR=2;PP=923;ReadPosRankSum=0.459;SC=CTGGTGTCTTGTCACTCACTG;SOR=0.082;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=21;WE=46998730;WS=46998711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr10	46998795	rs3127677	A	G	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.689;NF=41;NR=24;PP=832;ReadPosRankSum=0.474;SC=TGAACCTAGCACTGTGGGAGT;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=95;TCR=55;TR=65;WE=46998803;WS=46998785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,74:0.42:178
chr10	46998894	rs3127817	G	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=57;PP=1492;ReadPosRankSum=0.832;SC=AGCTCCAGCCGCCCCGAGCCG;SOR=0.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=203;TCF=85;TCR=118;TR=97;WE=46998902;WS=46998884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,112:0.48:232
chr10	46998995	rs4926045	C	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=2825;ReadPosRankSum=0.245;SC=GAGGCCAGAGCTCCGCAAGAC;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=70;WE=46999007;WS=46998985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr10	46998999	rs3127818	G	A	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCAGAGCTCCGCAAGACTGCC;SOR=0.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=94;TCR=72;TR=94;WE=46999007;WS=46998985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,106:0.55:192
chr10	46999019	rs3127819	G	A	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.162;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=0.381;SC=CAGCAGCACCGTGTGGCAGGC;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=101;WE=46999038;WS=46999009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,114:0.55:206
chr10	46999030	rs4925989	C	T	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=2853;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGTGGCAGGCCCAGCTGGGCG;SOR=0.903;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=83;WE=46999038;WS=46999009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr10	46999151	rs3127820	T	C	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.300;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1281;ReadPosRankSum=-1.251;SC=AGGCCACTGGTGGAGCAGCAC;SOR=0.667;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=83;WE=46999159;WS=46999141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,96:0.52:186
chr10	46999178	rs7090312	A	C	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=1.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,85:0.50:171
chr10	46999189	rs3127678	C	T	3755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=2.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,96:0.52:183
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chr10	46999577	rs11204659	G	T	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.102;NF=69;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.780;SC=GCCCCCAGCTGCTCTACTCTG;SOR=0.983;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=221;TCF=129;TCR=92;TR=113;WE=46999612;WS=46999567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,129:0.51:251
chr10	46999591	rs112620425	C	CATGAGGGAG	4215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=6.428;NF=21;NR=37;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TACTCTGTGGCATGAGGGAGG;SOR=0.514;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=58;WE=46999612;WS=46999567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,110:0.46:238
chr10	46999596	rs7895979	G	A	2950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.16;MQRankSum=-5.727;QD=11.53;ReadPosRankSum=2.448;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,131:0.51:256
chr10	46999604	rs3127683	A	G	9191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=92;PP=2962;SC=GAGGGAGGTGAGGGCTGGTGG;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=123;TCR=92;TR=215;WE=46999612;WS=46999567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr10	46999732	rs4579877	G	A	3946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=86;PP=2580;ReadPosRankSum=-1.442;SC=GGTTGTCTGGGGGGCTCCCTG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=278;TCF=126;TCR=152;TR=154;WE=46999740;WS=46999722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,178:0.53:338
chr10	46999747	rs3127821	T	C	3525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=69;PP=1959;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TCCCTGGGCATTCCCATTGCT;SOR=0.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=276;TCF=124;TCR=152;TR=129;WE=46999755;WS=46999737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,166:0.49:338
chr10	46999863	rs4445576	C	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,53:0.28:187
chr10	46999922	rs4926046	G	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=5.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,42:0.22:187
chr10	47000004	rs3127822	T	C	8376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=96;PP=2965;SC=CTGGAGGAGGTGCCGTCCCCT;SOR=1.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=164;TCR=96;TR=260;WE=47000012;WS=46999994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr10	47000071	rs4244614	G	A	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.274;SC=ACGGAGCTGCGGTGGACCTGG;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=199;TCR=174;TR=173;WE=47000087;WS=47000061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,189:0.44:425
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chr10	47000239	rs7912299	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=709;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GCGGCTGCTCCGGCGCGGCCC;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=38;WE=47000247;WS=47000229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr10	47086915	rs59974223	C	T	5558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=1.900;SC=TGGTCTTCATCGTCACTTCCT;SOR=0.703;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=421;TCF=212;TCR=209;TR=227;WE=47086923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,257:0.52:499
chr10	47086978	rs3740294	G	A	5076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.180;SC=TGATGTGTGTGACTGTGAGGC;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=420;TCF=228;TCR=192;TR=207;WE=47086986;WS=47086968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,233:0.49:471
chr10	47087371	rs1048156	G	A	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=77;PP=2879;ReadPosRankSum=1.022;SC=AGTTCCTGGCGGATAAGGTGG;SOR=0.602;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=372;TCF=208;TCR=164;TR=164;WE=47087379;WS=47087361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,175:0.41:431
chr10	47087474	rs1129838	C	T	6488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=538;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=1.271;SC=GGGCTTCATCCTGGTCTGTTA;SOR=0.819;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=438;TCF=211;TCR=227;TR=242;WE=47087482;WS=47087464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:247,286:0.54:533
chr10	47087608	rs1936339	T	C	13068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=221;NR=197;PP=2965;SC=TGGCCTTTGCTGTGCTCTGGC;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=418;TCF=221;TCR=197;TR=418;WE=47087616;WS=47087598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr10	47087680	rs1048157	C	T	4969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=0.023;SC=CCATCTGCCACGGGAACCTCA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=381;TCF=179;TCR=202;TR=201;WE=47087688;WS=47087670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,223:0.51:435
chr10	47087731	rs1048158	C	T	4759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=106;PP=2882;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CCTCCACCTGCGTCAACCCAT;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=399;TCF=188;TCR=211;TR=196;WE=47087739;WS=47087721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,225:0.49:461
chr10	47087830	rs1129839	G	A	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=70;PP=2122;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TGGAGGAGTCGGAGCATCTGC;SOR=0.386;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=261;TCF=105;TCR=156;TR=128;WE=47087838;WS=47087820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,139:0.49:283
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chr10	47416908	rs3127728	A	G	3206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=474;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-16.980;NF=59;NR=119;PP=2718;ReadPosRankSum=1.523;SC=GTTTACATCCATGTAGAATCA;SOR=0.935;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=432;TCF=154;TCR=278;TR=178;WE=47416916;WS=47416898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:305,164:0.35:469
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chr10	47669277	rs61845226	C	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.675;NF=6;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=-0.812;SC=ATCGGTGGAGCCTTCCTCTGA;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=28;WE=47669285;WS=47669267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr10	47669320	rs113650392	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-2.437;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr10	47680513	rs10572939	GCC	G	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=57.77;MQRankSum=-2.394;NF=1;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=-0.373;SC=ACATGTGACTGCCCCCCGTGA;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=9;WE=47680522;WS=47680503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr10	47701275	rs10906952	G	A	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.414;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TCAGGCACACGGCAGAACCCC;SOR=0.422;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=65;WE=47701283;WS=47701265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,72:0.60:120
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chr10	47915898	rs183064568	A	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.671;NF=1;NR=11;PP=154;ReadPosRankSum=0.859;SC=CTTCCAGCAAAAATCTCAAGC;SOR=0.892;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=12;WE=47915906;WS=47915881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
chr10	48370595	rs11204210	G	A	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=848;ReadPosRankSum=-0.997;SC=TGGCAGCTGGGAAGGGAGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=64;WE=48370603;WS=48370585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,68:0.59:116
chr10	48370747	rs35618062	C	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=848;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTGGGCAGTGCGGAGCTGGCA;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=55;WE=48370755;WS=48370737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr10	48371277	rs3814160	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1142;ReadPosRankSum=1.491;SC=GGCCCAGGTGCCCCCACCCTC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=62;WE=48371285;WS=48371266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr10	48371325	rs150817564	A	G	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CCTGCCACCCACCCTCACCTC;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=65;WE=48371333;WS=48371315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr10	48386110	rs2070706	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=328;ReadPosRankSum=0.577;SC=GCAGGCGCCATGGGAAATATT;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=19;WE=48386118;WS=48386100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr10	48414570	rs7923671	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=1.639;SC=GTCTGTTTCCATGACACTGAA;SOR=1.201;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=8;WE=48414578;WS=48414560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr10	48416274	rs12252199	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=685;ReadPosRankSum=0.363;SC=TGGCCAGTGGCCTCCACCCTG;SOR=1.604;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=34;WE=48416282;WS=48416264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr10	48426798	rs743509	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=1.533;SC=ACCTCAGCTCCGCCCTCACCC;SOR=0.093;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=17;WE=48426806;WS=48426788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr10	48429650	rs2236723	G	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=525;SC=AGGAGCAAACGCCCACCGATC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=48429658;WS=48429640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	48438734	rs1126827	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=1.509;SC=CGGCAAAGGGCCGAAGTCCAG;SOR=1.001;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=37;WE=48438742;WS=48438724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr10	49392575	rs931743	C	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=25;PP=2113;SC=AACAGGGGAGCCTCTTAAGCT;SOR=1.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=92;WE=49392583;WS=49392565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	49393002	rs2062704	C	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=31;PP=946;SC=TTATTTCCCTCATATCACACA;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=49393010;WS=49392992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	49450443	rs280612	A	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=749;SC=CAGAGCTGCCACTACGAGGCC;SOR=3.193;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=49450451;WS=49450433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	49609578	rs3730154	C	A	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=341;SC=ACTATCAGTACGTAAACAGTA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=49609586;WS=49609568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	49633873	.	T	TAC,TACAAGAATACATTCTTGTAA	817.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.24;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=2974;SC=GTAATATGAATATGACTAATG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=49633886;WS=49633863;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:18
chr10	49633875	.	T	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	49633876	.	GACT	G	362	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=0;PP=362;QD=48.5;SC=ATATGAATATGACTAATGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=49633886;WS=49633863;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,8:0.57:14
chr10	49633877	.	A	AATACATT	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.51;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	49633879	.	T	TTGTAAATG	1163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.60;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	49654342	rs1051508	C	T	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=354;SC=GGCTCCAGAGCGCCTGGCTGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=49654350;WS=49654332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	49654403	rs1051507	C	T	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=19;PP=1487;SC=GACCAGCAGACGTGGTACAGA;SOR=1.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=71;WE=49654411;WS=49654393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	49658248	rs1867585	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=12;PP=783;SC=CCAAGAGCACGGCTCTCCCTG;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=49658256;WS=49658238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	49659559	rs10776601	C	T	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=77;PP=2757;SC=GGCTGCCCCACGTCACCCCTC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=145;WE=49659567;WS=49659549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	49659637	rs3827681	T	C	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=72;PP=2088;SC=GGACAGGGAATAGAGCCATCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=100;WE=49659645;WS=49659627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	49661341	rs7092959	A	G	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=22;PP=1889;SC=TACACCTCCCACTTACCTTCC;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=88;WE=49661349;WS=49661331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	49662884	rs11101327	A	G	74.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=10.69;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	49667713	rs1867575	G	A	6739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=111;NR=97;PP=2965;SC=CCTTACCCCCGATCACAAGCT;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=208;WE=49667721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr10	49667795	rs3853761	T	C	5337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=112;PP=2965;SC=TGGCCTGGCCTGGCATGCGGA;SOR=1.241;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=69;TCR=112;TR=181;WE=49667803;WS=49667785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	49687556	rs4240511	A	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=13;PP=1191;SC=CTGCTGTGAGAAGCACAGGAT;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=49687564;WS=49687546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	49687594	rs4838601	G	A	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=32;PP=1534;SC=AGTGAGCAGGGTCTTTGGGGC;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=49687602;WS=49687584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	49687800	rs4080665	G	A	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=18;PP=796;SC=CCCGCTCCCCGGCACCACCTG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=49687808;WS=49687790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	49687925	rs4575219	C	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=634;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CCAGCAACAGCTGAGCTTTGC;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=43;WE=49687933;WS=49687915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr10	49687964	rs4240513	A	C	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	49687971	rs4240514	T	C	5399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.55;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	49688014	rs4838602	C	A	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=43;PP=1930;SC=TTTTTCCCTTCGTCTCACTTT;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=91;WE=49688022;WS=49688004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	49690351	rs1445157	T	C	6156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=72;PP=2965;SC=GTTCATTCTTTTGCATATGCA;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=112;TCR=72;TR=184;WE=49690359;WS=49690341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	49701445	rs9663545	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=600;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CCAGCCTGGTCCTCACAGCCT;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=40;WE=49701453;WS=49701435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr10	49701652	rs10735226	G	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=1.000;SC=CCACTCGGCTGCCTGTGTGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=49701660;WS=49701642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	49791143	rs146683289	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=916;ReadPosRankSum=1.089;SC=GTGAGGGCACGGCATCCGCCC;SOR=1.134;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=48;WE=49791151;WS=49791133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr10	49791572	rs11593803	C	T	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=582;SC=ATTTGTTCAACGATTCATTTA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=49791580;WS=49791562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	49804275	rs146550812	G	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=565;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GATTCAAGCGGATCTGGTGTT;SOR=1.125;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=40;WE=49804283;WS=49804265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,44:0.40:111
chr10	49804554	rs10776627	A	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=743;SC=CCTCACTGAGAGGTGGAGTGT;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=49804562;WS=49804544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	49804785	rs10745280	T	G	3586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=74;PP=2455;SC=CCCATTCTGGTGTCTCTCTCG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=114;WE=49804793;WS=49804775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr10	49812917	rs17010948	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=789;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TCCTCGCGCCTAGTCGCCCCT;SOR=0.308;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=98;TCF=20;TCR=78;TR=46;WE=49812925;WS=49812907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr10	49860130	rs2377612	G	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=1.586;SC=CCATTTCCAGGAGCTGAAGGA;SOR=0.551;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=49860138;WS=49860120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	49860153	rs2377613	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=0.026;SC=TCAGAACCCTGACCACAGATG;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=49860161;WS=49860143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr10	49860258	rs2377614	A	G	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=-0.562;SC=TTTCCCACATAGAACATAAAA;SOR=0.478;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=45;WE=49860266;WS=49860248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr10	49939077	rs2377628	T	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=498;ReadPosRankSum=1.593;SC=TGGCATGCCCTCTTAGTAATG;SOR=0.442;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=36;WE=49939085;WS=49939067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr10	49939139	rs1993986	T	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.852;SC=AAGATCATTCTTGTTTTCCTC;SOR=0.710;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=104;TCR=69;TR=73;WE=49939147;WS=49939129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,84:0.41:205
chr10	49944249	rs4838645	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=888;ReadPosRankSum=0.884;SC=TATTAGGTAGCGTCAGGTGCT;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=49;WE=49944257;WS=49944239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr10	49944315	rs1871600	A	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TTTCTTTGCAACATACAGTCC;SOR=0.027;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=12;WE=49944323;WS=49944305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr10	49983890	rs1871604	G	T	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=68;PP=2123;SC=TTAATGGGAAGTAAAAGATGA;SOR=1.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=98;WE=49983898;WS=49983880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	50011137	.	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=277;ReadPosRankSum=0.266;SC=AGATGGCGAGAGAAGGCCTTC;SOR=0.013;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=14;WE=50011145;WS=50011127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr10	50013402	rs2170132	T	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1062;ReadPosRankSum=0.258;SC=CTCCAAGATCTCCACCATCAT;SOR=0.537;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=67;WE=50013410;WS=50013392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,85:0.52:162
chr10	50025396	rs7097397	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=1036;ReadPosRankSum=0.776;SC=CCAGCGTGGCGAGCCCCGGAG;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=61;WE=50025404;WS=50025386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,79:0.52:151
chr10	50030730	rs10857651	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=-1.237;SC=TTAGTCCCAGGTAATACCTGG;SOR=0.054;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=8;WE=50030738;WS=50030720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr10	50031212	rs113439641	CT	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.361;QD=0.64;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,14:0.16:90
chr10	50038720	rs3747875	G	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=0.952;SC=GCCATCCTGAGTGTGCCATGT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=50038728;WS=50038710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	50038800	rs3747874	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=531;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TGGTGGCACAAAGGCAGCAGA;SOR=0.273;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=34;WE=50038808;WS=50038790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr10	50040562	rs3747873	A	G	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.169;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=23;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.646;SC=AGCTAGCTATAAAAATAGTGT;SOR=1.104;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=190;TCF=130;TCR=60;TR=83;WE=50040570;WS=50040552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,90:0.42:212
chr10	50040610	rs3747872	T	G	3276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.234;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=51;PP=2202;ReadPosRankSum=0.883;SC=TTGCTTCCCTTCCCTCAGCAT;SOR=1.111;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=291;TCF=163;TCR=128;TR=132;WE=50040618;WS=50040600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,150:0.46:328
chr10	50075461	rs2663019	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.390;SC=TAATTGGAAGGGCCTTTGGTT;SOR=0.276;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=15;WE=50075469;WS=50075451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr10	50083111	rs2620881	T	C	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.705;SC=ATTTAATTTTTCTTTTCAATG;SOR=0.570;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=77;WE=50083119;WS=50083101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,95:0.51:188
chr10	50085267	rs1904595	C	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=0.725;SC=ATTGCAATAGCCTTTAAGATT;SOR=0.417;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=14;WE=50085275;WS=50085257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr10	50108145	rs2671693	G	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=227;SC=TCAAAAGGACGACCCAGGAAG;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=50108153;WS=50108135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	50109902	rs2663046	G	A	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=40;PP=1280;SC=GACACCCTCAGTCTAAGGTAA;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=50109910;WS=50109892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	50110015	rs7068839	A	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=247;SC=CATGCCCAACAGTTTCCCTCA;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=50110023;WS=50110005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	50121784	rs10776653	T	C	4988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=1.370;SC=GGGCCCCCAGTGTGGTGGGCA;SOR=0.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=158;WE=50121792;WS=50121774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr10	50122181	rs7094610	C	A	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=43;PP=1558;SC=GCCCTTGGGGCCTTTCTCACC;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=50122189;WS=50122171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	50149674	rs2671717	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=9;PP=970;SC=GGGTGGGGCAAGAAGAGCTGG;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=50149682;WS=50149664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	50154768	rs2663066	A	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=543;SC=TGAATGTTTTACTTTAGGTCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=50154776;WS=50154758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	50155036	.	TAC	T	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=59.77;NF=0;NR=4;PP=70;QD=18.25;SC=CCACTCTCTGTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=4;WE=50155045;WS=50155026;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr10	50165411	rs3750867	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=50;PP=1187;SC=CAACATCATCTGGACCTTTGC;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=50165419;WS=50165401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	50186317	rs2292585	G	A	4568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=81;NR=67;PP=2875;SC=AGACAGGATCGTCTTCCCCGC;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=148;WE=50186325;WS=50186307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr10	50190923	rs61366126	G	GA	671.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.165;HP=11;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.600;NF=0;NR=31;PP=370;ReadPosRankSum=1.132;SC=CTATTGCACTGAAAAAAAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=31;WE=50190931;WS=50190913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,29:0.88:33
chr10	50227785	rs1913525	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=36;PP=1190;SC=TCAGCTCCAGTTCGGCATAGG;SOR=1.042;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=50227793;WS=50227775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	50227870	rs1913524	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=544;SC=ACCACAGGAGCTCTACATCAC;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=50227878;WS=50227860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	50227927	rs1913523	C	A	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	50339754	rs73302786	G	T	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1165;ReadPosRankSum=0.612;SC=CCAGCTGTTGGTCATGTGCTT;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=86;WE=50339762;WS=50339744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,103:0.42:247
chr10	50339962	rs75297145	A	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GCAGCACTCCAGCAGGTCTAT;SOR=1.000;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=145;TCF=85;TCR=60;TR=68;WE=50339970;WS=50339952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr10	50342079	rs7097375	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=23;ReadPosRankSum=1.534;SC=GCTCCCCATGGTCGCTAAGAT;SOR=1.112;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=5;WE=50342087;WS=50342069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr10	50374819	rs9418839	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=936;ReadPosRankSum=0.857;SC=GGCTCTGCGCTTGTGGGTTCA;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=56;WE=50374827;WS=50374809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr10	50376106	rs2466756	A	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=630;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CCATGTACCCACCAGGAGCAC;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=40;WE=50376114;WS=50376096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr10	50531604	rs7093235	T	C	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=73;PP=2244;SC=AGAACAGACTTGCAGCAGGGG;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=55;TCR=73;TR=128;WE=50531612;WS=50531594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	50532588	rs10857469	C	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=514;ReadPosRankSum=1.063;SC=TGAAGACCCACCAGCTAGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=36;WE=50532596;WS=50532578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
chr10	50532683	rs7921186	T	C	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=36;PP=1928;SC=CAGAAATTCTTCCCAGGGCCC;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=50532691;WS=50532673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	50532812	rs11101093	A	G	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GCCTCATTTGATGATCAGCAG;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=65;WE=50532820;WS=50532802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr10	50533463	rs10857470	T	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=991;ReadPosRankSum=-1.132;SC=AAGGGGAATTTCCCATCTATG;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=59;WE=50533471;WS=50533453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr10	50533617	rs2377940	T	C	5339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=83;PP=2929;SC=TACCCGAGGGTGACATAGAAG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=169;WE=50533625;WS=50533594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr10	50533776	rs10857471	C	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=852;ReadPosRankSum=1.092;SC=CCGGCTCCCCCGGGGAGAGCA;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=52;WE=50533784;WS=50533766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr10	50533841	rs11101094	G	C	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=903;ReadPosRankSum=1.052;SC=CAGGCCCCTGGAGGACCAGAG;SOR=0.980;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=44;WE=50533849;WS=50533831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr10	50534350	rs11101095	G	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1103;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CTCGGAGCCTGTCGGGAGGCG;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=62;WE=50534358;WS=50534340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,75:0.51:148
chr10	50534599	rs10857472	G	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=670;ReadPosRankSum=-1.609;SC=GCTGTACCCCGGCTTCCAGCC;SOR=0.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=46;WE=50534607;WS=50534589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr10	50534969	.	A	AACACACAC	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.88;QD=79.35;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	50594509	rs12261515	C	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=214;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CCAGCCCAGCCGAACCCAAAC;SOR=0.207;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=50594517;WS=50594499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	50666808	rs4253231	A	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=787;ReadPosRankSum=0.145;SC=TAAATTAATAATCAGAAATGC;SOR=1.014;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=41;WE=50666816;WS=50666798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr10	50681033	rs2229760	G	A	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CACCTAAGCCGCCCACCCGCG;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=78;WE=50681041;WS=50681023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,95:0.54:176
chr10	50683438	rs4838522	T	C	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=716;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TAGTTTGCATTCCCTTTCCTG;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=44;WE=50683446;WS=50683428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr10	50691009	rs4240506	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=481;SC=CACATTTACTCATCATTCTTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=50691017;WS=50690999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	50691360	rs4253162	T	C	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=60;PP=2862;SC=TCTTCTCCACTTGGAAATCTC;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=93;TCR=61;TR=152;WE=50691368;WS=50691350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	50701156	rs4253132	G	A	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=28;PP=1789;SC=CTGAAATATTGTGTTACCTTT;SOR=1.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=50701164;WS=50701146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	50723684	rs4253073	G	A	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=83;PP=2965;SC=TGTAAGACCAGTTCGAAACAG;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=190;WE=50723692;WS=50723674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr10	50724016	rs4253072	C	T	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=58;NR=91;PP=2965;SC=CAGTGGAACTCTGTCAATGTG;SOR=1.172;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=58;TCR=91;TR=149;WE=50724024;WS=50724006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr10	50740876	rs2228524	G	C	5013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=73;PP=2965;SC=AACGAAAGGAGAGGTACTCCT;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=156;WE=50740884;WS=50740866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	50818762	rs1880675	C	T	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=15;PP=1554;SC=CGGAGGCGTCCTCGGAAGAGC;SOR=1.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=50818770;WS=50818752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	50820345	rs8187730	C	A	6465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=113;PP=2965;SC=CCTTTTGATGCGTGCGAGGAC;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=89;TCR=113;TR=202;WE=50820353;WS=50820335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr10	50820424	rs2269338	G	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=791;ReadPosRankSum=-0.565;SC=ACCGCCTTGGGTCAAGGGGGC;SOR=0.536;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=51;WE=50820432;WS=50820414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr10	50822226	rs7923716	T	G	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=37;SC=GGCGGGGAGCTGGGGAAGGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=50822234;WS=50822216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	50823981	rs8178987	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AGGCCAGGCTCCCAATTAGCC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=50823989;WS=50823971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr10	50824038	rs8178988	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=501;ReadPosRankSum=0.781;SC=CATTCACCCACGCATGCATTC;SOR=1.112;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=27;WE=50824046;WS=50824028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr10	50824117	rs1880676	G	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=745;ReadPosRankSum=-1.778;SC=GGAATGCAGAGATGAAGCACT;SOR=1.168;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=46;WE=50824125;WS=50824107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr10	50824244	rs11101182	C	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=631;ReadPosRankSum=-1.124;SC=CTGCCAGCAACCCCTGGTGGA;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=37;WE=50824252;WS=50824234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr10	50824619	rs3810950	G	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1159;ReadPosRankSum=1.162;SC=CCGTAAGATGGCAGCAAAAAC;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=75;WE=50824627;WS=50824609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,95:0.49:195
chr10	50828064	rs10857519	A	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=0.904;SC=GACAGGGCAGAAGGAGAGATG;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=18;WE=50828072;WS=50828054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr10	50828506	rs1880677	G	A	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=82;PP=2965;SC=GACTGTTTGGGGGGATGTGAC;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=121;TCR=82;TR=203;WE=50828514;WS=50828496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr10	50856652	rs4838544	G	A	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=63;PP=2254;SC=GCTCAAGCACGTGTGAGTCTG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=124;WE=50856660;WS=50856642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	50856772	rs10580502	TAC	T	565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;QD=28.29;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	50857835	rs1917813	T	C	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=44;PP=1265;SC=TGTAGTCAAATTAAAGGAGAG;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=50857843;WS=50857825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	50863083	rs12264845	A	C	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=43;PP=2281;SC=TTTCTTTCCGAGTTTATGATT;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=83;TCR=43;TR=126;WE=50863091;WS=50863073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr10	50863147	rs8178992	T	C	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=90;PP=2965;SC=GCAGGCTCCATCGAAGACTGG;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=197;WE=50863155;WS=50863137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr10	50863565	rs7076926	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=40;PP=1188;SC=ATGGGCACCACGGCATAAGAC;SOR=1.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=50863573;WS=50863555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	50887651	rs1153781	G	C	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=22;PP=1299;SC=GGCCCCGCCCGGCGCGTAGCG;SOR=1.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=50887659;WS=50887641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	50901809	rs1153797	T	G	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=681;SC=CTCCTTTTCTTTCCTTCCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=50901817;WS=50901799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	50901938	rs1133837	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=722;ReadPosRankSum=-0.005;SC=ACTTGGAGTTCGGTAAGCCCT;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=46;WE=50901946;WS=50901928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr10	50902469	rs2278561	T	G	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=977;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TAGTTAACATTTTACCAGCCC;SOR=0.908;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=87;TCR=31;TR=57;WE=50902477;WS=50902459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr10	50902684	rs1055421	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=965;ReadPosRankSum=-1.937;SC=GTCGGCACAACAGCAGCTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=21;TCR=82;TR=53;WE=50902692;WS=50902674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr10	50916484	rs1258236	A	G	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=33;PP=1576;SC=CAGCCCGTGTAGGATGAAAGT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=50916492;WS=50916474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	50916542	rs4838554	C	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1002;ReadPosRankSum=0.015;SC=CTGACTTGTACTGTATTGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=59;WE=50916550;WS=50916532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr10	50916834	rs6537550	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=123;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CAAACCCAACGTGATTCTCCC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=50916842;WS=50916824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	50943186	rs1258256	C	T	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=20;PP=1432;SC=AGCCCCTCTCCTGGGCAGGAG;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=50943194;WS=50943176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	50944009	rs1258257	T	C	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=3;PP=789;SC=ATGGGACAGATGGAGCCAGGA;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=50944017;WS=50943999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	50944613	rs1258258	C	T	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=54;PP=1625;SC=CCCAGAGGGGCTGGGGCAGCT;SOR=1.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=50944621;WS=50944603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	50947918	rs1258259	A	G	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=31;PP=908;SC=CTTGCTGCACACAGTCACCAA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=50947926;WS=50947908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	50952851	rs1268723	C	T	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=822;SC=CGCAGCCAGACGCCCAGTCCA;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=50952859;WS=50952841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	50960209	rs1258184	G	A	6075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=99;PP=2965;SC=CCCGCAGAGAGAGGGTGTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=84;TCR=99;TR=182;WE=50960217;WS=50960199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr10	51124153	rs2664655	T	G	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=53;PP=1612;SC=ACAAGCTTCCTACTACCTCCC;SOR=1.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=51124161;WS=51124143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	51537292	rs4131357	C	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=554;ReadPosRankSum=-0.031;SC=ACAATAGAGTCTTTTAATCTA;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=33;WE=51537300;WS=51537282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr10	51539745	rs35494443	AC	A	617.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=619;ReadPosRankSum=0.797;SC=TGAACTTGCTACCCCCAATAG;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=21;WE=51539753;WS=51539735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr10	51539762	rs10763588	G	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=518;ReadPosRankSum=1.006;SC=ATAGAGAATTGACTCCCTCAT;SOR=1.127;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=28;WE=51539770;WS=51539752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr10	51540291	rs11006274	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=782;ReadPosRankSum=0.799;SC=CTGTGGGATCTCCCGCATGAA;SOR=0.541;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=41;WE=51540299;WS=51540281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr10	51549496	rs10993994	T	C	4808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=77;PP=2588;SC=TTCCCAATGATGTCGAATGCG;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=157;WE=51549504;WS=51549486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr10	51549545	rs4935176	G	T	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=86;PP=2777;SC=ATGCAGCTTTGCCTGGATGTA;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=57;TCR=86;TR=143;WE=51549553;WS=51549535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	51556921	rs10994385	G	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=1.656;SC=CAGCTACTCCGTCTTGCAAAA;SOR=0.869;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=51556929;WS=51556911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr10	51582911	rs113955117	C	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=499;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GACTGGCTTACCCAAAAGCAG;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=29;WE=51582919;WS=51582901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr10	51584528	rs113812384	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.102;SC=CAGAGTGAGACTGTCTCAAAA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=51584536;WS=51584518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	51620499	rs78584401	G	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQRankSum=-2.147;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	51623004	rs201547968	T	C	302.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.87;MQRankSum=-1.903;QD=21.58;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr10	51623024	rs146205287	A	C	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQRankSum=-4.604;QD=13.71;ReadPosRankSum=3.769;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr10	51623052	rs143647852	C	CT	1797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.899;NF=29;NR=22;PP=2933;ReadPosRankSum=2.401;SC=GGACGCGCAACTTAGTGTAGA;SOR=0.725;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=51;WE=51623069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr10	51623061	rs115719811	G	A	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.812;NF=43;NR=27;PP=2962;ReadPosRankSum=1.396;SC=ACTTAGTGTAGACGCAAGAAC;SOR=0.589;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=70;WE=51623069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr10	51623147	rs373071373	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.84;MQRankSum=-3.823;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr10	51623174	rs141118546	C	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQRankSum=-0.084;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	51623866	rs374725846	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.45;MQRankSum=-1.882;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.459;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	51631812	rs200391397	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQRankSum=-9.896;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,110:0.60:184
chr10	51632971	rs200644678	A	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.46;MQRankSum=-6.654;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr10	51633027	rs115081809	T	C	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.750;NF=34;NR=57;PP=1026;ReadPosRankSum=0.836;SC=AGTAACTATTTGGGTAGGTAG;SOR=0.644;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=213;TCF=77;TCR=136;TR=91;WE=51633035;WS=51633017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,81:0.51:160
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chr10	52103707	rs10763354	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=26;PP=1127;SC=GCCGCTGCCCATTGTCAGAGG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=52103715;WS=52103697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	52576068	rs4245008	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=-1.255;SC=AAATATCAACGCGAGATGATA;SOR=0.619;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=20;WE=52576076;WS=52576058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr10	52603659	rs10821877	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CAGCCACTGACCAAGAAGGCT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=52603667;WS=52603649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr10	52610352	rs71457593	T	TTG	1716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=1345;ReadPosRankSum=0.585;SC=CAAAAAGCATTTGTGTGTGTG;SOR=0.979;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=34;WE=52610361;WS=52610342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr10	52751070	rs66567258	AGCCGCCGCC	A	1419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=10;PP=2995;SC=CTGCCGTCCCAGCCGCCGCCG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=20;WE=52751086;WS=52751060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	53667443	rs10823860	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.977;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=533;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TAAAAAATTTCTAAGCTCTGG;SOR=0.153;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=32;WE=53667451;WS=53667433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr10	53667476	rs7081919	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=0.550;SC=ATTTGGCTTCGTATAGAAAGC;SOR=0.136;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=20;WE=53667484;WS=53667466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr10	53814229	rs1904010	G	T	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=37;PP=2273;SC=TTTTCTTATTGTTTCTACTTT;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=114;WE=53814237;WS=53814219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	53814383	rs12778630	C	T	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=83;PP=2658;SC=TTAGTAACTCCAGTAGGAACA;SOR=1.626;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=120;WE=53814391;WS=53814373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	53841337	rs1904024	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=246;ReadPosRankSum=-2.221;SC=AATACTTACCATATGCCATGT;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=21;WE=53841345;WS=53841327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr10	53841639	rs5784902	AG	A	272.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=239;SC=TCCTGACAATAGGGGTCTCAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=53841647;WS=53841629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	53893539	rs17642863	A	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=300;ReadPosRankSum=-1.542;SC=ATTAATCACAATGGACACTGT;SOR=1.206;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=19;WE=53893547;WS=53893529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr10	53921754	rs10824173	C	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=600;SC=ATTTTGATTGCAAAATGATTT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=53921762;WS=53921744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	54074757	rs2241529	A	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=37;PP=1595;SC=GAGGGGACGCAGGCGTGCAAA;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=54074765;WS=54074747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	54076271	rs1569198	A	G	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=76;PP=2965;SC=TGCAGGTTTAACAGTAACTAT;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=161;WE=54076279;WS=54076261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	54528266	rs930507	G	C	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GAGAGAAGGTGAGCCCTAAAA;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=68;WE=54528274;WS=54528256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr10	54528298	rs930508	G	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=861;ReadPosRankSum=0.219;SC=GGGTGAAACTGACTCATCCTT;SOR=0.964;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=50;WE=54528306;WS=54528288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr10	54528353	rs930509	C	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=365;ReadPosRankSum=1.711;SC=TTCTAGAGTACAGTTGCCGGA;SOR=1.467;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=19;WE=54528361;WS=54528343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr10	54530636	rs1982266	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=320;ReadPosRankSum=0.665;SC=CTCAGGAGAAAGGAGACCTTG;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=23;WE=54530644;WS=54530626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr10	54530694	rs1982267	G	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=270;SC=CTGTATGGTGGGCACCTGAGA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=54530702;WS=54530684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	54531235	rs1800450	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=344;ReadPosRankSum=-2.107;SC=TCCCTTGGTGCCATCACGCCC;SOR=0.357;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=25;WE=54531243;WS=54531225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr10	55568972	rs11003863	T	G	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=755;ReadPosRankSum=-2.754;SC=GAACTCAGACTCTTCTTCACT;SOR=0.557;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=50;WE=55568980;WS=55568962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr10	55582905	rs10825114	G	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CCTTATAAAGGGGATTATGGG;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=73;TCR=76;TR=66;WE=55582913;WS=55582895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
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chr10	55588137	rs4570494	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=169;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TTTCACATTTGTGCAAGTTAC;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=55588145;WS=55588127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr10	55590950	rs77597438	C	T	3095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.427;NF=36;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=0.827;SC=GATAGACAGACAGATAAAGCA;SOR=0.346;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=73;WE=55590958;WS=55590932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,83:0.50:166
chr10	55591313	rs7089209	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TAGATAAATAGTAAAATTAAT;SOR=1.027;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=17;WE=55591321;WS=55591303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr10	55626367	rs10825135	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CTAGTATCGTAGCTACTTCCC;SOR=0.798;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=10;WE=55626375;WS=55626357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr10	55626630	rs5785023	G	GA	601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.342;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr10	55663198	rs10740559	A	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	55663202	rs2593124	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	55719652	rs2593107	C	T	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=81;PP=2593;SC=GTAAGAACAGCGTAACAGCAC;SOR=2.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=19;TCR=81;TR=100;WE=55719660;WS=55719642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	55755491	rs2135720	C	T	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TTTGTATATTCGTTTACTAAA;SOR=0.427;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=156;TCF=56;TCR=100;TR=76;WE=55755499;WS=55755481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,90:0.47:191
chr10	55779915	rs3812658	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=441;ReadPosRankSum=-0.201;SC=TGTAGAGAGAGCAAAGCAGGC;SOR=0.427;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=28;WE=55779923;WS=55779905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr10	55826470	rs3812657	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=645;ReadPosRankSum=-1.018;SC=ATAAACTTACACTCTTTGAAA;SOR=0.423;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=86;TCF=68;TCR=18;TR=46;WE=55826478;WS=55826460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr10	55838950	rs1911433	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=557;SC=TAGCCTGTTGAAGAAAAGAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=55838958;WS=55838940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	55892600	rs201069783	T	TAC	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTAGAATTTATACACACACAC;SOR=0.112;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=7;WE=55892608;WS=55892590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	55943184	rs7093302	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=699;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AGTGTACACTTATATTATGTG;SOR=1.639;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=35;WE=55943192;WS=55943174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr10	55949151	rs16905686	G	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=387;ReadPosRankSum=1.091;SC=GAACCTATACGCAAATTAAAC;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=30;WE=55949159;WS=55949141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr10	55949264	rs5785045	AT	A	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=0.120;SC=AGAGTATACAATTTTTTTATT;SOR=0.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=55949272;WS=55949254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr10	55955444	rs4935502	T	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=15;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TTAACTTACATCTTCTATGTC;SOR=1.036;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=83;TCR=32;TR=60;WE=55955452;WS=55955434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr10	55973889	rs10763086	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CCCTTCATCAGCTGAGGAACA;SOR=0.420;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=15;WE=55973897;WS=55973879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr10	55996761	rs721825	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=465;ReadPosRankSum=3.069;SC=GAGACAGATGCTTTAGTTTGG;SOR=2.140;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=23;WE=55996769;WS=55996751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr10	56076975	rs10763098	A	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=279;ReadPosRankSum=-1.483;SC=CTTGAACATGATCCCATTGGG;SOR=0.093;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=17;WE=56076983;WS=56076965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr10	56077209	rs10740579	G	A	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=62;PP=2177;SC=GTCCTGTTAGGGAGAAAAACA;SOR=1.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=56077217;WS=56077199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	56089223	rs11004240	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=263;SC=TATTATATATAAACACCAAGG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=56089231;WS=56089213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	56089263	rs857395	G	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=626;SC=GAAGTGAGTGGCACAGAGCTC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=56089271;WS=56089253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	56129066	rs11594958	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=403;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CTTTTAAAATACTAATTAAAA;SOR=0.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=27;WE=56129074;WS=56129056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,32:0.36:88
chr10	56287689	rs10825347	A	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=753;ReadPosRankSum=1.523;SC=GGCACACACAATGAGAAAAAA;SOR=0.450;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=48;WE=56287697;WS=56287679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr10	56288081	rs11004349	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=602;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GTTCTAAAGAGAATAAAACAA;SOR=0.660;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=34;WE=56288089;WS=56288071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr10	56335031	rs7070334	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=55.93;NF=9;NR=3;PP=265;SC=TGCACAATGTACACATGTACC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=56335039;WS=56335021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	56335067	rs7070440	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=428;SC=TAATAAAAAAAAAAACTGAAA;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=56335075;WS=56335057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	56335099	rs10825362	C	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=421;SC=TATTATTTCTCGTCAGTTCTT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=56335107;WS=56335089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	56335273	rs7086121	G	A	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	56345303	rs4570492	T	C	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.390;NF=40;NR=15;PP=797;ReadPosRankSum=-0.104;SC=ACTTCATAGCTGTAGGCTAAC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=55;WE=56345311;WS=56345293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr10	56345335	rs2026413	T	C	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.06;QD=28.38;SOR=1.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	56345378	rs11396767	T	TG	2880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=36;PP=967;SC=ATATGTGTTTTTTTTTTTTTT;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=56345386;WS=56345368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	56345425	rs2026412	G	A	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=22.31;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	56345491	rs2026411	C	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=17;PP=469;SC=CCACAGATAACAGCCGCAATC;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=56345499;WS=56345481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	56345511	rs2026410	A	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=3;NR=20;PP=516;SC=CAACTTCAGCAGGTTCCCAGA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=56345519;WS=56345501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	56423968	rs11004439	A	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=891;ReadPosRankSum=1.454;SC=TCAAAGAGAGAGCCCAGGATG;SOR=0.761;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=188;TCF=90;TCR=98;TR=71;WE=56423976;WS=56423958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,96:0.41:234
chr10	58118630	rs2241666	T	C	3221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=74;PP=1775;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TGAAACACCCTGTCAAGCTCC;SOR=0.805;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=253;TCF=114;TCR=139;TR=131;WE=58118638;WS=58118620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,157:0.51:305
chr10	58119976	rs3861049	G	A	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=50;PP=2965;SC=CTCTCTGCCAGTGCTGCCCTG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=94;TCR=50;TR=144;WE=58119984;WS=58119966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	59064371	rs1275284	C	G	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=21;SC=ACATGTATCTCTCTGTGTGTA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=59064379;WS=59064361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	60095143	rs1905456	T	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=13;PP=453;SC=CCAGCGGGCATCGGACAGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=60095151;WS=60095133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	60148415	rs34084383	G	GT	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.071;NF=4;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.299;SC=ACTTACTTGGGTTTTTTATTT;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=10;WE=60148423;WS=60148405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	60548276	rs11812567	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.802;SC=TTTTATAACCGAATCATGTTC;SOR=0.317;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=60548284;WS=60548266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	60558125	rs2393503	A	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=628;ReadPosRankSum=0.393;SC=TCTTAAATTTATGTGAATTGA;SOR=1.060;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=36;WE=60558133;WS=60558115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr10	60559047	rs2893789	G	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=0.816;SC=TGTGTGATCTGTACTGTTTGT;SOR=0.929;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=15;WE=60559055;WS=60559037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	60563062	rs4245600	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=0.935;SC=CTGGTATGGAGAATTCAGTGA;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=21;WE=60563070;WS=60563052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr10	60566137	rs3740451	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=0.964;SC=CAGAAGTGGTGATTTATTATT;SOR=1.002;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=18;WE=60566145;WS=60566127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr10	60573753	rs9416746	G	T	3595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=68;PP=2219;ReadPosRankSum=-0.685;SC=TCAAGTGAGCGTTGTGTTTTA;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=298;TCF=147;TCR=151;TR=138;WE=60573761;WS=60573743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,169:0.47:356
chr10	60577393	rs4344442	T	C	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=880;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TGGCTGTAACTTAAATAGCTC;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=52;WE=60577401;WS=60577383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr10	60588553	rs4948550	T	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=863;ReadPosRankSum=0.609;SC=GCTTTTTGAATCGCCAAATGC;SOR=0.864;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=49;WE=60588561;WS=60588543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr10	60966393	.	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.253;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	60966706	rs10509097	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TTACAAATAGGAAAAGATGGG;SOR=1.002;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=60966714;WS=60966696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr10	60996453	rs10763600	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=875;SC=AAAAGCTTTAGTTGTTCTGGG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=60996461;WS=60996443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	60998252	rs3758565	C	T	95.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTTGAATTCCCTAGAGGTGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=60998260;WS=60998242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	61005244	rs2452505	G	C	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1542;ReadPosRankSum=-1.289;SC=GGATCTTTCTGTGGGCACCGT;SOR=0.641;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=192;TCF=98;TCR=94;TR=94;WE=61005252;WS=61005234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,103:0.49:212
chr10	61007534	rs1459996	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=351;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TTCACAATGAATCAAGTCATT;SOR=0.223;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=24;WE=61007542;WS=61007524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr10	61007592	rs2446724	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=320;SC=ATACTGTAACGGCCTCCACTT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=61007600;WS=61007582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	61014056	rs1903252	C	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=348;ReadPosRankSum=1.638;SC=ATGTGACATCCTGTTAACTAC;SOR=0.356;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=28;WE=61014064;WS=61014046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr10	61111975	rs284606	G	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=426;SC=GAACCGTGTGGCCTAGCCTAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=61111983;WS=61111965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	61122268	rs3078330	T	TTA	2901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=41;PP=2248;SC=TCTCCGGGAGTGAGCACATAC;SOR=1.999;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=45;WE=61122276;WS=61122258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	61414011	rs2242206	G	T	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=1801;ReadPosRankSum=0.912;SC=GTGTGTCACTGTGGGGTTTTT;SOR=0.556;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=236;TCF=107;TCR=129;TR=120;WE=61414019;WS=61414001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,141:0.51:278
chr10	61443808	rs1171660	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=500;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AGTAAATGTAATTAAATGATT;SOR=1.007;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=29;WE=61443816;WS=61443798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr10	61552774	rs1053265	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=630;ReadPosRankSum=-2.218;SC=GAGGTGGAGGCGGAGGTGGCT;SOR=0.470;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=37;WE=61552782;WS=61552764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr10	61564020	rs3841635	CTT	C	1199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=1147;SC=TTTTCAAACTCTTAGCCTTGA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=26;WE=61564029;WS=61564010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	61566624	.	T	C	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1231;ReadPosRankSum=-1.061;SC=AAAACCTCTGTAGAACCTGGG;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=78;WE=61566632;WS=61566614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,90:0.62:144
chr10	61574357	.	A	AAC	631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=391;ReadPosRankSum=-2.626;SC=CCAGAGCAGCAACACACACAC;SOR=0.500;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=14;WE=61574366;WS=61574347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr10	61592447	rs6479653	G	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1273;ReadPosRankSum=0.639;SC=TGGAAATCAGGCAACTCAAAT;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=80;WE=61592455;WS=61592437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
chr10	61592547	rs6479654	A	G	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=56;PP=1593;SC=ATGTGCAAGTATATACCTAGT;SOR=2.185;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=61592555;WS=61592537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	61612199	rs2271561	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=113;ReadPosRankSum=1.329;SC=TCCAAAGAACTTAAGCTACAA;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=61612207;WS=61612189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	61802342	rs2393603	C	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.092;HP=4;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=2000;ReadPosRankSum=0.742;SC=AAGGAAAGGACGGGGAAAATC;SOR=1.370;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=87;TCF=71;TCR=16;TR=44;WE=61802361;WS=61802332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr10	61802353	rs2393604	A	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=13;PP=2000;ReadPosRankSum=0.627;SC=GGGGAAAATCAGAATCACTTA;SOR=1.082;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=109;TCF=80;TCR=29;TR=56;WE=61802361;WS=61802332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr10	61802374	rs2393605	AA	TT	3592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.497;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=24;PP=2944;ReadPosRankSum=0.032;SC=TTTAGTGAAAAATATAAGTTT;SOR=1.068;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=171;TCF=115;TCR=56;TR=86;WE=61802383;WS=61802360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr10	61802561	rs2393607	G	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.590;NF=12;NR=53;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.460;SC=GTGAAACAGTGTTAGTTATAA;SOR=0.928;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=22;TCR=92;TR=65;WE=61802569;WS=61802551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,70:0.56:125
chr10	61802577	rs5785427	T	TC	2896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=64;PP=2900;SC=TATAAAGCAGTCCATTCTGAT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=65;WE=61802585;WS=61802567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	61815367	rs4948384	C	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=578;SC=AAGTAAAGCACCGATACTTTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=61815375;WS=61815357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	61819049	rs10733757	T	G	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=25;PP=2068;SC=TAAGATAAACTATTAACAAGT;SOR=2.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=99;WE=61819057;WS=61819039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	61828954	rs7923682	G	A	8670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=122;PP=2965;SC=TGGTTTTCTCGGATTGACTAA;SOR=0.930;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=159;TCR=122;TR=281;WE=61828962;WS=61828944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr10	61831290	rs28932171	T	C	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=76;PP=2965;SC=TGACTTATGATTTTTTTTACA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=158;WE=61831298;WS=61831280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	61831984	rs11599164	G	T	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=50;PP=2792;SC=TACTCTCAGGGTGACCAATGT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=89;TCR=50;TR=139;WE=61831992;WS=61831974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr10	61834573	rs17208576	G	A	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=49;PP=2188;SC=TTTCGGAGGCGGCTTTTGCTT;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=99;WE=61834581;WS=61834563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	61840167	rs7917800	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=698;SC=GGTTGTATGACAGGGTTTTCC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=61840175;WS=61840157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	61841144	rs7098848	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=12;PP=752;SC=GTGAGCCACCACGCCTGGCCA;SOR=1.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=61841152;WS=61841134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	61842498	rs2393595	A	G	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=63;PP=2077;SC=TCTCTAATCTAGAAGAATTTT;SOR=1.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=91;WE=61842506;WS=61842488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	61843451	rs10509122	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=187;SC=GTCACGTAACGTTAAAAGACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=61843459;WS=61843441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	61843475	rs41274682	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=112;SC=GTTACTATGTTACACGTGTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=61843483;WS=61843465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	61845154	rs7084246	A	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=661;SC=TACTAAAGGTAGTTTTCCTCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=61845162;WS=61845144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	61871430	rs10821675	C	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=346;SC=CTAACTATGGCAAAAATTCAC;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=61871438;WS=61871420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	61900046	rs118052400	A	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=605;ReadPosRankSum=0.457;SC=CGGCTGGGCTATTTGCACATT;SOR=0.444;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=43;WE=61900054;WS=61900036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr10	61900356	rs6479694	A	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=609;SC=TCAGGCCCCCAAAAAAATCTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=61900364;WS=61900346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	61926728	rs11814723	A	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=555;SC=TTATCTCTGAATTAATCAGTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=61926736;WS=61926718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	61962651	rs6479699	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.150;SC=GGAGACAGAGCGATACTCCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=61962659;WS=61962641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	61965625	rs2297979	A	G	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1143;ReadPosRankSum=1.050;SC=TCTTGCAGGCAATATGAAGAG;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=72;WE=61965633;WS=61965615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
chr10	62039654	rs1380451	G	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=6;PP=1153;SC=TAAAGTATAGGCACCTTAAAT;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=62039662;WS=62039644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	62540063	rs2448344	T	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=186;SC=AACCATTAAGTTGTCTTGTAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=62540071;WS=62540053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	62548098	rs2456772	G	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=655;SC=CTACTCTGTGGCAGTATCAAT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=62548106;WS=62548088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	62551815	rs3212319	GC	G	2456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=21;PP=2087;SC=TTTTCAGGTAGCTATTAAAAA;SOR=1.430;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=62551823;WS=62551805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	62551889	rs2456777	AA	GT	5583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.08;NF=71;NR=34;PP=2947;SC=AGAAATTTTTAATTTCCTGTT;SOR=1.498;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=105;WE=62551898;WS=62551879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	62553763	rs1871446	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=644;SC=CATATGTTATATCAACAGATA;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=62553771;WS=62553753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	63170292	rs7083475	A	G	5875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.292;SC=TAGAGTTGCAACACCACCACG;SOR=0.560;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=488;TCF=214;TCR=274;TR=229;WE=63170300;WS=63170282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:309,279:0.47:588
chr10	63175677	rs12766100	A	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCATATGTTTAAGGACTATAA;SOR=1.911;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=63175685;WS=63175667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	63422754	rs151189963	G	GGGGCCGACCCCGGCA	5025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=2969;SC=CGACTCCCTGGGGGCCGACCC;SOR=1.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=44;WE=63422762;WS=63422744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	63519674	rs2588915	G	A	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=10;PP=1389;SC=AGGACAAAAAGGGCAATGGCA;SOR=2.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=63519682;WS=63519664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	63520698	rs1992625	T	C	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=26;PP=999;SC=TAGTTGGTTTTACCATTGAAG;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=63520706;WS=63520688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	63699895	rs7073837	A	C	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=999;ReadPosRankSum=0.854;SC=CATTTCCCTCAAACCTATAAA;SOR=0.987;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=63;WE=63699903;WS=63699885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr10	63700228	rs4360655	A	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=647;ReadPosRankSum=1.881;SC=TTTTCGGTTGAAGATTTTTCT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=38;WE=63700236;WS=63700218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr10	63700245	rs4562771	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=717;ReadPosRankSum=-0.692;SC=TTCTGGAAACACTATCATTTA;SOR=0.855;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=33;WE=63700253;WS=63700235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr10	63818920	rs3832683	GA	G	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.216;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=3.006;SC=CTTTCTCGTTGAAAAAAAAAA;SOR=0.273;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=63818928;WS=63818910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	63944176	rs3125730	A	C	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=26;PP=1174;SC=ACCTTTAGTCACCCACAGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=63944184;WS=63944166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	63958112	rs3125734	T	C	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=89;PP=2412;SC=GGATTCTTCATGCTGACCAAT;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=60;TCR=89;TR=149;WE=63958120;WS=63958102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	63974950	rs4559572	C	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=176;SC=CATTTTTACTCCTCAGCTATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=63974958;WS=63974940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	63977011	rs148142088	GAAAAA	G	875.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=323;SC=ACCATTTGCTGAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=63977023;WS=63977001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr10	63977069	rs1432414	A	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=371;SC=CACTTTAAATACATCAAAATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=63977077;WS=63977059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	63978077	rs11355398	GA	G	947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.69;SOR=1.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr10	63982984	rs10740069	A	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=15;PP=924;SC=AGTAAAATATATACTGTACTT;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=63982992;WS=63982974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	63995983	rs3852448	C	T	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=14;PP=440;SC=AGCAACTATACACTTCCACCT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=63995991;WS=63995973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	64000878	rs1368158	T	G	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=19;PP=791;SC=AACATTTCAATTACAAATTAA;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=64000886;WS=64000868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	64001114	rs1368157	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=TTATAGTTTGTACTTTTAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=64001122;WS=64001104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	64005582	rs34205992	T	TA	196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=209;SC=TCTTAAACTCTAAAGTTCTAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=64005590;WS=64005572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	64005711	rs3815999	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=27;PP=991;SC=CATGTAGTTACGTTATAGAAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=64005719;WS=64005701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	64019037	rs10675790	A	ATAAAT	961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=478;SC=CTTTTTCTTAATACTCAGTCT;SOR=1.508;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=64019045;WS=64019027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	64136710	rs149800343	CAG	C	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.041;NF=1;NR=9;PP=404;ReadPosRankSum=-1.227;SC=GTGTTGCTGACAGGGGATGCT;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=64136719;WS=64136700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr10	64136751	rs1873686	G	C	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=61.53;NF=1;NR=6;PP=125;SC=CACCCCAATCGCCTTACAAGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=64136759;WS=64136741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	64148125	rs3852424	C	A	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=36;PP=1943;SC=TTATATTTCCCTTTTGTGTTC;SOR=1.072;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=93;WE=64148133;WS=64148115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	64148360	rs74156188	G	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.664;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr10	64148369	rs2893897	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=164;SC=CGAGTGTAAGATCCCTGTGGT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=64148377;WS=64148350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	64415031	rs10822043	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=196;ReadPosRankSum=0.562;SC=AAAACAATGGGAGATGAGATT;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=9;WE=64415039;WS=64415021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr10	64415184	rs7076156	A	G	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=59;PP=2759;SC=AGACCATCTCACCTTCCAACC;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=134;WE=64415192;WS=64415174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr10	64415413	rs7094595	T	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=1.032;SC=TTCCTTTCAGTAGCAGACTCA;SOR=1.473;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=11;WE=64415421;WS=64415403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	64426056	rs4746516	G	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=615;ReadPosRankSum=-1.070;SC=GTCATGGGCTGAATTGCATCC;SOR=0.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=44;WE=64426064;WS=64426046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,57:0.55:104
chr10	64564892	rs2236295	G	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=9.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=1.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr10	64564934	rs10995311	C	G	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=1015;ReadPosRankSum=0.402;SC=GGCTTCTGGCCCGGAGGCGCC;SOR=1.250;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=122;TCF=71;TCR=51;TR=71;WE=64564942;WS=64564924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr10	64573771	rs224083	C	T	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=64;PP=2148;SC=GCTTGGGGGACGGATAGGAAG;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=64573779;WS=64573761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	64893433	rs2175197	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=5.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GGCTCCAGGCTAGCCACTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=21;WE=64893441;WS=64893423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr10	64937314	rs35854283	G	A	62.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr10	64944317	rs10740107	T	A	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=35;PP=2365;SC=GCAAAAATTTTAAAAAATCCA;SOR=1.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=109;WE=64944325;WS=64944307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	64945364	rs3211105	G	A	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=65;PP=2035;SC=CTGAAGGCCAGTCTTTCAATT;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=64945372;WS=64945354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	64952835	rs41274064	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=885;ReadPosRankSum=1.306;SC=CTCAGACTTCGGAGGAGTATT;SOR=0.820;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=54;WE=64952843;WS=64952825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,62:0.44:142
chr10	64953311	rs4747098	G	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=212;SC=ACAATATTTTGTATTATAATT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=64953319;WS=64953301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	64953959	rs2306264	C	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=1.564;SC=TCTCTCCACCCTGTTATATTT;SOR=0.275;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=64953967;WS=64953949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	64960536	rs10465990	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=0.151;SC=GTGATGATACGGTAAGACTTT;SOR=0.095;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=9;WE=64960544;WS=64960526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	64967445	rs1904294	A	T	7691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=109;PP=2965;SC=TTTCACTAACACGATCTTTAG;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=121;TCR=109;TR=230;WE=64967453;WS=64967435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr10	64967950	rs139722368	ACTAAAC	A	3006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=2012;ReadPosRankSum=0.592;SC=TATCTTGCCTACTAAACCTTC;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=40;WE=64967963;WS=64967940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr10	64974380	rs41274074	G	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=252;ReadPosRankSum=1.295;SC=TTCTAAATTAGTGTCATTTGT;SOR=0.956;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=18;WE=64974388;WS=64974370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr10	64974537	rs10761725	A	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=392;ReadPosRankSum=-1.654;SC=TGTTCTGACGAATGAATAATC;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=30;WE=64974545;WS=64974527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr10	65139945	rs7477425	T	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=479;SC=TTCAAGCAATTGTCCTGCTTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=65139953;WS=65139935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	65225244	rs1061259	GA	CG	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=17;PP=2241;SC=GGGGGGCGCTGACTCTCTTAC;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=54;WE=65225253;WS=65225234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	65225450	rs1054693	C	T	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.051;NF=55;NR=42;PP=1707;ReadPosRankSum=-0.112;SC=CGGCCGCTGCCTCCTCCAGTG;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=119;TCR=96;TR=97;WE=65225468;WS=65225440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,114:0.48:238
chr10	65322464	rs36027145	A	ATCAG	2172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.241;NF=3;NR=38;PP=2202;ReadPosRankSum=-2.051;SC=CTCTGCAGCAATCAATCAATT;SOR=1.129;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=81;TCF=8;TCR=73;TR=41;WE=65322472;WS=65322454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
chr10	65379304	rs35995927	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=584;ReadPosRankSum=2.595;SC=TGCAAAAAGAGTAACTGGGGG;SOR=0.633;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=35;WE=65379312;WS=65379294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr10	65928826	rs10740151	T	C	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=61;PP=2700;SC=CACTCTTTTCTGTATAGCTTG;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=145;WE=65928834;WS=65928816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	68040325	rs4548513	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=193;ReadPosRankSum=1.027;SC=ATTCAATGAGCTTTTGCTTAA;SOR=0.665;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=13;WE=68040333;WS=68040315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr10	68535082	rs5785786	C	CT	2214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1757;SC=TATATTTACTCTTTTTTTCCT;SOR=2.712;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=57;WE=68535090;WS=68535072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	68685929	rs7902006	G	C	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=986;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AACTGCTGGGGTATGGAATAC;SOR=1.005;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=50;WE=68685937;WS=68685919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr10	69583206	rs962608	G	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=53;PP=1527;SC=AGTGACTCACGCCTATAATCT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=64;WE=69583214;WS=69583196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	69647332	rs932657	G	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=1054;SC=TAAATGTACGGTTTTTGGTTT;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=69647340;WS=69647322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	69648569	rs2236318	T	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=852;SC=GCTAACTCATTACTTCAGAAA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=69648577;WS=69648559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	69651125	rs7896005	A	G	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=18;PP=2254;SC=AAGGTAGAAGATTTAATTTTA;SOR=2.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=74;TCR=18;TR=92;WE=69651133;WS=69651115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	69668014	rs10997870	G	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	69692330	rs3758392	T	C	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=12;PP=1508;SC=CATTTAACAATATCAGAGATT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=69692338;WS=69692320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	69719074	rs7907843	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=136;SC=TATATATCTACTAATGTAAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=69719082;WS=69719064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	69750788	rs5785841	GA	G	973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.56;QD=25.62;SOR=3.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	69755112	rs2308195	C	CCTAT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=331;SC=TTAGTTTCTCCCTATTATATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=69755120;WS=69755102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	69902549	rs3814180	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=425;SC=CTTCTCACTGTTACAAAAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=69902557;WS=69902541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	69921335	rs10823142	T	A	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	69925123	rs10823146	C	T	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=968;SC=GTAGGAGAATCGCTTGAACCT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=69925131;WS=69925113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	69925176	rs10823147	T	C	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=21;PP=1524;SC=GCCACTGCGCTCCAGCCTGGG;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=69925184;WS=69925166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	69926097	rs2673794	T	C	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=21;PP=1486;SC=CAGCCAACTCTACCACCAACC;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=69926105;WS=69926087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	69926334	rs10823148	C	G	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=76;PP=2931;SC=CCGATTCTTTCCAGGAGAGGT;SOR=0.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=63;TCR=76;TR=139;WE=69926342;WS=69926324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr10	69933921	rs10997975	G	A	7076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=1.202;SC=TTTCCTTTCAGCATGACTGTT;SOR=0.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=106;TCR=121;TR=226;WE=69933929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,261:1.00:262
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chr10	69934258	rs3814182	C	G	9507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=133;PP=2965;SC=CCATCCCCAGCGGAAACCAGT;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=145;TCR=133;TR=278;WE=69934266;WS=69934248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr10	69934467	rs3814183	A	G	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=1387;ReadPosRankSum=1.009;SC=GTCGATGTGCACATTGAATAG;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=60;WE=69934475;WS=69934457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr10	69934535	rs7917519	G	A	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=496;SC=ATTCTCTTAGGCACAGAATGG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=69934543;WS=69934525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	69935059	rs7097776	A	G	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=37;PP=2168;SC=TGGGTGTGTCAGGTGTGGATT;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=69;TCR=37;TR=106;WE=69935067;WS=69935049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	69935235	rs6480306	T	C	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=85;PP=2943;SC=TTGTTGGATTTAGAAGGTTTA;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=130;WE=69935243;WS=69935225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr10	69948844	rs10733838	T	C	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=51;PP=1964;SC=GCTCTCCAGTTACATTCACCT;SOR=1.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=69948852;WS=69948834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	69954290	rs7081213	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=639;ReadPosRankSum=0.537;SC=AGGGTTCTGCGCTGTGCTGCA;SOR=0.845;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=18;WE=69954309;WS=69954280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr10	69954301	rs11815154	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=1176;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CTGTGCTGCACTCTGAGGAAG;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=22;WE=69954309;WS=69954280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr10	69955140	rs7069569	T	A	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1685;SC=GGTCCAGAAATTTTTATGTAA;SOR=1.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=69955148;WS=69955130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	69956999	.	CA	AA	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3,3;NR=0,0;PP=68,110;QD=34.2570708491;SC=TTTCCCCCTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3,3;WE=69957007;WS=69956989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	69956999	.	CA	CAA	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3,3;NR=0,0;PP=68,110;QD=34.2570708491;SC=TTTCCCCCTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3,3;WE=69957007;WS=69956989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	69957375	.	C	T	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=73;QD=26.9428031368;SC=CACTTTTTTTCATCATAAGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=69957383;WS=69957365;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	69959097	rs7079549	G	T	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=599;SC=CATCAGTCATGTGCCTCAGCT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=69959105;WS=69959087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	69959242	rs7079481	C	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=885;ReadPosRankSum=1.841;SC=GCTCATTGACCCACTCACTCA;SOR=0.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=58;WE=69959250;WS=69959232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,73:0.46:158
chr10	69959345	rs11279655	GCTGGGA	G	1788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.202;SC=AAGGTTTGCTGCTGGGACCCC;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=24;WE=69959358;WS=69959335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr10	69959397	rs7079974	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=363;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AAGAGGCAGAGCCTCTGCCAG;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=21;WE=69959405;WS=69959387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr10	69966392	rs3814185	T	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=211;SC=CTGCTCTTCTTTGACGTCTTC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=69966400;WS=69966391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	70045157	rs35708572	G	A	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=59;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TGAGAACAGCGTGTGCAGACC;SOR=0.803;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=203;TCF=83;TCR=120;TR=96;WE=70045165;WS=70045147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,113:0.47:240
chr10	70045201	rs7909365	C	A	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=91;PP=2965;SC=AGACAATCCCCAAGAAAACAG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=48;TCR=91;TR=139;WE=70045209;WS=70045191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr10	70045264	rs3816299	A	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=44;PP=1428;SC=TCCAGTTTGAATAAACTCTAG;SOR=1.578;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=70045272;WS=70045254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	70051810	rs3835100	A	G	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=30;PP=1942;SC=GATGGGGGGAAAAAAAACAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=90;WE=70051818;WS=70051800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	70051928	rs10823171	A	G	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=79;PP=2965;SC=GGACGATGCCATCCTCTGCTC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=168;WE=70051936;WS=70051918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr10	70056600	rs2394470	C	T	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=46;NR=18;PP=1472;SC=CACTCCAGCCCGTGCGACAGA;SOR=1.812;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=64;WE=70056608;WS=70056590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	70105560	rs1162753	G	A	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=65;PP=2965;SC=TGAATGAGCAGTGCATGACAG;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=102;TCR=65;TR=167;WE=70105568;WS=70105550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	70143774	rs7899885	C	T	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=35;PP=1223;SC=ATTTCTGACACGAGATTGTCT;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=70143782;WS=70143764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	70166913	rs59831114	T	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=1000;ReadPosRankSum=2.159;SC=ACTGAGGGCCTAGCGTTCGGT;SOR=0.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=57;WE=70166921;WS=70166903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr10	70266546	rs2275716	G	T	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=244;SC=GACAATCACAGATAAAGATTA;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=70266554;WS=70266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	70276728	rs2664412	G	A	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=437;SC=TGCCCACAGCGTATAGATATG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=70276736;WS=70276718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	70332066	rs3814177	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=384;SC=CTGTTTCCTGCGCCCTTTCAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=70332074;WS=70332056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	70332580	rs10823229	A	G	6230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=80;PP=2965;SC=CCAATGCAAGACACCCAAGTC;SOR=0.999;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=112;TCR=80;TR=192;WE=70332588;WS=70332570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr10	70392319	rs10733844	G	A	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=639;SC=TTGGAGTAGGGGGGTTTATCT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=70392327;WS=70392309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	70392375	rs1747	G	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=20;PP=1229;SC=AATTATGCAAGGCAAAGAATC;SOR=1.341;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=56;WE=70392383;WS=70392365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	70392470	rs114946478	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=7.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=1.699;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,35:0.23:153
chr10	70405855	rs3998860	A	G	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=75;PP=2965;SC=AGGGCACAATACAACAGAAAC;SOR=1.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=122;TCR=75;TR=196;WE=70405863;WS=70405845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr10	70442868	rs11284778	GA	G	273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=236;SC=AAAATAAAGTGAAAAAAAAGA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=70442876;WS=70442858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	70481547	rs1616158	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=32;PP=872;SC=CGAGCTCTGGCCCTTGAGGGT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=70481555;WS=70481537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	70497482	rs1162961	A	G	234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=0;PP=184;SC=TCAATGCCACACCAGAACAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=70497490;WS=70497472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	70497799	rs1149679	C	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=209;SC=AAAAAAGGAACGTCTCCAAGG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=70497807;WS=70497789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	70502288	rs1300253	G	A	5657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=109;PP=2965;SC=TACATGATACGTTTGGATTTG;SOR=1.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=66;TCR=109;TR=175;WE=70502296;WS=70502278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	70502426	rs1300252	T	C	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=310;SC=TGGACACAGTTGTGCAATCTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=70502434;WS=70502416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	70525591	rs1149688	G	A	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=13;PP=1507;SC=TCTTGCACATGTATATACATC;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=70525599;WS=70525581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	70531217	rs10823258	C	T	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=46;PP=1600;SC=GTAATAACAACCTGCTTTAGA;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=80;WE=70531225;WS=70531207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	70534744	rs1782323	A	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=3;PP=261;SC=TTTACGGTATATTTTGTTTGC;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=70534752;WS=70534734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	70641860	rs1341667	T	C	4814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=92;PP=2940;SC=GATGAAACATTACCCAGGTAG;SOR=1.361;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=143;WE=70641868;WS=70641850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	70673430	rs5030891	G	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=410;SC=TGTCCCCTGCGTTCTAACAAA;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=70673438;WS=70673420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	70696009	rs7084726	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=595;SC=TTTGGGAGGCTGAGGCGGGCA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=70696017;WS=70695999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	70696713	rs5030895	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=357;SC=CCGTTTCTTACGCTGCTGTTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=70696721;WS=70696703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	70696908	rs1539166	G	T	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=855;SC=TTGAACATAGGAAATATTGTA;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=70696916;WS=70696898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	70700944	rs5030900	A	G	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=29;PP=1453;SC=TCCTGAAAGGAAATATGGTAG;SOR=1.109;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=74;WE=70700952;WS=70700934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	70716106	rs5030896	A	G	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=91;PP=2664;SC=GGGACGCTGAATGGAGCGGAA;SOR=1.831;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=37;TCR=91;TR=128;WE=70716114;WS=70716096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	70722939	rs5030897	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=350;SC=GAAGGTAGAATTCCTTAATTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=70722947;WS=70722929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	70734599	rs5030902	A	T	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.32;SOR=3.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	70742192	rs2251911	T	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=396;SC=TAAGCACTTATGTTATCACCT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=70742200;WS=70742182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	70748784	rs2255607	G	A	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=87;PP=2965;SC=GGCCGAGGACGGCCCGGGTGC;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=66;TCR=87;TR=153;WE=70748792;WS=70748774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr10	70775959	rs35893997	C	T	3718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=2167;ReadPosRankSum=-1.211;SC=TTCGAGTTGCCCGTCTCTATG;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=128;WE=70775967;WS=70775949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,165:0.58:284
chr10	70856852	rs2229498	G	A	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=30;PP=1515;SC=TATCCTACGCGGAGAGCCAGG;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=70856860;WS=70856842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	70922180	.	G	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=135;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TAAAGGATGTGATTGTTGGAA;SOR=0.795;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=10;WE=70922188;WS=70922170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	70940306	.	C	T	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=62;PP=1687;ReadPosRankSum=1.042;SC=GCTAACCCGGCCTCTGGACAA;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=85;TCR=109;TR=108;WE=70940314;WS=70940296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,126:0.57:223
chr10	70951565	rs370229180	AT	A	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.552;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
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chr10	70992664	rs874556	C	T	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GGGAACGGCACAGAGGTACCT;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=84;WE=70992672;WS=70992654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,100:0.45:224
chr10	70992912	rs5030970	A	T	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=50;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GGGAAGCAGCAGTGCAGGAAT;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=80;WE=70992920;WS=70992902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr10	70992949	rs5030971	T	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.593;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TGGGCACGGGTGGGAGTCAGG;SOR=1.488;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=52;WE=70992957;WS=70992939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr10	70992970	rs5030972	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=674;ReadPosRankSum=0.392;SC=CTGCACGCAGGAGAGAACAGC;SOR=1.857;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=33;WE=70992978;WS=70992960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr10	70998703	rs72814215	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=571;ReadPosRankSum=1.097;SC=AGAAGAGAAGGCCATGGGGGA;SOR=0.929;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=35;WE=70998711;WS=70998693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr10	70998738	rs4145930	G	A	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=37;PP=2005;SC=AAGTTTCTGCGGCTCAGTTGC;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=70998746;WS=70998728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	70998909	rs5030973	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GAATTCACCTCGGTGTGGGAG;SOR=0.331;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=15;WE=70998917;WS=70998899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr10	71008077	rs112539375	G	GC	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GCTGAGCCCCGCCCCGCAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=8;WE=71008085;WS=71008067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	71008105	rs7903151	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=346;ReadPosRankSum=2.902;SC=GGACTGGGTTTACTGCTGCCC;SOR=1.071;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=19;WE=71008113;WS=71008095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr10	71010026	rs4745978	T	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=637;SC=GGAATGCAGCTGCTGCTTTCT;SOR=1.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=71010034;WS=71010016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	71016947	rs2279930	C	G	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1127;ReadPosRankSum=1.266;SC=CCCCTCTGCTCTGCCATCCTC;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=68;WE=71016955;WS=71016937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr10	71018660	rs1111335	T	C	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=34;PP=920;SC=AGATGACATCTGGACCCGATA;SOR=1.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=71018668;WS=71018650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	71026510	rs906219	C	A	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AGAAGGAGAACTAGGAACCCC;SOR=0.841;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=80;WE=71026518;WS=71026500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,95:0.53:178
chr10	71027231	rs2611	G	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=2.281;SC=TGTGTTGCAGGTGTTGATAGT;SOR=0.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=10;WE=71027239;WS=71027221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr10	71052083	rs4746836	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=396;ReadPosRankSum=0.039;SC=CCTGCCTCAGCCTCCTAAAGT;SOR=0.501;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=28;WE=71052091;WS=71052073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr10	71060610	rs906220	A	G	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=992;ReadPosRankSum=1.852;SC=AGAGCCCTGCATGATTTTGTA;SOR=0.754;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=74;WE=71060618;WS=71060600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,99:0.52:189
chr10	71060634	rs906221	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=1095;ReadPosRankSum=1.419;SC=AGAAAATCCTGGAATACCCAC;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=70;WE=71060652;WS=71060624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr10	71060696	rs906222	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.897;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=1412;ReadPosRankSum=-1.030;SC=AGGATACAAGGTTAATATACA;SOR=1.371;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=40;WE=71060715;WS=71060686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr10	71060707	rs906223	T	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=4;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=1412;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTAATATACATAAATCAATTG;SOR=1.168;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=33;WE=71060715;WS=71060686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr10	71098295	rs7912524	T	A	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=33;PP=1298;SC=CAGCTGGAAGTGGTGCTGTGC;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=71098303;WS=71098285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	71098376	rs10998724	T	G	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=617;SC=GCTGGAGCAGTAAAGCAGCGG;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=71098384;WS=71098366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	71098436	rs111495357	AGTGTGTGT	A	318.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=757;SC=TGGAGATGTGAGTGTGTGTGT;SOR=1.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=71098451;WS=71098426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	71142183	rs4746846	G	A	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1204;ReadPosRankSum=1.929;SC=AAGGGTGGCCGGAGGTCCCCA;SOR=0.813;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=86;TCR=31;TR=68;WE=71142191;WS=71142173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr10	71142420	rs748235	G	A	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=69;PP=2553;SC=ACCTCACCAAGGACATGCTGC;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=126;WE=71142428;WS=71142397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	71144702	rs749105	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=889;SC=CTCAGTGATCGGGCAGCACTG;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=71144710;WS=71144692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr10	71164655	rs2229170	C	T	5749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=77;PP=2965;SC=ATCCTGGGGACGCCCCGCCTC;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=92;TCR=77;TR=169;WE=71164672;WS=71164645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr10	71168653	.	T	G	117	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=117;QD=25.2952020912;SC=CCCCGCCCCCTCCAGGCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=71168661;WS=71168643;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	71168685	rs55953810	A	T	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=6;PP=783;SC=CACCTTCTTCATGGCCTGCAG;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=71168693;WS=71168675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr10	71243323	rs10823396	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=1.642;SC=CTAACAGGGCCCTTTCTGTGC;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=71243331;WS=71243313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr10	71244832	rs2305201	C	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=363;ReadPosRankSum=0.648;SC=CAGATGGTGCCTCCCCTGTAC;SOR=0.635;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=25;WE=71244840;WS=71244822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr10	71263991	rs5785921	G	GT	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=391;ReadPosRankSum=0.455;SC=CATTCCTACAGTTTTTTCACG;SOR=0.627;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=15;WE=71263999;WS=71263981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr10	71264325	rs1652804	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=44;PP=1064;ReadPosRankSum=0.340;SC=ATTGAGGTCGGGGTCCTGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=23;TCR=74;TR=58;WE=71264333;WS=71264315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr10	71391211	rs41277242	T	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=832;ReadPosRankSum=-0.056;SC=AACTTGCCTTTATTTCTCCCC;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=57;WE=71391219;WS=71391201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,66:0.53:125
chr10	71562437	rs10998973	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=722;ReadPosRankSum=-0.559;SC=AAATGGAGACGGCTATTTTGG;SOR=0.846;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=48;WE=71562445;WS=71562427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr10	71620436	rs67173564	A	AC	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CCTGGGCAGAACCTGCAGCCA;SOR=1.302;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=6;WE=71620444;WS=71620426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr10	71620671	rs4341432	C	G	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=170;SC=GCTAGGCTGGCGAACGGCTTC;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=71620679;WS=71620661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	71637905	rs10823446	C	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=436;ReadPosRankSum=2.806;SC=AGCCCTCCCCCCCATGAAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=26;WE=71637913;WS=71637895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr10	71647298	rs10999011	G	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.03;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	71649046	rs10999015	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=355;ReadPosRankSum=0.839;SC=ATGGAGCACAGGGGACAGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=22;WE=71649054;WS=71649036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr10	71649309	rs2683572	A	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=28;PP=970;SC=ATGGCTGTCCATGCTGGTCAC;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=71649317;WS=71649299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	71655443	rs1227744	G	A	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=70;PP=2219;SC=TCATGGGGGAGCAGGAGCACC;SOR=1.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=35;TCR=70;TR=105;WE=71655451;WS=71655433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	71657272	rs1227746	A	G	7968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=117;PP=2965;SC=GCTCCAGCCAAATAATTGCCC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=127;TCR=117;TR=244;WE=71657280;WS=71657262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr10	71658512	rs1227747	G	A	5133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=75;PP=2868;SC=AAAGGCGGACGTTCCAGGTAG;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=141;WE=71658520;WS=71658502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	71662783	rs942576	G	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=254;SC=CTCACCACCTGTTGCACTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=71662791;WS=71662773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	71665676	rs2683575	G	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=25;PP=561;SC=TTCCAACCTAGGTGGCTGTGC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=71665684;WS=71665666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	71684530	rs1228671	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=115;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GAGGCAGCCCAGAGGGACTCA;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=71684538;WS=71684520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr10	71685532	rs1227778	G	C	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=21;PP=1671;SC=GGTCCAGGCCGTGGGTTGAGA;SOR=1.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=71685540;WS=71685522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	71686677	rs2274178	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.170;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	71686905	rs3215785	CG	C	989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=634;ReadPosRankSum=0.715;SC=GGGCACTGGACGGGGGGGCTG;SOR=0.856;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=29;WE=71686913;WS=71686895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr10	71689645	rs2763339	T	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=11;PP=778;SC=AGAGAGGCAATGCAAATTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=71689653;WS=71689635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	71689966	rs59283631	TG	T	699.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=660;SC=GAAGGGGAGATGGGGGGGGGC;SOR=1.371;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=10;WE=71689976;WS=71689956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	71689968	rs115514231	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=8;PP=486;SC=AGGGGAGATGGGGGGGGGCAG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=13;WE=71689976;WS=71689956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr10	71874526	rs72807044	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=45;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CACCGCGCCCAGCCTATTTTT;SOR=0.088;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=71874534;WS=71874521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr10	71874569	rs16927320	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=-1.334;SC=CCATCACCAGCTTGGAGAGTT;SOR=0.069;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=7;WE=71874577;WS=71874559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	71874683	rs2271696	G	A	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=15;PP=983;ReadPosRankSum=1.239;SC=TACCCGGCTTGTAGGCCTGGA;SOR=1.509;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=138;TCF=93;TCR=45;TR=65;WE=71874691;WS=71874673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr10	71874734	rs2271695	G	A	2841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=46;PP=1800;ReadPosRankSum=0.094;SC=TGGCCACGGCGATGTTGGCGT;SOR=0.809;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=223;TCF=133;TCR=90;TR=118;WE=71874742;WS=71874724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,132:0.53:251
chr10	71874866	rs61736904	T	C	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=45;PP=1219;ReadPosRankSum=-1.466;SC=CACTGCTGGCTAGTCTGCTCT;SOR=0.814;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=67;WE=71874874;WS=71874856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,90:0.47:191
chr10	71874951	rs72807047	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AGGAGAGGGCGAGCTCTAGAC;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=71874959;WS=71874941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr10	71876382	rs2394656	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=195;ReadPosRankSum=-2.403;SC=GCTCACCAAACGCTTTGCGGT;SOR=0.725;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=15;WE=71876390;WS=71876372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr10	71880190	rs2280201	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=458;ReadPosRankSum=2.151;SC=CCTGAGCAAATTCCTGATGTT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=33;WE=71880198;WS=71880180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr10	71880757	rs4746962	A	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.584;SC=GCTCTGAGTAACCCCGTGGCC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=62;WE=71880765;WS=71880747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr10	71902413	rs2292722	G	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=128;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GGGGGCCAAAGAGCTGGTTAC;SOR=0.498;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=9;WE=71902421;WS=71902403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr10	71903582	rs74560210	GC	TT	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=853;ReadPosRankSum=-2.350;SC=TTCAGGCTGCGCCCTTCGTCC;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=22;WE=71903591;WS=71903572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr10	71905472	rs147890007	C	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=460;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GTGAAGCCCACCCATTCGCCG;SOR=1.091;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=25;WE=71905480;WS=71905462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr10	71905695	rs10999158	A	G	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=54;PP=2900;SC=GCAATGGCGCACCCTTGGGCA;SOR=1.290;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=92;TCR=54;TR=146;WE=71905703;WS=71905685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	71905735	rs11549689	G	A	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1349;ReadPosRankSum=-1.684;SC=CGCCATGGCTGGCCCGCGCTC;SOR=0.557;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=85;WE=71905743;WS=71905725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,95:0.52:184
chr10	71906010	rs11549688	C	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=350;ReadPosRankSum=0.470;SC=GCTCGAGGCTCGCGCACTGGG;SOR=0.193;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=24;WE=71906018;WS=71906000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr10	71974468	rs7911572	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=32;PP=942;SC=TCTTTATTCGCATTTAAGAAT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=71974476;WS=71974458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	71993094	rs7077538	T	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=855;ReadPosRankSum=-0.343;SC=AGTGCCGGAGTCCTGCCGCCG;SOR=0.826;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=56;WE=71993102;WS=71993084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr10	72014846	rs189393456	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=364;ReadPosRankSum=0.420;SC=GCTAGGGCCCGACTCAGAGGG;SOR=0.984;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=27;WE=72014854;WS=72014836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr10	72014967	rs113487866	G	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GGGCAGAGGCGGGCGCGGAAG;SOR=0.992;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=74;WE=72014975;WS=72014957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,86:0.54:159
chr10	72015409	rs10999212	C	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AGGAGTAGAGCGGGTAGGAGC;SOR=0.794;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=71;TCR=83;TR=67;WE=72015417;WS=72015399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,76:0.43:177
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chr10	72037687	rs35789490	T	TG	650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=514;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CTCTAGATGTTGGGGAAGACT;SOR=1.473;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=15;WE=72037695;WS=72037677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
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chr10	72061420	rs4746997	A	G	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=829;SC=AGCCCTGTGCAAAGGGCCATC;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=72061428;WS=72061410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr10	72136000	rs10999304	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GGCGCCATCACTCAGTGGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=72136008;WS=72135990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr10	72164470	rs3750766	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.852;SC=TTCGTGTTCGCTCTTGCCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=4;WE=72164478;WS=72164460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	72179746	rs1043098	C	T	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CACCCTGCCACCTGCCCAATA;SOR=0.515;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=63;WE=72179754;WS=72179736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr10	72181460	rs3793809	G	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=830;SC=TCATTTTATTGGTCCTAACTA;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=72181468;WS=72181450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	72195439	rs1904589	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=958;ReadPosRankSum=0.324;SC=GGCCCCAGGGTGCTTCAGCCA;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=69;WE=72195447;WS=72195429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,73:0.44:167
chr10	72201219	rs10999338	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=568;ReadPosRankSum=0.936;SC=CGCGGCACGCGGCACTGCCTA;SOR=0.352;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=41;WE=72201227;WS=72201209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr10	72207517	rs34717077	AC	A	2180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=13;PP=1909;SC=CCACCAGCCTACCAGATTGTG;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=72207525;WS=72207507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	72288900	rs10999377	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=297;ReadPosRankSum=1.176;SC=GTTTTCCTGCGGTGGGCTCTG;SOR=0.869;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=19;WE=72288908;WS=72288890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr10	72289126	rs10823560	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=0.168;SC=GCCTGCTGCCTCCCACCCCTA;SOR=1.329;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=14;WE=72289134;WS=72289116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr10	72289539	rs12785079	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=0.894;SC=GTTCTTTTTGCCCCTATTTCC;SOR=1.417;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=12;WE=72289547;WS=72289529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	72289701	rs2275059	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=601;ReadPosRankSum=0.373;SC=TGGGCACCGTGGGAAGCTGTG;SOR=0.668;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=38;WE=72289709;WS=72289691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr10	72290978	rs12773720	G	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=2411;ReadPosRankSum=0.187;SC=GCCCTGAGGTGGGGCAGTGGT;SOR=0.492;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=125;TCF=94;TCR=31;TR=58;WE=72290990;WS=72290968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr10	72290982	rs117602206	C	T	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=17;PP=2724;ReadPosRankSum=0.606;SC=TGAGGTGGGGCAGTGGTGCAG;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=100;TCR=34;TR=69;WE=72290990;WS=72290968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr10	72291172	rs61737673	G	A	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=64;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TGGACCCGGGGTCCGGGTGGA;SOR=1.025;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=208;TCF=71;TCR=137;TR=91;WE=72291180;WS=72291162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,100:0.42:239
chr10	72292258	rs10999378	G	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=378;ReadPosRankSum=2.044;SC=TCCCTCATGGGGGGCAGAAGC;SOR=0.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=21;WE=72292266;WS=72292248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr10	72293713	rs12764399	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=730;ReadPosRankSum=1.113;SC=GTGATGCCCACGGGCCTCCCC;SOR=0.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=49;WE=72293721;WS=72293703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr10	72293850	rs869574	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	72298631	rs1122918	T	C	6558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=74;PP=2965;SC=GTCCCAGGCTTGGTGCTCTCC;SOR=1.227;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=127;TCR=74;TR=201;WE=72298639;WS=72298621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr10	72307053	rs67684173	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=378;ReadPosRankSum=-1.606;SC=CCCCCTTCTCTGGCCCCAGGT;SOR=0.704;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=39;WE=72307061;WS=72307043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr10	72307101	rs3740447	C	T	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=470;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CGATGGGCACCGTGTGAAGAA;SOR=0.777;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=31;WE=72307109;WS=72307091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
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chr10	72324052	rs117649012	G	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=228;ReadPosRankSum=1.084;SC=AGGGCAGCAGGGTGGCATGTT;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=15;WE=72324060;WS=72324042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
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chr10	72358577	rs885822	G	A	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=69;PP=2252;ReadPosRankSum=0.558;SC=CCACTTCCGAGTGGCGCTCCC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=287;TCF=148;TCR=139;TR=145;WE=72358585;WS=72358567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,179:0.52:347
chr10	72432438	rs373452188	AGGCGGCAGC	A	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.550;NF=10;NR=2;PP=2708;ReadPosRankSum=0.354;SC=GAGGCGGCTGAGGCGGCAGCG;SOR=0.616;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=72432454;WS=72432428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr10	72432498	rs12762780	C	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.560;NF=18;NR=12;PP=353;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CTAGCCTCGCCGCCCTCAGCC;SOR=0.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=30;WE=72432506;WS=72432488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr10	72432521	rs12762616	A	C	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.361;NF=19;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-1.011;SC=GGACTTGGGGATCGGGCGCTT;SOR=0.487;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=36;WE=72432529;WS=72432511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr10	72434194	rs614201	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=441;ReadPosRankSum=0.879;SC=TCAGGCTAAGGGGCCCACCTA;SOR=0.309;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=24;WE=72434202;WS=72434184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr10	72462283	rs12775317	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=0.117;SC=AGTGTTTCCCGGTCACTTCTG;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=34;WE=72462291;WS=72462259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr10	72468584	rs117280157	C	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=742;ReadPosRankSum=0.145;SC=TGGGGTGGGCCCCACCCCACC;SOR=0.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=26;TCR=79;TR=43;WE=72468592;WS=72468574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr10	72492155	rs41277996	G	C	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=59;PP=2049;SC=TGGCAGCTGTGCCGTGAGCTC;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=72492163;WS=72492145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	72492212	rs2587478	T	C	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=39;PP=1164;SC=TTGGCCTGGTTCCAGTGTCCT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=72492220;WS=72492202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	72492244	rs10740357	A	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=777;SC=GAGGAGCTGGACTGCCACTGC;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=72492252;WS=72492234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	72493876	rs10740358	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=31;PP=722;SC=TTCCCCACGTTGCCCCTGGCT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=72493884;WS=72493866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	72494778	rs12765664	G	A	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=4;PP=898;SC=AAGGCAGCCCGTCCTCCCTGG;SOR=3.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=72494786;WS=72494768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	72496375	rs1861517	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=9;PP=750;SC=CTCCATCACTACCCTTTGTTC;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=72496383;WS=72496365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	72500763	rs10823607	T	C	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=55;PP=2246;SC=GGAGGCCGCCTGTGCTTAGGG;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=124;WE=72500771;WS=72500753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr10	72504920	rs10999505	C	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=269;SC=GAGTGGGGGACGCTGGGCAGT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=72504928;WS=72504910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	72505208	rs7907248	A	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.00;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	72505243	rs7923892	T	C	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=27;PP=807;SC=ACCCATTCCATGGTTTACATT;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=72505251;WS=72505233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	72513635	rs12774070	C	A	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=43;PP=1833;SC=ACAGTGCCTGCTGCCCCTCTC;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=72513643;WS=72513625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	72513682	rs2587475	C	T	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=57;PP=1757;SC=CCAAAGCCTGCGCCGGGGACC;SOR=1.034;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=72513690;WS=72513672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	72517837	rs6480463	C	T	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=28;PP=957;SC=GCAGCCTGCCCGCCTGTGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=72517845;WS=72517827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	72520330	rs10823615	A	G	6418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CAGATGCTGCAGAGCCTCCTG;SOR=0.281;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=114;TCR=94;TR=207;WE=72520338;WS=72520320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,242:1.00:243
chr10	72520567	rs10823616	A	G	5192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=102;PP=2965;SC=AAGACCTGAGACATCCCGGCA;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=55;TCR=102;TR=157;WE=72520575;WS=72520557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr10	72533910	rs7077672	C	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=10;PP=1012;SC=CCAGGTCCCACTGGCCTCACC;SOR=2.393;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=48;WE=72533918;WS=72533900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	72535007	rs2254174	C	T	7083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=105;PP=2965;SC=TTCCAGGATCCGACACAGGAG;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=205;WE=72535015;WS=72534997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr10	72536288	rs7897034	T	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	72536293	rs2254308	T	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.22;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	72536779	rs2254422	A	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=703;SC=TGCTGACTCCACAGGGCTGGA;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=72536787;WS=72536769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	72536936	rs2254433	A	G	5031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=82;PP=2965;SC=GAAGGAGGAAAGCCTGGACTC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=165;WE=72536944;WS=72536926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr10	72537450	rs2254445	T	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=485;SC=TAGGTCCTCCTTGCTGCTCCT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=72537458;WS=72537440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	72614421	rs2171157	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=14;PP=1559;SC=CTGTCTCTACTGTACTCTTGC;SOR=2.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=70;WE=72614429;WS=72614411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	72617256	rs2297842	A	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=1;PP=443;SC=TTGGGTTTCCACTCAACATTT;SOR=2.737;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=72617264;WS=72617246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	72619205	rs827255	C	T	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=110;PP=2965;SC=AGGCAGAAATCGTGAGGATAG;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=71;TCR=110;TR=181;WE=72619213;WS=72619195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr10	72633458	rs10762410	C	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=358;SC=TTGTCTCCTGCGATATAGAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=72633466;WS=72633448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	72636450	rs923177	T	G	7938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=138;PP=2965;SC=TTTCTTCTCTTGGAAATTTAG;SOR=0.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=110;TCR=138;TR=248;WE=72636458;WS=72636440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr10	72643671	rs9712	C	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=25;PP=1268;SC=TCAGTCACCCCTTCCCCCGGA;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=72643679;WS=72643661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	72648083	rs2854614	TC	GT	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	72648086	rs827239	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	72648134	rs827238	A	G	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=19;NR=16;PP=576;SC=CCCCGCCGCCAGCGACAGAGA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=72648142;WS=72648124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	72813306	rs10762420	G	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=964;ReadPosRankSum=2.013;SC=GCCTCTGTCTGTGTTCCTGGG;SOR=0.744;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=73;WE=72813314;WS=72813296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,97:0.44:221
chr10	72813361	rs10740361	A	G	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=894;ReadPosRankSum=0.553;SC=ATCTAATTGCAGGGTCACCCA;SOR=0.866;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=46;TCR=79;TR=57;WE=72813369;WS=72813351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,67:0.43:155
chr10	73039860	rs4415677	C	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=738;SC=GAGGCACAGGCCTAGCTCCAT;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=73039868;WS=73039850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	73044382	rs10823716	T	A	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=10;PP=554;SC=TGGGCAAGAGTGCCAGCAGGA;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=73044390;WS=73044372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	73044413	rs10762434	G	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=15;PP=764;SC=AAGGCCGGGGGTGTCCTGTGC;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=73044421;WS=73044403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	73044580	rs12770025	G	A	4501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=52;PP=2651;SC=GGAGCTCCGCGGGCACCACCA;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=131;WE=73044588;WS=73044570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	73044674	rs10999762	G	A	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=73;PP=2587;SC=CCATCCCTGAGGATGCTGGAG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=56;TCR=73;TR=129;WE=73044682;WS=73044664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	73044924	rs7350453	A	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	73044930	rs7350455	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.99;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	73044954	rs6480503	A	G	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=927;SC=GAAATTTCCCAGGCAAAGGCC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=73044962;WS=73044944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	73047593	rs7074280	G	A	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=56;PP=1686;SC=TGCCAGAGCCGGGACAGCCAT;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=73047601;WS=73047583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	73050983	rs3740462	C	T	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=1004;SC=CCAGAGTTTGCTCTAGAGATA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=73050991;WS=73050973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	73078862	rs7924115	C	G	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=21;PP=947;SC=AATGGGCGCACGCAGGCCCCA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=54;WE=73078870;WS=73078852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	73079004	rs72542481	C	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=20;PP=614;SC=CCGCCTGCCGCCTGCCAAGCC;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=73079012;WS=73078994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	73079147	rs17525188	G	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=132;SC=TCCCTCCCGGGCCCTGGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=73079155;WS=73079137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	73082563	rs2277257	A	G	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=52;PP=2126;SC=CTCCACCTACAGAACCACAAG;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=73082571;WS=73082553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	73103904	rs41281300	C	G	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=26;PP=2033;SC=TCTCTGCTCGCGTGGAACTGC;SOR=1.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=91;WE=73103912;WS=73103894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	73104056	rs2243540	A	G	6548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=108;PP=2965;SC=CAGGTAGGCGACTCTCTTCCC;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=196;WE=73104064;WS=73104046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr10	73111258	rs780667	G	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=12;PP=1306;SC=TGGCTCACCAGCCCCAGCCCA;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=73111266;WS=73111248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	73111408	rs780668	C	T	7707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=106;PP=2965;SC=GTGGACACTTCCTCCTGGACC;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=125;TCR=106;TR=231;WE=73111416;WS=73111398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr10	73115941	rs2252997	TG	CA	5586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=36;PP=2947;SC=TGACGGCCACTGTCTTCCTCG;SOR=0.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=84;WE=73115950;WS=73115931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	73121645	rs2487067	C	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=362;SC=TGAGTGCCCACCCCTGGCTGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=73121653;WS=73121635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	73121913	rs2487068	A	G	8152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=117;PP=2965;SC=CTACCCCGCCATCTGCACCAA;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=156;TCR=117;TR=273;WE=73121921;WS=73121903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr10	73121945	rs1084004	T	C	10550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=177;NR=148;PP=2965;SC=TCAACAAGGGTTCGGGCTCAC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=325;TCF=177;TCR=148;TR=325;WE=73121953;WS=73121935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr10	73157033	rs147915565	C	CCGAGG	2491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=1414;SC=AGAGCAGAGCCCGAGGCGAGG;SOR=1.047;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=24;WE=73157041;WS=73157023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	73199501	rs4747153	C	A	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=42;PP=2037;SC=CTCTCTGGAGCTGCAGAGGTG;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=102;WE=73199509;WS=73199491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	73326476	rs374236078	A	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=893;ReadPosRankSum=0.469;SC=TCACCCTTGTACTTGCTTTGC;SOR=0.994;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=53;WE=73326484;WS=73326466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr10	73326757	rs7087735	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=-0.756;SC=AAGAGAGTGACGGGGCATTCC;SOR=1.264;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=20;WE=73326765;WS=73326747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr10	73337850	rs6480531	G	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AGAGGTCTGCGGGCATGTGGG;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=33;WE=73337858;WS=73337840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr10	73377314	rs7903772	C	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.882;SC=AATCACTAGTCTCTACTTTTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=73377322;WS=73377304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	73403490	rs10823810	A	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=717;ReadPosRankSum=-1.894;SC=CTAGGGTGTGATCCTGGGGTC;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=37;WE=73403498;WS=73403480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr10	73406636	rs11598249	C	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	73439066	rs3802717	A	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=831;ReadPosRankSum=0.927;SC=AGTCTTCCCCACCCTCCCAGC;SOR=0.522;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=48;WE=73439074;WS=73439056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr10	73439101	rs1227042	T	C	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=24;PP=1327;ReadPosRankSum=0.722;SC=TGGCCCCCAGTCTCCTGCAGG;SOR=0.708;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=159;TCF=108;TCR=51;TR=79;WE=73439109;WS=73439091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,88:0.49:178
chr10	73447281	rs1227087	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=553;ReadPosRankSum=0.462;SC=CTGGTTATACGGAGAGGCCAA;SOR=1.374;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=30;WE=73447289;WS=73447271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr10	73447555	rs1227086	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GTGCAGACCCCGGCTCTGCAC;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=22;WE=73447563;WS=73447545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr10	73455201	rs3752752	T	C	4332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=87;PP=2435;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGGACATCAATGACAACCACC;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=323;TCF=166;TCR=157;TR=176;WE=73455209;WS=73455191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,204:0.54:380
chr10	73455273	rs3752751	T	C	3378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=84;PP=1773;ReadPosRankSum=0.168;SC=CAGACTCTGATGTGACCACGG;SOR=0.527;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=237;TCF=87;TCR=150;TR=138;WE=73455281;WS=73455263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,162:0.59:275
chr10	73455308	rs3752750	T	C	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=63;PP=1316;ReadPosRankSum=-1.230;SC=GCAGCAGAACTGCCAGGCGGC;SOR=0.358;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=152;TCF=40;TCR=112;TR=90;WE=73455316;WS=73455298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,100:0.61:165
chr10	73483773	rs72817951	G	A	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1125;ReadPosRankSum=0.444;SC=TGGCATTCAAGAAGTAACTCG;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=67;WE=73483781;WS=73483763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,70:0.49:142
chr10	73492079	rs1227065	A	G	3254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=2005;ReadPosRankSum=0.856;SC=GTACCGCTTCAACGCCTACAC;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=276;TCF=130;TCR=146;TR=128;WE=73492087;WS=73492069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,160:0.47:342
chr10	73494159	rs1227062	T	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=572;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGACACTTCCTAACCCATGTC;SOR=0.320;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=31;WE=73494167;WS=73494149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr10	73494229	rs1227061	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=434;ReadPosRankSum=1.056;SC=AGCCTGAGGCTTCGCCATGTC;SOR=0.407;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=25;WE=73494237;WS=73494219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr10	73494395	rs77770890	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=727;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CCCCTCCTGCTGCTGCCTCTG;SOR=0.669;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=53;WE=73494403;WS=73494385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr10	73499561	rs10762474	C	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=624;ReadPosRankSum=0.602;SC=ACTGAGAGACCACTGGCTAAG;SOR=0.456;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=41;WE=73499569;WS=73499551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr10	73501374	rs1227052	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=452;ReadPosRankSum=1.166;SC=GGGGAGCCTTCGGGCTACAGG;SOR=1.188;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=25;WE=73501382;WS=73501364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr10	73501556	rs1227051	G	A	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.693;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1677;ReadPosRankSum=0.889;SC=CAAGGACATGGCCTTCCGCAT;SOR=0.487;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=200;TCF=87;TCR=113;TR=111;WE=73501564;WS=73501546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,123:0.53:232
chr10	73515103	rs3747858	G	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=1.116;SC=CCCAGGCAGGGAGGAATACTC;SOR=0.415;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=46;WE=73515111;WS=73515093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr10	73520391	rs10999987	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=363;ReadPosRankSum=1.634;SC=CAAGGCACAGCCACTCCAGAG;SOR=1.082;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=23;WE=73520399;WS=73520381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr10	73520511	rs41305045	G	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.438;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=0.889;SC=GAGGAGGACCGGGGGGTTCTG;SOR=0.668;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=37;WE=73520519;WS=73520501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr10	73520632	rs3747869	A	C	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=1412;ReadPosRankSum=1.272;SC=TACTTTCACTATCCTGGGAGG;SOR=0.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=63;WE=73520640;WS=73520622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr10	73521371	rs3747867	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=571;ReadPosRankSum=-2.008;SC=GCACCTGCAGCTCCATGGCAC;SOR=0.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=37;WE=73521379;WS=73521361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr10	73533177	rs3747862	A	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1135;ReadPosRankSum=0.905;SC=GCCGGCCTCCAGGGCCGTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=74;WE=73533185;WS=73533167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,86:0.54:158
chr10	73537388	rs7917781	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=1.258;SC=GGATCCACCTTGGTCCCTCTG;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=73537396;WS=73537378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	73537614	rs17712523	G	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CTATGCCATCGTCGCAGGCAA;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=84;WE=73537626;WS=73537604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,94:0.56:167
chr10	73538896	rs6480555	T	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=525;SC=CATATCCGACTTCCCATATGA;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=73538904;WS=73538886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	73545236	rs3802709	G	T	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=1054;SC=GGTCACTCTCGCCCCGGCGAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=73545244;WS=73545226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	73550117	rs11592462	C	G	7279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=113;PP=2965;SC=GCCGTGGTGACCTACCAGCTG;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=221;TCF=108;TCR=113;TR=221;WE=73550125;WS=73550107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr10	73556957	rs139409005	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=688;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CTACCAGAGCGCTCTGTCAGT;SOR=0.745;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=43;WE=73556965;WS=73556947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr10	73571581	rs140848302	C	CCT	497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.071;NF=2;NR=8;PP=367;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CCCACCGGAGCCACAAGCCTG;SOR=0.986;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=10;WE=73571589;WS=73571571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	73578704	rs142614739	AAGTCTC	A	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=238;ReadPosRankSum=-0.680;SC=CCCCACGGCCAAGTCTCAGAG;SOR=1.536;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=6;WE=73578717;WS=73578694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	73583520	rs2249814	G	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=2.449;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr10	73591829	rs41306532	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=0.647;SC=CACCCTGCATGAGCAGCGCTG;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=23;WE=73591837;WS=73591819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr10	73594358	rs3878001	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-1.578;SC=TGTCCTTGAGCTGGACTCTGC;SOR=0.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=11;WE=73594366;WS=73594348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr10	73765773	rs11000129	T	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=667;ReadPosRankSum=-1.286;SC=TTCATCTTCCTTTCAAGGTGG;SOR=0.532;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=46;WE=73765781;WS=73765763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr10	73767281	.	G	A	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=75;PP=1984;ReadPosRankSum=-0.164;SC=TCTTCGAGCCGCTGTGGCACA;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=122;TCR=137;TR=138;WE=73767289;WS=73767271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,156:0.51:307
chr10	73767859	rs3740129	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=462;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CTGGGGCTGCGGCAGCCCGCC;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=27;WE=73767867;WS=73767849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr10	73822507	rs1530803	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=232;ReadPosRankSum=0.749;SC=GCAGCCGGCTCCTGAGGGCGT;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=13;WE=73822515;WS=73822497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr10	73822957	rs1530802	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=655;ReadPosRankSum=0.964;SC=CAGAGCAGGGGCCCAGGCTGT;SOR=0.919;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=36;WE=73822965;WS=73822947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr10	73823019	rs1668172	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=476;SC=AGAAGTCTATACACCCCCAGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=73823027;WS=73823009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	73824170	rs2242250	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.094;SC=TCTATGGCACGAAAACGCTCA;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=73824189;WS=73824160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr10	73824181	rs2242251	C	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=403;SC=AAAACGCTCACTCTCTATTTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=73824189;WS=73824160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	73824203	rs2242252	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=265;SC=GGGAGCTCATTCCACAGCTGT;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=73824211;WS=73824193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	73827292	rs1530804	A	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=234;SC=ACAAGGGCAGACTGGCCCAGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=73827300;WS=73827285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr10	73848105	rs10713496	TG	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-1.960;SC=GGGTTCGACCTGGGGGGGTCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=73848113;WS=73848095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	73856984	rs3312	A	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=889;ReadPosRankSum=2.049;SC=ACCACCCAGGAAAGTCACCAT;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=49;WE=73856992;WS=73856974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr10	73862032	rs1668154	C	T	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1412;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TGAAAGGGAGCTACTTCATGG;SOR=0.605;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=233;TCF=113;TCR=120;TR=92;WE=73862040;WS=73862022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,121:0.40:303
chr10	73964004	rs4237336	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=570;SC=CGAGACTCTGCCTCAAAAAAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=73964012;WS=73963994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	73970451	rs7069703	G	T	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GAGTTTCCTGGAAGTGTCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=76;WE=73970459;WS=73970441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,96:0.52:184
chr10	74035041	rs1053639	T	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=509;ReadPosRankSum=-1.787;SC=GACTGATTCCTGTGGTTGGAA;SOR=1.075;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=26;WE=74035049;WS=74035031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr10	74100642	rs9416018	G	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=561;ReadPosRankSum=-0.941;SC=GGTCAGAGGGGCTGAGTCAGG;SOR=0.592;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=45;WE=74100650;WS=74100632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr10	74139200	rs11000276	T	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=20;PP=1286;SC=TAACCATTCCTTTTTCTGCAT;SOR=1.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=74139208;WS=74139190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	74182917	rs10823922	T	C	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=26;PP=1327;SC=CTCATCATTATGTTAATACCT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=74182925;WS=74182907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	74183251	rs7069357	G	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=268;SC=TATTTTTGAGGTACAATTCTC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=74183259;WS=74183241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	74234817	rs915432	T	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1192;SC=TGCCCATCAGTTCCACATGTG;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=74234825;WS=74234807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	74235192	.	A	AT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=18;MQ=62.13;NF=1;NR=2;PP=49;QD=18.3333333333;SC=GCTTACAACAATTTTTTTTTT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=3;WE=74235200;WS=74235182;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr10	74235470	.	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=0.137;SC=TGCAGGAGTGAGCCACCGCGC;SOR=1.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=14;WE=74235478;WS=74235460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr10	74235771	rs11000322	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=708;SC=GATCACCTGCGGTCAGGAGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=74235779;WS=74235761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	74268031	rs3793927	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=950;SC=AAATTTTCTATAGAATGTATG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=74268039;WS=74268021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	74293584	rs10509343	A	T	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=22;PP=810;SC=AGCTACTGATAATAACTCAAG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=74293592;WS=74293574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	74293601	rs11818304	T	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=20;PP=802;SC=CAAGTGAAATTTATAAAATGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=39;WE=74293609;WS=74293591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	74695287	rs2461917	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=2;PP=291;SC=GTTGGAAGAATGAATGAGTCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=74695295;WS=74695277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	75035466	.	A	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TTACAGAATGAAATAATTATC;SOR=1.569;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=13;WE=75035474;WS=75035456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	75230635	rs3729702	G	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=477;ReadPosRankSum=0.235;SC=CAGGGAAACAGAATTCTTACC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=34;WE=75230643;WS=75230625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr10	75300994	rs4746136	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-0.748;SC=ACGGGTATCTGTACACAAATA;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=75301002;WS=75300986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr10	75301083	rs17672418	T	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=364;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TCCTAAGCAATACTAAGACGC;SOR=0.619;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=24;WE=75301091;WS=75301073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr10	75490217	rs11814282	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GGCACCGAACTTGCTCACAAC;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=75490225;WS=75490207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	75519322	rs10740418	T	C	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=1697;ReadPosRankSum=-1.398;SC=GACACTTCTGTAGACTTCAAA;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=203;TCF=116;TCR=87;TR=111;WE=75519330;WS=75519312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,124:0.52:237
chr10	75525999	rs3849969	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=593;ReadPosRankSum=-0.983;SC=GTGTTTCCTGAGGTTAATGAT;SOR=0.833;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=33;WE=75526007;WS=75525989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr10	75532848	rs145929404	GCCAGGACTCCAGGTGTCCAGGACTCCAGGTGT	G,GCCAGGACTCCAGGTGT	890.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=1,1;NR=8,8;PP=2970,938;SC=GCGGGTTGAGGCCAGGACTCC;SOR=0.941;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9,9;WE=75532887;WS=75532838;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:25
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chr10	75559662	rs141230821	C	CTCTA	1362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=1067;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAGAGCGAGACTCTATCTCAA;SOR=1.044;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=21;WE=75559670;WS=75559652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr10	75562161	rs13013	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-1.981;SC=TCTGGACCTGCCCCTTAGGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=75562169;WS=75562151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	75563600	rs74666201	G	C	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.487;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=857;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GGGGTATTTTGGGGGAAGGGA;SOR=1.287;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=52;WE=75563608;WS=75563590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,53:0.64:83
chr10	75607168	rs2242258	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=682;ReadPosRankSum=-1.603;SC=GCAACACTGGTTCTGTCTTCA;SOR=0.450;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=39;WE=75607176;WS=75607158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr10	75607696	rs67135801	CA	C	1531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=1577;SC=GCCCGAGGAGCAAGGACATCT;SOR=3.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=38;WE=75607704;WS=75607686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	75612881	rs2250140	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=674;ReadPosRankSum=-1.609;SC=TGTTTAGGCCTCTTCCTGAGC;SOR=0.616;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=42;WE=75612889;WS=75612871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr10	75620757	rs2664282	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=545;ReadPosRankSum=0.107;SC=TTGTGATGATTTGCTGAAGTA;SOR=1.193;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=26;WE=75620765;WS=75620747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr10	75632760	rs2675671	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=432;ReadPosRankSum=3.157;SC=GGGCAGACAACTTCTTGGTAT;SOR=1.000;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=36;WE=75632768;WS=75632750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,43:0.33:129
chr10	75673101	rs2227564	T	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=810;ReadPosRankSum=2.276;SC=GGCCTAAAGCTGCTTGTCCAA;SOR=0.580;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=154;TCF=74;TCR=80;TR=68;WE=75673109;WS=75673091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,85:0.45:189
chr10	75673731	rs2227566	C	T	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=908;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GGTATCTTCTCCCACAGTGAT;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=64;WE=75673739;WS=75673721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr10	75674740	rs2227571	C	T	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=611;ReadPosRankSum=0.027;SC=ATGAGCCCAGCGTGATCAAGG;SOR=0.419;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=48;WE=75674748;WS=75674730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr10	75843100	rs1908339	T	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.313;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=524;ReadPosRankSum=0.798;SC=AACAATGTAGTTATTGAATAT;SOR=0.401;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=35;WE=75843108;WS=75843090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr10	75863750	rs2270552	C	T	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=45;PP=1304;SC=GAAATTGGAGCGGGACTGGTT;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=51;WE=75863758;WS=75863740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	75865065	rs767809	G	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=371;SC=CCATCTCCCCGATGGTGATGG;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=75865073;WS=75865055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	75866929	rs2131957	C	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=487;SC=TGCTGCTGCACAGACAGTGCT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=75866937;WS=75866919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	75871735	rs2131956	C	G	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=62;PP=2930;SC=ATGCTGCTGGCTTCCCTGTCC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=93;TCR=62;TR=155;WE=75871743;WS=75871725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	75874166	rs372451454	CGT	C	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr10	75874192	rs28639484	T	C	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr10	75889760	rs35456205	GA	G	3756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=95;PP=2040;SC=CCTGAAGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.964;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=109;TCF=6;TCR=103;TR=98;WE=75889769;WS=75889750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	75896601	rs10762576	A	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=696;SC=ATGGAAGGCAAAAAGAAAGGC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=75896609;WS=75896591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	75936611	rs10824095	C	T	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=60;PP=2856;SC=CGCCGTGGCGCTGGGCAGGAG;SOR=0.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=144;WE=75936619;WS=75936601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	76158177	rs2126763	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=437;SC=TCTATTGAAACATATGCTAAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=76158185;WS=76158167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	76349029	rs12778270	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=299;ReadPosRankSum=1.055;SC=TCTTTTTTTTTTTTATTTCAG;SOR=1.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=19;WE=76349037;WS=76349019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr10	76429870	rs10740443	T	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=783;ReadPosRankSum=-2.067;SC=GAGCTTCAGATGTTACTGGGT;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=54;WE=76429884;WS=76429860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr10	76737350	rs17641765	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-1.494;SC=CTGTACATTCAAAAGCAATGA;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=76737358;WS=76737340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr10	76855326	rs3740318	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=327;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CTGATCCAGAAGTGCACCTTG;SOR=0.567;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=18;WE=76855334;WS=76855316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr10	76855412	rs3740317	G	A	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=918;ReadPosRankSum=-1.712;SC=AGGGGTTGTCGTCCGCCTCGA;SOR=0.928;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=62;WE=76855420;WS=76855402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,78:0.43:180
chr10	76857364	rs3824742	C	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=11;PP=883;ReadPosRankSum=0.079;SC=GGGAGGCAAGCGTGCCACCTC;SOR=0.904;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=52;WE=76857372;WS=76857354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr10	76861680	rs6480771	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=-2.042;SC=TTCGTGCTGCTGGCTTTCAGC;SOR=1.692;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=22;WE=76861688;WS=76861670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr10	76867899	rs7912300	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=263;ReadPosRankSum=-0.989;SC=GTAGAGGCCCTTGTGGGCGGC;SOR=0.412;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=16;WE=76867907;WS=76867889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr10	76971781	rs3740312	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	76971844	rs2804535	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=278;SC=CGTTATAGTTCTATTGTAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=76971852;WS=76971834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	77191441	rs55922628	C	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=158;ReadPosRankSum=-0.648;SC=TGCCGCCGCGCCCCCGCGCTC;SOR=0.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=12;WE=77191449;WS=77191431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr10	77312184	rs1367290	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=-0.967;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr10	77542558	rs2133705	C	T	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=247;SC=CCGCAACTTTCACTTGTTGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=77542566;WS=77542549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	77807027	rs1898071	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=22;PP=880;SC=GCTGGTCAGCTTGGAAAAGGA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=77807035;WS=77807017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	77807092	rs1898070	A	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=26;PP=848;SC=CCATGGTGGGAAAAGGGAAAA;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=77807100;WS=77807082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	77818594	rs7924288	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=469;SC=CATGGCAGTGCTTACACCCCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=77818602;WS=77818584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	78649399	rs2288840	C	T	5897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=127;PP=2965;SC=AGCAGGGAAACGGGTCTTTTC;SOR=1.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=59;TCR=127;TR=186;WE=78649407;WS=78649389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	78729669	rs2288837	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=179;ReadPosRankSum=0.560;SC=GGGTGAGGAGAGGGCGAGGGG;SOR=0.346;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=78729677;WS=78729659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	78767769	rs72390326	CTGTAGACTGCAT	C	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=2965;SC=CCAGGCTACTCTGTAGACTGC;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=12;WE=78767788;WS=78767759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	78839127	rs139730603	A	AGTGT,AGT	278.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7,7;NR=2,2;PP=73,153;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGCATGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=0.941;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9,9;WE=78839135;WS=78839117;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.89:9
chr10	78844579	rs34592624	G	GA	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.028;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr10	78868165	rs138226779	CAAA	C	1398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=21;PP=345;SC=AAACAAGAGCCAAAAAAAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=30;WE=78868188;WS=78868155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	78944590	rs1131824	G	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1154;ReadPosRankSum=1.970;SC=CCCGCAAGCCGAAGTAGAGAA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=73;WE=78944598;WS=78944580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,85:0.48:176
chr10	78944796	rs150813973	AC	A	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=395;ReadPosRankSum=1.441;SC=ATAAAAGAAAACATTTGGTCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=78944804;WS=78944786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr10	78977190	rs16934368	A	C	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=958;ReadPosRankSum=-1.209;SC=CACATGGCCAACTTCTCCCAA;SOR=0.579;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=68;WE=78977198;WS=78977180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,81:0.41:196
chr10	79163867	rs596832	G	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AGAGCCAGAAGGGGTCCCCAG;SOR=1.449;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=13;WE=79163875;WS=79163857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	79397495	.	T	TGCTGCC	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.714;NF=0;NR=3;PP=64;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TTGCTGCTACTGCTGCCGCCG;SOR=1.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=3;WE=79397503;WS=79397485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr10	79552151	rs1058202	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=356;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CTGAGTCTGGTGTCCCCTCAG;SOR=2.020;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=19;WE=79552159;WS=79552141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
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chr10	79566632	rs1058198	G	A	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1560;ReadPosRankSum=1.070;SC=AGAGGATGTCGTCCTTCTTAA;SOR=0.583;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=106;WE=79566640;WS=79566622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,123:0.51:243
chr10	79571108	rs2289309	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=0.912;SC=TAGCCCTGCACCCTGTGCCCT;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=10;WE=79571116;WS=79571098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr10	79575879	rs1248638	A	G	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=667;ReadPosRankSum=-1.175;SC=GGTGCCAGCCACTAACCACGT;SOR=0.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=42;WE=79575887;WS=79575869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr10	79577408	rs10824577	G	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=185;ReadPosRankSum=0.164;SC=GTAGAGAAATGAGCTCAGTCC;SOR=0.235;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=12;WE=79577416;WS=79577398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	79579047	rs1248635	A	G	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1381;ReadPosRankSum=1.604;SC=GGGCAGCTGGAGTACAGAGAA;SOR=0.688;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=88;WE=79579055;WS=79579037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,100:0.55:182
chr10	79579251	rs2289308	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.078;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=414;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GAGAAAAGACGCCCCAAAGGA;SOR=1.623;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=26;WE=79579259;WS=79579241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr10	79584178	rs1248629	G	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=255;ReadPosRankSum=1.227;SC=CCTGGCAGCTGCGCAGCAGAG;SOR=0.415;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=17;WE=79584186;WS=79584168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr10	79589904	rs55854323	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.732;SC=TGCTACCTGGCTCTCTTCGGG;SOR=0.048;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=79589912;WS=79589894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	79590685	rs10824579	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=426;ReadPosRankSum=-1.594;SC=AACATCCCACCGCGTAACGGC;SOR=1.005;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=19;WE=79590693;WS=79590675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr10	79590726	rs1248663	C	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=2.133;SC=CCATTTGAAACAGCTAAAATG;SOR=0.141;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=79590734;WS=79590716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	79595417	rs1248661	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	79614189	rs1248692	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=916;ReadPosRankSum=-0.963;SC=GGATAGAGGAACCAGGTCCTG;SOR=0.556;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=57;WE=79614197;WS=79614179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,67:0.48:141
chr10	79616605	rs1248696	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=29;PP=738;SC=ATTCACTTGCTGGTCAGTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=79616613;WS=79616595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	79628875	rs1248655	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=291;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CTCCCCAGACAGTGGTACTCA;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=20;WE=79628883;WS=79628865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr10	79729726	rs16935469	A	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=1.196;SC=ACTCCTTGGCAGATTCCAGCT;SOR=0.641;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=28;WE=79729734;WS=79729716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr10	79744817	rs117990962	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=588;ReadPosRankSum=-1.281;SC=ACCCAGAGTTTAAGACACAGT;SOR=0.244;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=27;WE=79744825;WS=79744807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr10	79745789	rs3815891	A	G	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1364;ReadPosRankSum=-1.441;SC=AGCGGCAACTACAAACAGCTC;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=112;TCR=89;TR=83;WE=79745797;WS=79745779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,107:0.44:241
chr10	79760001	rs2241551	T	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=0.355;SC=ATATTCTCACTAAATGGCAGG;SOR=0.160;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=79760009;WS=79759991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	79760686	rs7474957	T	G	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=912;ReadPosRankSum=1.058;SC=TGGAGGAAAGTGTAGATTAAG;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=61;WE=79760694;WS=79760676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,72:0.45:159
chr10	79760818	rs35536566	A	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=1027;ReadPosRankSum=3.371;SC=GCTGTCCCACACAGGCAATCA;SOR=0.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=62;WE=79760826;WS=79760808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,79:0.50:158
chr10	79762028	rs16935534	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=0.404;SC=CACTGCCAGCGTGGTCACGGA;SOR=0.925;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=28;WE=79762036;WS=79762018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
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chr10	79793551	rs3740254	A	G	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=26;PP=1265;ReadPosRankSum=1.346;SC=TGGCGCGCCCACGCCCCCACG;SOR=0.808;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=196;TCF=136;TCR=60;TR=92;WE=79793559;WS=79793541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,105:0.48:220
chr10	79793688	rs3740253	C	T	4136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=96;PP=2299;ReadPosRankSum=-2.266;SC=CCCGTGCAGTCATCTGCCGCG;SOR=0.761;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=346;TCF=146;TCR=200;TR=162;WE=79793696;WS=79793678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,201:0.48:415
chr10	79797690	.	CCT	C	341	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=59.81;NF=5;NR=3;PP=341;QD=46.5;SC=TTTTGCTTTTCCTCTCTACTT;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=8;WE=79797704;WS=79797680;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,8:0.25:32
chr10	79814319	rs72642283	T	C	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=477;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AGTGCAAGCATTGGGAAGAAT;SOR=0.460;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=39;WE=79814340;WS=79814309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr10	80288406	rs1865706	T	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TGAATATTTGTGTTGTTTCCA;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=52;WE=80288414;WS=80288396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr10	80310465	rs2670191	T	C	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=41;PP=1678;SC=TGGGTGTTGTTGGAACCTACT;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=97;WE=80310473;WS=80310455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	80310636	rs7090749	G	A	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=58;PP=2476;SC=TCCAATGTAAGTGTGGAAAAA;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=80310644;WS=80310626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	80763382	rs10762828	C	T	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=53;PP=1855;SC=GTGATGTCTGCGGCACTGAGC;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=80763390;WS=80763372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	80763534	rs10762829	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=395;SC=AAATTGGCCTAGCTTCCTAAC;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=80763542;WS=80763524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	80961519	rs2802371	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=180;ReadPosRankSum=0.504;SC=GGGCATCTGGTGGGTTCTGGC;SOR=1.207;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=16;WE=80961527;WS=80961509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr10	81073763	rs2997468	G	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=337;ReadPosRankSum=1.386;SC=CTGCAGGCATGGGGGGGAGGG;SOR=0.093;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=15;WE=81073771;WS=81073757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr10	81074125	rs1782652	T	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=0.508;SC=GGTCCCCAGCTCTCCTCTGTG;SOR=1.659;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=81074133;WS=81074115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr10	81108956	rs2233718	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=-0.330;SC=GTCGGGGCTCAGAGACCCCTG;SOR=1.850;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=23;WE=81108964;WS=81108946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr10	81192577	rs7898643	A	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.74;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	81205059	rs77237755	G	A	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=34;PP=1773;ReadPosRankSum=1.138;SC=GTGCGGCGCCGGCGGTCGGCT;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=128;TCR=59;TR=110;WE=81205067;WS=81205049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,130:0.59:221
chr10	81266411	rs1010929	T	C	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1417;ReadPosRankSum=-1.545;SC=AGACCTACAGTTGCAGAAGGT;SOR=0.520;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=79;WE=81266419;WS=81266401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,95:0.47:201
chr10	81267591	rs1250778	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=644;ReadPosRankSum=0.299;SC=GGGGACTCTCCAGTGCAAGAG;SOR=0.904;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=43;WE=81267599;WS=81267581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,48:0.40:120
chr10	81272814	rs200388618	G	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.357;NF=12;NR=28;PP=724;ReadPosRankSum=-1.953;SC=CCTGATCACGGTGCTGTCTGC;SOR=1.436;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=40;WE=81272822;WS=81272804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr10	81286374	rs1250962	A	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.685;NF=2;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TCAGGACAATAAACACCTTCA;SOR=2.647;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=14;WE=81286382;WS=81286364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr10	81317292	rs1965707	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=15.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.73;MQRankSum=-2.124;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.499;SOR=3.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr10	81317652	rs17886197	T	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGTCTCCTCTTGGCCATTCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=81317660;WS=81317642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	81317741	rs145350846	G	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.339;NF=12;NR=5;PP=289;ReadPosRankSum=1.213;SC=ATTCTAGAAGGTGGTGCTGAG;SOR=0.722;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=17;WE=81317749;WS=81317731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr10	81318578	rs17880662	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.220;NF=6;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CCATCACCCCTGTGTAACTGA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=6;WE=81318586;WS=81318568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr10	81318593	rs199733516	A	AG	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-5.131;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr10	81318663	rs17886395	C	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.626;NF=21;NR=16;PP=509;ReadPosRankSum=-1.523;SC=CTCTCGCCAGCCTCCCCCTTC;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=37;WE=81318671;WS=81318653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr10	81318820	rs17880349	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.934;NF=4;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTTGGAGCTAGTGAGACTCGA;SOR=1.312;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=22;WE=81318828;WS=81318810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr10	81318930	rs1250943	C	G	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=40;SC=GAACCCACCACCCCTGCAGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=81318938;WS=81318925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	81319267	.	C	T	98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=47.53;NF=4;NR=4;PP=98;QD=16.5964015684;SC=CTGCTCCTGCCGGAGGGATGG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=8;WE=81319275;WS=81319257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr10	81319423	rs1975008	C	T	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=22;PP=1046;SC=CCAAGCATCACCTGGCACCTG;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=81319431;WS=81319413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr10	81319483	rs1975007	A	G	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=22;PP=861;SC=GGGTCTCAAGACTGCTGAGGA;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=81319491;WS=81319473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr10	81342369	rs34032311	G	T	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=74;PP=2234;SC=TCCGCTCACCGTTGGTCATGA;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=121;WE=81342377;WS=81342359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	81342469	rs2678654	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.14;QD=28.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	81343036	rs3855862	G	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.22;QD=23.43;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	81371341	rs3997772	G	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.785;NF=4;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=0.296;SC=TCAGCAGCCTGGAGACCCCAC;SOR=1.112;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=12;WE=81371349;WS=81371331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr10	81371421	rs2678553	A	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.761;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.177;NF=5;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TTTTCCCGGGAGCTTCGGGTC;SOR=0.880;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=8;WE=81371429;WS=81371411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr10	81371729	rs1136450	C	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.889;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.344;NF=1;NR=21;PP=357;ReadPosRankSum=0.682;SC=GAGAGATGGTCTCAAAGGAGA;SOR=4.401;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=22;WE=81371737;WS=81371719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,15:0.19:77
chr10	81371953	rs1914663	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	81372081	rs1136451	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.118;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.726;NF=29;NR=13;PP=561;ReadPosRankSum=0.319;SC=CCATGGGTCCACCTGGAGAAA;SOR=1.088;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=42;WE=81372089;WS=81372071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,58:0.41:143
chr10	81373182	rs4253524	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=0.015;SC=GAATGGCCCAGAGGAGACAGA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=81373190;WS=81373172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	81373542	rs3997777	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQRankSum=-1.285;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr10	81373777	rs4253527	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.370;NF=37;NR=36;PP=1150;ReadPosRankSum=1.809;SC=GCCCGCAGGTCGGGGAAAAGA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=73;WE=81373785;WS=81373767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,80:0.47:171
chr10	81374651	rs1250991	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=417;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GGCATTCACACCACCCCCCAC;SOR=0.767;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=28;WE=81374659;WS=81374641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr10	81667398	rs372779703	GTTTGT	G	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=0.524;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	81680308	rs3750876	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=0.980;SC=CTCCACCTCCGGCAGGTGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=81680316;WS=81680298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	81681454	rs2257414	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.042;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=0.216;SC=TATGCAAGCCATATGTGGAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=81681462;WS=81681444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr10	81682470	rs2475643	T	A	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.872;NF=32;NR=42;PP=1333;ReadPosRankSum=0.788;SC=TCGTGACCAATGGTGAGCGGA;SOR=0.649;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=74;WE=81682478;WS=81682460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr10	81682645	rs1054053	A	G	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.586;NF=52;NR=44;PP=1480;ReadPosRankSum=0.984;SC=CTTGACGGGCAGGAGGCTGAC;SOR=0.820;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=96;WE=81682653;WS=81682635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,115:0.53:215
chr10	81698097	rs2819098	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=0.195;SC=AACAGGCACCGCATCAGGATG;SOR=0.602;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=81698105;WS=81698087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	81701722	rs2243639	T	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=560;ReadPosRankSum=0.385;SC=GCTGCCCCTGTGTTTCCAGGG;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=33;WE=81701730;WS=81701712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr10	81702722	rs1998374	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.959;SC=AGCATTCCTTTAGGATTCTGC;SOR=3.442;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=11;WE=81702730;WS=81702712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	81706324	rs721917	A	G	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=776;ReadPosRankSum=0.441;SC=AGCACTGGGCATTGTTCTGTG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=57;WE=81706332;WS=81706314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,66:0.56:117
chr10	81841421	.	C	CAA	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=59.19;NF=3;NR=4;PP=110;QD=17.4285714286;SC=GAGACCCTGTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=7;WE=81841429;WS=81841411;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,7:0.24:29
chr10	81901722	rs745182	C	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=622;SC=GGCCGTCCTCCGCTTGCTCCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=81901730;WS=81901720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	81904638	rs2819874	G	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=16;PP=1274;SC=CTCACTGGGGGCCTCTGCTTT;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=81904646;WS=81904628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	81915790	rs2789687	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=648;SC=GGGAATTTTCTCCCACTGCAG;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=81915798;WS=81915780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	81917708	rs1079242	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1152;SC=CAACCTGCACATGGAAGTTAC;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=81917716;WS=81917698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr10	81923961	rs2236557	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=23;PP=737;SC=CAGCACTCGGGAAGAAGGGTG;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=81923969;WS=81923951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr10	81925796	.	GCGCACACACACACA	G,GCA	3211.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=16,13;NR=16,16;PP=1488,56;SC=GCACACACGCGCGCACACACA;SOR=2.062;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=32,29;WE=81925817;WS=81925775;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.14,0.86:74
chr10	81926702	rs1049550	G	A	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=30;PP=1294;SC=TTGTTGGAGCGACTCCCCAGG;SOR=0.870;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=81926710;WS=81926692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	81993410	rs2945446	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-4.635;QD=0.48;ReadPosRankSum=1.983;SOR=1.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,11:0.16:68
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chr10	81995058	rs2678622	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.753;NF=29;NR=17;PP=580;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CGGAGCTGCCGAAAACTGTCA;SOR=0.651;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=142;TCF=88;TCR=54;TR=46;WE=81995066;WS=81995048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,43:0.32:133
chr10	81995190	rs377584813	CG	C	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=13.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQRankSum=-0.619;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr10	81995240	rs61862376	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.461;NF=4;NR=21;PP=407;ReadPosRankSum=0.576;SC=GCATCAGGAGGGCCACAATTC;SOR=0.033;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=25;WE=81995248;WS=81995230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	82013134	rs1298908	C	T	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.500;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=2749;ReadPosRankSum=0.412;SC=CTTCAATAATCTCCATTTGTG;SOR=0.369;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=66;WE=82013154;WS=82013124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,74:0.56:132
chr10	82013146	rs2573326	T	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.899;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=2749;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CCATTTGTGGTCCCTGGGACT;SOR=0.245;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=61;WE=82013154;WS=82013124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
chr10	82033594	rs2993763	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=651;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CGAAATGGCCGTAGCATGCTG;SOR=0.864;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=43;WE=82033602;WS=82033584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr10	82033683	rs4933327	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=639;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GATGGAACAGGAGCAGGGTTT;SOR=0.711;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=40;WE=82033691;WS=82033673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr10	82034262	rs2994388	G	A	3542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=60;PP=2221;ReadPosRankSum=0.593;SC=TAATAGCAGCGCATGGCACTT;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=134;TCR=104;TR=137;WE=82034270;WS=82034252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,159:0.56:282
chr10	82034842	rs10887711	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=939;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CAGCATATGCAGCTGAGCGGT;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=23;WE=82034862;WS=82034832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr10	82034854	rs10788546	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=939;ReadPosRankSum=-1.612;SC=CTGAGCGGTCTACCTTGGTGT;SOR=1.038;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=31;WE=82034862;WS=82034832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr10	82040052	rs1143694	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.433;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr10	82040346	rs2282367	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=24;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GTGCTAGGACAAGAATCCACC;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=106;TCR=44;TR=80;WE=82040354;WS=82040336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,91:0.51:177
chr10	82049251	rs145126070	T	TTTCTTC	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr10	82095968	rs1340383	T	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=276;ReadPosRankSum=-1.840;SC=AAGTAAATATTCCTTAATACA;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=16;WE=82095976;WS=82095958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr10	82112488	rs1572819	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=0.366;SC=GACACCTCCCATTGGGGGTGT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=82112496;WS=82112478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	82126808	rs1047952	C	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=0.366;SC=AAGGCAAGTTCAGGGACTCTC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=82126816;WS=82126798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	82182296	rs1870142	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=638;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTCAGAGAAAGGGATCCTGGC;SOR=0.425;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=45;WE=82182304;WS=82182286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,63:0.43:148
chr10	82182328	rs1870143	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=600;ReadPosRankSum=-0.200;SC=ATTGTTTTCCGGCCAGAACCA;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=44;WE=82182336;WS=82182318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,59:0.44:134
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chr10	82191643	rs6585994	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1027;ReadPosRankSum=0.532;SC=GTCCTTTGCTATTCAAGCAAA;SOR=0.687;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=61;WE=82191651;WS=82191633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,70:0.52:134
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chr10	84745256	rs2295933	C	T	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1377;ReadPosRankSum=0.251;SC=ACAGTGCAAGCGAAAACACAG;SOR=0.835;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=81;WE=84745264;WS=84745246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,96:0.49:196
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chr10	85908688	rs7069909	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=1.172;SC=TGGAATTTAAGCCTCATGTTT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=17;WE=85908696;WS=85908678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
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chr10	85958658	rs59594596	A	AAG	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=1.323;QD=13.60;ReadPosRankSum=-2.388;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
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chr10	85962650	rs7073076	T	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=595;ReadPosRankSum=0.942;SC=CAGCCATAGGTGGCAGAAGCC;SOR=0.435;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=34;WE=85962658;WS=85962640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
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chr10	85974381	rs3814212	A	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=796;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CTTCTAGTGTATGCCCTATGA;SOR=1.054;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=52;WE=85974389;WS=85974371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr10	85978809	rs4562752	T	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=687;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AGAACACTAATGTACTATTAT;SOR=0.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=34;WE=85978817;WS=85978799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr10	85978939	rs4244947	G	A	4063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=80;PP=2372;ReadPosRankSum=1.124;SC=GCCAGGGTCTGTTCTTGCATC;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=272;TCF=132;TCR=140;TR=152;WE=85978947;WS=85978929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,192:0.57:337
chr10	85978991	rs7895270	C	T	3098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=70;PP=1877;ReadPosRankSum=-1.293;SC=TAATGTGAATCTGTACTCTAG;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=215;TCF=84;TCR=131;TR=116;WE=85978999;WS=85978981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,145:0.55:262
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chr10	85985331	rs7898778	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=743;ReadPosRankSum=0.534;SC=CCCCAGCTTCCGAGTGGCAAA;SOR=0.534;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=47;WE=85985339;WS=85985321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr10	85992478	rs3814210	T	C	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1544;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CCCATAGTGCTCCTGGGCTCC;SOR=0.629;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=162;TCF=81;TCR=81;TR=93;WE=85992486;WS=85992468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,113:0.56:201
chr10	85992511	rs3814209	T	C	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1099;ReadPosRankSum=1.316;SC=TGGAAGTCGGTGGCTCAGTGA;SOR=0.554;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=89;WE=85992519;WS=85992501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,102:0.55:187
chr10	85993836	rs4933986	A	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=362;SC=TACCTGTACCATTAAGGGGCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=85993844;WS=85993826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	85993910	rs3814206	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=399;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CAGCGTAGCAGTGCTGTGCCA;SOR=0.993;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=26;WE=85993918;WS=85993900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,38:0.43:89
chr10	85994142	rs3829858	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GCCCTGCAGGAGTAAAAAAGA;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=26;WE=85994150;WS=85994122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr10	85996968	rs4933988	A	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=1.195;SC=AAGGTTGCCGACCCTTACCTA;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=13;WE=85996976;WS=85996958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr10	85997250	rs10887259	G	A	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=955;ReadPosRankSum=0.994;SC=GGCGTCGCAGGCCCCGCAGCA;SOR=0.577;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=55;WE=85997258;WS=85997240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr10	86001255	rs3841414	G	GGCCCAGCAA	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=2.641;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr10	86007496	rs146536539	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=726;ReadPosRankSum=0.365;SC=CACATCCAGCCTTCTCCGGTA;SOR=0.314;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=43;WE=86007504;WS=86007486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr10	86010273	.	TAC	T	125	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=125;QD=42.6666666667;SC=GACCATCTTATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=86010282;WS=86010263;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	86018098	rs76453358	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=1.825;SC=TGGCTCCATGGACTCCGTGAG;SOR=0.041;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=5;WE=86018106;WS=86018095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	86185654	rs1336202	T	G	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=46;PP=1265;SC=GAGCAGGTAATTACTGTTCTG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=86185662;WS=86185644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	86259872	rs56347056	C	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTCTTAACACTTCCTTTTAC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=15;WE=86259880;WS=86259862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr10	87362579	rs60453921	T	A	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=204;SC=TGGGCGAGTATCCCTTTCATG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=87362587;WS=87362569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	88024443	rs2607863	T	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=17;PP=1055;SC=CCATGTCCCATGCAGGAGCCG;SOR=1.573;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=88024451;WS=88024433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	88024553	rs10887569	C	T	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=59;PP=2283;SC=ACCTCCCACACGCTCGTCTGT;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=119;WE=88024561;WS=88024543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	88126056	rs11202000	T	G	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=35;PP=1450;SC=CGGCCCGGCCTCCAGCCGCGC;SOR=0.924;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=88126064;WS=88126046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	88203068	rs7094132	T	C	5151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=72;PP=2889;SC=GAAGTAGTGCTGTGTAGGAGG;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=91;TCR=72;TR=163;WE=88203076;WS=88203058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr10	88203208	rs7094269	T	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=38;PP=1082;SC=ATCTTTACTTTAAAACTGCTA;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=88203216;WS=88203198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	88213604	rs6586011	A	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=716;ReadPosRankSum=-0.265;SC=AAGGAAATAAAATATAGACTA;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=40;WE=88213612;WS=88213594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr10	88220866	rs7922658	C	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=690;SC=TTTTGAAGTACGTCAATGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=88220874;WS=88220856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	88230874	rs2288362	G	A	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=65;PP=2138;SC=CAAGAAAATAGAGCAGGTTAG;SOR=1.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=92;WE=88230882;WS=88230864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	88233628	rs3758520	C	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=790;ReadPosRankSum=-1.891;SC=AAGTACAGTTCACTTACTGTG;SOR=1.255;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=41;WE=88233636;WS=88233618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr10	88256943	rs4934215	C	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=20;PP=1554;SC=AAATCACTGACAGTGCTTTAC;SOR=1.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=88256951;WS=88256933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	88277457	rs10887621	C	T	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1590;ReadPosRankSum=-2.186;SC=GTGTCTTCAACGACCACATGA;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=96;WE=88277465;WS=88277447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,119:0.54:219
chr10	88281344	rs2289738	C	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr10	88281344	.	CCA	GCG	776	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=20;NR=31;PP=776;QD=16.2640759777;SC=CCGGCCGGGCCCAGGCCTAGC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=51;WE=88281354;WS=88281334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr10	88281346	rs4934218	A	G	4235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.01;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	88414569	rs2675703	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.861;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=987;ReadPosRankSum=0.363;SC=CCAAGAGTCCCGCCCAGCCCA;SOR=0.891;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=31;WE=88414578;WS=88414559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr10	88414570	rs11202106	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.294;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CAAGAGTCCCGCCCAGCCCAA;SOR=1.063;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=30;WE=88414578;WS=88414559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr10	88414758	rs2254051	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.232;SC=GCCACACACAGGGGCTTTGAC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=5;WE=88414766;WS=88414748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	88417724	rs10788521	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTGAGGGGTGCGGGAAGCTCT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=88417732;WS=88417714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	88419290	rs2254548	C	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=469;ReadPosRankSum=1.271;SC=GCGGCCCCTGCCCCACCACTC;SOR=0.354;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=26;WE=88419298;WS=88419280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr10	88420871	rs61612272	C	CA	79.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9772;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.180;SC=GGCGACAGAGCAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=88420879;WS=88420861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	88421997	rs2675698	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=65;ReadPosRankSum=-0.491;SC=ATCAGATGTGCGGCCCCTGCA;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=7;WE=88422005;WS=88421987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr10	88422116	rs1079610	C	T	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=19;PP=1315;SC=TCCACGCTGACCAGCCACACC;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=88422124;WS=88422106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	88422151	rs3740337	C	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=504;ReadPosRankSum=-1.758;SC=GATCTCCATACGGAGGCGCCA;SOR=0.500;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=36;WE=88422159;WS=88422141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr10	88422307	rs2803550	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGGACACTGAGGACGCTGGCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=88422315;WS=88422297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	88425555	rs2803554	C	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CCAGCCCCCCCACGTCTCCCT;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=58;TCR=101;TR=75;WE=88425563;WS=88425545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr10	88426350	rs17425484	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=42;ReadPosRankSum=0.128;SC=CCACCTCAAACTGCAAGGAGT;SOR=0.129;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=88426358;WS=88426340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	88428335	rs2803558	T	C	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=14;PP=949;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CAGGCAAGGCTGGGGGTCAGG;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=127;TCF=94;TCR=33;TR=60;WE=88428343;WS=88428325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,70:0.49:143
chr10	88439005	rs4468255	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=0.449;SC=TGGCCGTAGCGAATGAAAAAC;SOR=3.278;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=15;WE=88439013;WS=88438995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr10	88445385	rs3740345	G	C	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1162;ReadPosRankSum=0.358;SC=ACTGCCCCTGGTGGAGCCTCT;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=104;TCR=55;TR=68;WE=88445393;WS=88445375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,75:0.42:177
chr10	88451869	rs3740346	G	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=452;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AGATGCTGAGGGGCCACCAGG;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=35;WE=88451877;WS=88451859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr10	88458996	rs374727638	TTCTC	T,TTC	1368.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.316;QD=27.93;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,29,19:0.59,0.39:49
chr10	88466465	rs45459491	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=283;ReadPosRankSum=0.269;SC=CAAGTCCTGCCGACAGCCCAA;SOR=0.465;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=18;WE=88466473;WS=88466455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr10	88702350	rs4934281	G	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=44;PP=1838;SC=TGGAGGCCGTGAAGGGAGGCG;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=88702358;WS=88702340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	88702390	rs10887673	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.221;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=585;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CCCCGGCCTCGGCCTCGCAGC;SOR=0.885;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=38;WE=88702398;WS=88702380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr10	88705306	rs3750822	T	G	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TGGCCCACCCTCCCCTACTCA;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=100;WE=88705314;WS=88705296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,122:0.46:268
chr10	88717140	rs4244973	T	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=10;PP=617;SC=CTTACCGTCCTACGGGGTCCT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=88717162;WS=88717130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	88717154	rs3750823	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GGGTCCTTGCCGGTGTCCTCA;SOR=0.801;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=11;WE=88717162;WS=88717130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr10	88718436	rs1800373	A	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=414;ReadPosRankSum=-1.337;SC=CTGCAGCAGCACAACCCTGCA;SOR=1.215;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=22;WE=88718444;WS=88718426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr10	88719569	rs760112	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=1.078;SC=TGCAGACCATGAGGCTAAACT;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=88719577;WS=88719559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	88719789	rs760113	C	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=841;ReadPosRankSum=0.373;SC=AGGCCAACGCCGTGAGCGAGG;SOR=0.908;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=58;WE=88719797;WS=88719779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,77:0.53:146
chr10	88722398	rs9864	A	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=772;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CAGGAGGGTGAGGCATCCAAA;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=50;WE=88722406;WS=88722388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr10	88820592	rs17096421	A	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=756;ReadPosRankSum=1.912;SC=GCTGCCATTGATTGAAAATCA;SOR=0.537;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=46;WE=88820600;WS=88820582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
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chr10	88935590	rs11202370	C	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=57.74;NF=11;NR=4;PP=316;SC=TAATCTGATACTAAGCCTAGA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=88935598;WS=88935580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr10	88939962	rs7081609	T	C	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=50;PP=1613;SC=TATATACTGGTTGTGCAAAAT;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=66;WE=88939970;WS=88939952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	89264593	rs2233166	C	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GAAGCGCCCTCCAGACCCGCC;SOR=0.065;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=16;WE=89264601;WS=89264583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr10	89267957	rs3843597	C	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=23;PP=991;SC=AGTTTCCTGACCAATATGTGC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=89267965;WS=89267947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	89269267	rs3843598	G	A	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=360;SC=AGGCTAATGTGGTGAACATCC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=89269275;WS=89269257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	89419638	.	C	CGCT	1389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.795;NF=7;NR=11;PP=722;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GTCCGGCAGCCGCTGCTGCTG;SOR=0.770;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=18;WE=89419646;WS=89419628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr10	89419873	rs2255682	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=1.482;SC=GAGGGGGCGTCGGGAGGAGGA;SOR=2.165;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=9;WE=89419881;WS=89419863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr10	89420561	.	GAAAAAAAAAAAAAA	G	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9461;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=1;PP=398;ReadPosRankSum=1.150;SC=CCAATAAACTGAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=1;WE=89420582;WS=89420554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	89420582	.	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.94;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	89420587	rs9421661	A	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	89420789	rs2762528	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=876;ReadPosRankSum=1.111;SC=TCTCTAGTAGATAGACGTGCA;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=62;WE=89420797;WS=89420779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
chr10	89420898	rs10595979	TAA	T	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GGGAGAGGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.148;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=89420907;WS=89420888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	89463460	rs7923151	G	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=851;ReadPosRankSum=0.118;SC=CTCCAAAATCGATACTCATGC;SOR=1.309;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=52;WE=89463468;WS=89463450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr10	89463480	rs7923162	G	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=963;ReadPosRankSum=-2.471;SC=CTACTCCGATGCATGCTACAG;SOR=1.014;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=63;WE=89463488;WS=89463470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,84:0.51:166
chr10	89469083	rs72025574	CATAT	C	874.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.096;NF=0;NR=17;PP=736;ReadPosRankSum=0.303;SC=ATGTCATGTTCATATATATAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=17;WE=89469094;WS=89469073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr10	89475617	rs2302405	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=0.214;SC=TTTTGTTGTTGTTTCTTACTC;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=25;WE=89475625;WS=89475607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr10	89475640	rs3214322	GA	G	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=6.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr10	89475692	rs2302406	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.322;SC=GTTAGTCTTTAGTTTGCAAAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=89475700;WS=89475682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	89475717	rs2302407	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr10	90305177	rs11202769	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=452;ReadPosRankSum=1.067;SC=CTCACAATCACGGTGGAAGAC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=39;WE=90305185;WS=90305167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr10	90342837	rs2296545	C	G	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1552;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CACCTGAGTCCTCAGCCTTGT;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=236;TCF=111;TCR=125;TR=102;WE=90342845;WS=90342827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,119:0.41:289
chr10	90356598	rs1409136	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-2.002;SC=TAAAAAATTCATTGGTTCAAA;SOR=1.074;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=13;WE=90356606;WS=90356588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr10	90365290	rs2274312	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=-0.044;SC=ATACCAGCAGACCCAGTACAA;SOR=0.735;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=17;WE=90365298;WS=90365280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
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chr10	90484420	rs56390975	C	A	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.09;MQRankSum=1.052;NF=18;NR=33;PP=1836;ReadPosRankSum=-1.127;SC=GTCATTTATTCAGAAAAAAAT;SOR=0.421;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=51;WE=90484430;WS=90484410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
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chr10	90568182	rs3899739	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=570;ReadPosRankSum=1.120;SC=GGTGTGGGTCACCCCATGTCA;SOR=0.735;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=30;WE=90568190;WS=90568172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
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chr10	90580144	rs10788615	C	T	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=667;ReadPosRankSum=-1.589;SC=AATGGGCTCACGTGGATTTCA;SOR=0.368;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=50;WE=90580152;WS=90580134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
chr10	90585819	rs7893917	G	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=610;ReadPosRankSum=1.166;SC=TAACTTCGACGCCAGCATCAA;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=46;WE=90585827;WS=90585809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,57:0.40:144
chr10	90588154	rs1977537	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr10	90673024	rs12254856	G	A	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1466;ReadPosRankSum=-1.418;SC=CAAATGCGAAGTCAGCAAACC;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=230;TCF=134;TCR=96;TR=95;WE=90673032;WS=90673014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,109:0.43:255
chr10	90674251	rs11202889	A	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=557;ReadPosRankSum=0.533;SC=TGGGACATATAGTTTGTTTTT;SOR=0.418;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=38;WE=90674259;WS=90674241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr10	90676605	rs78467188	T	G	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=876;ReadPosRankSum=-0.958;SC=TTCAGTTTTTTTGTGTGTGTG;SOR=0.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=64;WE=90676613;WS=90676595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr10	90680951	rs139970435	T	TA	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr10	90683124	rs1530281	T	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=447;SC=TTATTGCTGTTGCACATTTTA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=90683132;WS=90683114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	90695265	rs3781211	G	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.535;SC=GATGCCAATTGTGTCCTAATT;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=11;WE=90695273;WS=90695255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	90701645	rs714887	A	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=822;ReadPosRankSum=1.894;SC=CAATCCAAAGAGCTGAGTTAG;SOR=0.681;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=53;WE=90701653;WS=90701635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr10	90733148	rs111980233	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-0.428;SC=AAATCTTTCATAGAGTTCCCG;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=90733156;WS=90733138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr10	90767395	rs2031611	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=288;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCCCTCTATAGTTCCCACCCT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=17;WE=90767403;WS=90767385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	90770439	rs2296600	C	G	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=930;ReadPosRankSum=0.531;SC=CTCTTGATTACTAGAAAGTCC;SOR=0.763;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=54;WE=90770447;WS=90770429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr10	90771829	rs2234978	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=581;ReadPosRankSum=-1.087;SC=AATCTCCAACTTTAAATCCTG;SOR=0.458;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=41;WE=90771837;WS=90771819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr10	90773303	rs1571019	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TTTATAATGAATACTCATAGT;SOR=1.552;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=90773311;WS=90773293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	90975649	rs3802656	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1108;ReadPosRankSum=-2.903;SC=TGGCTTTCTTGATGAGTTTTC;SOR=0.896;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=70;WE=90975657;WS=90975639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,84:0.51:166
chr10	90983629	rs1556478	C	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=761;ReadPosRankSum=-2.005;SC=CAGCATTTCACTCTGGTGCAT;SOR=0.939;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=50;WE=90983637;WS=90983619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
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chr10	90988250	rs2071509	C	G	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=145;SC=GATCCATAAGCAAATAATGAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=90988258;WS=90988240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr10	91092231	rs10509570	T	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TAGGGTTCCATCAGTTTCACT;SOR=0.907;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=116;TCF=82;TCR=34;TR=64;WE=91092239;WS=91092221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
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chr10	91174566	rs12762146	G	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=519;ReadPosRankSum=1.366;SC=ATGAGGTAAGGGTTTTCCTTT;SOR=0.586;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=38;WE=91174574;WS=91174556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr10	91222287	rs3740030	A	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=543;ReadPosRankSum=-2.197;SC=TCCAACAGCCAAGTTATGATC;SOR=1.136;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=30;WE=91222295;WS=91222277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr10	91352966	rs2296616	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=339;ReadPosRankSum=1.003;SC=CATTCAACGCGCACATCCGAG;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=27;WE=91352974;WS=91352956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr10	91371445	rs7896079	C	A	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=570;ReadPosRankSum=0.457;SC=AAGACAAACCCGACCTACCAT;SOR=0.988;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=37;WE=91371453;WS=91371435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr10	91371844	rs3802655	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GAATGCTATGCGTGCAAAGAA;SOR=0.069;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=18;WE=91371852;WS=91371834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr10	91373511	rs7079690	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=1.981;SC=CTGGTCATCCTCATTTGTTGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=91373519;WS=91373509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	91373624	rs7091626	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=258;ReadPosRankSum=-0.998;SC=GCCCCAGACTGGGATTCGGAA;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=20;WE=91373632;WS=91373614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr10	91373847	rs7076397	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=2.021;SC=AGTCTTTTTCAGTGGAGTTTT;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=17;WE=91373855;WS=91373837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr10	91465266	rs72818759	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=339;ReadPosRankSum=-1.132;SC=GCAAACAATGGCCTGTTTTTG;SOR=1.295;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=20;WE=91465274;WS=91465256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr10	91468925	rs1129777	C	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TTTTTTAAGGCAAACAGTTTC;SOR=0.034;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=91468933;WS=91468915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	91473975	rs11185854	T	C	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	91479211	rs17484219	G	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=0.478;SC=CCTCTCAAGAGAAATTATTTG;SOR=0.859;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=5;WE=91479219;WS=91479201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr10	91483908	rs7079174	G	C	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.67;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	91487649	rs12572012	A	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=482;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GAGACATCTAATAAGGTAATG;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=33;WE=91487657;WS=91487639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr10	91488979	rs3758388	A	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=304;ReadPosRankSum=0.035;SC=CTAAAGTCTCATATGGAAAAC;SOR=0.491;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=23;WE=91488987;WS=91488969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr10	91498127	rs1886996	T	C	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=45;PP=1430;SC=GAAAGTTGAATGTAGTCATTC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=91498135;WS=91498117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	91498626	rs12415422	T	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=407;ReadPosRankSum=1.109;SC=TGAAAAGATATAATTTTGTAA;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=24;WE=91498634;WS=91498616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr10	91505768	rs12414650	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=1.454;SC=TTATTCCCCTCGCAGGGCATG;SOR=1.154;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=20;WE=91505776;WS=91505758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr10	91510982	rs1326201	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=114;SC=AAAGTTTCTGTCTATATGGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=91510990;WS=91510977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	91522548	rs34354493	A	G	3314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=67;PP=2189;ReadPosRankSum=-1.571;SC=AGTGACAGTTAAGATTCCCAA;SOR=0.699;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=277;TCF=135;TCR=142;TR=133;WE=91522556;WS=91522538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,154:0.47:328
chr10	91522605	rs3740038	G	C	5904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=123;PP=2965;SC=AAATACTTAAGTGATGAGTAA;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=60;TCR=123;TR=183;WE=91522613;WS=91522595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	91522689	rs17127001	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=359;ReadPosRankSum=-0.074;SC=CCTGTTCATAGGCACTGCTGT;SOR=0.456;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=19;WE=91522697;WS=91522679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr10	92503476	rs55802807	C	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=490;ReadPosRankSum=-0.237;SC=CAAAGCAAATCCATAAGTAAA;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=26;WE=92503484;WS=92503466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr10	92635211	rs149175620	T	TA	105.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=133;SC=GCTTTCTTTTTAAAAAAAATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=92635219;WS=92635201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	92638707	rs75192201	C	CAGT	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=641;SC=GCAGAAATGTCAGTATATTAG;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=92638715;WS=92638697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	92645687	rs4144422	A	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=24;PP=646;SC=CTGTATTTGAATCTTAGAAAC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=92645695;WS=92645677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	92655338	rs59891149	A	AT	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=454;SC=TATTTGTTGCATTTTTTTCTA;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=16;WE=92655346;WS=92655328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	92655559	rs10881848	T	A	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.38;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	92655566	.	T	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.355;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	92655568	.	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.363;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	92655569	rs150762208	T	TCA	283.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.64;ReadPosRankSum=1.108;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	92662860	rs4568910	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=173;SC=CAAATTAGATATGAGAAGGAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=92662868;WS=92662850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	92663108	rs7089472	C	T	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=746;SC=TTTTTTGCGACGTCCCACCTT;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=92663116;WS=92663098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	92675649	rs3839929	GA	G	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=2.314;SC=TGGAAAATTGGAAAACGCTGC;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=92675657;WS=92675639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	92675857	rs150275749	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.671;SC=GGAAGAGTGGGAGAAGTGGAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=92675865;WS=92675847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	92676187	rs112074175	ATG	A	383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=433;SC=GCTAAATTACATGTGTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=92676196;WS=92676177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	92678740	.	AATAAATAAATATATATATATATAT	A	3148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.402;NF=10;NR=30;PP=2976;ReadPosRankSum=2.035;SC=CTAAAGCCAAAATAAATAAAT;SOR=0.427;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=40;WE=92678771;WS=92678730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,80:0.85:94
chr10	92680929	rs10881855	A	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=368;SC=TAACACTCCCACCCCCATTAG;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=92680937;WS=92680919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	93000211	rs10881907	G	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=720;SC=CATATGATGCGTTTTAACCTA;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=93000219;WS=93000201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	93170250	rs7081569	C	G	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=42;PP=1818;SC=GGTGGCGGCGCCCGCGCCTGA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=100;WE=93170258;WS=93170240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr10	93170365	rs71025355	CG	C	2529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=42;PP=1856;SC=TCTGGCGCCCCGGACGGCGGG;SOR=1.385;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=45;WE=93170373;WS=93170355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	93390149	rs1044563	C	T	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1319;ReadPosRankSum=0.145;SC=GCTCTTGCAACGAGCAGTTCT;SOR=0.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=97;WE=93390157;WS=93390139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,126:0.47:269
chr10	93572984	rs11186694	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=424;ReadPosRankSum=1.947;SC=TTTACTTTTCCGACTTTTACT;SOR=3.056;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=22;WE=93572992;WS=93572974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr10	93577141	rs1539041	T	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GCTGACATTTTATTCTCCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=93577149;WS=93577131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	93582248	rs61874701	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GTATTTATAAGCATTATAAAA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=93582256;WS=93582238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr10	93588201	rs1572933	G	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr10	93588208	rs1572934	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr10	93593527	rs1770474	G	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=-0.202;SC=AGACTTAAAAGTAGTAAAAAG;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=12;WE=93593535;WS=93593517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	93600297	rs111962010	ATGTTG	A	1323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AGTATCATGTATGTTGTGTTT;SOR=0.800;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=28;WE=93600309;WS=93600287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr10	93605405	rs1770466	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CATTTCCAGAATAAGTTTGAA;SOR=0.055;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=93605413;WS=93605395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
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chr10	93611176	rs112177544	A	ATATG	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=1.142;SC=TAATTTAAAAATATGAGAGAA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=93611184;WS=93611166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	93617306	rs1340420	A	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1208;ReadPosRankSum=0.698;SC=CCTCCCCACCAACTCTACCAC;SOR=0.614;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=79;WE=93617314;WS=93617296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr10	93668110	rs1107947	T	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=602;ReadPosRankSum=0.410;SC=CCTCTTGCCCTCGTTGGTCTT;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=42;WE=93668130;WS=93668100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,48:0.38:127
chr10	93716899	rs7894570	G	C	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=189;SC=ACTAGACCTAGAAATAAAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=93716907;WS=93716889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	93717189	rs72823191	C	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=953;ReadPosRankSum=1.473;SC=ATATCATTGACCTAAATAGAA;SOR=0.352;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=60;WE=93717197;WS=93717179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr10	93719497	rs66925910	GTATA	G	33.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	93743991	.	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=186;ReadPosRankSum=0.205;SC=TGTGCAGCCGCGTTTACTTGA;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=14;WE=93743999;WS=93743981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr10	93749380	rs41287646	T	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=617;ReadPosRankSum=0.802;SC=AATAACCTTTTAAATTTGTTT;SOR=0.579;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=35;WE=93749388;WS=93749370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr10	93754163	rs10882014	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=0.448;SC=TAAGGTCATGGCATTTAATTT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=93754171;WS=93754157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	93756883	rs10591030	ACT	A	2331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.431;NF=11;NR=25;PP=1487;ReadPosRankSum=-0.197;SC=ATCAGTAGAAACTCTGGTTCA;SOR=0.758;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=36;WE=93756892;WS=93756873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr10	93768096	rs11186794	G	C	37.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	93778520	rs140447601	CT	C	1541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.918;NF=24;NR=21;PP=653;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CTCATATATACTTTTTTTTTC;SOR=0.629;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=45;WE=93778528;WS=93778510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,70:0.55:127
chr10	93786557	rs61876492	A	C	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=888;ReadPosRankSum=2.457;SC=ATGAAAATATACTCCCCCAGA;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=54;WE=93786565;WS=93786547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr10	93812334	rs1711841	G	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=38;PP=1151;SC=ACTGGATGGTGGTTGAGAGCA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=93812342;WS=93812324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	93841227	rs2676811	A	G	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.13;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	93851714	rs1229578	T	C	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=70;PP=2008;SC=GAAAAAAAGTTGTTTACTTGG;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=113;WE=93851722;WS=93851704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	93870699	rs1557178	C	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=0.835;SC=GAAAGTCCAACTCTACTGCAT;SOR=1.154;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=13;WE=93870707;WS=93870689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr10	93999850	rs3824734	A	G	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=89;PP=2965;SC=GCTGCTGAGGAGGCTGATGGA;SOR=1.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=62;TCR=89;TR=151;WE=93999858;WS=93999840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	94215207	.	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr10	94238929	rs35864975	T	TA	711.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.444;NF=27;NR=1;PP=524;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCATAAAGATTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=28;WE=94238937;WS=94238919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,27:0.90:30
chr10	94266330	rs34053974	CT	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.748;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr10	94294291	rs4646955	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=509;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TATTAATGTGATAAGTACACA;SOR=1.871;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=27;WE=94294299;WS=94294281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr10	94353278	rs12256435	G	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=0.391;SC=GCGCGGTCCAGGGAGAGGGAT;SOR=0.193;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=19;WE=94353286;WS=94353268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr10	94366861	rs113442397	AAG	A	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=292;ReadPosRankSum=2.280;SC=GTCTATCACTAAGAGTCATAT;SOR=0.620;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=8;WE=94366870;WS=94366851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	94369060	.	AGTGTGTGT	A	249	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.9961;HP=2;HapScore=2;MMLQ=18;MQ=54.03;NF=8;NR=5;PP=249;QD=19.3846153846;SC=AGAGAGAGAGAGTGTGTGTGT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=13;WE=94369075;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr10	94392513	rs113828479	A	ATAATT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=323;SC=TTCAAAACTGATAATTTTGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=94392521;WS=94392503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	94407865	rs34357393	CA	C	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=1.113;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.942;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr10	94409800	rs6583833	C	T	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1251;SC=CTTGATGTGGCTGACTTCATG;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=94409808;WS=94409790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	94452430	rs2275729	T	G	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.672;SC=GCGGGCTCGTTGCAAGTTTTC;SOR=0.417;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=61;WE=94452438;WS=94452420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,79:0.56:142
chr10	94507612	rs2488066	A	G	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=43;PP=1776;SC=CACCACTACCACTGTCAGCCC;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=94507620;WS=94507602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	94511683	rs2096177	G	T	10713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=150;PP=2965;SC=ATATTTGTATGAAGGCTGCAG;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=332;TCF=182;TCR=150;TR=332;WE=94511691;WS=94511673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr10	94594565	rs2490741	G	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.948;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1320;ReadPosRankSum=0.970;SC=CGAACTGCCTGTTGAAGCTAC;SOR=0.467;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=224;TCF=87;TCR=137;TR=99;WE=94594573;WS=94594555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,116:0.43:272
chr10	94695617	rs1326331	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=835;ReadPosRankSum=1.212;SC=AAGAATCTTACTGTAATATTT;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=50;WE=94695625;WS=94695607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr10	94816807	rs60582805	G	GA	2739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=62;PP=2688;SC=AGTATATTCTGAAACTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=62;WE=94816815;WS=94816797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	94820860	rs1538648	A	G	4986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=57;PP=2965;SC=GTCTGTTTTTAGAACAGAGTT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=98;TCR=57;TR=155;WE=94820868;WS=94820850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	94822686	rs55843714	C	T	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=73;PP=2965;SC=TGGCCCGGACCTTCGAGCAGC;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=142;WE=94822694;WS=94822676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	94822895	rs12263200	G	T	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=14;PP=482;SC=GGTGGGAGGCGTTGTGGCGGT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=94822903;WS=94822885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	94826081	.	TCCTGCCG	T	957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=860;SC=GCCTCCTGCCTCCTGCCGCCT;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=94826095;WS=94826071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	95070037	rs2761286	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=46;PP=1441;SC=GTCAAGAAAAAATACTGTTCC;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=95070045;WS=95070027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	95070080	rs2797581	C	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=569;SC=CTTTAACCTACGACAGCTTCC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=95070088;WS=95070070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	95070526	rs787661	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=742;SC=ATTGCCTTCAGTTTTCCTCAA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=30;WE=95070534;WS=95070516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	95072906	rs787666	T	C	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=40;PP=1679;SC=TCATGTCCAATCTGCATTTCT;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=95072914;WS=95072896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	95083204	rs148815470	ATTTC	A	413.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=277;SC=AGATGAAACTATTTCTTTCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=95083215;WS=95083194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	95089762	rs17477816	T	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=519;SC=TAGTACATACTAGAAATAAGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=95089770;WS=95089752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	95093612	.	T	C	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=869;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TTCCCGAAACTGTCTGGGAGG;SOR=0.720;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=67;WE=95093620;WS=95093602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr10	95095600	rs787689	G	C	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CCTCCCTAGAGCCTGGTTGTC;SOR=0.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=156;TCF=115;TCR=41;TR=76;WE=95095608;WS=95095590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,87:0.51:170
chr10	95095667	rs7097740	A	G	3678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=65;PP=2131;ReadPosRankSum=1.889;SC=ACCAACACACATCTTACTCAC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=178;TCR=135;TR=151;WE=95095675;WS=95095657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,185:0.49:378
chr10	95097537	rs1614065	T	C	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.546;SC=CAAAGGATGTTGATTCTCCAC;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=74;WE=95097545;WS=95097527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,90:0.55:165
chr10	95098144	rs10786089	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=652;ReadPosRankSum=1.340;SC=CCTTCCTTTATGTTATAAGCC;SOR=1.225;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=44;WE=95098152;WS=95098134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr10	95099849	rs2761329	G	A	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=2.084;SC=AAAAAGAAAAGAAAAATTCTG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=16;WE=95099857;WS=95099839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr10	95101480	rs1408031	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.549;SC=TAATAATAAACTTGCAATGGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=95101488;WS=95101474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	95107324	rs7092152	A	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=0.748;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	95109737	rs2298158	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=558;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CTATGAAAACGATTTAAAGAG;SOR=0.678;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=32;WE=95109745;WS=95109727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr10	95123618	rs10882221	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=1.133;SC=AAGATGGAGCGGAGGAGAGGT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=95123626;WS=95123612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	95132905	rs787647	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GGAGAGGGACCGAAGACCCTG;SOR=0.188;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=10;WE=95132913;WS=95132895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr10	95139526	rs10882229	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=63;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TCACTGTACTAAGCACTTTCT;SOR=0.124;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=95139534;WS=95139516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr10	95162113	rs2272177	G	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=0.089;SC=GCCTAAAATAGAGAAGGAGTA;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=19;WE=95162121;WS=95162103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr10	95162525	rs3841653	TC	T	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=96;ReadPosRankSum=-1.196;SC=AATTCTTTGATCCCCCCCAAA;SOR=0.138;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=6;WE=95162533;WS=95162515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr10	95164040	rs788088	A	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=770;SC=GGAATCTGATACTATAATTTT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=95164048;WS=95164030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	95168634	rs2296142	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=602;ReadPosRankSum=0.031;SC=TTATGTTGTTACCACTTAACT;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=41;WE=95168642;WS=95168624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr10	95168735	rs2296143	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-1.887;SC=TTAGGATCCTCAGGTGTTGCT;SOR=0.489;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=8;WE=95168743;WS=95168725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr10	95169583	rs3818352	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=256;ReadPosRankSum=0.095;SC=CGGTTTTGTCTGCCATTATGT;SOR=0.651;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=24;WE=95169591;WS=95169573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
chr10	95216623	rs701882	A	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=19;PP=894;SC=CAAAGTTGAAAAAACAATGAA;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=95216631;WS=95216613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	95237963	rs3938769	A	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=729;SC=ACTGTTTGGAAGAATCATCAA;SOR=1.107;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=95237971;WS=95237953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	95238050	rs6583893	C	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=25;PP=784;SC=CCTGGCTGTCCGCATGGAACT;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=95238058;WS=95238040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	95241999	rs947597	A	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=59;PP=1617;SC=AGTGGAGACTAGGGCGCTGGA;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=85;WE=95242007;WS=95241989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	95259979	rs3740370	C	G	7594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=107;PP=2965;SC=AAGAGAGACACAGACTTTTGG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=111;TCR=107;TR=218;WE=95259987;WS=95259969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr10	95262981	rs7080916	A	G	4393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=44;PP=2386;SC=TAGTACTACCACATTGCTTGA;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=120;WE=95262989;WS=95262971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	95278829	rs2280605	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=909;ReadPosRankSum=0.321;SC=AAAGACTTCAATAAAAGTCTT;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=22;WE=95278849;WS=95278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr10	95278841	rs2280606	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=909;ReadPosRankSum=0.158;SC=AAAAGTCTTTCTTCTTCAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=16;WE=95278849;WS=95278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr10	95279506	rs2293277	A	T	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=67;PP=2225;SC=CATCAATTGCATGTAATTCTT;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=95279514;WS=95279496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	95279653	rs7068719	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=376;SC=ACAGCTTAACACACAGCTAGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=95279661;WS=95279643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	95287643	rs34668129	G	GA	854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=8;PP=437;SC=CTCAAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.819;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=24;WE=95287651;WS=95287633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	95360027	rs36014035	A	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=662;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CGGGTTCCTGACACTTCCAGA;SOR=1.371;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=32;WE=95360035;WS=95360017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr10	95360109	rs57477607	C	G	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1139;ReadPosRankSum=1.056;SC=GCCCGGTAGGCGCCCCATTCC;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=75;WE=95360117;WS=95360099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,95:0.49:194
chr10	95360380	rs61461737	A	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.160;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.502;SC=GCCCTTGGGGAACCCTGGAGC;SOR=0.272;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=62;WE=95360388;WS=95360370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,64:0.70:91
chr10	95360396	rs116736522	G	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1027;ReadPosRankSum=1.239;SC=GGAGCGCAAAGGGCGCAGCTG;SOR=0.950;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=66;WE=95360404;WS=95360386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
chr10	95360411	rs57029781	G	A	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=27;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CAGCTGCCCCGGCGGCCACTG;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=89;TCR=43;TR=83;WE=95360419;WS=95360401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,93:0.65:143
chr10	95360846	.	C	CGG	127	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=127;QD=38.5;SC=AGCCGACCCCCGCCGCCGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=4;WE=95360854;WS=95360836;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr10	95380790	rs1223306	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=27;PP=825;SC=TGACAAAGCCGCCCAGAGACA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=95380798;WS=95380780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	95381773	rs701865	T	A	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1037;ReadPosRankSum=-2.000;SC=CACGGTTAGATCATATCTGAA;SOR=0.698;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=73;WE=95381781;WS=95381763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,99:0.46:216
chr10	95388914	rs2857300	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=766;ReadPosRankSum=0.796;SC=AGCCGTGTAGAAAATCCTCAC;SOR=0.463;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=45;WE=95388922;WS=95388904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr10	95389041	rs714550	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=954;ReadPosRankSum=0.505;SC=ATGCCCCTGCGGATGAATACT;SOR=0.486;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=122;TCF=48;TCR=74;TR=56;WE=95389049;WS=95389031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr10	95389083	rs714549	A	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=784;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TCTGGGTCAGACCTCACCTCT;SOR=0.514;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=45;WE=95389091;WS=95389073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr10	95389124	rs714551	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=0.589;SC=GGATGCTCTCGCCTCTCCTCC;SOR=0.080;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=24;WE=95389132;WS=95389114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr10	95394455	rs1856563	T	C	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=10;PP=1322;SC=TCCTGTGAATTTATGATTATT;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=95394463;WS=95394445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	95395245	rs11187564	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.878;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr10	95395245	.	CCA	TCG	361	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=18;NR=2;PP=361;QD=20.7233937431;SC=CACCTTTTATCCATTTCAGAC;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=20;WE=95395255;WS=95395235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr10	95395247	rs616522	A	G	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.33;SOR=3.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	95400054	rs2275227	C	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=323;ReadPosRankSum=-0.910;SC=AAAAGATGGACTCAGTTTGAA;SOR=0.127;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=14;WE=95400062;WS=95400044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	95400510	rs12780304	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.999;SC=CTTACCTTCTTAAAGGAAGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=95400518;WS=95400508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	95405665	rs3831275	CTA	C	645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.132;NF=15;NR=0;PP=553;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TTGTATGAACCTATGTGTAAT;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=15;WE=95405674;WS=95405655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr10	95405814	rs1409332	C	A	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1511;ReadPosRankSum=-2.007;SC=GGTACGTAAACCTCTCTTTAG;SOR=0.741;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=198;TCF=97;TCR=101;TR=98;WE=95405822;WS=95405804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,122:0.49:250
chr10	95419032	rs720298	C	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	95421683	rs2422324	G	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CTTTTTAAAAGTTAAGAGCAT;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=9;WE=95421691;WS=95421678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr10	95422245	rs10882298	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=-0.087;SC=AAAAAAAGTTATCAGGACAAA;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=95422253;WS=95422235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	95432968	rs1572773	T	C	4366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=37;PP=2965;SC=AAAAATCTGTTTTTGGGCAGT;SOR=1.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=101;TCR=37;TR=138;WE=95432976;WS=95432958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	95433124	rs1326214	A	G	6367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=113;PP=2965;SC=CAGTTCCTCCAACATTCTTCC;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=65;TCR=113;TR=178;WE=95433132;WS=95433114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr10	95441272	rs11187583	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=1.350;SC=TTCTGCAGAAGATAATCTGGA;SOR=1.068;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=25;WE=95441280;WS=95441262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr10	95443644	rs11187585	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TAGGGCATAGCGGACTTCTAA;SOR=0.922;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=9;WE=95443652;WS=95443634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	95443683	rs117541318	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=665;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CATACGACAATGCCACATTTT;SOR=1.362;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=17;WE=95443696;WS=95443673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr10	95443688	rs8181435	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=1223;ReadPosRankSum=1.981;SC=GACAATGCCACATTTTCTACA;SOR=0.282;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=33;WE=95443696;WS=95443673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr10	95444931	rs767701	T	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=383;ReadPosRankSum=1.546;SC=ATTTGAATTTTAAAGTCTATA;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=21;WE=95444939;WS=95444921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr10	95454681	rs2275438	G	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.168;NF=8;NR=22;PP=564;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TACGAACTTTGTATGTCTTTG;SOR=0.822;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=30;WE=95454689;WS=95454671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr10	95454768	rs3215997	TA	T	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.83;MQRankSum=0.605;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.976;SC=TGATTGGTGGTAAAAAAAAGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=95454776;WS=95454758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	95457992	rs11187596	A	G	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=770;ReadPosRankSum=0.731;SC=TCAAATTAACATAATCAAATC;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=55;WE=95458000;WS=95457982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr10	95458141	rs11187597	A	G	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GCAGTAAGTCATCTTCAACTG;SOR=0.513;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=160;TCF=59;TCR=101;TR=85;WE=95458149;WS=95458131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,99:0.55:180
chr10	95459698	rs2275441	G	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CATGTAAACAGAATTCAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=95459706;WS=95459688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	95459817	rs726817	C	T	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=35;PP=1846;SC=TTCTCCACAGCGTTCATCATC;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=93;WE=95459825;WS=95459807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	95549836	.	C	CT	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=17;MQ=60.37;NF=3;NR=1;PP=51;QD=13.5;SC=TTTACATCACCTTTTTTTTTT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=95549844;WS=95549826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,4:0.44:9
chr10	95552653	rs1111820	T	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=76;PP=2010;SC=CGAAGGATTTTGATTGCATCA;SOR=1.438;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=111;WE=95552661;WS=95552643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
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chr10	95718474	rs829225	A	G	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=12;PP=922;SC=TATTTAGGCTATAATGATTAC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=95718482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	95987313	rs11187825	C	T	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=224;SC=AGCCAGGTAACTGGAAATGAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=95987321;WS=95987303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr10	96014622	rs10786156	C	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=637;ReadPosRankSum=2.365;SC=CTGAGTCATTCTCTCTTTTCT;SOR=0.500;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=39;WE=96014630;WS=96014612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr10	96025491	rs3740360	A	C	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=680;ReadPosRankSum=1.145;SC=TCTTTTGCCCATCTTTTAAGA;SOR=1.358;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=45;WE=96025499;WS=96025481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr10	96039597	rs2274224	G	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=729;ReadPosRankSum=-1.379;SC=GCCAACCCCCGACCTGCCAAT;SOR=0.907;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=47;WE=96039605;WS=96039587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr10	96043732	rs7084339	A	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1008;ReadPosRankSum=1.426;SC=GTTTCAGATGAGATTCCACTT;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=55;TCR=94;TR=70;WE=96043740;WS=96043722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,89:0.48:187
chr10	96053239	rs3740365	T	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=856;ReadPosRankSum=0.782;SC=GTTTTTGGCTTATTTATTTTC;SOR=1.087;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=49;WE=96053247;WS=96053229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr10	96058298	rs3765524	C	T	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1294;ReadPosRankSum=1.098;SC=CAGAAACTGACCCAGCACACC;SOR=0.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=83;WE=96058306;WS=96058288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,104:0.53:197
chr10	96064168	rs3818432	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.730;SC=TTTGAACTTTCAATTTATAAG;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=96064176;WS=96064158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr10	96066341	rs2274223	A	G	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1255;ReadPosRankSum=0.138;SC=TTTCTGTTCCACGTTCACTTC;SOR=0.533;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=82;WE=96066349;WS=96066331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr10	96068480	rs11187850	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=-1.317;SC=GTTTCACTCAACATATTTATG;SOR=0.791;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=27;WE=96068488;WS=96068470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr10	96084372	rs3831084	A	AT	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=326;ReadPosRankSum=0.695;SC=TCTGATACCCATAATTACACT;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=96084380;WS=96084362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr10	96087866	rs11187870	G	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=241;ReadPosRankSum=0.093;SC=GAAGCAAAATGGCACAGGGCT;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=19;WE=96087874;WS=96087856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr10	96100119	rs3740359	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=0.270;SC=GAAATGACAACAAACACCAAT;SOR=0.340;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=16;WE=96100127;WS=96100109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr10	96106025	rs11187894	C	T	120.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.210;SC=GAAAACATTTCTTTGCAGTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=96106033;WS=96106015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	96106240	rs11187895	G	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=177;ReadPosRankSum=-1.168;SC=AAATTTTTTTGGTTTATTAAT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=18;WE=96106248;WS=96106230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr10	96112233	rs7092226	T	G	72.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATAAAATATGTGTGTCTAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=96112241;WS=96112223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	96162370	.	G	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=998;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCCACCCCCAGATGGTGGGTC;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=63;WE=96162378;WS=96162360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,79:0.49:162
chr10	96163039	rs2477534	C	G	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=16;PP=987;SC=GGGACAGCCCCGCCAGCAGCT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=96163047;WS=96163029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	96271298	rs2860761	A	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=10;PP=888;SC=AACTTAGAGAAAATTATTTGT;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=96271306;WS=96271288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	96282390	rs10882469	G	A	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=3;PP=72;SC=CATGGACTCGGCTGGGTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=96282398;WS=96282380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	96305504	rs2274096	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=2;PP=342;SC=GGAGGGCGGGTGGGGAATGTA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=96305512;WS=96305494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	96305729	rs10882474	T	C	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=81;PP=2009;SC=GAAAACCTTTTGGGCGCGGGT;SOR=1.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=112;WE=96305737;WS=96305719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	96305830	rs73329627	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=0.070;SC=GAGGAGGAAAGGAGGGTTGGG;SOR=1.300;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=8;WE=96305838;WS=96305820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	96313960	rs11188019	A	C	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=35;PP=1226;SC=AAAGCAATATATACTCCAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=96313968;WS=96313950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr10	96343623	rs962234	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TCCCATTGTCTTGTTCTACTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=96343631;WS=96343613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	96353201	rs3781262	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=11;PP=1311;SC=TTCTCCTTCAGTCTTGTTGGT;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=96353209;WS=96353191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	96353422	rs11346357	AT	A	243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=11;PP=145;SC=TCCATTTTGAATTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=11;WE=96353430;WS=96353412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	96357022	rs2274417	A	G	179.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AATCTCAGACATGACATTTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=96357030;WS=96357012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	96448129	.	A	G	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=36;QD=17.6928031368;SC=TATGGGGTACATGTAATATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=96448137;WS=96448119;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	96466824	rs7904929	C	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=451;SC=TATGTACTTACCATGTGTATA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=96466832;WS=96466814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	96495266	rs3740367	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=447;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CAGGGCCATTGGCCTCTCCCT;SOR=0.177;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=22;WE=96495274;WS=96495256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr10	96522561	rs17885098	T	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.093;NF=24;NR=25;PP=834;ReadPosRankSum=-1.369;SC=CTCCTGGCCCTACTCCTCTCC;SOR=0.655;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=49;WE=96522569;WS=96522551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,55:0.71:78
chr10	96580140	rs28399511	T	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.358;NF=16;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=0.458;SC=TTTCTAGTACTATACTTTACA;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=16;WE=96580148;WS=96580130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr10	96602623	rs3758581	G	A	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.983;NF=54;NR=45;PP=1709;ReadPosRankSum=0.861;SC=TGAACGTGTCGTTGGCAGAAA;SOR=0.726;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=207;TCF=105;TCR=102;TR=99;WE=96602631;WS=96602613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,120:0.50:238
chr10	96731788	rs9332172	A	G	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=11;PP=1167;ReadPosRankSum=0.828;SC=AACTATGTGAATAATTTTGAA;SOR=0.703;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=100;TCR=23;TR=62;WE=96731796;WS=96731778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,74:0.52:143
chr10	96741053	rs1057910	A	C	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1486;ReadPosRankSum=0.044;SC=CCAGAGATACATTGACCTTCT;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=188;TCF=97;TCR=91;TR=91;WE=96741061;WS=96741043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,110:0.50:220
chr10	96745984	rs9332230	A	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=639;ReadPosRankSum=0.168;SC=AACTTTTTTGATCCATTGGAA;SOR=2.454;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=29;WE=96745992;WS=96745974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr10	96748737	rs1057911	A	T	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1072;ReadPosRankSum=0.508;SC=TTGTCAATGGATTTGCCTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=68;WE=96748745;WS=96748727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr10	96749181	rs9332245	T	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=395;ReadPosRankSum=0.189;SC=CTTTTATGCATAATGTAGGTC;SOR=0.672;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=23;WE=96749189;WS=96749171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr10	96954511	rs681838	T	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ATGAGATTCATATCCCATCTA;SOR=0.638;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=19;WE=96954519;WS=96954501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr10	96997589	rs1049961	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=351;ReadPosRankSum=0.086;SC=AACCAAAGTAAGCAGAGAACT;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=24;WE=96997597;WS=96997579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr10	96997670	rs1049921	A	G	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=793;ReadPosRankSum=1.522;SC=AACAGTGGTCAGATCTGCTGG;SOR=0.444;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=53;WE=96997678;WS=96997660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,69:0.56:124
chr10	96997820	rs1049814	A	G	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=699;ReadPosRankSum=0.153;SC=CAGTGCACACATAACACTCAG;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=54;WE=96997828;WS=96997810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr10	96998519	rs2860998	T	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=644;ReadPosRankSum=0.132;SC=CAGAACCACTTATAAATATAT;SOR=0.529;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=40;WE=96998527;WS=96998509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr10	96998591	rs2901833	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=1.609;SC=AAGTAACTTAGCCTCTCTGGT;SOR=1.371;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=18;WE=96998599;WS=96998581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr10	96998625	rs12778613	T	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=2.042;SC=TTCTATAAAATAGGAGATTAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=96998633;WS=96998615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr10	97023552	rs4917682	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=180;ReadPosRankSum=-1.875;SC=ACCTGCCTGGGCAGCCCTGGT;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=14;WE=97023560;WS=97023542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr10	97023895	rs2296962	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=0.348;SC=GCAGGCTGAGCGCCAGGGAGA;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=97023903;WS=97023885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr10	97101532	rs2274628	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=355;SC=TTTAAGTGGGGTCAAAGGGTA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=97101540;WS=97101522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	97110879	rs6583995	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=218;SC=GAGAACTAAACTGGCCTACAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=97110887;WS=97110869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	97116219	rs7076888	C	T	5611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=77;PP=2965;SC=ACCGCTGAATCAGCTGCTCAA;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=165;WE=97116227;WS=97116209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	97127264	rs6583997	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TAGATCACTTTTTATCACCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=97127272;WS=97127254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	97127462	rs6583998	C	A	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=44;PP=1592;SC=GAGCTCTGTACATGTCCAAAA;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=97127470;WS=97127452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	97127577	rs7074224	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=381;SC=CTAGTTTAGACCAGGACCTCT;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=97127585;WS=97127567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	97137105	rs1536556	A	G	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=68;PP=2236;SC=TACTTACAACACAGTTAACAT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=97137113;WS=97137095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	97141523	rs2274490	G	A	7732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=151;PP=2965;SC=ATTTTCTTGTGTCTACTTTCT;SOR=1.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=89;TCR=151;TR=240;WE=97141531;WS=97141513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr10	97154682	rs55688714	A	T	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=15;PP=2687;SC=AAAAGCCCAAATCTTATGCCT;SOR=3.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=98;TCR=15;TR=113;WE=97154690;WS=97154672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	97154698	rs11188311	G	A	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=33;PP=2965;SC=TGCCTACAATGGAACTATAAG;SOR=2.351;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=111;TCR=33;TR=143;WE=97154706;WS=97154688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	97157058	rs112372646	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=718;ReadPosRankSum=0.463;SC=AAAACAAAGGCAAAGAGCAAA;SOR=0.965;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=36;WE=97157066;WS=97157048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr10	97158713	rs2274489	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=455;SC=TGTACTCAGAGTGTACACTTG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=97158721;WS=97158703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	97175465	rs41315247	C	T	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=923;ReadPosRankSum=0.776;SC=GAGACAAGGCCGGGAGCCGGT;SOR=0.829;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=55;WE=97175473;WS=97175455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr10	97175752	rs61868669	G	C	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1291;ReadPosRankSum=0.968;SC=ACCTTTGGGAGCCGATCCAGC;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=72;WE=97175760;WS=97175742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,79:0.43:182
chr10	97181855	rs17849163	T	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=531;ReadPosRankSum=0.894;SC=GGAAAAAATCTCTCACTCACA;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=34;WE=97181863;WS=97181845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr10	97192324	rs943542	A	G	4950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=71;PP=2941;SC=GATTTTTGTAAGATCCATGTC;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=150;WE=97192332;WS=97192314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr10	97369939	rs10882640	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=748;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TCTTCCCAACCAGAGTCTTTC;SOR=0.529;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=53;WE=97369947;WS=97369929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
chr10	97371317	rs11188399	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-1.891;SC=CTGTAGCCTCAACAACTGAAC;SOR=1.721;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=97371325;WS=97371307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	97373966	rs2296692	A	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=262;ReadPosRankSum=1.761;SC=TGACCACACAAAATATAAAAA;SOR=0.570;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=20;WE=97373974;WS=97373956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr10	97385284	rs372198073	C	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=498;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGTTTTTAAACCTACTCTTCT;SOR=0.245;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=29;WE=97385292;WS=97385274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr10	97392969	rs3750701	G	A	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=35;PP=1094;SC=TCTGTCTGCAGAACACACTGT;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=97392977;WS=97392959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	97392993	rs3750700	T	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=778;SC=CTGGCAATCCTTTTTCCAAAC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=97393001;WS=97392983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	97397227	rs2275273	T	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=43;PP=1266;SC=GACTGTAAGTTACCGTACTGT;SOR=1.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=97397235;WS=97397217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	97412921	rs9787589	T	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=438;SC=CTCCAGCCTGTGTGACAAAAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=97412929;WS=97412911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	97440097	.	TCA	T	527	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=527;QD=142.5;SC=TTATGTCAGCTCACTTTAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=97440116;WS=97440094;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	97440098	.	CACT	C	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.105;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	97440103	.	T	TGG	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.86;ReadPosRankSum=-1.510;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	97440106	.	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr10	97446206	rs2297788	G	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.877;SC=AGATGCAGAGGAGCCAAATAT;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=58;WE=97446214;WS=97446196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr10	97447299	rs41302725	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=869;ReadPosRankSum=0.539;SC=GCTGTCTGCTGTGAGAGTAAA;SOR=0.921;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=49;WE=97447307;WS=97447289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr10	97447373	rs10786229	A	T	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=696;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GTGGTGATTGAGTTTGGAATG;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=50;WE=97447381;WS=97447363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,69:0.45:154
chr10	97447487	rs11188434	T	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=0.764;SC=CTAAAATGTTTTTTAAAAGAA;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=18;WE=97447495;WS=97447477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr10	97453433	rs41291570	G	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=954;ReadPosRankSum=-0.510;SC=ATTCCCAGGGGCCGAGGGAGT;SOR=0.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=59;WE=97453441;WS=97453423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,89:0.52:171
chr10	97471925	rs12244559	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.241;SC=TTTTTTGGTATGAATATTCAC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=97471933;WS=97471915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	97604406	rs3176886	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=181;ReadPosRankSum=0.421;SC=AATATCTCACAGCATCCATGG;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=14;WE=97604414;WS=97604396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr10	97698370	rs4918979	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=679;ReadPosRankSum=1.061;SC=GCCACGTATTCTAGAAGATGA;SOR=1.244;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=38;WE=97698378;WS=97698360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr10	97748040	rs7900838	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=472;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GGAGGTATCCGTTTCAGATGT;SOR=0.660;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=32;WE=97748048;WS=97748030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr10	97769856	rs4145209	G	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=403;ReadPosRankSum=0.664;SC=TGTCTCTGGAGAGTTCTTTAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=17;WE=97769864;WS=97769846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr10	97772253	rs3748224	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=340;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GAGAACAATACAGTACAATTC;SOR=0.092;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=17;WE=97772261;WS=97772243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	97772496	rs10748652	T	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.285;SC=TGTAAGTTATTATTATTTTTA;SOR=0.357;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=11;WE=97772504;WS=97772486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr10	97778853	rs1414922	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	97779219	rs1414921	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ATGGGGCCGGGGCAATCTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=9;WE=97779227;WS=97779209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	97816420	rs7099399	G	A	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1761;ReadPosRankSum=-1.446;SC=TCACTTGCCTGACATTTTCTC;SOR=0.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=97;TCR=94;TR=112;WE=97816428;WS=97816410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,127:0.56:227
chr10	97917797	.	G	C	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TTTGAAACAAGAGATAATGTT;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=88;TCR=86;TR=82;WE=97917808;WS=97917787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,97:0.44:222
chr10	97920099	rs67530050	T	TC	9087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=97;PP=2957;SC=TTGTGAAATGTCTAGGAGAAA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=37;TCR=99;TR=133;WE=97920107;WS=97920083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr10	97964154	rs10748665	C	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.11;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	97964154	.	CGTA	TGTA,TGTG	334	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=28,11;NR=3,1;PP=334,189;QD=11.895845566;SC=CCTTTTAACACGTAACTGCAA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=31,12;WE=97964165;WS=97964144;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.94:33
chr10	97964157	rs2242137	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.861;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr10	97975167	rs3835127	GTA	G	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=1;NR=5;PP=150;ReadPosRankSum=-1.803;SC=AAATGTGTGTGTATATATATA;SOR=0.693;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=97975178;WS=97975157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	97983526	rs10882746	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=1.087;SC=CTGTCCTGGTCGCTTGCCCCA;SOR=1.828;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=9;WE=97983534;WS=97983516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	97987144	rs2305846	C	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=434;ReadPosRankSum=-0.465;SC=GGCCGAGTGCCCAGGTCTGCG;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=26;WE=97987152;WS=97987134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr10	97987378	rs34233512	G	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=989;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CTGCCTGGCCGTCAGGACCAT;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=73;WE=97987386;WS=97987368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
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chr10	98078239	rs6584066	A	G	6671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=96;PP=2965;SC=CGAATGCATAAGAGCAGGGAA;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=209;WE=98078247;WS=98078229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr10	98082517	rs7097016	T	G	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=23;PP=629;SC=TATTGAAAATTGTTTTTCAGT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=98082525;WS=98082507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	98084110	rs41291616	G	C	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=824;ReadPosRankSum=1.351;SC=AGTAAGGTCGGACAAAAGCCT;SOR=0.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=58;WE=98084118;WS=98084100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,73:0.38:190
chr10	98084231	rs2181320	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=780;SC=TGCAACTCCAATCTGGGAGAG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=98084239;WS=98084221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	98088387	rs10882773	A	C	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=220;SC=CTATGTTGCAAATCTTAAGCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=98088395;WS=98088377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	98095794	rs10736102	T	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=71;PP=2097;SC=CCCCCGAGCTTTTTTCATGGA;SOR=2.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=98095802;WS=98095784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	98109606	.	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=364;ReadPosRankSum=-1.618;SC=GAAAAACACAGGGTCAGAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=19;WE=98109614;WS=98109596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr10	98111279	rs2146392	C	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=81;SC=TATCCCTTTGCTAAACTTTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=98111287;WS=98111269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	98116076	rs2861575	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=590;SC=ACAATGCATTCATTAAGTTTT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=98116084;WS=98116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	98138978	rs28438557	G	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.302;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=388;ReadPosRankSum=-1.558;SC=CCCTCTGATTGTTCCCTCACT;SOR=0.164;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=23;WE=98138986;WS=98138968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr10	98144312	rs7085022	G	A	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=13;PP=904;SC=CCTCACTCGCGCTGCATCAGC;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=98144320;WS=98144302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	98146654	rs12252784	C	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.004;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=616;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GCCCCACTTCCCCAAAGACTT;SOR=0.984;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=50;WE=98146662;WS=98146644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,58:0.38:151
chr10	98155678	rs41291628	G	A	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=461;ReadPosRankSum=2.354;SC=CTCTGAAACCGTAATCCTCCA;SOR=0.810;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=38;WE=98155686;WS=98155668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr10	98240035	rs2281801	A	T	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.15;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	98240045	rs2281800	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	98282160	rs17391197	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.471;SC=AACACTAAATACTCTATGCTC;SOR=0.191;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=98282168;WS=98282150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	98287094	rs10786298	T	A	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=17;PP=866;SC=TACTTTCAACTTAAGGCCTTA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=98287102;WS=98287084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	98287150	rs3789958	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=506;ReadPosRankSum=1.363;SC=AATAAAAGGTAAAAAAATGTC;SOR=0.877;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=30;WE=98287158;WS=98287140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr10	98287792	rs12779720	G	T	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=1260;ReadPosRankSum=0.456;SC=ACTTACCACCGGTAATCTTCT;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=72;WE=98287800;WS=98287782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr10	98311190	rs10882816	G	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=398;ReadPosRankSum=1.341;SC=TATATATATAGAGAGAGAAAA;SOR=1.185;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=25;WE=98311210;WS=98311180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
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chr10	98321917	rs147342848	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=1.074;SC=AAAACACTTTATACAAGGTAA;SOR=1.136;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=12;WE=98321936;WS=98321907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
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chr10	98346649	rs1062176	T	G	605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=660;ReadPosRankSum=-1.432;SC=CGCCGCCGCCTCCTCCGCCGC;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=14;WE=98346657;WS=98346626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr10	98369536	rs3748236	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=573;ReadPosRankSum=0.951;SC=GGGGAATGACACTTTTCCTGG;SOR=0.593;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=43;WE=98369544;WS=98369526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr10	98369755	rs41317270	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AGGGAAAAGACGATGGGAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=6;WE=98369763;WS=98369745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	98380137	rs12784975	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=671;ReadPosRankSum=0.101;SC=CTCCGATCGTTTCTTCTGGTT;SOR=0.588;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=41;WE=98380145;WS=98380127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr10	98380363	rs7910630	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=232;SC=ACTGGGGACCACTCACCAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=98380371;WS=98380353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	98383329	rs4917745	G	T	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=43;PP=1310;SC=TACTGAAAAAGTATCAAAATC;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=98383337;WS=98383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	98386433	rs1469847	C	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=711;SC=GCTCCAAAGACCCAGTTGGAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=98386441;WS=98386423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	98386558	rs4344416	G	A	4349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=56;PP=2936;SC=CTGCTGGCCAGGTCCACAGAA;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=133;WE=98386566;WS=98386548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	98392872	rs6584092	A	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=83;SC=TTCCAGGGTCACCATGAGAGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=98392880;WS=98392862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	98408714	rs912483	A	G	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=56;PP=1639;SC=GGCAACAGAAAGCACTCAGCC;SOR=3.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=65;WE=98408722;WS=98408704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	98416533	rs3748231	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CATCCAGCTACCAGGCCCCCA;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=14;WE=98416541;WS=98416523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr10	98469507	rs3748229	C	A	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1404;ReadPosRankSum=0.119;SC=GGCAGCAAGGCGGGCTTGTGG;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=82;WE=98469515;WS=98469497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,93:0.47:196
chr10	98742750	rs3829856	A	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=1071;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TTGTCTTGAAATCAAAGTTCC;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=60;WE=98742758;WS=98742740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,70:0.43:164
chr10	98778477	rs3740527	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.820;NF=16;NR=27;PP=649;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CCCAGGGAGACCCAGGAGTTA;SOR=1.266;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=43;WE=98778485;WS=98778467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr10	98778574	rs113945804	C	CTTCA	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr10	98790674	rs41284248	G	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=0.509;SC=TGCAGAGAGGGGACAGGCCGT;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=98790682;WS=98790664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	98797351	rs2805586	A	G	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=1.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	98797351	.	AGGATCTGCC	GGGATCTGCC,GGGATCTGCT	734	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41,12;NR=17,5;PP=734,268;QD=13.2546760784;SC=GAAAAGAAGCAGGATCTGCCC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58,17;WE=98797368;WS=98797341;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:58
chr10	98797360	rs75066754	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.395;SOR=1.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr10	98803252	rs35388136	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=2.127;SC=TGCAGCTGATGCGGTTGTTCC;SOR=0.412;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=16;WE=98803260;WS=98803242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr10	98808866	rs2805588	C	G	6436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=107;PP=2965;SC=AAGGGTTCTGCGCCAGGTGCC;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=85;TCR=107;TR=192;WE=98808874;WS=98808856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr10	98816786	rs2817675	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=-1.083;SC=CTCTACCTCCTTCTCTAGCCT;SOR=1.136;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=13;WE=98816794;WS=98816776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr10	98817687	rs7914872	A	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=1067;ReadPosRankSum=1.090;SC=CAATATCATAATCGGACCCCA;SOR=0.810;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=62;WE=98817695;WS=98817677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr10	98819317	rs2817676	A	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=0.672;SC=GAGAGGGGGCATCTGAATCCC;SOR=0.858;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=56;WE=98819325;WS=98819307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr10	98825940	rs1106375	G	A	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=45;PP=1450;SC=AGGTGGGCTGGAGGGCACTGA;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=98825948;WS=98825930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	98923361	rs2636772	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=578;SC=CACAGGCCTATGCCTGGCCTG;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=98923369;WS=98923351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	98979111	rs10714841	AT	A	247.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=265;SC=TTATATGTGGATTTTTCGACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=98979119;WS=98979101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	98988759	rs1468069	A	C	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=413;SC=CTGGTGAATGAACTCAAGGGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=98988767;WS=98988753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	98989454	rs2297987	A	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1366;SC=AGATGACAGTATATCAATTTT;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=98989462;WS=98989444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	99003613	rs793528	A	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=287;SC=GACAAGCCTGATTTCTCAGCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=99003621;WS=99003603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	99019144	rs3740522	C	T	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=57;PP=2731;SC=CTTTACTCTTCCCGTCAACAC;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=138;WE=99019152;WS=99019134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	99019177	rs2253301	A	G	5576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=79;PP=2965;SC=GCCACAGGACATGGGGTGCAA;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=172;WE=99019185;WS=99019167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr10	99025611	rs10882884	T	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=6;PP=1097;SC=CAAACACATCTCCTACCCTTT;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=45;WE=99025619;WS=99025601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	99079023	rs11189127	G	A	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=1;PP=81;SC=GAGCCGGCAGGATTCCGGCTC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=99079031;WS=99079017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	99094164	.	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=-1.040;SC=CTGTCCTGCGCCGCGTCCAGC;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=99094172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	99116903	rs1048445	C	T	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1051;ReadPosRankSum=0.802;SC=GGAACCTCGCCGGGCAGCCTT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=71;WE=99116911;WS=99116893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,97:0.49:199
chr10	99117120	rs10882905	G	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=317;SC=GCTTCCACACGGCTCATGTCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=99117128;WS=99117110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	99125949	rs2275580	C	T	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=76;PP=2266;SC=ACCTTGAAGCCGTGGTCCTTC;SOR=1.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=115;WE=99125957;WS=99125939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	99130161	rs149757559	CCCCA	C	4396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=40;PP=2942;SC=GGGTGCTTCCCCCCACCCAGT;SOR=1.029;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=60;WE=99130172;WS=99130151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	99160965	rs2275091	A	G	8825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=146;PP=2965;SC=AGACACCAGAAGGCAACTTTC;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=268;TCF=122;TCR=146;TR=268;WE=99160973;WS=99160955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr10	99205686	rs2297666	A	G	5322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=98;PP=2965;SC=CCTATCCAGGACTCTGTACGG;SOR=1.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=167;WE=99205694;WS=99205676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr10	99220707	rs3740526	C	T	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=59;PP=2461;SC=GGGCCCAGAGCCCAGGCCAGC;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=110;WE=99220715;WS=99220697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	99225738	rs2236575	T	A	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=87;PP=2965;SC=AGACAAAGGTTTACTGTGTGA;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=99;TCR=87;TR=186;WE=99225746;WS=99225728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr10	99240758	rs2275586	G	C	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=39;PP=1380;SC=AAGCTGGATTGCTCGTGCCCG;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=99240766;WS=99240748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	99337473	rs10786357	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=390;SC=GGAGGATGTCTCTGTGGGGTG;SOR=1.214;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=99337481;WS=99337463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	99337572	rs7094973	G	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=18;PP=744;SC=CCGAGGAGACGCACGCCAGAA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=99337580;WS=99337562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	99376843	rs4919121	A	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=985;SC=ACTACTTATTACTCATCTGTG;SOR=3.109;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=99376851;WS=99376833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	99498234	rs3818876	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=424;ReadPosRankSum=-0.758;SC=ATGGTTACAGGATGCAGACAT;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=22;WE=99498242;WS=99498224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr10	99503021	rs72835978	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GCTCTTGTTGCCCTGGAGTTA;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=99503029;WS=99503011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	99504630	rs10882993	G	T	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=47;PP=1867;SC=CTGCAGAGAGGTCGCCTGTCT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=99504638;WS=99504620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	99504725	rs10882994	A	G	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=894;SC=AGCAGCCATGACACTAAGTGC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=99504733;WS=99504715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	99507869	rs11189352	T	C	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=16;PP=1594;SC=TAGCCAGGCCTGTTTCTCCCA;SOR=2.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=99507877;WS=99507859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr10	99509969	rs3750615	T	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=3;PP=641;SC=GTTAGGAGGGTGACTCTTTCC;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=99509977;WS=99509959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr10	99510284	rs3829137	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CCCCCTGTTATCAGCTTGTTT;SOR=1.292;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=14;WE=99510292;WS=99510274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr10	99512472	rs1538723	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=15;PP=799;SC=CGTCTGTCAATGTCACCATTT;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=99512480;WS=99512462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	99514645	rs7922907	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=42;PP=1200;SC=TTACAGATGAATAACCTGAGG;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=99514653;WS=99514635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	99516955	rs10882995	G	A	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=937;ReadPosRankSum=0.736;SC=ATTTAGAAGCGCCAGGAGCAG;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=39;WE=99516963;WS=99516945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr10	99517355	rs3750612	A	G	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=46;PP=2440;SC=AACTCCAGGTACCTGAGGGTG;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=114;WE=99517363;WS=99517345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	99518810	rs1981238	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=469;SC=GGCATCATCACCCCCAGGATC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=99518818;WS=99518802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	99518874	rs10882996	G	A	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=14;PP=1383;SC=AGCTGGGCAGGGAGGGTGTGG;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=99518882;WS=99518864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	99518901	rs12412543	G	C	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=30;PP=1759;SC=TGGGGGGTCTGTGTGGGGCAT;SOR=1.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=81;WE=99518909;WS=99518891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	99519097	rs1981237	A	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=1075;SC=CGTCCTTGGGACCAGCAGTAG;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=99519105;WS=99519087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	99531571	rs11815012	C	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.34;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	99640255	rs10883009	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=589;ReadPosRankSum=0.456;SC=TGCCTTCCTCGCAGAGCCTCA;SOR=0.316;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=73;TCF=5;TCR=68;TR=34;WE=99640263;WS=99640245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr10	99642731	rs588061	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=0.883;SC=AGCCCCCTCCCTTGTAAGACC;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=9;WE=99642739;WS=99642721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr10	99655606	rs2297938	G	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=371;ReadPosRankSum=2.749;SC=AGAGCACACAGGGCTGGGATC;SOR=1.012;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=23;WE=99655614;WS=99655596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr10	99664456	rs7068503	T	C	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=868;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GGGTGCTCATTTGCAGATAGA;SOR=0.422;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=66;WE=99664464;WS=99664446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr10	99682981	rs894375	T	C	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=9;PP=1092;SC=CTGGCTCTCATGTGGCTTCTC;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=99682989;WS=99682971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	99683270	rs2289554	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=-0.620;SC=AGAGGAGGTTGGGTCATCTGC;SOR=0.187;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=20;WE=99683278;WS=99683260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr10	99696003	rs35027739	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=1015;ReadPosRankSum=-1.114;SC=CTGTGACCCCGATGGCGTTCC;SOR=0.638;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=120;TCF=60;TCR=60;TR=63;WE=99696011;WS=99695993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr10	99971224	rs72826282	A	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=348;ReadPosRankSum=0.350;SC=AAGAAATAATAATAAGGTGGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=17;WE=99971232;WS=99971214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr10	99991408	rs1952061	A	G	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=32;PP=1087;SC=CAAGAATTTCATACTGAAGAC;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=99991416;WS=99991398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr10	100011077	rs11189523	T	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=0.966;SC=ATGTTCCCATTTTACAGATAG;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=21;WE=100011085;WS=100011067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr10	100011970	rs3750598	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GTAAGAAATTGCCTTGAATGC;SOR=1.101;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=18;WE=100011978;WS=100011960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr10	100012011	rs10748722	C	T	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=23;PP=1301;SC=TCCAGGTGCCCTGGGCTGCTG;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=100012019;WS=100012001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	100013244	rs3750599	A	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGAAGGGCCAAACTGCTCCCT;SOR=0.484;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=14;WE=100013252;WS=100013234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr10	100015563	rs3763688	G	C	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=0.924;NF=27;NR=51;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CCCATCTGAGGTGTGGCCTCA;SOR=0.695;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=78;WE=100015571;WS=100015553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr10	100018844	rs7077073	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=281;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TGACCACAGCGTGCATGCCAC;SOR=0.577;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=23;WE=100018852;WS=100018834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr10	100019039	rs7077266	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=0.802;SC=AGAGCTTCAGGACTAAGGGAG;SOR=1.432;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=100019047;WS=100019029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	100020880	rs33995374	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=928;ReadPosRankSum=-1.105;SC=CTCCAGCCGCCGGCCCTGCGG;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=54;WE=100020888;WS=100020870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr10	100021983	rs746257	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=939;ReadPosRankSum=0.456;SC=GTGGAGTGGAGGTGATGCTCA;SOR=0.486;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=42;WE=100021991;WS=100021973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr10	100022446	rs10736125	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=365;SC=AGCCCAGCCCAAGAAGACTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=100022454;WS=100022436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	100022917	rs112780536	A	ATG	333.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.46;NF=0;NR=7;PP=331;SC=CCCCCCTCAAATGTGTGTGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=100022925;WS=100022907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	100219314	rs10883099	G	A	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=38;PP=1548;SC=ACTGGTAGCCGTGAGTGTGAG;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=100219322;WS=100219304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	100219374	rs10883100	T	A	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=49;PP=2089;SC=CTTGACCACATAAAAGCCCAT;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=101;WE=100219382;WS=100219364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	100219519	rs11189618	G	A	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=36;PP=1267;SC=AAAACAGTATGGGACTCATTA;SOR=1.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=100219527;WS=100219509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	100250019	rs59184373	GACACACACAC	G	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=3000;SC=GAGTAAACATGACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=100250036;WS=100250009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	100481315	rs147098746	A	AAAAT	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=78;SC=TCTTAAGACCAAAATAAATAA;SOR=1.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=100481323;WS=100481305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	100991971	.	TACAC	T	1019.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=8;NR=4;PP=638;SC=CGCGCGCGCATACACACACAC;SOR=2.093;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=12;WE=100991987;WS=100991961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	100991976	.	A	G	773.78	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.69;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr10	100991979	.	C	T	773.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.17;ReadPosRankSum=1.543;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,20:0.91:22
chr10	101090428	rs2862600	T	G	4553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=58;PP=2965;SC=GCACCAAAGTTGTGGAGGAGG;SOR=0.972;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=136;WE=101090436;WS=101090418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	101120787	rs3763792	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=1012;SC=GGGTGGGACCCAGGCACCAAT;SOR=1.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=101120795;WS=101120777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	101137063	rs3829211	G	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=668;SC=CCATTCCTAGGAGGGATGTGT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=101137071;WS=101137053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	101150256	rs3793931	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=246;SC=GGGAGGAGCCATGGACTCCTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=101150264;WS=101150246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	101372411	rs880568	T	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=29;PP=873;SC=GACCAACTCATTGAGGTCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=101372419;WS=101372401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	101420283	.	GCACACACACA	G,GCA	909.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=1,1;NR=9,9;PP=177,175;SC=GAATGGATACGCACACACACA;SOR=2.584;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=10,10;WE=101420300;WS=101420273;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.72:25
chr10	101420318	rs28529459	C	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.59;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	101420324	rs11190227	T	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.41;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	101439252	rs3740079	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=43;PP=1341;SC=TTTGTTGTCAGTCTCTTTTAA;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=101439260;WS=101439242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	101462193	rs10748790	C	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=435;SC=TGTGGGAATACGGAGTGGCTT;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=101462201;WS=101462183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	101473218	rs2231687	A	G	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=50;PP=1733;SC=TTAAAAGTAAAGTTGAATAAG;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=101473226;WS=101473208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	101480604	rs3832650	C	CAG	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=5;PP=502;SC=GAACAGGAAACAGGGTGAAGA;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=101480612;WS=101480594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	101544447	rs927344	A	T	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=30;PP=1982;SC=CCCTTGGGCTACCTATGGCTC;SOR=1.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=95;WE=101544455;WS=101544437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	101551902	rs2756108	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=200;SC=CTGCATACCGCTTTTCCTATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=101551910;WS=101551892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	101564954	.	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TCAGAAAGAAGATGGGTGCGG;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=101564962;WS=101564944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	101571528	rs3740074	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=627;SC=AGCAAAGGTTCTCAGCCCCTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=101571536;WS=101571518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	101576960	rs3740073	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=262;SC=CACAGTTATTTAAATTTAAGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=101576968;WS=101576950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	101591944	rs4148396	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=966;SC=ATCTTTCTGATAGGGAGGAAT;SOR=4.461;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=101591952;WS=101591934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	101823543	rs4462272	T	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=593;SC=GCAATGCTCCTACTCACAACT;SOR=2.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=101823551;WS=101823533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	101825160	rs3829161	C	G	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=63;PP=1955;SC=CGGTGAAGGGCCAACTGGGGC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=87;WE=101825168;WS=101825150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	101841153	rs10883439	A	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=323;SC=AGCTGTTCAGAACTTACAGGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=101841161;WS=101841143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	101912064	rs2862954	T	C	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=67;PP=2117;SC=TTAGAAGCAATGGCCTGGTAC;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=116;WE=101912072;WS=101912054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	101912194	rs1408579	C	T	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=512;SC=TCACCTATTGCTCTCCTGAGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=101912202;WS=101912184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	101914544	rs41290524	T	C	5933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=61;PP=2965;SC=ACTTCTATCATATCAGAGCTC;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=111;TCR=61;TR=172;WE=101914552;WS=101914534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr10	101953705	rs11597086	A	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=515;SC=ATAGCAACTCAATGTCACATT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=101953713;WS=101953695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	101967212	rs7909855	C	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=439;SC=ATGTGTATTACCATATCTCTT;SOR=2.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=101967220;WS=101967202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	101977883	rs2230804	C	T	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=71;PP=2037;SC=GGTTCTACTACTAAACTAGAA;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=28;TCR=71;TR=99;WE=101977891;WS=101977873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	101980459	rs986266	A	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=870;SC=AATATACTTTAAAGTAACAGA;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=101980467;WS=101980449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	102006429	rs4919438	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=516;SC=TTTCTAAACATCATCATGATT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=102006437;WS=102006419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	102016268	rs2270961	G	A	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=77;PP=2488;SC=ATTTTAGTCAGAATTGCAGAA;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=118;WE=102016276;WS=102016258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	102027407	rs12784396	C	T	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=36;PP=1364;SC=CGAATCCGCGCTCCCCGGAAA;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=102027415;WS=102027397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	102056745	rs2278842	C	T	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=29;PP=1695;SC=ACCAAGATGACCACCAGGTCC;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=71;WE=102056753;WS=102056735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	102059329	rs2242050	G	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=426;SC=GGGAGGGGTAGAAAAGATCTT;SOR=2.147;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=102059337;WS=102059319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	102088906	rs3829159	C	T	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=25;PP=1880;SC=AATGTTTATACATATAGTGCA;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=91;WE=102088914;WS=102088896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	102107251	rs1054411	C	G	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TCCCGGCATCCGAGAGCCAAG;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=89;TCR=60;TR=83;WE=102107259;WS=102107241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,99:0.56:176
chr10	102116208	rs111712956	ATCCCC	A	1867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.16;MQRankSum=1.836;NF=21;NR=12;PP=1434;ReadPosRankSum=0.932;SC=AAGACAGCCCATCCCCTCCCA;SOR=0.920;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=33;WE=102116220;WS=102116198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr10	102116311	rs2234970	A	C	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.549;NF=39;NR=45;PP=1271;ReadPosRankSum=1.007;SC=TGGCTTGCTGATGATGTGCTT;SOR=0.463;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=179;TCF=73;TCR=106;TR=84;WE=102116319;WS=102116301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,108:0.46:236
chr10	102222825	rs3793772	T	C	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=37;PP=1896;SC=AGTTGGGCTTTGAGAATTCCA;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=102222833;WS=102222815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	102222957	rs3793771	G	C	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=54;PP=1817;SC=GTGTACATCTGTCTTTTCACC;SOR=1.469;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=80;WE=102222965;WS=102222947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	102239829	rs2295770	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=244;SC=GAGCCCCAGGGATAGCCCCTT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=102239837;WS=102239819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	102241998	rs17113137	G	C	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=35;PP=1591;SC=CGCTTAATCCGGGGCCTCTCA;SOR=1.006;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=102242006;WS=102241988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	102247408	rs2298075	C	A	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=47;PP=1714;SC=ATGAGGACAGCCTTCAGGATA;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=102247416;WS=102247398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	102247526	rs2298074	G	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=794;SC=CAACCTCATGGAGCCCAGCCA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=102247534;WS=102247516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	102248884	rs3750720	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=7;PP=551;SC=GCAGTAAGGACACCTGGTACC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=102248892;WS=102248874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	102248950	rs3750719	C	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=14;PP=644;SC=CTACCATGACCTGCACCCAAG;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=102248958;WS=102248940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	102258439	rs9420792	C	T	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=736;SC=AGAGACTCTCCCTCTCCCTCA;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=102258447;WS=102258429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	102258991	rs41290542	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=799;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CCTAGCCCCACGTCACTCTTC;SOR=0.915;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=56;WE=102258999;WS=102258981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr10	102265056	rs140191147	AAC	A	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.609;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr10	102265183	rs2295772	G	A	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=46;PP=1619;SC=GGTATCAGTGGTGCTTGTGCC;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=82;WE=102265191;WS=102265173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	102265815	rs2295773	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=458;SC=CCTGTCTCATATGCTGGACTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=102265823;WS=102265805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	102265847	rs2295774	A	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=8;PP=717;SC=CCCATCACAGAGTACAAACTG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=102265855;WS=102265837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	102266316	rs3750626	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=297;SC=TATTATCTTACAAATGAATAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=102266324;WS=102266306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	102269085	rs3793706	C	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=733;SC=GGAAAGGATTCAAGTCGAGGG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=102269093;WS=102269075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	102269206	rs3763695	A	G	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=38;PP=1639;SC=CCCGCCGCCAACAATAACCCC;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=102269214;WS=102269196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	102275780	rs3750630	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=636;SC=CATGAGCCCTAAGAAACACAC;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=102275788;WS=102275770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	102289078	rs1800662	C	A	5192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=53;PP=2965;SC=TCAAGCCACCCAACCCAGCCG;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=110;TCR=53;TR=163;WE=102289086;WS=102289068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	102289743	rs10883506	C	G	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=24;PP=754;SC=TTTAAATACGCAGTTGGGAAG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=102289751;WS=102289733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	102295629	rs2295776	G	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=18;PP=886;SC=GTTTCCGTTGGGTGTGTGGTT;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=102295637;WS=102295619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	102295658	rs11190600	T	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.896;HP=12;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=-0.125;NF=16;NR=19;PP=651;ReadPosRankSum=1.473;SC=TTTTTTTTTTTGGGGTCCGGA;SOR=0.204;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=35;WE=102295666;WS=102295635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr10	102296061	rs2295779	A	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=319;SC=GCTGATTAACAGGAGAAATTA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=102296069;WS=102296051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	102296461	rs10883509	C	T	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=51;PP=1523;SC=TTAGGACACTCATTTTTCTTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=65;WE=102296469;WS=102296451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	102307671	rs7073586	A	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=170;SC=TGAGGGAAAGACTATGTCCCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=102307679;WS=102307661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	102506070	rs4472867	G	C	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=59;PP=1232;ReadPosRankSum=0.495;SC=CGTGAGTACCGGCGCCCGGCT;SOR=0.890;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=205;TCF=85;TCR=120;TR=96;WE=102506078;WS=102506060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,121:0.46:261
chr10	102539429	rs7901210	C	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=1.520;SC=TGCCTGCCCGCTTGAGGTCCA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=23;WE=102539437;WS=102539419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr10	102568808	rs184960110	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=210;ReadPosRankSum=0.016;SC=ATCTGCACACCGAGCCCTTTC;SOR=0.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=17;WE=102568816;WS=102568798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr10	102568983	rs1800898	A	C	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.173;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=946;ReadPosRankSum=1.119;SC=AGACATACCCAGTTGTGACTG;SOR=0.603;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=78;WE=102568991;WS=102568973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,101:0.50:202
chr10	102584597	rs11190717	G	A	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.732;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1539;ReadPosRankSum=0.007;SC=AGGCTGGGGTGGGGGGAGACA;SOR=0.800;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=89;WE=102584605;WS=102584587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,104:0.50:207
chr10	102673063	rs3802725	G	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=329;ReadPosRankSum=0.198;SC=GGTATGAGGGGAGGGCTGCAG;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=24;WE=102673071;WS=102673053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr10	102684380	rs10883563	C	A	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.786;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=1.066;NF=51;NR=49;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GGGAAAATTTCTGGGGGACCT;SOR=0.594;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=208;TCF=101;TCR=107;TR=100;WE=102684388;WS=102684370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,118:0.47:250
chr10	102689217	rs2273654	T	C	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=55;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TTTCATAATGTATTTTACCTT;SOR=0.573;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=164;TCF=52;TCR=112;TR=82;WE=102689225;WS=102689207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,90:0.50:179
chr10	102689504	rs10786614	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CTTAAAAAATGGTTTTCTTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=102689512;WS=102689494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	102707526	rs12780429	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GGCAACTGAGACAGTGCCTCA;SOR=1.112;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=9;WE=102707534;WS=102707516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr10	102744331	rs11591349	A	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=452;ReadPosRankSum=-2.747;SC=ACCAGACAAGACCTCTGCCAG;SOR=0.287;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=27;WE=102744339;WS=102744321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
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chr10	102746829	rs181211282	G	A	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=1946;ReadPosRankSum=1.554;SC=CCTCCAGCCCGAGCCCGGCCC;SOR=0.506;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=217;TCF=131;TCR=86;TR=119;WE=102746837;WS=102746819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,128:0.53:242
chr10	102762256	rs752974	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=340;ReadPosRankSum=-0.633;SC=GCTTACAGGTCGCCTGCGAGG;SOR=1.255;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=102762264;WS=102762246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr10	102770082	rs807023	T	G	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.941;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1143;ReadPosRankSum=0.497;SC=GCCACTGGGGTTCTTCATGGC;SOR=0.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=76;WE=102770090;WS=102770072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,95:0.48:197
chr10	102770293	rs200896335	T	TGCTGCG	1943.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.515;NF=1;NR=20;PP=1250;ReadPosRankSum=0.328;SC=TGACCCCGGCTGCTGCGGCTG;SOR=0.716;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=21;WE=102770301;WS=102770283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr10	102770327	rs807022	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.448;NF=16;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GGCTGCGGCTACGGCTCTGAG;SOR=0.895;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=39;WE=102770335;WS=102770317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr10	102775221	rs10579208	ATGTG	A	281.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=35.22;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	102775349	rs34125357	CT	C	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=671;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GGCTGGGTGACTGAAGGACCG;SOR=0.680;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=18;WE=102775357;WS=102775339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr10	102777461	rs10786615	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GAGGATCGCTTGAGCGTGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=10;WE=102777469;WS=102777451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	102777768	rs11190793	C	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=497;ReadPosRankSum=1.681;SC=GCTGGTAAGACGCGGTGTGGG;SOR=0.648;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=30;WE=102777776;WS=102777758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr10	102780265	rs7075659	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.508;NF=6;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AAAATGCTGGGATTACAGGTG;SOR=2.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=6;WE=102780273;WS=102780255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr10	102780312	rs7075685	G	T	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=14;PP=928;SC=TCTTCAGAGAGCCGGGCCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=102780320;WS=102780302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	102780354	rs77484072	TG	T	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.090;NF=9;NR=11;PP=627;ReadPosRankSum=0.687;SC=CCTCCAACCTTGGGAGATCTG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=20;WE=102780362;WS=102780344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr10	102780638	rs1998249	A	C	144.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=70;SC=GCCTGGAGGCAGCCCTGACCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=102780646;WS=102780628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	102783678	rs6584410	T	C	5531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=80;PP=2965;SC=CTGGGGGTTCTGCTTACCTGC;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=170;WE=102783686;WS=102783668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr10	102790163	.	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GAGCAGGGATGAGGGAGGGGT;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=10;WE=102790171;WS=102790153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr10	102792295	rs807014	G	A	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=53;PP=1948;SC=CAGAGAAGGAGGCCTGCCTTG;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=102792303;WS=102792285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	102798346	rs807049	T	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=621;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TGAAATGGGGTGACAGTGAGG;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=41;WE=102798354;WS=102798336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr10	102824349	rs807037	G	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=412;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CGCTGCCTTGGCCGCAATGCC;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=28;WE=102824357;WS=102824339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr10	102893840	rs12415670	G	A	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=962;ReadPosRankSum=-1.921;SC=TTGGGCCTGGGACGCTTCCTG;SOR=0.891;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=55;WE=102893848;WS=102893830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr10	102988345	rs941909	G	A	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=31;PP=1522;ReadPosRankSum=1.956;SC=AGAGCAGCGCGCGGCCCGCCA;SOR=0.327;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=181;TCF=128;TCR=53;TR=88;WE=102988353;WS=102988335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,97:0.49:198
chr10	102997581	rs678741	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.744;NF=17;NR=6;PP=354;ReadPosRankSum=0.507;SC=GCCTGTGTTGGGACCTAAGGA;SOR=0.795;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=23;WE=102997589;WS=102997571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr10	103221870	rs5787432	CAGG	C	2593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.254;NF=11;NR=48;PP=2969;ReadPosRankSum=0.530;SC=AAACAAAAGACAGGAGGAAAC;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=59;WE=103221880;WS=103221860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr10	103281308	rs9419923	A	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=767;ReadPosRankSum=0.549;SC=ATGTAGACATAATATAGCATG;SOR=0.277;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=70;TCF=64;TCR=6;TR=36;WE=103281316;WS=103281298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr10	103291249	rs9420859	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=483;ReadPosRankSum=-1.391;SC=AATCCCAGCATTTTTGGAGGC;SOR=0.232;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=25;WE=103291257;WS=103291239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr10	103340056	rs3730477	G	A	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1109;ReadPosRankSum=-0.722;SC=CGGTGGGACCGGCCATCTGGG;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=75;WE=103340064;WS=103340046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,100:0.50:200
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chr10	103340179	rs3730475	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=931;ReadPosRankSum=-0.529;SC=TGGACCTGGGAAAGAGAGCGG;SOR=0.526;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=59;WE=103340187;WS=103340169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,72:0.54:134
chr10	103340235	rs3730474	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=0.194;SC=CCCACAGCAGTACAAGGGCCT;SOR=1.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=22;WE=103340243;WS=103340225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr10	103343533	rs3730465	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GCAGATGCTGACATAAAAGCC;SOR=0.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=12;WE=103343541;WS=103343523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	103345940	rs3730462	CTGTTG	C	551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.781;NF=1;NR=9;PP=483;ReadPosRankSum=-1.065;SC=CAGATGACTACTGTTGTAACT;SOR=0.051;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=103345952;WS=103345930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr10	103354554	rs7911520	A	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;PP=922;ReadPosRankSum=1.048;SC=CATAAGCACAATGAACACTCC;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=50;WE=103354562;WS=103354544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr10	103361088	rs7874	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=803;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GAACAACCAACAAGAAGTGAG;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=58;WE=103361096;WS=103361078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr10	103368654	rs7006	T	C	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1194;ReadPosRankSum=-1.617;SC=GATGACGCCTTGCTGAGCTTT;SOR=0.753;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=88;WE=103368662;WS=103368644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,105:0.50:211
chr10	103559245	rs76134290	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=0.616;SC=AAATAAAATGGTCACACAGAT;SOR=0.492;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=28;WE=103559253;WS=103559235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr10	103565960	rs3740422	G	C	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=90;PP=2943;SC=TTTTCTCTTTGTTTGTTTGTT;SOR=2.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=28;TCR=90;TR=118;WE=103565968;WS=103565950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	103588734	rs1562364	A	G	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=32;PP=1808;SC=CCTTCCGCCCACACCTCAAGC;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=103588742;WS=103588724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	103590112	rs72844664	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=560;ReadPosRankSum=1.049;SC=TCGGGGCATAGGCAACACACA;SOR=0.762;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=42;WE=103590120;WS=103590102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
chr10	103599325	rs874885	A	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=432;SC=CCTCCTGCTCAGTAAGGAGGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=103599333;WS=103599315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	103603162	rs12413444	G	T	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=21;PP=1289;SC=GGCAGAGTGTGGGTGCGGGCC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=103603170;WS=103603152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	103717493	.	T	TA	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=18;MQ=59.63;NF=0;NR=5;PP=75;QD=15.6;SC=ATCAAGGCTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=103717501;WS=103717483;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,5:0.33:15
chr10	103825747	rs3737243	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=938;ReadPosRankSum=-2.265;SC=AGCCCAGCGGGGAAGCTAGCA;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=56;WE=103825755;WS=103825737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr10	103904763	rs11357964	TC	T	2533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.12;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	103908080	rs3740405	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GATAAGCAGAGTATACCTGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=103908088;WS=103908070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	103919197	rs377650259	C	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=674;ReadPosRankSum=1.123;SC=CAGACTGTACCTAAAAAGCAA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=50;WE=103919205;WS=103919187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr10	103920995	.	C	CT	48	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=48;QD=13.25;SC=AACTGGTTACCTTTTTTTTTT;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=4;WE=103921003;WS=103920985;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,4:0.24:17
chr10	103991381	rs2281983	G	A	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=28;PP=1712;SC=TCCACACGGCGATCTCCTCGC;SOR=1.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=103991389;WS=103991371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	104122106	rs142823189	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=1.356;SC=AGCCACCACGCCCGGCCAGAA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=104122114;WS=104122103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	104127171	rs2273555	G	A	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=48;PP=2965;SC=TGAAAACCCAGGAGTTCCTTA;SOR=1.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=94;TCR=48;TR=142;WE=104127179;WS=104127161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	104128954	rs7902882	T	A	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=25;PP=1389;SC=GTCTGTTCTCTTCCTCTTTTC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=75;WE=104128962;WS=104128944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	104136469	rs2180707	T	C	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=89;PP=2965;SC=TGTCCTTCATTGTGCGTGATG;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=75;TCR=89;TR=164;WE=104136477;WS=104136459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr10	104156911	rs12772374	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=-0.400;SC=AAGGGGAAAGATGTAGGTTGG;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=104156919;WS=104156909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	104157711	rs7897947	T	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=263;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TTGCATCATCTCAACTAATCC;SOR=1.313;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=20;WE=104157719;WS=104157701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr10	104157727	rs4919632	C	T	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=17;PP=795;SC=AATCCATATCCCACTCCATAG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=104157735;WS=104157717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	104159196	rs4919633	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=26;PP=1315;SC=CCGCGGAGCCAAGCGCCCCCT;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=66;WE=104159204;WS=104159186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	104160434	rs4919634	A	G	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=35;PP=1131;SC=TACACCTGGCAGTCCGAGCCC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=104160442;WS=104160424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	104161221	rs11191279	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=803;ReadPosRankSum=0.735;SC=GACCTTGCTGCTAAATGCTGC;SOR=0.508;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=53;WE=104161229;WS=104161211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr10	104161967	rs7077329	T	C	7558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=123;PP=2965;SC=GCCGGAGGCCTGAGGCTTTGA;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=126;TCR=123;TR=249;WE=104161975;WS=104161957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr10	104163489	rs7068416	G	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=12;PP=1248;SC=TGAGGCTTAGGTTAAGCAACC;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=104163497;WS=104163479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	104174895	rs2282295	G	A	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1280;ReadPosRankSum=0.434;SC=CTGTCTCGGAGTACTTGGCTG;SOR=0.643;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=87;TCR=74;TR=77;WE=104174903;WS=104174885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,90:0.51:176
chr10	104184189	rs12778231	T	C	2992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=2016;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TTGCCAAGGCTCTGGGGAGCA;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=115;WE=104184197;WS=104184179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,130:0.54:242
chr10	104196465	rs2224374	T	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=53;SC=TAACTTTGACTCGGGCTACTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=104196473;WS=104196455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	104210735	rs2281878	C	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=481;ReadPosRankSum=0.102;SC=GCTGCGGAAGCTGTGGGCCTG;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=37;WE=104210743;WS=104210725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr10	104214080	rs148334455	CT	C	1163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=3.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr10	104229057	rs35597970	C	CA	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=193;ReadPosRankSum=-1.184;SC=CCCACCCAGTCAGAGGCCTGG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=104229065;WS=104229047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	104229785	rs41306870	C	T	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TCAATGACCCCCTCTTCGGTT;SOR=0.689;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=87;WE=104229793;WS=104229775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,100:0.46:218
chr10	104230930	rs68007409	TTCGGTGCTGGG	T	830.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=2935;ReadPosRankSum=1.097;SC=TAAGTCTGATTTCGGTGCTGG;SOR=0.725;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=15;WE=104230948;WS=104230920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr10	104231054	rs11191295	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=537;ReadPosRankSum=1.406;SC=AGCTGCTTGTAGGCAGTGAGG;SOR=0.880;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=29;WE=104231062;WS=104231044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr10	104231234	rs913028	T	C	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=137;SC=GCTGGGAACTTGGCCACGCAT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=104231242;WS=104231224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	104231651	rs7081110	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.180;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	104231662	rs7081467	G	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	104232716	rs3740415	G	A	3334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=83;PP=2202;ReadPosRankSum=0.602;SC=GGGTGAGTGTGGACCTTGGGT;SOR=0.812;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=237;TCF=89;TCR=148;TR=130;WE=104232724;WS=104232706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,152:0.53:289
chr10	104232809	rs3740414	T	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.455;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=579;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GGTCTCCATTTCCCGACCCAG;SOR=1.916;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=27;WE=104232817;WS=104232799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr10	104240974	rs2296578	C	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCAGCCCTCCCGCTCCCTTTC;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=12;WE=104240982;WS=104240964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr10	104241983	rs12763720	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=486;ReadPosRankSum=0.525;SC=CCAAGGTCCCTTTGGGAGTGG;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=30;WE=104241991;WS=104241973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr10	104242886	rs2296581	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=861;ReadPosRankSum=1.398;SC=AGACAGTCAGGCTGGCAGGAA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=54;WE=104242894;WS=104242876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,61:0.45:136
chr10	104243883	rs7079810	C	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=523;ReadPosRankSum=-1.006;SC=TCCCAACCCCCACTCCATCCC;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=34;WE=104243891;WS=104243873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr10	104244139	rs2296582	G	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=893;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CGTAACTGAAGCAAAGGGGCA;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=58;WE=104244147;WS=104244129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
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chr10	104245575	rs2296586	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=364;ReadPosRankSum=1.708;SC=CTGCCTTGCTGGTTTGAGAGC;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=10;WE=104245596;WS=104245565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr10	104248087	rs2296588	T	C	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=640;ReadPosRankSum=2.196;SC=CAGGACCCTGTTCTCCCAAGA;SOR=0.638;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=39;WE=104248095;WS=104248077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr10	104248106	rs2296589	T	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=547;ReadPosRankSum=0.597;SC=GACTAAGCAGTGCAAGCTGAA;SOR=0.621;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=37;WE=104248114;WS=104248096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr10	104250209	rs111446950	CT	C	751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=549;ReadPosRankSum=0.383;SC=AACTGTTTTCCTTTGTTGACT;SOR=0.283;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=18;WE=104250217;WS=104250199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr10	104264107	rs2274351	C	T	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=846;ReadPosRankSum=-1.235;SC=CTCTGGGCCGCGGGGAGACGG;SOR=1.098;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=55;WE=104264115;WS=104264097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr10	104268877	rs2281879	G	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=240;ReadPosRankSum=0.038;SC=GCTTGACATTGTCTGATTTCC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=13;WE=104268885;WS=104268867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	104269217	rs2281880	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=2.198;SC=GGTGGTCCTCGTTAACACCTG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=104269225;WS=104269207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	104356822	rs10786690	A	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=16;PP=1264;SC=CTGTAAGAGCAGTGGCTGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=64;WE=104356830;WS=104356812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	104375258	rs2001389	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CCCAGCAGGCGTCCTCCAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=18;WE=104375266;WS=104375248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr10	104378750	rs10786698	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=346;ReadPosRankSum=0.515;SC=GTTCAAGCACGTTTTCCTGGG;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=22;WE=104378758;WS=104378740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr10	104387019	rs12414407	T	C	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1632;ReadPosRankSum=-2.378;SC=GTTTGACTTTTCCTGACAACA;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=79;TCR=132;TR=102;WE=104387027;WS=104387009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,124:0.51:243
chr10	104389932	rs4917980	T	G	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=63;PP=1887;SC=GGCCCTGCAGTGGCCAGCAGG;SOR=1.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=104389940;WS=104389922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	104414221	rs3850699	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	104415093	rs34032774	CT	C	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.340;NF=1;NR=12;PP=393;ReadPosRankSum=-1.473;SC=CAGGACCAGGCTGGTGGCACC;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=13;WE=104415101;WS=104415083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr10	104415720	rs4274160	T	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=0;PP=873;SC=TGGCCACCCCTACCCCTGCCA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=104415728;WS=104415719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	104415810	rs3217079	GCTCTCCCTGGA	G	4269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.455;NF=38;NR=39;PP=2974;ReadPosRankSum=2.120;SC=CTCTCCCCGGGCTCTCCCTGG;SOR=0.608;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=77;WE=104415828;WS=104415800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,114:0.48:238
chr10	104445545	rs3832710	AG	A	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TCATGTTGCCAGGTGGCCAAG;SOR=0.582;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=104445553;WS=104445535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr10	104449836	rs61869211	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGTGAGTCTCATCTCATTTAT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=104449844;WS=104449826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	104459079	rs59504153	TAA	T	2406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=16;PP=1630;SC=TCCATGTTTCTAACACATGGC;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=104459088;WS=104459069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	104465374	rs12761195	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.258;SC=TTTTTCATTCTAATGCCACTT;SOR=1.538;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=12;WE=104465382;WS=104465364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr10	104473813	rs2248684	C	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=406;SC=GCCTCGGACCCGCTGCAAGCC;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=104473821;WS=104473803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	104474046	rs71019606	CCCT	C	944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.357;NF=4;NR=16;PP=778;ReadPosRankSum=1.013;SC=CCCGCCGAGTCCCTCCTCCTC;SOR=1.071;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=20;WE=104474056;WS=104474036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr10	104474107	rs2248679	G	A	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=725;SC=CTGCGGCGCCGCCCCCGACGT;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=104474115;WS=104474097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	104486304	rs2244647	G	C	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=14;PP=1094;SC=ACAGTGGGACGTGCTCAGGTC;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=104486312;WS=104486294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	104486974	rs2244524	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GGTCAGGGAGCCATACTATGA;SOR=0.442;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=23;WE=104486982;WS=104486964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr10	104487072	rs2244518	G	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=82;SC=TTTAACCCTCGCAACAACCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=104487080;WS=104487062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	104489011	rs2244254	G	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=13;PP=731;SC=CTTTCTCCCTGAAGCCCGTGG;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=38;WE=104489019;WS=104489001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr10	104536365	rs2254563	C	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=385;SC=CCACCGTGTTCTTAACCCTCT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=104536373;WS=104536355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	104572276	rs284861	A	G	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=20;PP=1109;SC=CAATGCAAATATTCAGTGGGA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=104572284;WS=104572266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	104572963	rs284860	T	C	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=762;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CCTCTGTCAGTCCTCTGAGGA;SOR=0.860;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=42;WE=104572971;WS=104572953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr10	104573017	rs284859	G	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=1.357;SC=ACGGCCGCCCGCATGCCTGCT;SOR=0.814;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=31;WE=104573025;WS=104573007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr10	104591152	rs10883783	T	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TCCGTATAGTTGGAGCCAAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=104591160;WS=104591148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	104591182	rs284849	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=260;ReadPosRankSum=1.772;SC=CAGCAAGCTTGGCAGAGGTGA;SOR=0.416;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=15;WE=104591190;WS=104591172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr10	104592249	rs4919686	A	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=-1.148;SC=GCTAGATGTCACTGGGAGGGC;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=14;WE=104592257;WS=104592239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	104595248	rs4919687	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=725;ReadPosRankSum=2.200;SC=GGAGAAGGCAGGTACCTGGCA;SOR=0.512;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=38;WE=104595256;WS=104595238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr10	104596924	rs6163	C	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=282;ReadPosRankSum=0.086;SC=CCATACGAACCGAATAGATGG;SOR=0.826;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=24;WE=104596932;WS=104596914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr10	104596981	rs6162	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=479;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GCATATGGCCGTGTCTGGGGA;SOR=0.812;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=33;WE=104596989;WS=104596971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr10	104597152	rs743572	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=592;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GATAGACAGCAGTGGAGTAGA;SOR=0.595;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=36;WE=104597160;WS=104597142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr10	104629465	rs3740400	T	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=461;ReadPosRankSum=0.240;SC=TGTCCTCCCCTCACCCCTCGG;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=34;WE=104629473;WS=104629455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr10	104629793	rs3832685	G	GCTC	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=562;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TGCAGTCACAGCTCTTCTCCC;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=12;WE=104629801;WS=104629783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr10	104636855	rs3740392	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=409;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AACTCCTTTCTGCTAATAGCC;SOR=0.689;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=35;WE=104636863;WS=104636845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr10	104637992	rs10786719	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.723;SC=TAGACCTTGGAGGGATGCTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=104638000;WS=104637985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	104650251	rs7085854	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=449;ReadPosRankSum=-1.460;SC=TTTTCTTCTATTGAGACTAAA;SOR=0.156;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=25;WE=104650259;WS=104650241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr10	104660256	rs10748835	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	104814162	rs2275271	T	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=954;ReadPosRankSum=-0.378;SC=AGACAGACAGTGAGATGAAGG;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=77;WE=104814170;WS=104814152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,94:0.54:173
chr10	104836047	rs943036	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=68;ReadPosRankSum=1.271;SC=GTGAGTGCAGTGTGGCTGGAC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=104836055;WS=104836037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr10	104836940	rs2296568	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CCATCTAGGCCGCGCTGGCTG;SOR=1.426;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=9;WE=104836948;WS=104836930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr10	104849468	rs3740387	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=0.313;SC=CATCATCTTCGTCATGGCAGT;SOR=1.700;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=10;WE=104849476;WS=104849458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr10	104850632	rs3736922	G	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=881;ReadPosRankSum=-2.071;SC=AATAAATCAGGAATGTGAAAA;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=51;WE=104850640;WS=104850622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,55:0.43:128
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chr10	104851396	rs11191553	G	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=252;ReadPosRankSum=0.661;SC=GGAAGGAAAAGGAAGACATTT;SOR=0.458;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=20;WE=104851404;WS=104851386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
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chr10	104857205	rs34202831	GA	G	535.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.964;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.549;NF=0;NR=13;PP=883;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TCAAATACTGGATTTCTGTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=13;WE=104857226;WS=104857195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr10	104857218	rs10786737	A	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.991;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=897;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TTCTGTCCACAACAGGAATGG;SOR=2.960;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=15;WE=104857226;WS=104857195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr10	104857234	rs10883831	C	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=-0.215;SC=AATGGGGGAACCTTTTAAGGG;SOR=2.147;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=11;WE=104857242;WS=104857224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr10	104860395	rs2863727	T	G	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=14;PP=802;SC=AAATCTTGCCTGGCCTGGGAA;SOR=1.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=104860403;WS=104860385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	104934709	rs10883841	T	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=59;PP=1419;ReadPosRankSum=1.180;SC=CTCCAGGAGGTTGACATTTTA;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=74;TCR=126;TR=94;WE=104934728;WS=104934699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,110:0.46:238
chr10	105039579	rs1163086	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=241;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TATCATTCAAATAAGTACTTC;SOR=0.084;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=19;WE=105039587;WS=105039569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr10	105046689	rs3740381	G	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.751;SC=AAGTTCATTAGATGATTTTAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=105046697;WS=105046679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	105108455	rs4917387	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ACAATTGTAATTTATATATTC;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=105108463;WS=105108445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	105110740	rs113359610	A	AGGAGGC	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=5.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.000;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.458;SOR=1.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chr10	105127708	rs10883858	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=1.745;SC=TGGCGAAAATGCAATCACGCT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=105127716;WS=105127698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	105128134	rs10883859	T	G	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.085;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.425;SC=AGTGGCGGGCTCCGGAGCCCC;SOR=1.134;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=71;WE=105128142;WS=105128124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,80:0.55:146
chr10	105144986	rs7069667	A	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=791;SC=ATAGTCAAATATATATAAAAT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=105144994;WS=105144976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	105154089	rs7911488	A	G	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=1.101;NF=28;NR=44;PP=1252;ReadPosRankSum=0.908;SC=TCGATTGGCAACACAGACGAG;SOR=0.803;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=72;WE=105154097;WS=105154079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,90:0.46:197
chr10	105165615	rs7919031	G	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=921;SC=TGTGGCTTAAGGTTTAATGTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=105165623;WS=105165605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	105176179	rs7894407	T	C	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=806;ReadPosRankSum=1.249;SC=GTTTAAGAGGTTGCAGAGACC;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=43;WE=105176187;WS=105176169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr10	105214932	rs729211	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=306;ReadPosRankSum=0.134;SC=TGCCCAGCACTGAAACCCTTC;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=22;WE=105214940;WS=105214922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr10	105215016	rs2986016	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=482;ReadPosRankSum=0.555;SC=AGCTGGCCACACCTCACACTT;SOR=0.395;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=31;WE=105215024;WS=105215006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr10	105218252	rs2986017	A	G	7410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,195:0.46:422
chr10	105218252	.	AGC	GGT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=73;NR=80;PP=2944;QD=20;SC=CCGGCGGCCCAGCGGCCGCTT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=355;TCF=162;TCR=193;TR=153;WE=105218262;WS=105218242;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:202,153:0.43:355
chr10	105218254	rs4918016	C	T	7410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,193:0.46:421
chr10	105218359	rs2986018	T	C	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1401;ReadPosRankSum=-1.014;SC=CGCTGTAGGCTGCATTGTAGC;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=97;WE=105218367;WS=105218349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,114:0.47:240
chr10	105233110	rs2986035	C	T	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.597;SC=AGGAGGCGGTCCACCTGCTCC;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=158;TCF=93;TCR=65;TR=83;WE=105233118;WS=105233100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr10	105254090	rs2986041	G	T	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=13;PP=1190;SC=GCACCTCAGCGCCTGCCCGGC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=105254098;WS=105254080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	105344756	rs2236209	T	C	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=858;ReadPosRankSum=-0.604;SC=CCGACCTGCCTTTCAGCCCTG;SOR=0.782;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=82;TCR=64;TR=59;WE=105344764;WS=105344746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,71:0.39:180
chr10	105361816	rs4918031	T	G	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=87;PP=2965;SC=GGGACACGGGTATGCTGTTGC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=180;WE=105361824;WS=105361806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
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chr10	105363289	rs3740471	T	C	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CAAAGCCGAATGCAGGGATGT;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=123;TCR=126;TR=93;WE=105363297;WS=105363279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,110:0.38:291
chr10	105365386	rs7088714	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=1;PP=417;SC=AGTTTAGGCCATGGCACTGGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=105365394;WS=105365376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	105428453	rs10533306	CAG	C	5928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.220;NF=18;NR=114;PP=2982;ReadPosRankSum=-1.782;SC=AGAGGAGAACCAGAGAGAGAG;SOR=1.100;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=19;TCR=124;TR=132;WE=105428462;WS=105428443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,213:0.99:215
chr10	105483964	rs12220667	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=343;ReadPosRankSum=0.299;SC=CAGCCTCCCCAGGCTGGCCAT;SOR=0.393;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=22;WE=105483972;WS=105483954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr10	105495612	rs6584568	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=467;ReadPosRankSum=0.462;SC=CTAAAACTGCTACAGAGACCT;SOR=0.936;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=31;WE=105495620;WS=105495602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr10	105614884	rs4918064	A	G	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=3;PP=1330;SC=TGGGAGGGGCAAGGGGCCATC;SOR=5.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=61;WE=105614892;WS=105614874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	105615074	rs10883928	C	T	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.988;NF=45;NR=74;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CTTCTCATCCCGGCCGGGCTC;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=90;TCR=145;TR=119;WE=105615082;WS=105615064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,143:0.51:283
chr10	105615105	rs10883929	G	C	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=123;PP=2965;SC=TCCAGCTGCCGGGGTCCCGGG;SOR=1.621;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=53;TCR=123;TR=176;WE=105615113;WS=105615095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr10	105657316	rs10786775	G	C	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=12;PP=894;SC=TTGGTCGGAGGAGGCACTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=105657324;WS=105657306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	105658588	rs2902639	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.796;SC=AGCTGCTTCAGTTTTCTGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=16;WE=105658596;WS=105658578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr10	105659826	rs2487999	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=28;PP=1254;SC=TTACAGTAAGTGGTGGCATGA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=68;WE=105659834;WS=105659816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	105670134	rs200538919	TG	T	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=1.601;SC=AGCCCGTGTCTGGGGCTATAA;SOR=0.512;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=105670142;WS=105670124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	105727656	rs67597452	AAG	A	1286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.971;NF=3;NR=22;PP=987;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGTACAAGGTAAGAGGGGGAA;SOR=0.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=25;WE=105727665;WS=105727646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr10	105758670	rs10883960	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=822;ReadPosRankSum=0.321;SC=ATTTTGGAGTATCAGCTAAAA;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=50;WE=105758678;WS=105758660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr10	105763026	rs3740469	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=988;ReadPosRankSum=0.536;SC=CCTGAAGTTACTGTAGTTTCA;SOR=0.888;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=63;WE=105763034;WS=105763016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr10	105768158	rs805664	A	T	1055.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.351;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=700;ReadPosRankSum=1.069;SC=CTTTTTTTTTAAAAAAATTGT;SOR=1.949;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=49;WE=105768166;WS=105768147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,45:0.90:50
chr10	105781532	rs10883961	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=545;ReadPosRankSum=1.651;SC=TGTGTGTACTCGTCCGTCTAC;SOR=0.909;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=41;WE=105781540;WS=105781522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr10	105781596	rs68117222	CAT	C	1205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.856;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=755;ReadPosRankSum=1.649;SC=GGGCAGGAAACATAGAGATGA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=18;WE=105781605;WS=105781586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr10	105792205	rs813943	A	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=499;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCCCCATTTCAACACCAGCTT;SOR=0.646;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=27;WE=105792213;WS=105792195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr10	105793173	rs1747675	T	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=377;SC=AGCAGGGATCTCCCAGTACCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=105793181;WS=105793163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	105793587	rs11596192	C	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CCCCTCCAGCCCCTGCCTGCT;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=16;WE=105793595;WS=105793578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr10	105793750	rs17116350	T	C	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1173;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTAATCCAGATCTCCAGCAAA;SOR=0.769;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=75;WE=105793758;WS=105793740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,96:0.51:187
chr10	105796399	rs2274098	G	C	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=31;PP=981;SC=CCCTGGAGAGGAGAGGATGCA;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=105796407;WS=105796389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	105796449	rs2476957	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=357;SC=CGCAGCCATGATCCAGCCACA;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=105796457;WS=105796439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	105796738	rs805714	A	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=23;SC=CAAGGTTTGCATGACGAGTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=105796746;WS=105796728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	105796819	rs2476958	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=499;SC=GCACAGCCAGAATGTCTTCAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=105796827;WS=105796809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	105797378	rs2282437	G	A	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=783;SC=GGTGCAGGGCGTGGGGAAGGG;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=105797386;WS=105797368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	105797693	rs61382109	TA	T	588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=566;SC=GTCCTTCCCCTAAATTACAGA;SOR=2.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=105797701;WS=105797683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	105797989	rs200030951	TACACACACACACACACACAC	T	769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.67;QD=42.76;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	105798872	rs2274100	T	C	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=59;PP=1504;SC=CTGGAACACCTGGATCACCTG;SOR=1.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=86;WE=105798880;WS=105798862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	105799216	rs2296219	G	T	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=707;SC=TGTCACCTTTGGGTCCCTGGG;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=105799224;WS=105799206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	105799552	rs67083195	ACG	A	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.655;NF=19;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=2.938;SC=ACACACACACACGCACACGCA;SOR=0.859;Source=Platypus;TR=30;WE=105799561;WS=105799540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr10	105799599	rs11191905	C	A	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=19;PP=1386;SC=TCAACCATTCCTAGAGAAACA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=105799607;WS=105799589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	105800321	rs12763538	C	T	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=58;PP=1491;SC=GATGAATGGGCGGGTGGGTGG;SOR=3.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=67;WE=105800329;WS=105800311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	105800344	.	ATGGATGGATGGATAGG	A	169.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.533;NF=1;NR=25;PP=342;ReadPosRankSum=-1.551;SC=GGATGGATGGATGGATGGATG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=26;WE=105800367;WS=105800334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr10	105800348	rs139480552	ATGGATGGATAGG	A	381.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.181;NF=1;NR=25;PP=626;ReadPosRankSum=3.619;SC=GGATGGATGGATGGATGGATA;SOR=0.144;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=26;WE=105800367;WS=105800334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	105801253	rs4918079	G	A	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=72;PP=2126;SC=CTGGTGGCCCGCGTGGGCCGG;SOR=1.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=97;WE=105801261;WS=105801243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	105803080	rs2147269	A	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=318;SC=GTGAAGTAGGATAACTGATCT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=105803088;WS=105803070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	105805310	rs805719	G	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.85;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	105805436	rs805720	G	A	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=24;PP=1147;SC=TGGCCAGAGAGAGGCCTCCTC;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=105805444;WS=105805426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	105805497	rs813944	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=0.888;SC=AAAGAAATCTCATTTGGAAAT;SOR=0.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=39;WE=105805505;WS=105805487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr10	105806310	rs805721	C	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=308;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CATTTCTACTCGAATGGTGTT;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=21;WE=105806318;WS=105806300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr10	105809727	rs34422866	A	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=470;ReadPosRankSum=-0.091;SC=CTAGATCACAAGTTCCCTGAA;SOR=0.254;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=29;WE=105809735;WS=105809717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr10	105810400	rs805722	T	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=24;NR=13;PP=702;SC=GGTGGTCCCATTGGTCCTTTG;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=105810408;WS=105810390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	105810879	rs805723	C	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=706;SC=AACACATTGTCGAGTCTTGGC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=105810887;WS=105810869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	105814826	rs805691	C	A	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=82;PP=2782;SC=CCATACTCTGCCTTGTATTTT;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=69;TCR=82;TR=151;WE=105814834;WS=105814816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	105814937	rs805692	C	T	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=34;SC=CATTGCTGGGCTTCTCTTAGA;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=61;WE=105814945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	105815116	rs17821926	A	G	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.23;MQRankSum=-1.865;NF=37;NR=62;PP=1524;ReadPosRankSum=-0.271;SC=ACAAGGTTCAATCCATGGCAA;SOR=1.069;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=208;TCF=89;TCR=119;TR=99;WE=105815124;WS=105815106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,130:0.47:278
chr10	105815202	.	T	TCTCACACA	1816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.66;QD=37.85;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	105815241	rs1747677	A	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=595;SC=CACACACACAATAAGGGGATC;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=105815249;WS=105815231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	105816685	rs805696	T	C	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=91;SC=GCAGTGGGGCTGGCCTGCCTC;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=105816693;WS=105816675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	105816916	rs805698	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=27;PP=1017;SC=CCACTGCTGCCGTAGCTGTGG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=105816924;WS=105816906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	105817043	rs805699	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=316;SC=TGGGGGCTTTCAAGTTCCTGT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=105817051;WS=105817033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	105819956	rs805701	G	A	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=40;PP=1981;SC=TCTCCTTCTTGGCAGGTGTGT;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=96;WE=105819964;WS=105819946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	105821136	rs805704	A	T	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=30;PP=1308;SC=ACCAGCCTGAACCCTGGCAGC;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=105821144;WS=105821126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	105821294	rs805705	A	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=33;PP=913;SC=GAGAAGCCTGATCAGCCCTGG;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=105821302;WS=105821284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	105821836	rs805706	C	T	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=795;SC=ACAGCCTTCCCTGTGTGCTTG;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=105821844;WS=105821826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	105824333	rs805708	G	A	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=54;PP=2095;SC=ATCCAGGATCGTTGCATCGTA;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=105;WE=105824341;WS=105824323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	105837000	rs2274106	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=320;SC=GCTGCCCAATAGCTGTGTGTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=105837008;WS=105836990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	105905161	rs2289964	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=0.180;SC=GAGAAAAAAGCTGAAATCTAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=105905169;WS=105905151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	105963501	rs148523587	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=2.040;SC=CTTTCAATCTCAAGAAAATCC;SOR=1.232;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=15;WE=105963509;WS=105963491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr10	105991884	rs789577	T	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=52;NR=40;PP=1662;SC=AGGAGGGGACTTGGGGCAGGA;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=105991892;WS=105991874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	106075081	rs34043167	G	A	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GGACCACCTTGATCTGGCCGT;SOR=0.368;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=72;WE=106075089;WS=106075071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,82:0.57:145
chr10	106152111	rs11192036	T	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AGCTGTGAGATCAGACAGAAA;SOR=0.732;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=22;WE=106152119;WS=106152101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr10	106159305	rs10509772	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=450;ReadPosRankSum=-0.170;SC=AACAGACACGGGTATTTAATT;SOR=1.347;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=25;WE=106159313;WS=106159295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr10	106163753	rs7087640	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.516;SC=AAATTGAGTTTTCTCAGAACC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=6;WE=106163761;WS=106163743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	106166368	.	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=386;ReadPosRankSum=-1.454;SC=TTTAATAAGACAATGTGCATT;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=27;WE=106166376;WS=106166358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr10	106166570	rs10786792	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=703;ReadPosRankSum=0.795;SC=TTTGTTTTCTGTACTCATTGT;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=45;WE=106166578;WS=106166560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr10	106207269	rs1411711	G	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	106207451	rs12766595	A	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=887;ReadPosRankSum=1.062;SC=TCTGCTCTCCACTAGGAAAAG;SOR=0.421;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=55;WE=106207459;WS=106207441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,72:0.56:129
chr10	106401773	.	T	G	410	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=59.44;NF=1;NR=13;PP=410;QD=31.7693723248;SC=AATGGGGGGGTGGGTGGGAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=14;WE=106401785;WS=106401763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,14:0.61:23
chr10	106401777	.	T	G	394	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=59.33;NF=0;NR=13;PP=394;QD=32.9824009652;SC=GGGGGGTGGGTGGGAGCGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=13;WE=106401785;WS=106401763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,13:0.62:21
chr10	106582029	rs1490182	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-1.451;SC=GAAGGACTGCCGTGTCCCTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=106582037;WS=106582019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	106602496	rs5787553	C	CT	1711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.448;NF=13;NR=26;PP=1102;ReadPosRankSum=0.627;SC=AGTAAGCTTCCTTTTTTCCCT;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=39;WE=106602504;WS=106602486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,68:0.60:114
chr10	106675585	rs6584635	C	T	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1062;ReadPosRankSum=1.851;SC=TCTCTTTTACCTGCAGGTCGA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=155;TCF=87;TCR=68;TR=71;WE=106675593;WS=106675575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,79:0.43:184
chr10	106907440	rs791125	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=652;ReadPosRankSum=0.091;SC=GGAACCAGAACGACACGTACA;SOR=0.535;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=47;WE=106907448;WS=106907430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr10	106907586	rs791126	C	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=1.222;SC=TCCCTTGGGTCTGTCTCTCTT;SOR=0.307;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=25;WE=106907594;WS=106907576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr10	106916805	.	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=880;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CCAACATGCCGTGGGAAATTC;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=18;WE=106916827;WS=106916795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr10	106916819	rs2297500	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=880;ReadPosRankSum=0.970;SC=GAAATTCTGCGGCTTCTCTAA;SOR=0.569;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=23;WE=106916827;WS=106916795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr10	106961109	rs2306652	G	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=1.029;SC=GAAGCATGACGCAGAGATAGG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=106961117;WS=106961099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr10	106974123	rs113804925	A	AACACAC	1692.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.438;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.788;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,47:0.33:142
chr10	106983028	rs191572726	T	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1192;ReadPosRankSum=1.788;SC=TTCTGATTGATGTCAAATTAG;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=81;WE=106983036;WS=106983018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,101:0.62:162
chr10	108337276	.	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=889;ReadPosRankSum=0.546;SC=TCACCAGGTTGAGTAGAAGGG;SOR=1.571;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=52;WE=108337284;WS=108337266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr10	108367020	rs7082289	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=682;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CAGGGAGCACCGCCACCAGGA;SOR=0.874;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=47;WE=108367028;WS=108367010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr10	108371571	rs137930414	A	AGTTT	3142.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=16;PP=1882;SC=CTGCTGGGTTAGTTTGTTTGT;SOR=2.015;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=37;WE=108371579;WS=108371561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	108380006	.	CAG	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.30;ReadPosRankSum=-2.132;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr10	108389249	rs1322004	T	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=203;SC=TCAGGCATGATGGCAGCCCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=108389257;WS=108389239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	108427682	rs66783381	CA	C	219.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	108439103	rs821929	A	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=59;PP=1579;SC=AGAAAGAGAAAGGTGCCATTA;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=93;WE=108439111;WS=108439093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	108447836	rs821935	C	T	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=919;SC=CCCTTCCCCACTCCCTTTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=44;WE=108447844;WS=108447826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	108466412	rs2756231	C	T	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=66;PP=2152;SC=AAAAACAAGACTGTAAGAAGC;SOR=1.449;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=108466420;WS=108466402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	108469161	rs2756232	C	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=50;PP=1519;SC=CAGAGATTTACAGTCAGGGTG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=108469169;WS=108469151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	111440605	rs7898586	A	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.989;NF=27;NR=13;PP=694;ReadPosRankSum=0.699;SC=TTCATTACAGAAAGAGATTAG;SOR=1.059;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=40;WE=111440613;WS=111440595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr10	111440719	rs7915504	T	A	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.316;NF=25;NR=37;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TCTAGTCACTTGTAAACAATG;SOR=0.853;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=145;TCF=63;TCR=82;TR=62;WE=111440727;WS=111440709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,72:0.42:171
chr10	111625108	rs483072	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=614;SC=TATTCACCACTACATCTTTAA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=111625116;WS=111625098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	111630731	rs612155	G	C	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=794;ReadPosRankSum=-0.025;SC=ATTATGTGTGGCTCCAGAACG;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=42;WE=111630739;WS=111630721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr10	111633025	rs642938	A	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.471;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TTACTACCCCACATGTAATTT;SOR=2.494;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=10;WE=111633033;WS=111633015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr10	111635212	rs3818285	T	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=-1.629;SC=TGCTCTCAGCTGGAGCTCAGC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=17;WE=111635220;WS=111635202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr10	111646147	rs623980	A	G	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=830;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CCCAGAAAGCAGTAGGAACCC;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=52;WE=111646155;WS=111646137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
chr10	111647738	rs472049	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=1.134;SC=GAGGACGAGGCTGGAGACAAT;SOR=0.821;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=9;WE=111647746;WS=111647728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr10	111667702	rs686155	T	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=289;SC=TTCAAATTGATCACTCCACCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=111667710;WS=111667692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	111683280	rs145751207	CGGCG	C	808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=665;SC=GCGCGAGAGCCGGCGGGCGGG;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=111683291;WS=111683270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	111886089	rs3731566	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GAAATGTCAAGTAGTAAGCTT;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=15;WE=111886097;WS=111886079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr10	112038848	rs41291902	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=394;ReadPosRankSum=1.152;SC=GGCTGAATAAATGCAAATTAT;SOR=1.214;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=21;WE=112038856;WS=112038838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr10	112044553	rs5787843	G	GTTC	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.607;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr10	112044842	rs16448	TAAAAC	T	469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=288;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GTCTCCTCTTTAAAACAAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=7;WE=112044854;WS=112044832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr10	112054908	rs7074311	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CAAAAAATCTCCATCTCTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=112054916;WS=112054898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	112266822	rs1889566	GC	AT	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=41;PP=2799;SC=CGAGGCCTGCGCGACCCACCT;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=112266831;WS=112266812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	112327678	rs55750861	C	CA	2428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=43;PP=1860;SC=CGCAGCCTCTCCCCTGTCTCC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=46;WE=112327686;WS=112327668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	112328838	rs4917577	C	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=13;PP=328;SC=CTGTCCATTTCTATATTGGCT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=112328846;WS=112328828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	112349204	rs2419572	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=548;SC=TTAAGACAATAAACACGTTTA;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=112349212;WS=112349194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	112356331	rs7075340	G	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=45;PP=1260;SC=TTTGTGCATAGTGATAGATAT;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=112356339;WS=112356321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	112360315	rs35608195	GT	G	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr10	112361870	rs2419565	A	G	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=39;PP=1611;SC=GTTACAAATCAATCATGGAAC;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=112361878;WS=112361860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	112362019	rs2039874	G	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=309;SC=TTTTAAAGCTGTTTTCCTCAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=112362027;WS=112362009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	112543217	rs6585012	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=0.959;SC=AGGCTCATGCGTAGGCTCAAC;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=15;WE=112543225;WS=112543207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr10	112544063	rs7898438	A	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=269;ReadPosRankSum=0.919;SC=TGTTTAACTTATTAAGGAGCC;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=12;WE=112544071;WS=112544053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr10	112557514	rs6585014	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=0.943;SC=AGAGGCGATGCCGTAGCTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=112557522;WS=112557504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	112570243	rs11195338	T	C	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=46;PP=1378;SC=GCCCCAAGTCTCCAGGCAGGT;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=112570251;WS=112570233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	112572458	rs1417635	G	C	6007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=102;PP=2965;SC=AAAGCCAAGTGGGACAAGTAT;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=83;TCR=102;TR=185;WE=112572466;WS=112572448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr10	112579663	rs11195343	C	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=214;SC=ATCTATAAAACGAAGATGCTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=112579671;WS=112579657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	112583189	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	1222	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5001;HP=23;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=57.86;NF=5;NR=1;PP=1222;QD=204.166666667;SC=TGTTGTATTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=6;WE=112583209;WS=112583179;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,6:0.29:21
chr10	112590810	rs7070640	G	C	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=67;PP=2965;SC=ATCCCCCATCGTTTCCCAGGG;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=112590818;WS=112590800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	112595719	rs942077	G	C	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=43;PP=1371;SC=GCCACGCTTCGAAAGGAAAAA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=112595727;WS=112595709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	112641053	rs7081726	A	G	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=32;PP=2059;SC=GACTGAGGAAATAAAGAATGA;SOR=1.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=112641061;WS=112641043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	112642952	rs11195364	A	G	59.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AATCATATGTATAAATGTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=112642960;WS=112642942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	112654034	.	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=440;ReadPosRankSum=0.844;SC=TTTTTAAATAATGTACATCCT;SOR=0.862;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=27;WE=112654042;WS=112654024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr10	112667324	rs35793075	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=445;ReadPosRankSum=-1.629;SC=AAAGAGGAGACAGGAAATGAG;SOR=1.455;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=27;WE=112667332;WS=112667314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr10	112764594	rs1980869	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.917;SC=ATTGCTTTAATTGGTACTTCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=112764602;WS=112764584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr10	112771579	rs143187497	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=328;ReadPosRankSum=-1.798;SC=TGGTCTGATATAAATCTGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=20;WE=112771587;WS=112771569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr10	113913193	rs17129557	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=282;ReadPosRankSum=0.532;SC=AGGAGATCACTTCGGGACAGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=16;WE=113913201;WS=113913183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr10	113913222	rs2297991	T	C	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=17;PP=1357;SC=GACCCTGCGATGGCACCTTCA;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=113913230;WS=113913212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	113913469	rs3216019	TA	T	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=14.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.819;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr10	113917085	rs2254537	T	A	6571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=114;PP=2965;SC=ACAAAGGTTCTGGAAGCTTCT;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=86;TCR=114;TR=200;WE=113917093;WS=113917075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr10	113917982	rs6585140	C	G	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=864;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TGCCACCATGCCTGGCCAATT;SOR=1.897;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=39;WE=113917990;WS=113917972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr10	113918232	rs17129561	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=1.507;SC=GTACAAGGTAGCTGCCAAAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=12;WE=113918240;WS=113918222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	113919598	rs3740148	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.619;SC=AACAGAAAAACACGGGGGGTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=113919606;WS=113919588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr10	113920652	rs3824626	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=635;ReadPosRankSum=0.064;SC=AACGGTATCATGATGGTGGAA;SOR=0.847;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=11;TCR=71;TR=41;WE=113920660;WS=113920642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr10	113921354	rs2250802	G	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=807;SC=CTGCCCCTGAGTATGTATCTG;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=113921362;WS=113921344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	113926224	rs35019520	A	G	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1472;ReadPosRankSum=-1.130;SC=TAACATTCTAATAACACCTCT;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=207;TCF=88;TCR=119;TR=91;WE=113926232;WS=113926214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,111:0.43:259
chr10	113928487	rs2251579	A	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.582;SC=TACCAAACTCAAGCAATAATC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=113928495;WS=113928477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr10	113932699	rs2792700	T	C	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=42;PP=2528;SC=GAGGGGAAAATGGGGTAATAG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=92;TCR=42;TR=134;WE=113932707;WS=113932689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	113935379	rs10787428	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=820;ReadPosRankSum=-0.252;SC=CAGCACATTTTCAGTCACATT;SOR=1.006;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=49;WE=113935387;WS=113935369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr10	113937941	rs2487294	G	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=331;SC=AAAATCTTAGGGAAGAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=113937949;WS=113937931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	113940329	rs2792751	T	C	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=117;PP=2965;SC=GATCTGAAGATGGTGGGTCTA;SOR=1.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=66;TCR=119;TR=183;WE=113940337;WS=113940319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr10	114043371	rs41313475	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.319;SC=TGTTCTTCCCTTGATTTTAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=114043379;WS=114043361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	114043596	rs41314509	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=0.536;SC=CCATTTTCCTGGGACGAAAAG;SOR=0.583;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=44;WE=114043604;WS=114043586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
chr10	114053546	rs726009	C	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=351;ReadPosRankSum=1.498;SC=TGGAGGCATCCGAAATCGGTT;SOR=0.551;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=26;WE=114053554;WS=114053536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr10	114059064	rs41306846	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AAGTTGGAGAAGGGATGAACA;SOR=0.340;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=114059072;WS=114059054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr10	114059330	rs11279253	TCTCTGTTTTC	T	2932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=42;PP=2979;ReadPosRankSum=1.485;SC=GGAGTAAGCGTCTCTGTTTTC;SOR=1.214;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=113;TCF=11;TCR=102;TR=45;WE=114059347;WS=114059320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,78:0.43:181
chr10	114061979	rs10749114	G	A	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=67;PP=2288;SC=CTTTGGCCCCGGCAAAACTTT;SOR=1.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=106;WE=114061987;WS=114061969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	114136349	rs2277208	G	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.899;SC=ACATCATGCTGTCTCCCTCCT;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=114136357;WS=114136326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr10	114154815	rs11195943	C	T	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=542;ReadPosRankSum=0.175;SC=GACCTCAACCCGTCTTACCTC;SOR=0.405;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=36;WE=114154823;WS=114154805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr10	114169276	rs3736946	A	G	233.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=-1.184;SC=TGATATCGCCATGGTGATCTG;SOR=1.802;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=114169284;WS=114169266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr10	114171385	rs3831106	T	TAC	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=1.326;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr10	114181683	rs2255740	A	G	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=69;PP=2965;SC=TTTCTCAGCTAATTCAGCACG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=114181691;WS=114181673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	114185856	rs34341101	T	TG	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=494;SC=TACAGTTCCATGGTGTTGAAA;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=114185864;WS=114185846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	114186157	rs11195955	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACCCATGGGCCCATCGTGGA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=114186165;WS=114186147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr10	114186624	rs2256368	G	A	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=77;PP=2467;SC=ACAGGTGTGTGCTACCACTGA;SOR=1.282;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=121;WE=114186632;WS=114186614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	114192285	rs2306158	G	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=666;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CGAACCTGTCGTCAGTGATCA;SOR=0.931;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=39;WE=114192293;WS=114192275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr10	114197982	rs3736059	A	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TTTCACTTTTAGGCACTTTTC;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=114197990;WS=114197972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	114200355	rs2306159	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AGGCAAACAAGGTGGTAGCAA;SOR=0.823;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=76;WE=114200363;WS=114200345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,96:0.48:198
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chr10	114224502	rs3740143	C	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=0.334;SC=AATGCACAGTCTTTTGGGCTC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=21;WE=114224510;WS=114224492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr10	114496687	rs12770115	A	G	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1098;SC=CTTGGCAAGGATGCTATCAAA;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=114496695;WS=114496677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	114575096	rs377156614	T	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,26:0.18:143
chr10	114710869	rs72101402	AC	A	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.972;NF=12;NR=3;PP=244;ReadPosRankSum=0.799;SC=GTTTTTTTCTACCCCCCCCTC;SOR=0.349;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=15;WE=114710877;WS=114710859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr10	114849353	rs10749127	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-1.427;SC=AAAATGAAGCCGCCCACCCAA;SOR=0.960;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=18;WE=114849361;WS=114849343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr10	114901194	rs60649625	TG	T	533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=546;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GGAACGGTGGTGGGGGGGCCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=114901209;WS=114901184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr10	114901201	rs56913138	G	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=532;ReadPosRankSum=-1.052;SC=TGGTGGGGGGGCCCCTGTTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=11;WE=114901209;WS=114901184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr10	114903859	.	CTGTGTGTGTG	C	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=1.352;QD=23.52;ReadPosRankSum=1.531;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	114920534	.	G	A	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=70;PP=1740;ReadPosRankSum=0.888;SC=TTTTGACCTCGTTCCCCATCT;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=241;TCF=99;TCR=142;TR=116;WE=114920542;WS=114920524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,139:0.47:293
chr10	115312811	rs2240879	T	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.228;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=645;ReadPosRankSum=1.001;SC=CTGACATTTTTCCCCCCTAAA;SOR=0.422;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=37;WE=115312819;WS=115312801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr10	115327193	rs2286745	A	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=890;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GCTAAGGAGCACGCCCGGCAG;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=64;WE=115327201;WS=115327183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr10	115334124	rs3740530	C	T	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=74;PP=2363;SC=CACTTACCCACGCTGAGAATC;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=111;WE=115334132;WS=115334114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	115335843	rs911709	A	G	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=40;PP=1227;SC=AGCACTGCGCAATGCCATGGA;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=115335851;WS=115335833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	115338009	rs113801070	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=0.785;SC=TCCCAAACTCGACTATTGCCT;SOR=1.312;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=16;WE=115338017;WS=115337999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr10	115340492	rs2286742	G	A	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.047;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=61;PP=1776;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GGGTGGGGGGGATGGAGATTT;SOR=2.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=75;WE=115340500;WS=115340482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr10	115341545	rs2181082	G	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=0.587;SC=CTGCTCAGCTGTTGGGCTCAG;SOR=0.330;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=10;WE=115341553;WS=115341535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr10	115341753	rs2245056	G	A	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1368;ReadPosRankSum=0.961;SC=GAGGCTTTAAGAGCACGGCGG;SOR=0.868;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=79;WE=115341761;WS=115341743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
chr10	115341846	rs2245058	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GTGGTGGGGCGCTGATCCACC;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=29;WE=115341854;WS=115341836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr10	115343803	rs911703	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=-0.102;SC=ATGGTGGGGGCAGGTGGGGCT;SOR=0.954;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=10;WE=115343811;WS=115343793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr10	115343831	rs911701	A	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=361;ReadPosRankSum=-1.905;SC=GGCCACCTTCATGAGCAAGTT;SOR=0.399;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=25;WE=115343839;WS=115343821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr10	115343852	rs911700	C	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=407;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GGAGCTGGTGCTTCTCTGACA;SOR=0.467;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=31;WE=115343860;WS=115343842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr10	115349397	rs11196388	AG	A	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=1143;SC=CTTGCAAGCCAGGGGTGGCTT;SOR=2.891;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=29;WE=115349405;WS=115349387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	115357078	rs12241995	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.206;NF=9;NR=22;PP=504;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CTTCTTGGTAGGTACCTAACA;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=31;WE=115357086;WS=115357068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr10	115357131	rs113389465	CA	C	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.600;NF=0;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=-0.365;SC=TGATATGGAACATTTTACAGG;SOR=0.375;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=8;WE=115357139;WS=115357121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr10	115370254	rs12243176	A	G	8231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=88;PP=2965;SC=TCCTCCCTTCAATCTCTAACG;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=175;WE=115370262;WS=115370244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr10	115370274	rs10749138	T	C	7957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=88;PP=2945;SC=GTGCCTGGAATGACACATGCA;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=162;WE=115370282;WS=115370264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr10	115371873	rs1539588	G	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=0.264;SC=TTCAAAATAAGACTTGGGTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=115371881;WS=115371868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	115372156	rs1539587	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=401;ReadPosRankSum=-0.668;SC=ATGGAACTGCGCCTTTGAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=28;WE=115372164;WS=115372146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr10	115373851	rs2419850	T	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=3;PP=855;SC=CCAATACCCATGTCCAGAAGG;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=115373859;WS=115373841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	115375528	rs11196397	C	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=565;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GGTCAGCAGTCGGTGTGTAAT;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=39;WE=115375536;WS=115375518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr10	115377290	rs77678145	T	C	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1301;ReadPosRankSum=-2.197;SC=CTTCAAAGCATCTGGATGCTG;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=80;WE=115377298;WS=115377280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr10	115381747	rs868738	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=521;ReadPosRankSum=-0.843;SC=TGAGCTTTGCGGGCATGCACG;SOR=1.007;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=37;WE=115381755;WS=115381737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr10	115384467	rs3127086	C	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=311;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TTACAACAACCAGATGTATGT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=22;WE=115384475;WS=115384457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr10	115386088	rs3127087	C	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=511;ReadPosRankSum=0.418;SC=TTCCAGTGAACTTGATTTAGT;SOR=1.127;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=26;WE=115386096;WS=115386078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr10	115388588	rs2286741	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.431;SC=AAATCTGAGGATAGAGAAAGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=115388596;WS=115388581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	115388944	rs2286740	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=382;ReadPosRankSum=0.443;SC=GTACAGCCACCGGGCCCACCT;SOR=0.831;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=23;WE=115388952;WS=115388934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr10	115389356	rs2286736	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.128;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr10	115389366	rs2286735	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=1.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr10	115393929	rs3189030	G	A	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=953;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GTCAGTCACCGAGCTGTACTT;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=65;WE=115393937;WS=115393919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,82:0.55:148
chr10	115400958	rs1539592	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.54;NF=18;NR=2;PP=467;SC=TCTTACCTAGCCTTGGTTGTA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=115400980;WS=115400948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	115400972	rs1539593	G	A	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=567;SC=GGTTGTATCCGCTAACATTTA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=115400980;WS=115400948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	115401031	rs5788038	AT	A	2233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=29;PP=1126;SC=TAGAAGACAGATTTTTTTTTA;SOR=1.264;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=56;WE=115401039;WS=115401021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	115401081	rs3127105	T	C	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=38;PP=2122;SC=CTTCATGCCCTGCCCCACTCC;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=115401089;WS=115401071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	115401264	rs3121465	A	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=34;PP=963;SC=CAACCAAAGCATTCCCTTCAC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=115401272;WS=115401254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	115405615	rs3127106	T	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=43;NR=42;PP=1273;SC=GCTCTGAGCCTGTTTGAGAAC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=85;WE=115405623;WS=115405605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	115405664	rs3121478	C	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=41;PP=1324;SC=TAATGTGCAGCGCCTTTCATC;SOR=2.267;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=61;WE=115405672;WS=115405654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	115405703	rs35741231	G	GA,GAA	922.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5346;FS=6.173;HP=10;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=273;ReadPosRankSum=0.539;SC=TATTTTATCTGAAAAAAAAAA;SOR=2.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=25;WE=115405711;WS=115405693;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.69:29
chr10	115405791	rs3121479	A	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.39;NF=6;NR=17;PP=530;SC=CTTAATGTCAACATTTACTTA;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=115405799;WS=115405781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	115406485	rs3121483	C	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=293;SC=GCTATGCTGGCTGTCCGTGTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=115406493;WS=115406479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	115410234	rs2185913	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=711;ReadPosRankSum=2.773;SC=GGCTATCTGATAGGCGGGTGT;SOR=0.819;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=46;WE=115410242;WS=115410224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr10	115411614	rs2154028	A	G	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=57;PP=2034;SC=AGGAGTATCCACCACCGTGGA;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=115411622;WS=115411604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	115412686	rs3121488	G	A	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.62;SOR=1.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr10	115417289	rs1891762	G	A	5410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=95;PP=2965;SC=TCATGTCCCAGTGAAAAACTG;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=76;TCR=95;TR=171;WE=115417297;WS=115417279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
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chr10	115423094	rs12770981	G	C	2589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1468;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GTAGTGGTGGGGGCATCAAAC;SOR=0.901;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=237;TCF=130;TCR=107;TR=105;WE=115423102;WS=115423084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,126:0.44:287
chr10	115423695	rs3127124	A	C	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=57;PP=1220;ReadPosRankSum=0.032;SC=AAATGCAAGGAGAACCCCCAG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=76;TCR=111;TR=96;WE=115423703;WS=115423685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,129:0.55:236
chr10	115439569	rs7921977	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=-1.513;SC=GAGCGCACTACCCCGAGCCAG;SOR=1.302;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=8;WE=115439577;WS=115439559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr10	115451781	rs12358524	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=-1.367;SC=TGGAAAAGAACACCAGCTGCG;SOR=0.707;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=34;WE=115451789;WS=115451771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr10	115457114	rs78849490	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TTAATGGGGCGGTAACCCTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=115457122;WS=115457104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	115457450	rs77120019	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GGGACATTCAGGGAAGGAGGT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=115457458;WS=115457440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	115515120	rs3981351	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=40;PP=1255;SC=AATGCCCCACGGTTTCCTTCA;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=115515128;WS=115515110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	115525052	.	T	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=742;ReadPosRankSum=-1.565;SC=GAACTAGTAATTAGTGTAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=44;WE=115525060;WS=115525042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr10	115525175	rs4631835	T	C	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=79;PP=2965;SC=TCTGAATCTCTGATGTATTTT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=163;WE=115525183;WS=115525165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	115533975	rs3750903	T	C	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=16;PP=1858;SC=ATCTATTCCTTTTATCTGCAG;SOR=2.513;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=60;TCR=16;TR=76;WE=115533983;WS=115533965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	115534200	rs3750902	G	T	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=867;SC=AACATTACCAGAGACCAGTTT;SOR=4.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=115534208;WS=115534190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	115535426	rs7899829	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=489;SC=CCTGGACAATGTCATCTCAGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=115535434;WS=115535416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	115535599	rs3750901	T	C	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ACTATCTTGCTCTCACAGAAG;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=81;WE=115535607;WS=115535589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,97:0.49:199
chr10	115537960	rs2900990	C	T	4231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=94;PP=2904;SC=AAGTGAGAGGCTGGTTTTCAA;SOR=1.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=33;TCR=94;TR=127;WE=115537968;WS=115537938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	115540311	rs11196482	T	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1264;SC=GAAGCAACAATCTTAAAGATA;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=115540319;WS=115540301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	115540411	rs11196483	T	C	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=68;PP=2457;SC=CATTCCATGCTGCATCCTGTA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=149;WE=115540419;WS=115540401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr10	115609915	rs3750898	C	G	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=86;PP=2965;SC=TGTGAATCATCCGGTTTTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=173;WE=115609923;WS=115609905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr10	115675025	rs7895609	G	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=1709;SC=TTCCCTACCTGTACAAGCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=115675033;WS=115675015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	115805056	rs1801253	G	C	7451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=155;PP=2965;SC=GGCCTTCCAGGGACTGCTCTG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=90;TCR=155;TR=245;WE=115805064;WS=115805046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr10	115889872	rs606682	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCAGAGGGCTATGTCATTCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=115889880;WS=115889862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	115910928	rs7095762	G	T	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=496;ReadPosRankSum=0.823;SC=GCTATTAGTTGATCTCTGGAA;SOR=0.791;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=36;WE=115910936;WS=115910918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr10	115922774	rs1061159	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=883;ReadPosRankSum=-1.827;SC=TTCTGAGCCTGTGTCTGTTTT;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=47;WE=115922782;WS=115922764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr10	115963126	rs11313522	CT	C	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=358;ReadPosRankSum=0.627;SC=AATTATTCCTCTTTTTTTTTA;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=25;WE=115963134;WS=115963116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr10	115963813	rs10885537	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=218;ReadPosRankSum=-0.960;SC=AGCAGAGTACCATTATATTTC;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=11;WE=115963821;WS=115963803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
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chr10	116008464	rs9665610	T	A	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1142;ReadPosRankSum=1.303;SC=TCCCTGTAGTTATATCAACAT;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=75;WE=116008472;WS=116008454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,77:0.45:170
chr10	116008497	rs9664945	G	A	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.065;SC=GTTGCTGGAAGCCGTCTGTGT;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=82;WE=116008505;WS=116008487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr10	116014827	rs12262953	G	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGTCTTGTGGGTGTTTGTGTT;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=116014835;WS=116014817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	116032519	rs597371	A	G	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=965;ReadPosRankSum=-0.743;SC=ACGGAGACGGAACTTGCTCTG;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=53;WE=116032527;WS=116032509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,63:0.60:105
chr10	116051017	rs61869920	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=875;ReadPosRankSum=-1.422;SC=TCCCGTGCAGGAGGGCAGCAG;SOR=0.377;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=61;WE=116051025;WS=116051007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr10	116058933	rs1889450	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TTGAGAAGGTGTGGTGACAGC;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=116058941;WS=116058923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr10	116060194	rs3214266	A	AG	2219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.980;NF=16;NR=29;PP=1623;ReadPosRankSum=2.775;SC=CCTGCAGGGGAGGCCTGTACC;SOR=0.515;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=45;WE=116060202;WS=116060184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,75:0.52:145
chr10	116060387	rs2286396	T	C	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1958;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCAGGTACACTCGGTCAGATT;SOR=0.840;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=244;TCF=127;TCR=117;TR=119;WE=116060395;WS=116060377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,138:0.46:300
chr10	116068176	rs581327	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTCCCCTCCCAACCACATGAT;SOR=0.724;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=30;WE=116068184;WS=116068166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr10	116073801	rs621375	T	C	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=115;PP=2965;SC=CCTTGGAGGATTTGTAGCACT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=67;TCR=115;TR=182;WE=116073809;WS=116073791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	116075228	rs694883	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=407;SC=GAAACCTCTGAGGTCAGGGAC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=116075236;WS=116075218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	116075271	rs377755078	T	TCC	2113.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=11;PP=1208;SC=CCCTGCCCCTTCCCCAAGGAG;SOR=1.519;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=27;WE=116075279;WS=116075261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	116079505	rs10885547	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AGACCCAGATGTGGCAACTCG;SOR=0.392;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=20;WE=116079513;WS=116079495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr10	116079535	rs17586071	T	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.120;SC=CCACCAGAGGTTAGTGCTTGC;SOR=0.145;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=11;WE=116079543;WS=116079525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr10	116085744	rs66638979	G	C	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CGTCAGGTGGGTCCCATCTGG;SOR=0.849;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=73;WE=116085752;WS=116085734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,87:0.42:206
chr10	116085782	rs111594798	G	GCCC	3556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=2127;ReadPosRankSum=0.983;SC=CCGAGATCTGGCCCAAGGTCA;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=27;TCR=96;TR=46;WE=116085790;WS=116085772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,94:0.43:217
chr10	116091555	rs10787524	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=454;ReadPosRankSum=-2.604;SC=CCTGAACTGATGCTTACCATC;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=32;WE=116091563;WS=116091545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr10	116100320	rs4752395	T	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=459;ReadPosRankSum=1.072;SC=AACCATCTCTTTTGGCGTGGA;SOR=1.002;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=24;WE=116100328;WS=116100310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr10	116199175	rs941853	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.022;SC=TTGCTGTATAGGAACAGGAAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=116199183;WS=116199165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	116203974	rs10160093	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-1.345;SC=GTTTCTTTGTAGCAGATCCCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=116203982;WS=116203964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	116205267	rs6585279	C	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=707;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AGGTCAGCAACGGTCTTTAAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=31;WE=116205275;WS=116205257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr10	116209970	.	T	TA	202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=59.1;NF=2;NR=7;PP=202;QD=23.0;SC=CAATAAACCATAAAAAAAAAA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=116209986;WS=116209960;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,9:0.75:12
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chr10	116211246	rs2145895	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=1.204;SC=ATCTTAGTAGACCAGAAAGGC;SOR=0.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=116211254;WS=116211236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr10	116225365	rs7899255	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=-0.582;SC=ATGTTTAGTCGTTGATTTTTC;SOR=0.151;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=14;WE=116225373;WS=116225355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr10	116228048	rs1815248	G	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TTGTTTGTTTGTTTGAGATGG;SOR=1.044;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=19;WE=116228056;WS=116228038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr10	116304699	rs75901365	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=416;ReadPosRankSum=-0.457;SC=GGTCCCCTCTTGTTTGTTTCT;SOR=1.845;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=22;WE=116304707;WS=116304689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr10	116304971	rs2483595	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	116307504	rs2247528	A	G	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.017;SC=GCGCCTGCCCATTCTTGATAT;SOR=0.691;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=90;WE=116307512;WS=116307494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,101:0.60:167
chr10	116732120	rs17794983	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.383;SC=AATAGATCCGTAGGATGTTGG;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=116732128;WS=116732110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr10	116853177	rs2484265	C	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=1.313;SC=CCCTCCTCCTCCCGGTCAGGT;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=116853185;WS=116853169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	116856543	rs1264777	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=475;SC=TCTTCTGTTTTCATTTGAAAA;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=116856551;WS=116856533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	116931101	rs3086141	C	CTT	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=1423;SC=ATGTTTTTCTCTAATAAAATC;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=26;WE=116931109;WS=116931091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	117075175	rs1953758	G	A	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=39;PP=1271;SC=ATGCACCACAGTGAGATGGTT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=117075183;WS=117075165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	117228794	rs10885721	A	G	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=26;PP=1014;SC=CTAACATTACATTCTATGTGT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=117228802;WS=117228784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	117278891	rs41310290	C	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=263;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TGATATATGTCCTGTCAATCT;SOR=0.820;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=15;WE=117278899;WS=117278881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr10	117278988	rs6421370	G	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=325;SC=TCCCACAGAGGAGAGGTAACA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=117278996;WS=117278978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	117309098	rs1336108	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=253;SC=CAAATATATGGATCTCTATTG;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=117309106;WS=117309088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	117357116	.	CT	C	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=77;MMLQ=28;MQ=52.92;NF=0;NR=2;PP=50;QD=38.0;SC=GAGTCACACTCTTGTCACCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=117357124;WS=117357095;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr10	117486763	rs2254619	G	T	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=1511;ReadPosRankSum=0.055;SC=TCCAGCAACTGCTTCGAGAAC;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=103;WE=117486771;WS=117486753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,115:0.54:212
chr10	117849353	rs2072276	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=475;ReadPosRankSum=0.285;SC=GTGGTGGTAGTGGCAGTGGTG;SOR=0.937;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=35;WE=117849361;WS=117849343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr10	117856145	rs2072275	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=0.569;SC=CTTCTCCCATCCTGCTTCTCT;SOR=0.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=14;WE=117856153;WS=117856135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr10	117856379	rs66851912	TGCACAC	T	591.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.965;NF=1;NR=27;PP=798;ReadPosRankSum=1.088;SC=TGCCTTTTTCTGCACACGCAC;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=28;WE=117856401;WS=117856369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr10	117856386	rs376047022	GCACACGCA	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.98;MQRankSum=-0.844;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.089;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr10	117884950	rs2245020	G	A	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1308;ReadPosRankSum=1.282;SC=TGCAGACATCGTTGGACACGC;SOR=0.581;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=176;TCF=97;TCR=79;TR=88;WE=117884958;WS=117884940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,93:0.49:190
chr10	117986207	rs7094346	G	T	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=10;PP=525;SC=ATTTCTATTAGTACTACATTG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=28;WE=117986215;WS=117986197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	118031376	rs2532691	C	A	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=56;NR=38;PP=1713;SC=CCCAAAAAGACACTTCTTCCT;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=118031384;WS=118031366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	118031619	rs2577360	G	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=213;SC=GGAGCTCAGCGTGCAGCGATC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=118031627;WS=118031609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	118187399	rs10787669	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	118187405	rs10787670	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.98;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	118215150	rs34077637	C	CT	186.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=7;NR=0;PP=135;SC=CATGTTGATCCTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=118215158;WS=118215140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	118231360	rs10736251	G	A	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.16;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	118231363	rs1897519	A	G	4262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.35;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	118231406	rs10749217	A	C	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=46;PP=1646;SC=GCAGAGTGAGAAACTGACGCT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=118231414;WS=118231396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	118310802	.	CA	C	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=59.24;NF=0;NR=4;PP=38;QD=10.25;SC=ATTATCTTTCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=118310810;WS=118310792;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,4:0.21:19
chr10	118313116	rs2915749	T	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=22;PP=1637;SC=TATGTAAATATACTTTATGAT;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=75;WE=118313124;WS=118313106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	118313265	rs2915748	T	C	4571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=78;PP=2620;SC=CACCTTCCAATGTGCATGTCA;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=147;WE=118313273;WS=118313255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	118351905	rs1867991	A	C	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=17;PP=1580;SC=CGAAAACATGAAGCACTTCTG;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=118351913;WS=118351895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	118355695	rs2915765	A	T	11198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=206;NR=144;PP=2965;SC=ACAGCAAAAAATGTCCTGAAA;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=350;TCF=206;TCR=144;TR=350;WE=118355703;WS=118355685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr10	118357490	rs2915764	C	T	6821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=95;PP=2965;SC=GCTGTGAGCACGCACAACTGT;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=210;WE=118357498;WS=118357480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr10	118359461	rs17735613	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=0.443;SC=TTCTGAAAATACGGTCCTACT;SOR=0.084;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=118359469;WS=118359451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	118359548	rs3816355	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=510;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TCTCCTTATTTGTTTTCCCAG;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=35;WE=118359556;WS=118359538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr10	118363642	rs3010501	T	C	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=55;PP=1826;SC=ACCAGTACAGTATCTTCAGGT;SOR=1.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=118363650;WS=118363632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	118364818	rs2915754	G	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=271;SC=TAATCTAGAAGAGAAAACAGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=118364826;WS=118364814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	118364842	rs2915753	A	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=528;SC=CTGGCATTGTATGGTAATTAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=118364850;WS=118364832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	118368493	rs201976882	CCAAAA	C	2433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=4.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.89;MQRankSum=6.273;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.551;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr10	118368606	rs1049125	T	C	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.889;NF=41;NR=75;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GAAGACACGCTGCTCACCCTC;SOR=0.583;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=89;TCR=165;TR=116;WE=118368614;WS=118368596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,139:0.49:286
chr10	118380345	rs12415178	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=280;ReadPosRankSum=0.494;SC=TATGTGTTTACGATAAGTTAG;SOR=1.863;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=18;WE=118380353;WS=118380335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr10	118380387	rs12412456	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TGCCTTATCTATCCTGCCCCG;SOR=1.040;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=32;WE=118380395;WS=118380377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr10	118380511	rs3010502	A	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=32;PP=1213;SC=GCCCCATGTGAGCAGGGGATT;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=118380519;WS=118380501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	118380629	rs3214321	TC	T	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=383;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GCTGTCTAACTCCCTGTGCAC;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=12;WE=118380637;WS=118380619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr10	118383382	rs12256398	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.030;NF=25;NR=8;PP=468;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCTGTCCTGCAGAGTTTTCC;SOR=1.127;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=33;WE=118383390;WS=118383372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,33:0.35:94
chr10	118383463	rs56189579	A	AG	6363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=71;PP=2957;SC=CTAGGAAAAGAGTCTGCTACG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=98;WE=118383471;WS=118383453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr10	118383703	rs2286776	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=1.177;SC=AGTCACTGCCCTGGAATTTTC;SOR=0.648;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=118383711;WS=118383693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	118386325	rs9787637	C	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=633;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GGGGTGTGCACCTGGGGGCTG;SOR=0.526;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=43;WE=118386333;WS=118386315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr10	118387137	rs7092580	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=838;ReadPosRankSum=0.811;SC=TGCAAATAGGAAGCGGGGTCG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=10;WE=118387160;WS=118387127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr10	118387148	rs12768167	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	118387152	rs12768516	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	118387282	rs11544712	A	G	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.001;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.381;SC=AGACGCAGCTAGGGTACAGCC;SOR=0.738;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=61;WE=118387290;WS=118387272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr10	118387454	rs12768804	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=1.138;SC=CCTCGGCCAGCGCCTTTCCGA;SOR=1.445;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=12;WE=118387462;WS=118387444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	118389690	rs12763549	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=-2.090;SC=TGAAATAGCTACAGGAATGGC;SOR=0.489;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=20;WE=118389698;WS=118389680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
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chr10	118394551	rs2286779	G	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.249;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=365;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TAGAACAGAAGAAAGAGATGT;SOR=0.386;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=21;WE=118394559;WS=118394541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr10	118396278	rs11197776	G	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=537;ReadPosRankSum=0.970;SC=ACAAATTATGGTTTTTTTTTT;SOR=1.431;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=31;WE=118396286;WS=118396267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr10	118397884	rs4751995	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.782;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr10	118397894	rs4751996	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr10	118397971	rs10885997	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=306;ReadPosRankSum=0.605;SC=ATGAAAACTCAAAACAATATG;SOR=1.132;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=19;WE=118397979;WS=118397961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr10	118398046	rs7910135	C	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=0.236;SC=ATTATTCAAACTTGATTGAGT;SOR=1.508;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=10;WE=118398054;WS=118398036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	118404620	rs2301179	A	G	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.548;SC=AACGTGGTGCAGCTATTGCGG;SOR=0.821;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=188;TCF=94;TCR=94;TR=84;WE=118404639;WS=118404610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,95:0.44:215
chr10	118404700	rs2301178	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=643;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TTCTGGGTTCGCATTTCAGAA;SOR=0.576;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=51;WE=118404708;WS=118404690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,59:0.37:158
chr10	118423572	rs3830026	G	A	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1299;ReadPosRankSum=0.020;SC=TCTAGGAGAGGAACCGTCCGT;SOR=0.538;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=77;WE=118423580;WS=118423562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,85:0.54:156
chr10	118436068	rs2166634	G	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=-0.083;SC=ACGATACCCAGGCTTATCTGC;SOR=0.911;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=29;WE=118436076;WS=118436058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr10	118439206	rs61753067	T	C	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=831;ReadPosRankSum=-1.843;SC=AATAAAATCCTCTCCAAATAT;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=51;WE=118439214;WS=118439196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr10	118451699	rs740595	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=0.577;SC=AGGAAAGGGATGGCTCCTTGT;SOR=0.616;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=118451707;WS=118451689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	118451810	rs733216	A	G	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1055;ReadPosRankSum=1.269;SC=ACCACCCTGGACATCTTGAGT;SOR=0.489;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=59;WE=118451818;WS=118451800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr10	118452044	rs2240711	G	T	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=504;ReadPosRankSum=0.065;SC=GCCTCCTGTGGCTTCACTGAA;SOR=0.711;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=30;WE=118452052;WS=118452034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr10	118452099	rs2240710	C	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-0.777;SC=GTTTCAGGGTCCCCCAAACTT;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=118452107;WS=118452089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	118466662	rs144733258	GCGCACA	G	644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.447;NF=5;NR=7;PP=400;ReadPosRankSum=1.365;SC=GCACCCATGCGCGCACACACA;SOR=0.846;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=12;WE=118466675;WS=118466652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr10	118501765	rs3095121	A	C	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=5;PP=176;SC=GGTCCACCGGACCCCGGCCCC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=118501773;WS=118501755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	118620459	rs11197835	A	C	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=37;PP=1500;ReadPosRankSum=1.890;SC=ATATCGCTCTACTGAAGCACA;SOR=0.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=190;TCF=115;TCR=75;TR=96;WE=118620467;WS=118620449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr10	118628036	rs1637571	G	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=789;SC=GTGTGTGTGCGTGTATGTGTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=118628044;WS=118628026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	118633548	rs1637574	A	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=10;PP=1346;SC=TGAATTCATTATTTATCCCTT;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=118633556;WS=118633538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	118643670	rs2257791	G	A	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=28;PP=1704;SC=TAAGCAGGACGTATGTAAGTT;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=118643678;WS=118643660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	118645834	rs17095398	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=237;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TTCCAAACATGTCAGGCTTCT;SOR=0.199;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=17;WE=118645842;WS=118645824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr10	118646129	rs2531685	G	C	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=63;PP=1906;SC=AGAGAAAATAGTTGTCTCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=78;WE=118646137;WS=118646119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	118667346	rs2531690	A	C	7722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=102;PP=2965;SC=TTGTCCACCAAGGCTAATAAT;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=130;TCR=102;TR=232;WE=118667354;WS=118667336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr10	118708315	rs10595325	GAGA	G	1767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=13;PP=1271;SC=CACAATATAGGAGAAGATTTT;SOR=1.666;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=28;WE=118708325;WS=118708305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	118893846	.	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	118957027	rs67346047	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CCCCCAGGCCAGGAGATGCTG;SOR=0.733;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=11;WE=118957035;WS=118957017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr10	119001151	rs2619094	A	C	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=257;SC=TGGGGGGTCCACGGCCGCCTT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=119001159;WS=119001141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	119014023	rs2072362	C	T	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=27;PP=808;SC=GTAAGGCCCCCGTGTAGGCAA;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=119014031;WS=119014013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	119014931	rs363420	C	T	8523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=109;PP=2965;SC=TGCTGGCACGCGCTTGGGCCA;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=67;TCR=109;TR=176;WE=119014956;WS=119014921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr10	119014948	rs363343	C	A	8096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=103;PP=2965;SC=GCCACACCTGCTTTCTGAAGA;SOR=1.300;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=58;TCR=103;TR=161;WE=119014956;WS=119014921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr10	119026401	rs363266	T	C	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=32;PP=1236;SC=TTTCTGCCTTTGCTGTTACAA;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=119026409;WS=119026391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	119026566	rs363227	T	C	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=36;PP=1222;SC=AGATGGCATTTGACAAGTGGG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=119026574;WS=119026556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	119027123	rs363228	C	A	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=160;SC=TCAAGACTTTCCGAGATGATT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=119027131;WS=119027113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	119027411	rs363271	G	T	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=657;SC=TCCGTGTAAAGACACCTGCTT;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=119027419;WS=119027401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	119029515	rs363230	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=380;ReadPosRankSum=-0.445;SC=AGACACACTCCCTGATATTCG;SOR=0.184;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=24;WE=119029523;WS=119029505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr10	119029744	rs363272	G	A	4884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=75;PP=2922;SC=ACCTCAATACGTAATGGATAA;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=146;WE=119029752;WS=119029734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr10	119042761	rs363293	C	T	5163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=70;PP=2965;SC=CATTTGAAAGCTTAAATAGAC;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=170;WE=119042769;WS=119042751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	119307524	rs2240776	T	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=1114;SC=AGGCACTTGATAGAAGGGTGC;SOR=2.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=48;WE=119307532;WS=119307514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	119768551	rs7923321	C	T	6486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=91;PP=2965;SC=ATGGTTCATACGGCACTCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=187;WE=119768559;WS=119768541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr10	119793442	rs11198243	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=1.628;SC=GCTATTCCTCGTCAGGTGGGC;SOR=1.402;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=13;WE=119793450;WS=119793432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr10	119793629	rs2928118	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=444;SC=ACGCTACCACCGTACACAATT;SOR=2.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=119793637;WS=119793619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	120070427	rs4751651	G	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.41;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	120070709	rs3213691	G	A	30.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr10	120070843	rs34120011	G	GA	556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=11;PP=294;SC=TTACAAAGGAGAAAAAAAAAG;SOR=0.990;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=14;WE=120070851;WS=120070833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	120081948	rs853911	C	T	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=64;PP=2053;SC=TAACCTAAAACTAATCATGAG;SOR=1.588;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=92;WE=120081956;WS=120081938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	120353910	rs1613448	T	C	4688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=69;PP=2965;SC=ACCACCACGATCACCACCAGC;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=74;TCR=69;TR=143;WE=120353918;WS=120353900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	120453168	rs10510046	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=698;ReadPosRankSum=1.409;SC=ATACTGCACTTAGATGCTTTC;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=44;WE=120453176;WS=120453158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr10	120460715	rs2274314	G	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=183;ReadPosRankSum=0.889;SC=TTCAGAAGATGTTAACATTGG;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=14;WE=120460723;WS=120460705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	120467230	.	G	C	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=28;MQ=59.02;NF=0;NR=4;PP=62;QD=24.1928031368;SC=AAAAAAAAAGGAAGACACGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=120467238;WS=120467220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr10	120803435	rs565922	C	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=548;SC=CAAACCCACACGCAATCAGAC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=120803443;WS=120803425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	120803788	rs658352	T	C	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	120810623	rs669964	A	C	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=34;PP=2962;SC=TAACTCAATAAAGAATATACC;SOR=2.021;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=99;TCR=34;TR=133;WE=120810643;WS=120810613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr10	120810635	.	A	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=21;PP=1276;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GAATATACCAATTTGTTAAGG;SOR=0.877;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=115;TCR=47;TR=78;WE=120810643;WS=120810613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr10	120817450	rs10886375	A	G	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=27;PP=2347;SC=ATTTTTTAATAACTAAGATGC;SOR=1.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=106;WE=120817458;WS=120817440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	120818609	rs6585524	C	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=441;SC=CTATAGGAAACATATCATAAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=120818617;WS=120818599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	120819453	rs10787901	A	G	351.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.09;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	120819458	rs10787902	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=3;PP=106;SC=ATCCTAGTTGTTGTAAAACAA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=120819466;WS=120819448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	120820224	rs3740555	C	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1157;SC=GAGCACATAACATCACAAAAC;SOR=1.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=120820232;WS=120820214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	120828969	rs7908387	A	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=732;SC=TTTGCATCTCATCTTGTGTGA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=120828977;WS=120828959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	120832872	rs1397616	T	C	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=110;SC=AAACATCTACTTCAAAAGGAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=120832880;WS=120832862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	120864868	rs1511033	T	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=1;PP=395;SC=AGCGCAATCATCGCTCTCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=120864876;WS=120864858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	120896027	rs11198799	G	A	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=55;PP=2143;SC=ACCTAGCACCGTTTTCAGAAG;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=109;WE=120896035;WS=120896017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr10	120905940	rs10654248	C	CGT,CGTGT	288.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=33,33;PP=583,416;ReadPosRankSum=0.489;SC=TGAATCAGGGCGTGTGTGTGT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=2;TCR=83;TR=33,33;WE=120905948;WS=120905930;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.33:51
chr10	120905972	rs141608372	T	TGTGC,TGC	1090.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=9.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=39,39;PP=327,1265;ReadPosRankSum=0.122;SC=TGTGTGTGTGTGCACGTGTGT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=39,39;WE=120905983;WS=120905962;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.60:58
chr10	120905975	rs61874341	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.93;MQRankSum=1.712;NF=2;NR=27;PP=962;ReadPosRankSum=0.102;SC=GTGTGTGTGCACGTGTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=29;WE=120905983;WS=120905962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr10	120907173	rs150807690	T	TG	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=340;ReadPosRankSum=0.548;SC=TGTGTGTTTATGGGAAGGTTA;SOR=0.610;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=120907181;WS=120907163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	120907203	rs61874342	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CTTCTCCCCACCCTCCACCAG;SOR=0.273;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=15;WE=120907211;WS=120907193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr10	120914692	rs17668734	G	A	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GGCTTGCACTGTAGATGTAAA;SOR=0.954;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=162;TCF=76;TCR=86;TR=77;WE=120914700;WS=120914682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr10	120916467	rs2297696	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=0.524;SC=GCTTAGAGAGAGGTATGGAAG;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=120916475;WS=120916457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr10	120917269	rs2420494	A	T	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=23;PP=1719;SC=AAAGTACTTAATTAGCAAATA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=77;WE=120917277;WS=120917259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	120917616	rs2275112	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=901;ReadPosRankSum=-2.217;SC=GTGTTGCTGTGGAAGGAGAAC;SOR=0.676;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=47;TCR=98;TR=54;WE=120917624;WS=120917606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,66:0.39:170
chr10	120919246	rs2181118	T	C	4988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=77;PP=2643;SC=TCACCGTGGGTGCCATGAAAG;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=156;WE=120919254;WS=120919236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr10	120922017	rs12413842	T	C	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=60;PP=1266;ReadPosRankSum=0.567;SC=CTCACCAGCATGCACTGGACT;SOR=1.085;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=166;TCF=67;TCR=99;TR=93;WE=120922025;WS=120922007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,111:0.55:202
chr10	120922075	rs35233430	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=956;ReadPosRankSum=-0.726;SC=AGGCTCTCTATCCATTAGGAT;SOR=0.832;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=45;WE=120922083;WS=120922065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr10	120924874	rs933092	G	C	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=49;PP=2168;SC=TGCGTCCCCTGCCGCGCCCTA;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=110;WE=120924882;WS=120924864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	120933324	rs3758609	G	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=477;SC=CACAGTTCACGTCGTGAAATT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=120933332;WS=120933314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	120933561	rs4752257	T	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.084;SC=CACCTTTTTATTTTTAGGAAT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=120933569;WS=120933551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	120967376	rs2230347	C	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=652;ReadPosRankSum=-1.461;SC=AGCGGCAGCACCCCAGGCGCT;SOR=1.369;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=41;WE=120967384;WS=120967366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr10	121093160	rs10886461	A	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=13;PP=851;SC=CAGGGAGACTACTTAGGTGCT;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=121093168;WS=121093150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	121140321	rs2275036	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=-0.949;SC=CTTTTCTTGTCTCCAGACAGA;SOR=0.268;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=9;WE=121140329;WS=121140311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	121140511	rs4751714	A	G	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=35;PP=1170;SC=CAAAGGAAAAAATAGATCTCA;SOR=1.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=121140519;WS=121140501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	121140534	rs2275037	C	G	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=32;PP=888;SC=GGTTAGAAGACTGAGGAATAA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=121140542;WS=121140524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	121190113	rs915120	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=337;SC=TCAGTGGCCTTGGGGCTATCA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=121190121;WS=121190103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	121199189	rs2245364	T	C	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=75;PP=2965;SC=GATGCCAGTGTATCCTACCTG;SOR=1.261;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=124;TCR=75;TR=199;WE=121199197;WS=121199179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr10	121199437	rs915116	T	C	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=48;PP=1096;SC=AAGCTGTGAGTGTGAACAGAG;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=51;WE=121199445;WS=121199427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	121201626	rs2275044	T	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=61;PP=1623;SC=CCTGTGTCAATGCACCTTGAG;SOR=1.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=89;WE=121201634;WS=121201616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	121202971	rs75944858	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=233;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGTTGGTGGCGGCCATGAAAC;SOR=0.105;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=13;WE=121202979;WS=121202961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr10	121287019	rs3009921	G	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=548;SC=CAGCACTGCCGTCACCATCAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=121287027;WS=121287009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	121302244	rs77190301	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.79;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	121336568	.	G	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=697;ReadPosRankSum=-0.323;SC=AAACCTTAAAGAATGCTATGA;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=44;WE=121336576;WS=121336558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr10	121338401	rs4752334	T	A	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=62;PP=1927;SC=AATAAGACTCTGTAAGATGAA;SOR=1.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=83;WE=121338409;WS=121338391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	121347839	rs146020828	TTTTC	T	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.645;NF=0;NR=7;PP=223;ReadPosRankSum=0.050;SC=ATTCATCACCTTTTCTTTCTT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=7;WE=121347850;WS=121347829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	121435955	rs196294	A	C	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=910;ReadPosRankSum=0.636;SC=TTAAAAATATATTTTTGTGTC;SOR=0.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=63;WE=121435963;WS=121435945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,75:0.57:132
chr10	121436362	rs196295	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=805;ReadPosRankSum=1.739;SC=TGGAGAAGGTACAGGGGCTGG;SOR=0.744;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=45;WE=121436370;WS=121436352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,56:0.39:143
chr10	121551581	rs2289306	A	C	6944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=123;PP=2965;SC=CAGGGTTTGCACTTGGGAAGA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=93;TCR=123;TR=216;WE=121551589;WS=121551571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr10	121557940	rs35547475	CTT	C	807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=475;SC=TTTAGACAATCTTAGTTCATT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=121557949;WS=121557930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	121571507	rs3781503	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=900;SC=CTTGCTTAACTGATGTTGGGA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=121571515;WS=121571497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	121582556	rs2289307	T	C	5621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=59;PP=2965;SC=AACATTTAACTTTATACGTAT;SOR=1.454;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=119;TCR=59;TR=178;WE=121582564;WS=121582546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	121586882	rs3188055	A	G	8622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=130;PP=2965;SC=TCAAGTTTCAAATGAAACCCA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=128;TCR=130;TR=258;WE=121586890;WS=121586872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr10	121679151	rs369598461	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=460;ReadPosRankSum=0.488;SC=AATTGTTTTTCTTGTGTAGAT;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=30;WE=121679159;WS=121679141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr10	121717932	rs11199132	G	A	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=34;NR=14;PP=850;SC=CCAAGGGAATGTGAGCCTCTG;SOR=2.110;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=48;WE=121717940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	121717956	rs34665773	GT	G	1171.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQ=60.42;NF=19;NR=21;PP=698;SC=GCAAGTGATGGTTTTTTTTTT;SOR=1.154;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=40;WE=121717964;WS=121717946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	121718112	rs11199134	C	T	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=47;PP=1566;SC=GCAGAAGTCACGAGCAGGGTG;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=121718120;WS=121718102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	122216790	rs10886691	A	T	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=38;PP=2441;SC=GCACCAGCTGACGCCGCGGGA;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=88;TCR=38;TR=126;WE=122216798;WS=122216780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	122273276	rs5788426	CT	C	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.146;NF=17;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=-0.838;SC=ATACATCATCCTTTTTTTTTT;SOR=0.223;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=19;WE=122273284;WS=122273266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	122619466	.	T	TAC	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=449;ReadPosRankSum=0.671;SC=GGAATATTGATACACACACAC;SOR=0.123;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=10;WE=122619474;WS=122619456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr10	122665285	rs1652726	A	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=621;SC=CAAGCAGAGCATAGCCTGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=122665293;WS=122665275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	123238968	rs3135826	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=314;ReadPosRankSum=0.100;SC=ATACATAATTTGAATATATTT;SOR=1.519;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=123238976;WS=123238958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	123239112	rs1047057	G	A	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=69;PP=2426;SC=TCCACAGCCAGTACGCACGGC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=128;WE=123239120;WS=123239102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr10	123243197	rs2278202	G	A	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=15;PP=1144;SC=GGGGCTTCTAGAAGGAAGTTC;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=123243205;WS=123243187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	123246732	rs148450955	TTTCTAAGGCCAGCTCCTGCACC	T	719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=2083;SC=AAATCTGTCCTTTCTAAGGCC;SOR=3.383;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=123246761;WS=123246722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	123247037	rs2981461	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.61;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	123247044	rs2981460	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	123277666	rs60468962	G	GTA	1603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1304;SC=GTAGCGTCCAGTAGTACATTC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=26;WE=123277674;WS=123277656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	123277742	rs2420942	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=241;SC=AAGGATCAACCATGCAACCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=123277750;WS=123277732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	123279745	rs2981448	C	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=365;SC=AATAAATAAGCTGTGTTGTCC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=123279753;WS=123279735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	123298158	rs1047100	T	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=970;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CATTCTCCACTACACAGGTAT;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=58;WE=123298166;WS=123298148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr10	123596254	rs4237536	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=441;SC=TCTTGGGACATGAATGAATGT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=123596262;WS=123596244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	123673339	rs10749435	T	C	7631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=124;PP=2965;SC=CCCCTTTAGCTAGAAATTTCA;SOR=0.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=95;TCR=124;TR=219;WE=123673347;WS=123673329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr10	123687282	rs77778376	G	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CGGCCCCCTCGCGTCCTCGCT;SOR=2.428;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=9;WE=123687290;WS=123687272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	123719928	rs41287994	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=1.101;SC=CATCCTAAAACGAAAACATGA;SOR=0.645;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=27;WE=123719936;WS=123719918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr10	123724701	rs34074742	AC	A	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=654;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTGGCTCCAGACCCGCACACT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=19;WE=123724709;WS=123724691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr10	123724767	rs4752626	T	G	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=40;PP=2688;SC=TTAACTTTAATGTGTTTTTTT;SOR=1.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=87;TCR=40;TR=127;WE=123724775;WS=123724757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	123781339	rs2461221	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=-0.562;SC=ATGTGACCGTAGAGATAAACA;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=15;WE=123781347;WS=123781329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr10	123792487	rs5788528	A	AAAC	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	123842065	rs2459103	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=399;SC=AGGGCACTTGATGCCCTTTTG;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=123842073;WS=123842055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	123844172	rs41288002	G	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1088;ReadPosRankSum=0.403;SC=TAGAATCAGAGAAATCAGATT;SOR=0.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=67;WE=123844180;WS=123844162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr10	123845322	rs7073433	T	C	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=62;PP=2178;SC=AATGGAGTGCTGGGCCACTTC;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=123;WE=123845330;WS=123845312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	123847870	.	A	ATT	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=61.53;NF=5;NR=0;PP=95;QD=20.8;SC=TTTCCTAGGGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=123847878;WS=123847860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr10	123902994	.	G	GAATGGGT	322.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=455;ReadPosRankSum=0.286;SC=TCCATGTGTGGGCGGGTGGGT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=123903003;WS=123902984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	123902995	.	GC	G	322.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=455;ReadPosRankSum=0.746;SC=CCATGTGTGGGCGGGTGGGTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=123903003;WS=123902984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	123976391	rs10444046	C	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CTCGGAGAATCCTGCCCCTAG;SOR=1.077;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=64;WE=123976399;WS=123976381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,70:0.47:149
chr10	123989667	rs75759924	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=-1.889;SC=AATCAGAAGGGTGATTTTTAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=123989675;WS=123989660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	124009261	rs10887111	G	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=1.617;SC=GACAGGCTGGGCTTCCCTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=124009269;WS=124009251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr10	124034528	rs7096744	G	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=792;ReadPosRankSum=1.107;SC=TATGGAAAATGTCACCTTTAC;SOR=0.511;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=45;WE=124034536;WS=124034518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr10	124034703	rs7080859	T	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=785;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GGGGCTGGGTTCTGCACCACC;SOR=0.503;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=41;WE=124034711;WS=124034693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr10	124036141	rs6585808	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGGAATACAGTGTCTTTGCCT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=124036149;WS=124036131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	124036190	rs7086389	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=-1.091;SC=TGTTCAAAAATTAACCAGCAC;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=17;WE=124036198;WS=124036180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr10	124036226	rs7086403	T	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=638;ReadPosRankSum=0.589;SC=GATTTCCTTCTTGCTATACAA;SOR=0.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=34;WE=124036234;WS=124036216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr10	124036494	rs7090214	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AATGGCCCATTATTCCTGGGA;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=124036502;WS=124036484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr10	124036543	rs7072288	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TGATTGGCTGCAGTGGCTGTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=124036551;WS=124036533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	124045488	rs2181161	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=256;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TCTGAGATGCCTGGGGAGGCT;SOR=0.100;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=13;WE=124045496;WS=124045478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr10	124050575	rs11592545	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CAGATGGCTCGCTTGGCTGTG;SOR=0.399;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=124050583;WS=124050565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr10	124066652	rs7082865	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=405;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TACAAGCAGCGTGATTTTGTG;SOR=0.649;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=25;WE=124066660;WS=124066642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr10	124089036	rs2421013	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=779;ReadPosRankSum=0.744;SC=GACATAGGACGGAGCTTGAGG;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=53;WE=124089044;WS=124089026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr10	124091855	rs5788544	A	AG	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.711;SC=AAACCTGGTGAGGGGGGCAGG;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=124091863;WS=124091845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr10	124091921	rs4627016	C	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=440;ReadPosRankSum=-0.231;SC=AGGATCCCACCGTGGTCAGCT;SOR=0.980;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=30;WE=124091929;WS=124091911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr10	124094283	rs10788282	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.377;NF=11;NR=2;PP=151;ReadPosRankSum=-1.574;SC=ATGATCTGCCCGCCTCAGCCT;SOR=0.641;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=13;WE=124094291;WS=124094273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr10	124095982	rs3817280	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=429;ReadPosRankSum=-1.326;SC=TTGCAGTTCCACCTAAGGTGA;SOR=0.770;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=28;WE=124095990;WS=124095972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr10	124096035	rs3817281	T	C	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,59:0.39:151
chr10	124096041	rs1129973	T	C	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,58:0.37:155
chr10	124096061	rs1048347	A	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=843;ReadPosRankSum=1.276;SC=GAGCACAACCACGTCAGCCTG;SOR=0.977;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=150;TCF=95;TCR=55;TR=61;WE=124096069;WS=124096051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,70:0.38:182
chr10	124096209	rs3817284	C	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=944;ReadPosRankSum=0.970;SC=CAAGTGTTCACGTTGTCTTTT;SOR=0.714;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=34;TCR=97;TR=61;WE=124096217;WS=124096199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr10	124096306	rs3817285	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TGAAGATCCCTGGAAAATCTG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=124096314;WS=124096296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr10	124152936	rs3838776	G	GA	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=991;SC=ACAGGCTTTAGATTTGTCTTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=124152944;WS=124152926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	124175273	rs4751892	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=106;SC=ATCTGTTTCTGACTAATCTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=124175281;WS=124175263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	124176452	rs4612730	G	A	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=30;PP=1537;SC=TGAGGGCAGGGGTTTCTTACT;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=124176460;WS=124176442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	124183732	rs4405249	T	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=405;ReadPosRankSum=1.490;SC=AACCTCTTCGTGTAATACCAC;SOR=0.540;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=24;WE=124183740;WS=124183722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr10	124186714	rs2292626	C	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=684;SC=TTTAATGCTTCCTTGTAGTAT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=124186722;WS=124186704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	124189010	rs10591719	TTGTGTG	T	1186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=8;NR=6;PP=781;SC=GCTGCTGCCTTTGTGTGTGTG;SOR=2.147;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=14;WE=124189023;WS=124189000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	124189197	rs1045216	A	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1481;SC=CAACGCAGCCACCGCCACCTC;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=124189205;WS=124189187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	124214448	rs10490924	G	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=881;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GATCCCAGCTGCTAAAATCCA;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=54;WE=124214456;WS=124214438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr10	124214600	rs144224550	G	GGT	1503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.895;NF=4;NR=17;PP=931;ReadPosRankSum=1.846;SC=ATTCTGGAGTGGTGCCCTGCA;SOR=0.362;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=21;WE=124214608;WS=124214590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr10	124216384	rs72511653	C	CTA	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.083;NF=4;NR=2;PP=173;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CGTCATGTGTCTTTAAAAATG;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=124216392;WS=124216374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr10	124221270	rs1049331	C	T	178.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	124221276	rs2293870	G	T	178.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	124271589	rs2672586	G	A	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=38;PP=1382;SC=AGCGTGAGTTGGAGTCGTTTT;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=124271597;WS=124271579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	124320194	rs2981745	T	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=664;ReadPosRankSum=0.664;SC=ATAGCAGCAGTAGAAATATAC;SOR=1.019;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=38;WE=124320202;WS=124320184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
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chr10	124325569	rs3019516	A	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=661;ReadPosRankSum=1.087;SC=CTCCTCTGCTACTGTTGGCTA;SOR=0.986;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=35;WE=124325577;WS=124325559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr10	124325631	rs2981768	T	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=441;SC=CCTTGTCGAATGCAGGAATGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=124325639;WS=124325621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	124329580	rs11524819	C	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr10	124329583	rs11524820	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr10	124329672	rs3740220	TC	CT	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=1694;ReadPosRankSum=2.496;SC=CTTTTCCACCTCGCAGCTTCA;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=47;WE=124329681;WS=124329662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr10	124329710	rs11523871	C	A	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=669;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCCCTTGGATCCAACTGTAGC;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=50;WE=124329718;WS=124329700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr10	124329746	rs3740222	A	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=627;ReadPosRankSum=-1.767;SC=TTATGGGGGAACCCTGTGGGC;SOR=1.103;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=40;WE=124329754;WS=124329736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr10	124329801	rs3740223	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=318;ReadPosRankSum=1.036;SC=ATCCAGAAGAGATGCAGAAGC;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=20;WE=124329809;WS=124329791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr10	124330240	rs2981790	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.664;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=1178;ReadPosRankSum=0.933;SC=CCCAGCCTGGAGCCAGTACGG;SOR=2.267;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=20;WE=124330260;WS=124330230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr10	124330252	rs2981791	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=1178;ReadPosRankSum=0.507;SC=CCAGTACGGTAACACAGTGAT;SOR=1.460;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=30;WE=124330260;WS=124330230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr10	124330427	rs3013236	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CCCTCGGAGTCGACCCTGGAG;SOR=0.732;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=65;WE=124330435;WS=124330417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr10	124331867	rs7084792	C	T	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=51;PP=2165;SC=TGGAGTCAACCGTAGCAGAAG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=109;WE=124331875;WS=124331857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	124331944	rs2277229	C	T	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.741;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=2673;ReadPosRankSum=2.379;SC=TCATCTCTGACCCAGATGAGG;SOR=0.267;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=47;WE=124331971;WS=124331934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr10	124331957	rs2277230	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=8.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.412;SOR=0.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr10	124331963	rs2277231	A	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=7.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr10	124332035	rs2277232	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=355;ReadPosRankSum=0.479;SC=TATGTGCAACTCTGAGTCCAT;SOR=1.220;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=19;WE=124332043;WS=124332025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr10	124333308	rs2277235	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=681;ReadPosRankSum=1.471;SC=ATCCCTGTAGGCTCATTACCC;SOR=0.751;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=123;TCF=62;TCR=61;TR=48;WE=124333316;WS=124333298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,58:0.38:153
chr10	124335866	rs1985025	C	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=544;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GCCCTGAGACCTTGTGCCTCA;SOR=0.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=34;WE=124335874;WS=124335856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr10	124338476	rs1985796	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.259;SC=AAGATCATTAGGAATCATTAG;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=124338484;WS=124338466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	124389296	rs3013177	C	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=337;ReadPosRankSum=-0.753;SC=ACAGATGATTCCTTGTCACAA;SOR=0.201;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=17;WE=124389304;WS=124389286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr10	124399467	rs2261655	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	124399985	rs2261660	G	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=486;ReadPosRankSum=0.311;SC=GTCTTTATGCGATGGCCTTAA;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=29;WE=124399993;WS=124399975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,34:0.34:100
chr10	124402677	rs1052715	A	G	3206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=56;PP=1974;ReadPosRankSum=-1.768;SC=ACTCCTCGCCATCTCTTCGCA;SOR=0.870;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=299;TCF=170;TCR=129;TR=139;WE=124402685;WS=124402667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,156:0.46:337
chr10	124457452	rs2947594	C	T	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1266;ReadPosRankSum=-1.929;SC=GGTTTCTTTGCGGGGAGGAAT;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=73;WE=124457460;WS=124457442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr10	124457906	rs2901343	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GTTTGTAGTCCGGAGACAGCA;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=70;WE=124457914;WS=124457896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,84:0.45:188
chr10	124459139	rs11813597	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=0.346;SC=ACCGCAACGGTGAAGCAGAAC;SOR=1.467;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=22;WE=124459147;WS=124459129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
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chr10	124654345	rs35248586	CT	C	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=173;ReadPosRankSum=0.277;SC=TGTAACTACACTTTTTTTTTT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=15;WE=124654353;WS=124654335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	124711589	rs147647614	CTTTTAA	C	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.319;NF=0;NR=5;PP=188;ReadPosRankSum=-1.611;SC=TATATTGTCACTTTTAATAGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=124711602;WS=124711579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	124742586	rs3736585	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.999;SC=ACTTATTCACGTATCAAAAAC;SOR=2.165;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=11;WE=124742594;WS=124742576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr10	124742683	rs3736584	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=123;ReadPosRankSum=0.586;SC=GTATTGCAAACGGAGTTTTTC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=8;WE=124742691;WS=124742673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	124742792	rs3736583	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=412;ReadPosRankSum=0.233;SC=TTTCAGATTCGTTGGGCTTTT;SOR=0.688;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=24;WE=124742800;WS=124742782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr10	124742858	rs45498396	G	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=498;ReadPosRankSum=-2.492;SC=ATGGCCAGAGGCCACAGGCAC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=35;WE=124742866;WS=124742848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr10	124742895	rs3736582	G	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CCACCTGATGGGAAGAAAGCT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=28;WE=124742903;WS=124742885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr10	124746801	rs7096614	T	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=684;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TGAAGAAAATTTAAGTAAGGT;SOR=0.116;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=89;TCF=67;TCR=22;TR=48;WE=124746809;WS=124746791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr10	124768614	rs117921026	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=678;ReadPosRankSum=0.894;SC=CTGGCGTCCTGGGGGCCCAGG;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=45;WE=124768630;WS=124768604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr10	124787047	rs10794584	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=1.418;SC=CTGCTGCTGCTATGTAAGAAG;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=12;WE=124787055;WS=124787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr10	124787118	rs10902863	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr10	124812487	rs2421166	A	G	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=6;PP=1160;SC=CACTAACAGTAAATCCATGTT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=124812495;WS=124812477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	124812685	rs11307362	AT	A	2877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=5;NR=72;PP=1211;SC=TGGTAAATAGATTTTTTTTTT;SOR=1.813;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=95;TCF=7;TCR=88;TR=77;WE=124812693;WS=124812675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	124924484	rs34736387	CT	C	464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.786;HP=12;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=145;ReadPosRankSum=0.286;SC=AGAGAAGGGTCTTTTTTTTTT;SOR=0.223;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=14;WE=124924492;WS=124924474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr10	125426412	rs12263344	A	G	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=36;PP=2454;SC=GCCGGCGGCCAGACGAGCGCC;SOR=1.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=85;TCR=37;TR=120;WE=125426420;WS=125426402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	125426565	rs4980313	G	C	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=92;PP=2499;SC=TGCAGACGCTGGTGCTGCTGG;SOR=1.482;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=46;TCR=92;TR=138;WE=125426573;WS=125426555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr10	125426627	rs3808964	G	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=47;PP=1406;SC=GGGAACAGCCGCGCGGGATCT;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=125426635;WS=125426617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	125472769	rs117076882	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=523;ReadPosRankSum=1.884;SC=GGGGTTAGTTCCCTTCTTCTT;SOR=1.062;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=38;WE=125472777;WS=125472759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr10	125473208	rs12256385	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	125506302	rs7088479	T	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=15;PP=1499;SC=TCGTCTCTTCTGCCCCCGCAG;SOR=2.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=125506310;WS=125506292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	125521533	rs10794566	G	A	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=77;NR=66;PP=2570;SC=ACACGTGGTCGTCGGGGGTGG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=143;WE=125521541;WS=125521523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	125521590	rs10794567	G	A	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=72;PP=2654;SC=GGTCGTAGGGGTACGCCACCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=143;WE=125521598;WS=125521580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	125521721	rs10751743	G	A	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=42;PP=1251;SC=AAAATAAGCAGGAAGTCATTT;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=125521729;WS=125521711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	125521751	rs10794568	C	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=27;PP=815;SC=AGCTGTCAAACAGGGACATAG;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=125521759;WS=125521741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	125526689	rs1896392	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=428;SC=GTGAGAGTGTGAAGAATGCAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=125526697;WS=125526679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	125602021	rs10794571	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=274;ReadPosRankSum=-1.089;SC=AGAAAGAAAGCGGTGTTCTTC;SOR=0.481;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=27;WE=125602029;WS=125602011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr10	125602943	rs6599625	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr10	125622250	rs11299200	CA	C	2218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=46;PP=1854;ReadPosRankSum=-1.583;SC=CTGGAAAGGACAAATGCTTGT;SOR=0.910;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=143;TCF=32;TCR=111;TR=57;WE=125622258;WS=125622240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,80:0.40:199
chr10	125673492	rs7893288	A	G	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=46;PP=1863;SC=AGTGAGCACCAGAGTCAGGCC;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=125673500;WS=125673482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	125673547	rs4329614	T	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=54;PP=1954;SC=AATCCAACCTTAAAGGCAGGA;SOR=1.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=93;WE=125673555;WS=125673537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	125780751	.	AC	A	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=59.91;NF=1;NR=4;PP=63;QD=17.6;SC=CTCGGGGGGTACGGGGGGGGG;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=5;WE=125780760;WS=125780741;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr10	125780886	rs139630938	G	A	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=853;ReadPosRankSum=1.000;SC=AGTCGTCCGCGGATTTATTCG;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=56;WE=125780894;WS=125780876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,77:0.45:172
chr10	126086730	rs2459217	G	A	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=825;SC=ATCCCTTGCCGTATGTATGGG;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=126086738;WS=126086720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	126089656	rs2459215	T	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=529;SC=CTAGATAAAATACCAGAGGAA;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=126089664;WS=126089646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	126089703	rs2491158	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=283;SC=GCCTGTATTAGTTTCTAATTA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=126089711;WS=126089693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	126090430	rs17619406	A	G	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=1572;ReadPosRankSum=1.207;SC=TCAATTCACCATGTCATTTCT;SOR=0.734;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=238;TCF=111;TCR=127;TR=112;WE=126090438;WS=126090420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,141:0.47:302
chr10	126090465	rs17681531	T	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=52;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.618;SC=CTACTAAGCATCCTTTTCCCC;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=65;TCR=112;TR=82;WE=126090473;WS=126090455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,97:0.45:216
chr10	126090562	rs2491159	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=192;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GCAATTCTCCTGCCTCAGCCT;SOR=1.096;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=14;WE=126090570;WS=126090552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr10	126091814	rs2240882	A	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=6.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=585;ReadPosRankSum=1.111;SC=CTCACCAACTATTTCCTTTGT;SOR=0.239;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=26;WE=126091822;WS=126091804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr10	126093991	rs9422807	T	C	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=15;PP=995;SC=AGCACTATGATGCTAGTGAAA;SOR=1.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=126093999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	126097716	rs7923012	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=-1.299;SC=GAATTACTAAGAATTGTATTT;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=126097724;WS=126097706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	126100523	rs10794058	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=754;ReadPosRankSum=0.935;SC=GGGAAAAGACGGATTAATTTG;SOR=0.808;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=47;WE=126100531;WS=126100513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr10	126150338	rs2459213	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	126150388	rs2491156	C	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=198;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GCGCCGGCGCCGGCGTCGGTT;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=15;WE=126150396;WS=126150378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr10	126172863	rs6597801	A	G	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1647;ReadPosRankSum=1.387;SC=CTGAAGGAGCAAGGCCTGCGA;SOR=1.192;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=72;WE=126172871;WS=126172852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr10	126185451	rs10794134	T	C	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=755;SC=ACAGGCCCGGTGCTCAGCTCC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=126185459;WS=126185441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	126185618	rs3824810	A	G	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=64;PP=2392;SC=TCTGTCCCAAACTCTCTTCAG;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=126185626;WS=126185608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	126185707	rs3824809	C	T	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=48;PP=1491;SC=GCCTTTTGGGCTTCCACAAAG;SOR=1.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=126185715;WS=126185697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	126186771	rs17620824	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=641;ReadPosRankSum=0.187;SC=GGAATGGATTACAGGACTCAG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=32;WE=126186779;WS=126186761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr10	126394993	rs3781447	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.092;SC=ACCAGATGACCTCAAATCTGA;SOR=0.646;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=7;WE=126395001;WS=126394990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	126395123	rs7897256	T	C	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=41;PP=2309;SC=TTTGCTAAGCTTAGGTGCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=109;WE=126395131;WS=126395113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	126480276	rs74866494	C	T	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=547;ReadPosRankSum=-0.365;SC=TCCTCCCCTGCCCAGCGTCAC;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=43;WE=126480284;WS=126480266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,53:0.55:97
chr10	126480556	rs10901821	T	C	140.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CGACGCCCTCTGCTCTACCCC;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=126480564;WS=126480546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	126490581	rs146309339	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=461;ReadPosRankSum=-1.771;SC=GGCACCAGGGCCGGCCGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=22;WE=126490589;WS=126490571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
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chr10	126517989	rs2303611	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.883;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1226;ReadPosRankSum=0.568;SC=AGGATGGAGTGATGAAAGACA;SOR=0.476;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=181;TCF=72;TCR=109;TR=85;WE=126517997;WS=126517979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,107:0.49:218
chr10	126519851	rs140065578	G	T	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=679;ReadPosRankSum=0.883;SC=GTTGTAATCAGCGCTGAATTT;SOR=0.897;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=50;WE=126519859;WS=126519841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,61:0.39:158
chr10	126629204	rs7074163	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=517;SC=CACTATAAATGGTGTATGGAC;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=126629212;WS=126629194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	126660781	rs3802700	A	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=465;SC=GAAAGCACATAACATAGCTAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=126660789;WS=126660771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	126662451	rs3740534	C	T	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=TTCACTGTTACAGAGTGAACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=126662459;WS=126662441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	126686827	rs1982225	T	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=40;PP=1128;SC=CTCCTGAGACTCGGTTGTTGG;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=126686835;WS=126686817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	126714714	rs2946994	G	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=642;ReadPosRankSum=-1.613;SC=GCCACCTTCTGGTACGGTGAG;SOR=0.538;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=42;WE=126714722;WS=126714704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr10	126714966	rs3012075	A	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=645;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TGCAGGGGGTACGTGGGGCTC;SOR=0.279;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=44;WE=126714974;WS=126714956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr10	126715154	rs3781412	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=438;ReadPosRankSum=0.225;SC=TGCTGTCTGCAGAGGAGCCGC;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=30;WE=126715162;WS=126715144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr10	126715629	rs3781409	C	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;PP=886;ReadPosRankSum=1.448;SC=CTGGGGTCCACAACCAGGCAC;SOR=1.451;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=50;WE=126715637;WS=126715619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr10	126716346	rs2938006	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=536;ReadPosRankSum=2.119;SC=AAAATGACTGCGGATGAGGCA;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=43;WE=126716354;WS=126716336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr10	126721441	rs2839737	C	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=688;ReadPosRankSum=-1.305;SC=AAAGCCCAAACAGCCCCATTT;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=43;WE=126721449;WS=126721431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr10	126727353	rs2289431	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=0.349;SC=CCTCCTAGTCCCCAACCCCGC;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=126727361;WS=126727343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	127265374	rs11244568	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=439;ReadPosRankSum=0.031;SC=ATGGACTGGGTCCTCACCGGC;SOR=0.442;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=34;WE=127265382;WS=127265364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr10	127426430	rs3740181	A	G	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=16;PP=2035;SC=AACAAAAACAATATGTTGACC;SOR=2.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=69;TCR=16;TR=85;WE=127426438;WS=127426420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	127426588	rs3740180	C	A	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=73;PP=2325;SC=TCACTTTTTTCGTAAAGTTTG;SOR=1.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=101;WE=127426596;WS=127426578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	127426835	rs3943225	G	T	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1051;SC=AAGTTAGATAGATAGTGAATG;SOR=1.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=127426843;WS=127426825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	127436411	rs2296832	T	C	6436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=83;PP=2965;SC=ATTTTTTTCTTCCCCCTCAAA;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=112;TCR=83;TR=195;WE=127436419;WS=127436401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr10	127441573	rs10751530	G	T	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=81;PP=2286;SC=TATGTGTGTGGGTATATATAC;SOR=2.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=18;TCR=81;TR=99;WE=127441581;WS=127441563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	127445408	rs4962313	G	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=681;SC=TTGAGACAAGGTCTCACTCTG;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=127445416;WS=127445398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	127455977	.	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.981;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=252;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TCCCAAAGTGCGGGATTACAG;SOR=0.180;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=13;WE=127455985;WS=127455967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr10	127460952	rs10901424	G	T	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=27;PP=875;SC=CACACCATGGGTGCTGGGTGA;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=127460960;WS=127460942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	127462525	rs10901425	A	G	6326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=105;PP=2965;SC=CTGGTCGGCCACGGACAGTTG;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=81;TCR=105;TR=186;WE=127462533;WS=127462515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr10	127462833	rs28381281	C	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=17;PP=950;SC=ACCTGCGCACCGCCTCGGCCA;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=127462841;WS=127462823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	127483573	rs3740179	G	A	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=47;PP=1559;SC=AACAAGATCAGTCCTTGCCAT;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=70;WE=127483581;WS=127483563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	127484617	rs2281955	C	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=559;SC=CCTTCACCCTCTGCTTCCCCA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=127484625;WS=127484607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	127484653	rs2281954	G	A	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=828;SC=TGCCAGAACCGCCCCCAAACG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=127484661;WS=127484643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	127491732	rs74366862	CT	C	1922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1735;SC=AGCTCTGTTCCTTATGGACAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=41;WE=127491740;WS=127491722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	127500718	rs10901444	C	G	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=5;PP=1071;SC=CTGAGTTAAACTGTTTTTTAA;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=127500726;WS=127500708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	127504660	rs2366044	A	G	3778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=36;PP=2483;SC=ATAAAATAAGAAGACAGTAAA;SOR=1.424;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=106;WE=127504668;WS=127504650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	127515069	rs10159992	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=399;SC=TTGTATTCTTCACAGATGGCA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=127515077;WS=127515059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	127520313	rs11596442	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=546;SC=AGGGGAGTGGAAGAAACATCC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=127520321;WS=127520303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	127522572	rs3740206	T	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=720;SC=TGAAAATGATTTATCAAGATT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=127522580;WS=127522562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	127524612	rs4075326	C	T	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=10;PP=1422;SC=TGCCGTAGATCAAATGGGTTT;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=127524620;WS=127524602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	127530325	rs3208565	T	C	4884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=51;PP=2965;SC=TTACCATGGCTGCGATTGTTA;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=109;TCR=51;TR=160;WE=127530333;WS=127530315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	127548587	rs1539315	C	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=297;SC=CTTATGCTAACTCATGCAAAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=127548595;WS=127548577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	127584978	rs5006357	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.588;NF=34;NR=5;PP=801;ReadPosRankSum=0.906;SC=GGGCTTCAGGAGCAGTGTCCT;SOR=0.282;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=39;WE=127584991;WS=127584968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr10	127585015	rs79042596	G	T	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.724;NF=27;NR=8;PP=584;ReadPosRankSum=2.097;SC=CGCTACCCTCGCTCAGTGTCC;SOR=1.319;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=35;WE=127585023;WS=127585005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr10	127585035	rs113524015	C	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-6.612;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,41:0.32:129
chr10	127585040	rs5006358	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=5.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQRankSum=-7.426;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,52:0.39:135
chr10	127585090	rs74635147	C	A	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQRankSum=-12.810;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,57:0.33:175
chr10	127585097	rs78188902	T	C	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQRankSum=-12.903;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.453;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr10	127585099	rs79920605	A	G	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQRankSum=-12.878;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,55:0.32:172
chr10	127585112	rs72832617	T	C	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQRankSum=-11.856;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.463;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,64:0.36:178
chr10	127585120	rs80288044	G	C	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-11.512;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.586;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,68:0.38:180
chr10	127585150	rs74162870	C	A	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.684;NF=58;NR=46;PP=1648;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GCGACGCCGGCCCTGGCTGAG;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=104;WE=127585158;WS=127585140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,97:0.49:199
chr10	127585179	rs74162871	G	C	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=4;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.102;NF=57;NR=61;PP=1755;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GGAGTCCGGGGGTTCGCCCGC;SOR=0.646;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=183;TCF=83;TCR=100;TR=118;WE=127585187;WS=127585169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,111:0.58:192
chr10	127585237	rs5013589	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-4.355;QD=0.98;ReadPosRankSum=2.919;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,27:0.15:176
chr10	127585240	rs5013161	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-3.652;QD=2.27;ReadPosRankSum=2.143;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,27:0.16:174
chr10	127585263	rs5013162	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-2.539;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.133;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,23:0.16:144
chr10	127585273	rs5013163	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-1.948;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,22:0.18:120
chr10	127585288	rs5013590	C	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.345;NF=11;NR=21;PP=419;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TCCCCGGGAACGAGTGTGGGC;SOR=0.258;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=106;TCF=26;TCR=80;TR=32;WE=127585324;WS=127585278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr10	127585304	rs5013164	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.553;QD=0.81;ReadPosRankSum=-2.299;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,12:0.15:80
chr10	127585307	rs74579856	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=0.610;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=1.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,14:0.18:78
chr10	127668317	rs11244744	G	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=20;PP=1950;SC=TACAGCATAGGTGTCAACCCT;SOR=2.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=84;WE=127668325;WS=127668307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	127668431	rs11244745	A	G	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=105;PP=2965;SC=AGCAGGTCAAATACAACCTTA;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=99;TCR=105;TR=204;WE=127668439;WS=127668421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr10	127668487	rs2176097	G	A	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=93;PP=2965;SC=CAGTGGGGGTGGTATGATATT;SOR=1.357;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=48;TCR=93;TR=141;WE=127668495;WS=127668477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	127668610	rs2138275	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=14;PP=860;SC=GAGGTATGCTCATATGTGTGC;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=127668618;WS=127668600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	127677374	rs2280173	A	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=608;SC=AAACACTGCAATAATATTTGC;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=127677382;WS=127677364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	127685091	rs3736477	T	C	6857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=107;PP=2965;SC=ACTGAGCATGTTTATCTCTTT;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=106;TCR=107;TR=213;WE=127685099;WS=127685081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr10	127685876	rs61863577	A	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=0.655;SC=GGTGCAGAAGAAACTGTTGAA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=127685884;WS=127685875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr10	127693432	rs2138283	C	T	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=39;PP=1491;SC=TGTCAAATGCCGCTTCTTCCA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=127693440;WS=127693422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	127693630	.	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=0.916;SC=TACGGGACCTGCCTTGTTAAC;SOR=0.627;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=127693638;WS=127693620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr10	127697165	rs2292690	T	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=559;SC=GTGGAATTAATGTCAGAGCTT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=127697173;WS=127697155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	127706028	rs3781001	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=300;SC=TGTCAGATACCACTGCCCCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=127706036;WS=127706018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	127708091	rs2176099	AG	GT	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=768;SC=ATAAGCTCACAGGGACTGCTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=127708100;WS=127708088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	127708186	rs190745232	G	A	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=825;ReadPosRankSum=-1.805;SC=CTGCACCCCTGTCCTGGCTTG;SOR=0.698;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=55;WE=127708194;WS=127708176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr10	127708428	rs2138280	A	T	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=36;PP=1103;SC=AGGGTCACTTACCAGGAGCCA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=127708436;WS=127708418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	127708468	rs35835884	G	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=662;SC=AGGGCCTGCCGCTTGGCACAG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=127708476;WS=127708458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	127708503	rs2292694	G	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=398;SC=ATATCATCCTGTCACCATACA;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=127708511;WS=127708493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	127753359	rs56076315	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=277;ReadPosRankSum=1.075;SC=ATGCCGAGCTTGTGGCGGCCA;SOR=1.061;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=13;WE=127753367;WS=127753349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr10	127755544	rs1278280	T	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=228;ReadPosRankSum=0.861;SC=AGCTTCTGCTTTTTATGAACC;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=18;WE=127755552;WS=127755534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr10	127786969	rs2290842	A	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=506;ReadPosRankSum=1.821;SC=ACCAGCTCCCAATGCCCTTGG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=33;WE=127786977;WS=127786959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr10	127829012	rs1551678	C	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=1.121;SC=CAACAACTCACTTGAAGTATT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=127829020;WS=127829002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr10	127829043	rs71490760	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GAGGAGGGGGGTGGATTTCAG;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=16;WE=127829051;WS=127829033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr10	127829304	rs17154306	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GTCTCATTAAGTGTTTAAACA;SOR=0.074;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=127829312;WS=127829294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	127829322	rs12247230	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.484;SC=ACAAATGTGATTGAGTTTTTA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=127829330;WS=127829312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	127843641	rs1466358	T	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	127843641	.	TAGAAC	CAGAAC,CAGAAT	116	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12,6;NR=1,1;PP=116,69;QD=11.5977855806;SC=GGATTTATAATAGAACGCCTA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13,7;WE=127843654;WS=127843631;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:13
chr10	127843646	rs56196479	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	127843740	rs1466359	G	T	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=37;PP=2474;SC=GGCTACAAAGGTTAAGCACAG;SOR=1.530;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=120;WE=127843748;WS=127843730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	127843756	rs1466360	G	A	5121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=55;PP=2965;SC=CACAGATCCAGTGGTGTAAGA;SOR=1.228;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=96;TCR=55;TR=151;WE=127843764;WS=127843746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	127843921	rs1466361	T	C	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=65;PP=1979;SC=CAGAATTGCATTGATACATTG;SOR=1.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=93;WE=127843929;WS=127843911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	128019025	rs3740199	C	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=1502;SC=TCCCCACTCCCAACAGAGGCA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=128019033;WS=128019015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	128153623	rs7079392	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.556;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GACTTCTACCGCACATGGTGC;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=18;WE=128153631;WS=128153613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr10	128191222	rs61863954	A	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=496;ReadPosRankSum=0.827;SC=ACCATGACACATGGTTTAAAA;SOR=0.603;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=36;WE=128191230;WS=128191212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr10	128191368	rs10510159	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=472;ReadPosRankSum=-2.795;SC=CTTTGGAACATTGATAGCTGC;SOR=0.754;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=31;WE=128191376;WS=128191358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr10	128202308	.	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-0.508;SC=ATTAATTCAATTTTGACTAAA;SOR=0.126;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=128202316;WS=128202298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr10	128202435	rs1436803	T	C	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=44;PP=1609;SC=AGTCAGATTTTGCCTCTGTGA;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=128202443;WS=128202425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr10	128209769	rs2099552	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=14;PP=703;SC=TGGGGCCTCATACAGTACTGG;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=128209777;WS=128209759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	128209797	rs2099553	C	T	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=24;PP=904;SC=AGATACTCAGCGTGGACAGAA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=128209805;WS=128209787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	128209959	rs4962342	G	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=757;SC=TGTATTTGGCGACATGAAAGA;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=128209967;WS=128209949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	128335225	rs2842149	T	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=477;ReadPosRankSum=-0.311;SC=CAAACAGAAATATTTCCCAAT;SOR=0.592;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=27;WE=128335233;WS=128335215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr10	128788633	rs3750560	C	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=522;ReadPosRankSum=0.980;SC=ATACCTCATGCGTATTTGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=26;WE=128788641;WS=128788623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr10	128806888	rs9418761	G	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=10.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr10	128810642	rs9418773	C	T	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GGGCAGGGTACGTATTTTCCT;SOR=0.577;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=88;WE=128810650;WS=128810632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,107:0.47:226
chr10	128810669	rs9418691	C	T	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=922;ReadPosRankSum=0.748;SC=TTTCTATCAGCGTGTATTTGC;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=67;WE=128810677;WS=128810659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr10	128822842	rs9418706	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.354;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	128830592	rs9418802	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=1.218;SC=ACGGTGCGTTCGAGAGGAGAA;SOR=0.086;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=18;WE=128830600;WS=128830582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr10	128840842	rs880272	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=504;ReadPosRankSum=0.625;SC=TGTGTGGGGGAAGTCCGGTGG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=28;WE=128840850;WS=128840832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr10	128850841	rs9418817	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.042;NF=17;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=0.539;SC=TACTGATAGATGGAAACCAAA;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=17;WE=128850849;WS=128850831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr10	128859743	rs4751523	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=-0.264;SC=TGTGGAGGCACGCTGCCTTGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=128859751;WS=128859733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr10	128923954	rs1186355	A	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=63;PP=1638;SC=TAAAAATGAAAGGTCTTGATT;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=93;WE=128923962;WS=128923932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	128925761	rs1153016	A	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=4;PP=1113;SC=ATTAATAAAAACCCCTGAGTT;SOR=3.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=46;WE=128925769;WS=128925751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	128926013	rs1060561	A	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=57;PP=2117;SC=CCATGGGACGAGATTCTGAAC;SOR=1.440;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=84;WE=128926021;WS=128926002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	128952265	rs7068954	A	G	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=75;PP=2606;SC=CCTCAAATCAAATGCCTTCCC;SOR=1.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=111;WE=128952273;WS=128952255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	128974621	rs2489386	C	T	6640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=90;PP=2965;SC=CACTCTCCGACGTTGTGAGTA;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=193;WE=128974629;WS=128974611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr10	128974713	rs2489385	C	T	6974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.32;SOR=1.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr10	128974716	rs2489384	A	G	6867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=1.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr10	129046407	rs3740013	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=656;ReadPosRankSum=0.586;SC=CACATAACCATGTTTTAGGGC;SOR=0.636;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=59;WE=129046415;WS=129046397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr10	129160313	rs2296636	C	T	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=33;PP=2109;SC=GAATATTGTACCTCTTTTTTC;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=100;WE=129160321;WS=129160303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	129160458	rs2296635	G	A	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=67;PP=2175;SC=AATTCCATTCGACCCGAAGCT;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=103;WE=129160466;WS=129160448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	129179426	rs7099958	T	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=604;SC=TTATGAACATTGTAAAAAGGA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=129179434;WS=129179416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	129183015	rs878562	T	G	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=3;PP=1157;SC=CCCTGGGTGTTTCCGCCTCGG;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=129183023;WS=129183005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr10	129208954	rs11017943	T	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=557;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TTTCCCTGGCTGGGAGAGGAC;SOR=0.908;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=36;WE=129208962;WS=129208944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr10	129209084	rs2296628	A	G	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1427;ReadPosRankSum=0.192;SC=ATATCTAATGATCTGTCTGTC;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=85;WE=129209092;WS=129209074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,97:0.52:188
chr10	129213631	rs3736939	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=-1.032;SC=TACAGTTCCCATAACCACCCC;SOR=0.811;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=23;WE=129213639;WS=129213621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
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chr10	129245684	rs869801	G	A	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=53;PP=2384;SC=CATGACGGGGGCGGACGTGGC;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=120;WE=129245692;WS=129245674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	129249662	rs2229603	G	A	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=18;PP=1147;SC=TCGCAAGCAGGCATCGGTGGA;SOR=1.318;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=129249684;WS=129249652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	129249676	rs2229604	C	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=23;PP=1497;SC=CGGTGGACTCCGGGATCGTGC;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=129249684;WS=129249652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	129249693	rs2229605	G	A	4038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=1.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	129249701	rs2229606	C	G	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.20;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	129249914	rs3824814	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=18;PP=651;SC=CGGGATGTGCTATCGTAGTTA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=129249933;WS=129249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	129249925	rs10765104	T	C	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=586;SC=ATCGTAGTTATCAGAGTTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=129249933;WS=129249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	129350641	rs4080381	C	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TATCGCCATACGATTTTGAAA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=11;WE=129350649;WS=129350640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr10	129534475	.	C	CGCGG	70.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	129534476	.	CCA	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	129534478	rs147236104	A	AGCGCGGC	163.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.611;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	129534679	rs4751501	T	C	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=45;PP=2645;SC=AGCTTGGCGCTCTCCGCTCTG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=128;WE=129534687;WS=129534669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	129534722	rs79103670	C	T	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=6;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=37;PP=1475;ReadPosRankSum=0.286;SC=AGAAACCTGGCGGGGCCCCGG;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=97;WE=129534730;WS=129534712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,107:0.52:204
chr10	129534739	rs4751502	C	G	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1369;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCGGACTCCCCGGCTTGGGAA;SOR=0.627;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=95;WE=129534747;WS=129534729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,104:0.46:227
chr10	129534864	rs4751503	A	C	6902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=119;PP=2965;SC=GGGTTGAGGGAGCGAGGACTC;SOR=0.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=102;TCR=119;TR=221;WE=129534872;WS=129534854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr10	129535455	rs77244569	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=1.358;SC=GGTCGCACCCGGGCGCTGCTG;SOR=0.093;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=129535463;WS=129535445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	129536642	rs7085541	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr10	129536648	rs7085544	G	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr10	129682249	rs10765177	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=724;ReadPosRankSum=1.707;SC=TTGTTGGATGTCAGTTAGAGA;SOR=1.729;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=33;WE=129682257;WS=129682239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr10	129780512	.	CT	C	1451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=39;PP=657;ReadPosRankSum=3.135;SC=AGAAAACTGACTTTTTTTTTC;SOR=0.879;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=47;WE=129780520;WS=129780502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr10	129834422	rs10764738	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=0.442;SC=TGCCCTCCCCCGAGCCCAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=5;WE=129834430;WS=129834412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	129854369	rs4424589	T	C	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=38;PP=1702;SC=TTCATACTAATGCTACATTTT;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=95;WE=129854377;WS=129854359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	129859061	rs28411949	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.06;SOR=4.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	129859065	rs11016046	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.22;SOR=4.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	129859992	rs4462251	T	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=28;PP=1393;SC=AAGCTTTTTATTAATTTCTCA;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=129860000;WS=129859982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	129864515	rs10764743	C	T	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=68;PP=2280;SC=AGCATCATGCCCAGAGTTAAC;SOR=1.135;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=112;WE=129864523;WS=129864505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
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chr10	129871747	rs2275802	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.083;NF=1;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TGAGGAGTGCCGCCCAGCCCG;SOR=1.911;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=129871755;WS=129871737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr10	129871766	rs3216057	A	AG	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.420;NF=1;NR=5;PP=139;ReadPosRankSum=0.271;SC=CGGTCCCTCCAGGGCAGCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=129871774;WS=129871756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	129880911	rs72848780	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr10	129883370	rs1129205	A	G	6995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=110;PP=2965;SC=CCAGGACGCAAGACTCTCCCC;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=100;TCR=110;TR=210;WE=129883378;WS=129883360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr10	129897565	rs3781301	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=430;ReadPosRankSum=-1.184;SC=ATTTAAACACCCATTTTTAGA;SOR=1.054;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=25;WE=129897573;WS=129897555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr10	129899543	rs10082504	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=251;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TTTCTGCACACCTCTTGACAC;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=22;WE=129899551;WS=129899533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr10	129899578	rs8473	T	C	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=30;PP=1425;SC=TGCACAGATTTGCTCTCCAAA;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=78;WE=129899586;WS=129899568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	129899778	rs11106	G	C	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=63;PP=2735;SC=TTTGTTCTCAGTGACTTTGTC;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=123;WE=129899786;WS=129899768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr10	129900858	rs3191122	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=778;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TTTCAGGGACCGAGTCTTGTA;SOR=1.378;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=53;WE=129900866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,57:0.42:135
chr10	129901393	rs11016071	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=773;ReadPosRankSum=-1.559;SC=TGCTCTTGGCTGTCTCCTGCT;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=60;WE=129901401;WS=129901383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr10	129901501	rs2071496	G	C	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1763;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GGTGTGCGTGGTCTCCCCTGA;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=102;WE=129901509;WS=129901491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,116:0.56:207
chr10	129901722	rs10082432	G	A	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.365;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr10	129901726	rs10082533	C	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr10	129901747	rs10764749	C	T	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1446;ReadPosRankSum=0.174;SC=TGCTCTTGGCCGTCTCCTGCT;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=86;WE=129901755;WS=129901737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,91:0.59:155
chr10	129901825	rs10082391	T	C	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1730;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GATGCCTTTATCTTCACCTGC;SOR=0.792;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=235;TCF=132;TCR=103;TR=108;WE=129901833;WS=129901815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,134:0.47:287
chr10	129901946	rs1050767	T	G	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TGCCTCTTTGTGCTTGCTGTG;SOR=0.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=78;TCR=105;TR=89;WE=129901954;WS=129901936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr10	129902158	rs12777740	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1407;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CTTCTTTGCACGTTGCTTCAA;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=93;WE=129902166;WS=129902148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,102:0.41:250
chr10	129902281	rs1063535	G	A	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=112;PP=2965;SC=TTCTTTCCTGGGACGTGTCTT;SOR=0.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=86;TCR=112;TR=198;WE=129902289;WS=129902271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	129903016	rs7071768	T	C	9164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=152;PP=2965;SC=TTTCCTGAGGTTTCTCTTGGG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=115;TCR=152;TR=267;WE=129903024;WS=129903006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr10	129903465	rs2857028	A	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1168;ReadPosRankSum=1.134;SC=TAGTTTTCTCATGAGTCGTGG;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=72;WE=129903473;WS=129903455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr10	129904474	rs61738284	G	A	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr10	129904477	rs11591817	C	T	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,65:0.42:153
chr10	129905429	rs7918199	C	T	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1371;ReadPosRankSum=1.934;SC=AGTTTCTGCACTGGAGTTCCC;SOR=0.681;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=198;TCF=104;TCR=94;TR=91;WE=129905437;WS=129905419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,110:0.48:227
chr10	129905896	rs3740423	T	A	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GGCTGAGAGCTCCTTCTGTAC;SOR=0.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=113;WE=129905904;WS=129905886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,126:0.61:205
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chr10	129907741	rs2065718	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=553;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CATGTCAATCGAGTATTACAG;SOR=1.096;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=31;WE=129907749;WS=129907731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr10	129910475	rs997983	T	G	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1789;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CTTCGGCTGATAGACACTCTC;SOR=0.560;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=240;TCF=113;TCR=127;TR=98;WE=129910483;WS=129910465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,112:0.39:285
chr10	129911856	rs11016076	C	G	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=-2.979;SC=AAGGTATTCCCTCACTCTCAT;SOR=0.333;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=23;WE=129911864;WS=129911846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr10	129911919	rs12255393	T	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=0.395;SC=ATACCAAGACTAGTGATTTAT;SOR=0.139;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=18;WE=129911927;WS=129911909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr10	129913960	rs7095325	A	T	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=51;PP=2501;SC=TAAAGCTTCCAAAAGGGAGAT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=99;WE=129913968;WS=129913950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	129917560	rs2071498	T	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CTTCCTTCCATTCTGAAGACT;SOR=0.817;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=35;WE=129917568;WS=129917550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr10	129917670	rs41282878	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-1.235;SC=TCCAAGGATCAACGAACAAAC;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=16;WE=129917678;WS=129917660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr10	129921195	rs1063536	A	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=336;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TTAGCCGTACAGGCTCATCAA;SOR=0.641;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=26;WE=129921203;WS=129921185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr10	131265665	rs16906255	T	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=52;PP=1546;SC=CCGTCGGGTGTGGGGCCGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=74;WE=131265673;WS=131265655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	131334789	rs10734087	T	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=335;SC=CTCAAAACAGTGTGCTGCGAC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=131334797;WS=131334779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	131641361	rs35210769	T	TG	1854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=1159;SC=GGTTCTGGCATGGGGGGGAGG;SOR=2.457;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=40;WE=131641369;WS=131641351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	131665885	rs12572694	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=0.711;SC=GGGGTGTTCCGTAGCCACCCA;SOR=0.412;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=131665893;WS=131665875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	131671617	rs146060228	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.407;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GACCAAGGGCGGGGGCCTGGT;SOR=0.172;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=17;WE=131671625;WS=131671607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr10	131760352	rs573370	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=377;ReadPosRankSum=0.248;SC=CACGAGATCCATTTGTCAGTG;SOR=0.593;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=25;WE=131760360;WS=131760342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr10	131906096	rs55975328	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1152;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CTGTCACTTCCGAGGGAACAG;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=76;WE=131906104;WS=131906086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
chr10	132760953	rs11017616	G	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=1.537;SC=GGAGGATTCCGTGGGTGGCCC;SOR=2.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=10;WE=132760961;WS=132760943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr10	132915345	rs145821313	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.397;SC=GGTCTCCCTCGCAAAGATGGC;SOR=0.375;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=11;WE=132915353;WS=132915335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	132961555	rs11416735	C	CA	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=393;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GAGGAATAAACAAATCTCCTG;SOR=0.582;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=13;WE=132961563;WS=132961545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr10	133107496	rs61732111	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=518;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TGTGGGAAGACGGGCACCAGC;SOR=0.589;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=38;WE=133107504;WS=133107486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr10	133109961	rs4993310	G	A	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.69;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=49;SC=TGGGCCGGCGGCGGCGCGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=133109969;WS=133109951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	133607937	rs4897782	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	133607947	rs4897740	T	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr10	133608210	rs4897741	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=803;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GGCCCAGGGCACAGGCTGCAT;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=55;WE=133608218;WS=133608200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,63:0.46:136
chr10	133608237	rs4897783	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=767;ReadPosRankSum=2.238;SC=AGGCCCCTCCGCAGAGAGGCG;SOR=0.460;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=52;WE=133608245;WS=133608219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr10	133608291	rs4897742	TT	GG	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=1690;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CTGGCTGGGCTTCTGCACAGT;SOR=0.853;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=42;WE=133608300;WS=133608281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr10	133608495	rs4897744	A	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=0.588;SC=GGTGGCCACGACTTTGAGGAC;SOR=0.874;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=133608503;WS=133608485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr10	133754334	rs10870270	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=335;ReadPosRankSum=0.474;SC=CCTGAAAGTCGTTTGCACTCA;SOR=1.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=17;WE=133754342;WS=133754324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr10	133769482	rs7894	G	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=866;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GCGAACGTGAGGACCAAGTCT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=61;WE=133769490;WS=133769472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,75:0.58:130
chr10	133769568	rs11146336	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=587;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GAACAGTGACGCACCTGCTAC;SOR=1.795;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=31;WE=133769576;WS=133769558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr10	133918420	rs11146177	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=0.413;SC=CAGACATCCAGATCGAGCTGC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=40;WE=133918428;WS=133918410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
chr10	133918466	rs10870253	T	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=0.479;SC=TCCCCAGACCTCCACCCTTGA;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=30;WE=133918474;WS=133918456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr10	133931090	rs147938166	GGCAGGGGCGGGCGTGGGCGAGGGTGCAGGGGCGGGCGTGGGCGAGGGT	G	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	133948439	rs11146206	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.156;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=519;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GAGGTAAAGGCGCGCGTCCCA;SOR=2.325;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=28;WE=133948447;WS=133948429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr10	133948456	rs2637643	C	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=603;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CCCACGGCAGCGTTTTTGTTC;SOR=1.215;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=41;WE=133948464;WS=133948446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr10	133948634	rs2814182	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=499;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AGGACCGCAATGCATTGCTGT;SOR=1.635;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=35;WE=133948642;WS=133948624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr10	133948689	rs2637644	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=0.177;SC=GGGCTTCTGGCTCCTGGGGGT;SOR=1.449;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=12;WE=133948697;WS=133948679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	133951501	rs57086821	CA	C	836.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=614;ReadPosRankSum=0.644;SC=GGTGTGGGGACAAGCCAGCCC;SOR=1.460;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=18;WE=133951509;WS=133951491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr10	133954011	rs2818387	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=913;ReadPosRankSum=0.279;SC=TGGAATCCGACGGCTCCTCCG;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=66;WE=133954019;WS=133954001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,85:0.49:175
chr10	133954111	rs9733324	G	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=105;ReadPosRankSum=0.324;SC=CCGGGTCCTGGGCTTGGAGGA;SOR=1.668;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=12;WE=133954119;WS=133954101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr10	133955264	.	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GCCCCTCCCTGCACACTGGAG;SOR=1.508;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=12;WE=133955272;WS=133955257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr10	133955385	rs200660021	CTG	C	3719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.446;NF=36;NR=30;PP=2748;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GCTACTGACACTGTGTCTCTG;SOR=0.966;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=66;WE=133955394;WS=133955375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,100:0.49:203
chr10	133955427	rs11592585	A	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.04;MQRankSum=-0.965;NF=58;NR=43;PP=1306;ReadPosRankSum=0.538;SC=TCTCCAGGGCATGGCCAAGGA;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=130;TCR=90;TR=101;WE=133955435;WS=133955417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,122:0.49:251
chr10	133955569	rs5789117	C	CCG	3895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=55;PP=2837;SC=GTGACTTCCACCGCGCGTTCC;SOR=1.956;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=5;TCR=76;TR=59;WE=133955577;WS=133955559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	133958541	rs2637627	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1080;ReadPosRankSum=0.839;SC=TTCTGACGTCCCACGAGTGTG;SOR=0.958;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=148;TCF=87;TCR=61;TR=68;WE=133958549;WS=133958531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr10	134010224	rs1552681	C	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=425;SC=GGGACTGCTCCCAGGGCTGGC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=134010232;WS=134010214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	134021740	rs923659	G	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=847;SC=GGCTCATGGGGTAGGCCATGG;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=134021748;WS=134021730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	134038715	rs902629	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=452;ReadPosRankSum=-0.098;SC=AGCCAAGCCCAGGGGCTGCAG;SOR=0.659;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=34;WE=134038723;WS=134038705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr10	134137627	rs7914257	T	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=490;SC=CCCACTCCAATCACAGCAGCT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=134137635;WS=134137617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	134143942	rs1052281	C	T	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=93;NR=91;PP=2965;SC=GCCCGGGTGGCTGGCCTCCCC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=93;TCR=91;TR=184;WE=134143950;WS=134143932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr10	134143985	rs1132165	GC	TT	8554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=89;PP=2947;SC=TGTGCTTTCAGCTTCCTGATT;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=58;TCR=91;TR=146;WE=134143994;WS=134143975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr10	134144005	rs7085852	T	C	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1236;ReadPosRankSum=0.092;SC=TGGTAGATAGTTGGGTATGTA;SOR=0.505;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=73;WE=134144013;WS=134143995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,88:0.51:172
chr10	134145136	rs7086691	A	G	5449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	134145136	.	ACC	GCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41;NR=58;PP=2947;QD=20;SC=GGCAGCGAGGACCGCTCCAAA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=99;WE=134145146;WS=134145126;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,99:0.95:104
chr10	134145138	rs7080014	C	G	5449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	134145153	rs7100410	G	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=550;ReadPosRankSum=0.699;SC=CAAAGGTGGTGCCTCAGCAGC;SOR=0.500;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=39;WE=134145174;WS=134145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr10	134145166	rs13882	T	C	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=50;PP=2243;SC=TCAGCAGCAATTCTTTTCTGC;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=89;WE=134145174;WS=134145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	134145288	rs12778987	C	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.171;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr10	134145293	rs12784130	G	T	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=33.24;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	134145336	rs12784321	G	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=32;PP=918;SC=TCAAGGCCGCGGGCGCGGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=134145344;WS=134145326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	134145398	.	A	AC	100	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=22;MQ=61.34;NF=0;NR=6;PP=100;QD=20.5;SC=ACCCCCTGCCACCCCCGCGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=134145406;WS=134145388;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,6:0.50:12
chr10	134145420	.	AC	A	35	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9998;HP=7;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=35;QD=28.0;SC=GCGCACCACAACCCCCCCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=134145428;WS=134145410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr10	134147341	rs12416634	T	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=CTCTTTGGAATTGATGAATTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=134147349;WS=134147331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	134151034	rs2259594	A	G	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=18;PP=1969;SC=TTAGTTGGTTAACAAAACATT;SOR=2.359;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=78;WE=134151042;WS=134151024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	134151288	rs2259600	A	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1081;SC=ACTCTTGATTAAATTTTTACC;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=134151296;WS=134151278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	134157875	rs2698779	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	134161517	rs2474329	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GATGACCCTCCGTGACCTCCC;SOR=2.348;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=134161525;WS=134161507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr10	134161633	rs2474328	A	G	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=53;PP=2528;SC=GCTTTCTCCCACCTGTGGAAA;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=131;WE=134161641;WS=134161623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	134165291	rs2261222	C	G	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=63;PP=1788;SC=CCGCACAGCCCGCCCAGTGCA;SOR=4.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=70;WE=134165299;WS=134165281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	134166273	rs72479351	A	G	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=18;PP=1908;SC=TCCCTGTGGGACAGGCCGGTT;SOR=2.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=76;WE=134166281;WS=134166263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	134180353	rs45626936	C	T	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=51;PP=2797;SC=CTCCTAGAGCCGGAGATGGGA;SOR=1.273;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=87;TCR=51;TR=138;WE=134180361;WS=134180343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	134188874	rs1054038	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=328;SC=CTGATTTCGCGCAGCCTGTTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=134188882;WS=134188864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	134210943	rs188071015	T	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=188;SC=CGCCTCCGGGTTGGGGGTGGC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=134210951;WS=134210933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	134218269	rs11146363	C	T	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=39;PP=1066;SC=CCCTCCTGCCCGCGGGGTTCA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=134218277;WS=134218259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	134237240	rs1881746	T	C	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=4;PP=874;SC=GCTGTGTGTGTGTGTGTGGCT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=134237284;WS=134237230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	134237249	rs150298334	C	CTGTG	2379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.18;QD=49.58;SOR=2.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	134237276	rs1574449	T	G	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.81;QD=37.73;SOR=2.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	134237425	rs1574448	A	G	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=71;PP=2301;SC=TGCCAGCTTCAGCCTGAAGAG;SOR=1.246;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=114;WE=134237433;WS=134237415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr10	134239228	rs12775406	T	C	4730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=87;PP=2581;SC=TGTACCCACGTGTGCGCGTGC;SOR=1.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=134239236;WS=134239218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr10	134598628	rs2804003	A	G	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=76;PP=2577;SC=CGCCATCTCCACCGCGTGCCG;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=121;WE=134598636;WS=134598618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	134622408	rs2767434	T	C	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=77;PP=2518;SC=AGAAGCCTCGTCTGTGGAGAA;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=120;WE=134622416;WS=134622398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	134622507	rs2767431	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=18;PP=488;SC=CAGCTGCTCCAACTGAGGGCG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=134622515;WS=134622497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	134623959	rs2254419	T	C	6750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=119;NR=98;PP=2965;SC=GGAGACGCACTGTTTCTCCAA;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=119;TCR=98;TR=217;WE=134623967;WS=134623949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr10	134624504	rs2274429	C	T	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=69;PP=2662;SC=GGTAGGACCGCGCCAGGTCCA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=134624512;WS=134624494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	134626453	rs3750586	C	T	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=71;PP=1987;SC=CTGTACCAGACCCCACCGTGC;SOR=4.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=8;TCR=71;TR=79;WE=134626461;WS=134626443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	134627593	rs11146529	G	A	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=12;PP=1181;SC=GGGGGCAGTGGCTCCCCGCTG;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=134627601;WS=134627583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	134627882	rs7070307	G	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=497;SC=TGCCATGCCCGGGTGGGGTGA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=134627890;WS=134627872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	134691434	rs142539335	T	C	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=632;ReadPosRankSum=0.841;SC=CTTGTCCTTCTCTTTACTCCT;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=38;WE=134691442;WS=134691424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr10	134699290	.	A	AGGGAGCACTCACAGGCGGTGGG	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr10	134726108	.	C	CCT	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=18.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.021;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.071;SOR=3.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr10	134730022	rs115347200	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=489;ReadPosRankSum=1.513;SC=GGCCCCGGGCGGTGCTCAAGG;SOR=0.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=30;WE=134730030;WS=134730012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr10	134730204	rs76482478	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=908;ReadPosRankSum=-0.277;SC=ACACACATGCGGTGGGAGGGG;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=59;WE=134730212;WS=134730194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,79:0.50:158
chr10	134735672	rs7915371	A	G	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=909;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CCAGGCCTGCATTCACCAGGA;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=57;WE=134735680;WS=134735662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr10	134736076	rs4880288	T	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=718;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GCCATCTGGATCCTGTCCCGG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=45;WE=134736084;WS=134736066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr10	134736164	rs117918463	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=929;ReadPosRankSum=0.715;SC=CGTCCTCCTCGATCTGCGCCA;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=59;WE=134736172;WS=134736154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr10	134738232	rs4075501	A	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=591;ReadPosRankSum=-0.523;SC=CCGCAACGCCAGCCAGGGGCT;SOR=0.876;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=44;WE=134738240;WS=134738222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr10	134740088	rs118132336	T	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=857;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGCCGCTCGGTTGTACACTTT;SOR=0.628;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=57;WE=134740096;WS=134740078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr10	134740365	rs10781544	T	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=5.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=491;ReadPosRankSum=2.170;SC=CAACTCCTTGTCTGCCTGCGG;SOR=3.528;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=23;WE=134740373;WS=134740355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr10	134740387	rs150569360	T	C	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=676;ReadPosRankSum=1.992;SC=CCCCACCACCTGAGAGCGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=33;WE=134740395;WS=134740377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr10	134741099	rs11146048	A	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=398;ReadPosRankSum=0.435;SC=CCATGCCACTAAGGAAGCCAT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=19;WE=134741107;WS=134741089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr10	134750604	rs10870211	C	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=30;PP=887;SC=TCAAACAATTCGGTAGAGGTT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=134750612;WS=134750594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	134750648	rs111544813	A	ATTAAG	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=116;ReadPosRankSum=1.315;SC=TTTCTCATTAATTTTGTATCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=3;WE=134750656;WS=134750638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	134752007	rs60993054	TC	T	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=0.495;SC=GGAACTCCCGTCCCCCCCCCG;SOR=0.527;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9;WE=134752015;WS=134751997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	134752287	rs12247654	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=-0.308;SC=AGCAGAGAGCACGCTCAAAGC;SOR=0.984;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=26;WE=134752295;WS=134752277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr10	134754940	rs4593925	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=380;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AAAAAGCATGGACAGGAAATG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=20;WE=134754948;WS=134754930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr10	134755241	rs41306417	C	A	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.662;SC=AAGAGAACACCACCACAGAAG;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=73;WE=134755249;WS=134755231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr10	134755298	rs4880292	C	G	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=51;PP=1691;SC=GCACCACGGGCCCGCTTTCAG;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=134755306;WS=134755288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	134755852	.	T	C	92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.9990;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=92;QD=42.2570708491;SC=CGGGCTGGGATGAGAGGGTCC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=134755868;WS=134755843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr10	134755860	.	T	TC	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=50;QD=36.5;SC=GATGAGAGGGTCCGGGGCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=134755868;WS=134755843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
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chr10	134884610	rs4486541	C	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=687;ReadPosRankSum=-1.692;SC=ATGGACGTACCGGCCCATCGA;SOR=0.358;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=46;WE=134884618;WS=134884600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr10	134884755	rs11101751	C	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=419;ReadPosRankSum=-1.727;SC=GCCTCGCAGCCAGGGAGGAGA;SOR=1.457;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=23;WE=134884763;WS=134884745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr10	134885677	rs7069085	A	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=111;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GGGGAGAGTGAGGCCCAGACA;SOR=1.347;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=134885685;WS=134885667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr10	134885700	rs7094939	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=0.234;SC=ACCATGGGCCTGAGAACGTCC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=134885708;WS=134885690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	134886618	rs4838684	G	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1030;ReadPosRankSum=0.746;SC=GGAGCTGGGTGCCCAGGGCTG;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=40;TCR=93;TR=60;WE=134886626;WS=134886608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,66:0.45:147
chr10	134894004	rs144784996	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=0.848;SC=CTTGGTGGTACGGAGACAGGA;SOR=0.086;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=23;WE=134894012;WS=134893994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr10	134895530	rs34883766	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=-2.296;SC=ATCCGCTCCCCTCCCCCACTC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=14;WE=134895538;WS=134895520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr10	134898594	rs4838694	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=-0.137;SC=ACCTGCCTCCAAGGGGCAAGC;SOR=0.720;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=134898602;WS=134898584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr10	134902314	rs10745302	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=369;ReadPosRankSum=-1.564;SC=TTGACCTTCCAGAGGCCATGG;SOR=0.350;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=23;WE=134902322;WS=134902304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr10	134902396	rs10776692	C	G	4236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.41;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,107:0.59:181
chr10	134902396	.	CGC	GGT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=58;NR=33;PP=2944;QD=20;SC=CTCACGCTTCCGCAACTTTGC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=91;WE=134902406;WS=134902386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:64,91:0.59:155
chr10	134902398	rs10776693	C	T	4236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,108:0.58:186
chr10	134906343	.	G	GGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=2.521;QD=6.04;ReadPosRankSum=-2.280;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr10	134912314	rs11101916	G	A	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GGGGAACTGCGTGAGCGTCGT;SOR=0.896;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=69;WE=134912322;WS=134912304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,77:0.39:198
chr10	134915993	rs7905581	G	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=30;PP=1007;SC=AGAAGGGGAGGAAAGCTGAGC;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=134916001;WS=134915983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	134916121	rs7918862	T	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=771;SC=ATTCTTGAAGTTGCAAGCCCG;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=134916129;WS=134916111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	134942166	rs2806452	A	G	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1226;ReadPosRankSum=0.825;SC=TGGCGGTGTCACAGGGCCACT;SOR=0.789;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=83;WE=134942174;WS=134942156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,93:0.43:215
chr10	134974187	rs56406605	A	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=-3.158;SC=GGCGCCCTCCATGGCCGAGGG;SOR=1.230;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=14;WE=134974195;WS=134974177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	134981690	rs2998152	T	C	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=1186;ReadPosRankSum=0.978;SC=CAGGCCCTTCTCAGCTGGCGG;SOR=1.168;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=71;WE=134981698;WS=134981680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr10	134981837	rs2998151	T	C	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=55;PP=1219;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GTGGGGGTAATGTGCCACACC;SOR=0.905;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=73;TCR=107;TR=89;WE=134981845;WS=134981827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,102:0.50:202
chr10	134981942	rs3008303	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=526;ReadPosRankSum=0.151;SC=GGAGCGGAGCCGCTGCTGCCC;SOR=0.397;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=35;WE=134981950;WS=134981932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr10	134996785	rs149228737	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=227;ReadPosRankSum=0.186;SC=GGAGAAGTGCTGGCCGCGGTC;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=19;WE=134996793;WS=134996775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr10	134997480	rs57510763	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.924;NF=24;NR=26;PP=671;ReadPosRankSum=1.965;SC=TCGAGTCCTTCGGAGCGCTGC;SOR=0.683;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=50;WE=134997488;WS=134997470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr10	134997514	rs67800134	A	G	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.057;NF=18;NR=26;PP=2064;ReadPosRankSum=0.199;SC=GAACCCACACACGTGCATCCT;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=44;WE=134997532;WS=134997504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr10	134997524	rs138319019	T	TCTTG	1825.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.045;NF=3;NR=20;PP=2055;ReadPosRankSum=-1.046;SC=ACGTGCATCCTCATGCACATA;SOR=0.836;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=23;WE=134997532;WS=134997504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr10	134997641	.	CCA	C	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=179;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CACACACATGCCACACACACC;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=134997650;WS=134997631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr10	134999602	rs3008393	G	C	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=1896;SC=AGTCTGAGACGAGCCGGGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=134999610;WS=134999592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	135000148	rs3810965	T	C	5432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.566;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=0.951;SC=CAGAAGGAGCTAGGCAGCTGG;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=243;TCF=105;TCR=138;TR=127;WE=135000167;WS=135000138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,147:0.51:290
chr10	135000159	rs3810964	A	G	5165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=0.964;SC=AGGCAGCTGGAAAGTGCAGCC;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=223;TCF=90;TCR=133;TR=116;WE=135000167;WS=135000138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,136:0.51:266
chr10	135012162	rs2998139	T	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=39;PP=1233;SC=AAGCTCTCCCTGGAGGCCCAC;SOR=1.164;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=63;WE=135012170;WS=135012152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	135012429	rs3008390	TT	AC	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=20;PP=1863;SC=CCACCTGGAGTTGCTTCCGGG;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=49;WE=135012438;WS=135012419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	135012652	rs3008388	T	C	5855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=104;PP=2965;SC=CCTGCGTGGATGCCTCGCCAC;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=97;TCR=104;TR=201;WE=135012660;WS=135012642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr10	135015427	rs9418941	C	A	4611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=54;PP=2842;SC=TTGGCACTGCCGGGTGGGGCA;SOR=1.104;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=135015435;WS=135015417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr10	135015667	rs9419023	C	T	8989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=128;PP=2965;SC=CTCTCATGGTCGCCCGGGCGA;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=142;TCR=129;TR=270;WE=135015675;WS=135015657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr10	135016089	rs3008386	T	C	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=67;PP=2952;SC=GAACCTCTCCTACCACCGTCT;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=132;WE=135016097;WS=135016079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	135016175	rs3008385	T	G	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=65;PP=2373;SC=TCCTCCTTGCTCCTCTCCTGC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=125;WE=135016183;WS=135016165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr10	135020315	rs3008375	T	C	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=48;PP=2451;SC=TCCGAGACCCTGGCTGCAGGC;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=115;WE=135020323;WS=135020305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	135032376	rs3008370	A	G	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1209;ReadPosRankSum=0.493;SC=TGATTGCAAAATCTTGCTATG;SOR=0.580;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=81;WE=135032384;WS=135032366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,102:0.45:227
chr10	135043802	rs7092433	C	A	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.83;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135044009	rs11599284	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=332;ReadPosRankSum=1.625;SC=GCTGCTGCTGGGGACGCTGCT;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=26;WE=135044017;WS=135043999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr10	135051562	rs2998143	A	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=16;PP=922;SC=TCCCTGGCCCAGGCCAGACAT;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=135051570;WS=135051552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	135053413	rs9418951	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=360;ReadPosRankSum=0.181;SC=CTCACCCCTGTTCTGATCTTG;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=20;WE=135053421;WS=135053403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr10	135053604	rs9418952	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=295;ReadPosRankSum=-0.294;SC=ACCCCTGTCCGGGCCCCAGGC;SOR=0.112;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=18;WE=135053612;WS=135053594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	135053710	rs74164127	C	A	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.804;NF=20;NR=22;PP=1414;ReadPosRankSum=0.139;SC=CAGCCTCTGGCGTCCCACCCC;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=42;WE=135053729;WS=135053700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr10	135053721	rs9419033	C	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.780;NF=20;NR=25;PP=1414;ReadPosRankSum=-1.751;SC=GTCCCACCCCCCTACCCCAGG;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=45;WE=135053729;WS=135053700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr10	135053773	rs9418953	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=2.294;SC=GGGCCCCGGGGCCTGTGTGCT;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=24;WE=135053781;WS=135053763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr10	135061112	rs12355840	C	T	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=701;ReadPosRankSum=0.930;SC=GAACGGCGGGCGGCTCTGAGG;SOR=0.785;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=53;WE=135061120;WS=135061102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr10	135076523	rs2995300	C	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=469;ReadPosRankSum=-0.075;SC=TAGATGCATTCCTGAGGTTAG;SOR=1.802;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=26;WE=135076531;WS=135076513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr10	135076596	rs2230576	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=758;ReadPosRankSum=0.792;SC=GACCGTGGAATGCTGGAACGC;SOR=0.905;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=56;WE=135076604;WS=135076586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr10	135076758	rs3008318	T	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=558;ReadPosRankSum=0.515;SC=GAAAAGATAATTGATGTTGAA;SOR=0.732;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=31;WE=135076766;WS=135076748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr10	135076903	rs3121298	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGCAGTCACAATATATACAGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=135076911;WS=135076893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	135077121	.	C	T	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=92;QD=18.110173221;SC=GCAGTGCCACCGTCAGCCCCG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=135077129;WS=135077111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	135077121	rs3216041	C	CGTCAGCCCCGTGGGGAGGCCGTGCCACT	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr10	135081684	rs2995309	T	C	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=23;PP=654;SC=CACCACACCCTGAGTCTCTCC;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=135081692;WS=135081674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	135081754	rs11101672	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=-1.715;SC=ATGAGAGACAGACAGGCCCAG;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=11;WE=135081762;WS=135081744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr10	135082346	rs2275720	A	G	3088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=66;PP=1823;ReadPosRankSum=-0.384;SC=ACCACCACGAAGACGGGGAGG;SOR=0.568;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=212;TCF=92;TCR=120;TR=121;WE=135082354;WS=135082336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,144:0.58:250
chr10	135082810	rs2995310	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=418;ReadPosRankSum=1.580;SC=TCTGCCTATACCTGTGTGTCG;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=25;WE=135082818;WS=135082800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr10	135082874	rs2995311	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=871;ReadPosRankSum=0.489;SC=CCGGGCCCGCGGCTTCTGCCT;SOR=0.625;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=51;WE=135082882;WS=135082864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr10	135083164	rs2275719	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.151;SC=CCACATGCGCCGACGGCGAGG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=135083172;WS=135083154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr10	135083812	rs885023	C	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CCACGTGGGGCACATGCCCGG;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=22;WE=135083820;WS=135083802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr10	135084232	rs5789159	C	CAGA	1819.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.919;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.820;SC=AGGGCGGTCTCAGCTCACCTG;SOR=1.358;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=26;WE=135084240;WS=135084222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr10	135084322	rs3008321	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.966;NF=32;NR=21;PP=865;ReadPosRankSum=3.292;SC=GTGGGACCAGAAGCGGGTTAG;SOR=0.651;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=53;WE=135084330;WS=135084312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr10	135084601	rs2995314	T	C	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1074;ReadPosRankSum=0.951;SC=CAGCTCACCATGGGGACAGGT;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=84;WE=135084609;WS=135084591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,99:0.52:191
chr10	135085321	rs1131720	C	T	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=738;ReadPosRankSum=-1.143;SC=CAATGCTGCCCGCCATGATGC;SOR=0.468;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=45;WE=135085329;WS=135085311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr10	135085426	rs1131719	A	G	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1462;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GGGCCATGGTACAGGCCACGC;SOR=0.689;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=181;TCF=91;TCR=90;TR=92;WE=135085434;WS=135085416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,104:0.50:209
chr10	135085754	rs1131718	G	A	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1009;ReadPosRankSum=1.190;SC=CAAACCCCACGGTAGTCCCGG;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=69;WE=135085762;WS=135085744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,99:0.56:177
chr10	135086380	rs3008324	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=397;ReadPosRankSum=-0.290;SC=ACTGGGGACACGAGACCCTCA;SOR=1.429;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=25;WE=135086388;WS=135086370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr10	135087521	rs3008326	G	A	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1257;ReadPosRankSum=0.007;SC=TGTAGCCGGAGCCCAGCAGGT;SOR=0.615;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=97;TCR=80;TR=89;WE=135087529;WS=135087511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr10	135089035	rs2275725	A	G	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=644;ReadPosRankSum=0.080;SC=GGCAGACGCCACGGCAACACG;SOR=0.827;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=47;WE=135089043;WS=135089025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr10	135090183	rs2995317	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=364;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GCGGGGTGCGAGCAGGCCAGG;SOR=1.132;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=23;WE=135090191;WS=135090173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr10	135096784	rs2995325	A	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=645;ReadPosRankSum=1.128;SC=CGGGCCCTGCATGCGCACGTG;SOR=0.408;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=32;WE=135096792;WS=135096774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr10	135097224	rs56403249	T	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	135097227	.	CGCA	C	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.228;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	135097232	.	T	TCG	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.579;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	135097434	rs2995326	A	G	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=947;ReadPosRankSum=0.904;SC=CCATCACTTCAAACATCATGT;SOR=0.349;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=67;WE=135097442;WS=135097424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr10	135098672	rs3008334	G	A	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=49;PP=1913;ReadPosRankSum=-1.684;SC=CGTGCTTGCAGTAGAACATGT;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=120;TCR=84;TR=120;WE=135098680;WS=135098662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,144:0.56:255
chr10	135098830	rs3008335	T	C	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=62;PP=2212;ReadPosRankSum=-1.349;SC=CGTGAATCTCTCGGACACTGA;SOR=0.766;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=265;TCF=137;TCR=128;TR=132;WE=135098838;WS=135098820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,147:0.49:303
chr10	135098845	rs2995327	C	T	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=57;PP=2280;ReadPosRankSum=-0.279;SC=CACTGAAGGCCGGGGAGAGCC;SOR=0.879;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=266;TCF=145;TCR=121;TR=134;WE=135098853;WS=135098835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,153:0.49:311
chr10	135103311	rs141370078	C	CGCCCGCTGCGCCGCGGACGCCAAGTCCCT,CGCGGACGCCAAGTCCCT	1036.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=5.488;NF=7;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=-0.061;SC=CCCAAGTCCCCGCCCGCTGCG;SOR=0.636;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=9;WE=135103319;WS=135103301;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.29:52
chr10	135105966	.	G	A	1148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=58.3;NF=14;NR=4;PP=1148;QD=65.7095118082;SC=CCGTGTCCCCGTGTCCCTCCG;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=18;WE=135105974;WS=135105919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:38,18:0.32:56
chr10	135105983	rs2864768	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.651;NF=23;NR=8;PP=542;ReadPosRankSum=-5.274;SC=TCCGTGTCCCCGTGTCCCGGG;SOR=0.479;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=31;WE=135105991;WS=135105973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr10	135112940	rs2298120	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=279;ReadPosRankSum=0.267;SC=CCTGCTGCAGCGTGGAGCCTG;SOR=0.425;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=16;WE=135112948;WS=135112930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	135122507	rs3008357	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=656;ReadPosRankSum=1.172;SC=CGGCGGAGCCGCTGCCTGTAG;SOR=0.605;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=37;WE=135122515;WS=135122497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr10	135122723	rs146063105	AGGCGGGACCTGAGGTGGTGG	A	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.027;NF=1;NR=11;PP=2971;ReadPosRankSum=1.208;SC=AGCCTGGGACAGGCGGGACCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=12;WE=135122750;WS=135122713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr10	135139635	rs2275723	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CTGCGGGAGGGGCCGGGTCAG;SOR=0.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=91;WE=135139643;WS=135139625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr10	135141572	rs2298122	G	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=556;ReadPosRankSum=0.214;SC=GGACCCAAGAGAGCCCTGAAC;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=42;WE=135141580;WS=135141562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr10	135160950	rs4838721	C	T	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1216;ReadPosRankSum=2.068;SC=CATCCCTGAGCCCCAATCCCC;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=60;TCR=97;TR=80;WE=135160958;WS=135160940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr10	135165790	rs4369319	A	G	5587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=97;PP=2965;SC=ACCCTGGGCCATGTCCTGAGT;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=90;TCR=97;TR=187;WE=135165798;WS=135165780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	135171364	rs1891372	T	C	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=5;PP=323;SC=GGGGTCCCCGTGCAAGCCTCG;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=135171372;WS=135171354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	135178087	rs10745294	A	C	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=43;PP=2656;SC=TTAATGATAAAATTTAAAAGG;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=122;WE=135178095;WS=135178077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	135179458	rs6537598	G	C	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=24;PP=1925;SC=CCTCTCCAGTGTCTTCCTGGC;SOR=1.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=83;WE=135179466;WS=135179448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	135180430	rs2230261	A	G	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=42;PP=1515;SC=TCCGGTCACCAGTGAGGACCA;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=83;WE=135180438;WS=135180420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	135184126	rs1049951	G	A	3928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=35;PP=2663;SC=CTCCTCGAAGGTCTTCAGGGC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=89;TCR=35;TR=124;WE=135184134;WS=135184116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	135186806	rs10466126	A	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=670;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CGGGCCGCGGACGCAGGACAG;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=43;WE=135186814;WS=135186796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr10	135192762	rs12250188	C	G	132.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	135194890	rs10745295	A	G	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=9;PP=1055;SC=GTGGGAACTCAGAGCACGTAT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=135194898;WS=135194880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	135197419	rs4240520	G	A	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=1146;SC=GGACTTCCGTGGAGGGCTTTA;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=135197427;WS=135197409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	135202379	rs57719627	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.489;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GGGCTCTCTTTCTCCATGCAG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=135202387;WS=135202369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	135202594	rs10776679	T	C	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=54;PP=1569;SC=CCACACACGCTGGTTCCTGCC;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=135202602;WS=135202584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	135204799	rs6537600	C	T	7115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=109;PP=2965;SC=CATTCTAACCCTGGCTCTTCT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=211;WE=135204807;WS=135204789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr10	135204950	rs1046175	C	G	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=69;PP=2657;SC=AGCCCAGGCCCAGGCTCTAGC;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=129;WE=135204958;WS=135204940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr10	135205009	rs1046178	C	G	3444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=60;PP=2082;SC=GGCTGGGACCCTCATTTCTTC;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=103;WE=135205017;WS=135204999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr10	135207936	rs10160083	T	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=33;PP=1095;SC=TCCCGGTCGTTCTGGGCTGGC;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=135207944;WS=135207926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	135209105	rs4838742	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=407;SC=TCCCTCAGATATAGTCTTTTT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=135209113;WS=135209095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	135211892	rs2252852	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=17;PP=2078;SC=TGACAGAGCCAAGACTCCAGT;SOR=2.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=82;TCR=17;TR=99;WE=135211900;WS=135211882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	135213263	rs2814206	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=491;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCAGAGCACATCTTGTCTCGT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=23;WE=135213271;WS=135213253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr10	135215756	rs145673810	CGGGGCT	C	2088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.48;MQRankSum=2.103;NF=1;NR=31;PP=1499;ReadPosRankSum=0.179;SC=TGTGGTGAGCCGGGGCTGGGG;SOR=0.420;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=92;TCF=7;TCR=85;TR=32;WE=135215769;WS=135215746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr10	135232934	rs2243619	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=460;ReadPosRankSum=0.232;SC=TGGCTGGCCGCGCGGTGTCAG;SOR=0.215;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=28;WE=135232942;WS=135232924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr10	135233541	rs2255246	A	G	6271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=96;PP=2965;SC=TAACGTGAACATTATTCAGCC;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=102;TCR=96;TR=198;WE=135233549;WS=135233531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr10	135237003	rs4077586	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	135237060	rs2480253	A	G	156.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=96;SC=CCCCGCGCGCACCCCCGCGGA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=135237068;WS=135237050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135237166	rs2492666	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.832;SC=AGCCCAGCACGTTGCGGGTGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=135237174;WS=135237156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	135237196	rs4838682	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.57;MQRankSum=-1.327;NF=4;NR=3;PP=69;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CTTCGTGGGGCTAAACCTGCG;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7;WE=135237204;WS=135237186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	135267445	rs2253522	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=373;ReadPosRankSum=0.072;SC=CTGTGACCTCTGCCATTGCCC;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=22;WE=135267453;WS=135267435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr10	135267738	rs2253529	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=141;ReadPosRankSum=1.266;SC=TCCACATGGCTGGATCCCTGT;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=135267746;WS=135267728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr10	135269955	rs11101759	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=495;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GGCTTCACAACGTGTCCTGCC;SOR=0.957;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=33;WE=135269963;WS=135269945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr10	135271789	rs2480245	C	T	5927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=89;PP=2965;SC=TGAAGCCTTCCGCAGTCTGAG;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=105;TCR=89;TR=194;WE=135271797;WS=135271779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	135272947	rs2257044	CC	AG	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=516;SC=GGTCCTGGGTCCCTCCCGCTG;SOR=2.019;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=23;WE=135272956;WS=135272937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	135273463	rs731947	C	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=33;PP=1435;SC=ATGCCTGGGACCTGCGGGACG;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=135273471;WS=135273453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	135278193	rs2492654	A	G	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=28;PP=938;SC=CTGGGGCGCCATGTGCAGCAA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=135278201;WS=135278183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	135279283	rs2243812	T	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=27;PP=1797;SC=TTTTTGGGAATTCCCTTTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=135279291;WS=135279273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	135279810	rs2243909	T	G	4481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=53;PP=2965;SC=CGTCCTGGGATCCCTTCTTGG;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=143;WE=135279818;WS=135279800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	135280765	rs2246634	C	T	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=37;PP=1727;SC=GAAATGCCGCCAGCAGGACTG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=84;WE=135280773;WS=135280755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	135340866	rs11445593	T	TC	734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=842;SC=CACAGGATTGTCTCCCGGGCT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=135340874;WS=135340856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	135347397	rs915909	T	C	5257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=100;PP=2965;SC=ACCCTGAGATTGAAGGTAGGC;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=79;TCR=100;TR=178;WE=135347405;WS=135347387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr10	135347533	rs943976	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=523;SC=TGAGATGGCTAGATGCACTGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=135347541;WS=135347523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	135350490	rs147973606	A	AGATGGGTGGAT	804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=2983;SC=GTGATTGAATAGATGGGTGGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=135350498;WS=135350480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	135351137	rs2070676	G	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=520;SC=TCCTTCAACTGGAAATATACT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=135351145;WS=135351127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	135351174	rs2070677	T	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=6;PP=1050;SC=TATTCAAAACTACATTCTTCA;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=135351182;WS=135351164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	135351362	rs2515641	T	C	4639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=84;PP=2883;SC=ATGGAAAGTTTAAGTACAGTG;SOR=1.013;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=146;WE=135351370;WS=135351352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr10	135352153	rs2249694	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=248;SC=TAGGCAGAGAAGGGTGAGTCC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=135352161;WS=135352149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135352168	rs2249695	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=311;SC=GAGTCCTGCCTTGTGATGGCC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=135352176;WS=135352158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	135352509	rs2480257	T	A	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=4.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	135352514	rs2480256	A	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.07;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	135369054	rs3020514	A	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=43;PP=1974;SC=ATACAACATCAGTCATCTTCC;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=96;WE=135369062;WS=135369044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	135370060	rs2987791	G	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=204;SC=ACTTGACCTTGGTCTCATCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=135370068;WS=135370051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	135371466	rs2987792	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=634;SC=TGTCAAGGTATTGGGTTTTGG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=135371474;WS=135371456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	135381215	rs3020499	A	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=3;PP=150;SC=CTGGGCAGGCATGGGGAGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=135381223;WS=135381205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135381276	rs3020500	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=8;NR=7;PP=262;SC=GGCTCTGGAGTGTGGCTGGGC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=135381284;WS=135381266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	135381592	rs3020501	C	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=29;PP=2034;SC=CGAGCCCAGCCAGGCCTAGGG;SOR=1.817;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=77;TCR=29;TR=106;WE=135381600;WS=135381582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	135381623	rs3020502	T	C	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=54;PP=2352;SC=CCCAGGGCACTGAGGGCGCCA;SOR=1.072;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=137;WE=135381631;WS=135381613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr10	135381766	rs3020503	C	T	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=71;PP=2395;SC=CCGCGTTCCCCGGGTCCCGCG;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=111;WE=135381774;WS=135381756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	135381927	rs2987800	T	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=18;PP=538;SC=AGAGGAAGGCTGCCTCCTGTA;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=135381935;WS=135381917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	135438888	rs150376644	C	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQRankSum=-9.884;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:362,85:0.19:447
chr10	135438929	rs201901202	T	G	4642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=-15.656;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:400,138:0.26:538
chr10	135438951	rs200483318	G	A	5397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQRankSum=-17.534;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:387,158:0.29:545
chr10	135438955	rs201563622	C	T	5281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQRankSum=-17.797;QD=9.69;ReadPosRankSum=2.119;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:390,155:0.28:545
chr10	135438967	rs145018822	C	T	4550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQRankSum=-18.038;QD=9.08;ReadPosRankSum=4.128;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:366,135:0.27:501
chr10	135438977	rs79631365	G	A	4214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=-19.931;QD=9.10;ReadPosRankSum=3.772;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,125:0.27:463
chr10	135439049	rs200347477	G	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=31.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-9.182;QD=0.32;ReadPosRankSum=-5.865;SOR=3.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,29:0.10:281
chr10	135439287	rs199817432	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.87;MQRankSum=-3.087;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	135439300	rs200952781	T	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.59;MQRankSum=-2.515;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	135439305	rs187707655	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.59;MQRankSum=-2.515;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	135439321	rs200063193	C	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.18;MQRankSum=-2.189;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	193096	rs2280539	T	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=875;ReadPosRankSum=-1.526;SC=CTGAGACTGCTGGCATGAAGG;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=71;WE=193104;WS=193086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,75:0.55:137
chr11	193112	rs7951297	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,25:0.19:132
chr11	193146	rs61736219	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=443;ReadPosRankSum=1.581;SC=ACCCTGTTCTGCATCTGCCGT;SOR=0.736;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=37;WE=193154;WS=193136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,36:0.31:117
chr11	193194	rs2686896	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,58:0.76:76
chr11	193863	rs2294081	T	C	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr11	193865	rs2686894	T	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr11	193979	.	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=-2.992;SC=CAACACAGCACCCACACAGCC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=6;WE=193987;WS=193969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr11	194330	.	C	CG	778.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=827;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CAGACCCCCCCCCACTGAGGG;SOR=0.765;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=13;WE=194340;WS=194320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr11	194332	.	C	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=806;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GACCCCCCCCCACTGAGGGCC;SOR=0.854;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=19;WE=194340;WS=194320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr11	194640	rs2979429	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.839;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AACACACTCGGGGCCACAGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=6;WE=194648;WS=194630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	197557	rs7103852	A	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=23;PP=1456;SC=CATTGCGTCCACAGGCTTCAT;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=197565;WS=197547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	198062	rs11605246	C	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.819;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.868;NF=25;NR=33;PP=832;ReadPosRankSum=0.021;SC=TGGACACCCCCTGACCCGACT;SOR=1.003;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=58;WE=198070;WS=198052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,66:0.44:151
chr11	205889	rs72878029	T	C	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1136;ReadPosRankSum=0.479;SC=GCCCTCTGCCTTCCCTCTGAT;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=64;WE=205897;WS=205879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,68:0.53:129
chr11	207359	rs375304678	C	CGGCCACAGCCGCCTCAGACGT	1045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=631;SC=GACACCGACGCGGCCACAGCC;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=3;WE=207367;WS=207349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	207400	rs71487219	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=5;PP=97;SC=GCGGGGAAAGAGCTTCCGGCC;SOR=1.230;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=207408;WS=207390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	207462	rs11245998	A	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=7;PP=317;SC=GCCCCTAGATAGCCCAGCCCC;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=207470;WS=207452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	209002	rs2177173	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=9;PP=253;SC=GTGCGCGGGTAGCAGGGAGGG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=209010;WS=208992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	212408	rs72878032	C	T	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=936;ReadPosRankSum=0.557;SC=ACAGAGAATCCTCTACAGACA;SOR=0.549;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=50;WE=212416;WS=212398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr11	214421	rs3216	G	C	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=620;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTTGCAACCTGGGGAAGCCAC;SOR=0.887;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=56;WE=214429;WS=214411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,65:0.34:193
chr11	218640	rs535716	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=196;ReadPosRankSum=-1.719;SC=GTTAGCATCTGTTTCCTCATC;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=218648;WS=218630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	219089	rs511744	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=350;SC=CTTTACAAGCTCCTCAGGATG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=219097;WS=219079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	223832	rs144507767	C	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.665;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.783;NF=2;NR=7;PP=178;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TGCCCTCCAGCCTCCTCCCTG;SOR=1.492;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=9;WE=223840;WS=223822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	223854	rs201048317	C	T	263.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=43.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	223859	.	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.253;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr11	223860	.	C	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;QD=24.44;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,4:1.00:4
chr11	223862	.	C	CTCCAGGG	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.52;QD=53.50;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	223976	.	ACTCCTCCCTGCACAGGCCTGCCGACAGCCCATGAGATGACTCCTGTACCCCTCCCTTCCCCTGCCCTCCAGC	A	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr11	224048	.	C	A	262	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=4;PP=262;QD=22.8285548113;SC=TGCCCTCCAGCCTCCTCCCTG;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=13;WE=224056;WS=224038;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,13:0.41:32
chr11	233067	rs11246020	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=757;ReadPosRankSum=0.491;SC=TAGTGAGTGACGTTGGGCTTG;SOR=0.426;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=58;WE=233075;WS=233057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr11	233212	rs11555236	C	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=613;ReadPosRankSum=1.753;SC=CACTCCCCGGCGATCTGCAGG;SOR=0.780;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=39;WE=233220;WS=233202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr11	233298	rs12365010	T	G	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=785;ReadPosRankSum=1.941;SC=AGGGCAGGAGTCAGGGGAGGG;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=42;WE=233306;WS=233288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr11	235894	rs9795476	T	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=600;SC=CCCCCATAAGTGACGTCCACA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=235902;WS=235884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	236343	rs7118852	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.83;NF=1;NR=4;PP=84;SC=CGCGCAGTCCAAGGAGTCCTC;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=236351;WS=236333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	236370	.	C	CCGGCGCCCCGCCCG	231.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=38.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	236871	rs2272563	T	C	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=192;SC=GAGAGTTTTGTCCGGAGCGCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=236879;WS=236867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	237087	rs1045288	A	G	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=52;PP=1946;SC=CAGAGCCAGAACTCCGGGCCC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=237095;WS=237077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	237209	rs56312618	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=381;ReadPosRankSum=1.741;SC=GCAGGCGGGCGGAGGAGCGGA;SOR=1.101;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=21;WE=237217;WS=237199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr11	243987	rs6598060	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=415;SC=TGGGGTCTTCGTTTTGCAGAA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=243995;WS=243977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	244106	rs10902112	A	G	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	244108	rs7107362	A	G	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.07;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	244115	rs7128044	G	A	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	244129	rs7116130	C	T	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=45;PP=1751;SC=TGATGCTCGGCGGTGCTCAAA;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=244149;WS=244096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	244141	rs7128029	G	A	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=45;PP=1657;SC=GTGCTCAAAGGCTGGTGGCTT;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=244149;WS=244096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	244167	rs1128320	C	T	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	244171	rs1128321	T	C	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=1.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	244197	rs1128322	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=38;PP=1055;SC=TCATTCTTCATGTAGTTAGAC;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=244205;WS=244187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	244414	rs2272565	C	T	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.07;NF=77;NR=52;PP=2965;SC=CTGATTGTTCCTTCTTTTCCA;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=129;WE=244422;WS=244404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	244490	rs3830667	ATACCTTTTAG	A	7051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=70;PP=2981;SC=CATGTGGGCAATACCTTTTAG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=97;WE=244507;WS=244480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	244552	rs2272566	A	G	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.864;NF=33;NR=29;PP=752;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CTCACTGTCCAGACCTTTAGA;SOR=0.670;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=62;WE=244560;WS=244542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,60:0.41:145
chr11	247200	rs3830001	G	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=602;SC=CTAGGCAACAGAGTGAGACCC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=247208;WS=247193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	250877	rs12793187	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=514;ReadPosRankSum=1.216;SC=TAAGCGAACACCCAGGAGCCA;SOR=0.835;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=42;WE=250885;WS=250867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,54:0.36:149
chr11	252318	rs6598055	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TTTTTTCTAACGTTCCTGTGA;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=252326;WS=252308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	279798	rs4758626	G	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.351;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr11	280000	rs4758627	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCCTGAGCAGGGCCGGGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=6;WE=280008;WS=279990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	280221	rs6421985	A	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=42;PP=1523;SC=GGAGGAGGCGATGGGGCCCGC;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=280229;WS=280211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	280464	rs77447196	C	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=1135;ReadPosRankSum=0.829;SC=GCTGGAGAGGCCGGGCACGCG;SOR=0.792;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=64;WE=280472;WS=280454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,71:0.61:116
chr11	280673	rs12807092	C	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=26;PP=1209;SC=GGCTGCTGAGCAAGGCGCTGC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=280681;WS=280663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	280816	rs7482965	AT	TC	10600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=77;PP=2947;SC=TTCTACAAGTATTTCCGGGAT;SOR=1.040;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=117;TCR=81;TR=192;WE=280825;WS=280806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	284093	rs9734280	A	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=8;PP=539;SC=AGGCTCTGCGAGGTCCAGGGA;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=284101;WS=284083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	284538	rs6598047	T	C	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=48;PP=1459;SC=GGCAGAGCCCTGCCCTGACCA;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=284546;WS=284528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	284716	rs760059	C	T	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=109;SC=CCTGGGGGCTCCCCCTGGACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=284724;WS=284706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	290816	rs10902120	A	G	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=28;PP=1201;SC=TCCTGACAGCAGTGGGCGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=290824;WS=290806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	292798	rs11602423	A	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=8;PP=276;SC=AGGTGTCTCAATGCCAGGCCT;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=292806;WS=292788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	293001	rs35259273	A	AG	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=651;ReadPosRankSum=0.517;SC=CTGAGGGGTGAGGCCATGGTG;SOR=0.465;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=19;WE=293009;WS=292991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr11	293188	rs12801980	T	C	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=618;ReadPosRankSum=-0.573;SC=ACGAGTACCATTCAGGGGTCA;SOR=0.415;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=40;WE=293196;WS=293178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr11	293785	rs12418165	C	T	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.348;NF=58;NR=50;PP=1714;ReadPosRankSum=-2.170;SC=TCTCTGCCCACGCAGTGGGCC;SOR=0.706;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=108;WE=293793;WS=293775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,122:0.65:188
chr11	294512	rs149098966	A	ACCCCAGGCTGTCCCTCACCCCCAGACTGCCCTCTCAC	2764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=54.21;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	294523	.	C	T	1373	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=59.77;NF=18;NR=29;PP=1373;QD=29.9525789904;SC=CCCCAGGCTGCCCCTCACCCC;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=47;WE=294550;WS=294513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr11	294537	.	G	A	1373	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=26;MQ=59.77;NF=10;NR=19;PP=1373;QD=48.5438349154;SC=TCACCCCCAGGCTGCCTCTCT;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=29;WE=294550;WS=294513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr11	299219	rs11246058	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.303;SC=AAGGACCCCCCACGGAGCTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=299227;WS=299209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	308065	rs9704108	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=495;SC=GTTCTGCCCTTATCTGGCCCT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=308073;WS=308055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	308178	rs1058873	T	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,57:0.34:170
chr11	308178	.	TCA	CCG	1663	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=30;NR=18;PP=1663;QD=35.759747393;SC=GGTAACCCGATCACCGCTGGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=48;WE=308188;WS=308168;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:91,48:0.35:139
chr11	308180	rs10398	A	G	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,59:0.33:179
chr11	308290	rs1058900	T	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.157;NF=17;NR=26;PP=538;ReadPosRankSum=0.443;SC=ATGCTGGGGGTGCCCCACAAC;SOR=0.626;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=43;WE=308298;WS=308280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,49:0.38:128
chr11	308314	rs14408	T	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.842;NF=12;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=1.104;SC=GCTCCCCCGATGTCCACCGTG;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=33;WE=308322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr11	308363	rs1058935	G	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.161;NF=13;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=-1.532;SC=CTGACCATGTGGTCTGGTCCC;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=31;WE=308371;WS=308353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr11	308426	rs1058964	G	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.546;NF=13;NR=15;PP=391;ReadPosRankSum=2.183;SC=TAGCATTCGCGTACTCCGTGA;SOR=0.874;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=28;WE=308434;WS=308416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr11	309127	rs1059091	A	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.841;NF=30;NR=16;PP=602;ReadPosRankSum=0.341;SC=CATTCTGCTCATCATCATCCC;SOR=0.488;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=46;WE=309135;WS=309117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,51:0.40:126
chr11	314207	rs9667990	C	G	7716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.04;NF=111;NR=124;PP=2965;SC=TGTGCTGGGGCCACCCCCCAG;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=235;WE=314215;WS=314197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	372157	rs34063493	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=311;ReadPosRankSum=-1.011;SC=GTCCACGCTGCGCCATCCACA;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=29;WE=372165;WS=372147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,35:0.33:106
chr11	372700	rs35475866	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=176;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TTCCTGGGGGGGCTGGGAGGC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=21;WE=372708;WS=372690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr11	373408	rs376849299	AC	A	521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=0.514;QD=22.68;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr11	375804	rs61876283	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=801;ReadPosRankSum=-0.249;SC=GGGCGAGGGCGGGGGTGCCTG;SOR=0.768;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=50;WE=375812;WS=375794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr11	379598	rs1134699	A	G	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=919;ReadPosRankSum=-0.779;SC=AAAGTCCCGAACCCGCTCCCG;SOR=0.713;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=53;WE=379606;WS=379588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,77:0.57:135
chr11	380774	rs35355019	A	AC	2386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.18;MQRankSum=1.042;NF=29;NR=25;PP=2055;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TGCCGGGGGGACCTTGCAGGA;SOR=0.957;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=54;WE=380782;WS=380764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,78:0.66:119
chr11	381560	.	C	T	109	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5341;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=44.85;NF=6;NR=0;PP=109;QD=23.9618687579;SC=CACCTCTCCGCCCCCGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=381568;WS=381550;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	400124	rs139128100	C	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.098;SC=TCTTCTACAACGCCACCGGCT;SOR=1.426;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=9;WE=400132;WS=400114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	428385	rs10794323	A	G	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=9;PP=1292;SC=AGGGCCACGCACCTGTTGATC;SOR=2.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=428393;WS=428375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	428489	rs10794324	T	C	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=68;PP=2730;SC=GTCATGATGATGATGGTCACA;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=428497;WS=428479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	429659	rs7111432	C	T	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=89;PP=2965;SC=GTGGCTGCGGCGGGGGCAAGG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=171;WE=429667;WS=429649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	430456	rs11603743	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=306;SC=GGGGAGGGACAGGAAAGGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=430464;WS=430446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	431622	.	C	T	246	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=11;NR=2;PP=246;QD=21.5977855806;SC=GGGGCGTCCGCGGGTATCTGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=431630;WS=431612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	431834	rs55914928	A	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=26;PP=1400;SC=TCTCCAGGCCAGCCCACCCCT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=431842;WS=431824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	433387	rs7395065	A	G	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=89;PP=2965;SC=TCCAGGAGGAAAGTGCGGTAC;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=178;WE=433395;WS=433377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr11	433568	rs7396813	G	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=289;SC=CCTCTATTCCGCCTCAGAACC;SOR=1.493;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=14;WE=433576;WS=433558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	433995	rs7396776	G	A	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=39;PP=1628;SC=GGGCCAGGTGGGGCCCGGGAG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=434003;WS=433985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	441806	rs10794325	C	A	571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=431;SC=GGGACCCCCCCCACACACACA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=441814;WS=441796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	534242	rs12628	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1195;ReadPosRankSum=2.715;SC=CGTCCACAAAATGGTTCTGGA;SOR=0.550;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=216;TCF=99;TCR=117;TR=84;WE=534250;WS=534232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,96:0.37:258
chr11	534409	.	GCCCAGC	G	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.950;NF=0;NR=9;PP=349;ReadPosRankSum=-2.260;SC=CCAGGCCCAGGCCCAGCCCCA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=534422;WS=534399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	549959	rs7942030	C	T	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=50;PP=1900;SC=GCTGTGGCCTCGCTGACCTGG;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=103;WE=549967;WS=549949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	550028	rs11246180	C	G	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=50;PP=2445;SC=GCTGGGGAGGCCTGGGCTGGG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=550036;WS=550018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	551235	rs35537971	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CGGCCCCCCCGCGGCTGAGCC;SOR=0.752;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=26;WE=551243;WS=551225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr11	551405	rs7396875	G	A	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=34;PP=1118;SC=CATCTCATGCGCTTCTCCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=551413;WS=551395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	551753	rs4963198	G	A	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=60;PP=2081;ReadPosRankSum=-1.875;SC=CTGCTGGTCCGTGGGGGCCCC;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=130;WE=551761;WS=551743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,141:0.69:203
chr11	552547	rs3740652	T	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=260;SC=GGCTGGAGCTTCTCCTCCTCT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=552555;WS=552537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	552756	rs12361381	T	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=13;PP=469;SC=AACACCCCACTTCTATAGGGG;SOR=0.927;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=552764;WS=552746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	552787	rs12361383	T	C	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.79;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	552787	.	TG	CC,CG	161	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7,9;NR=5,11;PP=161,83;QD=17.8723229052;SC=CCAGATCAGATGTGTCAACCT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=12,20;WE=552796;WS=552777;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.60:20
chr11	552788	rs11246182	G	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr11	552875	rs28575794	A	G	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=145;SC=GCTCACGACCAAGGGAGGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=552883;WS=552865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	553866	rs12792519	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=108;ReadPosRankSum=0.514;SC=CCACTGCCTCGGGGCTGCAGG;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=553874;WS=553856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	554047	rs12793222	G	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=973;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AGCTCCCCGCGGTGGTCGACA;SOR=0.508;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=61;WE=554055;WS=554037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr11	554166	rs10902170	C	G	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=40;PP=1445;SC=GGTGGCCTCACGCCTGAGCCC;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=554174;WS=554156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	554214	rs10902171	G	C	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=37;PP=1279;SC=GCCAGCACCAGATGCAGCAGC;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=554222;WS=554204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	554299	rs10902172	C	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=25;PP=982;SC=TGCCAGGCTTCCCTGTGCTGG;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=554307;WS=554289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	555182	rs9704177	G	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	555223	rs55731724	AC	A	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=272;SC=GGACGAGGAGACAGAGGGGAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=555231;WS=555213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	556121	rs936467	G	A	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=12;PP=571;SC=CAGACCTGGAGGGGCGTGGAG;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=556129;WS=556111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	556457	rs28407128	T	C	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=30;PP=1959;SC=CCAGCTCCAGTCCGGCGCCGG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=556465;WS=556447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	556521	rs28406183	C	G	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=49;PP=2577;SC=TCCAGTGGTCCGGGTCTGTGC;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=126;WE=556529;WS=556511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	556857	rs7938269	G	C	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=24;PP=1064;SC=TGCTGTAGCTGCCGGCCTGCA;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=556865;WS=556847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	557342	rs936466	T	C	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=22;PP=1226;SC=GCGTCTTCACTTGCCAAGGTG;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=557350;WS=557332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	557989	rs7129811	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=722;ReadPosRankSum=-1.096;SC=CCTCCATCTCCTGGAGCGTGC;SOR=0.377;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=50;WE=557997;WS=557979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr11	558884	rs2061586	C	T	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=40;PP=2158;ReadPosRankSum=0.460;SC=ACCACCGGTGCGGGGTGGGGC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=106;WE=558892;WS=558873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr11	559016	rs3943356	C	T	4976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=66;NR=92;PP=2853;SC=TCGGTTTCTTCAACCTCCTGG;SOR=1.006;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=158;WE=559024;WS=559006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	562437	rs11246189	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=424;ReadPosRankSum=1.143;SC=TGGAGCTCAGGGTGCAGAGGA;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=28;WE=562445;WS=562427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr11	568211	rs7395206	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=1.370;SC=GCGGGCGGAGGGATTGACCCC;SOR=0.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=8;WE=568219;WS=568201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	587425	rs12800061	C	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=18;PP=535;SC=AGAACTGTGCCCATTACTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=587433;WS=587415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	601785	rs2396545	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=27;PP=595;SC=AGCCTCCCGCTGGCCTTGGCA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=601793;WS=601775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	606656	rs936470	G	C	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=31;PP=982;SC=CAGGCTGTTCGCAAGCACTCA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=606664;WS=606646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	606749	rs936469	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	607175	rs936468	G	A	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=24;PP=1401;SC=CCCAAGGCCCGTCAGGAAACA;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=607183;WS=607165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	609068	rs7928902	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=36;PP=1732;SC=CTTCCCCAGCGCCCCTTGCAC;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=609076;WS=609058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	609353	rs11539530	G	A	9554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=158;PP=2965;SC=ACTCTTCCCCGGAGCGAGACT;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=142;TCR=158;TR=300;WE=609361;WS=609343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr11	610277	rs11246212	T	C	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=71;PP=2040;SC=GTCAGGCAGGTGTTCTCCGAG;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=54;TCR=71;TR=125;WE=610285;WS=610267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	611503	rs7941547	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=6;PP=995;SC=CTCTGCCGCCGTCTGTCTGCG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=611511;WS=611493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	611531	rs12419618	G	A	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=14;PP=1761;SC=CCTAGGGCCTGCTCCTGAGCA;SOR=2.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=75;WE=611539;WS=611521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	611802	rs17155933	C	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=50;PP=1412;SC=GGGCTATGCCCGGGGAGCTGT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=56;WE=611810;WS=611792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	612843	rs10902178	T	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=13;PP=627;SC=CCGGCGTGTGTCCTCCCCTCC;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=612851;WS=612833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	612967	rs11246213	A	G	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=14;PP=1381;SC=GCCTGAGCACATGGCCTCCCC;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=66;WE=612975;WS=612957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	613165	rs1051390	G	C	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=84;PP=2965;SC=GTGCTCCCAAGGACCCCTGGA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=171;WE=613173;WS=613155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	613192	rs12422022	A	G	8328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=87;PP=2965;SC=CCCCCAGGCAAGGGCCTCACT;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=173;WE=613200;WS=613182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	613208	rs1131665	T	C	7933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=85;PP=2965;SC=TCACTGACCTTGGAAGAAGAC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=168;WE=613216;WS=613198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	613297	rs1061505	T	G	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=0.151;SC=AGCCTGGGGGTCCGCCCACCT;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=129;WE=613305;WS=613286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr11	613742	.	G	A	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=2;PP=157;QD=21.3079125052;SC=GTGAGTGACGGGGGTGGGCGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=613750;WS=613732;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	613757	.	A	G	362	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=15;NR=4;PP=362;QD=20.8826953972;SC=GGGCGGGGACAGGCTGCCCCT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=613765;WS=613747;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	614318	rs1061502	T	C	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=39;PP=1461;SC=AGGTCCCCCTTGTCACCAGCT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=614326;WS=614297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	614864	rs1061501	C	T	9021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=144;NR=124;PP=2965;SC=CCGAGTTATCCCGCAGCATCA;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=144;TCR=124;TR=268;WE=614872;WS=614854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr11	615010	rs12290989	GA	TT	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=61;PP=2947;SC=GCCCAGGCCTGAAGAGGGGGA;SOR=1.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=95;WE=615019;WS=615000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	616970	rs1610161	A	T	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=45;PP=1277;SC=GAGGTCTGAGATGAGCCGGGT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=616978;WS=616960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	617214	rs35600572	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	617221	rs34449380	T	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.16;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	617228	rs112006329	G	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.88;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	617378	rs61877856	C	T	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=32;PP=1286;SC=CACCACCGGGCGCATCGTAGG;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=617386;WS=617368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	617420	rs61877857	A	G	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=28;PP=1151;SC=CCTCGCCCTCATCGCCGCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=617428;WS=617410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	617519	rs34889521	A	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=38;PP=1242;SC=CAAACCAGACAGCCTTGTACC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=617527;WS=617509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	617967	rs2740379	C	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=863;SC=AGCTTTGCCACAGCAGCACTT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=617975;WS=617957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	618013	rs7108757	C	T	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=24;PP=1500;SC=ACAAGGACGGCGAGGCCAAGG;SOR=1.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=72;WE=618021;WS=618003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	619671	rs1124816	C	T	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=66;PP=2794;SC=GCCTTGGATGCACTCTCTACC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=136;WE=619679;WS=619661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	621795	rs12801890	G	A	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=36;PP=1648;SC=CAGTCCCCGCGGCTTCGCTGG;SOR=0.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=621803;WS=621785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	626220	rs12280580	C	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=1;NR=4;PP=85;SC=GTCAGTCCCTCCTGGGTGGAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=626228;WS=626217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	636496	rs936461	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=898;SC=AGCCGAACCTACTGTCCGGTC;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=636504;WS=636486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	636689	rs747302	G	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.83;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	636689	.	GG	CA	1049	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=23;NR=32;PP=1049;QD=20.044870452;SC=GGGGGCTGAGGGCCAGAGGCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=55;WE=636714;WS=636679;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr11	636690	rs936462	G	A	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	636701	rs3842250	CG	C	2369.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=26;PP=1387;SC=CCAGAGGCTGCGGGGGGGGGG;SOR=0.970;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=28;WE=636714;WS=636679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	636703	rs2396543	G	T	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	636703	.	GGGG	TGGC,TGGG	538	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4,16;NR=5,26;PP=58,538;QD=12.3853194291;SC=AGAGGCTGCGGGGGGGGGGCG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=9,42;WE=636714;WS=636679;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.18:49
chr11	636706	rs375614821	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.777;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr11	636784	rs1800955	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.427;SC=GCGTGGAGGGTGCGCACGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=636792;WS=636774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	639372	rs146876215	GGC	G	2090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=2076;SC=TAAGAGTGGGGGCGGGTCACA;SOR=3.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=46;WE=639381;WS=639362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	640349	rs1870723	G	A	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=26;PP=1228;SC=GGAGGGGGGGGGTACGAGGCC;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=640357;WS=640331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	640369	rs7482904	G	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=26;PP=1482;SC=CGGCTGGGCGGGGGGCGCTAA;SOR=1.379;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=640377;WS=640359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	678561	rs10902190	C	T	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=10;PP=1348;SC=CACACTTTACCAGCCACTGAT;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=678569;WS=678551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	680866	rs7483337	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=402;SC=TGTGCTTTAGAAGTGAGAATC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=680874;WS=680856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	686798	rs7121608	G	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.729;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=764;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TGGCTGGGCCGCCTCAGAGGG;SOR=1.524;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=47;WE=686806;WS=686788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr11	704753	rs7941896	G	A	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=716;SC=GGCCCGAGAGGCCAGCCTGGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=704761;WS=704743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	709680	rs11605783	T	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=48;PP=1242;SC=GGGGGACAGCTGCTCCTGCCC;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=709688;WS=709670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	710558	rs7395822	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=8.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=-0.584;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.735;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr11	710567	rs7396652	A	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=8.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.565;QD=8.07;ReadPosRankSum=-2.637;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr11	720197	rs3087546	C	T	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=71;PP=2133;SC=CGACCAGTCGCTGCGGCTGCT;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=102;WE=720205;WS=720187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	720957	.	GC	G	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=58.58;NF=4;NR=0;PP=67;QD=29.0077249675;SC=GAGGGGAGGAGCCCGGCAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=4;WE=720965;WS=720947;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr11	720978	.	G	GC	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=58.2;NF=3;NR=3;PP=89;QD=25.4742934119;SC=GAGGGGAGGAGCCGGCAGGGG;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=6;WE=720986;WS=720968;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,6:0.32:19
chr11	721570	rs7635	C	T	2852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CCCAGCAAATCCTCAACTGCG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=136;TCR=127;TR=108;WE=721578;WS=721560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,140:0.43:329
chr11	721715	rs201616905	GGCAGGTGCAGGGGACGGGGCCA	G	1698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.371;NF=3;NR=27;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GGACGGGGCCGGCAGGTGCAG;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=30;WE=721744;WS=721705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr11	723429	rs4078520	C	T	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=40;PP=1239;SC=CATATGGGTACGCTGCCACCA;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=723437;WS=723419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	725877	rs66512023	G	GC	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=125;SC=TGGGGTCGCAGCCCCCAGCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=725885;WS=725867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	726178	rs28498399	G	C	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=42;PP=1493;SC=ACGGTGAGAGGTGCTGCTTCG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=81;WE=726186;WS=726168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	763314	.	G	GT	483	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=1;PP=483;QD=47.0;SC=GCCCTCACCTGCCCCGCCCTC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=763322;WS=763304;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	771034	rs7930569	A	G	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=47;PP=1785;SC=CGGCCGGGACAGTGGAGCTGG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=771042;WS=771024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	772490	rs12224894	G	A	6091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=96;PP=2965;SC=AGCACAGGGCGGCGACACCGT;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=67;TCR=96;TR=163;WE=772498;WS=772480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr11	774982	rs7952095	C	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=6;PP=479;SC=CCTCCCAGGCCGCGGCGGCAG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=774990;WS=774972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	775275	rs7942564	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=352;SC=TACACCCAAGAACGACTACTT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=775283;WS=775265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	799670	rs28649421	G	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=403;SC=CTGGGGCCAGGTGCGGCCAGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=799678;WS=799660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	800485	rs7121646	TC	AT	8100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=76;PP=2904;SC=CAAGGAGGGCTCGGGGAGGAC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=159;WE=800494;WS=800475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	801631	rs55974235	T	TG	1609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=31;PP=1322;SC=GCCGCTGGGATGGGGGAGAGA;SOR=1.201;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=35;WE=801639;WS=801621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	801776	rs7479183	T	G	191.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.392;HP=1;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.710;NF=7;NR=4;ReadPosRankSum=0.847;SC=GGGGTGGAAGTTGCCAGGGAC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=801784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,8:0.44:18
chr11	802115	rs7479101	A	G	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.87;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	802125	rs28498421	T	C	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	802379	rs10902221	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=16;PP=497;SC=TGAGCAGCCTTGAGGGGTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=802387;WS=802369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	802902	rs28360884	T	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=329;SC=CTGCGGGCAGTTGCTGGCTTA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=802910;WS=802892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	804212	rs7104785	C	A	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=74;PP=2614;SC=GCAGCAGCTGCAGAGGCTGCT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=130;WE=804220;WS=804202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	822622	rs7942159	A	G	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=37;PP=1048;SC=CTCTGCTCCGAGGACTGTGGC;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=822630;WS=822612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	824789	rs1138693	T	C	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=34;PP=2044;SC=CAGCACCAGCTGGCCGGGCCT;SOR=1.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=824797;WS=824779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	824987	rs66460720	CTGCA	C	5973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=87;PP=2974;SC=CACTCACCAGCTGCATGCACT;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=3;TCR=93;TR=90;WE=824998;WS=824977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	825110	rs1138714	A	G	172.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=6;PP=113;SC=TTTACTCCTGAGAACTTTGCA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=825118;WS=825100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	828784	rs28507876	A	G	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=47;PP=2187;SC=TGAGTCCCCCACCCCAAGAGA;SOR=1.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=111;WE=828792;WS=828774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	828916	rs7126805	G	A	5049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=68;PP=2965;SC=AGTCTGGACCGGGCTCACACT;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=154;WE=828924;WS=828906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	829539	rs28558789	A	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=24;PP=720;SC=GGTCCTGGGCAAGTGAGTCGG;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=829547;WS=829529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	830487	rs4075290	C	T	4637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=76;PP=2832;SC=CTGGGCCTCACGTATCACCCC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=146;WE=830495;WS=830477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	830670	rs4075289	G	T	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=28;PP=832;SC=GAGCTGCAGAGCCGCGAGCAG;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=830678;WS=830660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	831122	rs7114218	C	T	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=31;PP=1306;SC=TCATCCCCATCTCAAGTCCCA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=67;WE=831130;WS=831112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	836008	rs5030778	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=12;PP=791;SC=CCTATCCGTCTCCCAGTCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=836016;WS=835998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	836023	rs28475448	C	T	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=16;PP=1037;SC=GTCAGGGGCCCGGTGCTGTGG;SOR=1.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=49;WE=836031;WS=836013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	836227	rs28434354	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=11;PP=612;SC=GGCAGATGCGATGACCTTTGT;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=836235;WS=836217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	836539	rs56063221	TG	T	2056.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=39;PP=1009;SC=TGTGCTCACCTGGGGGGGGGG;SOR=0.904;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=48;WE=836548;WS=836529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	836971	rs28620453	G	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=584;SC=ATGTGCCACTGGGCCCTGGAG;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=836979;WS=836961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	837121	rs28655651	G	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=862;SC=ATGCCGAGGTGTGACCTCAGC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=837129;WS=837111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	837582	rs1130663	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.16;NF=18;NR=43;PP=1293;SC=CTCTTTGTGGGCAGCGAGACC;SOR=1.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=837590;WS=837572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	837661	rs56265615	GT	G	676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=636;SC=CTACGAGGTGGTGGGGGGGCA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=837669;WS=837651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	838110	rs5030780	C	T	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=88;PP=2965;SC=CGTCTGCTTACGCCCACCCGG;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=99;TCR=88;TR=187;WE=838118;WS=838100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	840319	rs3059	C	T	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=17;PP=1103;SC=GAATTCGGGGCAGGACGCTCA;SOR=1.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=840327;WS=840309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	840363	rs6591	C	T	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=41;PP=2030;SC=TGGGTGGGTTCCAGCGTGGTC;SOR=1.104;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=102;WE=840371;WS=840353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	840477	rs4895	A	G	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=64;PP=2188;SC=CATCCAGCGCATCCCTGTGTC;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=840485;WS=840467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	840578	rs34627090	AC	A	1581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=788;SC=TGCTGGCCTCACCCCCCCCGC;SOR=1.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=34;WE=840586;WS=840568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	840604	rs28677123	C	G	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=28;PP=831;SC=GCAAGGCGAACAGATTCACCC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=840612;WS=840594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	840639	rs28636471	T	A	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=366;SC=GATCTAGCAGTATGATCCTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=840647;WS=840629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	842543	rs28372895	C	G	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.32;SOR=1.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	842627	rs9705236	T	C	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.57;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	842630	rs9704020	C	T	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.05;SOR=4.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	842653	rs35249369	C	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=677;SC=ACCGGCCCCGCCACCGCTGGC;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=842661;WS=842643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	849090	rs28402197	C	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=312;SC=GGTGGGTGCGCGCGACTGCCC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=849098;WS=849080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	850170	rs28704105	T	G	4781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=24;PP=2965;SC=CGCCGGGGGCTCCTTCTTCGG;SOR=2.967;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=135;TCR=24;TR=159;WE=850178;WS=850160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	862652	rs28505621	T	C	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=39;PP=1909;SC=GGCTGCCAACTTGCTCATCAT;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=862660;WS=862642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	864626	rs28377158	A	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=34;PP=976;SC=CCTCACGGGCAGCCAGGACAG;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=864634;WS=864616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	865447	rs28423070	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=3;PP=286;SC=GGGCCGGCGAGGGGGTCTGGA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=865455;WS=865437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	865503	rs28581489	G	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=7;PP=489;SC=GACCCCCCCCGCACCCCCAGA;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=865511;WS=865493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	866044	rs28457111	A	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=12;PP=462;SC=CCACTTTGTTAGGACCTTCTG;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=866052;WS=866034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	866133	rs11246335	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=0.497;SC=GCAGGAGGGCGAGTTCAGGGG;SOR=1.919;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=866141;WS=866123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	866183	rs28439203	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=114;SC=GGGCTCCCTCTTAGTGGACAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=866191;WS=866173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	866498	rs28663055	T	C	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=22;PP=1595;SC=GGACAGGGACTGCTCTGGGCT;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=866506;WS=866488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	900809	rs11246340	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=306;SC=ATCTCTGAGCGGTCAAAGTAA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=900817;WS=900799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	900894	rs28454252	T	G	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=988;SC=ACCCCCGCAGTTTGAGCCATC;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=900902;WS=900884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	902939	rs12799186	G	A	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=15;PP=1544;SC=ACCTCCCTCTGCACTGTGAGG;SOR=2.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=902947;WS=902929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	903070	rs28380110	G	C	5740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=76;NR=92;PP=2965;SC=GGTCCGTCACGACCAAACCCC;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=168;WE=903078;WS=903060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	904911	rs28634117	T	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=343;SC=ATGCAGCACATGGGCAACCCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=904919;WS=904901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	970029	rs7396107	C	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=396;SC=AGCGTCTGCACTGCACCTGCC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=970037;WS=970019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	970373	rs7394436	G	C	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=59;PP=1391;SC=ACTGAGGCCCGGTGCCCGTGT;SOR=4.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=66;WE=970381;WS=970363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	970405	rs7394427	G	A	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=915;SC=TTCCTTCTCTGCCCACAGCTG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=970413;WS=970395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	972270	rs7933889	C	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=44;PP=1537;SC=GTGCCGGGCTCGTGCCGGGCT;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=69;WE=972278;WS=972260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	977036	rs6597960	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=29;PP=2236;SC=GGGGGTGCTCCGTGCAGCTCT;SOR=1.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=104;WE=977044;WS=977026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	985547	rs10794358	C	T	5405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=74;PP=2951;SC=ATGCCGTGCTCTTCGAGGCCA;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=158;WE=985555;WS=985537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	992691	rs10902263	G	T	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=41;PP=1186;SC=TCGAGGTATGGCCCGCAGGAT;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=992699;WS=992681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	993684	rs112511283	C	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.785;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr11	993694	rs36081583	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.378;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr11	1003523	rs10902264	G	A	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=191;SC=CTGTGTCCGCGTCCCTGCGTC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=1003531;WS=1003520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	1003642	rs10902265	G	A	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=27;PP=1295;SC=TCCTCGTGCTGTGAGTTTTTT;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=69;WE=1003650;WS=1003632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	1007831	rs10902267	T	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=559;SC=GCAGACAGTGTTTTGAGGATT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=1007839;WS=1007821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	1009416	rs7126709	C	T	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=786;SC=TCTGGAGGGACGGCCCCGGGG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=1009424;WS=1009406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	1009589	rs28612764	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=292;SC=CACGCAGCCCACGACCCAGCG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=1009597;WS=1009579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	1009622	rs28464902	C	T	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=7;PP=515;SC=GGGGCGGCCCCGGGGGACACG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=1009630;WS=1009612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	1009890	rs11246380	T	C	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=44;PP=1121;SC=TGGTGAGATGTGTAGCTCTTT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=1009898;WS=1009880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	1010694	rs1128413	C	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=33;PP=1033;SC=TCTTCGTGGCCATCCTGCAGA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=1010702;WS=1010684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr11	1016928	.	CTGGCC	GTGGCC,GTGGCT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=91;MMLQ=27;MQ=51.68;NF=327,95;NR=438,187;PP=2962,2944;QD=20;SC=CCTGCTGCTGCTGGCCGAGGT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=917;TCF=406;TCR=511;TR=765,282;WE=1016941;WS=1016900;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.83:917
chr11	1016934	.	G	A	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=7.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=-10.386;QD=5.26;ReadPosRankSum=2.012;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,91:0.18:501
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chr11	1016963	rs76273000	G	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=9.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-14.016;QD=2.33;ReadPosRankSum=3.370;SOR=1.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:442,59:0.12:501
chr11	1016968	.	T	C	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.913;ClippingRankSum=0.000;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=9.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQRankSum=-14.501;QD=1.97;ReadPosRankSum=2.144;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:444,57:0.11:501
chr11	1016972	.	G	A	896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=9.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-16.576;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.321;SOR=1.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:459,55:0.11:514
chr11	1016976	rs78728217	T	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=10.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=-15.961;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.839;SOR=1.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:457,50:0.10:507
chr11	1016977	.	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=10.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-16.149;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.512;SOR=1.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:462,50:0.10:512
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chr11	1016984	rs78839362	G	A	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=9.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-19.157;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=1.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:463,57:0.11:520
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chr11	1017200	.	G	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=0.000;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=17.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQRankSum=-8.621;QD=0.49;ReadPosRankSum=-2.812;SOR=2.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,29:0.09:322
chr11	1017220	rs56238842	T	C	6804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.376;NF=75;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=0.477;SC=GCCATCTGTGTGTGGGTAGGG;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=122;TCR=159;TR=175;WE=1017248;WS=1017210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,175:0.62:281
chr11	1017231	rs35840539	A	G	6711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQRankSum=-11.222;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,164:0.61:271
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chr11	1017240	rs62891761	G	A	4228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=0.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQRankSum=-10.281;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,141:0.55:258
chr11	1017280	rs199539548	G	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=10.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQRankSum=-4.705;QD=2.43;ReadPosRankSum=-3.273;SOR=1.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:344,52:0.13:396
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chr11	1017302	rs35330958	G	C	7664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.141;NF=133;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GAAGTGTGGTGTGAGGGTGTG;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=526;TCF=317;TCR=209;TR=211;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:316,203:0.39:519
chr11	1017317	rs33943903	G	T	9852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=650;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.131;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.922;NF=141;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=1.280;SC=GGTGTGATGGGGTTGGATAGG;SOR=0.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=631;TCF=349;TCR=282;TR=251;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:389,259:0.40:648
chr11	1017325	rs55903826	A	C	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=4.832;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:532,153:0.22:685
chr11	1017337	rs76686156	TC	CA	11708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=730;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.333;NF=150;NR=135;PP=2944;ReadPosRankSum=1.767;SC=GTAGTGGTGGTCTGGAAGGAT;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=702;TCF=371;TCR=331;TR=285;WE=1017346;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:419,307:0.42:726
chr11	1017381	rs34912894	G	C	4294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=768;ExcessHet=3.0103;FS=0.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-14.826;QD=5.65;ReadPosRankSum=2.187;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:591,169:0.22:760
chr11	1017384	rs34095361	G	C	8065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=756;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-15.267;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.307;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:472,277:0.37:749
chr11	1017421	rs35549382	G	T	6902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=579;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=74;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.934;NF=109;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=0.034;SC=AAGGGTGTGGGTAGCCTGCTG;SOR=0.612;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=631;TCF=339;TCR=292;TR=238;WE=1017429;WS=1017411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:357,217:0.38:574
chr11	1017440	rs78729877	C	T	6898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-11.133;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.839;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:348,187:0.35:535
chr11	1017443	rs80266715	C	G	5301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=5.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=524;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=79;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-11.270;NF=153;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TGGTGGCCGACGTGGTGTGGG;SOR=0.317;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=629;TCF=385;TCR=244;TR=274;WE=1017451;WS=1017442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:323,148:0.31:471
chr11	1017458	.	A	G	721.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=13.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-6.607;QD=1.29;ReadPosRankSum=2.156;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:501,57:0.10:558
chr11	1017461	rs77216712	G	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=13.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-6.782;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.716;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:496,54:0.10:550
chr11	1017464	rs112874139	T	C	3455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQRankSum=-13.056;QD=7.02;ReadPosRankSum=4.307;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:372,120:0.24:492
chr11	1017466	rs201054567	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=-13.894;QD=1.97;ReadPosRankSum=4.021;SOR=1.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:450,59:0.12:509
chr11	1017470	rs75533660	G	T	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-15.010;QD=5.19;ReadPosRankSum=4.501;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:474,102:0.18:576
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chr11	1017483	rs79986665	T	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=-16.389;QD=3.78;ReadPosRankSum=4.115;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:519,92:0.15:611
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chr11	1017883	rs79644784	C	A	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=91;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.259;NF=112;NR=84;PP=2691;ReadPosRankSum=3.637;SC=GCAGAAGTGGCCATCTGTGCA;SOR=0.836;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=519;TCF=228;TCR=291;TR=196;WE=1017891;WS=1017873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,67:0.21:321
chr11	1017900	rs77920671	G	T	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-7.058;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,62:0.21:295
chr11	1017921	.	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=3.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-4.084;QD=5.71;ReadPosRankSum=-2.752;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,46:0.19:237
chr11	1017932	.	CA	TG	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-3.133;QD=0.38;ReadPosRankSum=1.818;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,17:0.08:215
chr11	1017935	rs138784536	A	G	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=18.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQRankSum=-7.040;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=1.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,39:0.20:194
chr11	1017939	.	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-3.606;QD=0.58;ReadPosRankSum=2.426;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,18:0.09:205
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chr11	1017945	.	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=6.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-2.250;QD=2.20;ReadPosRankSum=-4.643;SOR=1.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,27:0.14:192
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chr11	1017968	rs61869009	T	A	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=17.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=5.313;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.678;SOR=1.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,53:0.32:165
chr11	1017981	rs61869010	T	A	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=9.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=6.674;QD=13.82;ReadPosRankSum=4.201;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr11	1017988	rs112579249	G	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-5.632;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.553;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,35:0.22:158
chr11	1018024	.	C	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-8.004;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,55:0.33:169
chr11	1018025	rs10751677	C	A	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-8.353;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,60:0.36:169
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chr11	1018042	rs200364398	A	G	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-7.552;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.214;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,57:0.32:177
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chr11	1018215	.	G	GCA	1685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.880;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=5.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-10.288;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.828;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,54:0.23:232
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chr11	1018222	.	AAT	A	1100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.042;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=29.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-9.829;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.359;SOR=2.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,39:0.18:214
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chr11	1018483	rs78265558	C	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=6.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-13.700;QD=1.45;ReadPosRankSum=3.363;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,21:0.10:200
chr11	1018496	rs67341709	G	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=3.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-13.825;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,20:0.10:204
chr11	1019375	rs9704308	C	T	5142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=98;PP=2965;SC=TGGCGGTCGACGCCGTGGCCC;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=67;TCR=98;TR=165;WE=1019383;WS=1019365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
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chr11	1028088	rs75016849	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=327;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GGCGTGAGTCCCGGCCCCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=19;WE=1028096;WS=1028078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr11	1033240	rs61869016	T	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=19;PP=507;SC=GCCAAGCGCTTGGCCTCCCAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=1033248;WS=1033230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	1036454	rs116996199	G	A	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=16;PP=1107;SC=CCTGGCAGCGGGGGCTGGTCA;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=1036462;WS=1036444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	1075092	rs41369349	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=0.360;SC=CAGCCTGCGCGGCTCTGCTGA;SOR=1.429;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=14;WE=1075100;WS=1075082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr11	1075850	rs11825969	G	A	3780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=82;PP=2227;ReadPosRankSum=-1.032;SC=CCGGGGTGGAGTCCATCCTGC;SOR=0.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=228;TCF=93;TCR=135;TR=140;WE=1075858;WS=1075840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,169:0.63:269
chr11	1075920	rs11825977	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1130;ReadPosRankSum=0.347;SC=TAACGGGGCCGTGTGAGTGTG;SOR=0.176;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=62;WE=1075928;WS=1075910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,71:0.65:110
chr11	1077493	rs34367348	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-1.564;SC=CCACCCCAGGCGCCCAGCTTC;SOR=1.833;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=1077501;WS=1077483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	1078752	.	C	T	427	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=4;PP=427;QD=65.9673160782;SC=GCTGTGTCTGCGCCGGGCACC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=7;WE=1078772;WS=1078742;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	1078763	.	TT	GG	408	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=4;PP=408;QD=76.911312477;SC=GCCGGGCACCTTGAGCTGGGG;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=6;WE=1078772;WS=1078742;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	1078787	.	A	G	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=23;MQ=58.59;NF=1;NR=2;PP=24;QD=19.5904041824;SC=CACTCACCGCACCGGGCACCT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=3;WE=1078795;WS=1078777;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	1079532	.	C	CT	359	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=48.59;NF=4;NR=0;PP=359;QD=98.0;SC=GGGACACTCACCACGCCGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=1079545;WS=1079524;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	1079534	.	ACGCC	A	359	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=52.02;NF=4;NR=0;PP=359;QD=98.0;SC=GACACTCACCACGCCGGGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=1079545;WS=1079524;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	1079809	rs10902081	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=0.124;SC=GGCCCCGCCCCGGCACTGCCC;SOR=0.432;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=29;WE=1079817;WS=1079799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr11	1079879	rs7127117	T	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=366;SC=ACGGCTCCGCTGGGTGGTGGG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=1079887;WS=1079869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	1080880	rs201057210	CACA	C	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.021;NF=11;NR=6;PP=733;ReadPosRankSum=1.081;SC=ACAGGGTGACCACAACGATTC;SOR=1.395;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=17;WE=1080890;WS=1080870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr11	1081090	rs61732120	C	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TCTTCAAGTCCGATGGCAGTG;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=161;TCF=70;TCR=91;TR=84;WE=1081098;WS=1081080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr11	1086163	rs7926689	C	A	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1036;ReadPosRankSum=0.605;SC=CAGCCCCCCACCCCCTGCCCT;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=68;WE=1086171;WS=1086153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr11	1090501	rs35179278	C	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.663;SC=GGTCCCCCCCCAGCTCAGACC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=1090509;WS=1090491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	1093412	.	C	T	914	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MMLQ=16;MQ=43.3;NF=23;NR=53;PP=914;QD=12.483831744;SC=ACCCCAACCACGACACCCATC;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=241;TCF=95;TCR=146;TR=76;WE=1093420;WS=1093402;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:165,76:0.32:241
chr11	1093430	rs199573018	C	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=2.963;QD=2.61;ReadPosRankSum=4.855;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,41:0.26:160
chr11	1093512	.	C	A	678	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=25;MQ=58.66;NF=25;NR=29;PP=678;QD=13.199466899;SC=CTACGATGACCCCAACCCCAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=54;WE=1093520;WS=1093502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:78,54:0.41:132
chr11	1093710	rs7944723	C	G	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1381;ReadPosRankSum=0.842;SC=GCACAGCACCCATTGCTGAGT;SOR=0.467;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=83;WE=1093718;WS=1093700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,94:0.61:154
chr11	1101649	rs7480563	T	C	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.182;SC=GGTGCTGTCCTTTCTACTGGT;SOR=0.727;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=64;WE=1101657;WS=1101639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,79:0.66:120
chr11	1103137	rs11245955	G	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=10;PP=850;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CTTCCTGGCCGGGCTGGGGCT;SOR=0.407;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=47;WE=1103145;WS=1103127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr11	1103477	rs11245956	C	T	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.840;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=708;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CAGCTACCCCCGCCCACGGCA;SOR=0.298;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=41;WE=1103485;WS=1103467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr11	1103786	rs9988872	A	G	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=27;PP=1385;SC=GCCCTGCCCTAAGCCGCTGCC;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=1103794;WS=1103776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	1155265	rs35396393	G	A	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.092;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=909;ReadPosRankSum=0.243;SC=TCCCCGCTCAGGCCTGGAGGT;SOR=0.462;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=144;TCF=40;TCR=104;TR=62;WE=1155273;WS=1155255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,69:0.42:163
chr11	1156646	rs35783651	C	G	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=611;ReadPosRankSum=0.624;SC=CCGTGGTCAGCGAGCTCCTCT;SOR=0.617;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=42;WE=1156654;WS=1156636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr11	1156709	rs34664315	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=-0.896;SC=GTCCCCTGGGGGCTCAGTGTT;SOR=1.514;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=14;WE=1156717;WS=1156699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	1156750	rs36021067	C	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.215;SC=ACACTCCGGGCACACACATGC;SOR=2.187;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=1156758;WS=1156740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	1157476	rs28707071	C	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=563;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TGCAGGCAGACCCCGCCTCTG;SOR=0.488;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=40;WE=1157484;WS=1157466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,48:0.31:153
chr11	1158073	rs28691231	T	C	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=857;ReadPosRankSum=-1.390;SC=GCTCCCCCTGTGCAGACACCT;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=60;WE=1158081;WS=1158063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,77:0.57:135
chr11	1158834	rs28433367	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=1.611;SC=GCCCCCGTCCCGGGCCCCTGG;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=1158842;WS=1158824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	1159133	rs35917282	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=344;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TGGGGGTTGCGACCCAGGCCG;SOR=1.406;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=19;WE=1159141;WS=1159123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr11	1159150	rs28542750	A	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=422;ReadPosRankSum=-2.357;SC=GCCGGCAGGCACCCTCGTCTG;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=21;WE=1159158;WS=1159140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr11	1161315	rs28403537	T	C	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=51;PP=2218;SC=CTGGATGGGGTGCAGACGGTG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=120;WE=1161323;WS=1161305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	1161713	rs28404876	G	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GCCGCAGCTGGAGGGAAAGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=7;WE=1161721;WS=1161703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	1161935	rs34974357	C	A	3084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=55;PP=1941;ReadPosRankSum=0.674;SC=TGGGGTCCCGCCCCACAGCCC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=304;TCF=177;TCR=127;TR=131;WE=1161943;WS=1161925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,153:0.41:375
chr11	1213115	rs113511365	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-8.661;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:295,84:0.22:379
chr11	1213125	rs78716500	G	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=11.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-11.625;QD=4.35;ReadPosRankSum=-4.578;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,90:0.23:393
chr11	1213142	rs200544156	C	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=15.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-12.114;QD=1.35;ReadPosRankSum=-3.629;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:335,41:0.11:376
chr11	1213204	rs72479396	C	G	19883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1030;ExcessHet=3.0103;FS=2.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-4.082;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:353,654:0.65:1007
chr11	1213209	rs377214284	TG	CA	5890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1020;ExcessHet=3.0103;FS=1.420;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-3.907;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.230;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:801,198:0.20:999
chr11	1213245	rs67624660	T	A	31627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.657;NF=441;NR=317;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.213;SC=CAGTCACCAGTGACTGTCATC;SOR=0.652;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=1075;TCF=596;TCR=479;TR=758;WE=1213325;WS=1213222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:338,778:0.70:1116
chr11	1213257	rs76779582	T	C	35569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.631;QD=31.15;ReadPosRankSum=-2.718;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,815:0.71:1142
chr11	1213259	rs75991767	T	G	36096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1201;ExcessHet=3.0103;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.625;QD=30.59;ReadPosRankSum=-2.611;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:333,847:0.72:1180
chr11	1213264	rs72846341	G	A	38294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1266;ExcessHet=3.0103;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.604;QD=30.81;ReadPosRankSum=-2.550;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:334,909:0.73:1243
chr11	1213272	rs78252457	A	C	22841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1317;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.002;QD=18.62;ReadPosRankSum=3.130;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:613,614:0.50:1227
chr11	1213275	rs71251383	G	A	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1373;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.429;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1098,200:0.15:1298
chr11	1213281	rs75618268	C	T	30240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.127;NF=369;NR=326;PP=2962;ReadPosRankSum=2.511;SC=CAAAGTGGTTCGACGTGGACT;SOR=0.773;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=1282;TCF=718;TCR=564;TR=695;WE=1213325;WS=1213222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:609,771:0.56:1380
chr11	1213284	rs200981907	C	T	6801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1436;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.558;QD=5.07;ReadPosRankSum=3.747;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1025,317:0.24:1342
chr11	1213287	rs112774721	G	A	5822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1467;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.572;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1203,233:0.16:1436
chr11	1213293	rs77207494	C	T	20102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=287;NR=248;PP=2962;ReadPosRankSum=0.516;SC=ACGTGGACTTCCCATCCCCTG;SOR=0.776;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=1358;TCF=773;TCR=585;TR=535;WE=1213325;WS=1213222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:906,560:0.38:1466
chr11	1213296	rs78466479	A	G	11026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1152,339:0.23:1491
chr11	1213302	rs371630624	T	C	12112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.789;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1162,358:0.24:1520
chr11	1213311	rs80058880	C	T	12966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1574;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=8.38;ReadPosRankSum=2.269;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1156,392:0.25:1548
chr11	1213314	rs73395695	C	T	37130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1602;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=6;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=483;NR=335;PP=2962;ReadPosRankSum=2.659;SC=GACCCCACGGCGGGGACAAGG;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=1433;TCF=796;TCR=637;TR=818;WE=1213325;WS=1213222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:606,969:0.62:1575
chr11	1213317	rs76191775	G	A	13510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=2.655;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1189,420:0.26:1609
chr11	1213405	rs67262263	G	A	26337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1527;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=348;NR=385;PP=2962;ReadPosRankSum=3.150;SC=GTGCCGAGCCGAGAGCCACCC;SOR=0.595;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=1351;TCF=622;TCR=729;TR=733;WE=1213448;WS=1213395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:687,820:0.54:1507
chr11	1213416	rs78511643	G	A	9714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1450;ExcessHet=3.0103;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:940,496:0.35:1436
chr11	1213424	rs61867531	A	G	49655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1439;ExcessHet=3.0103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.77;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,1195:0.84:1428
chr11	1213428	rs61867532	T	C	36204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1402;ExcessHet=3.0103;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.01;ReadPosRankSum=1.194;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:376,1016:0.73:1392
chr11	1213440	rs61867533	T	C	47480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.537;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=418;NR=589;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.323;SC=AACACCTGGGTCAGGTGGTGC;SOR=1.028;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=1211;TCF=520;TCR=691;TR=1007;WE=1213448;WS=1213395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,1122:0.83:1349
chr11	1213460	rs200307483	G	A	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1169;ExcessHet=3.0103;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.404;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:993,159:0.14:1152
chr11	1213461	rs61867534	T	G	13519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=268;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AGTGCAGCCGTGAAGAGGGCC;SOR=0.781;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=1056;TCF=432;TCR=624;TR=432;WE=1213469;WS=1213451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:547,570:0.51:1117
chr11	1213481	rs201626282	G	A	4872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1042;ExcessHet=3.0103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.850;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:800,221:0.22:1021
chr11	1213533	rs73395699	C	T	7785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=726;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=317;PP=2962;ReadPosRankSum=-6.097;SC=ACGAGGTGCGCGTGCTCTGCT;SOR=0.836;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=706;TCF=260;TCR=446;TR=420;WE=1213541;WS=1213523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:330,363:0.52:693
chr11	1213804	rs77998608	T	C	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=6.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr11	1213804	.	TAT	CAC	1997	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10;NR=34;PP=1997;QD=46.6015426105;SC=GTCAGTTTTTTATCCAGGAAC;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=137;TCF=47;TCR=90;TR=44;WE=1213814;WS=1213794;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:93,44:0.32:137
chr11	1213806	rs28653192	T	C	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=9.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=1.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,61:0.39:155
chr11	1215271	rs71025716	GA	G	709.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.51;NF=17;NR=1;PP=695;SC=CTGTTGGGAGGAAAGCCCCAG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=1215279;WS=1215261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	1215580	rs1132433	A	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=756;ReadPosRankSum=-1.547;SC=GGGTGATGACAAACGAGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=89;TCR=96;TR=64;WE=1215588;WS=1215570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,66:0.33:200
chr11	1215698	rs28452143	A	G	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=62;PP=2965;SC=CCCGTCGACCACGCCCTGCGT;SOR=1.140;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=93;TCR=62;TR=155;WE=1215706;WS=1215688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	1216316	rs58550179	G	GC	4357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=43;PP=2874;SC=GAGATGTCCGGCTCTGGAACG;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=61;WE=1216324;WS=1216306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	1216333	rs60138698	TA	T	4247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=42;PP=2592;SC=AACGTGAGCATACCCTGACCA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=60;WE=1216341;WS=1216323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	1216440	rs28415193	G	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=644;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGTCTACCACGGTCGGGCCCA;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=39;WE=1216448;WS=1216430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr11	1216491	rs1132434	G	C	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=645;ReadPosRankSum=-1.434;SC=CCATCTGCCAGCTGATTCTGA;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=39;WE=1216499;WS=1216481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr11	1217084	rs28652890	T	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=582;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CCCAGCACCCTGCCCATCCCT;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=40;WE=1217092;WS=1217074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr11	1217228	rs28592983	T	C	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=112;PP=2789;SC=CGGCACTCTGTGCGTCCCACG;SOR=1.411;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=56;TCR=112;TR=168;WE=1217236;WS=1217218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	1218128	rs28503875	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=470;ReadPosRankSum=0.111;SC=ACGGAGAGCCGGTGAAGGTGA;SOR=0.656;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=34;WE=1218136;WS=1218118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr11	1218143	rs28515631	A	C	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1107;ReadPosRankSum=1.446;SC=AGGTGAGTGGAAGGCATGGCC;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=65;WE=1218151;WS=1218133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr11	1218708	rs35779873	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=-1.587;SC=GCCACACCGTCGGCATGGACT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=1218716;WS=1218698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	1219094	rs35700114	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.501;SC=GGGGCGGGGGACAGACTCCTA;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=1219102;WS=1219084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr11	1219118	rs28742281	T	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	1219151	rs35915689	C	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=117;ReadPosRankSum=0.267;SC=GCCGCTGCCCCGCGCCCGTGG;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=9;WE=1219159;WS=1219141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	1219773	rs34666042	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	1220171	rs34831688	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,78:0.29:267
chr11	1220462	rs35288961	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.760;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=1.315;SC=GAGCACTGGGGCATGTGGGGA;SOR=1.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=7;WE=1220470;WS=1220452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr11	1220519	rs35525357	GA	G	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.532;NF=4;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-1.374;SC=GGACTCTCTGGAAGCCCACGG;SOR=0.512;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=5;WE=1220527;WS=1220511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	1220599	rs28633254	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.276;NF=24;NR=9;PP=489;ReadPosRankSum=2.016;SC=CCCTCCAGCCTGGCGAGACCT;SOR=1.165;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=33;WE=1220607;WS=1220589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr11	1220760	rs28514396	T	C	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=499;ReadPosRankSum=0.292;SC=GGCTTCACCCTTAGATGGGTT;SOR=0.829;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=31;WE=1220768;WS=1220750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr11	1220796	rs28502687	T	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ATCCCTGCAGTGCCAGCAGAC;SOR=0.904;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=21;WE=1220804;WS=1220786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr11	1220967	rs1132436	C	T	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=1078;ReadPosRankSum=0.465;SC=TTCTGCCCGCCGCCCCCGCCC;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=70;TCR=21;TR=55;WE=1220975;WS=1220957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr11	1221264	rs35968147	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-1.910;SC=CCCAGGGCTCTAGGTGCCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=11;WE=1221272;WS=1221254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr11	1221305	rs2075844	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GAGGGGCCAGACAAAGGGCTC;SOR=0.148;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=6;WE=1221313;WS=1221295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr11	1221592	rs28728088	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=-0.424;SC=GCCCAGAGCTTGGCACGGCGC;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=12;WE=1221600;WS=1221582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	1221817	rs1132440	G	C	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1271;ReadPosRankSum=1.174;SC=TGGGCCGGCGGTGCCCTGCGC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=79;WE=1221825;WS=1221807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,97:0.69:141
chr11	1221985	rs3087562	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=546;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CCTCTGAGCTCGGCTTCCAAG;SOR=0.830;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=39;WE=1221993;WS=1221975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,47:0.36:131
chr11	1248197	rs908224	G	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=5;PP=239;SC=AGGGCTGGGGGGGGGTTGGGT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=1248205;WS=1248187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	1248491	rs908223	T	G	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=34;PP=1636;SC=GTTGCCAGTGTGGGGATCAGA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=1248499;WS=1248481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	1248731	rs2075854	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=187;ReadPosRankSum=-0.504;SC=ACCGGGCACCAGGCAGGGAGG;SOR=0.754;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=12;WE=1248739;WS=1248721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	1250384	rs2471912	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-1.371;SC=GCCCAGCCCCACCTCCTTTTG;SOR=0.250;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=16;WE=1250392;WS=1250374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr11	1250488	rs2075859	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=336;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CGCAGCTCTGCGAGGACCACT;SOR=0.893;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=30;WE=1250496;WS=1250478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr11	1250603	rs2075860	G	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-1.115;SC=CTCATCAGGCGTGGAAGCAGA;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=16;WE=1250611;WS=1250593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	1251390	rs56118514	G	A	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1719;ReadPosRankSum=0.305;SC=GCTTGGGGCCGGGTCTTCAGA;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=102;WE=1251398;WS=1251380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,122:0.61:200
chr11	1252047	rs2672807	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=364;SC=CAGGTCCAGGTCTGAGCTTCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=1252055;WS=1252037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	1252708	rs2735709	G	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.082;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=708;ReadPosRankSum=-1.197;SC=AGACAGGCCTGGGGCTGCAGC;SOR=0.686;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=61;WE=1252716;WS=1252698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,71:0.34:209
chr11	1253401	rs12421917	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=280;ReadPosRankSum=0.305;SC=GTACTCCTCGCCCCCACCCCC;SOR=0.570;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=14;WE=1253409;WS=1253391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr11	1253856	rs1318321	T	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=927;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GACGCCCCGATGCCTCCCACC;SOR=1.058;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=73;WE=1253864;WS=1253846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,93:0.47:196
chr11	1253942	rs908229	T	C	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1435;ReadPosRankSum=1.776;SC=TGTCCTCCTATGTGCACGCCT;SOR=0.921;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=95;WE=1253950;WS=1253932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,130:0.56:232
chr11	1253969	rs72846370	A	G	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=4.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,58:0.32:183
chr11	1253976	rs76956995	A	G	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=8.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,53:0.32:165
chr11	1253980	rs202127660	A	G	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=11.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-3.095;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,51:0.34:151
chr11	1254038	rs11026355	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=165;ReadPosRankSum=1.018;SC=TGTCCACACCGCGTGGGGGTG;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=12;WE=1254046;WS=1254028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr11	1254599	rs2672806	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	1254940	rs2735719	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.911;SC=GAGGCCCAGCGTTCGGCGGGG;SOR=0.070;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=23;WE=1254948;WS=1254930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr11	1255089	rs147340559	CCCCTG	C	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.109;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.578;NF=1;NR=12;PP=504;ReadPosRankSum=0.438;SC=GTAAGTGCCACCCCTGCCCTG;SOR=0.048;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=13;WE=1255101;WS=1255079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
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chr11	1258175	rs80092233	C	T	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=38.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-4.384;SOR=1.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,78:0.26:303
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chr11	1258199	rs80200632	C	T	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=15.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,95:0.28:338
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chr11	1258240	rs77287508	CA	TG	3970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=2944;ReadPosRankSum=0.708;SC=GTGGGGGACGCACTGGAGTTT;SOR=0.894;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=273;TCF=140;TCR=133;TR=98;WE=1258249;WS=1258207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,109:0.35:312
chr11	1258283	rs78669250	G	A	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.730;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,91:0.39:232
chr11	1258286	rs77996005	C	T	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.773;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,90:0.39:229
chr11	1258295	rs79118814	A	G	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,83:0.40:206
chr11	1261640	rs2735733	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=278;ReadPosRankSum=0.252;SC=GGCCCAGTACCGTCTGGGTGA;SOR=0.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=24;WE=1261648;WS=1261630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr11	1263687	rs55933911	C	T	4063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=76;PP=2327;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CCTGCAAGAACGAAGACCAGA;SOR=0.641;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=248;TCF=126;TCR=122;TR=160;WE=1263695;WS=1263677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,180:0.65:279
chr11	1267325	rs55813014	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.855;NF=26;NR=24;PP=645;ReadPosRankSum=2.328;SC=ATCCCCTCCTTCACCCTTGGG;SOR=0.900;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=50;WE=1267333;WS=1267315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,32:0.20:157
chr11	1267562	rs60268710	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.888;NF=9;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=0.172;SC=ACTGGCCCCACGGCCACCCCG;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=20;WE=1267570;WS=1267552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr11	1271321	rs2943517	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQRankSum=-1.686;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.321;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr11	1272226	rs2943512	A	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.474;NF=23;NR=12;PP=429;ReadPosRankSum=1.181;SC=AACACCCATCACCCCAGTGCT;SOR=0.927;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=35;WE=1272234;WS=1272216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr11	1279486	rs2249550	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,18:0.21:85
chr11	1280301	rs2249686	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=595;ReadPosRankSum=1.297;SC=GGTGAGACCCGAGGCACCTGC;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=41;WE=1280309;WS=1280291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr11	1281134	rs2857476	T	C	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=775;ReadPosRankSum=0.529;SC=TCACCCCCAATGGGGCTCTGC;SOR=0.794;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=61;WE=1281142;WS=1281124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,76:0.41:184
chr11	1284227	rs12417955	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.979;SC=TAGGCATAGCAGGATGCAGGG;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=20;WE=1284235;WS=1284217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,25:0.27:94
chr11	1304706	rs3838783	TG	T	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=457;ReadPosRankSum=1.680;SC=TGCCTGGGCATGGGGGCTGGG;SOR=0.775;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=15;WE=1304714;WS=1304696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr11	1307228	rs72846381	G	A	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=778;ReadPosRankSum=0.295;SC=GGGAGCACACGCACCTGTGAT;SOR=0.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=46;WE=1307236;WS=1307218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr11	1309956	rs3750920	C	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TCAGGGACTCCGGGATGGTGA;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=66;WE=1309964;WS=1309946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,80:0.62:130
chr11	1432691	rs61868960	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=27;PP=1191;SC=CCTGCATCTGTCCTTCCTCCC;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=1432699;WS=1432681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	1464903	rs56896587	CG	C	1023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=25;PP=760;SC=CAGAGCGTGGCGGGGGGGCGC;SOR=2.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=27;WE=1464911;WS=1464893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	1471154	rs11028332	C	T	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=15;PP=376;SC=GGCAGCCTCGCGGACCCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=1471162;WS=1471144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	1472050	rs61869028	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GAGGCGCCAGAGTGGGGCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=14;WE=1472058;WS=1472040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	1472475	rs3838784	TG	T	1061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.644;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=684;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CCAGTGCCCCTGGGGGGGCTG;SOR=0.238;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=28;WE=1472483;WS=1472465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr11	1477797	rs61869032	C	T	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=792;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GGCCCAGGCCCGTCCAGGGCA;SOR=0.605;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=46;WE=1477805;WS=1477787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr11	1481610	rs28555282	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CGTCGAGGCCTCTTCGTTCAT;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=1481618;WS=1481600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	1481930	rs4963048	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.408;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr11	1491096	rs9440	G	A	4348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=52;PP=2800;SC=GGGGCTGCACGGAGACCAGAG;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=75;TCR=52;TR=127;WE=1491104;WS=1491086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	1492445	rs4881724	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=985;SC=CCGGCACAGGAGCTTGGTCAC;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=1492453;WS=1492435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	1501670	rs10742185	G	C	5133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=87;PP=2723;SC=TGCAGAACTCGGAGATGGTGC;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=167;WE=1501678;WS=1501660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	1502097	rs10767696	A	G	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=62;PP=2025;SC=TCTTGCCATTAGGCTTGGCTT;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=37;TCR=62;TR=99;WE=1502105;WS=1502087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	1502401	rs4881735	A	C	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=14;PP=1247;SC=CCCCTCACCAAGTCCTCCAAC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=1502409;WS=1502391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	1507512	rs1881502	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=325;SC=CCTGGACAGCTTGCGTGTGGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=1507520;WS=1507508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	1507731	rs1881503	A	G	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=98;PP=2965;SC=TCCACTTTGCAGGGACTGGCC;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=87;TCR=98;TR=185;WE=1507739;WS=1507721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	1509238	rs2334554	T	C	6590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=99;PP=2965;SC=CCCTAAGCCATGCTCTGAGCA;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=204;WE=1509246;WS=1509228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr11	1509421	rs2334553	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=350;SC=CCAACAGCAGGGACACAGGTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1509429;WS=1509411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	1576005	rs59483236	T	C	85.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	1576137	rs11604635	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=102;SC=ACAGAGGGAACGGGAACAGGA;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=1576145;WS=1576127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	1576235	rs6578504	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=6;PP=209;SC=GGCGGCTGGCTGGGGCGGGAT;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=1576243;WS=1576225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	1576283	rs11603496	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=9;PP=375;SC=CTCAGGACTGGGTCCTGCCCT;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=1576291;WS=1576273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	1576863	rs12576976	A	G	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=7;PP=231;SC=CTCTCCTGCAATGGTGCCACC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=1576871;WS=1576853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	1585277	rs3740620	C	T	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=49;PP=1654;SC=GCCCTGGCCCCGTCCCAGATA;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=88;WE=1585285;WS=1585267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	1606120	.	ACCACAGCCACCCTTGGATCCCCCACAAGAG	A	544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=1221;SC=CACAGCCGGAACCACAGCCAC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=1606157;WS=1606110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	1619172	.	ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG	A	877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=43.89;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	1619202	.	G	A	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=59.02;NF=4;NR=9;PP=197;QD=17.8285548113;SC=CCCCCTTGGAGCCCCCACAGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=13;WE=1619210;WS=1619192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,13:0.45:29
chr11	1628844	rs1989592	A	G	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=28;PP=1749;SC=CACAGCTGCAATCATTCCTGG;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=78;WE=1628852;WS=1628834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	1628965	rs57186801	G	A	6337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=74;PP=2626;SC=GCTTGCAGCAGCTGGACTGGC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=68;TCR=74;TR=142;WE=1628973;WS=1628955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	1628992	rs60210378	G	A	5752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=64;PP=2183;SC=ATGACCCACAGCCTGAGGAGC;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=121;WE=1629000;WS=1628982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	1630342	rs10837527	T	A	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=14;PP=450;SC=AGTTTTCCTCTATTAATTCTT;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=1630350;WS=1630332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	1651169	rs71454095	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=6;PP=430;SC=GCTGTGGCTCTGGCTGTGGGG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=1651177;WS=1651162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	1651190	.	CGGCTGTGGA	C	438	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=17;MQ=50.12;NF=1;NR=4;PP=438;QD=92.4;SC=GCTGTGGCTCCGGCTGTGGAG;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=5;WE=1651207;WS=1651180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,5:0.31:16
chr11	1651199	.	A	G	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=15;MQ=48.14;NF=3;NR=2;PP=110;QD=28.9542425094;SC=CCGGCTGTGGAGGCTGTGGGG;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=5;WE=1651207;WS=1651180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	1651199	.	A	AGGCTGTGGCTCC	118.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;QD=29.55;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,4:1.00:4
chr11	1651228	rs71454096	C	G	41.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=10;NR=11;PP=386;SC=TCCGGCTGTGCGGGCTGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=1651236;WS=1651218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:0,2:1.00:2
chr11	1651613	.	TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC	T	3872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=35;PP=2915;SC=GCTGTAAGCCTTACTGCTGCC;SOR=1.007;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=52;WE=1651650;WS=1651603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	1651830	rs4752770	G	T	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=60;PP=1793;SC=GAAGGGCCCGGCTGCCCAGCT;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=83;WE=1651838;WS=1651820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	1651917	rs4752769	C	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=441;SC=CACCAGTGCTCCCGAAACTGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=1651925;WS=1651907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	1718833	rs73404785	T	G	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=46;PP=1847;ReadPosRankSum=-1.032;SC=GGCCAGCTGCTGTGTCCCCAT;SOR=1.040;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=192;TCF=113;TCR=79;TR=121;WE=1718845;WS=1718823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,138:0.61:226
chr11	1756681	rs7943617	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=-1.535;SC=AGGAGGACAGGAAATGGGCAG;SOR=0.362;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=25;WE=1756689;WS=1756671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr11	1770224	rs111693235	C	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=423;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TGCCGCAGCCCCCCGGACGGC;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=31;WE=1770232;WS=1770214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr11	1771797	rs3740621	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=528;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCTGTCTGCCTGCCTGTGCCT;SOR=0.585;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=39;WE=1771805;WS=1771787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr11	1774666	rs12214	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=600;ReadPosRankSum=0.342;SC=GAGGGGCCGCTGGGCCAGGGG;SOR=1.064;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=38;WE=1774674;WS=1774656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr11	1774934	rs112379600	A	G	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=1230;ReadPosRankSum=0.829;SC=ACCCAGGCCTAGCACCACCCG;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=65;WE=1774942;WS=1774924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,74:0.72:103
chr11	1776024	rs55725229	TC	T	784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=835;SC=CTTGCCCAGCTCCCACTACTC;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=1776032;WS=1776014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	1776332	rs2292963	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=1.328;SC=GAGTAAGAGGGTGAATGTGGC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=9;WE=1776340;WS=1776322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr11	1778496	rs56363318	C	T	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=12;PP=928;ReadPosRankSum=1.669;SC=GAAGGCTCCCCGTCCAGCCCC;SOR=1.332;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=54;WE=1778504;WS=1778486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr11	1780205	rs11555039	A	G	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TCACCGACACAGTGTCCTGGC;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=88;WE=1780213;WS=1780195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,104:0.66:158
chr11	1780867	rs2230067	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=-1.676;SC=CGTAGTACTGGGCCTGGCAGG;SOR=1.402;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=23;WE=1780875;WS=1780857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr11	1782594	rs17571	G	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.422;SC=GGCTGGCACCGCCTGGGAGTA;SOR=0.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=80;WE=1782602;WS=1782584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,94:0.58:163
chr11	1782761	rs72850961	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=280;ReadPosRankSum=1.737;SC=ACGCTGCCAATGCTGCACATC;SOR=1.008;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=22;WE=1782769;WS=1782751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr11	1785401	rs144932926	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=0.963;SC=CGGCCTGGCCTGGGGTCGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=8;WE=1785409;WS=1785391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	1853107	rs616594	C	T	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=41;PP=1983;SC=TGGCCGGCCACAGGAAGTGGT;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=1853129;WS=1853097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	1853121	rs867839	C	T	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=746;ReadPosRankSum=2.048;SC=AAGTGGTGGGCGTCAGGTGAG;SOR=0.802;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=47;WE=1853129;WS=1853097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr11	1855854	rs2063551	G	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=581;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGTGGTGCGTGCTGGGGTAGA;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=37;WE=1855862;WS=1855844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr11	1857042	rs907605	G	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GTCATGCAAGGGCTGCCCGGG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=1857050;WS=1857032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	1857112	rs907606	C	A	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=15;PP=1485;ReadPosRankSum=0.359;SC=CCAACTCACTCCAGGTGCAAC;SOR=0.951;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=68;WE=1857120;WS=1857102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr11	1857173	rs564271	T	C	4942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=66;PP=2775;SC=GCAATGGGGGTGCCTGCAGCT;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=152;WE=1857181;WS=1857163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	1857747	rs3741232	T	C	3618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.20;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,93:0.57:163
chr11	1857751	rs3741231	C	G	3585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=4.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.27;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,92:0.57:161
chr11	1857930	rs3741229	G	A	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.070;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=447;ReadPosRankSum=0.453;SC=GGGGGTCTGAGCCCCAACTCG;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=29;WE=1857938;WS=1857920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr11	1858572	rs2292474	C	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1164;ReadPosRankSum=1.401;SC=CATTGCCCAGCGGCACCCCCT;SOR=0.965;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=63;WE=1858580;WS=1858562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,64:0.65:99
chr11	1861225	rs1877444	C	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=-2.965;SC=GCCCCACCCACCCACCAAGAC;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=1861233;WS=1861215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	1861760	rs907610	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=38;PP=1458;SC=CACCGCAGAGTGTGATGCTGC;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=1861768;WS=1861750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr11	1890971	rs76102571	C	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.163;NF=8;NR=26;PP=539;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CGAGGGCTGGCGAGCTTGCCA;SOR=1.132;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=104;TCF=29;TCR=75;TR=34;WE=1890979;WS=1890961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
chr11	1891035	rs61278563	G	GA	1055.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=1026;SC=GGGCGTGGGGGGGGCTGGTTT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=26;WE=1891043;WS=1891025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	1891284	rs688601	T	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GTAATGGGGATGATAGGACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=1891292;WS=1891274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	1891319	rs61868778	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=0.886;SC=ATTGTGAGGACGGAGGCGCTG;SOR=0.072;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=1891327;WS=1891309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	1891905	rs12416967	C	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	1901467	rs2271439	A	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=19;PP=521;SC=GAGCAGCCCCATAACGCGTGC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=1901475;WS=1901457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	1902635	rs536462	G	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=16;PP=838;SC=AGCCGCCCAGGCCTAAGCTCC;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=1902643;WS=1902625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	1902793	rs11545725	A	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.445;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=138;ReadPosRankSum=0.826;SC=GAGCCCCCCCAGTGCAGGAGT;SOR=0.411;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=11;WE=1902801;WS=1902783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr11	1905447	.	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=315;ReadPosRankSum=0.184;SC=GAGTAGCTGGGGAGATGGAGG;SOR=1.061;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=18;WE=1905455;WS=1905437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	1910707	rs613638	T	C	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=41;PP=1484;SC=TCTGTGGGGGTGGGCACCTCT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=82;WE=1910715;WS=1910697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	1911115	rs11041692	T	C	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=44;PP=1442;SC=GCCTGGACTGTGGTGGGCAGT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=1911123;WS=1911105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	1911439	rs17173834	G	T	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=43;NR=61;PP=1984;SC=TTCTGCAGGGGTGATGCCACG;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=104;WE=1911447;WS=1911429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	1950302	rs629990	A	G	6135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=112;NR=80;PP=2965;SC=CCGCAGCCGCACTGGCTTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=112;TCR=80;TR=192;WE=1950310;WS=1950292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	1950906	rs2292473	T	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=9;PP=599;SC=TTGGGGGTACTCCCAGCTGAA;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=1950914;WS=1950896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	1950925	rs2292471	T	C	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=12;PP=747;SC=AAAAGGACGGTGGCCTTCAGT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=1950933;WS=1950915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	1956212	rs513735	T	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=73;PP=2298;SC=AGAGCAGCCATCTCCCTGCGT;SOR=1.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=99;WE=1956220;WS=1956202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	1961701	rs375322681	TCTCA	T	294.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.47;NF=11;NR=0;PP=522;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=1961712;WS=1961695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	1961869	rs11041941	T	C	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=59;PP=2480;SC=CATGGCTGTCTATGTAGATTA;SOR=0.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=130;WE=1961877;WS=1961859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	1976988	rs177720	A	G	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=49;PP=1669;SC=TGATTTATCAACTGCCGCACG;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=1976996;WS=1976978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	1993975	rs190063	C	A	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=30;PP=1062;SC=TCAGGATGGACGTCTTCTACT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=1993983;WS=1993965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	2016619	rs3741219	A	G	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=33;PP=1603;SC=CGGGCCCTGCACAGGCACTTG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=2016627;WS=2016609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	2016924	rs10840159	A	G	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=42;PP=1446;SC=GGGGGTGGCCATGAAGATGGA;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=2016932;WS=2016914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	2017017	rs2839702	A	C	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=36;SC=TGGTTCCTCTAGCTTCACCTA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=2017025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	2017110	rs2839701	C	G	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=48;PP=2239;SC=GCTCACCTTCCAGAGCCGATT;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=110;WE=2017118;WS=2017100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	2017439	rs3024270	C	G	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=44;PP=1682;SC=AGACAGAGGTCGGGGCAGTGA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=2017447;WS=2017429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	2018168	rs2067051	C	T	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=61;PP=2609;SC=CTCCTGGTGACGTCCTGCTGC;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=137;WE=2018176;WS=2018158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	2018336	rs2075745	A	T	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=56;PP=2254;SC=GTCCCCTGCCATGTCCCTGTC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=101;WE=2018344;WS=2018326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	2018449	rs2075744	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=60;NR=53;PP=2331;SC=CGGGCCCATAACCCCCCAGCC;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=2018457;WS=2018439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	2018853	rs2839698	G	A	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=56;PP=2186;SC=ATGCCTGGGCGCCTACTCCAC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=110;WE=2018861;WS=2018843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	2156536	rs3213225	G	A	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=11;PP=783;SC=GAGGTTGGGCGTCCTCACCGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=2156544;WS=2156526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	2161858	rs3741212	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=1.152;SC=CTTTCCCCACAAATGAGATCT;SOR=0.814;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=14;WE=2161866;WS=2161848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr11	2167543	rs1003483	T	G	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=75;PP=2383;SC=CCCAGCTCCTTTCTCCAAGGG;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=131;WE=2167551;WS=2167533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	2167618	rs1003484	A	G	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=34;PP=1085;SC=CCTTGCGCTCACTCCCCTCGC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=2167626;WS=2167608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	2169014	rs10770125	A	G	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=28;PP=888;SC=CTCCCACACAAGCTCGGTGGT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=2169022;WS=2169004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	2175292	.	C	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.150;SC=CCTCTCAGCTCTCACCCTTCA;SOR=0.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=2175300;WS=2175282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	2181060	rs3842753	T	G	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=44;PP=2127;SC=GCGGCGGGTGTGGGGCTGCCT;SOR=0.988;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=103;WE=2181068;WS=2181050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	2182004	rs5506	A	G	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=33;PP=1900;SC=AGCAATGGGCAGTTGGCTCAC;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=99;WE=2182012;WS=2181994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	2182224	rs689	A	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=425;SC=GTGATCTGGGAGACAGGCAGG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=2182232;WS=2182214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	2186335	rs2070762	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GGCTGCTGCAACCAGGGGTCG;SOR=0.073;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=2186343;WS=2186325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	2187071	rs6578990	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=17;PP=1164;SC=GTGACCAGGATACCACCCCCA;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=2187079;WS=2187061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	2187398	rs4072823	T	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=28;PP=765;SC=GACACTTCCCTGGCGGCAGAG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=2187406;WS=2187388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	2187855	rs12419447	G	C	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=1113;ReadPosRankSum=0.423;SC=GCCAGGGCGCGCACTCACGGC;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=64;WE=2187863;WS=2187845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,76:0.56:136
chr11	2188238	rs6357	C	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=688;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CGTAGAGGCCCTTCAGCGTGG;SOR=0.525;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=42;WE=2188246;WS=2188228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr11	2188566	rs7925924	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=511;SC=TTAGTCTCTCCTGTTGTGCCA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=2188574;WS=2188556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	2189185	rs4074905	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GGGGATGCACGGGTCAGGAGG;SOR=0.982;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=21;WE=2189193;WS=2189175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr11	2189983	rs4930043	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=0.935;SC=GGAGGCACATCTGGCTGGCTG;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=10;WE=2189991;WS=2189973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	2193001	rs74555599	C	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=419;ReadPosRankSum=-1.094;SC=GGCGTGGTGGCGTCGGGGGTG;SOR=0.843;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=30;WE=2193009;WS=2192991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr11	2194175	rs10743149	T	C	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=827;SC=GGCCAGAGCCTGCCTTGACAA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=2194183;WS=2194165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	2194420	rs10770142	G	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CACTGTGGCAGCCAGAGCTGG;SOR=0.662;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=7;WE=2194428;WS=2194410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	2320558	rs16928079	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.032;SC=CTCGCTGTGACGCAGGTGGGA;SOR=1.329;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=5;WE=2320566;WS=2320549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	2320884	rs1501466	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-1.899;SC=GAACAAGGGCACCATGGGCGG;SOR=0.626;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=32;WE=2320892;WS=2320874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr11	2322954	rs16928084	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=805;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GGCCCAGTCCACACTTGCTCA;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=58;WE=2322962;WS=2322944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,73:0.35:206
chr11	2323029	rs756924	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=930;ReadPosRankSum=-2.621;SC=CCACACCAGGTCCTGCCCATG;SOR=0.785;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=58;WE=2323037;WS=2323019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr11	2323198	rs734095	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=0.535;SC=CTGCCCCTCCCCTTCCTGCCT;SOR=1.162;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=2323206;WS=2323188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	2323528	rs2074021	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=0.723;SC=ACAGGGATTATCCCTCCCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=10;WE=2323536;WS=2323518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	2324041	rs2074022	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=572;ReadPosRankSum=0.943;SC=CAGCAGTCCCATGCCCCACAC;SOR=0.687;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=47;WE=2324049;WS=2324031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr11	2324852	rs2651824	A	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=591;SC=GAGGTCAGGGATACTGCCTTA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=2324860;WS=2324842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	2329995	rs11554947	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=399;ReadPosRankSum=0.555;SC=TGGCGTTCTGCGCACAGGTGC;SOR=0.744;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=32;WE=2330003;WS=2329985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr11	2330077	rs2234297	C	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=405;ReadPosRankSum=-0.915;SC=AGTGGAGGGTCCCCCAGTAAG;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=32;WE=2330085;WS=2330067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr11	2330400	rs2521273	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=389;ReadPosRankSum=-2.780;SC=CTTGGCCTTAGGGGTTGACTA;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=26;WE=2330408;WS=2330390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr11	2330479	rs2521274	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=695;ReadPosRankSum=0.408;SC=TGGGGCAGACGGTACCAGTGG;SOR=0.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=44;WE=2330487;WS=2330469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr11	2330563	rs2521275	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=478;ReadPosRankSum=0.884;SC=CCCATCCTTCCGTCCTGGATG;SOR=0.779;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=35;WE=2330571;WS=2330553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr11	2334740	rs739546	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=-0.955;SC=TCCGCTTTGGGGAGATCCACC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=2334748;WS=2334730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr11	2337012	rs11022252	G	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=449;SC=GAACCAGGAAGCTGGGACTGT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=2337020;WS=2337002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	2356471	rs9645649	G	A	117.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5952;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=42.83;MQRankSum=0.431;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=1.383;SC=CAGACATTCCGAAAAGTTCGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=2356479;WS=2356461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr11	2356603	rs2651795	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.770;NF=23;NR=13;PP=521;ReadPosRankSum=-1.937;SC=TCCAACTTGTTGAGACTTGGC;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=36;WE=2356611;WS=2356593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr11	2356769	rs2651794	T	C	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.606;NF=55;NR=33;PP=1802;ReadPosRankSum=-2.159;SC=TACACCTGGATTACCTTGCCA;SOR=0.987;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=88;WE=2356777;WS=2356759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr11	2357108	rs2173888	C	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TGTTGGACATCCTCACCAACA;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=2357116;WS=2357098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	2400338	rs2651796	C	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=586;ReadPosRankSum=-1.730;SC=GGACCTCAGCCGTTGCTTAGT;SOR=0.885;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=40;WE=2400346;WS=2400328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr11	2407084	rs71029143	G	GT	4367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=60;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TACAAGAAACGTGCTAGAACA;SOR=0.832;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=34;TCR=107;TR=77;WE=2407092;WS=2407074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,138:0.58:237
chr11	2424684	rs2234283	A	C	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=44;PP=1844;SC=TGGGGCAGCCACCATGGAGGC;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=2424692;WS=2424674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	2427291	rs800342	A	C	3721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=68;PP=2260;ReadPosRankSum=1.304;SC=GCTCTCTCAGACCCCCGAGGT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=275;TCF=141;TCR=134;TR=143;WE=2427299;WS=2427281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,173:0.54:323
chr11	2428307	rs138931856	CCTCGGCCTCACCCAGGTGCTCCCGCTTGTG	C	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.992;NF=0;NR=2;PP=738;ReadPosRankSum=1.008;SC=GGACCCGCCACCTCGGCCTCA;SOR=1.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=2;WE=2428344;WS=2428297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	2432666	rs34364959	C	T	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=839;ReadPosRankSum=0.789;SC=TCCAGGCGGCCGTCATGGGGG;SOR=0.646;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=57;WE=2432674;WS=2432656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,64:0.40:159
chr11	2432820	rs2651822	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=852;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CAGGCAGGGGATTGCTGTCCC;SOR=0.541;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=64;WE=2432828;WS=2432810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,68:0.34:199
chr11	2432964	rs2074234	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=386;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TGGCGAGGACTGTGCGGCCAG;SOR=0.532;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=31;WE=2432972;WS=2432954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr11	2433568	rs148615642	A	AGGATCAGGGTTCAGCGTGCCATGG	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	2434628	rs11601529	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr11	2434684	rs11601544	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TCCTGGCCGGGCAGCTCACAG;SOR=0.376;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=15;WE=2434692;WS=2434674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr11	2434840	rs11605894	C	T	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=790;ReadPosRankSum=2.546;SC=GCAAAACTGTCGGCTCCAACT;SOR=0.461;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=61;WE=2434848;WS=2434830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr11	2435946	rs4929981	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=0.565;SC=GTCACTCACCAAGGGCCAGCC;SOR=0.840;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=13;WE=2435954;WS=2435936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr11	2436733	rs11605072	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=367;ReadPosRankSum=-2.360;SC=AGGGAAGGGGGACAAGAGAGT;SOR=1.040;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=26;WE=2436741;WS=2436723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr11	2438963	rs34350821	C	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=-2.410;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
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chr11	2441646	rs11607968	G	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CTGCGCCCATGCAGGGAGACG;SOR=0.375;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=17;WE=2441654;WS=2441636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr11	2441686	rs35998237	T	TG	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=178;ReadPosRankSum=0.094;SC=CAGCTTGGGCTGGTCCCGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=7;WE=2441694;WS=2441676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr11	2444094	rs2301699	C	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=852;ReadPosRankSum=-2.556;SC=GGAAATGGGGCCTCATGGGTT;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=55;WE=2444102;WS=2444084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr11	2542605	rs10400376	TA	GG	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=24;PP=2858;SC=CACTGTGTGTTATCCGGTGTC;SOR=1.439;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=71;WE=2542614;WS=2542595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	2549329	rs145292450	TGG	T	1541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=1130;SC=CCCCATAAGGTGGGGGGCAGA;SOR=3.086;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=32;WE=2549338;WS=2549319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	2593070	.	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-1.030;SC=CTGCGCCTGAGAGGGAGATTC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=2593078;WS=2593065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr11	2593416	rs12786951	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=0.770;SC=ACACTAGGACAGCTTGAGATG;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=2593424;WS=2593406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	2593977	rs4930127	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=318;ReadPosRankSum=-0.981;SC=GCGGCGTAGGACGCCCAGTGA;SOR=0.723;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=15;WE=2593985;WS=2593967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr11	2683357	rs760419	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-1.216;SC=AGGGGACTGGAGCTCAAGGAG;SOR=0.425;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=17;WE=2683365;WS=2683347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr11	2789856	rs163161	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=4;PP=297;SC=CCACTCACAGATGAGGTGAAA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=2789864;WS=2789850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	2790163	rs11024034	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=2.178;SC=AGCCCTGTGCTGAGCCTTCCT;SOR=0.297;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=14;WE=2790171;WS=2790153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr11	2797320	rs163150	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=579;SC=GAGGGTGCCCAGGTCCTGCCC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=2797328;WS=2797310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	2798448	rs163148	A	G	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=9;PP=191;SC=TCCAAAGTACATTTTACAAAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=2798456;WS=2798438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	2905204	rs34289096	G	GC	1515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.474;NF=8;NR=29;PP=917;ReadPosRankSum=0.583;SC=GGCCCTCCGCGCCCCCCCAGG;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=37;WE=2905212;WS=2905194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr11	2906196	.	ACCGCGACCGGAG	A	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=2;PP=762;SC=CAGGACCGCGACCGCGACCGG;SOR=2.093;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=2906215;WS=2906186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	2906803	rs188494894	C	T	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=642;ReadPosRankSum=1.172;SC=AGGGCGGAGGCCGGGCGCAAG;SOR=0.988;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=36;WE=2906811;WS=2906793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr11	2920953	rs75027200	CA	C	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.201;NF=1;NR=20;PP=307;ReadPosRankSum=1.422;SC=CTGTTCATGACAAAAAAAAAG;SOR=0.957;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=21;WE=2920961;WS=2920942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr11	2924610	rs1048047	G	A	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GACCAGGGCCGGTCCCCCGGC;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=67;WE=2924618;WS=2924600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,79:0.65:121
chr11	2924640	rs146413382	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=816;ReadPosRankSum=0.752;SC=GCTCTAGGCCGGTCCTCGGTC;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=55;WE=2924648;WS=2924630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,65:0.35:188
chr11	2924850	rs34816459	T	TC	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1132;SC=CAGTTGGGACTCATGCCACGC;SOR=4.332;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=2924858;WS=2924840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	2929552	rs429886	A	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=52;PP=1693;SC=GCGGGCCGGTATTTGGCAGGT;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=90;WE=2929560;WS=2929542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	2929659	rs424663	G	A	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=364;SC=ACCCCACACCGGACCCCCCTG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=2929667;WS=2929649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	2930594	rs67769451	CG	C	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=327;SC=CAGGTAGGGCCGGGGGGACTG;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=2930602;WS=2930584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	2930656	rs2286660	T	G	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=115;SC=CCGGGACACCTCCAGGGAGGT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=2930664;WS=2930646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	2939392	rs445679	G	A	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=55;PP=1658;SC=GCCAGGGCCCGGCCCTTCCTC;SOR=1.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=74;WE=2939400;WS=2939382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	2940492	rs450244	T	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=20;PP=1525;SC=GGCGCCAAGGTCGGGGTGTGG;SOR=1.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=2940500;WS=2940482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	2950558	rs13390	A	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=844;ReadPosRankSum=0.795;SC=CGCTTCTCCAACTCGCCCTCG;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=51;WE=2950566;WS=2950548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,60:0.61:98
chr11	2950683	.	TGCCCCTCCCCGCCCC	T	174	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.00;ReadPosRankSum=1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr11	3028039	.	C	T	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1089;ReadPosRankSum=0.266;SC=AGCCCAGCCCCGGGAGCTCTC;SOR=0.657;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=82;WE=3028047;WS=3028029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,103:0.45:229
chr11	3050210	rs434114	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=375;ReadPosRankSum=0.137;SC=TCCCTAGGGAAGGCCCTTGTG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=21;WE=3050218;WS=3050200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr11	3061780	rs399565	C	T	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=863;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CTGAGTGTCACGGGAACTCAG;SOR=0.868;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=54;WE=3061788;WS=3061770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,74:0.73:101
chr11	3061949	rs2285390	C	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=0.641;SC=TTACTTATGGCATTAAAATTT;SOR=1.341;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=23;WE=3061957;WS=3061939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr11	3061992	rs369461	T	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=307;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AATTCAGTCTTGATTCCTCAA;SOR=0.061;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=16;WE=3062000;WS=3061982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr11	3076018	rs7934892	T	C	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=137;SC=GAGCAGTGCCTGGCACAGACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=3076026;WS=3076008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	3076257	rs7945933	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=395;ReadPosRankSum=0.446;SC=CCTTCAAGACCGCAAAGGAAA;SOR=0.404;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=27;WE=3076265;WS=3076247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr11	3076285	rs406598	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=0.898;SC=CACCCAGTGAGATCAGGAAAG;SOR=0.404;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=24;WE=3076293;WS=3076275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr11	3109284	rs3217567	G	GC	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCCCGCAGCGCCTTGTGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=4;WE=3109292;WS=3109274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	3109403	rs2289999	A	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr11	3109408	rs2289998	C	T	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.334;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr11	3109426	rs10160757	T	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.673;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=657;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AGCTCTGCCCTCAGGGCTCCT;SOR=1.066;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=43;WE=3109434;WS=3109416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr11	3110956	rs895564	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=-1.955;SC=CTTGTGGGTTCCAGCTCCGAT;SOR=1.445;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=11;WE=3110964;WS=3110946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	3110976	rs895563	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=0.551;SC=TGACAACCCCAGCCGCGGCCT;SOR=1.508;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=12;WE=3110984;WS=3110966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	3115354	rs9795009	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=0.256;SC=CTGCTCCCCTTATGTGCACTG;SOR=0.257;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=14;WE=3115362;WS=3115344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr11	3128774	rs3741353	T	C	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=935;ReadPosRankSum=0.097;SC=TGCTCCGCACTTCACATACGT;SOR=0.334;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=44;WE=3128782;WS=3128764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr11	3129103	rs147555918	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=770;ReadPosRankSum=1.455;SC=GTCTCGGCCCGGCTTGCAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=48;WE=3129111;WS=3129093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr11	3140627	rs11025457	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=388;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GGCCTGACTCCGAGCCGGGCT;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=18;WE=3140635;WS=3140617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr11	3141530	rs34752531	C	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.87;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr11	3141537	rs55862536	T	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.72;ReadPosRankSum=-1.025;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr11	3141744	rs34950527	C	T	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1286;ReadPosRankSum=0.763;SC=CGCAGCAGTGCAGCAGCACCG;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=60;TCR=82;TR=83;WE=3141752;WS=3141734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,93:0.57:162
chr11	3143030	rs6578322	T	C	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=178;SC=TTCCTACCACTGGTGTCCTTA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=3143038;WS=3143028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	3150482	rs11025526	A	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=262;SC=GCCCCTGGCTAAGAAGTCCCC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=3150490;WS=3150472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	3242833	rs7929163	G	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=0.277;SC=TGATAAGAGAGTTTTTCCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=12;WE=3242841;WS=3242823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	3242907	rs11602794	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=330;ReadPosRankSum=1.623;SC=CCAGAAATTCGGTCGTAAAGA;SOR=1.081;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=26;WE=3242915;WS=3242897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,31:0.30:102
chr11	3242933	rs10833491	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=333;ReadPosRankSum=-2.181;SC=TTTCTCTTCACGTTTCTCAAA;SOR=0.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=32;WE=3242941;WS=3242923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,39:0.32:122
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chr11	3243367	rs12280457	G	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CACCATCAGGGGCGGGATGAG;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=3243375;WS=3243357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	3243427	rs12275900	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=1.383;SC=TGATCCCTCGTACATCCTCGA;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=3243435;WS=3243417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	3249552	rs4391795	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=274;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GTGCAGGCGCCGCTGAGCAGC;SOR=0.322;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=19;WE=3249560;WS=3249542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr11	3249829	rs11026040	G	A	3346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=2264;ReadPosRankSum=2.033;SC=TGAGATCCGCGCAGGCCACGT;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=215;TCF=105;TCR=110;TR=135;WE=3249837;WS=3249819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,148:0.59:249
chr11	3249984	rs12295710	C	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=565;ReadPosRankSum=1.411;SC=TCCTGGGCGCCGTTGGCGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=39;WE=3249992;WS=3249974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,41:0.34:119
chr11	3361087	rs2073805	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=43;PP=1523;SC=TTGAAACATATTAATATGAGG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=83;WE=3361095;WS=3361077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	3381369	rs62619253	G	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=397;ReadPosRankSum=-1.990;SC=AATGTTCTCAGGTTCAGTAAA;SOR=0.882;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=37;WE=3381377;WS=3381359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr11	3381843	rs2157763	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;ReadPosRankSum=1.870;SC=ACAGATGAATACACTTTATGA;SOR=0.838;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=13;WE=3381851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr11	3382069	rs6578335	C	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=50;PP=1727;SC=CCCACTGCAGCCCCCGCTCCT;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=3382077;WS=3382059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	3382215	rs6578336	T	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=187;SC=TTCTGCCCCCTGTGACACGGA;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=3382223;WS=3382205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	3383962	rs10734319	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=229;SC=CTAAAGTACATCTTTTCATTT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=3383970;WS=3383952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	3388118	rs11026762	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=0.760;SC=AACATGGCAAAACCCTGTCTC;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=4;WE=3388126;WS=3388108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	3390006	rs7943767	T	C	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=690;ReadPosRankSum=-1.110;SC=ATTAAACTCATGCATATCCAC;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=54;WE=3390014;WS=3389996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr11	3390173	rs1989786	A	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=-0.261;SC=AATCAAGCCTAAAATGTAAAA;SOR=1.897;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=11;WE=3390181;WS=3390163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	3390547	rs7925972	G	C	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=264;SC=AAACCAGGGTGGGGGGGCGTT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=3390555;WS=3390537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	3390911	rs4758575	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.120;SC=GGAATCTGTCGTGGCTGAACT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=3390919;WS=3390901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	3392351	rs2269735	T	C	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.627;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,78:0.60:130
chr11	3392357	rs2269734	T	G	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr11	3392972	rs2269732	G	A	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1686;ReadPosRankSum=-1.423;SC=TACTTGATTCGAGGTGAAATG;SOR=0.837;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=95;WE=3392980;WS=3392962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,123:0.56:220
chr11	3394894	rs10833820	G	A	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=61;PP=1527;ReadPosRankSum=0.231;SC=CACCTGCATCGTGAGAATATG;SOR=1.138;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=126;TCF=33;TCR=93;TR=80;WE=3394902;WS=3394884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,84:0.64:132
chr11	3394960	rs10833821	A	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=519;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CCATCAACAGAAAGACCAAGA;SOR=0.344;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=25;WE=3394968;WS=3394950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr11	3398760	rs7932709	G	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=598;SC=CCTCTGACAGGGGCATGTGAT;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=3398768;WS=3398750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	3398795	rs7932797	G	A	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=944;SC=TGTGTCTCCAGGGATTGAAAG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=3398803;WS=3398785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	3400237	rs2301567	G	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GCCCCTCCCTGTCTCTCAGGA;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=17;WE=3400245;WS=3400227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr11	3400334	rs7931660	A	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=27;PP=980;SC=GGGTCACACGACCTACGGCTA;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=3400342;WS=3400324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	3400422	rs6578342	C	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=12;PP=319;SC=GGAAGCCGTCCTCTCCTCTCC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=3400430;WS=3400412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	3659993	rs2271586	G	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=299;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GTGCCTCTTCGTCATATGAAG;SOR=0.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=23;WE=3660001;WS=3659983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,34:0.31:111
chr11	3661140	rs4910876	T	C	3082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=51;PP=2180;SC=GGACAGAGTCTCCCAGCCTCT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=97;WE=3661148;WS=3661130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	3661585	rs3062849	A	ATGG	6575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=78;PP=2957;SC=CAGGGGCAGGATGGGAACAGC;SOR=1.355;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=10;TCR=83;TR=86;WE=3661593;WS=3661575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	3663011	rs932097	G	A	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=25;PP=951;SC=CCCCCTTGGGGCTAGGAGATG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=3663019;WS=3663001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	3663170	rs7111519	G	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=274;SC=TCGAGGGGCTGGAGGCAGATC;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=3663178;WS=3663160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	3663201	rs7128137	A	G	182.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CTCCAGGCGCACGGGATCCCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=3663209;WS=3663191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr11	3681519	rs2280134	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=357;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GCCAGCAGACTGGCCCAGGGC;SOR=0.907;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=30;WE=3681527;WS=3681509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,33:0.34:98
chr11	3704775	.	CT	C	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5559;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=53.85;NF=3;NR=0;PP=29;QD=11.6666666667;SC=AACTGCAGGTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=3;WE=3704783;WS=3704765;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr11	3774409	rs118050485	G	A	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=761;SC=TGCTGGGAATGTCTTATAAAC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=3774417;WS=3774399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	3829419	rs2278845	G	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=391;ReadPosRankSum=0.585;SC=TTTCAGAAGGGCGAGGCTGGA;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=23;WE=3829427;WS=3829409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr11	3838910	rs7946577	G	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=532;ReadPosRankSum=0.828;SC=GTCAGAGTCAGAGATAATTCA;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=29;WE=3838918;WS=3838900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr11	3838953	rs10835147	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=429;ReadPosRankSum=2.133;SC=AGAATCACAGTCCTCCCTGAG;SOR=0.176;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=25;WE=3838961;WS=3838943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr11	4103524	rs2304891	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.487;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr11	4104060	rs2898950	A	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=139;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TTTCTCATTTATTCCATTCTC;SOR=0.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=10;WE=4104068;WS=4104050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr11	4104087	rs10767828	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CTGCTCTTTTTGAGCTGGGGG;SOR=0.957;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=19;WE=4104095;WS=4104077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr11	4104355	rs894455	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
chr11	4104745	rs2289570	C	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=1.371;SC=GACCTCTTTGCGGGGATGAAG;SOR=0.937;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=24;WE=4104753;WS=4104735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr11	4107929	.	C	G	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=1210;ReadPosRankSum=0.316;SC=TCCATCACCACCATCACCACT;SOR=1.002;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=65;WE=4107937;WS=4107919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr11	4123345	rs1348310	C	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=440;ReadPosRankSum=0.164;SC=TGGGTTCCTTCTTTCATGTGT;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=36;WE=4123353;WS=4123335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr11	4123427	rs232054	C	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=1.971;SC=CTATGCCCTTCGATATAAAAT;SOR=1.819;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=19;WE=4123435;WS=4123417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr11	4133317	rs56336381	C	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=564;ReadPosRankSum=0.271;SC=TAGGGAAATACGCCTTGACCT;SOR=0.675;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=37;WE=4133339;WS=4133307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,49:0.38:129
chr11	4141132	rs183484	C	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=478;ReadPosRankSum=0.167;SC=CAACACAGCTCGATATGTGGA;SOR=0.927;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=33;WE=4141140;WS=4141122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,36:0.32:114
chr11	4153767	rs10835662	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AACTTTGATAAAGACAGTCAT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=4153775;WS=4153757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr11	4159457	rs9937	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr11	4159466	rs1042858	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,17:0.24:70
chr11	4185463	rs979941	T	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=21;PP=1122;SC=TGCTCAGCACTAGGGCAGATG;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=4185471;WS=4185453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	4185595	rs979942	T	G	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=49;PP=1867;SC=TCTGTAGAGGTCACCTTGCTC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=4185603;WS=4185585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	4388527	rs61885767	A	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=0.605;SC=TACCACTTTCATACCCACTTA;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=9;WE=4388535;WS=4388517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr11	4388905	rs11031960	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=776;ReadPosRankSum=0.273;SC=AGACCACCGTCGACATTAGAA;SOR=0.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=46;WE=4388913;WS=4388895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,49:0.36:135
chr11	4389587	rs7929171	G	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=529;SC=GATAAAATCTGCAACATTCTT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=4389595;WS=4389577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	4389639	rs4910623	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=73;SC=CATAATCTTCGTCTTCTTTGA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=4389647;WS=4389629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	4409386	rs2554933	C	T	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=217;SC=GTCTTGAACGCGAACCTTTCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=4409394;WS=4409379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	4409511	rs12805578	A	G	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1126;SC=TTGTAGAAGGAAACCCCTCCC;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=4409519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	4410752	rs2855142	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=465;SC=GAGCAGCTGGCTTCTGGAGAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=4410760;WS=4410742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	4562905	rs12420623	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=404;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AACAAGGAGACTGATGAAGCC;SOR=0.612;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=26;WE=4562913;WS=4562895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr11	4566377	rs2657168	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=2.068;SC=AAACATCCTGCTGCGTTTAGT;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=19;WE=4566385;WS=4566367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr11	4566711	rs2709182	C	T	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1266;ReadPosRankSum=0.310;SC=TTGGCCTGGACGCCTGCTTGG;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=63;TCR=77;TR=84;WE=4566719;WS=4566701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr11	4567335	rs2657167	C	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=693;ReadPosRankSum=1.872;SC=TCCGAGAGAGCCTTCTCCAAA;SOR=0.483;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=43;WE=4567343;WS=4567325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr11	4594737	rs5789333	G	GT	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=0.786;SC=AAGCACAGGAGTCTTTTTTAC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=4594747;WS=4594727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	4594739	rs919519	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=304;SC=GCACAGGAGTCTTTTTTACCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=4594747;WS=4594727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	4608262	rs12793957	A	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=10.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQRankSum=-9.966;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=1.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr11	4608542	rs1847632	C	T	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.847;NF=41;NR=35;PP=1162;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGAATTCTCACGCCTCAAGTG;SOR=0.831;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=199;TCF=98;TCR=101;TR=76;WE=4608550;WS=4608532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,80:0.41:196
chr11	4615390	rs2010722	C	T	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=10.265;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.62;MQRankSum=-3.594;QD=28.85;ReadPosRankSum=0.565;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr11	4615508	rs2010719	C	G	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.52;QD=25.84;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	4621485	rs2231978	C	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=55;SC=CCAAGCCTCTCTGGTTAGGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=4621493;WS=4621475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	4622159	rs2231972	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=30;PP=1486;SC=GATGAAGGGGTGAGGCTGGAT;SOR=0.920;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=4622167;WS=4622149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	4623788	rs931811	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=83;SC=CTATTTTTCCTAGCTTCCTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=4623796;WS=4623778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	4674575	rs3817098	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=544;ReadPosRankSum=-1.532;SC=GTGACTCTCCGCTGCCCGTCA;SOR=0.528;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=42;WE=4674583;WS=4674565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,53:0.37:143
chr11	4703165	rs1123991	C	A	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=41;PP=1934;SC=AGCGGTGTACCACTGAGAGGC;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=90;WE=4703173;WS=4703155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	4711986	rs11033350	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=279;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AATTCTACAATTTTATGTTTC;SOR=0.132;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=18;WE=4711994;WS=4711976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	4712079	rs1505192	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=591;ReadPosRankSum=0.709;SC=CAAAGGGGAGATCAGCAGGTA;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=39;WE=4712087;WS=4712069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr11	4712353	rs11033352	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=835;ReadPosRankSum=-0.670;SC=TTGATTCTGGTGTCTGTGCAT;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=62;WE=4712361;WS=4712343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,68:0.43:160
chr11	4729650	rs7122597	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=346;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CTTTTCATTCGGGGGGTTGCA;SOR=1.101;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=23;WE=4729658;WS=4729640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr11	4730985	rs4619142	C	T	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=67;PP=2965;SC=ACCCATGTATCATTTTCTCTC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=156;WE=4730993;WS=4730975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	4731180	rs4432013	G	A	6350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=102;PP=2965;SC=CTTTATTGCCGTCTGTAACCC;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=190;WE=4731195;WS=4731170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	4731468	rs4436535	G	A	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=51;PP=1838;SC=TGTTCTGATCGTCCGCTCTGT;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=97;WE=4731476;WS=4731458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	4731583	rs4471413	C	T	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=61;PP=2965;SC=AGTTTGTCACCAGTGCACAGA;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=152;WE=4731591;WS=4731573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	4790268	rs1030726	C	A	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=54;PP=2190;SC=TTTACACTGTCGATGATGGGG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=109;WE=4790276;WS=4790244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	4790308	rs1030725	A	G	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=53;PP=1951;SC=GCAGGTATACATTAGCCATCA;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=95;WE=4790316;WS=4790298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
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chr11	4790410	rs1030724	A	G	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=42;PP=2526;SC=CTGCTCCCACATGGGAGACAC;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106;WE=4790418;WS=4790386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	4790471	rs1030723	G	A	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,86:0.54:160
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chr11	4790482	rs12792898	T	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.449;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=1.041;SC=AGTGAATAATTAAGATATATG;SOR=0.511;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=67;WE=4790490;WS=4790461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,81:0.45:179
chr11	4790575	rs12788102	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.205;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GAATGTCTGAACATGCTAATT;SOR=0.480;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=167;TCF=93;TCR=74;TR=63;WE=4790583;WS=4790565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,75:0.39:192
chr11	4790605	rs112024216	A	G	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CTGGATGGTAACAATAGGAGT;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=69;WE=4790613;WS=4790595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,85:0.43:196
chr11	4790671	rs11033795	C	T	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=86;PP=2965;SC=AAAGTAGTGGCAATATTAGTA;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=156;WE=4790679;WS=4790661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	4790758	rs11033796	G	A	4393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=65;PP=2892;SC=ACCTCAGAGGGTCACAGATGG;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=134;WE=4790766;WS=4790748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	4790857	rs11033797	A	G	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=76;PP=2684;SC=CAATGCAGCTATATAGACTGA;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=4790865;WS=4790847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	4790873	rs34672924	CG	C	5949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=71;PP=2954;SC=ACTGATTTCACGTGCCTCAAA;SOR=1.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=93;WE=4790889;WS=4790863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	4790881	rs111736749	A	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CACGTGCCTCAAACCAGAGGA;SOR=1.039;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=69;WE=4790889;WS=4790863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr11	4790948	rs11033800	C	A	6443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.06;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	4790951	rs11033801	A	G	6408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	4791178	rs10836609	C	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.347;SOR=1.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr11	4791181	rs10836610	T	G	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=1.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr11	4824878	rs2053116	A	C	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=2008;ReadPosRankSum=-0.673;SC=ATATGGGAGGAACGTGTGCTA;SOR=0.378;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=93;WE=4824886;WS=4824868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr11	4825010	rs6578533	T	A	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=62;PP=2608;SC=AAGAGCCCATTCCCACGACTT;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=130;WE=4825018;WS=4825000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	4825225	rs7941731	A	G	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=55;PP=2401;SC=TGGGAAGCAGATAGCCACGTA;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=4825233;WS=4825215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	4827092	rs1865284	A	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=255;ReadPosRankSum=1.420;SC=TATCAATCTCAGAATCGATGG;SOR=0.355;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=24;WE=4827100;WS=4827082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,22:0.26:86
chr11	4827283	rs919899	A	T	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=54;PP=1657;SC=AAAAAAAAAAATCCTGAAAAG;SOR=2.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=4827291;WS=4827273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	4827322	rs934485	A	G	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=769;SC=CAAAGGCCTTATCTTTTCCTA;SOR=5.353;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=30;WE=4827330;WS=4827312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	4842866	rs35003053	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=627;ReadPosRankSum=-2.407;SC=TCAGCCACAGACCTGAGCTTG;SOR=0.714;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=40;WE=4842874;WS=4842856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr11	4843164	rs113211514	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1022;ReadPosRankSum=0.510;SC=TGTCCTTCTGCAGTTCTATGG;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=67;WE=4843172;WS=4843154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,80:0.37:214
chr11	4869649	rs12361955	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=626;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AGTGCCAGGAGGATCATAGGG;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=46;WE=4869657;WS=4869639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,61:0.36:168
chr11	4869906	rs7117260	A	C	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=26;PP=898;SC=GACCTGTGGGAGGCAGTAGGG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=4869914;WS=4869896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	4870139	rs11602455	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=286;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CTGAGGCAGGGACAGTGTGAG;SOR=1.136;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=19;WE=4870147;WS=4870129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr11	4870261	rs11602499	G	C	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=1029;ReadPosRankSum=1.491;SC=AGGGCGGGCTGCAGGGCAATG;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=29;WE=4870277;WS=4870251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr11	4870269	rs12417164	A	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=2347;ReadPosRankSum=-1.266;SC=CTGCAGGGCAATGATCCAGAG;SOR=0.730;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=61;WE=4870277;WS=4870251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,75:0.66:114
chr11	4870284	rs35918613	G	C	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=511;ReadPosRankSum=0.640;SC=CCAGAGGATGGTGCCATTTCC;SOR=0.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=31;WE=4870292;WS=4870274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,37:0.35:107
chr11	4880892	rs11034368	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=413;ReadPosRankSum=0.004;SC=TTCTTCAAATTTGCTTGGTCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=32;WE=4880900;WS=4880882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr11	4880992	rs7947547	C	G	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=895;ReadPosRankSum=0.223;SC=TAAATGCTCCCAAAATCTGTG;SOR=0.490;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=57;WE=4881000;WS=4880982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,67:0.64:104
chr11	4904209	rs17251220	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GTCAATTCCAATTGAATTTTA;SOR=0.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=4904217;WS=4904199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	4928866	rs7941509	C	T	4448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=57;PP=2859;SC=TGTTCAATGCCATGGGAATTT;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=124;WE=4928874;WS=4928856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	4936613	rs16907312	G	T	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=1229;ReadPosRankSum=0.097;SC=AATTTCTCGTGCTCCAACCCA;SOR=0.982;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=70;WE=4936621;WS=4936603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr11	4944892	rs34583466	G	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=385;ReadPosRankSum=0.485;SC=TGCTGAGCACGGTGCGAAGGA;SOR=0.823;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=35;WE=4944900;WS=4944882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr11	4944986	rs12796015	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=351;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GTGATTGACAATGATGCTAGA;SOR=0.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=35;WE=4944994;WS=4944976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr11	4945199	rs34742470	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=1.026;SC=GGCCACGTAGCGGTCAATGGA;SOR=0.969;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=25;WE=4945207;WS=4945189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr11	4945631	rs10836955	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr11	4964627	rs2595993	C	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TATCAGATTGCCCCTAGGTGC;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=4964635;WS=4964617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	4964649	rs2595992	G	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=1.446;SC=GTGTAGGTGAGCTCAAGGTAA;SOR=1.276;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=9;WE=4964657;WS=4964639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr11	4964753	rs2605301	A	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=541;ReadPosRankSum=-1.743;SC=ATTTTGTGCTAGATAATTCTT;SOR=0.860;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=35;WE=4964761;WS=4964743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr11	4964784	rs2605302	A	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=643;ReadPosRankSum=0.375;SC=GCTATCCTGTACATTAAAGAA;SOR=0.807;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=43;WE=4964792;WS=4964774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr11	4965239	rs2570581	G	A,T	631.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=4,7;NR=3,3;PP=109,178;SC=CTGCCTATCCGCACACTGGGA;SOR=1.270;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=7,10;WE=4965247;WS=4965229;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.58:24
chr11	4965301	rs2605303	G	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=902;SC=ACTACTGCTTGGTTGTACTAC;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=4965309;WS=4965291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	4967468	rs28698374	G	A	6411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.817;NF=138;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.963;SC=AATTGGGTTCGTCAGTGGAGG;SOR=0.723;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=297;TCF=185;TCR=112;TR=223;WE=4967476;WS=4967458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,275:0.77:359
chr11	4967532	rs2595988	G	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-3.392;QD=2.06;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:307,71:0.19:378
chr11	4968198	rs3845246	C	A	3059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.934;NF=48;NR=82;PP=2566;ReadPosRankSum=-1.650;SC=AGAATGGTGCCATTTCCTAGA;SOR=1.087;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=130;WE=4968206;WS=4968188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,119:0.76:157
chr11	4976241	rs2570571	C	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=27.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQRankSum=-7.123;QD=0.29;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=2.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,15:0.11:135
chr11	4976291	rs55889636	G	A	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-6.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.686;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=4.751;NF=58;NR=64;PP=1942;ReadPosRankSum=0.525;SC=CAGGGTGTAAGACACAGCAAT;SOR=0.267;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=122;WE=4976299;WS=4976281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,116:0.92:126
chr11	4977026	rs10837027	C	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.283;NF=2;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=1.551;SC=GTAAAATAGGCATATCTGTAA;SOR=0.538;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=4977034;WS=4977016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr11	5012592	rs61880629	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=738;ReadPosRankSum=0.218;SC=TAGCTTCTGTCGTCCACAGCC;SOR=1.187;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=48;WE=5012600;WS=5012582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
chr11	5013421	rs5789346	G	GT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=0.000;QD=0.51;ReadPosRankSum=-3.021;SOR=1.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,13:0.15:85
chr11	5013423	rs60905583	T	TG	1586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=47;PP=994;ReadPosRankSum=3.971;SC=TTACTGTTGTTTTTTTTTTCT;SOR=0.383;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=51;WE=5013431;WS=5013411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,65:0.79:82
chr11	5020416	rs2445290	A	G	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=54;PP=2279;SC=TTTCCATCTTAGCAGTGAATG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=109;WE=5020424;WS=5020406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	5067984	rs2500016	A	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=44;PP=1648;SC=GGCCCTTTCTACAACCTCTGT;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=5067992;WS=5067974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	5068137	rs2500017	G	A	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=41;PP=2588;SC=TTATGTGGCCGTCTGTGCTCC;SOR=1.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=117;WE=5068145;WS=5068127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	5068177	rs2500018	A	T	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=63;PP=2965;SC=TTGACATCCCAAGTGTTGGTG;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=148;WE=5068185;WS=5068167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	5068297	rs58664826	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,50:0.27:182
chr11	5068431	rs17350764	G	A	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=65;PP=2965;SC=TCTCCGTGCTGTCTTCCGCCT;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=136;WE=5068439;WS=5068421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	5068661	rs2500019	A	G	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.06;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	5068661	.	AC	GC,GT	1091	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=30,14;NR=71,25;PP=1091,488;QD=11.1462496292;SC=AGATTCGAGAACGAGTGCTCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101,39;WE=5068670;WS=5068651;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:101
chr11	5068662	rs57026471	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=6.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.980;SOR=0.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,51:0.42:121
chr11	5079946	rs2445332	C	T	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=27;PP=951;SC=ATATTTTCTTCACACATTTAT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=5079954;WS=5079936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	5080068	rs2500052	G	A	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=35;NR=21;PP=1242;SC=CGGCCAAAGCGATGAGTCATA;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=5080076;WS=5080058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	5080234	rs2445333	T	C	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=0.941;NF=44;NR=46;PP=1473;ReadPosRankSum=0.214;SC=TGTCAAACACTAGATTACAAA;SOR=0.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=90;WE=5080242;WS=5080224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,96:0.54:179
chr11	5080337	rs61746343	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=550;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GGGAATTACATGATTCCCACA;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=43;WE=5080345;WS=5080327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr11	5172786	rs10768611	A	G	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=47;PP=2701;SC=ATATAAGGGGAGATGTGAGAC;SOR=1.263;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=5172794;WS=5172776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	5199222	rs7924390	A	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=262;SC=TGAAACACTGAGTGAAGGATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=5199230;WS=5199215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	5199340	rs113029548	A	AATGCCC	4134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=2834;SC=CCAATCTGGCAATGTGCTCAC;SOR=1.321;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=44;WE=5199348;WS=5199330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	5199645	rs6578560	T	C	4269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=83;PP=2907;SC=GCCAGCACCTTAGGGGCTGCA;SOR=1.304;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=44;TCR=83;TR=127;WE=5199653;WS=5199635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	5199660	rs6578561	T	C	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=79;PP=2226;SC=GCTGCAGCAGTGGCGAGCAGG;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=114;WE=5199668;WS=5199650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	5199675	rs6578562	C	T	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=67;PP=2163;SC=AGCAGGAAGTCGGCTGAGGCC;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=96;WE=5199683;WS=5199665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	5199708	rs6578563	T	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1427;SC=AAGAGATACATGGGCTCATGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=5199716;WS=5199698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	5199817	rs5789371	GC	G	561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=413;SC=AGGTATGCAAGCCTTCCAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=11;WE=5199825;WS=5199807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	5221645	rs11512276	C	A,G	5009.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=22,44;NR=45,48;PP=1042,1606;SC=CGAATGATCCCCCACAGGATC;SOR=1.014;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=67,92;WE=5221653;WS=5221635;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:198
chr11	5221825	rs11036212	G	A	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=43;PP=1653;SC=GGGATGGAAAGCCAGGGGTAT;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=5221833;WS=5221815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	5247733	rs7480526	A	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.116;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.972;SC=CCTGTTACTTATCCCCTTCCT;SOR=2.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=8;WE=5247741;WS=5247723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr11	5247791	rs10768683	C	G	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=42;PP=1867;SC=AAACATCAAGCGTCCCATAGA;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=92;WE=5247799;WS=5247781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	5248243	rs713040	A	G	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=32;PP=972;SC=CAGGAGTCAGATGCACCATGG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=5248251;WS=5248233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	5263577	rs10128555	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=0.405;SC=CATCCTTTTTCACCAGAGTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=5263585;WS=5263567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	5269582	rs371855998	AG	A	3621.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-1.988;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,91:0.63:145
chr11	5269584	rs1065686	T	A	3664.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-1.988;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,91:0.63:145
chr11	5269586	rs371890964	A	AG	3655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-2.048;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,92:0.63:145
chr11	5269799	rs28440105	A	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQRankSum=0.923;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.519;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	5274452	rs34879481	G	GT	891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.626;NF=12;NR=7;PP=715;ReadPosRankSum=2.671;SC=TTTATTATTTGATTGCTTGCA;SOR=0.776;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=19;WE=5274460;WS=5274442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr11	5289896	rs3061750	A	AAAAC	1436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=1257;ReadPosRankSum=2.416;SC=ACTTGATGAAAAAACAAACAA;SOR=1.211;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=26;WE=5289904;WS=5289886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
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chr11	5322520	rs12283334	G	A	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=62;PP=1963;ReadPosRankSum=0.978;SC=TCACTGTCTTGAGGATTAGTA;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=89;TCR=102;TR=118;WE=5322528;WS=5322510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,134:0.61:219
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chr11	5344552	rs7934105	C	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	5344561	rs7933257	G	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.14;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	5344681	rs11036815	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=453;ReadPosRankSum=-0.371;SC=TTCATTAAAGGAGGAAAGAGG;SOR=0.732;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=33;WE=5344689;WS=5344671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,37:0.30:122
chr11	5344772	rs10742622	T	C	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=78;PP=2935;SC=AACCCATCACTGTAACATAGA;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=155;WE=5344780;WS=5344762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	5344847	rs10768793	A	G	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=66;PP=2600;SC=CTTCACCAGAAGCAATGCCTA;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=114;WE=5344855;WS=5344837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	5344902	rs7937237	C	G	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=47;PP=2278;SC=GATGATCAGACAGTCTAGGAA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=5344910;WS=5344892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	5345128	rs10837814	G	A	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GTATTGGTGAGAATGGAAGCA;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=98;WE=5345136;WS=5345118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,107:0.60:178
chr11	5345170	rs7952293	A	G	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=81;PP=2965;SC=GCAATGAAACAATCATATGCC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=164;WE=5345178;WS=5345160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	5345486	rs4910750	G	A	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=33;PP=1074;SC=GCCCTGGAAAGCCAGTCAGCA;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=5345494;WS=5345476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	5364276	rs4910551	G	A	2223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;ReadPosRankSum=-0.888;SC=AAAATAGAGGGGCCTGATTGG;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=80;WE=5364284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,98:0.62:159
chr11	5364450	rs11036912	A	G	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.256;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;ReadPosRankSum=2.648;SC=AAGTGAGTGTATAAAGTAGGC;SOR=0.615;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=96;WE=5364458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,124:0.64:194
chr11	5364742	rs11036913	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=0.527;SC=TGGGAGCTGCCGCTGGACGAC;SOR=0.497;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=17;WE=5364750;WS=5364732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr11	5364776	rs78253695	T	TGTC	298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=1.515;SC=ATAGAAGAAATGTCTTTCTGT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=5364784;WS=5364766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr11	5372881	rs77135024	G	A	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=34;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TTCTCATCAGGAATGATCATA;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=92;WE=5372889;WS=5372871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,116:0.60:192
chr11	5373114	rs5006888	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=897;ReadPosRankSum=1.405;SC=ACCATCCGCAGCCCCTTAAGA;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=59;WE=5373122;WS=5373104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr11	5373497	rs7106330	G	C	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.360;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TGTCACTGTAGTTTGTCTGAC;SOR=1.057;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=72;WE=5373505;WS=5373487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr11	5373646	rs5024041	T	C	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1699;ReadPosRankSum=1.643;SC=GCATACTTCGTTTATTCTCTC;SOR=0.622;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=90;WE=5373654;WS=5373636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,108:0.71:152
chr11	5373713	rs12802177	A	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.844;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=1.056;SC=AATTCAGGGGACCTGGACAGG;SOR=0.393;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=29;WE=5373721;WS=5373703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr11	5373807	rs5024037	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=1.082;SC=GTGGAAATCAGTCAATCCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=23;WE=5373815;WS=5373797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr11	5410934	rs1498467	T	G	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.713;NF=22;NR=34;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TTAACTCCCATAGTATCTACT;SOR=0.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=56;WE=5410947;WS=5410924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,65:0.34:189
chr11	5411031	rs1498468	C	T	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=719;ReadPosRankSum=1.898;SC=CTTTGACCGCCTTGTGGCCAT;SOR=0.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=53;WE=5411039;WS=5411021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,64:0.43:149
chr11	5411239	rs1498469	T	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=579;ReadPosRankSum=0.704;SC=TGCACAGATATCACCTTCAAT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=36;WE=5411247;WS=5411229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr11	5411395	rs9783355	C	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=562;ReadPosRankSum=1.616;SC=TGCACCGCTCCTCTCTGTGCT;SOR=1.160;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=38;WE=5411403;WS=5411385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr11	5411579	rs10768906	GT	AC	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.154;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.402;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,17:0.24:72
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chr11	5474838	rs2030094	G	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=579;ReadPosRankSum=-1.327;SC=TGGCCCTTGGGGGAAATACAG;SOR=0.520;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=41;WE=5474846;WS=5474828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,43:0.33:129
chr11	5475118	rs12577167	A	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1327;ReadPosRankSum=-1.672;SC=GCGCTATGCAACTGTGCTCAC;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=72;WE=5475126;WS=5475108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,80:0.57:141
chr11	5475170	rs16931292	G	C	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=809;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCAGCTGCTCGAAGCTTCATC;SOR=0.827;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=46;WE=5475178;WS=5475160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr11	5475506	rs11037502	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=873;ReadPosRankSum=1.025;SC=ACAGTGCACCGCTTTGGGAAG;SOR=0.467;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=54;WE=5475514;WS=5475496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,57:0.42:137
chr11	5510284	rs417425	A	G	4248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=50;PP=2744;SC=TGGAGTCCTCAATTCTACTTG;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=131;WE=5510292;WS=5510274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	5510341	rs404280	C	T	5827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=83;PP=2965;SC=CATTAAGGTACACAACCATTC;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=170;WE=5510349;WS=5510331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	5510497	rs2467219	T	C	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=53;PP=2116;SC=ATATGGGCATTGCCCGACTGG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=103;WE=5510505;WS=5510487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	5510598	rs7950082	A	T	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1427;ReadPosRankSum=1.889;SC=GCCATTTCCTATGGCTTTATC;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=76;WE=5510606;WS=5510588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,85:0.64:132
chr11	5510626	rs444878	T	C	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=59;PP=2564;SC=CAGTCTTTCATCTTCCATCTC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=122;WE=5510634;WS=5510616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	5510928	rs392296	G	A	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=1019;SC=AAAAAAAAGTGTAGGATGGCT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=5510936;WS=5510918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	5511003	rs426886	G	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=248;SC=ATGGCAGGAAGCTCTGGAAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=5511011;WS=5510993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	5529865	rs186434	G	A	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=980;SC=CTCCATGTGTGGAAGTCCAGG;SOR=0.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=5529873;WS=5529855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	5536415	rs10769023	C	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=0.562;SC=AGCTGCTCTGCTCATCTGACA;SOR=1.005;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=38;WE=5536423;WS=5536405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr11	5536537	rs393044	A	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=32;PP=1450;SC=GCTGGTATCCAAGCTGGCTGC;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=5536545;WS=5536527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	5536848	rs2017433	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=1150;ReadPosRankSum=-1.563;SC=ATTGATATCAGCATAGTTCTG;SOR=0.501;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=33;WE=5536860;WS=5536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr11	5536852	rs2017434	A	G	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=2268;ReadPosRankSum=1.452;SC=ATATCAGCATAGTTCTGACCC;SOR=1.044;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=56;WE=5536860;WS=5536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,66:0.64:103
chr11	5537045	rs872751	T	G	3505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=2133;ReadPosRankSum=0.547;SC=GGGAAACTTCTGGGTTCTGCT;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=133;WE=5537053;WS=5537035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,160:0.66:242
chr11	5537780	rs1809862	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-2.369;SC=GCTCTCAGGCCACAGGATAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=5537788;WS=5537770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	5549254	rs1498480	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=297;ReadPosRankSum=0.892;SC=GCCTTGTCAGTGACCACCAGC;SOR=0.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=16;WE=5549262;WS=5549244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr11	5549316	rs1846317	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=612;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CAGGCACACAAGCACAGAGAG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=35;WE=5549324;WS=5549306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr11	5549531	rs1560811	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=0.675;SC=GTGAGGGTGATGCTAGGGCTT;SOR=1.911;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=16;WE=5549539;WS=5549521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr11	5566030	rs1995158	A	G	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1053;ReadPosRankSum=-1.857;SC=GCTTTCTGGCAGGCATCTTGG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=70;WE=5566038;WS=5566020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,75:0.66:113
chr11	5566051	rs1995157	C	A	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=1010;ReadPosRankSum=0.578;SC=GAGGGAAGGCCAAAGACAGCA;SOR=0.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=61;WE=5566059;WS=5566041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,68:0.63:108
chr11	5566112	rs1995156	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=988;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CTGAGATGACCGTCATGATGG;SOR=0.800;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=51;WE=5566120;WS=5566102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr11	5566365	rs1566275	T	C	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=887;ReadPosRankSum=0.398;SC=AGCTACATAGTGATCAAATGC;SOR=0.377;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=58;WE=5566373;WS=5566355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr11	5566489	rs10769054	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=1081;ReadPosRankSum=0.870;SC=ATACTGAGTGCTTTAGGCACA;SOR=0.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=65;WE=5566497;WS=5566479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,76:0.69:110
chr11	5566830	rs10838299	A	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=1.006;SC=AACTAATTATAATTATTGCCT;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=5566838;WS=5566820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	5573002	rs55690955	C	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=664;ReadPosRankSum=-2.782;SC=TAAAGGTTGGCAAACATAATA;SOR=0.845;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=47;WE=5573010;WS=5572992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,55:0.41:135
chr11	5602438	rs2341432	T	A	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=651;ReadPosRankSum=0.810;SC=GGTTATAGCCTCATTTCCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=45;WE=5602446;WS=5602428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr11	5602615	rs2341434	A	G	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.950;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GCCCTGAGCCACAGCTTCATC;SOR=0.480;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=197;TCF=115;TCR=82;TR=74;WE=5602623;WS=5602605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,84:0.38:220
chr11	5602679	rs892336	T	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.155;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=981;ReadPosRankSum=0.896;SC=GCCAGATCAATATCATTGCAC;SOR=0.996;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=217;TCF=102;TCR=115;TR=72;WE=5602687;WS=5602669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,91:0.36:255
chr11	5602790	rs2163946	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,36:0.30:122
chr11	5602928	rs10838375	G	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=-0.348;SC=ATGTCCCTGCGCTTTTTTCTG;SOR=0.422;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=33;WE=5602936;WS=5602918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,33:0.35:95
chr11	5602968	rs10769086	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=341;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TGGGAGAAGCGTCCCATGCTA;SOR=0.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=31;WE=5602976;WS=5602958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr11	5617987	rs12272467	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=860;SC=GAGCAGAGTCGTGCGTGGTTG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=5617995;WS=5617977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	5618298	rs146384026	A	ATTTTAT	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=560;SC=GGTTAGAGACATTTTAATCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=5618306;WS=5618288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	5631479	rs3740999	A	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=483;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TGTAGAGGTAAGGAGATTCAG;SOR=0.537;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=39;WE=5631487;WS=5631469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,47:0.39:122
chr11	5631622	rs7125403	G	T	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=30;PP=1561;SC=AGAAGATGCGGTTTGTATTTA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=5631630;WS=5631612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	5653417	rs4287358	AT	GA	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=715;SC=GCCAGTCTTTATTGTCTGTGC;SOR=2.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=17;WE=5653426;WS=5653407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	5655150	rs7941976	T	A	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=50;PP=1778;SC=ATTCTGAAGGTTTTCTGAGAC;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=5655158;WS=5655140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	5655233	rs3824951	G	A	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=34;PP=965;SC=GAGTCCTGAAGCCATTTGATT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=5655241;WS=5655223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	5655722	rs368950284	TACAC	T	150.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=166;SC=ATAATATAAATACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=5655733;WS=5655712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr11	5662319	rs7108834	C	T	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=7;PP=772;SC=CATTTTTTTTCCTACTGTTCT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=5662327;WS=5662309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	5663575	rs12792498	T	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	5663920	rs66637086	CT	C	1864.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=12;PP=1470;SC=TCTGGTTTATCTTTTTAATTC;SOR=2.419;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=41;WE=5663928;WS=5663910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	5664974	rs7109861	T	C	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=61;PP=1526;SC=CCCTTTGTCTTGACTTATCTC;SOR=1.386;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=90;WE=5664982;WS=5664964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	5689145	rs34080219	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=2.147;SC=GTAGAAATAGCTTTCATCCCT;SOR=0.105;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=5689153;WS=5689135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	5691191	rs4309185	C	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=242;SC=GGCAACAGAGCGAGACTTCAT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=5691199;WS=5691181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	5700340	rs3740995	T	C	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=23;PP=1357;SC=TGTCAGCTTCTAACTCTTCAG;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=67;WE=5700348;WS=5700330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	5701001	rs10838525	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.364;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=342;ReadPosRankSum=2.055;SC=TTGGTACTCCCGGGCAACCTC;SOR=0.136;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=24;WE=5701009;WS=5700991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr11	5701409	rs3824949	G	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=916;ReadPosRankSum=-0.068;SC=AGAAGCCATAGTAGCTATTCC;SOR=0.927;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=51;WE=5701417;WS=5701399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr11	5717762	rs10838543	T	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=674;ReadPosRankSum=-1.551;SC=GTGAGCACCATGGAAAAAAAC;SOR=0.827;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=55;WE=5717770;WS=5717752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,71:0.35:200
chr11	5718517	rs7935564	G	A	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=29;PP=929;SC=GATAAAGGAGGATCAAGAGGC;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=5718525;WS=5718507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	5719750	rs1063303	G	C	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=37;PP=909;SC=CGGAGGTTGAGGGGATCGTCA;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=5719758;WS=5719740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	5719835	rs2291844	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=389;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GAGGCCGATTTTCCTTCCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=10;WE=5719856;WS=5719825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	5719848	rs7950912	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=367;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CTTCCCTTCCCAGTCTCTAGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=5719856;WS=5719825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	5729580	rs2291845	T	C	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.032;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=1344;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GAGGTTTTTTTAGGTTAGGAT;SOR=0.339;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=69;WE=5729588;WS=5729570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,73:0.68:108
chr11	5755605	rs1498552	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=283;SC=ATAGAGGATTAGAGGGCCTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=5755613;WS=5755595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	5758062	rs7397032	T	C	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=69;PP=2949;SC=CCTCCCTGAGTGCTTTGCTCA;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=5758070;WS=5758052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	5758118	rs7396766	A	C	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=74;PP=2965;SC=CTGGTATCCTACTCTGCATGG;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=168;WE=5758126;WS=5758108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	5776287	rs7936512	C	T	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=99;PP=2965;SC=ATGTTCTTCACCCACACCTTC;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=175;WE=5776295;WS=5776277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	5776470	rs7394584	T	G	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=63;PP=2535;SC=CTCACCAAGCTCCTGCCCTAC;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=122;WE=5776478;WS=5776460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	5776623	rs7396938	A	T	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=60;PP=2229;SC=TGTATCACCAACTCCTATACC;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=109;WE=5776631;WS=5776613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	5777023	rs10742782	C	T	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=380;SC=TTTCTGGAAGCACTGTATTGA;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=5777031;WS=5777013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	5777053	rs10742783	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=GGAGTTTGTTAACTGGTGCAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=5777061;WS=5777043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	5809308	rs7934670	A	T	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=67;PP=2458;SC=ATGGCACAGAAGTGGGCAGTG;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=117;WE=5809316;WS=5809298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	5809548	rs7948009	G	A	4075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=55;PP=2597;SC=TATGGAAGGCGCTTGGTGAGG;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=126;WE=5809556;WS=5809538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	5810105	rs61619938	TA	T	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=328;SC=GAGCAGGAAATAAAAAAAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=5810113;WS=5810095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	5841856	rs4758435	C	T	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=68;PP=2965;SC=TTGACTTTAACGCCTGCCTGG;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=144;WE=5841864;WS=5841846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	5842310	rs8181529	T	G	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=60;PP=2905;SC=TCACATGTGTTCCATTGTGAT;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=126;WE=5842318;WS=5842300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	5842356	rs8181512	A	G	5053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=68;PP=2965;SC=TTTTTCACTCATCGTTTTGTA;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=160;WE=5842364;WS=5842346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	5862731	rs10838719	A	G	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.404;NF=32;NR=20;PP=917;ReadPosRankSum=-0.850;SC=ATGGTGTACCAAAGAGGTTTG;SOR=1.093;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=52;WE=5862739;WS=5862721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr11	5877909	rs12417880	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=0.426;SC=ATGTTATTGGCTGCAGCATTC;SOR=0.437;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=17;WE=5877917;WS=5877899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr11	5877979	rs12419602	T	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=864;ReadPosRankSum=-1.943;SC=CTCCAACTGGTTAGTGATTGG;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=56;WE=5877987;WS=5877969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,73:0.64:114
chr11	5905412	rs17233457	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ATACCATTACCTCTAGCACAC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=5905420;WS=5905402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr11	5906048	rs4758168	G	A	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=77;PP=2906;SC=GCATAACATCGTACCTCACAC;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=132;WE=5906056;WS=5906038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	5906073	rs4757986	G	T	4487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=72;PP=2965;SC=TGTGAGCACAGGGGTCTGGCC;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=137;WE=5906081;WS=5906063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	5906143	rs11823809	T	C	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=46;PP=1791;ReadPosRankSum=1.887;SC=TGATTTCTTATATTATTGTGG;SOR=0.509;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=99;TCR=73;TR=102;WE=5906151;WS=5906133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,118:0.61:192
chr11	5906192	rs1453435	A	C	7215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=119;NR=106;PP=2962;SC=GCTTATCCTTAGAGCTGTTTT;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=119;TCR=106;TR=225;WE=5906213;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr11	5906203	rs11823828	T	G	3924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.612;SC=GAGCTGTTTTTCGCCTTCCCT;SOR=0.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=234;TCF=123;TCR=111;TR=138;WE=5906213;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,168:0.61:275
chr11	5906205	rs4757987	G	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=2.062;SC=GCTGTTTTTCGCCTTCCCTCT;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=98;WE=5906213;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,112:0.40:281
chr11	5906291	rs11823842	T	C	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=57;PP=2314;ReadPosRankSum=-1.678;SC=CACACCAGCATTTTTTTCTTT;SOR=0.875;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=134;WE=5906299;WS=5906281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,163:0.62:263
chr11	5922222	rs10160336	T	C	4523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=56;PP=2884;SC=CCGGCACTGATCTGGGCTTGT;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=5922230;WS=5922212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	5922366	rs16926729	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=970;ReadPosRankSum=0.960;SC=TGACAGTCACGGGCATAGATC;SOR=0.974;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=62;WE=5922374;WS=5922356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr11	5922707	rs7106300	C	T	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=70;PP=2567;SC=GATGCCCGGCCTAAGGCACTC;SOR=1.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=119;WE=5922715;WS=5922697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	5923073	rs10838803	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.097;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr11	5923297	rs4601752	A	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=26;PP=834;SC=TTACATATCCAAAGCTGAAGT;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=5923305;WS=5923287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	5968540	rs142409098	G	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=641;ReadPosRankSum=0.839;SC=TAATTTTCCAGATCACTGAAA;SOR=0.821;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=37;WE=5968548;WS=5968530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr11	5968728	rs1840178	T	C	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=61;PP=1567;SC=ACCCTCCTGATGACCATCTGG;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=76;WE=5968736;WS=5968718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	5969185	rs10769378	A	G	6143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.717;SC=ACCTTTACCAATTTGCTGGAG;SOR=0.266;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=186;WE=5969193;WS=5969175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chr11	5989223	rs61730422	G	A	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=1.062;SC=TATCTGAGTCGAGAAGAAAGT;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=48;WE=5989231;WS=5989213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,62:0.37:168
chr11	5989415	rs7114672	C	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=793;ReadPosRankSum=3.026;SC=ATGATGAACACCTGAAGGAAG;SOR=0.956;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=48;WE=5989423;WS=5989405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr11	6007272	rs4237768	A	G	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=762;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AGGAGATACCATGTGGCCAGA;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=50;WE=6007280;WS=6007262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,61:0.65:94
chr11	6007613	rs4354673	T	G	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.196;NF=56;NR=33;PP=1513;ReadPosRankSum=0.506;SC=GAAGATAAGTTTTCCCAACAA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=89;WE=6007621;WS=6007603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,103:0.61:170
chr11	6007680	rs4436524	A	G	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.893;NF=59;NR=41;PP=1710;ReadPosRankSum=1.231;SC=ATTCCGATGCACCCTATGACC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=100;WE=6007688;WS=6007670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,104:0.59:177
chr11	6007743	rs4436525	A	G	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.970;NF=46;NR=51;PP=1612;ReadPosRankSum=-1.540;SC=GCTACATAGCAATCCAGAGCC;SOR=0.642;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=97;WE=6007751;WS=6007733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,106:0.57:186
chr11	6007899	rs4501959	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.069;NF=29;NR=40;PP=1136;ReadPosRankSum=1.173;SC=AGAACCAGGTCGATGGCAGCT;SOR=0.506;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=69;WE=6007907;WS=6007889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr11	6048056	rs11040335	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=774;ReadPosRankSum=1.824;SC=TAGGGTTCAATGCAGGAGGAA;SOR=0.706;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=57;WE=6048064;WS=6048046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,63:0.57:110
chr11	6173346	rs11826453	G	T	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1405;ReadPosRankSum=0.664;SC=TCCCCAGATTGTCAGGGTCAT;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=86;WE=6173354;WS=6173336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,96:0.58:166
chr11	6173364	rs325695	T	A	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=70;PP=2929;SC=CATTTTTCCATTTACCATAGA;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=138;WE=6173380;WS=6173354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	6220376	rs325610	G	C	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=702;SC=GCCACTGTGAGACCCCCAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=6220384;WS=6220366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	6221169	rs10839531	A	G	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=64;PP=2452;SC=CGGGAGGCCCATGCCAAGGCC;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=57;TCR=64;TR=121;WE=6221177;WS=6221159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	6221214	rs11040799	T	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=49;PP=2222;SC=TGTGTCATTCTGGCCTTCTAC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=98;WE=6221222;WS=6221204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	6227083	rs10742968	C	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=655;SC=TGGCACGAACCGCCCCATTTA;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=6227091;WS=6227073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	6231731	rs10769671	C	T	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=71;PP=2240;SC=CACATCAGCACCTGCTGATAC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=102;WE=6231739;WS=6231721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	6239139	rs11040809	A	G	4281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=69;PP=2760;SC=CCACACCACGACGTGCCTCAC;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=134;WE=6239147;WS=6239129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	6239344	rs3750944	G	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=23;PP=941;SC=GGGTACTGTCGTCACAGAAGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=6239352;WS=6239334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	6239972	rs368609593	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=-1.579;SC=TCAGCATAACGTGGTTACATG;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=32;WE=6239980;WS=6239962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr11	6243804	rs3750945	A	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=905;SC=AAAGTTCCAGATAGGCGGTAC;SOR=1.010;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=48;WE=6243812;WS=6243794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	6243843	rs3750946	C	G	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=24;PP=888;SC=CAGAGGTCTGCACAAAAAGAA;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=6243851;WS=6243833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	6243963	rs3750947	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=543;SC=TCTACCCACCGCCTCCTACGT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=6243971;WS=6243953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	6243982	rs325606	T	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=648;SC=GTTAGTCCTGTCACTGAGGTT;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=6243990;WS=6243972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	6265102	rs150015060	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.263;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=350;ReadPosRankSum=-0.803;SC=TGGAGGTGAAGGTCCTGGTTC;SOR=0.175;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=25;WE=6265110;WS=6265092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr11	6265503	rs369394973	G	A	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=939;ReadPosRankSum=0.929;SC=CGCATTGAACGGCTGGAGTGG;SOR=0.736;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=64;WE=6265511;WS=6265493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr11	6281108	rs2929180	T	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=9;PP=513;SC=TGGAGCCGCGTTGGGAGCCCG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=6281116;WS=6281098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	6281334	.	C	CT	3403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.776;NF=6;NR=45;PP=2043;ReadPosRankSum=0.141;SC=CAGCCCCCCCCACAAGCTATT;SOR=0.650;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=91;TCF=13;TCR=78;TR=51;WE=6281342;WS=6281324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,100:0.56:177
chr11	6281400	rs11040819	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.504;NF=8;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CACACTACCTTCTCAAACGTC;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=29;WE=6281408;WS=6281390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr11	6281479	rs78337258	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=6.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=1.891;SC=CCCCCACAGCCTACAACTTCA;SOR=2.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=6281487;WS=6281469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	6290756	rs3901667	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=0.605;SC=AAAGGATTCAAGTTCACCATT;SOR=2.517;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=6290764;WS=6290746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	6291227	rs117657121	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.581;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=233;ReadPosRankSum=2.358;SC=GGTCTTCCCCGGTTGGCAGGG;SOR=1.433;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=16;WE=6291235;WS=6291217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	6291466	rs77873910	A	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=817;ReadPosRankSum=2.306;SC=TGTCCGGACTACTCATGGTGC;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=52;WE=6291474;WS=6291456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr11	6292837	rs10839535	C	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	6292838	rs10839536	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=195;SC=CCAGACATACGAAACACAAAC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=6292846;WS=6292827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	6340525	rs12570	A	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=499;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GCTGGGCTTCAGCGCTCCGGC;SOR=1.129;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=36;WE=6340533;WS=6340515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr11	6340706	rs1051992	A	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=755;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TTCGGCCTCCAGCTGCTCTGG;SOR=0.855;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=49;WE=6340714;WS=6340696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,63:0.41:152
chr11	6341684	rs2682123	C	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=14;PP=417;SC=CACAGGCCCCCGCTCCAACGC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=6341692;WS=6341674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	6411935	rs3838786	TGCTGGC	T	7559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=71;PP=2990;SC=ATGGGCCTGGTGCTGGCGCTG;SOR=0.956;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=143;TCF=47;TCR=96;TR=111;WE=6411948;WS=6411925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	6412931	rs7951904	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TGCACTGGGATCATGACTACC;SOR=0.699;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=9;WE=6412939;WS=6412921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr11	6413366	rs72896268	C	T	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=65;PP=1640;ReadPosRankSum=0.184;SC=GGCTGCCTGCCGAAGCCCTGC;SOR=0.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=59;TCR=106;TR=100;WE=6413374;WS=6413356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,110:0.60:182
chr11	6413543	rs67992843	G	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CCTTTCTACTGTTTTGCCGCA;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=6413551;WS=6413533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	6415392	rs11601088	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=913;ReadPosRankSum=1.211;SC=GTTACCCTTGCTCCTTGCCCC;SOR=0.970;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=57;WE=6415400;WS=6415382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,63:0.39:160
chr11	6415491	rs142787001	A	T	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.992;SC=CTGGACCATGAGACCTACATC;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=190;TCF=105;TCR=85;TR=80;WE=6415499;WS=6415481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,112:0.45:251
chr11	6416959	rs1800606	C	T	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.844;NF=57;NR=26;PP=1489;ReadPosRankSum=1.243;SC=GCAGTCACTCCCCAGCCTACC;SOR=1.035;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=90;TCR=46;TR=83;WE=6416967;WS=6416949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,99:0.63:157
chr11	6417004	rs1799755	CTAG	C	2305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.647;NF=19;NR=24;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CACCACCCTACTAGTAGCTTA;SOR=0.919;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=43;WE=6417014;WS=6416994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,67:0.35:190
chr11	6424610	rs1800423	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=726;ReadPosRankSum=-1.520;SC=CCCAGCTCCATTGGGGCCTCA;SOR=0.556;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=37;WE=6424618;WS=6424600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr11	6424856	rs2682093	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=441;ReadPosRankSum=0.613;SC=GGCCCAAAATCAACAGGCCTG;SOR=0.428;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=29;WE=6424864;WS=6424846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr11	6461834	.	C	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.258;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.961;HP=20;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.090;NF=1;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-2.340;SC=AAAAAAAAAACCAGAAGGTGA;SOR=0.160;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=6;WE=6461842;WS=6461824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	6470057	rs2723636	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=0.288;SC=CACAGTCCAGGCTCACCCAGT;SOR=0.301;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=5;WE=6470065;WS=6470047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	6499215	rs2303493	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=109;ReadPosRankSum=1.333;SC=CTAATGCCCAAATTTCCACCC;SOR=0.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=10;WE=6499223;WS=6499205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr11	6500309	rs2253104	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr11	6503127	rs2303492	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=2.421;SC=AGAGTTTAGCGGTAGACTGCT;SOR=0.485;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=24;WE=6503135;WS=6503117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr11	6519642	rs11604149	G	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=892;ReadPosRankSum=0.922;SC=GCTGAGCTCCGAACTCTGTTC;SOR=0.660;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=64;WE=6519650;WS=6519632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr11	6520015	rs11040899	G	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=360;ReadPosRankSum=0.098;SC=CATTGACACTGCCTGAGCTAC;SOR=0.658;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=27;WE=6520023;WS=6520005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr11	6520164	rs2555158	T	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AATGCAGAGGTGGAGCCTGTT;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=26;WE=6520172;WS=6520154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr11	6524240	rs11040900	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TCTCCACGTGCGCACCCTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=14;WE=6524248;WS=6524230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr11	6530278	rs10839568	C	T	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=928;ReadPosRankSum=0.053;SC=TCATTCCATTCTTTAAGTATT;SOR=0.601;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=166;TCF=100;TCR=66;TR=64;WE=6530286;WS=6530268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,73:0.37:200
chr11	6532519	rs4758423	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=449;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GCAGGAGCTACACTCTGTGTC;SOR=0.333;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=31;WE=6532527;WS=6532509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr11	6541580	rs2555143	T	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=293;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GCACAAGTACTAATGGCATGG;SOR=1.194;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=17;WE=6541588;WS=6541570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr11	6549634	.	GGT	G,GGTGTGT	376.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=10,10;NR=2,2;PP=313,361;ReadPosRankSum=0.489;SC=GCAGCGAATGGGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=12,12;WE=6549643;WS=6549624;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.64:11
chr11	6549779	rs4633449	A	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=690;ReadPosRankSum=2.059;SC=GACTCAAAAGACGAATTTCTG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=42;WE=6549787;WS=6549769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr11	6549995	rs7480644	A	G	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.71;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr11	6550004	rs2344828	A	G	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.18;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr11	6550309	rs2344829	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CACAAAAGGCGGGTTGCTGCT;SOR=0.861;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=22;WE=6550317;WS=6550299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr11	6554941	rs4282961	C	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=522;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GTACGTCGAGCTGGAGGAGCG;SOR=1.025;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=33;WE=6554949;WS=6554931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr11	6555365	rs7103810	A	G	6689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=108;PP=2965;SC=ACAGTCAGCGACCTCAGTGAA;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=96;TCR=108;TR=204;WE=6555373;WS=6555355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr11	6560141	rs11040914	A	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=401;SC=AACACCTTTCATCCCCAAGTT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=6560149;WS=6560131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	6561270	rs10839577	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=787;ReadPosRankSum=2.219;SC=GCAGCCCCCAATGGGAGGTAG;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=50;WE=6561278;WS=6561260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr11	6567895	rs11270441	C	CTGCCCTACTGCA	4462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=2957;SC=ATTGAGGAGGCTGCCCTACTG;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=42;WE=6567903;WS=6567885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	6568213	rs58186801	T	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CTGGCAGCCATGGAGGACACC;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=71;WE=6568221;WS=6568203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,82:0.42:195
chr11	6579106	rs11040920	C	A	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1063;ReadPosRankSum=1.202;SC=GTTGAGCCCCCACCTGGCCCG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=62;WE=6579114;WS=6579096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr11	6579539	rs10839583	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=186;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TGAGGCCAAGAACCCCATATG;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=9;WE=6579547;WS=6579529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr11	6588228	rs10769699	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=563;ReadPosRankSum=0.442;SC=TGCCAGCTGCGTGCTCATTGT;SOR=0.464;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=44;WE=6588236;WS=6588218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,59:0.39:152
chr11	6591157	rs10839585	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=658;ReadPosRankSum=-0.687;SC=CTCAGGAGAGAGGTTTGAACT;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=35;WE=6591165;WS=6591147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr11	6621516	rs11040933	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=-1.357;SC=AAAAGACCCAGTGAGAACCAA;SOR=0.856;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=23;WE=6621524;WS=6621506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr11	6622714	rs2288283	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=46;PP=1419;SC=ATCTTCTCTTGTTCTTTTGCC;SOR=1.340;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=6622722;WS=6622704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	6622857	rs11826421	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=-0.561;SC=ATGGGAAGGTGCACATGAGGC;SOR=0.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=21;WE=6622865;WS=6622847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr11	6626049	rs55802517	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=425;ReadPosRankSum=-0.698;SC=TTTTAAAGCTGTATAGTGACA;SOR=0.999;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=28;WE=6626057;WS=6626039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr11	6626072	rs12272856	C	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=583;ReadPosRankSum=-0.667;SC=ATGAGATTGTCCATTTTTCAG;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=35;WE=6626080;WS=6626062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr11	6629530	rs2048092	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=0.541;SC=AAGCATGTGTGCTCTTCCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=29;WE=6629538;WS=6629520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr11	6629665	rs1043388	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=-1.735;SC=TGAATGAACACGGGAATGTGC;SOR=0.757;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=19;WE=6629673;WS=6629655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr11	6630028	rs11314683	TC	T	8795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=113;PP=2974;SC=GAGGTCCATCTCCCCCATCCC;SOR=0.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=63;TCR=118;TR=171;WE=6630036;WS=6630018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	6630833	rs1043390	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=841;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ACTGGATGCCGTATGGATCCC;SOR=1.093;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=52;WE=6630841;WS=6630823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr11	6632349	rs2555174	C	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=1.860;SC=TCAGTTTCCCCAAAGGGGTGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=10;WE=6632357;WS=6632346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	6632857	rs1876300	A	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=302;ReadPosRankSum=-0.201;SC=GAAAGTTTTGACAGCAGGCTA;SOR=1.030;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=21;WE=6632865;WS=6632847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr11	6636106	rs1128396	T	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=181;ReadPosRankSum=0.197;SC=CATCAAAGAGTCCTGCCCCAT;SOR=1.535;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=10;WE=6636114;WS=6636096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	6637504	rs2072651	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=-0.880;SC=CTCCCAGGCTGCAGAGGTGTA;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=12;WS=6637494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr11	6637518	rs7943955	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=542;SC=AGGTGTAAGCATTGTCTAAGT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=6637526;WS=6637494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	6638124	.	C	T	3772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=76;PP=2483;ReadPosRankSum=1.138;SC=ATCGTGGGTCCGAGGGTGAGT;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=226;TCF=110;TCR=116;TR=144;WE=6638132;WS=6638114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,166:0.62:266
chr11	6638506	rs1800738	A	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.744;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=595;ReadPosRankSum=1.936;SC=GTGTGCCCCAACCCCCATTCA;SOR=1.916;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=31;WE=6638514;WS=6638496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr11	6646108	rs10458926	T	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=421;ReadPosRankSum=-1.911;SC=ACCTGAAGTGTGAGGAAAAGT;SOR=0.960;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=39;WE=6646116;WS=6646098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr11	6647622	rs11827437	T	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=731;ReadPosRankSum=0.955;SC=CTGGGCGAGATAGAATGCATC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=49;WE=6647630;WS=6647612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr11	6647931	rs34782445	C	T	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=32;PP=1527;ReadPosRankSum=0.586;SC=ACTGTGAGCGCGAGACTGGGA;SOR=0.934;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=88;WE=6647939;WS=6647921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,100:0.69:144
chr11	6647978	rs4442534	C	T	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=51;PP=1500;ReadPosRankSum=0.079;SC=AACCCCAGCCCATTTGGGAGT;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=97;WE=6647986;WS=6647968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,116:0.66:177
chr11	6648054	rs370487968	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=0.263;SC=TAGCCTCACTGCTAGCCCGGG;SOR=0.577;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=51;WE=6648062;WS=6648044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,56:0.35:158
chr11	6648424	rs4758443	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=947;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ATCGCGCACCGTGATGGTGAC;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=52;WE=6648432;WS=6648414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr11	6648937	rs11040937	C	T	708.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=419;ReadPosRankSum=-0.153;SC=ATACATGTGTCGTGGGGATGG;SOR=0.278;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=26;WE=6648945;WS=6648927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr11	6651810	rs2659872	A	G	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=969;ReadPosRankSum=0.710;SC=CGCGTACCGTAAGCGCGCGCC;SOR=0.741;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=55;WE=6651818;WS=6651800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr11	6652618	rs2659871	C	T	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=71;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CCAGTGTTCCCGGAGGCACGC;SOR=0.703;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=215;TCF=69;TCR=146;TR=103;WE=6652626;WS=6652608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,121:0.49:247
chr11	6653232	rs2659870	C	G	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=685;ReadPosRankSum=-1.870;SC=TAAGGCTATGCGGTCTCAGGA;SOR=0.982;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=42;WE=6653240;WS=6653222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr11	6654613	rs11040938	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TTTGGGTCTGACACCAAGTGG;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=6654621;WS=6654603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr11	6655332	rs2659869	T	A	3781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=81;PP=2468;ReadPosRankSum=1.701;SC=CAACCTGCCCTTGGTCTACTG;SOR=0.659;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=226;TCF=98;TCR=128;TR=145;WE=6655340;WS=6655322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,163:0.61:267
chr11	6655433	rs997263	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.034;SC=CATCACCGCTGTGGGCATCAA;SOR=0.779;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=44;TCR=89;TR=74;WE=6655441;WS=6655423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,85:0.53:160
chr11	6703892	rs1567135	T	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=171;ReadPosRankSum=0.324;SC=AGTACCCAAGTTTAATTCTGC;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=15;WE=6703900;WS=6703882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr11	6735869	rs7937911	A	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=895;ReadPosRankSum=0.906;SC=CTTCAAGCACATCTTGCTTTG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=53;WE=6735877;WS=6735859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr11	6736745	rs7130858	G	A	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1167;ReadPosRankSum=1.772;SC=GGTTAGTCCTGTTTCCATTGA;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=71;WE=6736753;WS=6736735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,85:0.63:135
chr11	6737138	rs3741274	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=624;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CACACTGTTGTTTCCACATGT;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=38;WE=6737146;WS=6737128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr11	6737258	rs3741273	C	T	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=910;ReadPosRankSum=0.747;SC=TCTTATTCACCTTGATATGTT;SOR=1.054;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=53;WE=6737266;WS=6737248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,58:0.62:93
chr11	6737893	rs11040980	C	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1547;ReadPosRankSum=-1.612;SC=GCCATGACTTCTTGGGTGTTC;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=88;WE=6737901;WS=6737883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,105:0.62:170
chr11	6737927	rs11040981	G	A	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1588;ReadPosRankSum=1.313;SC=TAAAGTTCTCGTTCATCAGGC;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=92;WE=6737935;WS=6737917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,110:0.59:188
chr11	6738291	rs11040983	C	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1538;ReadPosRankSum=-1.761;SC=AAAGAGGCAACTTGGAAAGAT;SOR=0.563;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=83;WE=6738299;WS=6738281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,98:0.60:163
chr11	6738728	rs17262495	T	C	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1556;ReadPosRankSum=0.918;SC=ATGTTAGAGGTACATATGCTG;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=93;WE=6738736;WS=6738718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,102:0.57:178
chr11	6738952	rs10769716	G	T	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.615;SC=ATCAGGGAGTGACTATTAGGT;SOR=0.550;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=183;TCF=98;TCR=85;TR=101;WE=6738960;WS=6738942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,113:0.57:198
chr11	6739551	rs11040984	T	C	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1086;ReadPosRankSum=-2.413;SC=TCTCATTCTTTGGCCAGAAAT;SOR=0.698;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=73;WE=6739559;WS=6739541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,88:0.61:145
chr11	6739809	rs11040985	C	T	4934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,127:0.58:218
chr11	6739814	rs7114441	C	T	4864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.11;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,125:0.57:220
chr11	6739841	rs79708590	G	A	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=62;PP=1865;ReadPosRankSum=1.653;SC=TCAAGAGGCAGTCTTTCCTGC;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=88;TCR=105;TR=116;WE=6739849;WS=6739831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,134:0.59:228
chr11	6740136	rs10839601	G	A	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.700;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=2174;ReadPosRankSum=-1.963;SC=CTGACAAGTGGAAAGTTTGGC;SOR=0.502;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=118;WE=6740144;WS=6740126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,134:0.61:220
chr11	6740206	rs10839602	C	T	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.097;NF=50;NR=58;PP=1937;ReadPosRankSum=2.508;SC=TGAATATCCACTGGGTGAATG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=90;TCR=104;TR=108;WE=6740214;WS=6740196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,120:0.55:218
chr11	6740285	rs10839603	G	A	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=1670;ReadPosRankSum=2.300;SC=TTTCATATGGGTCAAAAGCCT;SOR=0.467;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=80;TCR=92;TR=101;WE=6740293;WS=6740275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,115:0.60:191
chr11	6740462	rs10839604	G	C	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1344;ReadPosRankSum=1.130;SC=ACGTCTTATAGATGAGATGGA;SOR=0.666;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=74;WE=6740470;WS=6740452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,84:0.56:150
chr11	6789294	rs7924459	G	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.295;NF=9;NR=13;PP=371;ReadPosRankSum=0.080;SC=CTCAAGGCCCGCATGACCTCC;SOR=0.617;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=22;WE=6789302;WS=6789284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr11	6790028	rs10839616	C	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.666;NF=20;NR=15;PP=481;ReadPosRankSum=0.197;SC=CATGTGGAGCCGGGCTTCTAT;SOR=0.974;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=35;WE=6790036;WS=6790018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr11	6790106	rs7102536	T	C	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=40;PP=1634;SC=AAATGTAGCATAGAGCAGTTC;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=6790114;WS=6790096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	6816778	rs866347	A	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=797;ReadPosRankSum=0.001;SC=TGTGGAGGGTAGAATGGTTCC;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=58;WE=6816786;WS=6816768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,69:0.36:190
chr11	6816875	rs7122644	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=504;ReadPosRankSum=0.050;SC=CTGTAGTGGCGCAGGAGCAGG;SOR=0.346;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=35;WE=6816883;WS=6816865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr11	6867894	rs7105094	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=486;ReadPosRankSum=-2.219;SC=CTAAATTCTATTGAATGACAA;SOR=1.034;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=33;WE=6867902;WS=6867884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr11	6890939	rs4758141	C	T	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=5.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.87;ReadPosRankSum=2.569;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,65:0.65:100
chr11	6890946	rs4758142	A	G	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=5.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.52;ReadPosRankSum=2.537;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,69:0.63:109
chr11	6891113	rs3930075	A	G	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.120;NF=22;NR=33;PP=1053;ReadPosRankSum=1.262;SC=CCCATGCTACACAGCCCCATG;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=55;WE=6891121;WS=6891103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr11	6891528	rs7117739	C	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.263;NF=30;NR=41;PP=1367;ReadPosRankSum=-1.418;SC=ACACAGCACTCTTTGAGATCT;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=71;WE=6891536;WS=6891518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,75:0.58:130
chr11	6891605	rs10839631	A	G	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.448;NF=44;NR=24;PP=1098;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TCCTATACTCACATTGCTGCT;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=68;WE=6891613;WS=6891595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,84:0.63:133
chr11	6891704	rs10839632	T	C	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1084;ReadPosRankSum=2.507;SC=CTTTTCTATATATCATTAAGC;SOR=0.759;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=190;TCF=89;TCR=101;TR=72;WE=6891712;WS=6891694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,99:0.43:230
chr11	6891758	rs7926083	A	C	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1470;ReadPosRankSum=1.604;SC=CCTGAGGGCAAGAAGCTGCTA;SOR=0.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=104;WE=6891766;WS=6891748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,117:0.58:202
chr11	6898663	rs10839635	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=525;ReadPosRankSum=-0.881;SC=ACGTATTTCCGACCCCAATCC;SOR=0.958;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=35;WE=6898671;WS=6898653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr11	6898758	rs7102808	A	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=489;ReadPosRankSum=0.570;SC=CTACAGCTCAAGGAATAAAGA;SOR=0.738;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=36;WE=6898766;WS=6898748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr11	6913127	rs2741804	A	G	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=46;PP=1483;ReadPosRankSum=0.813;SC=CACAACCCCCATAAGAAAAAT;SOR=0.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=96;WE=6913135;WS=6913117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,110:0.61:180
chr11	6913244	rs1965208	A	G	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=54;PP=2192;SC=TAGCCTCAGTATGAAGGTGGT;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=6913252;WS=6913234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	6913290	rs1965209	A	G	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1401;ReadPosRankSum=1.700;SC=CTGGTCCATGATCCTGTTGCC;SOR=0.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=74;WE=6913298;WS=6913280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,87:0.71:123
chr11	6942476	rs10839658	C	A	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1478;ReadPosRankSum=0.643;SC=TCTTAGAAATCTCTCCTTTGC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=93;WE=6942484;WS=6942466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,103:0.63:163
chr11	6942628	rs11605995	A	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,31:0.24:131
chr11	6942726	rs10839659	G	C	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=1054;ReadPosRankSum=0.940;SC=TTCAGGTCCTGGGCCAGTGGG;SOR=0.407;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=60;WE=6942734;WS=6942716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,69:0.78:88
chr11	6942952	rs2035844	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TTATCTCCACTGTTATCCAGA;SOR=0.411;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=32;WE=6942960;WS=6942942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr11	6943254	rs1388535	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=365;ReadPosRankSum=-0.808;SC=AGAGCTATGGCAACATTCTTT;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=27;WE=6943262;WS=6943244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,28:0.26:108
chr11	6953858	rs11041108	A	G	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=693;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CAGTAAAGATATGGTGACCCT;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=47;WE=6953866;WS=6953848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr11	6962971	rs10839663	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=1.870;SC=GAACTTGTGCCAAACATGGTT;SOR=1.329;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=10;WE=6962979;WS=6962961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr11	6965012	rs2515947	C	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=571;SC=AGACATTATTCGCTTTTGTTC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=6965020;WS=6965002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	6976988	rs2239731	A	T	6077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=73;PP=2965;SC=CCGAAAGTGGACACCCTTCTT;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=177;WE=6976996;WS=6976978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	7022160	rs2857919	A	G	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=71;PP=2814;SC=CATGCTTTACAGATGGAGCAT;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=136;WE=7022168;WS=7022150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	7022360	rs2239734	A	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1145;ReadPosRankSum=1.199;SC=ATGCTGAACTATGAGCTTCTG;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=68;WE=7022368;WS=7022350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,86:0.32:269
chr11	7022531	rs1156525	A	T	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1524;ReadPosRankSum=0.159;SC=TAAGTTCCTGAGACTTTTGCT;SOR=0.991;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=79;WE=7022539;WS=7022521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
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chr11	7059960	rs12801277	A	C	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=23;PP=1879;SC=ACACCCTGGAATGAAGTGAAG;SOR=1.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=83;WE=7059968;WS=7059950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	7060948	rs117823353	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=191;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTTGCAGGGTCGGCCCAGACT;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=14;WE=7060956;WS=7060938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr11	7063755	rs7123944	C	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=25;PP=1297;SC=AACACTTGTTCGATGTGGATG;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=7063763;WS=7063745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	7064457	rs76429148	T	C	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.245;SC=CAGCTCTGTTTACCTGCTATA;SOR=0.722;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=61;WE=7064465;WS=7064447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,69:0.44:156
chr11	7065289	rs6578821	C	A	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=590;SC=AGGGAGGAGGCGTTTAGCTGA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=7065297;WS=7065279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	7070866	rs1552727	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=522;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GAGAGAAATGGTTTTGTAATA;SOR=1.308;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=24;WE=7070874;WS=7070856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr11	7071031	rs1552726	G	A	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=84;PP=2965;SC=CATTGTGTGAGGCCTTGAAAC;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=71;TCR=84;TR=155;WE=7071039;WS=7071021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	7078804	rs16921939	A	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=228;ReadPosRankSum=0.955;SC=TTTTCAGGCAAGATTCCAAAG;SOR=0.399;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=14;WE=7078812;WS=7078794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr11	7078882	rs79249984	T	G	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=668;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GAGTGGTCATTCCTGCTTTTC;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=45;WE=7078890;WS=7078872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,52:0.41:128
chr11	7079038	rs10839708	G	A	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=53;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GCTTTTGTGTGAGGCCTTAAG;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=67;TCR=96;TR=90;WE=7079046;WS=7079028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,112:0.56:200
chr11	7083610	rs117124176	T	A	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr11	7083620	rs117583918	T	C	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr11	7091772	rs10769763	C	A	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=46;PP=1309;SC=CCTCAGAATCCACCTAATTGT;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=63;WE=7091780;WS=7091762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	7110363	rs4758158	G	A	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1589;ReadPosRankSum=0.972;SC=TGGTTGAAGCGGATCGCCCGG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=92;WE=7110371;WS=7110353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,110:0.54:204
chr11	7110751	rs11041171	A	G	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=26;PP=1003;SC=CGGCGGCTACACGGCGGATTT;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=7110759;WS=7110741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	7324475	rs4412741	T	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=78;PP=2710;SC=ACTTCCTAGATCCTCCCACGC;SOR=1.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=132;WE=7324483;WS=7324465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	7335424	rs2035639	C	G	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=52;PP=2288;SC=AGATTCTTAGCTAGCCCCTAA;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=120;WE=7335432;WS=7335414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	7507182	rs118163706	A	G	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=27;PP=1131;SC=GCCGCAGTGTACCCAGGACCC;SOR=0.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=61;WE=7507190;WS=7507172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	7509292	rs12223776	G	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=425;SC=TAAATGATAGGTATTTATATT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=7509300;WS=7509282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	7509325	rs78697293	G	A	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=699;SC=TAAATAACAAGCAATAATTTG;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=7509333;WS=7509315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	7509751	rs78522704	T	C	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=48;PP=1499;SC=AGAGTAAGAATTGGAGGTGTG;SOR=2.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=7509759;WS=7509741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	7531229	rs76280703	G	A	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=42;PP=1681;SC=GGCCCTCATCGCATCACCTGC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=81;WE=7531237;WS=7531219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	7598952	rs6578880	C	G	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=18;PP=447;SC=GTGTGTGTGCCTGTGTGTGGT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=7598960;WS=7598942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	7614282	rs7939893	TG	CA	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.191;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=-0.306;SC=ACAAATTACATGCATCCCTTA;SOR=2.409;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=8;WE=7614291;WS=7614272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr11	7619518	rs4758206	T	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=27;PP=816;SC=CTTAATATTATATTTTTCCCA;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=7619526;WS=7619508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr11	7650564	rs56298316	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=784;ReadPosRankSum=-0.390;SC=GGCCTGGACACTCTTTTCCTT;SOR=0.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=43;WE=7650572;WS=7650554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr11	7650607	rs6578887	A	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=59;PP=2882;SC=TCCTTGTGCCAAGAACATAGC;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=148;WE=7650615;WS=7650597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	7652034	rs11823260	T	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr11	7652096	rs72851307	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=417;ReadPosRankSum=1.370;SC=TTTTGTGGTACGATTATAGGT;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=23;WE=7652104;WS=7652086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr11	7652385	rs4130354	T	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=454;SC=TAAATTAATATAGTGCCCCTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=7652393;WS=7652375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	7656809	rs11041490	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.064;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=1206;ReadPosRankSum=0.998;SC=AGCCCTTCCCGGTGTTAGAAC;SOR=0.895;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=70;WE=7656817;WS=7656799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,86:0.57:151
chr11	7662732	rs4643071	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=764;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GTGGCTGGGACGACACTGCTG;SOR=0.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=42;WE=7662740;WS=7662722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr11	7663726	rs4402283	T	C	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=828;SC=CAAACCTGCATGGGTGAATCT;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=7663734;WS=7663716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	7670249	rs4237757	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=680;ReadPosRankSum=0.064;SC=CCTTGTAAAAAGCAGAGGAAT;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=30;WE=7670257;WS=7670239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr11	7670353	rs4758009	A	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=649;ReadPosRankSum=0.670;SC=GAATCCTGACACATCTGGGGT;SOR=1.243;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=38;WE=7670361;WS=7670343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr11	7670440	rs4758209	A	G	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=77;PP=2844;SC=TAGAGTTGACAGACGAATGCT;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=150;WE=7670448;WS=7670430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	7670943	rs10839831	G	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CTGAAACATCGAGCATGAGCA;SOR=1.839;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=23;WE=7670951;WS=7670933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr11	7672272	rs3923491	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TAAGGACAAGGCACAAAAGCT;SOR=0.169;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=12;WE=7672280;WS=7672262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	7673015	rs5864	G	A	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=59;PP=1413;ReadPosRankSum=0.867;SC=CTGAACAGGAGAAGCGAGAGA;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=49;TCR=99;TR=86;WE=7673023;WS=7673005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,93:0.57:164
chr11	7673099	rs11041498	T	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.48;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr11	7673106	rs11041499	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	7686584	rs1128627	A	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.053;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr11	7686596	rs13172	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.014;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr11	7686602	rs16411	G	GTGTT	2523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=0.993;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr11	7686674	rs13854	T	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=753;ReadPosRankSum=0.028;SC=CCGTCTGGATTAGTGGTGGCG;SOR=0.803;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=43;WE=7686682;WS=7686664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr11	7686810	rs55826178	C	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=0.431;SC=GCAAGCTGAGCGATGCCAGGT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=7686818;WS=7686800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	7686915	rs11041521	T	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=384;ReadPosRankSum=0.420;SC=GTACTACTGCTCCCTGCAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=7686923;WS=7686905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr11	7686970	rs55635523	T	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=8;PP=2013;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TCACCCCAGGTCCCAGGCTCA;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=64;TCR=16;TR=47;WE=7686978;WS=7686949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
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chr11	7687913	rs72851388	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=1.214;SC=CCAACTCCCACGGCAAACAAG;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=12;WE=7687921;WS=7687903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr11	7689633	rs10743030	A	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=636;SC=GTTGTCCCTTAGAGGATCAAA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=7689641;WS=7689623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	7690685	rs4631871	T	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=648;SC=CTCTGAATTGTTGTACGCAAT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=7690693;WS=7690675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	7710729	rs4505055	C	G	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=977;SC=CCAAGATCAACGTGTCAGCAG;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=7710758;WS=7710719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	7710742	rs4365041	A	T	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=3.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	7710750	rs4277100	G	A	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=2.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	7710877	rs4503519	C	T	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=70;PP=2145;SC=CATCATTACACGATATTCTCC;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=118;WE=7710885;WS=7710867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	7712471	rs4509745	C	T	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=71;PP=2740;SC=GAACTGGGAACCAAAGAGTTG;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=141;WE=7712479;WS=7712461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	7716549	rs4287332	C	G	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=40;PP=1251;SC=CAAGAAAAGACGTAGTGCATG;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=51;WE=7716557;WS=7716539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	7716855	rs4528317	T	A	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=74;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=1251;SC=CCAGCTGCATTATCTGTGGCA;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=7716863;WS=7716845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	7720159	rs60610878	C	CT	336.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=333;SC=GGCATAATGGCTGTAGGTGCT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=7720167;WS=7720149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	7720426	rs4367936	C	A	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=47;PP=1379;SC=AGTCAATATGCAACTAATAAA;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=7720434;WS=7720416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	7721743	rs12279973	C	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=496;SC=AGAGGTAGAGCCTGTTGGTTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=7721751;WS=7721733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	7721870	rs10839849	G	A	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=46;PP=1701;SC=TGGATCCAGGGAAGCACTTTA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=7721878;WS=7721860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	7723171	rs5789540	GA	G	2769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=32;PP=2284;SC=ATGCACAATCGATTTTTAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=7723179;WS=7723161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	7723683	rs4373911	G	A	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=45;PP=2746;SC=AGACAATTCAGTATGATCCTC;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=86;TCR=45;TR=131;WE=7723691;WS=7723673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	7727886	rs7927138	C	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=30;PP=1201;SC=AGATTTACCTCGTTCAAAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=53;WE=7727894;WS=7727876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	7794545	rs1482784	C	A	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=51;PP=2609;SC=TGTAGGACAGCGATATCAATC;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=7794553;WS=7794535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	7794650	rs371799	G	C	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=63;PP=2791;SC=GGGAGGTACAGGTGGAGAAGG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=80;TCR=63;TR=143;WE=7794658;WS=7794640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	7794976	rs980145	T	A	6221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=96;PP=2965;SC=TGGGTGGAGTTCACCAGGGGT;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=201;WE=7794984;WS=7794966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	7817420	rs7949546	T	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=605;ReadPosRankSum=0.464;SC=GAAGAAAAGATGTGGTAGATT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=14;WE=7817442;WS=7817410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr11	7817434	rs7931990	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=605;ReadPosRankSum=0.203;SC=GTAGATTCTACATGAAACTTT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=16;WE=7817442;WS=7817410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr11	7817512	rs7931212	G	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=0.236;SC=CAAGAGAAGAGATAGGGTTCT;SOR=0.898;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=20;WE=7817520;WS=7817502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
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chr11	7817665	rs72484720	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.769;NF=20;NR=8;PP=338;ReadPosRankSum=1.678;SC=GAATCACCACTGTGTACAACA;SOR=1.241;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=28;WE=7817673;WS=7817655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr11	7817852	rs76615008	C	G	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.42;ReadPosRankSum=-1.513;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,87:0.44:197
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chr11	7817959	rs73406603	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=767;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GTAAGGGAGCGAAATCACAGA;SOR=0.663;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=175;TCF=85;TCR=90;TR=60;WE=7817967;WS=7817949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,72:0.36:200
chr11	7818056	rs73406604	T	C	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=767;ReadPosRankSum=-0.253;SC=ACCAGCTATGTAAACTACTAA;SOR=0.862;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=53;WE=7818064;WS=7818046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,57:0.35:164
chr11	7818151	rs73406606	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=542;ReadPosRankSum=0.884;SC=CATAGGCCATGGCAGCCAGAA;SOR=0.626;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=41;WE=7818159;WS=7818141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,41:0.30:135
chr11	7818190	rs73406607	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=561;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CAAAGAAAGCCGCTGAACCAA;SOR=0.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=41;WE=7818198;WS=7818180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,42:0.31:136
chr11	7818313	rs73406609	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=635;ReadPosRankSum=-0.214;SC=CCAAGTGGCTCAGAAAGAAAT;SOR=0.847;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=47;WE=7818321;WS=7818303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,58:0.34:169
chr11	7818383	rs138967151	G	GATATGGTTACCAGGTAGATGC	2286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,55:0.30:182
chr11	7818518	rs73406611	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=375;ReadPosRankSum=-1.137;SC=ACTAAATGAACCCTAATGAGA;SOR=0.742;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=24;WE=7818526;WS=7818508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr11	7847208	rs1482791	T	C	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1360;ReadPosRankSum=1.607;SC=CAAACGTCACTACAGAACAGA;SOR=0.993;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=75;WE=7847216;WS=7847198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,84:0.55:153
chr11	7847466	rs1482792	A	G	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.64;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	7847466	.	AGATAAC	GGATAAC,GGATAAT	467	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=33,18;NR=31,17;PP=416,467;QD=7.04330019605;SC=TAGTATCCTCAGATAACCCCA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64,35;WE=7847480;WS=7847456;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:64
chr11	7847472	rs1482793	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr11	7847523	rs1482794	T	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=365;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TCCCCATCTATATTGGGAATG;SOR=0.848;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=23;WE=7847531;WS=7847513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr11	7870670	rs61759825	A	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=348;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GCGGGTCTGCAGGGAGTTAGT;SOR=0.373;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=26;WE=7870678;WS=7870660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr11	7870760	rs17221305	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=379;ReadPosRankSum=0.753;SC=CTGCAACTCCGACGTCATCCA;SOR=0.638;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=33;WE=7870768;WS=7870750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr11	7871011	rs4758022	A	G	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=62;PP=2848;SC=ATGGCACACTATTTTTCATGT;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=141;WE=7871019;WS=7871001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	7949192	rs11041669	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=0.122;SC=CAAACTTAATGAATCTAAATT;SOR=0.955;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=12;WE=7949200;WS=7949182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr11	7949350	rs4758258	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=742;ReadPosRankSum=-0.455;SC=GTAGATAAGCAGATTCAGCAG;SOR=0.600;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=54;WE=7949358;WS=7949340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,66:0.40:163
chr11	7950024	rs12272735	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1205;ReadPosRankSum=1.844;SC=AGTTCAGGAGAAACAGGTACA;SOR=0.825;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=192;TCF=80;TCR=112;TR=72;WE=7950032;WS=7950014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,76:0.35:217
chr11	7960045	rs6578915	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=714;SC=AAAAAATGCAGTCTGTTTTCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=7960053;WS=7960035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	7961130	rs4758259	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=1.354;SC=AGTCGTAATCCCATAGCTGTG;SOR=0.404;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=18;WE=7961138;WS=7961120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr11	7981130	rs148579969	AT	A	749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=780;ReadPosRankSum=-0.020;SC=AGCTTCTTTGATTTCTTTCCT;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=22;WE=7981138;WS=7981120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr11	8009420	rs12278319	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.005;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	8013450	rs7941782	C	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.636;NF=11;NR=20;PP=527;ReadPosRankSum=0.778;SC=TTCATTTGCTCGGCTCCCCTC;SOR=0.825;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=31;WE=8013458;WS=8013440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr11	8013478	rs77896992	CATAA	C	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.588;NF=2;NR=14;PP=682;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CTCCCACACTCATAACTAGAG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=16;WE=8013489;WS=8013468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr11	8014479	rs4758267	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.409;NF=12;NR=3;PP=244;ReadPosRankSum=0.334;SC=TGCTGATCCACGAGTACTACA;SOR=1.085;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=15;WE=8014487;WS=8014469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr11	8016730	rs1105984	T	C	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1209;ReadPosRankSum=-1.187;SC=CACTGAGGCATGTGCTGATGA;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=88;WE=8016738;WS=8016720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,108:0.61:177
chr11	8061100	rs10769865	C	T	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=9;PP=621;SC=CTGAAGGAGGCCTTGAGTGAC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=8061108;WS=8061090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	8103104	rs11041733	G	T	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=60;NR=55;PP=2021;SC=AGGTACGCGGGCGCCGGGCCG;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=115;WE=8103112;WS=8103094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	8111540	rs2272382	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=610;SC=CAAGGTGGGCTGTGGACCCCC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=8111548;WS=8111532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	8115699	rs4758289	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=315;ReadPosRankSum=2.665;SC=GGGGCCAGGGTGGCGCCGCTA;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=29;WE=8115707;WS=8115689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr11	8115762	rs7396690	C	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=914;SC=CTACAGCCCTCCCCAGCAGGC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=8115770;WS=8115752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	8117228	rs11041739	A	G	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=56;PP=2225;SC=CCCCATGGGGACCCAGTGATA;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=109;WE=8117236;WS=8117218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	8118103	rs2242501	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=606;SC=GATATGGCTAAGAGTGTGTGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=8118124;WS=8118093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	8118116	rs2242502	A	G	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=791;SC=GTGTGTGCATAAGTTTGTGGG;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=8118124;WS=8118093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	8118185	rs10160258	C	G	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=25;PP=1263;SC=TCAGGGGCAGCGTAGACTTCT;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=8118193;WS=8118175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	8118200	rs7931842	C	A	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=29;PP=1301;SC=ACTTCTCCTCCTTCATCCCTT;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=8118208;WS=8118190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	8119063	rs7950355	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=10;PP=415;SC=CATATCTACCACTGACCTCTC;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=8119071;WS=8119053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	8122234	rs7394561	G	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;SC=GCTGATGTGTGTATGTGGAGG;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WS=8122224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	8122242	rs138755629	A	AG	795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=480;ReadPosRankSum=-0.714;SC=GTGTATGTGGAGGGGTACCAT;SOR=0.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=15;WE=8122250;WS=8122224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr11	8132301	rs11826236	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=561;ReadPosRankSum=0.633;SC=TATGCTTTATCGGTGCTGATG;SOR=0.619;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=38;WE=8132309;WS=8132291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,43:0.40:107
chr11	8149753	rs1528133	T	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=674;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TGGGGCAGACTAGAAGAGCTT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=52;WE=8149761;WS=8149743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,59:0.36:163
chr11	8159857	rs55990541	C	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1013;ReadPosRankSum=1.492;SC=GGCAGTATAGCATTTCCCATC;SOR=0.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=65;TCR=94;TR=74;WE=8159865;WS=8159847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,90:0.49:183
chr11	8159961	rs56359962	T	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=125;ReadPosRankSum=0.660;SC=ACCCCTCATATCAAACAAAAA;SOR=0.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=14;WE=8159969;WS=8159951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr11	8174763	rs10839983	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GAGTACTTTACATGCGGTATT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=8174771;WS=8174753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	8174966	rs10743052	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.052;SC=CTCACTCTTAGTTTTCTGCAA;SOR=0.285;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=19;WE=8174974;WS=8174956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr11	8246343	rs3816490	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=2.272;SC=GACAGAAGCCGGCCTGGCCTA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=22;WE=8246351;WS=8246333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr11	8248440	rs2290451	C	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GCGTGCACGCCTCCGCCGTGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=8248448;WS=8248430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	8248482	rs2290450	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=0.919;SC=CTCAGGCTGGCGTCTGGGGAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=8248490;WS=8248472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	8284838	rs204931	A	G	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=24;PP=1156;SC=GCGCCGCGGCAGGGGGCGAGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=8284846;WS=8284828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	8284860	rs204930	G	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=759;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GGTGAGGGGCGTCGAGACCCC;SOR=1.026;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=52;WE=8284868;WS=8284850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr11	8284981	rs176083	A	C	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=35;PP=1166;SC=CGCGCTTTGGAGGGGCGGCCG;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=67;WE=8285003;WS=8284971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	8284995	rs204929	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=38;PP=1339;SC=GCGGCCGGTCTTCGGGCAGCT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=8285003;WS=8284971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	8457237	rs10769907	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=GATGCCAAGTGTACAATAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=8457245;WS=8457227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	8483335	rs1900273	G	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=484;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AAAATGCAGCGCCTAATAGAG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=36;WE=8483343;WS=8483325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr11	8486310	rs1446464	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=499;ReadPosRankSum=1.114;SC=CCTTGTCTGTCGCTTCAATGA;SOR=1.499;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=82;TCF=23;TCR=59;TR=29;WE=8486318;WS=8486300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr11	8496516	rs2289923	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=508;ReadPosRankSum=0.860;SC=AGAAAACCAGGCCAAAAAGGA;SOR=1.445;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=27;WE=8496524;WS=8496506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr11	8639325	rs4929924	G	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=813;SC=GATGTACTACGGCTCCCAAAT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=8639333;WS=8639315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	8641501	rs7946508	C	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=310;SC=AATTTTGTGACTCTAGAAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=8641509;WS=8641491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	8641882	rs7943945	G	A	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=10;PP=462;SC=GGCATAGGACGAAGAAATGTA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=8641890;WS=8641872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	8642218	rs7950166	C	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=283;SC=ACTGAGTCTCCGGCTTTGCCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=8642226;WS=8642208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	8644530	rs4929948	T	G	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=84;PP=2645;SC=GCCACACATCTGTCATACAGT;SOR=1.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=35;TCR=84;TR=119;WE=8644538;WS=8644520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	8644562	rs10533257	TCATA	T	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=54;PP=2970;SC=CTATAGTCATTCATACATAGT;SOR=2.140;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=58;WE=8644573;WS=8644552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	8646237	rs12803166	G	T	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=39;PP=1983;SC=AGGAAGTTTGGATAGCATTTC;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=8646245;WS=8646227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	8662090	rs11042022	T	C	237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=98;SC=AGGTGGGGGATGGGGGAGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=8;WE=8662098;WS=8662080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	8662516	rs11042023	T	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=23;PP=894;SC=TGGGGAGCAGTGGGAGCAGCA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=8662524;WS=8662506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	8669437	rs10840100	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=409;SC=CAGGCACTACATCTGACGGCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=8669445;WS=8669427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	8670172	rs7950801	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=503;SC=GCTGCACAGCTCTCAGCCTTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=8670180;WS=8670162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	8704302	rs200312442	C	G	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=27;PP=1141;ReadPosRankSum=-2.277;SC=GCCCCGCCCCCGTGGCCGATA;SOR=1.053;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=207;TCF=134;TCR=73;TR=88;WE=8704310;WS=8704287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,95:0.39:243
chr11	8704384	rs143278201	C	T	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=57;PP=1570;ReadPosRankSum=2.071;SC=CGTTTCTTGCCTCCTCTTCCT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=274;TCF=130;TCR=144;TR=107;WE=8704392;WS=8704374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,118:0.36:326
chr11	8704711	rs3365	A	C	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1220;ReadPosRankSum=1.209;SC=CCCTGCCCCTAATTCCTTAGG;SOR=0.465;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=207;TCF=119;TCR=88;TR=85;WE=8704719;WS=8704701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,91:0.39:231
chr11	8704965	rs2073684	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.229;SC=CTCTAGTATTCCAGTTCTAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=8704973;WS=8704955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	8719262	rs75105504	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=153;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TTAGAAGAGCGTGAGTAGATA;SOR=0.373;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=12;WE=8719270;WS=8719252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr11	8719615	rs10840113	C	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TGAGCCCAGGCAGGTCGAGGC;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=8719623;WS=8719605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr11	8721611	rs36089509	TG	T	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr11	8721617	.	G	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.431;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GGCCTGGGGGGGGGCAGGGTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=3;WE=8721625;WS=8721601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr11	8732300	rs142788493	GCACACACACA	G	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=1.068;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.180;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr11	8735662	rs931756	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=0.275;SC=CACCACCCCAGCTTTTCTCAC;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=34;WE=8735670;WS=8735652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr11	8736046	rs931757	C	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=272;SC=CTCCCTCCTACGTGGCCATTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=8736054;WS=8736036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	8772367	rs77860546	T	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=1.384;SC=GCCAAGAGGGTGTCTGTGGCA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=5;WE=8772375;WS=8772357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr11	8788168	rs10743089	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=249;ReadPosRankSum=-2.304;SC=CTGGGTGAAGATCTGCACGAA;SOR=1.236;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=18;WE=8788176;WS=8788149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr11	8788225	rs10734637	A	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=833;SC=TATGCGCCCCACCTCCATTCT;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=8788233;WS=8788215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	8797681	rs72141186	ACG	A	550.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.196;NF=9;NR=1;PP=752;ReadPosRankSum=1.506;SC=GCACACAGACACGCACGTGCG;SOR=2.946;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=8797702;WS=8797671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
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chr11	8797732	.	C	CACACA	1134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.113;NF=11;NR=11;PP=1016;ReadPosRankSum=2.620;SC=CACACACACACACCTACCTCT;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=22;WE=8797741;WS=8797722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr11	8933853	rs2742519	T	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=207;ReadPosRankSum=1.124;SC=TCTTTTAGAGTTGGAATTCTT;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=13;WE=8933861;WS=8933843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	8934101	rs2742518	A	G	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=122;PP=2965;SC=GTGAACCAAAACTATGCCCCA;SOR=1.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=55;TCR=123;TR=177;WE=8934109;WS=8934091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	8938934	rs2016844	C	T	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=982;ReadPosRankSum=0.071;SC=GAACTGCTTACGCACTGGGTT;SOR=0.357;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=58;WE=8938942;WS=8938924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,79:0.75:105
chr11	8942942	rs2653601	C	T	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.192;SC=TGGCGGGGTCCGCGGTGGCTT;SOR=0.815;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=94;WE=8942950;WS=8942932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,116:0.62:187
chr11	8942999	rs2568023	G	A	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=76;PP=2835;SC=CCCCACTACTGCAGTTTGTGC;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=55;TCR=76;TR=131;WE=8943007;WS=8942989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	8946950	rs3751068	G	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.583;SC=ACATGTGGGAGGGAAGGGAGG;SOR=2.441;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=15;WE=8946958;WS=8946940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	8947021	rs2653588	A	G	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=40;PP=2547;SC=TGGCTTCCCAAGGCATGGCTC;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=117;WE=8947029;WS=8947011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	8947179	rs2568077	G	A	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1258;ReadPosRankSum=0.836;SC=TCTCCACACCGTCTTGTTCAC;SOR=0.711;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=69;WE=8947187;WS=8947169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,80:0.60:133
chr11	8947283	rs3751066	G	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=789;ReadPosRankSum=0.118;SC=TGTGCTGTGGGCTCCAACTCT;SOR=0.641;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=49;WE=8947291;WS=8947273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,53:0.40:133
chr11	8947586	rs11042127	C	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=546;ReadPosRankSum=0.958;SC=ACCGACTGGACCCCACCTAGG;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=33;WE=8947594;WS=8947576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr11	8948680	rs3751065	A	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.066;SC=CTGCGACAAGAGGAGCCTCGA;SOR=0.454;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=13;WE=8948688;WS=8948670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr11	8949094	rs2568075	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=516;ReadPosRankSum=0.553;SC=TCCTCCTTCCAGCACCCCCAA;SOR=1.508;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=34;WE=8949102;WS=8949084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr11	8959370	rs2742505	G	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1311;ReadPosRankSum=1.188;SC=GGAGCTGGGCGTAGCCTTCAT;SOR=0.488;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=73;WE=8959378;WS=8959360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,80:0.64:125
chr11	8959511	rs4910179	T	G	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=26;PP=1187;SC=CACTGTAATTTCCCAGGATAA;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=8959519;WS=8959501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	8959545	rs4909951	C	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=395;ReadPosRankSum=0.096;SC=AAAAGGCAGCCGTGGCAGCTC;SOR=0.948;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=23;WE=8959553;WS=8959535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr11	8970083	rs2653604	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=0.044;SC=CATAGACACACAACAGTGACC;SOR=1.565;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=6;WE=8970091;WS=8970073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr11	8977691	rs2742488	C	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=455;ReadPosRankSum=0.792;SC=GCAGAAAAGACGTAGACAGAC;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=26;WE=8977699;WS=8977681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr11	8977707	rs2568069	G	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=540;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CAGACAGACAGACAGGTAGAT;SOR=0.471;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=35;WE=8977715;WS=8977697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr11	8977830	rs2568068	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=460;ReadPosRankSum=-0.868;SC=TGGGCTCCACAACATGAAGGC;SOR=0.576;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=34;WE=8977838;WS=8977820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,41:0.37:112
chr11	8983547	rs2163626	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=-0.162;SC=AAATACTTAAAAAGAAAACTA;SOR=0.807;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=7;WE=8983555;WS=8983537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	8985916	rs3833778	G	GGGCTCA	2509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=30;PP=2216;SC=CTCCCGGCTCGGGCTCAGGCT;SOR=1.278;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=36;WE=8985924;WS=8985906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	9005036	rs2568046	T	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=21;PP=960;SC=CAGTTTTCTCTATCTGTCAAC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=9005044;WS=9005026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	9051385	rs7479998	C	A	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=36;PP=2228;SC=ACCCAGACACCTATCTTCTTA;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=109;WE=9051393;WS=9051375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	9052170	rs10769983	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CTGCTGGGGCGAGTGGAGCTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=9052178;WS=9052160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr11	9072140	rs3751052	C	T	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=760;ReadPosRankSum=0.069;SC=ACACCAACCACCTGATTCCAT;SOR=1.525;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=43;WE=9072148;WS=9072130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,45:0.75:60
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chr11	9113008	rs142900716	GGCA	G	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=399;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CAGCAGTGGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=9113018;WS=9112998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr11	9164437	rs74643810	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=220;ReadPosRankSum=0.745;SC=TCTCAGCCGAGCTGCCCTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=12;WE=9164445;WS=9164427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr11	9167399	rs10732517	T	C	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=441;SC=TGAGGAGAATTAGGAATCTTT;SOR=1.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=9167407;WS=9167389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	9198276	rs7394878	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=588;ReadPosRankSum=0.033;SC=GAGAAGGAAATGTATCTGCTA;SOR=0.518;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=31;WE=9198284;WS=9198266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr11	9199650	rs60693427	C	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=1039;ReadPosRankSum=0.234;SC=TCCAAGAGGCCTGAATGTACA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=57;WE=9199658;WS=9199640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,73:0.68:107
chr11	9228785	rs7396439	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=2.376;SC=ATGAAAAGATGTAAGAACATT;SOR=0.570;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=21;WE=9228793;WS=9228775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr11	9304939	rs1136330	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=1.701;SC=GAGATGGTGATGACAGCAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=9304947;WS=9304929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	9307951	rs76581517	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=425;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GCTGGACACTGTTAGATATGT;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=24;WE=9307959;WS=9307941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr11	9309405	rs5014247	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=302;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TCTTACTCACATTGATTTATT;SOR=0.223;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=24;WE=9309413;WS=9309395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr11	9310114	rs75446893	A	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-2.036;SC=ATTAGAATATAATTAAGTAGA;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=10;WE=9310122;WS=9310104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	9310153	rs144571752	G	GA	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=0.328;SC=AACATTTCAGGAAAAAAGTAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=9310161;WS=9310143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	9310169	rs10770007	C	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=6;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AGTATAAATACAAAAATTATC;SOR=0.086;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=9310177;WS=9310159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	9316937	rs4601780	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=14;PP=509;SC=TTTCTTCTCTGAAGAAATAAA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=9316945;WS=9316927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	9336071	rs4325312	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ACTACGCCGAAGCGCCACGGC;SOR=0.518;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=18;WE=9336079;WS=9336061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr11	9336140	rs116886507	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-0.266;SC=GCGAGTACTGCAACCTCCTGC;SOR=1.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=9336148;WS=9336130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	9406349	rs4606477	T	C	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=58;PP=2436;SC=TGCGGGGCACTATGGACCCAG;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=125;WE=9406357;WS=9406339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	9450377	rs2290423	T	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=853;ReadPosRankSum=-1.171;SC=TCTGTGTTTTTCATTCAGATC;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=48;WE=9450385;WS=9450367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr11	9495961	rs2278900	A	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=591;ReadPosRankSum=0.485;SC=TACTGAACTTACTTAAATGTT;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=28;WE=9495969;WS=9495951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr11	9522567	rs2290425	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CTAGGCAGGATTGAAGGATAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=9522575;WS=9522557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	9537904	rs10743108	G	C	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=33;PP=1177;SC=TACAGAAGGGGAACAGGTAAT;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=9537912;WS=9537894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	9595732	rs11042428	C	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.369;SOR=1.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	9603236	rs4370932	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=366;ReadPosRankSum=0.609;SC=GTAAGTATTGCAGATCTTCTG;SOR=0.858;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=25;WE=9603244;WS=9603226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr11	9607032	rs10770042	A	G	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=948;ReadPosRankSum=0.515;SC=CACAAGTTGAAGAGGGCGATA;SOR=0.530;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=68;WE=9607040;WS=9607022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,73:0.39:187
chr11	9715646	rs3763865	T	C	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	9751089	rs12360647	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.12;MQRankSum=-0.282;NF=2;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=0.719;SC=TCTGTTGCCCGGGCTGTAGTG;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=9751097;WS=9751079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	9754221	rs360157	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=204;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AGGCCGCCAACGAAAGCAAGC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=13;WE=9754229;WS=9754211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr11	9759608	rs93139	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=0.746;SC=TAGACTGGAATTCTAATGGAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=9759616;WS=9759598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	9759713	rs93138	T	G	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=920;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TTAATGTACTTCTACTCTAAC;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=49;WE=9759721;WS=9759703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr11	9759918	rs173396	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=365;ReadPosRankSum=0.557;SC=AGCCTGGGTCGGTGGGAACAG;SOR=0.355;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=17;WE=9759926;WS=9759908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr11	9769562	rs415895	C	G	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1366;ReadPosRankSum=0.946;SC=GCAGCTGGAGCAGCTTGAGTT;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=55;TCR=76;TR=80;WE=9769570;WS=9769552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,89:0.59:152
chr11	9801925	rs3751000	T	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=575;SC=TCTGGCAGCATGAGTTCTTCT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=9801933;WS=9801915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	9802228	rs360124	G	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=914;SC=CTTTACTTTTGTGGTCTCTAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=9802236;WS=9802218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	9806914	rs71453928	T	TACTG	1761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=1622;SC=ACACTTAAACTACTGACTGGA;SOR=1.609;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=27;WE=9806922;WS=9806904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	9812236	rs2645029	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=17;PP=541;SC=AGTTCCTGTAGATTAAAAAAA;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=9812244;WS=9812226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	9830732	rs10770066	A	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=541;SC=GACACTTTTGACTGGATGCAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=9830740;WS=9830722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	9861009	rs7483882	G	A	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=9;PP=1558;SC=AAGAAAGGAAGGAAGACCTCT;SOR=3.327;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=63;WE=9861017;WS=9860999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	9875353	rs375686	G	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=538;SC=AGAAACATGAGCAAAGTGATG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=9875361;WS=9875343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	9878332	.	ATTT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=0.791;QD=5.70;ReadPosRankSum=2.189;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	9917620	rs4910073	G	C	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=37;PP=1374;SC=AAATACATGCGAACTAACATC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=9917628;WS=9917610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	10014462	rs56223901	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=-0.329;SC=ATAAATGGCTCGGAAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=10014470;WS=10014452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	10019879	rs16907355	G	A	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=448;ReadPosRankSum=0.315;SC=GAATACATTCGGGAATTTTAA;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=34;WE=10019887;WS=10019869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr11	10315464	.	T	TCCCCGACGCCCGG	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=45.72;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	10315477	rs188768372	T	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CCGACGCCCGTCCCCGACGCC;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=10315485;WS=10315467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr11	10472492	rs35417007	GC	G	907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=605;ReadPosRankSum=0.059;SC=TGGCCTCAGTGCCCAGCAGCC;SOR=0.506;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=18;WE=10472500;WS=10472482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr11	10508938	rs3802917	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=373;ReadPosRankSum=0.180;SC=TGTTCACAGCTGCCTCACCCG;SOR=1.351;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=29;WE=10508946;WS=10508928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr11	10518251	rs16907878	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CTTGATTCTGGGTGTTTGATG;SOR=0.044;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=10518259;WS=10518241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	10518289	rs1466426	T	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=750;SC=AGGAAGTGACTGGGGCTGGTC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=10518297;WS=10518279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	10518521	rs2071016	C	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=911;ReadPosRankSum=-2.622;SC=GGGCTCATAGCGGCAGAGGCA;SOR=1.556;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=48;WE=10518529;WS=10518511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr11	10521764	rs3741041	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=466;ReadPosRankSum=0.879;SC=ACTACATGTATGCCAACATCA;SOR=0.594;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=45;WE=10521772;WS=10521754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,58:0.39:149
chr11	10521850	rs3741039	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.983;SC=GTACATGCACGCATGCACACA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=10521858;WS=10521840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr11	10553355	rs4910153	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=0.476;SC=ATGAGGCCATCGAAAGTTAAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=10553363;WS=10553345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	10553672	rs4910154	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	10553675	rs4910155	C	T	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=89;SC=GGCAAAACTTCATACAATAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=10553683;WS=10553662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	10555589	rs1065052	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=494;ReadPosRankSum=-2.555;SC=CTACTCTCCCAAGAAATTCTT;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=37;WE=10555597;WS=10555579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,45:0.31:145
chr11	10581623	rs746164	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.520;SC=ATTGGCCTTGCTTCTCACACT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=10581631;WS=10581613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	10603648	rs2288236	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=1.746;SC=AGGCTTTTTCAGTAACTTTCA;SOR=0.377;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=21;WE=10603656;WS=10603638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr11	10614911	rs3741033	C	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CACTCAGATTCTATTCTGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=10614919;WS=10614901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	10631247	rs3741042	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=426;ReadPosRankSum=0.082;SC=CGGTACAGGGCCTTCTGTAAC;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=26;WE=10631255;WS=10631237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr11	10645289	rs61892975	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=136;ReadPosRankSum=-0.875;SC=ACAAATCAGCACTCGCTGAGA;SOR=0.722;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=13;WE=10645297;WS=10645279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr11	10645569	rs2303402	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=1.243;SC=AAGCACCAGGAAATAGTTCCT;SOR=0.264;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=11;WE=10645577;WS=10645559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr11	10647702	rs2241489	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TGTCCCAGGAGAGCCCTCGCA;SOR=1.092;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=57;WE=10647710;WS=10647692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr11	10649161	rs1425152	C	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=606;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CATACGTGTGCATGCACACAC;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=40;WE=10649169;WS=10649151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr11	10650329	rs2278125	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=616;ReadPosRankSum=-0.672;SC=GTGAGTTGCTCCGAGAGGATG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=44;WE=10650337;WS=10650319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr11	10653729	rs3741032	C	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	10655609	rs2162044	C	T	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=52;PP=1636;SC=ACTCCTGCGGCAGGAGGACCC;SOR=1.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=81;WE=10655617;WS=10655599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	10673739	rs4909945	T	C	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=55;PP=2226;SC=GCTGGGGAGATGCCAAAAGGA;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=124;WE=10673747;WS=10673729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	10709168	rs4910169	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGTTATTTATTGGGCCTCCTT;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=10709176;WS=10709158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	10709194	rs1035694	C	T	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=185;SC=CTTCACCAGACACAGATGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=10709202;WS=10709184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	10709415	rs61314456	C	CT	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.93;MQRankSum=1.115;NF=2;NR=5;PP=144;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TTTAGCTTTGCTTTTTTTTGG;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=10709423;WS=10709405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	10711817	rs7123827	A	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=0.381;SC=CTCACCTGTAATCCCAGCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=10711825;WS=10711807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	10715124	rs10770136	T	C	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=20;PP=678;SC=GGCCAGCCTCTCTTCACTCTG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=10715132;WS=10715114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	10786023	rs3830388	A	AAGTTG	902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=1022;ReadPosRankSum=0.641;SC=ATACTGAATCAAGTTGCATGC;SOR=1.145;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=20;WE=10786031;WS=10786013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr11	10786142	rs3736326	C	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.07;MQRankSum=1.071;NF=26;NR=27;PP=725;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AAGCGGAACACGATGAGCATT;SOR=0.660;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=53;WE=10786150;WS=10786132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr11	10786175	rs7118399	C	T	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=877;ReadPosRankSum=0.219;SC=TTTCCGTTACCACGTCATATA;SOR=0.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=59;WE=10786183;WS=10786165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr11	10797276	rs72259410	CTTTCTT	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=-0.253;SC=ATATACTTTTCTTTCTTTTTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=10797289;WS=10797266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	10821055	rs3736327	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=497;ReadPosRankSum=1.538;SC=GCTTCTTTTCCAGTACATGAA;SOR=0.905;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=26;WE=10821063;WS=10821045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr11	10822202	rs4910190	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=469;ReadPosRankSum=-1.056;SC=TTCCTGTGAAGAACACAAGTA;SOR=1.155;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=28;WE=10822210;WS=10822192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr11	10822350	rs7951708	C	T	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=62;PP=2311;SC=CCTGGATAAGCGGTGGATTAG;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=113;WE=10822358;WS=10822340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	10823079	rs10840492	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=0.101;SC=AAAAGAAGTATAGAAAAGAGA;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=10;WE=10823087;WS=10823069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr11	10823576	.	C	CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCAGAATTTAACATTTGTTGCCTAA,CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCATAATTTAACATTTGTTGCCTAA	840.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=280.24;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,2,1:0.67,0.33:3
chr11	10823815	rs7105210	C	T	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=51;PP=2146;SC=TTCAGCTTAACGCAACCATTG;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=99;WE=10823823;WS=10823805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	10824540	rs10743150	G	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=165;SC=TACACACACAGAGTCTATGTG;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=10824548;WS=10824530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	10824731	rs2270620	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=585;ReadPosRankSum=0.433;SC=CTCAGCTTACCAACAAATTTA;SOR=0.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=43;WE=10824739;WS=10824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,48:0.42:113
chr11	10825671	rs72854312	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=938;ReadPosRankSum=0.128;SC=TTATTATCAGCTATAAGTCTT;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=47;WE=10825679;WS=10825661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,56:0.71:79
chr11	10826341	rs2242360	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=0.736;SC=TCAAAAATACATACCTATCTA;SOR=0.124;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=10826349;WS=10826331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	10827418	rs11042964	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=320;ReadPosRankSum=-0.103;SC=TAATCCACACTTCCCATCTTT;SOR=0.299;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=27;WE=10827426;WS=10827408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr11	10828361	rs10743151	C	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=433;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TACATGTTTACCACACCTGTT;SOR=0.604;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=31;WE=10828369;WS=10828351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr11	10828490	rs11373962	T	TA	1306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=1212;SC=TCAAAAAGAATAAGCATCTAT;SOR=2.073;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=10828498;WS=10828480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	10830106	rs7127279	A	G	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=44;PP=1344;SC=CTTTCCAGGTATCTGAAGCGC;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=67;WE=10830114;WS=10830096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	11292635	rs12282251	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=0.332;SC=CAGCAGGCAACGTTGCAGCAG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=11292643;WS=11292625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	11292700	rs10831567	G	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=301;ReadPosRankSum=0.282;SC=GTCAGGACGCGAGGCTCCTCA;SOR=0.743;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=20;WE=11292708;WS=11292690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr11	11292859	rs12282460	G	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr11	11292864	rs12282401	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr11	11314538	rs10437598	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=0.108;SC=TGGTTTTCCACGATGGCTGCC;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=18;WE=11314546;WS=11314528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr11	11348794	rs75793419	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=774;ReadPosRankSum=0.772;SC=TGAATTAACTCTGGAGAAACA;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=43;WE=11348802;WS=11348784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr11	11348828	rs745181	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=0.602;SC=GACAGATTTCATGTCCATAAT;SOR=1.532;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=24;WE=11348836;WS=11348818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr11	11354393	rs901554	A	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=137;SC=ACAGGGACGCAGAAGCAGAGA;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=11354401;WS=11354383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	11373508	rs7948121	T	C	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=6;PP=1514;SC=TGAGCGCCAGTGGCAGCTGGA;SOR=4.575;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=58;WE=11373516;WS=11373498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	11373587	rs7945066	A	G	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=72;PP=2965;SC=GGGGTGAAGGAGTTGGCACTG;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=103;TCR=72;TR=175;WE=11373595;WS=11373577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	11373635	rs1056963	C	T	6961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=105;PP=2965;SC=TGCTGACGGGCGTACTGCCCC;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=215;WE=11373643;WS=11373625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	11373808	rs1056951	T	G	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=65;PP=2619;SC=TGATTTTCACTGTGGACAAAG;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=11373816;WS=11373798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	11373925	rs4243927	A	C	5920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=85;PP=2965;SC=GTCCCCAGAAACTTGGCTATC;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=184;WE=11373933;WS=11373915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	11373960	rs2071461	C	T	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.438;NF=85;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.190;SC=ATAATTGTCACGTCCATGGAA;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=86;TCR=89;TR=173;WE=11373968;WS=11373950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,205:0.99:207
chr11	11374016	rs2896586	T	A	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=78;PP=2351;SC=TACAACCCAATCTCCACATAT;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=124;WE=11374024;WS=11374006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	11374269	rs2071460	A	G	6537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=102;PP=2965;SC=GTAAAATCGAATATCATAGTC;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=102;TCR=102;TR=204;WE=11374291;WS=11374259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	11374283	rs2896585	T	G	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=91;PP=2965;SC=CATAGTCTGTTAACGTCTGGT;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=185;WE=11374291;WS=11374259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	11398698	rs10444245	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=259;SC=AGGTCAAAGCGGAGAGACCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=11398706;WS=11398688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	11905993	rs10765894	C	T	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1390;SC=TAATCTGAAACATTATGTTTT;SOR=2.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=11906001;WS=11905983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	11913386	rs78720399	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CACTTTGGAAGGGGGCATGAG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=11913394;WS=11913376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr11	11913585	rs11022079	G	T	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=72;PP=2434;SC=GAAGGTTCTGGGGGTTCTACC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=11913593;WS=11913575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	11944265	rs72857625	A	G	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=843;ReadPosRankSum=-0.102;SC=ATTATGTCTTATTAAGAAATC;SOR=0.503;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=50;WE=11944273;WS=11944255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr11	11954786	rs10741562	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=385;ReadPosRankSum=-0.988;SC=TCATTGAACAGTGTAACCAAC;SOR=2.303;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=11954794;WS=11954776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	11969414	rs72857637	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=0.687;SC=GTAATAAAAAGTATATGATCT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=11969422;WS=11969404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	11969971	rs72857639	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=-2.459;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr11	11976628	rs7933089	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=852;ReadPosRankSum=-0.223;SC=ATATTCATCAGGATTTAGACT;SOR=0.563;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=45;WE=11976636;WS=11976618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr11	11977573	rs2307073	T	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=512;ReadPosRankSum=0.408;SC=ATTAATGGAATTGACAGATGA;SOR=1.923;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=32;WE=11977581;WS=11977563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr11	11986061	rs3206824	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=872;ReadPosRankSum=1.681;SC=GCAGGCTCCCTCAGCGCCATC;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=55;WE=11986069;WS=11986051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,66:0.58:113
chr11	11989899	rs2291599	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=443;ReadPosRankSum=0.657;SC=CCCAGGTGCCTGAGACCCTGG;SOR=0.381;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=30;WE=11989907;WS=11989889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr11	12023773	rs67506856	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-3.990;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,17:0.19:89
chr11	12024048	rs3834918	GA	G	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=144;ReadPosRankSum=-1.542;SC=GAGTCTATTAGAAAAAAAAAA;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=12024056;WS=12024038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr11	12262476	rs2641936	C	A	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=19;PP=1514;SC=GCACTTGCAACCTTCGTCTCC;SOR=1.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=12262484;WS=12262466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	12264140	rs880963	A	C	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=16;PP=1345;SC=TGCCTCCCTCACCCACTTCTT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=12264148;WS=12264130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	12313887	rs1874043	C	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=575;SC=AGGAAGCTAACCTACCTGTAC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=12313895;WS=12313877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	12315186	rs10741578	G	A	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=1010;ReadPosRankSum=2.507;SC=GAGGCGAGCCGTAGCCCAAGG;SOR=0.399;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=63;WE=12315194;WS=12315176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr11	12315407	rs10741579	G	C	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=66;PP=2853;SC=GCTGGACAGGGCAAGAGCTAT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=129;WE=12315415;WS=12315397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	12315716	rs1493951	C	T	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=44;PP=1780;SC=AGAGAGGGGCCCAGGAGAAGA;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=12315724;WS=12315706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	12315848	rs1493952	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=324;ReadPosRankSum=1.019;SC=ACTCTGAAGGCGGGAAGAAGG;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=27;WE=12315856;WS=12315838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr11	12315891	rs1493953	G	A	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=33;PP=1723;SC=AACTTTGCCCGCACAGGCCTG;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=12315899;WS=12315881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	12315915	rs1493954	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=565;ReadPosRankSum=-1.736;SC=TCGCTCATTCAGCCTTCGGAA;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=38;WE=12315923;WS=12315905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr11	12316389	rs3812754	A	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=10;PP=281;SC=TCCTCCTCCTACAGCGGGAGG;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=14;WE=12316397;WS=12316379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	12345459	rs903213	C	T	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=464;SC=AAGCCTATAACGATATTTTGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=12345467;WS=12345449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	12379792	rs10741583	G	C	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=16;PP=1025;SC=CAAGAACTCTGCCGGGGCCCA;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=12379800;WS=12379782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	12495623	rs7109678	G	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=29;PP=839;SC=ACGAGCCCCTGAGAGAAGGTA;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=12495631;WS=12495613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	12525781	.	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=522;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AGTGGGGTACTACTACACTTT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=31;WE=12525789;WS=12525771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr11	12525925	rs11547363	C	T	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=59;PP=2227;SC=AGTATTTCCGCGCACCAATTC;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=112;WE=12525933;WS=12525915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	12532912	rs12283539	A	C	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=264;SC=CAATGGAAGGAGGCTTTTTGA;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=12532920;WS=12532902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	12534707	rs2243707	G	A	6501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=81;PP=2965;SC=CAGAGTTCCCGGCACAGTCTA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=189;WE=12534715;WS=12534697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	12534808	rs2403631	A	G	6943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=114;PP=2965;SC=GCCAGGGATCAGCTCTTGTGC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=223;WE=12534816;WS=12534798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	12535209	rs2288293	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=627;SC=GCACCTGTGCCGAAGAAGGGA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=12535217;WS=12535199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	12535415	rs11022380	A	G	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=201;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=406;SC=TCCTGGGCCCAGGGCTCTTGG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=12535423;WS=12535405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	12535485	rs56043920	CACAGGCTCCTGCACTA	C	2425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=12;PP=2965;SC=ACGGAGCAGCCACAGGCTCCT;SOR=2.221;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=29;WE=12535508;WS=12535475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	12900358	.	G	GC	266.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr11	12900359	rs11022528	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	12903443	rs2304733	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=585;ReadPosRankSum=0.331;SC=CTGTTCCCAGCGTCAAGCCTT;SOR=0.952;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=43;WE=12903451;WS=12903433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,49:0.32:154
chr11	12951623	rs2245140	A	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=325;ReadPosRankSum=0.228;SC=AAGATGATTCATGTTGAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=18;WE=12951631;WS=12951613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr11	12951926	rs2727360	A	G	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=47;PP=1482;SC=GAGGCTTGACAGAAGTGAGGA;SOR=1.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=12951934;WS=12951916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	12952015	rs2727361	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GGTCAGTCAGCAGTTGAATTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=12952023;WS=12952005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	13398129	rs10741617	T	A	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=67;PP=2616;SC=CCAAGTTGAATGGTGCACAGT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=13398137;WS=13398119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	13399791	rs10832030	A	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=351;SC=TGAACTGCAAATGGATCATGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=13399799;WS=13399781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	13514263	rs6254	C	T	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=68;PP=2170;SC=CTCCCCACTTCGAAATGATAA;SOR=1.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=13514271;WS=13514253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	13514417	rs694	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=134;SC=ACTAAAAGGACAAGCAAAATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=13514425;WS=13514407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	13716530	rs7130943	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=733;SC=CACTCAGAACAAAGAAAAAAG;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=13716538;WS=13716520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	13716614	rs143770401	T	TA	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=126;ReadPosRankSum=0.126;SC=AAAAAATTAGTAAAACAAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=13716627;WS=13716604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	13716619	rs71482916	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=121;ReadPosRankSum=0.385;SC=ATTAGTAAAACAAAAAAACTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=13716627;WS=13716604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	13733401	rs7934570	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=-2.529;SC=CATTTTTCTGCTTTTTGTATA;SOR=0.238;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=10;WE=13733409;WS=13733391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr11	13744935	rs12421421	A	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=1.132;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	13744958	rs12420123	T	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TTTATTTATATTCTGTCTTAC;SOR=0.245;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=23;WE=13744966;WS=13744948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr11	13984583	rs3761859	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=893;ReadPosRankSum=1.726;SC=AGGGCTACTGCAGCCGTATCC;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=103;TCR=118;TR=73;WE=13984591;WS=13984573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,96:0.34:280
chr11	13984720	rs10741631	A	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=395;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GCATTAGGAGAGCGGGACCCG;SOR=0.296;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=30;WE=13984728;WS=13984710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr11	14101493	rs5789820	G	GC	4206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=41;PP=2971;SC=AGACTGCTGTGCTGCGGAACT;SOR=0.862;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=68;WE=14101501;WS=14101483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	14246099	rs11023151	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=1.211;SC=ATGGGACTGAATTTAGCTTCT;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=9;WE=14246107;WS=14246089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	14246336	rs2163463	G	A	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=34;PP=991;SC=GGGCCAAAGGGTGAGCCCTTG;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=14246344;WS=14246326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	14264916	rs2303973	A	G	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=37;PP=1773;SC=CCAAAGCCCAATGGCCAGCCT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=81;WE=14264924;WS=14264906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	14279473	rs149524802	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.035;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-0.403;SC=CCAGCCAGGGGCTGGCAGGAG;SOR=0.063;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=8;WE=14279481;WS=14279463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr11	14303282	rs2303972	T	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=78;PP=2634;SC=ATTCCAACAGTTATGTTTATG;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=14303290;WS=14303272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	14329984	rs2915408	C	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=563;SC=CTGGCTCTCACCTATAAATGA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=14329992;WS=14329974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	14480292	rs12576926	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=1.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	14497269	rs2597194	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=-0.333;SC=ATTTGACTGTCTTACATACAA;SOR=0.593;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=23;WE=14497277;WS=14497259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr11	14501267	rs200937608	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=31.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-1.792;QD=5.43;ReadPosRankSum=-3.651;SOR=5.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr11	14501296	rs2575857	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.489;SC=ATGGAACTAACAATTTTCGAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=14501304;WS=14501286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	14512060	rs2597189	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.349;SC=GTAATACTTTCAATTGTCACT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=14512068;WS=14512050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	14520566	.	T	TA	55	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5001;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=55;QD=12.2;SC=CATTACAAATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=14520574;WS=14520556;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr11	14532338	rs2597218	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CAGAATGTTGCATATATACTC;SOR=0.542;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=14532346;WS=14532328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	14540671	rs1823466	A	G	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=14;PP=1010;SC=ATATGCTTGTATTTCCATTCA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=14540679;WS=14540661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	14632570	rs1403247	A	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=678;ReadPosRankSum=0.639;SC=AGACCAACATACAACATAGGT;SOR=1.060;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=48;WE=14632578;WS=14632560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr11	14810762	rs4757268	A	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=642;ReadPosRankSum=0.168;SC=ATGGCAAAAGACCTCACCAAG;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=46;WE=14810770;WS=14810752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,48:0.38:126
chr11	14825704	rs3740823	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=71;ReadPosRankSum=-1.731;SC=AATTTCATGTATTATAAGTTA;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=7;WE=14825712;WS=14825694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr11	14852232	rs145753693	A	T	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=1.088;SC=TACTATATATATTTTTTGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=5;WE=14852240;WS=14852222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	14902317	.	GA	G	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=-2.022;SC=GAGTAAGCCTGAAAAAAAATA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=14902325;WS=14902307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr11	14913575	rs12794714	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=457;ReadPosRankSum=0.835;SC=GGGGAAGCTCGGATGAGGCTG;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=33;WE=14913583;WS=14913565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr11	14991539	rs5239	T	C	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=911;SC=TGCACATAGTTCTGCACCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=14991547;WS=14991529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	14992598	rs35909067	TAAGAGG	T	1321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=1804;ReadPosRankSum=-0.933;SC=ACACCACACTTAAGAGGCATG;SOR=0.751;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=22;WE=14992614;WS=14992588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr11	14992606	rs34294892	A	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=1825;ReadPosRankSum=-0.041;SC=CTTAAGAGGCATGGAATTGTC;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=27;WE=14992614;WS=14992588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr11	14999877	rs7929159	G	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=32;PP=975;SC=TCTGAAGTGAGAGGCATGAAA;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=14999885;WS=14999867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	15098718	rs2282653	G	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=165;SC=TTGCATTTTCGAGAAACACTT;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=15098726;WS=15098708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	15170644	rs1714354	T	C	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=508;ReadPosRankSum=0.099;SC=TCTTTTAGGATCTCGTTGTGC;SOR=0.803;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=40;WE=15170652;WS=15170634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr11	15170807	rs12222688	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TCCAGGCCAGGCCTGCCCCAT;SOR=0.542;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=6;WE=15170815;WS=15170797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr11	15198772	rs1624731	G	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=-0.313;SC=AGAAGGGGCTGGTATCTTCTC;SOR=1.162;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=15198780;WS=15198762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	15199957	rs1714376	T	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=35;PP=1292;SC=AGCACTTTGGTCAGCTGCTGG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=63;WE=15199965;WS=15199947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	15243059	rs17507577	G	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=683;ReadPosRankSum=-2.023;SC=CATCCTGACCGACAACAGCCA;SOR=0.355;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=44;WE=15243067;WS=15243049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr11	15267727	rs1945624	A	G	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=611;SC=AATGGAGGACAAAATCTTAGA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=15267735;WS=15267717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	16133413	rs4617548	A	G	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=24;PP=780;SC=CTGCTGCCAGAGTCCGCTGGT;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=16133421;WS=16133403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	16760244	rs1846936	T	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=393;SC=GCTTGGGCCCTTGGCGGATTG;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=16760252;WS=16760234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	16805226	rs739936	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=783;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CCTGCCAACACTTGAGCAAGC;SOR=0.408;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=47;WE=16805234;WS=16805216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr11	16807856	.	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=761;ReadPosRankSum=-2.130;SC=TTCAACCAGCCATTCTCCTCC;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=56;WE=16807864;WS=16807846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,68:0.37:184
chr11	16837788	rs217750	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=0.104;SC=AGGGCATGGAGCGTCGGTCCA;SOR=0.480;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=26;WE=16837796;WS=16837778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr11	16872653	rs35098462	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=869;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TCCCCCTCCCGACAAAAGCAA;SOR=0.563;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=56;WE=16872661;WS=16872643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr11	16874067	rs418113	C	T	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=946;SC=GACATTAGAACTTGGATTAAA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=16874075;WS=16874057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	16877497	rs11024058	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=380;ReadPosRankSum=0.442;SC=GAGTAAAAGCCGAGCTATAGA;SOR=0.985;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=24;WE=16877505;WS=16877487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr11	16892477	rs402973	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TGAAAGAAGTCTGAAGGTTGA;SOR=0.030;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=18;WE=16892485;WS=16892467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr11	17035493	rs71047521	C	CA	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.733;NF=10;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=0.873;SC=AGGGACCCCCCCCCCGCGGCA;SOR=1.410;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=11;WE=17035501;WS=17035483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr11	17035718	rs61881311	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=366;ReadPosRankSum=0.138;SC=CGGTGCGCGGATGCAGCCAGG;SOR=0.546;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=34;WE=17035726;WS=17035708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr11	17113483	rs7113396	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=138;SC=CCACATTCATCGAGAAGTTAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=17113491;WS=17113473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	17126670	rs2052188	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=351;SC=ACCTCTGTAACACATTTTTGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=17126678;WS=17126660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	17172133	rs2302511	T	C	5739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=105;PP=2965;SC=TGTTTCTTTGTGCTGTGACTG;SOR=1.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=68;TCR=105;TR=172;WE=17172141;WS=17172123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	17191019	rs214936	A	G	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=82;PP=2965;SC=TTTCTACATCAATATCTAATG;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=160;WE=17191033;WS=17191009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	17333377	rs12225041	T	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=230;SC=ATTTTCTAAGTTATTAAAATC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=17333385;WS=17333367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	17333663	rs2521998	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=634;SC=CATGTAATGAGTGAGGTATGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=17333671;WS=17333653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	17339127	rs2634462	T	C	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=1036;SC=TAATGTCTTTTTAGTCTCCTT;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=17339135;WS=17339117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	17351873	rs34471145	T	TA	2200.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=1871;SC=ATTATGGCATTAAAAAGATTT;SOR=1.965;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=48;WE=17351881;WS=17351863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	17352477	rs3842269	TACA	T	2247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=1631;SC=CAAAAAAAATTACAACAAGGA;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=35;WE=17352487;WS=17352467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	17394073	rs10832778	C	G	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=48;PP=1379;SC=CCTGATGGACCTGGTGCCACT;SOR=1.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=17394081;WS=17394063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	17408404	rs5213	C	T	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=11;PP=886;SC=AGGCCCTGGCCGGGCTACATA;SOR=1.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=17408412;WS=17408394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	17408630	rs5215	C	T	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=70;PP=2965;SC=GGCACTTTGACGGTGTTGCCA;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=159;WE=17408638;WS=17408620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	17409069	rs5218	G	A	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=75;PP=2965;SC=CGTGGCGCAGGGCGATCACCG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=174;WE=17409077;WS=17409059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	17409572	rs5219	T	C	6234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=110;PP=2965;SC=TACCTGGGCTTGGCAGGGTCC;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=98;TCR=110;TR=208;WE=17409580;WS=17409562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	17410283	rs5222	C	T	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=20;PP=1295;SC=GCTAAGAGCCCTTCTCCCCGC;SOR=1.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=17410291;WS=17410273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	17414757	rs41282912	C	T	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=843;SC=GGCCCTCCTGCGGCTTGGAGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=17414765;WS=17414747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	17415190	rs4148646	C	G	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=39;PP=2448;SC=ACGGCCACAACAGGCCAGTCC;SOR=1.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=115;WE=17415198;WS=17415180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	17418477	rs757110	C	A	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=34;PP=2471;SC=TGTCCAGGGGCGATGAGGGCA;SOR=1.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=114;WE=17418485;WS=17418467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	17429922	rs2106865	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=289;ReadPosRankSum=1.818;SC=TGCTTGGCCATCCCTGGATAT;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=19;WE=17429930;WS=17429912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr11	17434284	rs1805036	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=607;ReadPosRankSum=2.023;SC=CCACCAGACAGGTTGATGCCC;SOR=1.005;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=45;WE=17434292;WS=17434274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,59:0.39:153
chr11	17435936	rs4148631	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=-0.423;SC=TGGAGTGCAGGTAAGCACCTG;SOR=1.819;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=14;WE=17435944;WS=17435926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	17435966	rs4148630	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=424;ReadPosRankSum=0.589;SC=ATGGCTGGGTGTGGGTGATCG;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=23;WE=17435974;WS=17435956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr11	17436271	rs4148627	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=0.294;SC=GGGAGGTGCAGTTGGTAGAAA;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=17436279;WS=17436261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	17436936	rs4148626	A	G	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=51;PP=2364;SC=AGTGAACCATATCCTCCAGGA;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=17436944;WS=17436926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	17436951	rs12293228	C	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=570;ReadPosRankSum=0.695;SC=CCAGGAAGATCCTGAGCTCCC;SOR=0.861;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=42;WE=17436959;WS=17436941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,57:0.37:156
chr11	17464534	rs2073587	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=320;SC=CCTCCTGTCCTCACCGGGAGG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=17464542;WS=17464524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	17481948	rs886291	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=9;PP=763;SC=AGTGTGGCCATGGCTCACACA;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=17481956;WS=17481938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	17484971	rs2301703	G	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=11;PP=702;SC=CCCTGGCCCAGGTGGCCTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=17484979;WS=17484961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	17491571	rs10400389	C	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=853;SC=CAATAGCTGGCACATAATGAG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=17491579;WS=17491561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	17496516	rs1048099	A	G	4194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=73;PP=2506;SC=GGTTGTGCCCAGGGAAATGAA;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=124;WE=17496524;WS=17496506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	17515833	rs1055574	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=195;ReadPosRankSum=1.216;SC=CTCAAGGCTGATCCGAGGCTT;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=14;WE=17515841;WS=17515823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	17515970	rs2072225	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=157;ReadPosRankSum=0.110;SC=CTTTGTGGGTGCACACTCAGC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=12;WE=17515978;WS=17515960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr11	17516038	rs2072227	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=132;ReadPosRankSum=1.129;SC=CAAGGCCCTGCCACCCTTTGG;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=17516046;WS=17516028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	17517235	rs10832795	A	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=379;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CTATATATACAGAGCAGAGCA;SOR=0.856;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=29;WE=17517243;WS=17517225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr11	17517381	rs10530940	CAT	C	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=191;ReadPosRankSum=1.745;SC=TTCTCCAAGACATGTGTAGAG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=6;WE=17517390;WS=17517371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	17517407	rs1859824	G	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=85;SC=ATTCTGCTGGGCACGGGGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=17517415;WS=17517397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	17518180	rs2072229	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=0.479;SC=GCTCTGGCTATGAGAAGCTGC;SOR=2.086;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=16;WE=17518188;WS=17518170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr11	17519742	rs1064074	C	G	4233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=60;PP=2603;ReadPosRankSum=0.577;SC=GCAGGGCAGCCTCAGCCTCAG;SOR=0.947;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=277;TCF=172;TCR=105;TR=168;WE=17519750;WS=17519732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,197:0.60:327
chr11	17522810	rs2072234	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=462;ReadPosRankSum=0.801;SC=AGCCATGGGGTCACCGGCAGT;SOR=0.634;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=26;WE=17522818;WS=17522800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr11	17531449	rs2237965	G	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=27;PP=785;SC=TCACAATACAGCGAGCACTAT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=17531457;WS=17531439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr11	17532102	rs2237964	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.568;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr11	17533397	rs2190453	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=518;ReadPosRankSum=2.038;SC=CATGGAGAACGACCACATTGT;SOR=2.066;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=23;WE=17533405;WS=17533387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr11	17533635	rs2190454	G	A	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=55;PP=1979;SC=TATGACAAAGGTTAGAAATAG;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=97;WE=17533643;WS=17533625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	17537705	rs2237961	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.967;SC=ATTTAGTGTTGATAGGACAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=17537713;WS=17537695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	17538048	rs2237960	G	A	41.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	17539212	rs10766408	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=0.706;SC=GCATACAGTGTTTTCAACCTT;SOR=0.180;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=17539220;WS=17539202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	17542439	rs2240487	T	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=663;ReadPosRankSum=-0.935;SC=GAAGGGGTACTGGGTGTACCT;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=42;WE=17542447;WS=17542429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr11	17542583	rs2108332	C	T	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr11	17542586	rs2041031	T	C	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr11	17542649	rs2041032	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ATGGTTCTAGTCATGATGAAT;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=30;WE=17542657;WS=17542639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr11	17542872	rs2240488	G	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=657;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GCACAGACACGCGTGGAGCCG;SOR=0.995;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=33;WE=17542880;WS=17542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr11	17545091	rs4757539	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=385;ReadPosRankSum=1.199;SC=TCTGCAGGACAGGCTCCCCCA;SOR=0.289;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=24;WE=17545099;WS=17545081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr11	17548239	rs72870320	C	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=1009;SC=CCTTCAGGACCGGCCACCCCT;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=17548247;WS=17548229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	17548507	rs41282940	T	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=609;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CCCAGGGCTGTACCAGGATCC;SOR=0.434;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=42;WE=17548515;WS=17548497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr11	17548737	rs12795083	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=285;SC=CTCCCACCGTTATGGAGTACT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=17548745;WS=17548727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	17553105	rs2041027	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-0.873;SC=GAGATGCCGGGAATGCCTGGA;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=19;WE=17553113;WS=17553095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr11	17554910	rs5789992	A	ACC	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=5.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=1.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr11	17554914	rs2240489	G	C	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=42.08;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	17554916	rs2355022	C	A	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=2.001;QD=31.16;ReadPosRankSum=1.817;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,38:0.79:48
chr11	17554930	rs878546	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-2.274;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.364;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,6:0.15:39
chr11	17555498	rs11024319	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=0.049;SC=GCAGGGGGAGCGTCAGGTTAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=17555506;WS=17555488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr11	17569885	rs58569858	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GAACAAGCAGATTCCTGGTAT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=10;WE=17569893;WS=17569875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	17574588	rs4757543	T	C	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CTGGATCCTGTGAAGCCTGAG;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=68;WE=17574596;WS=17574578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr11	17580050	rs7130051	A	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=314;ReadPosRankSum=1.084;SC=TGGCTTTGCCAGCCCCTAGCC;SOR=1.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=18;WE=17580058;WS=17580040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr11	17580175	rs7130190	A	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=838;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AGCCAGTTGTACCAGTGATCT;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=50;WE=17580183;WS=17580165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr11	17580998	rs10832798	TC	CT	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=479;ReadPosRankSum=0.280;SC=CCTCCCATCCTCACTCCACGG;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=17581007;WS=17580994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr11	17583423	rs4757545	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-1.164;SC=AGAGAGACTGGGACTTAGGAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=17583431;WS=17583413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
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chr11	17600033	rs2355466	G	A	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=38;PP=1350;SC=GAGCGTGTCAGCCCGTGGCCC;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=70;WE=17600041;WS=17600023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	17612972	rs720460	T	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=27;PP=1732;SC=TGCCCTGTGATCTGGTCTGGG;SOR=1.338;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=17612980;WS=17612962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr11	17627613	rs7934079	G	C	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=35;PP=978;SC=TGTGTCGGGCGCGGTGCTGGC;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=17627621;WS=17627603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	17631091	rs740318	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCTGCCCTCACCCCATCACCG;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=17631099;WS=17631081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	17631751	rs2041028	C	T	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=64;PP=2965;SC=ACGACACCCCCACAGCCCTCC;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=17631759;WS=17631741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	17632306	rs1003490	C	T	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.695;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GCCCCAGTGGCCACACCCGGC;SOR=0.580;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=85;WE=17632314;WS=17632296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,92:0.57:161
chr11	17632651	rs7111528	C	T	7408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=122;PP=2965;SC=ACAGAGCTCACGCCTGCTACG;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=105;TCR=122;TR=227;WE=17632659;WS=17632641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr11	17633012	rs731783	T	C	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=44;PP=1510;SC=TATGTGACCCTTCCCTTCATC;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=68;WE=17633020;WS=17633002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	17653572	rs2058003	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=469;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CAGGGAGGGGAGGAGCTGGGC;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=23;WE=17653580;WS=17653562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr11	17655839	rs12277962	A	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=447;ReadPosRankSum=-1.039;SC=GTGAGTGTCCACCTTCACTTC;SOR=0.790;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=30;WE=17655847;WS=17655829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr11	17656686	rs11024350	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=542;ReadPosRankSum=-1.685;SC=GGACCAGATCCTGATCACGGG;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=39;WE=17656694;WS=17656676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,46:0.37:123
chr11	17660181	rs12290375	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=753;ReadPosRankSum=0.145;SC=GCCTACCACCGTCCACTCCTC;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=41;WE=17660189;WS=17660171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr11	17663416	rs12422210	G	A	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=48;PP=1896;ReadPosRankSum=0.117;SC=GAGCACCCGCGGGACCTCGCT;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=111;TCR=75;TR=118;WE=17663424;WS=17663406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,137:0.62:222
chr11	17663444	rs10832824	C	T	6934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=101;PP=2965;SC=GCGGCTCCTGCAGGAACGTGT;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=117;TCR=101;TR=218;WE=17663452;WS=17663434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr11	17663483	.	C	G	3197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=73;PP=2031;ReadPosRankSum=0.192;SC=CCAATGGCACCACCTCCCTGT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=222;TCF=100;TCR=122;TR=130;WE=17663491;WS=17663473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,148:0.58:256
chr11	17663742	rs2023483	G	C	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=17;PP=1375;SC=GTGCCGTGCTGGTCCGCTCTC;SOR=1.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=63;WE=17663750;WS=17663732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	17663862	rs2023484	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1441;SC=GGTGGGGTGGAGGTCCTGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=17663870;WS=17663852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	17667439	rs11024357	G	C	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=79;PP=2071;SC=AATGCCACCTGGGTGCCCTAT;SOR=1.335;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=42;TCR=79;TR=121;WE=17667447;WS=17667416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	17742681	rs10832853	G	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=46;PP=1363;SC=CCTGTCTTTTGGATTGTCCCG;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=72;WE=17742689;WS=17742671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	17800923	rs61882396	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=0.299;SC=TCTGCCAATACCCCGCTTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=6;WE=17800931;WS=17800913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	17899795	.	TA	T	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=60.67;NF=1;NR=5;PP=84;QD=14.8333333333;SC=AAGAGACCTGTAAAAAAAAAA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=17899803;WS=17899785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,6:0.50:12
chr11	17940172	.	GAC	G	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.268;NF=7;NR=0;PP=400;ReadPosRankSum=0.371;SC=AGCAGGAACAGACACACACAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=7;WE=17940181;WS=17940165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	17940209	.	A	ACT	628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-2.243;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr11	17981047	rs211146	C	T	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=22;PP=1553;SC=AATGCGGAGACGAAGGCATGC;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=17981055;WS=17981037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	18017517	rs211131	T	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=825;ReadPosRankSum=-1.471;SC=ACTAGATTGCTCTTTGAACCT;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=50;WE=18017525;WS=18017507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,53:0.77:69
chr11	18017631	rs490386	A	C	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	18023414	rs211134	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTAAGGCTTACCACATTTGTT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=18023422;WS=18023404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	18034592	rs3741202	G	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=0.048;SC=CGGGAGGGACGGCACGGGGGC;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=6;WE=18034613;WS=18034582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	18034605	rs3741201	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=116;ReadPosRankSum=0.454;SC=ACGGGGGCGGCGCCTGCCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=4;WE=18034613;WS=18034582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr11	18044304	rs211101	C	T	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=18;PP=891;SC=GGGCTGATCTCTCCCTGAAGA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=18044312;WS=18044294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	18102014	rs35394666	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-1.334;SC=TCAACTTCACGTAGGATTTTA;SOR=0.470;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=13;WE=18102022;WS=18102004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr11	18105302	rs3741199	T	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=711;ReadPosRankSum=0.367;SC=TCAAGAAGCATGGAATTGGCC;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=110;TCF=33;TCR=77;TR=47;WE=18105310;WS=18105292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,51:0.41:123
chr11	18108512	rs35525096	T	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1117;ReadPosRankSum=0.713;SC=TCTTGAAGAATGATGGGTGGA;SOR=0.632;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=211;TCF=98;TCR=113;TR=88;WE=18108520;WS=18108502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,99:0.40:245
chr11	18111692	rs11424886	A	AT	740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.048;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=352;ReadPosRankSum=-1.339;SC=AATTTAAAACATTTTTTTTCT;SOR=0.313;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=23;WE=18111700;WS=18111682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr11	18118538	rs4757613	A	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=0.566;SC=ATCCTAGCACATTGGGAGGCC;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=18118546;WS=18118528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	18127679	rs871699	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GCGTACCCGGTGGGACTCCCC;SOR=0.042;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=18127687;WS=18127669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	18158993	rs12291017	T	C	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.839;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=857;ReadPosRankSum=0.679;SC=CCACATTATATGTTCGCCGTT;SOR=0.791;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=187;TCF=95;TCR=92;TR=78;WE=18159001;WS=18158983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,84:0.40:209
chr11	18159169	rs2468839	A	G	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=34;PP=2175;SC=ACCTGTCATCAGTCATGTGTG;SOR=1.449;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=99;WE=18159177;WS=18159159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	18159254	rs4274188	A	G	7025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=93;PP=2965;SC=TAGTGGTGCTAATTCTGTTTG;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=201;WE=18159262;WS=18159244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr11	18159455	rs72863191	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=579;ReadPosRankSum=-1.864;SC=TGGCATTCAGTGGGCCCTGTT;SOR=0.924;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=40;WE=18159463;WS=18159445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr11	18195051	rs2445179	T	C	5826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=89;PP=2951;SC=ATTATACGTTTGCCATTACGC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=90;TCR=89;TR=179;WE=18195059;WS=18195041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	18195348	rs11024532	C	T	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.621;SC=ATCCCAGTCGCGTGGCTGATT;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=166;TCF=78;TCR=88;TR=90;WE=18195356;WS=18195338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,107:0.55:195
chr11	18210434	rs72866733	A	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.265;SC=GTGATCATGAAAACATACCAA;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=25;WE=18210442;WS=18210424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,32:0.36:88
chr11	18210480	rs2445150	T	C	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=47;PP=1301;SC=CTGACGGCGGTGGCGGGGGGT;SOR=1.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=18210488;WS=18210470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	18210580	rs2124372	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=778;ReadPosRankSum=0.700;SC=GCTGAAGCCGCTGCCCGCGGA;SOR=0.309;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=41;WE=18210588;WS=18210570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr11	18210814	rs7936382	GC	AA	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=800;ReadPosRankSum=-1.043;SC=CAAAGTAGGGGCCACGCTGGC;SOR=0.710;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=19;WE=18210823;WS=18210804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr11	18210849	rs6486412	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=299;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AAAGAGGCCTCCGCTTCATCC;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=17;WE=18210857;WS=18210839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr11	18231289	rs4757627	C	A	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=33;PP=1771;SC=CTAACATCTTCGAAACAAGAT;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=86;WE=18231297;WS=18231279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	18231749	rs2468789	T	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=340;SC=TTTATCGAGGTTTGGTGCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=18231757;WS=18231739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	18253176	rs2460827	C	T	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=48;PP=1865;SC=AAATAAATAGCAGTCTATTAA;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=103;WE=18253184;WS=18253166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	18264401	rs185270704	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=0.217;SC=CTCAAATAACGAAACAAAACA;SOR=0.617;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=17;WE=18264409;WS=18264391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr11	18267027	rs2468844	C	T	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CTCCGCACCACGGCCTGTGAG;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=77;TCR=62;TR=96;WE=18267035;WS=18267017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,120:0.67:180
chr11	18267135	rs56373142	C	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.027;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.672;NF=18;NR=42;PP=1128;ReadPosRankSum=-2.256;SC=CCATTCTCCCCGTTCCAAGGG;SOR=1.082;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=60;WE=18267143;WS=18267125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,71:0.70:101
chr11	18267188	rs58546509	GA	G	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.828;NF=1;NR=16;PP=542;ReadPosRankSum=1.284;SC=AAGGAGGAGTGAAAACACTGA;SOR=0.193;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=17;WE=18267196;WS=18267178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr11	18267373	rs1671927	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.266;NF=8;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=1.889;SC=CTAACTTCTCCACAAGGAGCT;SOR=0.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=9;WE=18267381;WS=18267363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr11	18267431	rs76546965	C	T	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.04;MQRankSum=-8.167;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr11	18267434	rs78891342	AA	GG	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQRankSum=-8.225;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.769;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr11	18267463	rs74872559	A	G	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.669;NF=50;NR=28;PP=1942;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TTACCTGATCACTTCTGCAGC;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=161;TCF=101;TCR=60;TR=78;WE=18267486;WS=18267453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,70:0.53:133
chr11	18267471	rs1136766	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.40;MQRankSum=0.635;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,36:0.27:134
chr11	18267478	rs79620496	G	A	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=2.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.14;MQRankSum=-6.106;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
chr11	18267651	rs80208174	A	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.377;NF=4;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GACTCCAACAACACCTTAGAG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=18;WE=18267659;WS=18267641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr11	18267702	rs4757631	T	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=6.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.584;SC=ACTTCAAGCTTTCAGCCTGTG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=18267710;WS=18267692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	18290737	rs145097411	T	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.97;QD=26.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	18290859	rs1136743	C	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.23;QD=42.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	18290874	rs1136747	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.01;QD=43.51;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	18290880	rs28720026	C	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.07;QD=43.82;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	18290902	rs34068567	TT	CC	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.22;QD=46.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	18290906	rs35474820	G	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.50;QD=42.61;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	18291321	rs12218	T	C	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=52;PP=1486;SC=ACTCGCTGGCTGATCAGGCTG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=18291329;WS=18291311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	18301605	rs11024601	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=585;SC=TTCTGTGCATTAAAAGACACA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=18301613;WS=18301595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	18303404	rs2271997	C	T	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=15;PP=961;SC=AGTGATGGGTCGGGACTAAAT;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=18303412;WS=18303394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	18305354	rs17853184	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=557;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TTGTCCCCTTCCATCAGGCTC;SOR=0.669;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=40;WE=18305362;WS=18305344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,45:0.35:130
chr11	18312953	rs4757638	G	A	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=596;SC=TTTTTAATACGAATTTCTATC;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=18312961;WS=18312943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	18314579	rs10665418	C	CTT	1587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=1128;SC=GGGATCAGAGCTTTTTTTGAG;SOR=4.073;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=32;WE=18314587;WS=18314569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	18317458	rs2305564	T	A	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=619;SC=TTCCTTTTTCTCATTTTCCAT;SOR=4.003;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=18317466;WS=18317448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	18317699	rs2305565	C	T	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=48;PP=1356;SC=AAAAAAGAAACAAAATCTAAT;SOR=2.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=18317707;WS=18317689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	18327684	rs1140047	G	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=8;PP=565;SC=ATCGTTACCTGAGAGTAATCA;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=18327692;WS=18327674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	18330385	rs35952141	G	GA	1670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=1084;SC=AAAAGAAAAAGAAAAAAAATC;SOR=2.342;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=45;WE=18330393;WS=18330375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	18354877	rs4150561	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=113;SC=AAAAATCAACTATGTAGAAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=18354885;WS=18354867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	18357180	rs4150579	A	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=672;SC=AAGCATCAGTATTGGAATAGG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=18357188;WS=18357170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	18357270	rs4150581	A	G	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=34;PP=2019;SC=TGTGAGTGTCATCATCTAACT;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=103;WE=18357278;WS=18357260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	18359983	rs111946613	ATGTT	A	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=137;SC=TATTATTATTATGTTTGTTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=18359994;WS=18359973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	18379629	rs4150661	C	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=49;NR=77;PP=2500;SC=CTGCCTAAATCAGCTTTAAAA;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=126;WE=18379637;WS=18379619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	18421237	rs4757652	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AAGCAATCCTCCTTCCACTTC;SOR=0.919;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=18421245;WS=18421227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	18428637	.	A	AT	928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.796;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.22;MQRankSum=0.316;QD=19.76;ReadPosRankSum=-1.635;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr11	18434159	rs143848190	T	TC	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-1.901;SC=TTCTTTGGCTTCCCCCCATCC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=4;WE=18434167;WS=18434151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr11	18434532	rs201993031	CCCTTCCTT	C	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.748;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.962;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	18456235	rs4757664	A	T	452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=385;SC=GAAAAAAAAAATTTTTTTAAG;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=18456243;WS=18456225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	18467821	rs2658565	T	C	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=71;PP=2597;SC=TGTGATGGATTTGGTAGGATC;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=130;WE=18467829;WS=18467811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	18478112	.	C	CAG	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.42;NF=6;NR=0;PP=197;QD=38.3333333333;SC=TCCTTCCACACGGGCCCAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=18478120;WS=18478102;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,6:0.29:21
chr11	18487274	rs140413894	G	T	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=930;ReadPosRankSum=1.610;SC=TTAGTCCAGCGAAATGTATCC;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=55;WE=18487282;WS=18487264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,73:0.39:185
chr11	18487404	rs72870279	A	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=488;ReadPosRankSum=0.924;SC=TCGGGGGTACACTGTGTAGGT;SOR=1.218;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=31;WE=18487412;WS=18487394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr11	18487425	rs2658563	A	G	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=48;PP=1339;SC=TCATTACATGAGTATACTGTG;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=18487433;WS=18487415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	18503159	rs2279900	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=499;ReadPosRankSum=-0.369;SC=AATCTTGGAACGTAAAATGAA;SOR=0.630;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=42;WE=18503167;WS=18503149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,54:0.41:133
chr11	18505632	rs2279902	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GCAGGAAACAGAGGCAAAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=18505640;WS=18505622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	18536215	rs12574333	G	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AGAACACTATGAATACTTACG;SOR=0.582;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=18536223;WS=18536205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr11	18537800	rs7942548	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.281;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	18537801	rs7928872	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr11	18548546	rs2292179	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GCAAGGGTGGACACCGTGTGG;SOR=0.510;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=19;WE=18548554;WS=18548536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr11	18548574	rs1857908	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=494;SC=AGGGGCCTGGTGGGGTGGGTT;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=18548582;WS=18548564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	18555901	rs56151250	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=176;ReadPosRankSum=0.429;SC=ATACAGAATGCACTTTCTTCT;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=16;WE=18555909;WS=18555891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr11	18555949	rs55999230	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=0.141;SC=CAGCTACTGATAGTCCAACAG;SOR=0.469;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=18;WE=18555957;WS=18555939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr11	18557825	rs56811637	T	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=274;ReadPosRankSum=1.551;SC=TGCTCCTTTATACTTTTGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=14;WE=18557833;WS=18557815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	18568542	rs34242612	A	T	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.838;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1159;ReadPosRankSum=-1.508;SC=ACTGAGAACTACCCAAAGAGT;SOR=0.456;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=76;WE=18568550;WS=18568532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr11	18586344	rs3832729	C	CAT	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.21;MQRankSum=1.319;NF=13;NR=2;PP=588;ReadPosRankSum=-0.870;SC=GGTTTTCCCACGACAAAATGA;SOR=1.284;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=15;WE=18586352;WS=18586334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr11	18591645	rs2305166	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=-1.611;SC=CAAAGACTACATGAAGAATAT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=18591653;WS=18591639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	18600283	rs61752314	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=1.062;SC=TAGGTGTCCATGGAATATTTG;SOR=0.840;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=32;WE=18600291;WS=18600273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr11	18600322	rs10500835	T	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TTTACATTCCTTAGTTCTTCC;SOR=0.975;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=23;WE=18600330;WS=18600312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr11	18610041	rs61884724	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=-0.354;SC=AGACCAGCCGCCCCGGCTCCA;SOR=0.569;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=7;WE=18610049;WS=18610031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr11	18628418	rs17579600	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCACATTCTTTTTTTTTTGAC;SOR=1.609;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=18628426;WS=18628408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	18631551	rs73424436	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=515;ReadPosRankSum=0.746;SC=GAGATGACCACTTTCCTTAAA;SOR=0.720;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=29;WE=18631559;WS=18631541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr11	18631622	rs7942526	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=215;ReadPosRankSum=-0.208;SC=AAAATGCCTCAAGGCTTTACC;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=18631630;WS=18631612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	18655858	.	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=595;ReadPosRankSum=1.240;SC=ACTGACAGCGCACCTAACCGA;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=46;WE=18655866;WS=18655848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,56:0.40:140
chr11	18720304	rs7946446	C	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=6;PP=422;SC=GACAGAACCCCGGCGCCGGGC;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=18720312;WS=18720294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	18728650	rs2289965	T	C	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=924;ReadPosRankSum=0.243;SC=TTCATGATGATGTAGTGAGCC;SOR=0.706;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=71;WE=18728658;WS=18728640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,80:0.59:135
chr11	18730895	rs11024768	A	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=198;SC=TGGAGGTACAATGTTGGGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=18730903;WS=18730890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	18732426	rs4237728	T	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=858;SC=CATGTAGATATTTGCCCACCT;SOR=3.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=18732434;WS=18732416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	18733521	rs7128042	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=526;SC=ATGAGACAGCCAGAGAGATGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=18733529;WS=18733515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	18733579	rs10832972	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=896;SC=GCTTAAGGTCTCCATGCTGAC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=18733587;WS=18733569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	18735321	rs10766493	A	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=202;SC=CTGGCCTCCTACTCAGCCTGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=18735329;WS=18735311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	18735396	rs10741752	G	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1050;SC=GCCCTGCCCTGACCCAGCACA;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=18735404;WS=18735386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	18735753	rs7106673	G	A	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=53;PP=2836;SC=CCCATGGGGCGGGGGAGAAGC;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=129;WE=18735761;WS=18735743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	18735947	rs7125943	T	C	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=79;PP=2965;SC=ACAATCTGCATGCCTGGCAAG;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=87;TCR=79;TR=166;WE=18735955;WS=18735937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	18736247	rs4265581	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=766;SC=GGCTGGTAGCGATGGTCATGG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=18736255;WS=18736237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	18736942	rs3887900	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=558;SC=CAGGGTCAGGGGGATTGGTCA;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=18736950;WS=18736932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	18737095	rs4424652	C	T	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=48;PP=1952;SC=CAGCTCTGCTCGCTTGCCCTC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=100;WE=18737103;WS=18737085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	18738281	rs10766494	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1167;SC=TCACGGTCAACAGTGAGCTGG;SOR=3.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=18738289;WS=18738271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	18738603	rs10766495	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=38;PP=1141;SC=GAGGGGTGGAGTGGTGAAGAG;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=18738611;WS=18738593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	18751041	rs1550870	C	T	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=27;PP=1077;SC=GGATGTCCACCACACCCTCCT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=18751049;WS=18751031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	18763698	rs4757706	A	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=396;SC=GCTAAGCTATAAGGCCAGCTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=18763706;WS=18763688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	18770822	rs921082	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=455;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GGGCTCCTCATGGACTCACCT;SOR=0.629;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=31;WE=18770830;WS=18770812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr11	18771041	rs2028897	G	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=49;PP=1502;SC=AGGGTGGGGGGCAGAACCTTG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=63;WE=18771049;WS=18771031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	18793360	rs4075664	T	C	241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=186;SC=GCTGGTTTCATGGAAAAGGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=18793368;WS=18793352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	18956194	rs2014931	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=568;ReadPosRankSum=-0.942;SC=AGAGCACAACTGCGTTTCCTG;SOR=0.960;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=44;WE=18956202;WS=18956184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,44:0.34:131
chr11	18978501	rs12363322	C	A	3444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=56;PP=2171;ReadPosRankSum=-0.924;SC=AGCAAGGAGTCTCCTCACGTC;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=133;WE=18978509;WS=18978491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,156:0.64:245
chr11	18994005	rs7114481	T	C	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=42;PP=1558;SC=TGAGGCGGAATGTATAACGTG;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=81;WE=18994013;WS=18993995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	19077765	rs10833049	T	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AGAGAAGGCGTTCCTGCGCAT;SOR=0.828;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=53;WE=19077773;WS=19077755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr11	19078022	rs10833050	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-2.501;SC=TTCACTGATTTTCATGACCAG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=19078030;WS=19078012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	19167850	rs2271001	A	G	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=88;PP=2717;SC=GATCTTGTAAAGTAAGATGGG;SOR=1.152;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=54;TCR=88;TR=142;WE=19167858;WS=19167840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	19184916	rs12798330	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=360;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TACTTTTTCTATAAGACTTGG;SOR=0.465;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=21;WE=19184924;WS=19184906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr11	19186826	rs2042687	A	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=267;SC=GGGCCCATGCATCGTTATTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=19186834;WS=19186816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	19188122	rs2242458	A	G	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=74;SC=GTTAGTTCTCAGTACTTTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=19188130;WS=19188112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	19191851	rs7114038	A	G	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=184;SC=GATCTGTGCCATACTTTCTCT;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=19191859;WS=19191841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	19191922	.	C	CTT	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=53;MMLQ=28;MQ=52.21;NF=2;NR=0;PP=75;QD=39.0;SC=AGTTTATTGCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=2;WE=19191930;WS=19191912;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,2:0.20:10
chr11	19194141	rs7111850	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=323;SC=TTTTTCTTTGTCCCTTTTCAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=19194149;WS=19194131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	19204403	rs45549043	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-1.949;SC=CATCCTTTTGATAGATTTATG;SOR=0.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=19204411;WS=19204393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	19206426	rs2288251	A	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.642;SC=ACCTCCAGGCATGAACGTAAT;SOR=0.558;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=68;WE=19206434;WS=19206416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,74:0.55:134
chr11	19252427	rs793252	G	T	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=833;ReadPosRankSum=1.817;SC=TGGCTCAGTTGGCTTTTGGGA;SOR=0.388;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=50;WE=19252435;WS=19252417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr11	19256250	rs793269	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=16;PP=691;SC=AGACAGAGGACAAATGCCATG;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=19256258;WS=19256240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	19261797	rs11025068	A	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AAAAGGAAATAGAAAAAGTTA;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=19261805;WS=19261787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	19372616	rs10655705	G	GGA	4929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=74;PP=2957;SC=TTATGGTGCTGATTGCTAAGT;SOR=2.158;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=78;WE=19372624;WS=19372606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	19735746	rs7943700	C	T	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=27;PP=1656;ReadPosRankSum=0.533;SC=ATGGCGGGCACGTCTGCAGCA;SOR=1.222;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=153;TCF=99;TCR=54;TR=88;WE=19735754;WS=19735736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,96:0.59:164
chr11	19735987	rs2278132	A	G	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.302;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=67;PP=1651;ReadPosRankSum=-1.380;SC=AGAAAAGGGGATCGCGGGTGG;SOR=1.213;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=148;TCF=45;TCR=103;TR=91;WE=19735995;WS=19735977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,99:0.60:165
chr11	19798951	.	C	CT	91	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5026;HP=13;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=59.74;NF=7;NR=1;PP=91;QD=12.0;SC=GGTGCTTCGGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=19798959;WS=19798941;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	19799924	.	G	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=574;ReadPosRankSum=-0.284;SC=ACTAGTGCCAGGATAAGAAAT;SOR=0.566;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=40;WE=19799932;WS=19799914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr11	19854088	rs6483617	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=617;ReadPosRankSum=0.092;SC=CGTCTCATCAGGGATCTCCAG;SOR=0.860;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=41;WE=19854096;WS=19854078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr11	19955500	rs1372989	A	G	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=66;PP=2552;SC=CAGGAATGAAAAGCATGCCCG;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=110;WE=19955508;WS=19955490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	19961457	.	C	CT	87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=59.83;NF=0;NR=5;PP=87;QD=19.2;SC=AACTTTCTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=19961465;WS=19961447;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr11	19967872	rs67192906	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=370;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GTTATGGTCATAGACATGGAT;SOR=0.333;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=26;WE=19967880;WS=19967862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr11	19970558	rs2585773	T	C	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=74;PP=1850;SC=TCAGCATGGATGCCCCCGGCT;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=26;TCR=74;TR=100;WE=19970566;WS=19970548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	19970579	rs2707084	C	T	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=56;PP=1590;SC=ACATGAGCGACGGGGATGTTC;SOR=2.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=75;WE=19970587;WS=19970569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	20005802	rs6483629	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=724;ReadPosRankSum=0.360;SC=AGGTAAGCTTGCTGCACTTGG;SOR=0.321;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=40;WE=20005810;WS=20005792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr11	20005857	rs7940346	G	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=1.712;SC=CCTGAGAAATGAGGGTTATGA;SOR=1.508;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=15;WE=20005865;WS=20005847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr11	20057371	rs6483634	T	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=567;ReadPosRankSum=-1.838;SC=CACATCTGAGTCAAGAGAGCT;SOR=0.474;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=34;WE=20057379;WS=20057361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr11	20065779	rs3802800	C	G	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=847;ReadPosRankSum=0.919;SC=AAGGACGAAGCCTTCAGCCCC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=47;WE=20065787;WS=20065769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,53:0.64:83
chr11	20066355	rs10219212	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.619;SC=AAGGCTCACGGTACATTAGTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=20066363;WS=20066348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	20067064	rs7125647	C	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.951;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1063;ReadPosRankSum=-1.768;SC=ACCAAACAGACAAGGAGAAAG;SOR=0.722;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=182;TCF=89;TCR=93;TR=70;WE=20067072;WS=20067054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,82:0.40:206
chr11	20072779	rs6483635	C	T	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.79;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	20098933	rs113817220	G	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=0.363;SC=TAGAAGACTGGAGTGACTGGA;SOR=1.781;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=20098941;WS=20098923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr11	20099112	rs4757028	A	T	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=54;PP=2585;SC=ACCTTGTGGCAGCCTTTGAAC;SOR=0.987;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=127;WE=20099120;WS=20099102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	20099399	rs6483641	G	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=225;SC=TTATGTGTTTGTTCATGCCTG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=20099407;WS=20099391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	20099541	rs6483642	C	T	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=47;PP=2189;SC=TTCCCTAGGACTCAGAACTGA;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=116;WE=20099549;WS=20099531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	20099767	rs7121301	A	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.08;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	20101704	rs1867114	C	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=22;PP=820;SC=GCCACTCCAGCGTGGGCAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=43;WE=20101712;WS=20101694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	20101744	rs1867115	C	A	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=943;SC=GAAGAAGAAGCGGAAGAACTG;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=20101752;WS=20101734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	20101769	rs3758695	C	T	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=26;PP=856;SC=AGTGCACATCCACTCTCCTGG;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=20101777;WS=20101759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	20101789	rs146636848	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GGGACTGACGGACAGAGTCAG;SOR=0.116;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=16;WE=20101797;WS=20101779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	20104847	rs10657903	A	AGG	185.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=77;SC=TTGCTTTAATAGGACTGTGCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=20104855;WS=20104837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	20112373	rs2289560	A	G	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=20;PP=920;SC=GGGGACTAAAAGGAGCTGCTT;SOR=0.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=20112381;WS=20112363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	20112417	rs2243624	A	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=21;PP=847;SC=CTAGAATTTCAGAATGCATGG;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=20112425;WS=20112407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	20117232	rs2289566	T	C	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=715;ReadPosRankSum=-1.396;SC=CCAGACCACATCTCTTTCTTA;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=50;WE=20117244;WS=20117222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,74:0.39:191
chr11	20119373	rs10833241	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=102;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CTTGTGGCCCCAGTTTTGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=9;WE=20119381;WS=20119363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr11	20122392	rs2245314	C	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=719;SC=GGAGAGGAATCACCTCAGGTC;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=20122400;WS=20122382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	20124914	rs2243411	A	C	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=55;PP=2053;SC=GCTCTCTGGGAGAGATCTTCA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=113;WE=20124922;WS=20124904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	20127046	rs11025385	C	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=143;ReadPosRankSum=1.047;SC=TCACCATCATCAGCTTGAAAA;SOR=1.274;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=13;WE=20127054;WS=20127036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr11	20127310	rs112982200	A	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=2;PP=35;SC=GCGGGCTGGCATCCTCAGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=20127318;WS=20127300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	20129075	rs4757890	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.875;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr11	20139632	rs2245836	G	C	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1184;ReadPosRankSum=-1.426;SC=CAGGGTGGGCGGCCAACTAGA;SOR=0.972;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=74;WE=20139640;WS=20139622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,82:0.57:143
chr11	20178551	rs10717537	CG	C	673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr11	20178717	rs831464	G	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=869;ReadPosRankSum=0.427;SC=AGCATGCCCCGCCGAGGCTTC;SOR=0.862;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=48;WE=20178725;WS=20178707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,56:0.58:96
chr11	20181412	.	T	G	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.838;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=835;ReadPosRankSum=0.822;SC=GATGTGTGTGTGGGGGCCCGC;SOR=3.321;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=37;WE=20181420;WS=20181402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr11	20385228	rs3808991	T	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=196;SC=GGAGTTCGTCTCCAGGTCCCG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=20385236;WS=20385218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	20385606	rs10437608	G	A	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=101;SC=GCTGGCTCAGGTGCGGGCGAT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=20385614;WS=20385596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	20398034	rs10741834	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1064;ReadPosRankSum=0.872;SC=TCCATCCTTCTAGGCCTCCCA;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=51;WE=20398042;WS=20398024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr11	20403825	rs7926967	A	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=787;SC=TATGCCACTGATGGTTAATCC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=20403833;WS=20403815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	20403904	rs10766664	G	C	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=171;SC=ACATTGGCTAGAGGTAGATTG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=20403912;WS=20403894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	20404506	rs2403587	T	C	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.95;MQRankSum=0.000;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.655;SOR=2.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr11	20404613	rs3824886	T	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=20;PP=1244;SC=CTTGGGCCAGTGGGCATTCTG;SOR=1.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=20404621;WS=20404603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	20404757	rs3781679	T	C	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=85;PP=2965;SC=CATGACCACATTGGAGAAATG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=92;TCR=85;TR=177;WE=20404765;WS=20404747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	20411199	.	TAAAA	T	264	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=60.77;NF=6;NR=3;PP=264;QD=29.6666666667;SC=CCAGCAGAGTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=9;WE=20411210;WS=20411189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,9:0.50:18
chr11	20411418	rs7937501	G	C	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.44;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	20411424	rs7937204	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	20419028	rs7934372	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=634;SC=CATCACACTGTACTCCCTCCC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=20419036;WS=20419018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	20424326	rs10833319	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=0;PP=85;SC=TTTCTTAGGAAAAAAATAAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=20424334;WS=20424316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	20429454	rs10741836	T	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=24;PP=1603;SC=TTAATTACCCTAGGTAGTTTT;SOR=1.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=20429462;WS=20429444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	20448531	rs12797994	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=11;PP=300;SC=TATTTTTTAAGTAGCTACATT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=20448539;WS=20448521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	20473655	rs1001669	T	G	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=8;PP=490;SC=TAAACTCTTTTTTTCCCCTTT;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=20473663;WS=20473645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	20483748	rs3758803	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=437;ReadPosRankSum=1.239;SC=TTTATAATGGTATTGCTATTT;SOR=0.357;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=22;WE=20483756;WS=20483738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr11	20515555	rs6483697	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=18;PP=645;SC=TAATTATTACGGAAGTACATT;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=20515563;WS=20515545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	20529886	rs6483700	G	A	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=32;PP=1523;SC=GTTCACAAGAGTAAGAAAGAT;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=20529894;WS=20529876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	20622975	rs1443547	G	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=699;ReadPosRankSum=2.175;SC=AGAGGCGCAAGGCGCGCAGGC;SOR=0.378;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=49;WE=20622983;WS=20622965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,49:0.35:139
chr11	20623007	rs7109418	C	T	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1706;ReadPosRankSum=0.866;SC=CCGGGAGCTCCGGGCCCGGCA;SOR=1.217;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=87;WE=20623015;WS=20622997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,98:0.65:151
chr11	20623023	rs2241941	C	T	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=1803;ReadPosRankSum=2.140;SC=CGGCAACGCGCTGCACTGTAA;SOR=0.878;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=91;TCR=60;TR=95;WE=20623031;WS=20623013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,111:0.61:181
chr11	20623042	rs1443548	T	C	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=63;PP=2965;SC=AAGATCCCTTTTCTGCGAGGC;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=94;TCR=63;TR=157;WE=20623050;WS=20623032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	20623156	rs1443549	C	G	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=104;PP=2965;SC=GTGGTGCTGGCCACGGATGGA;SOR=1.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=61;TCR=104;TR=165;WE=20623164;WS=20623146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	20628407	rs72927519	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=-1.377;SC=GTTGCTGAAACAGGACATCAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=20628415;WS=20628397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	20628479	rs2278649	T	C	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=7;PP=1270;SC=GCTCAGCCCCTAGCCCAGAGG;SOR=2.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=20628487;WS=20628469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	20639400	rs7925597	A	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=27;PP=960;SC=TGTATGCATCATTGGCTAAAG;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=20639408;WS=20639390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	20639457	rs11025653	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=621;ReadPosRankSum=1.478;SC=ATCTAAGAGAAAGCTGTGAGA;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=31;WE=20639465;WS=20639447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,36:0.77:47
chr11	20639479	rs11827415	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=-2.350;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr11	20648418	rs4923548	C	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=800;SC=TATAACCAGCCCTGGGGGAGT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=20648426;WS=20648408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	20652148	rs111750026	CAT	C	929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.710;NF=18;NR=3;PP=856;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TGCAGACAAACATGTGGGCAC;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=21;WE=20652157;WS=20652138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr11	20658679	rs2000959	C	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.409;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=324;ReadPosRankSum=-2.705;SC=CTGGGTGGTACAATTTGACTC;SOR=0.255;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=23;WE=20658687;WS=20658669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr11	20660149	rs72932948	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GCTTGAGTGTCGGTAAGGCAT;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=25;WE=20660157;WS=20660139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr11	20673832	rs72932998	C	A	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=682;ReadPosRankSum=0.887;SC=TTTCTCTTTCCAGTTTATCCT;SOR=0.940;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=43;WE=20673840;WS=20673822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr11	20673867	rs2276433	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.551;SC=ACCAGTGGGAGCCCATGACCT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=29;WE=20673875;WS=20673857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr11	20676417	rs1401793	C	T	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1240;ReadPosRankSum=-2.718;SC=AGTGCTAGTCCAGTGGTGTGG;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=59;TCR=87;TR=75;WE=20676425;WS=20676407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,92:0.53:173
chr11	20699315	rs34330747	T	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-1.054;SC=ATTAGCGGGGTAAGGGAGCAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=20699323;WS=20699307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	20699394	rs1793003	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=153;ReadPosRankSum=0.286;SC=TCCTTGTATTCCCTGCCACTC;SOR=0.187;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=13;WE=20699402;WS=20699384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr11	20805335	rs2280363	C	T	6170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.007;SC=AGAAGCCATCCACTTCAGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=191;WE=20805343;WS=20805325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr11	20949115	rs2293241	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=774;SC=TACCTAGCACCCACTAGCCAT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=20949123;WS=20949105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	20949763	rs4363596	C	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=173;SC=TCATTCGGGCCGGAGAAAACA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=20949771;WS=20949753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	20959185	rs1880088	A	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=685;SC=CCTCCACACAATTCCTTTCAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=20959193;WS=20959177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	20959429	rs1880087	T	C	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=74;PP=2537;SC=TTATGGTCCCTATCACTTCTG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=126;WE=20959437;WS=20959419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	20959482	rs1880086	G	C	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=57;PP=1771;SC=TGAGGTTCTTGAGTGGGGCAT;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=20959490;WS=20959472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	20959533	rs1880085	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=664;SC=ACTCTCTGCGGTGGGTTGGAT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=20959541;WS=20959523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	21305927	rs4151053	T	C	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=55;PP=1757;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CAAGTCTTTGTGCATTGCTGA;SOR=1.081;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=93;WE=21305935;WS=21305917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,101:0.98:103
chr11	21306113	rs4151054	A	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=0.693;SC=CAATGCAGTGAGTATCCCAGC;SOR=0.160;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=15;WE=21306121;WS=21306103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr11	21581665	rs7119475	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=803;SC=AATGCTACTGCAAATGATGGT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=21581673;WS=21581655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	21581805	rs8176789	C	T	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=38;PP=1556;SC=TGGCAGGGGGCTTTGACTGTC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=72;WE=21581813;WS=21581795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	21581997	rs8176790	C	T	270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=200;SC=TTCTACCTCCCCAGCTCTCTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=21582005;WS=21581987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	21592228	rs4922847	C	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=961;SC=GGTGACCAAACATCCAAGAAG;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=21592236;WS=21592218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	22214877	rs139514865	A	AAGGAGGAGGGGAATGAGGAGGAGG	2548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=2974;SC=GGAGGAGGAGAAGGAGGCCTG;SOR=1.547;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=21;WE=22214885;WS=22214867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	22214903	rs12792259	G	C	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=21;PP=1183;SC=GGAAGAGCAGGCCCTTAGAAG;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=62;WE=22214911;WS=22214893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	22233029	rs4922980	G	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=414;SC=TTAGGTGGGGGGAAAACACAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=22233037;WS=22233019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	22239661	.	T	TCACACACACACACACA	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=116.40;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	22242729	rs4312063	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=24;PP=710;SC=ACGTTGATGATGTAAAGAAAG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=22242737;WS=22242719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	22271870	rs7481951	A	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=241;ReadPosRankSum=0.859;SC=TAGTTGGCTTAGCTTGTTTTA;SOR=0.948;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=13;WE=22271878;WS=22271860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	22296094	rs72105710	CTTTT	C	1443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.168;HP=12;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=16;NR=11;PP=559;ReadPosRankSum=1.255;SC=TGATCTTCCTCTTTTTTTTTT;SOR=0.096;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=27;WE=22296105;WS=22296084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr11	22297606	rs5790245	AT	A	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.34;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	22363396	rs1562447	T	A	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=58;PP=1764;SC=CATCTCCTGTTTGAGCCCCGT;SOR=1.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=79;WE=22363404;WS=22363386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	22364744	rs2246710	G	A	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=40;PP=1870;SC=TGAGCCTTTGGTACTGACTCT;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=22364752;WS=22364734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	22391534	rs2665677	G	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=508;SC=TTCCCACTTAGGTTTGAAAAT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=22391542;WS=22391524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	22397739	rs2248436	A	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=219;SC=TCATATATATATTCTATATGT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=22397747;WS=22397729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	22707467	rs395398	A	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=357;SC=AAGTACAGAGAGTTCTTTTTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=22707475;WS=22707457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	22747745	rs337448	A	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=175;SC=GGCATGAGGTAATTCCGAAGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=22747753;WS=22747735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	22759168	rs7934119	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GAGCACGAGGAATGAGGGTCA;SOR=0.999;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=13;WE=22759176;WS=22759158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	22770922	rs2270755	G	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=199;ReadPosRankSum=1.746;SC=TTCTTGAAATGTATTTTAAGC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=22770930;WS=22770912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	22851172	rs2286811	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=413;ReadPosRankSum=-0.691;SC=AATGGCTCGGCCCGCCCCGCA;SOR=0.578;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=26;WE=22851180;WS=22851162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr11	22851409	rs2286810	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-1.050;SC=ACCGCCCTCCACTGGCTCGGC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=22851417;WS=22851399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	22880918	rs3213707	T	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=-2.001;SC=TTCTATTATGTTAGGGACCAC;SOR=1.230;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=12;WE=22880926;WS=22880908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	22881002	rs3213706	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr11	24759855	rs1564992	G	A	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=992;ReadPosRankSum=1.559;SC=TACTGTAAGTGTGTTTCTTCT;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=59;WE=24759863;WS=24759845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,78:0.58:134
chr11	24784862	rs2716532	A	T	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=15;PP=626;SC=GAGGTAAGATATATTTCATCT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=24784870;WS=24784852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	26465500	rs4032918	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=19;PP=474;SC=GGTTTTTAACGTAATAGGTGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=26465508;WS=26465490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	26481611	rs2047099	G	A	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=54;PP=2155;SC=TTAGAGATCAGATTTCAACAT;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=101;WE=26481619;WS=26481601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	26547348	rs430563	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	26547353	rs410617	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	26552679	rs9988806	T	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=452;ReadPosRankSum=2.911;SC=AGTACTTAAGTGAATTGTAGT;SOR=1.061;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=23;WE=26552687;WS=26552669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr11	26552696	rs2131696	T	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.542;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr11	26552702	rs293937	T	C	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.33;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	26558841	rs386635	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=344;SC=GAAGTCATTTGGGTTATCTTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=26558849;WS=26558831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	26558873	rs375562	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=399;ReadPosRankSum=2.601;SC=CGATTCATTGTTCCCCGTATA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=18;WE=26558881;WS=26558863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr11	26559172	rs396863	G	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=608;SC=CTGTGCACTGGCTCCTCTGCC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=26559180;WS=26559162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	26563464	rs410036	A	T	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=585;SC=AAAAAATAGAACCAAATGTAT;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=26563472;WS=26563454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	26563652	rs420143	T	G	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=678;SC=AGCAAAGTATTCTGTTTTGTG;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=26563660;WS=26563642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	26568966	rs2663168	A	G	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=54;PP=2554;SC=CATGCAGGCTATACTTTGGTG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=124;WE=26568974;WS=26568956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	26574740	rs395770	T	C	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=62.13;NF=14;NR=1;PP=371;SC=AAGTGAATTCTTAGTCACAGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=26574748;WS=26574730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	26574782	rs59938249	TG	T	822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=9;PP=884;SC=TTTTTGTTTTTGTTTTTTCTC;SOR=3.014;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=26574790;WS=26574772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	26584625	rs444178	C	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.310;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=9;PP=999;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TTAATTAAAACCACTGTGCCC;SOR=1.832;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=49;WE=26584633;WS=26584615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr11	26586801	rs15783	G	A	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1285;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TTGATAAGGGGTAAACCCAGT;SOR=0.651;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=74;WE=26586809;WS=26586791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,81:0.58:140
chr11	26587133	rs293980	T	C	7513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=143;PP=2965;SC=GCTCTGCTGATGAGTTACTGG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=101;TCR=143;TR=244;WE=26587141;WS=26587123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr11	26587394	rs11029619	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=192;ReadPosRankSum=1.663;SC=GAATTTTGGCTAAGGCCAACA;SOR=0.615;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=17;WE=26587402;WS=26587384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	26588795	rs150988105	C	CT	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=14.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.842;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	26588804	rs293976	C	T	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=631;SC=ACTTTTTTTTCCTCAAGCAAT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=26588812;WS=26588785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	26619872	rs7112022	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=103;ReadPosRankSum=0.196;SC=AGCAATATGATGTGATTTGGG;SOR=0.231;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=13;WE=26619880;WS=26619862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr11	26620101	rs10835009	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=311;ReadPosRankSum=1.013;SC=ATTAGATTTTTCCCTTGATCT;SOR=1.312;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=17;WE=26620109;WS=26620091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr11	26645894	rs1012552	A	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=353;SC=TTCTATTTAAAGTAAAATGTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=26645902;WS=26645884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	26655658	.	G	A	325	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.7;NF=17;NR=3;PP=325;QD=17.9885606274;SC=AAATTAAAAAGACAAACTTGA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=20;WE=26655666;WS=26655648;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,20:0.38:52
chr11	26656370	rs7933233	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=0.271;SC=TCTTGACCCATTAGTTCACGC;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=11;WE=26656378;WS=26656360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr11	26656563	rs7946841	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=637;ReadPosRankSum=0.789;SC=CTTACAGATTCGTAGGCCACC;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=47;WE=26656571;WS=26656553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr11	26656714	rs10835033	C	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=0.713;SC=GTTCAGGGAACTTTATGGATA;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=14;WE=26656722;WS=26656704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr11	26663284	rs10835039	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	26663298	rs11603910	T	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.25;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	26663304	rs57264690	A	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	26663394	rs10835040	A	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=365;ReadPosRankSum=0.844;SC=ATTGTTAACCAGATGCTTGAA;SOR=1.212;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=29;WE=26663402;WS=26663384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,32:0.31:103
chr11	26669167	rs10501059	A	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=278;ReadPosRankSum=0.302;SC=GTTCCAACATAAGTAAAACAT;SOR=0.473;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=26669175;WS=26669157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr11	26677867	rs10835050	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=473;ReadPosRankSum=1.403;SC=CAAGAAAATTTGGGCCTCCAC;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=43;WE=26677875;WS=26677857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,43:0.28:154
chr11	26677947	rs10835051	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=500;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GAGGCCCGCCCTGGAGTTCCA;SOR=0.583;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=38;WE=26677955;WS=26677937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,40:0.28:142
chr11	26692594	rs138625216	T	TTGTGTGTGTGTGTG	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	26692631	rs7128384	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=290;ReadPosRankSum=-1.205;SC=GTGTGTGTGCATTCATACAGG;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=26;WE=26692639;WS=26692621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr11	26692733	rs7114378	T	C	3803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.34;ReadPosRankSum=2.096;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,97:0.52:187
chr11	26692742	rs7128823	G	A	3880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=3.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,104:0.55:190
chr11	26692933	rs7101361	A	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=-1.501;SC=ACTCTGACCTAAGACATTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=16;WE=26692941;WS=26692923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr11	26694812	rs4278475	C	T	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=853;SC=AACTCTGAAGCTGAAACTCAA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=26694820;WS=26694802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	26694842	rs4551716	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=389;ReadPosRankSum=1.262;SC=AGTTCTCACACTCACTGCTTT;SOR=0.868;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=24;WE=26694850;WS=26694832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr11	26694979	rs4369354	A	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.994;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=829;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GCTGAACTCCACACCAGCATA;SOR=0.947;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=55;WE=26694987;WS=26694969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,59:0.41:144
chr11	26700099	rs12793773	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=579;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AATAATGAAGGGTGCCTTTGT;SOR=0.283;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=30;WE=26700107;WS=26700089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr11	26702482	rs10767569	T	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GGTACTTCCCTGAGTGAGTCT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=26702490;WS=26702472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	26702664	rs10734383	C	T	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=19;PP=728;SC=GGTCTGTTGACAGAGGCAAAG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=26702672;WS=26702654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	26705310	rs3924551	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,8:0.15:53
chr11	26713961	rs61877324	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=479;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GTCCTGAATAGCACATGCAGG;SOR=0.476;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=31;WE=26713969;WS=26713951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr11	26718692	rs112314177	T	C	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1288;ReadPosRankSum=2.126;SC=CATCATCAGATTGTTGTTGCT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=76;WE=26718700;WS=26718682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,83:0.62:133
chr11	26734209	rs10742156	C	T	7836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=126;PP=2965;SC=TGTAGATGACCGTGGCAGCAT;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=97;TCR=126;TR=223;WE=26734217;WS=26734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr11	26742876	rs112477229	AG	A	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=0.591;SC=GCTATCATCAAGAGGATGAGA;SOR=1.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=26742884;WS=26742866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	26742894	rs199753466	AT	A	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=8;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=0.111;SC=AGAAAAAAAAATTAGAGAAGA;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=7;WE=26742902;WS=26742884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr11	26743240	rs113908376	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=932;ReadPosRankSum=-1.695;SC=TAATCCCAAACTGCAAAGTTC;SOR=0.574;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=55;WE=26743248;WS=26743230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,63:0.55:114
chr11	27077118	rs10767598	C	T	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=40;PP=1963;SC=ACCTGGATTCCGCAAAAGCAC;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=91;WE=27077126;WS=27077108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	27078643	.	C	CATA	232	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=232;QD=43.5;SC=TTAAGCAAAGCATAATTGGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=27078651;WS=27078633;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,6:0.26:23
chr11	27114788	rs3183973	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1067;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATGATGAACACGCATACAAGT;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=74;WE=27114796;WS=27114778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr11	27147270	rs1044273	G	A	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TATTTGATGTGCCTGTTGAAA;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=63;WE=27147278;WS=27147260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,79:0.57:138
chr11	27362257	rs80317617	T	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1094;ReadPosRankSum=1.352;SC=AAGTTTTCCATTGGCATAACC;SOR=0.486;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=151;TCF=71;TCR=80;TR=67;WE=27362265;WS=27362247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr11	27371775	.	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.613;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-2.970;SC=AAAGAAGAAAGACTCTAAGAG;SOR=0.169;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=10;WE=27371783;WS=27371765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr11	27379127	rs3741407	C	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GTACAAGAACCTCTTTTGCTT;SOR=1.549;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=17;WE=27379135;WS=27379117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr11	27384585	rs11549824	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GGCAGCGGCGGCGACGGCGAG;SOR=1.410;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=64;WE=27384593;WS=27384575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,71:0.39:184
chr11	27390089	rs2447997	T	C	5873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=91;PP=2965;SC=TGCAGTATAGTTTAGTGTAGA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=177;WE=27390097;WS=27390079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	27393813	rs2448001	G	A	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=40;PP=2646;SC=TCTATTTTTTGAAACTCATGC;SOR=1.353;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=116;WE=27393821;WS=27393803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	27395377	rs2448003	G	A	60.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr11	27395447	rs77328098	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=0.528;SC=TATTTTGATTCGACAATGTTA;SOR=0.320;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=11;WE=27395455;WS=27395437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	27401703	rs78698326	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=2.093;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr11	27401743	rs2472623	A	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1136;SC=CATTGTCACTAAAAGACCCTG;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=27401751;WS=27401733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	27401927	rs2448005	T	G	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.013;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr11	27401940	rs2472622	T	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=38;PP=1248;SC=TCATATTTTATGTTTTAAACA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=27401948;WS=27401917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	27406844	rs6484295	G	A	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=737;ReadPosRankSum=-0.621;SC=AGTCAGGGATGCTTGAGATCT;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=48;WE=27406866;WS=27406834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,59:0.52:114
chr11	27412535	rs12273521	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=353;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CTGTTTTTATCTCAGATGAAA;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=17;WE=27412543;WS=27412525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr11	27413855	rs1871251	T	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=182;SC=CTCTGGCCTCTCATACTACTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=27413863;WS=27413845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	27523164	rs151336878	T	TGAAGTTAAAATTTCAGGC	2457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=2957;SC=GAGTTCTCTGTGAAGTTAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=31;WE=27523172;WS=27523154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	27523186	rs10835188	G	T	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=165;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=511;SC=TTCAGGCAAAGTTATGCATCT;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=27523194;WS=27523176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	27679662	rs2353512	T	C	3980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=60;PP=2219;SC=TTTTGTCTGCTGCCGTTACCC;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=27679670;WS=27679652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	27695910	rs10835210	C	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	27722510	rs373949465	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=856;ReadPosRankSum=0.275;SC=CCCGGGCCACAGACACACCTT;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=65;WE=27722518;WS=27722500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr11	27910923	rs6484341	T	A	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=27;PP=2267;SC=CTTTTCTTCATCCTCTGGAAG;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=72;TCR=27;TR=99;WE=27910931;WS=27910913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	28045430	rs34088899	AT	A	310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=11;PP=259;SC=TTAGTTAAGCATTTTTTTTAT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=28045438;WS=28045420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	28106058	rs997555	C	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=380;SC=AAAGACCCTTCTAACCCTCAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=28106066;WS=28106048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	30253318	rs611246	A	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=821;SC=AGGAAAAAAAACTTTTGAAGC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=30253326;WS=30253308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	30253641	rs609896	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=662;SC=AGCAAGGGTGTTGAAGGTCTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=30253649;WS=30253631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	30255185	rs6169	C	T	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=38;PP=1667;SC=AACTGGTATACGAAACAGTGA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=82;WE=30255193;WS=30255175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	30352473	rs35824273	C	CAG	1811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=1233;SC=CAAAATAAAACGGAAAATTTG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=30352481;WS=30352463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	30435599	rs10767842	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=284;SC=CAAGAGAGAAGGTCCATATAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=30435607;WS=30435590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	30438948	rs492604	C	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=139;SC=GACTTTTCTTCTCGTATTCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=30438966;WS=30438938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	30438958	.	CT	C	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9997;HP=15;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=20;MQ=60.83;NF=2;NR=0;PP=26;QD=14.5;SC=CTCGTATTCACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=2;WE=30438966;WS=30438938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,2:0.18:11
chr11	30557498	rs117025040	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	30902893	rs273613	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=322;ReadPosRankSum=-0.120;SC=GAATACGGAATGGCACAATAT;SOR=0.723;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=29;WE=30902901;WS=30902883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr11	30921291	rs273561	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.799;SC=TTCAATTAGAAACAAGTAATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=30921299;WS=30921281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr11	30922081	rs273560	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=127;ReadPosRankSum=1.212;SC=CATTGTTCAACGAATAATGAA;SOR=0.188;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=10;WE=30922089;WS=30922071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr11	30930393	rs175398	T	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TCAACTTGTATGAACATAAAG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=30930401;WS=30930383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	30933064	rs273602	A	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=-0.835;SC=AGCTCCATGCATGCTCTGTAA;SOR=0.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=18;WE=30933072;WS=30933054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr11	30965855	rs273605	A	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=256;ReadPosRankSum=1.220;SC=TTAGGAACCAAGTCTATCTCC;SOR=0.641;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=26;WE=30965863;WS=30965845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,29:0.29:100
chr11	30974115	rs158633	C	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=417;ReadPosRankSum=1.672;SC=TTATGGCCCACCTAAAACAAA;SOR=0.698;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=26;WE=30974123;WS=30974105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr11	31326420	rs2616821	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TAGCACTAGATACCAAACTCT;SOR=0.502;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=11;WE=31326428;WS=31326410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr11	31327316	rs2616815	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=877;ReadPosRankSum=0.151;SC=CTGTGCACTCCTCCAGCAGCT;SOR=0.655;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=58;WE=31327324;WS=31327306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,68:0.43:157
chr11	31327766	rs2761592	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=430;ReadPosRankSum=0.016;SC=GAAAACTTTGGAACACTAGTT;SOR=0.679;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=31;WE=31327774;WS=31327756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr11	31458730	rs7479413	T	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=494;SC=TCAGGTTTCATATATTTAGAT;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=31458738;WS=31458720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	31648529	rs2273943	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=213;SC=ATATAATACTGTTTTGACATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=31648537;WS=31648519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	31653956	rs4922872	C	A	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=95;PP=2965;SC=GATCCAGGTACGAAATTTCCA;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=64;TCR=95;TR=159;WE=31653964;WS=31653946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	31812582	rs2071754	C	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=457;SC=GCTAGTCCTTCCACTGGCCAC;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=31812590;WS=31812572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	31814879	rs3026384	G	A	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=45;PP=2083;SC=ACTGTAGTGCGAAAAGCTCTC;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=31814887;WS=31814869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	31837949	rs1540318	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=252;SC=GTCCTCGGCTCGCCCTGGGCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=31837957;WS=31837939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	31838128	rs4440995	G	A	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=49;PP=1763;SC=CGAAGCAGGCGACCTGCTCGC;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=98;WE=31838136;WS=31838118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	31838252	rs5790869	C	CG	1002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=880;SC=GAGCAGGGGGCGCCACCGCTC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=20;WE=31838260;WS=31838242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	32113057	rs223045	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=607;ReadPosRankSum=-2.004;SC=CGCCTGGGCGAGAGCCACGCG;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=37;WE=32113065;WS=32113047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr11	32118925	rs223073	A	G	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=51;PP=1603;SC=GGGGGCCCAGATCACAAGCTT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=32118933;WS=32118915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	32119030	rs223072	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=0.998;SC=CCCTCCTCTGTAAACTCAGAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=32119038;WS=32119020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	32121942	rs72902298	A	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=543;ReadPosRankSum=0.593;SC=TGTTTTTTACAGATAAAAAAC;SOR=0.523;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=37;WE=32121950;WS=32121932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr11	32122003	rs2281411	C	A	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1181;ReadPosRankSum=0.351;SC=AGCATTCAGCCGTAAAAGCTG;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=78;WE=32122011;WS=32121993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr11	32122020	rs2073223	T	G	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1296;ReadPosRankSum=0.995;SC=GCTGGACAAATGAGGACAATA;SOR=0.689;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=94;TCR=85;TR=87;WE=32122028;WS=32122010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,96:0.45:211
chr11	32122268	rs223065	C	A	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=20;PP=545;SC=CAAGTCTATACGTCACTCCTG;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=25;WE=32122276;WS=32122258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	32124579	rs223060	C	T	6610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=75;PP=2965;SC=AGTCACTGAACTAAGTCAAAA;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=123;TCR=75;TR=198;WE=32124587;WS=32124569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	32124685	rs223059	G	A	8391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=148;PP=2965;SC=TCCCCAAGAAGCTGCCTACCA;SOR=1.017;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=106;TCR=149;TR=254;WE=32124693;WS=32124675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	32125755	rs72904117	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=0.594;SC=GAGTTTTGCAATGCAGTCATG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=32125763;WS=32125745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	32125855	rs223058	A	G	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=34;PP=1358;SC=AACATCATACAGAACTAGTAC;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=32125863;WS=32125845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	32410774	rs1799937	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=0.694;SC=AGAGACAGGCACAAGTTCAAC;SOR=1.136;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=20;WE=32410782;WS=32410764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr11	32414333	rs2234593	G	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=282;ReadPosRankSum=0.718;SC=ATTTGAAAATGATACTGGAAA;SOR=0.758;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=22;WE=32414341;WS=32414323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr11	32417849	.	T	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=665;ReadPosRankSum=1.405;SC=GCTTAAAATATCTCTTATTGC;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=41;WE=32417857;WS=32417839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr11	32439038	rs2295081	T	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=371;ReadPosRankSum=0.008;SC=AAACTGTACTTTCTTCATAAG;SOR=0.301;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=25;WE=32439046;WS=32439028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr11	32449417	rs5030171	C	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	32449420	rs5030170	C	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	32449661	rs2234585	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CGGGGTGCGAGGCTGCGGGCA;SOR=1.026;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=16;WE=32449669;WS=32449651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr11	32456562	rs1799925	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=319;ReadPosRankSum=0.410;SC=AAGCGCCCGGGGGCGCAAAGT;SOR=1.244;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=20;WE=32456570;WS=32456552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr11	32460575	rs11031784	T	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.481;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TTCTCAACCCTTACTTTCACC;SOR=1.379;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=29;WE=32460583;WS=32460565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,35:0.29:120
chr11	32460676	rs34163689	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GGCCGCCCTCCGGGAGTCACC;SOR=0.466;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=13;WE=32460684;WS=32460666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr11	32610467	rs11031885	G	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=634;ReadPosRankSum=0.956;SC=GTTGTTAACGGTACCTGCCAC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=30;WE=32610475;WS=32610457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr11	32615352	rs66536432	A	AT	555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.088;NF=14;NR=4;PP=565;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TCTTAAAAATATTTTAAATGA;SOR=0.598;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=18;WE=32615360;WS=32615342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr11	32657266	rs201854	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=514;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CTTCCTCAAATGTTTTTTGAT;SOR=0.914;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=39;WE=32657274;WS=32657256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr11	32676632	rs61176333	A	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.202;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	32676635	rs58867287	C	CATATAT	93.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.960;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	32676636	rs58870509	C	CAAGATAATA	64.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.687;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	32676638	rs58027589	T	TAC	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.480;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	32676640	.	G	GGT	70.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.241;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	32676641	.	C	CCATTA	70.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	32697291	rs7116464	A	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=563;SC=TGCAATATATATGTTATTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=32697299;WS=32697281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	32704946	rs1396995	C	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=249;SC=TATCCCCTTTCATATTACTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=32704954;WS=32704936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	32722320	rs11031943	A	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	32724611	rs4756174	C	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-2.041;SC=ATTTTGTGTTCCTGGAATGCA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=32724619;WS=32724601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	32781829	rs11442361	G	GA	310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=258;SC=GGTCTTAACTGAAAAAAAATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=32781837;WS=32781819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	32949463	rs146740108	A	AT	352.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;MQRankSum=0.530;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.916;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr11	32954344	rs1022586	G	A	3936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=80;PP=2885;SC=ATCTCAGACTGTAACTCCTGA;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=130;WE=32954352;WS=32954334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	32956244	rs7940077	A	G	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=66;PP=2870;ReadPosRankSum=-0.588;SC=AGTGGAGAGAATGCTACATCA;SOR=0.305;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=121;WE=32956252;WS=32956234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr11	32956620	rs7481878	A	G	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=83;PP=2965;SC=AAAAACAACCAGAAGTCAAAA;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=68;TCR=83;TR=151;WE=32956628;WS=32956610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	32975333	rs7395190	T	G	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=841;SC=TTAAACTGTTTTGAGTTTTAC;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=32975341;WS=32975323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	32990842	rs6416072	G	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=81;SC=TAGTTTGTCTGCTTAGTGTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=32990850;WS=32990832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	33005708	rs184830540	G	A	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1240;ReadPosRankSum=0.576;SC=TAGATAGACCGGAATGTTGGG;SOR=0.824;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=64;WE=33005716;WS=33005698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,71:0.72:98
chr11	33014668	rs7941237	G	A	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=602;SC=TCACAGACTGGGTAGCTTATA;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=33014676;WS=33014658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	33050100	rs3802790	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TGGTGAGCATATAGTAACTAT;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=33050108;WS=33050090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr11	33053005	rs36077875	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=570;ReadPosRankSum=1.107;SC=GCAGAAGCTTTCCTGAGCAAC;SOR=0.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=39;WE=33053013;WS=33052995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,47:0.32:148
chr11	33053107	rs966191	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=0.228;SC=ACTTATCTGACGTTCATAATG;SOR=0.490;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=20;WE=33053115;WS=33053097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr11	33053737	rs4511261	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-0.126;SC=ATTCACCATTCATTGTTAATT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=33053745;WS=33053727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	33054562	rs2273536	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.766;SC=CAAATTTCAGGTGTTTTTTGA;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=33054570;WS=33054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr11	33054596	rs2273537	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TAAGTAGTTGGACTTTAATTT;SOR=0.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=33054604;WS=33054586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	33054754	rs2273539	C	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GATTTTTCTGCTTAAATATGA;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=33054762;WS=33054744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	33054794	rs2273540	T	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-0.300;SC=AACTTTTTACTTTTAAACTTT;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=33054802;WS=33054784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr11	33055078	rs1059432	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	33065394	rs1064005	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=860;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AGGAAGGCCTCGAAGATGCTG;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=103;TCR=50;TR=55;WE=33065402;WS=33065384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,59:0.34:173
chr11	33065547	rs7926030	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=423;ReadPosRankSum=1.305;SC=GTTTTATGAGGCCTCCTTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=14;TCR=73;TR=30;WE=33065555;WS=33065537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr11	33076191	rs2273544	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.210;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,25:0.23:107
chr11	33078251	rs4471389	A	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	33078643	rs2273546	T	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.901;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr11	33079445	rs2273548	G	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=209;ReadPosRankSum=1.956;SC=TTGATTAAACGTAGCTGTGTT;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=15;WE=33079453;WS=33079435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr11	33080496	rs11032133	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=245;ReadPosRankSum=0.195;SC=AAATCCTTTTTTCTTTCAGAG;SOR=0.600;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=20;WE=33080504;WS=33080486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr11	33106908	rs3834432	C	CTTTATAG	1446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=1335;SC=ACTGTGGATACTTTATTTCAT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=18;WE=33106916;WS=33106898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	33113653	rs7950763	T	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=2;PP=996;SC=TAAAAATAATTTTAAACAGGT;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=33113661;WS=33113643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	33113910	rs113144162	A	AT	2714.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.70;QD=29.83;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	33118529	rs11363325	GC	G	794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.766;NF=0;NR=16;PP=581;ReadPosRankSum=-0.050;SC=ATATACCTATGCAAAAGAAAG;SOR=0.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=33118537;WS=33118519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr11	33183017	rs3736213	A	G	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=1003;SC=CGCCCACTCAAATATGAATTA;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=33183025;WS=33183007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	33360783	rs3847592	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=410;SC=AGATAATTGTAGTTCCCTCTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=33360791;WS=33360773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	33360886	rs5790925	AT	A	2493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=22;PP=1875;SC=TGAAATTTTGATTTTCTTAGG;SOR=1.432;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=47;WE=33360894;WS=33360876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	33362723	rs266470	G	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=427;SC=TAATGATTGCGCATTTTACTT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=33362731;WS=33362713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	33363057	rs80111299	C	T	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.740;SC=ATTTATACAGCGTGTATATTT;SOR=0.754;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=82;TCR=30;TR=64;WE=33363065;WS=33363047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,77:0.59:131
chr11	33370884	rs4756641	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.152;SC=CTACTAAAAAGCCTACGATTT;SOR=0.317;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=33370892;WS=33370874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	33680249	rs11032332	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=295;ReadPosRankSum=2.144;SC=TCGGGACGCCGCCTGAGGTCT;SOR=0.986;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=8;WE=33680271;WS=33680239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr11	33680263	rs12226271	A	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=295;ReadPosRankSum=2.475;SC=GAGGTCTGGGACAGTGCTAAC;SOR=1.048;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=8;WE=33680271;WS=33680239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr11	33680371	rs12280103	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=601;ReadPosRankSum=1.208;SC=TGCACGACAGCGCCTCCTTCA;SOR=0.385;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=46;WE=33680379;WS=33680361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr11	33680613	rs2295064	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.736;SC=AGAGCTGCTGATTTTCTTTCT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=33680621;WS=33680603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	33719821	rs831611	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=201;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCACACAAAGTGGGCACTGTA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=14;WE=33719829;WS=33719811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr11	33719850	rs831612	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=285;ReadPosRankSum=1.808;SC=ACATGCTGGTAGCAACAAGAA;SOR=1.492;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=19;WE=33719858;WS=33719840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr11	33763682	rs3794200	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAGTTTTTTAGTTATTTCATG;SOR=0.763;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=16;WE=33763690;WS=33763672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr11	33768086	rs7120610	T	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=434;ReadPosRankSum=0.079;SC=TCAATTGCATTCTGGGTATAT;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=32;WE=33768094;WS=33768076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,42:0.31:134
chr11	33773161	rs7479064	G	C	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=23;PP=633;SC=CACCTATAAAGCAGGAAAGGG;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=33773169;WS=33773151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	33778729	rs12224154	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=601;ReadPosRankSum=0.817;SC=CAGTGCAAAGTTCTCCTTAAA;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=31;WE=33778737;WS=33778719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr11	33780163	rs1522086	A	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=411;ReadPosRankSum=-1.365;SC=AAGGCACAAAAAAGAGTGAAT;SOR=0.510;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=32;WE=33780171;WS=33780153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr11	33790268	rs1915894	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=1.271;SC=GGCCAAATATGAACAGTAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=33790276;WS=33790258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	33886294	rs2038602	A	G	4395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=61;PP=2678;SC=AGCGGTCCCCAATGTTCTGCT;SOR=0.944;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=33886302;WS=33886284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	33891357	rs11032432	G	C	81.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	34093349	rs10718447	AT	A	1409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=21;PP=1087;SC=AAGATGTTATATTTTTTATTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=35;WE=34093357;WS=34093339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	34107785	rs4755360	G	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=18;PP=1287;SC=ATTTTAGTCAGACTCTGTAAC;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=34107793;WS=34107775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	34113717	rs2982592	C	T	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=61;PP=1712;SC=GTTTTAGTAGCAGACCATATG;SOR=2.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=75;WE=34113725;WS=34113707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	34149199	rs2957512	T	C	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=199;SC=CTTGCAGATTTAGGGGCATGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=34149207;WS=34149189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	34152939	rs2957516	T	C	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=37;PP=1809;SC=GCGGACACTGTATGAGGTTTC;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=34152947;WS=34152929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	34154641	rs2957518	C	T	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=39;PP=1590;SC=TTCTGCCTCCCGTGCCCCCCA;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=34154649;WS=34154631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	34158411	rs2982615	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=19;PP=977;SC=GGTAGCTGGTATCGGTGCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=34158419;WS=34158401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	34158431	rs2957521	T	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=12;PP=716;SC=GCCTGCTATTTGTGGCGTGCT;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=34158439;WS=34158421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	34162139	rs370072701	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=-1.067;SC=CTGTTGCTTGCGTGGAGGAGA;SOR=0.439;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=8;WE=34162147;WS=34162129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr11	34163705	rs2982612	T	C	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=42;PP=1882;SC=TGCAGGTAGATGGAAGAGAAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=107;WE=34163713;WS=34163695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	34176214	rs2957525	A	G	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=7;PP=972;SC=TGGGCACCCTAGCCCAGGCCC;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=34176222;WS=34176204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	34188981	rs7120870	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr11	34188981	.	CA	TG	280	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7;NR=14;PP=280;QD=15.8794226125;SC=GATGGTGAACCAGAGTTAACA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=21;WE=34188990;WS=34188971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr11	34188982	rs7120749	A	G	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.42;ReadPosRankSum=1.779;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr11	34189564	rs4756111	A	G	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=66;PP=2376;SC=TGCACGTGCTAAACTGTTTGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=119;WE=34189572;WS=34189554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	34226041	rs2955944	A	G	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=57;NR=32;PP=1622;SC=CCCAGCCCTGAGACCTCGCCG;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=34226049;WS=34226018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	34470679	rs769218	G	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=540;SC=ACCCGTGACAGTGTAAATGAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=34470687;WS=34470672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	34482908	rs769217	C	T	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=57;PP=2029;SC=ACCAGCGTGACGGCCCGATGT;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=108;WE=34482916;WS=34482898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	34533002	rs28395819	A	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=460;ReadPosRankSum=0.063;SC=CTAGCTGCCTAGTAAGTAGGA;SOR=1.314;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=34;WE=34533010;WS=34532992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,40:0.37:107
chr11	34643780	rs286920	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=1.041;SC=CTGATTTACCATGCTCCCAGG;SOR=0.415;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=11;WE=34643788;WS=34643770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr11	34673051	rs4987414	AG	A	3373.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=25;PP=2207;SC=CCTGGGGAAAAGAGATCGCTG;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=34673061;WS=34673041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	34673053	rs201988979	A	T	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=25;PP=1367;SC=TGGGGAAAAGAGATCGCTGAC;SOR=1.519;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=68;WE=34673061;WS=34673041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	34678433	rs447228	C	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,44:0.34:128
chr11	34678433	.	CGC	TGG	406	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24;NR=13;PP=406;QD=12.418050672;SC=GTCAATTAAACGCCTCTCATT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=37;WE=34678443;WS=34678423;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr11	34678435	rs435537	C	G	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=1.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	34680053	rs3818514	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=822;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TAGATCATTAGTAACCTGCCT;SOR=0.293;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=47;WE=34680061;WS=34680043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr11	34680400	rs286891	T	A	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1073;ReadPosRankSum=0.107;SC=AAAGAGAAATTCTGGAGCGTG;SOR=0.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=72;WE=34680408;WS=34680390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,83:0.42:199
chr11	34680598	rs11032804	C	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=498;ReadPosRankSum=-1.084;SC=ATGAGGGGAACAAGAAACTAC;SOR=0.968;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=24;WE=34680606;WS=34680588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr11	34904399	rs2288667	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=280;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CAGTGTTTATCGAAACAGAGT;SOR=0.657;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=23;WE=34904407;WS=34904389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr11	34904509	rs2288668	T	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-1.111;SC=ATTCTATTTTTCCCTCAACAT;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=34904517;WS=34904499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	34905145	rs2303957	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CAGTTAGACATGCTGTTTGTG;SOR=1.136;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=8;WE=34905153;WS=34905135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	34909827	rs35393135	GA	G	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr11	34909833	rs61752923	A	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=8;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AAAGGAAAAAAAAATACCTAT;SOR=0.275;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=10;WE=34909841;WS=34909817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
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chr11	34910077	rs1571134	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ATATGGTTATGGGCTTATTTT;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=34910085;WS=34910067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	34910397	rs1977420	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr11	34910433	rs1977421	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.780;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr11	34912013	rs2303959	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-1.196;SC=GTAATTAAGAAGAAAAGACAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=34912021;WS=34912003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	34912289	rs2915224	T	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CTGGTGGCATTGTAGAATATT;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=8;WE=34912297;WS=34912279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	34916410	.	C	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=-0.878;SC=TTCAGTTACACAAATGTCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=34916418;WS=34916400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	34916484	rs1326940	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TGTTCTTTGGATATAACACAT;SOR=0.142;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=14;WE=34916492;WS=34916474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr11	34918273	rs34774694	G	GCAA	1318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=752;ReadPosRankSum=1.126;SC=GCATAATAAAGCAACAACAAC;SOR=0.776;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=17;WE=34918281;WS=34918263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr11	34918375	rs2986429	A	G	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.338;NF=37;NR=37;PP=1233;ReadPosRankSum=-2.216;SC=GTGACCTTGAACTTCAATTTT;SOR=0.591;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=202;TCF=107;TCR=95;TR=74;WE=34918383;WS=34918365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,81:0.36:224
chr11	34937813	rs2956114	G	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=319;ReadPosRankSum=1.705;SC=TCTCCCTCCCGAGCATCACAG;SOR=0.471;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=28;WE=34937821;WS=34937803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr11	34937884	rs2956113	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=-1.723;SC=CTTTGCGCGCGGCGCTTAGCC;SOR=1.002;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=20;WE=34937892;WS=34937874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr11	34937901	rs2956112	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=-3.453;SC=AGCCTGGGATACGGCAGCGAG;SOR=1.121;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=17;WE=34937909;WS=34937891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr11	34937931	rs2956111	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=7.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=2.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,7:0.14:50
chr11	34938115	rs2956110	C	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=105;ReadPosRankSum=1.181;SC=CCGCTAGCGTCTGGGGGCGTG;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=9;WE=34938123;WS=34938105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr11	34938265	rs2956109	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.653;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=923;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TGGGCTTCCCCGGCCGCCGAA;SOR=0.403;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=31;WE=34938280;WS=34938255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr11	34938272	rs11539201	C	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CCCCGGCCGCCGAAGCGTAGG;SOR=1.234;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=53;WE=34938280;WS=34938255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,62:0.63:98
chr11	34963224	rs2915190	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=1.090;SC=TTGTGAAAGCCTCAGGACTTA;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=34963232;WS=34963214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	34963416	rs2986407	T	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.049;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=309;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GGCCCCCGGGTGGGCCTCTGC;SOR=1.708;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=23;WE=34963424;WS=34963406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr11	34978892	rs2243948	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=797;SC=GCAGTCATGGGGTTTTACTTC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=34978900;WS=34978882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	34982146	rs2732554	T	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.28;SOR=3.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	34982146	.	TTC	GTA	1592	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=29;PP=1592;QD=48.3961139665;SC=AAAGAGCTTATTCAGTCTTAA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=34;WE=34982156;WS=34982136;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,34:0.94:36
chr11	34982148	rs2767036	C	A	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	34991727	rs497582	T	C	4482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=65;PP=2718;SC=TTCGAAGAGTTATTGCCAAGA;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=124;WE=34991735;WS=34991717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	34999484	rs733567	G	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=352;SC=TAATATTATTGATCCAGGACC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=34999492;WS=34999474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	34999745	rs10768108	C	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=317;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TAGCAGACTTCAAATGATTTT;SOR=0.269;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=20;WE=34999753;WS=34999735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr11	35161288	rs12365962	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=588;SC=AAGCCCCACCGGGCTGTGTCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=35161296;WS=35161278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	35198007	rs111607249	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=246;SC=TTGTAGGCATGAGCCACCGCG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=35198015;WS=35197997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	35198032	rs4756195	A	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=397;SC=GCCTTATTTGACTTTTTAAGG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=35198040;WS=35198022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	35198108	rs4756196	A	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=17;PP=1534;SC=TAACATTTCTATTTCTTCCCA;SOR=1.734;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=63;WE=35198116;WS=35198098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	35223158	rs11033025	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=790;SC=AATGGAAGAATAGAATCATTA;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=35223166;WS=35223148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	35226155	rs9666607	A	G	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=72;PP=2965;SC=CAAACACCCAAAGAAGACTCC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=64;TCR=72;TR=136;WE=35226163;WS=35226145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	35229673	rs1467558	T	C	7650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=93;PP=2965;SC=AGTCATAGTATAACGCTTCAG;SOR=1.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=155;TCR=93;TR=248;WE=35229681;WS=35229663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr11	35244044	rs7116739	G	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=585;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CAGTCACCTCGCTAGAACTGA;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=40;WE=35244052;WS=35244034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr11	35302668	rs2236273	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=1.302;SC=CCCCCACCCCATACTCTCCAC;SOR=0.681;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=5;WE=35302676;WS=35302658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	35323200	rs2273689	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=252;ReadPosRankSum=1.792;SC=GACCTGTTGGATGAATCACAT;SOR=1.096;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=20;WE=35323208;WS=35323190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr11	35344345	rs7115450	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AGAACCAGGAAGCAGAGATTT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=17;WE=35344353;WS=35344335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr11	35453796	rs11344760	GC	G	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=548;SC=CCCTGGCACAGCCCAAGTTCA;SOR=2.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=35453804;WS=35453786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	36031593	rs262404	G	A	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=18;PP=1278;SC=GGACTGAAGAGTATAACCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=36031601;WS=36031583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	36057626	rs262451	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=780;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TTGCTGTGCCGTCTGACCTGT;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=169;TCF=108;TCR=61;TR=58;WE=36057634;WS=36057616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,64:0.34:190
chr11	36103228	rs1138807	A	G	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=1813;ReadPosRankSum=-0.214;SC=AATGTGGCCCAACCTTCTTCC;SOR=0.769;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=116;WE=36103236;WS=36103218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,135:0.57:237
chr11	36103381	rs3740962	A	G	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=36;PP=1058;SC=CCGCCAGCCAAACTTGTCCAC;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=36103389;WS=36103371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	36251046	rs4755444	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=518;ReadPosRankSum=1.585;SC=ACCTGTAAGGGTGTCTCAAGT;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=35;WE=36251054;WS=36251036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr11	36422792	rs330261	G	A	5548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=91;PP=2965;SC=ATTCCAAGCAGCTCGGCAGGC;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=74;TCR=92;TR=165;WE=36422800;WS=36422782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	36453506	rs746761	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=-2.260;SC=TGTGACTCAGTCTTTGATGTC;SOR=0.129;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=33;WE=36453514;WS=36453496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr11	36459130	rs4756316	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=352;SC=AACTTGGAGATTGGGCGCTTG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=36459138;WS=36459120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	36472800	rs3740958	A	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=758;ReadPosRankSum=0.673;SC=GTTATTTGCAACTGGAGGAGC;SOR=0.922;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=49;WE=36472808;WS=36472790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr11	36484167	rs11033639	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=598;ReadPosRankSum=0.869;SC=ACCCAGCTTCCCCCCGCCCCA;SOR=0.395;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=36;WE=36484175;WS=36484157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr11	36484208	rs514352	T	C	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=32;PP=963;SC=CCAACATCACTGACAACCCTG;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=36484216;WS=36484198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	36514290	rs2303439	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=319;SC=ACATTGGCAGTTGAATAGGTG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=36514298;WS=36514280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	36518824	rs3830511	T	TA	3202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=55;PP=1928;SC=ATCCTATAATTAAAAAAATAA;SOR=1.380;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=65;WE=36518832;WS=36518814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	36595600	rs3740955	A	G	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=998;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GCCCGTCAGCACAAGAGAAGA;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=62;WE=36595608;WS=36595590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,74:0.51:144
chr11	36597313	rs2227973	A	G	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1626;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GAAGTGTATAAGAATCCCAAT;SOR=0.617;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=79;TCR=108;TR=101;WE=36597321;WS=36597303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,111:0.53:208
chr11	36612090	rs1818545	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TCTTCTAACACGGCTCATTTG;SOR=1.785;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=16;WE=36612098;WS=36612080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr11	36655089	rs3758874	A	G	249.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.8374;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CAGTTATTAGATCTGTAATTC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=36655097;WS=36655079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr11	36669778	rs1566245	C	T	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=46;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AGAAATGCTGCATGCTTCTGT;SOR=0.789;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=41;TCR=85;TR=65;WE=36669786;WS=36669768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,81:0.55:146
chr11	42209105	rs11416548	G	GA	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.6005;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.694;NF=17;NR=4;PP=294;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TACTGAAAGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=21;WE=42209113;WS=42209095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,26:0.84:31
chr11	42262449	rs10837795	G	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=318;SC=CTTTATGAAGGAAAAAAACCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=42262457;WS=42262446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	43343072	rs5743221	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=24;PP=812;SC=TCTTACAGAATCACAAAGTTA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=36;WE=43343080;WS=43343062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	43391648	rs61156323	C	T	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=32;PP=1507;SC=GGAGCCCATGCGTATCTCTCT;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=43391656;WS=43391638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	43419087	.	C	CT	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.9983;HP=19;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=59.97;NF=0;NR=2;PP=24;QD=13.5;SC=TTGCCACTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=43419095;WS=43419077;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr11	43427268	rs61883556	G	A	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=69;PP=2079;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GACTTGAAAAGTTAAGTCTTT;SOR=0.870;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=168;TCF=67;TCR=101;TR=112;WE=43427276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,129:0.65:198
chr11	43472895	rs6485426	G	C	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=55;PP=1876;SC=CTAAGTGTCTGTAACCTCTTC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=79;WE=43472903;WS=43472885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	43702581	rs4573669	G	A	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=706;SC=GCGGCGGCCCGGACCAGGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=43702589;WS=43702571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	43702615	rs4573668	G	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=11;PP=405;SC=TAGTTCTGGGGTCTGCTCCTG;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=43702623;WS=43702605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	43772549	rs12801203	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	43775734	rs4643069	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.677;SC=CAGTTATCCGATACTGACATA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=43775742;WS=43775724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	43776481	rs7115919	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=621;ReadPosRankSum=-0.259;SC=AACTTCTACTCAATCAACCAG;SOR=0.790;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=45;WE=43776489;WS=43776471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr11	43852491	rs6485471	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=-1.552;SC=CCTGCATCCTTGGCCATCATG;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=17;WE=43852499;WS=43852481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	43861748	rs10734518	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=241;ReadPosRankSum=1.508;SC=CATTAAAAACGTGGTTTCTTT;SOR=1.230;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=15;WE=43861756;WS=43861738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr11	43876435	rs3736505	A	G	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1333;ReadPosRankSum=0.609;SC=TTTTTGAATCACAAATCAATA;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=86;WE=43876443;WS=43876425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,106:0.70:151
chr11	43876698	rs11555762	C	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=349;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCCTAGGGCTCGATAATCTCA;SOR=0.889;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=24;WE=43876706;WS=43876674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr11	43905440	rs2271818	C	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=435;ReadPosRankSum=0.492;SC=TAGTTTTTAACTTTATTTTGA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=25;WE=43905448;WS=43905430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr11	43905484	rs2271817	T	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=-1.566;SC=GTCAGTATCCTTGAGGATTAA;SOR=0.606;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=38;WE=43905492;WS=43905474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr11	43908104	rs3740983	T	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=705;ReadPosRankSum=-2.192;SC=CCACTGGGTATAGCATATTGT;SOR=0.772;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=85;TCR=33;TR=43;WE=43908112;WS=43908094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,51:0.37:137
chr11	43911365	rs2434478	T	C	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=46;PP=1508;SC=AACAGAGGACTGGCATCAGAG;SOR=0.878;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=84;WE=43911373;WS=43911355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	43940566	rs7926534	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=353;SC=AAACATTTATTACAACAAATG;SOR=2.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=43940574;WS=43940556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	43940644	rs1048928	G	T	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=25;PP=1255;SC=TGGATCATGGGACCTTGTTAA;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=43940652;WS=43940634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	43946967	rs1973717	A	G	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=30;PP=989;SC=GATCGTCTCCACGCTGCACCA;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=43946975;WS=43946957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	43947990	rs12797684	T	C	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=18;PP=1431;SC=CAGGCCACTTTCAAACTCTGT;SOR=1.581;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=43947998;WS=43947980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	43954812	rs2434476	T	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=634;SC=TACTAGCTGGTGGATGTCCCT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=43954820;WS=43954802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	43964842	rs7077	G	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,81:0.52:155
chr11	44080210	rs2074051	T	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=44;PP=1069;SC=AGGCTGGTTCTGCCTCATCTT;SOR=1.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=66;WE=44080218;WS=44080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	44081555	rs73533657	T	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AAGGCCAGGGTGTCTTTTTGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=44081563;WS=44081545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr11	44096284	.	CTCTT	C	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;QD=36.25;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
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chr11	44104701	rs79395013	C	CCT	2469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GATCTTCTGGCCTCTTTCACC;SOR=0.689;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=36;WE=44104709;WS=44104691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr11	44117898	rs11037860	T	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.001;NF=4;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GGGCATGTTATGCCGGGGACT;SOR=1.101;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=17;WE=44117906;WS=44117888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr11	44146257	rs10769018	A	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=0.156;SC=ACTTACTGTCATAAGTTTAAT;SOR=0.914;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=29;WE=44146265;WS=44146247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr11	44151457	rs7125352	T	C	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=23;PP=2610;SC=GGGAAAGAGATAATACTTACC;SOR=2.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=90;TCR=23;TR=113;WE=44151465;WS=44151447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	44151480	rs11037881	G	T	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=28;PP=1511;ReadPosRankSum=3.109;SC=AAGGGATGTGGGGCTGAAGGA;SOR=0.462;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=160;TCF=117;TCR=43;TR=92;WE=44151488;WS=44151470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,109:0.57:190
chr11	44151577	rs11037882	T	A	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1917;ReadPosRankSum=0.134;SC=ATGTAAACTGTTTTGCTGTTG;SOR=0.689;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=264;TCF=134;TCR=130;TR=116;WE=44151585;WS=44151567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,142:0.46:311
chr11	44255614	rs11037909	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-0.151;SC=ATTTATCAGCTAAAGGGAACT;SOR=1.002;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=44255622;WS=44255604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	44257802	rs3740878	T	C	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=591;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TTATTGTCCTTGACACTGACA;SOR=0.503;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=62;WE=44257810;WS=44257792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,88:0.51:171
chr11	44286566	rs3802805	G	A	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=56;PP=2184;SC=TCTGGCCCACGTGACTGCCAG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=113;WE=44286574;WS=44286556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	44289289	rs10742699	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=493;ReadPosRankSum=0.684;SC=CGTTTGGGAAACGGTGCGGCC;SOR=2.613;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=23;WE=44289297;WS=44289279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr11	44289312	rs10769024	C	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=0.805;SC=ACATAAATATCAACCTTGGTC;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=44289320;WS=44289302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	44296828	rs11037927	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=380;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TCAGGAGACCCCAACTGCAGC;SOR=0.602;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=21;WE=44296836;WS=44296818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr11	44297054	rs10769028	T	C	9225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=147;PP=2965;SC=TGTTGCTCTCTGAGTCGGCCT;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=144;TCR=147;TR=291;WE=44297062;WS=44297044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr11	44297253	rs11037929	A	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=50;PP=1651;SC=GTTGAACCAAACAAGAGAAGG;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=44297261;WS=44297243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	44297343	rs11037930	C	A	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=259;SC=ATGCGAGGTCCGGAGACTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=44297351;WS=44297333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	44331309	rs12421995	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=292;ReadPosRankSum=0.108;SC=GGCTGCGGCGGCGGCTGGGGC;SOR=0.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=19;WE=44331317;WS=44331299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr11	44331509	rs3824915	C	G	2315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1346;ReadPosRankSum=0.018;SC=GGGAAATGCCCTAAAAGGCGA;SOR=0.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=96;TCR=94;TR=95;WE=44331517;WS=44331499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,112:0.51:218
chr11	44585933	rs934178	T	C	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=660;ReadPosRankSum=0.530;SC=CTTACTCCACTCGTACAAAGC;SOR=1.092;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=41;WE=44585941;WS=44585923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr11	44608866	rs7930303	T	C	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1155;SC=GGAAAGAGGCTACATGAGCCT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=44608874;WS=44608856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	44609198	rs7102843	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=652;SC=GCCCTCAGGTGTTCAGTCTGA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=44609206;WS=44609188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	44627168	rs11604994	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.597;SC=CGGCAGGTGTGGGCAGTCCCC;SOR=0.084;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=44627176;WS=44627158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	44636684	rs12788360	G	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=-0.997;SC=CCCTGGGAGCGCCAGGAAAGT;SOR=0.467;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=10;WE=44636692;WS=44636674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr11	44636839	rs883752	C	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=904;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AGGAGATGGGCGGCATCGTGA;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=60;WE=44636847;WS=44636829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr11	44639921	rs2303863	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=435;ReadPosRankSum=-0.495;SC=AGGAGGTGTGCGGGGGGCTGC;SOR=1.258;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=23;WE=44639929;WS=44639911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr11	44640268	rs1139971	A	G	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=50;PP=1774;SC=TGTGGCCATCATCGAGGTCTG;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=99;WE=44640276;WS=44640258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	44640640	rs7107335	C	G	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.361;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1605;ReadPosRankSum=1.352;SC=GCCGGCACGTCCATTCCGAAG;SOR=0.893;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=220;TCF=97;TCR=123;TR=100;WE=44640648;WS=44640630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,121:0.45:266
chr11	44919366	rs11038189	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.177;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=744;ReadPosRankSum=0.797;SC=GCTGATGCCCGAAGAACTGCC;SOR=1.167;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=48;WE=44919374;WS=44919356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,64:0.44:144
chr11	44919413	rs11038190	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=335;ReadPosRankSum=0.688;SC=CCCTTCTCAGTGTACCTCTGC;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=31;WE=44919421;WS=44919403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr11	44925038	rs11038198	A	G	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=42;PP=1859;SC=GTTGGGTTCCAGCAAGAGAGG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=44925046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	44925359	rs11456363	C	CT	4752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=65;PP=2936;SC=GCTGGATTGCCTGGGTTCCAA;SOR=1.068;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=81;WE=44925367;WS=44925349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	44928135	rs2306665	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.990;SC=CACAGGGGCCGGCGCTAGAGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=44928143;WS=44928125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	44940873	rs11038214	G	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.439;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=906;ReadPosRankSum=0.495;SC=AGTGAGTGACGCCCCAGAGAT;SOR=0.590;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=58;WE=44940881;WS=44940863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,76:0.61:125
chr11	44948052	rs835988	G	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CTGCCAAGTCGCTGTTTCTGG;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=44948060;WS=44948043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	44950784	rs835990	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=378;ReadPosRankSum=0.800;SC=CCAGCACCCAGTGTCCTCCCG;SOR=0.895;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=22;WE=44950792;WS=44950774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr11	44968756	rs4755920	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	45204071	rs1078930	A	G	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=554;SC=GGCTATTGTTAGCCCCATTTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=45204079;WS=45204061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	45230443	rs12226640	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=625;ReadPosRankSum=1.681;SC=CACACCTGGCTGAGCGTAAGA;SOR=1.140;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=48;WE=45230451;WS=45230433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,57:0.42:135
chr11	45230862	rs3781705	C	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=755;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TATCACCAGTCCCCCCCGCCA;SOR=0.621;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=45;WE=45230870;WS=45230852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr11	45234877	rs11038356	T	C	5048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=91;PP=2918;SC=TGTCCCGTGGTGGCAGGCCTT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=176;WE=45234885;WS=45234867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	45235433	rs3781704	G	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=391;SC=GGGAAGAGGAGGCAGGGGGCA;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=45235441;WS=45235423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	45672261	rs3802762	A	G	6534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=112;PP=2965;SC=AGGAGGAGCCACTGCGCGTGG;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=196;WE=45672269;WS=45672251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	45832935	rs1139266	G	A	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	45834044	rs4756027	C	T	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=16;PP=1418;SC=GGCTGGGACGCCCAAGATCAA;SOR=1.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=63;WE=45834052;WS=45834034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	45834198	rs7943306	T	C	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.08;SOR=1.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	45834198	.	TTCC	CTCC,CTCT	629	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41,19;NR=61,27;PP=629,593;QD=6.50756090733;SC=TTCATGAGGGTTCCGCCCCCA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=102,46;WE=45834209;WS=45834184;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:102
chr11	45834201	rs55758172	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr11	45868850	rs11394694	C	CG	2647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=37;PP=1933;SC=CGTGAGGGGGCGGGCCTGTTC;SOR=0.995;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=46;WE=45868858;WS=45868840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	45877529	rs2292913	A	G	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=66;PP=2821;SC=TGTGGACTCCACAGGTTCCTA;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=144;WE=45877537;WS=45877519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr11	45877688	rs2292912	C	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=848;SC=CTGTCCCTGACGGTTTCCCCA;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=45877696;WS=45877678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	45883914	rs4755343	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=527;SC=CTCAGCATTTTTGGGTTAAGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=45883922;WS=45883904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	45891418	rs7123390	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=270;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GGTCAGGCCCGTCAAAGGGCA;SOR=0.046;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=45891426;WS=45891408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr11	45891508	rs4755345	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=342;SC=CTTGCCTTCAATGGAAGGGTT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=45891516;WS=45891498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	45926445	rs2271847	T	C	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=138;PP=2965;SC=CCAAGACTTGTGATGAAGAGG;SOR=0.900;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=111;TCR=139;TR=249;WE=45926453;WS=45926435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr11	45935253	rs2271845	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=909;SC=CCGGACAACACACAGTGCTTG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=45935261;WS=45935243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	45935384	rs1132349	A	G	6627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=95;PP=2965;SC=AGAAGCGGTCATAGAAAGGAG;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=105;TCR=95;TR=200;WE=45935392;WS=45935374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	45936035	rs3802758	G	A	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=52;PP=2461;SC=ACACAAGGGCGGCAGATGAGC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=105;WE=45936043;WS=45936025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	45937267	rs10742772	C	T	6901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=96;PP=2965;SC=GCCAGCTGGACGAGGGCGATG;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=199;WE=45937275;WS=45937257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	45937968	rs3215273	CTA	C	481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=466;SC=CACCCACAGACTATGTGGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=10;WE=45937977;WS=45937958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	45944994	rs33927614	G	GC	2523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=14;PP=2314;SC=GAGAAGGGGGGCTGCTGCCGA;SOR=2.406;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=51;WE=45945002;WS=45944984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	45949201	rs884668	C	T	4415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=79;PP=2965;SC=ACGGGGCATGCGTGGGACCCC;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=137;WE=45949209;WS=45949191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	45949534	rs939105	C	T	4515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=54;PP=2965;SC=TGCCGGCATTCGAGACCCTGC;SOR=1.222;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=89;TCR=54;TR=143;WE=45949542;WS=45949524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	45959669	rs10742773	C	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=6;PP=815;SC=GTGTCTTTGTCCTCCTCGGCC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=45959677;WS=45959659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	46105688	rs2932515	G	A	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=43;PP=2337;SC=CTTAACAACAGTGTGGGAGAA;SOR=1.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=46105696;WS=46105678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	46331806	rs10629837	T	TTTTG	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=0.674;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.613;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	46332893	rs4625425	T	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=3.052;SC=ATGGGAGTTCTAATCCTTTTA;SOR=3.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=14;WE=46332901;WS=46332883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr11	46342081	rs67946579	TG	T	1642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=33;PP=1487;SC=CCACGACAGGTGGGGTGTGTG;SOR=1.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=38;WE=46342089;WS=46342071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	46342259	rs79068197	A	AG	5960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=48;PP=2936;SC=TTCTCTCTCCAGGATCTGGGC;SOR=1.132;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=83;WE=46342267;WS=46342238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	46385815	.	C	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=613;ReadPosRankSum=0.444;SC=TCAACTTCCTCATCAGGAATG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=40;WE=46385823;WS=46385805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr11	46387868	rs1317826	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=634;ReadPosRankSum=0.018;SC=GAGGGGCAGCAGCGGCCCAGC;SOR=0.978;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=40;WE=46387876;WS=46387858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr11	46391602	rs12575519	T	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=996;ReadPosRankSum=-2.242;SC=GCACCTGCGGTCCTGAGCCCA;SOR=0.641;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=136;TCF=46;TCR=90;TR=61;WE=46391610;WS=46391592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,62:0.41:151
chr11	46392825	rs10838601	C	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=440;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TGCTGCTCCACGCCTGCCCTG;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=25;WE=46392833;WS=46392815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr11	46393958	rs7936413	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=312;ReadPosRankSum=0.008;SC=GACTGTCTCTTGGCTCCCCAT;SOR=1.136;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=20;WE=46393966;WS=46393948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr11	46396479	rs2046768	T	C	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=662;ReadPosRankSum=0.585;SC=CGCCCGCCTTTGCAGGTACTG;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=58;WE=46396487;WS=46396469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr11	46397323	rs3740974	A	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=-2.440;SC=TCTCTCGGCAAGTGGTTTGGT;SOR=1.347;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=46397331;WS=46397313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	46398916	rs34406563	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=333;ReadPosRankSum=1.187;SC=TTCAGCCCTGTGGTTCTGTGG;SOR=1.121;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=23;WE=46398924;WS=46398906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr11	46399538	rs2279465	T	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=238;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GACTTGTTTGTATCCCTGAAC;SOR=1.140;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=14;WE=46399546;WS=46399528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr11	46404340	rs74916763	GCCCC	G,GC	4001.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=24.544;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.37;MQRankSum=0.626;QD=32.27;ReadPosRankSum=2.900;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,35,82:0.28,0.66:124
chr11	46406767	rs2067482	G	A	4446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=1.216;SC=CAGGGTTGATGGTGCTGTTGA;SOR=1.201;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=346;TCF=227;TCR=119;TR=175;WE=46406775;WS=46406757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,195:0.49:399
chr11	46515902	rs3802888	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-1.860;SC=CTAATTAGGCAGCACATTAAT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=46515910;WS=46515892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	46534546	rs3802890	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=0.584;SC=AAGAGCTGCAAAACTCCCACA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=46534554;WS=46534536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
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chr11	46567475	rs61882746	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.825;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr11	46686260	rs10838610	G	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=552;ReadPosRankSum=0.033;SC=CCCCTATCACGTCAGGCCCCC;SOR=0.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=36;WE=46686268;WS=46686250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr11	46694313	rs67065551	GTC	G	2347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=1445;SC=TTGGTGTGGAGTCGCAGAAAG;SOR=1.077;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=31;WE=46694322;WS=46694303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	46702691	rs4319473	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=820;ReadPosRankSum=1.625;SC=TGGGTTGTGGGGGCCCGCTTC;SOR=0.945;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=52;WE=46702699;WS=46702681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr11	46702920	rs4268467	T	C	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=43;PP=1719;SC=CCTTGATGTTTTTCTTGTACC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=87;WE=46702928;WS=46702910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	46722731	rs4752928	T	C	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=70;PP=2305;SC=TCCTCAGTCTTCTCTCCTCCG;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=44;TCR=70;TR=114;WE=46722739;WS=46722721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	46726184	.	C	A	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=62;PP=1791;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GTTACACAGCCCCAGTGATCA;SOR=0.895;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=106;TCR=128;TR=110;WE=46726192;WS=46726174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,118:0.45:260
chr11	46741908	rs3136433	C	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.331;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	46742249	rs3136434	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=997;ReadPosRankSum=0.002;SC=TCATCCATCTTTCTGTTTCTC;SOR=1.007;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=62;WE=46742257;WS=46742239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr11	46742489	rs3136436	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=483;ReadPosRankSum=-0.111;SC=AGGCCGAGGCAGTCCCCAGCA;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=25;WE=46742497;WS=46742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	46744925	rs2070852	G	C	3753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.312;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=77;PP=2338;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GCAATTTCCTGTTCCAGAATC;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=311;TCF=152;TCR=159;TR=144;WE=46744933;WS=46744915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,173:0.47:371
chr11	46749648	rs5898	G	A	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=859;ReadPosRankSum=1.371;SC=TCCTGTACCCGCCCTGGGACA;SOR=0.773;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=62;WE=46749656;WS=46749638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,66:0.58:113
chr11	46750064	rs3136472	C	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=0.328;SC=GGAAGAAACACCCAGGGGGCT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=46750072;WS=46750059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	46760466	rs3136515	G	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=384;SC=GGATTGGATGGGTAGGGTGAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=46760474;WS=46760456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	46760756	rs3136516	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=698;ReadPosRankSum=0.159;SC=TGCCTGGCAGGGGAATACTGA;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=42;WE=46760764;WS=46760746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr11	46760913	rs3136532	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-0.974;SC=ATGTGTTCCGCCTGAAGAAGT;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=13;WE=46760921;WS=46760903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr11	46776697	rs4237546	A	G	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=174;SC=AAACTTCTCCATAAGAATATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=46776705;WS=46776687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	46781718	rs10466476	A	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=0.110;SC=GAAGAAAGTGAATCAGTATTT;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=46781726;WS=46781708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	46784697	rs7928445	A	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-1.505;SC=GATCCAGGCAACCAATAACTC;SOR=1.410;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=13;WE=46784705;WS=46784687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	46799174	rs11300195	GC	G	1648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=1210;ReadPosRankSum=0.621;SC=TAAATTTGCTGCTATACTGTC;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=32;WE=46799182;WS=46799164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr11	46802094	rs6485691	C	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=323;SC=TACTCAATAACGTTTTATAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=46802102;WS=46802084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	46812227	rs7940578	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.898;SC=GTGTCTCATATTGTTGTCGAG;SOR=1.347;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=46812235;WS=46812217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	46822686	rs10734549	C	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.556;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=551;ReadPosRankSum=0.253;SC=AAGCAAACAGCAAACTAGGCC;SOR=0.404;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=31;WE=46822694;WS=46822676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr11	46837625	rs59649961	AC	A	1288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr11	46837633	rs58152993	AT	A	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.02;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr11	46890165	rs3816614	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=738;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGAGCAGGGCCGGCTATCAGG;SOR=0.643;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=49;WE=46890173;WS=46890155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,56:0.41:135
chr11	46890388	rs2290884	C	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=42;PP=1020;ReadPosRankSum=-1.420;SC=AGGAGAGATACAACCGCGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=111;TCF=27;TCR=84;TR=54;WE=46890396;WS=46890378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr11	46893108	rs2306029	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=587;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GACACATGGCTGACCAAGACC;SOR=0.681;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=57;WE=46893116;WS=46893098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,72:0.45:161
chr11	46897253	rs2306032	G	C	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1065;ReadPosRankSum=0.591;SC=AGGAGAGGGTGGGGGGTGGTG;SOR=0.558;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=85;WE=46897261;WS=46897243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,96:0.48:201
chr11	46897995	rs964551	G	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=646;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ACACTACCCAGTGCGATACAG;SOR=0.339;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=42;WE=46898003;WS=46897985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr11	46898771	rs6485702	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=550;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TCTACTCCAATGGCAATGGTG;SOR=0.465;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=35;WE=46898779;WS=46898761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr11	46907827	rs2306027	C	T	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=992;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GAAGCCCTTCCCTGGAGAGGG;SOR=1.196;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=53;WE=46907835;WS=46907817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr11	46911457	rs2306035	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=376;ReadPosRankSum=-0.049;SC=ACCTCAACCATGAGGCTACTT;SOR=0.758;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=21;WE=46911465;WS=46911447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr11	46911704	rs2306036	C	T	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=31;PP=1085;SC=TCAGTCTGGACGTGGTCTGCC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=46911712;WS=46911694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	46914583	rs10838631	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=7;PP=872;SC=ACAGCAACACTTTCCGGTGGG;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=46914591;WS=46914573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	46914598	rs10769215	A	G	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=10;PP=952;SC=GGTGGGCCCCATCCAGATTGG;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=46914606;WS=46914588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	46917983	rs898604	G	A	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=45;PP=1331;SC=AGACAGATGAGACTCAAGGTG;SOR=1.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=46917991;WS=46917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	46958299	rs17787930	G	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=599;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GGAGAGAGACGGCAACCTGGG;SOR=0.439;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=35;WE=46958307;WS=46958289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr11	46969616	rs2867207	T	C	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=36;PP=1576;SC=GTAAGATATATGAAAGGCCAC;SOR=1.189;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=46969624;WS=46969606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	47009041	.	G	GT	231.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=194;SC=GGTGCAGCTAGTTTGTCCAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=47009049;WS=47009031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	47181040	rs1965952	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.186;NF=11;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=0.845;SC=CAGCCTGTGCGACAGAGCAAG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=47181048;WS=47181034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	47185510	rs4752969	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=177;ReadPosRankSum=-0.932;SC=AATATTTCTTAAACTCCACTG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=47185518;WS=47185508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	47187067	rs7117346	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr11	47188314	rs4752820	T	C	3674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=43;PP=2100;SC=CACTTACCTCTGCATCCACCT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=47188322;WS=47188304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	47188592	rs3740690	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TCTCCCCTGGTGAGGAGTCAC;SOR=0.120;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=47188600;WS=47188582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	47189416	rs60076400	T	TA	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.119;NF=15;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=-1.374;SC=TCAGCTTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.591;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=30;WE=47189424;WS=47189406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	47193367	rs57323109	T	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=-0.044;SC=AACAGAATCATGTAAGGGGCC;SOR=0.121;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=47193375;WS=47193357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	47196982	rs2279439	C	T	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=546;ReadPosRankSum=-1.807;SC=GGATGATACACGCTACTGACA;SOR=0.998;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=32;WE=47196990;WS=47196972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr11	47201924	rs11039119	G	A	3536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=64;PP=2205;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CTGGACCCTGGATGCCACACC;SOR=0.607;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=242;TCF=118;TCR=124;TR=129;WE=47201932;WS=47201914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,158:0.55:288
chr11	47203904	rs10838664	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=399;ReadPosRankSum=0.083;SC=AAGCTGGCCCGACAGTCCTGC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=25;WE=47203912;WS=47203894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr11	47204175	rs2279438	A	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=1.575;SC=GGGCTGTCAGATGGGCTCCTC;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=20;WE=47204183;WS=47204165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr11	47237680	rs2291120	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=1.335;SC=ACTTACTGTTTGTGGGAGTGT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=47237688;WS=47237673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	47238522	rs326212	T	C	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=46;PP=1346;SC=ACCCCAGCACTGTGGCTGTGG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=47238530;WS=47238512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	47238665	rs326211	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=304;SC=AGTGGTTCGCACCTGTAATCC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=47238673;WS=47238655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	47251199	rs830085	G	A	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=14;PP=706;SC=AGAGAAACTCGAATCAACTCT;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=47251207;WS=47251189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	47259668	rs326222	T	C	8927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=164;PP=2965;SC=TCTCCTCATGTTGACACTCTT;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=111;TCR=164;TR=275;WE=47259676;WS=47259658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr11	47261831	rs200729606	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=-0.514;SC=AGAAAGGTCATGTCAGCGTTC;SOR=0.960;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=20;WE=47261839;WS=47261821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,20:0.25:80
chr11	47267408	.	C	CGTGT	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.083;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.676;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	47298201	rs2291119	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=812;ReadPosRankSum=1.529;SC=GAAGTGGAAACCAAGTTGTAA;SOR=0.412;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=66;TCR=13;TR=45;WE=47298209;WS=47298191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr11	47298360	rs326214	G	A	4901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=96;PP=2965;SC=ACCCACTGGAGTATATGTTTC;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=54;TCR=96;TR=150;WE=47298368;WS=47298350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	47303275	rs326217	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=779;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TCTATGGCAATGATGTGGATT;SOR=0.783;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=72;WE=47303283;WS=47303265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,92:0.46:199
chr11	47307332	rs148495681	G	GTCATTA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=95;SC=GGACAGATTAGTCATTATGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=47307340;WS=47307322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	47311572	.	G	A	2308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=39;PP=1529;ReadPosRankSum=0.471;SC=GCAGTCAGAGGACGATGCCCG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=96;WE=47311580;WS=47311562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr11	47331116	rs1017594	T	C	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=60;PP=2264;SC=AGATCGCTTGTTGGCCACACT;SOR=1.125;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=99;WE=47331124;WS=47331106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	47337013	.	GTTTT	G	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.67;MQRankSum=0.792;NF=0;NR=5;PP=114;ReadPosRankSum=0.277;SC=TATCAGATTGGTTTTTTTGTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=47337024;WS=47337003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	47361084	rs2856653	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=-0.505;SC=GTCTCTCCCATGGGGTAGCCA;SOR=0.976;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=13;WE=47361092;WS=47361074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr11	47362431	rs2697926	A	G	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=911;SC=GGCAAAGCTGAAGCTGGGCCC;SOR=3.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=47362439;WS=47362421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	47364762	rs896818	A	G	5093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=99;PP=2965;SC=AGTGCGCCCCATGATAATCCC;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=63;TCR=99;TR=162;WE=47364770;WS=47364752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	47365199	rs2856650	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=287;ReadPosRankSum=0.770;SC=CTCAGCCCCGGCCACCCCACC;SOR=0.907;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=20;WE=47365207;WS=47365189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr11	47370041	rs3729989	T	C	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=53;PP=1219;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CAGCGGTAGCTGCCAGTGAAG;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=74;TCR=105;TR=91;WE=47370049;WS=47370031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,106:0.50:214
chr11	47371484	rs11570050	AG	A	1958.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=1565;SC=CTGCAAAGGCAGGGGCGACAG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=38;WE=47371492;WS=47371474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	47371598	rs3729986	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=453;ReadPosRankSum=0.214;SC=GGCCGCATCACGAAGAGGCCA;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=31;WE=47371606;WS=47371588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr11	47380061	rs10734557	A	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=0.376;SC=ACACCCACTCACACAGCCACT;SOR=0.180;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=14;WE=47380069;WS=47380051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	47380340	rs3740688	G	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.441;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=585;ReadPosRankSum=-1.175;SC=CTGGGTGGGGGCAGGGCACAG;SOR=1.283;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=36;WE=47380348;WS=47380330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr11	47380593	rs3740689	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.283;SC=AGTCAGGAAGGGCCAGCTTAC;SOR=1.165;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=15;WE=47380601;WS=47380583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
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chr11	47431966	rs755555	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=764;ReadPosRankSum=0.080;SC=TCTCCGGTGGCGCCCAGGGCT;SOR=0.523;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=44;WE=47431974;WS=47431956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr11	47432034	rs755554	G	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=1.037;SC=GTCACAGAGTGTCTGAGATGG;SOR=1.519;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=18;WE=47432042;WS=47432024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr11	47436531	rs11039228	G	T	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=29;PP=1393;SC=TGTGGCTACCGCACTGCTGGT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=47436539;WS=47436521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	47437033	rs11602837	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=656;ReadPosRankSum=-2.733;SC=GAGCCTCCCGCCAGACAGGAG;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=37;WE=47437041;WS=47437023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr11	47440758	rs2293579	G	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=871;ReadPosRankSum=-0.836;SC=ACTGGGGACAGGACAGATACC;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=51;WE=47440766;WS=47440748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr11	47443947	rs187473185	G	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=640;ReadPosRankSum=-0.523;SC=AATGGCTGGGGAAACAGGGAG;SOR=0.630;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=36;WE=47443955;WS=47443937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr11	47446292	rs55927797	A	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CAGCTCCTTGAACTCCCCAAG;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=21;WE=47446300;WS=47446282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr11	47447346	rs10838709	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=420;ReadPosRankSum=0.076;SC=TTAGGAAGTACGAGAGGCGAC;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=27;WE=47447354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr11	47460098	rs10769267	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=201;SC=GATCTTGAACCCCGGGGCTCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=47460106;WS=47460088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	47460306	rs7126210	A	G	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=38;PP=1788;SC=TGTGGGAGCAAGGTAGGGCCT;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=85;WE=47460314;WS=47460296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	47462522	rs117944027	T	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=0.851;SC=GCTATGAAACTTCTGCCCTGC;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=15;WE=47462530;WS=47462512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr11	47462837	rs10716680	AG	A	1455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=43;PP=1211;SC=AGCACAGGGTAGGGGGGGCAG;SOR=4.407;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=44;WE=47462845;WS=47462827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	47463483	rs34729771	AG	A	374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=222;SC=CCTGCGAGGGAGGCCAGTGGC;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=47463491;WS=47463473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	47464284	rs34625105	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=711;ReadPosRankSum=0.776;SC=GCTCATGGCCCGGTACTTCAG;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=55;WE=47464292;WS=47464274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,60:0.37:164
chr11	47469439	rs7111873	A	G	7338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=103;PP=2965;SC=TGTTGTGGGCATAGCGCAGGG;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=133;TCR=104;TR=236;WE=47469447;WS=47469429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr11	47504935	rs11607518	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=391;ReadPosRankSum=0.243;SC=CATGCTGCTGGACTTTAATGG;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=26;WE=47504943;WS=47504925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr11	47587413	.	T	C	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1052;ReadPosRankSum=0.657;SC=GTCGGGCCGCTGGGGTCTCCA;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=77;WE=47587421;WS=47587403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,84:0.46:183
chr11	47587452	rs11537751	C	T	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1397;ReadPosRankSum=1.252;SC=CTCTTTGCCTCGGCAGCTGGT;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=100;WE=47587460;WS=47587442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,121:0.52:234
chr11	47587577	rs58926533	TC	T	3594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=71;PP=2737;SC=GGGGGCCCGCTCCCCCTCGCC;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=75;WE=47587585;WS=47587567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	47609867	rs4486587	G	A	6278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=89;NR=104;PP=2965;SC=GGGCCGCTGGGCCCAGGTCTT;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=89;TCR=104;TR=193;WE=47609875;WS=47609857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	47611316	rs10769279	C	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=5;PP=1036;SC=TTCGAGCCTCCGGCCCGGCCT;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=52;WE=47611324;WS=47611306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	47640429	rs1064608	G	C	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=846;ReadPosRankSum=-1.784;SC=TTCCCAAAGGGGACCTTCCGG;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=65;WE=47640437;WS=47640406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,80:0.41:196
chr11	47640661	rs55656834	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=0.159;SC=TTTCTCCTTATTAAGTTCTTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=47640669;WS=47640651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	47648814	.	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=58;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TGAAGTGCAGTGACCTCCTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=47648822;WS=47648804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	47684450	rs6485766	C	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=426;SC=TGTTCACCTGCGCAGAACGAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=47684458;WS=47684440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	47701528	rs12286721	C	A	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=62;PP=1973;SC=TTTTTACCTTCATTTGGTCAG;SOR=1.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=103;WE=47701536;WS=47701518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	47736314	rs4752863	C	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=13;PP=395;SC=TACAAAGCCACAAGAGGACAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=47736322;WS=47736304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	47758449	rs34910028	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.221;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	47772401	rs11039366	C	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=383;SC=AAGGCTTCCACTCCTGTGCTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=47772409;WS=47772391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	47776047	rs7928954	G	A	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=24;PP=1275;SC=AGTAGCTTCAGTAACTAAAAC;SOR=1.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=47776055;WS=47776037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	47786926	rs148666719	A	AAAAAGAAAAG	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-1.631;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	47800628	rs80090905	C	T	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1278;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AGGCACCAAGCGGTTACAAAG;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=76;WE=47800636;WS=47800618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,86:0.57:150
chr11	47813436	rs10742821	C	T	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=31;PP=1970;SC=ACAATAACAACATTACTACTG;SOR=1.510;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=99;WE=47813444;WS=47813426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	47828404	.	C	T	48	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=49.5;NF=3;NR=0;PP=48;QD=27.5904041824;SC=CACACACACACATATATATAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=47828412;WS=47828399;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr11	47834592	rs7110289	G	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=51;PP=1523;SC=CCCGAGCGATGTCCACATCTA;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=47834600;WS=47834582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	47837638	rs7130715	G	A	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=815;SC=AATGGAAAACGTTTCAGTTTA;SOR=3.797;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=47837646;WS=47837628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	47843133	rs7122182	A	C	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=943;SC=CCTGGTCTCGAACTCCTGAGC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=47843141;WS=47843123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	48118199	rs4752806	G	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=755;SC=CAGAGCTGTTGAGGCCCTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=48118207;WS=48118189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	48118347	rs11382316	T	TA	5552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=50;PP=2936;SC=CGAGAGCTGATAAGAACAGAG;SOR=1.065;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=95;WE=48118355;WS=48118337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	48145247	rs2270992	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=285;ReadPosRankSum=-2.172;SC=GCAATGGCACTGCCTCCTGCC;SOR=0.489;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=22;WE=48145255;WS=48145237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr11	48145375	rs1566734	A	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=432;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TATCTTCTACAATCAAATAAG;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=28;WE=48145383;WS=48145365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr11	48146622	rs1503185	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CAGCAGTCCCGAGACACGGAA;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=64;WE=48146630;WS=48146612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr11	48157869	rs2270994	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=604;ReadPosRankSum=0.992;SC=TAGGATGCCCTTCTAAGGAAC;SOR=0.922;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=37;WE=48157877;WS=48157859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr11	48166267	rs4752904	G	C	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=42;PP=1242;ReadPosRankSum=0.993;SC=ACACGTATGAGGATTTCAAAA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=137;TCR=99;TR=99;WE=48166275;WS=48166257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,113:0.43:264
chr11	48170870	rs4752908	T	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=34;PP=2165;SC=TGGTGTCAGCTGTGAACTAAT;SOR=1.572;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=108;WE=48170878;WS=48170860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	48171793	rs10734565	T	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=70;PP=1976;SC=AGCTGGGATCTGAGGGGAGTT;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=48171801;WS=48171783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	48184971	rs3830431	CCTTT	C	2998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.312;NF=23;NR=26;PP=2205;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGTTAGGCAGCCTTTCTGTCT;SOR=0.409;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=49;WE=48184991;WS=48184961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,80:0.49:163
chr11	48184983	rs2270990	G	T	6245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=48;PP=2962;SC=TTTCTGTCTGGATCTAAATCA;SOR=1.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=115;TCR=48;TR=163;WE=48184991;WS=48184961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	48238302	rs1566737	G	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TTAGCGTTATGATTGCATGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=48238310;WS=48238292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	48238421	rs10769329	T	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=23;PP=1164;SC=AGGATCCAGCTGTGCAGAGTG;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=48238429;WS=48238411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	48238549	rs11606506	G	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.513;SC=TTCCTTAGCTGCCTGTCCTTG;SOR=0.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=75;WE=48238557;WS=48238539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,84:0.49:171
chr11	48239182	rs7130086	C	A	3712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.03;MQRankSum=-1.037;NF=68;NR=72;PP=2352;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GTATTCTACACGGTCATCACC;SOR=0.669;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=272;TCF=136;TCR=136;TR=140;WE=48239198;WS=48239172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,172:0.52:330
chr11	48266582	rs7120549	A	C	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=26;PP=1680;SC=GTGAAGAAGTATTTTGTATCA;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=48266590;WS=48266572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	48267117	.	C	G	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=1073;ReadPosRankSum=1.614;SC=AAATCCTTCTCATCTTCCACC;SOR=0.450;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=59;WE=48267125;WS=48267107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
chr11	48267589	rs1503180	A	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=1006;SC=TTGTATTGATACTTGGGTTTA;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=48267597;WS=48267579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	48285301	rs713325	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GAACAAACTCAAGAGGGAGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=10;WE=48285309;WS=48285291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	48285842	rs1503193	A	G	7819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=120;PP=2965;SC=TCTCCTCGTGAGGATAGCATG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=118;TCR=121;TR=237;WE=48285864;WS=48285832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr11	48285856	rs10838850	C	T	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.348;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TAGCATGGGGCGGGGGCCTGC;SOR=0.688;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=110;WE=48285864;WS=48285832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,126:0.46:276
chr11	48285981	rs76884411	CCTT	C	4305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.981;NF=16;NR=50;PP=2708;ReadPosRankSum=2.259;SC=TGCGCAGACACCTTCTTCATT;SOR=0.664;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=179;TCF=49;TCR=130;TR=66;WE=48285991;WS=48285971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,116:0.44:266
chr11	48286231	rs10838851	T	A	2547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=58;PP=1559;ReadPosRankSum=1.757;SC=CTGTATTTTATACAGTGGTCA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=178;TCF=77;TCR=101;TR=98;WE=48286239;WS=48286221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,116:0.55:210
chr11	48286256	rs10838852	C	T	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1499;ReadPosRankSum=-1.077;SC=TCTCTTAAACCCTGTGATTTA;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=60;TCR=93;TR=86;WE=48286264;WS=48286246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,100:0.55:181
chr11	48328644	rs753095	C	T	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=61;PP=1712;ReadPosRankSum=0.720;SC=TAAGGAACAACGATGTGAAAA;SOR=0.867;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=233;TCF=113;TCR=120;TR=111;WE=48328652;WS=48328634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,132:0.48:276
chr11	48346450	rs79776366	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.128;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr11	48346458	rs77295176	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.797;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr11	48346487	rs33950768	TC	T	860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.206;HP=5;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=667;ReadPosRankSum=0.504;SC=GCAATGTTTTTCCCCCATGCA;SOR=2.940;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=24;WE=48346495;WS=48346477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr11	48346513	rs78206553	T	C	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=13.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,42:0.30:138
chr11	48346523	rs72911451	C	T	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=9.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=1.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,48:0.30:159
chr11	48346535	rs76964780	G	C	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=5.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,66:0.33:202
chr11	48346541	rs75498992	A	T	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=5.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=3.163;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=1.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,76:0.34:225
chr11	48346547	rs79042268	C	T	2860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=3.213;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.037;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,80:0.33:242
chr11	48346551	rs77470587	C	A	2818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=3.324;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,82:0.32:260
chr11	48346579	rs72911452	C	A	4075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=2.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=3.198;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,113:0.33:341
chr11	48346588	rs75900655	A	C	4659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=0.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=3.092;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,124:0.35:358
chr11	48346604	rs75647397	T	G	5101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=97;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.058;NF=69;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.173;SC=CACAGAATTTTTCATGCTGGG;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=178;TCR=146;TR=125;WE=48346623;WS=48346594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,138:0.35:393
chr11	48346615	rs73463988	G	A	5204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.948;NF=74;NR=62;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TCATGCTGGGGCTCTCACAGA;SOR=0.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=342;TCF=186;TCR=156;TR=136;WE=48346623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,149:0.37:405
chr11	48346660	rs138704181	TTTGCTGATC	T	5049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.501;NF=28;NR=59;PP=2971;ReadPosRankSum=0.870;SC=TTGTGGTCTTTTTGCTGATCT;SOR=0.628;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=237;TCF=60;TCR=177;TR=87;WE=48346689;WS=48346650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,140:0.37:381
chr11	48346681	rs78490540	G	A	4952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=1.764;NF=62;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=1.407;SC=ATGTGGTCACGGTTTGTGGCA;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=319;TCF=141;TCR=178;TR=134;WE=48346689;WS=48346650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,138:0.39:351
chr11	48346729	rs73463990	G	C	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.07;MQRankSum=1.560;NF=61;NR=60;PP=2240;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CCAGCCCCACGCTGGCTTCCC;SOR=0.720;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=259;TCF=129;TCR=130;TR=121;WE=48346737;WS=48346719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,132:0.45:291
chr11	48346791	rs73463994	C	T	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.383;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.570;NF=62;NR=63;PP=1942;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TTTTATTCTTCTTCTATGGCT;SOR=0.620;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=280;TCF=147;TCR=133;TR=125;WE=48346799;WS=48346781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,140:0.45:311
chr11	48346822	rs73463997	A	C	3508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=68;PP=2312;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TTGCTGACTCATTGTATGAGG;SOR=0.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=321;TCF=167;TCR=154;TR=143;WE=48346830;WS=48346812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,167:0.45:370
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chr11	48346932	rs80285195	G	A	5334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,136:0.45:305
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chr11	48347014	rs72473368	G	A	5531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,140:0.43:326
chr11	48347023	rs67077733	C	T	5147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=5.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,138:0.42:327
chr11	48347067	rs73464001	C	T	2890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=64;PP=1982;ReadPosRankSum=0.870;SC=CTTTGGTTGCCCTTCTGTGGG;SOR=0.709;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=309;TCF=158;TCR=151;TR=126;WE=48347075;WS=48347057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,138:0.40:349
chr11	48347100	rs73465905	C	T	5311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=73;PP=1879;ReadPosRankSum=-0.764;SC=AATCACTTTGCCTGTGACTTG;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=305;TCF=135;TCR=170;TR=127;WE=48347108;WS=48347090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,137:0.40:339
chr11	48347124	rs79019124	A	G	4513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,119:0.39:307
chr11	48347130	rs77395846	C	G	4525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,116:0.39:300
chr11	48347140	rs10838874	T	C	6608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.67;ReadPosRankSum=1.708;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,197:0.65:305
chr11	48347142	rs79891698	C	T	4286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.941;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,115:0.38:301
chr11	48347144	rs79124801	T	C	4253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=1.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,114:0.38:299
chr11	48347267	rs73465910	T	C	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=57;PP=1506;ReadPosRankSum=0.467;SC=AGATGGGAGATGCAAAGCCCT;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=136;TCR=123;TR=125;WE=48347275;WS=48347257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,142:0.48:298
chr11	48347306	rs73465911	G	T	2883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.236;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=66;PP=1885;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CTTCATTGTTGTTGCCTTGTT;SOR=0.967;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=265;TCF=122;TCR=143;TR=116;WE=48347321;WS=48347296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,135:0.44:304
chr11	48347342	rs76958755	G	A	4087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.687;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,112:0.43:263
chr11	48347346	rs74590631	A	T	3903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,105:0.41:256
chr11	48347358	rs76274696	C	T	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,97:0.40:244
chr11	48347363	rs77814753	C	T	3474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,94:0.40:233
chr11	48347392	rs79127479	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=943;ReadPosRankSum=0.242;SC=CATTATTTTATGGTATTCTGA;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=72;WE=48347400;WS=48347382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,80:0.42:192
chr11	48347419	rs73465913	A	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=881;ReadPosRankSum=0.790;SC=TGTTGAATCCACTCATTTATA;SOR=0.447;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=57;WE=48347427;WS=48347409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr11	48347492	rs79775762	G	A	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr11	48347498	rs78309417	A	T	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr11	48347539	rs79172951	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=402;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CTTTATTTTTGTAAGTGAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=25;WE=48347547;WS=48347529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr11	48347563	.	CT	C	206	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=27;MQ=59.28;NF=0;NR=11;PP=206;QD=20.6363636364;SC=CCAAGCCTTACTTTTTTTGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=11;WE=48347571;WS=48347553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,11:0.35:31
chr11	48347583	.	G	A	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=58.88;NF=0;NR=7;PP=89;QD=17.6816017925;SC=ATCATGTATAGTTGTATTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=48347591;WS=48347573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,7:0.32:22
chr11	48349128	rs76530627	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.957;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	48349128	.	GTA	ATG	402	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=402;QD=65.066839266;SC=TGTCTTTAAAGTAAAAGTAAA;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=48349138;WS=48349118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,7:0.44:16
chr11	48349130	rs75661263	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=2.101;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	48349152	rs73465924	A	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=260;ReadPosRankSum=-0.233;SC=ATTTTAGATTACAAGTATAAG;SOR=0.741;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=12;WE=48349160;WS=48349142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
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chr11	48349209	rs73465927	A	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=346;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TATTTCACTTAGCATAATGTC;SOR=1.582;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=21;WE=48349217;WS=48349199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr11	48349230	rs74884553	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.53;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
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chr11	48349252	rs76041098	G	A	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=497;ReadPosRankSum=0.191;SC=GCAAATGACAGAACTTCTTTC;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=38;WE=48349260;WS=48349242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr11	48349312	rs79572913	A	G	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,47:0.40:117
chr11	48349316	rs76607933	T	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr11	48349320	rs77184441	A	T	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
chr11	48349329	rs76765071	C	A	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr11	48349377	rs72911466	A	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=1219;ReadPosRankSum=-1.162;SC=AAGTTCTTAAAGCAGTTTCTG;SOR=0.705;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=16;WE=48349415;WS=48349367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr11	48349389	rs79223613	A	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr11	48349391	rs76599777	TG	CA	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.440;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr11	48349394	rs78755709	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.367;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr11	48349407	rs72911467	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=4;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=664;ReadPosRankSum=1.853;SC=GAACTCCCAATATGCTTATTT;SOR=0.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=48349415;WS=48349367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr11	48349425	rs79941850	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=0.131;SC=TTTGATATTATCATGTCTACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=48349433;WS=48349415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	48349903	rs11039681	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GCAGGAGACCGGGGCATATTT;SOR=0.877;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=10;WE=48349911;WS=48349893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	48366895	rs72473369	A	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=307;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TTTGTGTCACAAGACTTATTT;SOR=1.289;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=19;WE=48366903;WS=48366885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr11	48366958	rs76319939	T	G	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=20;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ATTTTTCACTTCTTTATTTTT;SOR=0.945;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=179;TCF=126;TCR=53;TR=73;WE=48366980;WS=48366948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,78:0.39:198
chr11	48366971	rs75689989	GG	CA	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=2944;ReadPosRankSum=1.243;SC=TTATTTTTGAGGGTGTAGATT;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=192;TCF=127;TCR=65;TR=71;WE=48366980;WS=48366948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,81:0.38:215
chr11	48367050	rs113897236	T	TAG	7139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=68;PP=2927;ReadPosRankSum=0.323;SC=GGAAGGAGGTTAGGTCTTAGA;SOR=0.957;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=259;TCF=94;TCR=165;TR=116;WE=48367058;WS=48367040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,186:0.44:418
chr11	48367073	rs7941588	A	C	16601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=206;NR=171;PP=2965;SC=CAGGTATGAAAAAGGGACAAA;SOR=0.871;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=378;TCF=207;TCR=171;TR=377;WE=48367081;WS=48367063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,449:1.00:449
chr11	48367097	rs73453179	A	G	4946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.439;SC=TAAGATGACAATGAAGATATG;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=419;TCF=220;TCR=199;TR=196;WE=48367105;WS=48367087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,229:0.46:495
chr11	48367133	rs79453749	C	A	7295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,195:0.44:447
chr11	48367136	rs78927905	C	T	7370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:251,189:0.43:440
chr11	48367155	rs75315666	T	A	6375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=3.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,167:0.41:403
chr11	48367159	rs75667244	C	T	6123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=5.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,158:0.40:392
chr11	48367163	rs74650698	A	G	5796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,153:0.39:388
chr11	48367170	rs77876442	G	A	5796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=6.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,152:0.39:389
chr11	48367190	rs78661795	A	T	5398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=10.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,140:0.38:373
chr11	48367195	rs79063955	C	T	4993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=9.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,133:0.36:368
chr11	48367249	rs74815769	C	T	4206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.481;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,116:0.36:324
chr11	48367252	rs76287086	G	A	4184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,116:0.36:322
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chr11	48367387	rs78788561	C	T	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=67;PP=1872;ReadPosRankSum=-0.497;SC=ATCCCAGAATCCCAGCCACCA;SOR=0.634;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=94;TCR=148;TR=105;WE=48367395;WS=48367368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,118:0.43:273
chr11	48367419	rs77576379	G	A	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,71:0.34:211
chr11	48367424	rs77976451	C	G	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,69:0.34:203
chr11	48367455	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=48;MMLQ=27;MQ=59.66;NF=7;NR=39;PP=2962;QD=20;SC=AAGGGCTTACGGATGGCCACA;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=132;TCF=36;TCR=96;TR=46;WE=48367482;WS=48367445;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:86,46:0.35:132
chr11	48367469	rs79686513	TG	CA	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=-4.271;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,20:0.21:94
chr11	48367474	rs75116918	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.593;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,11:0.13:82
chr11	48367499	.	A	G	1276	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=89;MMLQ=27;MQ=59.3;NF=1;NR=18;PP=1276;QD=68.9879585551;SC=TAATAAGATGATCTCAGCTGC;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=19;WE=48367519;WS=48367489;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr11	48367511	.	T	G	1276	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=89;MMLQ=24;MQ=59.16;NF=1;NR=13;PP=1276;QD=93.6265151819;SC=CTCAGCTGCCTCAAAGAAATG;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=14;WE=48367519;WS=48367489;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr11	48373632	rs4882248	T	A	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=85;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=108;SC=TATAAGTATGTAACAAACCTG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=48373640;WS=48373622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	48373748	rs73453188	C	G	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.361;HP=6;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=11;PP=1141;ReadPosRankSum=0.797;SC=ATATGGTGTTCTTTTCAGAGA;SOR=0.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=156;TCF=117;TCR=39;TR=55;WE=48373756;WS=48373738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,81:0.40:202
chr11	48373770	rs73453191	T	A	3234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=69;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=19;PP=1390;ReadPosRankSum=-1.717;SC=CAAGTCAAAGTTCATTTTAGG;SOR=0.396;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=189;TCF=133;TCR=56;TR=70;WE=48373778;WS=48373760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,95:0.40:235
chr11	48373797	rs72896825	C	T	4205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=2.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,114:0.39:290
chr11	48373805	rs75618010	G	A	4462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.492;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,119:0.41:293
chr11	48373815	rs74350365	A	G	4570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,119:0.39:303
chr11	48373817	rs75951679	C	T	4645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=0.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,121:0.40:306
chr11	48373820	rs3898634	A	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.37;ReadPosRankSum=1.928;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,48:0.15:312
chr11	48373827	rs80081241	G	A	3531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,128:0.40:317
chr11	48373833	rs75965588	GA	AG	5043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=3.706;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,136:0.42:326
chr11	48373885	rs76292854	A	G	5525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=2073;ReadPosRankSum=-0.575;SC=ACTGAGATGAACAGGTTACCT;SOR=0.643;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=296;TCF=144;TCR=152;TR=128;WE=48373893;WS=48373875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,149:0.42:351
chr11	48373900	rs77877396	A	G	5558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=67;PP=2090;ReadPosRankSum=-1.438;SC=TTACCTGCCAATGTGATCAAG;SOR=0.589;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=293;TCF=139;TCR=154;TR=132;WE=48373908;WS=48373890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,152:0.45:341
chr11	48373936	rs76304554	A	G	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=74;PP=1284;ReadPosRankSum=0.982;SC=ATAACAAACAAGAATTTCTGC;SOR=0.785;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=263;TCF=106;TCR=157;TR=122;WE=48373954;WS=48373926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,133:0.46:290
chr11	48373946	rs12797020	C	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,67:0.25:268
chr11	48373976	rs80225178	T	G	3406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr11	48373986	rs12420054	A	G	3335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.450;SOR=1.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,85:0.47:182
chr11	48374000	rs112772888	C	CT	1397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr11	48374031	rs72896827	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=10.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=2.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr11	48374041	rs72896828	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr11	48386956	.	C	CA	345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=0.182;SC=CTTAAACTCACTATTCTGACC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=11;WE=48386964;WS=48386954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr11	48387019	rs71220563	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=512;ReadPosRankSum=1.134;SC=ATATGAGTAGGTTCTGTGTTT;SOR=1.064;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=79;TCR=20;TR=31;WE=48387027;WS=48387009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr11	48387098	rs77594589	A	C	4820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.983;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,129:0.43:298
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chr11	48387115	rs75003399	G	A	5023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=4.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.239;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,128:0.42:308
chr11	48387118	rs79339252	G	A	4884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=4.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.406;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,129:0.42:304
chr11	48387154	rs72473370	A	G	3763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=5.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,109:0.39:281
chr11	48387155	rs10839483	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.56;ReadPosRankSum=2.110;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,38:0.14:277
chr11	48387164	rs72473371	G	A	3582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=2.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,96:0.35:271
chr11	48387186	rs1994140	A	G	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1445;ReadPosRankSum=-1.082;SC=TCAATAGGGAAGGTGATCATG;SOR=0.514;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=230;TCF=106;TCR=124;TR=99;WE=48387194;WS=48387176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,115:0.47:247
chr11	48387201	rs77053100	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,44:0.21:208
chr11	48387206	rs76817095	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,36:0.18:195
chr11	48387210	rs78428763	CC	TG	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=10.609;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-2.416;SOR=1.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,34:0.18:187
chr11	48387254	rs75441735	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=7.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=-2.030;SOR=1.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,22:0.12:188
chr11	48387258	rs78030134	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=9.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=1.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,24:0.13:188
chr11	48387262	rs75430864	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=1.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,25:0.13:190
chr11	48387278	.	C	CACT	452.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.616;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=24.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.573;SOR=2.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,26:0.12:208
chr11	48387279	.	G	GTCCTT	398.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.062;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=28.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.271;SOR=2.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,25:0.12:216
chr11	48387284	.	G	GATGTGAGTCTTTAGTA	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.995;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=29.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.340;SOR=3.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,26:0.12:215
chr11	48387301	rs76220342	G	A	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=694;ReadPosRankSum=0.364;SC=GGATTAGGACGTAAGAGGTAA;SOR=1.738;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=59;WE=48387309;WS=48387291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,49:0.22:222
chr11	48387335	rs73460769	C	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1551;ReadPosRankSum=-3.394;SC=AATGAGCATACACATCAGCCC;SOR=0.969;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=240;TCF=132;TCR=108;TR=89;WE=48387343;WS=48387325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,71:0.28:257
chr11	48387370	rs73460772	A	G	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=51;PP=1629;ReadPosRankSum=1.045;SC=CAAAGAGTCCAAAGACGTGAG;SOR=0.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=150;TCR=125;TR=111;WE=48387378;WS=48387360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,140:0.43:327
chr11	48387424	rs61917478	G	T	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=1839;ReadPosRankSum=0.945;SC=GGTCACAGATGAAATGGTCAA;SOR=0.511;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=317;TCF=173;TCR=144;TR=128;WE=48387432;WS=48387414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,159:0.42:375
chr11	48387490	rs77144540	G	A	4278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;ReadPosRankSum=-0.462;SC=GAATCAGAGCGTGAAGAAATC;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=310;TCF=161;TCR=149;TR=102;WE=48387498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,138:0.37:378
chr11	48387506	rs72898882	A	G	3909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1411;ReadPosRankSum=0.549;SC=AAATCCCCCGACCCATGCCAT;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=282;TCF=152;TCR=130;TR=86;WE=48387514;WS=48387496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,114:0.34:334
chr11	48387526	rs78378263	G	T	4537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.349;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,122:0.35:346
chr11	48387535	rs72898883	T	C	4917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.308;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=1.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,131:0.37:357
chr11	48387540	rs72898885	G	T	4716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.286;QD=13.29;ReadPosRankSum=-2.135;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,133:0.37:355
chr11	48387580	rs78299098	G	T	5106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=3.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,134:0.36:369
chr11	48387582	rs75027745	C	T	5271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=6.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,138:0.37:375
chr11	48387584	rs75821991	A	T	5289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=6.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,141:0.37:378
chr11	48387591	rs75297075	A	G	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=5.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.408;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,143:0.36:392
chr11	48387604	rs72898886	C	T	5326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=0.948;SC=CATAGGCCATCACCACGAGCA;SOR=0.862;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=342;TCF=176;TCR=166;TR=129;WE=48387612;WS=48387570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,153:0.38:401
chr11	48387630	rs73460777	C	T	5557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=4;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=74;PP=2547;ReadPosRankSum=-0.323;SC=ATCTCAACTCCCCCAAAGAAA;SOR=0.772;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=385;TCF=192;TCR=193;TR=154;WE=48387638;WS=48387620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:270,178:0.40:448
chr11	48387647	rs75615667	A	G	6072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GAAATGTTCTACAAAGAGCTG;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=395;TCF=200;TCR=195;TR=174;WE=48387655;WS=48387637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,187:0.42:448
chr11	48387668	rs10769651	C	G	3748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.929;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,149:0.35:426
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chr11	48387683	rs67755516	GT	G	6853.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=78;PP=2968;ReadPosRankSum=3.157;SC=GAAGGAAATAGTTTTCTTTTC;SOR=0.725;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=305;TCF=101;TCR=204;TR=119;WE=48387697;WS=48387658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:275,185:0.40:460
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chr11	48387825	rs75650204	T	G	6538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.096;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,180:0.39:466
chr11	48387833	rs79515387	T	C	6857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:283,181:0.39:464
chr11	48387850	rs73460781	G	T	6020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=90;PP=2359;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TGGTGAGAAAGTAGATGAGTG;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=416;TCF=196;TCR=220;TR=163;WE=48387858;WS=48387840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,181:0.39:469
chr11	48387890	rs74623688	T	C	5310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,149:0.35:422
chr11	48387894	rs75065468	C	T	5229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:262,143:0.35:405
chr11	48387900	rs74338058	G	A	4920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.414;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,131:0.33:394
chr11	48387917	rs66829866	AT	A	4370.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.921;NF=9;NR=61;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.499;SC=GCCAAGCAAGATGAATTCCGT;SOR=0.755;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=207;TCF=29;TCR=178;TR=70;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,118:0.35:334
chr11	48387919	rs114441034	G	A	4297.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.929;NF=35;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.008;SC=CAAGCAAGATGAATTCCGTTA;SOR=0.780;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=282;TCF=100;TCR=182;TR=96;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,117:0.35:333
chr11	48387930	rs75939575	T	C	3861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.179;NF=34;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AATTCCGTTATGTTGTTCACT;SOR=0.784;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=266;TCF=90;TCR=176;TR=97;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,101:0.33:302
chr11	48387945	rs139770813	C	CCA	3046.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.239;NF=6;NR=50;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.486;SC=TTCACTTGCTCGAAATCCAGT;SOR=0.861;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=164;TCF=15;TCR=149;TR=56;WE=48387968;WS=48387935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,82:0.34:242
chr11	48387946	rs114053360	G	T	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=4.361;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,78:0.33:239
chr11	48387960	rs79688019	T	C	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.439;NF=21;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TCCAGTTTGGTATTTGGATAA;SOR=0.928;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=60;TCR=140;TR=72;WE=48387968;WS=48387935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,68:0.32:211
chr11	48387978	rs78160589	T	A	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=4.179;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,55:0.35:156
chr11	48387983	rs75819836	T	C	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQRankSum=4.324;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,50:0.34:148
chr11	48388047	rs75982328	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.29;MQRankSum=3.415;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr11	48388047	.	TTA	CTG	832	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=27;MQ=61.21;NF=2;NR=14;PP=832;QD=55.3417421789;SC=TTGGTCAGGATTATTTTCTGT;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=16;WE=48388057;WS=48388037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,16:0.33:48
chr11	48388049	rs77697332	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=2.535;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.995;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr11	48388067	rs73460782	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=0.049;SC=TAACACTGATGGAATCCCTAA;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=10;WE=48388075;WS=48388057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr11	48388094	.	C	CTT	566	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=55;MMLQ=27;MQ=59.76;NF=1;NR=3;PP=566;QD=152.25;SC=AAACCCAAGACTAAGTTGAGC;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=4;WE=48388123;WS=48388084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	48388487	rs78414756	C	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=0.283;SC=GGTGAGTTCACTTTGAAATTA;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=48388495;WS=48388477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	48388524	rs76789954	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.000;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.234;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr11	48388524	.	CAA	TAG	989	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=105;MMLQ=28;MQ=59.79;NF=17;NR=0;PP=989;QD=61.3216396978;SC=ATTTCAGAATCAACTGAACTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=17;WE=48388534;WS=48388514;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr11	48388526	rs77473022	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.223;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr11	48388542	rs77282201	G	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=19.01;ReadPosRankSum=0.007;SOR=2.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
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chr11	48388553	rs80082776	C	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.362;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
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chr11	48388583	rs77992774	A	T	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.189;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
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chr11	48388612	rs76366705	T	C	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,78:0.44:176
chr11	48388614	rs146852809	T	C	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr11	48388621	rs75849499	ACA	GTC	3434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr11	48388641	rs80267937	G	A	4339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=2;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1496;ReadPosRankSum=-0.156;SC=ACTTCTGGAAGCATATCCTGG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=127;TCR=90;TR=100;WE=48388649;WS=48388631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,108:0.44:243
chr11	48388657	rs80000751	G	A	4993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CCTGGAAGAGGATAAAACAGC;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=245;TCF=141;TCR=104;TR=111;WE=48388665;WS=48388647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,125:0.44:281
chr11	48388681	rs76712816	G	A	5320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.358;SC=ATGCAAGGCAGCATTCCCCAG;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=128;TCR=127;TR=111;WE=48388689;WS=48388671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,136:0.44:308
chr11	48388698	rs77483743	C	T	5223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1860;ReadPosRankSum=0.031;SC=CCAGATGTATCTGAAACTTTA;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=246;TCF=116;TCR=130;TR=106;WE=48388706;WS=48388688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,133:0.44:302
chr11	48388717	rs78132200	T	C	4791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=1862;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TAGAATTCACTTGGAGAACTG;SOR=0.847;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=232;TCF=103;TCR=129;TR=104;WE=48388725;WS=48388707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,131:0.45:288
chr11	48388782	rs76039310	A	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.030;NF=10;NR=42;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.699;SC=AAGGATGACTATGAAAAATTA;SOR=0.731;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=23;TCR=89;TR=52;WE=48388790;WS=48388772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr11	48388833	rs73460789	A	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.980;NF=1;NR=23;PP=511;ReadPosRankSum=0.073;SC=GGTGAGGGAAAAAAAGCACCA;SOR=0.836;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=24;WE=48388841;WS=48388823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr11	48453678	rs600750	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=444;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TTGTTCTTGCGATAGTTTGCT;SOR=0.276;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=23;WE=48453686;WS=48453668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr11	48453787	rs4882063	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.976;NF=32;NR=30;PP=869;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TACCTGAAATGTCCTTTCTAC;SOR=0.726;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=62;WE=48453795;WS=48453777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,80:0.42:191
chr11	48510654	rs7103557	A	C	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.911;NF=64;NR=59;PP=2263;ReadPosRankSum=0.362;SC=TATCGAGCACATTTTCGGTGG;SOR=0.689;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=227;TCF=112;TCR=115;TR=123;WE=48510662;WS=48510644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,134:0.52:257
chr11	48510777	rs7103992	G	A	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.274;NF=29;NR=48;PP=1364;ReadPosRankSum=1.967;SC=GCTGCTGGTAGTGTCCTGGGT;SOR=1.192;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=77;WE=48510785;WS=48510767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,86:0.56:154
chr11	48511050	rs76991989	T	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.573;NF=12;NR=25;PP=577;ReadPosRankSum=1.060;SC=AAAAGCCCTCTCAACCTGCAG;SOR=0.820;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=119;TCF=43;TCR=76;TR=37;WE=48511058;WS=48511040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,42:0.31:137
chr11	48997107	rs2047941	G	A	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1114;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGCAATTAGGGATGGTGTATA;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=77;WE=48997115;WS=48997097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr11	48997334	rs1987879	T	G	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=1580;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CAATAATTGTTACAGACACCA;SOR=0.824;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=88;WE=48997342;WS=48997324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr11	48997592	rs1813231	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=806;SC=ATGTAATTAACAGAAATTAGA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=48997600;WS=48997582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	48999833	rs12576844	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTCCTGGAAAGCATTTTCTGT;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=21;WE=48999841;WS=48999823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr11	49000423	rs1965370	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.967;NF=13;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=0.482;SC=TCAGTCCGTACCTGGAATAGC;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=14;WE=49000431;WS=49000414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	49000503	rs139591465	T	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.804;NF=20;NR=14;PP=378;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CCTGGAATGTTCCATTCTGGC;SOR=0.739;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=34;WE=49000511;WS=49000493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr11	49000522	rs1963629	C	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.776;NF=39;NR=31;PP=1048;ReadPosRankSum=1.578;SC=GCTTTGCTTTCATTGAGTTGC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=70;WE=49000530;WS=49000512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr11	49000558	rs11040198	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.643;NF=26;NR=30;PP=722;ReadPosRankSum=1.058;SC=CCCTCCTTTTGCAGCCTCTCC;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=56;WE=49000566;WS=49000548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,73:0.42:172
chr11	49002343	rs9783302	T	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.316;NF=17;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CAAGTGTTTTTTCCTTGTTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=17;WE=49002351;WS=49002333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	49056627	rs144534447	CT	C	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=-1.477;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.113;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
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chr11	49075605	rs2851535	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=571;ReadPosRankSum=-0.327;SC=AATGCTTGCCGGAGGTGAATG;SOR=0.666;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=40;WE=49075613;WS=49075595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr11	49076963	rs34650085	C	CAA	1005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.821;NF=13;NR=15;PP=444;ReadPosRankSum=-1.665;SC=ATCAGTTCTGCAAAAAAAAAA;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=28;WE=49076971;WS=49076953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
chr11	49077012	rs2773242	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.622;NF=8;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=0.979;SC=GCTAATCACACAGTCATATGA;SOR=2.038;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=32;WE=49077020;WS=49077002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr11	49077889	rs36015501	AT	A	1375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.137;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.244;NF=8;NR=32;PP=664;ReadPosRankSum=1.478;SC=CAGAAATAGCATTTTTTTTAG;SOR=0.617;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=40;WE=49077897;WS=49077879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr11	49080616	rs60452246	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.000;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.905;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,45:0.36:124
chr11	49080677	.	T	TA	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5114;HP=14;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=18;MQ=59.36;NF=0;NR=6;PP=56;QD=10.0;SC=TTCTTGAAATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=49080685;WS=49080667;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,6:0.29:21
chr11	49138552	rs11040259	C	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.145;NF=36;NR=16;PP=784;ReadPosRankSum=0.951;SC=GGTTTGTGACCTGTCCCTGAT;SOR=0.546;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=52;WE=49138560;WS=49138542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr11	49145048	rs6485962	T	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQRankSum=-3.959;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	49145838	rs7933115	C	T	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.628;NF=55;NR=59;PP=1858;ReadPosRankSum=-2.297;SC=TTTCCTGGTGCCTCCTACAGA;SOR=0.601;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=197;TCF=103;TCR=94;TR=114;WE=49145846;WS=49145828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,93:0.49:190
chr11	49145855	rs185303438	T	G	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.071;NF=55;NR=63;PP=2008;ReadPosRankSum=-1.459;SC=CAGATCAGCATGGCAGAGCTT;SOR=0.615;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=118;WE=49145863;WS=49145845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,102:0.51:199
chr11	49170334	rs202694	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=47;PP=1358;SC=ATGTTTCTACTCAGAAAATAA;SOR=2.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=49170342;WS=49170324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	49176057	rs2988340	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQRankSum=-3.812;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.929;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,9:0.15:60
chr11	49176058	rs117109255	A	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.836;NF=17;NR=42;PP=1721;ReadPosRankSum=-1.902;SC=CAGAAAAAACAACAAAACATA;SOR=0.283;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=59;WE=49176066;WS=49176047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,51:0.85:60
chr11	49192667	rs10839236	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.91;MQRankSum=-1.005;NF=9;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-0.319;SC=ATATTCACTTCTTATTTTTAT;SOR=1.038;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=49192675;WS=49192657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	49194894	rs175849	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.372;NF=30;NR=10;PP=641;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TTTTCTTGCTGTTTGTTTGTA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=40;WE=49194902;WS=49194884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr11	49195090	rs202718	T	C	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.554;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.492;NF=26;NR=36;PP=976;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AAATTGCAAATGACTCAATAG;SOR=0.663;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=62;WE=49195098;WS=49195080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr11	49195129	rs67031328	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.34;QD=22.78;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	49196490	rs202716	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.842;NF=17;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=-1.734;SC=TGTAAATTCTTGTCACTTCAT;SOR=0.705;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=37;WE=49196498;WS=49196480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr11	49196652	rs202715	C	T	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=100;SC=AAACTGAAAACTGATTAACAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=49196660;WS=49196642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	49197416	rs144950409	A	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.655;NF=32;NR=23;PP=849;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TTAACTGTGTAGAAAAGTTTC;SOR=0.387;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=55;WE=49197424;WS=49197406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr11	49207315	rs182169	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=5.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.436;NF=9;NR=17;PP=500;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GATTCCAACCATCTGGATAGG;SOR=2.128;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=26;WE=49207323;WS=49207305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr11	49214499	rs4315497	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.433;NF=2;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=0.498;SC=TTTGATTACTGTAATCAAACA;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=49214507;WS=49214489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	49221885	rs202680	T	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.876;NF=56;NR=44;PP=1599;ReadPosRankSum=0.412;SC=CATCATAATGTGCTAGCTCAA;SOR=0.875;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=100;WE=49221893;WS=49221875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr11	49227488	rs202677	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=0.524;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	49227620	rs202676	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.520;NF=47;NR=15;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.122;SC=TGTACTTACTATAAGAACTTC;SOR=1.319;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=62;WE=49227628;WS=49227610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr11	49229500	rs111891603	C	CAAACAAAACA	672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.523;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr11	49229833	rs79122681	C	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=562;ReadPosRankSum=-0.946;SC=CTCCGCGAGGCGCCCCCCTAC;SOR=0.641;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=35;WE=49229841;WS=49229823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr11	49329521	rs1164671	T	C	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.539;NF=42;NR=45;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.425;SC=ATTTTGGTCATAAGTCATCCC;SOR=0.744;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=197;TCF=99;TCR=98;TR=87;WE=49329529;WS=49329511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,95:0.45:213
chr11	49329552	rs1164670	G	A	5517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=97;PP=2965;SC=TGGAAATCCGGATGGTCAAAG;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=87;TCR=97;TR=183;WE=49329560;WS=49329542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	49372872	rs3915110	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.785;NF=19;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=3.318;SC=TGATGAGGCAGTGGGCATAGT;SOR=0.823;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=47;WE=49372880;WS=49372862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,47:0.31:154
chr11	49400965	rs3974576	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.133;NF=16;NR=16;PP=508;ReadPosRankSum=0.948;SC=ATTCACTATCTAAGACTCTTC;SOR=0.407;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=32;WE=49400973;WS=49400955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,40:0.33:120
chr11	49401125	rs7102702	T	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=166;ReadPosRankSum=-1.542;SC=ATCAGACAGCTGTGTTATGCC;SOR=0.395;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=13;WE=49401133;WS=49401115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr11	49597799	rs7131345	C	T	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=49;PP=2568;SC=TGTCCTAAAACGGTCCTTCTG;SOR=1.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=127;WE=49597807;WS=49597789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	49598178	rs7101761	G	A	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.509;NF=39;NR=35;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.517;SC=AGGGCTTGGTGTGCTCTGTGG;SOR=0.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=74;WE=49598186;WS=49598168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,82:0.45:184
chr11	49598207	rs3750925	T	C	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=3.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-5.774;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr11	49598207	.	TCT	CCC	2197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=56.93;NF=33;NR=29;PP=2197;QD=36.2978689494;SC=TCCTCTTCCTTCTGCTCCAAG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=62;WE=49598217;WS=49598197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:78,62:0.44:140
chr11	49598209	rs7939515	T	C	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-5.774;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr11	49637416	rs7125677	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.519;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=1.304;SC=ATGCTAAAATACCCTTAATGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=49637424;WS=49637406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	49729299	rs67084465	AC	A	1369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.410;NF=8;NR=24;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TCTCATCAACACCCCAACTGG;SOR=0.747;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=32;WE=49729307;WS=49729289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr11	49805668	rs34269909	T	A	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.111;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=522;ReadPosRankSum=-1.670;SC=ATACCAGGAATTTGGCAGCAC;SOR=0.435;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=35;WE=49805676;WS=49805658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr11	49813442	rs7943083	A	G	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=174;SC=GGACCCTGCGACCTTCCGCAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=49813450;WS=49813432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	49829193	rs35198519	AT	A	1320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=475;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACGTATTTCTATTTTTTTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=35;WE=49829201;WS=49829183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr11	49974371	rs28662375	G	A	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=63;PP=2965;SC=CTATACCACCGTCATGAAGCA;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=150;WE=49974379;WS=49974361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	50003191	rs4598671	C	A	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.294;NF=31;NR=34;PP=1024;ReadPosRankSum=1.077;SC=GTGTAGACCACGGGATTTAAC;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=65;WE=50003199;WS=50003181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,83:0.54:153
chr11	51411460	rs34285763	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=12;PP=897;SC=ACATGAGGACGGACACTCCTC;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=51411468;WS=51411450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	51411740	rs35083184	A	T	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=80;PP=2801;SC=AAGGGAGCTTAGGATGACTCC;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=143;WE=51411748;WS=51411730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	51527482	rs35049610	C	T	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=38;PP=1637;SC=ATCTCAGTAGCACCAAAAATG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=86;WE=51527490;WS=51527472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	55035809	rs11407154	A	AT	684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=5.832;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.25;MQRankSum=-1.490;QD=23.61;ReadPosRankSum=0.431;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr11	55339829	rs557590	A	G	10802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=161;PP=2965;SC=TACTTCCATAACCCCTAGAAT;SOR=0.785;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=339;TCF=178;TCR=161;TR=338;WE=55339837;WS=55339819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr11	55541098	rs297118	G	A	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=68;PP=2965;SC=ACAATCATGTGCTTTTTCCTT;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=152;WE=55541106;WS=55541088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	55563602	rs68042892	G	A	3175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=57;PP=2108;ReadPosRankSum=2.770;SC=CTCTGTGTCTGGCTCTGATAT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=118;WE=55563610;WS=55563592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,138:0.56:248
chr11	55563738	rs67863827	G	A	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1839;ReadPosRankSum=0.096;SC=GTTAGTGGGCGCCACAAAGCC;SOR=0.773;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=172;TCF=88;TCR=84;TR=97;WE=55563746;WS=55563723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,102:0.54:188
chr11	55563776	rs297054	T	G	6158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=95;PP=2965;SC=CCACCTGACTTCTATCACCAT;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=195;WE=55563784;WS=55563766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	55563900	rs297055	T	C	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1082;ReadPosRankSum=0.849;SC=CTGAACCCTCTGATCTACAGC;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=160;TCF=67;TCR=93;TR=74;WE=55563908;WS=55563890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,85:0.46:183
chr11	55578987	rs67727364	T	C	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=8.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQRankSum=-0.948;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=1.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr11	55578991	rs66537410	C	T	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=7.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=-0.985;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.058;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,70:0.41:171
chr11	55579102	rs34961497	C	T	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.209;NF=50;NR=50;PP=1610;ReadPosRankSum=1.115;SC=GGTCAGCTCTCGGCTCCACAC;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=101;TCR=98;TR=100;WE=55579110;WS=55579092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,117:0.53:220
chr11	55579340	.	C	T	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.219;SC=TTGCTATACACAGTCACCATG;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=103;TCR=75;TR=74;WE=55579348;WS=55579330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,87:0.42:207
chr11	55579419	rs34948392	T	C	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.928;NF=50;NR=65;PP=1944;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CTCTGATTCATTTGTGCTTAG;SOR=0.928;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=201;TCF=94;TCR=107;TR=115;WE=55579427;WS=55579409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,129:0.53:242
chr11	55579801	rs12790505	T	C	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=62;PP=2028;ReadPosRankSum=0.077;SC=TATGCTGAACTCTGTGATCTA;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=109;TCR=115;TR=121;WE=55579809;WS=55579791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,144:0.54:265
chr11	55587117	rs297082	T	A	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=17;PP=1588;SC=TGCTGCTGACTGATAGAAATA;SOR=2.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=55587125;WS=55587107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	55587511	rs297081	A	G	5770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=87;PP=2965;SC=CTACACAGTTAACATGTCCCA;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=88;TCR=87;TR=175;WE=55587519;WS=55587501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	55594869	rs56711116	G	A	2836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.455;NF=44;NR=62;PP=1661;ReadPosRankSum=0.293;SC=CCACACCCCCGTGTACTTTTT;SOR=0.897;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=204;TCF=92;TCR=112;TR=106;WE=55594877;WS=55594859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,133:0.52:255
chr11	55595012	rs35645945	A	T	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=9.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-5.280;QD=16.36;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=1.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr11	55595017	rs117277709	GA	TG	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=9.561;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-5.101;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.154;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr11	55595081	rs7102394	C	T	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=4;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.094;NF=45;NR=32;PP=1354;ReadPosRankSum=0.364;SC=TCTGTAACCCCCTGCTGTACA;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=77;WE=55595089;WS=55595071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,102:0.50:202
chr11	55595114	rs34929168	GCG	TTC	4309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.758;NF=44;NR=44;PP=2934;ReadPosRankSum=0.191;SC=CTCAGAAGCTGCGTGTGGAGC;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=92;TCR=88;TR=88;WE=55595124;WS=55595104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,112:0.49:227
chr11	55595324	rs7102663	C	T	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.652;NF=36;NR=19;PP=972;ReadPosRankSum=-1.105;SC=AGAGTGTTACCATCATGATCA;SOR=1.230;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=131;TCF=76;TCR=55;TR=55;WE=55595332;WS=55595314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr11	55606302	rs6591699	G	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=1166;ReadPosRankSum=-1.560;SC=ACCTGGAACTGCAAATTCCCC;SOR=0.555;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=70;WE=55606310;WS=55606292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,74:0.44:170
chr11	55606693	rs6591700	G	A	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1590;ReadPosRankSum=-3.122;SC=ATGGGGAGTCGCATGTTCCCT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=86;TCR=80;TR=92;WE=55606701;WS=55606683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr11	55656437	.	A	AT	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=0.784;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.998;SOR=2.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr11	55681130	rs34573569	A	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=304;ReadPosRankSum=0.505;SC=ATTTCCTTAAAATAAAATTTT;SOR=0.762;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=21;WE=55681138;WS=55681120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr11	55681336	rs11231529	G	A	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1460;ReadPosRankSum=-1.584;SC=AGTGGGAAGTGCATGTAGAGA;SOR=0.919;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=174;TCF=82;TCR=92;TR=90;WE=55681344;WS=55681326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,98:0.50:197
chr11	55681494	rs2457239	G	A	5193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=78;PP=2965;SC=GTATCTGAGCGAGAGAGTAAT;SOR=0.759;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=164;WE=55681502;WS=55681484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	55681566	rs61749302	G	A	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1735;ReadPosRankSum=0.692;SC=AAGCATAGGCGGAAGGCCAGT;SOR=0.684;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=199;TCF=102;TCR=97;TR=103;WE=55681574;WS=55681556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,118:0.52:229
chr11	55682111	rs2940752	T	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=513;SC=AGAATGACAGTCTAGAACTTG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=55682119;WS=55682101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	55702929	rs34603986	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.727;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=205;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GAGATGCTTTATCTCATGAAG;SOR=0.094;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=14;WE=55702937;WS=55702919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr11	55703247	rs4465383	G	A	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1076;ReadPosRankSum=0.479;SC=TAAAACAAATGATTTCCACTG;SOR=1.003;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=67;WE=55703255;WS=55703237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,82:0.52:157
chr11	55703728	rs4367963	A	G	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=60;PP=2020;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AATCCTGATCAACAGCATCAA;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=121;WE=55703736;WS=55703718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,134:0.57:235
chr11	55703931	rs35011193	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=1.177;SC=ATGCTATAATGATGAAAAAAG;SOR=0.055;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=21;WE=55703939;WS=55703921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr11	55703981	rs35841857	T	TA	59.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr11	55746891	rs7481466	G	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1649;SC=AATGGGGAAGGCAACTGTATA;SOR=1.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=55746899;WS=55746881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	55761221	rs2449134	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=28;PP=1438;SC=TACTTCCTTACTCCTGAGGCT;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=70;WE=55761229;WS=55761211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	55761528	rs35607186	T	C	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=935;ReadPosRankSum=-0.555;SC=TTCAGGATTGTGTCAGAACAA;SOR=0.644;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=72;WE=55761536;WS=55761518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,86:0.42:203
chr11	55761738	rs2128152	T	G	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=31;PP=1387;SC=GCCGCATACCTGTCATAGGCC;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=55761746;WS=55761728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	55783155	rs34107711	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.167;NF=29;NR=17;PP=724;ReadPosRankSum=0.524;SC=AGCCAGCAAAAGAGATGGTTT;SOR=1.078;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=46;WE=55783163;WS=55783145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr11	55798152	rs1482011	G	A	8439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=125;PP=2965;SC=CAAACTTCTTGGCATCCAGGA;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=130;TCR=125;TR=255;WE=55798160;WS=55798142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr11	55860780	rs1842700	G	A	6697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=101;PP=2965;SC=CTGAGTTGATGTAAATGGCTG;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=207;WE=55860788;WS=55860770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr11	55872657	rs28681529	A	C	2435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.808;NF=31;NR=62;PP=1818;ReadPosRankSum=0.229;SC=TGTGGGGATGATATTGATAAT;SOR=1.404;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=204;TCF=87;TCR=117;TR=93;WE=55872665;WS=55872647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,100:0.47:211
chr11	55872876	rs2512961	C	T	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=106;PP=2965;SC=CTCAATGGCCCATGATCGCTA;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=96;TCR=106;TR=201;WE=55872884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr11	55873024	rs2449148	A	G	10993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=185;NR=151;PP=2965;SC=TTGCATTTCTACGACTCAAAC;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=185;TCR=151;TR=336;WE=55873032;WS=55873014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr11	55873368	rs1842696	G	A	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=44;PP=1807;SC=TGTGATTCCCGTGCTGAATCC;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=82;WE=55873376;WS=55873358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	55889790	rs2035408	G	T	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=11;PP=1726;SC=GTAGCTGGGAGTACAGGCGCC;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=74;WE=55889798;WS=55889780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	55890257	rs1842691	C	T	6905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=88;PP=2965;SC=AGTTATTATGCCCAAAAGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=134;TCR=88;TR=222;WE=55890265;WS=55890247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	55944048	rs10896103	G	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=243;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CAAATTATGAGTCTATCTTTT;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=13;WE=55944056;WS=55944038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr11	56000079	rs77295387	C	T	4052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.945;NF=73;NR=96;PP=2692;ReadPosRankSum=1.398;SC=TGTATAGTAGCATGTAAAATG;SOR=0.951;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=323;TCF=148;TCR=175;TR=169;WE=56000087;WS=56000069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,186:0.53:354
chr11	56000403	rs10791893	C	G	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1486;ReadPosRankSum=1.172;SC=CTAATGACCACTAAAATCAGT;SOR=0.878;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=82;WE=56000412;WS=56000393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,104:0.50:209
chr11	56015479	rs1531757	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.148;SC=ATGAGCAGACAACGAAGATTG;SOR=1.360;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=14;WE=56015487;WS=56015469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr11	56043702	rs7125697	G	C	4586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.224;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.413;NF=98;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.056;SC=TGCCTCCTCTGCTTGCTATTT;SOR=0.621;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=334;TCF=165;TCR=169;TR=181;WE=56043710;WS=56043692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,197:0.54:368
chr11	56086147	rs960193	T	G	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1211;ReadPosRankSum=0.586;SC=TCCTACGACCTCTATGTGGCC;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=84;WE=56086155;WS=56086137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,95:0.41:229
chr11	56113516	rs1905055	T	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GTTACCAAGATGAATCATGTG;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=137;TCF=92;TCR=45;TR=81;WE=56113524;WS=56113506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,94:0.57:166
chr11	56127746	rs7942390	A	G	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=25;PP=1562;SC=ATTTCACCAGAGTCACTGAGT;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=56127754;WS=56127736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	56128081	rs10896290	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.913;NF=8;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=0.439;SC=TTGATGGCCTATGACCGCTAT;SOR=0.791;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=31;WE=56128089;WS=56128071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr11	56128524	rs7928704	C	T	7532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=119;PP=2965;SC=TAACCATTCACTGGATACTGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=118;TCR=119;TR=237;WE=56128532;WS=56128514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr11	56128673	rs34649252	A	AT	563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=484;ReadPosRankSum=0.868;SC=AAACAATGTAATTTTAAACAG;SOR=0.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=15;WE=56128681;WS=56128663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr11	56143125	rs74467122	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.34;ReadPosRankSum=-3.057;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,27:0.13:212
chr11	56143156	rs11228165	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,47:0.19:242
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chr11	56143510	rs10791963	T	C	4369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.473;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.146;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,123:0.31:392
chr11	56143528	rs10791964	A	G	4493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.522;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,130:0.30:433
chr11	56143534	rs78854227	A	G	4795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.532;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:312,132:0.30:444
chr11	56143537	rs74691432	A	T	4754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.557;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,134:0.29:461
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chr11	56143966	rs12291978	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.238;NF=9;NR=14;PP=852;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATCCCTTAATCTATAGCCTCC;SOR=1.090;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=23;WE=56143985;WS=56143956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr11	56143977	rs12272403	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.204;NF=9;NR=13;PP=852;ReadPosRankSum=0.778;SC=TATAGCCTCCAGAATAAGGAG;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=22;WE=56143985;WS=56143956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
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chr11	56185224	rs12785840	A	G	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1473;ReadPosRankSum=-1.069;SC=ACGGAAAGTGATAACGGTGTG;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=86;WE=56185232;WS=56185214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,98:0.50:195
chr11	56185327	rs7933772	T	C	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1331;ReadPosRankSum=0.662;SC=TGCAGGGGACTACAGATGGCG;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=75;WE=56185335;WS=56185317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,87:0.49:177
chr11	56185345	rs6591324	A	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GCGACATAGCAATCGTAGGCC;SOR=0.761;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=73;WE=56185353;WS=56185335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,87:0.51:171
chr11	56185689	rs7931261	A	G	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AGTGACATAAATGATATTAAC;SOR=0.812;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=57;WE=56185697;WS=56185679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr11	56310222	rs628524	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=896;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GTTGATGACACTGGATCTACA;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=54;WE=56310230;WS=56310212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr11	56310497	rs72913727	C	T	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=58;PP=1566;ReadPosRankSum=-1.243;SC=TCGACATCTGCGGGGTTGCAT;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=104;TCR=137;TR=103;WE=56310505;WS=56310487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,117:0.43:270
chr11	56310877	rs66945922	C	CTT	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=389;ReadPosRankSum=0.943;SC=CTACCATAAACTGGTTTTGGT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=56310885;WS=56310867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr11	56344993	rs10792043	C	A	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.869;NF=62;NR=46;PP=1899;ReadPosRankSum=-1.835;SC=CAAATGTCTACAAAGGAGAGG;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=117;TCR=89;TR=108;WE=56345001;WS=56344983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,127:0.55:231
chr11	56380008	rs12292069	C	T	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=988;ReadPosRankSum=-0.367;SC=ACAAGCAATTCGTGACTGCAA;SOR=0.899;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=64;WE=56380016;WS=56379998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr11	56409603	rs11606499	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.705;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1354;ReadPosRankSum=0.253;SC=TAGAACTGGGCAGCACATCCA;SOR=0.453;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=83;WE=56409611;WS=56409593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr11	56431834	rs56067375	A	G	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=891;ReadPosRankSum=1.250;SC=CCTTGTTGCAATCATCAGAAT;SOR=0.561;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=57;WE=56431842;WS=56431824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr11	56467757	.	CACG	C	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.366;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	56467763	.	A	AGAT	181.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.866;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	56467764	rs78916686	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.923;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	56467787	rs74218731	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=64;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.226;SC=ATCTTATGTAACATAATTCTA;SOR=0.922;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=8;WE=56467795;WS=56467777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr11	56467810	rs76085479	A	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.35;ReadPosRankSum=-2.780;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	56467813	rs77180330	A	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.17;ReadPosRankSum=-2.850;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	56467816	rs78119960	G	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.83;ReadPosRankSum=-2.262;SOR=0.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	56467819	rs78036340	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.46;ReadPosRankSum=-2.382;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr11	56467833	rs73474897	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GAGCTCATTTTCTTTCCCCAT;SOR=0.382;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=20;WE=56467841;WS=56467800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr11	56467881	rs73474900	T	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=679;ReadPosRankSum=-0.054;SC=GGAGCAATCATACAGTGACTG;SOR=0.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=46;WE=56467889;WS=56467871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr11	56467926	rs1704284	A	G	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.434;NF=45;NR=33;PP=1068;ReadPosRankSum=0.871;SC=CAGACCCAGGAATGCAGCTGG;SOR=0.360;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=162;TCF=101;TCR=61;TR=78;WE=56467934;WS=56467916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr11	56468020	rs532637	T	C	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.37;QD=33.07;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	56468020	.	TG	CA,CG	1690	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=57.27;NF=31,82;NR=28,82;PP=612,1690;QD=11.2791165231;SC=TAATGACTCCTGCCTCCACAC;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=59,164;WE=56468029;WS=56468010;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:165
chr11	56468021	rs532635	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-6.497;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,71:0.37:193
chr11	56468044	rs3975155	T	G	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-5.334;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.545;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,52:0.33:156
chr11	56468047	rs2865519	A	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-5.677;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.862;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,49:0.33:147
chr11	56468048	rs2865520	C	T	5054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=73;PP=2962;SC=TATTTTTTCACTGGAAATCTG;SOR=1.094;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=124;WE=56468056;WS=56468034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	56468111	rs602224	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.477;NF=26;NR=13;PP=620;ReadPosRankSum=0.019;SC=ATCCTAGTGACCTGCATCTCT;SOR=1.505;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=39;WE=56468119;WS=56468101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr11	56468155	rs11228732	T	G	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.763;NF=36;NR=29;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TGGCTGCCTGTGTCAGTTCTT;SOR=0.312;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=65;WE=56468163;WS=56468145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr11	56468198	rs4990194	A	G	4533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-2.081;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,116:0.54:215
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chr11	56468212	rs591369	G	A	4629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-1.825;QD=21.14;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,120:0.55:219
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chr11	56468403	rs11228734	G	A	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=2833;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TCTGTGATTTGCTTCCCTTGG;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=96;TCR=133;TR=80;WE=56468424;WS=56468393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,97:0.37:263
chr11	56468416	rs11228735	G	A	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=2833;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TCCCTTGGTGGAGCTGGCCTG;SOR=0.607;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=209;TCF=91;TCR=118;TR=73;WE=56468424;WS=56468393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,93:0.38:243
chr11	56468448	rs80194264	AA	GT	3422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.505;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,91:0.43:211
chr11	56468452	rs79970235	A	C	3456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
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chr11	56468554	rs12420076	A	C	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=5.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.820;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,83:0.42:198
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chr11	56468638	rs7121276	G	T	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,75:0.28:271
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chr11	56468699	rs79251113	T	A	5123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.80;ReadPosRankSum=-1.815;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,131:0.43:305
chr11	56468704	rs79288825	T	C	5095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.23;ReadPosRankSum=-2.374;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,139:0.44:314
chr11	56468720	rs66943455	T	C	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=49;PP=1695;ReadPosRankSum=1.421;SC=ATGTTGAATCTCATGATCTAC;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=147;TCR=122;TR=108;WE=56468728;WS=56468710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,135:0.42:323
chr11	56468817	rs74605930	G	T	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.796;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,80:0.36:221
chr11	56468819	rs78460796	CC	TT	2868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=2.554;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.941;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,78:0.36:218
chr11	56468828	rs530142	G	C	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=2.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,64:0.33:193
chr11	56468832	rs79579174	G	T	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=1.060;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,59:0.32:185
chr11	56468835	rs588308	G	T	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr11	56468870	.	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=5.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.303;SOR=1.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
chr11	56468871	.	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.331;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.805;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr11	56468872	.	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.425;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr11	56468877	.	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.738;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,21:0.29:73
chr11	56468881	.	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.218;SOR=1.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr11	56468883	.	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.234;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,18:0.28:65
chr11	56468893	rs79757227	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr11	56468897	.	G	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	56468909	rs79696743	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
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chr11	56468910	rs79587945	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
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chr11	56510623	rs513873	A	G	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1266;ReadPosRankSum=0.716;SC=GCTGGAGAGTACTGTGAAGCC;SOR=0.762;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=76;WE=56510631;WS=56510613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,89:0.45:196
chr11	56510672	rs577576	T	C	8246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=108;PP=2965;SC=ACCCTGGTGTTTGTACAGGAC;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=98;TCR=108;TR=206;WE=56510680;WS=56510662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr11	56510694	rs1397053	T	C	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TTTTTACCAATGGTGGTGCAT;SOR=0.843;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=209;TCF=100;TCR=109;TR=94;WE=56510702;WS=56510684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,105:0.43:243
chr11	56756516	rs12420424	G	C	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1527;ReadPosRankSum=-2.226;SC=ATGGGTAATAGTGGAATAATC;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=80;WE=56756524;WS=56756506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,97:0.54:179
chr11	56756664	rs2853083	G	A	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.054;NF=36;NR=35;PP=1252;ReadPosRankSum=1.817;SC=AGAATTTGATGTTATTTCAGG;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=71;WE=56756672;WS=56756654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,89:0.65:136
chr11	56949691	rs12364102	G	A	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1792;ReadPosRankSum=0.196;SC=ACCTGCCAATGGACACCCGAA;SOR=0.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=109;WE=56949699;WS=56949681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,129:0.48:270
chr11	56954846	rs716745	C	T	3041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=71;PP=1715;ReadPosRankSum=1.482;SC=TCATTGCGTTCGTGGGCTTCG;SOR=0.834;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=307;TCF=148;TCR=159;TR=130;WE=56954854;WS=56954836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,158:0.42:372
chr11	57004344	rs948847	G	T	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1312;ReadPosRankSum=0.774;SC=CCAGACCGTTGCCCGTGGTGC;SOR=0.759;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=84;WE=57004352;WS=57004334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,99:0.59:167
chr11	57076820	rs78489201	T	G	3619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=70;PP=2398;ReadPosRankSum=0.091;SC=GCCAAACTGATAGCTCCTCTC;SOR=0.671;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=264;TCF=132;TCR=132;TR=136;WE=57076828;WS=57076810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,156:0.50:314
chr11	57077464	rs10896602	T	C	3302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=67;PP=2175;ReadPosRankSum=-2.449;SC=TCCCCAAATCTTGGCCCTGCT;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=315;TCF=167;TCR=148;TR=142;WE=57077472;WS=57077454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,159:0.44:358
chr11	57081197	rs4939134	G	C	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=43;PP=2413;SC=AGCTTCAGGAGTCTGGGCTTC;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=108;WE=57081205;WS=57081187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	57081475	rs4939135	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	57117385	rs2276042	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=0.420;SC=GAGGACCTAGCCATTCTTCCG;SOR=0.445;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=32;WE=57117393;WS=57117375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr11	57118467	rs3741090	A	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=466;ReadPosRankSum=0.719;SC=CCATCCACCCACCCCTGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=26;WE=57118475;WS=57118457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr11	57135663	rs55655702	A	AG	1259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=28;PP=1350;SC=TCTGGGGGGCAGGGTCTGCTG;SOR=2.073;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=32;WE=57135671;WS=57135653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	57137296	rs2276040	G	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=1015;ReadPosRankSum=-1.847;SC=GTCAAATGGGGTCACAAAAGA;SOR=0.508;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=157;TCF=112;TCR=45;TR=64;WE=57137304;WS=57137286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,74:0.40:183
chr11	57137371	rs2276039	G	A	4640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=83;PP=2584;ReadPosRankSum=0.132;SC=ATGAGACTACGCTGAAAATCG;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=294;TCF=156;TCR=138;TR=172;WE=57137379;WS=57137361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,214:0.58:367
chr11	57137424	rs2276038	C	T	4199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=91;PP=2598;ReadPosRankSum=-1.492;SC=CAGACCACAGCGGAGAAGCAG;SOR=0.887;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=261;TCF=117;TCR=144;TR=160;WE=57137432;WS=57137414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,189:0.59:318
chr11	57137538	rs67821929	A	AG	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=50;PP=2057;SC=TGCCTGAGCAAGGGGCATGGG;SOR=5.926;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=50;WE=57137546;WS=57137528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	57144152	rs1867126	G	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=623;SC=ACTCGGCCATGGCTCACTTTC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=57144160;WS=57144142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	57146225	rs34108746	A	G	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1983;ReadPosRankSum=0.815;SC=TGAATGCGATAGTTGAAGTTG;SOR=0.506;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=110;WE=57146233;WS=57146215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,131:0.62:213
chr11	57147016	rs540687	A	G	4769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=54;PP=2965;SC=GTAGCGGCAGATCTTGCACCT;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=147;WE=57147024;WS=57147006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	57147353	rs544079	G	C	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=34;PP=1030;SC=CTCCAGCAACGTCGCTCGAGC;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=57147361;WS=57147343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr11	57148175	rs669661	A	G	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=43;PP=1858;SC=AGCAAGAGGCATTGCATATCT;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=98;WE=57148183;WS=57148165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr11	57155288	rs630396	T	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=60;PP=2021;SC=CAGCCCAGTATGCAAAGTTCC;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=57155296;WS=57155278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
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chr11	57157405	rs490358	A	G	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=51;PP=1941;ReadPosRankSum=0.589;SC=GCCAGAAGTAAGGGGAGTTTC;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=196;TCF=104;TCR=92;TR=113;WE=57157413;WS=57157395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,134:0.58:233
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chr11	57184159	rs76902697	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=738;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GAAACAAAAGCCCCACCAGCA;SOR=0.510;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=46;WE=57184167;WS=57184149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr11	57184218	rs4938865	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=464;SC=GAGGGAATAGCATGGTGAATC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=57184226;WS=57184208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	57193653	rs12422015	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=-2.554;SC=CATGAGCAGAAGTGGAGTGGA;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=24;WE=57193661;WS=57193643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr11	57243588	rs2258835	A	G	3289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=52;PP=2131;ReadPosRankSum=1.686;SC=TCTGCACCCTACCTCAGGCCC;SOR=0.310;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=208;TCF=137;TCR=71;TR=133;WE=57243596;WS=57243578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,146:0.64:228
chr11	57258617	rs2729384	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=530;ReadPosRankSum=0.499;SC=AAGCAACAAGTTGCTGGATGT;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=39;WE=57258626;WS=57258607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr11	57265400	rs2581922	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=1.046;SC=ATACAATAGCCCCAGGAGACG;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=57265408;WS=57265390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	57268170	rs2250673	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=0.980;SC=CCCCAGCCCATTCATACTGCC;SOR=0.132;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=57268178;WS=57268160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr11	57334430	.	C	CCGCCG	180	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=21;MQ=60.3;NF=5;NR=2;PP=180;QD=26.5714285714;SC=GCCCCCCCCCCCCTCCTAGAA;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=57334438;WS=57334420;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	57334508	rs4939152	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.355;NF=24;NR=13;PP=678;ReadPosRankSum=-1.137;SC=ACTCCAGGAGGCCTTCCAGGT;SOR=0.923;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=37;WE=57334516;WS=57334498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr11	57346723	rs112429940	GCACCCTA	G	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=378;ReadPosRankSum=0.766;SC=CATAACCAAAGCACCCTACAG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=57346737;WS=57346713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	57369730	rs11229063	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=399;SC=AGAAAGGACAGAGGGAATGTT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=57369738;WS=57369720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	57374332	rs11603020	T	C	4047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=70;PP=2428;SC=ATCAGAAGACTCTGGTGGCTT;SOR=1.210;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=109;WE=57374340;WS=57374322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	57379170	rs2511988	A	G	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=14;PP=1263;SC=GACTGTTAAGATGCATCTCTT;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=57379178;WS=57379160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	57381989	rs4926	G	A	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=51;PP=1927;SC=CTTCCTCTTCGTGCTCTGGGA;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=96;WE=57381997;WS=57381979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	57413943	rs12793139	C	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=407;ReadPosRankSum=0.230;SC=AGTCCCCAGACAGCCCAAGGG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=19;WE=57413951;WS=57413933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr11	57414387	rs7947357	A	G	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=45;PP=2071;SC=GGTGATGTTCAGGCTAGCCTG;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=103;WE=57414395;WS=57414377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	57424389	rs55969690	GA	G	700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.95;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	57456244	rs549022	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=249;ReadPosRankSum=-1.674;SC=TGTCTAACTACGTTGGCCACA;SOR=0.990;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=14;WE=57456252;WS=57456234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	57461225	.	GTC	G	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.54;NF=3;NR=0;PP=65;QD=23.6666666667;SC=CTCTCGCTGTGTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=3;WE=57461234;WS=57461215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,3:0.18:17
chr11	57463500	rs1783978	T	C	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=20;PP=870;SC=ACACCTCGGCTTGGCTACTAA;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=57463508;WS=57463490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	57467035	rs11604333	C	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TTGACTCTACCTGCCTTCATG;SOR=0.425;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=57467043;WS=57467025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	57467166	rs76062648	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-1.869;SC=GTACATAGGAGAGATTGGGAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=11;WE=57467174;WS=57467157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	57506389	rs180908824	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=-1.140;SC=ATCTATACTTCCACTTTCCTT;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=57506397;WS=57506379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr11	57509429	rs635663	A	G	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=66;PP=2346;SC=CGGCAGCAGTAAGTGGGGACC;SOR=1.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=95;WE=57509437;WS=57509419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	57518470	.	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=715;ReadPosRankSum=0.538;SC=CCTTTACCCTCTGGCTCTGAA;SOR=0.636;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=43;WE=57518478;WS=57518460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr11	57571232	rs11229137	C	T	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=63;PP=1934;SC=AGCCACGCCACATTGAGTGGG;SOR=1.005;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=115;WE=57571240;WS=57571222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	57581613	rs623541	C	A	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=358;SC=ATAGTGAGACCTCATCTCTAC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=57581621;WS=57581603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	57798723	rs921135	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1017;ReadPosRankSum=0.875;SC=TCTTATGCTGATTGCCTATCC;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=69;WE=57798731;WS=57798713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,79:0.45:175
chr11	57798942	rs2513726	A	G	2920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1831;ReadPosRankSum=-1.356;SC=CTAACATTTTATGGCCCAAAT;SOR=0.656;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=246;TCF=120;TCR=126;TR=113;WE=57798950;WS=57798932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,135:0.47:288
chr11	57799183	rs7123727	C	T	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1340;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTGTGGTGAGCCTCTTCTATG;SOR=0.777;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=94;WE=57799191;WS=57799173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,112:0.47:238
chr11	57799371	rs1374570	G	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=541;ReadPosRankSum=1.361;SC=TTTTGGAAGGGACAGTGAGGA;SOR=0.466;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=30;WE=57799379;WS=57799361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr11	57876436	rs7935428	C	A	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=608;ReadPosRankSum=-2.163;SC=CTTGGCTTACCCACCTGCCGA;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=44;WE=57876444;WS=57876426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,56:0.41:138
chr11	57947163	rs111629598	G	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=879;ReadPosRankSum=0.897;SC=CCAGATGCTGGCAGTGCTGCT;SOR=0.570;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=53;WE=57947171;WS=57947153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr11	57958775	rs7120468	C	T	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1552;ReadPosRankSum=1.618;SC=CCGAGGGAGACCGAGTGGTGT;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=187;TCF=87;TCR=100;TR=92;WE=57958783;WS=57958765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,108:0.47:230
chr11	57958972	rs1451317	C	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=1.031;SC=CTCAATAGCACCTTCTGGAGA;SOR=0.484;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=28;WE=57958980;WS=57958962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr11	57971195	rs11229279	G	A	4797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.83;ReadPosRankSum=-1.848;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,124:0.51:242
chr11	57971201	rs11229280	G	A	4871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,129:0.51:253
chr11	57982229	rs1966836	A	G	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=1173;ReadPosRankSum=1.074;SC=GAAGACTTTTAGTTCCTTTCT;SOR=0.925;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=86;TCR=51;TR=65;WE=57982237;WS=57982219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr11	57982584	rs1966835	T	C	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.827;NF=58;NR=41;PP=1544;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TTTGTCGTCATTGACAATTTG;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=229;TCF=133;TCR=96;TR=99;WE=57982592;WS=57982574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,116:0.43:268
chr11	57982620	rs1966834	A	G	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.096;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.106;NF=60;NR=51;PP=1670;ReadPosRankSum=0.961;SC=GCCTATGACCACTTTGTGGCG;SOR=0.684;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=252;TCF=123;TCR=129;TR=111;WE=57982628;WS=57982610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,134:0.45:300
chr11	57982726	rs1993089	G	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.921;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.178;NF=13;NR=35;PP=639;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TTATTGCTCTGACACACACCC;SOR=1.321;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=48;WE=57982734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,51:0.36:140
chr11	57982763	rs1993088	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.448;NF=9;NR=20;PP=525;ReadPosRankSum=-1.146;SC=GCTCTTCTGTAACCACAACAC;SOR=1.586;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=29;WE=57982771;WS=57982753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr11	57982832	rs2867400	T	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.942;NF=33;NR=6;PP=676;ReadPosRankSum=-1.489;SC=TTCAGATACATTGATCAATGA;SOR=2.066;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=123;TCF=84;TCR=39;TR=39;WE=57982840;WS=57982822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,45:0.30:149
chr11	57982896	rs2903566	G	T	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.226;NF=66;NR=39;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TTTACACTCAGCTTCTTTTCC;SOR=1.006;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=231;TCF=133;TCR=98;TR=105;WE=57982904;WS=57982886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,126:0.45:278
chr11	57983194	rs7103033	A	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.909;NF=24;NR=39;PP=940;ReadPosRankSum=0.675;SC=CTTCCCTTTGATGCCCTGGAC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=63;WE=57983202;WS=57983184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr11	57995330	rs17555381	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGTTCTGTGTCATTTAGAGTT;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=18;WE=57995338;WS=57995320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr11	57996084	rs61902844	G	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=858;ReadPosRankSum=2.235;SC=CCCCCAAAATGTTGGAAAGCA;SOR=0.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=60;TCR=60;TR=57;WE=57996092;WS=57996074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr11	57996312	rs4245219	C	G	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=73;PP=2134;SC=ACTCAGTGGGCTCAGACTGGT;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=111;WE=57996320;WS=57996302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	58034543	rs10792156	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=613;ReadPosRankSum=0.846;SC=TGAGATGAACCGATCTTGCTT;SOR=0.463;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=38;WE=58034551;WS=58034533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr11	58125620	rs4127353	T	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=36;PP=2225;SC=ATCTAGAGAATATTTTGCCTT;SOR=1.353;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=105;WE=58125628;WS=58125610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	58126305	rs4939208	A	T	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=58;PP=2241;SC=AACCCAGTTAAAACCTTTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=116;WE=58126313;WS=58126295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	58207204	rs4938895	A	G	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=58;PP=2741;SC=ATGGCCAGGCAAGCACATACA;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=58207212;WS=58207194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	58295748	rs35632700	TCA	T	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=445;SC=CCTTTCAATCTCAGTGTCCTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=58295757;WS=58295738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	58318619	rs1047979	C	G	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=52;PP=2188;SC=ATTCCTGCTCCAGACCCCCAA;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=58318627;WS=58318609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	58331842	rs112960054	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TACCAGCCATCCCACAAAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=58331850;WS=58331832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	58478026	rs675423	G	A	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=24;PP=2117;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TTACTTGAGAGGTGTGAGTGG;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=89;WE=58478047;WS=58478016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr11	58478039	rs675757	T	C	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=35;PP=2322;SC=GTGAGTGGTATAGACTGGATT;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=100;WE=58478047;WS=58478016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	58478084	rs675815	T	C	4433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=60;PP=2914;SC=TTTGCCACCATTGGGAGATAA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=129;WE=58478092;WS=58478074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	58605922	rs10896850	A	G	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=42;PP=1488;SC=ATAAGACATGACATGAGAAAT;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=58605930;WS=58605912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	58674952	rs35731745	G	GT	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=975;SC=GCTCTTTTTTGTTTGTTTTGT;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=23;WE=58674960;WS=58674942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	58715285	rs565355	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=780;SC=AGATCCTCATCTCTGGGGATC;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=58715293;WS=58715275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	58978940	rs544864	C	T	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1346;ReadPosRankSum=0.090;SC=TGGCTGCTGGCCACACACCAA;SOR=0.745;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=82;WE=58978948;WS=58978930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,98:0.47:210
chr11	59056153	rs1894123	C	T	4110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=56;PP=2681;SC=GGAGTTGGTTCGGTTTGAGAG;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=132;WE=59056161;WS=59056143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	59132798	rs7941190	G	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=837;ReadPosRankSum=1.594;SC=TAAATCCCTTGATTTACAGTT;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=44;WE=59132806;WS=59132788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr11	59132882	rs10896964	A	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=649;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ACAGATTCTGAGATTTCTGCC;SOR=1.491;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=35;WE=59132890;WS=59132872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr11	59189405	rs9988824	T	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=10;PP=979;SC=TTTAAAATTATGTAAATGTCT;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=59189413;WS=59189395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	59189912	rs1453547	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=35;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GATCATATAGGGCCCACAGAA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=90;WE=59189920;WS=59189902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,104:0.60:173
chr11	59190499	rs11602535	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TTGTTTGTTATTGTAAGAGTG;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=14;WE=59190507;WS=59190489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr11	59190529	rs34222593	TACAA	T	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TAGAAGATCATACAAACAGTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=59190540;WS=59190519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr11	59210550	rs7947825	G	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=223;SC=CTCCCTCTCAGGCATTTTGTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=59210558;WS=59210540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	59210761	rs11605572	C	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1133;ReadPosRankSum=-3.182;SC=TCTATCTTACCACCCTGGCCT;SOR=0.687;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=73;WE=59210769;WS=59210751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,93:0.51:182
chr11	59211188	rs6591536	G	A	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTTCTTCTGCGACCTCCCACC;SOR=0.501;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=189;TCF=106;TCR=83;TR=90;WE=59211196;WS=59211178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,108:0.48:225
chr11	59211265	rs7941591	T	C	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TGGTGGTCACTGTCGGAGGAA;SOR=0.865;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=87;WE=59211273;WS=59211255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr11	59211421	rs17591107	C	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=914;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CAGCCCTTTTCGTGTACTTGC;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=57;WE=59211429;WS=59211411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr11	59224608	rs1453544	A	G	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1239;ReadPosRankSum=-1.011;SC=ACACACTCCTATGTACTTTCT;SOR=1.165;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=75;WE=59224616;WS=59224598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr11	59224720	rs1453543	A	G	5571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=88;PP=2965;SC=TCCTACAATGACTGCATGGCA;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=171;WE=59224728;WS=59224710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	59224885	rs1453542	G	C	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCTTGGGTGAGTGGTGGTTTG;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=65;WE=59224893;WS=59224875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,72:0.49:146
chr11	59225221	rs1453541	T	C	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1375;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CGGCCCTTCATGACGCTGCCC;SOR=0.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=101;TCR=79;TR=98;WE=59225229;WS=59225211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,113:0.55:207
chr11	59245233	.	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1142;ReadPosRankSum=0.816;SC=TGGAGGGGTGGATGTATTTTC;SOR=1.058;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=65;WE=59245241;WS=59245223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr11	59345898	rs495564	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=0.576;SC=TAATGGTTAGGTCCTGTTATA;SOR=0.342;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=25;WE=59345906;WS=59345888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr11	59361787	rs3216084	AT	A	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=301;ReadPosRankSum=0.772;SC=AGACAGTTTAATTTTTTTTGC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=18;WE=59361795;WS=59361777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr11	59368213	rs80049069	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=13.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.365;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr11	59368691	rs55667192	C	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=617;ReadPosRankSum=-1.218;SC=AAATATGATGCTAAAATACCA;SOR=0.954;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=30;WE=59368699;WS=59368681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr11	59369401	rs7106463	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=29;PP=834;SC=CTTATTCTGGAAACTTTTAAC;SOR=2.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=59369409;WS=59369391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	59417171	rs7112355	T	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=575;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GACTACTAGCTAAAGACAAAC;SOR=0.634;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=36;WE=59417179;WS=59417161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr11	59417201	rs111578876	AT	A	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=104;ReadPosRankSum=2.205;SC=AAAGACTGAGATTTTTTTTTT;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=10;WE=59417209;WS=59417191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr11	59418134	rs76847509	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=1.270;SC=CCAAAGAACATTGACTGATTG;SOR=0.425;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=10;WE=59418142;WS=59418124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr11	59425286	rs34703318	A	AT	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=-0.462;SC=ACCTTAAGAAATTTTTTTAAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=59425294;WS=59425276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	59427066	.	G	A	166	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=17;MQ=53.32;NF=0;NR=8;PP=166;QD=25.0964015684;SC=GTGCAGTGGCGTGATCTCGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=59427074;WS=59427056;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	59480951	rs499033	T	C	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=39;PP=2042;SC=CGCTATAAACTGGTCATAAGC;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=59480959;WS=59480941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	59480969	rs472177	A	G	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;ReadPosRankSum=1.429;SC=AGCCATGACTACCAGCAGGAC;SOR=0.568;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=52;WE=59480977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,66:0.49:135
chr11	59481119	rs74398490	G	T	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=39;PP=1540;ReadPosRankSum=1.242;SC=TTCTAGAACTGCCAGATTAGC;SOR=0.909;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=233;TCF=136;TCR=97;TR=101;WE=59481127;WS=59481109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,114:0.45:256
chr11	59516459	rs507235	T	C	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=3.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr11	59516464	rs497596	G	A	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr11	59554659	rs75068197	A	G	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=809;ReadPosRankSum=0.433;SC=CTTTCCTTGGAGCTGAGCCAG;SOR=0.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=51;WE=59554667;WS=59554649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr11	59554708	rs75459935	A	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=568;ReadPosRankSum=-1.092;SC=AGGGAAGTGTACAAGTTACAG;SOR=0.045;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=30;WE=59554716;WS=59554698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr11	59556218	rs2509730	A	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=289;ReadPosRankSum=0.200;SC=GGGAGTGCGTAGGGATAAATA;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=17;WE=59556226;WS=59556208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	59559500	rs79081229	T	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=1.462;SC=CTATTGTAGATGGCTATGTGG;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=18;WE=59559508;WS=59559490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr11	59560509	rs17154180	T	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=1.281;SC=ATTTTCAGGGTCCTTATCAGA;SOR=0.260;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=11;WE=59560517;WS=59560499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr11	59565021	rs17511545	C	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.989;SC=TTCTTTATCTCCTTATAGTTC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=59565029;WS=59565011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr11	59568190	rs17154200	A	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=471;ReadPosRankSum=-2.617;SC=TTTAACTCCAAGTTCTGTCCT;SOR=1.201;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=29;WE=59568198;WS=59568180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr11	59574345	rs7109616	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=0.998;SC=ATGCGGACTTCGACATCATCT;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=18;WE=59574353;WS=59574335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr11	59575156	rs78416481	G	A	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1490;ReadPosRankSum=-1.077;SC=ATTGCTGCTCGATGCTGAATT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=96;WE=59575164;WS=59575146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,119:0.46:261
chr11	59611657	.	C	T	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=59.61;NF=1;NR=5;PP=78;QD=18.7952020912;SC=GTTGCCCAGGCTAGAGTGCAA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=59611665;WS=59611647;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	59612859	rs35211634	T	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=597;ReadPosRankSum=0.893;SC=GCATGAACTCTGGGTCTGGGT;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=45;WE=59612867;WS=59612849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr11	59623433	rs1042613	G	A	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=69;PP=2488;SC=CGTTTGGATTGCTGAATGCTC;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=124;WE=59623441;WS=59623423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	59629305	rs557564	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=563;SC=AATCAGAAAACCTGAGAAATG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=59629313;WS=59629295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	59814287	rs2276044	A	G	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.365;SC=TCTAGAAGGCATAGTATGCTG;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=115;WE=59814295;WS=59814277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,128:0.55:234
chr11	59829804	rs506053	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GATAAGCTCTCGTTCTGTTAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=59829812;WS=59829795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	59830103	rs481950	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=771;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TCCCCTGGCTATATGTTATTT;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=53;WE=59830111;WS=59830093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr11	59830198	rs533855	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GGTTTTGATTTGCAATTCTTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=59830206;WS=59830188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	59834298	rs12221875	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=128;ReadPosRankSum=2.013;SC=ATTGATGTTAGCCTCGCATCT;SOR=0.582;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=59834306;WS=59834288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	59836887	rs2298584	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=1.056;SC=TTGAGATACTATCTCTTCTAC;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=59836895;WS=59836877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr11	59837577	rs10897003	T	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CATCAATGAATGGATTTTATT;SOR=1.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=59837585;WS=59837567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	59940396	rs595718	A	G	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.10;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	59940400	rs2044979	C	T	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	59940403	rs2044978	A	G	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	59940407	rs592346	A	G	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=2.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	59946302	rs598862	C	T	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=41;NR=50;PP=1760;SC=TCACCATACTCTAAACATCAA;SOR=1.408;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=91;WE=59946318;WS=59946292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	59946466	rs587634	T	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=381;SC=TGTAGTGTAATGTAGTAGCTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=59946474;WS=59946456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	59947252	rs583791	C	T	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=28;PP=2248;SC=AAGCTATTGGCATCTTCCTCC;SOR=1.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=74;TCR=28;TR=102;WE=59947260;WS=59947242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	59997335	rs608659	T	C	5562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=68;PP=2944;SC=TCTGATCAAATGTGAGTTTAC;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=164;WE=59997343;WS=59997325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	60050125	rs10792260	A	G	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1210;ReadPosRankSum=0.672;SC=CAGATGTCTCAATATAGGAAT;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=72;WE=60050133;WS=60050115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,88:0.57:155
chr11	60057525	rs12279983	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CTTGCAGGCTTGTATCAAGGA;SOR=0.686;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=21;WE=60057533;WS=60057515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr11	60059810	rs10750931	A	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=858;ReadPosRankSum=-1.084;SC=ACATCTGTGGAAAGGATTGCA;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=58;WE=60059818;WS=60059800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,62:0.30:209
chr11	60060016	rs2044981	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.398;SC=AACTATATAGTATTCTGTCAC;SOR=0.072;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=60060024;WS=60060006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	60070176	rs6591561	A	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TCATGGGACTATGTCCATCTT;SOR=0.459;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=156;TCF=61;TCR=95;TR=70;WE=60070184;WS=60070166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr11	60073597	rs4644658	C	T	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=50;PP=2744;SC=GGTGCTCCTCCTAAGTGTGCT;SOR=1.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=132;WE=60073605;WS=60073587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	60073702	rs3018806	A	T	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=82;PP=2587;SC=TTTGAAGATGACTGTATTAGT;SOR=1.248;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=130;WE=60073710;WS=60073692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	60102384	rs2304935	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=1721;ReadPosRankSum=-0.356;SC=ATCACAACCTATTTCCAATGA;SOR=0.890;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=42;WE=60102404;WS=60102374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr11	60102396	rs2304934	A	G	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=1721;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTCCAATGAGACCATCATAAT;SOR=0.791;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=44;WE=60102404;WS=60102374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr11	60102507	rs2304933	G	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=999;ReadPosRankSum=-0.260;SC=AAAAGTCAAAGTTATTGGGGT;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=65;WE=60102515;WS=60102497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,80:0.64:125
chr11	60102631	rs10792268	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=226;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGCTGGAGGGACTTTGGGGTA;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=13;WE=60102639;WS=60102621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	60102790	rs1443250	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TTTCTTTTACGAAAGTAATGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=60102798;WS=60102785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	60103096	rs11230280	A	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.531;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=2.515;SC=GGTTTCTAGAATTGCCTCTGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=60103104;WS=60103086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	60103112	rs12798157	T	C	144.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=110;SC=TCTGCACTTATGTGATCTGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=60103120;WS=60103102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	60105199	rs2289614	G	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=540;ReadPosRankSum=1.108;SC=TTCTTACCCAGCATGTCTCTT;SOR=1.387;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=28;WE=60105207;WS=60105189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr11	60107470	rs2289612	C	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=54;PP=1610;SC=CTTAATCTTGCCTAGTGTATC;SOR=2.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=60107478;WS=60107460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	60152468	rs79791578	A	ATTT	1665.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=1239;SC=ATTATAATGTATTTTATACTC;SOR=3.145;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=25;WE=60152476;WS=60152458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	60152531	rs2233244	A	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=40;PP=1977;SC=TTTGAAGTGCAGTCTAGATTT;SOR=1.299;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=112;WE=60152539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	60163958	rs6591579	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=411;SC=GCTCATCTCTGAGGGCTCCAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=60163966;WS=60163948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	60172076	rs61898304	T	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.335;SC=CCTTAATGTGTCAAGTATCCA;SOR=0.723;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=80;WE=60172084;WS=60172066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,107:0.58:184
chr11	60197299	rs34169848	G	A	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=46;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.019;SC=AAAATCTTAGGGGTAAGTAAG;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=134;TCF=32;TCR=102;TR=59;WE=60197307;WS=60197289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,65:0.45:145
chr11	60202747	rs894590	C	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.89;QD=24.61;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	60202798	rs11377519	C	CA	648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=9;PP=303;SC=CAGAACATAGCAAAAAAAAAA;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=13;WE=60202806;WS=60202788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	60230722	rs10792278	G	T	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=41;PP=1296;SC=TTGGGTTAAAGTAATTAAGAA;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=60230730;WS=60230712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	60268679	rs2186918	G	C	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=83;PP=2783;SC=TAGAACACCAGTCCTTCTTGG;SOR=1.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=46;TCR=83;TR=129;WE=60268687;WS=60268669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	60285575	rs10736706	A	G	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=36;PP=1464;SC=CATCTTTCACATTTTCATGTG;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=81;WE=60285583;WS=60285565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	60291413	rs6591595	C	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=21;PP=873;SC=ACAAAGTATCCGACTCGATCT;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=60291421;WS=60291403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	60309947	rs4939400	A	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=600;SC=GTTGTATAATATTAAGAAACA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=60309955;WS=60309937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	60531264	rs12363342	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=138;ReadPosRankSum=0.341;SC=AAACAACGCCAGTGGCCTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=12;WE=60531272;WS=60531254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr11	60531346	rs1032939	T	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=263;ReadPosRankSum=0.090;SC=GAGCCACCGCTGGGGGCACAG;SOR=0.488;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=22;WE=60531354;WS=60531336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr11	60534901	rs4939450	G	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=781;SC=CTTTCCCAGTGGCCAACAAGC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=60534909;WS=60534891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	60543367	rs17628721	C	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=1.981;SC=CACACTTTCCCCAGTGCTTTC;SOR=1.981;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=60543375;WS=60543357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	60558375	rs11602321	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=403;ReadPosRankSum=0.647;SC=CAGTAGGTCCAGGGCACTAGT;SOR=0.483;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=32;WE=60558383;WS=60558365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr11	60559805	rs931861	A	G	9574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=157;PP=2965;SC=GTGAGTGGGCACACTGAGATC;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=129;TCR=157;TR=286;WE=60559813;WS=60559795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr11	60561613	rs751026	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CTGACTTCAGCGAAGGTGCTG;SOR=0.205;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=27;WE=60561621;WS=60561603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr11	60562975	rs4939457	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CACGTGATGCGTGCAGACACC;SOR=0.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=15;WE=60562983;WS=60562965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr11	60567230	rs11230483	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TATTTAATCTCAATGTCATTT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=65;WE=60567238;WS=60567220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,81:0.58:140
chr11	60567275	rs579967	G	A	5992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=76;PP=2965;SC=AGCTGCTGTTGCTATTAATAT;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=170;WE=60567283;WS=60567265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	60610065	rs2074420	G	A	4628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.771;SC=AGCTACCGCCGGTCCCAGGAT;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=142;TCR=135;TR=169;WE=60610073;WS=60610055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,201:0.61:329
chr11	60617646	rs495949	T	C	10148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=133;PP=2965;SC=AGGCTGCAGCTGCACTAATGT;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=178;TCR=133;TR=311;WE=60617654;WS=60617636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr11	60620585	rs2467642	A	G	9562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.32;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	60620590	rs2428461	C	G	9844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	60635091	rs550479	T	C	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=27;PP=1685;SC=TACTGCTGGTTGCCACCCTGG;SOR=1.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=90;WE=60635099;WS=60635081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	60637164	rs489172	C	T	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1134;ReadPosRankSum=2.041;SC=TCTGTCTCAACCCCACAAACC;SOR=0.822;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=265;TCF=129;TCR=136;TR=85;WE=60637172;WS=60637154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,107:0.35:310
chr11	60638461	rs10897122	C	T	4157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,186:0.60:308
chr11	60638470	rs566411	A	G	12878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.69;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr11	60689445	rs555835	T	C	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=782;ReadPosRankSum=-2.066;SC=GGTCGGTGCCTGACCCTTCCA;SOR=0.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=66;WE=60689453;WS=60689435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,87:0.56:156
chr11	60695301	rs575123	C	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=500;ReadPosRankSum=-1.514;SC=CACACCCTGCCGGCACTGCTC;SOR=0.355;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=29;WE=60695309;WS=60695291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr11	60703777	rs55920775	G	A	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1445;ReadPosRankSum=0.805;SC=GGAGGAGACCGAAGCCAGGGA;SOR=0.351;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=84;WE=60703785;WS=60703767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,96:0.70:138
chr11	60705454	rs2905692	A	G	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=64;PP=1995;SC=CCATGATGGCACCCTGCATGG;SOR=1.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=94;WE=60705462;WS=60705444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	60750048	rs2905506	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=20;PP=1552;SC=CCCCACTCCATTTGGTGTGCT;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=60750056;WS=60750038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	60750240	rs3019541	G	A	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=71;PP=2190;SC=GGAGGAAAGCGAGGTGCGAAG;SOR=2.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=60750248;WS=60750230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	60750298	rs72195127	GTCTGCAGGGAC	G	1563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=2957;SC=GAGAAGCCCAGTCTGCAGGGA;SOR=3.383;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=25;WE=60750316;WS=60750288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	60775007	rs4939485	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=457;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CCACCGGTCTCAGCTCTCTGG;SOR=0.948;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=31;WE=60775015;WS=60774997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr11	60775227	rs139918339	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=606;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CCTGAGCTGCCGCCCCCGCCT;SOR=0.799;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=41;WE=60775235;WS=60775217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr11	60776334	rs2905518	A	G	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=83;PP=2965;SC=GGGCGGAGTCACTGAAGCCCG;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=60776342;WS=60776324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	60776484	rs2074226	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=405;ReadPosRankSum=1.283;SC=GAGAAAGTGGTAAATGCCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=19;WE=60776492;WS=60776474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr11	60778650	rs10528068	C	CGTGT,CGTGTGTGTGTGTGT	2963.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.350;NF=1,1;NR=40,40;PP=736,1477;ReadPosRankSum=1.054;SC=GAAGCTTGGACGTGTGTGTGT;SOR=1.702;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=99;TCF=3;TCR=96;TR=41,41;WE=60778658;WS=60778640;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.41,0.53:68
chr11	60783108	rs2074229	C	T	2935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=37;PP=1744;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TCACCTCTGCCGTTCATACTC;SOR=0.510;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=183;TCF=121;TCR=62;TR=103;WE=60783116;WS=60783098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,130:0.57:227
chr11	60783126	rs3019556	C	T	12505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	60783135	rs3019557	A	G	12798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr11	60784934	rs2074231	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=124;ReadPosRankSum=-1.390;SC=CCTCCCCACCACCGCCTCTGC;SOR=1.101;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=12;WE=60784942;WS=60784924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr11	60785038	rs2074232	A	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=573;ReadPosRankSum=1.870;SC=TCAGGATGGGAAGGGGTGTGA;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=42;WE=60785046;WS=60785028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,50:0.38:131
chr11	60785263	rs61755080	A	G	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1060;ReadPosRankSum=1.120;SC=CCACATCCCAACTGCCAACCC;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=75;TCR=93;TR=74;WE=60785271;WS=60785253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,86:0.44:197
chr11	60785352	rs1050922	A	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=607;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GCACCTCTTCAGGGGAGGATT;SOR=0.879;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=37;WE=60785360;WS=60785342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,52:0.40:129
chr11	60890563	rs4245224	C	T	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=782;ReadPosRankSum=-1.512;SC=AGGGGCTGCACTAGAGTCCTC;SOR=1.051;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=48;WE=60890571;WS=60890553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr11	60891310	rs7106643	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=320;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CCCCCACCCATACCTGCCCCC;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=20;WE=60891318;WS=60891300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr11	60892606	rs637186	A	G	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=77;PP=2719;ReadPosRankSum=-0.641;SC=AGGAACTCCCACCTGTCAGCT;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=122;WE=60892614;WS=60892595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
chr11	60893235	rs2229177	C	T	3099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=76;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.961;SC=CTGGAAGGGGCTCTGCATCGC;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=271;TCF=116;TCR=155;TR=135;WE=60893243;WS=60893225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,152:0.49:308
chr11	60899767	rs754382	A	G	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=54;SC=AGGCATGGCTAATGGTGGCTG;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=60899775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	60906450	rs508970	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GAGAGGCAGAAATCTCTGAGA;SOR=0.465;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=16;WE=60906458;WS=60906440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	61099072	rs2230356	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=523;ReadPosRankSum=0.444;SC=CCTCTTTGACGGGCCGAAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=30;WE=61099080;WS=61099062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,43:0.36:118
chr11	61100308	rs2512810	G	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.93;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	61106525	rs2512809	C	T	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=8;PP=407;SC=CACTCCACTCCTTCCACCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=61106533;WS=61106515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	61106892	rs2513329	G	C	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=85;PP=2074;SC=TGTGCGGCACGGTGCTTATAC;SOR=1.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=36;TCR=85;TR=121;WE=61106900;WS=61106882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	61108974	rs2260655	G	A	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=45;PP=1458;SC=GAACGTGGTCGCCAAGGCCAT;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=61108982;WS=61108964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	61110169	rs4939514	A	C	9822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=141;NR=169;PP=2965;SC=ACCCCTCCTAAACCTCTGGGG;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=310;TCF=141;TCR=169;TR=310;WE=61110177;WS=61110159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr11	61112802	rs2305465	C	T	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=53;PP=2812;SC=AGTTGTCTGTCCTGCTCCTGG;SOR=1.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=131;WE=61112810;WS=61112792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	61123965	rs76030461	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=404;SC=GTCCAGCCTGAGCCCTATCCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=61123973;WS=61123955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	61165280	rs3741265	G	A	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=624;SC=GAAAGATGCCGCTCAGTATTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=61165288;WS=61165270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	61165731	rs11382548	C	CA	8348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=72;PP=2957;SC=TTTCTGCCATCGTATGGACAG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=27;TCR=72;TR=98;WE=61165749;WS=61165721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	61165741	rs10897158	G	C	8389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=77;PP=2526;SC=CGTATGGACAGGATTTGAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=154;WE=61165749;WS=61165721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	61179285	rs3019198	G	A	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=23;PP=981;SC=ACTTGGCTTCGATGCCATGAA;SOR=1.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=54;WE=61179293;WS=61179275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	61197460	rs34378918	GC	G	544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=4;PP=282;SC=CCCAGGTCCCGCCCCCCCCGC;SOR=1.981;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=13;WE=61197468;WS=61197450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	61204361	rs896831	A	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=19;PP=766;SC=ATAAGTTGTCAACTTCTCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=61204369;WS=61204351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	61205434	rs879647	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=743;SC=ATTAGACACAGCCTTCTCAAC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=61205442;WS=61205424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	61205688	.	TGAGAC	T	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=1.984;QD=3.48;ReadPosRankSum=-3.403;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	61249383	rs3019200	C	A	6890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=111;PP=2965;SC=GCTACTGCACCGCCTACGGTG;SOR=0.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=82;TCR=111;TR=193;WE=61249391;WS=61249373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	61253200	rs3019187	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=363;SC=CACCTGCTGGGACACTGAGCC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=61253208;WS=61253190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	61253973	rs2957858	A	G	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.05;NF=112;NR=82;PP=2965;SC=TCCTGGTGCCAGTGGCTGCTT;SOR=1.054;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=194;WE=61253981;WS=61253963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	61254376	rs3019188	G	C	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=685;SC=GCTGCCTCAGGCTGGCCACCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=61254384;WS=61254373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	61286328	rs201838981	T	TACCCCACAG	765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr11	61404766	rs75153210	C	T	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.153;NF=62;NR=29;PP=1433;ReadPosRankSum=0.369;SC=AAGTGCTTGACATCACAGAGG;SOR=1.177;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=91;WE=61404774;WS=61404756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,106:0.60:177
chr11	61487690	rs198430	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=654;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TCGTCCTACCGGCCATCTTCC;SOR=0.950;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=46;WE=61487698;WS=61487680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr11	61490880	rs9735635	C	A	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1666;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GCGCCCCTACCTAATGCCTCC;SOR=0.831;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=97;WE=61490888;WS=61490870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,127:0.52:245
chr11	61491097	rs566009	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=615;SC=CTGTCTGGTGAGCAGAGGTCT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=61491105;WS=61491087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	61496648	.	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=180;ReadPosRankSum=-0.829;SC=ATGCCCCTCACGAGAACCACC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=61496665;WS=61496638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	61496657	rs198417	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=211;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ACGAGAACCACCCACTTCACA;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=61496665;WS=61496638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	61505168	rs198444	G	A	5906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=97;PP=2965;SC=GTGAGGATGCGATGGAGTATT;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=83;TCR=97;TR=180;WE=61505176;WS=61505158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr11	61505583	rs2240287	G	A	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1057;ReadPosRankSum=0.417;SC=CCTGGCTGACGGCCCTGTCTC;SOR=0.483;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=61;WE=61505591;WS=61505573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr11	61505696	rs198443	G	T	8176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=1.100;SC=CCCCACCTGGGCACCCTGCCT;SOR=0.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=253;WE=61505704;WS=61505674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,303:1.00:304
chr11	61508522	rs198440	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=72;ReadPosRankSum=-0.310;SC=GACCCAAGTGACTCCATGAGG;SOR=0.199;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=7;WE=61508530;WS=61508515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	61511498	rs3741252	C	T	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=37;PP=2066;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGTGGCGGGCCGGCCTCCCGC;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=127;TCR=68;TR=107;WE=61511506;WS=61511488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,123:0.56:218
chr11	61523300	rs10709102	GA	G	926.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=905;ReadPosRankSum=0.743;SC=GGTGTGCAGGGAGCCTTGGAG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=24;WE=61523308;WS=61523290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr11	61524507	rs2238001	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=731;ReadPosRankSum=0.929;SC=AATTATTAACTGAATCATTAA;SOR=0.581;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=55;WE=61524515;WS=61524497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr11	61524974	rs198460	G	A	4378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=92;PP=2855;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GAAGATTACTGGTCCCCAGGG;SOR=0.532;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=307;TCF=129;TCR=178;TR=165;WE=61524982;WS=61524964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,193:0.53:365
chr11	61534872	rs547589	A	C	7985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=143;PP=2965;SC=GGCCACTGCTACCGTCAGGAT;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=109;TCR=143;TR=252;WE=61534880;WS=61534862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr11	61536583	rs579383	G	A	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=30;PP=1677;SC=TGGGTGGTGCGGAGAAATGCC;SOR=1.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=61536591;WS=61536573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	61543499	rs174528	T	C	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=49;PP=2621;SC=AGCCCCATCCTGAGGTGCCAC;SOR=1.301;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=141;WE=61543507;WS=61543489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	61543961	rs174529	T	C	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=78;PP=2193;SC=AGGAAGACACTGCCCTGGGTG;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=124;WE=61543969;WS=61543951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	61547068	rs7943728	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=420;ReadPosRankSum=0.453;SC=GATGGCAGGCGGGTTGGAAAG;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=27;WE=61547076;WS=61547058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr11	61547237	rs108499	C	T	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=41;PP=1816;SC=ACCGCTCCTCCGACCTCCAGC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=61547245;WS=61547227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	61548559	rs509360	A	G	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=51;PP=2965;SC=GGAGGTTGCTATGTTCTGTCT;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=147;WE=61548567;WS=61548549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	61549025	rs174533	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=985;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TTCTTAGCCTGTGCCTGGTTC;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=73;WE=61549033;WS=61549015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,89:0.48:187
chr11	61551356	rs174535	T	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=303;ReadPosRankSum=-1.856;SC=TCCCTGTCAGTAGTGGCACCC;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=22;WE=61551364;WS=61551346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr11	61551927	rs174536	A	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.579;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=-0.648;SC=ACTGGGCCCCAAAATGGGCAA;SOR=0.024;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=13;WE=61551935;WS=61551917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr11	61557422	rs117110139	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=694;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GCAAAGCGAAGGGGTGGACTG;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=46;WE=61557430;WS=61557412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr11	61557803	rs102275	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAATAAGGCTATAACCTGCC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=61557811;WS=61557793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	61557826	rs102274	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=1.336;SC=TGGGCATCACTAGCCCTCCTC;SOR=0.053;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=61557834;WS=61557816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	61560081	rs174538	G	A	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.091;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=953;ReadPosRankSum=1.759;SC=GAACACGTCGGCAGGAGCAGG;SOR=0.876;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=45;TCR=106;TR=61;WE=61560089;WS=61560071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,68:0.40:170
chr11	61569830	rs174546	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=1.152;SC=TCCCCTCTGCCTTGGCTCCAG;SOR=1.013;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=27;WE=61569838;WS=61569820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr11	61570783	rs174547	T	C	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1626;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CACCTACGCATCCTTTTCAAT;SOR=0.702;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=229;TCF=115;TCR=114;TR=100;WE=61570791;WS=61570773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,112:0.40:278
chr11	61571348	rs174548	C	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=334;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TCCAGACTCACTCATCTTCAG;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=18;WE=61571356;WS=61571338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr11	61571382	rs174549	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=0.718;SC=CAATCCTGCAGTATCTAGTGC;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=61571390;WS=61571372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	61579463	rs174554	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGGATTACAGACATGAGTCAC;SOR=0.425;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=12;WE=61579471;WS=61579453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr11	61580635	rs174556	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=313;ReadPosRankSum=1.007;SC=TGACTGTGATCCCATCTAGAC;SOR=0.901;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=25;WE=61580643;WS=61580625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr11	61582708	rs174561	T	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=719;ReadPosRankSum=-0.641;SC=GCCGCGGCATTCCCGGCCCCA;SOR=0.766;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=52;WE=61582716;WS=61582698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,66:0.45:148
chr11	61593816	rs174568	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=527;ReadPosRankSum=-1.250;SC=GGCCGGTCCACGCTTCTCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=40;WE=61593824;WS=61593806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,49:0.36:138
chr11	61615803	rs174589	C	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=567;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TTGTCCTGGGCGAATGGCAGA;SOR=0.361;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=32;WE=61615811;WS=61615793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr11	61624705	rs498793	T	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=287;ReadPosRankSum=0.751;SC=CCTCAGCCTGTGTTACAGGCC;SOR=0.549;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=27;WE=61624713;WS=61624695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr11	61624885	rs526126	G	C	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=23;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GCACAGGCAGGGTGGAATGGA;SOR=1.065;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=139;TCF=93;TCR=46;TR=77;WE=61624893;WS=61624875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,80:0.54:147
chr11	61641211	rs6591665	A	G	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=865;SC=TGGAGGGGTGAGGGTATCGAT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=61641219;WS=61641201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	61645967	rs174453	C	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=619;ReadPosRankSum=0.538;SC=AGGTTGTCCACGTCCCTCCCC;SOR=0.786;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=39;WE=61645975;WS=61645957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr11	61647427	rs174635	T	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=347;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CCGAGGGAGCTGCTCCTGGCC;SOR=0.534;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=22;WE=61647435;WS=61647417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	61658629	rs693672	T	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=611;ReadPosRankSum=0.411;SC=GGCTTCCTTATGGCTTCCTTA;SOR=0.803;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=45;WE=61658637;WS=61658619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,53:0.45:118
chr11	61658800	rs174465	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=492;ReadPosRankSum=0.763;SC=TGGGCAGCGGCGCCCCCGGCT;SOR=0.384;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=29;WE=61658808;WS=61658790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr11	61670037	rs174471	C	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=911;ReadPosRankSum=-1.345;SC=AAATGGGTCACGGGGGCTGGC;SOR=0.886;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=56;WE=61670045;WS=61670027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,69:0.54:128
chr11	61671956	rs174472	A	G	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TCGGCACAGTAAACACACGGC;SOR=1.107;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=60;WE=61671964;WS=61671946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr11	61672235	rs174473	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=341;ReadPosRankSum=1.244;SC=CCTCCTGCATTGTGAAGTCCA;SOR=0.821;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=28;WE=61672243;WS=61672225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr11	61672265	rs174474	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=287;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCACGTCCTCTCGGTACACCC;SOR=0.548;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=22;WE=61672273;WS=61672255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr11	61674118	rs174476	C	T	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1439;ReadPosRankSum=1.203;SC=TGATGACCAGCGTCTTCAAGG;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=84;WE=61674126;WS=61674108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,93:0.59:157
chr11	61675644	rs174477	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=536;ReadPosRankSum=-1.497;SC=CTCCTGGCCTTGGGCCTCCTC;SOR=0.762;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=36;WE=61675652;WS=61675634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr11	61724514	rs195162	C	T	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=758;SC=GTGGGAAGGGCTGTGGTCCAC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=61724522;WS=61724504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	61725599	rs113492158	A	ATCCTCCTCC	2760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=2983;SC=TTGCTACCACATCCTCCTCCT;SOR=3.296;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=23;WE=61725607;WS=61725589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	61726871	rs195158	G	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=423;SC=CAGGAAGGGCGTCATGGGGTG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=61726879;WS=61726861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	61730183	rs1800008	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=689;ReadPosRankSum=-1.367;SC=TCTCAGAGAGCGATGGGGCCT;SOR=0.792;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=76;TCR=36;TR=45;WE=61730191;WS=61730173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,53:0.41:130
chr11	61730234	rs1800009	T	C	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=22;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GGAGGAAAACTGTGGAGTTTA;SOR=1.016;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=182;TCF=117;TCR=65;TR=73;WE=61730242;WS=61730224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr11	61730553	rs17185413	T	C	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.059;SC=AGGGAAGTGTTCGGGACCTTT;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=82;TCR=99;TR=79;WE=61730561;WS=61730543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,94:0.41:227
chr11	61731534	rs195155	G	T	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=17;PP=998;SC=GAAATGAAGGGACCTTCCATA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=61731542;WS=61731524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	61735553	rs11271453	T	TGCTGCAGATTGGGAA	4344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=2974;SC=TGTGACACCTTGCTGCAGATT;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=32;WE=61735561;WS=61735543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	61736135	rs77709427	GT	TG	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=414;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CAGGGTGGATGTGAATTTATG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=61736144;WS=61736125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	61895541	rs1675130	A	G	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=8;PP=856;SC=GTTGTGGGTCAGGTGGGTATT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=61895549;WS=61895531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	61895741	rs1675131	A	G	6594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=102;PP=2965;SC=GGCTTGAGGAAATCCAAGAGG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=87;TCR=102;TR=189;WE=61895749;WS=61895731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	61896215	rs1792946	G	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=30;PP=1999;SC=AGGCAGCCTCGAGTGACACCC;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=92;WE=61896223;WS=61896205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	61897197	rs1792944	C	T	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=607;SC=CTTGGAGAGACTGGGTGCCAC;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=61897205;WS=61897187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	61897359	rs1675133	C	T	7921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=114;PP=2965;SC=ACGGCTCCGTCCTGCGGCGTG;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=135;TCR=114;TR=249;WE=61897367;WS=61897349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr11	61906299	rs1614060	A	G	7988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=109;PP=2965;SC=GCTCTGCACTACGGCCATCCT;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=146;TCR=109;TR=254;WE=61906307;WS=61906289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	61906374	rs1675126	T	C	9249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=166;PP=2965;ReadPosRankSum=1.883;SC=CTGAGAACAATGGAAATAACT;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=293;TCF=127;TCR=166;TR=292;WE=61906382;WS=61906364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,352:1.00:353
chr11	61907909	rs1675124	A	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=53;PP=1504;SC=CCAAGGAGGCAGCTCCATGCT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=61907917;WS=61907899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	61908440	rs2277283	T	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=568;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CAGATGCTCATGACCCCGACC;SOR=0.860;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=43;WE=61908448;WS=61908430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,54:0.34:157
chr11	61908672	rs1675123	G	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=265;SC=TGTGGCCACCGGCTGTCTTGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=61908680;WS=61908662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	61913196	rs7129085	G	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=26;PP=943;SC=AGGAAGAGGAGGCACGTAGGC;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=61913204;WS=61913186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	61914056	rs11230931	G	A	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=12;PP=1094;SC=CCTGGGCTTCGGGGGAGTAGG;SOR=2.221;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=61914064;WS=61914046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	61915823	rs3890102	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=182;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CTGGTTGCCCATTCAGCAATC;SOR=0.903;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=16;WE=61915831;WS=61915813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr11	61959725	rs3831484	GTC	G	1430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.966;NF=3;NR=25;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GGTAATTTCTGTCTCTTTCAT;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=28;WE=61959734;WS=61959715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr11	61960763	rs11441356	T	TC	1839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=1383;ReadPosRankSum=1.904;SC=CCTCTACCCTTCAATTGTCTT;SOR=0.526;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=34;WE=61960771;WS=61960753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,58:0.60:96
chr11	61960809	rs7951859	C	A	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TGGATGTTAACCTGTTGTCTC;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=82;TCR=54;TR=82;WE=61960817;WS=61960799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,96:0.58:166
chr11	61960827	rs2232941	T	C	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1183;ReadPosRankSum=-1.995;SC=CTCCAGGAGCTGCATGACCGA;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=91;WE=61960835;WS=61960817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,105:0.59:178
chr11	62010667	rs2232949	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=0.106;SC=TGTGAACATATAACCCAGGGG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=16;WE=62010675;WS=62010657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	62037583	rs11603383	G	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=775;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GTGGAATTAAGATGCCTACCT;SOR=0.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=88;TCR=42;TR=49;WE=62037591;WS=62037573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr11	62040519	rs17709552	A	G	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1411;ReadPosRankSum=0.318;SC=TGAGAAACCAACTACGGATTG;SOR=0.659;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=216;TCF=103;TCR=113;TR=92;WE=62040527;WS=62040509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,101:0.39:256
chr11	62040655	rs72919472	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=1.603;SC=TTTGTTCTACCGTAGAAAAGA;SOR=0.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=12;WE=62040663;WS=62040645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	62040694	.	TAC	T,TACAC	440.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=8,8;PP=234,228;SC=ATATTTTACATACACACACAC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8,8;WE=62040703;WS=62040684;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.53,0.47:15
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chr11	62064841	rs4477443	T	C	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.86;ReadPosRankSum=2.165;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
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chr11	62105391	rs2513749	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=-0.648;SC=ACCCGCGCGGCTTCCTTGGGC;SOR=0.193;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=19;WE=62105399;WS=62105386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr11	62124696	rs143687152	C	CTTTTGTTTTG	201.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=722;SC=ATCTACAGTTCTTTTGTTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=3;WE=62124704;WS=62124686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	62156572	rs74692811	G	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=990;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CTCATTTTCAGCCTGTCACTT;SOR=0.579;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=175;TCF=110;TCR=65;TR=74;WE=62156580;WS=62156562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,77:0.40:192
chr11	62158886	rs2958531	G	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=875;SC=GACCTTTGTCGGTACTTGAGC;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=62158894;WS=62158876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	62158924	rs2958532	C	T	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=32;PP=1553;SC=TTTCATGTAGCGTCCGACTTC;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=62158932;WS=62158914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	62190448	rs11231085	C	G	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=917;ReadPosRankSum=1.258;SC=GTTGAAGTTTCTGTGGCTCGT;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=96;TCR=78;TR=66;WE=62190456;WS=62190438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,76:0.36:214
chr11	62201458	rs4084164	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=386;ReadPosRankSum=0.503;SC=ACCAACTGAAAGAAGGTCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=19;WE=62201466;WS=62201448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr11	62283814	rs76939572	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=429;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CACCCACCCTTACTAACAAAA;SOR=0.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=24;WE=62283822;WS=62283804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr11	62292882	rs566144	G	T	9860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=125;PP=2965;SC=ATGTCCACTTGGGGACCCCTG;SOR=0.975;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=294;TCF=169;TCR=125;TR=294;WE=62292890;WS=62292872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr11	62293948	rs486903	G	A	6636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=95;PP=2965;SC=AGCCAGGCATGCTGAACTTTG;SOR=0.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=121;TCR=95;TR=216;WE=62293956;WS=62293938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	62328038	rs11231144	T	C	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=38;PP=951;SC=ATGGTCATTGTGCTGGCAGAT;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=62328046;WS=62328028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	62334096	rs7124057	A	G	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=150;SC=TGCTCTCCACAATCAAAATTT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=62334104;WS=62334086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	62334908	rs1061093	G	C	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.246;NF=37;NR=20;PP=1362;ReadPosRankSum=0.304;SC=GTTTCACTTCGCCCAAGACAG;SOR=1.276;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=57;WE=62334916;WS=62334897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
chr11	62365619	rs11231155	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=1173;SC=CAGTCCTGGAATTGGGGAGAG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=62365627;WS=62365609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	62369018	rs12226821	C	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=39;PP=1162;SC=CGGTGGGCTGCCGCTTCGAGG;SOR=2.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=62369026;WS=62369008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	62369881	rs35156678	G	A	14345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr11	62369884	rs35880596	C	G	14320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	62370155	rs71490394	G	A	11363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=213;NR=153;PP=2965;SC=CGGCGCCTGGGCCGGAGGGAA;SOR=1.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=366;TCF=213;TCR=153;TR=366;WE=62370163;WS=62370145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr11	62370490	rs71458425	C	CGAGGGCCG	9953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=50;PP=2973;SC=TTCCCGGTCCCGAGGGGCCTC;SOR=1.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=120;WE=62370498;WS=62370480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	62378660	rs12808829	G	A	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=49;PP=2215;SC=ATTGGGTCCCGCTAGGCTCTT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=101;WE=62378668;WS=62378650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	62378801	rs11553576	T	C	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=70;PP=2716;SC=GTGGCAGTCCTGGGGGGGCTG;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=144;WE=62378809;WS=62378791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	62379700	.	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=618;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GAGTTACGTGGGGCGTAGAAT;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=36;WE=62379708;WS=62379690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr11	62380027	rs113222038	C	T	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=6;PP=188;SC=CCCCGGGGCGCGCGCGAAGGG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=62380035;WS=62380017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	62380732	rs4387351	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=760;SC=CACCTCTGCATTCCCTTGGGC;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=62380740;WS=62380722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	62381106	rs1799959	G	C	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=59;PP=2721;SC=CTGGTCGTCGGCCTCGGGCTA;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=62381114;WS=62381096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	62381483	rs72927237	T	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=558;SC=CTGCCATTTATTAGCTGTGAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=62381491;WS=62381473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	62381703	rs35904570	C	CT	4057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=33;PP=2936;SC=TCCAGACATCCTAACCCCTCT;SOR=1.466;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=75;WE=62381711;WS=62381693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	62381808	rs1801144	G	C	6156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=76;PP=2965;SC=ACTCACCCCGGCCTTGCCTGC;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=84;TCR=77;TR=159;WE=62381816;WS=62381798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	62384869	rs4963224	T	C	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=78;PP=2057;SC=ACCATTTGCCTGCTCCAGCCA;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=124;WE=62384877;WS=62384859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	62394881	rs7949030	A	G	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=57;PP=1933;SC=ACAAGTCAGAAATGCTCCTCC;SOR=1.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=62394889;WS=62394871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	62397177	rs948683	C	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=41;PP=2128;SC=AGAGAAGAGACGGGTAGTGAG;SOR=1.047;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=104;WE=62397185;WS=62397167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	62400016	rs10897289	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=23;PP=939;SC=CCCTCCTTTTTCCCCGTGCCT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=62400024;WS=62400006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	62401716	rs2957121	A	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=20;PP=1067;SC=ACCTCCCCCCAAAGGCTAGAG;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=62401724;WS=62401706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	62416859	rs117991865	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=1.225;SC=GAAAAGAGGAGCCAATATGTG;SOR=0.497;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=40;WE=62416867;WS=62416849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,49:0.29:171
chr11	62432815	rs4489748	T	C	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=438;SC=GTAAGTGTGGTTTTAGCTGTA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=62432823;WS=62432811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	62433091	.	G	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.222;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CTCCATCGGGGTGCTCACACT;SOR=0.330;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=66;WE=62433099;WS=62433081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,75:0.67:112
chr11	62434173	rs11231181	G	A	7777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=118;PP=2965;SC=GGGTGGCCCAGGCCAAACACC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=114;TCR=118;TR=232;WE=62434181;WS=62434163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr11	62438750	rs17637597	T	C	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=52;PP=2037;SC=TGAGTGTTTGTTCCAGAGTTG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=101;WE=62438758;WS=62438740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	62438846	rs3809079	G	A	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=965;SC=AAACCACAGAGCACAGCTCGG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=62438854;WS=62438836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	62458275	rs6856	T	C	7756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=117;PP=2965;SC=CTGAGGGATCTTCAGGGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=117;TCR=117;TR=234;WE=62458283;WS=62458265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr11	62469929	rs72929434	C	A	3875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=59;PP=2496;SC=CTCTCTAGTTCCCATACTCAC;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=62469937;WS=62469919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	62487378	rs12291015	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=239;SC=CAGATGCTAATGCTATGCTCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=62487386;WS=62487372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	62490219	rs576251	G	A	10018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=174;PP=2965;SC=ACCTACAACCGGACTTCCCAT;SOR=0.967;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=306;TCF=130;TCR=176;TR=304;WE=62490227;WS=62490209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr11	62496519	rs584845	T	C	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=99;PP=2965;SC=AGAAAACATATTGCATACCAC;SOR=1.411;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=52;TCR=99;TR=151;WE=62496527;WS=62496509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	62505764	rs6675	C	T	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=44;PP=2589;SC=TCCAAGATGCCAACGTCCGGC;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=62505772;WS=62505754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	62521408	rs72929469	A	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=20;PP=2329;SC=CCCGCCCCTTAGCCACCCTCC;SOR=2.419;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=80;TCR=20;TR=100;WE=62521416;WS=62521398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	62521475	rs72929471	T	C	10011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=196;NR=104;PP=2965;SC=GAGATCTTTTTCGCTCCCAGG;SOR=1.299;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=196;TCR=104;TR=300;WE=62521483;WS=62521465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr11	62521663	rs3829248	C	T	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=59;PP=1775;SC=CTTTAATTGGCTTAAGATTGC;SOR=3.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=69;WE=62521671;WS=62521653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	62555059	rs3087924	G	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=237;SC=ACATGGCGAGGCCACTTTCGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=62555067;WS=62555049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	62563353	rs539465	G	A	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=51;PP=2965;SC=CTACAAACTCGGGACTCTAAA;SOR=1.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=98;TCR=51;TR=149;WE=62563361;WS=62563343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	62564009	rs4693	T	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=46;PP=1615;SC=GGAGCCCTTGTCGGTCTCCAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=62564017;WS=62563999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	62638200	rs549706	T	A	198.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	62638203	rs56065503	T	A	198.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	62638310	.	G	GTAATAA	141.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.27;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	62652063	rs489381	A	G	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=62;PP=2254;SC=CTAGAGCCTCATAATATTCTC;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=122;WE=62652071;WS=62652053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	62652779	rs4726	C	T	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1270;ReadPosRankSum=1.550;SC=TACAAAATCCCTAGTCACACA;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=67;WE=62652787;WS=62652769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,81:0.64:127
chr11	62677352	rs2067479	G	A	8021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=104;PP=2965;SC=TGTTGACGTAGCACAGCCAGT;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=136;TCR=104;TR=240;WE=62677360;WS=62677342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	62744899	rs3017670	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=796;SC=TTAGAGTTCCAGCATGAATGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=62744907;WS=62744889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	62747145	rs3017671	A	G	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=92;PP=2965;SC=CTTCTGAGATATTGGGTTATG;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=160;WE=62747153;WS=62747135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	62847352	rs11231338	G	A	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1568;ReadPosRankSum=1.135;SC=AGATATAAAGGCATAATCTTG;SOR=0.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=97;WE=62847360;WS=62847342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,120:0.60:200
chr11	62847453	rs7945121	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=438;ReadPosRankSum=-1.694;SC=TCCTGCTTTATGTTTCTTGAA;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=24;TCR=72;TR=39;WE=62847461;WS=62847443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr11	62847562	rs7926818	G	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr11	62848367	rs10897341	A	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=369;SC=TCCCCACTCAAGTGACAGCTA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=62848375;WS=62848357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	62848445	rs11231340	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=235;ReadPosRankSum=1.401;SC=TGGTTTCTGGAAGGAGGAGGA;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=17;WE=62848453;WS=62848435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr11	62848487	rs11231341	A	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=324;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGAAGACTCCATAGGAAATCC;SOR=0.598;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=21;WE=62848495;WS=62848477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr11	62848568	rs11231342	C	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.682;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,23:0.23:98
chr11	62848664	rs11231343	A	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=511;ReadPosRankSum=-1.609;SC=TATCATCATTATTTCTTTATG;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=30;WE=62848672;WS=62848654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
chr11	62848995	rs6591733	G	C	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=31;PP=2353;SC=TCAGAAATTTGTGTTTTGAAA;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=100;WE=62849003;WS=62848985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	62850684	rs4963356	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGGTAACTACTTTCTTTCCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=62850692;WS=62850678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr11	62863518	rs7113279	A	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1044;ReadPosRankSum=0.347;SC=CGGAACAGGGAAAAAATGGAT;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=89;TCR=101;TR=63;WE=62863526;WS=62863508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,83:0.32:260
chr11	62871460	rs12283166	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=2.477;SC=ATCCACTTCTCCCAGTATATT;SOR=0.191;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=62871468;WS=62871450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	62886319	rs948060	G	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=534;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CCAGGTGTCAGAATTTTCCTT;SOR=0.722;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=40;WE=62886327;WS=62886309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,48:0.35:136
chr11	62886800	rs4963245	G	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=474;ReadPosRankSum=-1.706;SC=ATGATCTTCCGTCCAACCCTA;SOR=0.752;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=26;WE=62886808;WS=62886790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr11	62902172	rs1939782	A	C	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=60;PP=2965;SC=GACCTCCCAGAAGTGACCCAG;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=157;WE=62902180;WS=62902162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	62910849	rs1939749	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=680;ReadPosRankSum=0.421;SC=GGGCCTCTTATCTCAGTCACG;SOR=0.940;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=46;WE=62910857;WS=62910839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,61:0.38:161
chr11	62911079	rs1939748	G	C	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1040;ReadPosRankSum=-1.969;SC=GTCAGACACAGTGTCATTGTC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=105;TCR=106;TR=68;WE=62911087;WS=62911069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,80:0.33:244
chr11	62931484	rs6591771	T	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1088;ReadPosRankSum=1.216;SC=AGGATCATCATGAGGGAAGCC;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=74;WE=62931492;WS=62931474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr11	62931538	.	C	A	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.510;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1117;ReadPosRankSum=1.142;SC=ATTCCAGTAGCTCTTCCCCTT;SOR=0.498;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=78;WE=62931546;WS=62931528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,86:0.62:138
chr11	62951064	rs1525072	C	A	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=30;PP=2697;SC=ACCCATAACTCTACCTGTGTT;SOR=2.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=94;TCR=30;TR=124;WE=62951072;WS=62951054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	62951221	rs11231397	C	G	4053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.144;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=91;PP=2776;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TGCAGCTTTTCTAAGTTCCTT;SOR=1.004;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=235;TCF=104;TCR=131;TR=156;WE=62951229;WS=62951211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,171:0.64:267
chr11	62984697	rs7949840	T	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=573;ReadPosRankSum=0.460;SC=CAAGGCTAGATAGAGGATCAA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=30;WE=62984705;WS=62984687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr11	62984868	rs11231409	T	C	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=2180;ReadPosRankSum=1.162;SC=AAAGCCAGGCTTCCCAGGGTT;SOR=0.445;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=115;WE=62984876;WS=62984858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,128:0.64:199
chr11	62985544	rs12417255	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=472;ReadPosRankSum=0.497;SC=AAAAGATACACGCACTCACAT;SOR=0.358;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=30;WE=62985552;WS=62985534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr11	62987638	rs11336277	CA	C	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TTTGCAAAGACAAAAAAAATC;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=62987646;WS=62987628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	62995875	rs7106186	G	A	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=24;PP=1501;SC=TAGATGAAAAGTGTTTCATGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=75;WE=62995883;WS=62995865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	62996162	rs7126435	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=298;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCATTACCTGATATTCACT;SOR=3.947;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=17;WE=62996170;WS=62996152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr11	63057925	rs1790218	G	A	7383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=123;PP=2965;SC=ATCCCCAGTGGCAGCTTCTTC;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=112;TCR=123;TR=235;WE=63057933;WS=63057915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr11	63064823	rs576641	T	C	6283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=AGCTTGCCATTACTGACACCT;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=63064831;WS=63064813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	63064970	rs575009	T	G	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=68;PP=2965;SC=TATGACCCTTTAATTTGACCT;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=144;WE=63064978;WS=63064960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	63066903	rs515213	T	C	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=2;PP=1182;SC=AAAGGGAACATATTTCTCTTG;SOR=4.362;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=43;WE=63066911;WS=63066893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	63067138	rs513338	T	G	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=65;PP=1960;SC=CATTAAAAGTTTGGTGACATG;SOR=1.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=21;TCR=65;TR=86;WE=63067146;WS=63067128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	63067181	.	A	AGTGTGTGTGT	855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=7;PP=2708;SC=TTGCAACAGTAGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=7;WE=63067189;WS=63067171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	63069715	rs557658	A	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=531;SC=ACTGACCAATAACTGCCTGGG;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=63069723;WS=63069705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	63072310	rs1201559	C	T	5235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=101;PP=2965;SC=TTCCTCCTACCAGAAACCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=164;WE=63072318;WS=63072300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	63129782	rs517655	A	G	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=18;PP=1751;SC=GAAAGGCATCACAGTATAAAG;SOR=2.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=83;WE=63129790;WS=63129772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	63129876	rs516763	T	G	6618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=96;PP=2965;SC=CTGCTCAATGTCTGCTCATCA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=123;TCR=96;TR=219;WE=63129884;WS=63129866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	63138482	rs566456	G	A	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=7;PP=1753;SC=GTAATGCTGAGAAAGGAAGCC;SOR=3.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=57;TCR=7;TR=64;WE=63138490;WS=63138472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	63175800	rs7109920	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AAAATAAATCATAACAGTCAT;SOR=0.943;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=25;WE=63175808;WS=63175790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr11	63176367	rs4088469	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.621;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=466;ReadPosRankSum=0.599;SC=TAAATAGCCCGGTTGCCCCTC;SOR=1.999;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=24;WE=63176375;WS=63176357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr11	63177242	rs78795943	A	AT	2970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1902;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CATTTTTGTGATTTTTTGTTG;SOR=0.665;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=230;TCF=97;TCR=133;TR=73;WE=63177250;WS=63177232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,131:0.38:347
chr11	63258416	rs10897424	T	C	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=91;PP=2413;SC=GGCCCGGTACTGGCGGTTCGC;SOR=1.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=58;TCR=91;TR=149;WE=63258424;WS=63258406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	63274120	rs12272556	G	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.399;SC=CCCAGCACCTGCCCTGGGTTC;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=14;WE=63274128;WS=63274110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	63278516	rs138157635	C	T	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1339;ReadPosRankSum=1.748;SC=GCAAATACCACATGGCCTTGT;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=238;TCF=129;TCR=109;TR=95;WE=63278524;WS=63278506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,115:0.41:283
chr11	63278621	rs2239679	C	G	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=55;PP=1387;ReadPosRankSum=0.385;SC=GGGGGCGCAGCCTGGGTGAGC;SOR=0.422;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=103;TCF=17;TCR=86;TR=67;WE=63278629;WS=63278611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,71:0.66:107
chr11	63283220	rs3740633	C	G	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1286;ReadPosRankSum=2.058;SC=TCCCTTCAGGCTGGAGCACAG;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=173;TCF=71;TCR=102;TR=86;WE=63283228;WS=63283210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,102:0.48:212
chr11	63284035	rs3781604	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-0.938;SC=GGGAAGGCACAAGAGTGCAAA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=63284043;WS=63284025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr11	63313644	rs584905	T	C	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=29;PP=1319;SC=AGGTTGAAGTTGGTGTGGCCA;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=68;WE=63313652;WS=63313634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	63357919	rs593759	C	T	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=70;PP=2153;SC=CCCAGCCGGGCATCTGCCCTT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=96;WE=63357927;WS=63357909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	63413962	rs147319344	AAAAT	A	2114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=43.16;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	63487386	rs542998	T	C	4723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=69;PP=2965;SC=GTGAAAGTGGTTTTACCTGAT;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=146;WE=63487394;WS=63487376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	63585458	rs142984715	C	T	4041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.03;MQRankSum=-1.057;NF=88;NR=54;PP=2551;ReadPosRankSum=0.833;SC=CACCCTCGGCCGACACAGCTC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=266;TCF=165;TCR=101;TR=142;WE=63585466;WS=63585448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,174:0.53:328
chr11	63636181	rs12792726	G	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=13;PP=844;SC=GTCTGCCTGCGTTGTTGCTCC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=63636189;WS=63636171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	63668557	rs224174	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=56;PP=1743;SC=TGCTCCCCGCCCCATTCTCTG;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=68;WE=63668565;WS=63668547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	63673603	rs10625190	C	CTG	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=547;ReadPosRankSum=1.449;SC=GTTGAGCCCGCTGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=12;WE=63673611;WS=63673593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr11	63679369	rs320108	T	C	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=4;PP=69;SC=TCCAGAGGGGTTCCAATCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=63679377;WS=63679359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	63680045	rs320109	C	A	7936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=120;PP=2965;SC=AATACCCCTTCGAACTAGTTA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=124;TCR=120;TR=244;WE=63680053;WS=63680035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr11	63680297	rs320110	A	G	10713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=175;PP=2965;SC=CTCTGCCTCCAGAGAGAAACC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=340;TCF=165;TCR=175;TR=340;WE=63680305;WS=63680287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr11	63681513	rs10897461	T	C	5157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=80;PP=2965;SC=CCGTGAGGCCTTCAGGGCTCA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=159;WE=63681521;WS=63681503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr11	63682312	rs4375445	G	C	13674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr11	63682315	rs34212439	C	G	13719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr11	63682317	rs113350066	TG	T	13687.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=115;PP=2974;SC=CAGCTGAGCCTGAGCTGCCCC;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=34;TCR=116;TR=149;WE=63682327;WS=63682302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr11	63682319	rs57942405	A	C	13471.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=115;PP=2965;SC=GCTGAGCCTGAGCTGCCCCGG;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=256;TCF=128;TCR=128;TR=237;WE=63682327;WS=63682302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr11	63713317	rs3740637	G	A	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=30;PP=1486;SC=TGCAGAGAAAGTCAAGCAAAG;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=63713325;WS=63713307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	63714319	rs4980500	T	C	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=83;PP=2965;SC=AGTCTCCCGTTGTGGGTCCCC;SOR=0.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=114;TCR=83;TR=196;WE=63714327;WS=63714309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	63720086	rs4980513	T	G	4839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.073;SC=CCTGGCGATGTTCCAGGCACT;SOR=2.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=31;TCR=126;TR=155;WE=63720094;WS=63720076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,164:0.99:166
chr11	63766368	.	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=0.622;SC=GACAGTGAGAGCCCGCCCCCA;SOR=0.392;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=20;WE=63766376;WS=63766358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr11	63767186	rs709594	A	G	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=53;PP=1785;SC=CGGCAGCCTGACTGGCGCTGG;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=63767194;WS=63767176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	63767249	rs11600062	C	T	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=34;PP=939;SC=CGGGGGGCGACGGGGTCAGAC;SOR=1.453;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=63767257;WS=63767239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	63769144	rs539432	C	G	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=71;PP=2896;SC=ACGCTGAGAACGGCTCAGGCC;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=128;WE=63769152;WS=63769134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	63883985	rs614397	T	C	10103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=156;PP=2965;SC=TCCCTGATGATGCCACCACCC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=330;TCF=174;TCR=156;TR=329;WE=63883993;WS=63883975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr11	63884027	rs614035	C	T	9801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=172;PP=2965;SC=TCAACAACGCCGGCATCCCCC;SOR=0.955;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=132;TCR=172;TR=304;WE=63884035;WS=63884017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr11	63884561	rs34856996	G	A	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=935;ReadPosRankSum=0.805;SC=ACCTGCAGAAGCTCTACCTGC;SOR=1.032;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=57;WE=63884569;WS=63884551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr11	63885305	rs3824854	C	T	3577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=62;PP=2053;ReadPosRankSum=0.010;SC=ATGAGACACCCGTGTGTGCCA;SOR=0.829;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=316;TCF=165;TCR=151;TR=136;WE=63885313;WS=63885295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,171:0.44:387
chr11	63885632	rs4379854	A	G	8626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=127;PP=2965;SC=GCGCCAAAGAAGAGTACGTGG;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=139;TCR=127;TR=266;WE=63885640;WS=63885622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr11	63885704	rs677447	C	T	7946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=154;PP=2965;SC=CCATTGGCTACGGCACCACGC;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=92;TCR=154;TR=246;WE=63885712;WS=63885694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr11	63918589	rs2282492	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-0.830;SC=GCCAGCAGGCTGTCCTTGCCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=11;WE=63918597;WS=63918582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr11	63962152	rs2282490	T	C	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.466;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr11	63962162	rs67546972	G	A	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr11	63964657	.	C	T	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=23;QD=19.2570708491;SC=ATGTTAGTTGCATTTCAGAAC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=63964665;WS=63964653;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	63967770	rs11231722	C	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=871;ReadPosRankSum=1.628;SC=CTCAAGGTGACGAGACCTGTG;SOR=0.720;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=163;TCF=81;TCR=82;TR=67;WE=63967778;WS=63967760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,85:0.42:204
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chr11	63971256	rs148030896	C	CTTTG	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.228;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GCTGGAAGGGCTTTGTTAGTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=4;WE=63971264;WS=63971246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	63974710	rs142842309	CCTT	C	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CTCCCGCCCTCCTTCATGAGC;SOR=0.330;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=63974720;WS=63974700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	63986713	rs11603538	C	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=610;ReadPosRankSum=-1.305;SC=CTCCTCTCCCCCCGCTCCAGA;SOR=0.745;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=45;WE=63986721;WS=63986703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,45:0.36:126
chr11	63988102	rs3802933	C	T	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1053;ReadPosRankSum=2.741;SC=CCTACGGCCTCGTTGCCCCCC;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=73;WE=63988110;WS=63988086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,85:0.34:249
chr11	63990996	rs5792315	AC	A	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.083;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=473;ReadPosRankSum=1.717;SC=CCTGCTCACCACCCTGTCACA;SOR=0.120;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=16;WE=63991004;WS=63990986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr11	63991801	rs1059440	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=667;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TATTTCACAATGGGACCGCAT;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=34;TCR=82;TR=51;WE=63991809;WS=63991791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,52:0.42:125
chr11	63994692	rs1860368	T	C	3437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=5.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,152:0.55:276
chr11	63994696	rs2429456	T	C	10078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.05;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr11	63995302	rs2429455	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=211;ReadPosRankSum=-1.403;SC=AATTCTAGCCCTCAGTACCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=63995310;WS=63995292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	63997329	rs633561	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.65;SOR=1.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	63997338	rs633557	T	C	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.83;SOR=1.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	63997578	.	A	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr11	63997882	rs11311686	AT	A	722.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.789;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr11	63999240	rs3741404	G	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=274;ReadPosRankSum=0.442;SC=TTTCAGCCCTGTCAGCTCCTG;SOR=0.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=13;WE=63999248;WS=63999230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr11	63999529	rs3741403	C	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=41;PP=943;ReadPosRankSum=1.866;SC=GCATCTCTGGCGGGTGCCACA;SOR=0.436;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=23;TCR=81;TR=53;WE=63999537;WS=63999519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr11	64000410	rs1058735	C	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GTCAGCCAGTCCTCCACAGCA;SOR=0.408;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=25;WE=64000418;WS=64000400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr11	64002238	rs7482791	T	C	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	64003843	rs11603042	G	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=726;ReadPosRankSum=0.445;SC=GGCCAGGCTTGGGGGGTGCTG;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=25;TCR=89;TR=45;WE=64003851;WS=64003833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,52:0.40:129
chr11	64004557	rs67110559	AAGAGAGAGAGAGAGAG	A	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQ=60.72;NF=2;NR=2;PP=1193;SC=CACAGTCTCAAAGAGAGAGAG;SOR=2.147;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=64004589;WS=64004547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	64004692	rs12366035	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=60.11;MQRankSum=-0.850;NF=18;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=1.257;SC=TGAAGCCAGACAGGTGAGTCT;SOR=0.809;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=31;WE=64004700;WS=64004682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr11	64010085	rs2070765	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=758;ReadPosRankSum=-1.686;SC=AGGACCAGAGAGTGCTTGGGA;SOR=0.541;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=47;WE=64010093;WS=64010075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr11	64011441	rs654573	T	C	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=55;PP=1371;SC=CCCCTACAGGTGGTGCAACCC;SOR=1.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=64011449;WS=64011431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	64011554	.	C	CA	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5064;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=18;MQ=56.32;NF=0;NR=3;PP=51;QD=21.0;SC=CAGACTGTTCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=64011562;WS=64011544;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr11	64012225	rs605187	G	C	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=933;SC=GTCGGGGACCGTCACTTCTTC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=64012233;WS=64012215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	64012784	rs12798333	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=456;ReadPosRankSum=-1.336;SC=GGGGAGGAGGGAGAGACATAA;SOR=1.080;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=30;WE=64012792;WS=64012774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr11	64012949	rs57467371	TG	T	351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=8;PP=166;SC=CAAAGCGGGGTGGGGGGGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=64012957;WS=64012939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	64019006	rs371707004	TGGCG	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CGGGACAGACTGGCGGGCGGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=1;WE=64019017;WS=64018996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr11	64022459	rs632439	A	G	4705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=78;PP=2965;SC=GGCCAGACCCAGTGAACACAG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=147;WE=64022467;WS=64022449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	64023971	rs7943988	G	A	4016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=66;PP=2481;ReadPosRankSum=-0.077;SC=AGGCCCGGCTGCTCATCGAAA;SOR=0.607;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=238;TCF=139;TCR=99;TR=153;WE=64023979;WS=64023961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,182:0.63:291
chr11	64024056	rs588177	C	A	7507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=104;PP=2965;SC=CAGGTGGGACCCCAGCTGACC;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=125;TCR=104;TR=229;WE=64024064;WS=64024046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr11	64026144	rs2244625	G	A	11238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=173;NR=173;PP=2965;ReadPosRankSum=0.209;SC=TCAAGACCTCGCCCTACCCCG;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=348;TCF=173;TCR=175;TR=346;WE=64026152;WS=64026134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,414:1.00:415
chr11	64026685	rs28395882	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=1.344;SC=GCGAGAGCTCCGCGGCCACCG;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=23;WE=64026693;WS=64026675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr11	64030944	rs2510067	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=21;PP=915;SC=GTCAGCCCTGTGGCTCAGCTC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=64030952;WS=64030934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	64033555	rs3815362	C	T	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1556;ReadPosRankSum=0.460;SC=TGGATAGACCCGTCGTCAGCC;SOR=0.572;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=101;TCR=72;TR=89;WE=64033563;WS=64033545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,102:0.52:195
chr11	64044284	rs72922077	C	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.954;SC=CCTGCCCACTCTTGCCATCCG;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=11;WE=64044292;WS=64044277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr11	64052306	rs652611	T	G	4503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=92;PP=2965;SC=CTCGTCCGCATCCTTTTTCCT;SOR=1.363;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=149;WE=64052314;WS=64052296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	64066859	rs2232417	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=688;SC=GGACTGGCACGGTGACAGCGC;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=64066867;WS=64066849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	64070940	rs11231746	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=989;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TAACCCTTTTTTCTCTTCTCC;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=64;WE=64070948;WS=64070930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,76:0.56:135
chr11	64072244	rs2286613	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=441;ReadPosRankSum=2.705;SC=GATGCATGGTCCGTGAGTCAG;SOR=1.169;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=26;WE=64072252;WS=64072234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr11	64082437	rs650008	C	T	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=33;PP=1082;SC=CTCTGGTGCGCTTGCTCAGCC;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=58;WE=64082445;WS=64082427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	64085074	rs550819	T	A	7534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=160;PP=2965;SC=GGGATGCTCCTCTCGATGCTA;SOR=1.424;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=84;TCR=160;TR=244;WE=64085082;WS=64085064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr11	64085148	rs28364831	A	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=738;ReadPosRankSum=0.006;SC=GTGGGAGCTGAGGTAGGTAGG;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=43;WE=64085156;WS=64085138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr11	64085785	rs7938623	A	G	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=37;PP=2262;SC=GCAAGACGGTACAGTGAAGGA;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=64085793;WS=64085775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	64085938	rs7941847	T	C	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=45;PP=1467;SC=AGAGTATCGCTTTATTTCCTG;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=64085946;WS=64085928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	64088435	rs566049	A	G	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=63;PP=2421;SC=GGGGGCCCTTAGCCTCTTCAA;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=110;WE=64088443;WS=64088425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	64088562	.	TGGAGAGAGTCCTCTGTG	T	601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.328;NF=2;NR=12;PP=2247;ReadPosRankSum=0.585;SC=GAGTCCTCTGTGGAGAGAGTC;SOR=0.288;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=14;WE=64088586;WS=64088552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	64107735	rs663743	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=347;ReadPosRankSum=-0.811;SC=ACCCCGACCCGGGCATGGAGG;SOR=0.882;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=27;WE=64107743;WS=64107725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr11	64108539	rs66493355	C	T	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1446;ReadPosRankSum=0.222;SC=AGAGGAGCCCCTTCGGGAAGG;SOR=0.529;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=62;TCR=79;TR=73;WE=64108547;WS=64108529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,80:0.53:152
chr11	64109118	rs647152	T	G	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1215;ReadPosRankSum=-2.694;SC=CTGGGCCAGATCCTGGGGAGC;SOR=0.533;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=77;WE=64109126;WS=64109108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,91:0.47:194
chr11	64110348	rs11602301	T	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=198;SC=TGTAGGGGAGTGGGGGGGCTG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=64110356;WS=64110338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	64110422	rs11601860	A	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CATGGACAGAAGGGCGGGGCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=64110430;WS=64110412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	64110668	rs574835	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=562;ReadPosRankSum=-0.153;SC=GGGTGCTCTCGGGGGTGCTGG;SOR=0.735;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=30;WE=64110676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr11	64110683	rs479552	G	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=709;ReadPosRankSum=0.659;SC=TGCTGGAGGCGTCCAAGGCGC;SOR=0.685;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=37;WE=64110691;WS=64110673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr11	64111928	rs685870	T	C	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=59;PP=1782;SC=GCCTGAGGCCTGGGGGTTGAG;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=64111936;WS=64111918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	64116843	rs1318165	A	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=22;PP=1097;SC=GAGTTGGGGGACCGGCTGGAG;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=64116851;WS=64116833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	64118422	rs614047	G	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=576;SC=CTGCCGCAGAGAGACAGAAGT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=64118430;WS=64118420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr11	64120435	rs489419	T	C	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=26;PP=1169;SC=TGGGGTCCTGTCTGGCCTCCC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=64120443;WS=64120425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	64120451	rs61886887	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=418;ReadPosRankSum=0.469;SC=CTCCCCTCCCCGGCATAACTT;SOR=1.270;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=25;WE=64120459;WS=64120441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr11	64124515	rs612448	T	C	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=42;PP=1922;SC=CTCTAGGCCCTGAGGTACAGG;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=113;WE=64124523;WS=64124505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	64124823	rs519763	C	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=38;PP=1745;SC=GTGGCTCCCGCTGAGGCAGCG;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=89;WE=64124831;WS=64124813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	64124940	rs600377	T	G	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=77;PP=2731;SC=GACTGTGGCCTGGGCTGATCT;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=151;WE=64124948;WS=64124930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	64124980	rs542907	G	A	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=74;PP=2438;SC=AGGGGCATGAGAATAAAGCTG;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=129;WE=64124988;WS=64124970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	64127744	rs521950	A	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=18;PP=1301;SC=CCAAGACGCAAGAGCACACGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=64127752;WS=64127734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	64127881	rs564687	T	G	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=71;PP=2950;ReadPosRankSum=1.868;SC=CCCAACGGGGTTGGGGTGGCT;SOR=0.233;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=145;WE=64127889;WS=64127871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr11	64135435	rs508168	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.497;SC=ATAAAACCAGGTGGAATAAAA;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=64135443;WS=64135427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	64135541	rs3217512	GTC	G	1156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=647;ReadPosRankSum=0.586;SC=CCCCACCAGAGTCTCCTCACC;SOR=0.502;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=17;WE=64135550;WS=64135531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr11	64137875	rs11606081	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=0.917;SC=CTGGAGGTCATAGACCATGGT;SOR=1.044;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=24;WE=64137883;WS=64137865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,31:0.32:97
chr11	64138805	rs11542299	T	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,78:0.34:228
chr11	64138905	rs17857342	T	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=143;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CCCCGTCGCCTCCAAAGGGGC;SOR=1.364;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=11;WE=64138913;WS=64138895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr11	64326795	rs2277312	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=582;ReadPosRankSum=0.316;SC=AATGTCAGGCAAACACCCCAT;SOR=0.936;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=41;WE=64326803;WS=64326785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,48:0.37:131
chr11	64332862	rs71456318	A	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=317;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GGCAGGAGGCAGAGCTGGGAC;SOR=1.284;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=29;WE=64332870;WS=64332852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr11	64359286	rs3825016	C	T	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=69;PP=2309;SC=AGAGGCCCCACCAGTGCCGCC;SOR=1.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=105;WE=64359294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	64360274	rs11231825	T	C	7292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=123;PP=2965;SC=GTGACTCTCATGCTCTGAAGC;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=101;TCR=123;TR=224;WE=64360282;WS=64360264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr11	64361384	rs2021860	G	T	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=776;SC=TAGAGGCCAGGGGTGCATGGG;SOR=3.442;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=64361392;WS=64361374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	64365943	rs1529909	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=615;SC=GGCCAGGCACTGGGGGCCACA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=64365951;WS=64365933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	64367115	.	C	T	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=38;QD=18.1928031368;SC=CCACCCCCCACCCCCACCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=64367123;WS=64367105;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	64367325	rs1630320	A	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=67;PP=2163;SC=TGTTGCTGGCAGGGCTCTGCA;SOR=1.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=104;WE=64367333;WS=64367315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	64387932	rs2277311	G	A	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=51;PP=1597;SC=ACGGTGGCACGGGGGATGCCC;SOR=1.481;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=76;WE=64387940;WS=64387922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	64387966	rs139084202	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=343;ReadPosRankSum=1.160;SC=GACCAGACTGGTCTGAGTCCC;SOR=0.352;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=20;WE=64387974;WS=64387956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr11	64418900	rs526338	G	A	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=77;PP=2965;SC=GATCGGCCACGATGGCACGCA;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=182;WE=64418908;WS=64418890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	64434727	.	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=864;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CTGACCTTTTCGCCCATCCCT;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=139;TCF=93;TCR=46;TR=56;WE=64434735;WS=64434717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,61:0.39:158
chr11	64480308	rs2666560	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=20;SC=AGCCCTGGAGCGCTCGCACCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=64480316;WS=64480298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	64480641	rs2518907	G	A	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=74;PP=2932;SC=TGGCCAAGAGGCCGCGGAAGG;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=148;WE=64480649;WS=64480631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	64496587	rs559977	T	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=48;PP=1280;SC=CGCAGGCTTGTGCCCCCCTAC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=64496595;WS=64496577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	64497161	rs534221	C	T	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=36;PP=1972;SC=CCCACCAAAACAGTAACTCTC;SOR=1.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=95;WE=64497169;WS=64497151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	64497189	rs533515	A	C	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.34;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	64503179	rs553618	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=691;SC=GAGGCAGGGGAAGCCCAGAGC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=64503187;WS=64503169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	64503496	rs556356	A	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=42;PP=1383;SC=CCCTGCCCACAGCCACAGAGC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=64503504;WS=64503486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	64503543	rs33956572	CT	C	1369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=27;PP=1266;SC=CACAGCTCAGCTCAGAGCTCG;SOR=2.649;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=29;WE=64503551;WS=64503533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	64507315	rs550930	T	C	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=105;PP=2872;SC=AGCACCTTGCTGGCCTCTCCC;SOR=1.506;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=52;TCR=105;TR=157;WE=64507330;WS=64507305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	64507680	rs547280	A	C	7111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=112;PP=2965;SC=CATGCGCATGACTCGTGGCCC;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=89;TCR=112;TR=201;WE=64507688;WS=64507670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	64507799	rs546323	G	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=64;PP=2242;SC=CATCTCCCCCGACCCCGTCAT;SOR=1.295;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=99;WE=64507807;WS=64507789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	64510898	rs2904961	C	T	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=36;PP=1508;SC=GGCGTCCTGCCCGCCTCGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=64510906;WS=64510888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	64511050	rs2073797	G	C	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=54;PP=2147;SC=CGGGAAGCCTGAGCCTGGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=64511058;WS=64511040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	64520942	rs2959652	G	T	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=32;PP=1891;SC=ACAGAGGCGTGGAGTGGGTGG;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=97;WE=64520950;WS=64520932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	64522066	rs625172	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=536;SC=CCCAGTCTCCACTCCCTTATC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=64522074;WS=64522056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	64525216	rs589691	C	T	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=46;NR=31;PP=1407;SC=CCCTCCCCTTCTCTGGGCTCC;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=77;WE=64525224;WS=64525206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	64525464	rs490980	C	T	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1169;SC=GGGTGGGGGCCGTGGGCCGGT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=64525472;WS=64525454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	64525644	rs489192	G	T	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=660;SC=TTCGGACCTTGCCAGAGATGA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=64525652;WS=64525634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	64535357	rs575375	T	C	5564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=100;PP=2965;SC=TGCCTGCGCCTCCTAGTGGCA;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=71;TCR=100;TR=171;WE=64535365;WS=64535347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	64535849	rs561158	C	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=763;SC=ATGGAAAGTTCTGAAGAATTC;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=64535857;WS=64535839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	64536866	rs484886	T	C	4640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=77;PP=2965;SC=AGGTTTCTGCTAGGAGGCTTC;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=64536874;WS=64536856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	64563934	rs483544	A	G	7947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=116;PP=2965;SC=GCCCCTGCGGACCCTGCCTCC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=131;TCR=116;TR=247;WE=64563942;WS=64563924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	64572018	rs2959656	T	C	5922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=115;PP=2965;SC=GGTGATGCTGTGGGTGCTGGC;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=81;TCR=115;TR=196;WE=64572026;WS=64572008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	64572403	rs654440	C	G	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=26;PP=1308;SC=CATCGGCACCCAAGGGGATGG;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=64572411;WS=64572393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	64572557	rs540012	A	G	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=51;PP=1716;SC=CCCAGCCCACATGCAGCACAG;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=92;WE=64572565;WS=64572547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	64591972	rs10792447	T	C	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=45;PP=2316;SC=ATTCAGGGGATAGGGGGAGGC;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=118;WE=64591980;WS=64591962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	64594490	rs646709	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=6;PP=1191;SC=AGCCTCACCAAAGTGGCTTGT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=64594498;WS=64594480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	64596916	rs10897529	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=6;PP=991;SC=TGCCTGGCCCCCCTGCCAAGC;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=64596924;WS=64596906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	64597506	rs3741395	T	C	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=73;PP=1675;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CAAGGTCAGCTGCTGCACGCG;SOR=1.046;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=79;TCR=123;TR=113;WE=64597514;WS=64597496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,131:0.58:224
chr11	64598944	rs684071	A	G	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=35;PP=2523;SC=CGCAGGCCTGAACTGCTTCCT;SOR=1.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=81;TCR=35;TR=116;WE=64598952;WS=64598934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	64599139	rs11231887	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=1.655;SC=TCGCTCTCTGCCAGCAGCAGC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=24;WE=64599147;WS=64599129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr11	64601634	.	G	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=1.921;SC=TCCAGGAACAGACTCCTGTCT;SOR=0.446;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=64601642;WS=64601629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	64602782	rs11605623	C	T	5261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=68;PP=2965;SC=TTGCCTTGTCCGTCTGTTGTA;SOR=0.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=160;WE=64602790;WS=64602772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	64603844	rs138577794	A	ACTCACCCAC	2812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=22;PP=2986;SC=GCCCAGGGCCACTCACCCACC;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=27;WE=64603852;WS=64603834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	64604178	rs2904960	T	C	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	64605689	rs541525	A	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=473;SC=CCCGAGGCCCAAGGCCCAGGA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=64605697;WS=64605679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	64606765	rs676977	T	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=61;PP=1795;SC=GACTGCTGGCTCCTCGCGATG;SOR=2.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=64606773;WS=64606755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	64606910	rs142726755	C	CCTGCTCCCA	2764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=8;PP=1673;SC=GCTTGGCCCGCCTTGTATCCC;SOR=1.755;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=22;WE=64606918;WS=64606900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	64621856	rs3897618	A	G	7608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=164;NR=93;PP=2965;SC=GCAGGTCGGCAGGCAGCTCGT;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=164;TCR=93;TR=257;WE=64621864;WS=64621846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	64622869	rs10897533	G	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1093;ReadPosRankSum=2.296;SC=AGATCTCTCCGAGGTTGTTCA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=72;WE=64622877;WS=64622859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,81:0.63:128
chr11	64645871	rs1211284	A	G	3993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=87;PP=2489;ReadPosRankSum=-1.416;SC=GCAGCCCCTCAGCCACCGTCT;SOR=0.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=104;TCR=141;TR=151;WE=64645879;WS=64645861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,180:0.62:291
chr11	64662849	rs77802938	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=549;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CAGAGCGCTTATCCTGCAGGG;SOR=1.051;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=34;WE=64662857;WS=64662839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,39:0.40:97
chr11	64664774	rs658006	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=407;ReadPosRankSum=0.325;SC=AGAGGAGAAACTGAGGCCCTG;SOR=1.230;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=25;WE=64664782;WS=64664764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr11	64665358	rs61742063	T	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=569;ReadPosRankSum=0.560;SC=TGTGTCCACCTCCTGGGGCCT;SOR=0.567;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=134;TCF=54;TCR=80;TR=41;WE=64665366;WS=64665348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,44:0.30:149
chr11	64665394	rs61741079	T	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=664;ReadPosRankSum=-2.325;SC=TCTCTACGCCTTCGGCCTGCC;SOR=0.678;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=135;TCF=61;TCR=74;TR=45;WE=64665402;WS=64665384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,49:0.32:154
chr11	64665502	rs11827610	T	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=562;ReadPosRankSum=0.970;SC=TGGGAACCTGTGCTGTCCTGG;SOR=1.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=36;WE=64665510;WS=64665492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,43:0.34:127
chr11	64668674	rs79672196	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=-0.469;SC=TTTTATAGACAGGGTCGGGTC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=8;WE=64668682;WS=64668664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr11	64669412	rs79516487	G	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr11	64669417	rs682673	T	C	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=18;PP=767;SC=AACTGGTCCATCCCTCCCACC;SOR=1.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=71;WE=64669425;WS=64669402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	64670671	rs112310812	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=117;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TCCGGAGCCCAGGCACGTGAG;SOR=0.039;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=12;WE=64670679;WS=64670661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr11	64673705	rs7942472	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=778;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GGGAGGCCAGCCCCACCGTGC;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=69;TCR=94;TR=54;WE=64673713;WS=64673695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,63:0.33:191
chr11	64676450	rs75977085	G	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=565;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GAAGAGGTGGGGCCAAGTCTC;SOR=0.470;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=42;WE=64676458;WS=64676440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr11	64677293	rs656195	G	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=58;PP=2167;SC=CCAGGGGTCCGGCTCAGGCCG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=109;WE=64677301;WS=64677283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	64678920	rs638583	T	C	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=115;SC=AGACCAGGCCTTCTGCCCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=64678928;WS=64678910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	64679331	rs60711419	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=318;ReadPosRankSum=-1.009;SC=GTGGGCCTGGGCAGAGAGCCG;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=24;WE=64679339;WS=64679321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr11	64679362	rs35115827	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=558;ReadPosRankSum=-1.388;SC=ATGTCGCTGCGCACAGAGGAG;SOR=0.438;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=43;WE=64679370;WS=64679352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,49:0.43:115
chr11	64680407	rs594820	G	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=288;SC=AGTAAATCCCGCACTTGACAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=64680415;WS=64680397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	64680801	rs61744001	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=340;ReadPosRankSum=0.237;SC=TGTGCAGGAAGGCAGGCGGCT;SOR=0.768;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=23;WE=64680809;WS=64680791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr11	64680819	rs618006	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=659;ReadPosRankSum=0.476;SC=GCTGATGCACGTCCACCGGCG;SOR=0.555;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=39;WE=64680827;WS=64680809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr11	64693093	.	C	CCCCG	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=334;ReadPosRankSum=3.384;SC=TGTGCCCCCCCCCCAAAGGCC;SOR=0.780;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=10;WE=64693101;WS=64693083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr11	64697950	rs111934356	C	T	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1462;ReadPosRankSum=0.740;SC=GCCTCCTCCTCAGCATCATCA;SOR=0.767;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=255;TCF=127;TCR=128;TR=109;WE=64697958;WS=64697940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,123:0.41:302
chr11	64700767	rs675090	G	A	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1013;SC=GCAGGGAGGAGTCAGACCCCC;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=64700775;WS=64700757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	64701295	rs185359743	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=1019;ReadPosRankSum=1.685;SC=CCCAGGTGGCCGCCAGTGGGG;SOR=0.764;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=65;WE=64701303;WS=64701285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,79:0.74:107
chr11	64702200	rs673995	C	T	8043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=95;PP=2965;SC=CCCACCAGAACGTCAAGCCCT;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=156;TCR=95;TR=251;WE=64702208;WS=64702190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr11	64702765	rs2307669	C	CTCTG	1138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=1195;SC=CCACCGTCCACTCAGCTCTTT;SOR=0.846;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=21;WE=64702773;WS=64702755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	64707978	rs586616	A	G	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=19;PP=954;ReadPosRankSum=0.391;SC=GCTGCTCTACATATCAGAGAA;SOR=0.916;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=65;WE=64707986;WS=64707968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr11	64713485	rs596321	T	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=369;ReadPosRankSum=0.955;SC=ACCGGAATCCTGACTTGTAAC;SOR=0.347;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=26;WE=64713493;WS=64713475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr11	64714780	rs7482817	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=1.138;SC=CAGGATCAACCAACAGTAATA;SOR=0.139;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=11;WE=64714788;WS=64714770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	64718050	rs138174447	TTTTC	T	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=1.173;QD=22.93;ReadPosRankSum=-1.884;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr11	64721908	rs495330	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=535;SC=GTTTCCCAGAGCCCTGGAAGG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=64721916;WS=64721898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	64726701	rs602404	A	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=620;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GGTGAAGGTAAAGAAGAGGTG;SOR=1.094;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=35;WE=64726709;WS=64726691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr11	64757504	rs574381	G	C	10254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=168;PP=2965;SC=TCCGCCTGCTGTCATCCCACC;SOR=0.932;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=299;TCF=131;TCR=168;TR=299;WE=64757512;WS=64757494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr11	64761779	rs626670	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=6;PP=669;SC=AGCCACAGGATCCTTTTCTCA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=64761787;WS=64761769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	64781891	rs58717149	T	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AATCGCCCCGTCGGGCCGGGA;SOR=0.430;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=64781899;WS=64781881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	64785809	rs78241716	A	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GAGAACAGGGACTTCTCCTTA;SOR=1.479;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=8;WE=64785817;WS=64785799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr11	64787880	rs79393344	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=406;ReadPosRankSum=0.568;SC=CCTCTATCTTTTCTCCCCCAG;SOR=0.877;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=33;WE=64787888;WS=64787870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,33:0.33:99
chr11	64789194	rs664226	T	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=960;SC=TCCTCCCAGGTCCTGGAGCTG;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=64789202;WS=64789184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	64794918	rs3832791	T	TG	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=10;PP=1374;SC=AGCGCAGGCCTGGCGAGGCGG;SOR=1.981;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=33;WE=64794926;WS=64794908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	64799789	rs532373	C	T	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=1484;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TGTCCCTGGGCGAGGGGCTGC;SOR=0.955;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=59;WE=64799797;WS=64799779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr11	64799894	rs678614	A	C	8850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=107;PP=2965;SC=AGTCTCATGTACCTCATAGGT;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=153;TCR=107;TR=260;WE=64799902;WS=64799884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr11	64799998	rs534236	T	C	8010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.914;SC=AGGAGTTCCCTGCTTTCCCCC;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=103;TCR=148;TR=249;WE=64800006;WS=64799988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,306:0.99:308
chr11	64802267	rs6591869	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=811;SC=TGGGGCAGAAGCCCCTGTGGG;SOR=3.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=64802275;WS=64802257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	64807294	rs653111	G	A	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=42;PP=1172;SC=TGGGACTCTCGCTCCTGCACT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=64807302;WS=64807284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	64808647	rs10160811	A	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=295;SC=GCGGGCCCAGACAGGTTCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=64808655;WS=64808637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	64808681	rs34998502	AC	A	433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.63;NF=4;NR=6;PP=295;SC=GCCGCTCCCCACCCCCCGGCC;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=10;WE=64808689;WS=64808671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	64809090	rs12271134	T	G	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=51;PP=1563;SC=CGAGCTGTGCTCCTGGACCTG;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=64809098;WS=64809080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	64809133	rs10792455	T	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=33;PP=1032;SC=CCGAGGCAGCTGTGGTGCTGG;SOR=1.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=64809141;WS=64809123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	64809167	rs10792456	A	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=20;PP=628;SC=CACGCTGCTGACCGTAGTGGC;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=64809175;WS=64809157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	64809441	rs3862374	C	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=498;SC=TCACCATTAGCCCCCTCCCAG;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=64809449;WS=64809431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	64810771	rs11231929	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.68;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	64813685	rs36053340	G	C	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.983;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=801;ReadPosRankSum=1.506;SC=TGCTGCTCCAGCAGGGCCCCA;SOR=0.997;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=53;WE=64813693;WS=64813675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,57:0.35:161
chr11	64820654	rs477539	C	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=430;SC=CCTCCGGGGGCGAAGGTCCCT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=64820662;WS=64820644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	64833935	rs548150	G	A	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=2223;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCCTTCCGGGGGTTTGGGTCA;SOR=0.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=109;WE=64833943;WS=64833925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr11	64834432	rs573957	T	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=40;PP=1152;SC=CACCTCCTGCTTCAGCCACCT;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=64834440;WS=64834422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	64835046	.	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=-1.241;SC=GCCACGTGGGCCCTGACCTGA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=64835054;WS=64835036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	64851305	rs947799	C	T	8182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=97;PP=2965;SC=TTTAAGGGCGCCTCCTCCGGC;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=147;TCR=97;TR=244;WE=64851313;WS=64851295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr11	64851453	rs35819335	CT	C	7800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=130;PP=2951;SC=CCAGACATAACTTAGGCTCCG;SOR=1.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=13;TCR=136;TR=143;WE=64851461;WS=64851443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	64855986	rs2282498	A	G	6823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=90;PP=2965;SC=CGGTTGAAGAACATGGCTCCG;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=102;TCR=90;TR=192;WE=64855994;WS=64855976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	64856108	rs2282499	A	C	7262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.071;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.157;SC=GCACCCTCCCACTCCTGCCAC;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=114;TCR=112;TR=223;WE=64856116;WS=64856098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,265:0.99:268
chr11	64856500	rs525781	A	G	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=52;PP=1591;SC=TCTTGCAGCCACATCTTGCCC;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=65;WE=64856508;WS=64856490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	64863969	rs61505294	TG	T	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=12;PP=399;SC=GCACGGGGAGTGGGGGGGTGC;SOR=1.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=15;WE=64863977;WS=64863959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	64876740	rs72932837	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=365;ReadPosRankSum=0.569;SC=ACCTGGGCACCTTCTCTTGCA;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=21;WE=64876748;WS=64876730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr11	64878661	rs625004	T	C	7431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=104;PP=2965;SC=TATCCCTCCCTTCTTATCTGG;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=120;TCR=104;TR=224;WE=64878669;WS=64878651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	64880090	rs4930284	G	C	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=20;PP=919;SC=CGTCCCTGCCGGGGCTGGAGG;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=64880098;WS=64880080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	64882789	rs1129195	C	T	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=25;PP=1371;SC=TCACCAGCTACTGGTTACTAC;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=64882797;WS=64882779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	64884052	rs1546532	G	A	5943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=78;PP=2965;SC=CGCAGTCTAGGGCCAGGGGTG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=105;TCR=79;TR=183;WE=64884060;WS=64884042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	64896237	rs3802936	G	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=829;SC=TCCAAGGTTGGGCAGATTCTC;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=64896245;WS=64896227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	64898226	rs9971407	C	T	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=20;PP=1197;ReadPosRankSum=0.587;SC=GCGCTGGCAGCGATGCACGAA;SOR=0.851;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=85;TCR=37;TR=73;WE=64898234;WS=64898216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,93:0.60:155
chr11	64898357	rs11369296	G	GC	13274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=136;PP=2974;SC=TGGGGCCTGTGCCTGCTGTGC;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=101;TCR=151;TR=228;WE=64898365;WS=64898347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr11	64900270	rs3825073	G	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=0.117;SC=GAGCACAGAAGAGGCCTGTCA;SOR=0.625;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=30;WE=64900278;WS=64900260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,30:0.27:110
chr11	64937683	rs17743381	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=301;ReadPosRankSum=1.728;SC=GCTATATAAGCGCACTCGCGG;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=21;WE=64937691;WS=64937673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr11	64977644	rs625750	C	T	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=25;PP=1246;SC=AGGCCCTTGTCCCTGGGGTGC;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=64977652;WS=64977634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	64977937	rs542380	A	G	6634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=127;PP=2965;SC=AGTGTCCCCAACTGCCTCCCA;SOR=1.213;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=205;TCF=77;TCR=128;TR=204;WE=64977945;WS=64977927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	64981472	rs239258	G	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=817;ReadPosRankSum=-1.856;SC=AGAACTTCACGGCCGCTGTCC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=61;WE=64981488;WS=64981462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,70:0.41:170
chr11	64981522	rs11605576	C	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.397;SC=CACACTGAGGCCTCCACCAAC;SOR=0.718;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=84;WE=64981530;WS=64981512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,94:0.56:167
chr11	64981587	rs11605632	G	A	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=914;ReadPosRankSum=-1.493;SC=TGGGGCCCCTGAGCCCTGCCG;SOR=0.515;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=67;WE=64981595;WS=64981577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,77:0.49:156
chr11	64981837	rs12420456	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CGAGACCTGGCGCAGTCCGTC;SOR=1.239;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=17;WE=64981845;WS=64981827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr11	64981853	rs239259	G	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CCGTCTACATGGCCGGGGTGC;SOR=0.330;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=28;WE=64981861;WS=64981843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr11	64990041	rs514076	G	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.45;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	64993195	rs10633296	C	CAGTA	4135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=47;PP=2957;SC=CTTCTGGAAACAGCAAAAGCC;SOR=1.240;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=55;WE=64993203;WS=64993185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr11	65003812	rs625427	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=1092;SC=GGCTCCACCCTTCTCCACTAC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=65003820;WS=65003802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	65004301	rs2904982	G	T	6514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=101;NR=107;PP=2965;SC=GGCCGTCTGCGTCCTGACCGA;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=101;TCR=107;TR=208;WE=65004309;WS=65004291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	65004386	rs56657874	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=700;ReadPosRankSum=-0.287;SC=ACCAAGAGGCCGAAAGTTACA;SOR=0.686;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=43;WE=65004394;WS=65004376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr11	65118971	rs620888	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=413;SC=TGATATTTCATAATATTTGAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=65118979;WS=65118961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	65143701	rs80042162	CT	C	351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.985;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.824;NF=5;NR=5;PP=250;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CACAGGCCCCCTGGCTTCCGG;SOR=0.323;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=10;WE=65143709;WS=65143691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr11	65144075	rs624307	T	C	6161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=113;PP=2965;SC=GACTTGATCATGTCTAAGGGC;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=77;TCR=113;TR=190;WE=65144083;WS=65144065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr11	65147294	rs547221	G	A	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=798;ReadPosRankSum=0.090;SC=AGCCCCAGATGCCTCCCCGAA;SOR=0.930;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=54;WE=65147302;WS=65147284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,60:0.41:148
chr11	65147862	rs573864	C	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=398;SC=GGACAAGGGACTAAGACCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=65147870;WS=65147852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	65161129	rs2073800	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=757;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GTGCCCCAGACGATGACGTGG;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=157;TCF=94;TCR=63;TR=65;WE=65161137;WS=65161119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,75:0.42:180
chr11	65161328	rs4930154	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=332;ReadPosRankSum=1.564;SC=TGAAGCCCCATTGGGGGATGG;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=17;WE=65161336;WS=65161318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr11	65164114	rs7940559	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CCCTCTGTCTGGTGCCTGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=9;WE=65164122;WS=65164104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	65164357	rs12417665	C	T	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr11	65178620	rs2957274	G	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=133;SC=GGAAGGAGCCGTCGCGCTGGA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=65178628;WS=65178610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	65211979	rs12803915	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=908;ReadPosRankSum=-0.174;SC=AGCACTAGCAGGAGGGGCTCC;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=59;WE=65211987;WS=65211969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr11	65212122	rs3825071	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=0.829;SC=TGCTGTGGACCGTGGATCCTG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=65212130;WS=65212112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	65222952	rs1784858	T	C	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=993;ReadPosRankSum=0.604;SC=AAGATAAGGTTGTGCTTCTGG;SOR=0.641;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=63;WE=65222960;WS=65222942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,77:0.61:127
chr11	65271832	rs3200401	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr11	65302893	rs947791	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=650;ReadPosRankSum=0.616;SC=GGTCCCTGTCGCAGGACCACA;SOR=0.170;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=39;WE=65302901;WS=65302883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr11	65307402	rs11227217	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=408;ReadPosRankSum=0.979;SC=AGGAACCGCCCGCCTCCGCCC;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=30;WE=65307410;WS=65307392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr11	65308174	rs147365999	C	CGGGCGGGGCCTACAGGAG	973.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.957;QD=23.18;ReadPosRankSum=-1.342;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr11	65314814	rs66973976	CG	C	1184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.491;NF=18;NR=8;PP=724;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GACTCCGTCTCGGGGGAAAAA;SOR=0.207;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=26;WE=65314822;WS=65314804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,29:0.85:34
chr11	65314830	rs58621819	A	T	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=12;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.755;NF=27;NR=7;PP=644;ReadPosRankSum=3.085;SC=AAAAAAAAAAAAATGCAGGCA;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=34;WE=65314838;WS=65314820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr11	65320780	rs4244811	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.812;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=201;ReadPosRankSum=-1.305;SC=ACTGGGGAGGGGCACAGCAGA;SOR=0.811;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=19;WE=65320788;WS=65320770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr11	65325325	.	C	CCAGCAG	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=-1.271;SC=CCGCCCAGGCCCAGCAGCAGC;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=7;WE=65325333;WS=65325315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	65337251	rs1346	A	T	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=30;PP=1668;ReadPosRankSum=0.897;SC=GGGCGGCTGGAAGCGCAATGC;SOR=1.094;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=106;TCR=51;TR=101;WE=65337259;WS=65337241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr11	65337714	rs1784220	GA	TT	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=508;ReadPosRankSum=-0.373;SC=AGTTACCAAGGAGACGCTCCT;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=65337723;WS=65337704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr11	65338034	rs1151496	A	G	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GAGGCAGCCCACTCCGGCAAG;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=94;TCR=77;TR=105;WE=65338042;WS=65338024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,118:0.61:192
chr11	65347636	rs1194100	G	C	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=50;PP=2544;SC=CCAAGTCCCAGTGAGGCTGCG;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=113;WE=65347644;WS=65347626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	65349063	rs3741380	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=470;ReadPosRankSum=1.139;SC=CCTCGGCTCCGGAAAGGCTCT;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=26;WE=65349071;WS=65349053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr11	65349756	rs6591182	T	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=569;ReadPosRankSum=1.627;SC=AGGCCCCAGGTGAGCAGCTGG;SOR=1.285;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=28;WE=65349764;WS=65349746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr11	65349849	rs1194099	A	T	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=34;PP=1433;SC=GGTTCAGGGGACCTGGAAACA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=65349857;WS=65349839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	65352062	rs2298615	C	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=0.568;SC=GCCAGGCTCTCAGTGTCAGAT;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=41;WE=65352070;WS=65352052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr11	65352093	rs117753710	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TGGACTGCCGGGCCCAGCAGT;SOR=0.286;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=22;WE=65352101;WS=65352083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr11	65357697	rs1151503	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=0.081;SC=GCATACATCTAGGGATCCCTT;SOR=0.576;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=9;WE=65357705;WS=65357687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr11	65359625	rs4261292	C	G	4824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=109;PP=2965;SC=CAGAGGGCTGCGTGTGGACCC;SOR=1.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=49;TCR=109;TR=158;WE=65359633;WS=65359615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	65363275	rs3814752	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GGGAACTGGCGGCTCCACCTC;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=65363283;WS=65363265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr11	65366192	rs7946115	G	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=643;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GTTTCCCCATGTGCACAGTGA;SOR=0.986;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=38;WE=65366200;WS=65366182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr11	65366240	rs7932616	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=-1.742;SC=TCCTGCTCCGTGGTGCCTCTG;SOR=1.276;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=17;WE=65366248;WS=65366230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	65366847	rs10791820	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=211;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TGAAGCAGGCCGGCTTCAGGC;SOR=0.509;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=13;WE=65366855;WS=65366837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr11	65367253	rs4326800	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=1.174;SC=CGGGCAGAGGCGGCACAGGTG;SOR=1.292;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=15;WE=65367261;WS=65367243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	65373621	rs1151527	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=23;PP=646;SC=CAGGCTTCAGAGATAAACTTT;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=65373629;WS=65373611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	65380916	rs2004649	G	A	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1313;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGGGCGGGCCGCCACCCCGAG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=78;TCR=113;TR=86;WE=65380924;WS=65380906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,100:0.43:232
chr11	65383755	rs58950470	G	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=777;ReadPosRankSum=0.308;SC=GTCCCGGGAGGGGGGGCGCGG;SOR=1.048;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=44;WE=65383763;WS=65383745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr11	65383896	rs7947140	G	C	9261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=138;PP=2965;SC=ACCTCTATGTGTGGATCTTCC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=140;TCR=138;TR=278;WE=65383904;WS=65383886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr11	65385606	rs1151489	A	G	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=49;PP=2226;SC=ACCCTGACCCAGCCTGACCGG;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=65385614;WS=65385596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	65386206	rs1193851	C	G	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=68;PP=2016;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CCTGAGAGCTCCCGGGGTGCA;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=103;TCR=128;TR=123;WE=65386227;WS=65386196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,136:0.53:259
chr11	65386981	rs144100036	T	TA	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=483;ReadPosRankSum=0.638;SC=ATCTGTCACTTACACTTGGGG;SOR=1.027;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=13;WE=65386989;WS=65386971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr11	65387378	rs61744384	T	A	2704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=70;PP=1888;ReadPosRankSum=-1.570;SC=CTGAGGGTGCTGTGCACTATT;SOR=0.462;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=277;TCF=98;TCR=179;TR=116;WE=65387386;WS=65387368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,131:0.41:320
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chr11	65412467	rs2306364	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=502;ReadPosRankSum=0.743;SC=ACTGCCGGGCGGGCCAGGGCT;SOR=0.985;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=36;WE=65412475;WS=65412457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,49:0.30:162
chr11	65414368	rs75894763	G	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=948;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TGGTGCTGGTGGCGCCGCGCG;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=66;WE=65414376;WS=65414358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,76:0.43:176
chr11	65415028	rs4930157	T	G	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=76;PP=2397;SC=GCGGCCAGACTCTGCCCAGCC;SOR=1.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=115;WE=65415036;WS=65415018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	65417027	rs117408336	C	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=728;ReadPosRankSum=1.126;SC=CCCTGCTCTCCCCAGCTCTCT;SOR=0.642;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=45;WE=65417035;WS=65417017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,56:0.40:139
chr11	65417434	rs746429	G	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=63;PP=1751;ReadPosRankSum=1.284;SC=TGTCGGAGGCGGGCAGTGGGA;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=110;TCR=135;TR=114;WE=65417442;WS=65417424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,127:0.47:270
chr11	65423082	rs1144792	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=20;PP=1343;SC=ATGGGGCCCAGGAGTCTTCAT;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=65423090;WS=65423072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	65480090	rs2236682	G	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;ReadPosRankSum=-0.228;SC=GGCCTGGAAAGGGGTGGCACT;SOR=0.897;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=34;WE=65480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr11	65480768	rs4244812	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CCCCTTCCCCATCCCACTGCC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=65480776;WS=65480758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr11	65480791	rs551115	A	G	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=9;PP=1030;SC=CCCCGCCCCAAAGGAAGACCC;SOR=2.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=45;WE=65480799;WS=65480781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	65481166	rs1151500	T	C	5301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.47;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	65481465	rs487264	T	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=651;SC=GGCAGAACATTGTTCAAATGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=65481473;WS=65481455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	65484569	rs563427	A	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=741;SC=CTCTAGGGGAACCAGCCAGAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=65484577;WS=65484559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	65546857	rs610037	A	C	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.485;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1639;ReadPosRankSum=-1.022;SC=GGACGCAGTGAAGGTAAAAGA;SOR=0.435;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=89;WE=65546865;WS=65546847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,104:0.59:175
chr11	65547333	rs12146493	G	A	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TTATCCGTGAGCAGTCCCCCC;SOR=0.525;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=175;TCF=83;TCR=92;TR=88;WE=65547341;WS=65547323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,101:0.51:197
chr11	65554680	rs10896044	C	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=1;PP=703;SC=GGTGGAACCGCCGCGCGCCGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=65554688;WS=65554678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	65601560	rs17854357	G	C	2491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1450;ReadPosRankSum=1.415;SC=CGGAGGTTGGGAAGGAGGGCA;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=99;TCR=63;TR=88;WE=65601568;WS=65601550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,113:0.56:200
chr11	65617113	rs11327250	AG	A	4416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=49;PP=2969;SC=GGCCTCCCCCAGGGGGTGGTA;SOR=1.043;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=90;WE=65617121;WS=65617103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	65623347	rs652021	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=478;ReadPosRankSum=-1.304;SC=AGGAGCCACAGAAGTTCCCAT;SOR=0.631;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=26;WE=65623355;WS=65623337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr11	65623519	rs4621	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=60;PP=1400;ReadPosRankSum=1.177;SC=TGGCGTAGGGGTCGTCGACAG;SOR=0.557;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=296;TCF=126;TCR=170;TR=109;WE=65623527;WS=65623509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,126:0.36:350
chr11	65623739	rs11227332	A	G	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1633;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CGTATACGTCAAGAAAAGGAT;SOR=0.626;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=88;TCR=123;TR=102;WE=65623747;WS=65623729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,131:0.49:265
chr11	65624934	rs7125986	A	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=435;ReadPosRankSum=0.664;SC=TGCGCTCCCGAACGGGCCGCG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=33;WE=65624942;WS=65624924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr11	65628334	rs13817	G	A	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=964;ReadPosRankSum=0.286;SC=CGCAGCAGGCGCCGCACGCGC;SOR=0.918;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=62;WE=65628342;WS=65628324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr11	65629743	rs200286461	C	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=352;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GCTCAGAAGTCCCCCAGGGTG;SOR=0.852;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=23;WE=65629751;WS=65629733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	65629932	rs659857	T	C	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=8.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,66:0.53:125
chr11	65629932	.	TCG	CCC	1928	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27;NR=28;PP=1928;QD=36.0266886339;SC=CTGGGAGTGCTCGACCCTGGC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=55;WE=65629942;WS=65629922;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:53,55:0.51:108
chr11	65629934	rs545500	G	C	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr11	65630098	rs3216088	T	TG	1119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=1939;ReadPosRankSum=1.581;SC=CTGTTGAGATTGGGGGGGGTG;SOR=0.534;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=32;WE=65630109;WS=65630088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr11	65630101	rs633877	G	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.971;NF=16;NR=26;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TTGAGATTGGGGGGGGTGGGC;SOR=0.819;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=42;WE=65630109;WS=65630088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr11	65630698	rs538394	T	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=0.142;SC=GGCAGAGGAGTGGGGAAAACA;SOR=0.412;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=16;WE=65630706;WS=65630688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	65631167	rs648732	C	T	2189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1451;ReadPosRankSum=1.981;SC=TGTGGGTGGCCCAGGAGACCA;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=118;TCR=84;TR=84;WE=65631175;WS=65631157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,101:0.43:234
chr11	65631879	rs630758	C	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr11	65631879	.	CCG	ACA	166	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=166;QD=43.8935749724;SC=GAACAGGGTCCCGGCACCATT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=5;WE=65631889;WS=65631869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,5:0.26:19
chr11	65631881	rs630755	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.466;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr11	65631973	rs630303	G	A	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=595;ReadPosRankSum=-2.136;SC=CCTAGTTCCGGCTGAAGCGCT;SOR=0.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=43;WE=65631981;WS=65631963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr11	65632262	rs558114	G	T	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=1294;ReadPosRankSum=0.072;SC=CCCTCTTGACGCGGGGCCTGC;SOR=0.750;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=258;TCF=99;TCR=159;TR=90;WE=65632270;WS=65632252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,127:0.41:311
chr11	65636053	rs601314	T	C	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=62;PP=1859;SC=GGCTCGTTGATGCAGCGGTAC;SOR=1.311;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=65636061;WS=65636043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	65637536	.	C	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=564;ReadPosRankSum=-1.204;SC=AAGGGAGCGCCCCCACCTCAC;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=35;WE=65637544;WS=65637526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr11	65637984	rs630394	C	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=597;ReadPosRankSum=-1.696;SC=GCCGGGACTACAGAAGCTGCT;SOR=1.299;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=29;WE=65637992;WS=65637974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr11	65647260	rs658524	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CTCCAGCCCCACCCTCACACC;SOR=0.385;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=7;WE=65647268;WS=65647250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	65649774	rs604630	A	G	7762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=122;NR=111;PP=2965;SC=GAAGGTGGCCAGCGCCATCTC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=122;TCR=111;TR=233;WE=65649782;WS=65649764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr11	65649984	rs687672	T	C	3299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=64;PP=1804;ReadPosRankSum=0.649;SC=ATTTTGTGGATGTCTCCGTGC;SOR=0.573;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=321;TCF=184;TCR=137;TR=141;WE=65649992;WS=65649974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,166:0.43:382
chr11	65651830	rs658938	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=1.266;SC=GCTGGGGCAAAGCCAAGCTGG;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=17;WE=65651838;WS=65651820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	65653242	rs568617	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=0.578;SC=CTCTCTGCCTCAAGTCACTGT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=65653250;WS=65653232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	65655259	rs2308217	G	GCC	3242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=2233;ReadPosRankSum=2.467;SC=GTCTGGCGGGGCCTAGCAGGG;SOR=0.699;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=119;TCF=44;TCR=75;TR=54;WE=65655267;WS=65655249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr11	65655393	rs641018	G	C	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=58;PP=1849;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CACCATCCCAGAGGGTGAGCA;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=90;TCR=95;TR=113;WE=65655401;WS=65655383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,127:0.61:208
chr11	65661656	rs507062	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=452;ReadPosRankSum=1.352;SC=TCGCCCCTCATGGTGGCCCAG;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=39;WE=65661664;WS=65661646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr11	65664346	rs637571	T	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=19;PP=1293;SC=CTGGCCGGGGTTGTGGGGGGC;SOR=1.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=65664354;WS=65664336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	65667796	rs1058068	G	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=23;PP=1383;SC=CGGGTTCCCCGAAGTCTCGGA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=65667804;WS=65667786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	65684929	rs9667389	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=626;SC=ATTTGGCCCCCCTAGGTCAGT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=65684937;WS=65684919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	65685225	rs7947504	T	C	6893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=140;PP=2965;SC=CACCTGAAGCTGGCCTTCAAC;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=94;TCR=140;TR=234;WE=65685233;WS=65685215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	65713207	rs9795469	T	C	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=83;PP=2583;SC=CCCGTCGGTGTGACCAGGGCA;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=157;WE=65713215;WS=65713197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	65714281	rs117754316	C	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=276;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GAGGGAGCACCCGGGTGAGGT;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=17;WE=65714289;WS=65714271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr11	65715747	.	T	TCATC	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.36;MQRankSum=0.549;NF=0;NR=7;PP=370;ReadPosRankSum=1.628;SC=AACTTTTGGATCATCCATCCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=65715755;WS=65715737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	65727301	rs491973	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=148;ReadPosRankSum=-1.553;SC=CCACAGGTCAATGGGGGTGAG;SOR=0.458;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=13;WE=65727309;WS=65727291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	65732651	rs550435	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=786;ReadPosRankSum=-0.043;SC=AGAAGCTGGCGGCTGCCAAGG;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=51;WE=65732659;WS=65732641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr11	65732800	rs552130	T	C	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1270;ReadPosRankSum=0.613;SC=GCATCACTTTTTCCCCTCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=69;WE=65732808;WS=65732790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
chr11	65733289	rs556643	G	A	2915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=44;PP=1849;ReadPosRankSum=0.561;SC=GACACTGGTGGCCTTGCTACC;SOR=0.883;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=109;WE=65733297;WS=65733279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,127:0.59:216
chr11	65733393	rs688862	C	T	2867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=1797;ReadPosRankSum=2.504;SC=AGGGCCTCACCGTGGAGCATG;SOR=0.829;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=230;TCF=121;TCR=109;TR=110;WE=65733401;WS=65733383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,130:0.47:274
chr11	65734539	rs1151505	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=524;ReadPosRankSum=2.100;SC=ACTTAACCTCCCTGTGCCCCA;SOR=3.014;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=22;WE=65734547;WS=65734529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr11	65735174	rs660118	G	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=560;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CCACCGCCGGGGTCCCCGCAG;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=42;WE=65735182;WS=65735164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr11	65744247	rs622779	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.296;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=293;ReadPosRankSum=0.563;SC=TGTGAGGGCCGCGCCGCTGGG;SOR=0.618;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=22;WE=65744255;WS=65744237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr11	65744275	rs543952	T	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=6;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-1.132;SC=CGTTTGGGGGTGCTCAAGCTG;SOR=1.060;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=24;WE=65744283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr11	65744421	rs542332	C	T	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CAGGTGGTGACCAGTGGGTGG;SOR=1.036;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=66;WE=65744429;WS=65744411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,70:0.64:110
chr11	65746653	rs679581	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=2.238;SC=AGACCTGGCCATCAAATGACA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=65746661;WS=65746643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr11	65767153	rs507672	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=587;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TCCCCTGTAGATAAGAAGAGA;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=29;WE=65767161;WS=65767143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr11	65767215	rs506873	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=402;ReadPosRankSum=0.176;SC=CCATAGGAAGGGGTTCTATCT;SOR=0.521;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=20;WE=65767223;WS=65767205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr11	65771050	rs147010511	TCACTGAG	T	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=997;ReadPosRankSum=0.565;SC=CTCTTATCTCTCACTGAGCAC;SOR=0.991;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=17;WE=65771064;WS=65771040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr11	65779590	rs1131544	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=344;ReadPosRankSum=0.246;SC=TGCCACGCGACGCCCGGGCCC;SOR=0.366;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=24;WE=65779598;WS=65779580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr11	65780702	rs9667817	A	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=13;PP=834;SC=GGCCTGGAGCAGCCTGGCAGG;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=65780710;WS=65780692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	65788072	rs3814747	C	T	7751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=123;PP=2965;SC=ATGTAAATTACGAGGATGGGA;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=111;TCR=123;TR=234;WE=65788080;WS=65788062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr11	65789137	rs34114713	C	G	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.701;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=68;PP=2048;ReadPosRankSum=0.871;SC=GGTGCCTGAGCCTGGCGGGCT;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=192;TCF=86;TCR=106;TR=119;WE=65789145;WS=65789127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,149:0.65:228
chr11	65790527	rs2845570	G	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=472;ReadPosRankSum=1.118;SC=CGCTGGAGCCGGCCGGCTGAA;SOR=1.478;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=28;WE=65790535;WS=65790517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr11	65793454	rs1203998	C	T	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1403;ReadPosRankSum=-1.325;SC=TGGAACCCACCGTATTGGGAC;SOR=0.618;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=69;TCR=82;TR=84;WE=65793462;WS=65793444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,98:0.59:167
chr11	65793797	rs1893316	G	A	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=65;PP=1644;ReadPosRankSum=0.585;SC=ACCTATCTGCGTTATTGGTGT;SOR=0.761;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=85;TCR=122;TR=109;WE=65793805;WS=65793787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,133:0.52:254
chr11	65793874	rs3841469	CA	C	1132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=925;ReadPosRankSum=-1.318;SC=ACTCTGGAGCCAAAAGAGCTC;SOR=0.678;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=29;WE=65793882;WS=65793864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr11	65810209	rs61895584	C	T	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=114;PP=2965;SC=TGGGCTGCCACGGCTGCAGCT;SOR=1.968;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=40;TCR=114;TR=154;WE=65810217;WS=65810199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	65810749	rs7937692	T	C	9909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=168;PP=2965;ReadPosRankSum=0.493;SC=AGGCGTTGGGTACGCGCCGGA;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=300;TCF=131;TCR=169;TR=296;WE=65810757;WS=65810739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,339:0.99:341
chr11	65811208	rs4930170	G	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=491;ReadPosRankSum=0.068;SC=CTTGACCCCTGCCCTTACCCA;SOR=0.543;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=30;WE=65811216;WS=65811198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr11	65824472	rs547404	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=581;ReadPosRankSum=-2.004;SC=GTGATTTAGACATTTTTAAAA;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=37;WE=65824480;WS=65824462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr11	65825951	rs491618	T	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-1.034;SC=AATTTGTAAGTGTTCAGTAAG;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=12;WE=65825959;WS=65825941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr11	65826704	rs1049872	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=766;ReadPosRankSum=-0.938;SC=AGAAAGAGAAGGAGCCAGAGA;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=46;WE=65826712;WS=65826694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr11	65868310	rs475817	T	A	9263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=148;PP=2965;SC=GAACACCTGTTATGGCCTTTC;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=140;TCR=148;TR=288;WE=65868318;WS=65868300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr11	65868455	rs56269595	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CTCATTTCTACTGCATTCTGC;SOR=2.288;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=25;WE=65868463;WS=65868445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr11	65983522	rs548858	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=598;SC=GGTCTTGTGCATTCCTTGGCT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=65983530;WS=65983519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	65985000	rs557082	A	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1803;SC=TAGGGACCAAACCCCTGAGAG;SOR=1.089;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=65985008;WS=65984990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	65997898	rs561948	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=308;SC=ACTTGCTTTCAGGAAAAGAAA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=65997906;WS=65997888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	66010633	rs524268	T	C	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=82;PP=2783;SC=CTGTCACCCCTAGTGTCCATC;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=134;WE=66010641;WS=66010623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	66029130	rs572827	G	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=158;SC=TTCACTGGGTGCCAGAGCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=66029138;WS=66029120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	66031450	rs525698	T	C	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=110;PP=2965;SC=CTGGGCAGGCTGGGGGTCTGG;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=67;TCR=110;TR=177;WE=66031458;WS=66031440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	66031660	rs1151539	C	T	5877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=72;PP=2965;SC=GGCCCGATGACCCCAATGTGG;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=106;TCR=72;TR=178;WE=66031668;WS=66031650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr11	66033301	rs474005	C	T	6547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=107;PP=2965;SC=CATTCACTGCCTGATGCCCCT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=108;TCR=107;TR=215;WE=66033309;WS=66033291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	66036293	.	A	ACC	296	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.7075;HP=9;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=61.29;NF=0;NR=23;PP=296;QD=13.4782608696;SC=TCTTCCGCTGACCCCCCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=23;WE=66036301;WS=66036283;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,23:0.66:35
chr11	66040049	rs555853	G	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.31;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	66040053	rs555826	A	G	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.89;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	66050712	rs4073582	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=754;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GCCCCTGTCTGCCCCAGGTAC;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=52;WE=66050720;WS=66050702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr11	66050948	rs3016315	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=20;PP=1154;SC=CCTTTTGCCCCTGAGGACTGA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=66050956;WS=66050938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	66054823	rs510398	C	T	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=3;PP=1594;SC=GGGAGGGATACAGTCCAAATC;SOR=5.010;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=60;WE=66054831;WS=66054813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	66059782	rs6591210	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=6;PP=236;SC=GCCCCCGGCGTCCCCTCATCC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=66059790;WS=66059772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	66099987	rs1784029	C	T	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1439;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CAGGCCACTCCGCCCGGCGGT;SOR=1.069;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=177;TCF=78;TCR=99;TR=80;WE=66099995;WS=66099977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,85:0.43:200
chr11	66100152	rs1784030	T	C	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=92;PP=2965;SC=CAATCGAGGCTTCTGGGGGCA;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=67;TCR=92;TR=159;WE=66100160;WS=66100142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	66101974	rs3016317	C	T	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.45;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	66101974	.	CGGAG	TGGAA,TGGAG	624	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23,40;NR=20,35;PP=624,495;QD=15.7550668573;SC=TATGGAGAGACGGAGCCTCAC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=43,75;WE=66101986;WS=66101964;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.57:75
chr11	66101978	rs10896110	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr11	66102807	rs10444359	G	A	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1292;ReadPosRankSum=1.098;SC=TTCGGGCGGTGTGCTGCGAGC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=68;WE=66102815;WS=66102797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,84:0.70:120
chr11	66103046	rs3016763	C	T	6512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=79;PP=2965;SC=AGGAGCAGGGCCCGTGGACAC;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=122;TCR=79;TR=201;WE=66103054;WS=66103036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	66103565	rs192954875	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.260;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr11	66104057	rs3016316	T	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=704;SC=GGGTCAGGGGTCCCCTCCATG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=66104065;WS=66104047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	66104993	rs3116068	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GCCCTGAGGCCGGACAGCCTG;SOR=1.168;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=57;WE=66105001;WS=66104983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr11	66105194	rs1052566	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=67;ReadPosRankSum=0.621;SC=AGGAGTCCAGGCCAGTGCCAG;SOR=0.241;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=8;WE=66105202;WS=66105184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr11	66105817	rs2276106	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=0.221;SC=CCCTGCCCCACCCCCCACCTC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=17;WE=66105825;WS=66105807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	66107527	rs1785633	C	A	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1249;ReadPosRankSum=1.249;SC=CCAACCCCCTCCCCTGGGTCT;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=197;TCF=117;TCR=80;TR=84;WE=66107535;WS=66107517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,102:0.43:235
chr11	66107674	rs1784035	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=71;PP=2054;SC=GCAGTTTGTCATCCCACCATT;SOR=2.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=89;WE=66107682;WS=66107664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	66108660	rs947978	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=874;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GAAGAGGGTACAGAACCACCC;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=55;WE=66108668;WS=66108644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr11	66108894	rs2236679	G	C	4410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.400;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=100;PP=2401;ReadPosRankSum=0.674;SC=CAGCAAGCCCGGTGTTAGGCG;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=124;TCR=166;TR=175;WE=66108902;WS=66108884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,208:0.60:345
chr11	66109527	rs112182142	C	CTGTGTG	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=570;ReadPosRankSum=0.750;SC=TGTAGGGGCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=16;WE=66109536;WS=66109517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr11	66109779	rs1784037	AT	GA	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=822;SC=AGGCAGCAGGATGCTGAACAC;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=29;WE=66109788;WS=66109769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	66130736	rs1039593	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=289;SC=TTTCTTCCCCACAGCACTCCA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=66130744;WS=66130726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	66131149	rs1039594	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.752;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=539;ReadPosRankSum=-0.676;SC=CCCTTCTTTCCGGGCCTCAGT;SOR=1.758;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=29;WE=66131157;WS=66131139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr11	66131906	rs7125100	A	G	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=946;SC=CTGTGGTAGAAGCTGAAGTCA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=66131914;WS=66131896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	66133311	rs4930358	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=737;SC=TACCAGGCCATTTGGACTACC;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=66133319;WS=66133301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	66133336	rs2279861	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=-1.695;SC=AATCACCTCCATGCTCTTTCA;SOR=1.992;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=17;WE=66133344;WS=66133326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr11	66134085	rs8187658	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=0.818;SC=CCAGGTTTCCCGACAGCCAGG;SOR=1.101;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=66134093;WS=66134075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr11	66135179	rs2279862	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=647;ReadPosRankSum=0.456;SC=CTCTCAGGGCCTCAGGCTCAG;SOR=0.585;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=37;WE=66135187;WS=66135169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr11	66135898	rs2292123	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=419;SC=CCATATCACCTGCTTACCTCC;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=66135906;WS=66135888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	66138894	rs7946434	G	C	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=24;PP=1347;SC=CTACAACCCCGATCACCCCGG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=66138902;WS=66138884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	66206169	rs11110	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=764;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TCGCCCGGATCACACCGCCGA;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=45;WE=66206177;WS=66206159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr11	66258916	rs75546553	G	A	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=685;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CAGAGCGGGTGTGGAGGTGGG;SOR=0.888;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=49;WE=66258924;WS=66258906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,59:0.46:128
chr11	66262806	rs10791878	T	C	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=26;PP=1449;SC=AGTGGCCACCTTAAGCCCGAC;SOR=1.105;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=70;WE=66262814;WS=66262796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	66272142	rs1671063	A	G	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=1425;SC=GGTATGCAACAGTCACTGATG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=73;WE=66272150;WS=66272132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	66278059	rs1791688	C	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=11;PP=1018;SC=TTGTACTCGCCCTTCCCTGTG;SOR=2.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=52;WE=66278067;WS=66278049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	66285268	rs10736656	G	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=4;PP=189;SC=AAGAGATGGGGTCTCACCATG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=66285276;WS=66285258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	66299515	rs8432	A	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=19;PP=535;SC=CTGAGACCTGAGCTGCTGTGA;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=66299523;WS=66299505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	66318972	rs490998	G	A	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=26;PP=1299;SC=ATGACCTTTGGCCCTTGGCCT;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=66318980;WS=66318962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	66324583	rs678397	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=35;PP=1677;SC=AATGCCAGCCTTCTGCCCACT;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=66324591;WS=66324573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	66324762	rs677488	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=479;SC=CCCTGCTAACCCCAAGCGTGG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=66324770;WS=66324752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	66327673	rs1671064	G	A	5425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=59;PP=2866;SC=ACCATTGACCGGCTGCAACTG;SOR=1.151;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=98;TCR=59;TR=156;WE=66327681;WS=66327663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	66328095	rs1815739	T	C	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=59;PP=2223;SC=CGAGGCTGACTGAGAGCGAGG;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=121;WE=66328103;WS=66328085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	66328719	rs618838	T	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=4;PP=369;SC=GGTGCCCAGCTGTGACCAGAC;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=66328727;WS=66328709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	66328877	rs607736	G	A	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=21;PP=1569;SC=ATGGGGCCAGGGCTGGGCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=66328885;WS=66328867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	66329732	rs540874	A	G	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=49;PP=1440;SC=CTACAGAAGCAGAATGGGATG;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=66329740;WS=66329722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	66331458	rs572846	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=7;PP=483;SC=CCCCGGACCCACGATGCAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=66331466;WS=66331448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	66333598	rs545009	C	T	6069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=83;PP=2965;SC=CAGGCTCTTTCCTCAGGAGAG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=178;WE=66333606;WS=66333588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	66335308	rs2242663	T	C	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=24;PP=2788;SC=TCATAGCATCTTGGTTTCCAG;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=96;TCR=25;TR=120;WE=66335316;WS=66335298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	66335548	rs1127894	A	G	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=99;PP=2965;SC=GCGACCCCTGACCCGCCTGGA;SOR=2.355;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=31;TCR=99;TR=130;WE=66335556;WS=66335538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	66335832	rs1044522	G	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=15;PP=591;SC=CGAAGCGGGTGGGCGCCAGCA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=66335840;WS=66335822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	66360584	rs1110708	C	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=264;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGCCGCCACCCGGTGGCTGAC;SOR=0.598;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=19;WE=66360592;WS=66360574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr11	66406070	rs670900	A	C	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=67;PP=2125;SC=AGAGGATCTGAGGGAACGCCG;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=66406078;WS=66406060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	66453629	rs139904707	G	A	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=948;ReadPosRankSum=0.087;SC=TGAGTTGGCCGCAGTGGACAG;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=83;TCR=92;TR=69;WE=66453637;WS=66453619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,79:0.41:195
chr11	66457681	rs35532855	C	T	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=56;PP=1393;ReadPosRankSum=0.650;SC=CTGCATGTGGCGGCCGATCTC;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=167;TCF=54;TCR=113;TR=84;WE=66457700;WS=66457671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,103:0.53:195
chr11	66468469	rs506028	A	G	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1197;ReadPosRankSum=0.013;SC=GTTGATGGCCACTGCCTGAGC;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=72;WE=66468477;WS=66468459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,91:0.52:176
chr11	66472274	rs4930388	T	C	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=43;PP=2150;SC=GGCACCCGGCTCTGCACCTCG;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=66472282;WS=66472264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	66481264	rs615536	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=79;ReadPosRankSum=0.687;SC=TGTGAGATCTCGAAGAGGAAG;SOR=0.719;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=6;WE=66481272;WS=66481254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr11	66583759	rs7930203	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=0.802;SC=TCTAAATTAGATATATTTCTG;SOR=1.473;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=11;WE=66583767;WS=66583749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr11	66583779	rs543191	T	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=339;SC=GTAGAATAAATAAGTTCAGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=66583787;WS=66583769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	66595649	rs144691982	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TCTGCCTCCTCATCTCCCTGT;SOR=0.621;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=94;TCR=34;TR=75;WE=66595657;WS=66595639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,81:0.57:142
chr11	66610645	rs7570	G	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=618;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CGCAGGACGTGCTGTGGCTGC;SOR=0.447;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=43;WE=66610653;WS=66610635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr11	66626234	rs3741194	T	C	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=870;ReadPosRankSum=-2.741;SC=GAGATTGGGGTGACCGGCGCT;SOR=0.768;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=74;WE=66626242;WS=66626224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,94:0.56:168
chr11	66812338	rs11227668	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=-1.836;SC=ATGCAGATGGATAGGGGGTGG;SOR=0.185;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=25;WE=66812346;WS=66812328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr11	66816211	rs149550378	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=412;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CATGTGGCACGCTGTCCGGCG;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=31;WE=66816219;WS=66816201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr11	66837965	rs4930409	T	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=50;PP=1969;SC=GACTGACCTGTGCAAGGACAA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=66837973;WS=66837955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	66982717	rs189683982	G	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=407;ReadPosRankSum=1.011;SC=TTTTTGTTATGTATTTTAAGA;SOR=0.861;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=74;TCR=22;TR=32;WE=66982725;WS=66982707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr11	66995603	rs3741189	T	C	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=70;PP=2965;SC=CCCACCTAACTAAGGAATTTC;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=138;WE=66995611;WS=66995593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	67012606	rs117322901	T	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=262;ReadPosRankSum=-0.130;SC=TCTTCTACCCTATCCAGTCTT;SOR=0.649;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=20;WE=67012614;WS=67012596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,19:0.27:71
chr11	67017445	rs34463980	C	CA	2800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=3;PP=2957;SC=CCCTCTCCAACGTGACCTTTC;SOR=6.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=66;WE=67017453;WS=67017435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	67034266	rs2228418	C	A	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=53;PP=1827;SC=GCAAGAAGATCCTGCTGCCCG;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=67034274;WS=67034256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	67050292	rs2071007	G	A	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=122;PP=2965;SC=TGACGATGGTGGGTGCAGGTC;SOR=1.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=47;TCR=122;TR=169;WE=67050300;WS=67050282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	67052466	rs10896164	G	A	5328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=59;PP=2965;SC=TAAGGAGCCCGTGCGGGGGTC;SOR=1.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=126;TCR=59;TR=185;WE=67052474;WS=67052456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	67057092	.	GC	G	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=16;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=106;QD=21.8;SC=CCGTCCTGGAGCCCCCCCCCC;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=5;WE=67057112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,5:0.42:12
chr11	67068859	rs2298815	T	C	6907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=126;PP=2965;SC=GCTCTGCTGTTGCCGCATCAG;SOR=1.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=83;TCR=127;TR=209;WE=67068867;WS=67068849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	67071584	rs4244822	C	G	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=62;PP=1822;SC=CTGCTCTCTCCGCAGGACCAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=102;WE=67071592;WS=67071574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	67076810	rs3737460	T	G	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=31;PP=2965;SC=CAGGTCCGATTGCCAGTGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=101;TCR=31;TR=132;WE=67076818;WS=67076800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	67141148	.	AT	A	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=11.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.720;SOR=2.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr11	67174375	.	G	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,42:0.23:186
chr11	67177278	rs7122299	G	A	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=78;PP=2645;SC=GGCTGATGCCGGCCCGGCAAA;SOR=1.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=126;WE=67177286;WS=67177268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	67184725	rs61734601	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.551;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-0.633;SC=ACAAGCCTTCGCCCCCAACAC;SOR=0.204;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=13;WE=67184733;WS=67184715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr11	67192332	.	CCA	C	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=58.37;NF=3;NR=1;PP=58;QD=15.25;SC=ATGACAATGGCCACACACACA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=67192341;WS=67192330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	67196237	rs1476792	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=235;ReadPosRankSum=0.466;SC=CTCTATTAAGTTCTGATCCCA;SOR=0.215;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=14;WE=67196245;WS=67196227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr11	67196544	rs917570	C	G	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1183;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGAAGGGGAACTGGGGAGCAC;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=188;TCF=87;TCR=101;TR=77;WE=67196552;WS=67196534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,90:0.45:201
chr11	67199706	rs1638588	C	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=553;ReadPosRankSum=-1.900;SC=CTGTTCTGTTCTGTTGGGATT;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=40;WE=67199714;WS=67199696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr11	67200819	rs4930427	C	T	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=51;PP=1569;ReadPosRankSum=1.534;SC=AGCCGCCCTTCACCGCAGAGA;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=269;TCF=146;TCR=123;TR=113;WE=67200827;WS=67200809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,129:0.42:307
chr11	67201008	rs1790753	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=130;ReadPosRankSum=0.596;SC=GCCAGGGCCACCCCGGCCTGT;SOR=0.829;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=10;WE=67201016;WS=67200998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr11	67202044	rs1790752	G	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=753;ReadPosRankSum=-1.771;SC=CCCTGCCTCCGCCCCCCAGGG;SOR=1.003;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=142;TCF=42;TCR=100;TR=47;WE=67202052;WS=67202034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,62:0.35:175
chr11	67202156	rs13859	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr11	67205978	rs872375	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=-2.195;SC=GCCTCCTGTGGGGACATGAAG;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=35;WE=67205986;WS=67205968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,37:0.29:126
chr11	67207426	rs2302264	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TCCGCAGGCCGACCCCTAAGG;SOR=0.752;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=6;WE=67207434;WS=67207416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr11	67223920	rs1638564	CA	GC	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CGCAGTCAGTCAGGGAGCCCG;SOR=0.731;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=45;TCR=87;TR=36;WE=67223929;WS=67223910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,52:0.32:161
chr11	67224988	rs17501521	C	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,53:0.29:183
chr11	67232014	rs187107929	T	C	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=37;PP=1948;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CCTCTTCCCTTGAGATGAGGG;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=103;TCR=54;TR=109;WE=67232022;WS=67232004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,125:0.69:181
chr11	67257037	rs4084113	C	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=871;ReadPosRankSum=-1.522;SC=GCTGGGGGAGCGGACAGAGAC;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=110;TCR=82;TR=63;WE=67257045;WS=67257027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,69:0.33:211
chr11	67257273	rs611697	G	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=715;SC=CATGATCTCTGCGAGGGCAGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=67257281;WS=67257263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	67257823	rs641081	C	A	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.638;SC=CCAGCTGGACCAGCAGATCAC;SOR=0.239;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=171;WE=67257831;WS=67257813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr11	67258391	rs4930199	A	G	6036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=76;PP=2965;SC=CGAGAGCTGCAGGCCCTGGAG;SOR=0.972;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=105;TCR=76;TR=180;WE=67258399;WS=67258381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	67262264	.	T	TGAGTGGGCGA	1596	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=61.98;NF=24;NR=4;PP=1596;QD=57.6428571429;SC=GCCTCTCTGGTGAGTGGGCGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=28;WE=67262272;WS=67262254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,28:0.76:37
chr11	67262282	rs202207490	C	CGA	3292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=2979;SC=CGAGAGTGGGCGAGTGGGCGA;SOR=3.611;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=28;WE=67262297;WS=67262272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	67262289	.	GC	AC	2976	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.85;NF=22,85;NR=4,28;PP=2976,907;QD=20;SC=GGGCGAGTGGGCGAGGGGGCG;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=26,113;WE=67262297;WS=67262272;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,113:0.90:126
chr11	67262289	.	GC	GCGAGAGGAC,GCGAGTGGAC	4343.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=22,85;NR=4,28;PP=2976,907;SC=GGGCGAGTGGGCGAGGGGGCG;SOR=2.833;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=26,113;WE=67262297;WS=67262272;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.27,0.73:98
chr11	67263767	rs618633	A	G	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=43;PP=1312;SC=CGCAGGGGTCAGCCGCGTGGA;SOR=1.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=67263775;WS=67263757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	67264679	rs2276120	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=673;ReadPosRankSum=1.389;SC=ACTAGAGGCGCCCCCGCAGCC;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=37;WE=67264687;WS=67264669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr11	67266484	rs140488259	C	T	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=772;ReadPosRankSum=-1.424;SC=TGCAGGGCAACGAAGCCAGTG;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=97;TCR=121;TR=64;WE=67266492;WS=67266474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,84:0.33:257
chr11	67267043	rs79324721	T	A	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=29.20;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	67267043	.	T	TCCAA	485	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=67.45;NF=17;NR=0;PP=485;QD=28.8823529412;SC=CATCCATCCATCCATCCATCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=17;WE=67267051;WS=67267033;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,17:0.77:22
chr11	67271740	.	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=46;PP=1107;ReadPosRankSum=1.436;SC=GCTGCGCGCGGCCCCGAGCCC;SOR=1.643;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=56;WE=67271748;WS=67271730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,59:0.86:69
chr11	67288594	rs2276118	C	T	4781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=70;PP=2747;ReadPosRankSum=0.087;SC=GTAGCCGTCCCGGTCTCGGTC;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=163;WE=67288602;WS=67288584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,203:0.73:279
chr11	67351529	rs145589007	A	AG	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=1472;ReadPosRankSum=-2.163;SC=GGGGGCGGGGAGGGGGGGCAG;SOR=0.422;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=24;WE=67351548;WS=67351519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr11	67351531	rs1079719	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.862;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.202;SOR=1.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr11	67351540	rs1871041	A	G	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=10;PP=1463;SC=GGGGGGGCAGACTGCGCTCAC;SOR=3.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=68;WE=67351548;WS=67351519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	67351585	rs4147581	C	G	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.087;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=0.710;NF=74;NR=29;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CTCCAGCAAACTTTTCTTTGT;SOR=1.100;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=156;TCF=107;TCR=49;TR=103;WE=67351593;WS=67351575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,117:0.67:174
chr11	67351674	rs8191445	G	A	4652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=91;PP=2662;ReadPosRankSum=-1.081;SC=AAGGGAGGCAGGGGCTGGGGC;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=112;TCR=138;TR=166;WE=67351682;WS=67351664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,206:0.68:304
chr11	67351774	rs2370143	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=219;ReadPosRankSum=0.213;SC=CCTTCCTGTTCCCCGCCTCTC;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=19;WE=67351782;WS=67351764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr11	67352256	rs762803	C	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=614;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GAGTCTTGAACCTCCAAGTCC;SOR=0.616;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=48;WE=67352264;WS=67352246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,56:0.34:163
chr11	67352689	rs1695	A	G	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,94:0.26:368
chr11	67353844	rs1871042	C	T	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1024;ReadPosRankSum=0.335;SC=GAGTCCCTGGCCCCCCTGCCC;SOR=0.755;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=260;TCF=141;TCR=119;TR=83;WE=67353852;WS=67353834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,104:0.35:299
chr11	67353970	rs4891	T	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=575;ReadPosRankSum=1.797;SC=GGCGCCTCAGTGCCCGGCCCA;SOR=0.755;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=60;TCR=107;TR=55;WE=67353978;WS=67353960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,67:0.34:198
chr11	67372477	rs12421329	G	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=515;ReadPosRankSum=0.184;SC=TGCTCCAGTGGGTGGGGACCA;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=176;TCF=79;TCR=97;TR=50;WE=67372485;WS=67372467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,63:0.31:204
chr11	67372593	rs12793832	A	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=133;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AACAGGGCTCATCATTCCTGA;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=9;WE=67372601;WS=67372583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr11	67374581	rs1871043	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=391;ReadPosRankSum=0.291;SC=CACGGGTGTTTGGGGCCGGGT;SOR=0.591;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=134;TCF=37;TCR=97;TR=38;WE=67374589;WS=67374571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr11	67374748	.	G	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.483;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,61:0.30:203
chr11	67375162	rs1382089	T	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=481;SC=AGGGCCAAGCTGCCACACTCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=67375170;WS=67375152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	67375184	rs7948073	T	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.416;SC=CTTGTGGGGCTGTGTGGTGCC;SOR=0.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=5;WE=67375192;WS=67375174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr11	67395714	rs7124513	C	T	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GTGCAAACACCTCATCTACCT;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=136;TCR=124;TR=78;WE=67395722;WS=67395704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,94:0.31:301
chr11	67399735	rs2514021	T	C	6521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=90;PP=2965;SC=CCCTTTGCCTTCCGCCCACTG;SOR=0.907;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=113;TCR=90;TR=203;WE=67399743;WS=67399725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	67399970	rs3765088	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=1366;ReadPosRankSum=1.797;SC=GGTGGGGCCCCAGGATGGGTC;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=64;WE=67399978;WS=67399960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,68:0.70:97
chr11	67401635	rs12787511	G	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=621;ReadPosRankSum=-0.332;SC=AGGCCCTTCCGTCCCCACCGT;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=98;TCR=38;TR=44;WE=67401643;WS=67401625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,52:0.32:162
chr11	67402362	rs3758938	T	G	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=530;ReadPosRankSum=-1.176;SC=GCCCAGGATCTTCACCTGGAA;SOR=0.806;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=47;WE=67402370;WS=67402352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,63:0.34:188
chr11	67407146	rs2447591	T	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=30;PP=969;SC=GTGGTCTTCCTACTCGAGCTG;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=67407154;WS=67407136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	67412203	rs143278298	C	CCA,CCACA	685.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=38.10;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,10:0.44,0.56:18
chr11	67414492	rs948445	C	T	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=51;PP=1500;SC=CAGGGGCTCCCGGGGCACAGG;SOR=1.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=67414500;WS=67414482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	67430589	rs78402723	A	G	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=39;PP=2848;SC=GGCTGGGGGAACCTGCGGTCT;SOR=1.545;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=125;WE=67430597;WS=67430579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	67430762	rs1551886	T	C	5053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.620;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=1.906;SC=GGGTGGGTAGTGGATCTCCTT;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=69;TCR=95;TR=162;WE=67430770;WS=67430752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr11	67431038	rs1979375	G	A	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=32;PP=2257;SC=GAGGCCCAGGGTGTGGATCAA;SOR=1.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=106;WE=67431046;WS=67431028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	67431110	rs1979376	G	A	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=99;PP=2965;SC=CTTCCCTAGGGGTGGAAATGG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=100;TCR=99;TR=199;WE=67431118;WS=67431100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	67432804	rs2447571	T	C	8795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=137;NR=161;PP=2965;SC=GCCACGCGGCTGCAGCCCAGC;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=137;TCR=161;TR=298;WE=67432812;WS=67432794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr11	67432854	rs6591270	T	C	6310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=128;PP=2965;SC=GTTGATGATGTGGCCCAGGTT;SOR=1.203;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=82;TCR=128;TR=210;WE=67432862;WS=67432844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	67433708	rs5792424	C	CG	10653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=111;PP=2981;SC=GGGGCGGGCTCGGGGCCAGCC;SOR=1.119;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=209;TCF=87;TCR=122;TR=194;WE=67433716;WS=67433698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	67433758	rs1551887	G	A	10782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=178;PP=2965;SC=TGGGGACGTCGGGCACTGCTG;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=357;TCF=179;TCR=178;TR=357;WE=67433766;WS=67433748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr11	67433869	rs1551888	C	T	6936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=132;PP=2965;SC=CACCACGCAACTCCCTGCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=82;TCR=132;TR=214;WE=67433877;WS=67433859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr11	67434010	rs1871032	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=487;ReadPosRankSum=1.251;SC=GGCTACTGGGCGGGGAGAGCA;SOR=1.140;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=29;WE=67434018;WS=67434000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr11	67434416	rs4646823	C	A	6839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=95;PP=2965;SC=TCCAGGCCTGCAGGTTCTTGA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=97;TCR=95;TR=192;WE=67434424;WS=67434406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr11	67564056	rs74682508	T	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.05;QD=26.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	67564104	rs10896235	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.40;MQRankSum=-2.036;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.683;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	67564135	rs77521350	G	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.350;NF=18;NR=10;PP=386;ReadPosRankSum=-1.004;SC=ATGCAGGCCCGGGTGGGCGTG;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=28;WE=67564143;WS=67564125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr11	67564162	rs75324740	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.012;NF=11;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=1.185;SC=CACATAGCTCAGTGGTGAACA;SOR=0.439;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=20;WE=67564170;WS=67564152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,12:0.19:64
chr11	67564181	rs79260939	G	A	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=40;NR=39;PP=1211;SC=CAGCTGGCACGTCTCTGGGTT;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=67564189;WS=67564171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	67564197	rs72657419	T	C	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=45;PP=1136;SC=GGGTTGCAGATGGTAAGGGCC;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=67564205;WS=67564187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	67564293	rs117919932	T	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.94;QD=29.48;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	67765163	rs5792426	A	AG	2529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=1797;SC=ATGGCCAGGAAGCCACTGCCA;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=67765171;WS=67765153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	67782947	rs2286170	G	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=351;ReadPosRankSum=0.552;SC=GGGGTTGGGGGTATGAGAGGG;SOR=0.758;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=24;WE=67782955;WS=67782937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr11	67786064	rs11433668	A	AC	4481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=43;PP=2936;SC=GCCCTCAGGAACTCCGGGCCT;SOR=0.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=68;WE=67786072;WS=67786054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	67786764	rs1636207	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=723;ReadPosRankSum=-1.743;SC=GGAACAGGCAAGGCTCAAGGG;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=44;WE=67786772;WS=67786754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
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chr11	67790243	rs3764818	C	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=783;ReadPosRankSum=-0.789;SC=GGGGTGCGGCCGGGCTGGGCA;SOR=0.625;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=52;WE=67790251;WS=67790233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,66:0.65:102
chr11	67795299	rs308341	G	A	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.776;NF=53;NR=63;PP=1904;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TGCGCAGCCCGGGGATGGAGA;SOR=0.750;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=216;TCF=102;TCR=114;TR=116;WE=67795307;WS=67795289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,143:0.56:257
chr11	67795353	rs3751082	G	A	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.508;NF=33;NR=46;PP=1357;ReadPosRankSum=0.159;SC=CGCGCCGCCTGAGGATGCTGC;SOR=0.921;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=79;WE=67795361;WS=67795343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr11	67795378	rs11436139	G	GC	5298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=72;PP=2974;SC=GGCCATGGAGGCCAAGGCTGC;SOR=0.878;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=31;TCR=77;TR=100;WE=67795386;WS=67795368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	67798381	rs77155493	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=546;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CGCATGCGCCGCCCGCTCTGC;SOR=0.687;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=42;WE=67798389;WS=67798371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr11	67799731	rs3133266	C	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=42;PP=1607;SC=CCTGGTATGACGTCACGCCCT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=92;WE=67799739;WS=67799721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	67800494	rs3115545	T	G	4975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=75;PP=2965;SC=GTCCTGGGCATGAGGGGACAG;SOR=0.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=168;WE=67800502;WS=67800484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	67801282	rs3133267	C	T	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=2;PP=653;SC=GCAGCCGCCGCCGCTACTTTC;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=67801290;WS=67801272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	67801496	rs12803743	T	C	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=795;ReadPosRankSum=1.765;SC=AGACAGTGAGTGCTGTCCACA;SOR=0.591;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=69;WE=67801504;WS=67801486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,84:0.46:182
chr11	67801517	rs3115546	G	T	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=75;PP=2671;SC=GACAGACCCGGTGCTGTGCCA;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=132;WE=67801525;WS=67801507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	67803215	rs2075627	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=0.984;SC=GGCCGGGCACGGTGGCTCACG;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=12;WE=67803223;WS=67803205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr11	67804156	rs3133269	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=1.446;SC=GGGCCGTTCCCGGCCTGCCTG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=67804164;WS=67804146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	67814979	rs2471829	G	C	7510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=114;PP=2965;SC=TCATGTTCCTGTTCGCCCTGG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=235;WE=67814987;WS=67814969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr11	67815086	rs12418239	G	A	3468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.659;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=56;PP=2558;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GGGCCAGGCAGCCCCTCACCA;SOR=0.956;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=261;TCF=156;TCR=105;TR=146;WE=67815094;WS=67815076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,152:0.52:291
chr11	67833800	.	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=1.058;SC=CAACTCAGAGCGGCATTTTGA;SOR=0.960;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=24;WE=67833808;WS=67833790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr11	67837771	rs3819255	A	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=366;ReadPosRankSum=-0.965;SC=CTATTAAAAAATTTTCAAAAA;SOR=0.625;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=21;WE=67837779;WS=67837761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr11	67837837	rs75812975	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=311;ReadPosRankSum=0.054;SC=TCTTGGGGCTTTGGTTAAACA;SOR=1.051;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=18;WE=67837845;WS=67837827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr11	67842165	rs139339257	G	A	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1350;ReadPosRankSum=0.480;SC=TCAACTAAGCGTTTATGAACA;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=199;TCF=92;TCR=107;TR=86;WE=67842173;WS=67842155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,101:0.44:230
chr11	67933557	rs187333230	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=0.852;SC=GGCATACTTTCGGAATCGCCA;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=11;WE=67933565;WS=67933547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	67957518	rs2512606	A	T	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=95;PP=2965;SC=CACCACCATGATCTTGGATTC;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=60;TCR=95;TR=155;WE=67957526;WS=67957508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	68030173	rs3802746	C	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=816;ReadPosRankSum=0.706;SC=ATCAGCTGCACCTCCTGAAGT;SOR=0.521;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=52;WE=68030181;WS=68030163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,70:0.45:155
chr11	68115764	rs643981	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=0.797;SC=GTGTCACCATCTCTCTCTCGA;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=18;WE=68115772;WS=68115754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	68131167	rs10791978	A	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=2;PP=888;SC=GCAATGACTGACGGGGGACCC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=68131175;WS=68131157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	68133035	rs314776	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=695;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCTGGTTTTCTCAGTCCACAC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=52;WE=68133043;WS=68133025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr11	68153710	rs17848255	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=575;ReadPosRankSum=0.796;SC=TTCCCTTGCCCGGCCCACCCC;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=33;WE=68153718;WS=68153700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr11	68157299	rs4988320	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=948;ReadPosRankSum=1.742;SC=TGGGGATGCTGCAGAGACCAG;SOR=0.340;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=62;WE=68157307;WS=68157289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,79:0.61:130
chr11	68170825	rs687482	A	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.18;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	68170825	.	AAAGTTGCG	GAAGTTGCG,GAAGTTGCT	285	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=20,8;NR=1,0;PP=285,108;QD=15.2272005975;SC=AGGTGCAGGTAAAGTTGCGGC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21,8;WE=68170841;WS=68170823;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:21
chr11	68170833	rs686921	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr11	68171013	rs545382	T	C	3129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=61;PP=1607;ReadPosRankSum=-1.612;SC=CGCACATTTTTGGGTTCACGC;SOR=0.609;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=287;TCF=151;TCR=136;TR=124;WE=68171021;WS=68171003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,157:0.44:353
chr11	68173861	rs471966	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=258;ReadPosRankSum=0.696;SC=GGACCTGACCCGGGGGTGAGT;SOR=0.195;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=15;WE=68173869;WS=68173851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr11	68179166	rs689179	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=167;ReadPosRankSum=-0.782;SC=CTCGCCGCACATACCCTGTGG;SOR=1.284;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=13;WE=68179174;WS=68179156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr11	68192690	rs556442	G	A	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=48;PP=2321;SC=CCCTGGTGGTGGACAACACAC;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=103;WE=68192712;WS=68192680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	68305521	rs11403965	G	GT	929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=974;SC=CATTCTAGCAGTAAGTCCAGG;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=68305529;WS=68305511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	68312645	rs10896340	A	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=544;SC=AAGCACTCACATACTATTTGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=68312653;WS=68312635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	68315798	rs10736668	C	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=512;SC=TCTGGGGAGCCGGTAACAGGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=68315806;WS=68315788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	68331715	rs10501398	C	G	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=12;PP=1934;SC=TGGTCGATAACCTTGAATGAT;SOR=3.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=78;WE=68331723;WS=68331705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	68456410	rs3136540	T	C	7446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=125;PP=2965;SC=TGAAATATCATCAACTTAACA;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=106;TCR=125;TR=231;WE=68456418;WS=68456400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr11	68458470	rs1042577	T	C	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=93;PP=2659;SC=CTCCTGGGCATGTTTGTCTGT;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=51;TCR=94;TR=144;WE=68458478;WS=68458460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	68476011	rs4930597	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=17;PP=429;SC=ACAGTGCACCATTTCTACCTA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=68476019;WS=68476001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	68530318	rs7112615	C	A	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=70;PP=2288;SC=GGCAAGGAGACGTGGACTTCA;SOR=1.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=109;WE=68530326;WS=68530308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	68548260	rs3019576	C	A	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=84;PP=2965;SC=AAAGAGGCAACAATGAGGAGA;SOR=1.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=52;TCR=84;TR=136;WE=68548268;WS=68548250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	68549340	rs2228502	A	G	8182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=127;PP=2965;SC=CTAACGTCACAAAGAACGCTG;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=120;TCR=127;TR=247;WE=68549348;WS=68549330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	68566647	.	GAAA	G	2725.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=49.56;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	68566648	.	A	AC	1333	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.18;NF=24;NR=4;PP=1333;QD=48.7142857143;SC=CTTCATACGGAAAAATTTCAT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=28;WE=68566659;WS=68566638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,28:0.85:33
chr11	68566649	.	AAA	GCT	2414	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=29;NR=4;PP=2414;QD=75.0747840867;SC=TTCATACGGAAAAATTTCATC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=33;WE=68566659;WS=68566638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,33:0.65:51
chr11	68566651	.	A	ACGCT	2725.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=49.56;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	68566839	rs3019603	G	A	3077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=74;PP=2604;SC=ATTATTGGGGGAAAAAAAAAT;SOR=1.629;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=124;WE=68566847;WS=68566829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	68658686	rs61887147	C	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=16;PP=1156;ReadPosRankSum=2.347;SC=ACATGCTGCTCCAGTTAAACT;SOR=0.957;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=72;WE=68658694;WS=68658676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,88:0.63:139
chr11	68671477	rs1249463	T	C	3245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=78;PP=1729;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TGCTGGAGCTTGAGAGAGACG;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=231;TCF=95;TCR=136;TR=130;WE=68671485;WS=68671467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,156:0.56:279
chr11	68678962	rs560096	T	C	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=882;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GAAGCGGTTTTATTTGCGCTG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=49;WE=68678970;WS=68678952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,57:0.55:104
chr11	68700701	rs645436	G	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=308;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTCCTCACTTGCTGTGGTTCA;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=13;WE=68700709;WS=68700691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr11	68703009	rs598255	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=0.497;SC=TCATGGTGCACCTTCTGTCCT;SOR=0.936;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=16;WE=68703017;WS=68702999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr11	68705674	rs17612126	C	A	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=932;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GATCTGCCCACGGAGGAGGAC;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=62;TCR=61;TR=62;WE=68705682;WS=68705664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr11	68705876	rs4378405	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGTGGGTTCCGTCTCCAGGAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=68705884;WS=68705866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr11	68773810	rs57545280	AG	A	263.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=166;SC=AGCGTGGGGGAGGGGGGGGGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=68773818;WS=68773800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	68777183	rs11228437	G	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=494;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GCCCAGAGGAGCCCACTGCCC;SOR=0.533;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=42;WE=68777191;WS=68777173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr11	68777323	rs11544721	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GGCACTTACCTTGTTCCTGTT;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=14;WE=68777331;WS=68777313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr11	68816370	rs4930642	A	G	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=40;PP=2067;SC=GCGTCAGCAAAAACGCCAGGG;SOR=1.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=68816378;WS=68816360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	68821648	rs12285715	G	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=30;ReadPosRankSum=-2.539;SC=CGACTGACTGGGTCCAAGGCC;SOR=0.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=68821656;WS=68821638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	68822739	rs1470892	T	C	12523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=221;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.315;SC=ACCGCGCTGCTCCCTGGGAGC;SOR=1.084;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=369;TCF=148;TCR=221;TR=369;WE=68822747;WS=68822729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,461:1.00:463
chr11	68825037	rs3750973	A	C	4563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=46;PP=2873;SC=CCGCCCGTCTATCTTGCAGGG;SOR=1.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=91;TCR=46;TR=137;WE=68825045;WS=68825027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	68830226	rs10792015	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=717;ReadPosRankSum=-2.147;SC=CTCCACTTTGGGCTCAGTGAC;SOR=2.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=32;WE=68830234;WS=68830216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr11	68831293	rs11228472	C	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=313;ReadPosRankSum=0.468;SC=GTCACCGAGCCCTGCAGGCAG;SOR=0.789;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=19;WE=68831301;WS=68831283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr11	68834831	rs7950657	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=1.254;SC=CTGGCCATGAGCTCAGCCTGC;SOR=1.091;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=11;WE=68834839;WS=68834821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	68834968	rs6591368	T	C	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=41;PP=1932;SC=CTTCTGCTCTTAGCAGGATGA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=68834976;WS=68834958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	68835182	rs10750840	T	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AGGCCTTTTTTTCGATAAGTG;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=14;WE=68835190;WS=68835172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	68837794	rs61881024	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=609;ReadPosRankSum=0.626;SC=ACGCTCAGCAATGGAGACCTC;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=68;TCR=30;TR=37;WE=68837802;WS=68837784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,44:0.39:114
chr11	68838028	rs3829236	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=556;ReadPosRankSum=-1.154;SC=ACCGATACACCCTGCTGCCTC;SOR=0.289;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=37;WE=68838036;WS=68838018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr11	68839334	rs10896415	G	A	3054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.829;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=47;PP=1840;ReadPosRankSum=0.378;SC=GGGAAGGGTCGGGGGTTCTGA;SOR=0.444;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=196;TCF=121;TCR=75;TR=114;WE=68839355;WS=68839324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,136:0.60:225
chr11	68839949	rs896969	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GCAGGATGCTCGTTACAGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=15;WE=68839957;WS=68839939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr11	68840014	rs3750963	G	A	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=821;ReadPosRankSum=0.816;SC=CAAGCCAGACGCCAGGGCAGG;SOR=0.378;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=51;WE=68840022;WS=68840004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,71:0.64:111
chr11	68840160	rs3750965	A	G	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=628;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AGCTCCCACAAACAGGCCATG;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=37;WE=68840168;WS=68840150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr11	68840397	rs1466221	T	C	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=645;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TGCGTTCCTATGGCAGTGTTC;SOR=0.397;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=48;WE=68840405;WS=68840387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr11	68840412	rs1466220	C	G	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=773;ReadPosRankSum=0.424;SC=GTGTTCTGCTCTCAGCTGAGG;SOR=0.459;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=54;WE=68840420;WS=68840402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,66:0.54:122
chr11	68840617	rs3750966	T	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=255;ReadPosRankSum=-0.362;SC=GGGAATGGAGTTCTCTTTGGC;SOR=0.035;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=18;WE=68840625;WS=68840607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr11	68845867	rs7945151	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=378;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TCAAATCCCAGAATAAGAGGG;SOR=2.406;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=18;WE=68845875;WS=68845864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
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chr11	68846519	rs7124310	A	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=59;PP=1801;SC=GCCGGCCTCTACTGGGCGGGT;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=70;WE=68846527;WS=68846509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr11	68849073	rs3829240	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=509;ReadPosRankSum=0.000;SC=GACTGTGCCCGTCACCCTGGG;SOR=1.247;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=24;WE=68849081;WS=68849063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr11	68851414	rs2376558	T	C	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=45;PP=1755;SC=TGTCCTCAGCTGATGGCCGTG;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=68851422;WS=68851404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	68851466	rs896973	G	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=518;ReadPosRankSum=0.631;SC=ACATGCGTGCGTTTGGCGGGA;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=36;WE=68851474;WS=68851456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr11	68853504	rs2290421	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=566;ReadPosRankSum=0.400;SC=GTGGCTGGGACGGGGACTCGG;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=28;WE=68853512;WS=68853494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr11	68855197	rs1123665	T	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=-1.667;SC=ACATCCATCCTGAGGCTCATC;SOR=1.292;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=68855205;WS=68855187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr11	68855233	rs1551305	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=250;ReadPosRankSum=-2.346;SC=CTGTGTCCCTGTGACACTCAC;SOR=1.051;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=18;WE=68855241;WS=68855223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr11	68855363	rs3829241	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=447;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GAGGAGCCCGGGGAGGATGAG;SOR=0.888;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=26;WE=68855371;WS=68855353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr11	68855483	rs1551306	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=22;ReadPosRankSum=0.812;SC=ACAGGTGCCCGTCATGGAAGA;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=68855491;WS=68855473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	69063476	rs116926312	C	T	3341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=69;PP=2222;ReadPosRankSum=1.751;SC=GGTGCATGGGCGGCATGGGCT;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=121;TCR=132;TR=134;WE=69063484;WS=69063466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,150:0.52:286
chr11	69462910	rs9344	G	A	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.353;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1465;ReadPosRankSum=0.009;SC=AGTGTGACCCGGTAAGTGAGG;SOR=0.533;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=175;TCF=73;TCR=102;TR=89;WE=69462918;WS=69462900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,109:0.51:215
chr11	69466115	rs7177	C	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=299;SC=CAGGTGCTCCCCTGACAGTCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=69466123;WS=69466105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	69489452	rs184753070	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=340;ReadPosRankSum=1.696;SC=ATGGACGCGTCCTCTGGGCCG;SOR=1.949;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=18;WE=69489460;WS=69489442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr11	69518010	rs377560349	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=579;ReadPosRankSum=2.641;SC=CGGCGCATCCGCCCCGTGGGG;SOR=0.635;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=37;WE=69518018;WS=69518000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr11	69588729	rs2073464	G	A	4600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=54;PP=2865;SC=GAGAAGCCACGAGCCTGCTAG;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=69588737;WS=69588719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr11	69589959	rs9666584	A	G	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=53;SC=GACCTCGGGCAGGAGTGCGCA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=69589967;WS=69589949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	69625385	rs35420992	C	T	3052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TACTAGACACCGTCCGGTACA;SOR=0.671;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=118;WE=69625393;WS=69625375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,143:0.57:253
chr11	69625511	rs7932320	T	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=731;ReadPosRankSum=0.606;SC=GGGGAGACTGTGGCAGCGTCA;SOR=0.407;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=47;WE=69625519;WS=69625501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr11	69630973	rs3926882	G	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.417;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr11	69630978	rs7483837	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.404;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr11	69633633	rs41538178	C	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GCCGCAACCGCGCCCCAGGGC;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=69;WE=69633641;WS=69633623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,69:0.67:103
chr11	69924226	rs2509134	C	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=4;PP=225;SC=CCCCCTTTCACACCCGGTATG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=69924234;WS=69924216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	69924352	rs11233117	C	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=473;ReadPosRankSum=-0.240;SC=AAAATCTGACCGGCGCGGCCA;SOR=0.513;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=36;WE=69924360;WS=69924342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr11	69924476	rs11233122	T	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.667;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=-2.058;SC=AGCAGCCGGGTGGCGGCGCGA;SOR=1.501;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=13;WE=69924484;WS=69924466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr11	69931876	rs2509128	C	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=227;SC=CCCTCCCCCTCTCCCCCACTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=69931884;WS=69931866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	69933717	rs2509133	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	69949135	rs55698329	GCC	G	2666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=19;PP=1337;SC=GAGATGCACCGCCCCCCCTCA;SOR=1.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=41;WE=69949144;WS=69949125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr11	69957940	rs2515251	C	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=37;PP=1156;SC=CACACCCCCCCGGGAGCTGCA;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=69957948;WS=69957930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	69962432	rs9666084	A	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=522;ReadPosRankSum=0.995;SC=TCTGTGTGAAATGTTGCCCCA;SOR=1.315;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=34;WE=69962440;WS=69962422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr11	69962642	rs2515245	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=32;PP=1020;SC=TGGCTCTGTCAGAGCCTGGAG;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=69962650;WS=69962632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	69970412	rs2509160	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=547;ReadPosRankSum=0.205;SC=GAGCAACCTCGGAGTGCCACA;SOR=0.623;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=39;WE=69970420;WS=69970402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,52:0.39:132
chr11	69970637	rs2515258	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=306;ReadPosRankSum=-1.148;SC=GTTTGAACTCAAAGAGCTTGT;SOR=1.852;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=16;WE=69970645;WS=69970627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	69978358	rs2515264	G	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.428;SC=TTACTGGGGTGCGCAGTGCAT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=69978366;WS=69978348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	69995966	.	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=697;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GGACCTCCTTGGGACTTACAC;SOR=0.953;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=39;WE=69995974;WS=69995956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr11	69998470	rs12807936	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=0.564;SC=AAAAGTTGTCCTTAGTGGACA;SOR=0.782;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=69998478;WS=69998460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr11	69999122	rs10160639	A	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=6;PP=1064;SC=CTCAGACTCAAAATTAACAAG;SOR=2.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=69999130;WS=69999112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	69999252	rs3781663	G	A	4810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=75;PP=2965;SC=GGCCACTGTGGGTTAACTTTC;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=143;WE=69999260;WS=69999242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	70001976	rs10751195	A	G	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.806;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.209;SC=GCCGCCTCCCACTTCACCGCA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=56;WE=70001984;WS=70001965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr11	70002184	rs59375526	TA	T	661.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-1.062;QD=6.18;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr11	70002185	rs34657087	AT	A	1225.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.174;NF=6;NR=61;PP=910;ReadPosRankSum=1.951;SC=TGTTGTATATATTTTTTTTTA;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=67;WE=70002193;WS=70002169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,63:0.60:105
chr11	70002987	rs3781658	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=540;ReadPosRankSum=0.158;SC=ATGCACCCACGCTGACACACA;SOR=0.874;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=28;WE=70002995;WS=70002977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
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chr11	70007562	rs2276069	C	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=288;ReadPosRankSum=-1.477;SC=TGCTTAACTTCTCTGGGCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=16;WE=70007570;WS=70007552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	70007865	rs2155461	A	C	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=64;PP=2053;SC=GCCTTTCCCCAACCTCGCTTC;SOR=1.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=89;WE=70007873;WS=70007855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	70016247	rs35843284	T	TG	1431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.93;NF=2;NR=27;PP=1131;SC=AGGGGAAGTTTGGGCTCTGGA;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=29;WE=70016255;WS=70016237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	70031914	rs7115648	C	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=-1.810;SC=AGAGACTCCTCCAGAGGCTTG;SOR=1.981;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=16;WE=70031922;WS=70031904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr11	70031947	rs7103524	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=0.858;SC=TGGGACACCCGAGGAGGGGAC;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=70031955;WS=70031937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	70033826	rs35553507	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=30;PP=1319;ReadPosRankSum=0.181;SC=TTCTGCCACGCGTTGCCTCTC;SOR=0.552;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=174;TCF=115;TCR=59;TR=84;WE=70033834;WS=70033816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,95:0.48:197
chr11	70034096	rs3740722	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=-1.494;SC=TGCCTACCACGGGGGCGTCCT;SOR=0.668;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=14;WE=70034104;WS=70034086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	70118251	rs670012	T	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=0.738;SC=TGAGCTTAATTACTGTAGCCT;SOR=0.655;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=8;WE=70118259;WS=70118241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr11	70118489	rs546502	G	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1216;ReadPosRankSum=0.576;SC=GTTACACGAGGTTGGTCATGA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=67;WE=70118497;WS=70118479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr11	70179672	rs2282481	C	T	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GAGCATGCAGCCCTGAGGGTG;SOR=0.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=43;TCR=94;TR=81;WE=70179680;WS=70179662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,86:0.59:146
chr11	70200594	rs7943389	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=60;PP=1801;SC=CAGAGCGCACCTGTCTTTTCG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=66;WE=70200602;WS=70200584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	70208311	rs7130178	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1218;ReadPosRankSum=0.067;SC=ATGCAGTTGCGTGGGTTACAG;SOR=1.180;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=74;WE=70208319;WS=70208301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr11	70208350	rs10751231	G	A	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=66;PP=2965;SC=TACTTTGTAGGCTGTACCTCA;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=159;WE=70208358;WS=70208340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	70211574	rs670310	A	G	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.726;SC=CACTCCTCCCAGCGCGTTTTC;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=151;TCF=68;TCR=83;TR=76;WE=70211582;WS=70211564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,96:0.53:181
chr11	70222604	rs664130	G	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=385;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TAGATTTGATGAAAGTTTTAT;SOR=0.304;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=25;WE=70222612;WS=70222594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr11	70229171	rs552282	G	A	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1366;ReadPosRankSum=-0.207;SC=ACTACATTTTGGAATCCAGTG;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=84;WE=70229179;WS=70229161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,99:0.55:179
chr11	70253586	rs569732	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=920;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TGTGTCACAATCCAGGCTGTG;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=54;WE=70253594;WS=70253576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,67:0.58:115
chr11	70268474	rs77395560	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=694;ReadPosRankSum=0.449;SC=GGGTGGTCCCGCAGACTGCAT;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=40;WE=70268482;WS=70268464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr11	70279766	rs643301	C	T	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=1479;ReadPosRankSum=1.608;SC=ACAGCACCTACGATGAGTACG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=103;WE=70279774;WS=70279756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,119:0.60:200
chr11	70280992	rs3802780	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=505;ReadPosRankSum=-0.871;SC=GAGGCAGCAGGAGCCTCCGCG;SOR=0.115;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=25;WE=70281000;WS=70280982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr11	70349061	rs7110158	A	G	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=41;PP=1295;SC=AGAGGATGGCATCAGTGAGAG;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=70349069;WS=70349051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	70544937	rs7117514	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=373;ReadPosRankSum=0.581;SC=CCCACAGCACATGAGGCTGGT;SOR=1.383;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=23;WE=70544945;WS=70544927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr11	70672399	rs3019835	G	A	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=408;SC=GTTATATTCCGGACCAACTCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=70672407;WS=70672397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	70757705	rs4246962	C	T	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=91;PP=2965;SC=ATTAATTATCCGTTTTCCCAG;SOR=1.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=155;WE=70757713;WS=70757695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	70766554	rs4077321	C	T	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=38;PP=1323;SC=AAAGGAGAGGCGGAGGGTGGA;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=70766562;WS=70766544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	70766664	rs4495913	A	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=301;SC=AAGTCATTAAAAATCAAAAAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=70766672;WS=70766654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	70829858	rs3924047	T	C	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=22;PP=1873;SC=GTCCATGCACTGTGGGCTGAA;SOR=1.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=88;WE=70829868;WS=70829848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	71146577	rs909217	G	A	6675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=111;PP=2965;SC=GCAGGTGGCCGCCGCCACAGG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=107;TCR=111;TR=218;WE=71146585;WS=71146567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	71146691	rs760241	A	G	6761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=101;PP=2965;SC=GCCTCTGCCCATCGGCGGATG;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=127;TCR=101;TR=228;WE=71146699;WS=71146681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	71146886	rs138659167	C	G	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=63;PP=1717;ReadPosRankSum=0.404;SC=AGTACAGACCCTGGGGGGCGA;SOR=1.101;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=175;TCF=80;TCR=95;TR=103;WE=71146895;WS=71146876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,118:0.58:202
chr11	71146952	rs1792268	G	A	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=70;PP=2684;SC=TGTGGGCTCGGGGGCCCAGCG;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=121;WE=71146960;WS=71146942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	71149069	rs949176	A	G	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=51;PP=1456;SC=CACTCCACGCAGATGCAGCAG;SOR=2.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=71149077;WS=71149059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	71150217	rs2852853	C	T	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=831;SC=CCAGCACTGGCCCAGGGTCCT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=71150225;WS=71150207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	71152461	rs949177	A	G	4045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=89;PP=2739;SC=CTTGCAGGCCATTGATCTGAT;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=46;TCR=89;TR=135;WE=71152469;WS=71152451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	71153459	rs11603330	C	A	6278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=114;PP=2965;SC=AAGGGGGACGCATAGCAGGAA;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=185;WE=71153467;WS=71153449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr11	71155153	rs1790334	A	G	15017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=141;PP=2965;SC=CCACAGGGCCAGTCAGGGCGC;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=296;TCF=155;TCR=141;TR=296;WE=71155161;WS=71155143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr11	71155171	rs1044482	C	T	14936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=145;PP=2965;SC=CGCAGCTGTACTGGTCACAAG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=146;TCR=145;TR=291;WE=71155179;WS=71155161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr11	71164471	rs12789751	G	A	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=42;PP=1443;SC=GTGGCGCACGGGCACCGTGGC;SOR=1.300;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=71164479;WS=71164461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	71164544	rs12791871	A	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=440;SC=GGCCCTGGGCATGGGATCAGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=71164552;WS=71164534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	71166060	rs2276359	T	TG	3102.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=16;PP=1906;SC=GTTTGTTTTTTTTTTTATCCT;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=71166068;WS=71166050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	71166337	rs1790373	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=462;SC=CGCCACACCCACTGTTGGGCC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=71166345;WS=71166327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	71169547	rs2276360	G	C	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=72;PP=2677;SC=AGCGGCCCTTGTGGAGTCTCC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=128;WE=71169555;WS=71169537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	71169648	rs2276361	A	G	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=895;SC=GCTCAAGGGCATGACCCACCC;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=71169656;WS=71169638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	71174452	rs2276362	A	G	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=77;PP=2965;SC=GGGCAGACACACATGTACCTC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=176;WE=71174460;WS=71174442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	71174589	rs1629304	T	C	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=42;PP=1016;SC=GGCTCTCAGCTGAGGGCTGCC;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=71174597;WS=71174579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	71183474	rs2282621	C	T	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	71183477	rs2282620	C	T	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	71183645	rs2282619	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=254;SC=ATCCAGGTAATGGAAGGCACC;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=71183653;WS=71183635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	71184190	rs7935125	C	A	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=15;PP=1637;SC=AGGGCACCCACCTCTTCGGAA;SOR=2.365;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=71;WE=71184198;WS=71184180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	71184678	rs7950441	A	C	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=45;PP=1869;SC=GCAGCCACCAAGTGCTGCGCA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=71184686;WS=71184668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	71185479	rs2276354	T	C	9234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=176;NR=108;PP=2965;SC=AGAAGGGTTGTGACGGGGACC;SOR=1.175;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=177;TCR=108;TR=284;WE=71185487;WS=71185469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr11	71185518	rs2186778	T	C	12865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=220;NR=175;PP=2965;SC=GTGCCATGATTGCCATGAACG;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=396;TCF=221;TCR=175;TR=395;WE=71185526;WS=71185508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,482:1.00:482
chr11	71188502	rs3794065	G	A	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=102;PP=2965;SC=CCCCTGTTACGGCGGTAGGAG;SOR=1.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=39;TCR=102;TR=141;WE=71188510;WS=71188492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	71189436	rs2276353	T	C	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=60;PP=2426;SC=AATTTCCTTCTCCAGGAAGTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=121;WE=71189444;WS=71189426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	71192851	rs3814734	A	G	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=17;PP=1568;SC=GGAAAGTGCTAACACCCACGT;SOR=1.893;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=68;WE=71192859;WS=71192841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	71279936	rs72475645	A	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=17.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-6.855;QD=3.02;ReadPosRankSum=3.489;SOR=1.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,34:0.22:156
chr11	71279995	rs200834593	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-4.203;QD=5.77;ReadPosRankSum=-2.655;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,28:0.22:128
chr11	71280000	.	T	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=6.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=-4.170;QD=5.59;ReadPosRankSum=-1.768;SOR=1.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,22:0.18:121
chr11	71290670	rs2015464	C	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.815;NF=15;NR=4;PP=390;ReadPosRankSum=0.577;SC=AAAACAGTCACCCCAGGGCTG;SOR=0.673;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=19;WE=71290678;WS=71290660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr11	71290740	rs4081429	A	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.470;NF=16;NR=20;PP=504;ReadPosRankSum=2.852;SC=ATGAGAGCCAATATGACTGTG;SOR=0.732;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=36;WE=71290748;WS=71290730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr11	71290790	.	A	ACAGCAGCTGGACTGGGAGCAGCAGGACCTG	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQRankSum=-8.116;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.050;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,15:0.22:68
chr11	71498562	rs12786239	G	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-3.451;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
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chr11	71498591	rs12270466	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-2.331;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.696;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr11	71498601	rs12283300	G	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-2.488;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
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chr11	71507022	rs374595711	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.322;NF=8;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=1.477;SC=ACCTGGAACTGTCCGCTGGTC;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=10;WE=71507030;WS=71507012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	71507186	rs74830167	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.769;NF=19;NR=22;PP=431;ReadPosRankSum=1.040;SC=AACCCAGAGATGTGCCAGCTG;SOR=0.713;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=41;WE=71507194;WS=71507176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr11	71507261	rs111708284	A	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=9.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-7.010;QD=1.36;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,12:0.15:78
chr11	71668362	rs3216157	CT	C	2917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1955;SC=GTTAACCCAGCTTAATTGAGT;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=48;WE=71668370;WS=71668352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	71701523	rs2276384	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=686;SC=TAGTTTGCCCGCACTTGCTCT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=71701531;WS=71701513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	71707149	rs150328027	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=497;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GAGCAGCTGGAAAGTGGGGCA;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=28;WE=71707157;WS=71707139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr11	71707465	rs1055452	T	C	248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=179;SC=CTCAAAGGGGTGCTTGGGCCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=71707473;WS=71707455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	71712175	rs1892919	G	A	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=16;PP=1917;SC=GAGCTGGCAGGGAGGGCACAG;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=81;WE=71712183;WS=71712165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	71714526	rs949324	G	C	10369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.88;SOR=1.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr11	71714526	.	GGT	CGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=127;NR=63;PP=2947;QD=20;SC=GACCAGGTGAGGTCAGCATCG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=133;TCR=69;TR=190;WE=71714536;WS=71714516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,190:0.94:202
chr11	71714528	rs949323	T	G	10369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=1.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	71715215	rs2845857	C	G	8684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	71715218	rs2852365	T	C	8776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	71719619	rs2155145	G	T	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=553;SC=CCCGTTTTTCGTTATTCTTCT;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=71719627;WS=71719609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	71727422	rs1057992	A	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=14;PP=622;SC=CACACCAACCAGCAGCACACA;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=71727430;WS=71727412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	71728543	rs34393610	G	GA	1951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.553;NF=50;NR=18;PP=1364;ReadPosRankSum=-1.623;SC=ATTGACTGGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.976;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=69;TCR=22;TR=68;WE=71728551;WS=71728533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr11	71728908	rs11278712	AGTCAAC	A	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=685;SC=CATCACCCAGAGTCAACGCTG;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=71728921;WS=71728898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	71729656	rs949325	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=665;SC=AAGGGAGGAGACGGCATAGGG;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=71729664;WS=71729646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	71730715	rs2298456	T	A	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=696;SC=TAAGAAGGTGTAAAGATTTGC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=71730723;WS=71730705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	71733519	rs10128658	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=34;PP=953;SC=CTTCTCAGTGCCCCCATTCTG;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=71733527;WS=71733509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	71734211	rs2298457	T	C	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=39;PP=1636;SC=GACAACAACGTAGAAAACAGG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=71734219;WS=71734201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	71740378	rs35948003	A	AAC	6808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=68;PP=2930;SC=CGTTAGAAGCAACATGGTTTG;SOR=0.845;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=88;WE=71740386;WS=71740368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	71740521	rs1939247	A	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=648;SC=AGCCACCTGAAATGCAACCAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=71740529;WS=71740511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	71797422	rs597513	T	A	8785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=134;PP=2965;SC=CAGCAAGCACTCAACAAATGT;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=138;TCR=134;TR=272;WE=71797430;WS=71797412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	71799277	rs117948560	A	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=670;ReadPosRankSum=2.364;SC=ATTGGAAACGATCTGATAAGA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=38;WE=71799285;WS=71799267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr11	71849741	rs652197	C	T	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=229;SC=TTATTTGAGCCCAGGATGTTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=71849749;WS=71849731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	71883540	rs633738	G	A	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=53;PP=1992;SC=TGGCTTTGGTGACTGCTGCGG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=97;WE=71883548;WS=71883530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	71932120	rs2508202	G	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=733;SC=GTCTCCCCCCGACCCACCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=71932128;WS=71932110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr11	71946333	rs2276046	T	C	4050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=65;PP=2498;ReadPosRankSum=-2.521;SC=TCCCATCTGCTCCTCAGGGGA;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=250;TCF=141;TCR=109;TR=155;WE=71946341;WS=71946323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,184:0.64:289
chr11	71948536	rs11548491	C	G	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=62;PP=1849;ReadPosRankSum=0.792;SC=CGTGGTGGGGCTGAGGCCCGT;SOR=0.518;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=114;WE=71948544;WS=71948526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,126:0.63:199
chr11	71954893	rs182932220	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=0.834;SC=TGGAGGAGCCGAGCGCGGGGC;SOR=2.448;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=13;WE=71954901;WS=71954883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr11	72004714	rs680660	T	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=41;PP=1008;ReadPosRankSum=0.215;SC=AGCTTGGAGGTCGGCCTCCAT;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=48;WE=72004722;WS=72004704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
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chr11	72281818	rs380126	A	G	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=101;NR=58;PP=2880;SC=GAATCCCAACACTCATCCTGC;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=101;TCR=58;TR=159;WE=72281826;WS=72281801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	72281884	rs433640	C	T	7320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.04;NF=118;NR=104;PP=2965;SC=AGCAGGGATTCGCTGTATGGG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=118;TCR=104;TR=222;WE=72281892;WS=72281874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr11	72282039	rs409512	T	C	5663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=97;PP=2965;SC=CCTTCATTCCTGCCCCAACCC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=82;TCR=97;TR=179;WE=72282047;WS=72282029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	72288599	rs1980091	G	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.848;NF=16;NR=28;PP=703;ReadPosRankSum=1.138;SC=CCACGCGCTCGTACAGCTCTG;SOR=0.285;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=44;WE=72288607;WS=72288589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr11	72288650	rs3842266	TG	T	1075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=903;SC=TGCGGGTGCATGGGGGGCAGA;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=29;WE=72288672;WS=72288640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	72288664	rs1980090	C	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=664;SC=GGGCAGAGGGCGAGAGGCCAG;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=27;WE=72288672;WS=72288640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	72289176	rs379276	C	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=473;SC=ATCAGTTGGACCTGGGCCAGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=72289184;WS=72289166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	72290138	rs3825011	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.01;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=365;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CAACCCAGAGCGGTCCAGGGA;SOR=1.281;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=24;WE=72290146;WS=72290128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr11	72290629	rs392565	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=334;ReadPosRankSum=-1.037;SC=TGAGGATGGCGATGGCCTGAG;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=21;WE=72290637;WS=72290619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr11	72290757	rs10898855	C	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.751;SC=GCCCCCAGGTCAGCAGAGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=72290765;WS=72290747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	72291883	rs644698	C	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=12;PP=530;SC=ATGAGACTCCCAGACACCCCA;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=72291891;WS=72291873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	72291927	rs577536	T	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=9;PP=712;SC=GGCAGGGTCTTACCGAGGCCA;SOR=1.387;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=31;WE=72291935;WS=72291917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	72292176	rs7108477	C	T	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=985;SC=TGGTTTGGAGCCCAGCAGACC;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=72292197;WS=72292166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	72292189	rs3781937	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=1.043;SC=AGCAGACCCGGGTTTAAATCA;SOR=0.217;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=20;WE=72292197;WS=72292166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr11	72292353	rs57803658	G	GA	2658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=20;PP=2561;SC=CTGTCCCAGGGAGGGGACCCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=56;WE=72292361;WS=72292343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	72292860	rs376724	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=481;ReadPosRankSum=-1.847;SC=CCGGGGGCAACGGATGTGACA;SOR=1.371;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=27;WE=72292868;WS=72292850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr11	72293039	rs379638	G	A	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=47;PP=1455;SC=GTATCAAGACGGGGCCCTTGC;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=72293047;WS=72293029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	72293079	rs414178	A	G	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=975;SC=CCACACTCAAAATCTGGAGTC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=72293087;WS=72293069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	72293602	rs4944557	A	G	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=38;PP=1171;SC=TATACTCATCATCGGAGACCT;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=72293610;WS=72293592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	72294440	rs426907	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=171;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CTGGGTCCCCGGGGAATCTGG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=12;WE=72294448;WS=72294430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr11	72294714	rs408269	C	T	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=181;SC=AGTAAAGACCCCACCCCCACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=72294722;WS=72294704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	72294734	rs56267207	A	AC	125.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=212;SC=TTTCATCCAGACCCCGCGCCG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=72294742;WS=72294724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	72295502	rs366711	T	C	6842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=89;NR=119;PP=2965;SC=TCCGGGACGCTGGAGGCGGTG;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=89;TCR=119;TR=208;WE=72295510;WS=72295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr11	72295573	rs35014697	C	G	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
chr11	72295906	rs452228	A	G	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=69;PP=2744;SC=CTCCCTCCACACCCTCTCACC;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=128;WE=72295914;WS=72295896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	72296700	rs424234	C	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=29;PP=850;SC=TATCCAACCTCCTGCCTCCAA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=72296708;WS=72296690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	72302191	rs429075	C	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=974;SC=GGCCCAGAGACGTTTAGTGAC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=72302199;WS=72302181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	72307742	rs1877652	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=497;ReadPosRankSum=1.374;SC=GCGAGGCTCAGAGATACCGAG;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=26;WE=72307750;WS=72307732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr11	72308511	rs142826924	TCCCTGC	T	863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=6;PP=690;SC=CCACAGTCCCTCCCTGCCCCT;SOR=1.402;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=13;WE=72308524;WS=72308501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	72309540	rs4943939	C	T	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=35;PP=2253;SC=GCTCATCCCGCTTAATTAAGC;SOR=1.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=112;WE=72309548;WS=72309530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	72316344	rs10898857	G	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=1007;ReadPosRankSum=0.938;SC=GTACACAGGGGTCTGTGGGGC;SOR=0.869;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=43;TCR=83;TR=58;WE=72316352;WS=72316334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr11	72326210	rs572421	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-1.330;SC=GGGTGTCCCCATCCACAGGAG;SOR=1.012;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=16;WE=72326218;WS=72326200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr11	72366929	rs907858	C	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=601;ReadPosRankSum=-0.077;SC=ACCCTCGGGCCCCCCAGAGTG;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=38;WE=72366937;WS=72366919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr11	72367102	rs907857	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCCGGCATCCGGAGAGGAAT;SOR=0.116;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=9;WE=72367110;WS=72367092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	72368986	rs3781916	T	G	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1163;ReadPosRankSum=0.677;SC=GGGCAGGGCATGTCCCTCCTG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=67;WE=72368994;WS=72368976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr11	72385095	rs12786089	A	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=962;ReadPosRankSum=0.037;SC=CTCCATGCCAACCCCAGCTCC;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=63;WE=72385103;WS=72385085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,64:0.52:123
chr11	72396653	rs36094095	T	A	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=1146;ReadPosRankSum=2.011;SC=ATAAGGGGTGTCTGAACAGAA;SOR=0.465;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=72;WE=72396661;WS=72396643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,85:0.62:138
chr11	72396800	rs12802369	A	G	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1267;ReadPosRankSum=0.999;SC=AAGCTGCTGCAGCTGCTGCAG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=56;TCR=84;TR=79;WE=72396808;WS=72396790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,95:0.57:166
chr11	72396990	rs12805218	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1387;ReadPosRankSum=1.961;SC=GAGGGCAATCGGGGAGGGCAA;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=82;WE=72396998;WS=72396980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,104:0.60:173
chr11	72399607	rs2306609	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=387;ReadPosRankSum=0.965;SC=GGAGAAGAGGGCACTTTAGTC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=24;WE=72399615;WS=72399597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	72415107	rs117520345	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=1.198;SC=CCCTGAGCTGGTAGATGAGAT;SOR=0.806;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=18;WE=72415115;WS=72415097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr11	72528973	rs891655	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=733;SC=ACGGGTACTCCTGTGTTTGCT;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=72528981;WS=72528963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	72532569	rs1864651	G	T	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=51;PP=2027;SC=CCTGTGCAAGGTCCCAAACCT;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=72532577;WS=72532559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	72532621	rs1864652	T	G	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=55;PP=1924;SC=GGCGGGCAGGTGAGCAGCCGA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=72532629;WS=72532611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	72532708	rs11235603	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=676;SC=CCTGTCCGCCCCCAGATGGCC;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=72532716;WS=72532698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	72533711	rs4944806	A	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=14;PP=718;SC=ATGTGGTCGGAGCCCACGAGA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=72533719;WS=72533701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	72536272	rs2303969	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=8;PP=1154;SC=CACAGGCACCGGTAAGAGGGC;SOR=3.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=46;WE=72536280;WS=72536262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	72537072	rs3765638	G	A	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=645;SC=GCCCAGGCCCGCAGAACAGAC;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=72537080;WS=72537062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	72538141	rs3862793	T	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=692;SC=GGGAGGACACTGGGTTCTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=72538149;WS=72538131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	72540225	rs891657	G	T	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=19;PP=814;SC=GAGCTAACTTGACAGATGAGG;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=72540233;WS=72540215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	72598704	rs7129851	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=41;PP=1191;SC=ATAATTCAAAGGGCTTTAGTG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=72598712;WS=72598694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	72788823	rs6592510	C	T	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=55;PP=1843;SC=ATTATAAGGACACACAGGAAA;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=98;WE=72788831;WS=72788813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	72945341	rs2511241	C	T	7756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=101;PP=2965;SC=GTGTGCGTGCCTGGGCTGTGT;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=144;TCR=101;TR=245;WE=72945349;WS=72945331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr11	72946020	rs1783596	C	T	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=1866;ReadPosRankSum=0.604;SC=ACTCCTTCCGCTCGCTGGACC;SOR=0.623;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=291;TCF=132;TCR=159;TR=131;WE=72946028;WS=72946010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,147:0.43:342
chr11	72946140	rs3741156	G	C	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1704;ReadPosRankSum=0.914;SC=CTGGGCAGAGGCTCGTACGCT;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=106;TCR=103;TR=96;WE=72946148;WS=72946130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,110:0.45:245
chr11	73100232	rs11826896	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=682;ReadPosRankSum=3.130;SC=TTATGGTGAGCTGGGGATGGG;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=41;WE=73100240;WS=73100222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr11	73100320	rs11826909	C	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=471;ReadPosRankSum=0.452;SC=GGGGAACCCCCTGCTGGGCAG;SOR=1.313;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=29;WE=73100328;WS=73100310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr11	73106088	rs28641751	C	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=412;ReadPosRankSum=0.793;SC=CTCTGTGCCCCGGGATCCCCG;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=31;WE=73106096;WS=73106078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr11	73141708	rs146458450	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.327;SC=CACTCCATTCGCCACTGCTGT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=73141716;WS=73141698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr11	73361781	rs7940286	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=788;ReadPosRankSum=0.690;SC=CTGTGGCACCGTGACTGTGGG;SOR=0.530;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=45;WE=73361789;WS=73361771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr11	73362766	rs670811	C	T	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=36;PP=1982;SC=CTATTCCTGTCCCTGCTTTAC;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=73362774;WS=73362756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	73364368	rs6592527	C	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=526;SC=TCCAGCTGCTCCTCACAACAG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=73364376;WS=73364358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	73364629	rs7942217	T	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=29;PP=915;SC=ATTTGCAGTGTCTGGCCCTTT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=73364637;WS=73364619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	73364673	rs7952228	G	A	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=425;SC=GGCTTAAACCGAGGACTGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=73364681;WS=73364663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	73366697	rs2008734	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GTTACCATGAGCTGAGGAGAA;SOR=0.132;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=18;WE=73366705;WS=73366687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr11	73390772	rs71469461	GAA	G	1870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.807;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=1348;ReadPosRankSum=2.108;SC=AGAGCTGTGGGAAAGAGAGAA;SOR=1.173;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=37;WE=73390781;WS=73390762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr11	73441743	rs72976849	T	A	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.050;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr11	73441772	rs2037709	A	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=22;PP=897;SC=ACTTGTAACAAAAAATAGACA;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=73441780;WS=73441762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	73441913	rs72976851	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.150;SC=ACACATTACATTGGGTTCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=10;WE=73441921;WS=73441903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	73471036	rs72976884	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=549;ReadPosRankSum=-0.164;SC=ATGGCCCAGACTAATTTCCCA;SOR=0.617;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=37;WE=73471044;WS=73471026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr11	73498933	rs1792174	T	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=137;ReadPosRankSum=-0.346;SC=AGGCCGTTCCTTCAGTGTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=9;WE=73498941;WS=73498923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	73528717	rs1670564	G	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=430;ReadPosRankSum=-1.401;SC=CTGGAGAATAGTAGTCCCTAG;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=26;WE=73528725;WS=73528707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr11	73669310	rs10793068	C	A	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CTCTGGTCCGCCCTCAGAAAC;SOR=0.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=77;WE=73669318;WS=73669300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,93:0.45:206
chr11	73669334	rs10793069	A	C	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CCAGCTGATAAGACTTGTATT;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=198;TCF=107;TCR=91;TR=89;WE=73669342;WS=73669324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,111:0.46:242
chr11	73669514	rs141051090	AAGTCTCT	A	1248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.446;NF=2;NR=21;PP=1314;ReadPosRankSum=0.058;SC=ATCATTCCTTAAGTCTCTAGA;SOR=0.481;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=23;WE=73669528;WS=73669504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr11	73670645	rs653263	T	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=717;ReadPosRankSum=-1.080;SC=ACGTCTTCCATGGCAAACCTG;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=61;WE=73670653;WS=73670635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr11	73670795	rs148856834	ATTATT	A	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=1.209;QD=23.13;ReadPosRankSum=3.429;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	73675810	rs34780089	C	CTG	43.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=2;NR=2;PP=126;SC=GATAGGGAGGCTGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=73675818;WS=73675800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	73675860	.	G	GCGCGCGCGCCCC	288	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=23;MQ=59.06;NF=2;NR=2;PP=288;QD=76.5;SC=GTGTGTGTGCGCGCGCGCGCA;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=4;WE=73675868;WS=73675850;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	73679219	rs2306817	G	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=580;ReadPosRankSum=0.811;SC=TAAGCTTCTCGGGCTTCTAAT;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=15;WE=73679240;WS=73679209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr11	73679232	rs2306818	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=580;ReadPosRankSum=0.815;SC=CTTCTAATCCATCTGGGCTAT;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=19;WE=73679240;WS=73679209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr11	73681090	rs2306819	C	T	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TCATCTTCTTCGACATCCAGT;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=66;WE=73681098;WS=73681080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,81:0.47:174
chr11	73681135	rs72982975	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=886;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AGAAGCAGATGCTGCGCCAGG;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=62;WE=73681143;WS=73681125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,68:0.40:170
chr11	73685896	.	A	AGAAAGAGGGAAGGTGGTAGGTAAAGGAGCGGAAGGAAGAGGTGGG	854.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.19;ReadPosRankSum=-1.370;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr11	73686859	rs10535527	ACTT	A	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=258;ReadPosRankSum=0.615;SC=GTAATCCAGGACTTCTTTTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=73686869;WS=73686849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	73689104	rs660339	G	A	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CTGGGCGCTGGCTGTAGCGCG;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=94;WE=73689112;WS=73689094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,111:0.56:198
chr11	73715542	rs2075577	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=557;ReadPosRankSum=0.504;SC=TGAGCAGGTGGTAGTCCAGCA;SOR=0.998;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=33;WE=73715550;WS=73715532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr11	73715666	rs2734828	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=704;ReadPosRankSum=2.039;SC=TGTGAAATGGGTGGGGAGGGA;SOR=1.064;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=43;WE=73715674;WS=73715656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr11	73796608	rs1095424	T	C	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=9;PP=1491;SC=AGGGCTATACTATTCACAATG;SOR=2.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=58;WE=73796616;WS=73796598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	73882090	.	T	TGG	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.630;NF=13;NR=7;PP=642;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CGGGGTTGGCTGGGGGGCGCC;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=20;WE=73882098;WS=73882080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr11	74047683	rs1044782	A	G	6515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=89;PP=2965;SC=GTGTCATGACATATTGGTGTA;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=112;TCR=89;TR=201;WE=74047691;WS=74047673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	74049569	rs3867270	A	G	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=56;PP=2733;SC=GTTCTGTTCCACTTGTCCGAA;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=145;WE=74049577;WS=74049559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	74053547	rs592644	C	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=24;PP=816;SC=CCAGTGGTAACGTCCCGTACA;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=74053555;WS=74053537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	74054346	rs641271	G	T	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=14;PP=1356;SC=AAATTTTGAAGATTTTAATAT;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=66;WE=74054354;WS=74054336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	74054498	rs117796442	G	C	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1210;ReadPosRankSum=0.305;SC=TTAAGTGACTGTCTCACAAAT;SOR=0.473;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=76;WE=74054506;WS=74054488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr11	74057647	rs519083	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=403;SC=GTGGTTATTTTGGGATAATGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=74057655;WS=74057637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	74057931	rs3741130	C	T	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=90;PP=2940;SC=TCAATGTTAACGTTCCTGTAT;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=48;TCR=90;TR=138;WE=74057939;WS=74057921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	74085420	rs35170680	T	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=9;PP=1473;SC=AGCCACCATGTCCAGTCAAAA;SOR=3.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=74085428;WS=74085410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	74109342	rs904155	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=656;SC=GCAGGGTGTTCGTAACAGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=74109350;WS=74109332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	74204198	rs10736797	G	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=488;SC=CCTCACCTCCGTTGGTCCAGC;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=74204206;WS=74204188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	74204269	rs10736798	T	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=23;PP=1095;SC=ACCGCCCTGCTCCGCGGCGCT;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=74204277;WS=74204259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	74204591	rs60455691	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=284;ReadPosRankSum=0.329;SC=CACGGGCCCCGCGGGCTCGCA;SOR=0.454;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=19;WE=74204599;WS=74204581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr11	74204727	rs4944895	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=12;PP=378;SC=AGGCGCACCAACCGAACGGCG;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=74204735;WS=74204717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	74207823	rs72985951	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.087;NF=29;NR=10;PP=668;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TCAAAACACAGGTGCACAACA;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=39;WE=74207831;WS=74207813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr11	74207856	rs643738	G	A	5342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=42;PP=2619;SC=AACATCCCCAGTGGGAAAAAA;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=85;TCR=42;TR=127;WE=74207876;WS=74207846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	74207868	rs111326594	A	AC	1720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.13;MQRankSum=1.571;NF=22;NR=22;PP=986;ReadPosRankSum=0.495;SC=GGGAAAAAAGACCCCCCCAGC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=44;WE=74207876;WS=74207846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,75:0.45:166
chr11	74208878	rs79509943	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GCCTATAGACGACATGGTAAA;SOR=0.512;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=12;WE=74208886;WS=74208868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr11	74303841	rs2298572	T	C	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=88;PP=2845;SC=GCCTTGACCCTCTGTCTGCTT;SOR=2.172;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=29;TCR=88;TR=117;WE=74303849;WS=74303831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	74340196	rs2298792	A	G	3486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=32;PP=2304;SC=AAAACCCATAAGAGCATGTGA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=96;WE=74340204;WS=74340186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	74345550	rs3824999	T	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=860;SC=GACATGTCAATTTAGAGAACC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=74345558;WS=74345540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	74347434	rs4944920	G	C	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=39;PP=1173;SC=TGTGAATCATGCCCAAGTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=74347442;WS=74347424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	74407676	rs3819242	C	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=304;SC=TGTGTCTGCACGTGCACAACA;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=74407684;WS=74407666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	74408384	rs10751240	C	T	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=38;PP=1320;SC=AGGCAAAAACCTACAGTCGGT;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=74408392;WS=74408374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	74408619	rs3741124	C	G	5883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=99;PP=2965;SC=AATCCTAGCTCTGGTCATTAG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=87;TCR=99;TR=186;WE=74408641;WS=74408609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr11	74408633	rs3741123	A	G	5840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=103;PP=2965;SC=TCATTAGAACATGTATACGTC;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=187;WE=74408641;WS=74408609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	74408740	rs3741122	C	T	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=599;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CTGTCACCTGCACCATCCTGC;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=36;WE=74408748;WS=74408730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr11	74413872	rs34528207	A	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=596;ReadPosRankSum=-2.007;SC=ATCTCCACCAAGTCCGAGGCC;SOR=0.533;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=41;WE=74413880;WS=74413862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,54:0.60:90
chr11	74415834	.	G	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.579;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=519;ReadPosRankSum=0.094;SC=AGAAGGTAGAGACCAGGGATA;SOR=0.780;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=26;WE=74415842;WS=74415824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr11	74419357	rs1944937	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=292;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CTTTGCAGGCCTGGCAGCAGG;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=17;WE=74419365;WS=74419347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr11	74419378	rs7948433	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=397;ReadPosRankSum=0.664;SC=AGTCTGGCAGCGGGAGGGGTG;SOR=0.296;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=27;WE=74419386;WS=74419368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr11	74429987	rs12417156	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GGCCACTCAGGCAAAAGAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=14;WE=74429995;WS=74429977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr11	74431277	rs4944943	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GACCCTTAGTTGAATGCTATT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=8;WE=74431285;WS=74431267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr11	74441796	rs11236234	T	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=-0.918;SC=GCGCTGTCCCTCACATTCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=8;WE=74441804;WS=74441786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr11	74555056	rs3814726	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=192;ReadPosRankSum=0.543;SC=GCACAGACTTCCCTGGCCTAA;SOR=0.943;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=11;WE=74555064;WS=74555046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr11	74559446	rs4944960	G	C	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=969;ReadPosRankSum=-1.635;SC=CTTGGTTGTCGTCATGCGCGG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=51;WE=74559454;WS=74559436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr11	74559481	rs4944961	C	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=-0.938;SC=GAGGCTGCTTCGGCACCTTTG;SOR=1.064;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=35;WE=74559489;WS=74559471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr11	74563077	rs2304683	G	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=686;ReadPosRankSum=-1.659;SC=AGACGAACTCGCAGAGAGATG;SOR=0.910;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=50;WE=74563085;WS=74563067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,52:0.41:127
chr11	74618265	rs61736355	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TGTCTCCAGCGCTGGGAACCT;SOR=0.625;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=24;WE=74618273;WS=74618255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr11	74645032	rs140602440	G	GTTCA	889.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.307;NF=0;NR=16;PP=782;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TTGTTTGCTTGTTCATTCATT;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=16;WE=74645040;WS=74645022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr11	74645053	.	T	TTCAC	351	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=60.21;NF=0;NR=16;PP=351;QD=22.4375;SC=CATTCATTCATTCATTCATTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=16;WE=74645061;WS=74645043;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,16:0.36:45
chr11	74645078	.	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=276;ReadPosRankSum=1.116;SC=TCCATTCATTCGCCAAATATT;SOR=2.683;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=14;WE=74645086;WS=74645068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr11	74651761	.	T	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=443;ReadPosRankSum=1.738;SC=GAAGAACAAGTAGATGTGAGA;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=34;WE=74651769;WS=74651751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
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chr11	74660631	rs1282690	G	A	3373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=71;PP=2093;ReadPosRankSum=-0.036;SC=ACCTGGACCCGGTCCTCTTTA;SOR=0.594;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=267;TCF=115;TCR=152;TR=128;WE=74660639;WS=74660621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,158:0.49:321
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chr11	74674616	rs562581	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=159;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTGTTTGTTTATTTATTTATT;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=6;WE=74674624;WS=74674602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	74676794	rs514534	G	C	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=58;PP=2149;SC=TTGATTCCTTGTTTTTCTCAC;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=74676802;WS=74676784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	74700896	rs681566	A	G	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=38;PP=2666;SC=AGAAAGCGGGAAGGACTTGAT;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=86;TCR=38;TR=124;WE=74700904;WS=74700886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	74705696	rs544115	T	C	7612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=121;PP=2965;SC=AGAAGCGTTCTACGAGGAGAG;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=100;TCR=121;TR=221;WE=74705704;WS=74705686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	74862356	rs2851069	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=222;ReadPosRankSum=1.278;SC=GAAGATTTGCTTCCTCTCCCC;SOR=0.859;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=14;WE=74862364;WS=74862346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	74862391	rs1944612	A	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1236;SC=TCCTGAGATTAAATTAGGGGC;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=74862399;WS=74862381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	74874979	rs80169385	C	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=621;ReadPosRankSum=-2.678;SC=GCACCGCCCACCTCTGCCTGC;SOR=1.065;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=40;WE=74874987;WS=74874969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr11	74880151	rs74885054	T	TC	941.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=779;ReadPosRankSum=2.598;SC=AACAGTACCTTCCCCCGGGGT;SOR=0.454;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=23;WE=74880159;WS=74880141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr11	74880856	rs7125268	C	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1277;ReadPosRankSum=1.204;SC=TAACTGACTGCCACTCTCATA;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=137;TCF=46;TCR=91;TR=78;WE=74880864;WS=74880846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,90:0.57:157
chr11	74883577	rs12422149	G	A	3687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=69;PP=1968;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CAGTTTCGGCGAAAGGTCTTA;SOR=0.624;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=299;TCF=146;TCR=153;TR=137;WE=74883585;WS=74883567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,179:0.46:386
chr11	74904362	rs1621378	T	C	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=68;PP=2887;SC=GGCATGGCCATCTTCCTGCCC;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=149;WE=74904370;WS=74904352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	74988021	rs34053901	G	GTCCCC	609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=532;ReadPosRankSum=-1.899;SC=TCTCACAGGCGTCCCCGGGTT;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=11;WE=74988029;WS=74988011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr11	74992181	rs145394042	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=602;ReadPosRankSum=1.451;SC=AGTCCACACCGCAAGCCTGTG;SOR=0.702;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=42;WE=74992189;WS=74992171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,51:0.36:143
chr11	74995350	rs647630	C	T	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=58;PP=2503;SC=GAGTAAGCGGCCTCTCCCAAC;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=129;WE=74995358;WS=74995340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	75062547	rs34867163	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=309;ReadPosRankSum=0.554;SC=CGAACGCAGAACCAGGACGCA;SOR=0.565;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=22;WE=75062555;WS=75062537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr11	75062783	rs35382855	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	75110589	rs3133187	A	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=933;ReadPosRankSum=0.077;SC=GCGCGGCGGCAAGATGGCAGT;SOR=0.704;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=48;TCR=68;TR=57;WE=75110597;WS=75110579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr11	75133765	rs11539810	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.555;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=748;ReadPosRankSum=0.287;SC=CATCCCGCCCGCCAAGGATGT;SOR=1.021;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=59;WE=75133773;WS=75133755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,64:0.36:178
chr11	75141630	rs11236430	T	C	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=59;PP=2115;SC=CGCACGGCGCTTCGCAGCCCG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=75141638;WS=75141620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	75141762	rs3018101	T	C	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=27;PP=997;SC=TTATTTCCTCTCTTGACCATT;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=75141770;WS=75141752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	75152243	rs571353	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=768;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TGGGACAGGGCGTGGGAGTTG;SOR=0.515;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=127;TCF=82;TCR=45;TR=54;WE=75152251;WS=75152233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,62:0.42:149
chr11	75152375	rs56155408	C	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=971;ReadPosRankSum=-1.774;SC=AGGGGAGAGGCAGGTCAGCAT;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=68;TCR=107;TR=67;WE=75152383;WS=75152365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,75:0.39:192
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chr11	75166220	rs73006143	C	A	190.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=-0.282;SC=ATAGGCCTCTCCACTAGAATC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=8;WE=75166228;WS=75166211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
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chr11	75279846	rs649257	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=388;ReadPosRankSum=-0.934;SC=GGTCCTATACCGTGGGTGTCA;SOR=0.397;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=29;WE=75279854;WS=75279836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr11	75282882	rs585821	G	A	2937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=47;PP=1816;ReadPosRankSum=-2.412;SC=AGGCCGACTTGTCACGCATGT;SOR=0.511;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=222;TCF=136;TCR=86;TR=112;WE=75282890;WS=75282872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,136:0.51:266
chr11	75298468	rs61895095	A	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.383;SC=AGAATCGTGAACCTTTGCATG;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=83;WE=75298476;WS=75298458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,97:0.50:193
chr11	75428958	rs554202	A	G	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=47;PP=2156;SC=GCCCTTGTTTATGCCGTGGGA;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=111;WE=75428979;WS=75428948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	75428971	rs34643721	G	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=976;ReadPosRankSum=-1.737;SC=CCGTGGGAGCGCAGGCTGCAG;SOR=0.913;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=65;WE=75428979;WS=75428948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr11	75430950	rs650861	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=5;PP=941;SC=TGCTAGTGCCAGGCCTATGGG;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=75430958;WS=75430940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	75501852	rs2510635	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=21;PP=645;SC=ACCCACCCACAGGGAAGCAAG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=75501860;WS=75501842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	75852448	rs636420	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=1.557;SC=GCAGGAGTTCCGATAAGTGAA;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=75852456;WS=75852438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr11	75902539	rs11236648	A	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=1161;SC=TGTGTGCGTGACCCTGAGCTG;SOR=2.393;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=45;WE=75902547;WS=75902529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	75902571	rs2508779	A	G	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=16;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.731;SC=GTGCAACACCAGTGACCCTTT;SOR=1.358;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=64;TCR=16;TR=79;WE=75902579;WS=75902561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr11	75905929	rs11236649	G	A	351.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CTGATCCAGGGCTAGGACCCT;SOR=0.416;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=75905937;WS=75905919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr11	75907438	rs3215303	AC	A	650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.722;NF=10;NR=7;PP=511;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CCACCCATGAACCCATCCCTC;SOR=1.038;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=17;WE=75907446;WS=75907428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr11	75917189	rs1717626	G	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=1.876;SC=TCGCAAGCCTGCGGGAGGCAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=75917197;WS=75917179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	75917334	rs1879633	T	C	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=46;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.707;SC=CCCCAGTCCCTGGCCTGTGCG;SOR=0.724;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=184;TCF=100;TCR=84;TR=104;WE=75917342;WS=75917324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,126:0.56:226
chr11	76207633	rs10899226	G	A	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=38;PP=1418;SC=TTTTTCATCAGTGTTTTACAG;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=76207641;WS=76207623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	76207709	rs72930511	G	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=23;PP=721;SC=TTTTCTTGTCGTGATTATAAT;SOR=1.259;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=37;WE=76207717;WS=76207699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	76237725	rs11363199	CA	C	3465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=84;PP=2974;SC=TAAATATTTTCAATTCTTATA;SOR=4.106;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=86;WE=76237733;WS=76237715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	76257215	rs3753051	T	C	4787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=83;PP=2964;SC=GTCCATCCACTGTTGGCTCTT;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=148;WE=76257223;WS=76257205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	76370792	rs4304809	A	G	6799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=107;PP=2965;SC=CACAGTCCTCAGGACGCACGT;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=99;TCR=107;TR=206;WE=76370800;WS=76370782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr11	76372052	rs3740779	A	G	7642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=110;PP=2965;SC=GGCGGGGCAGACCCTCGAAGG;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=128;TCR=110;TR=237;WE=76372060;WS=76372042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr11	76372418	rs3740778	T	C	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=108;PP=2965;SC=GACGAAGTGCTGTGTAGAAGC;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=197;WE=76372426;WS=76372408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr11	76372564	rs10751259	T	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=855;SC=TGGGGAGGGGTAGGGTGGGGA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=76372572;WS=76372554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	76406341	rs10751260	G	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=17;PP=1507;SC=TTCCTGAAAAGTAGGGTACGC;SOR=2.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=76406349;WS=76406331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	76427731	rs10751261	T	C	9732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=117;PP=2965;SC=GATGCCAACGTCCCCTCCCAG;SOR=1.159;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=184;TCR=117;TR=301;WE=76427739;WS=76427721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr11	76429160	rs10899266	T	A	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	76430529	.	C	G	372	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=22;MQ=52.25;NF=11;NR=7;PP=372;QD=22.5984006971;SC=GTCTGCACGACGAGCATGCCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=76430537;WS=76430519;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	76430572	.	C	T	250	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=56.42;NF=12;NR=7;PP=250;QD=14.9879585551;SC=CCCGGACCCCCACTCAAGGCA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=19;WE=76430580;WS=76430562;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr11	76506572	rs1149620	T	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=387;ReadPosRankSum=0.803;SC=CTTCCAACAGTGTCTAGACTG;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=24;WE=76506580;WS=76506562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr11	76507692	rs1149621	T	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=648;ReadPosRankSum=0.928;SC=ACACCCGGGATTCTGCTGCCA;SOR=0.500;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=42;WE=76507700;WS=76507682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,54:0.62:87
chr11	76579431	rs201919657	CTCTCTGTG	C	134.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.48;QD=33.74;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	76637651	rs4379869	G	A	5930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=75;PP=2965;SC=GTTCGGTGCAGTTCAGAGTGT;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=170;WE=76637659;WS=76637641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	76637680	rs4479014	G	A	6452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=91;PP=2965;SC=GTCTGGAAAAGCGGTACATTG;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=177;WE=76637688;WS=76637670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	76637730	rs4604914	C	G	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=85;PP=2965;SC=AACACTGTATCTGAAGAAATG;SOR=1.018;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=145;WE=76637738;WS=76637720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	76637785	rs4457775	G	A	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=61;PP=1990;SC=TTCTAAAAGCGGTTTTCAATT;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=77;WE=76637793;WS=76637775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	76668478	rs4945125	C	T	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=18;PP=551;SC=TAATTTTTAACTTTTTGTGTG;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=76668486;WS=76668468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	76669891	rs3740768	A	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=112;SC=AGAGTCAGCTATATCTTGCCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=76669899;WS=76669881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	76687399	rs1517909	A	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=587;SC=AGTACTTTTAAAATTTCATTG;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=28;WE=76687407;WS=76687389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	76687448	rs1517908	A	C	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=317;SC=CTCATAGTGGATTAATATAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=76687456;WS=76687438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	76701365	rs3824889	G	T	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=618;SC=TAAAACATTCGACTCACCATA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=76701373;WS=76701355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	76701606	rs3740767	G	A	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=46;PP=1345;SC=TAAAAGAGCCGATATTCCATC;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=76701614;WS=76701596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	76701657	rs3740766	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=483;SC=GATTGTTTACGATACATGGCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=76701665;WS=76701647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	76727866	rs112678860	GT	G	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.244;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.217;SOR=1.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr11	76751541	rs11292198	CT	C	12200.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=153;PP=2951;SC=GGGCATGTGTCTTGGAGCGCG;SOR=0.762;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=216;TCF=60;TCR=156;TR=213;WE=76751549;WS=76751531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr11	76751584	rs11292199	CT	C	16026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=169;PP=2951;SC=CGAGGGCATCCTGGCCCTTCG;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=60;TCR=169;TR=229;WE=76751592;WS=76751574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr11	76751603	rs11292200	CT	C	16420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=176;PP=2951;SC=CGGCGTGCAGCTTGCCTGGCG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=45;TCR=180;TR=219;WE=76751611;WS=76751593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr11	76795839	rs12362168	A	G	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=13;PP=891;ReadPosRankSum=1.087;SC=TCCGCTTCACAGGGCACATCA;SOR=0.621;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=125;TCF=96;TCR=29;TR=62;WE=76795847;WS=76795829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr11	76799004	rs7121748	T	C	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=78;PP=2327;SC=GGCCATTCGCTGGCCCCTCAC;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=59;TCR=78;TR=137;WE=76799012;WS=76798994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	76804629	rs3832735	AGTCTGTGTCTGTCAC	A	1465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=5.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.393;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=1.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,46:0.26:176
chr11	76814110	rs2233549	G	A	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1534;ReadPosRankSum=1.104;SC=TGGACAAGCCGGGCAAGGTCA;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=157;TCR=105;TR=95;WE=76814118;WS=76814100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,111:0.35:316
chr11	76827152	.	C	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=325;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CTGGCCACACCGTGCCGCTGG;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=23;WE=76827160;WS=76827142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr11	76827223	rs11606456	G	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=720;ReadPosRankSum=0.910;SC=TTCTGGTGGGGCTGCCTCTTA;SOR=0.612;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=45;WE=76827231;WS=76827213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr11	76853783	rs1052030	T	C	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=934;ReadPosRankSum=0.946;SC=GACCTGAGATTGGGGCAGGAG;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=63;WE=76853791;WS=76853773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr11	76859069	rs4074664	C	T	253.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CCCACCCCGCCCGACTTGCCT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=9;WE=76859077;WS=76859059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr11	76918322	rs2276291	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=556;ReadPosRankSum=-1.010;SC=CAGTGCTCACTGCCCCTCCCA;SOR=0.486;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=34;WE=76918330;WS=76918312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr11	76919445	rs143053600	C	CTGAGT	1861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GTTGCTTAAACTGAGTGTGCT;SOR=0.633;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=22;WE=76919453;WS=76919435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr11	76919468	rs1320703	A	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.669;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,57:0.52:109
chr11	76919478	rs948962	C	A	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.065;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr11	76919619	rs948961	G	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr11	76919629	rs948960	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.35;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr11	76919865	rs1320702	T	A	3547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.065;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=80;PP=2034;ReadPosRankSum=0.528;SC=ACCTCTGCACTCTAGTTGCCT;SOR=0.988;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=215;TCF=92;TCR=123;TR=134;WE=76919873;WS=76919855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,160:0.61:264
chr11	76920003	rs11237122	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CCCCAAGGGATGGCCCAACCC;SOR=0.502;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=15;WE=76920011;WS=76919993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	76923352	rs12418037	A	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CAGACCCTGGAAAGAGTGCTC;SOR=0.659;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=31;WE=76923360;WS=76923342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr11	76924130	rs2276289	A	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=457;SC=TGCCTGAACCACAGACACGGT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=76924138;WS=76924120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	76924874	rs883223	G	A	3918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=60;PP=2315;ReadPosRankSum=2.222;SC=GGCCCAGGCCGTGCCTCTCTA;SOR=0.607;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=251;TCF=148;TCR=103;TR=142;WE=76924882;WS=76924864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,177:0.61:291
chr11	76925040	rs883224	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=743;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GGCGCATCCTGCTGGGCCTAG;SOR=0.509;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=58;WE=76925050;WS=76925030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,70:0.40:174
chr11	76925075	rs948959	G	T	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=64;PP=1851;SC=TGCCTGCAGCGTAGCCAGCCT;SOR=2.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=76925083;WS=76925065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	76928025	rs12363944	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.637;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=266;ReadPosRankSum=-1.177;SC=TGGCTTATCCACCTTCAGGGT;SOR=1.246;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=21;WE=76928033;WS=76928015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr11	76928149	rs2282576	A	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=51;PP=2360;SC=CCAGGCTTCAAAGGTGTGACA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=76928157;WS=76928139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	76944015	rs4945161	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=743;ReadPosRankSum=1.048;SC=AGGGCTGGGGGGCCTGCACTG;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=44;WE=76944023;WS=76944005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr11	76954788	rs34784710	T	TA	3758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.865;NF=22;NR=30;PP=2143;ReadPosRankSum=0.694;SC=ATTATACTGATATTGTTTTTA;SOR=0.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=52;WE=76954796;WS=76954778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,91:0.58:157
chr11	76954812	rs11237145	T	C	4298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1267;ReadPosRankSum=0.492;SC=AGGGTTTCAATGGATACTAAA;SOR=0.554;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=95;WE=76954820;WS=76954802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,108:0.58:187
chr11	76954833	rs11237146	G	A	4542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CGGCCCACATGCTGAAAACCA;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=105;WE=76954841;WS=76954823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,125:0.58:217
chr11	76954898	rs7104577	A	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AAAAATCTCTAAGGAGAAACA;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=70;WE=76954906;WS=76954888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,84:0.47:179
chr11	76979465	rs1618188	A	C	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=738;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TTGAACTTATACCCTCCTCCC;SOR=1.167;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=40;WE=76979473;WS=76979455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr11	76979554	.	C	T	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.492;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1195;ReadPosRankSum=0.328;SC=ACAGCTTTCTCAAAGGACATC;SOR=0.626;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=78;WE=76979562;WS=76979544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,96:0.60:160
chr11	76979889	rs1621624	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TCCAGGGGCTTCCATGGTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=76979908;WS=76979881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	76979900	rs1613357	C	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=5;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=-2.000;SC=CCATGGTTCTCTTTTCTTCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=76979908;WS=76979881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	76980743	rs1620915	T	C	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
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chr11	77051683	rs2725832	G	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=585;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CTTGGCCCTTGGCCTTACCTC;SOR=0.786;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=37;WE=77051691;WS=77051673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr11	77051820	rs51500	C	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=976;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TGCAGGAATACAGATAAAGGG;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=72;TCR=85;TR=65;WE=77051828;WS=77051810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,70:0.39:181
chr11	77069746	rs2250647	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=2.253;SC=CTGCAAACCAATGATAAATAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=77069754;WS=77069739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	77069790	rs2250639	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=361;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CATACAGAAAGTACCTTTAGT;SOR=0.880;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=19;WE=77069798;WS=77069780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr11	77090211	rs562939	T	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=739;SC=CATCCCAGACTAATAGGCATG;SOR=2.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=77090219;WS=77090201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	77335982	rs2013296	C	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=836;SC=AAACAAAAAACCCACTTTAAA;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=77335990;WS=77335972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	77348951	rs148672055	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=1.287;SC=CGTGTGGAGTTTGACCGCGCA;SOR=0.512;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=6;WE=77348959;WS=77348941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	77531810	rs10751277	T	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=25;PP=868;SC=GGGGAAGTTGTGGTGCCGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=77531818;WS=77531800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	77587973	rs616354	T	C	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=31;PP=1673;SC=GCAGCAGCCATGGTTCTTCAT;SOR=1.305;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=85;WE=77587981;WS=77587963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	77605501	rs1793336	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=414;SC=TAGCATATTATACTATAAAAA;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=77605509;WS=77605491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	77614770	rs2276349	T	G	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=76;PP=2394;SC=CCCATGAACATGACTTCTCAA;SOR=1.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=106;WE=77614778;WS=77614760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	77629132	rs60400274	A	AT	3041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=1898;SC=GCACAGTTAGATCTGAATTGT;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=77629140;WS=77629122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	77671281	rs12796422	A	G	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=18;PP=1459;SC=CGCTGCCACTATTAACTAGCG;SOR=2.155;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=69;WE=77671289;WS=77671271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	77698524	rs7938133	C	T	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=35;PP=2496;SC=TTATTGGTAACAGATCTTTAA;SOR=1.798;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=91;TCR=35;TR=125;WE=77698532;WS=77698514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	77698651	rs6592756	T	C	6809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=121;PP=2965;SC=GTAGCTCACGTCTGTAATCCC;SOR=1.046;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=83;TCR=121;TR=204;WE=77698659;WS=77698641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr11	77702033	rs2276441	T	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=602;SC=TACCTAGCACTTGGAAGACAC;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=77702041;WS=77702023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	77734001	rs11237360	G	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr11	77734007	rs11237361	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr11	77734209	rs11237362	T	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1228;ReadPosRankSum=1.637;SC=CACTTACCGTTGGCCGCCTGG;SOR=0.603;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=97;WE=77734217;WS=77734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,115:0.62:185
chr11	77775466	rs545869	C	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=533;SC=GTGCAACCCACTGGGAGAGGA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=77775474;WS=77775456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	77790653	rs534418	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=8;PP=1227;SC=TCCGCCGGATTAGGTTATCAA;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=77790661;WS=77790643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	77790863	rs499799	C	G	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=112;PP=2965;SC=ACCACTACCCCGGCCTAAGCG;SOR=1.054;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=194;WE=77790871;WS=77790853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	77811990	rs1263505	T	C	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=13;PP=1165;SC=GCTTGGCACATATCTAAGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=77811998;WS=77811980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	77815108	.	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=470;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TCTGTTAAAAGAATAGAAAAA;SOR=0.532;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=31;WE=77815116;WS=77815098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr11	77823557	rs624350	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=438;SC=TGCTCCCCCTGTTCATCCTGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=77823565;WS=77823547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	77825275	rs10899440	A	G	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=60;PP=2965;SC=GTAAGGGAAAAATCGAAAATG;SOR=0.938;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=77825283;WS=77825265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
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chr11	77832076	rs518624	T	A	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=14;PP=868;SC=ACATCAGAATTAGTAAGGGAA;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=77832084;WS=77832066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr11	77920457	rs2256051	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=1.011;SC=AAGGGGACCCGCATGTACATG;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=18;WE=77920465;WS=77920447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr11	77920563	rs2510045	G	T	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=46;PP=1598;ReadPosRankSum=0.308;SC=CGCCCTCTCCGCCCGAGGAGC;SOR=0.814;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=274;TCF=161;TCR=113;TR=117;WE=77920571;WS=77920553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,129:0.41:311
chr11	77920863	rs2512527	C	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.162;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=961;ReadPosRankSum=-0.285;SC=ACACCCCCCCCACCAGCCTGT;SOR=0.381;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=64;WE=77920871;WS=77920853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr11	77920930	rs2511188	A	G	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.64;ReadPosRankSum=1.807;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr11	77921527	rs2512526	G	C	10888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=164;PP=2965;SC=CCGCCCTGCCGCTTCTCTGGG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=331;TCF=167;TCR=164;TR=331;WE=77921535;WS=77921517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr11	77924544	rs2450139	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TGTCCACCCCGGATATCCTGC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=77924552;WS=77924534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	77924607	rs901105	A	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=275;ReadPosRankSum=-0.410;SC=TAGAGGAAACATTGAAAGGTG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=19;WE=77924615;WS=77924597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr11	77924656	rs72075084	TTCTAAG	T	1170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=1006;ReadPosRankSum=1.122;SC=AGGGTGTGAATTCTAAGTCTA;SOR=0.948;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=21;WE=77924669;WS=77924646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr11	77924870	rs2450138	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=315;ReadPosRankSum=-2.295;SC=TGTGAACCTGCTGCCAACCTG;SOR=1.204;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=22;WE=77924878;WS=77924860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr11	77930345	rs2450122	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=0.853;SC=TGGAAGGCTCTGAGGACTGCC;SOR=0.999;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=31;WE=77930353;WS=77930335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr11	77930499	rs901104	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=573;ReadPosRankSum=1.116;SC=GTAGCTGTGAGTTACCAGTTA;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=37;WE=77930507;WS=77930489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr11	77931346	rs901103	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=272;ReadPosRankSum=0.866;SC=TACTGCCCCCCCAACTCTACT;SOR=1.276;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=17;WE=77931354;WS=77931336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr11	77936064	rs1385601	A	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-1.200;SC=GACGCCATCAATCTTTTGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=77936072;WS=77936056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	77936166	rs1385600	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=493;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GGAAAGAGCCAACTCCATCAC;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=36;WE=77936174;WS=77936156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr11	77937800	rs2248407	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=904;ReadPosRankSum=-0.735;SC=GGAGGTCCCCGAACTCCCTGC;SOR=0.437;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=63;WE=77937808;WS=77937790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,72:0.44:164
chr11	78128775	rs11237488	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=-0.020;SC=ATGCTGCCGGCCTGGAGCCCC;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=41;WE=78128783;WS=78128765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr11	78128797	rs881338	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=0.363;SC=CGCCGGGTCGCGCGGACGAGG;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=30;WE=78128805;WS=78128787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr11	78180179	rs11237514	A	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=9;PP=710;ReadPosRankSum=0.009;SC=AGCAAATGCCATATTTTGCTA;SOR=0.425;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=83;TCF=70;TCR=13;TR=47;WE=78180187;WS=78180169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr11	78180507	rs10899517	AA	TC	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr11	78189558	rs4944202	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	78204073	rs66546995	CACAGAT	C	3456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.276;NF=31;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=0.339;SC=ATTTTAATGTCACAGATACCT;SOR=0.703;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=55;WE=78204086;WS=78204063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,89:0.56:160
chr11	78204299	rs56279811	T	TA	1314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.040;NF=3;NR=37;PP=1491;ReadPosRankSum=0.800;SC=TTTAAGTATTTAAATATTCAG;SOR=1.245;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=5;TCR=75;TR=40;WE=78204307;WS=78204289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr11	78204380	rs4474465	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.044;NF=1;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.316;SC=TTTGCTGCTACATATTTCTCT;SOR=0.368;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=78204388;WS=78204370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	78277277	rs10751296	A	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.231;SC=ATTGTCGCAGATACTCCAGAG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=74;WE=78277285;WS=78277267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,82:0.59:140
chr11	78279790	rs10501429	T	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=-0.237;SC=ACTCCCAAAATTTAATTCTCT;SOR=0.329;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=28;WE=78279798;WS=78279780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr11	78372536	rs2277277	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=523;ReadPosRankSum=-1.082;SC=GTGTGTGGATGAGCTCGTAGG;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=37;WE=78372544;WS=78372526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr11	78437352	rs597327	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=341;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GCCCCTGGCTTATCTTTTGTA;SOR=0.628;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=23;WE=78437360;WS=78437342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr11	78440736	rs512004	G	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=262;ReadPosRankSum=0.621;SC=TCGACTCACCGAGTGGAGGGA;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=15;WE=78440744;WS=78440726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr11	78443235	rs1790557	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=208;ReadPosRankSum=-1.813;SC=TTTTGCATAACAGGCTGATGG;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=14;WE=78443243;WS=78443225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr11	78443586	rs17826919	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=585;ReadPosRankSum=0.049;SC=CGAACCGCAGGATGATGGAGA;SOR=0.518;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=33;WE=78443594;WS=78443576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr11	78482155	rs116862565	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=844;ReadPosRankSum=1.984;SC=TACATCTGCCGTTGCCATTGC;SOR=0.487;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=59;WE=78482163;WS=78482145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr11	78489793	rs1573527	C	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.19;ReadPosRankSum=2.086;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr11	78489798	rs1573528	C	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr11	78602525	rs10736817	C	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=627;SC=GGTCAGTGTGCAAGCCACATG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=78602533;WS=78602515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	79133220	rs11237828	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=459;ReadPosRankSum=0.183;SC=TTTGATCTGGTACTCCTTAAG;SOR=0.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=23;WE=79133228;WS=79133210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr11	79133292	rs36083983	TAC	T	58.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=2;PP=151;SC=ACATGGTTCTTACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=2;WE=79133301;WS=79133282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	82443417	rs3780	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=518;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CATCGTTCTTCAGATTTAGGA;SOR=0.111;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=35;WE=82443425;WS=82443407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr11	82443672	rs6592081	C	G	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CAAATGGCCCCGCCCGTCCTC;SOR=0.581;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=64;TCR=75;TR=86;WE=82443680;WS=82443662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,109:0.63:174
chr11	82444216	rs986097	C	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=609;ReadPosRankSum=-1.237;SC=GGCGCAGCCACCTCACCCCCC;SOR=1.014;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=36;WE=82444224;WS=82444206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr11	82560312	rs10792653	T	G	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=98;PP=2965;SC=TCAACAGATGTCTTTACAGAT;SOR=2.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=30;TCR=98;TR=128;WE=82560320;WS=82560302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	82560858	rs10736757	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=292;SC=TGTACATTATACTTTAACAAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=82560866;WS=82560848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	82561339	rs13306597	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=503;ReadPosRankSum=-1.001;SC=ATTAAGAAACGTTCATGTCCA;SOR=0.229;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=33;WE=82561347;WS=82561329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr11	82561661	rs10792655	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=434;SC=AAATAGAATTTCTAGGCAATT;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=82561669;WS=82561651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	82564294	rs2229437	T	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=371;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TAGCTTTCAGTTCCTCAGCCA;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=28;WE=82564302;WS=82564284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr11	82595975	rs6592087	T	A	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=68;PP=2780;SC=TTTGAAAGGTTTTACTAGCAC;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=141;WE=82595983;WS=82595965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	82641001	rs2127363	C	A	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=133;SC=TACTTTACTCCCACTTGATCA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=82641009;WS=82640994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	82641157	rs2170009	A	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=9;PP=379;SC=GTAAAATTTCAAAGTTCATTG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=82641165;WS=82641147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	82641364	rs10431162	G	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=1.803;SC=CATTTCCATTGTAATGAATTA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=82641372;WS=82641354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	82643760	rs7947780	G	T	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1676;ReadPosRankSum=-1.601;SC=ACCACAGCAGGTTATCTGTGA;SOR=0.622;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=275;TCF=141;TCR=134;TR=109;WE=82643768;WS=82643750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,128:0.40:323
chr11	82644904	rs7130899	G	A	9872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=181;NR=132;PP=2965;SC=TGTATCTGGTGTTTCACAACC;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=313;TCF=181;TCR=132;TR=313;WE=82644912;WS=82644894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr11	82704967	rs3793986	C	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	82704967	.	CA	AT	133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=133;QD=46.6169687156;SC=TGGCTGAGTGCATTGTTTCCA;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=82704976;WS=82704957;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr11	82704968	rs3793987	A	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	82752499	rs138934935	TAGAA	T	1605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=1515;ReadPosRankSum=0.988;SC=AAACATATATTAGAAAGGGCT;SOR=0.550;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=34;WE=82752510;WS=82752489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr11	82752734	rs34023989	TA	T	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr11	82872530	rs11233498	T	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=240;ReadPosRankSum=-1.407;SC=CGTTTTTTTTTAAAAAATGTG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=15;WE=82872538;WS=82872520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr11	82874970	rs10898088	G	A	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=818;ReadPosRankSum=0.760;SC=GAATTCTTCTGCAGAACTTAC;SOR=4.294;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=33;WE=82874978;WS=82874960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr11	82875359	rs7130527	G	A	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1198;ReadPosRankSum=2.174;SC=TAATAAGGCAGCAGTTACTGG;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=82;WE=82875367;WS=82875349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,99:0.59:169
chr11	82878393	rs17144692	G	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=679;ReadPosRankSum=-0.481;SC=ATTATCTATCGTCTATTTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=31;WE=82878401;WS=82878383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr11	82880341	rs12284052	G	A	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CACATGGTCAGCCAGGGGTTG;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=86;WE=82880349;WS=82880331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,95:0.58:165
chr11	82892837	rs138976866	TAC	T	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=255;ReadPosRankSum=0.126;SC=ATATTGAAGATACACAGTAAA;SOR=0.614;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=7;WE=82892846;WS=82892827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr11	82893611	rs112646694	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=107;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TGAAAGGAGGCGGTTCATAAT;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=11;WE=82893619;WS=82893601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr11	82895657	rs17144746	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TTACAAGACTAAATGTTATTT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=82895665;WS=82895647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	82895826	rs118001085	A	G	2968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=51;PP=1827;ReadPosRankSum=1.741;SC=ACCCTGTGACAGTCCCAAAGT;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=228;TCF=128;TCR=100;TR=122;WE=82895834;WS=82895816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,145:0.53:274
chr11	82905679	rs11233519	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1486;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GGGGCCTGGACTCAACTCCTC;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=88;WE=82905687;WS=82905669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,97:0.54:178
chr11	82921538	rs553484	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=376;ReadPosRankSum=1.772;SC=GTTATCTCTTCCTGACTTTTT;SOR=0.160;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=20;WE=82921546;WS=82921528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr11	82952108	rs625102	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.832;SC=TTGGAGGAACTAGAACTAATA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=82952116;WS=82952098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr11	82959338	.	TACACACACAC	T	1473	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=58.89;NF=0;NR=4;PP=1473;QD=369.0;SC=ATTAAAGGAATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=82959355;WS=82959328;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr11	82968164	rs628223	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=-0.244;SC=ACTTGCTTACGGACCCTTAGC;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=12;WE=82968172;WS=82968154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	82968418	rs657824	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr11	82973004	rs8789	C	T	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1117;ReadPosRankSum=0.176;SC=AAGTAAACACCGAAGCTGTGA;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=45;TCR=80;TR=64;WE=82973012;WS=82972994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,83:0.54:153
chr11	82973045	rs645954	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=676;ReadPosRankSum=0.005;SC=GGTCTTGTATCTGTAATTATT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=18;TCR=56;TR=38;WE=82973053;WS=82973035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr11	82984770	rs146002262	T	TA	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=196;ReadPosRankSum=0.035;SC=AGCAGGAAGTTAAAAAAAAAG;SOR=1.270;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=11;WE=82984778;WS=82984760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	82985161	rs34416960	GA	G	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.003;SC=AATTGATAAGGAAAAAAATCT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=82985169;WS=82985151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	82985959	rs573871	C	T	57.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAAGAGATTCAAGGAAGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=82985967;WS=82985949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	82996986	rs494791	A	C	5114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CTTGGGAGAGAAAGAGCCGCC;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=355;TCF=172;TCR=183;TR=193;WE=82996994;WS=82996976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,225:0.54:413
chr11	83191809	rs79947027	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TCTTGACTGAGTGTTTTCTTG;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=83191817;WS=83191799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	83197394	.	C	CA	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=61.53;NF=1;NR=4;PP=85;QD=18.2;SC=ACTTGTCATGCAAAAAAAAAA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=83197402;WS=83197384;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr11	83585289	rs144508115	G	GGGAAGGAAGGAAGGAGAGAGGGAA	848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.66;QD=84.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	83585577	rs202072095	AT	A	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.623;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	83810113	rs3750917	T	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=35;PP=1057;SC=AAAGCAGATATTAAATGATGT;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=83810121;WS=83810103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	83878075	rs1869472	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=649;ReadPosRankSum=-0.406;SC=TTCCAGTTCTGGCCCTAACTG;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=45;WE=83878083;WS=83878065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr11	83962251	rs7933566	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=7;PP=562;SC=CACAGTTTTAAAAGAAGGTAG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=83962259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	84028143	.	C	T	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=998;ReadPosRankSum=0.798;SC=TCCATCCCATCGGACCCCCGG;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=199;TCF=102;TCR=97;TR=79;WE=84028151;WS=84028133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,106:0.42:250
chr11	84822798	rs601375	T	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.375;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,71:0.66:107
chr11	85339542	rs575050	G	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.743;SC=TTGACTGAGTGGGGGCGGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=85339550;WS=85339537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	85347008	rs75480347	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TCTAGAAAGGCAATTATCAAT;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=85347016;WS=85346998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	85418591	rs3069561	AACAG	A	739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr11	85435001	rs34653849	T	TA	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=1.449;SC=TAATCCCAATTAAAAAAAATC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=7;WE=85435009;WS=85434991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	85435730	rs550404	C	T	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1422;ReadPosRankSum=0.300;SC=CAGTTATTAACGGAGCCTCGG;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=89;WE=85435738;WS=85435720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,107:0.45:240
chr11	85436352	rs641393	G	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=543;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CGAAATTTCCGTTTGAGAAGG;SOR=0.746;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=42;WE=85436360;WS=85436342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr11	85436394	rs556669	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=459;ReadPosRankSum=-1.117;SC=AAGATGAGCATCCTGGGGAAA;SOR=0.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=29;WE=85436402;WS=85436384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,30:0.30:99
chr11	85436500	rs580459	T	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=584;ReadPosRankSum=-0.361;SC=TCTGCAGCCATCTGAATCAAA;SOR=0.709;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=39;WE=85436508;WS=85436490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,51:0.38:133
chr11	85436699	rs598346	A	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1346;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CAGTGATAACAGGCGCCAACT;SOR=0.933;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=223;TCF=108;TCR=115;TR=90;WE=85436707;WS=85436689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,97:0.37:262
chr11	85436868	rs597480	G	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1026;ReadPosRankSum=0.576;SC=CTCAGTATCAGCAAAATCTGT;SOR=0.666;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=63;WE=85436876;WS=85436858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,78:0.39:202
chr11	85437896	rs491867	A	G	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=60;PP=1870;ReadPosRankSum=1.035;SC=TGGATGATACACCCTGTGACT;SOR=0.589;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=274;TCF=132;TCR=142;TR=122;WE=85437904;WS=85437886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,136:0.42:322
chr11	85447611	rs680498	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.413;NF=17;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TTTGTTGTGATGAGTGACCTT;SOR=0.959;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=28;WE=85447619;WS=85447601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr11	85456703	rs647912	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=325;ReadPosRankSum=0.050;SC=GTGCTGCATCTTCTTCTGGCT;SOR=0.976;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=19;WE=85456711;WS=85456693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr11	85671702	rs618679	A	C	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=14;PP=626;SC=CCATCTCCCAAAACAAGTAGC;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=85671710;WS=85671692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	85692181	rs76719109	A	C	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=58;PP=2587;SC=CCATTGTTGCAGCATTCCAAG;SOR=1.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=88;TCR=58;TR=146;WE=85692189;WS=85692171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	85692342	rs2508688	A	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=31;PP=750;SC=ATACTTATATAGAACAGAGTA;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=85692350;WS=85692332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	85714288	rs7951988	T	C	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=17;PP=1638;SC=TATGATTAAATCCATTTTATA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=74;WE=85714296;WS=85714278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	85718641	rs10792821	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.886;SC=AAGAAAAGCATTGTATTTAAT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=85718649;WS=85718631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	85718663	rs10751133	A	C	33.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	85725937	rs592297	C	T	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=21;PP=1291;SC=GTGCATCCATCTGATTCTGAA;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=85725945;WS=85725927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	85737129	rs545213	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	85737502	rs541674	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=355;SC=AACACATTCTATTAAGCTTAT;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=85737510;WS=85737492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	85966177	rs7950735	G	T	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=13;PP=744;SC=ATTTAAGATAGGATTGCGATT;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=85966185;WS=85966167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	85967670	rs74971473	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.518;SC=TTTGATTTGTACTTTTCTTAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=85967678;WS=85967660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	85968623	rs974144	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=360;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AAATCTTCTCCTGTCAGTAAG;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=27;WE=85968631;WS=85968613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr11	85977117	rs10898460	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=383;SC=TTTTGGTTTTGCATACAGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=85977125;WS=85977107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	85979636	rs72285136	CGT	C,CGTGTGTGTGT	723.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=1,1;NR=11,11;PP=919,871;SC=GTACTTCCATCGTGTGTGTGT;SOR=3.352;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12,12;WE=85979645;WS=85979626;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.40,0.60:25
chr11	86017658	rs291247	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=0.959;SC=ATTGTTTTTTAAAAAAGACAA;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=86017666;WS=86017648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	86037696	rs12295985	T	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=1.450;SC=AAGATTAGACTGGAGCATGAA;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=14;WE=86037704;WS=86037686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr11	86037733	rs11419370	G	GC	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GATTTGGATGGGATGGAAGTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=86037741;WS=86037723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	86111700	rs12272824	A	T	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=8;PP=916;SC=ACTCGTTTTCATTCATTCTTT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=86111708;WS=86111690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	86119396	rs4412777	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=302;SC=TTTTATTGGCGCAGGGTCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=86119404;WS=86119386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	86123467	rs3741006	G	A	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=32;PP=1904;SC=TCAGTCCTGCGCTTAATGCTC;SOR=1.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=86123475;WS=86123457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	86133784	rs1056194	C	T	5823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=90;PP=2965;SC=CTTCGTTTCCCGGGGAAAGTT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=84;TCR=90;TR=174;WE=86133792;WS=86133774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr11	86153911	rs7548	G	A	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1148;SC=TGAGTGGTGGGTAGAGTCTCC;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=86153919;WS=86153901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	86157998	rs4944580	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=301;SC=CTTTCTGAAATTCAGTTTGCT;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=86158006;WS=86157988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	86161147	rs4944581	A	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=11;PP=571;SC=CCCCCACCTCAATGACTCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=86161155;WS=86161137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	86161388	rs1042780	C	G	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=111;PP=2965;SC=AAAGCTTGTTCTTGGTGATTC;SOR=0.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=86;TCR=111;TR=197;WE=86161396;WS=86161378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	86175193	rs11234662	A	G	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=97;PP=2965;SC=AAGTTGGCCAACCTTTAGCAA;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=71;TCR=97;TR=168;WE=86175201;WS=86175183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	86175300	rs605251	G	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=44;PP=1200;SC=ATTTGTTAAAGCATCATCAAG;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=58;WE=86175308;WS=86175290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	86208897	rs609848	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=5;PP=200;SC=ATGCCAAGAAAGAAATGGCCC;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=86208905;WS=86208893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	86267678	rs4943943	G	A	7074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=98;PP=2965;SC=ACTTCTCCACGTCCGAAGTCA;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=211;WE=86267686;WS=86267668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr11	86270684	rs34249558	C	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=103;SC=AGGAAACAGACAGCTCAGCCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=86270692;WS=86270674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	86650282	rs4631906	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AACAAAAAATTCTAATTACAG;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=17;WE=86650290;WS=86650272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr11	86868347	rs556139	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=-0.197;SC=GATTGTAGATCATATATTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=86868369;WS=86868337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr11	86868361	rs59532014	GT	G	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=13;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=265;ReadPosRankSum=2.427;SC=TATTTTTGCTGTTTTTTTTTT;SOR=1.911;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=86868369;WS=86868337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr11	86947617	rs12224600	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=0.354;SC=TTTGCTTTTATGAGTCACTCA;SOR=1.565;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=11;WE=86947625;WS=86947607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	86988314	rs10898654	C	T	41.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	87006776	rs10792935	G	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=16;PP=807;SC=ATAGGTACTTGTATCTCAAAA;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=87006784;WS=87006766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	87007008	rs10792936	A	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	87013252	rs2276103	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=0.485;SC=TTGCCAAAGCGTATTTGTTTA;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=17;WE=87013260;WS=87013242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	87013438	rs2276102	G	A	6957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=118;PP=2965;SC=GGAAAAACCCGGAAGAATGAA;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=100;TCR=118;TR=218;WE=87013446;WS=87013428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	87032162	rs139466681	CATAAG	C	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.619;NF=5;NR=0;PP=168;SC=TCCCATCCCACATAAGATAAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=87032174;WS=87032152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	87032215	rs7112344	T	C	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=2;PP=1308;SC=TATATTAATATTTGTTTACTG;SOR=5.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=87032223;WS=87032205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	87846757	rs9144	C	T	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=859;SC=AGAGAATATACTGAAATCTGG;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=87846765;WS=87846747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	87847018	rs3740925	C	T	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1738;SC=TTCTCTCTCACTGAAAAAACA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=87847026;WS=87847008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	87847063	rs1027027	C	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=634;ReadPosRankSum=0.635;SC=CATGTGGTATCTCTATCCTGA;SOR=1.028;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=36;WE=87847071;WS=87847053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr11	87908346	rs302647	C	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=369;ReadPosRankSum=0.162;SC=TCCCCCCGCGCTCACCTGCGA;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=22;WE=87908354;WS=87908336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr11	87908448	rs302646	A	G	7185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=82;PP=2965;SC=GGTAGTGCGAAGAGAAGTTCT;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=125;TCR=82;TR=207;WE=87908456;WS=87908438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr11	87909673	rs35854553	T	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=0.967;SC=AGAAGGTAAATTTTTTTGAGG;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=7;WE=87909681;WS=87909663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	88033661	rs217116	A	G	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=867;ReadPosRankSum=0.831;SC=AAATAGTTCCAAACAAATTAA;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=49;WE=88033669;WS=88033651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr11	88045583	rs217086	A	G	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=50;PP=2666;SC=AAGGTGTGCTATGTTGACATA;SOR=1.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=131;WE=88045591;WS=88045573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	88045815	rs5793312	C	CT	540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=610;SC=AAATGTGCCCCTTTCAAAACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=88045823;WS=88045805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	88059683	rs217060	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=19;PP=485;SC=AATCATATCAGTTTCTTTAAG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=88059702;WS=88059673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	88061405	rs580743	A	C	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=58;PP=1416;SC=CATTATGTTGAGATTAAGCAT;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=77;WE=88061413;WS=88061395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	88068052	rs217076	G	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=418;SC=ATCAGAAGAGGTTTCAGATAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=88068060;WS=88068042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	88068329	rs217077	T	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=185;SC=AATTTCAATTTTAATTGTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=88068337;WS=88068319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	88070563	rs580808	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=471;SC=ATGCTCTGGCCACCCACAAGC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=88070571;WS=88070553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	88242024	rs2941563	T	G	6847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=129;NR=93;PP=2965;SC=GCTGCGCGCCTCCCGTGACTT;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=129;TCR=93;TR=222;WE=88242032;WS=88242014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	88245413	rs308882	G	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=2962;ReadPosRankSum=0.221;SC=TGTGCCTTTGGTTACAGTGCC;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=67;WE=88245438;WS=88245403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,73:0.45:162
chr11	88245424	rs144972069	CATGGCCA	C	2865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.458;NF=14;NR=28;PP=2940;ReadPosRankSum=1.063;SC=TTACAGTGCCCATGGCCATAA;SOR=0.695;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=42;WE=88245438;WS=88245403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,79:0.40:196
chr11	88258689	rs4753486	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=105;ReadPosRankSum=0.524;SC=AATGGGGGTTCCTGCTTCTCA;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=8;WE=88258697;WS=88258679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	88338165	rs3816649	G	A	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=43;PP=1379;SC=TAGCTTTGAGGTACAAATCTA;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=88338173;WS=88338155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	88645129	rs626218	T	A	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.53;QD=28.73;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	88911696	rs1042602	C	A	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=2005;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CTTGGGGGATCTGAAATCTGG;SOR=0.734;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=269;TCF=139;TCR=130;TR=128;WE=88911704;WS=88911686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,150:0.49:309
chr11	89133449	rs317139	C	T	6761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.917;NF=96;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=0.609;SC=AGGGATGACTCATGACCGAAA;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=97;TCR=110;TR=205;WE=89133457;WS=89133438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,248:0.99:250
chr11	89221958	rs597046	G	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=214;SC=TATTCATTAAGTTACACCTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=89221966;WS=89221954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	89223616	rs490934	C	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=18;PP=1512;SC=TCCAAGTTCACCTTACTTACC;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=89223624;WS=89223606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	89223931	rs2304500	G	A	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=563;SC=CTGAGACTAAGCATTTGGGTT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=89223939;WS=89223921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	89224101	rs3816123	G	T	4611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=71;PP=2442;SC=CTGTATTCACGGAAAATGACC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=141;WE=89224109;WS=89224091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	89224131	rs34495256	T	TCTC	6270.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=64;PP=2969;SC=TTCCTCCACATCTCTCCCATC;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=74;WE=89224139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	89224229	rs35177439	G	GT	3156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=37;PP=2918;SC=ATAAAGTTTTGTAAGTTGAGA;SOR=0.867;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=63;WE=89224237;WS=89224219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	89224326	rs10830279	G	A	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=58;PP=2359;SC=AGGACAGAGAGAACGCAAGGA;SOR=0.743;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=124;WE=89224334;WS=89224316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	89224453	rs2289125	A	C	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=42;PP=1235;SC=TGCCCGCCGGACCGAGAAGGA;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=89224461;WS=89224443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	89370552	rs72971036	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	89370598	rs12363392	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.002;NF=15;NR=3;PP=303;ReadPosRankSum=1.645;SC=CTCACTCTGTTACCAGGCTCC;SOR=0.864;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=18;WE=89370606;WS=89370588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr11	89370719	rs12363079	A	G	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.403;NF=20;NR=31;PP=686;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CAGGTCAGCAATCTGGACAGG;SOR=0.840;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=51;WE=89370727;WS=89370709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr11	89371726	.	G	A	320	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=43.55;NF=12;NR=8;PP=320;QD=17.7385606274;SC=GCAAGGTCTAGTGACTGCAGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=20;WE=89371734;WS=89371716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:50,20:0.29:70
chr11	89372210	rs7924505	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.132;NF=12;NR=7;PP=189;ReadPosRankSum=0.060;SC=AATTGGTTTGCAACTTAAAAA;SOR=0.110;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=19;WE=89372218;WS=89372200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr11	89372292	rs7942274	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.395;NF=26;NR=15;PP=678;ReadPosRankSum=0.233;SC=TCACCTAATGTCAGAGGTAAT;SOR=1.062;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=41;WE=89372300;WS=89372282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr11	89372341	rs7942295	T	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.093;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.097;NF=28;NR=20;PP=868;ReadPosRankSum=-2.107;SC=CATACAACAATAATGAAAAAT;SOR=0.878;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=48;WE=89372349;WS=89372331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr11	89372524	rs7945304	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.422;NF=9;NR=24;PP=415;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AGCACATTCTTGAAAGTTTAT;SOR=0.319;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=33;WE=89372532;WS=89372514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr11	89378138	.	C	A	114	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=45.37;NF=6;NR=2;PP=114;QD=18.5964015684;SC=ATTAAACATTCATATCTAACC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=8;WE=89378146;WS=89378128;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,8:0.30:27
chr11	89378269	rs11018694	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.302;NF=28;NR=20;PP=581;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CTGGATTCTGCTGAGCTAGCT;SOR=1.309;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=48;WE=89378277;WS=89378259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr11	89392653	rs10765230	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.080;NF=4;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=-1.551;SC=TGATATTACCAAATCTGGAAC;SOR=0.465;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=6;WE=89392661;WS=89392643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr11	89392799	rs10830330	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.266;NF=20;NR=13;PP=514;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CTATCCAGACGGTTGGAATCT;SOR=1.012;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=33;WE=89392807;WS=89392789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr11	89402557	rs80292557	G	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.744;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.945;NF=34;NR=25;PP=930;ReadPosRankSum=1.311;SC=TAATAATGTTGTTTTGTGTCC;SOR=0.429;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=59;WE=89402565;WS=89402547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr11	89402687	rs11018718	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.860;NF=8;NR=20;PP=468;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GAGACTATTTTAATTTTAACT;SOR=0.714;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=28;WE=89402695;WS=89402677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr11	89402728	rs11018719	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.29;MQRankSum=-1.009;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.965;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	89403414	rs10734120	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=201;SC=ACGCCTTTTCCCCTGTTAATC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=89403422;WS=89403404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	89405190	rs10047486	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-1.334;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr11	89407391	rs2075536	A	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.649;NF=7;NR=14;PP=263;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GTAGCCAGGAATTATTTGCCA;SOR=0.457;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=21;WE=89407399;WS=89407381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr11	89409158	rs4753234	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQRankSum=-2.730;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	89409166	rs4753235	G	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQRankSum=-1.169;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	89413781	rs10830339	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-4.400;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=1.031;SC=TTTCAGGAAACTACACTCTGA;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=7;WE=89413789;WS=89413771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr11	89413850	rs10830340	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.516;NF=7;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=1.163;SC=AAGAGGTATACAATTACATAT;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=15;WE=89413858;WS=89413840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr11	89413867	rs7128813	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.228;NF=10;NR=8;PP=243;ReadPosRankSum=0.507;SC=ATATAATTTAGGAAAACCCAA;SOR=0.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=18;WE=89413875;WS=89413857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr11	89413975	rs10830341	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TATGACATCACATCTTCACAG;SOR=0.458;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=15;WE=89413983;WS=89413965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr11	89424716	rs2035677	A	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.840;NF=5;NR=22;PP=701;ReadPosRankSum=0.896;SC=ACATATATGTACATATGTGTA;SOR=0.641;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=27;WE=89424767;WS=89424706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
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chr11	89424740	rs2130024	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQRankSum=3.982;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.802;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr11	89447256	rs1967075	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.502;NF=5;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-1.691;SC=GCATTAAACTATATTTAGTAG;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=89447264;WS=89447254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	89447313	rs1967074	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.933;NF=12;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=0.539;SC=TAAGGAAAGAATAAAACCACT;SOR=1.276;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=13;WE=89447321;WS=89447303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr11	89447375	rs17221124	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.213;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=685;ReadPosRankSum=-1.458;SC=TATAAATTTGCGGAGCATGAT;SOR=1.225;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=37;WE=89447383;WS=89447365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr11	89451057	rs3881253	A	G	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.562;NF=17;NR=40;PP=2140;ReadPosRankSum=-0.986;SC=ACAGGTCACAAACCTGACCAA;SOR=0.614;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=33;TCR=78;TR=57;WE=89451079;WS=89451047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr11	89451071	rs3881254	C	A	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.984;NF=9;NR=38;PP=2140;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGACCAAGGCCTTGGGAATTC;SOR=1.034;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=47;WE=89451079;WS=89451047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr11	89531540	rs12417980	C	T	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=51;PP=1925;SC=CCCGCCTTTCCATCTATCTTC;SOR=0.742;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=102;WE=89531548;WS=89531530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	89774448	rs77759231	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=-11.910;QD=0.84;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=1.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,46:0.14:324
chr11	89909096	.	ATG	A	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.619;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,7:0.13:53
chr11	91545212	rs4753345	C	G	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=39;PP=1198;SC=CACAGCAAGACTATTTAACTG;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=91545220;WS=91545202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	92086513	rs10830902	C	T	8107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=145;PP=2965;SC=TACAAATTATCTCCTGGTGAG;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=110;TCR=145;TR=254;WE=92086521;WS=92086503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	92086649	rs10830903	G	A	10724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=179;NR=158;PP=2965;SC=TAAAAGCACAGGTCACCATCA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=337;TCF=179;TCR=158;TR=337;WE=92086657;WS=92086639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr11	92088177	rs7479732	C	T	9079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=0.598;SC=AGATCTTGGACTGGGGGGTCA;SOR=0.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=131;TCR=146;TR=276;WE=92088185;WS=92088167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,330:1.00:331
chr11	92531356	rs7949157	A	G	7172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ATCACCACTCAGAAGGCCCTG;SOR=0.291;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=127;TCR=103;TR=229;WE=92531369;WS=92531346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,264:1.00:265
chr11	92532677	rs12362722	T	C	6687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=92;PP=2965;SC=GCGGAAAACCTTCTTTGTCTA;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=115;TCR=92;TR=207;WE=92532685;WS=92532667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	92534442	rs3847531	A	G	6394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CAAAGGGGGCATATTCGTCAT;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=124;TCR=93;TR=215;WE=92534450;WS=92534432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,236:0.99:238
chr11	92539384	rs4753415	A	G	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=142;SC=TAATATATTGAAATATGTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=92539392;WS=92539378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	92564767	rs6483189	T	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=17;PP=1337;SC=GCCCACTCATTTTCCTGTGTC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=92564775;WS=92564757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	92570790	rs111868413	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=356;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GGAAGGAAGCGCTACACCTCT;SOR=0.201;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=24;WE=92570798;WS=92570780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr11	92570812	rs11020075	TC	AA	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=1266;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TACTGTCACCTCTTTGTACCT;SOR=0.938;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=31;WE=92570821;WS=92570802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr11	92573911	rs10765565	G	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=414;ReadPosRankSum=0.463;SC=TCTGGAATACGTGTTGTGTGT;SOR=0.408;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=27;WE=92573919;WS=92573901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr11	92577031	rs4753068	C	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.846;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=9;PP=748;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTTCTATCTGCGGGTTTTTAA;SOR=1.597;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=46;WE=92577039;WS=92577021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr11	92577070	rs4753419	T	C	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=23;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TTTCTTCCTTTGTTGCCTTTT;SOR=1.330;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=162;TCF=104;TCR=58;TR=80;WE=92577078;WS=92577060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,90:0.48:187
chr11	92577659	rs75081660	G	T	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GAGATGCACAGCAGCGAGTTC;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=98;WE=92577667;WS=92577649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,110:0.49:223
chr11	92590448	rs4753069	A	G	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=29;PP=1205;SC=GCAGTGTGTCAGTTATGAAGC;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=92590456;WS=92590438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	92592536	rs35216054	GT	G	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.986;NF=1;NR=26;PP=868;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TCATGTTAGTGTTTTGGCTCT;SOR=0.436;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=27;WE=92592544;WS=92592526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr11	92599851	rs3847553	G	A	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=51;PP=2965;SC=CAGGGTGTAGGGAACATATTC;SOR=1.384;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=107;TCR=51;TR=158;WE=92599859;WS=92599841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	92615715	rs12224637	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=289;SC=ACTTGGGGACCACAGTGGCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=92615723;WS=92615713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	92615751	rs58520864	T	TC	236.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=229;ReadPosRankSum=0.474;SC=TAACTCCCCCTCCCCCCCCCC;SOR=0.387;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=92615759;WS=92615741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr11	92623877	rs12277422	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=552;ReadPosRankSum=0.132;SC=CTCCTCTCCCGGAGGACTTCC;SOR=0.877;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=40;WE=92623885;WS=92623867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr11	92715516	rs141048711	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=0.318;SC=GACAAACTCATGAAATGGTGG;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=92715524;WS=92715506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	92914765	rs61920515	T	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCCAACTTTATCATATTTTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=92914773;WS=92914755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	93118515	rs3020057	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=175;ReadPosRankSum=-1.360;SC=TGCATTGTACGTTATGATAAC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=16;WE=93118523;WS=93118505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr11	93122128	rs72972364	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ACAATATAATCGTTACAATTT;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=6;WE=93122136;WS=93122118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	93122446	rs3020056	T	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr11	93122447	rs3020055	C	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr11	93141580	rs2259633	C	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.255;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=184;ReadPosRankSum=1.585;SC=AAAAGTGGAACAAAATGAAGA;SOR=1.422;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=14;WE=93141588;WS=93141570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr11	93170925	.	G	A	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=22;QD=14.1928031368;SC=CCCCACCCCCGCCAAGAAAAA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=93170933;WS=93170915;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr11	93212161	rs2605594	A	G	6209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=127;NR=66;PP=2965;SC=TGGGGTCCGCAGCCGGCTGCG;SOR=1.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=127;TCR=66;TR=193;WE=93212169;WS=93212151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	93212254	rs2658797	C	T	8877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=152;PP=2965;SC=GCGTGGGCAGCACCACTGTAG;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=120;TCR=152;TR=272;WE=93212262;WS=93212244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr11	93400052	rs7123801	G	A	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=150;SC=TTACATTAGAGTGTTCTAAAT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=93400060;WS=93400042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	93402096	rs1944101	C	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=493;SC=AACAAAAAACCTGGTAAAGTA;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=93402104;WS=93402086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	93403067	rs1954994	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=548;SC=TTGTACAGGAGTATATCTGGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=93403075;WS=93403057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	93408831	rs10831088	G	A	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=54;PP=1913;SC=GACACAAAACGGGTGATTGAC;SOR=1.222;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=86;WE=93408839;WS=93408821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	93408958	rs35646565	C	CA	320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=405;SC=TAATAATAATCAAAACCTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=93408966;WS=93408948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	93412774	rs1944100	A	G	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=54;PP=1557;SC=ATAGCATTGCAGGACTGATTA;SOR=2.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=93412782;WS=93412764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	93425159	rs4753495	C	A	4203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=70;PP=2481;SC=CCTCAAGAAGCAGCAGCCAGG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=131;WE=93425167;WS=93425149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	93454831	rs59894789	GGTGT	G	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.507;NF=7;NR=3;PP=489;ReadPosRankSum=0.349;SC=GCATATGTCTGGTGTGTGTGT;SOR=1.085;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=10;WE=93454842;WS=93454821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr11	93462607	rs7131178	A	T	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=10;PP=1050;SC=TAGGTGAGTGAGTTTCTGCCT;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=93462615;WS=93462597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	93463332	rs7101779	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=26;PP=929;SC=TAACTGAGGGAGAAGGACTTA;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=93463340;WS=93463322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	93463666	rs7119918	C	A	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=19;PP=609;SC=GGCAACAATCCTGGATTATTA;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=93463674;WS=93463656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	93463726	rs34898352	T	TAG	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.193;NF=1;NR=6;PP=246;ReadPosRankSum=0.220;SC=AGGAGTGCTATGGCTTCCTAT;SOR=1.051;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=93463734;WS=93463716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr11	93464175	rs1944108	A	C	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=877;ReadPosRankSum=-1.288;SC=TTGCTAGCAAAGTAGCAGATA;SOR=0.659;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=67;WE=93464183;WS=93464165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr11	93466866	rs2155248	G	T	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=57;PP=1576;SC=AGGGGTTCGAGGCTACAGTGA;SOR=2.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=73;WE=93466874;WS=93466856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	93474570	rs11280945	T	TGCGTGA	8677.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=53;PP=2965;SC=ACTGGCCTGGTGTCCTAGAGC;SOR=1.061;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=87;WE=93474578;WS=93474560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	93474678	rs630648	G	C	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=72;PP=2513;SC=TATTTCCGTGGCCCAAGTAAT;SOR=1.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=115;WE=93474686;WS=93474668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	93474791	rs623510	G	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=549;SC=GCGCAGGGAGGACTGACTAAC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=93474799;WS=93474781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	93474827	rs631116	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=304;SC=GCTCGCGTATTCTGAGGAGGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=93474835;WS=93474817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	93480708	rs624856	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TTACTACTTATGTATATCTAT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=93480716;WS=93480698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	93480717	rs5793654	A	ATATCTTACT	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	93483346	rs681321	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TGTATCTTGTGATTATGTCTA;SOR=1.402;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=93483354;WS=93483336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	93487008	rs623993	G	A	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=932;SC=CTGTTGATCAGTTGGCAAGGA;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=93487016;WS=93486998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	93490682	rs604414	T	A	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=58;PP=1607;SC=GTGTGTGCACTTACTTAAGAT;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=93490690;WS=93490672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	93494878	rs72097212	AAG	A	1202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.922;NF=2;NR=22;PP=987;ReadPosRankSum=1.535;SC=TATTTAGAAAAAGAAATAATT;SOR=0.303;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=24;WE=93494887;WS=93494868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr11	93517874	rs7116967	C	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=1079;ReadPosRankSum=1.260;SC=GGACCGAGGGCGACGCGCAGG;SOR=1.130;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=30;WE=93517894;WS=93517864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr11	93517886	rs2848477	G	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ACGCGCAGGAGTGGCCGGGCG;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=28;WE=93517894;WS=93517864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr11	93521405	rs676586	C	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=622;SC=GGCTTTGTGCCTGTTGTTCCA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=93521413;WS=93521395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	93527219	rs657177	T	C	4574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.06;NF=50;NR=87;PP=2965;SC=TATGTTCTATTCTCTAATTTC;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=137;WE=93527227;WS=93527209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	93527282	rs5793656	GA	G	1652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=45;PP=1443;SC=ATATAGGTAGGAAAAAATAGA;SOR=3.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=45;WE=93527290;WS=93527272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	93534929	.	T	TGA	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	93534930	.	TTC	GAT	1413	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=18;NR=2;PP=1413;QD=73.8233937431;SC=TCATAAAATTTTCGAATCATT;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=20;WE=93534940;WS=93534920;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,20:0.83:24
chr11	93534930	.	TTC	T	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	93534990	rs655699	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=474;ReadPosRankSum=0.938;SC=TTAACTTCTTGTATTTAAAAG;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=38;WE=93534998;WS=93534980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr11	93540914	rs72978409	T	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=644;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AAAAAAATTTTTTTCCAGTAG;SOR=0.424;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=38;WE=93540922;WS=93540904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr11	93754508	rs2511403	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=469;ReadPosRankSum=0.019;SC=TGTGCAGGCTGCCTGCCTGCT;SOR=0.099;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=24;WE=93754516;WS=93754498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr11	93797619	rs1945783	A	G	5466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=70;PP=2965;SC=TTTCTGCACCAACCCTGATTC;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=167;WE=93797627;WS=93797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	93801012	rs10765650	C	T	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=54;PP=1513;SC=TTAGATAGAGCCTTGTATGTA;SOR=2.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=67;WE=93801020;WS=93801002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	93801062	rs10765651	C	T	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=604;SC=GAAAATATAACGCTCATCTCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=93801070;WS=93801052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	93803405	rs7119800	A	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.475;SC=TATCCTTTTTAAAAAAACTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=93803413;WS=93803395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	93803717	rs1878799	C	G	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=71;PP=2215;SC=AGGTAAGCACCCTTTGTTGGT;SOR=1.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=104;WE=93803725;WS=93803707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	93806416	rs1914725	T	C	4860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=96;PP=2965;SC=CTCTTCTGCTTTACTTCTTTC;SOR=1.369;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=53;TCR=96;TR=149;WE=93806424;WS=93806406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	93806705	rs2949862	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CCATTACCTGCCCTGAGAGCT;SOR=0.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=93806713;WS=93806695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	93834223	rs7927016	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=412;SC=CTCTAAAGTGGAGTAGAGTTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=93834231;WS=93834213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	93844034	rs7925817	G	T	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=12;PP=1181;SC=AGCAAAGAAGGCTACTAGCTG;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=93844042;WS=93844024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr11	93886838	rs7928030	G	C	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1236;SC=TTGCTTTATAGATAAGGAAAC;SOR=1.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=93886846;WS=93886828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	93913458	rs3020015	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=0.685;SC=TACGGGAGTCTACCGAGAGCC;SOR=0.480;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=20;WE=93913466;WS=93913448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr11	94113288	rs3740867	C	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=745;ReadPosRankSum=0.545;SC=GAGACAGACCCCTCCCACTCC;SOR=0.868;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=53;WE=94113296;WS=94113278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr11	94203868	rs610611	A	T	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=923;ReadPosRankSum=-1.096;SC=GTGATGTGCAAACGAAAGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=57;TCR=104;TR=65;WE=94203876;WS=94203858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,86:0.44:196
chr11	94209348	rs13447623	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=0.412;SC=TGATCTTGCATTGACAACCTT;SOR=0.098;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=11;WE=94209356;WS=94209338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	94223855	rs608452	A	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=113;SC=ATACAAAATCAGCTTTGAGCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=94223863;WS=94223845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	94231257	rs2509943	C	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=602;SC=TGCGGAGACTCCTTTCTGAAA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=94231265;WS=94231247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	94231847	rs1046654	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-1.135;SC=GCCTGACTTTGATGTCAAAAT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=94231855;WS=94231837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	94245740	rs2509324	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=16;NR=10;PP=461;SC=GGTGGCGCCCAAGGCGGGTCG;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=94245748;WS=94245730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	94250684	rs582049	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=367;SC=TATCATGTAGATATAATGGCT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=94250692;WS=94250674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	94250709	rs582077	T	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=556;SC=GATTGGGCAGTATTTATACTA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=94250717;WS=94250699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	94261211	rs116564208	C	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=568;ReadPosRankSum=-0.934;SC=AAAGAGAATACGCTAATAATT;SOR=1.042;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=34;WE=94261219;WS=94261201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr11	94261255	rs647484	C	G	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=43;PP=1920;SC=GACAGTGGCCCTGGAAGGGAT;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=108;WE=94261263;WS=94261245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	94261514	rs12282965	A	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=25;ReadPosRankSum=0.711;SC=GGTTGCTTTTAGTTTGGCCAT;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=94261522;WS=94261504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	94264882	rs12294732	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=639;ReadPosRankSum=1.104;SC=TGCTTCAGTCGTGAGGGTTTG;SOR=1.532;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=39;WE=94264890;WS=94264872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr11	94264927	rs595672	T	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=823;ReadPosRankSum=1.902;SC=GTTACTGGGATGACATGGGTG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=55;WE=94264935;WS=94264917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr11	94265043	rs60740931	CT	C	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.647;NF=1;NR=22;PP=293;ReadPosRankSum=0.630;SC=TATTTTTTCACTTTTTTTTTT;SOR=1.119;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=23;WE=94265051;WS=94265033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr11	94320237	rs7110167	T	C	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1344;ReadPosRankSum=0.724;SC=GGCCTGGGTTTGCCATTTCTG;SOR=0.872;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=90;TCR=33;TR=76;WE=94320245;WS=94320227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,82:0.60:137
chr11	94322352	rs11020845	AG	TA	6614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=0.906;NF=69;NR=69;PP=2944;ReadPosRankSum=0.637;SC=CACACCTTTCAGAAGCGGGAT;SOR=0.506;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=249;TCF=115;TCR=134;TR=138;WE=94322361;WS=94322342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,168:0.55:304
chr11	94326627	rs11020851	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=-0.020;SC=ATGTAAGGATGCTCACCTGGC;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=22;WE=94326635;WS=94326617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr11	94326765	rs57607909	G	C	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=807;ReadPosRankSum=0.082;SC=CAACAGTGAGGCTCAGCTCGC;SOR=0.731;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=57;WE=94326773;WS=94326755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,73:0.48:151
chr11	94337220	rs593690	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=301;ReadPosRankSum=2.106;SC=TGATGTTCAGCTGGTAAGTAC;SOR=0.826;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=23;WE=94337228;WS=94337210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr11	94354019	rs504010	T	C	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=25;PP=2245;SC=TCTTAATTATTATCAATACTT;SOR=2.033;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=102;WE=94354027;WS=94354009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	94474044	rs11300560	GT	G	2928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=18;PP=2353;SC=GCTGGTGCTTGTGCGGGTTCG;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=53;WE=94474052;WS=94474034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	94501849	rs2915239	G	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=991;SC=TGGGGGCCCGGGGCTGAGATC;SOR=4.461;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=94501857;WS=94501839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	94533373	rs2303960	C	T	5009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.001;SC=ACCAGCACCCCGGGATGCTCC;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=306;TCF=150;TCR=156;TR=178;WE=94533381;WS=94533363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,226:0.59:382
chr11	94592684	rs367781663	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=577;ReadPosRankSum=0.700;SC=TTTTCTACTCCTTCAGAAACA;SOR=1.822;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=31;WE=94592692;WS=94592674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr11	94696474	rs58293261	G	GA	244.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.747;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr11	94699391	rs58215154	TACACACACAC	T	445.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=5.441;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=845;SC=CATACACATATACACACACAC;SOR=2.056;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=10;WE=94699408;WS=94699381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,13:0.93:14
chr11	94699507	rs34805065	A	AT	1787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=1217;SC=GGCCAGTGAGATAAGGAGAGG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=94699515;WS=94699497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	94703049	rs7107185	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=85;SC=TTAGACACGGTAAAGGAGATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=94703057;WS=94703042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	94704037	rs3737505	C	G	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=6;PP=1709;SC=ATAACAGTAACTAAACATAAA;SOR=4.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=64;WE=94704045;WS=94704027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	94704092	rs4753645	T	A	8895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.09;SOR=1.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	94704092	.	TAG	AAA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=114;NR=44;PP=2947;QD=20;SC=TATTTTAGAATAGCATGGTAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=118;TCR=49;TR=158;WE=94704102;WS=94704082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,158:0.95:167
chr11	94704094	rs4753646	G	A	8895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=1.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	94704689	rs3831469	A	AAC	1117.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=1026;ReadPosRankSum=0.818;SC=ATGTTACTTAAACACACACAC;SOR=0.836;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=23;WE=94704697;WS=94704679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,36:0.92:39
chr11	94759059	rs10752685	A	G	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.33;QD=26.86;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	94782539	rs620838	G	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=242;SC=TCAGGCATTTGGAGGACACCG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=94782547;WS=94782529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	94800902	rs5793709	G	GC	16412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=153;PP=2973;SC=TCGCGCTACAGCGCTCTCCCT;SOR=0.990;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=275;TCF=120;TCR=155;TR=263;WE=94800910;WS=94800892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr11	94823448	rs3016947	A	T	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=832;SC=GCCGCTGGACATGCCCCCAGT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=94823456;WS=94823438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	94862577	rs3740861	G	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1224;ReadPosRankSum=0.586;SC=TACACCATGGGCGCTATTCCA;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=180;TCF=88;TCR=92;TR=81;WE=94862585;WS=94862567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,98:0.46:212
chr11	94908658	rs11021065	G	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1118;ReadPosRankSum=-0.746;SC=ACTGAAACACGTACTTTTTCT;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=75;WE=94908666;WS=94908648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,80:0.43:185
chr11	94915241	rs10831316	T	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=345;ReadPosRankSum=-1.540;SC=TCCAAGACTTTCTAGTCAAAA;SOR=1.431;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=21;WE=94915249;WS=94915231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr11	95509037	rs3789960	C	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=186;ReadPosRankSum=1.058;SC=TGCTATTACTCAAGTTTAGCC;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=12;WE=95509045;WS=95509027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	95512060	rs1150360	A	G	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=60;PP=2150;SC=TCTTCTTTCAATTGACTTATA;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=112;WE=95512068;WS=95512050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	95519195	rs3748252	A	T	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=0;PP=854;SC=GAATAGATCCAGTCTCAGTAG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=95519203;WS=95519185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	95519506	rs3748253	G	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=28;PP=787;SC=TATACCCAGTGTTGTAGACAT;SOR=3.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=95519514;WS=95519496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	95520695	rs1313288	T	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=12;PP=792;SC=TGAGCCACTGTGCCCAGCCAG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=95520703;WS=95520685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	95521648	rs1727165	A	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=16;PP=790;SC=GTCAAAAACTATTCAGTATAC;SOR=1.077;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=95521656;WS=95521638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	95521953	rs3748256	A	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=567;ReadPosRankSum=1.267;SC=TATATTACAGACAAATTAAGA;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=41;WE=95521961;WS=95521943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr11	95522468	rs61902252	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-1.081;SC=AGGCGCCGGCGAAGAGGGGCT;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=8;WE=95522476;WS=95522458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr11	95524067	rs12272061	G	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=33;PP=874;SC=CATTCACTGTGGCTGTGTCGA;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=95524075;WS=95524057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	95527525	rs77122249	T	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=561;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GTTCACAGAGTATGTGCGTCT;SOR=0.700;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=33;WE=95527533;WS=95527515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr11	95528663	.	C	CT	87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=15;MQ=60.88;NF=4;NR=1;PP=87;QD=19.2;SC=AGCTGTTATTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=95528671;WS=95528653;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr11	95528714	rs522536	C	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.72;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	95545955	rs79343957	C	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	95545955	.	CA	AC	123	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=123;QD=44.1169687156;SC=AGATAATTAACATTTTATTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=95545964;WS=95545945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr11	95545956	rs76989808	A	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	95551136	rs666398	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=32;PP=836;SC=AATTATTTTACATCACTGGAT;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=95551144;WS=95551126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	95555133	rs61903295	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=218;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AGTCAAAACCACCAGAAAAGG;SOR=0.313;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=14;WE=95555141;WS=95555123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr11	95555841	rs56284050	G	GTGCCTTTACCAGTGTGTGGATCA	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.667;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr11	95561294	.	A	G	102	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=102;QD=27.3542425094;SC=TTGAGCAAGTATGGTTGAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=95561302;WS=95561284;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	95562327	rs534488	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;ReadPosRankSum=-1.000;SC=ACTTAACCATGTTCTACTTCT;SOR=0.927;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=45;WE=95562335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr11	95562535	.	G	GA	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5010;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=84;QD=16.0;SC=TAATGATTAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=95562543;WS=95562525;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr11	95564259	rs644799	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=529;ReadPosRankSum=0.746;SC=TGATGAAGAAAGAAACAGCAG;SOR=1.135;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=37;WE=95564267;WS=95564246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr11	95569183	rs499637	G	A	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=6;PP=994;SC=TCTACTATACGATTGTTAACT;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=95569191;WS=95569173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	95569253	rs627568	A	C	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=815;ReadPosRankSum=-1.569;SC=GCTGCTTTTAAGGAGACAAAG;SOR=1.298;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=55;WE=95569261;WS=95569243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr11	95580926	rs566204	G	A	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.926;SC=ACAACCAGTGGGTTTCCTCAA;SOR=0.821;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=78;WE=95580934;WS=95580916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,104:0.53:198
chr11	95591872	rs11021336	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACTTGGAACTATCTTGTAAAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=95591880;WS=95591862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	95598629	rs687559	A	G	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=18;PP=2016;SC=TAAGATGCTGAGAAGACTGCA;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=82;WE=95598637;WS=95598619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	95657111	rs3824874	T	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=564;ReadPosRankSum=0.677;SC=GCTCGAGCTCTTCTCCATCGC;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=40;WE=95657119;WS=95657101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,46:0.39:118
chr11	95712897	rs7123133	G	T	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1493;ReadPosRankSum=0.336;SC=AATTGCTTTGGGTTTCTCTGT;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=285;TCF=150;TCR=135;TR=100;WE=95712905;WS=95712887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,114:0.35:330
chr11	95713024	rs7123272	G	A	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1264;ReadPosRankSum=0.276;SC=TTCTTGTCCCGTGAGAAGTAG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=111;TCR=129;TR=91;WE=95713032;WS=95713014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,105:0.36:289
chr11	95713175	rs74393839	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=1.753;SC=CATGTTATCTCCTCTGTAACT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=95713183;WS=95713165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr11	95724658	rs488398	C	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=553;ReadPosRankSum=-1.990;SC=CAGGTTTGTTCAGTAGAAATT;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=30;WE=95724666;WS=95724648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr11	95825374	rs10557243	TTGCTGCTGC	T	1648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.171;NF=14;NR=25;PP=2997;ReadPosRankSum=0.475;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=0.456;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=39;WE=95825390;WS=95825364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr11	95825797	rs7931870	A	G	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=57;PP=1461;ReadPosRankSum=1.133;SC=GTCCAGCAGAAGAGGGCAAGG;SOR=0.788;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=102;WE=95825805;WS=95825787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,120:0.60:200
chr11	96074983	rs200971316	C	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=846;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGTGACTGAGCCCCCTCCAAG;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=48;WE=96074991;WS=96074973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr11	96092376	rs10765801	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TATCTGACAACGAATATATAT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=7;WE=96092384;WS=96092366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr11	96116366	rs144377544	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	96116444	rs10831519	T	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=442;ReadPosRankSum=-0.058;SC=AAGAGAATTCTGTTTTACTAA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=28;WE=96116452;WS=96116434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr11	96116597	rs142006540	T	A	554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-0.109;SC=TTCCTCCTCATCAACTTCATC;SOR=0.604;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=25;WE=96116605;WS=96116587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr11	99426742	rs11220444	T	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGCTGTCTAGTGCATATTAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=99426750;WS=99426741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	99428929	rs11375374	C	CT	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr11	99690286	rs10790978	T	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=304;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GTATTCAAAATCTCTTCCTGG;SOR=0.425;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=22;WE=99690294;WS=99690276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr11	99690376	rs12292659	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.131;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,69:0.28:247
chr11	99690428	rs7125822	T	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.923;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,63:0.25:252
chr11	99827810	.	G	GT	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.43;NF=0;NR=6;PP=75;QD=14.5;SC=ATTAGTGTGTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=6;WE=99827818;WS=99827800;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr11	99872630	rs72994870	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ACTTATTTCAATACATCGAAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=99872638;WS=99872620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	99941322	rs2059014	C	T	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=42;PP=1404;SC=ACCTGTTCTGCTGTAATTTTA;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=99941330;WS=99941312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	100061827	rs3031278	G	GAA	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=437;ReadPosRankSum=0.361;SC=CAGTAAAACAGAAAAAAAAAC;SOR=0.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=24;WE=100061835;WS=100061817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr11	100168289	rs1944178	C	T	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=30;PP=2786;SC=TCTGACTTATCTCAGGATTTT;SOR=1.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=91;TCR=30;TR=121;WE=100168297;WS=100168279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	100168320	rs75986029	T	TC	5923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.281;NF=63;NR=67;PP=2979;ReadPosRankSum=0.377;SC=GGTTGGGAGTTTTTTTCTCCT;SOR=1.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=130;WE=100168328;WS=100168308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,210:0.99:212
chr11	100169829	rs1944180	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=4;PP=1033;SC=TTAATTAAGAATTTGGAGAAA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=100169837;WS=100169819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	100226883	rs1216183	T	A	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=75;PP=2328;ReadPosRankSum=-1.896;SC=GACCCTTCACTCTCTCTCCAC;SOR=0.626;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=296;TCF=156;TCR=140;TR=155;WE=100226891;WS=100226873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,181:0.53:343
chr11	100226962	rs1216182	C	T	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=65;PP=1648;ReadPosRankSum=0.643;SC=AAACTGCTGACTTAATTTGCT;SOR=0.745;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=199;TCF=66;TCR=133;TR=95;WE=100226970;WS=100226952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,117:0.53:222
chr11	100641200	rs7944598	A	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=215;ReadPosRankSum=0.249;SC=AAGTTCTATTACTAATATTTA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=15;WE=100641208;WS=100641190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	100730087	rs661237	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TCACATTGTTGTTAGGATCAA;SOR=0.144;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=11;WE=100730095;WS=100730077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	100730213	rs646392	G	A	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=56;PP=2032;SC=ACATTGGATAGAGTAGCCATT;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=100730221;WS=100730203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	100804088	rs626529	A	G	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=560;SC=CTAGTGGAAAATACAACCCAC;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=100804096;WS=100804078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	100807130	rs581921	T	C	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=67;PP=2243;SC=GTGACTTGGTTAGTAGTATTT;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=100807138;WS=100807120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	100811574	rs35159175	CAT	C	1671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=1098;SC=ATTAAGAACTCATATTCTAGT;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=22;WE=100811583;WS=100811564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	100811690	rs661973	G	T	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=111;SC=TTCAGACAGTGATAACCGCTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=100811698;WS=100811680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	100812338	rs151209547	A	AAC	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=58.96;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	100812340	.	GAC	CAG	186	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=186;QD=79.8226249541;SC=CTGATTCTAAGACACTCTACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=100812361;WS=100812330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr11	100812342	rs370937549	CACTCTACCCTAT	C	413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.37;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	100812344	.	CTCTACCCTAT	C	549	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=549;QD=292.0;SC=TTCTAAGACACTCTACCCTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=100812361;WS=100812330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr11	100814409	rs619066	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1107;SC=ACATTTTAATGTGGCAACTTG;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=100814417;WS=100814399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	100814609	rs618155	G	T	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=859;SC=GGTTTGAGCTGTTCTTTTCAC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=100814617;WS=100814599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	100819305	rs633967	T	C	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=17;NR=22;PP=657;SC=GGTTTTATTGTCCTAATAATT;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=100819313;WS=100819295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	100819392	rs504081	A	G	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=220;SC=AAAGGAAATCAGGGGAGTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=100819400;WS=100819382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	100819430	rs482050	A	G	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=77;SC=AGTCTCACTCATGGCCCATAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=100819438;WS=100819420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	100819447	rs481991	C	A	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=ATAACTCTACCTTTCTGACTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=100819455;WS=100819437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	100820555	rs11820715	C	G	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=1539;ReadPosRankSum=0.929;SC=TCAAGACACTCTTTTCATCTA;SOR=0.532;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=102;WE=100820563;WS=100820545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,119:0.46:259
chr11	100820725	rs694556	A	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=855;SC=TTTTATCATGAAGTTATTTTT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=100820733;WS=100820715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	100827326	rs151243237	AAATAT	A	8236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=77;PP=2965;SC=GGGTGCTGAGAAATATAATCT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=107;WE=100827338;WS=100827316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	100830440	rs7950832	T	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=13;PP=1448;SC=GAGGGTGAAGTTCCCTCCTCT;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=100830448;WS=100830430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	100830579	rs6590829	G	A	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=98;PP=2965;SC=TGAGTTCAGCGTAAACACCTA;SOR=0.986;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=70;TCR=98;TR=168;WE=100830587;WS=100830569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	100830693	rs563460	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=526;SC=GTTGCCTGATTGGTACAGCAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=100830701;WS=100830683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	100933598	rs11571221	G	GAATGA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=164;SC=AGCATCAATCGAATGAAATAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=100933606;WS=100933588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	100998105	rs11571153	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=10;PP=720;SC=TGGCGGCCGCCGCCGCCAACG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=100998113;WS=100998095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	100998623	rs1379130	G	A	6466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=91;PP=2965;SC=AGGCCTCCGCGCCTTCCTCCT;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=204;WE=100998631;WS=100998613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	100999838	rs11437764	A	AG	1560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=1235;SC=CCCCGTCTCCAGGAGGAGGGA;SOR=1.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=28;WE=100999846;WS=100999828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	101323770	rs12805398	C	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1133;ReadPosRankSum=1.590;SC=CTTCTGTATTCTGAGATTTTT;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=64;WE=101323778;WS=101323760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr11	101323856	rs59743346	TAAG	T	2004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GCAAGAGTGATAAGAAGTCAA;SOR=1.160;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=36;WE=101323866;WS=101323846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr11	101323983	rs12804391	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.110;SC=TAATTGAGCAGGTTTTTGTTT;SOR=0.242;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=12;WE=101323991;WS=101323973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	101340007	rs11224773	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=0.233;SC=CTACCTCTCAATAACAGAATT;SOR=1.501;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=14;WE=101340015;WS=101339997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr11	101344177	rs12362848	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=382;ReadPosRankSum=1.290;SC=TTACATAAACGCTGTTAAACT;SOR=0.620;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=31;WE=101344185;WS=101344167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr11	101347093	rs12366144	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=245;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TCAAAGTATCATTTGCGTCAA;SOR=0.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=16;WE=101347101;WS=101347083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr11	101359750	rs36111323	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=514;ReadPosRankSum=0.061;SC=GAACTTGACCGCCATTGTCTG;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=32;WE=101359758;WS=101359740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr11	101359932	rs7931830	C	T	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=157;SC=CAATGAAATACATTGTTAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=101359940;WS=101359922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	101374626	rs4542378	G	A	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=848;SC=TAAAGAGCTTGTTGAATAAAC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=101374634;WS=101374616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	101375549	rs10501986	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=666;SC=AACAGAAAGATTGTAAACAAA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=101375557;WS=101375539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	101390471	rs11224815	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=219;ReadPosRankSum=0.407;SC=CTGAACACCTCTTGCTACCAC;SOR=0.899;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=17;WE=101390479;WS=101390461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr11	101771248	rs3858418	G	A	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=70;PP=2782;SC=ATCACAGTCCGTCCACCTCCT;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=144;WE=101771256;WS=101771238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	101771381	rs3858419	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=1.707;SC=AAAAGAGACGGTACTGCCACT;SOR=0.257;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=12;WE=101771389;WS=101771371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	101775663	rs1661409	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=555;ReadPosRankSum=1.705;SC=ACACATTTAAGTAAATTTATA;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=35;WE=101775671;WS=101775653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr11	101778710	rs1661410	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-0.313;SC=ACTACAGAGCATAGAGTCTTC;SOR=0.275;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=15;WE=101778718;WS=101778700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr11	101818728	rs11225080	A	G	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=683;ReadPosRankSum=0.580;SC=AGATAAAGTGATTCTGTACTG;SOR=0.246;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=43;WE=101818736;WS=101818718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,56:0.56:100
chr11	101826949	rs930469	T	C	4043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=65;PP=2013;ReadPosRankSum=-0.109;SC=AGCATTCTACTGCAGCCACTC;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=327;TCF=185;TCR=142;TR=149;WE=101826957;WS=101826939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,199:0.49:409
chr11	101832478	rs7926728	G	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=625;SC=CCAGAAATTTGGTGATGAAGT;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=101832486;WS=101832468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	101833644	rs7109233	C	T	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=37;PP=2335;SC=TTCCAAAGACCATTAAAAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=101833652;WS=101833634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	101848990	rs3740931	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=323;ReadPosRankSum=-2.038;SC=TTTTCTTGATATTTGAAAGTA;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=23;WE=101848998;WS=101848980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr11	101857758	rs6590942	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=452;SC=AATGATCTCAGTGAAAGACTA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=101857766;WS=101857748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	101863706	rs1274901	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TTCTCCTCAACTGGCTTTTTA;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=18;WE=101863714;WS=101863696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr11	101868415	rs1783742	C	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CATGTACTTCCCTAGGACTAG;SOR=0.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=68;WE=101868423;WS=101868405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,84:0.47:180
chr11	101918327	rs12804542	A	G	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=67;PP=2156;SC=GAACCGAGGCACAGGGAGAGA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=100;WE=101918335;WS=101918317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	101918686	rs7934495	A	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr11	101982041	rs34558896	T	TGGA	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=128;ReadPosRankSum=2.286;SC=CGAGGCGAAGTGGAACTGGAG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=101982049;WS=101982031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr11	101984718	rs2033082	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.944;SC=AAAAGTATCCATTTGAAAACC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=101984726;WS=101984708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	102098354	rs3858420	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=0.245;SC=ACTTAACAGTGGGATATGTTA;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=8;WE=102098362;WS=102098344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr11	102207024	rs7124969	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=330;SC=TAATTTATGACTACTGAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=102207032;WS=102207014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	102207851	rs1055088	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=213;SC=CCAAAACATCGTCTAAACTTT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=102207859;WS=102207841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	102248377	rs34510872	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=454;ReadPosRankSum=0.209;SC=CCTTTACAAGCGAGAGAACTG;SOR=0.795;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=30;WE=102248385;WS=102248367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr11	102323160	rs2436036	C	T	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.17;NF=35;NR=15;PP=932;SC=CAGACACACGCGGAACTTTCT;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=102323168;WS=102323150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	102391425	rs14983	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=429;ReadPosRankSum=0.886;SC=ATGGAGTGGAGGAACAGTGCT;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=30;WE=102391433;WS=102391415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr11	102398433	rs3216144	C	CT	4818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.768;NF=37;NR=46;PP=2963;ReadPosRankSum=0.412;SC=CAATGTTTGACCCCTAGGAAA;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=82;TCR=104;TR=83;WE=102398444;WS=102398423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,127:0.44:286
chr11	102398436	rs78978042	C	T	4814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.279;SC=TGTTTGACCCCTAGGAAACAG;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=250;TCF=143;TCR=107;TR=108;WE=102398444;WS=102398423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,128:0.44:289
chr11	102398593	rs10502001	C	T	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.981;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=61;PP=1485;ReadPosRankSum=0.701;SC=TTCTATGACGCGGGAGTTTAA;SOR=1.052;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=231;TCF=101;TCR=130;TR=100;WE=102398601;WS=102398583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,107:0.42:257
chr11	102449650	rs7934921	T	A	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=10;PP=999;SC=TGAAAGGACCTAAGACCAAAT;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=102449658;WS=102449640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	102449951	rs1940054	A	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=173;SC=CTGGTCAGGCATATGGACACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=102449959;WS=102449941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	102465281	rs7116339	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=1.264;SC=AATGCTGGCAGGGCTAGATAT;SOR=0.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=102465289;WS=102465271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	102477377	rs1784424	G	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=622;ReadPosRankSum=-1.288;SC=ATGGGGCAGAGTGGGCTTCCC;SOR=0.703;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=39;WE=102477385;WS=102477367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr11	102477395	rs1784423	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=679;ReadPosRankSum=-1.988;SC=CCCCAGGAATACTTTCCGAGG;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=41;WE=102477403;WS=102477385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr11	102482738	rs1711416	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=433;ReadPosRankSum=0.206;SC=CTACAATTTAGATTTTTCTCT;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=25;WE=102482746;WS=102482728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr11	102495745	rs2509023	C	T	58.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr11	102563888	rs34605175	GA	G	1288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=1189;ReadPosRankSum=0.775;SC=CATAGTAGAGGAAAACTAATT;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=36;WE=102563896;WS=102563878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr11	102564576	rs17099394	G	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=851;ReadPosRankSum=-0.249;SC=GTGTCAAAGTGATGCTATTGT;SOR=0.484;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=95;TCF=74;TCR=21;TR=49;WE=102564584;WS=102564566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr11	102573396	rs2701994	C	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=620;SC=GGGAACTTTACAGTTAAAAAG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=102573404;WS=102573386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	102576358	rs2846707	T	C	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=23;PP=1482;SC=GCCAGTTGCATATTTTCTTCA;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=73;WE=102576366;WS=102576348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	102576375	rs1939015	G	A	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=32;PP=1671;SC=TTCATTTTCCGTCATCCGGAC;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=102576383;WS=102576365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	102584023	rs1939018	T	A	5964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=63;PP=2965;SC=ACGAAAATGCTTGCTGAACTT;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=119;TCR=63;TR=182;WE=102584031;WS=102584013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	102584104	rs35866072	T	G	2754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=1607;ReadPosRankSum=0.140;SC=GTTAAGCCATTTATTGCCTCT;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=104;TCR=119;TR=105;WE=102584112;WS=102584094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,129:0.47:272
chr11	102584207	rs33927742	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=695;ReadPosRankSum=-0.204;SC=AAAGAGAGATAATTTATTGAA;SOR=0.285;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=40;WE=102584215;WS=102584197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr11	102584466	rs3832755	G	GT	2308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.297;HP=9;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.325;NF=22;NR=39;PP=1334;ReadPosRankSum=-1.593;SC=CATTTATTAGGTTTTTTTTTC;SOR=0.074;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=61;WE=102584474;WS=102584456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,84:0.95:88
chr11	102584607	rs2509013	T	C	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=30;NR=64;PP=1873;SC=AACAAAATGTTATCCGATTTA;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=94;WE=102584615;WS=102584597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	102589052	rs34829643	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	102591994	rs1892886	A	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.198;SC=ATCATGAGGTAGCAAAAATTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=102592002;WS=102591985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	102592049	.	TTG	T,TTGTGTG	1270.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=19,19;NR=8,8;PP=727,856;SC=GTTACCTTTATTGTGTGTGTG;SOR=1.949;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=27,27;WE=102592060;WS=102592039;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.38:39
chr11	102593042	rs948218	T	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=1.172;SC=CTCACACTCTTCAAAGGCAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=102593050;WS=102593032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	102593273	rs12803000	T	G	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TTTCCTCATTTGGCTTCCCCG;SOR=0.465;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=190;TCF=105;TCR=85;TR=85;WE=102593281;WS=102593263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,109:0.48:228
chr11	102594376	rs6590983	A	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=915;ReadPosRankSum=0.428;SC=CCATTCTATTAATTACTAATC;SOR=0.643;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=55;WE=102594384;WS=102594366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr11	102594427	rs6590984	T	C	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=46;PP=2015;SC=CAAAAATTAATCCAGTCACAC;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=102594435;WS=102594417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	102594444	rs12802760	G	A	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=754;ReadPosRankSum=0.751;SC=ACACAAGAGTGTCATTAATCT;SOR=0.711;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=44;WE=102594452;WS=102594434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr11	102595413	rs11225394	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.925;NF=11;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TTTTAATTAACAAGAGAAAAC;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=102595421;WS=102595403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	102595492	rs3765620	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.07;MQRankSum=-1.021;NF=45;NR=23;PP=1051;ReadPosRankSum=-1.284;SC=TACCTGAACAGTTTTTGTATT;SOR=0.509;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=134;TCF=93;TCR=41;TR=68;WE=102595500;WS=102595482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr11	102595579	rs17099450	G	C	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.05;MQRankSum=1.057;NF=41;NR=48;PP=1380;ReadPosRankSum=-1.981;SC=CGTCTTCAGGGAGAACATGAT;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=89;WE=102595587;WS=102595569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,102:0.48:214
chr11	102595666	rs2155052	C	G	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=47;PP=1440;SC=AGCACCCTGACGTTCACAGCA;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=102595674;WS=102595656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	102623115	rs531335	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=292;SC=TTCTCAAGCTACACAGGTGTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=102623123;WS=102623105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr11	102642716	rs17860997	A	AT	3305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=23;PP=2614;SC=AGATTCCTGCATGACAATGAA;SOR=1.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=52;WE=102642724;WS=102642706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	102643505	rs17860992	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TGTAGGGTAGGGAAATATCCT;SOR=0.061;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=19;WE=102643513;WS=102643495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr11	102646913	rs17860975	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	102647310	rs470154	T	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=970;SC=TCATTGTAGATCTGCAATGCC;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=102647318;WS=102647300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	102647536	rs2276108	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=144;ReadPosRankSum=0.220;SC=TGTTCAGAATTCACCAGCTCT;SOR=0.098;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=11;WE=102647544;WS=102647526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr11	102647552	rs3819099	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=89;ReadPosRankSum=1.188;SC=GCTCTTTCTTCCATAAATACA;SOR=0.027;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=8;WE=102647560;WS=102647542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	102649235	rs7119084	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=0.168;SC=TTAAAACTCAGGTAATAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=102649243;WS=102649225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr11	102649543	rs470277	T	A	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=602;SC=CTGTTCCAATTAAACAACAGT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=102649551;WS=102649533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	102650389	rs17293607	C	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1198;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTCTGCATTCCTTGGATTTTT;SOR=1.260;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=71;WE=102650397;WS=102650379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr11	102661080	rs2239008	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.371;SC=AAAATAGACAGTTCTTCAGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=102661088;WS=102661070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	102661665	rs1938901	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TGTGAAATGGGGAGTGGATGG;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=8;WE=102661673;WS=102661655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr11	102663503	rs7125062	T	C	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=919;ReadPosRankSum=0.044;SC=AGTTTCCATCTAATTTCTGGT;SOR=0.459;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=61;WE=102663511;WS=102663493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr11	102666043	rs491152	A	G	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=61;PP=2680;SC=TAAAATACCTAGAGTTAGTTT;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=102666051;WS=102666033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	102666316	rs470558	T	C	3539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=82;PP=2210;SC=GTTCATGAGCTGCAACACGAT;SOR=1.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=126;WE=102666324;WS=102666306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	102668603	rs5794198	CA	C	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.25;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	102668702	rs470358	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=481;ReadPosRankSum=0.413;SC=TATTGTCACATGCAATGCAGC;SOR=0.775;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=36;WE=102668710;WS=102668692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr11	102668882	rs3213460	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.502;SC=GCCTCTTGCTGCTCCAATATC;SOR=0.180;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=7;WE=102668890;WS=102668872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	102707339	rs639752	C	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=42;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TGGAAACTCTCATCACCTATT;SOR=0.630;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=70;WE=102707347;WS=102707329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,78:0.56:139
chr11	102707914	rs575027	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=434;ReadPosRankSum=0.407;SC=AAATTTTGAGAAGGGAACTGG;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=21;WE=102707922;WS=102707904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr11	102709425	rs520540	A	G	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=883;ReadPosRankSum=0.546;SC=TTCCTCTGATAGCCCAGAATT;SOR=0.448;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=58;WE=102709433;WS=102709415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr11	102711338	rs591058	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=186;ReadPosRankSum=0.238;SC=TTTAAGAAATTGAGAACAATA;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=16;WE=102711346;WS=102711328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr11	102713114	rs371497584	TTTTTGTTTTG	T	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.960;NF=1;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=-1.245;SC=TTTCATGTGTTTTTTGTTTTG;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=102713131;WS=102713104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	102713465	rs602128	A	G	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1006;ReadPosRankSum=0.296;SC=AGTGACCAACATCAGGAACTC;SOR=0.681;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=68;WE=102713473;WS=102713455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr11	102713620	rs679620	T	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=687;ReadPosRankSum=-0.938;SC=ACATCTTTTTTGAGGTCGTAG;SOR=0.840;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=59;WE=102713628;WS=102713610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr11	102735103	rs476185	A	G	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=41;PP=1223;SC=CTCTGATGAAAAAAACCAAGG;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=102735111;WS=102735093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	102737944	rs28381681	CA	C	1296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=765;SC=TGTTTTCTGACAAAAAAAATT;SOR=3.258;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=33;WE=102737952;WS=102737934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr11	102738795	rs5003690	G	T	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=76;PP=2445;SC=AGGAACAAGTGGTGCCTAAGA;SOR=1.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=46;TCR=82;TR=121;WE=102738803;WS=102738783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	102824826	rs478927	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=2.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=1.913;SC=AACTTCATACTAGTGTGTTCA;SOR=2.147;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=12;WE=102824834;WS=102824816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr11	102825091	rs640198	T	G	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=750;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGTGTTGAATTCTTTAAAAAG;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=51;WE=102825099;WS=102825081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr11	102954119	rs11225545	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-1.659;SC=AAATCGTCATGCTAAAGGTAC;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=16;WE=102954127;WS=102954109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr11	102960146	rs200511043	G	GT	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.231;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	102988504	rs12146610	A	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=937;ReadPosRankSum=1.247;SC=CTAACAGGTCAGGTGTGGCAG;SOR=0.880;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=70;WE=102988512;WS=102988494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,82:0.44:187
chr11	102993426	rs118117890	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=0.105;SC=GTGAATCTTCCGTTTCACTGT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=102993434;WS=102993418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	103004929	rs2450918	C	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.548;SC=ATTGATATGTCTTGTATAGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=103004937;WS=103004919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	103013954	rs2514006	G	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.320;SC=TTAACATATTGGTTCTGTGTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=103013962;WS=103013944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	103019443	rs2514000	C	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-0.829;SC=AATATATAATCTCAACATTAT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=103019451;WS=103019433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr11	103025071	rs72175476	AGT	A	299.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=10.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=333;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AACATACACAAGTGTGTGTGT;SOR=4.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=103025080;WS=103025066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr11	103026040	rs5794210	CT	C	193.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=1.743;SC=ATGACTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=9;WE=103026060;WS=103026030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr11	103029373	rs688094	G	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=222;SC=AATTGTTAAAGTAGATGTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=103029381;WS=103029363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	103029516	rs688906	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.616;SC=AGATGTCAGAAATCATTAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=13;WE=103029524;WS=103029506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr11	103033914	rs657936	A	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=746;ReadPosRankSum=0.550;SC=ATAGGCATGGAACGTGGAAAG;SOR=0.910;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=54;WE=103033922;WS=103033904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr11	103047007	rs585692	C	A	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=30;PP=1727;SC=GGCTTAATACCATGTCAAAGT;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=83;WE=103047015;WS=103046997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	103050028	rs632672	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=241;ReadPosRankSum=0.097;SC=TTTCATATTAAGTAAAATAAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=103050036;WS=103050018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr11	103057048	rs658804	A	G	2422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1396;ReadPosRankSum=-1.099;SC=CTAGGGGTCGATTAGCAACAT;SOR=0.445;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=182;TCF=104;TCR=78;TR=92;WE=103057056;WS=103057038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,117:0.51:228
chr11	103058126	rs586592	C	T	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=64;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTACAGTTCACTGTAGTGCAC;SOR=0.692;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=107;TCR=108;TR=123;WE=103058134;WS=103058116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,140:0.53:262
chr11	103060309	rs617059	A	G	194.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=111;SC=AGAGCAGCACAGTTTCAAAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=103060317;WS=103060302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	103062371	rs146014868	T	TTGTGTG	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AGTGTGTATCTTGTGTGTGTG;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=103062379;WS=103062361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	103074349	rs631712	C	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=707;SC=GAAAAAGCATCATTTATTAAA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=103074357;WS=103074339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	103074639	rs613978	C	A	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=157;SC=AAAGTAACACCTAACTAGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=103074647;WS=103074629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	103082590	rs589623	G	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=24;NR=15;PP=703;SC=ACACCAAGCCGATACATGACC;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=103082598;WS=103082580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	103086381	rs679691	G	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=273;SC=CTTTTCTATAGGGCTTTATTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=103086389;WS=103086371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	103086399	rs78873690	G	GTA	691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=841;SC=TTTACTGTGTGTGTAAAATTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=103086407;WS=103086389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	103086725	rs635193	C	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.222;SC=GATATTATGTCCTTAAGCTTT;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=12;WE=103086733;WS=103086715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	103091237	rs636510	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=470;SC=TAAGAGAGAGAACATTAGTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=103091245;WS=103091227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	103091546	rs670464	G	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=801;SC=ATATTATTTCGGCAATGAATG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=103091554;WS=103091536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	103092945	rs654061	A	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=290;SC=GCTTTTTAAAATGTGGTGCTT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=103092953;WS=103092935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	103092968	rs669940	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=135;SC=TCATTGCCAACTGTTTAGATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=103092976;WS=103092958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	103101868	rs667819	G	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=1.085;SC=AAGTAAAGGTGTTATAATACT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=103101876;WS=103101858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	103104930	rs1784259	C	A	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.699;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=66;PP=2193;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TACCTTTAAACTGCAGGAAAT;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=93;WE=103104938;WS=103104919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr11	103114624	rs146123206	CT	C	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.962;NF=1;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=-2.029;SC=CTGGGTCCTACTGTATGGGAC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=103114632;WS=103114614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr11	103123999	rs648387	G	T	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.239;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=655;ReadPosRankSum=0.405;SC=CCAATTGTGTGTTTTTTTTAA;SOR=1.857;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=37;WE=103124007;WS=103123989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr11	103174035	rs12362743	T	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=513;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GTTCCCACACTTGATGATATT;SOR=0.421;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=44;WE=103174043;WS=103174025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr11	103178525	.	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=-1.517;SC=CTTTACTCCTATTTTACTACA;SOR=1.165;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=26;WE=103178533;WS=103178515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr11	103187169	rs72975657	T	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.076;SC=AGGAGTTATATATTTTTAAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=103187177;WS=103187159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	103229027	rs2566913	T	C	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=64;PP=2848;SC=CCAAATTTGATAGAGAAATCT;SOR=0.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=80;TCR=64;TR=144;WE=103229035;WS=103229017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	103229110	rs2671333	G	A	6221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=96;PP=2965;SC=ATATTCTTCTGATTCTTTTGC;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=171;WE=103229118;WS=103229100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	103229173	rs2514408	A	C	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=65;PP=1805;SC=GAGTCATACAAGTAATCACAT;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=103229181;WS=103229163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	103229188	rs2512128	G	C	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=55;PP=1810;SC=TCACATTGCAGAGGTTCCTAA;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=103229196;WS=103229178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	103229238	rs2512129	G	A	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=902;SC=CTTCATACCAGTGCACATCAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=103229246;WS=103229228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	103325908	rs11225812	C	T	2482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1704;ReadPosRankSum=1.709;SC=ATTTCCCCCCCTCTAGAACTG;SOR=0.474;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=97;WE=103325916;WS=103325898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,109:0.57:191
chr11	103327166	rs7121138	G	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=540;ReadPosRankSum=-0.155;SC=ATCTCAAAGTGACCTATCTTT;SOR=0.897;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=31;WE=103327174;WS=103327156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr11	103345030	rs11225822	A	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=145;SC=ATACATTAGAACTCCGATTTC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=103345038;WS=103345020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	103780455	rs10791649	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=539;ReadPosRankSum=0.019;SC=AGATACAATCACATCGTTCAT;SOR=1.389;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=33;WE=103780463;WS=103780445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr11	103780610	rs4754997	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=-1.594;SC=CAGATGCCACCTACTTATTAC;SOR=1.230;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=27;WE=103780618;WS=103780600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr11	103780695	rs4754998	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	103907956	rs7102675	G	A	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=53;PP=1986;ReadPosRankSum=2.132;SC=GAAGGTGGCCGGCCTGCAAGG;SOR=0.671;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=225;TCF=125;TCR=100;TR=118;WE=103907964;WS=103907946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,143:0.53:270
chr11	103908735	rs1052313	G	A	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1644;ReadPosRankSum=-1.729;SC=GACGAAAAGAGCATTAAAGCA;SOR=0.895;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=185;TCF=78;TCR=107;TR=94;WE=103908743;WS=103908725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,123:0.49:251
chr11	104757836	rs5794352	T	TA	443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=558;SC=CAAGATGAATTAGAGCTTTGG;SOR=3.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=104757844;WS=104757826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	104758035	rs484438	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=720;SC=AACATTATCTGCAAATAAAAG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=104758043;WS=104758025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	104761013	rs635846	T	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=648;SC=GAAATGCTCTTTTCGGTGATA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=104761021;WS=104761003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	104761100	rs513131	T	C	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=48;PP=2088;SC=AAATCACTTATGTGGTGTGGA;SOR=1.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=104761108;WS=104761090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	104761206	rs647039	C	T	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=85;PP=2518;SC=GTATCTGCACCGGCTTTTCCA;SOR=1.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=131;WE=104761214;WS=104761196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	104761271	rs693506	A	C	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=33;PP=975;SC=CATTATGTCTAATTAAAGAAG;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=104761279;WS=104761261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	104762228	rs544216	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=682;SC=AGCCAGCACTGAGGAATCAGA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=104762236;WS=104762218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	104763117	rs497116	G	A	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=67;PP=2965;SC=AGTAGATCTCGCATCCCCAAA;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=157;WE=104763125;WS=104763107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	104763716	rs617983	A	G	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=85;PP=2708;SC=ATTTCCAGAAAAGCTGAAAGA;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=44;TCR=85;TR=129;WE=104763724;WS=104763706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	104768000	rs693001	G	A	5720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=91;PP=2965;SC=TTTGCCTGCAGTTTGAGCTGT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=173;WE=104768008;WS=104767990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	104768098	rs555367	T	C	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=62;PP=2000;SC=CTGTATTTAATACATTATTTT;SOR=1.349;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=95;WE=104768106;WS=104768088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	104768909	rs650940	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=0.200;SC=AGAACAGAAATCCAGGTGTTT;SOR=1.508;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=15;WE=104768917;WS=104768899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr11	104819327	rs9507	T	C	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=37;PP=1709;SC=CATCTTCCTCTAGGTTCTCAG;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=104819335;WS=104819317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	104819542	rs5794358	G	GAAAC,GAAACAGAC	682.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.26;NF=0;NR=12;PP=861;SC=CACACACAGAGAGAGACACAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=104819554;WS=104819532;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:16
chr11	104819544	.	GAG	CAC	629	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=0;NR=12;PP=629;QD=56.8723229052;SC=CACACAGAGAGAGACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=104819554;WS=104819532;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr11	104819544	rs33955446	G	GACAC	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=42.67;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	104819546	rs5004914	G	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;QD=53.21;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	104820163	rs649739	A	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1130;SC=AATGTACTTTATTTACACTGG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=104820171;WS=104820153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	104839222	rs658560	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=880;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CTACTCCCAAACTCCTAGTCA;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=50;WE=104839230;WS=104839212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr11	104866384	rs3181334	A	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=1.508;SC=CCATATAAGCAGTCAGCTGTC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=104866392;WS=104866374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	104870945	rs3181328	C	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=686;ReadPosRankSum=1.824;SC=CAATCCTCTGCATACACCTTC;SOR=0.612;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=40;WE=104870953;WS=104870935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr11	104871322	rs45613137	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TGTAACATCCGGGTCGTGGTG;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=104871330;WS=104871312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	104872981	rs544211	C	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=47;PP=1349;SC=CTTTTCAACCCCCATATGCCT;SOR=1.497;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=70;WE=104872989;WS=104872971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	104874179	rs3831481	T	TGA	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=541;ReadPosRankSum=0.636;SC=CTAAGAACTTTGAGAGAGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=13;WE=104874187;WS=104874169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	104877717	rs2282658	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=0.173;SC=AGAAATGAAACTGTAGGTAGA;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=9;WE=104877725;WS=104877707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr11	104877803	rs2282657	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GTTAGATGCAACCTTACGTTT;SOR=1.102;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=163;TCF=107;TCR=56;TR=67;WE=104877811;WS=104877793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,71:0.39:183
chr11	104877927	rs507879	T	C	6275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=116;PP=2965;SC=TCAATTTTGGTATCATAATAT;SOR=1.241;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=68;TCR=116;TR=184;WE=104877935;WS=104877917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	104893693	rs5794371	C	CAG	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=1366;SC=TGTCTCTACACAGTCTCAGGA;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=27;WE=104893701;WS=104893683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	104893999	rs1699090	A	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=636;SC=CTGGGAACCTATAGTTTCATC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=104894007;WS=104893989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	104896226	rs483345	G	A	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=6;PP=167;SC=GGAGAAAAATGAGGACAAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=104896234;WS=104896216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	104896880	rs534811	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=202;SC=CTGTAAACCTAGAGTTCTTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=104896901;WS=104896870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	104896893	rs476889	C	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=243;SC=GTTCTTGACTCAAATGGACTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=104896901;WS=104896870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	104899817	rs505901	C	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=4;PP=859;SC=TATTGATAGCCCCAACAAAGA;SOR=3.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=104899825;WS=104899807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	104900115	rs503153	G	C	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=41;PP=1211;SC=CATGCAAATAGACACATGCAT;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=104900123;WS=104900105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	104900385	rs501192	C	T	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=660;SC=AAGGCATCAGCACTCACCACC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=104900393;WS=104900375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	104900488	rs580253	G	A	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=46;PP=2124;SC=TTGAGTTGTAGTATATCTGGG;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=110;WE=104900496;WS=104900478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	104900948	rs45483194	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=0.070;SC=CAAGTTTGTATTTTAGATTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=104900956;WS=104900938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	104901007	rs473549	C	T	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=26;PP=2269;SC=TAATATTATTCAGTTATACGA;SOR=1.907;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=77;TCR=26;TR=102;WE=104901015;WS=104900997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	104903719	rs572687	G	A	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=602;SC=ATTTACCCACGTTTGATCCTA;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=104903727;WS=104903709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	104904570	rs568910	A	C	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=53;PP=2636;ReadPosRankSum=1.058;SC=CTTTACAACTACATAAGTGCC;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=126;WE=104904578;WS=104904560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,143:0.99:145
chr11	104905047	rs539595	G	A	8561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=153;PP=2965;SC=TCAAAGCTCGGGTCTTATCCA;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=162;TCR=153;TR=315;WE=104905055;WS=104905037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr11	104912012	rs17103597	G	T	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=545;SC=TTGCTCAATGGGATGTGCTTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=104912020;WS=104912002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	104912221	rs542571	T	A	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=48;PP=2677;SC=CAGAAGTATGTTCCTCCAGAA;SOR=1.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=104912229;WS=104912211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	104912458	rs1503391	A	C	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1174;SC=TGCAAGAGACAAGGAATATCA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=104912466;WS=104912448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	104914087	rs71037294	AG	A	124.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=62.13;NF=5;NR=0;PP=168;SC=AGATTAAAAAAGAAAATTATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=104914095;WS=104914077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	104915441	rs545911	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=-5.579;QD=10.10;ReadPosRankSum=-2.289;SOR=2.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr11	104915444	rs473394	C	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQRankSum=-5.366;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=1.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr11	104971210	rs1792771	C	T	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=27;PP=2556;SC=AGGCCCTAGGCGAACTTGAGT;SOR=2.087;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=84;TCR=27;TR=111;WE=104971218;WS=104971200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	104971257	rs12806837	G	A	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.152;NF=63;NR=29;PP=1417;ReadPosRankSum=-1.104;SC=GAGTCCCAGCGTCCCTGCCAG;SOR=0.948;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=182;TCF=119;TCR=63;TR=92;WE=104971265;WS=104971247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,110:0.50:220
chr11	104972190	rs1792773	C	T	6741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.97;NF=108;NR=84;PP=2965;SC=AAAGCATGCACCACCTTTCTT;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=108;TCR=84;TR=192;WE=104972198;WS=104972180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	104972274	rs34077014	CT	C	1233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=759;ReadPosRankSum=-0.035;SC=ATATGCATGTCTTTTTTTATT;SOR=0.696;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=10;TCR=86;TR=37;WE=104972282;WS=104972264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,57:0.41:138
chr11	105009425	rs4755080	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=409;ReadPosRankSum=1.083;SC=AATGGAGTCTGAGGCTAAAAT;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=23;WE=105009433;WS=105009415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr11	105836923	rs632549	G	A	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=438;SC=TACGTATGCAGTTACTGTCAA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=105836931;WS=105836913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	105842916	rs559190	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=439;SC=GGATGGTCTTCCCAGGAAACT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=105842924;WS=105842906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	105844923	rs509512	C	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=814;SC=ACTTGTAAATCATTTCAGGTT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=105844931;WS=105844913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	105965216	rs1893175	G	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=186;SC=TATATATATAGAGAGAGAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=105965224;WS=105965206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	106407855	rs201392082	AATAT	A	43.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.967;NF=0;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=0.967;SC=ATAATTGACAAATATATATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=1;TCF=0;TCR=1;TR=1;WE=106407866;WS=106407845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr11	106408031	rs11279851	TCAAATG	T	2928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=2212;ReadPosRankSum=0.021;SC=CACGGAGAACTCAAATGTGTC;SOR=0.842;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=101;TCF=19;TCR=82;TR=42;WE=106408044;WS=106408021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,79:0.40:196
chr11	106408071	rs1791468	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=842;ReadPosRankSum=1.802;SC=ACCTCTATTTCCAGCCTTATG;SOR=0.736;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=64;WE=106408079;WS=106408061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,73:0.43:171
chr11	106579204	rs12420232	C	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=327;ReadPosRankSum=-0.822;SC=AAACAAAGGCCAAGACAGGAA;SOR=0.648;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=20;WE=106579212;WS=106579194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr11	106680653	rs141065153	CAATTT	C	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=2.064;SC=GTAAAAAAATCAATTTAATTC;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=106680665;WS=106680643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	106695697	rs77535954	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.013;NF=11;NR=21;PP=500;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GAATGTTACTAAATTTTCTAA;SOR=0.453;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=32;WE=106695705;WS=106695687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr11	106697172	rs61678754	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.528;NF=7;NR=9;PP=212;ReadPosRankSum=1.444;SC=CTTCTCCATATGATGAAAGAT;SOR=0.732;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=16;WE=106697180;WS=106697162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr11	106807443	rs11331245	AT	A	2689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.815;HP=12;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.214;NF=6;NR=79;PP=1428;ReadPosRankSum=1.265;SC=CTTGCTCTTGATTTTTTTTTT;SOR=1.503;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=8;TCR=102;TR=85;WE=106807452;WS=106807433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr11	106849520	rs10890630	T	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CATCTGCGAATGCAACTCATA;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=24;WE=106849528;WS=106849510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr11	106888608	rs3107973	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=246;ReadPosRankSum=-0.693;SC=TCGGGGCCGGGGCGGCGGCAG;SOR=0.330;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=13;WE=106888616;WS=106888598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr11	107197536	rs630782	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=0.547;SC=GCTGCTGTGACTCTCTCTGCC;SOR=0.144;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=107197544;WS=107197526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr11	107197640	rs3758911	T	C	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1026;ReadPosRankSum=1.310;SC=TACACCTCAATAGTTTTTACT;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=144;TCF=95;TCR=49;TR=71;WE=107197648;WS=107197630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,87:0.51:172
chr11	107205426	rs10789620	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CAAATAAAAACCCTCTACAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=107205434;WS=107205416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	107216388	rs474364	C	T	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.75;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	107224225	rs4576794	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=705;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GAGAATGTAAGCAAAGGATAA;SOR=0.525;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=34;WE=107224233;WS=107224215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr11	107286893	rs11439588	T	TG	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=-0.372;SC=CCGGTGGTAGTTTACACAAGG;SOR=1.880;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=10;WE=107286901;WS=107286883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	107287139	rs520729	T	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	107381533	rs655009	G	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=592;SC=GCTAAAACAGGGTCCAAAATC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=107381541;WS=107381523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	107381765	rs654093	G	A	3999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=73;PP=2448;SC=CAACCAATCTGTAACAGAGAA;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=131;WE=107381773;WS=107381755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	107402995	rs589788	A	T	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=10;PP=1274;SC=TCTCATAAAGAAAAAGAATCC;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=107403003;WS=107402985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	107403202	rs5794554	TAG	T	2515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.295;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.263;NF=0;NR=39;PP=1867;ReadPosRankSum=1.440;SC=GAATGATTAATAGAGTTTGGC;SOR=3.000;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=39;WE=107403211;WS=107403192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr11	107420530	rs645056	A	G	7759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=125;PP=2965;SC=CGGAATGTGTATCAATATGAG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=109;TCR=125;TR=234;WE=107420538;WS=107420520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	107462878	rs542650	A	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=918;SC=CTCAGTGTTTATGCTCAACCT;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=107462886;WS=107462868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	107462977	rs5794560	G	GT	282.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=275;SC=TAATGAATATGTTGTCAGCCT;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=107462985;WS=107462967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	107502123	rs10539761	ACCC	A,ACC	207.92	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=8,8;NR=1,1;PP=90,78;ReadPosRankSum=1.094;SC=AAATTGCACTACCCCCCCCCC;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9,9;WE=107502133;WS=107502121;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.67:9
chr11	107578721	rs583362	C	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=-1.413;SC=CCTCTGGCTTCTCCTCACCTC;SOR=1.282;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=22;WE=107578729;WS=107578711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr11	107643289	rs60511673	T	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AACCATGTTGTCCAGGCTGGT;SOR=0.586;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=11;WE=107643297;WS=107643279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	107646918	rs484427	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.049;NF=10;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-0.577;SC=ATTTAGTCAGGTGTGATGATG;SOR=0.914;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=11;WE=107646926;WS=107646908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	107650473	rs650686	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=188;ReadPosRankSum=1.935;SC=GCGCCTGGCCGGGACCCCAGT;SOR=0.759;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=20;WE=107650481;WS=107650463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr11	107650505	rs519422	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=165;ReadPosRankSum=-1.454;SC=TTTTTTCTAACCGACATAGTC;SOR=1.453;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=14;WE=107650513;WS=107650495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr11	107663631	rs148577551	TTTTCTTTC	T	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.26;MQRankSum=1.344;NF=0;NR=10;PP=2156;ReadPosRankSum=0.581;SC=AATCTTTTTATTTTCTTTCTT;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=10;WE=107663646;WS=107663621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr11	107673628	rs556153	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=0.366;SC=GCCAAGAAGATGAGAAGGTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=107673636;WS=107673618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	107675566	rs495836	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=396;ReadPosRankSum=0.845;SC=GCATTTTAGTCACTATACTTC;SOR=0.361;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=24;WE=107675574;WS=107675556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr11	107677399	rs34066069	C	CA	2271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1836;ReadPosRankSum=0.889;SC=AAAACATAAACAAATTTGCTG;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=53;WE=107677407;WS=107677389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,88:0.42:212
chr11	107904646	rs10890800	C	T	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=38;NR=42;PP=1530;SC=TCGTAAGTACCCCACTAATTC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=107904654;WS=107904636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	107917087	rs7117111	A	G	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=45;PP=1520;SC=TTATTAAGCAAGCACAGGCAG;SOR=1.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=107917095;WS=107917077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	107925327	rs3847562	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=49;SC=ACTCAAAATACTGATTTTGAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=107925335;WS=107925317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	107948858	rs10890807	T	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=422;SC=TTTATCTGTATATTTTCAATA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=107948866;WS=107948848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	107992325	rs3741055	T	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=1.645;SC=TACTCAGCCCTCTGCGACCAT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=33;WE=107992333;WS=107992315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr11	107992346	rs3741056	G	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=418;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GGCTGTGCTGGCGGCACTTCT;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=27;WE=107992354;WS=107992336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,36:0.38:96
chr11	108006047	rs10890817	A	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=678;ReadPosRankSum=-0.820;SC=AGGCATATTCATATTTTAGAA;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=45;WE=108006055;WS=108006037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr11	108012510	rs34420529	A	AAAGT	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=264;SC=GGATTTTGAAAAATTCTAGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=108012518;WS=108012500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	108014684	rs374107553	AC	A	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=1.716;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.049;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	108014799	rs10890819	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.14;MQRankSum=1.334;NF=9;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=0.814;SC=AGGGGCGATACTCCATTATGC;SOR=0.252;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=20;WE=108014807;WS=108014789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr11	108043988	rs2070661	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=21;PP=880;SC=CTCTTGTGAACTTCACTAGAA;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=108043996;WS=108043978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	108057430	rs4753833	G	A	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	108059000	rs3781869	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.77;SOR=3.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	108061379	rs659584	C	T	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=135;SC=ATTTTTTGGGCAAGCAACTGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=108061387;WS=108061369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	108064935	rs11212546	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=263;SC=GCTTCTAAAGAATCTTGCCTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=108064943;WS=108064925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	108068954	rs683312	T	C	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=22;PP=723;SC=AAATCTAATCTCAAGAGTTGT;SOR=1.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=108068962;WS=108068944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	108093208	rs228589	A	T	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=15;PP=1407;SC=ATAACCCTCCATCCCGCGTCC;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=108093216;WS=108093198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	108098459	rs2066734	TAA	T	1590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=1134;ReadPosRankSum=0.536;SC=TTCCTTGAAATAAGTGTGATT;SOR=0.829;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=30;WE=108098468;WS=108098449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr11	108121410	.	C	CTT	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5051;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=58.66;NF=2;NR=0;PP=20;QD=11.5;SC=TCAAATTATCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=2;WE=108121418;WS=108121400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr11	108129657	rs672655	A	G	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=10;PP=755;SC=ACTGTCTGCCAAGAATAATTG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=108129665;WS=108129647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	108137775	rs642496	T	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=11;PP=886;SC=CACCTGGCTCTGCCTCCCAAA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=108137783;WS=108137765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	108143182	rs664677	C	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=468;SC=AAGTAACTTACAATAACCTTT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=108143190;WS=108143172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	108150207	rs1799757	CT	C	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=955;ReadPosRankSum=1.867;SC=TGTTTGCTTGCTTGTTTTAAG;SOR=0.957;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=27;WE=108150215;WS=108150197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr11	108151707	rs3218681	T	TA	1833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.90;QD=33.34;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	108175462	rs1801516	G	A	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=905;ReadPosRankSum=0.818;SC=TTTACTCCAAGATACAAATGA;SOR=0.393;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=60;WE=108175470;WS=108175447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr11	108183167	rs659243	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=10;PP=659;SC=GGAAGCCAGAATACAACTATT;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=108183175;WS=108183157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	108196712	rs3212322	CATT	C	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=1021;SC=TTGCTGCTTTCATTATTATTA;SOR=2.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=22;WE=108196722;WS=108196702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	108218196	rs227075	T	C	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	108224697	rs179108	G	A	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=37;PP=997;SC=AATCCCAGCTGCTCAAGAGGC;SOR=3.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=108224705;WS=108224687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	108225483	rs664982	C	T	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=7;PP=774;SC=GATAAAGATACGTTGACAACA;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=108225491;WS=108225473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	108225661	rs664143	A	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=36;PP=1326;SC=TGTGTATCTCATCAGGAAGTC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=108225669;WS=108225651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	108256837	rs113995	A	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=219;SC=GTAACTCTCAAGACTTTCTCA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=108256845;WS=108256827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	108345515	rs11374964	G	GA	514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=465;ReadPosRankSum=1.568;SC=TTTCCTTAAAGTGTAGCCGGG;SOR=0.387;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=12;WE=108345523;WS=108345505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr11	108352160	rs3901850	C	T	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=40;PP=1078;SC=TTTAATATGGCAAGCATAATC;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=108352168;WS=108352150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	108361578	rs11212676	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=424;ReadPosRankSum=-1.725;SC=AGCTCCAGGAGGTATGTATAC;SOR=1.538;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=23;WE=108361586;WS=108361568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr11	108380335	rs1943382	T	C	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=79;PP=2965;SC=GTGTCACAATTTGAGTCCACT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=173;WE=108380343;WS=108380325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	108464209	rs2640738	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.991;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=988;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGGATCTTCCTGGCCTCTTCG;SOR=0.425;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=75;WE=108464217;WS=108464199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,90:0.45:200
chr11	108535792	rs2306118	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=2;PP=423;SC=GCATGCGCCTCTGTGCGTTTG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=108535800;WS=108535782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	108722851	rs10890899	C	G	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=20;PP=1338;SC=TTATATGCTGCTAATTTTTCT;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=108722859;WS=108722841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	109964007	rs7116424	A	G	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=91;PP=2650;SC=TGTGCAACCCAGGGAGGGGGC;SOR=1.537;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=42;TCR=91;TR=133;WE=109964015;WS=109963997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	109964079	rs7116552	C	A	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=17;PP=775;SC=GGGAGGGCCGCGGTGGCCGCT;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=109964097;WS=109964069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	109964089	rs11395531	T	TG	1466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=15;PP=1069;SC=CGGTGGCCGCTTCTCCGCGGG;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=25;WE=109964097;WS=109964069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	109964257	rs7116683	A	G	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=25;PP=780;SC=CCCGGGCGCCAGGCGGAGGGC;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=109964265;WS=109964247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	110023628	rs665013	C	T	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=9;PP=1424;SC=TTAAGTGTTCCGTAATAATCT;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=110023636;WS=110023618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	110033860	rs11213287	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=380;SC=TTTTTTACTCTGTAAACGTGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=110033868;WS=110033852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	110050502	rs11213291	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GTCTAAAAAACAATTATAATA;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=24;WE=110050510;WS=110050492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr11	110103924	rs10450619	A	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	110118364	rs17110988	A	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=300;ReadPosRankSum=-0.980;SC=ACTAAAAAAAATACCACTATC;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=24;WE=110118372;WS=110118354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr11	110126197	rs2306085	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=0.145;SC=TGAATGACCAATCTTAAGAGT;SOR=1.066;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=25;WE=110126205;WS=110126187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr11	110128994	rs10789756	C	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.538;SC=AGAATCCTTTCAGTAACTTGA;SOR=1.675;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=10;WE=110129002;WS=110128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr11	110150486	rs61003001	TA	T	116.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.282;NF=0;NR=6;PP=64;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CACTTTCTGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=110150494;WS=110150476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	110452999	rs2008772	C	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.15;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	110453009	rs4079590	G	A	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.16;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	110453250	rs4142632	C	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=697;SC=TTAACAAAAACCACATCTACC;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=110453258;WS=110453240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	110479839	.	A	ATT	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=60.29;NF=2;NR=4;PP=79;QD=14.1666666667;SC=ATGAGGACACATTTTTTTTTT;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=6;WE=110479847;WS=110479829;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr11	110494724	rs7128425	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=1.060;SC=TGGTTGGGTGTATGTGTCAAC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=110494732;WS=110494721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr11	110582310	rs2305289	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=337;ReadPosRankSum=1.489;SC=CGAAAACTGCTATGGAGCAGC;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=22;WE=110582318;WS=110582300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr11	110582814	rs7112658	CG	AA	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=4;HapScore=4;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=529;ReadPosRankSum=-2.094;SC=GGGGCTGCGGCGGCGGAGGGC;SOR=1.002;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=15;WE=110582823;WS=110582804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr11	110582834	rs7112669	C	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=298;ReadPosRankSum=1.915;SC=CACGGGCCCCCGCTCAGCGTC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=18;WE=110582842;WS=110582824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr11	110697305	rs120434	C	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=460;ReadPosRankSum=0.196;SC=GAATGCTGATCCTTAACCATG;SOR=1.112;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=29;WE=110697313;WS=110697295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr11	110697444	rs120436	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	111154724	rs7926730	C	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=554;ReadPosRankSum=0.476;SC=GTTTCCCAGGCAGAGACTCAG;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=36;WE=111154732;WS=111154714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr11	111156836	rs3087967	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=449;ReadPosRankSum=0.627;SC=TTCCAAAGATTGTTTTAGGTG;SOR=0.648;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=33;WE=111156844;WS=111156826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr11	111179054	rs3087587	A	G	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1075;ReadPosRankSum=0.540;SC=CTCTCCAGGCAGCAGAGTACT;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=68;WE=111179062;WS=111179044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr11	111229470	rs12282082	T	C	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=1024;SC=CACATTCTCTTTCACACACAC;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=111229491;WS=111229460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	111229483	rs80223743	A	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.171;NF=16;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=0.014;SC=ACACACACACACTCACACTCT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=18;WE=111229491;WS=111229460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr11	111249785	rs11213863	C	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CCCCCGTGGCCCCATCACCTC;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=111249793;WS=111249775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	111249819	rs10789825	A	G	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=9;PP=1101;SC=CCAATTCCAGACCAAGCTGTG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=111249827;WS=111249809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	111250085	rs74368417	C	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=-2.331;SC=CCTCAGGCACCGGTGCAACGT;SOR=0.910;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=111250093;WS=111250075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr11	111324146	rs61896867	A	C	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1145;ReadPosRankSum=1.051;SC=GCAGTGTCACAGCCTGAGCTG;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=80;WE=111324154;WS=111324136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,98:0.52:190
chr11	111326284	rs7925584	T	C	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=949;SC=TCAGCAGCAGTTGAAAGCACA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=111326292;WS=111326280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	111327213	rs11213913	G	A	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=23;PP=1963;SC=GCCCAGGGCTGAGCAGGCAAT;SOR=2.016;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=92;WE=111327221;WS=111327203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	111368047	rs489078	G	T	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=53;PP=2090;SC=CTCTACTAACGGCATAACTGA;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=95;WE=111368055;WS=111368037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	111383789	rs11606481	C	T	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=24;PP=770;SC=CCGGCTCGGGCAGCCCGCAGC;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=111383797;WS=111383779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	111383846	rs2187473	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GTGGGTCCTGCGCAGCCTGCC;SOR=0.741;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=111383854;WS=111383836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	111420364	rs634679	A	G	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=5;PP=1055;SC=TGGATGAGCCATCCTGCGGCA;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=111420372;WS=111420354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	111422217	rs663763	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=312;SC=CCACCCATGCCCAGAATAGTT;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=111422225;WS=111422207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	111487106	rs571462	C	G	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=40;PP=1378;SC=CTAACACTATCTCCATTCATT;SOR=0.928;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=111487114;WS=111487096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	111608216	rs61756429	T	A	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.540;SC=GGGAAGTGGTTCTTGTCAGCC;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=86;WE=111608224;WS=111608206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,115:0.46:250
chr11	111623088	rs4936675	T	A	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1030;ReadPosRankSum=0.630;SC=AAGACCACATTTAAAAATCAA;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=70;WE=111623096;WS=111623078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr11	111636627	rs643506	T	G	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=48;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CGTCTCGGCCTGGCACCGCGC;SOR=0.804;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=22;TCR=86;TR=61;WE=111636635;WS=111636617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr11	111637117	rs139691367	T	TCCCGCCCCGCGCCCAGGC	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;QD=42.41;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	111659476	rs2554996	C	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=6;PP=137;SC=GACATTGTCCCAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=111659484;WS=111659466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr11	111742145	rs10708475	CG	C	3180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=22;PP=2292;SC=GCAGCCGGGGCGCGTATCCCC;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=52;WE=111742153;WS=111742135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	111747427	rs634983	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TTTTAGAGACCGAATCAATTA;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=9;WE=111747435;WS=111747417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr11	111749265	rs3802845	C	T	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1235;ReadPosRankSum=0.024;SC=CTTGTGAGGGCGCTCCTTTCC;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=79;WE=111749273;WS=111749255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr11	111749349	rs611010	A	T	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.335;SC=ATGCGGGAAGATGAAATAAAT;SOR=0.951;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=72;WE=111749357;WS=111749339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr11	111784229	rs4252588	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=1490;ReadPosRankSum=0.505;SC=GGCCTCGGGCCGCCCCAGCTG;SOR=0.405;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=162;TCF=113;TCR=49;TR=87;WE=111784237;WS=111784219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr11	111795085	rs7124407	C	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=255;ReadPosRankSum=-0.655;SC=AAAAAGAAAACAGGTAACTTT;SOR=0.375;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=17;WE=111795093;WS=111795075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr11	111795148	rs7124433	C	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=470;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CAATAGAACTCCAATCTTTGG;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=31;WE=111795156;WS=111795138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr11	111800488	rs5794769	A	AT	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.346;NF=9;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TGAGCTTTAAATTTTTTTTTT;SOR=1.104;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=17;WE=111800496;WS=111800478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,21:0.27:77
chr11	111848361	rs11364849	AG	A	974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=5;PP=875;SC=TAGCTTTGCTAGGCTGGCCTT;SOR=2.066;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=111848369;WS=111848351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	111848531	rs10891303	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=0.406;SC=TGAGCTGAAGCCACTCTGGCT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=32;WE=111848539;WS=111848521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr11	111853106	rs11455434	G	GC	4781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=67;PP=2936;SC=CGGCCAGGGAGCCTGGAACCT;SOR=0.953;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=87;WE=111853114;WS=111853096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	111866442	rs3839945	GAC	G	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=113;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGTGGAACTGACTATTCATC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=111866451;WS=111866432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	111889635	rs650461	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=1.085;SC=TTTAGTGAATCAGATTCCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=10;WE=111889643;WS=111889625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	111889654	rs476581	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=0.833;SC=TGTTTTTTCACTGTGGCTTTT;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=14;WE=111889662;WS=111889644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	111896324	rs2303436	C	T	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CCGGCTCCCGCTCGTCGCAAC;SOR=0.960;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=78;WE=111896332;WS=111896314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,85:0.46:185
chr11	111908162	rs627441	T	C	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=955;ReadPosRankSum=-1.688;SC=AAACCACAAGTGCCACCACCT;SOR=1.002;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=82;WE=111908170;WS=111908152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,105:0.61:172
chr11	111915765	rs11455845	C	CA	1185.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.470;HP=13;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.102;NF=22;NR=21;PP=718;ReadPosRankSum=1.223;SC=TCTCAAAAGACAAAAAAAAAA;SOR=0.763;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=43;WE=111915773;WS=111915755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,51:0.86:59
chr11	111916001	rs11335731	AG	A	2378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1858;SC=GGGCATCTTTAGGTTGTTTAG;SOR=1.999;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=111916009;WS=111915991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	111916647	rs10891314	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=0.578;SC=CCTTTCTATCGATGTAAATAT;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=19;WE=111916655;WS=111916637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr11	111930576	rs3882890	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ACCTGGCACACAGGCTCTTAA;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=111930584;WS=111930566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	111933088	rs10891315	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=1.630;SC=GAAATGCAGTATTTTCTTTCA;SOR=1.207;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=18;WE=111933096;WS=111933078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr11	111941959	rs1425917	G	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=915;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CTTTTCTGCTGCATGAAGAAC;SOR=0.660;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=56;WE=111941967;WS=111941949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr11	111956989	rs14396	C	A	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=24;PP=1590;SC=GTGACGGCGACACCAAAACCC;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=75;WE=111956997;WS=111956979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	111957143	rs487201	T	C	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1270;SC=ATCTTCCCTGTTTTACACCTT;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=111957151;WS=111957133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	111957819	rs7121782	G	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=824;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GACCACTGTAGTCTAGGGGTC;SOR=0.195;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=49;WE=111957827;WS=111957809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr11	111963860	rs592626	A	G	126.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	112025915	rs4988359	T	C	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=318;SC=ATTCAATAAATGCCAGAAGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=112025923;WS=112025905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	112064431	rs7105056	T	C	4621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=84;SC=GTGATAGTGATGATTATTTAA;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=160;WE=112064439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	112065434	rs10891338	T	C	6194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=95;PP=2965;SC=CATTATGACCTGGATGGAACA;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=90;TCR=95;TR=185;WE=112065442;WS=112065424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	112071294	rs12420140	G	A	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=5;PP=1214;SC=GACAACTCTAGTTTGCCAAAT;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=112071302;WS=112071284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	112071570	rs7948124	AA	TT	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=60;PP=1739;SC=TTGATTTTTTAAAAATCTTCC;SOR=3.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=8;TCR=63;TR=68;WE=112071579;WS=112071560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	112087101	rs2676377	T	A	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=686;SC=TAGCACTGAGTCATCTGATAA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=112087109;WS=112087091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	112088499	rs2217401	A	C	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=39;PP=2377;SC=AAGCAATTTTATCCTAGTTTT;SOR=1.149;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=102;WE=112088507;WS=112088489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	112123095	rs2564872	A	G	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=85;PP=2965;SC=TTCAGAGTAGAAAGTATAGGC;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=154;WE=112123103;WS=112123085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr11	112130987	rs2518361	G	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=381;SC=CTCATTCTTTGTCTTCCTTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=112130995;WS=112130977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	112832307	rs11381910	G	GA	6402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=73;PP=2957;SC=ACCGCGGCAAGACATCCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=29;TCR=76;TR=101;WE=112832315;WS=112832297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	112832339	rs11284059	GC	G	5015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=57;PP=2908;SC=TTACAATGCTGCCAAACTAAG;SOR=0.881;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=72;WE=112832366;WS=112832329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	112832353	rs7105734	T	C	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	112832358	rs6589347	T	C	4335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	112983874	rs1245088	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=322;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TAAATAAAATAAAGTCTGCAT;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=18;WE=112983882;WS=112983864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr11	112984037	rs1245087	G	A	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=577;SC=CAAATTAGATGATCAGTAAGT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=112984045;WS=112984027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	113073066	rs5794855	T	TTTTTG	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.504;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr11	113091849	.	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.639;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=338;ReadPosRankSum=0.733;SC=TAAGCTAAATCCTAAATTAAA;SOR=2.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=113091857;WS=113091839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr11	113103996	rs584427	T	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=525;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GGAGAGCAGTTGGTGAAGAAG;SOR=0.620;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=36;WE=113104004;WS=113103986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr11	113105907	rs646558	C	A	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=938;ReadPosRankSum=-1.748;SC=CCAGCTGCCCCCCTTTTCCCA;SOR=0.550;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=68;WE=113105915;WS=113105897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr11	113111501	rs2303377	T	C	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=901;ReadPosRankSum=-0.324;SC=CATTTTTCTTTCTTCAGCGGC;SOR=0.702;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=48;WE=113111509;WS=113111491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr11	113113515	rs635596	G	A	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1302;ReadPosRankSum=0.062;SC=TCTGTCTGTCGTGTTTCCATA;SOR=0.982;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=91;TCR=72;TR=80;WE=113113523;WS=113113505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,94:0.49:192
chr11	113130734	rs77029508	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=2.720;SC=CCCCCATCATTGCTTCTTATT;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=113130742;WS=113130724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	113186776	rs2236709	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=102;SC=ATTGCCGCACGTAAATGAGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=113186784;WS=113186770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	113195595	rs948178	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=0.971;SC=CAACAAGCAGAGGGTAGGATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=10;WE=113195603;WS=113195585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	113200558	rs7928978	A	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=550;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CTGACATTCTACTGTTCGAAT;SOR=0.383;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=26;WE=113200566;WS=113200548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr11	113200709	rs2303380	G	A	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=41;PP=1580;SC=AAGGTAAGAGGGTATTTCTTT;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=113200717;WS=113200699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	113209428	rs10891536	C	G	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.535;SC=AGCCCAATGACACCCAGTGTC;SOR=0.523;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=173;TCF=103;TCR=70;TR=77;WE=113209436;WS=113209418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,90:0.44:203
chr11	113211329	rs2288159	G	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=902;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GTGTTGCAGCGAGACACCAGC;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=92;TCR=42;TR=55;WE=113211337;WS=113211319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,67:0.42:161
chr11	113211370	rs10891537	T	G	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=42;PP=1481;ReadPosRankSum=0.386;SC=AGTGGTTTTCTTTGTATCTGT;SOR=0.913;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=104;WE=113211378;WS=113211360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,129:0.62:208
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chr11	113230600	rs2276070	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr11	113230773	.	C	CTTGTTTTGTTTTGTTTTGTT	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.092;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	113233059	rs2298490	G	A	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=21;PP=1356;SC=CTCCCCGTTAGCTTTTAAAGG;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=113233067;WS=113233049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	113234466	rs713233	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	113234471	rs719803	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	113234679	rs719802	T	C	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=55;PP=1830;SC=AGGGAGCCCTTGTCCCAGAGG;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=113234687;WS=113234669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	113235419	rs2298489	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=354;SC=GCTGATGAGTAAGTGAACAAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=113235427;WS=113235409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	113235864	rs7949242	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CTGGGACTGCATGCCACACAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=113235872;WS=113235854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	113239082	rs10891540	G	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1427;ReadPosRankSum=0.155;SC=CTACCATGCAGACCTTCCAGG;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=198;TCF=106;TCR=92;TR=88;WE=113239090;WS=113239072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,113:0.46:245
chr11	113239363	rs184851736	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GTTCCAGTGCGCCGCAAGGTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=113239371;WS=113239353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	113264272	rs17115439	T	C	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=56;PP=2527;SC=ACATCGTGTCTATCTACGGGG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=113264280;WS=113264262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	113264470	rs4938013	A	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=46;PP=1385;SC=CGGGCAACATACTCCTGGACA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=75;WE=113264478;WS=113264460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	113264511	rs11214596	C	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.399;SC=AGGGCTCTGGCCAATCCTCCG;SOR=0.968;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=26;WE=113264529;WS=113264501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr11	113264521	rs4938014	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.416;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=673;ReadPosRankSum=1.578;SC=CCAATCCTCCGCTCCCTTTCA;SOR=0.248;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=18;WE=113264529;WS=113264501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	113265292	rs10891546	T	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=254;SC=ATGAATAGCTTACCGAAGGTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=113265300;WS=113265282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	113266702	rs11214598	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=417;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CATGCCCTGTTGGGATCCTCA;SOR=1.368;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=26;WE=113266710;WS=113266692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr11	113268059	rs11604671	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=563;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GCGCCAGCCCGGGGAGGTGAG;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=33;WE=113268067;WS=113268049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr11	113270015	rs4938016	G	C	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1172;ReadPosRankSum=-2.499;SC=TGGGGATGACGGCACTGCGCG;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=83;TCR=109;TR=88;WE=113270023;WS=113270005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,111:0.50:220
chr11	113270160	rs2734849	A	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CCCAACCTGCATGAGGCTGAG;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=82;WE=113270168;WS=113270150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,90:0.52:173
chr11	113270374	rs2734848	C	T	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=65;PP=2421;SC=AGAGCGGCTACGGCCCACTGC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=116;WE=113270382;WS=113270364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	113271065	rs2734847	T	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=320;SC=GATCACCTGATATCAAGAGTT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=113271073;WS=113271055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	113281397	rs6276	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=0.541;SC=TGAGGCTGGCCGGCCTGGGCA;SOR=0.165;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=15;WE=113281405;WS=113281387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr11	113283459	rs6277	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=890;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CGGGGCTGTCGGGAGTGCTGT;SOR=0.354;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=58;WE=113283467;WS=113283449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr11	113283477	rs6275	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=691;ReadPosRankSum=-1.710;SC=TGTGGAGACCATGGTGGGACG;SOR=0.478;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=52;WE=113283485;WS=113283467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr11	113285299	rs2511521	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CAGAGATCAGGAGGGTGGGGG;SOR=0.970;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=113285307;WS=113285289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr11	113287511	rs35352421	G	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=837;ReadPosRankSum=-1.212;SC=CAGGGACTCTGCTCCCTCAGG;SOR=0.374;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=45;WE=113287519;WS=113287501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr11	113294976	rs11608185	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.197;SC=AAAAACCACCTGGGGAAGCAC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=113294984;WS=113294966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	113294998	rs12808482	T	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=0.439;SC=AGGAAACTCATTGGTAAAAGC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=113295006;WS=113294988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr11	113561054	rs7110736	A	G	6871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	113561057	rs7110738	A	G	7032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=1.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	113561247	rs11601435	T	C	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.66;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	113561256	rs11607591	G	A	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.30;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	113566207	rs4936279	C	A	4522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=78;PP=2740;SC=GCAGGGGCCGCCCTGCAGCCA;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=145;WE=113566215;WS=113566197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr11	113569931	.	CTG	C	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.93;NF=0;NR=4;PP=96;QD=29.75;SC=CTTTGTCTGTCTGTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=113569940;WS=113569921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr11	113569933	rs12797654	G	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=23.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	113570405	rs4936280	T	C	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=50;PP=1291;SC=GCCAGCACACTGCCTGAGAAA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=113570413;WS=113570395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	113570490	rs3802856	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=234;SC=AAGTCACCACTATGGGGCTAG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=12;WE=113570498;WS=113570480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	113576932	rs7926267	A	G	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=30;PP=1486;SC=TGGCACAGAGACGTAACCTTA;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=113576940;WS=113576922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	113608164	.	GA	G	104	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=57.85;NF=8;NR=0;PP=104;QD=13.625;SC=AAACAAAACTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=8;WE=113608172;WS=113608154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,8:0.40:20
chr11	113609854	rs4351850	T	A	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=689;SC=ATTTCTAATTTTCTCATTCAA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=113609862;WS=113609844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	113618470	rs2459977	T	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=229;SC=AAAGAATCATTTACATATATT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=113618478;WS=113618460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	113618968	rs2513584	G	C	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=20;PP=2295;SC=TGTGCTGTCTGGGCTCTTTAC;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=83;TCR=20;TR=103;WE=113618976;WS=113618958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	113670052	rs2459971	T	A	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=80;PP=2965;SC=TGGGTCGAATTGTTGGAGGCT;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=174;WE=113670060;WS=113670042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	113678924	rs2513582	G	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=15;PP=709;SC=GTTGGTTAAAGGCAGCAGAGA;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=29;WE=113678932;WS=113678914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	113680018	rs2513581	G	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=969;SC=CACAAGGAACGAAAACATCCT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=113680026;WS=113680008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	113712526	rs7112957	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=351;SC=AGTCTATATATAGGAAACACT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=113712534;WS=113712516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	113723144	rs17802653	G	A	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=555;SC=TGATGTGATTGACAGGGAACT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=113723152;WS=113723134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	113802601	rs1176746	A	G	7364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=115;PP=2965;SC=TAAGTGTGCCAGTGTGTATTT;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=97;TCR=115;TR=212;WE=113802609;WS=113802591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr11	113813567	rs45519137	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=1.494;SC=AAACATATTTCTAAGATAAAT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=113813575;WS=113813557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	113846006	rs1062613	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=755;ReadPosRankSum=-0.925;SC=GTGGGCCTCGTCCTGAGCACT;SOR=0.614;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=47;WE=113846014;WS=113845996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr11	113848184	rs4020460	G	GCT	1558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=1163;SC=TGGGCCACCTGCTCCGACCTT;SOR=2.432;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=25;WE=113848192;WS=113848174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	113848273	rs1985242	A	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=964;ReadPosRankSum=0.713;SC=TTTCCTGTCAATGAATGCATA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=56;WE=113848281;WS=113848261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,69:0.49:142
chr11	113848474	rs1176722	G	A	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TGTCTACTTTGAACTGTTCTC;SOR=0.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=77;WE=113848482;WS=113848464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr11	113849753	rs1176720	G	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	113856681	rs10160548	G	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=242;ReadPosRankSum=-1.294;SC=TCATCACAGGGTCCAGCAGGC;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=15;WE=113856689;WS=113856671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr11	113857886	rs1150220	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GGCATCCCATGCCCTGCCTTA;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=16;WE=113857894;WS=113857876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	113860425	rs1176713	A	G	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=59;PP=1712;ReadPosRankSum=0.406;SC=TTTACCTGCTAGCGGTGCTGG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=110;TCR=114;TR=117;WE=113860433;WS=113860415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,139:0.53:261
chr11	114057944	rs682155	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.430;SC=GGCCCAGCAGAAGTTTACAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=114057952;WS=114057934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr11	114315188	rs540712	A	G	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=21;PP=1497;SC=TAAAAGTGAAATTTCATTTCT;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=114315196;WS=114315178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	114316989	rs654531	C	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=167;SC=GAATTGGGAGCAACAACGTCA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=114316997;WS=114316979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	114421646	rs79339030	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=-2.601;SC=TGGGAAATGAAGAAATAGAGG;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=8;WE=114421654;WS=114421642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr11	114421674	rs75026329	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr11	114421683	rs79413019	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
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chr11	114421705	rs78231204	A	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.710;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr11	114421711	rs77069178	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.746;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,27:0.28:97
chr11	114421713	rs112529011	GT	G	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.557;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=2613;ReadPosRankSum=2.713;SC=AGATAGGGCAGTAGTTGAGGT;SOR=1.216;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=21;WE=114421729;WS=114421688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,27:0.28:98
chr11	114421721	rs78612878	G	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.732;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=2002;ReadPosRankSum=1.583;SC=CAGTAGTTGAGGTGGGGGAGG;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=33;WE=114421729;WS=114421688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,31:0.29:107
chr11	114421747	rs78105386	G	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=6.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.94;ReadPosRankSum=-2.054;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,57:0.35:163
chr11	114421754	rs73016111	G	A	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=11.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.90;ReadPosRankSum=-2.275;SOR=1.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,60:0.35:173
chr11	114421768	rs75860289	A	T	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=9.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.930;SOR=1.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,68:0.35:196
chr11	114421769	rs76481835	C	G	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=10.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.540;SOR=1.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,69:0.34:202
chr11	114421773	rs74572030	A	G	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=10.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=1.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,69:0.33:211
chr11	114421789	rs113431368	A	AC	3336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.635;HP=2;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GTGAGGGCTTACTGTGTGATC;SOR=1.137;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=63;WE=114421807;WS=114421779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,89:0.36:245
chr11	114421799	rs79701489	C	T	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.271;NF=63;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.241;SC=ACTGTGTGATCTGCATCAAAG;SOR=0.924;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=225;TCF=141;TCR=84;TR=98;WE=114421807;WS=114421779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,96:0.39:249
chr11	114421817	rs73568242	G	T	3214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=3;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.192;NF=61;NR=42;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.602;SC=AAGGTGATTTGCTCCTACCTT;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=138;TCR=93;TR=103;WE=114421825;WS=114421807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,107:0.42:257
chr11	114421857	rs78453693	T	C	5193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.088;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.375;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,136:0.46:295
chr11	114421861	rs76118887	G	A	5277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=0.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.062;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,140:0.47:296
chr11	114421895	rs78257939	G	A	3931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=6;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.03;MQRankSum=1.103;NF=50;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=1.596;SC=GATCAGCAGCGTTTTTTGAAG;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=250;TCF=112;TCR=138;TR=115;WE=114421920;WS=114421885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,139:0.45:306
chr11	114421909	rs79082937	T	C	4756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.114;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,124:0.45:276
chr11	114421912	rs78658939	A	G	4731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=0.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.124;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,122:0.45:274
chr11	114421927	rs78842965	G	A	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=59;PP=1569;ReadPosRankSum=-0.961;SC=AGGACATGACGAATGTCCTAG;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=83;TCR=134;TR=94;WE=114421935;WS=114421917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,113:0.43:264
chr11	114421962	rs75409523	G	A	3069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,85:0.38:225
chr11	114421967	rs79109814	A	G	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,82:0.38:215
chr11	114422003	rs73568250	A	C	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=2446;ReadPosRankSum=1.219;SC=TATTTTATTTATAACTTGTAA;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=19;TCR=76;TR=34;WE=114422044;WS=114421993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr11	114422016	rs76270589	T	A	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr11	114422025	rs75158214	C	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=5.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.24;ReadPosRankSum=-1.713;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr11	114422029	rs78778953	T	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=-2.045;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr11	114422036	rs77481744	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=5.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr11	114422052	rs10790022	G	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=75;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=272;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GTGAGTCACTGTCTTCTTTCC;SOR=0.033;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=13;WE=114422060;WS=114422042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr11	114422068	rs76698432	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.571;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	114422068	.	CTA	TTC	445	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=80;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=8;PP=445;QD=49.8467874862;SC=TTTCCCTCTGCTAACTAACAA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=10;WE=114422078;WS=114422058;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	114422070	rs75429280	A	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.910;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	114452339	rs2292819	G	A	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=1057;ReadPosRankSum=0.161;SC=TAAGCCAGATGAACAGAGTGC;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=85;TCR=48;TR=69;WE=114452347;WS=114452329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,77:0.53:145
chr11	114465526	rs78608548	A	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=-1.482;SC=GCACAAAAACATACAACAAAA;SOR=1.685;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=114465534;WS=114465516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr11	114550320	rs17550338	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	114550334	rs1612325	A	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=292;SC=GCCATGTCGTACTTATTTGAT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=114550342;WS=114550324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	114569054	rs1712838	A	G	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=72;PP=2911;SC=ACCACTTGGGACACAGGAAGC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=139;WE=114569062;WS=114569044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	114574819	rs12364744	C	T	6564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=134;PP=2965;SC=AATTTATCCACGGAAAGGACA;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=90;TCR=134;TR=224;WE=114574827;WS=114574809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr11	114576626	rs1356428	A	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=28;PP=889;SC=GAAACAAAAAATATAAATGAC;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=114576634;WS=114576616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	115049180	rs17304149	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=75;SC=TCCTAATCAGCGGCTGCTAAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=115049188;WS=115049170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	115061533	rs4936322	T	C	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=30;PP=1542;SC=GCAAACCAAATGGCCATTTTG;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=78;WE=115061541;WS=115061523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	115080311	.	A	ATGG	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	115102224	rs11607928	A	G	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=52;PP=1604;SC=CAAATTAAACATATGTGCTTT;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=78;WE=115102232;WS=115102214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	116619390	rs377491137	A	T	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=47;PP=892;ReadPosRankSum=-0.351;SC=AAGGGGGGAAAGTAAGGAGTC;SOR=1.045;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=148;TCF=29;TCR=119;TR=54;WE=116619398;WS=116619380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,67:0.39:174
chr11	116628057	rs61905112	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=1.238;SC=TGTTGCCCAGGCTGGAGTACA;SOR=3.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=6;WE=116628065;WS=116628047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	116628401	rs2075295	T	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=374;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GAAATCCTTCTTTGCATATAG;SOR=0.772;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=23;WE=116628409;WS=116628391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr11	116631707	rs3825041	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=0.019;SC=TCTGATGTCCTCTAGGTGAAG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=15;WE=116631715;WS=116631697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	116633825	rs918144	C	T	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.914;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1419;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GAGAAGGATCCGGGGTGTCAT;SOR=0.533;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=208;TCF=116;TCR=92;TR=90;WE=116633833;WS=116633815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,98:0.41:239
chr11	116633862	rs11820589	G	A	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.722;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1545;ReadPosRankSum=0.684;SC=AGATGGATCCGGGGTGTCATG;SOR=0.978;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=230;TCF=108;TCR=122;TR=92;WE=116633870;WS=116633852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,117:0.40:289
chr11	116643465	.	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.840;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=273;ReadPosRankSum=0.561;SC=AAGGAACTGCCGGGCGGCCGA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=116643473;WS=116643455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	116655600	rs35120633	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=967;ReadPosRankSum=1.300;SC=CTGAGCGGGGGCATTGCATTC;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=67;WE=116655608;WS=116655590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,68:0.43:159
chr11	116657590	rs140050044	C	CA	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-0.917;SC=AACCCATACACAAACCACTAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=116657598;WS=116657587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	116658031	rs12285095	T	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=0.200;SC=TTCACAAATCTTATCTCACTT;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=16;WE=116658039;WS=116658021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
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chr11	116662579	rs651821	C	T	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=644;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CTTGCCATTACCTGCTCTGAG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=40;WE=116662587;WS=116662569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr11	116692334	rs5104	C	T	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=1967;ReadPosRankSum=2.567;SC=GGCCTGCGTGCTGACCTGGGT;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=111;TCR=132;TR=108;WE=116692342;WS=116692324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,114:0.43:265
chr11	116692694	rs5100	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=-0.027;SC=ACACGTGCTAGGACAGGTGAG;SOR=0.207;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=14;WE=116692702;WS=116692684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr11	116693464	rs5092	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.872;NF=25;NR=48;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.311;SC=CCCACATCACCGTGGCCACCT;SOR=0.898;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=164;TCF=61;TCR=103;TR=73;WE=116693472;WS=116693454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr11	116701153	rs2070668	T	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GAGCCCGTATTAGCAGGGAGC;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=116701161;WS=116701152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	116701535	rs4520	T	C	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1391;ReadPosRankSum=0.121;SC=TCATGCAGGGTTACATGAAGC;SOR=0.653;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=83;WE=116701543;WS=116701525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,101:0.59:170
chr11	116701674	rs2070666	T	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.309;SC=CACCCGCCCCTGCCCTGGTGA;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=6;WE=116701682;WS=116701664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	116703640	rs5128	G	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=858;SC=TCCATCCTGCGAGCTCCTTGG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=116703648;WS=116703630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	116703671	rs4225	G	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.271;SC=CTCCAGGGCTGCCCCTGTAGG;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=14;WE=116703679;WS=116703661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	116707684	rs2070665	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=19;PP=1664;SC=TCTGCCCCCTACCCCTGCCCT;SOR=1.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=70;WE=116707692;WS=116707674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	116708020	rs5070	A	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=1011;ReadPosRankSum=0.428;SC=TTAGGGAGAAAGCCCCCCGAT;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=61;WE=116708028;WS=116708010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr11	116718415	rs61905145	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=448;ReadPosRankSum=0.803;SC=AAGGAGCCCAGGCAAAAGACA;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=24;WE=116718423;WS=116718405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr11	116720089	rs2289893	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=0.537;SC=CAAGGGACAATGGGCAAGGCT;SOR=0.818;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=116720097;WS=116720079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	116728630	rs12225230	G	C	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=566;ReadPosRankSum=0.125;SC=CAAAGATTCAGGGTCCCCAGG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=47;WE=116728638;WS=116728620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,51:0.36:141
chr11	116732512	rs2075292	G	T	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=35;PP=1436;SC=AAGGGTACCAGGCTATCGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=116732520;WS=116732502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	116732856	rs484646	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CAAAATGCACAGGCAAATCAG;SOR=1.015;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=19;WE=116732864;WS=116732846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr11	116744389	rs11216169	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=313;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GACCATGAGATGAGGGGAAGG;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=29;WE=116744408;WS=116744379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr11	116766899	rs10892044	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=348;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CATCACTAAATTCCTGGGATA;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=25;WE=116766907;WS=116766889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr11	116824884	rs511676	T	G	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=63;PP=1894;SC=TACAGGAAGATAAACTAATGA;SOR=2.110;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=83;WE=116824892;WS=116824874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	116968798	rs7128071	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=335;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CCCGGCTGGGGGGCGCGGACC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=23;WE=116968806;WS=116968788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr11	117015189	rs113560866	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=376;ReadPosRankSum=1.314;SC=GGGTCGGAAGGGGCTGCGAGG;SOR=0.245;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=12;WE=117015203;WS=117015179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr11	117015195	rs2735183	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=783;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GAAGGGGCTGCGAGGTGTTAT;SOR=1.491;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=18;WE=117015203;WS=117015179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr11	117030581	rs1871757	T	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=494;SC=TGTTGAGAGTTCAAGCATGGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=117030589;WS=117030571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	117030624	rs35139041	AT	A	1482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=12;PP=690;SC=CCAGTTAATAATTTTTTTTTT;SOR=2.644;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=40;WE=117030632;WS=117030614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	117032125	rs3736120	G	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=188;SC=TACTGTCATTGCTTGAGAATA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=117032133;WS=117032115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	117034388	rs3057863	CAAAAAA	C	1706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=23;NR=4;PP=679;SC=GACCCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.312;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=27;WE=117034401;WS=117034378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	117034619	rs7122944	G	T	6772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=140;PP=2965;SC=GTATGTAGTCGTTGGTGGGTA;SOR=1.429;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=75;TCR=141;TR=215;WE=117034627;WS=117034609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	117034729	rs10790175	T	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=43;PP=1243;SC=TATCATACTTTCGTTGACCTC;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=117034737;WS=117034719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	117042238	rs10750103	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.662;NF=10;NR=6;PP=221;ReadPosRankSum=2.054;SC=GGCAACAGAGCGAGACTCTTG;SOR=0.169;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=16;WE=117042246;WS=117042228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	117042377	rs4936367	G	A	3626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=55;PP=2124;SC=CTCAGAGATAGTGAGACTAGA;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=114;WE=117042385;WS=117042367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	117052069	rs35248926	GTCTCT	G	6923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=47;PP=2967;SC=AGGGCTCATAGTCTCTGGAGC;SOR=1.594;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=96;WE=117052081;WS=117052059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	117053165	rs7946257	A	G	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=10;PP=1623;SC=ATAGGGGACTATTCCCTTCTA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=65;WE=117053173;WS=117053155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	117059347	rs90192	C	T	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=5;PP=1209;SC=ATAATTGTTACAATTGCCTCA;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=117059355;WS=117059337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	117059552	rs474339	G	A	10812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=181;PP=2965;SC=GGTCTGACCCGTGGGCCTGGC;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=143;TCR=181;TR=324;WE=117059560;WS=117059542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr11	117064506	rs115787357	T	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=329;ReadPosRankSum=1.928;SC=AAAGGCTGGGTGGGACAGCGG;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=17;WE=117064514;WS=117064496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr11	117064693	rs521171	C	G	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=52;PP=1654;SC=AGCACTCACCCTCAGGCTCCT;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=117064701;WS=117064683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	117078338	rs199953984	A	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQRankSum=-6.634;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,26:0.29:91
chr11	117078378	rs2269396	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.28;MQRankSum=-8.604;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,51:0.28:185
chr11	117078486	rs373961831	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.62;MQRankSum=-4.003;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,38:0.21:184
chr11	117090545	rs3882895	T	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=1538;ReadPosRankSum=0.336;SC=TGTGCACCTATAGTCCCGGCT;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=26;TCR=79;TR=41;WE=117090566;WS=117090535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr11	117090558	rs74830	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=1538;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TCCCGGCTACCTGGGAGGCCC;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=36;WE=117090566;WS=117090535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr11	117095361	rs236919	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=443;ReadPosRankSum=0.125;SC=GCAGTTCTCCCGGGACTGTAT;SOR=0.826;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=34;WE=117095369;WS=117095351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr11	117096652	rs2277287	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=276;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CTCACCTGCAGCTGTAGATGT;SOR=0.168;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=19;WE=117096660;WS=117096642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr11	117097952	rs2306473	C	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=992;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CTGCACATCGCGTGCCATGGT;SOR=0.618;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=62;WE=117097960;WS=117097942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,71:0.42:171
chr11	117100029	rs4938362	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=395;ReadPosRankSum=2.003;SC=ATAGTCAAAAGCCCATTAAAG;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=22;WE=117100037;WS=117100019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr11	117100594	rs500389	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=337;ReadPosRankSum=-1.009;SC=GAAAAAGGATATGGAAGAGAT;SOR=0.356;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=24;WE=117100602;WS=117100584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr11	117109270	rs678837	G	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=578;ReadPosRankSum=-2.353;SC=CTAGTAGTTAGGTTGAAAGTA;SOR=0.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=33;WE=117109278;WS=117109260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr11	117110740	rs650585	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=1.426;SC=AAGCTTACTACCTCACAAAGC;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=117110748;WS=117110730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr11	117152540	rs505045	G	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=602;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GTTCATTGATGTCTTCTCCAG;SOR=0.633;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=37;WE=117152548;WS=117152530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
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chr11	117163765	rs490460	C	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=468;ReadPosRankSum=-1.214;SC=CCTTGGTTTTCTTACCTCCTT;SOR=0.902;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=33;WE=117163773;WS=117163755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
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chr11	117252489	rs897836	T	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.249;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=471;ReadPosRankSum=-1.174;SC=AAGAAGAGCCTCCCCAGGGCC;SOR=0.391;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=28;WE=117252497;WS=117252479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr11	117258198	rs501776	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=383;SC=GACACCCTCTTAGCCTGGGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=117258206;WS=117258188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	117261358	rs60684637	GA	G	109.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.7455;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.140;NF=4;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.431;SC=TCTCCAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=117261366;WS=117261348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr11	117261853	rs494553	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=371;ReadPosRankSum=1.728;SC=CGGAGAAGAGCGAGCAGGCTG;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=24;WE=117261861;WS=117261843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr11	117263103	rs478693	T	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=695;ReadPosRankSum=-1.347;SC=CGAGCCTCTCTCTCCAGCCCT;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=41;WE=117263111;WS=117263093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr11	117266312	rs2305830	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=297;ReadPosRankSum=0.343;SC=AAGGAGCACACCCACCTGTTG;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=22;WE=117266320;WS=117266302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr11	117266466	rs483837	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=1.289;SC=CACTTAGCCCTGCTGGCTGCC;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=117266474;WS=117266456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	117266722	rs693181	C	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=540;ReadPosRankSum=0.355;SC=ACCCCTCCCCCCCATCGCCAG;SOR=0.700;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=33;WE=117266730;WS=117266712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr11	117266754	rs693147	A	C	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=38;PP=2155;SC=CCTCTCACTCATCTTTCCTTC;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=109;WE=117266762;WS=117266744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	117267884	rs573455	A	G	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=78;PP=2725;SC=TTCCTTGTGCAGCAGACACGC;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=136;WE=117267892;WS=117267874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	117282800	rs522885	G	T	10898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=187;PP=2965;SC=CTCTCTTCTCGTCAACACCCA;SOR=1.035;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=320;TCF=133;TCR=187;TR=320;WE=117282808;WS=117282790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr11	117282979	rs521099	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=299;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGAAAGCACCCTCCTTCCCCC;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=16;WE=117282987;WS=117282969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr11	117303393	rs880615	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-0.586;SC=ATTGTGATCACTGCTCACTGC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=117303401;WS=117303383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	117303858	rs11216382	T	C	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=885;ReadPosRankSum=0.072;SC=ACTCACCCAGTTGCTTGATGC;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=48;WE=117303866;WS=117303848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr11	117306291	rs661789	G	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=408;SC=TGTGAGCCAGGGAAGGGGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=117306299;WS=117306281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	117309581	rs61905269	G	A	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.549;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.427;SC=ATCTTCCCCCGCATCCAGACC;SOR=0.474;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=118;TCR=82;TR=101;WE=117309589;WS=117309571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,117:0.52:227
chr11	117332343	rs2298766	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.00;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr11	117332352	rs588048	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.65;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	117335722	rs538847	T	C	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=983;ReadPosRankSum=-0.261;SC=GATTGAAGGCTTGGACCACCA;SOR=0.642;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=64;WE=117335730;WS=117335712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr11	117375596	rs2276343	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TCCGTTCCCCGTCCCTGCCCT;SOR=0.990;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=14;WE=117375604;WS=117375586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr11	117389517	rs3819210	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=1.415;SC=TCACCAAGCCATGGAGAGACG;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=13;WE=117389525;WS=117389507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	117391966	rs2276340	G	A	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=42;PP=1473;ReadPosRankSum=0.189;SC=TGCTGAGCCCGCGGATGGAGA;SOR=0.823;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=245;TCF=141;TCR=104;TR=103;WE=117391974;WS=117391956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,126:0.42:301
chr11	117395481	rs2276339	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=1.656;SC=GGCGCCCTCAGAGGTTACTGG;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=22;WE=117395489;WS=117395471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr11	117395497	rs55642294	C	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.538;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=670;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ACTGGGGCTGCAGAAGGGGCT;SOR=0.330;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=45;WE=117395505;WS=117395487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr11	117395620	.	C	A	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1297;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CGCTGATGGTCAGCCCTGTGA;SOR=0.575;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=89;WE=117395628;WS=117395610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,103:0.58:177
chr11	117403235	rs3741280	G	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=771;ReadPosRankSum=0.922;SC=AAAAACCTGTGTTCTGGAGAC;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=83;TCR=97;TR=64;WE=117403243;WS=117403225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,79:0.37:213
chr11	117580254	rs2508559	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=436;SC=TTGCGGGGGTTGGGGGGAGTG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=117580262;WS=117580244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	117580356	rs605500	C	T	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=20;PP=914;SC=GAGAGGGTTACAGAACCATAA;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=117580364;WS=117580346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	117580509	rs655086	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=13;PP=414;SC=GCGGCTGTGAAAAAGAATGGA;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=117580517;WS=117580499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	117580585	rs604245	A	G	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=161;SC=AAGACTGGCCATGAGACAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=117580593;WS=117580575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	117667688	rs113876980	C	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=853;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CCCGCCTCGCCGCCAGCCGCG;SOR=0.631;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=50;WE=117667696;WS=117667678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr11	117668060	rs112872285	G	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	117691774	rs7483165	T	C	277.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.13;ReadPosRankSum=0.439;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr11	117693255	rs529623	T	C	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=75;PP=2958;SC=GCTGTCTCTCTCCGCAGCCTG;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=146;WE=117693263;WS=117693245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	117698762	rs7117314	G	A	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=33;PP=1118;SC=AGGAGTGCAGGAGAGCAGGGA;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=117698770;WS=117698752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	117707191	rs10790214	T	C	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=23;PP=1047;SC=TCTCCTGCTTTAGGCTCCCAA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=117707199;WS=117707181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	117707229	rs10892184	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=4.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=1.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr11	117709028	rs516655	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=442;ReadPosRankSum=-1.583;SC=AAAACACTTCGGCTGCCTCTG;SOR=0.872;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=36;WE=117709036;WS=117709018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr11	117711232	rs496164	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=0.055;SC=TGTGGGATGCATGGGACAGAG;SOR=0.084;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=26;WE=117711240;WS=117711222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr11	117712887	rs473057	G	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=474;ReadPosRankSum=0.844;SC=AGAGGTGCACGGTAGGGCGGG;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=22;WE=117712895;WS=117712877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr11	117772848	rs491822	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=323;ReadPosRankSum=-0.926;SC=GGTGGGAGTCCGATGGTGCCC;SOR=0.638;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=17;WE=117772856;WS=117772838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr11	117773110	rs494457	G	C	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=414;ReadPosRankSum=1.316;SC=CAAGGAGGGAGAGCAAAGGGA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=117773118;WS=117773100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr11	117774146	rs2186627	C	G	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=804;ReadPosRankSum=0.097;SC=GTAGGTCCACCCTTTTTCAAC;SOR=0.420;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=56;WE=117774154;WS=117774136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr11	117774291	rs2845712	A	C	6249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=87;PP=2965;SC=TCTGCCTACAACCTGGGTGCT;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=111;TCR=88;TR=198;WE=117774299;WS=117774281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	117776471	rs3802873	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=343;ReadPosRankSum=1.071;SC=GACCTCCAGACGTCAGTGAAG;SOR=0.511;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=28;WE=117776479;WS=117776461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr11	117776526	rs3802872	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=465;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AAGGAGCACAACCACTCTGGG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=24;WE=117776534;WS=117776516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr11	117781435	rs2155194	A	G	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=17;PP=1255;SC=AACACTGGAGAGAGATATACC;SOR=1.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=117781443;WS=117781425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	117781618	rs2155195	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=636;SC=CCCTTTCCCCATGTGACATTG;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=117781626;WS=117781608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	117782638	rs2277288	A	G	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=25;PP=819;SC=CAAGTCCTCCAGCAGGCTAGA;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=117782657;WS=117782628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	117784434	rs11605749	C	G	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=33;PP=1317;SC=TTGAGACACCCTATGAAGAGC;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=75;WE=117784442;WS=117784424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	117785260	rs4936410	T	C	5335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=97;PP=2597;SC=AGCTGGGTCATGGCCAGCCCC;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=68;TCR=97;TR=165;WE=117785268;WS=117785250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	117789312	rs201746372	CGGGCTGGAGATGCCT	C	5756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=89;PP=2933;SC=CGGAGATGCCCGGGCTGGAGA;SOR=1.789;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=168;TCF=18;TCR=150;TR=102;WE=117789334;WS=117789302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	117790658	rs10790220	C	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=33;PP=935;SC=ATGGGGCCCCCTGGCCCTGCA;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=117790666;WS=117790648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	117790674	rs12418028	A	G	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=789;SC=CTGCAGGGCCAGGAACACCTT;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=117790682;WS=117790664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	117799804	rs722729	C	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=12;PP=1487;SC=AGCAGCTTCTCCTCCCAGGGG;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=117799812;WS=117799794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	117863829	rs2508450	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=395;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TTGACAAACCTGTGGCCAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=19;WE=117863837;WS=117863819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr11	117864047	rs2256111	A	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TGGCCCCCGCAAATGACACAT;SOR=0.750;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=133;TCF=44;TCR=89;TR=62;WE=117864055;WS=117864037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr11	117869670	rs2229113	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.040;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GCTGGGAAACAGGGAGCCCCC;SOR=1.101;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=74;WE=117869678;WS=117869660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
chr11	117965530	rs2276122	A	G	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1131;ReadPosRankSum=0.937;SC=TTTTCCTTCAATTACAGGATC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=81;WE=117965538;WS=117965520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,87:0.56:154
chr11	117965595	rs2276123	C	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=447;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GGCTTTCATTCGTCCACCTTA;SOR=0.725;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=32;WE=117965603;WS=117965585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr11	117965646	rs2276125	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.223;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=147;ReadPosRankSum=-0.490;SC=TAAGCCACTCGCGCCTGGCCC;SOR=1.668;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=13;WE=117965654;WS=117965636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr11	117973673	rs2276129	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=325;ReadPosRankSum=1.998;SC=GCCCAAGTCTGTGTGCTACCA;SOR=0.906;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=21;WE=117973681;WS=117973663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr11	117979744	rs10892216	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TTGGGCTTGTCGGTCAATGCC;SOR=1.368;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=12;WE=117979752;WS=117979734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr11	117979814	rs10892217	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	117982495	rs1941635	T	G	7489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=139;NR=93;PP=2965;SC=GTGGTGGGTGTGGAGGAGGCC;SOR=1.069;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=139;TCR=93;TR=232;WE=117982503;WS=117982485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr11	117986152	rs7925897	A	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=-1.622;SC=AGGAAAGGATAGTCAGATAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=117986160;WS=117986142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	117988082	rs642215	T	C	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=42;PP=1940;SC=GCATCGTTAGTTGGGGCTATG;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=97;WE=117988090;WS=117988072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	117988223	rs643014	G	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=43;PP=1530;SC=TCTACCTGGGGGGTGCCAATC;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=73;WE=117988231;WS=117988213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	117996119	rs7944738	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=474;SC=CATCGCCTGACCACCTGTGTT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=117996127;WS=117996109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	118037813	rs8192613	G	T	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=79;PP=2465;SC=TGGAAAGGAAGCAGAGCCACT;SOR=1.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=114;WE=118037821;WS=118037803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	118067426	rs648947	A	G	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=670;SC=CACCTGGCTCAGCTGAGGCCA;SOR=2.208;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=118067434;WS=118067416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	118067621	rs951657	A	G	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=124;PP=2965;SC=CCTATTTGCTAGGCATCGACC;SOR=0.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=94;TCR=124;TR=218;WE=118067629;WS=118067611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr11	118068949	rs1617182	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=49;PP=1411;SC=GCCAGGGCTACCCGGCTCACC;SOR=3.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=59;WE=118068957;WS=118068939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	118071097	rs1626649	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=185;SC=GAGAATGGCATAAGTAGGGCC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=118071105;WS=118071087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	118074117	rs1793173	A	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=539;SC=AGGTCCCTCAATGCTCCCCAG;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=118074125;WS=118074107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	118074337	rs1793174	A	G	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=44;PP=1648;SC=GGAGTACTCCACAGACATCCT;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=118074345;WS=118074327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	118081270	rs143034248	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=-0.743;SC=CCCTTTGAGGCGGATTTCACA;SOR=0.773;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=16;WE=118081278;WS=118081260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr11	118081345	rs17121881	A	T	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=32;PP=1567;SC=ATTGCATAAGATGTCCCCCAT;SOR=1.053;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=81;WE=118081353;WS=118081335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	118081468	rs17121882	C	T	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=44;PP=1367;SC=AAAAGAGGTGCCAGACCGAGG;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=118081476;WS=118081458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	118083664	rs1715429	A	G	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=92;PP=2965;SC=TTGCTCTTAAATCTCCCACTG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=94;TCR=92;TR=186;WE=118083672;WS=118083654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	118107805	rs1793140	A	G	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=33;PP=2204;SC=GAATATTATGATGCACATCTG;SOR=1.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=102;WE=118107813;WS=118107795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	118108003	rs1793141	G	A	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=80;PP=2545;SC=TGAGAGAAAAGGTTAACTTGG;SOR=1.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=110;WE=118108011;WS=118107993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	118110977	rs2853006	T	C	6237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=87;PP=2965;SC=CTATAGTAAGTTTGTCAGTGA;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=181;WE=118110985;WS=118110967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr11	118134597	rs4936426	C	T	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=592;SC=GTGCCTGAATCACTGGCAGCT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=118134605;WS=118134587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	118134785	rs1624780	T	G	6091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=99;PP=2965;SC=AGGAGGAAACTCTGAGAGAAG;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=98;TCR=99;TR=197;WE=118134793;WS=118134775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	118175540	rs2231441	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=-1.236;SC=AGCATTGGGAACAATGGCCCC;SOR=0.519;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=118175548;WS=118175530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr11	118178007	rs1126924	C	T	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TTCTAGTTGGCGTTTGGGGGC;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=89;WE=118178015;WS=118177997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,105:0.60:174
chr11	118179197	rs1599810	A	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.56;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	118179197	.	ATGG	GTGA,GTGG	402	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2,11;NR=9,31;PP=147,402;QD=18.2243522602;SC=GTTTTCAAATATGGAATGAAA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=11,42;WE=118179208;WS=118179187;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.26:42
chr11	118179200	rs1599809	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr11	118182801	rs1945764	G	A	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=424;SC=CACTAGAAAAGTTTTACCTAC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=118182809;WS=118182791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	118182829	rs1945765	T	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=0.505;SC=ACTTAAACCATGATATTTTCT;SOR=0.169;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=10;WE=118182837;WS=118182819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr11	118183733	rs28423005	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TGGTACCACACGGCATCAGTG;SOR=1.179;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=118183741;WS=118183723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	118185140	rs2298821	T	C	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GGGAATGAAATGTTTCCCCTC;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=37;WE=118185148;WS=118185130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr11	118209960	rs2276424	A	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.870;SC=AGGAGAAGAGAAAACGGTCAG;SOR=1.002;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=9;WE=118209968;WS=118209950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr11	118210106	rs2276423	G	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=0.320;SC=CATTCAGTGTGAGCCTCTCTA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=7;WE=118210114;WS=118210096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr11	118210424	rs67065773	TAC	T	1191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.726;NF=29;NR=7;PP=1255;ReadPosRankSum=0.413;SC=AGCTCACTGGTACACACACAC;SOR=0.643;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=36;WE=118210435;WS=118210414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr11	118211797	rs7129048	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=365;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CCTGCTCCATTGACAACCAAG;SOR=0.849;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=24;WE=118211805;WS=118211787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr11	118215075	rs150376137	AGGCT	A	1598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=8;PP=1139;SC=GCTGCTGCACAGGCTGGCTGG;SOR=1.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=23;WE=118215086;WS=118215065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	118221137	rs3753060	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.268;SC=AGGATCTTCCCTTGCCCTGCC;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=118221145;WS=118221127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	118221349	rs3753059	TG	CT	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.391;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=1368;ReadPosRankSum=1.015;SC=TCGTCCTTGCTGTTGGGGTCT;SOR=0.443;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=40;WE=118221358;WS=118221339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,51:0.43:119
chr11	118221474	rs1561966	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=412;SC=TGTACCCAATGGAAGAGACTG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=118221482;WS=118221464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	118239266	rs2276421	G	A	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=602;ReadPosRankSum=-2.003;SC=CATCTTCTTGGTTACATTTAT;SOR=0.331;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=100;TCF=76;TCR=24;TR=39;WE=118239274;WS=118239256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr11	118240332	rs11216860	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=1.401;SC=CTCCAACTTATGCTTGTGTCC;SOR=0.582;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=8;WE=118240340;WS=118240322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	118245971	rs143426471	C	CTG,CTGTGTGTG	1180.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=23,23;PP=715,921;ReadPosRankSum=0.419;SC=CTTCTCAAAACTGTGTGTGTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=23,23;WE=118245979;WS=118245961;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.59:29
chr11	118246021	rs112243842	T	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=0.618;SC=CCTTATCCTTTTTCACAGAGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=118246029;WS=118246011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr11	118250586	rs7949539	A	G	119.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTTTGGAGAAACAACTCAAAC;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=6;WE=118250594;WS=118250576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr11	118257048	rs3216092	G	GT	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.111;SC=ATGGTCCCTCGTTTTCCCAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=118257056;WS=118257038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	118301616	rs11288713	AT	A	1191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.66;QD=23.83;SOR=4.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr11	118355642	rs9332801	A	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.320;SC=CTGTTCCTATAACACCCAGGG;SOR=0.803;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=65;WE=118355650;WS=118355632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,76:0.57:133
chr11	118362414	rs562780	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=-2.771;SC=TTCCTCTCTCTCATTCTTCAG;SOR=1.356;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=15;WE=118362422;WS=118362404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr11	118365168	rs2276045	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=482;ReadPosRankSum=0.021;SC=TAATTACCCTGTGAATACAAT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=26;WE=118365176;WS=118365158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr11	118365263	rs9332819	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=106;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TTGAGAGGAACTTGGTGAGGT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=6;WE=118365271;WS=118365253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	118368665	rs7107305	A	G	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=29;PP=1745;ReadPosRankSum=1.182;SC=CTGGTCGTTTACTATATATTG;SOR=0.795;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=108;TCR=50;TR=97;WE=118368673;WS=118368655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,116:0.62:186
chr11	118368822	rs7123835	T	G	2990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=68;PP=1925;ReadPosRankSum=0.780;SC=ATGAAAGAGATTCCCTCTCAG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=213;TCF=93;TCR=120;TR=115;WE=118368830;WS=118368812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,131:0.53:248
chr11	118373861	rs2071702	C	T	3690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=73;PP=2473;ReadPosRankSum=0.377;SC=CCATTATCAACGAACATATGG;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=255;TCF=135;TCR=120;TR=149;WE=118373869;WS=118373851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,164:0.58:282
chr11	118380007	rs201876561	T	TA	333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.878;NF=0;NR=18;PP=232;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TTTCTACATTTAAAAAAAAAA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=18;WE=118380015;WS=118379997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	118402962	rs45558732	G	T	3339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=2062;ReadPosRankSum=0.955;SC=GGGTGGCAGGGGGGCCTGGCA;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=119;TCR=102;TR=131;WE=118402970;WS=118402952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,153:0.60:255
chr11	118405343	rs512849	G	A	7992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=129;PP=2965;SC=ACACCCTCCCGTTCCTCCAAG;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=117;TCR=129;TR=246;WE=118405351;WS=118405333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr11	118443063	.	GC	G	57	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=57;QD=22.0;SC=CACAGGCCCCGCCCCCCCCCC;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=3;WE=118443071;WS=118443053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,3:0.33:9
chr11	118500963	rs680465	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GCCTGCGGGAGAAGGCAACAA;SOR=0.829;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=118500971;WS=118500953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	118502492	rs517124	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.225;SC=GTGGGGGTTGCGGGGGGGCAG;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=118502500;WS=118502482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	118505676	rs58507527	GT	G	3223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=37;PP=2020;SC=GAGGCACCTGGTAGGCCCGCC;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=118505684;WS=118505666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	118509668	rs483598	A	G	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=827;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CCGTGCAGGAATCAGAACGCC;SOR=0.850;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=136;TCF=89;TCR=47;TR=51;WE=118509676;WS=118509658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,60:0.36:166
chr11	118515352	rs201097422	TC	T	3369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.481;NF=21;NR=62;PP=2493;ReadPosRankSum=-0.740;SC=CTGCCTGGGGTCCCCCACGCC;SOR=0.614;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=187;TCF=43;TCR=144;TR=83;WE=118515360;WS=118515342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,130:0.48:271
chr11	118516619	rs148657742	T	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=793;ReadPosRankSum=1.603;SC=GGGCCTGTGCTCCACCCCAAG;SOR=0.526;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=41;WE=118516627;WS=118516609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr11	118518964	rs11314049	GC	G	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=420;SC=CCCCAAAACAGCACCCACCAG;SOR=4.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=118518972;WS=118518954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	118529017	rs6589669	T	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=12;PP=465;SC=GCAGGAGGCTTAGCAGGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=25;WE=118529025;WS=118529007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	118529044	rs11448549	C	CG	1465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=525;SC=GAAGGGTGGCCCCAGGCAGTG;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=118529052;WS=118529034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	118529069	rs6589670	G	C	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	118529078	rs6589671	G	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.11;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	118529595	rs745663	A	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1226;ReadPosRankSum=0.974;SC=GGGTGCAGGGAGGGCTTGGGC;SOR=0.465;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=178;TCF=83;TCR=95;TR=78;WE=118529603;WS=118529585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,80:0.41:193
chr11	118529703	rs2276064	G	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=702;ReadPosRankSum=1.953;SC=TCCTGGGCCCGACGTAAAGGT;SOR=1.135;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=47;WE=118529711;WS=118529693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,63:0.45:140
chr11	118622744	rs6589689	G	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=45;PP=1683;SC=CACAAAGAGAGGAGCATTCCC;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=84;WE=118622752;WS=118622734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	118625609	rs580079	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=1.415;SC=AAAAAACATGCGTTTAAAAAT;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=14;WE=118625617;WS=118625599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	118651809	rs555649	T	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=716;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TTATTCTACTTGTATTTTACA;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=188;TCF=87;TCR=101;TR=66;WE=118651817;WS=118651799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,83:0.36:229
chr11	118754649	rs10892307	C	G	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1536;ReadPosRankSum=0.074;SC=GCCGGCACAGCCATGAACTAC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=87;WE=118754657;WS=118754639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,104:0.64:162
chr11	118757191	rs1790192	G	A	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.11;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr11	118757219	rs1623316	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=310;ReadPosRankSum=0.723;SC=TAATTCTCATCAATGAAAGGT;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=19;WE=118757227;WS=118757209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr11	118768466	.	CT	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=2.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=2.124;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,15:0.15:100
chr11	118769032	rs11217081	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	118769442	rs7104819	A	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=920;ReadPosRankSum=1.818;SC=ACATCTGTCCAGGGTGGCACA;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=52;WE=118769450;WS=118769432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr11	118770321	rs11217083	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.599;SC=GCCAGAGGTCAAAGTCTTCAC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=118770329;WS=118770311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	118781601	rs11376918	C	CA	8674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=116;PP=2971;SC=GACAGGGAGACAAGACACGCA;SOR=1.080;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=20;TCR=120;TR=136;WE=118781609;WS=118781591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	118781638	rs11376919	C	CG	5983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=102;PP=2974;SC=AGAGGCGCGCCGAGGCCAGGG;SOR=1.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=6;TCR=102;TR=108;WE=118781646;WS=118781628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	118781655	rs11376920	C	CG	4432.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=83;PP=2971;SC=AGGGAAGCGCCGCCGGAGCGG;SOR=1.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=7;TCR=83;TR=90;WE=118781663;WS=118781645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	118828942	rs623500	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TCCCGCAAGTAAGGAGGTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=22;WE=118828950;WS=118828932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr11	118842745	rs36158515	A	AG	2027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=47;PP=2025;SC=GGCGTGGCGGAGGGTGGCCTA;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=47;WE=118842753;WS=118842735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	118842780	.	A	AG	880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=923;SC=CCCGGGGCAGACGGCTCCCCA;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=118842788;WS=118842770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	118868842	rs58467585	A	AG	332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=4;PP=447;SC=CCGAGGGGTCAGGGTCAGAGG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=118868850;WS=118868832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	118889058	rs142437389	C	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AAAAAGGAAGCGCTGCTCAGA;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=70;WE=118889066;WS=118889048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,79:0.37:215
chr11	118889114	rs10892321	A	G	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=84;PP=2921;SC=TCCGGGGCAAAAGGCGGAGCC;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=143;WE=118889122;WS=118889104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	118898435	rs56966114	AC	A	9192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=112;PP=2972;SC=AGACAACCACACCACAGTGCC;SOR=0.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=51;TCR=115;TR=162;WE=118898443;WS=118898425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr11	118915755	rs13929	G	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.107;NF=13;NR=3;PP=265;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AAAGGAGCTGGATGGGGAATG;SOR=1.371;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=16;WE=118915765;WS=118915745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr11	118915757	rs11363127	TG	T	1484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=10;PP=1000;SC=AGGAGCTGGATGGGGAATGGG;SOR=1.730;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=26;WE=118915765;WS=118915745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	118915944	rs1043314	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=205;ReadPosRankSum=0.282;SC=GAAACTCCCCAGCAACCTGAT;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=18;WE=118915952;WS=118915934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr11	118919132	rs2276060	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=614;ReadPosRankSum=0.334;SC=CAGAGGCAAGGCCCACAGAGC;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=113;TCF=68;TCR=45;TR=39;WE=118919140;WS=118919122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,44:0.36:123
chr11	118919206	rs568922	T	C	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=65;PP=2965;SC=CAAATATGAATGCTTCCAAGC;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=160;WE=118919214;WS=118919196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	118920050	rs35384663	C	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=511;ReadPosRankSum=-2.005;SC=CCTGCTTGGACTGTGGCAATC;SOR=0.971;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=42;WE=118920058;WS=118920040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr11	118920112	rs670192	A	G	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=39;PP=1272;SC=CCTTGGGAGCACCAGTCAAGA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=118920120;WS=118920102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	118920453	rs673768	T	C	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=77;PP=2965;SC=CACACAAGTATATTCTCTCCC;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=152;WE=118920461;WS=118920443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr11	118921922	rs200691655	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=733;ReadPosRankSum=1.328;SC=GGGGGACCCACCCCAGCCCAT;SOR=0.842;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=42;WE=118921930;WS=118921912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr11	118922200	rs1804690	G	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=607;ReadPosRankSum=0.868;SC=TGATGTGGAAGTTGAAATCAT;SOR=0.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=40;WE=118922208;WS=118922190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr11	118925341	rs538478	G	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=787;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GCTCGGCCTGGTTGAAGAAGA;SOR=0.908;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=55;WE=118925349;WS=118925331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,70:0.44:160
chr11	118926720	rs470679	A	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=17;PP=1130;SC=CCCAAGCTCAATTCCCATCAT;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=118926728;WS=118926710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	118927013	rs57740718	T	TC	4967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.128;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.190;NF=30;NR=65;PP=2977;ReadPosRankSum=0.162;SC=AGCCTACTTCTCCCTTCTCCC;SOR=0.331;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=95;WE=118927021;WS=118927003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr11	118938880	rs584115	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.669;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr11	118938880	.	ATC	GTT	116	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=116;QD=16.9467874862;SC=AAGGAAGTCCATCTCCTAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=10;WE=118938890;WS=118938870;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr11	118938882	rs670526	C	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=454;SC=GGAAGTCCATCTCCTAACTTG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=118938890;WS=118938870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	118939939	rs5795166	T	TC	1888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=15;PP=1652;SC=CTTGCCACGTTCCTACAGCTT;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=39;WE=118939947;WS=118939929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	118940957	rs1784302	C	G	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TCACAGATGGCAGTGTTACAT;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=70;WE=118940965;WS=118940947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr11	118942134	rs45609135	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=280;ReadPosRankSum=2.333;SC=GTGATCTCTGGTTATATATTT;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=16;WE=118942142;WS=118942124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	118942638	rs1614264	A	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.609;SC=ATGCCTGGATACTGCCAATCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=118942646;WS=118942628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	118944675	rs3825061	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=0.256;SC=AGTCTGGAGGCACTTTGGGAT;SOR=0.169;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11;WE=118944683;WS=118944665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr11	118947634	rs540261	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=677;ReadPosRankSum=-1.324;SC=AGCCATCCTACGTGATCCGCA;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=47;WE=118947642;WS=118947624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,56:0.35:159
chr11	118949083	rs1177563	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=-1.249;SC=AAGACAGTTCGTGCCGTCTCC;SOR=0.376;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=18;WE=118949091;WS=118949073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	118949331	rs1177562	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=875;ReadPosRankSum=-0.450;SC=GTCGCTTCTGCGACGTCTTTG;SOR=0.448;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=48;WE=118949339;WS=118949321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr11	118949799	rs1168568	G	A	5373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=1.393;SC=AGTGCCACACGTGGTTGATTG;SOR=0.424;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=317;TCF=173;TCR=144;TR=192;WE=118949807;WS=118949789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,234:0.60:392
chr11	118952173	rs15818	A	G	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1671;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CTGCAGCTCAAGTGCTCCAAT;SOR=0.510;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=110;WE=118952181;WS=118952163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,127:0.55:231
chr11	118952371	rs4614	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.945;SC=GTGGAGGACCAAGAGAACAGA;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=9;WE=118952379;WS=118952361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	118955679	rs589925	C	T	3809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.377;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=58;PP=2353;ReadPosRankSum=1.719;SC=GGCCGGAGCCCCCGGCTTCCC;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=319;TCF=202;TCR=117;TR=153;WE=118955694;WS=118955669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,181:0.47:386
chr11	118958869	rs1006195	G	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=-1.810;SC=AGGTTCTGAAGTTCCTTTCTT;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=17;WE=118958877;WS=118958859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	118959331	rs17075	G	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=626;ReadPosRankSum=0.908;SC=ACTAATCCAAGTCTCTACCCG;SOR=1.097;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=36;WE=118959339;WS=118959321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr11	118959732	rs549893	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=0.700;SC=CGTAGCACAGCGCTAGGCTCA;SOR=0.636;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=8;WE=118959740;WS=118959722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr11	118967758	rs643788	T	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=928;ReadPosRankSum=-1.577;SC=GAGAAGGTGATGGCACTGCCC;SOR=0.422;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=63;WE=118967766;WS=118967748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr11	118968959	rs10544271	TAG	T	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-1.218;SC=TACTACTGGGTAGAGAGAAAT;SOR=0.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=118968968;WS=118968949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	118970875	rs10892330	T	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.05;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr11	118978411	rs7940073	G	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=423;SC=GGGGCAGCGGGTGAGCCCCAG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=118978419;WS=118978401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	118981025	rs617948	A	G	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=765;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GGATCTAAGGATTGGTTTCAG;SOR=0.672;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=43;WE=118981033;WS=118981015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr11	118983681	rs682795	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=1.292;SC=TTAATTCCAACTCCCCCTGTT;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=15;WE=118983689;WS=118983671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	118984287	rs4938630	A	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=5;PP=390;SC=CTCTGAAGCAACTCCCAGCTC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=118984295;WS=118984277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	118985151	rs595782	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=424;ReadPosRankSum=0.132;SC=CTCGAGCCAGTGTGCCTTCTC;SOR=0.454;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=32;WE=118985159;WS=118985141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr11	118986630	rs608444	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr11	119005132	rs100803	C	T	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=864;ReadPosRankSum=0.496;SC=CCTCCCCCAGCCCCTGAGCCA;SOR=0.445;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=125;TCF=32;TCR=93;TR=53;WE=119005140;WS=119005122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
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chr11	119043656	rs643423	C	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=608;ReadPosRankSum=0.288;SC=CGCTCCCCCACCCGGGAGGCA;SOR=0.978;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=40;WE=119043664;WS=119043646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,50:0.41:122
chr11	119052826	rs4245191	C	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1081;ReadPosRankSum=0.255;SC=CCGCTGACGGCGGCAGGTGTT;SOR=0.644;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=70;WE=119052834;WS=119052816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,88:0.51:174
chr11	119054488	rs10790286	C	T	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1009;ReadPosRankSum=0.623;SC=GAGCCTCTGACTGTGTCACCA;SOR=0.344;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=66;WE=119054496;WS=119054478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr11	119059404	rs1815811	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=1090;ReadPosRankSum=0.367;SC=GCCTCGCCCCGGGGCAGCAGC;SOR=0.604;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=165;TCF=108;TCR=57;TR=70;WE=119059412;WS=119059394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,76:0.41:187
chr11	119060963	rs45535039	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CACAGCTCTATTGAGTTCTAC;SOR=0.933;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=16;WE=119060971;WS=119060953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr11	119064394	rs11217175	C	T	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=46;PP=1798;ReadPosRankSum=1.101;SC=CTCCTTGTTTCCCTTCCTTGC;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=189;TCF=113;TCR=76;TR=110;WE=119064402;WS=119064384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,131:0.58:224
chr11	119065484	rs60630529	A	AC	2823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=45;NR=17;PP=1670;SC=CTCACTGCCCACCCTCTCTCA;SOR=2.598;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=62;WE=119065494;WS=119065474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	119065709	rs10750139	G	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=735;ReadPosRankSum=-1.333;SC=CTGCACCTGCGGTGGCAAGTG;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=31;TCR=92;TR=56;WE=119065717;WS=119065699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr11	119145705	rs3842642	G	GT	2453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.834;NF=4;NR=44;PP=1889;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TCTGAATTTCGTTATCTTGAG;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=8;TCR=81;TR=48;WE=119145713;WS=119145695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,82:0.60:137
chr11	119146659	rs2511854	G	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GCCTTCCACCGTAATACCAGC;SOR=2.170;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=15;WE=119146667;WS=119146649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	119148573	rs2510152	G	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=42;PP=870;ReadPosRankSum=0.540;SC=TGTTTCACATGATAACCATAT;SOR=1.112;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=129;TCF=37;TCR=92;TR=54;WE=119148581;WS=119148563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,64:0.43:148
chr11	119155618	rs2298650	G	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=207;ReadPosRankSum=0.122;SC=AGCTTTAGGAGAGTTGAAAGA;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=14;WE=119155626;WS=119155608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	119181170	rs2249466	T	C	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=925;ReadPosRankSum=0.760;SC=GAGACGGGGGTAGCGTGCTGG;SOR=0.521;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=63;WE=119181178;WS=119181160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,72:0.41:177
chr11	119181674	rs2510146	G	C	2942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=65;PP=1810;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ACCATCGTTGGCCCAGCCAGT;SOR=0.607;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=251;TCF=109;TCR=142;TR=118;WE=119181682;WS=119181664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,140:0.46:303
chr11	119185133	rs6589731	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=0.464;SC=CCCAAAGCACCGAGATTACAG;SOR=1.550;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=12;WE=119185141;WS=119185123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr11	119185347	rs6589732	G	A	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1556;ReadPosRankSum=-1.728;SC=CCATCTCAGCGGCTGCGCACC;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=77;TCR=85;TR=92;WE=119185355;WS=119185337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,103:0.56:185
chr11	119185748	rs35929108	G	A	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=943;ReadPosRankSum=1.496;SC=TCTCCTTGTGGACCTAATGGG;SOR=0.507;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=62;WE=119185756;WS=119185738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,73:0.48:151
chr11	119205735	rs12797083	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=0.270;SC=TCATTTTCCTTCCAAATTAAT;SOR=0.420;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=17;WE=119205743;WS=119205725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr11	119205830	rs12795576	A	G	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1126;ReadPosRankSum=1.366;SC=CCATAGCCCTATCATGGAGGC;SOR=0.438;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=67;WE=119205838;WS=119205820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,71:0.63:113
chr11	119206375	rs2511841	G	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1616;ReadPosRankSum=0.079;SC=GGAGGATGACGGACGTAGTGG;SOR=0.486;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=90;WE=119206383;WS=119206365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
chr11	119207928	rs6649	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1035;ReadPosRankSum=1.122;SC=TCACTAGGGTCCAAATACAGA;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=65;WE=119207936;WS=119207918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr11	119210583	rs1135258	G	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=184;ReadPosRankSum=1.118;SC=GGGCGGCAGGGTGAGAGTAGC;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=14;WE=119210591;WS=119210573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	119214771	rs948413	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=1.177;SC=GGCTGGGGGGATGGGGTGGTG;SOR=0.120;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=6;WE=119214779;WS=119214761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr11	119215165	rs10790289	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.858;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-3.325;SC=ATAGGGCTGGCGGTGATTACA;SOR=0.330;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=20;WE=119215173;WS=119215155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr11	119215253	rs2509388	G	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	119215256	rs10892350	C	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	119216231	rs2510143	A	G	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=77;PP=2965;SC=GCTGTATTGCATGGTCTGTGG;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=163;WE=119216239;WS=119216221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	119216504	rs3814762	C	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=775;ReadPosRankSum=1.574;SC=GAGGGGCTCACGCCTGACTCC;SOR=0.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=59;WE=119216512;WS=119216494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr11	119217254	rs883247	C	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=282;SC=TTTCTGGAGTCCCTGTGACAG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=119217262;WS=119217244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	119217280	rs139821533	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.192;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	119227844	rs11217253	G	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=1;PP=639;SC=TGGAGGAGTGGGGGGAGAGTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=119227852;WS=119227834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	119229374	rs7937208	T	C	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=15;PP=1317;SC=TGTTGAACACTAGGCAGAAAC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=119229382;WS=119229364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	119229758	rs45533837	T	C	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.002;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1427;ReadPosRankSum=-2.177;SC=GTTCTCAGGGTTGGACTTAGG;SOR=0.982;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=168;TCF=75;TCR=93;TR=79;WE=119229766;WS=119229748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,91:0.44:205
chr11	119229964	rs2241646	G	A	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=47;PP=1837;SC=AGCGCGGTGCGTATCTCTGGA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=87;WE=119229972;WS=119229954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	119243670	rs33929148	C	T	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CTTGCGCGTCCGGGCCAGCAT;SOR=0.660;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=90;WE=119243678;WS=119243660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,93:0.48:192
chr11	119244095	rs587985	C	T	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.07;NF=67;NR=69;PP=2706;SC=CATAGGAGGACGGGGTGTAGG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=119244103;WS=119244085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	119252151	rs565296	C	T	5486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=73;PP=2965;SC=CCCCGAATCCCCCCTCCCGGA;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=164;WE=119252159;WS=119252141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	119252199	rs670906	T	G	5314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=81;PP=2965;SC=CTTCTTGGAGTATGGACGAGT;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=119252207;WS=119252189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	119290034	rs1054735	G	C	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=34;PP=1480;SC=TGAGGGATTGGGGGGAGGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=119290042;WS=119290024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	119291480	rs3138091	G	A	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=51;PP=2389;SC=CCCTCTCTTTGTCACCTGCGC;SOR=1.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=125;WE=119291488;WS=119291470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	119291688	rs3751026	A	G	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=47;PP=1526;SC=CACACTTACCACCAGGGCTGG;SOR=1.286;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=119291696;WS=119291678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	119509625	rs1022080	C	T	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.24;NF=8;NR=35;PP=963;SC=AGAGCAGGCCCGGGAGCTCTG;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=119509633;WS=119509615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	119510644	rs7940667	A	C	5792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=88;PP=2965;SC=GAGCACAGCAACTAGGATGAG;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=184;WE=119510652;WS=119510634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	119535677	rs137909701	C	CCCT	1300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CCCTCCACCGCCCTCCTCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=23;WE=119535685;WS=119535667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr11	119548052	rs10892429	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=374;ReadPosRankSum=-0.541;SC=AGAGGGAAGTGTGGGTGGGAG;SOR=0.275;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=20;WE=119548060;WS=119548042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr11	119584506	rs4245205	T	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=434;SC=GGGCAGCTCCTATCTCTCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=119584514;WS=119584496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	119879327	rs17245368	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=0.849;SC=TCGCCAGGGACGGCCGCTCTG;SOR=1.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=119879335;WS=119879317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	119879425	rs648374	T	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=362;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TTCTCCGAGATTGCGAGTGCC;SOR=0.353;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=27;WE=119879433;WS=119879415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr11	119879488	rs1944496	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=-1.063;SC=TCCCTTGTACGGTGTCTGGCT;SOR=1.143;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=24;WE=119879496;WS=119879478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr11	119984202	rs506127	A	G	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=0;PP=82;SC=CATGCCCTGCAGATCCCAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=119984210;WS=119984192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	119984535	rs519672	G	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=299;SC=CTTTGAGGAAGATTGGGTCAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=119984543;WS=119984525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	119986167	rs503559	T	C	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.06;NF=60;NR=81;PP=2924;SC=GCGCTGGTGGTCAGGGGTGCC;SOR=0.978;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=141;WE=119986175;WS=119986157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	119987576	rs488222	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=9;PP=409;SC=GAGAAGGGACCGGCACACCCT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=119987584;WS=119987566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	119989107	rs10466595	C	G	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=833;SC=ACAGCCAGGTCTATGACTCTC;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=119989115;WS=119989097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	119989123	rs10466596	G	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=24;PP=714;SC=CTCTCTAGCCGCTGGCCACAA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=119989131;WS=119989113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	119992839	.	A	AGTGT	218.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-0.924;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.777;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr11	119993897	rs66674912	CCT	C	12277.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=124;PP=2967;SC=GTTTCCCCAACCTCTCAGAGA;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=49;TCR=130;TR=170;WE=119993906;WS=119993880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr11	119999191	rs569044	A	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=20;PP=1288;SC=TCCTTTTGCAATGACAGCTCC;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=119999199;WS=119999181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	120007889	rs470645	G	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=15;PP=1986;SC=GAGGGGTGGGGTGAGAGAGGA;SOR=2.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=70;TCR=15;TR=85;WE=120007897;WS=120007879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	120040442	rs2444240	T	G	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=10;PP=1491;SC=GGCAAAGGCTTGCGGGATGCG;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=63;WE=120040450;WS=120040432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr11	120099679	rs2508490	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=727;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TGCGTCTGCCGCTATGGCCTG;SOR=0.624;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=52;WE=120099687;WS=120099669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr11	120107411	rs882856	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=405;ReadPosRankSum=0.282;SC=GCTAAAGGAGGAAGGGGTAAA;SOR=0.275;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=28;WE=120107419;WS=120107401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr11	120117394	rs118125468	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=0.485;SC=TGATTCTGGAGCCTTTGAACA;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=120117402;WS=120117384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	120139700	rs6589803	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCAGCCTCCCCTCCAAGGTGA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=120139708;WS=120139690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	120175749	rs7110845	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=279;ReadPosRankSum=-1.667;SC=GCATTTGGGCACCCTGGGCTG;SOR=0.686;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=21;WE=120175757;WS=120175739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr11	120176310	rs12790634	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=337;ReadPosRankSum=-1.168;SC=ACAAGAGGAGGAGGCTGCCTC;SOR=1.702;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=18;WE=120176318;WS=120176300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr11	120198093	rs1893261	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AAATGACCCAGTGCTGTTTTC;SOR=1.234;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=15;WE=120198101;WS=120198083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	120276903	rs61900795	T	C	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=578;ReadPosRankSum=0.120;SC=ATTTTAATTATAAGCATCCCT;SOR=0.996;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=35;WE=120276911;WS=120276893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr11	120278359	rs6589812	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.549;SC=TTCCTGGTTTTTCTTGTAAGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=120278367;WS=120278349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	120292570	rs532006	T	A	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=602;SC=AGGTAAGGAATAGGCTATTAT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=120292578;WS=120292560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	120300327	rs11217865	A	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=467;ReadPosRankSum=-0.393;SC=ATTGTAACCAATGCCATTAGT;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=25;WE=120300335;WS=120300317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr11	120310959	rs7108596	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=941;ReadPosRankSum=-2.872;SC=CTAAAAAATAGATTGTTACTT;SOR=1.012;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=55;WE=120310967;WS=120310949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr11	120310978	rs9666435	A	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=2.509;SC=TTTCTGCAATATCTGATTTGT;SOR=1.090;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=28;WE=120310986;WS=120310968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr11	120312746	rs723937	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=0.573;SC=CTACTCAATGGTGACCTAGCA;SOR=0.671;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=12;WE=120312754;WS=120312736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	120319064	rs2305008	A	C	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1527;ReadPosRankSum=1.220;SC=CAAGGTAAGAATGAAATAATG;SOR=0.510;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=171;TCF=76;TCR=95;TR=101;WE=120319072;WS=120319054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,115:0.59:194
chr11	120328858	rs766894	T	C	2835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=52;PP=1863;ReadPosRankSum=0.745;SC=TAGAGACAGATCCACCCAACT;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=135;TCR=107;TR=117;WE=120328866;WS=120328848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,136:0.49:277
chr11	120330149	rs2305010	G	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=0.723;SC=GAGAATGTAAGATAAATAAAG;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=120330157;WS=120330139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	120331292	rs57250811	TA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	120347886	rs111312404	T	TTGTTG	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.31;MQRankSum=0.948;NF=15;NR=2;PP=916;ReadPosRankSum=1.686;SC=GATATTTCTTTTTTCTTTTTT;SOR=1.483;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=17;WE=120347894;WS=120347876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr11	120349142	rs7120040	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=487;ReadPosRankSum=1.152;SC=ACTAAGTATGACACTCATGTG;SOR=0.818;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=29;WE=120349150;WS=120349132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr11	120355230	rs503473	A	G	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1239;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TGTAAAAGTTATGAGTTCCAG;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=76;TCR=103;TR=85;WE=120355238;WS=120355220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,112:0.50:222
chr11	120355791	rs9625	G	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=1.723;SC=AGTTAGAGCCGCATGTCCTGG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=14;WE=120355799;WS=120355781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	120382409	rs7952113	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=168;ReadPosRankSum=-0.940;SC=CGCGCCTCGCTGCGCTCCTCC;SOR=0.573;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=14;WE=120382417;WS=120382399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr11	120385841	rs2243746	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CCCCCTCCCCTGGCCACCCAG;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=13;WE=120385849;WS=120385831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
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chr11	120690372	rs56326825	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ATAAAAGAACTCACCCTCCAC;SOR=0.089;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=13;WE=120690380;WS=120690362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr11	120707644	rs3934628	C	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=611;ReadPosRankSum=-0.108;SC=CAGGGGATGACGAGTACAGGA;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=37;WE=120707652;WS=120707634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr11	120732508	rs3824978	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TGTTAACTCCCAGAAAAACTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=120732516;WS=120732498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	120776001	rs2156634	G	A	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=33;PP=2384;SC=TGCTGCAGGAGAACCCATATT;SOR=1.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=81;TCR=33;TR=114;WE=120776009;WS=120775991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	120823528	rs10750178	A	G	3840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=35;PP=2533;SC=TTGACTGAATATGTGCGGTGA;SOR=1.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=80;TCR=35;TR=115;WE=120823536;WS=120823518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	120827609	rs644057	A	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=879;ReadPosRankSum=-0.624;SC=TCATGCAGCAAGGCTCCACCA;SOR=0.718;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=55;WE=120827617;WS=120827599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr11	120831878	rs607142	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=0.748;SC=CTCCGCATCTCATTATCTCTT;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=15;WE=120831886;WS=120831868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	120837821	rs2276319	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=468;ReadPosRankSum=0.515;SC=GGGTGGCCAGGAGGTGTGCCG;SOR=0.525;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=33;WE=120837829;WS=120837811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr11	120852961	rs499804	C	A	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1301;ReadPosRankSum=-2.625;SC=TATGATCGATCGTGTTGGCAG;SOR=0.796;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=163;TCF=63;TCR=100;TR=78;WE=120852969;WS=120852951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,98:0.49:200
chr11	120856998	rs371012924	CGGGCGGGGCGGGAG	C	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=3.081;NF=2;NR=11;PP=2677;ReadPosRankSum=0.513;SC=GCGCAGAGGCCGGGCGGGGCG;SOR=0.490;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=120857019;WS=120856988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr11	120857051	rs11218092	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GCCGCCAGCCGGAACTTGTAC;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=5;WE=120857059;WS=120857041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	120996292	rs536069	A	G	3156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=2106;ReadPosRankSum=0.373;SC=TGTACCACGCAGACTGGAAGT;SOR=0.763;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=259;TCF=132;TCR=127;TR=134;WE=120996300;WS=120996282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,150:0.51:295
chr11	120998942	rs10502247	C	T	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1644;ReadPosRankSum=1.114;SC=ACTTGGAAATCGACATCAACA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=91;TCR=103;TR=104;WE=120998950;WS=120998932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,115:0.51:226
chr11	121000212	rs643744	T	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=461;ReadPosRankSum=-1.630;SC=GTTGGTATCTTTGTGGGTTCC;SOR=0.233;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=24;WE=121000220;WS=121000202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr11	121000784	rs586473	T	C	3186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=61;PP=1974;ReadPosRankSum=1.083;SC=TCACTGCCTATTACCGCACCT;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=232;TCF=114;TCR=118;TR=117;WE=121000792;WS=121000774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,146:0.50:290
chr11	121032978	rs526433	G	A	5390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=82;PP=2965;SC=GGCTGCTACAGCCACAAGAAG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=157;WE=121032986;WS=121032968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	121037529	rs2186747	C	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GCAGAGGCAGCGACAGCTTCG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=20;WE=121037537;WS=121037519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr11	121178302	rs1061332	A	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.049;SC=AAAAAATAATATCCATACAGT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=121178310;WS=121178292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	121367626	rs12364988	T	C	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=27;PP=2171;SC=TTGAACGACATGAACCCTCTG;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=101;WE=121367634;WS=121367616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	121393212	rs630813	C	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=18;PP=885;SC=CAGCTGCACTCCCCTCACACA;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=121393220;WS=121393202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	121403229	rs636588	T	C	6162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=83;PP=2965;SC=TCATCACGGCTATTGCCCAGG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=178;WE=121403237;WS=121403219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	121403345	rs631232	T	C	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=55;PP=1601;SC=TATCTCTCTATAGCACTATGT;SOR=2.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=72;WE=121403353;WS=121403335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	121414476	rs2276346	G	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=469;SC=ATGGATATGCGTGGACTTCCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=121414484;WS=121414466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	121416187	rs11218325	A	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=345;SC=TTATTCACTCAGCAGTGTTGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=121416195;WS=121416177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr11	121437819	rs1699107	C	G	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=60;PP=2218;SC=CTGTGTCAAACAAGGTACTTC;SOR=1.074;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=101;WE=121437827;WS=121437809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	121445084	rs1792126	T	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=32;PP=1035;SC=TAAGGGGACATCACATCCTGA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=121445092;WS=121445074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	121447807	rs1790212	A	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1321;SC=ACCCATTTGCAGCACACTGAC;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=121447815;WS=121447797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	121448090	rs2070045	T	G	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1668;ReadPosRankSum=1.670;SC=GGGACTGGTCTGATGAAGCCA;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=237;TCF=123;TCR=114;TR=112;WE=121448098;WS=121448080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,129:0.48:267
chr11	121448183	rs3824966	C	G	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1173;ReadPosRankSum=1.656;SC=TTTAAACGATCGGAAAATCTA;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=155;TCF=56;TCR=99;TR=74;WE=121448191;WS=121448173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr11	121456962	rs1699102	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=488;ReadPosRankSum=2.623;SC=GCTGCCCAAACGGCACTTGCA;SOR=0.518;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=32;WE=121456970;WS=121456952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr11	121460664	rs1625828	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=518;ReadPosRankSum=0.376;SC=CTGGAACTTGGGTCTGGAGGA;SOR=1.347;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=28;WE=121460672;WS=121460654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr11	121475798	rs1784929	T	A	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=18;PP=1154;SC=ACTTTGTTTGTCTTTTTCTCC;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=121475806;WS=121475788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	121475922	rs3824968	T	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=723;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGCCCTCTGCTTCTTGTGTAT;SOR=0.443;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=42;WE=121475930;WS=121475912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr11	121478958	rs2282649	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCAGTATGACCGGAAAATGGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=19;WE=121478966;WS=121478948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr11	121483401	rs1010159	C	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.115;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=729;ReadPosRankSum=0.629;SC=TTAGTGTGCCCCATGACTAGC;SOR=1.080;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=45;WE=121483409;WS=121483391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,50:0.33:153
chr11	121483651	rs1010158	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=192;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GGTATTCTCTGGAAGCTGTTC;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=121483659;WS=121483641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr11	121489416	rs1784933	G	A	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=1;PP=1272;SC=CTTAAATTGGGGATTTCAAGG;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=48;WE=121489424;WS=121489406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	121491782	rs1792120	G	A	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=50;PP=2812;SC=GTTGTATGCAGTTGCAGTCAA;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=83;TCR=50;TR=133;WE=121491790;WS=121491772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	121493001	rs1614735	T	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.129;NF=9;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TCATTCTCAATGACTTTGGAA;SOR=0.619;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=22;WE=121493009;WS=121492991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr11	121493072	rs11454566	T	TA	331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=8;PP=184;SC=ATAGATAGTGTAAAAAAAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=121493080;WS=121493062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	122165766	rs532540	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=45;PP=1585;SC=ATGACAGTATGGACAGCCTCA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=82;WE=122165774;WS=122165756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	122172113	rs558962	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=4;PP=386;SC=CCAGCCTGGGTGACAGAGAGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=122172121;WS=122172103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	122172318	rs615683	C	T	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	122172321	rs693194	T	C	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.05;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	122646967	rs12790613	G	A	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=75;PP=2707;SC=AAGTGTTCAGGCAGCATGTGA;SOR=0.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=142;WE=122646975;WS=122646957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr11	122653950	rs2156802	C	T	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=53;PP=1725;SC=CACTGTGGTTCCAGAAGCTAC;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=122653958;WS=122653940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	122659918	rs955051	T	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=853;ReadPosRankSum=0.507;SC=CCAGCGAGGGTTGGATCTATG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=49;WE=122659926;WS=122659908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr11	122665437	rs872414	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=319;ReadPosRankSum=-0.580;SC=ATACATCGTCATCCAACTCTC;SOR=0.788;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=28;WE=122665445;WS=122665427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr11	122665549	rs11218816	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=1.617;SC=GCAGGTAAGGCTGATTGCTAG;SOR=1.371;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=122665557;WS=122665539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	122709178	rs3134425	T	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.443;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=725;ReadPosRankSum=1.341;SC=TCTCCCCCTTTAAAAGAAACT;SOR=0.247;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=46;WE=122709186;WS=122709168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr11	122738718	rs17126930	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=327;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TCTTTTTTTGTAGAAAACGAA;SOR=1.055;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=24;WE=122738726;WS=122738708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
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chr11	122742154	rs56148911	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-0.984;SC=CGCAGTGTCACCTCAGTGGAC;SOR=0.973;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=14;WE=122742162;WS=122742144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr11	122775227	rs3107630	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=586;SC=TGTCTAGATATCGCTTCCTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=122775235;WS=122775217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	122776007	rs74695569	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=672;ReadPosRankSum=1.318;SC=TGTCCAGGGATACAGGACAAG;SOR=0.394;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=39;WE=122776015;WS=122775997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr11	122827905	rs143794192	ATTAAC	A	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.228;NF=8;NR=1;PP=376;ReadPosRankSum=-1.166;SC=AGGAGAAACAATTAACTTAAC;SOR=1.460;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=122827917;WS=122827895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	122830214	rs7107502	G	A	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=65;PP=1787;SC=GAAAAGAAACGCCAACCACCT;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=82;WE=122830222;WS=122830204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	122830251	rs1057703	T	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=561;ReadPosRankSum=-0.214;SC=AATGGCCTATTATTATCATCT;SOR=0.776;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=25;WE=122830259;WS=122830241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr11	122830274	rs1057704	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=478;SC=CTGCCGTCCATGTTTGCTTTC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=122830282;WS=122830264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	122849816	rs7939002	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=558;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CCGGCCAGGTGTAGGTAATTT;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=29;WE=122849824;WS=122849806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr11	122852349	rs62624971	G	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=0.227;SC=GAAGACGCCGGGTGTAGAGGA;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=23;WE=122852357;WS=122852339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr11	122928622	rs4802	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=297;ReadPosRankSum=-1.452;SC=CTTCCTTCTCAGCAGTCTGAG;SOR=0.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=18;WE=122928630;WS=122928612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr11	122928875	rs4936770	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	122929407	rs1064585	T	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=345;ReadPosRankSum=1.661;SC=AGACATTGAGTATACCATTGG;SOR=1.359;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=18;WE=122929415;WS=122929397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	122929624	rs1461496	A	G	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=1072;ReadPosRankSum=0.957;SC=TGGTCGCTCAAACATCCAAGG;SOR=0.764;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=58;WE=122929632;WS=122929614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,70:0.66:106
chr11	122930108	rs76152311	T	TTG	2782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=1920;ReadPosRankSum=0.811;SC=CTACGAATGTTTAACAATCAC;SOR=0.822;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=43;WE=122930116;WS=122930098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr11	122931075	rs149047184	A	AC	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CAGCTGGAGCACCCCCCCCAC;SOR=1.347;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=9;WE=122931083;WS=122931065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr11	122931213	rs1461497	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=442;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CCATCTGTTCCCCTCCCTCGC;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=27;WE=122931221;WS=122931203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr11	122931528	rs3057456	AAC	A	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.841;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.512;NF=1;NR=15;PP=605;ReadPosRankSum=1.036;SC=GTCAAATGAAAACACTTTCAA;SOR=1.258;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=16;WE=122931537;WS=122931518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr11	122931625	rs41361350	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=89;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TACCATATAGGTAGCAAAGGT;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=122931633;WS=122931615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	123065683	rs2302605	C	T	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=728;ReadPosRankSum=1.620;SC=CCCCGCTCAGCTGCTGCTTGG;SOR=0.540;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=51;WE=123065691;WS=123065673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,60:0.66:91
chr11	123065730	rs11219061	C	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GGACCTCGGGCGAGCTGGGCG;SOR=0.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=11;WE=123065738;WS=123065720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr11	123154795	.	TCTTA	T	126	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=126;QD=28.2;SC=CTTCCTTCCTTCTTACTTACT;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=5;WE=123154806;WS=123154785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	123154894	rs149387350	TTC	T	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=4.424;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr11	123306172	rs17671708	T	C	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CTGCACAAAGTTGAAAATATG;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=164;TCF=95;TCR=69;TR=76;WE=123306180;WS=123306162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,92:0.46:202
chr11	123448305	rs76968140	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=-2.034;SC=ACCCCGTTGAGGCGGTACCTC;SOR=0.487;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=19;WE=123448313;WS=123448295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr11	123455124	.	G	A	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=103;MMLQ=24;MQ=56.22;NF=0;NR=3;PP=29;QD=21.2570708491;SC=GTGGGGTGCGGTTGGGCTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=123455132;WS=123455114;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr11	123464637	rs1148101	G	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=423;SC=ACACCGAGGCGCCGTTCCTCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=123464645;WS=123464627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	123464786	rs118067934	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=-1.676;SC=CTATTGTCACGCAGGTGTTAA;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=34;WE=123464794;WS=123464776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr11	123504673	rs1148111	C	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=296;ReadPosRankSum=1.179;SC=ACAGAGCTTTCTGACTTAAAG;SOR=1.002;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=14;WE=123504681;WS=123504663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	123504959	rs1148110	C	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=1.226;SC=CAGTGCCCAGCGTGGGAACAC;SOR=1.075;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=123504967;WS=123504949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	123513506	rs1783901	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=411;ReadPosRankSum=2.739;SC=GGGGACAATGCCACCGGGAGA;SOR=0.201;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=22;WE=123513514;WS=123513496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr11	123524295	rs68105605	T	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=1.732;SC=CATCTCAAAATCCCAGCTCTC;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=123524303;WS=123524285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	123524411	rs3851102	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGTTAGCATTGTTACTGTTAC;SOR=0.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=22;WE=123524419;WS=123524401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr11	123596703	rs3183878	A	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=18;PP=1824;SC=ATGGGGACCTAGCTAGGAGGT;SOR=2.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=78;WE=123596711;WS=123596693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	123597804	rs679597	A	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=514;SC=AAGACTAAATAGAATGCCTGT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=123597812;WS=123597794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	123599044	rs675172	T	C	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=32;PP=1051;SC=TTGAAGGTCATACAATAGGTG;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=123599052;WS=123599034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	123600475	rs1144507	A	G	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=48;PP=1753;SC=CTCAGGCTCCACTCCTAAATG;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=123600483;WS=123600465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	123624658	rs12364099	G	T	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1202;ReadPosRankSum=-1.374;SC=CAAAATGCTGGTGTCTATGCA;SOR=0.715;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=74;WE=123624666;WS=123624648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,80:0.56:142
chr11	123676413	rs7952150	G	A	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=1068;ReadPosRankSum=0.952;SC=TTATGTACACGTAGGACCCAG;SOR=0.504;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=63;WE=123676421;WS=123676403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,70:0.58:120
chr11	123753937	rs1939927	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=0.232;SC=ATTGCAGTGCATTCTGGTAAT;SOR=0.683;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=31;WE=123753945;WS=123753927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr11	123754844	rs10893099	T	C	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=54;PP=1672;SC=GATCCTATAATTAGAGAAGTG;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=79;WE=123754852;WS=123754834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	123777049	rs10750249	G	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=257;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTTTCATAGAGAGAAAACACT;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=123777057;WS=123777039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr11	123777302	rs17127947	T	G	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1277;ReadPosRankSum=0.059;SC=AATCGTCAACTTCATACCCCC;SOR=0.486;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=201;TCF=89;TCR=112;TR=90;WE=123777310;WS=123777292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,110:0.47:233
chr11	123777412	rs17127950	A	G	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1115;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGATAGATCCATCTCCTATTC;SOR=0.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=87;WE=123777420;WS=123777402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr11	123777497	rs10750250	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1272;ReadPosRankSum=-1.705;SC=GCCATGGCCTGCGATCGCTAC;SOR=0.439;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=69;WE=123777505;WS=123777487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr11	123777536	rs7926767	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=963;ReadPosRankSum=-0.012;SC=CTGCTCTACAGGGTCATCATG;SOR=0.860;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=56;WE=123777544;WS=123777526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,64:0.52:124
chr11	123777861	rs61748875	T	C	3106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1985;ReadPosRankSum=0.215;SC=TTAGCACCTGTAGCTCCCACC;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=105;TCR=98;TR=110;WE=123777869;WS=123777851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,137:0.55:251
chr11	123777986	rs7942047	T	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=848;ReadPosRankSum=-0.345;SC=ACTGTGATTCTCATGTTGAAT;SOR=1.050;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=51;WE=123777994;WS=123777976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
chr11	123778031	rs7927385	G	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=-0.747;SC=AATGAAGTAAGAAATGCTCTG;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=42;WE=123778039;WS=123778021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr11	123810492	rs77776318	A	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=854;ReadPosRankSum=0.544;SC=ACACCTGCACACAACCATGTA;SOR=1.156;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=47;WE=123810500;WS=123810482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,57:0.48:118
chr11	123886307	rs79057843	CA	TG	4317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.767;NF=45;NR=43;PP=2944;ReadPosRankSum=1.294;SC=CTCGTGACAGCATTCATCCTC;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=212;TCF=105;TCR=107;TR=88;WE=123886316;WS=123886297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,114:0.44:257
chr11	123886681	rs1893766	A	G	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.505;NF=99;NR=84;PP=2636;ReadPosRankSum=-1.306;SC=GTACACCAGCATGATGAGTGG;SOR=0.884;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=350;TCF=187;TCR=163;TR=183;WE=123886689;WS=123886671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,180:0.49:365
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chr11	123886984	rs4936880	A	G	2920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.95;MQRankSum=0.079;NF=55;NR=66;PP=2043;ReadPosRankSum=-2.862;SC=TGGGAGGCGCAGAGCCTTTCA;SOR=0.817;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=121;WE=123886992;WS=123886974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,132:0.52:252
chr11	123887164	rs4936881	A	C	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.777;NF=41;NR=51;PP=1636;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CAAGGAGGTGAAGAAAGCTGT;SOR=0.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=71;TCR=90;TR=92;WE=123887172;WS=123887154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,116:0.58:199
chr11	123887184	rs4936882	T	G	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.230;NF=33;NR=53;PP=1539;ReadPosRankSum=0.661;SC=TGTTGAAACTTAGAGACAAAG;SOR=0.763;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=86;WE=123887192;WS=123887174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,112:0.59:190
chr11	123887314	rs517598	T	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=409;SC=AGTGTTAAACTTTATTCCAAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=123887322;WS=123887304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	123893987	rs142337884	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.68;MQRankSum=-1.686;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=0.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr11	123894119	rs12366219	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=69.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQRankSum=-10.457;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.602;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,43:0.21:204
chr11	123894136	rs28499345	A	G	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=52.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQRankSum=-11.695;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.869;SOR=3.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,66:0.27:249
chr11	123909627	rs11219420	T	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=3.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQRankSum=-2.519;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=1.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,45:0.37:122
chr11	123909637	rs4936889	G	T	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQRankSum=-2.139;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,53:0.39:135
chr11	123909695	rs3894197	G	C	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.755;NF=43;NR=42;PP=1363;ReadPosRankSum=1.131;SC=TGTCAGTAGGGTGGCGTTGGA;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=85;WE=123909703;WS=123909685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,97:0.49:196
chr11	123994657	rs4144889	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	124006972	rs2276054	G	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=523;ReadPosRankSum=1.131;SC=AGATTAATCAGCTATGCCCAG;SOR=0.239;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=35;WE=124006980;WS=124006962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr11	124006993	rs2276053	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=-1.207;SC=CTGACCGGGAGGATGCCAGTG;SOR=0.405;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=24;WE=124007001;WS=124006983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr11	124015796	rs17690410	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=0.086;SC=TGGCATTATGCCTTGCAAGTA;SOR=1.136;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=10;WE=124015804;WS=124015786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr11	124015994	rs1056615	C	T	6235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=102;PP=2965;SC=TCTGGCTGCACAGCAATGGTA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=94;TCR=102;TR=196;WE=124016002;WS=124015984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr11	124016366	rs2282505	C	G,T	864.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=18,8;NR=0,2;PP=440,151;SC=AGACTTGGTGCGTGTTCTCCT;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=18,10;WE=124016374;WS=124016356;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:29
chr11	124016740	rs9326269	A	T	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=47;PP=1306;SC=GTTCTTGTGTATTATAACTCT;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=124016748;WS=124016730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	124029037	rs4936895	G	A	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=22;PP=1789;SC=CATAGCCAAAGCACTCATCAG;SOR=2.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=81;WE=124029045;WS=124029027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	124029075	rs4935866	G	A	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=44;PP=2580;SC=TGACATTGGTGTTTAGACTTT;SOR=1.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=128;WE=124029083;WS=124029065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	124029292	rs1893011	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=976;ReadPosRankSum=-0.448;SC=GGCTTCACACGCCCATGTACT;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=59;WE=124029300;WS=124029282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,69:0.51:134
chr11	124029541	rs4936896	A	G	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=81;PP=2965;SC=GCCACAGAGCATGTATCATCC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=167;WE=124029549;WS=124029531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	124056377	rs2512228	T	C	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=44;PP=1998;SC=CGATACACAGTCATCATGAAC;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=82;WE=124056385;WS=124056367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	124056566	rs7937809	G	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TTAGCCCAGAGGGTGAGCTTC;SOR=0.942;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=79;WE=124056574;WS=124056556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
chr11	124056581	rs2466584	A	G	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1153;ReadPosRankSum=0.021;SC=AGCTTCACCAACGTTGGCCTC;SOR=0.690;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=67;WE=124056589;WS=124056571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr11	124056732	rs2512227	T	G	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=48;PP=2558;SC=TCTGTGCCTATGGGCCCATCA;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=100;WE=124056740;WS=124056722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	124056787	rs2512226	G	A	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=50;PP=2356;SC=GCTGGGAACCGTGGTACAAAT;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=124056795;WS=124056777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	124096195	rs7946214	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.375;NF=45;NR=22;PP=1149;ReadPosRankSum=1.097;SC=TTTTCTTTGGGTCTGCAGCAT;SOR=1.132;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=67;WE=124096203;WS=124096185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,71:0.46:155
chr11	124120302	rs2512239	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	124121199	rs4268525	G	C	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=10.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-2.413;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.478;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,74:0.34:217
chr11	124134686	rs7931968	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-1.335;SC=TGCTAAATTGGGATAAATTAT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=124134694;WS=124134676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	124134743	rs2466637	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.173;SC=ATAAACAAGGGATCACTTTCC;SOR=0.247;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=10;WE=124134751;WS=124134733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr11	124135009	rs2512168	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.694;NF=18;NR=21;PP=624;ReadPosRankSum=0.034;SC=CCTATGTACTGTTTCCTCAGC;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=39;WE=124135017;WS=124134999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,45:0.38:118
chr11	124135140	rs62622835	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.468;NF=37;NR=22;PP=1043;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTACTTCTTCCTCGTTTTTGC;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=59;WE=124135148;WS=124135130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr11	124135438	rs2512167	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=276;ReadPosRankSum=0.167;SC=ATCTTTAGTGGAATTAACATC;SOR=0.322;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=18;WE=124135446;WS=124135428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr11	124135481	rs2466701	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=207;ReadPosRankSum=0.642;SC=TCAGCTCTTACATCTTCATCA;SOR=1.598;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=14;WE=124135489;WS=124135471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr11	124179656	rs4936917	G	T	57.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	124179835	rs4936918	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=514;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGGTGTAGAACACAGAGGACA;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=36;WE=124179843;WS=124179825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr11	124180082	rs4936919	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=711;ReadPosRankSum=2.096;SC=AAGCTCATTGAGGTGTGTGTT;SOR=0.600;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=46;WE=124180090;WS=124180072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr11	124180282	rs7107539	A	C	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=887;ReadPosRankSum=-1.851;SC=GCAGTGGGCTACAGATGGCAA;SOR=0.678;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=47;WE=124180290;WS=124180272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr11	124189306	rs2466620	G	A	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.550;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1689;ReadPosRankSum=-0.768;SC=AGTGCTGGAAGGGGGCTTGAA;SOR=0.853;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=98;WE=124189314;WS=124189296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,120:0.53:226
chr11	124189729	rs2512219	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=732;ReadPosRankSum=-1.794;SC=AGCAACATAACGGTCATATTC;SOR=1.739;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=44;WE=124189737;WS=124189719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr11	124190137	rs2466621	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=1.462;SC=GAGAAAAGAGAGACATTAGAT;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=19;WE=124190145;WS=124190127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	124266697	rs201661436	A	AG	1348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQRankSum=-0.490;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr11	124266912	rs28398895	A	G	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=96;PP=2965;SC=TCAACATGTAACATTCAGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=121;TCR=96;TR=217;WE=124266920;WS=124266902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr11	124267177	rs61910862	T	C	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.95;QD=26.28;SOR=1.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	124267189	rs507335	T	C	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.82;QD=26.81;SOR=2.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	124293767	rs2188707	G	A	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=690;SC=AAATTCCTCCGCCTATAAATA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=124293775;WS=124293757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	124294236	rs4057749	A	G	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=598;ReadPosRankSum=-2.441;SC=AGAACGTCACACAGATAATGG;SOR=1.447;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=40;WE=124294244;WS=124294226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr11	124294377	rs4057750	A	G	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GTGACCATGTAGAGCAGGGGG;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=71;WE=124294385;WS=124294367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr11	124294703	rs10750270	T	C	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=527;ReadPosRankSum=-1.236;SC=GAGCTGGAGCTCTGGCTGTTC;SOR=0.555;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=35;WE=124294711;WS=124294693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr11	124440362	rs55861866	C	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=839;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TACATGCTGACAGTGATGGCC;SOR=0.791;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=50;WE=124440370;WS=124440352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr11	124440617	rs12792184	C	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.925;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=900;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GTCTTCTTTTCGGCTGGATTC;SOR=0.874;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=57;WE=124440625;WS=124440607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr11	124494780	rs113773557	A	AT	357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=1;PP=309;SC=TAATAATGTGATTTTTTTATT;SOR=3.767;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=124494788;WS=124494770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	124519650	rs143070599	C	A	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=991;ReadPosRankSum=0.432;SC=AAAGAGCCAGCACACTGCTGA;SOR=0.603;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=63;WE=124519658;WS=124519640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr11	124622739	.	C	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=36;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGAGCTTCCTCTCCCCTGTCC;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=7;WE=124622747;WS=124622729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr11	124624705	rs72422616	TA	T	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.73;ReadPosRankSum=1.689;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr11	124739699	rs114324840	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=0.801;SC=CCATTTGATATGTGGGTCAAC;SOR=1.880;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=124739707;WS=124739689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	124739988	rs4936957	T	C	6727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=102;PP=2965;SC=ATTTTGACATTATGGGAACAG;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=97;TCR=103;TR=199;WE=124739996;WS=124739978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	124740410	rs3923890	A	T	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=14;PP=1416;SC=CCTGTCTTTAAGTACCTTGAC;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=63;WE=124740418;WS=124740400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	124740691	rs7925879	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=29;PP=952;SC=ATGGTTGGCAAGAGACTGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=124740699;WS=124740681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	124744005	rs77513537	C	T	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1294;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TGGCAGATGGCGTGCAGCTGG;SOR=0.482;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=173;TCF=99;TCR=74;TR=93;WE=124744013;WS=124743995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr11	124745427	rs74664498	G	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=310;ReadPosRankSum=1.069;SC=ATGACTATTTGTGTCCTTCTC;SOR=0.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=15;WE=124745435;WS=124745417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr11	124747333	rs10790713	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=-0.479;SC=ACTGTCCTGAAACTCCCGAAT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=6;WE=124747341;WS=124747323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	124747827	.	C	T	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,104:0.54:192
chr11	124747837	rs7933204	G	A	7065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.69;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	124749584	rs3802905	C	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=751;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CAATCTTGGGCTGTTCATTGG;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=40;WE=124749592;WS=124749574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr11	124750232	rs4366494	C	T	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=406;SC=AGAGCTGAGCCTGTGGTCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=124750240;WS=124750226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	124750447	rs71859853	CCGGAGT	C	1751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.248;NF=6;NR=27;PP=1586;ReadPosRankSum=0.723;SC=CTGGCCGGAGCCGGAGTCGGA;SOR=0.966;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=33;WE=124750460;WS=124750437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr11	124756406	rs7104934	G	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=899;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CGAAACCAAAGCTATCCACAG;SOR=0.561;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=58;WE=124756414;WS=124756396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,69:0.45:152
chr11	124757560	rs12418548	G	A	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.512;SC=AGGGCCCTGGGCTGGTAAGCC;SOR=0.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=73;WE=124757568;WS=124757550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,88:0.58:153
chr11	124757758	rs57713193	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr11	124757762	rs117896640	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr11	124757815	rs59771534	A	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=0.556;SC=CTTCAGCCTTATTCAATTCAG;SOR=0.412;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=8;WE=124757823;WS=124757805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr11	124763647	rs7927528	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=467;ReadPosRankSum=0.587;SC=GCAGGAGGAAAGCTAAATCCA;SOR=0.540;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=36;WE=124763655;WS=124763637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr11	124763989	rs7928168	G	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.796;SC=AGGCATTGAGGGCCTGGCAGG;SOR=0.694;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=11;WE=124763997;WS=124763979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	124765168	rs12421354	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=129;ReadPosRankSum=0.111;SC=GGGGACACAGCGTCAGAACCC;SOR=0.375;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=9;WE=124765176;WS=124765158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	124765229	rs12421677	G	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=251;ReadPosRankSum=1.556;SC=GGCCAGGGCAGAAGGGAGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=14;WE=124765237;WS=124765219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr11	124766128	rs4078313	A	G	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=737;ReadPosRankSum=0.445;SC=GGCTCTCCCTATGTCCTGCGC;SOR=0.847;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=50;WE=124766136;WS=124766118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,60:0.41:147
chr11	124766591	rs4078483	C	G	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=58;PP=1765;SC=GAAGGTGACACGGAGCAGGGC;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=124766599;WS=124766581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	124767876	rs117483938	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CCTTGGAGAACTGGGAGGAGA;SOR=0.483;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=124767884;WS=124767866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	124789755	rs3802904	T	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=25;PP=1054;SC=GAGGAGGGAATGGAATACACA;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=124789763;WS=124789745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	124790922	rs10893303	C	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CCAGCGCCCCCCCGGGACCTC;SOR=0.569;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=124790930;WS=124790912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	124792173	rs10893304	C	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=453;ReadPosRankSum=0.822;SC=GTGCCAAAACCGTTGGGGACT;SOR=0.697;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=33;WE=124792181;WS=124792163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr11	124793682	rs10790715	T	C	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=52;PP=2356;SC=TTCTCCACCATGCAGCTGTAC;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=130;WE=124793690;WS=124793672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	124824839	rs12272437	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=0.497;SC=ATGGTGGGGTTCCCCACCACC;SOR=0.264;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=21;WE=124824847;WS=124824829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr11	124829914	rs7482800	T	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=0.517;SC=GTACCTGTTCTTTTTATTTTA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=18;WE=124829922;WS=124829904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr11	124856583	.	GTGTT	G	347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.633;QD=4.40;ReadPosRankSum=2.046;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr11	124856600	.	CGCGCGCGCGT	C	1606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.793;NF=19;NR=15;PP=2984;ReadPosRankSum=0.798;SC=TGTGTGTGCGCGCGCGCGCGT;SOR=0.912;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=34;WE=124856617;WS=124856571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,47:0.32:145
chr11	124856951	rs4608089	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=509;SC=TTTGATATTTCGATTATTTTG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=124856959;WS=124856941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	124857708	rs4936966	G	A	5868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=573;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.142;SC=AAATATCAAGGCCAGGATTTT;SOR=0.763;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=475;TCF=254;TCR=221;TR=224;WE=124857716;WS=124857698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:297,271:0.48:568
chr11	124861269	rs4936967	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr11	124862514	rs6590113	A	G	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=33;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GAGTGAGAGAAGAATTGCCTC;SOR=1.045;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=166;TCF=104;TCR=62;TR=97;WE=124862522;WS=124862504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,109:0.59:186
chr11	124863136	rs7951202	C	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=496;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTGGAGTGCCCTTGGTATGTT;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=35;WE=124863144;WS=124863126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr11	124863249	rs11219864	G	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=85;ReadPosRankSum=1.786;SC=AAGATTGACAGGGCAATGTAA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=124863257;WS=124863239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	124873610	rs12793774	T	C	216.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.8374;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TTCATTCTTTTTTGATTTTAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=124873618;WS=124873609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr11	124873755	rs72518768	CT	C	3208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.347;NF=21;NR=39;PP=2175;ReadPosRankSum=-0.254;SC=ACTGGACCTTCTTAACAGGCT;SOR=0.603;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=60;WE=124873763;WS=124873745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,103:0.53:195
chr11	124874914	rs12286897	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=3.493;SC=GTTTGCTTGCATTTGTTTTTG;SOR=0.724;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=124874922;WS=124874904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	124875124	rs35971753	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=229;ReadPosRankSum=1.834;SC=TTATTCGATCTGCTCTGTGAG;SOR=0.452;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=19;WE=124875132;WS=124875114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr11	124908352	rs7107487	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=1.400;SC=AGAGCAAGAATGTTATGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=124908360;WS=124908342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	124910335	rs4491235	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-1.825;SC=CTCACAGAGTGCTTGTCATAT;SOR=0.069;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=124910343;WS=124910325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	124933351	rs12791554	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=327;ReadPosRankSum=0.416;SC=GGAGGCGTGCCGGGACCTCCT;SOR=0.435;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=25;WE=124933359;WS=124933341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr11	124946817	rs12276292	C	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	124946823	rs12276295	C	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	124947149	rs12276567	G	A	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=935;ReadPosRankSum=-0.761;SC=AGAACTGCTCGGAGCAGATCA;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=41;WE=124947157;WS=124947139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr11	124947396	rs55752830	A	G	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=46;PP=1457;SC=CGCCTTCCTCATCGCCTATGC;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=77;WE=124947404;WS=124947386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	124951467	rs4396301	C	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=255;SC=CTGACCTCACCGACCCAGTGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=124951475;WS=124951457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	124954282	rs948270	A	G	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=77;PP=2457;SC=CCTCTGGCCTATGTGCACGTC;SOR=1.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=109;WE=124954290;WS=124954272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	124954652	rs4936976	G	C	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=40;PP=2297;SC=GATGGTTGTTGCAGACCTCAG;SOR=1.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=108;WE=124954660;WS=124954642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	124955032	rs948268	T	C	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=69;PP=2194;SC=TCTCTGCTGATCTGGTGAGTG;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=109;WE=124955040;WS=124955022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	124955977	rs3808995	C	T	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=69;PP=2771;SC=ATCAGCCCAGCGCTCAGTTTC;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=126;WE=124955985;WS=124955967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	124958122	rs3802808	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=-1.905;SC=ACAAGCAGGGAAGGCAAACCC;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=15;WE=124958130;WS=124958112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	124972208	rs14065	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=559;ReadPosRankSum=-0.963;SC=GCTCCAGTGCAACACACTCCC;SOR=0.425;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=38;WE=124972216;WS=124972198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
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chr11	124972691	rs2155666	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr11	125009529	rs11219919	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=551;ReadPosRankSum=1.089;SC=CCCTTCCTCTGTCCGGGACAG;SOR=0.314;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=18;WE=125009551;WS=125009519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr11	125009543	rs74844643	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.467;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=551;ReadPosRankSum=-0.824;SC=GGGACAGGATGTAGGGTTTCC;SOR=0.039;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=14;WE=125009551;WS=125009519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	125298871	rs595849	A	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=757;ReadPosRankSum=-0.535;SC=AGATCAGCATATGCCCAGCCC;SOR=0.499;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=46;WE=125298879;WS=125298861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr11	125323965	rs11220082	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=0.294;SC=CCCTGCGTTGCTGGGGAGGCC;SOR=1.002;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=9;WE=125323973;WS=125323955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	125326026	rs2241514	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=760;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CCGTCTCCCGCATAACACCTG;SOR=0.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=58;WE=125326034;WS=125326016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr11	125443429	rs1284351	T	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=654;ReadPosRankSum=0.653;SC=TGCTTGAGTCTGGGAGTATGA;SOR=0.753;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=55;WE=125443437;WS=125443419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,69:0.48:144
chr11	125443473	rs1284352	A	C	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=835;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CCAGTGCACTATAGCAGGGCA;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=57;WE=125443481;WS=125443463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr11	125443562	rs78075934	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=91;ReadPosRankSum=2.190;SC=AAAGACTTTATGCATATGATC;SOR=0.437;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=12;WE=125443570;WS=125443552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr11	125445394	rs494989	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=2.035;SC=TATTTCTTTTGTGCTTTTTCC;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=15;WE=125445402;WS=125445384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	125445679	rs2702007	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TATATATACACATTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=125445687;WS=125445669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	125446070	rs550276	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=1.433;SC=CCCACAAAAGATAAGATATAA;SOR=0.326;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=21;WE=125446078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr11	125452081	rs11220136	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.711;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr11	125452300	rs55912941	A	AC	2436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=25;PP=1503;SC=TGAAGCAAAGACCCTGGCAAA;SOR=1.010;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=34;WE=125452321;WS=125452290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	125452313	rs4627097	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.913;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.752;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr11	125462162	rs573173	A	G	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=33;PP=2353;SC=GCAGTTACCAAGGCACAGTAA;SOR=1.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=106;WE=125462170;WS=125462152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	125467144	rs513209	C	A	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.531;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.75;MQRankSum=-0.149;NF=6;NR=45;PP=956;ReadPosRankSum=1.745;SC=GAAAAAAAAACCCTTAAATTC;SOR=2.356;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=51;WE=125467152;WS=125467133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,60:0.95:63
chr11	125478209	rs6590153	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CAGCTTTTTTCCTTTTTTCTT;SOR=1.714;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=14;WE=125478217;WS=125478199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr11	125479363	rs2241502	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=611;ReadPosRankSum=-1.748;SC=GTTTCTACTCGCTGCTGGATC;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=36;WE=125479371;WS=125479353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr11	125479496	rs2241501	C	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=947;ReadPosRankSum=1.981;SC=TATGTGGCCTCGTGTTCTGAA;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=59;WE=125479504;WS=125479486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr11	125482345	rs538232	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TACTGCAACTGTTTCAAGTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=125482353;WS=125482335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	125489788	rs525186	A	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=468;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TCTACTCTCAACAAATTGCAG;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=25;WE=125489796;WS=125489778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr11	125497466	rs491528	G	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=222;ReadPosRankSum=1.918;SC=TAGAAGAAATGGAATTCTGTA;SOR=0.318;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=15;WE=125497474;WS=125497456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr11	125514274	rs541725	T	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TCACATGTATTCTTTTTTGGT;SOR=1.215;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=9;WE=125514282;WS=125514264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	125514573	rs521102	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=0.093;SC=ACCTTTTCCTGAAGAAGAATT;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=17;WE=125514581;WS=125514563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	125525195	rs506504	A	G	4369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=74;PP=2691;SC=CAGCCAGAAGATTTGGCTTCC;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=136;WE=125525203;WS=125525185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	125547660	rs7949943	C	G	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CACCTGAAGTCAATGACTGGC;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=83;TCR=35;TR=62;WE=125547668;WS=125547650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,75:0.54:140
chr11	125616483	rs498803	G	T	7525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=85;PP=2965;SC=TTGAGTGGATGTTCATAGAAG;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=152;WE=125616491;WS=125616473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	125616502	rs2553829	T	A	7541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=88;PP=2965;SC=AGCTTTGAGATGGGGTTTGGA;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=152;WE=125616510;WS=125616492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	125617193	rs11220207	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=421;ReadPosRankSum=-1.493;SC=GGACCCTGAAGGGCAGACTAT;SOR=0.986;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=32;WE=125617201;WS=125617183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr11	125617317	rs496459	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.847;NF=15;NR=17;PP=437;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GTAAGTATGAAGAGGACCTGT;SOR=0.534;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=32;WE=125617325;WS=125617307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr11	125617376	rs5795459	CT	C	597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=565;SC=ATTCCTCCACCTTTCTTTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=125617384;WS=125617366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	125617606	rs537916	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=444;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GATAGAAATTGTTCAGTGTAG;SOR=1.206;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=13;WE=125617618;WS=125617596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr11	125617610	rs2114084	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=879;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GAAATTGTTCAGTGTAGGATG;SOR=0.749;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=22;WE=125617618;WS=125617596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr11	125617769	rs542285	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=801;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TATACAGGGACGTATCAGCCA;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=56;WE=125617786;WS=125617759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
chr11	125617881	rs541350	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-2.324;SC=GAAAATTAGATGGAGGTGGTC;SOR=0.111;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=12;WE=125617889;WS=125617871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr11	125617908	rs2282539	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.038;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=0.419;SC=GAGGGTGGGGGCCTACAGCTA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=125617916;WS=125617898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr11	125618709	.	TCA	T	379	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=379;QD=42.7777777778;SC=CTAAAAAAAATCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=125618718;WS=125618699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	125618728	rs35822751	CA	C	510.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr11	125618730	rs374899259	CT	C	510.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr11	125618731	.	T	C	187	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=9;PP=187;QD=20.1610193225;SC=ACACACACACTACAGAAGAGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=11;WE=125618739;WS=125618721;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,11:0.61:18
chr11	125647712	rs522690	T	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=13;PP=1510;SC=AAAAGAACACTACTGTTTCTC;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=125647720;WS=125647702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	125647982	rs1365081	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.355;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=618;ReadPosRankSum=-1.557;SC=GGACCTTATTCTTGCCTAGTG;SOR=1.127;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=29;WE=125647990;WS=125647972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr11	125648216	rs517463	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=161;SC=CAGTAATGAACCCCTTATCTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=125648224;WS=125648206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	125648321	rs10893426	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=344;ReadPosRankSum=-1.392;SC=TGGCAGGAGGCGAAACCCCTA;SOR=1.061;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=22;WE=125648329;WS=125648311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr11	125648503	rs494361	G	A	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=82;PP=2965;SC=CCATGTTACAGTCTCACATAC;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=174;WE=125648511;WS=125648493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	125659423	rs495869	A	C	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=776;ReadPosRankSum=0.751;SC=AGGGTCAGGGAAGGTGTTGTA;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=53;TCR=69;TR=53;WE=125659431;WS=125659413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr11	125707761	rs11220236	A	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=637;ReadPosRankSum=0.239;SC=TCCACCCTGCAGTTATGGGTC;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=40;WE=125707769;WS=125707751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr11	125708198	rs10160391	C	T	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=26;PP=1681;SC=TCTTCATTTTCAGGAGACAAA;SOR=1.464;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=80;WE=125708206;WS=125708188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	125763567	rs10717222	C	T	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=163;SC=TTTTTTTTTTCTTTTAAGAGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=125763575;WS=125763557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	125763746	rs3088241	C	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1032;ReadPosRankSum=0.040;SC=AATTAGTATTCTCTTCCTCTA;SOR=0.578;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=67;WE=125763754;WS=125763736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,77:0.48:160
chr11	125766044	rs549990	C	A	7663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=132;PP=2965;SC=CCAGCTCCTGCTGAATTTTCT;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=107;TCR=132;TR=239;WE=125766052;WS=125766034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr11	125766173	rs622756	A	C	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=40;PP=1304;SC=GTGTCATTATAAGCCATGATA;SOR=2.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=125766181;WS=125766163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	125766204	rs600761	G	C	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	125766207	rs471980	C	T	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	125776216	rs34692223	A	ATT,ATTT	861.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.89;QD=41.03;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,10,11:0.48,0.52:21
chr11	125776259	rs681416	G	C	233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=9;PP=197;SC=CTGTCCCCCAGGCTGGAGTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=125776267;WS=125776249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	125778074	rs5795465	AT	A	668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=0.407;SC=TAAGTGTTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=20;WE=125778082;WS=125778064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr11	125780194	rs2272104	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=-0.149;SC=ATTTTTATTGCAGTTGAAATT;SOR=0.392;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=125780202;WS=125780184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	125788678	rs683155	T	C	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=845;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CTAATGTTTGTGCCCGAGGTG;SOR=0.757;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=171;TCF=73;TCR=98;TR=82;WE=125788686;WS=125788668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr11	125810571	rs4937070	T	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=16;NR=23;PP=638;SC=GGACATCTCATTGCTGAGTGT;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=125810579;WS=125810561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	125810663	.	C	CT	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=15;MQ=59.58;NF=0;NR=3;PP=46;QD=16.6666666667;SC=AATTTTCTAACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=125810671;WS=125810653;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,3:0.25:12
chr11	125825412	rs73019364	A	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=235;SC=GTGAGTGTGGAACCCCAGTCA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=125825420;WS=125825402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	125830970	rs684535	A	T	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=53;PP=2086;SC=TACAATGTTGATCTCTGTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=125830978;WS=125830960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	125831701	rs2276061	G	A	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=77;PP=2965;SC=GCTGAGTAGGGACTGGTTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=183;WE=125831709;WS=125831691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	125848261	rs3740904	C	T	5332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=85;PP=2965;SC=GAGGCACGGCCGTGTACATTC;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=160;WE=125848269;WS=125848251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	125851300	rs624070	T	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=27;PP=652;SC=CACACACGCATGCACACATGC;SOR=2.115;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=35;WE=125851308;WS=125851290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	125864326	rs2155355	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=25;PP=662;SC=GAAAAATTAATGTAACCTTCT;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=125864334;WS=125864316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	125867039	rs140720667	TATATAA	T	2070.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=1937;SC=TGTCTCAAAATATATAAATAT;SOR=3.417;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=35;WE=125867061;WS=125867029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	125867053	rs11220309	G	T	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=9;PP=1213;SC=TAAATATATGGATCTAAAGTT;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=125867061;WS=125867029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	125873622	rs112706148	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=106;SC=GGCTGAGGCCGGAGAACTGCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=125873630;WS=125873621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	125873639	rs512761	G	T	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=171;SC=TGCTTGAACCGGGGAGGCGGA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=125873647;WS=125873629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	125891103	rs3832751	C	CA	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.091;NF=12;NR=2;PP=448;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ACAGTAATTTCAAGAAAACCC;SOR=0.631;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=14;WE=125891111;WS=125891093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	125891269	rs3740912	C	T	7406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=118;PP=2965;SC=TGAATCTTAACATGTTCCAGG;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=122;TCR=118;TR=240;WE=125891277;WS=125891259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr11	126045822	rs560813	T	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1151;ReadPosRankSum=0.874;SC=GGGTGTCTGTTCACCTTTCTG;SOR=0.483;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=68;WE=126045830;WS=126045812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr11	126079429	.	C	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=802;ReadPosRankSum=0.041;SC=TACTTCTTCACCACCTGACGG;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=54;WE=126079437;WS=126079419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr11	126080757	rs608367	T	C	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=36;PP=1398;SC=AGCTGCAGGTTCCTCCACCTT;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=126080765;WS=126080747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	126080776	rs71475941	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=640;ReadPosRankSum=1.245;SC=TTTCCCGCGTGGTCCTTACCA;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=39;WE=126080784;WS=126080766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr11	126081336	rs587891	T	C	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=34;PP=2033;SC=CTGGTCCCTTTGGACTCACCG;SOR=1.510;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=104;WE=126081344;WS=126081326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	126081403	rs2282580	T	C	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1009;ReadPosRankSum=0.393;SC=CGCTAATCTCTGGGCATTTAT;SOR=0.847;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=91;WE=126081411;WS=126081393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,113:0.51:220
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chr11	126138453	rs12786155	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-1.136;SC=AAGCGGAGTCCGGGTTACGCG;SOR=1.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=17;WE=126138461;WS=126138443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr11	126139100	rs1786702	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=929;SC=CTCAGAGGGGTTATGATTCGG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=126139108;WS=126139090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	126139313	rs1786703	T	A	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=65;PP=2394;SC=GGAAGGGGGTTAGCTTACCTA;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=108;WE=126139321;WS=126139303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	126145931	rs2276025	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=720;ReadPosRankSum=-1.066;SC=GCCTTCCCACTCCTCACCCTC;SOR=0.481;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=44;WE=126145939;WS=126145921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr11	126146244	rs56321210	C	T	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=509;ReadPosRankSum=0.579;SC=GGAGGGTTGCCGGCCATGCTG;SOR=1.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=126146252;WS=126146234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr11	126147713	rs594318	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=196;ReadPosRankSum=0.579;SC=TCCTCTCAGGCAGGCCATTGC;SOR=0.804;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=126147721;WS=126147703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	126160687	rs1893352	A	G	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.510;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=1068;ReadPosRankSum=0.209;SC=CTCTCTCTCTACCCTCTGTAG;SOR=1.103;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=71;WE=126160695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,80:0.46:173
chr11	126161490	rs614700	T	C	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=34;PP=842;SC=CGAAGCTCTCTGCTCCTCAGC;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=126161498;WS=126161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	126162843	rs8177374	C	T	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1654;ReadPosRankSum=1.944;SC=CCCCTGCTGTCGGGCCTCAGC;SOR=0.801;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=120;TCR=92;TR=105;WE=126162851;WS=126162833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,124:0.51:241
chr11	126163124	rs609634	C	T	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=25;PP=1626;SC=AGTAACTTGGCCAAGTTACTC;SOR=1.240;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=67;WE=126163132;WS=126163114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	126163691	rs611953	A	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=32;PP=984;SC=GGAGTGAGTCACAGCGCTTTG;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=126163699;WS=126163681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	126164349	rs625413	T	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=15;PP=1683;SC=CAGGGTTCAATGCCTTCACCT;SOR=2.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=77;WE=126164357;WS=126164339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	126176578	rs637462	G	A	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=43;PP=2003;SC=CTGAGCTCCAGTTGCAGTTCT;SOR=0.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=126176586;WS=126176568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	126213395	rs240536	T	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=57;PP=1789;SC=TTTCCTCACCTTTCCCAGAGT;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=87;WE=126213403;WS=126213385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	126278203	rs2298475	T	C	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1932;ReadPosRankSum=-0.167;SC=AACCCCCAGATTGAACAATGC;SOR=0.900;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=217;TCF=99;TCR=118;TR=107;WE=126278211;WS=126278193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,125:0.50:248
chr11	126294817	rs948052	G	A	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1380;ReadPosRankSum=-1.408;SC=CACGCTGCTTGCCCGCAGGAC;SOR=0.642;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=206;TCF=100;TCR=106;TR=98;WE=126294825;WS=126294807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,125:0.52:241
chr11	126301481	rs3802817	T	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=582;SC=TATCCCCCCATGATCTCACCC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=126301489;WS=126301471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	126305279	rs4937132	C	G	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=49;PP=1523;SC=GCTGCTTGAGCGGGGCTGGGT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=126305287;WS=126305269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	126310082	rs878830	A	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=0.347;SC=TGCCCTTAGGATGCGGAATTT;SOR=0.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=126310090;WS=126310072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr11	126310119	rs3740917	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=356;ReadPosRankSum=-0.214;SC=GTCAGAGCTCAGCAGAATGGC;SOR=0.137;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=26;WE=126310127;WS=126310109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr11	126310156	rs3740918	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=560;ReadPosRankSum=0.200;SC=AGCACTGCCTGTTCTGAGAAA;SOR=1.007;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=35;WE=126310164;WS=126310146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr11	126310299	rs3212313	T	C	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=64;PP=1994;ReadPosRankSum=0.099;SC=AAGTGACTGTTGGGCTGCTGG;SOR=0.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=311;TCF=169;TCR=142;TR=138;WE=126310307;WS=126310289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,153:0.43:358
chr11	126315024	rs3802819	T	C	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1372;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CAGGCTCAGATGCCAAGAGCA;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=83;TCR=98;TR=113;WE=126315032;WS=126315014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,135:0.63:214
chr11	126315056	rs3802820	C	A	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=1156;ReadPosRankSum=0.943;SC=GCACTCTTGTCTCTGGGAACA;SOR=1.126;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=79;WE=126315072;WS=126315046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,86:0.59:147
chr11	126396674	rs674537	G	A	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=40;PP=1138;SC=CAGGGCTGGCGCAGGAGACTG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=126396682;WS=126396664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	126526181	rs523249	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=22;PP=712;SC=CATAACCTCCATGATTCAGTT;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=126526189;WS=126526171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr11	126858392	rs670637	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCCTTCCTGAAGAATTTCAGA;SOR=0.105;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=126858414;WS=126858382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
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chr11	126858484	rs558276	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GGCTCCTGAATGGAGCAGCAG;SOR=1.492;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=126858492;WS=126858474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	126873226	rs7115473	G	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=0.269;SC=GGCTGCCCGCGGCCTCACCTC;SOR=0.148;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=126873234;WS=126873216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr11	126873592	rs494442	C	T	8060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=108;NR=131;PP=2965;SC=TGCAAGCCGGCGGGATGCCAG;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=108;TCR=132;TR=239;WE=126873600;WS=126873582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr11	126873721	rs11377295	G	GC	2660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=53;PP=2326;SC=TGAGCCCCTGGCCCGCCCCCC;SOR=1.854;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=54;WE=126873729;WS=126873711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	128332262	rs34846069	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=0.075;SC=GCCATCACTCGTCGGCATCTG;SOR=0.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=12;WE=128332270;WS=128332252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr11	128355859	rs1122832	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=658;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TAAGAAGATATTATTTTTGAT;SOR=1.557;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=33;WE=128355867;WS=128355849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr11	128359269	rs79963544	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=412;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TTACCCAGGGCGCAGAGGGCT;SOR=0.902;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=30;WE=128359277;WS=128359259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr11	128443083	rs7935676	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=1.336;SC=ATGCTCACAGGTTTGTGGATT;SOR=0.791;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=20;WE=128443091;WS=128443073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr11	128443099	rs7935393	A	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=0.543;SC=GGATTAGAATACACAAGGAAG;SOR=0.546;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=18;WE=128443107;WS=128443089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr11	128634760	rs74400777	C	T	126.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.8061;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGGAGGAGGGCCAGCTGGGCA;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=4;WE=128634768;WS=128634750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr11	128638216	rs35044982	TG	T	2486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=53;PP=1603;SC=CCCCACTCTCTGGGGGGGCAG;SOR=1.668;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=57;WE=128638224;WS=128638206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	128652012	rs639336	G	T	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=62;PP=1932;SC=ACCAGCTTGCGTGTTCCACTC;SOR=1.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=128652020;WS=128652002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	128679211	rs630797	G	C	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=823;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TAACATGCACGTCTTTCCTTG;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=48;WE=128679219;WS=128679201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr11	128680466	rs61733405	C	G	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1596;ReadPosRankSum=2.632;SC=TGACGGACCCCGATGAGGTGG;SOR=0.653;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=231;TCF=114;TCR=117;TR=107;WE=128680474;WS=128680456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,132:0.46:290
chr11	128708947	rs1231254	T	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=609;ReadPosRankSum=-1.149;SC=CCCTAAATTGTTGACTGCTTC;SOR=0.914;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=35;WE=128708955;WS=128708937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr11	128774474	rs11221507	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CTGCGGCTTCTTAGCAAAACC;SOR=1.426;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=15;WE=128774482;WS=128774464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	128781339	rs6590357	T	C	7073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=0.802;SC=TGGAGAAGAGTGGCAAGTGCA;SOR=0.279;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=240;TCF=112;TCR=128;TR=237;WE=128781347;WS=128781329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,252:1.00:253
chr11	128781978	rs7118824	T	G	7289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=83;PP=2965;SC=GCCTCTTCCTTGTGTCTCCTC;SOR=0.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=140;WE=128781986;WS=128781968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	128782002	rs7118833	T	C	6646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	128782012	rs7102584	C	G	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	128786139	.	A	AGATGGATGGATG	248.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=525;SC=ATAGATGATTAGATGGATGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=128786147;WS=128786132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	128786294	rs4937391	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=438;ReadPosRankSum=0.367;SC=TGTAACTTCCGTTTCCCCAGG;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=27;WE=128786302;WS=128786284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr11	128804789	rs2155548	C	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GTCATGTAGACTATGGCTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=7;WE=128804797;WS=128804779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	128842243	rs77561606	A	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	128842251	rs76301868	G	T	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	128846547	rs665619	C	A	6384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=111;PP=2965;SC=ATAAAAAACACATAGTGTGAA;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=81;TCR=111;TR=192;WE=128846555;WS=128846537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr11	128846664	rs10893943	T	C	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=37;PP=1093;SC=TTTAGTACTCTATTACATAAT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=128846672;WS=128846654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	128868090	rs669678	G	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=692;SC=AGAAAGCTTAGTACATGCATT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=128868098;WS=128868089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	128868239	rs670440	T	C	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=92;PP=2965;SC=TTAGAAGGTGTTCCCCCAGGT;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=194;WE=128868247;WS=128868229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	128932128	rs35714464	A	AG	9163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=72;PP=2979;SC=TGAATCATAAAAAAACTTTCC;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=147;WE=128932136;WS=128932118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr11	128934033	.	T	TAAA	79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=79;QD=29.3333333333;SC=CAAAGAGTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=128934041;WS=128934023;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr11	129061849	rs2511810	G	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=380;SC=CTGCTCCCTTGAGCTCCAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=129061857;WS=129061839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	129722553	rs558813	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=218;ReadPosRankSum=1.146;SC=TTTTCCGTCACTGGTAAGAGC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=13;WE=129722561;WS=129722543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr11	129728603	rs371642069	T	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=979;ReadPosRankSum=-0.149;SC=AGGGCGCAGATGTCCCACTGC;SOR=0.462;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=113;TCF=22;TCR=91;TR=56;WE=129728611;WS=129728582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr11	129735677	rs3817614	G	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=0.682;SC=GCCCCAGAAAGACCAGCCACT;SOR=1.371;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=11;WE=129735685;WS=129735667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	129743012	rs1650826	A	G	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=41;PP=1548;SC=GCATGAGGCCAAGAGCTTAAT;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=129743020;WS=129743002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	129744252	rs1030467	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=684;ReadPosRankSum=3.631;SC=CAAAGAAAACTCACCTGGTGT;SOR=0.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=46;WE=129744260;WS=129744242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,48:0.37:131
chr11	129744872	rs1016364	A	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AAGTTATTTGAACTCTAGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=12;WE=129744880;WS=129744862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	129752177	rs1783910	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=597;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TAGCAGTCATAAAAGAGTTCA;SOR=0.605;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=36;WE=129752185;WS=129752167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr11	129752991	rs2293664	G	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=489;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TCAGATGAAGGCTCCTAGAGG;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=28;WE=129752999;WS=129752981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr11	129753900	rs2303663	T	C	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CGTGTCTTCCTCAGGACAGCC;SOR=1.075;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=125;TCF=90;TCR=35;TR=76;WE=129753908;WS=129753890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,89:0.62:143
chr11	129754103	rs3214551	T	TG	4837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=78;PP=2974;SC=TCTGGTCACTTTCAAAAGTAA;SOR=2.207;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=8;TCR=84;TR=85;WE=129754111;WS=129754093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	129754627	rs12574106	G	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=0.502;SC=GACAGCGGCAGCTTGGTTCTC;SOR=0.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=129754635;WS=129754617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	129754644	rs1131972	A	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=5;PP=536;SC=TCTCACCTGCAGTTTTCATAT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=129754652;WS=129754634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	129755669	rs1783914	G	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=408;SC=CGAAGAATCTGTATTGATTAC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=129755677;WS=129755659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	129758327	rs1650823	G	A	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=19;PP=2598;SC=TTGTTTTTTAGAACACAGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=85;TCR=19;TR=104;WE=129758335;WS=129758317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	129772172	rs1540408	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=279;ReadPosRankSum=-0.695;SC=AGAACAGACATGAGGTGGGTG;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=18;WE=129772180;WS=129772162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr11	129780436	rs141740226	T	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=772;ReadPosRankSum=-0.221;SC=ATTCTGCTGCTGCTGCTGCTG;SOR=0.682;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=53;WE=129780444;WS=129780426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr11	129793305	rs2241573	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=1.063;SC=TCACCTGGTGATAAGAACCAC;SOR=0.721;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=23;WE=129793313;WS=129793295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr11	129794950	rs2241571	T	C	4660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=100;PP=2472;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TCCAAGGATGTGCTGCTGATG;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=305;TCF=135;TCR=170;TR=173;WE=129794958;WS=129794940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,215:0.58:368
chr11	129801043	rs2277033	C	T	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1663;ReadPosRankSum=0.301;SC=ACTGGGTTTCCTGTGGCAGCT;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=96;WE=129801051;WS=129801033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,110:0.52:211
chr11	129940076	.	GTGCGGCGCCGGGGGTCCGGCTC	G	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	129940806	rs112826009	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=0.515;SC=GCGAAGCGGCAGGGCCGGGGG;SOR=2.400;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=19;WE=129940814;WS=129940796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr11	129998900	rs651935	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=15;PP=957;SC=AGGCTTCCTCTGGGTGCCACA;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=129998908;WS=129998890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	130060612	rs858704	A	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=544;ReadPosRankSum=-0.165;SC=GGGGGCGGGTAGGGCTGTGGG;SOR=1.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=34;WE=130060620;WS=130060602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr11	130064223	rs610005	A	G	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=64;PP=2028;SC=CCCTCGGGCCACAGAGAAGGG;SOR=2.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=86;WE=130064231;WS=130064213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	130064647	rs597661	G	A	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.14;MQRankSum=1.593;NF=43;NR=67;PP=1751;ReadPosRankSum=-1.936;SC=GAGCTATGGGGCGTGTGAACG;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=196;TCF=74;TCR=122;TR=110;WE=130064665;WS=130064637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,126:0.55:231
chr11	130064705	rs597576	A	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=68;PP=1926;SC=CTCCCTGTGCAGATGTGTGTG;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=87;WE=130064713;WS=130064695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	130064747	rs58417767	ATGTGTGTG	A,ATGTGTG	817.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.13;QD=35.55;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,16,7:0.70,0.30:23
chr11	130066261	rs17667603	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=1.055;SC=TGTGAAGGTGCGCTTCAAATT;SOR=0.587;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=26;WE=130066269;WS=130066251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,29:0.31:95
chr11	130066335	rs476106	C	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=876;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TGGAGATCAACGGGGAGAAGT;SOR=0.766;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=57;WE=130066343;WS=130066325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
chr11	130066372	rs858713	G	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=745;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GGGGGCTGCCGGGCCCATGCT;SOR=1.075;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=41;WE=130066380;WS=130066362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr11	130066452	rs11368852	G	GC	976.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=642;ReadPosRankSum=-0.542;SC=CTTGTGCCCCGCCCCCCCTCC;SOR=1.055;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=31;WE=130066460;WS=130066442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr11	130067892	rs858715	C	T	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=36;PP=1116;SC=CCACCCTGCCCGCGTCCCATG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=130067900;WS=130067882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	130067987	rs595073	A	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=606;SC=CTCTGGCCCCACTCCCCACCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=130067995;WS=130067977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	130069790	rs613501	T	G	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=53;PP=2495;SC=TGTCCCCTTGTGGTTTGATGT;SOR=1.097;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=131;WE=130069798;WS=130069780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	130070111	rs117266705	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AGGTTGGCACCGAGGCAGGGC;SOR=1.721;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=17;WE=130070119;WS=130070101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	130270855	rs59317921	T	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=30;PP=1698;SC=AACTTGAAATTTCCAGTGTCC;SOR=1.116;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=130270863;WS=130270845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	130271647	rs747249	A	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=15;PP=1236;SC=GCTGGCTTAGATGGGTGACTT;SOR=1.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=54;WE=130271655;WS=130271637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	130271678	rs747250	T	G	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=25;PP=2003;SC=ACATTCCACATGCAGCTCTCC;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=89;WE=130271686;WS=130271668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	130278924	rs2291344	T	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=683;SC=AGCACTTTTCTTCTTTCTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=130278932;WS=130278914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	130281488	rs2131535	G	A	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=83;PP=2448;SC=GCCTCCATCTGCCACGGGCTG;SOR=1.592;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=118;WE=130281496;WS=130281478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	130284344	rs7106106	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=16;PP=1766;SC=GTGGTTTCCTTCTGGAGAACA;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=70;WE=130284352;WS=130284334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	130286766	rs2291347	G	A	7116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=86;PP=2965;SC=TAGGATCTACGCAACCTTGGA;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=146;TCR=87;TR=232;WE=130286774;WS=130286756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	130297948	rs7927048	C	G	6259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	130297957	rs7942034	T	C	6533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	130298117	rs10548872	GGCA	G,GGCAGCA	1432.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=3,3;NR=21,21;PP=622,714;SC=GCGGGCCAGCGGCAGCAGCAG;SOR=1.949;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=24,24;WE=130298127;WS=130298107;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.56,0.44:36
chr11	130298447	rs903024	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=24;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TCCTCCGCCCCTGCCCGCGCC;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=130298455;WS=130298437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	130298454	rs376646843	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	130332263	rs73044871	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=510;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGTGCCCCCTCGGAGCCGGGC;SOR=1.647;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=30;WE=130332271;WS=130332253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr11	130332313	rs61300224	C	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GGTTCATTATCCCCTTACCAT;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=141;TCF=96;TCR=45;TR=56;WE=130332346;WS=130332303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,69:0.41:169
chr11	130332325	.	C	G	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.620;SC=CCTTACCATTCAGATTCTGGG;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=107;TCR=59;TR=101;WE=130332346;WS=130332303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,115:0.59:195
chr11	130332338	rs11604959	A	G	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.181;SC=ATTCTGGGCTAGCCAAACCTC;SOR=0.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=118;TCR=72;TR=77;WE=130332346;WS=130332303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,93:0.42:224
chr11	130339312	rs731446	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=317;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GATCCTGCAATCTGGAGCCCT;SOR=0.664;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=28;WE=130339320;WS=130339302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,36:0.36:101
chr11	130716157	rs7943757	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=441;ReadPosRankSum=-0.846;SC=GATTCTATTGCATAATCTCCA;SOR=0.784;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=29;WE=130716165;WS=130716147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,40:0.38:105
chr11	130731518	rs202084321	CCTT	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=1.363;SC=TGGGGGAAGTCCTTCTTCTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=130731528;WS=130731508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr11	130748131	rs3190331	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=1.120;SC=AAACGTGCATACAACTGGGAC;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=23;WE=130748139;WS=130748130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr11	130749715	rs2282528	A	G	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=98;PP=2933;SC=TAGGTATTTCAGGCCTACCTC;SOR=1.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=38;TCR=98;TR=136;WE=130749723;WS=130749705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	130750642	rs2298566	A	C	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=49;PP=1864;SC=CTGAAGAAGCAGGAGGTACTG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=130750650;WS=130750632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	130763772	rs3794143	C	T	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.409;SC=ACCAATTTACCCAACTCCCTC;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=62;TCR=79;TR=80;WE=130763780;WS=130763762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr11	130773076	rs3751039	G	A	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=1098;ReadPosRankSum=0.498;SC=AGATTCCCTGGACACTATTCA;SOR=0.889;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=60;WE=130773084;WS=130773066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,79:0.60:131
chr11	130775688	rs3198419	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=681;ReadPosRankSum=1.707;SC=TACTACTCATCTCTGTGCCCC;SOR=0.984;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=37;WE=130775696;WS=130775678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr11	130775782	rs1865298	C	T	7364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=89;PP=2965;SC=ACTCCAACTACCCCAAGTACC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=129;TCR=89;TR=218;WE=130775790;WS=130775772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr11	130776524	rs4414223	T	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.854;NF=17;NR=2;PP=394;ReadPosRankSum=0.879;SC=TCTTACCACATTGCCTTCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=19;WE=130776532;WS=130776514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr11	130776613	rs4373936	A	G	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.918;NF=41;NR=29;PP=1162;ReadPosRankSum=0.933;SC=ACCTCAGCCTAGACCTGGTAC;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=70;WE=130776621;WS=130776603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr11	130776646	rs4586174	T	A	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=73;PP=2786;SC=CAGAAACAGGTTGTAATTTAT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=148;WE=130776654;WS=130776636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	130776690	rs6590536	C	T	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=52;PP=2658;ReadPosRankSum=-0.608;SC=CTGGCAAGTACTGATAATAAA;SOR=0.868;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=88;WE=130776709;WS=130776680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,99:0.56:176
chr11	130776701	rs6590537	A	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=3;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=2658;ReadPosRankSum=-1.179;SC=TGATAATAAAACACAACAAGA;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=79;WE=130776709;WS=130776680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,90:0.57:159
chr11	130780015	rs1781	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=483;ReadPosRankSum=-0.693;SC=TAGCGATCTCCGGAATGGCAC;SOR=0.676;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=33;WE=130780023;WS=130780005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr11	130780225	rs681982	C	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=433;SC=CCATGTTTCCCAATGGAAGAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=130780233;WS=130780215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	130784007	rs3838799	TA	T	1209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=1171;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TACTCTGCCTTACATATTAGC;SOR=0.631;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=18;WE=130784019;WS=130783997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr11	130784011	rs118027083	T	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CTGCCTTACATATTAGCTTCA;SOR=0.758;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=28;WE=130784019;WS=130783997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr11	130784754	rs3751037	C	G	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=46;PP=2965;SC=GGACCTCGAACATTTGGCTGT;SOR=1.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=106;TCR=46;TR=152;WE=130784762;WS=130784744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	130784971	rs3751036	C	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=53;PP=2282;SC=GCAGAGATGTCGGCACTGAGG;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=85;WE=130784979;WS=130784961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	131530083	rs2472253	G	C	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=18;PP=1056;SC=GTAGGACTCGGGTGGGCCAGT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=131530091;WS=131530073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	131531000	rs2739287	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=45;PP=1487;SC=GTCTTCCCCCTAGATTCGGTG;SOR=1.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=131531008;WS=131530990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	131531015	rs2658857	T	G	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=44;PP=1300;SC=TCGGTGGAGATTCCTTTCCTC;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=131531023;WS=131531005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	131781634	rs11222836	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=847;ReadPosRankSum=0.016;SC=GGCGTGCCTGGGTTGGCGGAG;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=44;WE=131781642;WS=131781624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr11	132177563	rs2305272	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=822;ReadPosRankSum=0.376;SC=TTTCACCACACGTTACCGGTT;SOR=1.007;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=137;TCF=90;TCR=47;TR=55;WE=132177571;WS=132177553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,68:0.39:174
chr11	132177633	rs2305271	A	C	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=102;PP=2965;SC=GGGCATCACCAGGGAGCAGTC;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=186;WE=132177641;WS=132177623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	132177740	rs2305270	G	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=430;ReadPosRankSum=0.360;SC=ACCACCACGCGCCCTGCACGT;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=26;WE=132177748;WS=132177730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr11	132184394	rs730253	G	C	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=4;PP=952;SC=TTCTTCCTATGAGGACACATA;SOR=3.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=132184402;WS=132184384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	132200128	rs3837377	T	TA	4613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=84;PP=2966;SC=GTGGGGTATGTAAAACTCTTC;SOR=1.836;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=105;TCF=8;TCR=97;TR=92;WE=132200136;WS=132200118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	132205215	rs8894	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=543;SC=GGGGGGAAAAAAGTTTTAAAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=132205223;WS=132205205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	132306153	rs1940024	T	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1114;ReadPosRankSum=2.339;SC=AAGACATTGCTATCAATTCAT;SOR=0.678;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=75;TCR=118;TR=78;WE=132306161;WS=132306143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,95:0.43:221
chr11	132306403	rs2298479	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=-0.802;SC=TTTTTTTCTCGTTGTAAAAAT;SOR=0.129;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=132306411;WS=132306393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	133328729	rs113245202	T	C	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=282;SC=TGTGTGTGTATATACACATAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=133328750;WS=133328719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	133328742	.	G	A	71	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=71;QD=35.2570708491;SC=ACACATAGATGCACGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=133328750;WS=133328719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	133328779	.	C	CAT	306	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.34;NF=6;NR=1;PP=306;QD=46.1428571429;SC=CATACACACACATGTGTGTGT;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=7;WE=133328787;WS=133328769;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,7:0.32:22
chr11	133788869	rs10791338	A	G	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=46;PP=2104;SC=GACGGCAGGGAAGAAGGATGA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=133788877;WS=133788859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	133788992	rs12800905	T	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.14;NF=29;NR=33;PP=1055;SC=TCTGTCTCTCTGCAGCTTCCT;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=133789000;WS=133788982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	133792021	rs596430	T	C	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.607;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.136;NF=105;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GGTCTACCTATGCGCCCCCTG;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=105;TCR=78;TR=183;WE=133792029;WS=133792011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr11	133792644	rs34845616	G	A	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=33;PP=969;SC=AGGGTGGGGAGCACTCATGAG;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=133792652;WS=133792634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	133794599	rs329670	T	C	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=32;PP=2965;SC=AACCAGGCACTGCCTTAGTTT;SOR=2.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=107;TCR=32;TR=138;WE=133794607;WS=133794589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	133801262	rs329671	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-0.237;SC=CCCGGGGCTCGCTGGGCCCTC;SOR=0.476;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=10;WE=133801270;WS=133801252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	133805585	rs329637	C	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=798;ReadPosRankSum=0.605;SC=TGTACTTCCCCGAGTCCTCCG;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=58;WE=133805593;WS=133805575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr11	133814191	rs595986	A	G	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=812;ReadPosRankSum=1.987;SC=CTTTGCACTCATACCAGCCCT;SOR=0.404;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=56;WE=133814199;WS=133814181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr11	133822133	rs73034295	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=2.100;SC=CATGGGCAGCGCCTTTTGGGG;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=133822141;WS=133822123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	134018850	rs373298428	AACAC	A	1060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.000;QD=31.20;ReadPosRankSum=0.679;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr11	134064528	.	TA	T	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,14:0.16:86
chr11	134093662	rs144391118	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=1.706;SC=GCCCCCACCCCGCCCCCACCG;SOR=1.209;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=10;WE=134093670;WS=134093652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	134105030	rs1259022	A	G	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=676;SC=CCACTTTGAGAATCTTCACAG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=134105038;WS=134105020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	134126612	rs473041	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=36;PP=956;SC=CTTTGTCTCCTGATAATGTAA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=134126620;WS=134126602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	134132559	rs561945	G	A	4838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=83;PP=2881;SC=CAGAACGGGGGCGGGATCGCT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=148;WE=134132567;WS=134132549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	134146483	rs181828569	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	134151975	rs472287	G	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=20;PP=2109;SC=CGTCCAGGCCGCTACATCTGC;SOR=2.454;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=91;WE=134151983;WS=134151965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	134152030	rs10791352	G	A	6105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=77;PP=2965;SC=CGGGGCTACAGTCCCAGAGTC;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=112;TCR=77;TR=189;WE=134152038;WS=134152020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr11	134177275	rs2510356	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=-1.070;SC=ATAGAAATTACATGGTTCCCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=134177283;WS=134177265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	134180695	rs526507	G	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=394;ReadPosRankSum=0.726;SC=GAACCCTGGGGTTAAAATCTG;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=20;WE=134180703;WS=134180685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr11	134181101	rs1144218	T	C	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=51;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GGAGTGGCCATTGGAGGGATG;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=37;TCR=85;TR=73;WE=134181109;WS=134181091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,76:0.58:132
chr11	134182135	rs751719	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=366;ReadPosRankSum=-1.377;SC=ATTTCCCATTTGAAGAACCCT;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=23;WE=134182143;WS=134182125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr11	134182375	rs2509062	G	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=833;SC=CGCTCATGACGTGGCACAGGT;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=134182383;WS=134182365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	134182583	rs369227852	C	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.84;ReadPosRankSum=1.170;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr11	134182856	rs1144216	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=572;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TGAGACAGTCAGCCTCCCTTC;SOR=1.218;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=32;WE=134182864;WS=134182846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr11	134183235	rs11223754	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=315;ReadPosRankSum=-1.310;SC=AACGGGTTGTCGGGTAGACGC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=134183243;WS=134183225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	134183450	rs1144215	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=0.650;SC=CGGGAGAGGGTGGGGAAACCA;SOR=1.292;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=15;WE=134183458;WS=134183440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr11	134184141	rs1144214	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	134188542	rs481252	T	C	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=14;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.559;SC=ATTATGGATTTGTGTTCATCA;SOR=1.086;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=118;TCF=86;TCR=32;TR=62;WE=134188550;WS=134188532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr11	134188851	.	A	AT	128	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5044;HP=15;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=59.09;NF=3;NR=9;PP=128;QD=10.9166666667;SC=GTGTCTGAACATTTTTTTTTT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=12;WE=134188859;WS=134188841;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr11	134201864	rs3098651	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=0.191;SC=AGGCGACCAGTGCGCGGCTCC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=134201872;WS=134201854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	134226244	rs61740182	G	A	2631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=38;PP=1676;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AATGAATATGGTTCCTATAAT;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=106;TCR=66;TR=102;WE=134226252;WS=134226234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,117:0.56:210
chr11	134237113	rs10791357	C	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=11;PP=711;SC=TTTTGTCTGGCCAGCCTGCTT;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=134237121;WS=134237103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	134238389	rs3741100	G	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=668;SC=TTCTGTGATTGGGGTTTTATG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=134238397;WS=134238383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	134240142	rs10791358	T	C	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=32;PP=2324;SC=GAGCAGGCAGTGACATTTGGG;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=87;TCR=32;TR=119;WE=134240150;WS=134240132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	134241094	rs4937880	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1213;SC=CAGCTCTGCAATAGGCGTCTC;SOR=1.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=134241102;WS=134241084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	134251777	rs729687	C	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=426;ReadPosRankSum=0.951;SC=AACCTGGTGCCGCCCTGCCCA;SOR=0.776;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=28;WE=134251785;WS=134251767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr11	134856661	rs1971950	C	A	7167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=1.270;SC=ATGCTTGGACCCCAGCTTGTA;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=82;TCR=149;TR=229;WE=134856669;WS=134856651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr12	176139	rs17852242	A	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.414;NF=15;NR=14;PP=382;ReadPosRankSum=2.298;SC=CCTCATCCACACCCAGCGAGA;SOR=0.663;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=29;WE=176147;WS=176129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr12	235022	rs12822449	C	T	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=36;NR=27;PP=1151;SC=GGCGCTGTGCCCCCACGCCCC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=63;WE=235030;WS=235012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	235126	rs112633842	G	GC	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=436;ReadPosRankSum=-0.558;SC=AAGGGGCCCTGCTTTGGGGGC;SOR=0.665;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=13;WE=235136;WS=235116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr12	235128	rs11608642	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=556;ReadPosRankSum=0.820;SC=GGGGCCCTGCTTTGGGGGCTG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=25;WE=235136;WS=235116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr12	247900	rs7313003	G	A	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=931;ReadPosRankSum=1.975;SC=GGGCGCCGGAGAGCGCGGGCC;SOR=1.031;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=50;WE=247908;WS=247890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr12	248202	rs56204927	C	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=35;PP=1478;SC=GCAGAGGCTGCGGCTAGTGGG;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=248210;WS=248192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	250130	rs12321262	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=1.200;SC=ATCCTCTGCGTGAGGACATTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=250138;WS=250120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	250239	rs2291928	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=592;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GGAAAGAGTCATGGATGGCTT;SOR=0.772;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=49;WE=250247;WS=250229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr12	271373	rs4980805	A	G	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=103;SC=ACTGTGTGCCAGACACTGCAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=271381;WS=271363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr12	274647	rs4980859	T	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=1084;ReadPosRankSum=1.599;SC=CGTACACCTTTTGCAAGTCAG;SOR=0.486;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=65;WE=274655;WS=274637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr12	274839	rs2291923	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=367;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TGGCTGGCTCTGGCCCTCGGC;SOR=0.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=22;WE=274847;WS=274829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr12	275065	rs2291922	A	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=541;ReadPosRankSum=-1.971;SC=GTGTAAGGACACGGGCTCCCG;SOR=0.634;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=35;WE=275073;WS=275055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr12	280349	rs2291919	C	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=815;ReadPosRankSum=1.182;SC=CCTGGTTGCCCAGGTGAGTGA;SOR=0.850;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=57;WE=280357;WS=280339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr12	283642	rs2291917	C	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=549;SC=GGAGAGATGGCGAGAGGGTCA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=283650;WS=283632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	284058	rs216230	T	C	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=46;PP=1369;SC=CCCTGGGCGGTCCCGGCTCTC;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=284066;WS=284048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	301843	rs646569	A	G	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=53;PP=1693;SC=AGCCATGGGTAAGATAGGGGG;SOR=1.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=75;WE=301851;WS=301833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	310078	rs73604805	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.643;SC=CCCACTCCCCACCTCCCCCAC;SOR=0.818;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=9;WE=310086;WS=310068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr12	319111	rs526690	T	C	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=82;PP=2291;SC=CCCAGGAGACTGCAGGAGGCC;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=130;WE=319133;WS=319101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	319125	rs557881	A	G	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=70;PP=2339;SC=GGAGGCCCACACTCTTGCACT;SOR=1.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=113;WE=319133;WS=319101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	330315	rs570680	T	G	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=61;PP=1892;SC=CAACATCTGCTGCCTCCCCAC;SOR=1.219;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=330323;WS=330305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	332362	rs2289954	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=490;ReadPosRankSum=0.217;SC=TGCCACTGGCCGCATAGTAGT;SOR=0.708;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=33;WE=332370;WS=332352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,51:0.45:113
chr12	335434	rs3782867	C	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=407;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CAGAACGCATCCACTGAATGG;SOR=0.569;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=23;WE=335442;WS=335424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr12	347068	rs2289957	T	A	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=799;SC=CGGCCCACAGTGGGTGGGGAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=347076;WS=347058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	351711	rs525797	T	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=769;SC=GGGGATATAGTGACAAGCCCA;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=351719;WS=351701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	442832	rs138072544	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=681;ReadPosRankSum=-0.858;SC=AAAGAAGTAACTGTTTAGCTA;SOR=1.095;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=39;WE=442840;WS=442822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr12	464254	rs3759371	T	C	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=38;PP=2811;ReadPosRankSum=1.321;SC=CCATGATATATCAGGATAGAA;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=93;TCR=38;TR=130;WE=464262;WS=464244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr12	495217	rs10774152	G	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=29;PP=904;SC=TTAAAGGGGGGTTTTGCCACA;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=36;WE=495225;WS=495207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	496439	rs7965303	A	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=632;SC=AATCTGCCAAAACTAAAATTA;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=496447;WS=496429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	496533	rs10848877	C	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=221;SC=AGTAAAAAAACTTTTTTTAAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=496541;WS=496523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	537828	.	G	T	156	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=63.02;NF=6;NR=1;PP=156;QD=27.2530303639;SC=TTAATTTGGGGTTACAATTGT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=537849;WS=537818;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	537841	.	T	TA	177	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=10;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=62.82;NF=8;NR=0;PP=177;QD=23.625;SC=ACAATTGTTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=537849;WS=537818;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,8:0.57:14
chr12	540994	rs7310504	A	G	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=781;SC=AGAAAAGCTGAGTAAAATCTT;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=541002;WS=540984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	550911	.	CT	C	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9999;HP=20;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=18;MQ=58.99;NF=6;NR=3;PP=88;QD=10.1111111111;SC=ATCATCATTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=9;WE=550919;WS=550901;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,9:0.47:19
chr12	619618	rs11830324	T	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.431;SC=CATGGGGGGGTTGGACGCTGG;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=5;WE=619626;WS=619608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	619660	.	AGGGAAACG	A	428	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.08;NF=6;NR=3;PP=428;QD=53.9751790481;SC=CTGGGCTGGGAGGGAAACGGG;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=9;WE=619675;WS=619650;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
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chr12	645557	rs34868457	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=0.229;SC=TACTAGGGACCTTCTACCGTA;SOR=0.184;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=645565;WS=645547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	652470	rs34907895	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-0.974;SC=CCCAGCCTCCCGGAGCTGAGG;SOR=0.260;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=17;WE=652478;WS=652460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
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chr12	653984	rs1008587	T	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=12;PP=1357;SC=TTCCCGCCAATCCTGGCGGGA;SOR=2.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=59;WE=653992;WS=653974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	654427	rs57782477	A	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=344;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGAAGCCACAGCATCAAGCA;SOR=0.356;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=24;WE=654435;WS=654417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr12	655707	rs4980937	T	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr12	658788	rs4980938	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=0.875;SC=TGTGGCGGGGGCCAGAGGGAG;SOR=0.598;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=18;WE=658796;WS=658778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr12	658993	rs73592377	C	T	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=68;PP=1786;ReadPosRankSum=-1.214;SC=CAGCCAGCCACGTGGACTCCT;SOR=0.832;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=202;TCF=86;TCR=116;TR=115;WE=659001;WS=658983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,135:0.55:245
chr12	661458	rs10588224	TACAC	T	112.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5063;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=0;PP=30;SC=TCCTGAGTACTACACACACAC;SOR=1.981;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=2;WE=661469;WS=661448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	661656	rs7298766	A	G	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=497;ReadPosRankSum=0.694;SC=GAGTACATCAAGATTGACCAG;SOR=0.909;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=35;WE=661664;WS=661646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr12	661772	rs7314430	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=1.043;SC=TGTTCAGACCGTGCCAGCCCC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=661780;WS=661762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr12	662448	rs758790	T	C	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=54;PP=2155;SC=CCAGGATGCTTGAGGGAAGAC;SOR=0.969;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=126;WE=662456;WS=662438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	662838	rs1056008	T	C	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1014;ReadPosRankSum=2.438;SC=CTCAGGCCCCTGGAAGGGGCT;SOR=0.845;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=59;WE=662846;WS=662828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr12	663224	rs11063564	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CAGGGGCCTAAGGGCTGGTAG;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=6;WE=663232;WS=663214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	665634	rs73592399	T	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=18;PP=1277;ReadPosRankSum=-2.475;SC=AACAACTAGCTTTGCAGGCTT;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=151;TCF=112;TCR=39;TR=73;WE=665642;WS=665624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,82:0.50:164
chr12	666943	rs7300933	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=234;ReadPosRankSum=1.369;SC=GGGGACCACCAGCCAGGGGGT;SOR=0.275;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=15;WE=666951;WS=666933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	666966	rs78107563	G	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=175;ReadPosRankSum=0.285;SC=CATGGGCCACGTCCATCCTAA;SOR=0.458;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=12;WE=666974;WS=666956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	674629	rs73594223	C	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=2.713;SC=GAGCTGCCCCCACAACACCCA;SOR=1.880;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=674637;WS=674619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	675441	rs4980836	T	A	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=30;PP=879;SC=CTCTTTCCAATCCAGATGGGA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=675449;WS=675431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	719385	rs75785593	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=1.506;SC=ACACCCAGCAGACACAGAATC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=719393;WS=719375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	719663	rs2535404	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=538;ReadPosRankSum=0.554;SC=GCCTTCTGCCCCCGTGGGTCC;SOR=1.096;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=29;WE=719671;WS=719653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr12	719681	rs2535405	G	A	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=952;SC=TCCCCACAGCGGCCAGCCCAG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=719689;WS=719671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	752327	rs6489690	C	A	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=31;PP=1353;SC=GTCCCCCTGCCGCTGCCCAAG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=752335;WS=752317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	772673	rs4980959	C	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=1.277;SC=ATTCATCCCTCTGATGTGGGA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=17;WE=772681;WS=772663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	862641	rs3088353	T	G	176.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=2.287;SC=CGGCCGCGGTTCCCTGCAGAC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=862649;WS=862631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	862989	rs3168640	T	C	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=81;PP=2552;SC=GCGTCATCTGTGACTCCAATG;SOR=0.894;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=145;WE=862997;WS=862979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	863517	rs3858703	G	A	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=58;PP=1883;SC=TTTATTTGACGGTCCTTTGGA;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=86;WE=863525;WS=863507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	936468	rs2158502	C	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=49;PP=1575;SC=CTGGCTTTCTCACATTCCTTT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=936476;WS=936458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	939302	rs10774466	A	G	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=48;PP=1531;SC=AAAATGCTGCACAGATCTACC;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=939310;WS=939292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	966208	rs2240284	G	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=449;SC=TCCTGCAGGCGAGTCAGAAAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=966216;WS=966198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	974137	rs11441896	C	CA	156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=0;PP=184;SC=TAGCTCTCCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=974145;WS=974127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	974355	rs11441897	T	TC	2786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.610;NF=9;NR=44;PP=2153;ReadPosRankSum=1.344;SC=CTCCCAGTGCTCTTCCACCCC;SOR=0.811;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=133;TCF=32;TCR=101;TR=53;WE=974363;WS=974345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,93:0.44:212
chr12	974404	rs7300829	T	C	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.05;MQRankSum=1.163;NF=28;NR=45;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CCTTCCCTCCTCCGGACTGCC;SOR=0.903;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=177;TCF=77;TCR=100;TR=73;WE=974412;WS=974394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,85:0.43:198
chr12	987482	rs1012729	G	A	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=36;PP=1508;SC=CAGTGAGTCAGCCTCAAGCTC;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=81;WE=987490;WS=987472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	990912	rs956868	A	C	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=34;PP=2467;SC=AGTAGCACAGACCCAAGCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=107;WE=990920;WS=990902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	993930	rs7300444	C	T	7565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=117;PP=2965;SC=AAGGACCCAACACAGCACCTC;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=225;WE=993938;WS=993920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr12	994487	rs7955371	G	C	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=67;PP=2965;SC=TCACAGCTGTGCATTCAGCTT;SOR=0.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=994495;WS=994477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	995291	rs11450919	G	GT	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=858;SC=AATATGATCAGTTTTTTTTCT;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=35;WE=995299;WS=995281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	1017197	rs4766334	C	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=24;PP=794;SC=ACATGAATTACGAGGTAAGTC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=1017205;WS=1017187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	1022679	rs6413436	A	G	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1063;SC=CTGACAGCTAATGATTTCTGG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=1022687;WS=1022669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	1035947	rs6489763	C	A	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=7;PP=408;SC=TGTGTAACTACGTTAACTATG;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=1035955;WS=1035937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	1040219	rs11571409	G	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=615;SC=AGGCCCCTTCGGATGAGAATG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=1040227;WS=1040209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	1041981	rs201398506	A	C	57.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=28.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1041983	rs199628282	A	G	57.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=28.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1041986	rs200633668	C	G	57.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=28.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1041991	.	T	C	57.53	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=28.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1041992	.	A	G	57.53	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=28.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1041993	rs201451927	G	C	57.53	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=28.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1041996	rs113084521	A	C	55.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=27.65;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	1042261	rs56170870	GA	G	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=70;ReadPosRankSum=0.926;SC=ATAAAAAGCGGAAAAAAAAAA;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=1042269;WS=1042251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	1219286	rs7131703	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTAACTTCTTTAAATATCATG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=8;WE=1219294;WS=1219276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	1221221	rs74679668	T	TAG	617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=488;SC=CCTGTGAACTTAGAAACTACC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=1221229;WS=1221211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	1224917	rs7973282	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=-1.114;SC=ATGACCTATCACACAGTTCGT;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=1224925;WS=1224907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr12	1224972	rs7973392	A	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr12	1224980	rs61912159	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	1292399	rs111929784	CTA	C	969.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=796;ReadPosRankSum=-0.513;SC=ATTTAAACCTCTATTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=21;WE=1292408;WS=1292389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr12	1313732	rs7977526	T	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.111;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGTTTGCGAATATTGTCTTGA;SOR=0.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=50;TCR=65;TR=60;WE=1313740;WS=1313722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr12	1372114	rs2286031	A	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=279;SC=AGAACATTTAATAAGCAAACA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=1372122;WS=1372104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr12	1589821	rs7315267	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=-1.274;SC=TTAATTTGTATTCTTTCGGAA;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=1589829;WS=1589811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr12	1589914	rs7315390	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.404;NF=22;NR=6;PP=425;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GTGTGGGTAGTGGGCAGGGGG;SOR=0.962;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=28;WE=1589922;WS=1589904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr12	1590013	rs11613546	C	T	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1249;ReadPosRankSum=1.398;SC=CCACAGAATCCGTTGCATCCC;SOR=0.756;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=86;WE=1590021;WS=1590003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,115:0.46:251
chr12	1590069	rs11609462	G	A	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1303;ReadPosRankSum=1.220;SC=CTCATGGTAAGGAAATGCAGA;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=60;TCR=98;TR=85;WE=1590077;WS=1590059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,97:0.51:191
chr12	1675847	rs73030956	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=363;ReadPosRankSum=0.833;SC=CCAGAGTGCCGGAGGCGCAGA;SOR=0.438;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=27;WE=1675855;WS=1675837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,27:0.33:82
chr12	1676039	rs12422360	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=605;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CTCTTCCTAACGAGGTCGCCT;SOR=0.983;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=82;TCF=23;TCR=59;TR=40;WE=1676047;WS=1676029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr12	1703322	.	A	AGCC	388.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=191;SC=GCTTCTCCCCAGCCGCCGCCG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=4;WE=1703330;WS=1703312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	1748766	rs6489313	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=218;ReadPosRankSum=0.683;SC=CGTGGCGTGCGGGTCCGTCGG;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=18;WE=1748774;WS=1748756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr12	1748834	rs2270036	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=381;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CTTACCGCCCTGGCCTCATTC;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=31;WE=1748842;WS=1748824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr12	1863728	rs11061971	A	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=-1.416;SC=ATGTGGAGGAAGTGGCAGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=16;WE=1863736;WS=1863718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	1889823	rs767870	G	A	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=23;PP=692;SC=TGTAAAGTCCGTATTTTGGCC;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=1889831;WS=1889813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	1889920	rs10848575	TT	AA	265.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	1902766	rs2058111	T	G	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TGCTGACTTTTTGGGATGGCT;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=76;WE=1902774;WS=1902756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,101:0.56:179
chr12	1904726	rs3078853	G	GAC	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=903;SC=CCCTGTGGAGGACACGGGCGG;SOR=2.494;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=18;WE=1904734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	1905091	rs3815325	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=366;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GGGCAGCTAAGGGAACGGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=18;WE=1905099;WS=1905081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr12	1906764	rs74059368	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GACCTCGCCTCGGCACTCCCA;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=26;WE=1906772;WS=1906754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr12	1919543	rs2286377	C	T	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=50;PP=1586;SC=ATGCCAGGGCCCTCACCCACC;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=1919551;WS=1919533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	1919635	rs147251076	AGCT	A	623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.878;NF=5;NR=8;PP=515;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GGGAGAGGGAAGCTGGCCTGC;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=13;WE=1919645;WS=1919625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr12	1937511	rs10437823	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=415;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CTTCCTGGGGTACCCGAGGCT;SOR=0.957;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=25;WE=1937520;WS=1937501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr12	1950011	rs58188909	A	AC	5852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=64;PP=2957;SC=CAACCCAGTCATGGGGAAGAG;SOR=0.869;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=78;WE=1950019;WS=1950001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	1955664	rs7137553	G	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	1955668	rs7138458	C	A	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	1955890	rs7137876	T	C	5362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=94;PP=2846;SC=GGTCACCACATGGCTGTGGCA;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=73;TCR=94;TR=167;WE=1955898;WS=1955880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	1967853	rs112675242	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=598;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CAGCAGCAGATGCCGGCCTGT;SOR=0.414;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=45;WE=1967861;WS=1967843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr12	1967947	rs2286369	C	G	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=324;SC=CCTCATGCCCCCTTCTTTACC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=1967955;WS=1967937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	1969262	rs10848582	T	C	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1735;ReadPosRankSum=1.816;SC=GAGTTGCTGGTATTCATGTTC;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=207;TCF=97;TCR=110;TR=115;WE=1969270;WS=1969252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,133:0.54:248
chr12	1969435	rs2370057	G	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CCCCCACCTCGCCCCCAGGGC;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=11;WE=1969443;WS=1969425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr12	1993337	rs2429184	T	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=565;SC=TGCTCAGCACTTCCAGGGCTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=1993345;WS=1993327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	1995042	rs10774003	A	G	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=200;SC=ATAAGCAAAAAGGGCCACAGA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=1995050;WS=1995032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	1995403	rs10735005	T	C	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=58;PP=1763;SC=ATGATATTAATGAAGTCATTC;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=1995411;WS=1995393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	2016550	rs112521420	A	ATTGTC	1256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=1365;SC=CAGTGCCCCTATTATTTCCAG;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=2016558;WS=2016540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	2016938	rs113797488	AGCCTGGTGAGTAT	A	863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=2910;SC=CTGGTGGGCCAGCCTGGTGAG;SOR=2.093;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=14;WE=2016958;WS=2016936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	2018987	rs34288687	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=392;ReadPosRankSum=0.311;SC=TCGCCACCCTACGCCGCCACC;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=20;WE=2018995;WS=2018977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr12	2019322	rs8181786	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=203;SC=ACAGACAAAAGGCACACACAT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=2019330;WS=2019312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	2022411	rs1558142	T	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=559;SC=TTCCGGCACATGGAGCCTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=2022419;WS=2022401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	2024316	rs758157	A	G	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=82;PP=2965;SC=ATGCATATGCATACACACACG;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=152;WE=2024324;WS=2024306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	2038978	rs79802812	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	2039022	rs66541354	G	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	2039690	rs2429172	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=274;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CAGAGAGCTCACTCTGCCTGG;SOR=0.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=13;WE=2039698;WS=2039680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr12	2055266	rs7222	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=463;ReadPosRankSum=0.491;SC=ACATACTTTTTTTTTAAAAAA;SOR=0.843;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=26;WE=2055274;WS=2055256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr12	2058245	rs2240612	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=478;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ATGACGTGCTTGCTTACCTGA;SOR=1.671;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=27;WE=2058253;WS=2058235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr12	2062323	rs149912567	T	TTGC	2337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.523;NF=14;NR=21;PP=1368;ReadPosRankSum=1.717;SC=GAAGCTTCTCTTGCTGCTGCT;SOR=0.658;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=35;WE=2062333;WS=2062313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr12	2064529	rs150660202	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=468;ReadPosRankSum=0.801;SC=TCCCCTGACTATATTCTGGGT;SOR=0.405;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=27;WE=2064537;WS=2064519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr12	2064733	rs139886104	T	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=552;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TACACTGAAATAGAAAAGAAA;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=36;WE=2064741;WS=2064723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr12	2077897	rs2470425	G	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AAGTTAGGGAGAGGCCACTGG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=12;WE=2077905;WS=2077887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	2224228	rs2299661	C	G	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=95;SC=GGCCCTCTTCCCTCAGCATCT;SOR=2.093;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=2224236;WS=2224223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	2602219	.	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=0.577;SC=TTTAAACATGTCTTGCGCTGT;SOR=1.493;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=14;WE=2602227;WS=2602209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	2613521	rs1008832	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=336;ReadPosRankSum=1.130;SC=GTCCCCTCCCAATCTGCTCAC;SOR=0.978;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=24;WE=2613529;WS=2613511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr12	2613716	rs2238087	C	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=510;ReadPosRankSum=0.009;SC=GTAAGCTGACCGTTTCTATGT;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=34;WE=2613724;WS=2613706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr12	2659848	rs10848675	T	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=27;PP=914;SC=CATTTCTGAATTGCTCCACCT;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=2659856;WS=2659838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	2676683	rs2370602	C	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=3;PP=681;SC=CTGCCTCCCTCTCTGCCTCCT;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=2676691;WS=2676678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	2690702	rs11832738	G	A	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=30;PP=1752;ReadPosRankSum=0.636;SC=AATGAGGCACGATGGGGAGGA;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=92;WE=2690710;WS=2690692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr12	2692186	rs3751254	T	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=85;SC=GGCACGCCCCTCAGGTCCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=2692194;WS=2692176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	2706720	rs215983	G	C	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=71;PP=2456;SC=TCTGCTCTGTGTGGCTGGATC;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=107;WE=2706728;WS=2706710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	2757756	rs2239127	T	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.37;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	2757769	rs2239128	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.800;SOR=2.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	2757782	rs2239129	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.455;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	2760708	rs216045	G	A	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=22;PP=1677;SC=CCTGCCTTCCGCCACTGCCAC;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=83;WE=2760716;WS=2760698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	2760970	rs1990322	G	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=978;SC=CCGGGGAATCGCAGGGCTGCC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=2760978;WS=2760960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	2773855	rs7315556	G	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=356;SC=GAGCATTCAGGGAATGATGAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=2773863;WS=2773845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	2774668	rs2302728	C	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=350;SC=CATCAGTAGGCCCCAGCTGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=2774676;WS=2774658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	2783476	rs7136355	T	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=828;SC=AGGAATGGCATTGGACGGGGC;SOR=3.967;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=2783484;WS=2783466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	2788879	rs1051375	G	A	7174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=128;PP=2965;SC=ACCCCAGCACGGTCAGCACTG;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=90;TCR=128;TR=218;WE=2788887;WS=2788859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr12	2791130	rs10848683	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.55;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	2791130	.	CGA	TGG	687	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=2;PP=687;QD=56.9590672971;SC=AGGCACGTTCCGATGTGTGAG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=2791140;WS=2791120;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr12	2791132	rs10774053	A	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.52;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	2791205	rs10774054	A	G	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=863;SC=CTGCTCAGGAAAGCAAACCCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=2791213;WS=2791195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	2795255	rs2270373	C	T	2995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=48;PP=1737;SC=CTCCTGGCACCCCACCAGGGT;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=100;WE=2795263;WS=2795245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	2851185	rs12319038	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=495;SC=AGCTGCCCCTATGGGTGGCCA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=2851193;WS=2851175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	2851259	rs12319097	A	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.51;QD=27.42;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	2851357	rs10774059	C	T	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.13;QD=43.02;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	2851365	rs4765989	T	C	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.58;QD=45.10;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	2876636	rs4313632	A	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=22;PP=1178;SC=GGTGAGAAGCAGCTTTGTTCT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=2876644;WS=2876626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	2908330	rs56196860	C	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=570;ReadPosRankSum=-2.292;SC=AGGGGGAGAACCTGGATCTGC;SOR=0.955;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=35;WE=2908338;WS=2908320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr12	2968458	rs2215292	T	C	5864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=91;PP=2965;SC=GATGCTGTTTTCTCCGAGACC;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=183;WE=2968466;WS=2968448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr12	2977954	rs28990703	A	G	175.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=1.221;SC=GACATGAAAGAGTTCATGAGA;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=8;WE=2977962;WS=2977944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	3017219	rs10848733	A	G	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=953;ReadPosRankSum=2.193;SC=GTGCCTCCCAAGTGATGAAGA;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=68;WE=3017227;WS=3017209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr12	3018802	rs35490316	G	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=0.245;SC=CCGTGATGCTGATGGTCTTGG;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=41;WE=3018810;WS=3018792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr12	3031358	rs2302283	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TGATCACATATGCCAAATCTA;SOR=1.439;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=13;WE=3031366;WS=3031348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr12	3039319	rs10848747	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=386;ReadPosRankSum=0.497;SC=AGAATAGTTAAGAATGTTTTA;SOR=0.109;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=21;WE=3039327;WS=3039309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr12	3040029	rs10848749	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=572;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GATACTTACTCTTCATTACTC;SOR=1.038;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=32;WE=3040037;WS=3040019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr12	3046802	rs33973716	A	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=526;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TCCAGGAAACAAACGTACTTG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=31;WE=3046810;WS=3046792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr12	3047466	rs2074987	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GCCTCCAGGAGGGGTTGGGTG;SOR=1.657;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=17;WE=3047474;WS=3047456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	3049698	rs998814	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=557;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CTTCCCAGAATGTATCCAAAC;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=85;TCR=65;TR=52;WE=3049706;WS=3049678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,66:0.35:187
chr12	3049938	rs1047341	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TGTCCCCCACCGACAAGTCCC;SOR=0.359;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=26;WE=3049946;WS=3049928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr12	3120078	rs2286647	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=413;ReadPosRankSum=-0.538;SC=AGAGTGAGGGCAGGGCTCCTC;SOR=1.055;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=25;WE=3120086;WS=3120068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
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chr12	3121159	rs3782837	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=322;ReadPosRankSum=1.045;SC=ATACTGCCGGTTTCTGGATTA;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=18;WE=3121167;WS=3121149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr12	3127652	rs2159411	A	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=12;PP=1556;SC=CCACCCCCACACCACAGGGCC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=75;WE=3127660;WS=3127642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr12	3131189	rs79782169	C	T	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=6.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,63:0.40:156
chr12	3131199	rs78551487	C	A	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=5.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.671;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr12	3131206	rs3741952	T	C	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.884;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=1.437;SC=TAACCCCTTCTTTCCTGCCAC;SOR=0.232;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=102;TCF=26;TCR=76;TR=59;WE=3131214;WS=3131179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,68:0.61:111
chr12	3131238	rs4759379	A	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=769;ReadPosRankSum=0.641;SC=TGGTAGTGAGAACGGGGCGAG;SOR=0.293;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=40;WE=3131246;WS=3131228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr12	3149483	rs7294804	A	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1234;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CAGCCATGGCATGCCCCTTCT;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=77;WE=3149491;WS=3149473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr12	3310439	rs740776	C	T	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.10;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	3310482	rs740775	C	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=57;PP=1683;SC=CTTACCATAGCGTGAATACCC;SOR=1.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=3310490;WS=3310472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	3315433	rs2058243	A	G	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=704;ReadPosRankSum=0.760;SC=CTGAATGCCCACTCTGTGCAC;SOR=0.641;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=52;WE=3315441;WS=3315423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,57:0.37:154
chr12	3387521	rs651196	C	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=379;ReadPosRankSum=-1.660;SC=GGGACCTGCACTGTTCCCAGG;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=3387529;WS=3387513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr12	3387555	rs651243	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=516;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GTGAGAGCAGCGCCAGGCTAA;SOR=0.207;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=27;WE=3387563;WS=3387545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr12	3387865	rs663134	C	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=275;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GGAATATTAGCCACCTGGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=16;WE=3387873;WS=3387855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr12	3390804	rs605613	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-2.334;SC=GAGGTAAGAGCGAGGACGAGG;SOR=0.307;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=3390812;WS=3390794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	3391032	rs564247	T	G	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1006;ReadPosRankSum=1.216;SC=GGCCTCAGCCTCAGAGGGAAG;SOR=0.564;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=63;WE=3391040;WS=3391022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr12	3392351	rs632887	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=736;ReadPosRankSum=0.539;SC=GCTTTGTGTCACCTGCCTGCG;SOR=1.272;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=40;WE=3392359;WS=3392341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr12	3409277	rs7306401	C	T	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=102;PP=2965;SC=CTGCAGGTGCCGGAGAAGGCC;SOR=1.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=150;WE=3409285;WS=3409267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	3490820	rs10848860	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=352;SC=TTGTTTCAATTAAACTTTTAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3490828;WS=3490810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	3600967	rs757609	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=530;SC=CTTTCCCCAGTTTCATCCCGC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=3600975;WS=3600957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	3662965	rs71539446	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=2.233;SC=AGCGGGAGGAGCGCAGAGCAC;SOR=0.269;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=9;WE=3662973;WS=3662955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr12	3686237	.	A	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.450;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1021;ReadPosRankSum=1.856;SC=CGGCTCCTGCACAGCCCCCAC;SOR=1.475;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=21;TCR=79;TR=52;WE=3686245;WS=3686227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr12	3702219	rs4765741	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=411;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CTGTGGCTTCATACCCAGACG;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=30;WE=3702227;WS=3702209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr12	3725866	rs4766146	A	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=442;ReadPosRankSum=2.295;SC=CTTTAAGACTAAGAAGAAGAC;SOR=1.052;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=29;WE=3725874;WS=3725856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr12	3725967	rs4766147	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TACAAAGGCCCAGGACCCCGT;SOR=1.148;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=14;WE=3725975;WS=3725957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr12	3728397	rs17770235	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=510;ReadPosRankSum=0.385;SC=TCCCTCGGGGTCACACTCTGT;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=35;WE=3728405;WS=3728387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
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chr12	3736745	rs10848894	T	C	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1243;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGGTCAGGCATGCACGGCCTT;SOR=0.534;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=98;WE=3736753;WS=3736735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,109:0.54:203
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chr12	3757923	rs758530	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAGCTCCTACAGTATGCAAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=3757931;WS=3757913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr12	3782480	rs56040859	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=317;ReadPosRankSum=0.564;SC=ACACAGGGCCTGGTCCCCACT;SOR=0.026;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=22;WE=3782488;WS=3782470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr12	3782647	rs36030417	A	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=361;ReadPosRankSum=1.495;SC=TCTTCTCCTCATGGGCTTCTT;SOR=1.019;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=22;WE=3782655;WS=3782637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr12	3782701	rs17697920	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=237;ReadPosRankSum=-2.367;SC=CAAAGTTGGACAGTAAATGAG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=16;WE=3782709;WS=3782691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr12	3782779	rs61907258	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.825;SC=AGGGACGCTCATGTGGAAGTG;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=3782787;WS=3782769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	3787926	rs1160848	G	GGCCCC	590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.905;NF=10;NR=2;PP=519;ReadPosRankSum=-2.177;SC=ACAAAGGACAGGCCCCCACTG;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=3787934;WS=3787916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr12	3787956	rs242019	A	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=6;PP=1145;SC=GCGGGCCTTTACCTGCACTGC;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=3787964;WS=3787946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	3788145	rs242018	C	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=853;ReadPosRankSum=-1.269;SC=TCCTCATCTTCGCCCATGTCG;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=61;WE=3788153;WS=3788135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,75:0.40:188
chr12	3788222	rs242017	G	A	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=794;ReadPosRankSum=0.927;SC=CTGTTCACCTGCATCTTCCTG;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=61;WE=3788230;WS=3788212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,77:0.41:190
chr12	3788260	rs242016	G	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=562;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TGAAGAAGAAGTGACCTGGGG;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=41;WE=3788268;WS=3788250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,51:0.39:132
chr12	3805904	rs11062767	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=793;ReadPosRankSum=0.801;SC=ATCTGGCATTCTCAGTGGGCA;SOR=0.546;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=47;WE=3805912;WS=3805894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr12	3948718	rs3809251	G	A	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=104;PP=2965;SC=GCGATTATAGGAGGATCATTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=208;WE=3948726;WS=3948708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr12	3950854	rs143956426	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.738;NF=24;NR=21;PP=677;ReadPosRankSum=-1.110;SC=ATGTTCCCCCAGCCATCTTTT;SOR=0.792;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=45;WE=3950862;WS=3950844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr12	3982657	rs4766179	A	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=654;SC=ACGCTTATCCATACGCGCGCG;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=3982665;WS=3982647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	4388084	rs3217805	C	G	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TGTGTGCCACCGGTAAGATGA;SOR=0.562;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=198;TCF=95;TCR=103;TR=97;WE=4388092;WS=4388074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,107:0.46:231
chr12	4446330	.	C	CATTT	860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.934;NF=0;NR=14;PP=719;ReadPosRankSum=-0.395;SC=AAAGCAGGTACATTTATTTAT;SOR=2.196;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=14;WE=4446338;WS=4446320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr12	4481899	rs3832879	C	CG	6299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=81;PP=2936;SC=AGACTCATTGCCATCCAATTC;SOR=1.074;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=105;WE=4481907;WS=4481889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	4537658	rs2970806	G	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=23;PP=858;SC=TTCAACGTCAGACCCACCTGG;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=4537666;WS=4537648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr12	4626131	rs12831479	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.415;SC=AATTTCCTATCTTCCACCAAC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=4626139;WS=4626121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr12	4655670	rs2907492	C	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=296;ReadPosRankSum=0.814;SC=ACAGAGGAAACAGGTAAAATG;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=19;WE=4655678;WS=4655660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr12	4657203	rs7314915	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=1.683;SC=ATTTTCCTATATCTAGACATT;SOR=0.883;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=4;WE=4657211;WS=4657193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	4667887	rs71459908	A	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.508;SC=TGTTCTTTTGATCTAGTTTAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=4667895;WS=4667877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	4667910	rs7308641	A	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	4671490	rs740059	G	A	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1296;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GCAGTCAGGCGCGAGTACGAG;SOR=0.865;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=83;WE=4671498;WS=4671480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,96:0.59:163
chr12	4671611	rs7306848	CG	GA	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=908;ReadPosRankSum=0.080;SC=CTGTGGTGCGCGGACAAGAAA;SOR=0.390;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=24;WE=4671620;WS=4671601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr12	4672096	rs7295624	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTTAAAGGCTATTCTGTGACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=4672104;WS=4672086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	4672394	rs7299185	T	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=620;ReadPosRankSum=-1.579;SC=CACTCTACCTTATTGTTTCTG;SOR=0.119;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=35;WE=4672402;WS=4672384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr12	4677255	rs2240766	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=387;ReadPosRankSum=1.276;SC=AGAGGTATCATTGCGAGGTCC;SOR=0.792;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=23;WE=4677263;WS=4677245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr12	4682418	rs3815360	T	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GGCATTTACTTCTATATAATG;SOR=0.299;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=12;WE=4682426;WS=4682408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	4697987	rs2041295	A	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr12	4697991	rs2041294	AT	GG	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr12	4700221	rs2302248	G	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=493;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGAGAGGTAGGTAAAGAGCCT;SOR=0.326;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=34;WE=4700229;WS=4700211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr12	4705317	rs3741925	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=251;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTCCACAGGTCCTGCATGATC;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=20;WE=4705325;WS=4705307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr12	4708150	rs3741926	T	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=0.314;SC=CAGCCTTATATGTTTTTTTAC;SOR=1.136;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=8;WE=4708158;WS=4708140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	4714008	rs2286576	T	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=269;ReadPosRankSum=1.680;SC=AACTGAGAAGTTGTCCTGGGG;SOR=0.223;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=4714016;WS=4713998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr12	4725134	rs7301885	G	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=41;PP=1268;SC=TGCCAAGGCTGGAGCAGAGAG;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=4725142;WS=4725124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	4735737	rs2072358	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=908;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CTACCCATTGAAGGACGGCTT;SOR=0.790;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=54;WE=4735745;WS=4735727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,73:0.58:125
chr12	4736495	rs1990312	C	T	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=37;PP=1695;SC=ATCAGGTCCTCGGCCCAGGAG;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=4736503;WS=4736485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	4736631	rs11063265	A	G	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=75;PP=2965;SC=TGGGAGCTTCAAATGCTGCAT;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=116;TCR=76;TR=190;WE=4736639;WS=4736621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	4736677	rs11063266	G	C	7825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=109;PP=2965;SC=TTTCTGCTGAGTTTTATGCCA;SOR=0.837;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=236;WE=4736698;WS=4736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr12	4736690	rs10774251	A	G	8309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=114;PP=2965;SC=TTATGCCACAAGGTAAGCCCC;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=242;WE=4736698;WS=4736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr12	4737042	rs7972737	G	A	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1362;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CTGTGACGCTGTGGAGATTCC;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=90;WE=4737050;WS=4737032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,112:0.54:208
chr12	4737318	rs7960207	A	G	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=76;PP=2965;SC=CATAATCTCCATTACGAGATT;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=156;WE=4737326;WS=4737308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	4737459	rs2072356	C	T	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=63;PP=2902;SC=GTGATGATCCCGAGACTCTGT;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=129;WE=4737467;WS=4737449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr12	4737715	rs2072355	C	T	6307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=100;PP=2965;SC=TACTGAACTCCCGTTGCCAAG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=189;WE=4737723;WS=4737705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	4758188	rs714621	G	C	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=18;PP=992;SC=CGAAACCGTCGTTTCTTGGTT;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=4758196;WS=4758178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	4763780	rs3217056	GCA	G	1309.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1245;SC=GACATGAAGAGCACACTCATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=4763789;WS=4763770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	4768354	rs7972657	A	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=34;PP=1280;SC=GTAAGTAACAAATTGATCTGG;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=63;WE=4768362;WS=4768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	4768437	rs7958182	C	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=25;PP=718;SC=TTATCACAGACATATGTAGAA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=4768445;WS=4768427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	4771682	rs2267549	G	A	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=27;PP=1634;SC=AAACAGGTTTGTTTGGTTATT;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=4771690;WS=4771672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	4779087	rs1009633	A	G	94.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TACAATATCAAAATCTCCTCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=4779095;WS=4779077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	4830000	rs10849133	T	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GAATAAACGCTACGGGGCAGT;SOR=2.404;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=17;WE=4830008;WS=4829990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr12	4835882	rs2286578	T	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=71;PP=1689;ReadPosRankSum=-1.900;SC=GCGAGGATCTTTCTGAGGCCC;SOR=0.230;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=214;TCF=64;TCR=150;TR=111;WE=4835890;WS=4835872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,126:0.53:239
chr12	4853806	rs34776842	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=661;ReadPosRankSum=1.011;SC=ACTGGCTGGGAAGCTGCCACA;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=41;WE=4853814;WS=4853796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr12	4853898	rs17783505	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=483;ReadPosRankSum=-1.165;SC=TCTTCTGGAAAGGGCAGAGAG;SOR=0.883;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=24;WE=4853906;WS=4853888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr12	4853915	rs12312983	T	C,G	1367.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=4,7;NR=16,18;PP=375,423;SC=AGAGGAGATATTGTGCATGTA;SOR=2.049;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=20,25;WE=4853923;WS=4853905;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.52,0.48:52
chr12	4870363	rs2191157	G	A	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=45;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.118;SC=AGGAGGTGGCGGTTATGTAAT;SOR=0.479;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=124;TCF=38;TCR=86;TR=67;WE=4870371;WS=4870353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr12	4873163	rs1468556	G	T	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=926;ReadPosRankSum=0.334;SC=TCAGGGACCCGTTCCAGGCAA;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=66;WE=4873171;WS=4873153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,71:0.42:168
chr12	4881766	rs2286581	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr12	4881775	rs2286582	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.03;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr12	4959874	rs10774275	T	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=847;ReadPosRankSum=1.380;SC=ACTAACTACATGTCCTTTTGT;SOR=0.893;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=55;WE=4959882;WS=4959864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,59:0.45:132
chr12	5021228	rs1048500	T	C	7423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=117;PP=2965;SC=AAACGCTGTGTATCATCTGGT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=221;WE=5021236;WS=5021218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr12	5021348	rs2227910	G	C	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=76;PP=2829;SC=ATTTCATCACGCTGGGCACCG;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=126;WE=5021356;WS=5021338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	5021984	rs4766309	T	A	6483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=91;PP=2965;SC=ATTGCACCACTGCTAACCAAA;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=114;TCR=91;TR=205;WE=5021992;WS=5021974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	5022041	rs4766310	G	A	5847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=107;PP=2965;SC=AAAAAACAAAGGCAAGCAAAC;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=68;TCR=107;TR=175;WE=5022049;WS=5022031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	5154462	rs2359641	T	C	5337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=111;PP=2965;SC=AGCCAGGGGGTGGAGGAGGCG;SOR=1.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=63;TCR=111;TR=174;WE=5154470;WS=5154452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr12	5603632	rs6332	G	A	6298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=1.925;SC=CATTCCAGCCGGTGATTGCAA;SOR=0.634;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=380;TCF=195;TCR=185;TR=219;WE=5603640;WS=5603622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,279:0.58:484
chr12	5674754	rs2277398	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=693;ReadPosRankSum=0.061;SC=CCAGACGGGCGGACAGAATAA;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=47;WE=5674762;WS=5674744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr12	5721962	rs3741837	A	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=25;PP=1370;SC=TTAGAACAAAAGGGAGCTCTG;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=5721970;WS=5721952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	5848953	rs17195410	C	T	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=5;PP=1120;SC=CCTCCTTCACCTTCATCAGCA;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=5848961;WS=5848943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	5916350	rs2277403	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=401;ReadPosRankSum=1.421;SC=GGTCAGTCAAGGTATTTTAAT;SOR=0.452;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=24;WE=5916358;WS=5916340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr12	5961048	rs7485945	G	A	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1329;ReadPosRankSum=0.727;SC=CACTTTTCCTGTGTCTCTAGG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=83;WE=5961056;WS=5961038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,106:0.45:238
chr12	6030301	rs3741901	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=433;ReadPosRankSum=0.262;SC=GCATCGAGCGGTCCCAGCTCA;SOR=0.486;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=33;WE=6030309;WS=6030291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr12	6032129	rs12817045	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.365;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	6032138	rs12817050	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.981;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	6054395	rs6489680	A	G	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=73;PP=2299;SC=ATGTGGACGCAGACCCCGCCG;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=125;WE=6054403;WS=6054385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	6055132	rs6489682	T	G	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=833;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGGAGTGCCATCTCCCCGGGA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=76;TCF=63;TCR=13;TR=42;WE=6055140;WS=6055122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr12	6062853	rs3759320	C	T	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=34;PP=984;SC=TCATCTCTCTCATCCAGTAGT;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=6062861;WS=6062843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	6062878	rs3759321	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=488;ReadPosRankSum=0.394;SC=CCTAGAATTCGGAAAGTCAAC;SOR=1.148;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=13;WE=6062897;WS=6062868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr12	6062889	rs12297442	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.017;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=488;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GAAAGTCAACATCCAACTCCA;SOR=1.965;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=12;WE=6062897;WS=6062868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	6076781	rs11063962	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=2.048;SC=GGAAGCAGAGGCACCAGGGTC;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=20;WE=6076789;WS=6076771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr12	6078424	rs35335161	A	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=30;PP=1456;ReadPosRankSum=0.357;SC=GCTCAGCTGAAAGCCCGAGGG;SOR=0.522;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=166;TCF=116;TCR=50;TR=93;WE=6078432;WS=6078414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,97:0.55:177
chr12	6078616	rs2270239	T	G	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=66;PP=1942;SC=CAGGGTCCCATTGGGAATGTG;SOR=2.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=20;TCR=66;TR=86;WE=6078624;WS=6078606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	6085513	rs216855	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=863;SC=AGCCGCTCTAAGTGCTGAGAA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=6085521;WS=6085503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	6090825	rs216866	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.660;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	6091000	rs216867	A	G	5050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=71;PP=2951;SC=CATTGGTGGCAGTTGAGGCCA;SOR=0.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=163;WE=6091008;WS=6090990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	6091164	rs216868	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=0.847;SC=CAGGCTGAGGGTAGGACAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=17;WE=6091172;WS=6091154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	6092567	rs138350612	G	GGATAGATAGATA	394.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQ=60.45;NF=0;NR=5;PP=1240;SC=ACATGGGTTAGGATAGATAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=6092575;WS=6092557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	6092629	rs10535241	TGATA	T	33.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=77;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=84;SC=GAGATAGATTTGATAGATAGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=6092640;WS=6092619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	6094845	rs177702	G	A	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=43;PP=1569;SC=AGGGCAAAGCGAGGTTCAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=86;WE=6094853;WS=6094835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	6103094	rs34230288	C	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=713;ReadPosRankSum=-2.535;SC=GCATAAGAGGCGATCACCTCA;SOR=0.798;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=51;WE=6103102;WS=6103084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr12	6105387	rs216902	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=720;ReadPosRankSum=1.027;SC=CTGTGCACACGCCTGGACAGA;SOR=0.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=18;WE=6105404;WS=6105377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr12	6105396	rs34444862	G	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=424;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CGCCTGGACAGAGAGAAGCAG;SOR=0.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=11;WE=6105404;WS=6105377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr12	6121078	rs216305	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.617;NF=4;NR=3;PP=114;ReadPosRankSum=-0.492;SC=CAAGGAGGCCCCCTGTACATG;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=6121086;WS=6121068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	6127891	rs1800385	C	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.484;NF=10;NR=17;PP=502;ReadPosRankSum=-0.576;SC=ATCTCTCGCACCCGCTGCAGG;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=27;WE=6127899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr12	6127919	rs1800384	T	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.041;NF=11;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CTTTGGACTGTGCCTCGCTGA;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=20;WE=6127927;WS=6127909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr12	6127943	rs216310	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.35;QD=28.73;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	6128443	rs216311	T	C	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=62;PP=2378;SC=AGGAGCAGGGTGATGCGGGAG;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=119;WE=6128451;WS=6128433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	6128984	rs216312	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=185;SC=CAGTGTACAATGACTTCCATA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=6128992;WS=6128974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	6143984	rs216321	T	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1457;ReadPosRankSum=2.116;SC=CTTCCGGTCCTGACAGACACT;SOR=0.791;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=197;TCF=102;TCR=95;TR=106;WE=6143992;WS=6143974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,126:0.54:234
chr12	6144164	rs499648	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.710;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr12	6144169	rs669667	T	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	6145529	rs216325	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=376;ReadPosRankSum=0.992;SC=CTGGGTCCCCGGCGCAGCCCC;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=21;WE=6145537;WS=6145519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr12	6153659	rs216293	G	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=630;ReadPosRankSum=1.333;SC=GTGAAGGAGAGAATGGACCTA;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=39;WE=6153667;WS=6153649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr12	6153750	rs216294	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GGGGACCAGCAGCTGCCTGAG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=6153758;WS=6153740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	6161963	rs10622633	G	GAGA	1238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr12	6172202	rs1800378	T	C	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=57;PP=1755;SC=CGTCACTGTATGCTGGATGCG;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=109;WE=6172210;WS=6172192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	6172348	rs2239159	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GACTTAGGGGCAGATGGGGTG;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=6172356;WS=6172338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	6204902	rs5796209	CA	C	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=407;SC=GGCTGGAGTGCAGCGGCTATT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=6204910;WS=6204892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	6230288	rs6489694	A	G	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=7;PP=1416;SC=CACCAGGGCTAAGCTCAGCCA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=6230296;WS=6230278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	6232426	rs2286608	G	A	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1436;SC=CTGGTGTGGCGACTATCAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=6232434;WS=6232416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	6344600	rs2072372	C	A	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=1.911;SC=CGTCTTCTTACAATTTGTTTC;SOR=0.228;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=155;WE=6344608;WS=6344590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr12	6345199	rs3181300	C	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=110;SC=GTTCCCCTTTCCATCCACCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=6345207;WS=6345189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	6352215	.	A	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.063;SC=AAAAGGAAAAAAAAAAGACTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=6352223;WS=6352214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	6352292	rs9668222	T	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=8;PP=1102;SC=TACTTTGAGTTACAGACGTAT;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=6352300;WS=6352282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	6422272	rs10849440	T	C	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=49;PP=1928;SC=TGGCTGTGGCTTCAGCCTTTC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=6422280;WS=6422262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	6422988	rs2286716	G	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=146;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CACACATACGGCCCCAATTGT;SOR=1.112;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=11;WE=6422996;WS=6422978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr12	6425525	rs71584810	G	A	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1470;ReadPosRankSum=0.021;SC=CTCGGGCCTCGGGCCAGCCTC;SOR=0.921;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=94;WE=6425533;WS=6425515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,108:0.56:193
chr12	6439255	rs10849443	A	G	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=56;PP=2174;SC=AGGTGGCGCAACATTAGTGCG;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=6439263;WS=6439245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	6439470	rs12426675	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=758;ReadPosRankSum=-0.215;SC=AACTGAGGAAAAAGAAAGAAA;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=45;WE=6439478;WS=6439460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr12	6442346	rs1800692	A	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=793;ReadPosRankSum=1.372;SC=GCTAAAGGAGAAGCGCCTGCA;SOR=0.495;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=49;WE=6442354;WS=6442336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr12	6457062	rs2228576	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=0;PP=233;SC=AGAGGACAGGTGGAGGAACTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=6457070;WS=6457052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	6458274	rs3764874	G	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=430;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CCCAGAGAAGGCCACAGCATT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=23;WE=6458282;WS=6458264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr12	6459326	rs61918248	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=223;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AGGCCGGGCGTGGTGGCTCAC;SOR=0.965;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=21;WE=6459334;WS=6459316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr12	6463862	rs11614164	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=0.994;SC=GCTTTGCAGGGCCAGCCAGGG;SOR=1.290;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=14;WE=6463870;WS=6463852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr12	6483463	rs3741914	T	C	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=14;PP=1363;SC=GCCTGCCCAGTGAGCACCTCA;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=63;WE=6483471;WS=6483453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	6484709	rs10849447	T	C	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=517;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GCCCGCCCGCTGGCCGGCCAG;SOR=1.077;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=45;WE=6484717;WS=6484699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,51:0.45:113
chr12	6495275	rs2364480	C	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=852;ReadPosRankSum=0.320;SC=CCTGCAAGGCCGGGCACTTCC;SOR=0.531;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=60;WE=6495283;WS=6495265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,72:0.49:147
chr12	6495635	rs5796232	C	CGG	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.124;HP=8;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.570;NF=0;NR=11;PP=178;ReadPosRankSum=-0.119;SC=CTGAGGGACACGGGGGGGGCG;SOR=1.513;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=11;WE=6495643;WS=6495625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr12	6500105	rs12354	T	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=574;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CATGACTGACTGAGTCTGAGA;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=42;WE=6500113;WS=6500095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr12	6551899	rs2886090	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=431;SC=CCTGTAATCCCAGCACTTTGG;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=6551907;WS=6551889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	6552154	rs3759341	A	G	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.39;QD=22.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	6560473	rs2532502	A	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=29;PP=1037;SC=GAGCCTTGTCATTACAGCTGC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=6560481;WS=6560463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	6560573	rs1059501	G	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.256;SC=GCACCTGCGGGAGCTGCACTA;SOR=1.581;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=11;WE=6560581;WS=6560563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	6561603	rs151118790	CAG	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=194;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CTAAGCCCAACAGGGGAAAGG;SOR=0.340;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=6561612;WS=6561593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	6562285	rs2041384	C	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.76;ReadPosRankSum=1.794;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr12	6562293	rs2041385	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr12	6562753	rs2532501	A	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1344;ReadPosRankSum=1.004;SC=CATGGCCAACATGCAGGTCTC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=6562761;WS=6562743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr12	6562810	rs2532500	A	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=31;PP=1064;SC=TCCCAGGGTCACCAAGAATGA;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=6562844;WS=6562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	6562823	rs2041387	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=565;ReadPosRankSum=-1.674;SC=AAGAATGAGGCGCTCTGGCAC;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=17;WE=6562844;WS=6562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr12	6562836	rs2041388	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=565;ReadPosRankSum=-0.877;SC=TCTGGCACCCGACGCTGAACT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=12;WE=6562844;WS=6562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr12	6565750	rs10774432	A	G	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=21;PP=807;SC=GGCTGGTCTCAAACTCCCAAC;SOR=0.884;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=6565758;WS=6565740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	6567787	rs2243750	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=706;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CCATGTGTAATCTTATTCCTC;SOR=1.129;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=37;WE=6567795;WS=6567777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr12	6569983	rs2243977	C	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1102;ReadPosRankSum=0.253;SC=ATGATTCCTGCGCACGATGAT;SOR=0.504;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=72;WE=6569991;WS=6569973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,94:0.52:181
chr12	6570163	rs2534710	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=38;PP=1089;SC=TCTAACCACCCCCCCGCCCAG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=6570171;WS=6570153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	6572048	rs1045452	A	G	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=71;PP=2965;SC=CAAGGGCGAAAGGAAAGGAAG;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=6572056;WS=6572038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	6572191	rs12964	T	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=794;SC=CTCCGCTCTGTTCCCAGCCTG;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=6572199;WS=6572181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	6573061	rs2534714	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=137;ReadPosRankSum=0.499;SC=CAGATTAGAAATAACTACAAA;SOR=0.631;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=13;WE=6573069;WS=6573051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr12	6573146	rs2534715	T	C	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=686;ReadPosRankSum=1.745;SC=AGGACCCTCTTCAGGCCTGGT;SOR=0.937;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=43;WE=6573154;WS=6573136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr12	6573716	rs2534716	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.922;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=147;ReadPosRankSum=-1.705;SC=AACAAGAGGGTGAATTACACC;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=10;WE=6573724;WS=6573706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	6573749	rs2534717	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=-2.284;SC=ATTCAGGTCTCTCCATTGTTA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=5;WE=6573757;WS=6573739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr12	6574301	rs1017101	G	T	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1367;ReadPosRankSum=-1.262;SC=CAGTATGTCTGTAGCTTTTCA;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=74;WE=6574309;WS=6574291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,85:0.62:138
chr12	6575044	rs2072375	G	T	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=726;ReadPosRankSum=1.730;SC=TCTTTAGCTTGGCAGCACTGC;SOR=0.727;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=51;WE=6575052;WS=6575034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr12	6575191	rs2534718	A	T	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=28;PP=1043;SC=GAAACAAAGCAGCTAAGCTTC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=53;WE=6575199;WS=6575181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	6579565	rs2534720	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=7;PP=1361;SC=CCGGTCCGGAAGCGGCGCGCG;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=6579573;WS=6579555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	6579757	rs2532489	T	C	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=108;PP=2834;SC=AGACACCCGGTGAGGGACGCT;SOR=1.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=65;TCR=108;TR=172;WE=6579765;WS=6579747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr12	6579812	rs2072376	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=545;ReadPosRankSum=-0.343;SC=TCGCGCCGACTACCCCGCGGT;SOR=0.237;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=33;WE=6579820;WS=6579802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr12	6601743	rs1001127	A	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ATAGACAAGGAACATTACAGT;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=6601751;WS=6601733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	6604418	rs6489718	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=585;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GTCACTGTACCTAGCTCTTTC;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=38;WE=6604426;WS=6604408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr12	6618871	rs7309414	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.338;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1077;ReadPosRankSum=0.934;SC=TTTGTTTTTTCCATCTTCATA;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=188;TCF=98;TCR=90;TR=77;WE=6618879;WS=6618861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,93:0.43:216
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chr12	6619402	rs714775	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=731;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CATGATGATATCAAGGCTGTT;SOR=0.272;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=42;WE=6619410;WS=6619392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr12	6620495	rs7358768	G	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.84;MQRankSum=3.810;QD=26.06;ReadPosRankSum=1.024;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr12	6623382	rs4764604	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=11.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr12	6623389	rs4764605	T	C	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.51;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	6624139	rs9788151	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=206;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TTAAGTCCAGTGTTGAAAGGC;SOR=0.280;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=20;WE=6624147;WS=6624129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr12	6626369	rs758739	G	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=407;SC=TTTAAGGACTGTAATGTGTCT;SOR=1.112;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=6626377;WS=6626359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	6631169	rs917634	C	A	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=73;PP=2872;SC=CCATTGGCATCATCAGCAAGA;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=150;WE=6631177;WS=6631159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	6631888	rs2072373	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=601;ReadPosRankSum=-1.886;SC=CAGGGAAAATGCGGAAGGCCT;SOR=1.903;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=30;WE=6631896;WS=6631878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr12	6635567	rs7311174	A	T	6940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=102;PP=2965;SC=CTTGGGCAGAATTGGGCCCTT;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=99;TCR=102;TR=201;WE=6635575;WS=6635557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr12	6637845	rs2072374	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=26;PP=1189;SC=CCATTCCTAGTCTCCGGGACC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=6637853;WS=6637835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	6638116	rs740850	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=368;ReadPosRankSum=0.171;SC=TACAGGGCAACGCAATCTATA;SOR=1.011;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=24;WE=6638124;WS=6638106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr12	6638666	rs7316224	C	T	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=1724;ReadPosRankSum=0.594;SC=ATCCTCATCTCCCCTTCCTGC;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=124;TCR=90;TR=111;WE=6638674;WS=6638656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,134:0.49:272
chr12	6639088	rs1043262	A	G	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=55;PP=2205;SC=TGTCAGTTGTAGGCAAGCTGC;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=6639096;WS=6639078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	6639981	rs2240871	C	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=734;ReadPosRankSum=1.700;SC=AAACCATCCACTGGTACGTAA;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=51;WE=6639989;WS=6639971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,61:0.37:166
chr12	6640267	rs10849485	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=0.908;SC=CCTGTTCCCGGCCGAGAAGGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=6640275;WS=6640257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	6643927	rs3741915	T	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=1.079;SC=GGGAGGCGTGTGTGTCGGCCG;SOR=0.385;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=6643935;WS=6643917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr12	6643991	rs1136666	C	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=562;ReadPosRankSum=0.422;SC=CCACATCGCTCAGACACCATG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=34;WE=6643999;WS=6643981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr12	6644256	rs3741918	T	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CTTCCCCTAGTCCCCAGAAAC;SOR=1.565;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=6644264;WS=6644246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	6646320	rs1065691	T	C	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=786;ReadPosRankSum=0.975;SC=CCTCTGCTGATGCCCCCATGT;SOR=0.870;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=59;WE=6646328;WS=6646310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr12	6647109	rs1803621	T	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=508;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CCTCCACCTTTGACGCTGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=38;WE=6647117;WS=6647099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr12	6657538	rs2286724	T	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=239;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GGGAGTGGGCTTCAGGCTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=16;WE=6657546;WS=6657528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr12	6659694	rs2286726	G	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=0.366;SC=GACTTTTGTTGCTTGTCTTTC;SOR=0.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=6659702;WS=6659688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	6660219	rs7312991	C	T	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.249;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.096;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,50:0.40:126
chr12	6660225	rs7301426	T	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.213;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,51:0.41:124
chr12	6692190	.	C	T	5589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCACAGCCCTCACCTTCTGAA;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=418;TCF=232;TCR=186;TR=236;WE=6692198;WS=6692180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,260:0.54:483
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chr12	6747578	rs1882553	G	C	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=49;PP=1808;SC=CACCTACACAGAGATTCAGTG;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=89;WE=6747586;WS=6747568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	6748035	rs12826388	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=0.398;SC=CCTAGCTGCTCGCAGAGGGGG;SOR=0.069;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=6748043;WS=6748025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	6749093	rs2365087	A	G	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=167;SC=GAGGCAGGAGATTCAGTGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=6749101;WS=6749087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	6753212	rs189409557	C	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-1.141;SC=CTGAGTGGATCTGGAGGCTGA;SOR=0.442;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=11;WE=6753220;WS=6753202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	6756240	rs3803130	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=402;SC=CGAGACCAGGACAGACAGACC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=6756248;WS=6756230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	6762026	rs4764506	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=1040;SC=GTGCCAAACTTCCCACCAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=6762034;WS=6762016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	6764831	rs4764616	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=490;SC=TCAGGGAACTGTGTCCAGGGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=6764839;WS=6764825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	6777069	rs3835029	TTGC	T	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.99;MQRankSum=1.059;NF=4;NR=15;PP=822;ReadPosRankSum=0.330;SC=GTGGTGGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=0.495;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=19;WE=6777079;WS=6777059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr12	6804902	rs10849498	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=43;PP=1317;SC=CCCCAGCCTCACCCAGTCACT;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=6804910;WS=6804892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	6835068	rs7487866	A	G	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ATGAAAAAGAAGCACTTGGCT;SOR=0.468;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=149;TCF=25;TCR=124;TR=76;WE=6835089;WS=6835058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr12	6835081	rs2365100	G	A	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.683;SC=ACTTGGCTGGGTGCGGTGGCT;SOR=0.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=17;TCR=96;TR=60;WE=6835089;WS=6835058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
chr12	6836837	rs66951403	G	T	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1386;ReadPosRankSum=0.225;SC=CTGAATTTAGGGTAGGAATTG;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=106;TCR=109;TR=98;WE=6836845;WS=6836827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,112:0.43:262
chr12	6836852	rs7138427	A	G	7050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=112;PP=2965;SC=GAATTGGATGACGTATGGAGC;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=96;TCR=112;TR=208;WE=6836860;WS=6836842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr12	6836913	rs2178691	G	T	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=85;PP=2800;SC=CCTGAAGGTGGAAATGAGCCC;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=131;WE=6836921;WS=6836903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	6839453	rs871365	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=0.618;SC=AAAATGCAGGGATTATGGGGG;SOR=0.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=6839461;WS=6839443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	6840209	rs3168600	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=567;ReadPosRankSum=0.467;SC=GAATTGAAAGGACTGTCGTTT;SOR=0.479;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=35;WE=6840217;WS=6840199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr12	6840371	rs11227	G	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=757;ReadPosRankSum=0.254;SC=TAGGGAGGAGGCAAATGTAGG;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=51;WE=6840379;WS=6840361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,55:0.56:98
chr12	6857898	rs35247189	C	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=376;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GAGGACCGTCCGCAGGTGCAC;SOR=0.242;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=21;WE=6857906;WS=6857888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr12	6859308	rs2302370	T	C	3836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.101;NF=78;NR=82;PP=2327;ReadPosRankSum=0.872;SC=CGCTCAATCCTACCTTCTCTG;SOR=0.543;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=349;TCF=160;TCR=189;TR=160;WE=6859316;WS=6859298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,189:0.45:416
chr12	6859797	rs2302368	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AGCATACTGTTTCCCTCTTGC;SOR=0.069;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=18;WE=6859805;WS=6859787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	6861043	rs2302367	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=696;ReadPosRankSum=-1.535;SC=CTTTCCTAACTAACCTCCAAC;SOR=0.899;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=44;WE=6861051;WS=6861033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr12	6879202	rs4764622	T	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=789;ReadPosRankSum=0.845;SC=TGGCAAAGTCTGGGCTCAAAG;SOR=0.300;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=56;WE=6879210;WS=6879192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr12	6879279	rs4764621	A	G	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GGGCTCTGCCAGAGCTTCCTG;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=67;WE=6879287;WS=6879269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr12	6882120	rs3214312	AG	A	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.498;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=615;ReadPosRankSum=0.503;SC=GCCCCACAGGAGGGGACCAGC;SOR=0.346;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=17;WE=6882128;WS=6882110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr12	6883670	rs2365094	G	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=400;ReadPosRankSum=-0.185;SC=AAAGCCAGGTGCCTGTTTCCA;SOR=0.794;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=23;WE=6883678;WS=6883660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr12	6883700	rs2365095	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=531;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GGCTTGGCAGCCCTGCTGTGT;SOR=0.653;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=34;WE=6883708;WS=6883690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr12	6887020	rs870849	T	C	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=51;PP=1957;SC=CTGTTTCTCATCCTTGGTGTC;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=6887028;WS=6887010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	6909380	rs3216776	TG	T	9442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=88;PP=2957;SC=GGGGTCTCAATGCAGATGACG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=26;TCR=90;TR=114;WE=6909396;WS=6909370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	6909388	rs2365568	A	G	9427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=93;PP=2965;SC=AATGCAGATGACGTGGGAGGA;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=182;WE=6909396;WS=6909370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr12	6909442	rs2255301	T	C	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=82;PP=2965;SC=AGCGGCGACATTGAGACCTGA;SOR=0.996;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=143;WE=6909450;WS=6909432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	6924109	rs11575099	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CATGCACTGTCTTGCAGAACC;SOR=1.098;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=28;WE=6924117;WS=6924099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr12	6924718	rs3782736	C	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=882;SC=AACCATGTGACCTTGGGTGAG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=6924726;WS=6924708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	6925149	rs10744715	C	T	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1438;ReadPosRankSum=2.223;SC=CTGCTGCCTCCACATGCCAAC;SOR=0.959;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=83;WE=6925157;WS=6925139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,90:0.58:156
chr12	6926363	rs1055141	T	C	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=43;PP=1791;SC=TGATGCTGAGTTTGAAACTGG;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=85;WE=6926371;WS=6926353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	6927470	rs12226953	C	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=382;SC=CACCCCTCCCCTCTCCCCCAA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=6927478;WS=6927466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	6928075	rs12821756	T	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=27;NR=38;PP=1152;SC=CCTGCCAGTGTCCTCAGTAAG;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=6928083;WS=6928065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	6928135	rs55764611	TA	GG	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=12;PP=683;SC=GGGAGGGAGTTAGAGAGGAGG;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=20;WE=6928144;WS=6928125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	6928586	rs7136817	CA	AG	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=1383;SC=AGCAGATCCCCAGCCTCTGGC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=6928595;WS=6928576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	6933787	rs1051409	A	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=1246;ReadPosRankSum=-1.250;SC=CTTTTGAGGTACCAGCCATTG;SOR=1.015;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=151;TCF=92;TCR=59;TR=71;WE=6933795;WS=6933777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr12	6934989	rs2071080	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=1.242;SC=TAAGCAGGCACCCTGCTGTCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=6934997;WS=6934979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	6935631	rs2071081	A	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=320;ReadPosRankSum=-2.781;SC=AGGGCACCATAGAGCTGGGTG;SOR=1.893;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=20;WE=6935639;WS=6935621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr12	6938023	rs57050687	C	CG	1753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=1318;SC=GGGCGCGGCGCGCTTCGCGTG;SOR=0.963;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=29;WE=6938031;WS=6938013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	6939850	rs10744716	A	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=953;ReadPosRankSum=0.146;SC=TGTGGGGGAAACAGCCACACG;SOR=1.049;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=57;WE=6939858;WS=6939840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr12	6940254	rs7305463	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GCCAGTGGGAAGGGGGCTCTT;SOR=0.533;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=66;WE=6940262;WS=6940244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr12	6941021	rs1047771	G	A	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=974;ReadPosRankSum=0.754;SC=GATCCCTGGGGGAGAAGAGGC;SOR=0.688;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=52;WE=6941029;WS=6941011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr12	6942672	rs4963513	A	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=479;ReadPosRankSum=-1.299;SC=AACAGAAGAAACTTAATGAGA;SOR=1.126;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=27;WE=6942680;WS=6942662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr12	6942823	rs4963512	A	G	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1032;ReadPosRankSum=0.645;SC=GATATGCCCCATGGTGGGAGG;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=75;WE=6942831;WS=6942813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr12	6946247	rs1129646	G	T	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=867;ReadPosRankSum=1.163;SC=TTAAGGCTGCGCAGGTGAGCA;SOR=0.408;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=57;WE=6946255;WS=6946237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr12	6946545	rs4963510	C	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.988;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=186;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CCACCCTCCCCTTGCCTTCCT;SOR=0.193;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=6946553;WS=6946535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr12	6948468	rs1129649	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=639;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CAGGAGTGGATAGAAGCCAAA;SOR=0.778;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=46;WE=6948476;WS=6948458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr12	6954875	rs5443	C	T	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=75;PP=1949;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GCATCACGTCCGTGGCCTTCT;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=256;TCF=117;TCR=139;TR=141;WE=6954893;WS=6954865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,170:0.55:309
chr12	6955865	rs138991440	C	CCACA	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.22;MQRankSum=2.479;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=1.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr12	6959095	rs367917525	AC	A	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=333;ReadPosRankSum=-0.276;SC=ACATACAGAAACCCAGGACTC;SOR=0.368;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=6959103;WS=6959085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
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chr12	6965805	rs66621175	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=492;ReadPosRankSum=-1.290;SC=TGCAGAGCCCTCTCTCTCTGC;SOR=0.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=27;WE=6965813;WS=6965795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr12	6969731	rs2071059	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.383;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.749;SC=TTCTCCCTCTATCAGCCCCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=6969739;WS=6969721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr12	6979010	rs2071069	G	A	4463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=81;PP=2655;ReadPosRankSum=-1.975;SC=GCCCACATGGGGCAACCCCTT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=331;TCF=178;TCR=153;TR=176;WE=6979018;WS=6979000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,212:0.53:400
chr12	7014962	rs2071071	A	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=833;ReadPosRankSum=0.450;SC=GGGCTGAAGGAGGGGGTTGGG;SOR=0.897;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=50;WE=7014970;WS=7014952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr12	7015129	rs184876216	G	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=1.675;SC=GTGCGTTTTGGGGGGACCAGA;SOR=1.009;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=13;WE=7015137;WS=7015119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr12	7015915	rs1007924	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=0.373;SC=GCTAGGGCACATGGCAGTCTG;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=7015923;WS=7015905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	7016449	rs3741921	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=211;ReadPosRankSum=0.812;SC=TTGGAGTGGCCCTTTGAGCTC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=13;WE=7016457;WS=7016439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	7018949	rs2301137	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=1.248;SC=CCACTCCTCCCTCTCTACCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=7018957;WS=7018939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	7022085	rs1057077	T	A	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=76;PP=2160;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GAGGCTGATGTGATTCGACAG;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=87;TCR=138;TR=124;WE=7022093;WS=7022075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,150:0.55:271
chr12	7023123	rs710415	A	G	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=1037;ReadPosRankSum=1.148;SC=TATGACAGAGAACAGAGGATG;SOR=0.953;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=60;WE=7023131;WS=7023113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,70:0.63:111
chr12	7026893	rs376463507	A	AG	1034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=1018;SC=GCAATAAGCCAGCCTGCGGCT;SOR=3.334;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=22;WE=7026901;WS=7026883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	7026932	rs2071419	T	C	151.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGAGGGAGCATGCAACTCATG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=7026940;WS=7026922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	7044647	rs367827860	A	AG	1135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=1125;SC=TATGCAAGAGAGCCCCAAATC;SOR=2.694;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=24;WE=7044655;WS=7044637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	7045891	rs377147612	ACAGCAGCAGCAGCAG	A	1434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.301;NF=2;NR=17;PP=2995;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AGCAACAGCAACAGCAGCAGC;SOR=0.399;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=19;WE=7045913;WS=7045881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr12	7046077	rs11547602	G	A	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1456;ReadPosRankSum=2.192;SC=CAGCACACCTGCCCCCACCTC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=109;TCR=94;TR=101;WE=7046085;WS=7046067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,113:0.51:220
chr12	7046591	rs181318837	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=694;ReadPosRankSum=0.323;SC=AGGGCCGCCCCTGAGCGCCAC;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=45;WE=7046599;WS=7046581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr12	7047143	rs7969685	C	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=889;ReadPosRankSum=-0.656;SC=CCGAGCAGCGCGCGCGCGAAG;SOR=0.461;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=57;WE=7047151;WS=7047133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr12	7049999	rs2071076	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=1.680;SC=TGGTTTGCCCCAAACCTGCCT;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=10;WE=7050007;WS=7049989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	7053085	rs3087835	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-1.026;SC=TCACTGTGCAAAAATTATGGG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=7053093;WS=7053075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	7053149	rs1044189	A	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=2.060;SC=GGTTTGGGCCACGCCTGGGCG;SOR=0.405;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=26;WE=7053157;WS=7053139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr12	7053362	rs915997	A	G	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=62;PP=2067;SC=GTCAAGGCATAGGCTGCTGGC;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=85;WE=7053370;WS=7053352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	7054859	rs2019743	G	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=6;PP=983;SC=TTCATGCTTAGACTACCACCC;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=7054867;WS=7054849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	7055860	rs2301262	T	C	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=16;PP=888;SC=TGCGGCCCTCTGCCGTGGCTT;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=7055868;WS=7055850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	7065281	rs10744724	C	T	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=36;PP=1936;SC=CAGACCATCTCGCCTCCTCTC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=7065289;WS=7065271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	7065406	rs7963446	G	A	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=72;PP=2776;SC=GGGCCACGTGGGAGGAGAGGC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=64;TCR=72;TR=136;WE=7065414;WS=7065396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	7065576	rs2110071	G	A	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=65;PP=2547;SC=CCACGCTTGCGTCCAGAACCA;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=133;WE=7065584;WS=7065566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	7065635	rs2110072	T	C	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=76;PP=2622;SC=CCAGCCAGGGTTGTCTGGAGG;SOR=0.895;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=64;TCR=77;TR=140;WE=7065643;WS=7065625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	7069425	rs28579154	G	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=22.336;HP=13;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=934;ReadPosRankSum=0.730;SC=CAGGGCCTGGGGGGGGGGGGG;SOR=0.820;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=72;WE=7069433;WS=7069412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,73:0.92:79
chr12	7069620	rs759052	T	C	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=65;PP=1841;SC=TGACTGCCACTGCCCGGCATC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=105;WE=7069628;WS=7069610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	7069654	rs759053	G	A	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=43;PP=1404;SC=TGCCCAGCCCGATCCTCACTT;SOR=1.488;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=7069662;WS=7069644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	7079215	rs7301709	T	G	4068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=54;PP=2538;SC=CTGGAGGTTCTCGCAGCACCC;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=119;WE=7079223;WS=7079205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	7080210	rs60117710	A	AG	5239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=52;PP=2957;SC=CGGAGGCCGTAGTTTATTGTG;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=70;WE=7080220;WS=7080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	7080212	rs17857448	T	C	5248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=52;PP=2033;SC=GAGGCCGTAGTTTATTGTGGT;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=90;WE=7080220;WS=7080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	7090659	rs60570787	A	AG	4445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=31;PP=2967;SC=AATGAGGGAGAGCTCCGCTCT;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=7090667;WS=7090649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	7171620	rs7965055	C	T	2840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1663;ReadPosRankSum=-1.706;SC=GCCACTTCTGCAACAATTTCA;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=251;TCF=115;TCR=136;TR=111;WE=7171628;WS=7171610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,140:0.46:307
chr12	7175047	rs1143664	A	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=450;ReadPosRankSum=0.092;SC=GTGAGGAGCCATATTACTACA;SOR=0.928;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=34;WE=7175055;WS=7175037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr12	7187784	rs374614759	GT	G	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.053;QD=9.38;ReadPosRankSum=2.396;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr12	7188562	rs75380747	G	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=441;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GCCCTCCGATGATGCGCTGCC;SOR=0.772;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=27;WE=7188570;WS=7188552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr12	7241055	rs36136293	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTAAGTGTGCAGCAAGTTTGA;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=7241063;WS=7241045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	7242953	rs4505141	A	G	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=231;SC=ATGCACCACAATGGCTCTGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=7242961;WS=7242943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	7244956	rs12422724	A	T	7884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	7244962	rs12426834	T	G	7940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	7246403	rs34879108	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=544;ReadPosRankSum=-0.739;SC=GCCTGTGTGTCAGAGCTGAGG;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=31;WE=7246411;WS=7246393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr12	7246581	rs56876910	T	TTG	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr12	7249598	rs3742089	T	C	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1013;ReadPosRankSum=0.493;SC=TTGGGGTAGATGGTGTGGGCA;SOR=0.442;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=75;WE=7249606;WS=7249588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr12	7252506	rs34796296	C	T	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1553;ReadPosRankSum=-1.890;SC=CCTGCTGCCGCGGCCTGATAA;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=95;WE=7252514;WS=7252496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,106:0.58:182
chr12	7260825	rs35898229	A	AC	895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=-1.743;SC=TCCTGGCGGGACCCCCCCCAT;SOR=0.479;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=21;WE=7260833;WS=7260815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr12	7277236	rs2290237	T	A	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=568;ReadPosRankSum=0.547;SC=AGATACAGCATCTCTCCCTCC;SOR=0.700;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=40;WE=7277244;WS=7277226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr12	7283134	rs71445143	T	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CCTGCCCTGCTGTACCCCGCT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=7283142;WS=7283124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	7284301	rs2167285	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TGCCCTTCCACCGCTCTCTCT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=12;WE=7284309;WS=7284291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	7284484	rs10772466	A	C	3542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=51;PP=2272;SC=GGTTGGAGGAAAGAATGGAAA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=7284492;WS=7284474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr12	7287886	rs6488452	A	C	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=41;PP=2716;SC=AGGCTGGCTGACGTGTCTTCA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=124;WE=7287894;WS=7287876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	7287914	rs2278822	C	T	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=65;PP=2965;SC=TTCTCTCTGGCATATGCAGGG;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=94;TCR=66;TR=159;WE=7287922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr12	7290352	.	A	ATGTGTGTG,ATGTG	91.50	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.8199;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.674;NF=5;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TTGGACTGGAATGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=7290360;WS=7290351;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.75:4
chr12	7309199	rs7296261	G	A	6547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=99;PP=2965;SC=GGCCTGGCTCGGGTGTGGGGC;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=115;TCR=99;TR=214;WE=7309207;WS=7309189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr12	7309471	rs1868799	C	A	4125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=1.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	7309471	.	CGG	AGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=23;NR=54;PP=2947;QD=20;SC=CCAGACGTCCCGGAGCCCCAA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=77;WE=7309481;WS=7309461;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr12	7309473	rs1868800	G	C	4125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=1.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	7310635	rs142128898	C	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.07;MQRankSum=1.076;NF=31;NR=22;PP=735;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CCCCCAGCAGCGACGAGAGAC;SOR=0.511;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=53;WE=7310643;WS=7310625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,70:0.47:149
chr12	7355898	rs4883087	C	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=666;SC=TTTTAAAAAACTTATTCAGAT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=7355906;WS=7355888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	7360143	rs3825405	C	A	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=4;PP=1014;SC=CAATTAATTCCGGAACCTGTT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=7360151;WS=7360133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	7362204	.	G	T	1479	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=62;NR=20;PP=1479;QD=18.4606245433;SC=CAGAGTTTGAGCTGAGTCGGT;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=108;TCF=88;TCR=20;TR=82;WE=7362212;WS=7362194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,82:0.76:108
chr12	7362204	rs141721291	G	GCTGAGTCGGTGGAGTAATGTGCAGAGTTTGAT	4106.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=77.49;SOR=5.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	7463398	rs10843387	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=410;ReadPosRankSum=0.054;SC=ATTATAGCTATATCTTGGAAT;SOR=0.491;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=27;WE=7463406;WS=7463388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr12	7463491	rs7962994	C	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=357;SC=GCTGGGTGCGCTGGCTCACAC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=7463499;WS=7463481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	7470534	rs7968312	A	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=1.181;SC=CTTAAGATATAGGGGCAAAGT;SOR=0.034;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=7470542;WS=7470524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	7470566	rs7971931	T	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GATACCAGTTTGTAATTTTTG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=7470574;WS=7470556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	7477298	rs10743732	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=0.165;SC=ATTAATTCTCGTTATGAAGCA;SOR=0.238;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=7477306;WS=7477288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	7481085	rs11051240	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GCTTGAAAACTCAACTGTTGA;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=12;WE=7481093;WS=7481075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	7521563	rs148414953	TGA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=-1.573;SC=GCGACTGTCCTGAGAGAGAGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=2;WE=7521572;WS=7521553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr12	7525795	rs10845007	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=190;SC=TAAATCAGCACTTATTGTCAT;SOR=2.147;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=7525803;WS=7525785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	7525865	rs11053518	G	C	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=447;SC=TTTATGGTAAGTTATATTTCA;SOR=1.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=7525873;WS=7525855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	7551022	rs6488268	A	T	10541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=167;PP=2965;SC=AACACATGCAAAGGCTTTCCA;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=320;TCF=153;TCR=167;TR=320;WE=7551030;WS=7551012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr12	7551050	rs6488269	A	C	10229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=161;PP=2965;SC=ATTGTTTACAAACAACAGCTG;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=143;TCR=161;TR=304;WE=7551058;WS=7551040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr12	7585247	rs58195891	T	C	7640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=125;PP=2965;SC=CACATATAGTTCCCCACCTTT;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=117;TCR=125;TR=242;WE=7585255;WS=7585237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr12	7591681	rs139638620	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.411;NF=11;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CTCCAGCCCTGTGTCCTGCCC;SOR=1.462;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=31;WE=7591689;WS=7591671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr12	7596855	rs7954905	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=746;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GTTCATAGTTTTCCAAAGGGG;SOR=0.752;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=13;TCR=61;TR=37;WE=7596863;WS=7596845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr12	7637769	rs61729512	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=551;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CTGCCACAGCGTGTCAGGTCC;SOR=0.506;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=41;WE=7637777;WS=7637759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr12	7638020	rs10743939	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=520;ReadPosRankSum=1.497;SC=ATTCTGCAGCGAAACATAGAA;SOR=1.172;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=38;WE=7638028;WS=7638010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,41:0.40:102
chr12	7639054	rs76573683	T	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=203;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CTCAGTCCTTTCTCTATGTAA;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=13;WE=7639062;WS=7639044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	7640336	rs62622400	G	A	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=956;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTCACAGTATGAGAACCAATT;SOR=0.564;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=58;WE=7640344;WS=7640326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr12	7640589	rs7980201	C	T	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1135;ReadPosRankSum=-1.093;SC=GAGAGAAGTCCGAATCACAGA;SOR=1.051;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=149;TCF=69;TCR=80;TR=72;WE=7640597;WS=7640579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,76:0.46:166
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chr12	7649653	rs4883264	T	C	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1457;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TCCCCCATTCTCCTTGGAATC;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=89;WE=7649661;WS=7649643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,101:0.63:161
chr12	7655137	rs3210140	A	G	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1191;ReadPosRankSum=0.802;SC=AAGGGACTCAAGTTGACAAAA;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=74;WE=7655145;WS=7655127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,83:0.41:203
chr12	7655278	rs11836971	T	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AAACTCTTCATTCTAAATTGC;SOR=0.900;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=95;WE=7655286;WS=7655268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,104:0.52:200
chr12	7803562	rs10431308	C	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=16;PP=1105;SC=TCAGGAAAGACCTTTGAAGAA;SOR=1.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=7803570;WS=7803552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	7803646	rs10431309	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=698;ReadPosRankSum=0.012;SC=GCTCCAGTGCGTACAACATCA;SOR=0.578;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=44;WE=7803654;WS=7803636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr12	7805236	rs2302515	C	G	8993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=141;PP=2965;SC=TGGAGCAGCTCATGGATGGGT;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=119;TCR=142;TR=259;WE=7805244;WS=7805226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr12	7805467	rs2080127	C	T	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=71;PP=2037;SC=TGTCATGCCACATTTAGAGAG;SOR=1.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=7805475;WS=7805457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	7805508	rs112046539	CTTTT	C	1221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.26;QD=37.02;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	7818348	.	GACACACACACAC	G	539.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=9.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=1.939;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=2.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr12	7818444	rs7294364	C	A	2721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.05;MQRankSum=-1.124;NF=48;NR=48;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GCCCCCGGATCCATTTTACCT;SOR=0.579;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=96;WE=7818452;WS=7818434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,122:0.56:217
chr12	7843373	rs3815479	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=0.504;SC=AATAGAAATGCCAGACACCCA;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=20;WE=7843381;WS=7843363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr12	7847940	rs6488591	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=187;SC=TTAAATGAGACAAAATATGAA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=7847948;WS=7847930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	7864199	rs61753205	C	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.672;NF=39;NR=49;PP=1213;ReadPosRankSum=0.666;SC=CAACCTACATCCCAGGGTCTC;SOR=0.544;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=65;TCR=94;TR=88;WE=7864207;WS=7864189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,104:0.54:194
chr12	7864312	rs999074	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr12	7894056	rs73056605	G	A	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.028;NF=57;NR=57;PP=1807;ReadPosRankSum=2.889;SC=GTCAGGCTTGGATGATACTGT;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=226;TCF=109;TCR=117;TR=114;WE=7894064;WS=7894046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,125:0.49:255
chr12	7894132	rs80204298	GA	G	2114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.711;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.935;NF=1;NR=50;PP=1771;ReadPosRankSum=0.113;SC=GAGGCACTGGGAAAGAGAAAT;SOR=0.420;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=51;WE=7894140;WS=7894122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr12	7894188	rs73056607	C	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=632;ReadPosRankSum=0.037;SC=TTGTACTATACAATCTTATGC;SOR=0.293;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=33;WE=7894196;WS=7894178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr12	7898824	rs7134479	A	G	284.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.98;MQRankSum=1.289;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr12	7942472	rs12826131	AG	GA	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=2296;ReadPosRankSum=0.254;SC=ATTACTATAAAGAAGTGTTAT;SOR=0.945;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=34;TCR=79;TR=55;WE=7942481;WS=7942459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr12	7942514	rs12816791	C	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=0.940;SC=CCCCTTTTTCCATTATAACTT;SOR=3.758;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=21;WE=7942522;WS=7942504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr12	7942556	rs12821889	G	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TATGTCCCAGGTCTCAGGAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=7942564;WS=7942546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	7945640	rs2889551	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.95;MQRankSum=-2.771;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.001;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	7945670	rs4354764	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.56;MQRankSum=-2.252;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.100;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr12	7945757	rs4438116	C	T	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.714;NF=65;NR=32;PP=1369;ReadPosRankSum=-1.613;SC=AATACCTCAGCCTCCAGCAGA;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=146;TCR=73;TR=97;WE=7945765;WS=7945747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,104:0.44:238
chr12	7945829	rs4242903	G	C	7647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=138;PP=2965;SC=TTTGTCCTTGGAATAAGGTGA;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=109;TCR=139;TR=247;WE=7945837;WS=7945819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr12	7945871	rs11831829	C	T	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.831;NF=23;NR=59;PP=1325;ReadPosRankSum=-1.093;SC=ATGGCTAAGACCTCTGTGGAT;SOR=0.451;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=167;TCF=43;TCR=124;TR=82;WE=7945879;WS=7945861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,87:0.49:178
chr12	7945916	rs34261320	G	A	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-7.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=1597;ReadPosRankSum=1.471;SC=TCCGTACATCGCCTCTTGCAA;SOR=0.203;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=37;WE=7945935;WS=7945906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr12	7945927	rs58791167	A	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=1597;ReadPosRankSum=1.594;SC=CCTCTTGCAAATAATTTATGA;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=30;WE=7945935;WS=7945906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr12	7947017	rs1860931	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.959;NF=21;NR=0;PP=464;ReadPosRankSum=0.225;SC=CTCTGTATTATGAATATTTTA;SOR=2.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=21;WE=7947025;WS=7947009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr12	7947304	rs4012939	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.659;NF=7;NR=18;PP=346;ReadPosRankSum=-2.450;SC=ACCCCAGCCTTTACTCTTCCT;SOR=0.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=25;WE=7947312;WS=7947294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,23:0.26:88
chr12	7967076	rs10845983	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.071;NF=19;NR=22;PP=552;ReadPosRankSum=1.422;SC=GTAAAGGCCAAGAAGGTAATG;SOR=0.404;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=41;WE=7967084;WS=7967066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr12	7970331	rs3040823	C	CAA	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=0.761;QD=36.69;ReadPosRankSum=0.900;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr12	7970335	.	A	AAAATATAGATAG	888	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=57.91;NF=9;NR=1;PP=888;QD=89.8;SC=CAGTCTCAAAAATATATATAT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=7970355;WS=7970325;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,10:0.83:12
chr12	7970339	.	T	TAGATAGATAG	755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=0.784;QD=27.99;ReadPosRankSum=1.940;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr12	7970343	rs3040793	T	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=0.727;QD=26.68;ReadPosRankSum=3.058;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr12	7970347	rs3040789	T	G,TATAGATAGATAGATAGATAG	1984.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.55;QD=76.34;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,18,8:0.69,0.31:26
chr12	7970721	rs10845990	T	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=1.050;SC=AAGCTCCTCCTGTCCTGACGT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=7970729;WS=7970711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr12	7980035	rs10846003	T	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=32;PP=2002;SC=CCACCATGCCTGGCATTTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=109;WE=7980046;WS=7980025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	7980306	rs56049529	T	TA	1394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.77;QD=31.70;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	7982753	rs71038781	CT	C	176.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;QD=19.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	7984447	rs10772787	G	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=983;ReadPosRankSum=0.357;SC=GCTCACGCCTGTAATCCCAGC;SOR=0.647;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=55;WE=7984455;WS=7984437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr12	7985460	rs17728008	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=758;ReadPosRankSum=1.242;SC=AAACTTGTAATTGATGACTGT;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=49;WE=7985468;WS=7985450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr12	8043429	.	C	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=1.039;SC=TGGACAGCTGCGGGCAAGCTC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=7;WE=8043437;WS=8043419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr12	8043688	rs7297809	G	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=437;ReadPosRankSum=0.377;SC=TCACACCCAGGAGTACTTCTA;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=35;WE=8043696;WS=8043678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr12	8074192	rs25684	G	A	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.844;NF=42;NR=85;PP=2681;ReadPosRankSum=1.901;SC=TGAGGAAGCCGGTGAAGATAA;SOR=1.502;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=43;TCR=86;TR=127;WE=8074200;WS=8074182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr12	8082367	rs17847967	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=35.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQRankSum=-9.721;QD=0.29;ReadPosRankSum=-2.015;SOR=3.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,23:0.10:229
chr12	8088766	rs2541281	T	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=204;SC=TCCAAAGTCTTACCATTACAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=8088774;WS=8088756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	8090271	rs11056574	C	T	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.57;QD=25.28;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	8196445	rs2277414	T	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=582;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TTCAGTCCTTTCAGAGGCAAA;SOR=0.142;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=73;TCF=11;TCR=62;TR=31;WE=8196453;WS=8196435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr12	8200925	rs35574503	G	A	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=-0.288;SC=AGGAGGGTGGGGTGATGTCCT;SOR=0.634;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=21;WE=8200933;WS=8200915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr12	8235172	rs66928724	GT	G	261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=10;PP=196;SC=TATTTCTGCCGTTTTTTTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=8235180;WS=8235162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	8245239	rs2231750	C	G	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=724;ReadPosRankSum=0.791;SC=TTCAGGAAATCTCAAACTAAG;SOR=1.778;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=32;WE=8245247;WS=8245229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr12	8248367	rs2231754	T	C	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.615;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1129;ReadPosRankSum=0.379;SC=TCAATTGAAATCTTTGATCTG;SOR=0.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=49;TCR=75;TR=69;WE=8248375;WS=8248357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr12	8276432	rs7295783	C	T	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=8;PP=1038;SC=TAAGAAAGATCTGAAACAGAT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=8276440;WS=8276422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	8278181	rs2024301	A	T	8681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=119;PP=2965;SC=ACTGCCCCTCACAAAAGTAAT;SOR=0.759;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=131;TCR=119;TR=250;WE=8278189;WS=8278171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr12	8286762	rs7315526	G	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=29;PP=961;SC=TTTCTCTTTCGGGCCTGCACG;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=8286770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	8287048	rs11043498	C	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=32;PP=1226;SC=TGGGACTCCTCCGGGTTTTGC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=8287056;WS=8287038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	8288098	rs10840746	T	C	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=137;SC=ATGTGCTCTCTCTTGGCTCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8288106;WS=8288094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	8289226	rs4322490	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=564;SC=CGATGTCTTTGATTCTGCCCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=8289234;WS=8289225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	8289300	rs4573763	T	C	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=28;PP=2194;SC=ATCCTCTCCTTTTCTTCTTGT;SOR=1.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=98;WE=8289308;WS=8289290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	8374770	rs9668474	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQ=59.85;NF=11;NR=9;PP=297;SC=CCTCGTGCCTGTCTGGGGTGA;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=8374789;WS=8374760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	8374781	rs71265055	C	CACG	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=712;SC=TCTGGGGTGACGTACGTGGTC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=8374789;WS=8374760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	8543143	rs4403873	T	A	334.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=3.111;NF=6;NR=7;PP=180;ReadPosRankSum=2.867;SC=GAGCGGCCTCTCGGCGGAGCT;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=13;WE=8543151;WS=8543133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr12	8543219	rs376843169	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQRankSum=-2.287;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.221;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr12	8543224	.	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQRankSum=-2.287;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.221;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr12	8608583	rs4528410	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=-2.067;SC=TTAGTCCTATAAGAGTGTGTA;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=14;WE=8608591;WS=8608573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr12	8612336	rs10770736	G	C	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=975;ReadPosRankSum=-1.715;SC=TTTTTTCTCAGGGAGAGATCA;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=64;TCR=84;TR=78;WE=8612344;WS=8612326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,93:0.52:178
chr12	8612481	rs12300621	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.43;ReadPosRankSum=1.856;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	8617976	rs7302011	A	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.47;ReadPosRankSum=-2.825;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	8617982	rs7315873	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.73;ReadPosRankSum=-2.199;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr12	8666378	rs11045985	C	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=562;ReadPosRankSum=0.125;SC=CTCTCCTTTCCATTTCAAAGA;SOR=0.852;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=36;WE=8666386;WS=8666368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr12	8667897	rs4304840	A	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=687;ReadPosRankSum=-1.470;SC=CTTACTTCTCAGTGTCTGTTT;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=56;WE=8667905;WS=8667887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,64:0.43:149
chr12	8670978	rs74059866	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-0.311;SC=ATAGCATAAGATGAGAATCTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=8670986;WS=8670968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	8693240	rs5014225	C	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=352;SC=TTCCTCTGTCCCCCCACTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=8693253;WS=8693230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	8693245	.	A	AC	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=619;SC=CTGTCCCCCCACTTTTTTTTT;SOR=4.003;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=15;WE=8693253;WS=8693230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	8693333	rs4620776	G	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.96;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	8693419	rs145952293	T	TTCTC	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=635;SC=GGTTTTTTGTTTCTCTCTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=8693427;WS=8693409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	8757481	rs2028373	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=10;PP=296;SC=AAGTTCTTTCGTGGTTTTCTA;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=8757489;WS=8757471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	8757522	.	C	CA	201	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=18;MQ=59.71;NF=0;NR=12;PP=201;QD=17.1666666667;SC=AAATAATCTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=8757530;WS=8757512;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,12:0.67:18
chr12	8765447	rs1345004	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=606;SC=TTCTCTGTCTTAGTCTGACAG;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=8765455;WS=8765437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	8802008	rs2289382	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=201;ReadPosRankSum=-0.112;SC=CCCTCCTCTAGTACCAGACTT;SOR=0.144;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=13;WE=8802016;WS=8801998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	8802962	rs2289385	C	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=306;ReadPosRankSum=0.838;SC=GTACATTCAGCAATAACTAGG;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=16;WE=8802970;WS=8802952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	8803202	rs3841565	CA	C	2181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=53;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.514;SC=AAGCCCAATACAAAAAAATAA;SOR=0.727;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=14;TCR=97;TR=63;WE=8803210;WS=8803192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,93:0.55:169
chr12	8807195	rs17802192	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=0.123;SC=TGGCTTTGTGTTTTATGTATA;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=34;WE=8807203;WS=8807185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr12	8807982	rs34501309	A	AT	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.168;QD=1.41;ReadPosRankSum=-2.292;SOR=1.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,10:0.18:55
chr12	8808006	rs11046589	T	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=361;ReadPosRankSum=-4.590;SC=TGCGGTAAAATTTACCTGTTT;SOR=0.644;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=24;WE=8808014;WS=8807996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr12	8808362	rs151087918	CAAACA	C	1649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.870;NF=20;NR=13;PP=1365;ReadPosRankSum=-1.562;SC=AACAAACAAACAAACAAAAGT;SOR=0.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=33;WE=8808374;WS=8808352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr12	8808630	rs35365089	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=333;ReadPosRankSum=1.400;SC=ATACCAAAGGCATTGTGATTT;SOR=0.732;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=19;WE=8808638;WS=8808620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr12	8813498	rs12833793	T	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ATCCAGTCTATAGCAAAGGAA;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=38;WE=8813506;WS=8813488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr12	8813595	rs12809190	T	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ATGGTTATACTTTATCTTTGT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=16;WE=8813603;WS=8813585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	8850706	rs112263725	G	T	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=410;SC=CTGGGCGAGTGTGCGAGGACG;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=8850714;WS=8850696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	8926011	rs2969089	T	C	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=59;PP=2643;SC=GTGGCATTGATCTGCTGATGA;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=135;WE=8926019;WS=8926001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	8988403	rs4883188	A	C	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=57.37;NF=2;NR=6;PP=204;SC=AGGTCAGGAGATCGAGACCAC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=8988411;WS=8988393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	8988777	rs1894814	A	G	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=743;SC=CACTGTTTATACCCCTCTGCT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=8988785;WS=8988767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	8989916	rs11047510	A	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=399;SC=GCACTGGCCCAGATTGTCAGA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=8989924;WS=8989906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	8990813	rs10743504	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=470;SC=GAGTTTTTCTATATTAGAAAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=8990821;WS=8990803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	8995694	rs7307991	A	G	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=54;PP=2528;SC=TGGTTGGAGCACATGCTAAAA;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=134;WE=8995702;WS=8995684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr12	8995966	rs7136813	G	A	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=65;PP=2331;SC=ATGTGAGACCGGGAAACGGGG;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=8995974;WS=8995956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	9004512	rs1860927	G	A	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=41;PP=1672;SC=CTTTCAAGCCGTTCTTTGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=9004520;WS=9004502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	9004892	rs1860926	C	A	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=49;PP=1769;SC=GTGCTGATGACGCAAAAACCC;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=88;WE=9004900;WS=9004882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	9009820	rs1558526	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=627;ReadPosRankSum=0.438;SC=CCCAGTGGCTGTGGCGAGCAG;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=36;WE=9009828;WS=9009810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr12	9009999	rs3079157	T	TAA	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=586;ReadPosRankSum=-0.994;SC=GACAGATTGATGATACAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=14;WE=9010007;WS=9009989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr12	9010671	rs11612600	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=-1.274;SC=ATGCCAACGTGGGAAATCTCC;SOR=1.148;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=22;WE=9010679;WS=9010661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr12	9013442	rs35198143	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=365;ReadPosRankSum=0.580;SC=CTGCTGCCTGCTGCCCTGACT;SOR=0.620;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=21;WE=9013450;WS=9013432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr12	9016573	rs10219561	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=16;PP=488;SC=GCCAAGCAACACAATGCATAT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=9016581;WS=9016563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	9016665	rs17802489	G	C	32.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=40;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTGGAGATAGAGGAAAACAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=9016673;WS=9016655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	9020489	rs7308811	A	G	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=74;PP=2965;SC=TACCGCCTACATGCCATCTGA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=155;WE=9020497;WS=9020479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	9020912	rs1476910	A	G	5267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=82;PP=2965;SC=GATGTGAGCAACCGACTTCAC;SOR=0.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=63;TCR=82;TR=145;WE=9020920;WS=9020902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	9021053	rs5796325	C	CGTGT,CGT	1466.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=10,10;NR=15,15;PP=990,58;SC=TGTGTGTGTACGTGTGTGTGT;SOR=1.071;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=25,25;WE=9021061;WS=9021043;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:31
chr12	9021256	rs12816475	C	T	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=37;PP=1008;SC=ATTTATCTAGCTGTGAGGGGA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=9021264;WS=9021246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	9021316	rs10664353	T	TAC	113	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=122;SC=ATGGCGTGTATACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=9021324;WS=9021306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	9068472	rs10771204	G	T	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=5;PP=1241;SC=CAGAATTCAGGTTTGGGAAGA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=9068480;WS=9068462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	9068813	rs7304121	C	T	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=534;SC=AAACTAAAGACTGGGGGGGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=9068821;WS=9068803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	9070366	rs4883198	T	A	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=43;PP=1702;SC=AAATGTCACTTTATGAACGAC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=9070374;WS=9070356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	9074259	rs1805741	C	T	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=42;PP=2965;SC=TGAGCTCTCCCAGTGCTACCA;SOR=1.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=95;TCR=42;TR=137;WE=9074267;WS=9074249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	9082855	rs1805778	A	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=1;PP=477;SC=AATCAGATACAGAGCCAGAGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=9082863;WS=9082854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr12	9085099	rs887783	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=899;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TTTTAATTTAGAATGATTATT;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=50;WE=9085107;WS=9085089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,52:0.43:122
chr12	9086553	rs1805773	G	A	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.323;NF=60;NR=59;PP=1929;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTCCTGCCAAGGCATCTCCAG;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=244;TCF=133;TCR=111;TR=119;WE=9086561;WS=9086543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,131:0.49:269
chr12	9086683	rs1805735	A	T	5983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=97;PP=2965;SC=AAAAGATAAAACTGGTTGAGT;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=79;TCR=97;TR=176;WE=9086691;WS=9086673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	9086898	rs1049925	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.778;NF=40;NR=32;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GAATGCTAATACTCCAAGCAG;SOR=0.514;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=72;WE=9086906;WS=9086888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,79:0.45:176
chr12	9087081	rs1805772	G	A	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.368;NF=41;NR=51;PP=1522;ReadPosRankSum=2.617;SC=CCCGGTGAGGGCAGGGCCATA;SOR=0.481;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=92;WE=9087089;WS=9087071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,113:0.50:228
chr12	9087866	rs16917905	A	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=706;ReadPosRankSum=-0.344;SC=CATTTGGGGGAAGGAGACTCG;SOR=1.012;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=50;WE=9087874;WS=9087856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr12	9087906	rs113120861	ATAG	A	1596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=1276;ReadPosRankSum=0.475;SC=TCGGTGTAAAATAGTAGTTAC;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=27;WE=9087916;WS=9087896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr12	9090086	rs12371786	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=1.914;SC=CTTTGTCTCCGGACCTCTTAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=9090094;WS=9090076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	9094548	rs1805765	A	G	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.929;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1378;ReadPosRankSum=1.427;SC=TGTAGGGGGAAAAAAAAGAAG;SOR=0.860;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=81;WE=9094556;WS=9094538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,97:0.58:168
chr12	9095226	rs1805731	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TGTCAGCTGTTTCCTAAGATA;SOR=2.147;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=22;WE=9095234;WS=9095216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr12	9095268	rs1805730	A	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=-1.118;SC=GAGTAGTGATACTAAATGAAA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=9095276;WS=9095258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	9095905	rs113829875	T	TAC	1774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CAGCATAATGTACACATACAA;SOR=1.016;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=34;WE=9095913;WS=9095895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr12	9097933	rs1805725	C	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=341;SC=ACACTAGAAACGGCCAAGACA;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=9097941;WS=9097923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9099034	rs4140911	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=399;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GGGAGGGCAGGTAGGATCAGG;SOR=0.078;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=24;WE=9099042;WS=9099024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr12	9142297	rs1805723	T	C	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AGAATGACTATGGACCACAGC;SOR=0.389;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=170;TCF=98;TCR=72;TR=82;WE=9142305;WS=9142287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,103:0.49:210
chr12	9161986	rs9888309	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=857;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TCTGTGCATGCGGCCTTAAGT;SOR=0.874;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=50;WE=9161994;WS=9161976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr12	9205540	rs2216143	T	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TACATTTTTTTAATCTCCTTA;SOR=0.871;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=16;WE=9205548;WS=9205530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	9223242	rs16917971	A	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=574;ReadPosRankSum=-1.629;SC=TTCTATGTCCATGTTAAGCAT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=35;WE=9223250;WS=9223232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr12	9242623	rs11609582	A	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=983;ReadPosRankSum=0.918;SC=ACATTTCCTGAAAAAAAAGGC;SOR=0.758;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=63;WE=9242631;WS=9242613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr12	9246176	rs3832852	CTATGG	C	1177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.881;NF=5;NR=14;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.560;SC=ACATCTGACTCTATGGTGAGT;SOR=0.379;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=19;WE=9246188;WS=9246166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr12	9248233	rs226405	T	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=56;PP=1492;SC=CAGTCTTCATTGTCCTGGTCA;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=91;WE=9248241;WS=9248223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	9248332	rs55933766	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=2.099;SC=GCAAACTTATTTGTGACTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=9248340;WS=9248322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr12	9251265	.	G	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=538;ReadPosRankSum=0.274;SC=ACAGCACGGAGGGCGCAGACG;SOR=0.505;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=38;WE=9251273;WS=9251255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr12	9253894	rs226397	C	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=27;PP=857;SC=GAGTCCCTGCCGGCAATAATT;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=9253902;WS=9253884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	9254241	rs2228222	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=500;ReadPosRankSum=0.919;SC=ACTGGTAGCCGTAACAGGGAC;SOR=0.771;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=32;WE=9254249;WS=9254231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr12	9256708	rs226390	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=0.257;SC=AACCTTCAATCGGTTTCTAAT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=9256716;WS=9256698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr12	9303349	rs3741852	G	C	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.431;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=55;PP=1188;ReadPosRankSum=1.565;SC=TCACCTGAAAGGAAAAGTGGG;SOR=0.466;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=205;TCF=88;TCR=117;TR=104;WE=9303357;WS=9303339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,117:0.49:238
chr12	9305473	rs10771357	T	C	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1455;ReadPosRankSum=0.212;SC=CATCGCAAGTTTGGGGCACAG;SOR=0.630;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=78;TCR=106;TR=87;WE=9305481;WS=9305463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,91:0.45:202
chr12	9307373	rs2377741	T	G	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=63;PP=2105;SC=GGAGCCTGGGTTTGGTAAAGA;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=106;WE=9307381;WS=9307363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	9310565	rs4882981	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=564;ReadPosRankSum=0.155;SC=CTCTCTCTCTCTCTCGACAGG;SOR=1.127;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=9310584;WS=9310555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	9310576	rs10771364	T	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=564;ReadPosRankSum=0.615;SC=TCTCGACAGGTTCTTGCTCTG;SOR=0.990;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=9310584;WS=9310555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	9310959	rs7298673	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=0.437;SC=CTCCCTTCACCCCTGGGGGAT;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=9310967;WS=9310949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	9311265	rs3741850	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.770;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	9313518	rs7972015	T	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.706;QD=4.04;ReadPosRankSum=-3.526;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr12	9317784	rs2277413	A	G	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=82;PP=2929;SC=GAGTGTGAAGACCTCTCCACG;SOR=1.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=37;TCR=82;TR=119;WE=9317792;WS=9317774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	9333749	rs919209	G	A	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=63;PP=2114;SC=TGAAGGAAACGTCAACCAGTG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=110;WE=9333757;WS=9333739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	9334571	rs3741849	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=926;ReadPosRankSum=1.795;SC=AATCGCTCACCTTGTTGGCTA;SOR=0.481;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=54;WE=9334579;WS=9334561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr12	9334728	rs3832849	G	GAGTGAGACAAAATGGTCATA	4824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=45;PP=2971;SC=AACATGGAGAGAGTGAGACAA;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=47;WE=9334736;WS=9334718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	9344962	rs12423745	A	G	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.455;SC=GAGAGAATCAACCTCAAGAAA;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=90;TCR=106;TR=86;WE=9344970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,99:0.46:216
chr12	9345273	rs10771407	A	G	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=58;PP=2331;SC=TGTGCTGAGCACCCTGGTGGT;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=115;WE=9345281;WS=9345263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	9345408	rs2075395	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=394;ReadPosRankSum=1.940;SC=CAAAATGAATAGTTACAACGG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=24;WE=9345416;WS=9345398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr12	9349370	rs11049396	C	CT	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=204;ReadPosRankSum=1.682;SC=GACAAGAAAACTTTTTTTTTG;SOR=1.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=13;WE=9349378;WS=9349360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr12	9352908	rs6487668	C	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=541;SC=CTACATAATCCCTCAAAATTG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=9352916;WS=9352898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9353828	rs3759275	A	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=205;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AGATCTGAAAATTTTTAAAGT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=14;WE=9353836;WS=9353818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	9353875	rs3759274	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=215;ReadPosRankSum=0.284;SC=AACCTCCTACTCTCTAAAAGC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=15;WE=9353883;WS=9353865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr12	9446913	rs61916248	C	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.38;QD=53.89;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	9446932	rs61916249	G	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.35;QD=37.18;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	9446977	rs3874129	G	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=29;PP=1187;SC=CCTTAGGAGAGGCCTGGTTTT;SOR=1.217;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=74;WE=9446985;WS=9446967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	9447484	rs77482466	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=8.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQRankSum=-4.745;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.716;SOR=2.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr12	9450357	rs375411540	A	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.37;QD=28.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9450594	rs61916255	C	T	238.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.42;QD=34.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	9450603	rs142596611	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	9452062	rs75887043	A	C	154.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.46;QD=22.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	9452110	rs79328008	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.93;MQRankSum=0.842;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	9453726	rs61917369	G	A	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.69;QD=43.94;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	9453743	rs28415351	C	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.31;QD=39.10;SOR=3.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	9453864	rs61917370	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.242;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.528;NF=15;NR=25;PP=392;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TCCCCTCCCCAGGCCAGGGCC;SOR=0.332;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=47;TCR=89;TR=40;WE=9453872;WS=9453854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,35:0.24:148
chr12	9455342	rs80134739	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=44;PP=1474;SC=TGCAAAACCCACCGGGCTGCT;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=9455350;WS=9455332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	9455428	rs11050141	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.09;QD=32.80;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9456640	rs201046098	C	A	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.32;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	9456729	rs11050148	T	C	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.72;MQRankSum=0.549;QD=28.76;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr12	9456838	rs10843357	G	A	5813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=110;PP=2965;SC=TCCACATCCAGTTTCCTTCCT;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=57;TCR=110;TR=167;WE=9456846;WS=9456828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr12	9458412	rs10743653	G	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.50;QD=29.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	9458891	rs370295997	A	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.53;QD=31.56;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	9462680	.	GTAA	G	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.19;QD=43.45;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9462681	.	T	TGCC	842	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=48.3;NF=2;NR=14;PP=842;QD=57.3733910254;SC=TTTCTGTGGGTAATACCTCAT;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=9462694;WS=9462671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,16:0.67:24
chr12	9462685	.	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.19;QD=43.82;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9462686	.	C	CCGTTTT	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.19;QD=43.45;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9462709	rs2889720	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=123;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=14;PP=573;SC=CCAGGCACAGAGGCGGAGGAG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=9462717;WS=9462699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	9463010	rs4883234	C	G	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=97;PP=2901;SC=TGGAATTCACCTTCCAGAAAA;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=57;TCR=97;TR=154;WE=9463018;WS=9463000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr12	9463077	rs10771513	A	C	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=39;PP=877;SC=GCCTGGCCTCAGGCAGCAAAG;SOR=3.417;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=9463085;WS=9463067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	9463105	rs11050177	A	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.22;QD=32.15;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	9463774	rs55809356	G	T	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=56.63;NF=19;NR=31;PP=944;SC=AACCTGTGCGGTGTGGTTTCT;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=9463782;WS=9463764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	9463806	rs10771515	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=53.21;NF=7;NR=21;PP=590;SC=CTGTTTCTTCTCCTCCTACGA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=9463814;WS=9463796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	9464109	rs12824979	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.796;NF=16;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=-1.227;SC=CTGGCACCCTAAACCTGTCTC;SOR=2.321;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=18;WE=9464117;WS=9464099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr12	9464126	rs201695391	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQRankSum=-4.171;QD=0.90;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,9:0.12:72
chr12	9464178	rs112191067	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-4.927;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,39:0.18:214
chr12	9464241	rs61917427	C	A	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.192;NF=29;NR=47;PP=987;ReadPosRankSum=2.031;SC=GAGCTTGGGTCTGAGACCATG;SOR=0.803;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=253;TCF=129;TCR=124;TR=76;WE=9464249;WS=9464231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,95:0.30:312
chr12	9464271	.	C	CGTT	1498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=13.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-15.031;QD=5.31;ReadPosRankSum=-3.107;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,53:0.19:282
chr12	9464828	rs12581470	C	T	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=25;PP=1288;SC=TCTTGTCTCCCCCCCACGTGT;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=9464836;WS=9464818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	9465872	rs4012572	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	9549634	.	AG	A	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=47.7;NF=7;NR=0;PP=132;QD=23.5714285714;SC=GAGTACTGGAAGAAAAAAAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=9549642;WS=9549624;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,7:0.58:12
chr12	9555175	rs374009125	C	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=-5.590;QD=0.42;ReadPosRankSum=2.627;SOR=0.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,11:0.14:76
chr12	9555185	rs72475431	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQRankSum=-8.416;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.706;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr12	9555195	rs58903301	T	TC	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-5.035;QD=3.88;ReadPosRankSum=4.038;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,12:0.17:71
chr12	9555201	rs199717489	C	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=-5.135;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.047;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,11:0.16:67
chr12	9570971	rs7487238	G	A	131.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5339;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=55.16;MQRankSum=-0.674;NF=3;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=0.157;SC=GAGACCAAGCGGGAGGCCTGG;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=7;WE=9570979;WS=9570961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	9571547	rs61916776	C	G	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=58;PP=2055;SC=CAGAGGCTGGCGCTCCGAGCA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=9571555;WS=9571537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	9571599	rs73242993	C	A	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.979;NF=20;NR=28;PP=638;ReadPosRankSum=0.222;SC=GGCGACCCCCCCTCACCTTCC;SOR=0.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=48;WE=9571607;WS=9571589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr12	9571670	rs77617533	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=589;SC=CTTCTCCAGCTCCCATCTGTC;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=9571678;WS=9571660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	9572244	rs7305608	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=20;PP=630;SC=CAGCTGCTCCATTCTACCCCT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=9572252;WS=9572234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	9572788	rs145731114	C	CGCACCTGGAT	1711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=2900;SC=GCATGACGCCCGCACCTGGAA;SOR=3.737;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=17;WE=9572796;WS=9572778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr12	9572871	rs10843741	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.046;NF=2;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.547;SC=ACAGAGGACATTTCCCAGAGA;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=9572879;WS=9572861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	9572944	rs7955974	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.132;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGGGGACTGGAGAACCTCAC;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=9572952;WS=9572934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	9573130	rs7358608	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.226;NF=7;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GGCAGCCAGACGGCCCAGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=8;WE=9573138;WS=9573120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	9573223	rs4763936	C	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.260;NF=14;NR=14;PP=888;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AGAAACCACACCGCACAGGTT;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=28;WE=9573232;WS=9573213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr12	9573224	rs7358609	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=4;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.352;NF=15;NR=12;PP=860;ReadPosRankSum=1.493;SC=GAAACCACACCGCACAGGTTA;SOR=0.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=27;WE=9573232;WS=9573213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr12	9573287	rs375873947	AAGGAAGGG	A	931.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=1.601;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.696;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr12	9573291	rs67766754	AAGGG	A	618.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=9.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.786;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.472;SOR=2.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr12	9573304	.	AG	A	1218	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=6;HapScore=3;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=59.44;NF=5;NR=23;PP=1218;QD=44.1428571429;SC=GGAGGGAGGGAGGGAGCCCCC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=28;WE=9573317;WS=9573277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,28:0.97:29
chr12	9573307	.	GAG	CCC	1172	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=27;MMLQ=29;MQ=58.96;NF=3;NR=8;PP=1172;QD=112.315261351;SC=GGGAGGGAGGGAGCCCCCATG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=11;WE=9573317;WS=9573277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,11:0.28:39
chr12	9573309	.	G	GCCC	681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-1.135;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.196;SOR=1.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr12	9573338	rs4763950	G	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=75;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=1227;SC=TCAGCCACCCGCAAACCGCGT;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=9573346;WS=9573328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	9574002	rs10771709	C	T	5585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=77;PP=2965;SC=GCAGGTCTCTCTTCTGGAACG;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=108;TCR=77;TR=185;WE=9574010;WS=9573992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	9574042	rs7298124	C	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.338;NF=61;NR=43;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GGAGACCCCGCTGCAGATGAC;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=235;TCF=133;TCR=102;TR=104;WE=9574050;WS=9574032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,118:0.44:268
chr12	9574119	rs4764050	A	G	6083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=120;PP=2965;SC=CCGAAAACTGAAGATGCAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=75;TCR=120;TR=195;WE=9574127;WS=9574109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	9574344	rs4237949	T	G	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.44;QD=23.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9574480	rs7132464	T	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.71;QD=28.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	9577027	rs3825308	C	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.840;NF=7;NR=4;PP=161;ReadPosRankSum=1.470;SC=TTCTGGCTTGCGGCCCCAGGA;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=11;WE=9577035;WS=9577017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr12	9577310	rs7296629	A	C	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=54;PP=1565;SC=AAGGGGGTCCACAGTTGAGTC;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=9577318;WS=9577300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	9577992	rs201150453	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.82;MQRankSum=-1.751;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.244;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	9578197	rs76671194	A	T	5343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.017;NF=102;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=5.080;SC=GGGCTGCAAGAGCTGCACAGA;SOR=0.222;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=251;TCF=112;TCR=139;TR=205;WE=9578205;WS=9578187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,226:0.87:261
chr12	9580203	rs58705479	G	C	6804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=85;PP=2965;SC=ATTGGATGTGGAATGTGGAAA;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=133;TCR=85;TR=218;WE=9580211;WS=9580193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr12	9580395	rs61914681	C	G	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.88;QD=43.49;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	9581584	rs4763564	C	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.294;NF=9;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CTCCCAAGGGCTGGGATTACA;SOR=1.105;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=10;WE=9581592;WS=9581574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr12	9581791	rs4763566	T	C	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.012;NF=13;NR=27;PP=447;ReadPosRankSum=-0.605;SC=ATCAGGTTCTTGGCCTTCAAA;SOR=0.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=40;WE=9581799;WS=9581781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr12	9581856	rs200761361	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	9582244	rs201653123	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.23;MQRankSum=-0.704;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	9583216	rs3864916	T	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.62;QD=42.05;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	9583221	rs3864915	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.35;QD=39.18;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	9583324	rs4012577	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.91;MQRankSum=-0.593;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.268;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr12	9584916	rs3882934	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	9585598	rs200479049	T	C	106.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.07;QD=21.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9590052	rs149680272	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.431;NF=28;NR=19;PP=651;ReadPosRankSum=0.423;SC=TGCTGCAGGCGTTCTTCTCGC;SOR=1.217;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=47;WE=9590060;WS=9590042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr12	9590197	rs61914700	T	C	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=34;PP=1099;SC=GCTCTCCTTCTCCAACCAGCA;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=9590205;WS=9590187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	9590651	.	A	ACTGAGTAAC	1301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQRankSum=-8.264;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.478;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,42:0.23:182
chr12	9751035	rs3072716	C	CAT	3081.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=6;PP=2385;SC=AATGCACAGACATTAATATGG;SOR=4.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=50;WE=9751043;WS=9751025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	9752576	.	TAA	T	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=60;QD=15.75;SC=AGCGAAGTGGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=9752585;WS=9752566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr12	9754221	rs3072720	A	AAAAC	3232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.82;QD=43.69;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	9832822	rs2114872	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=7;PP=216;SC=AAGAAGAACACGTTTGCTTCC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=9832830;WS=9832812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	9832882	rs2114873	T	C	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=112;SC=CCATGTAGAATTGTGAGTCAG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=9832890;WS=9832872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	9840773	rs7310460	T	A	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=616;SC=TTTAGACATCTGCTTTTACAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=9840781;WS=9840763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	9906067	rs1051065	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=210;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAAGTGAACATGTTTCCTTAT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=9906075;WS=9906057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr12	9906324	rs111791571	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=1.687;QD=3.42;ReadPosRankSum=-2.339;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr12	9906350	rs57931161	GA	G	324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=226;SC=GACAAGAATTGAAAAAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=9906358;WS=9906340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	9980243	rs2232543	A	G	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=1191;SC=ATTTAATTTCATTTTTTCAAT;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=9980251;WS=9980233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	9994445	rs33911869	GTGT	G	2631.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=19;PP=1485;SC=ACCAAGGGAAGTGTTGTTATT;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=31;WE=9994455;WS=9994435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	10014936	rs253148	A	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.703;SC=GATGCCTTACATAGGTCATGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=10014944;WS=10014931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	10015082	rs253147	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=128;ReadPosRankSum=0.280;SC=AAAATAAAATGAAGGATGTAA;SOR=0.707;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=8;WE=10015090;WS=10015072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	10015177	rs253146	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TCATACCTGAAAAATAAAAAT;SOR=0.608;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=13;WE=10015185;WS=10015167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr12	10041364	rs1797517	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=521;ReadPosRankSum=1.188;SC=GAATGTAAACGTCAGCAGTCT;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=30;WE=10041372;WS=10041354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr12	10046052	rs576601	C	A	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1278;ReadPosRankSum=-0.789;SC=CAGTTTAAAACCTGGACATTT;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=169;TCF=98;TCR=71;TR=80;WE=10046060;WS=10046042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,90:0.46:196
chr12	10051433	rs1407899	A	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-1.053;SC=GGATGAAGACAGATTTAACTG;SOR=0.939;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=10;WE=10051441;WS=10051423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr12	10069302	rs526680	C	T	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=32;PP=1448;ReadPosRankSum=1.339;SC=AACTCACCAACCATTGAATGT;SOR=0.965;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=201;TCF=127;TCR=74;TR=96;WE=10069310;WS=10069292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,108:0.48:225
chr12	10074626	rs688577	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=399;ReadPosRankSum=-1.939;SC=TTTATACAAACAATCTCTGAA;SOR=0.627;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=20;WE=10074634;WS=10074616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr12	10104003	rs118182007	T	C	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=946;ReadPosRankSum=2.388;SC=TCCTCTCAATTTGAGAAATTC;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=66;WE=10104011;WS=10103993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr12	10124336	rs2984956	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=220;SC=ATAGAAGTGGTTATAGACTTG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=10124344;WS=10124326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	10124373	rs2961542	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=81;SC=GATATAGTTACTATTCAACTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=10124381;WS=10124363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	10131684	rs607567	T	G	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=83;PP=2868;SC=CCCCTGTTTTTGTCAAGAGGA;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=117;WE=10131692;WS=10131674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	10131939	rs536947	C	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=664;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GTGGAGTTCACGTAACTTTGA;SOR=0.043;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=34;WE=10131947;WS=10131929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr12	10132234	.	TG	T	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.748;NF=0;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=-0.437;SC=AGTCATAATTTGGGGGAAAGA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=10132242;WS=10132224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	10136672	rs2961544	G	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=425;SC=AAAGAAAACTGAAAAAGTATA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=10136680;WS=10136662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	10137557	rs479499	A	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=23;PP=823;SC=CACTTATAAAAAAAGAATGAT;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=10137565;WS=10137547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	10137645	rs588272	T	G	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=190;SC=CAAATACATTTAAGGAGTGTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=10137653;WS=10137635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	10138830	rs576031	C	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=TGCGTCAGAACAGAAAAAGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=10138838;WS=10138820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	10146014	rs11447004	A	AC	1181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=1073;SC=ACAAAAAAAAAAACGATTCTC;SOR=1.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=28;WE=10146022;WS=10146004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	10146236	rs617956	C	T	6616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=97;PP=2965;SC=GGTCAGGACTCAGATGAACTG;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=204;WE=10146244;WS=10146226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	10146470	rs542700	G	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=826;SC=TTTATTTGGAGAATACCTGCA;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=10146478;WS=10146460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	10147850	rs521040	T	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=709;ReadPosRankSum=0.111;SC=GTACTCCTATTGTAAACATAA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=54;WE=10147858;WS=10147840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr12	10148031	rs522837	T	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=397;ReadPosRankSum=0.357;SC=AAAAAAAACTTATAGGACACA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=20;WE=10148039;WS=10148021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	10149406	rs581949	T	C	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=25;PP=1458;SC=AGGTTTCTCTTCCTTGCCTCC;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=10149414;WS=10149396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	10149657	rs582968	T	C	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=51;PP=2072;SC=TACATTTTCTTCACATTCAAT;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=94;WE=10149665;WS=10149647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	10149851	rs583903	C	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=66;PP=2214;SC=TTCATTCTCACCTTGTAGGTA;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=117;WE=10149859;WS=10149841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	10151642	rs612593	T	C	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=62;PP=2965;SC=TTACCGGAGATGAGAGCTGGT;SOR=1.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=118;TCR=62;TR=180;WE=10151650;WS=10151632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr12	10151762	rs11379994	T	TC	3366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.712;NF=7;NR=51;PP=2106;ReadPosRankSum=-2.433;SC=AGTTTCCAACTTTACAATTTC;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=15;TCR=102;TR=58;WE=10151770;WS=10151752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,100:0.51:196
chr12	10163583	rs590429	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=-1.420;SC=ATAGTTGTGGAATGTATTAGA;SOR=1.659;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=10;WE=10163591;WS=10163573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr12	10165469	rs476474	A	G	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=30;PP=1340;SC=GGCTGGTGACATTGGGGATGA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=10165477;WS=10165459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	10165593	rs620449	T	G	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=29;PP=910;SC=CGTCTGATACTTTTCTGCTGT;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=10165601;WS=10165583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	10167277	rs637790	G	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=62;PP=2277;SC=GATCTCCAGTGTACTGAAGAG;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=10167285;WS=10167267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	10206925	rs7315231	A	G	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=63;PP=1989;SC=GATTATTAACAGCATCCATTT;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=10206933;WS=10206915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	10215582	rs10772230	G	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=704;SC=GTGAGGCAAGGGGCTTTTTGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=10215590;WS=10215572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	10217326	rs10622534	C	CTT	4146.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=34;PP=2965;SC=ATTTTTGTCTCATAGGATTTT;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=61;WE=10217334;WS=10217316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	10241541	rs11376074	A	AT	632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=-1.415;SC=TTGGCAACTGATTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=16;WE=10241561;WS=10241531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr12	10241553	rs5008763	C	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.04;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr12	10241593	rs1352477	A	T	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=6;PP=909;SC=GTTGCCATTTAAAAAAAGATA;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=10241601;WS=10241583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	10241829	rs2277416	G	T	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=47;PP=1419;SC=GCTCTGCAGGGAACAGAAGAG;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=10241837;WS=10241819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	10245158	rs11347002	GA	G	316.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=300;SC=AAGTAGTAATGAAATGAAATG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=10245166;WS=10245148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	10245237	rs11444183	G	GT	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=137;SC=AGGAGTTGTTGTTTTCTGCCC;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=10245245;WS=10245227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	10251256	rs10706436	GA	G	125.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=94;SC=GAATATAACTGAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=10251264;WS=10251246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	10251287	rs6488257	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=258;SC=TGTCACAGGGCGAGTAATTGG;SOR=1.493;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=10251295;WS=10251277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	10251385	rs3816845	T	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=25;PP=1256;SC=GTGGTCTATTTGGACTCCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=10251393;WS=10251375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	10251445	rs2306894	C	G	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=46;PP=2355;SC=TGTGGCAGAGCCTTGAGAATG;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=113;WE=10251453;WS=10251435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	10271055	rs7959451	T	C	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=33;PP=2257;SC=CCACCCTTCCTCTTACATTGA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=97;WE=10271063;WS=10271045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr12	10312878	rs2634156	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=18;PP=1045;SC=AGGCAGTGACCTCACTAGCAG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=50;WE=10312886;WS=10312868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	10312914	rs3816844	G	A	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=723;ReadPosRankSum=0.898;SC=GGAAACTGACGAGAGAGGCAT;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=46;WE=10312922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr12	10313075	rs3736235	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=569;ReadPosRankSum=1.621;SC=TGGGGAGTAATGTTTCTGAGT;SOR=0.794;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=48;WE=10313083;WS=10313065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr12	10313134	rs3736234	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=-4.077;SC=AGTTAGTGTTGGATCCACAAA;SOR=0.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=24;WE=10313142;WS=10313124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr12	10313358	rs3736232	C	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=652;ReadPosRankSum=0.380;SC=CAATACTCCACCCCAACAAAT;SOR=0.467;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=40;WE=10313366;WS=10313348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr12	10321514	rs6488266	C	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=-1.422;SC=CAATATACCCCTTTATTTTCA;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=14;WE=10321522;WS=10321504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	10339178	rs4764308	C	T	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1497;ReadPosRankSum=2.013;SC=CTCTCCAGAGCACTATCACAT;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=195;TCF=93;TCR=102;TR=105;WE=10339186;WS=10339168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,118:0.52:229
chr12	10373324	rs7301041	T	A	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=787;SC=ATTAGATACCTCTTGTTTTTT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=10373332;WS=10373314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	10460543	rs2302489	A	T	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=5;PP=916;SC=TTCATTCTCTATTTTTGCTAA;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=10460551;WS=10460533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	10461883	rs10734825	A	G	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=7;PP=956;SC=CTCCGTTATCAAATGAAAGAA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=10461891;WS=10461873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	10462052	rs10772256	T	G	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=50;PP=1618;SC=TTCGTTGATGTCTACGTTGGG;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=10462060;WS=10462042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	10462431	rs7980604	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=10;PP=235;SC=ATTTTACATTGCTCAATCTAA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=10462439;WS=10462421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	10467533	rs2537752	T	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=166;SC=AATTGTCATGTATGTGAAACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=10467541;WS=10467523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	10511662	rs10743886	C	T	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=66;PP=2136;SC=AATTCCAGAGCAGGGAGAAAA;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=113;WE=10511670;WS=10511652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	10525644	rs1351113	A	G	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=36;PP=1897;SC=CTTTAGTCTCAGTTGGCAGTG;SOR=1.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=10525652;WS=10525634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	10525740	rs1049172	C	T	4489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=78;PP=2827;SC=TGCAGATGTACGTATTTGGAG;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=135;WE=10525748;WS=10525730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	10532111	rs2255353	T	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=625;SC=TATTAAAAGTTTGTATTGTTA;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=10532119;WS=10532101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	10532326	rs2255336	T	C	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=15;PP=660;SC=CTCCATATTGTTACCATAATA;SOR=0.843;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=10532334;WS=10532316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	10532434	rs2617151	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=599;SC=GAAGCATAAAAGGTTTGGGTA;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=10532442;WS=10532424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	10560824	rs2617169	T	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=245;SC=TTATGGCTCATTGTTATAGTT;SOR=1.244;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=10560832;WS=10560814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	10560957	rs2617170	T	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=19;PP=755;SC=CAGGGAAAAATTGTTCTGCTC;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=10560965;WS=10560947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	10561913	rs3214902	TA	T	1536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=1402;SC=AAATATTCCCTAATCTTTCCC;SOR=3.056;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=34;WE=10561921;WS=10561903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	10562025	rs1841957	C	T	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=65;PP=2965;SC=CTTGATGATCCGAAGAAGCAT;SOR=0.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=156;WE=10562033;WS=10562015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	10562089	rs1841958	A	C	6220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=93;PP=2965;SC=TGAAATGGAGATTTTATTGCC;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=183;WE=10562097;WS=10562079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	10565113	rs17548983	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=69;PP=2194;SC=TCAGGGGCGGTGGCTTGTGTC;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=116;WE=10565121;WS=10565103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	10570965	rs2682495	C	G	5582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=87;PP=2965;SC=ATTATCTATACAAAGCAGACT;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=88;TCR=87;TR=175;WE=10570973;WS=10570955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	10571042	rs2741882	A	G	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=64;PP=2119;SC=TACCAATGTAATAACAACTGT;SOR=1.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=92;WE=10571050;WS=10571032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	10571091	rs2682494	T	G	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=39;PP=1367;SC=ATGGCCACAATGACGTGCTAA;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=10571099;WS=10571081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	10571106	rs2682493	G	C	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1148;SC=TGCTAATAAAGATATGAATTA;SOR=1.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=10571114;WS=10571096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	10571158	rs10743890	C	T	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=23;PP=1055;SC=AAAATTAGTTCACATATTTGC;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=10571166;WS=10571148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	10571177	rs4394921	A	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=18;PP=1060;SC=GCAACAGTATAAACATATATG;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=10571185;WS=10571167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	10571504	rs4579992	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.44;QD=43.13;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	10571514	rs4275705	C	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.15;QD=44.91;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	10571536	rs33947579	A	AT	196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.99;QD=28.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	10571622	rs4093355	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=27.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	10572839	rs2253365	A	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=425;SC=ATATTAGAATATTAGATCCCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=10572847;WS=10572829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	10572982	rs2741881	A	G	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=61;PP=2965;SC=CATATATTTTATCAATCCCTT;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=151;WE=10572990;WS=10572972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	10573094	rs2682491	C	G	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.70;QD=44.93;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	10573094	.	CA	GG	1399	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5002;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=41.5;NF=21;NR=52;PP=1399;QD=19.8968202036;SC=CCTTTGCTGCCACTTTGGGTC;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=73;WE=10573103;WS=10573084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,73:0.88:83
chr12	10573095	rs2682490	A	G	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.47;QD=44.93;SOR=2.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	10573145	rs2682489	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.99;MQRankSum=-2.450;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	10579308	rs117236878	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.34;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	10583611	rs3003	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.16;NF=18;NR=1;PP=540;SC=ATTTTTGTATCAGAGCAAATA;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=10583619;WS=10583601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	10586921	.	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.726;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=4.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.43;MQRankSum=-4.069;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=1.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,6:0.09:66
chr12	10586946	rs113946028	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=14.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.93;MQRankSum=-4.981;QD=8.32;ReadPosRankSum=-2.150;SOR=3.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,24:0.25:97
chr12	10586956	rs72475445	C	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=7.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.51;MQRankSum=-4.217;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=2.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,31:0.29:108
chr12	10586961	rs1356930	T	C	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.02;MQRankSum=4.190;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,80:0.68:117
chr12	10586978	rs144149096	A	AT	1555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.739;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.328;NF=76;NR=76;PP=2933;ReadPosRankSum=1.125;SC=TTATGGCTGAATTTATGGCTT;SOR=1.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=152;WE=10586997;WS=10586968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,65:0.35:187
chr12	10586989	rs5796394	AT	A	4032.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=6;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.492;NF=67;NR=79;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TTTATGGCTTATTTTCTGCAA;SOR=0.562;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=146;WE=10586997;WS=10586968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,144:0.61:235
chr12	10587111	rs61917677	A	G	5863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=125;PP=2965;SC=ATTCGGGGAAAAATTGTTCTG;SOR=1.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=50;TCR=125;TR=175;WE=10587119;WS=10587101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	10587158	rs35801775	A	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.396;HP=6;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.360;NF=6;NR=23;PP=525;ReadPosRankSum=-2.296;SC=AATGATTTTTATAAAAACTGA;SOR=0.029;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=29;WE=10587166;WS=10587148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr12	10588444	.	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.098;NF=35;NR=26;PP=970;ReadPosRankSum=-0.496;SC=TTCAGGGAAGGATTTTGAAGA;SOR=0.573;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=133;TCF=81;TCR=52;TR=61;WE=10588452;WS=10588434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,75:0.50:151
chr12	10588530	rs75545535	C	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=27.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.603;NF=30;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=2.544;SC=CCTTTGCTGCCGCTTTGGGTC;SOR=0.637;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=153;TCF=58;TCR=95;TR=58;WE=10588538;WS=10588520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,60:0.37:163
chr12	10588581	rs28403159	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=8.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=40.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.478;NF=3;NR=34;PP=807;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TCTTTGTTTATTCATCTCTGC;SOR=4.437;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=37;WE=10588589;WS=10588571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr12	10588647	rs28730284	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.220;NF=1;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=-1.346;SC=GAAGCTATAAATGGTGTATAT;SOR=0.582;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=10588655;WS=10588637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	10599347	rs2682471	T	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.32;QD=30.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	10602077	rs2734440	C	T	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=25;PP=881;SC=TAAACCTATACGTATGCAACA;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=10602085;WS=10602067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	10603670	rs2253849	T	C	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=28;PP=1577;SC=TAAAATGGAGTTTTTATTGCC;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=10603678;WS=10603660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	10658507	rs10845152	G	A	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=992;ReadPosRankSum=0.046;SC=GCAACATGGCGGGCGGAGAAG;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=60;WE=10658515;WS=10658497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,76:0.46:166
chr12	10659228	rs11053826	A	T	4035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.212;NF=79;NR=76;PP=2654;ReadPosRankSum=1.721;SC=AGTAAAGAAAATTCCAGTACC;SOR=0.641;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=286;TCF=150;TCR=136;TR=155;WE=10659236;WS=10659218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,180:0.53:342
chr12	10659438	rs10772299	T	C	6317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=93;PP=2965;SC=CATGTGTAAATCAATCTTTTC;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=99;TCR=93;TR=192;WE=10659446;WS=10659428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	10659964	rs10772300	C	G	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=51;PP=1534;SC=CTGGAAGTTGCAATTTCTCTT;SOR=4.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=56;WE=10659972;WS=10659954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	10675250	rs7980396	G	C	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=67;PP=2965;SC=ATGGGGCCCAGTTCTTACCAA;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=152;WE=10675258;WS=10675240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	10675295	rs10845155	G	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1170;ReadPosRankSum=0.365;SC=AAACTTCTAGGAAATCATTTC;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=73;TCR=82;TR=72;WE=10675303;WS=10675285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,86:0.46:186
chr12	10746385	rs2244387	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=-0.987;SC=CTCACTCTGGGCTCCAGCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=10;WE=10746393;WS=10746375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	10748314	rs2168749	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=14;PP=658;SC=ACTTTAAAAACGATCTCATTT;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=10748322;WS=10748304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	10748403	rs2682484	A	T	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=32;PP=1077;SC=GAGAACGTCAAATTTTAAAGT;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=10748411;WS=10748393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	10759032	rs10772333	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=9;NR=16;PP=378;SC=ATTCTTTAAATGCCTAAAACA;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=10759040;WS=10759022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	10760328	rs3947920	G	A	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	10760335	rs2125090	T	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.92;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	10760380	rs2125089	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=18;PP=670;SC=ATCTTGGCTAGCAAACTGACT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=10760388;WS=10760370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	10762069	rs7311796	G	A	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=745;SC=AGGGATGCAAGTAAGAATTTT;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=10762077;WS=10762059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	10763236	rs10845182	G	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=341;SC=TTCTGATCATGACATCATTTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=10763244;WS=10763226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	10763419	rs72054859	CTAGACATG	C	368.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=1040;SC=AAGATCATTGCTAGACATGTA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=10763448;WS=10763409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	10763440	rs12811247	G	T	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=144;SC=GACAATAAATGTTTGCTGGTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=10763448;WS=10763409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	10765500	rs116702057	C	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=914;ReadPosRankSum=-1.856;SC=TCAAGAGTGCCGTCCTCTAAG;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=50;WE=10765508;WS=10765490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr12	10766244	rs10772335	A	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=74;PP=1888;SC=TTCCTCCTGCAGTGCAGCCCT;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=107;WE=10766252;WS=10766234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	10774698	rs2900467	A	G	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=160;SC=ACTACATACAATTCAGTTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=10774706;WS=10774688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	10775195	rs1078437	T	C	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=88;PP=2965;SC=CACGCTTGCATATTTGCATAC;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=147;WE=10775203;WS=10775185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	10783729	rs2290717	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=27;PP=1209;SC=CACAGCTACCACTGCAAATCT;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=10783737;WS=10783719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	10786757	rs5796407	T	TGAA	4020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=45;PP=2597;SC=GAGAAGAGAATGAAGAAGCCT;SOR=1.364;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=49;WE=10786765;WS=10786747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	10856845	rs141466000	CA	C	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.629;NF=0;NR=6;PP=221;ReadPosRankSum=-1.483;SC=AAGTAAAAAACAAAATGCTTC;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=10856853;WS=10856835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	10870900	rs11309033	AC	A	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.489;NF=0;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=0.135;SC=TCCACAGGCCACCCACCTTCC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=10870908;WS=10870890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	10871667	rs33016	A	G	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=24;PP=1195;SC=GCAAATATACACACACACATA;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=10871675;WS=10871657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	10954258	rs619381	C	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=662;SC=TTAGAATAGACATTACTTTCC;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=10954266;WS=10954248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	10958658	rs2537817	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=258;SC=TTTCATATCATGCAGGCAATT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=10958666;WS=10958648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	10978402	rs597468	G	A	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=33;PP=1440;SC=GTCATTCTTCGTTTTATAATC;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=10978410;WS=10978392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	11138935	rs66679979	T	C	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=51;PP=2589;SC=CAGTCAAATATGAAAGATGTA;SOR=1.072;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=124;WE=11138943;WS=11138925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	11183191	rs116737741	T	C	8043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=154;PP=2965;SC=AACTCCAAACTGATATCATTA;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=107;TCR=154;TR=261;WE=11183199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr12	11201689	rs2597986	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=496;SC=AGTAAACCAACTCTGGACACC;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=11201697;WS=11201679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	11201962	rs2597987	T	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=TTTAAATGTGTAGTAACATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=11201970;WS=11201952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	11418954	rs1896551	A	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=27;PP=713;SC=TCATCTTCTTATTCACTTCCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=11418962;WS=11418944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	11421093	rs61463237	T	TGGG	2805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1790;SC=CTGGAGGAGGTGGACACACGG;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=35;WE=11421101;WS=11421083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	11421522	rs59152757	C	T	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=23;PP=880;SC=CATTCATAAGCAGAAGAAGAT;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=11421530;WS=11421512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	11506211	rs76504934	A	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=11;PP=426;SC=CCTGGAGGAGATCGGGCACTT;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=11506219;WS=11506201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	11506749	.	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.388;NF=6;NR=13;PP=222;ReadPosRankSum=-2.467;SC=GTCCTTGTGGTTTTCCTGGAG;SOR=1.563;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=19;WE=11506757;WS=11506739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr12	11506893	rs10845341	C	T	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=26;PP=1083;SC=GTGGGGGGCCCTGGGGCTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=11506901;WS=11506883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	11546742	rs201044388	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQRankSum=0.617;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.870;SOR=1.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr12	11803220	rs2856305	A	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.25;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	11903726	rs199664048	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.912;NF=10;NR=0;PP=1484;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATGTGTGGGCTTTTTTTTTT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=11903760;WS=11903716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr12	11903751	.	TGC	T	177	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=20;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=59.19;NF=10;NR=0;PP=177;QD=18.0;SC=TTTTTTTTTTTGCTTTTTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=10;WE=11903760;WS=11903716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	11904752	rs2856338	T	C	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=507;ReadPosRankSum=-0.109;SC=ATATTCATTATTGTTGCAGAT;SOR=0.478;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=35;WE=11904760;WS=11904742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr12	11904767	rs10845410	C	T	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr12	11904770	rs2724599	A	T	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.370;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr12	11904983	rs2724600	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-1.000;SC=AGAAGAGAAAACATGGCTTTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=11904991;WS=11904973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	11992168	rs11611479	G	A	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.221;SC=ACAGCAACACGTTTGAAATGA;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=84;WE=11992176;WS=11992158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,116:0.53:218
chr12	12006544	rs17210957	G	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=636;ReadPosRankSum=0.930;SC=GACAAATCCAGGAAGTTTAAT;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=33;WE=12006552;WS=12006534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr12	12044393	rs71435871	T	TTA	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	12044494	rs113420500	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=780;ReadPosRankSum=-1.590;SC=TTTCCTGCCACGTGGATCAGG;SOR=1.102;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=52;WE=12044502;WS=12044484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr12	12230938	rs1641721	C	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.153;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GGAAATTGAACAAAATCAGTT;SOR=1.644;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=25;WE=12230946;WS=12230928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr12	12240199	rs879732	C	T	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=55;PP=2359;SC=AAATTGTTTACTCCTGGCCAC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=112;WE=12240207;WS=12240189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr12	12247921	rs71435888	AT	A	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQRankSum=1.812;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	12251711	rs2448031	C	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=978;SC=TAGCTGATGTCTTCCTTGCAG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=12251719;WS=12251701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	12251761	rs1797646	C	G	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=26;PP=1563;SC=AACCCTCCCCCAAACTAACAT;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=12251769;WS=12251751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	12252078	rs1797647	T	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=380;SC=TCAGGAGAGGTCTCGTTCGTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=12252086;WS=12252068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	12265118	rs55833207	CA	C	272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;QD=24.79;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	12278468	rs2302684	A	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=ACAGTGAAGTAGTCTGATTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=12278476;WS=12278458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	12301898	rs2302685	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=689;SC=TTTACCACAACGGCTCGAGGT;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=12301906;WS=12301888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	12397668	rs10219768	T	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	12397668	.	TTA	ATT	711	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=13;PP=711;QD=58.8052211432;SC=TCAAATCGGTTTAAGTGAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=12397678;WS=12397658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr12	12397670	rs10219748	A	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	12483275	rs1861676	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=669;ReadPosRankSum=-0.536;SC=TTCAAAGTTAGGTTGGAGATT;SOR=0.963;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=41;WE=12483283;WS=12483265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr12	12483713	rs4763282	A	G	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1590;ReadPosRankSum=0.134;SC=AGTTTCTCCAAGTGATCTGAG;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=98;TCR=74;TR=88;WE=12483721;WS=12483703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,98:0.51:191
chr12	12483927	rs4763818	G	A	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=80;PP=2212;SC=GAAGGCTTATGTAACTCCATG;SOR=2.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=18;TCR=80;TR=98;WE=12483935;WS=12483917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	12510074	rs12826711	C	G	585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=1.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr12	12510097	rs10772552	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TGCGGCAAAGCCAGTGTCATC;SOR=0.272;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=21;WE=12510105;WS=12510087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	12514050	rs11054846	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.133;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	12618427	rs3751261	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=673;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CCCGGCCCTGCGGAGAGGACT;SOR=1.230;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=36;WE=12618435;WS=12618417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr12	12618715	rs967648	T	C	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=39;PP=1053;SC=CTGTAGCTGCTGCCCGGCCTG;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=12618723;WS=12618705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	12630346	rs12815760	G	A	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1997;ReadPosRankSum=1.832;SC=AAGGCCTGGCGGTCTGCAGCT;SOR=0.641;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=112;WE=12630354;WS=12630336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,125:0.53:235
chr12	12790737	rs10845599	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=439;ReadPosRankSum=-1.462;SC=CACTTTGGGAGGCCGAGGTGG;SOR=1.473;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=22;WE=12790745;WS=12790727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr12	12814818	rs4763862	C	T	4286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=60;PP=2965;SC=GCATCAAAGACCCACGATGCC;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=130;WE=12814826;WS=12814808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	12938793	rs7297140	G	A	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=29;PP=793;SC=TGAAGAATCAGCTGCTTCTAG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=12938801;WS=12938783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	12939741	.	C	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AGTGGCTGCTCCGCTGAACTC;SOR=0.976;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=11;WE=12939749;WS=12939731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	12939812	.	C	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=394;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CACGGAGACTCCAGGCTGACC;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=25;WE=12939820;WS=12939802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr12	12967127	rs1051374	C	T	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=62;PP=1651;ReadPosRankSum=0.904;SC=CCACCAAGATCCAGATTGAAG;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=200;TCF=83;TCR=117;TR=108;WE=12967135;WS=12967117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,120:0.52:230
chr12	12967264	rs3741826	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-1.759;SC=GATATGGTCACTAAAGGTACA;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=12967272;WS=12967254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	12977400	rs1010878	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=433;ReadPosRankSum=0.994;SC=GTTTGTTCTCGTGTTTGTCTA;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=25;WE=12977408;WS=12977390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr12	12980446	rs12425168	G	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=-1.389;SC=AAACTAAGGTGCAGAGATGGT;SOR=1.082;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=22;WE=12980454;WS=12980436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr12	13028653	rs10845659	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=1.734;SC=TACCCCCTCCAGGCCCCCAGC;SOR=0.549;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=21;WE=13028661;WS=13028643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr12	13061294	rs2075288	C	T	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1547;ReadPosRankSum=-0.641;SC=TGGCCACAGCCGGGGTTGTGA;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=189;TCF=117;TCR=72;TR=95;WE=13061302;WS=13061284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,105:0.50:209
chr12	13101454	rs7294444	G	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=0.645;SC=TATGTGTGCTGTACAATATAT;SOR=0.592;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=23;WE=13101462;WS=13101444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr12	13102605	rs4630382	G	A	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.973;NF=46;NR=46;PP=1322;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CGACCGGGTCGTCCCACTGGG;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=91;TCR=95;TR=92;WE=13102613;WS=13102595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,109:0.49:222
chr12	13136615	rs759601	C	G	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=2656;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TGTGTGAGAACTCCGTGTTAA;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=81;WE=13136631;WS=13136605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
chr12	13136623	rs735689	T	C	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=5;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=0.516;SC=AACTCCGTGTTAAAAATTCCA;SOR=0.860;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=186;TCF=98;TCR=88;TR=106;WE=13136631;WS=13136605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,123:0.57:214
chr12	13136729	rs2052329	G	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=752;ReadPosRankSum=-1.574;SC=GATAGTACCCGTATACCCCTT;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=46;WE=13136737;WS=13136719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr12	13142174	rs850918	C	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=656;SC=CAAAGCTGGTCCCCGAGACCA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=13142182;WS=13142164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	13153388	rs147879664	G	GGCAGCAGTGCAGCAGT,GGCAGCAGTCCAGCAGTGCAGCAGT	1108.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=63.66;QD=52.80;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,12,9:0.57,0.43:21
chr12	13153773	rs1291364	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=481;SC=TCTTGGTAGCTGTCCCTCTAC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=13153781;WS=13153763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr12	13154582	rs59113920	CG	C	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.066;NF=14;NR=12;PP=774;ReadPosRankSum=-0.910;SC=ATCTGCTGAGCGGGGGCCCCC;SOR=0.685;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=26;WE=13154590;WS=13154572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr12	13154790	rs1291363	G	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1893;ReadPosRankSum=0.377;SC=CCAACTACCTGATCGTGTCCA;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=100;WE=13154798;WS=13154780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,109:0.52:208
chr12	13154911	rs1291362	A	G	3589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=69;PP=2272;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CGTCTTCTCCATGAATGTCAT;SOR=0.745;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=287;TCF=146;TCR=141;TR=145;WE=13154919;WS=13154901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,171:0.51:338
chr12	13155166	rs1291361	G	T	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=58;PP=1635;ReadPosRankSum=-1.877;SC=CTCCACCGCAGTGGCATCCTA;SOR=1.136;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=75;TCR=108;TR=92;WE=13155174;WS=13155156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,99:0.49:204
chr12	13208552	rs4763924	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=973;ReadPosRankSum=0.404;SC=AGAGCGAAGACGATCTGGTGC;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=53;WE=13208560;WS=13208542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr12	13211212	rs6488582	G	A	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=521;SC=TTTGTTTTATGTACAGTGTCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=13211220;WS=13211202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	13211495	rs76117339	GT	G	906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.545;NF=2;NR=24;PP=612;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TAAGAGACGTGTTTTTTTCAA;SOR=0.886;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=26;WE=13211503;WS=13211485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr12	13214537	rs3741818	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.032;NF=21;NR=9;PP=459;ReadPosRankSum=0.711;SC=CTAATCTTGTATGCCTTTCGG;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=30;WE=13214545;WS=13214527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr12	13214791	rs3741817	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=429;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TGACTCTCACGTGGTGGAGTA;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=27;WE=13214799;WS=13214781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr12	13215685	rs2200498	C	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=579;SC=TGTTCAGCCCCTTGCGTCTTT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=13215693;WS=13215675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	13219832	rs16908634	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-2.379;SC=CCTTCCCATAGCCTTCTAATG;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=13219840;WS=13219822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	13221606	rs1386005	T	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=60;PP=2638;SC=AGACATTAGATTTCCTTCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=130;WE=13221614;WS=13221596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	13224027	rs3825270	C	T	90.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TTCGTGCTCTCGGAACACCCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=13224035;WS=13224024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	13256353	rs10772620	A	G	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=33;PP=2965;SC=AGCAGTAAAGATATGTGTATG;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=97;TCR=33;TR=130;WE=13256361;WS=13256343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	13294280	rs7978768	C	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=17;PP=1340;SC=CCTCTGGTGCCTGACCATAAC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=64;WE=13294288;WS=13294270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	13369196	rs8885	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TTCTCCTCATCCATTTCTTTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=13369204;WS=13369186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	13529068	rs4763975	A	G	75.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	13529401	rs7957232	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=0.121;SC=ATAGATATAATACAATGAATA;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=13529409;WS=13529391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr12	13717508	rs1806201	G	A	6619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=105;PP=2965;SC=TCATGGTTGCGGTGGGGGAGT;SOR=0.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=197;WE=13717516;WS=13717498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr12	13720272	rs4764010	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=368;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GAGAAAGAGGAGTATTGAGCA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=13720280;WS=13720262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr12	13768354	rs1468845	C	T	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=25;PP=1888;SC=AAAGTGAGCACGTTTTAAACT;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=87;WE=13768362;WS=13768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	13769664	rs1805199	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=240;ReadPosRankSum=0.889;SC=CAGTATTGTCTGAACAATCCC;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=22;WE=13769672;WS=13769654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr12	13769725	rs1805536	G	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.803;SC=ACATACTAGAGATAGGAATAC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=13769733;WS=13769715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	13828659	rs11055581	T	C	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=991;ReadPosRankSum=-1.188;SC=TGCTCAAGAATTGTCAAAGAC;SOR=0.834;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=67;WE=13828667;WS=13828649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,84:0.41:206
chr12	14018777	rs7301328	G	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=423;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TGCCCAGGATGGGGGTGAGAG;SOR=0.773;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=22;WE=14018785;WS=14018767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr12	14577892	rs2231909	A	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=31;PP=1402;SC=ATTGATGCTAATGAAGAAACT;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=14577900;WS=14577882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	14579235	rs11055969	A	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=467;SC=GAAACTTTCTAAGCCTGTGGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=14579243;WS=14579225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	14589113	rs61758731	G	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=215;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GTCGATATATGGAAGAAGAAT;SOR=1.600;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=20;WE=14589121;WS=14589103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr12	14590981	rs10734876	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=50.99;NF=4;NR=0;PP=81;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=14590989;WS=14590971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	14591220	rs4479040	G	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=103;SC=ATTGACTTGAGTTGTATACTC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=14591228;WS=14591210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	14628705	rs7298275	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=231;SC=CAGCCATTTAAGGGTCCAGAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=14628713;WS=14628695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	14634392	rs140044044	C	CAGTT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=515;SC=ATGCATATGTCAGCTAGATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=14634400;WS=14634382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	14649196	rs61754409	A	G	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=70;PP=2965;SC=AAACAACCACATATGTTGTAA;SOR=1.097;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=110;TCR=70;TR=180;WE=14649204;WS=14649186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr12	14656768	rs1600	G	C	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=35;PP=1417;SC=TAGACCTCTGGCATGCCCTGA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=67;WE=14656776;WS=14656758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	14664250	rs2287541	A	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.471;SC=AATTTGCTCCACAATGTACAG;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=74;WE=14664258;WS=14664240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,85:0.56:151
chr12	14664595	rs10846013	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GTCTGCAGCAATATCAATCCA;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=29;WE=14664603;WS=14664585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr12	14688644	rs7957558	C	T	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=41;PP=2233;SC=TTATCTATGACGTTGAAGTCC;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=110;WE=14688652;WS=14688634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	14689451	rs1345531	T	C	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=803;ReadPosRankSum=-0.007;SC=GGGCGCTATATAGAAAAAGTC;SOR=0.534;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=46;WE=14689459;WS=14689441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr12	14694993	rs1862014	G	C	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=103;SC=CATGCCATTAGCAAAAAGTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=14695001;WS=14694983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	14720366	rs10846023	C	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=AGGGCTGGAGCGAGACCGCCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=14720374;WS=14720358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	14720554	rs147342083	GGCA	G	3640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=35;PP=2522;SC=TAACAACAGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.766;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=49;WE=14720564;WS=14720544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	14720583	rs7954623	T	C	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=39;PP=1409;SC=GCAGAAGCGGTGGCGGCTGTG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=14720591;WS=14720573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	14769468	rs1558795	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=424;SC=GAGTACAGAAGAGGATTAGCA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=14769476;WS=14769458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	14774849	rs7302418	T	A	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=2;PP=989;SC=ACTAGAGCGGTCAAGAGTAGT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=14774857;WS=14774839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	14781503	rs4764105	A	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=161;SC=TTCTCATTCTAAGGTGCCACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=14781511;WS=14781493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	14794062	rs10772800	G	A	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=1093;SC=CTTTCCGCAGGATGATCTCCT;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=57;WE=14794070;WS=14794052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	14804994	rs7313027	G	C	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=620;SC=TTAGGAGACAGTGTTGTGGTG;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=14805002;WS=14804984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	14822855	rs7314345	G	A	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=464;SC=ACACAATGACGCTTGATTTCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=14822863;WS=14822845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	14827463	rs3217157	AATC	A	9808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=74;PP=2967;SC=TTAGCTGTGGAATCATCTATT;SOR=1.308;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=142;WE=14827473;WS=14827453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	14829893	rs1420635	A	C	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=67;PP=2469;SC=CATTGTCCTCAAAGTACTGGT;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=139;WE=14829901;WS=14829883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	14832830	rs11336448	CT	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	14834421	rs56944147	GA	G	7809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=92;PP=2969;SC=CCTGGAATAGGAAAAAGAGAA;SOR=1.127;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=114;TCF=19;TCR=95;TR=106;WE=14834435;WS=14834411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	14834427	rs58911033	G	T	7849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=92;PP=2965;SC=ATAGGAAAAAGAGAAACTAAA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=152;WE=14834435;WS=14834411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	14841126	rs76507201	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=1.540;SC=CATCCTGAGCCCTTGTTTTAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=14841134;WS=14841116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	14923522	rs12818627	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GTTCTCCCCGTGCCCGCCAAG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=14923530;WS=14923512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	14927825	rs6645	C	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=455;ReadPosRankSum=1.403;SC=AGCTGGCTCCCCCAGCAAAGG;SOR=1.038;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=28;WE=14927833;WS=14927815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr12	14947675	rs34868934	TA	T	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.591;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.973;NF=1;NR=14;PP=176;ReadPosRankSum=0.492;SC=GGAGGTCTGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.250;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=15;WE=14947683;WS=14947665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr12	14949720	rs71438330	C	CA	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	14959391	rs2241221	T	C	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=1451;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CTTTTGGATTTTCATAATGGC;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=62;TCR=93;TR=77;WE=14959399;WS=14959381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,89:0.50:178
chr12	14976063	rs7304054	A	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=856;ReadPosRankSum=0.462;SC=CAAATGCTCAAAATTTTTAAG;SOR=0.423;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=51;WE=14976071;WS=14976053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr12	14976178	rs7307438	T	A	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=37;PP=1599;ReadPosRankSum=-1.527;SC=AGAGTACCAATGTAGAGGAGT;SOR=1.010;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=91;WE=14976186;WS=14976168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,103:0.50:204
chr12	14976417	rs139293175	CTA	C	2800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=1941;ReadPosRankSum=0.135;SC=TCCAAAACCACTATGATAGAC;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=47;WE=14976426;WS=14976407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr12	15034996	rs2430735	T	A	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=9;PP=1251;SC=TATGTATTTCTGTAATGCTGC;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=15035004;WS=15034986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	15067511	rs148149515	T	TGTGTGC	1349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.83;MQRankSum=3.528;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.722;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr12	15073831	rs2445382	G	C	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=820;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CCGACTCAGGGTCTGAAGGGA;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=46;WE=15073839;WS=15073821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr12	15081897	rs2445371	A	C	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.15;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	15081897	.	AG	CA,CG	1301	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=38,79;NR=40,88;PP=1164,1301;QD=15.6085624982;SC=CCAGCTGGCAAGTCTCCTTCA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=78,167;WE=15081906;WS=15081887;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:167
chr12	15081898	rs11056243	G	A	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,100:0.48:210
chr12	15082004	rs11056244	T	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=469;ReadPosRankSum=1.566;SC=GCTTCCTGACTATTTTTCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=22;WE=15082012;WS=15081994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr12	15090762	rs3748296	G	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AATCAAACTGGGTGGCTGTCT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=15090770;WS=15090752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	15090837	rs3748297	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=513;ReadPosRankSum=0.606;SC=TGGTTCCCTTAAGGTAGAACA;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=32;WE=15090845;WS=15090827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr12	15091221	rs11432737	A	AT	5926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=36;PP=2957;SC=GGCAAAATGCACTTATCCAGG;SOR=1.901;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=98;WE=15091229;WS=15091211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	15095707	rs10772822	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-1.160;SC=AGGAAAAACATACACTGCAAA;SOR=0.361;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=8;WE=15095715;WS=15095697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr12	15101034	rs72428197	GCACACACACA	G	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.985;NF=0;NR=5;PP=1169;ReadPosRankSum=1.585;SC=TTTAGTCCTTGCACACACACA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=15101051;WS=15101024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	15101072	rs4764142	T	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=1.784;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	15102681	rs28683560	G	C	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=683;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CAGAGACCAAGTTTTCTTTGT;SOR=0.658;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=40;WE=15102689;WS=15102671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr12	15103605	rs2430711	A	G	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=59;PP=2030;SC=GCTCATCATCATCATCCTCCT;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=15103613;WS=15103595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	15131110	rs75300825	T	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.832;SC=AAAAACTTTCTATTACTTTCT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=15131118;WS=15131100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	15131995	rs2233623	C	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=167;SC=GAGTTTCTCACATACAAACAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=15132003;WS=15131985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	15134353	rs2230872	A	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=910;ReadPosRankSum=0.487;SC=TGATTTGTCCATGGGAGGCAT;SOR=0.613;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=59;WE=15134361;WS=15134343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr12	15262179	rs1055151	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=409;ReadPosRankSum=0.322;SC=TCTCTGTGATGTTCCCTTCTC;SOR=0.538;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=32;WE=15262187;WS=15262169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr12	15273932	rs2247574	C	T	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.544;SC=CAACAGAAAACATTATTCTTT;SOR=0.685;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=95;TCR=37;TR=70;WE=15273940;WS=15273922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr12	15273957	rs2247568	A	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1418;ReadPosRankSum=1.226;SC=GGGGCCATAAATTTTTATTGA;SOR=0.837;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=111;TCR=66;TR=91;WE=15273965;WS=15273947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,104:0.50:207
chr12	15652330	rs4764197	T	C	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=706;SC=AAGTGTGTGATGTTTAGAAGA;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=15652338;WS=15652320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	15656832	rs4764199	T	A	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1185;SC=CTTTTTTATATATGATTTAGA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=15656840;WS=15656822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	15661441	rs888163	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=142;ReadPosRankSum=0.455;SC=TTTTTAAACCAGAATCTTTTA;SOR=0.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=12;WE=15661449;WS=15661431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	15669737	rs1050646	T	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=599;ReadPosRankSum=-0.753;SC=ATCCTTTGGGTCCTACGGCCG;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=32;WE=15669745;WS=15669727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr12	15673103	rs2302688	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=260;ReadPosRankSum=-1.126;SC=CTCCCACAGTCTTTTGTCTCC;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=16;WE=15673111;WS=15673093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr12	15677992	rs960666	A	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=359;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GACACGTCAAATGTTTGCATA;SOR=0.337;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=18;WE=15678000;WS=15677982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr12	15679120	rs6488782	C	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.327;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1006;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TGCCTCCAGGCGACATCTATA;SOR=1.823;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=54;WE=15679128;WS=15679110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr12	15679208	rs7134888	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=296;ReadPosRankSum=1.173;SC=TAAGAAGAGTGCACAGAGATG;SOR=1.792;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=21;WE=15679216;WS=15679198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr12	15731724	rs5796639	T	TG	2895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=19;PP=2562;SC=AATAAACCAGTTGAACAATAA;SOR=2.082;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=57;WE=15731732;WS=15731714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	15731744	rs1024843	C	T	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.353;NF=36;NR=16;PP=893;ReadPosRankSum=-2.232;SC=ATCCAATTCACACCACGTATG;SOR=0.777;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=52;WE=15731752;WS=15731734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr12	15733669	rs3748299	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=838;ReadPosRankSum=1.308;SC=CCACCCAGGGGCCACTGCCTG;SOR=0.685;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=57;WE=15733677;WS=15733659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr12	15748020	rs1558787	C	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=990;SC=TCCACGAGTGCTCAGTCTTAG;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=15748028;WS=15748010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	15776217	rs77967764	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=380;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AGACTATTGACAGTCCTAAAA;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=25;WE=15776225;WS=15776207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr12	15777486	rs4623959	T	C	194.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=141;SC=TATCCTCGCCTGGTATAAATG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=15777494;WS=15777476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	15803992	rs4237955	T	C	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=28;PP=743;SC=AATGTATCCATGCTCACAGTT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=15804013;WS=15803982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	15813449	rs146612691	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=227;ReadPosRankSum=-0.578;SC=ACACCCGCCTCGGCCTCCCAA;SOR=0.830;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=18;WE=15813457;WS=15813439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	15818880	rs4363660	T	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=17;PP=532;SC=CTATAACATATCAATTAACTC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=15818888;WS=15818870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	15822229	rs4237957	A	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=846;SC=AAATCTAGTAACTAATATGCA;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=15822237;WS=15822219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	15822244	rs4237958	T	C	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=7;PP=1210;SC=TATGCAGATATATTATCAAAA;SOR=2.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=15822252;WS=15822234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	16036261	rs10734889	C	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=636;SC=TATTCCCAGCCAATTACAGAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=16036269;WS=16036251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	16050808	rs10772879	T	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=50;SC=ACTTAAATTTTTTTTCAGTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=16050816;WS=16050798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	16055926	rs71042275	G	GT	933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=474;SC=TCAATCATATGTGCAGTTAGT;SOR=0.846;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=16055934;WS=16055916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	16109673	rs2306181	T	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=410;SC=GGAGTGATTTTGCATGAAGTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=16109681;WS=16109663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	16185463	rs57961487	CTT	C	802.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=658;ReadPosRankSum=1.327;SC=AGTTTTTCCTCTTTTTGTTTT;SOR=1.136;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=19;WE=16185472;WS=16185453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr12	16342825	rs61915888	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TCCCTCCTGCGCTTGTCTACC;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=16342833;WS=16342815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	16347308	rs3942536	G	A	4000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=1511;ReadPosRankSum=0.039;SC=ATCCCAGGACGTTCAACAATG;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=73;TCR=110;TR=94;WE=16347316;WS=16347298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,112:0.52:214
chr12	16347327	rs117728539	G	T	3617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1413;ReadPosRankSum=1.062;SC=TGTTAATGATGCCAGGAAGAA;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=59;TCR=108;TR=82;WE=16347335;WS=16347317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,95:0.49:193
chr12	16369828	rs1671511	A	T	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=47;PP=2029;SC=TATTTTTACCATCTGAGATGA;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=99;WE=16369836;WS=16369818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	16397677	rs1527014	G	A	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=50;PP=2174;SC=GCAGTATTGCGGGTGGCATGT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=109;WE=16397685;WS=16397667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	16397746	rs1852451	C	T	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=60;PP=1943;SC=TGCAAGTAATCGGAGATATTA;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=92;WE=16397754;WS=16397736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	16430284	rs1671487	G	A	6587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=86;PP=2965;SC=ACAAGCAAATGTACACCAGTT;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=200;WE=16430292;WS=16430274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr12	16510395	rs2075239	T	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=1.491;SC=TAGATATGGGTACTCCCTATG;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=8;WE=16510403;WS=16510385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr12	16516710	rs3759207	T	C	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=903;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GTGTCTTTAATAGTTATCTTT;SOR=0.514;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=60;WE=16516718;WS=16516700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr12	16529036	rs71054810	AT	A	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.048;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.699;SOR=0.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr12	16743165	rs2058798	A	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=351;SC=TTCTTGAAGCAAAACTAACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=16743173;WS=16743155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	16743217	rs2058799	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	16757863	rs78062402	T	C	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=82;PP=2819;SC=CAGCTTCGCATTGAGCACCAA;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=54;TCR=82;TR=136;WE=16757871;WS=16757853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	17142520	rs35949588	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=541;ReadPosRankSum=0.315;SC=GTGGCTCACGCCTGTAATCCC;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=33;WE=17142528;WS=17142510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr12	17142546	rs7955087	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=1.080;SC=TTTGGGAGGCTGAGGCAGGCG;SOR=1.048;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=21;WE=17142554;WS=17142536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr12	18234097	rs941047	T	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CTCTCTGATATAGGAAATCTC;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=17;WE=18234105;WS=18234087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	18234256	rs941048	T	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.659;SC=ATAAACATCATTTCCACCTCC;SOR=0.850;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=88;WE=18234264;WS=18234246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,105:0.50:210
chr12	18234461	rs11043840	T	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-0.822;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	18234474	.	AAAAC	A	374	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=15;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=56.54;NF=0;NR=9;PP=374;QD=41.8888888889;SC=AAAAAAAAAAAAAACAGATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=18234488;WS=18234464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	18234480	.	G	C	339	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=57.79;NF=1;NR=6;PP=339;QD=53.3958875067;SC=AAAAAAAACAGATTTATAACC;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=18234488;WS=18234464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	18237688	rs6486881	C	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=568;ReadPosRankSum=-1.588;SC=GACCCACTTCCGCTGGAAGAT;SOR=0.624;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=29;WE=18237696;WS=18237678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr12	18243282	rs12303456	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=-1.823;SC=TGGAGTTACTGTTTAGACACA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=18243290;WS=18243272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	18443809	rs7133666	C	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AGATATCATGCAGCTGATGTT;SOR=1.739;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=12;WE=18443817;WS=18443799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	18443955	rs7133903	C	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=506;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGGTAAGCAACCTTGCAAATA;SOR=0.921;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=35;WE=18443963;WS=18443945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr12	18446881	rs7301521	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=362;ReadPosRankSum=0.437;SC=TGCATTTTTGCACAAATGACC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=32;WE=18446889;WS=18446871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr12	18473729	rs11044026	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-0.084;SC=AAAAGGCTTATATAGTTAAGG;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=18473737;WS=18473719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	18499777	rs10770357	C	G	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=88;PP=2659;SC=ACAGGTGAGTCGTGGTGAGTT;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=50;TCR=88;TR=138;WE=18499785;WS=18499767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr12	18641326	rs7137852	T	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=601;SC=TCCGGCTGGATGTGGTTTAAA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=18641334;WS=18641316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	18801017	rs501379	T	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=467;SC=TTTTCACTTCTGGGCCTCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=18801025;WS=18801007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	18836699	rs117823712	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=506;ReadPosRankSum=-0.232;SC=AGGCTCCCAATCTCTTCTCCT;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=23;WE=18836707;WS=18836689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr12	18854540	rs11279217	ATCCTCCTCC	A	1923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=43.72;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	18872325	rs10841078	G	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=330;SC=GAACTTCCAAGTATTTTTAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=18872333;WS=18872315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	18889517	rs144525318	A	AAATTTGAG	2673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=1721;SC=ATTAAAGTTAAAATTTGAGAA;SOR=4.133;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=31;WE=18889525;WS=18889507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	18890472	rs5796766	GT	G	1240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=834;SC=ACACACAGTGGTTTTTTTTGC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=36;WE=18890480;WS=18890462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	19282670	rs28512290	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=848;ReadPosRankSum=1.323;SC=CTCGCTCGTTCCCTCCTCCCT;SOR=0.627;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=55;WE=19282678;WS=19282660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr12	19283135	rs61913270	C	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=696;SC=CCCGGCTCCCCGCAACCTGCC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=19283143;WS=19283125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	19406863	rs6486942	C	T	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=18;PP=1122;SC=TTTCTTTTTTCCTTTTTTCAG;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=19406871;WS=19406853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	19418588	rs6486945	G	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=49;SC=GTTCATTTATGTACAAGAACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=19418596;WS=19418582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	19418874	rs7316780	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=284;SC=AAAAAAGCTACCTTATAGTGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=19418882;WS=19418864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	19428009	rs2279537	T	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.721;SC=AATATTGGTTTAAATTGTGTT;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=7;WE=19428017;WS=19427999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	19440358	rs200910877	GA	G	852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.162;NF=21;NR=9;PP=359;ReadPosRankSum=-1.103;SC=ACATTGATAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.294;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=30;WE=19440366;WS=19440348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr12	19441082	rs7960486	C	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=232;ReadPosRankSum=1.722;SC=ATTCCCTTATCCTTAAAACAG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=17;WE=19441090;WS=19441072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	19512563	rs11044515	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=42;PP=1117;SC=AAAATAAAGTGTGTTTCTTTC;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=19512571;WS=19512553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	19522484	rs113006194	A	AAAAG	408.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=9;NR=0;PP=484;SC=TTTAAAAAGAAAAAATCACAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=19522502;WS=19522474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	19522494	rs57357758	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.63;MQRankSum=-1.076;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-1.321;SC=AAAAATCACAATAGAACCAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=19522502;WS=19522474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr12	19592600	rs143333997	GGGA	G	2438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=25;PP=1526;SC=GGCGGCGGTGGGGAGGAGGAG;SOR=0.729;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=32;WE=19592610;WS=19592590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	19626314	rs28703623	T	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	19626318	rs57423687	T	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	19626322	rs11044583	T	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	19626326	rs12370241	T	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=60.46;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	19646943	rs66556640	CTGGTGTATTTCA	C	807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=2957;SC=CTGAGAAAATCTGGTGTATTT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=19646962;WS=19646933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	19873411	rs4301848	G	T	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=458;SC=AATTCTCGCAGGTTGTGGGAG;SOR=3.716;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=19873419;WS=19873401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	19873497	rs4369485	A	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=24;PP=1127;SC=TAAGTCCGATAACATCTGATG;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=19873505;WS=19873487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	20522114	rs138187101	A	AGCGT	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=587;ReadPosRankSum=1.210;SC=AATTGGGAAGAGCGTGCGTGC;SOR=1.880;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=16;WE=20522135;WS=20522104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	20522124	rs144106925	CGTGT	C	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=343;ReadPosRankSum=-1.433;SC=AGCGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.340;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=12;WE=20522135;WS=20522104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	20522252	rs12305038	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.917;NF=14;NR=10;PP=372;ReadPosRankSum=-2.274;SC=ACGAGTCAGGGACAAGCCCGT;SOR=0.867;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=24;WE=20522260;WS=20522242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr12	20709733	rs4762972	G	A	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=57;PP=1721;SC=AATAAAATGTGGAGCGAGGAA;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=76;WE=20709741;WS=20709723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	20724988	rs7966459	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=190;ReadPosRankSum=-0.037;SC=ATTCATGAAAGCATGTTTTTA;SOR=0.352;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=17;WE=20724996;WS=20724978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr12	20766559	rs10743380	C	T	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=66;PP=2557;SC=TGAATCCCGTCACTTCGCTCA;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=121;WE=20766567;WS=20766549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	20766685	rs7308381	G	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=827;SC=TTTTTTAATTGTCTTCTAGGT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=20766693;WS=20766675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	20769026	rs68125264	TTAGA	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=193;SC=CACTCAAATTTTAGATAGATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=20769037;WS=20769019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	20774464	rs10743381	A	G	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=74;PP=2096;SC=TGGTTTGTCTATTCTAATAAC;SOR=2.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=98;WE=20774472;WS=20774454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	20774539	rs10734705	A	G	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=502;SC=CTTATGTGATAATACAGATTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=20774547;WS=20774529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	20783099	rs7304499	A	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.20;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	20783099	.	AC	CC,CT	197	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5,0;NR=16,5;PP=197,29;QD=11.036724407;SC=AATAATAAAAACGATGATAGT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21,5;WE=20783108;WS=20783089;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:21
chr12	20783100	rs11045348	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.608;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	20786787	rs4265636	T	C	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=47;PP=1620;SC=AAAACAGTGATCTACATTTCT;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=20786795;WS=20786777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	20786841	rs10743382	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.232;SC=ATGATGTTGGTCAGGTCGGTC;SOR=0.941;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=20786849;WS=20786831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	20801855	rs9284155	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.80;QD=31.47;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	20803323	rs9804769	A	C	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TTTCTCTTCTATTCAACTTTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=20803331;WS=20803313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	20852546	rs34243130	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1245;ReadPosRankSum=0.613;SC=TCCAGTTGTTCTGCAAAACTT;SOR=0.866;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=76;WE=20852554;WS=20852536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr12	20864481	rs142446674	T	TA	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.688;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.027;NF=0;NR=18;PP=325;ReadPosRankSum=1.171;SC=AACAAGCTTTTAAAAAAAAGA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=18;WE=20864489;WS=20864471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr12	20893052	rs2037154	C	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=685;SC=ACATTTTTAACATAACTGTCT;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=20893060;WS=20893042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	20893108	rs2271656	C	T	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=17;PP=1211;SC=TTTTCCCTATCGTGTTACAGA;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=20893116;WS=20893098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	20893354	rs12368368	G	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=378;SC=CAATCATCTCGAGCAATGATT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=20893362;WS=20893344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	20903757	rs10841611	T	C	8396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=132;PP=2965;SC=CCGCATCTCATTGCTACAGCA;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=115;TCR=132;TR=247;WE=20903765;WS=20903747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr12	20903865	rs10841612	G	A	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=62;PP=1701;SC=GTGATCTGTAGTCATAGAATA;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=75;WE=20903873;WS=20903855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	20905250	rs6487138	C	T	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=370;SC=ACATATATATCTGGGACTAAC;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=20905258;WS=20905240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	20968828	rs10734710	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=411;SC=AGGCCACTAACTGTCAAAAAG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=20968836;WS=20968818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	21011480	rs4149117	T	G	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=45;PP=1998;SC=TATTTTGACATCTTTACCACA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=98;WE=21011488;WS=21011470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	21011581	rs4149118	G	A	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=42;PP=1129;SC=TTTTATACTTGTAAGTGGGCA;SOR=2.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=21011589;WS=21011571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	21013948	rs3764009	C	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=301;SC=GTTGCTCTTACAGTTATAGGT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=21013956;WS=21013938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	21014139	rs3764008	C	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=515;SC=TATAAAGTTTCTGATATTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=21014147;WS=21014129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	21014163	rs3764007	T	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=324;SC=CAAAATTGATTTAAGAACAAA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=21014171;WS=21014153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	21015610	rs1036261	A	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=39;PP=1585;SC=AGTGTATTGTATAATATTACT;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=21015618;WS=21015600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	21015760	rs7311358	G	A	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=41;PP=1273;SC=TTGCTAAAATGTACGTGGATA;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=21015768;WS=21015750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	21031020	rs2417938	A	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=142;SC=TCCATCTTGTAATATCATCGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=21031028;WS=21031010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	21032242	rs4149142	T	G	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=152;SC=TCCCAGGTTCTCCACCCTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=21032250;WS=21032232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	21036411	rs2053098	A	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=8;PP=603;SC=ATTACTCAGCACACTTGGGTG;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=21036419;WS=21036401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	21051489	rs4149153	C	T	134.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=50;SC=ATGTTAAATACTAAAGACTGA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=21051497;WS=21051479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	21054369	rs3764006	G	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=18;PP=743;SC=GAGCACAAGGGGCTTGTAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=21054377;WS=21054359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	21054918	rs2082518	T	C	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=35;PP=1087;SC=TTACCTCTTATAGAAGCATTA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=21054926;WS=21054908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	21065365	rs10841706	C	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=25.60;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	21168758	rs34168692	T	TA	378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=6;PP=140;SC=TTGCATATGTTAAAAAAAAAC;SOR=1.473;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=21168766;WS=21168748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	21176135	rs1546308	T	C	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=64;PP=2965;SC=ACTGTGAATGTAATGGGAATG;SOR=0.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=153;WE=21176143;WS=21176125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr12	21176247	rs1546307	A	G	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=65;PP=1807;SC=ACGAGGTACCATGATAGTGCT;SOR=2.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=82;WE=21176255;WS=21176237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	21201572	.	A	ATG	141	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=141;QD=48.0;SC=ACATATTTAAATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=21201580;WS=21201562;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	21201663	rs11045689	G	A	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=11;PP=480;SC=CGCCCTACCTGCTGTTGCAAT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=21201671;WS=21201653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	21220349	rs1910163	A	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=20;PP=692;SC=GAAATTTAACATGTAAATATT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=21220357;WS=21220339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	21317810	rs4149033	A	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=856;SC=GGCAATTATAAAACTCAATAC;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=21317818;WS=21317800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	21327652	.	T	TA	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=61.5;NF=2;NR=4;PP=81;QD=14.1666666667;SC=TAGTAAGTGTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=21327660;WS=21327642;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,6:0.60:10
chr12	21331389	rs61760242	TTACTTG	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	21331549	rs4149056	T	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=283;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TGGATATATGTGTTCATGGGT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=20;WE=21331557;WS=21331539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr12	21331599	rs4149057	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=116;ReadPosRankSum=0.499;SC=CATAGTACCATTGGGGCTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=9;WE=21331607;WS=21331589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr12	21331625	rs2291075	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=2.474;SC=TTGATGATTTCGCTAAAGAAG;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=11;WE=21331633;WS=21331615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr12	21331987	rs2291076	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=1.048;SC=ACCATGATAACGTCTTTCTAA;SOR=0.374;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=15;WE=21331995;WS=21331977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr12	21427608	rs3736080	G	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=76;ReadPosRankSum=1.399;SC=TTATTTGTACGGCAAAGTTTA;SOR=0.204;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=10;WE=21427616;WS=21427598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr12	21447066	rs722994	C	T	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=562;ReadPosRankSum=0.540;SC=TAAAATAATGCCATAGATATT;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=28;WE=21447074;WS=21447056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr12	21467666	rs10841789	A	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.718;SC=CAAAGTCTTAATTAAGAGCCT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=21467674;WS=21467656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	21472254	rs10505872	G	A	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1000;ReadPosRankSum=1.394;SC=ACATTATTTCGGTAGCAAATA;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=60;WE=21472262;WS=21472244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr12	21593404	rs4762702	G	C	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=17;PP=549;SC=TGTATAACTTGTTAATATTAA;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=21593412;WS=21593394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	21609127	rs4367993	T	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=30;PP=963;SC=CAACGAACTGTTAGGTCACTT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=21609135;WS=21609117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	21615207	rs3213210	A	G	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=120;SC=CTTGATTTACAGTATTTTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=21615215;WS=21615197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	21623122	rs13035	T	G	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=26;PP=1323;SC=TTTAGTAACATTCATATCAGG;SOR=0.925;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=68;WE=21623130;WS=21623112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	21624309	rs11046076	A	T	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=3;PP=1099;SC=TGCAATTTTTAAAAAAAAACC;SOR=4.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=42;WE=21624317;WS=21624299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	21626324	rs917852	A	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.52;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	21626330	rs917853	C	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.10;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	21627745	rs2159943	A	G	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=793;SC=GCTTTAATTGATAAAAGTTAT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=21627753;WS=21627735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	21628812	rs10160843	G	A	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=32;PP=945;SC=CCTGGAAGATGGTTTTCAACA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=21628820;WS=21628802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	21629987	rs917854	T	C	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=489;SC=TGGCTGTCTATGTACAACTTT;SOR=1.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=21629995;WS=21629977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	21644667	rs10841834	G	A	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=34;PP=1141;SC=GAGGCAGCGCGGATACAATGA;SOR=1.430;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=21644675;WS=21644657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	21654831	rs1060126	G	T	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=70;PP=2738;SC=CCGAGGTGCTGTCGCCGCTGT;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=151;WE=21654839;WS=21654821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	21657590	rs67392337	AT	A	7337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.151;NF=10;NR=118;PP=2951;ReadPosRankSum=1.663;SC=AAGTTACTGAATTACCTCTAG;SOR=1.308;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=10;TCR=122;TR=128;WE=21657598;WS=21657580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr12	21680609	rs7966780	C	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=468;ReadPosRankSum=3.056;SC=AGGTTTAAGCCCGGGTTGTCC;SOR=0.933;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=35;WE=21680617;WS=21680599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr12	21689882	rs10431213	T	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GCAGCACATGTAGAATTCAGT;SOR=0.936;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=7;WE=21689890;WS=21689872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr12	21692166	rs36023861	CA	C	384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=4;PP=206;SC=ATATAGCTTTCAAAAAAAAAT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=21692174;WS=21692156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	21711009	rs7967170	C	A	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=264;SC=AAACTGAACCCATTTTCCTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=21711017;WS=21710999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	21711111	rs7977474	G	C	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=26;PP=1814;SC=TTTAAAGTTCGCCACATGAAC;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=86;WE=21711119;WS=21711101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	21711385	rs7977846	G	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=497;SC=TGATGACTAAGTCTTGTGTGT;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=21711393;WS=21711375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	21712545	rs1871136	A	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=644;SC=GAATAGTGAAACCTTAAGTGA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=21712553;WS=21712535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	21712574	rs1871137	C	T	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=14;PP=788;SC=GAAAGCATTTCAAGCACCTAC;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=21712582;WS=21712564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	21712728	rs111250042	GACATTCTTTGAAATT	G	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=1375;SC=TTGTTTTGTTGACATTCTTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=21712750;WS=21712718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	21713308	rs4639981	T	A	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=57;PP=2965;SC=CATTCACAGGTTGTGAGATTA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=95;TCR=57;TR=151;WE=21713316;WS=21713298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	21713402	rs2306180	T	C	5073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=90;PP=2965;SC=AAAAACACCATCACTGTGATG;SOR=1.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=60;TCR=90;TR=150;WE=21713410;WS=21713392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	21715801	rs1473421	A	G	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=33;PP=2541;SC=CTTCCCACAGAAGAAAGTTCT;SOR=1.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=111;WE=21715809;WS=21715791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	21715989	rs8192697	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=748;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CAAAACAAAACCAAACAGTTT;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=44;WE=21715997;WS=21715979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr12	21716055	rs1473422	A	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=1203;SC=TTAATGTACAAAGGGGGCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=21716063;WS=21716045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	21716098	rs1473423	T	C	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=16;PP=1097;SC=CAATTCTGTTTTCTCTCTACC;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=21716106;WS=21716088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	21727315	rs7963756	C	A	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=53;PP=1550;SC=CTTGATTGTGCTCATGGTCCA;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=21727323;WS=21727305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	21733121	rs2126887	T	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=263;SC=TGTCTCAAATTCAATCCATTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=21733129;WS=21733120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	21757272	rs153944	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=202;SC=TAGCCTAAATATATATTCCGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=21757280;WS=21757263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	21789968	rs1677134	G	T	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=113;SC=AATACAATGCGAGAAATCATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=21789976;WS=21789958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	21791272	rs1650289	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	21791455	rs1427830	A	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.20;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	21791565	rs1677129	A	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=55;SC=ATAGTTCCCCAAAAAGGCTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=21791573;WS=21791555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	21794865	rs1626023	A	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=254;SC=ACAAGTAATTATTTCTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=21794873;WS=21794855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	21796814	rs4762862	G	A	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1390;SC=AATAACAACAGAAACACCAAA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=21796822;WS=21796804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	21797029	rs1650294	A	G	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=54;PP=1558;SC=TAGAATTGGCAGTCACAGAAT;SOR=2.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=21797037;WS=21797019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	21799803	rs67155709	T	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=491;ReadPosRankSum=-0.942;SC=AAAAAAATATTAGATCACTTT;SOR=1.151;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=24;WE=21799811;WS=21799793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr12	21799999	rs1540405	G	C	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=91;PP=2965;SC=TCTAGGATGCGTCAGCTCACA;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=155;WE=21800007;WS=21799989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	21807432	rs1677078	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=471;SC=AAACTGTGTATACATGCTGAA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=21807440;WS=21807422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	21807640	rs1650315	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=1132;SC=AACATTACACGTATATCTGCA;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=21807648;WS=21807630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	21807687	rs7953579	C	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=723;SC=TAAAATGTTACTGTTGCAATT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=21807695;WS=21807677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	21995555	rs1643235	C	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=244;SC=TCTTCACTCACTTCCCATAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=21995563;WS=21995545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	22005510	rs704183	A	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=665;SC=CCTCTCGAAAATAGTAATACA;SOR=2.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=22005518;WS=22005500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	22014161	rs2418018	C	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	22014163	rs2418019	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	22014165	rs2418020	C	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	22016004	rs4148670	GA	G	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.690;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	22017422	rs697250	A	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=836;SC=CTGCAAGTATAGCAAACAATG;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=22017430;WS=22017412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	22017486	rs697251	C	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=472;SC=CGTCAGGTAACAGATACAATA;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=22017494;WS=22017476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	22035873	rs1356368	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=1180;ReadPosRankSum=-1.588;SC=TTACTGAACACTTACTCACAT;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=30;WE=22035891;WS=22035863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr12	22035883	rs1283802	T	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=1130;ReadPosRankSum=0.057;SC=CTTACTCACATTGCTACCTAA;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=25;WE=22035891;WS=22035863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr12	22047151	rs704216	G	T	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=71;PP=2389;SC=TGGAAAAAGTGTCACACATGC;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=103;WE=22047159;WS=22047141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	22047174	rs704217	C	T	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=52;PP=1663;SC=ACATTCAGTCCTAGAAACCTA;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=22047182;WS=22047164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	22063115	rs10770865	A	G	6130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=113;NR=85;PP=2965;SC=CCCATAGATTAGGACACAGGA;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=114;TCR=85;TR=198;WE=22063123;WS=22063105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	22063337	rs4148656	A	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=271;SC=CAAACATTTAATTTTTTTGAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=22063345;WS=22063327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	22063737	rs4762719	G	T	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=17;PP=1652;SC=AGGAAACAAAGAGTATTCACA;SOR=2.120;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=22063757;WS=22063727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	22063749	rs4762720	T	C	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=27;PP=2214;SC=GTATTCACAGTCTTTACATAC;SOR=1.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=96;WE=22063757;WS=22063727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	22063971	rs4148654	A	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=29;PP=844;SC=GACCAGGTGTACAGTTTGCAT;SOR=2.531;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=22063979;WS=22063961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	22065699	rs3835048	G	GA	144.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=219;SC=TCAATTCTCTGAAAAAAAGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=22065707;WS=22065696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	22068849	rs3759236	G	T	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1079;SC=ATATCTCTGTGGCAAGAAAAA;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=22068857;WS=22068839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	22078245	rs2900493	G	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=474;SC=ATATTTTAGAGAGCCTCTGAT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=22078253;WS=22078235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	22078556	rs2277404	T	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=1.083;SC=GAGCTCTGATTCTTAAAATAC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=22078564;WS=22078546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr12	22078571	rs2176394	T	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=161;SC=AAATACAACTTCTGCAAGCCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=22078579;WS=22078561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	22078838	rs2277405	T	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=3;PP=742;SC=AAAACAAATATCTCTTTAAGG;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=22078846;WS=22078828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	22086976	rs6487252	A	C	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=763;SC=GAAACCTTAAAACTTTCTAGA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=22086984;WS=22086966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	22089348	rs4586220	G	A	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=75;SC=TTGCTTGTTCGTTTCTCACAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=22089356;WS=22089342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	22207944	rs6416226	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.497;SC=TTTATACTCCTTTGGATCTGT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=22207952;WS=22207934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	22215408	rs143225178	GAATT	G	2288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.816;NF=0;NR=36;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.409;SC=AATGGACCAGGAATTAATTAT;SOR=0.232;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=36;WE=22215419;WS=22215398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,61:0.58:105
chr12	22354921	rs704219	A	G	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=68;PP=2170;SC=TGTGGTTATAAATTTTCATGT;SOR=1.456;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=97;WE=22354929;WS=22354911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	22440281	rs2287166	A	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=865;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TGAGGAGCAGATTCATTCACT;SOR=0.909;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=49;WE=22440289;WS=22440271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr12	22440315	rs2072542	A	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=461;ReadPosRankSum=0.596;SC=GAGATGTGCCACCTTACCTCA;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=30;WE=22440323;WS=22440305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr12	22478425	rs4762904	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=567;ReadPosRankSum=0.237;SC=AGGGATAAAAATCGATTCCTT;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=39;WE=22478433;WS=22478415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr12	22478698	rs4762905	C	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.393;SC=ACAATAATAACTAATAATAAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=22478706;WS=22478688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	22489150	rs3809202	A	G	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=68;PP=2284;SC=GGGAAGGGGGAGCTTTTCCTA;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=129;WE=22489158;WS=22489140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	22602796	rs2063573	A	G	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=81;PP=2556;SC=AAACCACTGCATCACCACTTA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=139;WE=22602804;WS=22602786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	22606738	rs12424580	G	C	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=20;PP=1427;SC=GGGCTCTAAAGAGCAATTCTC;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=22606746;WS=22606728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	22796994	rs11429701	A	AT	4732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=81;PP=2936;SC=TTTGAAAAATAGGGCATTTAA;SOR=2.167;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=85;WE=22797002;WS=22796984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	23689301	rs4636755	T	C	124.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAAAATGTCTTTTTGCAACTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=23689309;WS=23689292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	23757245	rs1479452	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=239;ReadPosRankSum=0.695;SC=TGCTGGCATACAATAGACATT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=23757253;WS=23757235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr12	23908833	rs187585822	G	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=0.264;SC=GTCACCTGCTGTTTCAAAATC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=20;WE=23908841;WS=23908823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr12	23915547	.	G	GA	155	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.9842;HP=17;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=20;MQ=61.04;NF=8;NR=4;PP=155;QD=13.4166666667;SC=AATACAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=12;WE=23915555;WS=23915537;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,12:0.46:26
chr12	23998888	rs7980561	T	C	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1129;ReadPosRankSum=1.037;SC=GGACACAGCATCAACTTTGTT;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=165;TCF=98;TCR=67;TR=74;WE=23998896;WS=23998878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,95:0.48:197
chr12	24102665	rs141363242	CCT	C	582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.25;QD=32.37;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	24103911	rs35800209	GCA	G	564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;QD=31.37;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	24985653	rs3736212	G	A	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.445;SC=AATACTTGTCGTACCTCGCCT;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=91;WE=24985661;WS=24985643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,101:0.48:209
chr12	25031449	rs6487436	A	G	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=58;PP=2747;SC=CCCAAAATAAAGAGTCAGTTT;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=25031457;WS=25031439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	25054891	rs2291894	G	A	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=909;SC=CCTACGTGACGCTCACCATGA;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=25054899;WS=25054881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	25147300	rs699030	G	C	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=29;PP=868;SC=TTTCTGAAGAGACTGCATTTG;SOR=1.480;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=43;WE=25147308;WS=25147290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	25147362	rs1846016	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=0.940;SC=GGAGGCCGAGGCAGGCAGATC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=4;WE=25147370;WS=25147352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	25148755	rs864161	C	G	9848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=190;NR=126;PP=2965;SC=AGTATATCCCCAACAGGAATC;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=316;TCF=190;TCR=126;TR=316;WE=25148763;WS=25148745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr12	25149982	rs75288396	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=-0.718;SC=AGCTGAGATCGTGCCACTGCA;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=4;WE=25149990;WS=25149972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	25232120	rs6487450	T	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=380;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TAAAACAACCTCTTTGGAATG;SOR=0.184;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=20;WE=25232128;WS=25232110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr12	25240988	rs75911568	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=205;ReadPosRankSum=-2.046;SC=GACTGGTTATGAAGTATTTCC;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=16;WE=25240996;WS=25240978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr12	25242595	rs7969931	C	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=-0.019;SC=ATCGGTTAACCTTAGACAAAG;SOR=0.536;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=15;WE=25242603;WS=25242585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr12	25242758	rs77453388	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr12	25242776	rs10743538	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=2.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=217;ReadPosRankSum=0.092;SC=CCAGACTCACCTGCTACAGTC;SOR=0.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=14;WE=25242784;WS=25242766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr12	25243115	rs1908946	G	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=674;ReadPosRankSum=0.501;SC=ATCACTAACTGTTTAAAACTA;SOR=0.461;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=44;WE=25243123;WS=25243105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr12	25243893	rs1979522	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=256;ReadPosRankSum=-0.635;SC=ATGGGCAAGCCTGCTGTAGGG;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=19;WE=25243901;WS=25243883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
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chr12	25255034	rs10842467	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=541;ReadPosRankSum=-0.340;SC=GTCTTAATATCTTCTGAATTT;SOR=0.751;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=28;WE=25255042;WS=25255024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr12	25257166	rs12828225	T	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AAGTAGGAGATCTGTGAATGT;SOR=0.420;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=25257174;WS=25257159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	25257182	rs34133737	GA	G	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=931;SC=AATGTGCCAAGAAAAAAATAA;SOR=4.047;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=32;WE=25257190;WS=25257172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	25261735	rs859146	G	T	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=44;PP=1323;SC=CTCAGTACATGCTTCAGTAAG;SOR=1.996;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=57;WE=25261743;WS=25261725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	25272027	rs2291365	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=434;ReadPosRankSum=2.134;SC=GTTTCAACTTAAGGGTTTTTA;SOR=1.453;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=20;WE=25272035;WS=25272017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	25274593	rs2220195	A	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=408;SC=GTGTTTAATAAGGTTAAAGCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=25274601;WS=25274583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	25276351	rs3830289	TGCTCTACC	T	1876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=2939;ReadPosRankSum=0.545;SC=AACTGATACTTGCTCTACCAT;SOR=0.372;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=26;WE=25276366;WS=25276341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr12	25297713	rs7971062	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=45;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TTTAATTTTGCTCCAATTTTG;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=25297721;WS=25297703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	25299921	rs11047863	G	A	6577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=87;PP=2965;SC=GGAAAGTATTGCCCACAAGGG;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=123;TCR=87;TR=210;WE=25299929;WS=25299911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	25302481	rs10842485	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=299;SC=CATTTTTCAATTTAAAAAATA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=25302489;WS=25302471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	25311489	rs10842496	G	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=170;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TATTTCAAACGGGCTTCCTCT;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=12;WE=25311497;WS=25311479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr12	25343516	rs10842501	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.386;SC=AGTGATTATACAACTATCTAT;SOR=1.402;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=6;WE=25343524;WS=25343506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	25343703	rs200099292	TTTCC	T	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=574;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TCTTTGTAACTTTCCTTGCAA;SOR=2.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=14;WE=25343714;WS=25343693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr12	25362217	rs9266	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CTTTACATTCATCAGGGATGA;SOR=0.671;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=22;WE=25362225;WS=25362207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr12	25362777	rs1137282	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=163;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TCTTTTTACCATCTTTGCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=14;WE=25362785;WS=25362767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr12	25368462	rs4362222	C	T	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=52;PP=2825;SC=GTCGGATCTCCCTCACCAATG;SOR=1.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=130;WE=25368470;WS=25368452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	25380071	rs11836509	T	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	25388290	rs7133635	G	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=586;SC=CATCAAAGACGGTTGTAGACT;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=25388298;WS=25388280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	25388316	rs7133640	G	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-1.629;SC=AATTATAATAGGGAAGAAACA;SOR=1.833;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=25388324;WS=25388306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	25671759	rs1479500	T	A	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=29;PP=1534;SC=GTTGACCGAGTCCTGGGCTGT;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=73;WE=25671767;WS=25671749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	25673079	rs1382849	C	T	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	25679932	rs1705419	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=252;SC=CTTCAGATAGGAGTGTCTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=25679940;WS=25679922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	25699523	rs278990	A	G	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=840;SC=GTAACCAGGAAAGAAGTAAAT;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=25699531;WS=25699513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	26026988	rs11048315	G	A,T	2798.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=35,37;NR=10,13;PP=764,917;SC=CAGCCACCTCGCTGAGCCACA;SOR=2.108;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=45,50;WE=26026996;WS=26026978;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.49,0.51:105
chr12	26231843	rs7133685	G	T	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=33;PP=1464;SC=AAAAAAAGGCGCTAACCGAAA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=68;WE=26231851;WS=26231833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	26231898	rs4963952	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=505;ReadPosRankSum=0.913;SC=TCATGATTATGTATACAAAAA;SOR=0.469;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=32;WE=26231906;WS=26231888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr12	26275555	rs11048413	G	A	432.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.780;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr12	26405724	rs16930378	T	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=292;ReadPosRankSum=0.804;SC=TAAATTGCGTTTACTTAAATG;SOR=1.931;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=19;WE=26405732;WS=26405714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr12	26492555	rs34679762	A	AT	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=-1.352;SC=CAAAAAAGGGATTTTTTTAAA;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=26492563;WS=26492545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	26551649	rs17470625	A	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=-1.204;SC=TTATAGAAGCAGAGAATTCCA;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=26551657;WS=26551640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	26568456	rs66797056	TAAGAAAAGA	T	2183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=38;PP=2971;SC=AAAACACTAATAAGAAAAGAA;SOR=2.540;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=39;WE=26568472;WS=26568446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	26581306	rs4963995	G	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=23;PP=1041;SC=TCATATGAGGGTGATTTGCTA;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=26581314;WS=26581296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	26592288	rs2270960	G	A	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=51;PP=1511;SC=TTAGCCTTTCGGACACCTCAG;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=26592296;WS=26592278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	26596618	rs2220406	C	T	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=100;PP=2965;SC=TTTAGGTCTTCTTTTCCCCTT;SOR=1.519;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=47;TCR=101;TR=147;WE=26596626;WS=26596608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr12	26639346	rs36049222	T	TA	144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	26647311	rs12371474	T	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=602;ReadPosRankSum=-0.490;SC=ACCTTAATTGTAGACATTATT;SOR=1.167;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=29;WE=26647319;WS=26647301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr12	26703459	rs11048575	T	G	148.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AAATTTTGTATTACAACACAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=26703467;WS=26703449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	26732987	rs2230376	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=157;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TGTCTGAAAAGGGAGAATTAA;SOR=0.458;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=12;WE=26732995;WS=26732977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	26733062	rs2230375	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=133;ReadPosRankSum=1.490;SC=TGTCTGCATGTTTCCTGTCTG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=12;WE=26733070;WS=26733052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr12	26749831	rs2230377	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=505;ReadPosRankSum=-1.441;SC=GGATGCAGTCGTCATGGGTCA;SOR=0.907;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=35;WE=26749839;WS=26749821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr12	26752897	rs12832680	C	T	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=9;PP=509;SC=ACTAGAAATACTAGAAGCCAC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=26752905;WS=26752887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	26755486	rs10842758	T	C	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1492;ReadPosRankSum=0.906;SC=AAGTATAATATATAAGCAAAA;SOR=0.420;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=68;WE=26755494;WS=26755476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,69:0.65:106
chr12	26755546	rs3736185	C	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=503;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTGTATCTGCCGACCTCCTTT;SOR=0.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=37;WE=26755554;WS=26755536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,43:0.36:121
chr12	26777379	rs2880875	T	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=757;SC=GTGAAAATATTTTTGTCTTCA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=26777387;WS=26777369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	26784850	rs2230372	G	A	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1223;ReadPosRankSum=1.370;SC=TCACATCCTCGTGCTCGGTGG;SOR=0.454;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=89;WE=26784858;WS=26784840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,99:0.54:183
chr12	26809177	rs2880877	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=461;ReadPosRankSum=-0.458;SC=AGACATTTGACGTGGAGTTCA;SOR=1.508;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=26;WE=26809185;WS=26809167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr12	26809316	rs2230379	G	A	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CCCGGTCAACGTGCATGTGGA;SOR=0.330;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=92;WE=26809324;WS=26809306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,117:0.60:194
chr12	26810777	rs2291264	T	C	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=899;ReadPosRankSum=-0.905;SC=CAATGTCATCTGAAAGGATGG;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=66;WE=26810785;WS=26810767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,79:0.52:153
chr12	26810816	rs2291263	T	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=813;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CTGCTTGCATTGAGACCACCC;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=47;WE=26810824;WS=26810806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr12	26811045	rs12313993	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=238;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CACACAGATCTGACAAATAAT;SOR=0.270;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=23;WE=26811053;WS=26811035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr12	26812245	rs2306549	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=-1.331;SC=CTGTCAGAATGCACTGCCAAA;SOR=1.340;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=22;WE=26812253;WS=26812235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr12	26816496	rs1375656	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=929;SC=TTGCCCAACATAAAATATTTC;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=26816504;WS=26816486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	26816831	rs2306548	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=0.253;SC=TGTTTTGCAACCTTTTTTTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=26816839;WS=26816821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	26819095	.	A	ATAGATAGATAGATAGATAGAT	74.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=1496;SC=AGATAGATAGATTTTTTTTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=26819103;WS=26819085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	26834804	rs111626763	T	TACTC	5909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=26;PP=2918;SC=TTTAAAGAGTTACCTCCTTTC;SOR=2.815;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=93;WE=26834812;WS=26834794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	26835085	rs10842774	T	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CCGAACACAGTAACTCCCACA;SOR=0.191;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=26835093;WS=26835075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	26835427	rs3830262	ATG	A	2034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.958;NF=17;NR=17;PP=1328;ReadPosRankSum=0.669;SC=TATAAGGAACATGTGTCACAC;SOR=0.386;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=34;WE=26835436;WS=26835417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr12	26848410	rs1982385	A	C	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=160;SC=TTACCTGTGAACCATAGGCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=26848418;WS=26848400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	26848663	rs3830260	A	AT	1265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=1217;SC=AATTCAATTAATATTCTATCC;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=26848671;WS=26848653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	27058563	rs7397665	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.922;SC=AAAATAATATATTCACAGAAC;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=27058571;WS=27058553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	27059149	rs1488053	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.419;SC=TAATAAAAAACTGCTGATTAT;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=7;WE=27059157;WS=27059139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	27059224	rs1488052	G	A	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=27;PP=1205;SC=TTGACAATAAGTAACACAAAC;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=61;WE=27059232;WS=27059214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	27059422	rs1488051	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=0.614;SC=TAATTTATTATTTCCAAATTT;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=27059430;WS=27059412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	27064232	rs3210635	C	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=965;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CTTTTCCACGCTCTAAGATTC;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=18;TCR=64;TR=49;WE=27064240;WS=27064222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,57:0.58:98
chr12	27066350	rs3736227	C	T	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=31;PP=1416;ReadPosRankSum=-1.800;SC=TGTGATATAACAAAAGGCACC;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=170;TCF=111;TCR=59;TR=92;WE=27066358;WS=27066340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,102:0.54:188
chr12	27075705	rs7137176	A	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TTAATTATTCATTTGCTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=27075713;WS=27075695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	27081566	rs2029309	C	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=261;SC=GCTGTCTCTACTATTCTGAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=27081574;WS=27081558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	27081873	rs2029310	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=140;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GTTGACAAGAGTATGTGCAAT;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=13;WE=27081881;WS=27081863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr12	27087703	rs708158	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=169;SC=ATGTGTAGTATATGCCAGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=27087711;WS=27087693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	27107268	rs2129092	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=593;ReadPosRankSum=1.115;SC=ATCAAAAGCAGTCATTGACAT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=38;WE=27107276;WS=27107258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr12	27109655	rs2046937	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=1.064;SC=AATCGTATTTATTGCTCTTTA;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=27109663;WS=27109645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	27117382	rs11048788	G	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.589;SC=GTTGCCAACTGCATATATCAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=27117390;WS=27117372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	27152666	rs7314394	T	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=414;ReadPosRankSum=0.985;SC=CATAAATTACTGAGCTGATCC;SOR=1.051;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=34;WE=27152674;WS=27152656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr12	27175494	rs3963548	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=372;ReadPosRankSum=-2.646;SC=TTTTGGCGTCTGTTTGCTGCG;SOR=0.795;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=25;WE=27175502;WS=27175484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr12	27175640	rs1872191	A	G	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GCAAAACTTGAAAGTGGGGAG;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=69;WE=27175648;WS=27175630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,77:0.58:132
chr12	27179551	rs145100138	CTTATT	C	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.930;NF=0;NR=12;PP=449;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AGAAATTCAGCTTATTTTATT;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=27179563;WS=27179541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	27181513	rs8628	T	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=1.374;SC=TATGACACATTACCTTTTTAG;SOR=2.219;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=19;WE=27181521;WS=27181503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr12	27182956	rs111936388	A	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=167;ReadPosRankSum=-0.176;SC=TGTATAGGGTAAATATAATAG;SOR=0.360;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=14;WE=27182964;WS=27182946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr12	27234200	rs708165	T	C	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1252;ReadPosRankSum=0.673;SC=GATGGGGACTTTTGGTGGCAT;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=72;WE=27234208;WS=27234190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,82:0.57:145
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chr12	27461984	rs6487599	T	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=264;SC=TTAAGGGAAGTTACTTTTCTT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=27461992;WS=27461974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	27468313	rs2346053	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=1.446;SC=AGAGAATTTTATGCCTTGGTT;SOR=0.350;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=18;WE=27468321;WS=27468303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr12	27470682	rs2242185	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=2;PP=157;SC=TTATTAGCAACGTGATTGTAA;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=27470690;WS=27470672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	27470866	rs6487601	G	A	4115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=59;PP=2548;SC=CTCAAGAAACGTACAGAAAAG;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=128;WE=27470874;WS=27470856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	27472201	.	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=1.929;SC=TTGAAGTAATGCAGCTAGAAT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=27472209;WS=27472191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	27486168	rs62758860	GA	G	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=266;SC=TCTCGGGCCGGAGCATCGCCT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=27486176;WS=27486158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	27529219	rs4964059	A	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=370;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTATTTCTCTATCAAGAACTA;SOR=0.044;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=20;WE=27529227;WS=27529209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr12	27533367	rs4964060	A	G	5495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=111;PP=2965;SC=CCACACTTCGATAAGTGAAAT;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=61;TCR=111;TR=172;WE=27533375;WS=27533357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr12	27569025	rs1256955	G	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=137;SC=TTTAAGTGGCGTTGTGGAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=27569033;WS=27569015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	27623433	rs35052632	G	GT	988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=1080;SC=TGAACAGCCAGTTGAAAGGGG;SOR=4.479;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=25;WE=27623441;WS=27623423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	27623490	rs776199	A	G	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=14;PP=1464;SC=TCTGGTGTCAATGAAGAGGAT;SOR=2.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=27623498;WS=27623480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	27623558	rs395098	C	T	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1255;ReadPosRankSum=1.157;SC=CTTACAGTGCCGAAGAAATGG;SOR=0.620;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=72;WE=27623566;WS=27623548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,84:0.50:167
chr12	27623728	rs396407	T	C	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=669;ReadPosRankSum=-1.968;SC=GCAGAAGCAGTTTCTAGGGTC;SOR=0.331;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=13;TCR=61;TR=37;WE=27623736;WS=27623718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr12	27623751	rs411432	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=405;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AACTGCAGACGTTCTTGGGCC;SOR=0.751;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=23;WE=27623759;WS=27623741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr12	27625823	rs386428	A	T	5512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=96;PP=2965;SC=ACACTGAAAAATGGGTAAGAG;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=174;WE=27625831;WS=27625813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	27625879	rs381905	G	A	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.69;SOR=1.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	27625887	rs401739	T	C	4347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.77;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	27627805	rs411816	G	A	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=46;PP=1557;SC=ACCCTCAAGCGTCTACATCTC;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=27627813;WS=27627795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	27654898	rs61731840	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=119;ReadPosRankSum=0.607;SC=ATGTCCTCACCGTCACTGGAC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=9;WE=27654906;WS=27654888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr12	27746844	rs7976122	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.424;NF=4;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=0.625;SC=TGGAAGGTGCGTCTTCCCAGG;SOR=1.492;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=9;WE=27746852;WS=27746834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	27786115	rs3751231	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.367;NF=12;NR=2;PP=267;ReadPosRankSum=0.352;SC=TTAACTGATACAGGTATCGCA;SOR=0.507;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=14;WE=27786123;WS=27786105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	27788021	rs2075378	G	A	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1014;ReadPosRankSum=0.769;SC=CAGCAGAAACGCTTGTTGAAT;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=64;WE=27788029;WS=27788011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
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chr12	27802932	rs17224002	A	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GTATCTGTTAAATTATAATAG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=27802940;WS=27802930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
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chr12	27813754	rs7132997	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=350;SC=TGGAGAGTAAATAACTTCTTA;SOR=2.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=27813762;WS=27813744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	27813903	rs7133222	C	T	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=24;PP=824;SC=TTTAAATATACGTGTGGATGT;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=27813911;WS=27813893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	27813961	rs7133231	A	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=23;PP=723;SC=GAGCTATGCCATTTTAAAAGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=27813989;WS=27813951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	27813973	rs7133328	C	T	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=1.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	27813981	rs7133545	G	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.63;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	27814085	rs6487629	C	T	136.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=78;SC=CCTGCCCCCACGAATTCAGAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=27814093;WS=27814075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	27817408	rs34613698	CT	C	2160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.106;NF=3;NR=41;PP=1498;ReadPosRankSum=2.393;SC=AGTTTTTCTACTTTGGTTGAC;SOR=0.670;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=98;TCF=8;TCR=90;TR=44;WE=27817416;WS=27817398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr12	27820302	rs2033024	C	T	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=510;SC=GACTGTGTTACTGAAAAGTTA;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=27820310;WS=27820292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	27826780	rs2052673	T	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.77;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	27832308	rs10743607	G	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=455;SC=CTCTTTGTAAGTCACTGATTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=27832316;WS=27832298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	27841925	.	CT	C	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.337;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr12	27845924	rs3764010	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=0.487;SC=TTTGTTGTTCCAACTTCTGCT;SOR=2.075;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=17;WE=27845932;WS=27845914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr12	27849795	rs929948	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr12	27849795	.	CA	TG	996	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27;NR=26;PP=996;QD=19.8012806578;SC=TTTGGGGATCCAACAAGCAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=53;WE=27849804;WS=27849785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr12	27849796	rs929949	A	G	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.92;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	27863693	rs17552080	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CGGTGCCAGCCCAGGGAGCCT;SOR=0.175;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=14;WE=27863701;WS=27863689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	27867706	rs11049106	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=518;ReadPosRankSum=0.567;SC=TTATCTTTTACGTACAGCGGA;SOR=0.387;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=33;WE=27867714;WS=27867696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr12	27915718	rs10842975	A	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=624;ReadPosRankSum=0.541;SC=ATTTGCAAGGATCCTGATTTT;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=36;WE=27915726;WS=27915708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr12	27944858	rs2288232	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=678;SC=CCAGGTAGGTGGTCTGCCCAT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=27944866;WS=27944848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	28122893	rs6246	A	G	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1116;ReadPosRankSum=1.733;SC=TTTGCGAACCAGGCCCTTTCG;SOR=0.764;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=163;TCF=81;TCR=82;TR=75;WE=28122901;WS=28122883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr12	28336713	rs61920228	C	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=189;SC=GTAAGATGTGCCTGCTTCTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=28336721;WS=28336703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	28412372	rs11049488	G	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=593;ReadPosRankSum=0.832;SC=TGCCTTTCCTGCAGGTATTGG;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=47;WE=28412380;WS=28412362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr12	28412398	rs7969414	G	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.775;HP=17;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.984;NF=12;NR=17;PP=354;ReadPosRankSum=-0.560;SC=AGGAATTAGGGTTTTTTTTTT;SOR=1.095;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=29;WE=28412406;WS=28412388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr12	28457618	rs6487674	A	C	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=31;NR=32;PP=910;SC=ACTTCACTGAAGTTGCTGATG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=28457626;WS=28457608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	28544464	rs3741760	G	A	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=716;SC=GAGAAAAAATGTGCTTATGTA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=28544472;WS=28544454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	28605370	rs144054230	G	GCAGT	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=293;ReadPosRankSum=0.500;SC=AAATTATTATGCAGTCTTTCA;SOR=0.412;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=28605378;WS=28605360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	28605426	rs10771427	G	A	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=848;SC=AAAAGAAGCAGTGAAGGATGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=28605434;WS=28605416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	28636830	rs1511551	G	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=0.641;SC=CTAACAGATCGCAAAAGATTC;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=28636838;WS=28636820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr12	28726042	rs6487692	C	T	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=4;PP=897;SC=TAAAAAAAGGCTTTAGCACCG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=28726050;WS=28726032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	29423460	rs2216854	G	A	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCAAAGTGCTGATGGAGAAGC;SOR=0.707;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=125;TCF=43;TCR=82;TR=61;WE=29423468;WS=29423450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr12	29423583	rs2194519	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TATGCCTTATAGGAAAGCGTG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=29423591;WS=29423573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	29444284	rs7972032	G	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=972;ReadPosRankSum=1.161;SC=TACTGAGCCAGGGTCTCTGAG;SOR=0.964;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=57;WE=29444292;WS=29444274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,69:0.49:142
chr12	29446477	rs10679359	T	TA	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.861;NF=0;NR=17;PP=273;ReadPosRankSum=-1.199;SC=ATAGTTTCTGTAAAAAAAAAG;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=17;WE=29446485;WS=29446467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr12	29462224	rs6487807	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.416;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TAACAAAATTCTTAGTGCTGG;SOR=1.519;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=25;WE=29462232;WS=29462214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr12	29485449	rs10743656	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=322;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AAGGTCACTCGTCTATGTAGA;SOR=0.983;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=21;WE=29485457;WS=29485439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr12	29486745	rs1052583	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=470;ReadPosRankSum=0.968;SC=TAGCCATCGCTTTTTATCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=24;WE=29486753;WS=29486735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr12	29496224	rs3782511	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.448;SC=TCCTAAAAGGGAGGCAAAAGG;SOR=0.475;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=15;WE=29496232;WS=29496214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	29524365	rs3214493	TA	T	1337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=1491;ReadPosRankSum=-1.635;SC=AATTCATTGATAAATTCTTCC;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=41;WE=29524373;WS=29524355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr12	29586810	.	C	CA	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=1.532;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	29593768	rs66808023	GA	G	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=878;SC=TTAGCAATTGGATTTTTTACC;SOR=2.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=29593776;WS=29593758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	29604392	rs1347570	C	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=28;PP=1673;SC=ATACTGCTTGCTGAAACTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=29604400;WS=29604382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	29607931	rs2060570	T	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=603;SC=TAGTGGGCACTAAAGCAGCCA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=29607939;WS=29607921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	29608449	rs1369904	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=585;SC=TTTAATTCCTTAAAGATTTGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=29608457;WS=29608439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	29617643	rs117893886	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=748;ReadPosRankSum=1.390;SC=CACCTGTATCGGTGGCAAGTA;SOR=0.488;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=44;WE=29617651;WS=29617633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr12	29628016	rs2043623	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=20;PP=645;SC=TGGTAAATCTGGCCTTGAAGC;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=29628024;WS=29628006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	29630081	rs7975356	G	A	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=77;PP=2965;SC=ATGACACCTTGTGTTACTGGG;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=181;WE=29630089;WS=29630071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	29639186	rs3847680	T	C	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=34;PP=1598;SC=CACATACCCTTTCCTCTCTGG;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=75;WE=29639194;WS=29639176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	29642459	rs61918687	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=472;ReadPosRankSum=-0.957;SC=TTTTGACACAGTAATAGAAGA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=31;WE=29642467;WS=29642449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr12	29642542	rs967182	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=389;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GGCTGGTTTACACTTTTGTAC;SOR=0.826;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=27;WE=29642550;WS=29642532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr12	29642573	rs967181	A	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=388;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TCCATTCCCCAATCAGGGAAG;SOR=0.928;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=23;WE=29642581;WS=29642563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr12	29648191	rs10492374	T	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CCACTGCATTTTTAATATTCT;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=14;WE=29648199;WS=29648181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	29648275	rs10843438	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=808;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ATATATTCACGGCTGTTGTAT;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=43;WE=29648283;WS=29648265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr12	29650361	rs10771544	A	C	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=161;SC=AATGCAAAAAATTTCAAAAAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=29650369;WS=29650351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	29650702	rs822879	C	T	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=43;PP=1249;SC=CGCCCTTTATCCCCTCCTGCG;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=29650710;WS=29650692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	29667659	rs299438	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GACAATCAAAGTACAATTCTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=3;WE=29667667;WS=29667649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	29721945	rs2254945	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GTGAGAGCTGCCCCTCACAGC;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=12;WE=29721953;WS=29721935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	29736480	rs2113879	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.693;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGCTCAGTCCATGCACAAAAA;SOR=1.276;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=18;WE=29736488;WS=29736470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr12	29736523	rs2288230	G	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=0.985;SC=AAACAGGGTGGAAGGAACGGG;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=29736531;WS=29736513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr12	29736553	rs2113880	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GGGGTGCAATAGCTTCCCCCC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=29736561;WS=29736543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr12	29921074	rs302316	A	G	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=212;SC=CACAAGGAACACAGACGGAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=29921082;WS=29921064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	29936613	rs184221	T	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=13;PP=351;SC=CGGCCGGCGCTAGCCCGCAGC;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=29936621;WS=29936603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	30783743	rs2278558	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TCACACTCCTCTTGTGAAATA;SOR=0.243;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=13;WE=30783751;WS=30783733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr12	30809492	rs7974489	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=1;PP=47;SC=TCCAAAAATTGAAGTGATTAT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=30809500;WS=30809482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	30814043	rs67741303	CTATTA	C	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=240;ReadPosRankSum=0.640;SC=TTAAATGCTACTATTATATCA;SOR=0.425;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=30814055;WS=30814033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	30814259	rs10771753	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=358;ReadPosRankSum=0.084;SC=CCCCGCTTTACAAAAGTTAGC;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=26;WE=30814267;WS=30814249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr12	30815157	rs2118780	A	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=748;SC=AATGTTGTTAAGCAGCACATG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=30815165;WS=30815147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	30818081	rs10843807	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=0.637;SC=AGGTCAATTTATCCAAAAAAC;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=30818089;WS=30818071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	30818406	rs10843808	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	30822226	.	G	GA	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=19;MQ=57.82;NF=0;NR=3;PP=43;QD=16.0;SC=TCTAAAATGAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=30822248;WS=30822216;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr12	30822240	rs7955420	C	A	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=218;SC=AAAAAAAAAACGTAACAAATG;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=30822248;WS=30822216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	30823971	rs1054426	A	G	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.020;SC=ATGCTTGCTGAAGAACACGGG;SOR=0.886;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=66;TCR=104;TR=75;WE=30823979;WS=30823961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,91:0.44:206
chr12	30841285	rs12809355	G	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=270;ReadPosRankSum=0.200;SC=GGTAAGAAAGGACATTCACCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=16;WE=30841293;WS=30841275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr12	30843377	rs2289302	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=509;ReadPosRankSum=0.062;SC=AATAAAACTCTCATTCTACTC;SOR=0.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=29;WE=30843385;WS=30843367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr12	30848675	rs12809335	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=874;ReadPosRankSum=-1.740;SC=TTCCGCGACCCCTGGATTACC;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=59;WE=30848683;WS=30848665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr12	30867794	rs10843820	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=-1.747;SC=TACTACGTTGCAAATGACAAA;SOR=0.193;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=30867802;WS=30867784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	30868002	rs13656	C	T	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.335;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=1251;ReadPosRankSum=1.423;SC=GTCTGGGAAACACATTCGTCT;SOR=1.064;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=65;TCR=82;TR=77;WE=30868010;WS=30867992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,101:0.56:180
chr12	30877391	rs7299800	G	T	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GACTCCTAAAGATATGATTTT;SOR=0.346;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=67;WE=30877399;WS=30877381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,78:0.56:139
chr12	30878859	rs7304879	G	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=0.532;SC=CCAGTCAGAAGCCCCATGAAT;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=30878867;WS=30878849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	30879088	rs10843822	T	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=610;ReadPosRankSum=0.549;SC=TAGGAAACAGTTTATCACTAC;SOR=0.285;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=39;WE=30879096;WS=30879078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
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chr12	30949206	rs256654	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=662;ReadPosRankSum=1.280;SC=CATCCTCTCGATGGCCGCGCC;SOR=0.884;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=42;WE=30949214;WS=30949196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr12	31131712	rs35097	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=35;PP=1024;SC=TCCCCCTACATATCTGCATCC;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=31131720;WS=31131702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	31132479	rs35096	A	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=23;PP=1663;SC=GCTGATGGGGACTTCGCTCCT;SOR=1.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=31132487;WS=31132469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	31135418	rs2075332	C	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=702;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AGCCTGGGACCCTACGCAGGC;SOR=1.011;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=43;WE=31135426;WS=31135408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr12	31135460	rs191006991	C	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=716;ReadPosRankSum=1.323;SC=TCTGCCTCTGCCTCCAGTTCA;SOR=0.438;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=46;WE=31135468;WS=31135450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr12	31135478	rs35089	T	C	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1510;ReadPosRankSum=-1.206;SC=TCAAGTGCTGTGGAAGCAACA;SOR=0.231;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=83;WE=31135486;WS=31135468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr12	31135579	rs2075333	T	C	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=38;PP=944;SC=ACAGTGGTGGTGCGCTGCGGC;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=31135587;WS=31135569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	31135905	rs888473	A	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=186;SC=TCCTCTGGCCAGTCCTCAGCC;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=31135913;WS=31135895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	31144884	rs35076	A	G	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1230;ReadPosRankSum=0.212;SC=CTGCCCCTCAAGACAACATGT;SOR=0.895;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=88;WE=31144892;WS=31144874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,94:0.44:212
chr12	31237026	rs28559720	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.113;NF=19;NR=27;PP=711;ReadPosRankSum=-1.258;SC=AAGTGGGAGTACTGGAGGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=46;WE=31237034;WS=31237016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr12	31237372	rs3930906	A	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=1.142;SC=AGGTCCCGGGAGGGGATGCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=31237380;WS=31237362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	31237700	rs3881296	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.059;NF=12;NR=6;PP=180;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TCTCCCCTCCGTGACCCTCAC;SOR=1.309;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=18;WE=31237708;WS=31237690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr12	31238075	rs4931428	G	A	192.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.282;NF=2;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GACAGAGGCGGTAGCACTACC;SOR=0.859;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=31238083;WS=31238065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr12	31240862	rs7308754	A	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.369;NF=16;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=-1.389;SC=GTTCTCTCTCACACACACAGA;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=23;WE=31240870;WS=31240852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr12	31240925	rs7308773	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.787;NF=27;NR=22;PP=668;ReadPosRankSum=2.085;SC=AAGGTAACACAAGTGTCCTCA;SOR=0.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=49;WE=31240933;WS=31240915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr12	31240960	rs7309189	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.240;NF=21;NR=26;PP=678;ReadPosRankSum=0.036;SC=GGGGGTATAGGCTGGGCTGTG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=47;WE=31240968;WS=31240950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr12	31242271	rs2005896	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=495;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GCAGGTCCACGTGTGTTGGTA;SOR=1.274;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=27;WE=31242279;WS=31242261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr12	31242314	rs2005897	T	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-2.122;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
chr12	31242399	rs3881298	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.728;NF=21;NR=26;PP=706;ReadPosRankSum=-1.641;SC=ACGACCGCTGTGTGGACATGC;SOR=0.839;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=47;WE=31242407;WS=31242389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,59:0.37:161
chr12	31242440	rs2075318	A	G	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.504;NF=14;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=-1.250;SC=CACTGGGACCATGGTGTAGCC;SOR=0.641;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=34;WE=31242448;WS=31242430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr12	31244703	rs374684190	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQRankSum=-8.370;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,32:0.19:165
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chr12	31244924	rs1808349	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=315;ReadPosRankSum=2.360;SC=GAGGGTGCACGAGTCAAGGCG;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=31244932;WS=31244914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
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chr12	31246371	rs10843882	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=312;ReadPosRankSum=0.628;SC=AAGGGTCGGCCGGGTGCGGTG;SOR=0.785;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=22;WE=31246379;WS=31246361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr12	31246438	rs7970074	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr12	31249861	rs2075322	C	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=58.79;MQRankSum=-0.191;NF=26;NR=39;PP=1042;ReadPosRankSum=0.997;SC=GATGCACATCCAAGGCTTCCT;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=65;WE=31249869;WS=31249851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,77:0.44:175
chr12	31250669	rs7971579	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.931;NF=8;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=1.797;SC=CTGTGGGCTGGTTGTCCTAGA;SOR=0.095;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=31250677;WS=31250662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr12	31253995	rs1046456	C	T	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.072;NF=50;NR=61;PP=1576;ReadPosRankSum=0.150;SC=TCCTGCCCCTCGTCATCTGCA;SOR=0.764;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=220;TCF=102;TCR=118;TR=111;WE=31254003;WS=31253985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,126:0.49:258
chr12	31254642	rs7952861	T	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.651;NF=9;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=0.034;SC=CCAAGTCCTCTTCCTTGGCTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=31254650;WS=31254632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	31254701	rs7966366	G	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.181;NF=14;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=1.221;SC=AGGTGAAGACGCGGTTTGTGG;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=19;WE=31254709;WS=31254691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr12	31254752	rs7966272	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-1.159;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr12	31255263	rs10771803	G	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.772;NF=59;NR=54;PP=1679;ReadPosRankSum=0.818;SC=CGTCATGCTGGGCTTGGGTCT;SOR=0.454;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=113;WE=31255271;WS=31255253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,131:0.53:248
chr12	31255772	rs58740356	A	AG	665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.997;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.094;NF=8;NR=8;PP=584;ReadPosRankSum=0.284;SC=ACAGTCGGAGAGGCTGAGGGA;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=16;WE=31255780;WS=31255762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	31256075	rs3825318	GG	AA	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.084;NF=2;NR=5;PP=188;ReadPosRankSum=1.602;SC=TGCCCCCTCCGGAAGCTTGGA;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=31256084;WS=31256065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	31256417	rs139488871	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.752;NF=18;NR=14;PP=492;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CTGTTTCCTATATAAGTCTGA;SOR=0.374;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=32;WE=31256425;WS=31256407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr12	31256517	rs140335402	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.384;NF=17;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=-0.461;SC=GCAGGCAGGGCCATCAGGCAC;SOR=0.758;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=38;WE=31256525;WS=31256507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,45:0.43:105
chr12	31256546	rs1046457	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.567;NF=17;NR=22;PP=500;ReadPosRankSum=0.861;SC=TTTTGCCAGCGTAGTGCTCCT;SOR=0.567;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=39;WE=31256554;WS=31256536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr12	31256905	rs1046458	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.670;NF=4;NR=7;PP=76;ReadPosRankSum=0.178;SC=GAGTCCAGAGTGCTGCCAGGA;SOR=2.012;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=11;WE=31256913;WS=31256895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr12	31264743	rs4930953	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.308;NF=5;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-1.423;SC=TGCTTCTCCACCTGGGATTTA;SOR=0.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=15;WE=31264751;WS=31264733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr12	31264770	rs1053552	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.899;NF=3;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CATTTAAACAATAAACACATT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=12;WE=31264778;WS=31264760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	31265823	rs2302848	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=57.58;MQRankSum=-3.866;NF=5;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTGTGAAGACAGAGGTTGATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=31265831;WS=31265813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr12	31265872	rs2302849	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.676;NF=10;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=1.599;SC=TAGATATAAACACCACATTCA;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=13;WE=31265880;WS=31265862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr12	31265925	rs2302850	C	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-9.197;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,35:0.25:139
chr12	31265983	rs1053534	G	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-9.487;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.600;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,42:0.24:177
chr12	31266042	rs2302853	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-4.423;QD=2.68;ReadPosRankSum=-2.516;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,22:0.21:104
chr12	31267744	rs7968684	A	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQRankSum=-6.177;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.682;SOR=1.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,22:0.25:88
chr12	31269189	rs25559	C	CATCAT	162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-7.045;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,6:0.12:51
chr12	31270149	rs7316147	GC	CA	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.132;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-8.421;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,8:0.08:98
chr12	31270171	rs7301557	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=48;PP=1308;SC=GGATCCCCATTGCAGGGCGGG;SOR=1.463;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=31270179;WS=31270161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	31282765	rs2536839	A	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=-4.395;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,18:0.20:89
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chr12	31285101	rs2933405	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.564;NF=31;NR=4;PP=751;ReadPosRankSum=2.463;SC=TCTCTATTCTATTATTTTAAG;SOR=1.184;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=35;WE=31285109;WS=31285091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
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chr12	31285991	rs3853618	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.01;MQRankSum=-1.246;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.669;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	31286189	rs3844571	T	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=48;PP=1524;SC=CCAGCTCACTTAAGCATGGCT;SOR=1.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=31286197;WS=31286179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	31288835	rs200865477	G	GA	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.491;NF=9;NR=3;PP=392;ReadPosRankSum=1.427;SC=GAAATATTAAGAATATTTTAG;SOR=0.614;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=12;WE=31288843;WS=31288825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr12	31288884	rs4931444	G	T	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=25;PP=1915;SC=ACAGAACAACGCACCTCTACA;SOR=1.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=31288892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	31288955	rs11051266	G	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.391;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.301;NF=38;NR=21;PP=751;ReadPosRankSum=0.586;SC=TTGAACAACCGAAAAGGGTGA;SOR=0.944;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=197;TCF=120;TCR=77;TR=59;WE=31288963;WS=31288945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,66:0.30:223
chr12	31297722	rs55758709	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.409;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.051;SC=ATATAATCCACGAAGGAACAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=31297730;WS=31297712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	31297871	rs12309295	G	C	2367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.028;NF=43;NR=44;PP=1384;ReadPosRankSum=0.627;SC=TCAGATTTCAGTAGAAGGACG;SOR=0.421;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=68;TCR=81;TR=87;WE=31297879;WS=31297861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,111:0.60:186
chr12	31300754	rs116358569	T	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.930;NF=43;NR=17;PP=950;ReadPosRankSum=1.827;SC=GACTGATGCATGATTTCTAAG;SOR=1.029;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=60;WE=31300762;WS=31300744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,53:0.58:91
chr12	31300838	rs145803469	G	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.244;NF=43;NR=28;PP=993;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CCAAATAGAAGAACTTTACAT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=187;TCF=116;TCR=71;TR=71;WE=31300846;WS=31300828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,64:0.42:152
chr12	31300891	rs56144986	C	A	3683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.247;NF=88;NR=71;PP=2840;ReadPosRankSum=0.369;SC=GAGTAATGCACAGTAACAACC;SOR=0.660;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=252;TCF=143;TCR=109;TR=159;WE=31300899;WS=31300881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,155:0.61:254
chr12	31301888	rs11051274	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.521;NF=11;NR=21;PP=408;ReadPosRankSum=-1.168;SC=AGGTACATTATTGGGATCCGA;SOR=0.539;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=32;WE=31301896;WS=31301878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,38:0.27:143
chr12	31302233	rs12308258	C	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.333;NF=35;NR=16;PP=667;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AGCATGTATTCTTTAGTCAAA;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=97;TCR=41;TR=51;WE=31302241;WS=31302223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,55:0.38:145
chr12	31307173	rs4931449	A	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.458;NF=9;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=-1.251;SC=TGAAAATAGTATTGTTAAGCT;SOR=0.532;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=12;WE=31307181;WS=31307163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr12	31310983	rs7971718	G	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.003;NF=23;NR=27;PP=639;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGCATTGACCGTAACTTCAAA;SOR=0.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=50;WE=31310991;WS=31310973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,65:0.33:197
chr12	31311973	rs61733843	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.187;NF=12;NR=34;PP=680;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGAAAAATCCGATTGTTTTGA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=36;TCR=98;TR=46;WE=31311981;WS=31311963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,44:0.32:136
chr12	31359159	rs3065666	C	CAATGGTAA	797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=917;ReadPosRankSum=0.834;SC=TCATACCAACCAATGGTAAGC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=13;WE=31359167;WS=31359149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr12	31359210	rs2164498	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=1.188;SC=CTCTTTGTGTAAAGACCCACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=31359218;WS=31359200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	31539122	rs3741877	A	G	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=930;ReadPosRankSum=2.402;SC=TTTGCTTTTCAGCCACAACTG;SOR=0.822;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=64;WE=31539130;WS=31539112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,83:0.53:156
chr12	31539303	rs708200	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=0.144;SC=ACAACTTTTGGTCTTTCAAAA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=31539311;WS=31539293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	31542191	rs10843937	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=1.591;SC=ATGATCTGGTATAACCTTTTC;SOR=1.863;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=13;WE=31542199;WS=31542181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr12	31545103	rs708218	T	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=242;SC=AATATATATATCCTTATCACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=31545111;WS=31545093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	31545381	rs792874	A	G	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=33;PP=1329;SC=CTATGTCTAAAAAAAACACTA;SOR=1.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=31545389;WS=31545371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	31545682	rs7975761	A	G	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=809;ReadPosRankSum=0.935;SC=AATAAACCAAAGTACTATGGG;SOR=0.795;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=53;WE=31545690;WS=31545672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
chr12	31551350	rs1798769	C	T	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=30;PP=996;SC=GACAGGGTTCCCGCTCAGCCC;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=31551358;WS=31551340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	31568221	rs793159	C	T	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=21;PP=2274;SC=CAGCCATAATCATTTGAGCAA;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=74;TCR=21;TR=95;WE=31568229;WS=31568211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	31577378	rs34764768	A	AT	621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.099;NF=15;NR=7;PP=360;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AAAAGAGCCTATTTTTTTTTA;SOR=1.058;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=22;WE=31577386;WS=31577368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr12	31586007	rs2682695	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=300;ReadPosRankSum=0.431;SC=CATTAAGAATCTACACAATGA;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=19;WE=31586015;WS=31585997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr12	31600400	rs7976644	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=273;ReadPosRankSum=1.079;SC=TTTGTTGTACGTAAGGCCAGC;SOR=0.020;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=20;WE=31600408;WS=31600390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr12	31632449	rs3741878	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=0.771;SC=TCTAATAATATACCCCATGGA;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=18;WE=31632457;WS=31632439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr12	31633258	rs113784337	G	GT	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.185;SC=AATAAATGTTGTTTTTTTAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=31633266;WS=31633248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	31648723	rs4931506	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.888;NF=42;NR=33;PP=2201;ReadPosRankSum=0.380;SC=AAGAGTAAATGAGGGGAAAAA;SOR=0.401;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=75;WE=31648736;WS=31648713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr12	31648728	rs143241018	GA	G	1901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.767;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.738;NF=17;NR=33;PP=2219;ReadPosRankSum=0.399;SC=TAAATGAGGGGAAAAAAAACA;SOR=0.419;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=50;WE=31648736;WS=31648713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,84:0.53:159
chr12	31648826	rs4930979	C	T	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.899;NF=28;NR=37;PP=887;ReadPosRankSum=0.179;SC=GAATGTTCTTCTCAAAGGACT;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=138;TCF=56;TCR=82;TR=65;WE=31648834;WS=31648816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr12	31648948	rs4931507	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-2.000;SC=GACTGATAATGTTGAGATCTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=31648956;WS=31648938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	31693975	rs34225458	T	TA	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=11;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=107;ReadPosRankSum=0.871;SC=TCTTACCATATAAAAAAAAAA;SOR=0.992;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=10;WE=31693983;WS=31693965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr12	31743735	.	C	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=296;ReadPosRankSum=0.955;SC=GGAGCCCGAGCCCGGGCCGGG;SOR=0.490;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=23;WE=31743743;WS=31743725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr12	31814741	rs7959989	G	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=269;SC=CTCTTCCTCAGAATTCTCAGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=31814749;WS=31814731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	31908050	rs6488005	A	C	6974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=101;PP=2965;SC=CCAAGCCCATAGATAGATCAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=102;TCR=101;TR=203;WE=31908058;WS=31908040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr12	32135441	rs3759301	T	C	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1328;ReadPosRankSum=0.031;SC=AATGCCAGACTCATCTCATGA;SOR=0.733;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=192;TCF=111;TCR=81;TR=78;WE=32135449;WS=32135431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,99:0.44:225
chr12	32261435	rs1144715	A	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=53;SC=TGGGTAGCAAATAACCACTTA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=32261443;WS=32261428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	32446835	rs261877	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=374;ReadPosRankSum=1.381;SC=CCCATGAGGTGTTTTTATTAT;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=17;WE=32446843;WS=32446825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr12	32446901	rs261878	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=696;ReadPosRankSum=0.351;SC=GAGAGTTATATATTGACTGTT;SOR=0.674;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=65;TCR=27;TR=40;WE=32446909;WS=32446891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr12	32459070	rs41521147	T	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=425;ReadPosRankSum=-1.410;SC=AGAACTTTGTTTAGGGCCGCT;SOR=3.628;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=21;WE=32459078;WS=32459060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr12	32481093	rs3748275	G	C	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=1.079;NF=78;NR=61;PP=2259;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GGCGGGGTGTGTCATCCCCGG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=173;TCR=138;TR=139;WE=32481101;WS=32481083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,171:0.46:368
chr12	32481369	rs34447944	C	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1236;ReadPosRankSum=0.996;SC=GGGAGCTAGCCCCCATGATTG;SOR=0.459;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=138;TCF=56;TCR=82;TR=70;WE=32481377;WS=32481359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,88:0.54:163
chr12	32481577	rs3748276	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAGTATCGTCAAGATGAGAGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=32481585;WS=32481567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	32487644	rs10844188	T	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=737;ReadPosRankSum=0.126;SC=GTAGGTGGGGTAAAGGCTTTA;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=39;WE=32487652;WS=32487634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr12	32490348	rs2388988	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=68;ReadPosRankSum=0.522;SC=TCTAAATTTCGGTCAAATTTA;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=32490356;WS=32490338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	32490369	rs2388987	G	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.62;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	32490369	.	GCTTAAC	ACTTAAC,ACTTAAG	373	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=21,16;NR=4,2;PP=71,373;QD=4.23084850189;SC=TTACTTTTCAGCTTAACTCCC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25,18;WE=32490383;WS=32490359;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:25
chr12	32490375	rs4604975	C	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=6.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.338;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr12	32490764	rs2270786	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=363;ReadPosRankSum=0.756;SC=TGCATGCAGCGATCTTCATAG;SOR=0.247;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=24;WE=32490772;WS=32490754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr12	32490849	rs7309590	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	32490850	rs1057779	C	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.69;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	32491626	rs1471909	G	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=353;SC=TTAAATGCCAGTATAAATAAT;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=32491634;WS=32491616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	32491969	rs2291419	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.718;SC=AATAGACTCTCCCCTTCCTTC;SOR=1.802;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=32491977;WS=32491959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	32520416	.	GA	G	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=14;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=27;QD=16.5;SC=CTGTATTTAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=32520424;WS=32520412;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr12	32530257	rs7298381	G	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=511;SC=AGGGAAGAGTGCATATATCAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=32530265;WS=32530256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	32530385	rs7298319	C	G	5731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=72;PP=2965;SC=TTCTCAAAATCTATGCAAAAA;SOR=1.083;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=109;TCR=72;TR=181;WE=32530393;WS=32530375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr12	32552769	rs2651369	C	G	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=24;PP=1282;SC=GGGTGGCGATCCGGCGGAAGT;SOR=1.163;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=32552777;WS=32552759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	32639156	rs6488061	C	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=1.307;SC=GCAAAGTATACAATAGATGAG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=16;WE=32639164;WS=32639146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	32854543	rs188923566	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=-1.324;SC=TTCATTTTTGATCTATTCTTA;SOR=0.148;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=23;WE=32854551;WS=32854533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr12	32854602	rs9737752	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=270;SC=CTGTAGCATAGTTAGAAGTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=32854610;WS=32854592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	32890685	rs2177704	C	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1148;SC=TTATTTTCATCTTTCATGTTA;SOR=2.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=32890693;WS=32890675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	32945495	rs7956824	C	T	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=72;PP=1929;ReadPosRankSum=0.700;SC=AGTTTTTTAGCGATTTCTTCC;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=367;TCF=172;TCR=195;TR=142;WE=32945503;WS=32945485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,189:0.40:472
chr12	32945721	rs6488091	G	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=505;ReadPosRankSum=1.295;SC=TTCTGGATGCGGCCTGTGGGT;SOR=0.523;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=29;WE=32945729;WS=32945711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr12	32945769	rs6488092	G	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=0.886;SC=CTGCTACTCCGCAGCAGCCAT;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=13;WE=32945777;WS=32945759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr12	32949029	rs149968852	A	AG	711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=739;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GACGGGCAGAACTGAAGGACT;SOR=2.093;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=22;WE=32949037;WS=32949019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr12	32949252	.	AC	A	239	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=9;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=59.12;NF=1;NR=8;PP=239;QD=27.8888888889;SC=GAAAAAAAAAACAAAACACTT;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=9;WE=32949261;WS=32949231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,9:0.28:32
chr12	32955642	rs12299276	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=-0.272;SC=ATTCAGGCTGGAGTGCAGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=32955650;WS=32955632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	32974218	rs7967264	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=0.433;SC=CACTGTTTCATCTCTGAATTG;SOR=0.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=32974226;WS=32974208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	32974245	rs10772008	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=0.881;SC=GGTATGTCTACAATATCATTA;SOR=0.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=8;WE=32974253;WS=32974235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	33021934	rs1046116	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=445;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CCTGGATGGCAGCATGTGGTC;SOR=0.517;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=32;WE=33021942;WS=33021924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr12	34175508	rs12367881	T	C	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=774;SC=AGGAGTAGGTTCTTGGGCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=34175516;WS=34175498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	38710583	rs7296576	C	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=256;SC=TATGTGGCCCCGTCTGGCTAG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=38710591;WS=38710573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	38712142	rs6582584	C	G	8785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=138;PP=2965;SC=TGGATCTTTGCATGGTCTGAA;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=138;TCR=138;TR=276;WE=38712150;WS=38712132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr12	39087687	rs826877	A	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=53;PP=1562;SC=AGGGTAAATAAATTTAACAAA;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=39087695;WS=39087677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	39124173	rs5797589	G	GA	1670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1161;SC=AAAATTAAAGGAAAAAAGTAC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=34;WE=39124181;WS=39124163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	40011025	.	CT	C	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=43;QD=16.3333333333;SC=ACATATTATTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=40011033;WS=40011015;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr12	40037727	rs10735878	A	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=27;PP=786;SC=CTGGTAAGTCATTCCAATTGC;SOR=1.201;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=40037735;WS=40037717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	40077028	rs10047563	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=570;SC=ATACACACACATCTATATATT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=40077036;WS=40077018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	40345185	rs11446411	G	GA	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=11.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.029;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr12	40619082	rs2256408	G	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=56;PP=1791;SC=TACTCCGAGCGCGGTAATCAC;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=40619090;WS=40619072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	40619301	rs2723273	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=655;SC=CTAAAAAGGAGAGGGGGTGCT;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=40619309;WS=40619291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	40619542	rs2256286	A	G	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=51;PP=1447;SC=GGTTATTCCCAAAATTTGGCT;SOR=1.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=40619550;WS=40619532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	40626230	rs1352879	T	C	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=93;PP=2965;SC=GAGTATTTATTTGTACACATG;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=48;TCR=93;TR=141;WE=40626238;WS=40626220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr12	40626285	rs1352878	C	T	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=54;PP=1573;SC=AAGGCTACTCCTGTGGAATTC;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=67;WE=40626293;WS=40626275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	40631733	rs150000948	A	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=-1.405;SC=ATGTTAAAGCAGCTCTTTACT;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=40631741;WS=40631723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	40645257	rs7955902	C	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=435;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TTTTTTCTCCCCTAATCCAGG;SOR=0.997;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=23;WE=40645265;WS=40645247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr12	40657537	rs10784461	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.309;SC=CAGTCTGTTCAACTCAAATGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=40657545;WS=40657527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	40657700	rs7308720	C	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=304;ReadPosRankSum=0.519;SC=CAGCTTTGAACAGGGTATGTT;SOR=0.279;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=21;WE=40657708;WS=40657690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr12	40657771	rs10784462	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.136;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.639;SC=GAACTAGGGGCGCTTTTTCAG;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=12;WE=40657779;WS=40657761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr12	40677584	rs73108368	G	T	122.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=1.383;SC=AATTGGAGATGTAGAGAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=40677592;WS=40677578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	40681142	rs138343113	C	CT	1308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.492;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.021;NF=33;NR=8;PP=1584;ReadPosRankSum=0.059;SC=TGGTGTATCTCTTATTTTCAG;SOR=1.571;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=41;WE=40681150;WS=40681132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr12	40681352	rs66810434	T	TA	462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.847;NF=1;NR=16;PP=261;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GTATTTATTATAAAAAAAAAC;SOR=0.452;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=17;WE=40681360;WS=40681342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr12	40702846	rs7305344	A	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=0.676;SC=ATTTTTTTTTAAAAAAGGATT;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=40702854;WS=40702836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	40702911	rs7133914	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=361;ReadPosRankSum=-1.077;SC=TATTTAGGTCGTGAGGAATTC;SOR=1.104;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=24;WE=40702919;WS=40702901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr12	40702987	rs11175964	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=717;ReadPosRankSum=-0.256;SC=ACCTCAGCAAGGGACAGGCTG;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=38;WE=40702995;WS=40702977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr12	40703087	rs10650388	C	CGT	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=260;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TGTCTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=40703095;WS=40703077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr12	40703152	rs11175966	C	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=1.055;SC=TCTTTAAATACTTTCTTAAAA;SOR=0.078;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=40703160;WS=40703142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	40708922	rs1427266	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TCTTCACCTGCAAAATGAGGA;SOR=0.163;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=14;WE=40708930;WS=40708912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	40709185	rs721713	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=835;ReadPosRankSum=1.707;SC=GCATTTTAGAATTTGGGTTTA;SOR=0.479;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=58;WE=40709199;WS=40709175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr12	40713759	rs1896252	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.785;SC=AAAATAAATTTTAGTGATTAT;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=40713767;WS=40713749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	40713834	rs1427263	C	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=294;ReadPosRankSum=0.475;SC=ACCCTAAGGGCATTATTTCGC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=19;WE=40713842;WS=40713824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr12	40713873	rs11176013	A	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=361;ReadPosRankSum=-1.289;SC=TTCTTTCAAAAAAAAGGAAAT;SOR=1.236;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=19;WE=40713881;WS=40713863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr12	40714785	rs10878368	A	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=1101;ReadPosRankSum=2.284;SC=TTGCTCAACAAGGTTGGGTGT;SOR=0.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=71;WE=40714793;WS=40714775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,77:0.53:146
chr12	40715013	rs7307276	T	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=0.640;SC=TGAAGACTTATTAGATTTTTA;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=10;WE=40715021;WS=40715003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
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chr12	40716037	rs66762941	TA	T	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.020;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.340;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr12	40716260	rs10878371	T	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=356;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TTAATGATGGTGAAGAACATC;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=28;WE=40716268;WS=40716250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr12	40753044	rs111612315	C	CT	180.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.59;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	40753303	rs3789330	A	G	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=131;SC=TTTTTTCCTTATAATCATTAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=40753311;WS=40753293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	40757114	rs10626458	A	ACATG	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=547;SC=TAGTGTTTTTACATTAAGAAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=40757122;WS=40757104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	40757186	rs11317573	AT	A	1967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=14;PP=1126;SC=ATGACTTTCTATTTTTTTTTC;SOR=2.505;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=58;WE=40757194;WS=40757176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	40758652	rs3761863	T	C	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AGGGAGGTAATGGTAAAAGAA;SOR=0.769;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=113;TCR=47;TR=159;WE=40758660;WS=40758642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr12	40761007	rs3789328	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=300;SC=TTGGTAGTTTATAGTGTAAAG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=40761015;WS=40760997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	40761315	rs12426498	A	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-1.036;SC=ATAATTTAGTACATTAGTTAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=40761323;WS=40761305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	40761358	rs4768238	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=204;SC=ATCTAAGTCAACTAAAAATAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=40761366;WS=40761348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	40761663	rs66737902	T	C	126.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TACTCACATTTTTTGAAATAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=40761671;WS=40761653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	40787385	rs7968721	C	A	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=398;SC=TCTGTAGATCCAACATTTTTC;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=40787393;WS=40787375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	40793993	rs1820544	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=-0.108;SC=AAAATATAATCTCTCTTATTA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=14;WE=40794001;WS=40793983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	40799969	rs10784595	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr12	40799975	rs10784596	G	C	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.724;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr12	40802128	rs370137485	C	T	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1238;ReadPosRankSum=0.278;SC=AAGACAAGTCCGGAGACAGTC;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=83;WE=40802136;WS=40802118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr12	40802150	rs1019709	G	A	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=75;PP=2568;SC=GGATGCTGGAGGTTCAAAGTC;SOR=1.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=126;WE=40802158;WS=40802140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	40805973	rs77815501	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=542;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AGGTCAGAAGACAGCCCAGCA;SOR=0.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=40;WE=40805981;WS=40805963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr12	40808832	rs994798	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.443;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=678;ReadPosRankSum=1.617;SC=AGTGACAATTATTTTATATTC;SOR=1.037;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=42;WE=40808840;WS=40808822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr12	40815530	rs73101534	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	40815548	rs6581732	T	A	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=110;SC=GATAGAATTGTATTTGAGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=40815556;WS=40815538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	40820208	rs11176575	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=472;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TTATTTTGTAGCACTGTAACA;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=25;WE=40820216;WS=40820198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	40821176	rs7955308	G	A	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=46;PP=2725;SC=ATTTCTCCAGGAACACAAAGA;SOR=1.170;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=129;WE=40821184;WS=40821166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	40822012	rs7960062	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=547;SC=AAATAAAAAGCAATCTCACTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=40822020;WS=40822002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	40825487	rs2114567	G	A	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=564;ReadPosRankSum=-0.311;SC=AGACAGGAACGTGCTTAAATA;SOR=0.858;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=38;WE=40825495;WS=40825477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,43:0.39:111
chr12	40827479	rs2162470	T	C	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=1444;SC=TTCACTTGGGTGAAGAACTGA;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=40827487;WS=40827469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	40830583	rs11564168	T	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=965;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TACTTCCTTCTCAGTTTCGCT;SOR=0.502;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=32;TCR=90;TR=61;WE=40830591;WS=40830573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr12	40830599	rs201817965	CGTGTGT	C,CGTGT	2194.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=36.58;SOR=2.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,36,24:0.60,0.40:60
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chr12	40832161	rs11176635	T	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.710;SC=CTCATCCATATTGATGACAAT;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=46;TCR=88;TR=64;WE=40832169;WS=40832151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr12	40834376	rs10878592	C	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=352;ReadPosRankSum=0.260;SC=TTATTTCCAGCGTCTGTCGGG;SOR=1.254;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=17;WE=40834384;WS=40834366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr12	40834955	rs10784618	C	A	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=58;PP=1468;ReadPosRankSum=1.248;SC=ACTGTCCATGCTCTTTTGGTG;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=214;TCF=93;TCR=121;TR=100;WE=40834963;WS=40834945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,115:0.47:247
chr12	40835596	rs4768263	T	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=458;ReadPosRankSum=0.388;SC=ATTATTTTGTTCTTCTTTACA;SOR=0.746;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=21;WE=40835604;WS=40835586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	40835734	rs7966110	C	G	3096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=61;PP=1897;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TCTGCCACATCTATGGGGAAG;SOR=0.753;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=129;TCR=116;TR=127;WE=40835742;WS=40835724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,147:0.47:312
chr12	40835749	rs11176655	T	C	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=62;PP=1716;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GGGAAGGTCATGTTAGAACTT;SOR=0.641;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=243;TCF=113;TCR=130;TR=120;WE=40835757;WS=40835739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,164:0.53:309
chr12	40835817	rs11176659	T	C	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=47;PP=1198;ReadPosRankSum=-1.353;SC=CTTGAGGTAATTATGAGTATG;SOR=0.278;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=135;TCF=37;TCR=98;TR=72;WE=40835825;WS=40835807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,87:0.54:161
chr12	40837264	rs11564230	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=1.033;SC=AACTGGAATGTATGTATATCG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=20;WE=40837272;WS=40837254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr12	40838146	rs10784620	A	T	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1231;ReadPosRankSum=0.584;SC=GCAGTGACTTACACAGGGTTT;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=75;WE=40838154;WS=40838136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,96:0.49:197
chr12	40838216	rs10784621	T	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=856;ReadPosRankSum=-2.017;SC=TACCATGATGTGTGCATTGAA;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=71;TCR=82;TR=73;WE=40838224;WS=40838206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr12	40839467	rs7972395	A	G	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=42;PP=997;ReadPosRankSum=-1.878;SC=CTTTAAGAATATGCATAAAGT;SOR=0.436;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=33;TCR=85;TR=60;WE=40839475;WS=40839457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr12	40839521	rs1346307	T	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=591;ReadPosRankSum=0.619;SC=TTGTTTCTCCTAATTTCGTGT;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=26;WE=40839529;WS=40839511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr12	40840325	rs10878597	T	C	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1296;ReadPosRankSum=-2.024;SC=TGCTCCTTACTTGGATGAGAA;SOR=0.579;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=244;TCF=139;TCR=105;TR=94;WE=40840333;WS=40840315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,138:0.44:311
chr12	40841781	rs1820547	A	G	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=54;SC=CACTGCACCTAGCCACAACAC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=40841789;WS=40841779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	40842167	rs6581750	C	T	70.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=0.674;SC=AATATCATTTCATTATATTCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=40842175;WS=40842157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	40843504	rs12581232	A	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=389;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CCACTACAACAGCTACCACCA;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=30;WE=40843512;WS=40843494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr12	40844250	rs10878599	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=0.202;SC=AAAGCTTTTGGGGAAAAAAAG;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=16;WE=40844258;WS=40844240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr12	40844667	.	A	C	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=24;QD=19.5904041824;SC=CGGACCATCCAAACAGTTTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=40844675;WS=40844657;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr12	40852398	rs1035811	T	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.51;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	40857214	rs10878623	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=611;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TATCCATATATATTAAGCACC;SOR=1.183;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=38;WE=40857222;WS=40857204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr12	40857943	rs2933353	A	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=1.444;SC=GTATCTGGAGAAACCCCTGCA;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=30;WE=40857951;WS=40857933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr12	40859036	rs2131202	C	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=921;ReadPosRankSum=0.072;SC=GATGTCATTCCGAGGCTGTGG;SOR=1.132;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=62;WE=40859044;WS=40859026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr12	40859551	rs2131203	T	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CATTGTAACCTTTTATGTAGA;SOR=1.919;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=40859559;WS=40859541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	40868879	rs60890556	C	CA	1401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=1069;ReadPosRankSum=0.289;SC=GAGCCTGAACCATTGTTGTTG;SOR=0.798;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=27;WE=40868887;WS=40868869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr12	40894745	rs111256342	A	ACTGAGAATAC	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,18:0.23:79
chr12	40928574	rs117855857	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.623;NF=3;NR=3;PP=48;ReadPosRankSum=-1.578;SC=TTTCAAATGACCTTCAACATT;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=6;WE=40928582;WS=40928564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr12	40954283	rs1492321	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.550;NF=21;NR=6;PP=478;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CAATAAAGCTATAAACAAAGA;SOR=0.416;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=27;WE=40954291;WS=40954273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr12	41303825	rs2304819	A	C	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=28;PP=1193;SC=TTGAAACCACAATTCAAATAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=41303833;WS=41303815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	41312365	rs10879356	A	T	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=742;SC=TTTTCAAGTAATTTTTTTTCA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=41312373;WS=41312355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	41330531	rs2289522	T	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=652;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGGAGATTATGATGGATCTT;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=28;WE=41330539;WS=41330521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr12	41331612	rs1442193	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=265;SC=ATGTTGGTTGTTTACTGATTT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=41331620;WS=41331602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	41337435	rs1056019	C	T	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=52;PP=2159;SC=TGGAAATCAACAACATTACAA;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=121;WE=41337443;WS=41337425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	41582590	rs10879830	G	C	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=30;PP=855;SC=CTGCCCGCCGGCTCCGCAGCC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=41582611;WS=41582580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	41582603	rs10879831	G	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=26;PP=584;SC=CCGCAGCCGCGGGGGCTGCGC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=41582611;WS=41582580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	41588124	rs3847980	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=239;SC=AGGCATTATCATTTTTACTTT;SOR=4.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=41588132;WS=41588114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	41946315	rs11301675	TA	T	251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=171;SC=ATAATATTGGTAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=41946323;WS=41946310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	41946453	rs285585	T	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=28;PP=1358;SC=GTGTTGTTCTTTCAGGAGGTC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=41946461;WS=41946443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	41949370	rs285580	T	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=944;SC=AGAGAAATATTATGTATACTG;SOR=4.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=41949378;WS=41949360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	41957568	rs157971	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=354;SC=ATCATTATCACGGTTATCTCT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=41957576;WS=41957558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	42481732	rs7972986	G	A	113.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9748;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=62;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AACGGATGTTGTCATCTTCAA;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=6;WE=42481740;WS=42481722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	42481803	rs824722	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=AGGTACATATGTAAGTTCAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=42481811;WS=42481793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	42499538	rs61942483	TT	AC	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=749;ReadPosRankSum=-1.718;SC=TCAATTTAGTTTTTAATAAAA;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=16;WE=42499547;WS=42499533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr12	42503505	rs824695	T	A	873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=25;PP=817;SC=TAAAACAATTTAAAAAAAAAC;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=42503513;WS=42503495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	42629550	rs7960176	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=297;ReadPosRankSum=0.240;SC=TACAAGAGCTTAGATGTACTG;SOR=0.523;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=19;WE=42629558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr12	42632354	rs75085410	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=84;ReadPosRankSum=-1.530;SC=CCTTGGTACCCCCGGCTGCCG;SOR=0.813;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=9;WE=42632362;WS=42632344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	42707437	rs3761677	C	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.100;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr12	42717811	rs17091074	A	T	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.970;NF=55;NR=34;PP=1418;ReadPosRankSum=0.333;SC=ACTCGATAAGATTTACTTACC;SOR=0.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=115;TCR=73;TR=89;WE=42717819;WS=42717801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,118:0.52:227
chr12	42717961	rs3747557	G	T	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=51;PP=1514;SC=TTCTTTTTTTGTTGTTTGAGA;SOR=3.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=42717969;WS=42717951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	42726620	rs12581958	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	42729891	rs7296357	T	G	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=53;PP=1472;SC=ACCAGTGTAGTTTACAAAAGA;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=61;WE=42729899;WS=42729881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	42737635	rs61471584	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=315;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TACCAGTTTTTATGTTTTTGA;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=20;WE=42737643;WS=42737625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr12	42737665	rs59844371	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.587;SC=ACCAAAAGACGTTGGAATGAC;SOR=1.721;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=18;WE=42737673;WS=42737655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr12	42737739	rs58826545	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-1.403;SC=TGCTAAAATAAGAATGTATGT;SOR=0.425;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=9;WE=42737747;WS=42737729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr12	42749072	rs17091102	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-1.635;SC=CTTGACTCACTGTGATGTCTG;SOR=0.622;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=14;WE=42749080;WS=42749062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	42778922	rs1669906	G	A	3238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=69;PP=1986;SC=ACCACAGTTAGCAGTAGACCT;SOR=1.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=98;WE=42778930;WS=42778912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
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chr12	42836270	rs1452104	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-1.717;SC=ATTACTCACAAATTGTGTTGG;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=42836278;WS=42836260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	42839836	rs1669885	A	C	7676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=130;PP=2965;SC=GGACCCAACCAAGTACCAGAA;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=118;TCR=130;TR=248;WE=42839844;WS=42839826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr12	42853058	rs68074167	GT	G	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5429;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=1.145;SC=AATGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SOR=1.473;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=9;WE=42853066;WS=42853048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	42853084	rs12658	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=-1.595;SC=CTGTAGCTGGCGCTGATACAA;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=9;WE=42853092;WS=42853074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr12	42853350	rs1043656	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-1.559;SC=GGAAAACCAAAGCAGCTACGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=42853358;WS=42853340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	42853520	rs1043652	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=1.254;SC=AGCACTTTAAACTATTTTCAC;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=42853528;WS=42853510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	42854205	rs3747562	A	G	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr12	42854208	rs3747563	A	G	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=3.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr12	42859961	rs12230583	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=407;ReadPosRankSum=1.321;SC=ACTAATGGCTAGGTGACAGGG;SOR=1.419;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=24;WE=42859969;WS=42859951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr12	42862750	rs2708062	T	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=293;SC=TGCTACCTCTTTTAGTGATTA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=42862758;WS=42862740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	42866065	rs2305422	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.947;SC=AAGAAGAATAAGGACTGAGGA;SOR=1.781;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=10;WE=42866073;WS=42866055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	43763234	rs1390000	G	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.623;SC=TAATGCAATCGTTGTTGTCAA;SOR=0.559;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=17;WE=43763242;WS=43763224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr12	43769228	rs10506226	A	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=351;ReadPosRankSum=0.213;SC=TGCTGAAAACAGTGTATCCAG;SOR=0.632;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=31;WE=43769236;WS=43769218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr12	43769276	rs10880473	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=504;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AGTCTTCCCTTCTACTCCCAT;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=33;WE=43769284;WS=43769266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr12	43769718	rs7972295	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=0.221;SC=AACAACATCTAGTTTAGGTCC;SOR=1.828;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=16;WE=43769726;WS=43769708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr12	43770617	rs9804726	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CTGGATAGTCGCCGGTGGGAA;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=43770625;WS=43770607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr12	43817432	rs75724100	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGAAAGAAGATGGAACAGAGA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=43817453;WS=43817422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	43817445	rs6582463	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.143;SC=AACAGAGACACAGTAAGCAGA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=43817453;WS=43817422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	43819298	rs10785430	G	A	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1263;ReadPosRankSum=0.225;SC=CATGTTAACAGACAAGAGTGC;SOR=0.966;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=83;WE=43819306;WS=43819288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr12	43821335	.	T	TA	55	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5001;HP=12;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=55;QD=12.2;SC=ATTTACATGGTAAAAAAAAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=5;WE=43821343;WS=43821325;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr12	43846272	rs7307955	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=772;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTGTTCTTACGTCTCAGAAA;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=52;WE=43846280;WS=43846262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr12	43847620	.	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-1.320;SC=CTTACGGACTGACCTCCAGTT;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=13;WE=43847628;WS=43847610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	43884330	rs7297170	C	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TATGACATGACTACTACCACA;SOR=0.424;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=13;WE=43884338;WS=43884320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr12	43945603	rs275602	A	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=34;PP=2435;SC=GCCCCCACTTAGCCGCTGAAG;SOR=1.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=88;TCR=34;TR=122;WE=43945611;WS=43945593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	44191789	rs144307978	AT	A	610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=539;SC=TCCTGCTAGCATTTTGTCAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=44191803;WS=44191779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr12	44926334	rs2270479	T	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=397;ReadPosRankSum=0.860;SC=AGAGAAGTTCTTAAATTCTAG;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=30;WE=44926342;WS=44926324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
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chr12	45173571	rs1123078	C	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=893;ReadPosRankSum=-0.094;SC=AAAGAAGGAACGTGAGTAGAC;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=52;WE=45173579;WS=45173561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr12	45173858	rs1122352	T	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=745;ReadPosRankSum=0.762;SC=TCAAAAACGATTGAAGTGATC;SOR=0.677;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=45;WE=45173866;WS=45173848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr12	45173884	rs1122351	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=507;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CTACGGGATGGAATAGATGTA;SOR=0.235;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=32;WE=45173892;WS=45173874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr12	45270272	rs4415832	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-1.833;SC=CCCAGGAGCCGTTGCAGCCTC;SOR=1.329;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=11;WE=45270280;WS=45270262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	45278055	rs56181373	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=364;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TCACAATTAAGACACAACAAT;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=30;WE=45278063;WS=45278045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr12	45307633	rs374144	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=438;ReadPosRankSum=-0.630;SC=ATAATAATAATGTCTAAAAGG;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=30;WE=45307641;WS=45307623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr12	45410063	rs77385942	T	C	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.140;SC=GGAGGAATGCTTCCATTCAGA;SOR=0.816;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=103;TCR=93;TR=101;WE=45410083;WS=45410053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,118:0.51:231
chr12	45410075	rs1224442	A	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=1.695;SC=CCATTCAGACAGCCCCAGTAA;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=96;WE=45410083;WS=45410053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr12	45417666	rs2731038	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=660;ReadPosRankSum=-0.015;SC=AGAGGCAGCATGCTCTCTTCT;SOR=0.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=120;TCF=47;TCR=73;TR=54;WE=45417674;WS=45417656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr12	45444238	rs11182810	T	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=119;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CCGCCGGCGCTCCCAGATCCC;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=45444246;WS=45444228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	45444264	rs11182811	G	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=234;ReadPosRankSum=0.097;SC=CACCCGGCCTGGGGGCGCGGG;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=15;WE=45444272;WS=45444254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr12	45664213	rs10748415	G	A	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=639;SC=ATATTGGCCTGTTGTATTTAT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=45664221;WS=45664203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	45695735	rs4140756	C	A	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=25;PP=1798;SC=TTTAAAAGTACAGAACTACGT;SOR=1.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=90;WE=45695743;WS=45695725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	46211541	.	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=322;ReadPosRankSum=-1.528;SC=TATCTGGACTCCCAAATGAAG;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=21;WE=46211549;WS=46211531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr12	46215163	rs2059404	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-1.585;SC=AGAATTTATTGCATTTTATTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=5;WE=46215171;WS=46215153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	46254499	rs10577231	CAT	C	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=397;ReadPosRankSum=0.353;SC=TGTATAACAACATAATCAAAT;SOR=0.723;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=10;WE=46254508;WS=46254489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr12	46321514	rs7315731	A	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,15:0.23:65
chr12	46367903	rs10880879	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=219;ReadPosRankSum=-2.408;SC=TATGTTTATATTATACTGTAG;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=15;WE=46367911;WS=46367893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr12	46367939	rs11183268	G	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=3.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=330;ReadPosRankSum=-0.908;SC=ACAGCATTATGTCTAAAAACT;SOR=0.949;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=22;WE=46367947;WS=46367929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr12	46385815	rs11574952	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=635;ReadPosRankSum=0.698;SC=GCCGACCGACCGCTTCACTGC;SOR=0.959;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=40;WE=46385823;WS=46385805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr12	46633328	rs7959095	G	T	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=311;SC=GTTTCACCATGTTGGTCAGGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=46633336;WS=46633318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	46662485	rs2242355	G	C	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=711;SC=GGCGGATTTCGGAGGAAGGTG;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=46662493;WS=46662478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	46755112	rs7961994	A	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=671;SC=ATCTATAGAAAGAATATTTAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=46755120;WS=46755102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	46758494	rs2307061	A	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=41;PP=1327;SC=TCCTATAAGGAGGGGTGGCAG;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=59;WE=46758502;WS=46758484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	46759017	rs7968173	T	A	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=831;SC=AAATATCCTCTGAAAAATATA;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=46759025;WS=46759007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	46759057	rs12307969	G	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=352;SC=CATTTCATAGGAATACCATGA;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=46759065;WS=46759047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	46761127	rs10880959	G	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=26;PP=745;SC=GAGAATTCTGGTGAGAGAAGG;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=46761135;WS=46761117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	47159123	rs4768756	A	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=15;PP=952;SC=ATACTTTTACAGAGAACCACT;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=47159131;WS=47159113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	47159196	rs2430921	A	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=413;ReadPosRankSum=-1.127;SC=ACTGAACTAAATCCTATTTTA;SOR=0.795;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=26;WE=47159204;WS=47159186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr12	47160241	rs117433039	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=535;ReadPosRankSum=0.962;SC=CATCTCACACTGCTCTAGCAA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=42;WE=47160249;WS=47160231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr12	47162889	rs2465582	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.372;SC=GTGGCTCCCAATGTCAGTTAG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=47162897;WS=47162887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	47162938	rs2216433	T	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=5;PP=978;SC=CCAGAGCCTCTCAGGGATAAA;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=47162946;WS=47162928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	47163306	rs180403	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr12	47168898	rs180414	G	A	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=56;PP=2160;SC=CCATGAGAAGGGGGATGTCTA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=104;WE=47168906;WS=47168888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	47170621	rs12316767	C	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=501;ReadPosRankSum=-0.644;SC=AAAATCATACCTACCCAGGTC;SOR=1.119;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=29;WE=47170629;WS=47170611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr12	47170887	rs180419	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=1.649;SC=CTATATTGCTCATCATGAAGA;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=47170895;WS=47170877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	47173662	rs180426	A	G	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1209;ReadPosRankSum=0.478;SC=GTGAGAGACAAGGATATTAGA;SOR=0.886;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=160;TCF=84;TCR=76;TR=74;WE=47173670;WS=47173652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr12	47173830	rs2287471	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=531;ReadPosRankSum=-1.821;SC=TGGAAAATGTGACAGCTTAAT;SOR=0.954;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=25;WE=47173838;WS=47173820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr12	47178307	rs180430	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=286;ReadPosRankSum=-0.506;SC=GGATCCATTGAAAAGTATATC;SOR=0.602;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=21;WE=47178315;WS=47178297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr12	47471439	rs2269828	G	A	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=72;PP=2965;SC=CATCACTAGCGGGGCCAGGAC;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=156;WE=47471447;WS=47471429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	47581629	rs832733	T	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=549;ReadPosRankSum=0.073;SC=CATTTCCACCTAGACGGGCCT;SOR=0.721;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=36;WE=47581637;WS=47581619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr12	47629368	rs2244818	G	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1433;ReadPosRankSum=0.628;SC=AAGTCACCGGGGGTTTTCTTC;SOR=0.501;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=87;WE=47629376;WS=47629358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,93:0.58:159
chr12	47757917	rs77921585	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1081;ReadPosRankSum=0.146;SC=TGCAAAAATACTGGAGCTTGC;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=93;TCR=75;TR=75;WE=47757925;WS=47757907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,89:0.42:214
chr12	47758032	rs215383	A	G	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=58;PP=1830;SC=CAGACTGCAGATGACCAGGGT;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=86;WE=47758040;WS=47758022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	47761212	rs58616	G	A	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=52;PP=1656;ReadPosRankSum=0.039;SC=TTCAAGGTTAGTACCCTGATA;SOR=0.604;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=222;TCF=130;TCR=92;TR=121;WE=47761220;WS=47761202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,146:0.53:274
chr12	47761313	rs11419253	A	AT	1833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.564;NF=3;NR=45;PP=500;ReadPosRankSum=-1.877;SC=TTCGCTCTCTATTTTTTTTTT;SOR=0.636;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=83;TCF=3;TCR=80;TR=48;WE=47761321;WS=47761303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,68:0.96:71
chr12	48081539	rs7136422	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=482;ReadPosRankSum=3.037;SC=GCATTTAATTCCCAATTCCTA;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=22;WE=48081547;WS=48081529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
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chr12	48104746	rs1235152	G	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=379;SC=CCCACTTCACGCTGCCTCTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=48104754;WS=48104736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr12	48110613	rs2524317	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.48;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	48132451	rs2072116	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=513;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TAGTAGTGAATGCCTGCTCTC;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=39;WE=48132459;WS=48132441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr12	48134300	rs12828238	G	A	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=623;ReadPosRankSum=0.246;SC=GAAGGCAGAGGCTCCAGGGGA;SOR=0.770;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=37;WE=48134308;WS=48134290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr12	48134381	rs35703007	CG	C	1209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=748;ReadPosRankSum=-1.140;SC=AAAAGGTAGCCGGGGGGACTC;SOR=0.711;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=30;WE=48134389;WS=48134371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr12	48134634	rs11168219	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GAGAGGTCAGCGAGTGCTGAG;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=75;WE=48134642;WS=48134624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr12	48134695	rs2074533	T	C	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1499;ReadPosRankSum=0.792;SC=CTGCCTCCCATACCTGGTGGA;SOR=0.619;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=206;TCF=108;TCR=98;TR=93;WE=48134703;WS=48134685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,112:0.48:235
chr12	48142418	rs757281	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=394;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CATTTTTCTCCATTAGCCAGC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=24;WE=48142426;WS=48142408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr12	48143095	rs149061709	G	GCTCTGGT	1255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=846;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CAGGCCCTCTGCTCTGGTCCC;SOR=1.219;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=14;WE=48143103;WS=48143085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr12	48144243	rs757279	A	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=345;ReadPosRankSum=-1.010;SC=CACACTGTGAACTGTGGGCCC;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=25;WE=48144251;WS=48144233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr12	48144925	rs2016123	T	C	4821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=80;PP=2963;SC=TCATGAGTTCTCACGGGCTCG;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=145;WE=48144933;WS=48144915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	48145368	rs2072115	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=829;ReadPosRankSum=1.565;SC=GGAACTATGCATTAGAAAGGC;SOR=0.363;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=58;WE=48145376;WS=48145358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr12	48164758	rs2544025	G	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=-0.093;SC=ATGCACTCCGGACCACGGGGC;SOR=0.385;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=16;WE=48164766;WS=48164748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	48165910	rs7300569	C	A	666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=890;ReadPosRankSum=-2.228;SC=AGCACACACACAAAAAAAACT;SOR=0.614;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=53;WE=48165918;WS=48165899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,49:0.25:197
chr12	48172778	rs73105899	C	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=483;ReadPosRankSum=0.586;SC=CTGGAGCACCCTGGGGATGGG;SOR=0.324;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=40;WE=48172786;WS=48172768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr12	48178127	rs3192737	A	G	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=63;PP=1874;SC=TCCTCCACTTAGGGTCGGCTC;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=93;WE=48178135;WS=48178117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	48178465	rs3815138	T	C	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=58;PP=2326;SC=GAACACAACATGGGAGAACTG;SOR=0.944;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=136;WE=48178473;WS=48178455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	48178513	rs7972177	A	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1001;ReadPosRankSum=0.767;SC=TGCCCAGGCCAGGAGAATGCT;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=69;WE=48178521;WS=48178503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,79:0.47:167
chr12	48178604	rs11168236	T	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=516;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GAATCAGCCATGTCTTTACCA;SOR=1.517;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=33;WE=48178612;WS=48178594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr12	48179402	rs3815131	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=72;ReadPosRankSum=-0.273;SC=ACAGAGGCTTCCGCTTCGCCT;SOR=0.666;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=7;WE=48179410;WS=48179392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	48179463	rs3815130	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATCTGCCTGCTCCTTGGGTA;SOR=1.845;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=13;WE=48179471;WS=48179453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr12	48181778	rs6580637	T	C	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1426;ReadPosRankSum=-0.297;SC=AGAGTAAGTGTCAGGAGGAGG;SOR=0.483;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=78;WE=48181786;WS=48181768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,98:0.47:210
chr12	48185356	rs2240105	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=539;ReadPosRankSum=-1.608;SC=AGACAGGGCCACTAGGCCATT;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=35;WE=48185364;WS=48185346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr12	48195939	rs2525051	G	C	3266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=1980;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AGCTTCTCGCGTTCTTACAGC;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=148;TCR=120;TR=129;WE=48195947;WS=48195929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,159:0.48:328
chr12	48196340	rs190129215	C	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=324;ReadPosRankSum=0.608;SC=GGCCTCAGCTCACCCAGCAGT;SOR=0.585;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=19;WE=48196348;WS=48196330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr12	48259126	rs12717991	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.101;SC=GGGCACCAAACGATTCCTACT;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=12;WE=48259134;WS=48259116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	48272895	rs2228570	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CATTGCCTCCATCCCTGTAAG;SOR=0.471;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=19;WE=48272903;WS=48272885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr12	48358279	rs11609253	C	A	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=580;SC=GCCCAGACAACTTTTCTTCTA;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=48358287;WS=48358269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	48360620	rs2286024	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=556;SC=TCAGCTTTTGACTTATAGGTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=23;WE=48360628;WS=48360610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	48367829	rs1635560	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=596;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TGCTCCAGGCGGTTTGGGCAC;SOR=0.381;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=38;WE=48367837;WS=48367819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,45:0.43:105
chr12	48371595	rs1793949	G	A	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=32;PP=1026;SC=TCCTCCTTCCGGAAGCAGCCC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=48371603;WS=48371585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	48373718	rs11443755	A	AC	691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=6;PP=515;SC=ATCCCAGAACACCCCCGCCAT;SOR=2.030;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=14;WE=48373726;WS=48373708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	48374513	rs1635554	A	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=41;PP=1944;SC=CCAGAAGAGCAGGAGACTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=92;WE=48374521;WS=48374503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	48374826	rs2276458	T	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=235;SC=CAAGAGCCCCTTGGGCCCTGC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=48374834;WS=48374816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	48375475	rs1793937	C	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=360;ReadPosRankSum=0.742;SC=TGAGGGAGGACAAGACAGAAC;SOR=1.136;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=24;WE=48375483;WS=48375465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr12	48375568	rs1635553	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=508;ReadPosRankSum=2.006;SC=CCTTCTCGCCATTAGCACCAG;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=40;WE=48375576;WS=48375558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr12	48375965	rs2276457	C	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.14;ReadPosRankSum=-2.430;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr12	48375975	rs2276456	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.27;ReadPosRankSum=-2.067;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr12	48376137	rs2276455	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=358;ReadPosRankSum=-0.453;SC=AAAAGGCAGGGAGCTTTGGAA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=22;WE=48376145;WS=48376127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr12	48376213	rs12811832	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=804;ReadPosRankSum=-0.283;SC=ATAAGGGAACGGAAGCGATCA;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=57;WE=48376221;WS=48376203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr12	48376291	rs2276454	G	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=947;ReadPosRankSum=-1.070;SC=TTACCCTGTCGCCTTTGGGCC;SOR=0.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=63;WE=48376299;WS=48376281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr12	48376443	rs3842680	A	AC	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=413;ReadPosRankSum=0.351;SC=CTCTCCCTGAACCCATGTTCA;SOR=1.279;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=8;WE=48376455;WS=48376433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	48376447	rs3829737	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=442;ReadPosRankSum=0.246;SC=CCCTGAACCCATGTTCATGGA;SOR=1.288;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=8;WE=48376455;WS=48376433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr12	48376503	rs3829736	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=288;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CCCTTCCTCCCATGTAGACCT;SOR=2.712;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=15;WE=48376511;WS=48376493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	48376530	rs11168337	C	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=546;ReadPosRankSum=-1.786;SC=CAGCTCCCCCCACTTCTGTTC;SOR=1.358;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=34;WE=48376538;WS=48376520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr12	48376969	rs11168338	C	A	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.159;SC=ATATCACAGACCCCTGAACAA;SOR=0.879;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=67;WE=48376977;WS=48376959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,81:0.43:187
chr12	48377970	rs1635550	A	G	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1315;SC=TTTTCTTCCCACTTGCAGTCC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=71;WE=48377978;WS=48377960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	48379961	rs1635547	A	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr12	48379964	rs1635546	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	48380031	rs1635544	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=480;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AAAAGTCACGAGACTTGACCA;SOR=0.408;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=32;WE=48380039;WS=48380021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr12	48380682	rs10875714	G	A	3321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=67;PP=1785;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CTTGAAAAGAGAGGCAGGTCC;SOR=0.679;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=260;TCF=110;TCR=150;TR=114;WE=48380690;WS=48380672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,157:0.50:313
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chr12	48386553	rs1635534	A	G	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=14;PP=1366;SC=TTAAGGGATAACAATACTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=48386561;WS=48386543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	48386577	rs1793915	G	T	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=26;PP=1784;SC=GCCTCACAGGGTTGTTTCGAG;SOR=1.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=83;WE=48386585;WS=48386567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	48387052	rs1793912	A	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.45;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	48387052	.	AATGGG	CATGGC,CATGGG	356	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10,25;NR=0,0;PP=163,356;QD=21.6467874862;SC=AGTGTGATAAAATGGGTATCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10,25;WE=48387065;WS=48387042;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:25
chr12	48387057	rs1793911	G	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	48388995	rs3216168	TC	T	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.200;NF=11;NR=3;PP=437;ReadPosRankSum=0.506;SC=CCAGGCCCTTTCAAAGGAGGC;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=14;WE=48389003;WS=48388985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	48389023	rs10875716	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.018;NF=18;NR=9;PP=423;ReadPosRankSum=2.508;SC=CATTTGTCTACTCGTGTATAC;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=27;WE=48389031;WS=48389013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr12	48389643	rs1034762	A	C	6248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=120;PP=2965;SC=GGCAAAAAGAATTGCAGATAC;SOR=1.144;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=78;TCR=121;TR=198;WE=48389651;WS=48389633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr12	48390585	rs2213163	T	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.901;SC=TGGGAATGGATTATTAGATGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=48390593;WS=48390575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	48391416	rs3737548	G	T	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=979;ReadPosRankSum=0.114;SC=GACCAGGGGGGCCGGGAGGAC;SOR=0.746;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=67;WE=48391424;WS=48391406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr12	48391657	rs34392760	T	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=523;ReadPosRankSum=-1.393;SC=TACTCACTTTTTCACCTTTGT;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=31;WE=48391665;WS=48391647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr12	48392433	rs1793958	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=415;ReadPosRankSum=0.102;SC=GGTGACCCAGACTTTGTTATT;SOR=0.144;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=24;WE=48392441;WS=48392423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr12	48398002	rs3803184	G	C	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=38;PP=1359;SC=AGGCAGGCAGGGGCGGGGGAA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=48398010;WS=48397992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	48398080	rs3803183	T	A	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=33;PP=916;SC=AGCACCAGCGTCTGGGGAGCC;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=48398088;WS=48398070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	48465559	rs138171426	TC	T	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.724;NF=1;NR=18;PP=707;ReadPosRankSum=0.601;SC=AGTTATACTTTCTAGATATCT;SOR=0.749;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=19;WE=48465567;WS=48465549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr12	48468652	rs4258439	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=0.588;SC=GCATGTAAACAGAATCCTAGC;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=48468660;WS=48468642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	48477422	rs886588	A	G	3302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=65;PP=2074;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TGGGGCTCAAAAGACTTCGAC;SOR=0.650;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=127;WE=48477430;WS=48477412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,150:0.54:277
chr12	48499131	rs2408955	G	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=361;ReadPosRankSum=0.739;SC=ACGAGGCATAGATCCAGAGAT;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=25;WE=48499139;WS=48499121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr12	48499931	rs4760619	A	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=458;ReadPosRankSum=0.025;SC=GTGGCTGAAGAGGAGGGGGCT;SOR=0.857;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=38;WE=48499939;WS=48499921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr12	48502100	rs725454	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CAAGGGGGAAAGTCTGTGTGT;SOR=1.402;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=13;WE=48502108;WS=48502090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr12	48512285	rs4760682	C	A	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=45;PP=2098;SC=GGTAGAGATACAAGTAAGCAA;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=100;WE=48512293;WS=48512275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr12	48512331	rs11168414	C	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=920;ReadPosRankSum=0.098;SC=AGAGGAGACCCGACTGTGGAG;SOR=0.508;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=61;WE=48512339;WS=48512321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr12	48512521	rs11168415	A	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GGCCTCACAGACACGCCCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=48512529;WS=48512511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	48516464	rs2269935	G	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GACTGAGGTGGCTCTAGCCAG;SOR=1.214;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=48516472;WS=48516454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr12	48525861	rs10875747	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=753;ReadPosRankSum=0.858;SC=TGAAGGCTCTACCTAGGTGCT;SOR=0.917;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=49;WE=48525869;WS=48525851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
chr12	48526712	rs2228500	G	A	2681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=38;PP=2962;ReadPosRankSum=0.729;SC=GGACGACTCCGAGCTGCCTAC;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=108;TCR=68;TR=99;WE=48526727;WS=48526702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,119:0.57:208
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chr12	48527059	rs2269933	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=246;ReadPosRankSum=0.783;SC=CATGCCAGGTGCCTCACCCAG;SOR=0.240;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=18;WE=48527067;WS=48527049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr12	48534814	rs34700912	A	AG	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=319;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CAGTAGGAACAGCAGGAATTA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=48534822;WS=48534804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr12	48537624	rs4075913	A	G	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=113;PP=2965;SC=TTGTTCCTAAATGAAGAAGAA;SOR=1.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=196;WE=48537632;WS=48537614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr12	48538979	rs11168427	A	G	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=1242;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTGACTGCCCATCCCTCATTG;SOR=0.751;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=87;WE=48538987;WS=48538969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,108:0.51:211
chr12	48539482	rs8716	T	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=400;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CCGGGGAAGCTGCCGTCTAAA;SOR=0.131;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=24;WE=48539490;WS=48539472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr12	48543237	rs75959434	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1181;ReadPosRankSum=1.515;SC=TCCCAGGCTACGGCGCACGGC;SOR=0.790;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=75;WE=48543245;WS=48543227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr12	48543978	rs61918826	T	C	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=591;ReadPosRankSum=1.771;SC=GGAAAAGAACTGTCCTCAAAC;SOR=0.356;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=48;WE=48543986;WS=48543968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr12	48545553	rs10783230	G	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=588;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ATCTTAACACGGTTTTTCCTT;SOR=0.458;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=37;WE=48545561;WS=48545543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr12	48545630	rs10875750	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=1.550;SC=TTTGCTGGTGCTTCTATTCAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=48545638;WS=48545620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	48547128	rs11168428	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=422;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CAAGGACTCTCCTGTCAATAC;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=24;WE=48547136;WS=48547118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	48578325	rs10783231	A	C	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	48578631	rs7486941	G	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=160;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ACTCCCTCGAGGAAGGATTTG;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=12;WE=48578639;WS=48578621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	48596241	rs11168459	A	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=371;ReadPosRankSum=0.219;SC=ATGATGGTGTACAGGAGGGAG;SOR=0.620;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=27;WE=48596249;WS=48596231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr12	48597053	rs17122812	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=440;ReadPosRankSum=-1.518;SC=AAATTCCGTCACTATGCTGCC;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=28;WE=48597061;WS=48597043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr12	48723324	rs2732441	C	G	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=75;PP=1863;ReadPosRankSum=0.220;SC=GAAGGAGCTCCGAAACGCCGG;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=236;TCF=95;TCR=141;TR=124;WE=48723332;WS=48723314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,145:0.51:285
chr12	48723595	rs1471997	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=356;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GTGTGGAGACGGAACGCGAGG;SOR=1.220;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=22;WE=48723603;WS=48723585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr12	48736985	rs2732481	T	G	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1354;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TGGGGCACGCTGCCGTTTCCT;SOR=0.739;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=194;TCF=97;TCR=97;TR=90;WE=48736993;WS=48736975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,101:0.45:223
chr12	48737245	rs2732484	A	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=768;ReadPosRankSum=-0.087;SC=CAAGGTGGGAACCCCATACAA;SOR=0.924;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=42;WE=48737253;WS=48737235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr12	48738236	rs2634676	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=-1.272;SC=ACATCATTCTATTACACTCCC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=48738244;WS=48738226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr12	48738555	rs34591795	GA	G	769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=466;SC=CTATATTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=48738563;WS=48738545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	48740855	rs2634675	A	G	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=201;SC=CCTTTCTTGTAGGTCCATTTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=48740863;WS=48740845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	48740879	rs10875799	C	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=0.355;SC=TTCCAAGGGTCTTATGACCCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=48740887;WS=48740869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	48741219	rs901962	A	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=564;SC=AAGGGTCACAACTTCTGTATC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=48741227;WS=48741209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	48877056	rs7972785	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=517;ReadPosRankSum=0.467;SC=AGCTCCAGAGTCCTTGGTTTC;SOR=0.667;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=30;WE=48877064;WS=48877046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr12	48879951	rs11168599	T	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=543;ReadPosRankSum=0.435;SC=ATATCATTCTTTCTTTGCAGC;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=40;WE=48879959;WS=48879941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr12	48880381	rs2731091	A	G	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TCCAAGAAACATCTTGTCTTC;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=100;WE=48880389;WS=48880371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,113:0.48:234
chr12	48880550	rs2731092	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=432;ReadPosRankSum=-2.248;SC=TGGCATGAGGTGGGAGGTGGG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=35;WE=48880558;WS=48880540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr12	48883012	rs2705127	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr12	48883020	rs2731096	G	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr12	48884535	rs2731102	G	C	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=47;PP=1470;ReadPosRankSum=0.574;SC=AGCTAATACAGTGCAGGTCTG;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=103;TCR=99;TR=94;WE=48884543;WS=48884525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr12	48884756	rs2731103	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=0.686;SC=CAAAGTCTCACCCTAGGATCT;SOR=0.144;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=48884764;WS=48884746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	48888594	rs11458	C	T	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=63;PP=1979;ReadPosRankSum=1.015;SC=CATAAGGCCTCCAGATTCCTT;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=122;WE=48888602;WS=48888584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,142:0.55:258
chr12	48888689	rs9268	C	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=1210;ReadPosRankSum=-1.292;SC=AGACACAGCTCTTCAGTCAAT;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=73;WE=48888697;WS=48888679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,87:0.46:191
chr12	48888763	rs2705132	A	G	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=46;PP=1322;SC=CTTCCGCCAGATGCTTTACCC;SOR=1.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=48888771;WS=48888753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	48919556	rs2731073	A	G	6642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=99;PP=2965;SC=GCTGCTGCTCATGATCAGGGC;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=109;TCR=99;TR=208;WE=48919564;WS=48919546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	48919659	rs4075258	TG	CA	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.040;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=2757;ReadPosRankSum=-1.241;SC=CCCAAGATGCTGGAGAACCTC;SOR=0.539;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=62;WE=48919668;WS=48919649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,78:0.51:154
chr12	48919793	rs2705143	T	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.766;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TGCTGCCATCTGCCGCCCACT;SOR=0.719;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=46;WE=48919804;WS=48919783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,51:0.43:118
chr12	48919796	rs12425460	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.994;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=2311;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGCCATCTGCCGCCCACTACT;SOR=0.748;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=59;WE=48919804;WS=48919783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,70:0.57:122
chr12	48921533	rs7299323	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.150;SC=TTTACAATTGCCTAACTTACT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=48921541;WS=48921528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	48953504	rs11168637	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=1.219;SC=AAGGACTGACGCAGCCTGACA;SOR=1.426;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=9;WE=48953512;WS=48953500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr12	48954040	rs1807757	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=585;ReadPosRankSum=-0.462;SC=GTTTCAGGCCATGTGTCATCC;SOR=0.904;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=39;WE=48954048;WS=48954030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr12	48954225	rs7312017	G	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1263;ReadPosRankSum=0.642;SC=TGCTCTTATTGACCTGTTCTG;SOR=0.938;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=74;WE=48954233;WS=48954215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,85:0.42:201
chr12	49048738	rs3741628	G	T	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=962;ReadPosRankSum=0.064;SC=ATATCCACTGGGTCTTCAGCA;SOR=0.483;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=55;WE=49048746;WS=49048728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr12	49048985	rs6580690	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=0.342;SC=TTTTACAAGAGCGTCCAACAA;SOR=0.197;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=49048993;WS=49048975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr12	49054491	rs3741629	G	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.150;SC=AACTCAAGGTGTGGACTATAT;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=49054499;WS=49054481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	49073358	rs3741630	A	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=1.094;SC=TGCCAAATAGATCAAGGCATT;SOR=0.425;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=49073366;WS=49073348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	49075811	rs2277365	T	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=809;ReadPosRankSum=0.144;SC=CATTTTGTCCTACGGCTCCAG;SOR=0.275;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=49;WE=49075819;WS=49075801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr12	49076036	rs10783277	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=0.871;SC=CCAGCGGCTCTCAGATCGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=49076044;WS=49076026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	49086963	rs3741632	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=858;ReadPosRankSum=0.828;SC=CAAATGCAGTGGGCTGAGTGG;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=50;WE=49086971;WS=49086953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr12	49091972	.	G	GA	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=61.19;NF=2;NR=1;PP=54;QD=19.6666666667;SC=GCTTGCTAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=49091980;WS=49091962;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr12	49093729	rs7308699	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GGTTTCCACACTAAAATATTA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=49093737;WS=49093719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr12	49162867	rs145562725	A	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=443;ReadPosRankSum=1.692;SC=GAACAGCAAGAGACTAGTGGA;SOR=0.786;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=44;WE=49162875;WS=49162857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,51:0.36:140
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chr12	49218171	rs2070615	A	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=656;ReadPosRankSum=-1.222;SC=GAGTTGGGCCATGAGTCAGTA;SOR=0.895;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=46;WE=49218179;WS=49218161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr12	49218546	rs2446995	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=902;ReadPosRankSum=0.452;SC=CCCATTTTGGGTAGGTGGGTA;SOR=0.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=60;WE=49218554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr12	49218810	rs11379348	G	GT	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=930;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TGGGGACAGTGTTCTAGGCAG;SOR=0.553;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=23;WE=49218818;WS=49218800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr12	49219569	rs2453469	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=651;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AGTCCCCACCACCTGCTTCTG;SOR=0.624;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=35;WE=49219577;WS=49219559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr12	49221328	rs142474395	G	A	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=795;ReadPosRankSum=1.263;SC=ACAAGGTGAGGTCTGTACTGC;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=52;WE=49221336;WS=49221318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr12	49221622	rs1045340	G	A	7456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=132;PP=2965;SC=AGGACTCAGAGCACAACCACA;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=92;TCR=132;TR=224;WE=49221630;WS=49221612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr12	49230035	rs1057908	T	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=21;PP=1187;SC=CCTGACGCTGTATAGGTGTTG;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=53;WE=49230043;WS=49230025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	49255798	rs1565933	G	C	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=670;ReadPosRankSum=1.327;SC=TTACCTTCTTGAGTGCGCTGT;SOR=0.778;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=43;WE=49255806;WS=49255788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr12	49259194	rs2453489	T	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=5;PP=320;SC=ATCTGATGGGTCCTCTGGGTG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=49259202;WS=49259184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	49298059	rs3809147	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=0.114;SC=TTTCTTCTAAGCTCTGTAACG;SOR=1.078;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=15;WE=49298067;WS=49298049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	49308284	rs10747556	A	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=769;ReadPosRankSum=1.523;SC=CTGCAGAGGCACCGGCTCAGT;SOR=1.160;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=52;WE=49308292;WS=49308274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
chr12	49310724	rs10875891	GA	AG	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GTATCCCTCAGAGCAGGGACA;SOR=0.391;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=37;WE=49310733;WS=49310714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr12	49312593	rs10875893	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=0.242;SC=AGGCCCAAAGAACTCAGGCCC;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=29;WE=49312601;WS=49312583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr12	49314862	rs10875894	C	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=313;ReadPosRankSum=1.248;SC=AGGAGCTCACCAAGGTAAAGC;SOR=1.480;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=19;WE=49314870;WS=49314852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	49314994	rs4760600	A	G	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=892;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TGGAAAAGGTACAACAAAGTG;SOR=0.457;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=49;WE=49315002;WS=49314984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr12	49318546	rs2293449	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCAGCCTAGCGTTCCCCTTAC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=49318554;WS=49318536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	49319036	rs12829682	A	C	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.662;SC=ATTACCACCCAACAAGGCTCG;SOR=0.710;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=231;TCF=109;TCR=122;TR=95;WE=49319044;WS=49319026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,109:0.40:272
chr12	49325142	rs11168794	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AGTAGGAGAAGGTGGTAGTAG;SOR=0.184;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=49325150;WS=49325132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	49332366	rs4760666	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=422;ReadPosRankSum=1.231;SC=CTTGTGGGGACAGGGAAAGGA;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=30;WE=49332374;WS=49332356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr12	49333896	rs5798094	G	GA	1666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=869;ReadPosRankSum=0.538;SC=GAACCCTTTGGAAAAAAAACA;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=95;TCF=16;TCR=79;TR=46;WE=49333904;WS=49333886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
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chr12	49334762	rs12122	G	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.066;NF=23;NR=13;PP=540;ReadPosRankSum=1.640;SC=CGATCTCCCCGAGTTTCAGCT;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=36;WE=49334770;WS=49334752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
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chr12	49359989	rs1051886	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=44;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GGAGCACGTTGTGCCCACGGC;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=178;TCF=71;TCR=107;TR=75;WE=49359997;WS=49359979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,78:0.41:189
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chr12	49427919	rs61942218	T	C	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=57;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CATCAGCTTCTGGGAACTCAC;SOR=0.588;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=195;TCF=71;TCR=124;TR=93;WE=49427927;WS=49427909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,106:0.47:225
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chr12	49484933	rs117527954	G	A	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=59;PP=2046;ReadPosRankSum=1.093;SC=ACACGTGGACGTGGTTGCGGG;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=115;TCR=102;TR=123;WE=49484941;WS=49484923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,145:0.56:261
chr12	49494304	rs138195319	C	T	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1070;ReadPosRankSum=1.161;SC=CCCATCCACACCCCCCGGGAG;SOR=0.901;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=68;WE=49494312;WS=49494294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,79:0.52:153
chr12	49494862	rs35472356	C	CA	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GCCCTCCTTTCAAATTAAGTC;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=5;WE=49494870;WS=49494852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr12	49497643	rs2047101	T	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=728;ReadPosRankSum=1.139;SC=CAGGGCAGTGTGGGAACATTG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=42;WE=49497651;WS=49497633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr12	49498130	rs10783302	G	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=444;ReadPosRankSum=-1.803;SC=TCAAACTTCCGTTAACTAAAC;SOR=0.479;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=32;WE=49498138;WS=49498120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr12	49500398	rs10783304	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=458;ReadPosRankSum=-1.024;SC=ATGACACAGAGCCTGTGCCCG;SOR=1.038;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=30;WE=49500406;WS=49500388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr12	49500509	rs10747561	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1016;ReadPosRankSum=-1.159;SC=GACATTGTTACGCCCATTTTG;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=69;TCR=82;TR=72;WE=49500517;WS=49500499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,77:0.45:170
chr12	49521672	rs2753	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=791;ReadPosRankSum=-1.042;SC=AAGCTTTAACGTCTGTCAGTT;SOR=0.599;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=47;WE=49521680;WS=49521662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr12	49522578	rs1057725	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.403;NF=11;NR=3;PP=228;ReadPosRankSum=-1.158;SC=CCTGGGGTGCTGGGTAAATGG;SOR=1.927;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=14;WE=49522586;WS=49522568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	49522605	rs1057548	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.281;NF=14;NR=12;PP=350;ReadPosRankSum=0.387;SC=CCAGCTTGGACTTCTTGCCAT;SOR=0.328;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=26;WE=49522613;WS=49522595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr12	49522786	rs1865157	C	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ATTTCTATTTCAACTTTTTAG;SOR=1.207;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=13;WE=49522794;WS=49522776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	49523485	rs147263503	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.068;NF=24;NR=25;PP=812;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CCTGGCCAACGTGGATGGAGA;SOR=0.428;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=49;WE=49523493;WS=49523475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr12	49523523	rs34070757	GAT	G	1931.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=1434;ReadPosRankSum=2.235;SC=AAGGAAAAAAGATATCACAAT;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=33;WE=49523532;WS=49523513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr12	49525008	rs2241727	G	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=595;ReadPosRankSum=-0.007;SC=GCTGTATACAGGGCCCCAGCG;SOR=0.358;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=44;WE=49525016;WS=49524998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr12	49579696	rs697624	C	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.808;NF=21;NR=14;PP=535;ReadPosRankSum=0.214;SC=CCATGAGCAGCGAGGTGAACC;SOR=0.405;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=35;WE=49579704;WS=49579686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr12	49580180	rs1056875	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-3.456;NF=15;NR=12;PP=294;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CAGCATCTTCTTTGCCTGTGA;SOR=0.666;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=27;WE=49580188;WS=49580170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr12	49580752	rs34741313	AC	A	91.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=161;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CCAGCACGATACAAAGATTAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=49580760;WS=49580742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	49582692	rs1039225	T	G	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1293;ReadPosRankSum=0.725;SC=AGCTTAAAGGTTTTCCAAGTA;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=68;WE=49582700;WS=49582682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr12	49667103	rs9668136	A	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=724;SC=ATAAAATTGAAGTTTCCATTT;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=49667111;WS=49667093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	49933229	rs148933979	G	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=577;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TCCTGGCGCCGCAGAACACCT;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=42;WE=49933237;WS=49933219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,66:0.45:147
chr12	50035694	rs138798728	C	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=710;ReadPosRankSum=-1.398;SC=CCCACAGGACCGGGGCTTCTG;SOR=0.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=39;WE=50035702;WS=50035684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,43:0.80:54
chr12	50055893	rs74719879	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.518;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=215;ReadPosRankSum=-0.941;SC=GATGAGGGGGGTGACATGCCT;SOR=1.465;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=14;WE=50055901;WS=50055883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr12	50151977	rs2720305	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=921;ReadPosRankSum=0.316;SC=AGAATTGATCGTAATACTGTG;SOR=0.328;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=56;WE=50151985;WS=50151967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr12	50152593	rs199503942	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	50188391	rs12314502	C	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.07;MQRankSum=0.385;NF=7;NR=0;PP=425;ReadPosRankSum=1.111;SC=GTCACTGACCCCCCCACCAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=50188403;WS=50188381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	50188395	rs60633549	CA	C	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.98;MQRankSum=0.473;NF=7;NR=0;PP=439;ReadPosRankSum=1.111;SC=CTGACCCCCCCACCAGCTGCT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=50188403;WS=50188381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	50188434	rs2603105	T	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.51;MQRankSum=1.049;NF=8;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTTTGACCTCTGGGAAGCCCC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=50188442;WS=50188424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	50189807	rs2720298	C	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=931;ReadPosRankSum=0.983;SC=CATAGGGGTACGATTCTGGGA;SOR=1.010;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=55;WE=50189815;WS=50189797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr12	50189834	rs2603104	T	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=862;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GACTGGGGGGTACTCCAGGGC;SOR=0.675;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=50;WE=50189842;WS=50189824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr12	50192009	rs1075366	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=-0.552;SC=ATCTGCTTTTTTTGGCATTCG;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=19;WE=50192017;WS=50191999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr12	50197880	rs7953534	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=0.569;SC=CAGGGAATGAGGAGGAAGTGA;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=15;WE=50197888;WS=50197870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr12	50271372	rs1248263	G	T	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=443;SC=TGTGAGGAAGGTAGGGCATAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=50271380;WS=50271362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	50281049	rs612674	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=0.103;SC=CCTAGCCCTACCCGCAGGTGC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=50281057;WS=50281039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	50283465	rs643971	G	A	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=630;SC=CCTGGCCCCAGTCTGGTGCCC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=50283473;WS=50283455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	50290728	rs297935	A	G	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=501;SC=CTACGGGCTCAGATTAGGTCA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=50290736;WS=50290718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	50291735	rs297937	G	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=380;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CCCCACTGAGGCTCCCAGTCC;SOR=1.422;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=20;WE=50291743;WS=50291725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	50297670	rs706795	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCGTGGGTTCTAGCAACATCC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=50297678;WS=50297660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr12	50304588	rs487165	A	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=761;ReadPosRankSum=-0.334;SC=AGGCATCGGCATTCTGAGTCG;SOR=0.676;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=48;WE=50304596;WS=50304578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,64:0.38:170
chr12	50304949	rs450798	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=172;ReadPosRankSum=0.418;SC=TTTCCCCAGGGTCTCACGGGT;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=16;WE=50304957;WS=50304939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr12	50345079	rs3782319	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=-1.193;SC=GAGAGAGATGGAGACAGAGGC;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=11;WE=50345087;WS=50345069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr12	50348078	rs426496	T	C	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=43;PP=2625;SC=TAGGCTTCTCTGTGGCCCTGG;SOR=1.530;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=130;WE=50348086;WS=50348068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	50348359	rs12372344	T	C	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=1103;ReadPosRankSum=0.544;SC=GGACAAGGACTTCCTGCCCTG;SOR=1.009;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=58;WE=50348367;WS=50348349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,65:0.58:113
chr12	50348674	rs402813	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=273;SC=TCAGTTTCCACGTCTGTGAAT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=50348682;WS=50348664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	50349090	rs410837	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=413;SC=CGGGGAGGAGAGGTGCGGCCG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=50349098;WS=50349080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	50349123	rs371777	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=0.426;SC=CCGGGGCCTGCGGGCTCCGCG;SOR=1.241;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=11;WE=50349131;WS=50349113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr12	50349143	rs403201	C	G	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=19;PP=953;SC=GTGCCGGTGCCGGCGCGGGTG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=50349151;WS=50349133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	50349411	rs457487	C	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=493;SC=GCGGCCTCTACGGCCCCGACG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=50349419;WS=50349401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	50349765	rs467323	C	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=802;SC=TTGGGGGTTCCGGGAATGATG;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=50349773;WS=50349755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	50356174	rs139560378	TGGG	T	573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=263;SC=GTGAGTGCCCTGGGGGGGGGG;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=50356184;WS=50356164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	50358073	rs296753	C	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=45;PP=1528;SC=GGGTGGGCCACGGAGTGGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=50358081;WS=50358063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	50358888	rs41308104	G	A	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1058;ReadPosRankSum=0.827;SC=TCAAAGGCACGTATGAGCCTG;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=74;WE=50358896;WS=50358878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr12	50368013	rs296748	C	T	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=17;PP=913;SC=TGTCACCCCCCTCCAGCTGAG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=36;WE=50368021;WS=50368003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	50386015	rs296737	C	T	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=83;PP=2842;SC=CACACACACACGCACCTGCCT;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=63;TCR=83;TR=146;WE=50386023;WS=50386005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	50393372	rs378943	G	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=408;SC=TTTTACACAGGCCAGTTTAGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=50393380;WS=50393362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	50452708	rs653576	C	G	5641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=85;PP=2965;SC=TCCTGGGCTCCCTGGCTGTGC;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=165;WE=50452716;WS=50452698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr12	50467506	.	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=5.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr12	50467644	rs706792	G	T	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=37;PP=2206;SC=GGTGCTGTGGGCGGTGGCCTT;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=50467652;WS=50467634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	50467769	rs706793	G	A	8807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=155;NR=124;PP=2965;SC=TGGCCTTCCCGGCAGTCACCC;SOR=0.906;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=279;TCF=155;TCR=124;TR=279;WE=50467777;WS=50467759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr12	50473660	rs404751	A	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=705;SC=CACTCAACTGAGACCTCTCAC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=50473668;WS=50473650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	50482211	rs646782	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=45;PP=1585;SC=TGAGTTTTTTTCCATTGTTGT;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=50482219;WS=50482201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	50498119	rs80155721	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=627;SC=GCTTGAGTTTGGGGGTGGGAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=50498127;WS=50498109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	50498139	rs836178	T	G	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=801;SC=AGATGAGAAGTGGGGCTCCCT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=50498147;WS=50498129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	50503082	rs836179	A	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=364;SC=AGAAACTCACAGCCATCCTTC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=18;WE=50503090;WS=50503072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	50503269	rs836180	C	T	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=59;PP=1930;SC=GTGAATTCATCCACTGCCTGC;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=50503277;WS=50503259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	50537860	rs201562974	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=384;ReadPosRankSum=-0.574;SC=AGAAAACCCACGGGCCAATTC;SOR=0.339;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=30;WE=50537868;WS=50537850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr12	50744094	rs7296277	G	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=815;SC=AAAACTAGACGTAAATAATTA;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=50744102;WS=50744084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	50744119	rs7296291	G	A	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=16;PP=1231;SC=TACCTGGCATGCTGGATCAGC;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=50744127;WS=50744109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	50744171	rs7312252	T	C	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=31;PP=1707;SC=CCAACTGAACTGTGTCCATAT;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=82;WE=50744179;WS=50744161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	50744753	rs10506292	T	C	4772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=94;PP=2965;SC=TTGCCAATCTTTTCTTAGCAA;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=54;TCR=94;TR=148;WE=50744761;WS=50744743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	50746348	rs7304951	A	G	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=86;PP=2965;SC=TGAGGGGTGAAAGGGATCCCC;SOR=0.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=164;WE=50746356;WS=50746338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	50746917	rs10876023	A	G	5448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=82;PP=2965;SC=GGCCTGCTGAAGGGTTAGAGT;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=95;TCR=82;TR=177;WE=50746925;WS=50746907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr12	50747005	rs10876024	T	C	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=70;NR=76;PP=2965;SC=AGAGAGACCCTCAGGGCCTGG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=146;WE=50747013;WS=50746995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	50749221	rs4435082	G	C	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	50749227	rs4625558	T	G	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	50750040	rs7964439	C	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=311;SC=TACTGAAGAACAAAACATAAA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=50750048;WS=50750030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	50754563	rs12303082	T	G	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=41;NR=15;PP=1169;SC=TGTTTCTTCTTTTCGTCGAGG;SOR=2.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=50754571;WS=50754553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	50821551	rs146142861	G	T	95.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.03;NF=3;NR=1;PP=63;SC=TTAGCAGGTAGCATCTAAAGG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=50821559;WS=50821541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	50829263	rs113327207	T	TTATTC	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=565;SC=ACTATTTTGTTTTTTCAGAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=50829271;WS=50829261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	50856259	.	C	CA	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=58.22;NF=5;NR=7;PP=157;QD=13.4166666667;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=12;WE=50856267;WS=50856249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:28,12:0.30:40
chr12	51034721	rs2731436	C	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=22;PP=659;SC=TAATACTTGTCTTTTTTTTCC;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=51034729;WS=51034711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	51076844	rs2731447	C	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=329;SC=ATAAATATTACATACTTAGAC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=51076852;WS=51076834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	51089572	rs2684890	G	A	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=13;PP=1618;SC=TTATTGTGGTGTATTACATAT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=73;WE=51089580;WS=51089562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	51089616	rs2684891	T	C	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=44;PP=2965;SC=AACTTCATCCTTTTTGAATTT;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=100;TCR=44;TR=144;WE=51089624;WS=51089606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	51135167	rs1975351	A	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=13;PP=1104;SC=GTATATGTCCAAGCCACATTT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=51135175;WS=51135157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	51135275	rs1866422	T	C	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=71;PP=2577;SC=ACCACCCAATTGATATTGAGA;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=150;WE=51135283;WS=51135265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	51173733	rs3809319	A	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=54;SC=TATTAAACTTAAACATGTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=51173741;WS=51173732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	51182122	rs10747592	C	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=9;PP=302;SC=TGTGCCATCACATCCGGCTAA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=51182130;WS=51182112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	51203226	rs4986837	GT	G	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=7;PP=604;SC=TAGAGTTCTGGTTTTTTTTAC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=51203234;WS=51203216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	51236802	rs10876100	T	C	6635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=103;PP=2965;SC=CTCTCACTTATACTCAGACCA;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=115;TCR=103;TR=218;WE=51236810;WS=51236792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr12	51236931	rs829121	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=41;PP=1186;SC=GGCGCATGCAGAGGGCAGTAC;SOR=3.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=51236939;WS=51236921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	51319346	rs2359005	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=762;SC=GAGGAGGACTAGTTAGTAGCA;SOR=2.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=51319354;WS=51319336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	51354625	rs67646958	G	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=324;SC=ATCACCATGTGTGGCTAATTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=51354633;WS=51354615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	51354692	rs141832341	G	GT	2482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=13;PP=1554;SC=CAAACTCCTGGTCTCACACGA;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=35;WE=51354704;WS=51354682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	51354694	rs79907213	C	T	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	51354694	.	CTC	TTT	2153	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=34;NR=13;PP=2153;QD=46.9461249971;SC=AACTCCTGGTCTCACACGATG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=47;WE=51354704;WS=51354682;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,47:0.90:52
chr12	51354696	rs79534240	C	T	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.15;SOR=2.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	51354803	rs12306808	C	T	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=68;PP=2653;SC=AGCTAAAGTACAGAAGAGATC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=66;TCR=68;TR=134;WE=51354811;WS=51354793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	51382232	rs161044	T	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=40;PP=1267;SC=AAAGACAAAATATGGTCATCA;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=51382240;WS=51382222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	51386527	.	A	AAAG	960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=64.05;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	51386548	rs224568	A	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=14;PP=669;SC=AGAAGAAGTAACAAAAGGGTT;SOR=0.746;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=26;WE=51386556;WS=51386538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	51386839	rs224569	C	G	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=169;SC=TGCTGTGCTGCGCACTGTGCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=51386847;WS=51386829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	51386868	rs224570	T	C	107.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=87;SC=GGCTCAAGTCTGGACCTCATT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=51386876;WS=51386858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	51393116	rs224454	C	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=37;PP=1641;SC=CTCCCATTCCCGCTCTCCTTA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=51393124;WS=51393106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	51399050	rs224589	T	G	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=26;PP=1537;SC=GATGTGAGAGTGTATTATGTG;SOR=1.305;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=51399058;WS=51399040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	51399997	rs224590	A	G	153.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=72;SC=CAGGAGAATCACTTGAATGCG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=51400005;WS=51399987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	51400084	rs140582579	AAAAC	A	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=3;PP=142;SC=CTCCGTCTCAAAAACAAACAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=51400095;WS=51400074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	51402905	rs445520	T	G	5642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=57;PP=2965;SC=CTTACTCAAATAATCGACCGT;SOR=1.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=106;TCR=57;TR=163;WE=51402913;WS=51402895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr12	51442944	rs12379	G	A	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=92;PP=2965;SC=CCGCTTCTATGTCCTGTACAC;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=106;TCR=92;TR=198;WE=51442952;WS=51442934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	51447506	rs7971308	A	G	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=29;PP=2261;SC=TGGATTGTCTATTGTATTAAC;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=51447514;WS=51447496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	51461425	rs4768956	C	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=10;PP=621;SC=CCCTGGTGTACATATACTATC;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=51461433;WS=51461415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	51467596	rs11169696	A	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=11;PP=752;SC=ATCCCAGAACACTTAGGCACC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=34;WE=51467604;WS=51467586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	51504799	rs7978782	T	C	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=79;PP=2428;SC=TTGAACAATTTTGAGGGCCAC;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=37;TCR=79;TR=116;WE=51504807;WS=51504789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	51518787	rs3751275	C	G	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=33;PP=1952;SC=GATAACTTCTCCAGCATCAAA;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=51518795;WS=51518777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	51519106	rs17122760	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=49;PP=1476;SC=CAACATCCACATTATATAAGG;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=51519114;WS=51519096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	51585335	rs10783419	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GTGGCACCAGGCAGCTGAGCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=51585343;WS=51585325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr12	51585599	rs10735831	T	G	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr12	51585599	.	TGC	GGT	1710	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=32;PP=1710;QD=45.2171249965;SC=GAACCATCCCTGCTTATCTGG;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=39;WE=51585609;WS=51585589;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:36,39:0.52:75
chr12	51585601	rs10747606	C	T	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr12	51632507	rs7979728	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=304;ReadPosRankSum=0.181;SC=GCGGGACCGCGCGGACCCTCC;SOR=0.484;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=19;WE=51632515;WS=51632497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	51636259	rs1049467	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=841;SC=AAGGCCACCTCTGTGCCGGGA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=51636267;WS=51636249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	51663215	rs2114876	T	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.21;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	51681846	rs4611251	C	T	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=12;PP=489;SC=TTTTAATGTACAAAAAAATAG;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=51681854;WS=51681836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	51681903	rs7954976	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=16;PP=796;SC=TCCGAGGAGTTAGCTGAGATA;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=51681911;WS=51681893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	51685831	rs3210837	T	C	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=39;NR=60;PP=2446;SC=ACTTGGCCCTTTCAGTGGTAG;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=99;WE=51685839;WS=51685821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	51686204	rs7306505	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=21;NR=45;PP=965;SC=TTACGATGCATGTAATAAAAA;SOR=1.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=51686212;WS=51686194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	51686285	rs7135343	A	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=345;SC=GTGAAATGAAAAAAGGCCAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=51686293;WS=51686275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	51691149	rs3782469	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=313;ReadPosRankSum=0.761;SC=TCAGGAGATCAAGACCATCCT;SOR=1.744;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=21;WE=51691157;WS=51691139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr12	51693357	rs2288368	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=677;ReadPosRankSum=0.047;SC=GAACAGGAAGGGTTTACCAGT;SOR=0.245;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=36;WE=51693365;WS=51693347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr12	51693632	rs60046549	G	GT	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TTTTGCTTTTGTTTTTTTTGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=4;WE=51693640;WS=51693622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	51722311	rs7138439	C	T	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=1021;SC=GCAAGTCCTACTGCAGATCTA;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=51722319;WS=51722301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	51735022	rs934089	A	T	3670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=44;PP=2243;SC=AATGTAGGCAACTTACTCTTG;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=114;WE=51735030;WS=51735012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	51740388	rs907354	C	A	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=53;PP=2378;SC=AGGGTTGCGACTGGACCATAT;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=119;WE=51740396;WS=51740378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	51748326	rs2288369	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=348;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ACCTCTTAACGGTGCTACCAG;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=23;WE=51748334;WS=51748316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr12	51748395	rs7971653	G	A	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=27;PP=830;SC=GGCACAAAGAGGACACTTCCC;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=51748403;WS=51748385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	51752897	rs907347	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=777;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AAACCTCTCCGAGAACCATTT;SOR=0.919;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=49;WE=51752905;WS=51752887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,55:0.52:106
chr12	51754629	rs2241545	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GGATCTGGAGAGACAGAGGGA;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=30;WE=51754637;WS=51754619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr12	51759408	rs200923829	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=-0.509;SC=ACTTTGCTGTATACCCAATCC;SOR=0.768;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=32;WE=51759416;WS=51759398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr12	51773557	rs2278216	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GTCTGCGGAGGAGCCTCATCC;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=18;WE=51773565;WS=51773547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr12	51796904	rs907350	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=600;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GTAATAGGTATAAACTGCTCA;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=35;WE=51796912;WS=51796894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr12	51846090	rs1995691	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GGGTAGGCAAGTGTGTACCCT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=51846098;WS=51846080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	51851126	rs4512904	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=407;ReadPosRankSum=2.469;SC=GTGAGTGCCTGCTTTCCAGAC;SOR=0.804;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=23;WE=51851134;WS=51851116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr12	51852511	rs6580835	C	T	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=44;PP=1042;ReadPosRankSum=0.697;SC=TTGCTGGAATCTGGGTAAGGT;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=65;WE=51852519;WS=51852501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,75:0.56:135
chr12	51855984	rs2271149	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TCAGATCCCCGTGACAGAGAT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=51855992;WS=51855974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	51863643	rs4491281	T	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=722;SC=CCAGGTCCACTGTGGGGGAAA;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=51863651;WS=51863633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	51864979	rs2292217	T	C	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=23;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TTCCAGTGCTTGTTTAGATGA;SOR=1.000;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=142;TCF=94;TCR=48;TR=75;WE=51864987;WS=51864969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr12	51869098	rs868884	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=341;ReadPosRankSum=0.155;SC=GGAGAACTCCGGATGTCCTGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=51869106;WS=51869088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	51874054	rs4761970	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=1.193;SC=TTGGGAAAAACTGGAGCAAAT;SOR=0.725;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=16;WE=51874062;WS=51874044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr12	51879826	rs10783445	G	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=396;SC=ACCTTGTCATGTAGAAAAGCA;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=51879834;WS=51879816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	51888998	rs2102376	G	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.423;SC=TAAGTGTACAGTTGAGTGGCA;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=51889006;WS=51888988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	51890721	rs10783448	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=341;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TTTAAGTCCAGGAAGGAAATT;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=19;WE=51890729;WS=51890711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	51898014	rs3896351	A	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=668;ReadPosRankSum=-1.857;SC=AGAGCTAAATATTCAGCCTCC;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=42;WE=51898022;WS=51898004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr12	51898108	rs3858636	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CAGGTTATGGGAATCACAAGA;SOR=0.317;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=51898116;WS=51898098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	51901390	rs7305599	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=141;ReadPosRankSum=2.058;SC=GTGCATTGGAAGGCATCCAGC;SOR=0.069;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=51901398;WS=51901380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	52080965	rs4761829	C	T	8780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=114;PP=2965;SC=TTTTACGGGACCCATGGAACT;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=150;TCR=114;TR=264;WE=52080973;WS=52080955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr12	52099153	rs2291265	C	T	6282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=74;PP=2965;SC=GTTTTCAGCCCGGTTCATTTG;SOR=1.256;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=124;TCR=74;TR=198;WE=52099161;WS=52099143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr12	52100566	rs10783474	G	A	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=742;SC=ATGTGTATATGTATATTATAC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=52100574;WS=52100556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	52156255	rs303767	A	C	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=34;PP=2345;SC=TCTACTATTTATTTTTCTTAC;SOR=1.470;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=108;WE=52156263;WS=52156245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	52159438	rs56879517	G	GT	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.79;MQRankSum=0.809;QD=20.74;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr12	52163789	rs303808	G	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=442;SC=GATGAGGAGCGGATGGGCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=52163797;WS=52163779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	52173781	rs76315468	G	GTTC	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=626;SC=TGGAGCCACAGTTCTTGGGAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=52173789;WS=52173771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	52174044	.	T	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=0.839;SC=GCAGAGACTGTAAAGGGCGAG;SOR=0.653;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=15;WE=52174052;WS=52174034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr12	52184271	rs303815	T	C	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=51;PP=1913;SC=CACAGAAACCTATTCCCCGCC;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=52184279;WS=52184261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	52200028	rs303828	C	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=16;PP=1295;SC=GGGTGTCTCCCATCTCAATAA;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=52200036;WS=52200018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	52200742	rs60637	C	A	8119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=108;PP=2965;SC=TGCCCAAGCCCAATACCATTG;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=142;TCR=108;TR=250;WE=52200750;WS=52200732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr12	52204246	rs172559	T	C	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=74;PP=1901;SC=TAAGTGGCAATGCTTTGCCAA;SOR=1.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=107;WE=52204254;WS=52204232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	52215102	rs303819	T	G	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=60;PP=2221;SC=CCTTTGGGAGTCTCCCCCGAC;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=52215110;WS=52215092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	52225638	rs633370	T	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.943;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=453;ReadPosRankSum=0.295;SC=TATATATACATTTTTGAGACA;SOR=0.177;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=30;WE=52225646;WS=52225628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr12	52284233	rs706832	T	C	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=58;PP=2965;SC=CTGGCCTCCCTGATTCCACCT;SOR=1.373;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=110;TCR=58;TR=168;WE=52284241;WS=52284223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	52345497	rs10540557	TGCG	T	1861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=12;PP=884;SC=GCTGCTGGGCTGCGGCGGCGG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=19;WE=52345507;WS=52345487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	52369300	rs2242106	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.364;SC=TGAGTGCATGCCCTTGTTGGG;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=57;WE=52369308;WS=52369290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr12	52369956	rs3214829	G	GA	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=2.189;SC=CATCTAGGCAGCAAGACTAGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=52369964;WS=52369946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	52370086	rs139425993	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr12	52381026	rs2252518	C	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=0.318;SC=CCCCGGTGCGCATAGCACGGG;SOR=0.299;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=52381034;WS=52381016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	52403110	rs10876227	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=1.979;SC=TCAGCCTAGCGAGGGTAGTCA;SOR=1.668;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=15;WE=52403118;WS=52403100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr12	52404618	rs1298913	T	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=803;SC=CTATGGGACTTCTACACCTTT;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=52404626;WS=52404608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	52448157	rs2701124	G	A	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=74;PP=2965;SC=CACCGAGTCCGGGACCCCGTG;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=160;WE=52448165;WS=52448147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	52473649	rs77130816	C	G	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=29;PP=1081;SC=CCGGAGCCCCCCGAGGGGCCG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=52473657;WS=52473639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	52565322	rs3741737	G	T	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=84;PP=2965;SC=GGGAACATAAGGGGTAGGGGA;SOR=0.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=164;WE=52565330;WS=52565312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr12	52565512	.	C	G	81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=59.52;NF=0;NR=9;PP=81;QD=12.8634680608;SC=GGGTGGGGGACGGGGGGGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=9;WE=52565520;WS=52565502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr12	52574780	rs4762060	A	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=359;SC=TCAGCTGGATATGGTGGGGGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=52574788;WS=52574770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	52602013	rs1902767	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=572;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TTGGCGCCTCCGTAATCTCCC;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=40;WE=52602021;WS=52602003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr12	52627007	rs7308751	C	T	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=39;NR=13;PP=1034;SC=GGATAAAAGGCGCGGAGTGTC;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=52627015;WS=52626997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	52627215	rs7308888	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=33;PP=1125;SC=TCGGCGCCTCACGGCCGCGCG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=52627223;WS=52627205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	52631313	rs6580870	A	G	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=36;PP=2056;SC=GAAATTAACCACCGCACAGCT;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=52631321;WS=52631303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	52631394	rs10637094	C	CAT	7388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=77;PP=2957;SC=TGTCTGAAAACATGGGACAAA;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=13;TCR=81;TR=89;WE=52631402;WS=52631384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	52631510	rs10546862	ATGTG	A	200.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-0.000;QD=28.65;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	52632573	rs7300317	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1011;ReadPosRankSum=-2.544;SC=AGGACCATGGAGCTGGGTGAC;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=62;WE=52632581;WS=52632563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,89:0.47:190
chr12	52635241	rs2078201	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=475;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CTGATGTCCCGTCTGGTCCCT;SOR=0.465;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=29;WE=52635249;WS=52635240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr12	52635360	rs999665	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=695;ReadPosRankSum=-0.026;SC=AGGTCAAGGCGCAGTATGAGG;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=57;WE=52635368;WS=52635350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr12	52635443	rs2243588	T	C	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=63;PP=2119;SC=CAGGGGCGTATTTCCTCCTGC;SOR=1.315;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=98;WE=52635451;WS=52635433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	52635560	rs999666	A	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTGGTGCTCAGCCCTGGAGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=52635568;WS=52635550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	52639302	rs2608009	G	C	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=25;PP=902;SC=CTGCAGCGGGGCAAGCAGGAT;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=52639310;WS=52639292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	52645754	rs1894035	T	C	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.066;SC=TAAGAAAAAGTTTGCCTGCCC;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=105;TCR=71;TR=76;WE=52645762;WS=52645744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,83:0.40:207
chr12	52647197	rs11612499	A	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=41;PP=1395;SC=ATGATTGTGCAGGTTGTGCAG;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=52647205;WS=52647187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	52649887	rs2168762	T	C	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=60;PP=1769;SC=CTCCCACTGTTGGCTTCCATG;SOR=1.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=52649895;WS=52649877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	52649954	rs2242139	T	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=788;SC=AGGTTGCTCTTGCAGCACTCA;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=52649962;WS=52649944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	52660904	rs2857686	C	T	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=22;PP=780;SC=GACTTATGGCCTAACCTTTGT;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=52660912;WS=52660894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	52661192	rs1870222	A	G	4574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=57;PP=1890;SC=CCTTAGCGATAACCGCTGCAA;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=52661200;WS=52661182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	52661209	rs1870223	T	C	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=51;PP=1351;SC=GCAAGCTGGTTGAGCTGGAGG;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=79;WE=52661217;WS=52661199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	52661302	rs1870224	C	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=18;PP=493;SC=CTTCTTGCCACCTTCTAGATG;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=52661310;WS=52661292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	52679937	rs3660	C	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=294;SC=TTTCAAAGTGCAGGAGAAGTA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=52679945;WS=52679927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	52680008	rs3657	T	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=15;PP=836;SC=GCAGGAAAGATGCCTGGGGCC;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=52680016;WS=52679998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	52681416	rs7300801	T	C	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=26;PP=1339;SC=CCGTCAGCCTTTGGATCATGC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=52681424;WS=52681406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	52681437	rs3187034	A	G	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.50;QD=29.25;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	52681533	rs7300941	T	C	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=54;PP=1913;SC=GCTCATGAGGTTCAGGGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=106;WE=52681541;WS=52681523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	52681714	rs6580872	T	C	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=39;PP=2269;SC=TTAATAGATATCTCACATCCC;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=112;WE=52681722;WS=52681704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	52681733	rs7954186	A	C	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=54;PP=2965;SC=CCTCCCACTGACACGTCTAGC;SOR=1.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=146;WE=52681741;WS=52681723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	52681925	rs6580873	A	C	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=59;PP=1404;SC=CTGGAGAATGAGGATCTCCTG;SOR=3.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=72;WE=52681933;WS=52681915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	52681968	rs6580874	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.71;QD=33.40;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	52685190	rs75660643	C	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=-1.318;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr12	52699419	rs111906777	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=8.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-5.484;QD=0.30;ReadPosRankSum=-7.506;SOR=1.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,21:0.11:183
chr12	52699548	rs2032360	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=11.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-11.520;QD=1.58;ReadPosRankSum=-1.424;SOR=1.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,25:0.18:142
chr12	52700100	rs11612715	C	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=18;PP=492;SC=CCCAGCCCTGCCAGGGTTCTC;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=52700108;WS=52700090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	52702370	.	G	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=1.302;SC=GAGGTGCTAGGAGGCTGCCGC;SOR=1.445;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=23;WE=52702378;WS=52702360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr12	52708420	rs2857671	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=18;NR=16;PP=511;SC=GCCACTTAATGCCTCCCCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=52708428;WS=52708410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	52708565	rs2857670	A	G	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=25;PP=1100;SC=ACACGCAGAGATCCCCGCACA;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=52708573;WS=52708555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	52708730	rs113407094	A	AGGTGT	311.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=317;SC=TCTATTCTGAAGGAGGGAACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=52708738;WS=52708720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	52708978	rs3825221	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=324;SC=GACCAACCTATCCTCTTTACT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=52708986;WS=52708968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	52709032	rs3741721	T	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=29;NR=12;PP=794;SC=TCTGCATATATTCATAGTCAA;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=52709040;WS=52709022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	52709880	rs2852468	A	G	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.53;QD=42.97;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	52709883	rs2248473	T	C	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.01;QD=44.52;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	52710246	rs2270267	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=12;PP=1096;SC=GGCCGGGCTCTGGTACCTGGC;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=52710254;WS=52710236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	52710309	rs2257286	G	A	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=40;PP=2161;SC=GGTTCAGCTCGTTGATCTCCT;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=105;WE=52710317;WS=52710299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	52710715	rs2857669	G	A	7085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=45.42;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	52710721	rs2852464	G	C	7173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=43.74;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	52710897	rs2852463	TG	CA	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=36;PP=2422;SC=TCATCGGGAGTGAACTTCTCA;SOR=1.488;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=56;WE=52710906;WS=52710887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	52710913	rs2852462	A	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TCTCATGTTTAGAGAAACAAA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=52;WE=52710921;WS=52710903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr12	52711450	rs2248619	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=145;SC=CCCACCATGGTTGAGAGCCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=52711458;WS=52711440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	52711549	rs2857667	G	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=14;PP=747;SC=GGAGGTAGGCGCAGTCCACAT;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=52711557;WS=52711539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	52711624	rs2857666	C	T	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=33;PP=1605;SC=ACCTGGCTGCCATGTGGCAGG;SOR=0.908;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=52711632;WS=52711614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	52711776	rs2852459	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=33;PP=1149;SC=AGGGAGAACAGGACCTTGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=52711784;WS=52711766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	52713199	rs11290512	CA	C	1354.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=999;SC=CATCAGAGGACAAAGAGGGGT;SOR=1.552;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=52713207;WS=52713189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	52755097	rs1791627	A	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=672;SC=CACTCAGCTCAGCTTTCTCTA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=52755105;WS=52755087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	52774235	rs951773	A	G	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=50;PP=2362;SC=TGGTACTCGCACAGCTGCCGC;SOR=1.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=123;WE=52774243;WS=52774225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	52776679	rs1732297	A	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=235;SC=CACTGTCTTGATGTGAGTAGT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=52776687;WS=52776675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	52778772	rs1732303	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=312;SC=AGCACTCTAGCGCATTTTGGC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=52778780;WS=52778762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	52788928	rs2658658	G	A	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=73;PP=2446;SC=GAGGACAGGCGTGCTGACCCC;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=124;WE=52788936;WS=52788918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	52789509	rs1732264	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=563;SC=CCCCCAAGACTCCAGAGCCAG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=27;WE=52789517;WS=52789499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	52789597	rs1732265	A	G	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=44.71;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	52789605	rs1732266	T	A	3998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=43.46;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	52789691	rs34479712	A	C	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.17;NF=18;NR=37;PP=1275;SC=TTTTCAATGAATGTGGGTAGG;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=52789701;WS=52789681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	52789693	rs11304728	GT	G	2705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=1770;SC=TTCAATGAATGTGGGTAGGGG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=52789701;WS=52789681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	52790899	rs1791635	T	C	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=62;PP=2011;SC=AGTTCAGGTGTTCTCTGGTTC;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=52790907;WS=52790889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	52790940	rs2249384	C	T	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=45;PP=1262;SC=TACCTTCTTCCGCTTCTGGGC;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=56;WE=52790948;WS=52790930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	52818504	rs298104	T	G	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1179;ReadPosRankSum=0.759;SC=CTGCTGCCGCTTCCATAGCCA;SOR=0.830;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=87;WE=52818512;WS=52818494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,97:0.47:206
chr12	52818677	rs2669873	C	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=1.611;SC=TTCCAATGTCCCCTGCTTAGT;SOR=2.737;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=19;WE=52818685;WS=52818667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr12	52822258	rs401926	A	G	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=61;PP=1965;ReadPosRankSum=1.248;SC=GCAAGCTGGAACACTGTAAGG;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=233;TCF=114;TCR=119;TR=116;WE=52822266;WS=52822248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,135:0.51:267
chr12	52824352	rs395623	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=882;ReadPosRankSum=-0.212;SC=ACTCAGCCTCGGCCCGGCTGC;SOR=0.412;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=53;WE=52824360;WS=52824342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr12	52824562	rs443084	T	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=719;ReadPosRankSum=0.521;SC=TAACTACCCATCTAGGTCAGG;SOR=0.648;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=20;TCR=66;TR=46;WE=52824570;WS=52824552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr12	52825363	rs1798640	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=511;ReadPosRankSum=0.755;SC=TGATCTCCTCGGGCAGAGATT;SOR=0.982;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=32;WE=52825371;WS=52825353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr12	52827534	rs67876	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=475;ReadPosRankSum=0.522;SC=ATGGGATGGCCCTTCCAAGAG;SOR=0.957;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=26;WE=52827542;WS=52827524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr12	52827818	rs298109	T	C	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.218;SC=ACTCCAAACCTGTTGCTGGCC;SOR=0.626;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=75;TCR=89;TR=94;WE=52827826;WS=52827808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,107:0.55:196
chr12	52841765	rs388626	G	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.068;NF=21;NR=26;PP=620;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CAGCAATGGCGGCCTGTAGGT;SOR=0.557;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=47;WE=52841773;WS=52841755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,59:0.38:154
chr12	52842736	rs437014	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.819;NF=0;NR=37;PP=800;ReadPosRankSum=1.691;SC=CCTGCTGTGATCTGCAGCTCC;SOR=3.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=6;TCR=86;TR=37;WE=52842744;WS=52842726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr12	52844016	rs4024141	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.892;NF=5;NR=33;PP=868;ReadPosRankSum=0.876;SC=AAATTTGCCATTTCTTTAATC;SOR=0.362;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=38;WE=52844024;WS=52844006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
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chr12	52862767	rs2567	G	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
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chr12	52862783	rs2568	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=716;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GCAACCTGAGGAGACGGCTCT;SOR=0.668;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=14;WE=52862791;WS=52862757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr12	52863038	rs410562	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.058;NF=26;NR=31;PP=988;ReadPosRankSum=1.684;SC=TGCCGACACCGCTGGCACCGC;SOR=0.702;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=57;WE=52863046;WS=52863028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,59:0.44:134
chr12	52863213	rs412533	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.778;NF=24;NR=29;PP=661;ReadPosRankSum=-0.777;SC=ACTTGTCCAACGCCTTCGCCA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=53;WE=52863221;WS=52863203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,59:0.41:144
chr12	52863621	rs382367	T	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.980;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.103;NF=32;NR=47;PP=1459;ReadPosRankSum=0.307;SC=CATCCTTGAGTGCCATCTCCC;SOR=0.303;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=79;WE=52863629;WS=52863611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr12	52863709	rs452600	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=785;ReadPosRankSum=-0.353;SC=AACTTCTTGTCTGCTCCTCCG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=47;WE=52863717;WS=52863699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr12	52863732	rs434339	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=-1.476;SC=GGAGGCTGGCCCTTGTTTAGT;SOR=0.874;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=32;WE=52863740;WS=52863722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr12	52864240	rs415580	G	T	4940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=79;PP=2770;ReadPosRankSum=0.143;SC=ACTGCCTGATGGGTCTAGCAA;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=382;TCF=217;TCR=165;TR=182;WE=52864248;WS=52864230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,233:0.50:470
chr12	52864843	rs604303	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=797;ReadPosRankSum=1.168;SC=GATGTCCCCAGTGAAGTCTGC;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=50;WE=52864851;WS=52864833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr12	52865439	rs28499430	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.326;NF=12;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=-1.572;SC=TTTGAACCCCCGGCTTCATCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=12;WE=52865447;WS=52865429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	52865548	rs28759265	G	C	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.835;NF=60;NR=35;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.720;SC=ACACATATGAGCCAGTGGGTA;SOR=0.844;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=195;TCF=116;TCR=79;TR=95;WE=52865556;WS=52865538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,115:0.47:245
chr12	52865592	rs644414	A	T	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.213;NF=35;NR=49;PP=1241;ReadPosRankSum=0.017;SC=GGATTCAACAATTTCCTGAAT;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=84;WE=52865600;WS=52865582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,92:0.46:200
chr12	52865687	rs391567	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.276;NF=1;NR=17;PP=370;ReadPosRankSum=2.380;SC=TTCTTTAATCCCCCCATCCTC;SOR=0.384;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=18;WE=52865695;WS=52865677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	52866060	rs11608915	C	T	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=36;PP=1307;SC=CTCTAGGAACCGCACCTGGAA;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=65;WE=52866068;WS=52866050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	52867416	rs201473468	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.93;MQRankSum=-1.691;QD=3.07;ReadPosRankSum=-2.744;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	52881376	rs1053857	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.236;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	52881380	rs1053854	A	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.236;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	52881428	rs28667515	A	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=267;ReadPosRankSum=2.029;SC=CAGGAGAGGAAAGGCAACCTG;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=18;WE=52881436;WS=52881418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr12	52882410	rs144849815	T	TGAA	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=1181;SC=TATTTCCTAGTGAAGGGGCCA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=24;WE=52882418;WS=52882400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	52884283	rs298119	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.966;NF=26;NR=7;PP=609;ReadPosRankSum=0.672;SC=TGTCCCCAGTAAAGTCTGCAG;SOR=1.172;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=33;WE=52884291;WS=52884273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr12	52884557	rs298120	T	C	4823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.515;NF=83;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.364;SC=TCACTTCCGATATTTACAGAG;SOR=0.885;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=377;TCF=180;TCR=197;TR=184;WE=52884565;WS=52884547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,215:0.49:436
chr12	52885019	rs298121	C	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.641;NF=37;NR=40;PP=1054;ReadPosRankSum=1.967;SC=GAAAAGCAGCCTGGGATTCAA;SOR=0.519;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=200;TCF=88;TCR=112;TR=77;WE=52885027;WS=52885009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,81:0.35:231
chr12	52885201	rs298122	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.249;NF=19;NR=4;PP=385;ReadPosRankSum=1.661;SC=TTCATTTCCACGGACATGGGT;SOR=1.995;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=23;WE=52885209;WS=52885191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr12	52886478	rs376545	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.642;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.916;NF=24;NR=27;PP=1700;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TCTTGATCTGTTCACGCTCCT;SOR=0.906;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=51;WE=52886498;WS=52886468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr12	52886490	rs711317	A	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-8.398;NF=22;NR=27;PP=1700;ReadPosRankSum=1.119;SC=CACGCTCCTCAGCCCGCACCC;SOR=1.060;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=49;WE=52886498;WS=52886468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr12	52942001	rs34468387	G	A	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=1059;ReadPosRankSum=0.761;SC=TACTGGGTGCGGACTTCGTCA;SOR=0.814;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=79;TCR=32;TR=64;WE=52942009;WS=52941991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,73:0.58:126
chr12	52942362	rs622446	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=933;SC=TCTGATGCGGGAGATGGTTGG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=52942370;WS=52942352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	52942998	rs635206	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=245;SC=TTGAGGGGGGCTAACAGAGCA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=52943006;WS=52942988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	52946498	rs665470	C	T	5524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=58;PP=2965;SC=TTCTGGATCTCGGGGTCCAGC;SOR=1.366;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=109;TCR=58;TR=167;WE=52946506;WS=52946488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr12	52946543	rs665522	C	T	6819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=94;PP=2965;SC=CTCTCATTGACGGTAACCTGG;SOR=0.883;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=212;WE=52946551;WS=52946533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr12	52946890	rs628819	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=531;SC=GCTCAGATGCAGGAGGGAGGA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=52946898;WS=52946880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	52964718	rs597048	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=722;ReadPosRankSum=0.096;SC=AGGCTGCTAGGATCCACGGGG;SOR=0.358;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=41;WE=52964726;WS=52964708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr12	52964934	rs669865	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	52965173	rs670741	T	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=737;ReadPosRankSum=1.198;SC=GGAACTTGATTTCTTTGTCCA;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=49;WE=52965181;WS=52965163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr12	52965722	rs673363	T	C	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=4.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,66:0.61:108
chr12	52965761	rs673449	C	T	2690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=852;ReadPosRankSum=0.370;SC=TCTCTGCTGTCGTGCGCCGGT;SOR=1.042;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=57;WE=52965769;WS=52965751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr12	52965782	rs673476	T	C	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=792;ReadPosRankSum=0.897;SC=TAATCTCCACTTCATATCTGC;SOR=0.824;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=46;WE=52965790;WS=52965772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr12	52966137	rs685720	T	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=837;ReadPosRankSum=1.350;SC=CTGACCCTGGTGCATACTCCC;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=21;WE=52966152;WS=52966127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr12	52966144	rs34211466	TC	T	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.171;NF=9;NR=7;PP=841;ReadPosRankSum=0.297;SC=TGGTGCATACTCCCCCATCTC;SOR=1.040;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=16;WE=52966152;WS=52966127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr12	52966390	rs11170176	A	T	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.612;SC=GTTCAGGTCCAGCTGCTGCAG;SOR=0.477;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=66;WE=52966398;WS=52966380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,78:0.45:174
chr12	52979741	rs2292502	G	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=352;ReadPosRankSum=-1.249;SC=GAAGCCTTCTGCTCACAGAGC;SOR=1.055;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=26;WE=52979749;WS=52979731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr12	52980078	rs17116392	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-1.803;SC=CTGAGATGGATTCTCTCTGTT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=52980086;WS=52980068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	52985293	rs12824366	A	G	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=862;ReadPosRankSum=2.141;SC=TCTTTAGGGCAATCTCCTCGT;SOR=0.661;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=90;TCR=33;TR=58;WE=52985301;WS=52985283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,67:0.47:142
chr12	52986132	rs617820	T	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=396;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GCCAGAAACCTCTTGTTAAAG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=28;WE=52986140;WS=52986122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr12	52986187	rs12833456	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=673;ReadPosRankSum=0.311;SC=TACCCCTTCATAAAGGCACTT;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=45;WE=52986195;WS=52986177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr12	52992812	rs11170187	T	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=984;ReadPosRankSum=0.471;SC=GGCTCCAGGTTCTTCCTGCAG;SOR=0.530;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=52;WE=52992820;WS=52992802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,64:0.41:157
chr12	52994955	rs61747192	G	A	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=57;PP=1468;ReadPosRankSum=2.426;SC=GGATGCCCCCGGGTGGGCACA;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=99;TCR=125;TR=102;WE=52994963;WS=52994945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,131:0.47:280
chr12	53002956	rs591636	T	C	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=769;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CTCAGGGGGCTGGGCGGTGGA;SOR=0.944;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=41;WE=53002964;WS=53002946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr12	53004694	rs9739031	T	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=584;ReadPosRankSum=1.391;SC=CTCTCAATGGTTGAGCCCTCC;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=39;WE=53004702;WS=53004684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr12	53009156	.	GTGTC	G	1706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.052;NF=7;NR=23;PP=1337;ReadPosRankSum=-2.106;SC=AGCAGAGTGTGTGTCTGTGTG;SOR=0.488;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=30;WE=53009167;WS=53009146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr12	53011955	rs61736102	G	A	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=53;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CCAGCTCCACGTTCAGGGGTG;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=165;TCR=105;TR=136;WE=53011963;WS=53011945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,145:0.48:303
chr12	53043636	rs632952	G	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=237;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TGGCTGCTTAGACACAATGGG;SOR=0.752;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=14;WE=53043644;WS=53043626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr12	53044267	rs638043	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GGGGCGGGTGCCAACATTCAT;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=14;WE=53044275;WS=53044257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr12	53045777	rs11835758	G	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=619;ReadPosRankSum=0.438;SC=CGAAGCCCCCGCCACCACCAC;SOR=0.671;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=43;WE=53045785;WS=53045767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr12	53069014	rs14024	T	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=561;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGAAACAAACTTCACGCTGGA;SOR=1.245;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=37;WE=53069022;WS=53069004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr12	53069222	.	CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT	C	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=4.020;NF=2;NR=8;PP=2258;ReadPosRankSum=1.298;SC=CCATAGCTGCCACCTCCGGAG;SOR=0.789;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=10;WE=53069250;WS=53069212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr12	53070121	rs698170	T	G	6142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=65;PP=2965;SC=GGGCCAGCTTTGTGTTCATCA;SOR=1.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=151;WE=53070129;WS=53070111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	53070145	rs936958	G	A	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CCTGGTAGTCGCGCAGCAGGC;SOR=0.561;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=77;WE=53070153;WS=53070135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,90:0.49:185
chr12	53071338	rs626480	A	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=31;PP=1834;SC=AAGCAGTCAGAAAATAAAAGA;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=53071346;WS=53071328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	53071382	rs2741159	A	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=749;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TTGTGGGTTCAGGCTTAAAAA;SOR=1.097;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=42;WE=53071390;WS=53071372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr12	53071560	rs2741158	A	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=759;ReadPosRankSum=-1.458;SC=ATGAAGGCACATTCTCTCCAG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=51;WE=53071568;WS=53071550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
chr12	53073471	rs3837476	C	CA	506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=444;ReadPosRankSum=-1.365;SC=TTCAAACCTACTGTGTTTTGA;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=12;WE=53073479;WS=53073461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr12	53084872	rs643027	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=9;PP=911;ReadPosRankSum=0.563;SC=GAGAGGGGATCAGGAAGGGCG;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=91;TCR=18;TR=52;WE=53084880;WS=53084862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr12	53084928	rs11170236	T	G	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=39;PP=1668;ReadPosRankSum=0.008;SC=GCAGGCGTGATGTGTGGCAGA;SOR=0.870;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=222;TCF=135;TCR=87;TR=105;WE=53084936;WS=53084918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,110:0.45:245
chr12	53085089	rs636127	T	C	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=48;PP=1304;SC=CCTCCACTCCTGCCTCGTGCC;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=53085097;WS=53085079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	53085262	rs2684339	C	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=268;ReadPosRankSum=1.277;SC=TCAGAGGGACCGGGCAAGGCC;SOR=0.330;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=22;WE=53085270;WS=53085252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr12	53086645	rs3782489	G	A	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=1452;ReadPosRankSum=1.356;SC=TCTCCCTGCCGTGATCTGGAG;SOR=0.775;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=168;TCF=62;TCR=106;TR=90;WE=53086653;WS=53086635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,110:0.52:210
chr12	53088484	rs10783528	C	T	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.509;SC=CGCACTGCATCGATGATGCTG;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=66;WE=53088492;WS=53088474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,74:0.51:145
chr12	53089371	rs10783529	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=TCATTACCCCGACCTGGGGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=53089379;WS=53089361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	53089405	rs10783530	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=1.068;SC=GTGGAGAGGATGGCTGACTCC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=53089413;WS=53089395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	53089460	rs5798218	GACCC	G	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=1220;SC=TCCCTAGTGGGACCCTAGTGT;SOR=2.910;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=22;WE=53089471;WS=53089450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	53090068	rs588706	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=0.967;SC=CCACCCTGCCGTTGTCACAGA;SOR=0.252;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=16;WE=53090076;WS=53090058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	53090190	rs7138818	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=474;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CGCTGCCAGTCCTCTTGTTGA;SOR=0.969;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=27;WE=53090198;WS=53090180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr12	53091566	rs1567759	C	A	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1141;ReadPosRankSum=1.225;SC=CGCAGGTCACCGATGTAGTTC;SOR=0.824;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=71;WE=53091574;WS=53091556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr12	53096913	rs1625862	G	A	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.95;NF=40;NR=52;PP=2010;SC=CACCAGCCCCGGTGCTGCCAA;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=92;WE=53096921;WS=53096903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	53162773	rs1464423	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=567;ReadPosRankSum=1.420;SC=CTCCATAGCCACTGCTGCTGC;SOR=0.954;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=39;WE=53162782;WS=53162762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr12	53163467	rs10876340	A	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=1.337;SC=CATTTGCCCCACTAGGGGTCA;SOR=0.352;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=17;WE=53163475;WS=53163457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr12	53165621	rs12828901	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=411;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GGCCCAGAAGACCTCTGGGAT;SOR=0.456;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=22;WE=53165629;WS=53165617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	53165862	rs12296490	C	T	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1640;ReadPosRankSum=0.426;SC=TCCAAGGACACAGGGAGGGTT;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=105;TCR=95;TR=104;WE=53165870;WS=53165852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,129:0.53:244
chr12	53165940	rs6580904	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=4;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.607;SC=TCATACTGGGCGCGGACCTCG;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=95;WE=53165957;WS=53165930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,103:0.45:229
chr12	53165949	rs12296548	C	T	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.731;SC=GCGCGGACCTCGGCAATGATG;SOR=0.817;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=110;WE=53165957;WS=53165930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,131:0.55:239
chr12	53167313	rs7399317	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=773;SC=ACTCTCTCCATGGGGGCAGCT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=53167321;WS=53167303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	53184491	rs11170279	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=361;ReadPosRankSum=-0.069;SC=AAAGCCAATCACTTCCCTCTC;SOR=0.997;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=27;WE=53184499;WS=53184481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr12	53186088	rs3887954	G	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=378;ReadPosRankSum=0.632;SC=TACTGTGCACGAACTTCAGCA;SOR=0.746;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=29;WE=53186096;WS=53186078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr12	53186122	rs4432093	G	A	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=44;PP=1659;SC=GGTCCAGGGAGCGATTATTGT;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=53186130;WS=53186112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	53187150	rs4919750	C	T	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=56;PP=1712;SC=TCTTTACTATCTCCCTGTTAG;SOR=1.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=76;WE=53187158;WS=53187140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	53202380	rs2307028	T	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=11;PP=699;SC=CTGACTTCTATTGGGCTTGAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=53202388;WS=53202370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	53204614	rs2307027	C	T	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=25;PP=993;SC=GGGGTGGGCACGGGGAGAAAA;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=53204622;WS=53204604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	53204757	rs10783539	T	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=322;SC=ATTTAACCTATATTCATTGAA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=53204765;WS=53204747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	53207583	rs11267392	C	CCACCAAAGCCACCAGTGCCGAAACCAGCTCCGAAGCCGCCGG	4972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;QD=85.74;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	53216184	rs4415849	A	G	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=15;PP=549;SC=CAGAAAGGCCAGGAGAGCAGT;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=53216192;WS=53216174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	53217056	rs10876353	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=455;ReadPosRankSum=1.143;SC=AGCACCCTCCGGGGTCATCCC;SOR=1.532;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=21;WE=53217064;WS=53217046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	53217701	rs10876354	C	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=492;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CCTCCCCCTGCAGCCTCTGGA;SOR=0.580;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=30;WE=53217709;WS=53217691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr12	53223661	rs7970710	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	53227803	rs2638497	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=647;ReadPosRankSum=0.122;SC=AGCCCGCCCCAACAAGGCCCC;SOR=0.576;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=43;WE=53227811;WS=53227793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr12	53240008	.	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=383;ReadPosRankSum=0.601;SC=TCAAGAAGTAGAGGTACTCTC;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=25;WE=53240016;WS=53239998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr12	53242440	rs2013335	A	G	2732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=68;PP=1643;ReadPosRankSum=-0.295;SC=TGGGGTCAGCAGATTCTGGTT;SOR=0.621;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=222;TCF=85;TCR=137;TR=113;WE=53242448;WS=53242430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,131:0.50:263
chr12	53294381	rs8608	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr12	53294821	rs4351899	T	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CCCAAATGTTTACATAAATGA;SOR=1.002;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=8;WE=53294829;WS=53294811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	53295917	rs2035875	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.725;SC=AGTCTGGAGGAAAGCAAGCAG;SOR=1.238;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=13;WE=53295925;WS=53295907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr12	53298769	rs1065306	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.608;NF=12;NR=12;PP=403;ReadPosRankSum=0.975;SC=TGGACATGGTAGAGGCAGGAG;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=24;WE=53298777;WS=53298759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr12	53298835	rs2070910	T	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.680;NF=5;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=1.151;SC=AGAAGCTGCTTCTTGGTGAGG;SOR=0.634;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=16;WE=53298843;WS=53298825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr12	53343461	rs17120866	A	AC	2456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=49;PP=2078;ReadPosRankSum=2.270;SC=TTCCATAACCACCCAACCCCT;SOR=0.769;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=113;TCF=12;TCR=101;TR=57;WE=53343469;WS=53343451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,92:0.47:197
chr12	53400440	rs61927957	T	G	5970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=63;NR=126;PP=2965;SC=TTACTGCCTCTGGATGTTTGG;SOR=1.565;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=63;TCR=126;TR=189;WE=53400448;WS=53400430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	53416119	rs7975725	T	C	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=81;PP=2965;SC=CCACCTGGGGTTGAATTGGAG;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=152;WE=53416127;WS=53416109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	53416251	rs10506315	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=635;SC=AGATAACTTACGGTTTTTGTT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=53416259;WS=53416241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	53421746	rs59856997	CT	C	2950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=57;PP=1367;SC=GTAACTTTGCCTTTTTTTTTT;SOR=0.896;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=65;WE=53421755;WS=53421736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	53432088	rs7968918	T	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=1004;SC=TGTTTCTTGGTTGTTTTCTCC;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=53432096;WS=53432078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	53433089	rs1548204	C	A	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=50;PP=2885;SC=GTGGTCCAGGCGACGGAGGGA;SOR=1.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=89;TCR=50;TR=139;WE=53433097;WS=53433079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	53433486	rs8916	C	T	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=40;PP=1082;SC=ATCCAGCTTCCGTAAGTGTTG;SOR=4.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=53433494;WS=53433476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	53433709	rs1356993	C	G	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=478;SC=GTTCTCATCCCTTCTGCAAGG;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=53433717;WS=53433703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	53433788	rs1356994	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=21;PP=1247;SC=CTCCTCTCCAATGGACAATGC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=53433796;WS=53433778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	53442956	rs12369033	G	C	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=33;PP=983;SC=TGTGTTGGGAGGGGGGACCTC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=53442964;WS=53442946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	53449735	rs2364153	T	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=562;SC=TGAGAGTCCTTTGCTGTCAGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=53449743;WS=53449725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	53662624	rs6580942	C	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=501;ReadPosRankSum=0.614;SC=TTGCTGCCCGCCTTGAAGGTG;SOR=0.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=31;WE=53662632;WS=53662614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr12	53662733	.	A	G	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CTCTCTGAGTAACCCTATTTC;SOR=0.592;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=100;TCR=60;TR=81;WS=53662723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr12	53662735	rs4758965	C	T	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=0.451;SC=CTCTGAGTAACCCTATTTCTA;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=84;WE=53662743;WS=53662723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,91:0.47:195
chr12	53664308	rs146243389	GTTTGGGGTTGCTCCACTGCCCTCAAACAGC	G	870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.543;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr12	53666713	rs4759086	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=58;ReadPosRankSum=0.431;SC=GAAGGGCCTCACCAGCACCCT;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=53666721;WS=53666703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	53670545	rs1318648	C	A	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=56;PP=1998;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TGGAGCTGAGCCCCGAGGAGA;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=117;TCR=110;TR=116;WE=53670553;WS=53670535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,139:0.53:261
chr12	53671549	rs2272313	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=442;ReadPosRankSum=0.049;SC=GAGGAAGGGAAGTTCTCTCCA;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=31;WE=53671557;WS=53671539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr12	53673424	rs77269929	T	TTGG,TTGGACC	1355.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=1435;ReadPosRankSum=0.610;SC=GAGGTCAAACTACAGTCCAAG;SOR=0.171;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=15;WE=53673433;WS=53673414;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.58:50
chr12	53673425	.	A	C	1443	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=17;NR=7;PP=1443;QD=61.5738005228;SC=AGGTCAAACTACAGTCCAAGG;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=24;WE=53673433;WS=53673414;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr12	53673425	rs370889472	A	ACCC	1355.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=5.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr12	53677072	rs1609473	T	G	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=69;PP=2965;SC=AGGGCCCTCTTGGAATGGACA;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=74;TCR=69;TR=143;WE=53677080;WS=53677062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	53677089	rs4454760	G	A	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=70;PP=2965;SC=GACAGGCTATGTGAGAGGGCT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=143;WE=53677097;WS=53677079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	53681683	rs1379610	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=1.368;SC=TGCCTCCACTACGCCACCTGC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=53681691;WS=53681673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	53681883	rs1110719	A	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=12;PP=621;SC=CTGAGCCTAAAGACGGATGCC;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=53681891;WS=53681873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	53682267	rs3080422	CAA	C	3298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.360;NF=14;NR=33;PP=1884;ReadPosRankSum=0.557;SC=GAAGGAAGAACAAAGAGAATG;SOR=0.726;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=47;WE=53682276;WS=53682257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr12	53682326	rs1110720	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1021;ReadPosRankSum=0.571;SC=CCCCAGGTGGGAAGACTCCAG;SOR=0.915;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=62;WE=53682334;WS=53682316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr12	53682457	rs56358776	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=389;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CCTCGGCTCCGGCTCCCCTCA;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=25;WE=53682465;WS=53682447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr12	53682986	rs3214023	C	T	7043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=105;PP=2965;SC=TGGCCTTGTGCCTGGGCCACC;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=112;TCR=105;TR=216;WE=53682994;WS=53682976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr12	53684619	rs61754164	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGCCCTCTGCATTCAGGTTCT;SOR=0.474;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=16;WE=53684627;WS=53684609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr12	53686703	rs1056685	G	A	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=57;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CTGGCTGTGCGTGGAAACCTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=83;WE=53686711;WS=53686693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr12	53689190	rs1870240	C	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=321;SC=TGAACTCACACAACAGTCTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=53689198;WS=53689180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	53690188	rs59765323	CT	C	665.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=25.61;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	53691962	rs2694861	C	A	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=33;PP=948;SC=CACCTCTTGACCCTATCTCCA;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=53691970;WS=53691952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	53692955	rs1020745	G	A	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=20;PP=1299;SC=ACAAACTGTAGTTAGTCGGTC;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=53692963;WS=53692945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	53693277	rs56249432	TG	T	697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=679;SC=GGTGATGAGATGGGGGGTGTG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=21;WE=53693285;WS=53693267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	53693532	rs1534284	AA	GC	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=14;PP=2340;SC=ATGGGACACCAATTCCTGCGC;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=57;WE=53693541;WS=53693522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	53700848	rs1534282	C	T	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=85;PP=2637;SC=AGCGGCTTCACTGGCGGTCAC;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=133;WE=53700868;WS=53700838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	53700860	rs711316	A	G	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=74;PP=2346;SC=GGCGGTCACCACACCCGAGAG;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=38;TCR=74;TR=112;WE=53700868;WS=53700838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	53702371	rs4759287	T	C	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=36;PP=1414;SC=ACTGGTCCCCTGCCAGCTCAC;SOR=0.864;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=53702379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	53703021	rs1546808	G	A	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=46;PP=1524;SC=CACCTCCTCGGAACCAGGGAA;SOR=1.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=67;WE=53703029;WS=53703011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	53708011	rs7953255	G	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=20;PP=1022;SC=CCTTTCAGACGTCCTCACCAC;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=53708019;WS=53708001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	53709708	rs7960963	G	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=723;SC=GCACTCTACGGGCTGTCCTTT;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=53709716;WS=53709698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	53714290	rs4759232	T	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=258;SC=TAAAGGGGTGTTGACTCATTT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=53714298;WS=53714280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	53714496	rs4759231	A	G	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=25;PP=1105;SC=AAAAGTGAGGAGTGTGACGGT;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=53714517;WS=53714486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	53714509	rs7298879	T	G	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=23;PP=965;SC=GTGACGGTGATTCAGTCTCTT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=53714517;WS=53714486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	53714993	rs4759020	C	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=132;SC=GCCCTTCTAGCCTCCTGCCGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=53715001;WS=53714989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	53722098	rs7138938	A	G	5472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=69;PP=2965;SC=CTGGTTCTCCATGGGTGCGCT;SOR=1.087;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=170;WE=53722106;WS=53722088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	53722128	rs7139272	G	A	6766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=77;PP=2965;SC=TCAGGTGGTCGCTTCGGGTAA;SOR=1.212;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=128;TCR=77;TR=205;WE=53722136;WS=53722118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr12	53775742	rs3832826	CAA	C	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=0.569;SC=TCCCCAAAGACAAAGGAGTTT;SOR=1.714;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=9;WE=53775751;WS=53775732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	53777171	rs3741651	A	G	3415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=2216;ReadPosRankSum=-1.962;SC=CACAAGCCCAAACAATCACCT;SOR=0.649;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=272;TCF=136;TCR=136;TR=129;WE=53777179;WS=53777161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,155:0.47:329
chr12	53817916	rs2272002	T	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-1.103;SC=ATGGCAGGGCTCAGGTTCCAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=53817924;WS=53817906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr12	53819467	rs2071558	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.008;NF=33;NR=25;PP=971;ReadPosRankSum=1.598;SC=ACAGTGTCCCCAGCAGGTAAT;SOR=0.782;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=58;WE=53819475;WS=53819457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr12	53822670	rs3741664	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=-0.069;SC=TTCTCTCTGCGTTTCCCCAGG;SOR=0.848;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=19;WE=53822678;WS=53822660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr12	53824143	rs11170555	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TCTCTGCCAGAGTGTCTGTCT;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=7;WE=53824151;WS=53824133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	53825325	rs10876455	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=476;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CTGTCTTGTCTGCCTCATCAC;SOR=0.837;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=33;WE=53825333;WS=53825315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr12	53839770	rs113942405	T	TCTTTCCC	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.113;NF=1;NR=9;PP=601;ReadPosRankSum=0.365;SC=GATGCTATCTTCTTTCCCCTT;SOR=2.159;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=10;WE=53839778;WS=53839760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr12	53877562	rs784565	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=10;PP=447;SC=AGGGCCATAACAGATCTCAGT;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=53877570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr12	53880653	rs7958457	C	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=884;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GGGACCATTGCGTGACTTTAG;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=60;WE=53880661;WS=53880643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,71:0.58:122
chr12	53896984	rs2280448	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.831;SC=ACTCTGCCCCGAGGCCTGGCC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=17;WE=53896992;WS=53896974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr12	53946410	rs33921258	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.180;NF=21;NR=20;PP=673;ReadPosRankSum=0.437;SC=GGTGGTCCTCGTTTGTAAATC;SOR=0.741;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=41;WE=53946418;WS=53946400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr12	53946595	rs3741652	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GGTGCTAGAACGCAGGGAGAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=53946603;WS=53946585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	54059281	rs71455254	G	A	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.609;SC=TATCTAAGATGGGCTCAGGGA;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=73;WE=54059289;WS=54059271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr12	54069803	rs916134	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GCGCGTGCGCAGCGCACAGAG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=54069811;WS=54069793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	54070062	rs4020138	C	CTG	1641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.202;NF=2;NR=28;PP=1355;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGAGCGCCGACTGCAGAAATG;SOR=1.116;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=30;WE=54070070;WS=54070052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr12	54117878	rs61922775	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=630;ReadPosRankSum=-1.066;SC=GCAGTGGCGCGATCTTGGCTT;SOR=0.486;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=34;WE=54117886;WS=54117868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr12	54339052	rs4759058	C	A	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=63;PP=2097;SC=CACCCACCCGCTGCTTGCCCC;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=114;WE=54339060;WS=54339042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	54348554	rs72049639	CGGGAT	C	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=375;SC=AGTTAGAGTGCGGGATGGGAT;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=54348586;WS=54348550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	54348571	rs199806153	G	GA	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=329;SC=GGATGGTGGGGGGGGGGGATC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=54348586;WS=54348550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	54348578	rs55661050	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=311;SC=GGGGGGGGGGGATCGGTTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=54348586;WS=54348550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	54349365	rs10876524	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=474;SC=CAAACCCGACCTCTTACCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=54349373;WS=54349355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	54350471	rs141144844	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=167;ReadPosRankSum=1.567;SC=GCCCTCCCTGGATATCCTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=54350479;WS=54350461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	54367061	rs4759315	T	G	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=42;PP=2222;SC=ACTTCTGCTCTCCGTCGCGCA;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=114;WE=54367069;WS=54367051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	54385599	rs11614913	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=16;PP=596;SC=CAAGAAACTGCCTGAGTTACA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=54385607;WS=54385589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	54394497	rs2241820	C	T	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=14;PP=438;SC=AGGAGAAGGCCGACCTGGACC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=54394505;WS=54394487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	54405190	rs4142680	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=474;SC=CCCCCCCCCCCTTAGCAACTC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=54405198;WS=54405180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	54428011	rs2071449	C	A	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=414;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GACGGGGGAACGCTGCAAGCT;SOR=0.746;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=24;WE=54428019;WS=54428001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr12	54448575	rs144938914	TG	T	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.447;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGGTGAGGGTGGGGGGCGGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=54448583;WS=54448565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	54575458	rs971	T	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1066;SC=CAGCTAAAGGTAACTGTTCTA;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=54575466;WS=54575448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	54575800	rs2233921	C	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=359;SC=TTGCTCCAGTCCAGGAGATGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=54575808;WS=54575790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	54635846	rs2293602	G	T	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=165;SC=AAGAAGAAATGTAAGTAAATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=54635854;WS=54635836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	54651471	rs1140681	A	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=30;PP=873;SC=TAAGGCCACCAGGTCCCTGCA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=54651479;WS=54651461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	54677980	rs7967622	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=538;SC=TTTTATTATCCCAAATATGAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=54677988;WS=54677970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	54686097	rs117464430	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=0.158;SC=GGGTTGGGGAGTACCTTTATC;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=54686105;WS=54686090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	54687232	rs10506328	A	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=30;PP=1015;SC=TCTCTCAGGAACAAGCTGGAT;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=54687240;WS=54687222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr12	54764618	rs2706248	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=457;SC=TGGGGAAAACTCTGAAGAAGG;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=54764626;WS=54764613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	54764962	rs2244933	G	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=484;ReadPosRankSum=-1.634;SC=ACATTCCCAGGTACAATATGA;SOR=0.479;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=29;WE=54764970;WS=54764952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr12	54765005	rs3830651	TCTAA	T	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=573;ReadPosRankSum=3.020;SC=GTGGGTTCTTTCTAACTAAGC;SOR=1.855;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=54765016;WS=54764995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	54767613	rs2706258	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=0.066;SC=ATCACTGTGCCTGGCTCCAGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=54767621;WS=54767603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	54767812	rs2887875	G	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=871;ReadPosRankSum=0.350;SC=GGGGAGCTGGGTCTCCAGGTT;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=64;WE=54767820;WS=54767790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,75:0.48:156
chr12	54767981	rs3832831	C	CAG	543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=575;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GATCTCCCCACAGAGCTCCCT;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=54767989;WS=54767971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	54772755	rs2706256	C	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=10;PP=289;SC=GCAGAGGGAGCGGTAGCCAGC;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=54772763;WS=54772745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	54796593	rs12422998	C	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TTCATTTAATCTTTCCAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=54796601;WS=54796590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	54799450	rs1249378	A	G	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=54;PP=2230;SC=CCACTCACCCATCCCCATTGA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=117;WE=54799458;WS=54799440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	54805753	rs1922254	G	T	4766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=58;PP=1871;SC=CTGACCCTGTGGGGGGGAAAA;SOR=1.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=98;WE=54805773;WS=54805743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	54805765	rs1249181	C	T	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=56;PP=1766;SC=GGGGGAAAAGCGAGGCAGTTG;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=54805773;WS=54805743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	54905815	rs2458409	C	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=832;ReadPosRankSum=-1.330;SC=AGGGCTCCCTCTACATCACCC;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=49;WE=54905823;WS=54905805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr12	54910837	rs1691630	G	A	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1186;ReadPosRankSum=1.443;SC=GTGTAGCTACGTGGCACTCAC;SOR=0.503;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=77;WE=54910845;WS=54910827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
chr12	54911768	rs1795838	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=857;ReadPosRankSum=-0.124;SC=AGGATGATCCCTAGTGATTTT;SOR=0.324;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=40;WE=54911776;WS=54911758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr12	54920566	rs12369172	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=154;ReadPosRankSum=1.171;SC=TGCCTTACTTTGTGTTGGCAC;SOR=1.702;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=12;WE=54920574;WS=54920556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr12	54920591	rs12367426	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=1.137;SC=TCCTTTACACGGTAGGACCTC;SOR=0.175;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=54920599;WS=54920581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	54925072	rs35861129	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=560;ReadPosRankSum=0.042;SC=AACTCCTGGGCCCCTATGGCA;SOR=0.625;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=39;WE=54925080;WS=54925062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr12	54925750	rs10747697	A	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=380;SC=GAAGAGGGAGAGTAATTTGGC;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=54925758;WS=54925740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	54932788	rs4758966	T	C	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=68;PP=2319;SC=GGTGTGAGAATAGGGAATGGA;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=110;WE=54932796;WS=54932778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	54943620	rs79700402	C	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=352;ReadPosRankSum=1.722;SC=AGCCGAGGTGCTGTCTCCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=20;WE=54943628;WS=54943610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr12	54943775	rs117325458	T	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1006;ReadPosRankSum=2.089;SC=TCTCTGTAAGTCCCCGGCCCG;SOR=0.847;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=67;WE=54943783;WS=54943765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,70:0.46:153
chr12	54955324	rs10747699	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=240;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CTGGGGCTCCTGGGGTCAGGA;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=17;WE=54955332;WS=54955314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr12	54955461	rs9668037	A	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.015;NF=14;NR=17;PP=456;ReadPosRankSum=1.213;SC=GGAGGAGGGAAAGGACAGGTT;SOR=0.562;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=31;WE=54955469;WS=54955451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr12	54955545	rs3036634	C	CGT	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.033;NF=1;NR=9;PP=373;ReadPosRankSum=1.802;SC=ATGTTTTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=10;WE=54955553;WS=54955535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	54955647	rs1552957	G	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=81;SC=CCCCACCTTTGTAAAAATTGC;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=54955655;WS=54955637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	54969936	rs144891023	GGA	G	1186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=869;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GCAGTGGTAGGGAGGGATTTG;SOR=0.818;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=20;WE=54969945;WS=54969926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
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chr12	54970454	rs1249950	T	C	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=769;ReadPosRankSum=0.292;SC=TTCAGGAGAATAAGCAGAAAT;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=52;WE=54970462;WS=54970444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr12	54971347	rs1249951	C	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=502;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AAAGGAGGTACCTTCTCAGAA;SOR=0.182;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=27;WE=54971355;WS=54971337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr12	54975837	rs1249958	T	C	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=35;PP=1485;SC=CTCCTGGGTTTCTGTGCTCTC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=54975845;WS=54975827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	54976876	.	A	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=0.832;SC=TGGGGGGTAGAGGTACAGGGA;SOR=0.250;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=54976884;WS=54976866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	55002014	rs1795819	C	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=378;SC=TTGGATGTGGCGTCTCCCACA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=55002022;WS=55002004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	55002053	rs1795818	C	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=0.370;SC=GCACCCTCATCATTAGGGCCT;SOR=0.752;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=8;WE=55002073;WS=55002043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr12	55002065	rs1716356	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=12;PP=780;SC=TTAGGGCCTCGTGACATCATT;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=55002073;WS=55002043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	55002409	rs11170988	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ATACCTGCCCGGGGGCTTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=55002417;WS=55002399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	55004150	rs937308	C	A	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=44;PP=1453;SC=AGAGAGGTGGCGGCTAGGCTG;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=55004158;WS=55004140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	55248357	rs1048371	G	T	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=29;PP=1310;SC=CTGATCTTCAGGTCACCACCA;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=55248365;WS=55248347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	55248739	rs10783684	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=506;SC=TTGGTTTTCATGGGTTTTATC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=55248747;WS=55248737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	55250549	rs10783685	T	G	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=50;PP=2818;SC=TCCTTCTAATTTCAGCTGGTC;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=136;WE=55250557;WS=55250539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	55250612	rs1349910	A	G	6407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=103;PP=2965;SC=CAACCACTGCAACCACTGCTG;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=208;WE=55250620;WS=55250602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr12	55250714	rs10876639	G	A	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=89;PP=2965;SC=TCCTTTATGTGGCTCCTTGAT;SOR=1.454;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=47;TCR=89;TR=135;WE=55250722;WS=55250704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	55368291	rs62623446	C	T	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=604;ReadPosRankSum=-0.822;SC=ACGGCTCTGACGGAGCCAGGC;SOR=0.496;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=38;WE=55368299;WS=55368281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr12	55523414	rs11171309	A	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=0.723;SC=ACTTAAAGAAATAAGAAATGC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=55523422;WS=55523408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	55523586	rs58036029	AT	A	2595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.744;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=1700;ReadPosRankSum=0.816;SC=TCATTTGTATATTTTGCCCTG;SOR=0.424;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=52;WE=55523594;WS=55523576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,95:0.58:165
chr12	55523685	rs12303066	C	T	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1693;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CTTCAGGGTACGCCCAGAGCT;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=226;TCF=122;TCR=104;TR=106;WE=55523693;WS=55523675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,115:0.46:249
chr12	55523860	rs7305779	A	C	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TCTGTTATTGAACCCAAGGCT;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=91;TCR=94;TR=93;WE=55523868;WS=55523850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,122:0.55:220
chr12	55524172	rs7306491	G	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1211;ReadPosRankSum=1.700;SC=TGTGATTCTCGCCCACTTCAG;SOR=0.467;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=173;TCF=72;TCR=101;TR=84;WE=55524180;WS=55524162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,92:0.47:194
chr12	55524314	rs7137261	T	C	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=1080;ReadPosRankSum=0.302;SC=TAAAGATACATTCTACTGAGG;SOR=0.991;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=49;WE=55524322;WS=55524304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr12	55641031	rs7302063	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=290;ReadPosRankSum=-1.611;SC=TTCCTCTTCTGTTCTAATTTT;SOR=1.270;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=18;WE=55641039;WS=55641021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr12	55641075	rs7301705	A	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=650;ReadPosRankSum=-0.011;SC=ATCAACTATGAGAAACCATAC;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=38;WE=55641083;WS=55641065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr12	55641255	rs4522268	C	T	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1730;ReadPosRankSum=0.796;SC=TTTCTTCCTCCGAAATTTCTC;SOR=0.713;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=218;TCF=108;TCR=110;TR=101;WE=55641263;WS=55641245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,116:0.47:247
chr12	55641295	rs4388990	A	G	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1740;ReadPosRankSum=0.257;SC=ACAACTGTCTACATTCCCAAA;SOR=0.529;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=199;TCF=89;TCR=110;TR=100;WE=55641303;WS=55641285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,116:0.51:228
chr12	55641328	rs6581025	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=55;PP=1548;ReadPosRankSum=0.276;SC=ATGGCAACAGGTGATAAGACC;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=85;TCR=111;TR=96;WE=55641336;WS=55641318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,113:0.49:229
chr12	55688267	rs7308594	G	A	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=88;PP=2965;SC=TACAGCTACCGTATGTCATGG;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=171;WE=55688275;WS=55688257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	55714406	rs5798345	C	CA	1612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=1201;ReadPosRankSum=2.088;SC=ACAGAAATAACAGAGTTTATT;SOR=0.728;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=31;WE=55714414;WS=55714396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr12	55714772	rs7132431	G	A	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=73;PP=2924;SC=CCTCTGCATTGCTTGAGTATC;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=140;WE=55714780;WS=55714762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	55714876	rs7132347	C	G	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=60;PP=2422;SC=TTTAAAGCTTCATTACTGTAG;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=55714884;WS=55714866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	55715119	rs7132916	G	A	7699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=105;PP=2965;SC=CATGGTTGTTGTCTCCATCTC;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=139;TCR=105;TR=244;WE=55715127;WS=55715109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	55726450	rs7976828	A	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=387;ReadPosRankSum=0.377;SC=GAGCACTTTAAAAAAACAATT;SOR=0.966;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=21;WE=55726458;WS=55726440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr12	55758832	rs7962135	T	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1128;SC=GGTGTCATAGTTTTCTGGTTT;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=55758840;WS=55758822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	55759851	rs7489047	A	G	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.927;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=644;ReadPosRankSum=-0.129;SC=TATGTAAAAAATGTACCCCCA;SOR=0.292;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=39;WE=55759859;WS=55759841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr12	55759878	rs10876751	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=-0.334;SC=AAGCTGAATGAAAAACTCTCT;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=16;WE=55759886;WS=55759868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	55794264	rs7967395	A	G	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=5;PP=467;SC=ACGTATTGACATTCACTCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=55794272;WS=55794254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	55794976	rs7971073	A	G	5397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=97;PP=2965;SC=CATCCTTAAAACAATTCTGAA;SOR=1.173;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=61;TCR=97;TR=158;WE=55794984;WS=55794966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	55805499	rs61956295	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQRankSum=0.885;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	55805787	rs7300096	C	A	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.28;MQRankSum=0.071;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr12	55806238	rs7300594	A	G	8589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=117;PP=2965;SC=GTGGCTTCTCAGACTCCTTCA;SOR=1.084;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=288;TCF=171;TCR=117;TR=288;WE=55806246;WS=55806228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr12	55807293	rs3887805	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.96;QD=27.54;SOR=7.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	55808469	rs7132076	C	G	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=35;PP=1650;SC=TGCACTGCTTCTCGTTCATAT;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=79;WE=55808477;WS=55808459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	55819933	rs10876774	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=0.963;SC=CAATAGTATTTGAAAAAAAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=12;WE=55819941;WS=55819923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	55820121	rs6581046	C	T	5278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=82;PP=2965;SC=TTTTCTCGTTCCTATTTCTTA;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=81;TCR=82;TR=163;WE=55820129;WS=55820111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	55863224	rs60683621	C	G	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=811;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AAAAGGCTTTCTTCTTTTGCT;SOR=0.924;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=43;WE=55863232;WS=55863214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr12	55863381	rs10747756	A	G	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=40;PP=1894;SC=TTGTAGGATAAGAGAAATGTC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=55863389;WS=55863371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	55863398	rs12313730	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=632;ReadPosRankSum=-1.548;SC=TGTCACAAATGAAATGATCAA;SOR=0.888;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=37;WE=55863406;WS=55863388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr12	55886294	rs7133698	G	A	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=70;PP=2903;SC=GACCATTATCGCCCTCACCAT;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=148;WE=55886302;WS=55886284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	55886489	rs7304753	T	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=848;ReadPosRankSum=0.600;SC=GGTAACTGAATTTTTTCTTTT;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=61;WE=55886497;WS=55886479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,73:0.42:174
chr12	55887087	rs12579181	G	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=1.122;SC=ATTGCATTTCGTTTAAAAAAG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=25;WE=55887095;WS=55887077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr12	55944926	rs7313959	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=749;SC=TGTTCATTAAGATAAGCTTTA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=55944934;WS=55944916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	55945119	rs7313899	A	G	9773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=138;PP=2965;SC=CATGCTAAGTATCCTAGGAAA;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=310;TCF=172;TCR=138;TR=310;WE=55945127;WS=55945109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr12	56030938	rs10876838	C	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1349;ReadPosRankSum=0.332;SC=CTGGGCTCCCCGCATCCCCAG;SOR=0.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=80;WE=56030946;WS=56030928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,90:0.54:166
chr12	56031273	rs7970885	G	A	2938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1733;ReadPosRankSum=-1.348;SC=CGAGATCTCCGTGATGACAGC;SOR=0.806;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=252;TCF=125;TCR=127;TR=111;WE=56031281;WS=56031263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,136:0.47:290
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chr12	56075599	rs199581976	C	T	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1958;ReadPosRankSum=1.125;SC=GCCCCTGCACCTCATGGCTCT;SOR=0.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=124;TCR=96;TR=119;WE=56075607;WS=56075589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,145:0.56:258
chr12	56079084	rs3852533	C	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=64;PP=2017;SC=TATAAGGACACCAGGCCAGAC;SOR=1.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=88;WE=56079092;WS=56079074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	56080043	rs201332795	C	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=792;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CAGACAGGCCCGGTGATAGTT;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=49;WE=56080051;WS=56080033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr12	56080148	rs3782239	T	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=36;PP=1143;SC=GATGGAAAGATTGAGGAAGGA;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=56080156;WS=56080138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	56080164	rs7306191	T	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1090;SC=AAGGACAGGATCCCCTATCTC;SOR=1.355;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=56080172;WS=56080154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	56082506	.	CA	C	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=26;MQ=59.51;NF=3;NR=1;PP=54;QD=14.5;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=56082514;WS=56082496;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr12	56082785	rs3782240	C	G	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=666;SC=TCAGCTCAACCCTGCTGAGAC;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=56082793;WS=56082775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	56086993	rs144983062	C	T	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=842;ReadPosRankSum=0.964;SC=CCCTCCAGCTCAACCTGCATT;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=54;WE=56087001;WS=56086983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr12	56088206	rs7953669	T	C	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=86;PP=2965;SC=CACCTCACCCTTCCGGCCCCG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=81;TCR=86;TR=166;WE=56088214;WS=56088196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	56088773	rs2293410	C	T	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=68;PP=2035;SC=TCAGACCCCACTCCTGCTAAG;SOR=1.258;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=56088781;WS=56088763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	56089357	rs1800974	C	T	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=30;PP=1485;SC=GAAGCGGGCGCGGACCAGCTG;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=56089365;WS=56089347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	56089554	rs2293411	T	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=349;SC=CTGCTGCTTATTAGCCATGTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=56089562;WS=56089544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	56090038	rs7974721	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=495;SC=CAGCTCCTCCCCCTGGGCTAA;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=56090046;WS=56090028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	56091617	rs2293412	A	G	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=101;PP=2965;SC=CTAGAGAACCAGCTGTCAGCC;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=115;TCR=101;TR=216;WE=56091625;WS=56091607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	56093817	rs11171660	T	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=1417;ReadPosRankSum=1.788;SC=ACATCCAGAGTAGGGGCCACA;SOR=0.389;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=68;WE=56093825;WS=56093807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr12	56096816	rs2293413	T	C	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=55;PP=1723;SC=TCCCCCACTCTGTTCATGCAG;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=56096824;WS=56096806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	56105977	rs12578814	G	A	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=524;ReadPosRankSum=1.702;SC=CAGCTTGACCGCTCCGGTCTT;SOR=0.462;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=33;WE=56105985;WS=56105967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr12	56115585	rs3138142	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.897;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=698;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGGGTCCCATCGGGGTCACCC;SOR=1.087;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=47;WE=56115593;WS=56115575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr12	56115778	rs3138141	C	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=265;ReadPosRankSum=-2.379;SC=GCAGCCCACTCAACAAACGTG;SOR=0.693;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=56115793;WS=56115768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	56115785	rs3138140	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=354;ReadPosRankSum=0.524;SC=ACTCAACAAACGTGGGCCAGC;SOR=0.330;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=56115793;WS=56115768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	56117700	rs13193	C	G	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GGATACGAGTCTCCATCGTGG;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=219;TCF=104;TCR=115;TR=78;WE=56117708;WS=56117690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,99:0.36:274
chr12	56120589	rs2231464	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=545;ReadPosRankSum=-1.235;SC=CCTGAGAGTACGGAGGAGCAC;SOR=0.867;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=42;WE=56120597;WS=56120579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr12	56213297	rs56108400	G	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-1.277;SC=TGGGGGAAATGAGATATGCTG;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=56213305;WS=56213287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	56222194	rs77764447	T	G	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=66;PP=2133;ReadPosRankSum=1.270;SC=CATCTCTAGGTGGTCCTGGAC;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=126;WE=56222202;WS=56222184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,139:0.54:256
chr12	56236043	rs2291268	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=214;ReadPosRankSum=1.204;SC=ATGGTTTAGGGTCAGGAGGAG;SOR=0.188;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=14;WE=56236051;WS=56236033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	56236318	rs7310325	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=5;PP=148;SC=AGGAGGGACCTGATATGGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=56236326;WS=56236308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	56236531	rs7294345	A	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=22;PP=1183;SC=GACTTACCACAGGCGCCACCT;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=56236539;WS=56236521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	56295544	rs147424544	GAAGT	G	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=1273;SC=GCAGGAGGTGGAAGTAAGCCA;SOR=4.479;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=26;WE=56295555;WS=56295534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	56295734	rs7302270	A	G	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=67;PP=2817;SC=GCTCTTTGCTAGGCTGGCTGA;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=70;TCR=67;TR=137;WE=56295742;WS=56295724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	56298115	rs61956424	T	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.88;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	56298120	rs61956425	A	G	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	56326493	rs57799285	GCA	G	260.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=28.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	56330572	rs7297871	G	A	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=54;PP=2200;SC=GCAAGGTCTCGGCTCTCTACC;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=56330580;WS=56330562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	56335107	rs1136082	A	G	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=82;PP=2965;SC=AGCAGGGGCAAAGGTGAGGAG;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=126;WE=56335115;WS=56335097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	56348028	rs1052206	G	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=28;PP=1468;SC=GGAGGGGGCTGTTCTCACCAA;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=56348036;WS=56348018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	56364321	rs2069408	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=2;PP=328;SC=TTATCCCCCCAGTGCATTACC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=56364329;WS=56364311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	56374695	rs773109	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=50;PP=1928;SC=AATCAATTCCGATGGTGGAGA;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=90;WE=56374703;WS=56374685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	56379427	rs1873914	G	C	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=63;PP=2582;SC=CTGATTCAGTGTATTCTTTCA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=132;WE=56379435;WS=56379417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	56384687	rs705698	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=175;SC=CAGAGGACATTCATTGTCTCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=56384695;WS=56384677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	56398454	rs773115	G	C	3662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=70;PP=2174;SC=CTGTCCAGTCGGCCATCACAG;SOR=0.880;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=129;WE=56398462;WS=56398444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	56415472	.	CTGTGTGTGTG	C	607	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=57.35;NF=0;NR=4;PP=607;QD=152.5;SC=AGGATGGGGGCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=56415489;WS=56415462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,4:0.24:17
chr12	56417403	rs2658479	T	C	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=34;PP=1674;SC=AGGATATGAATGGGAAATGGT;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=91;WE=56417411;WS=56417393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	56426577	rs1619653	A	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=34;PP=990;SC=AGTATCTCCCACACTGAGGGA;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=56426585;WS=56426567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	56428344	rs2452822	G	C	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=46;PP=2748;SC=CTGAGTTCCTGTTCTCCACAG;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=124;WE=56428352;WS=56428334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	56435929	rs1131017	C	G	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1578;ReadPosRankSum=0.390;SC=ACCGTCTCCTCTCTCCGGTCC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=103;WE=56435937;WS=56435919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,121:0.55:219
chr12	56436472	rs705706	T	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=513;SC=GGCTCTGTTCTTTGGAGCCTC;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=56436480;WS=56436462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	56477694	rs2271194	A	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=416;ReadPosRankSum=0.619;SC=CAGGTTAGTGAGCCCACCCTC;SOR=0.459;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=26;WE=56477702;WS=56477684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr12	56478658	rs7971751	A	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.392;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	56488913	rs705708	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=-1.380;SC=GCCATGTCTTGGGATCAGCTC;SOR=1.259;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=12;WE=56488921;WS=56488903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr12	56493822	rs2292238	A	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.417;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1295;ReadPosRankSum=-1.585;SC=GGGTAAGACAACTTCTAATTA;SOR=0.443;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=197;TCF=110;TCR=87;TR=81;WE=56493830;WS=56493812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,95:0.40:235
chr12	56494991	rs2271189	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=797;ReadPosRankSum=-0.446;SC=CAATGTGTAGGAGCCGGAGCA;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=57;WE=56494999;WS=56494981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr12	56503864	.	C	T	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=731;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TTCTCTAGGCCGGGCGCGGTG;SOR=0.466;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=41;WE=56503872;WS=56503854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr12	56525230	rs73125289	G	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=716;ReadPosRankSum=0.362;SC=CTTTTCTGGGGAAAGGCTTTG;SOR=0.642;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=44;WE=56525238;WS=56525220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr12	56528118	rs2292237	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=443;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CCTCCTCTACATCTCCAGGCT;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=30;WE=56528126;WS=56528108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr12	56564056	rs60041436	CTTTT	C	1272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=10;PP=876;SC=GTGTCTAACACTTTTCTTTTT;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=56564067;WS=56564046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	56575742	rs773644	T	G	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=30;PP=1649;SC=GGGTAGACTGTTCCTGGCATT;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=75;WE=56575750;WS=56575732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	56601237	rs703823	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=498;SC=CCACCCAAACACATAAGACAT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=56601245;WS=56601227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	56604416	rs10532115	GAT	G	1043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GCCTGGATATGATATAACTCT;SOR=1.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=21;WE=56604428;WS=56604406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr12	56604420	rs79677444	T	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.879;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=650;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GGATATGATATAACTCTACAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=25;WE=56604428;WS=56604406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr12	56607927	rs4759218	C	T	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=43;PP=1392;SC=ACACTCATTGCCAAGATCCAT;SOR=1.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=56607935;WS=56607917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	56620255	.	C	G	94.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCACTCTCCTCAGCCTAGAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=56620263;WS=56620245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	56625045	rs1274497	T	C	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=33;PP=2429;SC=GCCCCTAAGCTATTCCCCTCA;SOR=1.501;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=104;WE=56625053;WS=56625035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	56629276	rs901073	A	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=549;SC=GGCTTGCCACAATCCATGCAA;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=56629284;WS=56629274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	56647911	rs808919	G	C	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=43;PP=1620;SC=CGCCATTGGTGGAGACTGCAG;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=96;WE=56647919;WS=56647901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	56649601	rs1274490	A	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=403;SC=CATGGTGCAGAGCACTGCGCC;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=56649609;WS=56649591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	56650742	rs1274491	C	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=272;SC=ACCCTTAACCCCCACCTTTAA;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=56650750;WS=56650732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	56711371	rs3809129	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=408;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GGGAGAGGGCCGTGGTTCTTT;SOR=0.515;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=27;WE=56711379;WS=56711361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr12	56717466	rs773665	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=23;PP=767;SC=CGTCTTCAAACTGGGATTCCT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=56717474;WS=56717456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	56722060	rs1918496	T	G	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=34;PP=1389;SC=TCAATCTCTATTATGTGATTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=56722068;WS=56722050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	56726518	rs2643626	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=494;SC=CTGGCTATCTGCAAAGCAGCT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=56726526;WS=56726508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	56814256	rs10631263	G	GGAT	905.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=875;ReadPosRankSum=1.144;SC=ATGACGATAAGGATAAGGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=19;WE=56814264;WS=56814246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr12	56814570	rs812279	T	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=554;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AGGGCTCTTCTCCTAAAAGTG;SOR=0.522;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=34;WE=56814578;WS=56814560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr12	56814653	rs2291739	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=679;ReadPosRankSum=0.415;SC=CCATAGGAGCGGGATAGAAAA;SOR=0.978;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=37;WE=56814661;WS=56814643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr12	56815922	rs774047	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=436;ReadPosRankSum=-1.312;SC=GTACAGCTCCCGAAGATGAGC;SOR=0.618;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=31;WE=56815930;WS=56815912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr12	56818982	rs12824030	G	C	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=989;SC=GCTAAAGAGGGCTTTCCCCAT;SOR=2.476;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=56818991;WS=56818972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	56818983	rs35382350	C	CT	533.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.588;NF=0;NR=18;PP=592;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTAAAGAGGGCTTTCCCCATC;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=18;WE=56818991;WS=56818972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	56821998	rs774026	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=0.682;SC=AGCTCTTTCTACATTGTGGGG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=8;WE=56822006;WS=56821988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	56822378	rs774027	T	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=754;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TCTGGAGATATGTCCATCTCA;SOR=1.218;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=39;WE=56822386;WS=56822368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr12	56822641	rs774028	G	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=171;SC=CTAGCTCACTGTATCTCCAGT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=56822649;WS=56822631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	56825311	rs774033	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=0.824;SC=GCTGGCGCAACACCTCCAGTT;SOR=0.525;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=34;WE=56825319;WS=56825301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,43:0.36:119
chr12	56825981	rs774039	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGTAACTGAAATCAAGGAAAG;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=56825989;WS=56825974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	56826061	rs774040	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=10;PP=542;SC=GCCTTCCCCAGATAATGCAGC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=56826069;WS=56826051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	56827694	rs2279665	C	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=682;ReadPosRankSum=-0.453;SC=AATAGCGGATCAGATCCTTCA;SOR=1.516;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=29;WE=56827702;WS=56827684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr12	56827753	rs34697596	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=200;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CCTTGGAAGAAGCTCCATCCA;SOR=0.531;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=11;WE=56827761;WS=56827743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
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chr12	56866334	rs2638314	T	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TCTCCTTTTTTAAAAAAATTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=56866342;WS=56866324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	56866962	rs2657878	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=1.182;SC=CGTGAGCCACCGCACCTGGCC;SOR=0.602;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=19;WE=56866970;WS=56866952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr12	56869577	rs5798384	C	CT	2129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=1708;SC=GCTTTCCTCTCTGAGGCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=37;WE=56869585;WS=56869567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	56869949	rs34325581	C	CT	399.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.294;HP=11;HapScore=1;MGOF=114;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=268;ReadPosRankSum=-0.920;SC=CTTTCTCTTTCTTTTTTTTGA;SOR=4.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=17;WE=56869957;WS=56869939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr12	56869971	rs79174190	TTTGTCACCC	T	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=12;PP=2890;SC=ACAGTCTTGCTTTGTCACCCT;SOR=3.611;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=13;WE=56869987;WS=56869961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	56881614	rs117867773	G	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=755;ReadPosRankSum=1.346;SC=AGTGAGCGAGGAGAGGGGAGA;SOR=0.889;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=41;WE=56881622;WS=56881604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr12	56915782	rs808929	G	A	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=404;SC=TCTCTCTCTCGCTCGTTCCCT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=56915790;WS=56915772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	56933651	rs2657902	G	A	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=73;PP=2388;SC=CTGAGAGGCCGGATGCTTCAT;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=116;WE=56933659;WS=56933641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	56933722	rs2657903	G	A	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=39;PP=1044;SC=GCTTTTAACCGTGTGCTCCCT;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=56933730;WS=56933712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	56956213	rs3759091	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.564;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.739;SC=ATATGTGTCATTGGCTCAGCA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=5;WE=56956221;WS=56956203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr12	56956516	.	C	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=1.201;SC=ATGCATGCCACCACTCCTGGC;SOR=1.835;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=11;WE=56956524;WS=56956506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	56982290	rs2470385	C	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=76;SC=ATACGAAGAACGTAGGAAGGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=56982298;WS=56982280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	56992630	rs2242497	C	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=653;ReadPosRankSum=1.277;SC=AAAGACCGGGCGGTTCACCCA;SOR=0.563;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=49;WE=56992638;WS=56992620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr12	56993714	rs2256341	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1155;ReadPosRankSum=0.414;SC=GCTGGCTGGCCCCTCAGCCTC;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=68;WE=56993722;WS=56993704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,70:0.55:128
chr12	57030026	rs2255074	T	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=630;ReadPosRankSum=-1.705;SC=TCCTTGGGCCTCCACTTCACG;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=39;WE=57030034;WS=57030016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,44:0.40:111
chr12	57033680	rs12229457	T	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.722;SC=AACAAATCACTAAGAAAGATC;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=8;WE=57033688;WS=57033670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	57058450	rs146702882	G	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-0.688;SC=ATTTATTCAAGGTCATAAAGA;SOR=1.201;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=24;WE=57058458;WS=57058440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr12	57065713	rs2958154	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=481;ReadPosRankSum=0.567;SC=TCTCACCTTTCTCATTTCTTT;SOR=0.406;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=32;WE=57065721;WS=57065703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr12	57106660	rs4788	A	T	3097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=62;PP=1665;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TGACCAATTCAATGTCCTTAA;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=87;TCR=122;TR=107;WE=57106668;WS=57106650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,142:0.57:251
chr12	57106810	rs898609	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.468;SC=AATGCTATACGGCGAGAGTTA;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=13;WE=57106818;WS=57106800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	57108203	rs4902	A	G	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1229;ReadPosRankSum=0.948;SC=GTTCTTCATCAATTTCAGCTG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=107;TCR=47;TR=74;WE=57108211;WS=57108193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,90:0.49:185
chr12	57109792	rs2958149	A	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=780;ReadPosRankSum=2.965;SC=AATCAGAGGCAGCAGCTCATC;SOR=0.415;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=53;WE=57109800;WS=57109782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr12	57109931	rs2926747	A	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=679;ReadPosRankSum=0.860;SC=ACTGGTGGGGAGGGTGCTGCA;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=41;WE=57109939;WS=57109921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr12	57112637	rs11171951	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.11;MQRankSum=1.000;NF=20;NR=20;PP=606;ReadPosRankSum=1.184;SC=GGGAAGGGCAGATTCACCACT;SOR=0.422;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=40;WE=57112645;WS=57112627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr12	57114100	rs2926743	A	G	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.255;SC=AGATAATGAAAAAGAGGTAGC;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=194;TCF=84;TCR=110;TR=86;WE=57114108;WS=57114090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,102:0.45:228
chr12	57114307	rs2958127	A	T	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=1269;ReadPosRankSum=-1.041;SC=AATGGTCTTCACTGTAGGGTC;SOR=1.049;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=64;WE=57114315;WS=57114297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,75:0.57:132
chr12	57132186	rs56401813	AT	A	1000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=803;ReadPosRankSum=1.757;SC=AAAACCCTGTATTTAAAGTGA;SOR=0.576;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=25;WE=57132194;WS=57132176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr12	57133140	rs1131514	T	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TAGGCACAGATATGCGACCTG;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=26;WE=57133148;WS=57133130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr12	57137828	rs1026565	T	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=409;ReadPosRankSum=1.337;SC=CTTAAAGTGCTTGGAGACTTT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=26;WE=57137836;WS=57137818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr12	57140461	rs2958129	A	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.966;NF=40;NR=13;PP=923;ReadPosRankSum=0.431;SC=CACACACACAAATTAATGAGA;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=83;TCR=29;TR=53;WE=57140469;WS=57140451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr12	57140506	rs2958130	G	A	3930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=42;PP=1794;ReadPosRankSum=0.134;SC=ATAGTTAATAGTAGTCAGAGG;SOR=0.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=144;TCR=85;TR=113;WE=57140514;WS=57140496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,139:0.50:278
chr12	57180855	rs4277148	C	T	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=7;PP=1556;SC=ACTGCATGATCTTAAAAATAT;SOR=3.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=57180863;WS=57180845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	57181148	.	T	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=1.875;SC=TTGGTGCTTCTTGGAATGAAG;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=14;WE=57181156;WS=57181138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr12	57346828	rs4319546	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.685;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=221;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GAAGGTAAAACACAAACAATA;SOR=1.461;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=16;WE=57346836;WS=57346818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr12	57350928	rs11172074	G	A	3781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=75;PP=2439;ReadPosRankSum=-1.182;SC=AAACCTGGGTGGTTACCTTTG;SOR=0.679;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=323;TCF=163;TCR=160;TR=146;WE=57350936;WS=57350918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,178:0.46:388
chr12	57486647	rs324019	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=334;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GTGCTCTGCCAGTCGAGTGGC;SOR=1.154;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=22;WE=57486655;WS=57486637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr12	57492745	rs3024974	G	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=971;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CCTCCTTCCTGCAGATAAGCA;SOR=0.826;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=68;WE=57492753;WS=57492735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,85:0.45:190
chr12	57492996	rs841718	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=351;ReadPosRankSum=0.658;SC=AGGATGACACGCGGGCAGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=18;WE=57493004;WS=57492992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr12	57502182	rs324011	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=0.955;SC=TCCTAGGGACCGTCCCCACCA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=10;WE=57502190;WS=57502172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	57535266	rs1799986	C	T	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=862;ReadPosRankSum=-0.349;SC=ACTGCATGGACGGCTCAGATG;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=62;WE=57535274;WS=57535256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,79:0.44:178
chr12	57543572	rs10876966	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=1.538;SC=AAACAAGGAGCATGAGGCCAC;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=35;WE=57543580;WS=57543562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr12	57559809	rs1800174	G	A	2680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1886;ReadPosRankSum=0.666;SC=ATACTGGAGCGGGCAGGAAGC;SOR=0.655;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=192;TCF=97;TCR=95;TR=106;WE=57559817;WS=57559799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,118:0.55:214
chr12	57561379	rs1800175	G	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=627;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TCCAGGGAAGGCAAAGGGCTT;SOR=1.550;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=30;WE=57561387;WS=57561369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr12	57561451	rs1800176	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=1.996;SC=TGGGAGAAAACAGGAGAAGTC;SOR=0.136;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=57561459;WS=57561441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	57567180	rs1800177	G	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=693;ReadPosRankSum=-0.025;SC=AATGTGGGCAGGAGGAGACCG;SOR=0.527;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=47;WE=57567188;WS=57567170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr12	57567762	rs1800194	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.356;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GCGAGCTCTGCGGTGAGGCCT;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=57567770;WS=57567752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr12	57569513	rs1800180	G	A	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=49;PP=1390;ReadPosRankSum=0.281;SC=AGGTGTGGTGGGGCAGGCCGA;SOR=0.891;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=69;WE=57569521;WS=57569503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr12	57578288	rs1800181	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GACCCAGGCTCCTGTTCCCTG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=57578296;WS=57578278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	57579727	rs1800182	A	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=57;PP=1280;ReadPosRankSum=0.311;SC=AGGAAGTGGGACATGGGGCGG;SOR=0.724;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=48;TCR=108;TR=80;WE=57579735;WS=57579717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,91:0.53:171
chr12	57581028	rs6581127	C	G	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=27;PP=2153;SC=CCTGACAAATCGCTGCTCCTG;SOR=1.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=95;WE=57581036;WS=57581018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	57585144	rs1800139	C	T	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1030;ReadPosRankSum=1.522;SC=TCGGGCTGGCCGTGTATGGGG;SOR=0.673;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=66;WE=57585152;WS=57585134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr12	57587839	rs1800187	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=2.166;SC=TCCTCCCCATCGCTCACTGCA;SOR=0.553;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=28;WE=57587847;WS=57587829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr12	57588977	rs1799739	CG	C	2723.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=2214;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CTGCAGACGACGGCGAACCAT;SOR=0.944;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=63;WE=57588985;WS=57588967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,92:0.41:226
chr12	57589659	rs1800154	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.726;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=980;ReadPosRankSum=-0.270;SC=ACCCGACCTGCGGCCCCAGTG;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=71;WE=57589667;WS=57589649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,85:0.52:165
chr12	57589784	rs7397167	A	C	3744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=56;PP=2322;SC=TGCACCAGCCAAGGTGGGCCC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=57589792;WS=57589774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	57589865	rs1800189	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=743;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TCCGCCCCTCCGCAGAGCACA;SOR=0.872;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=42;WE=57589873;WS=57589855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,51:0.40:129
chr12	57590735	rs7308552	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=4;PP=867;SC=CCCTGCCACATGCCCAGCCCA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=57590743;WS=57590725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	57590758	rs1800191	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=422;ReadPosRankSum=1.692;SC=GCTCCCTGTGCCTGCAGTGCC;SOR=0.214;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=25;WE=57590766;WS=57590748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr12	57590797	rs1800156	C	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=798;ReadPosRankSum=0.274;SC=GGCTGAAGGACGACGGCCGGA;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=78;TCR=38;TR=60;WE=57590805;WS=57590787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,72:0.55:132
chr12	57590869	rs7308698	T	C	7783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=100;PP=2965;SC=GCATCAACACTCATGGCAGCT;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=220;WE=57590877;WS=57590859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr12	57591226	rs1800165	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=-1.587;SC=ACAGCCTCCCTTGCAAGTCTC;SOR=0.606;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=37;WE=57591234;WS=57591216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr12	57591458	rs1800166	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=1.245;SC=GTGAGGCGGGCGGCCCTCGGC;SOR=0.825;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=26;WE=57591466;WS=57591448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr12	57592557	rs1800168	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=814;ReadPosRankSum=-0.533;SC=ACATAAAAAGCGGAGGATATG;SOR=0.430;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=49;WE=57592565;WS=57592547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,62:0.60:104
chr12	57593101	rs1140648	G	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.274;SC=ACAAGACCACGGGCACCAACA;SOR=0.570;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=80;WE=57593109;WS=57593091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,93:0.50:186
chr12	57593894	rs1800159	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	57594955	rs11172124	G	A	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=42;PP=1178;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CAGAGGTGGTGGTGGGCCGGT;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=44;TCR=73;TR=70;WE=57594963;WS=57594945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,78:0.60:131
chr12	57595066	rs9669595	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TATATTGGGTGTAACTTGCTT;SOR=1.589;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=23;WE=57595074;WS=57595056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr12	57602815	rs7956957	C	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=220;ReadPosRankSum=-1.149;SC=CTTTCCACCCCGAGCCTGGGT;SOR=0.665;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=16;WE=57602823;WS=57602805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr12	57603417	rs1800162	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=348;ReadPosRankSum=0.030;SC=TGTCGTGGACAGCATGGCCAG;SOR=0.794;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=22;WE=57603425;WS=57603407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr12	57604802	rs1800164	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=393;ReadPosRankSum=-0.791;SC=AGCCAGGCCCAAGCTGCTGGC;SOR=1.500;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=23;WE=57604810;WS=57604792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	57605168	rs10783814	T	C	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=62;PP=2078;SC=TCCACCCAGCTGGGCCCCTGC;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=109;WE=57605176;WS=57605158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	57606386	rs7304504	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=613;SC=GCCCCCTGCCAGTGAAGTCCT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=57606394;WS=57606376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	57614958	rs7134826	G	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=27;NR=15;PP=775;SC=AGGCTGTCCTGTCCACCCCAC;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=57614966;WS=57614948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr12	57619209	rs7979061	C	G	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=53;PP=2346;SC=CGGCGGGGCCCGGGCTTGGGG;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=111;WE=57619217;WS=57619199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	57619362	rs10783816	G	A	4860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=72;PP=2773;ReadPosRankSum=3.110;SC=TGTACGACCCGTCGCAGGTGT;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=308;TCF=187;TCR=121;TR=185;WE=57619370;WS=57619352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,217:0.59:367
chr12	57627717	rs34095989	G	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.715;SC=GAGGGAAGGGGCTCCCATGCT;SOR=0.740;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=74;WE=57627725;WS=57627707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,81:0.50:161
chr12	57629608	rs116973701	G	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.754;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=766;ReadPosRankSum=-1.309;SC=GAGCAGGAGGGGGGAGGGTTA;SOR=1.524;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=36;WE=57629616;WS=57629598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr12	57639190	.	C	T	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=47.06;NF=0;NR=3;PP=49;QD=27.9237375157;SC=GGTCTCCCTCCGTCACCCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=57639198;WS=57639180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	57643318	rs35971501	G	GC	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=468;SC=TGGCTTCCCAGCCCCCCACAC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=15;WE=57643326;WS=57643308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	57691990	rs34608793	AC	A	765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=806;SC=AATACATGAAACTGCTTTGCA;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=57691998;WS=57691980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	57693060	rs4760126	G	A	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=27;PP=1175;SC=CAGTAAGGCTGGCAGGTGCCA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=57693068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	57703935	rs7139302	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=27;NR=11;PP=827;SC=TGAGGGTGCAGTGGGCCCTAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=57703943;WS=57703925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	57704005	rs57612216	GA	G	1738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=30;PP=900;SC=GTCTCTAAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.723;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=47;WE=57704014;WS=57703995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	57843014	rs776037	C	T	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=1166;ReadPosRankSum=-1.080;SC=GTTGGTAGAACTGACAGTCAG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=54;WE=57843022;WS=57843003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr12	57845706	rs2280139	G	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=683;SC=ACCTGGGGGGGCTAAATTTTA;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=57845714;WS=57845696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	57848639	rs3809114	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=166;ReadPosRankSum=1.369;SC=CCTAGCCCCAGTGCTAGAAAT;SOR=0.538;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=13;WE=57848647;WS=57848629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr12	57848708	rs3809113	C	G	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=30;PP=1402;SC=CACTGGAACTCACAGCTGCCT;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=70;WE=57848716;WS=57848698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	57857354	rs10876987	T	C	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=6;PP=1158;SC=GGGTGGGGGATACCAGGGATG;SOR=3.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=51;WE=57857362;WS=57857344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	57858414	rs3817475	A	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=23;PP=1248;SC=ATGGAGAGACATGCCCCTTTA;SOR=1.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=57858422;WS=57858404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	57858835	rs3817474	G	A	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=1080;SC=CCTCCAAATAGCCCAATCCTT;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=57858843;WS=57858825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	57859431	rs2228225	G	A	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=57;PP=2965;SC=AGTGCCGGGAGGAACCCTTGG;SOR=1.199;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=149;WE=57859439;WS=57859421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	57859932	rs2292657	G	A	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1093;SC=AGGTGGAGTCGTGGAAGAGGA;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=57859940;WS=57859922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	57865321	rs2228224	G	A	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=46;PP=2040;SC=TTTCTGGGGGGTTCCCAGGTT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=57865329;WS=57865311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	57865821	rs2228226	G	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1559;SC=TGGGGAAACAGAATTCCTCAA;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=57865829;WS=57865811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	57865928	rs474058	A	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=231;SC=CTGCAGTCCCATGCACAAGAT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=57865936;WS=57865918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	57869241	rs527226	T	C	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=26;PP=1205;SC=GCTCCCGGACTCTCCCTCCCC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=62;WE=57869249;WS=57869231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	57869447	rs2277318	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=737;SC=GAGAAATCTGTATCCCTAGCT;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=57869455;WS=57869437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	57869476	rs2277317	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.95;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	57869486	rs2277316	A	G	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.56;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	57869500	rs524522	A	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;SC=CGGCCCAGGCAAGGGCTCTCC;SOR=1.931;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=18;WE=57869508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	57869530	rs3216740	CA	C	926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=851;SC=ACCCTGCCCCCAACTGCTCCT;SOR=2.753;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=22;WE=57869538;WS=57869520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	57869582	rs2277315	T	C	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=16;PP=1435;SC=TCCCGGCCGGTCGGAGCCTCC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=57869590;WS=57869572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	57870121	rs486699	A	C	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=14;PP=1162;SC=GCCCGCACCCATCCTGCGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=57870129;WS=57870111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	57870155	rs11544238	A	C	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=24;PP=1416;SC=ACCCAGCCTGAGGAGGGCGCT;SOR=1.468;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=57870163;WS=57870145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	57870463	rs10706671	AG	A	4308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=71;PP=2951;SC=GGGATCTGTAAGTCACCCTCG;SOR=2.115;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=3;TCR=71;TR=74;WE=57870471;WS=57870453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	57870648	rs512490	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=541;SC=GAAATGGGAGATTCACATGGG;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=57870656;WS=57870638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	57871555	rs3825080	A	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=656;SC=TCCCTCCCCCATTGTCTTCTC;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=57871563;WS=57871545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	57883193	rs183195960	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=415;ReadPosRankSum=0.255;SC=TGACTCATGTCCCCTGCATTT;SOR=0.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=28;WE=57883201;WS=57883183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr12	57883801	rs899653	G	A	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=37;PP=1308;SC=TGGTGTAGGGGTTACAGAATG;SOR=1.318;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=57883809;WS=57883791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	57891804	rs537161	T	C	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=766;SC=CCTGTGGGTTTGTGTGCAGAA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=57891812;WS=57891794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	57905687	rs1284467	A	G	5052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=83;PP=2965;SC=ATTCAGCCTTAGTGTTGAAAC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=160;WE=57905700;WS=57905677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	57920262	rs2127318	T	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=579;SC=CTTTGAGGGTTTTCTGGGTTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=57920270;WS=57920252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	57940749	rs775325	C	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=12;PP=537;SC=CTGGTTTCTGCTGGGGGTCCT;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=57940757;WS=57940739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	57958313	rs775322	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=0.478;SC=GTCCCAGTGGATGAGGGTGTG;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=23;WE=57958321;WS=57958303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr12	57966630	.	G	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ACATGCCTTTGAACTAGACCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=57966638;WS=57966620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	57968738	rs11172254	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GCTAAAGGTCGTTTGGAAAAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=57968746;WS=57968732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	57974670	rs775245	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=0.795;SC=TGTCCCCTACGCTCCTCTGGG;SOR=0.475;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=17;WE=57974678;WS=57974660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr12	57975155	rs775246	A	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=722;ReadPosRankSum=-1.566;SC=GGGCAAATGCAGGGTCATAGC;SOR=0.952;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=114;TCF=84;TCR=30;TR=44;WE=57975163;WS=57975145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr12	57975570	rs775247	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=3;PP=205;SC=CAGCTCTATCACTGAGGATGA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=57975578;WS=57975560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	57975910	rs775248	C	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=0.923;SC=ACCTGTAGTCCTAGCTACTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=57975918;WS=57975900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	57977003	rs775249	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TTTCAGGTAGCGTCAGGCTGC;SOR=1.480;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=19;WE=57977011;WS=57976993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr12	57994743	rs775235	T	G	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=57;PP=2424;SC=CTCCTGCTCTTGTGGGCTCCT;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=107;WE=57994751;WS=57994733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	57995089	rs812873	T	C	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=40;PP=2215;SC=AGTATGATGCTAAGAAGAAAG;SOR=1.104;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=57995097;WS=57995079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	58000378	rs703834	G	A	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=43;PP=1825;SC=GGAGGGGCAAGTTGTTTCTAT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=89;WE=58000386;WS=58000368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	58003922	rs10437954	G	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=4;PP=243;SC=GCAACTCCCCGGACGCGCGCA;SOR=1.244;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=58003930;WS=58003912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	58004563	rs7314872	C	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=289;ReadPosRankSum=0.452;SC=AAGTTCGCATCTAATTTGCAT;SOR=0.965;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=17;WE=58004571;WS=58004553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr12	58005682	rs60586224	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=527;ReadPosRankSum=1.311;SC=GGCGCCATGCGGGGGGGGCAC;SOR=0.830;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=39;WE=58005690;WS=58005672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr12	58007678	rs7305391	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.282;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.454;SC=TACTCTGGGGGCAGGGCGGCT;SOR=1.665;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=14;WE=58007686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	58008952	rs703833	C	T	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=15;PP=1107;SC=GGCAACTGGCCGAGGAGGCCT;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=58008960;WS=58008942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	58009372	rs2277323	G	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.936;NF=32;NR=31;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GAGGGCTGCTGTCTTCCCGAG;SOR=0.585;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=63;WE=58009380;WS=58009362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,80:0.54:148
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chr12	58013175	rs2277324	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCCAAGCCGCGGCTCTCGCCA;SOR=0.089;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=58013183;WS=58013165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
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chr12	58019472	rs774895	T	G	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=75;PP=2273;SC=GGGGAGCCTGTTAAGGGGCAG;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=35;TCR=75;TR=110;WE=58019480;WS=58019462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	58022074	rs12322482	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=454;ReadPosRankSum=0.300;SC=TGGTTGGGGAGGCTGCAGAAA;SOR=0.505;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=30;WE=58022082;WS=58022064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,35:0.32:109
chr12	58023012	rs35287199	CTG	C	1108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=651;ReadPosRankSum=0.558;SC=AGTGCCTACTCTGTGTCCCAC;SOR=0.617;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=16;WE=58023021;WS=58023002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr12	58023981	rs715930	C	A	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TGTAAGTGACCAGTTGTAGTT;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=68;WE=58023989;WS=58023971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,84:0.43:194
chr12	58025813	rs774896	G	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=636;ReadPosRankSum=0.164;SC=GCAAGAGGTAGCCGGAGGCCG;SOR=0.733;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=38;WE=58025821;WS=58025803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr12	58026001	rs2307095	G	A	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1678;ReadPosRankSum=0.564;SC=CGTCCTCAGAGGCTCCTGCCG;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=93;WE=58026009;WS=58025991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,104:0.57:183
chr12	58026021	rs2258877	A	G	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=1233;ReadPosRankSum=0.649;SC=GGCTCCCAAGAGCGCTCTCCA;SOR=0.711;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=80;WE=58026029;WS=58026011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,84:0.45:188
chr12	58026159	rs774897	A	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=845;ReadPosRankSum=-0.890;SC=CGGTTTCCTCACACACCCGAG;SOR=0.482;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=51;WE=58026167;WS=58026149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr12	58089413	rs3825078	A	T	5155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=65;PP=2965;SC=CTCCTTACTGAAAGTCTGGAG;SOR=1.010;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=156;WE=58089421;WS=58089403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr12	58090232	rs72303843	AGTCGG	A	1590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.20;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	58090246	rs11172303	C	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.82;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	58110062	rs141328077	T	TG	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.431;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.409;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	58112189	rs799265	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=266;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GGGAACTGGAAAACATCATCC;SOR=0.078;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=14;WE=58112197;WS=58112179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr12	58120276	rs12318065	C	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=155;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TCCAGCGGTCCGCCCGGTGTG;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=11;WE=58120284;WS=58120266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	58124803	rs238523	C	T	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=32;PP=945;SC=AAGCAGTCAACATGGTACAGA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=58124811;WS=58124793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	58125438	rs12307841	T	C	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=56;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GGAATGGTTATTGGAATCAGT;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=46;TCR=106;TR=81;WE=58125446;WS=58125428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
chr12	58126234	rs17852479	C	A	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1307;ReadPosRankSum=-2.488;SC=GGGAGCTGGGCAGGGACTTGC;SOR=0.827;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=77;WE=58126242;WS=58126224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr12	58127766	rs238526	T	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=594;SC=GTAGCCTCCTTAGGGCCTCCC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=58127774;WS=58127756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	58127967	rs12422249	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=752;ReadPosRankSum=0.887;SC=CTTGCGGGGAGTGAGGGAGCA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=54;WE=58127975;WS=58127957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr12	58135659	rs238530	T	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=40;PP=1963;SC=TGCTAGTCCCTGATACACCCA;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=102;WE=58135667;WS=58135649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	58145156	rs2270777	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=352;ReadPosRankSum=-0.596;SC=CTTTTCAATCCCCTTTAACCC;SOR=0.227;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=24;WE=58145164;WS=58145146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr12	58149446	rs1689582	C	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=11;PP=311;SC=CCTTCGCTGGCTGCTCCACCC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=58149454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	58150989	rs35101706	CCA	C	1256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=1051;SC=CCGCCAGTTACCACAGTCTCC;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=58150998;WS=58150979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	58186626	.	T	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=221;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CCACCCACCTTGGCTTCCCAA;SOR=0.287;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=58186634;WS=58186619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	58202419	rs2277326	C	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.6689;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TATGAAGCCACATGATATAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=58202427;WS=58202409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr12	58204283	rs2172521	T	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=1202;SC=ACTCCTATTTTAGCACGGCCC;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=58204291;WS=58204273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	59196995	rs61221959	AT	A	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=2.515;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=91;ReadPosRankSum=1.110;SC=ATTTGCCTGGATTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=7;WE=59197003;WS=59196985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	59197223	rs1148531	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CCTTGGTGCCAGATTTCCATG;SOR=0.754;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=7;WE=59197231;WS=59197213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr12	59199648	rs1497232	A	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=729;SC=TCAGAGGGGCACCTTAAGTTT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=59199656;WS=59199638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	59199972	rs17121482	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GGTACTAGATGTAACAGAAGA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=59199980;WS=59199962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr12	59205542	rs10713014	CA	C	43.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	59267701	rs2293659	C	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=381;ReadPosRankSum=1.481;SC=TTTACACTAACTAGTCGGATG;SOR=0.478;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=26;WE=59267709;WS=59267691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr12	59268129	rs10877180	C	T	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.967;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1800;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AATATGGGGGCAGTAACAGAA;SOR=0.916;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=102;WE=59268137;WS=59268119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,116:0.51:226
chr12	59270333	rs2279718	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=1203;ReadPosRankSum=0.802;SC=TGTCAGCTAACGTTCCCTGAG;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=72;WE=59270341;WS=59270323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,83:0.56:149
chr12	59272973	rs11172791	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=-0.826;SC=GTTTGTTTGTTTGATACTTAC;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=16;WE=59272981;WS=59272963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr12	59279589	rs11172795	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=355;ReadPosRankSum=0.915;SC=TCTCTTTTAGGGTAACTAAAT;SOR=1.426;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=25;WE=59279597;WS=59279579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr12	59279660	rs11172796	A	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=768;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TAGTAATAGAACGGATCCGAT;SOR=0.970;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=51;WE=59279668;WS=59279650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr12	59280742	rs10877182	A	G	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=827;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CCCAGGTGGCATATCATTTGT;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=50;WE=59280750;WS=59280732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr12	59280828	rs10877183	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCCAACTTACCTCTTACACCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=59280836;WS=59280818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	59282702	rs17533647	T	C	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=75;PP=1590;ReadPosRankSum=-1.010;SC=GGCCTTGGAATGTCAGTCCAT;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=74;TCR=142;TR=114;WE=59282710;WS=59282692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,128:0.54:237
chr12	59307625	rs10877187	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=369;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AGTTAACCAATTTAAAGCGCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=59307644;WS=59307615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	59307636	rs10783927	T	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=369;ReadPosRankSum=1.460;SC=TTAAAGCGCGTATCTTTACTA;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=59307644;WS=59307615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	59307957	rs11834094	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=181;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTGAATAACTCACTATAATCC;SOR=1.428;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=14;WE=59307965;WS=59307947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr12	59308003	rs11172820	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TAAGGGGTAACGTATTTTACT;SOR=1.519;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=19;WE=59308011;WS=59307993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr12	59313151	rs12426955	G	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=25;PP=1331;SC=ATCGAGTTCCGCCCTTTCCAT;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=59313159;WS=59313141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	59313248	rs12426969	G	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=608;ReadPosRankSum=1.296;SC=GAGAACAACAGAAGTACGTCC;SOR=0.436;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=38;WE=59313256;WS=59313238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr12	59313936	rs61754220	T	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=-1.963;SC=CGCCGCTGTCTGACCGGCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=20;WE=59313944;WS=59313926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr12	59917056	rs77370077	A	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=857;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AGACTCCCCAAGGTATACTCA;SOR=1.146;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=46;WE=59917064;WS=59917046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr12	62104219	rs7399207	A	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=810;ReadPosRankSum=0.891;SC=AGGAGAAAATATAGTCAACAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=48;WE=62104227;WS=62104209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr12	62114671	rs7485027	T	C	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=876;ReadPosRankSum=-1.379;SC=TCTTTCTACTTCTCCATTCGA;SOR=0.465;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=53;WE=62114679;WS=62114661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
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chr12	62696477	rs35496480	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AAAACTTGTTTTAAATACTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=62696485;WS=62696467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	62696599	rs11174420	C	T	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=33;PP=1506;SC=TTAAGGAACACCTTATTGATG;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=62696607;WS=62696589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	62705886	rs10431509	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	62706046	rs73137512	A	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=-0.048;SC=GAAATTACTTATATTTCTCTT;SOR=0.783;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=6;WE=62706054;WS=62706036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr12	62706180	rs10431510	A	G	255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=5;PP=171;SC=TGTAAAAAATACCCTAAATAT;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=62706188;WS=62706170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	62708442	rs10877825	G	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	62715412	rs111666891	CTGTAT	C	3671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=58;PP=2957;SC=TTTAAGCATACTGTATTATAC;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=61;WE=62715424;WS=62715402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	62717783	rs139681009	CT	C	427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=23.76;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	62717976	rs11174424	G	T	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=22;SC=AAAATTTTATGCAGAAAATGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=62717984;WS=62717966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	62775580	rs140199372	T	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=0.029;SC=CATAAATAGATATACAGTACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=14;WE=62775588;WS=62775570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	62777565	rs56298756	G	T	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=16;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TTGTACATATGTTTAAAAATC;SOR=0.615;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=85;TCR=30;TR=61;WE=62777573;WS=62777555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr12	62778065	rs2044846	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=19;PP=516;SC=GAATGGATCCACTTACCAAAC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=62778073;WS=62778055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	62785537	rs3213984	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=0.999;SC=TAACATTAAAATATACTTTAA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=62785545;WS=62785527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr12	62797926	rs17717700	G	T	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=880;ReadPosRankSum=0.432;SC=TGTATTTAACGTGATCTTTGA;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=46;WE=62797934;WS=62797916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr12	62810962	rs10459254	G	A	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=25;PP=1063;SC=CTGGAGGAAAGAAAAAATGAT;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=53;WE=62810970;WS=62810952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	62861111	rs6581450	T	C	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=59;PP=1673;SC=AAGCTTCAGGTGACGTCAGGA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=106;WE=62861119;WS=62861101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	62864417	rs12427111	A	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=186;ReadPosRankSum=1.297;SC=GAGGAAGACAACTCTGAAGCT;SOR=1.158;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=14;WE=62864425;WS=62864407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	62883990	rs11393430	C	CT	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1093;SC=AAGAGTTACACTATTGAGGGA;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=62883998;WS=62883980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	62887608	rs61921910	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TTTTTGAGATCGCTATTACTG;SOR=0.051;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=62887616;WS=62887598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	62888729	rs7135893	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TGTATACCTTCTCTTATTTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=62888737;WS=62888719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	62892905	rs4025987	C	G	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1142;SC=GGCCTTTGCTCAGATGATCAA;SOR=1.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=50;WE=62892913;WS=62892895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	62894636	rs17120341	T	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AACCTTGTGCTAAAGATGCAT;SOR=0.719;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=17;WE=62894644;WS=62894626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr12	62928747	rs11364534	TA	T	1961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=49;PP=1156;SC=CTGTGTCAGTTAAAAAAAACA;SOR=1.819;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=51;WE=62928755;WS=62928737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	62931083	rs73141045	C	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=675;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AATTAGCTATCAAGGAAACTT;SOR=0.916;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=37;WE=62931091;WS=62931073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr12	62943371	rs10877874	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=1.578;SC=CAACCTGAGTGGCAGAGTGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=8;WE=62943379;WS=62943361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	62965149	rs2270732	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=356;ReadPosRankSum=1.234;SC=TTAATGCTTATATTAAACTGT;SOR=0.262;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=26;WE=62965157;WS=62965139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr12	62979216	rs11174557	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=887;ReadPosRankSum=0.108;SC=TTTTAAAGAGGTCCCAAGATG;SOR=0.729;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=61;WE=62979224;WS=62979206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr12	62997643	rs7302456	G	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AAGCCTCGGCGCCCGGCCGGC;SOR=1.961;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=12;WE=62997651;WS=62997633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	63083521	rs11174604	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1243;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AGATGTTGGAGTCATGCACCT;SOR=1.009;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=158;TCF=65;TCR=93;TR=79;WE=63083529;WS=63083511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,92:0.47:194
chr12	63113828	rs342170	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CCTTGTCTTTTACCACAAACC;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=63113836;WS=63113824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	63359011	rs699595	A	T	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=434;SC=TGAAAAAAAAAAATCAAACCT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=63359019;WS=63359001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	63359549	rs143590555	ACTGCTG	A	3502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=2995;SC=TACTAAGGGTACTGCTGCTGC;SOR=0.881;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=50;WE=63359562;WS=63359539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	63543553	rs10747984	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQRankSum=0.428;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.969;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	63543555	rs11837411	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQRankSum=0.428;QD=14.30;ReadPosRankSum=-2.214;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	63543578	.	T	A	261	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=53.18;NF=11;NR=0;PP=261;QD=26.8882920497;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=63543588;WS=63543568;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,11:0.44:25
chr12	63543578	.	TCA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQRankSum=-0.114;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	63544209	rs1042615	A	G	8117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=121;PP=2965;SC=AGGCCGACGCAAACATGCCGA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=128;TCR=121;TR=249;WE=63544217;WS=63544199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr12	63954304	rs1054891	T	C	8169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=114;PP=2965;SC=AGTTAACCTTTAATACTCTGT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=244;WE=63954312;WS=63954294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr12	63974439	rs61935050	C	T	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=45;PP=2883;SC=AATACCTACACACCTGATGTG;SOR=1.436;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=95;TCR=45;TR=140;WE=63974447;WS=63974429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	64011062	rs4105524	A	G	5754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=87;PP=2965;SC=AAAAAAACCAACTTTATGAAC;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=89;TCR=87;TR=176;WE=64011070;WS=64011052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	64041195	.	C	CATAATAATAATAATA	209.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.69;QD=34.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	64057447	rs35598493	CAGA	C	5848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=34;PP=2948;SC=TGCAGTTGACCAGAAGTTCAT;SOR=2.045;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=87;WE=64057457;WS=64057437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	64061745	rs11175110	C	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=263;SC=TACTAGGCACCCACAAACCCT;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=64061753;WS=64061735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	64078548	rs61935227	G	A	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.39;QD=44.88;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	64078557	rs61935228	C	T	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.85;QD=42.78;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	64078612	rs61935229	G	A	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=46;PP=2089;SC=TGGTATCGCGGCATGTGGAAT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=108;WE=64078620;WS=64078602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	64118558	rs3864455	A	G	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=11;PP=1333;SC=CTCATCAGTTAATTCTGGTAG;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=64118566;WS=64118548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	64174696	.	A	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=0.842;SC=CTCAGAAATTAAAGTTAGGAT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=64174704;WS=64174686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	64472803	rs789710	A	T	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=64;PP=2352;SC=CCACAGAATCAGTGAAGTCCA;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=116;WE=64472811;WS=64472793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	64485593	rs5798729	A	ACC	1902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=1369;SC=GAATTGTAAGACTATGATCTA;SOR=4.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=64485601;WS=64485583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	64587633	rs699638	C	A	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=30;PP=1906;SC=TAACCTTTGGCTCCAGGTTTC;SOR=1.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=92;WE=64587641;WS=64587623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	64609562	rs2335390	C	T	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=28;PP=1235;SC=AGAAGTCTGCCATCTCCATCC;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=64609570;WS=64609552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	64668659	rs6581534	G	T	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=46;PP=2406;SC=GGGTGATTTCGTTTTGACTTC;SOR=1.069;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=115;WE=64668667;WS=64668649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	64671412	rs3057140	C	CTATA,CTA	807.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;NF=1,1;NR=7,7;PP=54,260;SC=GCCAGGGCCCCTATATATATA;SOR=0.804;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8,8;WE=64671420;WS=64671402;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:17
chr12	64678416	rs12581905	G	A	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=85;PP=2965;SC=GCAACTACAAGGTCCCAATGT;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=114;TCR=85;TR=198;WE=64678426;WS=64678406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr12	64712511	rs7955105	A	G	4997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=83;PP=2965;SC=ACTCATTTCCATTCCCATTGC;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=163;WE=64712519;WS=64712501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	64803798	rs11175383	A	C	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=42;PP=1848;SC=CCAGAAAACTACAAGTATAAC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=64803806;WS=64803788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	64818598	rs61931552	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ATTAATCCATGTTACTTATTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=12;WE=64818606;WS=64818588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	64821982	rs56063305	TA	T	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.002;NF=1;NR=11;PP=137;ReadPosRankSum=2.407;SC=TGTTGGCATTTAAAAAAAAAA;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=64821990;WS=64821972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr12	64825634	rs73120335	T	G	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=916;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCTGAAAATCTCTTGAAGATC;SOR=0.704;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=63;WE=64825642;WS=64825624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr12	64827444	rs61931555	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=476;ReadPosRankSum=0.452;SC=TGTACATCTATATGACCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=27;WE=64827452;WS=64827434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr12	64858100	rs57810028	A	AT	643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=0.894;SC=CCAATCAATGATTTTTTTTTT;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=23;WE=64858108;WS=64858090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,26:0.93:28
chr12	64879903	rs7487627	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=0.717;SC=GATTTTTATTATAATACATTT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=64879911;WS=64879893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	64889417	rs149784987	T	C	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=941;ReadPosRankSum=0.107;SC=GTTTCTGCTCTTATTAATGTC;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=57;WE=64889425;WS=64889407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr12	64891392	rs146676333	G	GGTT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.99;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	65004316	rs3741747	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-0.835;SC=TGCCCGGGGCTGCGCGCCGGG;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=14;WE=65004324;WS=65004306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr12	65004387	rs3741748	C	T	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr12	65134536	rs1690277	C	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=1.930;SC=TGGATTACTACAGTAGATAAT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=65134544;WS=65134526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	65146532	rs1147096	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TTTTCTTTAGCGGTGTCTGTA;SOR=1.230;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=14;WE=65146540;WS=65146522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr12	65146676	rs1147095	T	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=526;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AAAGAGAGTCTTGTATGATTC;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=34;WE=65146684;WS=65146666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr12	65150485	rs2620733	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1006;ReadPosRankSum=0.580;SC=TGCTCTTGTCCTAGCTCTTCC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=64;WE=65150493;WS=65150475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr12	65153080	.	C	CCGGGA	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=324;ReadPosRankSum=0.289;SC=CGGGGTGACCCCGGGACGGGA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=65153088;WS=65153070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	65222347	rs1144426	C	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=537;ReadPosRankSum=1.264;SC=TTCTTTAGAGCCTCTGGAATG;SOR=0.446;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=27;WE=65222355;WS=65222337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr12	65270436	rs7311657	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=444;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CCAGCTCTAGACTGCAGACGC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=19;WE=65270444;WS=65270426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr12	65460368	rs3782498	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=3;PP=1110;SC=AACTTATTCTAATCAAACATT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=43;WE=65460376;WS=65460358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	65462429	rs72205564	ATGTGTGTGTGTG	ATG,A	1868.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.18;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.076;NF=13,13;NR=7,7;PP=36,1477;SC=CCAAAAAACCATGTGTGTGTG;SOR=2.409;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=20,20;WE=65462448;WS=65462419;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.96:46
chr12	65471467	rs2289936	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=579;ReadPosRankSum=0.404;SC=TGCATCTTAAATATTCTTATC;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=36;WE=65471475;WS=65471457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr12	65477613	rs150722125	TTTC	T	544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=41.90;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	65514266	rs7301320	T	C	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=76;PP=2377;SC=TTCTCTGTTGTGCTTTTCTGA;SOR=0.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=136;WE=65514274;WS=65514256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	65609707	rs34604927	G	GT	357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=6;NR=2;PP=208;SC=ATTATTTGGTGTTTTTTTTCT;SOR=2.985;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=8;WE=65609715;WS=65609697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	65633880	rs34562240	GTGAT	G	2883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=22;PP=2468;SC=ATTATGTCAAGTGATTGATTC;SOR=1.284;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=47;WE=65633891;WS=65633870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	65856899	rs61921506	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=10;PP=657;SC=CTGCTTTGTACATGCTTTTCC;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=65856907;WS=65856889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	65881702	rs11175783	C	T	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=46;NR=27;PP=1478;SC=TGAGACTGTGCCTCAAATTAA;SOR=1.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=73;WE=65881710;WS=65881692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	66232383	rs3834468	T	TG	1469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=1201;SC=CTTCTTTTTTTTAAAGAAAAA;SOR=1.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=66232391;WS=66232373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	66260230	.	T	C	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=535;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTGCAGCTGGTAGACCTGTGG;SOR=0.805;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=29;WE=66260238;WS=66260220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr12	66261467	rs139811507	G	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=1.073;SC=AGTCAGAGCCGTAAGGCTGCC;SOR=0.614;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=23;WE=66261475;WS=66261457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr12	66308644	rs10878345	A	G	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=232;SC=TAGTAGAGACAGGGTTTCACC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=66308652;WS=66308634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	66517828	rs2464304	T	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=23;PP=657;SC=AACTATTAACTCCATGTATGA;SOR=1.154;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=38;WE=66517836;WS=66517818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	66531694	rs1185629	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=518;SC=CTTTTTTCTCATTAAATTTTT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=66531702;WS=66531684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	66597701	rs1882200	C	T	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=38;PP=1093;SC=TAATGTGGCTCTTAATCTGTA;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=66597709;WS=66597691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	66603399	rs11465955	C	T	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=557;SC=CTGGATTTGCCGGCACTTTTT;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=66603407;WS=66603389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	66605228	rs1152888	A	G	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=705;SC=TTCCTAAGGAATACTGCTTAA;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=66605236;WS=66605218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	66696255	rs3741605	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=7;PP=1162;SC=TCAGGTTTTATGTACGCTGGC;SOR=3.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=48;WE=66696263;WS=66696245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	66696410	rs3741604	C	T	7502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=126;PP=2965;SC=CGTACCTGCGCCAACTTCAGG;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=117;TCR=126;TR=243;WE=66696418;WS=66696400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr12	66698438	rs2118139	G	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=884;SC=TAAGTTTGATGAAACTTTGAG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=66698446;WS=66698428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	66698461	rs2118140	A	G	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=6;PP=1217;SC=AACGGTTTCTAAATAATCTCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=66698469;WS=66698451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	66698895	rs4430553	T	C	5759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=100;PP=2965;SC=GAGTTGTTCCTAGACAATGAG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=71;TCR=100;TR=171;WE=66698903;WS=66698885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	66698954	rs1971302	C	G	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=63;PP=1849;SC=TTATCATCAACTTTCAGTGTA;SOR=2.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=84;WE=66698962;WS=66698944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	66717692	rs7969887	T	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=799;SC=GTCTGAGTAGTAGTTAATGTT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=66717700;WS=66717682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	66717716	rs7957877	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=8;PP=995;SC=ACAAGTGAAACGGAGACTTTC;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=66717724;WS=66717706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	66742700	rs200232418	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=273;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GTTAATGCCACGTTGATTGAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=66742708;WS=66742690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	66786073	rs7970076	A	G	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=32;PP=1969;SC=TCTGGGGGACAAAGTAAAGAC;SOR=1.448;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=100;WE=66786081;WS=66786063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	66786091	rs13277	G	C	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=39;PP=2596;SC=GACATACCTTGAGTTCCATAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=66786099;WS=66786081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	66786341	rs7970771	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=26;PP=1246;SC=AATATACCAAGATACTCCGTG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=66786349;WS=66786331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	66786644	rs2270594	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=29;PP=930;SC=TCCCTGTATGGTACTGAATAT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=66786652;WS=66786634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	66814466	rs7397861	C	G	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1090;ReadPosRankSum=-1.422;SC=TTAAGAGAGGCCTTAAAATGA;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=98;TCR=88;TR=80;WE=66814474;WS=66814456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,100:0.43:233
chr12	66814487	rs7397862	C	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=978;ReadPosRankSum=1.895;SC=ATCAGAAAATCCATTTTCCTT;SOR=0.868;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=73;WE=66814495;WS=66814477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,95:0.39:244
chr12	66826527	rs143524823	GAAGT	G	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=280;SC=TGTAGGAACTGAAGTAAGATG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=66826538;WS=66826517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	66826555	rs6581694	A	G	141.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=110;SC=TTAAAATCCTAGTAAATTAAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=66826563;WS=66826545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	66849062	rs11613371	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=-0.658;SC=GAGCTGTTAGCTGCTCAGCAT;SOR=0.582;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=15;WE=66849070;WS=66849052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr12	66849408	rs1038923	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=114;SC=GCCACACTTGTCAACCAGTAA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=66849416;WS=66849398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	66849908	rs4913434	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=324;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GAGAAAAGGAGAGTGTGAGAA;SOR=0.330;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=20;WE=66849916;WS=66849898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	66849926	rs4913435	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=504;ReadPosRankSum=0.233;SC=GAAAAATATAATTGAAATAAA;SOR=0.404;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=31;WE=66849934;WS=66849916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr12	66856975	.	AAAAT	A	471	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=471;QD=55.5555555556;SC=TCATTTACTTAAAATAAAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=66856992;WS=66856965;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
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chr12	66856981	rs144154456	AAAG	A	801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.09;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr12	67701103	rs812325	G	A	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=26;PP=1964;SC=GTGTTATTTGGAGTGGTTTAA;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=67701111;WS=67701093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	67706466	rs1060350	G	A	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=58;PP=2122;SC=TAGCAGCACTGCTAACCATTC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=67706474;WS=67706456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	68045455	rs7307918	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=-1.764;SC=ATTTGGGTTTCGATGGTGGTT;SOR=0.096;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=17;WE=68045463;WS=68045445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr12	68052178	rs3741644	G	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=1.984;SC=GAGAGTGGGGGAACGCGCTGA;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=46;WE=68052186;WS=68052168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr12	68552041	rs2234686	TA	T	370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=14;PP=207;SC=ACCTGCATTCTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=68552049;WS=68552031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	68595719	rs10748100	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=243;ReadPosRankSum=0.419;SC=AATCTGCAGATAAAGTACAGA;SOR=0.489;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=12;WE=68595727;WS=68595709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr12	68595787	rs10748101	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.225;SC=ATAAGGATTTAGAATTCTTAC;SOR=0.793;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=7;WE=68595795;WS=68595777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr12	68646521	rs2227491	T	C	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=924;ReadPosRankSum=1.464;SC=CACACGGCCCTGTTCGTCACA;SOR=0.667;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=70;WE=68646529;WS=68646511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,87:0.53:163
chr12	68688939	rs7958232	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=509;ReadPosRankSum=1.361;SC=AAGTAGAAAACGTTAGGAAAA;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=29;WE=68688947;WS=68688929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr12	68707287	rs2306392	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=748;ReadPosRankSum=0.264;SC=CCTCTGTTCTGGGGCTGGAGG;SOR=0.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=45;WE=68707295;WS=68707277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr12	68708761	rs2306393	C	T	3497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=60;PP=1816;ReadPosRankSum=2.532;SC=AGATTTCTCACGTACATCCAA;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=296;TCF=168;TCR=128;TR=134;WE=68708769;WS=68708751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,172:0.48:357
chr12	68715417	rs7964052	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CTCTGAAATGGAAATCATTTA;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=68715425;WS=68715407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	68719216	rs2870812	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=121;ReadPosRankSum=-0.885;SC=CATCCATTAAGCTACCTGATT;SOR=0.973;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=11;WE=68719224;WS=68719206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr12	68720627	rs962976	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TCTTTCTTGAGTAACATCCTT;SOR=0.891;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=74;WE=68720635;WS=68720617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,87:0.39:223
chr12	68721040	rs962977	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=380;ReadPosRankSum=-1.213;SC=ATTAAAAATCAGGGGGTCACA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=22;WE=68721048;WS=68721030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr12	68724951	rs3741808	G	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=989;ReadPosRankSum=-1.669;SC=TACAAGACTCGGACAAATAAG;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=66;WE=68724959;WS=68724941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr12	69021043	rs140347699	CATACA	C	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=-2.248;SC=TAGAGCAACCCATACAATACA;SOR=0.439;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=8;WE=69021055;WS=69021033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	69021247	rs151199986	T	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=-0.142;SC=AATGGTTTGGTAGCCAACCAC;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=16;WE=69021255;WS=69021237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	69042454	.	CT	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=10.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=0.617;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr12	69048131	rs112638624	T	TG	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=0.431;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	69050235	rs141697489	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.345;NF=12;NR=16;PP=310;ReadPosRankSum=-0.246;SC=ATGAGGTATGGTCAAATATAC;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=28;WE=69050243;WS=69050225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,38:0.43:89
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chr12	69080728	rs2259702	T	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=280;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TTTCTGTGGGTCTGTTTTAGG;SOR=0.273;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=20;WE=69080736;WS=69080718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
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chr12	69127245	rs34342902	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=631;ReadPosRankSum=-1.937;SC=CAAAAAAGCACGAAGCTGCAA;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=40;WE=69127253;WS=69127235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr12	69127497	rs146300763	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GTTCATCTTACCTCTCTTGTG;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=69127505;WS=69127487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr12	69141678	rs57821268	T	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr12	69207162	rs1470383	G	A	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=245;SC=ATTGGATACTGTCTGTGATCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=69207170;WS=69207152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	69218038	rs2291857	T	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=0.008;SC=ATTGAAAGGTTAAATTGCATA;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=69218046;WS=69218028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	69233634	rs710633	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=611;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CCCTAGTTGACCTGTCTATAA;SOR=0.341;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=29;TCR=86;TR=42;WE=69233642;WS=69233624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr12	69250548	rs3741598	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=351;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CACTAAAATGCAGCCTTTGTG;SOR=1.473;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=22;WE=69250556;WS=69250538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr12	69262969	rs116926028	G	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=307;ReadPosRankSum=1.234;SC=CTGCTCTTATGATATTAGCTG;SOR=0.120;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=19;WE=69262977;WS=69262959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr12	69265578	rs2228654	A	G	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1574;ReadPosRankSum=-2.652;SC=CGATGCTGTAATAACAGTCAG;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=93;WE=69265586;WS=69265568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,105:0.54:196
chr12	69279736	rs2701085	A	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=1087;SC=GAACTCTGGTAAGACTAGGAA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=69279744;WS=69279726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	69633379	rs2305642	A	G	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=17;PP=883;ReadPosRankSum=0.737;SC=CGCGGCGGGCAGACCTGCAGG;SOR=1.071;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=128;TCF=88;TCR=40;TR=64;WE=69633400;WS=69633369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr12	69645864	rs490872	A	G	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=22;PP=672;SC=TCTTTTTTTCAGGGGGAGACA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=69645872;WS=69645854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	69652336	rs5798930	G	GT	1012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=15;NR=7;PP=492;SC=TTAGTGAAGTGTTTTTTTTTC;SOR=2.432;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=22;WE=69652344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	69653146	rs2231700	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=664;ReadPosRankSum=1.145;SC=TGCTATACACTGTTGTGACTA;SOR=0.277;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=84;TCF=69;TCR=15;TR=41;WE=69653154;WS=69653136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr12	69667075	rs1463335	T	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=318;ReadPosRankSum=-0.569;SC=AATTTCAGGTTGTGGCATTCA;SOR=0.597;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=20;WE=69667083;WS=69667065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr12	69744104	rs686407	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=655;ReadPosRankSum=1.719;SC=AGAATTGAGACTCAATACAAA;SOR=1.167;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=35;WE=69744112;WS=69744094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr12	69753595	rs622656	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGGAGTTGACGGTTACTCAC;SOR=3.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=69753603;WS=69753588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	69756762	rs10784775	G	A	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=31;PP=831;SC=ACAACCTGTAGTTTTTTTTTT;SOR=2.964;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=35;WE=69756770;WS=69756752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	69759551	rs11286051	AT	A	465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=313;ReadPosRankSum=-0.438;SC=ATAATTTACTATTTTTTTTCT;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=16;WE=69759559;WS=69759541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr12	69967862	rs547497	G	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=843;ReadPosRankSum=1.483;SC=CATTGGAGGCGAGGGTTTCTA;SOR=0.405;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=52;WE=69967870;WS=69967852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr12	69979115	rs2601007	G	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-1.840;SC=GCCCCCTCCAGTGTGAAAGGC;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=69979123;WS=69979105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr12	69980141	rs484319	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=486;ReadPosRankSum=2.339;SC=CTTGTTCTAAGCATTGTTTTA;SOR=0.292;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=29;WE=69980149;WS=69980131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr12	69981111	rs11177732	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GTTTCTAGGGGTAGATACATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=69981119;WS=69981101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	69981862	rs530701	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=334;ReadPosRankSum=0.420;SC=TACTTCCTCTGTCTTTACTAT;SOR=0.496;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=23;WE=69981870;WS=69981852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr12	69986788	rs1043434	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.121;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr12	69987494	rs710773	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TAGAATTTCAGCAGTTATTCT;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=13;WE=69987502;WS=69987484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr12	69991568	rs3217625	AAT	A	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.342;NF=1;NR=13;PP=650;ReadPosRankSum=0.824;SC=GAAAATGTTGAATATATTTTT;SOR=0.997;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=14;WE=69991577;WS=69991558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr12	69991627	rs710765	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.991;SC=ATGGTTCTTACAGAAATCTTA;SOR=1.048;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=7;WE=69991635;WS=69991617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr12	69991660	rs11832926	A	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr12	69995039	rs11177742	C	A	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=29;PP=1386;ReadPosRankSum=-1.215;SC=TCATGCTCTTCATTTTTCACT;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=138;TCR=63;TR=91;WE=69995047;WS=69995029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,110:0.46:238
chr12	69995273	rs7200	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=2.040;SC=ATTTGCCGTGTCATTTTCCAT;SOR=1.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=19;WE=69995281;WS=69995263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr12	70064146	rs17813545	T	C	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=41;PP=1780;SC=TTCTCTAAGATGTGCTTTGCG;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=70064154;WS=70064136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr12	70064295	rs3847772	C	T	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=53;PP=1612;SC=AGAAGTGCCACAAACCATCAC;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=70064303;WS=70064285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	70065072	rs3847773	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=55;SC=AGCCTCCCCAAGTAGCTAGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=70065080;WS=70065062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	70065126	rs200930771	CTT	C	195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.157;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr12	70070942	rs710718	A	G	5664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=73;PP=2965;SC=AAAGAATTCCATGAAAAGTAT;SOR=1.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=184;WE=70070950;WS=70070932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr12	70072479	rs3741755	C	G	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=9;PP=1360;SC=TTCTTGGTCTCTAATTAGCGT;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=70072487;WS=70072469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	70078172	rs710714	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=396;SC=TTATTGCCCTCGAGCCAAAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=70078180;WS=70078164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	70078575	rs12425422	T	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=441;SC=TCCCTGTCAATTGGGAAAATC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=70078583;WS=70078565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	70091432	rs775429	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=9;PP=448;SC=AGTACCTGTATACCAAACTTA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=70091440;WS=70091422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	70091452	rs1025016	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=223;ReadPosRankSum=-0.780;SC=ATTGCTGTATAAAGAACAGCA;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=13;WE=70091460;WS=70091442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	70188346	rs35394896	T	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.979;SC=ATAACTGTTTTAAAGATACCT;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=17;WE=70188354;WS=70188336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr12	70190408	rs17120917	A	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=-1.388;SC=ACGAATTATCAATAAAAATGA;SOR=0.793;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=20;WE=70190416;WS=70190398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr12	70195293	rs10879014	T	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.417;SC=AGTGGAACTTTGGAGAAGAAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=70195301;WS=70195283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr12	70273303	rs1240286	C	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=466;SC=CTCTGGCAGGCACCTAGAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=70273311;WS=70273293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	70273985	rs7295793	T	G	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=883;ReadPosRankSum=0.911;SC=TTTTAGAGCCTCATTGCCTCC;SOR=0.709;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=60;WE=70273993;WS=70273975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,74:0.44:170
chr12	70274101	rs7310544	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=599;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAACAAGGGCGATGCCATCAA;SOR=0.372;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=34;WE=70274109;WS=70274091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr12	70274160	rs1240287	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=548;SC=GAGCAGCCCTGCAAAAGTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=70274168;WS=70274150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr12	70330087	rs813147	A	G	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=70;PP=2821;SC=CACAGGAGCCAGCTCTGCTGC;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=137;WE=70330095;WS=70330077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
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chr12	70672149	rs11611635	T	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-0.753;SC=AGCAAATTGGTTACACCTCAA;SOR=0.180;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=70672157;WS=70672139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	70724053	rs11615947	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=561;ReadPosRankSum=1.214;SC=TAGTATAATGGACTTCTTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=41;WE=70724061;WS=70724043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,49:0.43:115
chr12	70740194	rs3817487	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=-1.448;SC=AATACATCCAGTTCCAGTAAT;SOR=0.507;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=13;WE=70740202;WS=70740184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	70794186	rs710651	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.730;SC=CTGTTATATCGTAGATTATGC;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=70794194;WS=70794176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	70913818	rs630608	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=516;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GAAAAGAAATATACTCTTTAT;SOR=0.312;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=24;WE=70913826;WS=70913808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr12	70915347	rs369876	A	G	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=46;PP=2075;SC=ATAATTGTTTACGCTGTTTAT;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=99;WE=70915355;WS=70915337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	70918141	rs1025407	T	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GTGATCCTCCTGCCTCAGCCT;SOR=0.055;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=21;WE=70918149;WS=70918131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr12	70918185	rs1025408	A	G	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=663;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GTAAGCCTCTATGCCTGGCCA;SOR=0.515;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=43;WE=70918193;WS=70918175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr12	70928616	rs3752703	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=620;ReadPosRankSum=0.574;SC=AACATACACCGCATATCTTAA;SOR=0.688;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=47;WE=70928624;WS=70928606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr12	70928724	rs582954	A	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=34;PP=1257;SC=GCCAGTAATGATCACACTTTA;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=70928732;WS=70928714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	70932572	rs17226374	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=1215;ReadPosRankSum=0.612;SC=CTATTTCTTATTAAAGGCATT;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=19;WE=70932581;WS=70932564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	70932573	rs11332712	TA	T	754.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=1217;ReadPosRankSum=0.660;SC=TATTTCTTATTAAAGGCATTC;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=19;WE=70932581;WS=70932564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	70933687	rs919595	A	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=948;ReadPosRankSum=0.527;SC=CCATCTTTCAACAAATTATAC;SOR=0.727;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=57;WE=70933695;WS=70933677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr12	70938176	rs4761221	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=443;ReadPosRankSum=1.900;SC=CTTCTAGAGAGGTTGTACAAT;SOR=1.688;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=21;WE=70938184;WS=70938166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr12	70949973	rs11424259	A	AT	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=2.453;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr12	70953277	rs2303963	T	C	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=869;ReadPosRankSum=-1.418;SC=AGACAGTAAGTGCATCTCTGG;SOR=0.608;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=63;WE=70953285;WS=70953267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,79:0.45:174
chr12	70953456	rs2303962	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=502;ReadPosRankSum=-1.449;SC=TGCCATAACATATACAAATAA;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=27;WE=70953464;WS=70953446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr12	70953477	rs34465365	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GATAGCTGAGCAACATCAGAC;SOR=0.507;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=17;WE=70953485;WS=70953467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	70963619	rs2304821	G	A	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TGCCGACACCGTGTAGGAATC;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=71;TCR=51;TR=72;WE=70963627;WS=70963609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,90:0.60:150
chr12	70983895	rs2165627	A	C	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1301;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GCACCACAGAATCATTGAAGA;SOR=0.645;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=77;WE=70983903;WS=70983885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr12	70984019	rs1465934	C	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1227;ReadPosRankSum=0.473;SC=TGGAACTAAACGGTGAAATGA;SOR=0.913;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=74;WE=70984027;WS=70984009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
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chr12	70988287	rs34615667	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=529;ReadPosRankSum=2.238;SC=GCAGCCCTGCAGCCTCAGTCA;SOR=0.719;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=38;WE=70988295;WS=70988277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
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chr12	71002893	rs2252784	C	T	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1392;ReadPosRankSum=0.880;SC=AGAAATAATCCTGAAGTTATA;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=89;WE=71002901;WS=71002883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,95:0.53:178
chr12	71003360	rs2717431	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=503;ReadPosRankSum=0.360;SC=CTTTGACAGCTGGATAAGCTG;SOR=1.112;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=28;WE=71003368;WS=71003350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr12	71050694	rs5798997	T	TA	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=-0.946;SC=AAACCACAGTTAAAAGTAGTA;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=71050702;WS=71050684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	71056569	rs7969289	T	C	32.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	71078135	rs7958846	G	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=0.757;SC=AAATAGCTGGGCTAGTACAAA;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=20;WE=71078143;WS=71078125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr12	71139664	rs3803036	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=536;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GGTGGTAGCTTTGATCTCAGG;SOR=0.968;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=31;WE=71139672;WS=71139654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr12	71158270	rs3751287	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	71286606	rs149684669	G	A	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CTTGAGCTTCGGAAGAGGAAT;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=155;TCF=66;TCR=89;TR=77;WE=71286614;WS=71286596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,106:0.50:210
chr12	71314102	rs12830783	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=321;ReadPosRankSum=0.354;SC=CTAAGCCTGGCAACCCCTTAC;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=23;WE=71314110;WS=71314092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr12	71509836	rs1796329	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=524;SC=AAATAGCTGACGTTTTTCCAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=71509844;WS=71509826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	71511971	rs11178616	G	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=679;SC=ATCTCACTAGGGAGTGCCAGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=71511979;WS=71511961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	71522953	rs1796330	G	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=25;SC=CGAGGGAGATGATGGGCCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=71522961;WS=71522943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	71523043	rs1705263	C	A	249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=2;PP=183;SC=TGTTCACCATCAATATTTCTT;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=71523051;WS=71523033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	71526677	rs1397566	A	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=883;SC=TTAAATTATAATCTTCTGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=71526685;WS=71526667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	71531889	rs1798093	T	C	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=32;PP=1986;SC=AGGTAGTATTTCAATTTTTCA;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=71531897;WS=71531879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	71532922	rs2971392	A	C	5098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TGATTTTACCACAACCCACAC;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=368;TCF=211;TCR=157;TR=181;WE=71532930;WS=71532912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,242:0.51:472
chr12	71898287	rs7136209	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=1.415;SC=TCAAGCAGGGGAATGAGTTCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=71898295;WS=71898277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	71898358	rs7307225	T	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=524;ReadPosRankSum=-1.775;SC=TGGTGGCATTTGCTGCTCCTC;SOR=1.039;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=33;WE=71898366;WS=71898348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr12	71918078	rs7980959	T	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.941;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=689;ReadPosRankSum=0.577;SC=TACAGTTGCTTTTGATATTTG;SOR=1.561;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=31;WE=71918086;WS=71918068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr12	71947173	rs1148985	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=72;ReadPosRankSum=-0.424;SC=ACATTTTAAGGGAGGAAAACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=6;WE=71947181;WS=71947163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	71955394	rs1280603	T	C	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=140;SC=TTTTTTATCCTCTAGAGAGTA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=71955402;WS=71955384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	71960208	rs1797372	G	A	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=15;PP=777;SC=ATCCCATCCAGTTTGTTGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=71960216;WS=71960198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	71960329	rs1797373	G	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=22;PP=922;SC=AATATTATAGGTTGAAGTGCT;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=71960337;WS=71960319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	71960533	rs1797374	G	A	6464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=77;PP=2965;SC=TGCCATTAGAGCTTGATCAGT;SOR=1.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=117;TCR=77;TR=194;WE=71960541;WS=71960523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	71960584	rs1726469	T	C	6855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=106;PP=2965;SC=GTGTGATGCCTGAATGAAAGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=220;WE=71960592;WS=71960574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr12	72013832	rs1298463	A	G	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=45;NR=33;PP=1601;SC=ATGCAACAAGAGCTTCCAGCA;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=72013840;WS=72013822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	72018142	.	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.029;SC=ACTTTTCACATTTCATTAAGA;SOR=0.551;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=10;WE=72018150;WS=72018132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	72019989	rs55719302	T	TAC	1137.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.041;NF=15;NR=8;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CAAATAATTATACACACACAC;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=23;WE=72019997;WS=72019979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,40:0.91:44
chr12	72022556	rs1148996	C	G	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=141;SC=ACTGTATTGTCTAAAAACCCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=72022564;WS=72022546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	72023336	.	T	TACACACAC,TACACAC	86	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=28;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=7,7;NR=1,1;PP=53,86;QD=7.0;SC=AGAGATACAGTACACACACAC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8,8;WE=72023344;WS=72023326;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:16
chr12	72026872	rs1011331	T	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=487;SC=TCAAACACCGTGGCTTTTGAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=72026880;WS=72026862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	72028607	rs34399921	TAA	TA,T	400.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026,0.4974;FS=6.990;HP=13;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2,2;NR=15,15;PP=213,14;ReadPosRankSum=1.739;SC=TGAAGCTTGCTAAAAAAAAAA;SOR=2.946;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=17,17;WE=72028616;WS=72028597;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:19
chr12	72030252	rs1149006	T	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1089;SC=AAAAGTAGCATTAAATTTTTG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=72030260;WS=72030242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	72291778	rs73140671	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.924;SC=GAAATCTTGATAAGAGTAAAG;SOR=0.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=11;WE=72291786;WS=72291768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	72355504	rs76143560	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=574;ReadPosRankSum=0.595;SC=GCAGATGAAAATCACTTCTCT;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=32;WE=72355512;WS=72355494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr12	72372601	rs4760816	C	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=939;SC=ATATGTCACTCAGTTGTCAAG;SOR=2.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=41;WE=72372609;WS=72372591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	72372862	rs7305115	A	G	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=74;PP=2376;SC=TCTACACCCCAGAACCGTGAG;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=131;WE=72372870;WS=72372852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	72388374	rs1007023	G	T	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=73;PP=2395;SC=TAAAACCAGTGCTATTTATGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=35;TCR=73;TR=108;WE=72388382;WS=72388364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	72416235	rs4290270	A	T	5765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=81;PP=2965;SC=AACTGCGGGCATATGGAGCAG;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=177;WE=72416243;WS=72416225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr12	72425010	rs17110741	T	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=13;PP=1223;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ATTACAGAGTTTAACAGGTTT;SOR=0.831;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=132;TCF=105;TCR=27;TR=68;WE=72425031;WS=72425000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr12	72666485	rs74594364	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	72666488	rs78720771	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	72666499	rs79761722	A	G,AAGG	1127.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=49.03;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,15,8:0.65,0.35:23
chr12	72893531	rs1444607	T	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=1.280;SC=TAGACTGTGATTTAGAAAACA;SOR=0.616;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=72893539;WS=72893521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	72962547	rs11179252	G	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.742;SC=ATTAGAAAGAGAATATAAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=72962555;WS=72962537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	72969423	.	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.535;SC=GGACATTTAAAAAAATCTATT;SOR=0.144;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=72969431;WS=72969413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	73012599	rs112881013	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.83;MQRankSum=0.736;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TTTGCTTTTCCGTCTTTTATT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=73012607;WS=73012589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	73012649	rs111312234	CT	C	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=1.049;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.580;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	73014917	rs7139238	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=379;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TTGCAACAACATATATCAAGC;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=31;WE=73014925;WS=73014907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr12	73015115	rs74105937	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.844;SC=TCACTTTCCCGAGAGGACTGC;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=73015123;WS=73015105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	73015662	rs2217678	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=1.834;SC=AACATTTTGTGTCAGGTTCAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=73015670;WS=73015652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	74932159	rs590352	G	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=45;PP=1419;SC=ATCAGCAGCTGCAGCGCTCAC;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=74932167;WS=74932149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	75687185	rs7967562	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=-2.687;SC=TAGAAAGCATGTAAGAAATAA;SOR=2.115;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=16;WE=75687193;WS=75687175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
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chr12	75693520	rs11180451	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=330;ReadPosRankSum=-0.168;SC=ATTTAAATGACACAAACCTAT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=75693539;WS=75693510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr12	75693691	rs117647160	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=1.565;SC=GAGTTCTTATCCTGTTAAGAA;SOR=0.662;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=22;WE=75693699;WS=75693681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr12	75693751	rs7301532	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.922;SC=GATGGAAATTGTAAATGTACA;SOR=0.018;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=75693759;WS=75693741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	75706720	rs60971359	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=437;ReadPosRankSum=0.625;SC=TAAAGACAACTTCACCATCCA;SOR=0.310;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=27;WE=75706728;WS=75706710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr12	75710004	rs10879900	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=0.846;SC=TCAACTGTTGCAATTATTTAT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=75710012;WS=75709994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	75760742	rs12366348	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=526;ReadPosRankSum=-0.608;SC=CACCCAAGGGGCAGCTTGCAG;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=38;WE=75760750;WS=75760732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr12	75784773	rs7978856	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr12	75785100	rs11180483	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1218;ReadPosRankSum=0.784;SC=GGGGCGACGTCATTCCCCGAG;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=176;TCF=79;TCR=97;TR=78;WE=75785108;WS=75785090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,95:0.48:199
chr12	75785468	rs4393363	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=0.727;SC=AATATCAAGGGTAAAGAAAAT;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=20;WE=75785476;WS=75785458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr12	75796721	rs7135440	G	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=351;ReadPosRankSum=2.731;SC=TGATAGTCTTGCCACCTACCA;SOR=0.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=19;WE=75796729;WS=75796711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr12	75816612	rs1543946	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=361;ReadPosRankSum=0.625;SC=AAATTAGTAACTATATTATTT;SOR=1.358;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=16;WE=75816620;WS=75816602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr12	75816814	rs144850646	G	GACA	823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.974;NF=1;NR=15;PP=636;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TAATGGATTGGACAAGAAAAA;SOR=1.044;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=16;WE=75816822;WS=75816804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr12	75874913	rs2242435	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-1.047;SC=TAATACCTTCGTAATACTGAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=75874921;WS=75874903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	75875576	rs1909979	C	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=664;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGTTACATTTCAGATGAACCC;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=40;WE=75875584;WS=75875566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr12	75884254	rs28932170	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=-1.776;SC=CTGGCTTTGACGCTCTTTCCA;SOR=0.776;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=10;WE=75884262;WS=75884244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr12	75893478	rs35207358	CA	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	75893486	rs1056900	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=1.501;SC=ACCAAAAAAAAAAAAAGCCCT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=75893494;WS=75893468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	75895619	rs2306391	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=393;ReadPosRankSum=0.366;SC=ATAAAAAATATATCAGTTAAA;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=22;WE=75895627;WS=75895609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr12	75900382	rs11540407	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.381;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	75900588	rs2070162	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=513;ReadPosRankSum=0.780;SC=CTCCTTGCTAACAGTTTTATC;SOR=0.471;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=33;WE=75900596;WS=75900578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr12	75900702	rs2704766	G	A	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=53;PP=1757;SC=ACATGCTACAGAAGGAAAGAG;SOR=1.054;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=86;WE=75900710;WS=75900692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	76424937	rs71716769	TTGC	T	3774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.373;NF=19;NR=61;PP=2985;ReadPosRankSum=-1.497;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.389;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=91;TCF=19;TCR=72;TR=80;WE=76424947;WS=76424921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr12	76444510	rs4831914	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=283;ReadPosRankSum=1.103;SC=AAGACTCTTAGAGGCTGGGTG;SOR=1.238;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=20;WE=76444518;WS=76444500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr12	76447792	rs35076461	AT	A	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr12	76449900	rs1059143	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=184;ReadPosRankSum=2.163;SC=TTTCTTCATCTTTTTTCTCAT;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=14;WE=76449908;WS=76449890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
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chr12	76461257	rs3214625	T	TA	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.098;NF=4;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-1.601;SC=TGACGTGCTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.035;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=13;WE=76461265;WS=76461247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr12	76462612	rs10880034	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=1.289;SC=TCCAAAAAAATAGACTGGTAC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=16;WE=76462620;WS=76462602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr12	76780471	rs73137003	A	T	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=32;PP=1003;SC=CAAAAATTTTAAAAAATGTAT;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=76780479;WS=76780461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	76804168	rs35236201	G	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=110;SC=TTTCTAAGTAGCCAACAATAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=76804176;WS=76804158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	76804493	rs34492199	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=382;SC=GTATAGACTATATTTGATATA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=76804501;WS=76804483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	76805983	rs12814818	T	C	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=12;PP=1227;SC=GAACAACAAATATTGAGTGAG;SOR=2.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=56;WE=76805991;WS=76805973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	76852809	rs34838249	C	T	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=13;PP=566;SC=TGTTTAGTTACACTTGAATGC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=76852817;WS=76852799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	77158419	rs1017784	T	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=280;SC=GGGCCTGGTGTGGTTTTTGAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=77158427;WS=77158409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	77199250	rs140164197	AACTTG	A	904.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=891;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TAATTATTAGAACTTGACTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=19;WE=77199262;WS=77199240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr12	77202798	rs10778920	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.512;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr12	77214681	rs1477748	G	A	147.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TGATCAAATAGATATAGACTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=77214689;WS=77214673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	77214788	rs2306142	G	A	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=20;PP=1519;SC=TTAGATGACTGGAGGAGTAGT;SOR=1.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=77214796;WS=77214778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	77236968	rs1979743	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CTTTTGATTCGGAGGTGCCGT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=77236976;WS=77236958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	77239420	rs143729859	AAAAT	A	987.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.934;NF=9;NR=9;PP=747;ReadPosRankSum=0.154;SC=ATATTTTGAGAAAATAAATAG;SOR=0.122;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=18;WE=77239431;WS=77239410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr12	77254207	rs35557984	GA	G	3773.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.550;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.181;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,168:0.56:301
chr12	77256477	rs2047226	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=0.097;SC=GAATCAAAAATAAGAAGTAAT;SOR=0.193;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=77256485;WS=77256467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	77256681	rs2047227	T	G	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCTGTGAAATTGAAGTAAATA;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=64;WE=77256689;WS=77256671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr12	77419341	rs310831	A	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=412;ReadPosRankSum=2.010;SC=GCCTCACCTGATGTAATTTTA;SOR=0.513;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=29;WE=77419349;WS=77419331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr12	77419593	rs310830	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=868;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CACCAAGAGTAGAAGAAACCG;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=51;WE=77419601;WS=77419583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,55:0.62:89
chr12	77424135	rs10862960	C	T	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=1092;ReadPosRankSum=-2.158;SC=AGAAACGTAACGAAGTTAGCA;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=67;WE=77424143;WS=77424125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,81:0.42:193
chr12	77426776	rs753266	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=308;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TTTAGTCAAAGTTAACACTAG;SOR=0.268;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=19;WE=77426784;WS=77426766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr12	77438436	rs2242384	T	C	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1134;ReadPosRankSum=1.433;SC=TACTATGGTCTGGGGCATCTT;SOR=0.862;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=105;TCR=68;TR=86;WE=77438444;WS=77438426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,100:0.51:198
chr12	77438607	rs2242383	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=648;ReadPosRankSum=1.971;SC=AGCATCAAAGTATATGATTTT;SOR=1.133;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=21;TCR=65;TR=34;WE=77438615;WS=77438597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr12	77449790	rs310791	A	G	5052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=88;PP=2965;SC=CTGTCAACAAACTTAACTGGA;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=148;WE=77449798;WS=77449780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	78225186	rs17195772	C	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=599;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TGGAGTCTACCAGACTGAGGT;SOR=0.538;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=69;TCR=28;TR=38;WE=78225194;WS=78225176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr12	78225374	rs10735309	A	G	4729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=84;PP=2965;SC=TTTGGAACTTACTGAAACAGA;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=150;WE=78225382;WS=78225364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr12	78511755	rs300442	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=660;ReadPosRankSum=1.548;SC=CCTTAATTCATACTTTATAAA;SOR=2.179;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=34;WE=78511763;WS=78511745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr12	78513833	.	T	TATATA	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=101;QD=59.5;SC=ATGTATAAGGTATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=78513841;WS=78513823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,2:0.40:5
chr12	78530979	rs1852464	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=810;ReadPosRankSum=2.310;SC=ATTTGTCTCAGTTTAACCTTC;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=58;WE=78530987;WS=78530969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,74:0.58:128
chr12	78540174	rs34144410	TA	T	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=86;ReadPosRankSum=1.635;SC=CATTCAGAGGTAAAAAAAAAA;SOR=1.180;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=8;WE=78540182;WS=78540164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	78562687	rs1726431	A	G	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=52;PP=1692;SC=AATATAATAGACATCTATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=78562695;WS=78562677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	78569059	rs2442134	G	A	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=19;PP=1470;SC=TTCATGAGCCGATGTGATACT;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=78569067;WS=78569049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	78570914	rs1020462	G	C	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=37;PP=2381;SC=TTCTGTCCTTGTTTCAGCTGA;SOR=1.470;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=112;WE=78570922;WS=78570904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	78571186	rs1020461	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=737;SC=CTGTACCAATTATTTTCAGAT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=78571194;WS=78571176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	78571490	rs958836	T	C	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GATGCATGAATACTGCAAAGA;SOR=1.212;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=71;WE=78571498;WS=78571480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr12	78582362	rs300513	T	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=789;SC=TCTGTTTTGATTTTATTTTTT;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=78582370;WS=78582352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	78582566	rs400289	A	G	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=41;PP=1451;SC=AGGTAAAAGCAATAATGAAAA;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=71;WE=78582574;WS=78582556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	78590946	rs300498	A	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=464;SC=GAGGACAAAGAGTGCTATTCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=78590954;WS=78590936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	78591249	rs981213	C	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=327;SC=CTTCTTGTACCTGTATGCATT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=78591257;WS=78591239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	78592992	rs11272983	ATGGGAACATTATTAC	A	3901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=43;PP=2933;SC=ACCAATTGAAATGGGAACATT;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=78593014;WS=78592982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	78593070	rs140965470	AAATTT	A	1249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=90;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.863;NF=16;NR=25;PP=1178;ReadPosRankSum=0.651;SC=TGTGAATGTAAAATTTAATTT;SOR=0.671;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=41;WE=78593082;WS=78593058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr12	78594405	rs3214044	T	A	169.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.22;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	78598891	rs9971904	G	A	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=53;PP=1809;SC=AGCACATTCCGCAAACTGACA;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=78598899;WS=78598881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	79611374	rs2037743	C	T	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=82;PP=2965;SC=TGCCAAGCAACGCCACAGAGC;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=150;WE=79611382;WS=79611364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	79611536	rs2400390	T	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=30;PP=902;SC=GGAAAGAAAGTAGAACTCCGT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=79611544;WS=79611526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	79747441	rs11609641	C	T	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=91;PP=2677;SC=AATGCTGTTTCGTCGTGGATA;SOR=2.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=26;TCR=91;TR=117;WE=79747449;WS=79747431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	80014907	rs2307223	A	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1139;SC=CTTCATTCTGAATAGTGTTCT;SOR=1.573;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=80014915;WS=80014897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	80175764	rs2111687	G	A	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=6;PP=140;SC=ACAGGTTCGTGAGTAAAGCAA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=80175772;WS=80175754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	80201271	rs34190005	TTA	T	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=257;SC=AGTACTAAGATTATATACCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=80201280;WS=80201261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	80216060	rs3849223	C	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=786;SC=TATATAAAGACGTTGGATAAC;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=80216068;WS=80216050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	80602001	rs1244908	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=0.781;SC=GAATTATGGTTATCTAGAGCA;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=24;WE=80602009;WS=80601991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr12	80603406	rs4842344	A	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	80604767	rs80086846	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.694;SC=AAATAAGTGAAATGTTTTACA;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=18;WE=80604775;WS=80604757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	80626970	rs1451105	T	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=307;SC=GTCATAGCTTTGGGAAAATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=80626978;WS=80626960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	80632596	rs143126749	TTG	T	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.63;ReadPosRankSum=1.972;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,7:0.13:55
chr12	80645734	rs11438265	A	AT	145.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.7346;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=135;SC=CAAGTATGCAATTTTTTTGCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=80645742;WS=80645724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	80645799	rs2100258	A	T	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.82;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	80647155	rs10862083	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=1;PP=1033;SC=ATGCGTAGGTATTCAACAGAA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=80647163;WS=80647145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	80648148	rs144548100	ATTTAT	A	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	80648399	rs7295623	C	T	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=23;PP=733;SC=TTTCTTTAGACTGGGGAGAAA;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=80648407;WS=80648389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	80650276	rs147846753	T	TCAAA	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=630;SC=TTTCTTTACATCAAACAAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=80650284;WS=80650266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	80655692	rs10778721	G	A	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1766;SC=AATATCTGAAGGTTATGAACA;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=80655700;WS=80655682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	80663825	.	GA	G	248	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=13;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=60.58;NF=10;NR=3;PP=248;QD=19.4615384615;SC=GAAATTCAGGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=13;WE=80663846;WS=80663815;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,13:0.48:27
chr12	80663838	.	A	C	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.92;NF=6;NR=3;PP=159;QD=21.5301347275;SC=AAAAAAAAAAACAACAGATTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=9;WE=80663846;WS=80663815;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	80665397	rs4483657	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=834;ReadPosRankSum=-2.397;SC=ACAAAAAGTTAAGGACATTTT;SOR=1.846;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=39;WE=80665405;WS=80665387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr12	80671834	rs11114382	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.256;SC=AGATAGAGTGCCTTAGACAGC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=80671842;WS=80671833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	80672064	rs1376384	A	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=748;ReadPosRankSum=0.706;SC=TGGTAAGGAGATCCATTTATT;SOR=1.078;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=48;WE=80672072;WS=80672054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr12	80707236	rs11114396	T	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=390;ReadPosRankSum=-0.035;SC=AATTAAGTAATCTTTCACCTC;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=21;WE=80707244;WS=80707226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr12	80712307	rs7963215	A	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.10;SOR=1.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	80712420	rs10778725	G	A	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=57;PP=1732;SC=TCTGTTTGCCGAGAAGCAGTG;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=89;WE=80712428;WS=80712410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	80726708	rs1451101	A	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=0.714;SC=ATTTCTTAGCACAGTTTCTGT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=11;WE=80726716;WS=80726698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	80730466	rs73137398	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=0.045;SC=TAATGTTTCAGAAACATTTCT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=80730474;WS=80730456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	80730561	rs11300714	CT	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=0.547;SC=AAAAGTATTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=5;WE=80730569;WS=80730551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	80735737	rs61735664	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=317;ReadPosRankSum=0.091;SC=GGAATTTGCAATGAAGATCCG;SOR=1.536;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=80735745;WS=80735727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	80746234	rs147703967	G	GAAT	2157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=1748;SC=ACTGTTAACTGAATATTTTTC;SOR=2.078;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=33;WE=80746242;WS=80746224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	80747209	rs7312569	C	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=861;ReadPosRankSum=1.571;SC=CTGTTTGAATCTAAGAGAAGA;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=56;TCR=82;TR=59;WE=80747217;WS=80747199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,76:0.45:169
chr12	80747242	rs7297767	A	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=747;ReadPosRankSum=-1.603;SC=AGTTGGAACTATTCTTCACAG;SOR=0.920;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=50;WE=80747250;WS=80747232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr12	80749392	rs6539501	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TCTGAGAAAAACAATAGACTT;SOR=0.116;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=80749400;WS=80749382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	80750659	rs11836060	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=812;ReadPosRankSum=2.503;SC=ATTCAAGTTCGACAGGAAGAA;SOR=0.404;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=58;WE=80750667;WS=80750649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,66:0.44:151
chr12	80750741	rs5799468	G	GA	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.727;SC=AAGGATCTAGGAAAAAAATCT;SOR=0.748;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=15;WE=80750749;WS=80750731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr12	80752660	rs2034528	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=410;SC=TGAAAACCTTATTATGCCAAC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=80752668;WS=80752650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr12	80760470	rs34113015	GT	G	848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=711;SC=ATTAGTATCTGTTTTTTCACT;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=80760478;WS=80760460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	80761411	rs11114416	G	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=199;ReadPosRankSum=1.106;SC=TAAAGTATTTGGAAGAAGACT;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=13;WE=80761419;WS=80761401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr12	80761430	rs1551118	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=242;ReadPosRankSum=-1.783;SC=CTTTTGTTATGCTATAGAGTG;SOR=0.485;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=17;WE=80761438;WS=80761420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr12	80761465	rs2717482	G	A	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=22;PP=914;SC=ATAACCATACGGGCTTTCACA;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=80761473;WS=80761455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	80762163	rs57527553	T	TCC	2018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=4.373;NF=14;NR=37;PP=973;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TTGGAAAATGTCCCCCCCCAC;SOR=0.739;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=164;TCF=30;TCR=134;TR=51;WE=80762171;WS=80762153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,74:0.34:219
chr12	80762246	rs10778730	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.164;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=496;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GTTACATTTTGAAGTATCTGA;SOR=2.093;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=28;WE=80762254;WS=80762236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr12	80764574	rs10862099	C	T	131.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5434;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.465;SC=TACATAATGGCGAATGTGTTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=80764582;WS=80764564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	80765683	rs5799469	TGAA	TAA,T	193.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=-1.118;SC=TATTTTTCTATGAAGGCTTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=80765695;WS=80765673;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.46:13
chr12	80765685	rs201680829	AAG	A	193.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	80765687	.	G	A	305	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=305;QD=67.9542425094;SC=TTTCTATGAAGGCTTTGTGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=80765695;WS=80765673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr12	80765741	rs1037336	C	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=550;SC=TTTTCTAGTACAAGAGAACAT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=80765749;WS=80765731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	80765945	rs10778734	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-0.374;SC=ATGATGCAAAGAGAGAAACAA;SOR=0.465;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6;WE=80765953;WS=80765935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr12	80771813	rs2717477	G	A	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TAGACTGTACGTGCCAGTGGA;SOR=0.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=62;TCR=96;TR=85;WE=80771821;WS=80771803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,95:0.53:179
chr12	80816492	rs4482093	C	T	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=756;ReadPosRankSum=0.771;SC=TCTCTGGAATCGAGTTGATGG;SOR=0.733;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=47;WE=80816500;WS=80816482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
chr12	80818876	rs10746164	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=526;ReadPosRankSum=0.618;SC=GGGACTGAAAAGAAGCCATCC;SOR=0.993;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=33;WE=80818884;WS=80818866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr12	80821391	rs61127339	C	CT	780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.896;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.720;NF=2;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TATTTCACTCCTTTTTTTTTG;SOR=0.204;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=19;WE=80821399;WS=80821381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr12	80821446	rs7294514	T	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=16;PP=317;SC=TGTGCCACTTTGTTAATGTAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=80821454;WS=80821436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	80828679	rs4128303	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GCTTTTTAAACTTTGGAAAAT;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=11;WE=80828687;WS=80828669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	80828843	rs9669382	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=0.105;SC=GTTAAAGGCAAAGGTTACAGT;SOR=0.836;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=14;WE=80828851;WS=80828833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr12	80838012	rs10746166	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=2;PP=485;SC=TTGAGTAATATGGGCTCATTA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=80838020;WS=80838002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	80840771	rs7311270	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AGAAATCTCCGTACTGTTTCT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=17;WE=80840779;WS=80840761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr12	80842199	rs11513908	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.326;NF=1;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.038;SC=ACATGTGCACAATGTGCAGGT;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=8;WE=80842207;WS=80842189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	80848925	rs7979859	T	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CTGCTTTTGATGATGGCAATA;SOR=1.051;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=26;WE=80848933;WS=80848915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr12	80849328	rs4482094	G	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=26;PP=809;SC=TTCAGTTGTAGCAGCTGAAAC;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=80849336;WS=80849318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr12	80852758	rs10862125	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=730;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GATATCTATACAATCAACAAA;SOR=1.030;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=38;WE=80852766;WS=80852748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
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chr12	80855597	rs4499068	T	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=19;PP=1317;SC=TAATCCTAAATGGAGAAAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=63;WE=80855605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr12	80855818	rs7976388	A	C	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.746;NF=19;NR=31;PP=611;ReadPosRankSum=-1.241;SC=GTGCGCCGTGAGAGAGCCGAA;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=50;WE=80855826;WS=80855808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr12	80855835	rs11524045	C	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.420;NF=8;NR=28;PP=590;ReadPosRankSum=-1.318;SC=CGAAGCAGGGCGAGGCATTGC;SOR=0.790;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=36;WE=80855843;WS=80855825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr12	80855856	rs4448754	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.733;NF=1;NR=21;PP=415;ReadPosRankSum=0.973;SC=CTCACTTGGGGAGCACAAGGG;SOR=1.965;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=22;WE=80855864;WS=80855846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr12	80862469	rs56105723	A	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=220;ReadPosRankSum=2.321;SC=TTATGTATTTATTTTCTATAA;SOR=0.328;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=80862477;WS=80862459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr12	80878174	rs7311413	T	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=848;SC=ATATTTTTAATTTCCCCCTTT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=80878189;WS=80878164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	80878181	rs56351124	C	CT	1831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=1227;SC=TAATTTCCCCCTTTTCTTTTC;SOR=2.356;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=32;WE=80878189;WS=80878164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	80889165	rs145970310	T	TTTG	880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=571;SC=AAAACAATGTTTTGTTGTTGT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=80889173;WS=80889155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	80889829	rs10778752	T	A	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=25;PP=920;SC=TCAACCCACGTTGGAGAAAGT;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=80889837;WS=80889819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	80890325	rs56929349	T	TG	3019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=47;PP=2445;SC=GCTTTTGTTTTCTTTGTTTGT;SOR=1.550;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=52;WE=80890333;WS=80890315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	80899901	rs11114486	C	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=-0.926;SC=TGGAATCATACAAAAATATAC;SOR=1.039;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=20;WE=80899909;WS=80899891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr12	80900058	rs7964887	T	C	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=220;SC=AGTTTAATGTTAATAGTTTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=80900066;WS=80900048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	80900335	rs7975096	G	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=760;ReadPosRankSum=0.932;SC=TTACCTATTTGATTTCTCTTT;SOR=0.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=18;WE=80900356;WS=80900325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr12	80900348	rs7965277	T	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=760;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TTCTCTTTAGTACTGAAGAAA;SOR=1.032;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=23;WE=80900356;WS=80900325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr12	80900397	rs12824064	C	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=688;ReadPosRankSum=0.178;SC=CTAGTACACTCAAAGGTGAAG;SOR=0.649;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=45;WE=80900405;WS=80900387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,53:0.58:91
chr12	80900495	rs7976085	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CTATAACATTCCAAGAAACAC;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=10;WE=80900503;WS=80900485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr12	80904325	rs7963676	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=131;ReadPosRankSum=-1.070;SC=ACATTAGGAACCTGATTATTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=80904333;WS=80904315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	80933465	rs2222752	G	A	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=97;SC=ATGATAAATAGTAAAATCGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=80933473;WS=80933460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	80933785	rs7954867	A	C	172.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=6.021;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ATTTTAGGAAATTTTACTATT;SOR=2.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=80933793;WS=80933775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	80935300	rs11114502	A	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=1.293;SC=AGGGTAACTGATGATTTTTGT;SOR=0.435;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=11;WE=80935308;WS=80935290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr12	80935345	rs6539524	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=683;ReadPosRankSum=1.596;SC=ACCTGAAGGGTTTGTTGGAAA;SOR=1.117;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=40;WE=80935353;WS=80935335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr12	80936026	rs17713202	A	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=508;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TACTTCTGATAATTACATAAT;SOR=0.409;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=29;WE=80936034;WS=80936016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr12	80936082	rs11114503	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=652;ReadPosRankSum=-0.988;SC=TTTTTGCTGCCGCAAGAACTA;SOR=0.496;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=45;WE=80936090;WS=80936072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr12	81007513	rs186848048	T	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.497;SC=AAGATGATCCTACTGCTGTCC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=64;WE=81007521;WS=81007503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
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chr12	81624720	rs1950100	T	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=0.767;SC=AGGGGTTATATTTCAATGTAG;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=81624728;WS=81624710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	81676690	rs117109468	T	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TTGAGCTAAGTGAAGGTTTAC;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=9;WE=81676698;WS=81676680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	81688958	rs1882188	C	G	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=236;SC=CCCTAGAGGACATAGATGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=81688978;WS=81688948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	81688970	rs1882187	A	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=174;SC=TAGATGCACAAAGAAATTAAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=81688978;WS=81688948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	81695836	rs10862288	G	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=274;SC=CAGAAGAGGTGCTAAATAAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=81695844;WS=81695826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	81696399	rs1921053	G	A	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=41;PP=1868;SC=GTGGAAAAACGGATCAGATGG;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=81696407;WS=81696389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	81746835	rs2060206	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=475;ReadPosRankSum=0.805;SC=CTAGTAATTACATTTTTAGTA;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=60;TCR=4;TR=28;WE=81746843;WS=81746825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr12	81751813	rs11835074	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=0.996;SC=AAAAATGAAACTATGTATTTA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=14;WE=81751821;WS=81751803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	81762478	rs10506275	G	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=444;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AAATATTCATGTGATTTTACC;SOR=0.974;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=25;WE=81762486;WS=81762468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr12	81769581	rs10862301	C	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GAACCTGCCGCAGGATAGCTT;SOR=0.385;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=66;WE=81769589;WS=81769571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,84:0.49:173
chr12	81833745	rs2272083	G	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1326;ReadPosRankSum=-1.077;SC=AAGTGTGGCAGGTTACCTCCT;SOR=0.777;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=229;TCF=113;TCR=116;TR=100;WE=81833753;WS=81833735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,116:0.44:266
chr12	82617279	rs7304928	G	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=435;SC=ATGAAAGCTTGTTTGAAGGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=82617287;WS=82617269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	82751955	rs6539662	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=647;SC=TTATATCCTAAAACTTAGCAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=82751963;WS=82751945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	82752080	rs61737397	C	T	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1123;ReadPosRankSum=0.873;SC=TTCCTGTACCCGACAGTGGAA;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=95;TCR=67;TR=74;WE=82752088;WS=82752070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,82:0.44:185
chr12	82752633	rs4882530	G	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=19;PP=696;SC=GGGCGGGAAGGGAGGCGGAGG;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=82752641;WS=82752623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	82783668	rs10778908	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=41;PP=1350;SC=CAGAGCTGATCAGCAGTATTG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=74;WE=82783676;WS=82783658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	82792787	rs4296098	C	A	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=33;PP=1891;SC=AAGGAAAGTGCAAAATAAAGT;SOR=1.203;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=82792795;WS=82792777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	82792949	rs34765930	G	A	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=885;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GCCACATCAAGAAGAAAATTT;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=50;WE=82792957;WS=82792939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr12	82828426	rs10683876	T	TATAAG	3975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=16;PP=2974;SC=TTATAAATCTTATAAGACTCA;SOR=2.010;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=47;WE=82828434;WS=82828416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	82832418	rs2717448	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=292;SC=ACAGTCACGTGTGGTTCCAAC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=82832426;WS=82832408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	82850427	rs2731290	A	G	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.97;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	83324499	rs10746259	G	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=436;SC=CTTTGTTTCGGGCCACATCAT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=83324507;WS=83324489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	83358930	rs2403023	A	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1119;SC=ACCTCTTTCCATATTTGAAAA;SOR=1.539;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=55;WE=83358938;WS=83358920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	83424455	rs11115554	A	T	1294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;QD=25.89;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	83525962	rs7970515	T	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=611;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GGCCTCCTAATTGTTTTCCTT;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=38;WE=83525970;WS=83525952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr12	85277608	rs17183612	C	T	4882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=51;PP=2965;SC=TGGTGATTAGCAGAATGAGGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=147;WE=85277616;WS=85277598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	85285920	.	T	TA	59	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9999;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=59.2;NF=0;NR=3;PP=59;QD=20.6666666667;SC=GCGAAGTATTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=85285928;WS=85285910;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,3:0.23:13
chr12	88177515	rs368363293	CGCTGCGCTGCACAGCAAAT	C	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=2969;ReadPosRankSum=0.837;SC=ACCATTTCCTCGCTGCGCTGC;SOR=1.042;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=12;WE=88177546;WS=88177505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr12	88177538	rs193130559	A	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=1114;ReadPosRankSum=0.654;SC=AGCAAATGAGAGCTCCCTGTC;SOR=0.896;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=15;WE=88177546;WS=88177505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr12	88177722	rs1796320	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=504;ReadPosRankSum=-2.282;SC=TTGTTTCCACGGCAGTTTGCT;SOR=1.320;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=27;WE=88177730;WS=88177712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr12	88177791	rs1675574	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=764;ReadPosRankSum=2.615;SC=TGCAGGAAGGCGCAGTGCGGC;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=50;WE=88177799;WS=88177781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,63:0.41:154
chr12	88178271	rs112316052	TGCC	T	2720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.993;NF=10;NR=36;PP=1992;ReadPosRankSum=-1.477;SC=AGGCCGCTGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.422;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=95;TCF=13;TCR=82;TR=46;WE=88178281;WS=88178261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr12	88379566	rs10858676	A	G	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=279;SC=CAAGCTGTCAAGAAATTCCAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=88379574;WS=88379565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	88440676	rs9262	G	C	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=29;PP=1403;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CAATGATCTCGTGTCCTGGTT;SOR=1.202;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=172;TCF=103;TCR=69;TR=85;WE=88440684;WS=88440666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr12	88453608	rs2471512	C	T	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=226;SC=GGATCTACTTCCAGTTTTTCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=88453616;WS=88453598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	88454594	rs11405846	T	TA	651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=408;SC=ATGATCACATTAAAAAAAATT;SOR=1.708;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=16;WE=88454602;WS=88454584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	88473049	rs2468245	C	T	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=69;PP=1978;SC=TAAAGGAAAACTGACATTTTA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=87;WE=88473057;WS=88473039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	88474000	rs201353893	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=560;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CTCTTTAGCCGTTCTACTAGA;SOR=0.228;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=37;WE=88474008;WS=88473990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr12	88478316	rs11356711	TA	T	467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=455;SC=AGCATTTGCTTAAAAAAACTA;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=17;WE=88478324;WS=88478306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	88483272	rs10717563	TA	T	2417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=58;PP=1476;SC=TGCCTGATATTAAAAAAAATA;SOR=2.120;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=64;WE=88483280;WS=88483262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	88496838	rs2471532	C	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=171;SC=TTTTTCTGGTCAAGCACTAGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=88496846;WS=88496828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	88505078	rs2468255	T	C	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=17;PP=655;SC=AAACAACATTTGATCCTTCTG;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=38;WE=88505086;WS=88505068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	88522823	rs71082425	A	AC	1731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=1198;SC=CTAAAAGACAAAGTTATTTCA;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=88522831;WS=88522813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	88522936	.	C	CTTA	32	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=32;QD=53.9871282029;SC=CGTATTCATACTTATATACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=88522944;WS=88522926;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	88525048	.	AT	A	42	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=50.71;NF=0;NR=4;PP=42;QD=11.5;SC=TTCAGCAGTAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=88525056;WS=88525038;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr12	88547277	rs2468230	T	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=17;PP=509;SC=ACCCAATACATACAGAAGCAG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=88547285;WS=88547267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	88900246	rs10506953	G	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATCTTTTATGGCAATAACTCC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=88900254;WS=88900236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	88900891	rs41283112	C	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=524;ReadPosRankSum=0.988;SC=AGGCTGGAGTCTCCAGGGGGA;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=39;WE=88900899;WS=88900881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr12	88909178	rs190711063	A	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=1.157;SC=TCTCAAGAAGACCATAAAAGG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=88909186;WS=88909168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	88910307	rs2291557	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-1.036;SC=AAATAGTCTTCAGACTTAACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=88910315;WS=88910297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	88926072	rs4842477	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GAAAAAAAAGCCTGCAAGTCA;SOR=0.204;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=88926080;WS=88926062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	88926290	.	C	CA	217	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=60.48;NF=1;NR=16;PP=217;QD=13.2941176471;SC=CCTACAGAGACAAAAAAAAAA;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=17;WE=88926298;WS=88926280;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,17:0.34:50
chr12	89743223	rs704075	G	A	6251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.14;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr12	89743223	.	GTC	ATA,ATC	1104	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=33,71;NR=38,81;PP=1104,1076;QD=16.3023644347;SC=TGTCATAGGCGTCGTTCATCG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=71,152;WE=89743233;WS=89743213;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:152
chr12	89743225	.	C	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.283;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
chr12	89745477	rs2279574	C	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1388;ReadPosRankSum=0.583;SC=AGCCCGAGCACCGACTCGCCG;SOR=0.697;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=93;WE=89745485;WS=89745467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,113:0.48:234
chr12	89853408	.	G	A	427	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=13;PP=427;QD=30.7847475031;SC=AAAAAAACCCGACTTACTGTG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=89853416;WS=89853398;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	89853694	rs7953615	G	A	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=308;SC=GATCATTTTGGTAAGGTTGAA;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=89853702;WS=89853684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	89861265	rs9308287	C	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=576;SC=CTTCATGGTACTAATTAAAAT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=89861273;WS=89861255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	89861529	rs10506972	T	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=395;SC=AAGAAGACTATGGATATCAAT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=89861537;WS=89861519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	89864432	rs10777167	T	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=215;SC=ATCACATAGCTCTAAGCTTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=89864440;WS=89864422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	89885923	rs6538189	C	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=769;SC=ATTTATAACTCATTTGATTTA;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=89885931;WS=89885913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	89885942	rs6538190	T	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=676;SC=TAATTATAGTTAATACTTAAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=89885950;WS=89885932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	89917518	rs2230281	A	G	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=57;PP=2911;SC=GGGCTCCCCTATCTGCATATA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=139;WE=89917526;WS=89917508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	89918677	rs11105310	C	A	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=125;SC=AGGCCCAGACCGCTGGATAGG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=89918685;WS=89918676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	89919630	rs67346689	ACC	A	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=3;PP=139;SC=CCAGGGAGGGACCCCCCCCAC;SOR=0.941;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=89919639;WS=89919620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	90015579	.	C	CA	126	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=62.13;NF=1;NR=7;PP=126;QD=16.5;SC=CTACAGTGACCAAAAAAAAAA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=90015587;WS=90015569;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	91334194	rs4520662	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=411;SC=AGTAGACTCCTTGAATAGGAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=91334202;WS=91334184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	91449990	rs2735333	C	T	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=70;PP=2747;SC=AGACCTGCCTCACACTTCTAG;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=136;WE=91449998;WS=91449980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	92539344	rs709223	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=31;PP=769;SC=CCGGGGCGGCTGGGGCTCGGC;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=92539352;WS=92539334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	92539378	rs1049979	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=0.953;SC=CGGCGGAGCAGCCACCCCGGG;SOR=0.602;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=12;WE=92539386;WS=92539368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr12	92816525	rs73222027	G	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=0.348;SC=CATTTTCTTGGTTTGAATTCT;SOR=1.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=92816533;WS=92816515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr12	92818369	rs145810261	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=0.547;SC=GCATGACTCATGAGCAAGGAA;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=92818377;WS=92818359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	92818482	rs12580153	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=836;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TCCTTTCATTCCTCTATTTAC;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=52;WE=92818490;WS=92818472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr12	92818786	rs1515565	A	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=32;PP=1040;SC=TTTTGTCCAAAAATTTTAAAT;SOR=1.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=92818794;WS=92818776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	92821674	rs61935211	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=0.627;SC=GGGCGACAGAACGAGACTCCG;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=92821682;WS=92821664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr12	92821860	rs11284604	CT	C	1559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.929;NF=8;NR=22;PP=1099;ReadPosRankSum=0.472;SC=TAATTAACCCCTGTTACTTAC;SOR=0.870;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=30;WE=92821868;WS=92821850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr12	93100895	rs71456571	T	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=688;ReadPosRankSum=0.260;SC=AGCCCCACCCTACGACACCCT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=45;WE=93100903;WS=93100885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr12	93131203	rs2036553	A	C	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=76;PP=2965;SC=CTCCCGACCGATCAATTAGAC;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=170;WE=93131211;WS=93131193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	93147907	rs9669519	A	T	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=9;PP=1372;SC=TCCACGTGCCAGAGCTGCTAG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=93147915;WS=93147897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	93150102	rs924326	T	C	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=18;PP=1498;SC=AAAGAACACATGGCAGAAAAC;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=77;WE=93150110;WS=93150092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	93155399	rs201381357	GAAGAAAGA	G,GAAGA	953.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.14;QD=36.68;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,13:0.50,0.50:26
chr12	93155535	rs1504907	G	A	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=50;PP=1681;SC=CAGAAAGCACGAGATTCCTAG;SOR=0.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=87;WE=93155543;WS=93155525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	93196332	rs61756483	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=289;ReadPosRankSum=1.402;SC=TTTTGTAGTTCTGTTACTGTT;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=19;WE=93196340;WS=93196322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	93196422	rs10745623	T	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=15;PP=527;SC=TTCAGGATTTTTTTTTCTTCC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=93196430;WS=93196412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	93202801	rs7970286	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=905;ReadPosRankSum=1.571;SC=ACATTTCCTTCTCCATTTCAA;SOR=0.917;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=55;WE=93202809;WS=93202791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr12	93206878	rs3925797	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=548;SC=ATCTGTAACAGCATTTACAAA;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=93206886;WS=93206868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	93236402	rs7300619	C	T	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=14;PP=392;SC=ACTAAATTGTCTAAAAGATAA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=93236410;WS=93236392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	93236419	rs7316894	T	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	93247775	rs3065021	G	GATA	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=837;SC=AAAAGGAAAAGATAATACTGT;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=93247783;WS=93247765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	93289284	rs56326442	GA	G	116.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=0.319;QD=14.53;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	93397725	rs17020888	T	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=41;PP=1084;SC=ATTATACCTCTTACGTCTCCC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=93397733;WS=93397715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	93609340	rs7305552	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TTCCCAATTCAACAGTTGGGG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=93609348;WS=93609330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	93721801	rs7976742	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=0.829;SC=AGAGAAACATACCTTGTGTAA;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=18;WE=93721809;WS=93721791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr12	93721949	rs11380531	A	AC	158.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=130;SC=TGAAGTCCTAACCCCAGTACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=93721957;WS=93721939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	93771224	rs35443572	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TTTCTAGGCCTTCACTCTCGC;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=62;WE=93771232;WS=93771214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr12	93788674	rs11107010	G	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GCCAGGCCTGGAGTACAGTGG;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=93788682;WS=93788664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	93862989	rs4761720	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-2.183;SC=GGTATGCTTAGAAGCAGATTC;SOR=1.609;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=93862997;WS=93862979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	93863162	rs4761721	C	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.81;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr12	93863170	rs4761722	C	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.804;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr12	93864474	rs1552861	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-1.911;SC=TCCTACTTGTAAGTTAGAACA;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=93864482;WS=93864464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	93881574	rs139138639	C	CT	218.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=140;SC=CTATGTTGTACTTTTTTTTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=93881582;WS=93881564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	93894779	rs6538424	A	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	93894823	rs6538425	G	C	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=86;SC=CTAAGAAATGGCTGATACGTA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=93894831;WS=93894813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	93898249	rs7971966	A	G	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=154;SC=ATCAGTATATAGAAATATTTT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=93898257;WS=93898239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	93967035	rs930316	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=576;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GCGCGGGAAGAGCTTCTTGGA;SOR=0.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=32;WE=93967043;WS=93967025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr12	93968378	.	CT	C	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5025;HP=12;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=4;NR=0;PP=38;QD=11.0;SC=CACACACCACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=93968386;WS=93968368;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr12	94243853	rs56944668	C	T	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GCCCATGGTGCTGTCTCTGGG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=80;WE=94243861;WS=94243843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,101:0.47:217
chr12	94562802	rs2361358	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=307;SC=TAGTCTAAGAGAATATATGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=94562810;WS=94562792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	94562875	rs2361359	C	G	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=23;PP=2271;SC=ATAATGAGAACTATTGTTGTT;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=74;TCR=23;TR=97;WE=94562883;WS=94562865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	94563134	rs3214968	A	AT	1480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.48;QD=29.61;SOR=5.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	94603249	rs2610671	G	A	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=18;PP=1562;SC=CACTGTACAAGGTCTGGCATT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=94603257;WS=94603239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	94603300	rs2305971	C	T	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1027;ReadPosRankSum=0.485;SC=AACTAATGCACGTATGGGGTC;SOR=0.847;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=68;WE=94603308;WS=94603290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr12	94613764	rs3833789	AT	A	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.960;NF=10;NR=7;PP=418;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAAAATCATCATTTTTTCCCC;SOR=0.532;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=17;WE=94613772;WS=94613754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr12	94620264	.	AT	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.004;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.282;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr12	94671922	rs11341959	CA	C	4589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=59;PP=2126;SC=TCCTTAAAACCAAAAAAAACA;SOR=1.017;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=92;WE=94671930;WS=94671912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	94673509	rs10713724	GC	G	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=714;SC=CCCCCTCCCTGCCCCCACCAG;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=20;WE=94673517;WS=94673499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	94688232	rs1880934	C	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=344;ReadPosRankSum=0.729;SC=AAATTTTGAACACTCATATAT;SOR=1.163;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=21;WE=94688240;WS=94688222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr12	94692628	rs144449115	AAAAG	A	1164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.312;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.786;NF=0;NR=22;PP=949;ReadPosRankSum=1.257;SC=AATATTAACTAAAAGAAAGAC;SOR=1.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=22;WE=94692639;WS=94692618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr12	94694872	rs55787485	T	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=832;ReadPosRankSum=1.163;SC=TGCAGTCTTATGAGTTTGACA;SOR=0.388;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=53;WE=94694880;WS=94694862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr12	94698880	rs3803071	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TTACCACTCACAGCATCAGGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=94698888;WS=94698870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	94763899	rs117829816	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=0.092;SC=AACAAGAAAACGCTCTGGTAG;SOR=0.826;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=14;WE=94763907;WS=94763889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr12	94769758	rs4761611	A	G	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=22;NR=23;PP=901;SC=CTTTTTCCAAACGTTCTGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=94769777;WS=94769748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	94769769	rs74340001	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr12	94772742	rs2271979	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=789;ReadPosRankSum=0.236;SC=TTGTTCCACTCGTTTGCTGTC;SOR=0.414;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=50;WE=94772750;WS=94772732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr12	94972290	rs2270893	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=906;ReadPosRankSum=1.380;SC=GCAGCTGGTCCTCCAGTCGCT;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=59;WE=94972298;WS=94972280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr12	94975799	rs3747553	G	A	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1620;ReadPosRankSum=0.648;SC=TATTGAAAACGAACACAGGTG;SOR=0.778;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=92;WE=94975807;WS=94975789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,99:0.48:208
chr12	94976084	rs3747552	T	C	2741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=50;PP=1341;ReadPosRankSum=0.649;SC=GCTGCTTGTCTGCGTTGTTCA;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=104;WE=94976092;WS=94976074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,129:0.54:239
chr12	94976383	rs3747550	T	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.575;SC=ACAGAATCTATGCACATACAA;SOR=0.409;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=11;WE=94976391;WS=94976373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	95044161	rs1274523	A	C	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=22;PP=1181;SC=CGGCCGGGGTACGAGTAGGTC;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=95044169;WS=95044151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	95228007	rs2289031	T	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=322;SC=CGGCATCCTGTCTGGGTCCAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=95228015;WS=95227997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	95365610	rs374549154	T	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=506;ReadPosRankSum=0.552;SC=ATAATAGACATAAAGCACATA;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=32;WE=95365618;WS=95365600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr12	95396669	rs6538588	A	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=-0.091;SC=AAATAAAGTGAGAGTAACAAC;SOR=0.495;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=19;WE=95396677;WS=95396659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	95397275	rs17321986	G	T	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=16;PP=1267;ReadPosRankSum=1.686;SC=AAGAGCTGTGGATTCTCCAAG;SOR=1.449;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=144;TCF=103;TCR=41;TR=73;WE=95397283;WS=95397265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr12	95397552	rs835044	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=1.030;SC=CAGAAGGTTCTCACGCGAACG;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=18;WE=95397560;WS=95397542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	95434116	rs249141	T	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GATTTGTCATTTGAATGACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=95434124;WS=95434107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	95475419	rs7399211	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GCCTGTGGTCCTCATTACCAT;SOR=0.207;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=10;WE=95475427;WS=95475409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr12	95500635	rs61938198	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.767;NF=9;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=0.104;SC=GTACCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=95500643;WS=95500625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
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chr12	95604290	rs10507047	T	C	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=846;ReadPosRankSum=-0.481;SC=ACTGTCATCCTGGCAAGTTTC;SOR=0.842;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=63;WE=95604298;WS=95604280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,76:0.44:173
chr12	95611141	rs6538617	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.896;SC=GTCCCGCCGCCCCGCGGCGCA;SOR=0.325;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=28;WE=95611158;WS=95611131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr12	95611150	rs79350049	C	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=1;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=1760;ReadPosRankSum=0.766;SC=CCCCGCGGCGCAGCCTGAGCG;SOR=1.274;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=37;WE=95611158;WS=95611131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr12	95611185	rs6538618	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=643;SC=CGGCCGACTCTAGCGACCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=95611193;WS=95611175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	95617758	rs10507048	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.271;SC=GTTGTATCACGAAAGTTTTGA;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=95617766;WS=95617748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	95617829	rs10777677	A	G	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=681;ReadPosRankSum=-1.645;SC=ATACCCAAGTATATAGTTGAG;SOR=1.166;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=39;WE=95617837;WS=95617819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr12	95618094	rs66936338	CTT	C	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	95636815	rs76574241	T	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=319;ReadPosRankSum=0.510;SC=ACTTTTATTATAGACCTTAAA;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=22;WE=95636823;WS=95636805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr12	95637234	rs1873052	C	T	3277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=66;PP=2111;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TCATCTATTCCTCTCACCCTC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=131;TCR=129;TR=135;WE=95637242;WS=95637224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,153:0.50:304
chr12	95637578	rs1873053	C	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=437;ReadPosRankSum=1.763;SC=AGTTCTTGCTCTCTCAAAACT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=29;WE=95637586;WS=95637568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr12	95639138	rs79929197	A	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGAAACAGGGAGAGGATTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=95639146;WS=95639128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	95639261	rs7979908	G	A	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=1661;SC=AAACTCTTTTGGGAAAAACTG;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=95639269;WS=95639251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	95651093	rs3751272	T	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.038;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=-1.748;SC=GAATTTGTTTTGCTATCAATT;SOR=2.765;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=95651101;WS=95651083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	95651888	rs6538624	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=282;SC=TATTATTTTTTGGCTGACTAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=95651896;WS=95651878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	95656936	rs12305760	A	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=641;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TGTGCTCTCCATTGTAAAGGC;SOR=0.402;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=41;WE=95656944;WS=95656926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr12	95660182	rs17855933	A	G	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TATGCTTCCCACTTGGTGGAT;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=70;WE=95660190;WS=95660172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr12	95668437	rs3816838	G	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=649;ReadPosRankSum=0.079;SC=TAAAGATTAGGGAATGTGATA;SOR=1.466;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=36;WE=95668445;WS=95668427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr12	95675989	rs56228929	CA	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.697;SC=GGATAAAGTGCAAAATTTAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=95675997;WS=95675979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	95676053	rs3215007	T	TG	891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=687;SC=GACCAATATTTTTATTGATCT;SOR=2.400;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=17;WE=95676061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	95694111	rs17855934	T	G	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.777;SC=ATGTGAAAACTCTCTAGAAGG;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=75;WE=95694119;WS=95694101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,79:0.52:153
chr12	95694394	rs14121	G	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=24;PP=697;SC=ACTTTTGGTGGTGAGGAGGAA;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=95694402;WS=95694384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr12	95771236	rs2727663	T	C	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=43;PP=1013;SC=GACATGTGGATGGAAATTTGG;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=95771244;WS=95771226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr12	95927762	rs3812813	T	C	8378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=162;PP=2965;SC=TCTCCAGTTGTGTTATCATTC;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=107;TCR=162;TR=269;WE=95927770;WS=95927752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr12	95966944	rs4762567	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=297;ReadPosRankSum=0.019;SC=GCTGGACTACATCTCTAGTTT;SOR=0.997;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=22;WE=95966952;WS=95966934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr12	96063999	rs3829304	T	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.272;SC=AGCAAGTGTATCCAGATAACA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=96064007;WS=96063989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	96104461	rs2431012	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=641;ReadPosRankSum=-1.799;SC=AAAATGATGGGTTATCTCATA;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=44;WE=96104469;WS=96104451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr12	96106943	rs4129599	T	C	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=930;ReadPosRankSum=0.629;SC=CACAGATGCGTTGACTTTACA;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=51;WE=96106951;WS=96106933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,64:0.62:104
chr12	96131895	rs17288108	A	G	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1502;ReadPosRankSum=0.174;SC=TCTGTATCGTATGGTGGTGAC;SOR=0.519;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=100;WE=96131903;WS=96131885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,113:0.52:216
chr12	96180969	rs368445088	A	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=807;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTCTGTGCACATCCTCCGCAG;SOR=0.957;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=55;WE=96180977;WS=96180959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr12	96217159	rs10777742	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=1.018;SC=ATATTAAAAACGCCATCTATT;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=96217167;WS=96217149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	96253003	rs66876037	A	AG	813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.42;NF=0;NR=21;PP=860;SC=CTCTGCTTTTAGGTTTCTGAG;SOR=4.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=96253011;WS=96252993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	96254880	rs17024787	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=0.475;SC=ATTGGTGATTCGGTAGAAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=11;WE=96254888;WS=96254870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr12	96263376	rs56236436	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.048;NF=11;NR=28;PP=640;ReadPosRankSum=1.249;SC=GAGAAACATTCTTGTAACTAT;SOR=0.964;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=39;WE=96263384;WS=96263366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr12	96263437	rs10735335	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=7.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=-0.904;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.871;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr12	96263437	.	GAC	AAA	1023	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=60.35;NF=1;NR=12;PP=1023;QD=82.8052211432;SC=TGAGCCATGTGACTAGAAGAC;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=13;WE=96263466;WS=96263427;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,13:0.43:30
chr12	96263439	rs10735336	C	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.37;NF=4;NR=23;PP=715;SC=AGCCATGTGACTAGAAGACCT;SOR=3.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=27;WE=96263466;WS=96263427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	96263453	rs142067399	TTAAAGG	T	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.45;MQRankSum=1.336;NF=1;NR=8;PP=694;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AAGACCTCCTTTAAAGGTAAA;SOR=0.086;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=96263466;WS=96263427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	96266035	rs2117914	T	C	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GACTGTACTTTTGCCGCCATT;SOR=0.504;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=150;TCF=100;TCR=50;TR=75;WE=96266043;WS=96266025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,80:0.47:169
chr12	96273291	rs10507067	A	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=79;ReadPosRankSum=2.208;SC=GCACTCCACAATGTAAACTAT;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=7;WE=96273299;WS=96273281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	96282427	rs77783810	T	A	957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr12	96284650	rs6538681	A	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=23;PP=1129;SC=CTGAAAGGACAGCTGTCCTCC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=96284658;WS=96284640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr12	96292170	rs75959092	C	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=773;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CACCTTTTCACTGCTTGTACC;SOR=0.532;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=53;WE=96292178;WS=96292160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
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chr12	96313248	rs11108335	G	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=-1.179;SC=CGTTCACAAGGACTCAAATAT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=96313256;WS=96313238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	96337164	rs7955759	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GGCGACCCTCGGCGCGAGGCG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=96337172;WS=96337154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	96337183	rs7955450	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CGACATGGCAAGCGGCCACAG;SOR=0.446;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=12;WE=96337191;WS=96337173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	96337225	rs1436121	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=358;ReadPosRankSum=-1.869;SC=GCAAGTGGTGCTGGTGTGCGC;SOR=1.168;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=23;WE=96337233;WS=96337215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr12	96346594	rs1982138	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=394;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GGAAATGTATTCTACCAGGTA;SOR=0.484;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=26;WE=96346602;WS=96346584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr12	96354455	rs2043608	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=553;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GCACATTCATGCTATGGGAAA;SOR=0.302;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=29;WE=96354463;WS=96354445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr12	96355949	rs3751266	T	C	151.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=0.489;SC=GAGGCTGAGGTGGGAGAATTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=96355957;WS=96355944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	96356048	rs112878109	A	AAC	2411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=13;PP=1713;SC=TCTCAAAAATAAAACAAACAA;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=96356068;WS=96356038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	96356060	rs3751265	G	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.249;NF=22;NR=9;PP=556;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AACAAACAAAGCAATTTAATG;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=31;WE=96356068;WS=96356038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr12	96356280	rs5800239	A	AC	1775.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=1375;SC=CTCACCCCAGACCAAGAGCTG;SOR=1.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=33;WE=96356288;WS=96356270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	96359301	rs4762657	T	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=915;SC=CAGGAGTCCTTGGATTATATA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=96359309;WS=96359291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	96359426	rs4762658	C	G	5988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=77;PP=2965;SC=ACAAAAGCTCCCATTCTAGAG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=182;WE=96359434;WS=96359416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr12	96360350	rs1025606	A	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TGAGGCCTAAATCCCTTTTCC;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=13;WE=96360358;WS=96360340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr12	96367900	rs2230885	G	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=650;ReadPosRankSum=-0.506;SC=AGAACTGAATGATACAATGGA;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=33;WE=96367908;WS=96367890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr12	96371894	rs4762659	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=666;ReadPosRankSum=2.534;SC=GTGCTCCTCACAGGATGAGCT;SOR=1.345;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=40;WE=96371902;WS=96371884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr12	96374554	rs6538693	G	A	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,94:0.57:164
chr12	96374563	rs6538694	T	C	3632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,92:0.56:164
chr12	96374614	rs7297245	C	T	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1210;ReadPosRankSum=-1.466;SC=CCTCCAGAAACTGTCTCTCCC;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=58;TCR=75;TR=67;WE=96374622;WS=96374604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,81:0.50:161
chr12	96374672	rs6538695	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=2;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=1173;ReadPosRankSum=1.054;SC=TTGAAGATAATGTTTGCTGGT;SOR=0.443;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=43;WE=96374691;WS=96374662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr12	96374683	rs6538696	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=1173;ReadPosRankSum=1.903;SC=GTTTGCTGGTCACTTCAAGTA;SOR=0.730;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=34;WE=96374691;WS=96374662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
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chr12	96379806	rs3213737	G	A	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1240;ReadPosRankSum=0.320;SC=CACAAAACACGTAACCAAATA;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=85;WE=96379814;WS=96379796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,91:0.48:191
chr12	96386646	rs111580568	G	GCCCTCCCT	895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=5.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=0.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
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chr12	96653501	rs4762144	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=20;PP=711;SC=GTTTGCTTTACTTCCCAGACA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=96653509;WS=96653491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr12	96660985	rs75958097	A	G	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TTAAGGACTCATTAACTGATG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=68;WE=96660993;WS=96660975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr12	96691355	rs5800246	T	TA	448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=335;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TCCAATTTACTATGTTTTTCT;SOR=1.292;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=96691363;WS=96691345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	96694162	rs10777781	G	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=204;SC=AATGAAAAATGTAGTATTTAC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=96694170;WS=96694152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	96948163	rs7971858	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=-0.499;SC=AAAGTAGGTAAGTAAAGCATG;SOR=1.012;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=25;WE=96948171;WS=96948153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr12	96986190	rs2052293	G	A	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=7;PP=541;SC=TAGATACTGAGAACAAATCAA;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=96986198;WS=96986180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	96988037	rs815896	C	G	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=24;PP=2294;SC=CACCTATGTTCAATCTGAGTA;SOR=2.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=76;TCR=24;TR=100;WE=96988045;WS=96988027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	96992494	rs815890	C	T	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=28;PP=914;SC=ATACTGCGAGCTTTGAAAGTA;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=96992502;WS=96992484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	97020673	rs10507074	T	C	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=20;PP=667;SC=AAAAATTTCATCTTATGGTAG;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=97020681;WS=97020663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	97023937	rs9919717	A	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=19;PP=561;SC=ATAAAAAAGCAAACAAATCTT;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=97023945;WS=97023927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	97023991	rs1362949	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.47;NF=6;NR=16;PP=426;SC=GAGTAAGTTTCCTATGAGTTT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=97023999;WS=97023981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	97024016	rs35205059	TG	T	512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=407;SC=TTTTAGGTAATGAAATTAAGA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=97024024;WS=97024006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	97045672	rs11314540	GT	G	71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=55;SC=AGTAGAAACTGTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=97045680;WS=97045662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	97051632	rs10710617	AT	A	397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=235;SC=GAAATTACACATTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=11;WE=97051640;WS=97051622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	97079041	rs7974435	C	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	97079041	.	CCG	GCA	816	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=15;PP=816;QD=51.1451691095;SC=GGAAGGATCCCCGTACTAGCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=97079051;WS=97079031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	97079043	rs7974634	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	97085107	rs4762319	A	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.47;SOR=2.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	97098415	rs10860069	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=168;SC=AATTACTTTTCCAATAAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=97098423;WS=97098405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	97098549	rs11108643	T	C	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=17;PP=761;SC=TCAGGAAAACTTCTTACCAGT;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=97098557;WS=97098539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	97102578	rs7968231	G	A	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=32;PP=1315;SC=ACCAAACTTGGAAGGTAATTG;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=97102586;WS=97102568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	97102700	rs10581594	TTATA	T	628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=671;SC=TTCTCTATGCTTATATAATGA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=97102711;WS=97102690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	97136239	rs1990828	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.929;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=-0.914;SC=AAAGATGACAGTGAGTTTTTA;SOR=0.188;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=17;WE=97136247;WS=97136229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
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chr12	97303682	rs34499067	TA	T	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.778;NF=0;NR=13;PP=136;ReadPosRankSum=0.939;SC=TAGTATCCTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=13;WE=97303690;WS=97303672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
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chr12	97328714	rs1610921	TGCTTATAA	T	1053.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.130;NF=13;NR=5;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.617;SC=TCCTTATGAATGCTTATAATT;SOR=0.372;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=18;WE=97328729;WS=97328704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr12	97331219	rs67367047	GT	G	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=12.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=0.342;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.777;SOR=3.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
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chr12	97338696	rs249585	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=212;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TTTAAAGTTTGTGGACACTTC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=97338704;WS=97338686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr12	97339388	rs249589	G	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=263;SC=TTTCAAGTTTGCACATGCCAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=97339396;WS=97339378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	97345955	rs2304697	A	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=13;PP=343;SC=GAGTAAAAGGATGATGGGATT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=97345963;WS=97345945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	97639049	rs1012314	T	C	5793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=67;PP=2965;SC=TAATGCAGTCTCTCCATTTGT;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=123;TCR=67;TR=190;WE=97639057;WS=97639039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr12	97639144	rs1012315	A	G	8085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=126;PP=2965;SC=AAAAAAACTGATTATAGAAGC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=121;TCR=126;TR=247;WE=97639152;WS=97639134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr12	97885496	rs61943698	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.057;SC=CTGCTGTAAGTGTAAGCATCT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=97885504;WS=97885486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	98332667	rs1349300	C	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=898;SC=TTTTTTAAAACACAACTTATA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=98332675;WS=98332657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	98332704	rs1349299	C	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=20;PP=1800;SC=AACTCCTTTGCTCAATATTTA;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=98332712;WS=98332694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	98332904	rs3072891	TCA	T	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1109;SC=TTTCTTAGCCTCAGTTTTCTC;SOR=3.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=23;WE=98332913;WS=98332894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	98389341	rs1477006	A	T	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=248;SC=CAAGACCCAAAGCAAAAGTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=98389349;WS=98389331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	98849074	rs117051519	T	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=826;ReadPosRankSum=-1.250;SC=GGAGCCGCTGTGTGTGAGGAT;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=52;WE=98849082;WS=98849064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr12	98849314	rs12827746	A	T	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=35;PP=1578;ReadPosRankSum=0.770;SC=TCTGATATTAAGCCATGACAA;SOR=0.774;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=90;WE=98849322;WS=98849304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,104:0.59:175
chr12	98887013	rs17028385	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=0.191;SC=TCTTTCCCGCATTGCCACTTT;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=98887021;WS=98887009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	98897645	rs2289377	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GTGGCGCCCCGCCAGATTACA;SOR=1.675;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=16;WE=98897653;WS=98897635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr12	98925650	rs3213901	G	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=16;PP=574;SC=CAAATGTATGGAATTTTTTCA;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=98925658;WS=98925640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	98931528	rs12825374	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=324;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GTGTAGCCTGTGATTACAGCA;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=25;WE=98931536;WS=98931518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	98940228	rs34449077	A	AT	1452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.048;NF=11;NR=22;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GGAATTAGGTATTCAGATACA;SOR=0.740;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=33;WE=98940236;WS=98940218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr12	98941223	rs10860342	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=0.812;SC=CTTTATATGTATCAATTTTCT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=10;WE=98941231;WS=98941213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	98985056	rs934930	T	C	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=22;PP=692;SC=CCATGTCAACTTAGCTAGGCT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=98985064;WS=98985046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	99020688	rs148210292	TGACA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=443;SC=AGAATCAGACTGACAAAGATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=99020699;WS=99020678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	99056125	rs10745833	T	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=CTATTTGTTTTAAAAAAAATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=99056133;WS=99056121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	99116919	rs11109582	A	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=10;PP=681;SC=CACCCCTCCAATGAGATAGGA;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=99116927;WS=99116909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	99129497	rs10860361	G	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=606;SC=CATGTGCCTGGCATTGTGGTA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=99129505;WS=99129487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	99129541	rs7300187	G	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=249;SC=CAAAACAAAAGTCTTGCTCTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=99129549;WS=99129531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	99166805	rs2287574	G	T	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=987;SC=CTGTTGAAAGGGGGTGGGTAC;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=99166813;WS=99166795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	99175840	rs7954506	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=703;SC=ACCAGCAGTCAGTTTACTTCA;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=99175848;WS=99175830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	99447139	rs3794799	C	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TGTGTCCCAACAACAGAATGC;SOR=0.400;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=29;WE=99447147;WS=99447129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr12	99478626	rs3803094	C	T	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.547;SC=GTACTAAATACAAATACTCCT;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=70;WE=99478634;WS=99478616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr12	99478889	rs7970088	G	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=542;SC=GAGAAAACCAGTGAGTGACCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=99478897;WS=99478879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	99638276	rs2712643	C	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.464;SC=ATGAAGGGAGCAAATATTTTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=99638284;WS=99638266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	99639930	rs923724	G	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=793;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TTTCATTCCAGTTGGAGCCGT;SOR=0.203;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=22;WE=99639952;WS=99639920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr12	99639944	rs35408837	CT	C	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=10;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.017;NF=15;NR=7;PP=816;ReadPosRankSum=0.312;SC=GAGCCGTATGCTTTTTTTTTT;SOR=0.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=22;WE=99639952;WS=99639920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr12	99640557	rs1552759	T	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=495;ReadPosRankSum=-1.586;SC=ACTCACAGGCTGGAGAGGATC;SOR=0.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=40;WE=99640565;WS=99640547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr12	100041852	rs11109967	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=1.165;SC=CACGACTGCTGGCCCACCTGC;SOR=0.368;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=100041860;WS=100041842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	100041939	rs34319076	AT	A	1945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=3;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=1762;ReadPosRankSum=0.346;SC=AACTGTCTTGATTTAAAGGAA;SOR=0.579;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=27;WE=100041950;WS=100041929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr12	100041942	rs79915291	T	A	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=3;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TGTCTTGATTTAAAGGAAGAC;SOR=0.576;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=42;WE=100041950;WS=100041929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr12	100042040	rs11109968	C	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=1109;ReadPosRankSum=-1.560;SC=GAAGCTGCAGCGGCAACTGTA;SOR=0.948;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=63;WE=100042048;WS=100042030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr12	100042163	rs11109969	A	G	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1531;ReadPosRankSum=-1.254;SC=AATGGTAACAATGGGCATCGT;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=92;WE=100042171;WS=100042153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,106:0.62:170
chr12	100048839	rs11109976	T	A	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=996;ReadPosRankSum=-1.794;SC=AAAAGCAAACTTTTACCTGGG;SOR=0.852;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=65;WE=100048847;WS=100048829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,75:0.47:160
chr12	100169519	rs10778023	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TACTTCTGGTAATCAGTTTTT;SOR=0.172;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=16;WE=100169527;WS=100169509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	100173822	rs116442602	C	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CACTATCTAACTGCTGTAATT;SOR=1.022;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=100173830;WS=100173812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	100536318	rs374036647	G	C	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=688;ReadPosRankSum=0.439;SC=GCTGACTCCAGTGCGGGCTGG;SOR=0.510;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=41;WE=100536326;WS=100536308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,52:0.60:87
chr12	100787095	rs1998925	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=280;ReadPosRankSum=1.464;SC=TTAGCTGAAGTAGCACATCCA;SOR=1.345;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=16;WE=100787103;WS=100787085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr12	100795699	rs11568544	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=222;ReadPosRankSum=2.052;SC=ATTTTACTGCATATGGGTTTG;SOR=0.465;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=19;WE=100795707;WS=100795689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
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chr12	100806503	rs11568536	C	T	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=966;ReadPosRankSum=-1.861;SC=TTGGGTTGACCGATATGAAAA;SOR=0.504;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=57;WE=100806511;WS=100806493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
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chr12	101012490	rs7961640	G	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=978;SC=AATATAAACCGGTACTATTCT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=101012498;WS=101012480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	101017445	rs1469385	T	C	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=43;PP=2786;SC=GTTTGCCACATTAGAACAAAA;SOR=1.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=123;WE=101017453;WS=101017435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	101018014	rs1045602	T	C	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=56;PP=1547;ReadPosRankSum=-1.147;SC=TGAAACATAATCATATTTCTT;SOR=1.154;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=209;TCF=91;TCR=118;TR=89;WE=101018022;WS=101018004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,103:0.43:239
chr12	101127795	rs17030480	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=569;SC=TTTTCTGGATCGCCCTCTTGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=101127803;WS=101127785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	101133494	rs17478305	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=386;ReadPosRankSum=0.217;SC=ATGATGCCTGCCTGTTTATTA;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=19;WE=101133502;WS=101133484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr12	101133748	rs73145643	A	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=1051;ReadPosRankSum=-1.455;SC=AGATGCAGGCATCCCTGTGTA;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=70;WE=101133756;WS=101133738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
chr12	101133912	rs4764751	G	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=889;SC=TTGGAGATTCGGGACTGGGTG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=101133920;WS=101133902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	101365007	rs10778090	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGGTCCATGCATTCTAAGTTC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=101365015;WS=101364997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	101433990	rs665071	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTTCACAAGAGGAAACTCAT;SOR=0.627;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=6;WE=101433998;WS=101433980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	101473243	rs73156642	T	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TTTTGATTCCTTAGTGGAATC;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=18;WE=101473251;WS=101473233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr12	101473272	rs651784	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=2.065;SC=TGATTAAGTGGAGAATTCCAC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=101473280;WS=101473262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	101491375	rs1842888	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=1.483;SC=TGTAATATTCGCTGAAAGCTT;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=101491383;WS=101491365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	101510371	rs349661	T	G	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=24;PP=1542;SC=ACAATTGCAGTGACGTCTGGG;SOR=1.525;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=101510379;WS=101510361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	101520648	rs3832861	C	CTG	1782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.030;NF=8;NR=12;PP=790;ReadPosRankSum=-2.213;SC=ACATTCTCCTCTGTTTTAGCA;SOR=0.455;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=20;WE=101520656;WS=101520638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr12	101550961	rs150497001	A	AAC	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CTCATGATACAACACACACAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=6;WE=101550969;WS=101550951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	101551854	rs10860693	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-1.732;SC=ATAAAACAGATATAGATCATC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=101551862;WS=101551844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	101552075	rs2671444	G	A	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1081;SC=TGGTTAGTATGTATCTGGGGT;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=101552083;WS=101552065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	101584223	rs12313149	A	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=1017;ReadPosRankSum=0.523;SC=TTAATGATTCATATACCATGG;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=61;WE=101584231;WS=101584213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr12	101683929	rs703715	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=1.047;SC=CTGATAAAAACGCACTTTTCA;SOR=1.236;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=12;WE=101683937;WS=101683919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	101687043	rs2290720	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=276;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TTACTAAGTTCGGAGTATTTT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=17;WE=101687051;WS=101687033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr12	101701930	rs7975348	T	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=576;ReadPosRankSum=-0.116;SC=AAATACTGACTGGTCTTCTCC;SOR=0.420;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=36;WE=101701938;WS=101701920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr12	101715202	rs55721648	C	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AGTTATTACTCTGTGTACATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=101715210;WS=101715192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	101728166	rs2002895	A	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=485;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AATTTGGTATATGTATTTGGT;SOR=0.877;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=28;WE=101728174;WS=101728156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
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chr12	101750814	rs10082778	T	A	4444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=80;PP=2965;SC=CACTTCCTCCTATATGTTTTA;SOR=1.008;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=137;WE=101750822;WS=101750804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	101755683	rs7313312	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=499;ReadPosRankSum=1.384;SC=CTAGATCTTATGTTTTCCTAG;SOR=1.131;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=32;WE=101755691;WS=101755673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr12	101757530	rs2305862	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=-0.475;SC=AGGTAAGGACGTAAATGCAAT;SOR=1.109;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=20;WE=101757538;WS=101757520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr12	101761516	rs2305859	T	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=2.814;SC=TAAAAATGTTTTATCATTTCT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=12;WE=101761524;WS=101761506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	101761867	rs1457564	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=0.692;SC=TGATTGAGGTGTTTTTGTTTG;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=101761875;WS=101761857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	101777489	rs10860719	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=618;ReadPosRankSum=1.479;SC=TGCACATGAGGATTTCTAACT;SOR=0.226;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=45;WE=101777497;WS=101777479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr12	101779964	rs4764794	T	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1099;SC=GAAATTACAGTAGGTTGTCTG;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=101779972;WS=101779954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	101790373	rs73159756	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=0.253;SC=AAATTGAAAATATTTAATTTC;SOR=0.357;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=15;WE=101790381;WS=101790363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	101795009	rs17500203	A	C	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.756;SC=AGAAACTGACATATCAATTGC;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=55;WE=101795017;WS=101794999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,62:0.58:107
chr12	101796965	rs12370450	G	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=757;ReadPosRankSum=-0.811;SC=ACATGTGCAGGTGTGTGCACA;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=64;WE=101796973;WS=101796955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr12	101870804	rs7979430	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=11;PP=269;SC=TATCGATCATGTTAATAAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=101870812;WS=101870794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	102008103	.	T	A	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5164;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=61.34;NF=4;NR=0;PP=62;QD=24.1928031368;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=102008111;WS=102008093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr12	102020488	rs825073	A	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=217;SC=TTGCCTGAAAAACTCAGGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=102020496;WS=102020480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	102020810	rs825074	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.578;SC=AACAGTTTTCGCCTGTGCTGG;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=7;WE=102020818;WS=102020800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr12	102025926	rs61935677	C	G	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=69;PP=1822;ReadPosRankSum=-2.225;SC=GGTAAGAGAGCCTTCTTGCCT;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=214;TCF=76;TCR=138;TR=108;WE=102025934;WS=102025916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,123:0.49:251
chr12	102036305	rs2293468	C	T	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=55;PP=1323;ReadPosRankSum=0.121;SC=GAATCACCGACCTGCGCGGCA;SOR=0.868;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=195;TCF=78;TCR=117;TR=87;WE=102036313;WS=102036295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,101:0.44:230
chr12	102041757	rs17031746	A	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=564;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATCTGTGAAGAAATCAGGGCT;SOR=0.915;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=34;WE=102041765;WS=102041747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr12	102041967	rs3834936	C	CA	1391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1149;SC=GTTTAATAGACAAAAAAATTG;SOR=3.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=38;WE=102041975;WS=102041957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	102042985	rs3215353	A	AT	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=1.416;SC=TGGACAAGGTATTTTTCCTGA;SOR=0.152;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=11;WE=102042993;WS=102042975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr12	102043301	rs2272336	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTCTATTTGCGATGATTTTTA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=102043309;WS=102043291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	102044912	rs825046	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=414;ReadPosRankSum=0.556;SC=TCAAAACAAACATTGTAGTAG;SOR=1.112;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=25;WE=102044920;WS=102044902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr12	102045163	rs3817552	C	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1097;ReadPosRankSum=1.567;SC=AGGTGGTTCACAAGGGAAGGT;SOR=0.509;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=143;TCF=52;TCR=91;TR=64;WE=102045171;WS=102045153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,84:0.48:174
chr12	102045231	rs10860759	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=360;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TCTCCATTTTCTAAATTACAT;SOR=1.392;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=21;WE=102045239;WS=102045221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr12	102046303	rs145871881	C	CCT	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.611;SC=GGCTTCTCATCCTCTCTCTCT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=102046311;WS=102046293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr12	102046394	rs1997205	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=449;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GTCTTTTCAGCTTGGGTCATA;SOR=0.071;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=32;WE=102046402;WS=102046384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr12	102046595	rs1997204	T	C	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=64;PP=1747;SC=TGCATAGTTGTGTTCTTTTTT;SOR=1.241;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=101;WE=102046603;WS=102046585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	102046874	rs3835190	AC	A	1230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=1057;ReadPosRankSum=0.039;SC=GATAACAAAGACTATGCTTAA;SOR=0.430;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=26;WE=102046882;WS=102046864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr12	102053675	rs17511481	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=828;ReadPosRankSum=0.025;SC=AGTAGACTTTCCTTCTTTGTC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=45;WE=102053683;WS=102053665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr12	102053753	rs12372616	C	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.022;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	102053753	.	CAT	GAC	434	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=434;QD=54.1630972069;SC=GAGGACTTATCATTGGAGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=102053763;WS=102053743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	102053755	rs12367753	T	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.696;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	102057166	rs2254631	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=165;ReadPosRankSum=-0.235;SC=AGCTGTGTAGTAAATAGTTTA;SOR=1.038;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=11;WE=102057174;WS=102057156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	102060668	rs148269135	T	TACAC	293.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.20;QD=41.96;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	102061793	rs147564199	GTTAATGCT	G	414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=9;PP=2797;SC=TTGATATTTTGTTAATGCTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=102061808;WS=102061783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	102064118	rs7139095	T	C	6416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=88;PP=2965;SC=AGATTCGCATTCCAAGACACC;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=179;WE=102064126;WS=102064108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	102069077	rs764291	A	G	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1154;ReadPosRankSum=-1.061;SC=TAGACCGTCCAGGTCCACCCC;SOR=0.753;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=76;WE=102069085;WS=102069067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,86:0.58:149
chr12	102069264	rs1263786	G	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-1.277;SC=TTCATCAGAGGTAAAGGAGAT;SOR=0.321;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=9;WE=102069272;WS=102069254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	102071290	rs1263784	T	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CATTGTAAAATTATGATAATG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=14;WE=102071298;WS=102071280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr12	102074442	rs2303631	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-1.181;SC=TGGTGAGGGCAAGGGAAGCAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=102074450;WS=102074432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	102078094	rs2303629	G	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=206;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AAGTACTCAAGTTTGGTGTTA;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=15;WE=102078102;WS=102078084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr12	102079418	rs2764	G	A	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=81;PP=2516;SC=TAATTGATTCGTATCTGCGAG;SOR=1.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=45;TCR=81;TR=126;WE=102079426;WS=102079408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	102120364	rs222508	A	G	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=133;SC=TGAAGCCCCCATTGTATCATC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=102120372;WS=102120354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	102433811	rs4237982	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=665;SC=GGGTCTATCATGTTACTTAAA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=102433819;WS=102433801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	102444064	rs7958593	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=0.875;SC=CAAAGTGAGACCCTGTCTGAC;SOR=0.743;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=102444072;WS=102444054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	102455044	rs200289876	A	T	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1411;ReadPosRankSum=-0.923;SC=AAACTGTAGAAAAGCGGTTGA;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=85;WE=102455052;WS=102455034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,90:0.58:155
chr12	102455729	rs3751129	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=859;ReadPosRankSum=2.453;SC=GAGGAAGCCCGTCCTCATCCA;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=63;WE=102455737;WS=102455719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,80:0.46:175
chr12	102514184	rs4764863	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=5;PP=764;SC=GTGGGACCGAAGTATTATGGT;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=102514192;WS=102514174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	102517804	rs2036771	G	A	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1331;ReadPosRankSum=0.161;SC=TTTCTATGGCGGAGAACAACA;SOR=0.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=74;TCR=87;TR=79;WE=102517812;WS=102517794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
chr12	102545563	rs55772007	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-1.466;SC=AGAAGCTGGCAGCTGTCATGC;SOR=0.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=34;WE=102545571;WS=102545553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
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chr12	102589619	rs147960534	T	TTAAAAA	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
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chr12	102872155	rs67214112	C	CT	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TTTAAAAGTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=9;WE=102872163;WS=102872145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	103234479	rs798709	A	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1001;SC=AAGCCTCTGTATGTGTGTATG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=103234487;WS=103234469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	103237468	rs772897	G	C	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=39;PP=1499;SC=CCACGTAATAGAGGGGCTGGA;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=103237476;WS=103237458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	103238017	rs12580432	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=478;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CATATCAAAACGGATACAAAT;SOR=0.659;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=32;WE=103238025;WS=103238007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr12	103240630	rs1522306	C	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-0.565;SC=AGGGCCATAGCCTATAGCACT;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=103240638;WS=103240620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	103246700	rs1042503	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=946;ReadPosRankSum=-0.885;SC=GCAGGCCAGCCACAGGTCGGA;SOR=0.910;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=57;WE=103246708;WS=103246690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr12	103248924	rs1126758	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=617;ReadPosRankSum=0.968;SC=TCTGCAGGAACTGAGAAACGT;SOR=0.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=37;WE=103248932;WS=103248914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr12	103249164	rs2251905	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-1.302;SC=CACAGCAGAACGCAGGTTAGG;SOR=0.556;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=12;WE=103249172;WS=103249154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	103260273	rs10860933	T	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGCAGGACTCTTCATGCTGGT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=103260281;WS=103260264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr12	103260608	rs2247836	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=0.112;SC=CTACCAGATATTGTGAGTGAC;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=103260616;WS=103260598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	103271193	rs1718301	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=576;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGAGGGGAGTGGAGGAGAGGC;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=34;WE=103271201;WS=103271183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr12	103271350	rs2037639	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=434;ReadPosRankSum=0.080;SC=AGAAGGCAACGTCCTGAGTAC;SOR=0.834;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=32;WE=103271358;WS=103271340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
chr12	103352171	rs71438488	C	CGCA	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.39;MQRankSum=1.307;NF=11;NR=6;PP=709;ReadPosRankSum=0.649;SC=GCGCAGAGCGCGCAGCAGCAG;SOR=0.818;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=17;WE=103352181;WS=103352161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	103561799	rs1401988	C	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=3;PP=1185;SC=TTAATATGTACATGCATCTCT;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=46;WE=103561807;WS=103561789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	103670917	rs12311525	A	G	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1043;ReadPosRankSum=1.694;SC=ATCATACCAAACGATACTCAC;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=66;WE=103670925;WS=103670907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,92:0.44:208
chr12	103696182	rs79387839	T	G	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1265;ReadPosRankSum=1.899;SC=AGGAGTCTGCTTTGGATGTCG;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=100;WE=103696190;WS=103696172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,122:0.50:243
chr12	103699685	rs7488867	C	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=630;ReadPosRankSum=-0.936;SC=TCTGTTTATACTGAAGTTAAA;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=42;WE=103699693;WS=103699675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr12	103762084	rs138043759	G	GTC	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	103762097	rs7969447	A	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9913;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTCTCTCTCACACACACACA;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=103762105;WS=103762074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	103872172	rs10778257	T	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=571;ReadPosRankSum=-0.348;SC=AGAATTCTTCTTCCCTTTGTT;SOR=1.151;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=33;WE=103872180;WS=103872162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr12	103988117	rs703596	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=-0.518;SC=ATTCTACCACCTAGAGTAACT;SOR=0.126;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=11;WE=103988125;WS=103988107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr12	103988311	rs703597	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=439;ReadPosRankSum=-2.395;SC=ATGCTTGGACTTTGAGACTTG;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=30;WE=103988319;WS=103988301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr12	104014402	rs140346177	A	AAC	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=0.705;SC=ATCCTCCTTAAACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=104014410;WS=104014392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	104015999	rs703612	T	C	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=54;PP=1687;SC=AAAAAAGAAATTTCAGCAGAA;SOR=2.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=104016007;WS=104015989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	104032074	rs1582876	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CTTCTATGCCATCCCAATTCT;SOR=0.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=104032082;WS=104032064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	104034048	rs115840458	A	G	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=951;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AGTCTTTTCAATTCCTCCACC;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=67;WE=104034056;WS=104034038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,87:0.49:177
chr12	104042736	rs697199	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=182;ReadPosRankSum=-1.410;SC=GTCATGCAGGTGAGAGGGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=104042744;WS=104042726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	104044241	rs12829198	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=713;ReadPosRankSum=1.212;SC=CTCATTTGGCGTTTTCTTTCT;SOR=0.562;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=48;WE=104044258;WS=104044231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr12	104048454	rs1609860	C	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=903;ReadPosRankSum=0.247;SC=AAGTTAGAACCCACATTTGAG;SOR=0.808;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=68;WE=104048462;WS=104048444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,80:0.43:184
chr12	104048592	rs831425	C	T	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=694;SC=GCTAGGATCCCGAGCAGAGAG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=104048600;WS=104048582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	104053955	rs11111705	A	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=701;SC=GGTGAACGTTAGCTATTTGGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=104053963;WS=104053946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	104099544	rs11111718	C	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1138;ReadPosRankSum=0.064;SC=TACTGCAGCACCATTGGGAAA;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=44;TCR=92;TR=69;WE=104099552;WS=104099534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr12	104100617	rs697212	C	T	3000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=51;PP=1845;ReadPosRankSum=-1.256;SC=GCCAGCCCTGCCCAGGGAATG;SOR=0.881;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=262;TCF=140;TCR=122;TR=119;WE=104100625;WS=104100607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,143:0.45:316
chr12	104111687	rs703653	C	A	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=620;SC=CCCCACTTCTCGGGGATGCAG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=104111695;WS=104111677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	104124061	rs4981042	A	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=36;PP=1156;SC=TTATGTTTTCAGCCTGGAGTG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=104124069;WS=104124051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	104129471	rs1946820	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=CATTCATAGCGGGCTCATTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=104129479;WS=104129461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	104133355	rs4981029	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.253;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GTGTGTGCCCGTGCACGTATG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=104133363;WS=104133345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	104140517	rs2056128	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=0.076;SC=AAATAGCAGCATGGTGTGGGA;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=13;WE=104140525;WS=104140507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	104147207	rs3751198	A	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=639;SC=TAAGATGGGGAAGACTTGAGC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=104147215;WS=104147197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	104149022	rs11111748	G	A	8306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.03;NF=155;NR=108;PP=2965;SC=CATTAACCAAGTGATGCCACA;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=155;TCR=108;TR=263;WE=104149030;WS=104149012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr12	104149251	rs7296626	C	T	8638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=154;PP=2965;SC=GAAAGGTAACCGCCCCAGCTA;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=104;TCR=154;TR=258;WE=104149259;WS=104149241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr12	104149520	rs7313163	T	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=43;PP=1253;SC=CTGCTTGGTTTGCCTCAGGCA;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=104149528;WS=104149510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	104157170	rs7300663	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=1.127;SC=AAAAGGAAAAGCTCCCAGAGG;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=104157178;WS=104157160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	104159667	rs11111755	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	104159716	rs10861094	C	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=0.377;SC=ATATTATTAGCCACCTTTTGT;SOR=0.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=104159724;WS=104159706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	104171947	rs60237513	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	104171948	rs57944247	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	104182609	.	G	A	3377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=61;PP=1841;ReadPosRankSum=0.240;SC=AGCTGGTCATGAGATACCTGC;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=258;TCF=130;TCR=128;TR=121;WE=104182617;WS=104182599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,165:0.49:340
chr12	104187419	rs12426059	G	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=355;ReadPosRankSum=0.364;SC=CCCTAAGGAAGAAGCTTTGTC;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=20;WE=104187427;WS=104187409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr12	104190523	rs12425205	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=480;SC=CATCTTTCTTGTAATGTTCAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=104190531;WS=104190513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	104192506	rs10082821	A	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=32;PP=864;SC=GAAACCAATGATTTTCACACC;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=104192514;WS=104192496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	104237882	rs2576974	G	A	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=42;PP=2333;SC=TTTCAGCATTGTTTTGTGTCT;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=106;WE=104237904;WS=104237872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	104237896	rs7966100	G	A	3517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=48;PP=2417;SC=TGTGTCTTCCGTTGTATCTTT;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=117;WE=104237904;WS=104237872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	104309712	rs2583273	C	T	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=73;PP=2264;SC=CAGCCACCGACCCCCACTGCT;SOR=1.898;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=101;WE=104309720;WS=104309702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	104324148	rs2722187	G	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=8;PP=760;SC=CCCGCCCGCGGGAAGTGGGGG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=104324156;WS=104324138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	104335750	rs58392270	TAA	T	4474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=59;PP=2797;SC=ATTTGTGGAGTAAAACCAGAT;SOR=1.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=65;WE=104335759;WS=104335740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	104359931	rs4135039	T	A	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=56;PP=1622;SC=GTCTTTTAAATCCCGGCCGGA;SOR=1.561;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=81;WE=104359939;WS=104359921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	104359982	rs4135040	C	A	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=861;SC=GTGGCCTGGTCGGCCTTTCCT;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=104359990;WS=104359972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	104378529	rs4135119	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.912;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=0.516;SC=GATTCTAGCTCTGCTATGTTA;SOR=0.743;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=104378537;WS=104378519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	104396838	.	T	TAGGG	377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=8.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=2.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	104476264	rs2253274	T	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr12	104492003	rs2629755	A	G	31.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	104618454	rs6539128	A	G	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=683;SC=GAGCCACCGCACCTATAGCTG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=104618462;WS=104618444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	104645363	rs7960443	G	A	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=64;PP=2244;SC=TCACCAGCACGGCCACTGCAG;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=109;WE=104645371;WS=104645353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	104645384	rs73180108	C	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=884;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ACTCCAGAGCCCTGCTTCAGG;SOR=0.951;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=48;WE=104645392;WS=104645374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr12	104645405	rs7975161	T	C	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=54;PP=1535;SC=CCTATATAGATGGTCACTCTG;SOR=1.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=76;WE=104645413;WS=104645395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	104651594	rs7297584	A	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=141;SC=TTGACAATTGAATAGAATCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=104651602;WS=104651586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	104684773	rs11111981	A	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TTCTTTAGAGATGGAGGTCTC;SOR=0.116;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=104684781;WS=104684763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	104698582	rs11111987	A	G	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1023;ReadPosRankSum=0.916;SC=ATGTTAACCAAATGGGTGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=57;WE=104698590;WS=104698572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,64:0.40:162
chr12	104703957	rs35882028	T	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	104703957	.	TCT	AGA	751	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=9;PP=751;QD=67.8723229052;SC=GGAGTCTCACTCTGTGAGACT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=104703980;WS=104703947;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	104703958	rs34794131	C	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	104703959	rs34873076	T	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	104703965	rs66665385	ACTCCCAGG	A	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=1802;SC=ACTCTGTGAGACTCCCAGGCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=104703980;WS=104703947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	104703991	rs10861190	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	104707151	rs5018287	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.917;SC=TCCCCTGGCAATAATCTAACT;SOR=0.936;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=8;WE=104707159;WS=104707141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr12	104707180	rs6539137	A	T	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=286;SC=AAGCCTAATTAAAAAAATCAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=104707188;WS=104707170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	104709559	rs4964287	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=962;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TTGTAGGTCTCGGAGGAACAT;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=63;WE=104709567;WS=104709549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr12	104732818	rs35337648	A	AT	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=239;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TTTGAGTTGGATTTTTAAGAA;SOR=2.147;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=9;WE=104732826;WS=104732808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	104733165	rs10861202	A	G	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=48;PP=1501;SC=TGATTCCTCAAAAGAGGGCTT;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=104733173;WS=104733155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	104742310	rs11611385	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CCTGCGTGTCCTGTGCTTACC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=104742318;WS=104742300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	104985271	rs77877813	G	GTCT	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=779;SC=TCACTGTTTGGTCACAGCTAG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=104985279;WS=104985261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	104985289	rs1615960	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=677;SC=TAGGGGCATGATGGTGGCATC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=104985297;WS=104985279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	104985407	rs11112118	T	C	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=41;PP=1949;SC=AAATTGAACTTAAAGGAAGAG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=104985415;WS=104985397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	104985443	rs61938575	G	A	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=45;PP=2349;SC=AGGTCCCACAGCAGGGCTGGA;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=104985451;WS=104985433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	104985540	rs11112119	G	T	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=60;PP=2317;SC=CATGACCCACGGGTGTGTTGT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=104985548;WS=104985530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	104985580	rs11112120	G	A	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=53;PP=1647;SC=GTGACTAGTAGTTCATAAAAG;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=80;WE=104985588;WS=104985570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	104985655	rs313323	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=663;SC=AAACTTGTCTCGGTTTTCTAT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=104985663;WS=104985645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	104995800	rs5800627	A	AT	976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.010;HP=12;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.934;NF=7;NR=28;PP=584;ReadPosRankSum=1.044;SC=CAGCATGTGAATTTTTTTTTT;SOR=0.707;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=35;WE=104995808;WS=104995790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,40:0.91:44
chr12	105260159	rs149586274	TACACAC	T	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.333;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr12	105431835	rs10861315	T	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=630;ReadPosRankSum=1.174;SC=GTGAGCCACCTCACCTGGCCC;SOR=0.620;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=41;WE=105431843;WS=105431825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr12	105432040	rs11112328	A	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=4.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=3.171;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.274;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr12	105433463	rs4964120	C	T	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.454;SC=ACAGGATCTGCAGTGAATCAA;SOR=0.507;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=129;TCF=95;TCR=34;TR=67;WE=105433471;WS=105433453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr12	105433523	rs4964317	T	A	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=56;PP=1786;ReadPosRankSum=2.498;SC=TAGGAGTGGATCCAGTGAAAC;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=153;TCR=123;TR=125;WE=105433531;WS=105433513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,156:0.47:333
chr12	105433607	rs4964318	G	A	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=61;PP=1444;ReadPosRankSum=0.796;SC=GGAATAAAACGGGAATTAAAA;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=219;TCF=74;TCR=145;TR=88;WE=105433615;WS=105433597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,102:0.40:254
chr12	105433702	rs7315784	A	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=387;ReadPosRankSum=0.068;SC=AGGTCAGGAGATCGAGACCCG;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=19;WE=105433710;WS=105433692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr12	105434467	rs11112330	C	T	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.995;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=892;ReadPosRankSum=1.950;SC=CAGTCAAGGGCGTGACCTGAG;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=65;WE=105434475;WS=105434457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr12	105434533	rs10861316	C	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=919;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TAGCCCAGAACCCAGTTTTCC;SOR=1.212;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=141;TCF=62;TCR=79;TR=61;WE=105434541;WS=105434523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,77:0.44:176
chr12	105440421	rs10861324	T	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=327;ReadPosRankSum=1.151;SC=ATAAATATATTTCACTTTTTT;SOR=0.203;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=19;WE=105440429;WS=105440411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr12	105443966	rs7485673	T	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=0.173;SC=CTTATAGAGATCATGGTCCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=105443974;WS=105443956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr12	105444410	rs118150892	C	T	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=736;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CCTTTGGGGCCACTCTAGAGT;SOR=0.730;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=56;WE=105444418;WS=105444400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,73:0.39:186
chr12	105455651	rs6539183	A	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=472;SC=GGAAAAATACAGATTAAAAGC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=105455659;WS=105455641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	105477951	rs11112362	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=314;SC=AGACAATGGCCTGCGTGCCAG;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=105477959;WS=105477941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	105478327	rs7303961	C	T	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=79;SC=GACTGCCTGGCTCGCGGCTCG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=105478335;WS=105478317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	105504764	rs1196839	G	A	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=220;SC=TTTAACTTTGGAACTTTATTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=105504772;WS=105504754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	105514480	rs1196837	A	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.203;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=417;ReadPosRankSum=0.283;SC=ACTCTTAAAGAGGCGTGTGTG;SOR=0.090;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=12;WE=105514491;WS=105514470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	105514483	rs57967713	C	CGT	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.634;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=445;ReadPosRankSum=0.123;SC=CTTAAAGAGGCGTGTGTGTGT;SOR=0.037;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=105514491;WS=105514470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	105527385	rs1211276	G	C	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=231;SC=CAGTACCTGGGATGTTTGTTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=105527393;WS=105527375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	105534025	rs1196808	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=11;PP=1522;SC=AATTTTGCCTGAAATTTTTAA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=54;TCR=11;TR=65;WE=105534033;WS=105534015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr12	105536430	rs5800652	C	CTA	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	105538757	rs12425803	T	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GCTTATTTTTTAAGAAATTAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=105538765;WS=105538747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	105540668	rs11112389	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTCAGATTTTCGGATTAAGGA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=105540676;WS=105540658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	105541046	rs3215374	AT	A	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=175;ReadPosRankSum=1.299;SC=ATGAATTTCCATTTTTTTTCT;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=11;WE=105541054;WS=105541036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr12	105541138	.	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.345;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr12	105541201	rs3830657	ATG	A	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.385;NF=5;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-0.105;SC=ACATTAATATATGTGTGTGCA;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=105541210;WS=105541191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	105543326	rs1196802	T	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=24;SC=CAGTAAAATTTATTTGAATTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=105543334;WS=105543317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	105546172	rs1663564	G	A	8235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=111;PP=2965;SC=AAAACTTGGAGTAACACCTGA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=138;TCR=111;TR=249;WE=105546180;WS=105546162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr12	105546332	rs7315964	G	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=559;ReadPosRankSum=1.031;SC=GAAAGCCTGAGCTCAGCTTTA;SOR=2.170;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=26;WE=105546340;WS=105546322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr12	105550565	rs35149056	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=-2.026;SC=GCAGCAATGCCATTAGGTATG;SOR=1.445;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=21;WE=105550573;WS=105550555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr12	105551167	rs10083185	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=1.141;SC=AGACCAGAGGGTAATATGTAA;SOR=0.242;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=11;WE=105551175;WS=105551157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	105556485	rs1373552	T	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=0.566;SC=GAAGATTTTCTTAGCAAAATT;SOR=0.148;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=105556493;WS=105556475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	105558324	rs146551772	AAAT	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=1.150;SC=GAGCTTTTAAAAATAATAATA;SOR=1.179;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=2;WE=105558334;WS=105558314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	105558566	rs117460788	A	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=506;ReadPosRankSum=-1.232;SC=GTCTTTAGTAATAGACAGTAA;SOR=0.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=34;WE=105558574;WS=105558556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr12	105568122	rs935241	G	A	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=29;PP=1883;SC=CTCTATGTTCGTTTGGATTTC;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=105568130;WS=105568112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	105568176	rs935240	G	A	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=48;PP=2364;SC=CATATTTTCCGTCATTGGTTA;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=120;WE=105568184;WS=105568166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	105570981	rs73179990	A	G	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AATCACTAACATGAACCTGTA;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=204;TCF=92;TCR=112;TR=82;WE=105570989;WS=105570971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,105:0.42:253
chr12	105582245	rs1196852	A	G	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=47;PP=1246;ReadPosRankSum=0.905;SC=AGCATTTTCCACTCAGGATCT;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=66;TCR=109;TR=76;WE=105582253;WS=105582235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,97:0.46:212
chr12	105583747	rs73179996	G	A	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=707;ReadPosRankSum=-1.529;SC=TTCTCCCAGAGATAACCTCTC;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=42;WE=105583755;WS=105583737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,60:0.50:119
chr12	105583877	rs2272495	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=787;ReadPosRankSum=-1.840;SC=ACTGGCTGTTGCTTTGGGAAC;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=59;WE=105583885;WS=105583867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr12	105597672	rs7300130	G	A	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=811;ReadPosRankSum=-1.660;SC=TGGCTGGCCCGCCTCGCACGC;SOR=1.242;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=23;WE=105597688;WS=105597662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr12	105597680	rs3736628	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.800;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=1227;ReadPosRankSum=1.271;SC=CCGCCTCGCACGCGGCACTGG;SOR=0.157;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=30;WE=105597688;WS=105597662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr12	105600752	rs12311156	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=162;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TTCTTTCTACGACGATGCTTC;SOR=0.169;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=11;WE=105600760;WS=105600742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	105600935	rs2293643	G	A	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=787;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GGGAGGAGAGGTGCTGCTTCC;SOR=0.871;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=44;TCR=72;TR=52;WE=105600943;WS=105600925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr12	105601697	rs7975115	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=277;ReadPosRankSum=-1.379;SC=GAGGAAGGCATGAAAGGCCTT;SOR=0.161;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=18;WE=105601705;WS=105601687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr12	105611333	rs4964342	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=776;ReadPosRankSum=-1.079;SC=ACAAAAAAACTATGAAGAAAA;SOR=1.024;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=45;WE=105611341;WS=105611323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr12	105623073	rs2293644	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=625;ReadPosRankSum=0.362;SC=GGAAGATCCACACACCCGCAC;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=52;WE=105623081;WS=105623063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,67:0.45:149
chr12	105629865	rs1196785	C	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=17;PP=444;SC=GAGCACTCCCCGGCTCTGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=105629873;WS=105629855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	105742457	rs75924647	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=312;ReadPosRankSum=0.661;SC=GGAAGTTGCTGTTTTTCATGA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=22;WE=105742465;WS=105742447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr12	105759838	rs1432588	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=521;SC=ATGCATGTGGCGTGTGCTAAT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=105759846;WS=105759828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	105760369	rs7962661	A	G	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=39;PP=2965;SC=GTACCATTTAAATTGGTTTGA;SOR=1.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=100;TCR=39;TR=139;WE=105760377;WS=105760359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	105789562	rs1534253	C	T	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1146;SC=CTGACTTTGGCAAGCAGAATG;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=105789570;WS=105789552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	106460856	rs7136283	A	G	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.731;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=935;ReadPosRankSum=1.483;SC=CGCTGATGACACTGGAAGGGC;SOR=0.910;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=154;TCF=90;TCR=64;TR=64;WE=106460864;WS=106460846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,70:0.41:170
chr12	106464785	rs4964437	G	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.743;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACCCCCAGCAGCCCCAGGAAC;SOR=1.863;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=18;WE=106464793;WS=106464775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	106466490	rs73193828	A	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=488;ReadPosRankSum=-0.070;SC=ACACATTGGGAAAGCTGCTCA;SOR=0.293;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=29;WE=106466498;WS=106466480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr12	106480450	rs2251027	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-2.227;SC=TAATAGGAAAAAAATCATGCA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=106480458;WS=106480444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	106500158	rs35769739	GT	G	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.15;MQRankSum=0.815;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.232;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr12	106500408	rs1427785	T	C	62.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	106532072	rs1215597	C	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=0.060;SC=CGGGGCTTCCCAATGAGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=106532080;WS=106532062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	106641489	rs368519473	GGGC	G	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	106647783	rs2704898	T	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=730;ReadPosRankSum=0.538;SC=AAATCAGACATCTCAGTCCGA;SOR=0.628;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=46;WE=106647791;WS=106647773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr12	106704974	rs4964460	G	A	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=54;PP=1906;SC=GCAGAGCTTTGCAAGTGACTC;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=91;WE=106704982;WS=106704964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	106708278	rs2253838	T	G	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=65;PP=2162;SC=AGAGGTAACCTGGGGGCATTT;SOR=1.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=91;WE=106708286;WS=106708268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	106708352	.	TGTGAGAGAGA	T	953	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=59.34;NF=0;NR=8;PP=953;QD=119.5;SC=TGTGTGTGTGTGTGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=106708369;WS=106708342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,8:0.53:15
chr12	106708354	rs138352358	TGAGAGAGA	T,TGAGAGA	237.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.24;QD=23.77;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,4,6:0.40,0.60:10
chr12	106708356	.	A	T	550	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=54;MMLQ=28;MQ=59.38;NF=1;NR=7;PP=550;QD=73.0964015684;SC=TGTGTGTGTGAGAGAGAGAGA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=106708369;WS=106708342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	106717224	rs12424952	C	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-2.329;SC=GAACATAGATCATTGTTAGTG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=106717232;WS=106717214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	106723190	rs11112940	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AGCCTGTGAGAGTGAAGTCTC;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=13;WE=106723198;WS=106723180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	106751805	rs61943670	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=1.041;SC=TGCTCGGGCCGCCAAGGGGGC;SOR=2.670;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=106751813;WS=106751795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	106763013	rs7134881	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TTATGATCTTCGAAGAAGTAT;SOR=0.616;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=12;WE=106763021;WS=106763003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr12	106763268	rs7135054	A	G	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=949;ReadPosRankSum=1.694;SC=TTCAATGTGGACCATAATTCT;SOR=0.785;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=55;WE=106763276;WS=106763258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr12	106773676	rs7310703	A	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-1.318;SC=TTTTTAAAGTACTTATTAGAA;SOR=0.392;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=106773684;WS=106773666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	106890059	rs721438	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=0.502;SC=AGCTCTTCTGCCCCTTGCCAG;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=106890067;WS=106890049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr12	106890135	rs2288270	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr12	106893930	rs7137444	A	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=866;ReadPosRankSum=0.713;SC=CGTTGTGTGGATTAAGTAGCA;SOR=0.636;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=62;WE=106893938;WS=106893920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,75:0.56:134
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chr12	106995136	rs7295853	G	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=142;ReadPosRankSum=-1.265;SC=TAATGACCAGGGCCCAGGGAC;SOR=1.634;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=15;WE=106995144;WS=106995126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr12	107033047	rs10861641	A	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=601;ReadPosRankSum=2.043;SC=GAGAGTCGAGAGGACTTTTAC;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=29;WE=107033055;WS=107033037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr12	107078448	rs10467029	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=0.615;SC=CTGAAGCCACCGGAACCATGC;SOR=0.191;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=107078456;WS=107078438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	107078562	rs5800715	A	AAAG	1620.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.354;SC=CGCTCAGCACAAAGAATTTTC;SOR=0.561;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=23;WE=107078570;WS=107078552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr12	107080617	rs56287989	CTTT	C	494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=11.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.003;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	107080638	rs55658229	TCC	T	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.76;ReadPosRankSum=2.471;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	107083031	rs9804754	G	A	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=17;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.480;SC=ATTAATGTATGTCTTTGTTGT;SOR=0.767;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=92;TCR=30;TR=67;WE=107083039;WS=107083021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr12	107090201	rs10778502	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=389;ReadPosRankSum=0.998;SC=TGATGCCCACTGTGCTGCAGG;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=38;WE=107090209;WS=107090191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr12	107126065	rs7307472	A	G	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=53;PP=1291;ReadPosRankSum=-1.095;SC=ACCACTTGGTAATGTTATTTG;SOR=0.961;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=166;TCF=54;TCR=112;TR=74;WE=107126073;WS=107126055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,85:0.44:192
chr12	107144328	rs12424114	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=-0.952;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.506;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr12	107364873	rs10778520	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=422;ReadPosRankSum=-0.280;SC=ATGATATTTTCTCTCATTAGG;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=30;WE=107364881;WS=107364863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,32:0.37:86
chr12	107395106	rs8192440	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=564;ReadPosRankSum=1.127;SC=CAGTTTCTCCACCTGGCCACA;SOR=0.764;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=46;WE=107395114;WS=107395096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,59:0.35:167
chr12	107712880	rs10082935	C	T	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTGGCCGCCTCTAGCTGACTC;SOR=0.708;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=190;TCF=96;TCR=94;TR=86;WE=107712888;WS=107712870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,110:0.45:244
chr12	107713511	rs961498	G	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=43;PP=1045;SC=AGTGGCCCTGGGTCAGGCTCG;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=107713519;WS=107713501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	107713696	rs111260184	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=12;PP=1079;SC=AGTCCCGCCGGCAGCCGCCGC;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=107713704;WS=107713686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	107714310	rs11383016	T	TC	1481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=10;PP=1283;SC=TGCTCCCACTTCCCCACTCCC;SOR=2.252;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=32;WE=107714318;WS=107714300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	107914141	rs1861586	C	T	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=2;PP=103;SC=CCTACATTGGCTTTCTTTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=107914149;WS=107914131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	107937768	rs1558781	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=840;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CAAGCACCACGGCAATGGCAC;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=54;WE=107937776;WS=107937758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr12	108003911	rs4964599	T	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=12;PP=1721;SC=CGGAGTTTGCTCCTGTGCCCC;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=70;WE=108003919;WS=108003901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	108035805	rs9919699	T	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1122;ReadPosRankSum=0.606;SC=AGAGCAGAGTTTTTTGTGAGC;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=67;WE=108035813;WS=108035795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr12	108035903	rs9919712	T	C	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1132;ReadPosRankSum=0.008;SC=CGACAAATGATGGCACCTGCA;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=75;TCR=99;TR=92;WE=108035911;WS=108035893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr12	108045292	rs2241186	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=262;ReadPosRankSum=1.005;SC=TCTTTGTCCTTTTCCTCTAGT;SOR=0.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=13;WE=108045300;WS=108045282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	108045336	rs2241185	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=8;PP=1298;SC=GTCCCCTACCTGTGACACTGC;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=108045344;WS=108045326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	108045392	rs2241184	T	C	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1459;ReadPosRankSum=0.233;SC=TAGTTCCTTATTGTTACCTCC;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=86;WE=108045400;WS=108045382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,99:0.63:156
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chr12	108086697	rs2287216	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=835;ReadPosRankSum=0.042;SC=ACATCTTTTTTCTAATTATGC;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=42;WE=108086705;WS=108086687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr12	108090518	rs2287214	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr12	108097379	rs73187399	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=496;ReadPosRankSum=0.136;SC=GAAATACTGTCAAATAGATTC;SOR=0.359;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=27;WE=108097387;WS=108097369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr12	108106058	rs1802937	T	C	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=807;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GGCCTAAAAATGTTCCATGCG;SOR=0.532;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=68;WE=108106066;WS=108106048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,80:0.57:141
chr12	108127965	rs17306603	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=471;ReadPosRankSum=0.145;SC=TTTTCATCCAAAATTGCTTGT;SOR=0.503;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=25;WE=108127973;WS=108127955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	108136172	rs2302734	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TTTGAAATGCATACTAAGTAC;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=35;WE=108136180;WS=108136162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr12	108140032	rs3803120	T	C	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1220;ReadPosRankSum=1.007;SC=AATAGTGTTTTACAGTTCCAA;SOR=0.497;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=67;WE=108140040;WS=108140022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,76:0.54:141
chr12	108147982	rs4964617	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GGTTTTTACACATGGGCAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=108147990;WS=108147972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	108150758	rs1814335	C	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=1.545;SC=AAAGAGCACACACAACTAGTT;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=14;WE=108150766;WS=108150748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr12	108154199	rs2302733	A	G	3223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1717;ReadPosRankSum=1.307;SC=AATGGCACCAAAAACAACGGC;SOR=0.865;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=216;TCF=117;TCR=99;TR=107;WE=108154207;WS=108154189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,144:0.55:264
chr12	108600237	rs1106752	A	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1254;SC=TCAGATTCCCACCTGTGGTAT;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=108600245;WS=108600227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	108686008	rs1057401	C	G	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1293;ReadPosRankSum=0.419;SC=GCAGTTTGCACACGATGGTGA;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=79;WE=108686016;WS=108685998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,95:0.49:192
chr12	108913377	rs5800830	GT	G	115.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=4;PP=20;SC=AAATGTTTTAGTTTTAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=108913389;WS=108913367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	108917520	rs34982944	G	GA	199.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.385;NF=1;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.036;SC=GTTAAAAGGTGAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=12;WE=108917528;WS=108917510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr12	108918146	rs2303633	C	T	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=20;PP=1239;SC=TCCTGGTCTCCGGCTTCTCTG;SOR=1.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=108918154;WS=108918136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	108923950	rs1549096	A	G	5651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=85;PP=2965;SC=CTTTCTCATCATCCTCATCTG;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=164;WE=108923958;WS=108923940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	108931779	rs2287550	C	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=9;PP=682;ReadPosRankSum=-1.290;SC=GACTTTGTCACCGCTCTCTGT;SOR=1.354;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=114;TCF=81;TCR=33;TR=46;WE=108931787;WS=108931769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr12	108932053	rs2287551	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=493;SC=ATTGCCAGCACGACCAAGTGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=108932061;WS=108932043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	108932916	rs7133076	C	T	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=46;PP=1262;SC=GGAAGCACAACACATCTGCAA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=57;WE=108932924;WS=108932906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	108936428	rs11113982	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=3.802;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TTCCAATATATAAAAGTTCAA;SOR=2.584;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=7;WE=108936436;WS=108936418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	108936484	rs888555	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=212;ReadPosRankSum=-1.548;SC=TACTTTCATAGCTTGTAAAAC;SOR=0.078;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=15;WE=108936492;WS=108936474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr12	108936516	rs888556	T	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=1.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	108936519	rs888557	C	T	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.07;SOR=1.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	108941679	rs12579216	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=453;ReadPosRankSum=0.099;SC=AATCCTTCACGGCTTTCTCAA;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=31;WE=108941687;WS=108941669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr12	108943028	rs2052423	G	A	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=46;PP=1278;SC=TTAAAACACCGTCATCAAGTA;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=108943036;WS=108943018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	108954502	rs1160332	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=10;PP=1128;SC=GTCACGAAAAGCGGGTTTGCA;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=108954510;WS=108954492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	108954823	rs1063936	C	T	5858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=72;PP=2965;SC=ATAACACCTTCCTCCTTGTCC;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=165;WE=108954837;WS=108954813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	108954862	rs2072579	G	C	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=836;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CCTCCTCTCCGTCAGCCTTGG;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=64;WE=108954870;WS=108954852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,78:0.37:211
chr12	108956417	rs10778647	TT	GG	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=15;PP=1958;SC=GGCTGGGGCTTTCCGTCTGAG;SOR=2.471;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=93;TCF=73;TCR=20;TR=87;WE=108956426;WS=108956407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	108956433	rs2287555	C	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.316;HP=5;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.115;NF=47;NR=15;PP=997;ReadPosRankSum=1.157;SC=CTGAGGCGGGCGGCATCGGCT;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=62;WE=108956441;WS=108956423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
chr12	108956526	rs60547936	A	AG	7416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.128;NF=22;NR=127;PP=2975;ReadPosRankSum=-0.331;SC=GGGACAAAAGAGGGACGCGCG;SOR=1.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=23;TCR=131;TR=149;WE=108956534;WS=108956516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,276:0.99:278
chr12	108956610	rs2287556	C	G	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=66;PP=2034;SC=TGGGAGCTGTCCCCTCCCACG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=84;WE=108956618;WS=108956600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	108959119	.	A	G	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=27;PP=1278;ReadPosRankSum=0.741;SC=GAAAAGGGGAAGATTGTGGAT;SOR=0.898;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=155;TCF=98;TCR=57;TR=79;WE=108959127;WS=108959109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr12	108960906	rs10861945	G	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=243;SC=TTTTTTATTGGCTGGCCCTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=108960914;WS=108960896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	108961228	rs876161	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;ReadPosRankSum=0.705;SC=CCCTAAGAGAATCATGCCAGA;SOR=0.582;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=28;WE=108961236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr12	108961293	rs888546	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=756;SC=ATTTCTAAACCTCACAAATAT;SOR=0.957;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=108961301;WS=108961283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	108961354	rs888547	T	C	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=16;PP=1059;SC=ATGAGGAAGCTAAGGCTTGGG;SOR=1.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=108961362;WS=108961344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	108961383	rs888548	A	G	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=22;PP=1365;SC=CCCACATCACATGGCTAATAA;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=108961391;WS=108961373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	108985479	rs112991728	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=534;ReadPosRankSum=0.772;SC=CCTCTGGTGTCTCCACTGGGA;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=32;WE=108985487;WS=108985469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr12	108985945	rs7975237	A	G	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=76;PP=2475;SC=CCCCAGGGTTATGGGCTGGGG;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=122;WE=108985953;WS=108985935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	108986031	rs74504010	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=0.483;SC=AGCCCTCGGCCTCCCCACTAC;SOR=0.979;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=18;WE=108986039;WS=108986021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	109016803	rs7311687	C	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr12	109016806	rs8179162	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr12	109017264	rs7300972	T	C	4235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,111:0.51:218
chr12	109017264	.	TGG	CGA	2301	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=40;NR=35;PP=2301;QD=31.3929049982;SC=GTAGGTTCCATGGACAGGGCC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=75;WE=109017274;WS=109017254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:98,75:0.43:173
chr12	109017266	rs61729674	G	A	4235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,107:0.50:216
chr12	109017411	.	GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC	G	1248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-3.418;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr12	109017441	.	G	C	1526	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=58.83;NF=10;NR=11;PP=1526;QD=74.3224386927;SC=GCTGCTGGTGGAGTGGTCTGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=21;WE=109017478;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:53,21:0.28:74
chr12	109017454	.	T	C	1202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=58.86;NF=11;NR=9;PP=1202;QD=61.8385606274;SC=TGGTCTGTGCTTCCATGGCTG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=20;WE=109017478;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:51,20:0.28:71
chr12	109017650	rs63748999	GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT	G	2606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=6.119;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,77:0.33:230
chr12	109025432	rs8179115	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=702;SC=CCCCCCTCCCTACCCTCCACC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=109025440;WS=109025431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	109041375	rs141599477	T	TA	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=66;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TTGTAAGATATAAAATGTAGT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=109041383;WS=109041365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	109095137	rs3741782	A	G	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=50;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AGAATTATGCACCAAACTGAA;SOR=1.134;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=70;WE=109095145;WS=109095127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,71:0.44:161
chr12	109182049	rs3741778	T	C	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=844;ReadPosRankSum=2.301;SC=CAATCTCCTGTGTCCGCTGCT;SOR=1.034;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=61;WE=109182057;WS=109182039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
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chr12	109194449	rs3217206	TC	T	121.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=135;SC=CCCGTTAGGATCCCCCCTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=109194457;WS=109194439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	109205189	rs11114060	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=0.551;SC=TGGTCCAGGACGGGCTGTTGG;SOR=0.069;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=109205197;WS=109205179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	109217007	rs34849596	G	GT	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=442;ReadPosRankSum=-0.383;SC=AAGCTCCAATGTAAGAGTATC;SOR=0.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=12;WE=109217015;WS=109216997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr12	109221013	rs10861970	C	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=401;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TGGCAGGAAACCAGTAATCAG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=31;WE=109221021;WS=109221003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr12	109221123	rs117096112	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=234;ReadPosRankSum=3.743;SC=AAAGAGGTTCGTGGCTGCAGT;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=16;WE=109221131;WS=109221113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr12	109270506	rs7136681	A	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=7;PP=1357;SC=CTCATCTAGCACACAGACACC;SOR=3.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=109270514;WS=109270496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	109277492	rs11114083	C	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=-0.268;SC=AGGGGCTGTCCCCTAAGCCCC;SOR=0.453;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=30;WE=109277500;WS=109277482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr12	109278747	rs2111902	T	G	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1213;ReadPosRankSum=2.587;SC=GGTGATGATGTTGTGCCTCAA;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=81;WE=109278755;WS=109278737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr12	109286576	rs11114087	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGGAGATTTTGTGGACCACCA;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=109286584;WS=109286566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	109287984	rs3825251	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=115;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GAGAACAGGGAATACCAGGGT;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=109287992;WS=109287974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	109293109	rs11420034	G	GA	2004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.442;NF=19;NR=35;PP=851;ReadPosRankSum=0.660;SC=ATGGCAGCAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.501;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=54;WE=109293117;WS=109293099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr12	109293283	rs75885639	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGTAATGCCCTCTTCCACTCC;SOR=0.978;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=23;WE=109293291;WS=109293273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr12	109293320	rs3918347	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=0.120;SC=TTTTCAGGGAACAGTCATGTC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=14;WE=109293328;WS=109293310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	109306627	rs11114094	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCTGCTTGCTAAAAAGGATCT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=12;WE=109306635;WS=109306617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	109309424	rs4964773	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=659;ReadPosRankSum=-0.821;SC=ATTTCTTCTGTCCTCGGGTGT;SOR=0.627;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=45;WE=109309432;WS=109309414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr12	109338835	rs36131538	C	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=853;SC=AACCTCCTGCCGGAATCCACA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=109338843;WS=109338825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	109339023	rs36191519	C	T	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=90;PP=2965;SC=AATTTGCAGCCGACATTCCTC;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=59;TCR=90;TR=149;WE=109339031;WS=109339013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	109354632	rs36181716	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1027;SC=TAACTCCTGATCCAGACCATG;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=109354640;WS=109354622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	109371381	rs149284306	C	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=23;PP=696;SC=CCCTCTCTACCCATTGCCAAG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=109371389;WS=109371371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	109371442	rs36182807	G	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=340;SC=TTAAAACCATGCATTACCATT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=109371450;WS=109371432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	109458559	rs138861157	A	ACC	545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=32.10;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	109490426	rs140371213	C	CCGG,CCGGCGG	2672.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=12,12;NR=21,21;PP=694,748;SC=ATCCCTCGGTCCGGCGGCGGC;SOR=1.217;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=33,33;WE=109490434;WS=109490416;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.44,0.56:59
chr12	109511144	rs7967182	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=-1.525;SC=TATTTTTTCTTAAGAGGTAGT;SOR=2.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=109511152;WS=109511134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	109511256	rs7967322	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1110;ReadPosRankSum=0.037;SC=CACCTCACCCTACATCCAATC;SOR=1.016;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=65;WE=109511264;WS=109511246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,77:0.55:140
chr12	109530278	rs145676752	G	GCA	1047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.190;NF=19;NR=8;PP=817;ReadPosRankSum=0.150;SC=AGCCCTCAATGCACACACACA;SOR=1.358;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=27;WE=109530287;WS=109530268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr12	109547586	rs2878959	A	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.329;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr12	109577735	rs2878960	C	T	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=103;PP=2965;SC=ACTACTCCTCCGACGAGGACT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=88;TCR=103;TR=191;WE=109577743;WS=109577725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	109605898	rs34285	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=0.751;SC=CCCTCGCCTCCTTCCCCTGTG;SOR=1.149;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=25;WE=109605906;WS=109605888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr12	109617865	rs11065772	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGATTGCTGATGTTAATCTGC;SOR=0.344;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=13;WE=109617873;WS=109617855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	109623336	rs7978168	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=539;ReadPosRankSum=0.789;SC=TTTTGGGGCCGTGTTCTGGTA;SOR=1.355;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=27;WE=109623344;WS=109623326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr12	109625976	.	CTCCTTCCTTCCT	C,CTCCT	1210.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.01;QD=39.06;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,14,17:0.45,0.55:31
chr12	109629457	rs7135947	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=734;ReadPosRankSum=1.240;SC=CCATCCGAGGCGACTTTAGGA;SOR=0.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=45;WE=109629465;WS=109629447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr12	109635031	rs2268393	A	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=608;ReadPosRankSum=-0.084;SC=AAAACACAGCACTGGCCTGTG;SOR=0.662;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=35;WE=109635039;WS=109635021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr12	109635076	rs2268392	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=266;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GGTGCCTTTCTGGTAAATTCT;SOR=2.531;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=17;WE=109635084;WS=109635066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr12	109637188	rs7299171	G	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=809;ReadPosRankSum=0.428;SC=CTCCCTACCCGACTCCTCCTC;SOR=0.689;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=57;WE=109637196;WS=109637178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr12	109658191	rs73191161	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=-0.505;SC=GAATTTTTTTGAGGCTTTTAA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=109658199;WS=109658181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	109670468	rs3742027	T	C	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=50;PP=1865;ReadPosRankSum=-1.731;SC=TGCCATCACCTTACAGGATGA;SOR=0.828;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=116;WE=109670476;WS=109670458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,142:0.55:258
chr12	109670657	rs3742026	G	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=270;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ATGGGGGCTGGGCAGACTTCC;SOR=0.885;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=21;WE=109670665;WS=109670647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr12	109672951	rs7138373	T	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=2.148;SC=ATTTGCCTATTCTGGACGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=109672959;WS=109672941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	109675029	rs2241220	T	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1292;ReadPosRankSum=1.306;SC=AGCTGGAACTTAACCGGATGC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=79;WE=109675037;WS=109675019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,87:0.47:185
chr12	109683575	rs10744772	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=548;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GCGGAGCCTAACCCCTGGCTG;SOR=0.469;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=30;WE=109683583;WS=109683565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr12	109685330	rs4766587	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=205;ReadPosRankSum=1.422;SC=CCATCCCTACGATGTTCACAT;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=12;WE=109685338;WS=109685320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	109685545	rs2284689	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=715;SC=AATTTTGCTCATGGTTAATTT;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=109685553;WS=109685535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	109691991	rs2075259	A	G	7881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=103;PP=2965;SC=ACCACAGACTAAGTCAGAGAC;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=133;TCR=103;TR=236;WE=109691999;WS=109691981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr12	109692053	rs17848835	C	T	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=69;PP=1798;ReadPosRankSum=0.309;SC=ATCACACCCACTGACCCCATT;SOR=0.806;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=260;TCF=124;TCR=136;TR=126;WE=109692061;WS=109692043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,151:0.49:310
chr12	109694230	rs10849967	T	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TCAGCCAGCCTCCTCCTGAGG;SOR=0.144;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=109694238;WS=109694220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr12	109695891	rs11066004	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.150;SC=AAAGGGCACCAATAGGTCTGC;SOR=0.859;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=109695899;WS=109695881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	109696838	rs2075260	G	A	8023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=113;PP=2965;SC=CGCCCAGGCCGTCAAGGACTT;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=237;WE=109696846;WS=109696828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr12	109697796	rs2075261	A	G	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=66;PP=2403;SC=CCGAGGTAAGAGTCTGATGAG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=127;WE=109697804;WS=109697786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	109704177	rs2075262	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=-0.585;SC=ACCGTGGCCCGCCCAGCCACT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=18;WE=109704185;WS=109704167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
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chr12	109725688	rs7959782	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=483;ReadPosRankSum=1.627;SC=GTGGTTGGGTGGCAGGTGAGT;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=29;WE=109725696;WS=109725678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
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chr12	110231717	rs10850750	C	G	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=46;NR=40;PP=1708;SC=GTGGGGGGCACGGGGGCCAGG;SOR=0.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=86;WE=110231725;WS=110231707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	110240838	rs3825394	T	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=899;ReadPosRankSum=1.835;SC=ATGAACTCCCTCATGTTGCCG;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=61;WE=110240846;WS=110240828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr12	110353234	rs143201598	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=546;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TGCAGGCATGGGAAGCAGACC;SOR=0.714;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=31;WE=110353242;WS=110353224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr12	110418635	rs7960775	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=703;SC=ATTAAAAGCCATATGTATAGC;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=110418643;WS=110418625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	110483827	.	T	C	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1495;ReadPosRankSum=-1.407;SC=AGGTACACAATGGCCATGCAT;SOR=0.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=260;TCF=151;TCR=109;TR=119;WE=110483835;WS=110483817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,143:0.43:335
chr12	110891515	rs201827961	A	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=278;ReadPosRankSum=0.446;SC=TATTTTTATCAAAAGCTAACA;SOR=0.395;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=19;WE=110891523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr12	110905869	rs7958683	G	A	7221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=91;PP=2965;SC=AGGGTTCCCAGTACACACACC;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=129;TCR=91;TR=220;WE=110905877;WS=110905859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	110939421	rs6606687	T	C	8126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=94;PP=2965;SC=TGTTCTGCATTCGAGAGGCCA;SOR=1.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=162;TCR=94;TR=256;WE=110939429;WS=110939411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr12	110953014	.	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=0.325;SC=TCCTGTCTCTCGATTACTAAC;SOR=1.344;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=21;WE=110953022;WS=110953004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr12	111089227	.	G	A	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=56;PP=1544;ReadPosRankSum=1.192;SC=AAAAGACCAAGATGGTGATGC;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=76;TCR=108;TR=96;WE=111089235;WS=111089217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,111:0.52:214
chr12	111290871	rs886132	G	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=18;PP=618;SC=ACAGATCTGTGCTCACCCATT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=111290879;WS=111290861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	111296332	rs4766432	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=335;SC=GTGCCTGGAGTGCTCCGTCAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=111296340;WS=111296325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	111317904	rs35762292	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-1.007;SC=GGGCTGGGGATAGGTCCAGGG;SOR=0.478;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=18;WE=111317912;WS=111317894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr12	111342558	rs34300256	G	T	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=62;PP=2310;SC=TCCCCCCAGTGCTGGGGGCTG;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=111;WE=111342566;WS=111342548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	111345411	rs67912779	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=37;PP=1066;SC=GGCCGAGGAGCGAGAAGTAAA;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=111345419;WS=111345401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	111350999	rs2233260	G	A	7462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.130;NF=121;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TGTGTAGGGGGGACAGGGGGC;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=246;TCF=121;TCR=125;TR=245;WE=111351007;WS=111350989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,267:0.99:269
chr12	111351029	rs3833910	TC	T	8817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=120;PP=2974;SC=ACCCCCTTCCTCCCCCACAGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=47;TCR=125;TR=165;WE=111351037;WS=111351019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr12	111375170	rs1056618	A	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr12	111375170	.	AGC	GGT	1314	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=17;NR=19;PP=1314;QD=37.9852187462;SC=TCCCCCGCCAAGCCTGCCAGA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=36;WE=111375180;WS=111375160;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr12	111375172	rs1056620	C	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.11;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr12	111651876	rs73197969	T	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=537;ReadPosRankSum=-0.220;SC=ATCCTGTCTTTTCTCAGCTTT;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=29;WE=111651884;WS=111651866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr12	111651949	rs3825398	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.497;NF=6;NR=7;PP=245;ReadPosRankSum=0.440;SC=AAAAAAAGAAGAAAAATCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=13;WE=111651957;WS=111651939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	111701429	.	A	AAAAAC	948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.163;NF=9;NR=2;PP=384;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ACTCTCTCTCAAAAACAAAAC;SOR=0.473;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=11;WE=111701437;WS=111701419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr12	111786082	rs6490073	G	C	5078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=79;PP=2965;SC=CATTTACCGAGTAGAGCGGGC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=111786090;WS=111786072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	112036753	rs10560189	GGCT	G	1940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=1325;SC=CGCGGGCGGCGGCTGCTGCTG;SOR=1.038;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=28;WE=112036763;WS=112036743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	112036797	rs4098854	C	T	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=26;PP=951;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=49;WE=112036805;WS=112036787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	112036929	rs695872	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=10;PP=533;SC=GCGGGGACGCGCGGGCGCCGA;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=112036937;WS=112036919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	112037000	rs695871	G	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=20;PP=716;SC=GGGAGAAGGAGGACGACGAAG;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=45;WE=112037008;WS=112036990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	112119387	.	CAA	C	112.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	112167527	.	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.917;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=-1.792;SC=CATGACAAAGGGTTTCACTGC;SOR=0.105;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=14;WE=112167535;WS=112167517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr12	112610714	rs11066188	G	A	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=34;PP=1004;SC=AGGGCACACCGGGATGACTGT;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=112610722;WS=112610704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	112638688	rs35054697	CGT	C	795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;QD=30.61;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	113269736	rs11829717	A	G	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TACTTGGTGCATGTTGTACTT;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=54;WE=113269744;WS=113269726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
chr12	113313470	rs2891411	C	T	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGTTTGTCTCCTCTCCCTGCT;SOR=0.684;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=78;WE=113313478;WS=113313460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
chr12	113319471	rs886476	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=1.318;SC=AGCACACAGCGTGGACCAACA;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=113319479;WS=113319461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	113319600	rs2240194	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=765;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TGGATTCAAACGGCTTGGCTG;SOR=1.058;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=46;WE=113319608;WS=113319590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr12	113319778	rs10850088	G	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CATCCTGTGAGTAGCAAAGCC;SOR=0.925;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=77;WE=113319786;WS=113319768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
chr12	113325460	rs7979186	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=306;ReadPosRankSum=0.860;SC=AGGTACTTGGTCCAGTGATAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=113325468;WS=113325450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	113325629	rs4141253	T	C	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1297;ReadPosRankSum=-0.970;SC=AGGACAAATTTGGCCACAATG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=95;TCR=92;TR=100;WE=113325637;WS=113325619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,115:0.52:223
chr12	113328981	rs3741982	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=-1.512;SC=ATGTGGGTCTGGAGTCTCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=113328989;WS=113328971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	113348870	rs1131454	G	A	5226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=78;PP=2965;SC=GTTGACTGGCGGCTATAAACC;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=161;WE=113348891;WS=113348860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr12	113357193	rs10774671	G	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=15;PP=1019;SC=CACCCTTTCAGGCTGAAAGCA;SOR=1.436;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=113357201;WS=113357183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	113357209	rs1131476	G	A	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1095;SC=AAGCAACAGTGCAGACGATGA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=113357217;WS=113357199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	113357237	rs1051042	G	C	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=27;PP=1648;SC=GATCCCAGGAGGTATCAGAAA;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=85;WE=113357245;WS=113357227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	113357442	rs2660	G	A	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=44;PP=1543;SC=GATCCAGAGAGGACAAAGCTC;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=113357450;WS=113357432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	113369644	rs7968145	C	T	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=19;PP=1044;SC=ACAGGCTCCTCAATATGAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=113369652;WS=113369634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	113369715	rs11352835	TA	T	2729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=37;PP=2080;SC=GAAGGAACTATACCAATAATT;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=113369723;WS=113369705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	113369759	rs7967461	G	C	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=33;PP=1010;SC=ACAGACAAGAGGAGCCTCATT;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=113369767;WS=113369749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	113376320	rs3815178	C	T	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=14;PP=891;SC=TCCCCTTGCACCTGCGCCGGG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=113376339;WS=113376310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	113376331	rs1859331	C	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=17;PP=1126;SC=CTGCGCCGGGCGGCCATGGAC;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=55;WE=113376339;WS=113376310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	113376388	rs1859330	G	A	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=36;PP=1787;SC=GTGGCCAGAAGGCTGCAGCCG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=92;WE=113376396;WS=113376378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	113376452	rs1859329	C	T	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=54;PP=2133;SC=TGGCCGCTGCCCTGAGGGAGC;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=112;WE=113376460;WS=113376442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	113376543	rs3038120	C	CCAAAGGG	4283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=40;PP=2830;SC=CTTTATGTGTCCAAAGGGGAG;SOR=1.378;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=42;WE=113376551;WS=113376533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr12	113385918	rs7961861	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.686;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=949;ReadPosRankSum=-1.415;SC=AGTGAGGGGGCCCCAGGACCC;SOR=0.197;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=61;WE=113385926;WS=113385908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr12	113386616	rs34647135	T	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=687;ReadPosRankSum=-1.363;SC=ATTGGGTTGATGCAGAAACCA;SOR=0.693;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=40;WE=113386624;WS=113386606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr12	113386950	rs2285932	T	C	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=54;PP=1748;SC=AAAAGGCCATTGACATCATCT;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=94;WE=113386958;WS=113386940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	113387034	rs3214199	A	AG	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=451;ReadPosRankSum=0.670;SC=GTGGAGACACAGGGGGGACCC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=17;WE=113387042;WS=113387024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr12	113398919	rs2072136	G	A	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1266;ReadPosRankSum=-0.084;SC=AGGTCTACTCGAGGCTCCTCA;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=84;WE=113398927;WS=113398909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,99:0.43:229
chr12	113400824	rs113210418	CA	C	244.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=313;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TCCCACTCCTCACTCTGCTTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=113400834;WS=113400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	113400826	rs61942232	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CCACTCCTCACTCTGCTTCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=113400834;WS=113400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	113401199	rs45603631	G	A	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1473;ReadPosRankSum=1.057;SC=AAGCAGCAGCGCTGGGGATGC;SOR=0.619;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=209;TCF=129;TCR=80;TR=103;WE=113401207;WS=113401189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,127:0.49:260
chr12	113402297	rs11066461	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GACCCACTTCCGCCCTCGTAG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=13;WE=113402305;WS=113402287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	113405181	rs1557866	A	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=8;PP=1401;SC=CACTGGGACAACATGGGAGCC;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=113405189;WS=113405171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	113416653	rs2384075	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=0.494;SC=CAGCAAGGCCGAGCTACTGGG;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=20;WE=113416661;WS=113416643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr12	113424893	rs2072138	C	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CCGATGGTACCCTTGTCCTCT;SOR=0.448;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=68;WE=113424901;WS=113424883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr12	113425154	rs1293767	C	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=42;PP=1316;SC=GCCAAAGAAGCGGGTGCCAGA;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=113425162;WS=113425144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	113435293	rs1293756	C	A	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=35;PP=2029;SC=CTAGATCCCCCAATGAGCTGC;SOR=1.225;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=96;WE=113435301;WS=113435283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	113435450	rs1293755	A	T	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=67;PP=2913;SC=TCAGAACCGTACTGGAGCTGA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=143;WE=113435458;WS=113435440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	113440921	rs2072137	T	C	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1423;ReadPosRankSum=2.336;SC=AGCACTGGCCTTTCTCATGTC;SOR=0.840;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=84;WE=113440929;WS=113440911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
chr12	113444418	rs929291	T	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=735;ReadPosRankSum=-2.590;SC=AAGGACAGTCTTTGTTCTGAC;SOR=0.982;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=54;WE=113444426;WS=113444408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,72:0.46:155
chr12	113444543	rs2240184	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=1.205;SC=ATCTTTACGACGTTCCCATCA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=113444551;WS=113444533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	113448288	rs15895	A	G	4340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=56;PP=2826;SC=AGAAACTTCTAGAGATCATCT;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=132;WE=113448296;WS=113448278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	113496313	rs1732785	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=295;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TACCTTGCAGCGTAGGATGCT;SOR=0.425;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=16;WE=113496321;WS=113496303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr12	113530845	rs3217697	C	CAG	3908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=2125;SC=CTGCAGTTGGCAGAGAGGTAC;SOR=0.826;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=43;WE=113530853;WS=113530835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	113530899	rs1628639	A	G	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=42;PP=1485;SC=GACAGAAGGCAAGCCAGGTCC;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=113530907;WS=113530889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	113531295	rs1625170	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	113531305	rs1674095	A	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.56;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	113531338	rs7954586	C	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=260;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GCCCCCTAACCCCCAGGGATG;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=20;WE=113531346;WS=113531328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr12	113533050	rs2243397	C	T	6413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GCCCCCACACCCCTCCAACTC;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=98;TCR=95;TR=192;WE=113533058;WS=113533040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,232:1.00:233
chr12	113533124	rs2243396	C	T	7615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=117;PP=2965;SC=CTGTCCCTCTCTGCAGGGCCC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=225;WE=113533132;WS=113533114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	113534633	rs61758447	C	T	3296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=58;PP=2113;ReadPosRankSum=1.787;SC=ACCACAAGACCGAGTTTGGAT;SOR=0.917;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=269;TCF=148;TCR=121;TR=138;WE=113534641;WS=113534623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,154:0.47:325
chr12	113539822	rs1674101	A	G	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=39;PP=1475;SC=CGGCTGAGGGAACACAGCTTC;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=113539830;WS=113539812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	113541940	rs1613480	C	T	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.292;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1170;ReadPosRankSum=0.908;SC=GGACGCCCCCCGCTCCCCATC;SOR=0.665;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=79;WE=113541948;WS=113541930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr12	113544874	rs2468355	C	T	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=59;PP=2534;SC=GCTGAGAAGCCAGATGTGGCC;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=139;WE=113544882;WS=113544864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	113545393	rs736285	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.214;NF=42;NR=12;PP=854;ReadPosRankSum=-1.559;SC=GTGCCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=1.769;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=54;WE=113545401;WS=113545383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr12	113553408	rs1284878	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.447;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=2.934;SC=CCATTGAGGGCGGTGATGTCG;SOR=3.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=113553416;WS=113553398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	113553481	rs1284879	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=457;ReadPosRankSum=-1.208;SC=GTCCAGAAAGCGCCCAGCCAG;SOR=1.005;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=36;WE=113553489;WS=113553471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr12	113553624	rs201119080	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=363;ReadPosRankSum=0.538;SC=AAGATGACCTCGGCCCCTGGG;SOR=0.837;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=23;WE=113553632;WS=113553614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr12	113557073	rs16934243	G	A	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1104;ReadPosRankSum=0.083;SC=GTCTGAGGGCGAAGGAAGTGG;SOR=0.847;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=163;TCF=95;TCR=68;TR=67;WE=113557081;WS=113557063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,79:0.42:190
chr12	113566050	.	GACACAC	G	402	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=402;QD=57.8571428571;SC=TGGAGACCCAGACACACACAC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=113566063;WS=113566040;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,7:0.58:12
chr12	113568797	rs7976407	A	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=423;ReadPosRankSum=0.258;SC=GGCAGCCATGAGTGGAGGGTC;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=24;WE=113568805;WS=113568787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr12	113796566	rs7965471	A	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=24;PP=911;SC=CGCGATGGGCAGGTCCCTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=113796574;WS=113796556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	113836715	rs73194896	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.635;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr12	113836721	rs73194898	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.426;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	113837128	rs2069251	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=371;ReadPosRankSum=-1.147;SC=GAGACTGGCTCAGGAAAGGGT;SOR=0.627;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=27;WE=113837136;WS=113837118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr12	113867245	.	G	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=0.700;SC=CTGAGCTGAGGGGGGAATGAG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=113867253;WS=113867235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	114261286	rs930004	T	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=20;PP=597;SC=AGAGGGAAGTTGGGGAGAGCG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=114261294;WS=114261276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	114282496	rs2075387	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1056;ReadPosRankSum=-1.673;SC=GGCCGTCTTCCGCCGCAGGGC;SOR=0.971;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=64;WE=114282504;WS=114282486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr12	114282678	rs2075386	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-0.883;SC=GCCTGCCTGCGTCTCAGATGC;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=20;WE=114282686;WS=114282668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr12	114296745	rs10744803	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=625;ReadPosRankSum=0.394;SC=AATAGAGGCCCGCAAGGGAGG;SOR=1.284;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=35;WE=114296753;WS=114296735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr12	114356365	rs117728820	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.366;SC=GATTGTTCCCCGGGGAGTGGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=114356373;WS=114356355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	114362621	rs1458713	A	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.917;SC=AGGCAAGGGCACCTGTCAAAC;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=198;TCF=87;TCR=111;TR=93;WE=114362629;WS=114362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,111:0.48:232
chr12	114377899	rs7299217	G	C	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=40;PP=1456;SC=TCCTGCAGCTGGGCCGCCAGG;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=114377907;WS=114377889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	114384426	rs11066842	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CAGGTAGAACGTGGCCACTCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=114384434;WS=114384416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	114793240	rs883079	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=319;ReadPosRankSum=1.451;SC=AAATCTTGTCCGTGGGGTTCT;SOR=1.051;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=18;WE=114793248;WS=114793230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr12	114823187	rs2277377	G	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=539;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CGGGCAGGAAGGCTGGTGGAG;SOR=0.776;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=28;WE=114823195;WS=114823177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr12	114832510	rs2236017	C	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=597;ReadPosRankSum=0.736;SC=AAAGAGCAGACGGCCCCAGGC;SOR=1.546;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=31;WE=114832518;WS=114832500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr12	115110251	.	T	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	115110252	rs1532691	T	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	115118997	rs515746	G	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=605;SC=TAAACCACCCGTAATCTTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=115119005;WS=115118987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	115801070	rs1920947	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TTTTGGGCAAGTTACACAGCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=115801078;WS=115801060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	116412921	rs1992068	AT	TC	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=1503;SC=GTTAATGACAATAGCTGAGCC;SOR=1.378;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=37;WE=116412930;WS=116412911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	116586414	rs10549054	CTA	C	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=1.501;SC=ATGGAGATATCTATATATATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=116586423;WS=116586404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	116866112	rs202127912	CCA	C	277.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.996;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr12	116866113	rs370202370	CA	C	707.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.322;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr12	117013676	rs78152888	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=388;ReadPosRankSum=0.695;SC=GATTCGCTGCCGCAGCAGCCG;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=22;WE=117013684;WS=117013666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr12	117013730	rs7303998	G	C	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=32;PP=1896;SC=TCGCCGCCGCGGCCCAGATCC;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=97;WE=117013738;WS=117013720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	117175828	rs111959200	C	T	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	117175856	rs11832734	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	117186316	rs1532395	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=603;SC=CCACCCCCAGAAATTCTATTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=117186324;WS=117186306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	117187907	rs111256849	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=702;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCCACCACCATTTCCACCATG;SOR=0.902;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=39;WE=117187915;WS=117187897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr12	117217141	rs4767452	T	C	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=52;PP=1369;SC=TCATCCTGGCTGTCAAGTCCA;SOR=1.354;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=81;WE=117217149;WS=117217131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	117286981	rs4767461	C	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=578;SC=TTTGGAGTCGCATTGTCTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=117286989;WS=117286971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	117287112	rs73220476	C	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=980;ReadPosRankSum=1.073;SC=GATTGCTGTCCCCGCAGCACG;SOR=0.522;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=62;WE=117287120;WS=117287102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,72:0.62:116
chr12	117289613	rs903775	G	C	2780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=44;NR=33;PP=1471;SC=AGAAAGAAAGGTCAGCTTTGG;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=117289621;WS=117289603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	117290601	rs903772	T	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=52;PP=1350;SC=TCAGCCTCCCTGTAGCCATCT;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=74;WE=117290609;WS=117290591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	117348968	rs112339051	C	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=124;ReadPosRankSum=1.328;SC=CGGAGGTGGGCTCCGGGCGCG;SOR=0.822;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=11;WE=117348976;WS=117348958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr12	117349014	rs11068230	C	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GCTGGCCCAGCGTCTCCTGGA;SOR=2.697;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=19;WE=117349022;WS=117349004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	117383320	rs4076700	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=153;ReadPosRankSum=-0.318;SC=CACATGTTACGAACCAACTGG;SOR=0.539;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=10;WE=117383328;WS=117383310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr12	117423264	rs7131746	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=446;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TGGGTCTAATGTAAGCACGTA;SOR=1.115;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=25;WE=117423272;WS=117423254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr12	117465857	rs4529958	T	C	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=36;PP=1924;SC=TCCGCGCCTATGAGTTTGCGG;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=111;WE=117465865;WS=117465847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	117465981	rs2291916	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=927;ReadPosRankSum=0.293;SC=TGTTTAGGGATGTGCCTCAGT;SOR=0.480;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=65;WE=117465989;WS=117465971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr12	117476896	rs9308	C	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=527;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GGGGAGGCGGCCCCATTGCAA;SOR=1.009;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=29;WE=117476904;WS=117476886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr12	117477082	rs118025365	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=792;ReadPosRankSum=-0.074;SC=CAGGCCCCCCGGTCCTCGGCC;SOR=0.523;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=46;WE=117477090;WS=117477065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr12	117477104	rs2270794	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=556;ReadPosRankSum=1.242;SC=TTCCCACCTACCGTCTCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=33;WE=117477112;WS=117477094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr12	117486478	rs2291911	C	T	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=30;PP=1412;ReadPosRankSum=2.242;SC=CACGCATGATCGGCATACCCA;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=185;TCF=123;TCR=62;TR=85;WE=117486486;WS=117486468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,90:0.44:206
chr12	117494543	rs2173654	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TCTAGGAAACAAGTATCCCGA;SOR=2.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=8;WE=117494551;WS=117494533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr12	117494587	rs2173653	G	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=495;ReadPosRankSum=0.981;SC=CTGCCACTGGGCTGGTTCAGG;SOR=1.051;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=20;WE=117494595;WS=117494577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr12	117593216	rs4767506	C	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=350;SC=CAGCCACAGCCTTGGGAGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=117593224;WS=117593206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	117593387	rs79478437	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr12	117593391	rs4767507	A	G	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.94;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	117595930	rs2279765	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=1.682;SC=TCTTTTTTGCGGCGAGGGATT;SOR=0.982;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=14;WE=117595938;WS=117595920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr12	117595978	rs2279766	A	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=281;SC=CAAAGGACCAAAAGGGGTGGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=117595986;WS=117595968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	117603561	rs4767511	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=106;SC=TCAGCTCAACGAAGAGATACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=117603569;WS=117603551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	117611934	rs57632063	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=195;ReadPosRankSum=0.741;SC=AGAGCGAGACCCTGTCTCTAA;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=117611942;WS=117611928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	117612357	rs3817015	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=425;ReadPosRankSum=2.283;SC=TTATCACTTTTTCATGACATA;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=22;WE=117612365;WS=117612347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr12	117612377	rs73206061	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=461;ReadPosRankSum=0.975;SC=AATGGCAGCACACTAACAAAT;SOR=1.085;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=27;WE=117612385;WS=117612367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr12	117636032	rs11068409	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.695;SC=GATTACAGGCGTGAGCCATCG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=7;WE=117636040;WS=117636022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	117636074	rs112407951	A	AT	349.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.410;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	117636075	rs59514465	A	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	117660467	rs816363	C	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=557;SC=AGTAGGATGTCCAAGTGTGCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=117660475;WS=117660457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	117662712	rs2293046	G	A	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=652;SC=TTTCTGAGGCGGTGATGCCGT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=117662720;WS=117662702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	117665544	rs904658	A	C	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=58;PP=1784;SC=AAATAAAAGTAACAGTTGGCA;SOR=3.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=67;WE=117665552;WS=117665534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	117669914	rs3741475	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GGCGGAGCTCGTCTGTCCAGT;SOR=1.565;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=117669922;WS=117669904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	117672339	rs1875140	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-0.371;SC=TGCAGCTCCCTAGAGCAGGGA;SOR=0.760;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=11;WE=117672347;WS=117672329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	117681353	rs34385734	A	ACCAT	336.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.49;NF=0;NR=4;PP=263;SC=CATCTATCCAACCATCCATCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=117681361;WS=117681343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	117685138	rs2291908	T	C	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=23;PP=1107;SC=TGTAGGTCCATGAGATCCAGA;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=117685146;WS=117685128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	117685270	rs1047735	G	A	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1076;SC=TGTCCACAGCGTGTCCGAAGG;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=117685278;WS=117685260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	117691409	rs55641698	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.061;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	117691727	rs2682822	T	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=241;SC=CAACTTACCCTTGTCCACCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=117691735;WS=117691717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	117693817	rs11068428	G	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=31;PP=1043;SC=CCTTTACGGGGAAAGAAACGC;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=54;WE=117693825;WS=117693807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	117696164	rs1093329	G	A	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=17;PP=1391;SC=AGTTACCCTCGGGGGTGGCGG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=117696172;WS=117696154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	117715724	rs3215291	AC	A	622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.190;NF=12;NR=5;PP=517;ReadPosRankSum=-1.673;SC=CACTGGGCAAACCCACTCACC;SOR=0.916;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=17;WE=117715732;WS=117715714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr12	117718473	rs11282297	G	GGGTAAAA	1795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=1461;ReadPosRankSum=1.196;SC=AAAAGTCTGTGGTCTGGGGAC;SOR=0.509;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=25;WE=117718481;WS=117718463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
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chr12	117969378	rs7296195	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=1.085;SC=TCTTAGGCACCCCCACAACAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=117969386;WS=117969368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	117993064	rs7955803	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=557;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TGATGTCACACGGAACGGACT;SOR=0.781;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=41;WE=117993072;WS=117993054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,52:0.37:140
chr12	118017201	rs4767569	C	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=772;SC=CAGATAATAACAGTATTGACC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=118017209;WS=118017191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	118020115	rs11068551	G	A	6100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=86;PP=2965;SC=TGGAGTTGCCGAGATCTCTGC;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=184;WE=118020123;WS=118020105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	118199286	rs617641	C	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=676;ReadPosRankSum=0.670;SC=CCGTCTCTGTCGTGGGCCACT;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=39;WE=118199294;WS=118199276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr12	118455759	rs2393374	T	G	8523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=141;PP=2965;SC=TGGAAATCCTTTACCCATTGA;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=115;TCR=142;TR=256;WE=118455767;WS=118455749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr12	118464688	rs5745870	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=353;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CCCTCTGTCTACACAGAGCAC;SOR=1.258;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=118464696;WS=118464678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr12	118467553	rs4767654	A	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=766;ReadPosRankSum=1.050;SC=GACCTAACTCATTTGATTTTG;SOR=0.891;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=51;WE=118467561;WS=118467543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr12	118473054	rs9788041	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=621;ReadPosRankSum=-0.320;SC=ACAAGCCTTCTGGAGAGAAGC;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=44;WE=118473062;WS=118473044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr12	118475967	rs11068779	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=-1.352;SC=GTGGTGGCCATGGCCCACCAG;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=118475975;WS=118475957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr12	118476079	rs11068780	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=238;ReadPosRankSum=-0.773;SC=AAAGCAATAACGCTGGAGACT;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=13;WE=118476087;WS=118476069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	118480874	rs7312586	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=631;ReadPosRankSum=0.954;SC=GGGGCAGGGAGGCGACATAGT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=33;WE=118480882;WS=118480864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr12	118506186	rs67405503	A	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=606;ReadPosRankSum=0.890;SC=GCTTACCTTGAAGATCCTGGA;SOR=0.395;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=45;WE=118506194;WS=118506176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr12	118506327	.	TTCC	T	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.613;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr12	118509086	rs7135400	A	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=-1.441;SC=GGTGGGAGCAAGGCAGGGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=13;WE=118509094;WS=118509076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr12	118541239	rs7961197	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.778;NF=10;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=-0.711;SC=GCAAAGACGGCCGAGCTGCGA;SOR=1.833;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=11;WE=118541247;WS=118541229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	118589069	rs2249624	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.089;NF=2;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=1.319;SC=ACACACATAGGCACACACATG;SOR=1.193;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=11;WE=118589077;WS=118589059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr12	118589092	rs140297022	GCGCA	G	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=242;ReadPosRankSum=1.415;SC=GTGCGCGCGCGCGCACACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=118589104;WS=118589082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	118589096	.	A	G	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MMLQ=23;MQ=59.94;NF=0;NR=4;PP=138;QD=43.1928031368;SC=GCGCGCGCGCACACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=118589104;WS=118589082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	118599500	rs74622505	T	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GTGCAGAAATTTGTGATTCTG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=118599508;WS=118599490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	118650917	rs353886	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TAAAAAAATGCTTTGGAATAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=5;WE=118650925;WS=118650907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
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chr12	118682751	rs428073	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=614;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CACCACCTCACTGGTGTGAGC;SOR=0.257;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=41;WE=118682759;WS=118682741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
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chr12	119563084	rs7296134	C	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=762;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GGATGGTGACCAGTGCAAAGG;SOR=1.253;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=49;WE=119563092;WS=119563074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr12	119563128	rs34183325	C	T	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.764;SC=ATCTCTCACTCTCCCTTTTTT;SOR=0.946;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=98;WE=119563136;WS=119563118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,124:0.57:218
chr12	119563288	rs34186549	A	AC	916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.552;NF=2;NR=29;PP=1052;ReadPosRankSum=1.144;SC=AGAGCAGGTAACCCCTTGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=31;WE=119563296;WS=119563278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr12	119563325	rs12422371	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.061;NF=5;NR=22;PP=476;ReadPosRankSum=0.030;SC=CAGCCACAGCCGAGCCCAGGC;SOR=1.151;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=27;WE=119563333;WS=119563315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr12	119568421	rs7298308	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=112;ReadPosRankSum=0.114;SC=GTTGGTCCTGCATACATCTCC;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=9;WE=119568429;WS=119568411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	119568670	rs7298583	C	A	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CCTCTGCCAGCCTTGGCCACG;SOR=0.683;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=68;WE=119568678;WS=119568660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,70:0.63:111
chr12	119568691	rs4298970	A	G	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=991;ReadPosRankSum=1.082;SC=ACACTTGGGGAATGTGGAGGC;SOR=1.002;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=59;WE=119568699;WS=119568681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr12	119568721	rs11064675	T	C	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=599;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GGGCAGTGTATGGTACACTTT;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=46;WE=119568729;WS=119568711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr12	119591176	rs34002484	A	AC	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=-0.050;SC=ATTATTAACCACCGGTGGGGA;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=119591184;WS=119591166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	119871387	rs1716471	A	G	5888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=98;PP=2965;SC=TCCAAGTGGCACAAACTCCCT;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=80;TCR=99;TR=178;WE=119871395;WS=119871377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr12	119871493	rs1716470	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=37;PP=1087;SC=CCCTCCTGTTGGAGACTAGCT;SOR=2.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=119871501;WS=119871483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	119871533	rs1727388	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=529;SC=TTACTGTCTCTTGGATTTTTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=119871541;WS=119871523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	119957813	rs76512640	G	T	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=939;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GTGCTCAGTAGAGTCTGAAGA;SOR=0.862;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=57;WE=119957821;WS=119957803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,57:0.55:103
chr12	119957861	rs708884	T	C	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TCCTCCCACATGTAGTTACTG;SOR=0.870;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=80;WE=119957869;WS=119957851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,91:0.52:174
chr12	119958068	rs573590	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=278;ReadPosRankSum=0.192;SC=ACTGCAGGGATGCTCCTCCCC;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=18;WE=119958076;WS=119958058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	119960612	rs708887	G	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	119960622	rs77377737	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr12	119978404	rs708889	A	G	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=451;ReadPosRankSum=1.536;SC=GATTGCCACTATGTCTGCCTC;SOR=0.484;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=29;WE=119978412;WS=119978394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr12	120067561	rs2301653	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=392;SC=GCTACAACGATGGAGACTACG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=120067569;WS=120067551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	120067727	rs2301654	C	T	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=74;PP=2965;SC=CTTTCTCGAACGCCCGTTGGA;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=87;TCR=75;TR=161;WE=120067735;WS=120067717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	120067864	rs2893805	G	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=54;PP=1747;SC=CTTCTAGTGCGGGAGTGGGTG;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=120067872;WS=120067854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	120078577	rs2301655	T	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=887;SC=CCAAAGGAGTTTCTAAGGAAT;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=120078585;WS=120078567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	120106376	rs6490267	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.336;SC=TCTCTTAGCGGTCCAAGAACC;SOR=0.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=120106384;WS=120106366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	120112099	rs278145	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=523;ReadPosRankSum=1.815;SC=AGAATAACTCCGCAGACCTTC;SOR=0.287;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=26;WE=120112107;WS=120112089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr12	120114205	rs10849690	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=187;ReadPosRankSum=1.535;SC=CTCTTGGAACCAGTGCATCCT;SOR=0.317;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=13;WE=120114213;WS=120114195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	120114507	rs278149	G	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.807;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CGGACCATCCGCCGTGGGTCA;SOR=0.495;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=34;WE=120114515;WS=120114497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr12	120126074	rs10669112	A	AAGG	2938.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=2154;ReadPosRankSum=1.263;SC=GGAGTGAAATAAGGAGGAGTG;SOR=0.631;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=14;TCR=93;TR=46;WE=120126082;WS=120126064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
chr12	120135717	rs278126	G	T	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1169;ReadPosRankSum=-1.722;SC=GAAGGAACATGCGGCCGGCCC;SOR=0.757;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=72;WE=120135725;WS=120135707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,94:0.51:183
chr12	120150196	rs804667	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=384;ReadPosRankSum=1.414;SC=GGATTTCCCCCGTTCCCACTG;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=23;WE=120150204;WS=120150186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr12	120156141	rs278102	G	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GCACGATGGCGGACATGGCGA;SOR=0.660;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=43;TCR=68;TR=58;WE=120156149;WS=120156131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr12	120158203	rs7299963	C	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=775;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TTCCTATGATCATATATCACA;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=42;WE=120158211;WS=120158193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr12	120168357	rs55993032	G	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=704;ReadPosRankSum=1.851;SC=GCTGCAGAGCGAGAATCTCAG;SOR=0.801;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=44;WE=120168365;WS=120168347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr12	120171995	rs278109	T	C	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=36;PP=2762;SC=TGTCCAGCATTCTCTGCAGCT;SOR=1.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=126;WE=120172003;WS=120171985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	120172173	rs11064891	G	A	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=56;PP=1582;ReadPosRankSum=0.835;SC=CTGCAAATCAGTAGCACTGAT;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=82;TCR=108;TR=97;WE=120172181;WS=120172163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,105:0.49:216
chr12	120189879	rs904655	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.133;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	120189888	rs904654	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.523;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	120195354	rs34851548	TG	T	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=568;ReadPosRankSum=-1.272;SC=GCCTTCCTGGTGGGGGTGGTG;SOR=0.616;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=19;WE=120195362;WS=120195344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr12	120220282	rs440299	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=0.659;SC=AGGTCCAAGCAAGCCGAGATG;SOR=1.981;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=10;WE=120220290;WS=120220272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	120220589	rs385959	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=0.876;SC=TGGTTGCCGACTCCGGTTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=12;WE=120220597;WS=120220579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	120270528	rs4767849	T	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=540;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGACCAAGAATACTTTTTAGT;SOR=0.880;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=34;WE=120270536;WS=120270518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr12	120575549	rs3864938	A	C	6304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=93;PP=2965;SC=TCCAGCAGATACTCGATGATG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=194;WE=120575557;WS=120575539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr12	120654039	.	CAG	C	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=-1.935;SC=GGCATTAGGACAGGGGACAGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=120654048;WS=120654029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr12	120720038	rs7960743	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=781;ReadPosRankSum=-3.212;SC=CACTGCCGCCTGGCCCCTCCA;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=54;WE=120720046;WS=120720028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr12	120750239	rs2261612	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=15;PP=695;SC=CTGTTCAGTCAGCGTCTTCCT;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=120750247;WS=120750229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	120762765	rs5637	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=799;ReadPosRankSum=0.579;SC=AGCCAGAGCACGAGTATGAAT;SOR=0.765;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=48;WE=120762773;WS=120762755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,64:0.42:151
chr12	120783527	rs1076205	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=34;PP=961;SC=GAAGTGAGGCGCTGACCTCTC;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=120783535;WS=120783517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	120783561	rs1076206	T	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=23;PP=652;SC=ATCGCCCCCCTACTGCAGGTC;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=120783569;WS=120783551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	120791042	rs1007469	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=231;ReadPosRankSum=0.321;SC=ACCCTGAGAAGTCAGACTGCC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=16;WE=120791050;WS=120791032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr12	120794653	rs1179441	T	C	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=8;PP=1527;SC=CCCCTGCTAGTCCTGGGAGCA;SOR=3.327;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=64;WE=120794661;WS=120794643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	120796703	rs1179445	T	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=536;SC=ACGCAGATCCTGGGGGATAGG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=120796711;WS=120796693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	120800696	rs1557769	T	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.674;SC=GGCTGCAAGGTGGATTGGCCT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=120800704;WS=120800686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	120800823	rs757123	A	G	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=24;PP=1040;SC=CCCCAGCAGCAAGCGCCCCCA;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=120800831;WS=120800813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	120800988	rs73221336	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TGTGGCCTACCGCCACCAGCA;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=15;WE=120800996;WS=120800978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr12	120801064	rs34243955	GC	G	134.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=83;SC=CTCTTTAAAGGCCCCCCCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=5;WE=120801072;WS=120801054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	120806129	rs111293994	C	CT	1661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.673;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;MQRankSum=0.313;QD=34.62;ReadPosRankSum=1.553;SOR=2.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr12	120806706	rs11065094	C	G	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=72;PP=1584;ReadPosRankSum=0.794;SC=ACAAAGGGCCCGCGTGAGCGC;SOR=0.532;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=235;TCF=83;TCR=152;TR=115;WE=120806714;WS=120806696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,136:0.50:274
chr12	120882835	rs3858722	TAC	T	941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=1013;SC=AATATGACAGTACAAAAGTAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=120882844;WS=120882825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	120884328	rs2235217	C	T	5166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=93;PP=2965;SC=CCCCTCTGGGCGGGCGCCAGG;SOR=1.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=159;WE=120884336;WS=120884318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	120897652	rs28390349	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=3;PP=1092;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAAAC;SOR=3.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=43;WE=120897660;WS=120897642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	120934407	rs1563333	C	T	7863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=141;PP=2965;SC=GGGGTTCCTTCCCCCCGATCC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=87;TCR=141;TR=228;WE=120934415;WS=120934397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	120941927	rs7136951	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=179;SC=AGAACATGCCCCTCACTTCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=120941935;WS=120941917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	120942911	rs4766966	G	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=354;SC=CCTCTTGTTTGTTCTCACTTG;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=120942919;WS=120942901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	120947788	rs4766968	G	C	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=24;PP=2113;SC=TTTCCTGAGAGTCATACAAGC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=92;WE=120947801;WS=120947778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	120947948	rs500003	G	A	5459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=103;PP=2965;SC=AGTGAGTTCCGGGTCTCAGTG;SOR=1.184;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=64;TCR=103;TR=167;WE=120947956;WS=120947938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	120966659	rs55848094	G	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=5;PP=1229;SC=GAACTAATTGGATGTTAAATC;SOR=3.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=120966667;WS=120966649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	120966921	rs3742052	A	G	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=47;PP=1449;SC=AGCTCCATAGAGCACAGCTCC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=59;WE=120966929;WS=120966911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	120990582	rs12309824	A	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=85;SC=GGCTTTTTTTAAGCTATTGTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=120990590;WS=120990572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	120992401	rs3213565	C	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=880;SC=TGCAGTGCCTCATGAACCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=120992409;WS=120992391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	120994932	rs7956998	G	A	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=1;PP=929;SC=ATGTACCTACGTTGTAAACAA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=120994940;WS=120994922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	120995332	rs2292681	G	A	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=70;PP=2951;SC=TGCTACATATGAGTGTCCATG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=143;WE=120995340;WS=120995322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	120998443	rs603574	A	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=784;SC=CCCCAGAGAAAAGGCTGTATT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=120998451;WS=120998433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	120998481	rs787949	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=14;PP=1159;SC=CTACACCATCGTGAGCTTTGA;SOR=1.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=120998489;WS=120998471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	121004564	.	CAA	C	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=18;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=59.44;NF=7;NR=0;PP=95;QD=14.0;SC=GACCCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=7;WE=121004574;WS=121004554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,7:0.30:23
chr12	121004590	rs546417	C	A	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=9;PP=687;SC=AAATTGAATTCTGTAAATGGG;SOR=1.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=31;WE=121004598;WS=121004580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	121009198	rs651627	C	T	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=133;SC=CATTCTAATACGGCTGGACAA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=121009206;WS=121009188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	121017171	rs7174	A	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=716;SC=TCCTCCTCTAATAAGCAGCTT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=121017179;WS=121017161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	121017243	rs509445	A	C	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=40;PP=2288;SC=CAGGGATGAAAGATATCTTTG;SOR=1.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=116;WE=121017251;WS=121017233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	121017439	rs563920	A	G	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=71;PP=2363;SC=CTTGTGAAAGATCTCGACCTT;SOR=1.526;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=107;WE=121017447;WS=121017429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	121017474	rs3833953	GT	G	3320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=44;PP=2965;SC=GTAGGGGGAAGTGTCTTGTTA;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=80;WE=121017482;WS=121017464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	121019323	rs591992	T	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=469;SC=CTGTCAGCTCTCTCAAGCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=121019331;WS=121019313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr12	121094110	rs569499	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CCGCTGAACTTGGCTTCACAG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=121094118;WS=121094100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	121097622	rs529584	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=301;ReadPosRankSum=-0.490;SC=CCCAGGTTAGGTATTTTGTGA;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=22;WE=121097630;WS=121097612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr12	121133037	rs504403	G	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=330;ReadPosRankSum=-1.965;SC=TTGAGCTGATGACTATTTTGG;SOR=1.129;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=18;WE=121133045;WS=121133027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr12	121176549	rs487915	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=629;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GACTGCTCTCCGTCCTCCTCC;SOR=0.858;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=41;WE=121176557;WS=121176539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr12	121220375	rs2393717	G	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=1.452;SC=TGTAGTGATGGTTGTACAGCT;SOR=0.307;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=121220383;WS=121220371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr12	121221628	rs7137504	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=395;ReadPosRankSum=-0.649;SC=AACTTCATTCCGCCAAACACT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=23;WE=121221636;WS=121221618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr12	121222411	rs3213570	C	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1212;ReadPosRankSum=-1.412;SC=AAGAGAAAAACAGACAGATTA;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=70;WE=121222419;WS=121222401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr12	121222556	rs3213567	T	C	219.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=9.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CCAACGAGATTATGAGCTCCT;SOR=4.398;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=121222564;WS=121222546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr12	121248584	rs674021	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=1064;SC=CCTCCAACTTGTATCAACCCC;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=121248592;WS=121248574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	121341535	rs35912287	G	GC	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=45;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CCCAACCCGCGCCCCCCCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=2;WE=121341543;WS=121341525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	121341849	rs2686458	A	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=5;PP=166;SC=CGGGCTCCGAAGCGGCCCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=121341857;WS=121341839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	121416622	rs1169289	C	G	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1131;ReadPosRankSum=1.214;SC=CGGCCCTGCTCGAGTCAGGGC;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=73;WE=121416630;WS=121416612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,87:0.39:222
chr12	121416650	rs1169288	A	C	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1193;ReadPosRankSum=-1.299;SC=AGAGGCACTGATCCAGGCACT;SOR=0.933;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=188;TCF=98;TCR=90;TR=66;WE=121416658;WS=121416640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,75:0.36:211
chr12	121426594	rs1169294	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=432;ReadPosRankSum=0.910;SC=TATGGGGAGAGACAGCCCTTG;SOR=3.287;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=23;WE=121426602;WS=121426584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr12	121431272	rs2071190	T	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=1.446;SC=GGAATGGACGTGGGAAGGTGA;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=121431280;WS=121431262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr12	121431300	rs1169301	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=271;ReadPosRankSum=0.277;SC=CAGTACCCCACTCACGGCTTT;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=16;WE=121431308;WS=121431290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	121432302	rs1169302	T	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=638;SC=CTCTTTGCACTTCAGTTTGGT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=121432310;WS=121432292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	121434630	rs55853809	C	CTCATTCAT	2439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=11;PP=1834;SC=GCCACTGGGACTCATTCATTC;SOR=1.270;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=24;WE=121434638;WS=121434620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	121434833	rs2259852	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=0.460;SC=AGGGTAAGGGGGACTGATGTT;SOR=1.112;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=11;WE=121434841;WS=121434823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr12	121435342	rs2259820	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=416;ReadPosRankSum=0.682;SC=CCTGACCACCCTGCAGCCCGT;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=26;WE=121435350;WS=121435332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr12	121435427	rs2464196	G	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=716;ReadPosRankSum=-1.463;SC=GTGACCCAGAGCCCCTTCATG;SOR=0.833;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=52;WE=121435435;WS=121435417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,70:0.40:175
chr12	121435475	rs2464195	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1136;ReadPosRankSum=0.813;SC=CACGGTGAGCGCCCTGTGCCC;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=109;TCR=69;TR=75;WE=121435483;WS=121435465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,97:0.42:230
chr12	121435587	rs2259816	G	T	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GGACAAGTGTGTTTCCGTGAT;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=181;TCF=73;TCR=108;TR=84;WE=121435595;WS=121435577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,108:0.48:225
chr12	121437221	rs1169304	T	C	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=72;PP=2165;SC=GGCCCTCCCTTGGCCTGTGAC;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=121;WE=121437229;WS=121437211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	121437382	rs1169305	A	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=18;PP=555;SC=GGACCCTGCCAGCATCCAGCA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=121437390;WS=121437372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr12	121439433	rs1169310	G	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1104;ReadPosRankSum=0.907;SC=GAGAGGCCCTGGATCAGCGTG;SOR=0.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=67;WE=121439441;WS=121439423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr12	121442199	rs3751151	T	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=2.391;SC=CCTTCTCCACTGTTCCAGGGC;SOR=0.518;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=39;WE=121442207;WS=121442189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr12	121442214	rs3751150	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=522;ReadPosRankSum=1.091;SC=CAGGGCTGTGGATGGCTGACT;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=35;WE=121442222;WS=121442204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr12	121444026	rs2708082	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-2.132;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
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chr12	121450354	rs2264778	C	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.577;SC=CAGATAGATGCACTTTTAAGA;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=20;WE=121450362;WS=121450344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr12	121450384	rs2254971	G	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=0.028;SC=GGCCGGGCGCGGTGGCTCACG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=10;WE=121450392;WS=121450374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	121454257	rs2258227	T	A	7741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=111;PP=2965;SC=AATCGCTCACTGTGCCACTGG;SOR=0.864;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=135;TCR=111;TR=246;WE=121454265;WS=121454247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr12	121454313	rs2258287	C	A	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1680;ReadPosRankSum=0.804;SC=AGAACACCGCCGTTATCAAGC;SOR=0.617;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=213;TCF=92;TCR=121;TR=102;WE=121454321;WS=121454303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,112:0.44:252
chr12	121471337	rs3213545	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=959;ReadPosRankSum=0.694;SC=TGGTGAAGACGAGAGCATCGG;SOR=0.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=69;WE=121471345;WS=121471327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr12	121605355	rs7958311	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=732;ReadPosRankSum=2.125;SC=CATCACTGCCGTCCCAAATAC;SOR=1.004;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=42;WE=121605363;WS=121605345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr12	121622024	rs28360458	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=169;ReadPosRankSum=-1.804;SC=AATATTAAACGTAACTTTATA;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=121622032;WS=121622014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	121622304	rs3751143	A	C	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=953;ReadPosRankSum=0.865;SC=TGCCTGGAGGAGCTGTGCTGC;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=181;TCF=83;TCR=98;TR=84;WE=121622312;WS=121622294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,98:0.46:214
chr12	121622520	rs1653624	A	T	4769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=74;PP=2965;SC=GACTTTGCCAACCTGCCCAGC;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=152;WE=121622528;WS=121622510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	121706533	rs1718120	T	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=268;ReadPosRankSum=0.196;SC=CCAGGTCCTGTTTAAAGCAGG;SOR=1.141;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=18;WE=121706541;WS=121706523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr12	121707321	rs1109453	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=744;ReadPosRankSum=-1.157;SC=AGGAGAATGCGGATACTCACA;SOR=0.879;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=43;WE=121707329;WS=121707311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr12	121712077	rs3817190	T	A	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=29;PP=1673;ReadPosRankSum=0.461;SC=GACCCGGAGGTGTCAAGGGGG;SOR=1.138;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=167;TCF=107;TCR=60;TR=91;WE=121712085;WS=121712067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,103:0.54:189
chr12	121746542	rs79486147	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=577;ReadPosRankSum=0.287;SC=AACCCTTCACGTATAGTTTTC;SOR=0.452;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=44;WE=121746550;WS=121746532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr12	121764799	rs4980993	A	C	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=19;PP=1392;SC=GTCGAGCAGAACTGTCCAACA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=121764807;WS=121764789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	121768248	rs2280067	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=681;SC=TAATTAAAGTCATATGAAACT;SOR=3.477;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=121768256;WS=121768238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	121773552	rs3751162	T	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=652;SC=ATCAATGTATTTTAAACGCTG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=121773560;WS=121773542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	121785795	rs1169961	C	A	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=43;PP=1245;SC=TCACTCCAAACATGCAAATAA;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=121785803;WS=121785785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	121789927	rs1799525	C	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=480;ReadPosRankSum=1.025;SC=AGCCAGCGGGCGCCTCTCACC;SOR=0.979;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=28;WE=121789935;WS=121789917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr12	121840360	.	T	TA	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=30;QD=19.5;SC=TATAAGGGATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=121840368;WS=121840351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr12	121840634	rs11831315	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.101;NF=6;NR=16;PP=248;ReadPosRankSum=-1.782;SC=CTATAGCACATGTTATTGTAA;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=22;WE=121840642;WS=121840624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr12	121858208	rs3751135	A	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr12	121858212	rs3751134	G	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.53;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr12	121861424	rs28557279	C	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=43;PP=1083;ReadPosRankSum=0.376;SC=ACTTGACCCCCAACATTTCAA;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=71;TCR=97;TR=74;WE=121861432;WS=121861414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,90:0.46:194
chr12	121867829	rs1138515	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=579;ReadPosRankSum=0.270;SC=CCTCCTCTCCGACAGGAATGT;SOR=1.061;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=35;WE=121867837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr12	121880885	rs3842645	T	TG	1035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=693;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TCGTGGGATTTGGTCTCCTCG;SOR=1.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=20;WE=121880893;WS=121880875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr12	121883027	rs7954896	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=274;ReadPosRankSum=-0.958;SC=TCTCCAGCAACCCTACCTGCC;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=23;WE=121883035;WS=121883017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr12	122017006	rs374034783	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=0.877;SC=CAAAGATGCTGAAAAGCAGGA;SOR=0.204;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=122017014;WS=122016996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr12	122064773	rs141919534	CCCGCCA	C	7861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=44.17;SOR=1.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	122079189	rs3741595	C	T	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=1915;ReadPosRankSum=0.026;SC=CCACCGTCATCGGCACGCTGC;SOR=0.558;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=299;TCF=139;TCR=160;TR=136;WE=122079197;WS=122079179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,158:0.45:355
chr12	122079441	rs3825175	T	C	9638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=176;PP=2965;SC=GCCATAAGACTGACCGACAGT;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=313;TCF=137;TCR=176;TR=313;WE=122079449;WS=122079431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr12	122097043	rs63632160	GCACACA	GCA,G	1264.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5355,0.4645;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8,8;NR=2,2;PP=552,7;SC=ACACACGCGCGCACACACACA;SOR=2.910;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=10,10;WE=122097056;WS=122097033;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:33
chr12	122097078	rs375019396	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.112;NF=21;NR=8;PP=455;ReadPosRankSum=0.544;SC=CACACACCCCGGCTGGCAGGC;SOR=0.483;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=29;WE=122097086;WS=122097068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr12	122097305	rs2720032	G	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=593;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CGGGGGGTGGGGGTGGTGTGC;SOR=0.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=40;WE=122097313;WS=122097295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr12	122199444	rs76845075	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=0.328;SC=CAGAGGCAGCGCGTGCTGTGG;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=122199452;WS=122199436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	122209333	rs12299238	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=952;ReadPosRankSum=0.517;SC=GAGTTGGGGCGGGGAGGAATG;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=60;WE=122209341;WS=122209323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr12	122209613	rs11043192	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=-0.714;SC=AGCTGTCCCCGCCCCAGGTCA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=122209621;WS=122209603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	122212525	rs11043195	C	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=258;ReadPosRankSum=2.190;SC=GGGCAGCGGACCCCCTCAGCG;SOR=1.162;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=16;WE=122212533;WS=122212515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr12	122212659	rs11043196	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=832;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TGGGTATCTCCTGTCTGGGCT;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=50;WE=122212667;WS=122212649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr12	122212752	rs7314742	G	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=924;SC=TCCTGGGGCCGGGGCAGCCTC;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=122212760;WS=122212742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	122217856	rs59641582	G	GGT	2336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=18;PP=1445;SC=GGTTCCCCCAGGTGTCTCCCA;SOR=1.159;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=31;WE=122217864;WS=122217846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	122218489	rs7136373	C	G	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1246;ReadPosRankSum=0.838;SC=CTCCACTTCTCGCTAGCTGTG;SOR=0.915;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=79;WE=122218497;WS=122218479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,93:0.48:194
chr12	122231368	rs2707067	C	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=392;ReadPosRankSum=-0.133;SC=AGGGGCGTCCCTCGCCCCCAC;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=30;WE=122231376;WS=122231358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr12	122231573	rs2707066	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	122243905	rs1168666	C	T	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1413;ReadPosRankSum=1.972;SC=ACCTGGGCATCGCCAAGGTGG;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=92;WE=122243913;WS=122243895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,106:0.51:209
chr12	122248582	rs895952	C	G	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CAACACCCCTCCCAGACTCCG;SOR=0.795;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=84;WE=122248590;WS=122248572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,107:0.53:203
chr12	122257890	rs11043202	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=132;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GGGGTAGATCGCTGACCGTCC;SOR=0.269;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=11;WE=122257898;WS=122257880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr12	122281575	rs1795963	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=-2.321;SC=TGCAGAGCTCATACTCCCCCC;SOR=0.091;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=14;WE=122281583;WS=122281565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr12	122284715	rs2247291	T	C	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1461;SC=TTTGCAGAGATCGTCCCTGGC;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=122284723;WS=122284705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	122287132	rs3832816	CT	C	594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=374;SC=AAGAGAGACTCTTTTTTTTGC;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=122287140;WS=122287122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	122292546	rs3741586	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=653;ReadPosRankSum=1.080;SC=AGTCAGCTGCGGGGCTCCTGG;SOR=0.722;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=38;WE=122292554;WS=122292536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr12	122295335	rs1154510	T	C	4530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.81;SOR=1.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	122295335	.	TGGCCTGAAT	CGGCCTGAAA,CGGCCTGAAT	845	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13,38;NR=27,61;PP=603,845;QD=16.4116968716;SC=TAGAATGACGTGGCCTGAATC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=40,99;WE=122295352;WS=122295325;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:99
chr12	122295344	rs2707072	T	A	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=1.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr12	122326812	rs2230681	T	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=50;PP=2393;SC=CAGGCCGGCGTCGTGACTGTC;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=122326820;WS=122326802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	122359172	rs6486782	T	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=810;SC=AGCTGGTTATTATGGTCAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=122359180;WS=122359162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	122359397	rs142042908	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	3433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.47;QD=54.50;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	122361929	rs34885077	CT	C	328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=347;SC=TCCCCCAGTGCTTTTGAGAGT;SOR=1.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=122361937;WS=122361919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	122389248	rs1185260	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=606;SC=ATTTCCCAAGACAGCAAGTTC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=122389256;WS=122389238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	122391961	rs181269239	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.290;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr12	122391961	.	GTA	ATG	306	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17;NR=2;PP=306;QD=18.9193618349;SC=ATAAAATATCGTATTGATAAA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=19;WE=122391971;WS=122391951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,19:0.46:41
chr12	122391963	rs1154513	A	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.91;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	122392038	rs11043265	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=947;ReadPosRankSum=0.106;SC=CTTCAACAAGCTTGTGGGAAA;SOR=0.474;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=61;WE=122392046;WS=122392028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr12	122394921	rs11043271	A	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=0.589;SC=ATTAGGTATTATATAGATGCT;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=122394929;WS=122394911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	122409664	rs658957	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=1.681;SC=ATCTTTGTGATATGGTTTGGC;SOR=0.473;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=13;WE=122409672;WS=122409654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	122413196	rs77422261	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=519;ReadPosRankSum=0.256;SC=CTTGACCCCATTCTATGGTCT;SOR=0.518;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=35;WE=122413204;WS=122413186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr12	122439369	rs1182927	T	C	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=62;PP=2965;SC=GCCTCAAGAGTTAAACAATCA;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=146;WE=122439377;WS=122439359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	122441492	rs144947431	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=654;ReadPosRankSum=-1.908;SC=CCCCTCCCCTCACCCAAAAAA;SOR=1.154;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=38;WE=122441500;WS=122441482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr12	122492598	rs2280573	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.377;SC=TGTAGCCTTCAAAGACCACTG;SOR=1.569;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=13;WE=122492606;WS=122492588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	122497001	rs28629903	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.252;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=276;ReadPosRankSum=2.256;SC=CCCCAAGGATTTGGAAGGAGT;SOR=0.183;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=21;WE=122497009;WS=122496991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr12	122611620	rs75503016	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=5;PP=234;SC=CAGTATCCCCACCATGCCCTG;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=122611628;WS=122611619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	122611641	rs78324047	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=6;PP=331;SC=CCCTGTGTGGCTCTGAAGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=122611649;WS=122611631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	122612325	rs7488393	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=0.456;SC=GAAGGAAAGGGTACCTGGGAA;SOR=1.148;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=23;WE=122612333;WS=122612315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr12	122612350	rs7486198	G	T	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=629;ReadPosRankSum=0.302;SC=GTCTGCCCTAGGGGAGGGGTG;SOR=0.648;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=39;WE=122612358;WS=122612340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr12	122612598	rs7484733	T	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=587;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GCTGGTCCTGTAGGAGAGGCT;SOR=1.011;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=32;WE=122612606;WS=122612588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr12	122612625	rs10847611	C	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.88;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	122612625	.	CGCCTGCCCTG	GGCCTGCCCTA,GGCCTGCCCTG	293	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4,12;NR=13,35;PP=223,293;QD=16.2628161684;SC=GGTAGTGCAGCGCCTGCCCTG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=17,47;WE=122612643;WS=122612615;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:47
chr12	122612635	rs6489238	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.318;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr12	122613540	rs6489244	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=269;ReadPosRankSum=0.550;SC=TGGGACGTACTTTCTGAGTGA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=17;WE=122613548;WS=122613530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr12	122613599	rs10847853	A	G	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=21;PP=1137;SC=AGGCCTGATTATAGTGCCGGA;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=122613607;WS=122613589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	122614060	rs7487608	G	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1224;ReadPosRankSum=1.803;SC=CTCCCTGAGAGTTCTGTATAT;SOR=0.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=157;TCF=105;TCR=52;TR=78;WE=122614068;WS=122614050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,95:0.51:187
chr12	122614209	rs5801481	CT	C	3299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=61;PP=2287;ReadPosRankSum=0.025;SC=AGGACCCCCACTTTGACATGA;SOR=0.506;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=8;TCR=121;TR=65;WE=122614217;WS=122614199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,112:0.51:220
chr12	122614387	rs7487292	T	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr12	122615515	rs4758654	C	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=401;ReadPosRankSum=0.337;SC=ACGGTTGCCTCCATCTCCCCC;SOR=2.235;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=20;WE=122615523;WS=122615505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr12	122616759	rs7955571	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=5.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr12	122616766	rs7955575	G	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=7.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.243;SOR=0.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr12	122617989	rs7978353	A	G	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=802;ReadPosRankSum=1.177;SC=CACATGGATGAGCAGGGCTGT;SOR=0.753;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=52;WE=122617997;WS=122617979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr12	122618131	rs36045144	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=498;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GCCCCGCCCCACCGCCCATCT;SOR=0.766;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=36;WE=122618139;WS=122618121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr12	122619528	rs11287019	CT	C	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.871;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GCCTCTCTATCTTTTTTTTAA;SOR=1.901;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=13;WE=122619536;WS=122619518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr12	122622207	rs11307581	CT	C	2492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.125;NF=7;NR=52;PP=2118;ReadPosRankSum=2.171;SC=GGATCTGTGTCTTGTCTGGAA;SOR=0.928;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=13;TCR=107;TR=59;WE=122622215;WS=122622197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,83:0.45:186
chr12	122623000	rs4758686	T	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=557;ReadPosRankSum=-1.044;SC=TGCAGAAGACTGTGGAGTACA;SOR=0.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=48;WE=122623008;WS=122622990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr12	122623595	rs9668430	A	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=0.497;SC=CCTGTCACCAAGCTCCTCACG;SOR=0.440;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=33;WE=122623603;WS=122623585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr12	122625212	rs7488857	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TTTTGATCGCATGTTTGTGCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=122625220;WS=122625202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	122626381	rs11057509	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=490;ReadPosRankSum=-1.613;SC=GCATGTGGCCGCATGAGATGC;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=31;WE=122626389;WS=122626371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr12	122626842	rs4758685	G	A	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=47;PP=1646;ReadPosRankSum=1.142;SC=GTTGGAAGGCGTCTTTCTTTC;SOR=0.686;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=191;TCF=96;TCR=95;TR=100;WE=122626850;WS=122626832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,125:0.52:241
chr12	122658383	rs6489173	A	G	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=56;PP=2965;SC=AATCTCTAGGACACTCACATC;SOR=1.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=147;WE=122658391;WS=122658373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	122668965	rs10847623	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=0.491;SC=CTAAACTCTATCCCTAATCGT;SOR=1.148;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=14;WE=122668973;WS=122668955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	122674032	rs10847725	C	T	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=44;PP=1559;SC=TTCTCAGAGCCGAGATCAATT;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=80;WE=122674040;WS=122674022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	122674758	rs4758651	G	A	6842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=105;PP=2965;SC=GGACCCTCCGGCACCTGCGAC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=218;WE=122674766;WS=122674748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	122676013	rs11060167	A	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr12	122684966	rs11060679	G	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=13;PP=706;SC=CATGGGAGCCGCACTCCCTGG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=122684974;WS=122684956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	122689161	rs12827843	C	G	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=377;ReadPosRankSum=0.245;SC=CTCCAGCTGCCGTTCATGCTT;SOR=0.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=30;WE=122689169;WS=122689151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr12	122689181	rs7136356	C	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=421;ReadPosRankSum=-1.995;SC=TCCTCCCCAGCCTTCCGCAGC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=32;WE=122689189;WS=122689171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr12	122689244	rs12828049	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=0.793;SC=CAGATTCTTTCACCGCCTCTG;SOR=1.230;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=22;WE=122689252;WS=122689234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr12	122691738	rs4758675	C	A	6838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=107;NR=118;PP=2965;SC=GTGCCTGAGGCGGCTGGGGCT;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=107;TCR=118;TR=225;WE=122691746;WS=122691728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr12	122701001	rs2271411	T	A	902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=3.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr12	122703014	rs7963565	C	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AATAGGCAAGCAAAAAACGTA;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=37;TCR=79;TR=62;WE=122703022;WS=122703004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,73:0.53:139
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chr12	122723317	rs72289319	TACACAC	T	673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.746;NF=0;NR=25;PP=1139;ReadPosRankSum=0.882;SC=TACATATACATACACACACAC;SOR=0.830;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=25;WE=122723332;WS=122723307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr12	122748099	rs36124217	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1054;ReadPosRankSum=-1.157;SC=CTTTTGGATCAAACACAAGCT;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=68;WE=122748107;WS=122748089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,75:0.50:151
chr12	122760929	rs112247423	C	CCACACACACACACACA	1272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.171;NF=4;NR=15;PP=597;ReadPosRankSum=0.344;SC=TAGTGGGAAACCACACACACA;SOR=0.639;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=19;WE=122760938;WS=122760919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr12	122762604	rs2271409	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=220;ReadPosRankSum=-0.867;SC=AAAGACTAAATGATACAAAAG;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=18;WE=122762612;WS=122762594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr12	122812503	rs1129167	G	C	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=6;PP=983;SC=CTTTGGCTTTGTCGGCTTGCT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=122812511;WS=122812493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	122817507	rs7956480	A	G	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=19;PP=696;SC=ACCTAAGGTCAGCACTCTTTT;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=122817515;WS=122817497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	122838956	rs4997380	A	G	920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.58;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	122964708	rs10846978	T	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=7;PP=631;SC=TCACATCACATGATAATTTAA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=122964716;WS=122964698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	122966373	rs4758692	T	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=396;SC=AATTAATGTATATTACCTAGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=122966381;WS=122966371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	122968149	rs11354559	GA	G	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=903;SC=TATTTAAGCAGAAAAAAAGAC;SOR=2.110;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=33;WE=122968157;WS=122968139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	122983460	rs7314638	A	G	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=28;PP=1266;SC=TAACAATGCAAATCATAAAAT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=60;WE=122983468;WS=122983450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	122990042	rs1115154	A	G	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=34;PP=2070;SC=CAAGAAGTCTATAAGTCCCAA;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=122990050;WS=122990032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	122991478	rs9988963	C	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=597;SC=GTCCTGTTAACAAACACTGAA;SOR=1.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=31;WE=122991486;WS=122991468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	122993011	rs10773230	C	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=520;SC=GAAGAGAATACAAAAATGGAT;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=122993019;WS=122993001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	122995468	rs10709275	GA	G	525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=530;SC=GGTGATGTGGGACCTGCAGTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=122995476;WS=122995458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	122999358	rs11322682	CA	C	283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=7;PP=128;SC=ATTTAAGACTCAAAAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=122999366;WS=122999348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	122999535	rs6489056	C	T	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=968;SC=CACAAATATGCCACCATATTA;SOR=3.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=122999543;WS=122999525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	123001737	rs57311174	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=4;PP=708;SC=CTCTCTGAGGGTCCTATTAAA;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=123001745;WS=123001727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	123030788	rs7968222	G	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=37;PP=1165;SC=TGACAGTTAAGAACCTTATTG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=123030796;WS=123030778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	123031330	rs78620163	A	G	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=172;SC=TATCTTGTGTACTGTGCTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=123031338;WS=123031320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	123079035	rs4319547	A	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=476;SC=TCCATAGACCACTATTTTCTT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=123079043;WS=123079025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	123087442	rs7307735	A	G	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=43;PP=2537;SC=AAGGTAATGGATTAAAACATT;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=111;WE=123087450;WS=123087432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	123102921	rs11837038	T	G	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=38;PP=1796;SC=TGGCAGCGTGTGATACAGATA;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=123102929;WS=123102911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	123103016	rs7301589	G	T	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.71;QD=26.75;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	123106893	rs1014188	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=TTGGGCTTCCGATTGTCAGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=123106901;WS=123106892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	123110654	rs3803005	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=439;SC=TATGTAGATTTGTATCACTTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=123110662;WS=123110644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	123200099	rs61955034	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.870;NF=28;NR=8;PP=557;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TTCCAGGAAATCTTAGGCCGA;SOR=0.965;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=36;WE=123200107;WS=123200089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr12	123200247	rs56308926	G	C	4369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=92;PP=2965;SC=CGGAGTTGGCGATTAACGCCT;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=77;TCR=92;TR=169;WE=123200255;WS=123200237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	123200354	rs200905183	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQRankSum=-3.854;QD=3.50;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,24:0.28:87
chr12	123200693	rs17884481	A	G	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.349;NF=25;NR=19;PP=663;ReadPosRankSum=-0.845;SC=AGGGGCAGGAAGAACTCCAGG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=44;WE=123200701;WS=123200683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr12	123200768	rs1798192	T	G	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ACATTTGCAGTGCCATTCTGG;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=70;WE=123200776;WS=123200758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,88:0.50:175
chr12	123200937	rs1696352	T	G	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.139;NF=37;NR=36;PP=1167;ReadPosRankSum=1.743;SC=CCGTGAGGAATATGATGCTGC;SOR=0.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=93;TCR=86;TR=73;WE=123200945;WS=123200927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,88:0.43:207
chr12	123201072	rs3825152	T	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.557;NF=28;NR=36;PP=1085;ReadPosRankSum=-1.759;SC=GAAAGTCAGCTACTGCCAGGT;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=64;WE=123201080;WS=123201062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr12	123201291	rs3825156	A	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.518;NF=28;NR=43;PP=985;ReadPosRankSum=2.445;SC=TCATGAGTGCAGCTAGTGAGT;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=170;TCF=69;TCR=101;TR=71;WE=123201299;WS=123201281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,71:0.36:195
chr12	123265952	rs1798563	A	G	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=57;PP=1778;SC=ATTAGATTTGACCGGGCACGG;SOR=3.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=68;WE=123265960;WS=123265942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	123273573	rs76417864	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=-1.098;SC=GAGTAGATCAATTCCTGGCCT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=123273581;WS=123273563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	123281967	rs10744394	G	A	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ATCCTTCTCTGTCACATAAGA;SOR=0.554;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=78;WE=123281975;WS=123281957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,97:0.55:177
chr12	123297718	rs4759391	T	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=271;ReadPosRankSum=-1.714;SC=AGCCTGGGCGTCAGAGCAAGA;SOR=0.199;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=16;WE=123297726;WS=123297708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr12	123307754	rs7954285	CA	TG	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=0.871;SC=GTGATCCGCCCACCCTGGCCT;SOR=0.582;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=123307763;WS=123307744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	123333065	rs2135014	C	T	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1366;ReadPosRankSum=0.157;SC=TCTGGTCCTACGCCATTGGGC;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=207;TCF=97;TCR=110;TR=90;WE=123333073;WS=123333043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,110:0.44:249
chr12	123334929	.	G	T	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5051;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=56.93;NF=1;NR=3;PP=21;QD=13.9428031368;SC=GCCGCTGGGTGGGGGGGGCCC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=123334937;WS=123334919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	123335240	.	T	TG	77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=45.19;NF=3;NR=0;PP=77;QD=34.0;SC=GCCGCTGGGTTGGGGGGCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=123335248;WS=123335230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr12	123335483	rs2271048	A	G	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=1.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr12	123335488	rs2271049	G	A	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr12	123335527	rs2271050	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CCGCGTCTCACGCCCAGGCGT;SOR=1.671;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=24;WE=123335535;WS=123335517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr12	123339344	rs2292136	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.923;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=627;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GCCCGGTCTCAGGTGATCTCT;SOR=2.876;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=14;WE=123339366;WS=123339334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	123339358	rs2292137	C	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.235;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=627;ReadPosRankSum=1.744;SC=GATCTCTGATCTGTGAGTTTG;SOR=2.720;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=15;WE=123339366;WS=123339334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr12	123339712	rs2292138	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=47;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.957;SC=CCCTTTGAGGACCCCAGGCAC;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=76;WE=123339720;WS=123339702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,83:0.46:180
chr12	123340453	rs11418615	G	GC	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.24;MQRankSum=1.376;NF=6;NR=21;PP=1045;ReadPosRankSum=-1.673;SC=AGCTGGAGGTGCGGGGTGGGG;SOR=1.054;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=27;WE=123340461;WS=123340443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr12	123341289	rs897386	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	123341297	rs897385	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-2.572;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr12	123341833	rs7138398	G	C	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1079;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CTGTCTCCGTGATCTGCCTGT;SOR=1.017;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=45;TCR=81;TR=61;WE=123341841;WS=123341823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr12	123341863	rs2343109	G	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=556;ReadPosRankSum=-0.341;SC=TTCATGTAAAGGGGATCATAC;SOR=0.923;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=44;WE=123341871;WS=123341853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr12	123342628	rs34131980	CCTCTT	C	1734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.371;SC=TCTAACCTGTCCTCTTCACCC;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=28;WE=123342640;WS=123342618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr12	123343571	rs2343110	T	G	3070.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQ=60.16;MQRankSum=2.007;NF=29;NR=28;PP=1787;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGCCTGTCGGTGGGGGGGGCT;SOR=0.525;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=154;TCF=70;TCR=84;TR=57;WE=123343580;WS=123343561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,84:0.43:195
chr12	123343572	rs5801491	G	GGC	3061.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.531;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.035;NF=8;NR=27;PP=1805;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GCCTGTCGGTGGGGGGGGCTC;SOR=0.520;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=35;WE=123343580;WS=123343561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,81:0.42:191
chr12	123343927	rs3215147	C	CG	2806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.929;NF=26;NR=49;PP=1301;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GCCCGTGGGACGGGGGGGGAC;SOR=0.811;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=174;TCF=65;TCR=109;TR=75;WE=123343935;WS=123343917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,124:0.45:276
chr12	123344910	rs937765	A	C	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.043;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=480;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CTTGAGGGCCACTTTCCACCT;SOR=0.163;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=44;WE=123344918;WS=123344900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr12	123345347	rs7306948	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=1492;ReadPosRankSum=2.122;SC=CTTGCACGCCGACAGCAGCAC;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=41;WE=123345368;WS=123345337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr12	123345360	rs7298176	T	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=1492;ReadPosRankSum=0.280;SC=AGCAGCACACTGGGCTCTGGG;SOR=0.451;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=41;WE=123345368;WS=123345337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr12	123345509	rs34149579	G	T	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1251;ReadPosRankSum=1.565;SC=CTGCAGGAATGTTCTCGCACA;SOR=0.909;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=77;WE=123345517;WS=123345499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr12	123345736	rs10847910	C	G	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.667;NF=36;NR=46;PP=1194;ReadPosRankSum=1.723;SC=AGATGGAGACCCAGGTAGGCG;SOR=0.769;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=196;TCF=88;TCR=108;TR=82;WE=123345744;WS=123345726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,99:0.42:235
chr12	123345756	rs3215148	G	GC	3295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.016;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.583;NF=9;NR=48;PP=1881;ReadPosRankSum=1.151;SC=GCCCATGGCTGCCCCGTGACC;SOR=1.087;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=135;TCF=27;TCR=108;TR=57;WE=123345764;WS=123345746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,89:0.45:199
chr12	123352179	rs3825143	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=0.962;SC=AACCTGGTTACAGGGACAGCC;SOR=0.595;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=22;WE=123352187;WS=123352169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr12	123425575	rs4148866	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=689;ReadPosRankSum=0.118;SC=CCTGTCCCACCGATACCCGAC;SOR=0.642;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=45;WE=123425583;WS=123425565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr12	123433137	rs10848106	T	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=3;PP=477;SC=GCTGCCAGGGTGCACAGTCCC;SOR=2.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=123433145;WS=123433127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	123460297	rs148367749	TAGAG	T	3712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.093;NF=24;NR=39;PP=2966;ReadPosRankSum=2.168;SC=AACTGAGGCTTAGAGAGTGAA;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=63;WE=123460319;WS=123460287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,98:0.46:213
chr12	123460823	rs883563	A	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=16;PP=975;SC=CTGCTGCCCCACTCCCTCCTC;SOR=1.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=123460831;WS=123460813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	123460962	rs884956	T	C	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=46;PP=1759;SC=CATCTAGGGGTTCTCATCCCA;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=123460970;WS=123460952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	123466111	rs55742290	C	T	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=36;PP=1632;SC=CCCTCCTGGCCTTCCAGCCTC;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=84;WE=123466119;WS=123466101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	123471402	rs2049506	T	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=502;SC=CGTCTCATGGTCACCCCTTCC;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=123471410;WS=123471392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	123473254	rs1463877	T	C	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=13;PP=1637;SC=TCCTGGGAGGTCCCAGGCCCC;SOR=2.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=123473262;WS=123473244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	123476586	rs7135296	G	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=1095;SC=GGCAGGGGTCGGGCCAAGCCT;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=123476594;WS=123476576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	123477311	rs937564	T	C	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=154;SC=GGTTGTCTGCTGAAAGTTAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=123477319;WS=123477301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	123485188	rs883263	A	G	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=20;PP=959;SC=GCCTCTCCCCAGACAGTACCC;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=123485196;WS=123485178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	123492112	rs3897102	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.524;SC=CACTTCCCACCCCTGGCTTTG;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=6;WE=123492120;WS=123492102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	123645803	rs1051431	G	A	7713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=106;PP=2965;SC=TACACTGTTCGTAGCTAACTG;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=123;TCR=106;TR=229;WE=123645811;WS=123645793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr12	123647725	rs1727296	G	C	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=79;PP=2421;SC=CCTTCTATATGTATCAGCATA;SOR=3.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=94;WE=123647733;WS=123647715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	123651162	rs1716167	A	G	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=14;PP=967;SC=CTAAGAAAACATAACATCCCT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=123651170;WS=123651152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	123664514	rs1727301	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=423;ReadPosRankSum=0.546;SC=CAAGCAATTTGTTCTCAGTTG;SOR=1.011;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=23;WE=123664522;WS=123664504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr12	123665695	rs1727306	A	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=22;PP=1018;SC=TAGAACATGAACCATTACCCC;SOR=0.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=52;WE=123665703;WS=123665685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	123682594	rs11610710	G	A	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=5;NR=1;PP=103;SC=CCGCGCCACTGCACTCCAGCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=123682602;WS=123682593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	123694724	rs2682434	C	T	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=58;PP=1726;SC=TGTGCACAAACACACAGAATA;SOR=1.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=84;WE=123694732;WS=123694714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	123699200	rs77954523	GTTT	G	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=385;SC=TAGGCAAGTTGTTTTTTAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=123699210;WS=123699191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	123699520	rs1727322	A	G	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=52;PP=1542;SC=GCCAGGCGTGATAGCTCACGC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=123699528;WS=123699510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	123703103	rs2851451	T	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=11;PP=224;SC=GACAGAGTCTTGCTGTGTCGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=123703111;WS=123703093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	123707527	rs34047404	GTA	G	1911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1825;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GTGTGTGTGTGTATATGTACG;SOR=1.926;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=68;WE=123707537;WS=123707515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr12	123707552	rs36043549	TA	T	3764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=51;PP=2275;SC=TATATGTATATAAAAAAAGGA;SOR=1.110;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=76;WE=123707560;WS=123707542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr12	123710835	rs1626703	A	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=311;SC=AAATAATTACACTTAGCAGTT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=123710843;WS=123710825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	123715113	rs941306	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=AAAAAGCCACCAAAGCTAGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=123715121;WS=123715103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	123738678	rs1568427	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=186;SC=TCCCTGAGCCATTCCTCCCTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=123738686;WS=123738668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	123746357	rs4759416	C	G	4127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=51;PP=2620;SC=ATGCCTGAAACAGAGGCAGAG;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=123;WE=123746365;WS=123746347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	123746510	rs4759417	C	T	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=1019;SC=CCCTGAAGGACGCTAACAATC;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=123746518;WS=123746500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	123794022	rs6488867	T	C	5205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=94;PP=2965;SC=CTTCACAACATTTTCTAAACT;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=60;TCR=94;TR=154;WE=123794030;WS=123794012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	123794450	rs2277343	A	T	289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.34;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	123799974	rs6488868	A	G	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=56;PP=2827;SC=CCCTTCTATCACCATGTGTAA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=146;WE=123799982;WS=123799964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	123801672	rs10846515	T	G	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=31;PP=2284;SC=GGCGTGAGCCTCTGTGCCCGG;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=109;WE=123801680;WS=123801662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	123810662	rs111400678	A	AC	2420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=31.04;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	123810873	rs61388686	G	A	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=109;PP=2965;SC=GCTCTCTGGCGATGACCCACT;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=183;WE=123810881;WS=123810863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr12	123812207	rs7959415	C	T	5328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=57;PP=2965;SC=GAATAACACACTTCTTAGATT;SOR=1.355;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=103;TCR=57;TR=160;WE=123812215;WS=123812197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	123812611	rs10846517	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=327;SC=TCACATTAGTATTAAGTAAGA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=123812619;WS=123812601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	123812629	rs28419092	G	C	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=259;SC=AGAATCTCCAGTCTTTCAAGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=123812637;WS=123812619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	123813493	rs7301163	C	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=425;SC=TTTCTCTCTGCAACATTCATC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=123813501;WS=123813483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	123815668	rs6488869	A	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=828;SC=CACCATGACGACCGGCTGATT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=123815676;WS=123815658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	123816007	rs11282939	T	TATGTTG	1460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=1799;SC=GGAGTAGGAATATGTTATGTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=26;WE=123816015;WS=123815997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	123821234	rs7486223	T	A	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=605;SC=GACAATGAGGTCCTACTCTGT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=123821242;WS=123821224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	123825339	rs7312145	A	G	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=227;SC=CACTCCATCAATCTGCAAGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=123825347;WS=123825329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	123825389	rs7315453	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=381;SC=TCCAGCGAGGTTTAAGCATAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=123825397;WS=123825379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	123832710	rs11325003	TA	T	5891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=104;PP=2966;SC=AGACAAAAAATAAAAGGACAG;SOR=1.249;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=13;TCR=106;TR=116;WE=123832718;WS=123832700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	123832746	rs10846523	G	A	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=88;PP=2596;SC=CAAGGACAAGGTTTGCATTTA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=37;TCR=88;TR=125;WE=123832754;WS=123832732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	123875394	rs28660993	C	T	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=74;PP=2313;SC=AGCCTCTGTCCTCTGCAAGAA;SOR=1.263;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=116;WE=123875402;WS=123875384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	123892145	.	C	T	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.433;NF=29;NR=46;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TACCTCACCTCATCCTCATCG;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=75;WE=123892153;WS=123892135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr12	123969828	rs11522343	A	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=787;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AAAGGGCCACATAGACCATTA;SOR=1.104;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=124;TCF=42;TCR=82;TR=55;WE=123969836;WS=123969818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr12	123983941	rs9697264	G	A	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=47;PP=2076;SC=GAGGGTGGACGCAGGTCAGGG;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=123983949;WS=123983931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	123997770	rs78426500	T	G	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TATGTGTGTGTCGTGTGTGTT;SOR=0.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=86;TCR=46;TR=69;WE=123997778;WS=123997760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr12	124008073	rs2292500	A	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;PP=984;ReadPosRankSum=0.313;SC=CCTCTGAGAAATTGACATCCT;SOR=0.732;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=76;WE=124008081;WS=124008063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,86:0.54:159
chr12	124069111	rs71088937	GGGC	G	1591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=12;PP=1253;SC=GAAGGCAGCGGGGCGGCGGCG;SOR=1.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=26;WE=124069121;WS=124069101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	124069213	rs786446	T	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=40;PP=2225;SC=TGCTGGTGCTTCTGGCCGCTC;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=124069221;WS=124069203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	124071507	rs11289530	AT	A	1042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=881;ReadPosRankSum=0.571;SC=CATTCAGAAGATTTACATCAC;SOR=0.392;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=27;WE=124071528;WS=124071497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,38:0.41:92
chr12	124074848	rs78072538	A	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=306;ReadPosRankSum=1.295;SC=AAAAAAAAAAAGACATTGACA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=18;WE=124074856;WS=124074838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr12	124075111	rs77895354	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=811;ReadPosRankSum=-1.029;SC=GAAAGCATTGACTTTAAAAGT;SOR=0.107;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=44;WE=124075119;WS=124075101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr12	124086620	rs786427	G	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=447;SC=CTGGAGCTGCGGGAAGCGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=124086628;WS=124086610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	124086998	rs786428	C	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-1.655;SC=AGAGGGGCCGCGACCCACCCC;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=124087006;WS=124086988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	124090453	rs786436	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=32;PP=1796;SC=TCCTTTAACCAGTGCTTTGCA;SOR=1.477;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=124090461;WS=124090443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	124090605	rs4047521	ACT	A	2779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.436;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.907;NF=16;NR=31;PP=2112;ReadPosRankSum=0.977;SC=GGAAACCAAAACTCTCTGTTT;SOR=0.879;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=108;TCF=31;TCR=77;TR=47;WE=124090614;WS=124090595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,79:0.46:173
chr12	124097528	rs884892	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ATACAAATTAACTTTTACAGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=124097536;WS=124097518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	124097766	rs11057306	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=280;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TTTCTTCGCAATCATAAGCAG;SOR=0.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=18;WE=124097774;WS=124097756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr12	124097824	rs3748268	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TCTGTGGTAGAGGCATCAGGG;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=13;WE=124097832;WS=124097814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr12	124099925	rs3748269	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=370;ReadPosRankSum=1.817;SC=GGTCCCCAAATGCCCCATTCT;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=27;WE=124099933;WS=124099915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr12	124101347	rs6488883	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=69;ReadPosRankSum=-2.190;SC=AGGCCTTGCCGTGCTCCATGT;SOR=0.180;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=5;WE=124101355;WS=124101337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	124104460	rs7302183	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=0.728;SC=GGTTTCACTACAACACTATTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=124104468;WS=124104453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr12	124116833	rs7300147	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-1.921;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr12	124124445	rs11572934	C	CGTGT	2537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.982;NF=13;NR=30;PP=2051;ReadPosRankSum=-1.146;SC=TGCGTGCGTGCGTGTATGTGT;SOR=0.763;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=119;TCF=31;TCR=88;TR=43;WE=124124453;WS=124124435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,73:0.36:204
chr12	124144395	rs1051793	A	G	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.389;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=67;PP=1808;ReadPosRankSum=0.084;SC=TCCCACCCCCAGTTCATGTTG;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=300;TCF=143;TCR=157;TR=126;WE=124144403;WS=124144385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,145:0.41:356
chr12	124156897	rs7306549	A	G	163.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TGTGAACTCTATGAAATTGTA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=124156905;WS=124156887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	124158080	rs7978447	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=378;ReadPosRankSum=1.288;SC=GCTGATGTGTACTTTTATTGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=19;WE=124158088;WS=124158070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr12	124171323	rs7297576	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TAGCATTCGCTACGCTTGCCA;SOR=1.460;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=124171331;WS=124171313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	124171658	rs7309528	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=-0.929;SC=GTAGGCCCTGCAACGCGGTCA;SOR=0.195;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=27;WE=124171666;WS=124171648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr12	124172555	rs7298831	A	T	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=876;ReadPosRankSum=1.432;SC=ATTGTGTTTTAGCAGATAACT;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=55;WE=124172563;WS=124172545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr12	124172731	rs7313032	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=609;ReadPosRankSum=-0.450;SC=GCAGGTAATCGTTGCAATATT;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=35;WE=124172739;WS=124172721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr12	124172746	rs7302449	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=371;ReadPosRankSum=-0.041;SC=AATATTAGTATGCTAGACCGT;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=24;WE=124172754;WS=124172736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr12	124172778	.	T	A	99	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=54.39;NF=0;NR=8;PP=99;QD=16.7214015684;SC=TTTTTTTTTTTATGAGACGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=124172786;WS=124172768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,8:0.47:17
chr12	124177016	rs35946281	C	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=2.339;SC=TTTCTTCCTCCGTTATAATTA;SOR=1.148;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=12;WE=124177024;WS=124177006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr12	124177289	rs7137946	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=168;ReadPosRankSum=2.064;SC=TGTTACACTTTGACGTCATTT;SOR=1.468;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=15;WE=124177297;WS=124177279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr12	124179417	rs7966867	T	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=833;ReadPosRankSum=-1.528;SC=GATCAACCCCTAGAATTGTGA;SOR=0.461;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=47;WE=124179425;WS=124179407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr12	124179620	rs12828633	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=74;ReadPosRankSum=1.000;SC=AAACTAAGTTGGACTTGTTTC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=4;WE=124179628;WS=124179610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	124179739	rs12831081	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.063;SC=AATGGTGCACATTATATTTTA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=9;WE=124179747;WS=124179729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr12	124180011	rs11834492	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CTCTGTTGCCTAGTCTGGAGT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=124180019;WS=124180001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	124180958	.	C	G	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTGTGTTTGTCTAGGTTACCA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=102;TCR=54;TR=70;WE=124180966;WS=124180948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,81:0.45:181
chr12	124181049	rs7298440	C	T	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1523;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCGGGTAATCCGGTTTGGTCA;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=182;TCF=74;TCR=108;TR=94;WE=124181057;WS=124181039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,108:0.51:210
chr12	124181820	rs7979528	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=1.227;SC=TGAATATCAAAGACAGCATGA;SOR=1.154;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=13;WE=124181828;WS=124181810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr12	124197099	rs1139320	C	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=434;ReadPosRankSum=0.261;SC=CCTCCGGGCGCGGGTCGGCCC;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=27;WE=124197107;WS=124197089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr12	124197280	rs66647364	A	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=833;ReadPosRankSum=-2.293;SC=TGGCGCCCCCAATCCCGCGCA;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=48;WE=124197288;WS=124197270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,57:0.58:98
chr12	124207098	rs7301641	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=619;ReadPosRankSum=0.801;SC=TTCTCAAAACTATGGAAGATG;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=31;WE=124207119;WS=124207088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr12	124209332	rs1139789	T	C	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=627;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TGAAACGCAATGTTGAGGTAC;SOR=0.816;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=56;WE=124209340;WS=124209322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr12	124209352	rs11837144	C	T	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=727;ReadPosRankSum=0.077;SC=CTGAACAGCTCGTGAGGAAAT;SOR=0.984;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=47;WE=124209360;WS=124209342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr12	124210782	rs1399961	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=667;ReadPosRankSum=-2.020;SC=CCTTAGAGAGTGATTCTTTGT;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=42;WE=124210790;WS=124210772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr12	124218359	rs10744159	T	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=380;ReadPosRankSum=-0.848;SC=AAATAAGGAGTATTGACTGTA;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=23;WE=124218367;WS=124218349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr12	124220055	rs2271660	T	C	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=953;ReadPosRankSum=1.043;SC=GATGTGAGACTGTGTTCAACT;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=66;WE=124220063;WS=124220045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr12	124220354	rs2333838	A	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	124229429	rs7135542	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=696;ReadPosRankSum=-0.466;SC=TTTGTTACAGTGACAGCGTCG;SOR=0.771;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=54;WE=124229437;WS=124229419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr12	124251942	rs78441107	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TCTGTATCCTTCGTCTCTTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=124251950;WS=124251933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	124258887	rs7131750	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CACAAATAGGTAGCGGGCAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=124258895;WS=124258877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	124265687	rs11057353	T	C	6422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=99;PP=2965;SC=GGGAGTCACATCTGGAGAAGT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=98;TCR=99;TR=197;WE=124265695;WS=124265677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr12	124265851	.	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=467;ReadPosRankSum=0.613;SC=TTGAAGGTAAGGTTTCATTTT;SOR=1.581;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=21;WE=124265859;WS=124265841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr12	124267638	rs11057354	A	G	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=29;PP=1289;SC=CTGACTGATCACTTTTATTTT;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=124267646;WS=124267628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	124267703	rs11057355	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=450;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GAGAGGTGTCTGACCTGGCAG;SOR=0.600;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=39;WE=124267711;WS=124267693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr12	124268458	rs7303002	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=352;ReadPosRankSum=0.477;SC=CCACCCTAATAATGAGAGTTC;SOR=0.156;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=21;WE=124268466;WS=124268448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr12	124274474	rs10846559	A	G	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=36;PP=2138;SC=GATTGGACAGATTTTGGAGGA;SOR=1.239;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=101;WE=124274482;WS=124274464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	124274758	rs35056478	C	CT	112.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.180;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GATGCTTAGTCTTTTTTTTTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=124274766;WS=124274748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	124281322	rs76791219	T	C	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=62;PP=1496;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GGATTAAGCATACCATCCTCC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=75;TCR=129;TR=97;WE=124281330;WS=124281312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,113:0.46:247
chr12	124297653	rs75275217	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=459;ReadPosRankSum=1.650;SC=TAATATGTACGTTGGAGGCAA;SOR=1.981;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=30;WE=124297661;WS=124297643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr12	124298224	rs75207436	G	T	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.384;SC=ACTACTTTTCGTGTAAGTTGG;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=102;TCR=90;TR=81;WE=124298232;WS=124298214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,95:0.42:225
chr12	124317874	rs78764267	C	T	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1884;ReadPosRankSum=1.153;SC=AACGCTTTCTCTAATAGGGGA;SOR=0.777;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=229;TCF=113;TCR=116;TR=124;WE=124317882;WS=124317864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,149:0.53:280
chr12	124319864	rs4930730	T	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=585;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GTTGATTTGGTTCTGTCTCAT;SOR=0.866;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=36;WE=124319872;WS=124319854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr12	124325977	rs4930729	T	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=51;PP=2026;SC=TCGGAAGATCTTGCGGGCTGA;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=110;WE=124325985;WS=124325967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	124330311	rs34934281	C	T	3182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=53;PP=1974;ReadPosRankSum=0.461;SC=GAGTTGGTAACGCGCATCACC;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=155;TCR=114;TR=125;WE=124330319;WS=124330297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,149:0.46:321
chr12	124332702	rs10846561	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.541;SC=AAAGCAGGACATGGCATTTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=124332710;WS=124332692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	124333519	rs7960854	C	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=561;SC=GTTTCTGGGCCGTTGACACTC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=124333527;WS=124333509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	124343620	rs7314612	G	A	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=969;ReadPosRankSum=2.132;SC=ATTGTATGGCGTGTGTGTTGT;SOR=0.268;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=67;WE=124343628;WS=124343610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,82:0.55:150
chr12	124350360	rs7313897	G	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=382;SC=CAGTTAAAAAGCTCATGGAAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=124350368;WS=124350350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	124350444	rs7314963	C	T	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=8;PP=1294;SC=CCTTAAACATCTAGTTTATCT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=124350452;WS=124350434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	124350704	rs10773043	T	C	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=233;SC=TGTTTGTAGTTGAAGGCGATG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=124350712;WS=124350694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	124352338	rs10846565	T	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=377;ReadPosRankSum=0.330;SC=ACCAACATGTTGGGTCTTATG;SOR=0.936;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=19;WE=124352346;WS=124352328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	124355944	rs117975072	C	T	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.630;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=812;ReadPosRankSum=-1.936;SC=CTCCATGTTGCCCCCAGTGCT;SOR=1.013;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=48;WE=124355952;WS=124355934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr12	124360117	rs10846567	G	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=32;PP=910;SC=ACTTATCCATGTAGGCACAGC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=124360125;WS=124360107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	124362256	rs113178558	T	TG	625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.21;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr12	124363724	rs72053758	GTGTC	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=412;SC=TGCGCTCTGTGTGTCTGTCTG;SOR=3.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=8;WE=124363735;WS=124363714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	124363986	rs117792477	G	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=-1.663;SC=ATATTAGGACGCGAATTGTGG;SOR=0.339;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=25;WE=124363994;WS=124363976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr12	124364131	rs1317312	G	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=12;PP=1104;SC=CAAGTTTCAGGCCGTGTACTG;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=124364139;WS=124364121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	124366150	rs34756279	CT	C	748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.89;MQRankSum=1.508;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr12	124371614	rs117282643	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=1.655;SC=TCTCCTCCAGCGTCCCCACCC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=5;WE=124371622;WS=124371604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr12	124377992	rs114772660	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.383;SC=AGGTACCCGCGGTGGAGCCTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=124378000;WS=124377982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr12	124383312	rs200729045	C	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=809;ReadPosRankSum=0.745;SC=CGGAGAAGTCCGCCGCCTGCG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=52;WE=124383320;WS=124383302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr12	124387574	rs58411567	G	A	4843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=44;PP=1892;SC=CCGAGGCCGAGACGACCCTGG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=124387594;WS=124387564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	124387586	rs61587964	A	G	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=48;PP=2021;SC=CGACCCTGGCAGAGGTCATGC;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=103;WE=124387594;WS=124387564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	124398843	rs113172657	A	ACTG	6251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=54;PP=2924;SC=CAGAAGGTAAACTCACGGCAG;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=82;WE=124398851;WS=124398833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	124399155	rs79478560	G	A	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=43;PP=1243;SC=GGGGGTCTACGTGGGTGTCAC;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=124399163;WS=124399145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	124399597	rs376385346	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=357;ReadPosRankSum=0.640;SC=CTGTTCTCTGGAGAATGCCCC;SOR=2.448;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=13;WE=124399605;WS=124399587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	124409502	rs7133378	G	A	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=408;ReadPosRankSum=0.327;SC=ATGGATTCTCGTCCCTTTCCA;SOR=0.214;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=25;WE=124409510;WS=124409492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr12	124414098	rs3802999	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=567;ReadPosRankSum=1.078;SC=GACTTTCCTCCGGGTTCAACC;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=32;WE=124414106;WS=124414088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr12	124417889	rs4930721	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGACCGAGAGCGAGCCCAGCG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=124417897;WS=124417879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	124418472	rs77020228	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=0.416;SC=GCCAGAACTTCAGGTCCCTTA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=124418480;WS=124418464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	124418674	rs12298484	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=940;ReadPosRankSum=2.112;SC=TCCGGGCCACCACTCTCTCTG;SOR=0.881;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=58;WE=124418682;WS=124418664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr12	124419062	rs11057396	A	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=342;ReadPosRankSum=0.114;SC=GCTGGGGAGGAGGCCAGCCAG;SOR=0.571;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=24;WE=124419070;WS=124419052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr12	124420076	rs113646068	C	CAGGA	876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=937;ReadPosRankSum=2.832;SC=CTGGGGTTGTCAGAGTGATCG;SOR=0.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=17;WE=124420084;WS=124420066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr12	124427169	rs35650208	CCA	C	876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=635;ReadPosRankSum=1.263;SC=AGAGCTCAGGCCACACGCATA;SOR=0.277;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=16;WE=124427178;WS=124427159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr12	124427306	rs11057401	T	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TGTTCCGAACTTTTGACTGTC;SOR=0.657;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=68;WE=124427314;WS=124427296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,78:0.44:179
chr12	124427524	rs35825716	G	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=297;ReadPosRankSum=-1.275;SC=TGGGGTCAGAGGGCACCCTCT;SOR=0.404;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=26;WE=124427532;WS=124427514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr12	124428162	rs4930725	T	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=2.458;SC=AAACCACGGCTCCTGAAGGGC;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=124428170;WS=124428152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	124798801	rs12318072	C	T	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.190;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=37;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TCTATGCGCCCGTACCCACCG;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=97;WE=124798809;WS=124798791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,107:0.68:157
chr12	124799387	rs904647	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-1.433;SC=ATGGGTCCATGGAGTGCCCTT;SOR=0.126;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=14;WE=124799395;WS=124799377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr12	124810174	rs10846657	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=314;ReadPosRankSum=1.959;SC=CTGTGAGCCCGGCAGCCCCTG;SOR=0.297;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=21;WE=124810182;WS=124810164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	124810968	rs1006100	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=-1.593;SC=AAGACAGCACCGACGCTACGG;SOR=0.619;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=20;WE=124810976;WS=124810958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr12	124824721	rs143952466	C	CGCCGCTGCT	3596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=25;PP=2979;SC=CCCCCACCCCCGCCGCTGCTG;SOR=0.750;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=45;WE=124824729;WS=124824711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	124825447	rs1702334	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=464;SC=TCCCAGCACCAGCCATGGAAC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=124825455;WS=124825437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr12	124827822	rs190772242	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=712;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGGCATTTACGGGGAGTTGTT;SOR=0.367;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=44;WE=124827830;WS=124827812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr12	124829234	rs1263992	C	T	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=623;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CCTCATAGGTCAGGGGGCTCT;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=45;WE=124829242;WS=124829224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr12	124829255	rs1244085	A	G	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=772;ReadPosRankSum=0.340;SC=GCCGCGGCTTACCCAGCTCAG;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=52;WE=124829263;WS=124829245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr12	124831067	rs2272370	C	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=219;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GCCACCGCCACCCCTCCTAGA;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=13;WE=124831075;WS=124831061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	124832474	rs1244065	G	A	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=50;PP=1756;SC=AGGAGAGGGTGAGGCCATCAT;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=93;WE=124832482;WS=124832464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	124832492	rs1244064	C	G	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=46;PP=1647;SC=CATTCCGTGGCTCCCTGAGCC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=124832500;WS=124832482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	124832606	rs1244063	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=22;PP=860;SC=CGCTACCTCCAGATGGAGCCT;SOR=0.780;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=124832614;WS=124832596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	124835352	rs4765551	A	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=0.939;SC=AAATGCAGGCAAAGACGTGCT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=124835360;WS=124835342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	124838591	rs4765555	C	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-0.664;SC=ATGGGCTGGCCCCGTGCTGGT;SOR=1.911;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=124838599;WS=124838581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	124838772	rs1244082	C	G	6161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.82;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	124838772	.	CGT	GGA,GGT	1017	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=33,69;NR=24,60;PP=958,1017;QD=17.7450504362;SC=GGGCTGAGGGCGTGTCTGTGG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=137;TCF=72;TCR=65;TR=57,129;WE=124838782;WS=124838761;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.42:137
chr12	124838774	rs3817108	T	A	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.652;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,87:0.50:174
chr12	124838897	rs1244081	A	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=49;PP=1709;SC=TGAGGGAGACAGCTGTGAAGA;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=124838905;WS=124838887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	124839150	rs2271142	G	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=565;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TAAGAGGAGCGAGTCACGTGC;SOR=0.605;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=43;WE=124839158;WS=124839140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,62:0.40:154
chr12	124839165	rs2271141	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=491;ReadPosRankSum=1.410;SC=ACGTGCTGCCGGAGCAGGGTC;SOR=0.557;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=34;WE=124839173;WS=124839155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,49:0.40:124
chr12	124839540	rs2271139	C	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=493;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CCCCCACAGTCCAGAGTGCCT;SOR=0.346;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=39;WE=124839548;WS=124839530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr12	124839867	rs870050	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=283;ReadPosRankSum=1.092;SC=CTGAGTGGAGATGACCCAGGC;SOR=1.074;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=17;WE=124839875;WS=124839857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr12	124839899	rs870051	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TGGCCCCCACTCAGACTTCAT;SOR=2.075;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=15;WE=124839907;WS=124839889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr12	124839945	rs870052	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.249;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=365;ReadPosRankSum=0.384;SC=ATAAGAAGACTAAGCCCCCAA;SOR=1.640;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=25;WE=124839953;WS=124839935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr12	124841421	rs4765144	C	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=0.962;SC=GGCCTTCCTGCACCCACAGTA;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=16;WE=124841429;WS=124841411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	124848137	rs1794956	T	C	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=33;NR=16;PP=799;SC=TGCAGGTGCATGCTCCCGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=124848145;WS=124848127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	124856618	rs7961196	A	G	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1615;ReadPosRankSum=0.740;SC=CACTGCAGGTAGCACTGGAGT;SOR=0.460;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=220;TCF=97;TCR=123;TR=107;WE=124856626;WS=124856608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,122:0.49:247
chr12	124856660	rs3741513	T	A	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=55;PP=1629;ReadPosRankSum=0.406;SC=AGCTCTTGGCTGTGGTGGCCC;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=71;TCR=101;TR=92;WE=124856668;WS=124856650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,103:0.51:201
chr12	124857033	rs7978237	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=0.541;SC=GGTGGGTGGCCCTGGGGGTGG;SOR=0.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=124857041;WS=124857023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	124857199	rs1109271	G	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGGGTCTGGCGGGGCCTCCAG;SOR=0.468;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=31;WE=124857207;WS=124857189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr12	124857234	rs1702329	C	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=31;PP=901;SC=CCTGACCCTCCGGATGAGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=124857242;WS=124857224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	124859045	rs2695993	A	G	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=79;PP=2684;SC=GAAGTGAGGCAGCACCAAGTA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=143;WE=124859053;WS=124859035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	124859135	rs11057606	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=366;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GCTGCTGCTCGCTCTCCTGCC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=24;WE=124859143;WS=124859125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr12	124882834	rs117510453	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=-0.920;SC=AGGCCTTGACGGTGTCACCGC;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=8;WE=124882842;WS=124882824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	124885249	rs2293514	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=892;ReadPosRankSum=0.096;SC=GATAGGATGGCTTCACCCGAG;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=56;WE=124885257;WS=124885239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr12	124885290	rs2293513	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=422;ReadPosRankSum=0.234;SC=TGGAGGAGACTGTTTCTTTAG;SOR=0.667;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=33;WE=124885298;WS=124885280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr12	124887058	rs35831183	G	GGCT	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.745;NF=3;NR=7;PP=325;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GCGGGGCATGGGCTGCTGCTG;SOR=0.593;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=10;WE=124887066;WS=124887048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	124922325	rs1702322	C	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=251;SC=TTCCTCCTTTCCTGGCCGGCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=124922333;WS=124922323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	124934459	rs1147284	C	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=55;PP=1832;SC=GCTGGCCACTCGCCACTACAG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=124934467;WS=124934449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	124968359	rs906303	C	T	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=84;PP=2308;SC=TAGGAGATTGCGGCTCTGAGA;SOR=2.073;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=28;TCR=84;TR=112;WE=124968367;WS=124968349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	125263204	rs701104	A	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=2;PP=81;SC=CCCGCCCACCACAGCCCTGTA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=125263212;WS=125263194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	125270773	rs2293440	A	G	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.480;SC=CCACTCCGGCAGAGACGCAGG;SOR=0.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=66;WE=125270781;WS=125270763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,78:0.44:179
chr12	125271090	rs838897	G	C	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=57;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TGGGGCCGCAGGCTGCGGGCT;SOR=0.630;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=25;TCR=96;TR=74;WE=125271098;WS=125271080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr12	125284748	rs5888	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=553;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GAACCGGGTCAGCGTTGAGGA;SOR=0.469;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=42;WE=125284756;WS=125284738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr12	125324553	.	C	T	1759	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=23;MQ=45.0;NF=42;NR=36;PP=1759;QD=22.9970668275;SC=TTTCTCCGCACCCTCACCCCA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=78;WE=125324561;WS=125324543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,78:0.95:82
chr12	125324570	.	C	T	2095	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MMLQ=23;MQ=49.72;NF=54;NR=46;PP=2095;QD=21.2977121255;SC=CCCAACGGCACACATGGGCCC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=100;WE=125324578;WS=125324560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,100:0.95:105
chr12	125348263	rs4238001	C	T	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1283;ReadPosRankSum=0.186;SC=GCGGAGCAGCCCATGTCTGCG;SOR=0.622;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=151;TCF=51;TCR=100;TR=74;WE=125348271;WS=125348253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,81:0.49:166
chr12	125398039	rs1071862	G	C	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.181;NF=34;NR=37;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CACTGGGCTCGACCTCAAGGG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=71;WE=125398047;WS=125398029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,75:0.46:164
chr12	125400044	rs74801788	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=379;ReadPosRankSum=0.702;SC=TTCCACCTTCCTGTACATTCT;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=31;WE=125400052;WS=125400034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr12	125400206	rs6488957	A	G	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=498;SC=TAGAATCCCAACCTTATTTCA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=125400214;WS=125400196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	125434434	rs4562928	C	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=3.046;SC=ATGTTTTAAGCCTCCCTGTGT;SOR=0.368;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=125434442;WS=125434424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	125434580	rs4447263	C	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=1012;ReadPosRankSum=1.142;SC=CAGACAGCTCCGGTATGAGGC;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=60;WE=125434588;WS=125434570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr12	125435388	rs10773125	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.749;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=529;ReadPosRankSum=-0.708;SC=AGGGAAGAACCCATGCCCAGG;SOR=1.596;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=30;WE=125435396;WS=125435378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr12	125436850	rs4375522	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=-0.651;SC=ACAGCTGAGAGGGAACAAGCC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=125436858;WS=125436840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	125436897	rs4502074	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=0.728;SC=CCTGCCCCTCACCAGGTGCCC;SOR=0.869;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=21;WE=125436905;WS=125436887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	125437019	rs4429156	T	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=666;ReadPosRankSum=2.373;SC=CCCCCAGGCCTGCCGTCACGA;SOR=0.761;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=65;WE=125437027;WS=125437009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,73:0.38:192
chr12	125437142	rs6488959	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=1.250;SC=AGAGTGAGGTCGGTGGTGGCA;SOR=0.368;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=30;WE=125437150;WS=125437132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
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chr12	125453235	rs11057940	C	A	5260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	125456004	rs4542508	C	A	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=32;PP=931;SC=CCAGCCTAAGCCCCAAGGGCC;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=125456012;WS=125455994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	125456048	rs73229579	A	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TTGAGGAGACAGTGTTAGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=15;WE=125456056;WS=125456038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr12	125456911	rs6488966	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=395;SC=TAAGTAACTCACCCAAAGTCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=125456919;WS=125456910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	125457151	rs12320413	T	C	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=72;PP=2014;SC=CGACCCTGTATGGGCAGAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=104;WE=125457159;WS=125457141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	125465023	rs4072887	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=242;ReadPosRankSum=1.934;SC=ATCACAAACACGGGGTGGCGA;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=20;WE=125465031;WS=125465013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr12	125466987	rs11057949	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=272;ReadPosRankSum=0.988;SC=CAGAGGACCCCATAACCTGTG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=17;WE=125466995;WS=125466977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr12	125467158	rs11558556	C	T	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=692;ReadPosRankSum=0.619;SC=GCTTCTGTAGCATCTCTGCTC;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=42;WE=125467166;WS=125467148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr12	125467238	rs12424339	G	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=547;ReadPosRankSum=-0.215;SC=AAGTGAGACTGTAATAAAATT;SOR=0.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=31;WE=125467246;WS=125467228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr12	125478381	.	C	CCTG	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=368;ReadPosRankSum=0.695;SC=GGGCCGGGCTCCTGCTGCTGC;SOR=0.735;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=8;WE=125478389;WS=125478371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	125497313	rs11057985	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=111;ReadPosRankSum=0.954;SC=TATGAGTGAACATTTTTTATT;SOR=1.329;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=9;WE=125497321;WS=125497303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr12	125509502	rs7303493	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=814;ReadPosRankSum=0.904;SC=CTGGCCCCTGCGTAACGAGCC;SOR=1.010;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=54;WE=125509510;WS=125509492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr12	125562533	rs150463073	G	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=7;PP=861;SC=TGGGATTACAGGCGTGAGCCA;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=125562541;WS=125562523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	125562809	rs7303092	G	A	3778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=77;PP=2538;SC=CACATCTTCCGGGGCTGGGGC;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=115;WE=125562817;WS=125562799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	125833964	rs7971264	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=319;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TCTCAGAACACGGTTTTATTC;SOR=0.193;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=23;WE=125833972;WS=125833954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr12	125834095	rs1491893	C	A	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CAGAGGAGTCCTTTTTCCTTA;SOR=0.647;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=77;WE=125834103;WS=125834085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,84:0.42:198
chr12	125834395	rs3803155	T	C	4806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=116;PP=2868;ReadPosRankSum=-0.756;SC=GGGATGACAGTGACCTTACGG;SOR=0.550;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=396;TCF=169;TCR=227;TR=212;WE=125834403;WS=125834385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,233:0.50:466
chr12	125899979	rs379676	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=256;ReadPosRankSum=-0.843;SC=ATGTTACAGATGCTTTCCCAG;SOR=1.961;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=125899987;WS=125899969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	126003934	rs964998	T	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=800;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TCTTGACATTTTGCTGAGTCT;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=42;WE=126003942;WS=126003924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr12	126068417	rs6489006	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=457;ReadPosRankSum=0.352;SC=TTTTGAACACTGCCATTCTCA;SOR=1.418;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=22;WE=126068425;WS=126068407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr12	126138386	rs142810353	C	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.621;SC=AGGTCAAATTCGAACCAAGTA;SOR=0.696;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=190;TCF=92;TCR=98;TR=86;WE=126138394;WS=126138376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr12	126932624	rs758564	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=684;ReadPosRankSum=0.080;SC=AGTGGCTATCGGGGCAGACAA;SOR=0.820;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=43;WE=126932632;WS=126932614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr12	126932764	rs758565	C	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCATCAGAAACCCACCCTCTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=126932772;WS=126932754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	126947430	rs1019149	G	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCCTAGAAAGGTACAGGCCCT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=14;WE=126947438;WS=126947420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr12	127229327	rs10773323	T	A	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=21;PP=1513;SC=AAAGGAAGAATCAACACTTTC;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=127229335;WS=127229317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	128108780	rs3803151	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.95;QD=28.66;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	128899673	rs11059681	A	G	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=49;PP=2036;SC=TGGGATGACCACGGCGCCGGG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=107;WE=128899681;WS=128899663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	129028708	rs11610490	G	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr12	129028712	rs12812251	G	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr12	129181625	rs902058	A	G	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=113;SC=ATGGGCCAGCATATAGAGTGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=129181633;WS=129181615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	129181701	rs902059	A	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=8;PP=774;SC=AAGAAATATTACTGGTAAAGG;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=129181709;WS=129181691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	129181810	rs885546	A	G	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=45;PP=1670;SC=CAGAGAAGACAATAACCGTGC;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=129181818;WS=129181800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	129181834	rs902060	A	G	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=48;PP=1654;SC=ATGACAAAGTATCGGTGACAG;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=129181842;WS=129181824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	129189591	rs4533104	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=7;PP=637;SC=TCTAAGGGAAAAGGCATCCCC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=129189599;WS=129189581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	129190021	rs11059841	A	G	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=92;PP=2965;SC=GCACAGGCCAAGATGGGCACC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=167;WE=129190029;WS=129190011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	129278864	rs1059312	A	G	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.662;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1223;ReadPosRankSum=1.499;SC=CAGCCAGAAGAAAAAAGTAAT;SOR=0.339;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=83;WE=129278872;WS=129278854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,93:0.51:182
chr12	129283711	rs2291350	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GGCCATCCACGTGAAAACACC;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=9;WE=129283719;WS=129283701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	129293346	rs11059924	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=367;ReadPosRankSum=1.099;SC=CAGCAAAGGCCGAGCACATGA;SOR=0.107;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=22;WE=129293354;WS=129293336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr12	129298468	rs10688448	C	CAATA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=208;SC=AATTATTCCTCAATAAAGAGT;SOR=1.863;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=5;WE=129298476;WS=129298458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	129298727	.	A	AGACCTGAGCGCCGTATGATG	3897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.10;MQRankSum=-0.262;QD=40.18;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr12	129298759	.	C	T	1231	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=17;MQ=51.28;NF=45;NR=27;PP=1231;QD=17.5801557298;SC=ACCTGACCGCCGTATGATGGA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=72;WE=129298767;WS=129298749;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:99,72:0.42:171
chr12	129298775	.	C	CCACCGTATGATGGACCTGACCGCTGTATGATGGACCTGAG	4832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=20.836;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.14;MQRankSum=0.301;QD=37.17;ReadPosRankSum=1.867;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:17,113:0.87:130
chr12	129298819	.	C	T	2090	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MMLQ=24;MQ=51.85;NF=65;NR=54;PP=2090;QD=17.8552202735;SC=ACCTGACCGCCGTATGATGGA;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=119;WE=129298828;WS=129298805;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:82,119:0.59:201
chr12	129299675	rs2306683	C	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=53;PP=1594;SC=GGATGAAAACCATATACGGTC;SOR=2.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=129299683;WS=129299665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	129399352	rs11610307	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.695;NF=8;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTGACAGAGCGAGACTCTGTC;SOR=0.320;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=9;WE=129399360;WS=129399342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr12	129410789	rs12425716	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=318;ReadPosRankSum=-1.545;SC=ATAAGAGTAGGAGAAGCTGGC;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=17;WE=129410797;WS=129410779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr12	129559421	rs73159540	C	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=813;ReadPosRankSum=0.302;SC=TCCACCTTGACCAGGGTGCCT;SOR=0.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=52;WE=129559429;WS=129559411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr12	129559557	rs10773594	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=744;ReadPosRankSum=-0.206;SC=TATCCAAGGGCGTGACTGAGC;SOR=0.952;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=50;WE=129559565;WS=129559547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
chr12	129563020	rs2002553	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.135;SC=TGCCTGCCTGGTGTGTGATCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=129563028;WS=129563019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	129566270	rs12578725	A	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.143;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr12	129566406	rs79031518	C	T	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.069;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr12	129822051	rs11060257	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.799;SC=AACTTTGTGGTTTCGTTTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=129822059;WS=129822041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	130521306	rs600949	G	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.299;SC=TGCAAACAAAGAGTGAGAAAC;SOR=0.850;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=78;TCR=36;TR=60;WE=130521314;WS=130521296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr12	130838987	rs2173082	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1003;ReadPosRankSum=2.797;SC=TTGGCATCAGCTCTTTATTTT;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=59;WE=130838995;WS=130838977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr12	130839645	rs1874521	A	C	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.42;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	130839645	.	AACTTTCTC	CACTTTCTC,CACTTTCTT	536	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10,5;NR=50,21;PP=536,457;QD=9.51285354245;SC=GGCAGAAAGTAACTTTCTCCT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60,26;WE=130839661;WS=130839635;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:60
chr12	130839653	rs78606548	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr12	130841638	rs1106042	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=0.421;SC=ATGCAAATGAGAAAAGCAATA;SOR=0.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=11;WE=130841646;WS=130841628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr12	130847389	rs2242363	A	G	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=40;PP=1792;SC=AAGGTTAGTCACCTGTGGGGT;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=81;WE=130847397;WS=130847379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	130855668	rs141303392	GAATCACCCT	G	1497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.656;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.785;NF=10;NR=10;PP=2938;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TAAGAAACTGGAATCACCCTA;SOR=0.170;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=20;WE=130855684;WS=130855658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr12	130884202	rs2292669	A	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.009;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=552;ReadPosRankSum=0.523;SC=AGAGATTAAAAAGGCTAAATA;SOR=1.444;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=35;WE=130884210;WS=130884192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr12	130890611	.	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=226;ReadPosRankSum=1.456;SC=GGCGTATGACGTTCATGCCCA;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=13;WE=130890619;WS=130890601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr12	130916685	rs7966010	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=0;PP=830;SC=GGGTTTGTAATCTGAGCAGAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=130916693;WS=130916675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	130935710	rs2398519	C	G	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=38;PP=2226;SC=GCACAGGCAGCCCCGGCAGCC;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=109;WE=130935718;WS=130935700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	130941150	rs2277361	G	C	5963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=64;PP=2965;SC=GGTCAATCTTGCCAGCGTGCT;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=111;TCR=64;TR=175;WE=130941158;WS=130941140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	130941338	rs1356081	G	A	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=86;PP=2525;SC=GTGTGCACATGTGCACTGTGT;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=109;WE=130941346;WS=130941328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	131276448	rs4759786	G	T	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=59;PP=2049;SC=ATGGTTGCTAGGACAATGTTG;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=104;WE=131276456;WS=131276438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	131280714	rs10848205	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=44;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TAATTTCATATTGCCACATTA;SOR=0.875;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=36;TCR=92;TR=60;WE=131280722;WS=131280704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
chr12	131280752	rs34749116	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=667;ReadPosRankSum=-0.399;SC=AAAATAAAACGACCTGGCCAG;SOR=3.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=30;WE=131280760;WS=131280742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr12	131285663	rs1881060	T	C	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=30;PP=1801;SC=ACATGACTGATATCTCTCTTG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=131285671;WS=131285653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	131296880	rs7961690	G	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=1.434;SC=TGCCTGGGATGGGCTTCAGAA;SOR=0.706;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=28;WE=131296888;WS=131296870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr12	131296908	rs9668291	C	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=515;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GGAGCGGGTGCGGGTGGGAGC;SOR=1.069;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=32;WE=131296916;WS=131296898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr12	131297348	rs4759794	T	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	131306314	rs17564	C	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=636;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TTTATCAATACTGTTTCTAAT;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=40;WE=131306322;WS=131306304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr12	131323708	rs10848214	T	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=10;PP=283;SC=CGGCCGGGCCTCGGGCTCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=131323716;WS=131323698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	131438971	rs56090874	G	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=287;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AGACCCTCAGGAATTTCACTT;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=131438979;WS=131438961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr12	131439237	rs7350616	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=320;ReadPosRankSum=-1.990;SC=TCTGAGCACCGCTCTCCCCCT;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=131439247;WS=131439227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	131439239	rs10848261	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=1.676;SC=TGAGCACCGCTCTCCCCCTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=131439247;WS=131439227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	131453378	rs7309920	T	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=1;PP=1131;SC=GGCTGGGGGATGTGAGGTCCG;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=131453386;WS=131453368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	131466562	rs4759534	T	C	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=35;PP=1120;SC=TGGAGCTGTATACGCGGGACA;SOR=1.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=131466570;WS=131466552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	131471608	rs1547577	T	C	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=38;PP=2120;SC=ATTCCCACAGTACTCAGAATG;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=97;WE=131471616;WS=131471598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	131485014	rs4759821	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=253;ReadPosRankSum=-1.106;SC=TGGTCGGTCATGGTGGCTCAT;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=131485033;WS=131485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	131485025	rs4759822	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=253;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GGTGGCTCATACCTATAATCC;SOR=0.074;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=131485033;WS=131485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	131488566	rs10773836	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.566;NF=5;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=-1.307;SC=CATTGCTTTACCCTTTTTTTT;SOR=0.105;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=131488574;WS=131488556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	131488858	rs12311722	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=856;ReadPosRankSum=0.739;SC=GTGGCTGCGCTGGACTCCCTT;SOR=0.321;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=70;WE=131488866;WS=131488848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,79:0.61:130
chr12	131490413	rs7978321	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=310;ReadPosRankSum=0.511;SC=GAGGGTTCTTAGGAGTGAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=15;WE=131490421;WS=131490403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr12	131498946	rs1212936	C	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=33;PP=1029;SC=CTGAGGAATGCTGGGTTGTCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=131498954;WS=131498936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	131498995	rs1195923	G	A	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=573;SC=CCTTGGTGCCGGCCCGAACTG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=131499003;WS=131498985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	131555329	rs10744491	C	A	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=45;PP=1980;SC=GCTGATTGGACTGTGGAGTAC;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=106;WE=131555337;WS=131555319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	131555635	.	G	A	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=52.33;NF=0;NR=5;PP=80;QD=22.9542425094;SC=GAAAGGAGGTGGAGCCATGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=131555643;WS=131555625;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,5:0.56:9
chr12	131569234	rs2293656	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1055;ReadPosRankSum=1.002;SC=CAGGGGTCGCGGGACCTGGGG;SOR=0.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=59;WE=131569242;WS=131569224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,68:0.64:107
chr12	131602811	rs7961434	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=1.161;SC=CATAGTTCCCCCTCTGTATAC;SOR=1.508;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=16;WE=131602819;WS=131602801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr12	131603031	rs7295131	G	A	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=732;ReadPosRankSum=2.059;SC=TTTGGCAGGCGTTCCATGGAA;SOR=0.484;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=52;WE=131603039;WS=131603021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr12	131620588	rs868158	A	G	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1233;ReadPosRankSum=-1.610;SC=CCAGGTTGACAGCCAAGGCAG;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=84;WE=131620596;WS=131620578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,98:0.53:184
chr12	131620738	rs2280683	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=640;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GCGGGGAGGCAGGGCCGCCAG;SOR=0.405;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=38;WE=131620746;WS=131620728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr12	131621374	rs117771717	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=187;ReadPosRankSum=0.026;SC=GACGCCTCTCCGTCCTCACGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=12;WE=131621382;WS=131621364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	131622735	rs7302341	T	C	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=67;PP=1801;SC=CGAGCAGCTCTGCCCGCACCT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=131622743;WS=131622725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	131623850	rs35160436	A	AC	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.691;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.336;NF=1;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=0.696;SC=CTCAGAACACACCCCCCCAAA;SOR=0.246;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=19;WE=131623858;WS=131623840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr12	131687287	rs7486559	G	C	6494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.88;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	131687287	.	GCG	CCC,CCG	1136	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=45,87;NR=37,66;PP=1136,1023;QD=14.505705791;SC=CCTCCTCCCCGCGACGTGACG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=89;TCR=66;TR=82,153;WE=131687297;WS=131687277;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:155
chr12	131687289	rs12816480	G	C	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,93:0.51:182
chr12	132209932	rs138640311	ATG	A	2277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.364;NF=24;NR=19;PP=1853;ReadPosRankSum=1.066;SC=TGACGTGAATATGTGTGTTTT;SOR=0.496;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=43;WE=132209941;WS=132209922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr12	132237750	rs1051219	C	T	2901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=1694;ReadPosRankSum=-1.095;SC=CCGGAATCGACGTGACTACTT;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=96;TCR=115;TR=113;WE=132237758;WS=132237740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,138:0.55:251
chr12	132237848	rs1982528	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=51;PP=1841;SC=ACCACACCACTACCGCCCCCA;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=132237856;WS=132237838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	132240937	rs3217666	C	CAT	948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=807;ReadPosRankSum=1.249;SC=TCCAGTGAAACATATACCGTA;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=18;WE=132240945;WS=132240927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr12	132241229	rs7136191	A	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=12;PP=323;SC=ACATTCCACCATAAGTTGGCA;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=132241237;WS=132241219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	132250712	rs1051233	G	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=646;ReadPosRankSum=-0.395;SC=GGGAAAAGCTGGCCCAGGCGT;SOR=0.583;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=47;WE=132250720;WS=132250702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr12	132262911	rs75324057	A	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=793;ReadPosRankSum=0.020;SC=TGGTACCCTCATGACCCCCAT;SOR=0.372;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=42;WE=132262919;WS=132262901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr12	132269830	rs66665803	G	GA	6899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=138;PP=2974;SC=AAAGGTCTGGGAAAAAATCAA;SOR=1.856;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=8;TCR=146;TR=145;WE=132269838;WS=132269820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	132271113	rs7136643	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=27;PP=1317;SC=CTGGGGCCAGTAGGAAGCGGA;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=132271121;WS=132271103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	132313098	.	G	GGCTGCCGCT	570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=219;SC=GGACTCTCGCGGCTGCCGCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=132313106;WS=132313088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	132323082	rs7971187	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	132323089	rs7965611	C	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=53;SC=CCCACCCTTGCGGATGCTCGG;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=132323097;WS=132323073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	132323294	rs4964884	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=-0.046;SC=GAGGTGGGTGTGTGGCCAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=10;WE=132323302;WS=132323284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	132325239	rs6598163	G	A	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=66;PP=2107;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GGCGGGCAGCGCCGCCGACAT;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=297;TCF=154;TCR=143;TR=138;WE=132325247;WS=132325229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,160:0.46:349
chr12	132326051	rs4964929	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.098;SC=CCCTCTGGCGCAGCCGGCATC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=132326059;WS=132326041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	132335592	rs11835665	G	A	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.119;SC=CTCACAGGCCGATGGATCTGT;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=96;WE=132335600;WS=132335582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,122:0.51:238
chr12	132395052	rs7295593	G	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=9;PP=331;SC=AGCAGGCTTGGGATGGGGATG;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=132395060;WS=132395043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	132396343	rs11615995	C	T	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=6;PP=906;SC=GAGCGGAGCACAGGAAGAAAG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=132396351;WS=132396333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	132396603	rs11616018	C	T	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=72;PP=2334;SC=GTGACACAGACGACTTCGTCA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=119;WE=132396611;WS=132396593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	132398255	rs68126752	AC	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=0.809;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.829;SOR=1.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr12	132398256	rs4964880	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-0.539;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.715;SOR=0.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	132401566	rs11546871	C	T	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=57;PP=1827;SC=GCCCCGGACCCGGGCAGCACG;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=132401574;WS=132401556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	132401642	.	T	C	696	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=5;HapScore=3;MGOF=59;MMLQ=22;MQ=56.4;NF=12;NR=25;PP=696;QD=19.7505733121;SC=GGCTGTGGGATGGGGGTCGGA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=37;WE=132401655;WS=132401632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr12	132401647	.	G	GTTGGGGGGAGC	1424	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=59;MMLQ=22;MQ=53.66;NF=0;NR=8;PP=1424;QD=181.875;SC=TGGGATGGGGGTCGGAGGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=8;WE=132401655;WS=132401632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr12	132401866	.	CGTGGGAT	TGTGGGAC,TGTGGGAT	51	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4,6;NR=2,2;PP=20,51;QD=12.2446458104;SC=GCTCGGAGGCCGTGGGATGGG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6,8;WE=132401881;WS=132401856;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.75:8
chr12	132403161	rs11609348	A	G	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=55;PP=1893;SC=CGACCCCATTACTGCGAACCT;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=97;WE=132403169;WS=132403151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	132403323	rs113517126	C	A	126.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.13;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	132403330	.	G	GT	43.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	132404212	rs7299195	A	G	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;PP=1097;SC=GTGACAGGGTAACAGGGAGGC;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=132404220;WS=132404202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	132404669	.	C	T	3047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=67;PP=1744;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TCTTCAGCCACGCTGTGCAGA;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=112;TCR=139;TR=123;WE=132404677;WS=132404659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,145:0.50:292
chr12	132406275	rs7311029	A	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=15;PP=1221;SC=CTGCTTAGGGAAGGTCAGCAG;SOR=1.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=132406283;WS=132406265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	132417451	rs113696185	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=240;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AAGAAAAGAGGTTGAATTGAC;SOR=0.269;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=15;WE=132417459;WS=132417441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr12	132426506	rs149378338	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=1.228;SC=ACCGCTCTCACGGCAGGTGGC;SOR=0.926;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=25;WE=132426514;WS=132426496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr12	132427909	rs7961398	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=256;SC=CTTTCCCTGCACAGGTTCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=132427917;WS=132427899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	132626668	rs1133690	T	C	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=16;PP=998;SC=ACATACCTGCTGGGCCAGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=132626676;WS=132626658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	132633321	rs202156229	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5065;FS=4.506;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-1.428;SC=CTGCCGGCCCCCGCCCAGCTG;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=132633329;WS=132633311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr12	132633458	.	GCTCAC	ACTCAC,ACTCAT	432	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=59.83;NF=23,15;NR=29,19;PP=187,432;QD=4.26483101052;SC=CCGCCGCCTCGCTCACACCAC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52,34;WE=132633471;WS=132633448;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:52
chr12	132635521	rs7397057	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=425;ReadPosRankSum=-1.131;SC=TCTGTCTGTCTGCAGGGGGGG;SOR=0.499;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=37;WE=132635529;WS=132635511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr12	132635779	rs12818246	C	T	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=29;PP=1777;SC=GCTCCATCCGCTGCTCCTTCC;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=85;WE=132635787;WS=132635769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	132839265	rs28431148	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GGGACCCCGGAAGCCATAGCT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=11;WE=132839273;WS=132839255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	132862868	rs78370891	G	A	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=836;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TGCTCCGATCGAGGGAGATGC;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=65;WE=132862876;WS=132862858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,88:0.54:163
chr12	132862976	rs28503969	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=609;ReadPosRankSum=1.154;SC=CCTGGCCCAGGCCTCCTGGCC;SOR=0.712;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=45;WE=132862984;WS=132862966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr12	132911861	rs28672358	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-1.209;SC=GTGTGTGCCTGTGTGTGTGCC;SOR=0.804;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=5;WE=132911869;WS=132911851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	132911891	rs28683048	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TTGTGTGTGTGTGCATGTGTG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=9;WE=132911899;WS=132911881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	132911948	rs28722154	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.499;SC=TGTACATATATGTGCATGTGT;SOR=0.790;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=12;WE=132911956;WS=132911938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	133031898	rs10870487	A	G	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=13;PP=1304;SC=CAGTAGCTCCAACCTCACAGC;SOR=2.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=64;WE=133031906;WS=133031888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	133032047	.	T	TGTGTGCATGTTGAC,TGTGTGTGCATGTTGAC	5083.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=3,3;NR=40,41;PP=1266,1472;SC=TGTGGACATATGTGTGTGCAT;SOR=1.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=43,44;WE=133032071;WS=133032037;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:121
chr12	133032110	rs9706362	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=198;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=687;SC=CTTGTGTGTGTGTGCATGTGT;SOR=4.125;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=133032118;WS=133032100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	133032132	rs113386371	C	CGT	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=786;SC=TGCATGTGAACGTGTGTGTGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=20;WE=133032140;WS=133032122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	133067343	.	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=1;PP=248;SC=CGCGCCCCGCACCGCGCGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=133067351;WS=133067333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	133067473	rs28435470	G	A	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=33;PP=1055;SC=CGGCTTCGCAGGCGTTGAGGC;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=133067481;WS=133067463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	133102462	rs4883569	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=1.016;SC=CCGCCTGCCCGCTGCGCCCCG;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=133102470;WS=133102452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	133104406	rs7135930	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr12	133104461	rs4883566	A	G	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=997;SC=TGAGGGCTGCAGGGCAGCTGT;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=133104469;WS=133104451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	133104735	rs4883565	T	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=695;ReadPosRankSum=0.292;SC=CACCATGGGGTTGGTGGGGGG;SOR=0.920;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=37;WE=133104743;WS=133104725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr12	133124753	rs79009737	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.115;SC=GGTGGGTGCAGGGGGCTTGTG;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=13;WE=133124761;WS=133124743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr12	133153281	rs10870473	A	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=177;ReadPosRankSum=1.461;SC=TGCTCCCCTTACTGGACTGGC;SOR=1.755;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=11;WE=133153289;WS=133153271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr12	133158632	rs3751304	C	T	285.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=1.902;SC=TCATGCTCCCCGGCCTCTGCC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=133158640;WS=133158622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr12	133159846	rs56171012	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=1.048;SC=GGCGGGCGGCCTGCACCCCGC;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=16;WE=133159854;WS=133159836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr12	133160238	rs7966712	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	133181116	rs61745120	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=833;ReadPosRankSum=-0.773;SC=CTGTTGTTGCGGACGCAGCAG;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=56;WE=133181133;WS=133181106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,73:0.43:169
chr12	133225975	.	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=719;ReadPosRankSum=0.292;SC=GGACCATCCCGGATGGCCCCG;SOR=0.780;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=42;WE=133225983;WS=133225965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr12	133233705	rs5744889	T	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=14;PP=883;SC=AGCCCAGCCTTGGGGCCCCAC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=133233713;WS=133233695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	133252796	rs4077170	C	G	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=51;PP=1916;SC=TAGCCCTAGCCAAGTTCATTA;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=97;WE=133252804;WS=133252786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	133252947	rs5744759	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=491;SC=AGACGCTCTGTGTGTGGATTC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=133252955;WS=133252937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	133253310	rs5744757	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=422;SC=ACCCACCCCCAGCCTGCTCTA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=133253318;WS=133253300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	133254083	rs5744750	T	C	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=83;PP=2965;SC=AAGTCTATTCTTCTGTGGATT;SOR=1.138;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=52;TCR=83;TR=135;WE=133254091;WS=133254073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	133256904	rs5744738	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=502;SC=CCATGAACAGCCTAGGGCCAG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=133256912;WS=133256894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	133263743	rs111877885	A	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=3;PP=303;SC=GGCTGCGGGAACCGGGCCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=133263751;WS=133263733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	133263825	rs2075784	G	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=9;PP=832;SC=AGAGCCTCAGGAGGGCGCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=133263833;WS=133263815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	133264332	rs11538534	C	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=8;PP=260;SC=CGCCCAGTACCTGCTCTTCCT;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=133264340;WS=133264322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	133267164	rs34659814	CT	C	162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;QD=23.25;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	133272380	rs10781627	G	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=526;SC=GGAAGCAGGGGTTAGGACCTG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=133272388;WS=133272370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	133277983	rs7958567	T	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=27;PP=965;SC=CAGCCTCTGCTAACATTACTT;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=133277991;WS=133277973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	133281462	rs10007	G	A	4948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=76;PP=2855;SC=AAAGGCAGTCGCTGCCTTCAG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=141;WE=133281470;WS=133281452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr12	133287418	rs117520285	T	C	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=2;PP=24;SC=CGGAGCGCCGTCGGGGCCGTG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=133287426;WS=133287408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	133287459	rs7486453	C	T	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=49;SC=CGGGAGCAAGCGGCATGGCGT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=133287467;WS=133287449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	133287721	rs7973452	A	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=12;PP=313;SC=GTTGGGATCGAGATCGGGACC;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=133287729;WS=133287711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	133294826	rs149250932	G	GC	587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.474;NF=0;NR=17;PP=591;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GGCCTCACCAGCCCCCGGGCG;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=133294834;WS=133294816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr12	133295161	.	G	GT	167	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=63.97;NF=7;NR=0;PP=167;QD=28.2857142857;SC=CTGGGTGGGGGGTCCTGGGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=133295169;WS=133295151;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr12	133297103	rs10781631	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=252;SC=CCGTGTTAGCTGGGATGGTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=133297111;WS=133297096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	133297182	rs10870498	A	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=14;PP=983;SC=GTGAGCCACCATGCCCGGCCT;SOR=2.080;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=56;WE=133297190;WS=133297172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	133304146	rs10437912	C	T	1374.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=23.464;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.55;MQRankSum=2.342;QD=37.14;ReadPosRankSum=0.064;SOR=7.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,34:0.92:37
chr12	133304149	rs10437913	G	C	1374.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=22.974;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.53;MQRankSum=2.270;QD=39.27;ReadPosRankSum=0.179;SOR=6.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr12	133304891	rs10870499	T	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=56.58;NF=3;NR=11;PP=267;SC=TCTCGGCTCATCGCAAGCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=133304899;WS=133304881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	133306589	rs10781634	C	T	6976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=116;PP=2965;SC=TTCCTCCCCACGGGGGGCCTT;SOR=0.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=91;TCR=116;TR=207;WE=133306597;WS=133306579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	133306808	rs149597645	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=741;ReadPosRankSum=0.815;SC=TTCTTCCAAGCTCATGTCATC;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=53;WE=133306816;WS=133306798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr12	133306920	.	CCCATCCATGACCAACTGCCGTGACCCCAGCAACAGCAACTCTTATACCCAAAACCTCCCCACT	C	1426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=6.435;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;MQRankSum=0.000;QD=32.43;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=2.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr12	133306927	.	AT	GC	1262	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=22;PP=1262;QD=45.3609612021;SC=CGCCCCATCCATGACCAACTG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=133306936;WS=133306917;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	133306964	.	AT	GC	99	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=50;MMLQ=27;MQ=58.24;NF=0;NR=5;PP=99;QD=30.4935749724;SC=AGCAACTCTTATACCCAAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=133306973;WS=133306954;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,5:0.50:10
chr12	133311888	rs10781636	C	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=9;PP=1073;SC=CCCAGAAAAGCCTTCTGGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=133311896;WS=133311878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	133311944	rs10747081	T	C	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=27;PP=1218;SC=TTAATCAAAATGCAACCAACT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=69;WE=133311952;WS=133311934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	133312191	rs10781637	T	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=10;PP=229;SC=AGTAGCTGCCTGTCTCCGCAC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=133312199;WS=133312181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	133327470	rs7304425	A	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=440;SC=AAATCAGAGAAGAGTGACTGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=133327478;WS=133327460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	133331537	rs1132375	G	A	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=60;PP=2965;SC=GCCTCATGGTGGTAGAAAGAA;SOR=1.145;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=91;TCR=60;TR=151;WE=133331545;WS=133331527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	133349620	rs3741483	C	G	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=24;PP=1707;SC=AAACATCGACCACACAATCAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=82;WE=133349628;WS=133349610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	133349893	rs3741484	A	G	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.54;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	133353168	.	C	T	272	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=52.43;NF=13;NR=3;PP=272;QD=19.1732007842;SC=GCCCCTCCAGCTCCTTCCTCC;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=16;WE=133353176;WS=133353166;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,16:0.84:19
chr12	133354203	rs12371815	C	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=544;ReadPosRankSum=-0.343;SC=AGACCCCGCCCATTGCCAGGA;SOR=0.269;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=35;WE=133354211;WS=133354193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr12	133354470	rs900444	T	C	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=838;ReadPosRankSum=-0.121;SC=AGGGGGTGAATGCACTCCCGG;SOR=0.854;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=154;TCF=55;TCR=99;TR=66;WE=133354478;WS=133354460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,79:0.44:178
chr12	133358870	rs2306546	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=0.351;SC=TGAGTTTGACGAGTTTGAATA;SOR=0.204;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=133358878;WS=133358860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr12	133360530	rs11147073	T	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=2;PP=877;SC=TCTGTAACCATTCCACCAAAG;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=133360538;WS=133360520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	133360964	rs1009320	G	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=708;SC=CTGTGGTGCCGGCAGGCATGA;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=133360972;WS=133360954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	133363212	rs144581238	GCCTCCCCCCCGGCCCCCGCA	G	2347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.111;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.304;NF=7;NR=31;PP=2924;ReadPosRankSum=2.139;SC=ATTCTGGTTCGCCTCCCCCCC;SOR=0.273;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=38;WE=133363239;WS=133363202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr12	133363264	rs2242294	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=3;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.215;NF=13;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=-1.714;SC=CTCCCCCGGGCACATGCAGAC;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=26;WE=133363272;WS=133363254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,31:0.33:94
chr12	133363376	rs7976379	G	T	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=694;ReadPosRankSum=0.343;SC=TGCAACGACTGTGGAAGGGAA;SOR=1.106;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=46;WE=133363384;WS=133363366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr12	133365497	rs968522	A	C	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=163;SC=ACAGGCCCCGACCCAGACAGA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=7;WE=133365505;WS=133365487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	133365914	rs77794360	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=303;ReadPosRankSum=-1.545;SC=CGCTGGGCGGCGGGGCGTGGG;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=133365928;WS=133365904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	133365920	rs11147076	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=1.237;SC=GCGGCGGGGCGTGGGGGGCGT;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=133365928;WS=133365904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	133372395	rs4758905	A	C	5932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=60;PP=2965;SC=CATTCCTGCAAGGAGGGTTCT;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=120;TCR=60;TR=179;WE=133372403;WS=133372385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	133373375	rs2242292	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=271;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AGAAACCCACCGCCCTGGCAT;SOR=0.380;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=18;WE=133373383;WS=133373365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr12	133378244	rs149456851	AC	A	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.001;NF=27;NR=10;PP=1263;ReadPosRankSum=-2.465;SC=CAGGTTAAAAACAAAAACATG;SOR=0.287;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=37;WE=133378252;WS=133378234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr12	133378440	rs2291258	C	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=986;ReadPosRankSum=0.301;SC=GGACACTCTGCAGGGACGAGA;SOR=0.688;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=70;WE=133378448;WS=133378430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,82:0.49:167
chr12	133381562	.	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,23:0.18:127
chr12	133383923	rs10781653	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=457;SC=CCTCATTTTCTTTCACACTCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=133383931;WS=133383913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	133385188	rs3741488	A	T	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=1265;ReadPosRankSum=1.223;SC=CAAGCAGCATACTTAAAACTG;SOR=1.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=56;WE=133385196;WS=133385178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr12	133398461	.	C	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=22;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.132;NF=12;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=1.283;SC=AAAAAAAAAACAACTTTGAAT;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=23;WE=133398469;WS=133398451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr12	133398527	.	T	TC	3758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.907;NF=17;NR=56;PP=2856;ReadPosRankSum=0.573;SC=CACCACGTCCTCCCTCAACAC;SOR=0.588;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=137;TCF=39;TCR=98;TR=73;WE=133398535;WS=133398517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,135:0.55:244
chr12	133417982	rs375411000	T	TAA	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=-0.373;SC=ACTCAGAGGGTAAAGCTCCAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=133417990;WS=133417972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	133419418	rs2306544	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.496;NF=9;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AGTGGAAGACGGAGATAAAAC;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=13;WE=133419426;WS=133419408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr12	133419808	rs4758950	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=1.210;SC=TAGTTTCCTCGGACCGTTCTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=133419816;WS=133419798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr12	133423662	rs2306536	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=259;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TGGAGAGCCACGAGGCTCTCG;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=23;WE=133423670;WS=133423652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr12	133423866	rs10747087	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=424;SC=AGGGCTGCACGTTCACGGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=133423874;WS=133423856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	133423884	rs2306538	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCTGCAGCACGAGAAGTCTTG;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=133423892;WS=133423874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	133428416	.	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=276;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GCGAGGAGAGGTGCACCTGAG;SOR=2.049;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=13;WE=133428424;WS=133428406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr12	133432992	rs2306539	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GTGAGCTCTCGGTCACGGTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=133433000;WS=133432982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	133433173	rs2062163	T	C	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=36;PP=1852;SC=TGATTTTATTTCTGGCATCCA;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=133433181;WS=133433163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	133433237	rs3816759	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=1397;ReadPosRankSum=2.255;SC=AAGGACACAGCGCCATTCACC;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=39;WE=133433248;WS=133433227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr12	133433240	rs11147110	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=1404;ReadPosRankSum=-1.750;SC=GACACAGCGCCATTCACCGGC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=42;WE=133433248;WS=133433227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr12	133433300	rs11147111	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=428;ReadPosRankSum=0.803;SC=AGCTCGCGTGCGCAGTGCTGC;SOR=0.453;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=25;WE=133433308;WS=133433290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr12	133435595	rs4758955	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=446;ReadPosRankSum=-1.932;SC=CCCTGCCCCACACGGGACGAA;SOR=0.327;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=35;WE=133435603;WS=133435585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,34:0.37:91
chr12	133437981	rs12578891	A	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=484;ReadPosRankSum=1.135;SC=CACAGCACGGAGCATGGCAGC;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=27;WE=133437989;WS=133437971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr12	133438277	rs2306543	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=34;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GAGAGAACCATGCCTGTAAGG;SOR=0.465;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=6;WE=133438285;WS=133438267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr12	133439002	rs9943856	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=1.274;SC=AACACAGCAAGGCACCATCTC;SOR=0.569;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=16;WE=133439010;WS=133438992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr12	133439115	rs9943858	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=9;PP=373;SC=ACTTGAGCCCGGGAGTTCGAG;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=133439123;WS=133439105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	133447224	rs11147126	T	C	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=758;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CCAGCCTGGGTAACAGAGCGA;SOR=0.267;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=51;WE=133447232;WS=133447214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr12	133448968	rs138320999	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=630;ReadPosRankSum=0.004;SC=TGTTAATCACTGTTCCACTGG;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=49;WE=133448976;WS=133448958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr12	133454294	rs11147137	C	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.07;MQRankSum=1.091;NF=29;NR=33;PP=819;ReadPosRankSum=1.385;SC=ACTGTGAACACTACTGCACTT;SOR=0.553;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=62;WE=133454302;WS=133454284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr12	133454354	rs149820641	TA	T	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.104;NF=3;NR=21;PP=289;ReadPosRankSum=1.650;SC=TGTACATATGTAAAAAAAAAC;SOR=0.610;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=24;WE=133454362;WS=133454343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr12	133463969	rs113492159	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=347;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CCCGACCCCAGAGGCCGAGAC;SOR=1.255;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=24;WE=133463977;WS=133463959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr12	133682655	rs710945	A	G	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.052;NF=28;NR=29;PP=977;ReadPosRankSum=0.826;SC=CTCGACATCAAAGAATTCACA;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=57;WE=133682663;WS=133682645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr12	133683261	rs905226	T	C	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=57;PP=971;ReadPosRankSum=1.827;SC=AGAAAAACTATGAATGTATGG;SOR=0.401;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=171;TCF=45;TCR=126;TR=82;WE=133683269;WS=133683251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,89:0.48:184
chr12	133683280	rs905225	A	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=43;PP=899;ReadPosRankSum=0.486;SC=GGAATTTTTTAAAAAGAAGTA;SOR=0.410;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=106;TCF=17;TCR=89;TR=54;WE=133683288;WS=133683270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr12	133696743	rs144074942	G	GAAC	641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=839;ReadPosRankSum=1.928;SC=AGTATTTACAGAAAATGTTAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=11;WE=133696762;WS=133696733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr12	133696754	rs55957232	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.751;NF=18;NR=3;PP=838;ReadPosRankSum=1.629;SC=AAAATGTTATATTAAAAAAAG;SOR=1.002;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=21;WE=133696762;WS=133696733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
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chr12	133768273	rs10870589	G	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=423;ReadPosRankSum=2.003;SC=AAACTGGAGGGCTTCTATGAA;SOR=0.416;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=20;WE=133768281;WS=133768263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	133770306	rs7960924	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=1.611;SC=AACTTCCATTCGGAAGATTGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=133770314;WS=133770296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	133778684	rs7963812	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=1.577;SC=CTAGTATACCGCAATCATGTG;SOR=0.465;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=11;WE=133778692;WS=133778674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr12	133778796	rs7975069	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=390;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CTGGGAAGTACGGCAAAAAGC;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=27;WE=133778804;WS=133778786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr12	133780309	rs36127550	G	T	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1689;ReadPosRankSum=-1.317;SC=CCTTTAGTTTGAAGTCCCAGC;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=109;WE=133780317;WS=133780299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,122:0.50:242
chr12	133781163	rs36174733	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GATAGAAACAATCATATATAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=133781171;WS=133781153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	133787329	rs138369699	A	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=360;ReadPosRankSum=0.118;SC=AAGGCAGCTCAGTCTTTACTG;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=26;WE=133787337;WS=133787319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr12	133795418	rs142613020	C	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1249;ReadPosRankSum=0.928;SC=GTTGACCAGGCAGACCATCCA;SOR=0.791;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=76;WE=133795426;WS=133795408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,86:0.54:159
chr12	133795885	rs144454089	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=181;ReadPosRankSum=0.212;SC=GGAGGGCAGGGCCTGGCTCAG;SOR=0.317;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=13;WE=133795893;WS=133795875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr12	133795960	rs36140725	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=385;ReadPosRankSum=1.093;SC=AGGGCTGGAAAAGAGACAGTG;SOR=0.752;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=26;WE=133795968;WS=133795950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr12	133796033	rs36130280	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=398;ReadPosRankSum=0.285;SC=TGTGCTTTCTCCCTCATCAGG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=26;WE=133796041;WS=133796023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr12	133797649	rs147515371	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=341;ReadPosRankSum=0.993;SC=TGTAGGCTTGTGGGGACTGTT;SOR=0.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=20;WE=133797657;WS=133797639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr13	19600475	rs9511168	C	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=772;SC=CTGGTCTTGTCGCATCTTCTC;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=19600483;WS=19600465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	19601129	rs35887366	TA	T	1262.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=31;PP=765;SC=TCAACACCTGTAAAAAAAATA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=32;WE=19601137;WS=19601119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	19601182	rs2039524	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=452;SC=TATTTGGCTTCTAGTAAAAAT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=19601190;WS=19601172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	19606506	rs12865916	C	T	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=74;SC=AACTCAAAAACGAAAATTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=19606514;WS=19606496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	19751544	rs2297224	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.46;MQRankSum=-0.421;NF=9;NR=9;PP=253;ReadPosRankSum=0.731;SC=GTTCCAGGGTCGTGTGGGTGG;SOR=0.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=18;WE=19751552;WS=19751534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr13	19752625	rs605109	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.450;SC=TACAAAGTACATGCTGTTCAA;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=19752633;WS=19752615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr13	19753686	rs36215074	G	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=940;ReadPosRankSum=1.119;SC=GCCCCACGTGGATAGAGATAC;SOR=0.653;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=55;WE=19753694;WS=19753676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr13	19756026	rs783595	C	G	82.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	19775652	rs66950030	CA	C	61.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.43;MQRankSum=1.383;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr13	19775755	rs115152530	A	G	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=16;PP=778;SC=TTTTTTCTGGATAGCCAGGAA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=19775763;WS=19775745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	19775867	rs114445450	G	A	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.07;QD=42.91;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	19775875	rs138429293	T	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.07;QD=42.91;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	19778703	.	A	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQRankSum=-1.150;QD=20.19;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr13	19778705	.	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.94;MQRankSum=-0.967;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr13	19782646	rs9512066	G	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=33;PP=1400;SC=TGCTCCACAGGGACCCATATC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=19782654;WS=19782636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	19801420	rs9551255	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.891;NF=25;NR=12;PP=655;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GTGTTCATGCCTAGCTGCTTC;SOR=1.302;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=37;WE=19801428;WS=19801410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr13	19933372	rs4771142	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.94;MQRankSum=-1.192;NF=5;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=-0.152;SC=AGTTCTGAGCGAGGGAGAAAT;SOR=0.515;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=8;WE=19933380;WS=19933362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr13	19941233	rs3002090	C	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=16;PP=525;SC=CCTAGTGATCCTACTGAATTA;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=19941241;WS=19941223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	19943770	rs4112696	A	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-1.235;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr13	19949218	rs35633897	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-1.769;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.388;SOR=1.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr13	19949227	rs34936230	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-2.073;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr13	19949287	.	G	T	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=57.57;NF=1;NR=2;PP=20;QD=18.2570708491;SC=GCCCGCTCTCGGCTTTCAAAG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=3;WE=19949295;WS=19949277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr13	19962045	rs9554181	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.158;NF=2;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TCGTGCTTTCGTTTGTTCATG;SOR=0.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=7;WE=19962063;WS=19962035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr13	19962055	rs9512903	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.417;NF=3;NR=11;PP=575;ReadPosRankSum=1.418;SC=GTTTGTTCATGAAGATGAAGG;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=14;WE=19962063;WS=19962035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr13	20000630	rs2497218	T	C	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=62;PP=2156;SC=TTAATTAATATTTTGTCTGTT;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=108;WE=20000638;WS=20000620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr13	20000702	rs4408395	G	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=913;SC=CCTAGATAACGATAACAAAAG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=20000710;WS=20000692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	20004762	rs7139692	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.314;NF=9;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=1.978;SC=CTTAACATCATGGATTAAAAA;SOR=0.358;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=23;WE=20004770;WS=20004752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr13	20004798	rs2497068	C	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=691;SC=AAGCTAACAACGTATCAATAG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=20004806;WS=20004788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	20025406	rs2497236	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.855;NF=8;NR=13;PP=349;ReadPosRankSum=1.256;SC=TTACATGGCACCAACACAAGC;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=21;WE=20025414;WS=20025396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr13	20038584	rs7339103	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=0.850;SC=TTTGTCAGATAAAGACCCTTA;SOR=0.602;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=28;WE=20038592;WS=20038574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr13	20038714	rs34800894	CA	C	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.911;NF=0;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-1.190;SC=TCATATAACACAAAAAAAATT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=20038722;WS=20038704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr13	20039289	rs2497079	A	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=6;PP=1117;SC=TATATTCTCAAGAATAAAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=20039297;WS=20039279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	20041323	rs2497251	G	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=61;SC=AATGCTAAAAGTAATGAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=20041331;WS=20041313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	20041563	rs2492391	C	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.52;NF=0;NR=4;PP=80;SC=CCACAAACTACTGACTCATCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=20041571;WS=20041553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	20066994	rs78472618	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQRankSum=-4.500;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.618;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr13	20067011	rs76437836	A	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.34;MQRankSum=-4.887;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr13	20067081	rs76668072	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.415;NF=4;NR=4;PP=88;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GATAGGAGACACGATTCTAAA;SOR=0.350;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=8;WE=20067089;WS=20067071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr13	20208232	rs2298004	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.400;SC=AATGCAAGCACGCGAAATCGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=20208240;WS=20208222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr13	20221516	rs35424555	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.354;NF=24;NR=23;PP=829;ReadPosRankSum=-1.007;SC=GTCAAGCTATAAGAAAGTGTT;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=47;WE=20221524;WS=20221506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr13	20236083	.	C	T	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5209;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=34;QD=22.9237375157;SC=ATGGTCACATCGCTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=20236091;WS=20236073;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr13	20240743	rs9508812	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=0.413;SC=GACTGTGCCATAGTTAAGTCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=20240751;WS=20240733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr13	20247171	.	A	G	86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=17;MQ=53.48;NF=5;NR=0;PP=86;QD=24.1542425094;SC=CTCCAGCCTGAGTGACAGAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=20247179;WS=20247161;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	20247226	.	CG	C	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=50;MMLQ=20;MQ=58.14;NF=2;NR=5;PP=24;QD=10.4329856957;SC=GGAACCTATACGGTTTTTTTT;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=7;WE=20247247;WS=20247216;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr13	20251752	rs2290811	T	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.674;SC=GACCATTACATATCTTCATTA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=20251760;WS=20251742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	20251791	rs2290810	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.436;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr13	20277413	rs75085951	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-7.698;NF=24;NR=25;PP=617;ReadPosRankSum=0.543;SC=ACACCACTCATTGGTGCTTGA;SOR=0.324;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=49;WE=20277421;WS=20277403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr13	20325625	rs2340650	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.610;NF=4;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=0.277;SC=AACATTAAAACATACAGAAAT;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=12;WE=20325633;WS=20325615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr13	20356941	rs9508887	T	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCTAGATTTATAGACAGTGTG;SOR=0.437;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=11;WE=20356949;WS=20356931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr13	20398669	rs9508907	T	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=226;ReadPosRankSum=-2.029;SC=ATATAATCTGTGTTCTGCAGC;SOR=0.725;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=17;WE=20398677;WS=20398659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr13	20398742	rs9508908	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=-1.854;SC=CTATTGTTGACGTGCATTTCA;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=23;WE=20398750;WS=20398732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr13	20601004	rs7981272	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=24;SC=AACAGCTTTTTATTTTATATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=20601012;WS=20600994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	20608354	rs11272380	T	TTTTCTTGAGGTG	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=2967;SC=TTCTTAAGCTTGTCGTCATAT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=20608362;WS=20608344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	20657188	rs9509028	T	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=568;SC=GTAACAGATTTCTATTTTTAT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=20657196;WS=20657178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	20716411	rs11617415	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=414;ReadPosRankSum=-0.506;SC=AAGCCTTGAGCGCCGGGGGCT;SOR=0.904;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=32;WE=20716419;WS=20716401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr13	20716533	rs968566	G	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=33;PP=1248;SC=AGGGCTAGCAGTTTGAAGTCC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=58;WE=20716541;WS=20716523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	20762956	rs3751385	A	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=347;ReadPosRankSum=1.749;SC=GGGAAATGCTAGCGACTGAGC;SOR=0.998;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=19;WE=20762964;WS=20762946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr13	20978504	rs4638418	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=0.121;SC=GCAATAAACCCTCAATGAACA;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=7;WE=20978512;WS=20978494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr13	20978958	rs67871298	CAG	C	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=116;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GAAATGCATTCAGAGAGTTTC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=20978967;WS=20978948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr13	21005941	rs4578496	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=1.201;SC=AGTGGGCCACATAGGTTATTA;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=21005949;WS=21005931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr13	21005987	rs4614565	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGGAGAGAAGCCTGTCATCGT;SOR=0.330;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=21005995;WS=21005977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr13	21006475	rs7983215	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=1023;SC=AAGGAGATGATCCTGGGTTTG;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=21006483;WS=21006465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr13	21086599	rs7139733	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=1.006;SC=TTTCCAGGGCGTTCCTTATCT;SOR=0.340;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=18;WE=21086607;WS=21086589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr13	21099828	rs9315667	A	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.202;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr13	21148408	rs4326897	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	21156999	rs9509289	G	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=507;SC=CAATAGATGAGTTATAGAGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=21157007;WS=21156989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	21157257	rs35700311	GA	G	440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=436;SC=TAGTGTTAAAGATTATAACCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=21157265;WS=21157247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	21205124	rs35290473	TG	T	2842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=38;PP=2009;SC=CATATTACAGTGGTAGTAACC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=21205132;WS=21205114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	21205140	rs1329519	A	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=40;PP=1339;SC=TAACCTTCAGATATTCCATTT;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=21205148;WS=21205130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	21205192	rs9509307	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=771;SC=AAAAAGGACAGTAGAGTGAAA;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=21205200;WS=21205182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	21358061	rs17318617	A	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=565;SC=TATTCAGCCTATTGAAGAGAT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=21358069;WS=21358051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	21361513	rs4146442	T	C	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=359;SC=ATGGTTTCCTTGCCCCCGAAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=21361521;WS=21361503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	21416945	rs2762995	G	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=521;SC=TATGTTTTATGAAAGCTGCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=21416953;WS=21416935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	21442945	rs9509410	G	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=244;SC=CTTTTGGGGGGCAAGAGGAAC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=21442953;WS=21442935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	21476997	rs7326480	A	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=196;SC=CGCTGTCGACACCGGCGTCGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=21477005;WS=21476987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	21562832	rs2770928	C	T	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=32;PP=1451;SC=GAGGTGCTGCCCAATTCATAC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=21562840;WS=21562822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	21562948	rs558614	G	A	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=37;PP=1333;SC=CTGGTGGGCCGCGGGACCGGC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=21562956;WS=21562938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	21721220	rs3742222	G	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=199;SC=AATTTTGGAAGTGTGTTATAA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=21721228;WS=21721210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	21729226	rs17345383	C	T	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=828;ReadPosRankSum=1.341;SC=ATGTTAAAATCGGTCCAGCTC;SOR=0.478;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=52;WE=21729234;WS=21729216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,56:0.78:72
chr13	21729952	.	TA	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.570;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=91;ReadPosRankSum=1.642;SC=TGATAAAAGCTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=21729960;WS=21729942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr13	21732094	rs4770121	C	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=8;PP=544;SC=TAGTTACTTCCGGAGGTGTAG;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=21732102;WS=21732084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	21732175	rs17279819	G	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=222;ReadPosRankSum=1.400;SC=CAAAGCATGTGTCTGAATTTA;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=16;WE=21732183;WS=21732165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr13	21732193	rs17345571	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=1.299;SC=TTAAAACCAACGAAGTACGAT;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=14;WE=21732201;WS=21732183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr13	21735998	rs17345690	T	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=260;ReadPosRankSum=1.194;SC=CTGGATTCTGTATCTATGGCC;SOR=1.053;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=20;WE=21736006;WS=21735988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr13	21736133	rs4561294	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=CTTTATGGTACAGAAGTCCCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=21736141;WS=21736123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	21746453	rs2026600	T	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=7;PP=324;SC=CTAAAACAAATGCTATAAAAT;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=21746461;WS=21746443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	21751005	rs9550717	G	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=1.029;SC=CTCCAGGTCCGGCCGCGCCAG;SOR=1.685;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=17;WE=21751013;WS=21750995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr13	21951016	rs9509669	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=55;SC=TTTTAAAAGGAAGAATCTTAC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=21951024;WS=21951006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	21976837	rs9506668	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=428;ReadPosRankSum=1.425;SC=TGAAGTGTTCTTGTCAAGTGT;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=29;WE=21976845;WS=21976827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr13	22033463	rs149977193	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	22096611	rs1359190	T	G	95.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CATTATCATTTTGCAGATATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=22096619;WS=22096601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr13	22096843	rs1200028	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=12;PP=324;SC=TTAGAATATATAGAGACATTA;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=22096851;WS=22096833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	22140911	rs66467009	TA	T	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr13	22178308	rs2761924	G	A	211.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=6;PP=155;SC=GCGCAGCTAGGCGGCGCTTCT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=22178316;WS=22178298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	22275394	rs9509841	A	G	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=46;PP=2445;SC=ATACGTACTCATCAAACCTAT;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=126;WE=22275402;WS=22275384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr13	22275583	rs9509842	G	A	4819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=90;PP=2965;SC=GACAAAGACAGTTTCTTCACT;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=141;WE=22275591;WS=22275573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr13	23251016	rs35856253	CT	C	518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.26;NF=2;NR=12;PP=500;SC=AATCCCAGCACTTTTGGGAGG;SOR=1.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=23251024;WS=23251006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	23253313	rs9506904	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=415;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GTGAGAAGACTATGCACGGTA;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=29;WE=23253321;WS=23253303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr13	23279254	rs314874	G	A	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=42;PP=2017;SC=AAGAGAAGTTGTCGACAGATT;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=98;WE=23279262;WS=23279244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	23279279	rs314873	T	C	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=48;PP=2521;SC=CAGAGGCCATTGAAGATTTTA;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=118;WE=23279287;WS=23279269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr13	23853734	rs141669762	GTTGCATTTTCTCCA	G	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=1252;ReadPosRankSum=-2.021;SC=GTTTGAATGTGTTGCATTTTC;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=23853755;WS=23853724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr13	23894744	rs1536725	T	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=13.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.93;ReadPosRankSum=3.226;SOR=1.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr13	23894746	rs1536726	T	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=13.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.26;ReadPosRankSum=2.999;SOR=1.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr13	23894748	rs1536727	T	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=12.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.41;ReadPosRankSum=2.507;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr13	23894750	rs1536728	T	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=11.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.43;ReadPosRankSum=2.999;SOR=1.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr13	23894752	rs1536729	T	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.30;ReadPosRankSum=2.668;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr13	23898454	rs9510700	C	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=449;SC=GGATTTGCTGCTGACCAGGGT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=23898462;WS=23898444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	23898509	rs1800353	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr13	23898664	rs1800354	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=381;SC=CAGGAGCACAACCACATCTGC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=23898672;WS=23898654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	23907677	rs2737701	C	T	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=28;PP=1375;SC=ATGATGATGACTGTGTCCATT;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=23907685;WS=23907667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	23908034	rs2737700	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=563;ReadPosRankSum=1.157;SC=GAATACAGCCAGCTTTCATTA;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=47;WE=23908042;WS=23908024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr13	23929095	rs1536365	T	C	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1494;ReadPosRankSum=-2.085;SC=GCTCGCTGAATAGAGGCTCTA;SOR=0.884;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=81;WE=23929103;WS=23929085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,93:0.58:161
chr13	23930055	rs2031640	A	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=718;ReadPosRankSum=0.320;SC=CATCTTTGAGATTCCAACATT;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=38;WE=23930063;WS=23930045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr13	24234369	rs3751366	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.12;ReadPosRankSum=2.137;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr13	24234375	rs3751365	A	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr13	24234517	rs3751364	A	G	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=31;PP=1142;SC=CTCTGCGGTCACAGGACATTC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=24234525;WS=24234507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	24242801	rs7329483	A	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=9;PP=534;SC=CCCCATCAAAAACTTTAAGTT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=24242809;WS=24242791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	24243200	rs3751363	T	C	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=754;SC=AGGAGAGTGGTGCTGTCATCC;SOR=2.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=24243208;WS=24243190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	24321711	rs12866705	T	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=17;PP=511;SC=GCTGAGAGACTGAACAAGTGT;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=24321719;WS=24321701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	24411772	rs7333040	T	C	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=33;PP=1437;SC=TCCATCATGCTAGGAGTTAGC;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=24411780;WS=24411762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	24415443	rs2274344	T	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=434;SC=GGTAAATGCCTGCAACTGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=24415451;WS=24415433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	24436230	rs1886972	C	T	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=108;SC=TAAAATATGTCGACTCCTCAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=24436238;WS=24436220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	24463618	rs2077440	C	G	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=5;PP=106;SC=GGCACGTTGTCGTCCAGAGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=24463626;WS=24463608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	24465307	rs3814794	G	A	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=492;SC=TAACTTTTCCGTTTTCACCTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=24465315;WS=24465297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	24465717	rs3864970	A	G	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.49;QD=30.09;SOR=2.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	24465743	rs3864971	A	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.58;QD=31.60;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	24468539	rs139605562	AC	GT	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=405;SC=GGGATAAGTGACCTAAGAAAT;SOR=2.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=24468548;WS=24468529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	24468568	rs12866374	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=348;SC=TGACTTCCCAAGCGCCCATCT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=24468576;WS=24468558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	24468643	rs150835167	CTG	C	2641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=1700;SC=TGGGGACTGACTGTCACAATT;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=24468652;WS=24468633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	24468704	rs78881146	G	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=32;PP=1062;SC=CTGAATGTTGGAGGTGCGAGG;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=24468712;WS=24468694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	24468832	rs78017736	G	A	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=55.56;NF=1;NR=6;PP=137;SC=CAAGATAGAAGAGAGAGTTCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=24468840;WS=24468822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	24470913	rs7317337	T	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=325;SC=GAGATGAAAGTAATGAAGAGA;SOR=2.147;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=24470921;WS=24470903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	24471039	rs66990269	T	G	1885.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=9.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.87;MQRankSum=-1.015;QD=37.72;ReadPosRankSum=0.729;SOR=1.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,46:0.92:50
chr13	24471048	rs35159134	C	T	1916.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=8.551;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.26;MQRankSum=0.945;QD=38.34;ReadPosRankSum=0.478;SOR=1.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr13	24471232	rs9510930	A	G	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=298;SC=TGGGAAATGGATGAGCTGTCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=24471240;WS=24471222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	24797913	rs1220546	C	T	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CGGCCCATGACGCACGGGTAC;SOR=0.698;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=78;WE=24797921;WS=24797903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr13	24798120	rs1220547	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=728;ReadPosRankSum=-1.109;SC=GCCTGAGACTTCAGGCACACA;SOR=0.826;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=40;WE=24798128;WS=24798110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr13	24852765	rs148559364	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=38;SC=GCTTTCATGTATCATCATTCC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=24852773;WS=24852755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	24860240	rs9507300	A	G	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=59;SC=TGCCACCAGCATATCCAAGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=24860248;WS=24860235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	24868752	rs34017703	TA	T	1227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=977;SC=AAACAGTGGCTAATGACGTAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=25;WE=24868760;WS=24868742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	24869025	rs7993660	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=555;SC=AAAGCACCCCACATGATCCCA;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=24869033;WS=24869015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	24869048	rs9553233	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=381;SC=CCACTCGCCCTTCCCGCACCT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=24869070;WS=24869038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	24869062	rs9553234	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=278;SC=CGCACCTTTGATCTGGTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=24869070;WS=24869038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	24890337	rs9511193	C	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-2.277;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr13	24890337	.	CAA	GAG	180	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=55.36;NF=1;NR=5;PP=180;QD=38.911312477;SC=GGCTGCCTTTCAACTTCTCTC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=6;WE=24890347;WS=24890327;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr13	24890339	rs9511194	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-2.739;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr13	24892820	rs3864972	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.681;NF=10;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.505;SC=CACCTGCGCTTGTGTGGAGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=10;WE=24892828;WS=24892810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr13	24892841	rs9580939	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.646;NF=11;NR=2;PP=159;ReadPosRankSum=0.145;SC=CAGAGTGCCCGTCAGGGCGGG;SOR=1.387;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=13;WE=24892849;WS=24892831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr13	24893135	rs111305106	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.810;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CACAGTTCTTACTCTCCAGAC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=24893143;WS=24893125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr13	24895559	rs3751357	A	G	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.42;QD=27.72;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	24895684	rs2862239	A	G	5884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=107;PP=2965;SC=TTTTCTCCAGAAATGTTCAGG;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=88;TCR=107;TR=194;WE=24895692;WS=24895674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr13	25008588	rs1372085	A	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=10;PP=571;SC=CCAGTGTTGTATGCACACTAT;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=25008596;WS=25008578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	25008630	rs1822135	A	G	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=751;SC=CAGAAAGCACAGGATACTGTC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=25008638;WS=25008620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	25008903	rs9318536	G	T	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.48;QD=29.53;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	25009099	rs9511259	A	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=768;SC=CAATAGGGTGAAGAAGGTGGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=25009107;WS=25009089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	25016230	rs9511267	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=134;SC=GAGCTTGTGCCGTGGGCCACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=25016238;WS=25016220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	25016589	rs73172117	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr13	25016598	rs3816225	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr13	25016687	rs4770683	C	T	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=453;SC=TGTGGAAATACAAATAAAATA;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=25016695;WS=25016677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	25020757	rs9511273	T	C	354.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=203;SC=GAGCATTATATATGGAAATAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=25020765;WS=25020747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	25020782	rs9318553	C	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=264;SC=TCATAACTTTCAAACAATGGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=25020790;WS=25020772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	25020863	rs9318554	G	A	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=13;PP=397;SC=ACCATTGTACGAAATTCTTTC;SOR=0.906;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=25020871;WS=25020853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	25020910	rs9507346	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.04;NF=6;NR=12;PP=341;SC=CTGAAATGGGGAAAAAAATAA;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=25020918;WS=25020900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	25021144	rs78060735	GTCT	G	1515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=14;PP=1011;SC=CAAACTCTGCGTCTTCTTACC;SOR=1.085;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=21;WE=25021162;WS=25021134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	25021154	rs61947037	C	T	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=15;PP=756;SC=GTCTTCTTACCTGTGTGCAGT;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=32;WE=25021162;WS=25021134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	25021200	rs9318558	A	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=20;PP=900;SC=TCGATCATTGAGAAACAAGGA;SOR=1.005;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=25021219;WS=25021190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	25021211	rs7333856	C	T	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.502;NF=19;NR=21;PP=618;ReadPosRankSum=1.068;SC=GAAACAAGGACGGCACCTGGG;SOR=0.115;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=40;WE=25021219;WS=25021190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr13	25021245	rs7334587	A	G	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.179;NF=15;NR=19;PP=491;ReadPosRankSum=0.518;SC=GGCCTCGGGCACATCTGGATT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=34;WE=25021253;WS=25021235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,36:0.82:44
chr13	25021263	rs77269056	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQRankSum=-0.593;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr13	25021323	rs73172125	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.683;NF=2;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=1.138;SC=TTGGTCTTCTATCTATTTATA;SOR=0.465;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=9;WE=25021331;WS=25021313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr13	25027744	rs4770684	A	G	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=61;PP=2211;SC=CTCTGCTGCCATGGTATTGCT;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=127;WE=25027752;WS=25027734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr13	25029218	rs2275660	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=580;SC=GCATGCAAGGCGATTTGCTTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=25029226;WS=25029208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	25043029	rs4770694	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.76;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	25043033	rs4770695	C	G	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.33;QD=32.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	25049812	rs8001930	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.67;NF=0;NR=5;PP=112;SC=TATTCCTTCTTCAAGCCTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=25049820;WS=25049802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25052261	rs4770696	C	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=12;PP=691;SC=AGGCTGTTTGCGAAACTCCAT;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=25052269;WS=25052251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	25052420	rs17080653	T	A	806.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=5.917;NF=11;NR=18;PP=596;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TTGTACTACATGCGAAAGGAA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=29;WE=25052428;WS=25052410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr13	25059023	rs4769362	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=57.63;NF=0;NR=7;PP=189;SC=TGGTTGTTTCCGGAAACACAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=25059031;WS=25059013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	25065008	rs1361577	A	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=570;SC=ATCACCACATATCAAAATTAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=25065016;WS=25064998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	25068620	rs2862906	G	C	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	25068808	rs9318600	A	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=88;ReadPosRankSum=0.771;SC=GTAATTTTCAAAGTATTCACT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=8;WE=25068816;WS=25068798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr13	25068934	rs4770700	G	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=254;SC=AAATAAAGCAGTAGGTCCTTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=25068942;WS=25068924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	25072181	rs17470243	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=498;ReadPosRankSum=0.502;SC=AGGTTGGGAGGTCGGCTGATT;SOR=0.429;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=35;WE=25072189;WS=25072171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr13	25072200	rs1965154	T	A,C	1575.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=17,7;NR=17,13;PP=525,195;SC=TTCATTGAAATGAGTTATGAA;SOR=0.880;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=34,20;WE=25072208;WS=25072190;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:68
chr13	25074408	rs9581088	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.454;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=423;ReadPosRankSum=0.150;SC=TACACAAGATTTTACAAACTC;SOR=0.122;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=26;WE=25074416;WS=25074398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr13	25074490	rs9578751	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=789;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CTCTGTGGCACTGTCCGGGCA;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=51;WE=25074498;WS=25074480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr13	25074568	rs73154379	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=601;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CAAAGACTTACTATAATTAGT;SOR=0.732;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=31;WE=25074576;WS=25074558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr13	25075694	rs9581089	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=666;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CAATTCTCTGCCTATGGTATC;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=35;WE=25075702;WS=25075684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,37:0.82:45
chr13	25075720	rs9578753	C	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=819;ReadPosRankSum=2.005;SC=CAAACCCAAGCGTGTACTATG;SOR=0.903;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=47;WE=25075728;WS=25075710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,50:0.74:68
chr13	25075859	rs1539096	C	T	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=56;PP=1721;SC=GTCTCTTTTCCCTGATAGATT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=25075867;WS=25075849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr13	25078073	rs2012359	C	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GAATAATATCCTAGCTTGCAA;SOR=0.293;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=6;WE=25078081;WS=25078063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr13	25280753	rs2289905	C	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=102;SC=TCCAACCTCTCAGGTGGGCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=25280761;WS=25280743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25283657	rs2289910	G	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=377;SC=CCCATCACACGAGGGCCTGCC;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=25283665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	25283744	rs7318859	G	A	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=3;PP=255;SC=GAGGGAGGGGGAACCGAGAGT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=25283752;WS=25283734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	25338586	rs9578783	A	G	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=77;SC=TGGTGTCACCAGAAACTGCGT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=25338594;WS=25338576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	25353939	.	A	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-0.603;SC=GTCCTCTTTAAGTGTGTACAT;SOR=0.502;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=31;WE=25353947;WS=25353929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr13	25356007	rs368663578	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5727;FS=2.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=1.519;SC=CAGAAGCAAACGATAGAGGAA;SOR=2.066;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=25356015;WS=25355997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr13	25356053	rs9707144	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=1.715;SC=AGAAACAGTTTGACCAACTTT;SOR=1.584;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=8;WE=25356061;WS=25356043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr13	25363776	rs6490979	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=225;SC=TGATTTTTGTCTAGAGAACAT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=25363784;WS=25363766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	25367301	rs1158061	C	T	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1210;ReadPosRankSum=0.549;SC=CATGTCTGTCCTAACCAGTGA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=70;WE=25367309;WS=25367291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr13	25370255	rs1446294	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=349;SC=TATTAATGTGACTTAAACATT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=25370263;WS=25370245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	25376420	rs1026014	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=21;SC=TCAGTTTGTTCGCAGTTGCGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=25376428;WS=25376411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	25378476	rs9511451	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr13	25399752	rs2121253	A	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=570;SC=CCCTTTATTTACTAGATAGAG;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=25399760;WS=25399742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	25400338	rs12869348	A	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.053;SC=AGTTTTCTCGATATATTTTTT;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=25400346;WS=25400328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr13	25404743	rs4769382	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=262;SC=AGAAGGTAATTTATTTATTAT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=25404751;WS=25404733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	25417795	rs34260997	TATC	T	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=0.319;SC=GTCATATAAGTATCATCACAG;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=25417805;WS=25417785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr13	25418996	rs9511472	T	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=189;ReadPosRankSum=0.993;SC=ATTTTGTATTTTTTTCCCTGG;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=12;WE=25419004;WS=25418986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr13	25419176	rs6490984	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=15;PP=413;SC=ATCTAAAGACAATGGGAAGAC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=25419184;WS=25419166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	25424369	rs9511476	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.473;SC=TTTACTACATATAGTTGGTTC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=25424377;WS=25424359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	25440318	rs9507425	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=148;ReadPosRankSum=-1.951;SC=GTATGAAGAGGAACAATGGGA;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=9;WE=25440326;WS=25440308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr13	25442631	rs113369387	A	G	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=22.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25442631	.	A	AG	130	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=26;MQ=65.02;NF=5;NR=0;PP=130;QD=26.6;SC=AAAAAAAAAAACTTGCTTTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=25442639;WS=25442621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25442921	rs2275938	A	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=339;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TAAACACTATAAGTGACTCTT;SOR=1.508;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=16;WE=25442929;WS=25442911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr13	25444934	rs2305368	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.369;SC=GATTTTGTTTCAATGGGCTGA;SOR=0.495;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=4;WE=25444942;WS=25444924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr13	25448120	rs8001764	G	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=78;SC=GGTTGATTCCGTATCTTGGCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=25448128;WS=25448110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25451097	rs9553460	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=266;ReadPosRankSum=-0.941;SC=AGTTTCAGCCGGAAGAGAATT;SOR=0.565;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=21;WE=25451105;WS=25451087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr13	25457207	rs9318911	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=336;SC=TTTTAGAATCTAATCTTTTCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=25457215;WS=25457197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	25458232	rs34991318	AGTT	A	1815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=1313;ReadPosRankSum=0.049;SC=CTGTTTAAAAAGTTGTTACAG;SOR=0.954;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=33;WE=25458242;WS=25458222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr13	25458267	rs3831371	G	GAATT	2246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=1855;ReadPosRankSum=0.717;SC=AGGAAGGGAAGAATTTAATGA;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=35;WE=25458275;WS=25458257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,57:0.72:79
chr13	25458650	rs1530876	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=497;SC=CCTGACGAAAGTATGGCTAAT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=25458658;WS=25458640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	25459657	rs3742164	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=250;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TTTTTTACACGTGGTTTAGAA;SOR=0.275;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=13;WE=25459665;WS=25459647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr13	25459713	rs34888101	G	GTT	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.425;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=264;ReadPosRankSum=-1.406;SC=AGTAATGTATGTTTGAAGAAT;SOR=0.895;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=7;WE=25459721;WS=25459703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr13	25460428	rs9511502	A	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=1213;SC=AAAGTGTAACAGAGCTGGATG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=25460436;WS=25460418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	25466774	rs9318917	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=369;SC=CCCGCCTCCCTGCCTACCGCA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=17;WE=25466782;WS=25466764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	25466955	rs3742165	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=506;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ACCATTTGGTTTCCTTTCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=29;WE=25466963;WS=25466945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr13	25479541	rs17402892	A	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=357;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TGTGAATCTGACTTTGGTTTT;SOR=0.442;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=25;WE=25479549;WS=25479531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr13	25486287	rs2290276	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	25486911	rs9511510	G	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=260;ReadPosRankSum=-2.228;SC=GGTTTGTAAGGGTTGTTTGAC;SOR=0.899;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=25;WE=25486919;WS=25486901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,28:0.28:100
chr13	25670676	rs117014540	G	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=836;ReadPosRankSum=0.521;SC=TAATAATAAAGCACTGTATGA;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=46;WE=25670684;WS=25670666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr13	25670851	rs75475407	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-6.990;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=1.216;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,9:0.12:78
chr13	25670868	rs200859889	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-7.941;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,14:0.15:93
chr13	25670873	rs77142265	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-7.987;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,14:0.15:94
chr13	25670877	rs112107735	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-8.032;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,14:0.15:95
chr13	25670907	rs76264750	C	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.690;NF=17;NR=16;PP=998;ReadPosRankSum=-0.436;SC=AAAAGAGTTCCCCAATGTTTA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=33;WE=25670927;WS=25670897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,26:0.22:117
chr13	25670919	rs76861216	A	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.162;NF=19;NR=15;PP=998;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CAATGTTTACATCAAGAATTT;SOR=1.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=34;WE=25670927;WS=25670897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,33:0.26:126
chr13	25670953	rs74040928	G	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-11.064;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,37:0.28:132
chr13	25670953	.	GCC	ACT	1211	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=56.61;NF=17;NR=16;PP=1211;QD=38.3172083292;SC=GATGATGAGCGCCTTAAGGAT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=33;WE=25670963;WS=25670943;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:86,33:0.28:119
chr13	25670955	rs79397892	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=3.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-11.156;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,37:0.28:134
chr13	25670978	.	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=5.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-11.186;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.527;SOR=1.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,39:0.29:135
chr13	25670981	rs77476965	G	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-11.405;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.565;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,40:0.29:140
chr13	25670984	rs11619791	C	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=4.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-11.217;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.065;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr13	25670988	rs74564616	T	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=3.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-11.217;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.767;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr13	25671008	rs76447065	C	T	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-10.203;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,47:0.31:150
chr13	25671015	rs75314628	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-9.739;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,43:0.29:150
chr13	25671027	rs78826513	A	G	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.266;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.960;NF=19;NR=19;PP=1841;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TGGAAAATCCAAAGGATTTGG;SOR=0.421;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=38;WE=25671035;WS=25670998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,44:0.29:154
chr13	25671062	rs78534836	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-8.788;QD=0.82;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,24:0.15:156
chr13	25671080	rs76241879	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=10.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-7.249;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.463;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,26:0.15:171
chr13	25671089	rs75281454	G	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=10.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-7.893;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,28:0.16:178
chr13	25671097	rs140090397	A	AT	639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=9.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-8.213;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.658;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,28:0.15:191
chr13	25671143	rs78671990	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-10.292;QD=1.48;ReadPosRankSum=-3.821;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,23:0.11:216
chr13	25671149	rs368285293	ACGG	A	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-10.320;QD=1.82;ReadPosRankSum=-4.941;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,24:0.11:227
chr13	25671154	rs371971190	AGACGGAACT	A	551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=2.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-10.289;QD=2.42;ReadPosRankSum=-3.259;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,28:0.12:228
chr13	25671168	rs78552667	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=3.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-9.699;QD=2.94;ReadPosRankSum=-2.578;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,30:0.14:220
chr13	25671172	rs79593984	C	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-9.626;QD=3.07;ReadPosRankSum=-2.116;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,30:0.14:217
chr13	25671200	rs76111404	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-10.026;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.069;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,41:0.19:220
chr13	25671206	rs76614854	A	G	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=6.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-10.368;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,42:0.18:229
chr13	25671210	rs80062522	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=9.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-10.265;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.924;SOR=1.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,42:0.19:225
chr13	25671214	rs201081849	T	G	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=13.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-10.557;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.470;SOR=1.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,45:0.20:225
chr13	25671271	rs79246694	A	G	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=6.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-7.947;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.338;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,42:0.23:185
chr13	25671272	rs376589131	AG	A	1285.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-7.973;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.549;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,42:0.23:186
chr13	25671274	rs76994938	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=6.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-7.895;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,42:0.23:183
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chr13	25671369	rs76804900	G	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=12.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.83;MQRankSum=-1.968;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.592;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,36:0.21:171
chr13	25671398	rs77306665	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=20.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQRankSum=-3.389;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.240;SOR=1.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,30:0.18:163
chr13	25671429	rs77466429	G	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=29.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQRankSum=-4.930;QD=1.28;ReadPosRankSum=-2.271;SOR=3.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,19:0.12:152
chr13	25802491	rs4770813	A	G	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=191;SC=CTTGGTCCCCATCCTCAGGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=25802499;WS=25802481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	25825889	rs4312169	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=444;SC=TTCGATCAAATTGATGGTACA;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=25825897;WS=25825879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	25831888	rs7995033	T	C	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=47;PP=2152;SC=GCCAAGAAGATTGCAGCATCC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=109;WE=25831896;WS=25831878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr13	25848404	rs4387458	A	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=82;SC=CTTACATGCAACATTCTCAAT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=25848412;WS=25848394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25876011	rs11556093	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=695;ReadPosRankSum=0.150;SC=CGGAACGGGAGCGTCTAGGTA;SOR=0.661;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=48;WE=25876019;WS=25876001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr13	25886932	rs4341628	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=458;SC=TGAACTTTTAAGGATCCTTAT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=25886940;WS=25886922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	25893363	rs59567333	GTTTATA	G	368.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=308;SC=ATGCTTAACAGTTTATATTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=25893376;WS=25893353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	25901781	rs7997070	A	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	26043182	rs7317185	A	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.07;MQRankSum=-1.007;NF=26;NR=34;PP=744;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CGTCTGTTGGAGACCAGCTGG;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=60;WE=26043190;WS=26043172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr13	26104547	rs9581376	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.541;SC=TGTAAAATACGTAGCTAGTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=26104555;WS=26104537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	26107595	rs7319869	CT	TG	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.186;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr13	26107606	rs7319993	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr13	26108400	rs10492697	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=5.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr13	26125731	rs9581389	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=0.508;SC=GTGTCCCTGCTGTCCTTCTGT;SOR=0.069;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=26125739;WS=26125721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	26127821	rs9740054	G	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTGAACTCACGGTTCCTGACA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=26127829;WS=26127811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr13	26127890	rs12853449	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=1.794;SC=AATAGACTTTGGTTGTGAACA;SOR=0.686;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=17;WE=26127898;WS=26127880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr13	26128128	rs7331675	CA	AG	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=471;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTTAATTGAGCACTCAAAAAA;SOR=0.385;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=12;WE=26128137;WS=26128118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr13	26133009	rs12862551	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GAAATCTACCCGTTTCATACA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=26133017;WS=26133002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	26137989	rs12871941	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-1.286;SC=TGAATCCCTATAGGACTTTAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=26137997;WS=26137979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr13	26148966	rs6491066	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=279;ReadPosRankSum=0.073;SC=AACAAACATTCGGAATCCTTA;SOR=0.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=21;WE=26148974;WS=26148956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr13	26182773	rs68126613	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.872;SC=GGTGTCACCTATTCAATTCTC;SOR=0.596;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=13;WE=26182781;WS=26182763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr13	26182894	rs67280567	C	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.219;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr13	26273385	rs6491088	G	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=26;PP=1173;SC=ACGTGGCCCTGATCATCGATG;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=26273393;WS=26273375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	26273403	rs7335858	C	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr13	26273538	rs2296003	C	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=447;SC=GTATCCCGTGCTTATACAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=26273546;WS=26273528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	26402089	rs17585718	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=263;ReadPosRankSum=0.165;SC=TTTCTGTGATATCGGGAATCT;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=17;WE=26402097;WS=26402079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr13	26436641	rs2249800	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-1.008;SC=CTTACAGCCACGATGAGCTTC;SOR=0.804;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=26436649;WS=26436631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr13	26445247	rs145017510	GGT	G	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.772;NF=4;NR=7;PP=410;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TTGATTGAGTGGTTTTTTTTT;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=11;WE=26445256;WS=26445237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr13	26501227	rs1185907	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=10;PP=591;SC=TTCATTCATTCACCTTCTTCC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=26501235;WS=26501217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	26535625	rs9511998	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=338;SC=TTGTTTTTGTGTTGTGAAATA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=26535633;WS=26535615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	26586775	rs2274135	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=-1.315;SC=GTACCGCGGGCGGGGGCTGAT;SOR=1.473;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=26586783;WS=26586765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr13	26625047	rs4770911	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AGCGCAGCCAGCAGCAGCTGC;SOR=0.465;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=13;WE=26625055;WS=26625037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr13	26625135	rs4769452	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=1.106;SC=GGGCGCGGACAGCGCGTCTCC;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=13;WE=26625143;WS=26625125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr13	26625172	rs4770912	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr13	26974562	rs998692	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=-2.396;SC=AAGCAATACCGTCATGTTTGT;SOR=0.617;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=21;WE=26974570;WS=26974552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,23:0.26:87
chr13	27239161	rs977351	A	G	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=20;PP=1031;SC=ATTTTATTCTACAGGCAAACA;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=27239169;WS=27239151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	27250823	rs3764108	T	C	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=31;PP=958;SC=GTGTGTACCATGGAGCGTCTT;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=27250831;WS=27250813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	27256728	rs9507763	C	G	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=13;PP=623;SC=GACTATGTGCCTCATATCTCT;SOR=1.206;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=27256736;WS=27256718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	27334024	rs76476101	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TACAGCAGGGTGACAATCCAA;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=12;WE=27334032;WS=27334014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr13	27643597	rs9512534	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.623;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr13	27829310	rs3094293	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;PP=897;SC=AGAATACTTTGCAGTTACTTA;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=27829318;WS=27829300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	27830639	.	A	C	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=28;MQ=46.6;NF=2;NR=2;PP=130;QD=41.1928031368;SC=GCTGGAACCTATTCCCTATGA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=4;WE=27830671;WS=27830629;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr13	27997985	rs33932496	GC	G	799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=680;ReadPosRankSum=0.173;SC=TCTCAAAAGTGCTTCTCAGGT;SOR=0.930;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=19;WE=27997993;WS=27997975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr13	28009031	rs7323	G	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=900;ReadPosRankSum=-0.992;SC=AGAAAGGGATGTATGTCGCTG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=51;WE=28009039;WS=28009021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr13	28009920	rs1218825	G	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=440;SC=CATTTTTGCTGAAAGCACGAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=28009928;WS=28009910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	28143229	rs8002697	A	G	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=26;PP=1246;SC=CTCCATGTGGAAAGAGACGCT;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=28143237;WS=28143219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	28367061	rs1231058	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=23;PP=885;SC=CGCTGCCTCTACTCAAGGCTT;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=28367069;WS=28367051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	28498323	rs9805632	G	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	28519354	rs2504220	A	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=599;ReadPosRankSum=0.453;SC=ACATTGCCAGAGTCTTGGCGA;SOR=0.592;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=41;WE=28519362;WS=28519344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr13	28519377	rs7333200	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=853;ReadPosRankSum=1.038;SC=TGGCCCGACGCGCTCCGCTTT;SOR=1.061;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=48;WE=28519385;WS=28519367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,53:0.70:76
chr13	28537242	rs1805108	A	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=221;ReadPosRankSum=1.395;SC=CCGCTGCAGAACCCGGTGGGT;SOR=2.833;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=28537250;WS=28537232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr13	28537317	rs1805107	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=724;ReadPosRankSum=-0.712;SC=ACAGAGCCAGGCACTGAGGCT;SOR=1.007;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=42;WE=28537325;WS=28537307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr13	28537537	rs2504212	T	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=-0.084;SC=AAAAGCACATTGTGGTGAAGA;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=43;WE=28537545;WS=28537527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr13	28541583	rs2481967	T	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=-1.636;SC=AATTGGGGCATCAAGGAGCGA;SOR=0.674;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=15;WE=28541591;WS=28541573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr13	28552614	rs4463949	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=1.213;SC=AGACACCGGCGGGAGCGCGTC;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=13;WE=28552622;WS=28552604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr13	28562605	rs3897926	T	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=475;ReadPosRankSum=0.492;SC=CTTACCTGACTGTGCAAGGGC;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=34;WE=28562613;WS=28562595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr13	28589267	rs4073630	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	28589495	rs9579142	C	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=393;ReadPosRankSum=1.993;SC=GTGCCAGACACTGTTGCAGGC;SOR=1.508;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=12;WE=28589517;WS=28589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr13	28589509	rs9579143	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=393;ReadPosRankSum=0.571;SC=TGCAGGCACACGGGCTGCGGC;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=28589517;WS=28589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr13	28589662	rs4497507	C	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=7;NR=3;PP=213;SC=AGGGGTGGGGCGGCACCGAGA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=28589670;WS=28589652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	28597447	rs35829721	ATC	A	660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=569;ReadPosRankSum=1.059;SC=ATCTTTTCAAATCTTTTTTTT;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=14;WE=28597456;WS=28597437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr13	28602226	rs60462219	AAG	A	619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=6;PP=513;SC=AAGAATTAAAAAGAGAGAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=12;WE=28602235;WS=28602216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	28607916	rs2491222	T	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=395;SC=CCTTGAAACATGGCAAACAGT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=28607924;WS=28607912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	28607989	rs2491223	T	G	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=19;PP=1407;SC=CCCATTTTTGTGCATCTTTGT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=28607997;WS=28607979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	28609825	rs2491227	A	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1290;SC=AAAAAAAAATAGCAAAGAATT;SOR=3.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=28609833;WS=28609815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	28609846	rs2491228	A	T	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=883;SC=TAGACAGGTGAGCTGTCATCA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=28609854;WS=28609836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	28609991	rs2491229	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	28609997	rs2491230	T	C	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.84;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	28610183	rs2491231	A	G	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=755;SC=AGGTTTCCCTATAGAAAAGAA;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=28610191;WS=28610173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	28622356	rs2153000	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=0.377;SC=TCTCAAGGGCGACAAGCAAGG;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=25;WE=28622364;WS=28622346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,32:0.35:91
chr13	28623587	rs35602083	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=350;ReadPosRankSum=-1.387;SC=TATCCGGTGTCGTTTCTTGCC;SOR=0.889;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=23;WE=28623595;WS=28623577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr13	28623699	rs9507985	G	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=664;ReadPosRankSum=-1.347;SC=AACAGAGTTTGCATTTAATGT;SOR=1.075;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=34;WE=28623707;WS=28623689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr13	28623759	rs9513004	C	T	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=905;ReadPosRankSum=-0.848;SC=AGAATACAAACTTGTCCTATT;SOR=0.913;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=54;WE=28623767;WS=28623749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,59:0.61:97
chr13	28623938	rs67491524	G	GA	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=152;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TCCCAAGTGAGAAAAAAAAAG;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=28623946;WS=28623928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr13	28624294	rs1933437	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=0.163;SC=CCTTATGTCCGTCCCAAATAA;SOR=0.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=27;WE=28624302;WS=28624284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,32:0.29:109
chr13	28636084	rs7338903	G	A	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=28;PP=929;SC=TCCCTGGGGCGTCGACCAGCA;SOR=1.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=28636092;WS=28636074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	28644510	rs2387350	C	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=166;SC=AGATGTGAGGCCATAATATAC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=28644518;WS=28644500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	28674628	rs12872889	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CTGGCCGCCGTCGCGCGCCAA;SOR=1.236;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=5;WE=28674636;WS=28674618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr13	28834854	rs139094014	CT	C	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=61.07;MQRankSum=0.319;NF=0;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=-2.100;SC=GGAAACCTGTCTTTTAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=28834862;WS=28834844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	28835527	rs5802469	T	TC	1090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=714;SC=TATACTTATTTTGTTTCATAG;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=28835535;WS=28835517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	28882948	rs9579177	G	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=11;PP=396;SC=GGTCTATCGGGGTGCACTAGG;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=28882956;WS=28882938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	28883061	rs7993418	G	A	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=10;PP=326;SC=AAGCATTTACGTATCTAATGA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=28883069;WS=28883051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	28885672	rs4771238	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	28886113	rs7328692	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=261;SC=TTTTGATGTAAATAAATTTAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=28886121;WS=28886103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	28886388	rs61763562	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TTGGGTTTATAGCACCAGCAC;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=10;WE=28886396;WS=28886378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr13	28893484	rs2296188	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.842;SC=AAAGGCTGTCTAACCAAAGGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=28893492;WS=28893474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	28964325	rs7983774	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-0.589;SC=AGAATTGTTCGTGCACAAATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=28964333;WS=28964315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr13	28970917	rs7990486	C	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=452;SC=GAAATAACTCCTTACGAGATC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=28970925;WS=28970907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	28980150	rs5802481	A	AG	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=439;SC=TTTATGTGTGATCTTCTTTTC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=28980158;WS=28980140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	29236489	rs1340815	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=3;PP=383;SC=GACACAGCTGCCTGGGTGTGT;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=29236497;WS=29236479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	29238576	rs3737528	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=9;NR=13;PP=337;SC=TTTATAGATATGATTTTGAGC;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=29238584;WS=29238566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	29274977	rs3831478	T	TA	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-0.414;SC=ACATATTCTTTAAAGTGCCTC;SOR=0.799;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=29274985;WS=29274967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr13	29275102	rs947027	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=226;SC=CTCTATAAAATAAAGCATTAC;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=29275110;WS=29275092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	29275129	rs705423	C	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=6;PP=305;SC=TAGGTAAAATCATACATATTT;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=29275137;WS=29275119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	29674840	rs1536720	T	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=0.635;SC=TTCGAATTCATAATCTGTAGA;SOR=1.101;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=17;WE=29674848;WS=29674830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr13	29674855	rs1536719	A	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=338;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TGTAGAATTCATTATCTCATT;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=24;WE=29674863;WS=29674845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr13	29675131	rs3829381	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GGCAGGGTGGGGTGCCTTCAC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=29675139;WS=29675121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	29898768	rs928661	A	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=34;PP=1512;SC=AAAGATGCTCAGAAAGATCAA;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=29898776;WS=29898758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr13	29898881	rs928660	A	G	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.71;SOR=1.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	29898889	rs928659	G	C	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.77;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	30014373	rs7337496	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=438;SC=TTCACGTCTCCGTTGTTATAA;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=30014381;WS=30014363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	30071310	rs2258198	G	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=54;ReadPosRankSum=0.963;SC=GATCACAGCTGCCCAGGCTGT;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=6;WE=30071318;WS=30071300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr13	30072487	.	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=272;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GCTGGATTCGTGACATTGGTT;SOR=1.287;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=15;WE=30072495;WS=30072477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr13	30075114	rs882953	C	T	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=11;PP=1306;SC=TAAAGCATTGCGAACTGATGT;SOR=2.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=30075122;WS=30075104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	30077088	rs2482096	C	T	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=766;SC=GTTCAGTGTCCACTAGCATGA;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=30077096;WS=30077078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	30090404	rs2989592	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=542;SC=AGGAGGTGGCTTCAATCCATG;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=30090412;WS=30090394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	30091516	rs2490267	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=1004;SC=GCATCCACTGTTCTCCCCTAA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=30091524;WS=30091506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	30091714	rs2482089	G	A	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=22;PP=1299;SC=TCTTACCTATGAGGCTGGTTG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=30091722;WS=30091704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	30091819	rs2482090	G	C	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=55;PP=1829;SC=CTGGTAAAAAGCCCAGCTGGG;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=30091827;WS=30091809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr13	30097417	rs117900613	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=1.068;SC=CGGAAAGAGCGCAGAGGGAGC;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=17;WE=30097425;WS=30097407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr13	30098215	rs2776957	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=272;SC=CAAGCATTGGCTTGTTTGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=30098234;WS=30098205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	30098226	rs2776958	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=292;SC=TTGTTTGCCCAGGGTGCAGGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=30098234;WS=30098205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	30346188	rs2234416	A	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=436;ReadPosRankSum=0.817;SC=TAACATTTAAAACAAGCGAAT;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=26;WE=30346196;WS=30346178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr13	30346392	rs140223719	CTATAT	C	407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.495;NF=0;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=2.023;SC=TAAGGTACTACTATATTGTTT;SOR=0.929;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=10;WE=30346404;WS=30346382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr13	30351248	rs35681461	T	TA	1725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=12;PP=978;SC=AGGTAGGGCATAAGAATCAAC;SOR=1.519;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=23;WE=30351256;WS=30351238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	30351266	rs3818368	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=505;ReadPosRankSum=0.772;SC=AACATTATTCATACTCAAGAG;SOR=0.291;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=38;WE=30351274;WS=30351256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,50:0.74:68
chr13	30782915	rs143925753	CAT	C	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.922;NF=1;NR=21;PP=922;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AATTTTTGCACATGTTTTAAA;SOR=0.722;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=22;WE=30782924;WS=30782905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr13	30784437	rs75470540	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=598;ReadPosRankSum=0.407;SC=AAAATCACAGATCATTAAAAA;SOR=0.865;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=32;WE=30784445;WS=30784427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr13	30784566	rs11617724	A	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=663;ReadPosRankSum=0.838;SC=TCAGAAGCTCAGCTCTTCCTT;SOR=0.702;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=42;WE=30784574;WS=30784556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,60:0.63:95
chr13	30805627	rs202087	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.226;SC=TTCAAAAGACAAATTAAATGA;SOR=0.914;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=11;WE=30805635;WS=30805617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr13	31036681	rs1929606	A	G	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=19;PP=713;SC=TTACCTTTTCATATTTTTCCT;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=31036689;WS=31036671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	31204948	rs17608899	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=150;ReadPosRankSum=0.693;SC=GTGTAGTTTTTATCATTTTAT;SOR=1.214;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=31204956;WS=31204938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr13	31231513	rs7983138	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=378;ReadPosRankSum=0.557;SC=CTCCTTTGGTCGGTATTCAAT;SOR=0.201;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=26;WE=31231521;WS=31231503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr13	31231806	rs7984952	T	C	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=919;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CCAGTATCTTTAACATCGTGT;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=56;WE=31231814;WS=31231796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,68:0.55:123
chr13	31233063	rs3742302	G	A	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GATATTGCCAGTGAGTCTGCA;SOR=0.599;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=80;WE=31233071;WS=31233053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,96:0.60:159
chr13	31287979	rs147763360	G	GTA	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.466;NF=1;NR=24;PP=930;ReadPosRankSum=0.425;SC=ATCAGTGCTGGTGTGTGTGTG;SOR=2.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=25;WE=31287987;WS=31287968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr13	31309830	rs4769055	C	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=215;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AAGCCCTTCACTCAGGGAAGA;SOR=0.758;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=18;WE=31309838;WS=31309820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr13	31318020	rs4360791	G	A	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=327;SC=ACCAAACACAGTGTTCAGTAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=31318028;WS=31318010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	31318308	rs3803277	C	A	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=35;PP=977;SC=TGAGTCCTAACCCTGATGTTG;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=31318316;WS=31318298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	31480827	rs9531945	A	G	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=24;PP=951;SC=CGTGGTGGCCAGGCCCGGGGA;SOR=0.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=31480835;WS=31480817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	31531009	rs12857479	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=1020;SC=TGCTTTGATAGGACATTTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=31531017;WS=31530999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	31531195	rs6560988	T	C	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=24;PP=563;SC=CTTTTTTTCCTGGGTCATGTG;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=31531203;WS=31531185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	31725260	rs11556147	A	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=21;PP=744;SC=ATTCTGCACAAAAATGTTCCA;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=31725268;WS=31725250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	31725617	rs2146895	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=173;SC=CAACCGTTTCCTGTTAACATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=31725625;WS=31725607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	31725732	rs4941772	A	C	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=25;PP=1555;SC=CTGAGTTCCAATGTATGACTT;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=31725740;WS=31725722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	31728657	rs4943165	T	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	31728666	rs2274018	G	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.06;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	31729729	rs1047086	A	G	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=27;PP=968;SC=TGAAGGGGTCATTGAATGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=31729737;WS=31729719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	31729776	rs41292149	T	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=324;ReadPosRankSum=-0.948;SC=ACCGTATTGTTTGCATGAGTG;SOR=1.403;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=20;WE=31729784;WS=31729766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr13	31796969	rs2147515	G	C	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=23;PP=1283;SC=TCCAAGCTCCGTTTTTCAAAT;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=63;WE=31796977;WS=31796959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	31821148	rs117111131	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.169;SC=TCTTTGATCATTGTTTTCTCA;SOR=1.115;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=8;WE=31821156;WS=31821138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr13	31821240	rs9564692	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=0.969;SC=TACCGCAGTACGTTTGTTTAA;SOR=0.751;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=19;WE=31821248;WS=31821230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr13	31821256	rs9542307	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=275;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TTTAACTCACCTGTGAATTAC;SOR=0.559;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=22;WE=31821264;WS=31821246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr13	31821992	rs4943266	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=146;SC=TTTTGGTCAGTTTTTCTGTAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=31822000;WS=31821982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	31835268	rs34409451	AC	A	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.171;NF=1;NR=8;PP=326;ReadPosRankSum=0.232;SC=GTGTGCATCAACTTTAATTTC;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=31835276;WS=31835258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr13	31843598	rs1924817	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=299;SC=AGTTATGTAGATGAAGACAGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=31843606;WS=31843588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	31848535	rs912600	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=166;SC=ATATGGTTCAGCCTACTCTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=31848543;WS=31848525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	31850714	rs1028751	G	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=5;PP=341;SC=AAAACTTTATGCCGGAAATAT;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=31850722;WS=31850704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	31850989	rs4065552	G	A	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=101;SC=ATTCTTGAGTGTAAATTCAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=31850997;WS=31850979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	31891561	rs1041074	T	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=380;SC=TTTATTTATTTTATAAGTCAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=31891569;WS=31891551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	31891746	rs1041073	G	A	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=50;PP=1605;SC=TGACTCCGGCGAGCCTGTGTT;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=83;WE=31891754;WS=31891736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	31903834	rs1060709	G	T	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=110;SC=CCTAGCCTGCGCAGGGAATGA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=31903842;WS=31903824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	32340193	rs35564049	T	TA	456.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=0.183;SC=CATATTTATTTAAAAAAAATC;SOR=0.622;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=32340201;WS=32340183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr13	32349017	rs3848100	A	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=110;SC=AGACATACAAAGGTTCTCCTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=32349025;WS=32349007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	32360547	rs7325513	A	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=35;PP=1512;SC=CGATAACGGAACTATCACCTC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=32360555;WS=32360537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	32360691	rs140904878	T	TAA	335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=83;SC=CATCTAATGGTAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=32360699;WS=32360681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	32606069	rs424118	A	G	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=112;SC=TGGAGACAGAAAATCTCAACT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=32606077;WS=32606059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	32606087	rs433551	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=104;SC=ACTGGACACATATGTTTGTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=32606095;WS=32606077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	32606135	rs138481396	TC	T	80.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	32660137	rs423932	T	G	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=42;PP=1488;SC=AATACTTGAGTCCTACCCAGG;SOR=0.901;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=32660145;WS=32660127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	32676114	rs364995	A	G	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=39;NR=32;PP=1236;SC=AGCCATTGACAAAATCTCTGC;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=32676122;WS=32676104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	32698544	rs629265	T	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=443;SC=TACTTTTAGATAATATTTATT;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=32698552;WS=32698534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	32721615	rs2285330	C	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr13	32723799	rs204558	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=339;SC=ACCACCTGTTCGCTTGGTGCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=32723807;WS=32723789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	32731667	rs11409421	T	TA	77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=4;PP=74;SC=TAAAGATAGTTAAAAAAAAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=32731675;WS=32731657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	32758834	rs798971	A	G	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=29;PP=1019;SC=GACAGGTAGGATCAGAATTCT;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=32758842;WS=32758824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	32776253	rs2520704	A	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=252;ReadPosRankSum=-1.667;SC=ATTACCTAATAGCTGTTTATT;SOR=0.892;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=16;WE=32776261;WS=32776243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr13	32776306	rs2762035	A	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=235;ReadPosRankSum=0.264;SC=GTGGCTATGAAGAGTGAGAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=32776326;WS=32776296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr13	32776318	rs2762036	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=235;ReadPosRankSum=1.834;SC=AGTGAGAAAGTAACTATATAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=32776326;WS=32776296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr13	32776603	rs2428249	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=367;ReadPosRankSum=0.519;SC=GCGTGTCACTTGCCCTCTTGT;SOR=0.547;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=26;WE=32776611;WS=32776593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr13	32785086	rs798981	G	A	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=647;ReadPosRankSum=-0.359;SC=AGCAGACAGAGCCCGTGAACC;SOR=0.580;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=46;WE=32785094;WS=32785076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr13	32786416	rs798983	T	A	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTTTCTTCCATTCCCATCTAC;SOR=0.633;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=89;WE=32786424;WS=32786406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr13	32786614	rs798984	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CATAAATTTTACACGTACATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=32786622;WS=32786604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr13	32798225	rs9533917	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=62.13;MQRankSum=-0.842;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGCCAGCGAGACCCTGTCCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=32798243;WS=32798215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	32798235	rs5802638	T	TA	279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=195;SC=ACCCTGTCCCTAAAAAAAATT;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=32798243;WS=32798215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	32823882	rs2806630	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=587;SC=TTGAGTCCATGTGGCTGGGTC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=32823890;WS=32823872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	32825913	rs2806632	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=1005;SC=CATTCTGTCTATACGTTAAGT;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=32825921;WS=32825903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	32825941	rs2806633	C	A	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=26;PP=1477;SC=CCCTGTATGGCTAGTGGCTAG;SOR=1.408;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=32825949;WS=32825931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr13	32826186	rs2806634	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=1.237;SC=GGATTCAACTGTGAATGACAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=32826194;WS=32826176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr13	32828553	rs2157961	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=546;SC=TCTCTGTAAAAATAATCCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=32828561;WS=32828543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	32832149	rs2520686	T	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=18;PP=524;SC=TGCTAGTAGATGTTTTGCATC;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=32832157;WS=32832139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	32834538	rs5802640	C	CTATCT	557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=7;PP=317;SC=TCCTTTATTCCTAACAGAAAG;SOR=1.329;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=9;WE=32834546;WS=32834528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	32849316	rs71436473	C	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.447;SC=GAGATCGAGACCATCCTGGCT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=32849324;WS=32849306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr13	32852585	rs11617081	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=291;ReadPosRankSum=0.786;SC=CTATGTCTTTCCCTCTCTTTC;SOR=0.846;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=23;WE=32852593;WS=32852575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr13	32866221	rs6561216	A	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=56;SC=CCAGGTTCAAACGATTCTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=32866229;WS=32866211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	32906729	rs144848	A	C	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=44;PP=2528;SC=AAATGTAGCAAATCAGAAGCC;SOR=1.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=116;WE=32906737;WS=32906719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr13	32913055	rs206075	A	G	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=47;PP=1827;SC=AACCTACTCTATTGGGTTTTC;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=32913063;WS=32913045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	32915005	rs206076	G	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=18;PP=908;SC=GAACCAAAGTGTCACTTGTTG;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=32915013;WS=32914995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	32920844	rs206080	T	C	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=76;SC=ATTGAGCATCTGTTACATTCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=32920852;WS=32920834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	32929387	rs169547	T	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=22;PP=726;SC=AATCAAGCAGTAGCTGTAACT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=32929395;WS=32929377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	33052294	rs380627	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=291;SC=TCAATCTCAACGAAGAACTTG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=33052302;WS=33052284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	33101731	rs391612	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=379;SC=AGAAATAAACTATCAGAAATA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=33101739;WS=33101721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	33222831	rs2301389	G	A	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=186;SC=TACCATTTATGTTTGTTAAGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=33222839;WS=33222821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	33232334	rs7335546	G	A	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=3;PP=137;SC=TTTTCATTTAGCGTTCATAAT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=33232342;WS=33232324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	33232435	rs2301393	A	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=165;SC=AGAGCCCACAATTCAATAGGT;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=33232443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	33253136	rs11355777	GA	G	329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=236;SC=TTCATAGGGGGAAAAAAAACC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=33253144;WS=33253126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	33268573	rs561056	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	33309563	rs17516382	C	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=83;SC=ATAATACTTCCATTTGACTGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=33309571;WS=33309553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	33315186	rs2320469	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	33315189	rs2320470	G	T	129.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	33315206	rs733487	G	A	172.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=133;SC=TTTTTTTCTCGTTTATTTTTA;SOR=2.093;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=7;WE=33315214;WS=33315196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	33320054	rs4942867	A	G	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=461;SC=AATTAGATGTACAGAAGATTT;SOR=3.258;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=33320062;WS=33320044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	33332648	rs3752474	G	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=9;PP=753;SC=AAGTATCTGTGTTTTTAAAAA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=33332656;WS=33332638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	33333876	rs7988089	A	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=394;SC=CTTATTTTAGAGTGATTATTG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=33333884;WS=33333866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	33344241	rs112309957	AT	A	418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=5;PP=235;SC=ATAAATTGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.739;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=13;WE=33344249;WS=33344231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	33349341	rs3492	A	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.38;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	33590851	rs2772364	T	C	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=36;PP=1782;SC=CCATCTGGGATACGTTCACCC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=81;WE=33590859;WS=33590841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr13	33627829	rs570875	T	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=365;SC=TATAATCTGATTTGGGGATTC;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=33627837;WS=33627819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	33634983	rs564481	C	T	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=51;PP=1983;SC=AGGAAATGCACGTTACACATT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=33634991;WS=33634973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr13	33635463	rs648202	T	C	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=34;PP=1287;SC=AAGAGGTGGCTGAGAGAGTTT;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=69;WE=33635471;WS=33635453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	33635835	rs649964	T	C	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=1043;SC=TAATATCCAATGGAATCGATG;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=33635843;WS=33635825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	33635939	rs650439	T	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=16;PP=540;SC=TAGCTGCGGCTATCTCCTGAA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=33635947;WS=33635929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	33637913	.	C	CA	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5035;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=57.06;NF=1;NR=3;PP=39;QD=10.75;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=4;WE=33637921;WS=33637903;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,4:0.19:21
chr13	33686065	rs17518136	C	T	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=678;ReadPosRankSum=1.399;SC=GCAGATCCCACACCAACGAGC;SOR=0.960;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=44;WE=33686073;WS=33686055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,46:0.36:129
chr13	33701347	rs2764617	C	T	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=133;SC=GTAGGGTCCACTGCATCGAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=33701355;WS=33701337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	33703656	rs495680	T	C	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=858;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GGGAGTGAAATTCATGCATAC;SOR=0.726;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=57;WE=33703664;WS=33703646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,73:0.37:198
chr13	33713038	rs2858805	C	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=196;ReadPosRankSum=0.922;SC=GGGAGGGTAGCGGTGTTGTCA;SOR=0.663;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=16;WE=33713046;WS=33713028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr13	33739629	rs797232	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=1.054;SC=AGACCTTCAAGGTCTGTAAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=33739637;WS=33739619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr13	33741559	rs797229	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=340;ReadPosRankSum=1.161;SC=GCAAAAAGGCCGAGGGAAAAA;SOR=1.284;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=19;WE=33741567;WS=33741549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr13	34098232	rs1329344	A	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.558;SC=AACACTAGTTAATGCTAATGT;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=34098240;WS=34098222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr13	35618991	rs7996448	A	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=0;PP=279;SC=AGAGAGAGATAACAATGATAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=35618999;WS=35618981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	35630064	rs9530108	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=2.369;SC=ATATTCTTGTAGGGTTTTATG;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=35630072;WS=35630054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr13	35738430	rs9543506	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTGTTATTCTAATTGTCTAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=35738438;WS=35738420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr13	35745239	rs2120822	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=283;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TAAAGTAACCGAATTTGGTAA;SOR=0.380;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=18;WE=35745247;WS=35745229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr13	35806549	rs9565113	T	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.72;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	35864688	rs41292203	A	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	35926497	rs9565205	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-1.834;SC=AATAATTCATAGGTTAATTAT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=35926505;WS=35926487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	36141009	rs9544667	G	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=10;PP=692;SC=CATTTTGTGTGTACAAATTTT;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=36141017;WS=36140999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	36202269	rs11538677	A	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=548;ReadPosRankSum=-0.938;SC=GATCGACCTTATATTTGGCTA;SOR=0.703;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=43;WE=36202277;WS=36202259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,55:0.43:128
chr13	36220281	rs3818423	A	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CACCCGTTGAATTTTCTGGAC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=36220289;WS=36220271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr13	36224051	rs200267946	TACTGGG	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=254;SC=TAAAAAAGTGTACTGGGACTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=36224064;WS=36224041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr13	36367641	rs1926459	G	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.749;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
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chr13	36385031	rs2322807	G	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.306;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=706;ReadPosRankSum=-2.147;SC=CTGTGTACAGGGGGCCGTCTA;SOR=1.103;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=41;WE=36385039;WS=36385021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr13	36385199	rs3764060	T	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=138;ReadPosRankSum=0.648;SC=AAATTTAATGTATAGGAGGTA;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=36385207;WS=36385189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr13	36397031	rs3751346	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=0.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr13	36401746	rs9574698	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=269;ReadPosRankSum=-0.289;SC=ATCAATAAAGACTTACTTTCT;SOR=0.121;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=21;WE=36401754;WS=36401736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr13	36401838	rs35734430	A	G	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=962;ReadPosRankSum=1.044;SC=GAAGAACGATATTGGGATGCT;SOR=0.880;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=61;WE=36401846;WS=36401828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,68:0.67:101
chr13	36401909	rs9574699	T	C	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=32;PP=1065;SC=AAGGAAAAGTTATCTTCATCA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=36401917;WS=36401899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	36402475	rs2296646	G	A	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTTTTAAAATGAAACTTAACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=36402483;WS=36402465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr13	36443324	rs7986427	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=0.135;SC=AGCTGGACAAGCTCAGTTCTT;SOR=0.454;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=19;WE=36443332;WS=36443314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr13	36521433	rs1936004	T	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.788;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=376;ReadPosRankSum=0.310;SC=CTTGGCCTGGTGCAGCTCATT;SOR=1.376;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=27;WE=36521441;WS=36521423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr13	36521460	rs1936003	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=524;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AGCTGCCTCAAATTTCCCCTG;SOR=1.205;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=35;WE=36521468;WS=36521450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr13	36700349	.	TATA	T	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-1.231;QD=23.93;ReadPosRankSum=2.322;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr13	36700354	rs74044530	A	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=-1.348;QD=25.80;ReadPosRankSum=2.384;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr13	36700356	rs11438243	T	TG	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-1.231;QD=23.93;ReadPosRankSum=2.673;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr13	36745029	rs1328641	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=1.512;SC=CCTCACATTACAAATCTGTAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=36745037;WS=36745019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr13	36747798	rs1410633	C	G	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=142;SC=AGGTCCCCCTCTAAGTGGCAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=36747806;WS=36747788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	36788529	rs3762116	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CTCCCCAGGCCGGGCTTTGAG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=15;WE=36788537;WS=36788519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr13	36801256	rs9546784	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ATCTTTTCTGTACAATTTCCT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=36801264;WS=36801246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr13	36801415	rs9546785	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=329;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCTTTTTGTCCGAGGCATGTC;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=24;WE=36801423;WS=36801405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr13	36801579	rs9546786	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr13	36801587	rs9546787	T	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr13	36801612	.	T	TACACACAC	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr13	36805289	rs67328439	GA	G	468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.062;NF=12;NR=5;PP=248;ReadPosRankSum=0.244;SC=ATTATAAATGGAAAAAAAAAG;SOR=1.508;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=17;WE=36805297;WS=36805279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr13	36814682	rs9546834	A	G	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1566;ReadPosRankSum=0.128;SC=TCAGAAGGATACGCCCCTAAC;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=85;WE=36814690;WS=36814672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,105:0.68:155
chr13	36818037	rs9546862	A	G	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=726;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GTAATATTCAATGGAAAACCA;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=49;WE=36818045;WS=36818027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
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chr13	36822711	rs9315402	G	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=228;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CAAATGTAACGAATTAGAAAG;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=12;WE=36822719;WS=36822701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr13	36822849	rs9315403	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GTGTTTATCCCCTTGGTTCAT;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=15;WE=36822857;WS=36822839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr13	36822884	rs9315404	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=0.317;SC=ATAAGAGAGACAGTCAATTCT;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=36822892;WS=36822874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr13	36822908	rs9315405	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTAACTCTCCCATAACCAGGT;SOR=0.069;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=36822916;WS=36822898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	36827833	rs9546886	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.154;SC=AGAAACTTAACTCCAAAATCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=36827841;WS=36827823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr13	36827896	rs9546887	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=491;ReadPosRankSum=-0.728;SC=ACATAATTTACAGTAAGAAGA;SOR=1.106;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=31;WE=36827904;WS=36827886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr13	36828092	rs138966884	G	GTTTTGTAAGCA	1136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=2963;ReadPosRankSum=0.438;SC=GTAGGAAATAGTTTTGTGTTA;SOR=0.941;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=15;WE=36828100;WS=36828082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr13	36828237	rs9546897	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=342;ReadPosRankSum=0.708;SC=TTCAAGAGTCTTCTTTTCTTC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=16;WE=36828245;WS=36828227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr13	36829085	rs912928	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGGCACTTCCAGGTTCCTTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=36829093;WS=36829075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	36829209	rs1078302	C	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=550;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GTGGACATGGCGGTCATCCAG;SOR=0.394;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=32;WE=36829217;WS=36829199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr13	36829258	rs751518	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=988;ReadPosRankSum=-1.091;SC=GGGTCTTGCTGTGAAAACTGG;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=60;WE=36829266;WS=36829248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,70:0.66:106
chr13	36829301	rs751519	A	T	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GGCCAGTTCTAGGAACAACTT;SOR=0.766;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=67;WE=36829309;WS=36829291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,83:0.66:125
chr13	36871730	rs9547145	G	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=421;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TGAAGGCTCGGGGGGTGTGGA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=24;WE=36871738;WS=36871720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr13	36939758	rs3736920	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TGAAATATTTATCCAACTTTA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=36939766;WS=36939748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr13	36940028	rs1041140	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=492;SC=TACAGAGCCAGTCACCAAATC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=36940036;WS=36940018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	36942533	rs1056850	G	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=1.121;SC=AATAAAATACGCTCCAAAATT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=36942541;WS=36942523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr13	37007491	rs71438101	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=0.135;SC=GGACTACAGGAAAGTTGATTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=37007505;WS=37007481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr13	37007494	.	GTTGA	G	158	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=56.89;NF=0;NR=3;PP=158;QD=61.6666666667;SC=CTACAGGAAAGTTGATTGATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=37007505;WS=37007481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr13	37401917	rs11285105	GT	G	2250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=36;PP=1319;SC=CATCTACATGGTTTTTTATCT;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=42;WE=37401925;WS=37401907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	37439964	rs3748305	C	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.229;SC=ATGATTCCACCAGGAAACTTA;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=14;WE=37439972;WS=37439954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr13	37526560	rs6563506	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr13	37569200	rs2323165	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=118;ReadPosRankSum=0.171;SC=ATTAAAAATCACTTTTGAAAA;SOR=0.560;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=12;WE=37569208;WS=37569190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr13	37580139	rs1127446	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TGGCTAGCCAGTTCATTGCAG;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=19;WE=37580147;WS=37580129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr13	37581051	rs9576154	T	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AAGTCTAAGCTAATAGCATGT;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=8;WE=37581059;WS=37581041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr13	37583831	rs9469	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.828;SC=AGTGGTTGGCGTGCCTCTCTT;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=20;WE=37583839;WS=37583821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr13	37584838	rs7317750	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.713;SC=AAAGTTTGAAGGCTACCAGGG;SOR=1.381;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=8;WE=37584846;WS=37584828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr13	37593424	rs9566175	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-1.331;SC=ATACATTGTTTAGAAAAAAAG;SOR=0.075;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=37593432;WS=37593414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr13	37598113	rs4943441	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=501;SC=AAGCTGTCTTAAGAAACACTA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=37598121;WS=37598103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	37621528	rs1199983	A	G	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=4;PP=187;SC=CAGAGCTCTGAGTCAGCTACA;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=37621536;WS=37621518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	37625601	rs1543738	T	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=435;SC=AACACAAATTTGAACATACTG;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=37625609;WS=37625591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	37625770	rs5802853	A	AG	252.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=296;SC=GGCTATTAAGAGAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=37625778;WS=37625760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	37679268	rs9576175	G	T	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=47;PP=1785;SC=TCACTGCTACGTCCTCGCCGT;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=87;WE=37679276;WS=37679258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	37804353	rs1408229	A	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=620;ReadPosRankSum=-1.711;SC=ACCACAAGTAACAGAAGTGGC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=36;WE=37804361;WS=37804343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr13	38138730	rs4390468	C	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=497;SC=AGAAATACTTCGCAATTATGG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=38138738;WS=38138720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	38143325	rs58863577	CT	C	140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=61.53;NF=5;NR=1;PP=91;SC=TGGATGTTGTCTTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=38143333;WS=38143315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	38144114	rs4628831	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=197;ReadPosRankSum=0.938;SC=TTAGGTATTATATAAATGGAT;SOR=0.527;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=38144122;WS=38144104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr13	38152959	rs7322626	T	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	38153130	rs7322993	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=753;SC=AGACTTAGCCTATCAATGAGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=38153138;WS=38153120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	38153351	rs7323378	T	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=16;PP=555;SC=CATAAATTCATTCTAGACAAC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=38153359;WS=38153341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	38154161	rs73182687	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=0.218;SC=TATTTTGTCAGATTTAGATTT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=19;WE=38154169;WS=38154151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr13	38154189	rs7986347	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=859;SC=TTCACCTACAGTGCATGTAAT;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=38154197;WS=38154179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	38164445	rs1006416	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-0.337;SC=AAGTTAATAAGTCAGTTAAAA;SOR=0.948;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=12;WE=38164453;WS=38164435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr13	38166068	rs9547968	C	G	42.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr13	38166357	rs9603229	T	G	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=111;SC=GATACATTTTTACATAAATTT;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=38166365;WS=38166347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	38172867	rs17197663	G	A	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.812;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=833;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GAATCATCTTGAGTCTCTCCG;SOR=0.486;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=60;WE=38172875;WS=38172857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr13	38211313	rs75661457	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=380;ReadPosRankSum=-0.666;SC=ATCCTCGAGATTCCAGTTGAA;SOR=0.323;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=30;WE=38211321;WS=38211303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr13	38213053	rs73184537	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.712;SC=TCAGCTGAAAAATCAGAAGCC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=38213061;WS=38213043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr13	38225639	rs41292233	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	38237872	rs2985171	A	G	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=42;PP=1591;SC=CTGTACTGGAAAAAACAGAGA;SOR=1.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=38237880;WS=38237862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	38266000	rs7329237	G	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=284;SC=CTTTGGGGGTGAGGTTCTTGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=38266008;WS=38265990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	38320594	.	TA	T	29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9999;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=29;QD=11.6666666667;SC=AGGAGGCACCTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=38320602;WS=38320584;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	38357471	rs3904512	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=478;ReadPosRankSum=0.199;SC=ACTGAGCCATGTTTCATGCCA;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=32;WE=38357479;WS=38357461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr13	38357494	rs12583681	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CTATTTCTTCGTCTCTGAAAG;SOR=0.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=11;WE=38357502;WS=38357484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr13	38924083	rs2231330	A	T	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=24;PP=1314;SC=ACCGACTGCCATAATTCCTGG;SOR=1.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=38924091;WS=38924073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	38924263	rs2231332	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=40;PP=1688;SC=TGATCCGAGCTTTTCCAACAA;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=38924271;WS=38924253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	38930893	rs2481880	C	T	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=6;PP=369;SC=TCAAAAAATACGAGAAACACT;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=38930901;WS=38930883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	38931144	rs9548318	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=116;SC=CCACATTTCATTGATTTAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=38931152;WS=38931134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	38931650	rs34489703	G	GTT	220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=2;NR=3;PP=65;SC=ATAATACAGGGTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=38931658;WS=38931640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	38932545	.	G	GT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=61.53;NF=0;NR=3;PP=49;QD=19.3333333333;SC=TATTTAGCAAGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=38932553;WS=38932535;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr13	39262057	rs1868464	G	A	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=39;PP=1424;SC=TCGTGGAAGAGCTGCTGGGGA;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=39262065;WS=39262047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	39263023	rs12874397	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AGCTGGCAGCCGGCCAGGTGG;SOR=0.829;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=23;WE=39263031;WS=39263013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr13	39263714	rs2496423	T	C	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=80;PP=2965;SC=AGTGACTCAGTCCCCCACAGA;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=176;WE=39263722;WS=39263704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr13	39338612	rs2442370	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=324;SC=TTATTTCTGTTTTAAAATTTT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=39338620;WS=39338602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	39430314	rs9548509	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=441;ReadPosRankSum=-1.469;SC=ATCGAAGTTACCTTTGACGGG;SOR=0.561;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=32;WE=39430322;WS=39430304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr13	39433606	rs9532292	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=0.497;SC=AGATGGTCACACTGGACTCCA;SOR=0.865;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=22;WE=39433614;WS=39433596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr13	39438383	rs9566369	C	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ACTTGAAAGACTGTTAACAAT;SOR=1.360;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=13;WE=39438391;WS=39438373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr13	39452235	rs1540131	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TACCTTATCATATAACAGAAA;SOR=0.250;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=7;WE=39452243;WS=39452225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr13	39546530	rs8000175	C	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=382;SC=CAGGTCTCTGCGGGTACTCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=39546538;WS=39546520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	39564648	.	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.048;SC=CAAATGAAATCAGCATAAGCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=39564656;WS=39564642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr13	39618366	.	TTG	T	441	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=60.2;NF=0;NR=11;PP=441;QD=40.3636363636;SC=CTGAATATGTTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=11;WE=39618375;WS=39618356;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:26,11:0.30:37
chr13	39622075	rs9532318	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=18;PP=377;SC=GTTTCTTTCCTGGGAATATTT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=39622083;WS=39622065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	39952791	rs41286955	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=2.189;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	40229724	rs7327779	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.846;NF=12;NR=8;PP=281;ReadPosRankSum=-1.420;SC=CACGCTTCTGAGAGCCCAAGC;SOR=0.628;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=20;WE=40229732;WS=40229714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr13	40229842	rs67765306	A	AG	668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.419;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.345;NF=4;NR=12;PP=485;ReadPosRankSum=-1.988;SC=AGGTGGCAGCAGGGGGCGGGA;SOR=0.412;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=16;WE=40229850;WS=40229832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr13	40229891	rs3812882	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.319;NF=12;NR=13;PP=320;ReadPosRankSum=1.840;SC=GGAAGTGGTCGCAGTGTCTGC;SOR=0.411;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=25;WE=40229899;WS=40229881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr13	40229957	rs3812883	T	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.436;NF=5;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=-2.924;SC=GGCGACGACCTGCAACCCGCT;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=16;WE=40229965;WS=40229947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr13	40230043	rs3812884	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGGCCGGAGTCACAGGTTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=4;WE=40230051;WS=40230033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr13	40230122	rs3812885	A	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=0.491;SC=TCCCGGCAGCAGAGGGACCGC;SOR=1.659;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=9;WE=40230130;WS=40230112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr13	40230216	rs3812886	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=4;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=1255;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTCCGGAAAAGCGAAGGGGTT;SOR=0.907;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=36;WE=40230237;WS=40230206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr13	40230229	rs3812887	C	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.433;SC=AAGGGGTTTCCTGGGTGTTCT;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=40;WE=40230237;WS=40230206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr13	40230294	rs3812888	T	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=338;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TGAACGGTGGTGCCTCGAGAA;SOR=0.962;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=35;WE=40230302;WS=40230284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr13	40233404	rs7330515	T	C	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=49;SC=TTAATGAAAATAAATCATTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=40233412;WS=40233394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	40233691	rs7330016	C	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=CTTACTATTACGCCTGGCTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=40233699;WS=40233681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	40238162	rs4636783	C	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=665;SC=TTATTGACAGCATACCTAGAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=40238183;WS=40238152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	40238175	rs67976778	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=312;ReadPosRankSum=-0.236;SC=ACCTAGAAAGCAATAAGACAG;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=20;WE=40238183;WS=40238152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr13	40238387	rs4566029	T	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=289;SC=AACAGACTGATTCACCTTCTA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=40238395;WS=40238377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	40239139	rs7991151	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=GATCTCATTTGTTTTAAGTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=40239147;WS=40239129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	40253901	rs4941940	A	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=113;SC=GTGAAGTTATACTCTGACAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=40253909;WS=40253891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	40254281	rs35468663	TCAAA	T	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=0.547;SC=ATTTTAGTAATCAAACATTTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=40254292;WS=40254271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr13	40263979	rs9548882	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=0.555;SC=ATTTTGTTTTTACATATGCTA;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=5;WE=40263987;WS=40263969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr13	40268930	rs9548886	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=0.762;SC=AGCACAGTATAAGATTTTTTT;SOR=0.425;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=14;WE=40268938;WS=40268920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr13	40293288	rs5803008	AT	A	631.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=426;SC=TAACTTTTACATTTTTTTTTA;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=40293296;WS=40293278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	40297684	rs7985075	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TAGCTGTGTTCTCCTGGGAAA;SOR=0.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=22;WE=40297692;WS=40297674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr13	40298805	rs9532421	C	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=TATCTCTTGACATGCTGTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=40298813;WS=40298795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	40325310	rs4245396	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=1.834;SC=AATTTTTACTCTATAATTTGA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=40325318;WS=40325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr13	41185309	rs7331212	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-0.343;SC=AGAACAATGAGTTTTGTTCTA;SOR=1.091;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=41185317;WS=41185299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr13	41323397	rs13508	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.326;SC=AATTCCACATCCCAAAGTGAA;SOR=1.329;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=4;WE=41323405;WS=41323387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr13	41515286	rs1056820	T	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=734;ReadPosRankSum=-1.830;SC=TTTAGAACTGTAGTGGCTCCT;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=55;WE=41515294;WS=41515276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,59:0.34:175
chr13	41515371	rs7987185	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=893;ReadPosRankSum=1.229;SC=ATGAAGATAGCGATGGATCTG;SOR=0.852;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=56;WE=41515379;WS=41515361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr13	41517985	rs3764056	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=0.422;SC=TACCCTTTCCATCTTTGTTTT;SOR=1.262;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=15;WE=41517993;WS=41517975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr13	41525586	rs3736953	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-1.457;SC=CAACACATTTAAAGAGAAAAT;SOR=0.772;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=19;WE=41525594;WS=41525576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr13	41533052	rs7799	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=373;ReadPosRankSum=1.065;SC=AATCATGTCATTGGGCTCTTC;SOR=0.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=29;WE=41533060;WS=41533042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,32:0.30:105
chr13	41705495	rs584594	A	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=28;PP=1246;SC=CAGACAGCTAAAGTGGTGACA;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=41705503;WS=41705485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	41706800	rs9566703	A	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=7;PP=203;SC=ACCCCGCAGAACCGCCTCCCG;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=41706808;WS=41706790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	41767338	rs2039134	A	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.11;QD=41.85;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	41767341	rs2039135	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.63;QD=46.89;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	41791440	rs2274903	T	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=126;ReadPosRankSum=1.582;SC=ATTTATTTAATTTCTTTGCAG;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=10;WE=41791448;WS=41791430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr13	41797601	rs2026469	A	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=511;SC=TTTCTAAAAGACATATATACA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=41797609;WS=41797591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	41807950	rs3751344	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=777;SC=CAGACACTCATATAGGACTAT;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=41807958;WS=41807940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	41814709	rs71957887	TGAA	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=0.887;SC=CGAGGGCCTCTGAAGAAGAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=41814719;WS=41814699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr13	41828514	rs73179143	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=241;ReadPosRankSum=0.541;SC=CTCATTCTGCAGCAAATTACA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=17;WE=41828522;WS=41828504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr13	41834578	rs66465270	GT	G	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=1.248;SC=TAAGTGTGTGGTTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=41834586;WS=41834568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr13	41834744	rs2297555	C	T	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=53;PP=2554;SC=TTCGGTTTTCCTCATTCACAG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=120;WE=41834752;WS=41834734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr13	41835076	rs3215932	T	TA	332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=234;SC=ACACAGTCTTTAAAAAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=41835097;WS=41835066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	41835089	rs1332940	T	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=300;SC=AAAAAAATCATCTCTAAAGAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=41835097;WS=41835066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	41837220	rs3818721	C	T	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=74;SC=ATTTCAAGCACGTTAGAGAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=41837228;WS=41837212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	41893105	rs2065498	T	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=357;SC=CTAATTCAAATTAAATTTGTA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=41893113;WS=41893095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	41902939	rs3812896	T	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=21;PP=650;SC=ATGCAGAAAATTGGTGTTATT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=41902947;WS=41902929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	41948051	rs9525478	G	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=27;PP=753;SC=ACAAATTTAAGTTATGTTCAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=41948059;WS=41948041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	41949804	rs6560982	G	T	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=543;SC=CTTTTCCAGGGTGCATTTTAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=41949812;WS=41949794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	42032572	rs7136	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=1.814;SC=GCAGCGCCAGTGTCAGCGACA;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=29;WE=42032580;WS=42032562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr13	42043086	rs2324791	C	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=172;SC=TCATCCTAAGCCTTCTATAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=42043094;WS=42043076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	42044508	rs396963	A	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=432;SC=TGGGAAGCCCAGCATTGAGTT;SOR=2.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=42044516;WS=42044498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	42185696	rs3814782	T	C	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=43;PP=1608;SC=GGTCTAAATGTGATGGGAGCA;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=42185704;WS=42185686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	42189232	rs3862741	C	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=25;NR=25;PP=860;SC=TAAAAATGAACAATTGAGACA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=42189240;WS=42189222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	42275473	rs7322461	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=5;PP=294;SC=ATTTTAATCCATCTTTTAAAA;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=42275481;WS=42275463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	42303930	rs67369169	C	T	108.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAAGTATACACGTAGACACAC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=42303938;WS=42303920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr13	42357924	rs41288293	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=507;ReadPosRankSum=0.963;SC=CAAAGCAATACTCTTACCTGA;SOR=0.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=28;WE=42357932;WS=42357914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr13	42361743	rs112297676	T	TAC	351.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.45;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr13	42407738	rs35383891	A	G	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=39;PP=1227;SC=GGTAGCTTACATGGCTTTATA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=42407746;WS=42407728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	42465490	rs7332372	C	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=268;SC=CCATGTCTTACACAATAAAAT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=42465498;WS=42465480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	42481712	rs2003064	C	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=25;PP=972;SC=TAGAGTGTGACAGAACTTGCC;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=42481720;WS=42481702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	42524368	.	GCAAA	G	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=82;QD=50.0;SC=AAATGTGTTAGCAAACAAACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=42524379;WS=42524358;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr13	42701717	rs605371	A	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=569;ReadPosRankSum=-0.087;SC=AAGGTAACTCACGAGAATACT;SOR=0.960;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=35;WE=42701725;WS=42701707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr13	42701739	rs670676	A	T	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1057;SC=GTTTCAAGCAATTGAGGCTAT;SOR=1.498;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=42701747;WS=42701729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	42701803	rs957255	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=0.162;SC=GAAGCGCACTGTAGCATTATG;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=42701811;WS=42701793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr13	42703682	rs3742261	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=395;ReadPosRankSum=-1.286;SC=TTTTTTTCATTAACAGTCTCT;SOR=1.296;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=20;WE=42703690;WS=42703672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr13	42734389	rs10492444	C	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGGTAGCATACGCATCTCATG;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=42734397;WS=42734379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr13	42763154	rs9525594	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=-1.530;SC=TTTTCTCATTGCCATATTTTC;SOR=0.848;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=13;WE=42763162;WS=42763144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr13	42763505	rs9566933	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=1.379;SC=GCAAGCATAACGGAGTTTCCA;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=42763513;WS=42763495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr13	42764439	rs1170119	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=283;SC=TCTGGAATTTTGTTTGGCATA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=42764447;WS=42764429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	42772717	rs9533031	G	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.22;NF=12;NR=29;PP=864;SC=TTATTGACCCGGATCTAGATT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=42772725;WS=42772707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	42793298	rs9315899	G	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=720;ReadPosRankSum=0.063;SC=AAAGTACAATGATTTATTCTA;SOR=0.944;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=41;WE=42793306;WS=42793288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,57:0.73:78
chr13	42793479	rs180870	G	A	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=37;PP=1083;SC=ACCCAAATGAGGATGAGGTAT;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=42793487;WS=42793469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	42793766	rs11277175	AGGTTTTTC	A	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=1990;SC=TTATCAGAGTAGGTTTTTCTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=42793781;WS=42793756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	42794004	rs347382	G	A	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=66;PP=1992;ReadPosRankSum=1.395;SC=CATGGAGGTCGTGAAAATGTT;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=100;WE=42794012;WS=42793994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr13	42803341	rs545602	T	C	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=44;PP=1549;SC=TGGTGCTATTTCTTGGAAGAG;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=42803349;WS=42803331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	42869720	rs3835266	A	AG	372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=359;SC=ATCCTTTTCAAGCAGACAGCA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=42869728;WS=42869710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	42876290	rs41288311	A	C	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=64;PP=2659;SC=CACCTGCTACACCACCTTCTA;SOR=0.761;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=123;WE=42876298;WS=42876280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr13	42882762	rs238314	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=375;SC=ACACTTTTGCATATAATTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=42882770;WS=42882752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	42888230	rs9566957	A	G	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=212;SC=GTCCACTTTTAGATCCTTTGT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=42888238;WS=42888220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	43148565	rs2296533	T	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=17;PP=489;SC=ACCAGCCCCCTGCCGCCTCCC;SOR=1.075;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=43148573;WS=43148555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	43155168	rs2277438	G	A	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=105;SC=AGACTCTTGCGAGTATGAATT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=43155176;WS=43155158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	43155443	rs2277439	G	A	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=42;PP=1550;SC=AGTCCACATCGAGGCTGATAA;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=43155451;WS=43155433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	43360772	.	T	TA	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=85;QD=22.75;SC=TGTTGCACATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=43360780;WS=43360762;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,4:0.40:10
chr13	43462422	rs1044856	A	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=363;ReadPosRankSum=1.433;SC=GGCAGTAGAGATTAAATATGA;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=30;WE=43462430;WS=43462412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr13	43474371	rs4942174	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=8;PP=887;SC=TATCGTAATGCTTTCCTAAAA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=43474379;WS=43474361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	43491871	rs17621929	C	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=108;SC=ACTCAACCTCCGTACTGAGCA;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=43491879;WS=43491861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	43537240	rs1054813	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	43537246	rs9562444	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	43566099	rs942311	T	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=233;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GAAGCCAGGTTGTTAAAATAC;SOR=0.526;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=20;WE=43566107;WS=43566089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr13	43566373	rs3825511	A	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=293;SC=AGCGAGTCTCAAGATGGGATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=43566381;WS=43566363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	43788031	rs1044753	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=532;ReadPosRankSum=1.478;SC=ACAAAGGTTGCGTGCTGGACC;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=43788044;WS=43788021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr13	43788036	rs703206	T	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=345;ReadPosRankSum=-1.589;SC=GGTTGCGTGCTGGACCAACCC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=11;WE=43788044;WS=43788021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr13	43788158	rs703207	G	A	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=786;ReadPosRankSum=1.588;SC=AAGGCACACAGCTTCCATCTT;SOR=0.576;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=54;WE=43788166;WS=43788148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,69:0.51:134
chr13	43839494	rs4306408	G	A	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=34;PP=1365;SC=TTCAACCAACGTCAAGCAAGA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=74;WE=43839502;WS=43839484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	43843500	rs2289777	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=937;ReadPosRankSum=-0.732;SC=AGACTAATTGTACTGCAGATT;SOR=1.159;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=49;WE=43843508;WS=43843490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr13	43872419	rs4451860	C	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=80;SC=GCTGCCTTTCCATTTTCATTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=43872427;WS=43872409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr13	43935405	rs1535580	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=359;ReadPosRankSum=-0.423;SC=TTCTCATAGGCGTTACTTACT;SOR=0.901;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=22;WE=43935413;WS=43935395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr13	44433700	rs1562216	G	A	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=137;SC=AAGGTAATAGGACAGCTATGG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=44433708;WS=44433690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	44457925	rs3764147	A	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=652;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TTCCAATGACATCTGGATTAT;SOR=1.207;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=43;WE=44457933;WS=44457915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr13	44948295	rs201663302	T	TG	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	44948302	rs199705926	GA	G	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	44964723	rs2281848	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=272;SC=AGGTGACCTGCAGCCTCCTTT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=44964731;WS=44964713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	44969907	rs1467624	G	A	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=26;PP=1291;SC=GATTTGACTCGTAATTCTAAC;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=44969915;WS=44969897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	45010283	rs1555781	T	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=422;SC=TATCTTAAGCTTCCAAGATAA;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=45010291;WS=45010273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	45010616	rs7997320	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=1.349;SC=TAAATTTAAAGAAACTATCTT;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=23;WE=45010624;WS=45010606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr13	45090478	rs1336163	A	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=-1.018;SC=ATTCTGAAGAACCTGCTTTTT;SOR=0.882;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=18;WE=45090486;WS=45090468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr13	45090580	rs1336164	C	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=187;SC=GGGACTTCGGCATAAAGGCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=45090588;WS=45090570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	45517486	.	AAC	A	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.83;NF=1;NR=1;PP=49;QD=26.5;SC=CCTTAAAACAAACACACACAC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=2;WE=45517495;WS=45517476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr13	45554013	rs3783150	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=222;ReadPosRankSum=0.353;SC=AGGATAAAAAAACAGAACTTA;SOR=0.796;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=14;WE=45554021;WS=45554003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr13	45556056	rs148833607	T	TCATGTTTAACATAAAACATAAAA	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=-1.292;SC=TTTGCTATATTCATGTTTAAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=1;WE=45556064;WS=45556046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr13	45556123	rs12427714	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.835;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr13	45563464	rs1140993	G	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=367;ReadPosRankSum=0.765;SC=AGAACATCCAGCTGTCCCGCG;SOR=0.342;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=30;WE=45563472;WS=45563454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr13	45594390	rs117740041	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=1.248;SC=CTTAATCTAAGTAAAAATAAT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=45594398;WS=45594380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	45594584	rs7331627	T	C	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=261;SC=AAATAAGATATATAGAGCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=45594592;WS=45594574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	45826876	rs7982845	A	G	106.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=1.383;SC=AAAGTATTAAAGCTAGTGTAT;SOR=1.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=45826884;WS=45826869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr13	45912634	rs9595305	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CCCTAAGAATTTTTTACATAT;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=8;WE=45912642;WS=45912624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr13	45914957	rs2234216	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=126;ReadPosRankSum=1.265;SC=ACCGTGCGCCTGGCGCCGCCA;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=15;WE=45914965;WS=45914947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr13	45976349	rs11617888	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=0.569;SC=GATAGAACAAGTAAATTCAAA;SOR=1.042;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=13;WE=45976357;WS=45976339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr13	45985583	rs12872200	T	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.205;SC=TCTTCTTTGATTTATAGAAAC;SOR=0.400;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=12;WE=45985591;WS=45985573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr13	45985608	rs7997155	T	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CCTCCAGTGCTGTTTTTCCTG;SOR=0.498;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=9;WE=45985616;WS=45985598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr13	46039407	rs11619408	G	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=511;SC=CGGGCGCCCCGGCAGGACCCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=46039415;WS=46039397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	46060467	rs374009383	CG	C	1186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=1;PP=264;SC=AGACGGGAGACGGGAGACGGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=46060482;WS=46060457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	46060473	rs113621277	AC	A	1226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.59;QD=42.30;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	46066163	rs3014948	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=530;SC=CCAACCATTTTCCGTTCTTCA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=46066171;WS=46066153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	46077301	rs3014959	G	A	151.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=77;SC=ATATATATATGTACTTTGTAT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=46077309;WS=46077291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	46077381	rs3014960	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=281;SC=TTATACAGCAGATTGCACAGA;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=46077389;WS=46077371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	46085699	rs2985969	G	A	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=249;SC=ATGTTTCCAGGGATGACTGCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=46085707;WS=46085689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	46085864	rs2985970	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=37;NR=29;PP=1317;SC=GTTTTGTCAAATGCCACAGGC;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=66;WE=46085872;WS=46085854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	46093284	rs3818456	C	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=828;SC=CCTTAGATTTCCTTTTGAATT;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=46093292;WS=46093274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	46098994	rs3014966	T	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=289;SC=CATTGTGTTTTAATAGGTTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=46099002;WS=46098984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	46099243	rs2985984	A	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=32;PP=1100;SC=GTTTGCATTTATATAGTCCTT;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=46099251;WS=46099233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	46103935	rs2274285	A	G	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=1066;SC=GCAAAGGTCAATGACCTTGCG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=46103943;WS=46103925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	46104130	rs2274286	G	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=383;SC=TTTTCCTTTTGCTGTAGACAT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=46104138;WS=46104120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	46105021	rs66498730	AT	A	869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=785;SC=AATTTAAAAAATATTACCTTC;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=46105029;WS=46105011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	46108643	rs3014901	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=0;PP=259;SC=TTTTTTTTTTTCCATTCTAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=46108651;WS=46108633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	46108853	rs3014902	TG	CA	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=28;PP=2067;SC=CTTCTGCTGTTGGTTTCTAAA;SOR=0.886;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=52;WE=46108862;WS=46108843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	46170609	rs3014939	C	T	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=49;PP=2145;SC=GCCTTTTCCTCTTCTAGATAT;SOR=0.857;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=116;WE=46170617;WS=46170599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr13	46170719	rs142875900	CCCAGATACTCTTCCTCCT	C	2633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=36;PP=2973;SC=CCCTTCCTTCCCCAGATACTC;SOR=1.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=42;WE=46170744;WS=46170709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	46276503	rs872556	G	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=0.467;SC=CATGAGCCCTGAAAAACACCA;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=43;WE=46276511;WS=46276493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,45:0.34:133
chr13	46276766	rs17068928	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=0.271;SC=TCTACACGTTCTTTCAGACTC;SOR=0.211;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=5;WE=46276774;WS=46276756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr13	46277016	rs755428	A	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=571;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GAAGGATGTAACCTATCAGTG;SOR=0.760;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=46;WE=46277024;WS=46277006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,60:0.37:164
chr13	46287153	rs9316154	A	C	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=142;SC=TGACAAGGATAGGCCACATTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=46287161;WS=46287148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	46288145	rs7317245	A	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=441;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CGCCCTGCGGAAGATGGTCAG;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=27;WE=46288153;WS=46288135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr13	46541673	rs9534264	T	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=399;ReadPosRankSum=-0.222;SC=ATTTATTTGTTTCTTCAAATC;SOR=0.525;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=27;WE=46541681;WS=46541663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr13	46550061	rs11428563	G	GT	44.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=106;SC=TTTTATCTGTGATAGGGTCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=46550069;WS=46550051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	46562935	rs1134071	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=537;ReadPosRankSum=1.595;SC=CCCTCCTTTCATGGCGTCGAT;SOR=0.484;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=41;WE=46562943;WS=46562925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr13	46619026	rs962694	T	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=367;SC=CAGATTTTTATACTAGATAAA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=46619034;WS=46619016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	46619071	rs3736943	T	C	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=11;PP=766;SC=ACATGAACAATACAAAGTTCT;SOR=1.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=46619079;WS=46619061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	46619316	rs3736944	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=198;SC=GATATATTACTCCCCAAATAA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=46619324;WS=46619306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	46627677	rs1049669	T	C	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=710;SC=TAAAAATAATTTGATACAATG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=46627685;WS=46627667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	46629944	rs1926447	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=575;ReadPosRankSum=0.934;SC=ATTTTTACTAATTTTCTCAAT;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=38;WE=46629952;WS=46629934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr13	46629995	rs1926446	C	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.744;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=483;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CTGGAAGCAACAAGATATAGA;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=30;WE=46630003;WS=46629985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr13	46641324	rs34583549	T	TA	304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=233;SC=CAATAAAAGTTAAAAAAAATT;SOR=3.442;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=46641332;WS=46641314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	46641481	rs7337140	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=37;PP=1289;SC=CATTAACCACTGGCATAACAT;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=46641489;WS=46641471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	46656412	rs3818477	T	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=320;SC=TCAGGGAAGATATCTACCAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=46656420;WS=46656406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	46656669	rs2296642	A	G	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=24;PP=762;SC=GATCTTCCACATCTGCCAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=46656677;WS=46656659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	46708291	rs4941543	T	C	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=35;PP=1845;SC=GAACTTTTCTTTGCTTCCCTC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=46708299;WS=46708281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	46717047	rs9534341	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=421;ReadPosRankSum=-1.821;SC=TTCAAAACAATGTTCCCACTG;SOR=1.075;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=29;WE=46717055;WS=46717037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr13	46717246	rs2182485	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.651;SC=AATAAGCAATTGACTGAAATA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=46717254;WS=46717236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr13	46722703	rs10631906	C	CTTAA	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	46728771	rs4258501	T	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=546;SC=GTCTCCCTTCTTTGCTGCTCA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=46728779;WS=46728761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	46728924	rs2296122	C	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=982;ReadPosRankSum=-0.840;SC=ATTATGGTAACGGTGGGAAGA;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=64;WE=46728932;WS=46728914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,82:0.65:126
chr13	46836201	rs2764598	A	G	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=77;SC=AGAGAAAATCAATCCTTTCAT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=46836209;WS=46836191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	46930372	rs9526171	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=297;SC=CTGGTCCTGGTGTCCTCGGTC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=46930380;WS=46930362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	47256065	rs45439193	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=-0.605;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr13	47256071	rs151080336	T	TTGTGTGTG	199.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=6;PP=243;SC=GGGTCGATCTTTGTGTGTGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=47256079;WS=47256055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	47260054	rs842381	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=13;PP=875;SC=AGTAGATCTTTCCTTGGTAAA;SOR=1.342;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=41;WE=47260062;WS=47260044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	47261970	rs842375	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=177;ReadPosRankSum=1.251;SC=ATATGATTGCTATTAATTTCT;SOR=0.157;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=15;WE=47261978;WS=47261960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr13	47273458	rs706621	G	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=307;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AACCCTGTGTGTTTTGTCCAC;SOR=1.018;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=20;WE=47273466;WS=47273448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr13	47279375	rs11483731	C	CT	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.689;HP=10;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=112;ReadPosRankSum=-0.994;SC=CACTTTGTATCTTTTTTTTTC;SOR=2.160;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=8;WE=47279383;WS=47279365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr13	47279454	rs842387	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=266;ReadPosRankSum=-1.158;SC=GGCTGCTGGTAGATTCACCAG;SOR=1.037;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=17;WE=47279462;WS=47279444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr13	47279680	rs3832915	A	AT	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.227;NF=1;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=2.115;SC=GATTCTGTAGATTTTTTTACC;SOR=0.392;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=47279688;WS=47279670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr13	47289958	rs9526223	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.584;SC=GAAAAGTGCACGTGGATTGTT;SOR=0.065;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=47289966;WS=47289948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr13	47297352	rs7319836	G	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=18;PP=860;SC=CCTTTGTATTGTAGTGTTTCT;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=47297360;WS=47297342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	47302934	rs3742273	T	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=12;PP=616;SC=TTACTCACAGTTACCTCAGTG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=47302942;WS=47302924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	47308109	rs2298086	A	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=12;PP=393;SC=TTTTGGAAGCATGCCGAAAAT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=47308117;WS=47308099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	47308201	rs117493342	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=1.108;SC=GAGTTTGAACCATTGAATCGA;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=7;WE=47308209;WS=47308191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr13	47315984	rs3742274	T	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=426;SC=GTCCGCATAATGTCTGCACGT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=47315992;WS=47315974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	47358540	rs8192889	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=0.584;SC=ATGTGCACCATTAATACTGGG;SOR=0.350;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=14;WE=47358548;WS=47358530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr13	47408902	.	A	AT	143	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=60.36;NF=12;NR=0;PP=143;QD=12.6666666667;SC=CCAATCTCATATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=12;WE=47408910;WS=47408892;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr13	47409372	.	A	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=368;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGTGATGAAGAAAGGGCACCA;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=28;WE=47409380;WS=47409362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr13	47469940	rs6313	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=325;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TAGCTTCTCCGGAGTTAAAGT;SOR=0.384;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=20;WE=47469948;WS=47469930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr13	47470824	rs6312	C	T	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=37;PP=1872;SC=TCTTCAGGGTCCACACATGAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=47470832;WS=47470814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr13	48547467	rs7320366	A	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=299;SC=GCTTCAGGAGACTCAGCAGCA;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=48547475;WS=48547457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	48563008	rs6561424	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=132;SC=CTTAAAAAATGTGACTTACGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=48563016;WS=48562998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	48563246	rs6561425	A	G	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=115;SC=GTCCAAAAATAAGGCATTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=48563254;WS=48563236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	48571213	rs8001509	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=33;PP=1055;SC=GTCACTCTTGCTAACTACTTG;SOR=1.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=48571221;WS=48571203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	48575207	rs11316376	GA	G	2357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=31;PP=1634;SC=AGGGCACCCAGAAAAATGTCA;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=44;WE=48575215;WS=48575197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	48575292	rs9567972	C	T	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=56;PP=1930;SC=ACCCTCGAGACGACAGCGGAC;SOR=0.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=48575300;WS=48575282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr13	48671081	rs1571256	A	G	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=67;PP=2547;SC=TACTCTAGTCAATCATTTCTT;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=127;WE=48671089;WS=48671071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr13	48878271	rs2854351	T	C	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=84;SC=TCGGCGGGGATCCGTCCTCGC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=48878279;WS=48878261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	48878292	rs2252544	G	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=49;SC=CAGGGGCCGGGTCCCGGCGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=48878300;WS=48878282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	48919358	rs198617	T	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=7;PP=250;SC=TTTTATTAGGTTTACACTCTG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=48919366;WS=48919348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	48921884	rs198616	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=261;SC=AAAAGAAGATAAATAAAGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=48921892;WS=48921874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	48938897	rs144536235	TA	T	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr13	48947469	rs185587	G	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=5;PP=222;SC=CTTGGGAGATGGAAAACATTT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=48947477;WS=48947459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	48955676	rs2804086	T	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=CTCAAGAACATATAGGGAATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=48955684;WS=48955666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	49033747	rs198580	G	A	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=472;SC=TAATTAGAGCGATTTCATGAT;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=49033755;WS=49033737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	49034022	.	A	ATTTCTTTCTTTCTTTCT,AT	1984.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.25;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0;NR=43;PP=1966;SC=TTGTTAACTGATTCTTTCTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=43;WE=49034030;WS=49034012;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:59
chr13	49051012	rs3020646	C	T	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=74;PP=2174;SC=TTCCAGTAGCCGAGATGGTCA;SOR=1.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=111;WE=49051020;WS=49051002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	49107241	rs7997110	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=350;ReadPosRankSum=1.291;SC=GGCGCCGCGATGAGTTGGCGC;SOR=0.373;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=35;WE=49107249;WS=49107231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr13	49752915	rs1407826	A	G	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	49794650	rs9568169	C	A	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.712;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1312;ReadPosRankSum=0.533;SC=ACGTGGTGACCGTGATGCTGA;SOR=0.993;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=77;WE=49794658;WS=49794640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,94:0.58:161
chr13	49839889	rs9535182	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.849;SC=AGCTTTTTGGAGTCCTCAATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=49839897;WS=49839888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr13	49839979	rs7326191	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ATACACAAATGTCTGTCTAAA;SOR=1.242;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=17;WE=49839987;WS=49839969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr13	49840024	rs6561512	A	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=35;PP=2057;SC=GGATTACTGGAAGCAGCTAAG;SOR=1.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=49840032;WS=49840014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr13	49848566	rs181409808	A	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=-0.921;SC=ACTGACTGCCAAGGCGGGCAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=49848574;WS=49848556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	49852377	rs2274150	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.203;SC=TACTGTAGAAAATTGAATGAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=49852385;WS=49852367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr13	49852430	rs2274149	T	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=657;ReadPosRankSum=0.577;SC=AAAAATACATTGCAAAGTGTC;SOR=0.561;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=35;WE=49852438;WS=49852420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr13	49865727	rs143390986	G	GCC	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=0.032;SC=TTTAACTTAAGCATTGTTTTG;SOR=0.719;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=3;WE=49865735;WS=49865717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr13	49865748	rs6561514	A	G	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=360;SC=CTCTTACAACATGTAAGGCTG;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=49865756;WS=49865738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr13	49885216	rs912547	A	G	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=869;SC=CCTCACCCACACTACTCGCGT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=49885224;WS=49885206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	49951027	rs111664849	G	GTAGATAGATAGATAGATAGA	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=369;ReadPosRankSum=-0.126;SC=AAGTTGAATAGTAGATAGATA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=5;WE=49951035;WS=49951017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr13	49951142	rs8002829	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.546;NF=11;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=0.597;SC=TCAGTGTCACTAGCAGGCCAC;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=27;WE=49951150;WS=49951132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr13	49951193	rs8002858	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.58;ReadPosRankSum=2.137;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr13	49951310	rs8002153	G	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr13	50007393	rs7998660	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=0.410;SC=GTATGTTGAGCATAGTCTACA;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=6;WE=50007401;WS=50007383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr13	50008112	rs3764091	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=0.233;SC=CTTTTAGTTCGCACCTTTACT;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=6;WE=50008120;WS=50008102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr13	50008301	rs3764090	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=436;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TACGTTCTGAACAGCAACTTA;SOR=0.913;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=33;WE=50008309;WS=50008291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,34:0.33:103
chr13	50008418	rs77888154	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.333;SC=TGGTTTTAAATCTCAATCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=50008426;WS=50008408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr13	50035208	rs2077848	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=0.057;SC=AGGTAATGGTGATGCTGTTTT;SOR=1.075;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=5;WE=50035216;WS=50035198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr13	50038080	rs12429813	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=0.084;SC=CTGCCTCTGGGATAAGTCATC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=50038088;WS=50038070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	50050620	rs7998427	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AGAACAACAGAAAATAAGGAA;SOR=0.602;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=20;WE=50050628;WS=50050610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr13	50054308	rs4142285	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=1.816;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
chr13	50054346	rs7996852	G	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.170;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,13:0.18:74
chr13	50057097	rs2057413	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=0.525;SC=GGAGCTTACTGTGTAAGTAAC;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=22;WE=50057105;WS=50057087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr13	50057633	rs11619265	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.912;SC=CAAGAATTCAATATCATTCAG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=10;WE=50057641;WS=50057623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr13	50080847	rs2031532	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=503;ReadPosRankSum=0.279;SC=ATAATGTCCTATACTTTGCAC;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=29;WE=50080855;WS=50080837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr13	50087142	rs2247119	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=-1.741;SC=TTCTGACATGTAGCTTTCAAT;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=50087150;WS=50087132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr13	50092127	rs66480424	TACTC	T	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.227;NF=5;NR=2;PP=265;ReadPosRankSum=0.186;SC=AACAGGTACTTACTCAGTAAA;SOR=0.655;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=7;WE=50092138;WS=50092117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr13	50095127	rs3765526	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GTAAACATTTATGTAACATAA;SOR=0.507;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=17;WE=50095135;WS=50095117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr13	50096127	rs2274277	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr13	50100090	rs7322908	T	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.862;SC=GGATCATCTGTGGTCAGCAGT;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=50100098;WS=50100080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr13	50100389	rs7323493	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GCTGCTGCTGTTGCCATCTAA;SOR=0.527;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=5;WE=50100397;WS=50100379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr13	50100627	rs10546233	GTT	G	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr13	50100637	rs371713260	ATATT	A	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	50100647	rs61960012	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr13	50100667	rs6561533	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=1.834;SC=ACAATATACTGTACAGGTGAT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=50100675;WS=50100657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	50102810	rs1046295	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=1.384;SC=AGGGATTACCGTTTCCTAAGC;SOR=0.825;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=34;WE=50102818;WS=50102800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr13	50108252	rs7317982	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=257;ReadPosRankSum=0.504;SC=CCAGCAGCCTTGCGCTTCAGT;SOR=0.936;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=21;WE=50108260;WS=50108242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,23:0.32:72
chr13	50115669	rs1536195	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=272;SC=CACAATACTACTTTTAAAGAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=50115677;WS=50115659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	50121211	rs1570883	G	A	125.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	50121511	rs1570884	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=457;SC=TTAACCTTCAATATCAATTGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=50121519;WS=50121501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	50123622	rs3751384	G	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=4;PP=783;SC=ACGAGACGGCGGGAGTGGCAA;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=50123630;WS=50123612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	50126382	rs2274278	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=8;PP=261;SC=TTGTTTCCCAGGCCCAGCTGA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=50126390;WS=50126372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	50129615	rs2274284	A	G	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=28;PP=1224;SC=ATTGAAAAAGAAGGTAGAAAG;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=60;WE=50129623;WS=50129605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	50134358	rs12146924	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=14;PP=321;SC=TAAGTAACCATGGACAGAGTA;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=50134366;WS=50134348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	50141345	rs4942848	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=524;SC=GAAGACACACGCCTTCCGAAT;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=50141353;WS=50141335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	50205025	rs3803185	T	C	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=60;PP=1830;SC=CCAGGACCACTGCTGGGAGCT;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=102;WE=50205033;WS=50205015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr13	50244041	rs9535292	T	C	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=31;PP=863;SC=AGGATGGCACTGTAGACACAT;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=50244049;WS=50244031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	50260905	rs6561552	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=378;SC=CAACTCAATTTACATTTTTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=50260913;WS=50260895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	50275515	rs7446	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=705;ReadPosRankSum=0.689;SC=TCAGATCACACTGCACCTCTT;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=44;WE=50275523;WS=50275505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr13	50276679	rs12877931	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=348;ReadPosRankSum=-1.402;SC=ATCAAAACCACACTCATTTTA;SOR=0.619;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=24;WE=50276687;WS=50276669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr13	50295961	rs9535309	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=0.624;SC=GTTATCAAACAAACAAACAAA;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=50295969;WS=50295951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	50296026	rs9535310	T	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=949;SC=GTCCCCTGTATATGAATTCCT;SOR=1.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=50296034;WS=50296016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	50296115	rs1127021	C	T	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=26;PP=1106;SC=CCATAGGCGGCGGGGGATCCT;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=50;WE=50296123;WS=50296105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	50299648	rs3215711	AC	A	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=363;ReadPosRankSum=-1.361;SC=CTGTAAAAAAACAATAACACA;SOR=0.239;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=8;WE=50299656;WS=50299638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr13	50299677	rs2273817	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=1.800;SC=GACACATAACTACCACTTAAA;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=50299685;WS=50299667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr13	50464624	rs12876820	G	A	131.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=1.068;SC=CGGTTGCCAGGTGCGGATTCT;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=50464632;WS=50464614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr13	50464697	rs34893433	T	TG	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CCTGGGTTACTGCGGCCACCG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=6;WE=50464705;WS=50464687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr13	50467124	rs7316930	T	C	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1044;SC=TCCAGAACCATGGCAAGAAAC;SOR=2.372;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=50467132;WS=50467114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	51397440	rs9563002	C	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.256;NF=21;NR=23;PP=562;ReadPosRankSum=0.337;SC=ACTCCCGATGCCTTTAACACT;SOR=0.624;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=44;WE=51397448;WS=51397430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr13	51417535	rs898861	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.421;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=1.008;SC=TGGGGAGTTCGCCCGCGCCGC;SOR=0.056;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=9;WE=51417543;WS=51417525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr13	51484356	rs2274069	C	T	139.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CCGCCCCCCACCCCGGTGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=51484364;WS=51484346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr13	51530414	rs1328360	A	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=-0.516;SC=AACTTGAGACATGCAGTCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=51530422;WS=51530404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr13	51594741	rs1328361	T	G	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=35;PP=1332;SC=GTGGTGTCGTTGGGGGCGATG;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=51594749;WS=51594731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	51603768	rs9568497	T	C	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=19;PP=1070;SC=ATCCGAGTAGTAATGGAGAAA;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=51603776;WS=51603758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr13	51929375	rs9596506	T	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=447;SC=GTCAACATTATGTAAAAGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=51929383;WS=51929365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	51956122	rs9526753	T	C	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=205;SC=CAGGCGTGAGTCACTGCGCCC;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=51956130;WS=51956112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	52293532	rs912097	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=115;SC=TAACTGTTGTTCTCTTTGATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=52293540;WS=52293522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	52373687	rs490799	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=0.859;SC=GGCGATTTCAAGGGCAGTTGC;SOR=0.593;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=6;WE=52373695;WS=52373677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr13	52373814	rs9535761	G	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=737;SC=CTAGAAAGAGGAGACCCACAG;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=52373822;WS=52373804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	52391341	rs975504	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=535;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GGGGTGTTGGCAGGGAGAGAG;SOR=0.777;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=36;WE=52391349;WS=52391331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr13	52425587	rs36141261	A	AT	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.103;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.312;SC=ATTTGTAGTCATTTTTTTTTT;SOR=3.219;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=6;WE=52425595;WS=52425577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr13	52440130	rs1054515	A	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.264;SC=CAATGGCCACATTGCCGGAGA;SOR=0.458;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=63;WE=52440138;WS=52440120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,70:0.67:105
chr13	52492525	rs9596613	A	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=514;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TGCACAAGGCAGTATGAAGGG;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=41;WE=52492533;WS=52492515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr13	52520507	rs1801246	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=120;ReadPosRankSum=0.356;SC=CAGCCGTGGGCGTGGCCAGCC;SOR=0.541;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=12;WE=52520515;WS=52520497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr13	52701490	rs3076657	A	ACTT	1051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=646;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGAAATTTGAACTTAACTTTA;SOR=1.536;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=14;WE=52701498;WS=52701480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr13	52701637	rs1886544	T	G	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.693;NF=25;NR=31;PP=890;ReadPosRankSum=-0.960;SC=ATGGGCTGAGTTTCCTGGAAT;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=56;WE=52701645;WS=52701627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,77:0.69:112
chr13	52701782	rs1886543	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=-1.085;SC=AATAACTTTCTTTGTGGCCAC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=52701790;WS=52701772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr13	52707240	rs3368	C	G	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1123;ReadPosRankSum=1.035;SC=CTGAGTGAAGCCTCTCCTCAG;SOR=0.485;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=66;WE=52707248;WS=52707230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,73:0.62:117
chr13	52707751	rs3831081	T	TCACACA	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.524;NF=6;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CTAATTTAAATCACACACACA;SOR=0.136;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=52707759;WS=52707741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr13	52709742	rs2408611	G	A	147.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5729;FS=8.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.366;SC=ACAATGTGACGTACTTAGTGC;SOR=3.897;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=52709750;WS=52709740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr13	52709938	rs2296351	A	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=714;ReadPosRankSum=-0.213;SC=ACAAAGTGTCAGGGGTCTCTT;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=57;WE=52709946;WS=52709928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,62:0.54:114
chr13	52710044	rs2296350	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=474;ReadPosRankSum=0.619;SC=AAAAAAGATTTTTCAGCATGT;SOR=0.330;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=52710066;WS=52710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr13	52710058	rs2296349	T	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=474;ReadPosRankSum=-0.914;SC=AGCATGTACTTTCCAGATCAT;SOR=0.048;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=12;WE=52710066;WS=52710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr13	52717950	rs3783242	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGAGTATCTCCGATAATCATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=52717958;WS=52717940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	52718050	rs3837575	C	CT	630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=414;ReadPosRankSum=-1.779;SC=AAAATTCTTACTTTTTTTCTT;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=17;WE=52718058;WS=52718040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr13	52725180	rs117278993	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=338;ReadPosRankSum=1.712;SC=CCAATATGATCCATGCATCTG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=20;WE=52725188;WS=52725170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr13	52952928	rs113543720	CA	C	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=0.679;SC=TGGAAAGCTGCAAAAAAAAAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=52952936;WS=52952918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr13	52971893	rs3803264	G	A	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=573;ReadPosRankSum=-0.006;SC=CATCCACTACGATGTTGGGCT;SOR=0.422;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=39;WE=52971901;WS=52971883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr13	52989863	rs1056335	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-2.019;SC=TGTGAAGTTCCAATAAATTCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=52989871;WS=52989853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr13	53009048	rs11148252	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CTTTAAATGACTCAGTCAGAT;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=53009056;WS=53009038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr13	53010353	rs150816705	A	AACACACACAC	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	53029770	rs72440971	CGCGGTGGCGGTGGCGGTG	C	1153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.672;NF=0;NR=16;PP=2987;ReadPosRankSum=0.901;SC=AGGTGAAGGCCGCGGTGGCGG;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=53029795;WS=53029760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr13	53030565	rs9536079	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.998;SC=AACCAGCTTTGGAAGTAAACT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=53030573;WS=53030555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr13	53035783	rs7337054	T	C	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=54;PP=2220;SC=TCAGTAGAACTTCTGCCAATG;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=53035791;WS=53035773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr13	53035925	rs7335867	A	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=39;PP=1767;SC=ATCTGAAGTTATAGCCAGGCC;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=53035933;WS=53035915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr13	53036398	rs3803262	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.519;SC=TATGCCATTAAAGTAAGATTA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=53036406;WS=53036388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	53233194	rs9536223	A	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	53254082	rs4539485	T	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=137;SC=TGTTGATTAATTACTTCTGCC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=53254090;WS=53254072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	53254296	rs7986540	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=262;SC=CCTTTGTAAGAATATAAACTT;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=53254304;WS=53254286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	53278067	rs3742297	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=1.068;SC=CTGTAAAGGGTTTGATCTTGT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=53278075;WS=53278057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr13	53286950	rs7330220	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GGCTGATCTACAGCCACCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=18;WE=53286958;WS=53286940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr13	53287023	rs2147692	G	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AAAAACGATTGCATTTGAGCA;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=12;WE=53287031;WS=53287013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr13	53602970	rs2298229	A	G	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=862;ReadPosRankSum=-1.289;SC=TAAGAGGACAAGATGAGGCCC;SOR=0.638;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=56;WE=53602978;WS=53602960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,72:0.64:113
chr13	53617505	.	TG	T	125	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=18;MQ=68.43;NF=2;NR=4;PP=125;QD=26.3333333333;SC=GAAGGTGGGTTGTTTTTTTTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=53617513;WS=53617495;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	54615315	rs144930433	CA	C	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=1.434;SC=CATTGCATTACAACATGTACA;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=54615323;WS=54615305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	54615571	rs144567553	ATAGAT	A	866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.851;NF=1;NR=14;PP=749;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GCCAGAAGAAATAGATTGGAG;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=54615583;WS=54615561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr13	55748673	rs1572687	T	C	114.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AATTAGTCAATAATTTCTGTT;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=55748681;WS=55748663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	58298667	.	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=129;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CAAGCCCATTGAGAGCTGATC;SOR=0.116;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=9;WE=58298675;WS=58298657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr13	60240829	rs41293422	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=515;ReadPosRankSum=0.130;SC=CTACATTACACGCTTCCTTCT;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=33;WE=60240837;WS=60240819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr13	60385060	rs10665848	A	ATTAC	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=204;SC=ATTGCTTGCTAAAAAAATTTT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=60385068;WS=60385050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	60566644	rs36084898	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=348;ReadPosRankSum=0.732;SC=CATAAATTCATTTCTGATGTG;SOR=0.446;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=24;WE=60566652;WS=60566634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr13	60590299	rs2762134	C	T	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.20;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	60590299	.	CAGTTACAC	TAGTTACAC,TAGTTACAT	377	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12,10;NR=18,13;PP=40,377;QD=2.49237375157;SC=AGAAAAAAGACAGTTACACAT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30,23;WE=60590315;WS=60590289;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:30
chr13	60590307	rs12429010	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr13	60617060	rs2800294	A	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=114;SC=ACTATAATTAACACTATTTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=60617068;WS=60617050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	61041312	rs9538715	G	A	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=14;PP=1013;SC=GTTGTTTCCCGCCCTGTGTCC;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=61041320;WS=61041302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr13	61057808	rs9528147	A	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=242;SC=CCTATTTCTTATAAGAATCTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=61057816;WS=61057798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	61058724	rs7329723	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=48;SC=CACCCTCTCTGAAAGCCTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=61058732;WS=61058714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	61986918	rs3812872	C	A	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=77;PP=2965;SC=TCAGATAAACCACACCATCTA;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=61986926;WS=61986908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr13	61988107	rs4281600	T	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=50;PP=1585;SC=ATGCTGGAGTTGGGGGAGGGA;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=61988115;WS=61988097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	61988153	rs3812873	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=1.330;SC=AATAGGGGTCCGAGAGAGAAA;SOR=0.435;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=15;WE=61988161;WS=61988143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr13	63745832	rs298898	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AAATGGGATAGGATAATGATC;SOR=0.663;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=13;WE=63745840;WS=63745822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr13	67802339	rs8000556	A	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=443;ReadPosRankSum=-1.863;SC=TGCTGCTGGAAACTTTCACCA;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=29;WE=67802347;WS=67802329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr13	70535355	rs9592668	T	A	182.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=181;SC=GAATTTTTTTTAAAAAAGCGT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=70535363;WS=70535345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	70549636	rs71693665	CTTAAAAAAAT	C	813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.807;NF=15;NR=3;PP=2937;ReadPosRankSum=1.520;SC=CAACAAAAAACTTAAAAAAAT;SOR=0.779;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=18;WE=70549653;WS=70549626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr13	70681305	rs9564649	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=509;ReadPosRankSum=1.049;SC=ATTGAGAGATGCTTGGAAGCC;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=31;WE=70681313;WS=70681295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr13	70681873	rs3751428	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=226;ReadPosRankSum=0.302;SC=CTCACGCAGGAGTAGGCTGGT;SOR=1.473;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=13;WE=70681881;WS=70681863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr13	72038653	rs915052	C	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=253;SC=ATTTCATTAGCTCTTAAATAA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=72038661;WS=72038643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	72440658	.	TGCCGCC	T	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=36.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	73284411	rs7931	A	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=1.465;SC=TGCAATCTTCAAACCCTCTTG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=73284419;WS=73284401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr13	73301655	rs1465897	A	C	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=51;PP=1872;SC=GCGCAACGGAAACTCACCGTC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=94;WE=73301663;WS=73301645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr13	73301728	rs1465896	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=34;PP=891;SC=CCAGCACCGCTGCTACTCGCC;SOR=1.453;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=73301736;WS=73301718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	73302046	rs41283994	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=563;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CAAGACAGCGCGGAAGCGGGG;SOR=0.863;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=43;WE=73302054;WS=73302036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr13	73302157	rs11350390	CT	C	5877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=68;PP=2965;SC=TAGGTACGCTCTTTGTGGTCC;SOR=0.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=100;WE=73302165;WS=73302147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr13	73302378	rs150384029	T	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=424;ReadPosRankSum=3.164;SC=AGTAGACTCTTTTCCACCCCA;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=27;WE=73302386;WS=73302368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr13	73302481	rs4885034	G	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=281;SC=AGGTCTTGGCGAAAGGAGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=73302489;WS=73302471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	73309347	rs9543106	C	T	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=356;SC=ATAGCACTTGCATACTGTTGT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=73309355;WS=73309337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	73317585	rs9600019	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=1.242;SC=AATAAGTTTCCACTTTCTTAA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=73317593;WS=73317575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	73319482	rs141184748	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TGGAAAAGAGGGATGAGGAAG;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=73319490;WS=73319472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr13	73329358	rs10887	G	A	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=62;PP=2093;SC=TCCATAGAATGCCTCTGTCAG;SOR=1.104;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=43;TCR=62;TR=105;WE=73329366;WS=73329348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr13	73343039	rs2196979	C	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=16;PP=493;SC=CTTCAGCATACGTCAGAGATG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=73343047;WS=73343029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	73349359	rs7332388	G	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=18;PP=1114;SC=CATTCGTTCTGTCTCTTCTTC;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=73349367;WS=73349349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	73369642	rs1372000	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=0.485;SC=AGAGCAATATATTAAATTAAA;SOR=0.467;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=18;WE=73369650;WS=73369632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr13	73372202	rs9543124	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=402;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AAGAAGCTTCGGCTTTTTCTG;SOR=0.663;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=22;WE=73372210;WS=73372192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr13	73467847	rs141172083	GAAGT	G	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=76;SC=AGAAAACATAGAAGTAAGGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=73467858;WS=73467845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	73636910	rs113148226	A	AGTGT	534.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=574;ReadPosRankSum=0.073;SC=CAATAGATGTAGTGTGTGTGT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=73636918;WS=73636900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr13	73650108	rs148760123	C	CA	106.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-0.319;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr13	74339104	rs3764134	G	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.723;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=434;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TCATTCGATTGCCCCGGACCC;SOR=1.054;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=34;WE=74339112;WS=74339094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr13	74387518	rs11841865	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=1.097;SC=TTCTGTGCATATCATGCAAAT;SOR=0.439;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=17;WE=74387526;WS=74387508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr13	75860804	rs534538	C	A	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=111;SC=TGTGACTAGGCGCTCAGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=75860812;WS=75860794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr13	75873787	rs2297207	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=1.189;SC=GCAATTCAGTGACCTCCAAGA;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=18;WE=75873795;WS=75873777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr13	75876389	rs2297208	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=549;ReadPosRankSum=1.818;SC=CTAAATCCACGAGAATCGCAT;SOR=2.322;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=29;WE=75876397;WS=75876379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr13	75880667	rs2297209	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.441;SC=AACTTTAGACGTTTGATTGTA;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=6;WE=75880675;WS=75880657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr13	75884216	rs1062087	C	T	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=23;PP=802;SC=GACAGGAATACAACCAGCGGT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=75884224;WS=75884206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	75884290	rs2297203	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=1.098;SC=CAATCCATCTGCAGAGAAGAA;SOR=0.273;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=10;WE=75884298;WS=75884280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr13	75894015	rs2274758	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr13	75898596	rs2297210	C	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=0.473;SC=AATCTTCATTCACTATGAAAA;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=75898604;WS=75898586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	75901749	rs2297206	G	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=279;SC=AATCTTCTTAGTTAAAATAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=75901757;WS=75901739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	75910909	rs693134	C	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.549;SC=AAAAAAGATCCTTTTGTTAAA;SOR=0.293;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=75910917;WS=75910899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr13	75910950	rs9573525	T	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr13	75915215	rs80163254	TAT	CCA	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr13	75915250	rs35018625	T	TA	1028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=761;ReadPosRankSum=0.528;SC=AAGTAGGAAATATCTTCTCAC;SOR=0.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=23;WE=75915258;WS=75915240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,39:0.28:140
chr13	75915859	rs9888477	C	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=1.981;SC=TTCCTGCCTACAAGAAACCTT;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=6;WE=75915867;WS=75915849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr13	75923536	rs3831188	T	TA	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=-1.036;SC=GCTGACTAAATAAAAATAATA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=75923544;WS=75923526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	75936519	rs7983969	C	G	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1458;SC=CGCGCTGCTCCCCTTGGATCT;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=75936527;WS=75936509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	76055397	rs9573565	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=733;ReadPosRankSum=-1.547;SC=CTCCGAGCCCCTGTCTTGCCT;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=38;WE=76055405;WS=76055387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr13	76055820	rs7327548	G	C	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=655;ReadPosRankSum=1.683;SC=TTGGCTTCCCGGGGCCGGGCT;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=49;WE=76055828;WS=76055810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,57:0.74:77
chr13	76111702	rs9543964	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=135;ReadPosRankSum=-0.056;SC=TCGCGGACACAGGACTAGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=9;WE=76111710;WS=76111692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr13	76141091	rs74617651	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=0.328;SC=ATAAAATAAAGCATTCCCTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=76141099;WS=76141081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	76164073	rs35701234	GTCC	G	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=-1.170;SC=TAATTATGTAGTCCTCCTCGC;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=4;WE=76164083;WS=76164063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr13	76169219	rs2274046	T	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTATTGTGTTTACTTAAATTA;SOR=0.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=7;WE=76169227;WS=76169209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr13	76169234	rs7330411	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=354;SC=AAATTAACTGGTTGCCTATAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=76169242;WS=76169224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr13	76210742	rs2224797	A	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.228;SC=CGCGGGGACAACCCCTCCCCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=4;WE=76210750;WS=76210732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr13	76335196	.	GAT	G	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=70;QD=39.5;SC=CAGTTTGTTAGATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=76335205;WS=76335186;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr13	76378459	rs625033	T	C	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=32;PP=1607;SC=AATTTACATTTAAGATGCAGG;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=76378467;WS=76378449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	76383353	rs9530469	C	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=537;ReadPosRankSum=-0.239;SC=AAAATCTGTGCGTGTTGTTTG;SOR=0.986;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=36;WE=76383361;WS=76383343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr13	76383408	rs151237725	A	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=-1.469;SC=ATGTCACTAAATGGGGTTGTT;SOR=0.893;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=19;WE=76383416;WS=76383398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr13	76395278	rs7334674	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=340;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TCAAATGTGTGTCTTTGTGGT;SOR=1.218;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=24;WE=76395286;WS=76395268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr13	76395464	rs41286126	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=643;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AGCAACTTATCCTTCAGAAAT;SOR=0.204;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=34;WE=76395472;WS=76395454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,43:0.75:57
chr13	76409436	rs2273997	A	G	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=606;SC=CTTCAAATCTATCTGTAACAA;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=76409444;WS=76409426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	76410725	rs2273996	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=232;SC=TAAAAGGTTAACACGCAGATC;SOR=2.147;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=76410733;WS=76410715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	76417101	rs920701	C	T	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=162;SC=TGGCTTCAGACAATATTCCAG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=76417109;WS=76417091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	76419421	rs3832886	AT	A	212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=156;SC=AAAGGAGGTTATTTAATGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=76419429;WS=76419411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	76423248	rs7986131	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=395;SC=ATTGGGAACATGACCTCTTCA;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=76423256;WS=76423238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	76429619	rs4885354	C	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=23;SC=TGTATTCGTCCATCTGTGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=76429627;WS=76429609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	76445155	rs9544057	G	C	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=33;PP=1252;SC=TTAAAAACGGGCAGTTTTTAA;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=63;WE=76445163;WS=76445145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	76445189	rs9600566	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=270;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TTCTTTTTAGATGATTATCCC;SOR=0.866;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=18;WE=76445197;WS=76445179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr13	76445316	rs9600567	C	T	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=30;PP=954;SC=ACTCCTGCTCCTTCTCTGAAT;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=53;WE=76445324;WS=76445306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	76457148	rs7987971	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=322;SC=GGTATTCAATAATGCTGGTTC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=76457156;WS=76457138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	76457183	rs9530477	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=465;SC=TTCTTTCCCCTAGCTTTGTAT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=76457191;WS=76457173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	77459221	rs41287030	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GCAGCCAGGGGACAAAGGTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=77459229;WS=77459211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr13	77522725	rs67524409	GACTT	G	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=4.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.073;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
chr13	77522925	rs588702	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=352;SC=GGGAATGAATTATGACAAGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=77522933;WS=77522915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	77527707	rs9530614	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=0.778;SC=TATTCACACTATCACTGGTTG;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=34;WE=77527715;WS=77527697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,39:0.36:108
chr13	77531082	rs78901540	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TTGATGACTACGCTATCCTGC;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=15;WE=77531090;WS=77531072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr13	77531115	rs79145777	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=385;ReadPosRankSum=-0.763;SC=ACGGTTTGTACATCTCCAACT;SOR=0.474;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=26;WE=77531123;WS=77531105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr13	77531652	rs7995462	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=288;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TTCCAGTTTCGGAGCATGAAG;SOR=1.634;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=20;WE=77531660;WS=77531642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,32:0.32:99
chr13	77565972	rs654196	A	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=789;SC=GGACAGGTCAATTCATAAAAG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=77565980;WS=77565962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	77569901	rs605153	G	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=498;SC=GGATATGACAGTAGCAGCATG;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=77569909;WS=77569891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	77589725	rs599115	A	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=24;PP=662;SC=ACTGAAAAGCAAAAAAAATAA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=77589733;WS=77589715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	77725106	rs9574006	C	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=860;SC=ATTATAGAAACCAAATACCAT;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=77725114;WS=77725096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	77732333	rs3861128	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	77739291	rs9318468	A	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=9;NR=3;PP=188;SC=CCACTGCACCAGGCCCCAATT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=77739299;WS=77739281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr13	77835520	rs11436373	T	TA	149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=7;PP=112;SC=TCTTATGTATTAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=77835528;WS=77835510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	78134086	rs3742242	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=0.024;SC=TGAATATTTGCAGCATGCCTT;SOR=1.075;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=19;WE=78134094;WS=78134076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr13	78146301	rs678047	C	T	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=25;PP=984;SC=ACAATGCCTCCTCGAGCACAG;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=78146309;WS=78146291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	78178451	rs6563011	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=2.646;SC=TAGTGCTATACTTTAACATCA;SOR=0.136;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=9;WE=78178459;WS=78178441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr13	78178550	rs2274016	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=498;ReadPosRankSum=-0.817;SC=AATATTACGAGGTAAGACATT;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=35;WE=78178558;WS=78178540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr13	78191824	rs4142585	G	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=6;PP=423;SC=TAATGTACTTGGGTCAGAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=78191832;WS=78191814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	78272267	rs201380414	T	TGG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=81;SC=CGCCCCCCGCTGGCCTGCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=78272284;WS=78272257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	78272276	rs71102772	G	GC	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=24;SC=CTGGCCTGCAGCCTTTGGGTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=78272284;WS=78272257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	78475313	rs5351	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=-0.609;SC=AGAAACTGAATAGCCACCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=6;WE=78475321;WS=78475303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr13	78477674	rs5348	A	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=27;PP=1131;SC=TGATTCCCACAGAGGCTTTCT;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=78477682;WS=78477664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	79194750	rs35712557	TGA	T	1002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.111;NF=5;NR=12;PP=705;ReadPosRankSum=-0.134;SC=ACATTCTGGATGAGAGAGAAA;SOR=0.697;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=17;WE=79194759;WS=79194740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr13	79213186	.	C	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=173;ReadPosRankSum=1.968;SC=CTACTTCTTTCTGTAAACAAT;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=12;WE=79213194;WS=79213176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr13	79216178	rs9601108	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TTTACTCTAAGAAGTCTGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=79216186;WS=79216168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	79916792	rs374223990	T	TA	1202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=11;PP=1097;SC=ACAATGAAATTAAATACCTGA;SOR=1.432;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=26;WE=79916800;WS=79916782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	79918323	rs2274555	T	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=187;SC=TAGCATAAGATTAAGTTCACT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=79918331;WS=79918313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	79928477	rs9574411	A	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=113;SC=TCATATTTCTATGTAAAATAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=79928485;WS=79928467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	79932617	rs7994560	A	G	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=TCCTGACCCTAACCAAATACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=79932625;WS=79932607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	79939606	rs7319252	C	A	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=427;SC=AAATAAATCACCATTCCTTAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=79939614;WS=79939596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	79939921	rs11279869	TAAGAGA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=344;SC=TTAATATTGATAAGAGAAAAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=79939934;WS=79939911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	80910786	rs4728	C	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.39;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr13	80910792	rs700397	T	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.150;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr13	86369120	rs3825413	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=379;ReadPosRankSum=-0.865;SC=TCTGGGTTAGCAAATCAAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=25;WE=86369128;WS=86369110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr13	87045827	rs9513670	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=374;ReadPosRankSum=-1.617;SC=AATCTAGAGCTAAAGAATTCC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=25;WE=87045835;WS=87045817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr13	88270840	rs4036976	CTGT	C	647.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.844;NF=12;NR=2;PP=572;ReadPosRankSum=0.754;SC=AATGTCCTCCCTGTTGTTGTT;SOR=1.426;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=88270850;WS=88270830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr13	88270860	rs956960	A	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=279;ReadPosRankSum=1.269;SC=TGTTGTTGTCATTGTTGTTGT;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=19;WE=88270868;WS=88270850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr13	88325723	rs61959133	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=1.440;SC=TTTCAGATGGGGTGGGAGGTG;SOR=1.127;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=7;WE=88325731;WS=88325713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr13	93142362	rs722178	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=373;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CATTGTTTCCCGAAAACTCCA;SOR=0.301;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=25;WE=93142370;WS=93142352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr13	94938785	rs1409174	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=272;SC=TACAGGTGCAATAACCTAAAA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=94938793;WS=94938775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	94938808	rs56210803	GAT	G	561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=427;SC=GAAGTAACTAGATATGTCGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=94938817;WS=94938798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	94958100	rs10492630	T	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=51;SC=CTTGTTTACATTTCAAAATTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=94958108;WS=94958090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	95034540	rs9524470	T	C	543.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-0.846;SC=GTCTCTCTCTTAAAACTGTTA;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=19;WE=95034548;WS=95034530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr13	95090692	rs1540979	T	A	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=77;SC=TAGCAGTCCTTTTGCATGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=95090700;WS=95090682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	95096505	rs7339198	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=104;SC=CAAGTATTCCGAAATCTGAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=95096513;WS=95096495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	95097956	rs755684	C	T	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=62;PP=2047;SC=AGTAGAGCCTCCCAGGCTCAT;SOR=0.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=107;WE=95097964;WS=95097946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr13	95118735	rs12864325	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr13	95118741	rs12877849	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr13	95254382	rs9556404	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=278;SC=CCGCCGGCTGAGTCCGCCGGC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=95254390;WS=95254372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	95264604	rs9524559	C	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=31;PP=864;SC=ACCCAGATGCCGAAGGGAATC;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=95264612;WS=95264594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	95275576	rs4296139	C	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=2.516;SC=GAAAGAAAATCGTTTATTCTG;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=23;WE=95275584;WS=95275566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr13	95279505	rs9524568	T	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-0.549;SC=TTTTTTTTCATACATTTAGTA;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=15;WE=95279513;WS=95279495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr13	95673791	rs3742106	A	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=387;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AAACTAGTGGAAAATGCCTTC;SOR=0.714;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=30;WE=95673799;WS=95673781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr13	95673939	rs9524765	A	G	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=38;PP=1037;SC=AAGTATACCTAGAAAAAAAAA;SOR=2.511;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=50;WE=95673947;WS=95673928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	95696470	rs12875235	T	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=365;ReadPosRankSum=0.189;SC=TGTTTCCCATTTACACACTTA;SOR=1.580;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=17;WE=95696478;WS=95696460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr13	95714942	rs11568656	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGGTAAGGACGCTATGACTTG;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=95714950;WS=95714932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr13	95714976	rs1751034	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.572;SC=TGATTGACATCTTCTTCCTTA;SOR=1.241;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=8;WE=95714984;WS=95714966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr13	95726541	rs1189466	A	G	5002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=82;PP=2965;SC=GACGGACGGCAAACCAGCGGG;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=161;WE=95726549;WS=95726531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr13	95727780	rs1678339	T	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=888;SC=GAGAAGATGATAAGTGGGAAA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=40;WE=95727788;WS=95727770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	95727861	rs11568672	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AAAAACCTGCGGCCTCCCAAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=95727869;WS=95727851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr13	95735604	rs1189437	G	T	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=915;SC=AAAAATACTTGCATGAGTTGT;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=95735612;WS=95735594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	95829843	rs2296653	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GCAGGGGACAGTGTGGGGAGG;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=95829851;WS=95829833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr13	95829870	rs1751005	T	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=310;SC=GACACCAGAGTAGGATGAGCT;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=95829878;WS=95829860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	95847020	rs2274403	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=477;SC=GTAACACCTCAAAATTCTCTA;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=95847028;WS=95847010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr13	95859974	rs2274408	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TGTGAAAACATAGTAAAACTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=95859982;WS=95859964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	95860288	rs2274410	C	A	63.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	95861804	rs899494	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=413;ReadPosRankSum=-0.952;SC=CAGTCACTGCAATCGCCTGCA;SOR=1.189;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=22;WE=95861812;WS=95861794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr13	95861981	rs1678403	C	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=24;SC=TGGGTTTACACCTGCTAAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=95861989;WS=95861971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	95862873	rs4148472	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=488;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GTGAGCCCCTGCCTCCAGAAA;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=30;WE=95862881;WS=95862863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr13	95862896	rs899496	A	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=805;ReadPosRankSum=1.444;SC=ATAAAAGGGGAAAGAGGGGTG;SOR=0.570;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=46;WE=95862904;WS=95862886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr13	95863143	rs899497	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.884;SC=GACCAGATCTAAGCACAAGCA;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=95863151;WS=95863133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr13	95900172	rs145006616	G	GCACACACACACACACA	96.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.63;QD=32.12;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	95921534	rs3047283	TACA	T	1251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.871;NF=6;NR=11;PP=777;ReadPosRankSum=0.894;SC=ATACAGAGCCTACAACCTGTC;SOR=0.873;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=17;WE=95921544;WS=95921524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr13	95953405	rs61974974	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=261;ReadPosRankSum=0.272;SC=CAGCCGCAGAGGGCTTGGGCA;SOR=0.381;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=21;WE=95953413;WS=95953395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr13	96230279	rs1325774	T	G	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=902;ReadPosRankSum=1.054;SC=AAGAGCTCGCTGGCAAGCTGC;SOR=0.665;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=56;WE=96230287;WS=96230269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr13	96239805	rs11070136	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=711;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCGGGCTTGGGAGAATCATCA;SOR=1.032;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=44;WE=96239813;WS=96239795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr13	96258386	rs9556491	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TGATGGTAGCCAAATATGCCG;SOR=0.535;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=12;WE=96258394;WS=96258376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr13	96258410	rs7319952	A	G	731.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=493;ReadPosRankSum=0.354;SC=ACTAGTCAAGATACATACAGA;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=28;WE=96258418;WS=96258400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
chr13	96270202	rs17268561	A	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=788;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GAGCATCTGGAGGAACGAGGG;SOR=0.891;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=50;WE=96270210;WS=96270192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr13	96285672	rs3742151	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=104;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CACTGTGGCTCACGCCTGTAA;SOR=0.184;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=10;WE=96285680;WS=96285662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr13	96293523	rs61975171	A	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=1.746;SC=CTGGATTATGAATCGTGCTCA;SOR=0.313;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=32;WE=96293531;WS=96293513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr13	96293631	rs9561921	G	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=500;ReadPosRankSum=0.514;SC=TTCCTTGAGCGTCTTGATCTC;SOR=0.452;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=41;WE=96293639;WS=96293621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
chr13	96506664	rs11070154	A	G	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=65;PP=2088;SC=CACAAAATGGAGTATACCCAT;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=96506672;WS=96506654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr13	96529376	rs10601193	TCTGC	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=1;PP=105;SC=GGCCTTGTGATCTGCCTGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=96529387;WS=96529366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	96540141	rs9525075	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.46;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	96540141	.	TTT	CTC	385	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=8;PP=385;QD=21.9233937431;SC=TTCACTCAGATTTACCTTTCT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=96540151;WS=96540131;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	96540143	rs9525076	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	96540204	rs12876018	T	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=368;SC=TTTATCTTCATGTTGATAATC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=96540212;WS=96540194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	96555149	rs33949518	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=-0.133;SC=GAGTAAATAGCTGTAGCAATT;SOR=0.340;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=10;WE=96555157;WS=96555139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
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chr13	96599445	rs9556513	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=388;SC=AGAAGATGAACAAGGACTGTT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=96599453;WS=96599423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	96636170	rs9562008	G	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=234;SC=GTTTAGAACTGATCTATATAA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=96636178;WS=96636160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr13	96641695	rs555120	T	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=543;SC=AATTGAAAAGTACTTAAAAGT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=96641703;WS=96641685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	97079618	rs9556587	A	G	100.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GTAGATCTCAATGAAGGTTAG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=97079626;WS=97079608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr13	97639414	rs9284174	C	T	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1349;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CAGTCAAAATCAGGTTGTACC;SOR=0.492;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=70;WE=97639422;WS=97639404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,75:0.70:107
chr13	97986448	rs16952071	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=161;ReadPosRankSum=-1.532;SC=TGCTTTTGTGCATAAGAAGTG;SOR=0.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=97986456;WS=97986438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr13	98017211	rs3825422	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=1.519;SC=ATACTGGCTTAAAATAAGTCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=98017219;WS=98017201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr13	98087096	rs3803251	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=23;PP=601;SC=GTCCCGGGGCTGGAACTCCCC;SOR=1.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=98087104;WS=98087086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	98629334	rs9517155	G	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GGGCGGGCCCGGGGCCCCAAC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=23;WE=98629342;WS=98629324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr13	98634572	rs11620106	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGGAACTTGATAAGTAACCCT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=98634580;WS=98634564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	98640318	rs592246	C	T	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.97;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	98640386	rs588144	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GGTCTTTGTGACAATATAACC;SOR=0.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=18;WE=98640394;WS=98640376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr13	98645580	rs56411106	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=0.061;SC=AGAATATAATGAATATCCTTT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=98645588;WS=98645570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr13	98650024	rs651241	G	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TGTGTCACATGTTATAAGTAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=98650032;WS=98650014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	98658358	rs633161	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=436;ReadPosRankSum=1.243;SC=TTTCCTTTGAGGTAATAATTT;SOR=1.685;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=23;WE=98658366;WS=98658348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr13	98666549	rs6491395	T	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=308;SC=AAAAAAAATTTGAGACAGGGT;SOR=4.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=98666557;WS=98666539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	98670641	rs528546	G	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.312;SC=TTGCCTGTATGAGGAATATCA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=98670649;WS=98670636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr13	98829176	rs628778	T	C	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=59;PP=1779;SC=CCATGTCCTCTGGCCCCACAG;SOR=0.984;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=102;WE=98829184;WS=98829166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr13	98896776	rs7318267	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=1.123;SC=CTCAAAGCCACCGGCTCCTCC;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=12;WE=98896784;WS=98896766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr13	99042158	rs9582224	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=251;ReadPosRankSum=0.245;SC=TCCTATTTCAGTGGTGTATCT;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=23;WE=99042166;WS=99042148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,23:0.26:87
chr13	99061556	rs5806061	C	CT	1923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.254;NF=23;NR=19;PP=872;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AAAAAAATTACTTTTTTTTTC;SOR=0.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=42;WE=99061564;WS=99061546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr13	99062978	rs2291175	G	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=347;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TCTTTTGCTGGGTTTTGCAGA;SOR=0.505;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=31;WE=99062986;WS=99062968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,39:0.32:122
chr13	99063106	rs117039391	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=238;ReadPosRankSum=0.361;SC=CAAAAGCATTCGATTACATGA;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=20;WE=99063114;WS=99063096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr13	99076686	rs9584843	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CAACGATAACATTCCATGACC;SOR=0.317;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=13;WE=99076694;WS=99076676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr13	99076998	rs74111050	T	C	120.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCCATCAGCATGCATCACCTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=99077006;WS=99076988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr13	99092052	rs4772080	G	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=0.136;SC=TTTCCGATTTGGGTTTTTCCA;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=99092060;WS=99092046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr13	99093094	rs2146998	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=15;PP=425;SC=AGTGGAGGTATGCAGGGGCAG;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=99093102;WS=99093084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	99098318	rs2274053	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=573;ReadPosRankSum=-1.238;SC=GGCAGGTGCCCGCTGTGCTTC;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=39;WE=99098326;WS=99098308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr13	99098470	rs2274054	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=0.683;SC=GTAAGTGTCTCGCACAGGGCA;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=25;WE=99098478;WS=99098460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr13	99098882	rs2281766	A	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=998;ReadPosRankSum=1.234;SC=GCAGAAGCTGACCCCGAAAAG;SOR=0.504;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=48;WE=99098890;WS=99098872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,55:0.71:78
chr13	99100547	rs12261	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=695;ReadPosRankSum=-0.394;SC=ACGTGTTGAGTCACAAAGAGT;SOR=1.132;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=37;WE=99100555;WS=99100537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr13	99112468	rs112280830	T	TGCCTGAC	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=893;SC=CGCAAGGTGGTGCTGACAGCC;SOR=3.258;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=11;WE=99112476;WS=99112458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	99112680	rs4771305	C	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=23;PP=777;SC=AAGGCCTCTTCGGGATGTCTT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=99112688;WS=99112670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	99112754	rs4772083	TT	GC	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=664;SC=TGGCAATAATTTAATAAACCT;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=13;WE=99112763;WS=99112744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	99115927	rs2296149	A	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=26;PP=1126;SC=TGCTTGGGTCACTCAGGGGCC;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=58;WE=99115935;WS=99115917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	99127252	rs9513430	C	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr13	99127496	rs2274055	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=3.485;SC=AAACGGATGTCCTCTTACCTT;SOR=0.720;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=14;WE=99127504;WS=99127486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr13	99356612	rs1339067	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=0.117;SC=CGTCAGTTACAGCAGTGACTG;SOR=1.170;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=15;WE=99356620;WS=99356602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr13	99361959	rs2297319	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=453;ReadPosRankSum=-2.168;SC=TCTCAAAGACGACTCTGATCC;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=31;WE=99361967;WS=99361949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,37:0.29:129
chr13	99447005	rs812808	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=13;PP=576;SC=GGGCAGATCTTGAGGACAGAA;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=99447013;WS=99446995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	99448441	rs9554522	T	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=444;ReadPosRankSum=0.225;SC=AGAAAAATAATGTTTAAAAAT;SOR=0.358;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=32;WE=99448449;WS=99448431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr13	99448623	rs9554524	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=0.836;SC=CTGAAGGACGATAATGGAGGG;SOR=0.919;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=17;WE=99448631;WS=99448613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr13	99449330	.	C	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=172;ReadPosRankSum=-1.306;SC=AAACCCCTAACCAAGAACTCC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=14;WE=99449338;WS=99449320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr13	99449579	rs1289314	T	C	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=58;PP=2684;SC=CAGCATCTCCTTCCCGAATGA;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=125;WE=99449587;WS=99449569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	99449755	rs1289315	G	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=0.311;SC=TAGACAAAGAGCAAAGATTTT;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=34;WE=99449763;WS=99449745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr13	99457431	rs2296984	T	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=491;ReadPosRankSum=0.186;SC=CCTGGATGTATGCATACTTAG;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=40;WE=99457439;WS=99457421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
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chr13	99459891	rs9557078	A	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=105;ReadPosRankSum=-1.682;SC=CATTGCTATGAAACTTATCCA;SOR=0.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=10;WE=99459899;WS=99459881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
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chr13	99534048	rs6491461	G	A	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=11;PP=638;SC=TTTCTTAAATGTAATGTTCAG;SOR=1.044;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=99534056;WS=99534038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	99536031	rs9517474	G	A	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=21;PP=1211;SC=TTTGTCACAGGGCAGCAACTG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=99536039;WS=99536021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr13	99537202	rs2274641	C	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=6;PP=359;SC=ATTGGGATGACCCAATCTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=99537210;WS=99537192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	99537217	rs2274642	G	T	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=9;PP=442;SC=TCTTAAAATGGGACATACCCT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=99537225;WS=99537207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	99537942	rs2296998	G	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=340;ReadPosRankSum=-0.642;SC=AAAATCAAAGGAATGGTAAGC;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=27;WE=99537950;WS=99537932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr13	99538711	rs6491465	C	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=645;SC=CTTGAATTTTCCTTTACCAGG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=99538719;WS=99538701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	99538935	rs6491466	C	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=523;ReadPosRankSum=0.568;SC=AGAAATTAAACTTGGATATAT;SOR=0.236;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=26;WE=99538943;WS=99538925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr13	99540394	rs3737021	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
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chr13	99540406	rs3737023	A	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr13	99540500	rs2274643	A	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=507;ReadPosRankSum=0.593;SC=ACAAAACAGAATAAGAAAAAA;SOR=1.209;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=30;WE=99540508;WS=99540490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr13	99550351	rs2296999	T	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=183;ReadPosRankSum=0.511;SC=TCTTTGTCTCTGAACAACAAA;SOR=0.328;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=15;WE=99550359;WS=99550341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr13	99555187	rs35240640	AT	A	913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=9;PP=482;SC=ACCTCTGCCTATTTTTTTTTT;SOR=2.368;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=25;WE=99555195;WS=99555177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	99566730	rs41279134	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=319;ReadPosRankSum=0.089;SC=GGCCGTTTCTCTTAGGTGCCT;SOR=0.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=22;WE=99566738;WS=99566720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr13	99574524	rs7983462	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=383;SC=TTTACTGAAGCACCCATTGAC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=99574532;WS=99574514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	99575568	rs12428661	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=329;ReadPosRankSum=-1.904;SC=CATCTTTGTCGACCTCCTCGT;SOR=0.729;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=31;WE=99575576;WS=99575558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,38:0.31:121
chr13	99575775	rs7989935	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=1.691;SC=CATCTATGCCCTTGCTTTTCA;SOR=1.230;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=8;WE=99575783;WS=99575765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr13	99578219	rs12429249	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=0.358;SC=AACAGAAAGACGTGATTTTTG;SOR=0.307;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=99578227;WS=99578209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr13	99853443	rs7338947	T	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=14;PP=526;SC=CCCCAGGTGCTCTGCCCAGGA;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=99853451;WS=99853433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr13	99948031	rs41280144	G	A	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1408;ReadPosRankSum=1.365;SC=TACTCAGGCAGGTCATAAAGT;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=85;WE=99948039;WS=99948021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,95:0.63:151
chr13	99948178	rs2230342	C	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=768;ReadPosRankSum=0.803;SC=TATCAGAAATCACCAAATTTG;SOR=0.865;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=41;WE=99948186;WS=99948168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr13	99970429	rs56695114	CT	C	813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=506;SC=TCTCACCATTCTTTTTTTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=25;WE=99970437;WS=99970419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	99992487	rs1927725	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=171;ReadPosRankSum=-1.481;SC=CCGTGTGCAGTGTCTGGAGGC;SOR=0.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=12;WE=99992495;WS=99992477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr13	100199224	rs3751373	C	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=718;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CAGCCTTTCACGATTTGTGTT;SOR=0.286;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=35;WE=100199232;WS=100199214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr13	100207889	rs139130549	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=1.610;SC=GCTATTTCCACCTATGTGCAG;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=7;WE=100207897;WS=100207879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr13	100515161	rs10648017	A	AGACTT	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=804;SC=CTCAGGTCAAAGACTTAAATA;SOR=2.124;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=15;WE=100515169;WS=100515151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	100517409	rs7317032	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=583;ReadPosRankSum=0.483;SC=ACGAGCAATAGAAAGCCTGTT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=28;WE=100517417;WS=100517399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,30:0.83:36
chr13	100518400	rs2390354	T	A	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=157;SC=CCAGGGAGGTTTAGATATCTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=100518408;WS=100518396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	100518580	rs3783185	A	G	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=25;PP=1022;SC=TCTCCAAGCCATAGATCTGGT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=100518588;WS=100518570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	100523386	rs3742254	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=36;ReadPosRankSum=0.277;SC=GAAACAAATATGTTGTGTGAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=100523394;WS=100523376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr13	100537221	rs912283	T	C	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=2113;ReadPosRankSum=1.249;SC=ACTTGTGTCCTTCTATTCAGG;SOR=0.484;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=48;WE=100537240;WS=100537211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,69:0.56:123
chr13	100537232	rs912284	T	C	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=2113;ReadPosRankSum=0.869;SC=TCTATTCAGGTAGGTCGGTAT;SOR=0.460;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=53;WE=100537240;WS=100537211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr13	100537376	rs912285	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=262;ReadPosRankSum=1.341;SC=GAGGCCTGGCGCCTCCCCACA;SOR=1.012;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=17;WE=100537384;WS=100537366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr13	100622667	rs71114653	TGGC	T	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=1.803;QD=10.09;ReadPosRankSum=2.189;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	100637102	rs9585308	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=2.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-1.828;SC=CCCCCTCAGGTCCTTCTCCCT;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=100637110;WS=100637098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr13	100638193	rs72656054	A	T	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.826;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=994;ReadPosRankSum=0.169;SC=ATAAAAAAATAAAAACCCACA;SOR=1.045;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=57;WE=100638201;WS=100638183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,79:0.68:117
chr13	100638251	rs72656056	T	G	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1364;ReadPosRankSum=1.395;SC=CCACGTTCTTTCCCACCCTGT;SOR=0.464;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=81;WE=100638259;WS=100638238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,130:0.63:207
chr13	100807416	rs3215976	T	TA	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	100921056	rs4306370	A	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=545;SC=CCTAAGAAACATTTATAAAGC;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=100921064;WS=100921046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	100945533	rs9300598	G	A	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=54;PP=1969;SC=TTGAAATTCTGTGAAGGCTAT;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=92;WE=100945541;WS=100945523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	100945603	rs8002928	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=231;ReadPosRankSum=0.255;SC=TTCCAGAAAGATTTTAGAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=14;WE=100945611;WS=100945593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr13	100962156	rs35719359	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=302;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TAACTATGTTATTCGAGGTAA;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=23;WE=100962164;WS=100962146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr13	101020695	rs9518061	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=431;ReadPosRankSum=0.204;SC=ATATAAAATTATTAACTCTTT;SOR=0.358;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=22;WE=101020703;WS=101020685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr13	101077774	rs62619988	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-1.137;SC=AAACATGACAGGTTGTTTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=101077782;WS=101077764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr13	101144108	rs12428535	A	C	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=40;SC=AAAATATTTTAGTGAATATGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=101144116;WS=101144098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	101167798	rs142646074	G	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=423;ReadPosRankSum=1.200;SC=GGTGGTGGCCGTCTCTGTCAA;SOR=0.919;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=25;WE=101167806;WS=101167788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr13	101180056	rs72661023	C	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=525;ReadPosRankSum=-2.111;SC=GATGGAGGAACGCCCACCTTT;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=30;WE=101180064;WS=101180046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr13	101182535	rs41281122	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=-3.281;SC=ACGTTTACGTCGTCATTTATT;SOR=0.256;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=19;WE=101182543;WS=101182525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr13	101264908	.	TACACACACACACAC	T,TACACACAC	244.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.157;NF=0,0;NR=7,7;PP=298,733;ReadPosRankSum=0.157;SC=GATCATGTAATACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7,7;WE=101264929;WS=101264898;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.88:8
chr13	101286924	rs1890861	T	C	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=132;SC=AAACCATACATAACAAAGAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=101286932;WS=101286914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	101287365	rs946838	T	C	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=961;SC=GGACACGCTCTGCGACCACGA;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=101287373;WS=101287355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	101287404	rs2297943	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=20;PP=586;SC=GGTTACTCGCGGGGAGAAATG;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=101287412;WS=101287394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	101288688	rs9518119	G	C	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=169;SC=GTCCTTAGACGTGACTTCCAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=101288696;WS=101288684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	101289969	rs3809372	C	T	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=47;SC=GCAAGGACATCGCAAAGCCCC;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=101289977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	101289998	rs7985718	C	A	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=36;PP=1362;SC=CTGATTTTCACATAAAAGTGT;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=101290006;WS=101289988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	101316313	rs1298168	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=234;SC=GCCACGCTGGCCTTCTCTGCA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=101316321;WS=101316303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	101321067	rs2791680	T	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=713;SC=AAAACAACACTGTATAAATAT;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=101321075;WS=101321057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	101322446	rs189936808	T	C	444.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=332;ReadPosRankSum=1.651;SC=AGCCCCCTGATTGGGAAGGCA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=16;WE=101322454;WS=101322436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr13	101712026	.	C	CT	31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=31;QD=18.5;SC=TTTCCGTTGCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=101712034;WS=101712016;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	101712426	rs2274085	G	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=76;SC=CCTGCATGACGGGTGACCTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=101712434;WS=101712416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	101735026	rs12430032	T	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=514;SC=ACCGCTTAAGTAGGAAATATC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=101735034;WS=101735016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	101735211	rs17677552	G	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=28;PP=1052;SC=CCAAAGGTACGGTCACCGGGT;SOR=1.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=101735219;WS=101735201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	101736075	rs686141	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=15;PP=707;SC=GGCGAGGCGGAAGATGAAGAG;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=101736083;WS=101736065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	101753023	rs113145864	C	CTG	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=8;PP=846;SC=CCTTGACCTCCAGTTTCAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=18;WE=101753033;WS=101753013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	101753025	rs57703343	GT	G	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=8;PP=636;SC=TTGACCTCCAGTTTCAAGTAA;SOR=1.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=17;WE=101753033;WS=101753013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	101755480	rs9300647	G	T	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=11;PP=775;SC=TGCATTAGAGGTGGACTACTG;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=101755488;WS=101755470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	101755813	rs7331375	C	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=313;SC=TTGTACGTGCCATCTGTTAAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=101755821;WS=101755803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	101769546	rs658424	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.922;SC=AGAACTTCATTGTAGGCAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=101769554;WS=101769536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr13	101795160	rs660622	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	101795317	rs673213	A	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.797;NF=16;NR=4;PP=352;ReadPosRankSum=0.849;SC=AAATCATTTTATTTTCATTAT;SOR=1.164;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=20;WE=101795325;WS=101795307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr13	101795373	rs17484928	C	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=218;ReadPosRankSum=0.752;SC=CTCTGCGGTTCTTTTCTCAAA;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=21;WE=101795381;WS=101795363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr13	101795422	rs661585	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.470;SC=TCGAAACAGCAGATCTTACTT;SOR=0.716;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=24;WE=101795430;WS=101795412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr13	101844246	rs5806198	G	GA	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.759;NF=7;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGATATAATTGAAAAAAAAAT;SOR=0.769;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=9;WE=101844254;WS=101844236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
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chr13	101890040	rs9518352	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=53;SC=TGTTAAAATAATGTGACAGGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=101890048;WS=101890030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	102025429	rs56313970	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=276;ReadPosRankSum=0.485;SC=TATTGACAAATTATAAAAATA;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=19;WE=102025437;WS=102025419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr13	102106276	rs2297700	G	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=1.823;SC=GGGCCGAGTCGGAGCGACGCT;SOR=0.631;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=6;WE=102106284;WS=102106266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr13	102344867	rs981073	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=8;PP=286;SC=TAGTGTGCTCACCTCCTTGAA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=102344875;WS=102344857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	102366742	rs2281990	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=487;ReadPosRankSum=-0.219;SC=GAGATGGAAACCTTTAGTTAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=23;WE=102366750;WS=102366732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr13	102367888	rs9518501	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=177;ReadPosRankSum=1.627;SC=TCATAATCATGATACCTATAT;SOR=0.821;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=17;WE=102367896;WS=102367878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr13	102368056	rs1436266	G	T	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=44;PP=1261;SC=CATTAGAACAGATAAATGCGA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=102368064;WS=102368046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	102698415	rs7337292	A	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=24;PP=710;SC=GTCAAGATCTATTCTAACTCC;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=102698423;WS=102698405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	102698459	rs667685	G	A	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=19;PP=519;SC=GATGCCTTTTGTTCTTGCCTG;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=102698467;WS=102698449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	103257064	rs35697719	CAT	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.64;MQRankSum=1.207;NF=6;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TATACACACACATATATATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=103257073;WS=103257060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr13	103271206	rs4576935	G	A	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=44;PP=1253;SC=GGTAAACTTCGTGTATTTTAT;SOR=1.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=103271214;WS=103271196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	103275386	rs2230854	T	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=45;PP=1233;SC=TTGTGACCAGTGGAGGTATCC;SOR=1.295;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=103275394;WS=103275376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	103282279	rs660832	A	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=562;SC=AGTAAAATGTATGGTACATAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=103282287;WS=103282269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	103282299	rs660811	C	G	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=7;PP=692;SC=GTAGACTTTCCTTGTTTCCTT;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=103282307;WS=103282289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	103289338	rs2274463	C	T	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=173;SC=CCAACCAAACCAAGTCGCTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=103289346;WS=103289328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	103290535	rs613926	G	C	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=30;PP=1613;SC=ACCTTCCCCCGCTCTTTTAAA;SOR=1.234;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=103290543;WS=103290525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	103290574	rs614290	G	A	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=49;PP=2212;SC=GACACTTACCGATTCTTTTTT;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=111;WE=103290582;WS=103290564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr13	103292810	rs634293	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=22;PP=680;SC=TTTATCTGTAGCATGTATTTC;SOR=1.675;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=32;WE=103292818;WS=103292800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	103295485	rs3831118	A	AT	690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=615;SC=CATGGGAATTATCCCTAAGTG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=103295493;WS=103295475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	103295551	rs144831383	CTTCT	C	3401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=24;PP=2429;SC=TAAAGCTTTGCTTCTTTCTTT;SOR=1.550;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=48;WE=103295562;WS=103295541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	103296819	rs35462812	C	CAT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=61;SC=AGTTTGAAAACAGAATTGCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=103296827;WS=103296809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	103297435	rs10713633	CT	C	1116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.327;NF=2;NR=34;PP=605;ReadPosRankSum=0.749;SC=AAAAAAGGGCCTTTTTTTTTT;SOR=2.283;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=36;WE=103297444;WS=103297425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr13	103301537	rs664660	G	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=447;SC=ACTGCCCATCGTATACACTGT;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=103301545;WS=103301527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	103301619	rs3215841	G	GT	254.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=333;SC=TTTGGCTGAAGTATTTCTTCC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=7;WE=103301627;WS=103301609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	103307218	rs673424	C	T	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=246;SC=TCAGATTTTGCGCTTACCTTG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=103307226;WS=103307208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	103307322	rs677248	A	G	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=15;PP=711;SC=AGCCCAAGCAATAGACCTGTT;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=103307330;WS=103307312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	103307360	rs677179	G	A	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=16;PP=863;SC=TGTTTCACGTGAGGCCTTTGT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=103307368;WS=103307350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	103307483	rs672129	G	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=26;PP=763;SC=ATGAGTCAGTGTGGAGATAGG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=103307491;WS=103307473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	103315948	rs9585959	G	C	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=50;SC=AAGACAAATAGTCTTTTTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=103315956;WS=103315938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	103316113	rs7334625	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=14;PP=435;SC=TGTTCATTCTGATATATCTTA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=103316121;WS=103316103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	103328579	rs665479	G	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=133;SC=TTAATTTTATGGTTAAAGCTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=103328587;WS=103328569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	103328619	rs584710	C	A	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=369;SC=ATTTTATAAACAAGCTTTATC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=103328627;WS=103328609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	103330718	rs3806	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=330;SC=TAGTGAATGGGTATAAAAACA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=103330726;WS=103330708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	103339365	rs660207	A	G	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=41;PP=1904;SC=TGGAAATTCAATTCCTCGGCA;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=102;WE=103339373;WS=103339355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	103343014	rs9518809	T	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr13	103346659	rs7981120	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=176;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TTTACTTGAAGATGTCATCGC;SOR=0.223;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=15;WE=103346667;WS=103346649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr13	103346806	rs2390760	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGTCCTTCCCCCCGGCGCCCA;SOR=0.722;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=12;WE=103346814;WS=103346796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr13	103384824	rs9300756	G	A	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=13;PP=602;SC=TGATCTTTACGTTTGGGAGAA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=103384832;WS=103384814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	103385015	rs6491707	A	G	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=47;PP=1803;SC=CTTTAGAGATAGAAGATGCGG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=87;WE=103385023;WS=103385005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	103385299	rs7335290	A	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=20;PP=864;SC=ACTTCGGAAGAAATTCCAGAA;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=42;WE=103385307;WS=103385289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	103385798	rs7983175	T	C	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=25;PP=1025;SC=TCCTTTTGAATTTGCAGGGGT;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=103385806;WS=103385788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	103386116	rs7982465	C	G	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=64;PP=2233;SC=TTCTTCTGACCTGACTCGTGA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=122;WE=103386124;WS=103386106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	103386283	rs7982670	A	G	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=49;PP=2011;SC=TTGAGGGTACATGGAGAGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=103386291;WS=103386273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	103388220	rs9300758	A	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=35;PP=1477;SC=AATGAAGCAGATTTCCTCGGA;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=103388228;WS=103388210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	103391634	rs7322112	C	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=19;PP=743;SC=AGGCCCATTACATCTTTCACA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=103391642;WS=103391624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	103394003	rs1449707	G	A	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=49;PP=1693;SC=CTCCTGGCAAGTCTTCTGTTG;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=83;WE=103394011;WS=103393993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr13	103394613	rs9585986	T	G	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=42;PP=1790;SC=TGGGAAACTGTTATTCTTTTT;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=103394621;WS=103394603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr13	103394716	rs9585987	T	C	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=29;PP=1192;SC=GAGAAATAGATGTGTAGGGAT;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=62;WE=103394724;WS=103394706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	103395819	rs1375720	C	T	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=28;PP=1084;SC=GTAAACTGCCCACTGATTTTA;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=103395827;WS=103395809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	103396716	rs6491708	C	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=560;SC=GCAGTTTTCTCAGAAATAGAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=103396724;WS=103396706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	103397583	rs9582626	C	G	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=35;PP=1420;SC=TTTAACAATGCCTCCTGTTTC;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=103397591;WS=103397573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	103400083	rs1026158	G	A	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=55;PP=2583;SC=GTCTATCTGTGCTTTGCTTCA;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=103400091;WS=103400073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr13	103400729	rs12583104	G	A	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=23;PP=1221;SC=TTTGCTTCCTGGGGAAATGAG;SOR=1.163;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=103400737;WS=103400719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	103402522	rs9300760	C	T	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=39;PP=1693;SC=GGCTTAGACACGTTTCCTCTA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=103402530;WS=103402512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr13	103402772	rs9284197	T	C	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=81;SC=CAAATGAATATTAGAATATAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=103402780;WS=103402762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	103410782	rs1375719	T	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=555;SC=GATGAATTAATAACTGACCAA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=103410790;WS=103410772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	103410914	rs12855785	A	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=16;PP=809;SC=CTTTTGGGGCAACTGTCTTCC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=103410922;WS=103410904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	103445609	rs11441956	G	GT	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=538;SC=CCCTGATAGTGTATAATTTGT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=103445617;WS=103445599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	103474031	rs2148449	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=10;PP=810;SC=AACATTGAGACAGGCTGTATT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=103474039;WS=103474021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	103484060	rs2181676	G	A	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=58;PP=1708;SC=AAGCATTGACGTGTTTTAGAA;SOR=2.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=103484068;WS=103484050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	103484107	rs3825519	C	T	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=31;PP=852;SC=TAGATGGGTGCGGTAGCTCAC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=103484115;WS=103484097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	103491172	rs2281886	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=719;SC=TAGGTTGCAAGTAACAGAAAC;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=103491180;WS=103491162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	103491223	rs7337774	C	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=284;SC=TAAGGACACACGGCTGTCTTT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=103491231;WS=103491213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	103504517	rs1047768	T	C	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1289;ReadPosRankSum=-1.128;SC=GGGATCGCCATGGGAACTCAA;SOR=0.574;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=85;WE=103504525;WS=103504507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,98:0.58:169
chr13	103506509	rs1535729	A	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=5;PP=412;SC=AGCCCCGCCAAGGTTCCTTCC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=103506517;WS=103506499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	103510896	rs3736865	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr13	103511301	rs4150299	T	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=660;ReadPosRankSum=1.345;SC=TGCCATTGGCTCTCCACATTC;SOR=0.823;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=43;WE=103511309;WS=103511291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr13	103511428	rs3918332	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-1.526;SC=GCTAGCAAATGTGTCTCCTGA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=5;WE=103511436;WS=103511418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr13	103514091	rs7982448	T	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.68;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	103518769	rs6491716	T	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=528;SC=TACCACCTTCTTCAGACCCCT;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=103518777;WS=103518759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	103524762	rs4150360	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCCTTTGCTTCTTAAAAGAGA;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=28;WE=103524770;WS=103524752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr13	103527849	rs9514066	G	C	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=78;PP=2607;SC=TAAGGCAAAAGGAAAAACCCA;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=136;WE=103527857;WS=103527839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr13	103527930	rs9514067	G	C	4257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=67;PP=2358;SC=AGATTCTAAAGGAAAGAATAC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=122;WE=103527938;WS=103527920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr13	103528337	rs873601	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=666;SC=ATTAACTGGTGGCACGGTCTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=103528345;WS=103528327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	103698363	rs2301157	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATGAATTCCAATGAAATTCCA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=103698371;WS=103698353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	103698630	rs279940	C	T	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=764;ReadPosRankSum=1.297;SC=AATACACAGACAGTTAAGTAA;SOR=1.217;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=40;WE=103698638;WS=103698620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,47:0.78:60
chr13	103703579	rs8000956	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=514;ReadPosRankSum=1.200;SC=AGATTAAAATTCCCAATGTGA;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=27;WE=103703587;WS=103703569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr13	103705044	rs188096	A	C	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=1007;ReadPosRankSum=0.843;SC=ACAACGAGAGAAACCAGAGAT;SOR=0.679;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=61;WE=103705052;WS=103705034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,72:0.59:122
chr13	106119446	rs2391191	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GGTTTTCAAAGGAGCATTCTT;SOR=0.230;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=18;WE=106119454;WS=106119436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr13	107145463	rs7995379	G	C	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=36;PP=2030;SC=GCCCGTAGTCGCCGCTGACCT;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=97;WE=107145471;WS=107145453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr13	107862841	rs3751448	T	C	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=188;SC=CAAGGTTATATCAGTGAAAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=107862849;WS=107862831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	108955464	rs1224145	C	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	108959080	rs11381410	A	AT	380.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=-0.907;SC=CTATGTTAACATTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=13;WE=108959088;WS=108959070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr13	109282072	rs927855	T	G	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=637;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CATGCAATAGTGCATCCTGAG;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=35;WE=109282080;WS=109282062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr13	109282302	rs9284241	T	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=1.202;SC=ATTAAGGCAGTTCTCCTGGTA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=109282310;WS=109282292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr13	109458889	rs9514920	A	G	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	109459020	rs9301323	G	A	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=11;PP=526;SC=ATGTCTCTTCGCTGCAGTTAC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=109459028;WS=109459010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	109472601	rs2146327	G	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=386;SC=CCGGCTGTTAGTTGGACAGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=109472609;WS=109472591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	109472849	rs9521065	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=463;SC=CACAGCTACAAAGTGAGAGCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=109472857;WS=109472839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	109472933	rs9514924	T	C	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=123;SC=TACGATGATATAGGCGATGTG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=109472941;WS=109472923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	109496928	rs7989802	C	T	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=174;SC=AAAACAAATGCGCACTAATTT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=109496936;WS=109496918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	109550246	rs1337935	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.105;SC=ATAGCATTCTATGAGCAGGAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=109550254;WS=109550236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr13	109550561	rs7322768	A	G	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=933;SC=CGCTATGGACACACTGTGTAT;SOR=2.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=109550569;WS=109550551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	109707827	rs9521141	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=386;ReadPosRankSum=1.873;SC=AGCTGCCAGATACTTTTGATA;SOR=0.633;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=24;WE=109707835;WS=109707817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr13	109717928	rs1431267	A	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=16;PP=1128;SC=AAGTCCCTACAGGAGATGTTT;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=109717936;WS=109717918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	109717946	rs36009562	T	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=342;ReadPosRankSum=-2.660;SC=TTTTATATGGTCTCAGCCACC;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=29;WE=109717954;WS=109717936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr13	109779906	rs3815983	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=487;ReadPosRankSum=0.512;SC=AAGGTCAGCCCTGGGGAGGGA;SOR=0.394;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=30;WE=109779914;WS=109779896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr13	109793246	rs80260507	G	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.895;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr13	109793474	rs28705148	T	C	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=24;PP=1206;SC=CGCCCAAGGTTCACCCAAAGC;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=109793482;WS=109793464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr13	109793720	rs7986595	A	C	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=64;PP=1975;SC=TCAGGGAAGCAGAAGGTAAGC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=123;WE=109793728;WS=109793710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	109832084	rs1033870	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TGGACTGGAGGGCTCAGCTGT;SOR=0.086;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=15;WE=109832092;WS=109832074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr13	109858890	rs11430851	A	AT	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=293;ReadPosRankSum=1.799;SC=AGGTGTTGCTATCACACTTCA;SOR=0.495;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=8;WE=109858898;WS=109858880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr13	110408608	rs1865434	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TTTAATGATACTCTCTGACAT;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=30;WE=110408616;WS=110408598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr13	110434310	rs11618950	G	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=417;SC=CCAAAAAGTGGGAGCAGTGAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=110434318;WS=110434300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	110435302	rs9583424	T	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=14;PP=535;SC=CCGGCGGCGGTGGCGGCGGCT;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=110435310;WS=110435292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	110435953	rs4773092	A	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=31;PP=1164;SC=TGTCCCCGCCACAGGTGTAGG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=110435961;WS=110435943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	110436232	rs3742210	G	A	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=18;PP=565;SC=AGCCGCCCCCGCTCGCCGGGA;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=110436240;WS=110436222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	110807474	rs615742	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=442;SC=GGCCAGGCTTTGAGGCATGCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=110807482;WS=110807464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	110807496	rs616089	T	C	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=707;SC=TGGAAGGGGATGGTTGGAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=110807504;WS=110807486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	110815673	rs2298240	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=115;ReadPosRankSum=-1.972;SC=TCTATTTCTTCTAAGAAACAG;SOR=0.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=7;WE=110815681;WS=110815663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr13	110819457	rs652572	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.81;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	110819460	rs1778817	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.49;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	110819586	rs589985	G	A	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=24;PP=1196;SC=CCCTAGACACGCAAAGAGGAG;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=110819594;WS=110819576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	110821834	rs1838557	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr13	110821844	rs3832901	A	AACAC	475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	110824974	rs2289799	C	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GGCCAACAGGCATGGGGCTTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=110824982;WS=110824964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr13	110827574	rs874203	T	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr13	110828891	rs1975514	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=721;ReadPosRankSum=1.147;SC=GTCTGACAGGTTGACATCTAC;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=41;WE=110828899;WS=110828881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr13	110828922	rs1562173	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=847;ReadPosRankSum=-1.647;SC=GGGGAACACAGGCCTCATCCT;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=52;WE=110828930;WS=110828912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr13	110831451	rs503053	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=0.424;SC=AGGAGACCCATGCACACGAAT;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=110831459;WS=110831441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr13	110831837	rs2131939	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-1.540;SC=AACCAATAGCGTAAGTGAAGA;SOR=0.602;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=20;WE=110831845;WS=110831827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr13	110833564	.	C	T	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=40;QD=18.6928031368;SC=GGGACGTTCACAACCTGCATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=4;WE=110833572;WS=110833554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr13	110833702	rs16975492	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=129;ReadPosRankSum=1.187;SC=CTGGAGTCCCCGGTGGCCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=9;WE=110833710;WS=110833692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr13	110835460	rs72654112	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=533;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GTGAGAAAGACCAACAGTCAG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=34;WE=110835468;WS=110835450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr13	110838703	rs2305080	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.221;SC=TACAACTTCATGCTGCATCAC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=110838711;WS=110838693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr13	110839428	rs9521638	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CTCATTTCTCAATGCTTTGCA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=9;WE=110839436;WS=110839418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr13	110839550	rs536174	T	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=19;PP=744;SC=GCTCTCCCTGTCATGCCGGGC;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=110839558;WS=110839540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	110843985	rs1373744	T	C	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=11;PP=559;SC=ATTTATGGATTTGAAAAAGCA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=110843993;WS=110843975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	110844188	rs7330851	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-0.639;SC=ACAGAAAGACGGCACTTCGGC;SOR=1.179;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=11;WE=110844196;WS=110844178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr13	110844721	rs2241967	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.211;SC=GCATAAAAATCTGTATAGGAA;SOR=0.856;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=9;WE=110844729;WS=110844711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr13	110845314	rs685884	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=214;ReadPosRankSum=2.588;SC=AGAAGTCTCCGCAGTGCACTG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=13;WE=110845322;WS=110845304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr13	110847227	rs505050	G	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=299;SC=ATTCTAGGAAGAGATTGTGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=110847235;WS=110847219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	110850770	rs683309	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.847;SC=GGCACCCTGGTGTCTGCTTGC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=110850778;WS=110850760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr13	110850842	rs995224	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=-1.849;SC=CAGGGGGCCCAGGGGAACCAG;SOR=1.718;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=11;WE=110850850;WS=110850832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr13	110851036	rs995223	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=462;ReadPosRankSum=0.201;SC=AACTACAGCATAAACTCATTC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=26;WE=110851044;WS=110851026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr13	110856085	rs648263	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCTCTCTTTAATATCTCTCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=110856093;WS=110856075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr13	110857823	rs482757	C	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.442;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=553;ReadPosRankSum=1.549;SC=CTTGTAAAAACCACAGAGAAA;SOR=0.766;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=41;WE=110857831;WS=110857813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,47:0.35:134
chr13	110857895	rs677877	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=352;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CCTGTAGAATAAAGATGTAAA;SOR=1.778;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=22;WE=110857903;WS=110857885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr13	110859069	rs9588116	G	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=631;ReadPosRankSum=-0.961;SC=TCCCCTTAAAGGAATAAAAAG;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=46;WE=110859077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,59:0.63:93
chr13	110859690	rs598819	A	G	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=13;PP=1159;SC=TTTTCTCTTTATCTTTTGGAA;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=110859698;WS=110859680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	110859743	rs598893	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=430;ReadPosRankSum=1.286;SC=ATGAAGCCCACTCATACCTTT;SOR=0.445;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=35;WE=110859751;WS=110859733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,45:0.34:134
chr13	110861785	rs645114	C	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=474;ReadPosRankSum=1.656;SC=CTGGGAGAGACAGCATTTTAA;SOR=0.723;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=30;WE=110861793;WS=110861775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr13	110862085	rs77370634	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.554;SC=TCAACCATGACTGCATTATTT;SOR=1.300;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=5;WE=110862093;WS=110862075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr13	110862161	rs41275098	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=225;ReadPosRankSum=0.737;SC=ATATGGGTACCGGGATGCCAG;SOR=1.005;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=18;WE=110862169;WS=110862151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr13	110862268	rs2166207	A	C	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=731;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TTTATTTTCAAACCTCAATAT;SOR=0.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=44;WE=110862276;WS=110862258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,53:0.70:76
chr13	110864396	rs626444	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.232;SC=AAACAGTTTGTCACAAGCTGT;SOR=1.449;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=15;WE=110864404;WS=110864386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr13	110866065	rs3737328	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=344;SC=AAAAGGTGCCCGGCTCTGGAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=110866073;WS=110866055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	110866265	rs9521650	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TCCCACAGCCGTGCTTACCTT;SOR=0.954;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=33;WE=110866273;WS=110866255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr13	110895092	rs41275104	A	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.010;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=920;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CTGGAAGGAAAAGAAAACTTC;SOR=0.557;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=54;WE=110895100;WS=110895082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,69:0.73:95
chr13	110895150	rs41275106	A	G	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=724;ReadPosRankSum=0.874;SC=GCAAATGGAGATGGTTCTGGC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=43;WE=110895158;WS=110895140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,70:0.77:91
chr13	110959356	rs9515185	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=205;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AGCAGCCAGACGCTGAGCCGG;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=13;WE=110959364;WS=110959346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr13	111077197	rs4238272	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=23;PP=1155;SC=CCGGAGTAACGGGACCCAAGG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=111077205;WS=111077187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	111077400	rs58151684	AT	A	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=560;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TAGGCAATACATTTTGTGACT;SOR=1.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=18;WE=111077408;WS=111077390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr13	111077450	rs7326522	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=1.420;SC=TTTTGTTTATGACATAAAACA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=111077458;WS=111077440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr13	111082157	rs3929758	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=0.696;SC=CAGTCATCCACATTACCATAG;SOR=0.527;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=111082165;WS=111082147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr13	111082772	rs62621885	G	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=416;ReadPosRankSum=-2.184;SC=GCCTGGATTGGTCGGTTTCCA;SOR=0.570;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=27;WE=111082780;WS=111082762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr13	111088870	rs4771679	G	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=110;SC=CTCCCAGAATGTTTTCAACTC;SOR=2.093;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=111088878;WS=111088860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	111091149	.	ACC	A	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=13;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=67;QD=40.5;SC=ATTACTCCCCACCCCCCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=111091165;WS=111091139;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr13	111091157	rs9521759	C	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr13	111098017	rs4771680	T	C	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=133;SC=TAAAAAGACATTTTTGAGACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=111098025;WS=111098007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	111098338	rs7988186	A	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=186;SC=CCTAAAAAGTACAAGATCCCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=111098346;WS=111098328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	111102718	rs72657933	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=431;ReadPosRankSum=0.222;SC=GGCATCCCTGCGCTCTACGGG;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=31;WE=111102726;WS=111102708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr13	111118580	rs1927352	G	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=308;SC=TTGCATGAATGACAACCTGGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=111118588;WS=111118570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	111121444	rs9559813	C	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.023;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=1.115;SC=GGCTGATATTCCCCCCAGCCT;SOR=1.783;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=15;WE=111121452;WS=111121434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr13	111121483	rs9559814	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=-1.435;SC=TGAGATCCACATTAAGTCAGA;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=17;WE=111121491;WS=111121473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr13	111121620	rs9583500	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=43;ReadPosRankSum=0.983;SC=AGGACCAGGGCCCAGGGGCTT;SOR=0.627;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=7;WE=111121628;WS=111121610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr13	111130226	rs9559818	G	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=584;SC=GTGTTTTCCTGATTCTCTAGA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=111130234;WS=111130216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	111130519	rs2281974	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.708;SC=AAGGTAAGACCCCAGCCCTCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=111130527;WS=111130509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr13	111132820	rs1475438	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TCTGCTGGGCGCCTCTGTGGG;SOR=1.569;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=14;WE=111132828;WS=111132810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr13	111137167	rs1983930	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=308;SC=CGTGCAGCCCTATGGCTCAGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=111137175;WS=111137157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr13	111145676	rs2391833	G	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=193;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AGGTGTCGAGGGTGGGGACTC;SOR=0.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=20;WE=111145684;WS=111145666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr13	111153934	rs378601	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=251;SC=TCCACCACAGGTGATGGTGTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=111153942;WS=111153924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	111154058	rs439831	T	A	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	111154061	rs409858	T	C	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	111154160	rs2281968	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=429;SC=TCTGTGCTTCGACATCTCTAG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=111154168;WS=111154150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	111155363	rs406174	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=669;SC=CCATGCCACAGACTTGCCAGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=111155371;WS=111155353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	111155428	rs401316	C	T	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=28;PP=1417;SC=GGCCTTGGGGCCCTGTTTAAA;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=111155436;WS=111155418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	111155711	rs4773198	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=480;ReadPosRankSum=-0.963;SC=GTGTCCCTAACGTCTTGTTTG;SOR=1.141;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=34;WE=111155719;WS=111155701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
chr13	111155773	rs438758	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	111155773	.	TGGGGCG	CGGGGCA,CGGGGCG	422	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1,4;NR=10,31;PP=181,422;QD=21.3152613511;SC=CTGGACCCACTGGGGCGGTGG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=11,35;WE=111155787;WS=111155763;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:35
chr13	111155779	rs4773199	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr13	111156021	rs4773200	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=-1.581;SC=AATATTCAAACGGCAGGCGCT;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=7;WE=111156029;WS=111156014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr13	111156047	rs9284254	C	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=158;ReadPosRankSum=-1.118;SC=ACGGCTCAGGCCCGTTAGTGT;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=11;WE=111156055;WS=111156037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr13	111156153	rs9301460	G	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=406;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AGAGTGGAACGACCTTGTGTG;SOR=0.969;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=32;WE=111156161;WS=111156143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr13	111156411	rs414881	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=278;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CTGGCATTGCGTCCTCTTGTG;SOR=0.718;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=19;WE=111156419;WS=111156401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr13	111156499	rs4771683	C	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=22;PP=823;SC=TTGCAGGTTTCCGTGGGGCTC;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=111156507;WS=111156489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	111156773	rs4771684	A	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=138;SC=CTACACTCCTATGCCCAGCAG;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=111156781;WS=111156763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	111158874	rs445348	A	G	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=48;NR=43;PP=1490;SC=CCATGTGCCCAGTGGGCATGA;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=111158882;WS=111158864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr13	111164614	rs422733	T	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=7;PP=201;SC=CAAAAATTGGTTTTATTTTTT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=111164637;WS=111164604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	111164628	rs3074455	TAA	T	291.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	111176393	rs419244	A	G	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.459;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CCACGATGGCAAAGAGGCAGT;SOR=1.352;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=58;WE=111176401;WS=111176383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,68:0.63:108
chr13	111176519	rs375814	G	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=567;ReadPosRankSum=-0.461;SC=AGTACATGGAGCCCAGGCCGT;SOR=2.115;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=26;WE=111176527;WS=111176509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr13	111267706	rs371554585	A	AC	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CACAAACCAGACCCTGAACCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=111267714;WS=111267702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	111268196	rs330551	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr13	111276428	rs57813755	T	C	77.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=54;SC=CTTTTAGGTGTTGGGTTTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=111276436;WS=111276418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	111276642	.	ATTTCT	A	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=89;ReadPosRankSum=1.107;SC=TTTACTTAAAATTTCTTTATT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=111276654;WS=111276632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr13	111277710	rs141397891	TGATG	T	1511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.313;NF=2;NR=22;PP=943;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GAAAGCGTCCTGATGGATTTT;SOR=0.653;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=24;WE=111277721;WS=111277700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr13	111277810	rs330561	C	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=375;SC=ACAGAGACGGCGGGGTGGAGA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=111277818;WS=111277800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	111289915	rs59764598	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=115;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TGTAACACAGAATACTAAGAT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=111289923;WS=111289905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr13	111290880	rs330563	G	A	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.089;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1417;ReadPosRankSum=-2.172;SC=ACCTGAGCCCGCGCAGACCAG;SOR=0.400;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=92;WE=111290888;WS=111290870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,112:0.69:162
chr13	111290967	rs41275128	T	C	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;PP=1305;ReadPosRankSum=1.636;SC=GCTGAAGGCGTACGGTGCTTG;SOR=0.313;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=76;WE=111290975;WS=111290957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,85:0.65:130
chr13	111291044	rs330564	T	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=792;ReadPosRankSum=-1.542;SC=TATTGCAGCTTTTGGTTAAAC;SOR=0.343;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=44;WE=111291052;WS=111291034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr13	111293489	.	A	ATGC	764	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=764;QD=72.4545454545;SC=GCTTCAGACTATGCTGCGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=111293504;WS=111293479;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr13	111293495	rs77891729	C	CT	526.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.94;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr13	111293496	.	G	A	762	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=762;QD=79.6771212547;SC=ACTATGCTGCGTGGCCCACCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=111293504;WS=111293479;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr13	111293496	rs200532591	G	GCA	526.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.94;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr13	111293542	rs10220163	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr13	111293551	rs330569	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,1:0.33:3
chr13	111293585	rs10709696	TG	T	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=142;SC=GCTCTTCTGTTGGCTGTGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=111293593;WS=111293575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	111293847	rs330570	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=432;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GCATGGGTGCGTCTTGTCGTG;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=27;WE=111293855;WS=111293837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr13	111294920	rs11414164	G	GC	2673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=35;PP=1910;SC=GATTGTGGATGCCCCCTCCCC;SOR=0.815;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=49;WE=111294928;WS=111294910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr13	111294999	rs59247777	C	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=956;ReadPosRankSum=-1.522;SC=GCAGCTGGGCCTCTTTCTGGG;SOR=0.494;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=59;WE=111295007;WS=111294989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,67:0.65:103
chr13	111298201	rs75248725	C	T	190.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=1.593;SC=ACAGAAGCTGCGGGAGGCGAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=111298209;WS=111298194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr13	111298392	rs436462	A	G	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=30;PP=1027;SC=GTGTGTCAAAATCATCTGCCA;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=111298400;WS=111298382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	111299718	rs2296661	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	111315249	rs7989346	G	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=420;ReadPosRankSum=-0.975;SC=AGACAGGCCAGAAGACAAAGG;SOR=1.227;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=21;WE=111315257;WS=111315239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr13	111315287	rs78317917	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=932;ReadPosRankSum=0.688;SC=CAGCCAGAGCCCTCCGTGGGT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=22;WE=111315307;WS=111315277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr13	111315299	rs4622384	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=931;ReadPosRankSum=1.045;SC=TCCGTGGGTGTGCCTGTTTTC;SOR=1.040;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=23;WE=111315307;WS=111315277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr13	111315405	rs7993933	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=890;SC=AGCCTATTAAGGGCAAACAGC;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=111315413;WS=111315395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	111315489	rs2296659	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=15;PP=467;SC=CAGCAGATGCACCAAGAGGGA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=111315497;WS=111315479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	111315506	rs376834	A	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=346;SC=GGGAGACAACAATTATAAAAG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=111315514;WS=111315496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	111319754	rs4628819	T	C	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=38;PP=1609;SC=CAATTTCGTTTTCATGATGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=111319762;WS=111319744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	111340101	rs72661692	T	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=0.424;SC=CCACGAGCAATGATTCCTTCA;SOR=1.501;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=12;WE=111340109;WS=111340091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr13	111350281	rs72661701	C	T	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1160;ReadPosRankSum=-1.908;SC=GAAAATGTTCCTCAAGGACCT;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=78;WE=111350289;WS=111350271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,89:0.62:144
chr13	111358488	rs3818496	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.132;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr13	111364877	rs144160325	A	AG	161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	111365104	rs12875067	A	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=351;ReadPosRankSum=2.150;SC=GGTGTCCATGACACAGGGCGG;SOR=0.446;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=29;WE=111365112;WS=111365094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr13	111368164	rs7338333	T	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=19;PP=683;SC=GTGTCGCCCCTGCCCCTCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=111368172;WS=111368154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	111368316	rs9555726	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-1.536;SC=GGCCGCATCTCTGCTGACCCG;SOR=0.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=14;WE=111368324;WS=111368306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr13	111555680	rs111812847	GTTTTAA	G	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=273;ReadPosRankSum=-0.589;SC=AATCCTGTGCGTTTTAATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=111555693;WS=111555670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr13	111562803	rs35930208	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GGAAAGGGCCTACTATCCTCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=111562811;WS=111562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr13	111566989	rs59070384	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=6;PP=402;SC=GGCACGCCCCACGTCCCCCGC;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=111566997;WS=111566979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	111567039	rs56924528	G	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=15;PP=704;SC=TGGACAGCCGGGGAAAATGGC;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=111567047;WS=111567029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	111806245	rs61966721	A	G	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=706;ReadPosRankSum=0.540;SC=TGTGCTCTGTATTGCAGGTCT;SOR=0.681;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=52;WE=111806253;WS=111806235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr13	111893710	rs57317822	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCTGCGCCCCGAGGTCAGGAA;SOR=0.683;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=19;WE=111893718;WS=111893700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr13	111933098	rs2296353	C	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.108;SC=AGCAAGTGATCAGTTGCTTTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=111933106;WS=111933088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr13	111953317	.	C	T	57	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.9996;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=16;MQ=58.31;NF=0;NR=4;PP=57;QD=22.9428031368;SC=TTTTTTGAGACGGAGTGTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=111953325;WS=111953307;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr13	111953903	rs3742181	T	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=573;ReadPosRankSum=1.216;SC=CATCTTTAAATCTTTTTTTTC;SOR=1.786;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=29;WE=111953911;WS=111953893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr13	111955465	rs1555751	T	C	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=392;SC=CTATAAGGGATGTCCTCAGTT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=111955473;WS=111955455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	111968680	rs7991693	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GGCATGCACACGCCTCCCGCC;SOR=0.144;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=14;WE=111968688;WS=111968670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr13	111980478	rs2479955	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=235;ReadPosRankSum=1.467;SC=AGCGGAGAGCAGAGTGGCTTT;SOR=0.916;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=16;WE=111980486;WS=111980468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr13	111980537	rs1359428	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=0.116;SC=CAGTGTGTGACGTTCCTCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=23;WE=111980545;WS=111980527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr13	111991463	rs9522188	G	C	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=114;SC=GTGCACTCACGCAGGGAAACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=111991471;WS=111991453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	112278338	rs7992732	G	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=647;SC=TCTCAGAATAGCAGTATGAGG;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=112278346;WS=112278328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	112278521	rs7992659	C	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=762;ReadPosRankSum=0.026;SC=GGACCACTTGCCTGAACTTCT;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=39;WE=112278529;WS=112278511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr13	112297362	rs9560147	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=0.503;SC=ACGGAGGCAGCACCTCGAGTG;SOR=0.296;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=112297370;WS=112297352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr13	112297403	rs8000950	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=1446;ReadPosRankSum=0.721;SC=TCGTCCCCTACTGGGGCCAGC;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=36;WE=112297421;WS=112297393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr13	112297413	rs9560148	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=1019;ReadPosRankSum=0.269;SC=CTGGGGCCAGCGCTGTGTCAC;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=30;WE=112297421;WS=112297393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr13	112324912	rs1105513	T	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=306;SC=GATTTGCACTTTGATAACTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=112324920;WS=112324902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	112723111	rs137969745	C	CGGGCGT	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.506;NF=0;NR=7;PP=452;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GGCGCGGGCGCGGGCGTGAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=112723119;WS=112723101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr13	112723232	rs1056121	G	C	113.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=61.34;MQRankSum=0.319;NF=3;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CCGGCGCGGCGTGGCTTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=112723240;WS=112723222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	113032915	rs7324712	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	113032962	rs9550063	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr13	113052388	rs2296895	A	G	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.256;NF=36;NR=29;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.765;SC=AGGAGATTTTAGATCTGAATA;SOR=0.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=65;WE=113052396;WS=113052378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,87:0.59:148
chr13	113052562	rs2296894	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.162;NF=0;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=0.666;SC=AGACCAGCTATTTCTGGGGCA;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=17;WE=113052570;WS=113052552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr13	113053470	rs10816	T	A	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=835;ReadPosRankSum=0.329;SC=GGCATTGAGGTCAAAATTTCC;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=52;WE=113053478;WS=113053460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,68:0.80:85
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chr13	113153114	rs9549532	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=474;SC=GGGCAGGAGATTTGTAATTCT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=113153122;WS=113153104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	113201852	rs75968030	A	G	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=116;SC=AAAGACGTGCATGGGAAAGTC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=113201860;WS=113201842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	113333684	rs7338610	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CATCCTGGGACCTTGTTAGGA;SOR=0.346;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=10;WE=113333692;WS=113333674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr13	113344803	rs3742227	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=-0.978;SC=GGGGACCCGGGGACCAGACAG;SOR=0.385;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=18;WE=113344811;WS=113344793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr13	113439586	rs11616475	G	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=0.314;SC=CTTGGCTTGGGTCTGAGTGTC;SOR=0.899;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=24;WE=113439594;WS=113439576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr13	113464870	.	T	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.644;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr13	113525952	rs1765767	A	G	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=0;PP=202;SC=GTGTTGGCACACAAGAAAAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=113525960;WS=113525942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	113527967	rs1320525	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-1.335;NF=18;NR=32;PP=715;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTGTCTTTTCGCTTCTCTGGG;SOR=0.909;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=50;WE=113527975;WS=113527957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr13	113534907	rs9577174	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=288;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGAGCAGCGATGGGCCCCTCC;SOR=1.474;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=20;WE=113534915;WS=113534897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr13	113534984	rs9577395	C	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=752;ReadPosRankSum=0.585;SC=GGCTGCTGGACGCCGCCCGTG;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=51;WE=113534992;WS=113534974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr13	113536132	rs1290177	T	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=650;ReadPosRankSum=1.312;SC=CTCAGCAGAATGGGTGCGCAC;SOR=0.512;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=42;WE=113536140;WS=113536122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr13	113563351	rs2993328	A	G	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=81;SC=GCTTATGTTTATCCATGCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=113563359;WS=113563341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	113639862	rs2993287	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.735;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr13	113639869	rs3011543	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=2.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	113639872	rs3011542	A	G	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	113656216	rs7986677	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=384;ReadPosRankSum=0.927;SC=CTGACTCGCACTGGGCAGCAT;SOR=0.697;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=27;WE=113656224;WS=113656206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr13	113717022	rs7982214	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=10;PP=369;SC=CCGTGTGCTGGACTCAGCCAT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=113717030;WS=113717012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	113717099	rs76087203	C	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.442;SC=TGTCCAAACCCATGGATGGAG;SOR=1.911;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=113717107;WS=113717089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr13	113720477	rs143965865	G	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=802;ReadPosRankSum=2.146;SC=CCAGGCCACCGTGCAGAGGTG;SOR=0.931;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=52;WE=113720485;WS=113720467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,54:0.71:76
chr13	113735390	rs494129	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=0.047;SC=GCGTCCAGCCTGTGGGCTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=113735398;WS=113735380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr13	113738175	rs491455	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GCGTGGCTGCGGCGTCTCCAA;SOR=1.184;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=14;WE=113738183;WS=113738165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr13	113739518	rs546818	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-1.464;SC=ACCGTGGCCCGGCCTCCCCAG;SOR=0.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=113739526;WS=113739508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr13	113740602	rs2873281	G	A	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=858;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CGCCGCCTCCGTGGAATACAC;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=55;WE=113740610;WS=113740592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr13	113740706	rs1745949	A	G	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=171;SC=GTCCCTAGATAAGCCCACTCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=113740714;WS=113740696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	113741590	rs9604022	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TGCAGGGCTCGTTCAGCGTCT;SOR=0.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=113741598;WS=113741580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr13	113741851	rs514181	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=184;ReadPosRankSum=1.931;SC=TCTGAGGTGGCCACGCTGACA;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=10;WE=113741859;WS=113741841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr13	113742595	rs9324220	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=476;ReadPosRankSum=0.275;SC=CGTGTTTCCTCGGGGGCCTGA;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=27;WE=113742603;WS=113742585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr13	113742805	rs7986589	C	G	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=36;PP=2146;SC=CACAGTCCCCCCATGCGCAAG;SOR=1.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=110;WE=113742813;WS=113742795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr13	113743768	.	T	C	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=2;PP=44;QD=13.1285354245;SC=TCTCATCCAGTCCGTCCGGGT;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=113743776;WS=113743758;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr13	113744139	rs4907483	G	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=414;ReadPosRankSum=1.339;SC=TTCCTGCAGTGTGAAGAAGCT;SOR=1.036;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=32;WE=113744147;WS=113744129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr13	113744441	rs4907588	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=507;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GCGCTTTACCCTGCAGGGTTT;SOR=1.085;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=27;WE=113744449;WS=113744431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr13	113745402	rs41306043	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=744;ReadPosRankSum=-1.703;SC=ACTCTCTCTCCGGTTGTATTT;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=48;WE=113745410;WS=113745392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr13	113745611	rs4907485	T	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=32;PP=938;SC=GGGGATGCTCTCGTGGGTCTT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=113745619;WS=113745601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	113748690	rs7327099	C	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=491;SC=TTTATGAACCCGGGAAGATGA;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=113748698;WS=113748680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	113749475	rs2146752	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=0.105;SC=CATTGTTAATGTCAGAAGCAA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=10;WE=113749483;WS=113749465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr13	113750586	rs12855893	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=157;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AGCTCCCACCGGGGCAGGGCG;SOR=0.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=13;WE=113750594;WS=113750576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr13	113765158	rs36208758	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr13	113776947	rs563964	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr13	113776947	.	TGC	CGA	88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=88;QD=47.1559582874;SC=GATGAGGTTCTGCGGGGCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=113776957;WS=113776941;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr13	113776949	rs3211717	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr13	113783990	rs3211736	C	T	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=418;SC=TCGCTGGCCCCGCTGCTCCGT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=113783998;WS=113783980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	113792754	rs2251102	T	C	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=205;SC=ATTTTTAAATTTCTTTTTTCC;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=113792762;WS=113792744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	113792893	rs2026160	C	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=6;NR=6;PP=166;SC=CTTTTGTTCTCATTTTACTCA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=113792901;WS=113792883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	113801737	rs5960	C	T	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=14;PP=714;SC=GTGGTGGAACCATTCTGAGCG;SOR=0.990;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=34;WE=113801745;WS=113801727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	113801843	rs2031184	A	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=21;PP=766;SC=GGCCGTGGTGAGGGGCACCGT;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=113801851;WS=113801833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	113812962	rs2273971	G	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=519;SC=CTGTCCCAGCGCTCCGGGTGG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=113812970;WS=113812952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	113818708	rs3024731	A	T	205.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=1.593;SC=ACACACCAGAACTCTTGTGTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=113818716;WS=113818698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr13	113818817	.	T	TC	497	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=11;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=64.78;NF=6;NR=14;PP=497;QD=25.15;SC=TTTTTTTTTTTCCTTTTCAGC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=20;WE=113818825;WS=113818795;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr13	113818900	rs564081	A	G	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=26;PP=670;SC=AATCCTACACATGCAGCTGTG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=113818908;WS=113818890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	113826100	rs3024772	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=576;ReadPosRankSum=1.132;SC=CTCATCCCACGCACCAGGGGC;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=45;WE=113826108;WS=113826090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,59:0.45:132
chr13	113833221	rs9549352	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=340;ReadPosRankSum=-1.681;SC=TGAAGCTTCAAATTCTGGGCT;SOR=0.444;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=21;WE=113833229;WS=113833211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr13	113833499	rs486407	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.030;SC=GTGTTCTAAAGGAGTAAAAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=113833507;WS=113833489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr13	113852425	rs546686	C	T	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=889;SC=GCTTCAAGCACAAGATAATGC;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=113852433;WS=113852415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	113854600	rs3751412	T	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=547;SC=TGAAATTACATAAATCATAAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=113854608;WS=113854590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	113854715	rs3751413	C	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TCTGCAGACACCTGTGTGCAC;SOR=1.038;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=68;WE=113854723;WS=113854705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,88:0.62:143
chr13	113862801	rs9549692	G	A	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=9;PP=744;SC=CCGAACGGAAGAAGGGTGGCG;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=113862809;WS=113862791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	113882221	.	C	CA	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=30;QD=16.5;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=2;WE=113882229;WS=113882211;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,2:0.18:11
chr13	113888201	rs2146408	T	C	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=30;PP=1129;SC=TAACTCTGCTTGTTTCTTAGG;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=113888209;WS=113888191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	113888425	rs9549705	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTCTGAAAGCTGCAATCTTGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=113888433;WS=113888415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	113889355	rs2287249	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=235;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TTACTGATACATTTAATTGTT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=17;WE=113889363;WS=113889345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr13	113889474	rs2287250	C	T	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1146;ReadPosRankSum=1.130;SC=GTACCGTTTGCTCGCTGAGCG;SOR=0.747;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=67;WE=113889482;WS=113889464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,90:0.66:137
chr13	113889499	rs2287251	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=1.994;SC=TATCTTCACCATGGCTGGAAG;SOR=0.807;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=28;WE=113889507;WS=113889489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr13	113891075	rs2287253	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.262;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=137;ReadPosRankSum=0.872;SC=CCCATCTTTTGCAGAGAACCA;SOR=2.147;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=10;WE=113891083;WS=113891065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr13	113891359	rs2287254	A	G	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=71;SC=TTAGCCATCCACGGGAGAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=113891367;WS=113891349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	113893625	rs7317558	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AGGCAGCGATGTGGAGACCCG;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=8;WE=113893633;WS=113893615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr13	113893729	rs3794422	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=288;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CTCTGCTGACGTGTACTGCAC;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=22;WE=113893737;WS=113893719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr13	113897320	rs3764124	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=-0.453;SC=CTGAGAAAGACAAAGACATGG;SOR=0.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=23;WE=113897328;WS=113897310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr13	113899004	rs3932499	C	A	324.78	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.09;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	113899004	.	CA	AA,AT	48	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0,0;NR=8,4;PP=48,33;QD=10.3464015684;SC=AAATACAAAACATTAGCCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8,4;WE=113899013;WS=113898994;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:8
chr13	113899005	.	A	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	113900197	rs2302756	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.057;SC=AAAATTACACGGTTTATTTTG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=113900205;WS=113900187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	113907391	rs9549365	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=0.901;SC=TCCTATGCTTAACAGATGATT;SOR=0.631;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=8;WE=113907399;WS=113907381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr13	113909339	rs2302757	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=0.454;SC=AAAAGTCCCAAAGGAAAGGAA;SOR=0.718;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=24;WE=113909347;WS=113909329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,30:0.29:103
chr13	113917767	rs4907602	T	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=9;PP=534;SC=TTTAATGCCATTGTAATTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=113917775;WS=113917757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	113951722	rs7983578	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	113965176	rs9577503	C	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1037;SC=CAGCTTCAGCCGGGGAGGTAG;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=113965184;WS=113965166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	113978969	rs912010	G	A	1352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=27;PP=946;SC=TGGCAGGCAGGCAGACAGGCC;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=113978977;WS=113978959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	113999051	rs4406954	C	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=305;SC=AAAAAAAAAACGGTTTGTAAC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=113999059;WS=113999041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	114083421	rs148154052	A	AAG	1395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.77;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	114087997	rs12874568	T	C	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=142;SC=TGTGAGGTGGTTGTGGGTCAT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=114088005;WS=114087987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	114088341	rs59659705	T	TG	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=1.260;SC=GCCACTCAAGTCCTGCAGCAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=114088349;WS=114088331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr13	114144994	rs150680002	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=1.136;SC=TCTCCCCCGCGCCGCCCGCTT;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=10;WE=114145002;WS=114144984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr13	114149891	rs2261241	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=152;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CCTCCGGACCTGGATCATGAA;SOR=0.721;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=14;WE=114149899;WS=114149881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr13	114150358	rs2261237	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=109;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CTAGAGAGGGAGAGAGAGAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=114150366;WS=114150348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr13	114152755	rs2260218	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CCATGCTTGACGAGATTCTTG;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=72;WE=114152763;WS=114152745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,95:0.52:182
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chr13	114154208	rs2260163	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TCTGTTTAGCGTTCATTCTCC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=114154216;WS=114154198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
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chr13	114155965	rs2490958	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=0.340;SC=TTCCCATCAGGTGAAATCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=10;WE=114155973;WS=114155955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr13	114155982	rs2260086	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CGGGGAACTACGTCCTGTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=12;WE=114155990;WS=114155972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr13	114156093	rs2260080	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=567;ReadPosRankSum=-1.511;SC=GAATGCTGTCCTTGCCTTGTG;SOR=0.394;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=32;WE=114156101;WS=114156083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr13	114157952	rs2260011	G	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TTCACATCATGTGGTTTTGGT;SOR=1.863;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=14;WE=114157960;WS=114157942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr13	114164401	rs2490977	G	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.21;ReadPosRankSum=1.144;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
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chr13	114164431	rs2479746	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=371;ReadPosRankSum=1.545;SC=GTGACCCCAGCGTTGCTTCAC;SOR=3.407;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=18;WE=114164439;WS=114164421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr13	114164526	rs2479745	T	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=695;ReadPosRankSum=1.090;SC=CACTAAAAAGTGTGTGACTCA;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=47;WE=114164534;WS=114164516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,56:0.69:81
chr13	114175004	rs2260334	C	T	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=672;ReadPosRankSum=-1.970;SC=TCTTCATGGCCGTCATGCCGA;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=41;WE=114175012;WS=114174994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr13	114175032	rs2260335	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=654;ReadPosRankSum=-0.526;SC=ACAGGCGGGCGCCAGTGCATC;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=41;WE=114175040;WS=114175022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr13	114178434	rs72568608	TGTCA	T	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.344;NF=7;NR=11;PP=805;ReadPosRankSum=-1.056;SC=TTTTAATATATGTCAGTCAGT;SOR=0.957;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=18;WE=114178445;WS=114178424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr13	114188291	rs2260722	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=579;ReadPosRankSum=-1.400;SC=AAAAACTGAAAGATTATTTTA;SOR=1.031;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=34;WE=114188299;WS=114188281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr13	114193878	rs2257612	C	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.472;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CAGAGTGGTTCTGTAATATGT;SOR=0.158;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=60;WE=114193886;WS=114193868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
chr13	114201742	rs2259387	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=395;ReadPosRankSum=-1.020;SC=AGGCTCAGCATAGCCCTCCCT;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=22;WE=114201750;WS=114201732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr13	114202575	rs2259398	T	C	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=427;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAACTCTGTGTGGGTCCAGTC;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=32;WE=114202583;WS=114202565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr13	114202592	rs2259399	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=488;ReadPosRankSum=1.692;SC=AGTCTTCAGCAGTGACGTAAT;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=34;WE=114202600;WS=114202582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr13	114203670	rs2259482	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=52;ReadPosRankSum=-1.915;SC=TGAGACCAGCCCTGTGCTTTC;SOR=0.027;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=114203678;WS=114203660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr13	114303764	rs17852631	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TCACGTGCTCCGCCATGACCT;SOR=0.824;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=5;WE=114303772;WS=114303754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr13	114309226	rs11164142	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=604;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TCATCACCACGTAGAAGGCCA;SOR=1.134;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=42;WE=114309234;WS=114309216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr13	114312354	rs9285616	T	G	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=298;SC=GTACCCCACCTGGACAGGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=114312362;WS=114312344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	114312605	rs58459344	G	GA	154.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=2.722;SC=GGCCAGGGCCGTTTATCAGCG;SOR=0.495;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=114312614;WS=114312595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	114312606	rs58758822	T	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=290;ReadPosRankSum=2.625;SC=GCCAGGGCCGTTTATCAGCGC;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=114312614;WS=114312595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	114322289	rs9796035	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=384;ReadPosRankSum=1.409;SC=TCAGGGTCCTAGGGAAAGGGG;SOR=1.243;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=22;WE=114322297;WS=114322279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr13	114323997	rs9796234	T	C	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=706;ReadPosRankSum=0.084;SC=CGTCTCACTTTTCAGGGTGCT;SOR=0.685;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=39;WE=114324005;WS=114323987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr13	114453605	.	C	CTGTGTGCACG	1231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.320;NF=2;NR=15;PP=2970;ReadPosRankSum=0.888;SC=GTGTGCATGCCTGTGTGTGCA;SOR=0.952;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=17;WE=114453613;WS=114453595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr13	114498034	rs9577895	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-1.422;SC=AAGAAGCCCCGACCTCGAGCT;SOR=0.053;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=114498042;WS=114498024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr13	114498362	rs28653123	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=1.732;SC=CTCCTCTCAGTAAGTCTCATT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=114498370;WS=114498352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr13	114502416	rs7400029	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=0.045;SC=CTGAGATTCATGTGGGTTTTG;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=10;WE=114502424;WS=114502406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr13	114503915	rs9577890	CA	TG	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=857;ReadPosRankSum=2.626;SC=CCCATATCTACACCTGCGGGA;SOR=0.920;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=22;WE=114503924;WS=114503905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr13	114507836	rs7323732	A	G	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.946;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr13	114507840	rs7332019	G	A	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.15;ReadPosRankSum=1.927;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,43:0.73:59
chr13	114514918	.	T	A	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9999;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=4;NR=4;PP=93;QD=15.9714015684;SC=TTTTTTTTTTTAAAAAAAAGG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=8;WE=114514926;WS=114514908;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr13	114524056	rs7319527	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.196;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CTGGCCCCCCCACCCCCGGCA;SOR=0.096;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=13;WE=114524064;WS=114524046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr13	114524084	rs7319509	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TGGCCAGCCCCGGGTTCCCTC;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=114524092;WS=114524074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr13	114524130	rs41300076	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	114524843	rs41307142	C	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=61;SC=TACCAGAAACCCCAGCCTGTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=114524851;WS=114524842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	114524944	rs7400002	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5133;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GCAGGCCGCCAGCAAAGGTGA;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=17;WE=114524952;WS=114524934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr13	114526617	rs7987377	G	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=387;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GTCCCAGCCGGGGTGGGAAGC;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=32;WE=114526625;WS=114526607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr13	114542858	rs9604573	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=-0.287;SC=ATCATGTTCAGCTGCCCCACC;SOR=0.359;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=25;WE=114542866;WS=114542848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr13	114542942	rs9604490	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	114620051	rs11259844	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAAAATGAGACGTCTAGCGGG;SOR=1.270;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=4;WE=114620059;WS=114620041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	114623880	rs7399982	G	A	3000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=65;PP=1934;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CGTGTATTCAGTGCTGCTTCA;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=210;TCF=93;TCR=117;TR=114;WE=114623888;WS=114623870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,137:0.54:253
chr13	114751040	rs71449038	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr13	114758112	rs3737052	G	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=-2.505;SC=TTATTTAAACGATGCTTTTAA;SOR=0.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=24;WE=114758120;WS=114758102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr13	114772933	.	T	TCC	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=57.72;NF=3;NR=3;PP=130;QD=27.3333333333;SC=CTTACCCTTCTCCCCTCCTGC;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=6;WE=114772941;WS=114772923;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,6:0.29:21
chr13	114773126	rs9562086	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=883;ReadPosRankSum=0.948;SC=AGCCACACATCTGACGTGCAC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=46;WE=114773134;WS=114773116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr13	114774813	rs6560943	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=327;ReadPosRankSum=1.618;SC=AAGAGAACTCCGTCTCCTGAG;SOR=0.525;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=21;WE=114774821;WS=114774803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr13	114778593	rs7322518	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=382;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CTCAGAAAGCCTCGGTCCCTC;SOR=0.201;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=19;WE=114778601;WS=114778583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr13	114778859	rs146849472	C	CTCTCCCTCTCTCTG	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.013;NF=0;NR=10;PP=1382;ReadPosRankSum=-1.538;SC=GTGTCTGTCTCTCTCCCTCTC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=114778867;WS=114778849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr13	114780648	rs2274719	A	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=494;ReadPosRankSum=0.103;SC=GCGCTATGGCAGTTTCTCAGC;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=43;WE=114780657;WS=114780638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr13	114780764	rs2274717	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=-1.083;SC=CCCCAGACTCAGTGATGGCGT;SOR=0.895;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=33;WE=114780772;WS=114780754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr13	114781868	rs2274716	G	A	183.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=0.489;SC=AAAATGCCACGACAGCTCCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=114781876;WS=114781858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr13	114783444	rs7986543	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTGAAAGAAAACCTGAATCAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=114783452;WS=114783434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr13	114787031	rs2274713	T	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GGGCAGCCCGTGTGGAGCAAA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=16;WE=114787039;WS=114787021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr13	114792842	rs3829340	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=927;ReadPosRankSum=1.754;SC=TTCCACTTAACGTTGACCCAT;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=57;WE=114792850;WS=114792832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr13	114795094	.	T	C	182	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9983;HP=4;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=59.22;NF=3;NR=0;PP=182;QD=72.2570708491;SC=ACCTCTAAAATGGCGTCATCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=114795115;WS=114795084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,3:1.00:3
chr13	114795107	.	GT	G	320	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9967;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=61.47;NF=9;NR=0;PP=320;QD=39.2222222222;SC=CGTCATCCTGGTGGGCCAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=114795115;WS=114795084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,9:0.90:10
chr13	114806741	rs9525346	C	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTGGGAGGCCCAGGGGGGAGG;SOR=0.346;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=114806749;WS=114806731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr13	114839462	rs41291225	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr13	115010254	rs3211416	C	T	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=16;PP=1413;SC=TGAAGTGTTACAACCCACAGC;SOR=1.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=63;WE=115010262;WS=115010244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	19685269	rs376856717	C	T	102.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=20.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	19685446	rs370265762	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQRankSum=-2.166;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	19685516	.	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.806;NF=6;NR=7;PP=153;ReadPosRankSum=0.581;SC=GCCCCGGCTGCCCGGGGCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=13;WE=19685524;WS=19685506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr14	19889822	.	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.323;NF=2;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTCCTCGCGGCCGGACCGCGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=4;WE=19889830;WS=19889812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr14	20201561	rs4497603	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.812;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.627;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,63:0.24:258
chr14	20201972	rs4391979	A	C	4541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.593;NF=75;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.489;SC=ATGAGAATCAACAGAATTAGG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=243;TCF=107;TCR=136;TR=175;WE=20201980;WS=20201962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,188:0.73:256
chr14	20202040	rs8011997	T	A	5271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,160:0.75:213
chr14	20202040	.	TTCATA	ATCATA,ATCATG	1452	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=102,47;NR=49,18;PP=1452,1200;QD=9.84616697051;SC=TACTTGCTTATTCATAATGCA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=201;TCF=137;TCR=64;TR=151,65;WE=20202053;WS=20202030;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.75:201
chr14	20202045	rs8006842	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=4.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.763;SOR=1.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,70:0.32:222
chr14	20202389	rs4641652	G	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.625;NF=20;NR=22;PP=567;ReadPosRankSum=1.849;SC=TGCATTTCTGGGCTTGAGGGA;SOR=0.605;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=42;WE=20202397;WS=20202379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,48:0.27:176
chr14	20202554	rs4393497	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=74;ReadPosRankSum=1.374;SC=TATCATGTATATTATAAAGTA;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=7;WE=20202562;WS=20202544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr14	20215561	rs71313488	T	TTCTC	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-5.982;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,17:0.19:91
chr14	20215989	rs17210864	A	G	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=3.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.376;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:353,108:0.23:461
chr14	20216070	.	A	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-0.579;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,94:0.27:347
chr14	20216298	rs12896533	T	C	8401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.845;NF=143;NR=158;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GAACAAGGTCTTCTCTACCTG;SOR=0.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=403;TCF=191;TCR=212;TR=301;WE=20216306;WS=20216288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,354:0.74:481
chr14	20216560	rs12435367	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.402;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,27:0.22:120
chr14	20228354	rs12889503	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-0.626;QD=2.22;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:467,116:0.20:583
chr14	20265265	rs12100572	T	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=2.148;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,58:0.26:219
chr14	20295510	rs7145672	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-5.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.939;NF=22;NR=2;PP=446;ReadPosRankSum=-2.642;SC=TGAAGTACTGCATGTGCCAAA;SOR=0.062;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=24;WE=20295518;WS=20295500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr14	20295627	rs72663752	C	G	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=0.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.949;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.997;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:280,83:0.23:363
chr14	20295763	rs11621854	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.099;NF=13;NR=49;PP=1218;ReadPosRankSum=0.424;SC=TAAAGTCAGACCCTGGGCTCA;SOR=1.066;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=26;TCR=89;TR=62;WE=20295771;WS=20295753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr14	20295778	rs11621883	CC	AG	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.788;NF=12;NR=37;PP=2419;ReadPosRankSum=0.759;SC=GGCTCACAGCCCCCCTCTATT;SOR=0.994;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=49;WE=20295787;WS=20295768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr14	20295834	rs2801164	T	C	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.678;NF=23;NR=23;PP=811;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TACTCCTTCATTGTGGCTCCC;SOR=0.358;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=46;WE=20295842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
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chr14	20296541	rs56930122	C	CAA	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=11;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.276;NF=1;NR=18;PP=261;ReadPosRankSum=-1.620;SC=AAAAAGGGCGCAAAAAAAAAA;SOR=1.965;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=19;WE=20296549;WS=20296531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr14	20296658	rs10140079	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.619;SC=GGGAACTGAAAAAAGAAATTA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=20296666;WS=20296648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	20345346	rs12883767	A	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1103;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AGGTTTCTAAATTTTAATAAG;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=28;TCR=85;TR=59;WE=20345354;WS=20345336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr14	20403909	rs2792148	T	C	5677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=101;PP=2961;ReadPosRankSum=0.273;SC=TTTTCTTTTTTGCCATCTTCT;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=152;TCR=145;TR=205;WE=20403917;WS=20403899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,255:0.71:361
chr14	20404340	rs75008557	A	G	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.985;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,130:0.24:544
chr14	20404736	rs2792146	G	A	7825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=158;PP=2962;ReadPosRankSum=0.527;SC=CTGAGAAACCGTCATGTGAAC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=380;TCF=175;TCR=205;TR=293;WE=20404744;WS=20404726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,333:0.74:451
chr14	20404767	rs2792145	A	G	6075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=1.167;SC=ACTAGGGATCATTACGAAGGA;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=120;TCR=188;TR=239;WE=20404775;WS=20404757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,265:0.73:363
chr14	20404874	rs2792144	C	T	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ACAGAATTGGCTTTTTGTTTT;SOR=0.273;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=46;WE=20404882;WS=20404864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,60:0.74:81
chr14	20444490	rs11158071	C	T	7236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=95;PP=2965;SC=TCACTGTGGTCACTTTATTCT;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=112;TCR=95;TR=207;WE=20444498;WS=20444480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr14	20470399	rs7493807	G	A	7125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=83;PP=2965;SC=TTGAAGCAGGGCTATTTGTAC;SOR=1.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=132;TCR=83;TR=215;WE=20470407;WS=20470389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr14	20482471	rs12590785	C	T	4057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=52;PP=2683;ReadPosRankSum=-0.638;SC=CTGCTTTCATCTCCTCATTTC;SOR=0.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=124;WE=20482479;WS=20482461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr14	20482919	rs17308108	A	C	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=682;ReadPosRankSum=1.766;SC=AGCCAGCACCAGCCTGATGCA;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=62;WE=20482927;WS=20482909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,72:0.39:185
chr14	20501962	rs2775261	G	C	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=213;SC=AAACAAGAGAGTGTCTCTTCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=20501970;WS=20501952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	20502120	rs17277032	C	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=763;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TTTTATCTACCGAGTATCTGC;SOR=1.422;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=44;WE=20502128;WS=20502110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,44:0.39:114
chr14	20528207	rs1958715	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=607;ReadPosRankSum=-1.816;SC=TGAGTAAATGGATCTTAAAAA;SOR=0.801;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=36;WE=20528215;WS=20528197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr14	20528321	rs1958716	A	G	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=903;ReadPosRankSum=0.118;SC=TGCTACTGTGATGGGAAACAT;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=100;TCR=56;TR=63;WE=20528329;WS=20528311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,78:0.42:185
chr14	20528359	rs1959630	G	T	7617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;QD=34.94;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr14	20528359	.	GTCA	TTCA,TTCG	1821	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.17;NF=99,35;NR=77,31;PP=1821,1035;QD=10.5441546167;SC=TGACATGTAGGTCAACCCTTC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=100;TCR=79;TR=176,66;WE=20528370;WS=20528349;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:179
chr14	20528362	rs1958717	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.362;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,92:0.42:218
chr14	20528448	rs112192573	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	2982.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.712;NF=10;NR=34;PP=2964;ReadPosRankSum=0.110;SC=CCCAAGATGATCATAGATTTG;SOR=0.551;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=28;TCR=112;TR=44;WE=20528474;WS=20528438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,84:0.36:236
chr14	20528505	rs2775253	T	A	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=97;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.207;NF=38;NR=37;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.766;SC=GTGACCCAGATGTTCTTCATG;SOR=0.361;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=75;WE=20528513;WS=20528495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,79:0.41:192
chr14	20528528	rs2775254	G	A	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.664;HP=4;HapScore=2;MGOF=74;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=1.104;NF=31;NR=38;PP=1362;ReadPosRankSum=-1.201;SC=CTTCTTTGGGGGTGCTGAGAT;SOR=0.378;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=69;WE=20528536;WS=20528518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr14	20529019	rs1959629	C	T	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=881;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AAACTCTTGCCGTATTTTATA;SOR=1.105;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=51;WE=20529027;WS=20529009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr14	20529043	rs1959628	C	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=747;ReadPosRankSum=-1.876;SC=TTATCACACCCTTACTGAATC;SOR=0.777;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=47;WE=20529051;WS=20529033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr14	20529177	rs1959627	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=-2.630;SC=TTAAATGCTACGATAAGATAG;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=18;WE=20529185;WS=20529167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr14	20665790	rs4981822	T	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=825;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CCCATGTACATCCTGCTCGCC;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=51;WE=20665798;WS=20665780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr14	20665840	rs4981088	G	A	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1015;ReadPosRankSum=0.153;SC=CACCTCCACAGTCCCCAGCAT;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=66;WE=20665848;WS=20665830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr14	20665887	rs4981823	G	C	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=76;PP=2965;SC=AGATCATCTCGTTCTCTGGCT;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=142;WE=20665895;WS=20665877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	20666175	rs55781225	C	CA	4354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.456;NF=17;NR=84;PP=2825;ReadPosRankSum=2.123;SC=CTCTCACTTGCAAAAAAGGCC;SOR=0.865;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=230;TCF=48;TCR=182;TR=101;WE=20666183;WS=20666165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,177:0.49:363
chr14	20666556	rs2318886	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=0.356;SC=AAGGTCCTTGCGTAATTAATC;SOR=3.660;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=15;WE=20666564;WS=20666546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr14	20666587	rs139162797	TA	T	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=0.112;SC=TTTTGGGGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=20666595;WS=20666577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	20692188	rs12891553	T	C	7899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=119;PP=2965;SC=CTCTCTGAGATTAAAACCATC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=120;TCR=119;TR=239;WE=20692196;WS=20692178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr14	20692291	rs34693535	C	T	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=104;PP=2965;SC=ATGATCGGTACCTGGCCATCT;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=80;TCR=104;TR=184;WE=20692299;WS=20692281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	20692453	rs17211285	G	T	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=65;PP=2784;SC=TTGACCACTTGGTGTGTGACC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=131;WE=20692461;WS=20692443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr14	20692574	rs17277221	T	C	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=64;PP=2965;SC=CTTGGGATCTTACACTCTGGT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=139;WE=20692582;WS=20692564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	20692643	rs17277228	T	C	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=77;PP=2964;SC=TTTCTCCACATGTGGGTCCCA;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=157;WE=20692651;WS=20692633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr14	20692999	rs11851950	T	G	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=GCAGTTAAATTCAGCTCATTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=20693007;WS=20692989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	20698068	rs4981844	G	T	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=79;PP=2880;SC=ACCTTTCTGTGGTCCCAACAT;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=126;WE=20698090;WS=20698058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	20698190	rs143726998	C	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.07;MQRankSum=0.974;NF=37;NR=27;PP=999;ReadPosRankSum=-1.604;SC=TCAACCTCACCATGGTGTACA;SOR=0.936;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=64;WE=20698198;WS=20698180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr14	20698239	rs1953558	T	C	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=55;PP=2897;SC=AACTGTGCTTTAGGTTCCTTC;SOR=0.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=130;WE=20698247;WS=20698229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	20698298	rs1953559	T	G	5457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=62;PP=2965;SC=CACACTTGGTTGTTGTGTCTC;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=113;TCR=62;TR=175;WE=20698306;WS=20698288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	20698504	rs1953560	G	A	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=121;PP=2965;SC=CAGAGATCATGAATAGGGTTT;SOR=2.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=40;TCR=121;TR=161;WE=20698512;WS=20698494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr14	20757804	rs3737220	C	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=12;PP=1019;SC=ACTGTGGTCGCGATGCCACTG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=20757812;WS=20757794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	20760349	rs11625081	GC	AA	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=812;SC=GGAAAGAAGAGCAGAAACAGT;SOR=1.981;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=18;WE=20760358;WS=20760339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	20763446	rs1953551	T	C	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=26;PP=2009;SC=AAGGGTAAAATGGGGGAAATC;SOR=2.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=77;TCR=26;TR=103;WE=20763454;WS=20763436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	20764031	rs4981148	C	T	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=857;SC=AGAAGTGTATCCCAATTATAA;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=20764039;WS=20764021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	20764094	rs4981951	G	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=472;SC=TAGGAATCTAGAGAAATAAAC;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=20764102;WS=20764084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	20784718	rs1132644	G	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=11;NR=13;PP=422;SC=CTGAAGAGAGGCCTAAGAAGG;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=20784726;WS=20784708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	20788652	rs11292211	TA	T	516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=483;SC=TTATTGGCTATAAAAAAACAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=20788660;WS=20788642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	20794509	rs884368	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=631;SC=TCTCAAATTCATAATTTATTA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=20794517;WS=20794499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	20813289	rs2297616	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=41;PP=1269;SC=GTCTCTGGTAGGAGTGGATCT;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=20813297;WS=20813279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	20813672	rs3093890	A	G	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=45;PP=1486;SC=CTCAGAGAGCATCCTTTGTTA;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=20813680;WS=20813662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	20815013	rs1713430	C	T	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=47;PP=1864;SC=TCTCTCTCTCCCTTTCTAGGC;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=89;WE=20815021;WS=20815003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	20818602	rs3093902	C	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=2;PP=685;SC=TAACTGGCACCTGTGACGAAG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=20818610;WS=20818592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	20819112	rs3093904	T	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=492;SC=CTTCTCCCTTTCCTGCCTGTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=20819120;WS=20819102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	20820537	rs1760919	A	G	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=1025;SC=CGAAAGAAACACATCTTCTTT;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=20820545;WS=20820527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	20823857	rs142821331	C	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=84;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TTTAGTCATGCGCCTTTTAGC;SOR=0.141;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=20823865;WS=20823847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	20824181	rs3093930	T	C	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=948;ReadPosRankSum=-1.754;SC=ATGAAAGTTATGAGTTCAAAG;SOR=0.430;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=159;TCF=53;TCR=106;TR=79;WE=20824189;WS=20824171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,100:0.51:198
chr14	20824385	rs146647309	TATATC	T	727.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=831;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TCTGCCAAGTTATATCAGAAT;SOR=0.627;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=15;WE=20824397;WS=20824375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr14	20824415	rs3093933	G	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=26;PP=1299;SC=CTTCAGTTCAGCTCAGTCTCT;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=20824423;WS=20824405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	20825013	rs878157	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=292;SC=CTTTAAATTCCTAAAGATACC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=20825021;WS=20825003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	20825321	rs10625811	T	TTTCAC	3697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=40;PP=2931;SC=GAGACAGGAGTATGTCTGTGA;SOR=2.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=44;WE=20825331;WS=20825311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	20825323	rs200223594	T	G	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=39;PP=1209;SC=GACAGGAGTATGTCTGTGATC;SOR=2.155;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=49;WE=20825331;WS=20825311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	20825362	rs3093939	G	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=22;PP=754;SC=GTTTTTTTCCGATGAGAAAAG;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=20825370;WS=20825352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	20825965	rs2700	A	C	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=43;PP=1274;SC=GAATGTTGATATTAAATAAAC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=20825973;WS=20825955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	20836923	rs10531088	GCACA	G	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.722;NF=3;NR=4;PP=304;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GCAGGCGCACGCACACACACA;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=7;WE=20836934;WS=20836913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr14	20837033	rs2104978	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.834;NF=12;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=-1.124;SC=AGGTAGCACATGGAGGGCTGT;SOR=0.848;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=31;WE=20837041;WS=20837023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr14	20844383	rs2228042	C	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TGTGTGGCCGCGTCAGCAGCT;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=67;WE=20844391;WS=20844373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
chr14	20845521	rs2229101	A	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=765;ReadPosRankSum=0.320;SC=AGAGGGACTGAAGGGAGCATT;SOR=0.957;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=49;WE=20845529;WS=20845511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,60:0.38:157
chr14	20846521	rs2297615	A	T	6339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=94;PP=2965;SC=CCCCAAGAGCAACACTGGACC;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=99;TCR=94;TR=193;WE=20846529;WS=20846511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr14	20846950	rs8022805	C	T	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=1058;ReadPosRankSum=0.423;SC=GGCTAGCAGCCGGCAGTCTGG;SOR=1.181;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=57;WE=20846958;WS=20846940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,65:0.53:122
chr14	20848718	rs142580077	ACAATAGTAAGTCT	A	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TGGTGTGTCTACAATAGTAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=20848738;WS=20848708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	20849169	rs2228039	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=518;ReadPosRankSum=0.376;SC=GGTTGGTAAGGAACTTCGAAA;SOR=0.534;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=31;WE=20849177;WS=20849159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr14	20849854	rs12433941	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=404;ReadPosRankSum=1.204;SC=AACTGTCCTCGTGTGAGGAAG;SOR=0.852;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=29;WE=20849862;WS=20849844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr14	20849940	rs12436041	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=0.377;SC=CTCAAATAGCGGAAACTGGAG;SOR=1.490;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=24;WE=20849948;WS=20849930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr14	20850093	rs1713456	C	T	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=30;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CTGGACGAGGCAGGCAAACGG;SOR=0.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=171;TCF=117;TCR=54;TR=88;WE=20850101;WS=20850083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,98:0.52:188
chr14	20851840	rs2297614	A	G	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1095;ReadPosRankSum=0.365;SC=AGTGGGAGAGAAAAAAAAAGC;SOR=0.422;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=61;WE=20851848;WS=20851830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr14	20852029	rs1760904	A	G	6012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=90;PP=2965;SC=AAGACTAATGATGCCACCTTG;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=184;WE=20852037;WS=20852019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	20852267	rs2228041	C	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CAGCATCAGCCGTTGCACTGT;SOR=0.546;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=67;WE=20852275;WS=20852257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,79:0.45:174
chr14	20852817	rs1760903	G	A	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=56;PP=1852;SC=GAGATCCGACGTGCGGCCTCT;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=102;WE=20852825;WS=20852807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	20854734	rs945011	A	G	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=27;PP=1199;SC=CCCGCTCCCCATGCATGTCTC;SOR=1.013;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=20854742;WS=20854724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	20856327	rs76575764	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=0.272;SC=GTTTGGTGACCAGTTAAGTCA;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=19;WE=20856335;WS=20856317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr14	20857600	rs111751048	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=524;ReadPosRankSum=0.365;SC=GGACTCTCACAGAGGGGTACA;SOR=1.218;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=27;WE=20857608;WS=20857590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr14	20858944	rs4981171	T	C	3043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=62;PP=1635;ReadPosRankSum=1.630;SC=TCATGTTATGTGGTTGCACAG;SOR=0.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=143;TCR=142;TR=126;WE=20858952;WS=20858934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,152:0.45:336
chr14	20859013	rs872072	G	A	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=57;PP=1635;ReadPosRankSum=-2.056;SC=ACTGTGTATTGTCTGTGCCTT;SOR=0.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=93;TCR=124;TR=100;WE=20859021;WS=20859003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,110:0.46:239
chr14	20859084	rs872073	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=1009;ReadPosRankSum=1.122;SC=ATGGTGGGTGTTGAGTGTCTG;SOR=0.605;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=55;WE=20859092;WS=20859074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr14	20863677	rs2228036	C	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=386;ReadPosRankSum=0.218;SC=TCATTGCCATCCGAAGCTGCT;SOR=1.512;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=22;WE=20863685;WS=20863667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr14	20864049	rs2228026	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=875;ReadPosRankSum=1.328;SC=CGAGGGCATCAATGGCATCAT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=61;WE=20864057;WS=20864039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr14	20864720	rs77610051	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=505;ReadPosRankSum=-0.742;SC=AAGCAGCAGTGGCCTCTCCAC;SOR=0.288;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=28;WE=20864728;WS=20864710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr14	20864995	rs75786003	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=586;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GAAGGATCACTTGAGCCCAGA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=20865016;WS=20864985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	20865008	rs4982042	C	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=586;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGCCCAGAACCCAGGAATTAG;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=20865016;WS=20864985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	20869019	.	A	AAATCGTTTTCAGT	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CTTATAAATCAAATACAACAA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=1;WE=20869027;WS=20869009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr14	20869819	rs2297612	A	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=521;ReadPosRankSum=-0.261;SC=GCAGATTGTAAGACCATCCGA;SOR=0.467;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=36;WE=20869827;WS=20869809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr14	20871645	rs8009925	C	A	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1585;SC=AAAAAGGGAACTGGCTGTCCT;SOR=1.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=20871653;WS=20871635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	20871973	rs2228035	T	C	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=878;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTGGGCAAATTTGTCCGTCAT;SOR=0.505;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=50;WE=20871981;WS=20871963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,66:0.54:122
chr14	20872101	rs112374310	A	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1074;ReadPosRankSum=0.341;SC=CCTCCAAAACAAAACGAGATC;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=67;WE=20872109;WS=20872091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr14	20872863	rs6413437	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.12;MQRankSum=-1.025;NF=11;NR=21;PP=539;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCGGCAAGAAAGCAGCAATGG;SOR=0.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=32;WE=20872871;WS=20872853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr14	20872881	rs1760898	G	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.886;NF=8;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=0.642;SC=TGGCCAAGATGTTATTGGCCA;SOR=0.763;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=23;WE=20872889;WS=20872871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr14	20873524	rs3762146	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CCCAACATGAAGCTAGTCACC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=20873532;WS=20873514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	20873795	rs111482622	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=641;ReadPosRankSum=-0.198;SC=ACAAGGACCAACTTAAGCATC;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=38;WE=20873803;WS=20873785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr14	20874411	rs61734876	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CTGAAGGACATGGTCAGTAGG;SOR=0.613;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=24;WE=20874419;WS=20874401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr14	20875973	rs1713438	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=495;ReadPosRankSum=1.846;SC=ACTGAAAGCTAGAGACAAGAG;SOR=0.429;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=30;WE=20875981;WS=20875963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr14	20876189	rs10083536	G	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1202;ReadPosRankSum=-2.950;SC=ATCAGCTTGCGTCATGTGAGA;SOR=0.697;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=78;WE=20876197;WS=20876179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,95:0.45:210
chr14	20876253	rs1760897	A	G	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1347;ReadPosRankSum=2.025;SC=TTTAGACTAGAGAGGGTGGCC;SOR=0.855;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=79;WE=20876261;WS=20876243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,91:0.45:201
chr14	20876621	rs41301453	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=287;ReadPosRankSum=0.491;SC=GCTTGTATATGCCTAGAAGGA;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=18;WE=20876629;WS=20876611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
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chr14	20897064	rs7145318	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=834;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TGCTGCACAGCGGGCAGTGTC;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=59;WE=20897072;WS=20897054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr14	20897676	rs1953225	T	C	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1131;ReadPosRankSum=-2.219;SC=GACATTGAGCTCAGGGTTGTA;SOR=0.592;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=70;WE=20897684;WS=20897666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
chr14	20898058	rs79604136	G	C	3440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.992;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=75;PP=1930;ReadPosRankSum=0.577;SC=GGAAGCGTCCGGGGGCAGGCA;SOR=0.889;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=282;TCF=136;TCR=146;TR=136;WE=20898066;WS=20898048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,165:0.51:324
chr14	20898308	rs17242648	C	T	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=720;ReadPosRankSum=-1.043;SC=CCCGGCTGCCCGCACCCTCCG;SOR=0.483;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=48;WE=20898316;WS=20898298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr14	20903349	rs1713408	T	C	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=66;PP=2075;SC=ACATCTTCCCTGGCATTTCCA;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=117;WE=20903357;WS=20903339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	20903906	rs8017603	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=-0.676;SC=AAGGCAGTCCCTCTGGACGGG;SOR=0.886;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=43;WE=20903914;WS=20903896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr14	20916249	rs2275008	T	C	3530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=72;PP=2231;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TCTGTCCCAGTTTTTTACTGC;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=249;TCF=114;TCR=135;TR=131;WE=20916257;WS=20916239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,158:0.53:298
chr14	20916958	rs938883	T	C	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=52;PP=1887;ReadPosRankSum=1.642;SC=GCAGCTCAACTAGCTTCTTGC;SOR=0.595;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=91;WE=20916966;WS=20916948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr14	20916987	rs938882	G	A	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=45;PP=1697;SC=GGGAATAAGCGTACGAGGCAC;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=20916995;WS=20916977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	20917442	rs938881	A	T	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=50;PP=1777;SC=GTGATGAGGAAGTCCATGAAA;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=20917450;WS=20917432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	20919551	rs3120068	C	T	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=136;SC=CCGCAACTTCCGCCTCCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=20919559;WS=20919541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	20919623	rs3120067	T	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=3;PP=96;SC=TGCCACCACATCAAATTAATT;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=20919631;WS=20919613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	20919667	rs3120066	C	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=77;SC=GGTTTTGCCACGTTGGCCAGG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=20919675;WS=20919657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	20919712	rs3120065	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=76;SC=ATGATCCACCCGCCTCGACCT;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=20919720;WS=20919702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	20920043	rs1320150	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=23;SC=CATCTTTGTTCCTGACATTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=20920051;WS=20920033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	20920250	rs2275007	T	C	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=9;PP=559;SC=TATTCCACAGTTGGGCCACAG;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=20920258;WS=20920240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	20920340	rs2275006	A	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.34;NF=9;NR=18;PP=560;SC=TTATAATCCTAGAGATTGGAA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=20920348;WS=20920330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	20920360	rs3215948	A	AG	1012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=803;SC=AAAAAACAATAGTGGGGGACA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=20920368;WS=20920350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	20920749	rs1878703	C	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=346;SC=CACATTTTCACATCTACTCTT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=20920757;WS=20920739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	20925154	rs1130409	T	G	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=77;PP=2892;SC=CTATAGGCGATGAGGAGCATG;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=131;WE=20925162;WS=20925144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	20978531	rs2319198	G	A	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=26;PP=1794;SC=GGAGACCCCAGATACAATGCT;SOR=1.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=20978539;WS=20978521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	21024605	rs8014474	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=897;ReadPosRankSum=0.285;SC=CTCAGAGAACGCTCTGCTAGG;SOR=0.551;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=17;WE=21024627;WS=21024595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr14	21024619	rs1243647	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=897;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGCTAGGGCGATATGACAAAG;SOR=0.342;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=27;WE=21024627;WS=21024595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr14	21024786	rs12590446	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=744;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TGGTATTTCAAATGCTTCTGT;SOR=0.381;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=48;WE=21024794;WS=21024776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr14	21026773	rs891297	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=666;ReadPosRankSum=1.853;SC=TCGGAACATACTCTCACAAGA;SOR=0.462;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=48;WE=21026781;WS=21026763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr14	21058337	rs4981259	C	T	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=147;SC=TCCCCTTCCGCTCAAGGCATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=21058345;WS=21058329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	21108748	rs11621507	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	21108748	.	GC	AT	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=59.52;NF=2;NR=2;PP=37;QD=22.6169687156;SC=AGCTGAGATCGCGCCACTGCA;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=21108757;WS=21108741;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr14	21108749	rs11621774	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	21109141	rs17277522	C	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1076;ReadPosRankSum=0.015;SC=GGCCTTCTGACGGCCTGAAGC;SOR=0.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=64;WE=21109149;WS=21109131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr14	21109170	rs11628297	T	A	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=69;PP=2965;SC=TGCTCAGGACTGCCAGCACAA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=85;TCR=69;TR=154;WE=21109178;WS=21109160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	21109278	rs11627438	A	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=998;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TGTTGGTGCAAGCCAGGCGGA;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=62;WE=21109286;WS=21109268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,68:0.42:162
chr14	21109385	rs11622969	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=566;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AGCACAGGGACGAGTCCCCCC;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=44;WE=21109393;WS=21109375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,59:0.43:137
chr14	21109671	rs11627574	A	G	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1581;ReadPosRankSum=0.860;SC=AGAAGTACATAGGGGTCTGTA;SOR=0.824;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=177;TCF=80;TCR=97;TR=94;WE=21109679;WS=21109661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,102:0.52:195
chr14	21109726	rs11622794	G	A	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1319;ReadPosRankSum=1.239;SC=CACATTGCCTGTCAGATTCAG;SOR=0.669;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=63;TCR=91;TR=69;WE=21109734;WS=21109716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,82:0.46:177
chr14	21109859	rs11156622	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=636;ReadPosRankSum=-0.592;SC=ATTGTCTTTTTCACCTGTCCA;SOR=1.041;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=34;WE=21109867;WS=21109849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr14	21167576	rs3748338	A	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=680;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTTGCTGCTGACCCTGCTGGG;SOR=0.821;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=44;WE=21167584;WS=21167566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr14	21250124	rs1045922	G	A	5943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=113;PP=2965;SC=AAAAATCGTCGGCACAACTGC;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=79;TCR=113;TR=192;WE=21250132;WS=21250114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr14	21250366	rs7156801	T	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=435;SC=ATTGCATCCATGTTTTCTTTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=21250374;WS=21250356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	21360344	rs2233860	G	C	6592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=105;PP=2965;SC=TGTATCAGCAGTCCTCATCAT;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=214;WE=21360352;WS=21360334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr14	21458131	rs2741733	G	A	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=717;SC=ACAGGCACCTGTATTTCCGTT;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=21458139;WS=21458121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	21460578	rs2297718	T	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=203;ReadPosRankSum=-0.335;SC=CCCTTTTGTATTGGGGAGTGA;SOR=0.353;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=11;WE=21460586;WS=21460568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr14	21460902	rs2741738	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AAAGAGGATCTCCGCTGGACA;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=21;WE=21460910;WS=21460892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr14	21463430	rs2741739	G	T	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=69;PP=2495;SC=CACCCATATGGCACCAATTAC;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=117;WE=21463438;WS=21463420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	21463474	rs2783801	G	A	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=57;PP=1731;SC=AGACTGTCATGTATTGACAAG;SOR=1.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=21463482;WS=21463464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	21464371	.	C	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.288;SC=TTCACAGTGTCCCCATGAACT;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=60;WE=21464379;WS=21464361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr14	21467913	rs2234632	T	G	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=21;PP=948;SC=CATCACCGGCTAGTCCTCAGA;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=21467921;WS=21467903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	21468156	rs2149666	T	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=18;PP=1366;SC=TGACAGCTCTTGTGTGGGATG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=21468164;WS=21468146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	21486137	rs1243445	G	C	7396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=119;PP=2965;SC=CTCTTGTCCCGATACTCACTG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=234;WE=21486145;WS=21486127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr14	21486442	rs1243446	A	G	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1734;ReadPosRankSum=-1.525;SC=ACACACATAAATGAGCCATGC;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=236;TCF=127;TCR=109;TR=109;WE=21486450;WS=21486432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,122:0.45:269
chr14	21488046	rs1243448	G	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=37;PP=1264;SC=TGCTGCTCCCGTCGACTCTTC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=21488054;WS=21488036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	21490125	rs1243449	A	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=10;PP=591;SC=CTCCCAGAATAACCACTGCCC;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=21490133;WS=21490115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	21500395	rs1243462	A	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=26;PP=1609;SC=GAGGCAGCACAGGAGGGTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=80;WE=21500403;WS=21500385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	21500411	rs3818613	C	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=730;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GTGGGTTCTCCACCACACACC;SOR=1.291;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=45;WE=21500419;WS=21500401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr14	21500426	rs1754340	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=823;ReadPosRankSum=-1.110;SC=CACACCCTTCGCTCTGCTTAG;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=52;WE=21500434;WS=21500416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr14	21500455	rs3818615	T	A	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=933;ReadPosRankSum=0.638;SC=CTACCAGCCATCAGTTAGCAT;SOR=0.562;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=67;WE=21500463;WS=21500445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,84:0.52:161
chr14	21500541	rs35274235	T	TA	1608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=1148;ReadPosRankSum=0.164;SC=GATGTGGAGGTAAAAGTATCT;SOR=0.731;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=34;WE=21500549;WS=21500531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,63:0.46:136
chr14	21500597	rs3818616	C	T	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=47;PP=1575;SC=TCCACCCCCACCCCTCAAAAG;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=21500605;WS=21500587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	21501095	rs3748346	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=0.832;SC=ACATCTTACATACTCAGATGT;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=9;WE=21501103;WS=21501085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	21501195	rs3748348	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=262;ReadPosRankSum=0.652;SC=GGATTTGGGAGGAGCTTCTGG;SOR=0.916;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=15;WE=21501203;WS=21501185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr14	21502345	rs8007176	A	G	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=1581;ReadPosRankSum=0.308;SC=TCAATGCTTAAGGTATAGAAG;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=193;TCF=70;TCR=123;TR=96;WE=21502353;WS=21502335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,114:0.49:234
chr14	21503743	rs1243463	G	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=841;SC=CCTTTGCTGGGCAGCAGAAAA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=21503751;WS=21503733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	21503795	rs17242881	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=554;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CAACACCCTCAGTATAGCTCA;SOR=1.088;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=39;WE=21503803;WS=21503785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr14	21504447	rs1243464	A	G	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=97;PP=2762;SC=AAAAAGTGTGATCCCTTCTTT;SOR=2.268;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=27;TCR=97;TR=124;WE=21504455;WS=21504437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	21511458	rs1263872	G	C	10726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=156;PP=2965;SC=GAGCCACGGGGCCGTGTCCCT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=144;TCR=156;TR=300;WE=21511466;WS=21511448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr14	21511497	rs1243469	C	T	8677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=139;PP=2965;SC=CTCAGGGAAGCATCCGAACTG;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=121;TCR=139;TR=260;WE=21511505;WS=21511487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr14	21526044	rs12435011	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=222;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CTGTCTCCCTTAAGAGAGATG;SOR=0.144;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=15;WE=21526052;WS=21526034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	21526079	rs12437266	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.665;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=341;ReadPosRankSum=0.989;SC=AGGATGCTGCCCCCTGCTGCT;SOR=0.322;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=31;WE=21526087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr14	21542037	rs4982405	C	T	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=25;PP=1300;SC=ACTGCCCTCTCCTGCTGGTTT;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=21542045;WS=21542027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	21544056	rs7140850	C	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=81;SC=AGACTTCAAGCCATTGACCTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=21544064;WS=21544046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	21544842	rs11483416	T	TG	2587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=40;PP=2204;SC=CCATCAGTAGTGGGGAGAGGA;SOR=1.096;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=54;WE=21544850;WS=21544832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	21549893	rs7143633	G	C	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=65;PP=2427;SC=CCAGCAACACGTGGGAGAGGA;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=120;WE=21549901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr14	21551058	rs1958395	G	A	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=41;PP=1862;SC=GTCTGGCTGCGCTCAGTCCCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=99;WE=21551077;WS=21551048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	21551069	rs1958396	T	C	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=44;PP=2068;SC=CTCAGTCCCTTAAGCAAGGTA;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=21551077;WS=21551048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	21555087	.	AAATC	A	1999	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=59.59;NF=23;NR=18;PP=1999;QD=49.2682926829;SC=AAAAAGAAAAAAATCAACCAT;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=41;WE=21555098;WS=21555077;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,41:0.76:54
chr14	21556963	rs35186993	A	AT	3913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=46;PP=2869;SC=ATGTCCCTAAATTCACTGTAG;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=21556971;WS=21556953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	21558558	rs6571653	G	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=230;ReadPosRankSum=-1.188;SC=CGCCCGCCGCGCCTTCCACCT;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=13;WE=21558566;WS=21558548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr14	21562560	rs7149011	T	C	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1444;ReadPosRankSum=0.195;SC=CGTATAGGATTCATCCCCTTG;SOR=0.557;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=74;TCR=84;TR=92;WE=21562568;WS=21562550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,112:0.60:187
chr14	21570273	rs745696	T	C	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=978;ReadPosRankSum=-2.846;SC=CACCCCGCCTTTGGAAGGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=55;WE=21570281;WS=21570263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr14	21570614	rs4982408	A	C	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=884;ReadPosRankSum=0.127;SC=TGGGTTTCATAGTGGTGGTGG;SOR=0.779;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=63;WE=21570622;WS=21570604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,77:0.53:146
chr14	21571208	rs12880628	G	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=313;ReadPosRankSum=0.684;SC=AAACAGGATAGAAAATTGGGC;SOR=0.579;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=19;WE=21571216;WS=21571198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr14	21623010	rs8007993	T	C	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=17;PP=1418;SC=TTCACAGGGGTGGGCATGGGA;SOR=2.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=21623018;WS=21623000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr14	21623648	rs7161544	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=754;ReadPosRankSum=-0.622;SC=AGAGCAGGGGGTTACAAATAG;SOR=0.983;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=52;WE=21623656;WS=21623638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,56:0.46:123
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chr14	21624197	rs10135366	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=652;SC=AGAGGATCTTTTCTCCTTGGT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=21624205;WS=21624187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	21699069	rs8016099	A	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=902;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GAAAGAGAAGATGCCCACTGA;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=63;WE=21699077;WS=21699059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,90:0.49:183
chr14	21702445	rs3215705	TA	T	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=683;ReadPosRankSum=0.298;SC=TATTCCTTGATAAAACATTCT;SOR=2.262;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=21;WE=21702453;WS=21702435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr14	21768976	.	G	GA	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.021;NF=12;NR=0;PP=378;ReadPosRankSum=0.523;SC=GTGTACTGGGGACAGAAGGCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=21768984;WS=21768966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr14	21770730	rs6571751	A	G	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1383;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AGTAGCCAGTAAACCCAGTGA;SOR=0.672;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=84;TCR=82;TR=83;WE=21770738;WS=21770720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,96:0.50:191
chr14	21778717	rs72160728	AAAT	A	1011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=6.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.963;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr14	21778792	rs1957414	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.821;NF=20;NR=23;PP=707;ReadPosRankSum=0.191;SC=TGAGTCTCTGTTTCTTAGTAA;SOR=0.620;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=43;WE=21778800;WS=21778782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr14	21785790	rs3748357	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=571;ReadPosRankSum=0.897;SC=GCTGAAACTGGATAATAAAGA;SOR=0.588;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=39;WE=21785798;WS=21785780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr14	21792781	rs34067949	G	T	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=745;ReadPosRankSum=1.306;SC=CTCTAGAACAGCTCAAAGATG;SOR=0.647;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=55;WE=21792789;WS=21792771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr14	21796784	rs3748361	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=407;ReadPosRankSum=-1.506;SC=AAATACACCAGAGGTAAGACC;SOR=0.922;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=21;WE=21796792;WS=21796774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr14	21821821	rs3736824	A	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=459;ReadPosRankSum=0.999;SC=AAATGACATTAGATTAGGAAG;SOR=1.014;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=35;WE=21821829;WS=21821811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr14	21825924	rs3762156	T	C	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=172;SC=TGTGAGCCATTATGCCTGCCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=21825932;WS=21825914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	21826718	rs3762157	T	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=439;SC=TGGGCAGGATTTGCAGGTTTG;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=21826726;WS=21826708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	21828520	rs927412	T	A	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=26;PP=1784;SC=AGAAGCTGAGTGAAATGAAGT;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=21828528;WS=21828510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	21829129	rs3762158	C	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=18;PP=846;SC=GTTTTACAATCCCCTAAGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=36;WE=21829137;WS=21829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	21829404	rs1543494	T	C	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=94;PP=2965;SC=TATAGACATTTCTTTTTCAGG;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=59;TCR=94;TR=153;WE=21829412;WS=21829394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr14	21830635	rs1983768	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=103;SC=TTTTTAATAACGAAGTATCCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=21830643;WS=21830625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	21831052	rs10138699	T	C	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=40;PP=2428;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CCCGAATATGTGGTTCCTTAG;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=117;WE=21831060;WS=21831042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr14	21831112	rs10146717	G	A	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=75;PP=2965;SC=GAGCTCTGGAGTGGGATAAAA;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=169;WE=21831120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr14	21831692	rs10139379	T	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=294;SC=GAAGACACATTATTTAAAAGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=21831700;WS=21831682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	21833147	rs2295866	G	A	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=24;PP=873;SC=AATGTGGAGAGGTGTGAGACA;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=21833155;WS=21833137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	21836400	rs8008670	T	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=413;SC=TACACAACTTTCAAACCTCCT;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=21836408;WS=21836390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	21838160	rs2181125	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=31;PP=928;SC=TTATTTAGCAAACTATCACTG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=21838168;WS=21838150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	21838781	rs4982445	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=370;SC=CTACTTTTTACTTTTAAAGAG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=21838789;WS=21838771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	21840910	rs78373622	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=665;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TTGTTTAACTCACTGTTACTT;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=14;TCR=65;TR=36;WE=21840918;WS=21840900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr14	21859536	rs3762159	T	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=13;PP=848;SC=GAAACGATGATACAGTATGTC;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=21859544;WS=21859526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	21860360	rs1998332	G	A	6470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=94;PP=2965;SC=CCAAGTTAGGGTAAAACTCCC;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=194;WE=21860368;WS=21860350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr14	21861211	rs7152833	C	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=451;SC=CCCGGATATACTGTTACACTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=21861219;WS=21861201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	21864124	rs10134108	C	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=11;PP=354;SC=AGGATGAAGACCTAGCCACAC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=21864132;WS=21864114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	21869705	rs113076568	C	CT	894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=2;NR=23;PP=496;SC=GTAAAGCTGACTTTTTTTTTT;SOR=1.284;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=25;WE=21869713;WS=21869695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	21871653	rs8022395	C	T	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=46;PP=2130;SC=CTAGGCAGCGCACCATCTGAG;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=21871661;WS=21871643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	21874068	rs7155123	G	C	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=50;PP=1412;SC=AAACATGAAGGACTTCTGGGG;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=21874076;WS=21874058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	21928338	rs1045812	C	T	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1988;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AATGAAATTCCGAGGCAGAGG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=130;TCR=121;TR=130;WE=21928346;WS=21928328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,146:0.46:314
chr14	21928383	rs1045811	T	C	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.116;SC=ATCTAGGTAATTGCAAGTGTT;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=225;TCF=87;TCR=138;TR=117;WE=21928406;WS=21928373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,127:0.47:269
chr14	21928397	rs28927672	AT	GC	4516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=64;PP=2944;ReadPosRankSum=0.447;SC=AAGTGTTCAAATAGAATGTCT;SOR=0.852;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=198;TCF=71;TCR=127;TR=98;WE=21928406;WS=21928373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,118:0.49:243
chr14	21928485	rs61973205	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.765;NF=2;NR=21;PP=519;ReadPosRankSum=-0.878;SC=GGTGGCTCACACCTGTAATCC;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=23;WE=21928493;WS=21928475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr14	21930381	rs56719531	T	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=309;ReadPosRankSum=0.919;SC=AAAAAAAAAGTGTTGAATTGG;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=16;WE=21930389;WS=21930371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	21930596	rs10143000	G	A	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=76;PP=2373;SC=GACATAAATCGTATCATCAGT;SOR=1.537;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=113;WE=21930604;WS=21930586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	21931955	rs11848193	T	A	898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=828;ReadPosRankSum=0.253;SC=GGAGAAAATTTAAAAAAAAGA;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=49;WE=21931963;WS=21931945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr14	21945415	rs2282046	A	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=765;ReadPosRankSum=1.291;SC=AGGGTCTGAGACGGTGGGAGC;SOR=0.589;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=52;WE=21945423;WS=21945405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr14	21945629	rs12878084	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=283;ReadPosRankSum=1.782;SC=CCTAACTTATCCCCGCGACTT;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=17;WE=21945637;WS=21945619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr14	21950836	rs6571850	T	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=56;PP=1726;SC=AATATTTGCTTCAGTTTTAGT;SOR=1.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=76;WE=21950844;WS=21950826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	21955930	rs1061031	G	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=435;SC=TCTATTCCCTGCTACACTTGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=21955938;WS=21955920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	21956695	rs3215876	GA	G	984.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.533;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.784;NF=22;NR=8;PP=921;ReadPosRankSum=-1.553;SC=ATTTAGGGGGGAAAAGTGGTT;SOR=1.973;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=30;WE=21956703;WS=21956685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr14	21957159	rs12880071	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=0.563;SC=ATTTCCAGTTTATAATTCTCC;SOR=0.435;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=11;WE=21957167;WS=21957151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr14	21960408	rs3737050	A	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=202;SC=GTCTTTCCTAAGAGTATGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=21960416;WS=21960398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	21960816	rs1060722	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=200;ReadPosRankSum=-0.040;SC=ACTCCACCCTTTCATCCTATG;SOR=0.991;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=10;WE=21960824;WS=21960806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	21960969	rs7617	G	A	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=852;ReadPosRankSum=-0.443;SC=TGACCTCCCGGGGGCTCCAAC;SOR=0.575;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=58;WE=21960977;WS=21960959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,77:0.62:125
chr14	21967109	rs1061026	T	G	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1000;ReadPosRankSum=0.689;SC=TCTACTAAGTTCTGTCCTTAA;SOR=0.573;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=58;WE=21967117;WS=21967099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr14	21967916	rs1139130	A	G	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.470;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=75;PP=2012;ReadPosRankSum=0.920;SC=ACCCCCAGAGATTTAGACATT;SOR=0.954;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=273;TCF=127;TCR=146;TR=130;WE=21967924;WS=21967906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,149:0.45:334
chr14	21968876	rs3752411	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=865;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TGAGATTCATGGCCCGAGTCC;SOR=1.139;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=55;WE=21968884;WS=21968866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,59:0.44:134
chr14	21971246	rs17106830	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=742;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CCTTGCCCTAGGGGTAAATCC;SOR=0.613;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=44;WE=21971254;WS=21971236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
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chr14	22038210	rs17792766	G	T	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1091;ReadPosRankSum=0.485;SC=TGGCCTGAATGATCTGTATGT;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=71;WE=22038218;WS=22038200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr14	22038562	rs45612332	T	C	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=1295;ReadPosRankSum=-1.516;SC=CAGGAAGTGATAGAAATAGAG;SOR=1.254;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=175;TCF=107;TCR=68;TR=79;WE=22038570;WS=22038539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,85:0.42:203
chr14	22038659	rs17792778	T	C	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1785;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GAGGAGATGCTCATATCAATG;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=99;TCR=105;TR=101;WE=22038667;WS=22038649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,113:0.47:243
chr14	22038915	rs4982462	A	G	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=877;ReadPosRankSum=0.195;SC=CAAAACAAGAATTAACATAGA;SOR=0.439;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=57;WE=22038923;WS=22038905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr14	22070146	rs10134340	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.801;NF=24;NR=22;PP=710;ReadPosRankSum=0.628;SC=AAAACACAGCCGCTGCCCCAT;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=46;WE=22070154;WS=22070136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr14	22070509	rs11157069	G	A	2308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.081;NF=37;NR=48;PP=1362;ReadPosRankSum=-1.128;SC=GCATGGAGCCGGCGACCCAAG;SOR=0.863;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=85;WE=22070517;WS=22070499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,104:0.55:189
chr14	22070595	rs35103338	AC	A	1684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.664;NF=15;NR=30;PP=1497;ReadPosRankSum=-0.311;SC=ATTGCCAGGTACCTGTCATAG;SOR=0.858;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=45;WE=22070603;WS=22070585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,57:0.41:138
chr14	22090208	rs8016939	A	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=35;PP=1230;SC=TCCTGAATATACATTTTCCTA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=22090216;WS=22090198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	22090594	rs1063365	C	G	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=61;PP=2704;SC=TCTTACAATGCTCTGGATGGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=120;WE=22090602;WS=22090584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	22103007	rs41301457	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=716;ReadPosRankSum=1.233;SC=ATGTCTTTTTGTAGTCTGCTA;SOR=0.488;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=48;WE=22103015;WS=22102997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr14	22133416	rs12717305	A	G	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=2054;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TAACGCTTTCAGGGAACATTC;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=273;TCF=144;TCR=129;TR=131;WE=22133424;WS=22133406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,153:0.49:315
chr14	22133648	rs2874103	G	A	7653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=112;PP=2965;SC=GCTGATCATTGTGGCGTATGA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=113;TCR=112;TR=225;WE=22133656;WS=22133638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr14	22133997	rs970382	A	G	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=75;PP=2609;ReadPosRankSum=1.963;SC=GAAGGGCGCCAGAAAGCCCTG;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=49;TCR=75;TR=123;WE=22134005;WS=22133987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr14	22134018	rs61732411	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=699;ReadPosRankSum=0.433;SC=TCTACCTGCTCGGCCCACTTC;SOR=1.205;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=47;WE=22134026;WS=22134008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,52:0.42:123
chr14	22167296	rs6572018	G	C	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=79;PP=2613;SC=TTGGAGGCACGAACAAGATAT;SOR=1.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=42;TCR=79;TR=121;WE=22167304;WS=22167286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr14	22192106	rs926027	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=297;ReadPosRankSum=-1.290;SC=GACCCCCCCAATCCCGCCCGC;SOR=0.409;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=17;WE=22192114;WS=22192096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr14	22217356	rs2075477	G	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=18;PP=1217;SC=TAGGCTGACGGCAGAAGCAGA;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=22217364;WS=22217346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	22218051	rs2075478	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=681;SC=TAAAGCCACACTCTATTTCCT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=22218059;WS=22218041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	22236771	rs11623408	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=717;ReadPosRankSum=-1.145;SC=GTCTACATTTCAGGCCACATT;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=50;WE=22236779;WS=22236761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr14	22237127	rs760008	C	T	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=61;PP=2965;SC=CAAACTATTCCCCAGCATACT;SOR=0.983;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=143;WE=22237135;WS=22237117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	22237187	rs4329837	C	T	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1501;ReadPosRankSum=0.189;SC=TCTTGCTACTCATACGTGAAA;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=97;TCR=82;TR=92;WE=22237195;WS=22237177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,105:0.51:206
chr14	22265500	rs34668860	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CCTCACGCTCGCTATTCTCAA;SOR=2.891;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=22265508;WS=22265490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	22279809	rs2856411	A	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.579;SC=GGGTACAGCTAAGATCACGTC;SOR=0.932;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=47;WE=22279825;WS=22279799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr14	22279817	rs7156201	G	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=1877;ReadPosRankSum=1.501;SC=CTAAGATCACGTCTAAGGTAA;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=54;WE=22279825;WS=22279799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr14	22293510	rs2178782	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=12;PP=1222;SC=TTTGCATTCGTCCCGCCTGCA;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=22293518;WS=22293500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	22293554	rs35339724	G	GC	3716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=38;PP=2957;SC=ACATAGCGAAGCTGGTCTCTG;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=64;WE=22293562;WS=22293544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	22315479	rs7151170	G	A	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.627;NF=13;NR=38;PP=895;ReadPosRankSum=0.972;SC=TCAAGAACTCGACCTTGAAGT;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=51;WE=22315487;WS=22315469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr14	22320728	rs2017224	T	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=545;ReadPosRankSum=0.580;SC=GTTTCCCTTGTTCAGCCATGC;SOR=1.119;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=26;WE=22320736;WS=22320718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr14	22320876	rs2017238	A	G	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.089;NF=49;NR=43;PP=1346;ReadPosRankSum=0.182;SC=CTGATAGTACATTGTTTTTCC;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=92;WE=22320884;WS=22320866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,113:0.54:210
chr14	22321124	rs2017263	T	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=630;ReadPosRankSum=-2.682;SC=CTTCCTTCAATCTGAGGAAAC;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=42;WE=22321132;WS=22321114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr14	22321261	rs2017432	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr14	22321269	rs2072609	T	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.03;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr14	22321331	rs12892111	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.664;SC=GCCGACCCAGGCATTTCTATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=22321339;WS=22321321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	22322168	rs760003	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=416;ReadPosRankSum=0.599;SC=CATGGTAGAGAGTCACTGGAC;SOR=0.411;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=21;WE=22322176;WS=22322158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr14	22322369	rs11626323	T	C	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.373;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=912;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GTAGGAACCCTCAAATATAGA;SOR=0.415;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=53;WE=22322377;WS=22322359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,67:0.55:121
chr14	22322411	rs11629404	G	C	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=823;ReadPosRankSum=1.382;SC=AATGGTACACGTTAGCCAAAT;SOR=0.349;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=43;WE=22322419;WS=22322401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr14	22322523	rs11629446	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=588;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GAAGGTAAATGGAACATTATA;SOR=0.303;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=27;WE=22322531;WS=22322513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr14	22322563	rs11620886	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=911;ReadPosRankSum=0.158;SC=GATATGTACTCGTGTAATGTC;SOR=0.255;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=44;WE=22322571;WS=22322553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr14	22322690	rs12878216	G	A	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=71;PP=2171;ReadPosRankSum=-2.094;SC=TGCCCACAGGGACTGTGATGG;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=104;TCR=124;TR=131;WE=22322712;WS=22322680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,151:0.54:280
chr14	22322794	rs12879611	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=894;ReadPosRankSum=1.822;SC=ATATAGAAGTCGAATAGTCCA;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=46;WE=22322802;WS=22322784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr14	22322856	rs12884453	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=0.074;SC=CCTTGCCTCTTCCGTGAATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=22322864;WS=22322846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	22337119	rs909075	G	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=454;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GGGTAACAGAGTATATTAGTG;SOR=0.963;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=25;WE=22337127;WS=22337109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr14	22337181	rs909076	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=297;ReadPosRankSum=0.872;SC=GGTTTCCTCTCGTTACTATGA;SOR=1.134;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=16;WE=22337189;WS=22337171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr14	22337393	rs876093	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.747;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=873;ReadPosRankSum=1.155;SC=ACTTGGAAAAGGACCTCAGCT;SOR=1.010;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=56;WE=22337401;WS=22337383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr14	22356081	rs12885687	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=-0.135;SC=ATATCCATTCTAGGTGCATTT;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=22356089;WS=22356071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	22356225	rs17197550	G	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=510;ReadPosRankSum=2.232;SC=GGAAAATAATGTACAGTATCT;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=36;WE=22356233;WS=22356215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr14	22356551	rs10483261	T	C	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1745;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TTGATAATGTTCATATACTCC;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=179;TCF=93;TCR=86;TR=103;WE=22356559;WS=22356541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,123:0.57:215
chr14	22362971	rs2075481	A	G	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=31;PP=1601;ReadPosRankSum=-1.049;SC=CTGTCTCTGAAGGAGCCCTGG;SOR=0.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=203;TCF=127;TCR=76;TR=88;WE=22362979;WS=22362961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,115:0.46:250
chr14	22363080	rs12895616	T	A	5873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=-0.394;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,154:0.50:309
chr14	22363084	rs12890675	C	G	5848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQRankSum=-0.505;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,154:0.50:308
chr14	22392250	rs17182937	C	T	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=1001;SC=CCAGGTTCACCTCACAGTACA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=22392258;WS=22392240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	22392283	rs28501628	G	A	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=24;PP=1742;SC=TAAAGAAGAAGATTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=81;WE=22392291;WS=22392273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	22392304	rs34365759	G	A	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=33;PP=2258;SC=ATCTAGAAAAGGAACCAAACA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=74;TCR=33;TR=107;WE=22392312;WS=22392294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	22392366	rs12437316	C	T	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=65;PP=2813;SC=TGGCTAGGTACGGGTGGCCCA;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=79;TCR=65;TR=144;WE=22392374;WS=22392356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	22392499	rs12435124	T	C	2362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=45;PP=1780;SC=TATCCTTAAATCTTCAAATTC;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=22392507;WS=22392489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	22392626	rs10140810	A	C	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=46;PP=2430;SC=ACCAGTGATCAAAGTTATGGT;SOR=1.125;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=114;WE=22392634;WS=22392616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	22392703	rs8021861	G	C	5732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=76;PP=2965;SC=GTCTTATGACGAGCAAAATGC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=165;WE=22392711;WS=22392693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr14	22392807	rs8008040	T	C	3548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=73;PP=2366;SC=CAGCAATGTATTTCTGTGCAA;SOR=1.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=104;WE=22392815;WS=22392797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	22409517	.	ATCTCTCTC	A,ATC	144	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.24;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=121;SC=GGCTAAACAGATCTCTCTCTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=3;WE=22409530;WS=22409507;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:4
chr14	22409571	rs2178779	A	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=6;PP=639;SC=AACCCGTGGAAATTCAGTGAC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=22409579;WS=22409561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	22433866	rs17182972	C	T	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1216;ReadPosRankSum=0.887;SC=TGGGTAGAAACATGAGTGGTT;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=187;TCF=83;TCR=104;TR=88;WE=22433874;WS=22433856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,105:0.48:218
chr14	22446888	rs2075483	C	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=765;ReadPosRankSum=-0.061;SC=CCGCCCAGCTCAAGGTCCTGC;SOR=0.595;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=41;WE=22446896;WS=22446878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr14	22447248	rs2075484	A	G	4833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=0.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,128:0.41:315
chr14	22447251	rs2075485	G	A	4865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=0.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.034;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,132:0.42:317
chr14	22466017	rs2280763	T	C	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1502;ReadPosRankSum=0.388;SC=CAAGACCAAATTTTAGAGCCC;SOR=0.577;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=91;WE=22466025;WS=22466007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,115:0.57:203
chr14	22470693	rs5807105	T	TA	6438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=49;PP=2957;SC=TATGATGTGATAGGACAGAAA;SOR=1.436;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=105;WE=22470701;WS=22470683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr14	22470913	rs34215246	CT	C	1386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.699;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.330;NF=2;NR=34;PP=706;ReadPosRankSum=1.401;SC=CTCACATTTTCTTTTTTTTTA;SOR=2.081;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=36;WE=22470921;WS=22470903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr14	22476137	.	AAGGT	A	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19;NR=23;PP=2944;QD=20;SC=CATGGCTCAGAAGGTAACTCA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=42;WE=22476155;WS=22476127;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:80,42:0.34:122
chr14	22476138	rs71918459	AGGT	A	2978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=5.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,81:0.39:208
chr14	22476143	rs61981213	A	T	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=6.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,81:0.39:206
chr14	22476144	rs61981214	C	T	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=4.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,81:0.39:208
chr14	22476146	rs71419191	CA	C	3028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,83:0.39:215
chr14	22509188	rs4982545	T	C	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=24;PP=1359;SC=GTAGCAGTCTTAACTGCAGTT;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=60;WE=22509196;WS=22509178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	22520684	rs2072611	A	G	786.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.33;ReadPosRankSum=-0.611;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,19:0.95:20
chr14	22520692	rs2072612	G	T	840.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.54;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr14	22521012	rs2072613	C	G	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=49;PP=2322;SC=GTCTATTGCTCTTTTTCTGAA;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=22521020;WS=22521002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	22521051	rs2072614	G	A	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=44;PP=2021;SC=AGGAGGTGACGCAGATTCCTG;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=55;TCR=44;TR=99;WE=22521059;WS=22521041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr14	22533887	rs3811312	C	T	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=7;PP=1267;SC=AAGAGGTGTCCTTTCTGACTG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=22533895;WS=22533877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	22534497	rs3811306	T	G	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=53;PP=2364;SC=GAGGCTGAATTTAAGAAGAAT;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=115;WE=22534505;WS=22534487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr14	22539108	rs2272547	C	T	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.35;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	22539116	rs2272548	G	A	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.70;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	22565073	rs12897143	G	A	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=65;PP=2251;SC=GGATCAGATGGTTTAATTCCA;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=101;WE=22565081;WS=22565063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	22573582	rs2075498	A	C	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=57;PP=2965;SC=ATTTTGGCTGAAAAACGTTTT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=136;WE=22573590;WS=22573572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr14	22580570	rs1040301	C	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=26;PP=1372;SC=ATGGATAAAGCTTGAGGGAGA;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=22580578;WS=22580560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	22580762	rs11628824	G	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1769;ReadPosRankSum=-1.271;SC=AAGAAGGAGAGGACTTCACCA;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=118;TCR=104;TR=98;WE=22580770;WS=22580752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,115:0.44:259
chr14	22591821	rs8018887	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=1.631;SC=GTCTTTATAATTAACAGCAAT;SOR=0.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=22591829;WS=22591811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	22591988	rs2272550	C	A	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=978;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CACCCAGCCCCCCTCCATGGA;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=65;WE=22591996;WS=22591978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,81:0.50:161
chr14	22600863	rs3811291	G	A	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=52;PP=2153;SC=AGACCTAACAGAGGCCACCCA;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=105;WE=22600871;WS=22600853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	22615918	rs35208818	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=0.040;SC=GAGGCTCCTGGCTTTCTATGG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=22615926;WS=22615908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	22616547	rs2293730	A	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=516;ReadPosRankSum=-0.742;SC=ACATCACTGCAGCCCAGCCTG;SOR=0.378;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=40;WE=22616555;WS=22616537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr14	22631217	rs2075492	C	T	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AGGCAGGAGACAAGACAATCT;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=85;WE=22631225;WS=22631207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,97:0.46:210
chr14	22631678	rs2075493	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.490;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=747;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GATTCACTGTCTTCTTAAACA;SOR=1.223;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=51;WE=22631686;WS=22631668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,55:0.38:143
chr14	22636784	rs11157435	A	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=871;ReadPosRankSum=-0.822;SC=AGGGTCATGAAAAAATATCTG;SOR=0.785;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=51;WE=22636792;WS=22636774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,60:0.39:154
chr14	22636874	rs11157436	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=0.174;SC=CCTACTTCTGCGGCACAGAGA;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=25;WE=22636882;WS=22636864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr14	22636954	rs11157437	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TCCCCTAGCACAGATGCCCAC;SOR=1.274;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=11;WE=22636962;WS=22636944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr14	22670458	rs2075494	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=824;ReadPosRankSum=0.229;SC=GGCCTGGAACCTCAATGTGCA;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=72;TCR=25;TR=45;WE=22670466;WS=22670448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr14	22670975	rs2242542	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=646;ReadPosRankSum=0.258;SC=CAACCCCATAGGTATTATGGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=40;WE=22670983;WS=22670965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr14	22690209	rs2272551	A	C	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1731;ReadPosRankSum=1.991;SC=ACAAGCAGGAACCTGGGGAAG;SOR=0.453;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=79;WE=22690217;WS=22690199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr14	22694777	rs2242544	A	G	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=1042;ReadPosRankSum=1.872;SC=AGAACACTAAAAGGGTAAAGT;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=51;WE=22694785;WS=22694767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr14	22694926	rs2075496	C	T	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=813;ReadPosRankSum=0.844;SC=AGGGAGACACCGTAACTCTCA;SOR=0.684;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=122;TCF=72;TCR=50;TR=54;WE=22694934;WS=22694916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,68:0.45:150
chr14	22695084	rs4982579	C	T	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=65;PP=2469;SC=AAAGAACTTTCCAGCATCCTG;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=113;WE=22695092;WS=22695074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	22695128	rs12889091	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=0.536;SC=AGACTCGGCCATCTACCTCTG;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=36;WE=22695136;WS=22695118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr14	22739862	rs2075500	A	T	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=17;PP=1111;SC=GCATGACACGAGTTAGCTTGC;SOR=1.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=57;WE=22739870;WS=22739852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	22740245	rs2075501	A	G	6639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=80;PP=2965;SC=ACCAGTGAGAATAATTATTAT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=57;TCR=80;TR=136;WE=22740253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr14	22740270	rs2075502	G	A	6240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=71;PP=2960;SC=TCTGGTACAAGCAGCCTCCCA;SOR=0.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=124;WE=22740278;WS=22740260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr14	22749189	rs35972042	T	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=864;ReadPosRankSum=-0.118;SC=GCCCAGCTATTAGGGGCAAGA;SOR=0.877;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=48;WE=22749197;WS=22749179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr14	22749282	rs2075503	G	C	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=48;PP=2744;SC=GTCTGTTTCTGTCTCTCACAT;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=119;WE=22749290;WS=22749272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr14	22749742	rs4435168	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=651;ReadPosRankSum=-0.058;SC=AGGAAATAATTGTCTTCCCTA;SOR=1.134;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=42;WE=22749750;WS=22749732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
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chr14	22772123	rs2009858	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=774;ReadPosRankSum=0.081;SC=CAGTGAATGCCTCCTTCTGAA;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=45;WE=22772131;WS=22772113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,55:0.41:134
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chr14	22887730	rs2301201	A	G	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CAGGGTCAGCAGTTCCTTTCT;SOR=0.847;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=63;WE=22887738;WS=22887720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,70:0.44:160
chr14	22891794	rs2072615	G	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=883;ReadPosRankSum=0.488;SC=GTCAATAGGGGTCCCTGCCAC;SOR=0.997;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=44;WE=22891802;WS=22891784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr14	22891883	rs2072616	G	C	7353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=103;PP=2965;SC=GTAACACAATGACTTTCATAT;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=127;TCR=103;TR=230;WE=22891891;WS=22891873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr14	22924194	rs2242545	G	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TAGGGTTGCCGTAAAGGGAAA;SOR=0.432;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=85;TCR=36;TR=74;WE=22924202;WS=22924184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
chr14	22924531	rs760020	C	G	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=440;SC=CAGAAAGCTACCCTCCTCAAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=22924539;WS=22924521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	22930038	rs1882705	C	T	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=69;PP=2156;SC=TAGCAATCGCCCCCTCTCAAC;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=22930046;WS=22930028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	22933390	rs36090939	GC	G	689.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.149;NF=2;NR=17;PP=784;ReadPosRankSum=0.141;SC=TTTAGAAATGGCTAAGAAACC;SOR=0.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=19;WE=22933398;WS=22933380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr14	22934658	rs11997	C	A	3192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=2018;ReadPosRankSum=-1.320;SC=AGCCAAACCACTTTTTCTTCA;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=123;WE=22934666;WS=22934648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,146:0.56:259
chr14	22934918	rs11627907	C	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=643;ReadPosRankSum=-1.720;SC=CCTCATGAGGCAAATAGGCCT;SOR=0.687;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=45;WE=22934926;WS=22934908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr14	22938211	rs17198805	G	A	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=60;PP=1557;ReadPosRankSum=-0.649;SC=GGCCTTATCCGGTACCAGAAT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=238;TCF=93;TCR=145;TR=101;WE=22938219;WS=22938201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,123:0.43:284
chr14	22938561	rs11850502	A	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=0.977;SC=AACAAATGAAACTACTTACAG;SOR=2.527;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=19;WE=22938569;WS=22938551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr14	22942890	rs2254272	G	T	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=30;PP=1457;SC=TGTTGCCACCGCTGGAGCAGC;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=22942898;WS=22942880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	22947814	rs227858	G	A	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=21;PP=1722;SC=CTCCCAGCCCGTGATGGAAGG;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=22947822;WS=22947804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	22948471	rs227859	T	C	9360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=132;PP=2965;SC=CAAGGGGAGTTTGGGCAACTG;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=274;TCF=142;TCR=132;TR=274;WE=22948479;WS=22948461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr14	22952088	rs227861	G	A	5704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=98;PP=2965;SC=GGGAAGGGGGGATTCAAACAC;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=167;WE=22952096;WS=22952078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr14	22957488	rs1483971	G	T	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATGCTGAATCGTACCTGAGAT;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=62;WE=22957496;WS=22957478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr14	22963632	rs11372266	G	GC	317.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=263;SC=TCTGGCCAGAGCCAGCTGCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=22963654;WS=22963622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	22963646	rs226985	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=128;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GCTGCCCTCATAGGAATTAAT;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=22963654;WS=22963622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	22964840	rs137998884	T	TG	1269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=934;SC=CCTGCCATGCTGGAGGTGGCT;SOR=2.712;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=24;WE=22964848;WS=22964830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	22964880	rs226986	A	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.288;NF=26;NR=8;PP=497;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TTTTTGTTAGAGCATGTATTA;SOR=1.489;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=34;WE=22964888;WS=22964870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,38:0.38:99
chr14	22965118	rs11334443	TC	T	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=947;SC=GTTGATGAATTCCTGGCAATC;SOR=3.180;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=22965126;WS=22965108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	22965144	rs11334442	AC	A	805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=746;SC=GATTAGGTCAACGAAGAAGTA;SOR=2.636;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=22965152;WS=22965134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	22968959	rs76182103	C	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GAATTGTATCCATCATTAGCA;SOR=0.407;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=17;WE=22968967;WS=22968949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr14	22972622	rs226990	A	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=7;PP=1249;SC=CAGCCCGATTAAAAGTTTTCA;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=22972630;WS=22972612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	22972742	rs2170810	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.08;MQRankSum=1.515;NF=53;NR=52;PP=1680;ReadPosRankSum=1.843;SC=GTGTGGCTCTGGCAACACAGG;SOR=0.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=224;TCF=116;TCR=108;TR=105;WE=22972750;WS=22972732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,119:0.47:254
chr14	22972783	rs5807141	AC	A	8301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=113;PP=2951;SC=GGACAACTTTACCAAGTAAAA;SOR=0.951;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=24;TCR=116;TR=137;WE=22972791;WS=22972773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr14	22972815	rs2170811	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.184;NF=27;NR=43;PP=915;ReadPosRankSum=0.895;SC=TGGATGTTTCCAAGTGAAGTG;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=63;TCR=98;TR=70;WE=22972823;WS=22972805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,72:0.42:171
chr14	22972844	rs5020726	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.149;NF=14;NR=34;PP=674;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CACTCTGTTCATTTTTTGTTT;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=48;WE=22972852;WS=22972834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr14	22974041	rs4343185	T	G	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.313;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.538;NF=42;NR=10;PP=975;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AGGAAGGAGATGAAGAAAATT;SOR=0.961;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=111;TCF=86;TCR=25;TR=52;WE=22974049;WS=22974031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr14	22974150	rs11324184	TC	T	7488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=114;PP=2966;SC=TCACCGTTATTCCCCTGTAAG;SOR=0.989;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=32;TCR=117;TR=143;WE=22974158;WS=22974140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr14	22974256	rs3811207	A	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=1.768;SC=CATGTGTTAAACTGATAAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=26;WE=22974264;WS=22974246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr14	22975476	rs3751470	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=0.061;SC=TCAGGAAGGAAGGGCTGACAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=16;WE=22975484;WS=22975466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr14	22975700	rs969914	T	G	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=1160;ReadPosRankSum=1.539;SC=AAGTATATCTTTTCTCATTTC;SOR=0.950;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=49;TCR=87;TR=71;WE=22975708;WS=22975690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr14	22975728	rs3794450	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=812;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGTTATGTCCGTAAATCATAT;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=50;WE=22975736;WS=22975718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr14	22975755	rs3794451	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GTTCTTCTTATGCACACACAC;SOR=0.399;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=27;WE=22975764;WS=22975745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr14	22975756	rs112338851	G	GCACACACACACACA	835.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr14	22976559	rs1872160	A	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.493;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=0.424;SC=ATGTATCCCCAAATCTCCTTT;SOR=1.911;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=15;WE=22976567;WS=22976549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr14	22976790	rs170543	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=11;PP=268;SC=AGTTTTGCTCCTTGTTGCGCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=22976798;WS=22976780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	22978335	rs226997	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=24;PP=1179;SC=TGAATTATGGCGGTGCTACAA;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=22978343;WS=22978325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	22978451	rs11443893	G	GC	2224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=1632;SC=GGAAGCGACAGCACCCTTAGG;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=22978459;WS=22978441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	22978516	rs226998	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=1.269;SC=CTTATCTGCCGTGATATAGCA;SOR=0.333;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=13;WE=22978524;WS=22978506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr14	22978577	rs226999	A	G	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=80;SC=TCAGGGGAGGAGAAACATGCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=22978585;WS=22978567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	22979847	rs5807144	G	GA	368.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.439;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr14	22982069	rs11444527	A	AG	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=376;SC=TCTCCCCTCCAGGCTGGAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=22982077;WS=22982059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	22984499	rs227027	C	T	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=590;SC=GCCTATTGTCCGGTTGTTACA;SOR=4.804;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=27;WE=22984508;WS=22984489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	22984500	rs144430862	G	GGTT	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=1023;SC=CCTATTGTCCGGTTGTTACAG;SOR=4.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=21;WE=22984508;WS=22984489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	22985463	rs227029	G	A	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=39;PP=1183;SC=CTTTAAAATGGGATATGAGTG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=22985471;WS=22985453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	22985487	rs11453171	A	AC	954.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=1008;SC=GTATGCACACAGCATGCCCAC;SOR=4.255;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=24;WE=22985495;WS=22985477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	22988022	rs227009	C	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=368;SC=GAGGTGTGGACGGGAAGAAAC;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=22988030;WS=22988012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	22988748	rs227010	G	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=382;SC=CTTGCCGCCCGGGAGGTGCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=22988756;WS=22988738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	22989292	rs3811199	A	T	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=7;PP=1020;SC=GCCATGATTCATGCTGTGGTG;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=22989300;WS=22989282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	22990844	rs11624650	C	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=571;SC=ATTGTAAAGACGAAGGAGGGT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=22990852;WS=22990834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	22990930	rs11380759	A	AT	4240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=27;PP=2742;SC=GGCCTAATTCAAAAGGAAGCA;SOR=1.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=22990938;WS=22990920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	22993278	rs5807151	A	AG	1595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=11;PP=1198;SC=AGGTTTGTGTAGGCGACCTCG;SOR=1.880;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=31;WE=22993286;WS=22993268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	22994810	rs33919257	T	TC	484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=464;SC=AGGACCCCAGTCCTAGGTAGA;SOR=1.911;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=22994818;WS=22994800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	22998590	rs5807161	AG	A	2425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1887;SC=CCAACCAGGCAGGGAACTGCT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=22998598;WS=22998580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	22998619	rs5807162	AC	A	1953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1630;SC=TGGGAAGGGAACCCACCTTAT;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=22998627;WS=22998609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	22999179	rs11412657	T	TC	2867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=2024;SC=AAAGGGGGAATCCAGCCAGAG;SOR=2.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=47;WE=22999187;WS=22999169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	22999202	rs11412658	A	AG	3692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=23;PP=2832;SC=CCCATGAGGGAGATAGCTGCA;SOR=1.836;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=60;WE=22999210;WS=22999192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	23000185	rs227004	C	T	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=105;PP=2965;SC=GCCTGCTCTTCTCTGGCTGTT;SOR=1.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=43;TCR=105;TR=148;WE=23000193;WS=23000175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr14	23002265	rs11289756	GC	G	731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=782;SC=GGGTCCAATGGCCCTCTTTGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=23002273;WS=23002255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	23005041	rs5807163	A	AG	7295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=64;PP=2957;SC=TGGCAATCCTAGCTATGGCCC;SOR=1.263;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=122;WE=23005049;WS=23005031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr14	23006663	rs11396434	G	GC	896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=950;SC=AATGGCCACAGCACCCCCATC;SOR=2.215;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=20;WE=23006682;WS=23006653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	23006674	rs1154157	G	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=596;SC=CACCCCCATCGCTACCCTGTG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=23006682;WS=23006653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	23009291	rs1263637	G	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=45;PP=1478;SC=ACACAGAAAGGCCCTACTCTG;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=72;WE=23009299;WS=23009281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	23011096	rs1263639	T	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=693;SC=CCAGCCAGGCTTGCCCTGCCC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=23011104;WS=23011086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	23012873	rs56158321	C	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=25.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	23012926	rs11627600	T	C	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=12;PP=1135;SC=GATTATCCTGTTCTCCTGCCT;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=23012934;WS=23012916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	23013878	rs56031439	C	T	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=494;SC=GCTATGGTGCCGCAGACCTCC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=23013886;WS=23013868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	23014062	rs1263641	G	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=25;PP=1110;SC=CCCATGCCCAGAGTTTCCTGA;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=23014070;WS=23014052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	23014106	rs7153643	C	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=36;PP=1069;SC=CCCAGAGTGACTGTCACTAAT;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=23014114;WS=23014096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	23020489	rs371247	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=244;ReadPosRankSum=0.112;SC=CACCATCACATCCCTAACAGT;SOR=0.307;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=23020497;WS=23020479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr14	23020638	rs15795	T	C	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=852;ReadPosRankSum=0.033;SC=GGAACTCTCCTACCCCCAAGG;SOR=0.399;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=59;WE=23020646;WS=23020628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr14	23020688	rs11462449	G	GC	6321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=55;PP=2957;SC=CCCCGGCAATGCACCAACTGG;SOR=1.017;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=45;TCR=58;TR=97;WE=23020696;WS=23020678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr14	23020820	rs5807168	G	GC	6370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=73;PP=2957;ReadPosRankSum=0.215;SC=GGCTGCTGCAGCTCCGCTGGC;SOR=0.768;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=105;WE=23020833;WS=23020810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,164:0.99:166
chr14	23020825	rs3699	G	C	7604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=71;PP=2965;SC=CTGCAGCTCCGCTGGCTGTGC;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=144;WE=23020833;WS=23020810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr14	23020919	rs3700	C	T	6855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=35.16;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr14	23020919	.	CGG	TGC,TGG	1237	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=27;MQ=60.15;NF=42,75;NR=33,75;PP=1237,1163;QD=17.2062383315;SC=CTCTAGGTCCCGGAGAATGTT;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=150;TCF=75;TCR=75;TR=75,150;WE=23020929;WS=23020909;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:150
chr14	23020921	rs3701	G	C	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=8.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.687;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,91:0.47:193
chr14	23020970	rs3702	G	T	4487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=73;PP=2786;SC=CATAAAGAAAGACATAGTATT;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=137;WE=23020978;WS=23020960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	23021039	rs9125	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=1034;ReadPosRankSum=0.901;SC=TATGCTGTGTGTCTGGGCGTG;SOR=0.899;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=61;WE=23021047;WS=23021029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,69:0.61:114
chr14	23025758	rs10873025	G	A	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=3;PP=112;SC=CTGGGAGGGAGGGAGGTGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=23025766;WS=23025751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	23025815	rs60338447	AC	A	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TCTCTGAGGGACCCCCCCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=23025823;WS=23025805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	23025932	rs12888861	A	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=781;SC=AGGAATCTGCAGGTCTCAGGG;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=23025940;WS=23025922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	23026369	rs33982989	C	CG	528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.67;NF=11;NR=4;PP=582;SC=GGCTGGAGTCCGGATCCACCA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=23026377;WS=23026359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	23027743	rs4982639	G	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=862;SC=GCCAGAACACGCCACGTCACT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=23027751;WS=23027733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	23044002	rs7621	G	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=14;PP=1207;SC=ATGAGAATGAGTCAGCCAACA;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=23044010;WS=23043992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	23058084	rs1051101	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=47;PP=1434;SC=AAGGTACTCCAGTCCGCGCCC;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=59;WE=23058092;WS=23058074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	23067042	rs114422910	A	G	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1260;ReadPosRankSum=-1.834;SC=CAAGGGCCCCACTAGCTGAAA;SOR=0.677;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=89;WE=23067050;WS=23067032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,115:0.42:273
chr14	23102784	rs1753429	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=479;ReadPosRankSum=1.983;SC=TCCTCTTTTCAAAAACTCCTC;SOR=0.899;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=34;WE=23102792;WS=23102774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr14	23102882	rs1681596	C	A	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.182;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=1558;ReadPosRankSum=1.762;SC=GGAGTCACCACACTGCTCAGA;SOR=0.527;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=42;WE=23102904;WS=23102872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
chr14	23102896	rs1681597	A	G	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.503;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=1558;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GCTCAGAACCAAAGGGATCTT;SOR=0.431;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=45;WE=23102904;WS=23102872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr14	23102969	rs1753430	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=694;ReadPosRankSum=-0.197;SC=ATGCCACTAGGAATGATGACT;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=42;WE=23102977;WS=23102959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr14	23103044	rs1681598	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=680;ReadPosRankSum=0.693;SC=GGAATGCGCACTATGGTCAAG;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=33;WE=23103058;WS=23103034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr14	23103282	rs3751481	T	C	3513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1496;ReadPosRankSum=-2.868;SC=CCCAAGAGAATACAACGGTCC;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=184;TCF=95;TCR=89;TR=90;WE=23103290;WS=23103272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,99:0.47:209
chr14	23103304	rs45470397	G	T	3633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.785;SC=AATGCAGACAGAAGGTCTCAT;SOR=0.700;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=188;TCF=100;TCR=88;TR=93;WE=23103312;WS=23103294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,103:0.48:214
chr14	23103347	rs3751482	T	C	3966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,106:0.53:199
chr14	23103354	rs3751483	A	G	3906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.970;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,100:0.51:195
chr14	23103356	rs45494902	G	A	3869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.26;ReadPosRankSum=1.694;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,99:0.52:191
chr14	23103743	rs56305436	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.550;SC=GCTCAATTCTCCTAACAGAAC;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=23103751;WS=23103733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	23235697	rs1957373	C	T	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.547;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1123;ReadPosRankSum=0.483;SC=CTTCAACTTCCTTTCAATCTC;SOR=0.916;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=67;WE=23235705;WS=23235687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,94:0.49:191
chr14	23235808	rs1957374	G	A	3078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1689;ReadPosRankSum=-1.549;SC=CGCCTGATCTGCGGCTACAAT;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=119;TCR=107;TR=110;WE=23235816;WS=23235798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,143:0.53:270
chr14	23236524	rs8572	C	T	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=31;PP=1219;SC=CTATTCCCAGCAGCCCCGTGC;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=23236532;WS=23236514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	23239512	rs2075846	A	G	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=58;PP=1858;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TTCCTTCCTTATTTCATCCAG;SOR=0.577;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=229;TCF=125;TCR=104;TR=122;WE=23239520;WS=23239502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,125:0.51:243
chr14	23239880	rs1957502	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=11;PP=866;SC=GTGAACTGGGGTTGGAGGGTA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=33;WE=23239888;WS=23239870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	23242828	rs1061040	T	C	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=793;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TTTAGTTAGATTTGGGATCCC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=49;WE=23242836;WS=23242818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr14	23242980	rs11568422	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=1.382;SC=GCTGAGTTCAAGTGTCACTGA;SOR=1.483;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=7;WE=23242988;WS=23242970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr14	23244542	rs12891079	T	C	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=15;PP=986;ReadPosRankSum=-1.179;SC=CCACCAATAGTTTTTCTATTG;SOR=0.780;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=85;TCR=34;TR=57;WE=23244550;WS=23244532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr14	23245252	rs3829406	A	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=383;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CCTTTCTTCCACAGTGGGGTT;SOR=0.620;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=24;WE=23245260;WS=23245242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr14	23282449	rs1805059	C	T	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CAAAGATGCCCGAGCCGATCA;SOR=0.840;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=65;TCR=92;TR=68;WE=23282457;WS=23282439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,92:0.47:197
chr14	23282699	rs3829407	A	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr14	23282750	rs7157654	A	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.460;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	23291924	rs11625306	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=793;ReadPosRankSum=0.653;SC=ACAACTGCCTCCGGCCCCGAG;SOR=1.057;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=39;WE=23291932;WS=23291914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr14	23299286	rs4982685	T	C	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=76;PP=2965;SC=CACTGCAGCGTAGCCGCTTGG;SOR=0.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=96;TCR=76;TR=172;WE=23299294;WS=23299276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr14	23300095	rs9646148	T	G	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=48;PP=2843;SC=TAGTAGCAAATCCAGGACTAG;SOR=1.339;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=137;WE=23300103;WS=23300085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	23302585	rs12050397	T	A	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=25;PP=1070;SC=GGTGATGCAGTCCATCTCTAA;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=23302593;WS=23302575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	23306048	rs1042703	C	T	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=46;PP=2503;SC=CCCAAGACCCCCCCGTTGTCT;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=126;WE=23306056;WS=23306038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	23311042	rs17879412	CT	C	907.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=9;PP=677;SC=CACAGCAAGTCTTACCCAACA;SOR=0.784;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=16;WE=23311052;WS=23311037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	23311044	rs57542488	T	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=9;PP=428;SC=CAGCAAGTCTTACCCAACACT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=19;WE=23311052;WS=23311037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	23312718	rs2236303	C	T	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=982;SC=TTGCAGTCTCCGCACCGCCCC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=23312726;WS=23312708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	23312863	rs2236304	C	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=748;SC=ATCTGTCTGTCCTTCCGTCCC;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=23312871;WS=23312856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	23313182	rs2236308	A	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=41;PP=1143;SC=AGGCAGGTGGATCACCTGAGG;SOR=6.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=23313190;WS=23313172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	23314675	rs911912	C	T	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=37;PP=1115;SC=TGGAAAACAACGGCGATGATA;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=23314683;WS=23314665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	23341666	rs8011536	G	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=0.714;SC=CCTGCCGCCAGCCCCAGCACT;SOR=0.929;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=23341674;WS=23341656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr14	23352464	rs72363604	TGCACAC	T	2341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=1798;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GCTGCTGGGCTGCACACGCAC;SOR=0.922;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=29;WE=23352477;WS=23352454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
chr14	23355548	rs3751490	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=204;ReadPosRankSum=1.216;SC=GCACTCACTTGCAATCAGACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=23355556;WS=23355538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	23371255	rs61680322	G	GGGC	2980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.192;NF=22;NR=44;PP=2548;ReadPosRankSum=2.034;SC=GCAGCAGCCTGGGCGGCGGCG;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=74;TCR=153;TR=66;WE=23371263;WS=23371245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,83:0.39:214
chr14	23389991	.	G	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CAGGAAAGCAGATTGAAATGC;SOR=0.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=14;WE=23389999;WS=23389981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr14	23390272	.	G	C	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.336;SC=GCTGCTGTAAGAAGAAAGACA;SOR=0.538;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=68;WE=23390280;WS=23390262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,87:0.54:161
chr14	23391905	rs11624624	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;ReadPosRankSum=0.693;SC=GAGGAAGGAAGAAGCCCGTAC;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=32;WE=23391921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr14	23391913	rs8007089	T	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.341;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;ReadPosRankSum=-1.316;SC=AAGAAGCCCGTACCCCTCTAG;SOR=1.214;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=36;WE=23391921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr14	23421518	rs148307495	C	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=-2.773;SC=TTAGCCACCACGCCCAGCCTT;SOR=0.202;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=21;WE=23421526;WS=23421508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr14	23424186	rs2016392	A	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.854;NF=26;NR=14;PP=607;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CACCCACCTCAGCCTCCCAAA;SOR=0.327;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=40;WE=23424194;WS=23424176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr14	23448102	rs138898734	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=728;ReadPosRankSum=-1.449;SC=CCCAGAAATCGTCTCTGGGAC;SOR=1.197;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=48;WE=23448110;WS=23448092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr14	23456315	rs1043675	T	C	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=673;SC=GAGGCAAATTTGCTTTCTCAG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=23456323;WS=23456305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	23459156	rs11624528	G	A	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=41;PP=2159;SC=TCCCTCCACAGCCTAAGAAGG;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=23459164;WS=23459146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	23467664	rs3829409	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=279;ReadPosRankSum=-1.335;SC=CGCCTCGCTGGCAGCCAGCGT;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=18;WE=23467672;WS=23467654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
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chr14	23511357	rs4981456	G	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=264;SC=CAGCTTCTCTGTAGCGTCCCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=23511365;WS=23511347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr14	23518592	rs11626296	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=24;ReadPosRankSum=1.894;SC=ATAGAGCCAGCCCATAGGTCC;SOR=0.515;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=23518600;WS=23518582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	23518791	rs2295689	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr14	23518918	rs11623976	T	C	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=778;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CAACTTCATCTCTGTCCAGGG;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=51;WE=23518926;WS=23518908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr14	23523244	rs11625828	C	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=490;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TCTCTAAGCTCCAACAGAGAG;SOR=0.264;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=25;WE=23523252;WS=23523234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr14	23524137	rs11418548	T	TG	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.678;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=0.886;SC=GAACAACCGATGGGGGGGGAT;SOR=1.626;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=16;WE=23524145;WS=23524127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr14	23524466	rs117261340	T	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=640;ReadPosRankSum=0.117;SC=ACATGAATATTGCCTGTGGCC;SOR=0.769;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=44;WE=23524474;WS=23524456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr14	23530622	rs60168438	T	C	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=47;PP=1006;ReadPosRankSum=0.024;SC=ATTCACGCTCTGATCGAGTCC;SOR=0.638;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=81;WE=23530630;WS=23530612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,94:0.56:167
chr14	23548783	rs148403158	A	AGAACGT	3155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.41;MQRankSum=2.703;NF=8;NR=35;PP=2886;ReadPosRankSum=1.160;SC=ATGCTGAACGAGAACGTGAAC;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=21;TCR=87;TR=43;WE=23548791;WS=23548773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,79:0.50:158
chr14	23549319	rs1885097	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=610;ReadPosRankSum=0.138;SC=GTATGCTGAGATACTAATAGC;SOR=0.864;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=39;WE=23549327;WS=23549309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr14	23549379	rs941719	C	G	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=46;PP=2036;SC=ATGAGGACAGCGGGGGCTGGG;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=23549387;WS=23549369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	23549785	rs3811182	T	C	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1387;ReadPosRankSum=1.502;SC=TTACTCTAGGTATCTCTTCCC;SOR=0.454;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=188;TCF=82;TCR=106;TR=86;WE=23549793;WS=23549775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,98:0.46:215
chr14	23550126	rs4982727	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=1.030;SC=CAATGATATATACTTTCAGCA;SOR=0.657;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=9;WE=23550134;WS=23550116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr14	23550887	rs717984	C	A	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1292;ReadPosRankSum=0.710;SC=AAACTCAAAACAAGTCTGAAG;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=103;TCR=38;TR=76;WE=23550895;WS=23550877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,88:0.56:157
chr14	23559973	rs8020434	T	C	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	23571671	rs4444236	A	T	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=67;PP=2467;SC=CCTTGTCACTAGTTGCCTTGT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=23571679;WS=23571661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	23572776	rs148655160	T	TAAAAC,TAAAACAAAAC	1356.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=15,15;NR=5,5;PP=655,200;SC=AAAAGCAAAATAAAACAAAAC;SOR=3.407;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=20,20;WE=23572784;WS=23572766;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.40,0.60:30
chr14	23574095	.	GGCA	G	760	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=23;MQ=60.2;NF=1;NR=16;PP=760;QD=45.0588235294;SC=GACTAGTGGCGGCAGCAGCAG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=17;WE=23574105;WS=23574085;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	23574112	rs57331962	CA	C	366.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr14	23574114	rs55686792	GCA	G	366.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr14	23574116	.	A	G	246	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=60.19;NF=3;NR=12;PP=246;QD=18.7180808365;SC=CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=15;WE=23574124;WS=23574106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr14	23596320	rs761874	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.204;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.287;SC=ATGTGTTGGCAGGACCAAGGC;SOR=2.409;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=10;WE=23596328;WS=23596312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	23597735	rs10132060	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=-0.133;SC=GAGAAGCCCACAGGGATGGAG;SOR=1.075;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=10;WE=23597743;WS=23597725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr14	23598849	rs7157207	T	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=488;ReadPosRankSum=0.427;SC=CCAAAGGGAGTTTCTCTCACC;SOR=1.409;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=29;WE=23598857;WS=23598839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr14	23598952	rs7157021	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=704;ReadPosRankSum=0.998;SC=TGAAGCCCACATAGTTGATGA;SOR=0.758;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=51;WE=23598960;WS=23598942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr14	23607271	rs1569951	C	T	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=44;PP=1410;SC=AAGGAGAGGTCACCACTCCCC;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=66;WE=23607279;WS=23607261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	23609916	rs10151002	A	T	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=211;SC=CCCACCTCTCACCCCTCCCTG;SOR=2.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=23609924;WS=23609906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	23612489	rs2273394	C	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=329;SC=ACAAGCAGAACTGCTCCCTCA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=23612497;WS=23612479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	23624583	rs8011016	C	T	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=17;PP=589;SC=CCCCTCCTCCCTTCCTGGCTC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=23624591;WS=23624573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	23652004	rs1884545	G	A	3579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=2145;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TGACCAATCCGATCTCTTTCT;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=300;TCF=161;TCR=139;TR=138;WE=23652012;WS=23651994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,173:0.48:361
chr14	23730017	.	C	T	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=38;QD=24.2570708491;SC=TTCACTTCTCCGAGGAAGAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=23730025;WS=23730007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	23744800	rs148005528	ACAT	A	605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.156;NF=3;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=-3.347;SC=TTGTATGATCACATCATCATC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=6;WE=23744810;WS=23744790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr14	23745533	rs10131813	C	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=690;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GGTTTAGAGGCGGCAGTAGCT;SOR=0.396;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=50;WE=23745541;WS=23745523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr14	23777081	rs2231300	G	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GCCCCGGGGAGGGCCCAGCAG;SOR=0.529;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=73;WE=23777089;WS=23777071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,84:0.38:224
chr14	23777374	rs910332	A	G	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=70;PP=2186;SC=CTGGAGACGCAGCTGGCTGAC;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=96;WE=23777382;WS=23777364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	23780222	rs10149339	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1102;ReadPosRankSum=-1.209;SC=ACCACAGGACACATATCCCTG;SOR=0.445;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=73;WE=23780230;WS=23780212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,92:0.51:180
chr14	23789096	rs10640563	C	CTT	5017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=67;PP=2930;SC=TAATGAGTCACTTGATTTTTT;SOR=1.849;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=70;WE=23789104;WS=23789086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	23792019	rs8020117	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=736;SC=TTCAATTTATTGAATATTTAG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=23792027;WS=23792009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	23792215	rs2295126	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=593;ReadPosRankSum=0.769;SC=TAGCTGGCCCGGTGATCATGT;SOR=0.650;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=36;WE=23792223;WS=23792205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr14	23792416	rs45508899	A	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=0.084;SC=AGGTAATGGAATGATCAGTAA;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=23792424;WS=23792406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr14	23816998	rs12896494	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=499;ReadPosRankSum=0.037;SC=CGCAGCCTTCTACAGTGCTGA;SOR=0.869;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=32;WE=23817006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr14	23826819	rs2231810	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr14	23826822	rs2231809	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr14	23828250	rs34060515	TC	T	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.912;NF=0;NR=9;PP=266;ReadPosRankSum=-1.456;SC=TTCTGCCCCTTCCCCGGACCC;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=23828258;WS=23828240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	23828893	rs2231806	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=478;ReadPosRankSum=1.272;SC=GGGCTCTGGAGAAGGGGGAGC;SOR=0.586;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=31;WE=23828901;WS=23828883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr14	23829164	rs2231805	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=728;ReadPosRankSum=0.058;SC=GGGGCAACCCGGGTCAGAGGG;SOR=1.139;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=42;WE=23829172;WS=23829154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr14	23830042	rs2231798	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.996;SOR=0.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr14	23830048	rs2231797	T	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.972;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr14	23834174	rs72127341	TGGA	T	2451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=1587;ReadPosRankSum=0.144;SC=GGGCAGGCCGTGGAGGTCTCT;SOR=0.877;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=39;WE=23834184;WS=23834164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,63:0.55:115
chr14	23842017	rs7145531	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=402;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TGTTTTTTAACCTCAAGTCAC;SOR=1.206;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=26;WE=23842025;WS=23842007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr14	23842040	rs7145551	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=546;ReadPosRankSum=-1.012;SC=CCTAAAAAGACAGTGGAAATA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=41;WE=23842048;WS=23842030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr14	23845244	rs3811178	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.335;SC=TTTGGGGAAAGCCTGCACTTC;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=23845252;WS=23845234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	23848311	rs723840	C	T	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1302;ReadPosRankSum=0.273;SC=CCTCCCGGGACGGAGCTGCCA;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=81;WE=23848319;WS=23848301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,86:0.48:180
chr14	23851400	rs453361	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CCCAGGGATCCTGTGGTCCCA;SOR=0.047;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=23851408;WS=23851390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr14	23854155	rs8004990	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=400;ReadPosRankSum=1.658;SC=CCTTCTCCTCGGCGTTTCTGC;SOR=1.453;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=20;WE=23854163;WS=23854145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr14	23854324	rs178638	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TTTCTCCAGAAAGAATTAAAG;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=16;WE=23854332;WS=23854314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr14	23854352	rs178639	A	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr14	23855320	rs382872	G	A	4212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=74;PP=2377;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GGACCGCATCGTCCAGCTGGA;SOR=0.824;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=328;TCF=177;TCR=151;TR=169;WE=23855328;WS=23855310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,203:0.52:387
chr14	23855426	rs45520434	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.234;SC=TGCAGTAACCCAGGGGCAGGA;SOR=0.889;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=68;WE=23855434;WS=23855416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr14	23855478	rs396024	C	G	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;ReadPosRankSum=-1.528;SC=CTTCTCCAGGCCACATGGAGG;SOR=1.136;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=31;WE=23855486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr14	23855569	rs178640	A	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.401;NF=22;NR=16;PP=515;ReadPosRankSum=0.572;SC=GGGCCTCGGCAGCCATGCGGT;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=38;WE=23855577;WS=23855559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr14	23856896	rs178642	A	G	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=1124;ReadPosRankSum=0.430;SC=CTCAAAGCCTATGTTCCCCCT;SOR=0.599;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=68;WE=23856904;WS=23856886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr14	23858232	rs451794	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.332;NF=14;NR=14;PP=478;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CATGCCGGGCCGACTGCAGTG;SOR=0.020;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=28;WE=23858240;WS=23858222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr14	23858271	rs368353621	AGG	A	735.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=14;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.565;NF=4;NR=16;PP=256;ReadPosRankSum=1.960;SC=TCGCCTGGGGAGGGGGGGGGG;SOR=0.905;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=20;WE=23858280;WS=23858261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	23861811	rs365990	A	G	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=942;ReadPosRankSum=-0.920;SC=AAGGGCCAGCACCTGCTCATC;SOR=0.869;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=58;WE=23861819;WS=23861801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr14	23865885	rs452036	G	A	3070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=0.925;NF=52;NR=72;PP=1819;ReadPosRankSum=-1.397;SC=CAACCACCCAGTGGGGCTCTA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=96;TCR=131;TR=124;WE=23865893;WS=23865875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,145:0.54:267
chr14	23866713	rs412768	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=252;ReadPosRankSum=0.502;SC=GGGCTGGGCCATTCCACCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=23866721;WS=23866703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	23870173	rs147903010	C	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=789;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TGAGGTAGGCCGACTTGTCAG;SOR=0.321;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=85;TCF=13;TCR=72;TR=48;WE=23870181;WS=23870163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr14	23872666	rs434273	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=525;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CTGAGGTGGGTGGAGGGGAGG;SOR=0.750;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=42;WE=23872674;WS=23872656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr14	23873092	rs388914	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=-0.554;SC=AAATGTAAACGACCTCTTTGG;SOR=0.904;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=25;WE=23873100;WS=23873082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr14	23874117	rs440466	T	C	3221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=89;PP=1932;ReadPosRankSum=1.190;SC=CTTCCCAGCCTGGCCATCAGA;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=79;TCR=154;TR=135;WE=23874125;WS=23874107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,153:0.56:273
chr14	23874523	rs2277474	C	T	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1155;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CGGCCACCACCTCGGCATTGT;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=73;WE=23874531;WS=23874513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,85:0.57:150
chr14	23881920	rs12147570	G	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	23882144	rs2284651	T	C	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=478;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GGACAGGGCATGGGAACAAAG;SOR=0.464;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=44;WE=23882152;WS=23882134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr14	23882186	rs7149517	T	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=348;ReadPosRankSum=0.016;SC=GGGGCCTGCTTTGTGGGCAGG;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=22;WE=23882194;WS=23882176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr14	23883184	rs3729833	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=921;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CCTATGCCTCCCCTGGGCCTA;SOR=1.164;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=55;WE=23883192;WS=23883174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr14	23885997	rs3729828	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	23886264	rs3729825	C	T	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=1697;ReadPosRankSum=-2.140;SC=TGGAGGGACACGCCTCTTTGC;SOR=0.711;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=96;WE=23886272;WS=23886254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,102:0.53:191
chr14	23887645	rs7159367	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=222;ReadPosRankSum=0.483;SC=AGGAGGTGGGTTCAGCTTTCT;SOR=0.760;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=20;WE=23887653;WS=23887635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr14	23888323	rs34598192	T	TG	3188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=2297;ReadPosRankSum=-2.100;SC=AGGGAAGTGATTTGATGCAAG;SOR=1.329;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=64;WE=23888331;WS=23888312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,94:0.49:191
chr14	23888665	rs2277475	A	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=298;ReadPosRankSum=-1.098;SC=TGTGGTGGGAACCATGGAGCC;SOR=0.382;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=21;WE=23888673;WS=23888655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr14	23892888	rs7157716	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=865;ReadPosRankSum=-0.966;SC=TCAGCTTGGCAATGATCTCAT;SOR=1.046;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=50;WE=23892896;WS=23892878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr14	23899027	rs735711	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-1.869;SC=GCTGCTTCAGCTTGAACTTCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=23899035;WS=23899017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	23902753	rs2069540	G	A	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=758;ReadPosRankSum=0.205;SC=TGCCATACTCGGTCTCGGCAG;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=46;WE=23902761;WS=23902743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr14	23924767	.	AT	A	259	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=24;MQ=59.68;NF=8;NR=2;PP=259;QD=28.0;SC=AAAGCTGAGAATTTTTTTAAA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=23924775;WS=23924757;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,10:0.77:13
chr14	23924818	rs8005802	C	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=22;NR=12;PP=643;SC=GAAGATTAGACAAAAATATCA;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=23924852;WS=23924808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	23924830	rs10131038	A	G	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=21;NR=15;PP=558;SC=AAAATATCAAAGCAGGATAAA;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=36;WE=23924852;WS=23924808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	23938813	rs8015781	A	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=20;PP=1665;SC=GGAAGTGAGAAAGCCCTTATT;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=78;WE=23938821;WS=23938803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	23939927	rs5807217	GT	G	139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=87;SC=GAAGTGGAAAGTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=23939935;WS=23939926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	23940081	rs1028587	A	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=44.96;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	23940086	rs1028588	A	G	4231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=45.02;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	23940089	rs3215682	AC	A	4247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=30;PP=2489;SC=TAATCTAATCACTTGTTTTAT;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=56;WE=23940097;WS=23940071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	23944505	rs2236260	G	A	8522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	23944514	rs2236261	C	A	8169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=1.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	23945366	rs2295706	A	G	5251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=78;PP=2965;SC=ATTATGGTATAAACTTTGGCT;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=164;WE=23945374;WS=23945356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	23947374	rs1956950	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=268;SC=AATTGATTTTGCTTATGAATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=23947382;WS=23947364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	23991105	rs223122	G	A	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=2;PP=815;SC=AGCTCCCACCGAACACCCCTT;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=23991113;WS=23991095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	23995928	rs45503996	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=890;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GAGGGAACTTCGTTTAAGCCA;SOR=1.069;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=55;WE=23995936;WS=23995918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,61:0.38:160
chr14	23998816	.	A	G	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=932;ReadPosRankSum=0.389;SC=TCTGAGTGAAATAAGTCAAAG;SOR=0.569;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=136;TCF=93;TCR=43;TR=63;WE=23998824;WS=23998806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,71:0.43:164
chr14	23999306	rs3742488	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=674;ReadPosRankSum=1.946;SC=AGGAGGACTGGGGGGAAGGGA;SOR=0.901;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=41;WE=23999314;WS=23999296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr14	24001662	rs41307102	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	24436381	rs33966071	GA	G	1638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-1.902;QD=12.61;ReadPosRankSum=4.444;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,75:0.58:130
chr14	24519959	rs6573541	T	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=15;PP=911;ReadPosRankSum=1.717;SC=CCTGAAAAGTTATCTGATAAT;SOR=0.702;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=132;TCF=95;TCR=37;TR=57;WE=24519967;WS=24519949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,64:0.44:144
chr14	24522821	rs9972282	C	T	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=787;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CTCTCTTATCCCATTTGACCC;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=48;WE=24522829;WS=24522811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr14	24523594	rs11158525	G	A	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=50;PP=1805;ReadPosRankSum=0.006;SC=CTGACGCTTCGTCTCCCCCAG;SOR=0.923;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=259;TCF=133;TCR=126;TR=115;WE=24523605;WS=24523584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,131:0.44:296
chr14	24525634	rs4982851	C	A	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=81;PP=2637;SC=TGTCCCCATCCCAATGCAGAC;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=61;TCR=81;TR=142;WE=24525642;WS=24525624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr14	24525782	rs4982852	A	G	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=32;PP=2110;SC=TGCCACCTGCACCCACTGCCC;SOR=1.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=99;WE=24525790;WS=24525772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	24526206	rs45484702	T	C	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=55;PP=2136;SC=GCAAGAATCCTGGGCTCCTCG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=118;WE=24526214;WS=24526196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	24526287	rs7161473	G	C	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=58;PP=2717;SC=TAAGCTTCAGGAGCTGGGAGG;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=118;WE=24526295;WS=24526277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
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chr14	24526593	rs12431698	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=441;SC=GTATAAAGCAATGTCCATAGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=24526601;WS=24526583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr14	24529890	rs1951635	A	G	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=20;PP=1607;SC=CCCTGAGACTATGCCCCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=24529898;WS=24529880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	24531641	rs960266	G	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=726;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GGGGCCATGCGGGGGACTGAG;SOR=0.551;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=42;WE=24531649;WS=24531631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr14	24533321	rs58091590	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-1.133;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.935;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr14	24534471	rs116307579	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-1.904;SC=ACCTTCCTTCCGCCGGAAGAT;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=16;WE=24534479;WS=24534461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr14	24534781	rs12590548	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=358;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CACAGCCTGGGGAGCCCCCTT;SOR=1.010;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=24;WE=24534789;WS=24534771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr14	24542458	rs3742497	T	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=750;SC=CTGGAGATGGTGTCCCAGAGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=24542466;WS=24542448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	24543808	rs2070343	G	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=731;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GTGATCAGCTGGTCTGGAGAA;SOR=0.582;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=51;WE=24543816;WS=24543798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr14	24543873	rs2025256	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1256;ReadPosRankSum=2.081;SC=AAAGTAAGAAGACACAGACAG;SOR=0.640;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=81;WE=24543881;WS=24543863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,94:0.45:208
chr14	24545366	rs2070342	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=406;SC=AGGTGGCCATTGACTTCACCG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=24545374;WS=24545356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	24545835	rs45621931	C	T	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1284;ReadPosRankSum=-0.818;SC=ACAGACTCCACTCCCCAGGGC;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=69;TCR=93;TR=80;WE=24545843;WS=24545825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,96:0.51:190
chr14	24545984	rs2070345	G	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=415;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AGGAACTCGAGGGGAGGGCAG;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=24;WE=24545992;WS=24545974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr14	24563339	rs4982857	A	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=843;SC=AATGGGAGAGATGGGTTTGGC;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=24563347;WS=24563329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	24567498	rs3021119	A	C	7327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=116;PP=2965;SC=GACACGGTACAACTCCCGCCT;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=106;TCR=116;TR=222;WE=24567506;WS=24567488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr14	24572495	rs2071586	G	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=-2.425;SC=TCCCTCTCCTGTGTGTGCACA;SOR=1.056;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=23;WE=24572503;WS=24572485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr14	24572812	rs35618680	G	A	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1190;ReadPosRankSum=0.391;SC=ATGGAAGGGCGCAAGGGGGCC;SOR=0.493;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=81;WE=24572820;WS=24572802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,92:0.53:172
chr14	24587515	rs2277480	G	A	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=37;PP=2965;SC=AGACTCCACAGGTACACTGAG;SOR=1.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=96;TCR=37;TR=133;WE=24587523;WS=24587505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	24587545	rs2277481	A	G	6723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=75;PP=2965;SC=TCTAATCTAGAAAAGTTACAA;SOR=1.326;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=136;TCR=75;TR=211;WE=24587553;WS=24587535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr14	24587639	rs3825584	G	A	9655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=160;PP=2965;SC=GGCCGTTTCCGTAAATTCAAG;SOR=0.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=301;TCF=141;TCR=160;TR=301;WE=24587647;WS=24587629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr14	24587667	rs17101367	C	T	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=68;PP=1736;ReadPosRankSum=0.989;SC=AGGCCCGCGACGTAGGCTGGA;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=247;TCF=101;TCR=146;TR=113;WE=24587675;WS=24587657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,125:0.45:276
chr14	24587795	rs2277482	C	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=975;SC=CCTGAGGTTTCCATGTGCCTG;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=24587803;WS=24587785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	24600390	rs927494	T	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=2;PP=807;SC=GACCTCTGATTTCCCTGTGGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=24600398;WS=24600380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	24601318	rs11574503	G	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=707;SC=AGGAGAGAACGAGTGATGATG;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=24601326;WS=24601317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	24614361	rs7146672	T	G	4112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=46;PP=2154;SC=TCCACACTTATGGACTGTGAG;SOR=0.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=109;WE=24614369;WS=24614351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	24615435	rs4575	T	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=37;PP=1597;SC=AAAGATTCTGTCTGAAGACCT;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=69;WE=24615443;WS=24615425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	24617238	rs2273913	C	T	4149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=78;PP=2418;ReadPosRankSum=-2.480;SC=TGGAGAAATACGGCCGCAACC;SOR=0.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=341;TCF=165;TCR=176;TR=147;WE=24617246;WS=24617228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,195:0.46:420
chr14	24624741	rs2295979	C	G	4810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=83;PP=2965;SC=CTGCCCAGGGCAGCTACTGTG;SOR=0.999;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=145;WE=24624749;WS=24624731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	24625031	rs4982862	C	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=11;PP=306;SC=TTACAGACTACTCAGAAAGAC;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=24625039;WS=24625021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	24632481	rs56212235	G	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=-1.860;SC=TGCAACCCAGGTTTCCCTTCC;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=24632489;WS=24632471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	24646406	rs10690822	G	GGAA	4846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=28;PP=2969;SC=TGATCGCAGAGGAAGAAGCTA;SOR=1.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=65;WE=24646414;WS=24646396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	24646469	rs17199551	T	C	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=61;PP=2965;SC=TGGAGCTGGATAGTCAGACCC;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=104;TCR=61;TR=165;WE=24646477;WS=24646459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	24647814	rs1885711	T	C	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=7;PP=1201;SC=CTACACAGCCTATGGTGCAGC;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=24647822;WS=24647804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	24647902	rs34136797	C	T	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.995;NF=47;NR=32;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GGGTTGGGCACGAAGTATCCT;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=156;TCF=90;TCR=66;TR=79;WE=24647910;WS=24647892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,96:0.51:189
chr14	24647957	rs1885710	C	T	6892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.04;NF=109;NR=96;PP=2965;SC=CCTCAAACCCCGTGCCTACTA;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=109;TCR=96;TR=205;WE=24647965;WS=24647947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr14	24649669	rs2273912	C	T	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=32;PP=1916;SC=CCAGTACAGCCTGGAGCTCCT;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=90;WE=24649677;WS=24649659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	24650047	rs7145633	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=213;SC=GAGTGGCAGAATCTCTTATCA;SOR=2.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=24650055;WS=24650037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	24651624	rs149643983	CAG	C	2841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=52;PP=2597;SC=GGAGCCAGGTCAGGGGCTGGA;SOR=3.293;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=53;WE=24651633;WS=24651614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	24652107	rs34130297	A	AG	3039.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=47;PP=2620;SC=TCATGGGGGTAGGGGGTGGAC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=68;WE=24652115;WS=24652097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	24657407	rs6573607	T	G	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=36;PP=1419;SC=CCGAGAGAAGTGGGTAGGTAC;SOR=0.848;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=82;WE=24657415;WS=24657397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	24659408	rs67843857	ACT	A	974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=765;SC=TAAGTGAGACACTCTCATATC;SOR=2.030;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=16;WE=24659417;WS=24659398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	24679877	rs2295322	C	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=835;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ACATCATCTCCAAAGCCCATA;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=49;WE=24679885;WS=24679867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr14	24680606	rs71119065	TC	T	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=1.637;SC=CCTCCACCCCTCCCCCCGTAC;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=10;WE=24680614;WS=24680596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr14	24702987	rs11158615	A	G	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=46;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GGCCATCTGAATTAGTGAGAT;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=41;TCR=92;TR=65;WE=24702995;WS=24702977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr14	24718379	rs41294726	TCTCCGGGAGCCCTGGACTCCCC	T	977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=2808;SC=ACTGACTCCCTCTCCGGGAGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=15;WE=24718408;WS=24718370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	24718515	rs2229463	G	A	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.920;NF=34;NR=25;PP=850;ReadPosRankSum=1.322;SC=CTCCTGGCACGGGGCTAAGCT;SOR=0.794;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=59;WE=24718523;WS=24718505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
chr14	24724663	rs35312232	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=525;ReadPosRankSum=2.068;SC=TTCTCCTCCACATAAACAATC;SOR=1.038;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=33;WE=24724671;WS=24724653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr14	24736027	rs14193	G	A	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.184;SC=GGGTTCGGAGGCGATTGTGTG;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=63;WE=24736035;WS=24736017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr14	24736961	rs729421	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=-1.552;SC=TCCAGATACGTTGCCCGCATG;SOR=0.646;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=18;WE=24736969;WS=24736951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr14	24737203	rs941502	A	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=411;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TTCTCTTGGAACCTCCTCTGC;SOR=0.962;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=26;WE=24737211;WS=24737193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr14	24738379	rs59227799	T	C	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=47;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TCTGTGGGGTTCCAGGAGGCA;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=38;TCR=82;TR=69;WE=24738387;WS=24738369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,76:0.54:141
chr14	24739055	rs2295313	T	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=0.915;SC=ACCAGCTCAGTGGACCCATCC;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=24739063;WS=24739054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	24739363	rs58050348	A	AG	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=0.435;SC=CCAGAAGGGAAGGGGGGGGTC;SOR=1.696;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=15;WE=24739371;WS=24739353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr14	24740272	rs78807053	G	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=621;ReadPosRankSum=0.636;SC=CACTGGGGGTGAGGGCGCGGG;SOR=1.067;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=39;WE=24740280;WS=24740262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
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chr14	24769663	rs11158632	T	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=628;ReadPosRankSum=2.189;SC=AGGCCCTAGCTTTGTCCACGA;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=46;WE=24769671;WS=24769653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr14	24769849	rs113258190	A	AGAG,AGAGGAG	2562.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=7,7;NR=29,29;PP=499,1032;SC=GGAGTGCTGCAGAGGAGGAGG;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=36,36;WE=24769857;WS=24769839;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:61
chr14	24771080	rs4374085	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=-0.666;SC=TTTGTGTCCATAGTGCCCTGT;SOR=0.804;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=24771088;WS=24771070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr14	24771101	rs4366641	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=0.426;SC=ATCTTGTTGCCTAAAGTTTGA;SOR=1.755;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=7;WE=24771109;WS=24771091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	24771137	rs4247000	G	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=931;SC=CTGGATTTTGGGAAAGCCGCT;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=24771145;WS=24771127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	24771256	rs4247001	T	C	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=38;PP=1936;SC=TTTGCGCTCATCTCTGCAATG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=24771264;WS=24771246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	24771285	rs4280164	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=719;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GGCTACCTGAGTACTCGCGGT;SOR=0.854;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=45;WE=24771293;WS=24771275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr14	24772822	rs4982894	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=412;ReadPosRankSum=0.582;SC=CTGCTTTCATGGAGCTAACAT;SOR=1.068;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=21;WE=24772830;WS=24772812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr14	24772922	rs4982895	C	T	4512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=58;PP=2945;SC=TCATCATATTCTGTCTTCTCC;SOR=0.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=139;WE=24772930;WS=24772912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	24773387	rs2144494	T	C	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=67;PP=1431;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TTCTGTCCCTTGCCCAAAGTC;SOR=1.308;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=205;TCF=85;TCR=120;TR=102;WE=24773395;WS=24773377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,116:0.47:248
chr14	24776769	rs11158635	G	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=654;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGGGCTTGGTGAGTGTAAAGG;SOR=1.032;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=41;WE=24776777;WS=24776759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr14	24791136	rs4981504	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=184;ReadPosRankSum=-1.766;SC=TTGTGAAAACAAAGACGCTTG;SOR=0.484;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=14;WE=24791144;WS=24791126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr14	24793600	rs1884366	G	A	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=63;PP=2094;SC=CTGGGGGCCTGAAGGGAGACA;SOR=1.107;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=105;WE=24793608;WS=24793590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	24793647	rs6573722	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=405;ReadPosRankSum=1.911;SC=AGGCTCCCTGTGTGCTATGAA;SOR=0.404;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=34;WE=24793655;WS=24793637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr14	24794440	rs17184689	T	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.998;SC=GATTATCATTTTCCCCAGAAC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=24794448;WS=24794430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	24795115	rs11622527	G	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=347;ReadPosRankSum=0.074;SC=TGGGAGGGTGGGTGAAAGCAC;SOR=1.302;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=23;WE=24795123;WS=24795105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr14	24795231	rs67156008	CCA	C	5097.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=42;PP=2967;SC=CATCCCTTCTCCACCATATGA;SOR=1.250;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=24795245;WS=24795221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	24795237	rs55970272	T	C	5255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=44;PP=2333;SC=TTCTCCACCATATGACCTCAG;SOR=1.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=111;WE=24795245;WS=24795221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	24795258	rs11622863	C	T	4286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=1.565;SC=GGCCTGCGGCCCCCCCAGCCC;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=144;WE=24795266;WS=24795246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr14	24799024	rs1109152	G	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=310;ReadPosRankSum=1.266;SC=TGGTAGGCCTGGTTGGCCTTC;SOR=0.395;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=17;WE=24799032;WS=24799014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr14	24799287	rs1109153	A	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=532;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GAGACACCCCAGATTCTCACA;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=36;WE=24799295;WS=24799277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr14	24799578	rs12436417	C	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GAAAAGTGGGCAGCGAGCGGG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=30;WE=24799586;WS=24799568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
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chr14	24801635	rs1950502	A	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr14	24802263	rs8003158	A	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=33;PP=1061;SC=AGGAAAAGCCAGCAGCCCAGC;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=24802271;WS=24802253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	24803956	rs1124644	A	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=352;SC=TCACCCGCTCAAAGCCGCTAC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=24803964;WS=24803946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	24806229	rs724165	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1201;ReadPosRankSum=-2.598;SC=CCAAGTTTTCGCTGGCAAGGG;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=62;TCR=105;TR=76;WE=24806237;WS=24806219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,91:0.46:196
chr14	24806800	rs1950501	G	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=621;ReadPosRankSum=0.249;SC=CAAAGGTCAAGGCATAAAAAG;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=45;WE=24806808;WS=24806790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,49:0.40:124
chr14	24808168	rs3181248	G	A	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGGCCTGGCTGGAGCAGCTCT;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=83;WE=24808176;WS=24808158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,105:0.56:187
chr14	24835017	rs11362560	CG	C	842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=567;SC=GAACCAAGGACGGGGGGGCTG;SOR=2.546;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=24835025;WS=24835007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	24836815	rs28365903	C	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=599;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GGCGCTGATTCGGCAGCGCAA;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=39;WE=24836823;WS=24836805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr14	24836954	rs138364808	GGGA	G	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr14	24837668	rs45565135	G	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr14	24838621	rs1955915	C	T	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GAAGGACTTGCGGCCTGGCCA;SOR=0.827;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=214;TCF=124;TCR=90;TR=97;WE=24838629;WS=24838611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,117:0.47:248
chr14	24839083	rs2229309	G	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1327;ReadPosRankSum=-1.219;SC=GAAGCAGGGGGCCAGGGTGGG;SOR=0.606;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=78;WE=24839091;WS=24839073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
chr14	24839165	rs2228233	C	T	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1615;ReadPosRankSum=0.032;SC=ATGCCTCTGACGAGGCAGCCC;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=113;TCR=100;TR=108;WE=24839173;WS=24839155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,123:0.51:243
chr14	24843620	rs2295298	T	C	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=873;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TGGTACTGACTGGCTCCAACT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=57;WE=24843628;WS=24843610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr14	24843699	rs12890614	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=784;ReadPosRankSum=0.668;SC=GAGGGGAGGGCAGGCAGGGAG;SOR=0.951;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=53;WE=24843707;WS=24843689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr14	24845154	rs12880769	C	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=355;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CCCGAGGGCTCCCTGCCTCAT;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=24;WE=24845162;WS=24845144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr14	24845841	rs7149586	T	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1226;ReadPosRankSum=0.718;SC=CTCCTCTTTCTCCCTGGGGCT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=68;WE=24845849;WS=24845830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,70:0.47:150
chr14	24846757	rs2243891	A	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=36;PP=2317;SC=CTAGATTAAGACCTGCCTGGA;SOR=1.297;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=24846765;WS=24846747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	24846961	rs10362	G	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=1.647;SC=CCTCAGCCCTGCCCCCTTTCC;SOR=0.286;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=23;WE=24846969;WS=24846951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr14	24878485	rs12897153	G	A	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1629;ReadPosRankSum=-2.404;SC=GAGGTGAGCCGGGGGATCAAG;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=77;TCR=89;TR=90;WE=24878493;WS=24878475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr14	24882312	rs2273634	G	C	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=42;PP=1155;SC=TCGGTAAGATGGTCCCCAGAG;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=64;WE=24882320;WS=24882302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	24882373	rs3818251	G	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=601;SC=GGCATGGGAGGGATTAGGGCT;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=24882381;WS=24882363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	24882440	rs4982909	G	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=792;SC=GGGTCTCAGCGCCATGGAGAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=24882448;WS=24882430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	24882805	rs10146609	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=439;SC=TTAATACATATATGAAAGCAC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=24882813;WS=24882795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	24883720	rs143075190	GGGGTTTCCACAGA	G	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=2169;ReadPosRankSum=0.747;SC=ACTTTGGAATGGGGTTTCCAC;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=6;WE=24883740;WS=24883710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr14	24887462	rs3814811	T	C	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=41;PP=1336;SC=GGCATCTCTATCTGAAGAGCT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=24887470;WS=24887452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr14	24898693	rs2273631	C	T	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
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chr14	24898751	rs2273629	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=198;ReadPosRankSum=1.911;SC=GCATCTTTCCGTTTGTTGGAA;SOR=1.131;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=16;WE=24898759;WS=24898741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr14	24898780	rs5025771	C	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TACTCCACCACGGGTACCCTC;SOR=1.165;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=14;WE=24898788;WS=24898770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr14	24900209	rs1956905	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AGAGCAGGGCCGAGGAGAGCA;SOR=0.411;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=17;WE=24900217;WS=24900199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr14	24900231	rs3825588	G	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=311;ReadPosRankSum=0.368;SC=GGAAGAGGAGGGGCCTGGGGA;SOR=2.684;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=20;WE=24900239;WS=24900221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr14	24901276	rs7151995	G	T	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=55;PP=2161;SC=GAGATGGATTGGGGGTGGAAG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=24901284;WS=24901266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	24901433	rs17795094	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=671;ReadPosRankSum=-1.138;SC=TCTGTGTCCACCGTGAGCCTC;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=48;WE=24901441;WS=24901423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr14	24901844	rs2255591	A	G	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=62;PP=1832;ReadPosRankSum=-1.144;SC=CTAAGGGCCTAGGAGAGGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=208;TCF=96;TCR=112;TR=106;WE=24901852;WS=24901834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,120:0.50:239
chr14	24905533	rs2277488	G	A	4477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=48;PP=2767;SC=TACTGGTCTCGGTTGTCTGGG;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=91;TCR=48;TR=139;WE=24905541;WS=24905523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	24905548	rs2277489	G	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=26;PP=1143;ReadPosRankSum=-1.464;SC=TCTGGGAGGTGGGCAAGGGCC;SOR=1.244;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=162;TCF=96;TCR=66;TR=77;WE=24905556;WS=24905538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,95:0.48:199
chr14	24905736	rs3216750	CT	C	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.568;NF=1;NR=22;PP=835;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GCCCCCACCCCTGGCCCTCTC;SOR=0.887;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=23;WE=24905744;WS=24905726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr14	24906094	rs73593291	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-0.819;SC=AGTGGGTTGATACTGCCACTC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=24906102;WS=24906084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	24906167	rs17103735	C	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=684;ReadPosRankSum=2.359;SC=AGGACAATTACGAGAGGGGTG;SOR=0.448;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=41;WE=24906175;WS=24906157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
chr14	24906515	rs3742521	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=828;ReadPosRankSum=-0.072;SC=GAGTGGCTGCCGCCCTGTCAG;SOR=1.585;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=45;WE=24906523;WS=24906505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr14	24906534	rs3742522	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.626;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=501;ReadPosRankSum=1.100;SC=AGCTCCAGCCGCCTCCAGCTC;SOR=1.493;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=31;WE=24906542;WS=24906524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr14	24909281	rs1043839	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=588;ReadPosRankSum=0.152;SC=GCCCTTGCCACGACCTACTTA;SOR=0.993;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=41;WE=24909289;WS=24909271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr14	24909362	rs1043831	T	C	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=809;ReadPosRankSum=0.692;SC=CAGTGTTCGCTGTGGGATCAC;SOR=0.750;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=58;WE=24909370;WS=24909352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,72:0.49:146
chr14	24909475	rs3211056	C	G	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=33;PP=1283;ReadPosRankSum=0.592;SC=GGGCAGCACCCAAGGTCTGGG;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=82;WE=24909483;WS=24909465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,94:0.50:189
chr14	24909629	rs11538256	C	A	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.160;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1159;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GCCGATGGGGCCCCCCAGGCC;SOR=0.354;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=80;WE=24909637;WS=24909619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,87:0.51:169
chr14	24909731	rs2273628	C	T	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.224;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=1005;ReadPosRankSum=0.086;SC=TACAGGGGTCCTCTCAGCCTT;SOR=1.092;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=66;WE=24909739;WS=24909721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,80:0.42:189
chr14	24910210	rs712487	C	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=813;ReadPosRankSum=0.672;SC=TCCCCTTGGCCTCACCTTCTC;SOR=0.697;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=50;WE=24910218;WS=24910200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr14	24910317	rs10668100	C	CTT	1272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=843;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TGGAGGAACTCTGGTTGCAGG;SOR=0.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=20;WE=24910325;WS=24910307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr14	24910846	rs11628143	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.031;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GTTCCCCTGGCGAATATAAGG;SOR=0.023;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=24910854;WS=24910836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	24910876	rs11158703	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TTTGGGGGGCGTACCTACACC;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=13;WE=24910884;WS=24910866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr14	24910973	rs11625819	TT	GA	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=1813;ReadPosRankSum=0.102;SC=CGGCTGCCGATTACCTCTTTT;SOR=0.709;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=56;WE=24910982;WS=24910963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr14	24911116	rs11158704	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=748;ReadPosRankSum=0.703;SC=CCCTGAATTTCGGCTTAAGAG;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=47;WE=24911124;WS=24911106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr14	24911169	rs11158705	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=530;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CATTCATTTCCTGGGCATCCT;SOR=1.225;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=24;WE=24911177;WS=24911159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr14	24911452	rs11538255	T	C	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=451;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GCAGCCCCGATGCAGCGAGCT;SOR=0.658;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=36;WE=24911460;WS=24911442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr14	24911764	rs1956903	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.213;SC=CTGACACCAGGCTTCTCCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=12;WE=24911772;WS=24911754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr14	24911852	rs12897925	C	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=347;ReadPosRankSum=0.220;SC=GCTAGGAGGCCAAGGCCAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=22;WE=24911860;WS=24911842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr14	24970942	rs4600392	A	G	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=38;PP=1306;SC=CTCCCAACCAAGTAAAGGGGT;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=69;WE=24970950;WS=24970932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	24971008	rs4519248	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=0.709;SC=GCTGCTGGAACAATGGGCCAT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=19;WE=24971016;WS=24970998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr14	24975161	rs2073335	C	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=535;ReadPosRankSum=-1.572;SC=AACCTTCTGACCCCATCTCCT;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=33;WE=24975169;WS=24975151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr14	24975435	rs5249	G	T	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=51;PP=1488;SC=AGTTGAATTGGGATGGGAAGG;SOR=1.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=24975443;WS=24975425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	24975509	rs1885108	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;ReadPosRankSum=-1.781;SC=AATGAAGGACTGTCAGTCCTC;SOR=0.321;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=13;WE=24975517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	25043068	rs1885597	T	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=533;SC=TGCTCCTGCTTCCCTGAGCTC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=25043076;WS=25043058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	25043671	rs45567233	T	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1421;ReadPosRankSum=0.828;SC=AGCCACTGGGTTCACGTTTCG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=81;WE=25043679;WS=25043661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,90:0.45:198
chr14	25044089	rs2070697	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GCAGACAGCACGGGGAGGGCA;SOR=1.675;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=25044097;WS=25044079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	25044712	rs1957523	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=67;PP=2060;SC=AAGATGGGGACGGCAGGAGAG;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=90;WE=25044720;WS=25044702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	25045589	rs12878578	A	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=169;SC=CTGCTCAGGAAGTTTGCCCAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=25045597;WS=25045579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	25078914	rs1957526	A	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=172;SC=GGTACAGTAAACTCAGAGACC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=25078922;WS=25078904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	25102160	rs8192917	C	T	2915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=36;PP=1917;SC=GAAGTCGTCTCGTATCAGGAA;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=88;WE=25102168;WS=25102150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	25281843	rs712491	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=443;ReadPosRankSum=0.250;SC=GCGGAGGTCCCGAATTCTTGT;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=29;WE=25281851;WS=25281833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr14	25287095	rs854398	T	C	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=324;SC=ATGAATGAGATGACAAGACAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=25287103;WS=25287085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	26939474	rs1245213	T	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CAAAGCTAAATTAATCAGGAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=26939482;WS=26939464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	28733722	rs111768370	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.180;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CCCGCAGCCCGGCGCGGACTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=28733730;WS=28733712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	29237968	rs151157846	C	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=-2.413;SC=TCCCTGGGACCAGACTGTAAG;SOR=0.758;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=18;WE=29237976;WS=29237958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr14	29261309	rs56025822	A	AAAC	3837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.388;NF=25;NR=41;PP=2406;ReadPosRankSum=-1.659;SC=AGCACTAAAAAAAACAAACAA;SOR=0.679;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=144;TCF=49;TCR=95;TR=66;WE=29261317;WS=29261299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,105:0.50:208
chr14	30047580	rs2273815	C	T	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=541;SC=AAAAAAATTACCAGTAAAAAT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=30047588;WS=30047570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	30066929	rs2230505	A	G	4457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=84;PP=2946;SC=ACTTCTCTCCAATGATCCGGG;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=61;TCR=84;TR=145;WE=30066937;WS=30066919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	30066976	rs3783299	A	T	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=71;PP=2327;SC=TGTTGATGAAAGGATTTGCAG;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=112;WE=30066984;WS=30066966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	30068194	rs2273813	T	G	7783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=112;PP=2965;SC=TAGCAATGCTTCCAACTGGCT;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=129;TCR=112;TR=241;WE=30068202;WS=30068184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr14	30103441	rs1191599	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=144;SC=TTTCCTAACTTCGTTGCTTGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=30103449;WS=30103431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	30125577	rs5007053	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=496;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TGACCTGATTATTCTCATAAA;SOR=1.291;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=23;WE=30125585;WS=30125567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr14	30125660	rs6571317	A	G	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1237;ReadPosRankSum=2.376;SC=AATTTCTAGCACCAGGTAGCA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=76;WE=30125668;WS=30125650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,84:0.53:159
chr14	31050215	rs58049	A	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=10;PP=395;SC=ATTGACTGCAAGTAATAAAAG;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=31050223;WS=31050205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	31059969	rs7154847	G	A	5787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=111;PP=2965;SC=GATGTTAAACGTGAGATATTA;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=59;TCR=111;TR=170;WE=31059977;WS=31059959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr14	31060059	rs45502891	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=567;ReadPosRankSum=1.797;SC=ATGGTTTGGAACTACAGATTG;SOR=0.379;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=29;WE=31060067;WS=31060049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr14	31061778	rs117891151	T	C	188.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.54;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr14	31071402	.	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TAGGAAATGCCATATACATTT;SOR=0.169;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=12;WE=31071410;WS=31071392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr14	31091758	rs229143	T	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1048;SC=TGGGGAGAAGTTGCCATTAGC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=31091766;WS=31091748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	31097345	rs2273522	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.225;SC=TTGGGGTAGTGAATGATGATG;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=31097353;WS=31097335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	31099738	rs229150	A	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=32;PP=1120;SC=CTATCTGTGAAGGAGCTAAGA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=31099746;WS=31099728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	31103425	rs7149113	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	31103434	rs179287	A	G	174.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=23;SC=AGTATTATACAGTAGTCCTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=31103442;WS=31103415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	31103891	rs229155	A	G	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=210;SC=GGAAGTCCACACTGGTGCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=31103899;WS=31103881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	31107564	rs229162	T	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=34;PP=890;SC=AACAACAGAATTGTTTAGGCT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=31107572;WS=31107554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	31108977	rs2273521	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=0.610;SC=TTTCTTTTGTTTCTAGGTTTT;SOR=1.049;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=8;WE=31108985;WS=31108967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr14	31113310	rs11851205	G	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=859;ReadPosRankSum=0.684;SC=AGGGTGTTTTGTTTTCTGTTT;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=41;WE=31113318;WS=31113300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr14	31118967	rs8012494	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TAATCATTTATTTCCACACGA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=31118975;WS=31118957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	31127167	.	A	G	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=41;QD=18.9428031368;SC=GGAAATACACACTTCTGGTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=31127175;WS=31127157;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	31139349	rs230364	G	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=54;SC=GGGAGGAGATGTTTTAAATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=31139357;WS=31139339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	31175237	.	G	GT	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.98;NF=0;NR=4;PP=39;QD=12.75;SC=AGTTCTCCTGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=31175245;WS=31175227;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr14	31188397	rs142525576	C	T	70.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-0.253;SC=ATAGTAAGTGCTCATTAAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=31188405;WS=31188387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr14	31188414	rs11625381	A	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=82;SC=AGTATTAGGGATGGTTGTTAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=31188422;WS=31188404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	31191668	.	G	GT	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5009;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=60.77;NF=1;NR=2;PP=27;QD=10.6666666667;SC=TAAAAACTGTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=3;WE=31191676;WS=31191658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	31191772	rs17097130	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	31354374	rs12881068	A	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=829;ReadPosRankSum=0.356;SC=TGGAGGGGGAACTAATATGGC;SOR=0.796;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=45;WE=31354382;WS=31354364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr14	31355096	rs1045644	C	G	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.450;SC=AAGCTGTGCACTCATGAACAA;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=104;TCR=52;TR=81;WE=31355104;WS=31355086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,93:0.52:178
chr14	31359024	rs13122	A	T	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=646;SC=ACTGAAAGAAAAAGTACAAGG;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=31359032;WS=31359014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr14	31404277	rs9322868	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=399;ReadPosRankSum=2.959;SC=TGCCACCATATATTTATACAC;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=25;WE=31404285;WS=31404267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr14	31425437	rs12886419	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=450;ReadPosRankSum=0.948;SC=CTTGTAGAAATGCAATCCGGG;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=41;WE=31425445;WS=31425427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr14	31483761	rs179724	G	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TTTTACGTCTGTTTATAAAGT;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=31483769;WS=31483751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	31483955	rs11156654	T	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr14	31538984	rs7155228	C	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=-1.862;SC=CTAGAACTTACGCATGTCATT;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=21;WE=31538992;WS=31538974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr14	31549745	rs11621299	T	G	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=39;PP=2037;SC=CAGTGTCTTTTTTCTAACCCT;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=31549753;WS=31549735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	31578762	rs17097735	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=666;ReadPosRankSum=0.646;SC=TTCTCGTTCGCTCCACAGTGG;SOR=0.544;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=34;WE=31578770;WS=31578752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr14	31582380	rs1315794	A	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=253;SC=AGTAAACTGAAGCTGTTCATC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=31582388;WS=31582370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	31582526	rs2273483	T	C	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=58;PP=2397;SC=CAACTATATATAGAATACGCA;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=138;WE=31582534;WS=31582516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr14	31597685	rs7157007	C	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=742;SC=TATTCCTGAACTGCTAAATTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=31597693;WS=31597675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	31598248	rs17097743	A	G	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=56;PP=1561;ReadPosRankSum=0.267;SC=TTGCACTGGAAGATGACCCTA;SOR=1.096;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=189;TCF=82;TCR=107;TR=90;WE=31598256;WS=31598238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,105:0.49:216
chr14	31602666	rs34588788	A	C	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1125;ReadPosRankSum=0.036;SC=CACTTTTTACAAAAGTAATTG;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=95;TCR=56;TR=66;WE=31602674;WS=31602656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,79:0.46:172
chr14	31610939	rs12888959	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=0.317;SC=ACATGTATAATATGTTACTTT;SOR=0.502;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=6;WE=31610947;WS=31610929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr14	31610964	rs72670364	C	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=286;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TTAAGAGTTTCTTTTGTGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=21;WE=31610972;WS=31610954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr14	31617880	rs11845860	A	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TGAAAATTTAACAAATCAGTA;SOR=0.582;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=31617888;WS=31617870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr14	31619392	rs11620816	T	C	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=795;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GTTTACCTTGTTGCAATTCTT;SOR=0.479;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=51;WE=31619400;WS=31619382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr14	31647241	rs2274201	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=765;ReadPosRankSum=-1.461;SC=CACACTGTTCGGCTAAGTCTC;SOR=0.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=43;WE=31647249;WS=31647231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr14	31647439	rs33983486	T	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=915;ReadPosRankSum=2.160;SC=AAAGGGCTGGTAAGAAAGTGC;SOR=0.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=132;TCF=56;TCR=76;TR=61;WE=31647447;WS=31647429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,73:0.47:154
chr14	31793053	rs57656564	GAT	G	886.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=934;SC=TCAACTGAAAGATATATATAT;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=19;WE=31793062;WS=31793043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	31795361	rs3736917	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=270;ReadPosRankSum=0.437;SC=ATAATGTCCAATACTTACCAG;SOR=0.667;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=18;WE=31795369;WS=31795351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr14	31806943	rs4595710	T	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=853;SC=GGACACAATTTATAAATACAT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=31806951;WS=31806933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	31809486	rs8012940	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=358;SC=TTTGCTTATACTGGTATCAAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=31809494;WS=31809476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	31809568	rs11408327	G	GA	1981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=14;PP=1636;SC=AGATGCAGAGGAAACAAACAT;SOR=1.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=38;WE=31809576;WS=31809558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	31819047	rs3736918	C	T	3832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=61;PP=2226;SC=TCATCTACCACTTGGGCTAAT;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=125;WE=31819055;WS=31819037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr14	31819913	rs7158257	A	G	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=59;PP=1856;SC=AGCTGTTCCAATATAAGAAGC;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=94;WE=31819921;WS=31819903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	31819966	rs10602248	TTTTG	T	820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=595;SC=GTAGGTAAGTTTTTGTTTGTT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=12;WE=31819977;WS=31819956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr14	31863225	rs17097870	G	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=333;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AAAAATTACAGAAGAGACTTT;SOR=0.901;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=20;WE=31863233;WS=31863215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr14	31864300	rs7142126	T	C	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=798;SC=GAGATAGTCCTAGCTGACTAC;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=31864308;WS=31864290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	31864485	rs7141532	G	C	6525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=108;PP=2965;SC=CTGTGACAAGGTGCAGCGGCA;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=87;TCR=108;TR=195;WE=31864493;WS=31864475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr14	31868031	rs12882029	T	C	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=788;ReadPosRankSum=-1.265;SC=GCTGAAAAAATAGGAATAAAA;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=51;WE=31868039;WS=31868021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,61:0.49:125
chr14	31922408	rs34278949	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.057;NF=50;NR=19;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GCCTCCCAACGTGTTGGGATT;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=144;TCF=102;TCR=42;TR=69;WE=31922416;WS=31922398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr14	31952744	rs17097918	C	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GGAAGCCCAGCGCGGGGTTCA;SOR=0.556;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=63;WE=31952752;WS=31952734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,76:0.57:134
chr14	32032129	rs10143899	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GCTCATTTTTCCCCATTTTTA;SOR=0.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=12;WE=32032137;WS=32032119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr14	32032214	rs10144137	G	A	167.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=0.887;SC=TATTTGTGGTGGATCACTAAT;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=32032222;WS=32032204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr14	32034147	rs3759779	A	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=1.110;SC=ATTACATGAAAATATTAAAAG;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=8;WE=32034155;WS=32034137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr14	32047217	rs7142098	T	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=748;ReadPosRankSum=1.569;SC=CCCGTTGTTATGAACTCAGTA;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=53;WE=32047225;WS=32047207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,79:0.46:172
chr14	32123347	rs4981874	A	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TAAAGTAAGCAACATGAATTT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=32123355;WS=32123337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	32295772	rs17379143	T	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=629;ReadPosRankSum=0.847;SC=AGCAACATAATGCTGGAAGTA;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=30;WE=32295780;WS=32295762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr14	32296018	rs1540425	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=30;PP=914;SC=TTAGTCCTGTACAGAAGTCTT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=32296026;WS=32296008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	32315901	rs8006872	A	G	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=52;PP=1597;SC=GGAGTCTCACACCTGTAATCC;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=72;WE=32315909;WS=32315891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	32414145	rs1278926	C	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=247;ReadPosRankSum=0.753;SC=CTGCTGGGACCGACTGCAGCT;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=15;WE=32414153;WS=32414135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr14	32414386	rs1278927	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=498;ReadPosRankSum=1.418;SC=TTAATAGGGTCAAAGGAGGGT;SOR=1.113;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=33;WE=32414394;WS=32414376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr14	32414463	rs1278928	T	C	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=702;SC=TGGGCAGGCATCCATTATGTG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=32414471;WS=32414453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	32419235	rs1278941	A	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=7;PP=961;SC=CAGCCTGCCCAGGTTTATTAA;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=32419243;WS=32419225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	32419331	rs1278942	C	T	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=67;PP=2744;SC=TAAGAGCATACTCCCTGAAGA;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=146;WE=32419339;WS=32419321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr14	32419398	rs2236532	G	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=873;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CTGAGCAATAGGAATTTCTTC;SOR=0.957;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=52;WE=32419406;WS=32419388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr14	32419548	rs1278943	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=256;SC=CCCCTTCATACTGATCTAATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=32419556;WS=32419538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	32438586	rs1952967	T	G	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=924;ReadPosRankSum=0.006;SC=AGAAAAGCACTGTTGGCTGTA;SOR=0.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=59;WE=32438594;WS=32438576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr14	32563640	rs8004384	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=740;SC=GCTTGTTGTTACTTTTTTAAA;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=32563648;WS=32563630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr14	33015014	rs7150894	G	A	9092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=142;PP=2965;SC=ACTCTCCCACGCAGCCTACAT;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=129;TCR=142;TR=271;WE=33015022;WS=33015004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr14	33046388	rs1950703	A	G	7605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=103;PP=2965;SC=AAACTACAGAAAATTGGACTC;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=123;TCR=103;TR=226;WE=33046396;WS=33046378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr14	33147414	rs1950697	C	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=323;SC=AAAAGGAGCACTATAATGATG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=33147422;WS=33147404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	33147765	rs2273417	C	A	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=35;PP=996;SC=TTTAGCAAACCGACAAGGAGA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=33147773;WS=33147755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	33165084	rs3742927	A	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=81;SC=CTCTTCTCTTATTGTAGATAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=33165092;WS=33165074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	33165182	rs3742929	C	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=10;PP=524;SC=CTACATTTTGCGCCTTATCTT;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=33165190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	33242863	rs2273163	T	C	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ACTCATAGATTGGTTTCTCTC;SOR=0.845;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=83;WE=33242871;WS=33242853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,102:0.47:217
chr14	33291494	rs11845640	C	T	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1143;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGCGAAAAAGCGCATGTGGAG;SOR=0.639;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=75;WE=33291502;WS=33291484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,93:0.45:207
chr14	33292743	rs2239647	A	C	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=79;PP=2965;SC=GGCAAAAGGGAAAACCGAATG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=168;WE=33292751;WS=33292733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	33292914	rs2239648	A	C	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1586;ReadPosRankSum=0.568;SC=AGAAATGTCCAAATCACCACC;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=119;TCR=80;TR=92;WE=33292922;WS=33292904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,114:0.46:248
chr14	33293122	rs1051695	A	G	8201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=138;PP=2965;SC=TTCTATCAGCAACATTTCCTG;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=115;TCR=138;TR=253;WE=33293130;WS=33293112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr14	33293531	rs4647899	T	A	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1414;ReadPosRankSum=1.362;SC=GAGCCTTGTTTCTCTAGTGCT;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=87;WE=33293539;WS=33293521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,95:0.57:168
chr14	33294042	rs2057121	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=472;ReadPosRankSum=0.294;SC=TCCTCATGCCGTATATGTATT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=23;WE=33294050;WS=33294032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr14	33836599	rs1609948	A	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=495;SC=TTTTATCTTGAAATTCCGAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=33836607;WS=33836589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	34047362	rs4346123	T	C	3625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=1993;ReadPosRankSum=-0.523;SC=TTTGCCTCCTTCTCTCTTCAG;SOR=0.571;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=291;TCF=137;TCR=154;TR=136;WE=34047370;WS=34047352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,173:0.49:354
chr14	34047414	rs1958541	T	C	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.077;NF=24;NR=62;PP=1565;ReadPosRankSum=1.244;SC=TTTTTCCCTCTTTGAGACGGA;SOR=0.897;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=188;TCF=57;TCR=131;TR=86;WE=34047422;WS=34047404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr14	34149916	rs2297118	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=340;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAAGGGGCTCTTGTGGCTTTT;SOR=0.600;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=19;WE=34149924;WS=34149906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr14	34149997	rs2297117	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=168;ReadPosRankSum=0.360;SC=GCAAAATGCATGAGGCAGTAC;SOR=0.576;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=15;WE=34150005;WS=34149987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr14	34243477	rs8019077	T	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GCATTTCTCATAAGAAATGCT;SOR=0.204;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=8;WE=34243485;WS=34243467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr14	34247631	rs3831102	T	TC	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=468;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TCTTTATATTTCCTCCTTTCT;SOR=0.861;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=13;WE=34247639;WS=34247621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr14	34249813	rs61973025	A	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1323;ReadPosRankSum=2.001;SC=GCATCATGCTATCTCTCTGGG;SOR=0.794;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=164;TCF=101;TCR=63;TR=73;WE=34249821;WS=34249803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr14	34395148	rs3832940	GA	G	3283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.074;NF=17;NR=44;PP=2360;ReadPosRankSum=0.402;SC=GGACAGAAAGGAGAATAAAGA;SOR=0.438;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=127;TCF=30;TCR=97;TR=61;WE=34395156;WS=34395138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,98:0.47:209
chr14	34396100	rs10137361	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=0.125;SC=TTTAAAACTACATAAAATTGA;SOR=0.437;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=34396108;WS=34396090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr14	34561640	rs117160072	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=0.013;SC=CAGGTCTGTTTTGTATTACTA;SOR=0.702;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=22;WE=34561648;WS=34561630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr14	34985645	rs7797	G	A	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=111;PP=2965;SC=CTGCCTTCTCGGCAGCATCTT;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=87;TCR=111;TR=198;WE=34985653;WS=34985635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr14	34993859	rs111420332	A	ATGTGTGTGTG,ATGTGTGTG	836.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=9,9;NR=4,4;PP=97,149;SC=TAAACAAAATATGTATGTGTG;SOR=2.030;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=13,13;WE=34993882;WS=34993849;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:23
chr14	34993863	rs61981524	A	G	1503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=9;PP=942;SC=CAAAATATGTATGTGTGTGTG;SOR=2.030;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=35;WE=34993882;WS=34993849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	34998705	rs12147949	T	C	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=59;PP=1574;SC=TATTAGGATATGGCTAAGAAT;SOR=1.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=80;WE=34998713;WS=34998695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	35037008	rs11156848	T	C	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=31;PP=1424;SC=TTATTTAATTTACATAATAGT;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=35037016;WS=35036998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	35050586	rs4403967	G	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=3;PP=170;SC=TCTTGATCTCGTGACCTCGTG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=35050594;WS=35050576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	35062312	rs12432539	C	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=844;SC=GGTTATGATACTCCAAAAGAA;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=35062320;WS=35062302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	35075022	rs7151774	G	T	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=95;PP=2965;SC=AAGCTAAGGGGATCCAGAATG;SOR=1.050;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=67;TCR=95;TR=162;WE=35075030;WS=35075012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr14	35182406	rs35219728	GATA	G	3133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=22;PP=2590;SC=GACTGACTATGATAATAATAA;SOR=1.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=54;WE=35182416;WS=35182396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	35183548	rs10149653	C	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=331;SC=TCCCCGCCCCCCAAAATCCAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=35183556;WS=35183538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	35222626	rs3832925	A	ATTGT	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=1270;SC=TGGTCAATCAATTGTTATTGC;SOR=5.058;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=22;WE=35222634;WS=35222616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	35223956	rs8005659	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=170;SC=ACCTCTTTAAACAAAAATAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=35223964;WS=35223946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	35223971	rs8009900	A	G	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=288;SC=AATAAATATCAAAGATGCTAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=35223979;WS=35223961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	35224294	rs8010579	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=217;SC=TGTGTCTATACAGATATATAT;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=35224302;WS=35224284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	35227880	rs61981201	G	T	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=16;PP=2343;SC=ATAATATACAGGAATACATTT;SOR=2.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=83;TCR=16;TR=99;WE=35227888;WS=35227870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	35228090	rs61981202	G	A	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=94;PP=2723;SC=TGATAACAAAGCAAAATATTG;SOR=2.852;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=21;TCR=94;TR=114;WE=35228098;WS=35228080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	35230906	rs17526787	G	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=244;SC=CTCAACATTCGATATTTCCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=35230914;WS=35230896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	35237874	rs61981228	C	A	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=369;SC=ACATAAATTTCTTTAAAAAGT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=35237882;WS=35237864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	35240601	.	C	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=0.036;SC=GAAAACATCTCAAGTTTTTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=35240609;WS=35240591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr14	35242828	rs2275145	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=14;PP=554;SC=TCTCTTCTACGTCTTCATTCA;SOR=1.236;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=37;WE=35242836;WS=35242818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	35243006	rs2275146	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=215;SC=AGTTCAATATGCATATAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=35243014;WS=35242996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	35245748	rs17102726	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=504;SC=ATGTTTCATCATCATCATATT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=35245756;WS=35245738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	35468893	rs12433712	T	A	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=31;PP=1170;SC=AGGCACAGTTTAGTTTAGTTT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=35468901;WS=35468883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	35476673	rs28456062	G	A	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=211;SC=ATATAAAAATGTAAAGCCTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=35476681;WS=35476663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	35477785	rs1712351	G	A	136.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=79;SC=TATATGTATAGTTTGTTATAT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=35477793;WS=35477775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	35482797	rs2383692	A	G	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=46;PP=1504;SC=ATATGTTTCAATAGTGAGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=35482805;WS=35482787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	35483882	rs13379372	A	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=559;SC=ATGTATGTGAATGTGTTTTGT;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=35483890;WS=35483872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	35488309	rs17102982	A	G	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=378;SC=TTCCTCAGGCAAAAATGTTCT;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=35488317;WS=35488299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	35492298	.	AAGCTTGTTATTAGTTAAC	A	2930	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=30;PP=2930;QD=20;SC=TAAGAAAAATAAGCTTGTTAT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=31;WE=35492326;WS=35492288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,31:0.89:35
chr14	35492299	rs202204501	AG	A	3410.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=2.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	35492301	rs369856554	CTTGTTATTAGTTAACAG	C	3409.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=2.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	35492318	.	G	C	952	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=28;PP=952;QD=26.669492231;SC=TTAGTTAACAGACGGAAAAGA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=37;WE=35492326;WS=35492288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,37:0.86:43
chr14	35497285	rs78609489	T	C	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=34;PP=2174;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TTTTTTTTTTTCCCCTCAGGT;SOR=0.414;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=96;WE=35497293;WS=35497264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr14	35498443	rs28577270	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=582;SC=CGAATTGGGGGGAAAGTGTAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=35498451;WS=35498433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	35515606	rs4007475	TGG	T	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=841;SC=AGGCGGGCGCTGGGCGGGTGA;SOR=2.468;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=19;WE=35515615;WS=35515596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	35515920	rs2295103	C	G	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=70;PP=2574;SC=CCTGCGCGGCCGTCCTCCGAG;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=140;WE=35515928;WS=35515910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr14	35565856	rs17091786	A	T	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=46;PP=1434;SC=GAACACAAAGACATAATTAGA;SOR=1.192;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=35565864;WS=35565846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	35576458	rs10132769	A	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=8;PP=745;SC=ACTACAGTTTACATTTTAGTG;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=35576466;WS=35576448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	35579927	rs2295104	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=8;PP=213;SC=GTATGCCACCGCCTCGAATTA;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=35579935;WS=35579917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	35585669	rs12437439	C	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=104;SC=CTATGTTGCCCTGGCTGGTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=35585677;WS=35585659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	35585740	.	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=103;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GGATTACAGGTATGAGCCACC;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=9;WE=35585748;WS=35585730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr14	35596092	rs10147080	C	A	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=309;SC=AGGATAATTACAAGTTTGTAA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=35596100;WS=35596082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	35871093	rs696	C	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=231;SC=CGTTTTGGGCCAGGCAGTGTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=35871101;WS=35871083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	35871217	rs8904	G	A	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=49;NR=38;PP=1531;SC=GCCCCTTTGCGCTCATAACGT;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=87;WE=35871225;WS=35871207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	35871407	rs1022714	A	G	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=129;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=22;PP=541;SC=ACAGGCTGAGAGAGTTTGCCT;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=35871415;WS=35871397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	35871441	rs70937092	A	AGTAAGCTATTAAAAAAAGG	1210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=802;SC=TTAAAAAAAGAGGGGGGGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=35871449;WS=35871431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	35872792	rs2233415	A	G	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=916;ReadPosRankSum=1.167;SC=AGGTGAGGGTAAATAGTGCTC;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=61;WE=35872800;WS=35872782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,71:0.61:117
chr14	35873770	rs1957106	G	A	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=121;PP=2965;SC=CGTGGCGGTCGTCCAGTAGCC;SOR=0.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=100;TCR=121;TR=221;WE=35873778;WS=35873760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr14	36004075	rs1958260	A	G	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=57;PP=2965;SC=GCACCCACGGACTGCGCGTCT;SOR=1.408;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=108;TCR=57;TR=165;WE=36004083;WS=36004065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr14	36044337	.	G	GA	97	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=62.36;NF=0;NR=5;PP=97;QD=20.4;SC=CCATCTCAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=36044345;WS=36044327;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr14	36121087	rs35892589	CA	C	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=506;SC=GATCTGTAAGCAAAAAAAAAT;SOR=1.203;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=25;WE=36121095;WS=36121077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	36231816	rs11847872	G	A	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=563;SC=AGACAATTCAGAGATCTTTAG;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=36231824;WS=36231806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	36240374	.	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=-2.200;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr14	36334030	rs12890607	G	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=263;SC=AATTTAGGATGCCAAAGCATT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=36334038;WS=36334020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	36768276	rs4900833	T	C	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=38;PP=2201;SC=ATGACAAGGATGAGAGGAGTT;SOR=1.490;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=118;WE=36768284;WS=36768266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	36781037	rs7154340	C	T	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=868;SC=CATCTAACCACAAGTATGAAG;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=36781045;WS=36781027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	36789729	rs3168891	T	G	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=63;PP=1979;SC=AGAGGTTGGGTCTGCATCTTC;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=36789737;WS=36789719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	36789775	rs2899849	A	T	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=42;PP=1206;SC=CGGGCGATTAAGCTCCGTGGC;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=36789783;WS=36789765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	36789795	rs11558802	G	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=826;SC=CAGCAGCCATGATATCTTCTC;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=36789803;WS=36789785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	36840650	rs3742592	A	T	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=83;PP=2965;SC=CCAACCTACAACCCAGGGTCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=164;WE=36840658;WS=36840640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr14	36840695	rs3742593	A	G	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.419;NF=42;NR=44;PP=1426;ReadPosRankSum=1.375;SC=TCCCGGGACGATTCAGGGGCC;SOR=0.510;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=72;TCR=85;TR=86;WE=36840703;WS=36840685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr14	36942909	rs7159699	A	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=296;ReadPosRankSum=-0.463;SC=TTTTTTCAAGATGGTGTGCTC;SOR=0.123;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=19;WE=36942917;WS=36942899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
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chr14	36946282	rs117932795	C	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=47;PP=1574;SC=GGTGGGTATCCGCTTTTCCCT;SOR=1.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=71;WE=36946290;WS=36946272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	36946929	.	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=501;ReadPosRankSum=-1.021;SC=ACCTTTCTGAGAGCAGTCATT;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=31;WE=36946937;WS=36946919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr14	37131993	rs12883298	G	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=0.951;SC=GTAGTTAGTAGGGGACGGGTG;SOR=2.670;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=37132001;WS=37131983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	37132020	rs17104895	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=1.264;SC=CCCAGTCCCCGGATGCGTAGG;SOR=1.863;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=13;WE=37132028;WS=37132010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr14	37132048	rs12882923	A	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AGTGGCAGGCAGCTGTCCCAA;SOR=0.649;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=27;WE=37132069;WS=37132038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr14	37132061	rs12883049	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TGTCCCAAGCAGCGGGTGCGC;SOR=0.685;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=35;WE=37132069;WS=37132038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr14	37135605	rs7143727	G	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr14	37140504	rs8004187	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TAACCTCTAACTGCCAGACAT;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=37140512;WS=37140494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	37153163	rs1884217	A	G	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TGAGATAGGGACCCAGCATTT;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=48;TCR=93;TR=74;WE=37153171;WS=37153153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr14	37153185	rs10132292	T	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=1015;ReadPosRankSum=-2.024;SC=AAAAAATAAATTATTTGGAAT;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=60;WE=37153193;WS=37153175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr14	37203617	rs3061575	T	TTA	998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=530;ReadPosRankSum=1.195;SC=TTTTAGTGCTTTATATATAAT;SOR=0.286;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=54;WE=37203625;WS=37203607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr14	37203642	rs5807904	TA	T	3706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=27;PP=2723;SC=TTTAATGTCTTAAGAGTTTGT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=65;WE=37203650;WS=37203632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	37203697	rs10135196	G	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TGGTGCGAACGCATGCAATGC;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=64;WE=37203705;WS=37203687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr14	37344229	rs5807914	A	AG	1803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.284;NF=11;NR=28;PP=1602;ReadPosRankSum=0.094;SC=GATAAAGAAAATCCAATAAAC;SOR=0.973;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=94;TCF=24;TCR=70;TR=39;WE=37344237;WS=37344219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,57:0.38:149
chr14	37344275	rs712384	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.220;NF=10;NR=28;PP=676;ReadPosRankSum=0.205;SC=TCCTTGATCCCGTCGATTTCT;SOR=0.894;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=38;WE=37344283;WS=37344265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr14	37344347	rs2021404	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.311;NF=1;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TAGTAATAGGCTAGTGGCAAA;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=14;WE=37344355;WS=37344337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr14	37641880	rs1403	C	A	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=46;PP=1223;ReadPosRankSum=0.545;SC=GGCGCCCACGCCCTTCTCTAT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=48;TCR=92;TR=70;WE=37641888;WS=37641870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr14	37838604	rs35277854	C	CA	350.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=0.465;SC=ATTCTTGTTGCAAAAAAAAAA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=37838612;WS=37838594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr14	38016044	rs10151200	C	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CTTTATCAGCCAGGACATTCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=38016052;WS=38016034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr14	38061742	rs7144658	C	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=945;ReadPosRankSum=-2.035;SC=GGCATGCCGGCTACTGCGCCG;SOR=0.464;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=161;TCF=101;TCR=60;TR=71;WE=38061750;WS=38061732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,87:0.47:184
chr14	38064009	rs762083	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=309;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CCCCCGGCCCGCCTGCCTGCC;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=14;WE=38064017;WS=38063999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr14	38064215	rs79519281	G	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=70;PP=1806;ReadPosRankSum=-1.182;SC=ATCCAGCCCTGTGCGAAGCGA;SOR=1.059;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=196;TCF=65;TCR=131;TR=99;WE=38064223;WS=38064205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,116:0.52:223
chr14	38205027	rs1570399	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-1.408;SC=TTCTCTTTGGTTCTTTTGTTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=38205035;WS=38205017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	38206818	rs4901157	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TAGCTTATCAGATAGTATCTG;SOR=0.033;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=13;WE=38206826;WS=38206808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr14	38207008	rs11439106	A	AT	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.843;HP=11;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=252;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TAATCACCTTATTTTTTTTTA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=38207026;WS=38206998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr14	38207018	rs17107021	A	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.843;HP=9;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=231;ReadPosRankSum=-1.569;SC=ATTTTTTTTTAAAAGCATCTA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=6;WE=38207026;WS=38206998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr14	38218343	rs12586727	A	G	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=54;PP=1549;ReadPosRankSum=0.382;SC=AGATGCGAGCATACCTGTAAA;SOR=0.658;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=212;TCF=103;TCR=109;TR=107;WE=38218351;WS=38218333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,131:0.52:252
chr14	38222291	rs4901176	G	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=735;SC=TGTACCTCCCGCTGTCCCTAT;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=38222299;WS=38222281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	38256944	rs12586423	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=0.846;SC=ATGTAATATGTATACTACTAT;SOR=1.819;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=38256952;WS=38256934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr14	38260089	rs7153624	C	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=28;PP=753;SC=TGTAAAAAATCGAAAACCTGA;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=38260097;WS=38260079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	38264358	rs969446	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=216;SC=TTAAGAAAAACATGTATGTTA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=38264366;WS=38264348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	38265344	rs1951639	T	A	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	38266074	rs9805910	C	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=874;ReadPosRankSum=0.281;SC=AGGTCTTGGACGGAATCAGCT;SOR=0.313;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=63;WE=38266082;WS=38266064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,72:0.41:176
chr14	38277999	rs4901284	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=408;ReadPosRankSum=-0.918;SC=AATAGTTATACAGCATTTTAT;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=27;WE=38278007;WS=38277989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr14	38295646	rs10483494	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=381;SC=CTTTTTAAAGTGACTTATGGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=38295654;WS=38295636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	38310606	rs10151474	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=341;SC=TTTCTGTATAGTAAGTTGCCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=38310614;WS=38310596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	38678356	rs12437095	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=13;PP=409;SC=TCCTCTCCACGGTCGCCTGTG;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=38678364;WS=38678346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	38678492	rs12434340	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=5;PP=173;SC=TGGGCGGCTGTGGGCTGCAGG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=38678500;WS=38678482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	39502539	rs11418467	G	GA	614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=13;PP=417;SC=ACTCCTAGAGGAAAAAAGATA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=39502547;WS=39502529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	39502626	rs11283010	A	AAATAGAAC	137	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	39512122	rs4902326	T	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=183;SC=GGAAAAATAATCTACTCAATA;SOR=2.147;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=39512130;WS=39512112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	39514231	rs1884384	T	A	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=243;SC=GCGAATACATTAATAGGTTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=39514239;WS=39514221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	39517691	rs4902344	T	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=49;SC=GGTGGCACACTCCTGTAGTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=39517699;WS=39517681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	39517925	rs11556216	T	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=405;SC=ATTCTCCAAATTTCTGACACT;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=39517933;WS=39517915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	39532492	rs55993688	T	C	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=829;SC=CAAATGTACGTTGTACGTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=39532500;WS=39532482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	39554891	.	TAT	CAC	205	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5104;HP=2;HapScore=4;MGOF=36;MMLQ=25;MQ=55.25;NF=6;NR=0;PP=205;QD=43.0779791437;SC=TATAATTATATATACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=6;WE=39554901;WS=39554876;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,6:0.40:15
chr14	39556185	rs8018720	G	C	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=36;PP=1206;SC=GCTTGAGTAAGTGGTACTTTA;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=39556193;WS=39556175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	39565403	rs3818163	T	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=261;SC=GTTCAAAATATGAATGTTCTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=39565411;WS=39565393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	39583481	rs2277458	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=666;SC=GTCTATTAGTACGCCTGCGCT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=39583489;WS=39583471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	39591107	.	G	T	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=25;MQ=40.0;NF=0;NR=2;PP=23;QD=28.8856062736;SC=TGTATTTTTAGTAGAGGTGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=39591115;WS=39591097;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	39591565	rs61692397	C	CT	105.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=0;PP=74;SC=GACTTAACTTCTTTTTTTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=39591573;WS=39591555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	39605542	rs9322993	T	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=175;SC=TTTAACCAGTTTCTTATTGAT;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=39605550;WS=39605532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	39620936	rs8003807	C	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=354;SC=GTAAGAAAGGCGAATTCAACT;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=39620944;WS=39620926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	39627433	rs35270180	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=22;SC=ACTAAAATACGATATTTATAT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=39627441;WS=39627423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	39627747	rs761804	A	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=20;SC=TTTGAGACAGATTCTGGCTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=39627755;WS=39627737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	39645863	rs2252040	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=300;SC=AAATATAAATGTTTATTAACA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=39645871;WS=39645853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	39647188	rs68193573	T	A	178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=160;SC=ATGTTTTTTTTAAAAAATCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=39647196;WS=39647178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	39650234	rs2180792	A	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=29;PP=1071;SC=AGAATGTAAAACCCTTTCTCC;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=39650242;WS=39650224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	39736680	rs7140561	T	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=5;PP=288;SC=GAGCCCGGGGTTACCCCTCAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=16;WE=39736688;WS=39736670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	39748480	rs7158558	G	A	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=134;SC=GACGTTAAATGAATTGATTTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=39748488;WS=39748470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	39763006	rs956109	T	C	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=163;SC=TTATGAAATATTAAAGTTATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=39763014;WS=39762996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	39773639	rs2274398	G	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.25;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	39777676	rs1950952	G	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=81;SC=TCTTCAGACTGAACAAGCATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=39777684;WS=39777666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	39784012	.	A	ATGTGTGTGTGTG	202	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=59.76;NF=0;NR=8;PP=202;QD=27.5;SC=AGGTATATATATATGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=39784022;WS=39784002;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,8:0.67:12
chr14	39784014	.	A	G	219	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=57.66;NF=3;NR=6;PP=219;QD=28.1968013941;SC=GTATATATATATGTGTGTGTG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=9;WE=39784022;WS=39784002;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,9:0.69:13
chr14	39784042	.	A	G	154	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=105;MMLQ=28;MQ=51.78;NF=0;NR=5;PP=154;QD=37.7542425094;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=39784050;WS=39784032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr14	39784965	rs10150863	G	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=13;PP=313;SC=CAAATTGTATGTTTTTTTCAG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=39784973;WS=39784955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	39796048	rs36031495	GT	G	843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=11;PP=446;SC=AGATTTGTATGTTTTTTTTTC;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=39796056;WS=39796038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	39816781	rs12882375	C	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=328;SC=CTTGTGGCCGCAATATAGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=39816789;WS=39816771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	39818028	rs1140952	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=841;SC=TCTTGCTCCAATCAGAGGTCC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=39818036;WS=39818018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	39818145	rs1060878	G	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=9;PP=421;SC=TTTTCCACCAGGGGATTTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=39818153;WS=39818135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	39818222	rs7156249	G	T	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=5;NR=9;PP=226;SC=TCAATATGTGGTTTATTAATC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=39818230;WS=39818212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	39856043	rs10146207	G	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=786;SC=TCAGCAACTCGTCTCTCTTCT;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=39856051;WS=39856033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	39871159	rs36065920	AT	A	363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=434;SC=AAAGCATGCAATTTTGAGATC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=39871167;WS=39871149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	42355771	rs721222	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=299;SC=AATTAAATCACTGGATGCTAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=42355779;WS=42355761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	42360633	rs6572117	T	C	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=38;PP=1665;SC=TCATGCAGTCTCAGTTTTTGG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=42360641;WS=42360623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	42998026	rs10148466	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=426;SC=AACTGCTCATTGTTTTCTTAC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=42998034;WS=42998016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	44975511	rs45478391	G	A	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=26;PP=1043;SC=TAAAAGTACCGGGGGACCTTT;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=44975519;WS=44975501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	45537964	.	A	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=244;SC=TAAACTTAATATTATCATAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=45537972;WS=45537954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	45693648	rs35223850	G	A	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=16;PP=1241;SC=CACGTTCATCGCAATCTTCCT;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=45693656;WS=45693638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	47314938	rs1388568	C	T	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=14;PP=858;SC=TTTAACGTTACAACAAACCAA;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=47314946;WS=47314928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	47315127	rs1388567	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=687;SC=TTGCAGATCAGTTTCTCTTGA;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=47315135;WS=47315117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	47324127	rs3007133	G	A	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=160;SC=TGCTTATATCGTGGAATTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=47324135;WS=47324117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	47341131	rs2933208	C	G	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=69;SC=TGGGAAGATTCCTTGAGACCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=47341139;WS=47341121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	47528470	rs8009302	T	C	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=24;PP=990;SC=TCTCAGACTTTGTAGAGCTTC;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=47528478;WS=47528460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	47528551	rs10144183	T	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=37;PP=1112;SC=TTGGAAGAAGTCAATATATTT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=47528559;WS=47528541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	47530841	rs7147260	A	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.93;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	47530845	rs7147741	G	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.34;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	47582348	rs8006750	T	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=223;SC=ATCCACTGACTCCACAGAAAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=47582356;WS=47582338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	47613364	rs72680210	G	T	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=24;PP=1020;SC=CAGCTATACCGAACAGGAGGA;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=47613372;WS=47613354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	47687187	rs8011854	A	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=305;SC=GAAATCCATAATAGGCTTAAT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=47687195;WS=47687177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	47770841	rs2275504	C	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=217;SC=AAAAGCAATTCTTATTAGACT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=47770849;WS=47770831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	50044392	rs2883438	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=412;SC=ACCCTGTTGTTAATACCTCTG;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=50044400;WS=50044382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	50064971	.	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=145;SC=TGCTTAACATTTGCTCCCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=50064979;WS=50064968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	50065359	rs2281837	C	G	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=63;PP=2492;SC=GACGTGCGCCCGCAACGCGTA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=125;WE=50065367;WS=50065349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	50065444	rs12884574	G	A	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=62;PP=2090;SC=GCGCTCGGGGGAAAAGACGTT;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=107;WE=50065452;WS=50065434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	50065717	rs2281836	G	C	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=30;PP=1481;SC=CCAGCTTGACGTGGTTGTGGC;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=50065725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	50074122	rs17121605	T	A	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=32;PP=1367;SC=ATTCAGGCCATTTCCAGCAGT;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=50074130;WS=50074112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	50074520	rs7148147	C	T	3021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=45;PP=1749;SC=GAAGTCACTTCGGAGTTTGGA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=87;WE=50074528;WS=50074510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	50080871	rs6572592	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=TATACTAATCGCTTAATAATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=50080879;WS=50080861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	50087544	rs3007037	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=419;SC=TAACGGTCCCCGCCGGAGTGA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=50087552;WS=50087534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	50094913	rs2985696	C	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=301;SC=CTAATAAGTCCCACTTGACAA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=50094921;WS=50094903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	50100374	rs2985688	C	T	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=40;PP=1354;SC=CCGTGCCCTCCGACTCCTCGC;SOR=1.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=50100394;WS=50100364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	50100386	rs2985687	T	C	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=36;PP=1242;SC=ACTCCTCGCGTGTTTCCACAC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=63;WE=50100394;WS=50100364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	50100683	rs2985686	C	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=5;PP=287;SC=CTCCGTCCTCCGCGCGACTCC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=50100691;WS=50100673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	50101370	rs2985685	G	A	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=34;PP=1339;SC=CCAGGGCCGTGGCGTCCAGCA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=50101378;WS=50101360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	50101682	rs2985684	C	G	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=41;PP=1912;SC=CCACCCCGCGCTCACGCTCTA;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=97;WE=50101690;WS=50101672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	50110319	rs3218801	T	C	270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=134;SC=ACATAAGATATAGAGTTAAGC;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=50110327;WS=50110309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	50113915	rs7155238	T	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	50114117	rs3218792	CT	C	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=213;SC=AATGCTCAGACTTTTTTTTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=50114133;WS=50114107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	50114125	.	T	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=203;SC=GACTTTTTTTTAAAATAAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=50114133;WS=50114107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	50117066	rs34000915	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=32;PP=1356;SC=GGCACAGGATACACTCTCAAA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=50117074;WS=50117056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	50120858	rs3212323	C	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=7;PP=282;SC=TTGCAAAAATCTGAACAAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=50120866;WS=50120848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	50122280	.	C	CAG	66	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=66;QD=50.5;SC=ATTGCTAACTCTGTTTTTTTT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=50122288;WS=50122270;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	50131728	rs35615446	T	C	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=107;SC=AGAAGTTACATTGAGAACCCA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=50131736;WS=50131718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	50131846	rs3218791	G	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=9;NR=10;PP=270;SC=GGTCTAGTTGGACTGTTCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=50131854;WS=50131836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	50133033	rs3218797	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=12;PP=439;SC=AAAAGTTTGATGCTTATTAAG;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=50133041;WS=50133023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	50133057	rs3218798	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=14;PP=570;SC=CCTCTTTTAACTGCGTTATCA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=50133065;WS=50133047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	50133218	rs12432319	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=56;SC=ATTTGGGGTATACATTTCAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=50133226;WS=50133208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	50136385	rs183144363	G	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=112;SC=TTAAAATAGTGCCCTGATGAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=50136393;WS=50136375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	50175792	rs11157703	T	C	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=80;SC=TAGTATTTTATTAGCAATTTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=50175800;WS=50175782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	50195679	rs4301946	A	G	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=33;PP=1146;SC=CCGCGCATACATGTGCAGTTC;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=63;WE=50195687;WS=50195669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	50196373	rs34410594	T	G	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=8;PP=263;SC=ATTTTTTTCCTTCAGATCGTA;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=50196381;WS=50196363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	50199337	.	A	AT	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=51;QD=21.0;SC=GTGAGGGCAGATTTTTTTTTT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=50199345;WS=50199327;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr14	50199375	rs10146753	A	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=281;SC=AAAACCTTTTATTTTGATTAA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=50199383;WS=50199365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	50206702	rs4898631	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=129;SC=AAGTTCAATCGTGTCTCTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=50206710;WS=50206692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	50241205	rs66520673	TAGA	T	932.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=723;SC=AGGATATAAGTAGAAGAAGAA;SOR=2.303;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=16;WE=50241215;WS=50241195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	50241258	rs4499141	A	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=1009;SC=ACTTACATACATTTAATTTAT;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=50241266;WS=50241248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	50244835	rs4900949	C	T	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=7;PP=421;SC=CTAAGATAAACTGCTTGTATC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=50244843;WS=50244825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	50247290	rs4900952	G	T	134.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=77;SC=TAATTGCAGGGGGGGGAAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=50247298;WS=50247280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	50251369	rs10143621	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=396;SC=TCCTTTTTACATTCAGAAGAT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=50251377;WS=50251359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	50251888	rs8009346	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=24;PP=1056;SC=ACTAAATAGACGTTACAAAAC;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=50251896;WS=50251878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	50280577	rs3126194	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=81;SC=ACACTTCAGCTTCCCAAAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=50280585;WS=50280567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	50280688	rs3126195	T	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=9;PP=544;SC=GAATTCTGAATAGAAAGAAAT;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=50280696;WS=50280678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	50298962	rs3100906	T	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=13;PP=397;SC=GCTTCCAAGCTTGGTTTTATT;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=50298970;WS=50298952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	50300310	rs3100904	A	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=304;SC=AAGTGCTTACAAAATAATGTT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=50300318;WS=50300300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	50319327	rs3126160	T	C	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=27;PP=1267;SC=TAAGGAAACATATCAAGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=63;WE=50319335;WS=50319317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	50319499	rs3100887	G	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=23;PP=726;SC=ACTACCGCAAGTTCCTCTACT;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=50319507;WS=50319489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	50459609	rs10134002	T	C	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=29;PP=1086;SC=GATAAGAGAATAAGAGCTTCA;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=50459617;WS=50459599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	50459673	rs10134096	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=412;SC=TCATCTCCCATTGGGTTCAAT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=50459681;WS=50459663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	50477643	rs4900978	G	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=284;SC=CACATGCCATGTCACTTACTT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=50477651;WS=50477633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	50585012	rs74714090	A	T	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=16;PP=842;SC=AAATTAAAAAAAAAACTTTAC;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=50585020;WS=50585002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	50697878	rs2273326	C	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=25;NR=18;PP=738;SC=CGGGGGGCCACGGGCCACCCG;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=50697886;WS=50697868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	50877491	rs1265878	C	A	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=322;SC=AGATGAGATGCGATCTCTCAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=50877499;WS=50877481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	50929508	rs11624731	C	A	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=33;PP=1006;SC=TGCTAAAAGACAACAAAATGA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=50929516;WS=50929498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	50942047	rs12717408	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	50949196	rs11364906	TA	T	166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=75;SC=ACAGTCTACTTAAAAAAAATG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=50949204;WS=50949186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	50971446	rs7146431	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=515;SC=AAGACTTCTTCTGGGAAGAAG;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=50971454;WS=50971436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	51097536	rs2934692	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=342;SC=GCAAATTTCAGCTTTGTAAAT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=51097544;WS=51097526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	51206021	rs3015485	A	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=16;PP=1002;SC=AGCTTCTCCAATTACCTTCTC;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=51206029;WS=51206011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	51208236	rs76858548	T	TGTA	1802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=1690;SC=ATAACCAAGTTGTCCTAAGAT;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=32;WE=51208244;WS=51208226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	51223789	rs2073347	C	T	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=36;PP=1798;SC=AACATTCAGCCCCTCATTTTC;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=51223797;WS=51223779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	51224374	rs12882191	T	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=35;PP=1615;SC=CTGTAAAAACTGCTCTGTTTG;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=51224382;WS=51224364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	51224417	rs2236316	G	C	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=46;PP=1944;SC=TCAGTAGCTGGCTCATCCAAA;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=97;WE=51224425;WS=51224407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	51224551	rs78280523	A	T	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=50;PP=1704;SC=GCTTAAGAGGACGTCCCCATT;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=51224559;WS=51224541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	51228655	rs12883882	C	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=620;SC=ACTCATTGATCCTGCAGCAGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=51228663;WS=51228645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	51228682	rs6572694	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=325;SC=CAATAACACAGTGTGGCATCT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=51228690;WS=51228672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	51239067	rs8020503	C	G	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1662;ReadPosRankSum=1.058;SC=GCCAGGTGTCCAGTATTCTCT;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=84;WE=51239075;WS=51239057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr14	51289874	.	G	T	403	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=403;QD=33.6747086575;SC=GAAATCTGTGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=51289882;WS=51289864;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,13:0.81:16
chr14	51290141	rs9672090	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=25;PP=656;SC=GTGATCGTCCATACGGCAGAT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=51290149;WS=51290131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	51338875	rs11850408	A	C	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=3;PP=142;SC=GTGGCGGCGTATCGGGACACG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=51338883;WS=51338865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	51347023	rs12889998	T	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=79;SC=CTTTTTGTGGTGTTAGATTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=51347031;WS=51347013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	51347107	rs2185300	G	A	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=362;SC=GGAGACTTTCGGCCTTTGGAA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=51347115;WS=51347097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	51353493	rs7158183	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=190;SC=TTTGAACATATAGACACCAAA;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=51353501;WS=51353483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	51355517	rs10144606	C	A	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=19;PP=995;SC=TTACTGATTTCTTTCTTTCTT;SOR=1.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=51355525;WS=51355507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	51382358	rs1890701	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=264;SC=GTTAGCTCTATGGAGGTGCCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=51382366;WS=51382348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	51446216	rs2275462	T	G	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=42;PP=1592;SC=TTTTTCTATTTAAGTCGAGGA;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=51446224;WS=51446206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	51491956	rs11848681	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=22;PP=1163;SC=CCGGCGGGTTTCCTTGCGTCC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=51491964;WS=51491946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	51492135	rs11268748	C	CCACACAGGTGTTTT	816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=2900;SC=ACCAACAAGGCCAGCGAGACT;SOR=2.419;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=51492143;WS=51492125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	51710508	rs35110538	T	TA	553.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=1;PP=547;SC=TTAAATTTTTTATCCCAAGAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=13;WE=51710516;WS=51710498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	51710551	rs10131881	A	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.26;NF=27;NR=8;PP=806;SC=AACTTTTTTTAAAAAAAAATC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=51710559;WS=51710541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	51716161	rs59489282	GT	G	902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=15;PP=413;SC=CAGATTTTTAGTTTTTTTTTT;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=25;WE=51716169;WS=51716151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	51716188	rs7161242	T	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.69;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	51716467	rs7160810	G	A	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=15;PP=464;SC=GACCACAGCCGTACCCATACC;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=51716475;WS=51716457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	51720906	rs11157811	T	G	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=41;SC=TGGTTTTTTTTATCTTATCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=51720914;WS=51720896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	52165083	rs6572784	T	G	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=101;SC=TGATTTTCATTTTTAGTGTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=52165091;WS=52165073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	52182081	rs731715	T	A	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=45;PP=1752;SC=GCTTGCCTTCTGCCCGGAAGC;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=93;WE=52182089;WS=52182071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	52186966	rs2277495	G	A	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=33;PP=1652;SC=CCCGGGACACGGGGCCAGAAG;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=52186974;WS=52186956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	52294397	rs6572795	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=273;SC=ATTACACGCAGTGGAAAAGCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=52294405;WS=52294387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	52383228	rs11322270	GA	G	1329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.787;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.893;NF=13;NR=27;PP=516;ReadPosRankSum=1.202;SC=AAATAATCCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.503;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=40;WE=52383236;WS=52383218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,61:0.73:84
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chr14	52474721	rs1476284	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=517;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AAAGAATAGCCATGTAGCCTG;SOR=0.353;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=42;WE=52474729;WS=52474711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,49:0.43:113
chr14	52477867	rs10146989	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=175;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GCAGGGGAAAGCAAAGCCCAA;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=52477875;WS=52477857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	52478315	rs1051069	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=615;ReadPosRankSum=0.104;SC=GTTCCAGACCAGCACGGCTGA;SOR=0.803;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=42;WE=52478323;WS=52478305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr14	52481917	rs946615	C	T	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=1148;ReadPosRankSum=-1.278;SC=ACTGGTCATCCCGGGGGGTGC;SOR=1.026;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=164;TCF=71;TCR=93;TR=76;WE=52481925;WS=52481907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,91:0.48:191
chr14	52486961	rs77091361	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=1.188;SC=ACAATCTGTGCGACTGCATGG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=16;WE=52486969;WS=52486951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr14	52495354	rs74049344	T	G	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=24;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.855;SC=AGCCTCTGAATAGCAGAAGTC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=95;TCR=41;TR=82;WE=52495362;WS=52495344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,99:0.62:159
chr14	52495375	rs7144352	C	T	7671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=70;PP=2965;SC=AAAACACTGACAGATTAAAGA;SOR=1.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=116;TCR=70;TR=186;WE=52495383;WS=52495365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr14	52496387	rs2273430	C	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=39;PP=1236;SC=GCAAGGATTCCCCGGAGTGGG;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=52496395;WS=52496377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	52496407	rs2273431	C	T	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=38;PP=1379;SC=GGTCTGAATCCTCTGCATGAG;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=52496415;WS=52496397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	52505771	rs2029978	TT	AG	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1944;SC=TTTTCTGCAGTTTTTTTCATC;SOR=4.514;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=35;WE=52505780;WS=52505761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	52509788	rs3818187	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=408;SC=CCGGCATAACATTCAACCCAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=52509796;WS=52509778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	52520368	rs2101919	C	T	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=87;PP=2965;SC=TGTAGTGTGACCTGAAGCAGG;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=150;WE=52520376;WS=52520358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr14	52520746	rs35657569	G	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1040;ReadPosRankSum=0.055;SC=ACCCTCTAAAGGCTTTGTATC;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=73;WE=52520754;WS=52520736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
chr14	52520853	rs904059	A	G	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=69;PP=2393;SC=CATTCACATCATAGTAATCCA;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=125;WE=52520861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	52534997	rs7151874	T	C	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=242;SC=CCTTCCCCACTGGCCAGGGAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=52535005;WS=52534987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	52535387	rs984051	A	C	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=5;PP=1778;SC=GGGCTCCAGGAGTGGGGTCTG;SOR=3.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=66;WE=52535395;WS=52535377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	52535415	rs984050	G	A	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=21;PP=2451;SC=CCCTCTGGAGGCAGGGTTTCC;SOR=2.407;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=83;TCR=21;TR=104;WE=52535423;WS=52535405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	52535648	rs3920038	G	T	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=76;PP=2180;ReadPosRankSum=-1.048;SC=CATTAGCAACGGCAGCAGCAG;SOR=1.085;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=22;TCR=77;TR=98;WE=52535656;WS=52535638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr14	52536512	rs1497082	T	C	7162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=107;PP=2965;SC=GACCATGAAATACTACTGTGT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=106;TCR=107;TR=213;WE=52536520;WS=52536502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	52781195	rs1254598	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=13;PP=917;SC=GGAACGCTCCGGCTCTCAGAC;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=52781203;WS=52781185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	52794234	rs708502	T	C	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=41;PP=1178;SC=AAATTGTTCCTTGGAGAAATG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=52794242;WS=52794224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	52906081	rs2249922	T	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1198;ReadPosRankSum=0.989;SC=AAATATGCCCTCAAGATTCCT;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=74;WE=52906089;WS=52906071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr14	52906179	rs2249925	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=-0.254;SC=AATAGTAATTCGTAGAACATT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=16;WE=52906187;WS=52906169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr14	52907353	rs1952254	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=158;ReadPosRankSum=0.274;SC=CTTTTTTATACTGAGGATTTA;SOR=0.870;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=10;WE=52907361;WS=52907343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr14	53004157	rs10150229	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
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chr14	53100760	rs11157925	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=0.407;SC=AAGGTGATTTAGTGGTAATAT;SOR=1.414;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=16;WE=53100768;WS=53100750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr14	53110384	rs4898762	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=1.675;SC=GAAACCATCTTAGATAAATTT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=53110392;WS=53110374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr14	53130507	rs17125636	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=608;ReadPosRankSum=1.303;SC=ACAACGCAAATAAGTAATTTA;SOR=0.471;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=41;WE=53130515;WS=53130497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr14	53133036	rs12885338	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=506;ReadPosRankSum=-1.990;SC=TGATTTTGTTTATAAAGAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=23;WE=53133044;WS=53133026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr14	53197042	rs2277493	G	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=5;PP=291;SC=CTGGGACCCTGTAGTCTGCGT;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=53197050;WS=53197036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	53325090	rs6572868	C	T	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=30;PP=2207;SC=AAACAGTATTCCTATTCACAC;SOR=1.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=102;WE=53325098;WS=53325080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	53326454	rs3818453	C	A	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=61;PP=1862;SC=AAGAAAAGAACGGTTAAAAAC;SOR=1.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=86;WE=53326462;WS=53326444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	53345266	rs2357946	G	C	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=40;PP=2041;SC=ACCCTTTACCGGAATAAGTCC;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=103;WE=53345274;WS=53345256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr14	53345378	rs2357947	G	A	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=1920;SC=TGGCCTGCTCGTAAAGCTGAT;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=53345386;WS=53345368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	53386172	rs5808695	A	ATAAT	449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=439;SC=TTTAACAGCAATAATTAACTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=53386180;WS=53386162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	53415359	rs17125973	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=537;SC=CATTTAAATTAACATCATTTC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=53415367;WS=53415349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	53513478	rs10599915	AAG	A	4599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=25;PP=2969;SC=CATGTCCTTCAAGAGAGTTCA;SOR=2.237;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=76;WE=53513487;WS=53513468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr14	53522324	rs5808701	T	TA	1779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=1950;SC=CCCCCAAACTTATGTCTAGGA;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=53522332;WS=53522314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	53525392	rs915436	C	T	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=63;PP=1799;SC=GAAGTGTTATCTTTCAACAAA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=82;WE=53525400;WS=53525382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	53525427	rs12882412	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=1.095;SC=TAATATATGGCAAAATACAAA;SOR=1.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=15;WE=53525435;WS=53525417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr14	53529669	rs4898778	A	T	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=34;PP=2762;SC=ACCGTCGTTTAGTTATATAGA;SOR=1.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=93;TCR=34;TR=127;WE=53529677;WS=53529659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	53539471	rs875663	A	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=624;SC=AGTCTCTGTTACAGGAAAGTA;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=53539479;WS=53539461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	53619463	rs2358188	G	A	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=51;PP=2036;SC=GCTGCGGCGGGTGCAGCGACA;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=88;WE=53619471;WS=53619453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	53619480	rs140904345	T	TGCCGCC	3961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.22;NF=17;NR=31;PP=2982;SC=GACAAGGAGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.716;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=48;WE=53619488;WS=53619470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	53619544	rs2358189	G	A	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.07;NF=73;NR=57;PP=2384;SC=CGGCGGAGCTGAAGTCATAGT;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=130;WE=53619552;WS=53619534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr14	54415291	rs12898159	C	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=48;SC=TCCCTACACCCGTCATTCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=54415299;WS=54415281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	54418986	rs2761880	T	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=55;PP=1740;SC=AAAGAATAAATAAACACCAAT;SOR=2.245;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=71;WE=54418994;WS=54418976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	54863577	rs2235961	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=14;PP=1382;SC=CTAGGAACCAGTCAGCGATTA;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=65;WE=54863585;WS=54863567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	54869027	rs35529322	C	CGT	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.925;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.935;NF=0;NR=8;PP=320;ReadPosRankSum=0.342;SC=CATGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=54869036;WS=54869017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	54875276	rs4251623	C	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=310;SC=AGAATCCTTGCTTAGGATGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=54875284;WS=54875266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	54875514	rs2179896	A	G	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=42;PP=1247;SC=ACAGGTAGGTATAATATCACG;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=54875522;WS=54875504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	54875591	rs4251625	GT	G	559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=326;SC=GAACAAATCAGTTTTTTTTTA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=54875599;WS=54875581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	54877819	rs2143958	C	G	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=21;SC=TCACTTGAACCTGGGAGGCAG;SOR=1.179;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=54877827;WS=54877809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	54879473	rs2268332	G	T	4260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=58;PP=2587;SC=GCAACAGAGAGCCAGCCATGG;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=54879481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	54997792	rs74537102	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.293;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=645;ReadPosRankSum=1.738;SC=AATTTTGAAAGCATTACCTTT;SOR=0.358;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=43;WE=54997800;WS=54997782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr14	55034879	rs3742558	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	55154053	rs11626473	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=795;ReadPosRankSum=1.084;SC=CTTGGCATCTCGGGGAGGACC;SOR=0.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=49;WE=55154061;WS=55154043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,57:0.66:87
chr14	55168673	rs1022754	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=455;SC=AAATATAGCCAGACTATGTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=55168681;WS=55168663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	55215513	rs115404102	T	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1116;ReadPosRankSum=-1.369;SC=TCCCCATCTCTTGCACATCTT;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=70;WE=55215521;WS=55215503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr14	55218161	rs2295820	A	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=439;ReadPosRankSum=0.406;SC=CTTGTTATTTAATTACAGAAT;SOR=0.169;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=25;WE=55218169;WS=55218151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr14	55218435	rs2295822	A	G	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=39;PP=1130;SC=TGCTTCTTTGAAAGCTGATGC;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=55218443;WS=55218425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	55221345	rs911612	G	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=108;SC=TGACGGCACCGGTGGCAGACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=55221353;WS=55221342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	55221543	rs11627203	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=646;ReadPosRankSum=0.949;SC=TGCAGAGCTCTTTTGTTCAGT;SOR=0.678;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=37;WE=55221551;WS=55221533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr14	55227152	rs149416017	G	T	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.246;SC=TGGGGAGCTGGCCGTCGCCCC;SOR=0.694;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=83;WE=55227160;WS=55227142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr14	55241558	.	GA	AC	542	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=21;NR=4;PP=542;QD=23.8187149945;SC=AAAAAATGAGGAGACCTCCAA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=25;WE=55241567;WS=55241548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,25:0.68:37
chr14	55255673	rs11431	C	T	8536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=154;PP=2965;SC=AAGCTGAAGACGAGAGTGACC;SOR=1.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=96;TCR=155;TR=250;WE=55255681;WS=55255663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr14	55310492	rs841	G	A	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=51;PP=1826;SC=TTTTGTGCACGTACTTACACT;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=97;WE=55310500;WS=55310482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	55454119	rs147777028	C	CAATT	2346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=2037;SC=AAAATTAAAACAAGACAGAAA;SOR=2.628;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=34;WE=55454127;WS=55454109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	55454155	rs139807986	C	CATATAT	173.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=34.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	55474190	rs45459500	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=437;SC=AAATCAATATATATCTCAGAA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=55474198;WS=55474180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	55530120	rs3742564	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=26;PP=575;SC=CAGTTTTGGATGGAAGATTAA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=55530128;WS=55530110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	55604935	rs4644	C	A	5050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=64;PP=2965;SC=GGCGCCTACCCTGGAGCACCT;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=155;WE=55604943;WS=55604925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	55605036	rs4652	A	C	5406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=95;PP=2965;SC=GCCAAGTGCCACCGGAGCCTA;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=83;TCR=95;TR=178;WE=55605044;WS=55605026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	55609234	rs2075601	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=723;SC=TAGAAAATTACATGTTCTTTA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=55609242;WS=55609224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	55611839	rs11125	A	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=738;ReadPosRankSum=-0.612;SC=TTCAGATACAAGTACTGGTTG;SOR=1.233;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=48;WE=55611847;WS=55611829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr14	55617578	rs35448900	CA	C	975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=466;SC=TGAAAAACAACAAAAAAAAAC;SOR=0.804;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=23;WE=55617586;WS=55617568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	55619311	rs15870	A	G	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=18;PP=697;SC=TACTTACATGATTTTCTTCAA;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=55619319;WS=55619301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	55621550	rs77977490	A	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=673;ReadPosRankSum=0.866;SC=AATCACCTCAATACCAAATAG;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=42;WE=55621558;WS=55621540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr14	55636301	rs76187513	A	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=564;ReadPosRankSum=0.399;SC=GAGATTTTTTAAAATTAAAGG;SOR=0.436;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=40;WE=55636309;WS=55636291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr14	55643752	rs8009244	A	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=1220;ReadPosRankSum=0.920;SC=TCTTAGCAAGAGACTTATTAT;SOR=0.140;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=23;WE=55643765;WS=55643742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
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chr14	55643908	rs10144326	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.027;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=655;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCTTAGGTGCAAAGGAATTCT;SOR=0.302;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=51;WE=55643916;WS=55643898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr14	55647575	rs11351178	CA	C	2186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=39;PP=1704;SC=CATGGTAGTGCAATGCCTGTA;SOR=1.903;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=55647583;WS=55647565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	55647798	rs8012105	A	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.812;SC=GTGCCACTGCACTCCAACCTG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=55647806;WS=55647788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr14	55647840	rs11622636	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.735;SC=CACAAACAAACGAACAAATTC;SOR=0.116;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=55647848;WS=55647830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	55648115	rs58737648	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=220;ReadPosRankSum=-0.253;SC=ATCTGATCATCGTAAATGACC;SOR=3.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=55648123;WS=55648105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	55650182	rs139535554	ATAATGAGAC	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=486;ReadPosRankSum=1.150;SC=CAACCAGTTAATAATGAGACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=55650198;WS=55650175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	55655692	rs2274271	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TGGAACAAGCCCTTGAGATGT;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=11;WE=55655700;WS=55655682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr14	55817708	rs10144418	T	C	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=58;PP=1771;SC=ATGGAGTCTATGCTGGGAGGC;SOR=1.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=93;WE=55817716;WS=55817698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	55818403	rs35070799	T	C	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.060;NF=45;NR=50;PP=1747;ReadPosRankSum=-2.713;SC=ACAGATGCTGTTGATTGTATG;SOR=0.662;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=207;TCF=108;TCR=99;TR=95;WE=55818411;WS=55818393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,113:0.47:238
chr14	55818517	rs1045002	T	A	8592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=127;PP=2965;SC=CAGCCTTCCATTTTAAACTCC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=126;TCR=127;TR=252;WE=55818525;WS=55818495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr14	55818706	rs3742569	T	C	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=68;PP=2769;SC=CCATTTGTACTGCCAGCCTCT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=133;WE=55818714;WS=55818688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	55836773	rs10136596	A	G	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=197;SC=CCCCAAGTCTATGCAGCACTC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=55836781;WS=55836763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	55847466	rs946059	A	G	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=85;PP=2468;SC=AACTACTAATAATCCACGAGT;SOR=2.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=109;WE=55847474;WS=55847456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	55847525	rs77790976	C	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=0.328;SC=TTTAGTGCTTCCTTAATAGAT;SOR=0.569;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=12;WE=55847533;WS=55847515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	55847573	rs7145727	G	A	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	55848972	rs3783650	A	C	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=65;PP=2007;SC=ATGCAATATAACTGCAAGACA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=100;WE=55848980;WS=55848962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	55862523	rs76264591	A	G	31.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr14	55864130	rs8003279	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=617;ReadPosRankSum=-0.682;SC=AGTCGGCTTAACCTTTCCTTC;SOR=0.635;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=33;WE=55864138;WS=55864120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr14	55880918	rs946055	A	G	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=201;SC=AAATAACACAAAAGGAGTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=55880926;WS=55880908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	55881011	rs79919449	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=1.882;SC=AACATCTACAATTAAACGTAG;SOR=0.674;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=12;WE=55881019;WS=55881001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr14	55895816	rs75295884	G	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=-1.607;SC=GAAGCTGTAGGCTTTGTGAGG;SOR=0.382;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=16;WE=55895824;WS=55895806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr14	55902470	rs149591724	G	GA	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.349;SC=AATTTTTTAAGAAAAAACAGA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=55902478;WS=55902460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	55902542	rs7149317	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=-1.043;SC=CTAATTATTGGAAGGAATACT;SOR=0.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=17;WE=55902550;WS=55902532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr14	55903716	rs45612333	C	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=0.059;SC=ACAGGGGAGACCTGGGTGGGG;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=27;WE=55903724;WS=55903706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr14	55907004	rs41299189	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=0.544;SC=GGGAAACCAAGCCCGCCTCTT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=15;WE=55907012;WS=55906994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	55907172	rs8019270	C	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=423;ReadPosRankSum=-0.922;SC=CTCCATGGACCGTAATCCCAC;SOR=0.969;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=25;WE=55907180;WS=55907162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr14	56078739	rs1138345	T	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	56086190	rs7154548	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	56100160	rs10135907	G	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=285;SC=AGACTTTTGTGTTTTTACATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56100168;WS=56100150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	56101164	rs139496974	AAACT	A	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=848;ReadPosRankSum=0.477;SC=CAGCTCAGCAAAACTAACAAA;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=19;WE=56101175;WS=56101154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr14	56101212	rs34111199	C	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=995;ReadPosRankSum=-1.235;SC=TTTGTAATAACGGAAGGCTCC;SOR=0.548;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=58;WE=56101220;WS=56101202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr14	56106031	rs3831052	TGAC	T	886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=681;ReadPosRankSum=0.377;SC=TTTATACCTCTGACGACCTGT;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=15;WE=56106041;WS=56106021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr14	56108007	rs10483649	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=0.397;SC=GAAATACTACGTTTTGTATGA;SOR=1.058;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=9;WE=56108015;WS=56107997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr14	56108033	rs2341890	G	A	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=9;PP=272;SC=CTCTGAAACAGTGTTTCTGTA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=56108041;WS=56108023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	56108520	rs1951890	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=1.730;SC=TACTTGTTATATAACAAGATC;SOR=0.495;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=12;WE=56108528;WS=56108510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr14	56113917	rs17684916	A	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=0.639;SC=AGCATATAAGAATGAATTACT;SOR=0.743;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=8;WE=56113925;WS=56113907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr14	56114866	rs17128657	A	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=327;ReadPosRankSum=-1.810;SC=TTTCCTTGTGATTATTCAGTG;SOR=0.414;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=23;WE=56114874;WS=56114856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	56116576	rs71448463	AT	A	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=1.821;SC=TCTTTGGTCCATTTTTTTTTT;SOR=0.582;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=56116584;WS=56116566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	56119454	rs17684959	C	T	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TAGTTTAGTTCAATCAGCTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=56119462;WS=56119444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	56122689	rs35094494	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TTTTTCTTAGGGGTGATATTG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=56122697;WS=56122679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr14	56126456	rs7160678	C	A	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=35;PP=1488;SC=TTTATAAAGTCGTAACTATTT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=56126464;WS=56126446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	56133942	rs7150285	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=384;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTTGATTTGGCTCATCTTCTG;SOR=0.448;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=30;WE=56133950;WS=56133932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr14	56139313	rs3215766	GT	G	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.445;NF=10;NR=11;PP=672;ReadPosRankSum=-0.740;SC=ATCCTTGGTGGTTTTACTTGG;SOR=1.075;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=21;WE=56139321;WS=56139303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr14	56142480	rs3736877	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=1.113;SC=TTCATTCTTCAGTCCTAGAGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=56142488;WS=56142470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	56146228	rs12587735	T	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.544;SC=TTGTTTGGTTTTACATTTCTT;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=56146236;WS=56146218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	56147540	rs10483651	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=1.576;SC=TTAAGCCTCAGCTCAAATCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=56147548;WS=56147530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr14	56645265	rs17762499	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TCTTTCCTTTCGTCTTTTCAT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=56645273;WS=56645255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	56755425	rs34574403	C	CA	276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=228;SC=TTAATTGGAGCAAAAAAAAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=56755433;WS=56755415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	56763990	rs151133207	CAG	C	799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.996;NF=2;NR=15;PP=620;ReadPosRankSum=0.906;SC=AGGAGGGTGACAGGGGCTGGA;SOR=0.804;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=17;WE=56763999;WS=56763980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr14	56958173	rs1889382	C	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=319;SC=CCCTCAGGCCCATGTCTGTTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=56958181;WS=56958163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	56958247	rs12893562	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=317;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GAGAAATACTCCAAATGAATT;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=24;WE=56958255;WS=56958237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr14	56958328	rs12894026	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=529;ReadPosRankSum=0.302;SC=CAGTTTCAGCGCCACATCGGG;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=39;WE=56958336;WS=56958318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr14	57046829	rs2275025	C	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=24;PP=732;SC=CTGTCCCTCTCCCCTGGTCCC;SOR=1.036;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=57046837;WS=57046819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	57052511	rs3737171	G	T	4892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=63;PP=2965;SC=CTTTGTTCACGCTGGTGGCTA;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=88;TCR=63;TR=151;WE=57052519;WS=57052501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr14	57070501	rs10782433	A	G	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=32;PP=2000;SC=TTTTTGTTGGAAAAGAAGATT;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=90;WE=57070509;WS=57070491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	57072203	rs3818777	T	A	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=194;SC=GAATGCTTGGTTTTAATATAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=57072211;WS=57072193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	57092038	rs2274706	A	G	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=12;PP=1283;SC=ATTACTTGATAAACTTGATTC;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=57092046;WS=57092028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	57099859	rs1041316	G	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=63;PP=1878;SC=CTTACAAAAAGTATCTATAAC;SOR=1.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=90;WE=57099867;WS=57099849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	57101682	rs913742	A	G	7042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=103;PP=2965;SC=TGACTATTCTACATTTTTGTG;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=102;TCR=103;TR=205;WE=57101690;WS=57101672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr14	57116979	rs1958530	A	G	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=82;SC=TTCGGCCTGAAGAGCCAGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=57116987;WS=57116969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	57196766	rs10151357	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=550;ReadPosRankSum=1.190;SC=TTTTTTTCCACTGGGGAAAAT;SOR=0.459;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=33;WE=57196774;WS=57196756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr14	57271127	rs2277499	G	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GTTTCCGCGGGTTCTCCGACG;SOR=0.582;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=9;WE=57271135;WS=57271117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr14	57672459	rs201413464	AAG	A	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.883;NF=8;NR=2;PP=370;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTAGAAGTGAAAGAGGGGGGA;SOR=0.180;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=57672468;WS=57672449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr14	57672540	rs3742577	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.817;NF=19;NR=12;PP=439;ReadPosRankSum=-0.009;SC=CCTACTTTGATAGTTTTTTAA;SOR=0.307;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=31;WE=57672548;WS=57672530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr14	57672715	rs3742578	C	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=337;ReadPosRankSum=0.442;SC=TCATTTTCAACATCATAATTT;SOR=0.612;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=27;WE=57672723;WS=57672705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr14	57866623	rs2152360	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	57876265	rs11620639	G	A	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=86;PP=2952;SC=ACTATCATCCGCACAGAATCG;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=148;WE=57876273;WS=57876255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	57938124	rs1152531	C	T	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=49;PP=2027;SC=CTGTCCTGGTCCTCACCAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=57938132;WS=57938114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	57938260	rs1152530	T	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=40;PP=1320;SC=CCAGGGACAGTAGTTATTCAC;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=57938268;WS=57938250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	57945689	rs1152525	G	A	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=29;PP=2091;SC=TTTGGCCCACGGCACAGCGAT;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=101;WE=57945697;WS=57945679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	57948380	rs1152522	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=858;SC=TAGTACCTGCTATGAAAGACA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=57948388;WS=57948370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	57957654	rs1203339	T	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	57957664	rs1203338	T	A	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.47;SOR=1.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	58036494	rs2297113	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.433;SC=GGCAAAACCCGAGGCCACTTA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=58036502;WS=58036484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	58038544	rs725048	T	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=532;ReadPosRankSum=-1.370;SC=ACATCGTACTTTCTTACTTTA;SOR=0.968;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=30;WE=58038552;WS=58038534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr14	58060586	rs180872	C	T	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=187;SC=CATTCTGTGACAATGGCGAGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=58060606;WS=58060576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	58060598	rs238377	C	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=281;SC=ATGGCGAGATCTTTCTATTTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=58060606;WS=58060576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	58471699	rs727203	T	C	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=862;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GTGTGCTTTATTAAGTAAATT;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=45;WE=58471707;WS=58471689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr14	58478873	rs3837616	GA	G	401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=287;SC=TTCTCACTAGGAAAAAAATAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=58478881;WS=58478863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	58563694	rs2273442	G	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=292;ReadPosRankSum=1.824;SC=TCATCTTCTTGTCCCTCTAGG;SOR=0.199;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=17;WE=58563702;WS=58563684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr14	58600107	rs2180520	T	A	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=234;SC=CCTATTTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=58600115;WS=58600097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	58605790	rs3829765	G	A	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=40;PP=2170;SC=TCCAGGCTGGGTTTCTTTGTT;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=58605798;WS=58605780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	58666882	rs61975916	A	G	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=11;PP=1038;SC=GCGAGCGCCGAGACTTGTTGG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=58666890;WS=58666872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	58669660	rs75291796	AT	A	788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=1045;SC=TTAAAAAAAAATATTAGCAAA;SOR=1.942;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=58669668;WS=58669650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	58697795	rs111932447	C	CAG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=61;SC=CTTTTTTTGACAGTGTTGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=58697803;WS=58697785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	58724817	rs35486640	C	CTT	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=776;SC=AATAGAAACTCGTCGATAAGT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=58724825;WS=58724807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	58724860	.	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.887;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.414;SC=ACAGTGTACATAGAAACTACT;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=58724868;WS=58724850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	58730626	rs2348071	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=352;SC=CACCAACACTAATGATAGCTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=58730634;WS=58730616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	58734282	rs35846334	G	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=2.375;SC=TATTTCATTTGACCTTTGCAT;SOR=0.361;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=20;WE=58734290;WS=58734272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr14	58737766	rs8005100	A	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=356;SC=TCAGGGAATCACTTAGCCCAG;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=58737774;WS=58737756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	58742095	rs117497415	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-1.041;SC=TATTAGATTCGATGTAAACTT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=8;WE=58742103;WS=58742085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	58758331	rs11461912	G	GT	2274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=1866;SC=TTACCTAAGAGTAACTAAGTA;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=37;WE=58758339;WS=58758321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	58766617	rs1957038	A	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=44;PP=1619;SC=TCGCGCCCTGAACACTGCCAA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=79;WE=58766625;WS=58766607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	58770389	rs10145481	C	G	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=42;PP=1363;SC=CTAAAGGGTCCCTCCAGACCA;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=64;WE=58770397;WS=58770379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	58771632	rs7155580	A	G	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=404;SC=TAAAAGTAATATGCAAATTAT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=58771640;WS=58771622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	58838668	rs1051860	A	G	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=74;PP=2894;SC=CCTCATCATCATCTCCCCCAC;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=74;TCR=74;TR=148;WE=58838676;WS=58838658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr14	58838701	rs1051861	C	T	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=73;PP=2548;ReadPosRankSum=-1.131;SC=CTGTAGAATGCAGGTGATAAA;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=133;WE=58838709;WS=58838691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr14	58869510	rs7153357	T	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=698;SC=TTGTGAGTTATGACAGCTTAT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=58869518;WS=58869500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	58875692	.	C	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GATGAGTCCTCATTTCCAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=58875700;WS=58875682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr14	58907825	rs71107948	AT	A	47.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=52;SC=AATATATACAATTTTTTTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=58907833;WS=58907815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	58917225	rs1748970	C	G	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=719;SC=AAAGTATAGGCAAGAGTAATA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=58917233;WS=58917215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	58917454	rs1748971	G	A	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=95;PP=2965;SC=TGGAAGTGTCGTGTCACAGAG;SOR=1.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=48;TCR=95;TR=143;WE=58917462;WS=58917444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr14	58920240	rs1748975	A	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=536;SC=GAGTTTTGTTAAGATTTTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=58920248;WS=58920230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	58923395	rs1743721	G	A	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=17;PP=1293;SC=ATCTTCTGTAGCGTTGAAACT;SOR=1.318;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=58923403;WS=58923385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	58926527	rs1748980	C	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=215;SC=TATTTGTAGACATTTTAAGTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=58926535;WS=58926517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	58932772	rs1743716	A	G	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=76;PP=2270;SC=AATATGTGGGATGGATTTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=22;TCR=76;TR=98;WE=58932780;WS=58932762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	58934371	rs1632390	G	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=682;SC=TGAGAATATAGCCATTAAGAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=58934379;WS=58934361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	58937416	rs1748986	T	C	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=91;PP=2965;SC=GAAGCATCTCTTCCTCCTGTG;SOR=0.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=70;TCR=91;TR=161;WE=58937424;WS=58937406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	58953617	rs1743702	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=424;SC=TACTTAACCCTGCCATCAATT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=58953625;WS=58953607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	58953746	rs1617510	C	G	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=45;PP=2440;SC=CACCCCACTGCCTACCCCACA;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=112;WE=58953754;WS=58953736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr14	58954588	rs5808973	T	TA	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.503;NF=12;NR=19;PP=656;ReadPosRankSum=-2.123;SC=TCTGTCCTTTTAAAAAAAAAC;SOR=0.941;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=31;WE=58954596;WS=58954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr14	59010649	rs28535751	T	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.533;NF=17;NR=29;PP=602;ReadPosRankSum=1.074;SC=AAACTCGGGCTGTGGAGGTTT;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=46;WE=59010657;WS=59010639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr14	59105188	rs2003021	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=510;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TGGGGAGCTACTGGGGGAGGC;SOR=1.312;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=35;WE=59105196;WS=59105178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr14	59112475	rs863091	C	T	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1500;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GCGTTTGTGTCAGAGCCCCGG;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=90;WE=59112483;WS=59112465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,112:0.50:226
chr14	59113430	rs698025	G	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=875;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GGCCCGGCGCGGTCGCCGGGA;SOR=0.575;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=57;WE=59113438;WS=59113420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr14	59730422	rs67718668	AAGG	A	825.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.658;NF=1;NR=19;PP=742;ReadPosRankSum=0.700;SC=GGAGCCAGAGAAGGAGAAGAG;SOR=1.739;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=20;WE=59730432;WS=59730412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr14	59781871	rs3818289	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=699;ReadPosRankSum=0.101;SC=AAAATAAATACGTCATACCTT;SOR=0.809;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=79;TCF=75;TCR=4;TR=34;WE=59781879;WS=59781861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr14	59789586	rs8021976	A	G	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=35;PP=2342;SC=GCACTTAAGCATGGTGCATTT;SOR=1.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=86;TCR=35;TR=121;WE=59789594;WS=59789576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	59789727	rs8022614	G	A	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1291;ReadPosRankSum=0.787;SC=GCTGTATAAAGGCGTTAATGA;SOR=0.782;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=81;WE=59789735;WS=59789717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,97:0.49:196
chr14	59790813	rs6573250	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=272;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGGTTAGTAACGTTTCAGTCC;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=19;WE=59790821;WS=59790803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr14	59797115	rs941883	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=252;ReadPosRankSum=0.128;SC=CCTAATAAAGATCCTCATAAT;SOR=1.292;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=13;WE=59797123;WS=59797105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	59797235	rs941884	A	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=756;ReadPosRankSum=-0.150;SC=ATGAGCTACAACAGAAACTGG;SOR=0.839;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=45;WE=59797243;WS=59797225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr14	59798473	rs2146012	C	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=855;SC=AAATAACCATCCCTGTTCTTT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=59798481;WS=59798463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	59804999	rs1958180	A	G	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=46;PP=1737;ReadPosRankSum=-1.165;SC=CTTACCCTACATCACTTGTTT;SOR=0.962;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=244;TCF=141;TCR=103;TR=121;WE=59805007;WS=59804989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,147:0.51:288
chr14	59805217	rs3830986	GT	G	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=532;ReadPosRankSum=-2.475;SC=CCAGGGTTTTGTTTTTGTTTT;SOR=0.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=17;WE=59805225;WS=59805207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr14	59814502	rs941886	C	A	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=765;SC=AACTTAATGACCTTATTCTCT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=59814510;WS=59814492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	59819345	.	G	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=904;ReadPosRankSum=0.411;SC=TTTTTGAGATGAGCCGGTGAG;SOR=0.550;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=63;TCR=92;TR=61;WE=59819353;WS=59819335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,79:0.42:186
chr14	59834048	rs10130669	C	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=606;SC=ACAAAACTTACGTTTGACTCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=59834056;WS=59834038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	59978366	rs10635523	A	ATG	4481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=27;PP=2957;SC=TTCCACCCTGATGCGTGCATG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=63;WE=59978374;WS=59978356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	59992116	.	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=729;ReadPosRankSum=0.208;SC=TTGCTTTCTTGATCTCGTAAT;SOR=0.556;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=46;WE=59992124;WS=59992106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr14	60004844	rs4261431	C	T	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=37;PP=1434;SC=TGCCACAAATCCACTGATCTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=60004852;WS=60004834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	60031996	rs1980580	G	A	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=46;PP=1715;SC=GCTTCTCCCTGGGAGGAAAGA;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=77;WE=60032004;WS=60031986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	60032046	rs1980579	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=944;SC=TAAGAAAGGAATAGTCTGTGT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=60032054;WS=60032036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	60034840	rs982862	G	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=19;NR=6;PP=479;SC=TCTCCTACAAGCCATCTTCAC;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=60034848;WS=60034830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	60043422	rs4898996	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-1.481;SC=GGGAGGGGCCAGTGGAGACGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=60043430;WS=60043412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	60063472	rs6573275	A	G	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=71;PP=2342;ReadPosRankSum=0.334;SC=TTTACTCAGCATGCCTCTTAG;SOR=0.328;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=126;WE=60063480;WS=60063462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr14	60071972	rs1950787	T	C	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=635;SC=CTTCTGACTCTAGAATATAAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=60071980;WS=60071962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	60072023	rs1950786	G	A	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=23;PP=1586;SC=GCAGTTTACAGTATTACACCT;SOR=1.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=60072031;WS=60072013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	60444652	rs219328	A	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=241;SC=GAGTTTGTTAATTATTAAACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=60444660;WS=60444642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	60451770	rs219341	G	A	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=271;SC=ACTTCAGTTTGATGTAGAATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=60451778;WS=60451760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	60451816	rs219342	G	A	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=601;SC=ATTTTATTTTGCTTCAGAGTC;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=60451824;WS=60451806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	60468661	rs219369	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=705;SC=CCTTTTTTCACTGTATTTTTT;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=34;WE=60468669;WS=60468651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	60483598	rs219388	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=194;SC=ATACAACTTACCTAAATATAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=60483606;WS=60483588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	60484931	rs219391	C	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=137;SC=TTCAGCCGATCATTTAACCAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=60484939;WS=60484921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	60485240	rs219392	G	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=295;SC=GGTTTCCAATGCAAATTATTC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=60485248;WS=60485230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	60498876	rs219409	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=198;SC=TAGTTTTATGCTTCTGTATGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=60498884;WS=60498866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	60519920	rs95425	C	T	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=76;PP=2328;ReadPosRankSum=2.535;SC=CAAAGAAAAACTCGGTAATAA;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=114;WE=60519928;WS=60519910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,139:0.99:141
chr14	60574539	rs12465	A	G	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=85;PP=2965;SC=GAACACTTTTATACCAGTTAG;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=174;WE=60574547;WS=60574529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr14	60581673	rs35459418	CT	C	1482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.48;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	60581863	rs219314	G	A	5628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=CCAGTGGTCCGGAAAAACATT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=165;WE=60581871;WS=60581853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr14	60581935	rs150687	C	T	5823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=86;NR=92;PP=2965;SC=TAGAAACTAGCTTGCTTCATC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=178;WE=60581943;WS=60581925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	60582053	rs150688	G	A	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=60;PP=2328;SC=AATTCAAAGCGTATATATCAT;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=60582061;WS=60582043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	60712515	rs8018093	G	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=550;ReadPosRankSum=0.392;SC=CCAGGGTAGGGGGCACACCCT;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=36;WE=60712523;WS=60712505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr14	60750349	rs4899009	C	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.599;SC=AATTCTGAAACCAGTTTTTGG;SOR=0.169;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=10;WE=60750357;WS=60750339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr14	60750365	rs8012816	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=2.034;SC=TTTGGCACAACTGTAGGATAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=60750373;WS=60750355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr14	60752196	rs10653822	A	ATGCG	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.792;NF=3;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.652;SC=ACACGCACGCATGCGTGCACA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=60752204;WS=60752189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	60921673	rs1262175	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=382;SC=ACTCAAAGTTTCACAGCAGAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=60921681;WS=60921663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	60923783	rs11625921	C	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=885;SC=TCATTTTCTACTGACTTCCCA;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=60923791;WS=60923773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	60928201	rs1956549	G	A	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=19;PP=779;SC=AGAGATTAAAGCATTTTCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=60928209;WS=60928191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	60932569	rs10529202	AACACACACACACACACACACAC	A	1135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=5;PP=3000;SC=ATAAATTTATAACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=11;WE=60932598;WS=60932559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	60935281	rs12878738	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=464;SC=GAACACAAAACAAAATAATTA;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=60935289;WS=60935271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	60938319	rs35543839	T	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=598;ReadPosRankSum=0.927;SC=GTTCAGTACATGCCAACACTC;SOR=0.484;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=49;WE=60938327;WS=60938309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr14	60944959	rs11845369	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=278;SC=ACATTCTTACACACCATGTCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=60944967;WS=60944949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	60945203	rs11158285	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=370;SC=AAAGAGAAACGAATCTTTCTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=60945211;WS=60945193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	60975956	rs1956558	T	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=19;PP=1064;SC=GTCGGGGTCGTCCGCTCCCGG;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=60975964;WS=60975946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	60976537	rs33912345	C	A	3492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.369;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=71;PP=2278;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GCGCACGCGGCACCTGCTACG;SOR=0.668;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=326;TCF=157;TCR=169;TR=141;WE=60976545;WS=60976527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,165:0.42:390
chr14	60978071	rs1061108	C	G	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=55;PP=1659;SC=TCCAGCGCCACAGAAGCCAGG;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=60978079;WS=60978061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	61118783	rs4899014	C	T	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1167;SC=CCTCGGAGGCCGTGACTGGGC;SOR=5.507;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=61118791;WS=61118773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	61124940	rs10143202	A	G	4826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.072;SC=ATTCATGGACATATTTAAAGG;SOR=0.326;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=72;TCR=93;TR=164;WE=61124948;WS=61124930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr14	61180657	rs3742636	T	G	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=49;PP=2582;SC=GGCCAGTGGATGCAGGCCACT;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=117;WE=61180665;WS=61180647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	61278684	rs2020892	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=376;ReadPosRankSum=0.801;SC=ATTCCACGCCATATATAAATT;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=24;WE=61278692;WS=61278674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr14	61285352	rs973063	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=0.375;SC=TGAAATGCTTATGGAAAAGAC;SOR=2.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=61285360;WS=61285342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr14	61445967	rs7142228	A	G	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=52;PP=2887;SC=TGTTTGAAAGACAGCTGATGA;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=138;WE=61445975;WS=61445957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	61448510	rs2296924	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=660;SC=GGGAGGGAAAATAATAAACAT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=61448518;WS=61448500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	61449167	rs2296923	T	C	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=885;SC=GGAATTTCTTTACGAAATTTT;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=61449175;WS=61449157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	61449328	rs976272	T	A	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.11;NF=32;NR=51;PP=1716;SC=AGCTTATGTTTTGGCTAATAC;SOR=1.156;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=61449336;WS=61449318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	61451329	rs2182985	G	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=758;SC=ACATAATTCTGCTACTCAGAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=61451337;WS=61451319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	61451589	rs2149303	C	T	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=941;SC=ACATATAGAACTGGATGTCTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=61451597;WS=61451579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	61453739	rs33922839	C	CT	3075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=20;PP=2499;SC=ATCTGTTTCTCTTCTTTTTTC;SOR=1.954;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=57;WE=61453747;WS=61453729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	61497147	rs1465146	A	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=11;PP=603;SC=TAGGAACACTATTTATTCTTT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=61497155;WS=61497137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	61497285	rs1465145	T	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=23;PP=806;SC=TGTATTAATTTGATAAATATG;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=61497293;WS=61497275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	61509924	rs2296921	T	C	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=712;SC=TAGAGAAAGGTTTCCAGGTAA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=61509932;WS=61509914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	61643045	rs4902033	C	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=837;ReadPosRankSum=0.717;SC=AATTTCCCCCCTCAATACACA;SOR=0.909;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=57;WE=61643053;WS=61643035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,71:0.38:186
chr14	61747644	rs3196765	A	G	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1069;ReadPosRankSum=0.547;SC=CCGAGCAGTTACCGGTGCCCG;SOR=1.061;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=58;WE=61747652;WS=61747634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr14	61788816	rs45582331	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=388;ReadPosRankSum=0.531;SC=GCAGCGGCGCCGGCATGTCGT;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=23;WE=61788824;WS=61788806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr14	61789318	rs1886466	C	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=251;SC=TCTTCGTCCACGTGGCCGCGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=61789326;WS=61789308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	61915751	rs2296273	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=475;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AAGGATGGGCGCACCAGCTGC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=32;WE=61915772;WS=61915741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr14	61917736	rs150788890	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=304;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GGGAACACTATGCCCTAAGCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=22;WE=61917744;WS=61917726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr14	61952429	rs1536016	T	C	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=94;PP=2965;SC=CCTCTCCTGGTATGATCCATC;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=59;TCR=94;TR=153;WE=61952437;WS=61952419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr14	61995691	.	C	CGTGTGTGTGT	384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=745;SC=TGTGGCCGCACGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=61995699;WS=61995681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	61996018	rs17098729	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=265;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TTATGCACTGCAGCTTTGGAG;SOR=0.541;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=14;WE=61996026;WS=61996008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr14	61997226	rs1088680	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=0.441;SC=AGGCAGAGAACGAAGATGACC;SOR=1.113;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=22;WE=61997234;WS=61997216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr14	61997393	rs1088679	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=0.074;SC=TTTTCAGTACTTCCCACCAGT;SOR=0.334;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=14;WE=61997401;WS=61997383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr14	62037297	rs798792	C	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=5;PP=327;SC=TCCTGAACAGCATCCAGTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=62037305;WS=62037287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	62205175	rs10138153	T	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=590;SC=TTCAAACACTTATTTGAACCA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=62205183;WS=62205165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	62207152	rs148373460	T	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGATCTAGTTTGAAAATTCTG;SOR=0.105;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=62207160;WS=62207142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	62207557	rs11549465	C	T	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.994;SC=TCAGTTGTCACCATTAGAAAG;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=197;TCF=104;TCR=93;TR=84;WE=62207565;WS=62207547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,99:0.44:227
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chr14	62233569	rs73324981	A	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=227;ReadPosRankSum=1.296;SC=AATGAGTCGTAATATATTTTC;SOR=0.460;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=18;WE=62233577;WS=62233559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr14	62233806	rs1254677	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CAAGTACCATATTTTTATAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=62233814;WS=62233796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	62234159	rs10145554	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=-1.085;SC=AAAATGGAATAAGTATTGATA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=62234167;WS=62234149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	62462766	rs8019076	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=467;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TCTCAGGATGTTCAGAACTTC;SOR=0.443;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=29;WE=62462774;WS=62462756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr14	62463303	rs61743836	G	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr14	62463311	rs62639692	A	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.144;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr14	62550877	rs2353778	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GTAGTGCAGCGTGGGCCAATG;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=9;WE=62550885;WS=62550867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr14	63174616	rs7161127	T	C	5746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=79;PP=2965;SC=AATCTGTTTTTCTTAGTGGGT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=161;WE=63174624;WS=63174606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	63179333	rs12435381	C	T	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1136;ReadPosRankSum=0.340;SC=TCCTGGACTCCGTGAAAACTC;SOR=0.670;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=66;WE=63179341;WS=63179323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,81:0.50:163
chr14	63269317	rs12588427	T	C	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=63;PP=1608;SC=AGGTGAGAGATGAATAAGTGA;SOR=1.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=99;WE=63269325;WS=63269307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	63453773	rs1950975	A	G	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1333;ReadPosRankSum=1.203;SC=GGGAAGCAAAATTCATCTCAT;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=108;TCR=85;TR=88;WE=63453781;WS=63453763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,98:0.45:217
chr14	63473127	rs150609268	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=272;ReadPosRankSum=0.508;SC=TTGATTCGTAGTTGTCAAAAG;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=18;WE=63473135;WS=63473117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr14	63779846	rs5809192	G	GA	1344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.057;NF=0;NR=35;PP=1254;ReadPosRankSum=0.756;SC=CCCATAGATAGAAACAGAGAA;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=35;WE=63779854;WS=63779836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr14	63784407	rs11382440	A	AG	4689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=34;PP=2936;SC=GGTGATCCGAAGCCCCTGCAG;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=86;WE=63784415;WS=63784397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	64375985	rs2275018	G	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=800;ReadPosRankSum=-1.947;SC=ACAGAAACTGGGGAAACCTTA;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=57;WE=64375993;WS=64375975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,70:0.40:175
chr14	64408852	rs33976862	G	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CAATTATCCTGCACTTTCATG;SOR=0.452;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=18;WE=64408860;WS=64408842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr14	64421392	rs1255874	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=12;PP=1137;ReadPosRankSum=0.685;SC=GGGGTGTTACGTTCTTTTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=78;TCR=17;TR=62;WE=64421400;WS=64421382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr14	64423187	rs2792201	C	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=466;ReadPosRankSum=-1.024;SC=CAACTCTCTTCAGCTGATGTG;SOR=1.075;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=34;WE=64423195;WS=64423177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,44:0.35:126
chr14	64423316	rs34939365	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TATCATTTAAGTATACAAATT;SOR=0.990;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=13;WE=64423324;WS=64423306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	64430770	rs34753731	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.239;SC=AGAGTTGAGCGTAAGTATGTT;SOR=0.283;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=64430778;WS=64430760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	64434652	rs1255891	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.929;NF=1;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=1.799;SC=AGACCAAGGCGGGTGGATCAC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=64434660;WS=64434642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	64444876	rs1255896	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.760;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=573;ReadPosRankSum=1.093;SC=GTATCTTCACGTTTTATGTAG;SOR=0.169;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=34;WE=64444884;WS=64444866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr14	64457079	rs1255907	G	A	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=193;SC=TTAATGTTTAGCATATAATCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=64457087;WS=64457069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	64457638	rs1255908	T	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=648;ReadPosRankSum=-1.475;SC=CGTGTTAATTTGAGAATTTTT;SOR=0.434;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=36;WE=64457646;WS=64457628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr14	64460536	.	A	AT	55	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9995;HP=14;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.29;NF=5;NR=0;PP=55;QD=11.8;SC=TTTGTTTGCAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=64460544;WS=64460526;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr14	64462007	rs1255912	A	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=400;SC=TAGGATGAAAACTGTTCTGAA;SOR=1.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=64462015;WS=64461997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	64462071	rs1255913	G	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=137;SC=CTTCACACTCGCAGCAGAGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=64462079;WS=64462061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	64464236	rs8009321	C	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=1.441;SC=TGGAGAATTTCCACTTACACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=64464244;WS=64464226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	64468918	rs12147217	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=216;SC=AGCCATGACAGTTTTTTTTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=64468926;WS=64468908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	64469828	rs17751301	C	T	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.583;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1063;ReadPosRankSum=0.608;SC=AGATGCTGAACGGGGTGATGA;SOR=0.817;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=181;TCF=90;TCR=91;TR=75;WE=64469836;WS=64469818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,93:0.43:218
chr14	64470137	rs34215796	C	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.971;NF=3;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CTTCCTATGTCTTTCTGCTTC;SOR=1.569;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=19;WE=64470145;WS=64470127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr14	64470159	rs4027385	ACT	A	942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.074;NF=0;NR=22;PP=901;ReadPosRankSum=-1.664;SC=ATTCCATCCCACTCTATTCAG;SOR=0.578;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=22;WE=64470168;WS=64470149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr14	64476680	rs7146588	T	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=0.825;SC=TTTTCTATTCTTAGTCTTGAA;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=64476688;WS=64476670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	64476884	rs144318357	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.745;SC=TCACTGACAGGCCTGGTAGTA;SOR=0.728;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=10;WE=64476892;WS=64476874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr14	64491695	rs4902264	T	C	6900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.362;SC=TGGAAAGGAATGGAAGAACCA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=112;TCR=94;TR=204;WE=64491703;WS=64491685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,262:0.99:264
chr14	64494278	rs10151127	C	T	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=11;PP=1326;SC=GCTCATAGAACTAAAGAAGAA;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=64494286;WS=64494268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	64496749	rs4027402	C	T	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=62;PP=1971;SC=GATCAAATAGCGGTTGAGGAA;SOR=1.362;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=98;WE=64496757;WS=64496739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	64496872	rs3866737	G	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=440;SC=AGAAATTCCAGTGGTATTCAG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=64496880;WS=64496862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	64497930	rs4027404	G	A	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=59;PP=2612;SC=TGTCTCAACAGCATTCTCAAA;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=64497938;WS=64497920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	64498037	rs4027405	G	A	4441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=81;PP=2840;SC=GGAATCAGCTGCAGTGGAAAA;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=142;WE=64498045;WS=64498027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	64501192	rs9783605	G	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=250;SC=TTTTTCTTTAGTAAATGTCAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=64501200;WS=64501182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	64519035	rs1890908	A	G	5783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=117;PP=2965;SC=CTATGAGGGCAGTGATTTAAA;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=72;TCR=117;TR=189;WE=64519043;WS=64519025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	64519455	rs3829767	A	G	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=44;PP=1625;SC=GGAACACAAGATAAAGTTTTG;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=64519463;WS=64519445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	64520416	rs10138253	G	A	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=322;SC=TGGGTGCGGGGGCTCACGCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=64520424;WS=64520406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	64522674	rs8010911	G	C	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=31;PP=1437;SC=TGTCTTGAATGATGCTTATGA;SOR=1.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=64522682;WS=64522664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	64522843	rs8010699	A	G	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=48;PP=1887;SC=ACAGTAGCACACATCCAGGAC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=64522851;WS=64522833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	64523094	.	G	A	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=46;QD=20.1928031368;SC=TTTTTTCTCTGTCATTAACAC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=64523102;WS=64523084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	64532107	rs1255972	A	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=490;SC=CAGGAAAACCATAATAGTATG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=64532115;WS=64532097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	64537295	rs1255965	T	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=589;SC=AAAAATTATGTCTACTTCAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=64537303;WS=64537285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	64537657	rs1255964	G	A	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=954;SC=TATTAAGGACGTGTGCTTGAC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=64537665;WS=64537647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	64542872	rs1255960	G	A	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=352;SC=ATGACTATCAGGAGGAAAATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=64542880;WS=64542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	64551688	rs1255953	C	T	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=29;PP=1243;SC=CTTACAGACACGTGGGCTCCT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=64551696;WS=64551678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	64564527	rs8007972	C	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=411;SC=GGAGCTATACCGTACCAGAGA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=64564535;WS=64564517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	64565582	rs9323444	T	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=400;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TAGAACCAGATCTCTAAAAGA;SOR=1.017;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=28;WE=64565590;WS=64565572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr14	64604595	rs12881815	G	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GAGCTGTCCTGAATTAGAGGG;SOR=1.084;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=69;WE=64604603;WS=64604585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,75:0.43:174
chr14	64655161	rs1255986	C	T	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=676;SC=AGGTTGAGTGCGGAGAGCTAC;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=64655169;WS=64655151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	64656855	rs2256191	T	C	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=67;PP=2916;SC=GGGTGACCAGTTGATCAAGGC;SOR=0.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=64656863;WS=64656845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr14	64657684	rs1255988	C	A	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=59;PP=2193;SC=TACAGCGAACCGTCACTTGGC;SOR=1.104;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=98;WE=64657692;WS=64657674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	64669514	rs189611387	T	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=19;PP=1142;ReadPosRankSum=0.596;SC=TGCAAATATGTGTAGGGTGAA;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=66;WE=64669522;WS=64669504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,73:0.48:151
chr14	64674981	rs1152595	T	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=547;SC=GCTGTGGGCATCCACACTGCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=64674989;WS=64674971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	64676098	rs1152592	A	G	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=38;PP=2022;SC=GTGCAAAAGCACAGGCTTGGA;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=64676106;WS=64676088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	64680848	rs1152591	A	G	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=7;PP=1269;SC=CAGACTTCTCATGCTCTTCTA;SOR=3.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=59;WE=64680856;WS=64680838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	64681193	rs1152590	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=609;SC=TGTCAGGTAACAGCTGGGTTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=64681201;WS=64681183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	64686125	rs35648226	G	T	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=82;PP=2406;SC=TGAAGAGACTGCAGGTGAGTT;SOR=1.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=117;WE=64686133;WS=64686115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	64686207	rs915057	A	G	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=33;PP=931;SC=AGCAGATCCCATGTATTCGTG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=64686215;WS=64686197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	64687258	rs149978500	A	T	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.684;SC=ACAGAGCTCCAAAGTAGACTC;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=81;TCR=90;TR=86;WE=64687266;WS=64687248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,96:0.48:199
chr14	64688175	rs1152588	G	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=1021;SC=CTCGTATTCAGTGGGTAAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=64688183;WS=64688165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	64694195	rs928554	C	T	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=56;PP=2965;SC=CAGAGGGAAACTGAAGTGAAA;SOR=1.389;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=110;TCR=56;TR=166;WE=64694203;WS=64694185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr14	64699816	rs4986938	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=649;SC=ACGCTTCAGCCTGTGACCTCT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=64699824;WS=64699806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	64727458	rs78851986	T	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CATCTCTCTCTCCGGGAGCCT;SOR=1.186;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=17;WE=64727466;WS=64727448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr14	64746933	rs34967796	G	GA	1155.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.327;NF=3;NR=27;PP=627;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GGCTTTCTAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=30;WE=64746941;WS=64746923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr14	64814311	rs1256112	C	T	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=21;PP=718;SC=ACTGAGCTGTCTCTGAAGTTT;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=38;WE=64814319;WS=64814301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	64855041	rs1076991	T	C	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=37;PP=1274;SC=TGTGATCCCCTGGCCAGTCCC;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=64855049;WS=64855031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	64882380	rs1950902	A	G	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=52;PP=2603;SC=AATGCTGGGAAACTTGCTAGA;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=64882388;WS=64882370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	64902493	rs3818240	T	C	4126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=106;PP=2670;ReadPosRankSum=1.093;SC=TCCATGTTGGTATTTTACCAG;SOR=0.629;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=314;TCF=110;TCR=204;TR=167;WE=64902501;WS=64902483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,187:0.53:354
chr14	64905976	rs45618332	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=-1.214;SC=TCTCATACGACTGATACTGCC;SOR=0.826;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=22;WE=64905984;WS=64905966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr14	64908845	rs2236225	G	A	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=1967;ReadPosRankSum=0.739;SC=ATTGCAGACCGGATCGCACTC;SOR=0.558;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=262;TCF=143;TCR=119;TR=114;WE=64908853;WS=64908835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,133:0.45:295
chr14	64909151	rs2236224	G	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=628;ReadPosRankSum=1.996;SC=TCTGATTATCGGCAGTGTGCT;SOR=0.513;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=32;WE=64909159;WS=64909141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr14	64911627	rs1256143	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=352;SC=AGGGAAGATGTACCTCACAAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=64911635;WS=64911617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	64916242	.	C	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=576;ReadPosRankSum=0.313;SC=GAAGTGCACTCACTGGGCAGA;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=37;WE=64916250;WS=64916232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr14	64926433	rs75480958	GTGCT	G	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.78;NF=5;NR=1;PP=257;SC=AAACATTTCAGTGCTTGCTTA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=64926444;WS=64926423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	64935411	rs2230491	C	T	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CAGCAAAAGCCATTGGAGGGT;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=190;TCF=98;TCR=92;TR=85;WE=64935419;WS=64935401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,105:0.45:234
chr14	64935720	rs1256149	C	T	6668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=120;PP=2965;SC=AGCAATAGCACAACTTCTGGA;SOR=0.960;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=92;TCR=120;TR=212;WE=64935728;WS=64935710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr14	64947181	rs8003790	C	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=437;ReadPosRankSum=1.338;SC=AGATTATGGTCGGTAAGAATT;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=33;WE=64947189;WS=64947171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr14	64953580	rs10132969	T	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=676;ReadPosRankSum=1.285;SC=ATTTATGAATTAAAAATGCCA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=64953599;WS=64953570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	64953591	rs10143839	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=676;ReadPosRankSum=0.569;SC=AAAAATGCCACGCAAATTTTC;SOR=2.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=17;WE=64953599;WS=64953570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr14	64988114	rs10624421	C	CAA	1210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=1356;SC=ATTGTAATAGCAGTCATGCAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=26;WE=64988122;WS=64988104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	64988279	rs28626711	A	G	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1653;ReadPosRankSum=1.745;SC=ACCAAAGAGAATGGGGTTTTC;SOR=0.764;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=104;WE=64988287;WS=64988269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,135:0.49:276
chr14	64988924	rs10133411	T	C	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=906;ReadPosRankSum=-0.612;SC=TAGATGAGCATGTGCTAACCT;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=69;WE=64988932;WS=64988914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr14	65008251	rs1063391	C	T	11746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.02;NF=183;NR=154;PP=2965;SC=CGGCCGGCGACACCCACCTGG;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=337;TCF=183;TCR=154;TR=337;WE=65008259;WS=65008241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,433:1.00:433
chr14	65009534	rs35270454	C	CT	479.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.492;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr14	65016702	rs7156953	T	G	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=64;PP=2965;SC=CCGTATGGCTTCCAGGGCGAG;SOR=1.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=157;WE=65016710;WS=65016692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr14	65028728	rs2038271	C	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=-1.970;SC=ATATGAATTTCTTTCCTGTTT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=65028736;WS=65028718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	65031534	rs6573560	C	T	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TTTGCAGAAACTGATGGTCCA;SOR=0.590;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=94;WE=65031542;WS=65031524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,118:0.46:259
chr14	65031572	rs4902293	A	G	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=56;PP=1318;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TAACTTCCCAATCATGCCAGA;SOR=0.862;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=93;WE=65031580;WS=65031562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,116:0.46:252
chr14	65032226	rs8007313	C	T	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=56;PP=2202;SC=CATACATACACATATCCATAC;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=101;WE=65032234;WS=65032216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	65068221	rs11158545	C	A	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=88;PP=2965;SC=TTCGAATCCACCATTTCTGCG;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=71;TCR=89;TR=159;WE=65068229;WS=65068211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr14	65068330	rs372346293	CTG	C	1903.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.796;NF=5;NR=20;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CAATTCCTATCTGTCAGTTCC;SOR=0.873;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=25;WE=65068354;WS=65068320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,53:0.35:151
chr14	65068333	.	T	C	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=6.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-4.104;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,53:0.36:149
chr14	65068336	rs369006858	G	A	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-4.141;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,53:0.36:149
chr14	65068341	rs377267839	TTCTC	T	1999.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.021;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.130;NF=4;NR=20;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TGTCAGTTCCTTCTCGGCATT;SOR=0.886;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=24;WE=65068354;WS=65068320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,54:0.35:153
chr14	65068346	.	G	A	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-5.222;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,53:0.36:149
chr14	65209802	rs41309246	G	A	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1497;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TCACCACAGCGTTTCTTCTTC;SOR=0.505;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=207;TCF=120;TCR=87;TR=101;WE=65209810;WS=65209792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,127:0.49:258
chr14	65230317	rs94789	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=0.995;SC=TTTATAAGAGCGCGGAGACTC;SOR=0.892;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=11;WE=65230325;WS=65230307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr14	65230358	rs94788	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=393;ReadPosRankSum=0.825;SC=TCTCAAATCACGCAGGAAGTT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=26;WE=65230366;WS=65230348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr14	65233900	rs60545775	G	A	2267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=31;PP=1487;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CCTTCCTGACGAGGGTGCCCA;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=121;TCR=58;TR=93;WE=65233908;WS=65233890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,104:0.52:199
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chr14	65241228	rs229592	A	G	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.184;SC=TCAGCATCACAATGGCGCCCT;SOR=0.707;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=191;TCF=100;TCR=91;TR=77;WE=65241236;WS=65241218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,104:0.40:263
chr14	65242044	rs184528	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=1017;ReadPosRankSum=0.770;SC=CGATCTCCGCCGCCTCCACCA;SOR=0.686;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=64;WE=65242052;WS=65242034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr14	65245863	rs1741489	C	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-2.161;SC=GGTGAGGTGACGCAGGACTCA;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=22;WE=65245871;WS=65245853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr14	65245956	rs1741488	C	T	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr14	65245962	rs1741487	A	G	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr14	65246006	rs1741486	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=581;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TGACAATCACGGCCAACCTTT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=38;WE=65246014;WS=65245996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr14	65246040	rs2357726	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=368;ReadPosRankSum=1.216;SC=CATGGGCGGCGCAGAGCTTTG;SOR=1.357;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=23;WE=65246048;WS=65246030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr14	65246350	rs1741485	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCAGTCATCTACTGCCAAAAA;SOR=0.473;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=65246358;WS=65246345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	65246623	rs1626923	T	C	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GCTCCTCTTTTCGCACATTCA;SOR=0.672;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=144;TCF=54;TCR=90;TR=83;WE=65246631;WS=65246613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,100:0.53:189
chr14	65250939	rs229634	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=266;ReadPosRankSum=1.231;SC=CAGAGCACCCACCCGCCGCCC;SOR=0.283;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=19;WE=65250947;WS=65250929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr14	65253232	rs77806	T	C	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=634;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CCCAGGGCATTCCAGCCAGTA;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=37;WE=65253240;WS=65253222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr14	65259581	rs118108317	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=0.698;SC=CTAATGCCAGGACTTTGCAAC;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=65259589;WS=65259577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	65260227	rs229591	T	G	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=1136;ReadPosRankSum=0.389;SC=ACACCTCCTTTATGCGGGCCT;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=192;TCF=84;TCR=108;TR=75;WE=65260235;WS=65260217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,84:0.34:245
chr14	65263300	rs229587	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=695;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CTGGTTTTCACTGAGCCAGGT;SOR=0.433;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=40;WE=65263308;WS=65263290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,49:0.42:117
chr14	65267469	rs230703	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=326;ReadPosRankSum=1.195;SC=CAAAACAGCTTGTACCTTGCC;SOR=0.275;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=20;WE=65267477;WS=65267459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr14	65268167	rs230704	C	T	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=857;ReadPosRankSum=2.214;SC=AGCATCCCCACCAGGAGGGCA;SOR=0.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=54;WE=65268175;WS=65268157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,64:0.52:123
chr14	65268605	rs2273475	A	G	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1288;ReadPosRankSum=0.151;SC=TGTAGTCCCAAACAAGTGTAC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=75;WE=65268613;WS=65268595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,90:0.50:180
chr14	65269174	rs45607231	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.280;NF=3;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TATAAATGGCGCTTGGGTTGG;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=12;WE=65269182;WS=65269164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	65270272	rs17767579	C	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=250;ReadPosRankSum=-1.599;SC=GATTCTAAGGCCCTGGGCAGC;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=16;WE=65270280;WS=65270262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr14	65271634	rs1353857	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=481;ReadPosRankSum=0.413;SC=CAGCAGCCCCGGGGCCCACAG;SOR=0.423;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=27;WE=65271642;WS=65271624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr14	65271650	rs229581	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=629;ReadPosRankSum=2.454;SC=CACAGAAGGGACTTTACCAGC;SOR=0.754;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=38;WE=65271659;WS=65271640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr14	65289966	rs1695751	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=191;ReadPosRankSum=0.574;SC=ATCCTGACAGAAGCAGAACGC;SOR=0.385;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=9;WE=65289986;WS=65289956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr14	65381022	rs72726294	C	T	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=755;ReadPosRankSum=0.285;SC=CACCCTTTGCCCACGCACGGT;SOR=1.169;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=38;WE=65381030;WS=65381012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
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chr14	65410001	rs17880939	T	C	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.454;SC=TTCTTCTCTTTGTTGCTTTCC;SOR=0.688;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=211;TCF=120;TCR=91;TR=99;WE=65410009;WS=65409991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,117:0.46:252
chr14	65410200	rs3831077	CT	C	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.808;NF=0;NR=15;PP=553;ReadPosRankSum=0.081;SC=ACTGTACCATCTCCTATATTA;SOR=0.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=65410208;WS=65410190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr14	65414976	rs11540871	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGTCATCACACGAGAGGACAG;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=65414984;WS=65414974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr14	65415366	rs1886506	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.051;NF=13;NR=14;PP=451;ReadPosRankSum=0.074;SC=GAGCGGGCGCCTGGTCACCAG;SOR=0.555;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=27;WE=65415374;WS=65415356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr14	65415472	rs141876654	TGAAA	T	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.196;NF=2;NR=14;PP=634;ReadPosRankSum=0.493;SC=AGGACATTTCTGAAAGAGAGT;SOR=0.660;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=16;WE=65415483;WS=65415462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr14	65418475	rs17752452	G	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=293;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GAAAAACTGGGGAGCTAAAGG;SOR=1.295;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=20;WE=65418483;WS=65418465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr14	65419293	rs45454295	A	G	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=60;NR=51;PP=2216;SC=TCAACACCTGAAGAAAGGAAG;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=111;WE=65419301;WS=65419283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr14	65419473	rs59000318	C	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.942;SC=TTGAAAGGGGCTTTCCTCCCT;SOR=0.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=65419481;WS=65419463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	65453493	rs3215788	TG	T	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=391;SC=CTCTGCCCAATGGGGGGCGGC;SOR=2.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=13;WE=65453501;WS=65453492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	65470831	rs12587546	A	G	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=20;PP=1238;SC=TGCAGAACCCATCTTACAGTA;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=65470839;WS=65470821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	65544367	rs762810	C	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=844;SC=AGCACCTGAGCCCCAAGAAGG;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=65544375;WS=65544357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	65550816	rs7159443	T	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=10;PP=489;SC=ATTACCAGGGTAAGGCAGAGC;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=65550824;WS=65550806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	65568215	rs2781373	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=31;NR=18;PP=976;SC=CCCCAAAAAGGAATAGAACTG;SOR=0.960;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=49;WE=65568223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	65801811	rs12881755	A	G	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=44;PP=1222;SC=AATGTAGGTAAGAAAGGTGCT;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=65801819;WS=65801801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	65878807	rs1953416	C	T	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CTGTCGCAGCCGCGGGTCGGG;SOR=0.828;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=80;WE=65878815;WS=65878797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,96:0.48:202
chr14	65878909	rs1953417	C	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.380;SC=AGTAGGGCTTCGCTGAGTCTC;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=81;WE=65878917;WS=65878899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr14	66028446	rs2229677	A	G	5964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=104;PP=2965;SC=GCTTAAAACAACAGAATGAAG;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=84;TCR=104;TR=187;WE=66028454;WS=66028436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr14	66028505	rs3825639	T	C	4058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=85;PP=2382;SC=AAATACTGAATGAAGAATGAT;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=133;WE=66028513;WS=66028495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr14	66082573	rs8012278	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ATTTGGTACTACTTTTGTGCT;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=19;WE=66082581;WS=66082563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr14	66200177	rs3742597	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=502;ReadPosRankSum=1.629;SC=TTGTGTGTCTATGTGTTGTTA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=26;WE=66200185;WS=66200167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr14	66209190	rs1054218	C	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=1.659;SC=CAAACCATTTCAGCCAAACTG;SOR=0.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=20;WE=66209198;WS=66209180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
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chr14	66974474	rs928553	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=0.063;SC=CGGCCGGCCATTCCCGAGGGT;SOR=0.815;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=24;WE=66974482;WS=66974464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
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chr14	67243035	rs76056267	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=0.113;SC=ATGGAAAATATATGCACAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=14;WE=67243043;WS=67243025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr14	67291114	rs111931613	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=552;ReadPosRankSum=0.205;SC=CGTTGAATACAAAGTGTCCTA;SOR=0.486;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=42;WE=67291122;WS=67291104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr14	67291154	rs3784074	A	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=867;ReadPosRankSum=0.558;SC=AAGCAGGCAAATTTTTCTGCA;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=49;WE=67291162;WS=67291144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,67:0.41:162
chr14	67452473	rs201927021	A	AT	1054.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=579;ReadPosRankSum=2.282;SC=TGTTTCTAACATTTTTTGGCA;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=23;WE=67452481;WS=67452463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr14	67462820	rs188531686	T	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1132;ReadPosRankSum=1.110;SC=TGGAGCCATCTAAACCCTCTG;SOR=0.566;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=69;WE=67462828;WS=67462810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr14	67463012	rs7142068	C	T	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=810;ReadPosRankSum=0.773;SC=ATTTTCCTTTCGCCTTAATTT;SOR=0.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=48;WE=67463020;WS=67463002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr14	67490316	rs17103837	A	G	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1018;ReadPosRankSum=1.233;SC=CATGCTATAAACCCTAAATTA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=74;WE=67490324;WS=67490306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,89:0.46:194
chr14	67555835	.	TTTTTTTC	T	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=13.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.062;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.244;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	67567542	rs41285532	T	C	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=742;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TCCATACTGATGTTTGTTCTT;SOR=0.824;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=55;WE=67567550;WS=67567532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr14	67578727	rs41301475	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=347;ReadPosRankSum=-2.234;SC=ATCTGCAGCCATGTCAGTTAG;SOR=0.458;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=21;WE=67578735;WS=67578717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr14	67588868	rs41285474	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AGATACCATTGTAGGTGCTAG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=14;WE=67588876;WS=67588858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	67626314	rs147631769	CA	C	421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.399;NF=0;NR=19;PP=266;ReadPosRankSum=-1.532;SC=TTAACTATTCCAAAAAAAAAG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=19;WE=67626322;WS=67626304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr14	67646281	rs56264248	A	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=285;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TTTCTTTTCTACTTTATTCTG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=18;WE=67646289;WS=67646271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr14	67647470	rs41301469	C	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AAGGGCCCAACTGTATACGCC;SOR=0.576;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=14;WE=67647478;WS=67647460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	67671293	rs17836680	T	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=468;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CTGTGCATGATGCGGAGAACA;SOR=1.468;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=30;WE=67671301;WS=67671283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr14	67675224	rs10150082	A	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=733;ReadPosRankSum=1.978;SC=TAATAAAGAAATATGTGCTTT;SOR=1.044;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=40;WE=67675232;WS=67675214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr14	67691259	rs138146200	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTACAGACATGAGCCACTGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=67691267;WS=67691249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	67759205	rs117059441	G	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-1.691;SC=TTAATTTTTGGATACCTTTTC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=67759213;WS=67759195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	67807242	rs33973037	TA	T	2687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=82;PP=1473;SC=ATGACTAGAATAAAAAAAAAA;SOR=3.303;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=98;TCF=10;TCR=88;TR=87;WE=67807250;WS=67807231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	67809990	rs150124913	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=1.094;SC=CATCTTATTCATCTTTCAGTC;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=15;WE=67809998;WS=67809980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr14	67810033	rs2319777	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=260;ReadPosRankSum=1.984;SC=AGCAGTTTCACGACAAGTGGA;SOR=0.957;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=22;WE=67810041;WS=67810023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr14	67814219	rs72717396	C	T	60.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=-1.068;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	67814219	.	CT	TT	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000,0.5006;HP=15;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=54.84;NF=0,4;NR=3,4;PP=27,79;QD=10.3333333333;SC=TAAGTTCTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3,8;WE=67814227;WS=67814209;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	67814219	.	CT	CTT	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000,0.5006;HP=15;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=54.84;NF=0,4;NR=3,4;PP=27,79;QD=10.3333333333;SC=TAAGTTCTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3,8;WE=67814227;WS=67814209;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	67819567	rs10718799	CA	C	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.30;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	67847511	rs10132093	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=0.179;SC=GATTTTTACAGTATTTTGCAT;SOR=0.928;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=23;WE=67847519;WS=67847501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
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chr14	67850186	rs183335075	G	A	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=66;PP=1548;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CCAATTTAAGGAACACAGAGC;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=99;TCR=144;TR=111;WE=67850194;WS=67850176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,130:0.45:290
chr14	67857358	rs144802923	T	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr14	67862397	rs117607358	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CTAGGTGACAGTGACTGCCAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=67862405;WS=67862387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	67878717	rs12888674	A	G	5314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=80;PP=2965;SC=AATGTCCCGAAGCTCGACGCG;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=82;TCR=80;TR=161;WE=67878725;WS=67878707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	67912792	rs3742855	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=566;ReadPosRankSum=0.604;SC=GAATATACAAACTCTCCCAGC;SOR=0.396;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=36;WE=67912800;WS=67912782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr14	68022410	rs3742868	C	T	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=14;PP=1273;SC=CTGACACTCTCGAGCCACTTG;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=68022418;WS=68022400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	68028815	rs76630747	CG	C	2937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=36;PP=2032;SC=GGCTGAGCTACGGGAGCTCTC;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=50;WE=68028823;WS=68028805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	68038697	rs2236234	C	G	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=24;PP=978;SC=TGAACATGGGCGTCCCCACTT;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=68038705;WS=68038687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	68038729	rs2236233	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=20;PP=828;SC=GTGACCCCCCAGCAGCTCCAC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=68038737;WS=68038719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	68038779	rs2236232	T	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=22;PP=1466;SC=GGTGGTCAAGTCTCAGCAGCT;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=68038787;WS=68038769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	68039027	rs2236231	A	G	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=49;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GCAGGGTGGAAGCAGAATGCA;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=66;WE=68039035;WS=68039017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr14	68041124	rs1555400	G	C	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=44;PP=1271;SC=GACCAAGGTAGAGGGTGGGGC;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=68041132;WS=68041114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	68042255	rs4902490	A	G	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=25;PP=901;SC=CTGCCACTCTATGTCCTGATG;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=46;WE=68042263;WS=68042245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	68042496	rs4902491	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=594;SC=AGACTCCCTCATCCCCCACTG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=68042504;WS=68042486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	68042574	rs11158685	A	G	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=44;PP=2318;SC=CGGGATGCGCACATAGAGGAA;SOR=1.339;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=128;WE=68042582;WS=68042564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	68044005	rs4902492	C	T	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=46;PP=1846;SC=TCTCTGGTTCCGTGCTTTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=68044013;WS=68043995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	68045840	rs10635755	C	CTTCT	7442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=66;PP=2918;SC=TCCCCTCTTCCGTCTTTTTAG;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=96;WE=68045848;WS=68045830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr14	68045935	rs6573781	G	A	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=58;PP=1656;SC=CCAGGCCATCGCGCATGGAAG;SOR=2.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=70;WE=68045943;WS=68045925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	68046556	rs199794557	G	C	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=51;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GATCCCTCGGGCAGGGACCTG;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=151;TCF=52;TCR=99;TR=79;WE=68046564;WS=68046546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr14	68046602	rs6573782	C	T	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=63;PP=1783;SC=AGGTGACAGCCTCCCACTAAG;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=70;WE=68046610;WS=68046592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	68053149	rs749271	A	G	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1433;SC=AGCAGTCCTCAAGGCAGGGCA;SOR=1.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=68053157;WS=68053139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	68053977	rs6573783	A	C	4766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=70;PP=2859;SC=CGATTCCCCAACACCACTAGT;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=143;WE=68053985;WS=68053967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr14	68066979	rs7154825	C	T	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=62;PP=1868;SC=CCGGCCCTGGCCGTCTCGCCC;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=90;WE=68066987;WS=68066969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	68087820	rs3742878	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=0.210;SC=TTTGGATTCCGTCTGCGGCTT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=68087828;WS=68087810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	68113293	rs742869	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=439;ReadPosRankSum=-1.766;SC=ACCCACGGACGCACATGATAA;SOR=0.795;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=31;WE=68113301;WS=68113283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr14	68123366	rs3742880	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=406;ReadPosRankSum=-0.159;SC=ATTGCCAGCATATTCCTCATC;SOR=0.258;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=23;WE=68123374;WS=68123356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr14	68126768	rs72723111	T	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.777;SC=ATATGCTCCATGAGGCAGGGA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=68126776;WS=68126758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr14	68159626	rs3742881	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=-0.367;SC=AGTAATAGGAGGGAATTGAAA;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=19;WE=68159634;WS=68159616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr14	68191109	rs148944474	GTTT	G	437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=1.344;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.976;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	68191368	rs61991867	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=425;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TCCCACTGGGGCCTCTGTCCA;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=22;WE=68191376;WS=68191358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr14	68192653	rs7156725	G	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=766;SC=CTATCAAAATGTTACCCCAAC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=68192661;WS=68192643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	68193731	rs17852293	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=288;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CTCCTGGAGCGGCTAAAGGTG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=17;WE=68193739;WS=68193721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr14	68196636	rs718212	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=420;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GGTGAAATCTCTTTCCCATTC;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=18;WE=68196644;WS=68196626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr14	68200383	rs61991869	C	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=-1.045;SC=CATTTAGAAACATTCTGAGAA;SOR=0.535;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=19;WE=68200391;WS=68200373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr14	68219200	rs34373049	C	T	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=38;PP=1553;SC=CACCAACTGGCGGGCAGCTCT;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=68219208;WS=68219190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	68234539	rs3742883	T	C	7075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=130;PP=2965;SC=AGGGCTTTCATTCTTGGAGCT;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=78;TCR=130;TR=208;WE=68234547;WS=68234529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr14	68236522	rs2295111	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=131;ReadPosRankSum=0.512;SC=TTTATACATGGTATTAACTAC;SOR=0.397;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=14;WE=68236530;WS=68236512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr14	68242898	rs12886915	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=0.050;SC=TTCTCACTGGGAAGGGGAAGG;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=12;WE=68242906;WS=68242888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr14	68246855	rs2295106	T	A	1100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=791;ReadPosRankSum=1.796;SC=GTTATTTTTTTAAAAAGTGAA;SOR=1.009;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=48;WE=68246863;WS=68246845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr14	68246876	rs2295107	C	T	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=793;ReadPosRankSum=0.852;SC=CATTGATATGCAGAAAGGGGC;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=52;WE=68246884;WS=68246866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr14	68248281	rs2235962	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=339;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AGGCAGCAAGCGTGGGACCAG;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=22;WE=68248289;WS=68248271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr14	68249499	rs2235967	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CTGCTCACCACATGCCACAGC;SOR=0.556;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=145;TCF=86;TCR=59;TR=73;WE=68249507;WS=68249489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,83:0.49:171
chr14	68252979	.	C	CA	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=4.512;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.070;NF=1;NR=21;PP=304;ReadPosRankSum=0.749;SC=AGAGGGAATGCAAAAAAAAAA;SOR=2.925;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=22;WE=68252987;WS=68252969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr14	68257485	rs7143196	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=603;ReadPosRankSum=1.001;SC=TGAACGTGAACAGCACCTGTC;SOR=0.886;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=38;WE=68257493;WS=68257475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr14	68264867	rs12891164	A	G	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=-0.940;NF=44;NR=31;PP=1210;ReadPosRankSum=1.112;SC=GCTTCTCAGGAGGGCTGCGGC;SOR=0.934;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=75;WE=68264875;WS=68264857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,86:0.48:181
chr14	68265484	rs7160083	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=1.541;SC=TGAGGTTACAGTGAGAAGAAT;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=6;WE=68265492;WS=68265474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	68273430	rs181576	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=-1.727;SC=GAAACCAAGAACTCTTCTTTT;SOR=1.589;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=19;WE=68273438;WS=68273420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr14	68274020	rs181572	C	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=0.201;SC=ATTAGATGTCCTGAGCCACAC;SOR=1.730;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=16;WE=68274028;WS=68274010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	68280848	rs181563	A	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TTTGTCATCCAAGACAGATTT;SOR=1.151;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=14;WE=68280856;WS=68280838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	68290372	rs17783124	T	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=702;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTTTTATTGATAAGTTTTATG;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=38;WE=68290380;WS=68290362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr14	68290426	rs28604984	T	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=271;ReadPosRankSum=0.156;SC=ACTTGAAATATGAAAATGTAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=68290434;WS=68290416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr14	68290464	rs28623567	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AAATGATGGTGCTTTTCCATA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=68290472;WS=68290454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr14	68301767	rs34564590	G	GA	1052.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.841;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=609;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TATAGAGGTTGAAAAAAAACT;SOR=1.885;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=33;WE=68301775;WS=68301757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr14	68331437	rs961700	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-0.981;SC=TTCTCAACTAGAAGTTTCTCA;SOR=0.985;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=18;WE=68331445;WS=68331427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	68331675	rs1474939	A	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=-1.305;SC=TTTATCTAAAAAACTTTTTTT;SOR=1.708;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=20;WE=68331683;WS=68331665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr14	68773296	rs3837659	AC	A	7084.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=67;PP=2951;SC=ATATCTTTTGACCAATTTGCA;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=89;WE=68773306;WS=68773286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	68773298	rs60593979	C	G	7093.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=67;PP=2744;SC=ATCTTTTGACCAATTTGCATT;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=133;WE=68773306;WS=68773286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	68773353	rs2180770	G	A	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=66;PP=2190;SC=TGATCCTCTGGCCTAATAAAC;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=37;TCR=66;TR=103;WE=68773361;WS=68773343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	68773469	rs3784104	A	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=569;SC=ATGAACTTGCATGGCCGAAGT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=68773477;WS=68773459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	68878038	rs10146321	A	G	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=119;SC=CTGAGCCTCCAAGTACTCTCT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=68878046;WS=68878028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	68878369	rs10146772	C	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=441;SC=CTATTAGGGCCTAAAGAAACC;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=68878377;WS=68878359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	68934690	rs2074562	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5340;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGGAATAAGCATACAGCCTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=68934698;WS=68934687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	68935789	rs2525505	T	C	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.784;SC=GCTCAGGATATACATCTGTCC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=63;WE=68935797;WS=68935779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr14	68963746	rs765899	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CCCATAACTTCAATAAACAAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=68963754;WS=68963736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr14	69012355	rs2525529	C	G	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=83;PP=2953;SC=AGAACGGGGACAGGGCATGCC;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=138;WE=69012363;WS=69012345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr14	69117387	rs8021657	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=17;PP=1251;SC=CAAAACAACTAGTTTCTCAGA;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=69117395;WS=69117377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	69117512	rs8023214	T	C	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=49;PP=1408;SC=TTGGCACATTTGCATATCTGG;SOR=1.218;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=69117520;WS=69117502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	69257858	rs36045050	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-1.624;SC=AACTCTTTGCCCTAAGTTCCC;SOR=1.565;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=16;WE=69257866;WS=69257848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr14	69259502	rs11851414	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=0.041;SC=GCTGCACCACTTTCCCCATTG;SOR=0.057;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=69259510;WS=69259492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	69259533	rs3215689	T	TG	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.881;NF=7;NR=6;PP=379;ReadPosRankSum=-1.579;SC=CCCAAACTTTTGGGGGTTCTT;SOR=0.233;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=13;WE=69259541;WS=69259523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr14	69259662	rs1051533	C	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=375;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TCATCCTGTGCGTTCGCGCGA;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=25;WE=69259670;WS=69259652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr14	69262433	rs76356898	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.464;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr14	69262441	rs3742887	A	G	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	69263074	rs6573857	G	A	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=541;SC=TGGGCCGCAGGACCCCAGAAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=69263082;WS=69263064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	69328441	rs393673	A	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=23;PP=1704;SC=AGGGTCTCTCAGTTGTCTGGG;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=88;WE=69328449;WS=69328431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	69328594	rs412638	G	A	6436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=97;PP=2965;SC=TATGCCAACAGTAGCAATTAC;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=201;WE=69328602;WS=69328584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr14	69328613	rs440689	C	T	6343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=101;PP=2965;SC=ACAAAAATGACGTCATGATCA;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=103;TCR=101;TR=203;WE=69328621;WS=69328603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr14	69329116	rs424806	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CAAAAATAGGTTCTCTTATTG;SOR=0.250;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=69329124;WS=69329106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	69329149	rs1742501	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=551;SC=CAAAGGATCCCGAAGGCCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=69329157;WS=69329139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	69349528	rs56060157	A	G	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=977;ReadPosRankSum=-1.984;SC=ATCAATTAAAATGGACAAAAA;SOR=1.371;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=56;WE=69349536;WS=69349518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,64:0.72:89
chr14	69376658	rs743128	A	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=547;ReadPosRankSum=0.385;SC=AGCCCCTCAGACCCCAGCACT;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=35;WE=69376666;WS=69376648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr14	69392264	rs4899272	T	G	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CTGGGCCAGGTTCCGCCTCAC;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=92;TCR=77;TR=81;WE=69392272;WS=69392254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,91:0.47:192
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chr14	69445057	rs11620922	G	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
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chr14	69445646	rs4902685	A	G	161.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=119;SC=TGGGGGCTGCAGCGGGCGGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=69445654;WS=69445636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr14	69521637	rs145517654	C	T	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=47;PP=1725;ReadPosRankSum=0.282;SC=CTTCTGTCGGCGCCGCATGGC;SOR=0.748;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=100;WE=69521645;WS=69521627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,116:0.50:233
chr14	69695792	rs3742899	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=619;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CGGCAGAGGTGTGGTTTGTAT;SOR=0.409;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=20;TCR=61;TR=36;WE=69695800;WS=69695782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr14	69697453	rs1013762	C	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=0.999;SC=TGGTGATACTCCAGCTAACTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=69697461;WS=69697443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr14	69704553	rs8007859	G	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=536;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TGCCTACTCAGCGAAAGGAGG;SOR=0.996;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=34;WE=69704561;WS=69704543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr14	69704662	rs8008141	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=671;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CAAAGCACAGGAATTGTGGAA;SOR=0.438;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=41;WE=69704670;WS=69704652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr14	69787749	rs2274442	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=34;ReadPosRankSum=0.640;SC=CTGGTTTACCTGGCCTACTGA;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=6;WE=69787757;WS=69787739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr14	69791308	rs2045194	T	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=249;ReadPosRankSum=0.853;SC=CTTCTCTGCCTGGCAGAAGTA;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=16;WE=69791316;WS=69791298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr14	69795199	rs12879377	G	A	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=1091;ReadPosRankSum=0.912;SC=TGGGGCGGACGTGGCTGCAGC;SOR=0.657;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=65;WE=69795207;WS=69795189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,88:0.58:152
chr14	69799806	rs2274440	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=546;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CCTTAGGGTTCGACTGGAGCC;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=45;WE=69799814;WS=69799796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr14	69799892	rs1275677	A	G	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=50;PP=1493;SC=ATAAGGTCAGAGCTGCGGTGG;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=69799900;WS=69799882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	69813678	rs11625928	A	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=623;ReadPosRankSum=0.395;SC=CAGAGCTGATAGGATGCTGAC;SOR=1.123;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=39;WE=69813686;WS=69813668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr14	69818599	rs35286134	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=-1.147;SC=ACTGTAAGAACAAGGTCATGC;SOR=0.534;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=16;WE=69818607;WS=69818593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr14	69966850	rs4902723	G	A	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TCATCAAAGAGAGCTTTCTGC;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=68;WE=69966858;WS=69966840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr14	69967470	rs4902724	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=693;ReadPosRankSum=0.937;SC=CATGTCCTGGCCTGGGAGAGG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=40;WE=69967478;WS=69967460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr14	69988954	rs10146531	T	G	5435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=66;PP=2943;SC=GATCTCAGGGTTCCTTTGCTG;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=154;WE=69988962;WS=69988944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	69992873	rs8004574	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=651;SC=GACACCATTGACTTTGGGGTC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=69992881;WS=69992863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	69994473	rs1885400	C	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=25;PP=2041;SC=AGTCGGAACCCCACCCTTCCT;SOR=2.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=75;TCR=25;TR=100;WE=69994481;WS=69994463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	69995112	rs55727771	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GAGCCCCCTCGGCACTCTCCC;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=22;WE=69995120;WS=69995102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr14	70037611	rs7494244	A	T	3110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=67;PP=1951;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AAAACTATCAAAACTGGTGAG;SOR=0.811;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=228;TCF=110;TCR=118;TR=124;WE=70037619;WS=70037601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,143:0.53:268
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chr14	70263648	rs4646285	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=973;ReadPosRankSum=-0.103;SC=GCACAAAGGCCGTGAGGGGCA;SOR=0.548;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=61;WE=70263656;WS=70263638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
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chr14	70496867	rs227402	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
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chr14	70522484	rs1000521	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=1.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,82:0.52:157
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chr14	70530706	rs150956	C	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=294;SC=AGTCAGCCAGCAGACAAAAAC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=70530714;WS=70530696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	70634087	rs2114024	A	G	5726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=94;PP=2965;SC=GGTAGAAGGCACGGCTCTTCT;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=83;TCR=94;TR=177;WE=70634095;WS=70634077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr14	70634801	rs17765575	T	C	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1208;ReadPosRankSum=-1.389;SC=GTTTCTTAATTGTCACCTCCC;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=79;WE=70634809;WS=70634791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,92:0.59:157
chr14	70712880	rs2296918	A	C	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=4.155;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.96;MQRankSum=-1.811;QD=29.21;ReadPosRankSum=1.963;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr14	70713858	rs61979492	T	C	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=87;PP=2965;SC=TCTGTTAAGCTACATCTCATA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=160;WE=70713866;WS=70713848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr14	70713992	rs4902799	C	A	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=49;PP=1774;SC=AAAGCCCCCACAACAAGCACT;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=70714000;WS=70713982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	70714162	rs4899340	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.08;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	70714172	rs4899341	T	C	354.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.79;QD=39.42;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	70793004	rs4749	A	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	70795756	rs7157430	G	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	70795769	rs56128802	T	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.242;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	70795772	rs10648369	T	TAC	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	70924237	rs3751520	C	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQRankSum=-6.985;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,9:0.15:59
chr14	70924249	rs3751521	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=5.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-7.654;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.661;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,8:0.13:60
chr14	70924462	rs3751523	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;SC=AGAAGCTCTTAGTTTCTAGAC;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=70924470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	70924501	rs8010994	C	G	1069.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.370;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.88;MQRankSum=0.749;QD=32.42;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,30:0.91:33
chr14	70924501	.	CCGTGCA	GCGTGCA,GCGTGCC	342	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=44.95;NF=17,8;NR=15,7;PP=342,261;QD=11.7741003921;SC=ACACAGATGACCGTGCACTCC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=32,15;WE=70924515;WS=70924491;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.84:38
chr14	70924507	rs3751524	A	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.40;MQRankSum=-0.449;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr14	70924852	rs3829455	A	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.682;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.257;NF=15;NR=30;PP=609;ReadPosRankSum=-2.007;SC=TTCTGGAGCTAGTTGTTGTGG;SOR=1.413;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=45;WE=70924860;WS=70924842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,40:0.27:149
chr14	70925257	rs12436346	A	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.87;QD=32.08;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	70925818	rs2022624	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=22.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQRankSum=-9.355;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.997;SOR=2.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,36:0.22:165
chr14	70937494	rs8015742	T	G	4796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=76;PP=2965;SC=AGCCTCCAGGTGTTTGATTTC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=67;TCR=76;TR=143;WE=70937502;WS=70937484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr14	71108942	rs7154268	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.737;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr14	71109153	rs4902834	C	G	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1174;ReadPosRankSum=0.100;SC=GGACTCGCGCCCGGCCTCCCC;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=96;TCR=75;TR=83;WE=71109161;WS=71109143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
chr14	71109276	rs3742852	G	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.713;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,82:0.49:167
chr14	71197755	rs1476610	T	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=616;SC=TGACCTAGAATGCCATGATCC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=71197763;WS=71197745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	71201179	rs45600331	C	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=935;ReadPosRankSum=0.531;SC=GGGCACTGGACGACCACTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=28;WE=71201200;WS=71201169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr14	71201192	rs34322726	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=935;ReadPosRankSum=0.771;SC=CCACTGCTTATATCCATCTAC;SOR=0.677;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=26;WE=71201200;WS=71201169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr14	71202650	rs4141095	C	T	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=49;PP=2081;SC=ACCAGGACAGCTGGTGAAAGG;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=71202658;WS=71202640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr14	71208996	rs4899368	A	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=353;SC=TCAGTCCCGGACTCCCTCAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=71209004;WS=71208990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	71209025	rs4902843	C	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=295;ReadPosRankSum=1.805;SC=CACACGAGTTCTTTGCCCTGC;SOR=2.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=15;WE=71209033;WS=71209015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr14	71215729	rs10129495	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=500;ReadPosRankSum=-0.556;SC=AGTCTGAATAGAACATGTGAA;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=28;WE=71215737;WS=71215719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr14	71216863	rs10630067	C	CAT	3533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=41;PP=2349;SC=TGCAATAGCTCGAGTCTTTTC;SOR=1.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=46;WE=71216871;WS=71216853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	71227913	rs3814872	A	C	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=73;PP=1997;SC=GGCAAGGAAAAGAATACAGAA;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=46;TCR=73;TR=119;WE=71227921;WS=71227903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	71228000	rs11621281	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=0.539;SC=TCTCCTGTGGGCTCCAGCATT;SOR=2.093;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=11;WE=71228008;WS=71227990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	71444788	rs3814871	G	A	8766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=136;PP=2965;SC=GCCGGCATAGGGACTATGTTT;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=116;TCR=136;TR=252;WE=71444796;WS=71444778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr14	71445413	rs4391999	A	G	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=809;SC=CTGCTTTTTCATACTATTAAT;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=71445421;WS=71445403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	71455540	rs3829954	A	G	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=97;PP=2965;SC=TCTTTCCTATACATTTAAGCC;SOR=2.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=24;TCR=97;TR=121;WE=71455548;WS=71455530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	71462759	rs56021283	T	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=773;SC=TAGGAGCACTTTTTACATAGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=71462767;WS=71462749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	71485692	rs1859914	A	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=574;SC=CTTATACTTAAGATATACTTA;SOR=2.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=71485700;WS=71485682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	71500626	rs11461235	G	GT	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=3;PP=228;SC=TGTATTTTCTGTTTTTTTTTC;SOR=2.712;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=71500634;WS=71500616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	71513930	rs3217014	TG	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=415;SC=TGCAAGGCACTGTGAGATTAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=71513938;WS=71513920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	71568683	rs34093157	T	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=165;SC=CCTTTAAAAATTTATATATTA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=71568691;WS=71568673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	72040525	rs6574016	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=515;SC=TGGTATTCCAGTACTTTTTCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=72040533;WS=72040515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	72055468	rs1859643	A	C	6975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=95;PP=2965;SC=CTGGAGACTCATCTATTTTTC;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=111;TCR=95;TR=206;WE=72055476;WS=72055458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr14	72117156	rs8017465	T	C	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=49;PP=1732;SC=TTGAAGAATTTCTTCAACTAT;SOR=0.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=72117164;WS=72117146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	72169130	rs79937396	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=446;ReadPosRankSum=-2.145;SC=CCAGCCTCCATTGACAGGCAG;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=29;WE=72169138;WS=72169120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr14	72201985	rs2097887	C	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=925;ReadPosRankSum=-1.084;SC=TTTCTTCTCTCCTTTCCAGTC;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=68;WE=72201993;WS=72201975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,77:0.44:175
chr14	72457218	rs1476745	C	G	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=31;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CTGCTCACAGCTGCACAGGGA;SOR=0.467;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=183;TCF=128;TCR=55;TR=91;WE=72457226;WS=72457208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,101:0.50:201
chr14	72457682	rs7156200	A	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=366;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TGACAGGCCTAATCACTCACC;SOR=0.484;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=17;WE=72457690;WS=72457672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	72925171	rs2238186	G	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=0.256;SC=AAAACCTAGGGATATCTGAGG;SOR=0.409;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=21;WE=72925179;WS=72925161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr14	72932330	.	G	GTGGATGGA	978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.221;NF=6;NR=2;PP=714;ReadPosRankSum=-1.602;SC=GGGTGGATGGGTGGATGGATG;SOR=0.544;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=8;WE=72932338;WS=72932320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr14	72936954	rs8012037	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GGATAAGTTTTGTCTTCATAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=72936962;WS=72936944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	72939495	rs10131300	C	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=673;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TAGCCCCTAGCAACAGGAGCA;SOR=1.100;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=38;WE=72939503;WS=72939485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
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chr14	73220153	rs3742835	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TGACTAACCCCGTCATTCACA;SOR=1.115;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=22;WE=73220161;WS=73220143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr14	73220188	rs41314521	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-1.698;SC=AAGCCCAGAGAGAAGTGACTT;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=21;WE=73220196;WS=73220178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr14	73240486	rs8015749	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	73240509	rs12433339	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=-1.331;SC=TCAGAATTTCCTTCCTTTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=10;WE=73240517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr14	73358764	rs8006178	A	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.248;SC=TGGAGCGAGTAGGGGAACACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=73358772;WS=73358757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr14	73358945	rs11158986	A	C	4082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=68;PP=2545;SC=GGGGAAACTGAAAATCAGTTG;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=130;WE=73358953;WS=73358935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	73360819	rs5809598	T	TTGTC	16120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=167;PP=2965;SC=TAACAGAATATTGTCTCAGAG;SOR=1.104;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=216;TCF=21;TCR=195;TR=188;WE=73360827;WS=73360809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr14	73360949	rs2215901	A	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=678;SC=AGTTATTAGGAGAGCTGTCAA;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=73360957;WS=73360939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	73404680	rs3815500	A	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=877;ReadPosRankSum=2.347;SC=CTCTTTTAGGAACAGAAATGA;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=57;WE=73404688;WS=73404670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr14	73404795	rs2302587	G	A	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=678;ReadPosRankSum=0.063;SC=GTGCCGCTCTGGGGAGCCACT;SOR=0.683;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=45;WE=73404803;WS=73404785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr14	73404825	rs2302586	G	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=600;ReadPosRankSum=0.578;SC=TGTGCTTCTGGCATTGTACAC;SOR=0.650;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=34;WE=73404833;WS=73404815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr14	73406668	rs887936	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.801;SC=GGCTGAGACCCGTTCCTGGCT;SOR=2.459;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=17;WE=73406676;WS=73406658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	73408355	rs3742832	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=4;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=643;ReadPosRankSum=0.146;SC=TTTAGTGCCTGTTTCCTTCAT;SOR=0.089;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=11;WE=73408377;WS=73408348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr14	73408369	rs3832967	A	AT	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=635;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CCTTCATTACATCCTATGGAA;SOR=0.352;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=18;WE=73408377;WS=73408348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr14	73409613	rs2333012	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=8;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.861;SC=AGAGATGGGCGTCAGCGGGGC;SOR=0.115;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=51;WE=73409621;WS=73409603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,56:0.72:78
chr14	73409683	rs2240980	C	G	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.286;SC=ATCCATGCCCCCACCCTCTGT;SOR=0.905;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=206;TCF=123;TCR=83;TR=82;WE=73409691;WS=73409673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,96:0.40:239
chr14	73412739	rs2246976	C	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=59;PP=1438;ReadPosRankSum=-1.694;SC=CCGGAAGGTACGTTGCCCATC;SOR=0.952;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=61;TCR=95;TR=93;WE=73412747;WS=73412729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,111:0.58:192
chr14	73413965	rs2243443	G	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=4.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-1.187;SC=CTGGGTATCTGTGGGCTTCAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=73413973;WS=73413955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr14	73418732	rs3214336	GT	G	163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=121;SC=AGAAGCATGTGTTTTTTTTAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=73418740;WS=73418722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr14	73421284	rs57911111	A	C	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.149;NF=9;NR=36;PP=826;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GCCATCTAGTACTCTTTGACA;SOR=1.460;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=99;TCF=28;TCR=71;TR=45;WE=73421292;WS=73421274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
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chr14	73425315	rs7144193	C	T	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.558;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=833;ReadPosRankSum=0.043;SC=TCTCCTCTTTCCTAGTGGGCC;SOR=0.223;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=58;WE=73425323;WS=73425305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr14	73465027	.	C	CA	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=62.44;NF=0;NR=6;PP=81;QD=14.0;SC=TTGTTACCTGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=73465035;WS=73465017;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,6:0.60:10
chr14	73730290	rs177385	C	A	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=50;PP=2729;SC=GAACACACTGCTTAGGGTGGT;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=138;WE=73730298;WS=73730280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr14	73730639	.	C	T	147	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=57.77;NF=7;NR=3;PP=147;QD=18.1771212547;SC=CCCCCCTACCCCCTCTGACAG;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=10;WE=73730647;WS=73730629;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr14	73730695	rs1145948	A	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=3.978;NF=52;NR=27;PP=1545;ReadPosRankSum=1.359;SC=TGTGTGTGACAGCCCCCCGAC;SOR=1.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=79;WE=73730703;WS=73730685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr14	73957981	rs150704374	G	GC	6890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=106;PP=2936;SC=GGCGGTGGCGGCGTCCCGGAC;SOR=1.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=124;TCF=12;TCR=112;TR=118;WE=73957989;WS=73957971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	73989859	rs1074501	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=422;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CTGGTCATACCGCGTCCCAGC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=26;WE=73989867;WS=73989849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr14	74004595	rs72738342	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=59.96;MQRankSum=-1.769;NF=38;NR=40;PP=955;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GACTCACCTCCGCTAATTGTT;SOR=0.473;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=78;WE=74004603;WS=74004585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,107:0.47:230
chr14	74036216	rs56069624	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.308;NF=4;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CTAGCCCCGGAGCAGCCGGTC;SOR=0.186;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=20;WE=74036224;WS=74036206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr14	74060487	rs45522539	G	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=431;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTCCTTGCTGGCCATGGCTTT;SOR=0.868;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=26;WE=74060495;WS=74060477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr14	74061968	rs2010070	T	C	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.692;SC=TCGTGGACATTGTGGATATAA;SOR=0.607;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=143;TCF=74;TCR=69;TR=77;WE=74061976;WS=74061958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,91:0.52:174
chr14	74128945	rs45508195	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.108;SC=TTTTAAAGACATTTAAAAGCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=74128953;WS=74128935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	74156316	rs62004949	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=465;ReadPosRankSum=0.770;SC=AGAAAAAATACCTCTGATCTT;SOR=1.839;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=23;WE=74156324;WS=74156306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr14	74162452	rs11625036	G	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.484;SC=GGATGGTCTTGAACTCCTGAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=74162460;WS=74162449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	74192165	rs10136165	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CGCCCATGGTTTCTGCAGGCA;SOR=0.631;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=4;WE=74192173;WS=74192155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	74192994	rs2336074	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CAGAAAACAGACCTCAGGTCC;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=74193006;WS=74192984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	74193427	rs887508	A	G	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=41;PP=1400;SC=CCACAGGAGCATGAGGAGGGA;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=74193435;WS=74193417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	74196844	rs6574140	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=268;ReadPosRankSum=0.553;SC=AAAAGCCCTTTTTATCATCTC;SOR=0.454;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=18;WE=74196852;WS=74196834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr14	74203690	rs8007548	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=333;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TAGAAGGGGCGCCTCTCATAC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=16;WE=74203698;WS=74203680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr14	74206481	rs758774	T	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1007;ReadPosRankSum=1.744;SC=CAGGCCCATATACCACAGAGT;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=72;WE=74206489;WS=74206471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,78:0.40:196
chr14	74206855	rs17182544	C	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=0.341;SC=ACAGTGAGGTCGGACACTGGG;SOR=0.511;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=20;WE=74206863;WS=74206845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	74340797	rs11159042	A	T	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=55;PP=2578;SC=TCGTTGATGGAGGAGGTATTG;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=128;WE=74340805;WS=74340787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	74343981	rs45542836	T	A	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	74349227	rs8005140	G	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=473;SC=TTTTTGAGACGGAGTCTTGCT;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=74349235;WS=74349217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	74358703	rs140665239	CCT	C	2796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=16;PP=2256;SC=CTTAATGCCCCCTCTCTCTTT;SOR=1.965;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=49;WE=74358712;WS=74358693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	74371467	rs35370876	TA	T	577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=554;SC=GCTATAGTTTTAACAAAGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=74371475;WS=74371466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr14	74388908	rs1127392	T	C	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=30;PP=905;SC=GAGTTGATGATGGTAAGACTT;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=55;WE=74388916;WS=74388898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	74399212	rs6574155	C	T	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=62;PP=2136;SC=ACAGATACTTCTGAATTTTTC;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=104;WE=74399220;WS=74399202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	74399291	rs2336547	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=27;PP=846;SC=CTTGCTATCAGTCATCCTGTC;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=74399299;WS=74399281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	74404756	rs28927675	T	C	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=83;PP=2965;SC=AGACTTCTTTTTGTGTATCTC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=85;TCR=83;TR=168;WE=74404764;WS=74404746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	74409032	rs740506	G	A	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=763;SC=TGTATTTCAGGCCGCAGCCCT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=74409040;WS=74409022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	74413129	rs7146634	C	G	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=49;PP=1886;SC=GACACCATCTCCCTTTCTGCT;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=74413137;WS=74413119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	74413420	rs7148485	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=164;SC=TGGGGAGAATTTGGGGTCTGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=74413428;WS=74413410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	74416600	rs11621743	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=14;PP=1059;SC=GCCCCTGCTGTCTGTCTCCAA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=74416608;WS=74416590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	74424938	rs3180946	T	C	5425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=85;PP=2965;SC=CTTGGGTTCATATTACCCTAG;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=164;WE=74424946;WS=74424928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	74425056	rs3764859	C	A	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=47;PP=1458;SC=CTCTGGTTTTCGATTTAAGCT;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=58;WE=74425064;WS=74425046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	74428286	rs7141392	A	G	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=27;PP=1239;SC=AAGGATTCAGATACTATGGGG;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=63;WE=74428294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	74428445	rs8500	G	A	6729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=93;PP=2965;SC=TTCAGGTTCCGTGAGCCACCT;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=114;TCR=93;TR=207;WE=74428453;WS=74428435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr14	74433552	rs13743	A	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=211;SC=ATGTCCCCAGACTAGTTCAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=74433560;WS=74433542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	74433859	rs3742813	T	C	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=91;PP=2907;SC=TTTGCAGGCTTCCCACTACTC;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=48;TCR=91;TR=139;WE=74433867;WS=74433849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	74439495	rs11623794	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=576;SC=TAATCACCCCGACAAAGCACC;SOR=3.180;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=24;WE=74439503;WS=74439485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	74441537	rs2074933	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=18;PP=1240;SC=ATCTTTTCCTTCATAGAATGG;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=74441545;WS=74441527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	74441684	rs2074932	G	A	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=30;PP=1058;SC=CCAAATCCCAGGTAACTGTAA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=74441692;WS=74441674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	74449664	rs12431489	A	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=11;PP=797;SC=AAAAACTCATAAAGTATTCAT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=74449672;WS=74449654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	74454819	rs12434581	T	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=632;SC=TTTCCCAAGATGTGGCTGGGT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=74454827;WS=74454809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	74527203	rs8017248	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=672;ReadPosRankSum=1.704;SC=GAAACTTTGCGGGGGTTAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=74527211;WS=74527193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr14	74665543	rs10145171	G	A	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=9;PP=1104;SC=AAATCAATCTGCATTTTTAAA;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=74665551;WS=74665533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	74711883	rs35435463	C	T	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=45;PP=1826;SC=TCTTTACCTCCTACCAGCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=74711891;WS=74711873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	74726515	rs11383441	G	GC	1569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=1419;SC=TTGGGGTCCTGCCCTGCGGTG;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=34;WE=74726523;WS=74726505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	74753278	rs929449	T	C	11477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=172;PP=2965;SC=CCCTGGCCGCTGGCAGAGGAG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=336;TCF=164;TCR=172;TR=336;WE=74753286;WS=74753268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr14	74874540	rs11621669	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=604;ReadPosRankSum=-0.898;SC=CCTGGGCCCCAGGTGCTCTTA;SOR=0.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=35;WE=74874548;WS=74874530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr14	74874707	rs2884545	A	G	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.556;SC=AAAACAGTGGAGTTTGGTGAC;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=44;TCR=79;TR=62;WE=74874715;WS=74874697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr14	74876181	rs12590672	T	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CTGTGAAGCTTGTCTCACAGC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=65;WE=74876189;WS=74876171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr14	74876501	rs4026651	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GCAGTCCTCAGAGCCTGTCAG;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=15;WE=74876509;WS=74876491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr14	74969167	rs2286412	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=212;SC=TAGTTTATGACGGAGTTGTTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=74969175;WS=74969157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	74970448	rs5809669	G	GC	499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=409;SC=AGCCTGGAAGGCCCTCCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=11;WE=74970456;WS=74970438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	74973556	.	ATG	A	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.011;NF=0;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=-0.368;SC=AGGATAGAGGATGTGTGTGTG;SOR=0.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=20;WE=74973565;WS=74973546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr14	74973583	rs8020768	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.298;NF=2;NR=27;PP=558;ReadPosRankSum=1.333;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGCGCGT;SOR=0.527;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=29;WE=74973591;WS=74973573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr14	74973740	rs3815329	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=232;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GGCATCTTTCATAAGCTCTGC;SOR=1.151;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=21;WE=74973748;WS=74973730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr14	74991855	rs862031	A	G	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=764;ReadPosRankSum=0.214;SC=CCAGCACATCAGTGGAGGGGG;SOR=0.469;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=60;WE=74991863;WS=74991845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,68:0.44:156
chr14	75002775	rs4899522	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=501;ReadPosRankSum=0.118;SC=GCTGGGAAGCGGGTGCAGTCT;SOR=0.562;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=31;WE=75002783;WS=75002765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr14	75016482	rs2196861	T	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1127;SC=GCCTCTGACATCCTGGAGGGG;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=75016490;WS=75016472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	75017650	rs934999	G	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=16;PP=1299;SC=AAATGGGAGAGTCTGCAGACA;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=75017658;WS=75017640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	75019157	rs11622992	T	C	5439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=107;PP=2902;SC=GCTCTGTGGCTGGTGACCACC;SOR=1.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=66;TCR=107;TR=173;WE=75019165;WS=75019147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr14	75070493	rs3742793	G	C	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=72;PP=2258;SC=CCACCTTCTAGAGGCAGGGCC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=108;WE=75070501;WS=75070483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	75137664	rs2302832	T	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=-1.981;SC=ACTCTCCACATTCCCTCTATT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=27;WE=75137672;WS=75137654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr14	75151047	rs9671386	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGTTCCTGGAGGGAGTTGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=75151055;WS=75151037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	75182937	rs2287400	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-1.191;SC=CACCATAGCAGTGACCATGTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=75182945;WS=75182927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	75199555	.	TA	T	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.172;QD=0.91;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr14	75200697	rs3825708	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TTCTCAGACTGGTCAGTCGTT;SOR=0.565;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=74;WE=75200705;WS=75200687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,92:0.47:196
chr14	75230837	rs12885527	A	G	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=994;ReadPosRankSum=0.288;SC=CTTCCTCGCAATCCTATTTGA;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=72;WE=75230845;WS=75230827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,90:0.47:190
chr14	75231103	rs35864887	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CTTTCACCTAGAGGGCCCTGA;SOR=1.596;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=17;WE=75231111;WS=75231093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr14	75276079	rs957345	C	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=446;ReadPosRankSum=2.032;SC=ATTCTGTTCTCTAGCCTCCAG;SOR=0.968;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=27;WE=75276087;WS=75276069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr14	75278211	rs12588415	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=1.111;SC=AACATTTACTGTGTGGAGTAC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=75278219;WS=75278201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr14	75278302	rs8022046	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=409;ReadPosRankSum=0.250;SC=TTGCTGAAGCGCTTCCTATTA;SOR=0.349;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=30;WE=75278310;WS=75278292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr14	75279395	rs2302834	T	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=485;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GCCACCAGCCTCCTCCAGCTC;SOR=0.467;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=32;WE=75279403;WS=75279385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr14	75285108	rs189971138	A	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=0.637;SC=GAAAAGTTATATGAATAGTAT;SOR=0.140;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=23;WE=75285116;WS=75285098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr14	75287730	.	CTTTT	C	532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.789;NF=9;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TTAACTCAGTCTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=75287741;WS=75287720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr14	75321714	rs61978928	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-1.169;SC=AGTACCTGTTTTGATAGAGGA;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=75321722;WS=75321704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	75355767	rs57898381	TA	T	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=0.608;SC=GTTCGCCTGTTAAAAGGAGTT;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=75355775;WS=75355757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	75359670	rs2230237	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=957;ReadPosRankSum=1.654;SC=CGCCCTCACAGCCTCCTTCTG;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=70;WE=75359678;WS=75359660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,90:0.61:147
chr14	75360066	rs142872233	C	T	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1055;ReadPosRankSum=0.640;SC=GCAGTAAAACCCACTGTTGCC;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=62;WE=75360074;WS=75360056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr14	75361177	rs2070599	C	G	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=1099;ReadPosRankSum=1.471;SC=ACTTGCCCCACTCCTTATCTA;SOR=0.972;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=159;TCF=61;TCR=98;TR=73;WE=75361185;WS=75361167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,82:0.46:178
chr14	75366447	rs731952	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-1.611;SC=AGATACTATACTTGGGATGGG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=75366455;WS=75366437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	75367740	rs1799900	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=288;ReadPosRankSum=-0.446;SC=GGGTTGGCTTGATATTTCAAT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=17;WE=75367748;WS=75367730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	75367807	rs20578	C	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=822;ReadPosRankSum=-0.142;SC=ATATGGATGGCGGTACCTTCA;SOR=0.630;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=72;TCR=33;TR=57;WE=75367815;WS=75367797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,63:0.52:120
chr14	75373626	rs78810423	C	CTGAT	2024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=1684;ReadPosRankSum=0.191;SC=CCAAAGCCCGCTGATAGAGGG;SOR=0.328;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=31;WE=75373634;WS=75373616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr14	75378296	rs3081755	GTGTGTA	G	1943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=8;PP=2089;SC=ATGTGTGTTTGTGTGTATGTG;SOR=2.885;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=32;WE=75378309;WS=75378286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	75378331	rs759057	T	C	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=18;PP=1917;SC=TGTGTGTGTGTGCATGCATGT;SOR=2.448;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=80;WE=75378339;WS=75378321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	75386530	rs60425478	T	TGG	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.912;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr14	75386576	rs2286913	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=490;ReadPosRankSum=1.149;SC=ACTGCTCAGCGGCCGCTGCAG;SOR=0.658;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=35;WE=75386584;WS=75386566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr14	75388183	rs7156590	C	T	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=1332;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GGACCGTGCTCGTGAGCAAGG;SOR=0.649;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=193;TCF=70;TCR=123;TR=96;WE=75388191;WS=75388173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,110:0.48:231
chr14	75412908	rs8005277	A	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=23;PP=1367;SC=GGGACCCCGCACACTCACAGG;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=75412916;WS=75412898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	75415194	rs2159907	G	C	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=17;PP=1238;SC=CTACCCACCCGACCCCGGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=75415202;WS=75415184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	75416000	rs2268614	C	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=875;ReadPosRankSum=0.471;SC=ATCTTCTTCCCTCTCCAGGTA;SOR=0.647;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=113;TCF=68;TCR=45;TR=60;WE=75416008;WS=75415990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr14	75470446	rs175041	C	A	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=1115;SC=GTCACAGGCACATAAGGGAAC;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=75470454;WS=75470436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	75483812	rs13712	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=328;ReadPosRankSum=0.773;SC=GAGGCATGGATTGCTGCAGGC;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=28;WE=75483820;WS=75483802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr14	75485406	rs175052	G	A	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=535;SC=GAAACTTCCAGTGCAGATTTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=75485414;WS=75485396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	75485489	rs175053	A	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=21;PP=2038;SC=AGAAAGAGAAAATAAACTTTG;SOR=1.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=84;WE=75485497;WS=75485479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	75489632	rs175057	C	T	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GAAAAGAAAACGGAACAACGA;SOR=0.635;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=216;TCF=125;TCR=91;TR=97;WE=75489640;WS=75489622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,107:0.42:253
chr14	75497130	rs175070	C	A	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=4;PP=913;SC=CCTGGCACACCGCAGGTAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=75497138;WS=75497120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	75505008	rs3742780	G	C	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=1.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,95:0.57:167
chr14	75505016	rs175075	A	G	6342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.31;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	75506549	rs145063005	CATATATATATATATAT	C	559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=2113;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGAGTTAGGCCATATATATAT;SOR=0.793;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=5;WE=75506572;WS=75506539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr14	75513828	rs175080	G	A	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.923;NF=36;NR=58;PP=1673;ReadPosRankSum=0.307;SC=TCTCAAACTAGGCATCTGTTG;SOR=1.067;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=94;WE=75513836;WS=75513818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,106:0.46:228
chr14	75513883	rs175081	T	C	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.05;NF=92;NR=91;PP=2965;SC=TTCTCTGAGTTAAGGATGTGG;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=183;WE=75513891;WS=75513873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr14	75528580	rs10129657	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=0.350;SC=CAAGGTGGGCGGATCACCTGA;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=75528588;WS=75528570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	75535927	rs175499	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=816;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GGCCCGCCCAGCGCAGCCGAG;SOR=0.619;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=55;WE=75535935;WS=75535917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr14	75537381	rs11546525	C	T	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1445;ReadPosRankSum=-0.020;SC=AAGACTCTTACGAACAAGGTG;SOR=0.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=104;TCR=78;TR=94;WE=75537389;WS=75537371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,107:0.54:200
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chr14	75544101	rs12589815	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=207;ReadPosRankSum=-0.518;SC=AGTCAGTTACCGCTGTTGCTC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=75544109;WS=75544091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	75544189	rs12589876	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.177;SC=ACTCAGGAAGGAGATAGGTGC;SOR=0.974;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=15;WE=75544197;WS=75544179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr14	75551254	rs175487	C	T	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=13;PP=1119;SC=GGGGGCTCTACAGGCTCAGGA;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=75551262;WS=75551244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	75551442	rs175486	A	C	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=78;PP=2892;SC=CTAGTCACAGAAGTAGTTCAG;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=132;WE=75551450;WS=75551432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	75553655	rs175485	T	C	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=5;PP=1374;SC=TTCAGTACTTTGTGTTTTGTT;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=55;WE=75553663;WS=75553645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	75572559	rs119077	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=325;SC=CGGAAATAAATACCTTGATAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=75572567;WS=75572549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	75574087	rs10146482	C	T	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=51;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TGACACCTGACGGATAGCTTT;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=108;TCR=110;TR=100;WE=75574095;WS=75574077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,115:0.46:248
chr14	75580152	rs175464	G	A	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=36;PP=1112;SC=GGAAATGGGCGACATCGGATC;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=75580160;WS=75580142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	75587351	rs175454	T	C	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.80;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	75590822	rs8017642	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=958;ReadPosRankSum=-2.097;SC=TAATGTTGTCGTGCTGCAGCA;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=63;WE=75590830;WS=75590812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,76:0.50:152
chr14	75590846	rs175449	A	T	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1318;ReadPosRankSum=0.453;SC=CCAGAATAACAATCTCATTCA;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=80;WE=75590854;WS=75590836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
chr14	75590896	rs143597394	C	T	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1187;ReadPosRankSum=0.473;SC=CGGGTCAAATCGACTTCCTTC;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=73;WE=75590915;WS=75590886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,75:0.44:169
chr14	75601737	rs12435391	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=749;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CATTGTAAACATAATGAAGTG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=53;WE=75601745;WS=75601727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
chr14	75601782	rs175444	G	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=817;ReadPosRankSum=1.683;SC=GGCAGGGGAGGTGGGTAAAGG;SOR=0.447;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=45;WE=75601790;WS=75601772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr14	75601862	rs876402	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-1.422;SC=TTTTAAGTTCATTATCCTGGC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=75601870;WS=75601852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	75605792	rs1047418	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=635;ReadPosRankSum=1.599;SC=TGGTTCCTCAATTCCCACATT;SOR=0.669;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=45;WE=75605800;WS=75605782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr14	75735859	rs4903300	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=784;ReadPosRankSum=0.443;SC=AGTACTAGTAGCAAAGGAACT;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=53;WE=75735867;WS=75735849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,68:0.42:163
chr14	75745551	rs2239615	T	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=1.313;SC=GCAGCGAGCATCTGAGAAGCC;SOR=2.030;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=12;WE=75745559;WS=75745541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	75745626	rs7101	C	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=653;ReadPosRankSum=-2.511;SC=CAGCTCTGCTCCACAGCGCCC;SOR=0.431;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=39;WE=75745634;WS=75745616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr14	75746690	rs1046117	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=1049;ReadPosRankSum=0.231;SC=TCGTCTCCTCCGTGGCCCCAT;SOR=0.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=63;WE=75746698;WS=75746680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
chr14	75747407	rs3216792	AG	A	3183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.909;NF=23;NR=45;PP=2244;ReadPosRankSum=0.339;SC=TTAAAACTTAAGGGGAAAGTT;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=43;TCR=87;TR=68;WE=75747415;WS=75747397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,113:0.53:214
chr14	75758770	rs3742770	G	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=528;ReadPosRankSum=1.862;SC=GAACCACTCCGGCTCTGGCCA;SOR=0.826;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=34;WE=75758778;WS=75758760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr14	75758885	rs3742769	A	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=55;SC=AAGTTTGAGCATCCCTTGCTC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=75758893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr14	75759060	rs3742768	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=583;ReadPosRankSum=-0.296;SC=ATTATCCATACGGGCCTGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=44;WE=75759068;WS=75759050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr14	75760855	rs3742767	G	C	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1231;ReadPosRankSum=0.630;SC=TTGCTCCAGGGCAGGTCGCAG;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=90;TCR=65;TR=80;WE=75760863;WS=75760845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,89:0.49:180
chr14	75904660	rs3625	A	G	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=13;PP=1259;SC=TTCGGTGACCACAGGCTCCCT;SOR=2.372;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=75904668;WS=75904650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	75989286	rs175722	G	T	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=222;SC=CACCCATTCTGCCAAAGCCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=75989294;WS=75989276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	76045193	rs148092740	GTC	G	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=956;ReadPosRankSum=2.149;SC=GCAGCCTCTAGTCTCTGTTTC;SOR=1.276;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=24;WE=76045202;WS=76045183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr14	76045691	rs8011292	C	T	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CATTGACTGGCTGTCCATGTG;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=84;WE=76045699;WS=76045681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,107:0.55:194
chr14	76129287	rs2302592	C	G	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=6;PP=1099;SC=AGGTTGAGCACTGTTTAGGAA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=76129295;WS=76129277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	76156609	rs2303345	C	T	7405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=108;PP=2965;SC=GGATTCAAGGCTTTTCACATC;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=120;TCR=108;TR=228;WE=76156617;WS=76156599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr14	76173860	rs1005224	T	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=244;SC=TCATGTGGAGTGTAGGAATGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=76173868;WS=76173859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	76175565	rs1981898	C	A	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=57;PP=1776;SC=TAAAAGAAGGCTACCTATTTA;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=76175573;WS=76175555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr14	76175594	rs1981899	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=41;PP=1334;SC=TGCTTTGACAGATATTATTGT;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=76175602;WS=76175584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	76175666	rs8007792	C	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=397;SC=GTTTTTTTCACATGTATCCTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=76175674;WS=76175656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	76198818	rs5809726	CT	C	976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=29;PP=588;SC=ACTTAAAGCACTTTTTTTTTT;SOR=1.445;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=33;WE=76198827;WS=76198808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	76200523	rs17183712	A	G	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=659;ReadPosRankSum=-0.108;SC=AAAAAATTATATTTTCAGGGA;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=40;WE=76200531;WS=76200513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr14	76201482	rs2288141	G	T	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=53;PP=2965;SC=GGTGCAGCCAGACCTGCTAAT;SOR=1.365;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=99;TCR=53;TR=152;WE=76201490;WS=76201472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr14	76203747	rs967889	A	T	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=519;SC=GTGTGAAAGAAAATAAATGTT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=76203755;WS=76203738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	76224153	rs2113577	T	A	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=68;PP=2965;SC=TCTAACCCGGTTGTCCTTTCT;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=156;WE=76224161;WS=76224143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr14	76232398	rs2359870	T	C	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=1042;SC=TGATTCTTCGTATTTAGTGAT;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=76232406;WS=76232388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	76242089	rs1035614	A	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=453;SC=CTCTGGCATCACCATCCCTTA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=76242097;WS=76242079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	76287061	rs12206	T	C	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=55;PP=1333;SC=ACGTAGCTTCTGGCAATAATG;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=83;WE=76287069;WS=76287051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	76352929	rs1882827	C	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=592;SC=AGCTAAATCTCATTTGTCAGT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=76352937;WS=76352922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	76432136	rs3917187	T	C	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=53;PP=1687;SC=TCTGCTCCTATAGGGACTCAT;SOR=1.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=76432144;WS=76432126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	76488551	rs2058941	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=478;SC=CTGAGGTCGCACCACTGCACT;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=76488559;WS=76488541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	76524970	rs59989662	CT	C	341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.285;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr14	76525515	rs2302856	A	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=1.311;SC=CGGCACACCCAGTGGCCTAAT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=76525523;WS=76525505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr14	76525553	rs2302857	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=-0.371;SC=ACAGAGAAAAACAGGTTCAGG;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=21;WE=76525561;WS=76525543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr14	76542856	rs7140892	A	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=701;ReadPosRankSum=0.388;SC=AGTTAGATTTATACTCCAGGT;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=40;WE=76542864;WS=76542846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr14	76543004	rs17783366	G	A	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=58;PP=1568;ReadPosRankSum=1.135;SC=GCATCACAGAGATTTGGGGCT;SOR=0.898;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=90;TCR=112;TR=99;WE=76543012;WS=76542994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,116:0.46:254
chr14	76548783	rs137916626	GGACCTT	G	1389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.212;NF=1;NR=20;PP=985;ReadPosRankSum=1.759;SC=CATCTATAGTGGACCTTGATG;SOR=0.606;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=21;WE=76548796;WS=76548773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr14	76549377	rs7161722	G	A	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=240;SC=CCCAGCATGTGGGAAGCATAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=76549385;WS=76549367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	76549752	rs8536	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=260;ReadPosRankSum=0.064;SC=AGCTACAGTTGAGGGAAAAGG;SOR=0.337;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=17;WE=76549760;WS=76549742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr14	76662446	rs1900127	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.736;NF=7;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=0.200;SC=CATGGGAAAACTGAGACTACA;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=29;WE=76662454;WS=76662436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr14	76906157	rs12432875	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=498;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CCTGCGGGTCTGGCAGAAGCC;SOR=0.936;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=37;WE=76906165;WS=76906147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr14	76957745	rs2361292	G	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=563;ReadPosRankSum=-1.208;SC=CCCCTGGTCCGCCCTCCTGAC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=34;WE=76957753;WS=76957735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr14	76957887	rs2361293	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=32;PP=1017;SC=CGCTGCCCTATGACGACAAGC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=76957895;WS=76957877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	76964926	rs10139705	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=364;ReadPosRankSum=0.120;SC=GTCCCAGAGGCGGGGGTTTCT;SOR=1.802;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=20;WE=76964934;WS=76964916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr14	77229539	rs2270324	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGCCAAGAGTGAAGCCACACT;SOR=0.929;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=12;WE=77229547;WS=77229529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr14	77236147	rs7142166	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=440;SC=AAGAGTCTTCGAATGAGTGGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=77236155;WS=77236137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr14	77239567	rs2075772	A	G	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=895;ReadPosRankSum=-1.775;SC=ATCCTTCCTCACCTGAAGGGG;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=62;WE=77239575;WS=77239557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr14	77242101	rs72737517	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CGCCAGGCGTATGGAGATGAG;SOR=0.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=77242109;WS=77242097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr14	77245286	rs2242621	C	T	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=961;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CTTCCTCCCACAGGCCCTCGG;SOR=0.580;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=61;WE=77245294;WS=77245276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr14	77245644	rs17104866	G	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=0.815;SC=TCTGCTGATGGTGGGAAGGCC;SOR=0.803;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=24;WE=77245652;WS=77245634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr14	77269788	rs2075773	A	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=459;ReadPosRankSum=0.058;SC=GCAGAAGCGGAAACGTAGCAG;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=31;WE=77269796;WS=77269778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
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chr14	77292992	rs926120	C	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=807;ReadPosRankSum=0.184;SC=GGGAAGCAGTCGAGAGGTGGC;SOR=0.448;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=55;WE=77293000;WS=77292982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr14	77293072	rs72737548	C	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CAGCCTGAGACAGAAGGTGAA;SOR=0.871;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=11;WE=77293080;WS=77293062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	77294876	rs17104907	T	C	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=640;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCGGATGGCCTGTGGAGGAAA;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=44;WE=77294884;WS=77294866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
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chr14	77305833	rs12893724	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.178;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=0.400;SC=AATTATATTACCTCAGATGGT;SOR=0.037;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=77305841;WS=77305823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr14	77332367	rs1882844	C	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=36;PP=1732;SC=GCTTGAACCCCACTGGGACAA;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=77332375;WS=77332357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	77336428	rs11625243	G	A	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=61;PP=2113;SC=CCATGAGGCTGTACGGGTGCT;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=104;WE=77336436;WS=77336418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	77492891	rs879027	G	A	4920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=107;PP=2902;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GCTTCAATTCGTAGTCCATGC;SOR=0.825;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=431;TCF=202;TCR=229;TR=192;WE=77492899;WS=77492881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:270,231:0.46:501
chr14	77493761	rs200317113	TTGCTGC	T	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=25;PP=1318;ReadPosRankSum=1.134;SC=TGAGCTGTTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=25;WE=77493780;WS=77493751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	77493788	rs28692724	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.45;MQRankSum=0.000;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	77493791	rs377151545	CTGT	C	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=598;ReadPosRankSum=-0.343;SC=GCTGCTGCTGCTGTTGCTGCT;SOR=0.473;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=77493801;WS=77493778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	77493875	rs71428775	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=441;ReadPosRankSum=0.957;SC=CCGCCGCCGCTTCCTTAGCCG;SOR=0.446;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=22;WE=77493883;WS=77493865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr14	77600344	rs7141511	G	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CCAGGCCACCGGCATAACTGC;SOR=0.495;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=30;WE=77600352;WS=77600334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr14	77686012	rs117744819	C	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=341;ReadPosRankSum=1.622;SC=GCCCGAGCTGCAGCAGGTGTC;SOR=0.468;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=19;WE=77686020;WS=77686002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr14	77686303	rs2287377	A	C	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1174;SC=GCAGCTGAGAACTTTTCTCTC;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=77686311;WS=77686293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	77691652	rs440869	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=263;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TCCCAGGAAGGAGGCCCCGGA;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=14;WE=77691660;WS=77691642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr14	77691693	rs377468	C	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=626;ReadPosRankSum=1.365;SC=ATGACCTGGCCGCCTGGGTTC;SOR=1.080;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=32;WE=77691701;WS=77691683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr14	77691753	rs404728	T	C	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=34;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.770;SC=ACAGTTTCTCTCCTTTCCCCG;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=101;TCR=61;TR=92;WE=77691761;WS=77691743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,100:0.53:190
chr14	77697967	rs375566	A	G	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=47;PP=2374;SC=GGGACGACGCACGCATCTACA;SOR=1.141;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=124;WE=77697975;WS=77697957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	77703057	rs403291	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=564;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TGGGGTTTGCACCCAGGAATA;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=35;WE=77703065;WS=77703047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr14	77704974	rs8010477	G	C	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=38;PP=2965;SC=CCAAAAGACTGAGGTGTCTGG;SOR=1.891;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=106;TCR=38;TR=144;WE=77704982;WS=77704964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	77708804	rs61731611	C	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=626;ReadPosRankSum=-0.988;SC=ACCCCAAAGACATTATTTGGT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=51;WE=77708812;WS=77708794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr14	77709120	rs2287380	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=1015;SC=GTTGCATGCAAGTCTGGGCCC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=77709128;WS=77709110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	77709450	rs409109	T	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GATCAAGGAATAATTCAGGCG;SOR=1.358;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=15;WE=77709458;WS=77709440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr14	77712261	rs59262654	A	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=328;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCATTGATGAATATCTCTCTG;SOR=1.082;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=22;WE=77712269;WS=77712251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	77713036	rs2287383	C	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=615;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TCCCATGTGTCCACCAGGGCT;SOR=0.630;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=32;WE=77713044;WS=77713026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr14	77713070	rs8006732	T	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=322;ReadPosRankSum=-1.498;SC=ACAGGAGTGGTTATATGTGCT;SOR=0.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=17;WE=77713078;WS=77713060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr14	77737088	rs4903565	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=656;ReadPosRankSum=0.667;SC=CCAGCGCCCCGGCAGCGGCCA;SOR=0.396;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=45;WE=77737096;WS=77737078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
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chr14	77772599	rs3815627	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=-0.670;SC=CTGCCACCACGCCAGGGCTGC;SOR=0.275;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=10;WE=77772607;WS=77772589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr14	77787695	rs8177537	G	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=755;ReadPosRankSum=1.479;SC=TGCCCGCTGGGGCTCGAAGTT;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=50;WE=77787703;WS=77787685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,54:0.38:141
chr14	77794283	rs1046428	T	C	2853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=72;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.938;SC=CTAGAGGAGATGCGTCCCACT;SOR=1.034;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=215;TCF=87;TCR=128;TR=115;WE=77794291;WS=77794273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,140:0.53:262
chr14	77795311	rs5809824	CT	C	1296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.045;NF=29;NR=5;PP=1180;ReadPosRankSum=1.466;SC=CCTCAGGGCCCTTGGTTGAAG;SOR=1.370;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=34;WE=77795319;WS=77795301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr14	77796641	rs731346	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1085;ReadPosRankSum=1.575;SC=AACCCACCGGGACCTCTTTCA;SOR=0.742;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=70;WE=77796649;WS=77796631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr14	77809939	rs3815628	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GCTTGACTTCCTTTCACAAGT;SOR=0.238;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=17;WE=77809947;WS=77809929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr14	77843353	rs10141317	G	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=438;ReadPosRankSum=-1.606;SC=GCGGGCTGTGGGGCTCCAGGA;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=15;WE=77843371;WS=77843343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	77843363	rs10141114	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=371;ReadPosRankSum=0.661;SC=GGGCTCCAGGAGCCCGGCCCC;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=13;WE=77843371;WS=77843343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	77843384	rs3742737	G	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TCAGCCGCCTGCAGGTCAGAC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=18;WE=77843392;WS=77843374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr14	77843814	rs11844594	T	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=29;PP=1361;SC=GATGGAGAGCTGGAGCCTGAG;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=77843822;WS=77843804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	77843971	rs45540040	C	T	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1414;ReadPosRankSum=-1.369;SC=GGGAGCCAGACAGTGCTAAGA;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=77;WE=77843979;WS=77843961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr14	77844265	rs45527334	G	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CGGAAACCATGTCTGAGGTTT;SOR=0.556;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=58;TCR=88;TR=82;WE=77844273;WS=77844255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,87:0.56:156
chr14	77844592	rs10133824	T	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=1126;ReadPosRankSum=-1.006;SC=AGGAGGCAGGTCTAGAGCCTC;SOR=0.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=58;WE=77844600;WS=77844582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr14	77844869	rs4903576	A	G	6160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=81;PP=2965;SC=GTCAAATGAGAAAAAAAATCC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=177;WE=77844877;WS=77844859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr14	77845121	rs2193595	A	G	4576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.919;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=2.069;SC=ACTAAGTGACAAATTTAGAAA;SOR=0.879;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=53;TCR=85;TR=138;WE=77845129;WS=77845111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr14	77872509	rs13379432	T	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=-1.483;SC=AAATACCAGTTAGCACCACCA;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=31;WE=77872517;WS=77872499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr14	77872979	rs45557839	G	C	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.43;QD=25.08;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	77873878	rs141189280	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=568;ReadPosRankSum=-0.760;SC=TAAATTTCTACGCAGATATTA;SOR=0.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=35;WE=77873886;WS=77873868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr14	77880305	rs10130481	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GAGTGGAGATCCGCAGGCTTT;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=77880313;WS=77880295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	77880524	rs10592368	CTT	C	880.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=6.967;HP=23;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.236;NF=1;NR=16;PP=648;ReadPosRankSum=2.319;SC=ACTAGTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.056;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=17;WE=77880544;WS=77880514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr14	77880536	.	T	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.228;HP=17;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.137;NF=3;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=2.914;SC=TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA;SOR=2.215;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=20;WE=77880544;WS=77880514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr14	77889040	rs8017215	T	C	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=810;ReadPosRankSum=-1.576;SC=AGCAGTGAGATTCTTGTCCAT;SOR=0.596;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=56;WE=77889048;WS=77889030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
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chr14	77902418	rs2063997	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=383;ReadPosRankSum=-0.279;SC=AAGACATCGCATGAATGGCGT;SOR=0.095;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=26;WE=77902426;WS=77902408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr14	77914674	rs10483882	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=337;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GCAACAGTAATGGAGAATCAG;SOR=0.452;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=19;WE=77914682;WS=77914664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr14	77916205	rs760252	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TATAGGAACTTAAGGCTTAAA;SOR=0.582;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=17;WE=77916213;WS=77916195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr14	77917412	rs11159260	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGCCACCTCCAATGAGAATGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=77917420;WS=77917402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	77919587	rs2364158	T	C	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=45;PP=2965;SC=GTAGAGCCTTTATCAGTGATA;SOR=1.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=98;TCR=45;TR=143;WE=77919595;WS=77919577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr14	77923783	rs11845345	C	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=534;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GATCAAGATGCGGAGAGGCTG;SOR=0.831;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=34;WE=77923791;WS=77923773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,48:0.40:119
chr14	77930752	rs11624314	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	77930855	rs34099277	A	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CTGTGGTAGGATGGCTGTGTT;SOR=0.938;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=31;WE=77930863;WS=77930845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr14	77934587	rs3825694	T	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=0.008;SC=GTGACATTTCTCTTTTTCTGA;SOR=0.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=26;WE=77934595;WS=77934577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr14	77935659	rs11539461	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=615;ReadPosRankSum=0.137;SC=TGGGGCTTGCGACTCACAGGA;SOR=1.629;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=31;WE=77935667;WS=77935649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr14	77951124	rs3742728	C	T	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.111;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=50;ReadPosRankSum=0.716;SC=GGAGGGGTGGCGTTGCCTGGG;SOR=0.925;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=50;TCR=94;TR=74;WE=77951132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr14	77951364	rs7156032	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=-1.094;SC=GGGTCTGACCGGGTCATAAAC;SOR=1.162;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=36;WE=77951372;WS=77951354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr14	77951431	rs74063377	C	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AATCTCCACACTGCCTGCTTT;SOR=0.425;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=12;WE=77951439;WS=77951421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr14	77978621	rs73319080	A	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=211;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GGAGCACCAAAAAGGCTCAGT;SOR=0.299;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=16;WE=77978629;WS=77978611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr14	77984573	rs926114	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=35;PP=1064;SC=TACAGAGGACCTGCTGTCCTC;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=77984581;WS=77984563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	77987958	rs2072672	C	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.384;SC=ACAAAATAATCCTAAGTAAAA;SOR=0.169;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=13;WE=77987966;WS=77987948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr14	78018246	rs11159275	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.508;SC=GAAAATTCCATAGAAAGTGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=78018254;WS=78018243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	78018614	rs2178876	C	T	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=482;SC=TTGCATTCACCGGCAATGTCA;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=78018622;WS=78018604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	78023519	rs2272587	C	G	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=66;PP=2019;SC=ACAGTTATACCGCATCTTCCT;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=93;WE=78023527;WS=78023509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	78028803	rs2364602	A	G	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=45;PP=2203;SC=GTGATGCATGATTCAGTTCAT;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=104;WE=78028811;WS=78028793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr14	78036899	rs11344772	AG	A	1085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=49;PP=1082;ReadPosRankSum=1.174;SC=CCTGAATTTAAGAATTACTCA;SOR=0.387;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=2;TCR=74;TR=51;WE=78036907;WS=78036889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
chr14	78036919	rs375506101	TAAAAG	T	1296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.651;HP=4;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=1772;ReadPosRankSum=-2.379;SC=ATCACTTTATTAAAAGAAATC;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=40;WE=78036943;WS=78036909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr14	78036935	rs4903606	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=1363;ReadPosRankSum=1.555;SC=AAATCATAGTATATGTGTTGT;SOR=0.478;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=17;WE=78036943;WS=78036909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr14	78063440	rs12435993	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.606;SC=ATGTGTACCCAAATTTCTGAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=13;WE=78063448;WS=78063430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr14	78063823	rs34670650	AT	A	563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=551;SC=TACCTTAAGAATTTTCTAAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=78063831;WS=78063813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr14	78170896	rs8021036	C	G	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=47;PP=1433;SC=AACCTCCAAACACATTTCTTG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=78170904;WS=78170886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	78174473	rs11159286	A	C	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=55;PP=1998;SC=CTCAGCAGCGAGAGGTGCTGC;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=107;WE=78174481;WS=78174463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	78183706	rs176959	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=522;SC=GAGGAGAAAACGAAAGAACAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=78183714;WS=78183697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	78184566	rs176960	C	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=37;PP=1979;SC=CCTCAAACTGCACTGGTCCTT;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=78184574;WS=78184556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	78187032	rs45611739	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=843;ReadPosRankSum=1.293;SC=ACACACACAATATGCTGTTCC;SOR=0.440;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=50;WE=78187040;WS=78187022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr14	78187316	rs176965	A	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=323;SC=GATGATACATAATCAAGCTGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=78187324;WS=78187306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	78188937	rs61993671	A	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=662;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CCTTTTCAAAAATCTGATCTC;SOR=0.321;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=39;WE=78188945;WS=78188927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr14	78197365	rs114763	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.936;NF=22;NR=2;PP=499;ReadPosRankSum=0.322;SC=CAGCTCTTCTCTCCCTGGCTT;SOR=1.542;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=24;WE=78197373;WS=78197355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr14	78198666	.	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.712;SC=AGCTGGGAGCATGCAGAGAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=78198674;WS=78198663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	78200392	rs10134425	G	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=860;SC=TGTTTAGGGTGAGTATATAAA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=78200400;WS=78200382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	78201079	.	CA	C	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=55.54;NF=2;NR=1;PP=43;QD=16.3333333333;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=78201087;WS=78201069;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr14	78226850	rs1477264	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=282;ReadPosRankSum=1.634;SC=AAGGTAACCGGAAACAGCAAA;SOR=1.385;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=17;WE=78226858;WS=78226840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	78285461	rs3214433	GT	G	1597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GCTACGGTAGGTTTTTCCCTT;SOR=0.869;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=43;WE=78285469;WS=78285451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr14	78288709	rs9323652	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=446;ReadPosRankSum=0.361;SC=CCTGTACTGCAAGGTTTGGGC;SOR=0.442;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=33;WE=78288717;WS=78288699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr14	78325675	rs28498552	C	T	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=46;PP=1522;SC=TCAGAAAAGGCCCCGGCTGAA;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=78325683;WS=78325665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	78353273	rs4903665	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	78353277	rs10711154	AC	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=0.000;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr14	78353280	.	CACACGCACA	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr14	78353478	rs35636358	G	T	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1474;ReadPosRankSum=0.074;SC=CTCTGGGGACGGCCTCCCTGG;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=71;TCR=86;TR=92;WE=78353486;WS=78353468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,99:0.56:178
chr14	78374172	rs34272020	C	T	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=14;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GGGACCTGTCCACGGAGCGGG;SOR=1.261;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=143;TCF=101;TCR=42;TR=60;WE=78374180;WS=78374162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,73:0.42:172
chr14	78390880	rs2302944	T	C	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=50;PP=1776;SC=ACCCCGGCAATGTACTGGTGC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=78390888;WS=78390870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	78744823	rs10134857	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=562;SC=GGGTGAAGGTGGAACTAAGTG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=78744831;WS=78744813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	78748366	rs10147289	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=525;ReadPosRankSum=0.535;SC=TTTGAGTTTGCAGGGTTCCAA;SOR=0.883;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=33;WE=78748374;WS=78748356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr14	78766814	rs4903742	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=302;SC=AAGCTTCCACATTGTATGTTT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=78766822;WS=78766804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	78993170	rs12882387	A	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AAGAAAGGGGATTCATATTTT;SOR=0.406;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=60;WE=78993178;WS=78993160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,74:0.57:130
chr14	79081400	rs57416351	T	C	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1211;ReadPosRankSum=0.308;SC=CGTATTTCCATGGTTAGATTA;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=216;TCF=102;TCR=114;TR=103;WE=79081408;WS=79081390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,113:0.46:244
chr14	79111432	rs2287495	C	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.474;SC=CAGACAAGTGCTGATTGCTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=79111440;WS=79111427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	79176133	rs12147248	G	T	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=425;SC=AATGGCTGTTGTAAAATTATG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=79176141;WS=79176123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	79181046	rs1465481	A	T	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=48;PP=2097;SC=TAGGTTTCTTACATTTGGTTA;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=115;WE=79181054;WS=79181036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	79276733	.	C	A	203	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=54.72;NF=2;NR=6;PP=203;QD=29.7214015684;SC=AAAAAAAAAACAAAACTGACT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=79276741;WS=79276723;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr14	79454519	rs154325	G	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=609;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GGAACTTTGTGAAGATGTTTG;SOR=0.577;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=37;WE=79454527;WS=79454509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr14	80290425	rs932265	A	G	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=222;SC=CCCCAGCTTCAGGTGTTGTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=80290433;WS=80290415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	80669580	rs225014	T	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=0.377;SC=CCTCCTTCTGTACTGGAGACA;SOR=0.306;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=39;WE=80669588;WS=80669570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr14	80993330	.	G	GA	178	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=19;MQ=56.25;NF=2;NR=6;PP=178;QD=23.0;SC=AGGAATCCTGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=8;WE=80993338;WS=80993320;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,8:0.47:17
chr14	81025522	rs1530771	C	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=391;ReadPosRankSum=1.035;SC=ATGTAGTTTTCGAAATGATTT;SOR=0.452;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=29;WE=81025530;WS=81025512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr14	81259078	rs4523859	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=445;ReadPosRankSum=0.007;SC=ATTGAAAACCGTTCCTTAGGA;SOR=0.028;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=30;WE=81259086;WS=81259068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr14	81297385	rs7156572	G	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=885;ReadPosRankSum=1.342;SC=TGCTCACACTGGAGTTCATAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=38;WE=81297393;WS=81297375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr14	81297440	rs151108047	GAT	G	2409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.505;NF=26;NR=16;PP=1614;ReadPosRankSum=-1.807;SC=AATTCCATGAGATAAAATTAA;SOR=0.766;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=42;WE=81297449;WS=81297430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr14	81302496	rs111347550	C	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=716;ReadPosRankSum=-0.885;SC=CTAAGAAAAACCAAAAAGCCC;SOR=1.495;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=34;WE=81302504;WS=81302486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr14	81307218	rs7142753	T	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGGATATGAGTTACACAAAAT;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=81307226;WS=81307208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	81360861	rs117291528	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=1.188;SC=GAAGGTGCCCTTGGTACATCC;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=81360869;WS=81360851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr14	81422257	rs2239610	G	C	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=915;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GAGGTGGCCCGAAGTGCACAA;SOR=0.412;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=52;WE=81422265;WS=81422247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr14	81574687	rs3837640	T	TTCTC	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=4;PP=581;SC=ACCTAATTCATTCTCTCTCTC;SOR=2.093;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=11;WE=81574695;WS=81574677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	81574845	.	T	TTTTTTTCTTTTTAC	516	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=12;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=61.55;NF=16;NR=3;PP=516;QD=27.4210526316;SC=TTTCTTTTTTTTTTTTTGGAA;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=19;WE=81574853;WS=81574835;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:24,19:0.44:43
chr14	81574959	rs3783942	A	G	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=73;NR=64;PP=2467;SC=TGTATAGGCTACCTCTTGGAA;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=81574967;WS=81574949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	81575005	rs3783941	C	A	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=58;PP=1844;SC=GAAGGCCCCACGCTCCAGTAT;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=81575013;WS=81574995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	81610583	rs1991517	G	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1062;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTACCCACGAGATGAGGCAGG;SOR=0.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=64;WE=81610591;WS=81610573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,88:0.50:175
chr14	81667852	rs8019633	A	T	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=591;SC=AACTTCAAGTAGTTAATATAG;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=81667860;WS=81667842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	81670558	rs8006015	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=9;PP=491;SC=AAACTGATACAGACACAGAAA;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=81670566;WS=81670548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	81686978	rs113271579	GA	G	197.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.34;NF=0;NR=8;PP=227;SC=CAAGATTGGGGAAAAAATTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=81686986;WS=81686968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	81712638	rs59453808	T	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.31;NF=10;NR=1;PP=261;SC=GTCCATGCTTTTAACCAGATT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=81712646;WS=81712628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	81728288	.	T	TAA	37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=19;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.3;NF=0;NR=4;PP=37;QD=10.0;SC=GGGGAAATGATAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=81728296;WS=81728278;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,4:0.27:15
chr14	81743718	rs34323725	C	T	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=84;PP=2965;SC=CCCATGGAAACGGCACTCATG;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=147;WE=81743726;WS=81743708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr14	81744736	rs3813535	A	G	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=68;PP=2930;SC=CTCCAAGGTGAAGCCTCAGTT;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=81744744;WS=81744726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	83159052	rs71418905	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.204;NF=12;NR=5;PP=215;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TCAGGTTACCCCGCAAGCTTG;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=17;WE=83159060;WS=83159042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr14	85995608	rs12590399	T	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=7.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.025;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.927;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr14	85995614	rs12587861	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.059;QD=19.26;ReadPosRankSum=1.045;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	86088056	rs10141266	T	C	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=55;PP=2441;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGGGCGTAACTGTACTCTACC;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=130;WE=86088064;WS=86088046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,166:0.99:168
chr14	86088852	.	C	T	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=47;PP=1288;ReadPosRankSum=0.136;SC=CCCTTCATCTCTCAACGTGCG;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=78;TCR=108;TR=81;WE=86088860;WS=86088842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,103:0.45:230
chr14	87386566	rs61981246	A	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=4;PP=553;SC=TAAATGCTCAATAATGCAATT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=87386574;WS=87386556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	88400353	rs412915	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=5;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=1505;ReadPosRankSum=0.735;SC=CCTGGAAAAACGTTCACAGAG;SOR=0.583;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=46;WE=88400375;WS=88400343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr14	88400367	rs45572135	T	G	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=1934;ReadPosRankSum=1.234;SC=CACAGAGAGTTATAGTGGTTA;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=53;WE=88400375;WS=88400343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr14	88400449	rs413750	T	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.76;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	88400449	.	TG	CA,CG	267	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0,1;NR=13,28;PP=225,267;QD=21.4206057586;SC=TATCTATTACTGCAGAAATAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13,29;WE=88400458;WS=88400439;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:29
chr14	88400450	rs432946	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.576;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr14	88400486	rs1042029	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=1.409;SC=TTAAAGAGGCATTTTTAAAAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=88400494;WS=88400476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	88401213	rs421262	T	C	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=86;PP=2537;SC=ATGCCAGAGGTGAAATGACCC;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=137;WE=88401221;WS=88401203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	88406120	rs45626938	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr14	88406127	rs45567441	G	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.134;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr14	88406404	rs417276	T	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=137;SC=GTGGGGTTCTTGAGTGGCATC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=88406412;WS=88406394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	88407716	.	T	TA	260	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5001;HP=13;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=61.97;NF=11;NR=10;PP=260;QD=12.619047619;SC=CATATGCTATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=21;WE=88407724;WS=88407706;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:36,21:0.37:57
chr14	88407734	rs448805	G	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=18;PP=1126;SC=AAAAAAGTCAGTTACCTAAAT;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=88407742;WS=88407724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	88407875	rs421466	T	A	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=60;PP=2250;SC=TCTCTATGTATACATCACACT;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=98;WE=88407896;WS=88407865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	88407888	rs398607	A	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=673;ReadPosRankSum=0.351;SC=ATCACACTTTATAGTCAGATT;SOR=0.902;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=41;WE=88407896;WS=88407865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr14	88407917	rs12432149	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=686;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AAAATAAAACGGTTGATTAGT;SOR=0.951;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=37;WE=88407925;WS=88407907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr14	88411803	rs444902	T	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=321;SC=GTTCTTGAAATAGGAGGACCA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=88411811;WS=88411793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	88411837	rs366615	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=-0.940;SC=ACTTCAAAATGTACCTGACAA;SOR=1.158;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=19;WE=88411845;WS=88411827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr14	88411947	rs367327	T	C	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=51;PP=1740;SC=CGGCAGCCCATGTAATGGGTC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=88411955;WS=88411937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	88414211	rs398076	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=568;ReadPosRankSum=0.560;SC=AACTGCCATCGCTGTCAAGGA;SOR=0.778;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=41;WE=88414219;WS=88414201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr14	88414283	rs398343	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=36;PP=1320;SC=CATGTGGACAGAATAGCTTTA;SOR=1.054;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=88414291;WS=88414273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	88416390	rs440426	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=225;SC=CTATTTATCAAGAGAAACACC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=88416398;WS=88416380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	88417095	rs11300320	GA	G	1545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.272;NF=12;NR=35;PP=787;ReadPosRankSum=0.587;SC=TTATGACTCTGAAAAAAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=47;WE=88417103;WS=88417085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr14	88417161	rs431748	C	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=40;PP=1117;SC=AAAAGTTCAACAGTTAATGCC;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=88417169;WS=88417151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	88417244	rs443019	C	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=215;SC=GACTTTTTTACAATATAATAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=88417252;WS=88417234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	88431898	rs12888666	C	T	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=751;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TCCATGGCTCCTGGGCCGTCA;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=48;WE=88431906;WS=88431888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr14	88453186	rs2165567	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.470;SC=ACAACCTTCTATTACAAGCAG;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=88453194;WS=88453176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr14	88453424	rs2119703	G	A	1225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=32;PP=988;SC=GAGTTTTGAGGAAAAAAAAAG;SOR=1.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=48;WE=88453432;WS=88453414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	88454691	rs2245387	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=1.180;SC=AAGTAATGTGCCATTTTTTCA;SOR=0.307;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=88454699;WS=88454681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	88454910	rs2289511	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=343;ReadPosRankSum=-0.920;SC=AAGAAATCCAGTCATGAATAT;SOR=0.490;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=20;WE=88454918;WS=88454900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr14	88477413	rs6574978	C	T	6184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=82;PP=2965;SC=TTGATTATACCTGGAATAAAG;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=108;TCR=82;TR=190;WE=88477421;WS=88477403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr14	88477882	rs3742704	A	C	3473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=73;PP=2446;ReadPosRankSum=-0.520;SC=ACTTGTCAGCATCACAGTTAC;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=313;TCF=145;TCR=168;TR=133;WE=88477890;WS=88477872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,157:0.42:378
chr14	88651784	.	A	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.487;NF=32;NR=8;PP=758;ReadPosRankSum=0.255;SC=ATTTTGGACTAAAAAGTCTGT;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=40;WE=88651792;WS=88651774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr14	88651826	rs144490234	A	AAC	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.839;NF=15;NR=13;PP=965;ReadPosRankSum=-1.525;SC=GAATATTAAAAACACACACAC;SOR=1.109;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=28;WE=88651835;WS=88651816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr14	88652389	rs3742692	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=724;ReadPosRankSum=0.065;SC=GGATGGTGGCCGCCCGCTGCA;SOR=0.361;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=42;WE=88652397;WS=88652379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr14	88654235	rs424752	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TCCAGCCCACAGGACAGAGAC;SOR=1.402;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=17;WE=88654243;WS=88654225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr14	88729931	rs761971	G	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=-1.460;SC=GAAGAAGAGAGTTTGTTTATA;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=11;WE=88729939;WS=88729921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr14	88737193	rs1298237	T	C	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=920;ReadPosRankSum=-0.285;SC=ACATGGACCCTTGCTAACAAT;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=43;TCR=80;TR=59;WE=88737201;WS=88737183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr14	88792816	rs3742690	T	G	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=54;PP=1802;SC=AAGATGCCGCTCCAAGCGGTT;SOR=1.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=88792824;WS=88792806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	88852031	rs709886	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=3;PP=515;SC=ACGGCCTGGCAACGGTTTCCC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=88852039;WS=88852021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	88852279	rs5810413	TG	T	1230.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=1196;SC=GGCCGCCCCTTGGGGCGCTTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=30;WE=88852287;WS=88852269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	88862529	rs3179969	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=0.409;SC=TCCAGTAAGCGTGAGTACCAG;SOR=1.371;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=88862537;WS=88862519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	88894210	rs2295135	T	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=1.398;SC=TGGTTATAGCTCTCTCTGAAT;SOR=0.426;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=7;WE=88894218;WS=88894200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr14	88895669	rs386579	T	G	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.00;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	88895941	rs61975260	C	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=0.471;SC=AATTCAATAACAGTTTTAGTT;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=88895949;WS=88895931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	88934651	rs366476	G	A	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=291;SC=GTGTTCCCCTGGGGAGACAGA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=88934659;WS=88934641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	88935925	rs2297129	A	G	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1179;ReadPosRankSum=1.790;SC=TCTCTTGCCCAGTAAGGAGGT;SOR=0.521;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=79;WE=88935933;WS=88935915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,92:0.50:185
chr14	88936254	rs2297128	A	G	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1808;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CTTAAGAGAAATAAGTACCTA;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=109;TCR=123;TR=107;WE=88936262;WS=88936244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,125:0.47:264
chr14	88938652	rs2274736	A	G	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1384;ReadPosRankSum=0.967;SC=CTCCACTCTCACATCATCATA;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=85;WE=88938660;WS=88938642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,100:0.54:184
chr14	88945591	rs879932	A	G	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=863;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CACGTGCAGGAGGCGCCCGGG;SOR=0.799;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=53;WE=88945599;WS=88945581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr14	88946622	rs2401751	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1275;ReadPosRankSum=0.082;SC=CGACCGTTGAGGTCAATCTGG;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=74;WE=88946630;WS=88946612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,86:0.49:175
chr14	88967280	rs45446997	T	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTGCTAGAGTTCCCTGGACTG;SOR=0.455;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=59;WE=88967288;WS=88967270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr14	88967336	rs816069	C	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=-0.027;SC=AGTAACTATTCAGGAAGACAA;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=18;WE=88967344;WS=88967326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
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chr14	88971758	rs2274735	T	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=346;ReadPosRankSum=1.974;SC=TATTTAAATTTCATTGCAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=18;WE=88971766;WS=88971748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr14	88974417	.	T	C	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=33;QD=33.8856062736;SC=CTCATTGAGATACAATGCATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=88974425;WS=88974407;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr14	88983670	rs10150986	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=763;ReadPosRankSum=-0.914;SC=GACTTCAGTCGCACTAATCCC;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=17;WE=88983681;WS=88983660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	88983673	rs4904452	C	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1059;ReadPosRankSum=2.151;SC=TTCAGTCGCACTAATCCCTGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=21;WE=88983681;WS=88983660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr14	89037482	rs10682918	C	CAT	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.629;NF=1;NR=7;PP=274;ReadPosRankSum=0.376;SC=AGATTCATAACTTTTTTTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=89037490;WS=89037472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	89042180	rs1469602	T	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=352;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CTTAACTCTTTTAGACCTTCT;SOR=0.854;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=25;WE=89042188;WS=89042170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr14	89063167	rs2297124	A	G	9019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=143;PP=2965;SC=GTAATGTTTCAAGTTGTACTG;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=293;TCF=149;TCR=144;TR=292;WE=89063175;WS=89063157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr14	89077043	rs4899956	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.041;SC=AGCTACTCGGGAGACTGAGGC;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=89077051;WS=89077037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr14	89082289	rs12885870	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.148;SC=TTCAGGTTACATGTGTAATAT;SOR=1.292;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=89082297;WS=89082279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr14	89082396	rs61173654	A	AT	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=654;ReadPosRankSum=0.098;SC=TGACTAGCTGATTTCATAAAC;SOR=1.284;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=19;WE=89082404;WS=89082386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr14	89088266	rs4635267	C	T	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=694;ReadPosRankSum=0.409;SC=TACATAAATACGTGATTCTTA;SOR=0.452;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=52;WE=89088274;WS=89088256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr14	89088357	rs56144430	G	A	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=743;ReadPosRankSum=0.560;SC=CCTTTAACCAGTCCTTCCCTA;SOR=1.082;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=48;WE=89088365;WS=89088347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,52:0.34:152
chr14	89088388	rs2983488	G	C	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=61;PP=1894;SC=CCTCCCCCTTGTCCGCCTCCA;SOR=1.477;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=94;WE=89088396;WS=89088378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	89089149	rs11382327	C	CT	439	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.530;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.487;NF=0;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=0.180;SC=TAAGCAGAATCTTTTTTTTTT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=89089157;WS=89089139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr14	89091202	rs149369776	G	GGAA	596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.147;NF=13;NR=1;PP=686;ReadPosRankSum=1.392;SC=CATATGAGGAGGAAGGTCGGA;SOR=1.022;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=14;WE=89091210;WS=89091192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	89094243	rs1144916	G	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=590;SC=ATATTCATCTGTGAAACATGG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=89094251;WS=89094233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	89100627	.	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.376;SC=ATTTCCTGAGGCCTCCCCAGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=89100635;WS=89100617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr14	89105287	rs1152383	T	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=1.039;SC=GTTTGAAAATTTTAAGATGTA;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=8;WE=89105295;WS=89105277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	89129304	rs17260373	G	C	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=718;ReadPosRankSum=-2.122;SC=CTAAACGATAGAAAGTAGGTA;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=44;WE=89129312;WS=89129294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr14	89148486	rs17260380	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.637;SC=AATAGGATACCGAATAGTGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=89148494;WS=89148476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	89151392	rs17204164	C	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=279;ReadPosRankSum=2.458;SC=CACTTTTATCCACTTCTAGTA;SOR=0.884;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=17;WE=89151400;WS=89151382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr14	89205265	rs17188228	T	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=-1.647;SC=ATCACAGTAATTGGTTTAAAA;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=20;WE=89205273;WS=89205255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr14	89220844	.	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=605;ReadPosRankSum=-1.484;SC=AAAATGAAAAACTGTCACATA;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=31;WE=89220852;WS=89220834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr14	89258877	rs61982739	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=25;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GCTCCCGCTCGGGCCCGCGGC;SOR=0.850;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=89258885;WS=89258867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	89307320	rs17700296	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=660;ReadPosRankSum=1.894;SC=TTGATCAGACTGTATGAGAGT;SOR=0.845;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=49;WE=89307328;WS=89307310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,63:0.42:149
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chr14	89647259	rs140257053	G	GGCAGAGAACATGCATGGA	3099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=2;NR=22;PP=2973;SC=AGAGACAGAGGGCAGAGACAG;SOR=2.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=24;WE=89647267;WS=89647249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr14	89747473	rs7147341	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=34;PP=912;SC=TGACACCCTTTGAAAATGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=89747481;WS=89747463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr14	89878865	rs3742676	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=0.821;SC=AAATGATGAGCTGGCGAGGCC;SOR=0.382;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=20;WE=89878873;WS=89878855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	90263500	rs9026	T	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=560;ReadPosRankSum=-1.918;SC=ATCACAAGTCTGTAGCATGAC;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=29;WE=90263508;WS=90263490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr14	90263525	rs1555616	C	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=802;ReadPosRankSum=0.116;SC=TTAGTAGAGTCGAGTCTGCTG;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=45;WE=90263533;WS=90263515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr14	90303065	rs8021113	T	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.96;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	90303113	rs8019848	A	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=339;SC=CTGTAATCCCAGCACTTTGGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=90303121;WS=90303103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	90303383	rs8020323	A	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=13;PP=757;SC=TGCACAGGTGAGGGGTGTGCC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=90303391;WS=90303373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	90303435	rs12437204	T	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.00;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	90303445	rs12437206	T	C	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.14;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	90451303	rs1296406	A	G	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=93;SC=TCTTGTAGGCATTCCATCATT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=90451311;WS=90451293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	90456188	rs2401863	G	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CTACTATTGCGTAGAAATTTG;SOR=0.709;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=13;WE=90456196;WS=90456178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr14	90528967	rs12878088	C	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CTCATCCTTTCATTCATCCAT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=23;WE=90528975;WS=90528957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr14	90651357	rs12147332	G	A	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=45;PP=1221;SC=GAAGCCAGGAGTGGATGCTGG;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=90651365;WS=90651347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	90722824	rs2277516	G	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=459;SC=AGCACAACTTGGTCAGCGCAG;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=90722832;WS=90722814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	90723000	rs2277515	A	G	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=64;PP=2124;SC=GGGTCTCAGCAGCCTGAGGCG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=116;WE=90723008;WS=90722990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	90723059	rs2277514	T	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=43;PP=1405;SC=TCTTCTCCTTTTGCCGGCCTG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=90723067;WS=90723049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	90723109	rs6575119	T	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=662;SC=ACCGCGCTCATGTCCACCGCG;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=90723117;WS=90723099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	90723152	rs3825662	A	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=407;SC=TTGCCCGGGGATCCTGGGGCC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=90723160;WS=90723142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	90726676	rs11844225	G	A	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=64;PP=2181;SC=CTCTAGCTTTGTGATTCATTT;SOR=1.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=96;WE=90726684;WS=90726666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	90729931	rs8022531	T	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=759;SC=GGCTGCTTTGTAAATCTAGCG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=90729939;WS=90729921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	90729984	rs8015510	C	T	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=454;SC=CTGCTTTTTTCCCTTGGCATT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=90729992;WS=90729974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	90730071	rs4811	C	T	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.37;QD=32.39;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	90730265	rs2282030	G	A	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=987;SC=TTCCTGTCCCGTGGAAGTAGA;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=90730273;WS=90730255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	90731591	rs146245088	AATAAG	A	2240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.235;NF=2;NR=31;PP=1552;ReadPosRankSum=-1.310;SC=TTACTGAACTAATAAGAGAGG;SOR=1.043;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=91;TCF=6;TCR=85;TR=33;WE=90731603;WS=90731581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,63:0.38:166
chr14	90736477	rs114316342	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=476;ReadPosRankSum=0.826;SC=GGGCTGAGGCCTCTGAGCCAT;SOR=0.874;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=30;WE=90736485;WS=90736467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr14	90740588	rs10140761	G	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=295;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TCCGTGTGGGGTGTATGTGCA;SOR=0.740;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=18;WE=90740596;WS=90740578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
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chr14	90756760	rs3742671	A	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=572;ReadPosRankSum=-0.274;SC=GGTTGAAAAAAGTCAAGGGCT;SOR=0.794;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=37;WE=90756768;WS=90756750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr14	90767607	rs3825661	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=779;ReadPosRankSum=0.198;SC=GCAGATCTTTCACGCTGTCGG;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=46;WE=90767615;WS=90767597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr14	90767746	rs3742669	C	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=499;ReadPosRankSum=0.469;SC=GGGGAAGAAGCCTGGTTGATA;SOR=0.972;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=30;WE=90767754;WS=90767736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr14	90767860	rs3742666	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=138;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATACATGTCTTGATTTAAAG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=9;WE=90767868;WS=90767850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr14	90768183	rs8020828	C	T	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1370;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CTGAACATTCCAGTTCATCTT;SOR=0.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=213;TCF=85;TCR=128;TR=94;WE=90768191;WS=90768173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,109:0.45:242
chr14	90769635	rs2282033	T	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=0.651;SC=TTGTGTCACCTGATATGTTTG;SOR=0.255;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=90769643;WS=90769625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr14	90770210	rs4904670	C	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=291;SC=AATTGCTGCACAGTCCATCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=90770218;WS=90770200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	90863489	rs12886342	G	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=11;PP=1181;SC=CAGCAGCAGCGGCATCGGAGG;SOR=2.342;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=52;WE=90863497;WS=90863479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	90865283	rs2300497	T	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=473;SC=CACTTAAGAGTATAAACTTCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=90865291;WS=90865273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	90865462	rs2300498	C	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=26;PP=973;SC=TTACTGCCTCCAACGAAGTGT;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=90865470;WS=90865452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	90866346	rs2268433	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-0.905;SC=AACTGGAAAACCTATGTTGAA;SOR=0.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=90866354;WS=90866336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	91007618	rs1294572	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=3;PP=748;SC=GGCCTCAGTGTGGCAGATTCA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=91007626;WS=91007608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	91110582	rs3830889	TACATAC	T	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=576;ReadPosRankSum=0.622;SC=AAAAAGGTTTTACATACACAC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=91110595;WS=91110572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	91113471	rs2277512	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CTAAGGGCCCGTATTTATTTA;SOR=0.228;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=29;WE=91113479;WS=91113461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr14	91113537	rs1286422	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=269;SC=CATGTAAACCATTTCCCTCTT;SOR=2.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=91113545;WS=91113527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	91123575	rs3742660	T	C	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1108;ReadPosRankSum=0.611;SC=TGGCATCGTCTGGCTTCAGGC;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=181;TCF=108;TCR=73;TR=89;WE=91123583;WS=91123565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,101:0.47:215
chr14	91142817	rs80256733	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.01;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=561;ReadPosRankSum=2.256;SC=TGGGGTCACCGTGCAACTGCC;SOR=0.344;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=36;WE=91142825;WS=91142807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr14	91144341	rs35336897	AG	A	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr14	91165541	rs45602131	G	A	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1195;ReadPosRankSum=1.108;SC=CCACATTCTCGGCTCTTTAAT;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=81;WE=91165549;WS=91165531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,91:0.42:215
chr14	91165572	rs1749699	G	A	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1180;ReadPosRankSum=1.215;SC=GTCCCTCTGTGATCAAACCAA;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=82;WE=91165580;WS=91165562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,92:0.45:203
chr14	91365646	rs61587732	GAA	G	1290.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.761;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.574;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,45:0.78:58
chr14	91365649	rs117599685	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.942;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr14	91365828	rs114303120	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=495;ReadPosRankSum=-1.243;SC=ATCAGTACTGCCCCAAGACTA;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=28;WE=91365836;WS=91365818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr14	91592748	rs57615276	C	CTTCTT	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=954;SC=ATGTCTGTGCCTTCTTATAAT;SOR=2.066;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=19;WE=91592756;WS=91592738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	91633749	rs12436409	G	A	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.278;SC=ACTGTGGGTTGAAGCTTGGGA;SOR=0.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=104;TCR=60;TR=77;WE=91633757;WS=91633739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,92:0.47:195
chr14	91633956	rs146234967	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1131;ReadPosRankSum=2.192;SC=TGGAGAAAGTCCAGCCCTGGA;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=62;TCR=85;TR=70;WE=91633964;WS=91633946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,78:0.46:170
chr14	91636674	rs113777779	A	AC	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=0.952;SC=CAGCTCAGCCATTTCTAGCTG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=91636682;WS=91636664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	91642234	rs2295528	A	G	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=1615;ReadPosRankSum=0.555;SC=TTCTAATTGGATGCTCCCTGC;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=197;TCF=130;TCR=67;TR=93;WE=91642242;WS=91642224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,102:0.47:218
chr14	91710562	.	GAC	G	213	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=213;QD=36.0;SC=CCAGAACACAGACACACACAC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=91710571;WS=91710552;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	91739076	rs45560241	G	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr14	91739081	rs941920	A	G	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.59;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	91751788	rs11341843	TC	T	1671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.175;NF=15;NR=34;PP=1396;ReadPosRankSum=0.653;SC=ATCCTGAGGCTCCCCCTAAAA;SOR=0.730;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=49;WE=91751796;WS=91751777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,84:0.42:198
chr14	91751808	rs17802308	G	C	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.021;NF=35;NR=43;PP=1183;ReadPosRankSum=0.081;SC=ACTGTGTTGTGCTGAAGAAAT;SOR=0.772;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=162;TCF=78;TCR=84;TR=78;WE=91751816;WS=91751798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,100:0.52:194
chr14	91760522	rs12891713	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=287;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CTTACATGTACTGCTTCTGCT;SOR=1.141;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=22;WE=91760530;WS=91760512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr14	91763637	rs3742656	C	T	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=16;PP=1380;SC=GCTCCCCTGGCGCTGGCCTCA;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=91763645;WS=91763627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	91763971	.	CT	C	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.6257;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=42;QD=16.0;SC=CCTCTCTGGGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=91763979;WS=91763961;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr14	91773568	rs1970912	T	C	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=1154;ReadPosRankSum=0.594;SC=ACTCCTTCTTTAGCTACAGGT;SOR=1.103;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=59;WE=91773576;WS=91773558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,73:0.97:75
chr14	91776434	rs2277507	G	A	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=46;PP=1422;SC=CCCGGGCCACGGCTGCCTCCG;SOR=1.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=91776442;WS=91776424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	91874956	rs2295882	T	C	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=58;PP=2965;SC=ACAGTGACGATACTGATGGAC;SOR=1.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=109;TCR=58;TR=167;WE=91874964;WS=91874946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr14	91883129	rs45437097	G	A	6817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=121;PP=2965;SC=CTAAATCCATGTACATAGTCA;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=80;TCR=121;TR=201;WE=91883137;WS=91883119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr14	91883267	rs1285844	A	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=17;PP=609;SC=CAGAGACTGGACGGGTCAGTG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=91883275;WS=91883257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	91928933	rs4904784	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=113;SC=AACATTTATGTTGACCCTTAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=91928941;WS=91928923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	91942342	rs10145724	T	A	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=29;PP=874;SC=TTTTCCTGTATTTATAAAAAT;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=91942350;WS=91942332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	91942407	rs10145809	T	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=516;SC=TGAAAAAACTTCAATGTAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=91942415;WS=91942397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	91943185	rs147432318	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=1.440;SC=CTGGGATTTACAGGCGTGAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=91943193;WS=91943175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	91948643	rs6575195	G	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=719;SC=ACCTATAATGGTCATTTTCAA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=91948651;WS=91948633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	91957236	rs10131200	T	A	64.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	92040589	rs34650717	TC	T	448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.889;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.174;NF=5;NR=8;PP=437;ReadPosRankSum=1.290;SC=CTCGGGCGCCTCCGCCCCGCG;SOR=0.083;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=13;WE=92040597;WS=92040579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	92041075	rs1704614	C	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=337;SC=GCAGTGCCTACAGAGATCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=92041083;WS=92041065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	92053395	rs2295789	G	C	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=11;PP=936;ReadPosRankSum=-0.885;SC=ACTACTGACAGGGTCAATGCT;SOR=0.717;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=51;WE=92053403;WS=92053385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr14	92058445	rs1285637	G	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1321;SC=TGAAGAAGTGGAATTCCTGAG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=92058453;WS=92058435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	92074545	rs1743159	T	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=275;SC=AGCTTCACCTTCTCATTTAAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=92074553;WS=92074535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	92074856	rs1743158	C	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=CAATTTTTAGCTACAGGTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=92074864;WS=92074846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	92084004	rs1620238	C	G	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=1032;SC=CATCAAAAGTCACTTCAGCTG;SOR=1.355;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=92084012;WS=92083994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	92088016	rs1296082	G	A	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=13;PP=1640;SC=TGTATTTCACGATGTTGAGGG;SOR=2.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=72;WE=92088024;WS=92088006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	92105643	rs1704630	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=0.444;SC=AACAGAAGTCGAAAAACTTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=92105651;WS=92105633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	92126443	rs55665101	ATC	A	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.37;QD=28.34;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	92174343	rs4605095	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=270;SC=ATTGTGAGTGCCTCAAGGGTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=92174351;WS=92174333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	92268615	rs2402073	T	G	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=55;PP=2092;SC=ATACAGTCTCTTCACTTCTGA;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=118;WE=92268623;WS=92268605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	92280037	rs10134181	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.776;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=480;ReadPosRankSum=-0.395;SC=GAAGTCAAAATAAAACTCACA;SOR=0.309;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=29;WE=92280045;WS=92280027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr14	92343764	rs2430341	C	T	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=29;PP=1343;SC=GCATACAGCACGTTCCTAGGA;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=92343772;WS=92343754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	92403598	rs181500413	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.915;SC=GCCTTGTGTCCGGTGCATATT;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=17;WE=92403606;WS=92403588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr14	92420861	rs2430336	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=340;SC=CCTCAAGCAACCCTCTCACCT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=92420869;WS=92420851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	92441066	rs1051340	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-0.684;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	92454604	rs2273182	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.210;SC=GTAGTGGGGGAAAAATGAAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=92454612;WS=92454594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	92454748	rs2273184	A	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AAACTTTATTAAAAAAAAGTA;SOR=0.575;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=11;WE=92454756;WS=92454738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr14	92460098	rs2273185	C	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=0.575;SC=AAAGACTCTACAAGTAACTGT;SOR=0.418;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=10;WE=92460106;WS=92460088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr14	92473943	rs3818095	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-1.576;SC=TTAGTTTACTTAGTAGAATGT;SOR=0.553;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=92473951;WS=92473933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr14	92477168	rs2277526	A	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=4;PP=1472;SC=TCTGAACTTTACCCAGGTACT;SOR=4.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=56;WE=92477176;WS=92477158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	92491843	rs1555210	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=534;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TTATGAAAAACGTACTGCTTT;SOR=0.883;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=14;WE=92491861;WS=92491833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr14	92491853	rs2295171	T	C	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=535;ReadPosRankSum=1.644;SC=CGTACTGCTTTCCCCCCCCAA;SOR=0.317;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=18;WE=92491861;WS=92491833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr14	92537105	rs7158238	C	T	126.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;MQRankSum=-0.157;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr14	92537163	rs3092822	T	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=402;ReadPosRankSum=0.660;SC=TTACTTAAGATTCTTAATATG;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=21;WE=92537171;WS=92537153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr14	92537223	rs7158733	G	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=748;ReadPosRankSum=-1.203;SC=CATGGAGCTCGTATGTCAGAT;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=49;WE=92537231;WS=92537213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr14	92537354	.	CC	GC	1477	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=60.76;NF=1,1;NR=14,16;PP=1477,308;QD=99.1333333333;SC=GATAGGTCCCCCTGCTGCTGC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=15,17;WE=92537362;WS=92537344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr14	92537354	.	CC	CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	1477	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=60.76;NF=1,1;NR=14,16;PP=1477,308;QD=99.1333333333;SC=GATAGGTCCCCCTGCTGCTGC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=15,17;WE=92537362;WS=92537344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	92537354	rs12895357	C	G,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG	1829.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.46;QD=39.78;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,23,23:0.50,0.50:46
chr14	92537379	rs12896583	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.77;MQRankSum=4.056;QD=4.27;ReadPosRankSum=-2.814;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr14	92537387	rs12896588	T	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=3.625;QD=2.82;ReadPosRankSum=-2.859;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr14	92537388	rs12896589	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=3.625;QD=2.92;ReadPosRankSum=-2.860;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr14	92546144	rs2003721	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=142;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TGCAATGGCGTTATCTCAGCT;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=9;WE=92546152;WS=92546134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr14	92547145	rs761551	G	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=0.249;SC=CTCCCAAACTGCTAGCATCAC;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=92547153;WS=92547135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr14	92547176	rs761552	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=0.747;SC=CACCGTGCCCGTCCTATTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=11;WE=92547184;WS=92547166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	92547425	rs761553	C	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	92548785	rs1048755	C	T	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1075;ReadPosRankSum=0.350;SC=GCTTCTAACACTCGTTCCAGG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=66;WE=92548793;WS=92548775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr14	92548896	rs10146519	A	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=282;ReadPosRankSum=0.950;SC=AAAGGCTTTAAGTAAGTCAAA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=21;WE=92548904;WS=92548886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr14	92549586	rs16999141	G	A	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=47;PP=1688;SC=CACCCTTAACGACAAATATAG;SOR=1.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=74;WE=92549594;WS=92549576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	92549632	rs12590497	C	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=358;ReadPosRankSum=1.020;SC=ATCAACCTAACCAGTTAGTAA;SOR=1.068;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=18;WE=92549640;WS=92549622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr14	92555199	rs8003041	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=0.307;SC=TAGTGTATATTATAGGTAATA;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=22;WE=92555207;WS=92555189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr14	92559678	rs4904834	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=33;ReadPosRankSum=-1.646;SC=AAAGAAAACAGACAATATTAA;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=4;WE=92559686;WS=92559668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr14	92560008	rs1997920	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=0.165;SC=TATTCAAAATGTATTTCTCTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=92560016;WS=92559998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	92560288	.	GTTT	G	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.4995;HP=17;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=18;MQ=54.06;NF=2;NR=0;PP=24;QD=13.5;SC=AAGGCTATAGGTTTTTTTTTT;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=2;WE=92560298;WS=92560278;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr14	92560311	rs2402108	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.42;QD=21.58;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	92562277	rs17847278	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=407;ReadPosRankSum=0.081;SC=CAGAACGAGACTCTGTCTCAA;SOR=1.295;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=21;WE=92562285;WS=92562267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr14	92562568	rs12147767	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.355;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=2.306;SC=TTTAAAACAATATCTTGTGCA;SOR=0.412;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=28;WE=92562576;WS=92562558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr14	92582472	rs13350	G	A	261.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5466;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=115;ReadPosRankSum=-0.957;SC=AGACATTTCAGATTCTTCATG;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=8;WE=92582480;WS=92582462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr14	92582655	rs11160044	T	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.272;SC=GTCAGAAGAATGATTGCAATA;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=92582663;WS=92582645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	92584021	rs36078150	C	CTTTT	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.290;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=3.215;NF=0;NR=7;PP=175;ReadPosRankSum=-3.174;SC=AATACAACTGCTTTGTTTTTT;SOR=1.429;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=7;WE=92584032;WS=92584011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr14	92588002	rs3818263	T	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=335;ReadPosRankSum=0.401;SC=CCTCAGCGCCTACAGCGACCC;SOR=0.332;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=27;WE=92588010;WS=92587992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr14	92588155	rs10603293	ATTTT	A	1216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.68;ReadPosRankSum=2.838;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr14	92588192	rs12886909	T	C	712.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=6.131;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr14	92588219	rs7148709	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr14	92597500	rs372122742	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=401;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TCATAATTCTATGTTTTTATT;SOR=0.320;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=27;WE=92597508;WS=92597490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr14	92604780	.	C	CT	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5438;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=61.34;NF=0;NR=6;PP=79;QD=14.6666666667;SC=GTACAGGTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=92604788;WS=92604770;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	92627668	rs2025071	T	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=387;ReadPosRankSum=0.984;SC=GTAATTCTTGTTTGGTATTTT;SOR=0.660;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=23;WE=92627676;WS=92627658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr14	92627710	rs2025070	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TTTATATTCATGATCATGACC;SOR=0.293;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=92627718;WS=92627700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	92792255	rs941646	G	A	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=63;PP=2413;SC=TGCCAGACACGTGGAGAAATA;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=115;WE=92792263;WS=92792245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	92792432	rs941645	T	C	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=707;SC=GTTTATGGACTTGAGTGGGAA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=92792440;WS=92792422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	92905817	rs4900122	A	G	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=49;PP=1732;SC=ATAAATGCCAAGCCAAGAAGG;SOR=1.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=92905825;WS=92905807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	92909073	rs941650	T	C	5286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=76;PP=2874;SC=TCATCACCCATGGGGACGTCG;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=87;TCR=76;TR=163;WE=92909081;WS=92909063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	92915625	rs33921553	TACACACAC	T,TAC	318.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1,1;NR=7,7;PP=285,156;SC=CTCTTTTGTGTACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=8,8;WE=92915640;WS=92915615;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:10
chr14	92950048	rs35769213	CCTT	C	1779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=8;PP=1211;SC=TAATGGGGTCCCTTCTTCTCC;SOR=2.476;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=26;WE=92950058;WS=92950038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	92958612	rs7150406	G	A	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=47;PP=1821;SC=CAAAACAGATGCCTCATGCAT;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=94;WE=92958620;WS=92958602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	92959361	.	C	G	63	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=66;MMLQ=28;MQ=56.57;NF=1;NR=3;PP=63;QD=24.4428031368;SC=CACACACACACAGAGAAAGAT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=92959369;WS=92959351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr14	92960025	rs4904942	T	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=15;PP=534;SC=ACACTGGCGTTCTCCTCTCCC;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=92960033;WS=92960015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr14	93118229	rs117068593	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.437;SC=GGCCCCACGCCGCCCACCACC;SOR=1.802;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=21;WE=93118237;WS=93118219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr14	93125415	rs2295991	G	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.181;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=462;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GGGGCCAGGGGATGGGGATGG;SOR=2.753;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=23;WE=93125423;WS=93125405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr14	93142651	rs733447	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.803;SC=CTCCTGAGGAGGCTGCTCCCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=93142659;WS=93142646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr14	93154537	rs71698059	TGGC	T	3741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.521;NF=8;NR=50;PP=2430;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TGGACGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.492;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=149;TCF=17;TCR=132;TR=58;WE=93154547;WS=93154527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,99:0.47:212
chr14	93178191	rs1951708	A	G	9461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=150;PP=2965;SC=CCACGTCCGAATCTTCCATCC;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=124;TCR=150;TR=274;WE=93178199;WS=93178181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr14	93185301	.	G	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=300;ReadPosRankSum=0.027;SC=TCATCCCGTCGGTCAGGCATT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=93185309;WS=93185291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	93198972	rs12885208	A	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=-0.294;SC=CTTAACAAAAAAAAGATTAGT;SOR=0.297;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=11;WE=93198980;WS=93198962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr14	93199203	rs1613441	T	A	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=53;PP=1594;SC=CAACAAGAACTGATAAACATT;SOR=1.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=93199211;WS=93199193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	93276654	rs1040835	T	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1304;ReadPosRankSum=-2.507;SC=TCTGCAGACTTTTCAGGAGAG;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=74;WE=93276662;WS=93276644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr14	93276806	rs1040833	C	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr14	93276806	.	CTA	TTG	1368	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8;NR=23;PP=1368;QD=45.8538024149;SC=CATTAACTGTCTAATATAATT;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=31;WE=93276816;WS=93276796;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr14	93276808	rs1040832	A	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=4.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr14	93282872	rs142530146	T	TCTTCG	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.531;NF=2;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=-2.115;SC=TTCTCGCTTCTCTTCGCTTCG;SOR=0.207;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=93282880;WS=93282862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	93285962	rs12880298	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-1.089;SC=TGGGTGACGTGAGACTCTGAT;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=93285970;WS=93285952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	93286291	rs10716250	AC	A	617.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.524;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.516;NF=1;NR=13;PP=422;ReadPosRankSum=0.884;SC=GCTTAGGGTTACCCCACAAGT;SOR=1.138;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=14;WE=93286299;WS=93286281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr14	93290723	rs3818256	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=1.416;SC=TATTCACTTAATTATATACTC;SOR=0.720;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=12;WE=93290731;WS=93290713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr14	93290856	rs2273646	T	C	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr14	93290859	rs2273645	C	T	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,72:0.50:144
chr14	93303604	rs4904994	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=523;ReadPosRankSum=0.091;SC=AATTGTTCTTCTGTGGTAGCC;SOR=1.508;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=25;WE=93303612;WS=93303594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr14	93303850	rs113573267	T	TG	1679.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.52;MQRankSum=3.918;QD=27.54;ReadPosRankSum=1.338;SOR=1.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr14	93303854	rs74598769	T	C	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.87;MQRankSum=3.950;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.564;SOR=1.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr14	93303855	rs34061602	G	T	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.08;MQRankSum=3.987;QD=30.36;ReadPosRankSum=0.390;SOR=1.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr14	93389403	rs7159323	A	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.12;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	93392834	rs7146118	C	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=712;SC=GGATCATGGACTCCCAAAGAC;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=93392842;WS=93392824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	93398031	rs9658655	G	C	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1503;ReadPosRankSum=0.198;SC=GCTACAAGGAGATCCGGAAAG;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=107;TCR=106;TR=102;WE=93398039;WS=93398021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,130:0.51:256
chr14	93398078	rs9658656	G	A	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=934;ReadPosRankSum=0.596;SC=CTCAACGAACGTGTCTGGGAG;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=69;TCR=88;TR=72;WE=93398086;WS=93398068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr14	93398144	rs11851859	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=746;ReadPosRankSum=0.381;SC=CTTCATAACAACCCTGAAAGG;SOR=0.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=44;WE=93398152;WS=93398134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr14	93398670	rs2236132	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=202;ReadPosRankSum=1.362;SC=GGGAAAATGGTGGTCCCCCAC;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=17;WE=93398678;WS=93398660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr14	93401178	rs941581	A	G	3719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=63;PP=2311;SC=CGGCCATTGAAGCAGAGCTGG;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=117;WE=93401186;WS=93401168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
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chr14	93404674	rs6575304	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=466;SC=TCAGCAGTTGTGGCCAGTGGC;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=93404682;WS=93404664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr14	93406954	rs45585434	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=2.223;SC=GAGGCTCCCGCGCCTATCCTC;SOR=0.836;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=93406962;WS=93406944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr14	93407062	rs1043542	A	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=40;PP=1585;SC=CACTAGAGACAAGGGGGTGGA;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=91;WE=93407070;WS=93407052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	93407195	rs142097656	T	TA	1050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.186;NF=4;NR=18;PP=808;ReadPosRankSum=1.125;SC=AGTGCTGGCTTAGGGGAAGGA;SOR=0.570;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=22;WE=93407203;WS=93407185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr14	93407248	rs11446	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=31;PP=909;SC=TGGGGGGCCCAGAGGACGCCC;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=93407256;WS=93407238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	93412609	rs1998054	A	G	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=20;PP=1107;SC=ACCCCGCCTCACCTGCCTGGT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=93412617;WS=93412599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	93412743	rs2295394	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=839;ReadPosRankSum=1.526;SC=TGTCGATGCCGAAGAGTGACA;SOR=0.540;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=53;WE=93412751;WS=93412733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr14	93418155	rs2273392	TG	CC	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TCCTGGGGCCTGTGGCATGGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=93418164;WS=93418153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr14	93428802	rs2295393	T	A	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=830;ReadPosRankSum=1.756;SC=ACAAGGCAGGTACTTGGCACG;SOR=1.161;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=49;WE=93428810;WS=93428792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr14	93429060	rs2295392	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=638;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GCGGTCTACAGCGCCTGCCCT;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=45;WE=93429068;WS=93429050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,57:0.55:104
chr14	93649501	rs1046099	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=196;SC=TGCTCTACTCATTGCCATATC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=93649509;WS=93649491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	93651992	rs1268371	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GCGGGTATTATGGACCTGTTT;SOR=0.072;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=93652000;WS=93651982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr14	93681742	rs3783901	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=0.329;SC=TAAAATAGTATATGTTCTGGC;SOR=0.250;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=17;WE=93681750;WS=93681732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr14	93684814	rs10132640	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=0.511;SC=TGGGATTTTATTGTCCGTTAG;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=93684822;WS=93684805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr14	93693422	rs2905	C	T	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1275;ReadPosRankSum=0.129;SC=AATGAAAATGCGCTTCCCATT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=70;TCR=115;TR=92;WE=93693430;WS=93693412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,98:0.48:205
chr14	93720181	rs8012209	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=2.327;SC=TGTAGTACTATAATACTACTA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=93720189;WS=93720171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	93762162	rs2273639	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=-1.169;SC=ACAAACCAGACTTAAGATTTA;SOR=0.120;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=93762170;WS=93762152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	93799221	rs2273640	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CGTCGCCTCCGCCGCCGCCGC;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=12;WE=93799229;WS=93799211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr14	93799284	rs146686071	ACCG	A	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-2.823;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	93943998	rs61992606	G	A	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=52;PP=2089;SC=TGATATCAACGTTGGCTACCT;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=93944006;WS=93943988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	93953907	rs33942732	A	AT	402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.171;NF=17;NR=0;PP=340;ReadPosRankSum=-1.005;SC=TATTGGAGCTATTTTTTTTTT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=17;WE=93953915;WS=93953897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr14	93954192	rs12884458	C	T	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=30;PP=873;SC=CATGTGAGAACGTCATCATCA;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=93954200;WS=93954182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	93962691	rs8006093	G	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=158;SC=TCTTATATATGTATATCAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=93962699;WS=93962681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr14	93998806	rs942068	C	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=510;SC=ACAGAGTGAGCCACTGTCTCA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=23;WE=93998814;WS=93998796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr14	94109829	rs943318	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.612;SC=AAAAACAGCCGTGTGTGTAGT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=94109837;WS=94109819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	94152768	rs2296686	C	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=471;ReadPosRankSum=0.896;SC=GCTGGGCAGACAGTCACAGAC;SOR=0.798;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=29;WE=94152776;WS=94152758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr14	94160521	rs943323	C	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=426;ReadPosRankSum=-1.128;SC=TCTGGTTTGACGTTTCAGAGG;SOR=1.577;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=23;WE=94160529;WS=94160511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr14	94160611	rs960888	G	A	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=786;ReadPosRankSum=0.435;SC=GGTCTTCTGCGGCTGCAAACT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=54;WE=94160619;WS=94160601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr14	94187832	rs1887197	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=591;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TGTTGCTCTGCGAAGCACTCA;SOR=0.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=40;WE=94187840;WS=94187822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr14	94192137	rs10873436	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CTGGCCCCACCGGCTGGCAGC;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=16;WE=94192145;WS=94192127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr14	94245452	rs34914817	A	G	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	94245649	rs4905087	A	G	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=1.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	94245652	rs4900195	C	T	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr14	94394715	rs11554726	C	T	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TGGATAAGTCCGCACCCTGCC;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=78;WE=94394723;WS=94394705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,102:0.51:201
chr14	94400431	rs11625548	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=339;SC=CACATCTGCCTCGCTCCCGCT;SOR=2.200;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=94400439;WS=94400421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	94405871	rs10873442	G	C	5941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=121;PP=2965;SC=CGCGCTCGGGGGCCAGCGGCG;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=73;TCR=121;TR=194;WE=94405879;WS=94405861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr14	94406096	rs7155320	A	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=268;SC=CCAGCAGGAGAGCTCGGGCGC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=94406104;WS=94406086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	94410447	rs10134105	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=379;SC=CTTAGACACCTTGAAGCCTCA;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=94410455;WS=94410437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	94417421	rs7147919	G	A	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=116;PP=2965;SC=TGCCGTAGGCGTTCTTGGATT;SOR=1.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=82;TCR=116;TR=198;WE=94417429;WS=94417411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr14	94417541	rs4277287	A	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=44;PP=1218;SC=TGGTGTCTGCATTGTGCTGCA;SOR=2.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=94417549;WS=94417531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	94417586	rs4483793	G	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=433;SC=TCTTGCGCTCGCAGGCTGTGC;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=94417594;WS=94417576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	94419888	rs4243701	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=347;SC=CATGTAGGAGAAAGATACTCA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=94419896;WS=94419878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	94582130	rs3833507	T	TGGCCATGGC	1482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.697;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=2962;ReadPosRankSum=0.085;SC=CCTGCAGTTGTGGCTGTGCCC;SOR=1.564;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=18;WE=94582138;WS=94582120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr14	94594768	rs958187	T	G	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=12;PP=2343;SC=TCACGGAACTTCAGGGTGAGA;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=77;TCR=12;TR=89;WE=94594776;WS=94594758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	94595989	rs2273514	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=533;ReadPosRankSum=1.913;SC=GGGACGCGCCTACTCTGCCCT;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=38;WE=94595997;WS=94595979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr14	94700138	rs4905172	C	G	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=42;PP=1203;SC=TTATTACATTCGTTTAAAATG;SOR=2.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=94700146;WS=94700128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	94722764	rs6575403	C	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TAGTTATTAACTTCACTCAAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=94722772;WS=94722754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	94731440	.	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-1.602;SC=GCCACTTAATGTGGTACAGAT;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=94731448;WS=94731430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr14	94756794	rs941590	T	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1001;ReadPosRankSum=0.375;SC=CTCTTCCTCCTTGGGAGCCTG;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=57;WE=94756802;WS=94756784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr14	94772504	rs1042394	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=560;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GCACATCTCCGAGGTCATAGA;SOR=0.772;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=34;WE=94772512;WS=94772494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr14	94776219	rs2228542	C	T	3503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.439;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.952;SC=AGGGGAGCTCCGAGTCATGAA;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=106;TCR=146;TR=143;WE=94776229;WS=94776209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,158:0.56:284
chr14	94776221	rs2228541	A	C	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=62;PP=2959;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GGGAGCTCCGAGTCATGAAGG;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=106;TCR=143;TR=109;WE=94776229;WS=94776209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,126:0.45:281
chr14	94776387	rs2281520	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=-0.685;SC=AGAGGAAAACACAGTTCCAGG;SOR=4.762;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=13;WE=94776409;WS=94776377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr14	94776401	rs11160168	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=704;SC=TTCCAGGTGATCTCACGGGCC;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=94776409;WS=94776377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	94776441	rs11160169	C	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=2.349;SC=TGGCCTTCTGCATGCTTGGAA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=94776449;WS=94776431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr14	94780608	rs3748320	G	A	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=965;ReadPosRankSum=1.216;SC=CATTGCCCATGGTCATTTCTA;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=51;WE=94780616;WS=94780598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr14	94831028	rs34362280	G	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.175;SC=ACTTCCCTCTGCTTCAGCTTT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=94831036;WS=94831018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr14	94833033	rs1956172	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=609;ReadPosRankSum=0.473;SC=CAGAGAATGGTATTGTCCTGC;SOR=0.773;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=36;WE=94833041;WS=94833023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr14	94844843	rs1303	T	G	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1282;ReadPosRankSum=0.632;SC=TGGTATTTTGTTCAATCATTA;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=81;WE=94844851;WS=94844833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,100:0.52:194
chr14	94909630	rs3818257	C	T	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=63;PP=1725;SC=CTCTGTCTGTCGGCAGCCTGA;SOR=1.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=94909638;WS=94909620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	94912799	rs12888805	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=682;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TCTGGAGGACGGTGCAAGCCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=40;WE=94912807;WS=94912789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr14	94912896	rs1885137	T	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=660;ReadPosRankSum=1.280;SC=AAAGAAACTTTCCTGCTTCTG;SOR=0.701;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=38;WE=94912904;WS=94912886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr14	94914455	rs10129672	A	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=527;SC=TAATTCTGTCAGAGCAAGCCT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=94914463;WS=94914445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	94929367	rs2295652	G	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=549;ReadPosRankSum=1.503;SC=ACAGAAAGAGGGATGTGGTTT;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=35;WE=94929375;WS=94929357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr14	94929541	rs2224418	G	A	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=60;PP=1827;SC=AGTAAGAGGGGCCATCCTTCG;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=94929549;WS=94929531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	94929660	rs11624364	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AAACATCAGTGGCCCTAGTGG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=94929668;WS=94929650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	94930956	rs12891900	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CAGGCCTCTGTTTCCTTATCA;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=94930964;WS=94930946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr14	94930980	rs11628686	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.709;HP=1;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=909;ReadPosRankSum=-0.619;SC=AAATAAGAGCATGTGATTAAT;SOR=3.647;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=20;WE=94930992;WS=94930970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr14	94930984	rs13379439	G	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.181;HP=1;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=924;ReadPosRankSum=0.751;SC=AAGAGCATGTGATTAATTCTG;SOR=0.066;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=22;WE=94930992;WS=94930970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr14	94931016	rs8020984	T	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=14;PP=1682;SC=AGCTTGGACTTTTTTGCAAAT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=94931024;WS=94931006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	94931105	rs11628722	A	G	4939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=69;PP=2965;SC=TTTGTCAAAGACATTTTGGAT;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=144;WE=94931113;WS=94931095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
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chr14	94933473	rs28618118	C	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=327;ReadPosRankSum=-1.327;SC=GCTCCACTTTCTCAGTGTTCT;SOR=1.008;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=23;WE=94933481;WS=94933463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
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chr14	94933695	rs17090921	G	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.257;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=1713;ReadPosRankSum=-1.158;SC=TGTATATTCAGGGTGAAAGGG;SOR=1.123;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=49;WE=94933717;WS=94933685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr14	94933709	rs6575433	C	T	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.396;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=2079;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GAAAGGGCTTCTCCCACTTGG;SOR=0.404;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=58;WE=94933717;WS=94933685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr14	94936222	rs55683719	G	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=0.022;SC=ACCATTGAGGGGGTAAACTGA;SOR=0.409;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=22;WE=94936230;WS=94936212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr14	94942663	rs11850199	C	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GCTAGACATGCAAATGATATA;SOR=0.851;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=31;WE=94942671;WS=94942653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr14	95029852	rs5508	G	T	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=21;PP=1888;SC=TCCTCCTGCTGGTTGGACTAC;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=80;WE=95029860;WS=95029842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	95033671	rs3827893	A	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.960;SC=TAGAGAGTGAACACCAAATTA;SOR=0.653;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=19;WE=95033679;WS=95033661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr14	95034342	rs2070777	T	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=639;ReadPosRankSum=-0.054;SC=GAGCCGAAGCTGTTTGTGGGG;SOR=0.435;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=34;WE=95034350;WS=95034332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr14	95053890	rs6115	G	A	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=1784;ReadPosRankSum=0.581;SC=CCCAGCCAGAGCATCTTCTTC;SOR=0.834;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=203;TCF=105;TCR=98;TR=115;WE=95053898;WS=95053867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,123:0.51:240
chr14	95054176	rs6112	T	C	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=74;PP=2289;ReadPosRankSum=-0.094;SC=ACACTTTCCCTACCAACTTTA;SOR=0.810;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=254;TCF=124;TCR=130;TR=137;WE=95054184;WS=95054166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,153:0.52:294
chr14	95057270	rs6107	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=1.746;SC=GCTTCCCAAGGTCTATTCTGT;SOR=0.464;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=32;WE=95057278;WS=95057260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr14	95057344	.	C	CTCCACTCCACTCCAGTTCACTCTATTCAAT	132.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=26.43;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	95057374	.	TTCCAC	T	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.58;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=0;NR=3;PP=130;QD=49.0;SC=CTCTATTCAATTCCACTCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=95057386;WS=95057364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	95058360	rs6109	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=-1.056;SC=ACCTGCCCCTAGTGGCCTGGT;SOR=0.412;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=8;WE=95058368;WS=95058350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr14	95058462	rs6116	A	C	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=800;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CGGGGACAATATTCACTTTCA;SOR=1.146;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=48;WE=95058470;WS=95058452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr14	95058631	rs6108	A	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=577;ReadPosRankSum=-0.890;SC=AAGGGGGCTAAGCTATGGCCC;SOR=1.061;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=35;WE=95058639;WS=95058621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr14	95078677	rs1884082	G	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.493;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=460;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TCCCAAGCAGGGGGAGGAGTT;SOR=1.320;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=28;WE=95078685;WS=95078667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr14	95080803	rs4934	G	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=693;ReadPosRankSum=0.805;SC=ACCTCTCCTGGCTCTGGGGCT;SOR=0.452;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=38;WE=95080811;WS=95080793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr14	95107359	rs72696806	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=498;ReadPosRankSum=-1.230;SC=GTGAATCGCCCGAGGTCATAG;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=30;WE=95107367;WS=95107349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr14	95109833	rs17826595	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TTTGACTCACGTGCCACCAGC;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=75;WE=95109841;WS=95109823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr14	95110017	rs1884084	G	T	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=42;PP=1281;SC=AGATGAGGCAGCTGGAAGATG;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=95110025;WS=95110007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	95562366	rs145551486	A	C	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1311;ReadPosRankSum=-1.121;SC=AATACAGAAGAGCGTGAACTG;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=75;TCR=114;TR=92;WE=95562374;WS=95562356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,118:0.47:249
chr14	95566108	rs1778057	C	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=511;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CACACACACACAAACTTACCA;SOR=0.602;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=30;WE=95566116;WS=95566098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr14	95581899	rs2275182	G	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=16;PP=1364;SC=GCAAGTCTAAGTAAAGACTGG;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=95581907;WS=95581889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	95670749	rs139154234	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=629;ReadPosRankSum=0.664;SC=TCTTTGATGCGAACAAAAGTG;SOR=0.813;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=42;WE=95670757;WS=95670739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr14	95670804	rs5810715	C	CA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=0.952;SC=TATCTTCCTGCAAAAAAAAAC;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=95670812;WS=95670794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr14	95675883	rs17091921	C	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=0.413;SC=TTCCCGGATGCCTGATGGTGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=36;WE=95675891;WS=95675873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr14	95682152	.	CTGTGTGTGTGTG	C	431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-1.162;QD=20.56;ReadPosRankSum=1.821;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr14	95688959	rs945456	C	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=564;ReadPosRankSum=0.481;SC=TGGGGAGCCTCTGTGCTGGGA;SOR=0.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=41;WE=95688967;WS=95688949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr14	95696275	rs72710126	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=597;ReadPosRankSum=1.447;SC=CCGGCAGGGGGAGGCACTTAT;SOR=0.422;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=37;WE=95696283;WS=95696265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr14	95876097	rs3742344	C	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=48;PP=1318;SC=GAAACGACAGCTGGTTTTAAG;SOR=3.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=95876105;WS=95876087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	95884323	rs12434757	G	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=648;SC=CACACAGCACGCCCTCCGGAA;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=95884331;WS=95884313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	95898487	rs1187747	G	A	4288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.99;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	95905840	rs17092236	C	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=317;SC=CGGCCCCTGGCTCCACACTGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=95905848;WS=95905835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	95906321	rs9671369	G	A	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=74;PP=2637;SC=CAGCTTTTGCGTGGTCACAAC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=126;WE=95906329;WS=95906311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	95906441	rs910791	A	G	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=33;PP=954;SC=AGCCCAGGGCATCCTGAGTGC;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=95906449;WS=95906431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	95906476	rs910790	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.42;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	95910969	rs36019358	CAG	C	9027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=90;PP=2967;SC=GCAGGCTCTGCAGAGACACAG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=21;TCR=92;TR=110;WE=95910978;WS=95910950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr14	95918466	rs7144636	A	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.61;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	95918473	rs7144641	A	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.90;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	95918548	rs11362194	AC	A	4069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=34;PP=2967;SC=GTTCCAGCACACCCTGAGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=79;WE=95918556;WS=95918538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	95918625	rs4905318	T	C	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=87;PP=2671;SC=TATCAGAGAGTGGCTTCAGGT;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=77;TCR=87;TR=164;WE=95918644;WS=95918615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	95918741	rs4905319	G	A	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.56;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	95918745	rs4905320	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.49;SOR=3.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	95918759	rs4905321	C	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=653;SC=AGGTGAGGCTCCTCAACAGGA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=95918767;WS=95918731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	95921741	rs4905324	C	T	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=25;PP=1644;SC=GTGCCACCAGCTCGTCCTCGG;SOR=1.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=95921749;WS=95921731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	95923470	rs146162422	ACTGTC	A	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=34;NR=38;PP=2957;SC=ACCCTCTGTGACTGTCCCTAG;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=72;WE=95923482;WS=95923460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	95923670	rs2024863	A	C	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.09;NF=38;NR=60;PP=1944;SC=GCAGATCTACACGCTTCTGTG;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=98;WE=95923678;WS=95923660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	95932223	rs12434921	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=8;PP=903;SC=GGGTGGATACATGGATGGGTG;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=95932231;WS=95932213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	95932628	rs4900270	T	C	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=85;PP=2147;SC=ACCTGCCTCCTGGGTCGGGGG;SOR=2.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=20;TCR=85;TR=105;WE=95932636;WS=95932618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	95999820	rs3825546	T	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=882;ReadPosRankSum=1.006;SC=GTGGCAACAGTGACCAGAAAC;SOR=0.726;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=72;WE=95999828;WS=95999810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr14	96000090	rs45528633	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=1.589;SC=TGAGTGCTGGGTAGGAAGTCA;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=96000098;WS=96000080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	96009307	rs716315	C	T	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=24;PP=1172;SC=CATTTTGTTACAGTCATCATC;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=96009315;WS=96009297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	96103099	rs4905366	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=16;PP=1009;SC=TCACCTCACCATCTGCTCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=96103107;WS=96103089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	96103269	rs11160283	G	A	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=34;PP=1126;SC=TCTACTACACGCCCAGCCCTG;SOR=1.467;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=50;WE=96103277;WS=96103259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	96131432	rs1743491	A	G	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;PP=1023;SC=TGGAGGTGATATGCTTGAGAT;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=96131440;WS=96131422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	96131575	rs59088277	T	G	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=107;SC=CCCCTGAGAATGACCCTTATG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=96131583;WS=96131565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr14	96136775	rs2296310	C	A	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=1642;ReadPosRankSum=0.102;SC=CCTGTTTTATCCAGAGAGACA;SOR=0.785;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=111;WE=96136783;WS=96136765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,133:0.48:279
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chr14	96137935	rs911678	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=0.040;SC=TTTGTTTTGAGATGAATTTTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=96137943;WS=96137925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	96152728	rs11160284	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=0.201;SC=ACGCCGGAGCTGCTCCATTTA;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=23;WE=96152736;WS=96152718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr14	96157187	rs1064017	G	A	5964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=94;PP=2965;SC=GCTCTACCCCGGGAGGAAGTA;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=177;WE=96157195;WS=96157177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	96157482	rs1743530	C	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=8;PP=491;SC=GGGAAATCCACAAGCTGGAGT;SOR=1.220;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=96157490;WS=96157472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	96157698	rs1748958	A	G	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=37;PP=1141;SC=TGTGCGTCTCAGTGTAGGGAT;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=96157706;WS=96157688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	96556828	rs2369421	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=584;SC=GGCCAGACGCCGCTGTAGCCA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=96556836;WS=96556818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	96556914	rs2093722	T	C	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=33;PP=2046;SC=TCCAAGCCAATGCTGTCCTTC;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=100;WE=96556922;WS=96556904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	96557121	rs10148419	T	C	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=52;PP=2730;SC=GCTTGGAGGCTGGCCAGACCA;SOR=1.171;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=130;WE=96557129;WS=96557111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	96671139	rs1799722	C	T	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=792;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GATGACATCACTACCCAGCCC;SOR=0.710;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=51;WE=96671147;WS=96671129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr14	96671207	rs71103505	GGGTGGGGAC	G	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=2983;ReadPosRankSum=0.846;SC=CTCCGAGGAGGGGTGGGGACG;SOR=0.551;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=15;WE=96671223;WS=96671197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr14	96742344	.	C	T	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=989;ReadPosRankSum=1.333;SC=ATTTATCCATCAGATATACTT;SOR=0.646;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=61;WE=96742352;WS=96742334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,71:0.46:155
chr14	96742603	rs12893091	G	A	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=78;PP=2627;SC=AGCTGAAATGGAGGCGTGAGG;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=96742611;WS=96742593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr14	96757361	rs10454690	T	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=14;PP=315;SC=TTAAAACAAATTCTACAAATT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=96757369;WS=96757351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	96758160	rs2275022	C	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=256;SC=AAATATATATCTTACAATACA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=96758168;WS=96758150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	96761557	rs1770547	A	C	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=77;PP=2330;SC=TTCTTAGCAAACATTTAAATC;SOR=2.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=97;WE=96761565;WS=96761547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	96768514	rs3215949	G	GA	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TTAAAAATAAGAAAAAAAAAG;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=96768522;WS=96768504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	96771959	rs2289622	A	G	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1039;ReadPosRankSum=0.257;SC=GGGAGGGACTATTCCAAAATC;SOR=0.594;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=68;WE=96771967;WS=96771949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,81:0.48:170
chr14	96777408	rs3759602	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=237;ReadPosRankSum=-0.849;SC=AATGTAAACATGTCACGACAT;SOR=0.515;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=19;WE=96777416;WS=96777398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr14	96777468	rs3759601	G	C	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=738;ReadPosRankSum=1.919;SC=GACCTTCTTTGAAAGGCTCCA;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=46;WE=96777476;WS=96777458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,58:0.44:133
chr14	96781912	rs9323945	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=663;ReadPosRankSum=-2.278;SC=ATCACTCCATTCACTATGCCT;SOR=1.154;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=43;WE=96781920;WS=96781902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr14	96797724	rs1822372	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=880;ReadPosRankSum=0.976;SC=TAAGGTGATCGTGTGAGCAAG;SOR=1.365;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=54;WE=96797732;WS=96797714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr14	96813703	rs4905483	A	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CAGGTTCATTATGAATCACAA;SOR=0.245;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=10;WE=96813711;WS=96813693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr14	96829290	rs12434329	G	A	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=732;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TCTTCTTGATGGACTCCGAAA;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=49;WE=96829298;WS=96829280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr14	96848899	rs4905486	A	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=-1.416;SC=CACTTTATCAAAAAGAGGGGT;SOR=0.752;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=19;WE=96848907;WS=96848889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr14	96852071	rs1545280	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=339;ReadPosRankSum=0.908;SC=AATGTTGATATAAAGCTTAAA;SOR=0.662;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=27;WE=96852079;WS=96852061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr14	96864309	rs8019939	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CCTTGGTGGCACCCAGCAAGC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=96864317;WS=96864299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	96909025	rs12431832	A	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=17;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ATAGCCATCCACATATAACTG;SOR=0.743;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=120;TCF=89;TCR=31;TR=63;WE=96909033;WS=96909015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr14	96916228	rs10444759	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.566;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	96916232	.	G	GT	178	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=14;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=62.82;NF=1;NR=8;PP=178;QD=20.3333333333;SC=TATATGCGGTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=96916240;WS=96916218;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,9:0.64:14
chr14	96922752	rs2369679	C	G	5453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=101;PP=2965;SC=AATTGGCCAACTACTACAAAC;SOR=1.144;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=65;TCR=101;TR=166;WE=96922760;WS=96922742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr14	96998621	rs10533972	TTG	T	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=1.556;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr14	97321689	rs2230532	C	T	6393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=120;PP=2965;SC=CACACAATGGCGTGGGTATGT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=83;TCR=120;TR=203;WE=97321697;WS=97321679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr14	97410013	rs17094651	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-1.714;SC=GTGCTGTTTGTGCAGGTAAGA;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=40;WE=97410021;WS=97410003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr14	98435696	rs2124843	T	C	7926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.436;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.452;SC=AATATGGCTGTAAAGCTCGGT;SOR=0.544;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=97;TCR=124;TR=220;WE=98435704;WS=98435686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,288:1.00:289
chr14	98444253	rs8015127	C	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=14;PP=862;SC=CTGTAGGGACCATTTCCCACC;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=98444261;WS=98444243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	98444285	rs12890382	G	C	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=22;PP=1030;SC=AGCCCTACCCGGTCACCAAAT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=98444293;WS=98444275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	98444369	rs8016584	T	C	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=31;PP=1048;SC=ACCAAGCTGGTTTCCTCTCCG;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=98444377;WS=98444359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	99182559	rs8009159	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=615;ReadPosRankSum=-1.472;SC=GGCAAGGCTGGAGGCCACAAG;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=36;WE=99182567;WS=99182549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr14	99182626	rs4905757	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=531;ReadPosRankSum=-1.830;SC=CGCCCATCAGTGAGCCAACTT;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=38;WE=99182634;WS=99182616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr14	99392468	rs200318	C	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=491;SC=TGCATCACCTCTGTGTTGGCG;SOR=2.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=99392476;WS=99392458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	99640905	rs74649889	G	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=909;ReadPosRankSum=0.081;SC=GCAGGTCCCCGGGCGGCGTGG;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=56;WE=99640913;WS=99640895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr14	99642360	rs1152783	C	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CCACGGCCTCCGGCCCGAGCG;SOR=0.599;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=96;WE=99642368;WS=99642350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,117:0.59:198
chr14	99642647	rs2487507	T	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=0.057;SC=GGGATCCCAGTGCCCTGCCTG;SOR=0.651;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=26;WE=99642655;WS=99642637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr14	99961830	rs2069492	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=663;SC=TTGTTTCCCTTTTAGGTGACA;SOR=2.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=99961838;WS=99961820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	99981858	rs11621993	G	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=27;PP=793;SC=GCTAACTATCGGGCCTGAGCA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=99981866;WS=99981848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	99988724	rs2400681	A	G	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=6;PP=142;SC=CCGCTTATCCATCCCCCGAGC;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=99988732;WS=99988714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	100002473	rs12882209	A	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=50;PP=1505;SC=AGCAGACTCCATCCCCATTGC;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=100002481;WS=100002463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	100046271	rs34139518	T	TC	3315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.385;NF=50;NR=28;PP=2815;ReadPosRankSum=-0.832;SC=TCTGGCTCAGTCCAAGACTTT;SOR=0.726;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=78;WE=100046279;WS=100046261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,111:0.51:216
chr14	100069742	rs8007401	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=9;PP=407;SC=GCCCGCTCAGGCTGGCCTGGC;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=100069750;WS=100069732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	100119238	rs3825570	G	T	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=692;ReadPosRankSum=-1.963;SC=GGGCCTGGGTGGGGGCAGGCA;SOR=0.405;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=44;WE=100119246;WS=100119228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr14	100125721	rs7145262	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=648;ReadPosRankSum=1.412;SC=TGAGCCCTGGCTCAGGGCGAC;SOR=0.216;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=17;WE=100125739;WS=100125711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr14	100125731	rs11621678	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.472;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=916;ReadPosRankSum=1.054;SC=CTCAGGGCGACCCCGAGCCGC;SOR=1.877;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=22;WE=100125739;WS=100125711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr14	100135306	rs12436072	G	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=1142;ReadPosRankSum=1.209;SC=CCCAGGGCCAGGGTGGGGCCC;SOR=0.694;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=25;TCR=88;TR=62;WE=100135314;WS=100135296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr14	100141689	rs7158073	T	C	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=733;ReadPosRankSum=-0.683;SC=GAGGTGTTCGTGGGCGGACGC;SOR=0.781;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=58;WE=100141697;WS=100141679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,82:0.41:201
chr14	100150975	rs61984440	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CCTCGCCTAGTGCGCGCGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=100150983;WS=100150965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr14	100157967	rs754203	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-1.256;SC=CCTTGCCCCCAGGGCTCCTGG;SOR=0.465;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=100157975;WS=100157957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	100158241	rs4900442	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=41;PP=963;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CCCTGCCTTTCCTTGGGTTGG;SOR=1.270;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=94;TCF=19;TCR=75;TR=48;WE=100158249;WS=100158231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr14	100165673	rs3742376	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=486;ReadPosRankSum=0.844;SC=TGTGTGGGATCATGCATGGGA;SOR=0.210;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=38;WE=100165681;WS=100165663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr14	100184589	rs7151522	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=62;ReadPosRankSum=0.388;SC=GCCTTGGCACATGCTGTTCCC;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=100184597;WS=100184579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	100189287	rs10151332	C	T	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=42;PP=1868;SC=TTGTAGGACCCCTGACTGTTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=97;WE=100189295;WS=100189277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	100191710	rs76927709	C	T	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CAGAGATGAGCGGACCCTTTG;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=87;WE=100191718;WS=100191700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,108:0.57:190
chr14	100341430	rs1191121	A	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=84;PP=2539;SC=CCTACCATTCATCAAGTCATC;SOR=1.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=37;TCR=84;TR=121;WE=100341438;WS=100341420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	100344698	rs1191118	T	C	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=458;SC=TGATCTCCGTTGCTAGGCCTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=100344706;WS=100344688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	100357643	rs1191100	C	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=67;PP=2181;SC=AAGTAGCCAGCTTCAGGGGCC;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=100357651;WS=100357633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	100360855	rs1191098	A	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=286;SC=TTAGAATGACAGAAGGGTAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=100360863;WS=100360845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	100383963	rs3818279	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.673;SC=AGCAGGAAAACATTTTTCTCT;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=100383971;WS=100383953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	100384232	rs2273704	A	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=425;ReadPosRankSum=-1.418;SC=CTTATGGAAAAGAGGCCTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=35;WE=100384240;WS=100384222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr14	100387242	rs34263849	A	AT	3277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.680;NF=6;NR=72;PP=1822;ReadPosRankSum=1.255;SC=TCACTACTTTATTTTTTTAAT;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=16;TCR=167;TR=78;WE=100387250;WS=100387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,138:0.49:281
chr14	100404351	rs2295787	T	C	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=82;PP=2632;SC=TCTTGTCAGATTGCTCGGCTG;SOR=1.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=30;TCR=82;TR=112;WE=100404359;WS=100404341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	100406193	rs4900449	T	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=645;ReadPosRankSum=0.904;SC=CAGAGCAGGTTCCCAAGTGAG;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=36;WE=100406201;WS=100406183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr14	100563943	rs3206354	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-1.362;SC=AGGCAACCACGTTCTCCAATG;SOR=0.562;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=25;WE=100563951;WS=100563933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,37:0.34:110
chr14	100592959	rs726514	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=496;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CTCTGAAGCCGGGGCCGGCGG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=30;WE=100592967;WS=100592949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr14	100599164	rs941897	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.248;SC=TGAGATGAGCGCATCGCCAGG;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=19;WE=100599172;WS=100599154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr14	100607360	rs1951486	T	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=608;SC=GGGCGTTAAATCCTTCTCAGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=100607368;WS=100607350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	100607719	.	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=0.235;SC=GAGCAGCCACGGCAGAAAGGG;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=100607727;WS=100607709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr14	100608274	rs4905933	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=0.120;SC=TTACCATCTCTAGTTGAGGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=100608282;WS=100608264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	100615665	rs4905936	T	C	4749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=80;PP=2796;SC=TGCGGGCGGGTGTGCAGAAGA;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=150;WE=100615673;WS=100615655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr14	100625902	rs7157599	C	T	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=120;PP=2965;SC=CTCGAAGTCGCTGCGGCTCGC;SOR=1.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=81;TCR=120;TR=201;WE=100625910;WS=100625892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr14	100625964	rs61165113	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=44;PP=971;ReadPosRankSum=0.520;SC=GGCCGGCTCGGCTCTGCTGCA;SOR=0.634;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=56;WE=100625972;WS=100625954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr14	100759046	rs3825555	C	A	7385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=110;PP=2965;SC=CGAAGCTGGGCGTCTCACGCA;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=111;TCR=110;TR=221;WE=100759054;WS=100759036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	100759277	rs3742379	C	T	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=70;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GGCCCAGGGCCCGGAGGGTGT;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=150;WE=100759285;WS=100759265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,193:0.99:195
chr14	100792093	rs9324019	C	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=628;ReadPosRankSum=0.753;SC=CGGCCCCACTCTCCTCACCGT;SOR=1.692;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=32;WE=100792101;WS=100792083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr14	100792220	rs7155877	C	T	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=94;PP=2965;SC=CACCTGTCCACGGCCAGGAGA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=194;WE=100792228;WS=100792210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr14	100792482	rs1951519	C	A	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.698;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=81;PP=2817;ReadPosRankSum=1.239;SC=CTGAAGCCCACTTCTCCTGCA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=139;WE=100792490;WS=100792472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,156:0.99:157
chr14	100795139	rs35007880	G	T	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CAGCAGCGGCGGCTTTCGGCC;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=82;WE=100795147;WS=100795129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,98:0.52:187
chr14	100795630	rs4905950	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GGGCCGGAAGCGTGAGTCCAG;SOR=2.472;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=13;WE=100795638;WS=100795620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr14	100795663	rs10147903	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=-1.802;SC=TGGGCGCCCCGATCAGGCTCC;SOR=1.204;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=21;WE=100795671;WS=100795653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr14	100801423	rs2234532	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=444;SC=ATGTCCTGAGTGGCTCCTTCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=100801431;WS=100801413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	100803364	rs2234530	A	G	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=10;PP=1291;SC=TGGGTGGCAGAAGGCGGCTGT;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=100803372;WS=100803354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	100803655	rs2234528	C	A	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=769;SC=ATTCTGGACCCGGGAAAGGCC;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=100803663;WS=100803645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	100808493	rs5810992	G	GA	2202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=22;PP=1275;SC=AGGAAAAAAAGAAAAAAAATT;SOR=1.550;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=50;WE=100808501;WS=100808483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	100808510	rs1373	T	A	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=29;PP=1742;SC=AATTCAAAATTTTACCTAAAT;SOR=1.464;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=84;WE=100808518;WS=100808500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	100808845	rs9453	G	A	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=31;PP=892;SC=GTGGAGTGCAGCAGGGCTGGT;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=100808853;WS=100808835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	100813077	rs941923	T	C	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=15;PP=1885;SC=GCAGTGGGCCTCTTACCAATG;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=100813085;WS=100813067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	100820980	rs1009812	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=33;PP=976;SC=TTTGGAAATGGAAAATATAGA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=100820988;WS=100820970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	100826773	rs2234524	C	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=681;SC=TCAGTCTTACCACAGCTGGCC;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=100826781;WS=100826763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	100832252	rs724392	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=140;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GTTACGGAATCACCCAAAGGT;SOR=0.250;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=11;WE=100832260;WS=100832242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr14	100832282	rs2146105	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=14;PP=936;SC=AGTGACCTTGCGCACTTACAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=100832290;WS=100832272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	100832391	rs724391	T	C	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=42;PP=1489;SC=GCCAAGGGAGTGTCACAGTTT;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=86;WE=100832399;WS=100832381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	100847523	rs2181170	T	C	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=74;PP=2825;SC=GAGAAGCGATTGGGGATCTTG;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=138;WE=100847531;WS=100847513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	100847707	rs2273800	A	G	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1290;ReadPosRankSum=0.047;SC=TCATCTTTCCATGCTCAAAGT;SOR=0.681;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=162;TCF=78;TCR=84;TR=81;WE=100847715;WS=100847697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,104:0.52:200
chr14	100847930	rs3742387	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=827;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TTATTCAGCCATATTTGAATA;SOR=0.679;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=61;WE=100847938;WS=100847920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr14	100934602	rs4905966	C	T	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=42;PP=1196;SC=TATACGCTTGCGTGGCAGAGG;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=100934610;WS=100934592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	100995793	rs7493442	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.751;SC=TCTCAGAAGTGGGGGGCAGGA;SOR=0.608;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=9;WE=100995801;WS=100995783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr14	100996312	rs13065	T	C	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1185;ReadPosRankSum=-1.171;SC=GCACCACCTATCACCCCGTGC;SOR=0.872;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=77;WE=100996320;WS=100996302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr14	101005215	rs12893951	T	C	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GCAGTGAGCCTGCGTAGCTGG;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=81;TCR=102;TR=88;WE=101005223;WS=101005205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr14	101005236	rs12892571	A	G	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=47;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.125;SC=GGAAGGCCTCATGCTGGAAGC;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=165;TCF=67;TCR=98;TR=78;WE=101005244;WS=101005226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,84:0.45:187
chr14	101007072	rs6575788	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=1029;SC=CCCTCTCTGGCCTCCACACTC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=101007080;WS=101007062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	101012779	.	C	G	117	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5729;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=23;MQ=57.45;NF=7;NR=0;PP=117;QD=21.6816017925;SC=CCTCGCCCCGCCCCGGCCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=101012787;WS=101012769;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr14	101012796	.	C	G	498	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=23;MQ=59.02;NF=19;NR=3;PP=498;QD=24.2168732976;SC=CCTCGCCCCGCCCCGGCCCTC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=22;WE=101012804;WS=101012786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr14	101012813	.	C	G	646	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=23;MQ=58.97;NF=27;NR=10;PP=646;QD=18.3992219607;SC=CCTCGCCCCGCCCCGGCCCTC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=37;WE=101012821;WS=101012803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,37:0.84:44
chr14	101034190	rs61993005	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=10;PP=811;SC=GCCTTCCCCAGCGCCCTCACC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=101034198;WS=101034180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	101034419	rs58030748	T	C	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=140;SC=CGTCCCCAGCTTCCAGTCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=101034427;WS=101034409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	101036052	rs7141087	T	C	4761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=57;PP=2858;SC=AATCCAAGTGTTCCTCCATCC;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=141;WE=101036060;WS=101036042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr14	101138230	rs8011237	A	C	4918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=68;PP=2965;SC=CTCTCCTAGAACTTTCTGTCG;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=143;WE=101138238;WS=101138220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr14	101198417	rs6575799	A	G	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=27;PP=1848;SC=TGCCAACAACAGGACCTGCGT;SOR=1.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=95;WE=101198425;WS=101198407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	101198609	rs77235285	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=540;ReadPosRankSum=1.974;SC=CTGGACCTGTCGTCTGACAAA;SOR=0.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=32;WE=101198617;WS=101198599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr14	101200445	rs17577779	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=321;ReadPosRankSum=-2.803;SC=TGTTGTAGCCTAGCCCCTGAG;SOR=0.392;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=18;WE=101200453;WS=101200435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr14	101200645	rs1802710	T	C	4132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=95;PP=2184;ReadPosRankSum=0.491;SC=GCACTGACATTGGGGGCGACT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=314;TCF=135;TCR=179;TR=166;WE=101200653;WS=101200635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,202:0.51:393
chr14	101311731	rs139003317	CCCT	C	3112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=1978;SC=TCCTCATCCGCCCTCCTCCTC;SOR=1.451;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=42;WE=101311741;WS=101311721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	101347299	.	T	G	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=70;QD=11.6412458386;SC=GCGGGGTGGGTGGGTGGCTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=9;WE=101347307;WS=101347285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:31,9:0.22:40
chr14	101348584	rs11623267	C	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TCTTGCTCCTCGACTCCCCAG;SOR=0.781;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=62;WE=101348592;WS=101348574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr14	101349017	rs6575805	A	G	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=60;PP=2274;SC=GGGAGAGCGCAAACGGCTGGT;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=105;WE=101349025;WS=101349007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	101350298	rs3825569	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=470;ReadPosRankSum=-0.275;SC=ACTCAAACACTTCGGACATGG;SOR=0.734;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=29;WE=101350306;WS=101350288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr14	101351283	rs41286564	C	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GTATCAGGGTCTCAAGGACAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=101351291;WS=101351273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	101364085	.	TGGCGGGGGGGGG	T	40.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	101364088	.	C	T	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=13;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=24;QD=29.3856062736;SC=CCCTGGTTGGCGGGGGGGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=101364103;WS=101364078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	101391354	rs34857222	G	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=0.176;SC=ACAAAGAAATGTGTAAGTGAA;SOR=1.377;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=24;WE=101391362;WS=101391344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr14	101396148	rs35436326	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-2.013;SC=CAAGGATCTTGTTCTTAGTTT;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=101396156;WS=101396138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	101403072	rs1956732	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	101403075	rs1956731	C	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	101406011	rs1951026	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=898;SC=ATGAGTCTAGGACCTTGTTCA;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=101406030;WS=101406001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	101406022	rs1951025	T	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=-1.170;SC=ACCTTGTTCATGGGCCTTTTG;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=25;WE=101406030;WS=101406001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr14	101409763	rs35829821	A	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=889;ReadPosRankSum=1.070;SC=GAAGGTATACATGAATGAAGA;SOR=0.573;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=72;WE=101409771;WS=101409753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr14	101411953	rs12433065	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=416;ReadPosRankSum=1.674;SC=ATCAATAAACAAAGGTATAAA;SOR=1.383;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=27;WE=101411961;WS=101411943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr14	101412173	rs11847325	G	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=203;SC=TTTTAGTAAAGAAGTATATGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=101412181;WS=101412163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	101418192	rs10713875	TG	T	1664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=1201;SC=GGCCCAAGCTTGGGACCAATG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=29;WE=101418200;WS=101418182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	101420572	rs8015089	G	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=337;SC=TATCAAAGTGGCAGATTATAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=101420580;WS=101420564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	101423634	rs12887775	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=273;ReadPosRankSum=-2.241;SC=TATTTAAGAATATATAAGGAT;SOR=0.445;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=16;WE=101423642;WS=101423624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr14	101429568	rs16791	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TAGTTCATGAGTTTTGATTGT;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=101429576;WS=101429558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	101431194	rs4547276	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=671;ReadPosRankSum=0.920;SC=GTCTGTTAGAAAAGATACATG;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=38;WE=101431202;WS=101431184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr14	101432440	rs111435301	C	CAGA	3742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.341;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.963;NF=4;NR=48;PP=2523;ReadPosRankSum=2.411;SC=AGGTCCATCACAGAAGTAGAG;SOR=1.045;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=104;TCF=14;TCR=90;TR=52;WE=101432448;WS=101432430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr14	101433469	rs67466596	A	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=-0.140;SC=ATCACAAAAGAAATCTGGCCC;SOR=0.881;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=32;WE=101433477;WS=101433459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr14	101433552	rs2145502	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=0.439;SC=GTTCACTTCACTGTATTATTA;SOR=0.449;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=7;WE=101433560;WS=101433542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr14	101435371	rs12432302	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=680;ReadPosRankSum=0.040;SC=AGAAAAGAAAACCAGTTCTTT;SOR=1.100;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=45;WE=101435379;WS=101435361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr14	101436159	rs34955121	GT	G	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=631;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GTATTTCTTTGTTAATACATT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=18;WE=101436167;WS=101436149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr14	101439870	rs1956727	G	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=417;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GACTGATGTGGATTTCTTATT;SOR=0.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=23;WE=101439878;WS=101439860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr14	101439916	rs1956726	T	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=725;ReadPosRankSum=1.280;SC=GTATTAGTGTTAAATCAAAGA;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=43;WE=101439924;WS=101439906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr14	101440072	rs150296823	CTTG	C	2261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.047;NF=6;NR=30;PP=1461;ReadPosRankSum=1.834;SC=ATATGAGGACCTTGTTGTTGA;SOR=1.112;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=36;WE=101440082;WS=101440062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,60:0.56:108
chr14	101442218	rs12893444	A	G	3094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1943;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TACATGTCTGAAATTCTGAGG;SOR=0.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=221;TCF=106;TCR=115;TR=123;WE=101442226;WS=101442208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,144:0.57:254
chr14	101447517	rs10131435	A	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=667;ReadPosRankSum=1.548;SC=ATACATTTTCATTCTATTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=37;WE=101447525;WS=101447507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr14	101448425	rs75928883	C	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TTACATGAATCTATAGACTGA;SOR=0.444;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=135;TCF=41;TCR=94;TR=71;WE=101448433;WS=101448415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,75:0.49:153
chr14	101452574	rs4906029	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=557;ReadPosRankSum=0.885;SC=GTTTTGATTCTATTTTTATAA;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=29;WE=101452582;WS=101452564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr14	101453344	rs3742401	G	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=591;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TAAATTTAAAGACAACATAGA;SOR=0.460;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=41;WE=101453352;WS=101453334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr14	101454578	rs74797707	A	G	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=82;PP=2068;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CAGAAAGTCAATTTCCTCTGT;SOR=0.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=260;TCF=109;TCR=151;TR=139;WE=101454586;WS=101454568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,156:0.52:298
chr14	101454594	rs78341223	A	G	2938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=78;PP=1822;ReadPosRankSum=-1.286;SC=TCTGTTTCACATGATTCTATA;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=236;TCF=94;TCR=142;TR=128;WE=101454602;WS=101454584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,142:0.53:269
chr14	101489858	rs12892719	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr14	101492224	rs7141987	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCGCTCAGTGTGACCCAGCGG;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=18;WE=101492232;WS=101492214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr14	101492548	rs12586258	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=580;ReadPosRankSum=0.576;SC=ATCTGCGAGGCGTTTGCGACA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=35;WE=101492556;WS=101492538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr14	101495787	rs4906031	G	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=490;SC=GTGAAGGCTTGAAGAGCTTTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=101495795;WS=101495786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	101496145	rs9324030	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=-0.324;SC=CGAGGCTGACAGCGTGCCATG;SOR=0.218;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=10;WE=101496153;WS=101496135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr14	101496574	rs12435041	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.016;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr14	101496579	rs12435042	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.65;ReadPosRankSum=2.046;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr14	101498483	rs8018238	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=2.538;SC=CTGATCAGGACCTCCCTACCC;SOR=1.101;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=17;WE=101498491;WS=101498473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr14	101506555	rs76847254	A	G	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TGAGCCCTCCAGGGTAAGTGG;SOR=0.873;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=74;WE=101506563;WS=101506545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr14	101507727	rs12894467	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=463;ReadPosRankSum=0.982;SC=TAATCCTTCACGCATTTGCTT;SOR=0.532;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=33;WE=101507735;WS=101507717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr14	101512972	rs11160618	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr14	101512972	.	CCA	TCG	616	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=12;PP=616;QD=37.1926597146;SC=CGTGCTGTGCCCATTGTCTCA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=18;WE=101512982;WS=101512962;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr14	101512974	rs10140057	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.51;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr14	101514371	rs10132916	T	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=390;ReadPosRankSum=0.109;SC=GAGGGGACATTGGTGCCTGCC;SOR=0.559;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=33;WE=101514379;WS=101514361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr14	101514950	rs10144193	A	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=0.015;SC=GCATATGAATAGTTGGCTAGA;SOR=1.651;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=14;WE=101514958;WS=101514940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr14	101518760	rs1951032	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=196;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TGGTGAAGACGTGGGCCGTCA;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=14;WE=101518768;WS=101518750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	101518910	rs4906032	A	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=504;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CCTTCAGGCAAGGGGTCTTGG;SOR=0.427;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=33;WE=101518918;WS=101518900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr14	101520527	rs28752084	A	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.273;SC=GGACACCCGTAAGCTGCCTCA;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=101520535;WS=101520517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	101522556	rs56103835	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=312;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TGCCACCTCATGGTACTCGGA;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=25;WE=101522564;WS=101522546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr14	101531854	rs61992671	A	G	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CTGGTCCACTAGCCGTCCGTA;SOR=0.491;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=74;WE=101531862;WS=101531844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,84:0.49:170
chr14	102356761	rs116910053	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=0.454;SC=AATTCAAATACAATTTCACTG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=17;WE=102356769;WS=102356751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr14	102474751	rs45508391	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=460;ReadPosRankSum=-2.237;SC=TCTACCTCTTGGATTAGAAAT;SOR=0.457;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=26;WE=102474759;WS=102474741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr14	102507065	rs17541540	G	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.978;NF=32;NR=45;PP=1196;ReadPosRankSum=0.032;SC=GGGTTTTGCTGCTTAAAGGGA;SOR=0.973;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=77;WE=102507073;WS=102507055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,93:0.52:180
chr14	102510428	rs1190606	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TGTATCTGGGAAGGATGCTGC;SOR=2.030;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=102510436;WS=102510418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	102548224	rs2298877	T	C	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=42;PP=1503;SC=GGTAATACTCTTGGTTTCTAT;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=102548232;WS=102548214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	102548384	rs6575895	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=432;ReadPosRankSum=-1.422;SC=ACTGAAAGTTCACCATTTTCT;SOR=0.471;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=24;WE=102548392;WS=102548374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr14	102549262	rs10782495	A	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=6;PP=796;SC=AGCCACACACAACATAGTTTT;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=102549270;WS=102549252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	102550569	rs3742429	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=538;SC=ATTTAGTAGAGATGGGGTTTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=102550577;WS=102550559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	102550803	rs4947	G	A	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.76;NF=35;NR=43;PP=1591;SC=ACAATTTGATGTTGTTCTTTT;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=78;WE=102550811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	102551795	rs35308930	T	TTAA	2191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.279;NF=13;NR=27;PP=2139;ReadPosRankSum=-0.089;SC=AAAAATTGACTTAATACATTC;SOR=0.718;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=40;WE=102551803;WS=102551785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr14	102552773	rs8004640	A	G	14059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=1.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr14	102552773	.	AAT	GAG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=93;NR=152;PP=2947;QD=20;SC=GGCAACACGAAATTCCATCGC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=252;TCF=95;TCR=157;TR=245;WE=102552783;WS=102552763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,245:0.97:252
chr14	102552775	rs3736807	T	G	14059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.06;SOR=1.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr14	102568296	rs10873531	G	A	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=33;PP=1418;SC=CCAGTGACGCGGTGACAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=102568304;WS=102568286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	102568367	rs8005905	T	A	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=1059;ReadPosRankSum=2.230;SC=CCAGACACCATCAGATGCCAG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=102568375;WS=102568357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr14	102808330	rs12590618	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=55;PP=1332;ReadPosRankSum=0.541;SC=TGGTTGCTGTCGGCGAAGCCA;SOR=0.761;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=56;TCR=110;TR=84;WE=102808338;WS=102808320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,91:0.48:189
chr14	102808554	rs34220197	CGTGGA	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.020;NF=1;NR=3;PP=212;ReadPosRankSum=-1.044;SC=CGGTCGTCACCGTGGAGCCAG;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=102808570;WS=102808544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	102808562	rs56144634	C	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=-0.687;SC=ACCGTGGAGCCAGAGCCCTCA;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=4;WE=102808570;WS=102808544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	102814945	rs7012	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=485;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GATGCAGCCTGCTGTCGCTCT;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=28;WE=102814953;WS=102814935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr14	102815042	rs7011	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=551;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GGCCACCGTGCGCTTCAGGAG;SOR=0.902;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=40;WE=102815050;WS=102815032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr14	102873886	rs60215817	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=1.152;SC=TCATCTGCTTAGAAAGTTTAT;SOR=0.580;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=33;WE=102873894;WS=102873876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr14	102891646	rs4906197	A	G	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=503;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AAGGGACGCCACCATATCTTC;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=33;WE=102891654;WS=102891636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr14	102894593	rs1309353	G	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=708;SC=ACAGGCCACAGTTGCTGGTTT;SOR=3.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=102894601;WS=102894583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	102901201	rs10149146	A	G	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1297;ReadPosRankSum=-0.900;SC=AGAGCAGGACATCCTAACCAG;SOR=0.885;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=78;WE=102901209;WS=102901191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,83:0.48:174
chr14	102904551	rs142320181	CCCCGCTCCCTGCT	C	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.028;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.313;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr14	102918686	rs1190554	T	C	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=1331;ReadPosRankSum=0.526;SC=GCAGGCGGCTTGGTGCAGACA;SOR=0.568;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=243;TCF=143;TCR=100;TR=111;WE=102918694;WS=102918676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,130:0.46:285
chr14	102919047	rs2295976	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=-0.938;SC=CAAAACTGCCCGGCCTGTGTC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=102919055;WS=102919037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	102963128	rs11626608	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=0.833;SC=CACCTGACATTCTGGAGACAA;SOR=0.228;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=17;WE=102963136;WS=102963127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr14	102964359	rs146599191	C	CGCCCAAGCTCCCAGCTCCATCTGT	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	102964654	rs2403058	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CAGGGGCTTCAGAGTGACTCC;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=13;WE=102964662;WS=102964644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr14	103059220	rs1057881	G	A	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=17;NR=16;PP=521;SC=CCCGGCCCCCGCCGATGCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=103059228;WS=103059210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	103388999	rs2295828	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=269;ReadPosRankSum=-2.159;SC=CAAAGTCTCCTGGTGGGGTGC;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=30;WE=103389007;WS=103388989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr14	103412268	rs2403107	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=1.876;SC=GGATTGAGTCTGCAAGGATTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=103412276;WS=103412258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	103413941	rs8007924	T	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=233;SC=AGGCTGGAGGTTGAGACCCTA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=103413949;WS=103413931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	103414179	rs12886225	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=371;ReadPosRankSum=0.366;SC=GGAGACACGCGCACAGGACCC;SOR=0.874;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=27;WE=103414187;WS=103414169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr14	103434530	rs2093414	T	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	103440282	rs1018550	G	T	8798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=91;PP=2965;SC=TTCCATCATCGGCATGAACGT;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=172;TCR=91;TR=263;WE=103440290;WS=103440272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr14	103440473	rs8009219	G	C	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=48;PP=1311;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GCTGTCGCTCGAGCCTGTTTG;SOR=0.976;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=36;TCR=94;TR=65;WE=103440481;WS=103440463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr14	103449773	rs2269322	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GTCCAAACCCCGTCACCTCTT;SOR=0.260;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=103449781;WS=103449767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	103523598	rs34302315	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	103566904	rs1057640	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=458;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GTGTCAGCCAGCAGGCATCCA;SOR=0.803;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=32;WE=103566912;WS=103566894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr14	103568729	rs10142200	A	G	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=57;PP=1370;ReadPosRankSum=1.202;SC=CGGAGGAGGAAGCCCACCCTT;SOR=0.735;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=62;TCR=101;TR=90;WE=103568737;WS=103568719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,110:0.54:202
chr14	103570134	.	C	CGTGTGTGTGT	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.132;NF=3;NR=3;PP=1045;ReadPosRankSum=0.555;SC=GGCGCGCGCGCGTGTGTGTGT;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=6;WE=103570142;WS=103570124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	103573070	rs117509675	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=0.555;SC=GGCTCTATTCCCCAGCCTGGT;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=103573078;WS=103573060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	103574714	rs10144543	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.020;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=837;ReadPosRankSum=0.288;SC=TTGGGGCAGGCGGTGGCTCTG;SOR=1.183;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=51;WE=103574722;WS=103574704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr14	103576395	rs729185	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=537;ReadPosRankSum=-1.784;SC=CCATTCTGGCGCTGCGCCGAC;SOR=0.924;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=31;WE=103576403;WS=103576385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr14	103576415	rs729184	A	G	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=31;PP=1645;SC=CTGGGCCGCCAGCGGAACCAG;SOR=1.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=103576423;WS=103576405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	103576443	rs729183	TC	CG	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=1653;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TGCAGCACACTCAAGACCTGC;SOR=0.686;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=49;WE=103576452;WS=103576433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr14	103576608	.	C	T	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GAGCTGTGGTCAGTGGGGGTC;SOR=0.461;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=169;TCF=98;TCR=71;TR=80;WE=103576616;WS=103576598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr14	103576642	.	C	T	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1497;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GGGAGTCACTCTGGGCCCTGC;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=88;WE=103576651;WS=103576632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,104:0.50:209
chr14	103576775	rs3870	C	T	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=1014;ReadPosRankSum=0.569;SC=GTTTTGGGGCCGCAGAGCTCT;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=60;WE=103576783;WS=103576765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr14	103576803	rs11355422	CG	C	933.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.863;NF=3;NR=28;PP=447;ReadPosRankSum=-0.202;SC=GCCTATCGGGCGGGGGGGGGC;SOR=0.614;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=31;WE=103576811;WS=103576793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr14	103593950	rs1132339	C	G	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=55;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GCTCTGGGTGCAGAACCTCTA;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=85;TCR=124;TR=92;WE=103593958;WS=103593940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,111:0.45:244
chr14	103595997	rs2234130	G	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=213;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CAGAGACCAAGGCTGAGGGCC;SOR=0.908;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=17;WE=103596005;WS=103595987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr14	103596488	rs2234131	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=374;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CAGGGCACACGTACCGCCCGT;SOR=2.306;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=25;WE=103596496;WS=103596478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr14	103596609	rs2234133	T	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=209;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TGCCCCCTTGTCCAGGCGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=19;WE=103596617;WS=103596599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr14	103597565	rs749206	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=419;ReadPosRankSum=-1.123;SC=GTGGAGGGAGGAGGAGCTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=23;WE=103597573;WS=103597555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr14	103599938	rs2234143	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=514;ReadPosRankSum=-0.240;SC=AGATAGGCCGCTGGTGCCTCT;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=31;WE=103599946;WS=103599928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr14	103602278	rs710100	A	G	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=1123;ReadPosRankSum=1.218;SC=CACCGCCAGCATTAGACGTCA;SOR=0.967;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=70;WE=103602286;WS=103602268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,79:0.53:149
chr14	103803645	rs117392997	T	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=403;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TTTTTTGTAATAGGAATGTAA;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=25;WE=103803653;WS=103803635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr14	103852607	rs12436956	G	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=549;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GTTCGCGGGCGGGTCTGCGAA;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=27;WE=103852615;WS=103852597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr14	103852725	rs3825566	C	T	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=66;PP=2442;SC=ATTGTGCAAACGTGTGTGTCA;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=128;WE=103852733;WS=103852715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	103871602	.	G	A	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=46;PP=1133;ReadPosRankSum=0.968;SC=TACAGGCAGAGAGGTAAATAC;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=43;TCR=90;TR=70;WE=103871610;WS=103871592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,79:0.53:148
chr14	103915212	.	CTTGTG	C	117	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=117;QD=57.0094831114;SC=TGTTTAATAACTTGTGTTGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=103915234;WS=103915202;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,3:1.00:3
chr14	103915226	.	A	G	169	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=169;QD=50.9428031368;SC=TGTTGGGGGGATTATGTGTTT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=103915234;WS=103915202;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr14	103918182	rs2273702	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=430;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TTCATAGTTAGAGTTTATATG;SOR=0.855;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=21;WE=103918190;WS=103918172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
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chr14	103932888	rs1951393	C	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=749;SC=AAGCACAAGTCATATGAACAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=103932896;WS=103932878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr14	103934488	rs10137161	T	C	3626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=56;PP=2113;SC=AGAAGTGTTTTTTCAAGCCAA;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=102;WE=103934496;WS=103934478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr14	103946636	rs8014010	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=553;SC=TAAAAGACTGACATTCCTATT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=103946644;WS=103946626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	103986255	rs1803283	C	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=30;PP=1301;SC=CCAGCCGCTGCTCCATCTCGA;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=103986263;WS=103986245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	103987078	rs2071408	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=0.810;SC=AACACGGGGCGGGCGGGGGAA;SOR=1.440;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=11;WE=103987086;WS=103987068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr14	103988180	rs1136165	G	T	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=573;ReadPosRankSum=0.782;SC=TCTCGATGGCGCGGCGCTCCC;SOR=0.491;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=28;WE=103988188;WS=103988170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr14	103995489	rs2765038	C	G	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.40;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	103996205	rs2296487	T	C	43.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	103996396	rs2765037	G	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=30;PP=1409;SC=CAATGGTGGCGGTGCGTGTGC;SOR=1.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=73;WE=103996404;WS=103996386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	103996733	rs2756138	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=0.691;SC=CCTACAGACACATGTGGCTCC;SOR=1.044;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=18;WE=103996741;WS=103996723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr14	104001517	rs2756119	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=1200;ReadPosRankSum=0.503;SC=AGGAGGGAGGGGGGCATTGAC;SOR=0.523;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=59;WE=104001525;WS=104001507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr14	104027557	rs11625397	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.553;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr14	104027595	rs34186780	T	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.156;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr14	104028196	rs34050832	C	CA	2099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.263;NF=29;NR=26;PP=850;ReadPosRankSum=2.040;SC=TCCACTCTCTCAAAAAAAAAC;SOR=0.623;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=55;WE=104028212;WS=104028186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,77:0.96:80
chr14	104028270	rs7148456	T	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.084;NF=28;NR=33;PP=872;ReadPosRankSum=0.481;SC=GAGTCCACAATGGCCTAATGC;SOR=0.665;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=61;WE=104028278;WS=104028260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,75:0.48:156
chr14	104029449	rs2274267	G	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=815;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GCAGGGATACGGCGCCCAGCG;SOR=0.501;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=46;WE=104029457;WS=104029439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr14	104029792	rs2296483	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CTTACCGTGCGTTTTTTTTCG;SOR=0.330;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=24;WE=104029800;WS=104029782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr14	104029819	rs2296482	T	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr14	104040414	rs4906337	C	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=2.100;SC=GTTCTGAGAGCCTTTTTTTTT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=104040425;WS=104040404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr14	104053764	rs2403197	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=0.148;SC=GGAGTGTTTTCTTACCTGAAT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=104053772;WS=104053754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	104135966	rs12896171	A	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=39;PP=1068;SC=CATTCTTTTAATATTTTATTT;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=104135974;WS=104135956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	104136469	rs11333716	CT	C	6132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=51;PP=2965;SC=TAAATGTACTCTTATTTGGTT;SOR=1.430;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=101;WE=104136477;WS=104136459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	104136633	rs12590968	G	C	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=67;PP=1626;SC=ACAAAAGAAGGGGGCAGTCGT;SOR=2.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=88;WE=104136641;WS=104136623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	104139570	rs11160757	G	T	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=62;PP=2127;SC=GAGTGCTTTCGTCCCAAGTCC;SOR=1.089;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=102;WE=104139578;WS=104139560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	104143928	rs4906357	A	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=87;PP=2773;SC=TTTTACATGAATTTTATTGAA;SOR=2.152;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=30;TCR=87;TR=116;WE=104143936;WS=104143918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	104145597	.	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CACTCTTCCAATGTTTTTCCC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=104145605;WS=104145587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	104151400	rs35011804	C	T	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=69;PP=1968;SC=GGGGCGCAGGCCCTGCCGTCT;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=82;WE=104151408;WS=104151390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	104160061	rs111589287	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CTTGGCTTCCTTTCCTAGATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=104160069;WS=104160051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	104165294	.	C	T	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1264;ReadPosRankSum=-1.655;SC=CCAGCAGTCTCACCAGGAGCT;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=80;TCR=53;TR=74;WE=104165302;WS=104165284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,88:0.57:155
chr14	104165927	rs1799796	T	C	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=73;PP=1931;SC=TGGGGACAGCTGTCATTGTCT;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=44;TCR=73;TR=117;WE=104165935;WS=104165917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	104167075	rs861537	C	T	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=33;PP=1048;SC=GTGAGTCCCACGGCCTGCAGC;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=104167083;WS=104167065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	104167545	rs709399	G	A	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=56;PP=1891;SC=CAGTGACCCCGACCTGGCCCC;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=104167553;WS=104167535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	104177190	rs139961690	A	AAC	679.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=798;ReadPosRankSum=0.886;SC=TGTAGTTAAGAACACACACAC;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=20;WE=104177198;WS=104177180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr14	104178186	rs3212038	A	G	244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=5;PP=127;SC=GCCACTCTGCATCCCCTGTCG;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=104178194;WS=104178176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	104193099	rs2295151	C	G	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=44;PP=1940;SC=GACCAAGCTGCGTTTTAACGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=104193107;WS=104193089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	104194196	rs1535100	C	G	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=72;PP=2965;SC=AGTGCGCCCTCGTGTCCCTCA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=142;WE=104194204;WS=104194186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	104195610	rs2295148	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=34;PP=787;SC=ATCAGGCAGCTGCCCTGAGGA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=104195618;WS=104195600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	104199356	rs2295146	C	T	5173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=72;PP=2965;SC=GGACCAGTAACTCTACGTGGG;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=154;WE=104199364;WS=104199346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	104199580	rs8548	A	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=384;SC=GTGTATTGTCAATACTTAATT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=104199588;WS=104199570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	104202304	rs2295145	G	A	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=596;SC=AGAGACACGGGCAGCTAGTTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=104202312;WS=104202294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	104203938	rs8004408	G	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=610;SC=CAAACAGAAAGCTGTGCTGAA;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=104203946;WS=104203928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	104205123	rs17292804	G	A	3397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=53;PP=2054;ReadPosRankSum=1.627;SC=TGATCCCTTCGTCGTTGGGCT;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=226;TCF=132;TCR=94;TR=124;WE=104205131;WS=104205113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,154:0.55:281
chr14	104212949	rs2295141	T	C	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=857;SC=AGTCCTAAGCTTAGTGCAAGA;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=104212957;WS=104212939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	104216293	rs2295140	C	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=69;PP=2026;SC=AAAATACAACCTTTATGATTT;SOR=2.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=83;WE=104216301;WS=104216283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	104251006	rs4900594	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=463;SC=GGGATACCAACTTTCCCTCTA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=104251014;WS=104250996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	104251276	rs3742369	T	C	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=65;PP=2056;SC=ACATCTTTTTTACTCCAGAAT;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=111;WE=104251284;WS=104251266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	104394835	rs9324065	T	C	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=48;PP=1883;SC=TGCCGACGCCTGGGCCTTGAG;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=115;WE=104394843;WS=104394825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr14	104394850	rs9324066	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=825;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CTTGAGGATGCTGCGGAAGCT;SOR=0.907;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=59;WE=104394858;WS=104394840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr14	104429302	rs55873775	A	AGTGTGT	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5120;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=280;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTTGTATTTGAGTGTGTGTGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=104429310;WS=104429292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr14	104429453	rs6576013	A	G	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=24;PP=755;SC=GCAGTGTGACATGCATCCCAG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=104429461;WS=104429443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	104436931	rs11851097	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=950;ReadPosRankSum=0.941;SC=TCCGCAAACTCTTAAGAACAA;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=63;WE=104436939;WS=104436921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr14	104441925	rs10147923	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TTATAGTGAGCGTACTCTTGT;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=20;WE=104441933;WS=104441915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr14	104452405	rs10143030	C	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.573;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=852;ReadPosRankSum=1.018;SC=AGCACGTGTTCAGACATTGCT;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=43;WE=104452413;WS=104452395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr14	104452640	rs10143389	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=807;ReadPosRankSum=-1.683;SC=TTGATGACTTGGATATGAAGG;SOR=0.554;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=49;WE=104452648;WS=104452630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr14	104465037	rs10133836	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=39;PP=1614;SC=TGAGTTGGGCTTCTAAAACCA;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=104465045;WS=104465027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	104470686	rs28391043	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.539;NF=4;NR=26;PP=1036;ReadPosRankSum=1.121;SC=ATTCACTTTGGTCATTGTCAA;SOR=0.197;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=30;WE=104470717;WS=104470676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr14	104470698	rs151098927	GTTTATTTATTTA	G,GTTTATTTA	491.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.13;NF=0,0;NR=11,11;PP=2427,289;SC=CATTGTCAAAGTTTATTTATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=11,11;WE=104470717;WS=104470676;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.92:12
chr14	104471857	rs12147828	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.262;SC=CTCACTTTCCCGCTAACTCTG;SOR=0.610;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=10;WE=104471865;WS=104471847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr14	104473253	rs4900607	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=154;ReadPosRankSum=0.663;SC=TACCACAAACATATGAGGTAG;SOR=0.442;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=11;WE=104473261;WS=104473243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr14	104481016	rs7150795	G	A	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=7;PP=1299;SC=CTGCTCTGATGACATATGTAC;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=104481024;WS=104481006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	104481083	rs11160779	T	C	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ATATGAAGAATTGAAGACTAG;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=109;TCR=54;TR=74;WE=104481091;WS=104481073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr14	104481200	rs59025288	A	AT	2149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.692;NF=10;NR=49;PP=1115;ReadPosRankSum=0.164;SC=TTTCCTGGATATTTTTTTTCC;SOR=0.536;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=134;TCF=19;TCR=115;TR=59;WE=104481208;WS=104481190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,96:0.50:192
chr14	104491086	rs72042212	TACACACACACAC	T,TACACACAC	331.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=0,0;NR=15,15;PP=680,774;ReadPosRankSum=2.125;SC=ACAGGAAGTTTACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=15,15;WE=104491105;WS=104491076;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.69:13
chr14	104497543	rs10135507	C	T	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=861;ReadPosRankSum=0.354;SC=AGAAATATCTCATCCGGATTT;SOR=0.519;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=60;WE=104497551;WS=104497533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
chr14	104498472	rs4906405	G	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=25;PP=652;SC=CTGCTTTTCTGTTTATAGATC;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=104498480;WS=104498462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	104498530	.	ATCTTT	A	142	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=142;QD=51.0;SC=GGAATGTGTTATCTTTTCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=104498542;WS=104498520;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr14	104500427	rs10150865	A	G	3670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=71;PP=2066;SC=GATCCTGTTTATTCCTTGTCC;SOR=1.307;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=109;WE=104500435;WS=104500417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr14	104518453	rs7150461	A	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=755;ReadPosRankSum=-1.083;SC=CACACCCCTCAGGAAGCTGTG;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=38;WE=104518461;WS=104518443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr14	104552382	rs1770988	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-1.595;SC=GACAGAGGAGATTGCGGTGGG;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=104552390;WS=104552372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	104559623	rs941952	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=635;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CATCCTGACCTACGTCCTTGC;SOR=0.949;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=41;WE=104559631;WS=104559613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr14	104561998	rs1770983	T	C	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=63;PP=1625;ReadPosRankSum=0.004;SC=GCCCAGGTAATCCCAGGGGCC;SOR=0.862;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=217;TCF=88;TCR=129;TR=101;WE=104562006;WS=104561988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,130:0.48:269
chr14	104565402	.	C	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=-1.356;SC=GGCTGGGACTCGGCAGAGTTT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=13;WE=104565410;WS=104565392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	104569709	rs1467844	A	G	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=122;SC=AGCCTGGCACAGGCCGGACTG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=104569717;WS=104569699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	104570904	rs1744299	T	C	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=69;PP=2166;SC=CCACCCCTCATGGGCTGGGGG;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=108;WE=104570912;WS=104570894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	104571826	rs1744300	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=946;SC=GCAGCTGGGGACTGTGCACCC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=104571834;WS=104571816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	104573690	rs1744301	A	G	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=53;PP=1723;SC=CAGGTAATGGAGCTAGGGCTG;SOR=1.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=104573698;WS=104573665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	104575466	rs1771012	C	T	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=731;SC=GGCCGGTCCCCGTCCCTGTGC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=104575474;WS=104575456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	104575531	rs1744302	C	G	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=30;PP=1513;SC=CTGGGCTGGCCAGGGCAGAAG;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=79;WE=104575539;WS=104575521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	104578817	rs11850264	G	A	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=23;PP=2060;SC=CCCTGCCTTCGCACTCTACCT;SOR=2.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=74;TCR=24;TR=97;WE=104578825;WS=104578807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	104624331	rs142639926	G	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=266;ReadPosRankSum=1.708;SC=CCATGGCCCCGGCTGTGGGCC;SOR=0.358;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=21;WE=104624339;WS=104624321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
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chr14	104633457	rs113165602	A	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=-2.233;SC=AGGAGGGGTGAGGGAGTGGAG;SOR=1.222;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=18;WE=104633465;WS=104633447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr14	104639519	rs61743517	C	G	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1282;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CTGGCAGCCTCCAGGACACCC;SOR=0.866;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=83;WE=104639527;WS=104639509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,108:0.56:193
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chr14	104640481	rs2254205	G	C	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=33;PP=1440;SC=GCCTCGACCCGCAGGGACCAC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=104640489;WS=104640471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	104641438	rs201913589	C	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=948;ReadPosRankSum=0.592;SC=GCACGCCTCCCTGCCTGCCCG;SOR=0.542;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=68;WE=104641446;WS=104641428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,79:0.59:134
chr14	104641792	rs2487305	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CCAGGAAGGCCGTGGGCACCC;SOR=0.573;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=146;TCF=55;TCR=91;TR=76;WE=104641800;WS=104641782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,84:0.50:167
chr14	104642341	rs2487304	A	G	8004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=122;PP=2965;SC=GGTCCCGGCCAGTCAGCATCA;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=122;TCR=122;TR=244;WE=104642349;WS=104642331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr14	104642524	rs78184481	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=562;ReadPosRankSum=1.072;SC=AGCCCCGCTTCAGCCCCGACT;SOR=0.376;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=42;WE=104642532;WS=104642514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr14	104643409	rs2487303	A	G	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=57;PP=2224;SC=AGGTAGAAGCAGCACACCGTC;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=104643429;WS=104643399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	104643421	rs2487302	T	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=735;ReadPosRankSum=0.666;SC=CACACCGTCTTGCCGGACACG;SOR=0.889;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=53;WE=104643429;WS=104643399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr14	104643721	rs2487301	C	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=864;ReadPosRankSum=1.261;SC=GCCCTGTGGCCGGTCCCAGAG;SOR=0.522;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=58;WE=104643729;WS=104643711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,63:0.43:147
chr14	104643859	rs2487300	A	G	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1240;SC=CCCCGGGCCGAGGTGGCTCCT;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=104643867;WS=104643849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	104644099	rs2497297	T	C	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=61;PP=1670;SC=GTGGCAGCAGTGGCTATGAGA;SOR=0.930;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=104644107;WS=104644089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	104644212	rs61743202	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=0.391;SC=CGCAGCCTCAAGTCCCCCAAG;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=9;WE=104644220;WS=104644202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr14	104645755	rs35751202	G	GC	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=462;ReadPosRankSum=0.025;SC=ACCCAGCCCGGCCCACCGTGT;SOR=1.112;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=104645763;WS=104645745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr14	104710505	rs7142555	T	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=493;SC=CATCTCTCAATAGTACTGCTG;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=104710513;WS=104710495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	104710651	rs7141507	C	T	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=654;ReadPosRankSum=-0.294;SC=CGGCTGGCTCCTGGCCTCGAC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=43;WE=104710659;WS=104710641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr14	104940930	rs28453989	C	T	5424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=95;PP=2965;SC=CCTCACTCTCCCCTTAGAGCG;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=170;WE=104940938;WS=104940920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr14	104940967	rs28699424	G	A	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=946;ReadPosRankSum=2.614;SC=AATTAAGCTGGGGGCAAATGG;SOR=0.623;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=62;WE=104940975;WS=104940957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,72:0.47:153
chr14	104941016	rs28715110	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=721;ReadPosRankSum=-1.423;SC=GAGGATGGGGGACTGCCCGGG;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=40;WE=104941024;WS=104941006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr14	105055118	rs111285011	TGACGGGCAG	T	918.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.879;NF=5;NR=11;PP=2984;ReadPosRankSum=1.783;SC=CCTGCGGCTCTGACGGGCAGG;SOR=0.650;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=16;WE=105055134;WS=105055108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr14	105055304	rs11160811	A	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=0.382;SC=GGGGCACAGCAGGCGGCCCCG;SOR=1.332;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=20;WE=105055312;WS=105055294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr14	105057948	rs3803317	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=306;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTGACACCCCCGATGGGCACC;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=21;WE=105057956;WS=105057938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr14	105059573	rs28656783	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=140;ReadPosRankSum=1.233;SC=CCCCCGCCCCCGCCCCACACC;SOR=1.561;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=10;WE=105059581;WS=105059563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	105060024	rs12879330	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr14	105060029	rs12880651	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.970;SOR=1.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr14	105063253	rs11629201	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=0.279;SC=GGGAAGATCACCCACAGCAGG;SOR=1.646;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=17;WE=105063261;WS=105063243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	105070791	rs3803313	G	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=466;SC=GTCCCTTGCAGAGGAAGAAGA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=105070799;WS=105070781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	105167807	rs4983530	C	T	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=43;PP=2363;SC=GCGCGGACCCCGAGCTGTGCA;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=120;WE=105167815;WS=105167797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	105172296	.	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.088;SC=GGTACACTGGCGCTGACCCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=105172304;WS=105172286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr14	105172315	rs79559717	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AGGCTGCCCCGCCTGCGTGTT;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=9;WE=105172323;WS=105172305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr14	105172600	rs369652987	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=0.791;SC=AACGGTCCTCCCTGCCCTGGT;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=105172608;WS=105172590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr14	105173862	.	ACCCCACCCCCAC	A	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=2503;ReadPosRankSum=1.648;SC=GCAGGCGTCCACCCCACCCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=9;WE=105173881;WS=105173852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr14	105177351	rs3840006	CA	C	4287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=58;PP=2954;ReadPosRankSum=0.940;SC=CTACGTAAGTCAGGGGCAGCT;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=54;TCR=106;TR=87;WE=105177359;WS=105177341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,128:0.54:238
chr14	105178089	rs4983531	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.338;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	105178098	rs4983532	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr14	105179043	rs4497619	G	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=203;ReadPosRankSum=0.116;SC=CCTGCTCCTTGTCAGAGACCA;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=13;WE=105179051;WS=105179033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr14	105179194	rs10133301	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=538;ReadPosRankSum=0.969;SC=GGGCACTGGATGAGCTGTTTG;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=54;WE=105179202;WS=105179184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr14	105179707	rs73347510	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=499;ReadPosRankSum=-1.703;SC=TGTGCTCCAGCCTCCCCACCA;SOR=1.189;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=32;WE=105179715;WS=105179697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr14	105180484	rs9672043	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=444;ReadPosRankSum=0.965;SC=GAGGCTGCACCTGGGCTGGCT;SOR=1.244;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=25;WE=105180492;WS=105180474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr14	105180565	rs4983535	T	C	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=537;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CTGCAGGAGATCCCGTGGGCA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=38;WE=105180573;WS=105180555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr14	105180706	rs1128840	A	C	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.059;SC=AGGGTGGTCCACGGCCCCTGG;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=199;TCF=124;TCR=75;TR=102;WE=105180714;WS=105180696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,112:0.48:233
chr14	105240503	rs200775205	CACACCCCATCACACTGCCCCACACCAT	C	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=2.670;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.915;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	105258892	rs2494748	C	T	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,137:0.54:254
chr14	105258892	.	CA	TG	1766	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=71;NR=50;PP=1766;QD=15.0369245856;SC=CTACTACCCCCATCTCTCCCT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=233;TCF=135;TCR=98;TR=121;WE=105258901;WS=105258882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:112,121:0.52:233
chr14	105258893	rs2494749	A	G	9268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.93;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr14	105267579	rs12878684	A	G	5740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=77;PP=2965;SC=GCCGCCTGAGACAGCAGCGCG;SOR=0.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=176;WE=105267587;WS=105267569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	105268104	rs10141867	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=577;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CCCTGGACCTGTCGTTGAAGT;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=41;WE=105268112;WS=105268094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr14	105268228	rs4983387	G	A	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=47;PP=2303;SC=CTCACTGTCCGAACAGGAGGA;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=112;WE=105268236;WS=105268218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	105309252	rs12895703	T	C	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	105309256	rs12894371	A	T	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	105309608	rs12878750	C	T	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=439;SC=TGATGGTCTGCGGGTGTGAGC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=105309616;WS=105309598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	105350355	rs2841236	A	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1363;ReadPosRankSum=1.647;SC=ACGAGGACACACCCCGAAAGA;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=93;TCR=100;TR=88;WE=105350363;WS=105350345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,107:0.44:242
chr14	105350799	rs9788593	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=333;ReadPosRankSum=0.761;SC=AGGAGGAGGACGACAGCCTCA;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=21;WE=105350807;WS=105350789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr14	105350868	rs9788594	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=315;ReadPosRankSum=0.819;SC=TGGAGGAGGCCCGGAAGATGA;SOR=0.937;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=25;WE=105350876;WS=105350858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr14	105351637	rs2582549	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=270;ReadPosRankSum=0.499;SC=GGGGGTGGCCAGTGTCAGTGG;SOR=0.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=22;WE=105351645;WS=105351627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr14	105351673	rs894038	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=497;ReadPosRankSum=1.793;SC=GCTTCTCTGACCCTCGGTGCC;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=32;WE=105351681;WS=105351663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr14	105352255	rs2251389	T	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=741;ReadPosRankSum=0.500;SC=CGGCAGGCCCTGGGTGGCGCG;SOR=0.537;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=46;WE=105352263;WS=105352245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr14	105354293	rs2582548	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=474;ReadPosRankSum=-1.018;SC=GGGCCCGCTCAGGCAGTGCCC;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=34;WE=105354301;WS=105354283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr14	105356137	rs2919629	G	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=903;ReadPosRankSum=0.093;SC=GTGCCAGTGCGTTTTCTTGAG;SOR=1.119;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=45;WE=105356145;WS=105356127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr14	105356241	.	A	G	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=76;QD=22.1542425094;SC=ATGGATGGACAAATGGATGGA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=105356249;WS=105356231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	105359306	rs3742939	G	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTTCCTGCCGGCTGCAGGCTG;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=25;WE=105359314;WS=105359296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr14	105359827	rs2247712	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.745;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=538;ReadPosRankSum=0.341;SC=AGCCTCTGCCTGGGGCCCACG;SOR=0.218;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=32;WE=105359835;WS=105359817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr14	105360746	rs2841244	T	C	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=737;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CCCCTTGGCCTGCCCCCAGCC;SOR=1.026;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=51;WE=105360754;WS=105360736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr14	105363157	rs7152667	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CCCTGCACATAGGACAGACCA;SOR=0.859;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=4;WE=105363165;WS=105363147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	105363202	rs10147348	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.111;SC=TGCCACCAGGAGGCGGCCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=105363210;WS=105363192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	105393556	rs2841280	G	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=474;ReadPosRankSum=2.729;SC=GTGGGACAGAGAGGCTGGCAC;SOR=0.902;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=33;WE=105393564;WS=105393546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr14	105393707	rs879448	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.137;SC=AGGGAAGCCTCCCTGGGCTGC;SOR=0.312;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=21;WE=105393715;WS=105393697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr14	105398078	rs117085637	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TTTCTCTCCCGTCACAGGCGT;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=105398086;WS=105398068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr14	105398787	rs2582533	G	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CACCTCAGGAGGGAGGGGCTG;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=105398795;WS=105398777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr14	105404384	rs1048257	T	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=454;ReadPosRankSum=-0.206;SC=TCTCTTGTACTGATGAGCCAT;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=39;WE=105404392;WS=105404374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr14	105405599	rs3742935	G	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=847;ReadPosRankSum=1.600;SC=CTGGGGGCAGGGAAGGAGAAC;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=54;WE=105405607;WS=105405589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,71:0.60:119
chr14	105405942	rs28454709	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=802;ReadPosRankSum=0.120;SC=CAGCAGTGGAGAGGTGCAGCT;SOR=0.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=41;WE=105405950;WS=105405932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,45:0.38:117
chr14	105406238	rs2819419	A	C	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1333;ReadPosRankSum=2.512;SC=TCCTGCGAGTACTTGGTCATG;SOR=1.157;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=80;WE=105406246;WS=105406228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,94:0.44:212
chr14	105406372	rs61421370	C	T	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.236;SC=TGGGACATCCCCGAGCCCACA;SOR=0.696;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=87;WE=105406380;WS=105406362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,102:0.60:169
chr14	105407031	rs11623422	A	G	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CTGGGCCCTGAGACACACAGG;SOR=0.531;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=50;TCR=78;TR=69;WE=105407039;WS=105407021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr14	105407208	rs11851053	T	C	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=42;PP=1585;ReadPosRankSum=0.681;SC=TAGGAAAAGATACCTGACCAA;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=107;TCR=77;TR=99;WE=105407216;WS=105407198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,115:0.53:217
chr14	105407798	rs4465542	T	C	3296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=73;PP=1903;ReadPosRankSum=0.683;SC=ATGGGAAATGTGGAAGTCTTC;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=243;TCF=110;TCR=133;TR=138;WE=105407806;WS=105407788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,155:0.55:282
chr14	105408182	rs9672139	T	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=985;ReadPosRankSum=-0.340;SC=ACCTCGGGCATGTGGCCTTCT;SOR=0.933;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=46;WE=105408190;WS=105408172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,63:0.55:115
chr14	105408315	rs28600075	T	C	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CCTCCATCTTTGGCGCAGACA;SOR=0.404;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=97;WE=105408323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,120:0.51:234
chr14	105408811	rs2819421	A	G	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-7.707;NF=56;NR=53;PP=1745;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CTCCACCTTCAGCGCAGACAC;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=109;WE=105408819;WS=105408801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr14	105408955	rs2819422	A	G	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.608;NF=39;NR=50;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CTCCAGCCGCACACTGTCCAG;SOR=0.910;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=195;TCF=93;TCR=102;TR=89;WE=105408963;WS=105408945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
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chr14	105410183	rs10438246	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=495;ReadPosRankSum=0.469;SC=AGGAGTTTCATGTCCACCTGG;SOR=0.959;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=42;WE=105410191;WS=105410173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr14	105410411	rs11160825	C	T	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.882;NF=54;NR=71;PP=2026;ReadPosRankSum=0.099;SC=ACATCCTTGTCGGCCAGGGAC;SOR=0.951;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=218;TCF=100;TCR=118;TR=125;WE=105410419;WS=105410401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,135:0.56:242
chr14	105410775	rs2819424	A	G	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.310;NF=76;NR=52;PP=1812;ReadPosRankSum=0.238;SC=GGAGACTCACATCGGCTTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=216;TCF=121;TCR=95;TR=128;WE=105410783;WS=105410765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,149:0.59:252
chr14	105410827	rs28380382	C	T	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=70;PP=2357;ReadPosRankSum=0.391;SC=CATGGACTTCCCTGGGGCCGA;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=138;WE=105410835;WS=105410817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,156:0.59:263
chr14	105411153	rs34499888	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=1015;ReadPosRankSum=1.239;SC=CCTCGGGCACGGGGCCCTCCA;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=58;WE=105411161;WS=105411143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr14	105411700	rs4264326	A	G	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.166;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CTCCAGGTCCACAGAAGGGAG;SOR=0.894;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=62;WE=105411708;WS=105411690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
chr14	105411781	rs10438247	G	A	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1213;ReadPosRankSum=1.939;SC=CTCCGCCTTCGGCGCAGACAC;SOR=0.579;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=93;TCR=85;TR=79;WE=105411789;WS=105411771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr14	105411957	rs373797895	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=36.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-11.421;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.519;SOR=5.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,20:0.14:138
chr14	105411971	rs28737397	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=17.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-10.947;QD=2.92;ReadPosRankSum=-3.183;SOR=2.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,19:0.16:122
chr14	105412005	rs28564728	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-7.965;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,12:0.15:80
chr14	105412009	rs28714612	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-7.859;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,12:0.15:78
chr14	105412066	rs77154428	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-6.150;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.649;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr14	105412541	rs12433837	CA	TG	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.144;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.009;NF=4;NR=20;PP=2259;ReadPosRankSum=-1.439;SC=GGGCCCTTGACATCTATCTGG;SOR=1.414;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=24;WE=105412569;WS=105412531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,26:0.33:78
chr14	105412554	rs12436986	T	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQRankSum=-7.511;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=1.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr14	105412561	rs3000771	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQRankSum=-7.055;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr14	105413204	rs2582514	G	T	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.178;NF=41;NR=31;PP=1139;ReadPosRankSum=0.676;SC=GGCTGAATGCGGATGTCAGTG;SOR=0.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=72;WE=105413212;WS=105413194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr14	105413223	rs55797226	A	G	3379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.282;NF=48;NR=39;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TGGTCTTAAGATCCCCTTGCA;SOR=0.568;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=87;WE=105413231;WS=105413213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,98:0.53:185
chr14	105413790	rs11848564	G	A	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1676;ReadPosRankSum=-1.013;SC=ACGCCTCGATGGACTCGCCTG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=111;WE=105413798;WS=105413780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,132:0.46:285
chr14	105414238	rs60754080	C	A	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.831;NF=36;NR=34;PP=2714;ReadPosRankSum=-1.484;SC=GGAGAGGCTCCCGTCGGCCTC;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=70;WE=105414260;WS=105414228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,75:0.52:143
chr14	105414252	rs60106058	C	T	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.712;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.719;NF=40;NR=35;PP=2714;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CGGCCTCCACCTTCGGCGCAG;SOR=0.387;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=75;WE=105414260;WS=105414228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr14	105414280	rs2819429	T	G	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=69;PP=2965;SC=CACCGAGGCCTCGATGGACTT;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=108;TCR=69;TR=177;WE=105414288;WS=105414270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr14	105414629	rs72702027	G	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=1033;ReadPosRankSum=1.300;SC=GGGCCCTCTGGGAGTTTCACA;SOR=0.466;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=59;WE=105414637;WS=105414619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr14	105414790	rs2582513	A	G	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1597;ReadPosRankSum=0.657;SC=GGACTTGCCAAGGGCAGACAC;SOR=0.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=93;WE=105414798;WS=105414780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,110:0.52:211
chr14	105414810	rs10145032	C	G	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.95;MQRankSum=1.066;NF=44;NR=53;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CCCCAAACGACAGCATCTTGA;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=97;WE=105414818;WS=105414800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,115:0.53:218
chr14	105415200	rs10145566	G	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.287;NF=8;NR=20;ReadPosRankSum=1.123;SC=CAGTGGTCTTGAGGTCCCCCT;SOR=0.412;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=28;WE=105415208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,46:0.36:129
chr14	105415229	rs10134675	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=2.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-7.172;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,32:0.23:139
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chr14	105416220	rs2819435	T	A	6582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=2.126;NF=108;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=0.167;SC=GGAGGCTCACTTCGGCCTCCA;SOR=0.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=201;WE=105416228;WS=105416210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr14	105417222	rs2013274	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=21.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-10.979;QD=3.57;ReadPosRankSum=2.158;SOR=2.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,24:0.15:155
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chr14	105417228	rs2248960	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=28.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-11.251;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.314;SOR=2.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,23:0.14:161
chr14	105417243	rs77111827	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=30.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-11.350;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=3.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,21:0.12:170
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chr14	105418149	rs147978925	A	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=16.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-9.077;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.208;SOR=3.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,11:0.13:84
chr14	105418155	rs141600524	G	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=16.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-9.240;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.737;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,12:0.14:87
chr14	105418166	rs78116894	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=22.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQRankSum=-9.089;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.389;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
chr14	105418194	rs78447535	A	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.790;NF=26;NR=9;PP=558;ReadPosRankSum=-1.691;SC=TGGAGGGGAGACTCACGTCGG;SOR=1.493;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=35;WE=105418202;WS=105418184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,47:0.36:129
chr14	105420927	rs879210	A	G	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1811;ReadPosRankSum=0.063;SC=GTGCGTCCCTAGGTTCGTAGG;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=99;WE=105420935;WS=105420917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,117:0.59:199
chr14	105421050	rs879209	T	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=989;ReadPosRankSum=0.132;SC=TCCCCACCCTTGGTTTGGAGA;SOR=1.013;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=59;WE=105421058;WS=105421040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr14	105421236	rs66540327	CAGCCAGCAGGGTAGTGA	C	347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=2386;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CTCCCAGGCTCAGCCAGCAGG;SOR=0.743;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=6;WE=105421260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	105423891	rs149134261	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=817;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GTTCTCCCAGGGCCCAGGGAG;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=53;WE=105423899;WS=105423881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr14	105452035	rs10150682	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GCGGGTCCTGAACGGCGGGGG;SOR=1.460;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=9;WE=105452043;WS=105452025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr14	105457771	rs2247140	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=563;ReadPosRankSum=-2.443;SC=GCCGTGCCTCATGATCTCCTC;SOR=1.831;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=37;WE=105457779;WS=105457761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr14	105461067	rs894039	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=581;ReadPosRankSum=-1.298;SC=CAAGCTCAAACTGACACTCTT;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=42;WE=105461075;WS=105461057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr14	105478102	rs3803294	G	A	3601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=68;PP=2106;ReadPosRankSum=0.896;SC=AGCGGCACAGGTTGGGCTCCA;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=148;TCR=125;TR=147;WE=105478110;WS=105478092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,168:0.53:319
chr14	105523663	rs7147439	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=504;ReadPosRankSum=-0.475;SC=ATCAGATTGAGTCACAAGTTA;SOR=0.995;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=28;WE=105523671;WS=105523653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr14	105609335	rs10149229	A	G	3655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=73;PP=2258;ReadPosRankSum=0.849;SC=CCGGCCGCTCAATGGGGTTGC;SOR=0.508;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=326;TCF=152;TCR=174;TR=150;WE=105609343;WS=105609325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,184:0.45:407
chr14	105611282	rs2272591	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=467;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CCACCTCCACAGCACTGGCCC;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=32;WE=105611290;WS=105611272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr14	105614032	rs2242636	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.335;SC=GCAGAAGGGACTGGGGGGCGA;SOR=0.197;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=7;WE=105614040;WS=105614022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	105615026	rs2242634	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=247;ReadPosRankSum=0.221;SC=TCAGGGTGATAAGGGGCCCAC;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=12;WE=105615034;WS=105615016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr14	105617042	rs1057744	C	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=0.473;SC=CTGGCACACTCGTCTCGTTCC;SOR=0.665;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=51;WE=105617050;WS=105617032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr14	105617550	rs3830678	C	CGCAGCCCCA	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=62.53;MQRankSum=2.459;NF=1;NR=6;PP=1628;ReadPosRankSum=0.123;SC=CAGCAGCCCCCGCAGCCCCAG;SOR=0.859;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=7;WE=105617558;WS=105617540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	105618670	rs2238287	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=1.019;SC=TGAGCTGTGGTGCCTGAAAGG;SOR=0.466;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=22;WE=105618678;WS=105618660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr14	105622056	rs2816679	A	G	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=109;PP=2965;SC=CCCTCCACGCAGCCCAGCGGC;SOR=1.072;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=76;TCR=109;TR=185;WE=105622064;WS=105622046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr14	105643619	rs10139596	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=473;ReadPosRankSum=1.183;SC=AAGGACACACGGGCAGCTGAG;SOR=1.865;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=26;WE=105643627;WS=105643609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr14	105643652	rs10139450	A	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.988;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=254;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CTCGCAGCTGAGGCCGGGTGA;SOR=2.335;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=18;WE=105643660;WS=105643642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr14	105644151	rs1882848	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=2.161;SC=CACAGACCCATTGCACCCACT;SOR=0.646;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=11;WE=105644159;WS=105644141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr14	105647562	rs67388067	GGCGGGGGCCGCGAGCTCT	G	641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=2927;ReadPosRankSum=0.399;SC=CGCCCGGACAGGCGGGGGCCG;SOR=0.976;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=105647587;WS=105647552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr14	105676048	rs3087836	G	C	613.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=0.735;SC=TGTCCACGGGGAACTCCCAGC;SOR=2.400;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=20;WE=105676056;WS=105676038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr14	105686570	rs8005486	T	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=49;PP=1422;SC=GGCTAAGGGCTTTCTAGAACC;SOR=2.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=61;WE=105686578;WS=105686560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	105688082	rs28406206	C	T	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=28;PP=1223;SC=ACCCCAGGGCCGGAGGTCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=105688090;WS=105688072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	105692697	rs12883636	G	C	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=53;PP=1604;SC=CTGGGGTGCCGCGTGGGCCCC;SOR=2.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=105692705;WS=105692687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	105851374	rs35509750	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CCAGCCACCAACCCTCCGTGG;SOR=0.743;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=105851382;WS=105851364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	105858022	rs147461490	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=574;ReadPosRankSum=1.222;SC=TCCACCCCGCCGTCCGCATCT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=36;WE=105858030;WS=105858012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr14	105905126	rs4983620	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=28;PP=842;SC=GTGGGGGCTACGCCAGCTCCT;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=105905134;WS=105905116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	105911639	rs6576102	G	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=5;PP=1685;SC=CCCGAGGGGTGGTGTGGTTAC;SOR=3.943;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=66;WE=105911647;WS=105911629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	105916420	rs4983409	C	T	10835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=190;NR=148;PP=2965;SC=AAATGGAGAACCCGGAAATGG;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=338;TCF=190;TCR=148;TR=338;WE=105916428;WS=105916410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr14	105924538	rs7492915	G	A	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=780;SC=CCCCGCACCCGGGGAGGAGAG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=105924546;WS=105924528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	105924786	rs4074001	G	A	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=62;PP=2124;SC=GGTGGGTGTTGGGGACGTGAC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=105924794;WS=105924776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	105929443	rs7143366	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=10;PP=1385;SC=GCCTTCTGGCCGCAGCCCTGC;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=105929451;WS=105929433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	105930923	rs11845995	G	A	4385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=80;PP=2961;SC=GGGGACACCCGCCCTGCCTGC;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=142;WE=105930931;WS=105930913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr14	105931315	rs67940422	GTCC	G	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGAGCCCCACGTCCTCCTCGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=105931325;WS=105931305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr14	105931585	rs4983339	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=623;SC=ACCCAAGCTCATGCACTGGTG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=105931593;WS=105931575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	105935721	rs10150545	A	G	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=14;PP=1120;SC=CCATTGTCCCAAGGTGGCTGA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=105935729;WS=105935711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	105935824	rs13707	G	A	5164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=64;PP=2882;SC=CCACGGACAGGCCAGGCACAT;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=105935832;WS=105935814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr14	105936064	rs10150915	A	G	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=139;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=613;SC=GGTCCGTGTAACTCACTGGGG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=105936072;WS=105936054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	105936100	rs144496498	A	ACCTTGGCTGGTGGCC	1805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=307;SC=CAGGCACAGCACCTCCCAGCG;SOR=2.712;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=17;WE=105936108;WS=105936090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	105945891	rs11849001	C	T	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=49;PP=1684;SC=TCCACTGTTCCCCCGACCCAC;SOR=1.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=105945899;WS=105945881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	105953474	rs7160858	G	T	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=427;SC=CGAGGGGCGGGGTCTCCAAGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=105953482;WS=105953464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	105953595	rs7140395	T	C	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=48;PP=2046;SC=CCCGGAGCCGTCATGCCCAAG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=105;WE=105953603;WS=105953585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	105954705	rs55633823	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=463;ReadPosRankSum=1.171;SC=CCCTGCTACGCAGCCATGTTT;SOR=0.255;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=32;WE=105954713;WS=105954695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr14	105962234	rs7494350	T	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=36;PP=2145;SC=GAGCGGGAGCTGCCCAAAACC;SOR=1.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=113;WE=105962242;WS=105962224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	105962369	rs7494717	A	G	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=76;PP=2296;SC=ACTGGGCAGCACCCTTGGATC;SOR=1.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=28;TCR=77;TR=104;WE=105962377;WS=105962359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	105963944	rs4983426	CT	TC	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=1681;SC=TCTGGGGAGGCTCACTGCTGC;SOR=1.387;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=32;WE=105963953;WS=105963934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	105996049	rs10569304	TGCC	T	1275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.044;NF=3;NR=21;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CGCAACTCGGTGCCGCCGCCG;SOR=0.543;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=24;WE=105996059;WS=105996039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr14	106054428	rs9972103	C	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.92;QD=33.23;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	106054456	rs61984162	A	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.19;QD=29.82;SOR=2.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	106066454	rs4983454	T	C	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.74;QD=28.05;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	106067618	rs12884681	G	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=21;PP=869;SC=TCTTGCCCCCGCGTCCTGGCC;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=106067626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	106091329	rs8015545	G	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.002;NF=4;NR=17;PP=305;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TCCTGGTGCAGGACGGTGAGG;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=21;WE=106091337;WS=106091319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr14	106091504	rs1042306	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.093;NF=16;NR=8;PP=339;ReadPosRankSum=1.057;SC=AGATCATGAGAGTGTCCTTGG;SOR=0.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=24;WE=106091512;WS=106091494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
chr14	106091555	rs35035896	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.810;NF=21;NR=14;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CCCCCAGGAACTCAGGTGCTG;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=35;WE=106091563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr14	106091697	rs56210451	T	C	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.06;MQRankSum=0.961;NF=44;NR=41;PP=977;ReadPosRankSum=-1.901;SC=ATGATGGGCATGGGGGACCAT;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=85;WE=106091705;WS=106091687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
chr14	106091743	rs35171885	CA	C	2718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.988;NF=8;NR=45;PP=2113;ReadPosRankSum=1.500;SC=GGGAGTTACTCAGATCTGGGA;SOR=0.786;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=18;TCR=83;TR=53;WE=106091751;WS=106091733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr14	106110137	rs8009156	C	T	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=105;SC=TGCACCTCCACGCCGTCCACG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=106110145;WS=106110127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	106110330	rs8014709	T	C	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=19;PP=1041;SC=CCAGCTGGGGTCTGTCCCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=106110338;WS=106110320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	106173790	rs17349690	A	G	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.488;NF=22;NR=31;PP=753;ReadPosRankSum=1.267;SC=GAACCAGCACATCCTTGGGGC;SOR=0.160;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=53;WE=106173798;WS=106173780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
chr14	106173808	rs371291470	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=43.458;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.777;NF=0;NR=36;PP=759;ReadPosRankSum=-2.057;SC=GGCTGAAGCCGCGTGCCAGGC;SOR=5.778;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=36;WE=106173816;WS=106173798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chr14	106174654	.	C	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.532;NF=11;NR=6;PP=194;ReadPosRankSum=0.644;SC=TGTCAGGGCACGACGGGGTGG;SOR=0.540;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=17;WE=106174662;WS=106174644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr14	106188045	rs11624491	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=265;ReadPosRankSum=0.112;SC=TTCCTGGGGTCGTTGCAACAG;SOR=1.085;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=14;WE=106188053;WS=106188035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr14	106188230	rs1134590	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.260;NF=17;NR=27;PP=668;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TCTGCTCCCACTCGGCCCTGG;SOR=1.292;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=44;WE=106188238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,25:0.23:110
chr14	106188309	rs11624581	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.048;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.733;NF=9;NR=17;PP=415;ReadPosRankSum=0.408;SC=CGTGCTGTGCCGGGCGTCCGG;SOR=0.280;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=26;WE=106188317;WS=106188299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr14	106208082	rs11621259	G	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-4.505;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr14	106208086	rs1045853	A	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQRankSum=-4.682;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr14	106209340	rs11552998	T	C	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=915;SC=AGCCCAGGGCTGCTGTGCCCC;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=106209348;WS=106209330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	106235485	rs112228168	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=4;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.442;NF=6;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=0.308;SC=CCATGCTGGGTGCCCGGGAAG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=106235497;WS=106235475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr14	106235504	rs8082	C	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.867;NF=8;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=1.929;SC=AGTATGTACACGGGGTACGTG;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=10;WE=106235512;WS=106235494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr14	106235528	rs368273969	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQRankSum=-2.121;QD=3.91;ReadPosRankSum=2.643;SOR=1.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,8:0.17:48
chr14	106235535	rs371721170	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQRankSum=-3.044;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.881;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,9:0.16:58
chr14	106235567	rs139488657	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQRankSum=-4.552;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.667;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,14:0.19:75
chr14	106235569	rs4042058	C	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQRankSum=-4.076;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr14	106235611	rs1051112	A	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQRankSum=-6.661;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr14	106235874	rs147594653	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.015;NF=12;NR=4;PP=215;ReadPosRankSum=0.676;SC=GCAGGGTGTACACCTGTGGTT;SOR=1.002;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=16;WE=106235882;WS=106235864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr14	106236128	rs12890621	T	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.36;MQRankSum=-2.421;NF=2;NR=2;PP=40;ReadPosRankSum=0.647;SC=CGTGCTGTTGTACTGCTCCTC;SOR=0.330;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=4;WE=106236136;WS=106236122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	106236143	rs74093865	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.907;NF=8;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCCTCCCGCGGCTTTGTCTT;SOR=2.464;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=106236151;WS=106236133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	106236451	rs12895160	T	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQRankSum=0.056;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,36:0.36:101
chr14	106236458	rs11628528	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQRankSum=0.139;QD=11.69;ReadPosRankSum=-2.066;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,33:0.35:95
chr14	106237105	rs2753552	A	G	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=76;PP=2277;SC=GAGAGAAGGTATCTGAGCTGA;SOR=1.424;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=118;WE=106237113;WS=106237095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr14	106237642	rs2983777	T	G	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=13;PP=624;SC=TCACCGGTTCTGGGAAGTAGT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=106237650;WS=106237632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	106237811	rs11621054	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=0.993;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr14	106303325	rs3764172	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=572;ReadPosRankSum=1.778;SC=AGAAGACTGGATTCTGTGGCG;SOR=0.432;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=33;WE=106303333;WS=106303315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr14	106303699	rs10139433	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=217;ReadPosRankSum=0.485;SC=CCCTGGACCAGCTCTGGCATG;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=12;WE=106303707;WS=106303689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	106303846	rs1005582	C	T	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=63;PP=2965;SC=GTGGACAGGGCGGTCCACAGG;SOR=1.151;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=106;TCR=63;TR=168;WE=106303854;WS=106303836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr14	106303948	rs1005581	A	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=93;PP=2867;SC=GGGGAGGAACAGGGGCTGAGT;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=140;WE=106303956;WS=106303938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr14	106304899	rs762807	G	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=-0.864;SC=ACAGATAATGGGAGACACGTG;SOR=1.282;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=17;WE=106304907;WS=106304889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr14	106306841	rs709589	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=503;ReadPosRankSum=0.093;SC=GTGGTGCTCCCGGGCTGTGGA;SOR=0.353;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=32;WE=106306849;WS=106306831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr14	106307054	rs2753491	C	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=5;PP=219;SC=AGGCTGTCAGCCTCTGGCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=106307062;WS=106307044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	106307418	rs2753492	G	A	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=51;PP=2530;SC=GGACCTTCCCGGCCACCTCCC;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=121;WE=106307426;WS=106307408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr14	106310962	rs3751509	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	106311030	rs12589570	GT	AC	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.005;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=379;ReadPosRankSum=-1.614;SC=GGTCCGTTCAGTGTCCCTCTC;SOR=1.385;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=12;WE=106311039;WS=106311020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr14	106311374	rs2856940	A	G	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=150;SC=GAAGAAGGGAAGGGCCGCAGC;SOR=1.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=106311382;WS=106311364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	106318248	rs1059713	A	T	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=41;PP=1506;ReadPosRankSum=0.354;SC=ACCCGGAGGCAGCGCCCCTTT;SOR=0.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=108;TCR=85;TR=97;WE=106318256;WS=106318238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,127:0.52:242
chr14	106318342	rs2256593	T	C	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=53;PP=1074;ReadPosRankSum=0.996;SC=ATGCTTTCCCTGTGGTCGGGA;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=61;TCR=100;TR=86;WE=106318350;WS=106318332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,99:0.51:195
chr14	106318440	rs2256589	T	C	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.96;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	106318450	rs2753504	G	A	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.77;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	106321590	rs12365	C	A	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=45;PP=2304;SC=CTCACCGGGGCCACACATGGA;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=112;WE=106321598;WS=106321580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	106321913	rs1136534	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1287;ReadPosRankSum=-1.554;SC=GAGGCAGCTCGGCAATCACTG;SOR=0.907;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=78;WE=106321921;WS=106321903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
chr14	106329435	rs1950943	T	G	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=710;ReadPosRankSum=-1.319;SC=GTGGTCCCTTTGCCCCAGACG;SOR=0.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=47;WE=106329443;WS=106329425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr14	106329449	.	ATG	A	2457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,63:0.45:140
chr14	106329451	.	GTA	ACC	2213	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=24;NR=20;PP=2213;QD=51.7379062469;SC=AGACGTCCATGTAGTAGTAGT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=44;WE=106329461;WS=106329440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:78,44:0.36:122
chr14	106329453	.	A	ACC	2502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
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chr14	106330320	rs2857385	A	C	8820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=98;PP=2965;SC=GCCCCCCAGGATGCTCCGGGG;SOR=1.245;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=168;TCR=98;TR=266;WE=106330328;WS=106330310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr14	106330355	rs74678017	C	G	4404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=68;PP=2173;ReadPosRankSum=1.997;SC=GACCCAGCACCCTTATTTCCC;SOR=0.816;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=310;TCF=164;TCR=146;TR=153;WE=106330378;WS=106330345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,217:0.54:403
chr14	106330370	rs2857384	G	A	10367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=160;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.664;SC=TTTCCCCCCAGAAATGCAGCA;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=144;TCR=161;TR=303;WE=106330378;WS=106330345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,391:0.99:393
chr14	106330880	rs2236228	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=1.587;SC=TGCCCAGACACAAACCTGTGC;SOR=0.454;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=39;WE=106330888;WS=106330870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr14	106346740	rs2244932	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=238;ReadPosRankSum=0.711;SC=CCCGGCCCCCATCCTCACCAT;SOR=0.382;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=17;WE=106346748;WS=106346730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr14	106346795	rs2244930	G	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=463;ReadPosRankSum=-0.740;SC=GGTCATGAGGGCTGGGAAGGT;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=30;WE=106346803;WS=106346785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr14	106346990	rs2244917	G	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=0.772;SC=TGGGCTGCTGGGTGGGGTCTC;SOR=0.419;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=21;WE=106346998;WS=106346980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr14	106347371	rs112800624	T	A	3218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1917;ReadPosRankSum=0.699;SC=TGGGATGGGGTTTCTGTCCTG;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=226;TCF=131;TCR=95;TR=119;WE=106347379;WS=106347361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,146:0.55:265
chr14	106347420	rs72481504	T	C	3666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=72;PP=1914;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TACCCGACTGTGACACAGACA;SOR=0.565;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=255;TCF=133;TCR=122;TR=141;WE=106347428;WS=106347410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,171:0.56:308
chr14	106347467	rs2516984	A	C	9332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=147;PP=2965;SC=GGGGCCTTCCATTGCTGGGCT;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=263;TCF=116;TCR=147;TR=263;WE=106347475;WS=106347457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr14	106349827	rs188955129	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.695;NF=3;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=-1.445;SC=AACTGGAGGCGGGGCTGTCAG;SOR=0.386;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=10;WE=106349835;WS=106349817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr14	106350569	rs2516978	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=632;ReadPosRankSum=0.009;SC=GTGCAGGGCACCAGCCCATCG;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=74;TCR=13;TR=37;WE=106350577;WS=106350559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr14	106350623	rs2753523	G	C	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=29;PP=1407;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGTCTGGGCAGAAACCCTCGG;SOR=0.684;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=152;TCR=76;TR=88;WE=106350631;WS=106350613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,113:0.42:268
chr14	106350696	rs2857368	A	G	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1780;ReadPosRankSum=-1.115;SC=CTGCGAGTCCAGTCAGTTTTT;SOR=0.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=191;TCR=164;TR=132;WE=106350704;WS=106350686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:275,182:0.40:457
chr14	106354353	rs2516972	C	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=458;ReadPosRankSum=2.161;SC=AGCCCCTCAGCCCCAGGAGTG;SOR=0.097;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=26;WE=106354361;WS=106354347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr14	106354418	rs12894229	G	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.890;NF=56;NR=25;PP=1286;ReadPosRankSum=1.694;SC=GGGAATAGCAGTCACCACCAC;SOR=0.327;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=162;TCF=122;TCR=40;TR=81;WE=106354426;WS=106354408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,80:0.47:172
chr14	106354450	rs113647906	A	G	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=5;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.347;NF=71;NR=33;PP=1838;ReadPosRankSum=1.731;SC=AGTGACACGAACCCCCACAAA;SOR=0.486;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=233;TCF=166;TCR=67;TR=104;WE=106354458;WS=106354440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,98:0.41:241
chr14	106354474	rs199550558	TACAGGAG	T	4061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.439;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.639;NF=43;NR=39;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CTCCTGTCCCTACAGGAGACT;SOR=0.729;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=82;WE=106354488;WS=106354464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,113:0.37:308
chr14	106354495	rs200584328	A	AG	4966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQRankSum=-14.093;QD=14.40;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,131:0.38:345
chr14	106354498	rs202197703	CT	C	5049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-14.018;QD=14.22;ReadPosRankSum=-2.298;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,135:0.38:355
chr14	106354503	rs111599611	C	T	4953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-14.059;QD=13.65;ReadPosRankSum=-2.138;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,137:0.38:363
chr14	106354531	rs112554218	T	C	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.762;NF=66;NR=70;PP=1854;ReadPosRankSum=-0.604;SC=GCTCTCCTGCTGAGACTGTGC;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=324;TCF=161;TCR=163;TR=136;WE=106354539;WS=106354521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,145:0.40:361
chr14	106354666	rs188457056	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQRankSum=-6.269;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
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chr14	106356922	rs192882575	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=917;ReadPosRankSum=0.684;SC=CGGGGACACCGTGGGGCTCTG;SOR=0.513;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=59;WE=106356930;WS=106356912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr14	106356974	rs2753529	G	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=700;ReadPosRankSum=0.056;SC=TGGGTTCAGGGCGGCTGCTCC;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=55;WE=106356982;WS=106356964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr14	106357467	rs191478264	G	A	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
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chr14	106357527	rs190681079	G	C	3472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=58;PP=1911;ReadPosRankSum=0.086;SC=GACTTGGGACGGGGTTTCTGG;SOR=0.563;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=281;TCF=173;TCR=108;TR=142;WE=106357535;WS=106357517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,167:0.51:328
chr14	106357644	rs149695294	T	C	4007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=97;PP=2106;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CTGGGGTCAGTGCCCCTTGGT;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=365;TCF=161;TCR=204;TR=173;WE=106357652;WS=106357634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,201:0.47:428
chr14	106357673	rs145534823	T	G	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=80;PP=2121;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CCTTGACGGATCATCCCTCAA;SOR=0.526;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=276;TCF=105;TCR=171;TR=136;WE=106357681;WS=106357663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,146:0.48:304
chr14	106357749	rs2254707	C	T	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.88;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	106357749	.	CACCTCACAA	TACCTCACAA,TGCCTCACAG	1712	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12,5;NR=64,22;PP=1712,1283;QD=22.983831744;SC=AGAGGCCAGCCACCTCACAAC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=76,27;WE=106357766;WS=106357739;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:77
chr14	106357750	rs181471980	A	G	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr14	106357758	rs143569449	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr14	106359218	rs185679996	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-1.741;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr14	106359259	rs2857366	A	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.12;NF=13;NR=6;PP=374;SC=TCCCACTGAGAGAACCCTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=106359267;WS=106359249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	106359285	rs181750527	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-2.314;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.938;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr14	106359327	rs3021114	GC	AG	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.414;NF=13;NR=11;PP=775;ReadPosRankSum=-1.699;SC=AAGCAGGTGAGCTGGAGGCCT;SOR=0.735;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=24;WE=106359336;WS=106359317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr14	106359348	rs184135818	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.595;NF=3;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=1.634;SC=GGGGCTGCACAGCAGGGGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=8;WE=106359356;WS=106359338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr14	106359388	rs369242089	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.985;NF=2;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-2.030;SC=TGCTATGGGCAGCACCACTGT;SOR=0.495;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=6;WE=106359396;WS=106359378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr14	106360217	rs150427734	CG	TA	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.536;NF=39;NR=11;PP=2944;ReadPosRankSum=1.569;SC=CCAGCCCATCCGCTGTGATGG;SOR=0.657;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=50;WE=106360239;WS=106360207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr14	106360231	rs149611346	G	A	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=2;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.591;NF=41;NR=19;PP=2962;ReadPosRankSum=2.499;SC=GTGATGGCCAGGGTGTCCCTA;SOR=0.523;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=91;TCR=37;TR=60;WE=106360239;WS=106360207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,66:0.45:148
chr14	106360281	rs144346910	T	C	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.08;MQRankSum=1.440;NF=71;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.223;SC=GACCTGACTCTTCTGGTCCTG;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=215;TCF=134;TCR=81;TR=111;WE=106360300;WS=106360271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,125:0.49:253
chr14	106360292	rs3838842	GA	G	4495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.038;NF=31;NR=46;PP=2964;ReadPosRankSum=-1.555;SC=TCTGGTCCTGGAGAGCTCCAA;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=63;TCR=95;TR=77;WE=106360300;WS=106360271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,133:0.49:269
chr14	106361376	rs190627972	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=426;ReadPosRankSum=-1.446;SC=TGCACTGCTGTGGTAGCCACC;SOR=0.566;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=23;WE=106361384;WS=106361366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr14	106361418	rs2753533	T	C	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=37;PP=2081;SC=CGATCAAAATTGTAACATGGC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=106361426;WS=106361408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	106361515	rs143676405	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.397;NF=30;NR=39;PP=1007;ReadPosRankSum=-2.001;SC=CTCCCCCAAACGTAATCATAA;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=69;WE=106361523;WS=106361505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr14	106361561	rs61993631	GC	AT	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.27;QD=44.60;SOR=1.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	106361564	rs61993633	A	T	4336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.19;QD=45.65;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	106361605	rs192568966	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=93;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.393;NF=5;NR=21;PP=458;ReadPosRankSum=0.971;SC=GACCTGAGGAGGCAGCAGGGC;SOR=1.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=26;WE=106361613;WS=106361595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr14	106368526	rs200686094	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.335;NF=3;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=2.439;SC=GCCACTATATCCACCACAGTC;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=6;WE=106368534;WS=106368516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr14	106368542	rs201662702	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-3.038;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr14	106368544	rs200115395	G	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-2.958;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.830;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr14	106368551	rs201130584	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-2.563;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr14	106369335	rs2857353	G	A	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=12;PP=1095;ReadPosRankSum=1.538;SC=GGCTGAGATGGCCCAGGTGTC;SOR=0.924;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=89;TCR=24;TR=61;WE=106369343;WS=106369325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr14	106369395	rs139933477	T	C	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=33;PP=1720;ReadPosRankSum=0.841;SC=GCTCTTGTGCTCCTGGAGAGC;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=228;TCF=147;TCR=81;TR=105;WE=106369403;WS=106369385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,125:0.46:271
chr14	106369433	rs112597211	T	C	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=61;PP=2125;ReadPosRankSum=-1.972;SC=ACACAGCCCCTGGGTTTCCAG;SOR=0.910;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=300;TCF=168;TCR=132;TR=150;WE=106369441;WS=106369423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,182:0.50:364
chr14	106369534	rs2516960	A	G	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=137;PP=2965;SC=GTGGCCAGAGACCTTTCCCAC;SOR=1.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=60;TCR=137;TR=197;WE=106369542;WS=106369524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr14	106370370	rs141575023	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=301;ReadPosRankSum=-2.426;SC=AATAACTCCCCGAACCATAGT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=18;WE=106370378;WS=106370360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr14	106370603	rs2857350	G	C	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=1117;SC=AAACCTACCGGCAGGCCTGGG;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=106370611;WS=106370593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	106373085	rs139694830	TT	CC	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=1694;ReadPosRankSum=0.026;SC=GCATACACCATTAGTACAATA;SOR=0.429;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=45;WE=106373094;WS=106373075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr14	106373208	rs146631355	T	G	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.944;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=53;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TTCCAGGGGGTTTTTGTCTGA;SOR=0.442;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=67;TCR=105;TR=91;WE=106373216;WS=106373198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,104:0.51:204
chr14	106375551	rs2857348	C	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	106375551	.	CTGGAGCCAC	ATGGGGCCAC,ATGGGGCCAT	155	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=14,8;NR=1,0;PP=155,148;QD=13.8978583241;SC=GCCAGGGGCACTGGAGCCACG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15,8;WE=106375568;WS=106375541;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.94:16
chr14	106375555	rs2516957	A	G	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	106375560	rs112674522	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.783;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr14	106375638	rs2857347	T	C	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=542;ReadPosRankSum=0.692;SC=GTGGGGACACTGTGGGGCTCC;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=43;WE=106375646;WS=106375628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
chr14	106375721	rs111736413	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CGGGGCCTCCGACTGTGGCCA;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=68;WE=106375729;WS=106375711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr14	106376144	rs2516956	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=419;ReadPosRankSum=-2.480;SC=GCAGGGTGCCATGGACAGGAG;SOR=1.005;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=27;WE=106376152;WS=106376134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr14	106376354	rs2516955	A	G	8621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=156;PP=2965;SC=TGGGCTCAGCACAACTTGGTC;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=105;TCR=156;TR=261;WE=106376362;WS=106376344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr14	106377944	rs2516952	C	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.132;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	106378962	rs11160893	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=1113;ReadPosRankSum=1.482;SC=CCCTAGAGGCCGAGGGTCTGG;SOR=0.485;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=126;TCF=86;TCR=40;TR=65;WE=106378970;WS=106378952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,77:0.53:145
chr14	106379020	rs113166883	G	A	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=1912;ReadPosRankSum=0.126;SC=AGCTCTGAGCGGAGAAGTGTG;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=221;TCF=128;TCR=93;TR=113;WE=106379028;WS=106379010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,137:0.52:261
chr14	106380073	rs2856850	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=6;PP=399;SC=TTTGGGTCACAGGCTGCACTG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=106380081;WS=106380063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	106380171	rs3794478	C	T	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr14	106380174	rs2157630	C	A	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.17;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	106382687	rs2857339	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=771;ReadPosRankSum=0.840;SC=TCACTGTGGGCATAGCAGCTG;SOR=0.877;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=50;WE=106382695;WS=106382677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr14	106385233	rs2857334	AC	GT	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	106385245	rs2857332	C	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.13;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	106385332	rs2250700	G	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=24;PP=804;SC=GGCCAGGAGAGAGTTTTGGAC;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=106385340;WS=106385322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	106386996	rs59137576	T	C	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.027;NF=50;NR=38;PP=1410;ReadPosRankSum=-1.711;SC=GAGAAAGACCTTCCTGGCCAC;SOR=0.945;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=88;WE=106387004;WS=106386986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,108:0.45:242
chr14	106387171	rs56082637	T	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=72;PP=1782;SC=AGCCTAGGGGTGTGACCTGAA;SOR=2.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=89;WE=106387179;WS=106387161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	106388588	rs2516944	A	T	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=185;SC=GACAACCCCAAATTCAGACCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=106388596;WS=106388578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr14	106437080	rs72715495	C	T	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=966;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AAAAACACACCGGCCTGAATG;SOR=0.529;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=64;WE=106437088;WS=106437070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,82:0.52:157
chr14	106452628	rs7144717	T	G	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.919;NF=36;NR=15;PP=926;ReadPosRankSum=1.141;SC=CCTCCTCCCTTGGGTTTCTGA;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=51;WE=106452636;WS=106452618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr14	106452766	rs112806369	T	A	3636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=2273;ReadPosRankSum=-0.669;SC=ATGGTGACCCTGCCCTGAAAC;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=288;TCF=152;TCR=136;TR=147;WE=106452774;WS=106452756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,170:0.50:340
chr14	106471268	rs1143505	A	G	4728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.410;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,122:0.47:262
chr14	106471273	rs77346190	C	T	4875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.352;QD=18.06;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,129:0.48:270
chr14	106471353	rs34069216	C	T	6236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=541;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.391;NF=133;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CCCTGGAACTCCTGTGAATAT;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=459;TCF=251;TCR=208;TR=244;WE=106471361;WS=106471343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:247,293:0.54:540
chr14	106471388	rs34874585	C	A	5862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.355;NF=101;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.015;SC=GCCAGCGTTGCTCCATCCCAT;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=440;TCF=206;TCR=234;TR=226;WE=106471396;WS=106471378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,274:0.54:512
chr14	106471528	rs35966079	C	A	2933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-6.194;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,80:0.40:200
chr14	106471534	rs36065697	A	G	2967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-6.741;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.653;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,79:0.42:188
chr14	106471547	rs1143496	A	G	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.370;NF=32;NR=39;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CTGGGAGTGGACACCTGTAGA;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=81;TCR=97;TR=71;WE=106471555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,69:0.38:183
chr14	106471580	rs56320742	GC	TT	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.589;NF=25;NR=26;PP=2944;ReadPosRankSum=-2.452;SC=GTGGATGGAAGCCCCCTTGAC;SOR=0.554;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=51;WE=106471603;WS=106471570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,52:0.34:153
chr14	106471595	rs34652473	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.117;NF=27;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.509;SC=CTTGACTGGCTTCGATCCCTT;SOR=0.595;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=52;WE=106471603;WS=106471570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,45:0.33:136
chr14	106471689	rs56372013	A	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.364;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.145;NF=25;NR=35;PP=734;ReadPosRankSum=0.291;SC=CATGGTGAGGAGTTGTGCTCT;SOR=0.455;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=60;WE=106471697;WS=106471679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr14	106478401	rs78225485	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=14.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQRankSum=2.153;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr14	106494269	rs12895651	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=877;ReadPosRankSum=0.520;SC=TTATCATCATTCCAATAAATG;SOR=0.524;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=51;WE=106494277;WS=106494259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr14	106578952	rs11160922	A	T	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=15;PP=1041;SC=TGATTCATTCAACAATCCCTG;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=106578960;WS=106578942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	106667902	rs58794564	A	AC	11459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=135;PP=2936;SC=ACACAGAGACACCTGGTCAGA;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=72;TCR=144;TR=201;WE=106667910;WS=106667892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr14	106780817	rs8009554	A	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=12.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-7.811;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=1.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,12:0.19:63
chr14	106791006	rs10148365	C	T	6217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.628;NF=152;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CACTGTGTCTCTCGCACAGTA;SOR=0.900;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=294;TCF=195;TCR=99;TR=225;WE=106791014;WS=106790996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,256:0.76:338
chr14	106791119	rs4502119	A	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-0.114;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.776;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:501,157:0.24:658
chr14	106791131	rs10148460	A	G	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-0.356;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:498,165:0.25:663
chr14	106791200	rs8017285	GC	AG	3972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=0.596;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQRankSum=-1.238;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,118:0.29:412
chr14	106805236	rs61740539	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.831;NF=17;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=0.106;SC=CGGCCGTGTCCGCGGCAGTCA;SOR=1.037;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=24;WE=106805250;WS=106805226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
chr14	106805278	rs61739320	A	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.397;NF=37;NR=19;PP=950;ReadPosRankSum=-1.102;SC=ACTGGTTCTTAGACGTGTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=83;TCR=40;TR=56;WE=106805290;WS=106805268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,55:0.43:128
chr14	106805282	rs199855112	G	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-9.904;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.466;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,14:0.11:131
chr14	106805299	rs61739267	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=7.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-12.411;QD=0.60;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=1.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,18:0.11:165
chr14	106805341	rs200481782	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-10.481;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,45:0.16:276
chr14	106805343	rs200864088	A	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-10.589;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,47:0.17:281
chr14	106805380	rs201158628	G	T	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-11.882;QD=3.77;ReadPosRankSum=3.155;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:292,53:0.15:345
chr14	106805381	rs77489245	T	G	4143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-5.954;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.130;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,153:0.44:347
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chr14	106805439	rs142283571	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=0.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-4.489;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,43:0.15:295
chr14	106805440	rs6576153	A	G	10065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=144;PP=2962;SC=CAGAGACAGTACAGGTGAGGG;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=106;TCR=144;TR=250;WE=106805448;WS=106805429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr14	106805481	rs111274188	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=4.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQRankSum=-3.969;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,26:0.13:194
chr14	106805485	rs113376532	C	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=4.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-4.341;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,24:0.13:189
chr14	106805502	rs200772933	C	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.29;MQRankSum=-3.592;QD=2.51;ReadPosRankSum=-2.503;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,20:0.12:162
chr14	106805508	rs4462488	G	A	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=94;PP=2564;SC=TGCACCTGGGGCAGGACCCCT;SOR=1.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=37;TCR=94;TR=131;WE=106805516;WS=106805492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr14	106845193	rs10129987	C	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.27;QD=32.92;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	106845209	rs10129994	C	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=585;SC=ATGTGCACCTCCTCTGGGGTT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=106845217;WS=106845199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	106859191	rs61997354	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.837;NF=8;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GGACTGTATTGTCTCACAGTT;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=9;WE=106859199;WS=106859181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr14	106859351	rs1008525	G	C	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.15;QD=27.91;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	106877551	rs8020298	A	C	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=34;PP=1199;SC=TGCACCTGCGACCGCCCCCTC;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=106877559;WS=106877541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	106937467	.	G	GC	98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=46.48;NF=0;NR=3;PP=98;QD=47.0;SC=ACTTTGAGAGGCAAGGTGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=106937475;WS=106937457;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr14	107013201	rs2073673	G	T	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CGCCCTGGCTGTACCAAGCCT;SOR=0.614;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=84;WE=107013209;WS=107013191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,98:0.44:225
chr14	107034981	rs2731202	G	C	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1465;ReadPosRankSum=0.657;SC=GAGACTCCCCGGGCTTTTTCA;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=245;TCF=120;TCR=125;TR=116;WE=107034989;WS=107034971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,141:0.47:299
chr14	107048767	rs200617568	G	T	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=5.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQRankSum=-8.294;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.433;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:418,105:0.20:523
chr14	107048885	rs200064890	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.24;MQRankSum=-6.508;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,44:0.25:175
chr14	107048944	rs35850880	A	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.76;MQRankSum=0.971;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr14	107078567	rs2516904	T	C	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=66;PP=1869;ReadPosRankSum=0.963;SC=ACCCACTGCATAGCAGAGCTA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=106;TCR=147;TR=113;WE=107078575;WS=107078557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,132:0.45:295
chr14	107078790	rs1858692	C	T	7298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=117;PP=2965;SC=AAGAAGAGGACCCTCCAAATC;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=90;TCR=117;TR=207;WE=107078798;WS=107078780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr14	107082871	rs144729059	A	ATGC	1964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=1128;SC=AAATCAAGAGATGAGAAGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=19;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	107082879	rs59681319	C	CG	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.85;QD=44.13;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	107082880	.	T	G	444	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=55.06;NF=4;NR=13;PP=444;QD=28.1630125028;SC=GATGAGAAGCTTGATATATAT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=17;WE=107082905;WS=107082861;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,17:0.81:21
chr14	107082881	rs59072447	T	TA,TTAG	1897.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=892;SC=ATGAGAAGCTTGATATATATT;SOR=1.236;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:39
chr14	107082882	rs61261254	G	GA	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.22;QD=47.71;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	107082889	rs4043174	A	ATTT	1446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=886;SC=CTTGATATATATTTAATCTGT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=15;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	107082897	rs2337902	T	A	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=14;PP=609;SC=ATATTTAATCTGTAAGCTATA;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=23;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	107113851	rs2072045	C	T	3293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=58;PP=2090;ReadPosRankSum=0.312;SC=TTCACAGAGTCTGCATAATAT;SOR=0.920;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=282;TCF=156;TCR=126;TR=140;WE=107113859;WS=107113841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,161:0.46:348
chr14	107114009	rs11846079	T	C	3654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.776;NF=78;NR=69;PP=2773;ReadPosRankSum=0.723;SC=GACCAAGCCTTCCCCAGACTC;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=262;TCF=136;TCR=126;TR=147;WE=107114017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,149:0.53:280
chr14	107114193	rs2073670	A	G	3250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=78;PP=1823;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CCCAAACTCCATCATGACTCT;SOR=0.786;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=205;TCF=62;TCR=143;TR=108;WE=107114201;WS=107114183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,145:0.56:259
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chr14	107170398	rs4448834	C	T	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=49;PP=1681;SC=GGGGCTTCTTCAGAGGAGGAA;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=69;WE=107170418;WS=107170388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	107170410	rs10220412	G	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=459;ReadPosRankSum=1.805;SC=GAGGAGGAATGTGGTTGTTAT;SOR=0.099;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=27;WE=107170418;WS=107170388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
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chr14	107178832	rs10144402	A	G	3715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=38;PP=2560;SC=TCCGTGCACAATAATACGTGG;SOR=1.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=80;TCR=38;TR=118;WE=107178840;WS=107178822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	107178965	rs2073669	A	C	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=958;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CCAATCAATGAGTGCAAGCCA;SOR=0.492;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=78;WE=107178985;WS=107178955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,91:0.47:195
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chr14	107211211	rs2073668	G	A	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.932;NF=60;NR=45;PP=1737;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGCCTCCCCCGGACTCCACCA;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=116;TCR=83;TR=105;WE=107211219;WS=107211201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,122:0.53:230
chr14	107282809	rs201928713	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=17.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-15.083;QD=0.33;ReadPosRankSum=0.892;SOR=2.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,16:0.07:229
chr14	107282813	rs199801132	CA	AG	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=26.807;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-15.143;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.121;SOR=3.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,20:0.09:231
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chr14	107282846	rs200859769	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=20.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-13.490;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.195;SOR=2.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,31:0.17:185
chr14	107282852	rs201336503	T	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=14.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-13.283;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.954;SOR=1.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,34:0.19:180
chr14	107282859	rs201095197	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=14.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-12.047;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,41:0.23:181
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chr14	107282973	rs200848671	G	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=9.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-9.727;QD=1.57;ReadPosRankSum=-3.334;SOR=1.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,44:0.16:275
chr14	107282988	.	C	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=13.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-9.339;QD=1.72;ReadPosRankSum=-4.185;SOR=1.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,29:0.12:250
chr14	107282994	.	G	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=28.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-10.177;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.496;SOR=3.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,23:0.09:253
chr14	107282996	.	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.117;ClippingRankSum=0.000;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=28.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-10.472;QD=0.87;ReadPosRankSum=-3.517;SOR=3.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,22:0.09:255
chr14	107283002	.	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.718;ClippingRankSum=0.000;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=34.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-11.032;QD=0.17;ReadPosRankSum=-3.653;SOR=4.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,18:0.07:254
chr14	107283150	rs35227799	G	T	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-2.492;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.216;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr14	107283156	rs10133664	A	G	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-2.572;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr14	107283160	rs10133737	C	T	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-2.612;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr15	20170150	rs10431885	C	T	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=34;PP=1210;SC=AGAAGCCTTGCAGGAGATCCT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=20170158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	20433755	rs4114043	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.08;MQRankSum=-1.983;NF=7;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=0.244;SC=GTGAGTTTACGCTATGAGAAA;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=20433763;WS=20433745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr15	20446043	rs1823751	T	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=962;ReadPosRankSum=0.089;SC=GGTGAAGCGGTTGCTTCGAGG;SOR=0.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=114;TCR=105;TR=73;WE=20446051;WS=20446033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,100:0.37:268
chr15	20447987	.	A	G	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=53.0;NF=4;NR=0;PP=37;QD=17.9428031368;SC=ATATATTTCTACTGTTCATAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=4;WE=20447995;WS=20447977;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr15	20448077	rs3963874	T	C	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=33;PP=2463;SC=GAGCTGTCCCTTTAGGTCATT;SOR=1.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=112;WE=20448085;WS=20448067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	20448164	rs55697731	T	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQRankSum=-4.297;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.300;SOR=0.940;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,63:0.20:308
chr15	20450242	rs2444187	G	C	3690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.871;NF=74;NR=74;PP=2230;ReadPosRankSum=1.388;SC=GTTCCTGTGCGGCACACAGCA;SOR=0.484;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=214;TCF=112;TCR=102;TR=148;WE=20450250;WS=20450232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,165:0.65:252
chr15	20453896	rs2601517	G	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.41;QD=28.51;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	20453913	rs2601516	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQRankSum=4.010;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr15	20453992	rs4931912	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.855;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.215;NF=14;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GTCGTAGAGCTGGGACAGGCA;SOR=3.236;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=16;WE=20454000;WS=20453982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr15	20454025	rs4931913	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.310;NF=15;NR=11;PP=316;ReadPosRankSum=0.129;SC=GTCCAGATCCATGCCTGGCTT;SOR=0.899;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=26;WE=20454033;WS=20454015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr15	20454042	rs7168242	A	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.606;NF=3;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=1.439;SC=GCTTCACTGCAAAGAGAACCA;SOR=1.143;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=8;WE=20454050;WS=20454032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr15	20454162	rs4931914	C	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.922;NF=2;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=-0.875;SC=ATTTGGGATCCTCGCTCTCCT;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=10;WE=20454170;WS=20454152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr15	20456600	rs2924241	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.926;NF=9;NR=5;PP=211;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CCACAGCCCTGGCCAAACCCC;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=14;WE=20456608;WS=20456590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr15	20456640	rs8041606	A	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.957;NF=29;NR=12;PP=632;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CCTGGTGGTCAATGAGGAGGA;SOR=1.532;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=41;WE=20456648;WS=20456630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
chr15	20456665	rs8026258	T	A	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQRankSum=-6.747;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr15	20456673	rs8033709	C	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQRankSum=-6.961;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.940;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr15	20456677	rs8037872	G	A	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQRankSum=-7.246;QD=28.01;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr15	20456682	rs58201907	G	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQRankSum=-3.861;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr15	20456740	rs2954579	A	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.161;NF=21;NR=29;PP=1784;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CTCTTTCACCAGCGCCTGGCT;SOR=0.822;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=50;WE=20456751;WS=20456730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr15	20456743	.	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=3;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.873;NF=10;NR=10;PP=659;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TTTCACCAGCGCCTGGCTCAT;SOR=0.543;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=20;WE=20456751;WS=20456730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr15	20456787	rs60265308	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQRankSum=1.478;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr15	20456799	rs59849518	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=1.354;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr15	20456828	rs56331633	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.872;NF=0;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CCCGGCACAAGGGCCCTCATG;SOR=0.807;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=7;WE=20456836;WS=20456818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr15	20457155	rs11856094	A	C	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQRankSum=-4.504;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr15	20457155	.	ACC	CCT	1369	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=49.1;NF=23;NR=14;PP=1369;QD=38.445077699;SC=GCCAGCATTTACCGCCCACTC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=37;WE=20457165;WS=20457154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr15	20457157	rs11854770	C	T	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQRankSum=-4.611;QD=25.54;ReadPosRankSum=1.180;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr15	20457291	rs6599891	T	C	5452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=76;PP=2965;SC=TGGGCTTGTGTAAGCATCATT;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=180;WE=20457299;WS=20457281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr15	20457319	rs8038741	C	A	3172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.560;NF=66;NR=69;PP=2083;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GCACGCTGAGCATGGCAGGGC;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=135;WE=20457327;WS=20457309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,145:0.61:238
chr15	20462450	rs2343219	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr15	20462507	rs2343218	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=-0.869;SC=GGGGCCAAGGCTCTGTCCAGT;SOR=0.184;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=6;WE=20462515;WS=20462497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr15	20462585	rs3901622	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CCCAGCCTGCATCTGCCAATA;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=16;WE=20462593;WS=20462575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,17:0.25:69
chr15	20462603	rs2880572	G	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.594;NF=18;NR=10;PP=383;ReadPosRankSum=0.442;SC=ATAGCGCCACGTCCCAATCTG;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=28;WE=20462611;WS=20462593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr15	20462690	rs6422224	T	G	3059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=55;PP=1745;SC=CAGAACCCCATTGAGGGAGTC;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=20462698;WS=20462680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	20462792	rs62009635	T	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=0.560;QD=21.81;ReadPosRankSum=2.683;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr15	20462793	rs77195941	ATTT	A	470.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.505;QD=26.15;ReadPosRankSum=2.582;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr15	20462828	rs8039793	A	G	255.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=54.61;MQRankSum=-0.556;NF=2;NR=8;PP=193;ReadPosRankSum=1.747;SC=ACAGAGTCTCACTCTGTCGCC;SOR=2.225;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=10;WE=20462836;WS=20462818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr15	20464792	rs59686762	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.380;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.097;NF=29;NR=24;PP=787;ReadPosRankSum=1.424;SC=TCTCCTAAATGAAATATGGCA;SOR=0.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=53;WE=20464800;WS=20464782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr15	20464811	rs4983664	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=0.309;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,18:0.15:118
chr15	20464844	rs151047586	AG	A	1847.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.014;NF=3;NR=28;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.608;SC=CTAAAACCTCAGGATTTGTTT;SOR=0.604;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=31;WE=20464852;WS=20464834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr15	20464860	rs7177447	G	T	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.811;NF=36;NR=47;PP=1299;ReadPosRankSum=-1.597;SC=TGTTTTACTTGTTTATTTTTT;SOR=0.923;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=83;WE=20464868;WS=20464850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,88:0.84:105
chr15	20465103	rs6599901	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.742;NF=4;NR=6;PP=155;ReadPosRankSum=0.654;SC=GTGATCCACCAACCTCGGCCT;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=10;WE=20465111;WS=20465093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr15	20465167	rs10794632	A	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=0.768;QD=3.90;ReadPosRankSum=2.643;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr15	20465182	rs10794633	T	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.668;QD=5.43;ReadPosRankSum=2.285;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr15	20466352	rs4983837	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.721;SC=GCATTATAGGTGTGAAAACCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=5;WE=20466360;WS=20466342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr15	20466465	rs28660626	C	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.278;NF=16;NR=17;PP=365;ReadPosRankSum=-1.118;SC=TCTGAAAATACCAATTGTGGA;SOR=0.578;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=33;WE=20466473;WS=20466455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr15	20466516	rs4983836	C	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.24;QD=28.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	20466546	rs4931936	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.75;MQRankSum=-0.434;QD=7.99;ReadPosRankSum=-2.540;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr15	20466604	rs4983834	A	G	255.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.56;QD=36.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	20467100	rs4983661	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,23:0.20:114
chr15	20467242	rs59808209	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.159;NF=10;NR=15;PP=259;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GCTGGGCGTCCGACAAGCCTG;SOR=0.595;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=25;WE=20467250;WS=20467232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr15	20467994	rs2601503	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.844;SC=AATCTACCCACGATTCTGTTA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=20468002;WS=20467984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr15	20468050	rs4983831	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-4.097;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,17:0.20:85
chr15	20476906	rs4983827	T	C	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.794;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.198;NF=52;NR=9;PP=956;ReadPosRankSum=0.051;SC=CCAGTGCCCATGGCTTTGAGA;SOR=0.986;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=148;TCF=125;TCR=23;TR=61;WE=20476914;WS=20476896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,62:0.41:153
chr15	20476942	rs4983659	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.860;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=1.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,70:0.24:294
chr15	20477005	rs4248783	G	C	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.611;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:407,156:0.28:563
chr15	20477090	rs4931940	T	C	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.623;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,107:0.28:388
chr15	20482111	rs11629632	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=1.780;SC=TTGGGTTCGCGGCCACTCTGT;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=29;WE=20482119;WS=20482101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,31:0.27:115
chr15	20588563	rs2291972	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.134;NF=15;NR=1;PP=356;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GCGGTTGCAGAAGCCCAGTAG;SOR=2.200;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=16;WE=20588571;WS=20588553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr15	20588705	rs4931826	C	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=927;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TCTGGACATTCTTTCCTGAAA;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=62;WE=20588713;WS=20588695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,87:0.50:174
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chr15	20874897	rs7497658	A	G	5693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=87;PP=2965;SC=CCTATTCTGCATATGGTGGTG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=181;WE=20874905;WS=20874887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
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chr15	20875100	rs7497715	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=493;ReadPosRankSum=-0.165;SC=AGAGGTTAAAAATAACTTTCT;SOR=1.755;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=23;WE=20875108;WS=20875090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
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chr15	21145671	rs75530583	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.360;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.296;NF=33;NR=30;PP=621;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TCAGAGTAGGCGTAGATGTTT;SOR=0.439;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=155;TCF=89;TCR=66;TR=63;WE=21145679;WS=21145661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,73:0.39:189
chr15	21145700	rs76772429	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.173;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.311;NF=33;NR=35;PP=760;ReadPosRankSum=0.410;SC=CAATCAGAACGTGAAGTCCGA;SOR=0.596;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=68;WE=21145708;WS=21145690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,86:0.42:206
chr15	21145803	rs74875973	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.927;NF=4;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-2.599;SC=TACTTCTGCCGCAGAGTTTGG;SOR=0.055;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=10;WE=21145811;WS=21145793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr15	22318963	rs1429506	A	T	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.866;NF=47;NR=36;PP=1219;ReadPosRankSum=0.114;SC=TATCACAGAAAAGAACAAGGT;SOR=0.618;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=83;WE=22318971;WS=22318953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,94:0.53:176
chr15	22319148	rs71455753	C	G	2995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.652;NF=68;NR=46;PP=1847;ReadPosRankSum=-3.125;SC=AGCATAGGAACAAAGGATAAA;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=122;TCR=79;TR=114;WE=22319156;WS=22319138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,128:0.57:223
chr15	22319174	rs6602966	T	C	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.643;NF=57;NR=40;PP=1686;ReadPosRankSum=-0.707;SC=AGGTGCCAATTATGAAGACAG;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=227;TCF=131;TCR=96;TR=97;WE=22319182;WS=22319164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,113:0.42:266
chr15	22319253	rs6602967	A	G	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1458;ReadPosRankSum=2.117;SC=CTTCAATGGGACGGGATCACA;SOR=1.049;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=208;TCF=85;TCR=123;TR=86;WE=22319261;WS=22319243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,100:0.40:251
chr15	22319389	rs8025521	T	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.230;NF=26;NR=17;PP=785;ReadPosRankSum=-1.333;SC=ACTTGTTTAGTCATGATGCAT;SOR=0.824;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=43;WE=22319397;WS=22319379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,45:0.38:119
chr15	22319410	rs8029027	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=57.78;MQRankSum=-7.454;NF=42;NR=14;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GGATAACGTAGAGGGCGGCAG;SOR=1.204;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=141;TCF=100;TCR=41;TR=56;WE=22319418;WS=22319400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,58:0.38:154
chr15	22319445	rs6602968	G	A	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.884;NF=66;NR=37;PP=1565;ReadPosRankSum=0.682;SC=GTCAAAGGCCGTGATGCAAAG;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=244;TCF=153;TCR=91;TR=103;WE=22319453;WS=22319435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,108:0.39:276
chr15	22319565	rs4779265	G	A	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.91;MQRankSum=-0.832;NF=46;NR=74;PP=1955;ReadPosRankSum=1.133;SC=TTTAGTTGCAGTAACATAACA;SOR=0.581;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=198;TCF=72;TCR=126;TR=120;WE=22319573;WS=22319555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,140:0.59:239
chr15	22332751	rs930109	T	C	5499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=71;PP=2965;SC=TGAGATGTTTTTGCTGACAGT;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=168;WE=22332759;WS=22332741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr15	22344871	rs28571003	A	G	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-4.923;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,60:0.37:164
chr15	22344879	rs1366870	C	G	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=6.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-5.124;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.562;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,55:0.35:158
chr15	22369248	rs491208	T	C	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=5.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.083;NF=66;NR=44;PP=1930;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TCTGGCCTTGTTCAAGAAACT;SOR=1.304;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=110;WE=22369256;WS=22369238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,81:0.36:222
chr15	22382655	rs535034	A	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.111;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.651;NF=7;NR=24;PP=655;ReadPosRankSum=-1.618;SC=CCCTCTATTTATTTCTGGGCA;SOR=0.086;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=31;WE=22382663;WS=22382645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr15	22382728	rs2808136	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=7.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.43;MQRankSum=0.037;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr15	22382739	rs2671839	A	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.73;QD=32.17;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	22382821	rs12438969	G	C	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.032;NF=46;NR=25;PP=1090;ReadPosRankSum=1.274;SC=ACTCCTTGTTGTGATGGCCTT;SOR=1.059;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=71;WE=22382829;WS=22382811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr15	22383064	rs12441468	C	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=3.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-2.721;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr15	22383064	.	CTA	ATG	1476	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=57.97;NF=27;NR=9;PP=1476;QD=42.4852187462;SC=GGTGGAGCTTCTAATGGTCTT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=36;WE=22383074;WS=22383054;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,36:0.46:78
chr15	22383066	rs559754	A	G	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-2.750;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr15	22413700	rs267612	A	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.22;QD=33.46;SOR=2.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	22413940	rs7167256	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.655;NF=19;NR=24;PP=674;ReadPosRankSum=1.138;SC=ATTATCCAGGTGGTCCTCATC;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=43;WE=22413948;WS=22413930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr15	22414262	rs1429510	C	T	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.425;NF=44;NR=55;PP=1451;ReadPosRankSum=-1.145;SC=CTTTCCCAGCCGACAAGGTGG;SOR=0.478;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=80;TCR=107;TR=99;WE=22414270;WS=22414252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,121:0.56:217
chr15	22440816	rs4505267	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=453;ReadPosRankSum=0.589;SC=GTTTTGTGGCACTTGTGCCAG;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=35;WE=22440824;WS=22440806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr15	22466498	.	A	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=2.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-9.239;QD=0.97;ReadPosRankSum=1.554;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,12:0.09:128
chr15	22466508	rs200705243	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-9.201;QD=0.93;ReadPosRankSum=2.447;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,12:0.09:127
chr15	22466512	rs184389995	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-9.086;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.283;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,12:0.10:124
chr15	22482858	rs1807224	A	G	7986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=169;NR=95;PP=2965;SC=ATACACGGCCATGTCCTCAGA;SOR=1.309;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=169;TCR=95;TR=264;WE=22482866;WS=22482848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr15	22483277	rs753259	A	G	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=615;SC=ACGGTGAGGCACTGAGCTCTA;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=22483285;WS=22483267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	22489958	rs111826301	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr15	22489966	rs72687799	A	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr15	22490035	rs72687802	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr15	22840279	rs61744212	G	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=5;PP=195;SC=CACTTCTTCTGTGTCTGTCAG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=22840287;WS=22840269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	22845637	rs144200387	T	TTATTTTTAAA	1250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=2974;SC=TACATAAATGTTAGGTAGCTG;SOR=2.833;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=12;WE=22845645;WS=22845627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	22845652	rs71400446	T	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=133;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=7;PP=450;SC=TAGCTGTTATTTTTAAAAAGC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=22845660;WS=22845642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	22855425	rs35571762	C	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=TGGCAATTATCGTCATGGTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=22855433;WS=22855415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	22864438	rs35914296	A	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=18;PP=521;SC=GTCTTCTATGAATTACACATA;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=22864446;WS=22864428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	22869764	rs2289814	A	G	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=106;SC=CCAAATGGGCATGGTTCAGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=22869772;WS=22869754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	22873125	.	G	A	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.53;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	22873132	.	C	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	22873325	rs1046860	A	G	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=53;PP=1596;SC=TGAAAAGTGAAAATATTTTTA;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=22873333;WS=22873315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	22926229	rs2289824	G	A	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=17;PP=1103;SC=TTTTCTTAGTGTAAAAACAAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=22926237;WS=22926219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	22926307	rs7403459	A	G	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=42;PP=1550;SC=TCAAGGGTGCACCTGCCCTGT;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=22926315;WS=22926297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	22928537	rs79791617	G	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=884;SC=TCTGGGGGGGGTGTAACACCG;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=22928545;WS=22928527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	22929905	rs2305094	C	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.99;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	22929905	.	CA	GG	603	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=21;PP=603;QD=23.4452812451;SC=GGTGAGCACCCACCTCGCGCA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=28;WE=22929914;WS=22929895;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr15	22929906	rs2305093	A	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.91;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	22933510	.	TA	T	120	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=109;MMLQ=16;MQ=58.9;NF=3;NR=0;PP=120;QD=41.0;SC=TTTTTTTTTTTAAATGTGGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=22933518;WS=22933500;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr15	22933528	.	G	A	251	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=27;MQ=61.69;NF=10;NR=1;PP=251;QD=25.9792011407;SC=GCACGTTGGTGCATTTTGGGA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=22933536;WS=22933518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	22933691	rs1109036	G	A	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=45;PP=2020;SC=AGGTTGATGGGCCAAGCAGCC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=22933699;WS=22933681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	22939192	rs11633474	G	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=27;PP=1446;SC=AGGTGGTTCCGCTATTTGGGG;SOR=1.039;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=69;WE=22939200;WS=22939182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	22940670	rs3751566	C	T	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=786;SC=TGAGCTGCCCCAGTGCTGTGG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=22940678;WS=22940660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	22955211	rs36080947	C	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=38;PP=1142;SC=CCTTGCGGGGCGAGAAGGACC;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=22955219;WS=22955201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	22958104	rs4134803	A	G	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=326;SC=GCAGGCACCCAGCACACAGCC;SOR=2.124;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=22958112;WS=22958094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	22958151	rs55859252	C	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=472;ReadPosRankSum=3.377;SC=TTTTTGCTTGCGGGAGATAAC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=24;WE=22958159;WS=22958141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr15	22960700	rs2289817	A	G	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=231;SC=TGAGAGGTGGAAAATGGAGTT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=22960708;WS=22960690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr15	22962184	rs7359217	T	A	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=130;SC=ACGAAACATTTTGTTTTTCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=22962192;WS=22962174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr15	23052632	rs11263683	T	C	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=12;PP=609;SC=CAGCCTGAGTTGTCACACTCT;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=23052640;WS=23052622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	23059394	rs1991922	C	T	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=40;PP=1477;SC=CTTCAATACACCCATCATGGA;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=67;WE=23059402;WS=23059384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	23131745	rs7181884	G	A	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.49;QD=26.40;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	23132075	rs56264744	G	GA	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5069;FS=4.771;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.327;SC=CACTTTAACTGAAAAAAAAAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=23132083;WS=23132065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr15	23138992	rs202076313	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	23181922	rs1994761	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.513;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.034;NF=15;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAGTACTACTGTAACTATAT;SOR=0.329;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=29;WE=23181930;WS=23181912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,31:0.30:102
chr15	23181990	rs62000567	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=29.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.33;MQRankSum=-5.778;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,11:0.11:99
chr15	23182267	rs12050782	G	A	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.674;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.898;NF=28;NR=46;PP=1423;ReadPosRankSum=4.055;SC=AAATGGAAAAGTCATCATATG;SOR=1.157;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=74;WE=23182275;WS=23182257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,81:0.92:88
chr15	23200698	rs58552405	A	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.84;QD=28.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	23259270	rs200991698	A	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.34;QD=26.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	23299924	rs201796824	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQRankSum=-2.798;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,6:0.15:41
chr15	23299928	rs200546965	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.16;MQRankSum=-2.971;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,6:0.15:41
chr15	23300079	rs417713	T	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=7.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-3.810;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr15	23300080	rs28482434	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=7.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-3.810;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr15	23685004	.	G	GCAT	1380	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=54.59;NF=3;NR=22;PP=1380;QD=56.92;SC=TCCTTCTCTCGCATCTCCTCC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=25;WE=23685012;WS=23684994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr15	23685343	rs74203443	T	C	65.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.55;QD=21.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	23685466	.	C	CCCGCA	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=-2.937;QD=2.18;ReadPosRankSum=3.015;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr15	23685468	.	C	CTT	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQRankSum=-3.313;QD=1.93;ReadPosRankSum=3.790;SOR=0.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,3:0.09:33
chr15	23685517	rs372380699	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.213;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.956;NF=22;NR=16;PP=520;ReadPosRankSum=0.508;SC=TCTGTTCCGGCAGCCTCTGCT;SOR=0.357;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=38;WE=23685525;WS=23685507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr15	23685541	rs375981990	CT	C	3196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.168;NF=13;NR=53;PP=2977;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCCACATCTTCTTCTTCCTGC;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=23685549;WS=23685531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr15	23685583	rs368496365	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.092;NF=11;NR=16;PP=536;ReadPosRankSum=-1.930;SC=TCCCACATCTTCTCCTCCTGC;SOR=0.391;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=27;WE=23685591;WS=23685573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr15	23685604	.	TC	T	674.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=3.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-0.482;QD=9.24;ReadPosRankSum=-2.320;SOR=0.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr15	23685606	.	TCTTCCTGCTCCCACATCTTCTCCTCCTGCTCCCGCATCTTC	T	644.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-0.501;QD=8.71;ReadPosRankSum=-2.490;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr15	23685639	rs374969803	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.246;NF=7;NR=27;PP=1629;ReadPosRankSum=2.816;SC=CTCCTGCTCCCGCATCTTCTC;SOR=1.755;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=34;WE=23685655;WS=23685595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr15	23685895	rs111853398	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-4.987;NF=15;NR=8;PP=247;ReadPosRankSum=0.247;SC=ATCCTCTCCTCCTGGTCCCAC;SOR=0.883;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=23;WE=23685903;WS=23685885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr15	23685922	.	C	CCCGCATCTTCTCCTCCTGCTT	1971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-3.363;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr15	23686062	.	T	C	403	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=93;MMLQ=22;MQ=52.86;NF=12;NR=14;PP=403;QD=16.8373543287;SC=CCTGGTCCCGTATCTTCTCCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=26;WE=23686077;WS=23686052;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,26:0.38:68
chr15	23686088	.	TCTC	T	1271	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=81;MMLQ=28;MQ=53.16;NF=0;NR=15;PP=1271;QD=86.4666666667;SC=TCCCATATCTTCTCCTCCTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=15;WE=23686098;WS=23686078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr15	23686113	.	C	CTGCTCTTGCATCTTCTCG	2295	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MMLQ=24;MQ=53.63;NF=0;NR=15;PP=2295;QD=155.866666667;SC=GCATCTTCTCCTGTTCCCACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=15;WE=23686121;WS=23686103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,15:0.27:56
chr15	23686598	rs35708006	T	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=175;SC=TCCCGCAGCTTCTTCTGCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=23686606;WS=23686588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	23686673	rs59122400	G	A	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=187;SC=TCCTGTCTCCGCATCTTCTCC;SOR=1.493;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=23686681;WS=23686663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	23686914	rs57504140	T	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	23686924	rs58446506	T	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	23687812	rs2344891	T	G	344.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=7;PP=176;SC=GGTCTCATTTTTTTTTCTTTT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=23687826;WS=23687802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	23687818	rs72495057	CT	C	300.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.96;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	23688944	rs4778531	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=26;PP=851;SC=TTCTTGTGCCATGTGGACACA;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=23688952;WS=23688934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	23689510	rs12902150	C	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=19;PP=938;SC=GGAATCTTGGCGGTGAGCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=23689518;WS=23689500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	23889033	rs9785	G	T	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=167;SC=AAATCCAAACGTACACTCGTG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=23889041;WS=23889023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	23892792	.	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=0.335;SC=GGAAGCGGGCGGGGCCCGCAT;SOR=0.373;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=20;WE=23892800;WS=23892782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr15	23931900	.	C	T	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=38;PP=1719;SC=TGGTTAGCCTCAGGTGCAGCC;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=23931908;WS=23931890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	24921771	rs1563102	G	C	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=69;PP=2499;SC=CCGGCATCTTGGAAAGCCTGA;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=24921779;WS=24921761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	25307562	rs7402542	A	G	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=45;PP=2136;SC=CGTTCTCATCAGAACTGAGGT;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=122;WE=25307570;WS=25307552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	25310313	.	C	T	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=49;PP=1521;SC=GGGACAACTTCCACTAGTCCC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=25310321;WS=25310303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	25310440	rs6576402	A	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=105;SC=TACACAGGTCAGAGAGTCATA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=25310448;WS=25310430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	25415759	rs2714734	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=149;SC=GCCAGCCCCCGGTGCGCTGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=25415767;WS=25415749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	25415809	rs2739838	C	T	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=478;SC=CTGCACTGAGCTGTGGTGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=25415817;WS=25415799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	25415825	rs1883009	C	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=628;SC=TGAGCCCATCCGGGTCCTGCT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=25415833;WS=25415815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	25427395	rs145371358	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=268;SC=CCAGGTCAGCGTCCATCAGCC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=25427403;WS=25427385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	25429526	.	C	G	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=50;PP=2476;SC=TAGGATTACGCTGAGGCCCAG;SOR=1.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=121;WE=25429534;WS=25429516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	25652101	rs8032479	C	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=85;SC=AATTACATAACAACTAAAAAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=25652109;WS=25652092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	25925094	rs3816800	C	G	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=18;PP=560;SC=TGGGGAAAACCCTCCCCTGGA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=25925102;WS=25925084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	25925195	rs3736186	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=7;PP=271;SC=GAGACCCACATAGAGCAGAAG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=25925203;WS=25925185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	25925933	rs901003	C	A	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=2;PP=110;SC=TCTTCTGAGACGTGGCCATGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=25925941;WS=25925923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	25926186	rs2076743	G	A	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=15;PP=539;SC=AGGCGGCGTCGGCCATGTTAA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=25926194;WS=25926176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	25926325	rs35849027	T	TAAC	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	25937004	rs2066705	C	T	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=53;PP=1715;SC=AATCAATGTGCTAGATTTTCT;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=25937012;WS=25936994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	25937033	rs4906745	T	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=39;PP=1283;SC=CCCGCTGAACTCAGTCCTGTG;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=25937041;WS=25937023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	25961964	rs10873607	A	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=37;PP=1376;SC=CAGACAGCTCAGGCGAGAGGT;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=25961972;WS=25961954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	25963599	rs8024374	A	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=139;SC=TGGGCGGAGCAGAAAGAAACC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=25963607;WS=25963589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	25967085	rs1564828	T	C	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=46;PP=1394;SC=ACAGGATGAATGACCGTGAGG;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=25967093;WS=25967075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	25981190	rs7173593	A	G	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=16;PP=604;SC=GCAGGCAGACACACGATACTC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=25981198;WS=25981180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	25981367	rs7177724	C	T	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=131;SC=TTTTCTGTCTCGCATCCGCGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=25981375;WS=25981357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	26147821	rs74629745	G	A	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=105;SC=GCACACTGATGCATGTTGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=26147829;WS=26147811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	26260450	rs12440137	C	T	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=215;SC=GATGCATCTGCCCAACCTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=26260458;WS=26260440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	26260477	rs12437822	T	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=3;PP=271;SC=TTTTTCCTTTTCAGCCCAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=26260485;WS=26260467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	26866738	rs45542840	C	T	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=361;SC=GGTGTATTTCCTCCACGACCA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=26866746;WS=26866728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	27182357	rs140682	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=49;PP=1875;SC=CTGAAGTCGTTTACGTCTGGA;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=27182365;WS=27182347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	27188335	rs140683	T	A	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=371;SC=TTTCCGTTTTTCACTCTGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=27188343;WS=27188325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	27188353	rs140684	C	A	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=7;PP=524;SC=CCCTGCCTGACCCCCGCAGGG;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=27188361;WS=27188343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	27216746	rs2288694	C	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=16;PP=494;SC=GTAAGTGGCGCGGGGGCCGCA;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=27216754;WS=27216736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	27726080	rs56174531	A	G	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=AAGTGAAACTATGTTTTCATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=27726088;WS=27726070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	27772676	rs140679	C	T	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=14;PP=1275;SC=TTTTTGTGACCGTGTGCTTCC;SOR=1.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=27772684;WS=27772666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	27772892	rs2303879	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=316;SC=CAAATACCCAGTTCAACAAGA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=27772900;WS=27772882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	27890571	rs5811500	GT	G	972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=546;SC=GATTGTTGGGGTTTTTTTTTA;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=27;WE=27890579;WS=27890561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	28096453	rs8025804	A	G	145.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=2;PP=100;SC=AATCTGATACACACTAACTGT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=28096461;WS=28096443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	28096538	rs1800419	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=555;SC=CTCCCAGGCAAGCACCGAAGG;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=28096546;WS=28096528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	28116173	rs12594397	C	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=450;SC=TGCTCACTTTCGTCCTCTACA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=28116181;WS=28116163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	28116275	rs7175046	G	C	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=35;PP=1511;SC=AAGTTGAGCCGTCGACATGGA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=79;WE=28116283;WS=28116265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	28171147	rs2594928	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=25;SC=ATTACAACCTTCATTGTTTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=28171155;WS=28171137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	28195534	rs11632387	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=440;SC=AGGCCTGAGGCGTAATTAAAA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=28195542;WS=28195524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	28196821	rs7173419	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=407;SC=TCTCTGGCCTTCCACCAGCCC;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=28196829;WS=28196811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	28200408	rs7170989	T	C	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=35;PP=841;SC=TCACGCTGCGTGGTGAGATCG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=28200416;WS=28200398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	28211758	rs4778218	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	28211921	rs1800411	G	A	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=132;SC=GGAGAACAAGGCAAATCCCAA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=28211929;WS=28211911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	28228644	rs12910433	G	A	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=38;PP=1215;SC=CACAAATGGAGGAAAATGAAA;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=28228652;WS=28228634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	28230097	rs1900758	C	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=293;SC=TGGGCTCAACCGCCCCCACCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=28230105;WS=28230091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	28231793	rs10852218	T	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=20;PP=943;SC=AGATCATCTATGGGGAAAAGA;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=28231801;WS=28231783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	28235773	rs1800404	C	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=49;PP=1486;SC=CCAGCATGGCCGCCAGAGTTC;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=28235781;WS=28235763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	28357230	rs4778245	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=264;SC=CGGCTGCAGTTTACTTTACTG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=28357238;WS=28357220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	28359744	rs7495441	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=CAACAGAGACGGATGACCACC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28359752;WS=28359734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	28360081	rs7497014	T	C	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	28360888	rs5811542	C	CT	294.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=371;SC=CTAAAAGCCTCTAACTCTTCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=28360896;WS=28360878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	28361764	rs4778247	C	T	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=102;SC=AACTCAAGAGCAGGCACAGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=28361772;WS=28361757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	28362459	rs7495875	G	A	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=35;PP=1060;SC=AGACCCTGCCGTCTGGGGCGC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=28362467;WS=28362449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	28375872	rs6416603	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=325;SC=TTAGTGCAACATAAAATCATA;SOR=2.419;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=28375880;WS=28375862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	28377196	rs10627923	C	CCT	2752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=18;PP=1836;SC=CCTGGGGGCCCGACTGCGGTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=28377204;WS=28377186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	28377772	rs8025035	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=443;SC=ATGCAGCCTCCGGCCTCTGCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=28377780;WS=28377762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	28378122	rs4778141	T	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=AACTCAAAAGTTCACCACTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=28378130;WS=28378112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	28386626	rs11636232	C	T	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=27;PP=1480;SC=CTCCGATTAACTGCACGGGTC;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=73;WE=28386634;WS=28386616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	28414665	rs7494786	T	C	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=209;SC=TAAGAATATGTGATAAGGCCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=28414673;WS=28414655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	28419566	rs201182375	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQRankSum=0.677;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.219;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr15	28419619	rs141441362	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=0.568;QD=6.41;ReadPosRankSum=-2.319;SOR=0.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr15	28419695	rs149592795	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=0.170;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,23:0.26:89
chr15	28419746	rs139335991	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.715;NF=2;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GGCCGTGGTCGTTGTCACCCC;SOR=2.160;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=19;WE=28419754;WS=28419736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr15	28441817	rs2525936	G	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=136;SC=GTAGTTATTTGTTTTTTACAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=28441825;WS=28441807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	28447322	rs148451375	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.51;MQRankSum=0.055;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr15	28447562	rs146883683	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.149;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-6.022;NF=18;NR=23;PP=520;ReadPosRankSum=3.225;SC=TTCCTTCTGGAAAATCCCATC;SOR=0.397;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=41;WE=28447570;WS=28447552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr15	28502279	rs11631797	A	G	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.283;NF=35;NR=32;PP=1508;ReadPosRankSum=0.610;SC=AGTCCGCGGAACCATCCATCC;SOR=0.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=67;WE=28502287;WS=28502269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr15	28953403	rs202182931	G	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.32;QD=46.15;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	28953412	rs200486442	C	T	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.67;QD=40.75;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	29008641	rs372586219	GCCCCTCCATGGATCACCGGCA	G	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=10;PP=2966;SC=GAGCTGGCAGGCCCCTCCATG;SOR=0.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=29008669;WS=29008631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	29008851	rs145357312	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=19.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	29009050	rs112804410	A	AC	4756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=59;PP=2957;SC=TATAGGACTTAGACACCCTTG;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=79;WE=29009058;WS=29009040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	29009311	rs142374134	A	G	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=15;PP=421;SC=ATATAGTTACAGTAGTACTGA;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=29009319;WS=29009301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	29043336	rs11630550	C	T	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=160;SC=CTGTGTATTCCAGCTGTTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=29043344;WS=29043326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	29043486	rs11630596	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=4;NR=6;PP=138;SC=GAATTTCCACCTTCTGAACAA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=29043494;WS=29043476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	29043511	rs1877706	T	G	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=46.88;NF=1;NR=6;PP=142;SC=AATGTATCCTTAAGAGCTGTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=29043519;WS=29043501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	29052021	rs4036877	A	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.79;NF=18;NR=1;PP=469;SC=TGAACATTTAATAATTGCATT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=29052029;WS=29052011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	29385149	rs4779760	A	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=296;SC=TGCAGATGGCAATGGTTGGGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=29385157;WS=29385139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	29385204	rs4779761	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=7;PP=687;SC=TCCTTGTGCTATGGCCAGGCA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=29385212;WS=29385194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	29386593	rs8037972	G	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=32;PP=949;SC=GTGGGGGCTGGGGGGTTCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=29386601;WS=29386583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	29409063	rs192916971	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=467;SC=AGCCAGGGGTGGGGACCTGGA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=29409071;WS=29409053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	29415560	rs3751562	G	A	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=67;PP=2660;SC=GGTCCAGAACGTCAGCGCCGA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=138;WE=29415568;WS=29415550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	29415698	rs3751563	A	G	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=50;PP=1652;SC=AAACCCTGGCATCCGCATAGG;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=85;WE=29415706;WS=29415688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	29417099	rs12438521	G	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=38;PP=1170;SC=GACACCCACCGAGCGGCAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=29417107;WS=29417089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	29418520	rs2256273	C	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=14;PP=471;SC=GCGGGACACACGCCCGGGACC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=29418528;WS=29418510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	29418573	rs2672680	AT	GC	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=9;PP=727;SC=CTGGAGACACATGGCCAGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=17;WE=29418582;WS=29418563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	29418745	rs968476	G	T	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=12;PP=339;SC=GGGGACGCTGGCGTGGGACAG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=29418753;WS=29418735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	29428556	rs8023368	C	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=500;SC=TTGTCTGGGGCCCCAGGCCTC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=29428564;WS=29428546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	29429347	rs61741714	G	A	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=330;SC=GAACGGTGCCGTGAGGAGTCA;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=29429355;WS=29429337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	29444130	rs59230279	GC	G	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=413;SC=CCCAGAATGAGCCGAGGTCGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=29444138;WS=29444120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	29862654	rs111717681	C	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=300;SC=AGCGCCTAGCCCCCCCGGCCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=29862662;WS=29862651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	30001328	rs17683205	C	T	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=245;SC=GTGCTGGAGTCGAGGCCCAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=30001336;WS=30001318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	30008856	rs7166878	C	A	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=20;PP=824;SC=TCTGAGAATGCGCTGGCTTTG;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=30008864;WS=30008846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	30008889	rs2229518	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=26;PP=1026;SC=GATGGCTGGCGGCAATGTGTG;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=30008897;WS=30008879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	30011427	rs11073215	C	T	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=186;SC=TATTAAACTACGATTTAATAT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=30011435;WS=30011417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	30018553	rs4073316	A	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=11;PP=899;SC=TTTACTGAACAAGTCAAAAAA;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=30018561;WS=30018543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	30018627	rs2229515	T	C	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=37;PP=1457;SC=TGTTGTTGAATTGCTTCTTTC;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=30018635;WS=30018617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	30020106	rs11073221	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=351;SC=AAACCACAATAACATAATGAA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=30020114;WS=30020096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	30053684	rs2293186	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=382;SC=ATAAAACTTATAGATTTTGAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=30053692;WS=30053674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	30064495	rs1383315	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=296;SC=AATTTCTCTTCAGATCAATGA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=30064503;WS=30064485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	30069920	rs34542662	AT	A	299.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=329;SC=CAAATGTACTATTCTTTTGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=30069928;WS=30069910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	30070181	rs9920621	C	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=225;SC=TATGAACTTACATCTTGTTTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=30070189;WS=30070171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	30070198	rs1904812	A	C	297.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=59.56;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	30337377	rs10775120	G	C	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=57.46;NF=19;NR=29;PP=965;SC=GTCGACCCCAGTCCGGACCCC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=30337385;WS=30337367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	30700263	rs2564642	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=704;SC=TGCCCTCTCCTTCTCTGCCCC;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=30700271;WS=30700253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	30700278	rs62016505	C	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.93;QD=30.46;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	30927867	rs141692578	A	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=1235;SC=ATGGAGGTACAGTGATTTGCT;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=30927875;WS=30927857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	31048067	rs116457401	T	C	177.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.07;QD=44.48;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	31048088	rs61998400	T	C	210.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.87;QD=35.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	31048241	rs11633095	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=9;PP=290;SC=CACCTCACCCACTGCTGGGTC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=31048249;WS=31048231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	31060115	rs4779494	T	C	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=25;PP=1019;SC=AACCACTTCCTTTGCTCATCC;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=54;WE=31060123;WS=31060105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	31233220	rs2955792	C	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=188;SC=CAATTAGAGACGACAGAAAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=31233228;WS=31233210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	31233352	rs3840035	GTGAC	G	2824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=1929;SC=GGCTGCTAATGTGACTGACTA;SOR=1.214;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=34;WE=31233363;WS=31233342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	31234981	rs11293	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	31235005	rs3512	G	C	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=ACTCTTGGAAGTGCCTTTACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=31235013;WS=31234995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	31235357	rs2293319	C	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=75;SC=CTCATCATTACACAGGTTAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=31235365;WS=31235347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	31238783	rs11637469	T	C	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=746;SC=TTTCTGTTTCTCTCAATGGTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=31238791;WS=31238773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	31244263	rs2955789	C	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=46;PP=1472;SC=AAAGGAAAAGCAGTGTTAAAA;SOR=2.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=31244271;WS=31244253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	31245880	rs1404467	C	T	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=187;SC=TTATTTTATACGATCCCTATC;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=12;WE=31245888;WS=31245870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	31246840	rs34294266	A	G	149.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=41;SC=TATAATTTGTACAAATAGTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=31246848;WS=31246830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	31283844	rs28564430	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=443;SC=CGGGCGGGGATACGGCGCAGC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=31283852;WS=31283834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	31294702	rs61734298	G	T	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=53;PP=2096;SC=TTTAAACTTGGGGAAATAGTT;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=31294710;WS=31294692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	31330280	rs2288242	A	G	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=34;PP=1184;SC=TGCCATCCTCATTTTCCTTGG;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=31330288;WS=31330270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	31339151	rs11636121	A	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=324;SC=GGGGAGCTGGAGAATGCCGTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=31339159;WS=31339141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	31341461	rs10851487	G	A	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=309;SC=CTGCCATTAAGTACGGACCTC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=31341469;WS=31341451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	31341516	rs2288241	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=13;PP=510;SC=ACAATATGCACCAGTGACAAA;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=31341524;WS=31341506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	31342744	rs1035705	C	T	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=908;SC=TCTCCTTCTCCGTGGCTTTGC;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=31342752;WS=31342734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	31357138	rs919001	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=489;SC=GCAAGGATTGATATTTTCAAT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=31357146;WS=31357128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	31359457	rs3784599	T	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=675;SC=TCATGAAATTTAGGGACACTT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=31359465;WS=31359447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	31362352	rs2241493	C	T	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=25;PP=881;SC=CACCTGTTTGCTTTCCTCTTC;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=31362360;WS=31362342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	31368915	rs2241497	C	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=146;SC=GTGGTGGACACAAACTCTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=31368923;WS=31368906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	31369123	rs4779816	A	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=29;PP=1068;SC=AGAGTCTTTCATGCTAGGAAT;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=31369131;WS=31369113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	31369223	rs4779817	C	T	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=886;SC=TGGACCAATACATTCCCAAGC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=31369231;WS=31369213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	31369258	rs4779818	C	T	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=19;PP=565;SC=ATTCTTATACCTTTATAAAAC;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=31369266;WS=31369248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	31373727	rs4779504	T	C	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=6;PP=130;SC=TGCCCTCCCTTTGTTCCAGTC;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=31373735;WS=31373717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	31453147	rs75638145	G	A	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=53;PP=1778;SC=AGCGAGCCCCGCTTGAAGGAG;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=93;WE=31453155;WS=31453137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	31521505	rs34406656	CG	C	896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=10.492;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.10;MQRankSum=0.728;QD=22.99;ReadPosRankSum=2.015;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,36:0.92:39
chr15	31776004	rs2338682	C	G	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=83;SC=TGCGGCCAGGCACTGGTCCGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=31776012;WS=31775994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	31776210	rs199744400	TGGC	T	988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=4;PP=748;SC=CGCTTGGCCGTGGCGGCGGCG;SOR=2.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=17;WE=31776220;WS=31776200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	31779595	rs62004065	G	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=13;PP=729;SC=CCCTCCCCAGGATGCCCCAGC;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=31779603;WS=31779585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	31779838	rs16956777	C	G	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=25;PP=787;SC=AAGGAAATTCCCAAGCCAGGT;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=31779846;WS=31779828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	31793930	rs7164569	A	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=16;PP=603;SC=CCATGGACACAAGGGCAGAGA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=31793938;WS=31793920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	31823108	rs7176771	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=55;SC=ACAGATTTTCTACAGGTTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=31823116;WS=31823098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	31862437	rs12915326	C	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=24;PP=723;SC=ACAATACGAACGCATGAATAA;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=31862456;WS=31862427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	31862448	rs1459198	C	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=595;SC=GCATGAATAACGGTCTCATCA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=31862456;WS=31862427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	31862529	rs12898674	G	A	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=159;SC=AGTAGTTCTTGTTTTTCAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=31862537;WS=31862519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	31930149	rs7168828	C	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=532;SC=GCTGTGAACACTGCTGAAATG;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=31930157;WS=31930139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	31942001	rs71476547	G	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=5;PP=171;SC=AGCAGCGACCGGGCTCAGGAA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=31942009;WS=31941991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	31942073	rs12904841	T	C	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=5;PP=144;SC=TGCCACAGAGTTGGAGGTGAG;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=31942081;WS=31942063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	32393660	rs151204095	A	AAG	406.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=310;SC=TTAGGAAAAAAAACCAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=32393671;WS=32393650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	32393663	rs28650375	C	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=163;SC=GGAAAAAAAACCAAAAAAACA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=32393671;WS=32393650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	32450062	rs199927660	C	T	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.16;QD=23.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	32450704	rs201822909	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQRankSum=-7.719;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.171;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr15	32926076	rs11632524	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TTTCGTATTTCAAGTATTTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=32926084;WS=32926066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	32984196	rs6494593	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=25;SC=AGTCTGTAGCAATTCTAGCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=32984204;WS=32984186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	33091281	rs1258806	C	A	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=414;SC=AAGCTGGGGGCTCATAGTTAC;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=33091289;WS=33091271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	33191023	rs173224	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=21;PP=648;SC=TCCACGTAATACCATTTCTTA;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=33191031;WS=33191013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	33261232	rs2930131	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=105;SC=TTGGAGGTGCGGGAGACAAAG;SOR=1.445;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=33261240;WS=33261222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	33300291	rs11630735	A	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=379;SC=AAAATCAAAAAAGAGGCCAAT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=33300299;WS=33300281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	33446879	rs1399077	G	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=37;PP=1595;SC=TGTCTTTCGTGGGAGTCTGCT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=33446887;WS=33446869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	33446947	rs1399078	A	C	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=36;PP=1907;SC=ATGATGTCTGACTCCTCCCTG;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=33446955;WS=33446937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	33757840	rs2596163	G	A	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=186;SC=GAAATGATGCGATCTCAGGTT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=33757848;WS=33757830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	33765761	rs2245508	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=558;SC=TGTCCGCCCTACACCTTCTTC;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=26;WE=33765769;WS=33765751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	33795710	rs2572204	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=401;SC=ACCTTTTTGCATTCCTATTCA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=33795718;WS=33795700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	33795775	rs41279198	G	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1017;SC=ATGTTGTTGCGTGACTGATCT;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=33795783;WS=33795765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	33795950	rs3751634	G	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=522;SC=GTGAGTACCCGAATTGTGTCC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=33795958;WS=33795940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	33840414	rs1435100	A	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=21;PP=661;SC=AGGTAATGGAAGGCCTGGGAA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=33840422;WS=33840404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	33842222	rs1865496	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=53;SC=AGCAAGCCAGCAGCCTGGTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=33842230;WS=33842212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	33858935	rs11853872	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=27;PP=1067;SC=AGAGATGCCAGCGTGAGGAGT;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=33858943;WS=33858925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	33872143	rs8041153	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=11;PP=531;SC=GCTGCTGGCCAGTGCCTAAAC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=33872151;WS=33872133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	33872438	rs8023510	G	A	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=189;SC=CTGCATGCACGTGTTTATGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=33872446;WS=33872428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	33873657	rs668570	C	T	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=25;PP=1343;SC=GCATAAGGGACTGTGCTTTCT;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=33873665;WS=33873647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	33876449	rs10431811	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=555;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AAAAAAGAAAGAATTGTGTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=33876457;WS=33876439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr15	33876517	rs2643364	A	G	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=21;PP=1866;SC=AGCAAGTGAAATATTCGACAG;SOR=1.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=85;WE=33876525;WS=33876507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	33876543	rs624954	C	T	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=39;PP=2117;SC=CAAGTTCTCACGCCCATCATT;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=107;WE=33876551;WS=33876533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	33920662	rs35706688	T	C	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=39;PP=1805;SC=ACTTGCTCCTTTTCCTTTAGG;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=33920670;WS=33920652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	33923314	rs1495279	A	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=616;SC=GGCTAAATGAATGGCTCTTGT;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=33923322;WS=33923304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	33925364	rs2291732	G	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=33;PP=982;SC=GATCATCCACGTGCCGTTTTG;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=33925372;WS=33925354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	33990250	rs1111611	G	A	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=312;SC=GCAGGAGCACGAGGTGACTTG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=33990258;WS=33990240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	34015013	rs2293027	G	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=21;PP=1039;SC=GGGGAAACGGGCTCTTGGCAG;SOR=1.034;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=34015021;WS=34015003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	34016274	rs6495228	G	A	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=8;PP=815;SC=AGCAGCACGGGGGACGATGAA;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=34016282;WS=34016264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	34020914	rs28460434	T	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=55;SC=TTCAGATTTTTGGATTTGAGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=34020922;WS=34020904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	34028651	rs12909708	T	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=287;SC=CTTAAGTTGATGGTTAGCTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=34028659;WS=34028641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	34030887	rs12907197	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=23;PP=615;SC=TCCATTTGCCAGGACCTGTGC;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=34030895;WS=34030877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	34032267	rs12911737	G	A	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=890;SC=CCAGAGGGTAGCAAGAAATGT;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=34032275;WS=34032257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	34038511	rs3812937	A	G	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=138;SC=CCAGTGGGCAAGTGCCTCAGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=34038519;WS=34038501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	34040496	rs1565936	G	A	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=13;PP=481;SC=ACGCTGGGCCGATGGAAGCCA;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=34040504;WS=34040486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	34060740	rs2278317	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=514;SC=TAGTGCATCTCCCTAGAATGC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=34060748;WS=34060730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	34061523	rs2278316	C	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=AGTTAGCACTCTCTTTTTCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=34061531;WS=34061513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	34064043	rs1429754	T	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=425;SC=TCTGCCCAGATGACACTGCCA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=34064051;WS=34064033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	34103272	rs4780181	C	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=535;SC=GAACTCACACCGGCTTTCCTT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=29;WE=34103280;WS=34103262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	34115281	rs12914825	C	T	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=28;PP=1104;SC=CAGGTAAATGCGGGAAAACTA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=34115289;WS=34115271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	34118994	rs4041449	C	CAG	2819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=37;PP=2021;SC=ACACAGCACTCGGGCAAAACT;SOR=1.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=34119002;WS=34118984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	34129357	rs7182398	C	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=497;SC=CCTGGTCTGACGGACGAAGCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=34129365;WS=34129347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	34135826	rs2303868	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=636;SC=TACTAAGTATGCTATGTGTAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=34135834;WS=34135816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	34136971	rs7181900	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=344;SC=ACTATTTGTATAGCACATGCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=34136979;WS=34136961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	34137292	rs12899715	C	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=381;SC=TGGATCTAATCTCACTCCTTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=34137300;WS=34137282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	34140735	rs2278314	A	G	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=110;SC=TTTGATTTCTAGGACTTTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=34140743;WS=34140725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	34146783	rs2303308	G	A	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1185;SC=ACGTGCTGGGGGAACACTTAT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=34146791;WS=34146773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	34146886	rs713201	T	C	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=12;PP=987;SC=TCAGTGTGTCTCCCAAAATAA;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=34146894;WS=34146876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	34146922	rs713203	C	T	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=30;PP=2018;SC=AATGAGCACACTATGAGGCAA;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=94;WE=34146930;WS=34146912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	34151668	rs7180084	G	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=816;SC=TTCCCCTCTCGTGGCTTAGGG;SOR=2.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=34151676;WS=34151658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	34152777	rs2303310	T	A	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=17;PP=1125;SC=TTGCTTTGTCTTTGTATTTAA;SOR=1.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=58;WE=34152785;WS=34152767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	34156284	rs11072759	C	G	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=18;PP=574;SC=TTAATCCATGCGAATGAACTT;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=34156292;WS=34156274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	34156312	rs11072760	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=631;SC=GACCAGAGTATCTAATACTAT;SOR=1.214;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=34156320;WS=34156302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	34437863	rs4780222	A	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=186;SC=TTAAAAAAAAATCAAATAACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=34437871;WS=34437853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	34439759	rs75426827	T	C	33.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	34441102	rs6495551	C	T	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=86;SC=CAGTTGACCACAGTAAACAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=34441110;WS=34441092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	34517466	rs60202027	T	A	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=24;PP=849;SC=TAATGAGACCTGAGCCCTCAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=34517474;WS=34517456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	34517929	rs17236763	T	C	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1131;SC=TAGGTGGAGTTAACGTAGATA;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=34517937;WS=34517919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	34520863	rs17236784	A	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=408;SC=TGATGGTAGGAAATTGGAGTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=34520871;WS=34520853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	34528475	rs17817800	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=185;SC=TTTTGAAGCAGTAATGGGTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=34528483;WS=34528465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	34529776	rs17817806	A	G	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=47;PP=1661;SC=TACACATGTGAAAAATTAGAG;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=34529784;WS=34529766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	34532726	rs60604568	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	34537435	rs4371122	C	T	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=678;SC=AATAAACATGCATTATTTATC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=34537443;WS=34537425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	34537742	rs76107221	C	A	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=253;SC=ACAGCACTCACAGGTAAACTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=34537750;WS=34537732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	34542872	rs17236798	C	G	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=48;PP=1834;SC=TAGTACCAATCGGAATAGACT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=91;WE=34542880;WS=34542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	34543298	rs11382535	G	GA	522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=16;PP=408;SC=GCAGCAGTATGAAAAAAAAAA;SOR=2.531;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=17;WE=34543306;WS=34543288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	34544351	rs2290941	C	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=7;PP=412;SC=AAAAACTTGTCCAATAACTCC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=34544359;WS=34544341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	34544468	rs2290940	C	T	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=35;PP=1543;SC=AAAATTGACTCGAGTTACAGA;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=34544476;WS=34544458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	34547757	rs11421665	G	GA	64.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=65;SC=AGTAAAAGGTGAAAGTGTTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=34547765;WS=34547747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	34628570	rs347836	C	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=509;SC=GGATAAAGAACCCAGTAATGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=34628578;WS=34628560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	34634324	rs422388	C	G	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=41;PP=1788;SC=TCCAGGAACACAGAATGTATG;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=34634332;WS=34634314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	34635029	rs2615357	G	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=494;SC=ATTACAGGCGGGAGCCACTGC;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=34635037;WS=34635019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	34635200	rs2169479	C	T	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=50;PP=1746;SC=TGCCTATTTACACCCTGTTTT;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=34635208;WS=34635190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	34635369	rs2169480	A	G	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=156;SC=TCCTTCCTGCATAACCGGAAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=34635377;WS=34635359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	34635863	rs73376010	G	C	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=42;PP=1278;SC=AAGATTTAAAGTTAGGTCCCT;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=34635871;WS=34635853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	34638030	rs8031961	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=386;SC=CCTCACCCCACTTTTCCCTCT;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=34638038;WS=34638020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	34638198	rs12595504	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=19;PP=588;SC=AGACAGCCACAGTTAGTGCCC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=34638206;WS=34638188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	34638342	rs12592913	G	T	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=105;SC=CCCCGTCAAAGGTATCACACT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=34638350;WS=34638332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	34640218	rs374230	C	T	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=23;PP=1609;SC=AGTGCCGCCCCGTCTCCATCC;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=75;WE=34640226;WS=34640208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	34640378	rs430083	T	C	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=51;PP=1637;SC=TGACAGGGGATGGGGGCCCTT;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=34640386;WS=34640368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	34640959	rs371061	G	A	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=213;SC=AGTTTAGGCTGTTTAGGACTA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=34640967;WS=34640949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	34643103	rs347796	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=710;SC=CCGCAGAGAGACTTGTGTGGG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=34643111;WS=34643093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	35046816	rs2277558	T	A	373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=226;SC=AGCAATTTTTTAAAAAATCCT;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=35046824;WS=35046806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	35149008	rs8035240	C	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=31;PP=1383;SC=TGGTCTCTTCCGGGGCAGATG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=65;WE=35149016;WS=35148998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	35168056	rs2290321	C	T	181.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=1;PP=46;SC=ATCAGCACACCCAAACTGTAC;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=35168064;WS=35168046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	35185812	rs6495722	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.71;QD=25.52;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	35207397	rs2044920	C	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=2;NR=13;PP=278;SC=AGGAAAAAAACATCCATATTT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=35207405;WS=35207387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	35230924	rs12594085	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=11;PP=607;SC=TGCACTGAGTAAAAAAGAAGA;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=35230942;WS=35230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	35230934	rs10701045	A	ATAGT	1743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=12;PP=1163;SC=AAAAAAGAAGATACCAGAAAG;SOR=1.096;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=21;WE=35230942;WS=35230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	35252767	rs11636350	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=333;SC=AACCCTATGGGATTTGATACC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=35252775;WS=35252757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	35256624	rs9920529	C	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=632;SC=TATCTGAAGGCACTACACAGG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=35256632;WS=35256614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	35261649	rs7164169	A	G	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=31;PP=2525;SC=CCTCCTCCGGACTCCTAAATC;SOR=1.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=82;TCR=31;TR=113;WE=35261657;WS=35261639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	35261952	rs7164070	C	T	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=6;PP=152;SC=ATATCCTCAGCCTTCAGAGTC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=35261960;WS=35261942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	35664298	.	C	G	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=54;QD=29.5904041824;SC=AAATACTATGCAATTTTTTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=35664306;WS=35664288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	35664406	rs141638132	TA	T	807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=8;NR=12;PP=399;SC=TGAGGACACCTAAAAAAAAAA;SOR=1.112;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=20;WE=35664415;WS=35664396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	35674184	rs80019930	T	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=263;SC=TGCTCTCTTATCTGGTACTAA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=35674192;WS=35674174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	35703269	rs16960864	G	C	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=10;PP=220;SC=TATTCCCCTTGGGTAACTGGT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=35703277;WS=35703259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	35838145	.	AGGCACATGCGGGCC	A	1698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=6;PP=2935;SC=CCAGGGGCCGAGGCACATGCG;SOR=2.362;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=20;WE=35838166;WS=35838135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	36906129	rs7163791	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=27;PP=1041;SC=GCAGAGCCCCATTGCCGAGAG;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=36906137;WS=36906119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	36906211	rs7163988	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=1068;ReadPosRankSum=0.667;SC=ACTACTCTCAAAAAGAAGACA;SOR=0.504;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=47;WE=36906219;WS=36906201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr15	36937405	rs11073191	G	T	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.61;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	36937606	rs11073192	A	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=TGTTTTAAGTATTTTATTCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=36937614;WS=36937596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	36946153	rs10220771	G	A	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=19;PP=1474;SC=TTTCCCTTCAGTGCTTTCCTA;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=70;WE=36946161;WS=36946143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	36946441	rs10220785	C	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=369;SC=ACAATTATAACTACCTTTGGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=36946449;WS=36946431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	36949952	rs6495863	T	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=627;SC=AATTGACTTATTCTTCAGTGT;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=36949960;WS=36949942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	36984409	rs3743338	T	C	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=24;PP=1074;SC=AGGTGCGCAATTGACGAGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=36984417;WS=36984399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	36989469	rs2381887	G	A	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=37;PP=1292;SC=TGGTATTAGCGTTTTCCTGCT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=36989477;WS=36989459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	37110637	rs1194621	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=16;PP=474;SC=ACCACTGCCGTCGGCTCCGGC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=37110645;WS=37110627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	37173119	rs67033548	A	AT	1354.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=13;PP=821;SC=GTTTGCATTGATTTTTTGTGG;SOR=1.364;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=25;WE=37173127;WS=37173109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	37173147	rs12909623	T	G	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=17;PP=933;SC=AAATTTGCGGTGTTTCAGGAA;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=37173155;WS=37173137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	37173267	rs12903788	G	A	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.510;SC=ACCCAACTCAGGACTCTAAAG;SOR=0.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=50;WE=37173275;WS=37173257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr15	37187197	rs61146116	A	AT	147.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=145;SC=TCAAAGAGGAATTTTTTCCCC;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=5;WE=37187205;WS=37187187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	38230565	rs59125264	TG	T	899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=791;SC=CTTGAACCACTGGAGTGCTGA;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=38230573;WS=38230555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	38233223	rs1021796	T	C	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=TTAATTCCTCTATCAGGAGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=38233231;WS=38233213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	38233869	rs2937991	T	C	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=13;PP=790;SC=TTTGATTTCCTAGGTAATGAA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=38233877;WS=38233859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	38258772	rs2959336	A	C	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=993;SC=AGGCTACAGCAAGAAACCTCA;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=38258780;WS=38258762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	38590722	rs8040553	T	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=235;SC=TAAAAAAAATTAACTTCTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=38590730;WS=38590712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	38590771	rs8036280	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=462;SC=AGACAAAAAGAGTACAAATGG;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=38590779;WS=38590761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	38590854	rs8034630	G	A	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=15;PP=452;SC=AAGGATTTTTGAAGTGATGAA;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=38590862;WS=38590844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	38614525	rs7182445	G	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=23;PP=1036;SC=TTGATGACAAGAAGTTTGGTC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=38614533;WS=38614515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	38617113	rs1879938	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	38617113	.	CTC	TTG	422	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=2;NR=8;PP=422;QD=47.5467874862;SC=TTCTAAGACACTCTATTTGTC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=38617123;WS=38617103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr15	38617115	rs1879937	C	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	38631840	rs7163339	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=497;SC=TATATACTTATTGACTTGCTA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=38631848;WS=38631830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	38631930	rs7180446	C	A	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=24;PP=1180;SC=GAGGGTTGTTCCCAATAGGCA;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=57;WE=38631938;WS=38631920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	38632148	rs7181472	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=348;SC=GTAGAAATTGAATGATGTCAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=38632156;WS=38632138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	38641773	rs61670754	G	GTT	851.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.59;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	38641774	.	A	T	325	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=11;PP=325;QD=29.9809343789;SC=TAATTAATAGATAGGTAAAGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=38641785;WS=38641764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	38641774	rs34352434	A	AAAT	851.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	38641776	.	A	AAATTAGT	721	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=721;QD=74.6363636364;SC=ATTAATAGATAGGTAAAGTTT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=38641785;WS=38641764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	38641777	.	G	A	300	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=300;QD=30.4337465952;SC=TTAATAGATAGGTAAAGTTTT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=38641785;WS=38641764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	38641777	rs59928364	G	GTA	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	38643574	rs3751526	T	C	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=50;PP=2406;SC=AAGAAAATGTTAGGGGAAAAT;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=38643582;WS=38643564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	38805185	rs55888286	A	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=280;SC=ACAACAACAAAAAAAACCTAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=38805193;WS=38805175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	38988760	rs7171233	T	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=424;SC=TAGGCCGGGGTACCTCAGCCG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=38988768;WS=38988750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	38988815	rs7165988	C	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=12;PP=629;SC=TGATATGGAGCTACAAGGGGC;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=38988823;WS=38988805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	38990803	rs12595568	T	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=GTGTGGTGTGTAAGATGTTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=38990811;WS=38990793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	39876062	rs3830465	C	CAT	658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=6;PP=710;SC=CGTATACACACGTGCGCATAC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=39876070;WS=39876052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	39879517	rs2664141	C	T	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=53;PP=2092;SC=CTAATCATCACGTACCTGATG;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=120;WE=39879525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr15	39880277	rs35275624	G	A	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=26;PP=1245;SC=ACTGGTCCCCGTGGTCATCTT;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=69;WE=39880285;WS=39880267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	39882178	rs2228262	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=719;SC=GGCTGGCCCAATGAGAACCTG;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=39882186;WS=39882168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	39884667	rs45461294	G	A	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=574;SC=CCCACTGGCTGTATCAAACAA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=23;WE=39884675;WS=39884657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	39885301	rs2228263	T	C	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=39;PP=1560;SC=GTGAGACCGATTTCCGCCGAT;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=39885309;WS=39885291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	39885533	rs17632916	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=11;PP=731;SC=GAGGATGTCTAGGAACATGAT;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=39885541;WS=39885523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	39887493	rs146948724	A	AACTGAT	676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=802;SC=TTAACTTATTAACTAAGATGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=39887501;WS=39887483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	39887649	rs1051442	C	T	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=47;PP=1700;SC=CTTGAGAAAACCCCCAGGATC;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=82;WE=39887657;WS=39887639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	39888246	rs41315060	C	T	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=108;SC=TGATCCCCACCCTTACTCATC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=39888254;WS=39888236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	39894495	rs4415979	C	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=12;PP=478;SC=CAGGAATGCCCATAGCCAGGA;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=39894503;WS=39894485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	39910431	rs10152640	A	G	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=186;SC=TCAGAGAGACATGATGTGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=39910439;WS=39910421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	40005772	rs937961	C	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=20;PP=647;SC=TTCACCATCACGGTCAGGTTT;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=40005780;WS=40005762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	40005793	rs372148357	GA	G	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=15;PP=362;SC=CTAATTTAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=18;WE=40005801;WS=40005782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	40005920	rs937962	C	T	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=132;SC=ATATGTATAACGCTTTAAAGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=40005928;WS=40005910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	40019053	rs148196533	A	AAC	103	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=25.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40030440	rs1906163	G	A	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=31;PP=949;SC=ATATACTCAAGGAAATTCACA;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=40030448;WS=40030430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	40030457	rs34646792	GA	G	743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=425;SC=CACAGTTCAGGAAAAAAAAAA;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=22;WE=40030465;WS=40030447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	40031715	rs8033687	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=139;SC=AGTACTGGTTCATAAAAGTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=40031723;WS=40031705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	40056219	rs34937456	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr15	40062825	rs1565560	C	A	176.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.10;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	40062838	rs7179838	G	A	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQ=55.68;NF=0;NR=4;PP=59;SC=AAAAAAAACAGTTTCCGAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=40062846;WS=40062828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40062855	rs1565561	C	T	46.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=46;SC=AAAATACTGTCTTTTTTTAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=40062863;WS=40062845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	40062884	.	T	C	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=55;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=23;QD=28.8856062736;SC=TTCTAGAATATTTTGACACTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=40062892;WS=40062874;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	40094564	rs17717859	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40226495	rs566792	T	C	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=65;PP=2262;SC=TGGAGGCCATTTACGGCGCGG;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=113;WE=40226503;WS=40226485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	40254155	rs510949	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=568;SC=AGTTAATCACAAAGGAATGGG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=40254163;WS=40254145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	40259504	rs522933	G	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=161;SC=AGTTAATGTTGACTGGCCCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=40259512;WS=40259494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	40259519	.	C	CT	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=26;MQ=62.65;NF=3;NR=0;PP=45;QD=16.0;SC=GCCCAATATTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=40259527;WS=40259509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr15	40265799	rs2307105	A	G	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=38;PP=1819;SC=TCAGATTCTGAAGGACAAGAT;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=86;WE=40265807;WS=40265789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	40269126	rs112695691	T	TTTCC	830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.68;QD=41.54;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	40270214	rs7174071	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=6;PP=339;SC=GTATTTAAAAATGTCCATGTT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=40270222;WS=40270204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	40282625	rs4144472	T	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=921;SC=GACTCAGATGTCTTGATAATC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=40282633;WS=40282615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	40284523	rs7178419	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=658;SC=AGGTTTTATTCTACGGCAGAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=40284531;WS=40284513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	40284802	rs11070241	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=273;SC=TGTGGCCATACGTGACTTATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=40284810;WS=40284798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	40285120	rs11633992	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=24;PP=645;SC=AGCATTTGGGATTTAGTCCCG;SOR=2.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=40285128;WS=40285110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	40291140	rs2412457	C	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=47;SC=CTTAAAATGTCATTAGACTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=40291148;WS=40291130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	40300092	rs2279581	T	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=172;SC=CAGGTCAAATTTGTCTTTCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=40300100;WS=40300084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	40300214	rs2279580	G	C	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=30;PP=1701;SC=AGAAATCTGGGTTTCTCTCTC;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=83;WE=40300222;WS=40300204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	40313083	rs12916520	G	T	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=106;SC=ACTGTAACCGGTCTGTTTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=40313091;WS=40313073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	40322552	rs2250402	G	T	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=23;PP=1042;SC=AAACTCTCTTGGTCTCAGGTT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=40322560;WS=40322542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	40322817	.	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr15	40322818	.	C	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr15	40324837	rs2291621	C	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=555;SC=AGCCCTTTTACAGCACAATAG;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=40324845;WS=40324827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	40328575	rs7535	G	C	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=48;PP=1787;SC=GCTGTTGTTGGTGCTGTTGCT;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=83;WE=40328583;WS=40328565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	40328665	rs8208	G	A	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=29;PP=1140;SC=CTCTTCTTCAGCCCATCCATG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=40328683;WS=40328655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	40329033	rs2291619	A	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=7;PP=795;SC=CGGTATTAGCATTGAAATTCA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=40329041;WS=40329023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	40330564	rs7321	C	T	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=24;PP=974;SC=CCACAGTACCCTTCTTTGGAA;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=40330572;WS=40330554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	40330629	rs8041057	C	T	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=35;PP=1055;SC=TGAACACGGCCGCGTACGTGG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=40330637;WS=40330619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	40330693	rs937215	C	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=561;SC=GATGACCTAACCCAGCCCCGC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=40330701;WS=40330683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	40453307	rs2277559	A	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=7;PP=476;SC=GGAGTCGTGTACGTGCCTTGG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=40453315;WS=40453297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	40457129	rs3214012	A	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	40477831	rs1801376	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=31;PP=1006;SC=GAGACTGCACGACAGCCAGTT;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=40477839;WS=40477821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	40488851	rs1047130	G	A	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=32;PP=1602;SC=ATCAGCAAGCGTCTGAGGAGA;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=40488859;WS=40488841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	40491952	rs2172742	A	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=801;SC=TTTCATACACAAAACTAGAAT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=40491960;WS=40491942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	40494952	rs2412482	A	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.83;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	40494960	rs12898804	A	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	40500986	rs11630664	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=457;SC=GATATACATACCACTATATCC;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=40500994;WS=40500976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	40544493	rs55799438	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=342;SC=CGCTCAGCTGATTCTCCAGGT;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=40544501;WS=40544483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	40544520	rs55974545	G	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=375;SC=TCCGCGAGGCGGCCACTGGGC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=40544528;WS=40544510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	40544617	rs55863440	G	A	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=25;PP=1726;SC=CAAGCAGGTGGAGAGAAAGAG;SOR=1.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=81;WE=40544625;WS=40544607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	40545438	rs11636097	A	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=27;PP=921;SC=CGCCTAAGAGAGAGGCCCAGT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=40545446;WS=40545428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	40556685	rs7162809	A	G	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=58;PP=2161;SC=ATTTTATAAAAACACACCCCC;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=40556693;WS=40556675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	40556713	rs12902461	T	C	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=55;PP=1896;SC=GCCTGCTCCATAGGGGACTTG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=94;WE=40556721;WS=40556703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	40558744	rs748556	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=885;SC=AGTGGGTGTAGGGACACAGGC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=40558752;WS=40558734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	40565055	rs2253603	G	A	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=51;PP=2170;SC=TCAGGCCCCCGCCTGCCCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=120;WE=40565063;WS=40565045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	40573716	rs4924446	A	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=679;SC=ACCGAGACAGACAGAGCGTTG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=40573724;WS=40573706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	40582128	.	AAGAGAGAGAGAG	A	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=2;PP=1663;SC=CCTACTTGTGAAGAGAGAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=40582177;WS=40582118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	40582159	rs71403571	A	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.95;QD=39.99;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	40582161	.	A	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.09;QD=39.99;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	40582163	rs62021885	A	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.16;QD=40.09;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	40582165	rs62021886	A	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.28;QD=40.14;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	40582167	rs62021887	A	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.10;QD=40.19;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	40582169	rs8036867	A	T	1716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.26;QD=41.87;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	40583093	rs2412506	A	G	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.28;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	40583458	rs936209	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=13;PP=492;SC=CACCGCCACGAGCCTTACCTC;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=40583466;WS=40583448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	40583560	rs62021888	G	T	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=15;PP=525;SC=GCCGCGCCCCGCTGCAGCAGC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=40583568;WS=40583550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	40583876	rs9972418	T	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=31;PP=1286;SC=GGCTGGGCTGTCAGGTGCTCT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=40583884;WS=40583866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	40590265	rs2305648	C	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=21;PP=793;SC=CATATAACTGCATGGCCGCCA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=40590273;WS=40590255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	40593939	rs2305647	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=273;SC=GTAGGGGATACAGACAAACCT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=40593947;WS=40593929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	40595414	rs1869902	G	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=9;PP=581;SC=CTTCCCACCCGCACAGGGACC;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=40595422;WS=40595404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	40595565	rs2305645	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=31;PP=1045;SC=CTCCTGGGGGCAGGGTGCGGA;SOR=1.196;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=51;WE=40595573;WS=40595555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	40645311	rs369426346	GGTGT	G,GGT	484.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,8,10:0.42,0.53:19
chr15	40646520	rs71132169	CT	C	1425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=627;SC=AAAGCTGCTTCTTTTTTTTCC;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=28;WE=40646528;WS=40646510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	40648372	rs12900982	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=690;SC=CCCACCATGGTCCAGGGCCCT;SOR=4.548;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=29;WE=40648380;WS=40648362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	40655845	rs1898883	C	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=22;PP=1085;SC=CAAGGCTGTGCCCCCTGAGGC;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=40655853;WS=40655835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	40655873	rs1898882	G	C	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1175;SC=GAGAGAAGCTGCTCCCTCCAC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=40655881;WS=40655863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	40660515	rs35565646	G	A	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.32;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	40662748	rs3803359	G	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=487;SC=ACCTGCTTGCGACCTGCTGAG;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=40662756;WS=40662738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	40683780	rs2289332	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=21;PP=943;SC=GTGAAAGGGCGCAAGGGCTGA;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=40683788;WS=40683770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	40699940	rs2289331	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=352;SC=AGTTGGGAGGTCCGGGCAGTC;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=40699948;WS=40699930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	40700006	rs3214685	G	GTT	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=210;SC=AGCTCACACAGTTCTGGTAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=40700014;WS=40699996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	40700022	rs10518693	C	T	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=126;SC=GTAAATGAAGCCTCTCTAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=40700030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	40703339	rs8034416	C	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=325;SC=ACTTTACCGACACCCTGGTCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=40703347;WS=40703329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	40703609	rs4924466	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=12;PP=533;SC=CATTATCAGGATAATGGAGCA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=40703617;WS=40703599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	40705105	rs2289330	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=5;PP=324;SC=TAGGAAGGTGAGTGCCTTCTT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=40705113;WS=40705095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	40705159	rs2289329	T	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=625;SC=GGCTAATCTGTAACCAGGACC;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=40705167;WS=40705149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	40708422	rs11070270	A	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=29;PP=1205;SC=GGGGCAGTGGACCAGCTGCTG;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=59;WE=40708430;WS=40708412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	40711270	rs2075625	C	G	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=13;PP=1521;SC=AGGAGGCGGACGTTGCAGTGA;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=40711278;WS=40711260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	40712737	rs11790	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=504;SC=GTCCTATTCCTGTCCTCCAGC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=40712745;WS=40712727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	40716253	rs2304645	G	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=304;SC=CCACCACCCAGCCACTCTCAG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=40716261;WS=40716243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	40751555	rs3803357	C	A	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=61;PP=2589;SC=GCCATCTCATCAGCCCCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=124;WE=40751563;WS=40751545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	40756817	rs79551107	G	A	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=14;PP=410;SC=CTAAGACGTGGTAGGGGGAGG;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=40756825;WS=40756807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	40764549	rs582736	G	A	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=66;PP=2324;SC=AGTGACCATGGGTGTGGGGCC;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=109;WE=40764557;WS=40764539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	40898643	rs7177192	G	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=21;PP=663;SC=GGGAATGAAAGAGTTCAGGTA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=40898651;WS=40898633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	40907698	rs11427985	T	TG	435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=333;SC=CCAGGCACGGTGCTCACGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=40907706;WS=40907688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	40913840	rs2412541	G	T	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=42;PP=1559;SC=CAGTAATTATGCTAAAATGTA;SOR=1.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=40913848;WS=40913830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	40914177	rs11858113	T	C	3669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=56;PP=2332;SC=GGTGAAAATATGGATTTGACT;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=123;WE=40914185;WS=40914167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	40914772	rs11855334	C	T	6470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=106;PP=2965;SC=GCCACACTGTCGTCATTGGAT;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=76;TCR=106;TR=182;WE=40914780;WS=40914762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr15	40915045	rs8041534	T	G	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=48;PP=1955;SC=TTGATAAGACTATTGTATTTT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=40915053;WS=40915035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	40915190	rs8040502	A	G	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=61;PP=2797;SC=ATATACATGTAGGCAGGATGA;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=128;WE=40915198;WS=40915180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	40915894	rs11070285	T	C	8143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=128;PP=2965;SC=TCCTGCCAAATGAAATAGCTA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=138;TCR=128;TR=266;WE=40915902;WS=40915884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr15	40937115	rs141130902	CT	C	522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=575;SC=TCTCTTACGTCTTTCCTTTCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=40937123;WS=40937105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	40937727	rs6492959	C	T	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=969;SC=TAGACAATTACATGGAATTAA;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=40937735;WS=40937717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	40939448	rs8041095	G	A	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=169;SC=CAAGCCGGGCGGATCACCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=40939456;WS=40939438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	40947023	rs10444817	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=9;PP=524;SC=GCCAAGACTGCGCCATTGCAC;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=40947031;WS=40947013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	40949526	rs2412544	C	T	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=26;PP=953;SC=CATAATTTCACTGGATTTTTT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=40949534;WS=40949516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	40998305	rs45592734	T	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=273;SC=TTATATATATTTTTTTGCCAT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=40998313;WS=40998295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	41030579	rs34355108	C	CA	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=12;NR=7;PP=404;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAG;SOR=2.066;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=19;WE=41030587;WS=41030569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	41030865	rs2304582	C	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=669;SC=TGCATTGTCCCCTATCCCTGT;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=41030873;WS=41030855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	41036448	rs4923884	G	A	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=957;SC=TTCCAAGCTAGTATGTTACAG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=41036456;WS=41036438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	41047024	rs7169010	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=312;SC=GCAGGCAGGCGGGCGGGCGGG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=41047032;WS=41047014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	41063244	rs1866170	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=26;PP=832;SC=TGGGCAAAGCCGGGGTGACTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=41063252;WS=41063234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	41065890	rs2289219	C	T	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1284;SC=GCTCCGAGACCTGAGCGCCCA;SOR=1.410;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=41065898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	41104789	.	A	AAGAAAG	318.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=256;SC=GAAAGAAAGAAAAAATTATTA;SOR=3.056;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=17;WE=41104797;WS=41104779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	41105926	rs690347	T	G	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=15;PP=1164;SC=TGAAGAAGCTTCCCTGGATGA;SOR=1.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=41105934;WS=41105916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	41106485	rs7915	A	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=619;SC=TTCTGGGCCCAGCCACAGGAC;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=41106493;WS=41106475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	41146581	rs3736287	T	C	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=18;PP=978;SC=CTGACCTCCCTTCCACCCGTC;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=41146589;WS=41146571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	41148199	rs659232	C	T	9690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=161;PP=2965;SC=GTGGTTGTTACGGCAACAAGA;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=133;TCR=161;TR=294;WE=41148207;WS=41148189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr15	41149161	rs690458	G	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=32;PP=976;SC=ACCACACCACGCGGCCCCTCT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=41149169;WS=41149151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	41165739	rs1814692	A	C	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=69;PP=2508;SC=TAGCCCCCCGACACATGGAAT;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=121;WE=41165747;WS=41165729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	41192839	rs34865655	G	A	8672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=141;PP=2965;SC=CACATCCCCCGCCAGCTTGTA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=127;TCR=141;TR=268;WE=41192847;WS=41192829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr15	41193274	rs9806730	T	C	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=62;PP=1625;SC=GCTTTAGATGTGGAAGGGCTT;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=41193282;WS=41193264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	41193316	rs9806683	C	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=36;PP=1068;SC=GCTGGCTTCCCTTGCAGAGAG;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=41193324;WS=41193306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	41224124	rs3212278	G	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=390;SC=CAGACCTCCTGTCTCTTCCCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=41224132;WS=41224114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	41246237	rs3033592	A	ATC	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=3;PP=269;SC=GACCACTGACATGTCAGTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=6;WE=41246245;WS=41246227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	41315591	rs72527311	A	AAT	2695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1969;SC=TTTAAAAAGTAAGTCTAGACT;SOR=2.119;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=41;WE=41315599;WS=41315581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	41339481	rs11070320	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=355;SC=TTATTCTTAACAAAAGAAAAT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=41339489;WS=41339471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	41346092	rs2899010	T	C	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=685;SC=TTGGTGCCTATTGAGGCTTAA;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=41346100;WS=41346082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	41350768	rs67053863	CGT	C	812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.436;QD=29.03;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr15	41476101	rs521088	T	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=980;SC=AAGCCATCTGTATGGCCTTAA;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=41476109;WS=41476091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	41476209	rs522063	T	C	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=43;PP=2476;SC=GAAACCACAGTCTTTCTGATA;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=41476217;WS=41476199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	41483631	rs11371504	T	TA	2687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=9;PP=2341;SC=GGACATCCTTTACACCCACCT;SOR=3.334;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=50;WE=41483644;WS=41483621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	41483636	rs2412609	C	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=10;PP=1540;SC=TCCTTTACACCCACCTGAATT;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=58;WE=41483644;WS=41483621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	41605653	rs8032846	G	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=173;SC=AAAAAGCCTGGCTTCTTAATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=41605661;WS=41605643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	41634774	rs78809244	G	A	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=104;SC=TGTGGCTCACGCCTATACTCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=41634782;WS=41634764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	41672441	rs11376196	A	AT	421.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.546;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr15	41766966	rs167581	G	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=661;SC=GGGGGCTGCTGTTCTCTCTGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=41766974;WS=41766956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	41799079	rs316622	C	T	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=24;PP=990;SC=TGAGCCACCACGCCCAGCTGA;SOR=0.986;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=56;WE=41799087;WS=41799069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	41803914	rs2254078	A	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=339;SC=AGCCCAGCGCAGGGATAGGGG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=41803922;WS=41803904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	41805115	rs2253936	G	A	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=68;PP=2965;SC=TCGAGCCCCTGGCTGGGCCAG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=146;WE=41805123;WS=41805105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	41814172	rs2289740	G	C	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=42;PP=1479;SC=CTGAAGGGCAGAGGTCCAGGG;SOR=0.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=41814193;WS=41814162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	41815516	rs8027526	G	C	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=68;PP=2676;SC=GACAGGCGCTGCATGTCCTGG;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=121;WE=41815524;WS=41815506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	41815649	rs2297377	A	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=34;PP=1184;SC=ACAGCCCAAAAGAGCACATTT;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=41815657;WS=41815639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	41816190	rs2297378	T	G	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=90;PP=2965;SC=TGCCAAAGGGTGCCACAGTGA;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=74;TCR=90;TR=164;WE=41816198;WS=41816180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr15	41817367	rs2274858	A	G	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=97;PP=2965;SC=GCACAGTCTGAGGATCAGGGT;SOR=1.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=55;TCR=97;TR=152;WE=41817375;WS=41817357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr15	41819283	rs2297379	G	A	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=56;PP=2510;SC=GAGACAGGAGGTAAAAGGGAG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=124;WE=41819291;WS=41819273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	41819716	rs1200345	C	T	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=55;PP=1894;SC=TCTTCATCCTCGTCCTCATCC;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=41819724;WS=41819706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	41821752	rs1200349	T	C	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=26;PP=1320;SC=GAAGACTGAATCGAGCCTGCA;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=41821760;WS=41821742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	41822323	rs11632399	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=510;SC=ATGGCATGGCCCAGGGACTGG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=41822331;WS=41822313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	41827243	rs7181115	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=456;SC=ATAGACCCAAACTTTCCTCAG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=41827251;WS=41827233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	41828571	rs2297383	A	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=10;PP=649;SC=CCAGCCCCCAACCTGACCTCA;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=41828579;WS=41828561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	41851709	rs113721358	A	G	154.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=53;SC=CGAGGCTCGGAGCCGGGACAG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=41851717;WS=41851699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	41856543	rs11070339	A	G	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=906;SC=AGTTAGAATCATTCTGTGTTC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=41856551;WS=41856533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	41857303	rs2277536	T	C	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=43;PP=2965;SC=TGCCAGGTGCTGATGGCCGAG;SOR=1.827;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=121;TCR=43;TR=164;WE=41857311;WS=41857293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr15	41860698	rs2289743	C	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=413;SC=TCCTCCTCACCCTCCTCTGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=41860706;WS=41860688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	41991315	rs2178004	A	T	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=72;PP=2305;SC=AGATTTGAAGACTTTGCGGCA;SOR=1.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=123;WE=41991323;WS=41991305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	42003316	rs61736063	G	A	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=96;PP=2965;SC=AAAATCAGGCGAATAACTTTG;SOR=1.073;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=64;TCR=96;TR=160;WE=42003324;WS=42003306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr15	42026764	rs1918314	C	T	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=71;PP=2490;SC=TCACCTGTGACTTGGAGGATG;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=123;WE=42026772;WS=42026754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr15	42032383	rs17677991	C	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=34;PP=1051;SC=GGCGTTTGTCCCAGCAAAACG;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=42032391;WS=42032373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	42041712	rs2695163	G	A	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=54;PP=2775;SC=TTCAGATGAAGAGAGAATCTC;SOR=0.978;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=127;WE=42041720;WS=42041702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	42046568	rs2695164	A	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=591;SC=AGGGGAACAAACATTTGAAAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=42046576;WS=42046558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	42059521	rs2605570	A	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=863;SC=GAGGGGAAATAGATCTCACCT;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=42059529;WS=42059511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	42092326	rs62002090	C	T	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=108;SC=GTTATCTACCCCACCTCCCAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=42092334;WS=42092316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	42105918	rs1201689	C	G	7652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=141;PP=2965;SC=CCTGCACTTCCTTAGCACCTT;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=89;TCR=141;TR=230;WE=42105926;WS=42105908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr15	42109223	rs1197689	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=51;PP=1691;SC=TCACTGCTGTTAAGTTTGCAG;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=78;WE=42109231;WS=42109213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	42109975	rs2303518	T	G	6898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=112;PP=2965;SC=TTCCTTCATCTCCCTACGGGG;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=88;TCR=112;TR=200;WE=42109983;WS=42109965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr15	42111753	rs3034891	G	GC	6167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=81;PP=2988;SC=GGCGGGGGGGGGGCAGGAGAC;SOR=0.794;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=33;TCR=87;TR=110;WE=42111761;WS=42111743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,163:0.99:165
chr15	42114414	rs2303517	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=17;PP=907;SC=CTCCCCTCCCCACACCCAGAC;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=42114422;WS=42114404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	42115426	rs1197688	A	G	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=50;PP=1726;SC=ACAGGGTGAGAAGCCTGATGG;SOR=1.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=42115434;WS=42115416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	42115747	rs3959569	G	C	7460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=116;PP=2965;SC=GCTGATGGCCGTCCGTCTCGG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=113;TCR=116;TR=229;WE=42115755;WS=42115737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr15	42116903	rs28401754	T	C	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=60;PP=1808;SC=TTGGGCAGCATAGGTGAGGGG;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=42116911;WS=42116893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	42127443	rs2241523	G	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=770;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TGGGGTGGTCGTGGCCCTGGA;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=35;WE=42127451;WS=42127433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr15	42127734	rs2241522	A	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=19;PP=1401;SC=ACTGGATGGCAGCTTTCCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=42127742;WS=42127724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	42128568	rs2303516	C	G	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=52;PP=2965;SC=TGCACCAGGGCCCCTGATCCC;SOR=1.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=136;WE=42128576;WS=42128558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	42128855	rs7166139	T	C	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=52;PP=1671;SC=CTGAAAAGTCTCTAAGTCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=42128863;WS=42128845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	42129158	rs890505	G	A	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=37;PP=1951;SC=TGCCCAGGCCGCCTGGGGAGA;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=42129166;WS=42129148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	42129176	rs890504	T	C	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=37;PP=2236;SC=AGAGGCCCTGTCAAGGTCCAG;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=42129184;WS=42129166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	42129373	rs11547012	C	G	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=48;PP=1459;SC=TGGTGAACACCACCAAGCACG;SOR=1.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=42129381;WS=42129363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	42132200	rs2077543	C	G	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=1011;SC=ATGGAGATATCATGTCTCCTC;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=42132208;WS=42132190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	42133502	rs11635415	T	C	173.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=130;SC=GGAGGCGGTCTGGGGTCCCCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=42133510;WS=42133492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	42133885	rs1648837	TG	CA	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=2142;SC=CTCGGGGGACTGTGGTGGGGG;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=49;WE=42133894;WS=42133875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	42134301	rs1648835	A	C	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=34;PP=1600;SC=CCCTCCCATAACTCTATGGCT;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=79;WE=42134309;WS=42134291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	42134371	rs1648834	G	C	5793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=72;PP=2965;SC=TCTTAGGTCTGCATTCTTTGT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=156;WE=42134379;WS=42134361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr15	42134523	rs1648833	C	T	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=857;SC=GGGGCTGGGACCCAGGCCACA;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=42134531;WS=42134513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	42134652	rs1672464	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=825;SC=CTGTGGAGACGGTGGCGGGGC;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=42134660;WS=42134642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	42134839	rs1672465	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=49;PP=1260;SC=ACAACCAGGGTGCGGGGCTGG;SOR=1.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=67;WE=42134847;WS=42134829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	42134930	rs1648832	G	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=343;SC=TTGCGCTCGAGGGGGCACGAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=42134938;WS=42134920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	42135988	rs1672466	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=43;PP=1516;SC=TGCAGCTGGACGGAGACCTGC;SOR=1.013;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=76;WE=42135996;WS=42135978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	42136977	rs2305654	C	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=497;SC=CTAGAAAGCCCGGGGCACGTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=42136985;WS=42136967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	42137282	rs1648829	G	A	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=68;PP=2965;SC=CGGGGGCTGCGGCCTGGGGGC;SOR=0.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=42137290;WS=42137272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	42137576	rs1648828	C	T	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.37;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	42137581	rs1648827	A	C	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.95;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	42137773	rs4924580	G	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=1076;SC=ACCCTGGGTCGGGGTGGGGGT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=42137781;WS=42137763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	42138321	rs1197670	A	G	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=27;PP=2430;SC=GGGGGTTCACACCTCTTCCCC;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=110;WE=42138329;WS=42138311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	42139038	rs890508	G	A	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=39;PP=1161;SC=TTCCAGGTTGGGAAGGGTGGG;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=42139046;WS=42139028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	42139390	rs3214531	GT	G	411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=315;SC=GGTGTGGAGAGTTTTTTTCCA;SOR=2.584;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=12;WE=42139398;WS=42139380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	42143145	rs58422701	C	CCA	9030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=82;PP=2973;SC=AGCCTGGCACCCACAGTCACA;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=128;WE=42143153;WS=42143135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr15	42143533	rs1197665	T	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=59;PP=1916;SC=GCCCTGCAAGTTCCCGCGGCA;SOR=1.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=94;WE=42143541;WS=42143523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	42144332	rs1197662	T	C	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=326;SC=ACTGCATGCTTCAGGGAGACC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=42144340;WS=42144322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	42146189	rs62002122	C	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=291;SC=GATAGGTCCCCTCAGCCACCG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=42146197;WS=42146181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42147206	rs1648826	T	C	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=41;PP=1138;SC=CAGGGTCACTTGAGATGGTAT;SOR=1.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=42147214;WS=42147196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	42147663	rs1672467	G	C	5161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=71;PP=2965;SC=CTGCAGCCCTGCCTTTCCAGG;SOR=0.909;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=160;WE=42147671;WS=42147653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr15	42149472	rs1456235	T	C	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1160;SC=TTCCACATCTTGGGCAAGGCA;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=42149480;WS=42149462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	42149506	rs12442525	G	C	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=24;PP=1399;SC=ACAAAGGCCTGGGCCTGGCCC;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=42149514;WS=42149496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	42149596	rs1197675	C	G	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=48;PP=2093;SC=TCGCCCACCCCAGGCAGGGCC;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=42149604;WS=42149586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	42153519	rs2278965	G	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=406;SC=CGAAGGGGAGGATCCCTGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=42153527;WS=42153512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	42155812	rs2278966	G	C	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=7;PP=1288;SC=GGCCAGTGAGGGGGGAGACGC;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=42155820;WS=42155802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	42156321	rs1197657	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=477;SC=CCCCGGAGCATGAGGAACTGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=42156329;WS=42156311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	42159623	rs8032462	T	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=7;PP=859;SC=ACCCCAGCCTTGCAGGCTCAT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=42159631;WS=42159613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	42166500	rs12593397	C	T	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=41;PP=1766;SC=CTTGTGCTTGCGGTGAAGGCT;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=42166508;WS=42166490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	42170499	rs1201690	T	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.68;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	42170506	rs747780	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.11;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	42171537	rs1197683	A	G	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=33;PP=1344;SC=AGGGCGTGGCAGGTGTCCTCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=76;WE=42171545;WS=42171527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	42171877	rs1197685	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=305;SC=AGTCAGGCCCAGGCTGGGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=42171885;WS=42171867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	42175104	rs1197691	G	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=234;SC=GAGAAAACTGGCAGGCCAACA;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=42175112;WS=42175103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	42175507	rs1197692	T	C	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=57;PP=2708;SC=GTCCCCCACCTTGCTGTGTTT;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=121;WE=42175515;WS=42175497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	42178155	rs1210795	T	C	5126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=84;PP=2741;SC=GGCTGCCTTGTGCTGGAAGCG;SOR=0.837;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=70;TCR=84;TR=154;WE=42178163;WS=42178145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr15	42185439	rs1672459	C	G	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=43;PP=1792;SC=AGCTGGGGGCCTGGTATGGGT;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=94;WE=42185447;WS=42185429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	42187661	rs1704380	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=582;SC=TCCTTTCCCATTCTCCATCAT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=42187669;WS=42187651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42264431	rs1704413	A	G	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=37;NR=18;PP=1112;SC=GCGGGGCGGGAGCCGGGCGAG;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=42264439;WS=42264421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	42287578	rs1668586	G	A	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=33;PP=1587;SC=CTGATAGACCGGTGATGTAGC;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=42287586;WS=42287568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	42289522	rs1704357	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=625;SC=GACACAGCTTCAGGGTCCATT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=42289530;WS=42289512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	42292532	rs1668557	T	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=436;SC=ACTACCCACCTGCAACTTGGT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=42292540;WS=42292522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	42297092	rs2598464	G	A	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=67;PP=2576;SC=GAAGCTACTTGATGGCCAGGA;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=42297100;WS=42297082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr15	42298133	rs1704366	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=681;SC=GGAATCAGCAACAGCTATGAG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=42298141;WS=42298123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	42302590	rs1668568	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=498;SC=AGATAAAGAAATATTCCTGGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=42302598;WS=42302580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	42305769	rs75965569	GC	AT	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42305773	rs62004282	A	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	42305852	rs10625152	A	AGAG	3464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=24;PP=2633;SC=TCCGGTAAGCAGAGAAGGAGA;SOR=1.379;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=47;WE=42305860;WS=42305842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	42305998	rs1668565	T	C	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1111;SC=CAAGCATTACTCCAAGGCCAT;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=42306006;WS=42305988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	42306015	rs1668564	G	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=27;PP=803;SC=CCATTGCCCCGGGGGAGACTT;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=42306023;WS=42306005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	42311454	rs2724935	T	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=212;SC=CTCAGCCTCCTCATTGGAGCT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=42311462;WS=42311444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42362821	rs2459692	C	G	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=12;PP=1335;SC=TTCGGGACCCCGGCGGTGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=65;WE=42362829;WS=42362811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	42364652	rs1668587	G	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=159;SC=CAGTGGCTCCGCCAGGACAGG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=42364660;WS=42364642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	42373432	rs600415	C	T	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=756;SC=GGGAAGGGACCGCATAGTTGG;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=42373440;WS=42373422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	42433382	rs694456	A	T	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=36;PP=2000;SC=TGATGCCCCTACTAGACACAC;SOR=1.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=42433390;WS=42433372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	42434254	rs655427	G	A	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1465;SC=AGGTCTCCACGTTGTTCAGGA;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=42434262;WS=42434244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	42434505	rs654527	C	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=365;SC=GGCTGGCTCCCTGCGGGCCCT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=42434513;WS=42434495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	42436599	rs636535	T	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=109;SC=GAGCCAGAGGTGCAGGCAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=42436607;WS=42436589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	42437711	rs621560	T	C	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=709;SC=ATTCTTCTTGTCTCTGCCAGG;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=42437719;WS=42437701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	42453851	rs148082104	GA	G	2993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=31;PP=2027;SC=ACAAAGCCCAGATGCCACACA;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=42453859;WS=42453841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	42462167	.	T	TAA	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5720;HP=14;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=19;MQ=61.65;NF=1;NR=1;PP=29;QD=16.5;SC=CAGACTGATTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=42462175;WS=42462157;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
chr15	42519136	rs1678988	T	C	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=709;SC=GTACAACATTTATACACATTA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=42519144;WS=42519126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	42520760	rs1678987	C	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=980;SC=TTAAAAACCACAGATCCTTCT;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=42520768;WS=42520750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	42520829	rs1712417	T	C	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=44;PP=2772;SC=ACTTTCTATGTCCACCCATGG;SOR=1.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=132;WE=42520837;WS=42520819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	42523341	rs56119841	T	TC	5200.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=40;PP=2965;SC=GAAACCCATCTCAAGGGGAGA;SOR=1.340;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=84;WE=42523349;WS=42523331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	42524065	rs1630294	T	C	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=43;PP=1820;SC=CAGGCGTCAATTGCTGAGAGG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=42524073;WS=42524055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	42524165	rs1712420	C	T	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=60;PP=1853;SC=GTTAAAGTTGCTAGAAGTCTA;SOR=1.337;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=93;WE=42524173;WS=42524155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	42528676	rs1679012	C	T	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=57;PP=1728;SC=AGGCCAGATGCCAATACTAGA;SOR=1.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=42528684;WS=42528666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	42531768	rs11070363	C	T	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=769;SC=CTGAATTGCACAGGAACAATT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=42531776;WS=42531758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	42553218	rs5812215	AT	A	2295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.92;MQRankSum=0.286;QD=33.76;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr15	42560312	rs2412681	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=550;SC=ATATCCTATTCATTTCGTACC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=42560320;WS=42560302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42564369	rs4244587	CA	TG	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=28;PP=1969;SC=CTTCAATTACCAAAGCATCAT;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=49;WE=42564378;WS=42564359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	42564902	rs7181758	A	C	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=163;SC=CTATTTCTTCAATTTTAACCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=42564910;WS=42564893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	42568547	rs8043515	C	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=12;PP=451;SC=TTTATTTAGTCTTGAAGATGA;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=25;WE=42568555;WS=42568537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	42568630	rs8023678	G	A	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=272;SC=AAATATAGTAGCTAGATCAAA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=42568638;WS=42568620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	42570201	rs12916523	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=244;SC=GCTTTCTAACATATTCCCTCT;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=42570209;WS=42570191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	42570433	rs8024390	C	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=183;SC=TCAAGAAAGACAAGATGTCAT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=42570441;WS=42570423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	42570718	rs8024732	A	G	6551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=93;PP=2965;SC=TCCACCTATCAGGCATTATTG;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=135;TCR=94;TR=227;WE=42570726;WS=42570708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr15	42573067	rs8037020	C	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=139;SC=TACTGTAGATCAGTTTCTCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=42573075;WS=42573057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	42575963	rs2412689	A	G	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=69;PP=2965;SC=CTCAGCAGATAAGGCACAACT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=42575971;WS=42575953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	42579822	rs11070371	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=2;PP=1042;SC=CTAATTATTGTAATTGGTGCA;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=42579830;WS=42579812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	42579948	rs8037627	T	C	7341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=110;PP=2965;SC=TTAAAATTAATGAAGAGACTC;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=128;TCR=110;TR=238;WE=42579956;WS=42579938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr15	42580106	rs8036596	A	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=58;PP=1752;SC=TGCACTTCTTATTTTGGCTGC;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=70;WE=42580114;WS=42580096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	42584909	rs4923939	C	T	4970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=55;PP=2965;SC=CAGCTTGTTTCTCTCTTCCTG;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=138;WE=42584917;WS=42584899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	42589987	rs4924651	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.55;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	42589996	rs4924652	C	T	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.64;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42590034	rs72029141	TATTCATTC	T	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=2135;SC=TTCATTCATTTATTCATTCAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=42590049;WS=42590024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42603083	rs2412694	C	T	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=85;PP=2585;SC=TGTTCTGTTACATATCCAATG;SOR=1.394;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=44;TCR=86;TR=129;WE=42603091;WS=42603073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	42606094	rs7173358	A	G	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=138;SC=AGGCTGCAGTAAGCACTGTTC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=42606102;WS=42606084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	42606153	rs141877658	A	AAACAACAACAAC	1549.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=1680;SC=CTATCTCTAAAAACAACAGCA;SOR=3.258;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=13;WE=42606169;WS=42606143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	42606161	rs11637731	G	A	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.70;QD=40.33;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	42618531	rs2578652	T	A	5155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=78;PP=2880;SC=TCAAGATTGATCCTGACTACT;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=162;WE=42618539;WS=42618521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr15	42619508	rs1659215	C	T	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=29;PP=1940;SC=ACAATGCATCCTACTGTGAGG;SOR=1.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=42619516;WS=42619498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	42694089	rs28364486	C	T	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=776;SC=GAGGGGCCCTCTGGCTTCCTC;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=42694097;WS=42694079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42704105	rs3098423	C	T	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=53;PP=1885;SC=ATCAGTCATGCTCCTCCTCCA;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=42704113;WS=42704095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	42758159	rs2244773	T	A	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=435;SC=ACATTTGCTTTTGACGGATTA;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=42758167;WS=42758149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	42764519	rs7177521	G	C	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=67;PP=2382;SC=CAACGTCACAGCTGCAATGAG;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=121;WE=42764527;WS=42764509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	42805000	rs4573906	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=453;SC=CTCCTGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=42805008;WS=42804990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	42820451	rs9302112	C	T	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=16;PP=1117;SC=ACTCCTGACTCTTATATAGAA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=42820459;WS=42820441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	42851464	rs11070374	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=9;PP=666;SC=GCTGGGATTACAGGAGTGAGC;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=42851472;WS=42851454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	42930891	rs1197550	A	T	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1414;SC=TTTCTACTTAACTCTAGTTTT;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=42930899;WS=42930881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	43044852	rs56307230	T	C	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=71;PP=2965;SC=CTATCTGACCTTCAACATGTG;SOR=0.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=160;WE=43044860;WS=43044842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr15	43170690	rs10650948	T	TAC	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.833;NF=14;NR=4;PP=708;ReadPosRankSum=-1.070;SC=CCGATATGTATACACACACAC;SOR=1.347;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=18;WE=43170698;WS=43170680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,33:0.82:40
chr15	43170721	.	A	ACT	204	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=60.14;NF=15;NR=4;PP=204;QD=10.8947368421;SC=ACACACACACACACACTCTCT;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=19;WE=43170729;WS=43170711;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr15	43237805	rs11352938	AT	A	159.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.78;NF=0;NR=6;PP=195;SC=AAAAAGGGATATTTTCCCTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=43237830;WS=43237795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	43237813	rs67230215	TTCACCATTGA	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=1454;SC=ATATTTTCCCTTCACCATTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=43237830;WS=43237795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	43244699	rs2277532	A	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=848;SC=AACAAAACAAATAAGTACCAT;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=43244707;WS=43244689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	43256121	rs2054389	T	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=741;SC=CAATATTTTATCCCCATAGTA;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=43256129;WS=43256111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	43322113	rs3736054	C	A	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=1098;SC=TCTTGAGGTACATAGAGATAA;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=43322121;WS=43322103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	43324942	rs6493077	C	T	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=20;PP=537;SC=TCATCCAGTCCAGTATTTTTT;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=43324950;WS=43324932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	43328663	rs3784265	C	T	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=7;PP=483;SC=TATCTTCTCTCCTTAGAAAGA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=43328671;WS=43328653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	43330175	rs7166596	A	T	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=37;PP=1101;SC=TTCTCACGTGAAAAATGGAAG;SOR=3.516;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=43330183;WS=43330165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	43352041	rs4924704	G	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=32;PP=960;SC=TGAAGGGAACGAACCAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=43352049;WS=43352031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	43398108	rs68062403	A	G	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=44;PP=1984;SC=GACCGGGGGGAGGACAAAAGA;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=97;WE=43398116;WS=43398091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	43453056	rs11070392	C	G	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=652;SC=ATACAGTAGTCCTCCCTTATC;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=43453064;WS=43453046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	43478113	rs540587	G	C	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=73;PP=2283;SC=CCTTGCCTCAGTTCCTCCAGC;SOR=1.517;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=106;WE=43478121;WS=43478103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	43478511	rs530118	C	T	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=61;PP=1812;SC=ACCTTTTGCACGCACGCCAGG;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=43478519;WS=43478501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	43481299	rs6493079	A	G	468.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.56;MQRankSum=3.782;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.289;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr15	43483537	rs495286	T	C	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=138;SC=ATAATAGGCCTCGCCTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=43483545;WS=43483527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	43527236	rs579178	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=431;SC=CAAGTACCAAATCCCAGGGAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=43527244;WS=43527226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	43568999	rs530683	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=722;SC=GGTCCTGTGACGCCATGGGGC;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=43569007;WS=43568989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	43784000	rs555252	C	T	3572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=69;PP=2743;SC=ACCAACAAACCTTAATACAAA;SOR=1.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=38;TCR=69;TR=107;WE=43784008;WS=43783990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	43941125	rs2470122	G	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=9;PP=198;SC=CCCGCCCGCCGGACGAAGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=43941133;WS=43941115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	44028569	rs56181031	G	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.17;QD=28.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	44038899	rs2411284	C	T	5383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=76;PP=2965;SC=AGTTCTTCGCCCCCTGGTGAG;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=161;WE=44038907;WS=44038889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr15	44053617	rs8040336	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=1064;SC=ATTTTGACTTCTAAGATGGAA;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=44053625;WS=44053607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	44061802	rs1053492	C	T	5692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=62;PP=2965;SC=GGTGTGGTCACTGTAAGAACC;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=116;TCR=62;TR=178;WE=44061810;WS=44061792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr15	44062874	rs7181912	A	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.99;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	44068160	rs3844075	C	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=33;PP=1726;SC=AGGGTGGAGACCTCTTAAGCA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=44068168;WS=44068150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	44084705	rs4644832	G	A	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=146;PP=2965;SC=CGCGCTCTGTGGCCACCCTCA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=65;TCR=146;TR=211;WE=44084713;WS=44084695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr15	44090854	rs654276	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=9;PP=377;SC=TGAGAGGGGGTTGGGACAGGC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=44090862;WS=44090844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	44091351	rs656473	A	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=960;SC=AGTGTGTGTGAGAGAAATGGC;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=44091359;WS=44091341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	44120559	rs678084	T	G	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=71;PP=2286;SC=TACCACACCATCCCTGGTAAG;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=28;TCR=71;TR=99;WE=44120567;WS=44120549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	44778936	rs2453275	T	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=13;PP=357;SC=GGATTTTTTTTAAAAAAATGC;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=44778944;WS=44778926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	44794330	rs144086133	C	CTT	401.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=259;SC=TGCATATACTCTTATTTTTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=44794338;WS=44794320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	44843934	.	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=1.242;SC=CACAAACATTCAGGAATAGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=44843942;WS=44843924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr15	44903285	rs12909507	C	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=245;SC=AACTCTATCCCCAGTAAAAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=44903293;WS=44903275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	44943757	rs3759871	A	G	5743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=78;PP=2965;SC=GCCAAGGGAAAAACACTGCAT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=163;WE=44943765;WS=44943747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr15	44951174	rs7165146	A	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=765;SC=AACTAACCACACTTCCTATAT;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=44951182;WS=44951164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	44964693	rs117505434	C	T	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=64;PP=2672;SC=TGGAAGGAAGCTCTCAGTTCT;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=125;WE=44964701;WS=44964683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	44966389	rs8026845	T	C	3928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=62;PP=2227;SC=ATTCCCAGCATACCAGGGGCC;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=121;WE=44966397;WS=44966379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	45028919	rs11388295	C	CT	520.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.452;NF=11;NR=7;PP=353;ReadPosRankSum=1.046;SC=GTGAGTGACCCTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=18;WE=45028927;WS=45028909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr15	45047134	rs2470911	G	A	7333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=97;PP=2965;SC=CGATCCAGGCGACTATGTTGA;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=208;WE=45047142;WS=45047124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr15	45047573	rs3100139	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=249;SC=CATTTCTTCACGGTGGGTGAG;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=45047581;WS=45047563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	45048757	rs3759881	T	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=623;SC=ATATATTATCTACACACTAAA;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=45048765;WS=45048747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	45048774	rs74535971	C	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=17;PP=499;SC=TAAATGGTACCTAGGCTATGG;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=45048782;WS=45048764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	45059390	rs6493127	C	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=44;NR=21;PP=1259;SC=GTTTACCCCCCTTTCTCCCAT;SOR=1.410;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=45059398;WS=45059380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	45060014	rs3100143	A	T	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=49;PP=1437;SC=TTAAAGAGGTATTGAAATATT;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=60;WE=45060022;WS=45060004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	45250755	rs373082	CA	TG	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=214;SC=CAGCCAAATCCAGCTAATCTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=45250764;WS=45250745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	45353230	rs2854446	C	T	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=50;NR=43;PP=1861;SC=TGCTCCCACCCTCGGACATGG;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=93;WE=45353238;WS=45353220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	45357410	rs2854437	T	G	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=14;PP=1066;SC=GCATATATAATACTATTGTTA;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=45357418;WS=45357400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	45361011	rs28662287	C	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.76;QD=26.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	45364706	rs71114308	TG	T	34.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.50;QD=17.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	45387550	rs199138	A	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=9;PP=1400;SC=TGGAGCCAGGAGCTTTCTCTC;SOR=2.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=54;WE=45387558;WS=45387540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	45388382	rs2554451	C	T	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=1079;SC=TCTGAGCAAGCGGGGCTCCTG;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=45388390;WS=45388372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	45391566	rs269869	A	T	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=14;PP=1052;SC=AGGAGAAACCATCCCCAGAAC;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=45391574;WS=45391556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	45392075	rs269868	G	A	3618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=70;PP=2386;SC=CGAGGGTGGCGAGGCAAAGCC;SOR=1.397;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=106;WE=45392083;WS=45392065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	45398965	rs269862	G	T	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=16;PP=1182;SC=CAAATAGCCAGCCCCTCAGGC;SOR=1.567;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=45398973;WS=45398955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	45399467	rs190599	A	G	13468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=260;NR=162;PP=2965;SC=GACAGCACCAAGTGATTCCCC;SOR=1.174;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=422;TCF=260;TCR=162;TR=422;WE=45399481;WS=45399457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,487:1.00:487
chr15	45400164	rs269861	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.78;NF=21;NR=3;PP=539;SC=CAAGGGCTCATAGGGGCTGTC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=45400172;WS=45400158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	45400358	rs269860	C	G	8294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=120;PP=2965;SC=CCAGGAGCCCCCCAAGGAGCA;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=142;TCR=120;TR=262;WE=45400366;WS=45400348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr15	45404066	rs2001616	G	A	7108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=74;PP=2965;SC=GTCGAACACGGGGTCTCCAGG;SOR=1.299;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=134;TCR=74;TR=208;WE=45404074;WS=45404056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr15	45404979	rs182090	T	G	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=70;PP=2210;SC=CCCAAACCTCTCCCTAAGCCT;SOR=1.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=45404987;WS=45404969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	45405463	rs269856	G	T	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=19;PP=1008;SC=TCAGGGAGCCGCTTGCCGCAC;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=45405471;WS=45405453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	45408414	rs2576090	C	G	5369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=104;PP=2965;SC=AGCCCGTGTCCGTCTGCTCGT;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=72;TCR=104;TR=176;WE=45408422;WS=45408404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr15	45408691	rs2576091	C	G	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=1.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	45408699	rs2252371	C	T	5861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.42;SOR=1.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	45408710	rs2554459	A	G	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=43;PP=2565;SC=GCCTCACCCCACAGGGACCCC;SOR=1.350;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=82;TCR=43;TR=125;WE=45408718;WS=45408681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	45408933	rs2576092	T	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=782;SC=CTATGGTAAGTGCTGGAGGGA;SOR=4.021;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=45408941;WS=45408923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	45409271	rs955152	C	T	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=13;PP=833;SC=CACAGCGGGTCCCCCCACTCC;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=45409279;WS=45409261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	45413282	.	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=444;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AGCCCTCCCTCACCTGTGAGT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=27;WE=45413290;WS=45413272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr15	45424286	rs1706810	C	G	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=732;SC=TCTGGGCTCCCCCAAGGACAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=45424294;WS=45424276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	45428712	rs72724253	C	T	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=54;PP=1943;SC=GTCCTCTCTTCTCCTATTTCC;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=101;WE=45428720;WS=45428702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	45433646	rs1648283	T	G	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=94;PP=2965;SC=GTGGTGGGTCTGGAGCCTCGT;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=82;TCR=94;TR=176;WE=45433654;WS=45433636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr15	45439910	rs938129	A	G	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=75;PP=2308;SC=TCTGTTGGAGATGGGGAAGCC;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=106;WE=45439918;WS=45439900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	45444518	rs1706804	A	G	7876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=154;NR=95;PP=2965;SC=CGGGCATCACAGACACCACCC;SOR=1.182;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=154;TCR=95;TR=249;WE=45444526;WS=45444508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr15	45445499	rs1648304	G	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=664;SC=CTCTGGCCAGGGTCCTCGATC;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=45445507;WS=45445489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	45445692	rs1648303	A	G	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.02;QD=28.03;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	45445746	.	A	G	364	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MMLQ=27;MQ=56.52;NF=0;NR=19;PP=364;QD=20.9879585551;SC=GTGTGTGTGTATAATGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=45445754;WS=45445736;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr15	45446084	.	CA	C	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=55.56;NF=6;NR=4;PP=132;QD=13.6;SC=GACTCTGCCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=10;WE=45446092;WS=45446074;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:23,10:0.30:33
chr15	45446156	rs2458236	C	T	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=37;PP=1601;SC=CAGGTCTGAGCTCCCCCAGAA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=45446164;WS=45446146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	45454720	rs1706811	G	A	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	45467540	rs1632144	C	G	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=23;PP=1202;SC=TCACCTTCCGCGGTGGCCCCA;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=45467548;WS=45467530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	45544319	rs2899376	T	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=138;SC=CTCCTCTACATTGAGGGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=45544327;WS=45544309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	45545378	rs17215668	GC	G	1021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.192;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-3.736;NF=17;NR=9;PP=985;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TTCAGGCTTGGCCCTGAATTT;SOR=2.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=26;WE=45545386;WS=45545368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr15	45545478	rs11854484	C	T	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=50;PP=2592;SC=ACAGTGAACCCGGGGCTGGAG;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=134;WE=45545486;WS=45545468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr15	45554267	rs1060896	C	A	7071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=101;PP=2965;SC=CACACGCCAGCTTGTTCAAGA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=212;WE=45554275;WS=45554257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr15	45556829	rs11631021	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=640;SC=ACTCACATTGAAATAATATTC;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=45556837;WS=45556819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	45557456	rs11632419	C	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=31;PP=927;SC=AGATCAGCGCCCCTGTATACC;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=45557476;WS=45557446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	45557468	rs2271438	A	G	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=841;SC=CTGTATACCAATTTGACCCTA;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=45557476;WS=45557446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	45561868	rs2413769	C	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=195;SC=ACTACAAAGCCAGCAGAACAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=45561876;WS=45561858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	45777344	rs1153829	T	C	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=39;PP=1586;SC=AGGCAGGAGTTCCCAAAATAC;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=45777352;WS=45777334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	45779810	rs2453531	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=18;PP=864;SC=TACAGATGGGGTCAGCAATCT;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=45779818;WS=45779800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	45951409	rs55658411	A	T	820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.62;QD=41.04;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	45951413	rs56364627	T	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.57;QD=40.67;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	45962041	rs11638918	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=18;PP=1156;SC=CTTAGACCACATGGAACCACA;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=45962049;WS=45962031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	45968535	rs12914266	A	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=968;SC=AGCTGTCAGCATGAAGCGTTG;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=45968543;WS=45968525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	45974536	rs62008308	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=271;SC=TGGAGAGGGCGTGGACTGGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=45974544;WS=45974532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	45974593	rs62008309	A	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=823;SC=CACAGTGTATAGAGTAAGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=45974601;WS=45974583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	45981117	rs2304897	C	T	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=456;SC=GTACAAAAAGCTAGAATATAC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=45981125;WS=45981107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	45981317	rs10643	G	A	6019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=81;PP=2965;SC=AAGCAGAGCCGCTAGAAACCT;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=85;TCR=81;TR=166;WE=45981325;WS=45981307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr15	47873549	rs4775699	C	T	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1490;SC=GGCAGAACTACATATAAACAA;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=47873557;WS=47873539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	47873605	rs4774498	T	A	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=50;PP=2112;SC=TGGGAAGTAGTTTGAGAAAAG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=104;WE=47873613;WS=47873595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	48053229	rs501916	C	A	6048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=73;PP=2965;SC=AAGTAATACCCAACAAGGTGA;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=115;TCR=73;TR=188;WE=48053237;WS=48053219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr15	48053334	rs599111	G	T	7979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=116;PP=2965;SC=AAACTGCTTTGGTTTTGCTTG;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=115;TCR=116;TR=231;WE=48053342;WS=48053324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr15	48055119	rs3743276	T	C	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=217;SC=TTGAATGTAATTGTGCAACAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=48055127;WS=48055112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	48056735	rs565627	A	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=575;SC=CTCCTTCCTCACTTGACCTCT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=48056743;WS=48056725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	48056958	rs3743281	C	T	6780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=118;PP=2965;SC=CACCCATTGCCGATGAGCCCT;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=95;TCR=118;TR=213;WE=48056966;WS=48056948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr15	48058214	rs531596	C	T	9193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=146;PP=2965;SC=AAAGTAAGCTCGTGTTTCTTT;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=132;TCR=146;TR=278;WE=48058222;WS=48058204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr15	48058259	rs616871	T	A	8155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=138;PP=2965;SC=GAAACCTTTGTTGATGAGAAA;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=111;TCR=138;TR=248;WE=48058267;WS=48058249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr15	48058484	.	G	T	136	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=136;QD=28.4618687579;SC=CTTTTTTTTTGTTGTTATGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=48058492;WS=48058474;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	48058652	rs472081	G	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=268;SC=GTTTTTAACAGAAATAGTCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=48058660;WS=48058642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	48058684	.	GTTGTT	G,GT	468.86	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.19;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.6753;FS=4.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.548;NF=13;NR=2;PP=196;SC=ATGTTAAAATGTTGTTTTTTT;SOR=3.126;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=15;WE=48058696;WS=48058674;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.88:17
chr15	48058929	rs603569	G	A	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=81;PP=2544;SC=ACATTTGCACGTCGACATTAT;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=133;WE=48058937;WS=48058919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	48063076	rs568215	T	C	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=47;PP=1880;SC=CTGCTCTTCCTACTCCTGAGT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=90;WE=48063084;WS=48063066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	48443699	rs2470103	T	C	7614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=122;PP=2965;SC=TCCAAAGCCTTGATTTATTCC;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=234;WE=48443707;WS=48443689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr15	48450517	rs3736482	T	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=41;PP=1213;SC=AACTCTCTGATATTTTAATTA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=48450525;WS=48450507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	48460786	rs11070626	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=740;SC=CCCCTGCCTATATGAAGATTA;SOR=5.353;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=48460794;WS=48460776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	48460927	rs8023906	C	T	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=80;PP=2934;SC=TTTTCTCCAGCGCCCGAATTC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=152;WE=48460935;WS=48460917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr15	48520699	rs1484547	T	C	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=135;SC=TAATACATCATACTCTATAGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=48520707;WS=48520689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	48538979	rs35669481	A	AAAC	1011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=1018;SC=TGTCTCAAACAAACAACAACA;SOR=3.352;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=20;WE=48538987;WS=48538969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	48539026	rs11636073	A	T	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=22;PP=1374;SC=CAGGGGGAAAAAATGTAGTTG;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=70;WE=48539034;WS=48539016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	48539043	rs8028035	G	A	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=30;PP=1798;SC=GTTGAAAGCCGTTTGCTTATG;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=48539051;WS=48539033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	48541700	rs2279365	G	A	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=34;PP=2924;SC=TTCAAGCTTCGAGGCTATAAC;SOR=1.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=100;TCR=34;TR=134;WE=48541708;WS=48541690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	48561834	rs1484551	A	G	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=43;PP=2245;SC=GATTGCCCACATTTTTATGTC;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=48561842;WS=48561824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	48580713	rs1552311	T	C	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=38;PP=1381;SC=GAAAAAATTGTGTAAGTAGTT;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=74;WE=48580721;WS=48580703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	48623248	rs66822811	TCGGGCGCGGTGTCTTGCCCACAGCTTGGGGAGCGGCCC	T	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=2957;SC=TGAAAGGAAATCGGGCGCGGT;SOR=1.911;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=48623293;WS=48623238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	48712699	rs3214528	AT	A	552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=466;SC=CTCAATTATAATTTTTTTTCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=21;WE=48712707;WS=48712689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	48713996	rs1820488	G	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=820;SC=GGCCAACAACGCTTCACATAC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=48714004;WS=48713986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	48720526	rs363832	G	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=1015;SC=GGAAAGTGCGGTGCCAACTGT;SOR=3.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=48720534;WS=48720516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	48729648	rs2042746	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=412;SC=TCTCCACAAGTATTTTGAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=48729656;WS=48729638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	48736684	rs2303502	A	T	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=40;PP=2322;SC=TCATTCTGCTAAGTCCAGTGG;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=110;WE=48736692;WS=48736674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	48749040	rs6145556	C	CGTGT	666.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.528;NF=0;NR=22;PP=678;ReadPosRankSum=-2.476;SC=AAAGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=22;WE=48749048;WS=48749030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr15	48807637	rs4775765	C	T	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=55;PP=1797;SC=CTCACACCGGCAACTCCCAGG;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=48807645;WS=48807627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	48903126	rs1018148	A	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=40;PP=1204;SC=GGTCCCTCACAAACTTTGCTA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=48903134;WS=48903116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	49009405	.	ATT	A	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=18;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=16;MQ=57.57;NF=0;NR=4;PP=44;QD=11.75;SC=GTCTTTAACCATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=49009414;WS=49009395;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr15	49083577	rs58156069	C	T	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=43;PP=1434;SC=TTTTCATCTACGGTATTAAAA;SOR=1.116;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=49083585;WS=49083567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	49097733	rs34518970	T	TC	67.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.66;QD=22.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	49098016	rs1426200	C	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=350;SC=GGTGATTCACCGAAAATAGCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=49098024;WS=49098006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	49118087	rs3743292	C	T	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=496;SC=ATTTTATCTACAAACAAAGTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=49118095;WS=49118077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	49135892	rs882824	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=225;SC=CATGCCCCACCCTATACAATG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=49135900;WS=49135882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	49143232	rs17467239	G	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=561;SC=GCAACATTCTGGGCCTATCTG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=49143240;WS=49143222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	49149828	rs4774526	C	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=623;SC=CAAATAAATACATACAGATAA;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=49149836;WS=49149818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	49168649	rs34156861	TAC	T	266.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=238;SC=CATATATATATACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=6;WE=49168658;WS=49168641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	49168841	rs34224664	G	A	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=514;SC=TCCAATGTTCGAGGGCAGGAA;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=49168849;WS=49168831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	49421868	rs507054	T	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=488;SC=TGCTTGGCAATGATATAAAGT;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=49421876;WS=49421858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	49423098	rs2289390	C	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=108;SC=TGCTTCTCAACTTTCATATGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=49423106;WS=49423088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	49461248	rs577659	C	T	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=1171;ReadPosRankSum=-0.894;SC=CACTCTTTGGCTATGCTTTAT;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=61;WE=49461256;WS=49461238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr15	49493250	rs10629223	A	AGT	110.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=0;PP=324;SC=AGGCATATGGAGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=49493258;WS=49493240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	49620971	rs5812480	AT	A	53.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-0.366;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr15	49716845	rs16962440	T	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=TTTCAGGTGATATGTTTTCTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=49716853;WS=49716835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	49800394	rs58845336	G	A	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=12;PP=1061;SC=GCAGTATACAGAAACTTTACT;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=49800402;WS=49800384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	49867122	rs12901416	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=422;SC=ATCCAGAAAAACATTTTTGTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=49867130;WS=49867112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	49867148	rs12902794	T	C	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=577;SC=CTTATCTCTATTGAAAAATTA;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=49867156;WS=49867138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	49867323	rs12902107	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=34;PP=1007;SC=AAAAAAACAAGAGAGAGATGC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=49867331;WS=49867313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	50152583	rs4774549	G	T	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=41;PP=1232;SC=CAAAAGCATAGCCAGACCTTC;SOR=1.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=50152591;WS=50152573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	50226313	rs2452524	G	T	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=73;PP=2156;SC=TCCATCAGATGGTGGTCAAAG;SOR=1.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=101;WE=50226321;WS=50226303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	50474766	rs1648348	A	C	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=82;PP=2965;SC=CAGCTACGGGAAGCGGCGGCC;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=170;WE=50474774;WS=50474756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr15	50489677	rs1863511	A	T	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=29;PP=1815;SC=TTGTTTTGATATTTTTCTTAT;SOR=1.502;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=91;WE=50489685;WS=50489667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	50521265	rs5812509	T	TA	8675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=110;PP=2936;SC=GATCTGTACCTAACCCATAGA;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=34;TCR=115;TR=143;WE=50521273;WS=50521255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr15	50546933	.	TTTTCTC	T	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.01;MQRankSum=1.917;QD=26.68;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr15	50555710	rs854160	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=572;SC=AAGAAGGAGATGGATTTGGCC;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=50555718;WS=50555700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	50557738	rs854163	G	A	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=31;PP=1454;SC=ACCAGCAGCCGTTCCTGCAGG;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=50557746;WS=50557728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	50570999	rs11372405	G	GT	685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.471;NF=0;NR=25;PP=496;ReadPosRankSum=0.967;SC=AAAGAAGAGGGTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=25;WE=50571007;WS=50570989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr15	50581634	rs34330339	T	TA	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.065;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr15	50596370	rs77189483	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=644;SC=ATTTACATTATTGTTACTACA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=50596378;WS=50596360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	50601811	rs11636564	T	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=5;PP=1304;SC=ATAAACACAATACTGACTACA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=50601819;WS=50601801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	50652513	rs139520399	C	CA	1466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=1385;SC=TCACCATCCTCAAAGGTGTTA;SOR=2.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=34;WE=50652521;WS=50652503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	50731390	rs11632708	C	T	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=28;PP=1123;SC=ATGTATCCTTCGCTAGTTTGA;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=50731398;WS=50731380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	50754288	rs11431370	A	AT	254.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=335;SC=ATTGCTAGTTATTTTAGCTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=50754296;WS=50754278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	50754339	rs3098169	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=403;SC=ATTATTATTCGTCTGCGTTTT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=50754347;WS=50754329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	50763945	rs61751062	T	A	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=38;PP=1530;SC=TGCCAAAGATTTACAGATTGG;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=50763953;WS=50763935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	50773755	rs3131561	G	A	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=28;PP=943;SC=ACCATGAGCAGCAATCTCCTC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=50773763;WS=50773745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	50774431	rs11633608	G	A	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=718;SC=TTTGAGGCCAGTGCCATACAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=50774439;WS=50774421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	50776640	rs4775889	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=9;PP=216;SC=CCACACTGCTATCTTTTATCA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=50776648;WS=50776630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	50782703	rs11638390	A	G	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=48;PP=1653;SC=AGTAACTCCAACAGTTAATCG;SOR=0.838;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=50782711;WS=50782693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	50787868	rs17598061	T	G	56.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5723;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=0.319;SC=AGTGAGTGAGTTTTTTTTGGT;SOR=0.916;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=50787876;WS=50787858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr15	50789527	rs113527256	T	TA	1237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=1124;SC=CATGGGCACATAACAAAGGGC;SOR=2.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=50789535;WS=50789517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	50821945	rs3098200	G	A	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=12;PP=1765;SC=AGATAATTCTGGAGTTTTCTT;SOR=2.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=73;WE=50821953;WS=50821935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	50822178	rs62019151	T	C	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=40;PP=1205;SC=GAACCACTCATTTGTCTACAT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=50822186;WS=50822168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	50833113	rs2003359	A	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=508;SC=GAGCCACCGCACTCAGTCTAT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=50833121;WS=50833112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	50836243	rs3109878	T	G	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=51;SC=AAAAAAAGGATGCCAGGCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=50836251;WS=50836233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	50836284	rs12443399	G	C	99.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=37;SC=CAGCACTTTGGGGGGCCGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=50836292;WS=50836274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	50844711	rs17598264	A	G	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=108;SC=TGCTTTTACTATCTTCCCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=50844719;WS=50844701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	50854029	.	TA	T	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=61.94;NF=1;NR=6;PP=93;QD=14.1428571429;SC=CCACAACAATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=50854037;WS=50854019;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr15	50867082	rs473357	G	A	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=29;PP=2108;SC=TATCTTCTTTGTAAATACTTG;SOR=1.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=91;WE=50867090;WS=50867072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	50873262	rs2414060	A	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=386;SC=TTTATTTATTATAACTGTATT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=50873270;WS=50873252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	50878478	rs539383	G	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=242;SC=CAGAATTTTCGTCTTCTGACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=50878486;WS=50878468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	50878509	rs1395297	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=459;SC=TCACTGCTCATGTGTTTGACA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=50878517;WS=50878499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	50878574	rs3109894	G	A	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=20;PP=1026;SC=CTATTCATATGGTCAAAATAC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=50878582;WS=50878564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	50882045	rs113973270	T	TTTTTTTG	136.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.02;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	50885976	rs567109	G	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=440;SC=AGAAAATCAAGGAAGAGCTAT;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=50885984;WS=50885966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	50888619	rs675011	A	T	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=554;SC=ACAACTTAAAAATAGTAATTC;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=50888627;WS=50888609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	50899211	rs12439744	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=229;SC=ACAAAGTATACAGCATACTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=50899219;WS=50899201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	50899309	rs11633404	C	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=14;PP=510;SC=ACACACACACCCCCCTACGTA;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=50899317;WS=50899299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	50901929	rs35281039	TA	T	1255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=11;PP=641;SC=TTCCTAAAATTAAAAAAAAAA;SOR=2.540;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=43;WE=50901937;WS=50901919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	50903600	rs4775894	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=812;SC=ATTAATACTTCCTACTTTTTA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=50903608;WS=50903590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	50911865	rs34352984	AT	A	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.51;QD=25.46;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	50916575	rs137968959	GATTTAC	G	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=85;SC=AAGTCCTTAGGATTTACATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=50916588;WS=50916565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	50924995	rs2292175	G	A	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=136;SC=TATTTCACCAGTTTAGAATGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=50925003;WS=50924985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	50926516	rs62017191	C	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=204;SC=AGCAAGACTCCGTATCAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=11;WE=50926534;WS=50926506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	50926523	rs140773609	AAAAT	A	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=192;SC=CTCCGTATCAAAAATAAATAA;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=50926534;WS=50926506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	50935484	rs150936263	C	CA	732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=1;PP=428;SC=GAGTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=5.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=23;WE=50935492;WS=50935474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	50941108	rs2063011	C	G	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=38;PP=1048;SC=GAGATTAAAACACCCTTCAAA;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=50941116;WS=50941098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	50941131	rs2063010	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=640;SC=ATTAGAGTTAATGAAAAAATG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=50941139;WS=50941121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	50950141	rs17645826	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=217;SC=TCAGTAGATATTATAGTTCAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=50950149;WS=50950131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	51201158	rs76674534	A	G	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=40;PP=1129;SC=GCTCAGGGACATCGGAGTGAG;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=51201166;WS=51201148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	51201281	rs72742383	A	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=110;SC=TCTGCCTGGAAGCTTCACTTT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=51201289;WS=51201271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	51204364	rs1147129	G	A	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=93;PP=2965;SC=TGCATAGTCAGTGCCAACACA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=84;TCR=93;TR=177;WE=51204372;WS=51204354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr15	51204394	rs3214932	C	CT	7233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=81;PP=2957;SC=GAAATCTAGTCACTGTGGACT;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=13;TCR=85;TR=93;WE=51204402;WS=51204384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr15	51207818	rs2663553	G	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=295;SC=CCTTGAAGTTGCATCTATTAT;SOR=1.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=51207826;WS=51207808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	51276128	rs2306335	A	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=226;SC=TATTAGTTCCAGGCTTGAATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=51276136;WS=51276118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	51350655	rs76241791	AT	A	1016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=1326;ReadPosRankSum=1.095;SC=GGTAAAAAAAATATATATAAA;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=51350663;WS=51350645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr15	51634255	rs2446421	T	G	5361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.968;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=1.702;SC=GTAGGCGGGGTCTCTGTTCCC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=164;WE=51634263;WS=51634245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr15	51675932	rs11306243	AT	A	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-0.623;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr15	51768755	.	AT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=7.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.703;SOR=2.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,12:0.16:77
chr15	51914778	rs6493514	T	G	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.940;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=57;PP=1774;ReadPosRankSum=0.050;SC=GCGCGGGAGGTGCGACAAGCT;SOR=0.916;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=92;WE=51914786;WS=51914768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr15	51981595	rs201709954	GGGGTGT	GGT,G	2820.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=69,69;PP=41,1329;SC=CATATGCATGGGGGTGTGTGT;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=0;TCR=74;TR=69,69;WE=51981608;WS=51981583;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:83
chr15	51991454	rs2622774	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=705;SC=AAACATTTTTCGTAAAAATTT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=51991462;WS=51991444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	52264094	rs17612102	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=1093;SC=GTGAACCTGTTCTCGCCTGGG;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=52264102;WS=52264084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	52351093	.	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=0.267;SC=ATGGGGCTTTCTCCAAAATAG;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=52351101;WS=52351083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr15	52486335	rs59434591	G	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=432;SC=GCAAAACACAGCTATCTCTAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=52486343;WS=52486325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	52487523	rs3751604	T	A	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=818;SC=ATCAACATCTTATACCATAGT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=52487531;WS=52487513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	52504142	rs2278295	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=407;SC=CCTAAGGAACTTGTGACTAGG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=52504150;WS=52504132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	52505563	rs3751608	C	T	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1283;SC=TCTCCTACCCCATTCTGGCTG;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=52505571;WS=52505553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	52506655	rs6493546	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=253;SC=AGGATCCTTTCGTTAGCCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=52506663;WS=52506645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	52510825	rs62618748	A	C	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=61;PP=2288;SC=CATTTCTTGAATCTTATCAAT;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=46;TCR=61;TR=107;WE=52510833;WS=52510815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	52515678	rs4405492	G	T	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=14;PP=1459;SC=TGAATTTGACGCCACTGACAA;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=52515686;WS=52515668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	52531941	rs11635028	A	G	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=48;PP=2866;SC=TGATCTTCCAACTTTTTCTGC;SOR=1.305;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=135;WE=52531949;WS=52531931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	52534344	rs3751631	G	A	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=44;PP=1921;SC=CAAGATACCCGCGGCAGTGCT;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=52534352;WS=52534334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	52539673	rs10163109	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=21;PP=1643;SC=CAACTGTGGTCCGGAAATGCT;SOR=1.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=52539681;WS=52539663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	52548784	rs142512191	A	ACGCGCGCG,ACACGCGCGCG	4532.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=23,19;NR=20,20;PP=792,84;SC=ACACACACACACGCGCGCGCG;SOR=2.049;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=43,39;WE=52548792;WS=52548774;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.21,0.79:56
chr15	52553007	rs4497629	C	G	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=11;PP=1398;SC=AAAAACCATGCGGCTCTCAAC;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=52553015;WS=52552997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	52556429	rs4776032	A	G	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=33;PP=1298;SC=TGATCTGCACATTGCCCAGAT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=52556437;WS=52556419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	52564191	rs3751629	T	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=320;SC=AGGCCCTTCCTCTCAGCTGAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=52564199;WS=52564181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	52587880	rs12907067	C	T	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=28;PP=987;SC=ACGTGCGAGGCTCGGGGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=56;WE=52587888;WS=52587870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	52628489	rs8035295	T	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=286;SC=TTTTCCTCATTTAAAAATGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=52628497;WS=52628479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	52640990	.	T	TA	58	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=18;MQ=57.85;NF=3;NR=1;PP=58;QD=15.75;SC=AAGTATTTACTAAAAAAAAAA;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=52640998;WS=52640980;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,4:0.44:9
chr15	52667552	rs2414145	G	A	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=64;PP=2893;SC=ACTGAAGAACGATAGTGGCAG;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=52667560;WS=52667542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	52668822	rs1009157	G	A	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=991;SC=AAGAAAAAATGTCTAAAAGCA;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=52668830;WS=52668812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	52671784	rs2242058	C	T	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=25;PP=2035;SC=AACCACAAGGCCTTCTGCTCA;SOR=1.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=52671792;WS=52671774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	52675261	rs4774621	T	C	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=41;PP=2471;SC=TATGTACTTTTTCACTGGGTG;SOR=1.314;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=117;WE=52675269;WS=52675251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	52681573	rs1724623	A	G	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=40;PP=1270;SC=ATATTCATGGAAAAAAGGAAG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=52681581;WS=52681563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	52681643	rs71425744	AT	A	267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=13;PP=189;SC=AAGATCTTTTATTTTTTTTTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=52681651;WS=52681633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	52684004	rs1669872	C	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=1027;SC=GAAAGCATAACCCCTACTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=52684012;WS=52683994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	52689526	rs2924130	T	C	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=80;PP=2447;SC=CGCGGGCATTTGTGGCCTGCA;SOR=1.246;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=130;WE=52689534;WS=52689516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	52689631	rs1724577	T	G	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=1715;SC=CACCCATGAGTTCACAGAAGA;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=52689639;WS=52689621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	52897478	rs2414163	T	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=39;PP=1124;SC=AATTGTAATATTTAAATACCA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=52897486;WS=52897468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	52901433	rs12915981	C	T	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=17;PP=1181;SC=TTATTAGGTACTAAGTTTTTC;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=49;WE=52901441;WS=52901423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	52901638	rs3751614	T	C	5730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=94;PP=2965;SC=GCTCCAAGTGTTGAGCAATCC;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=85;TCR=94;TR=179;WE=52901646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr15	52901977	rs2414166	G	A	6584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=119;PP=2965;SC=TCAAATGTTGGGCAATTCTTG;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=83;TCR=119;TR=202;WE=52901996;WS=52901967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr15	52901988	rs202140626	C	G	6348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=116;PP=2965;SC=GCAATTCTTGCAATGATTTCT;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=78;TCR=116;TR=193;WE=52901996;WS=52901967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr15	52904046	rs4776063	C	A	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=799;SC=AGAAAATTATCATTGTAAAGT;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=52904054;WS=52904036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	53994493	rs6416452	A	G	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=64;PP=2528;SC=GACCATGTGGATAGAGTAATG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=127;WE=53994501;WS=53994483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	53998314	rs690235	G	T	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=50;PP=1502;SC=ATTCTAACTAGAGAGAGATGG;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=53998322;WS=53998304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	54008845	rs690346	T	C	7088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=135;PP=2965;SC=GCCTTCTCCATGCACTGTCCA;SOR=0.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=104;TCR=135;TR=239;WE=54008853;WS=54008835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr15	54306925	rs12437941	G	A	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=55;PP=2411;SC=TTTGAATGGAGGTGTTCAGGG;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=112;WE=54306933;WS=54306915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	54435446	rs1897069	G	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=172;SC=GCTTACCTTAGCTATACTTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=54435454;WS=54435436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	54529629	rs7162346	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=14;PP=1781;ReadPosRankSum=0.509;SC=AGTTGTGGGATCGTTCCAGTT;SOR=2.759;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=78;WE=54529637;WS=54529619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr15	54556259	rs12917364	A	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=8;PP=999;SC=ACTCCACAGAATGAAAGCACT;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=54556267;WS=54556249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	54630552	rs57449290	T	TTGTC	8039.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=54;PP=2918;SC=ATGTCTGTCTTTGTCAGGTTC;SOR=0.997;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=99;WE=54630560;WS=54630542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	54630758	rs12913366	A	G	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=902;SC=AGTTTAGCATAATAGTAAATA;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=54630766;WS=54630748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	54792428	rs8025195	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=834;SC=CACATTGCTTACTTTTAACCT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=54792436;WS=54792418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	54841696	rs10468008	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=165;SC=CTTTATAATAGACCAATTAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=54841704;WS=54841686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	54841874	rs9302181	A	G	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=25;PP=1017;SC=ATCTTGGACAATTATCCAAAC;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=54841882;WS=54841864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	54847509	rs8039515	G	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=604;SC=AATGCATTCAGGTGCAGAAGA;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=54847517;WS=54847499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	54847677	rs11639005	C	T	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=47;PP=1865;SC=CAAGACAATGCGCTATAATGG;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=54847685;WS=54847667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	54847786	rs11639014	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=29;PP=1030;SC=CCCTGATCTTAGCCATGTATC;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=54847794;WS=54847776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	54914716	rs2681964	C	T	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=340;SC=AAAAACTGCACAATTATTTTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=54914724;WS=54914706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	54915975	rs2414332	A	T	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=29;PP=2026;SC=CTAAAATGTGATATTTCCTTT;SOR=1.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=95;WE=54915983;WS=54915965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	54918911	rs11856235	T	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=750;SC=ATATCCTATTTGCCAACATAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=54918919;WS=54918903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	54918943	rs11852743	G	A	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=7;PP=1516;SC=AATGTATACAGTTTTCAGCAG;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=59;WE=54918951;WS=54918933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	54919047	rs1520411	A	G	6869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=79;PP=2965;SC=AGGAAAATCGACCAGGGGCTT;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=123;TCR=79;TR=202;WE=54919055;WS=54919037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr15	55653031	rs501231	A	G	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=16;PP=898;SC=TCCTTCTCCAAGGATACTCTT;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=55653039;WS=55653021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	55710365	rs56070549	T	C	4653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	55710369	rs6493785	T	A	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.33;ReadPosRankSum=2.019;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr15	55840995	rs2617227	A	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=855;SC=ATGAATGATTAAAAGTACAAT;SOR=3.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=36;WE=55841003;WS=55840985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	55841032	rs12917202	A	G	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=54;NR=15;PP=1411;SC=AAAACTTATGACCAAGTTCAA;SOR=2.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=55841040;WS=55841022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	55881111	rs1992236	A	G	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=42;PP=1327;SC=ACCTGTCTGTAGAATGCCTCC;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=68;WE=55881119;WS=55881101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	56030543	rs12906885	G	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=13;PP=1265;SC=TTTTATTTATGAAGTTAGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=56030551;WS=56030533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	56030756	rs4774222	T	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=43;PP=1355;SC=CTACAAACTCTAAAAGGTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=56030764;WS=56030746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	56032519	rs10152116	G	A	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=5;PP=1572;SC=TATTAATAAAGCAAGAAATCA;SOR=3.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=57;WE=56032527;WS=56032509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	56032975	rs7182733	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=312;SC=TTCAGGGTATGAGATGACGAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56032983;WS=56032965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	56034878	rs11632579	G	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=368;SC=TGGCGGTTCCGGACAGGCCGC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=18;WE=56034886;WS=56034868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	56035010	rs12910180	G	A	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=28;PP=1115;SC=ACAGCGGTAAGAGAAAGCAGA;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=61;WE=56035018;WS=56035000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	56141053	.	A	G	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=69;PP=2165;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CTTTCCTCTCAGATGGGCTGG;SOR=0.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=42;TCR=70;TR=111;WE=56141061;WS=56141043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr15	56152598	rs4774228	A	G	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=25;PP=2039;ReadPosRankSum=0.668;SC=ATCTAAGAGCATCTTACTGAG;SOR=1.042;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=103;WE=56152606;WS=56152588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr15	56207983	rs7174459	C	T	6417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=88;PP=2965;SC=TCTTCTGTAACGAGCCCTTCC;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=119;TCR=88;TR=207;WE=56207991;WS=56207973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr15	56243766	rs61732704	C	T	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=57.15;NF=1;NR=4;PP=74;SC=GGTCATATAACGTCACTCTCA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=56243774;WS=56243756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	56258809	rs6493829	A	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.90;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	56285625	rs62045233	C	A	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=3;PP=221;SC=AGCCTCCGGTCGTGGCCGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=56285633;WS=56285615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	56297909	rs3959682	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.25;QD=30.75;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	56297947	rs62046378	C	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.81;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	56379784	rs78110270	G	A	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=66;PP=2143;SC=TAACTGCAAGGGAAGTTGGCA;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=56379792;WS=56379774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	56386577	rs7170589	T	G	4600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=69;PP=2895;SC=CGACCAAAATTAGTGTCATGA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=56386585;WS=56386567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	56387931	rs11071247	C	T	9375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=148;PP=2965;SC=CCTGGGTCTCCTGCAATGTAG;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=134;TCR=148;TR=282;WE=56387939;WS=56387921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr15	56388033	rs12439907	T	C	9628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=149;PP=2965;SC=TGGTGAAAGTTAAGTTCTGAG;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=299;TCF=150;TCR=149;TR=298;WE=56388041;WS=56388023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr15	56390186	rs4363812	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=627;SC=TTGTGGCTACTCTTATACCTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=56390194;WS=56390182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	56394538	rs142841844	G	GA	303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=12;PP=272;SC=TATGAAATGAGAAAAAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=56394546;WS=56394528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	56471449	rs11637789	T	G	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=16;PP=876;SC=AGGATTTTAATATTAGTTATT;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=56471457;WS=56471439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	56535174	rs2460649	A	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=114;SC=ACCTCCAGAGATCCTACAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=56535182;WS=56535164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	56657581	rs2682033	A	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=5;PP=1013;SC=GCGGGAGGCAACCGGGATGTG;SOR=3.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=56657589;WS=56657571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	56680865	rs16976890	G	A	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=688;SC=CATTTGTGAAGTGTCCCTCAT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=56680873;WS=56680855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	56680944	rs1477589	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=292;SC=GGAAAAAATGTTAGGTGAAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=56680952;WS=56680934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	56704682	rs12441309	C	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=356;SC=TTGGTAACTACTTCTTTTATG;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=56704690;WS=56704672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	56719797	rs795785	G	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=285;SC=TTTTTTCCTTGTGTAGGACAT;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=56719805;WS=56719787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	56720704	rs77031591	G	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=453;SC=ACTTATTGTAGTGGTTTGAAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=56720712;WS=56720694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	56721264	rs795787	G	A	789.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=609;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GTGGTAACATGCAAAAAATCT;SOR=1.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=26;WE=56721272;WS=56721253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr15	56721406	rs808730	C	T	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=19;PP=602;SC=GAGAAAAATACTTTGTGGGTT;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=56721414;WS=56721396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	56735824	rs17819473	T	C	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=30;PP=2211;SC=AAAGAAGTGGTTATTTTAATA;SOR=1.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=102;WE=56735832;WS=56735814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	56739063	rs17238740	C	T	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.13;NF=31;NR=30;PP=1117;SC=TAATGGCATCCTTTTCAGCAA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=56739071;WS=56739053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	56739177	rs77189834	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=454;SC=TAAATGTTAGGACCATAAGAG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=56739185;WS=56739167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	56923714	rs8043381	G	A	5806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=83;PP=2965;SC=TTTCTTTTTCGTCTTCCAGGT;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=182;WE=56923722;WS=56923704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr15	56946296	rs8028457	C	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=2;PP=248;SC=AAAACAACAACATACTTTAAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=56946304;WS=56946286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	56959028	rs28620278	C	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=40;PP=1672;SC=TTGGATTTGACTGTATTAGGT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=56959036;WS=56959018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	56981703	rs1871861	T	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.28;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	57210562	rs213150	C	A	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=47;PP=1403;SC=ACGGTACCTGCCACCCCGCTC;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=57210570;WS=57210552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	57458784	rs3794617	C	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=337;SC=TAATTTGTAACTAAGTGTTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=57458792;WS=57458774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	57523563	rs3838866	AT	A	1234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=926;SC=TTATTTAGGCATTTTTTTTGG;SOR=5.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=41;WE=57523571;WS=57523553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	57731335	rs1280395	A	C	7938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=99;PP=2965;SC=CAGAATTAATACAGATGACAG;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=129;TCR=99;TR=228;WE=57731343;WS=57731325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr15	57731728	rs1280396	A	G	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=949;SC=GAACCGGGCAACAGCAACTTC;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=57731736;WS=57731718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	57732743	rs1280398	T	C	5649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=93;PP=2965;SC=TTTCCGAGGCTTTAATGGTTA;SOR=1.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=68;TCR=93;TR=161;WE=57732751;WS=57732733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr15	57732774	rs17820299	C	T	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=77;PP=2445;SC=TTGCCCTGTGCCAGCCGTTGG;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=40;TCR=77;TR=117;WE=57732782;WS=57732764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	57743933	rs1280406	A	G	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TAATCACTGAATAAATTCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=57743941;WS=57743923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	57817050	rs10518925	G	A	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=988;SC=TCGTGAGACAGCTTTGGTGCT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=57817058;WS=57817040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	57836823	rs8029295	G	A	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=43;PP=1274;SC=ACTGCAGTGCGGAGGCCCCAG;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=57836831;WS=57836813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	57838258	rs2635390	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=7;PP=511;SC=TCAGCCCACATTCTCTCCCGG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=57838266;WS=57838248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	57884181	rs1690328	T	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=5;PP=190;SC=GCACGCTTATTCTGCCCGGGA;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=57884189;WS=57884171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	57910444	rs935548	A	G	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=103;PP=2965;SC=CATGCAAGAGAATGGAGTTGG;SOR=1.185;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=165;WE=57910452;WS=57910434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr15	57914094	rs2934439	G	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=195;SC=AAGAATAATCGTATTCATATT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=57914102;WS=57914084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	57918090	rs2958059	A	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=35;PP=1170;SC=TTGGCCTGCAAGTACTCATCT;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=57918098;WS=57918080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	57924586	rs2733593	T	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=10;PP=848;SC=TGCCAATTCCTCTGGGCCCTG;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=57924594;WS=57924576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	57953564	rs986868	C	T	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=110;SC=AAATGAAAACCAAGGGCATCT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=57953572;WS=57953554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	57967219	rs1991252	T	C	7314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.04;NF=113;NR=104;PP=2965;SC=AGGCCAAGACTGAAGTGGAAA;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=217;WE=57967227;WS=57967209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr15	57967285	rs5812908	AT	A	3315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.334;NF=5;NR=75;PP=1290;ReadPosRankSum=2.635;SC=GAATTTCCTGATTTTTTTTTT;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=7;TCR=98;TR=80;WE=57967304;WS=57967275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,129:0.98:132
chr15	57976523	rs6493944	A	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=8;PP=1246;SC=CATTTTCTAGAGTTGTCTTAC;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=57976531;WS=57976513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	57976583	rs2554032	A	C	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=38;PP=2132;SC=CCTGACCTGCATTTTCTCATT;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=57976591;WS=57976573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	58000861	rs184344900	T	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=8;PP=1070;SC=ATGTTATATCTCAAGTTAAAA;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=58000869;WS=58000851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	58000981	rs1062707	C	T	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=48;PP=2724;SC=TGAAAGCTGCCATTGCAGAAT;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=111;WE=58000989;WS=58000971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr15	58465171	rs2292712	G	A	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=607;SC=GTAGTTCTCTGCCTAGAAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=58465179;WS=58465161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	58465483	rs2292713	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=215;SC=TAGGCACAGGCGAGAAAAAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=58465491;WS=58465473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	58471368	rs2249783	C	T	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=27;PP=1296;SC=TCTTTGCCATCTTTGACTCCA;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=58471376;WS=58471358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	58476092	rs3832977	G	GA	2129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=1672;ReadPosRankSum=-1.819;SC=ACAAGTGAGTGAAAAACTAGA;SOR=1.493;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=51;WE=58476105;WS=58476082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr15	58476281	rs1867380	A	G	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=69;PP=2389;SC=AGTCTTTAAGACAGAACAATC;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=58476289;WS=58476271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	58729144	rs17190517	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=896;SC=TCCCATAGAACGGTGTTGATA;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=58729152;WS=58729134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	58834741	rs690	G	T	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=847;SC=AGGAATCTGTGCAACTCTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=58834749;WS=58834731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	58837910	rs2414592	T	C	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=19;PP=882;SC=TCCTTGCTCCTGCGTAACCCT;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=58837918;WS=58837900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	58838010	rs6083	A	G	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=42;PP=1657;SC=GATGATGCCAATTTTGTGGAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=58838018;WS=58838000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	58840450	rs1007543	A	C	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=12;PP=1475;SC=CTCCTGTGGGATGAGAACCAA;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=58840458;WS=58840440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	58853079	rs3829462	C	A	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=12;PP=997;SC=ATTACCAGTTCAAGATCCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=58853087;WS=58853069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	58853109	rs3829461	A	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=28;PP=1205;SC=AAACTGAGACACCAATACAAA;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=58853117;WS=58853099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	58853212	rs71964604	GAC	G	3473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=37;PP=2327;SC=CTAGGGTGATGACACACTTAT;SOR=1.040;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=46;WE=58853226;WS=58853202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	58853218	rs55913623	C	T	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=37;PP=1376;SC=TGATGACACACTTATTTTTCT;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=58853226;WS=58853202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	58853307	rs4774305	C	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=554;SC=AAACCAAAAACTATCTGAGAC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=58853315;WS=58853297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	58853363	rs1869129	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=248;SC=AAAGACATTACCGTGACACAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=58853371;WS=58853353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	58857230	rs4775080	G	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=636;SC=ACCCTCTTCCGTCACCCCCTG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=58857238;WS=58857220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	58857255	rs4775081	A	G	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=835;SC=TCACTGCCAGATGCCGGCCTG;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=58857263;WS=58857245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	58857378	rs17269397	A	G	3719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=63;PP=2316;SC=CTGCCAACAGATCTCCCAACA;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=130;WE=58857386;WS=58857368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	59144199	rs16940850	A	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1081;SC=AAATGTGATGATCATGGCTGG;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=59144207;WS=59144189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	59185929	rs4238332	T	C	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=189;SC=ACAAAGCTTATATCTGGATTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=59185937;WS=59185919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	59344483	rs11394653	G	GT	3524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=2248;ReadPosRankSum=-1.618;SC=GCCTTTAAATGTTTTTTCTTT;SOR=1.323;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=79;WE=59344491;WS=59344472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr15	59347929	rs1446239	C	A	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=20;PP=934;SC=GCCAGGGTTCCAGTTCTCATG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=59347937;WS=59347919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	59368167	rs7178935	G	A	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=34;PP=1657;SC=CATTGCCAGTGGACCTGAGCA;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=59368175;WS=59368157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	59373588	rs7181728	A	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=315;SC=ATGCACTTGTAGTCACAGCTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=59373596;WS=59373578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	59381847	rs7177112	A	G	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=29;PP=1573;SC=GATTTAGCCTATCTCTTCTGT;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=81;WE=59381855;WS=59381837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	59406581	rs8039514	T	C	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=15;PP=1213;SC=TTTAAGCCAGTTGGCTCTGCA;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=59406589;WS=59406571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	59415891	.	GC	G	383	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=58.95;NF=0;NR=2;PP=383;QD=204.0;SC=TGTATGTTGGGCGGGGGGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=2;WE=59415899;WS=59415881;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,2:0.15:13
chr15	59428814	rs13498	A	G	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=15;PP=1308;SC=ATTTTTATATATACAGTATAT;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=59428822;WS=59428804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	59445759	rs11071408	G	A	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=161;SC=GGAGCTTGCCGGCTTCATCCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=59445767;WS=59445749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	59450668	.	GC	TA	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=367;SC=TTTTTGAGAAGCTTGGATTCC;SOR=1.473;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=8;WE=59450677;WS=59450658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	59453384	rs2306791	T	C	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=31;PP=1006;SC=GGGAGCCCCCTGCACTCCAGG;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=59453392;WS=59453374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	59487930	rs2306786	C	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=377;SC=TTTCCGAAAGCTTTGCCGACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=59487938;WS=59487920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	59494673	rs2306787	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=637;SC=GCCTGCCTTTCTAGAGGATGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=59494681;WS=59494663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	59499228	rs3809529	C	T	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=58;PP=2512;SC=GCCCTGTGTCCGCGTCAAGCA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=124;WE=59499236;WS=59499218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	59499274	rs3809528	C	A	4161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=65;PP=2327;SC=GGCTCTTCACCCCCGTGAGCA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=126;WE=59499282;WS=59499264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	59515434	rs2306779	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=770;SC=TGGTCACCAGCTTTAAAAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=36;WE=59515442;WS=59515424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	59524056	rs7165587	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=860;SC=TACGCCAAACTTTCTCTAAGG;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=59524064;WS=59524046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	59528994	rs11356613	AT	A	152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=111;SC=GCAGAAAAGAATTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=59529002;WS=59528984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	59548475	rs4508371	C	T	7606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.410;SC=TAAGGATCTTCTTCATACCTG;SOR=0.324;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=93;TCR=126;TR=218;WE=59548483;WS=59548465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,280:1.00:281
chr15	59664607	rs7175010	C	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=280;SC=CCCCTGGCCCCGGCAGCGCGC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=59664615;WS=59664597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	59750930	rs11071448	G	A	4647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=87;PP=2965;SC=TTACATTATCGGAGAATGGTT;SOR=1.413;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=130;WE=59750938;WS=59750920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr15	59750960	rs7359171	A	G	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=72;PP=2470;SC=GGCAAGAGAAACACTATTGTG;SOR=1.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=22;TCR=72;TR=94;WE=59750968;WS=59750950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	59752053	rs3803445	G	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=672;SC=TGTATTTCCAGACTTCTCTGG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=59752061;WS=59752043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	59784334	rs4291860	C	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TTAAGTGTGCCTTAGGTGACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=59784342;WS=59784326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	59784493	rs4296198	C	T	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=36;PP=1703;SC=AGATTCGTGCCCGGGACAACA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=59784501;WS=59784483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	59784648	rs4417505	A	G	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=55;PP=1679;SC=AAACTCCATTATAGTGGGGAA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=91;WE=59784656;WS=59784638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	59799278	rs4278683	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=322;SC=GGAATTCATTTGAACCTCTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=59799286;WS=59799268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	59801233	.	A	AT	1475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=44;PP=1329;SC=CAATACTATGATTTTTTTCCT;SOR=4.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=44;WE=59801241;WS=59801223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	59911892	rs3743119	G	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=338;SC=TGCTATTAGAGTGTGGGTAAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=59911900;WS=59911882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	59931429	rs2306354	G	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=14;PP=579;SC=ACTATTTTAAGACTATCAAAA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=59931437;WS=59931419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	59931556	rs8033208	G	C	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=190;SC=GAGATACAAAGATGCTTAGCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=59931564;WS=59931546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	59944203	rs11637071	A	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=138;SC=ATATTTAATGATATCATTCAA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=59944211;WS=59944197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	59944300	rs4774340	T	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=13;PP=665;SC=CTGGGTCAAATAGTCCAAGAT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=59944308;WS=59944290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	59960155	rs6151570	G	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=484;SC=AGGAACTCTGGGTTCACCCTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=59960163;WS=59960145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	59960941	rs6151566	CCT	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=305;SC=ATGGCTTCTTCCTCTTTTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=59960950;WS=59960931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	59960980	rs6151565	C	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=456;SC=CACGCGCGCGCGCGCACAGTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=59960988;WS=59960970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	59961646	rs2307273	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=353;SC=TACAAAATAATAGTTGAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=59961654;WS=59961636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	59964798	rs4774342	C	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=533;SC=AATTAGCTCACAATTCTGTCC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=59964806;WS=59964788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	59972372	rs6151510	A	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=14;NR=4;PP=352;SC=TTTTTTGGACAAAGAAACGTG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=59972380;WS=59972362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	59981242	rs2306358	C	T	160.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=1;PP=89;SC=CCCCGGACGTCGTGGGCACGC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=59981250;WS=59981232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	59981515	rs3087328	A	G	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=51;PP=1882;SC=TGACCCGGACACAGTGAGAAG;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=59981523;WS=59981505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	59981590	rs754641	G	A	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=43;PP=1581;SC=GAGGCGGCGGGGGCGTGGCGG;SOR=1.006;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=59981598;WS=59981580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	59981719	rs754642	C	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=356;SC=TGTGGGCGGACCCGTCGCGTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=59981727;WS=59981709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	60298165	rs72739945	C	T	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=496;SC=CGCCCCCTCTCGTTCTCCTCC;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=60298173;WS=60298155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	60643302	rs3743269	T	C	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1404;ReadPosRankSum=0.133;SC=GTCCCCTTCCTCCATCCATGA;SOR=1.366;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=59;WE=60643310;WS=60643292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr15	60649579	rs5813020	TC	T	2210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=43;PP=1799;SC=GAATCTATACTCCTACCCCTT;SOR=1.942;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=44;WE=60649587;WS=60649569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	60656827	rs12898870	T	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=543;SC=TATATACTGTTTTCCAAACTG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=60656835;WS=60656817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	60674672	rs3759911	C	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=77;PP=2380;SC=ACTCAAATGACACACATTTAA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=119;WE=60674680;WS=60674662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	60678298	rs11855679	T	A	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1566;SC=GGAAAAAAAGTACAACAAAAA;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=60678306;WS=60678288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	60678328	rs11858864	C	T	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=35;PP=1697;SC=AAGAGGCTCTCCTTTACTCTG;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=84;WE=60678336;WS=60678318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	60678350	rs7182242	T	C	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=46;PP=1792;SC=AGCACAGCGATTCATTATGCT;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=60678358;WS=60678340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	60689877	rs12904258	A	G	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=171;SC=AGGGCTTCTTAGAGAAGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=60689885;WS=60689867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	60689927	rs12904756	G	C	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=5;PP=192;SC=CCGGCCCGAGGGCCGGTGGCC;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=60689935;WS=60689917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	60690089	rs12904657	A	G	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=29;PP=1013;SC=CAGCGTCTCCACACCCCGCTA;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=60690097;WS=60690079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	60720488	rs59228235	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=332;SC=TACAACTTTATCCTTCCTATG;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=60720496;WS=60720478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	60724009	rs146081505	A	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=197;SC=TACATTTGACATAATAATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=60724017;WS=60723999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	60724118	rs12437617	C	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=10;PP=378;SC=AGCAAAATGCCTAAAAAATAC;SOR=0.922;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=22;WE=60724126;WS=60724108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	60724317	rs60675189	T	TA	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=98;SC=ATACAAAAAATCTGAAACTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=60724325;WS=60724307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	60734697	rs1063100	A	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=9;PP=486;SC=CTTCAACTCCATAACAAGCTT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=60734705;WS=60734687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	60740915	rs1901993	C	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=502;SC=ATCAATAGATCGAAAAAATGA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=60740923;WS=60740905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	60742063	rs1869484	G	T	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=55;PP=1643;SC=AATTGGTAAAGTATTAGTAAA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=88;WE=60742071;WS=60742053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	60771289	rs3743267	A	G	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=93;PP=2965;SC=GCGCGCCCAAAAAAGACCATA;SOR=0.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=159;WE=60771297;WS=60771279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr15	60771438	rs11389291	G	GC	659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=696;SC=GCAGCGAAGTGCGAGACTGGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=60771446;WS=60771428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	60789798	rs11071539	G	T	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=74;PP=2965;SC=AGGCTCTTAAGGTAGACACCT;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=102;TCR=74;TR=176;WE=60789806;WS=60789788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr15	60797607	rs7171309	T	C	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=16;PP=1724;SC=CCTGATGACATTCATTCTTTA;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=60797615;WS=60797597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	60824108	rs10851682	T	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=49;PP=1329;SC=CTTATAAAAGTGTTCCCTGAT;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=73;WE=60824116;WS=60824098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	61521567	.	A	G	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9999;HP=2;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=27;QD=20.5904041824;SC=CGACCGGCGAAAGCAGGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=61521589;WS=61521557;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	61521579	.	AAA	GAG	69	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9999;HP=4;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=69;QD=40.8226249541;SC=GCAGGAGGGAAAAAGCAGGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=61521589;WS=61521557;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	62211450	rs963024	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=590;SC=CCATTTCTTGGTACACTGAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=62211458;WS=62211440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	62221592	rs28411984	A	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=593;SC=ATGTTTAAATATAAAAGACTA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=62221600;WS=62221582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	62228696	rs11071641	G	C	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=219;SC=TACTGAATTAGTTCATACCAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=62228704;WS=62228689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	62239304	rs7166891	A	T	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=76;SC=ACCAAAAGAAAACTCATGAGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=62239312;WS=62239294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	62239697	rs7172145	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=103;SC=AAAATTAGCACGTTCCCCTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=62239705;WS=62239687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	62243090	rs10639244	A	AATAT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=331;SC=ATATAAGGGTAATATAACTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=62243098;WS=62243080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	62244281	rs17238252	C	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=499;SC=GGAAGAAATTCACACAATGTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=62244289;WS=62244271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	62255172	rs17304010	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=353;SC=TCAACTCCCAATGGATAAATA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=62255180;WS=62255162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	62259637	rs3784634	C	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=735;SC=AAGGGGCTTCCTTTTGGATCC;SOR=1.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=62259645;WS=62259627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	62265507	rs11071645	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=314;SC=AAGAGACTCAGAGTCACACTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=62265515;WS=62265497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	62270765	rs3784632	G	A	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=19;PP=1053;SC=ATATATACACGTATATTACAC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=62270773;WS=62270755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	62456358	rs8040712	A	C	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=55;PP=1891;SC=GCGCCTCCGAACAGGCTCTCC;SOR=1.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=78;WE=62456366;WS=62456348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	62456945	rs8025811	G	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=772;SC=CTGCGAGCGCGGGTCCCAGTC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=62456953;WS=62456935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	62539151	rs7402021	T	C	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=3;PP=1065;SC=CATCCACCTCTCTGGCATTCT;SOR=3.788;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=43;WE=62539170;WS=62539141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	62539153	rs59880159	T	TGG	2587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=1518;SC=TCCACCTCTCTGGCATTCTAA;SOR=3.912;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=35;WE=62539170;WS=62539141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	62539162	rs2955803	A	C	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=17;PP=1820;SC=CTGGCATTCTAAGCCATCCCC;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=78;WE=62539170;WS=62539141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	62539185	rs2945418	T	C	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=31;PP=2092;SC=AGCCCTCTGATGCCAGTCCTG;SOR=1.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=77;TCR=31;TR=108;WE=62539193;WS=62539175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	62539781	rs2611797	A	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=24;PP=919;SC=GCTGGTTAGCATCAGGGGCTT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=62539789;WS=62539771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	62932586	rs6494334	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=32;PP=947;SC=AAGAGGGGGACGGTGGCCAGC;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=62932594;WS=62932576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	62936830	rs11852582	C	T	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=968;SC=CTCTCCTGTGCACCTTGCGGA;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=62936838;WS=62936820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	62939440	rs938979	T	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=2;PP=443;SC=ATTATTATCGTGAACATCAGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=62939448;WS=62939430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	62944448	rs10775179	G	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=366;SC=TTAACACGCCGAGTTCTGCCT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=62944456;WS=62944438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	62967342	rs1878785	A	G	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=19;PP=1202;SC=CACCACATACAGTAACTACCT;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=62967350;WS=62967332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	62967395	rs1878784	C	T	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=37;PP=1924;SC=TAACTGGTCCCGACCACTGTC;SOR=1.054;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=62967403;WS=62967385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	62967554	rs1878783	T	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=36;PP=846;SC=GTGTTCACCTTGGCCCCTTCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=62967562;WS=62967544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	62979016	rs12917611	A	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=448;SC=GCAGAGGGCAAGGAGAGCACT;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=62979024;WS=62979006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	62989775	rs8034474	T	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=794;SC=GTGCCTCTTTTAGTTGGCCTT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=62989783;WS=62989765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	62991210	rs9630428	C	T	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=627;SC=TGAGTCTTTGCCTCTCAGTTG;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=62991218;WS=62991200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	62994428	rs12594220	G	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=154;SC=CAATCACTCAGGTTCTGATGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=62994436;WS=62994418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	62994814	rs56013393	G	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=759;SC=GGATTTCACCGGGATGTCTTC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=62994822;WS=62994804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	63009733	rs938983	A	G	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=27;PP=1615;SC=ATGCATGTATATTGCATATGC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=72;WE=63009741;WS=63009723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	63009804	rs1320191	C	T	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=61;PP=2716;SC=CAGCGGCAGCCACACAGACCA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=137;WE=63009812;WS=63009794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	63014548	rs10775181	A	G	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=37;NR=29;PP=1278;SC=TCATCTCTCTATAGCCTGGAA;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=63014556;WS=63014538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	63030398	rs12900862	T	C	4744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=58;PP=2965;SC=TGCTTCTCTCTCTCCACGAAT;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=142;WE=63030406;WS=63030388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr15	63044379	rs7171264	A	G	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=15;PP=1812;SC=AATCCAAATAAAGGAGAAAAT;SOR=2.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=63044387;WS=63044369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	63047793	rs4775538	C	T	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=75;PP=2965;SC=CCTGCCGCATCGCCTCATCCA;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=160;WE=63047801;WS=63047783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr15	63055658	rs10152548	T	A	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=503;SC=GAGGTGACTGTGTCAGGGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=63055666;WS=63055648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	63075918	rs111436593	CTCTGTGTG	CTG,C	1068.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=14,15;NR=4,4;PP=10,728;SC=ATGCGTTTCTCTCTGTGTGTG;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=18,19;WE=63075933;WS=63075908;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:29
chr15	63340647	rs4374117	A	G	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=40;PP=1193;SC=GGGCGCCGCCATCGCACAGAG;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=63340655;WS=63340637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	63349096	rs4775613	G	A	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=28;PP=1686;SC=CTTCCTATCTGAAATCAGCAT;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=63349104;WS=63349086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	63351687	rs4775614	A	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=10;PP=1191;SC=AAGCCTCACAAGCCACAGCAG;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=63351695;WS=63351677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	63351840	rs1071646	C	A	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=61;PP=2025;SC=TGAAAGAGGCCAAGCACATTG;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=103;WE=63351848;WS=63351830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	63353760	rs4774472	C	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=3;PP=999;SC=TCCTGGAAAACCTAAACATTT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=63353768;WS=63353750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	63363401	rs201620283	C	CATTTTGTTTT	788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=679;SC=CACATTCTTTCGTTTTGTTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=63363409;WS=63363391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	63413997	rs8182083	C	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=265;SC=CCGCCCCCTGCCCTTCCCTCC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=63414005;WS=63413987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	63414083	rs34317102	A	C	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=27;PP=1218;SC=GTACCGGCTCATGTCAGCAGT;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=69;WE=63414091;WS=63414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	63414723	rs189796619	TGG	CTC	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=1086;SC=GGGGCCCAGGTGGAGGGGGCG;SOR=2.753;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=22;WE=63414733;WS=63414713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	63433766	rs2729835	G	A	6909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=101;PP=2965;SC=GTTGTGGAAAGGAAACAAACG;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=98;TCR=101;TR=199;WE=63433774;WS=63433756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr15	63434110	rs8468	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=661;SC=TAGAGTATAACTGAATGCAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=63434118;WS=63434100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	63449543	rs7170846	A	C	6022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=59;PP=2965;SC=TCCGTCCCATATGACTCTCGG;SOR=1.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=133;TCR=59;TR=192;WE=63449551;WS=63449533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr15	63449680	rs2292038	C	G	6424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=118;PP=2965;SC=GATCTGCGCTCGGCATCAACT;SOR=1.224;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=189;TCF=70;TCR=119;TR=188;WE=63449688;WS=63449670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr15	63515946	rs11632192	A	G	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=260;SC=GTTAAGTGACACATGACTGTA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=63515954;WS=63515936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	63516266	rs17828874	G	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=1073;SC=TCAAAACAAGGAAATGCTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=63516274;WS=63516256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	63554824	rs72363505	GTA	G	147.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=118;SC=ATATATATGTGTATATATATA;SOR=1.022;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=63554833;WS=63554814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	63639016	rs2270764	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=431;SC=TCTTTTCTGAATCCCCGGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=63639024;WS=63639006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	63848805	rs3751043	C	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=29;PP=1038;SC=TTTATTCTTTCACCTGTGGTG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=63848813;WS=63848795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	63915786	rs11630290	C	T	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=381;SC=GTATCACTAACAGCATCACTT;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=63915794;WS=63915783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	63918307	rs1140422	G	C	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=65;PP=1602;SC=CCCCATACTGGGGGGGCACTG;SOR=2.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=14;TCR=65;TR=79;WE=63918315;WS=63918297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	63921152	.	CT	C	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9997;HP=17;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=58.19;NF=0;NR=2;PP=26;QD=14.5;SC=AAAACACATTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=63921160;WS=63921142;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr15	63922752	rs10851731	T	A	6153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=99;PP=2965;SC=CCACATCTTCTATGATTACTC;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=174;WE=63922774;WS=63922742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr15	63932513	rs2228517	G	C	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=51;PP=2223;SC=CAGGGTCAGGGAGACAGTTCT;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=104;WE=63932521;WS=63932503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	63935149	rs10519223	A	G	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=37;PP=2545;SC=TATAACTACAATATTACCTTT;SOR=1.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=115;WE=63935157;WS=63935139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	63937209	rs2229749	C	G	8016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=119;PP=2965;SC=TTGATTCCTGCTCCCACCATC;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=128;TCR=119;TR=246;WE=63937217;WS=63937199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr15	63953153	rs2272209	A	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=27;PP=1578;SC=AAAATAAAGAAGCTCTCAAAA;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=63953161;WS=63953143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	63954029	rs2228511	C	T	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=34;PP=1653;SC=ACAGGTAGTACGGATTTCCAC;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=63954037;WS=63954019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	63958762	rs1815130	T	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=888;SC=CCTAGTATTGTCCAAGTTTAA;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=63958770;WS=63958752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	63970456	rs2228510	T	C	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=52;PP=2002;SC=AGGATACGGATGAGCTGAATA;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=63970464;WS=63970446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	63982018	rs11636604	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=293;SC=ATACCAGTGTTCAACAGCTAC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=63982026;WS=63982008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	63984772	rs11630720	T	C	4845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=85;PP=2654;SC=GCAGCTACAGTGAAGAGACAA;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=72;TCR=85;TR=157;WE=63984780;WS=63984762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr15	63988357	rs2255243	C	G	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=10;PP=1370;SC=CTCTCCCTTGCCTCCTGTGTG;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=63988365;WS=63988347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	63998914	.	CTT	C	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=51;QD=18.6666666667;SC=TTACTATGCTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=63998923;WS=63998904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr15	63999112	rs72750987	G	C	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=221;SC=TATTAGAATAGAAATTCATGT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=63999120;WS=63999102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	64017798	rs11632718	A	G	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=314;SC=CCGTACTGCAATAAGATACTG;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=64017806;WS=64017788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	64020073	rs9920746	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=25;PP=784;SC=GGGACAATTGCTTCAAATGAA;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=64020081;WS=64020063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	64039050	rs8034675	T	C	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=257;SC=GTTGAATATATTGTATAGCTA;SOR=1.519;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=64039058;WS=64039040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	64039879	rs11631436	G	A	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=12;PP=814;SC=ACACACGCGCGCGCACACACA;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=39;WE=64039887;WS=64039869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	64048990	rs2271241	T	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=738;SC=TCTGTGAGTATCAAAGTATAA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=64048998;WS=64048980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	64050300	rs12912999	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=8;PP=907;SC=AAAATACTCAGTATTATTTAA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=64050308;WS=64050290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	64056437	rs3764186	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=44;PP=1550;SC=GGGAGAGACATATGCATTAAA;SOR=1.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=64056445;WS=64056427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	64214954	rs920762	G	C	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=24;PP=1163;SC=CAGCCTGCCAGAAATTCCTCA;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=64214962;WS=64214944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	64215375	rs4776669	G	C	7144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=126;PP=2965;SC=ATCCCAGGTCGACCCGAGCCA;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=99;TCR=126;TR=225;WE=64215383;WS=64215365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr15	64283625	rs7168753	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=479;SC=CCTCGTTTCATGAGCCTGTTT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=64283633;WS=64283615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	64365340	rs4622459	C	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=687;SC=GAACTTAAACCTGTTTTTGGC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=64365348;WS=64365330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	64367775	rs332234	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=406;SC=AAAACATTAATGCATTCTAAG;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=64367783;WS=64367765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	64385851	rs332259	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=7;PP=1386;SC=TACCATAAACTTCTAGCGCTT;SOR=3.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=56;WE=64385859;WS=64385841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	64410484	rs2290117	G	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=806;SC=TTTAGATATTGAGGACTGTGT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=64410492;WS=64410474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	64418221	rs2290119	C	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=797;SC=GGATGACTTTCAAGATACCAT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=64418229;WS=64418211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	64418397	rs1130603	G	A	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=65;PP=2157;SC=TTGTCCCTCCGCCCCCGGAGA;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=125;WE=64418405;WS=64418387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	64418483	rs2290121	C	T	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1398;SC=AAAATTCACTCACTGTTCAGT;SOR=1.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=64418491;WS=64418473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	64428657	rs2290122	G	A	6159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=111;PP=2965;SC=TGCTTGTTTTGGGAGTACTCT;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=83;TCR=111;TR=194;WE=64428665;WS=64428647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr15	64445681	rs34975001	GC	G	1399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=1287;SC=GGGTGGAGGGGCTTTTTTTTG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=64445689;WS=64445671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	64448365	rs2253557	C	T	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1031;SC=AAGGTGGAAGCAGGAGGGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=64448373;WS=64448355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	64675313	rs11635527	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=135;SC=ATGAATTGCTCGAACTTAGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=64675321;WS=64675303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	64693149	rs11380356	G	GT	718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.31;QD=27.64;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	64706259	rs2046356	G	A	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=21;PP=1866;SC=ACCAATTGTTGCATCCTTTTG;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=64706267;WS=64706249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	64737103	rs7167394	G	C	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	64737225	rs7167612	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=8;PP=530;SC=TCAGTCAAGAGTCTGATTCTC;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=64737233;WS=64737215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	64742670	rs7172012	T	A	223.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=0.385;SC=CTCAGAGCTTTGAGTTCCTGC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=64742678;WS=64742660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr15	64915106	rs525878	C	T	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=82;PP=2965;SC=TCTCATCTCCCTGTGAGCAGA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=137;WE=64915114;WS=64915096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	65033311	rs6494489	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=27;PP=1238;SC=GGAGGAACTACGGCCCTTCAG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=65033319;WS=65033301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	65040928	rs12911708	C	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=744;SC=CACGTTAAATCGGCCTGTCAT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=65040936;WS=65040918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	65041622	rs6494493	C	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=46;PP=1916;SC=TGTTCTCCACCTACTCACGTT;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=96;WE=65041630;WS=65041612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	65054562	rs57945504	T	TG	4415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=32;PP=2957;SC=TGGGGATGGGTGCTGGAGCAG;SOR=1.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=77;WE=65054579;WS=65054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	65054571	rs71133474	A	AG	4821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=43;PP=2936;SC=GTGCTGGAGCAGGCCCAGCCA;SOR=1.458;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=87;WE=65054579;WS=65054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	65108479	rs8036568	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=17;PP=1227;SC=CCCTTTGTCTTCTCTTTGTGG;SOR=1.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=65108487;WS=65108469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	65113493	rs1872592	G	A	7081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=105;PP=2965;SC=GGAGAGGAGCGTGGGGTGCTT;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=126;TCR=105;TR=231;WE=65113501;WS=65113483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr15	65116210	rs191345285	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=462;SC=CGGTCTGGGGGGCAGTCCGAG;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=65116218;WS=65116200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	65116328	rs12899195	A	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=353;SC=CGCGCAGAGGAAAGCAGCGCG;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=65116336;WS=65116318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	65153595	rs832885	G	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=325;SC=ACTGACCCTGGCTCTGAGCCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=65153603;WS=65153585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	65153690	rs12595292	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=996;SC=AGGTGGACAAGAGCTGCGCCC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=65153698;WS=65153680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	65153933	rs35667779	G	A	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=35;PP=987;SC=TGTGTTACACGTGCTCAGGGT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=65153941;WS=65153923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	65157085	rs371213556	T	TC	838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=7;PP=639;SC=CCATATACCATCCCCCCCACC;SOR=1.942;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=22;WE=65157093;WS=65157075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	65157482	rs2010875	C	T	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=64;PP=2965;SC=GAGTGCAGAACCGTCCCAGGC;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=153;WE=65157490;WS=65157472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr15	65158562	rs71396439	C	T	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=43;PP=1643;SC=TCAAAGCCAGCCCCTCCTCCC;SOR=0.936;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=77;WE=65158570;WS=65158552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	65208227	rs1471834	G	A	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1296;SC=AGGGAGGCTCGGGCTCTGTCC;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=65208235;WS=65208217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	65209880	rs2056497	A	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=263;SC=ATTCTGTTTTACTCCTGTACA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=65209888;WS=65209870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	65222875	rs7168400	T	C	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=12;PP=1215;SC=GCTTGGCCCTTGAATCTGCCC;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=65222883;WS=65222865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	65268979	rs4776255	C	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=520;SC=GACTCAAACACTGACATTTCT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=65268987;WS=65268969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	65273399	rs4776659	T	C	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=37;PP=1097;SC=GTGGAAAACCTTATAAATTTG;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=65273407;WS=65273389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	65298672	rs4776660	G	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=606;SC=GGAACAGACCGTAAACATGAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=65298680;WS=65298662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	65315961	rs4776661	T	C	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=14;PP=1370;SC=CAGGCTGACATCAACATTTAA;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=65315969;WS=65315951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	65344035	rs2946676	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=549;SC=TCACTTAGGGGTCATTGCTGT;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=65344043;WS=65344025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	65347405	rs2232762	G	A	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=69;PP=2866;SC=CATGCCGCGCGGTGAGCGGGG;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=65347413;WS=65347395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	65357491	rs2232753	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=7;PP=765;SC=CCCACGGGGTGGGTCCCAGGA;SOR=2.247;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=33;WE=65357499;WS=65357481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	65369395	rs2919358	C	T	8630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=116;PP=2965;SC=CTGCTGCAGGCCGTGGAGTGC;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=273;TCF=157;TCR=116;TR=273;WE=65369403;WS=65369385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr15	65369531	rs2946642	G	T	6842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=127;PP=2965;SC=ACAGTGCCGCGCTCTTCATCT;SOR=1.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=74;TCR=127;TR=201;WE=65369539;WS=65369521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr15	65369951	rs2919359	A	G	6389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=83;PP=2965;SC=TCGGCGGCGAATTCCAGAGGA;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=106;TCR=83;TR=189;WE=65369959;WS=65369941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr15	65370353	rs2919360	T	C	7154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=129;PP=2965;SC=TGGTGCGCGGTGACACCGTCT;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=90;TCR=130;TR=219;WE=65370361;WS=65370343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr15	65449169	rs2946670	C	T	8491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=117;PP=2965;SC=GAACAAAATACTCAACTGCTT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=150;TCR=117;TR=267;WE=65449177;WS=65449159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr15	65477368	rs76636977	C	T	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=31;PP=1335;SC=CAGTCCACCCCCCCCCCGACA;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=65477376;WS=65477358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	65489128	rs938952	C	T	3732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=59;PP=2335;SC=ACCACTCCACCCTGGCGCTGG;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=65489136;WS=65489118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	65489688	rs2679117	T	C	10265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.109;NF=165;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CCCCACTGTCTGCCGATGAGT;SOR=0.838;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=166;TCR=136;TR=300;WE=65489696;WS=65489667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,382:0.99:384
chr15	65490901	rs2679118	T	C	5942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=87;PP=2965;SC=GTGATGGGCTTTTTCCGACGA;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=96;TCR=87;TR=183;WE=65490909;WS=65490891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr15	65494212	rs2073711	A	G	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=583;SC=AGGCTTACCTATGACAATCAG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=65494220;WS=65494202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	65495820	rs2072048	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	65495827	rs2073707	A	G	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	65496475	rs2585035	T	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=602;SC=GATAATATAGTGCCATGTGGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=65496483;WS=65496465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	65496587	rs2585034	C	T	4385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=47;PP=2684;SC=ACCAGCCCTACCCCAAAGAAT;SOR=1.261;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=130;WE=65496595;WS=65496577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	65497849	rs2681038	A	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=880;SC=CTCTTGAGGGAACTCTGTCAG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=65497857;WS=65497839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	65497891	rs68021609	G	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=370;SC=TTCTTCTCTGGTAAAGACAAG;SOR=2.400;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=65497899;WS=65497881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	65621138	rs11853777	G	A	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=25;PP=1891;SC=GGATAGAAATGCTGGGGAGCC;SOR=1.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=89;WE=65621146;WS=65621128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	65621441	rs12907128	C	A	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=45;PP=1668;SC=AGTGGCAGCACGGAGAGCTGG;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=87;WE=65621449;WS=65621431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	65621857	rs509652	T	C	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=37;PP=2062;SC=CATTTAGGGCTAGAATGCCAG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=65621865;WS=65621847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	65623124	rs3058049	C	CTCTA	1620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=1267;SC=CCAGTGGAAGCTCTATCTTTC;SOR=1.802;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=22;WE=65623132;WS=65623114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	65624228	rs686739	G	C	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=53;PP=2604;SC=TCCAGGCCCCGCTTTCCCTGC;SOR=0.944;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=65624236;WS=65624218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	65667724	rs666623	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=617;SC=ATGCCAGTTCAGCAGAGTGGC;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=65667732;WS=65667714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	65676617	rs2292933	T	C	4511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=80;PP=2542;SC=CAGGAGCCTCTGGAGGCAGGG;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=145;WE=65676625;WS=65676607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	65676726	rs33918653	C	T	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=64;PP=2456;SC=CTGGTTCCTGCAGGCTGGGGG;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=123;WE=65676734;WS=65676716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	65678141	rs7183130	A	T	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=10;PP=378;SC=TATTTAGAAAAGAGCCGCAAT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=65678149;WS=65678131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	65684422	rs3216754	T	TC	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=857;SC=ACTTGCCCAGTCCCCACTGAA;SOR=1.179;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=21;WE=65684430;WS=65684412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	65684513	rs148990036	C	T	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=12;PP=629;SC=CTTCTTGAGCCGGACAGGCCC;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=65684521;WS=65684503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	65686908	rs12437686	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=418;SC=GAACATCAGCATGAGCTCTGC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=65686916;WS=65686898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	65688558	rs35517676	C	CT	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=288;SC=GTCTCTGCCCCCCCCCCAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=65688566;WS=65688548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	65688824	rs1550028	C	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=351;SC=CCTGCCCTCCCATATGTCCCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=65688832;WS=65688814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	65689267	rs12442757	T	C	6041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=68;PP=2965;SC=GGGCTGCGCGTTGGCAATTAG;SOR=1.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=107;TCR=68;TR=175;WE=65689275;WS=65689257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr15	65782451	rs60062953	A	AT	1739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1703;SC=AAGATTTAGAACTGTGCACTT;SOR=5.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=38;WE=65782459;WS=65782441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	65792839	rs11071846	G	A	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=3;PP=979;SC=CTTTGTTGGTGGGTAAACTGA;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=38;WE=65792847;WS=65792829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	65804213	rs352478	C	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=187;SC=ACATATTTAACATAGGCAGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=65804221;WS=65804203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	65804537	rs352477	A	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=8;PP=302;SC=GTCACTGATTAATTTATTCAT;SOR=1.445;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=65804545;WS=65804527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	65822777	rs452306	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=384;SC=AGGCCCGCTGCTGGCGCCGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=65822785;WS=65822769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	65822823	rs422390	C	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=6;PP=1089;SC=GCGCGGCCCGCGAGCGTGGGG;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=65822831;WS=65822813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	65994733	rs17810074	C	T	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=81;PP=2965;SC=GACAGACTTTCACATAAGCTG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=189;WE=65994741;WS=65994723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr15	66207857	.	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=192;ReadPosRankSum=0.189;SC=AACAGGTGCCGGTGACATGGT;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=16;WE=66207865;WS=66207847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr15	66257236	rs36088570	C	CA	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=265;SC=CGCCCATTCCCAGCTCATACC;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=66257244;WS=66257226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	66257408	rs333550	T	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=19;PP=769;SC=GCAGTCACAGTGCTGTGAGCA;SOR=0.970;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=44;WE=66257416;WS=66257398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	66274690	rs551474	T	C	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=40;PP=1400;SC=GGGTGCCAGGTGCGCAGAGCT;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=78;WE=66274698;WS=66274680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	66386853	rs7168565	G	A	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=36;PP=1476;SC=ATGGGGAGAGGGAGGAAGAAC;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=66386861;WS=66386843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	66585907	rs75040294	C	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.30;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	66601254	rs8025589	G	T	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=516;SC=AGATCCCTTTGGTAACACAGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=66601262;WS=66601244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	66604032	rs28616181	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=692;SC=ACCTTCTGACCGTGTTTCTCT;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=66604040;WS=66604022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	66612818	rs750295	A	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=1;PP=562;SC=CTTGGAACCCAGTATTGTTTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=66612826;WS=66612808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	66618342	rs3803412	A	G	6791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=107;PP=2965;SC=AAAGACTTGGATGAGAAGAGC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=91;TCR=107;TR=197;WE=66618350;WS=66618332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr15	66625248	rs375879175	C	T	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=56;PP=1859;SC=ACCATGTAACCGTAAGTCTGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=83;WE=66625256;WS=66625238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	66644521	rs9806123	C	G	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=35;PP=1472;SC=TGGAGGTACACGAACAGGTGC;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=75;WE=66644529;WS=66644511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	66645341	rs28614039	A	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=24;PP=879;SC=AATAGTCTCCACTATATAGAC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=66645349;WS=66645331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	66694431	rs16949879	A	G	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=812;SC=TGTGGTTACTACATTGTTCCA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=66694439;WS=66694421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	66727597	rs16949924	G	C	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=55;PP=1359;SC=TTGATTAACAGGTAATTGGAT;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=81;WE=66727605;WS=66727587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	66735551	rs6494573	C	T	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=23;PP=1442;SC=CAGCCACAGCCGAAAGTTATC;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=66735559;WS=66735541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	66745890	rs7169326	G	A	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=26;PP=1125;SC=CAGTGAGTAGGTGATTCCTGG;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=66745898;WS=66745880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	66792761	rs28706938	A	G	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=45;PP=1609;SC=AATCAACCAAAGAACAGGAAG;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=66792769;WS=66792751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	66793480	rs11071895	C	T	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=19;PP=1029;SC=AGCCTGTATTCCAACAAAAGA;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=66793488;WS=66793470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	66793677	rs12101954	G	C	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=52;PP=1974;SC=GACTTGCAGAGTATACCTAGT;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=66793685;WS=66793667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	66795937	rs28673176	C	T	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=41;PP=1378;SC=CATACGCCAACAATACCATTA;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=67;WE=66795945;WS=66795927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	66795980	rs8043062	A	G	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=712;SC=TGGTATGGTGAGGCAAACAAC;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=66795988;WS=66795970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	66796911	rs139436991	GC	G	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=2;PP=572;SC=TTCCACTACTGCTTCCCGGCG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=66796919;WS=66796904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	66806308	rs4238406	C	T	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=31;PP=1467;SC=TAATGTTGCTCGATACCTGTT;SOR=1.067;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=79;WE=66806316;WS=66806298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	66806517	rs4420479	G	A	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=AATCAGCATCGGTGAAAATGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=66806525;WS=66806507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	66815908	rs28509265	A	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=323;SC=TCCTTTATGAAATATATTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=66815916;WS=66815898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	66816183	rs6494579	C	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=329;SC=CTCAAAACTTCTTCAGATGTT;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=66816191;WS=66816173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	66821174	rs6494580	G	C	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=32;PP=2097;SC=TTCTCTGAAGGTTGCTTCTTT;SOR=1.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=66821182;WS=66821164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	66824526	rs4488397	A	T	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=6;NR=1;PP=136;SC=CTTCTCTTTTACTTGTTGGGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=66824534;WS=66824516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	66874670	rs8041988	C	T	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=29;PP=1064;SC=AGAGTGTGAGCTGTGAATGGA;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=66874678;WS=66874660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	66976149	rs2414910	G	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=243;SC=TCCAAAGGGAGCTCTGTCCCA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=66976157;WS=66976139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	67008708	rs2278603	G	A	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.947;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=40;PP=2361;ReadPosRankSum=-1.179;SC=GAAGAAAAAAGAGAGCGCTGC;SOR=1.628;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=85;TCR=43;TR=122;WE=67008716;WS=67008697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,128:0.96:134
chr15	67009941	rs2469123	C	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=65;PP=1855;SC=CTGCTCATGGCTGCCTGGCCA;SOR=2.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=81;WE=67009949;WS=67009931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	67234251	rs266383	A	G	4048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=59;PP=2422;SC=TTCACCCAGAACAGTTTCTCC;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=110;WE=67234259;WS=67234241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	67391394	rs5813427	GT	G	3618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=56;PP=2727;SC=CCTTTCTGTGGTTGCCGCCCT;SOR=1.090;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=66;WE=67391402;WS=67391384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	67391497	rs1866319	C	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.64;NF=0;NR=13;PP=340;SC=CTCTTGTTCACAGTCACAGGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=67391505;WS=67391487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	67430223	rs1866318	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=10;PP=711;SC=TTGGATTTCTTCTGTCTGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=67430231;WS=67430213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	67435075	rs745103	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=8;PP=534;SC=ACTGTGCTAAGTAACAGTGGA;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=67435083;WS=67435065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	67457335	rs1065080	A	G	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=28;PP=1928;SC=ACCACGAGCTACGGGCCATGG;SOR=1.561;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=88;WE=67457343;WS=67457325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	67457485	rs2289261	G	C	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=42;PP=2001;SC=ACCTCTCCCCGGCTCCCCATC;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=67457493;WS=67457475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	67596815	rs10438290	T	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=30;PP=992;SC=GTTGTTTTAATGAGCTCTTAT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=67596832;WS=67596805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	67692502	rs7495023	T	C	6362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=94;PP=2965;SC=AAATACAGCGTTGGCTCTTTA;SOR=0.870;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=113;TCR=94;TR=207;WE=67692510;WS=67692492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr15	67768151	rs3985641	G	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=52;PP=1804;SC=TGGCTATGATGTTGAGGTATG;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=67768159;WS=67768141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	67782440	rs10574862	AGGAAAT	A	4005.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=46;PP=2945;SC=CAATAAGCTAAGGAAATAGAC;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=67782453;WS=67782430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	67872983	rs7172298	T	C	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=160;SC=TCAAGGCTGATATGTATATAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=67872991;WS=67872973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	67879418	rs28730805	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=465;SC=TTTAGACTGGGTGCTGAGAAG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=67879426;WS=67879408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	67885058	rs28637534	T	C	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=127;SC=TTATTGCTTTTGATTACTAAC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=67885066;WS=67885048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	67951228	rs5813451	GA	G	3724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.47;NF=4;NR=98;PP=2104;SC=AACTTCTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=2.320;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=4;TCR=107;TR=102;WE=67951236;WS=67951218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	67962763	rs35395156	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=16;PP=652;SC=TTTAGCAAACAAAGACCTGTG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=67962771;WS=67962753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	67984705	rs4343227	G	A	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=33;PP=2965;SC=ATTTCGGATTGAGCAGATGAT;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=117;TCR=33;TR=150;WE=67984713;WS=67984695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	67985720	rs66548496	TA	T	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=182;SC=ATTGCCTTTGTAGATAAATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=67985728;WS=67985710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	67985931	rs8034680	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=23;PP=603;SC=GCAAAAATAATGTTTAAAACC;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=67985939;WS=67985921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	68040775	rs28730809	G	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=773;SC=GAGCATCAATGTTTTTATAAG;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=68040783;WS=68040765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	68041070	rs8037011	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=329;SC=GCTCTGAGCTATGTTACGTGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=68041078;WS=68041060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	68124665	rs72751453	C	A	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=74;PP=2410;SC=GAAGCTGGAACGGGAATTTCA;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=34;TCR=74;TR=108;WE=68124673;WS=68124655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	68346549	rs11855475	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=312;SC=GGGCGGAGGCTAGAGGCGGGC;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=68346557;WS=68346539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	68434212	rs113300929	T	TG	418.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=16.564;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=2.086;SC=GACATGTGTGTTTTTTTTTTT;SOR=5.418;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=13;WE=68434220;WS=68434202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr15	68445912	rs11633620	T	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=22.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=642;ReadPosRankSum=1.153;SC=TGTTTTCTACTTCTTTTTTTT;SOR=3.471;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=39;WE=68445920;WS=68445902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
chr15	68492028	rs11071986	G	A	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=61;PP=1973;SC=CTCTGCACACGGCCCAGAGGG;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=109;WE=68492036;WS=68492018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	68510770	rs8025947	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=918;SC=TCAGTTTACTAGGAGATAAAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=68510778;WS=68510760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	68522090	rs144971454	GGCGGAGCGGA	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=61.34;NF=0;NR=4;PP=583;SC=CCCGGGGCGGGGCGGAGCGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=68522107;WS=68522080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	68583175	rs6494729	T	C	7377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=116;PP=2965;SC=TGGCTGTCAATTCCAATACTC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=109;TCR=116;TR=225;WE=68583183;WS=68583165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr15	68603625	rs898591	C	T	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=22;PP=930;SC=AGGCCATCACCACCTCGTCCG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=68603633;WS=68603615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	68605067	rs4776394	A	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=9;PP=574;SC=GGGGGTGCTCAGATCCCGTCC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=68605075;WS=68605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	68605169	rs4777035	G	A	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=37;PP=1782;SC=CGAGCTGTTGGGCTTGACCTC;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=68605177;WS=68605159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	68608095	rs79232487	T	C	6010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=124;PP=2965;SC=TGTCTGGGCATTGCTGGGACC;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=62;TCR=124;TR=186;WE=68608103;WS=68608085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr15	68609833	rs1516871	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=417;SC=TATGAAAGCCTGGACCACAGC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=68609841;WS=68609823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	68613566	rs72741168	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=497;SC=ATATTACAGAAGAGACTTTCC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=68613574;WS=68613556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	68613778	rs3736494	G	T	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	68613787	rs3736493	A	G	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.20;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	68613922	rs8041788	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=341;SC=GCTCTGTCTCCACCACACTAG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=68613930;WS=68613912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	68641362	rs61119953	AG	A	741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=567;SC=CTCTCTTTCGAGGGGGGGCTC;SOR=3.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=68641370;WS=68641352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	68649587	rs12907890	G	A	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=60;PP=2169;SC=ACCTGTAGTCGTTGAGGTGAA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=111;WE=68649595;WS=68649577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	68656864	rs2306013	A	G	192.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=97;SC=CCGGAATGGCATAAGCAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=68656872;WS=68656854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	68656960	rs2306012	A	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=8;PP=429;SC=CAGGATGGACATGAGGGTGTG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=68656968;WS=68656950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	68695448	rs4777049	T	C	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=65;PP=2102;SC=TCAGGACCCATTGGCAGGTCA;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=68695456;WS=68695438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	68724262	rs2305078	G	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=29;PP=1043;SC=CTGGGAGGAGGGTCGCGTCCC;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=59;WE=68724270;WS=68724252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	68987315	rs11072043	A	C	183.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=2;PP=156;SC=TGTGGCCCAGACTGACTTGGC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=68987323;WS=68987305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	68987341	rs7359311	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=10;NR=3;PP=291;SC=AGGGCCCAAAAACAAAAATAA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=68987349;WS=68987331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	69003871	rs3736272	G	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=15;PP=947;SC=CCATGCATCTGCCCTCGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=69003879;WS=69003861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	69007656	rs1542746	T	G	5093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=107;PP=2965;SC=CCTAGGTAAGTGGCCCCGAGG;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=50;TCR=107;TR=157;WE=69007664;WS=69007646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr15	69011119	rs33913544	C	T	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=58;PP=1800;SC=AGGGCCTGATCGAGCCCATCT;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=88;WE=69011127;WS=69011109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	69011389	rs1491640	A	G	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=2.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	69011394	rs1491639	C	T	3511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=2.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	69112946	rs4777089	C	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=7;PP=270;SC=CGCCCCCCCCCAAAAAAAGTG;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=12;WE=69112954;WS=69112936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	69112971	rs35802209	G	GCA	590.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=3.468;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.560;NF=10;NR=6;PP=665;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CCCCCAGCGCGCACACACACA;SOR=0.707;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=16;WE=69112979;WS=69112961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr15	69238445	rs3743093	G	A	7424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=119;PP=2965;SC=ACTGGCATTGGGATCTCTACA;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=104;TCR=119;TR=223;WE=69238453;WS=69238435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr15	69325581	rs311893	C	T	6345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=91;PP=2965;SC=CCAAGGGCTGCGGCCAGTGCC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=98;TCR=91;TR=189;WE=69325589;WS=69325571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr15	69327825	rs311889	C	T	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=86;PP=2889;SC=TCGTGCACACCGTGGCTCACA;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=59;TCR=86;TR=145;WE=69327833;WS=69327815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr15	69328226	rs12907196	C	T	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=47;PP=1977;SC=GCTGCTCCTCCTCATGTTCAT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=103;WE=69328234;WS=69328216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	69329623	rs34924807	GA	AG	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=20;PP=1086;SC=GGAGCAGCTGGATACCCTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=25;WE=69329632;WS=69329613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	69347593	rs311905	G	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=935;SC=AAGCCCCAGGGTAAGGTAGTG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=69347601;WS=69347583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	69349087	rs311906	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=11;PP=324;SC=TCTGCTTCATTGCATTAGTAT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=69349095;WS=69349077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	69561518	rs3865014	G	A	4347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=69;PP=2845;SC=TGAGTCCCCAGTCTTCAAAGA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=142;WE=69561526;WS=69561508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr15	69676892	.	A	G	199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=47.7;NF=10;NR=2;PP=199;QD=19.4809343789;SC=CGTGTTCATCATGGAGGGTGA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=69676912;WS=69676882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	69676904	.	C	T	316	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=4;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=50.76;NF=13;NR=2;PP=316;QD=23.3847475031;SC=GGAGGGTGAGCGGGCCCTCCG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=15;WE=69676912;WS=69676882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr15	69676944	.	T	C	710	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=56.73;NF=27;NR=8;PP=710;QD=21.2791775013;SC=GCGGGTCCTCTGTGTTCATGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=35;WE=69676952;WS=69676934;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr15	69683945	rs2242464	C	G	4768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=47;PP=2965;SC=AACCTGGACACTCTTGGACCT;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=100;TCR=47;TR=147;WE=69683953;WS=69683935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	69684376	rs7183388	G	A	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=1434;SC=AGCCCGGGCAGTGGAGCCAAG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=69684397;WS=69684366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	69684389	rs11634798	A	T	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=42;PP=1586;SC=GAGCCAAGAAAAAAAAGAAAT;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=69684397;WS=69684366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	69684477	rs58280155	T	A	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1335;SC=GCTGGTTTTATTTTATTTTTT;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=69684489;WS=69684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	69684481	rs112633523	AT	A	1864.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=38;PP=866;SC=GTTTTATTTTATTTTTTTTTG;SOR=1.318;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=42;WE=69684489;WS=69684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	69684507	rs11634850	A	G	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=981;SC=AGTAGAGACAAGGTTTCGCCA;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=69684515;WS=69684497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	69709686	rs3759825	G	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=26;PP=1827;SC=GCAAAAGGTCGAACTTTCTTC;SOR=1.469;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=69709694;WS=69709676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	69715488	rs7180624	C	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=140;SC=TTGAACTTTTCTTTTTTTAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=69715496;WS=69715478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	69728949	rs3825858	A	G	6143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=88;PP=2965;SC=CACCTTTGCCATCATGCGAAA;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=201;WE=69728957;WS=69728939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr15	69732483	rs4776448	G	A	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=94;PP=2960;SC=AGTTAGGTTCGATATTTTGAA;SOR=1.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=36;TCR=94;TR=130;WE=69732491;WS=69732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	69732736	rs937724	C	T	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=71;PP=2775;SC=CTATTGTTACCGAACCTAAAA;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=138;WE=69732744;WS=69732726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	69740350	rs13613	A	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=644;SC=CTTGTATAGTATATGTTTTGC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=69740358;WS=69740340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	69747675	rs1463911	A	T	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=21;PP=793;SC=GAGATTTTTTAAAAAATAGTA;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=69747683;WS=69747665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	69754221	rs8041861	T	C	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=101;PP=2965;SC=CAATGATGAATGGAACCAGAA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=101;TCR=101;TR=202;WE=69754229;WS=69754211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr15	69857737	rs16953470	A	G	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=25;PP=2048;SC=AAAAATATACAATGCCTCCAA;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=99;WE=69857745;WS=69857727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	70347362	rs4777227	C	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=8;PP=1233;SC=CAGCTGGAGGCGGCGCAGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=70347370;WS=70347352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	70347816	rs11440222	A	AG	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=333;SC=CGAGGTAGACATGATTAACAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=70347824;WS=70347806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	70348468	rs3817045	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=5;PP=389;SC=ACAGTTTCCTGGGGTTGCAAC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=70348476;WS=70348458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	70348523	rs2270871	G	C	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=10;PP=1008;SC=TCCAAAGGGAGGTGCACCAGG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=70348531;WS=70348513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	70368432	rs2291986	T	C	5561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=73;PP=2965;SC=AAGAAGGTCTTACCTCTTGTG;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=107;TCR=73;TR=180;WE=70368440;WS=70368422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr15	70387560	rs12441129	A	C	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=709;SC=GATTTTTACCAACCCTAATTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=70387568;WS=70387550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	70388449	rs71149952	AG	A	1674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=12;PP=1468;SC=GGAGCCGCGCAGGGGACCCAC;SOR=2.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=38;WE=70388457;WS=70388439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	70958937	rs2241530	G	A	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=235;SC=ATTTTTGCACGCAAGTTGCTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=70958945;WS=70958927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	70960068	rs934005	G	A	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=63;PP=2965;SC=CAATTGGGGCGTATTTTACCT;SOR=1.058;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=158;WE=70960076;WS=70960058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr15	70991925	rs4776525	G	C	10413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=149;NR=201;PP=2965;SC=CAAGGATTGAGGTCACTTTTT;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=350;TCF=149;TCR=201;TR=350;WE=70991933;WS=70991915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr15	71125093	rs3825970	G	A	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=65;PP=2138;SC=CCACGATGGCGCACTCCTGGG;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=99;WE=71125101;WS=71125083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	71125204	rs1549317	A	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=26;PP=1571;SC=CAAAAGTCCCAAAAAGCTTGA;SOR=1.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=71125212;WS=71125194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	71175296	rs1528828	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=28;PP=828;SC=ACCTTATAGGATTTTATCTTT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=71175304;WS=71175286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	71186811	rs1881568	C	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=471;SC=AAGATTATTTCCCCATAATGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=71186819;WS=71186801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	71190616	rs139411761	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=410;SC=AGATTTTAACAGAAGTAACAC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=71190624;WS=71190606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	71193188	rs3830648	A	AAT	302.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=310;SC=AAATTCTCCAAATATAAGATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=71193196;WS=71193178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	71548937	rs4777350	T	C	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=18;PP=2506;SC=GCATATTTAATATCTGCTTTA;SOR=2.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=89;TCR=18;TR=106;WE=71548945;WS=71548927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	72023422	rs2277540	C	T	6054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=80;PP=2965;SC=GGTGTGCATACGTGCCAAGTG;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=102;TCR=80;TR=182;WE=72023430;WS=72023412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr15	72037610	rs2291994	G	A	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=26;PP=1035;SC=GCCTATTACCGGGTCACTTCA;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=72037618;WS=72037600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	72050139	rs8026426	C	T	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=829;SC=GGGAAACAGACGGCAGGAAAA;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=72050147;WS=72050129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	72050181	rs8026307	A	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=25;PP=1351;SC=CCATCATTTGAAAGTGGCTTC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=72050189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	72050436	rs924555	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=722;SC=GAACTGGGTATGTCTGCCTGT;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=72050444;WS=72050426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	72073003	rs2291275	C	T	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=109;PP=2965;SC=AGCCTGTCCCCGCCCCCAGGG;SOR=1.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=65;TCR=109;TR=174;WE=72073011;WS=72072993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr15	72105928	rs11351249	AC	A	6323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=69;PP=2969;SC=TTGGCGGTGGACCCCCACGGA;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=118;WE=72105936;WS=72105918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr15	72186286	rs2128112	A	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=139;SC=ATAATCCTGAACCTACGCATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=72186294;WS=72186276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	72191073	rs2415128	T	C	7467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.04;NF=105;NR=114;PP=2965;SC=CCTCCAAGGATCTGGGTCTCT;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=105;TCR=115;TR=219;WE=72191081;WS=72191063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr15	72191266	rs2415129	C	T	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=65;PP=2468;SC=ATCCTCCCATCCTGAAGGGTC;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=113;WE=72191274;WS=72191256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	72300031	rs3759820	A	C	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=219;SC=TCTTTTGGAAATGCTATTTAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=72300039;WS=72300026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	72302894	rs2957742	G	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=232;SC=ATGTATAAATGCAAATTAGAG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=72302902;WS=72302884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	72431883	rs7175792	G	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=216;SC=GCATTTTACAGTCAGGTATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=72431891;WS=72431873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	72432583	rs930871	A	G	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=41;PP=1387;SC=AGATCTCATTACCACACTTGC;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=72432591;WS=72432573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	72454729	rs897731	C	G	4821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=89;PP=2965;SC=CTGAAGAAAGCGGCAATACGG;SOR=1.005;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=158;WE=72454737;WS=72454719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	72457551	rs2959944	A	G	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=265;SC=GGCAGGTTTAAGAGATGCCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=72457559;WS=72457541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	72460339	rs8025939	T	A	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=270;SC=AAACAGTCCATTCCCCAGCGT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=72460347;WS=72460329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	72462165	rs11072348	A	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=24;PP=1221;SC=GTGTGTATCTATGACTGGGAA;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=72462173;WS=72462155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	72462831	rs7182776	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=353;SC=GGAGCCGTCTTATACCAGGAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=72462839;WS=72462821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	72543656	rs2959904	T	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=24;PP=785;SC=AGCTATCCTTTCTGAACAAGC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=72543664;WS=72543646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	72545876	rs1426166	T	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;SC=CGTTATCTCCTTGGAGAGGTG;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=72545884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	72546765	rs2912227	A	G	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=50;PP=1871;SC=TGGGCAGGCAAAGGAGAGGGG;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=93;WE=72546773;WS=72546755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	72556799	rs11072352	G	A	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=743;SC=TTTTGGAAGGGGGCATTCCAT;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=72556807;WS=72556789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	72557955	rs1426170	T	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=444;SC=GTCTTAGCTATAGCCTTACAC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=72557963;WS=72557945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	72559326	rs62022788	T	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=203;SC=TTTGTGAGAGTCTCAGTCTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=72559334;WS=72559316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	72637795	rs4777502	T	C	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=35;PP=1453;SC=ACCTCAGCAATTCACAGCGGA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=72637803;WS=72637785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	72638892	rs1800431	T	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=14;PP=549;SC=GGTTCCACTATGTAGAAATCC;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=72638900;WS=72638882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	72848073	rs142005464	G	A	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=11;PP=795;SC=AGGAGAAAGGGAAGGATTGAG;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=72848081;WS=72848063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	72859047	rs11403578	A	AT	135.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTATTGATAGATTTTTTTTTA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=72859055;WS=72859037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr15	72879653	rs139334001	A	ATTG	1800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=11;PP=910;SC=TCTTAACTATATTGTACTTTT;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=18;WE=72879661;WS=72879643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	72987588	rs4777527	G	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=28;PP=744;SC=GCAGTTTCATGGTATGTGTAT;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=72987596;WS=72987578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	73002035	rs8033604	G	A	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=14;PP=918;SC=AAAATATGCTGCCTAGCTCCA;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=73002043;WS=73002025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	73004739	rs33923961	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=638;SC=ACAAGTTCAAGTACAGTCATG;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=73004747;WS=73004729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	73023937	rs12914333	T	C	5991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=108;PP=2965;SC=TGGCACCCTTTGATTGGAAGA;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=83;TCR=108;TR=191;WE=73023945;WS=73023927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr15	73024181	rs9806635	G	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=607;SC=TAGAGATCCTGTAGGAATCTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=73024189;WS=73024171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	73028367	rs28397892	C	G	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.71;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	73028375	rs12324395	G	A	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.78;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	73048529	rs2304598	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=17;PP=656;SC=GATGCCAAGAGAGGCTGGAAC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=73048537;WS=73048519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	73052840	rs8024644	T	C	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	73052845	rs8023358	A	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.19;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	73067234	rs11634630	T	C	5317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=83;PP=2719;SC=GGAACTCTGATGCAACCTGGG;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=165;WE=73067242;WS=73067224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr15	73545714	.	AT	A	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=20.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.99;MQRankSum=2.303;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr15	73545732	rs2623989	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.744;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.836;NF=21;NR=13;PP=738;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TTTTTTTTTGTTTCTCTAGTT;SOR=0.045;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=34;WE=73545740;WS=73545722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr15	73566942	rs497539	G	A	5106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=58;PP=2965;SC=GGGGGTTTTAGTTTTTTTCCT;SOR=1.325;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=108;TCR=58;TR=165;WE=73566950;WS=73566932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr15	73581444	rs489531	A	G	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=16;PP=1250;SC=GCTCAGTGGCATAGGGCACAT;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=73581452;WS=73581434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	73590579	rs2292915	C	T	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=18;PP=1704;SC=TAGCACTGATCGCAAGTGCTA;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=69;WE=73590587;WS=73590569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	73614834	rs529004	T	C	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=29;PP=1601;SC=ATAGATTGGATGGCAGTTTGG;SOR=1.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=73614842;WS=73614824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	73616635	rs481579	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=40;PP=1057;SC=ATGCACAGCCTGCCCAGGCCA;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=73616643;WS=73616625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	73848808	rs922687	A	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=660;SC=CCTTTGTTCAATTCTTTGTTT;SOR=2.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=73848816;WS=73848798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	73982965	rs6495076	G	A	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=1;PP=1242;SC=TTTATCAGGAGCCCACTTTTC;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=73982973;WS=73982955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	74000839	rs2291011	G	A	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=55;PP=1933;SC=ATGTGTGTGCGTGCGCATGCA;SOR=1.077;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=74000847;WS=74000829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	74032234	rs11857595	C	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=141;SC=ATGTGCCCACCGCCCCCGGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=74032242;WS=74032224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	74033033	rs11858458	A	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=31;PP=926;SC=GGGTCCCTGCATCAGCCAGGT;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=74033041;WS=74033023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	74043523	rs7497362	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=39;PP=1145;SC=CTGGGCACACACTGCGTCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=74043531;WS=74043513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	74176453	rs66619071	GA	G	2378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=29;PP=1939;SC=ATCAGAAGGGGAAAAGCCACC;SOR=1.032;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=49;WE=74176461;WS=74176443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	74178966	rs62007098	G	A	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=37;PP=984;SC=GAGGTGTCCAGCTAGGGATCA;SOR=1.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=74178974;WS=74178956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	74179024	rs62007099	C	A	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=616;SC=GCAAGTCTTCCTTGCCTCCCC;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=74179032;WS=74179014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	74181255	rs7170803	A	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=612;SC=AGCAGGCTGTACTACTTGAGA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=74181263;WS=74181245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	74219546	rs1048661	G	T	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=39;PP=1861;SC=GGCATGGCCCGGGCCCGCACC;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=74219554;WS=74219536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	74234171	rs8042181	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=9;PP=443;SC=ATTCCAATGCAGAATGGAGTC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=74234179;WS=74234161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	74239307	rs67182653	G	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=4;PP=1087;SC=AGGAGGCTGTGCCACAGCAGG;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=74239315;WS=74239297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	74241749	rs2304722	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=13;PP=1343;SC=GCAGTTGAGGTGCAGCCCCCC;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=64;WE=74241757;WS=74241739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	74244278	rs8818	C	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=361;SC=CCCACAGGCACGGAGGGGCAT;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=74244286;WS=74244268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	74277795	rs10851866	T	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=16;PP=721;SC=CGGCCTCCACTGCCAGCTCCA;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=74277803;WS=74277785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	74284406	rs2304715	C	G	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=13;PP=1507;SC=TCCCCCCCGGCTCCGCCGTGC;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=63;WE=74284414;WS=74284396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	74317043	rs2277599	T	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=292;SC=TCCTTCCAGCTGCCCCTCCAG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=74317051;WS=74317033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	74317362	rs3825941	G	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=364;SC=CAGGGAGAGCGTCTGAGTGAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=74317370;WS=74317352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	74325182	rs2304716	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=19;PP=521;SC=GTGTTTGCTCAACGCCTTCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=74325190;WS=74325172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	74326711	rs2304718	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=373;SC=CAGGGCATCCGTTTCCCCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=74326719;WS=74326701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	74328116	rs743580	A	G	5229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=104;PP=2965;SC=GGCAGGGGAAAGCAGAGCCCA;SOR=1.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=66;TCR=104;TR=170;WE=74328124;WS=74328106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr15	74328141	rs743581	G	T	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=81;PP=2831;SC=CTTGGAGCAGGTGTTCCCCCT;SOR=1.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=124;WE=74328149;WS=74328131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	74335926	rs149213581	C	T	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=203;SC=GGATCAGACCCCTTATCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=74335934;WS=74335924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	74467856	rs1052622	G	A	5491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=112;PP=2965;SC=TCAAGGGTACGCCGCTGAGCC;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=57;TCR=112;TR=169;WE=74467864;WS=74467846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr15	74472716	rs351242	G	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=50;PP=1378;SC=TCCCCTGCAGGCAGCACATGG;SOR=3.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=59;WE=74472724;WS=74472706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	74476340	rs2277608	G	C	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=58;PP=2377;SC=CCTGGGGTGGGAGCCAGGGAG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=74476348;WS=74476330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr15	74483415	rs351228	T	C	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=47;PP=1793;SC=ACAAGGATTCTGGGGAGCAGG;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=98;WE=74483423;WS=74483405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	74489883	rs351218	A	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=9;PP=375;SC=CACTCATGTGACATCTTGGGG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=74489891;WS=74489873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	74528985	rs351175	T	G	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=11;PP=579;SC=CAGGACTGATTCCTGATCACC;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=74528993;WS=74528975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	74529130	rs11633321	T	G	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=1013;SC=CGTCCCTCCTTCAAAGTCCTT;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=44;WE=74529138;WS=74529120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	74536400	rs10552820	TAAG	T	4467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=41;PP=2819;SC=TGTCTCCCTCTAAGAAGGAGA;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=59;WE=74536410;WS=74536390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	74558927	rs440793	A	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=18;PP=1189;SC=CCCTACTCTCAACAATGTCTC;SOR=1.574;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=74558935;WS=74558917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	74560566	rs1038436	C	T	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=32;PP=1795;SC=ATTATCAGCTCGGAGCCCCAG;SOR=1.350;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=94;WE=74560574;WS=74560556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	74572242	rs351165	T	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=484;SC=CAAATATCTGTGTATGCCTTG;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=74572250;WS=74572232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	74572917	rs351164	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=9;PP=1439;SC=GAAAGCAGGCAGCGGGAGACA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=60;TCR=9;TR=68;WE=74572925;WS=74572907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	74588024	rs1484212	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=418;SC=GGGGTGTAGATGGTGTGCTTA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=74588032;WS=74588014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	74622365	rs2277601	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=135;SC=AGGATCAAGTCATAACCACCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=74622373;WS=74622355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	74622457	rs2277602	A	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=670;SC=ACTGACTTTCAAGTGTAGATG;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=74622465;WS=74622447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	74622678	rs1564782	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=348;SC=GGCAAAGCCAGTGAGGCCCAG;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=74622686;WS=74622668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	74623272	rs2277605	G	A	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=45;PP=2006;SC=GGGCCAAGGTGGACTCCCAGG;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=106;WE=74623280;WS=74623262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	74623302	rs2277606	T	C	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.81;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	74627222	rs2279356	G	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=758;SC=TTTGCTTTCTGCCTGGACAGC;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=74627230;WS=74627212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	74628242	rs900802	C	T	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=23;PP=1853;SC=GGGGTACTCACGCACCCCGCT;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=86;WE=74628250;WS=74628232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	74628891	rs2959003	A	G	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=41;PP=1366;SC=TATCATTGTGAAATACTCCAT;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=74628899;WS=74628881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	74703022	rs2075592	G	A	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=16;PP=1380;SC=AGAGGGAGGCGGCCAGGGCAC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=74703030;WS=74703012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	74703929	rs741761	T	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=13;PP=787;SC=TGCAGCGGCCTTGGTCCCAGC;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=74703937;WS=74703919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	74706943	rs1046146	G	A	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=57;PP=2513;SC=GCATGCGGTGGACGGCCACTT;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=125;WE=74706951;WS=74706933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	74709975	rs2075589	G	A	4791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=92;PP=2965;SC=TGAAGGGGGCGTAGCCTCTCA;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=154;WE=74709983;WS=74709965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	74710593	rs28362912	C	T	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.722;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=43;PP=2080;ReadPosRankSum=-0.670;SC=CCCTCCATACCCCCTCCCCCA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=108;WE=74710601;WS=74710583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr15	74918128	rs35200328	ATCC	A	3917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.24;NF=39;NR=19;PP=2868;SC=AGCCCTGCCCATCCTCCTCCT;SOR=2.147;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=58;WE=74918138;WS=74918118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	75142761	rs2305668	T	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=17;PP=1158;SC=TATTCTGCTCTAAGACTCAGA;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=75142769;WS=75142751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	75310075	rs12593566	C	A	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1126;SC=GAACTAACCCCTTCTGACCTC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=75310083;WS=75310065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	75311036	rs2289583	C	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=7;PP=281;SC=GGGGAGGGAGCACTGTTTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=75311044;WS=75311026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	75336729	rs2304899	A	G	7215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=114;PP=2965;SC=TCTGCCAGATATGGAAGAGCC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=111;TCR=114;TR=225;WE=75336737;WS=75336719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr15	75498548	rs1466663	A	G	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=59;PP=2453;SC=GCCCCATGGCAGGTACTCCTA;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=129;WE=75498556;WS=75498538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	75499602	rs12591506	C	A	7655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=121;PP=2965;SC=GAACAATGTGCGGGCTGTGCC;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=111;TCR=121;TR=232;WE=75499610;WS=75499592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr15	75499619	rs11072531	T	C	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=110;PP=2965;SC=TGCCACAGCCTGGTGCCTTCC;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=95;TCR=110;TR=205;WE=75499627;WS=75499609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr15	75499861	rs11072532	G	A	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=CAGAAGGAGGGCGCAAGGCCA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=194;WE=75499869;WS=75499851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr15	75503147	rs3743211	G	A	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=35;PP=1306;SC=GTGGCCAGAGGTGAGCCAGAG;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=79;WE=75503155;WS=75503137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	75518241	rs1994639	G	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.28;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	75518246	rs1994640	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.28;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	75521833	rs6495165	G	C	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=18;PP=1892;SC=TCCCCCTGGGGAGGTGAAAAG;SOR=1.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=75;WE=75521841;WS=75521823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	75643615	.	C	CT	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9996;HP=19;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=62.65;NF=2;NR=0;PP=24;QD=13.5;SC=CCTCATGTTGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=75643623;WS=75643605;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr15	75643759	rs7182283	G	T	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=26;PP=938;SC=TGGAACCACAGGAGTGCATCA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=75643767;WS=75643749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	75650836	rs1128933	G	A	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=78;PP=2772;SC=GGCAGCCAACGTCCAGCACAA;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=152;WE=75650844;WS=75650826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	75650972	rs3809549	G	A	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=64.01;NF=38;NR=51;PP=1964;SC=ATGGGACAGGGGTGGACATAC;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=75650980;WS=75650962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	75651022	rs149997575	C	CCCACATGCTGCCCAGCCCATA	4312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=1297;SC=CTCCACCATCCCCACATGCTG;SOR=0.911;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=35;WE=75651030;WS=75651012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	75651981	rs78610801	G	A	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=30;PP=1644;SC=GGCCCCGCCCGGTTTGGGCAG;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=75651989;WS=75651971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	75653378	rs7174408	T	C	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=12;PP=1082;SC=AGCCAAGGCCTGGCCTGACCT;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=75653386;WS=75653368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	75664570	rs4886696	AA	TT	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	75870906	rs138732372	G	A	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=3;PP=155;SC=CCTGGGGCGCGGTCGCCGGTG;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=75870914;WS=75870896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	75967814	rs1127646	A	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=207;SC=AGACAGCACCAGGCATGGAAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=75967822;WS=75967804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	75969781	rs11853792	C	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=35;PP=1001;SC=GAGTGATGGACCCTCAGCTGG;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=40;WE=75969789;WS=75969771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	75977920	rs62027240	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=453;SC=AGCTCTGCACAGGGTCCAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=75977928;WS=75977910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	75979782	rs8030131	G	T	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=30;PP=1600;SC=CCATGGTGTCGCGGGGGCTGA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=75979790;WS=75979772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	75980112	rs4414463	A	G	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=47;PP=2948;SC=AGCCACGGTCAGCCCCTGAGT;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=100;TCR=47;TR=147;WE=75980120;WS=75980102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	75981507	rs12900539	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=14;PP=593;SC=CCTGTGCAGGACCACCGCGGT;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=75981515;WS=75981497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	75981972	rs77164756	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=19.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-6.427;QD=1.76;ReadPosRankSum=-3.896;SOR=4.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,7:0.09:77
chr15	75981976	rs200493777	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=9.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-4.834;QD=2.12;ReadPosRankSum=-4.763;SOR=1.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,12:0.15:80
chr15	75982227	rs78884605	T	G	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=37;PP=1384;SC=CTTCATAATGTCCATAGGCAT;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=75982247;WS=75982217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	75982239	rs148229217	G	A	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=33;PP=1319;SC=CATAGGCATCGTCCTCATACT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=75982247;WS=75982217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	76031200	rs8041626	C	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=6;PP=1367;SC=GGGATGGGGGCGCGCCCTGCC;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=76031208;WS=76031198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	76078665	rs200768357	G	T	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1490;SC=TCTGAGCCGTGTCCTCTCACA;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=76078673;WS=76078655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	76175828	rs1868020	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=382;SC=TTTTTTATAGGGACGAGATCT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=76175836;WS=76175818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	76182949	rs335713	C	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=914;SC=TTTAAAATAGCGTCTACTTTC;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=76182957;WS=76182939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	76189624	rs335692	A	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	76191802	rs335689	G	A	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=32;PP=1644;SC=ATGGCTAAATGTGTTGACTGT;SOR=1.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=81;WE=76191810;WS=76191792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	76191852	rs335688	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=48;PP=2097;SC=AAAATCTTTCTAACATGCAGA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=101;WE=76191860;WS=76191842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	76191966	rs335687	T	C	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=31;PP=710;SC=TTACAGCCTTTGCATTTTGCT;SOR=3.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=76191974;WS=76191956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	76197071	rs3073843	A	ATCT	1254.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=1177;SC=TTAAAGGAACATCTCGTTCCG;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=22;WE=76197079;WS=76197061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	76222140	rs335679	G	T	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=406;SC=TGGAGTGCAAGTCAGTAACAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=76222148;WS=76222135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	76248133	.	CA	C	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=17;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=27;MQ=61.78;NF=2;NR=0;PP=22;QD=12.5;SC=GGTACCTGGCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=76248141;WS=76248129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr15	76248427	rs10711025	GT	G	559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=20;PP=333;SC=TAGAAAGAAAGTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=21;WE=76248435;WS=76248417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	76510073	rs1533600	G	A	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=244;SC=CTTGTGCAAAGTATCAATTAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=76510081;WS=76510063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	76518346	rs11281932	C	CCCTTA	586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=398;SC=ATTTTAACTTCCAATATATTA;SOR=2.985;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=12;WE=76518354;WS=76518335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	76577366	.	GA	G	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=11;PP=402;SC=AAGGCTGTCTGAAAGCTTATT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=76577374;WS=76577356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	76584686	rs3215000	T	TA	464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=452;SC=ATTGGCTACATAAACAGTCTG;SOR=2.448;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=76584694;WS=76584676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	76630055	rs138217367	T	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=2;PP=998;SC=GGGGCTGGAGTAGCCGAGGCC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=76630063;WS=76630050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	76630303	rs4636879	T	C	9873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=186;PP=2965;SC=AGCGGGACTATGTCAGGTGAG;SOR=1.053;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=314;TCF=128;TCR=186;TR=314;WE=76630311;WS=76630293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr15	76632907	rs7180257	A	G	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=108;PP=2965;SC=GACGGTGAGCAGCCGCTGGGC;SOR=1.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=49;TCR=108;TR=157;WE=76632915;WS=76632897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	76646271	rs117738772	C	T	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=52;PP=2965;SC=TAGACAATTACGTATAATGTA;SOR=1.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=130;TCR=52;TR=182;WE=76646279;WS=76646261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr15	76673627	rs17460201	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=0;PP=377;SC=TTATTCCTTATGCCCCAATTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=76673635;WS=76673617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	76957958	rs280021	A	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=24;SC=ACATCACTAAAAGTTTTTCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=76957966;WS=76957948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	77064389	rs66496622	TGAA	T	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=583;SC=CTATTAACTATGAAGAAGAAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=77064399;WS=77064379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	77085740	rs3102707	C	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=493;SC=TCACTGGAAACAACAAGGCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=77085748;WS=77085730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	77231158	rs4886841	C	T	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=56;PP=1886;SC=TAACTTTGGGCAAGTTATTAA;SOR=1.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=91;WE=77231166;WS=77231148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	77241568	rs1711018	T	C	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=69;PP=1773;SC=CTTTAATCTCTGAGCCTGTCT;SOR=1.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=99;WE=77241576;WS=77241558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	77308387	rs7173067	G	A	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=53;PP=2060;SC=ATAAGGACAGGAGAAGGGTTC;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=97;WE=77308395;WS=77308377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	77310345	rs12900395	C	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=12;PP=796;SC=AAAGCCAGGTCTGGAGTCCCA;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=77310353;WS=77310335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	77310636	rs3812911	G	C	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=42;PP=1646;SC=GAAGCAGGTGGCTTCCGCTCG;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=77310644;WS=77310626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	77322029	rs3935339	C	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=241;SC=CAATCATGGGCGCGGCGCTCT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=77322037;WS=77322019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	77323009	rs2469237	T	C	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=64;PP=1669;SC=GGGGCCCAAGTGAGGCAGTTG;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=99;WE=77323017;WS=77322999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	77324880	rs4078354	A	G	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=78;PP=2833;SC=GGTTGTGGGGAGTTGGGTCCC;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=143;WE=77324888;WS=77324870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	77328108	rs11373069	G	GA	866.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=9;PP=772;SC=AGTGTCCCCAGAAGGGGAGGG;SOR=1.445;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=19;WE=77328116;WS=77328098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	77344793	rs11737	T	A	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=71;PP=2728;SC=GCTTCTTCACTACTAGAGCCT;SOR=1.017;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=122;WE=77344801;WS=77344783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	77363451	rs11072641	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=208;SC=CCCCAGCAAGTGCCTCGCTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=77363459;WS=77363441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	77406396	rs3743479	C	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=412;SC=TAGAGGTTTGCCTTTCTTCTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=77406404;WS=77406386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	77407114	rs1867780	C	G	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=2.221;SC=TGAGGTGGGGCTGGGCTCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=148;WE=77407122;WS=77407104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,169:0.99:171
chr15	77426221	.	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=0.133;SC=CTCTTTAGTTCAAAATGGGAA;SOR=0.148;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=77426229;WS=77426211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr15	77471105	rs11856513	C	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=528;SC=AAAAAATTCCCATATTCTTCC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=77471113;WS=77471095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	77907145	rs3743481	G	A	4066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=68;PP=2635;SC=CCAGCGGGTTGGAGTCCAGGA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=119;WE=77907153;WS=77907135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	77907535	rs2271396	C	G	5536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=88;PP=2965;SC=TGAGTCGGTACAGCCTCTTGA;SOR=0.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=168;WE=77907543;WS=77907525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr15	77907775	rs2271397	T	C	11201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr15	77907784	rs2271398	G	A	11158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr15	77940335	rs72546309	C	T	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.98;SOR=1.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	78189084	rs4243062	T	C	4192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=60;PP=2353;SC=CGGCTAGAAATCTCCGTGGAC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=113;WE=78189092;WS=78189074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	78189206	rs4886959	C	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=32;PP=1151;SC=CCAGGAACACCGCCTGGGCCT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=78189214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	78189268	rs11630652	A	T	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=20;PP=758;SC=AAGACCTCAGAGTCAATGGCC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=78189276;WS=78189258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	78189370	rs4441238	A	C	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.534;NF=29;NR=27;PP=916;ReadPosRankSum=-0.486;SC=ATGCCTATGGACATTATGAAG;SOR=0.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=56;WE=78189378;WS=78189360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr15	78196212	rs7178928	A	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=174;SC=CAGGGCCAGGAAGGAAGGGGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=78196220;WS=78196202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	78207762	rs57642131	C	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.75;QD=44.62;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	78207864	rs66955965	C	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=10;PP=279;SC=CAAGGGGCAACACCAGCTCTT;SOR=1.302;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=78207872;WS=78207854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	78207914	rs67793790	T	C	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=10;PP=351;SC=GGTGATCAGCTCCCACCCTGG;SOR=1.519;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=78207922;WS=78207904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	78207974	rs71400903	T	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=4;PP=501;SC=AGATGTTGCATGCCCTACCTT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=78207982;WS=78207964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	78208021	rs58158543	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=15;PP=761;SC=TGATGACATCTTCCATCTCCT;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=78208029;WS=78208011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	78208141	rs58331113	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=28;PP=1115;SC=TGCAGCTCCCCGTGCCCATGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=78208149;WS=78208131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	78208236	rs76380402	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.66;QD=40.58;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	78208239	rs74587726	T	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.74;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	78211339	rs71400918	T	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.76;QD=44.13;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	78211344	rs144363575	CA	TG	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.07;QD=44.88;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	78211411	.	GCCTCCTGCTCTCGGAGCATCT	G	1631.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=12;PP=2967;SC=CACCCTCTGCGCCTCCTGCTC;SOR=1.096;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=21;WE=78211439;WS=78211401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	78211471	rs67630434	C	T	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=69;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=22;PP=437;SC=CTCCTGGAGTCTCTCCTCCTG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=78211479;WS=78211461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	78232240	rs12907147	G	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=42;PP=1337;SC=GTGGGTCCAGGGTGGCCCTGG;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=78;WE=78232248;WS=78232230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	78235104	rs60257193	T	G	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=61;PP=2476;SC=AGGGAGGGAGTCAGGTAATCA;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=125;WE=78235112;WS=78235094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	78269731	rs11852862	G	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.83;QD=43.43;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	78269737	rs11852790	A	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.83;QD=43.43;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	78269738	rs11852821	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.76;QD=45.99;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78269747	rs11852867	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.68;QD=43.24;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	78269760	rs71402931	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.49;QD=42.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	78269762	rs78023616	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.49;QD=45.41;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	78269763	rs75184028	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.49;QD=42.38;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	78269793	rs67603081	CT	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=128;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=167;SC=CCAGGGTGCCCTTGGGCAGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=78269810;WS=78269783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	78269798	rs142983118	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.42;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	78269801	rs140951103	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.42;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	78269802	rs143146370	T	TG	232.80	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.42;QD=38.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	78276660	rs12916320	A	G	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=28;PP=1312;SC=AAGGGGGTGTATGAGAACCAG;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=68;WE=78276668;WS=78276650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	78310306	rs35403054	GA	G	1337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=44;PP=735;SC=TATCCTGTTAGAAAAAAAAAA;SOR=3.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=44;WE=78310314;WS=78310295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	78317863	.	TTTA	T	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.63;NF=0;NR=1;PP=24;QD=36.0;SC=AAACTTGTATTTTATTATTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=1;WE=78317873;WS=78317853;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,1:0.10:10
chr15	78390414	rs2289524	T	C	6993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.04;NF=72;NR=180;PP=2965;SC=TTCAAAGAGATGCTGACTGCT;SOR=1.909;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=252;TCF=72;TCR=180;TR=252;WE=78390422;WS=78390404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr15	78398146	rs10456	G	A	10183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=126;PP=2965;SC=TGCCGTCACCGTCCAAGTCAG;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=300;TCF=174;TCR=126;TR=300;WE=78398154;WS=78398136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr15	78401540	rs11390540	A	ACC	360.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=371;SC=ATGTTCCCCCACCGCATATTC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=78401548;WS=78401530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	78402001	rs11072729	A	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=444;SC=TAAGATGGGCACAGCCAGGGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=78402009;WS=78401991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78403004	rs1992469	A	G	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=34;PP=1761;SC=TCACCTGGGAACTTGCTCGAA;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=78403012;WS=78402994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	78403179	rs2867986	C	G	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5302;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=126;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=50;PP=1314;SC=AGCCAGACAACGGGGAGACAG;SOR=1.132;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=81;WE=78403187;WS=78403169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	78403213	rs148709604	ACAGGTCTGCCAACTACAG	A	2431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=2967;SC=CAAAGCAGACACAGGTCTGCC;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=30;WE=78403238;WS=78403203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	78403668	rs75314194	C	T	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=39;PP=1314;SC=ATCCCTAAGCCCCAGCAGCCC;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=53;WE=78403676;WS=78403658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	78423433	rs112308337	G	A	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=41;NR=16;PP=1147;SC=GGGAGGCCTCGGCCAGCGACC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=78423441;WS=78423423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	78423479	rs8040395	T	C	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=70;NR=50;PP=1935;SC=GCGGGGCCTGTGTTGGGGGCC;SOR=0.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=120;WE=78423487;WS=78423469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	78423596	rs11547207	A	C	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=67;PP=2015;SC=CCGGGCTCCGACTCCCATCAG;SOR=1.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=108;WE=78423604;WS=78423586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	78441769	rs11555541	T	C	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=18;NR=20;PP=710;SC=CGTGGATCTCTAAGGTGAGCG;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=78441777;WS=78441759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	78441886	rs113037555	T	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=279;SC=AGGCGGTGGCTGCCCGCGGGG;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=78441894;WS=78441876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	78452244	rs62009339	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=373;SC=GGCTGAGGCATGAGAATCGCT;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=78452252;WS=78452234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78457536	rs62009341	G	C	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=45;PP=1324;SC=ACAAAATGATGCTTTTTTTTT;SOR=1.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=59;WE=78457545;WS=78457526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	78457537	rs11394499	C	CT	697.74	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.530;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.363;NF=2;NR=21;PP=365;ReadPosRankSum=0.482;SC=CAAAATGATGCTTTTTTTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=23;WE=78457545;WS=78457526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr15	78466127	rs2304824	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=38;PP=1479;SC=CAGAACTCCATAGCTTGTTCA;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=78466135;WS=78466117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	78466781	rs17850483	G	A	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=107;PP=2965;SC=TGAGCATGGCGTTGCTGATGA;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=99;TCR=107;TR=206;WE=78466789;WS=78466771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr15	78466919	rs62009343	C	G	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=25;PP=798;SC=GGTGCCCCAGCTGAACCACAA;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=78466927;WS=78466909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	78471110	rs17850484	G	A	5032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=82;PP=2666;SC=GGCAGATCTCGCCAATGCCCT;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=147;WE=78471118;WS=78471100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr15	78471954	rs17479031	G	A	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=48;PP=1833;SC=CACTGAGGCCGTAGCCCGCAT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=78471962;WS=78471944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	78472157	rs370177754	TCA	T	282.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=8;PP=378;SC=ACAGAAGAAATCACACACACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=78472166;WS=78472147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	78473018	rs17479135	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=5;PP=1138;SC=CAGGCATGGCGTATCAGACCC;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=78473026;WS=78473008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	78474517	rs6495277	T	C	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=48;PP=1267;SC=ATCCCAGCAGTGTCCACAAGC;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=78474525;WS=78474507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	78474787	rs45444496	C	T	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1532;ReadPosRankSum=1.876;SC=CCCCCCCCACCCCACCGGGCA;SOR=0.271;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=78;WE=78474795;WS=78474777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr15	78475236	rs62009346	C	T	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=645;SC=CTGGGTGCCCCGTCTCTGACC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=78475244;WS=78475226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	78485814	rs28700056	A	G	5382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=67;PP=2965;SC=GATACCCAGCATCTGACCCCA;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=103;TCR=67;TR=170;WE=78485822;WS=78485804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr15	78486189	rs2271902	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=17;PP=1076;SC=GTGGGTGGGGGCTGCTAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=78486197;WS=78486179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	78526556	rs10162606	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=398;SC=ATGACCAGTTCTTCCATCTTA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=78526564;WS=78526546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	78556580	rs200375873	GGGGGCGGCCTC	G	1808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=6;PP=2978;SC=GGAAGGGCAAGGGGGCGGCCT;SOR=2.726;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=20;WE=78556598;WS=78556570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	78557005	rs28484827	A	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=1;PP=290;SC=GTGACGCGCGAGCGGGCGGCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=78557013;WS=78556995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	78557086	rs66489434	GC	G	4570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=30.27;SOR=1.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	78558509	rs2037347	G	A	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=18;PP=1968;SC=CATTCATTGTGGTCCGCTTCT;SOR=2.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=85;WE=78558517;WS=78558499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	78563103	rs3169166	A	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=736;SC=ATCATGCTTTAAAAGGATATG;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=78563111;WS=78563093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	78565478	rs7163689	C	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=32;PP=1382;SC=TCTTGAAGATCTATATAATGG;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=78565486;WS=78565468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	78572359	rs9806426	C	G	4555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=49;PP=2723;SC=CTGCCTTCCTCCTTCCTAATT;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=136;WE=78572367;WS=78572349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	78580481	rs2277551	G	A	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=233;SC=AAAAATGGGCGCTGAACGGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=78580489;WS=78580471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	78581892	rs1879153	C	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=626;SC=AATGGCATTTCAATGAAAGAA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=78581900;WS=78581882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	78581938	rs16969675	C	A	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=11;PP=1261;SC=CCCAGTTTGTCAAAATAAGAT;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=78581946;WS=78581928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	78585106	rs2280364	C	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=602;SC=CCAGACTCCACTGTAGGTCCA;SOR=2.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=78585114;WS=78585096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	78587111	rs138711577	TTTG	T	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=1;PP=806;SC=TGTTCAGGTTTTTGTTGTTGT;SOR=4.804;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=16;WE=78587121;WS=78587101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	78587910	rs1040262	A	G	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=33;PP=1491;SC=TTTAGGAGCCAGGCAAGAATG;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=78587918;WS=78587900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	78632830	rs1127472	C	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=22;PP=857;SC=ACGAGCTGCTCAAGGCACTGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=78632838;WS=78632820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	78633595	rs2139440	T	G	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=80;PP=2912;SC=AGCGTCCCCGTGTCCCCGCTC;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=141;WE=78633603;WS=78633585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr15	78730591	rs954144	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=25;PP=894;SC=CTTGCCAGTCCGCCTGTCTTC;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=78730599;WS=78730581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	78758677	rs2958720	G	C	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=19;PP=859;SC=GCTCTCTCCAGTTAAAGTGCA;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=78758685;WS=78758667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	78758853	rs2938672	A	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=178;SC=TTTTTCTTAAAGTTTATTAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=78758861;WS=78758843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	78777312	rs9788758	G	A	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=919;SC=AATTATTGTTGGCTTTTCTGT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=78777320;WS=78777302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	78780104	rs2230940	T	C	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=49;PP=1790;SC=GGATGTTCAATTTGTGTGGGA;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=78780112;WS=78780094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	78786410	rs4887060	A	C	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=2044;SC=TGAGAATGCAAACAAAGTATT;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=78786425;WS=78786400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	78789488	rs13180	C	T	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=61;PP=2965;SC=CTGTTTTGGCCGAAAGTTATG;SOR=1.297;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=107;TCR=61;TR=168;WE=78789496;WS=78789478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr15	78807250	.	C	CTATA	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	78825498	rs12907169	G	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=628;SC=GAAATGGAAGGGGAATGAATT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=78825506;WS=78825491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	78825562	rs12906951	C	T	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=22;PP=1720;SC=GTATCAATCACGGAGATCTTA;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=78;WE=78825570;WS=78825552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	78911261	rs2869547	T	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=442;SC=CTGGCCACTGTGGGAAGCAGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=78911269;WS=78911251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	78917399	rs1948	A	G	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=44;PP=1911;SC=GGGCCTCATCAGCCACAACCC;SOR=0.932;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=100;WE=78917407;WS=78917389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	79044330	rs11632672	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=4;PP=198;SC=CCCATGTTCCAGAACACACAC;SOR=1.244;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=79044338;WS=79044320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	79045517	rs34816637	G	A	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.89;QD=44.10;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	79045521	rs12917502	T	C	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.77;QD=45.08;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	79054900	rs7495616	C	G	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=27;PP=954;SC=ACCACAGGGGCCTGAGCACTG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=47;WE=79054908;WS=79054890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	79056526	rs3830240	TC	T	299.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=4;PP=245;SC=GGGAAAGGCATCCAGGCCCAC;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=79056534;WS=79056516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	79058572	rs1809421	T	G	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=283;SC=GGGGTGCTCCTCGGCCCTTGG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=79058580;WS=79058562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	79058923	rs1809422	G	A	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=113;SC=TGGCAGGCACGGGGCTACCCG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=79058931;WS=79058913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	79059449	rs1810165	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=16;PP=572;SC=GCCAGGGGACGCTGGGGCAAG;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=79059457;WS=79059439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	79065380	rs7177201	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.31;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	79065384	rs28577997	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.31;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	79065394	rs3743061	T	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.54;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	79069734	rs7161774	G	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=19;NR=6;PP=475;SC=GCTGCCCCCTGAGCCCTCCTG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=79069742;WS=79069724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	79132814	rs7402877	T	C	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=6;PP=1178;SC=CCATCATGCCTAGCCAAAATC;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=79132822;WS=79132804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	79133026	rs6495341	C	T	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=97;PP=2965;SC=AGGTAAAGCCCAGAATCCTTT;SOR=1.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=46;TCR=97;TR=143;WE=79133034;WS=79133016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	79165441	rs8034658	G	T	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=34;PP=1175;SC=AACGGCGCAGGAGATAGAGGC;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=63;WE=79165449;WS=79165431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	79173005	rs17832351	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=414;SC=ATGCTTTTCAATTCTGCAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=79173013;WS=79172995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	79215568	rs34577742	C	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=39;PP=1281;SC=TTCCCCACAGCGGACCAGGGA;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=79215576;WS=79215558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	79217690	rs2044226	G	C	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=54;PP=2254;SC=AGTAGATGCCGGTTCTATACA;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=79217698;WS=79217680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr15	79223681	rs2289699	G	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=19;PP=1908;SC=TTTTGCCATCGCCCAGGGCAG;SOR=2.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=79223689;WS=79223671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	79229959	rs60254670	TGGCCAGAATG	T	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=2965;SC=CAGGGACCTGTGGCCAGAATG;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=79229976;WS=79229949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	79231478	rs12148472	T	C	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=20;PP=1384;SC=AGTTGGGCACTGACCTTAGAC;SOR=1.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=79231486;WS=79231468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	79237293	rs2289702	C	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=47;PP=1452;SC=AGCCAGGCCCCGGCGCAGAGC;SOR=1.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=79237301;WS=79237283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	79237405	rs28704487	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=284;SC=GCGGGGGGGGAGCGGCACGAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=79237413;WS=79237395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	79254480	rs4778732	T	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=11;PP=1247;SC=TGGGCTGGGCTCAGCTTCAGG;SOR=2.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=79254488;WS=79254470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	79264097	rs4238514	G	A	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=641;SC=AGCTGGGCTCGAGAGAATTCT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=79264105;WS=79264091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	79277247	rs4778750	A	C	5072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=64;PP=2965;SC=TCAGCCCAGTACTTTGCCCAC;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=156;WE=79277255;WS=79277237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr15	79277608	rs4778751	G	A	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=56;PP=1907;SC=ATGATAAATGGTCACTATTTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=91;WE=79277616;WS=79277598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	79288011	rs6495359	A	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=21;PP=1041;SC=GATGCCTGTGATGGGTCAGGG;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=79288019;WS=79288001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	79291262	rs12914556	C	T	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=61;PP=1742;SC=TCTGGCTGAGCTGGGGTGAGT;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=82;WE=79291270;WS=79291252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	79310288	rs2304994	G	A	4853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=70;PP=2643;SC=CATGAATGTGGACGCCTTTTC;SOR=0.944;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=119;WE=79310296;WS=79310278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr15	79317602	rs2304992	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=3;PP=488;SC=GCCAGGACAGCGCCTGCATGA;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=79317610;WS=79317592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	79324419	rs2304991	A	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=663;SC=CATCCCCCACACCTGCCTCCC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=79324427;WS=79324409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	79327686	rs736554	C	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=553;SC=GAAAACTGCACCGGCAGGATG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=79327694;WS=79327676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	79502096	rs12903401	G	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=28;PP=1611;SC=TTTACATCTTGTCCTGCAAAG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=79502104;WS=79502086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	79586361	rs8038778	T	C	4993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=75;PP=2965;SC=CCCGTTTGCCTCAACTGAAGA;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=137;WE=79586369;WS=79586351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	79606137	rs3825933	G	A	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=50;PP=2768;SC=ACTGCTATGTGGAGGACCCCC;SOR=1.054;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=124;WE=79606145;WS=79606127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	79606408	rs3784544	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=771;SC=CTTCATTGGCCTCTGTCTAGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=79606416;WS=79606398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	79614206	rs906440	T	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=719;SC=GCACAGACTCTTAGTTAGCAT;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=79614214;WS=79614196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	79614224	rs8037898	A	G	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=908;SC=CATTCAGTGGATATCACCTAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=79614232;WS=79614214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	79614418	rs906439	A	G	6502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=105;PP=2965;SC=GGGCCCGAGCAGAAGACCTTA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=206;WE=79614426;WS=79614408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr15	79750127	rs2902954	A	G	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=83;PP=2958;SC=ACAGCACAGGATCCTTGTCTC;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=149;WE=79750135;WS=79750117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr15	79750307	rs1004724	T	C	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=39;PP=2042;SC=TTGGCGAAATTGAACGGAAGC;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=79750315;WS=79750297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	80189058	rs71874818	GCGTGCGCGCGCCGGGAGGGGAAA	G	2480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=13;PP=2969;SC=CGACTAGGGGGCGTGCGCGCG;SOR=2.066;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=25;WE=80189088;WS=80189048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	80191343	rs7257	G	A	5132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=74;PP=2965;SC=TTCACAATATGGAGTGTCCTT;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=169;WE=80191351;WS=80191333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr15	80214976	rs78016257	GTGC	G	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=518;SC=CTAAAGGGGAGTGCTGATCCA;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=80214986;WS=80214968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	80215601	rs17286886	C	T	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=46;PP=1953;SC=TCGTCCGCCTCGGGTCCATCC;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=97;WE=80215609;WS=80215591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	80365745	rs2866367	T	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=395;SC=AATTGTAGTGTATTTCAGTAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=80365753;WS=80365735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	80367831	rs2469600	G	C	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=231;SC=AGAGTGGAAAGTAGTTTTCTA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=80367839;WS=80367821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	80405098	rs12594035	C	G	7165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=98;PP=2965;SC=CCTCATGTCTCTTTATTACCC;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=201;WE=80405106;WS=80405088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr15	80413935	rs934003	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=411;SC=CAACATACTACATATTAAAAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=80413943;WS=80413925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	80414173	rs1522636	C	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=24;PP=824;SC=GTAAGATGTACTCTCTGAATT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=80414181;WS=80414163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	80445512	rs71699670	A	AG	4939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=102;PP=2972;SC=GGGCGCGGGGAGGGAGTGGAG;SOR=1.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=4;TCR=111;TR=106;WE=80445520;WS=80445502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr15	80450328	rs1370276	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=331;SC=CTTCAATAGATAGGCTTTCTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=80450336;WS=80450318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	80450389	rs1370275	G	A	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=709;SC=TGACGGTGTCGTCTTCCTCCT;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=80450397;WS=80450379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	80452075	rs1370274	T	C	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=64;PP=2965;SC=ACGTGATCTTTTTTCTCCCTG;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=152;WE=80452083;WS=80452065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr15	80452268	rs1370273	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=838;SC=AGCAGGGGAGGTGAAGGCTGT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=80452276;WS=80452258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	80452886	rs733679	T	G	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=61;PP=1875;SC=TCTGCATCTGTGTGGAGGGTC;SOR=1.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=92;WE=80452894;WS=80452876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	80454745	rs2114716	T	C	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=104;PP=2965;SC=AGCATATTTGTCTCAGGAGCT;SOR=1.491;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=50;TCR=104;TR=154;WE=80454753;WS=80454735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr15	80460524	rs1545119	A	G	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=37;PP=1821;SC=CCTTGCTGGTACCCAGCTCTC;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=84;WE=80460532;WS=80460514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	80464669	rs7180031	A	G	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=679;SC=GAAGCTGAAGATCTGGTGCAG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=80464677;WS=80464659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	80465248	rs58363292	GA	G	3135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=9;PP=2965;SC=GATCTTTGTGGAGATGGCAGT;SOR=3.967;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=71;WE=80465256;WS=80465238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	80470040	rs2162550	G	A	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=78;PP=2397;SC=GGGTCAGCCTGTGGGCCTGGA;SOR=1.903;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=108;WE=80470048;WS=80470030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	80472431	rs2043691	C	A	4194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=61;PP=2630;SC=CTAAGCCTGCCGCTGCTCATT;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=136;WE=80472439;WS=80472421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	80736696	rs72238944	GGT	G	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr15	80743350	rs2278708	C	T	3794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=60;PP=2452;SC=GCGACCTCAGCGTTTCCAGGA;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=124;WE=80743358;WS=80743340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	80762526	rs5814026	TC	T	3921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.85;QD=31.37;SOR=1.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	80806183	rs11072922	T	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=12;PP=864;SC=ATCTACTTGATGGCAGCACCA;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=80806191;WS=80806173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	80845136	rs3924894	CT	TC	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=66;PP=2947;SC=AGTTTTGAGCCTATGGCAATT;SOR=1.306;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=106;WE=80845145;WS=80845126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	80987812	rs62007944	T	C	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=32;PP=1028;SC=TCTCGCTGGGTGAGCTGTGCT;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=80987820;WS=80987802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	81199236	rs2271164	A	G	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=48;PP=1486;SC=CTATGATGTCAGCCTCTAGAC;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=81199244;WS=81199226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	81212608	rs1553647	G	A	6296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=122;PP=2965;SC=ACTCCTACCCGGGGTACATCC;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=80;TCR=122;TR=202;WE=81212616;WS=81212598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr15	81217848	rs2271163	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=755;SC=GGTTTCTGTTCAGTCAATGCC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=81217856;WS=81217838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	81234741	rs1553646	C	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=455;SC=CTGTGTCCTGCGGCTGCTGGC;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=81234749;WS=81234731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	81410106	rs1533055	G	A	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=59;PP=2722;SC=CTTCCTCCTCGCTGACTTCAT;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=81410114;WS=81410096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr15	81410202	rs2280440	C	T	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=72;PP=2788;SC=TCTCCTAGTCCTTCTCATCTT;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=133;WE=81410210;WS=81410192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	81410488	rs2250029	G	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=573;SC=TTTTTCTGCAGACATATTCAG;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=81410496;WS=81410478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	81426539	rs2683255	G	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=289;SC=CAGGGCGAGGGTGCGCGCTGT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=81426547;WS=81426529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	81430305	rs55908952	C	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=397;SC=TGATTATAAACAAAATTGCAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=81430313;WS=81430295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	81571849	rs59298568	T	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=204;SC=TATTTCTTCATCTCACCCTGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=81571857;WS=81571839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	81582406	rs11632576	G	C	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=37;PP=1091;SC=AGCTCAGACAGTATAATAGTG;SOR=2.522;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=46;WE=81582414;WS=81582396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	81582868	rs8031107	G	A	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=43;PP=1482;SC=AGAGGCATCAGTGGAGTCTGG;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=87;WE=81582876;WS=81582858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	81584389	rs4072680	C	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=939;SC=AGAGGGAGGACGGAGCTGAGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=81584397;WS=81584379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	81589448	rs17875502	G	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=16;PP=715;SC=CTTCCAAAAGGAAGGGTCTTT;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=81589456;WS=81589438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	81600995	rs4238526	A	G	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=48;PP=1728;SC=ATGAAATCTTACAGCTGGGTG;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=81601003;WS=81600985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	81624768	rs4417518	C	T	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=33;PP=1751;SC=GCCTAGACATCTGAACAAATC;SOR=1.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=81624776;WS=81624758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	81625385	rs11636318	C	T	6757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=0.170;SC=GTAAGAGTCACATTCATTAAT;SOR=0.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=108;TCR=120;TR=227;WE=81625393;WS=81625375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,255:1.00:256
chr15	81631681	rs4489964	C	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=2;PP=976;SC=TCAATATGATCTAATTCCCTT;SOR=4.461;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=37;WE=81631689;WS=81631671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	81636267	rs7161991	C	T	5665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=84;PP=2965;SC=CAAACTTGCTCTCCAGATCCC;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=156;WE=81636275;WS=81636257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr15	81637284	rs4278705	G	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.602;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CTTCTTCAGGGGCTGTCCTGG;SOR=0.707;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=50;WE=81637292;WS=81637274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr15	81644098	rs143929525	C	T	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=40;PP=1570;SC=ACCGGTCCACCACAAAGTAGA;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=81644106;WS=81644088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	81649001	rs7167034	T	C	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=32;PP=846;SC=CTAGCACCCATGGAGCCTTTG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=81649009;WS=81648991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	81651651	rs12903128	G	A	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=16;PP=1223;SC=CATTTTATGCGACTGCTGTAA;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=81651659;WS=81651641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	81665211	rs71451583	C	CGTGTGTGT	313.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	81666529	rs11634486	G	A	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=28;PP=802;SC=TGCTCTGCCCGCTAGTTCTCA;SOR=1.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=81666537;WS=81666519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	82335444	rs11073028	G	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr15	82512429	rs2292189	C	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=880;SC=CTCTTGGCTCCTCTCCTTTTG;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=82512437;WS=82512419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	82545214	rs4344697	A	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=542;SC=ACTTATATTTAATTTGTTATT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=82545222;WS=82545204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	82558034	rs3858954	G	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=10;PP=506;SC=GAGTCTTAAAGCCAAGCAAGA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=82558042;WS=82558024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	82563991	rs16973457	C	T	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=47;PP=2888;SC=CGCCATGTGCCAGAAGAATAT;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=94;TCR=47;TR=141;WE=82563999;WS=82563981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	82574879	rs11630197	T	C	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1308;SC=TTTTCAACCATGGGAAATCCC;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=82574887;WS=82574869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	83215251	rs1267657	T	C	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=61;PP=2616;SC=GAGAATCTTCTAGGTAGGGGT;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=72;TCR=61;TR=132;WE=83215259;WS=83215241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr15	83224696	rs1145171	C	T	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=46;PP=1844;SC=GGTCCCAGGACGGCCACACAG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=83224704;WS=83224686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	83240293	rs783544	A	C	5653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=93;PP=2965;SC=CTGTTTTGGAAAGGAGCACAG;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=71;TCR=93;TR=164;WE=83240301;WS=83240283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr15	83241984	rs11336258	AT	A	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.031;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.282;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr15	83297138	rs10400906	C	T	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=60;PP=2207;SC=AGAAGACAATCTGATAGAGAT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=83297146;WS=83297128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	83328504	rs139753266	T	G	6181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=89;PP=2965;SC=CTGCTAAGGGTGACTGTGTTT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=112;TCR=89;TR=201;WE=83328512;WS=83328494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr15	83441012	rs1105287	C	A	3059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=66;PP=2154;SC=GAAGAGGAACCTCTAATAGAG;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=83441020;WS=83441002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	83447631	rs4779061	T	G	6205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=114;PP=2965;SC=TTTCAGGAATTTCCCGAGTCT;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=58;TCR=114;TR=172;WE=83447639;WS=83447621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr15	83451912	.	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=GTACAGTAGTGTGATCTTGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=83451920;WS=83451902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	83455137	rs11259947	A	G	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.48;SOR=2.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	83499665	rs3814282	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=14;PP=934;SC=CGCCGCCACCGCCGCCCCCAC;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=83499673;WS=83499655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	83499766	rs3814281	G	A	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=57;PP=2339;SC=GACCAGCCACGTCCTCTAGTG;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=126;WE=83499774;WS=83499756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	83521036	rs1256429	C	T	4637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=83;PP=2965;SC=AAAGCAGGGACGCCAGCTTAA;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=145;WE=83521044;WS=83521026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr15	83523368	rs1256426	C	G	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=25;PP=1740;SC=CAGCTGGCCTCGGGGCTCACT;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=83523376;WS=83523358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	83735449	rs66531444	AGCCCG	A	174.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.53;NF=2;NR=1;PP=233;SC=GGGATCTCCCAGCCCGGCCCG;SOR=1.981;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=83735461;WS=83735439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	83735970	.	A	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=285;SC=CCGCCTCCGGAGGCCGGCGCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=83735978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	84116344	.	G	GAGGAGGGA	8321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=67;PP=2974;SC=GGGAGGCGCAGAGGAGGGAAG;SOR=0.853;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=79;WE=84116352;WS=84116334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr15	84539619	rs4144691	C	G	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=80;PP=2965;SC=CGGCGTCTTTCTCGTAGAAAA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=86;TCR=80;TR=166;WE=84539627;WS=84539609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr15	84554018	rs8028931	G	C	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=665;SC=AGATAAATTAGACATTTACAT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=84554026;WS=84554008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	84611367	rs34047645	G	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=767;SC=GGGCTCTTGGGGGCCCTGCTC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=84611375;WS=84611357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	84639350	rs2277849	C	T	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=59;PP=2674;SC=TCTACCAGGGCTCCCTCTTGT;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=84639358;WS=84639340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	84651113	.	G	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=621;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CAAGGGAAGAGAAGCGTATTA;SOR=0.645;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=48;WE=84651121;WS=84651103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr15	84651290	rs7176737	T	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=73;PP=2867;SC=TAAAAATCCATGGTCTTGCTG;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=156;WE=84651298;WS=84651280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	84685070	rs146448200	C	A	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=6;PP=1812;SC=TTTAAGAACACCCAAGCTGGA;SOR=4.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=74;WE=84685078;WS=84685060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	84748914	rs17841161	G	C	5940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=144;PP=2965;SC=CCGTCGTCAAGGCAACAGAGG;SOR=1.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=64;TCR=145;TR=208;WE=84748922;WS=84748904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr15	84753177	rs12437525	A	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=29;PP=915;SC=AATTGCTGGCAAGAAAAACAG;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=84753185;WS=84753167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	84758840	rs1567086	A	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=3;PP=262;SC=AGACCCCGTCACTACAAAAAT;SOR=2.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=84758848;WS=84758830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	84784919	rs62026533	G	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=513;SC=GGAAAGTTGGGCTGGGCTAGG;SOR=2.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=84784927;WS=84784909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	84784964	rs11637158	C	T	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=30.08;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	84950209	rs10152249	T	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.85;QD=26.44;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	85149771	rs2271433	G	T	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=96;PP=2965;SC=TGTAGCTGTCGTTGCTTCCCT;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=164;WE=85149779;WS=85149761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr15	85159397	rs10083683	C	G	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1283;SC=GAACCTGGGACGCAGAGGTTG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=85159405;WS=85159387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	85163998	rs2044502	G	C	5267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=86;PP=2965;SC=CAGGGACACAGCCCAGGTGAG;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=156;WE=85164006;WS=85163979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr15	85175102	rs2121452	G	A	3965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=51;PP=2692;SC=TTTAGAGTGCGGTTGCAAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=132;WE=85175110;WS=85175092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	85186637	rs510875	G	C	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=115;SC=AGTCCTACATGAGCACCCTTG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=85186645;WS=85186629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	85188994	rs2271432	T	C	6449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=94;NR=97;PP=2965;SC=CCAGCCGGCCTGAAGCACAGC;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=191;WE=85189002;WS=85188984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr15	85191274	rs7169629	C	G	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=21;PP=787;SC=GCTTGGGACTCCACTTCCCAT;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=85191282;WS=85191264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	85198362	rs1107179	G	T	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1229;SC=ACCAGGCATTGTATGTAAAGA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=85198370;WS=85198352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	85200754	rs2292462	G	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=267;SC=TGGTGGCAAAGCCTGCTCCCT;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=85200762;WS=85200744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	85235757	rs12900890	C	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=660;SC=CTCCAACAAACTCTAAAATTC;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=85235765;WS=85235747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	85259053	rs6496355	C	A	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=695;SC=GCCCCGCCCCCGGTAGGCCCT;SOR=3.477;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=85259061;WS=85259043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	85333953	rs2241645	A	G	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=64;PP=2737;SC=AGGTATGCCAAATGCTGCTGC;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=85333961;WS=85333943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	85360101	rs11857356	T	C	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=37;PP=1822;SC=GGCTTGTCTATGTGCTGGGCC;SOR=1.168;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=85360109;WS=85360091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	85370597	rs891286	C	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=382;SC=CGGGGTGCTGCAGCTCTGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=85370605;WS=85370587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	85401259	rs306197	C	T	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=42;PP=1618;SC=GAGGTTTCCCCTGAGGGGCCT;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=85401267;WS=85401249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	85401419	rs167379	T	C	5718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=82;PP=2965;SC=CTCTGACAGGTCTCCCGGCAG;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=190;WE=85401427;WS=85401409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr15	85407564	rs2289138	A	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=470;SC=GCTGAGAATTACATTCTTGGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=85407572;WS=85407554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	85438118	rs7166433	T	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=7;PP=879;SC=GGCTGCAGGGTTCTGAAGAGG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=85438126;WS=85438108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	85438311	rs151038463	C	CTTG	2761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=35;PP=2387;SC=GAGGAGGTTTCTCAAGCCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=43;WE=85438319;WS=85438301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	85448906	rs2290269	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=42;PP=1293;SC=GGTCTGGCTGCCCAGAGCATC;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=85448914;WS=85448896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	85452074	rs138954946	C	T	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=150;SC=CACCGCCCAGCGACTCCAGCT;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=85452082;WS=85452064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	85461851	rs8187763	C	T	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=49;PP=1635;SC=TTCCCAGTGCCCATGGCCAGG;SOR=0.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=85461859;WS=85461841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	85467207	rs3825875	T	C	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=40;PP=2252;SC=ACATCTTTCCTGTTTGCAGAC;SOR=1.346;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=117;WE=85467215;WS=85467197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	85476441	rs2305367	G	A	7456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=153;PP=2965;SC=CCCTCTCCAAGCTGGTCTACC;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=94;TCR=153;TR=247;WE=85476449;WS=85476431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr15	85478153	rs7163966	G	T	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=7;PP=1092;SC=AGGATTTCCCGCTCTGAAATG;SOR=3.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=85478161;WS=85478143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	85478410	rs2242048	A	G	5065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=76;PP=2959;SC=TGGACATCCAAGGGCTCAGCT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=77;TCR=76;TR=153;WE=85478418;WS=85478400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr15	85487960	rs11479919	GC	G	9504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=123;PP=2966;SC=CGGGGGCCCTGCCCCACCCAC;SOR=0.775;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=55;TCR=130;TR=176;WE=85487968;WS=85487950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr15	85488572	rs8025045	T	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=30;PP=865;SC=TTGGGAAGGGTTCATGGAGTG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=85488580;WS=85488562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	85610349	rs35666574	C	T	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=85;PP=2965;SC=CTCAGGCTGTCCTTGCCTGTT;SOR=1.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=85610357;WS=85610339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	85666568	.	TACACACAC	T	243	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=243;QD=82.0;SC=ACTAATGGGATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=85666583;WS=85666558;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,3:0.27:11
chr15	86029097	rs11856869	C	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=485;SC=AACCATATGTCCATGAATATA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=86029105;WS=86029087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	86087212	rs7162720	C	T	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=66;PP=2702;SC=GCCTTATTTCCCTCCTCTCAT;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=139;WE=86087220;WS=86087202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	86087309	rs2291049	T	C	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=78;PP=2950;SC=CAGCTCTGTATCTTGCCTTCT;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=141;WE=86087317;WS=86087299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr15	86098507	rs7180143	G	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=570;SC=CATTAAGGTTGGACACTATTA;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=86098515;WS=86098497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	86098647	rs7164821	T	C	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=57;PP=2721;SC=CTTTCCTCTATTTTTAAAGCT;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=132;WE=86098655;WS=86098637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	86122654	rs2061821	T	C	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=37;PP=1161;SC=GACTTGGTCATGGAGCCAGGC;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=86122662;WS=86122644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	86122779	rs2061822	T	C	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=20;PP=1115;SC=TGCCACTGTTTGGAAGAATGT;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=86122787;WS=86122769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	86122916	rs2061823	T	C	4858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=67;PP=2928;SC=GTGCCCCTGCTGCCAGTTCCC;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=158;WE=86122924;WS=86122906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr15	86123019	rs2061824	C	T	6696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=118;PP=2965;SC=TTCACGAAGTCGTGAGGAGAG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=99;TCR=118;TR=217;WE=86123027;WS=86123009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr15	86123170	rs745191	G	T	5254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=GCCCTTCTTGGGCTGGAAGAA;SOR=0.998;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=86123178;WS=86123160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr15	86123833	rs4075256	T	C	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=39;PP=1824;SC=GACAGGGCAGTAGGCCTGTCC;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=86123841;WS=86123823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	86123924	rs4075255	C	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=30;PP=1569;SC=ATGAGGGTCCCGCCCCTCCAG;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=86123932;WS=86123914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	86123988	rs4075254	G	A	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=43;PP=1853;SC=CCTGCAAAGTGTGGGTAAGGC;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=86123996;WS=86123978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	86124419	rs4843073	C	T	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=37;PP=2066;SC=ACAACAGCTCCGCTCTGTTGC;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=86124427;WS=86124409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	86124483	rs4843074	C	G	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=51;PP=2448;SC=CTGCAGTCAGCCTTCTCCTCT;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=86124491;WS=86124473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	86124555	rs4843075	G	A	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=59;PP=2435;SC=GGTGAGTGGAGATGTGACGGT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=86124563;WS=86124545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	86124946	rs7162168	T	C	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=80;PP=2714;SC=AGGGAAGTCATGCGAGCCCCG;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=142;WE=86124954;WS=86124936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	86124968	rs11633087	G	A	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=68;PP=2931;SC=CTTCAGGCAGGGAAAGGAGCA;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=128;WE=86124976;WS=86124958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr15	86125031	rs7178065	G	A	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=62;PP=2311;SC=TGCCTAAGGGGGCAGACTTGA;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=106;WE=86125039;WS=86125021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	86129201	rs931082	T	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=691;SC=ATAAATGTGTTTATGTTGCTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=86129209;WS=86129191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	86182512	rs56092539	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=618;SC=AGAAAAAGATAGGAATGTTGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=86182520;WS=86182502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	86182856	rs35727345	C	CT	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=265;SC=ATGTAATTACCGAATTTTGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=86182864;WS=86182846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	86199049	rs17635450	C	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=232;SC=TTTAGTGTCTCAGTGTCTGCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=86199057;WS=86199039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	86212866	rs12904047	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=633;SC=TTATTTTACTATGTGGGTCTA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=86212874;WS=86212856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	86213172	rs338523	A	G	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=172;SC=TTTGCTTACTACTTCTTTGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=86213180;WS=86213162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	86227952	rs2306225	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=380;SC=AAAAAAATCAATCTTCTTGTT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=86227960;WS=86227942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	86253768	rs8037947	T	A	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=22;PP=1970;SC=TCAGGGCTTGTCAGAGGTGAA;SOR=2.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=87;WE=86253776;WS=86253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	86253911	rs8038249	T	G	5062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=94;PP=2965;SC=ATTCCCTTTCTGACTTTCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=65;TCR=94;TR=159;WE=86253919;WS=86253901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr15	86260700	rs3765096	C	T	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=96;PP=2965;SC=TTACCTAGAACATAAGTCTTA;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=63;TCR=96;TR=159;WE=86260708;WS=86260690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr15	86278174	rs2241267	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=345;SC=ACTTGTTTTCCCCTCATTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=86278182;WS=86278164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	86278309	rs2241268	G	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=16;PP=871;SC=AGATGTGGTCGGTCCCGTTTC;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=86278317;WS=86278299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	86284817	rs13511	T	C	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=65;PP=1906;SC=AGCAGAAATATAGAGCCTGTT;SOR=1.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=87;WE=86284825;WS=86284807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	86287724	rs11629690	G	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=17;PP=1154;SC=CAGAAACCCCGGTGCGCAGAA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=86287732;WS=86287714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	86311188	rs11637444	G	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=542;SC=GAAGAGGTGGGACTGCATTCC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=86311196;WS=86311186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	86311695	rs1978391	G	A	11520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=195;PP=2965;SC=TGGTTCCTCCGAAAACAAAGA;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=378;TCF=183;TCR=195;TR=378;WE=86311708;WS=86311685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr15	86312681	rs11073537	G	A	8186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=133;PP=2965;SC=CCTGCCTCCAGCAGTGACTCA;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=123;TCR=133;TR=256;WE=86312689;WS=86312671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr15	86313048	rs2614657	T	C	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=77;PP=2377;SC=ACATGGTGCGTCAGCTTGTGG;SOR=1.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=28;TCR=77;TR=105;WE=86313056;WS=86313038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	86940622	rs4362360	T	C	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=37;PP=1363;SC=AGGTGATCACTGCTCGAGTTC;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=81;WE=86940630;WS=86940612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	87097468	rs9788743	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=726;SC=TTAGGGTTAATAAATGATTTA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=87097476;WS=87097458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	87099537	rs752270	T	C	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=90;PP=2965;SC=AGCATTTATCTTGTGAAATTT;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=57;TCR=90;TR=147;WE=87099545;WS=87099527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr15	87531281	rs1006030	A	C	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=29;PP=1224;SC=TTGCCATTACAAACTTTTTCA;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=87531289;WS=87531271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	88423463	rs1560975	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=529;SC=TCTTATGAGCCCTCCCCCAAT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=88423471;WS=88423453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	88428702	rs2117655	C	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=110;SC=TAGAACAATACGGGAGAGTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=88428710;WS=88428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	88576185	rs2229910	G	C	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=68;PP=1965;SC=TGTCGGGCCCGGCATCCAGTG;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=88576193;WS=88576175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	88679785	rs1863480	G	A	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=32;PP=995;SC=TGATAACAGCGTTGTCACCCT;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=88679793;WS=88679775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	89169614	rs3743476	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=38;PP=1949;SC=TGCCTCCAGAACCAGGGTCCT;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=89169622;WS=89169604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	89169858	rs8027765	A	G	8124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=122;PP=2965;SC=CTACCATGGCAATGTCCTCTA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=234;WE=89169866;WS=89169848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr15	89172352	rs3826040	C	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=422;SC=GCTGCCTCCCCCCACAGGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=89172360;WS=89172342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	89172558	rs3743475	G	C	5020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=85;PP=2965;SC=CCCGGGATACGACCTATGTCC;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=144;WE=89172566;WS=89172548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr15	89173136	rs3826039	A	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=427;SC=TATGGTGTACAGTTGAGGTTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=89173144;WS=89173126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	89173657	rs3826038	A	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=132;SC=CCAGAGGAGTAGGGGTCATCT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=89173665;WS=89173647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	89182596	rs3200942	A	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=14;PP=2002;SC=TCCCCAAGGAACATGGCTGGG;SOR=2.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=63;TCR=14;TR=77;WE=89182604;WS=89182586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	89193584	rs8041679	G	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=754;SC=GGCTGGGGCAGTCACAGCTGG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=89193592;WS=89193574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	89195526	rs1137166	A	G	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=59;PP=1704;SC=AGCGCCTCCTACACAAGAGCA;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=71;WE=89195534;WS=89195516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	89385151	rs2293087	T	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=51;PP=1493;SC=AAGGCCACCTTCCCCTCCCCA;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=89385159;WS=89385141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	89386543	rs11324188	AG	A	3950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.08;QD=31.61;SOR=1.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	89390434	rs12911138	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=241;SC=GCTGCACACCGTGGGTCCCTG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=89390442;WS=89390424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	89391160	rs2272023	C	A	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=15;PP=1315;SC=TTGTGAGCCCCCGGACCCCAT;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=89391168;WS=89391150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	89392745	rs1568116	T	C	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=33;PP=1806;SC=CTCACAATGCTACGCTGGCCA;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=87;WE=89392753;WS=89392735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	89398105	rs2351491	C	T	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=23;PP=2160;SC=CTTGGCCTCCCACTGGCGCAG;SOR=1.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=89;WE=89398113;WS=89398095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	89398330	rs3743399	G	A	6900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=108;PP=2965;SC=CATCAGCCTCGGAAGAGCCGT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=218;WE=89398338;WS=89398320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr15	89398605	rs938608	G	T	7025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=81;PP=2965;SC=GAGTGGCCCAGCACTCCTACG;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=148;WE=89398613;WS=89398595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	89398631	rs938609	T	A	6865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=72;PP=2683;SC=TGAACTGCCCTCTGGAGCTGA;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=89398639;WS=89398621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	89400339	rs2882676	A	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=43;PP=2015;SC=GATGTCAGTGAACTTCCTTCA;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=89400347;WS=89400329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	89401109	rs4932439	A	G	5745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=81;PP=2965;SC=ACAACCAGGTATTAGTGGAGA;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=178;WE=89401117;WS=89401099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr15	89401615	rs3825994	T	G	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=76;PP=2711;SC=GTTTCCCCACTGTCTCTCTTG;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=89401623;WS=89401605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	89402051	rs1042630	A	G	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=40;PP=1905;SC=AGCTGGGGACATTAGTGGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=89402059;WS=89402041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	89402239	rs1042631	T	C	7142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=113;PP=2965;SC=AAGCTAACCTTGAGAGATCCT;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=110;TCR=113;TR=223;WE=89402247;WS=89402229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr15	89402596	rs698621	T	G	6772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=101;PP=2965;SC=CAACAGATGCTTCCATCCCAG;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=207;WE=89402604;WS=89402586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr15	89415247	rs3817428	C	G	8065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=122;PP=2965;SC=ATGCCCAAGACTACCAGTGGA;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=115;TCR=122;TR=237;WE=89415255;WS=89415237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr15	89430506	rs3743395	C	T	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=71;PP=2274;SC=GCAGGAGCAACGGGACCAGGA;SOR=1.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=113;WE=89430514;WS=89430496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	89436244	rs8024779	T	C	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=31;PP=1836;SC=TGGAGTCCTGTCTGGGCACTC;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=89436252;WS=89436234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	89436295	rs8039131	G	A	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=60;PP=2576;SC=ACTGCATCCTGCTGAGTGACT;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=133;WE=89436303;WS=89436285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	89444760	rs2015495	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=500;SC=CCCAGCCCCATATCCCAAGAA;SOR=2.925;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=89444768;WS=89444750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	89449137	rs3743388	C	G	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=48;PP=1631;SC=AAACTCCTAGCAGGGAAGGGA;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=89449145;WS=89449127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	89450546	rs1878327	C	T	4800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=72;PP=2773;SC=CACGCACAGACGAGGCGGCGA;SOR=0.799;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=89450554;WS=89450536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr15	89450587	rs1878326	G	T	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=68;PP=2399;SC=CCATTCTCCAGGCCCAGTGGC;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=120;WE=89450595;WS=89450577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	89731347	rs2239288	G	C	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=13;PP=1305;SC=CTGGCTTGCTGTGGCAAGGAA;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=89731355;WS=89731337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	89736558	rs6496562	T	C	4705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=97;PP=2965;SC=CAGGTAAGTGTTTCTTCCTGC;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=49;TCR=97;TR=146;WE=89736566;WS=89736548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	89754954	rs950541	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=549;SC=GCTGCCGTGCGACAGAACTCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=89754962;WS=89754944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	89758552	rs4932483	A	G	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=584;SC=CAGAGACCTGACCTCCTGCCA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=89758560;WS=89758542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	89761664	rs3825991	C	A	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=1064;SC=ACCTTAGAACCGGCCAGTCTA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=89761672;WS=89761654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	89802003	.	C	T	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1329;ReadPosRankSum=0.596;SC=GAGCCATCTTCAAAGGTAATA;SOR=0.577;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=164;TCF=64;TCR=100;TR=86;WE=89802011;WS=89801993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,101:0.51:197
chr15	89804043	rs17803620	C	T	5770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=76;PP=2965;SC=AAAGAAATAGCGTCTGAGATC;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=101;TCR=76;TR=177;WE=89804051;WS=89804033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr15	89804111	rs16942918	G	A	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=95;PP=2965;SC=TTGGGGGTAGGTTTTTGAGGG;SOR=1.185;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=60;TCR=96;TR=155;WE=89804119;WS=89804101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	89805189	rs3217022	C	CTG	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=202;SC=GAATTTATGTCTGGAGGTTTT;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=89805197;WS=89805179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	89806710	rs1981623	C	T	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=34;PP=1247;SC=CATCTTTTCCCTTTTCTTTGT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=89806729;WS=89806700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	89806721	rs1981624	G	A	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=33;PP=1202;SC=TTTTCTTTGTGTATCCTGCTT;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=89806729;WS=89806700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	89811482	rs7497351	T	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=306;SC=TGCCACCACATCGGGCTGATT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=89811490;WS=89811476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	89811543	rs7496308	G	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=670;SC=ATCAAGTGATGCGCCCGCCTT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=89811551;WS=89811533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	89817689	rs11073853	G	C	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=176;SC=ACTGGTAGAGGATACTTTTTC;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=89817697;WS=89817679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	89826496	rs9806604	C	T	5469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=111;PP=2965;SC=GGATTATTTACGTTAACTTGC;SOR=1.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=47;TCR=111;TR=158;WE=89826504;WS=89826486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr15	89836228	rs2283432	G	C	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=709;SC=AATAATATCTGTGCTTTTCTT;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=89836236;WS=89836218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	89838045	rs2283431	G	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=530;SC=AAGCTCTGTTGGGTGCTGCTG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=89838053;WS=89838035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	89838236	rs7183618	G	A	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=51;PP=1802;SC=CTCTGCAGAAGGTACAGCAGC;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=89838244;WS=89838226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	89844688	rs2159081	A	C	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=60;PP=1900;SC=TAGTACCGCTAACTTAATCCC;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=97;WE=89844696;WS=89844678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	89857698	rs16943011	T	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=459;SC=GCCAAAAATTTTAGATTACTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=89857719;WS=89857688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	89857711	rs71464462	A	ATACAAG	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=1207;SC=GATTACTGGTATACAACTGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=89857719;WS=89857688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	89858602	rs1138465	T	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=49;PP=1316;SC=GAGAGGATGGTGAAGATGAAA;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=89858610;WS=89858592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	89859932	rs3087377	A	AC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=761;SC=GGGAGCCTGCACCACCCCGAT;SOR=2.494;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=18;WE=89859940;WS=89859922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	89860786	rs2307438	A	C	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=42;PP=1295;SC=GACCCAATCTACTCTCACAGT;SOR=1.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=89860794;WS=89860776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	89862341	rs2302084	A	G	7012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CTAAGGGACCAGAAACAGAGG;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=99;TCR=129;TR=226;WE=89862349;WS=89862331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,257:0.99:259
chr15	89862366	rs2246900	T	C	6861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.909;SC=ACTTTGTCTTTCAGCATCTCA;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=214;WE=89862374;WS=89862356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,242:0.99:244
chr15	89863928	rs2307449	T	G	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=357;SC=GAACAGATGGTAGTACTAAAG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=89863936;WS=89863919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	89864316	rs2307433	G	GCTAC	5234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=45;PP=2957;SC=CTGTCAATATGCTGAGGGGCT;SOR=0.710;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=72;WE=89864324;WS=89864306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	89866954	rs2072266	A	G	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=157;SC=CTTAAGACCTAGGGAACTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=89866962;WS=89866944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	89867154	rs2072267	A	G	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=49;PP=1694;SC=CAAGGACCAAAGTAGTGAAGC;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=89867162;WS=89867144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	89869768	rs3176183	A	AC	933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=863;SC=CTGTGCCAGAACCCAGACCAG;SOR=2.468;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=22;WE=89869776;WS=89869758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	89871499	rs3176174	T	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=3;PP=710;SC=GCCCTCCCCTTCAGGGCCTCT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=89871507;WS=89871489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	89876236	rs2283430	C	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=12;PP=1193;SC=AGCACCCAGCCCGTAACAGGA;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=89876244;WS=89876226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	90026485	rs4932134	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=378;SC=GCTGGGGCAATAGCAAAAAGT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=90026493;WS=90026475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	90029469	rs187886135	G	T	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=28;PP=1333;SC=TGGGGTGGGTGGGGGCGGTGA;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=90029477;WS=90029459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	90029836	.	T	A	674	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=48.17;NF=3;NR=31;PP=674;QD=20.8462121337;SC=AGAGAGTGTGTGTGTGTGTGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=34;WE=90029844;WS=90029826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,34:0.83:41
chr15	90119614	rs11855211	G	C	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=544;SC=CAAATAAATAGGAACAGTTTT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=90119622;WS=90119604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	90126121	rs10775247	C	T	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=76;PP=2316;SC=CACTTTAAACCGTTTGCTCTA;SOR=1.305;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=115;WE=90126129;WS=90126111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	90128799	rs893724	T	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=198;SC=TCTACCTCTATTAATGATCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=90128807;WS=90128789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	90129188	rs1540504	T	C	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=28;PP=806;SC=GCTCCTAAACTAGTAACTAAC;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=90129196;WS=90129178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	90129227	rs1540503	A	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=17;PP=469;SC=CAGTCTTTTCAAGCATCGGGA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=90129235;WS=90129217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	90135196	rs8041127	A	G	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=10;PP=1403;SC=CAGTCAGTCCAGGGGAGGAGC;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=67;WE=90135204;WS=90135186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	90135432	rs34494298	A	G	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=84;PP=2388;SC=TATCTCTTGAATATTGATTAT;SOR=2.226;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=108;WE=90135440;WS=90135422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	90138670	rs8042146	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=475;SC=ATACCATGTGCCGTTCCTTAA;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=90138678;WS=90138660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	90144851	rs4932233	T	C	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=57;PP=2067;SC=TCAAAACCTATGTATGGTGTT;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=89;WE=90144859;WS=90144841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	90144894	rs4932234	T	C	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=26;PP=1942;SC=AGGACTACTTTTTAGGCTGGG;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=90144902;WS=90144884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	90144944	rs4244876	G	A	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=43;PP=2712;SC=TAACTGTTCCGTATTCGATCA;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=130;WE=90144952;WS=90144934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	90161355	rs2289486	G	A	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=48;PP=2752;SC=GTGGTATGGAGTAATCCTTGT;SOR=1.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=135;WE=90161363;WS=90161345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	90168108	rs894157	C	T	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=63;PP=2337;SC=GATGCCTTCCCGTGACGTGCA;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=111;WE=90168116;WS=90168098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	90172133	rs12914042	C	G	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=39;PP=1748;SC=AATAAAGGCTCGAGGGAGAGT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=76;WE=90172141;WS=90172123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	90172419	rs143394914	GGGGTGGGGGCTGTGGGCTGGGT	G	650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=11;PP=2974;SC=CAGGGCTGTGGGGGTGGGGGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=90172448;WS=90172409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	90173734	rs35820949	C	CAG	1086.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=1121;SC=CCTGCAGAGACGGGCACGCGT;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=90173742;WS=90173724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	90174789	rs9672286	C	T	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=1004;SC=GCTTGAGCAGCGAGTCCTTCT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=90174797;WS=90174779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	90174824	rs12900805	C	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=24;PP=1372;SC=TCGATCTCCCCGCGGATCTGC;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=90174832;WS=90174814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	90174955	rs9672296	C	T	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=49;PP=1646;SC=GGGGCAGAATCACCAGGGATT;SOR=1.141;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=90174963;WS=90174945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	90176073	rs3803530	C	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=281;SC=CAGGCGCTTGCTCTCCAGCCC;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=90176081;WS=90176063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	90176251	rs147787370	G	GAGGGAGGGAGGGAGGA	3282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=17;PP=1382;SC=GGGAGGGAGGGAGGGAACTCA;SOR=0.980;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=23;WE=90176259;WS=90176241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	90176432	rs3803531	T	G	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=44;PP=1560;SC=TCCTCTGGAATGCCGCGATCT;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=81;WE=90176440;WS=90176422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	90177159	rs11633151	C	T	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=77;PP=2271;SC=GGGGCTACCGCGAGCCTGCCA;SOR=1.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=121;WE=90177167;WS=90177149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	90188514	rs894159	A	G	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=31;PP=1860;SC=GCTGGCCCAGAACCGTGGAGG;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=91;WE=90188522;WS=90188504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	90190048	rs1110060	A	G	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=13;PP=657;SC=ACCCAGCCTCACCCTCTTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=90190056;WS=90190038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	90191827	rs8037349	T	C	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=39;PP=2965;SC=CCGCTCGCCGTCTCTTCGGGT;SOR=1.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=99;TCR=39;TR=138;WE=90191835;WS=90191817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr15	90192905	rs4932240	T	C	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=8;PP=912;SC=AGGTAAGCACTCCACTCCAAA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=90192913;WS=90192895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	90195765	rs11630003	AA	GG	3987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=24;PP=2831;SC=GCAAGAGGACAAGGCAGAAAT;SOR=1.408;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=71;WE=90195774;WS=90195755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	90195967	rs8179066	C	G	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=53;PP=1891;SC=CCTCCTGCCCCGCATCCTCGG;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=90195975;WS=90195957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	90196166	rs62021460	A	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=15;PP=348;SC=CCCCATGCCGAGGGAGGACTG;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=90196174;WS=90196156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	90211047	rs894162	A	T	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=735;SC=GGCAGCAGATAGCTGGCTCAA;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=90211055;WS=90211037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	90213134	rs2304794	T	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=465;SC=CAGTGGCTGGTTGAGCCACCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=90213142;WS=90213124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	90213229	rs6496589	G	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=19;PP=1305;SC=TCCTTGTCTGGAGGGAGGAGG;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=60;WE=90213237;WS=90213219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	90213343	rs111663599	C	A	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=62;PP=2043;SC=TCTCTGGCCACCCCCCAGGCA;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=117;WE=90213351;WS=90213333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr15	90214948	rs1077903	C	A	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=473;SC=TGCCCTCTTTCGCCCTTGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=90214956;WS=90214938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	90226947	rs7169981	C	A	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=83;PP=2813;SC=GATCCCTGACCAGGCTCAGCA;SOR=1.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=49;TCR=83;TR=132;WE=90226955;WS=90226937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	90320120	rs200021459	GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC	G	1059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=7;PP=2974;SC=GACGCAGGCGGAGGGGCAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=16;WE=90320151;WS=90320110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	90393808	rs4932252	G	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=467;SC=GGGCATATTCGTACTGTATTT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=90393816;WS=90393798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	90393949	.	C	CT	31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=19;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=31;QD=18.5;SC=TGATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=90393957;WS=90393939;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr15	90414642	rs3759831	C	G	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=24;PP=1245;SC=GAGGTGGCTACAGATGCCCAA;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=90414650;WS=90414632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	90420673	rs12440156	G	A	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=52;PP=1513;SC=TAAAATACACGTAACATAAAA;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=90420681;WS=90420663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	90454119	rs139739395	CTATTTACCCAGCCCTGAGAAGGCTGGG	C	2613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=2918;SC=CCCGTGTCTCCTATTTACCCA;SOR=1.316;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=22;WE=90454153;WS=90454109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	90616617	rs2277556	T	C	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=45;PP=1069;SC=GAGCCCCGGCTGGGTGAAACT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=90616625;WS=90616607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	90617539	rs6496620	C	T	5453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=68;PP=2965;SC=GGGCCAAGCGCAATGGACAGA;SOR=0.831;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=85;TCR=68;TR=153;WE=90617547;WS=90617529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr15	90623052	rs2970357	T	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=48;PP=1115;SC=CCTACTACAATGTGCTATAGC;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=90623060;WS=90623042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	90744960	rs11547964	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=379;SC=GGATCAGCCTGCCTCTGGGTG;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=90744968;WS=90744950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	90763285	rs3751658	C	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=800;SC=CACACCCTGGCACAAAGCGCA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=90763293;WS=90763275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	90764203	rs3825998	C	A	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=18;PP=1415;SC=CATGTGTCCACCCTCCTGCAG;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=90764211;WS=90764193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	90764219	rs4932305	G	A	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=24;PP=1799;SC=TGCAGAACATGGAGAACTTCA;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=90764227;WS=90764209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	90764348	rs3825999	C	G	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=87;PP=2963;SC=GGCAGGATGGCTTCATTGAGG;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=157;WE=90764367;WS=90764338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr15	90764359	rs3826001	T	G	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=81;PP=2780;SC=TTCATTGAGGTTCCATGTAGG;SOR=0.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=146;WE=90764367;WS=90764338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr15	90765093	rs66795544	CG	C	775.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=738;SC=TTTCCCATCCCGCCAAGGAGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=90765112;WS=90765083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	90765104	rs35147120	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=350;SC=GCCAAGGAGTACAGCTTGGCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=90765112;WS=90765083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	90766754	rs908048	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=528;SC=ATGGCTCAGCATGTGCCTAAG;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=90766762;WS=90766744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	90768156	rs1040083	A	G	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=23;PP=1576;SC=CCTGCCTGCCACCCCGAGGTG;SOR=1.832;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=84;WE=90768164;WS=90768146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	90768271	rs11547966	C	T	4947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TGCTGAACTTCCTCAAGGACC;SOR=0.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=152;WE=90768279;WS=90768261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr15	90768320	rs11073918	C	T	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=73;PP=2591;SC=CCGCATGCTGCTGCTGCAGCC;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=49;TCR=73;TR=122;WE=90768328;WS=90768310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	90771060	rs2271553	C	A	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=13;PP=1163;SC=AGGGGCATAGCCCAGAGGGAG;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=90771068;WS=90771050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	90771750	rs3751655	T	G	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=72;PP=2887;SC=CCCCCCGGGGTCCCGAGTCTT;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=123;WE=90771758;WS=90771740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	90772200	rs1044246	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=5;PP=1365;SC=GGAAGAGATAGCATGGCATGC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=54;WE=90772208;WS=90772190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	90772831	rs7024	C	T	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=46;PP=1285;SC=GGTTTTTATACATTTTTTAAT;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=57;WE=90772839;WS=90772821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	90773782	rs2073706	C	T	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=39;PP=1395;SC=AAGAGGAGGGCAGGGACTAAA;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=71;WE=90773790;WS=90773772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	90774259	rs1044813	G	C	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.94;NF=53;NR=36;PP=1858;SC=CAGGATCTGGGAAAGGGAGAG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=90774267;WS=90774249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	90774447	rs34604050	TAGAG	T	13374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=125;PP=2969;SC=CATCAAAGTCTAGAGAGCAGA;SOR=0.805;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=56;TCR=129;TR=180;WE=90774458;WS=90774437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr15	90775397	rs2073703	G	A	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=10;PP=1180;SC=GAGTTAGGGGGTCTAGCAGGG;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=90775405;WS=90775387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	90775700	rs4628940	G	A	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=37;PP=1155;SC=ATCAGGCAACGGTAAGCAAAA;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=90775708;WS=90775690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	90784057	rs113126276	T	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.47;QD=27.63;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	90784207	rs7166441	A	G	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=64;PP=2365;SC=GGACTGGGGCAGGCAAACCAT;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=117;WE=90784215;WS=90784197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	90784250	rs7171194	T	C	3701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=56;PP=2068;SC=AAGGATCTCATGGCAGAAGGG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=90784258;WS=90784240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	90794102	rs4932171	G	A	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.91;SOR=1.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	90794188	rs4932309	C	T	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=97;SC=CCTTCAACATCTGGAGGAGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=90794196;WS=90794178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	90794757	rs4357917	T	G	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=87;PP=2965;SC=CTCCCACTCTTCCTGATTTAT;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=159;WE=90794765;WS=90794747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr15	90794845	rs2882858	G	A	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=58;PP=1663;SC=CCAGCCCGTCGCTCACACTGT;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=79;WE=90794853;WS=90794835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	90796558	rs12912620	G	A	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=58;PP=2438;SC=GACAGACTGCGCTGTCTCACT;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=138;WE=90796566;WS=90796548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	90796704	rs12914094	C	T	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=1063;SC=GTGGCTGTCCCCTTGTGCAGA;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=90796712;WS=90796694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	90798953	rs2063739	C	T	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=46;PP=2358;SC=ATGCCACTTACTCTGGGGGCT;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=113;WE=90798961;WS=90798943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	90799282	rs1996179	A	G	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=15;PP=994;SC=CTCCAGGAAGAGCATGGACTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=90799290;WS=90799272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	90800293	rs2063741	G	A	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=43;PP=2341;SC=TTAGCTATGTGTGTGAAGCAC;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=90800301;WS=90800283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	90800408	rs2063742	C	G	5731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=89;PP=2965;SC=ATATGCGAGTCTACGTCCTGA;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=171;WE=90800416;WS=90800398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr15	90800449	rs2063743	C	T	4267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=83;PP=2765;SC=CGGATCTTCACATATGAGGAG;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=141;WE=90800457;WS=90800439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	90801248	rs2048706	C	A	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=4;PP=1833;SC=ACTGGCCTTCCTCTGAGCACT;SOR=4.587;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=65;TCR=4;TR=69;WE=90801256;WS=90801238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	90801584	rs2048707	G	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=36;PP=1099;SC=GTACACTCAGGTGGTGGAACA;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=90801592;WS=90801574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	90805084	rs12592600	A	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=465;SC=ATGTGGGGCTAGCCAAAGATG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=90805092;WS=90805077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	90809633	rs9635390	G	A	4860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=75;PP=2922;SC=CAGATACGGTGAGACTCAGGA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=78;TCR=75;TR=153;WE=90809641;WS=90809623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr15	90818400	rs4533265	A	T	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=20;PP=1117;SC=CTGCCGCTGGATCCTGACCCT;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=90818408;WS=90818390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	90818469	rs12595409	C	T	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=39;PP=1878;SC=CGGCTGGCTGCAGTCGAGCGA;SOR=0.988;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=97;WE=90818477;WS=90818459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	90818641	rs56294733	G	C	6039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=75;PP=2965;SC=CTGGTGATCTGTTTCATCCTC;SOR=1.057;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=109;TCR=75;TR=182;WE=90818649;WS=90818631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr15	90818827	rs4595780	G	A	5582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=101;PP=2965;SC=AACTGGGCCTGCGGCTTTGGG;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=171;WE=90818835;WS=90818817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr15	90976811	rs67352281	TGAATGCCACCGATGTTTTCTAA	T	1181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=7;PP=2957;SC=AGTTATTTGCTGAATGCCACC;SOR=1.528;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=12;WE=90976840;WS=90976801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	91017232	rs1145325	G	A	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=82;PP=2965;SC=GGCCATTAGGGGCAATTTTGC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=165;WE=91017240;WS=91017222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr15	91040725	rs2301832	A	T	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=46;PP=1336;SC=TGAGGGTTTCAGCATGTCTGG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=91040733;WS=91040715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	91043192	rs72311245	ATGTTTTGTTT	A	1628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=8;PP=2990;SC=AACTGTCAAAATGTTTTGTTT;SOR=2.494;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=19;WE=91043209;WS=91043182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	91083353	rs8033595	G	A	5207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=92;PP=2965;SC=CTGCGGAGCAGTGCGTCAGAG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=77;TCR=92;TR=169;WE=91083361;WS=91083343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr15	91141810	rs7180867	A	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=386;SC=AGATCCTAACATGAGTGTCTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=91141818;WS=91141800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	91147512	rs1104880	A	G	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=56;PP=2466;SC=ACTCTTGCAGAGCGAGGTGAG;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=125;WE=91147520;WS=91147502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr15	91181567	rs6496717	C	T	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=467;SC=CACAGAACACCGCGGTGAGGA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=91181575;WS=91181557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	91419432	rs11372849	T	TC	1739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=1203;SC=GTCCCCCGCCTCCCGGGGACT;SOR=1.524;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=32;WE=91419440;WS=91419422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	91419490	rs73489557	C	T	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=46;PP=1550;SC=TGCAGATCTTCGGGGACTATT;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=91419498;WS=91419480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	91420940	rs2071410	C	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1239;SC=GCCACTTTCCCACTGTGGATC;SOR=1.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=91420948;WS=91420930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	91420973	rs1573643	T	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=32;PP=789;SC=GGCTGTTCCATGGAGGGTTCC;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=91420981;WS=91420963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	91421283	rs1573644	T	C	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=1;PP=163;SC=GGTGCAGGGCTGGGTGTGCTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=91421291;WS=91421273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	91422543	rs8039305	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=5;PP=974;SC=AGCTGGGACCTGGGGTTCTTG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=91422551;WS=91422533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	91423543	rs6224	G	T	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=444;SC=CAGCGCCGCCGCCTCTCACAG;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=91423551;WS=91423533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	91423988	.	G	T	2432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.184;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=39;PP=1326;ReadPosRankSum=2.936;SC=CTGGGATGAGGATCCCTCTGG;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=96;WE=91424004;WS=91423978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,117:0.51:230
chr15	91424574	rs6226	G	C	8228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=109;PP=2965;SC=GCCCTCCAGGGTTCGCCCCCC;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=147;TCR=109;TR=256;WE=91424582;WS=91424564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr15	91425232	rs6227	C	T	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=222;SC=GTGGAGACTGCTTCCCATCCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=91425240;WS=91425222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	91428521	rs11330240	CT	C	5433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=67;PP=2957;SC=TGGGTGCTGGCTGTATCTGCC;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=23;TCR=73;TR=88;WE=91428529;WS=91428511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	91428955	rs1894400	C	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=467;SC=AACCTTGATGCAGCTTCCTCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=91428963;WS=91428945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	91430436	rs2071383	T	C	7168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=137;PP=2965;SC=GTGACAAGGCTAAGGACAAGT;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=104;TCR=137;TR=241;WE=91430444;WS=91430426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr15	91437388	rs2521501	A	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=767;SC=CCCACCAGGCAGAATAAGAAT;SOR=2.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=91437396;WS=91437378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	91449015	rs2072078	A	G	5872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=94;PP=2965;SC=TGGCCAATACAAGGGAGGGAC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=96;TCR=94;TR=190;WE=91449023;WS=91449005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr15	91450441	rs2677744	G	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=2;PP=973;SC=TTACAGCCTCGCGGTCTATCA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=91450449;WS=91450431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	91452595	rs2106673	A	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=43;PP=1954;SC=AAGAAGTCCCAGCTGTTCCGA;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=91452603;WS=91452585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	91452829	.	G	GC	193	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=67.08;NF=0;NR=7;PP=193;QD=31.1428571429;SC=CGGGCAGGGTGCCCCCCTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=91452837;WS=91452819;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,7:0.64:11
chr15	91452836	rs2677748	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.96;QD=26.09;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	91455618	rs6496737	C	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=35;PP=1349;SC=GCCACCTGACCCACAGTGGAC;SOR=1.355;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=91455626;WS=91455608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	91456102	rs1266492	T	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=49;PP=2235;SC=CTGCTCTTTCTCTAGCCCTAC;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=117;WE=91456110;WS=91456092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	91474738	rs1052535	G	C	5673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=86;PP=2965;SC=GTTCCTGATGGAATGAGCTGT;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=92;TCR=88;TR=178;WE=91474746;WS=91474728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr15	91478544	rs17635974	A	C	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=18;PP=861;SC=GCACGAGACAACCTCTCCGCG;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=91478552;WS=91478534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	91479054	rs2289619	T	C	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=707;SC=TGCCAGATGTTTTTTGCACCT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=91479062;WS=91479044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	91482935	rs12440774	G	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=22;PP=891;SC=GCCGTGATTTGTTCCATGCTT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=91482943;WS=91482925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	91491206	rs10635983	C	CCT	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=1645;SC=GGGCCTCCTCCGTCCTGCTCT;SOR=1.828;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=34;WE=91491214;WS=91491196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	91500260	rs11073963	A	G	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=314;SC=TTGGTCCCCAATTCGACCCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=91500268;WS=91500250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	91500296	rs10852140	T	C	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	91503049	rs6496741	A	G	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=10;PP=675;SC=TGTCCCCAGGAGCGGATGCGA;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=91503057;WS=91503039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	91503752	rs1867220	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=20;PP=471;SC=GGAGGCACTCTGCTCCACTCG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=91503760;WS=91503742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	91509734	rs14280	A	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=18;PP=1400;SC=TCATACATGCATACCCCCAAC;SOR=2.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=91509742;WS=91509724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	91513832	rs139256619	GGGA	G	2362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=1729;SC=AAATGACTATGGGAGGAGGCA;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=37;WE=91513842;WS=91513822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	91517780	rs12898311	G	C	5654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=48;PP=2965;SC=TACTTTCTTCGTCTTTTCCCA;SOR=1.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=122;TCR=48;TR=169;WE=91517788;WS=91517770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr15	91522597	rs28384140	T	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=62;PP=2082;SC=AATCCCCGATTCCCTAAAATG;SOR=1.199;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=100;WE=91522605;WS=91522587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	91523713	rs1867226	C	G	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=47;PP=1402;SC=AATTATAATGCAAAGCCACAA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=91523721;WS=91523703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	91524841	rs7172758	G	T	7401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=120;PP=2965;SC=GTGGTCTAATGCTTCCATACA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=226;WE=91524849;WS=91524831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr15	91525318	rs11857612	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=522;SC=GTTAAACTAACAAGTAAGTCA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=91525326;WS=91525308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	91527451	rs8031684	T	A	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=95;PP=2801;SC=TCCTCAAATTTCTTTTTTCTT;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=122;WE=91527459;WS=91527441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	91543761	rs11073964	C	T	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=TAAGCACCACCGAAGACGTAA;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=165;WE=91543769;WS=91543751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr15	91546497	rs4244883	T	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=381;SC=AGAGTATACATTTGGTTCTAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=91546505;WS=91546487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	91556937	rs77477989	G	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=6;PP=900;SC=AACAGAAAACGAACGGAGACA;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=91556945;WS=91556927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	91557186	rs1972926	C	T	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=35;PP=1023;SC=CAGTGGTTCACGCCTGTAATC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=91557194;WS=91557176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	91557674	rs111274092	GAA	G	5886.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=104;PP=2973;SC=CTATGAGAGAGAAAGAAAAAA;SOR=1.640;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=121;TCF=12;TCR=109;TR=116;WE=91557685;WS=91557664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	91560367	rs11857433	G	T	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=41;PP=1177;SC=ATTATTGAGGGCTTCCTAATT;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=91560375;WS=91560357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	91561061	rs11542638	G	T	6921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=102;PP=2965;SC=TTGGCAATTCGATCCAAAGGG;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=107;TCR=102;TR=209;WE=91561069;WS=91561051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr15	91827534	rs7169561	T	A	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=355;SC=AAATTTTCCCTTTTATTAAAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=91827542;WS=91827524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	92293868	.	G	GTCATGGGGGCAGCGACGGTAC	505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.86;QD=38.90;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	92293882	rs377140320	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	92293887	.	T	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	92293889	.	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	92293891	.	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	92293894	.	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	92293902	.	T	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	92293908	.	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	92432263	rs35188337	CA	C	201.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.62;QD=22.42;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	92459187	rs4077721	T	C	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=736;SC=GGCATCTTCTTGGATTGGCTC;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=92459195;WS=92459177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	92647645	rs1517618	G	C	4253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=57;PP=2189;SC=CGCACTCAGAGCCCGCCATGG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=120;WE=92647653;WS=92647635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr15	92647834	rs917355	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=358;SC=GGGGTGATGAATGAAGGGGTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=92647842;WS=92647824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	92663630	rs6496893	A	G	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=16;PP=1732;SC=AGGAGCAGGGAGCTATAAGAT;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=75;WE=92663638;WS=92663620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	92714879	rs2240589	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1369;SC=CACTTTATTGCTTTGACTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=92714887;WS=92714869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	92715131	rs2270061	A	T	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=46;PP=1399;SC=AGAACAGCCCACCACCACCCA;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=92715139;WS=92715121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	92715167	rs2270060	C	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=717;SC=TCACTTAGCGCGCTCCTCCCT;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=92715175;WS=92715157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	92937268	rs3743365	G	T	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.31;SOR=2.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	92937276	rs3743364	C	T	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	93015427	rs1455773	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1160;SC=CTTGCACCCGGCTGACCCCCA;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=93015435;WS=93015417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	93016128	rs13380006	C	T	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=26;PP=2252;SC=CACTGCACTGCTGTTTCTGTG;SOR=2.153;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=103;WE=93016136;WS=93016118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	93043545	rs7178722	T	G	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=28;PP=1616;SC=GGCTCCATGCTAATGACCTCG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=81;WE=93043553;WS=93043535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	93198513	rs503112	C	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=10;PP=958;SC=CCCTGTCGGCCGGCGGGGGAA;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=93198521;WS=93198503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	93198671	rs501381	A	G	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=58;PP=2100;SC=AGGCGTCGCCACTGCTGTTGG;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=93198691;WS=93198661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	93198678	rs68056278	TTGGAGC	T	4336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=46;PP=2975;SC=GCCACTGCTGTTGGAGCTGGA;SOR=1.122;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=57;WE=93198691;WS=93198661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	93198784	rs2438194	A	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=726;SC=GGTTCGGGCCACGGCGCGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=93198792;WS=93198774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	93306602	rs11634113	TG	CA	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.64;QD=42.43;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	93339219	rs7164758	T	C	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=65;PP=2292;SC=CAGCAGCAGCTGGGATTATGC;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=117;WE=93339227;WS=93339209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	93339701	rs28575385	A	T	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=54;PP=2447;SC=ATGCCTAGAAATCAGAAGGGC;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=120;WE=93339709;WS=93339691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	93447631	rs1439619	T	G	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=20;PP=1175;SC=ACGGCTCCCCTGGGGGGCGGG;SOR=1.545;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=93447639;WS=93447621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	93496874	rs1371390	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=386;SC=TTAAAGCCTTCAGTAGATCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=93496882;WS=93496864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	93510603	rs4777755	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=590;SC=AGGGGAGAGAAAATGGCTACC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=93510611;WS=93510593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	93515798	.	G	GA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	93515801	.	G	GTCTTAATTTTTACTTGCATGCCTTTAGGCTA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	93521604	rs11074121	A	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1152;SC=GAATTGGTCAAAAGAAGCAGG;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=93521612;WS=93521594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	93521651	rs11074122	T	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=25;PP=706;SC=GCTTTAGGGTTGGGGGCCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=93521659;WS=93521641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	93522312	rs2272461	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=262;SC=CTCTTTTTTTGGGGGGGTTGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=93522320;WS=93522302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	93527794	rs2272459	A	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=627;SC=AGAAGTGTTGATTATTCAAAG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=93527802;WS=93527784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	93536197	rs2272457	C	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=11;PP=357;SC=TGCAGGAATACGAAGAGCAGC;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=93536205;WS=93536187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	93540089	rs11630582	T	C	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=21;PP=1416;SC=GCCAGAGATATATTCAGAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=93540097;WS=93540079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	93552330	rs12915582	C	T	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=21;PP=1141;SC=ACAAGACTTACTTTCTGCAGA;SOR=1.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=93552338;WS=93552320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	93555717	rs2119010	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=27;PP=859;SC=ACAAATACCAATTCCACAGAA;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=93555725;WS=93555707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	93563661	rs964034	G	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=287;SC=GTTTTGTTTTGTGGGTCATAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=93563669;WS=93563651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	93567527	rs12905032	CC	TT	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=17;PP=1910;SC=TGAGGAAGAGCCAAGTGGGTA;SOR=1.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=46;WE=93567536;WS=93567517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	93567864	rs12906163	A	C	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=58;PP=1720;SC=CCTGGATCATAGGTCTCCTTT;SOR=1.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=97;WE=93567872;WS=93567854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	93588264	rs4299103	G	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=10;PP=1227;SC=GGAGCGGGACGAGGGCGCCCA;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=93588282;WS=93588254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	93588336	rs4238485	A	C	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=52;PP=2965;SC=CCCGAGTCCTATCATACAGGT;SOR=1.464;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=102;TCR=52;TR=154;WE=93588344;WS=93588326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	93588969	rs67584445	G	A	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=63;PP=1983;SC=GAGTGGGTGAGGCACAGTGGG;SOR=1.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=93588977;WS=93588959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	93595855	rs1997382	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=621;SC=GAGCCACCCATGCCACACACA;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=93595863;WS=93595845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	93609617	rs4778090	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=19;NR=45;PP=1410;SC=GCGTGACTCCAGGTGGGGGAA;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=64;WE=93609625;WS=93609607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	93616283	rs112633977	A	AAGG	5391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=53;PP=2975;SC=TTCAGAAAAAAAGAAGAAAAT;SOR=0.945;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=60;WE=93616291;WS=93616273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	93616864	rs72645174	A	C	10508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=141;NR=164;PP=2965;SC=CAGACGCGACACCGGTGCAGG;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=141;TCR=164;TR=305;WE=93616872;WS=93616854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr15	93616933	rs55816698	C	G	9093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=159;PP=2965;SC=CTCTGCATCTCAGCTACTAAC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=117;TCR=159;TR=276;WE=93616941;WS=93616923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr15	93616975	rs4598860	A	G	5971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=0.826;SC=TCGTGGCCCCAGGCCACCCAT;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=75;TCR=127;TR=200;WE=93616983;WS=93616964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,224:0.99:226
chr15	93844616	rs12914371	T	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=198;SC=GACTTCTTAGTGGTAGCACCT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=93844624;WS=93844614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	93844762	rs12909691	C	T	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=37;PP=1997;SC=TTCGTCCAACCTTTTGGATTG;SOR=1.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=97;WE=93844770;WS=93844752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	93844836	rs34239935	G	A	6225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.15;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	93844843	rs12914719	T	A	6303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	94304132	rs12905790	C	T	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=9;PP=2047;SC=TAAAATAAAACAGCTGAGATG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=81;WE=94304140;WS=94304122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	94304189	rs12910750	T	C	6311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=64;PP=2965;SC=GGTGATTTAATTGAAGTCACC;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=123;TCR=64;TR=187;WE=94304197;WS=94304179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr15	94857347	rs294553	T	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=9;NR=4;PP=208;SC=GGATGACACCTCTGCATCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=94857355;WS=94857337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	94857890	rs294552	G	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=167;SC=CTTAGCCACAGGATCGATTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=94857898;WS=94857880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	94858889	rs12101974	T	G	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=79;PP=2862;SC=TCTGTTATGGTGGGTGTAGCC;SOR=1.135;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=132;WE=94858897;WS=94858879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	94858980	rs8024196	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=41;PP=1217;SC=GATAGACAGTGGCTCAAATCT;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=94858988;WS=94858970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	94945719	rs7178698	G	T	6570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=79;PP=2965;SC=ATTCAGCACCGCAAAGAGGAA;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=120;TCR=79;TR=199;WE=94945727;WS=94945709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr15	94945882	rs68179993	C	T	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=89;PP=2734;SC=GACTTCACAGCTGGCCTCATG;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=35;TCR=89;TR=124;WE=94945890;WS=94945872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	96876611	rs7173047	T	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=13;PP=407;SC=CCTCGCCGGCTTTCCCCGGCC;SOR=1.358;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=20;WE=96876619;WS=96876601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	96880510	rs3833035	ATTC	A	1702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=1184;SC=TGATGACTGAATTCTTCTTCT;SOR=2.419;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=25;WE=96880520;WS=96880500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	97327393	rs3812907	C	T	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=2162;ReadPosRankSum=1.020;SC=AACCTCGTCGCGACATTTCTC;SOR=0.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=112;WE=97327401;WS=97327383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr15	97940925	rs7166971	G	C	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=37;PP=2278;SC=TTCCCAACACGATGAATTGAT;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=97940933;WS=97940915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	98301845	rs2048115	C	T	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=27;PP=936;SC=TTTTTTCCAGCTTTAAGTTCA;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=98301853;WS=98301835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	98302002	rs143322276	TAAC	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=215;SC=GAACAATTTTTAACAATAGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=98302012;WS=98301992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	98504100	rs4965046	G	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=21;PP=1252;SC=GGATGGGCGGGGAGGCTGGGT;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=98504108;WS=98504090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	98504322	rs112100339	C	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.29;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	98504326	rs12101554	A	G	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.44;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	98512622	rs5814833	CT	C	2050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=44;PP=1465;SC=AAGCAAAGCTCTTTTTTAAAA;SOR=1.712;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=46;WE=98512630;WS=98512612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	98513845	rs2130882	T	C	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1310;SC=AGATGTGGTATCAGAGGAAGA;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=98513853;WS=98513835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	98514282	rs62023730	A	G	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=32;PP=2693;SC=GCATATAACCATCATATAATT;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=107;TCR=32;TR=139;WE=98514290;WS=98514272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	98514489	rs3803385	A	G	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=75;PP=2238;SC=CTTTTTGGGAAAGAGACAGGA;SOR=2.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=23;TCR=75;TR=98;WE=98514497;WS=98514479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	98995052	rs56374714	G	GT	3219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=30;PP=2458;SC=CACAAGGGGGGTTACCTTGGT;SOR=1.119;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=58;WE=98995060;WS=98995042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	98995081	rs12101356	A	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=42;PP=2026;SC=GGAGACATCGAGCAGCTAACC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=97;WE=98995089;WS=98995071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	99192745	rs369532761	TTTTC	T	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.68;QD=42.67;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	99251356	rs7174918	C	T	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=23;PP=873;SC=ATGCTGACTGCTGCTTTCTCT;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=99251364;WS=99251346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	99456553	rs951715	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=465;SC=ACACTTCTTCGCAAGCTCACT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=99456561;WS=99456543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	99465473	rs3743262	C	T	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=35;PP=1587;SC=ACAACATCACCGACCCGGAAG;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=99465481;WS=99465463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	99467942	rs3841650	GGT	G	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=1150;SC=GAAGAAACGTGGTAAAACTGA;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=24;WE=99467951;WS=99467932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	99472734	rs4486868	T	C	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=32;PP=2136;SC=AGAAATGAAATGAGCAAATTG;SOR=1.592;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=79;TCR=32;TR=111;WE=99472742;WS=99472724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	99477911	rs2715449	T	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=528;SC=AAAGTTGACATCAAGCCATGC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=99477919;WS=99477901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	99478225	rs2229765	G	A	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=33;PP=1132;SC=GCATGCGTGAGAGGATTGAGT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=99478233;WS=99478215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	99478493	rs10400894	T	C	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=136;SC=AACACAGGCATCAGCAAGGGC;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=99478513;WS=99478483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	99478505	rs34389972	A	AC	283.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=250;SC=AGCAAGGGCCACCTGACCCTC;SOR=2.093;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=99478513;WS=99478483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	99478713	rs2293117	T	C	4722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=72;PP=2612;SC=TTTTCCTTTATAATCTCCCTG;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=137;WE=99478721;WS=99478703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr15	99492045	rs2684789	G	A	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=824;SC=CTGGTCCTGCGCCTCCCTTGC;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=99492053;WS=99492035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	99492061	rs17847195	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=24;PP=662;SC=CTTGCCAGGCGTGGCTAAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=99492069;WS=99492051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	99500256	rs2593053	G	A	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=30;PP=2015;SC=GCGCCCTCCCGGTTTGGACCC;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=94;WE=99500264;WS=99500246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	99511793	rs1521484	C	G	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=69;PP=2732;SC=TCCAGCATTTCCTGGATGATG;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=128;WE=99511812;WS=99511783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	99511804	rs5814919	A	AC	5690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=69;PP=2971;SC=CTGGATGATGACTCTCAAGGC;SOR=0.906;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=85;WE=99511812;WS=99511783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	99514431	rs199848298	GGGGGGGGGT	G	420.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.99;MQRankSum=-3.307;QD=32.34;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr15	99544429	rs2593051	G	A	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=19;PP=1758;SC=GAGAGTCCGCGGCTTCATTCT;SOR=1.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=99544437;WS=99544419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	99646107	rs60530833	A	AG	2094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=1344;SC=CGCAGGAGGCAAGGCGCTGCG;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=32;WE=99646115;WS=99646097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	99653666	rs2305446	C	T	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=9;PP=1048;SC=TGTTTAATAACGCCGGGTGTT;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=99653674;WS=99653656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	99653800	rs2305445	T	C	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=60;PP=2490;SC=CTTTAGAGAGTGATTGACTGC;SOR=0.879;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=132;WE=99653808;WS=99653790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	99670989	rs3743248	T	C	6322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CCAAGCAGCCTCAGGAGAACA;SOR=0.241;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=191;WE=99670997;WS=99670979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr15	99671760	rs260087	T	C	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=55;PP=2311;SC=GCATTCGCTTTAGGCGTTGGG;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=99671768;WS=99671750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	99671906	.	C	T	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1457;ReadPosRankSum=0.393;SC=TTTGCCCAGTCACAGGTGCTG;SOR=0.785;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=169;TCF=102;TCR=67;TR=89;WE=99671914;WS=99671896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,104:0.53:198
chr15	99672722	rs2292288	A	G	5817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=87;PP=2965;SC=GATAGTGCAGAGGACACATCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=172;WE=99672730;WS=99672712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr15	99701857	rs3803472	A	G	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=32;PP=1833;SC=CACACAGTAGATGCTTAATGG;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=99701865;WS=99701847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	99715352	rs2602016	A	G	3859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=60;PP=2700;SC=TCAGGATGATAAGATGTGCCT;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=126;WE=99715360;WS=99715342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	99798934	rs7162949	G	A	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=40;PP=1749;SC=CCTGTGGCTTGTATTCACTTT;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=99798942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	99799750	rs1976589	T	C	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=81;PP=2965;SC=ACAGAATCTCTGTGTGCTTTG;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=145;WE=99799758;WS=99799740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	100230790	rs3730280	A	G	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=531;SC=AGACAAGTCTATTTCAAATAC;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=100230798;WS=100230780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	100230908	rs325385	T	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=103;SC=AAGCCAGGCATAGAAAGATAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=100230916;WS=100230898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	100243487	rs34131461	GT	G	2227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=17;PP=1857;SC=GTCCAAATATGTTTTTTCTAA;SOR=2.334;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=59;WE=100243495;WS=100243477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	100246834	rs325409	T	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=394;SC=GAAAATGACATTCATATGAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=100246842;WS=100246824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	100246936	rs325408	T	C	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	100246942	rs325407	G	A	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=1.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	100251015	rs325403	C	G	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=59;PP=1714;SC=CCTACACACTCTCTTTTCCTA;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=88;WE=100251023;WS=100251005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	100269309	rs6598263	T	G	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=10;PP=1701;SC=AAGCTGGGCCTAGTCTTTAAA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=65;TCR=10;TR=75;WE=100269317;WS=100269299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	100269613	rs11852387	C	T	8625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=123;PP=2965;SC=TCGGAGGTGCCGGGAGCAGTG;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=138;TCR=123;TR=261;WE=100269621;WS=100269603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr15	100269796	rs6598264	A	G	4613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=88;PP=2965;SC=CTGTGGTCTCAGAAGACGGGC;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=63;TCR=88;TR=151;WE=100269804;WS=100269786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr15	100331253	rs1060457	G	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=19;PP=771;SC=GGCCCTAGTTGTGCCTCCTCG;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=100331261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr15	100332799	rs11639102	A	C	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.59;QD=45.37;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	100332807	rs11633999	C	T	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.40;QD=43.13;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	100339897	rs12910401	T	C	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=33;PP=1321;SC=GTGTTGATGTTGCCGATGATG;SOR=1.064;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=100339905;WS=100339887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	100339938	rs12905599	C	T	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=38;PP=1321;SC=GTGGTGCATGCGCAGCATCTC;SOR=0.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=69;WE=100339946;WS=100339928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	100339984	rs202154374	G	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQRankSum=0.073;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.931;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr15	100341157	rs12916271	T	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=13;PP=1421;SC=ACCTGCATCCTCAGTGCCACA;SOR=2.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=100341165;WS=100341147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	100345136	rs202231117	TA	T	1606.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.50;QD=26.78;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	100353107	rs8037668	T	C	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=56.28;NF=4;NR=0;PP=73;SC=ATTAAAAAGATATATTCAAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=100353115;WS=100353097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	100533218	rs7175995	C	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=960;SC=CCCTGCACTGCGGCACGGAGA;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=100533226;WS=100533208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	100537494	rs12900132	C	T	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=14;PP=1524;SC=GACCTGGGGGCGAGCGAGGGC;SOR=2.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=100537502;WS=100537484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	100603776	rs6598297	T	A	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=28;PP=1961;SC=AACACAGGCGTGAAACCAGCC;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=94;WE=100603784;WS=100603766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	100649465	rs142688382	C	CCAGCTCCTCTAAACACGCGGCA	1018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=2900;SC=GGTACGCGCTCCAGGAAGCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=100649481;WS=100649455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	100649473	rs75158695	C	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=219;SC=CTCCAGGAAGCGGAAAAAGAC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=100649481;WS=100649455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	100649512	rs35121839	A	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=627;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=113;SC=ACAGTGCAGGACTGAGCTCTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=100649520;WS=100649502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	100672237	rs12907333	T	G	5731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.05;NF=86;NR=97;PP=2965;SC=TTCCTCTGCCTGAAGCGGGCT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=183;WE=100672245;WS=100672227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr15	100673651	.	A	G	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=431;SC=CCAGAGGGTCATAAGTCTGTA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=100673659;WS=100673641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	100739405	rs12148118	T	C	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=15;PP=1497;SC=GGGTCCTTTATTGCAGATGCA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=100739413;WS=100739395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	100739757	.	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.462;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=0.300;SC=CTATGAGCCTCAGCCCACCTG;SOR=0.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=100739765;WS=100739747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr15	100801698	rs4965613	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=14;PP=634;SC=TCACAAACACGGCAGCATCCA;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=100801706;WS=100801688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	100801965	rs6598316	G	T	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=433;SC=GATGACTCACGGCCCTCGAAG;SOR=3.014;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=100801973;WS=100801955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	100802495	rs4965296	G	A	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	100802499	rs4965297	A	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	100889496	rs2289584	T	G	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=54;PP=1998;SC=GACAGCTCGATTCTGATGGGC;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=97;WE=100889504;WS=100889486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	100942962	rs2439928	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=17;PP=922;SC=CTCTCAGCCCTGAGGCCGTTC;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=100942970;WS=100942952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	100996076	rs11323964	AT	A	8111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=85;PP=2969;SC=ATTAAGAGCAATAATATTTGG;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=127;WE=100996084;WS=100996066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr15	101019529	rs2654574	C	T	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=17;PP=932;SC=AGGGATGACACAGTAGTGAAC;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=101019537;WS=101019519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	101019819	rs2587763	G	T	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=79;SC=ATTGACCTTTGCCATATTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=101019827;WS=101019809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	101020129	rs2587764	T	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=453;SC=CCTAAAGGAATTCACAGACAA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=101020137;WS=101020119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	101041896	rs1354332	T	C	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=46;PP=2965;SC=CAAATACACGTCTGATAATCA;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=90;TCR=46;TR=136;WE=101041904;WS=101041886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	101109358	rs28438569	A	G	239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=191;SC=AAACCCTTTTATGGTGATGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=101109366;WS=101109354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	101109677	rs8451	C	A	9080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=171;PP=2965;SC=GAACCAGAGGCCTTGATGGAG;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=116;TCR=171;TR=287;WE=101109685;WS=101109667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr15	101109794	rs12157	C	G	4366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=80;PP=2887;SC=CTAAACACTGCTCTGTGGATT;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=135;WE=101109805;WS=101109784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	101109818	rs12460	G	A	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=66;PP=2276;SC=CGTCAGAATCGTCAGAGCTGT;SOR=1.198;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=101109826;WS=101109808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	101109893	rs6598356	C	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=1355;SC=TGGTGTGAGCCCCCTTGGACA;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=101109901;WS=101109883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	101110265	rs2411836	T	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.28;NF=14;NR=20;PP=676;SC=CATTTTCATGTGTGTGATGGT;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=101110273;WS=101110255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	101110302	rs2411837	C	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=20;PP=636;SC=CTGAGTCAAGCTTTCAGTGGC;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=101110310;WS=101110292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	101110356	rs2411838	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.57;NF=4;NR=14;PP=321;SC=TGCAGATTAATGACCTTACAA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=101110364;WS=101110346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	101110372	rs3084804	AAC	A	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=604;SC=TACAAAAATAAACAGTTTTAC;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=101110381;WS=101110362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	101112342	rs1493652	T	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1059;SC=TATATATAAATTCATAGTGTC;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=101112350;WS=101112332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	101113748	rs2062816	C	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=411;SC=GGATAACATACAGCTTAAATT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=101113756;WS=101113738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	101113862	rs12719734	C	T	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=27;PP=1520;SC=TTACCTTTCACTTCACTTGCT;SOR=1.040;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=67;WE=101113870;WS=101113852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	101113950	rs12592868	A	G	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=38;PP=2527;SC=CATGATCTGGACTAGTGATAA;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=108;WE=101113958;WS=101113940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	101114418	rs8039437	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=60;PP=1728;SC=AAATGGTGTCGAAATGAGTCA;SOR=1.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=84;WE=101114426;WS=101114408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	101115448	rs4965678	C	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=81;SC=ATATGTGGCACACCGAGAAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=101115456;WS=101115438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	101120963	rs11247226	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=46;PP=1205;SC=AGATAAAAGATGTAATCATGG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=101120971;WS=101120953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	101152745	rs4965683	A	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1024;SC=TACTCAACATATTATTCTCTC;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=101152753;WS=101152735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	101555399	rs2034809	G	A	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=12;PP=2407;SC=TGCAGCGTGCGCCCCTGCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=84;TCR=12;TR=95;WE=101555407;WS=101555389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	101555714	rs753930	T	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=458;SC=TCCCCTTCAATGCCCTGTTGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=101555722;WS=101555704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	101561980	rs146724273	CGTGTGTGTGTGT	C	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.897;NF=11;NR=2;PP=2727;SC=CACGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=13;WE=101561999;WS=101561970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr15	101562793	rs11247253	G	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=813;SC=CGGCTGGCTCGAGAGCCAAGG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=101562801;WS=101562783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	101566118	rs4427776	C	T	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=24;PP=1900;SC=TCTGTCCTGTCCCTTGTTCCA;SOR=1.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=101566126;WS=101566108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	101567971	rs41535348	C	T	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=94;NR=57;PP=2820;SC=CGCCCGACAACGACATCAAGG;SOR=1.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=94;TCR=57;TR=151;WE=101567979;WS=101567961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	101569467	rs11639307	T	C	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=45;PP=1354;SC=CGCCAGGCTGTGCAGGTTGCT;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=101569475;WS=101569457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	101588923	rs34698485	C	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=815;SC=CACCGCGGGGCCACGTCAGCA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=101588931;WS=101588913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	101591857	rs10710683	CG	C	2183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=17;PP=1535;SC=GAGTGCTGCTCGGGGGGCCCT;SOR=2.049;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=47;WE=101591865;WS=101591847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	101591923	rs4965778	A	G	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=39;PP=2081;SC=TAGCCCTGACAGCCACAGAGA;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=109;WE=101591931;WS=101591913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	101593051	rs4965781	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=9;PP=936;SC=CTCGGCCGTTGGGGCAAATGA;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=101593059;WS=101593041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	101593474	.	C	T	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=65;PP=1884;ReadPosRankSum=0.374;SC=TGAAGAACTTCTCCGAGTTCC;SOR=0.915;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=225;TCF=107;TCR=118;TR=114;WE=101593482;WS=101593464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,127:0.46:279
chr15	101598200	rs11857803	G	A	4758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=64;PP=2559;SC=CTCAGCGACCGCTGGCCCTGT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=101598208;WS=101598190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	101598314	rs11853661	C	T	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=64;PP=1778;SC=AGGAGTACACCGTGGTGTTTT;SOR=1.386;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=100;WE=101598322;WS=101598304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	101601367	rs148929418	C	CACTT	5439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.150;NF=30;NR=72;PP=2918;ReadPosRankSum=0.684;SC=CAGTTTCTGCCACTTACAGGA;SOR=0.877;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=102;WE=101601377;WS=101601357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,199:0.99:201
chr15	101607513	rs2925201	T	C	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=68;PP=2159;SC=GTCTACATGGTTGCAGTGATG;SOR=1.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=92;WE=101607521;WS=101607503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	101717680	rs8024370	G	T	5182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=101;PP=2965;SC=CCAGCTGCTGGGTGGACCCAT;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=176;WE=101717688;WS=101717670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr15	101718927	rs3743193	G	A	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=85;PP=2965;SC=AAGGAGGGAGGGATTCCCAGC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=160;WE=101718935;WS=101718917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr15	101871941	rs34318939	G	GA	3171.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=47;PP=2689;SC=CCAGGCAAGAGAGACACACAA;SOR=0.979;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=59;WE=101871949;WS=101871931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	101887767	rs2949	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=271;SC=TGCACGCACACGCATTCATGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=101887775;WS=101887757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	101887794	rs1030	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=397;SC=TCAACAACTGTTTGTGAGCCA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=101887802;WS=101887784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	101888081	rs875293	C	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=476;SC=GAGGAAGCGCCCGGGGTTGAC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=101888089;WS=101888071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	101910511	rs2073591	A	C	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=2032;ReadPosRankSum=1.304;SC=GTGAGCCCAGACCCCATCCCC;SOR=0.365;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=100;WE=101910519;WS=101910501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr15	101910550	rs20543	G	A	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=56;PP=2334;SC=CTCTTTGCCAGAAGTTGAGAC;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=122;WE=101910558;WS=101910540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	101922563	rs147147955	C	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=563;SC=GGACGGGTCCCCCTGAGGGCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=101922571;WS=101922553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	101970308	rs2643354	G	A	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=60;PP=2051;SC=GAAATGGCATGTGACAGCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=97;WE=101970316;WS=101970298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	101971388	rs2643356	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=616;SC=TCCTAATTCTTTCCAGCATAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=101971396;WS=101971380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	101972035	rs2643358	G	A	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=193;SC=CAGGAAAGCCGGTACTGCACA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=101972043;WS=101972025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	101984036	rs11855154	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=272;SC=TGTTTATAAACGTGAAGGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=101984044;WS=101984026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	102029475	rs201114579	C	CG	259.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=212;SC=TTCCCACGCGCGCGCGGGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=102029483;WS=102029465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	102029519	rs186935141	C	A	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=6;PP=323;SC=GAGGCGCCCCCCTCGCGCGCG;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=102029527;WS=102029509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	102029597	rs1135910	C	G	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=20;PP=623;SC=AGTTGAGGTACCCGTGCGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=102029605;WS=102029587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	102029685	rs199543153	G	GGC	1627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=740;SC=GCGCGGCGGGGGCGGAGCAGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=102029693;WS=102029675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	102191869	rs672314	G	A	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=15;PP=1575;SC=ATAACTACATGTATTTACTAG;SOR=2.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=68;WE=102191877;WS=102191859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	102192034	rs507903	A	G	6813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=115;PP=2965;SC=AGAAAACCTTATTTTGTGTGG;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=85;TCR=115;TR=200;WE=102192042;WS=102192024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr15	102192540	rs675436	T	G	10004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.69;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr15	102192548	rs2939587	A	C	9804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr15	102196186	rs572705	C	T	6442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=87;PP=2965;SC=CAGGAATCTACAGCCATGCTT;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=117;TCR=87;TR=204;WE=102196194;WS=102196176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr15	102211654	rs606511	T	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=577;SC=ATTAGAATATTAGTACTATAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=102211662;WS=102211644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	102248947	rs147739028	T	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=723;SC=CTAGTCTATATTGATTTTTAA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=102248955;WS=102248937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	102284597	rs62027633	A	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.003;NF=39;NR=29;PP=955;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CAGCTCACACAGAAGCCTGAA;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=68;WE=102284605;WS=102284587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,85:0.45:188
chr15	102284675	rs182931332	A	G	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.951;NF=31;NR=42;PP=972;ReadPosRankSum=0.441;SC=GAGCCCTTCCAGAACACAGCA;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=73;WE=102284683;WS=102284665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
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chr15	102312240	rs59860046	GA	G	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.83;QD=34.26;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr16	103517	rs183360	A	C	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=79;PP=2486;SC=GTGTTGCAGGAGAAGCGGTGG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=103525;WS=103507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	103923	rs2562145	C	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=933;ReadPosRankSum=-1.168;SC=AGACGGAGGCCGCGGGTGGGC;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=86;TCR=45;TR=66;WE=103931;WS=103913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr16	105320	rs216596	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.31;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	105325	rs2858042	G	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.31;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	105444	rs2541594	C	T	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=38;PP=1706;SC=CACTTCTGCCCTTGGTCTTTT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=105452;WS=105434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	106777	rs216597	G	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=1.482;SC=GCAGAGGGCAGCTGGAGGGGC;SOR=1.078;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=106785;WS=106767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr16	106952	rs11435836	G	GC	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=615;SC=GATGGCCACTGCACTTCCTGG;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=14;WE=106960;WS=106942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	107275	rs1045001	T	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=0.327;SC=TGCCCAACAGTAACTGTCAGC;SOR=0.653;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=12;WE=107283;WS=107265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr16	108585	rs216598	T	C	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=961;ReadPosRankSum=0.592;SC=TGATGAACCCTGAGATGTGGG;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=73;WE=108593;WS=108575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr16	108796	rs34941405	T	TG	1771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=26;PP=1330;SC=GCAGTGGGGCTGGCAGGCCCC;SOR=1.201;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=32;WE=108804;WS=108786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	109665	rs3213509	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.924;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr16	109671	rs216599	A	G	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=56;PP=1044;SC=GAGAAGGCACACCCTAGGGCG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=106;WE=109679;WS=109655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	110165	rs216600	T	C	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=33;PP=1867;SC=TGGCATTCTCTCCCACATGAC;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=87;WE=110173;WS=110155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	110925	rs2562146	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=-0.172;SC=AATCAGATGATGGTCTACGGG;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=11;WE=110933;WS=110915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr16	112151	rs216602	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=116;SC=TGGCGAATATACTGCGCAAGT;SOR=1.445;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=112159;WS=112141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	112513	rs216604	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=11;PP=1011;SC=TCTCTGCCCCTCTTCCCTGCC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=112521;WS=112503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	113883	rs10659183	G	GCC	5169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=57;PP=2967;SC=GGGGCAGCATGCTGCCCCCAG;SOR=1.315;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=73;WE=113894;WS=113873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	113886	rs11285099	GC	G	5200.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=57;PP=2404;SC=GCAGCATGCTGCCCCCAGGCC;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=73;WE=113894;WS=113873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	113970	rs2157115	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.974;NF=12;NR=23;PP=496;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AGCCACCCCCTGAACTGTTAG;SOR=0.733;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=35;WE=113978;WS=113960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr16	114089	rs60334577	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GCACTGAGTCCAGAGAAGGAG;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=9;WE=114097;WS=114079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr16	114535	rs2562147	A	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=16;NR=23;PP=753;SC=GAGAGCGGTCAGTATCCAGAA;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=114543;WS=114525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	115185	rs1366553	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GTGCTCAGCACCGACTTTCTC;SOR=0.657;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=16;WE=115193;WS=115175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr16	128176	rs76079375	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr16	128179	rs2562162	T	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.07;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	129223	rs710079	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=407;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AGCCGTCCATCGTCAGACGTG;SOR=1.167;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=22;WE=129231;WS=129213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr16	129266	rs2234890	G	GT	976.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.046;HP=4;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=1656;ReadPosRankSum=0.576;SC=GTGTCAGGGTGTTTGTGCCTC;SOR=0.271;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=26;WE=129285;WS=129256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr16	129277	rs710080	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.930;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=1656;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTTGTGCCTCATAACAACCCA;SOR=0.413;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=40;WE=129285;WS=129256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr16	129654	rs710081	C	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=688;ReadPosRankSum=1.157;SC=GGTTGGAGTTCTTCGACCAGC;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=48;WE=129662;WS=129644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
chr16	136888	rs743725	T	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=47;PP=1141;SC=GATGGGTGGGTGTGAGCCCAA;SOR=1.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=66;WE=136896;WS=136878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	138772	rs57321480	A	AG	5389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=41;PP=2957;SC=ATGCTCCGACAGCTGGCCAGC;SOR=1.292;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=87;WE=138780;WS=138762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	142825	rs2541618	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=355;SC=GGCAGGTGGGTCAGGACAGTG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=142833;WS=142815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	148352	rs2541616	G	A	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=807;ReadPosRankSum=0.140;SC=ACCCTGCACCGGGTATGCACC;SOR=1.057;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=41;WE=148360;WS=148342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr16	160668	rs808892	T	C	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=43;PP=1214;SC=GCCTCAGCCTTCCAAGTAGCT;SOR=3.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=160676;WS=160658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	180529	rs75187722	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=587;ReadPosRankSum=-0.235;SC=ACCTGGAATCGCCGTCCTGCT;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=39;WE=180537;WS=180519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr16	188331	rs146357256	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.995;SC=AGGCGGAGGGGGCCTGAGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=11;WE=188339;WS=188321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr16	203132	rs2541598	C	G	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.92;QD=27.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	203135	rs2858919	T	A	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.92;QD=27.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	223706	rs2541640	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=724;ReadPosRankSum=0.323;SC=CTGAGTGGGCAGCAGCCTGTG;SOR=0.911;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=35;WE=223714;WS=223696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr16	277458	rs1203974	G	A	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=161;SC=CCCATCAAATGCAATGAAAAG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=277466;WS=277448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	284833	rs7202423	T	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=1082;SC=AGCGGCGCGGTCGGGTGAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=284841;WS=284823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	325771	rs111978133	GT	G	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=77;SC=GCGCCCCCGTGTCCCCATGCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=325779;WS=325761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	325943	.	A	AG	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=51;QD=47.0;SC=GGGATGACCGACGTCCCGCCC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=325951;WS=325933;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	330661	.	C	CG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	330678	rs368146102	G	A	234.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=129;SC=GCCGCGCGCCGCCATGCTGGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=330686;WS=330668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	332558	.	CG	GG	175	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=13;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=19;MQ=59.49;NF=5,0;NR=4,6;PP=175,124;QD=21.0;SC=GGGAACGGGGCGGGGGGGGGA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=9,6;WE=332566;WS=332548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr16	332558	rs61572786	CG	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=8.280;HP=13;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5,0;NR=4,6;PP=175,124;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GGGAACGGGGCGGGGGGGGGA;SOR=2.799;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=9,6;WE=332566;WS=332548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr16	333146	rs421195	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TATCTGCCCCCGCCCCACGCG;SOR=1.201;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=333154;WS=333136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr16	334890	rs419949	G	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1814;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CCTGCAGGACGAGGACGTGGC;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=112;TCR=109;TR=103;WE=334898;WS=334880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,118:0.47:250
chr16	335373	rs2685127	C	T	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=59;PP=1384;ReadPosRankSum=0.173;SC=GTCAACCAGACGCTGGCTGCG;SOR=0.574;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=166;TCF=59;TCR=107;TR=96;WE=335381;WS=335363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,107:0.55:195
chr16	336396	rs400037	G	A	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=937;ReadPosRankSum=0.178;SC=TGGGATCAGCGGCCAGTTAAG;SOR=0.864;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=64;WE=336404;WS=336386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,80:0.57:140
chr16	336660	rs11647490	G	A	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.632;SC=TGGATGCCACGGCCAACGAGC;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=247;TCF=119;TCR=128;TR=111;WE=336668;WS=336650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,153:0.49:314
chr16	337017	rs449401	G	A	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.033;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1393;ReadPosRankSum=0.071;SC=AGGGGCGGGGGCAGGGGTAGG;SOR=0.399;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=84;WE=337025;WS=337007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,111:0.67:165
chr16	338332	rs11374767	A	AC	1301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.302;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.734;NF=2;NR=38;PP=1383;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GCGTGTCCACACCCCATCCCG;SOR=1.388;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=40;WE=338340;WS=338322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr16	339415	rs387467	G	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.581;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=575;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GTGCGGGGAGGGGGCACCCCA;SOR=0.184;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=34;WE=339423;WS=339405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
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chr16	339727	rs423749	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=0.184;SC=AGCAGCACCCCATTCAAACAC;SOR=0.846;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=17;WE=339735;WS=339717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
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chr16	348222	rs214250	C	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=1190;ReadPosRankSum=-1.330;SC=GGGGCCCTGACGATGGATCGC;SOR=0.633;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=65;WE=348230;WS=348212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,77:0.57:136
chr16	359953	rs2301522	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=471;ReadPosRankSum=-0.926;SC=TGGGCTGAGGACCGCAAAGCC;SOR=0.660;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=31;WE=359961;WS=359943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr16	396264	rs1805105	A	G	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1267;ReadPosRankSum=-2.407;SC=CATCGTCCTCATCCATGTCCT;SOR=0.743;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=88;WE=396272;WS=396254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,108:0.51:210
chr16	396482	.	A	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GCCTGGTCAAACATGGCAGGA;SOR=0.802;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=35;WE=396490;WS=396472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,40:0.28:143
chr16	419283	rs11434190	A	AG	1527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=1476;SC=AGGGGGGCCCAGGCAACTGCC;SOR=2.200;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=33;WE=419291;WS=419273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	456239	rs11391097	G	GC	1909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=1506;SC=TGGGCCTTCAGCCTGGACTGG;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=456247;WS=456229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	456291	rs11391098	G	GC	3957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=56;PP=2964;SC=CTGGGCAGATGCCCCGGGAGT;SOR=0.709;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=71;WE=456299;WS=456281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	456416	rs3743890	T	G	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=32;NR=38;PP=1331;SC=GCCTCTCCCATGGTCCCCTGT;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=70;WE=456424;WS=456406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	456483	rs3785290	T	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=31;PP=666;SC=CCAGAGGCTATGGGGATGTTG;SOR=3.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=456491;WS=456473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	476096	rs1883371	A	G	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=25;SC=CGGGGGCGGCACAACTGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=476104;WS=476086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	532248	rs9935319	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=438;SC=GTAGAGACAAATTTCACTTTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=532256;WS=532238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	532279	rs12917958	C	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=684;SC=TGGTCTTGAGCTCCTGGGTTC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=532287;WS=532269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	539088	rs3830847	T	TAA	2398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=47;PP=2179;SC=CGTGCATTGGTGAGAGAACTT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=49;WE=539101;WS=539078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	539093	rs74390230	G	C	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=44;PP=1261;SC=ATTGGTGAGAGAACTTGCTTT;SOR=3.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=539101;WS=539078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	602046	rs7196821	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=13;PP=548;SC=TCCCGCCACCTGCAGGTACTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=602054;WS=602036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	603471	rs11248937	A	G	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=693;ReadPosRankSum=1.984;SC=ACAGCCCCCCACTCACGCCAG;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=51;WE=603479;WS=603461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr16	677581	.	C	A	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.910;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1303;ReadPosRankSum=1.619;SC=ACCCCAGAGCCCCCCCCAGAA;SOR=0.411;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=165;TCF=71;TCR=94;TR=90;WE=677589;WS=677571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,115:0.56:204
chr16	679670	.	C	T	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=623;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CTGCTATGCCCGGCCCAGGGG;SOR=0.887;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=47;WE=679678;WS=679660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,60:0.40:151
chr16	679814	rs12447874	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=44;PP=1492;SC=AAGCCCCTCCTTGGCAGCTCC;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=679822;WS=679804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	704907	rs147314016	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=0.037;SC=ACGGCCGCACGCTCAGAGGCT;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=704915;WS=704897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr16	712127	rs10903018	A	G	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=35;PP=1800;SC=CTGGGGCAGAAGCCTCATCTG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=712135;WS=712117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	718514	rs7204542	C	G	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=27;PP=1360;ReadPosRankSum=-1.051;SC=AGGAGATCACCATCCCCGCGG;SOR=0.555;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=84;WE=718522;WS=718504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,99:0.61:162
chr16	734388	rs377610819	G	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=732;ReadPosRankSum=-1.455;SC=GCCATTGGCCGGCAGCTTCGT;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=55;WE=734396;WS=734378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr16	737086	.	G	A	3204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=2156;ReadPosRankSum=0.449;SC=GCTGGCTGGCGTCGCGGAACA;SOR=0.553;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=251;TCF=139;TCR=112;TR=134;WE=737094;WS=737076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,144:0.53:273
chr16	781757	rs72773426	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GCCAACCTCCCGAGCAGGGCC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=781765;WS=781747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
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chr16	815628	rs1737340	A	G	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=66;PP=2722;SC=GTGAGACCCCAATCCCCAGCC;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=143;WE=815636;WS=815618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
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chr16	818452	rs150425699	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=882;ReadPosRankSum=1.604;SC=GAGCGGCACCGCCCGGTGCGG;SOR=0.671;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=60;WE=818460;WS=818442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,63:0.53:119
chr16	820328	rs3765328	A	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CGTGGGGCCAACTTCTGGGCC;SOR=0.586;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=29;WE=820336;WS=820318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr16	820888	rs12599339	T	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=680;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CTGCCGAAGGTCTCATGGGCC;SOR=0.698;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=48;WE=820896;WS=820878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr16	821051	rs148502959	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=222;ReadPosRankSum=-1.109;SC=CCACAGCTTTCCTCTCACCCT;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=12;WE=821059;WS=821041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr16	823094	rs7185842	A	G	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=70;PP=2080;ReadPosRankSum=-2.039;SC=TGCCGCGCCCACCGGCCTCCC;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=206;TCF=92;TCR=114;TR=123;WE=823102;WS=823084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,134:0.61:220
chr16	823153	rs74001009	A	G	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=50;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CCTTGACCACATGCTGGCACT;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=84;WE=823161;WS=823143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,104:0.53:195
chr16	824098	rs9927150	T	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=130;ReadPosRankSum=2.021;SC=CAAGAACTTGTCCAAACTACT;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=10;WE=824106;WS=824088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	824141	rs72759403	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=168;ReadPosRankSum=-0.559;SC=AGGGAAAAGCTGGACCGGTGA;SOR=0.358;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=17;WE=824149;WS=824131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr16	824284	rs7206516	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=679;ReadPosRankSum=0.735;SC=GCCTTCCCACCTGGCACGAAG;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=42;WE=824292;WS=824274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr16	824480	rs7184062	C	T	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=514;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCTGTAGCCCCTCCAGTGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=29;WE=824488;WS=824470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr16	824837	rs140815068	CG	TA	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=1482;ReadPosRankSum=0.614;SC=CCCACCCACCCGAGCGAGGTC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=40;WE=824846;WS=824827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr16	825255	rs73491269	G	A	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1295;ReadPosRankSum=2.193;SC=ATGAAGGCCCGGCAGTCGGCT;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=80;WE=825263;WS=825245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,100:0.61:164
chr16	825471	rs150696995	G	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.047;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CCTGGAGGCCGCACCGTGACG;SOR=0.470;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=70;WE=825479;WS=825461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,80:0.57:141
chr16	825771	rs117928503	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.265;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=0.991;SC=GGATGCTGGGCGGGTGTAGAC;SOR=0.197;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=825779;WS=825761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr16	828844	rs1737342	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=1.188;SC=GCAGAAGGGCATGGGCCGCAC;SOR=0.534;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=8;WE=828852;WS=828834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr16	830626	rs144942000	C	G	4830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=1.986;SC=ACAGTGTGCACGTGTAGGTGA;SOR=0.688;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=332;TCF=167;TCR=165;TR=177;WE=830634;WS=830616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,213:0.56:382
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chr16	839262	rs569951	A	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=74;PP=2443;SC=TGAACTTCAGATCGGAGGAGA;SOR=0.923;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=134;WE=839270;WS=839252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
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chr16	840378	rs3765263	A	G	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=37;PP=1587;ReadPosRankSum=-1.110;SC=GAGGCCCAGAAGCTTTCAGAC;SOR=1.100;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=99;WE=840386;WS=840368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,109:0.47:234
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chr16	840769	rs3765266	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TGGGCCTCGGAGACGGAGTGG;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=840777;WS=840759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr16	841802	rs143006475	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=253;ReadPosRankSum=-2.693;SC=AGGCCGGGAGCGTCCTGTAGG;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=16;WE=841810;WS=841792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr16	842518	rs35387463	C	T	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1247;ReadPosRankSum=1.580;SC=GCTGTGCCTTCGGGAGGCGGC;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=85;TCR=92;TR=81;WE=842526;WS=842508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
chr16	842605	rs140200915	G	A	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1646;ReadPosRankSum=0.638;SC=GTGCATGGGCGGGCGCCACAG;SOR=0.690;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=100;WE=842613;WS=842595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,126:0.55:229
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chr16	842952	rs148512557	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=429;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CCTCCAGCAGCCCTTCTCCAC;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=35;WE=842962;WS=842942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr16	843318	rs141333944	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=1.179;SC=CACGGTGCCCGGACCTCAGGA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=9;WE=843326;WS=843308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr16	843994	rs202104015	CG	C	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CCCGGGGAGACGGGTGGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=844002;WS=843984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr16	844037	rs138362369	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=87;ReadPosRankSum=0.245;SC=CATCTAGCTTCAGCACCCCAC;SOR=0.116;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=844045;WS=844027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr16	845278	rs61753374	C	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=-0.159;SC=GCTACCCACCCTTCCTGCCCG;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=44;WE=845286;WS=845268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
chr16	845901	rs2982244	T	C	6311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=89;PP=2965;SC=GAGCACACATTTGTACAGCCT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=183;WE=845909;WS=845891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr16	847597	rs2294450	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=-0.224;SC=GGTGTTCTGGTCCCTCCTCCC;SOR=0.191;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=13;WE=847605;WS=847587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr16	848000	rs148471037	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=-2.819;SC=GACATGCCCTCGCATTGCTTC;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=29;WE=848008;WS=847990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr16	848717	rs146909074	G	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.282;NF=47;NR=32;PP=1282;ReadPosRankSum=0.721;SC=CGGGTGCGGGGCTCACAGGAT;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=79;WE=848725;WS=848707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,106:0.59:180
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chr16	855342	rs614048	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGTGCAGGGGATGGCCCTGCT;SOR=1.112;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=21;WE=855350;WS=855332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
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chr16	863355	rs138733834	AGGACGCCGGACCGACAC	A	3396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.037;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.090;NF=22;NR=25;PP=2928;ReadPosRankSum=0.630;SC=GGGACCGGCAAGGACGCCGGA;SOR=1.332;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=47;WE=863379;WS=863345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,90:0.50:181
chr16	863398	rs13337837	C	T	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=3;HapScore=1;MGOF=92;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=2.582;NF=52;NR=44;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GGGTCCACCCCGACTCCCATG;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=96;WE=863406;WS=863388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,99:0.56:178
chr16	863498	rs13333991	G	C	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=1720;ReadPosRankSum=0.323;SC=CGAATGTTTTGCTCCGTGCTG;SOR=0.676;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=103;WE=863506;WS=863488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,131:0.58:227
chr16	905559	rs4984949	A	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=1.829;SC=AGGCGCCAGGAGGAATTGTCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=905567;WS=905553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	984113	rs11248955	C	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=351;ReadPosRankSum=2.047;SC=CATCACTGCCCTCCGTGCATA;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=22;WE=984121;WS=984103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr16	997352	rs12446579	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=464;ReadPosRankSum=0.310;SC=GGCTACGCAGAGGCAGGTGGT;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=30;WE=997360;WS=997342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr16	997454	rs72769410	C	T	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1082;ReadPosRankSum=0.368;SC=AATGAAGCACCGAGGGCGGTG;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=72;WE=997462;WS=997444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr16	997473	rs12447306	T	C	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=975;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TGTCCCTGGGTGCTGGCGGCC;SOR=0.617;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=73;WE=997481;WS=997463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,88:0.51:171
chr16	997496	rs12445470	C	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=982;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCAGCGTCCCCTCCAGCCCTG;SOR=0.489;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=60;WE=997504;WS=997486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,70:0.53:133
chr16	997520	rs12447329	T	C	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=957;ReadPosRankSum=1.326;SC=CTGCTCTCAGTACTCTTTGAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=53;WE=997528;WS=997510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr16	1004449	rs117150036	C	T	3316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=1988;ReadPosRankSum=0.935;SC=GTACGAAAGACGAGATGCCCA;SOR=0.813;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=243;TCF=115;TCR=128;TR=125;WE=1004457;WS=1004439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,155:0.51:301
chr16	1004605	rs12448005	A	G	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=856;ReadPosRankSum=-0.841;SC=CTCTGCAGGGAAGCAGCCCCC;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=47;WE=1004613;WS=1004595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr16	1004694	rs3751666	A	G	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=724;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CAAAACAAGCATGACTAGGAA;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=43;WE=1004702;WS=1004684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr16	1004743	rs3751665	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=3.386;SC=GCTCAGAATGCGGGGCGAGGC;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=27;WE=1004751;WS=1004733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr16	1014119	rs11862542	A	G	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=697;SC=CATGGCCGATAAATACTTTGT;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=1014127;WS=1014109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	1021000	.	CCGG	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr16	1021004	.	AGGCCCCGCCCATTCTC	A	545.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr16	1031090	rs113250895	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=658;ReadPosRankSum=1.117;SC=ACTCGTATGGGCAGGGCGGCC;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=43;WE=1031098;WS=1031080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr16	1031161	rs75555675	C	A	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1121;ReadPosRankSum=2.540;SC=GTGCGCTGTCCGCAGACTCTG;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=75;WE=1031169;WS=1031151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,93:0.55:168
chr16	1031303	.	TGAGAGA	T,TGTGAGAGAGAGAGA	277.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.000;NF=1,5;NR=17,18;PP=251,755;ReadPosRankSum=1.465;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=18,23;WE=1031316;WS=1031293;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.64:14
chr16	1031311	.	A	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.18;MQRankSum=0.431;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	1034834	rs237674	T	C	6388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=73;PP=2965;SC=ACTTCAGCAATGTGGACATCT;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=119;TCR=73;TR=192;WE=1034842;WS=1034824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
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chr16	1035245	rs112081163	C	T	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1553;ReadPosRankSum=0.728;SC=GCTACGCACCCGGCCTCTACC;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=97;WE=1035253;WS=1035235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,114:0.59:192
chr16	1115842	rs143173222	CGGCA	C	4083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.861;NF=21;NR=32;PP=2421;ReadPosRankSum=-0.228;SC=GAGGCAGGAACGGCAGGCGGT;SOR=0.720;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=53;WE=1115853;WS=1115832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,104:0.58:179
chr16	1115904	rs66626263	G	A	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=-0.817;NF=62;NR=41;PP=1408;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CTGCCGGGCCGGAGGCGCCTG;SOR=0.907;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=240;TCF=139;TCR=101;TR=103;WE=1115912;WS=1115894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,114:0.40:282
chr16	1116169	rs7189857	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=519;ReadPosRankSum=1.006;SC=CTGGAGTTGCAGGTGAGGCCA;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=41;WE=1116177;WS=1116159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr16	1116220	rs34024516	T	TG	2448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=36;PP=1955;SC=CGGGCCGCCCTGGGGGACGCT;SOR=0.949;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=51;WE=1116228;WS=1116210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	1116243	rs35432067	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=448;ReadPosRankSum=-1.682;SC=GGTTTGACTTCTGGGGCTGGG;SOR=0.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=30;WE=1116251;WS=1116233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr16	1116445	rs530518	A	G	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=53;PP=2814;SC=GTTCGGGTCGAGGTCTGCAGC;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=128;WE=1116453;WS=1116435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	1129023	rs4988484	C	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1282;ReadPosRankSum=0.297;SC=CTGGTGTGTGCGGCCGGGCTG;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=101;TCR=57;TR=79;WE=1129031;WS=1129013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,86:0.49:175
chr16	1129193	rs4988487	C	T	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1915;ReadPosRankSum=0.282;SC=GCCCTTCGGCCCCGTCCTGTG;SOR=0.691;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=109;WE=1129201;WS=1129183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,121:0.51:236
chr16	1129384	rs35162372	G	A	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GCATGTCGCTGCCGCTCCTGG;SOR=0.740;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=83;WE=1129392;WS=1129374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr16	1129872	rs169068	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=722;ReadPosRankSum=1.553;SC=GCCACGGAGCCGCGTCCAGAC;SOR=0.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=38;TCR=102;TR=49;WE=1129880;WS=1129862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,54:0.35:154
chr16	1129912	rs642249	A	G	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=61;PP=1877;SC=AGGCCACGCCACCCGCGCACC;SOR=2.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=76;WE=1129920;WS=1129902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	1130927	rs116550527	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.95;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr16	1130927	.	CGG	TGA	515	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=3;PP=515;QD=43.7282980663;SC=GGCTCTGGCCCGGGAGAGGGA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=1130937;WS=1130917;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr16	1130929	rs78134725	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.95;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr16	1131181	rs12599155	C	T	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=61;PP=1292;ReadPosRankSum=0.822;SC=GGCACCTTGGCCTTGCTCTGA;SOR=1.073;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=185;TCF=50;TCR=135;TR=77;WE=1131189;WS=1131171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,88:0.42:210
chr16	1244877	rs9936834	G	A	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.96;SOR=1.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	1244877	.	GTGGCGGGGCT	ATGGCGGGGCA,ATGGCGGGGCT	780	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=28,55;NR=12,24;PP=780,607;QD=20.8366968716;SC=GCGCACACCCGTGGCGGGGCT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=40,79;WE=1244895;WS=1244867;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.51:79
chr16	1244887	rs3751661	T	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr16	1250559	rs8044363	T	C	7085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=151;PP=2965;SC=ACGCCTGGATTGCCATCTTCC;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=78;TCR=151;TR=229;WE=1250567;WS=1250549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr16	1252259	rs9934839	A	G	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=67;PP=2630;SC=CCAGCCTCAGACTGGCCACAG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=124;WE=1252267;WS=1252249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	1252441	rs4984636	T	C	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=67;PP=2528;ReadPosRankSum=-0.878;SC=CCGCATGTGGTCGGGGAGCAT;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=54;TCR=68;TR=120;WE=1252449;WS=1252431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,143:0.99:145
chr16	1255030	rs2974835	A	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=1;PP=268;SC=GGTGGGAGCCACGGGTGGGGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=1255048;WS=1255022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	1255040	rs56412134	GC	G	884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=610;SC=ACGGGTGGGGGCCCCAGATCA;SOR=3.816;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=16;WE=1255048;WS=1255022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	1255058	rs8052049	T	G	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=881;SC=TCAGTGCCGGTGAGGGGTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=1255066;WS=1255048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	1257731	rs12930875	G	A	3244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=47;PP=2046;ReadPosRankSum=-0.620;SC=CCCCACTCACGGGGCCCCTCA;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=218;TCF=134;TCR=84;TR=125;WE=1257739;WS=1257721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,147:0.58:252
chr16	1260021	rs8056494	G	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=641;ReadPosRankSum=1.092;SC=AGAAGCCGCCGCCTCATCCCA;SOR=0.381;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=36;WE=1260029;WS=1260011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr16	1260481	rs8063574	T	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1288;ReadPosRankSum=1.541;SC=CTGACATTGATCCCGGCAGCA;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=193;TCF=111;TCR=82;TR=90;WE=1260489;WS=1260471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,108:0.47:230
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chr16	1261024	rs2738898	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=243;ReadPosRankSum=-0.356;SC=AGTCCCCTGACGCCACTGCCC;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=14;WE=1261032;WS=1261014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr16	1261119	rs2738899	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=537;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GCCGGCGCCTGGCAGCTGCTG;SOR=0.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=28;WE=1261127;WS=1261109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr16	1261219	rs2753326	A	G	6020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=1.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.34;ReadPosRankSum=-2.489;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,157:0.53:296
chr16	1261222	rs2753325	A	G	3135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=1.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,160:0.52:309
chr16	1261282	rs4984637	T	C	3836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=71;PP=2155;ReadPosRankSum=0.740;SC=TTTTTGGCATTTTGGGTGTGC;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=302;TCF=137;TCR=165;TR=133;WE=1261290;WS=1261272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,182:0.48:377
chr16	1261377	rs2738900	G	A	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.941;NF=30;NR=33;PP=1110;ReadPosRankSum=0.725;SC=CAGCGCCGCTGCGGGACGGGG;SOR=0.312;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=63;WE=1261385;WS=1261367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr16	1265600	rs2235634	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.986;SC=CCAGGTAGGTGGAGCCCGCGC;SOR=0.453;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=61;WE=1265608;WS=1265590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr16	1265720	rs3897150	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=379;ReadPosRankSum=1.457;SC=GCTGAAGCTGCGTCCCTGCTG;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=24;WE=1265728;WS=1265710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr16	1266803	rs11395347	C	CT	1457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=1505;SC=TTCCACTTGGCCGGGCCCGGA;SOR=4.351;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=34;WE=1266811;WS=1266793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	1268494	rs2745136	C	T	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.312;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1656;ReadPosRankSum=0.694;SC=GCGCCAGGGACGCCCCAAACC;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=113;WE=1268502;WS=1268484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,123:0.62:199
chr16	1269029	rs2738893	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=583;ReadPosRankSum=3.191;SC=CCAGATCCCATTGGCTGTGTC;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=38;WE=1269037;WS=1269019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr16	1270162	rs1054645	G	A	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1123;ReadPosRankSum=-2.243;SC=TTCGGACAGCGCTGCGTCTCC;SOR=0.897;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=72;WE=1270170;WS=1270152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,84:0.51:166
chr16	1270349	rs4247094	T	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=900;ReadPosRankSum=1.501;SC=ACAGCGTGGATGCTCAGGGCT;SOR=0.341;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=55;WE=1270357;WS=1270339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr16	1271890	rs1004041	G	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1270;ReadPosRankSum=1.532;SC=CGGGGAGGAAGAAGCCAGCCA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=161;TCF=90;TCR=71;TR=84;WE=1271898;WS=1271880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr16	1272038	rs11248860	G	A	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1181;ReadPosRankSum=0.598;SC=CCAGCTCACAGTGCCAGCCTG;SOR=0.296;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=69;WE=1272046;WS=1272028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,77:0.53:146
chr16	1272865	rs4984639	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=318;ReadPosRankSum=-0.917;SC=TGGGGAGACAGAGTGATCTCC;SOR=0.450;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=23;WE=1272873;WS=1272855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr16	1273638	rs909920	A	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=657;ReadPosRankSum=-0.595;SC=ATCCCAAGAAACCCACTGCAC;SOR=0.639;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=40;WE=1273646;WS=1273628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr16	1275135	rs9938123	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=20;PP=768;SC=CAGCCCCCAGTTTCACCCCCA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=1275143;WS=1275125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	1278599	rs4360940	A	G	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=15;PP=848;SC=TGGTGTTTTGAACAGGAGGGG;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=1278607;WS=1278589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	1278744	rs62012862	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=15.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQRankSum=0.772;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr16	1278767	rs201725275	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.64;MQRankSum=-1.140;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.708;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr16	1278806	rs199504258	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	1279537	rs188458795	C	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.20;MQRankSum=-2.529;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.326;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr16	1279545	rs1800990	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQRankSum=-2.486;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr16	1279555	rs148897236	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.11;MQRankSum=-2.659;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.908;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	1279574	rs199887053	C	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQRankSum=-1.768;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr16	1279584	rs111992451	T	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQRankSum=-1.733;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
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chr16	1279710	rs200630968	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQRankSum=-0.901;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	1279714	rs192643610	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQRankSum=-0.933;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
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chr16	1291831	rs202156919	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.20;MQRankSum=-1.389;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.810;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr16	1291850	rs200171211	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.38;MQRankSum=-1.221;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr16	1292124	rs144701102	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.81;MQRankSum=-1.891;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr16	1292147	rs145402040	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.10;MQRankSum=-3.202;QD=2.64;ReadPosRankSum=2.067;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,11:0.16:70
chr16	1292254	rs1060314	T	G	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-2.886;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,62:0.26:236
chr16	1292257	rs17135220	G	T	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-3.531;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,64:0.27:233
chr16	1292425	rs67723611	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.823;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GACCCTTCCCTATCCTGAGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=1292433;WS=1292415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	1306642	rs61739908	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=608;ReadPosRankSum=0.195;SC=CGGGGGCTCCCTCATCCACCC;SOR=0.756;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=39;WE=1306650;WS=1306632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,53:0.63:84
chr16	1306817	rs3993983	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=7.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQRankSum=0.363;QD=3.13;ReadPosRankSum=-2.643;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr16	1306873	rs113333718	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.848;NF=8;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AGCTGCTGCCGGTCAGCAGGA;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=13;WE=1306881;WS=1306863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr16	1306918	rs74470113	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-4.189;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.551;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr16	1306921	rs78324915	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-3.617;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
chr16	1306927	rs79472859	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-4.088;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr16	1306971	rs72775466	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-6.063;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,28:0.29:98
chr16	1306973	rs79313952	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-6.258;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,27:0.27:99
chr16	1306986	rs72775467	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-6.820;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.033;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,24:0.22:108
chr16	1323781	rs1610294	T	C	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=897;ReadPosRankSum=-0.057;SC=ACCAGGGGGCTGCCTGAGTCA;SOR=0.630;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=47;TCR=85;TR=74;WE=1323789;WS=1323771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,86:0.59:146
chr16	1358608	rs148430996	ATGAGGGAGGGAGGGAATTAG	A	2482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=13;PP=2973;SC=GATCGAATGAATGAGGGAGGG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=21;WE=1358635;WS=1358598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	1358917	rs11644706	A	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=253;SC=GGGAGGGGGGACCGGAAGCGC;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=1358925;WS=1358907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	1358976	rs11645809	T	A	219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=78;SC=GTCCCCCACGTCCCGCCCGCG;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=1358984;WS=1358966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	1364140	rs9941160	T	C	7169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=119;PP=2965;SC=GCGGACAGGCTCCCTCGGCTG;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=224;WE=1364148;WS=1364130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr16	1364281	rs4984806	T	C	5248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=83;PP=2965;SC=GTGGTTGTTTTCTTTTCTCTC;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=149;WE=1364289;WS=1364271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr16	1370303	rs909916	T	C	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=1.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	1370309	rs909917	C	G	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=2.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	1370597	rs4017786	G	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=83;PP=2551;SC=GGGAGTGGAGGACACAGGCTC;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=22;TCR=83;TR=105;WE=1370605;WS=1370587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	1370614	rs8063770	C	G	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=69;PP=2070;SC=GCTCACCCTACGGACAGCCAG;SOR=3.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=79;WE=1370622;WS=1370604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	1370630	rs8043720	A	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=52;PP=1607;SC=GCCAGGGTCCACGCCTCTGTG;SOR=4.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=1370638;WS=1370620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	1374656	rs761060	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=403;ReadPosRankSum=0.367;SC=TGGTCTGCCCAGCTGGCTCCG;SOR=1.244;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=24;WE=1374664;WS=1374646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr16	1374818	rs8063	A	G	9871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=141;NR=142;PP=2965;SC=GGCATCGTCAAAAGGAAGGGA;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=141;TCR=142;TR=283;WE=1374826;WS=1374808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr16	1388416	rs13338616	T	C	127.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=89;SC=CCATCCAGGCTGTGGGTGAGC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=1388424;WS=1388406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	1388888	rs7197416	C	T	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=69;PP=2910;SC=TGAGCTGACCCGGCTCTTTCT;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=161;WE=1388896;WS=1388878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr16	1389153	rs7202563	C	A	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=32;PP=1223;SC=TCACCCTGGGCCCCACACACA;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=1389161;WS=1389143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	1389751	rs113792347	C	G	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=715;SC=GGTGCACACACACACACGCAC;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=1389759;WS=1389741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	1391221	rs34468534	G	A	8093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=125;PP=2965;SC=AGCAGACCTCGGCTGCGCCGA;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=237;WE=1391229;WS=1391211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr16	1391871	rs2369699	C	G	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=74;PP=2965;SC=ACATCTGGTACAGGCCCCTGC;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=165;WE=1391879;WS=1391861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	1391928	rs376348144	C	T	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=1944;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GGGAGCAGGACGGACTCAGGG;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=116;TCR=86;TR=109;WE=1391936;WS=1391918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,119:0.55:215
chr16	1392877	rs742458	T	C	3505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=54;PP=1751;SC=GATGTGGGGCTGTCCCGCCTC;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=100;WE=1392885;WS=1392867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	1394507	rs1132356	A	C	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=60;PP=2965;SC=ATCCTGAATGACAAGAGTCCC;SOR=1.060;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=148;WE=1394515;WS=1394497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	1394551	rs11248872	A	G	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=66;PP=2965;SC=GACCCTGGCCATGAGGGGTAC;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=104;TCR=67;TR=170;WE=1394559;WS=1394541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	1394741	rs151251565	AGCCAACAGG	A	10038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=105;PP=2957;SC=CTGGGGTCGGAGCCAACAGGG;SOR=1.134;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=26;TCR=112;TR=128;WE=1394757;WS=1394731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	1397518	rs34339539	G	GC	2751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=22;PP=2120;SC=GCACCCAGGGGCCCCTCCTGA;SOR=1.477;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=54;WE=1397526;WS=1397508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	1398077	rs34766513	C	CCT	15835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=166;PP=2930;SC=GCGAGACTCCCGACTGGCCTC;SOR=0.818;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=242;TCF=62;TCR=180;TR=224;WE=1398085;WS=1398064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr16	1407792	rs4984644	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=57.07;NF=3;NR=6;PP=144;SC=GGGATGACAGTCATGAGCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=1407800;WS=1407782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	1407809	rs4984820	T	C	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=84;SC=CCACCGCGCCTGGCCTCGACT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=1407817;WS=1407799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1417408	rs4984823	T	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=115;SC=CTGCAGACCCTCTTGCCTGTG;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=1417416;WS=1417398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1419947	rs11248874	A	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=31;PP=1461;SC=TTGCAGTCCAACCTGGGCGAC;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=1419955;WS=1419937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	1433766	rs12918814	T	C	4621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=88;PP=2659;SC=CGGGTCCTGATGGTGCTGGGG;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=152;WE=1433774;WS=1433756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	1447278	rs61738727	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=259;SC=CGTGCTTCACACTGGGGCAGG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=1447286;WS=1447268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	1451519	rs761068	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=137;ReadPosRankSum=0.190;SC=CTGTTCTCGCGCTGTGCCCGC;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=11;WE=1451527;WS=1451509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr16	1451847	rs117069883	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=519;ReadPosRankSum=0.240;SC=AGTGTGTGGCGCTCCGCTGTC;SOR=1.105;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=27;WE=1451855;WS=1451837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr16	1451864	.	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.685;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=0.909;SC=TGTCCTGGCCCGCAGTCCTCA;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=17;WE=1451872;WS=1451854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr16	1455900	rs8044833	C	T	7762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=101;PP=2965;SC=CCTCAGGAAGCTCTCACCTGA;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=141;TCR=101;TR=242;WE=1455908;WS=1455890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	1458381	rs1609562	G	C	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=4;PP=203;SC=GGCCTTTCCCGAGCGGGGCGG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=1458389;WS=1458371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	1458561	rs2179534	T	C	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=39;PP=1455;SC=TGGGGAGCCATAGGATGAGGA;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=1458569;WS=1458551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	1464636	rs111437424	A	C	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=52;PP=1355;SC=TCGGCTTCTCAGTCTGCGGGG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=1464644;WS=1464626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	1476465	rs4984834	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=368;SC=AGTTAATCTCAGTCTCAAACA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=1476473;WS=1476455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	1484338	rs7192100	A	G	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=16;PP=894;SC=TCAGCCCCACAGGCCCTGGGT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=1484346;WS=1484328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	1484392	rs12598718	G	C	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=38;PP=1575;SC=GCTCTAATGAGTACAAAGCCA;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=82;WE=1484400;WS=1484382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	1484473	rs7192331	A	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=51;PP=1491;SC=GGGCTTCTCCAGGACCCCTCC;SOR=1.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=1484481;WS=1484463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	1486352	rs909974	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=452;ReadPosRankSum=-1.298;SC=TCTGTCACGATACCAGGGGAT;SOR=3.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=23;WE=1486360;WS=1486342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr16	1486875	rs3751894	C	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=946;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GATGGAAAGACGGACACGGGG;SOR=1.013;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=126;TCF=42;TCR=84;TR=58;WE=1486883;WS=1486865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr16	1486926	rs3751895	C	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=357;ReadPosRankSum=1.477;SC=ACTTCCAGCTCTGAGACATTT;SOR=1.130;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=23;WE=1486934;WS=1486916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr16	1487975	rs4984839	A	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=886;ReadPosRankSum=-1.024;SC=ACAGGTGGGCACGGGGAGGCC;SOR=0.469;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=72;WE=1487983;WS=1487965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,88:0.47:188
chr16	1488015	rs4984840	A	G	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TGTGCGTGGGAGACCCCGTTG;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=196;TCF=106;TCR=90;TR=78;WE=1488023;WS=1488005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,100:0.42:238
chr16	1488039	rs4984841	C	T	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1275;ReadPosRankSum=0.127;SC=ACATGTTGCGCTACCCCCTCA;SOR=0.798;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=226;TCF=113;TCR=113;TR=92;WE=1488047;WS=1488029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,115:0.42:273
chr16	1488224	rs4984843	T	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=692;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CCTGCCCACCTCTCAGCCCTG;SOR=1.109;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=43;WE=1488232;WS=1488214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr16	1488646	rs8054054	A	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=610;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CCAGTAGGACACGGTTCAGCG;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=45;WE=1488654;WS=1488636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,63:0.42:150
chr16	1492660	rs760993	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=20;PP=657;SC=AACAGAGGAATGGGAAACACA;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=1492668;WS=1492650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	1493030	rs1883480	C	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=-1.131;SC=GCAGCCTCGGCGGGCTGGGGG;SOR=0.685;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=30;WE=1493038;WS=1493020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr16	1493098	rs760994	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=209;ReadPosRankSum=0.534;SC=TCTGAAGGCCGCCCAGGCACG;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=12;WE=1493106;WS=1493088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr16	1493130	rs760995	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=327;ReadPosRankSum=0.249;SC=CCTTTTCTAGCTGGACCTGGA;SOR=1.518;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=16;WE=1493138;WS=1493120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr16	1493491	rs12929054	T	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=-2.751;SC=GACCTGTGGGTGGGGGAGCCG;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=12;WE=1493499;WS=1493481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr16	1493759	rs12596752	C	T	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=804;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GCGGCGGCGACGTGGTCCTCC;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=51;WE=1493767;WS=1493749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr16	1497137	rs12599176	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=0.682;SC=CAGAGGCAGGCGGGACCCTCA;SOR=0.861;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=1497145;WS=1497127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr16	1498197	rs2235578	A	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=-1.744;SC=GCGTCCACACAGCCCTCCATG;SOR=1.532;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=23;WE=1498205;WS=1498187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr16	1498520	rs12597739	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=622;ReadPosRankSum=1.408;SC=TGCCCGTCACACGCCACCAAC;SOR=2.448;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=32;WE=1498528;WS=1498510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr16	1499377	rs742408	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=421;ReadPosRankSum=0.742;SC=CAGGCCCAAACCCACCAAGAT;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=30;WE=1499385;WS=1499367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr16	1503879	rs2235579	T	A	3574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=95;PP=2377;ReadPosRankSum=1.177;SC=CATTGAACACTGCTCCAAGCA;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=261;TCF=95;TCR=166;TR=146;WE=1503887;WS=1503869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,160:0.54:294
chr16	1504017	rs4786337	A	G	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=586;SC=GCAGGGGGCTAGGGGGTCCTG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=1504025;WS=1504007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr16	1505599	rs7190701	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=717;ReadPosRankSum=0.125;SC=TGGGCAGGACCAAGGCCTGAC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=38;WE=1505607;WS=1505589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr16	1506130	rs41286695	C	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=476;ReadPosRankSum=-1.904;SC=GGGCTCCAAACGCCGCTGACA;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=36;WE=1506138;WS=1506120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr16	1507778	rs9922189	T	C	4370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=90;PP=2198;ReadPosRankSum=1.565;SC=GGGAGACGCATGGCCTCTGAT;SOR=0.637;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=355;TCF=163;TCR=192;TR=173;WE=1507786;WS=1507768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,216:0.49:441
chr16	1509273	.	A	AGGAGAGCAGCAGACACGTCGGGGCCTCAGGGAAGG	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-1.519;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.819;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr16	1509322	.	CAA	C	359	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=54.79;NF=0;NR=3;PP=359;QD=130.0;SC=GCTCAGCACACAAACGTCGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=3;WE=1509344;WS=1509303;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chr16	1509336	.	C	T	199	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=54.47;NF=0;NR=3;PP=199;QD=77.9237375157;SC=CGTCGGGGCCCCAGGGAAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=3;WE=1509344;WS=1509303;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chr16	1510567	rs2072950	T	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=798;ReadPosRankSum=1.632;SC=TTCCCCGTCATGACCACCCAG;SOR=0.657;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=51;WE=1510575;WS=1510557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,67:0.47:142
chr16	1511552	rs2744994	G	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=287;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GGAGTGGGCTGGCAGGGGGCA;SOR=0.554;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=19;WE=1511560;WS=1511542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr16	1515162	rs2235580	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr16	1524085	.	C	CA	258	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=13;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=58.73;NF=9;NR=14;PP=258;QD=11.4347826087;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=23;WE=1524093;WS=1524075;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:37,23:0.38:60
chr16	1524261	rs28550432	G	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=680;ReadPosRankSum=1.070;SC=AACTCGGTGCGAAGGGAGACT;SOR=0.742;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=42;WE=1524269;WS=1524251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr16	1524850	rs3751884	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=1.587;SC=GCGCAGCCCCAGGCCCAGCCC;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=22;WE=1524858;WS=1524840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr16	1545448	rs2235624	A	G	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=26;PP=1523;SC=CAGCAGACGCAGCCCGGCTTC;SOR=1.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=83;WE=1545456;WS=1545438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	1547220	rs2235630	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=2.887;SC=TCCCCTTGCCCGGTCCTGTCC;SOR=2.494;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=1547228;WS=1547210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr16	1551826	rs72779276	C	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=369;ReadPosRankSum=0.556;SC=GGGAGGCGAACCCCTCACACT;SOR=0.760;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=19;WE=1551834;WS=1551816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr16	1552570	rs58893598	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=439;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GGGTGGCTCCGGCCCTGTGAG;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=23;WE=1552578;WS=1552560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr16	1555589	rs2248128	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-0.259;SC=AGCAAGACCCAGCGGCTCTCC;SOR=0.713;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=29;WE=1555597;WS=1555579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr16	1557090	rs11248882	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=647;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GGCCTGTGCTAACCATGGATC;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=36;WE=1557098;WS=1557069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr16	1557268	rs3736721	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=332;ReadPosRankSum=1.458;SC=GTGGGGACGGCGTCGGGACCC;SOR=0.442;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=25;WE=1557276;WS=1557258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr16	1557794	rs12927760	A	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=340;SC=TGTGTGTGTGAGAGATGTGTC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1557802;WS=1557784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	1559838	rs3180228	T	C	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1195;ReadPosRankSum=2.172;SC=CAGACGTGGCTGAGAAAGACC;SOR=0.639;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=99;WE=1559846;WS=1559828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,122:0.52:235
chr16	1568402	rs2076434	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=816;ReadPosRankSum=0.502;SC=AGCCCTGAACACCTACTGCTA;SOR=0.921;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=53;WE=1568410;WS=1568392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,58:0.44:133
chr16	1570857	rs932391	T	C	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=645;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GGCCGGGAACTGAAGTGCGCC;SOR=0.253;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=85;TCF=12;TCR=73;TR=46;WE=1570865;WS=1570847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr16	1573754	rs78028801	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=988;ReadPosRankSum=2.562;SC=GGCCCGAGCACGGAGGCCTCG;SOR=0.418;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=60;WE=1573762;WS=1573744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,71:0.51:139
chr16	1573810	rs2745176	A	G	4398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=62;PP=2586;SC=CCAGGTCCCCACCGGTGGCCA;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=137;WE=1573818;WS=1573800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	1578434	.	G	GCA	280	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=5;PP=280;QD=43.0;SC=ACACACAGATGCACACACACA;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=7;WE=1578442;WS=1578424;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,7:0.24:29
chr16	1584618	rs2076438	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=511;ReadPosRankSum=-2.073;SC=ACATGGGAGATGTTAGGCGCG;SOR=0.894;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=43;WE=1584626;WS=1584608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
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chr16	1592087	rs2076444	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=583;ReadPosRankSum=-1.163;SC=AGTAAGTACCTGGGCGGGTGT;SOR=0.936;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=50;WE=1592095;WS=1592077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr16	1605051	rs9932984	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=0.367;SC=GCGCTCCATCAACGCACACCT;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=19;WE=1605059;WS=1605041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr16	1608082	rs2076436	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.734;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=1.078;SC=ACACCATCTGAGGGATGTGGT;SOR=0.336;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=21;WE=1608090;WS=1608072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr16	1608177	rs2235641	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=-0.103;SC=TTCATATGTAAAGCTGAAGCC;SOR=0.562;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=15;WE=1608185;WS=1608167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr16	1614097	rs8048410	A	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.887;NF=30;NR=19;PP=727;ReadPosRankSum=0.743;SC=GCCGGGGCTCACTCTGGTCCC;SOR=0.998;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=49;WE=1614105;WS=1614087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr16	1652614	rs2236269	T	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.870;SC=GAGAGGCAAATTCCCACAGTT;SOR=0.191;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=1652622;WS=1652604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr16	1656765	rs2859310	A	G	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=864;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CTGGCCTCATAGATGTCGTTT;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=58;WE=1656773;WS=1656755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,69:0.45:154
chr16	1657012	rs7192480	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=595;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TATACACACACACACCCATAG;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=38;WE=1657020;WS=1657002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr16	1657284	rs1894649	C	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=526;ReadPosRankSum=-1.107;SC=ACTCAGGCCTCCTCAGCGCTG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=30;WE=1657292;WS=1657274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr16	1657350	rs743963	A	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.054;SC=TAAAACAAACAATATGACTGT;SOR=0.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=1657358;WS=1657340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr16	1660274	rs1057983	A	G	4545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=74;PP=2411;ReadPosRankSum=0.860;SC=TTGATGCAACACGACCCTCAG;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=303;TCF=159;TCR=144;TR=162;WE=1660282;WS=1660264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,218:0.55:394
chr16	1660812	.	TGCAGCTCCGAG	T	1687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=2954;ReadPosRankSum=0.128;SC=GGCACGCACGTGCAGCTCCGA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=24;WE=1660830;WS=1660802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr16	1664931	rs7201813	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=661;ReadPosRankSum=0.307;SC=CCAGGAAGGATCCTCCGAGCG;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=48;WE=1664939;WS=1664921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr16	1670791	rs74702118	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GTGACAGGACAGTGTGCGCTG;SOR=0.495;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=1670799;WS=1670781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	1682281	rs3169425	A	G	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.699;SC=GCAAGCCAGCAAGCATGGTGA;SOR=0.613;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=69;WE=1682289;WS=1682271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,90:0.54:167
chr16	1691106	rs2072986	T	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=611;ReadPosRankSum=1.031;SC=CTAACTACATTGTGGTCTCAT;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=36;WE=1691114;WS=1691096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr16	1691250	rs79201173	A	T	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ATTCTCTAAAATACAGAAGCT;SOR=0.923;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=62;WE=1691258;WS=1691240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,70:0.61:115
chr16	1695395	rs9928010	G	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=5;PP=945;ReadPosRankSum=0.671;SC=CACCATGTTGGCCAGGCTGGT;SOR=0.142;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=93;TCF=87;TCR=6;TR=50;WE=1695403;WS=1695385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr16	1706435	rs61739874	C	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1022;ReadPosRankSum=0.500;SC=CGCTTCTAGACCCCTTGCCCC;SOR=0.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=123;TCR=96;TR=66;WE=1706443;WS=1706425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,83:0.32:257
chr16	1716010	rs8058190	A	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=690;ReadPosRankSum=-1.126;SC=CCCTGCGGCCACATCCTGCTG;SOR=0.679;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=36;WE=1716018;WS=1716000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr16	1728147	rs113571946	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=0.067;SC=GACCGTTCAAAGCCTAAGTCG;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=1728155;WS=1728137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr16	1733351	rs12719794	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGCTCAAACAGTCCTCCCACC;SOR=0.631;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=1733359;WS=1733343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr16	1748052	rs201846492	TG	T	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.230;NF=0;NR=8;PP=245;ReadPosRankSum=0.875;SC=CCCTGGGACTTGGTTGTCTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=1748060;WS=1748042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr16	1774484	rs111816884	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=186;ReadPosRankSum=-1.620;SC=TCAAAGCCTGCGGCCCTTCAA;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=14;WE=1774492;WS=1774474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr16	1810116	rs57876690	C	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=2.460;SC=GAGCACCTGGCTCCAACGCCA;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=19;WE=1810124;WS=1810106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
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chr16	1814019	rs2974846	G	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.245;SC=TGAAGTGGCTGTGCCGCCAGA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=1814027;WS=1814009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr16	1814391	rs2294618	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=592;ReadPosRankSum=0.474;SC=CAGGCCGCGATCCCCTGACCT;SOR=0.366;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=39;WE=1814399;WS=1814381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr16	1815337	rs2917508	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=246;ReadPosRankSum=-1.027;SC=AGTCAAGTGAGGCCCTGGGCC;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=1815345;WS=1815327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	1815946	rs2575371	C	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=41;PP=1561;ReadPosRankSum=1.256;SC=GCTGACGGGCCGTCCCTCTCC;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=249;TCF=153;TCR=96;TR=108;WE=1815954;WS=1815936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,118:0.39:304
chr16	1817431	rs2575369	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-2.412;SC=GACTCAGGCTCGAACAGGCGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=6;WE=1817439;WS=1817421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	1817754	rs2076427	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.691;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=1772;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GCCACGCCAGATGGGGTGGTG;SOR=0.940;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=45;WE=1817776;WS=1817744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr16	1817768	rs2076428	T	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.245;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=1772;ReadPosRankSum=0.614;SC=GGTGGTGGGGTGCTCAAGGCC;SOR=1.253;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=46;WE=1817776;WS=1817744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr16	1817935	rs2076429	A	C	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1284;ReadPosRankSum=0.921;SC=TGGCCTGCACACCTGCAGGGG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=73;TCR=106;TR=85;WE=1817943;WS=1817925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,95:0.45:212
chr16	1818152	rs2076430	C	T	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=2.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,62:0.40:154
chr16	1818152	.	CT	TC	685	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=32;NR=16;PP=685;QD=15.384747393;SC=GCCTCTCCCACTCTCCACCTG;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=48;WE=1818161;WS=1818142;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr16	1818153	rs2437734	T	C	5287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.11;SOR=1.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	1818503	rs2076431	G	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CCCTGAATGGGAGTGTGCTGG;SOR=1.057;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=44;WE=1818511;WS=1818493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,51:0.41:124
chr16	1818680	rs2072989	G	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=606;ReadPosRankSum=1.168;SC=GAGCCTGGCCGTCACTCTGCT;SOR=0.965;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=37;WE=1818688;WS=1818670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr16	1820992	rs11890	T	A	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=58;PP=1445;ReadPosRankSum=0.079;SC=GCCCCTGCCATACCTGTGCGG;SOR=0.534;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=216;TCF=94;TCR=122;TR=107;WE=1821000;WS=1820982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,116:0.48:244
chr16	1822159	rs2269123	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=551;ReadPosRankSum=-0.091;SC=AAAGACGGTTTCTTTCATCAA;SOR=2.023;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=26;WE=1822167;WS=1822149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr16	1822797	rs34595082	C	CACCT	660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.358;NF=5;NR=8;PP=562;ReadPosRankSum=-0.323;SC=GGGGTGCACGCACCTGCGCCG;SOR=1.055;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=13;WE=1822805;WS=1822787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr16	1823024	rs11552431	G	T	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1632;ReadPosRankSum=-2.219;SC=ACCGCGTAGAGCTGGGAGTCG;SOR=0.688;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=204;TCF=104;TCR=100;TR=103;WE=1823032;WS=1823014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,130:0.52:248
chr16	1823444	rs761065	C	G	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=52;PP=2223;SC=CGGAGCAGGTCCTGAAGCGCC;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=107;WE=1823452;WS=1823434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	1824115	rs2076433	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=261;ReadPosRankSum=-2.078;SC=TGGCAGGAAAGGGAACACTGG;SOR=2.187;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=15;WE=1824123;WS=1824112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr16	1824187	rs141044525	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=307;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CGCTTTGCTGCTGGACTGCCC;SOR=0.392;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=23;WE=1824195;WS=1824177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr16	1825768	rs2745169	A	C	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TGCTCACATGAGGTTCTAAAA;SOR=0.577;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=217;TCF=98;TCR=119;TR=100;WE=1825782;WS=1825758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,119:0.47:251
chr16	1825774	rs13339350	T	C	2942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=0.655;SC=CATGAGGTTCTAAAAGGCTTC;SOR=0.891;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=209;TCF=92;TCR=117;TR=113;WE=1825782;WS=1825758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,130:0.54:241
chr16	1826023	rs9929680	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=647;ReadPosRankSum=2.160;SC=TCCAGGTGCAGAAGCCCCGTC;SOR=0.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=44;WE=1826031;WS=1826013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,49:0.57:86
chr16	1826302	rs2437732	G	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=267;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CCTGGGCGGTGGGGGAGGACC;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=21;WE=1826310;WS=1826292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr16	1826377	rs2235636	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=533;SC=ACCTCAGGGGAAGGGTGGGTG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=1826385;WS=1826367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	1827522	rs13332165	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr16	1836796	rs2235648	C	A	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.173;SC=GCCCCAGTATCCCCCGCATGC;SOR=1.078;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=65;WE=1836804;WS=1836786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr16	1837900	rs344358	T	C	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=52;PP=2279;SC=GTGTCCCTGCTGGTGCGCCTG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=113;WE=1837908;WS=1837890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	1838037	rs2272977	C	G	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=61;PP=1807;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GCGGCTTCACCTGCCCACACT;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=229;TCF=119;TCR=110;TR=124;WE=1838045;WS=1838027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,154:0.52:296
chr16	1838479	rs28534374	A	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.034;SC=ATCCCCTCTAAGGCCACGGGT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=1838487;WS=1838471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr16	1838640	rs344359	T	C	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=35;PP=1344;SC=AGGAGTTCCCTGGGAGCCCCG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=78;WE=1838648;WS=1838630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	1838836	rs1065656	C	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CAGCGTCAGCCGGAGAGCTTC;SOR=1.967;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=19;WE=1838844;WS=1838826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr16	1842209	rs3751893	A	G	4485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=68;PP=2458;SC=CCGGGACTCCATCAGGCAGGC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=1842217;WS=1842199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	1843672	rs3817902	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr16	1844781	rs2256923	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=357;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GGGCACAGCCAGGGCTCGGGG;SOR=1.265;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=24;WE=1844789;WS=1844771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr16	1859150	rs1057071	G	A	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.39;SOR=1.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	1859153	rs1057070	T	C	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.18;SOR=1.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	1859432	rs1628812	G	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=47;PP=1147;SC=CACGCCCACCGGAGGAGCCAG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=71;WE=1859440;WS=1859422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	1859476	rs1629513	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	1859482	rs1629534	A	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.49;SOR=2.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	1859730	rs2745199	G	A	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=22;PP=2082;SC=AGGGGCCCGCGCCCACCACCT;SOR=2.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=92;WE=1859738;WS=1859720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	1859850	rs1742442	A	G	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=96;PP=2965;SC=AGAGAAACGCACCACTTTATC;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=81;TCR=96;TR=177;WE=1859858;WS=1859840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	1870037	rs144480059	TGGGCTGCCTGCTGAGCTGAGG	T	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.97;MQRankSum=4.927;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.525;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr16	1872160	rs238680	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=0.709;SC=GTGAGTCCCGGGTCTTTCTCA;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=25;WE=1872168;WS=1872150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr16	1872479	rs238679	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GGCCGCTGACATGGCCCGTCC;SOR=0.363;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=9;WE=1872487;WS=1872469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr16	1873087	rs104843	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=0.691;SC=AGGCCCTCCACGACAGGACGC;SOR=1.483;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=1873095;WS=1873077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr16	1876949	rs7188401	G	C	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.630;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=750;ReadPosRankSum=1.025;SC=AACTTGTTTTGTCCGCGAGCC;SOR=0.349;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=41;WE=1876957;WS=1876939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr16	1877698	rs3743852	C	G	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=969;ReadPosRankSum=-1.048;SC=ACGGCGAACTCAGACAGGAGG;SOR=0.611;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=58;WE=1877706;WS=1877688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr16	1877913	rs13166	C	G	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1472;ReadPosRankSum=0.570;SC=TGAGTTATTTCTTAACAAGTT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=69;TCR=94;TR=92;WE=1877921;WS=1877903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,105:0.55:190
chr16	1884501	rs171162	A	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.032;SC=ATAAACTTCCATTAGAGCTGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=1884509;WS=1884491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr16	1894912	rs9806826	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=494;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CCAGAACATTCGTTTCTTTAT;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=29;WE=1894920;WS=1894902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr16	1902889	rs1617255	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	1902901	rs7187251	A	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5723;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=36;SC=GTAAGTTTTTAAAAAAGTTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=1902909;WS=1902891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	1904239	rs10500322	T	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=631;ReadPosRankSum=0.658;SC=TTCACCTATATGTAGAAGTTC;SOR=0.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=34;WE=1904247;WS=1904229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr16	1907652	rs428123	G	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=7;PP=1107;SC=CCAGCTGATCGTGACCACTCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=1907660;WS=1907642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	1907701	rs408286	AG	CA	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=28;PP=2244;SC=CTCCCCTGCCAGATTGCACTT;SOR=1.907;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=96;WE=1907710;WS=1907691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	1907946	rs411193	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=397;SC=ATTGCAAAAACACAAGAAAGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=1907954;WS=1907936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	1910219	rs391288	A	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=309;SC=AAAGCCATTTATCATGTGACT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=1910227;WS=1910209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	1910373	rs433268	C	G	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=45;PP=2266;SC=TGATCATTCTCGCACAATCTC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=1910381;WS=1910363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	1911886	rs150893226	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=405;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TTGAGAATTACGAACTGTGTC;SOR=0.141;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=21;WE=1911894;WS=1911876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr16	1912021	rs1657125	T	G	4124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.03;MQRankSum=-1.246;NF=88;NR=78;PP=2278;ReadPosRankSum=-2.412;SC=AGAAAGAGACTTGATGTAATC;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=269;TCF=146;TCR=123;TR=166;WE=1912029;WS=1912011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,196:0.61:321
chr16	1912139	rs380846	T	C	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=86;PP=2809;ReadPosRankSum=1.393;SC=CCAATGCTTTTATTTTTCAAA;SOR=0.921;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=34;TCR=87;TR=120;WE=1912147;WS=1912129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr16	1912205	rs1657126	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=-0.646;SC=AAAAGTTTCATTTCAATTATA;SOR=1.056;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=21;WE=1912213;WS=1912195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr16	1915886	rs58422887	T	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CAGATGTACTTGATAAATTTA;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=13;WE=1915894;WS=1915876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	1917998	rs1742444	T	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=637;SC=AATGAGTATCTATATACTTGC;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=1918006;WS=1917988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	1918094	rs78268797	T	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=332;ReadPosRankSum=0.000;SC=AATCACCACATTATTGAAACC;SOR=0.676;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=24;WE=1918102;WS=1918084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr16	1918125	rs1742446	T	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=35;PP=1189;SC=GCCATATTTGTCTGCAGATCT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=1918133;WS=1918115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	1961674	rs337285	G	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1342;ReadPosRankSum=0.833;SC=CGCCGGACCAGGGCCTGGGGC;SOR=0.278;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=92;WE=1961682;WS=1961664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,106:0.51:206
chr16	1962046	rs1742399	CG	TA	6729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=68;PP=2944;ReadPosRankSum=0.156;SC=AGCGTCTGGGCGTAGTCGGAG;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=308;TCF=160;TCR=148;TR=149;WE=1962055;WS=1962036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,174:0.51:342
chr16	1962132	rs8055325	G	A	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=70;PP=1776;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GCGGCGGGGGGCCTCTCGCGT;SOR=0.827;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=239;TCF=98;TCR=141;TR=115;WE=1962140;WS=1962122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,131:0.48:273
chr16	1968338	rs199930198	T	TC	354.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=112;SC=GTCGCGCCGCTCCAGGCCCGG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1968346;WS=1968328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	1990994	rs13331553	T	C	6055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=551;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=0.605;SC=CCCACACGCCTATTTCCCAAG;SOR=0.759;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=461;TCF=221;TCR=240;TR=240;WE=1991002;WS=1990984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,278:0.51:547
chr16	1991513	rs9934331	G	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=411;ReadPosRankSum=0.311;SC=CCCGTTCCGAGGGTAGGCTGT;SOR=0.892;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=25;WE=1991521;WS=1991503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr16	1992930	rs41286697	C	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr16	1994743	rs2754179	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=7.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.787;SOR=1.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr16	1994749	rs2531332	A	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.66;ReadPosRankSum=1.386;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr16	1994931	rs61276345	C	CAAGAG	2236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.938;NF=3;NR=34;PP=2240;ReadPosRankSum=0.526;SC=GCCTTAGTCACTCTGGCCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=37;WE=1994939;WS=1994921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr16	1994980	rs11640479	G	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.025;NF=3;NR=18;PP=419;ReadPosRankSum=0.745;SC=ATCACTCAGGGCCGGCCCTAC;SOR=1.429;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=21;WE=1994988;WS=1994970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr16	1996075	rs1003904	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=0.270;SC=TGACTATCACGCCGCCCCTAC;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=12;WE=1996083;WS=1996065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr16	1996535	rs35725974	C	CA	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=537;ReadPosRankSum=0.541;SC=ATGCCCCCTACATGTATACCA;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=1996543;WS=1996525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr16	2003123	rs338778	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=450;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CGCCCACATAGGGGCAGGACA;SOR=0.638;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=28;WE=2003131;WS=2003113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
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chr16	2009590	rs114155571	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=864;ReadPosRankSum=1.612;SC=GGCCAGGGCAGCGCGTCCGGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=82;TCR=6;TR=42;WE=2009598;WS=2009580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
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chr16	2011126	rs758335	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=434;SC=CCGATGAGGCATTTGAGTCTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=2011134;WS=2011116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr16	2011430	rs80071661	A	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1098;ReadPosRankSum=0.718;SC=CTTGCTTTCAATTGTTCTCAC;SOR=0.814;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=63;WE=2011438;WS=2011420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,75:0.57:132
chr16	2011925	rs74903026	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=900;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GTGGGTGCCCCTGCTGTGTGG;SOR=0.316;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=42;WE=2011933;WS=2011915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr16	2012009	rs116746316	G	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=998;ReadPosRankSum=0.466;SC=TTGGCCCCACGCCCCAGATTC;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=68;WE=2012017;WS=2011999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,82:0.49:166
chr16	2012027	rs114278396	C	T	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1133;ReadPosRankSum=0.438;SC=TTCAAACCACCACTAACCATG;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=75;WE=2012035;WS=2012017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,93:0.49:189
chr16	2013715	rs72764892	C	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=1.040;SC=TAAGGTTACCCTATTTCTGCA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=2013723;WS=2013705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	2013756	rs72764893	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.65;MQRankSum=-0.797;NF=16;NR=7;PP=374;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TTGCCCTTTTTCTCTTGTTTG;SOR=0.374;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=23;WE=2013764;WS=2013746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr16	2013852	rs79381233	G	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=674;ReadPosRankSum=-2.164;SC=TAGGGCGAACGCTCACATGAC;SOR=0.532;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=47;WE=2013860;WS=2013842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
chr16	2014031	rs6366	C	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=370;SC=TCAGTTCTTTCGAAATGAATT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=2014039;WS=2014021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	2014283	rs2286466	A	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=17;PP=873;SC=GTACCTTAATAGGCAGGGAGA;SOR=1.157;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=43;WE=2014291;WS=2014273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	2015393	rs7193011	T	C	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CCTAACCTTGTTCTTTCTCCG;SOR=0.870;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=70;WE=2015401;WS=2015383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,87:0.45:192
chr16	2017071	rs72633262	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=403;ReadPosRankSum=0.982;SC=TAAGGCCCCCGTCTCCAGCCA;SOR=0.373;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=22;WE=2017079;WS=2017061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr16	2017157	rs114314659	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=572;ReadPosRankSum=-1.661;SC=GCCAACCCCTTTACTTGAAGT;SOR=1.574;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=25;WE=2017165;WS=2017147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr16	2017772	rs62617081	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=487;ReadPosRankSum=1.326;SC=AAGGAAAAAGGTTGTCCACAT;SOR=0.238;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=32;WE=2017780;WS=2017762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr16	2018316	rs116292986	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CCAACTCACCAGAGTCAGAAA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=2018324;WS=2018306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr16	2018554	rs114840677	G	T	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=1102;ReadPosRankSum=0.843;SC=CCTCGCAGGTGCCGCGTGGGA;SOR=0.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=56;WE=2018562;WS=2018544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr16	2018578	rs45488492	C	G	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TGGCAGAGCACCGGCAGCATT;SOR=0.895;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=62;WE=2018586;WS=2018568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr16	2018650	rs45484597	G	A	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1385;ReadPosRankSum=0.692;SC=ACCCGGCCGAGCGTGCTCGCC;SOR=0.800;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=108;WE=2018658;WS=2018640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,116:0.59:196
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chr16	2022316	rs115260840	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GCGAGAGGCTGTGTGTGCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=2022324;WS=2022306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
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chr16	2035868	rs1046502	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=594;ReadPosRankSum=1.625;SC=CCTACACAGGCTGTGCAGGAA;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=39;WE=2035876;WS=2035858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,44:0.40:109
chr16	2048826	rs2240691	C	G	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.000;NF=33;NR=20;PP=919;ReadPosRankSum=0.182;SC=GGACTAGGTACGCCCGTGGGG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=53;WE=2048834;WS=2048816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr16	2049003	rs2286468	A	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=739;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CTGGGGACACAGGCCGGGTGG;SOR=0.420;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=52;WE=2049011;WS=2048993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr16	2049631	rs144186452	G	A	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr16	2049640	rs2286469	A	G	5643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.50;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	2050293	rs3743847	C	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=719;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CAACAGCTATCAGGCCCCGTG;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=41;WE=2050301;WS=2050283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr16	2050346	rs3743846	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=694;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GGCTGCCCGCACCCGCCCACC;SOR=0.633;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=53;WE=2050354;WS=2050336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr16	2050941	rs8046471	A	C	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=275;SC=AACAAACAAAAAAAAAGAGCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=2050949;WS=2050931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	2052806	rs55662859	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=1.247;SC=GGCCAGTGGCGGAGCAGCAAG;SOR=1.631;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=22;WE=2052814;WS=2052796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr16	2059621	rs11366527	GC	G	3507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=47;PP=2002;SC=GGTCGCAGCGGCCCCAGCGCC;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=54;WE=2059629;WS=2059611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	2059674	rs71384660	T	C	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=40;PP=1156;SC=GCTCCCGCCTTCCCGCTCAGG;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=2059682;WS=2059664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	2059698	rs71384661	T	G	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.35;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	2059708	rs71384662	T	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	2059710	rs71384663	T	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.52;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	2059736	rs71148116	CG	C	745.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.90;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	2059762	rs71148117	GC	G	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=104;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=199;SC=CCGGGATCCGGCCCCCCTCTC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=2059770;WS=2059752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	2059778	rs71148118	GT	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=80;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=176;SC=CTCTCGGCCGGTCGTGGCGCC;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=2059798;WS=2059768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	2059782	rs71384664	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	2059790	rs968417	A	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	2059939	rs968418	A	C	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=11;PP=2354;SC=CCGCTCTACCATGAGCCGACC;SOR=3.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=79;TCR=11;TR=90;WE=2059947;WS=2059929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	2059955	rs62038790	A	G	5692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=31;PP=2965;SC=CGACCGCTCGAAGGTCCGCGC;SOR=2.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=100;TCR=31;TR=131;WE=2059963;WS=2059945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	2087460	rs12447809	G	T	904.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=602;ReadPosRankSum=1.232;SC=ACTGGGGGGGGGTGTGCCTCT;SOR=1.101;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=65;TCR=10;TR=37;WE=2087468;WS=2087450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr16	2087658	rs12445258	A	G	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=60;PP=1404;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GCCTTGGGGTAGGCGTCTGTG;SOR=0.916;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=154;TCF=48;TCR=106;TR=85;WE=2087666;WS=2087648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
chr16	2087785	rs34165865	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=0.929;SC=GGTGTGGGACTAGGGCTCACT;SOR=0.779;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=15;WE=2087793;WS=2087775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr16	2088312	rs11876	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=0.762;SC=GCTGCTCTGCCGGGGCCTGCT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=32;WE=2088320;WS=2088302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr16	2088401	rs150212258	AC	A	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.420;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=265;ReadPosRankSum=-1.092;SC=AATACCAGAGACCCCCCCCCT;SOR=1.781;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=21;WE=2088424;WS=2088391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr16	2088405	rs149481694	CCCCCCTTCCCCT	C	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=2983;ReadPosRankSum=2.492;SC=CCAGAGACCCCCCCCCTTCCC;SOR=1.445;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=21;WE=2088424;WS=2088391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr16	2098205	.	T	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1172;ReadPosRankSum=-2.435;SC=CATCCCTTAGTTTTAAGTCAT;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=79;WE=2098213;WS=2098195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr16	2103242	rs144408387	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.434;SC=CACAAGCCCCCGTTGTTCCTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=2103250;WS=2103238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr16	2105335	rs2516734	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=0.914;SC=TGTCCTGCGGCGGGAGGGGGA;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=2105343;WS=2105325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr16	2105400	rs1800720	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.287;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=585;ReadPosRankSum=1.138;SC=GCTTCTCCCCCAGCTGACTTT;SOR=1.646;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=29;WE=2105408;WS=2105390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr16	2107322	rs78160478	G	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=300;ReadPosRankSum=-0.458;SC=CTAGAGCGAGGCCCATGACTT;SOR=0.521;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=21;WE=2107330;WS=2107312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr16	2110571	rs2074968	C	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=7;PP=1063;SC=GGGCACTGCGCGCTCAGGCGT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=2110579;WS=2110561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	2111779	rs17135764	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=10;PP=1356;SC=GGGCTGAGGGTGTCTCCATGC;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=2111787;WS=2111769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	2112516	rs45478593	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.255;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=559;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CCTCCTGAACCTGATCTCCTA;SOR=0.798;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=49;WE=2112524;WS=2112506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr16	2115481	rs45477195	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=729;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TGACTCAGAACCATGAGCCTG;SOR=0.908;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=42;WE=2115489;WS=2115471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr16	2136455	rs76029733	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=241;ReadPosRankSum=0.662;SC=TGCTACCCCACGCCCTGGGGC;SOR=1.136;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=16;WE=2136463;WS=2136445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr16	2138218	rs1800718	A	C	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=68;PP=2274;ReadPosRankSum=0.684;SC=CCCCCTGCCTACGTCCCCAGA;SOR=0.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=286;TCF=143;TCR=143;TR=134;WE=2138226;WS=2138208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,146:0.46:316
chr16	2138269	rs1748	T	C	3649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=76;PP=2404;ReadPosRankSum=-1.109;SC=ACCCCACCGATATCTACCCCT;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=300;TCF=138;TCR=162;TR=141;WE=2138277;WS=2138259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,167:0.49:344
chr16	2138398	rs13332221	C	T	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1405;ReadPosRankSum=-1.547;SC=GTGGGCAGAGCGGTTGCCACG;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=77;WE=2138406;WS=2138388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,83:0.52:159
chr16	2138422	rs13332222	C	G	3162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1497;ReadPosRankSum=1.768;SC=CCCAGACTTACTGCCCAAGCC;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=83;WE=2138430;WS=2138412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,90:0.50:179
chr16	2140010	rs7203729	A	G	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=67;PP=1815;ReadPosRankSum=0.461;SC=GGGAGGGCTCAGGCTCACACC;SOR=0.785;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=188;TCF=79;TCR=109;TR=113;WE=2140018;WS=2140000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,114:0.58:197
chr16	2140454	rs3087632	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=626;ReadPosRankSum=0.054;SC=ACAGCCGCAGTGCCCAGAGCC;SOR=0.900;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=35;WE=2140462;WS=2140444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr16	2140680	rs10960	T	C	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1175;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CCTACCAGGATGGCCAGCTGG;SOR=0.574;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=145;TCF=90;TCR=55;TR=83;WE=2140688;WS=2140670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,97:0.58:168
chr16	2141396	rs11866494	C	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CGGTGGGAGGCGCGGGGTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=2141404;WS=2141386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	2144299	rs34123233	T	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=579;ReadPosRankSum=-1.290;SC=GGCAGTTTCTTGAGCCTCTTG;SOR=0.874;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=32;WE=2144307;WS=2144289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr16	2152651	rs9928278	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.781;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr16	2159996	rs9935526	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.683;NF=6;NR=5;PP=146;ReadPosRankSum=-1.598;SC=TCGGGGAGGCGGCCACCATCA;SOR=0.136;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=11;WE=2160004;WS=2159986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr16	2160503	rs71385734	T	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.349;NF=8;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CCGTGCGGCTTGCATTGACGA;SOR=0.653;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=23;WE=2160511;WS=2160493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr16	2160973	rs116092985	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.524;NF=4;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-0.869;SC=GCCACCAGCCAGGCCTCGTCC;SOR=0.169;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=7;WE=2160981;WS=2160963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr16	2200184	rs78391622	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=412;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GACCTTCCAACACCTGGGCTG;SOR=3.628;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=23;WE=2200192;WS=2200174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr16	2203456	rs26931	T	C	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=60;PP=2474;SC=GAGGAAGCCGTCCAGTCCCTA;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=112;WE=2203464;WS=2203446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
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chr16	2213800	rs138967457	G	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.966;NF=33;NR=8;PP=818;ReadPosRankSum=2.447;SC=CCCCACAGCAGGTCTGCACAC;SOR=1.185;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=41;WE=2213808;WS=2213790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr16	2216073	rs8062006	G	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=215;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCTCACACCGCAGCCTGTGT;SOR=0.317;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=2216081;WS=2216063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr16	2221440	.	G	A	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=886;ReadPosRankSum=0.564;SC=GGGCTGTGGCGCCCTGGCCTT;SOR=0.460;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=52;WE=2221448;WS=2221430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr16	2225823	rs12921326	G	A	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.387;SC=ACTGGCCCACGATTACTCATA;SOR=0.743;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=96;TCR=36;TR=68;WE=2225831;WS=2225813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr16	2233565	rs889495	T	C	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=678;SC=CGGGTGGGAGTTGTGGCCAGG;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=2233573;WS=2233555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	2238931	rs11860560	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=442;ReadPosRankSum=0.869;SC=GCCTGCTCCCGCCCTATCCCC;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=26;WE=2238939;WS=2238921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr16	2239401	rs369168497	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.095;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=1.590;SC=CCGCTGCCCCGCCCCCGCTCG;SOR=0.824;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=17;WE=2239409;WS=2239391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,27:0.32:85
chr16	2246378	.	GC	TA	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CAGCCTCTGCGCGGTCCCTAC;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=35;WE=2246387;WS=2246368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr16	2255763	rs12922719	A	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQ=60.36;MQRankSum=1.383;NF=5;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.086;SC=CCTGCGGCAGAGTGGCGCCCG;SOR=0.477;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=11;WE=2255771;WS=2255753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr16	2255804	rs3214648	TG	T	333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=11;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.351;NF=5;NR=7;PP=480;ReadPosRankSum=-1.492;SC=GCTGCGGAGGTGGGGGGGGGA;SOR=0.452;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=12;WE=2255815;WS=2255794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr16	2255807	rs112805476	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=8;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.226;NF=17;NR=8;PP=460;ReadPosRankSum=1.576;SC=GCGGAGGTGGGGGGGGGACGG;SOR=0.904;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=25;WE=2255815;WS=2255794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr16	2256047	rs3217423	AC	A	858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.934;NF=10;NR=12;PP=683;ReadPosRankSum=0.891;SC=CTGACCTTTGACCCCTGCCGT;SOR=0.909;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=22;WE=2256055;WS=2256037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr16	2256326	rs27699	C	T	3610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.272;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=73;PP=2313;ReadPosRankSum=-0.263;SC=GGCCTCAGGGCTACCTTCCCG;SOR=0.763;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=232;TCF=114;TCR=118;TR=132;WE=2256334;WS=2256316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,161:0.57:282
chr16	2256461	rs26863	C	G	3868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=68;PP=2564;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GGGTCGACCTCAGCACAGCCA;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=134;TCR=114;TR=145;WE=2256471;WS=2256451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,166:0.57:290
chr16	2257105	rs26862	C	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=23;PP=1155;ReadPosRankSum=0.346;SC=GCCTGCACCCCAACCAGGTGA;SOR=1.265;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=75;WE=2257113;WS=2257095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,85:0.57:148
chr16	2259766	rs26858	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CTGGCTTGGCAGGGCCGGGTA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=2259774;WS=2259756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr16	2259865	rs25852	C	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=498;SC=CCTGAAACCACAGCTCCAGCC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=2259873;WS=2259855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	2260567	rs26857	C	T	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.417;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=708;ReadPosRankSum=0.008;SC=CCAGCCACAACCCCCACAGCG;SOR=0.544;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=45;WE=2260575;WS=2260557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr16	2260612	rs26856	T	C	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=53;PP=2259;SC=AGGAGCAGGCTCACGGCTCTC;SOR=0.766;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=102;WE=2260620;WS=2260602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	2260935	rs26855	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=275;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CTGACCCTGCGCCTCCCCCTC;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=17;WE=2260943;WS=2260925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr16	2282256	rs26839	G	A	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=58;PP=2878;SC=GGCAGCCCCCGCCAGCAGGGG;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=100;TCR=58;TR=158;WE=2282264;WS=2282246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	2285357	rs26840	C	T	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1316;ReadPosRankSum=0.831;SC=CCATCACCATCGCCACCCCCG;SOR=0.889;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=85;WE=2285365;WS=2285347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,96:0.55:175
chr16	2287026	rs117794268	C	T	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=759;ReadPosRankSum=-1.663;SC=CCGCACCCGCCGCTCCTCCCC;SOR=0.950;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=47;WE=2287034;WS=2287016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,55:0.39:141
chr16	2288224	rs27620	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=0.190;SC=CAAAGGGCCAGTGGTGACACC;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=13;WE=2288232;WS=2288214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr16	2317780	.	G	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CTCCCCGCTGGTCTGAGTCCC;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=5;WE=2317788;WS=2317770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr16	2328790	rs150928	G	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=684;SC=TTCCTACGTGGAGCTACCTGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=2328798;WS=2328780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	2331430	rs149532	A	G	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=72;PP=2716;SC=GGGAGTCCGGACTGGGGGCCA;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=2331438;WS=2331420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	2334554	rs1183064	A	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=453;SC=GTGAGGGGGCACCTCCCAGGG;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=2334562;WS=2334544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	2337024	rs45442498	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTGGGCACCCCCTGCCACCTG;SOR=0.461;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=28;WE=2337032;WS=2337014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr16	2337993	rs313909	G	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=333;SC=ACTGGCCCCCGATGCCCCCGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=2338001;WS=2337983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	2338363	rs313908	C	G	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=50;PP=1465;SC=GACACCGGCACCGCTTGGGGC;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=64;WE=2338371;WS=2338353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	2373786	rs323060	C	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=36;PP=1110;SC=GCTGTCACAGCCGAGAACTCA;SOR=1.893;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=52;WE=2373794;WS=2373776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	2374394	rs117031141	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=576;ReadPosRankSum=-0.089;SC=CGGCCCGGCCGCACGTCTCAC;SOR=0.270;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=32;WE=2374402;WS=2374384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr16	2375961	rs46725	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=436;SC=CCTGCCCAGCCGCGTGGAGGC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=2375969;WS=2375951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	2479712	rs13337091	A	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=222;SC=AGCCCCTCGGAGCCTTCCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=2479720;WS=2479702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	2485620	.	ACACACACACATATATATG	A	368	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5032;HP=2;HapScore=2;MGOF=82;MMLQ=28;MQ=48.4;NF=4;NR=2;PP=368;QD=62.8333333333;SC=ATATGCACACACACACACACA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=2485645;WS=2485617;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,6:1.00:6
chr16	2485669	.	T	C	220	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5082;HP=2;HapScore=3;MGOF=50;MMLQ=27;MQ=50.76;NF=3;NR=1;PP=220;QD=63.6928031368;SC=CACACACACATATATATATAT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=4;WE=2485690;WS=2485655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,4:0.33:12
chr16	2485896	rs12928789	A	G	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=49;PP=1566;SC=CCCCACCTGCATGTTGGCGCT;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=2485904;WS=2485886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	2486998	rs12921396	A	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1029;SC=GGAGGGCTCTACTCTCCTGAA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=2487020;WS=2486988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	2487012	rs34456414	C	CT	2224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=7;PP=2159;SC=TCCTGAAACACAGCTGCTTTG;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=2487020;WS=2486988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	2488211	rs12926008	T	C	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=67;PP=1832;SC=CAGAAGGGGGTGTCCAAGGCC;SOR=1.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=98;WE=2488219;WS=2488201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	2489533	rs28647184	T	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=8;PP=427;SC=CTTGGATGCGTTTCTGTCCAC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=2489541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	2498828	rs28417759	A	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=42;PP=2341;ReadPosRankSum=0.382;SC=AGTGGGCTCCACCCTGAGACC;SOR=1.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=121;WE=2498836;WS=2498818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,149:0.99:151
chr16	2498849	rs28670436	G	A	5702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=63;PP=2965;SC=CCTTCTCGGCGTTGCAGGTTT;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=99;TCR=63;TR=162;WE=2498857;WS=2498839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr16	2499011	rs8060813	T	C	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=35;NR=43;PP=1742;SC=CTTATTAATCTTCGTTGTCGC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=78;WE=2499019;WS=2499001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	2499786	.	G	GTCCCCTCCA	2100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=19;NR=8;PP=1062;SC=CATCCCCTCCGTCCCCTCCAT;SOR=1.209;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=27;WE=2499794;WS=2499776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	2510603	rs4786284	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=15;PP=1017;SC=GGCCGTGCGACGGCTGCCCGT;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=2510611;WS=2510593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	2512523	rs3810794	G	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1146;ReadPosRankSum=0.834;SC=AGGAGCTCTCGGCAGGTCAGT;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=69;WE=2512531;WS=2512513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,90:0.63:143
chr16	2645965	rs1005273	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.726;SC=ATTTTCATCAGACATCATCTC;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=2645973;WS=2645955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	2747857	rs3094475	C	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=11;PP=741;SC=AGCGTGGATTCTTTGGTTTAG;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=2747865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	2748063	rs3094474	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=532;ReadPosRankSum=1.874;SC=CCCCTTTACTCCCCCGACCGG;SOR=0.704;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=31;WE=2748071;WS=2748053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr16	2749195	rs3094473	A	G	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=77;PP=2611;SC=GTGACTGTCCAGGATGTGGGG;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=131;WE=2749203;WS=2749185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr16	2752365	rs118149302	C	T	4225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=86;PP=2500;ReadPosRankSum=0.071;SC=TGGTCAGCATCGGCTCCTCTT;SOR=0.630;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=343;TCF=168;TCR=175;TR=174;WE=2752373;WS=2752355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,200:0.50:401
chr16	2802684	rs2240146	T	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=8;PP=232;SC=GTGGCGCAGTTGGAGCCCGTT;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=2802692;WS=2802674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	2808363	rs3094778	C	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=761;SC=CAGAGCGAGACTCTTATTTTT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=2808371;WS=2808353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	2808394	.	T	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.912;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=843;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TACTATTTTTTTAGACTCTGT;SOR=0.251;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=50;WE=2808402;WS=2808384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,51:0.78:65
chr16	2810623	rs2285879	T	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.72;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	2810623	.	TT	GG,GT	69	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0,0;NR=6,11;PP=63,69;QD=19.411312477;SC=TTTTCCTGCATTTCTCTCCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6,11;WE=2810632;WS=2810613;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.55:11
chr16	2810624	rs118128316	T	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr16	2812890	rs2240141	A	G	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=62;PP=2561;SC=CATGCCCTAAACAAAAGTCAC;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=113;WE=2812898;WS=2812880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	2812939	rs2240140	C	A	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=52;PP=2672;SC=ATCCTCCCAACCTAAAGCTAA;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=117;WE=2812947;WS=2812929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	2814162	rs3094775	G	A	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=49;PP=2400;SC=CCCCGCCAAGGGAAAGAAGTG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=2814170;WS=2814152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	2815237	rs3094773	A	C	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=69;PP=2757;SC=AGCCAAGACAAGAACCCCACT;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=142;WE=2815245;WS=2815227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	2818161	rs2301802	T	C	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=66;PP=2366;SC=GCTCCTCCTCTTCTTCATCAT;SOR=1.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=112;WE=2818169;WS=2818151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	2818704	rs3094792	T	G	4800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=57;PP=2889;SC=GGAAGGAGACTACCCAGCTTC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=144;WE=2818712;WS=2818694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	2821573	rs8017	C	T	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=57;PP=1709;SC=TGTGTTTCTGCTCTTGGCCAT;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=2821581;WS=2821563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	2825594	rs3094774	A	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=28;PP=902;SC=GAGGCCCTACATGGGGCAAGT;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=2825602;WS=2825584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	2834826	rs12931183	A	G	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=45;PP=1376;SC=GAGGAGCCTAAGTCCCAGCCC;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=2834834;WS=2834816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	2835189	rs12599918	G	A	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=52;PP=1850;SC=GAAGAGGAGGGACCTCTGAGA;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=2835197;WS=2835179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	2836027	rs7195287	T	G	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=68;PP=2965;SC=CAGGTGTTGGTGGGGAGACAC;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=137;WE=2836035;WS=2836017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	2836271	rs11643898	C	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=33;PP=979;SC=CTTATTTAACCCTCCCCAGAG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=2836279;WS=2836261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	2837592	rs34341809	T	G	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=907;SC=GGGCTTAAAGTGCCAGGAGAG;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=2837611;WS=2837582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	2837603	rs11076829	C	T	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=24;PP=655;SC=GCCAGGAGAGCGCGAGGCTCA;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=34;WE=2837611;WS=2837582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	2867530	.	GA	G	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=46;QD=20.25;SC=TGAGGGGGTAGAGGGGGGCCT;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=4;WE=2867539;WS=2867520;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr16	2867531	rs200594570	A	AG	82.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAGGGGGTAGAGGGGGGCCTT;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=2867539;WS=2867520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr16	2868958	.	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=828;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GGGGTACATCAAAGAGGATGA;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=44;WE=2868966;WS=2868948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr16	2871121	rs11076844	T	C	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=41;PP=1259;SC=GTGAGTGTCCTTGCCACCACT;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=2871129;WS=2871111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	2871555	rs10641	G	A	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=55;PP=2416;SC=CCTCCTGGCCGCTACTCTTTT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=2871563;WS=2871545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	2880614	rs2190809	T	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=712;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CCTGGAGGGGTGGGGTCCCCT;SOR=0.416;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=34;WE=2880622;WS=2880604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr16	2880870	rs2240614	G	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=17;PP=380;SC=CTCAGGGCAGGGGGTAAGCAC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=2880878;WS=2880860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	2881954	rs370752227	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=737;ReadPosRankSum=-1.267;SC=CAGCAAGGACCGCTATTTCTA;SOR=0.541;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=48;WE=2881962;WS=2881944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr16	2882197	rs12373	G	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=350;SC=AGGCCATCTGGGTGGTGGTGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=2882205;WS=2882187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	2891418	rs12596044	C	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=0.031;SC=CCCTAACATCCCTCTGCCCTT;SOR=0.936;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=11;WE=2891426;WS=2891408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr16	2891540	rs11859372	C	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=909;ReadPosRankSum=-1.473;SC=GGAGTAGGGGCTGTTTGAGTG;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=50;WE=2891548;WS=2891530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
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chr16	2892370	rs3810801	C	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=623;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CCTGCTGCTGCCACTGCCCAA;SOR=0.428;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=37;WE=2892378;WS=2892360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr16	2903047	rs1054912	G	C	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=2;PP=943;SC=AGATCCAGATGTGGATCTGGC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=2903055;WS=2903037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	2903068	rs113609771	A	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=570;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CGCCTTTCAGATCCGAGCCCC;SOR=1.660;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=27;WE=2903089;WS=2903058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr16	2903081	rs3743944	G	A	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=7;PP=1807;SC=CGAGCCCCGCGTCCCGCTGCG;SOR=3.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=66;WE=2903089;WS=2903058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	2903845	rs2074294	G	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.786;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=1072;ReadPosRankSum=-2.244;SC=GGCCAGGGGTGGGGGGCTCGA;SOR=2.488;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=25;WE=2903858;WS=2903835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr16	2903850	rs112285893	G	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.493;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=1017;ReadPosRankSum=1.327;SC=GGGGTGGGGGGCTCGAGGGAG;SOR=0.169;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=29;WE=2903858;WS=2903835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr16	2906711	rs117946652	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GCTCTTTCCCCCTCTCACCCC;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=8;WE=2906719;WS=2906701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr16	2906934	rs732532	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=376;ReadPosRankSum=1.669;SC=AGTGAGGAAGGCCCCCAACAC;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=24;WE=2906942;WS=2906924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr16	2946433	rs2285824	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=353;ReadPosRankSum=0.811;SC=GCCTGAGGGACAGGCCCTGGG;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=18;WE=2946441;WS=2946428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr16	2949248	rs7281	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=-2.958;SC=TCTTTGCTTTTAACATTGTGT;SOR=1.508;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=2949256;WS=2949238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr16	2972534	rs11865663	C	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.135;SC=TTTGACTGCCCTGGGGACCTC;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=2972542;WS=2972524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr16	2973249	rs11642228	T	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=272;SC=GAGGCTGTTTTTGTTTATTTT;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=2973257;WS=2973239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	3016885	rs58462745	A	G	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=59;PP=2678;SC=GGTCCTCAGGATGCTGACTGC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=118;WE=3016893;WS=3016875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	3017124	rs11641195	C	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=763;ReadPosRankSum=4.433;SC=CTGCTCCGCGCCTTCGATGGC;SOR=0.958;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=49;WE=3017132;WS=3017114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,55:0.70:79
chr16	3021116	rs4786365	T	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=650;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CCCTTGAGGATGTGACTGAAA;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=39;WE=3021124;WS=3021106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,45:0.39:116
chr16	3024188	rs2074528	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=563;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGGATGTGGGTGGGCGGACCC;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=40;WE=3024196;WS=3024178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr16	3065596	rs2257295	T	C	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=776;ReadPosRankSum=-0.554;SC=TCCCGGATGATGGCATGCGCC;SOR=0.927;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=59;WE=3065604;WS=3065586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr16	3085335	rs7204908	G	C	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1243;ReadPosRankSum=1.133;SC=TCCTTCTGCTGCAGCTGCAAG;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=78;WE=3085343;WS=3085325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,100:0.57:174
chr16	3085375	rs11077096	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=777;ReadPosRankSum=2.697;SC=CAGGCCCTGGGCCCCCTCCCA;SOR=0.992;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=62;WE=3085383;WS=3085365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,74:0.61:122
chr16	3086447	rs7206805	C	G	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.758;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=52;PP=1381;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CCTCCGGGGGCTCACCACCCA;SOR=0.866;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=94;WE=3086455;WS=3086437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,117:0.53:221
chr16	3097295	rs879734	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=426;ReadPosRankSum=1.924;SC=AGGCAGGCATCCGGGGCTGGG;SOR=0.054;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=25;WE=3097303;WS=3097285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr16	3097596	rs3743936	T	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ACCCAGCCTGTCCACCGCCCA;SOR=0.889;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=3097604;WS=3097586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr16	3100095	rs10431961	C	T	3056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=47;PP=1834;ReadPosRankSum=0.044;SC=GGCGGCGTCGCCGGTACGCTC;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=121;TCR=80;TR=117;WE=3100103;WS=3100085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,138:0.59:232
chr16	3105994	rs56307374	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-0.746;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	3106003	rs55999592	T	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.684;QD=22.93;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr16	3106066	rs55977932	G	T	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=2;PP=40;SC=GACCTGGGGTGGGGGTGGTAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=3106074;WS=3106056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	3106994	rs1064948	A	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=1.195;SC=CCTTTCCCCAAGCAGGGGCGG;SOR=0.260;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=17;WE=3107002;WS=3106984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr16	3108404	rs7359440	A	G	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=655;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CCCGGCCTCCACCCTGCAGGG;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=40;WE=3108412;WS=3108394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr16	3108713	rs79530442	G	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=825;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CCTGGGGGTGGGGAGAGGGAT;SOR=0.930;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=69;WE=3108721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr16	3109032	rs7188234	G	A	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1006;ReadPosRankSum=-1.446;SC=CAGGCCGCAGGACGTTGGCCT;SOR=0.577;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=64;WE=3109040;WS=3109022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,92:0.54:171
chr16	3117272	.	CTGTGTGTG	C	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=479;ReadPosRankSum=0.489;SC=CCATGTGTCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.330;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=2;WE=3117287;WS=3117262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr16	3163365	rs376764324	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=338;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGGCCAGAAGCTGGAGGGGGC;SOR=0.487;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=23;WE=3163373;WS=3163355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr16	3166587	rs224178	A	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=32;PP=857;SC=GGTGTTAGGGAGAGGTCCTGC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=3166595;WS=3166577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	3168836	rs224181	T	G	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=54;PP=2264;SC=CCATCAGTTTTGGGGAGATGC;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=3168844;WS=3168826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	3170188	rs12032	C	T	6611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=121;PP=2965;SC=GCCCGTTGTGCGGCAAGAGCT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=81;TCR=121;TR=202;WE=3170196;WS=3170178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr16	3282605	rs2075852	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=378;ReadPosRankSum=-0.396;SC=ACAGCCCTACTGGTAAGAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=28;WE=3282613;WS=3282595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,34:0.27:127
chr16	3282988	rs45532536	G	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=201;ReadPosRankSum=-1.681;SC=TCCCCATACCGCGAGGCCAGG;SOR=0.376;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=3282996;WS=3282978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr16	3293888	rs1231122	C	T	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1397;ReadPosRankSum=0.532;SC=CAATCAGCTCCGGAACTACGG;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=81;WE=3293896;WS=3293878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,97:0.67:144
chr16	3293922	rs1231123	A	T	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=52;PP=2011;ReadPosRankSum=-1.630;SC=AGGGAAAAAAATCCTGAGCAT;SOR=0.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=124;WE=3293930;WS=3293912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,144:0.65:221
chr16	3294154	rs3974658	GT	G	469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.085;NF=9;NR=12;PP=201;ReadPosRankSum=0.699;SC=CAGGTGTTTGGTTTTTTTTTT;SOR=1.038;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=21;WE=3294162;WS=3294144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr16	3294678	rs1231124	G	A	107.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=93;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATTCTCCACAGGGCACACCTA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=3294686;WS=3294668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr16	3296429	rs224204	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=-0.208;SC=AGACCCCGGGGTTGGGAACAT;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=9;WE=3296437;WS=3296419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr16	3296616	rs224205	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=292;ReadPosRankSum=0.734;SC=CTGGCCTCTACTTCTGGGCTC;SOR=1.040;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=27;WE=3296624;WS=3296606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,29:0.31:95
chr16	3297073	rs224206	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=907;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CAATCAGCGCATCGAGCAGGG;SOR=0.851;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=182;TCF=111;TCR=71;TR=71;WE=3297081;WS=3297063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,80:0.35:226
chr16	3297175	rs224207	T	C	3267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,90:0.38:238
chr16	3297181	rs224208	C	T	3282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.447;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,90:0.39:231
chr16	3298642	rs224211	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=257;ReadPosRankSum=1.759;SC=TCTTTCTGCAGTAGTCACCGG;SOR=1.422;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=21;WE=3298650;WS=3298632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr16	3298865	rs224212	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=8.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.533;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr16	3299749	rs224213	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=890;ReadPosRankSum=1.039;SC=GGGCGTGGCAGCGGGGACTCG;SOR=0.821;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=188;TCF=94;TCR=94;TR=68;WE=3299757;WS=3299739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,80:0.37:216
chr16	3301897	rs224218	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr16	3304463	rs224222	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=1.074;SC=TCTGCGCAGCCGGACCTCGGC;SOR=0.231;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=22;WE=3304471;WS=3304453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr16	3304573	rs224223	G	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=266;ReadPosRankSum=2.654;SC=GGCCCTCCGAGGCCTTCTCTC;SOR=0.100;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=18;WE=3304581;WS=3304563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr16	3304654	rs224224	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.975;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=439;ReadPosRankSum=0.025;SC=GGCTGGCAGCTCCGCCCCCGT;SOR=0.286;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=35;WE=3304662;WS=3304644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr16	3304762	rs224225	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=382;ReadPosRankSum=1.317;SC=CTGCGGAATCATCTGTGCCGT;SOR=0.606;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=37;WE=3304770;WS=3304752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,52:0.33:159
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chr16	3350639	rs7185015	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.904;SC=TGAACCACCAACAGGAGAAAA;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=6;WE=3350647;WS=3350629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr16	3364860	rs4786402	G	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=2431;ReadPosRankSum=0.126;SC=CTGTAAGACTGTCATTTGTCT;SOR=0.432;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=67;WE=3364875;WS=3364850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,81:0.69:117
chr16	3364867	rs12325636	G	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.947;SC=ACTGTCATTTGTCTAGGTAAA;SOR=0.979;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=29;WE=3364875;WS=3364850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr16	3367229	rs17611866	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=558;ReadPosRankSum=-1.470;SC=CATCAGCCTGTGTCTCTTTCT;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=42;WE=3367237;WS=3367219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr16	3405994	rs1228348	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TGGGCATATCAGACCATCCCC;SOR=1.489;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=19;WE=3406002;WS=3405984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr16	3406200	.	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=569;ReadPosRankSum=-2.373;SC=AATTTATGGGGACCAGGCAAG;SOR=0.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=47;WE=3406208;WS=3406190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,58:0.36:163
chr16	3406387	rs1218763	C	G	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=73;PP=2965;SC=TGATTGCCTGCCTGGGTGGCT;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=176;WE=3406395;WS=3406377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr16	3434027	rs17136367	G	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=0.704;SC=CTCAATTCTTGAATGTTCTAA;SOR=0.612;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=18;WE=3434035;WS=3434017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr16	3438865	rs11643983	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-1.312;SC=GGGAGAAACTGCTGGATGGTT;SOR=0.778;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=12;WE=3438873;WS=3438855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr16	3440390	rs4786412	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr16	3440394	rs27237	A	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr16	3441697	rs7204842	A	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=17;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.654;NF=9;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=1.751;SC=AAAAAAAAAAACAAAATACTA;SOR=1.251;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=12;WE=3441705;WS=3441687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr16	3452193	rs37811	T	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=422;ReadPosRankSum=0.717;SC=CCCAAGAGGCTCTCTCCCAGC;SOR=0.722;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=33;WE=3452201;WS=3452183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr16	3455079	rs37813	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=159;ReadPosRankSum=0.269;SC=GCTTGTACTTTAGATCCTCAA;SOR=0.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=11;WE=3455087;WS=3455069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr16	3458219	rs37819	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AAGTTGCCAGCGGAGGGCCAC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=3458227;WS=3458209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr16	3490922	rs2270494	G	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GATCCTCAAAGAGTATTGGTC;SOR=1.127;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=16;WE=3490930;WS=3490912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr16	3533577	rs1137454	C	G	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=57;PP=1732;SC=TCAACGGCGGCCACCCTCCCT;SOR=2.245;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=73;WE=3533585;WS=3533567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	3534892	rs13740	G	A	6553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=92;PP=2965;SC=CCCACCCTTCGGCCGCCCGCA;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=194;WE=3534900;WS=3534882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr16	3535116	rs4785936	T	C	4824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=77;PP=2965;SC=GCCACAAAAGTGGAAGGCCCT;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=156;WE=3535124;WS=3535106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	3535540	rs2240075	G	A	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=69;PP=2531;SC=CGCATGCACCGTCCCCAGGGC;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=123;WE=3535548;WS=3535530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	3594316	rs74760019	C	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=645;ReadPosRankSum=0.878;SC=TCCCCGATGGCGTTCTCCTGT;SOR=0.641;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=45;WE=3594324;WS=3594306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr16	3602227	rs56070390	AG	A	3160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=42;PP=2423;SC=TTCTGCTTCAAGGGCATCTGC;SOR=0.738;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=59;WE=3602235;WS=3602217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	3705819	rs181314680	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=291;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GGCACCAGCCCTGCTCAGCAC;SOR=0.400;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=20;WE=3705827;WS=3705809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr16	3706337	rs758745	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=1.409;SC=CCCAAGGTCCCGGACCAATGG;SOR=0.385;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=13;WE=3706345;WS=3706327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr16	3706668	rs34923865	A	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=753;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GTGGACAGCTACTACTACGAT;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=44;WE=3706676;WS=3706658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr16	3707409	rs1799892	G	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=349;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTCATAGGTCGGGCTTCAGAA;SOR=0.286;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=26;WE=3707417;WS=3707399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr16	3707747	rs1053874	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.125;SC=ATGCTGCTCCGAGGCGCCGTT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=66;WE=3707755;WS=3707737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr16	3721773	rs1136948	G	C	3015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=39;PP=1819;ReadPosRankSum=0.193;SC=TCAGGGGAATGTCCTCACTGT;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=171;TCF=105;TCR=66;TR=104;WE=3721781;WS=3721763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,132:0.64:206
chr16	3726160	rs8050400	A	G	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=51;NR=50;PP=1829;SC=AGGCAGGCAAAGAAAGGAAAA;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=101;WE=3726168;WS=3726150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	3738887	rs2072379	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=556;ReadPosRankSum=-0.113;SC=GAAACCAAAACAGATTCTGGT;SOR=1.292;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=27;WE=3738895;WS=3738877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr16	3778439	.	TTGCTGCTGC	T,TTGCTGCTGCTGC	5254.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=40,40;NR=34,34;PP=2980,2980;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.592;Source=Platypus;TR=74,74;WE=3778455;WS=3778429;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:132
chr16	3789537	rs129967	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr16	3795363	rs3025684	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=474;ReadPosRankSum=-0.152;SC=AAACTAGGAGGCAAAGAAGGC;SOR=0.978;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=39;WE=3795371;WS=3795353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,49:0.34:145
chr16	3811556	rs886528	A	G	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=1.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,71:0.26:277
chr16	3828539	rs56291013	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTCTGCAGGAGATTTGTGTCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=3828547;WS=3828529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	3828585	rs8052927	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=59;ReadPosRankSum=0.539;SC=GGCCTCAAGGGGAGGAGTCTG;SOR=0.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=7;WE=3828593;WS=3828575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr16	3831187	rs130018	T	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GTCACTCAGATCTGAAACAGG;SOR=1.055;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=14;WE=3831195;WS=3831177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr16	3831230	rs61753381	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,22:0.27:82
chr16	3832959	rs130025	C	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=846;ReadPosRankSum=1.385;SC=CAGACAAAAACGAGAGGTAAG;SOR=0.724;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=176;TCF=77;TCR=99;TR=57;WE=3832967;WS=3832949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,83:0.37:224
chr16	3860640	rs3025702	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=279;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TATTCTTGATATCTGTAGGGA;SOR=1.426;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=18;WE=3860648;WS=3860630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr16	4015729	rs879620	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=546;ReadPosRankSum=0.072;SC=ACAAATATTACTGTGTTTCGA;SOR=0.560;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=25;WE=4015737;WS=4015719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr16	4016676	rs2230742	A	G	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CTCCGCTGTCATGGTTCTTGG;SOR=0.561;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=62;TCR=88;TR=92;WE=4016684;WS=4016666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,101:0.60:167
chr16	4027423	rs2072346	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CCAGGCCCTACGCAACCTCGG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=4027431;WS=4027413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	4027605	rs2240735	C	T	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CGGCAATCAGCGCGGCCGAGC;SOR=1.074;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=79;WE=4027613;WS=4027595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,97:0.66:146
chr16	4027688	rs2531990	T	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=598;ReadPosRankSum=1.070;SC=ACCCCTGCTATACCCGGCCGC;SOR=0.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=33;WE=4027696;WS=4027678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr16	4027749	rs2601774	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=0.842;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	4039141	rs2072341	A	G	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=95;PP=2965;SC=CCAGCACCATAACTGTGCCAA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=58;TCR=95;TR=153;WE=4039149;WS=4039131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	4042449	rs2239307	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=408;SC=CCCCGACCTCCGCTGCGGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=4042457;WS=4042439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	4042470	rs2239308	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=0.524;SC=GCTGCTGCACTGGGCGTGGGA;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=4042478;WS=4042460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	4043292	rs2239309	C	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1253;SC=GTGCGGAGTGCTGTTACCCAA;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=4043300;WS=4043282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	4057637	rs73490521	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.365;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TGCTCTCTGGAGAGGACTCAC;SOR=0.048;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=10;WE=4057645;WS=4057627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr16	4165432	rs2530898	T	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=247;SC=GCTGGTGGGGTGGGGAAGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=4165440;WS=4165422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr16	4243020	rs72764668	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=0.162;SC=CAAAGCCCGCGCACCTCCTTT;SOR=0.941;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=8;WE=4243028;WS=4243010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr16	4245426	rs11076823	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CTTGAACCTCCGGCCTCAAGG;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=4245434;WS=4245416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr16	4245693	rs10852643	A	G	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=58;PP=1790;ReadPosRankSum=0.168;SC=GTGAGAAGGAACGGGCGCTGT;SOR=0.535;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=98;WE=4245701;WS=4245683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,115:0.69:166
chr16	4253117	rs13339613	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=424;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CGCCGACAGGCCTGCGCCGTA;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=33;WE=4253130;WS=4253107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr16	4254426	.	C	T	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=60.28;NF=3;NR=4;PP=39;QD=10.5387446496;SC=CCCCGGCCTCCAAGATACAGC;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=7;WE=4254434;WS=4254416;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	4254523	rs60137128	C	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.950;NF=53;NR=24;PP=1305;ReadPosRankSum=0.276;SC=ATATCTCCCTCCCCTGGTTAC;SOR=1.051;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=137;TCF=90;TCR=47;TR=77;WE=4254531;WS=4254513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr16	4254725	rs8054937	A	G	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=54;PP=1633;SC=GCTGGGCCTCAAGCAGGGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=4254733;WS=4254715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	4254758	rs62039298	A	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=530;ReadPosRankSum=1.455;SC=GCCAAGTTACACTGGACTGAG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=25;WE=4254766;WS=4254748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr16	4310468	rs251732	C	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,36:0.28:129
chr16	4386814	rs669561	T	C	5771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=79;PP=2965;SC=GCACCCACTATGTGGACAAGC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=172;WE=4386822;WS=4386804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr16	4410867	rs140995663	TCACTGCTGGCCCCACCTCTCCA	T	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.140;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.796;NF=6;NR=3;PP=728;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CCGCCACTCCTCACTGCTGGC;SOR=2.742;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=9;WE=4410896;WS=4410857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr16	4414727	rs2277852	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=278;ReadPosRankSum=0.417;SC=TGAGGCCCAGGCCCCCCGACT;SOR=0.385;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=20;WE=4414735;WS=4414717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr16	4414987	rs2277851	G	A	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.911;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1353;ReadPosRankSum=1.736;SC=GGATGGGGGCGAGGAAGCAAG;SOR=0.674;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=78;WE=4414995;WS=4414977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,89:0.56:158
chr16	4415410	rs3747575	G	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=497;ReadPosRankSum=0.222;SC=GGCCCTGTTCGAGTTCCTCCT;SOR=0.410;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=33;WE=4415418;WS=4415400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr16	4415455	rs3747576	C	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=639;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GGACTCCAGGCTGTGGATGTG;SOR=0.557;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=37;WE=4415463;WS=4415445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr16	4431202	rs758044	A	G	5138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TGGACCTGACAGCCAACAGGC;SOR=0.587;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=327;TCF=168;TCR=159;TR=210;WE=4431210;WS=4431192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,237:0.62:382
chr16	4432029	rs3810818	A	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=387;ReadPosRankSum=-0.750;SC=AGCCCCACAGAGCCGGCCACT;SOR=0.635;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=28;WE=4432037;WS=4432019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr16	4445327	rs3747579	C	T	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1196;ReadPosRankSum=-1.468;SC=GTCAAAGATCCGCAGCTGCTT;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=79;WE=4445335;WS=4445317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,101:0.65:155
chr16	4455675	rs3747580	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=654;ReadPosRankSum=1.696;SC=CAGCAGCTACGAGGGTCCTTT;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=36;WE=4455683;WS=4455665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr16	4475868	rs2304631	A	T	443.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.6208;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=2.479;SC=GCAGGCGCAGAGTCCCCGGGC;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=19;WE=4475876;WS=4475858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr16	4476089	rs1139652	T	C	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1119;ReadPosRankSum=0.469;SC=GTGTCAGCCTTACAGGTGAGG;SOR=0.453;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=71;WE=4476097;WS=4476079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,98:0.57:172
chr16	4484328	rs4785962	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=-0.864;SC=ATGTACTCACAGTTTTCTTTT;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=4484336;WS=4484318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr16	4484396	rs1139653	A	T	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=9;PP=1097;ReadPosRankSum=0.072;SC=AACAAAACATAACCCTTTCAT;SOR=0.954;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=92;TCF=74;TCR=18;TR=56;WE=4484404;WS=4484386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr16	4484613	rs4785964	A	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=696;ReadPosRankSum=0.390;SC=TGCCCATATGAATAGGTCTCA;SOR=0.495;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=38;WE=4484621;WS=4484603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
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chr16	4555534	rs143511999	G	A	4377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=66;PP=2572;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CAATGTCAGCGGAAGTGGAAA;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=127;TCR=98;TR=150;WE=4555542;WS=4555524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,191:0.67:287
chr16	4562351	rs8129	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=226;ReadPosRankSum=-1.366;SC=AAGCTCATTGTCAGCCCCCTG;SOR=0.394;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=17;WE=4562359;WS=4562341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr16	4562512	rs7665	A	G	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1379;ReadPosRankSum=-1.419;SC=ACCACTGAGCACAGGGAGCAA;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=89;WE=4562520;WS=4562502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,108:0.68:159
chr16	4621725	rs35531180	GA	G	1003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=971;SC=CTGGGGGTTGGAGCAATGAGG;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=4621733;WS=4621715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	4625126	rs9673241	G	A	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=32;PP=1856;SC=ACTGAGAGTGGGAGGCGGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=85;WE=4625134;WS=4625116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	4625164	rs76048912	C	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CCTCTGCCCCCTCTTCTGCAG;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=75;WE=4625172;WS=4625154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr16	4641814	rs5815211	AG	A	1720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1491;SC=CCCTCCTGGTAGGGGTCCTGC;SOR=2.170;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=39;WE=4641822;WS=4641804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	4649955	rs11076843	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	4649965	rs7403819	T	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	4660342	rs841184	C	T	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=26;PP=1081;SC=GCAGGACCCACGGAGCCGGGA;SOR=1.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=4660350;WS=4660332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	4664412	rs138923012	T	TG	672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=197;SC=ACAAAAGGGGTGGGGGGGGTC;SOR=0.770;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=15;WE=4664420;WS=4664402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	4664833	rs860889	T	G	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=61;PP=2014;SC=GCCTCCCTCCTCCGCCCGCGC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=101;WE=4664841;WS=4664823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	4674954	rs3747587	C	G	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=55;PP=2679;SC=CCGGCAGCGCCGCGCACCATG;SOR=1.100;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=81;TCR=55;TR=136;WE=4674962;WS=4674944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	4675116	rs1386092	G	T	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=55;PP=1506;SC=CGGGCGCGGGGGCGGGGACTC;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=67;WE=4675124;WS=4675106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	4714639	rs1659479	T	C	5379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=57;PP=2965;SC=TCCAGCTCATTTGTTGACCGA;SOR=1.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=106;TCR=58;TR=161;WE=4714647;WS=4714629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	4715012	rs3813746	C	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=816;SC=GCTGAGCCCTCGGTGCCGCAG;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=4715020;WS=4715002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	4718388	rs34069734	A	G	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=67;PP=2132;SC=GCATACTCATACATAGACACA;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=100;WE=4718396;WS=4718378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	4721468	rs715109	T	C	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=1.534;SC=AAGGTGTGTATCTGGGTGAGG;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=172;WE=4721476;WS=4721458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr16	4723451	rs2289314	A	G	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=18;PP=1494;SC=CAGGAGCCGTACTCTGGCCTT;SOR=1.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=4723459;WS=4723441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	4732953	.	GC	G	345.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=287;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CTGAGGTGAGGCCCCCCCGGG;SOR=1.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=5;WE=4732963;WS=4732943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr16	4732955	.	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=273;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GAGGTGAGGCCCCCCCGGGGA;SOR=1.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=8;WE=4732963;WS=4732943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr16	4736080	rs144808025	TTCTGGCTGCGC	T	2248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=8;PP=2938;SC=CCGCGTTGAATTCTGGCTGCG;SOR=2.348;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=26;WE=4736098;WS=4736070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	4736316	rs841225	C	T	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=52;PP=1681;SC=TACGTGACCTCCCAGACGCGC;SOR=1.168;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=83;WE=4736324;WS=4736306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr16	4748825	rs841214	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=532;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TGGCGAGCTCCTGCATCTCAG;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=33;WE=4748833;WS=4748815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr16	4751045	rs863980	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=375;ReadPosRankSum=1.686;SC=TCAGTTGCAGCGCGGGGAGGC;SOR=1.284;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=29;WE=4751053;WS=4751035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,29:0.30:96
chr16	4752134	rs841210	A	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=19;PP=1241;SC=TGCTCTCCACATCCCGCTCAT;SOR=1.580;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=4752142;WS=4752124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr16	4787987	rs859310	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=248;ReadPosRankSum=-0.058;SC=GTGTGTGTGCGATGTTAGTCT;SOR=1.457;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=18;WE=4787995;WS=4787977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,23:0.29:79
chr16	4790273	rs859305	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=783;ReadPosRankSum=0.225;SC=GCTCTGGTGAGGTCAGCGCTC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=57;WE=4790281;WS=4790263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,62:0.36:173
chr16	4794873	rs2075469	C	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=730;SC=ATCCTCAGACCGCATGGTGCC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=4794881;WS=4794863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	4796393	rs737700	A	G	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=50;PP=2022;SC=TCAAGGAAGCAGGGCTCCCAG;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=4796401;WS=4796383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	4796595	rs759988	T	C	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=38;PP=1029;SC=TGGTGGATCCTGATGGGGAGG;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=4796603;WS=4796585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	4796871	rs2341988	A	G	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=33;PP=1797;SC=AGCCCCAACAAGAGTTGGAAC;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=4796879;WS=4796848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	4797226	rs759989	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=527;SC=GCTGCCTGAATTGCATTCTTG;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=4797234;WS=4797216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	4797457	rs17853375	C	T	4398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=69;PP=2739;SC=GCTCAGGCCCCTGAAGACACA;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=144;WE=4797465;WS=4797447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr16	4801723	rs921863	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.140;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=0.022;SC=TGTATTGGGGGACCCTAAACC;SOR=0.184;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=18;WE=4801731;WS=4801713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr16	4802370	rs3747601	C	A	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=669;SC=AGTTTCAGGCCTGGTGATCAG;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=4802378;WS=4802360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	4802386	rs3747602	G	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=10;PP=765;SC=ATCAGGCTTTGGCACCGGGGC;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=4802394;WS=4802376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	4812209	rs12599765	G	A	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=27;PP=1078;SC=TAACAAGGAAGTGTGACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=4812217;WS=4812199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	4815425	rs4786548	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=447;ReadPosRankSum=0.675;SC=GGCTGAGAAATCTTTTGCAGT;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=25;WE=4815433;WS=4815415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr16	4815501	rs12928542	G	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=883;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CAAGGAATCTGCAGCTGCAGA;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=51;WE=4815509;WS=4815491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr16	4815608	rs4786549	A	G	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=85;PP=2847;SC=GCCCTTCCACAAGGACCACGG;SOR=1.114;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=4815616;WS=4815598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	4833421	rs7201715	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GATGTGTGGGAAGGAAATCAC;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=4833429;WS=4833411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr16	4833615	rs6500634	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=834;ReadPosRankSum=0.446;SC=CCTCTGCCCCCGCTGACCCCA;SOR=0.498;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=53;WE=4833623;WS=4833605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,61:0.74:82
chr16	4833861	rs112713748	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=253;ReadPosRankSum=-1.747;SC=CGGCAGCCCATGGTGGGGACC;SOR=1.730;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=15;WE=4833869;WS=4833851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr16	4833970	rs759991	C	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=974;ReadPosRankSum=1.179;SC=CGCAGCAGTGCACCCGGGTGT;SOR=0.882;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=57;WE=4833978;WS=4833960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,67:0.54:123
chr16	4834165	rs8043579	C	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr16	4834168	rs8043725	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr16	4835794	.	G	GA	845	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=16;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=59.4;NF=6;NR=12;PP=845;QD=48.4444444444;SC=AAAAAAAAAAGAGAGAGAACC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=18;WE=4835802;WS=4835784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,18:0.78:23
chr16	4836155	rs71402568	G	GT	663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=754;SC=GTTTTAGGCAGTTTTTCTCTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=20;WE=4836163;WS=4836145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	4837362	rs741695	T	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=542;ReadPosRankSum=0.392;SC=TGTGAGGTGCTATTATCAGGC;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=24;WE=4837370;WS=4837352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
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chr16	4846068	rs2075465	T	C	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1161;ReadPosRankSum=-1.858;SC=TGCCGGCCTCTGGGACCTGCA;SOR=0.423;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=77;WE=4846076;WS=4846058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,84:0.67:126
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chr16	4847524	rs1982515	T	C	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GAGGGTGCTGTAGGTTGCTGA;SOR=0.628;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=73;WE=4847532;WS=4847514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,85:0.64:133
chr16	4847619	.	T	TGGGGTACACCAGACCCCAAGACTGGGGCGCTCTGAGGGCGTGGCAGGGCCCTCAGAACCCCTGCCCACTGTG	1473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=46.05;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr16	4847640	.	GT	AC	523	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=59.58;NF=5;NR=11;PP=523;QD=36.0292421789;SC=AGACCCCAAGGTTGGGGCGCT;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=16;WE=4847649;WS=4847630;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,16:0.28:57
chr16	4848494	rs8053790	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=0.530;SC=GGCACCCCTCCGCGTCCATCC;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=7;WE=4848502;WS=4848486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr16	4849705	rs11553876	C	T	3541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.730;NF=77;NR=58;PP=2175;ReadPosRankSum=0.165;SC=CCTCAGCGCCCGTCTTGAACT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=111;TCR=83;TR=135;WE=4849713;WS=4849695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,154:0.66:234
chr16	4855279	rs8064024	A	G	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.513;SC=TATCGTTGTCAGACTGGTCCA;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=87;WE=4855287;WS=4855269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,117:0.65:179
chr16	4861709	rs2085329	G	C	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=33;PP=1626;SC=GGCCTGTCACGTGGGCCAGGG;SOR=1.029;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=4861717;WS=4861699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	4867565	rs6500635	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=603;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CCCAGACTCCACCGATCCAAC;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=34;WE=4867573;WS=4867555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr16	4872970	rs2075466	G	C	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=1000;ReadPosRankSum=-1.721;SC=CCAGTTATCTGCCACCAAAGG;SOR=0.464;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=56;WE=4872978;WS=4872960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,69:0.55:125
chr16	4897103	rs111601308	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=295;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AGCGCCGGCACCTTCTCTTCC;SOR=0.997;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=20;WE=4897111;WS=4897093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr16	4897153	rs2072595	A	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.605;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=624;ReadPosRankSum=-0.570;SC=AGGCAGCTCCAGGGCCGGCAG;SOR=1.251;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=40;WE=4897161;WS=4897143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr16	4903243	rs8056889	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=0.492;SC=GCTTCCGTAGCGGGGAAGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=4903251;WS=4903233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr16	4908504	rs3747613	C	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=739;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TGATGAAGTTCAAGGCCACAG;SOR=0.248;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=38;WE=4908512;WS=4908494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr16	4908667	rs3747614	A	G	2933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=60;PP=1762;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CTGAGGCGGTAAGTAGTTACT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=107;WE=4908675;WS=4908657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,131:0.65:203
chr16	4918732	rs56159834	A	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=0.854;SC=GACTGTATTGACAGGTGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=4918740;WS=4918722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr16	4920412	rs7200395	T	C	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=82;PP=2889;SC=TCTTAAGCAATGATGCGTCTG;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=158;WE=4920420;WS=4920402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	4920661	rs6500637	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CGCTTGCAGGTGCAACCCTCC;SOR=1.067;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=33;WE=4920669;WS=4920651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr16	4923091	rs2251666	G	A	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=896;ReadPosRankSum=0.697;SC=CAGTTTGCTCGGGTCACATGT;SOR=0.790;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=48;WE=4923099;WS=4923081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr16	4924160	rs12445265	A	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=793;ReadPosRankSum=0.192;SC=CAACAGGCCAATGTTGGCATC;SOR=0.982;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=48;WE=4924168;WS=4924150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr16	4927285	rs12444761	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=814;ReadPosRankSum=1.459;SC=CCCAGACTGGCCTGGCAGGTT;SOR=0.807;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=44;WE=4927293;WS=4927275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr16	4930100	rs1876359	C	T	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=897;ReadPosRankSum=0.179;SC=CTCAGCTTCACGGGAAAGGGC;SOR=0.546;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=56;WE=4930108;WS=4930090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,77:0.62:124
chr16	4935146	rs1049206	C	T	3231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=53;PP=1897;ReadPosRankSum=-1.943;SC=CCTTCTCCTGCACCACCACTT;SOR=0.930;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=208;TCF=113;TCR=95;TR=123;WE=4935154;WS=4935136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,149:0.60:250
chr16	4935656	.	G	A	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=40;PP=1441;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TGTCAGGCTCGATGCGCAGGA;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=93;WE=4935664;WS=4935646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,101:0.72:140
chr16	4938160	rs2734742	T	G	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=33;PP=1499;SC=TCACGTGGCTTCTCCTTCCAT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=4938168;WS=4938150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	4938947	rs199945441	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=-0.036;SC=ACCCCTGCTGTTTGTGCTTTG;SOR=0.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=8;WE=4938955;WS=4938937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr16	4939116	rs8060738	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=13;PP=354;SC=TTTAAAAAAGCAACCATGGAT;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=23;WE=4939124;WS=4939106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	4939225	.	G	GTT	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=66.83;NF=0;NR=3;PP=75;QD=32.0;SC=GCAAAAGGCAGTTTTTTTGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=4939233;WS=4939215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	4940809	rs2471844	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=46;PP=1769;SC=CCAGGTCCGGACAGTGCTCCT;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=77;WE=4940817;WS=4940799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	4940989	rs2471843	A	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=274;SC=GATGACACCCACTGAAGCCCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=4940997;WS=4940979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	4944518	rs1876363	C	G	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=76;PP=2844;SC=TCACAAAACACACGGCCGGAG;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=147;WE=4944526;WS=4944508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	4945221	rs12709119	A	G	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=64;PP=2928;SC=TTACCCCAAAAACTTTGTAGT;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=4945229;WS=4945211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr16	4947534	rs8051246	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=286;SC=ATCAGAAGCATGGGTGCTGGG;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=4947542;WS=4947524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	4948936	rs12443906	C	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=790;SC=GGGGTCTGCCCGAGCTCCAGG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=4948944;WS=4948926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	4949440	rs76087945	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GCCACTGCTCGCTTCCTTCCC;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=14;WE=4949448;WS=4949430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	4952598	rs2048098	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=1.794;SC=GGCCCCCCACCCAGACCCCGG;SOR=0.936;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=7;WE=4952606;WS=4952588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr16	4961003	rs8057613	A	G	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=883;SC=GGTGGGGGCTATGTCCCCACC;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=4961011;WS=4960993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	5009433	rs7200245	G	A	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=95;PP=2817;SC=AGTTGGAGGGGCTTGAGATCA;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=58;TCR=95;TR=153;WE=5009441;WS=5009423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	5041778	rs2972265	T	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=14;PP=1141;SC=CCTGTGGTGATCCTGTGACCC;SOR=1.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=53;WE=5041786;WS=5041768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	5046787	rs2270260	G	C	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=16;PP=975;SC=TGCCCCGGCTGGTTCTGTAAT;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=5046795;WS=5046777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	5050897	rs2286966	G	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=32;PP=1041;SC=GGTGTGAGGGGAGCACAAGGC;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=5050905;WS=5050887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	5056122	rs2302555	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=412;SC=CTGGGATTCCCGGAGTGGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=5056130;WS=5056112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	5061085	rs2908669	A	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=915;SC=GGCAGGGCTGATGTGTTTCAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=5061093;WS=5061075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	5075542	rs887854	G	A	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=32;PP=1252;SC=GAGGCTCCCCGTTCATCTCCT;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=5075550;WS=5075532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	5077395	rs71402581	TGGGAGGA	T	1764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	5077794	rs2937112	G	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GGAGCAGTGGGGGCTGCCGGG;SOR=0.392;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=25;WE=5077802;WS=5077784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr16	5078841	rs1995278	T	C	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=47;PP=2210;SC=GGGGCAGACCTGGACTTCAGC;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=123;WE=5078849;WS=5078831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	5083483	rs2972272	T	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1212;ReadPosRankSum=0.268;SC=AGCCGCCGGGTCCACCGGGCT;SOR=0.310;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=69;WE=5083491;WS=5083473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,73:0.65:113
chr16	5122072	rs112683515	G	GGTCT	4140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.172;NF=20;NR=64;PP=2420;ReadPosRankSum=1.381;SC=AGTGGCCAAGGGTCTGGGAGG;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=84;WE=5122081;WS=5122062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,152:0.99:154
chr16	5122191	rs34061670	C	CG	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=1330;SC=ATTAGACGAGCGGTTCTGCCC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=31;WE=5122199;WS=5122181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	5125365	rs4786590	C	T	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=44;PP=2552;SC=GGTTTCCTCCCCTTCAAGTCT;SOR=1.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=120;WE=5125373;WS=5125355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	5127335	rs11076869	T	A	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=23;PP=2017;SC=CTCAGGGAGCTCAAACTCTCC;SOR=1.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=92;WE=5127343;WS=5127325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	5517175	rs34212245	T	TTC	391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=143;SC=TCAATGTTTCTTCTCTCTCTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=5517183;WS=5517165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr16	5649187	rs17138179	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.050;NF=18;NR=43;PP=985;ReadPosRankSum=0.424;SC=TGAGAGCTGTATTCTGTCCTC;SOR=0.703;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=37;TCR=94;TR=61;WE=5649195;WS=5649177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr16	7102036	rs35212568	CT	C	4536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=46;PP=2966;SC=GACTTTTCCCCTTCATTTTCT;SOR=1.170;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=80;WE=7102044;WS=7102026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	7657373	rs1507010	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=733;ReadPosRankSum=0.916;SC=AAGTCTTCTCAGTCTTTTCTA;SOR=0.983;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=55;WE=7657381;WS=7657363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,62:0.38:163
chr16	7657432	rs4616299	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=740;ReadPosRankSum=0.968;SC=AATAACCTGAAGCAAGTGAAT;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=40;WE=7657440;WS=7657422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr16	7703785	rs3217052	G	GCT	2459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.375;NF=5;NR=27;PP=1374;ReadPosRankSum=1.516;SC=GACAGCCTGTGCTCTCTCTCT;SOR=0.776;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=32;WE=7703793;WS=7703774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,73:0.95:77
chr16	7704032	rs2302216	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=8;PP=215;SC=GAGCGCATGATGGTCTTGACT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=7704040;WS=7704022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	7715108	rs8064206	T	C	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=62;PP=1630;SC=TGGTTTGTCTTGCAGGACAGA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=7715116;WS=7715098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	7721778	rs2286541	C	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=1.003;SC=GGTGGCTATCCCTGTATCTAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=7721786;WS=7721768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr16	7726691	rs2191134	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=137;SC=TTTGGGTAACAGCTGCTCTGG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=7726699;WS=7726681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	7758948	rs2270127	G	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=407;ReadPosRankSum=0.071;SC=GCTTCTCACTGGAAGATGAGT;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=21;WE=7758956;WS=7758938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr16	7759164	rs7196923	T	C	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=66;PP=2090;SC=GTCCTCACTTTCTCCTGCCTC;SOR=1.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=93;WE=7759172;WS=7759154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	7759206	rs62011897	G	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-1.157;SC=ACCTCAGTACGGGTTGACGTC;SOR=0.118;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=11;WE=7759214;WS=7759196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr16	8619750	rs7198383	C	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=905;SC=GCCCCTCCCTCCCCTCCACGA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=8619758;WS=8619740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	8620096	rs9922116	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=292;SC=GCCACGCTGCTCAGCGTCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=8620104;WS=8620086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	8722629	rs2270286	G	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=531;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CAAGACTCTTGGACAGATTCA;SOR=0.552;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=43;WE=8722637;WS=8722619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,51:0.35:144
chr16	8728953	rs1731044	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=27;PP=1431;SC=AGGTCTTGTCCGCTTCCTGTG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=8728961;WS=8728943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	8728999	rs151312932	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=0.573;SC=CACGCTGCTTGTCGCTCCTTG;SOR=0.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=23;WE=8729007;WS=8728989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr16	8729254	rs3108687	C	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=631;SC=GGCAGAGGCACTGGAAATTGG;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=8729262;WS=8729244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	8729275	rs1641040	T	C	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=496;SC=ATGTTAGCTGTTGTTGATTTT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=8729283;WS=8729265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	8729323	rs1731043	A	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=167;SC=CTCTCCATTTATTCTCAGTGA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=8729331;WS=8729313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	8732733	rs1362345	C	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=368;SC=CGCACTGTCTCTCCCCATCAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=8732741;WS=8732723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	8732882	rs5815485	CA	C	6169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=82;PP=2975;SC=TCTCTCTAGGCAAAAAACATG;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=36;TCR=88;TR=116;WE=8732890;WS=8732872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr16	8733071	rs1641048	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=747;SC=TGTTTAGCAGATAGGACAGAC;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=8733079;WS=8733061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	8734830	.	G	GCTGGCTGT	605	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=64.69;NF=9;NR=4;PP=605;QD=47.1538461538;SC=TGGCTGGCTGGCTGGCTGGCT;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=8734838;WS=8734820;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,13:0.72:18
chr16	8735120	rs8062990	T	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=1358;SC=GCTCTGTGGTTTTGACAGAGC;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=8735128;WS=8735110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	8735200	rs8045911	G	A	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=31;PP=2025;SC=ATGAGCACCAGCTGTCATTCT;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=94;WE=8735220;WS=8735190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	8735212	rs1629322	T	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=34;PP=1818;SC=TGTCATTCTCTGAGCGCCTGC;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=99;WE=8735220;WS=8735190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	8735245	rs1641055	C	T	4906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=69;PP=2944;SC=ACCTCACGTTCATTTTCTTCT;SOR=0.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=163;WE=8735253;WS=8735235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr16	8735355	rs1641056	A	G	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=60;PP=1836;SC=GTAGGGGCATAGACCCGAGTT;SOR=1.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=85;WE=8735363;WS=8735345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	8736028	rs1614616	T	C	6560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.909;SC=AATTTCTGACTTGTACGATCA;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=194;WE=8736036;WS=8736018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,244:0.99:246
chr16	8736150	rs1615559	A	C	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=54;PP=2493;SC=CCGGGAGTTCAGTTTTAGAAG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=109;WE=8736158;WS=8736140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	8736246	rs1731007	G	A	6413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=72;PP=2965;SC=CTCTCTGTGCGGATTGCTCTG;SOR=1.276;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=126;TCR=72;TR=198;WE=8736254;WS=8736236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr16	8736499	rs1618219	C	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=43;PP=1189;SC=GTGTCCTTGTCAGTGTCATTA;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=8736507;WS=8736489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	8738350	rs11645418	C	T	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=35;PP=2111;SC=GCAAGGTGGGCAGAAACAGCA;SOR=1.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=110;WE=8738358;WS=8738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	8738398	rs1641065	A	G	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=64;PP=2934;SC=TGTGCGTCCGACTGGCTGGTT;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=155;WE=8738406;WS=8738388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr16	8738427	rs1641066	T	C	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=79;PP=2965;SC=CAACTTCACATTGAGACACTT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=164;WE=8738435;WS=8738417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	8738499	rs1731000	G	A	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=77;PP=2459;SC=GGAGCAGCTCGCAGATGGCAA;SOR=1.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=122;WE=8738507;WS=8738489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	8738579	rs1641067	A	G	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=891;SC=GCCTCCAGCAACTGGTAGGTC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=8738587;WS=8738569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	8738622	rs9933132	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=365;SC=GGTTGCTTTACTGTGAAGCGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=8738630;WS=8738612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	8739954	rs1641070	G	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=237;SC=TCTTTTCTCTGTTTGCTGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=8739962;WS=8739944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	8740015	rs1730994	A	C	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=1119;SC=TCGCCTCCACAAGGCGCGGCG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=8740023;WS=8740005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	8740418	rs1641072	T	C	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=60;PP=2144;SC=GCCATCATATTGCCGCTCGGC;SOR=0.838;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=113;WE=8740426;WS=8740408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	8740503	rs1730992	G	A	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=47;PP=1723;SC=TGAGAAGGAAGAGGCAGGAGC;SOR=0.936;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=83;WE=8740511;WS=8740493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	8740653	rs1641073	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=662;SC=AGTGATCTTCCTCAGAGGTGT;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=8740661;WS=8740643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	8829715	rs1640998	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.265;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,17:0.24:72
chr16	8839954	rs1731017	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=531;SC=CCTAGATCTCAGGTGAGTTGA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=8839962;WS=8839944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	8840025	rs2103340	C	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=167;SC=AAAAGCACAGCCAAGCTTAGG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=8840033;WS=8840015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	8841794	rs753071	T	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=527;SC=TGGAATAGTTTCCTGCCAACT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=8841802;WS=8841784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	8841895	rs368721800	A	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=792;ReadPosRankSum=1.023;SC=TTGGGAAAACATGAAAGATTT;SOR=0.965;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=39;WE=8841903;WS=8841885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr16	8841960	rs1641010	T	C	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=48;PP=1438;SC=TGTTCTTGCCTGCAGGAGTTA;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=8841968;WS=8841950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	8842128	rs1641011	T	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=217;SC=TTTTTCTCATTTCCTTTGTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=8842136;WS=8842118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	8851767	rs12930438	C	T	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=68;PP=2086;SC=TTCATTCATTCCATAAATATG;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=105;WE=8851775;WS=8851757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	8858580	rs2302608	T	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=33;PP=1652;SC=CTCACGGCTATTTCCCTCCCC;SOR=1.261;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=89;WE=8858588;WS=8858570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	8858700	rs148949594	G	GCA	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=269;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GAGGTTTGGGGCACACACACA;SOR=0.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=20;WE=8858709;WS=8858690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr16	8862212	rs8049072	C	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=62.13;NF=1;NR=4;PP=81;SC=ACATATTGTCCCACTGATTGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=8862220;WS=8862202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	8862506	rs1273406	C	A	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=189;SC=ATATACACCTCCTATGCACCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=8862514;WS=8862498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	8862592	rs1273407	T	C	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=14;PP=910;SC=CTGACAGCCTTGCGCTGAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=8862600;WS=8862582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	8873332	rs12447235	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=357;ReadPosRankSum=1.082;SC=TCCTCCCACTACAGGCCCGGT;SOR=0.432;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=21;WE=8873340;WS=8873322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
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chr16	8898811	rs77026919	A	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.577;SC=ATGAATCTTTACTCTGTATTT;SOR=0.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=8898819;WS=8898801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr16	8904877	rs34742119	T	TATG	925.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=758;SC=GCTGTTTATCTATGTTGCCCA;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=8904885;WS=8904867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr16	8907145	rs9924186	G	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TCAGACCCCCGACGCCTCTGT;SOR=0.114;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=16;WE=8907153;WS=8907135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr16	8948974	rs6898	T	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=1058;SC=GCCTCCTCCCTGCAAAGTCTC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=8948982;WS=8948964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	8949187	rs2231709	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=670;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TTCCACACTACGGGGGCATAA;SOR=0.858;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=41;WE=8949195;WS=8949177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr16	8949220	rs2231708	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=433;ReadPosRankSum=1.025;SC=GGGCTCACACCGGGACACAGC;SOR=0.927;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=25;WE=8949228;WS=8949210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr16	8952248	rs988065	A	G	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=42;PP=1999;SC=CATCAGCTGGAGTAATGAAGC;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=102;WE=8952256;WS=8952238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	8955280	rs75831927	C	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=299;ReadPosRankSum=0.291;SC=TTTGCCCCCCCAGTCCCCTCA;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=22;WE=8955288;WS=8955270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr16	8988386	rs28362503	CG	C	110.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=0;PP=86;SC=CACCAGCCCCCGGGGGGGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=8988394;WS=8988376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	8989403	rs1677473	A	G	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=43;PP=2542;SC=TAAAAACACAAATCAAGCTAC;SOR=1.294;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=118;WE=8989411;WS=8989393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	8992342	rs2304465	G	A	6851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=95;PP=2965;SC=CCAAAACCCCGAGCCTTCTCT;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=205;WE=8992350;WS=8992332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr16	8992868	rs2437724	AC	CA	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=16;PP=1741;SC=CAAGAAATGGACTGTCAGGTG;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=68;WE=8992877;WS=8992858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	8994563	rs2447919	C	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=23;PP=772;SC=CTTCCATGTACTTAAGTATTT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=8994571;WS=8994553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	8995177	rs199579856	GAAA	G	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	8996377	rs2447918	C	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=425;SC=AATAAAAACACGCTCATATTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=8996385;WS=8996367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	8998571	rs2437727	G	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=21;PP=455;SC=AGGCTGAGGCGGGCCGATCAC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=8998579;WS=8998561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	9004564	rs2447916	C	A	7632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=151;NR=71;PP=2965;SC=TAAAGAAGAACGCTACAACAG;SOR=1.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=151;TCR=71;TR=222;WE=9004572;WS=9004554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr16	9010260	rs138207509	ATTTTCTGAATTAGGTC	A	585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=2094;SC=AAAGATGGGCATTTTCTGAAT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=9010283;WS=9010250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	9010446	rs57510291	A	AC	1597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=851;SC=CTCCATTTAAAGCTCAACTTT;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=19;WE=9010454;WS=9010436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	9014350	rs1677470	T	C	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=32;PP=1062;SC=AGAACACACATTTTATTCCCA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=9014358;WS=9014340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	9014434	rs2447912	T	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=314;SC=TCCCAACTTTTTTGCTAATTT;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=9014442;WS=9014424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	9015252	rs30761	A	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=369;SC=CCCATTTATGATTTCATTGCT;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=9015260;WS=9015242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	9017061	rs139138924	T	TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	3140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=2957;SC=AGTAATGAAATACTGTCTTAC;SOR=3.258;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=8;WE=9017069;WS=9017051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	9030444	rs1382390	C	G	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=26;PP=1113;SC=ACTCACCTTCCAGCCCAAGCC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=9030452;WS=9030434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	9210373	rs8045589	A	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=250;SC=TGATATGTTTATCCAGAATAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=9210381;WS=9210363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	9862556	rs11866328	G	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.426;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=1.172;SC=GCAACACCTGGCTTATGAATG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=9862564;WS=9862546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr16	9916204	rs9806806	C	G	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=844;ReadPosRankSum=-1.666;SC=GATAGTTATTCCGAATGTTTC;SOR=0.506;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=49;WE=9916212;WS=9916194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr16	9934689	rs373772021	AAG	A	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr16	9943666	rs2229193	C	T	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1183;ReadPosRankSum=1.510;SC=ACGTCTCGGTCAGGGGGTCTA;SOR=0.612;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=73;WE=9943674;WS=9943656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr16	10524656	rs56252625	GGAC	G	5699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=80;PP=2967;SC=GTCATAACTAGGACGACTGAA;SOR=1.503;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=9;TCR=83;TR=88;WE=10524666;WS=10524646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	10532211	rs1532824	A	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=204;SC=AAGCAATCCTACCACCTCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=10532219;WS=10532201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	10566146	rs4453490	G	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=454;SC=AAATGAAAAAGTTAAATGTAC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=10566154;WS=10566136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	10567984	rs62027485	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-0.403;SC=TTTAGCTCATGTGCAGATTCA;SOR=0.973;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=13;WE=10567992;WS=10567974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr16	10574829	rs12596111	A	T	4088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=94;PP=2525;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CAGGTACTGAATCAAAGTGCT;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=73;TCR=137;TR=141;WE=10574837;WS=10574819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,177:0.68:262
chr16	10575824	rs1970817	C	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TTTTCAGACCCAATGGCATTG;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=66;WE=10575832;WS=10575814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr16	10625605	rs149380057	GATGAATGA	G	944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=5;PP=813;SC=GATTTATGTTGATGAATGAAT;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=10;WE=10625620;WS=10625595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	10625887	rs7195563	C	T	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=76;PP=2773;SC=GCATTCACCTCCCCATCTCCA;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=10625895;WS=10625877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	10625997	rs7194566	G	A	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=50;PP=2001;SC=CAGGGAGCGCGTTAGAAATGC;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=85;WE=10626005;WS=10625987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	10626059	rs35914943	AG	A	2095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=38;PP=919;SC=GTCTGGGGTGAGGGGGGGGGC;SOR=0.869;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=44;WE=10626067;WS=10626049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	10627085	rs4780939	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=330;SC=TGTAGAGACAAGATTTTGCCA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=10627093;WS=10627075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	10631912	rs2279868	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TGGCCTGGACCGCCTGCAGCG;SOR=0.432;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=10631920;WS=10631902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr16	10631945	rs1504883	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.805;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	10631985	rs1504884	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=205;SC=GCCGGCACTGTGGGGTACACA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=10631993;WS=10631975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	10769958	rs2719710	T	C	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=968;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CTCCCGCAGCTGGATGGAGTT;SOR=0.753;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=226;TCF=105;TCR=121;TR=80;WE=10769966;WS=10769948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,103:0.36:288
chr16	10770075	rs2719711	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=421;ReadPosRankSum=1.210;SC=GCAGTCCTGGAAGACCTCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=28;WE=10770083;WS=10770065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr16	10770091	rs2719712	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=234;ReadPosRankSum=0.803;SC=TCAGAATCTGTGGTTTCTCCG;SOR=0.386;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=22;WE=10770099;WS=10770081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr16	10775822	rs10221070	G	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=530;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GACACGCCAGGGATGGGGAGG;SOR=0.204;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=34;WE=10775830;WS=10775812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr16	10775855	rs12918646	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=442;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CTTACGTGCCGTCAATTTTCT;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=30;WE=10775863;WS=10775845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,38:0.35:109
chr16	10776063	rs10221071	G	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CCACACAGCAGGTGTGTGTTG;SOR=0.242;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=22;WE=10776071;WS=10776053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr16	10784013	rs17604545	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=562;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATGTGACCTCACTACTGGGCA;SOR=1.765;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=26;WE=10784021;WS=10784003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
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chr16	10992715	rs6498121	T	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CCAAGGTGGGTACAATAGAGA;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=22;WE=10992723;WS=10992705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,28:0.29:95
chr16	10995850	rs6498124	G	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=303;SC=TCCCAGGAAGGCCCCTCCAAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=10995858;WS=10995840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	10995933	rs8046121	A	G	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=16;PP=1404;SC=TCTCCTAGTGAGACCAGTGAG;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=10995941;WS=10995923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	10996332	rs6498125	C	G	68.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=45;SC=CATGGAGCCCCTTCTCTGTGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=10996340;WS=10996330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	11001680	rs34685848	G	T	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1719;ReadPosRankSum=1.895;SC=TCGGGCCATCGGCGGCTGCCT;SOR=0.922;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=110;WE=11001688;WS=11001670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,114:0.65:176
chr16	11002133	rs4781018	C	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=688;SC=AGAATGGATTCTCTCCATTTT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=11002141;WS=11002123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	11002904	rs2228238	G	A	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=33;PP=2517;SC=TGAGCGACACGGTGGCGCTGT;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=115;WE=11002912;WS=11002894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	11002927	rs7197779	A	G	4687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=56;PP=2838;SC=GAGTCCCTGCAGCAGCATGGG;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=148;WE=11002935;WS=11002917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	11003157	rs45481191	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-2.075;SC=TCTGGGACACCCCATGCCCTC;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=9;WE=11003165;WS=11003147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr16	11004150	rs4781019	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=1.685;SC=TGTGGGTCTGCGCAAGGTTTC;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=24;WE=11004158;WS=11004140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,24:0.26:91
chr16	11010150	rs6498130	G	T	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=13;PP=853;SC=GGCTGAGGAGGCCCTCACTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=45;WE=11010158;WS=11010140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	11012234	rs45509299	T	C	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=39;PP=1736;ReadPosRankSum=-1.407;SC=AGAACTCTCCTTGAGGTCAAA;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=96;TCR=56;TR=103;WE=11012242;WS=11012224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,130:0.68:191
chr16	11015906	rs6498134	A	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=3;PP=1168;SC=ATAAATATTGATTCCTTCCCC;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=11015914;WS=11015896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	11016045	rs2229322	C	T	3162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=64;PP=1845;ReadPosRankSum=-0.575;SC=ACTGCATCTGCGACGTGGGAG;SOR=0.659;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=207;TCF=96;TCR=111;TR=121;WE=11016053;WS=11016035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,145:0.59:245
chr16	11016508	rs57798917	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=113;SC=TCTGTAAAGTGGGGACAGTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=11016516;WS=11016498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	11038824	rs3743976	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.903;SC=GGGTTCGAACCCTGACCCCGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=11038832;WS=11038814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr16	11056378	rs16957839	C	T	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=60;PP=1731;ReadPosRankSum=1.489;SC=CGGGCCGTTACGTGTGCGTTC;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=57;TCR=91;TR=98;WE=11056386;WS=11056368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,113:0.63:180
chr16	11070973	rs16957855	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=0.133;SC=TTGAGACTAACTCAAATATGT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=11070981;WS=11070965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr16	11136048	rs2302557	C	G	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=35;PP=1746;SC=GGATAGGCAGCAGTCTTGGGT;SOR=1.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=87;WE=11136056;WS=11136038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	11137978	rs8052325	A	G	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=57;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TATTGTAGAAACAGAAGTGTG;SOR=0.875;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=130;TCF=38;TCR=92;TR=78;WE=11137986;WS=11137968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,105:0.63:166
chr16	11154770	rs2286973	G	A	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.344;SC=CCATCCGGGTGTTCTTCATGC;SOR=0.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=61;WE=11154778;WS=11154760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr16	11214668	rs3217121	AAC	A,AACAC	345.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=11.761;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=14,14;PP=267,386;ReadPosRankSum=1.774;SC=GTTGGCTACAAACACACACAC;SOR=5.417;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14,14;WE=11214677;WS=11214658;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.27:15
chr16	11250413	rs7189563	C	A	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=861;SC=ACCCGCCTTCCTCCTGCTGCC;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=11250421;WS=11250403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	11260440	rs11643123	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-2.023;SC=TGATATGGGGACATTTGGAGA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=11260448;WS=11260430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr16	11272572	rs11647285	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=1.036;SC=CTCCCTTTGTGTGTGTGGCCC;SOR=3.816;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=21;WE=11272580;WS=11272562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr16	11349403	rs27829	A	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=26;PP=628;SC=AGAGACAAAGAGGTGAGCTGG;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=11349411;WS=11349393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	11350059	rs27831	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=8;PP=205;SC=GCTCGCTCTGTTCGGCGCCCG;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=11350067;WS=11350049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	11367143	rs438289	G	A	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=1227;SC=GTTGCGGGTCGGGAGGGTGTC;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=11367162;WS=11367133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	11367154	rs429744	C	T	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=29;PP=1253;SC=GGAGGGTGTCCGCTTGGGCTC;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=64;WE=11367162;WS=11367133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	11367195	rs35598356	G	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=785;ReadPosRankSum=-2.563;SC=CGTTGTCCTTGTGGCCCTCCT;SOR=1.041;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=40;WE=11367203;WS=11367185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr16	11369855	rs2070923	G	T	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1309;ReadPosRankSum=0.519;SC=GGGGACGGGGGTTAGGGGGCT;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=79;WE=11369863;WS=11369845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,96:0.70:137
chr16	11369930	rs1646022	C	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=527;ReadPosRankSum=2.789;SC=CAGGGACATGCAGGGCAAGGC;SOR=0.853;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=38;WE=11369938;WS=11369920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,40:0.30:133
chr16	11374866	rs737008	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=418;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CTTCTACATCGCGGTCTGTAC;SOR=0.783;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=33;WE=11374874;WS=11374856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr16	11444403	rs2032929	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.396;NF=13;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=1.481;SC=GCCGAGATTGTGCCACTGCAC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=15;WE=11444411;WS=11444393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr16	11444430	rs2032930	T	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.492;NF=19;NR=5;PP=472;ReadPosRankSum=0.743;SC=CTGGGCGACATAGCAAGACTC;SOR=2.004;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=24;WE=11444438;WS=11444420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr16	11444454	rs57767216	GA	G	2518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=27;NR=22;PP=844;SC=CTCAAAAGAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.410;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=49;WE=11444462;WS=11444444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	11444469	rs2032931	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.401;NF=35;NR=17;PP=935;ReadPosRankSum=-1.855;SC=AAAAAAAGAACATTACTATGG;SOR=1.136;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=52;WE=11444477;WS=11444459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr16	11444709	.	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.095;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	11444716	rs2032932	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.057;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	11537347	.	A	AAGAGAGAGAGAGAG	2481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.51;QD=91.92;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	11537471	rs12925081	C	T	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=55;PP=1800;SC=GGAAGAAGACCCGGATGGGGT;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=11537479;WS=11537461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	11540596	rs4359463	A	C	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=58;PP=2394;SC=TGCCCCAGACACACTCACGTA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=11540604;WS=11540586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	11540712	rs4500747	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=40;PP=1182;SC=GCCTATCAGCTGTGAAGGTCT;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=11540720;WS=11540702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	11541685	rs4296278	A	G	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=602;SC=AGGTCAGCAGAGATTCTCCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=11541693;WS=11541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	11541896	rs4238608	G	A	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=44;PP=1331;SC=GCACCAATCCGCACAGCCGTG;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=11541904;WS=11541886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	11542894	rs4467099	C	T	4186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=43;PP=2505;SC=TGCACTGCTGCGTTCCAGGCT;SOR=1.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=82;TCR=43;TR=125;WE=11542902;WS=11542884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	11544673	rs12932948	G	A	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=29;PP=1118;SC=CAGGTTCAAGGCTCCTGCAAG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=11544681;WS=11544663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	11544741	rs6498192	G	A	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=26;PP=827;SC=GCAGGCAGCTGGAGGTCCCGA;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=11544749;WS=11544731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	11544824	rs6498194	G	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=227;SC=TTTCTAGGACGTTGGTAATGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=11544832;WS=11544814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	11550979	rs4559925	C	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=354;SC=GAGGCAGCAGCGAGCCAAGAT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=11550987;WS=11550969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	11553842	rs7206698	G	C	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=91;PP=2965;SC=TCTTGTCCCAGTGCTTCCCGT;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=169;WE=11553850;WS=11553832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr16	11554737	rs8046254	C	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=167;SC=CAGCGTATCTCAGCTCACGGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=11554745;WS=11554727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	11554867	rs8050530	C	T	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=16;PP=771;SC=GAGCTGGCCCCGTTGCTGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=11554875;WS=11554857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	11555016	rs6498202	C	G	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=21;PP=683;SC=GGTCAGCCCCCAGGGACCAGC;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=11555024;WS=11555006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	11555050	rs72777217	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GGCAAAGAAGGGACTCAGGTA;SOR=1.078;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=14;WE=11555058;WS=11555040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr16	11556121	rs4254342	A	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=27;PP=791;SC=GGAACCGCTCAGCCTCGCCAC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=11556129;WS=11556111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	11645700	rs148088828	A	ACAAG	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=575;ReadPosRankSum=0.947;SC=ACAAAACAAAACAAGTTTCTA;SOR=0.694;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=12;WE=11645708;WS=11645690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr16	11647532	rs9282774	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1429;ReadPosRankSum=-1.528;SC=GCACGTAGACCGTCTGCACGG;SOR=0.636;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=82;WE=11647540;WS=11647522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,88:0.68:130
chr16	11690308	rs113749419	A	AGAGGAGGAG	582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.971;NF=0;NR=9;PP=2340;ReadPosRankSum=0.637;SC=AAATCCCAATAGAGGAGGAGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=11690316;WS=11690298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr16	11769948	rs1050068	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=763;ReadPosRankSum=0.907;SC=CCACCACGGGCGTGGTCACAG;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=54;WE=11769956;WS=11769938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
chr16	11769963	rs1050069	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=788;ReadPosRankSum=0.399;SC=TCACAGTCATCGTCATCCTCA;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=56;WE=11769971;WS=11769953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr16	11773662	rs3190321	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=459;ReadPosRankSum=0.958;SC=GTGATGGGGACGTCTTCGGGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=22;WE=11773670;WS=11773652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr16	11773743	rs7188511	G	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CCAACACAATGAGTCCAAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=10;WE=11773751;WS=11773733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr16	11797365	.	TAC	TACAC,T	202.25	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.869;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=58.35;MQRankSum=0.772;NF=8,8;NR=1,1;PP=271,83;ReadPosRankSum=1.487;SC=AGGCTTTTGATACACACACAC;SOR=2.494;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=9,9;WE=11797374;WS=11797355;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.58:19
chr16	11820896	rs188005073	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.63;MQRankSum=0.693;NF=7;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=1.078;SC=GAGACAGAGCGAGACTCTGTC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=13;WE=11820904;WS=11820886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr16	11824056	rs11639945	T	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GACCTTCAAATAGTTATATAC;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=14;WE=11824064;WS=11824046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr16	11828018	rs4780398	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=0.435;SC=ATTTAAAAATAGAATGATTCC;SOR=0.610;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=15;WE=11828026;WS=11828008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr16	11940390	rs8052900	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=10;PP=895;SC=TGTTTAAGACTGTTCCACCTA;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=11940398;WS=11940380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	11940764	rs1019814	T	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=503;SC=AAGAAATACTTAGGCAACAAT;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=11940772;WS=11940754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	11940829	rs1019813	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=337;SC=TTAATGAACACTTGAGGGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=11940837;WS=11940819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	11945231	rs2075158	T	C	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=48;PP=1899;SC=ACCGCCACACTGCTTCCAAGC;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=11945239;WS=11945221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	12009150	rs28653099	C	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=2;PP=168;SC=CAGGGCCGCGCGCCCCCGGAC;SOR=1.473;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=12009158;WS=12009140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	12009279	rs424518	A	G	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=29;PP=2108;SC=GGCGCCGCCAACTGGGGGTGG;SOR=1.629;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=69;TCR=29;TR=98;WE=12009290;WS=12009269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	12009304	rs11544193	C	A	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=58;PP=2476;SC=GCTGCCGGGCCCCGCAGGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=140;WE=12009312;WS=12009294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	12009530	.	C	CCCG	1221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=10;PP=843;SC=CGCTGCTGCTCCCGCCGCCGC;SOR=0.906;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=15;WE=12009538;WS=12009520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	12009614	rs435108	G	A	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=19;PP=980;SC=ACAGAGAGCGGGAAATGGAGG;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=12009622;WS=12009604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	12009781	rs434762	G	A	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=78;PP=2849;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCTCAAC;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=66;TCR=78;TR=144;WE=12009789;WS=12009771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	12021332	rs256390	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=225;ReadPosRankSum=0.263;SC=TCTTGGGTTCGGGTGGTGATT;SOR=0.342;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=18;WE=12021340;WS=12021322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,20:0.26:77
chr16	12031353	rs62040806	T	C	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.151;NF=43;NR=17;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TTTATTCTTATTTGTGATTAC;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=60;WE=12031361;WS=12031343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr16	12031379	rs62040807	G	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.365;NF=53;NR=27;PP=1357;ReadPosRankSum=-1.521;SC=TACCTCTACAGAAAGTTAGTA;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=80;WE=12031398;WS=12031369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,93:0.74:126
chr16	12031390	rs677507	C	T	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=39;PP=2316;SC=AAAGTTAGTACACTCACCCAA;SOR=1.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=112;WE=12031398;WS=12031369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	12031448	rs636664	T	C	4611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=79;PP=2466;SC=TTCTCGGAAATGCAATAATGA;SOR=0.847;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=69;TCR=79;TR=148;WE=12031456;WS=12031438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	12059038	rs11570139	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.060;SC=AGACAGCCCCCGTAAGAACCC;SOR=0.693;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=12059046;WS=12059028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr16	12060163	rs373496	A	G	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=86;PP=2675;SC=AGGAAGATAAACTCTGAACCA;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=36;TCR=86;TR=122;WE=12060171;WS=12060153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	12136954	rs1703492	A	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.81;NF=15;NR=22;PP=759;SC=CGGGATGCGAACTGGGATGGG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=12136962;WS=12136944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	12162969	rs1641843	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=551;ReadPosRankSum=0.061;SC=ACGTTCTCCCAGATCCTGGAC;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=42;WE=12162977;WS=12162959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,47:0.27:177
chr16	12183686	rs350229	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=377;ReadPosRankSum=0.197;SC=CTCAGCAGTGCGTTCCTTCCG;SOR=1.296;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=30;WE=12183694;WS=12183676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr16	12296803	rs1701115	G	T	5782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=61;PP=2965;SC=CTGGTGGCGTGGGAGGTGACA;SOR=1.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=123;TCR=61;TR=184;WE=12296811;WS=12296793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	12297011	rs9933762	C	G	4106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=62;PP=1629;ReadPosRankSum=2.384;SC=AGTTGTATATCGTGGCCCCAC;SOR=0.919;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=302;TCF=143;TCR=159;TR=109;WE=12297019;WS=12297001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,126:0.37:339
chr16	12297035	rs113668050	G	C	4096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1230;ReadPosRankSum=1.047;SC=CAGGTGGACTGGTGGCGTTGG;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=289;TCF=136;TCR=153;TR=105;WE=12297043;WS=12297025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,121:0.37:327
chr16	12297247	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=57.33;NF=99;NR=55;PP=2962;QD=20;SC=CTGAAGTTGTATAGTGTGGCC;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=497;TCF=246;TCR=251;TR=154;WE=12297255;WS=12297224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:343,154:0.31:497
chr16	12297328	.	G	GTGGACTGGTGGCATTGGAGGTGACAGCTCTGAAGTTGTGTAGTGTGACCCTGGTGTCAGGTGGACTGGTGGCATTGGAGGTGACAGCTCTGAAGTTGTGTAGTGTGGCCCTGATGTCAGA	808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;QD=2.38;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,52:0.15:340
chr16	12297562	rs1701113	G	A	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=50;PP=1462;SC=TTTGCTGTAAGACAACCATCC;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=63;WE=12297570;WS=12297552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	12371915	rs12448443	T	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GGAGTCTGTGTGTCTTTGTTT;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=65;WE=12371923;WS=12371905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,75:0.69:109
chr16	12449855	rs7190509	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=236;ReadPosRankSum=-0.044;SC=ATTGAGCTTATGGGTGGATTG;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=12449863;WS=12449845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr16	12449925	rs11075062	C	G	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.316;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=927;ReadPosRankSum=-0.089;SC=AGATGTTTTGCTGACAGGTGT;SOR=0.365;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=60;WE=12449933;WS=12449915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr16	12450163	rs4781211	C	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=0.221;SC=CCCTGTGTGTCTGTCAAGCCT;SOR=0.551;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=12450171;WS=12450153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr16	12492133	rs8055030	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=695;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACATCCTCTCCAACCATCCCT;SOR=0.343;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=34;WE=12492141;WS=12492123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr16	12492153	rs8055044	C	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=898;ReadPosRankSum=0.720;SC=TCCACACAATCTCTTACCGTT;SOR=0.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=48;WE=12492161;WS=12492143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr16	12536703	rs11075077	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=133;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CTCCCATCTCAGCCTCACAAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=12536711;WS=12536693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr16	12536958	rs34889591	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=498;ReadPosRankSum=0.278;SC=AGGGAACAGTGTGTCAGAGGA;SOR=1.079;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=29;WE=12536966;WS=12536948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr16	12618465	rs11075087	G	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=342;ReadPosRankSum=-1.273;SC=TTGGTTGCCTGGATGGCGCTG;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=17;WE=12618473;WS=12618455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr16	12621176	rs2269446	C	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=2.163;SC=AGACTGCTGTCTCAGCTGGAA;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=25;WE=12621184;WS=12621166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr16	12758966	rs1713480	T	C	5101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=107;PP=2965;SC=GAACACGACTTTGACACCTGC;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=56;TCR=107;TR=163;WE=12758974;WS=12758956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	12759027	rs1713479	A	G	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=45;PP=1184;SC=TAGGTAACCTAGGGTCTCCAG;SOR=2.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=12759035;WS=12759017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	13002359	rs9938751	T	C	4808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=85;PP=2876;SC=CTGCTGTTTATGGAGGCACAG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=163;WE=13002367;WS=13002349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	13297242	rs13331224	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TCTGTGTCTTCACTTCCAGAT;SOR=1.179;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=14;WE=13297250;WS=13297232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr16	13307302	rs7195991	C	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=43;PP=963;ReadPosRankSum=-1.307;SC=CGTCTAAGTTCCAGTGTGTAG;SOR=0.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=15;TCR=70;TR=52;WE=13307310;WS=13307292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr16	14013993	rs1799797	T	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=462;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TTCCTTCGGCTGCGTTCGGCT;SOR=0.977;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=27;WE=14014001;WS=14013983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr16	14014055	rs3136042	C	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=583;ReadPosRankSum=0.498;SC=GACGGATTGCCATGGCGCCGC;SOR=0.858;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=43;WE=14014063;WS=14014045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr16	14014240	rs762521	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=0.704;SC=GTGCGGCCGCGCTGGCGCGGG;SOR=0.094;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=20;WE=14014248;WS=14014230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr16	14024829	.	G	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGTGTGAAAAGTGCTATATTC;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=14024837;WS=14024819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr16	14026007	rs254942	G	A	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=17;PP=849;SC=TTAACTTTTCGTATTAGGTTG;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=14026015;WS=14025997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	14026951	rs3136130	G	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=534;ReadPosRankSum=1.956;SC=GTAGCCTGGCGAGGTGATGTG;SOR=0.257;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=30;WE=14026959;WS=14026941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr16	14031520	rs31869	G	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=246;SC=TCAAATATTTGTTATTTGAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=14031528;WS=14031510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	14038545	rs1799799	T	C	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.58;ReadPosRankSum=2.112;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
chr16	14038552	rs1799800	G	A	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.827;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr16	14041958	rs1799801	T	C	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1619;ReadPosRankSum=2.741;SC=CAGCAGATTCTGAAACCCTTC;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=79;TCR=72;TR=95;WE=14041966;WS=14041948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,124:0.62:199
chr16	14646096	rs78379650	C	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.255;SC=AAATCTCAGCCCTACAGAGAG;SOR=0.425;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=14646104;WS=14646086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr16	14649626	rs16963773	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-0.386;SC=AGGCATTTTGCATTTTTAAGG;SOR=0.466;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=8;WE=14649634;WS=14649616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr16	14674918	rs116955432	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=2.607;SC=AAGGTATTCTTTTTTTTTTGA;SOR=1.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=8;WE=14674926;WS=14674908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr16	14675943	rs72787692	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=0.785;SC=AAGCCCCACACTCGACAGTAA;SOR=1.251;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=9;WE=14675951;WS=14675933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr16	14678349	rs374880534	A	AC	2573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.439;NF=6;NR=53;PP=1487;ReadPosRankSum=-2.128;SC=AGATTCACTGACCCCCCCAAA;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=10;TCR=90;TR=59;WE=14678357;WS=14678339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,105:0.66:158
chr16	14687144	rs75783314	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=652;ReadPosRankSum=-1.535;SC=AACACAGACCAACAGGTCACT;SOR=0.557;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=50;WE=14687152;WS=14687134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,58:0.42:138
chr16	14700254	.	G	A	245	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=54.57;NF=9;NR=4;PP=245;QD=21.5208625036;SC=GACCCTGAGGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=13;WE=14700262;WS=14700244;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr16	14742400	rs11546303	T	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=0.060;SC=AATCAGCAGATGGGAGGGGGA;SOR=0.677;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=34;WE=14742408;WS=14742390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr16	14763076	rs114300158	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=26;ReadPosRankSum=0.860;SC=ATAAAGATTTCTATATAGATA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=14763084;WS=14763066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr16	14951573	.	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.799;NF=19;NR=35;PP=656;ReadPosRankSum=-1.925;SC=GTGTAGAACCGAATGACCTGT;SOR=0.560;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=174;TCF=55;TCR=119;TR=54;WE=14951581;WS=14951563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,39:0.23:166
chr16	14958514	rs117835774	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=6.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-12.046;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=1.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,29:0.16:185
chr16	15069202	rs71232880	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-5.735;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr16	15082021	rs55973981	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.201;NF=13;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CACAAAGGGCGGGTGCTTCCA;SOR=1.588;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=14;WE=15082029;WS=15082011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr16	15082865	rs4985167	C	T	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.691;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.708;NF=48;NR=27;PP=933;ReadPosRankSum=-1.850;SC=TGGTCTCGCTCCCTGTGGCTC;SOR=0.938;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=256;TCF=152;TCR=104;TR=75;WE=15082873;WS=15082855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,82:0.29:285
chr16	15083131	rs4985166	A	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=34.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-6.544;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.660;SOR=5.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,15:0.15:103
chr16	15083531	rs375114359	C	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.695;NF=2;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-1.075;SC=GCCACGGGGCCAGGACCTGGG;SOR=0.760;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=6;WE=15083539;WS=15083521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr16	15083569	.	C	CGCA	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.124;NF=1;NR=5;PP=232;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACGCACGCGGCGCAGCAGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=15083577;WS=15083559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr16	15083868	rs9928601	A	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.790;NF=6;NR=5;PP=135;ReadPosRankSum=-1.227;SC=AGGACCAGGGAAGCAGGTGCA;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=11;WE=15083876;WS=15083858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr16	15084045	rs71374762	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.7331;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=62;SC=GCAAGGGCGCGAGGGCGGCCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=15084053;WS=15084035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	15091589	.	C	CT	490	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=19;MQ=48.95;NF=9;NR=1;PP=490;QD=49.9;SC=AAATTTCTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=10;WE=15091609;WS=15091579;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr16	15091601	rs28545123	G	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=14;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.918;NF=9;NR=4;PP=326;ReadPosRankSum=2.357;SC=TTTTTTTTTTGTTTCCCAGAT;SOR=0.307;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=13;WE=15091609;WS=15091579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr16	15092116	rs6498535	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.372;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.955;NF=16;NR=2;PP=297;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TTATAGGCAACATGGTCATGT;SOR=0.235;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=18;WE=15092124;WS=15092106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr16	15098047	rs11549900	C	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.232;NF=20;NR=7;PP=412;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TTAACAGAATCCAAAATATTG;SOR=1.238;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=27;WE=15098055;WS=15098037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,29:0.27:109
chr16	15100202	rs71271216	A	G	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.01;QD=31.11;SOR=3.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	15110077	rs4262938	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.76;MQRankSum=-4.958;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,27:0.18:153
chr16	15116400	rs4985161	T	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.789;NF=24;NR=4;PP=488;ReadPosRankSum=1.370;SC=ATATTTACAGTTGTTGAAATA;SOR=1.048;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=28;WE=15116408;WS=15116390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr16	15116521	rs4985160	C	T	3789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.796;NF=65;NR=69;PP=2183;ReadPosRankSum=0.262;SC=TCATGTCCCACGTCCATCTAA;SOR=0.650;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=134;WE=15116529;WS=15116506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,163:0.79:207
chr16	15116625	rs1058637	G	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.638;NF=16;NR=45;PP=1318;ReadPosRankSum=-1.735;SC=TAGTATATAAGTTCATCTGTT;SOR=1.040;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=61;WE=15116633;WS=15116615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,61:0.73:83
chr16	15120411	rs62039476	T	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=11.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.98;MQRankSum=-2.352;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.375;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr16	15126890	rs12926897	C	T	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=56;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.534;SC=ACTTGGTAACCGGCTTTGAAG;SOR=0.954;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=89;WE=15126898;WS=15126880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,100:0.65:154
chr16	15128416	rs35811052	A	G	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=46;PP=1455;SC=AGCAGGTAGGACGGCATAGCC;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=15128424;WS=15128406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	15129459	rs4985155	A	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.694;SC=TCCCCTGTTGACTGTTACTTG;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=14;WE=15129467;WS=15129449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr16	15129940	rs3198697	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=351;ReadPosRankSum=1.293;SC=CAGTCAGTCACATTGAAGACT;SOR=0.387;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=26;WE=15129948;WS=15129930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr16	15129970	rs7200543	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TGGAGCGCCTATCCAGTGGGC;SOR=1.131;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=54;WE=15129978;WS=15129960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr16	15131962	rs1135999	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.72;MQRankSum=-1.286;NF=14;NR=11;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTATTTCCAGAAAACAGTGTG;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=25;WE=15131982;WS=15131952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr16	15131974	rs1136001	G	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.74;MQRankSum=-1.317;NF=17;NR=11;PP=1144;ReadPosRankSum=0.475;SC=AACAGTGTGTGAGCTGGAGAT;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=28;WE=15131982;WS=15131952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr16	15132108	rs2740	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=468;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AGCCAACCTTACTGTCCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=26;WE=15132116;WS=15132098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr16	15132211	rs111536178	A	AAAAGTTG	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTAGTAAGAAAAAAGTTGATT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=15132219;WS=15132201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	15133783	rs34345533	C	CT	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.218;SOR=2.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr16	15133889	rs14347	T	G	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1831;ReadPosRankSum=0.962;SC=CTTGAAAGGATGCTCTGTAAA;SOR=0.377;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=104;WE=15133897;WS=15133879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,118:0.72:164
chr16	15135071	rs7498279	G	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=366;SC=GGAGCTCCTCGATGCAGAAAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=15135079;WS=15135061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	15135269	rs9926473	T	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=337;SC=TCCTTCCTGGTAGACGAGGGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=15135277;WS=15135264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	15155898	rs2966157	T	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=408;SC=AAAGCCAGTGTAGTGGCACAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=15155906;WS=15155888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	15166891	rs2941256	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=614;ReadPosRankSum=0.704;SC=CAAAGATGTTTATCAGGTCGC;SOR=0.790;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=46;WE=15166899;WS=15166881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,52:0.33:157
chr16	15168760	rs4985147	T	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=224;ReadPosRankSum=-0.843;SC=AAAAATTCAATGTCAAAGTGG;SOR=1.078;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=15;WE=15168768;WS=15168750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr16	15170452	rs2966183	C	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.561;NF=8;NR=20;PP=383;ReadPosRankSum=1.562;SC=TGTCCCACCACAAGTTTGAGT;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=28;WE=15170460;WS=15170442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,31:0.35:88
chr16	15173746	rs2941253	G	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=410;SC=GAGTCACCACGCCTGGCCAAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=15173754;WS=15173736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	15178499	rs76732059	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQRankSum=-9.020;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,45:0.21:211
chr16	15178612	rs373009083	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-10.999;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.793;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,19:0.13:145
chr16	15178688	rs8061051	C	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=817;SC=TTTGGGAGGCCGAGGTGGGTG;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=15178696;WS=15178678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	15187912	rs11075256	G	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=218;ReadPosRankSum=1.308;SC=CACGCCATGAGCTTTGTCCCA;SOR=0.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=18;WE=15187920;WS=15187902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr16	15494721	rs62039092	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr16	15596142	rs12448500	G	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=1003;SC=TAGCCAGGATGTGAAGCCTGT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=15596150;WS=15596132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	15695059	rs2071331	A	G	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=46;PP=1410;SC=ACATGTGCACACCGTCGCCAG;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=15695067;WS=15695049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	15696480	rs71293163	A	AAGGAAAGAAGGAGGGAGGCAGAG	2307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=59.17;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	15703361	rs58075088	T	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=693;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CTTTATAAAATTAGAATTTCT;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=37;WE=15703369;WS=15703351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr16	15705015	rs28509427	G	A	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=56;PP=1435;ReadPosRankSum=1.237;SC=ATCATCGGTAGAAGAACTACA;SOR=0.221;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=99;TCF=21;TCR=78;TR=74;WE=15705023;WS=15705005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,79:0.76:104
chr16	15705605	rs7185421	A	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=35;PP=1021;SC=CAAAGCAAATAGTTTATTTAT;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=15705613;WS=15705595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	15711335	rs62036917	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.124;SC=CTTGTTCACGGATTGCGACCG;SOR=1.371;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=13;WE=15711343;WS=15711325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr16	15715804	rs28670396	C	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=744;ReadPosRankSum=0.021;SC=ACGCTATGTCCGCCCAGAACC;SOR=1.060;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=38;WE=15715812;WS=15715794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr16	15718591	rs2071333	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=1.069;SC=CCTATTACATGTAACCACCCC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=8;WE=15718599;WS=15718581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr16	15724113	rs3752422	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GCCTGGCAACCCCCTTATTAT;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=21;WE=15724121;WS=15724103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr16	15727459	rs5815838	AT	A	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.58;QD=24.45;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	15729455	rs34376746	C	CAA	1029.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=898;ReadPosRankSum=-0.206;SC=AAATCCACTTCAAAAGTCATT;SOR=1.234;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=23;WE=15729463;WS=15729445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr16	15730245	rs4781677	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=1.674;SC=TGAGGTCCGTGGTTTTTTGGT;SOR=1.222;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=13;WE=15730253;WS=15730235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr16	15771601	rs6498567	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=15;PP=922;SC=TGTGCTACTGTGTCTAGCCTT;SOR=1.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=15771609;WS=15771591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	15771847	rs62036933	C	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.255;SC=AGACTCTCCTCTCTGCTTTTT;SOR=3.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=15771855;WS=15771837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	15781054	rs8044738	A	G	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=32;PP=1332;SC=CCCATTCTGCAGGTAAAGAGC;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=15781062;WS=15781044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	15781092	rs55734390	G	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.231;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=389;ReadPosRankSum=-0.100;SC=AAGGGACTTGGCCCACTCTGT;SOR=0.494;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=28;WE=15781100;WS=15781082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
chr16	15811023	rs1050163	C	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,60:0.26:228
chr16	15811062	rs1050162	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,81:0.30:267
chr16	15813211	rs11646134	G	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=1.905;SC=GAAAGGCCAAGCCCCACCAAG;SOR=0.722;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=13;WE=15813219;WS=15813201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr16	15813633	rs17284411	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=0.200;SC=CTGCTGCCCAGTTCAGCTTTG;SOR=1.532;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=11;WE=15813641;WS=15813623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr16	15818141	rs2075511	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GTTTATCATAAGCGGCCGCCT;SOR=0.888;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=21;WE=15818149;WS=15818131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr16	15818310	rs11130	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=0.669;SC=GGGACCATGAGTGGCCCCTGT;SOR=1.465;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=12;WE=15818318;WS=15818300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr16	15818842	rs16967510	A	G	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GACGCTCTCAACTTCATTCTA;SOR=0.590;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=64;WE=15818850;WS=15818832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,82:0.64:129
chr16	15835815	rs2075510	G	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=669;ReadPosRankSum=2.443;SC=TAATAAATTCGATCAGTGGTT;SOR=0.029;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=35;WE=15835823;WS=15835805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr16	15838940	rs2384934	G	C	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1331;ReadPosRankSum=0.009;SC=GAGTGAAGAAGCAGGGCTGGG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=80;WE=15838948;WS=15838930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,89:0.67:132
chr16	15839034	rs1050113	G	A	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1487;ReadPosRankSum=1.207;SC=TGAGGTAGGCGGCGCAGTTCC;SOR=1.066;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=80;WE=15839042;WS=15839024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,97:0.72:134
chr16	15841830	rs2293736	G	A	3177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=2125;ReadPosRankSum=0.528;SC=GTCACCCCGGGTACCTCCAGC;SOR=0.706;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=117;WE=15841838;WS=15841820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,134:0.65:205
chr16	15842023	rs880071	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=689;ReadPosRankSum=1.388;SC=CCAGCTTGCCGGACTGCAAAG;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=40;WE=15842031;WS=15842013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr16	15843899	rs6498570	G	A	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=47;PP=2045;SC=TGGGGTCCTCGGGGTAGGTGG;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=15843907;WS=15843889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	15843965	rs79295535	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=460;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TGGCTTCTGGGAGCCCCAGGG;SOR=1.537;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=34;WE=15843973;WS=15843955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,36:0.32:113
chr16	15850204	rs2272554	A	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=713;ReadPosRankSum=1.063;SC=GTACCTTCCCAGCATAATGGA;SOR=0.830;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=51;WE=15850212;WS=15850194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr16	15853596	rs2280764	C	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=0.027;SC=CTGCAGAGGGCAACCAGGGGA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=22;WE=15853604;WS=15853586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr16	15869801	rs2072619	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=1.248;SC=TGAAGAACTGTTCATATGTCA;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=13;WE=15869809;WS=15869791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr16	15872609	rs2075514	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=521;ReadPosRankSum=-1.016;SC=AGGGGTACCCATTTGGCCCAG;SOR=0.973;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=42;WE=15872617;WS=15872599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,50:0.40:124
chr16	15872748	rs11644832	G	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=860;ReadPosRankSum=-0.891;SC=AACTTCAGCCGTTAACCCCAT;SOR=0.928;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=57;WE=15872756;WS=15872738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,62:0.37:168
chr16	15872807	rs11645883	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=0.166;SC=GAGGTGGGGCGGGGAGATTCT;SOR=1.195;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=23;WE=15872815;WS=15872797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr16	15872829	rs62030562	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=454;ReadPosRankSum=-2.485;SC=GCGAACACTCAGAACCCCACA;SOR=1.418;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=24;WE=15872837;WS=15872819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr16	15876471	rs2075513	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=132;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TAGACCCTGATGCTAATGTTC;SOR=0.476;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=15;WE=15876479;WS=15876461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr16	15973654	rs8045082	G	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=1.655;SC=TTAAAAAAATGTCTTACATTG;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=10;WE=15973662;WS=15973644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr16	15982258	rs3213476	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.361;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=277;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CGCACGGGCCAAGACAGCAGC;SOR=1.143;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=20;WE=15982266;WS=15982248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr16	16108282	rs4148337	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=0.292;SC=CCAGCCTGGGTGACAAGAGTG;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=14;WE=16108290;WS=16108272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr16	16110244	rs185005	C	G	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	16110253	rs246215	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.84;SOR=2.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	16126758	rs924137	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=2.057;SOR=0.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr16	16126764	rs924138	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.66;ReadPosRankSum=2.014;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	16130342	rs201704029	G	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=391;ReadPosRankSum=0.063;SC=GATTGTCCGGGGCTACCGCCA;SOR=0.842;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=25;WE=16130350;WS=16130332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr16	16130524	rs246232	C	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.841;SC=CCTGTGGCCTCAATCCAGGAT;SOR=0.991;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=52;WE=16130532;WS=16130514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr16	16138322	rs246221	T	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.115;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=478;ReadPosRankSum=0.149;SC=CGGTGAAGGTTGTGTACTCCT;SOR=1.476;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=27;WE=16138330;WS=16138312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr16	16139714	rs35587	T	C	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.043;SC=AGTTCGTGAATGACACGAAGG;SOR=0.508;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=73;WE=16139732;WS=16139699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,91:0.68:134
chr16	16139878	rs35588	A	G	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=780;ReadPosRankSum=-1.203;SC=AAGGTAGGGGACGCTGTGCCA;SOR=1.021;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=42;WE=16139886;WS=16139868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr16	16149901	rs3765129	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=628;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GAGTGATGGGCTGATCCCAGG;SOR=1.536;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=33;WE=16149909;WS=16149891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr16	16161976	rs35604	G	A	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=51;PP=2681;SC=ACTCTCACTCGGGGCACAGCA;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=136;WE=16161984;WS=16161966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	16162019	rs35605	T	C	6075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=78;PP=2965;SC=GCAGGTGGCCTTGTGCACATT;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=102;TCR=78;TR=180;WE=16162027;WS=16162009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr16	16184232	rs2074087	C	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=23;PP=1355;SC=CATGTGCACTCACGTGGCCGG;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=16184240;WS=16184222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	16200756	rs11075296	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=38;PP=1161;SC=TAAGTGATGACAGTGGCTGGA;SOR=2.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=16200764;WS=16200746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	16205449	rs3851716	G	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=336;SC=GGTTGGTGCCGCTGTCTCCCA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=16205457;WS=16205439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	16219596	rs113369901	G	GAAAAAAAA	1486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=16;NR=6;PP=820;SC=TATCTCAGTGGAAAAAAAGAA;SOR=1.085;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=22;WE=16219604;WS=16219586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	16244584	rs58668703	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.05;MQRankSum=1.299;NF=32;NR=30;PP=693;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TCTGGGTCTTCCGGAGAAGGG;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=91;TCR=86;TR=62;WE=16244592;WS=16244574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,77:0.38:205
chr16	16251435	rs3896244	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=443;SC=CTGTGGAGGTGGCTGGTGCCC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=16251443;WS=16251425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	16253283	rs56822940	GC	G	1324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=22;NR=10;PP=606;SC=GGGACCCATTGCCCCCCCCCA;SOR=2.110;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=32;WE=16253291;WS=16253273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	16255195	rs3851721	T	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=113;SC=ACACACCATGTTGGTTTGGAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=16255203;WS=16255189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	16263837	rs7201980	T	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=234;SC=CAGACCTCACTGGTTCTCCCG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=16263845;WS=16263827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	16267079	rs11866320	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=603;SC=TTTGGTGGGAAGACTTGGGCC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=16267087;WS=16267069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	16271357	rs6416668	T	C	5332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=75;PP=2925;SC=AGAAGACACATGAGGGCCCCC;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=174;WE=16271365;WS=16271347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr16	16271409	rs9924755	G	A	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=979;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TCTCTGCGATGGCCCCATTTG;SOR=1.284;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=184;TCF=82;TCR=102;TR=65;WE=16271417;WS=16271399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,74:0.36:208
chr16	16272508	rs2283508	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=482;SC=TTGTTACATAGCATTGTCACA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=16272516;WS=16272498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	16272670	rs7500834	T	C	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=50;PP=1934;SC=CCTGGAGTAGTCCACCAGGCC;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=16272678;WS=16272660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	16278695	rs2239323	A	T	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=18;PP=1649;SC=CAGCCCAGCCAAACCCACCCT;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=16278703;WS=16278685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	16278863	rs8058694	G	T	5298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.08;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	16278869	rs8058696	G	C	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.05;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	16278975	rs368726658	GC	G	574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=351;SC=ACCATCCCCCGCCCCCCCCAG;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=16278983;WS=16278965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	16280889	rs7192265	C	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	16280895	rs7192961	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	16280921	rs8056103	T	C	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=111;SC=CATTATGGGCTGGGGTGGCCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=16280929;WS=16280911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	16281007	rs12931472	A	G	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=20;PP=1108;SC=TGAGTCTACGACACCAGGGTC;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=16281015;WS=16280997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	16281154	rs4369696	C	A	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=37;PP=1133;SC=TGTGTGGCAACAGCTTCCTGT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=16281162;WS=16281144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	16284272	rs7193932	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=733;SC=CAGTTGAGAACTCTTCCCTGC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=16284280;WS=16284262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr16	16291858	rs12929920	G	C	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=29;PP=1643;SC=TTCAAATCCCGTCTTCCTCCT;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=16291879;WS=16291848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	16291871	rs9940089	G	C	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1592;ReadPosRankSum=2.681;SC=TTCCTCCTCTGGCATACCTGC;SOR=0.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=91;WE=16291879;WS=16291848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr16	16291971	rs9940825	C	T	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=2699;ReadPosRankSum=0.571;SC=GCTGCACGTCCACGGACACCA;SOR=0.526;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=96;WE=16291991;WS=16291961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,116:0.79:146
chr16	16291983	rs9930886	A	G	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=2735;ReadPosRankSum=0.637;SC=CGGACACCAGATTGACCACAT;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=91;WE=16291991;WS=16291961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,107:0.79:135
chr16	16306145	.	G	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQRankSum=-0.253;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr16	16315407	rs201662659	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.651;NF=15;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TTCTACACCCCGATAGGAGGA;SOR=0.876;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=16;WE=16315415;WS=16315397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr16	17190040	rs3889206	G	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.126;NF=23;NR=6;PP=537;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TTGAAAATCCGTCAGAATAAT;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=29;WE=17190048;WS=17190030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr16	17221423	rs4782034	C	T	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=167;SC=TCCAAGTCCTCTTCTCCTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=17221431;WS=17221413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	17221755	rs3812961	T	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=0.605;SC=GGGCCCAAGGTGTGTAGGATC;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=17221763;WS=17221745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr16	17228368	rs12708815	G	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=650;ReadPosRankSum=0.396;SC=GGGACGTCTCGGCCCGTCGAA;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=51;WE=17228376;WS=17228358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,64:0.40:159
chr16	17292074	rs28709752	G	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-0.133;SC=CTTACCTGATGGGGTAGTCGG;SOR=0.169;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=24;WE=17292082;WS=17292064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr16	17294295	rs11075341	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=367;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GACGGACAGACCCCGAAGAAA;SOR=1.671;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=22;WE=17294303;WS=17294285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr16	17432427	rs4782002	T	C	2925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.423;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=68;PP=2076;ReadPosRankSum=0.903;SC=CTGTTCTCTGTCGGGAATGGT;SOR=0.958;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=116;WE=17432435;WS=17432417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,130:0.64:203
chr16	17432502	rs140051436	A	G	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=612;ReadPosRankSum=0.355;SC=TTTGGGACGGAGTCTCGCTCT;SOR=0.351;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=42;WE=17432510;WS=17432492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr16	17564658	rs117041807	G	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=0.829;SC=CACCATCTTCGGAGCGCGGCC;SOR=0.602;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=17;WE=17564666;WS=17564648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr16	18542951	rs200477993	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.96;MQRankSum=-1.634;QD=1.56;ReadPosRankSum=-2.490;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr16	18799615	rs2641892	C	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=567;ReadPosRankSum=0.799;SC=TGTATCAGAACTAATTTTTAC;SOR=0.483;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=33;WE=18799623;WS=18799605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr16	18804737	rs2650628	C	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=253;SC=AGCAATTAACCTGCTAAAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=18804745;WS=18804727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	18810011	rs17663173	T	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.271;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=1.519;SC=AGTAATCTAATAGCTCACTTA;SOR=0.208;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=14;WE=18810019;WS=18810001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr16	18812648	rs59767322	AG	A	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=306;ReadPosRankSum=-0.089;SC=CAGGGAGAGAAGGGCCGGGCC;SOR=0.895;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=10;WE=18812656;WS=18812638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr16	18823192	rs2291662	A	G	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1545;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TTGCACCGCTATGAAGCAACA;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=74;TCR=87;TR=91;WE=18823200;WS=18823182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,111:0.60:185
chr16	18823379	rs2606556	T	C	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=57;PP=1906;SC=CAAGATTTTTTTGGATCAGCT;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=18823387;WS=18823369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	18839362	rs12445870	T	C	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1166;ReadPosRankSum=0.659;SC=CCTGAACTGTTGCAATAGAAG;SOR=0.835;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=80;WE=18839370;WS=18839352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,106:0.61:173
chr16	18839496	rs12448649	G	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=710;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGCCACTGTTGAGAGAAAAAG;SOR=0.855;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=37;WE=18839504;WS=18839486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr16	18849858	rs35168818	C	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=961;ReadPosRankSum=-0.307;SC=AATGTAAAGTCTACTTTTATA;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=53;WE=18849866;WS=18849848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr16	18850905	rs9937446	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.797;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr16	18853875	rs2641810	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.732;SC=AGGTCACGGCGGCAGCTCATG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=18853883;WS=18853865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	18858727	rs2650615	A	C	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=44;PP=2246;SC=TATACTTTGAAACAAAGTGGC;SOR=1.152;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=115;WE=18858735;WS=18858717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	18860472	rs12931729	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.210;SC=CTTAAAAACTTTGACCTCACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=18860480;WS=18860462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr16	18861135	rs2650614	T	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=1.559;SC=TAACAAGCAGTGCAGGGTGTC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=18861143;WS=18861125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr16	18861335	rs2650613	A	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=16;PP=524;SC=GCTCACCAGCATGCTTCACGA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=18861343;WS=18861325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	18865324	rs59703706	ATAGGAGG	AAGGAGG,A	1357.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=1349;SC=ATGCTCAAGCATAGGAGGCTC;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=18865340;WS=18865314;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:31
chr16	18865326	rs58740437	AGGAGGC	A	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.80;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	18865332	.	C	A	585	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=21;PP=585;QD=28.1714187521;SC=GCATAGGAGGCTCCTACTGTC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=18865340;WS=18865314;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	19041491	rs4381586	T	C	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=213;SC=ACTACTCTTCTGGTTCCCTGC;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=19041499;WS=19041481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	19041595	rs28583298	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ACCATTGATGGGGTGAAATTT;SOR=0.542;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=12;WE=19041603;WS=19041585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr16	19046960	rs12933286	T	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=954;ReadPosRankSum=-2.132;SC=TCTTTTGCTGTTGTTTCTATA;SOR=1.375;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=50;WE=19046968;WS=19046950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,56:0.71:79
chr16	19049378	rs8043993	A	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=531;ReadPosRankSum=0.257;SC=AGGTAAATTAACTTGTACTCT;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=38;WE=19049386;WS=19049368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,46:0.32:142
chr16	19051520	rs11074355	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	19056069	rs55792501	A	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	19056769	rs12051270	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=218;ReadPosRankSum=0.561;SC=AAGTAAGTGCGAGGGGTGCCC;SOR=0.881;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=20;WE=19056777;WS=19056759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr16	19067933	rs17854511	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=516;ReadPosRankSum=0.257;SC=TCCCCAAGACGGTGAGCACCT;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=36;WE=19067941;WS=19067923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr16	19079095	rs4531717	T	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=27;PP=825;SC=CCTGCGCCGGTCTAGCGAGCT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=19079103;WS=19079085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	19079998	.	AAG	A	58	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=70.0;NF=2;NR=0;PP=58;QD=30.5;SC=AAAAAAAAAAAAGAAATTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=19080007;WS=19079991;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	19080184	rs4630530	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=100;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GAAGCCAGTGCCACTTGCCAC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=8;WE=19080192;WS=19080174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr16	19080227	rs75015998	C	CTG	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=802;SC=AAAAAACAAACAAATTAAAAA;SOR=1.044;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=19080235;WS=19080217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	19083221	rs4782202	A	G	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=32;PP=2112;SC=TTACCTGATCATAACGAAGAA;SOR=1.574;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=108;WE=19083229;WS=19083211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	19085298	rs11074359	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=2.226;SC=TTGATGGTTACGTTCAGGGTC;SOR=0.652;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=41;WE=19085306;WS=19085288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,49:0.36:137
chr16	19222713	rs229018	T	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=578;ReadPosRankSum=0.694;SC=TGGATTTGTTTCTGGTGCTGT;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=40;WE=19222721;WS=19222703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr16	19310092	rs1548450	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=373;ReadPosRankSum=0.769;SC=AGACCTGGGCTGAGGCCGACC;SOR=0.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=34;WE=19310100;WS=19310082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr16	19315621	rs16971804	C	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.843;SC=GTCACAGTTACAGCATGACCA;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=19315629;WS=19315611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr16	19333111	rs8049175	T	C	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=40;PP=2032;SC=GGCCAAATATTATTCAGGGTG;SOR=1.131;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=102;WE=19333119;WS=19333101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	19333153	rs8047832	A	C	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=63;PP=2246;SC=ACATTTGAATAGGTAGACTGA;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=125;WE=19333161;WS=19333143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	19333224	rs8048432	G	A	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=55;PP=1843;SC=TGCCCAACTAGAACTAAAAGG;SOR=1.469;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=81;WE=19333232;WS=19333214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	19333241	rs6497343	G	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=49;PP=1678;SC=AAGGCTGACCGTCCCCTGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=19333249;WS=19333231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	19455284	rs8052298	T	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=168;SC=GATGGATAAATGGATGGATAA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=19455292;WS=19455274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	19455318	rs144130376	AATGGATGG	A	651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=1081;SC=TACATGATTGAATGGATGGAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=11;WE=19455333;WS=19455308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	19455615	rs4782247	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=367;SC=GGAAAAAACTGAAATCACTGG;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=19455623;WS=19455605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	19460842	rs6497373	A	G	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=59;PP=1973;SC=AATCGGCAATATCTCCTTCCT;SOR=1.107;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=19460850;WS=19460832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	19471665	rs6497375	T	C	4966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=78;PP=2965;SC=AGGTATGGACTAAAGGCTTTT;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=68;TCR=78;TR=146;WE=19471673;WS=19471655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	19481234	.	T	G	407	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=55.42;NF=4;NR=15;PP=407;QD=23.2511164499;SC=TTTTTTTTTTTGAATTGGAGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=19481242;WS=19481224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	19503598	rs1475962	C	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=39;PP=1390;SC=CCTTTTTAAACGCTGTATAAA;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=19503606;WS=19503588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	19503770	rs1967950	T	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.25;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	19503773	rs1967951	T	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	19505406	rs1475964	T	C	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=108;SC=GGGGATAATTTGGTTTTACTG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=19505414;WS=19505396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	19505730	rs2245423	T	C	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=24;PP=766;SC=GGACACGAGCTTGCCTCCATG;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=19505738;WS=19505720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	19505751	rs2856608	G	A	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=577;SC=TAAAAAGCGCGTCAGAGAACT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=19505759;WS=19505741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	19508573	rs2187659	A	G	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.22;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	19508583	rs2187660	C	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.16;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	19509333	rs2245086	C	T	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=74;PP=2513;SC=GGGGAGGAGACGAAAATGGAA;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=136;WE=19509341;WS=19509323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	19547747	rs226891	C	G	5309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=68;PP=2965;SC=GAGGTAGTATCAACAGAATTG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=158;WE=19547755;WS=19547737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	19553183	rs17325092	T	C	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=22;PP=1419;SC=AGGTTTAGCATGTTACAATAA;SOR=1.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=19553191;WS=19553173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	19580490	rs62026186	T	C	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=36;PP=1982;SC=GCTGTAGCCATCTCAGTCCAG;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=93;WE=19580498;WS=19580480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	19598562	rs111461972	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.684;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=471;ReadPosRankSum=0.651;SC=CCAACACTGGGGATTACAATT;SOR=1.501;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=27;WE=19598570;WS=19598552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr16	19653534	rs11647156	A	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TCTGTCTCAAAAGTTTAAAAA;SOR=0.042;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=19653542;WS=19653525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr16	19653700	rs11643482	T	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1155;ReadPosRankSum=0.860;SC=TTGACTTTTATCTTTAAATGT;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=246;TCF=133;TCR=113;TR=88;WE=19653708;WS=19653690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,109:0.36:303
chr16	19663269	rs875648	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=4.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.145;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,39:0.27:143
chr16	19680414	rs957675	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.759;SC=CTTCAGGCCACGTGAAGAAGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=19680422;WS=19680404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr16	19680546	rs957676	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=-1.393;SC=TTAATATTGATGGGAAGATGC;SOR=0.789;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=38;WE=19680554;WS=19680536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,47:0.31:151
chr16	19693729	rs3815036	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=0.667;SC=GAGCCTCCCCCACCAAACCAT;SOR=0.467;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=11;WE=19693737;WS=19693719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr16	19799962	rs4782283	T	A	385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=348;SC=CTGTTTTTTTTAAAAAAATCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=19799970;WS=19799961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	19868687	rs2729	G	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=173;SC=TCTGCCCATGGTTTACAGCCT;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=19868695;WS=19868677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	19884285	rs2240047	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=292;SC=CAAGCGCACACGGCACCTTTG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=19884293;WS=19884275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	20043330	rs2147865	T	C	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=52;PP=2435;SC=ACATGATGTGTACCAGCCAGC;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=110;WE=20043338;WS=20043320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	20052123	rs1379575	G	A	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=60;PP=2455;SC=GAACTTTTTTGATTGCAATGG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=20052131;WS=20052113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	20085014	.	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.272;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=0.944;SC=TCGGTGGTGGCGGCGGCGGAG;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=6;WE=20085022;WS=20085004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
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chr16	20322425	rs11647569	T	C	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=223;SC=CTAACCTAGCTTGGCCTTGAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=20322447;WS=20322415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	20322439	rs11642182	A	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=263;SC=CCTTGATTCTATTAATACCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=20322447;WS=20322415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	20328685	rs1129818	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=9.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.959;SOR=1.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,30:0.23:131
chr16	20334679	rs4411505	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=228;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GTGCCCCTAACTGGGGTAATT;SOR=0.947;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=19;WE=20334687;WS=20334669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,21:0.27:77
chr16	20334807	rs368914613	AC	A	3520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=3.786;NF=38;NR=77;PP=1354;ReadPosRankSum=3.080;SC=TTTTTGCTGTACCCCCCCCCC;SOR=0.567;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=193;TCF=73;TCR=120;TR=115;WE=20334816;WS=20334796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,163:0.71:231
chr16	20334932	rs4393582	G	A	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=63;PP=1851;SC=TTTATAAACTGGGAAATTTCA;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=70;WE=20334940;WS=20334922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	20339131	rs4643330	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TCTTCATAATTAATCAATGAA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=13;WE=20339139;WS=20339121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr16	20344532	rs111699931	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCTGAACAAAGCATGAACTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=20344540;WS=20344522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	20355651	rs8054296	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=52;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GTGGCCGGGCGCATTAGCTCA;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=20355659;WS=20355641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr16	20359633	rs28544423	C	T	5093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.622;SC=CCTCACACGTCCCCTCCACGG;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=158;TCR=113;TR=182;WE=20359641;WS=20359623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,212:0.69:309
chr16	20359831	rs13335818	C	T	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=53;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CACAGGCCTTCACCTGGACGG;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=46;TCR=79;TR=84;WE=20359839;WS=20359821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,93:0.69:135
chr16	20360101	rs7193058	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=182;ReadPosRankSum=-1.330;SC=GGTGCGCCTGGCACGGATCCG;SOR=0.708;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=15;WE=20360109;WS=20360091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr16	20360993	rs71149135	G	GCCACATTC	1864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=1205;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TTTTAAAATAGCCACATTCAG;SOR=0.655;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=23;WE=20361001;WS=20360983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr16	20361087	rs111285796	T	TTCTGCCAGA	3251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.798;NF=9;NR=32;PP=2801;ReadPosRankSum=0.294;SC=ATTTTATGTTTTCTGCTTCCC;SOR=0.607;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=41;WE=20361095;WS=20361077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,79:0.63:126
chr16	20361950	rs36060036	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1221;ReadPosRankSum=2.252;SC=ACATATACAACGCACACACAC;SOR=0.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=76;WE=20361958;WS=20361940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr16	20370810	rs9652588	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,50:0.35:143
chr16	20370816	rs9652589	C	T	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,48:0.34:142
chr16	20370981	rs9929710	A	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=1.246;SC=TTGTGGTTGTAATAGTCAAGC;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=14;WE=20370989;WS=20370971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr16	20376734	rs8052918	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=412;ReadPosRankSum=0.200;SC=CCTCTTGGAGATACTTACAGA;SOR=0.978;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=27;WE=20376742;WS=20376724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr16	20376755	rs8054266	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=395;ReadPosRankSum=1.699;SC=ACATCACAAATACGTCCTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=31;WE=20376763;WS=20376745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr16	20386115	rs4522429	T	C	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=93;PP=2965;SC=ACCAGAGACCTCTCACTAGCA;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=195;WE=20386123;WS=20386105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr16	20410488	rs7185940	G	A	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=1896;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TTAGCACTAGGAGACTGCGTT;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=122;WE=20410496;WS=20410478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,146:0.67:219
chr16	20410547	rs9926580	C	T	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=62;PP=1715;ReadPosRankSum=0.574;SC=GAAACACCGGCGTTAACCTCT;SOR=0.828;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=55;TCR=89;TR=101;WE=20410555;WS=20410537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,115:0.67:172
chr16	20410669	rs9928648	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=325;ReadPosRankSum=1.088;SC=TTATCAACACAGGTGGTGGAG;SOR=0.257;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=15;WE=20410677;WS=20410659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr16	20441053	rs8062344	C	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.707;NF=21;NR=22;PP=613;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GCCCTCAACCCTGACGTGAGG;SOR=0.529;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=43;WE=20441061;WS=20441043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,45:0.74:61
chr16	20441084	rs8063682	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.255;NF=10;NR=19;PP=483;ReadPosRankSum=-1.134;SC=AACACCAGACTGGTGTGGAGC;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=29;WE=20441092;WS=20441074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr16	20441215	rs8062563	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.842;NF=0;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTTCTCAGGGACCACCCTTCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=20441223;WS=20441205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	20488803	rs1634306	T	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.71;QD=26.38;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	20492000	rs146233716	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.82;QD=31.36;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	20498079	rs2072080	T	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=42;PP=1328;SC=TTCCTATGATTATATGAGATT;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=20498087;WS=20498069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	20551855	rs28750179	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=290;SC=GTCAGCCACCATGTCCGGCCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=20551863;WS=20551845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	20552075	rs16970280	G	T	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=76;PP=2342;SC=GCGAGGCCAGGATCACAAATG;SOR=1.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=113;WE=20552083;WS=20552065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	20570661	rs62035059	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.66;QD=29.99;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	20647921	rs62033279	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=467;SC=GGAGAATGCACGGTGAGCTTC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=20647929;WS=20647911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	20749461	rs9788809	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=474;SC=CGTACTATAATGTATCTAATA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=20749469;WS=20749451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	20750498	rs34908456	AT	A	41.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=13.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	20753123	rs234271	T	C	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=73;PP=2799;SC=TCCTCGTCTATCGCCGGCGCG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=144;WE=20753131;WS=20753113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	20792188	rs5715	T	C	5536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=97;PP=2965;SC=AGGTATACTTTCACAAAAGTG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=174;WE=20792196;WS=20792178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr16	20796508	rs8058758	T	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=33;PP=986;SC=ACAGTCTCCTTATGATTATTT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=20796516;WS=20796498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	20810067	rs3213646	T	C	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=46;PP=1908;SC=CTTTTGCATATAGATAGGTGA;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=20810075;WS=20810057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	20810730	rs7198770	A	G	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=102;PP=2965;SC=TTTCCTTAGTACTAAAGAAAT;SOR=1.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=42;TCR=102;TR=144;WE=20810738;WS=20810720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr16	20811681	rs2301771	C	T	6572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=85;PP=2965;SC=TTAACAGCTGCTTTCTTTTAC;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=194;WE=20811689;WS=20811671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr16	20827647	rs5816137	AT	A	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.392;NF=0;NR=27;PP=342;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CACAAAAACAATTTTTTTTTT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=27;WE=20827655;WS=20827637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr16	20855309	rs9929443	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=855;SC=TGGCCATAGAATCCTTGGATG;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=20855317;WS=20855299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	20860897	rs6654	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=416;SC=CAGCAGACAGCTTTATGGAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=20860905;WS=20860887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	20873767	rs7187522	T	G	4571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=82;PP=2965;SC=CCTGCACCCCTCCTGCTATGT;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=153;WE=20873775;WS=20873757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	20974740	rs111539520	C	T	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=984;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AATGAACTCCCGGACCGCTGG;SOR=0.999;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=61;WE=20974748;WS=20974730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,73:0.76:96
chr16	20998720	rs111770788	G	A	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1706;ReadPosRankSum=0.829;SC=GACGATCATAGAAGACCCGAT;SOR=0.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=69;TCR=92;TR=101;WE=20998728;WS=20998710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,121:0.60:202
chr16	21030897	rs3095922	T	C	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=797;SC=GTTTAGAACATGTAATTCCAA;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=21030905;WS=21030887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	21069645	rs72780846	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=1.559;SC=TCAGACGCTACAAGGCTTGAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=21069653;WS=21069635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	21136477	rs7191215	A	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=30;PP=1522;SC=AAAGGTCCAAATGCAGGTCCC;SOR=1.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=74;WE=21136485;WS=21136467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	21151809	rs375227268	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.931;SC=CTGAGATGCCGAGAGTAACCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=21151817;WS=21151799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	21185384	rs1046480	G	A	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=62;PP=2654;SC=CTGTGGTTTGGGCTTCGTATC;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=128;WE=21185392;WS=21185374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	21261685	rs17707647	C	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=376;ReadPosRankSum=0.793;SC=AATCCATTCTCAATCGTCCAG;SOR=1.044;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=25;WE=21261693;WS=21261675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr16	21272591	rs14122	G	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.890;SOR=1.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,7:0.15:48
chr16	21289023	rs2075628	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=1.032;SC=CCCTCTTCCAGCCCCCGCATC;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=21289031;WS=21289013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr16	21327273	rs12446322	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TTCTTCTCTGGAAGAATTTTA;SOR=0.855;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=20;WE=21327281;WS=21327263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr16	21388110	rs2686119	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.918;NF=4;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=0.489;SC=CTCCCTGGAGTGCTACCTGCA;SOR=2.833;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=14;WE=21388118;WS=21388100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr16	21530959	rs4088604	G	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=0.617;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.147;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,9:0.16:58
chr16	21531111	rs7197243	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=4.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQRankSum=-2.547;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.590;SOR=1.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,15:0.19:78
chr16	21531494	rs42138	T	C	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=65;PP=2429;SC=ATGCCCGAGCTCATGATGGCG;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=21531502;WS=21531484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	21531609	rs42139	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-1.869;NF=5;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-2.438;SC=TGGCGGCCATCATCTTCTCCC;SOR=0.628;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=15;WE=21531617;WS=21531599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr16	21531681	rs42140	C	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.433;NF=8;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=0.987;SC=GGCCCGCACCCGCCATGCTCT;SOR=0.545;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=14;WE=21531689;WS=21531671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr16	21558789	rs201233292	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=3.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-1.406;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.770;SOR=0.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,64:0.20:327
chr16	21608472	rs194548	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=382;SC=GCTGTCCCCAGTGGGCAATCT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=21608480;WS=21608462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	21652720	rs1055740	A	G	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=207;SC=TTACATTCTGACATCCTTCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=21652728;WS=21652710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	21654369	rs1454372	A	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-2.326;SC=CTGTATTTACATTTTTTTTTG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=4;WE=21654377;WS=21654359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr16	21658266	rs3091404	C	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=858;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TGAGCCACCACGCCCAGCCAG;SOR=0.444;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=51;WE=21658274;WS=21658256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,51:0.76:67
chr16	21658389	rs1454373	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=754;ReadPosRankSum=-0.358;SC=ATGTGAGTGAGGTAATGATTT;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=56;WE=21658397;WS=21658379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,67:0.40:168
chr16	21663795	rs3091402	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=222;ReadPosRankSum=0.490;SC=AAATGCATTAGGTGAAAAATA;SOR=0.954;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=18;WE=21663803;WS=21663785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr16	21689791	rs215894	T	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr16	21690559	rs12445216	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GAGAGGGGAAGGGATGGTATA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=19;WE=21690567;WS=21690549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr16	21730449	rs215901	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=16;PP=820;SC=ATTCTCTTCTCGCAGGCTCTG;SOR=1.230;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=43;WE=21730457;WS=21730439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	21732553	.	TAC	T	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=144;QD=49.0;SC=ACATAATTATTACACACACAC;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=3;WE=21732562;WS=21732543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr16	21771645	.	A	G	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=47.29;NF=5;NR=0;PP=61;QD=19.1542425094;SC=CTCTTTGGGGATCATTGTTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=21771653;WS=21771642;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr16	21970546	rs2967178	T	C	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=15;PP=712;SC=GCATGAGATGTTGTTTTTAGC;SOR=1.094;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=21970554;WS=21970536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	21992122	rs2965803	T	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=175;SC=GTATTATTCTTATGTTTGGTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=21992130;WS=21992112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	22012146	.	AATGATG	A	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.373;NF=2;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=0.413;SC=CTCCTTCTCAAATGATGATGA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=4;WE=22012159;WS=22012136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr16	22128052	rs11649656	TT	GC	5685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=34;PP=2947;SC=GACCTGGGATTTCCACTTCTC;SOR=1.430;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=102;WE=22128061;WS=22128042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	22137603	rs55732851	G	A	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1341;SC=AACAAGGACTGTTTCAACCTC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=22137611;WS=22137593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	22144578	rs1105928	A	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=687;SC=GTGATGGTTGAACAACAATGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=22144586;WS=22144568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	22155629	rs9937453	A	G	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=55;PP=2336;SC=ATGGGTCCCAACTGCACTCAT;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=113;WE=22155637;WS=22155619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	22161136	rs1991020	T	C	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=38;PP=1314;SC=TGCAGAGAGCTTTCAGTCATG;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=22161144;WS=22161126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	22178256	rs6497575	G	A	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=38;PP=1364;SC=GCCCTGTACCGTGCCTTCGAA;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=71;WE=22178264;WS=22178246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	22178492	rs8060335	T	G	211.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;MQRankSum=1.645;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr16	22192784	rs55969568	G	A	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=34;PP=1986;SC=GCATCTAGACGGAATGTAAAG;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=22192792;WS=22192774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	22198157	rs146454107	T	TCCCTCCCTTCCTACCTCTCCCCAC	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=2;PP=635;SC=CTGCTCCCCATCCCTCCCTTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=22198165;WS=22198147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	22255898	rs2303188	C	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=23;PP=1846;SC=ACGCTGTCCCCAAAGCCCCTG;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=84;WE=22255906;WS=22255888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	22261900	rs2303187	G	A	3082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=29;PP=1582;SC=GGCATGTAAGGGGAGCACCTC;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=22261908;WS=22261890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	22262514	rs2303186	C	A	4249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=52;PP=2474;SC=AGTGGAAGGGCGCCTCCAACT;SOR=0.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=124;WE=22262522;WS=22262504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	22269867	rs4783453	A	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=72;PP=2652;SC=GGGAGCCCCCAAGTAAGGACC;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=134;WE=22269875;WS=22269857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	22328094	rs2290830	G	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=801;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GAGGACTGTGGCCCCTCCTGT;SOR=0.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=42;WE=22328102;WS=22328084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,57:0.75:76
chr16	22579730	.	A	ATGTG	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=8.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQRankSum=-1.415;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr16	22826339	rs208951	A	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=862;ReadPosRankSum=0.806;SC=TTATCCGAGTACACCCGGACG;SOR=0.812;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=185;TCF=103;TCR=82;TR=63;WE=22826347;WS=22826329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,67:0.32:212
chr16	23079353	rs8047644	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=511;SC=TAAAACACTTTGATTGCAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=23079361;WS=23079343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	23080634	rs10083789	C	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,68:0.27:249
chr16	23085441	rs13338545	T	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=144;SC=AGAAAACACATACTTATTTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=23085449;WS=23085431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	23098422	rs13339649	A	G	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CCTTTCTACTATTGGGTGGCA;SOR=0.748;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=92;TCR=41;TR=74;WE=23098430;WS=23098412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,87:0.59:148
chr16	23099227	rs3812995	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=332;ReadPosRankSum=0.858;SC=CTTTTTTTCTCGATCTCTTAA;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=19;WE=23099235;WS=23099217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr16	23117706	rs17740615	C	T	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=52;PP=1822;ReadPosRankSum=0.012;SC=TGGAAACATCCGATTTTCTCA;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=206;TCF=117;TCR=89;TR=116;WE=23117714;WS=23117696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,131:0.54:241
chr16	23200761	rs5734	T	C	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=670;ReadPosRankSum=1.143;SC=AGTCCCTGTATGGCTTTCCAG;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=49;WE=23200769;WS=23200751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr16	23200848	rs5735	T	C	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1764;ReadPosRankSum=0.039;SC=CCCACCGGATTCCGCTGCTGA;SOR=0.866;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=99;WE=23200856;WS=23200838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,114:0.58:196
chr16	23200923	rs5737	C	T	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1506;ReadPosRankSum=0.579;SC=GGAAAGTCGGCGGTAGCATCA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=60;TCR=77;TR=89;WE=23200931;WS=23200913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,98:0.64:153
chr16	23205657	rs4247210	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGGGCAGCAGGACAGTGGGGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=23205665;WS=23205647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr16	23221183	rs5740	A	G	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=107;PP=2965;SC=ACAGATTGGCAGGGGCACCCA;SOR=1.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=71;TCR=107;TR=178;WE=23221191;WS=23221173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr16	23221238	rs4281710	A	G	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=65;PP=1927;ReadPosRankSum=0.332;SC=GTTATATCTAAGCTGGGGTGT;SOR=0.888;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=90;WE=23221246;WS=23221228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr16	23223262	rs9941215	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CAAGGTTAAGGGAGGCTGACC;SOR=1.071;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=6;WE=23223270;WS=23223252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr16	23223300	rs9931527	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGCAGGAAACTCCCTGACATC;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=12;WE=23223308;WS=23223290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr16	23224106	rs12708649	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=205;ReadPosRankSum=-1.307;SC=GTGAGACGGGTGGCTGGGTTG;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=21;WE=23224114;WS=23224096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr16	23224416	rs13306653	G	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=363;ReadPosRankSum=1.096;SC=TTCTCTCTCCGTTGTAGAAGT;SOR=0.711;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=30;WE=23224424;WS=23224406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,37:0.30:125
chr16	23224517	rs13306654	T	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=217;ReadPosRankSum=-2.352;SC=CTCTGTCTCTTCCCACCACAG;SOR=0.579;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=21;WE=23224525;WS=23224507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,24:0.25:95
chr16	23225984	rs11643517	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=344;ReadPosRankSum=0.331;SC=GAGGACTGGTAATCTGGTAGG;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=24;WE=23225992;WS=23225974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr16	23226787	rs5723	C	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=355;ReadPosRankSum=-1.736;SC=TGGATGAGCTCTGAGGCAGGG;SOR=0.562;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=23;WE=23226795;WS=23226777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr16	23360199	rs238547	T	C	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=61;PP=2304;SC=TGGACTTCCCTGCCGTCACCA;SOR=0.794;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=131;WE=23360207;WS=23360189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	23364081	rs63982	A	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=251;ReadPosRankSum=0.383;SC=TGCTTTACAGATATGCATTCC;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=16;WE=23364089;WS=23364071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr16	23366528	rs2301601	C	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.112;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=351;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TGGCAAAGCACAGCTCTTGCC;SOR=0.194;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=24;WE=23366536;WS=23366518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr16	23379377	rs3214467	A	AG	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.42;MQRankSum=1.091;NF=0;NR=11;PP=309;ReadPosRankSum=0.529;SC=GGTGGGACTGAGGGGGGACCA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=23379385;WS=23379367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr16	23382967	rs13306634	C	T	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=408;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TCTGGCGCCCCCTCTGGCGCC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=25;WE=23382975;WS=23382957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr16	23382982	rs3214466	CT	C	1136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.72;MQRankSum=1.281;NF=15;NR=7;PP=791;ReadPosRankSum=0.096;SC=GGCGCCCCCCCTGGCACCTGC;SOR=0.481;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=22;WE=23382990;WS=23382972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr16	23383247	rs2303157	G	A	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=843;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GCCCCTGTCCGGGTTTATGGG;SOR=0.170;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=44;WE=23383255;WS=23383237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr16	23388415	rs250570	G	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=521;ReadPosRankSum=0.555;SC=CCAGCCAGAGGCTCAGCAGGG;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=32;WE=23388423;WS=23388405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr16	23400194	rs250587	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=493;ReadPosRankSum=1.788;SC=CTGGTGAGTCGCGAAACAGCA;SOR=0.704;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=28;WE=23400202;WS=23400184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr16	23400494	rs250586	C	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=567;SC=CTGAATACGACACAGAGAAGC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=23400502;WS=23400484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	23415307	rs117467600	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CTCTGGAGAACATGCTGAATT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=23415315;WS=23415297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr16	23421609	.	C	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=491;ReadPosRankSum=0.800;SC=TGACTCCTCTCTCCTACCTGT;SOR=0.502;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=32;WE=23421617;WS=23421599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr16	23456578	rs540719	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=0.493;SC=GTGGCTTGCTTCTGTCTTTAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=23456586;WS=23456568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr16	23486197	rs11074559	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=3.321;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr16	23489711	rs1135045	C	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=237;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GCTGGCTGTGCTGAGAGGAGG;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=17;WE=23489719;WS=23489701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr16	23490353	rs4968008	T	G	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=708;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AGCAACTTACTGAAGGTCATG;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=55;WE=23490361;WS=23490343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,66:0.38:172
chr16	23506940	rs722069	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.735;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.945;SC=CCCTAAAACAGTCTTGAGAGA;SOR=0.098;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=8;WE=23506948;WS=23506930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr16	23521643	rs1071685	G	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=621;ReadPosRankSum=0.944;SC=GCTACTCACTGAGCCACAGCT;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=45;WE=23521651;WS=23521633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr16	23521750	rs2285522	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=180;ReadPosRankSum=0.353;SC=GCCCCGACGCTGCGGCCGCGG;SOR=1.845;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=17;WE=23521758;WS=23521740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr16	23521780	rs2285521	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=-1.503;SC=CCTCTTCAGCCGCTGTAGCGT;SOR=1.075;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=10;WE=23521788;WS=23521770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr16	23533008	rs11074565	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TTGTCCTTTTGTGACTGACAT;SOR=0.671;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=10;WE=23533016;WS=23532998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr16	23535680	rs1468138	A	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=264;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CACTGCCCGAAACATCCTCTC;SOR=0.428;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=20;WE=23535688;WS=23535670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr16	23536366	rs6497670	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=0.373;SC=TAATTCTATATTGTATTCACT;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=23536374;WS=23536356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr16	23536684	rs6497671	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=423;ReadPosRankSum=0.459;SC=AAGCTCATACTAGATCTTTCT;SOR=0.612;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=27;WE=23536692;WS=23536674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr16	23540798	rs2072062	C	T	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=858;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GTGTGGAACCCTGAGCTCAGC;SOR=0.903;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=50;WE=23540806;WS=23540788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,54:0.39:139
chr16	23541223	rs2072061	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=-1.411;SC=TGCAGTCTGCGGAAGAAATCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=17;WE=23541231;WS=23541213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr16	23546561	rs2073951	G	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=-1.662;SC=TCCAGCCATAGACCAGGTCCT;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=23;WE=23546569;WS=23546551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
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chr16	23573833	rs152460	A	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=0.899;SC=AGGTGATCTGACCGCTTTGGC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=23573841;WS=23573823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	23581678	rs152457	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=0.183;SC=CCACGTGCAAAGTTTTGTTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=16;WE=23581686;WS=23581668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr16	23596842	rs60078693	A	ATTTT	788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.042;NF=0;NR=14;PP=646;ReadPosRankSum=1.100;SC=ACTATATTGAATTTATTATAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=14;WE=23596850;WS=23596832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr16	23606895	rs240744	G	T	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1732;ReadPosRankSum=0.165;SC=ATCCTTATTGGTCAAAGGTCA;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=108;WE=23606903;WS=23606885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,130:0.64:203
chr16	23607504	rs466719	G	C	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1043;ReadPosRankSum=-1.084;SC=CCGCGGAGCAGAGAGCGGTGC;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=71;WE=23607512;WS=23607494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,89:0.61:146
chr16	23625224	rs249935	T	C	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=868;ReadPosRankSum=-1.656;SC=TGAAAAAAGATGCCACGGGGA;SOR=0.532;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=53;WE=23625232;WS=23625214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr16	23625463	rs249936	A	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=253;SC=ACAAACCAGTATTCAGAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=23625471;WS=23625453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	23640467	rs249954	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=650;ReadPosRankSum=0.362;SC=ATTCTTTTCAGTTCATTAAAG;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=34;WE=23640475;WS=23640457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr16	23646191	rs152451	T	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=774;ReadPosRankSum=-0.225;SC=ACCTTTCACTTGAATAAATAA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=49;WE=23646199;WS=23646181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr16	23654509	rs703769	T	G	60.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=4;PP=47;SC=TCCTTTTTGTTTTTTTTTTGT;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=23654517;WS=23654499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	23677006	rs35586	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=133;ReadPosRankSum=0.325;SC=TATTACCTCCAGAAACTGTGG;SOR=1.215;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=12;WE=23677014;WS=23676996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr16	23677111	rs35585	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=311;ReadPosRankSum=-0.226;SC=ATTTTCCATCGCAAAAGTAAT;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=20;WE=23677119;WS=23677101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr16	23691590	rs8054430	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.092;SC=TGCTGAGCCTGCAGGGGTGCT;SOR=0.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=17;WE=23691598;WS=23691580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr16	23692405	rs40076	A	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TCTCTGGACCAACCTGGTCTC;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=19;WE=23692413;WS=23692395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr16	23700231	.	C	CTT	59	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=26;MQ=58.82;NF=0;NR=3;PP=59;QD=22.6666666667;SC=GACTCCCCAGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=23700239;WS=23700221;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr16	23701538	rs27770	A	G	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GGGTTGCTGTATAAGTTATTT;SOR=0.505;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=70;WE=23701546;WS=23701528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,80:0.68:118
chr16	23711813	rs74012338	G	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=1.250;SC=ATCTGCCCCTGGCTTTTCTCT;SOR=1.091;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=23;WE=23711821;WS=23711803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,24:0.28:87
chr16	23711925	rs26764	C	G	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=1550;SC=GCTCCTCCGGCTGGCCCCCGA;SOR=1.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=23711933;WS=23711915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	23712183	rs26763	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=665;SC=AGGGGGCAAAATCAGAGCTGG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=23712191;WS=23712176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	23712448	rs26762	G	T	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=47;PP=1395;SC=GGGGATAAAGGGCCCTTCACT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=23712456;WS=23712438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	23717833	rs36047689	G	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=1085;SC=TCTTGCAGGAGTGGGGGTTTC;SOR=1.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=23717841;WS=23717823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	23721601	rs4967959	T	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=39;PP=1577;SC=ACCAATGGGTTCTTGCCCCCT;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=23721609;WS=23721591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	23722042	rs3899652	T	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=26;PP=1063;SC=CCCCATTTTATAGATGAGGAT;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=23722050;WS=23722032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	23724753	rs3809682	G	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=735;SC=TGGAGAACTTGCCACGTGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=23724761;WS=23724743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	23768380	rs5816221	T	TG	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.641;NF=8;NR=2;PP=300;ReadPosRankSum=0.674;SC=GGAAAATTATTGGGGGATATG;SOR=0.387;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=23768388;WS=23768370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr16	23768802	rs80950	T	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=439;ReadPosRankSum=1.452;SC=GTTGGGAGCATGGAGAGCTGA;SOR=1.148;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=26;WE=23768810;WS=23768792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr16	23848762	rs3729883	G	A	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=32;PP=1151;SC=CTATTTGTGGGAAGAGAGGGT;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=23848770;WS=23848752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	24104328	rs880824	A	G	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=64;PP=1934;SC=TGCCACCTGAAATCAGGGAGT;SOR=2.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=14;TCR=64;TR=78;WE=24104336;WS=24104318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	24105669	rs7196765	G	A	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=83;PP=2724;SC=TCCATCAAACGCGGGGTCAAG;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=122;WE=24105677;WS=24105659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	24135112	rs1013316	T	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=469;SC=TACAAGATCGTCCTCAAACCC;SOR=2.147;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=24135120;WS=24135102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	24166130	rs432998	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=0.909;SC=TGGCCCTGCCTGGGAAGCCGC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=31;WE=24166138;WS=24166120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr16	24202458	rs3729904	C	T	4499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=70;PP=2855;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GACCTGAAGGCGAACGTGATA;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=277;TCF=164;TCR=113;TR=178;WE=24202466;WS=24202448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,201:0.64:316
chr16	24202615	rs198145	A	G	2667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=81;PP=1862;ReadPosRankSum=2.375;SC=CCTGTGCCTCATGTTTTCCAA;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=37;TCR=124;TR=105;WE=24202623;WS=24202605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,111:0.65:171
chr16	24357998	rs5816249	T	TG	827.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.911;NF=14;NR=4;PP=603;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GGACCCAGGCTGGCCCCCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=18;WE=24358006;WS=24357988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr16	24564879	rs72133882	GTA	G	440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=33.90;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	24567318	rs16973827	T	G	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=551;SC=TTTTTCTTGGTTAATACTGCC;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=24567326;WS=24567308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	24574645	rs139004713	AT	A	1925.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1066;SC=TTAATTTGGGATTTTTTTTAC;SOR=1.542;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=42;WE=24574653;WS=24574635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	24578330	rs7194163	G	T	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=164;SC=TACTAATGTTGCTACACTAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=24578338;WS=24578327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	24578458	rs7195386	T	C	3867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=33;PP=2514;SC=GAATTTATTTTTCCAGAAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=113;WE=24578466;WS=24578448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	24579397	rs7201851	T	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=594;SC=AGTGTAAATTTTATTGTGTAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=24579405;WS=24579387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	24582299	rs7196736	C	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=32;PP=1457;SC=ATGACAATACCGCGCCAGCTG;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=24582307;WS=24582289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	24583406	rs7593	A	G	4021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=67;PP=2470;SC=TGGAGAAAGCAAAAGAGAGCC;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=123;WE=24583414;WS=24583396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	24740999	.	G	GCGGTGT	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=2.040;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr16	24741005	.	TCGG	T	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.000;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.186;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr16	24741686	rs7202252	T	C	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=31;NR=43;PP=1390;SC=CCGATTCGCCTTTTCTGGGTT;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=24741694;WS=24741676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	24801979	rs13336754	C	T	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1651;ReadPosRankSum=2.015;SC=CAGTGGAGAGCGATGGTAGTA;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=98;WE=24801987;WS=24801969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,107:0.64:166
chr16	24807165	rs1030211	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=735;SC=AGGTCTTCCAGTTCCAAACCC;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=24807173;WS=24807155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	24834233	rs2303085	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=215;ReadPosRankSum=0.264;SC=GCATGCAGCACGGCCCGCTGA;SOR=0.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=15;WE=24834241;WS=24834223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr16	24838988	rs12933971	C	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=730;ReadPosRankSum=0.711;SC=GGGAGGGTAACGGCATTGGTG;SOR=0.189;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=36;WE=24838996;WS=24838978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr16	24881192	rs2667751	C	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=610;ReadPosRankSum=0.130;SC=GACTTTGTCTCCAAGATCTGA;SOR=0.884;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=38;WE=24881200;WS=24881182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr16	24883316	rs2667745	T	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.68;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr16	24883338	rs2667746	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=1.105;SC=ATTTGAAGGCCAGCACAGGTG;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=24883346;WS=24883328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr16	24888454	rs274074	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=523;ReadPosRankSum=-1.304;SC=CAAGGGATGACGTATGACTCT;SOR=2.093;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=24;WE=24888462;WS=24888444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr16	24888710	rs150243842	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GGGTAACACCTAGCAGAGGCA;SOR=0.840;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=11;WE=24888718;WS=24888700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr16	24902194	rs274081	T	C	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=32;PP=1244;SC=TTCTAGGTTTTGCCGCGGTTG;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=24902202;WS=24902184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	24902434	rs274082	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr16	24975425	rs12599343	G	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=326;SC=TATTCTGATAGAAATTATTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=24975433;WS=24975415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	24980189	rs12103073	G	A	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=39;PP=1128;SC=CAACAGGAACGCATTAGGGTG;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=24980197;WS=24980179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	25043277	rs11074669	G	A	7729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=103;PP=2965;SC=CGACGAGGGCGTGGGCTGCAC;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=142;TCR=103;TR=245;WE=25043285;WS=25043267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr16	25066321	rs67051289	A	AG	38.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.87;QD=19.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	25137289	rs7189229	G	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=142;SC=CTTCAGAACTGCCATCAGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=25137297;WS=25137279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	25137385	rs11861481	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.829;NF=19;NR=4;PP=326;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GGACAGTGAGGTCCTTCTTCC;SOR=1.216;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=23;WE=25137393;WS=25137375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr16	25137449	rs7188975	A	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=3.918;NF=22;NR=23;PP=653;ReadPosRankSum=0.951;SC=TGGGAGGAGGAAAGTGTTAGG;SOR=0.483;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=45;WE=25137457;WS=25137439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr16	25151398	rs10681142	A	ACT	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=1.436;SC=ATCCTTAAACACTATTGCTCT;SOR=0.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=3;WE=25151406;WS=25151388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr16	25163017	rs139504024	G	GGTGTGT,GGTGTGTGT	1096.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.000;QD=45.70;ReadPosRankSum=1.447;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,16,7:0.67,0.29:24
chr16	25172274	rs277899	G	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.067;NF=3;NR=15;ReadPosRankSum=0.500;SC=TTGGAAGATAGGATTTTGGTT;SOR=0.638;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=18;WE=25172282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr16	25172307	rs111379361	A	AT	171.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=2;PP=139;SC=CCTCTTACGTATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=8;WE=25172315;WS=25172297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	25180610	rs6497812	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=496;SC=CTTTGCAGATGTGATCATGGA;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=25180618;WS=25180600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	25239805	rs2287798	G	C	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=696;ReadPosRankSum=0.909;SC=CATCCTGAAGGCTCGGTGAAG;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=42;WE=25239813;WS=25239795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr16	25239872	rs2287797	G	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-1.633;SC=GTCCCAGACTGAGGACAGGGG;SOR=0.169;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=20;WE=25239880;WS=25239862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr16	25255080	rs141745999	T	TAAAACTCCTTGGTTTTGCACC	3372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.506;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=2963;ReadPosRankSum=0.706;SC=TCTTTTGGACTAAAACTCCTT;SOR=1.054;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=21;WE=25255088;WS=25255070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,72:0.59:123
chr16	25255506	rs11642611	C	T	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.130;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=61;PP=1664;ReadPosRankSum=-1.108;SC=ACAATTTGCTCTTCCGATGAC;SOR=1.126;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=93;WE=25255514;WS=25255496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,113:0.68:165
chr16	25258035	rs11649280	A	G	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=37;PP=1949;ReadPosRankSum=0.239;SC=TACCACTGAGATTCTGAAACA;SOR=1.327;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=179;TCF=108;TCR=71;TR=108;WE=25258043;WS=25258025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,133:0.59:226
chr16	25263278	rs2112811	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=425;ReadPosRankSum=0.220;SC=TCCCGGTAGAGGTCCCTTTGG;SOR=1.161;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=26;WE=25263286;WS=25263268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr16	25264440	rs11643089	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=252;ReadPosRankSum=1.725;SC=GAGATGAGTATGTATTGAAAC;SOR=0.653;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=19;WE=25264448;WS=25264430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr16	25268368	rs4787310	A	G	3488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=67;PP=2040;ReadPosRankSum=-0.551;SC=ATGCCCACTCAGGGTCCTTTT;SOR=0.707;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=131;WE=25268376;WS=25268358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,161:0.60:270
chr16	25704145	rs2943336	A	G	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=10;PP=706;SC=GGAGGCGCCCAGGACGCCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=25704153;WS=25704135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	25944700	rs4303490	A	G	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=89;PP=2965;SC=CATAATCTCAAACAGAGGTGT;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=70;TCR=89;TR=159;WE=25944708;WS=25944690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	27215267	rs877585	G	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=276;SC=GCGCTTTAGCGGTTCTTGGCG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=27215275;WS=27215257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	27215380	rs908382	A	C	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=39;PP=1213;SC=GCCGCAAGGCAGGCTGGAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=27215388;WS=27215370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	27226437	rs8054431	G	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,30:0.25:118
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chr16	27227168	rs11645703	T	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=515;ReadPosRankSum=1.081;SC=GGGTGACGGGTGCTGCAGCTG;SOR=0.787;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=85;TCR=44;TR=38;WE=27227176;WS=27227158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,40:0.29:137
chr16	27227327	rs199973631	G	A	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=68;PP=1742;ReadPosRankSum=0.919;SC=CTGAGGCCACGCACCTCTGCC;SOR=0.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=55;TCR=97;TR=107;WE=27227335;WS=27227317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,127:0.69:183
chr16	27236403	rs2958	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTGAAACACGGACGCCTTTC;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=27236411;WS=27236393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr16	27238034	rs34940876	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=0.658;SC=CCCTGCCCTGCGGGTACCTGG;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=26;WE=27238042;WS=27238024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,29:0.27:108
chr16	27238110	rs1127228	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=406;ReadPosRankSum=0.329;SC=GGATGTATTGCTCCATCTCCA;SOR=0.777;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=35;WE=27238118;WS=27238100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,47:0.30:158
chr16	27244548	rs28456036	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=165;ReadPosRankSum=-1.084;SC=AGTCTGGCAGAGGCACAGTAA;SOR=0.327;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=14;WE=27244556;WS=27244538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr16	27245712	rs34939984	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CCAGGCACTGCGGGCCGCAGG;SOR=1.341;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=22;WE=27245720;WS=27245702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr16	27253059	rs28363677	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=438;SC=ACTTAGTGACGAACCGTCCTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=27253067;WS=27253049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	27269023	rs7201652	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr16	27356203	rs1805010	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=256;ReadPosRankSum=0.103;SC=CCACACGTGTATCCCTGAGAA;SOR=0.592;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=20;WE=27356211;WS=27356193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,26:0.28:92
chr16	27356359	rs2074572	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GGGCGGAGTGCGGCAGGGGTG;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=11;WE=27356367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr16	27356398	rs2072130	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=0.382;SC=GCTGCCTGGGCTGAGGGTGGG;SOR=0.182;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=7;WE=27356406;WS=27356388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr16	27356667	rs3024560	T	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=192;ReadPosRankSum=-0.008;SC=ACTGGGAACATTCCTTCCATT;SOR=0.841;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=17;WE=27356675;WS=27356657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr16	27364158	rs3024610	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=1.501;SC=ATACACCTGCCGTGGTGTATC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=27364166;WS=27364148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr16	27367334	rs4787423	C	T	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=22;PP=739;SC=CAATAATACGCATTTACTGAG;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=27367342;WS=27367324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	27370932	rs138640688	AGTG	A	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=255;SC=TCTGGAATCTAGTGGTGTTGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=27370942;WS=27370922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	27371158	rs3024660	C	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=32;PP=1067;SC=GTGTAACAAACGACCCCGAAA;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=27371166;WS=27371148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	27414378	rs6498021	T	G	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=35;PP=1824;SC=TTCAAAACAATGGCTGGTGTG;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=27414386;WS=27414368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	27441283	rs179760	A	G	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=33;PP=1630;SC=TCCAAGAATCAGGGGCAAGTC;SOR=1.125;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=27441291;WS=27441273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	27494877	rs4787963	A	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=569;ReadPosRankSum=1.278;SC=TCTCCATGATATAAGGAGAGC;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=43;WE=27494885;WS=27494867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,47:0.34:137
chr16	27510117	rs11452553	C	CA	2928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=2392;SC=CTTGGCTCCACAGTCGATTCC;SOR=1.497;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=50;WE=27510125;WS=27510107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	27512475	rs141835106	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=-1.827;SC=CCAACAGCACGAGGCTGGCTC;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=13;WE=27512483;WS=27512465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr16	27561584	rs4787969	G	A	3818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=60;PP=2358;SC=CCTAGGCCATGAACCCCTGGA;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=27561592;WS=27561574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	27629661	rs4787980	G	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=757;SC=CTCTCAGCCTGCTGCGCCGGT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=27629669;WS=27629651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	27629957	rs143468302	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=311;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GCTTAGAATATTATCTGCAAC;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=15;WE=27629965;WS=27629947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr16	27642249	rs233453	A	G	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=8;PP=671;SC=TGCCACAACCACGCTGTAGTC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=27642257;WS=27642239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	27666204	rs233470	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=11;PP=333;SC=TAATCCCAGCACTTTGGGAGG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=27666212;WS=27666194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr16	27974487	rs2051743	T	C	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=38;PP=1584;SC=CTTTCTCCGATGCCGGGGCCA;SOR=1.109;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=95;WE=27974495;WS=27974477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr16	28132951	rs33048	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=295;ReadPosRankSum=-1.836;SC=GGGGGCAAGGTCTTTCCTAAA;SOR=1.573;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=17;WE=28132959;WS=28132941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr16	28133152	rs39998	C	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=0.167;SC=ACAGACAAGGCTGGTACCAGC;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=16;WE=28133160;WS=28133142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr16	28137248	rs39631	C	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.673;SC=GTCCAGCAAGCCACACACAGC;SOR=1.878;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=15;WE=28137256;WS=28137238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr16	28143489	rs9930464	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=6;PP=392;SC=CACAGCTTTTCATCATAAGCC;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=28143497;WS=28143479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	28157351	rs28379290	T	C	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=238;SC=CATGGCTGTCTCTTAGGCCAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=28157359;WS=28157341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr16	28167920	rs34751450	C	CAA	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.465;NF=0;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=1.400;SC=AATTCTCCTTCAAAAAAATAT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=28167928;WS=28167904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr16	28181306	rs28479048	A	G	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=683;SC=CATTAAAGCTATGAAGCATCT;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=28181314;WS=28181296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	28331299	rs76822530	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=188;ReadPosRankSum=0.770;SC=CAGGGTGGGAGGCGAAAACCG;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=12;WE=28331307;WS=28331289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr16	28506872	rs149271	A	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=723;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TGAACAGAGAAGAGAGGCTGA;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=42;WE=28506880;WS=28506852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr16	28507245	rs151136790	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=0.359;SC=GGCCAGGGCAATTTTAGATGG;SOR=0.662;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=20;WE=28507253;WS=28507235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr16	28507397	rs148114931	TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC	T	666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.179;NF=5;NR=5;PP=872;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GCGGGGAGGCTGGGACAGCCT;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=10;WE=28507431;WS=28507387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr16	28507644	rs180743	C	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.801;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=894;ReadPosRankSum=0.551;SC=CCCCAAACAGCCCCAGGTCCT;SOR=0.299;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=52;WE=28507652;WS=28507634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr16	28508048	rs180744	A	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1212;ReadPosRankSum=0.442;SC=CCAAAGGCCAAGGACCTGAGC;SOR=0.567;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=67;WE=28508056;WS=28508038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,73:0.60:121
chr16	28508069	rs151174	C	T	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.271;HP=7;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.645;SC=TGATGGGGGGCGCCCAGACCC;SOR=0.759;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=73;WE=28508077;WS=28508059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,81:0.62:131
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chr16	28508716	rs40832	T	C	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=39;PP=1729;SC=TTGGAAGGGGTGCTTGGGCAA;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=87;WE=28508724;WS=28508706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	28510393	rs40834	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=651;ReadPosRankSum=-0.677;SC=ACCTCTGGAGCTGCATCCAGG;SOR=0.134;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=34;WE=28510401;WS=28510383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
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chr16	28513530	rs181207	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=335;ReadPosRankSum=1.189;SC=CCTCCCTATCCGGGTCTCCTT;SOR=0.891;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=24;WE=28513538;WS=28513520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
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chr16	28601812	rs184895137	G	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=574;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GAACTTGCCTGGGCTACGGGA;SOR=1.044;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=33;WE=28601820;WS=28601802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,43:0.60:72
chr16	28602991	rs11401	A	G	3482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=71;PP=2125;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TGGCTCAGAGATACGTGGTGG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=85;TCR=106;TR=130;WE=28602999;WS=28602981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,155:0.68:227
chr16	28603393	rs27742	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.84;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr16	28606960	rs4987024	T	A	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ACCGCCCTGGTAGATCATGTC;SOR=0.996;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=63;WE=28606968;WS=28606950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr16	28607070	rs4149406	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.025;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.265;NF=11;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=0.632;SC=GGGGACTGCCACCTGGGAGAG;SOR=0.499;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=20;WE=28607078;WS=28607060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr16	28617485	rs1801030	C	T	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=33;PP=1582;SC=TGCTGAACCACGAAGTCCACG;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=28617493;WS=28617475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	28617552	rs3176926	C	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.251;NF=13;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=0.197;SC=TCTCCCTTTTCGGGTTCTGAG;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=26;WE=28617560;WS=28617542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr16	28617574	rs4149394	C	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.360;NF=15;NR=17;PP=460;ReadPosRankSum=0.793;SC=AGCAGAGGGCCCCTCAGTGGA;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=32;WE=28617582;WS=28617564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr16	28617595	rs4149393	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-4.944;NF=15;NR=20;PP=611;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GGCTCGGATTACTGATTCAGG;SOR=0.491;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=35;WE=28617603;WS=28617585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr16	28618065	rs3020806	A	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQRankSum=-2.802;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr16	28618068	rs74752114	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQRankSum=-2.716;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr16	28618071	rs3020805	C	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQRankSum=-2.517;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr16	28618237	rs9282862	T	C	3174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,141:0.65:218
chr16	28618237	.	TA	CG	1813	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=57;NR=60;PP=1813;QD=15.9527168792;SC=CACCACCCCTTAGCTCCACAC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=117;WE=28618246;WS=28618227;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:67,117:0.64:184
chr16	28618238	rs7499134	A	G	8297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=38.42;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	28618446	rs2925623	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.653;NF=21;NR=17;PP=656;ReadPosRankSum=-1.285;SC=ACACAGCCTGTCCCAGGCCAG;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=38;WE=28618454;WS=28618436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr16	28618545	rs2925624	G	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.308;NF=15;NR=14;PP=488;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CAAGTCAGGAGCTGAACCCTG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=29;WE=28618553;WS=28618535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr16	28618636	rs3020804	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.262;NF=15;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=0.758;SC=GTCACACCCCAATCTGGAGCA;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=33;WE=28618644;WS=28618626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr16	28618708	rs11648192	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=0.475;SC=TGAGGACCCACCCTCTAGCTT;SOR=0.839;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=11;WE=28618716;WS=28618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr16	28619911	rs1126447	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQRankSum=-6.290;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr16	28619920	rs1126446	A	G	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQRankSum=-5.949;QD=27.31;ReadPosRankSum=-2.353;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr16	28620652	rs35067810	G	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=385;ReadPosRankSum=1.895;SC=TGTGGAAACCGCCCAGGCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=20;WE=28620660;WS=28620642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr16	28620759	rs35827316	G	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=820;ReadPosRankSum=2.095;SC=GGCCAGAGCTGCTGTGGGAAT;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=51;WE=28620767;WS=28620749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr16	28620800	rs3760091	C	G	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.13;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	28620800	.	CAGGCCTA	GAGGCCTA,GAGGCCTG	651	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=32,14;NR=43,23;PP=501,651;QD=7.1436161673;SC=AGCAAAAGCACAGGCCTAGGC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75,37;WE=28620815;WS=28620790;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:75
chr16	28620807	rs35597330	A	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.282;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr16	28621311	rs2077412	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=626;ReadPosRankSum=2.111;SC=ATTGTGGGTGTTGTGTGGGGA;SOR=0.979;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=48;WE=28621319;WS=28621301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr16	28631314	rs141320733	T	TTGTGTG	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=4;PP=588;SC=GTATTGTATATTGTGTGTGTG;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=9;WE=28631322;WS=28631304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr16	28734477	rs202014506	G	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.95;MQRankSum=-1.102;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.608;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr16	28835680	rs149808056	T	TG	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TCGCTGGAGGTGGGGGTTCGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=28835688;WS=28835670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	28837203	rs62036622	T	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=295;ReadPosRankSum=0.547;SC=AGTTGCAGAGTAGGAGGAGAA;SOR=1.254;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=18;WE=28837211;WS=28837193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr16	28837515	rs8049439	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=232;ReadPosRankSum=0.995;SC=TTGCCTTCACTTTTCTTGAAA;SOR=0.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=17;WE=28837523;WS=28837505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr16	28838073	rs12448482	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=322;ReadPosRankSum=0.440;SC=CGTACTCTGGACTTCTTAAAC;SOR=0.458;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=18;WE=28838081;WS=28838063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr16	28842311	rs4344749	A	G	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.27;NF=15;NR=16;PP=741;SC=CAAAGGCACAACGGCCTCTGA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=28842319;WS=28842301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	28844068	rs7498491	T	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=238;ReadPosRankSum=0.451;SC=CCTCTGTTCTTTTGGCACTGT;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=16;WE=28844076;WS=28844058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr16	28844284	rs62036626	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=631;ReadPosRankSum=1.417;SC=AAAGGACTAGATAGGAGTCAA;SOR=1.329;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=28;WE=28844292;WS=28844274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr16	28844365	rs62036657	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=641;ReadPosRankSum=1.936;SC=GACTGTGTGTGTTTCTCTCTT;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=41;WE=28844373;WS=28844355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr16	28846840	rs56404918	T	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=203;ReadPosRankSum=1.646;SC=TGCTGGCCTGTGTGGCACTCA;SOR=0.774;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=12;WE=28846848;WS=28846830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr16	28846866	rs55719896	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=162;ReadPosRankSum=-1.078;SC=CCCCTCCCCAGCAGCATCAGG;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=12;WE=28846874;WS=28846856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr16	28847149	rs55830740	G	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=976;ReadPosRankSum=1.371;SC=CCATCCCATTGCCAAGTCCCT;SOR=0.957;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=54;WE=28847157;WS=28847139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,64:0.66:97
chr16	28847246	rs12928404	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CTTTTTTGTTTTCCACAGGCC;SOR=0.105;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=7;WE=28847254;WS=28847236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr16	28855522	rs61737565	G	C	3864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=60;PP=2457;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CTTCAGCCAGGCCCTGCTCTC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=227;TCF=127;TCR=100;TR=138;WE=28855530;WS=28855512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,165:0.62:265
chr16	28855727	rs4788099	A	G	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1160;ReadPosRankSum=2.276;SC=GTGGGAACAGACAGAGTCCTC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=73;WE=28855735;WS=28855717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,94:0.61:154
chr16	28857645	rs7187776	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=412;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GCACAGAAGAAGAAGGGCGCC;SOR=0.375;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=25;WE=28857653;WS=28857635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr16	28875122	rs7198606	T	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=862;ReadPosRankSum=1.408;SC=CTCTATGGTCTCTTCCTTCAG;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=40;WE=28875130;WS=28875112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,44:0.72:61
chr16	28875204	rs11864750	A	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=489;ReadPosRankSum=0.752;SC=GTGGGGGCGCAGGGAGCGGGA;SOR=1.508;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=11;WE=28875230;WS=28875194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr16	28875214	rs138146565	AGCCGCCGCC	A	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=4;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=705;ReadPosRankSum=2.522;SC=AGGGAGCGGGAGCCGCCGCCG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=28875230;WS=28875194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr16	28883241	rs7498665	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=281;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GGGACCCCCAACAGGGACAGT;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=28883249;WS=28883231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr16	28883327	rs28433345	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.645;SC=TGAGTGTGCATGTCTCCAGGC;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=28883335;WS=28883317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr16	28883841	rs62037369	C	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TCACCTCCCCCATCCCGCCCT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=72;WE=28883849;WS=28883831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,80:0.60:134
chr16	28890131	rs62037371	C	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=1011;ReadPosRankSum=1.269;SC=CTTGGAAGAGCGGCTGGTAAT;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=52;WE=28890139;WS=28890121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr16	28893724	rs5816477	ACT	A	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=708;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CAACTCCATAACTCTGCCTCC;SOR=0.551;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=17;WE=28893733;WS=28893714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
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chr16	28898793	rs6565259	T	C	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=903;ReadPosRankSum=0.652;SC=TGGCCACCACTGGTGTGGGCA;SOR=1.223;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=93;TCF=67;TCR=26;TR=50;WE=28898801;WS=28898783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
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chr16	28903767	rs200961662	AAC	A	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.044;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr16	28903769	.	C	A	274	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=274;QD=77.1928031368;SC=AAGGCTGTAACCTTGGCTCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=28903777;WS=28903754;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,4:0.24:17
chr16	28906084	rs9931989	G	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=370;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GGTGGAAGGAGGGTATGACAG;SOR=0.890;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=33;WE=28906092;WS=28906074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,37:0.30:123
chr16	28911946	rs151309999	G	A	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=873;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TGGACCCTCCGCGCAAGGAGG;SOR=0.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=64;WE=28911954;WS=28911936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr16	28912274	rs138101297	C	T	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=66;PP=1675;ReadPosRankSum=1.049;SC=TTAGTGTCCACGGAGATGACC;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=157;TCF=56;TCR=101;TR=100;WE=28912282;WS=28912264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,113:0.64:176
chr16	28913787	rs7189927	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;ReadPosRankSum=0.654;SC=CCCATGCAGGTGCTGAGAGGG;SOR=0.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=11;WE=28913795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr16	28915433	rs2071342	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=1.729;SC=CGTGCCTGGGAGATGCACCTG;SOR=0.784;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=8;WE=28915441;WS=28915423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr16	28915527	rs10499	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=498;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AAGGAAGTGAGCATCCTTTTG;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=41;WE=28915535;WS=28915517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,55:0.36:154
chr16	28922149	rs11646653	C	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=-0.596;SC=CCTTCCACCACGTGCAACTGA;SOR=0.672;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=55;WE=28922157;WS=28922139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,61:0.39:156
chr16	28925978	rs3924376	T	C	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=596;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CAGCGCCCCCTGGCCGTGCCC;SOR=0.659;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=45;WE=28925986;WS=28925968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,54:0.32:168
chr16	28944257	rs142342927	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GGAATGTTTCGGACCTAGGTG;SOR=1.739;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=14;WE=28944265;WS=28944247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr16	28944396	rs2904880	C	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=928;ReadPosRankSum=0.901;SC=GCCTCCGTGTCTCCCACCGAG;SOR=0.933;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=59;WE=28944404;WS=28944386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,64:0.47:137
chr16	28944700	rs35979293	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,46:0.27:172
chr16	28962755	rs12449272	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.447;SC=CGGCGGAAGGGCCAAGGGCTT;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=28962763;WS=28962745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr16	28993049	rs6565300	A	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=1.577;SC=AATTCGGTCGATACTGTCCCC;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=23;WE=28993057;WS=28993039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr16	28993649	rs11301233	AC	A	1338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=806;ReadPosRankSum=0.593;SC=ACAGGGACAAACCCCCCATTC;SOR=0.749;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=35;WE=28993657;WS=28993639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,59:0.37:161
chr16	28995757	rs7140	C	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=0.748;SC=CAGACACTACCTGGGTAGCTC;SOR=0.874;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=20;WE=28995765;WS=28995747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr16	28998111	rs4788115	T	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=545;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CCTTTTCACTTCCTTTCAGGG;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=40;WE=28998119;WS=28998101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr16	29001460	rs9929088	A	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.165;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,22:0.19:113
chr16	29088128	rs67548829	TACAACTATTGCTGTTATACTAAAGACCAATAGAAATAGCAAGATTAATTAAGATACCAGTTGAAA	T	345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=19.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQRankSum=2.411;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.566;SOR=3.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,18:0.13:139
chr16	29088221	rs2442141	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQRankSum=-1.013;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr16	29097556	rs61151630	C	CAT	1063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=7.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=55.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.770;NF=2;NR=30;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.373;SC=AATTTTGACACGTCACAGAGC;SOR=6.376;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=32;WE=29097564;WS=29097546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr16	29102189	rs56374327	C	CT	370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.17;QD=26.48;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr16	29141436	rs1646128	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.409;NF=17;NR=15;PP=479;ReadPosRankSum=0.541;SC=CCTCCCCAGAGTGTCTACCGG;SOR=0.596;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=32;WE=29141444;WS=29141426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr16	29142059	rs1642020	G	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=13;PP=513;SC=CTGGCGGGGAGAGCCAGGAGA;SOR=0.746;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=29142067;WS=29142049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	29142189	rs1642021	A	T	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.84;QD=27.68;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	29142204	rs1642022	A	G	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=7;PP=177;SC=GGTGCTGGGCACCAAGTCCTC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=29142212;WS=29142194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	29150785	rs1646119	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=1.373;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.887;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr16	29332380	rs257878	T	C	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=26;PP=1042;SC=GAGCTTCTCGTGGAGAATGCC;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=29332388;WS=29332370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	29376144	rs150113199	C	T	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.525;NF=65;NR=48;PP=2111;ReadPosRankSum=-1.222;SC=AGGACAACTCCGACCACTCCT;SOR=0.971;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=162;TCF=100;TCR=62;TR=113;WE=29376152;WS=29376134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,84:0.73:115
chr16	29624247	rs28455095	C	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.63;QD=28.44;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	29644794	rs11150561	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.05;QD=30.07;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	29645078	rs12597368	C	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=38;NR=7;PP=1036;SC=TGCACTCCAGCCTGTGTGACA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=29645086;WS=29645068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	29645104	rs35388990	CA	C	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=14;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=-0.472;NF=8;NR=16;PP=266;ReadPosRankSum=1.669;SC=AGTCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.595;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=24;WE=29645113;WS=29645094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr16	29647700	rs200123374	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.51;QD=31.21;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	29705854	rs9936468	C	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=191;SC=CCGCAGTCCCCCCCCTGGGAC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=29705862;WS=29705852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	29708350	rs9932770	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=461;SC=GGCTGACTTCACTCTGAAGGT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=29708358;WS=29708340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	29790669	rs235634	T	A	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	29790678	rs183527	T	G	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	29790709	rs12933548	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=569;ReadPosRankSum=1.039;SC=TGCTGTTGGCCAAGGCTTTTG;SOR=0.221;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=32;WE=29790717;WS=29790699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr16	29790767	rs235635	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=861;SC=AACAGGGGTGATGCAGAGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=29790775;WS=29790757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	29790864	rs235636	G	A	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=30;PP=1236;SC=AGAGTATGGAGGTGGTGGTGG;SOR=0.746;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=63;WE=29790872;WS=29790854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	29791561	rs235637	T	G	5626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=76;PP=2965;SC=GAAGAAGCTGTTATTTGTGAC;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=107;TCR=76;TR=183;WE=29791569;WS=29791551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	29791721	rs235638	G	C	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.09;NF=38;NR=70;PP=2182;SC=GTTTACCCCAGTAGCTGCAGC;SOR=1.382;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=108;WE=29791729;WS=29791711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	29791818	rs35586094	TA	T	390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.72;NF=0;NR=11;PP=236;SC=AATGGCTCAATAAAAAAAATA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=29791826;WS=29791808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	29809634	rs5816499	TACAC	T	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=3;PP=1196;SC=CTCCACCCCTTACACACACAC;SOR=0.941;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=29809645;WS=29809624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	29809673	rs202102958	ATTTC	A	703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5066;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=1499;ReadPosRankSum=-1.208;SC=ACACACGCTAATTTCTTTCTT;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=13;WE=29809684;WS=29809663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr16	29811319	rs235648	C	T	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=74;PP=2195;SC=AAGAGGAGATCGGGAGCCCTG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=27;TCR=74;TR=101;WE=29811327;WS=29811309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	29814234	rs2450399	G	A	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=72;PP=2735;SC=TGAAGACAGTGGAAGAGAAGG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=130;WE=29814242;WS=29814224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	29817998	rs111993640	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=416;SC=CGCTGAGCCCCGGGGGCCCCG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=29818006;WS=29817988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	29821420	.	GGCGGCGGCAGCGGCA	G	1033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.070;NF=7;NR=6;PP=2971;ReadPosRankSum=1.177;SC=TTTGTCCAATGGCGGCGGCAG;SOR=1.085;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=13;WE=29821442;WS=29821410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr16	29821744	rs2516825	G	A	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=56;PP=2271;SC=CTCCTCTTCTGTCAGACCTGA;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=29821752;WS=29821734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	29822841	rs11150572	A	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=335;SC=CCCCAGCCGCATCCCTCCCCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=29822849;WS=29822831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	29823202	rs12923293	A	G	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=8;PP=195;SC=CTGCTCGTAGAGACGCCTCCA;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=29823210;WS=29823192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	29825126	rs11150573	T	C	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=74;PP=2895;SC=CAGCTCCCAGTTGGCAGGTCC;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=134;WE=29825134;WS=29825116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	29828710	rs8058824	C	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=666;ReadPosRankSum=0.884;SC=TGCCTCAGCTCCCACACAACT;SOR=0.889;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=34;WE=29828718;WS=29828700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr16	29830829	rs11864180	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=424;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGGTATGGTGTACACCACCTC;SOR=1.101;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=19;WE=29830837;WS=29830819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr16	29842891	rs34127220	C	T	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1093;ReadPosRankSum=0.965;SC=CCTCCAGCCACCCCCATCCTC;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=68;WE=29842899;WS=29842881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr16	29848417	rs13331733	A	G	186.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.887;SC=GTTCTTACACACCTGAGACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=29848425;WS=29848407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr16	29852860	rs3815824	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GACAGCTGGGCGGATCTTCCT;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=29852868;WS=29852850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr16	29855731	rs9939514	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=855;ReadPosRankSum=0.742;SC=ACCAGCCTGGGCAACATGGCA;SOR=1.101;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=42;WE=29855739;WS=29855721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr16	29857316	rs4787480	G	A	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TTGAGAACTAGAGGAGGAGAC;SOR=0.578;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=85;WE=29857324;WS=29857306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,107:0.70:153
chr16	29859430	rs11350750	CT	C	38.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=4;PP=54;SC=CCCCTGGCATCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=29859438;WS=29859420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	29872361	rs3815822	G	A	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=385;ReadPosRankSum=0.849;SC=ACACCCTTCCGTCTAGGCTCA;SOR=0.203;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=27;WE=29872369;WS=29872351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr16	29906546	rs4787484	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=358;ReadPosRankSum=-0.289;SC=CAGTATGGCCCCTGCCCTTCC;SOR=1.545;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=18;WE=29906554;WS=29906536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr16	29907027	rs71389435	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=752;ReadPosRankSum=0.290;SC=CAGTCACATGCTTTGGTCCAG;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=40;WE=29907035;WS=29907017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr16	29907298	rs34549819	G	GT	818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.797;NF=2;NR=20;PP=826;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TTTTTGTTTTGTTTGAGACAG;SOR=1.402;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=22;WE=29907306;WS=29907288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr16	29908433	rs11649499	C	G	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=16;PP=486;SC=CGTGGGGTCCCGATCAGATCC;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=29908441;WS=29908423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	29912802	rs140411458	G	GGGT	2458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,69:0.32:214
chr16	29918034	rs1129700	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=291;ReadPosRankSum=1.470;SC=GGGGTTGGGATGGGTGGAGAA;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=16;WE=29918042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr16	29923510	rs4548895	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=2.015;SC=AGCTCCGCCAGCCTCTCTGCC;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=14;WE=29923518;WS=29923500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr16	29934754	rs12596042	T	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=2.041;SC=TAAAAAAAAATTTTTGTAGAG;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=23;WE=29934762;WS=29934744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr16	29937081	rs5816505	G	GA	1255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.005;NF=21;NR=6;PP=958;ReadPosRankSum=0.894;SC=GGGGTCTGGGGTGGGGGCACG;SOR=0.718;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=27;WE=29937089;WS=29937071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr16	29982961	rs9932702	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.667;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=0.068;SC=GGGTTGTAACCGGGGTAGAGC;SOR=0.264;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=14;WE=29982969;WS=29982951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr16	29993108	rs11642046	C	G	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1333;ReadPosRankSum=1.697;SC=TGGGCCCAGGCGTTAGGCCAT;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=81;WE=29993116;WS=29993098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,94:0.63:150
chr16	29994736	rs3814884	T	A	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.265;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=16;PP=1663;ReadPosRankSum=0.574;SC=AGTGCAGCACTCCTCTGAGTC;SOR=0.418;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=116;TCF=94;TCR=22;TR=77;WE=29994744;WS=29994726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr16	29994922	rs3814883	C	T	6805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=151;PP=2962;ReadPosRankSum=1.709;SC=CCACCTCTTCCGCCCGCCGCC;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=398;TCF=166;TCR=232;TR=263;WE=29994930;WS=29994912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,303:0.65:465
chr16	29998200	rs4077410	A	G	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.221;SC=AGGCTGGGACATGGAGCTTGT;SOR=0.642;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=78;WE=29998208;WS=29998190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,82:0.71:116
chr16	30000901	rs3814881	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=555;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CCCTTGATCCGTCCACTGCAT;SOR=0.578;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=37;WE=30000909;WS=30000891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr16	30016022	rs12928610	C	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=927;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GCTGCCGGGACCCCGAGGAGG;SOR=0.769;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=51;WE=30016042;WS=30016012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
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chr16	30078636	.	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TGACATCGCTCACCGCATCGT;SOR=2.000;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=14;WE=30078644;WS=30078626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr16	30097630	rs2289292	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=0.882;SC=GGAGAAAGTGCGGGGCAAAGG;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=13;WE=30097638;WS=30097620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr16	30119525	rs8061772	C	A	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=11;PP=729;SC=GTGGTGGTCACGGCCTCACCT;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=30119533;WS=30119515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	30129936	rs12922100	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-0.224;SC=GCTCTGAAGGCGAGGCTGCAC;SOR=0.191;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=30129944;WS=30129926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr16	30198151	rs1132812	A	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1373;SC=GGGAGATCCCAGATGGGGGCC;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=30198159;WS=30198141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	30208527	rs2304624	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.25;MQRankSum=0.489;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	30380486	rs4238961	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=293;SC=ATCGTTTTCGTTTCGCCCTCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=30380494;WS=30380476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	30386262	rs8046445	C	T	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=22;PP=887;SC=GTAGCTGGTTCCCAGTCCAAC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=30386270;WS=30386252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	30390314	rs12447833	T	C	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=7;PP=1661;SC=TTGGAGGCTCTGATACTGTCC;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=61;TCR=7;TR=68;WE=30390322;WS=30390304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	30393147	rs34518080	C	A	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1265;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CACTTTCACACCCCCTTCCTC;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=86;WE=30393155;WS=30393137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,98:0.63:156
chr16	30393660	rs4787643	G	A	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=111;PP=2965;SC=GGTTGGGGAGGGCAGCAAAAC;SOR=0.955;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=85;TCR=111;TR=196;WE=30393668;WS=30393650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr16	30393771	rs4788409	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=45;PP=1272;SC=GCTAGGAAGAGTCAGTGGGGT;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=51;WE=30393779;WS=30393761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	30406410	rs80225586	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.461;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=147;ReadPosRankSum=0.694;SC=ACCCCTTTCCCCGGGTCCGTC;SOR=1.445;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=11;WE=30406418;WS=30406400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr16	30407269	rs13333093	C	A	5335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=68;PP=2965;SC=TGTGGCCGGCCGAGATCCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=156;WE=30407277;WS=30407259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	30408765	rs12921440	C	T	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=46;PP=1730;SC=GTAGGAAATGCCTCTCTCAAA;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=30408773;WS=30408755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	30410445	rs4788413	C	T	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=51;PP=1463;SC=CCAGGGAGGGCGGAGGCCCAG;SOR=2.372;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=30410453;WS=30410435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	30424888	rs11314620	GT	G	861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=506;SC=GAAATTTTGGGTTTTTTTTTC;SOR=1.681;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=25;WE=30424896;WS=30424878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	30485393	rs11574938	G	C	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=61;PP=2193;SC=CGCCCTGGAGGGGAAGCGCAG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=30485401;WS=30485383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	30492823	rs1064524	C	T	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TTATGTTAAACGGAAGGACCC;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=93;WE=30492831;WS=30492813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,106:0.37:283
chr16	30495412	rs2285459	T	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=34;PP=1428;SC=ATTTCAGCTCTTCACTCTCCA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=67;WE=30495420;WS=30495402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	30495657	rs7197010	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=279;SC=AGGCCGGGCTTGGTGGCTCAC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=30495665;WS=30495647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	30500761	rs3087438	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=39;PP=1126;SC=TCAGATGGTCGCTCAGCCTGG;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=53;WE=30500769;WS=30500751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	30505513	rs4350585	A	G	7678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=114;PP=2965;SC=CTAACTCCACACCCCACACAC;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=118;TCR=116;TR=232;WE=30505521;WS=30505503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr16	30506337	.	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=1.146;SC=ATGCAGGGTCCAGTGCCAATA;SOR=0.124;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=30506345;WS=30506327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr16	30507972	rs28708641	T	C	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=TTTATTTTGGTTTTTTTTAGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=30507980;WS=30507962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	30510571	rs1557672	C	T	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=35;PP=1809;SC=AGCTCTCCTCCTGCTCCCAGG;SOR=0.909;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=30510579;WS=30510561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	30718841	rs181335500	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.316;SC=TTTGCCTTTGGGTGGGGAAGT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=30718849;WS=30718831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr16	30724070	rs4889500	G	T	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=55;PP=2042;SC=AGTTGAAACGGTGGTGCCCCA;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=30724078;WS=30724060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	30724221	rs4889501	C	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.64;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	30732406	rs1470129	C	G	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=15;PP=952;SC=GCTGGGGACACGGGTCTAGTA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=30732414;WS=30732396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	30734963	rs4889502	C	A	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=34;PP=2266;SC=TGCCATCCTCCCTCCCTGGGC;SOR=1.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=109;WE=30734971;WS=30734953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	30762640	rs4889504	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=36;PP=1200;SC=GCAGACGACCCCCCACCTCCT;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=30762648;WS=30762630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	30766247	rs9941201	G	A	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=30;PP=1732;SC=TGGCAAATCAGTGCAACTTGG;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=82;WE=30766255;WS=30766237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	30768492	rs71820772	GCTCTGGC	G	720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=669;SC=GCTCCTCTGGGCTCTGGCCTC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=30768506;WS=30768482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	30770267	rs7188077	C	G	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=858;SC=GTCCTGATGTCATCCAAACCC;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=30770275;WS=30770257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	30772040	rs4889505	A	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=42;PP=1512;SC=TATCATGACAAGGCTGTGACA;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=30772048;WS=30772030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	30773822	rs1550477	T	C	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=574;SC=CTCCTCCCGTTTGACGCCCCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=30773830;WS=30773812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	30779716	rs7195142	A	G	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=47;PP=1931;SC=CGGGAGCTTCAGGAACGGGAA;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=30779724;WS=30779706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	30780828	rs4889506	A	G	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=71;PP=2400;SC=TGCAGAAGCTAGAGGAGAAGG;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=117;WE=30780836;WS=30780818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	30832463	rs6565205	A	C	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=31;PP=2099;SC=GACACCGTCCAGCAGGTGGGC;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=96;WE=30832483;WS=30832453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	30832475	rs6565206	T	C	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=36;PP=2411;SC=CAGGTGGGCATGCCGTGGTGT;SOR=1.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=118;WE=30832483;WS=30832453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	30832701	rs8045550	A	C	9661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=157;PP=2965;SC=TGGGCGGGGGAAGAGTGAAGG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=123;TCR=157;TR=280;WE=30832709;WS=30832691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr16	30833246	rs9319587	C	T	7714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=94;PP=2965;SC=CATCCCCCTTCGTTCACACCT;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=149;TCR=94;TR=243;WE=30833254;WS=30833236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr16	30833272	rs8046609	A	G	8884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=124;PP=2965;SC=AACCGACAGCAACATGGGAGC;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=157;TCR=124;TR=281;WE=30833280;WS=30833262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr16	30833425	rs4889510	G	C	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=56;PP=1645;SC=CTCCCGTGTTGCAGGGGCTGC;SOR=4.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=63;WE=30833433;WS=30833415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	30886643	rs897984	T	C	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=43;PP=1639;SC=ACTGCTGAGGTTGCCCGAGGT;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=30886651;WS=30886633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	30938811	rs12930545	A	G	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=44;PP=1696;SC=GGTGGGGCAGATTGTCAGGGA;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=30938819;WS=30938801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	30964940	rs9926903	A	G	7011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=92;PP=2965;SC=CACCGTCCCAAGCTGAGCCAG;SOR=0.926;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=121;TCR=92;TR=213;WE=30964948;WS=30964930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	30977799	rs11150601	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=425;SC=AGAGGAGACAGGTGATGGAGG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=30977807;WS=30977789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	30980902	rs897986	T	C	4582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=82;PP=2965;SC=CTGTTAGTCCTCATTTGTCTT;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=58;TCR=82;TR=140;WE=30980910;WS=30980892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	30999142	rs9938550	A	G	7338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=90;PP=2965;SC=GCAGCGGGCAACCCTGATGGG;SOR=1.087;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=136;TCR=90;TR=226;WE=30999150;WS=30999132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr16	30999462	rs2305880	T	C	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=30;PP=1159;SC=GCCGGACCCGTACCATTCTCT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=55;WE=30999470;WS=30999452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	31004926	rs7194921	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=579;SC=GCACATTATTCACCTGCTCTT;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=31004934;WS=31004916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	31075175	rs2303223	G	A	3719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=32;PP=2322;SC=CATAGGCTTTGCCGCAACGCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=106;WE=31075183;WS=31075165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	31075708	rs2032917	C	G	8037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=126;PP=2965;SC=GTACAGGACACGCACTTGTAG;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=240;WE=31075716;WS=31075698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr16	31075869	.	C	A	3444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=69;PP=2075;ReadPosRankSum=-1.086;SC=TCAGAGAGAACCCTATCTCAT;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=127;WE=31075877;WS=31075859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,157:0.63:251
chr16	31088347	rs749671	G	A	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=51;PP=2283;SC=CTCCTGCTGAGGAGGAGCGGC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=31088355;WS=31088337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	31088625	rs749670	A	G	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=71;PP=2965;SC=CGCTGGGAGGAGAAAGGGATG;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=144;WE=31088633;WS=31088615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	31097574	rs4889535	G	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=442;SC=CTGATTGCAGGTCTTTCCCCC;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=31097582;WS=31097564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	31104192	rs144197331	C	CA	300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=12;PP=250;SC=CCATCTCTACCAAAAAAAAAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=31104200;WS=31104182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	31104509	rs8050894	C	G	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=95;SC=CAGGACGCTCCGTGATGAGCA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=31104517;WS=31104499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	31104878	rs9934438	G	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=499;SC=CTAGTCCAAGGGTCGATGATC;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=31104886;WS=31104868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	31105396	.	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=455;ReadPosRankSum=0.068;SC=CTGGGAGTCGGGGGCAGATTA;SOR=0.743;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=23;WE=31105404;WS=31105386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr16	31105554	rs2884737	A	C	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=81;PP=2965;SC=ACCCCCCTTCACCTGCGCGCC;SOR=0.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=114;TCR=81;TR=195;WE=31105562;WS=31105544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr16	31121793	rs14235	G	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=48;PP=1749;SC=TGTTGGCCACGCATCACCTGG;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=31121801;WS=31121783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	31122229	rs1549296	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=301;SC=TTCTTTGTCACAGGGGCTGCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=31122237;WS=31122219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	31141826	rs1549295	A	G	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=60;PP=2355;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CGGAGAAGCCACTGTCTGACC;SOR=0.291;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=109;WE=31141834;WS=31141816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr16	31141880	rs1549294	A	G	3794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=61;PP=2307;SC=GGGTGCTGCTAGAGATCCTGC;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=113;WE=31141888;WS=31141870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	31141993	rs1549293	C	T	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=38;PP=1597;SC=CCTGCTTCCTCATACCCTGTC;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=31142001;WS=31141983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	31142381	rs2855479	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=319;SC=GGGCTTCCCTACCCCTCCCCA;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=31142389;WS=31142371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	31151521	rs8047469	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.15;QD=25.40;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	31152717	rs889547	T	C	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.30;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	31153105	rs1549300	A	G	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=59;PP=2346;SC=CAGGGCCCCAATCCCAGGCTA;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=31153113;WS=31153095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	31153780	rs889546	G	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=190;SC=CGCGTTCCGCGGGCCCCGCCC;SOR=3.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=31153788;WS=31153770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	31154146	rs1549299	G	A	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GCGAAGCCGCGCTCAGGTTCA;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=162;WE=31154154;WS=31154136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr16	31191482	rs929867	A	G	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=43;PP=2170;SC=AGGCGTCGGTACTCAGCGGTG;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=31191490;WS=31191472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	31195279	rs1052352	C	T	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=72;PP=2147;SC=AGTCCTCCTACCCTGGCTATG;SOR=1.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=105;WE=31195287;WS=31195269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	31230463	rs7186832	C	T	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=29;PP=1345;SC=CATGCATGCGCAAGGAGAAGA;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=31230471;WS=31230453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	31230573	.	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=459;ReadPosRankSum=0.773;SC=TCCAGCCAAGAGTCTTTATCC;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=32;WE=31230581;WS=31230563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
chr16	31271545	rs11865830	G	A	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=5;PP=104;SC=AGGAGAAAGGGTTCAAGAAGA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=31271553;WS=31271535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	31273129	rs3764327	T	C	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=56;PP=2637;SC=GTGAGACCCTTAGATGGAGCC;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=121;WE=31273137;WS=31273119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	31273283	.	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=434;ReadPosRankSum=-0.657;SC=CAAAAGATGCAAAAGGGTGTA;SOR=1.101;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=19;WE=31273291;WS=31273273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr16	31276811	rs1143679	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=887;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GAGCCCATCCGCCTGCAGGGT;SOR=1.352;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=46;WE=31276819;WS=31276801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
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chr16	31288121	rs9939679	A	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=274;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AAGAAGAGATAGGAGAGATGT;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=20;WE=31288129;WS=31288111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr16	31335906	rs41476751	T	C	4269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCCCTGGGTCTTCCAAGCATG;SOR=0.558;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=267;TCF=125;TCR=142;TR=168;WE=31335914;WS=31335896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,180:0.62:292
chr16	31336719	rs1143682	G	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=941;ReadPosRankSum=0.231;SC=AGGTGTCCACGCTCCAGGTAG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=134;TCR=123;TR=81;WE=31336727;WS=31336709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,113:0.35:325
chr16	31336888	rs1143683	C	T	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=73;PP=2117;ReadPosRankSum=0.231;SC=GTGTCTGGGGCCTTGAAGAGC;SOR=0.706;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=195;TCF=95;TCR=100;TR=136;WE=31336896;WS=31336878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,152:0.67:226
chr16	31339625	rs28372932	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=2.142;SC=CTGTGTGCATGAGTCTGTGCA;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=14;WE=31339633;WS=31339615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr16	31340368	rs55742763	G	A	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=101;SC=AAATGGGCACGCACTGTGTGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=31340376;WS=31340361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	31342608	rs7188189	T	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=388;SC=TGCTCCCCGCTGCTCCCCCAC;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=31342616;WS=31342598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	31342788	rs111881239	C	CTTG	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AGTCGCCCTCCTTGTAGTTTC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=2;WE=31342796;WS=31342778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	31343005	rs1143678	C	T	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1346;ReadPosRankSum=-0.032;SC=TGAAGGGGGTCCCCCGGGGGC;SOR=0.581;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=78;WE=31343013;WS=31342995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,101:0.62:164
chr16	31368835	rs11574636	C	T	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=165;SC=GACGCTGCTGCCCGCACATCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=31368843;WS=31368825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	31371193	rs4264407	C	G	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=62;PP=2569;SC=GTGGGTGCTTCGATCCTGGTG;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=117;WE=31371201;WS=31371183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	31372290	rs11150617	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=1.383;SC=TGTGATCATGTTGATCTTGTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=31372298;WS=31372280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	31374535	rs2230429	C	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=561;ReadPosRankSum=0.506;SC=CAGGGCCACCCCTGGGGTCGC;SOR=0.943;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=137;TCF=92;TCR=45;TR=49;WE=31374543;WS=31374525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,56:0.38:149
chr16	31380596	rs12930249	C	T	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=157;SC=GGCAGCTGGCCGGGCGGGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=31380618;WS=31380586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	31384554	rs2070896	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=239;ReadPosRankSum=0.967;SC=TCTCCTTTCCTTCACCTGATA;SOR=0.965;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=18;WE=31384562;WS=31384544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr16	31391047	rs374886554	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=440;ReadPosRankSum=1.274;SC=GGGCTTTGGCGTGGGCTCTGC;SOR=1.055;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=34;WE=31391055;WS=31391037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr16	31404467	rs8050328	T	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCTGCAGGTTGTGGAGGGGG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=8;WE=31404475;WS=31404457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr16	31404571	rs8050500	T	C	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=33;PP=2293;SC=TGTGCCCCTCTTCCTGCTGTG;SOR=1.462;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=99;WE=31404579;WS=31404561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	31405463	.	A	AAAAAAAAAG	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=0.000;QD=15.66;ReadPosRankSum=-2.845;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr16	31422429	rs12444660	T	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=215;SC=CCCTCTGCTCTGTGGATGTGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=31422437;WS=31422419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	31427352	rs144776519	ATCTTG	A	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=172;SC=GAAGCCAAGGATCTTGTCTTA;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=31427364;WS=31427342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr16	31427678	rs8056122	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=345;ReadPosRankSum=-1.303;SC=GATGCTTGTGCTGCTCTCTGG;SOR=1.255;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=17;WE=31427686;WS=31427668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr16	31435366	rs116943658	GA	AG	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.118;NF=7;NR=7;PP=560;ReadPosRankSum=1.291;SC=GGGCACCCCCGAAGCTCTGAG;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=14;WE=31435375;WS=31435356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr16	31439239	.	G	GCCC	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	31439243	.	GACC	G	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.64;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	31439248	.	C	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	31439253	.	C	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=94.19;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	31470540	rs3813002	T	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=610;SC=TCGGAGGCCCTGGCCCACCTG;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=31470548;WS=31470534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	31470886	rs151069962	T	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=957;ReadPosRankSum=0.764;SC=TCGCTCTCGTTCTGCCTCGCG;SOR=0.552;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=193;TCF=91;TCR=102;TR=65;WE=31470894;WS=31470876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,75:0.36:210
chr16	31471378	rs9926717	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=-1.171;SC=CTTGCTCTCTAGACCCGGGCA;SOR=0.400;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=27;WE=31471386;WS=31471368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr16	31475764	.	C	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=-1.436;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,23:0.21:107
chr16	31476458	rs11150624	C	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1271;ReadPosRankSum=-1.071;SC=TGCAGCCCCGCGCCCAGGATC;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=73;WE=31476466;WS=31476448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,77:0.74:104
chr16	31483622	rs11646911	C	T	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=833;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TGTCTTCTTACTTCTGCTTTT;SOR=0.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=58;WE=31483630;WS=31483612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
chr16	31488916	rs10596	C	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=383;ReadPosRankSum=-0.867;SC=TCGGCTCGCCCTCTCCCCCGG;SOR=0.838;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=21;WE=31488924;WS=31488906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr16	31503751	rs4536493	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=9;PP=303;SC=TGTCTGCCCCAAGACCTTGGC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=31503759;WS=31503741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	31519048	rs11861164	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=32;PP=1545;SC=GCAGGGCTGAAAGCAGCAATA;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=31519056;WS=31519038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	31539386	rs8050390	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=133;ReadPosRankSum=1.931;SC=TTAAGGGGAGGAAGTGGGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=10;WE=31539394;WS=31539376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr16	31575186	rs7192364	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.226;NF=12;NR=5;PP=267;ReadPosRankSum=-1.314;SC=CCTTTCCTGCCCAAACTCAGT;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=17;WE=31575194;WS=31575176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr16	31580272	rs4889673	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.82;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=312;ReadPosRankSum=-1.861;SC=GCCATGGCGCCTTCCATAGTA;SOR=0.972;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=22;WE=31580280;WS=31580262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr16	31580530	rs4889548	A	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.858;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CTGACGTTGAACCATTTGACA;SOR=0.389;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=32;WE=31580538;WS=31580520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,42:0.40:104
chr16	31724836	rs2884713	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=365;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GAGGTTAGCTTCGGGGTCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=28;WE=31724844;WS=31724826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,28:0.26:107
chr16	31734197	rs34186495	G	GA	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr16	31770696	rs34487972	G	GA	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=0.635;SC=ATCCTATGGTGAAAAAAATCA;SOR=0.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=14;WE=31770704;WS=31770686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
chr16	31770723	rs12921028	T	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.560;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr16	31926619	rs3850114	G	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=47;PP=1699;SC=GAGAAACCCTGTAAATGGAAA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=31926627;WS=31926609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	31987859	rs370699866	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.570;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr16	32486756	rs28495417	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.052;NF=10;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GGGAGACAGGACACCTACCAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=14;WE=32486764;WS=32486746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr16	32487933	rs28612238	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CAGAGTAGAGGTTACACTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=3;WE=32487941;WS=32487923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr16	32859404	.	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=2.441;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.270;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,41:0.22:188
chr16	32889182	.	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.70;MQRankSum=-1.605;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr16	32891522	rs138173595	G	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQRankSum=-1.803;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr16	32891573	rs147501614	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.40;MQRankSum=-1.645;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	32893876	rs375167306	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=12.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQRankSum=1.176;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.815;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr16	32893880	rs149083075	G	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=11.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQRankSum=-1.518;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.321;SOR=2.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr16	32896606	rs139370574	GC	AT	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-8.512;NF=19;NR=10;PP=806;ReadPosRankSum=1.051;SC=CGTTGCCCAGGCCCACGGCGA;SOR=0.859;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=29;WE=32896615;WS=32896596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,29:0.23:127
chr16	32896672	.	G	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.556;NF=9;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=0.332;SC=ATCGCGCGCGGCGGCACGGCC;SOR=0.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=25;WE=32896680;WS=32896662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr16	32896688	.	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.226;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.061;NF=6;NR=15;PP=228;ReadPosRankSum=0.167;SC=CGGCCAGGCCGCCGCCGGGTG;SOR=0.296;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=21;WE=32896696;WS=32896678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr16	32936832	.	A	G	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.31;MQRankSum=1.905;QD=39.85;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,26:0.93:28
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chr16	33392008	rs56739713	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=0.169;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.699;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,18:0.20:89
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chr16	33408733	rs8058447	GC	AT	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQRankSum=-2.835;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,26:0.15:177
chr16	33408793	rs58465568	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.038;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.196;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,13:0.19:69
chr16	33410561	rs2632816	T	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.113;NF=32;NR=2;PP=774;ReadPosRankSum=0.349;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCCAA;SOR=1.947;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=34;WE=33410569;WS=33410551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr16	33410777	rs74905055	G	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=6.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-14.394;QD=0.64;ReadPosRankSum=2.793;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:345,59:0.15:404
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chr16	33424637	rs62033013	AA	GG	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-1.819;QD=26.26;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr16	33424691	rs2632824	T	C	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.732;NF=59;NR=18;PP=1283;ReadPosRankSum=0.045;SC=GGCCAGACTTTGTAGTTTGTA;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=96;TCR=29;TR=77;WE=33424699;WS=33424681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,85:0.63:134
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chr16	33424917	rs1906318	A	C	5432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.823;NF=117;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TCAGCCAGCAACTTGTGCCTC;SOR=0.665;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=378;TCF=180;TCR=198;TR=234;WE=33424925;WS=33424907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,233:0.58:405
chr16	33424950	rs2927971	C	T	4471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.901;NF=110;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GCTGCACGGCCTCAGGTCAAG;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=347;TCF=178;TCR=169;TR=213;WE=33424958;WS=33424940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,186:0.55:341
chr16	33500743	rs3888934	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-5.403;NF=7;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.624;SC=CACAGAGCCTTAGGCACCAAA;SOR=1.262;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=7;WE=33500751;WS=33500740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr16	33500893	rs4079166	C	T	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-11.768;QD=5.84;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,54:0.19:286
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chr16	33500915	rs4079164	T	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-9.760;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,64:0.21:298
chr16	33500973	rs58427145	CAG	C	1632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-2.866;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.304;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,53:0.26:204
chr16	33534128	rs4247491	G	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.105;NF=18;NR=4;PP=295;ReadPosRankSum=0.307;SC=GAACAGGACTGGACTCTGATT;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=22;WE=33534136;WS=33534118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr16	33534161	rs4247492	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.896;NF=10;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-1.110;SC=CTTTTAACCATATCTTCATTT;SOR=0.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=17;WE=33534169;WS=33534151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,15:0.21:70
chr16	33534194	rs112954068	C	CA	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=9.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-9.207;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.836;SOR=1.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,16:0.18:87
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chr16	33534205	rs75274563	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=16.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-9.254;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.941;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,20:0.21:94
chr16	33534209	rs111304289	T	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=12.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-8.854;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.030;SOR=1.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,22:0.23:97
chr16	33534212	rs74015084	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=12.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-8.804;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
chr16	33534254	rs79370116	C	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.311;HP=8;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.081;NF=7;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=2.152;SC=ACAGTAAAAACAAAGTCAAGA;SOR=1.378;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=22;WE=33534262;WS=33534244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,18:0.20:89
chr16	33534278	rs10445205	A	G	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.587;NF=13;NR=33;PP=819;ReadPosRankSum=2.522;SC=GATGAAATGCATGTAATTAAG;SOR=1.055;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=46;WE=33534286;WS=33534268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr16	33534325	rs375310866	CT	C	347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.729;HP=4;HapScore=4;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.391;NF=0;NR=8;PP=594;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGGCTCACAACTTTTGATCCC;SOR=0.021;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=33534362;WS=33534315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr16	33534330	rs28594967	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=4;HapScore=4;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.234;NF=1;NR=15;PP=650;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CACAACTTTTGATCCCAGCAC;SOR=0.155;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=16;WE=33534362;WS=33534315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr16	33534344	rs78083012	G	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-2.859;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr16	33534346	rs375719784	G	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-2.859;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr16	33534352	rs78884180	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-3.446;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	33534354	rs74594913	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-3.446;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	33534369	rs74800708	C	CAA	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.335;NF=0;NR=6;PP=184;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GCAGATCATACGAGGTCAGGT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=33534377;WS=33534359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr16	33539512	.	C	T	367	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=40.36;NF=24;NR=1;PP=367;QD=16.0708485019;SC=TAGACAACTGCTAAGTTTTAG;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=80;TCF=73;TCR=7;TR=25;WE=33539520;WS=33539502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr16	33539535	rs55950724	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.49;MQRankSum=-6.064;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,33:0.27:124
chr16	33539648	rs56161129	C	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.672;NF=20;NR=46;PP=1195;ReadPosRankSum=2.631;SC=CGGTCTGTAGCGACTCCTACA;SOR=0.702;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=149;TCF=53;TCR=96;TR=66;WE=33539656;WS=33539624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
chr16	33539747	rs56272308	G	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=7;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.201;NF=1;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CCCTCCAAAAGAAATGGTAAA;SOR=0.069;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=33539755;WS=33539737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr16	33629620	rs2005870	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.929;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,25:0.21:120
chr16	33629637	rs2005869	T	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.781;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,41:0.24:173
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chr16	33629973	rs2002923	G	A	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.825;NF=47;NR=50;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.278;SC=GGCTGGTGTGGGTCTCACGTA;SOR=0.678;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=322;TCF=162;TCR=160;TR=97;WE=33629981;WS=33629963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,116:0.31:379
chr16	33630022	rs2075113	A	T	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=6.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.917;NF=35;NR=49;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CGCAGACTCCATGAAGGGCCA;SOR=0.786;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=277;TCF=121;TCR=156;TR=84;WE=33630030;WS=33630012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,100:0.30:334
chr16	33630336	rs492688	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-7.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.330;NF=37;NR=9;PP=645;ReadPosRankSum=1.503;SC=CTGTACTTACATTTAATGTCT;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=86;TCR=22;TR=46;WE=33630344;WS=33630326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,49:0.43:113
chr16	33630533	rs2110374	A	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=44;PP=711;ReadPosRankSum=-0.731;SC=TCAGGGCAGGAGTCTCTGTGG;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=37;TCR=114;TR=57;WE=33630541;WS=33630523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,67:0.39:174
chr16	33647367	rs199922749	T	C	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.052;NF=47;NR=51;PP=1761;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GTCTGCGTAGTTTGTGTAACC;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=98;WE=33647375;WS=33647357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,122:0.65:187
chr16	33730779	.	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=17.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.07;MQRankSum=-5.875;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.827;SOR=1.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,8:0.14:59
chr16	33730784	.	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=18.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.08;MQRankSum=-5.521;QD=2.88;ReadPosRankSum=2.084;SOR=1.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr16	33784423	rs190376515	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=8.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQRankSum=-6.118;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,13:0.14:90
chr16	33961317	rs75989665	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=28.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-2.754;QD=10.21;ReadPosRankSum=2.903;SOR=1.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,28:0.29:98
chr16	33961323	.	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=7.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-0.490;QD=0.45;ReadPosRankSum=1.378;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,11:0.12:92
chr16	33961327	rs79375500	G	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=22.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-3.158;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.773;SOR=1.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr16	33961352	.	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=7.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQRankSum=-3.571;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.743;SOR=1.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,17:0.18:96
chr16	33961370	rs72797450	A	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=95;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.132;NF=25;NR=14;PP=668;ReadPosRankSum=0.472;SC=TGGCTGTGCCAGGCGTTCCGT;SOR=1.264;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=39;WE=33961378;WS=33961360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr16	33961386	rs76705741	G	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-8.932;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr16	33961390	.	GACCCGCTCCGCTGCGAGCCGGCTCTCC	G	1647.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQRankSum=-9.710;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr16	33961400	rs113037697	G	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQRankSum=0.853;QD=2.63;ReadPosRankSum=-2.108;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,20:0.14:138
chr16	33961418	rs113700972	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-1.544;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.277;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,24:0.15:158
chr16	33961453	rs74808338	A	G	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-12.772;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.790;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,47:0.28:169
chr16	33961465	rs74932417	G	A	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=7.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQRankSum=-12.528;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.163;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,58:0.27:215
chr16	33961467	rs74834425	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQRankSum=-2.963;QD=1.73;ReadPosRankSum=3.899;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,24:0.11:218
chr16	33961470	.	ACG	A	2003.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.894;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=8.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQRankSum=-12.873;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=1.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,59:0.26:224
chr16	33961471	rs137972467	C	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQRankSum=-3.099;QD=1.59;ReadPosRankSum=3.670;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,24:0.11:219
chr16	33961474	rs78784184	G	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=1.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQRankSum=-3.249;QD=1.56;ReadPosRankSum=3.442;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,24:0.11:225
chr16	33961475	.	G	GCA	2048.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.635;ClippingRankSum=0.000;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQRankSum=-12.931;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.374;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,58:0.26:226
chr16	33961481	rs366164	A	C	3310.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=8.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=10.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQRankSum=-14.356;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.439;SOR=1.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,87:0.36:241
chr16	33961482	rs78161808	T	C	3397.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=8.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=12.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-14.479;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.063;SOR=1.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,89:0.36:245
chr16	33961483	rs77018326	G	T	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=17.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQRankSum=-13.402;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,65:0.26:249
chr16	33961499	rs75192280	CA	TG	4191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.346;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.791;NF=76;NR=23;PP=2944;ReadPosRankSum=-2.786;SC=CCATGGGAAGCATCCCAAGTG;SOR=1.642;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=263;TCF=171;TCR=92;TR=99;WE=33961547;WS=33961489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,108:0.39:279
chr16	33961506	.	A	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQRankSum=-6.122;QD=0.69;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:275,25:0.08:300
chr16	33961520	rs75815313	C	T	3277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=11.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQRankSum=-13.911;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=1.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,95:0.29:323
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chr16	33961539	rs72797452	A	C	4737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQRankSum=-17.247;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,124:0.35:351
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chr16	33961902	.	C	A	361	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=89;MMLQ=27;MQ=54.39;NF=8;NR=18;PP=361;QD=15.2219697134;SC=TGGTGGCCCCCTCTGGGACCA;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=26;WE=33961910;WS=33961892;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,26:0.39:67
chr16	33961918	.	G	T	269	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=84;MMLQ=26;MQ=54.34;NF=5;NR=15;PP=269;QD=15.1885606274;SC=GACCAAACCCGGCTCCGCCTT;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=20;WE=33961926;WS=33961908;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr16	33962277	.	GT	CC	1139	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=89;MMLQ=24;MQ=51.21;NF=15;NR=19;PP=1139;QD=35.0725845548;SC=CGGTCTGCCTGTTCGCACGTG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=34;WE=33962286;WS=33962267;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:43,34:0.44:77
chr16	33962298	.	T	G	446	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=109;MMLQ=23;MQ=50.78;NF=14;NR=21;PP=446;QD=13.7363203585;SC=GGCGCGAAGGTTCGGGAGTGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=35;WE=33962306;WS=33962288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,35:0.46:76
chr16	33965407	rs140145020	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-0.979;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr16	33965408	rs146483430	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-1.647;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr16	33965436	.	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-0.485;QD=0.66;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,6:0.09:65
chr16	33965443	.	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-0.687;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.077;SOR=0.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,6:0.09:67
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chr16	33965533	rs78817399	A	C	7198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=4.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-9.700;QD=24.65;ReadPosRankSum=-1.621;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,180:0.62:292
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chr16	33965538	rs146300192	A	G	7499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQRankSum=-9.533;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,182:0.62:293
chr16	33965542	.	C	T	3254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=3.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=2.173;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,97:0.31:308
chr16	33965560	rs75603223	T	A	7492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.804;NF=130;NR=98;PP=2865;ReadPosRankSum=-0.032;SC=TCCCAGGGCTTTGCCTGTCTG;SOR=0.864;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=333;TCF=187;TCR=146;TR=228;WE=33965603;WS=33965550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,182:0.60:303
chr16	33965570	.	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-7.675;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:289,52:0.15:341
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chr16	33965589	rs62030476	G	A	8172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=0.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-3.682;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,209:0.56:372
chr16	33965595	.	C	A	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=8.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-7.633;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.219;SOR=1.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:304,67:0.18:371
chr16	33965618	.	C	T	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=10.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-8.231;QD=5.76;ReadPosRankSum=2.108;SOR=1.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,66:0.19:344
chr16	33965627	rs74218440	T	C	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=12.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-8.880;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.516;SOR=1.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,64:0.22:296
chr16	33965636	.	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=7.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=1.068;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.057;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,30:0.10:308
chr16	33965642	.	TGA	T	1546.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=7.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-7.565;QD=5.09;ReadPosRankSum=2.418;SOR=1.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,56:0.18:304
chr16	33965644	rs72799208	A	G	4844.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.622;NF=78;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GGGTTCCCTGACGTGGCCTGC;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=295;TCF=115;TCR=180;TR=208;WE=33965680;WS=33965608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,132:0.45:294
chr16	33965646	.	G	GCA	1684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=7.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-7.252;QD=6.45;ReadPosRankSum=2.981;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,55:0.21:261
chr16	33965655	rs113687113	C	A	3250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=4;HapScore=1;MGOF=115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.705;NF=31;NR=50;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CGTGGCCTGCCGGGGCCCTCC;SOR=0.499;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=270;TCF=97;TCR=173;TR=81;WE=33965680;WS=33965608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,86:0.37:231
chr16	33965665	rs74016532	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-3.661;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,44:0.18:243
chr16	33965666	.	G	A	3049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=5.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.997;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,79:0.33:237
chr16	33965669	.	C	G	2855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.931;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,79:0.34:235
chr16	33965672	.	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.322;QD=2.89;ReadPosRankSum=2.384;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,31:0.14:228
chr16	33965681	.	G	GA	2618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.029;HP=2;HapScore=1;MGOF=132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.924;NF=8;NR=40;PP=2437;ReadPosRankSum=0.158;SC=CCCAAGTGCAGACCGGCGACG;SOR=0.331;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=159;TCF=15;TCR=144;TR=48;WE=33965698;WS=33965671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,69:0.33:212
chr16	33965684	.	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.636;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,32:0.16:196
chr16	33965687	rs78198861	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.267;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.563;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,29:0.16:180
chr16	33965688	.	G	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.474;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,31:0.17:178
chr16	33965690	rs74964080	C	T	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.707;NF=22;NR=39;PP=2445;ReadPosRankSum=2.481;SC=AGACCGGCGACGTCCGCCCTC;SOR=0.668;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=170;TCF=53;TCR=117;TR=61;WE=33965698;WS=33965671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,55:0.33:169
chr16	33965708	.	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.960;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr16	33965711	rs76711006	G	A	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=62;PP=1900;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CTCTGCCGCCGTGCCCGCCCC;SOR=0.283;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=96;WE=33965762;WS=33965698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,81:0.75:108
chr16	33965727	.	C	T	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr16	33965731	.	C	T	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr16	33965735	.	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.488;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr16	33965741	rs111610856	C	T	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr16	34318731	rs6563853	T	G	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=38;PP=1249;SC=CATGCACATGTAGGAATGGGA;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=34318739;WS=34318721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	34681938	rs237988	C	T	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=31;PP=1236;SC=ATGAGTTCTTCCATGTTTAGA;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=34681946;WS=34681928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	34682019	rs237989	G	A	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=20;PP=697;SC=AGTATGAGTGGTTTCATGGTT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=34682027;WS=34682009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	46552134	rs56227132	G	T	145.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TAGTTCAGTGGTTTTTCTACT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=46552142;WS=46552124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr16	46565019	rs1436436	T	G	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=37;PP=1114;SC=GTCGTACCTTTTTACAGGATT;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=46565027;WS=46565009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	46602819	rs12934443	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=553;ReadPosRankSum=0.116;SC=AGCCAGAGCTCCTCCTCATGG;SOR=0.632;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=48;WE=46602827;WS=46602809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,54:0.30:178
chr16	46629640	.	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=431;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TCCAATGTTAGAGATAGCCTC;SOR=0.508;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=108;TCF=35;TCR=73;TR=33;WE=46629648;WS=46629630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,37:0.30:124
chr16	46637746	rs4967259	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=593;SC=CTACTGCTGATGAAAGGCAGG;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=46637754;WS=46637736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	46651417	rs34949348	TA	T	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=176;SC=ACATGGCAATTAGATGTGAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=46651425;WS=46651407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	46655210	rs6598679	A	G	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=30;PP=1644;SC=CGCCCAGCCCATGCGCTCCGG;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=83;WE=46655218;WS=46655200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	46696284	rs168745	G	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=63;PP=2478;SC=TCAGAGGTTCGTGATTCTCTT;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=123;WE=46696292;WS=46696274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	46697098	rs2304492	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=303;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAACATTTTAAGTTACCTTAA;SOR=0.608;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=22;WE=46697106;WS=46697088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr16	46705502	rs36310	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=527;SC=TTTAATTCAGTTGCAATTCCT;SOR=2.546;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=46705510;WS=46705492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	46714529	rs700582	A	G	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=6;PP=1100;SC=ACACTTTTATACATTCTACAA;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=46714537;WS=46714519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	46715191	rs700581	G	A	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=13;PP=965;SC=TTGTTAAGAAGTTACCCTTAA;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=46715199;WS=46715181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	46723598	rs33994299	T	C	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=993;ReadPosRankSum=1.187;SC=ACGGGAATTGTTCGCTTTAGT;SOR=0.618;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=103;TCR=118;TR=70;WE=46723606;WS=46723588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,87:0.30:292
chr16	46743675	rs4141491	G	A	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=68;PP=2121;SC=CTGAGTCAGTGGAACAGATTA;SOR=2.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=89;WE=46743683;WS=46743665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	46755213	rs194055	C	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=741;SC=ACATGAATGGCTCAGGGCAGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=46755221;WS=46755203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	46764482	rs36460	A	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=11;PP=725;SC=TAAGCCCCCCAACCAAGGCAG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=46764490;WS=46764472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	46773752	rs28185	G	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=104;SC=CAACCCCGAGGTGTTCAAGGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=46773760;WS=46773751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	46773999	rs28407821	C	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=228;ReadPosRankSum=0.968;SC=TCAGACTGCACCCCACTGGTG;SOR=0.896;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=23;WE=46774007;WS=46773989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
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chr16	47462851	rs17811434	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=413;SC=GGCAAACATCAAATGAGCATT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=47462859;WS=47462841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr16	48258198	rs17822931	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=577;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CTTACTGGCCCGAGTACACTG;SOR=0.139;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=32;WE=48258206;WS=48258188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,42:0.81:52
chr16	49412531	rs27813	A	G	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=46;PP=1768;SC=GGCCCCGGCCACCAGAATCCT;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=93;WE=49412539;WS=49412521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	49430229	rs27795	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=-1.565;SC=AGAACAGGTACGGTTTGAAGT;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=49430237;WS=49430219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr16	49557441	rs2287313	A	C	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=11;PP=1368;SC=CCAGCATAAGACTCCACCAGC;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=49557449;WS=49557431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	49557482	rs2287314	C	T	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=39;PP=2857;SC=TCGGTGCTGACGGGGGAACCG;SOR=1.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=95;TCR=39;TR=134;WE=49557490;WS=49557472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	49669787	rs147816446	G	A	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.537;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1854;ReadPosRankSum=-0.344;SC=TGCAGCCGGCGCAGAGGCCGT;SOR=0.754;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=109;WE=49669795;WS=49669777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,121:0.65:185
chr16	49764948	rs2292155	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTAAAAGAATCGCCCGGCATT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=5;WE=49764956;WS=49764938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
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chr16	50059500	rs7194313	C	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=538;ReadPosRankSum=0.746;SC=TTTCTTTTCACTGGCAGACAC;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=31;WE=50059508;WS=50059490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
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chr16	50069312	rs2041918	C	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=565;ReadPosRankSum=0.008;SC=AAAATTCTGTCTTTTCATTTT;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=35;WE=50069320;WS=50069302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
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chr16	50102618	rs60730387	G	GAAAT	3917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=6;PP=2918;SC=GCTAAAAATAGAAATGTGAGA;SOR=5.058;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=65;TCR=7;TR=61;WE=50102626;WS=50102608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	50106594	rs2287197	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=324;ReadPosRankSum=0.813;SC=TAAGTAGGTTTCCTACCAATG;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=24;WE=50106602;WS=50106584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr16	50109478	rs12931497	G	A	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1118;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTTTTGCCTCGTAGCATATTG;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=74;WE=50109486;WS=50109468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,84:0.61:137
chr16	50112971	rs66756058	GT	G	239.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=178;SC=TAATACAGCTGTTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=50112979;WS=50112961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr16	50120122	rs2287196	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr16	50251590	rs3887556	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr16	50251671	.	G	GTCTCTCTCTCTCTCTC,GTCTCTCTCTCTCTCTCTC	364.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.19;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2,2;NR=4,4;PP=66,34;SC=GCATGTTGCTGTCTCTCTCTC;SOR=0.892;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=6,6;WE=50251679;WS=50251661;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:9
chr16	50261735	rs4624170	C	T	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=55;PP=2694;SC=TTATAACTCACGTGACTTGTG;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=137;WE=50261743;WS=50261725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	50326661	rs8051594	A	G	6286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=112;PP=2965;SC=TGCAGGATGCATCCCGGGACC;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=82;TCR=112;TR=194;WE=50326669;WS=50326651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr16	50327439	rs2302712	A	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=479;ReadPosRankSum=0.308;SC=TGTGATTAGCATATCCCGGGG;SOR=0.394;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=35;WE=50327447;WS=50327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr16	50327456	rs2302713	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=4.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr16	50327462	rs2302714	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=6.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.53;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr16	50328421	rs2302716	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=0.623;SC=CTATGGAGGCTGAGGAAGGAC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=50328429;WS=50328411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	50328526	rs2302717	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CTCTGACACTCCCTCCCACCC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=12;WE=50328534;WS=50328516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr16	50334840	rs3833062	AG	A	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.280;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.548;NF=3;NR=17;PP=712;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CTGTGGATGGAGGGTTCTGCG;SOR=0.132;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=20;WE=50334848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr16	50335150	rs35262781	TG	T	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=0.369;SC=AGGCCGCAGCTGGGGGGGACC;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=15;WE=50335158;WS=50335140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr16	50338723	rs9924714	C	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.189;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1025;ReadPosRankSum=0.515;SC=TGGACGACCCCGACACCTTGT;SOR=0.302;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=63;WE=50338731;WS=50338713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,75:0.80:94
chr16	50339289	rs12444679	C	T	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=607;ReadPosRankSum=-1.661;SC=CTCAGTGGGACCCACCCATTC;SOR=1.465;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=36;WE=50339297;WS=50339279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr16	50342658	rs17289102	C	T	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=760;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TGACCCTGGCCGTCCTGACCA;SOR=0.955;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=41;WE=50342666;WS=50342648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,54:0.75:72
chr16	50342847	rs2302681	C	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=373;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCCCTTTGTACACTCAGGGCT;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=25;WE=50342855;WS=50342837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr16	50346748	rs3214383	T	TCC	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.528;SC=TTGCCACTCTTCCTGTCCCCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=50346756;WS=50346738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr16	50348409	rs9926131	A	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=423;SC=GCCATCTATTATGAAAGGTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=50348417;WS=50348399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	50353965	rs199533431	G	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CAAAGTTCCAGATACTAAAGC;SOR=0.929;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=16;WE=50353973;WS=50353955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr16	50354039	rs55820113	CAAAA	C	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.924;NF=3;NR=12;PP=456;ReadPosRankSum=1.284;SC=GAAAACAAAACAAAAAAACTG;SOR=0.357;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=50354050;WS=50354029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr16	50355741	rs9922362	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GCACTGATATGCATTTATGGT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=50355749;WS=50355731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	50367633	.	T	TA	72	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=18;MQ=58.52;NF=1;NR=3;PP=72;QD=21.0;SC=TAATACTAAGTAAAAAAAAAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=50367641;WS=50367623;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	50368663	rs1062348	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.735;NF=7;NR=6;PP=148;ReadPosRankSum=-0.256;SC=CGTGTGCTTCGGCATCTCCAG;SOR=0.741;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=13;WE=50368671;WS=50368653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr16	50402240	rs62029995	C	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=-1.464;SC=GAAAGGAAAGCGCGTCGATTA;SOR=1.765;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=25;WE=50402248;WS=50402230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr16	50641988	rs2357620	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-1.517;SC=CCATAGCCTGTGGTGGCCTGA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=50641996;WS=50641984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr16	50642137	rs730055	T	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=430;ReadPosRankSum=-0.575;SC=CTCATGGCACTGCTTTTAACG;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=34;WE=50642145;WS=50642127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,40:0.38:106
chr16	50642201	rs933566	G	C	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=55;PP=2197;SC=CTGTCTTCTTGTAGGAGCTCG;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=101;WE=50642209;WS=50642191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	50642364	rs73571947	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=0.398;SC=CAGAAAATCTGCAGATGGAGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=50642372;WS=50642354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr16	50709723	rs6596	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=334;ReadPosRankSum=2.330;SC=GAGCTGAAGCGATCTCAAAGA;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=25;WE=50709731;WS=50709713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr16	50731096	rs5743266	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-1.645;SC=GGCTTTTGGCGTTCTGCACAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=50731104;WS=50731086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	50733374	rs2076753	G	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=0.618;SC=GAGAAGTCCCGCACTGACCTT;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=50733382;WS=50733364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	50733969	rs2111235	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.495;SC=AACTTGGTCCATGGGATTTCC;SOR=1.802;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=50733977;WS=50733959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr16	50744624	rs2066842	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.724;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=341;ReadPosRankSum=0.774;SC=CATGGCTGGACCCCCGCAGAA;SOR=0.588;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=35;WE=50744632;WS=50744614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,47:0.34:138
chr16	50745199	rs2066843	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.056;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TGAGGAAGCGCCATCATGAGC;SOR=0.916;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=189;TCF=96;TCR=93;TR=77;WE=50745207;WS=50745189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,81:0.38:213
chr16	50756774	rs5743289	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-0.407;SC=AGAGGACACTCGAGTCTTTCT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=50756782;WS=50756764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr16	50759547	rs1077861	A	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.861;SC=GCATTTCTGAATAAGATCTGG;SOR=0.553;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=12;WE=50759555;WS=50759537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr16	50827601	rs2302759	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=464;ReadPosRankSum=0.612;SC=CTTAATGGATAAACTTTTGTT;SOR=0.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=35;WE=50827609;WS=50827591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr16	51171175	rs4614723	C	T	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=69;PP=2377;SC=AGCCCACTAACAGGTGAGCTG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=126;WE=51171183;WS=51171165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	51173559	rs1965024	G	A	5331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=1.249;SC=TCGACATCTCGAGGGGCAAAG;SOR=0.245;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=162;WE=51173567;WS=51173549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr16	51177113	rs4399530	A	C	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=340;SC=TGTCCTGAACATTTTATTATA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=51177121;WS=51177103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	51177327	rs34204387	G	GAA	1653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.017;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.43;MQRankSum=2.305;QD=31.20;ReadPosRankSum=2.129;SOR=0.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr16	52107849	rs33338	C	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=62;PP=1860;SC=TGAGGCTTGACTGCAAGGATT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=91;WE=52107857;WS=52107839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	52484466	rs142329828	G	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,10:0.19:54
chr16	52502318	rs2287144	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=1.488;SC=CTTGTGCCACATAAGAGAGAG;SOR=1.730;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=21;WE=52502326;WS=52502308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr16	52502571	rs9928698	A	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=0.771;SC=TGGTGTTGCTAAATAAAAGAG;SOR=0.154;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=52502579;WS=52502561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	52837310	rs4784258	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=345;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGTTTTGTTTCGTTTTTTAAT;SOR=1.371;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=52837330;WS=52837300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr16	52837322	rs4784259	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=345;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TTTTTTAATTATAGACCCCTA;SOR=1.236;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=10;WE=52837330;WS=52837300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr16	52992947	rs9933492	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=29;PP=1297;SC=TTCTGATTCCTTTCCGCTTGT;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=64;WE=52992955;WS=52992937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	52993016	rs9931362	A	C	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=40;PP=1553;SC=TTTAGGCTCCATCCCCCTCCT;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=52993024;WS=52993006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	53035331	rs74018575	A	C	274.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=0.362;SC=GAATGGAACAAGTTCCTGCAG;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=10;WE=53035339;WS=53035321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr16	53035592	rs12149531	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GCACATTCCTAGCCCCCAGCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=53035600;WS=53035582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr16	53037529	rs6499205	T	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=323;SC=TGGTGAGATGTAGTTTCATGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=53037537;WS=53037519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	53191470	rs12597487	T	C	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=81;PP=2694;SC=AGCTCTTTGCTTTTATTTTGG;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=124;WE=53191478;WS=53191460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	53256494	rs12597253	T	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=277;SC=ACAATCTTAATTTAATCAAAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=53256502;WS=53256484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	53272216	rs8049913	A	C	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=569;SC=TAGAAAAAAAACCCAATGTAT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=53272224;WS=53272206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	53279123	rs138968213	TA	T	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=161;SC=CACACACACATAACATATATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=53279131;WS=53279113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	53283966	rs8052283	G	A	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=39;PP=1260;SC=GGAATCCTCAGAATGATCTTC;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=53283974;WS=53283956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	53288265	rs6499510	G	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=624;SC=AAGAATTCTTGTATGTGTTTA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=53288273;WS=53288255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	53308315	rs57281432	A	T	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=176;SC=GCCTCCTGAGAGGCTCGCACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=53308323;WS=53308305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	53319390	rs112281896	T	TAATGA	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=164;SC=GATTAAAAAATAATGAAATCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=53319398;WS=53319380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	53320025	rs8056394	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=185;SC=TCATTTTAATGTATTATCCCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=53320033;WS=53320015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	53321734	rs3815548	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=2;PP=223;SC=TGCTGTGTCTTGGGCTCTTCT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=53321742;WS=53321724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	53325691	rs1894903	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=26;PP=970;SC=TAAATTGCACGTACTTCTGTA;SOR=0.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=53325699;WS=53325681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	53326860	rs2287078	G	A	7822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=113;PP=2965;SC=GACAAATTCAGCAGATACAAC;SOR=0.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=249;WE=53326868;WS=53326850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr16	53327041	rs7188463	A	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=42;PP=1145;SC=GGGTACAATTATCACGCTTTG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=53327049;WS=53327031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	53340080	rs3760010	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=535;SC=GAATAATTATGTAAAATCCTT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=53340088;WS=53340070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	53341748	rs6499548	T	G	4047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=58;PP=2650;SC=AATACAGCGATCCCAGTGTAC;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=53341756;WS=53341738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	53342860	rs12596466	C	T	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=474;SC=ATTTATTTTTCCTTTGTTGGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=53342868;WS=53342850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	53348157	rs62049810	T	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=135;SC=ATGATATTTTTAGTCCAAAAG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=53348165;WS=53348155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	53348207	rs8055218	T	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=350;SC=ACTAACACTTTCATATATTTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=53348215;WS=53348197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	53349000	rs12596829	G	A	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=46;PP=1345;SC=ATTTTTATGAGTTGTCAGATC;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=53349008;WS=53348990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	53352329	rs16952168	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=278;SC=TTTCATTATGTGGTGGTGTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=53352337;WS=53352319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	53358439	rs3743771	A	G	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TTCTCCTTCCACATCCTCTAC;SOR=0.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=81;TCR=89;TR=169;WE=53358447;WS=53358429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr16	53404203	rs10775327	C	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=46;PP=1257;SC=GGAACTTTTACCTGACTAAAA;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=53404211;WS=53404193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	53503818	.	T	C	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TTGATTTGTTTTGACCCTAGG;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=96;WE=53503826;WS=53503808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,112:0.60:186
chr16	53635933	rs4784319	A	T	329.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=203;ReadPosRankSum=0.183;SC=CTCATGTAGGAACTTTCATGT;SOR=0.169;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=12;WE=53635941;WS=53635923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr16	53639208	rs77008584	G	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=0.043;SC=AGGAAAGCAGGGGGGAGGACA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=53639216;WS=53639205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	53639438	rs3213758	C	T	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.440;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1555;ReadPosRankSum=0.631;SC=TGAAACATGTCGGCAAGGTCG;SOR=0.444;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=157;TCF=59;TCR=98;TR=95;WE=53639446;WS=53639428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,117:0.62:189
chr16	53671754	rs2111119	C	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1145;ReadPosRankSum=0.025;SC=TCTACACTGCCTTCTTGTGAA;SOR=0.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=72;WE=53671762;WS=53671744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr16	53672355	rs7203525	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GCATGTATGTCATTTTTTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=53672363;WS=53672345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr16	53682785	rs12600091	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=649;ReadPosRankSum=1.835;SC=CTTGATGGCTGTGAAAATGAT;SOR=3.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=29;WE=53682793;WS=53682775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr16	53692199	rs7192060	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=0.067;SC=TTGTAAAGGATGTACTAAGTT;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=13;WE=53692207;WS=53692189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr16	53692238	rs12598634	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=2.545;SC=ATTCATTCTCCAAATGTAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=17;WE=53692246;WS=53692228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
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chr16	53699003	rs4133017	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=46;PP=1430;SC=TTTTAGTGGCGCAGAGACCAC;SOR=1.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=53699011;WS=53698993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	53721906	rs74393433	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=2.130;SC=AATATGATTACAGAATTGAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=53721914;WS=53721896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr16	53860481	rs3826169	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=269;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AGATACACACGCATATACATG;SOR=0.503;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=23;WE=53860489;WS=53860471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr16	53878247	rs62033438	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=0.563;SC=TTGAAACTCTAGTGTCTAAAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=4;WE=53878255;WS=53878237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr16	54018921	rs16952730	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=625;ReadPosRankSum=0.432;SC=CTTCCAAATAGGTGAAGTTTA;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=68;TCR=74;TR=45;WE=54018929;WS=54018911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,55:0.33:165
chr16	54273780	rs17253625	C	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.339;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CAAGCAAGAGCGGGCGGAATG;SOR=1.167;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=71;WE=54273788;WS=54273770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,81:0.59:137
chr16	54274354	rs16953243	A	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=767;ReadPosRankSum=0.491;SC=CACAGCCTGGAAAAAGCAGAG;SOR=0.751;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=38;WE=54274362;WS=54274344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr16	54274562	rs17253832	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.947;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.759;SC=AAAGTATCACTAAGAGCAAGG;SOR=0.281;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=90;TCF=26;TCR=64;TR=61;WE=54274570;WS=54274552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr16	54274615	rs55970991	G	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=489;ReadPosRankSum=-1.104;SC=AGGAAAGAAGGATTCATTTCA;SOR=0.342;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=30;WE=54274623;WS=54274605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr16	54279640	rs72811791	G	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GCACCAGGGCGCTGGGAGTGC;SOR=0.264;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=28;WE=54279648;WS=54279630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr16	54279687	rs16953255	G	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr16	54279693	rs72811792	A	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.28;ReadPosRankSum=0.150;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr16	54318102	rs8050831	C	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=10;PP=1149;SC=TGCTCGGCGTCCTCTCCTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=54318110;WS=54318092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	54318172	rs1126960	C	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=0.791;SC=TGGGCACGGGCTGGAAAGCTG;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=32;WE=54318180;WS=54318162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,49:0.39:127
chr16	54318528	rs1450355	A	G	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=10;PP=397;SC=GAGCGGGTGCAGGCGGGGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=54318536;WS=54318518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	54319571	rs1868692	A	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=44;PP=1661;SC=AGGGAGCGCGAGTGAGCCCCA;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=54319579;WS=54319561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	54319994	rs1868691	G	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=24;PP=676;SC=GGAGAGGGGGGCCGACCCCCG;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=54320002;WS=54319984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	55359126	rs31078	A	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=858;ReadPosRankSum=0.478;SC=GCCTCTGATCATCCTCCTCTT;SOR=1.018;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=50;WE=55359134;WS=55359116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,59:0.76:78
chr16	55359141	rs31079	T	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=733;ReadPosRankSum=1.451;SC=CCTCTTGTGTTCTGGGGGAAG;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=44;WE=55359151;WS=55359131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,53:0.77:69
chr16	55360208	rs31081	G	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=314;SC=GGTGGGGGGGGGGTCTCTGAC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=55360216;WS=55360198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	55513575	rs17859835	C	G	3509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=81;PP=2162;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CAAGGAACCACGTTTAGACAA;SOR=1.056;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=226;TCF=93;TCR=133;TR=129;WE=55513583;WS=55513565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,157:0.55:286
chr16	55513623	rs243862	C	T	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=85;PP=2597;SC=TCTCCCCCTGCCCTCGGCGGT;SOR=1.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=31;TCR=85;TR=116;WE=55513631;WS=55513613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	55515593	rs1030870	G	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=805;SC=GTGTTGTCCAGAGGCAATGCA;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=55515601;WS=55515583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	55515621	rs1030869	T	C	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=14;PP=1440;SC=CTTAAGAAGATAACTCTGGAC;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=55515629;WS=55515611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	55516708	rs857403	T	A	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=169;SC=CCTGGCTTATTTCCTGTCTGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=55516716;WS=55516698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	55516767	rs1030868	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=674;SC=GCTTTGGTCAGTACTGTGCCA;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=55516775;WS=55516757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	55519535	rs1132896	G	C	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=47;PP=2108;SC=TGAAGTATGGGAACGCCGATG;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=55519543;WS=55519525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	55523705	rs243849	T	C	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=72;PP=1761;SC=ACTACGATGATGACCGCAAGT;SOR=1.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=27;TCR=72;TR=99;WE=55523713;WS=55523695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	55525913	rs243846	G	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=22;PP=548;SC=GAGGAGGGGGGAGGTCATGTA;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=55525921;WS=55525903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	55527026	rs11640428	A	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=272;SC=AGTGGGGAGAACCTCTGGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=55527034;WS=55527016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	55527113	rs2287074	G	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=21;PP=908;SC=CCACCCCCACGCTGGGCCCTG;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=55527121;WS=55527103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	55527298	rs243843	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=314;SC=TGAAGACTCCGCCAAATGCTT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=55527306;WS=55527288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	55530772	rs243838	T	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.43;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	55532458	rs2287076	T	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=539;SC=GTTCAGAGGTTGGTGGGCTCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=55532466;WS=55532448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	55536727	rs14070	C	T	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=26;PP=974;SC=ATCCTGGCTTCCCCAAGCTCA;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=55536735;WS=55536717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	55543073	rs17302903	G	C	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=42;PP=1658;SC=GCTTCGGCCGGGTTCTACGCC;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=92;WE=55543081;WS=55543063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	55543322	rs2241147	G	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GTCAGAGGGGGGTCCAGGTAA;SOR=1.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=20;WE=55543330;WS=55543312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr16	55562257	rs837549	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=548;SC=TTAATTAACAGAGCTAATTAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=55562265;WS=55562253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	55562466	rs837550	G	A	6422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=118;PP=2965;SC=TACCTTCTATGGTATCTCGAA;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=89;TCR=118;TR=207;WE=55562474;WS=55562456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr16	55579899	rs2397722	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=256;SC=CAATCTATAAGTATTTTCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=55579907;WS=55579889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	55583149	rs2160277	T	A	575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=495;SC=CTTTTTTTTTTAAAAAAAATG;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=55583157;WS=55583139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	55583448	rs9934904	A	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=GTCAGAGTTGAGAATTTATCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=55583456;WS=55583438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	55728081	rs28613651	T	G	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=28;PP=824;SC=TGACTCTTGTTGGGTGGCAGA;SOR=1.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=55728089;WS=55728071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	55729124	rs2279805	T	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=12;PP=919;SC=CTATAGCCAGTCCAGCAGTCA;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=55729132;WS=55729114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	55730124	rs5568	A	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=19;PP=885;SC=GAGGTCCTTGATGTTTCTTAC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=55730132;WS=55730114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	55735912	rs2242447	C	T	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=63;PP=2282;SC=CCCTGCTGTGCACTGCCCAAG;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=116;WE=55735920;WS=55735902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	55806311	rs28538364	G	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=31;PP=1059;SC=CGGGGAACTGGGGTCACCTGG;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=55806319;WS=55806301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	55806409	rs28366434	T	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=27;PP=958;SC=GGAGGGTCAGTGGGAGGAGAA;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=55806417;WS=55806399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	55806532	rs143032941	C	CAATACCT	2314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=1447;SC=CTTCTGATTACAGTCTCAGGA;SOR=1.220;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=25;WE=55806540;WS=55806522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	55807252	rs62030211	G	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.33;QD=40.31;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	55807256	rs60044394	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.33;QD=40.31;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	55813552	rs28666799	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=7;PP=332;SC=TTGCCCCACTCACCCAGCTCA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=55813560;WS=55813542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	55813600	rs28538101	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=464;SC=CATCCTCTGCTTTTGTCTTCA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=55813608;WS=55813590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	55813644	rs28418425	C	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=427;SC=ACAGGGAGACCTCAAAGAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=55813652;WS=55813634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	55813712	rs28613114	G	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=274;SC=AAGTTCCAATGAACTGTGAGT;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=55813720;WS=55813702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	55813750	rs28594163	G	A	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=GGTGGTTATAGTAACTCCTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=55813758;WS=55813740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	55844452	.	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=4.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.409;SOR=1.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,21:0.14:147
chr16	55844609	rs2244613	G	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.19;ReadPosRankSum=-1.344;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,11:0.11:99
chr16	55844617	rs2244614	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,8:0.10:84
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chr16	55855150	rs3217164	TG	T	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=3.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.428;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,24:0.18:135
chr16	55857396	rs150951789	A	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.944;NF=50;NR=11;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CTGGCATGACAAGAGCTGGGT;SOR=0.460;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=61;WE=55857404;WS=55857386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,69:0.88:78
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chr16	55862691	rs62028647	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-4.736;QD=0.81;ReadPosRankSum=2.368;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,38:0.15:249
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chr16	55862720	rs74019278	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-6.338;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.372;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,33:0.17:193
chr16	55862791	rs114632091	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=9.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-13.896;QD=0.24;ReadPosRankSum=-1.757;SOR=1.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,25:0.12:214
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chr16	55866894	rs56278207	T	TA	2341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=1363;SC=GTGCCCCGCATTTTGATTTCA;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=32;WE=55866908;WS=55866884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	55866900	rs12149359	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-4.085;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.106;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,9:0.16:58
chr16	55867006	rs12149371	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-4.534;QD=2.26;ReadPosRankSum=-2.591;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,6:0.13:46
chr16	55867013	rs12149373	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-4.364;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.899;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr16	55867042	rs3815583	A	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-3.399;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr16	55880323	rs11864688	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.030;SC=GAGAAATTATGGGAGGAGAAG;SOR=0.446;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=9;WE=55880331;WS=55880313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr16	55880480	rs11860456	A	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=721;ReadPosRankSum=0.482;SC=TGGTCCAAAAATCCACCCGCG;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=47;WE=55880488;WS=55880470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr16	55880534	rs11860488	G	C	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=926;ReadPosRankSum=-1.185;SC=AGTCCAGCTGGAGGTACTGCT;SOR=0.704;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=51;WE=55880542;WS=55880524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr16	55880639	rs11865638	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1159;ReadPosRankSum=0.330;SC=CCTCCTCACACCCCAGGCCTT;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=71;WE=55880647;WS=55880629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr16	55880825	rs11076120	T	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=0.937;SC=TGTATTTGATTAATCCTTTTC;SOR=2.891;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=55880833;WS=55880815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr16	55883618	rs2160276	T	C	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=63;PP=1874;SC=TGACAAAAGCTGGCTTCGTGT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=114;WE=55883626;WS=55883608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	55883761	rs7186875	A	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=216;SC=CCACCTATCAAGTCTTGGATG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=55883769;WS=55883751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	55890398	rs9937572	G	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1306;ReadPosRankSum=-1.155;SC=ATCTGGTCATGAGAAGGTAAA;SOR=0.682;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=73;WE=55890406;WS=55890388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,78:0.66:119
chr16	55895249	rs3859104	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=0.330;SC=CAAATAAATAACAGAGGGGTA;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=55895257;WS=55895239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr16	55905636	rs3859108	A	G	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=50;PP=1772;SC=CCTTGAGCATATGTTGATCTA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=101;WE=55905644;WS=55905626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	55909163	rs7194945	T	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=711;SC=CTGTGAACATTGACGGCGGCT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=55909171;WS=55909153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	56226638	rs149880726	G	GCA	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=3;PP=159;SC=TTTAATTCGTGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=56226646;WS=56226628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	56227909	rs76026714	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=441;ReadPosRankSum=-1.222;SC=GGGAAGGTGGGAGTGGGAGAC;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=25;WE=56227917;WS=56227899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr16	56227965	rs59779556	T	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=412;ReadPosRankSum=0.889;SC=AAATCTTGGATGTGTAACAGG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=29;WE=56227973;WS=56227955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr16	56228066	rs1190761	A	G	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=44;PP=1897;SC=TCTTATTTTTATTCGAGAGCT;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=85;WE=56228074;WS=56228056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	56362725	rs2241952	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=426;ReadPosRankSum=-1.312;SC=AGCGGGCGCATGGCCTGGAGC;SOR=0.539;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=35;WE=56362733;WS=56362715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,42:0.38:112
chr16	56368495	rs4784656	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=331;ReadPosRankSum=0.814;SC=CCCCACTCCCTATGGCCTGGA;SOR=0.197;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=56368509;WS=56368485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr16	56368501	rs4784657	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=588;ReadPosRankSum=0.403;SC=TCCCTATGGCCTGGAATGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=16;WE=56368509;WS=56368485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr16	56368689	rs1065375	C	T	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.706;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1378;ReadPosRankSum=2.518;SC=ACCAGCCCACCGAGCAGGACA;SOR=0.447;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=89;WE=56368697;WS=56368679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,107:0.63:170
chr16	56377748	rs1799917	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=943;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CAGCCCACAAAGAGATCTACA;SOR=0.391;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=176;TCF=98;TCR=78;TR=69;WE=56377756;WS=56377738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,84:0.38:219
chr16	56396486	rs4924	C	T	3849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=83;PP=2721;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GTGGGACGTACGCATGAGGCA;SOR=0.938;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=151;WE=56396494;WS=56396476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,160:0.65:246
chr16	56401294	rs2241957	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AAGACCACTGTCGGGACCACA;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=56401302;WS=56401284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	56435802	rs116895221	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=828;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CAGTTCCACACGCACACTAAA;SOR=0.786;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=56;WE=56435810;WS=56435792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr16	56436824	rs2440472	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=999;ReadPosRankSum=-0.260;SC=ACATTCTGACATACTCTGGGA;SOR=0.651;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=64;WE=56436832;WS=56436814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,68:0.65:105
chr16	56439014	rs117035805	A	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.288;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=995;ReadPosRankSum=-2.273;SC=TGGTTTAACCATGTTGTAATT;SOR=0.341;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=59;WE=56439022;WS=56439004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr16	56441862	rs2920704	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=844;ReadPosRankSum=0.742;SC=CAAGTCCTGCATCCAGTATCT;SOR=0.866;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=63;WE=56441870;WS=56441852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,75:0.62:120
chr16	56442066	rs4238787	C	T	443.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CATTCTTCTTCATGGAAGTGT;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=17;WE=56442074;WS=56442056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr16	56458908	rs140279056	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=314;ReadPosRankSum=1.310;SC=GGGCCCCTAGGCCCACCACGC;SOR=0.960;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=20;WE=56458916;WS=56458898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr16	56459332	.	T	TCGCTGCCGCTGC	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr16	56468561	rs8056687	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=0.168;SC=AGTTTTACAACAAACCCAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=12;WE=56468569;WS=56468551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr16	56485554	rs11076155	C	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=979;ReadPosRankSum=0.896;SC=CGGAGCCCGGCCCAGCCCGGG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=55;WE=56485562;WS=56485544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,65:0.61:106
chr16	56519423	rs8062526	T	C	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=933;ReadPosRankSum=0.869;SC=ATATGAATTATTGGATGCTAC;SOR=0.362;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=51;WE=56519431;WS=56519413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
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chr16	56535510	rs9929628	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=578;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CAGAGCCTCCAGCATATTATT;SOR=1.561;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=31;WE=56535518;WS=56535500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr16	56540190	rs4784675	G	C	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=47;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.648;SC=TCAGTTTACTGTCAAGTACGG;SOR=0.905;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=63;WE=56540198;WS=56540180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,70:0.62:112
chr16	56548501	rs4784677	C	T	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=87;PP=2930;SC=CTGGTTAATGCTGAGAAGAGA;SOR=1.488;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=42;TCR=87;TR=129;WE=56548509;WS=56548491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	56623191	rs7195310	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=17;PP=414;SC=AGTGCGCGCACAGCGGCGGCG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=56623199;WS=56623181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	56660906	rs708274	G	T	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1608;ReadPosRankSum=-1.728;SC=TCTTCTCCCAGATGTAAATAG;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=91;TCR=72;TR=95;WE=56660914;WS=56660896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,112:0.57:196
chr16	56667785	rs9936741	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=2.646;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,43:0.28:156
chr16	56673290	rs7190725	G	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=697;ReadPosRankSum=-1.512;SC=CAAGTCAGAGGCAGGAAACCA;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=46;WE=56673298;WS=56673280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,63:0.65:97
chr16	56673410	rs8049883	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.945;NF=13;NR=21;PP=526;ReadPosRankSum=0.179;SC=CCCAAGTTTCGTTCTTAAAAT;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=34;WE=56673418;WS=56673400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr16	56673436	rs58069153	A	AAG	1545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=1386;SC=AACTGAGGCCAAGAGTGCACC;SOR=2.012;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=29;WE=56673444;WS=56673426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	56673828	rs8052394	A	G	3398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.749;NF=91;NR=34;PP=2335;ReadPosRankSum=-2.126;SC=TGCATCTGCAAAGGGGCATCA;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=142;TCR=53;TR=125;WE=56673836;WS=56673818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,141:0.65:218
chr16	56683626	rs7189840	G	A	356.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=0.607;SC=CAAGAGAGCTGGTATGTGTGA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=56683634;WS=56683616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr16	56686002	rs2070838	G	C	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr16	56686005	rs4619400	T	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr16	56686030	rs964372	C	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=591;ReadPosRankSum=0.149;SC=TTTCCTCTTGCCCAAGCTCCT;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=35;WE=56686038;WS=56686020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr16	56686380	rs2013775	T	C	4213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=73;PP=2333;ReadPosRankSum=-1.885;SC=GGAGCTCTGATGGCTGGCCCT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=145;TCR=106;TR=174;WE=56686388;WS=56686370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,191:0.70:274
chr16	56686471	rs964374	G	T	5692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TGCCTTTTTCGCTTCCTTGCA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=115;TCR=174;TR=202;WE=56686479;WS=56686461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,249:0.68:364
chr16	56702000	rs904770	T	C	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=69;PP=2382;SC=CCAGCGGCTGTTTTTATAGTC;SOR=1.360;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=106;WE=56702008;WS=56701990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	56709728	rs8046181	GA	CG	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=14;NR=11;PP=876;SC=CTGTGCGGGGGAGGGAGAATG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=25;WE=56709737;WS=56709718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	56832302	rs9927884	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=0.982;SC=ATAGTAGATACCATTATGGTT;SOR=0.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=12;WE=56832310;WS=56832292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr16	56852822	rs1561139	G	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=481;SC=ATCAAATAGGGTAATAGAATT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=56852830;WS=56852812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	56855496	rs2118017	C	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=27;PP=953;SC=TCGCAGAGCTCGATGATAAGG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=56855504;WS=56855486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	56864398	rs1561140	C	T	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=40;PP=2148;SC=AGCAGTCAGCCTTTCCTTGTT;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=108;WE=56864406;WS=56864388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	56864618	rs4461062	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=663;SC=TGAGGTGGCACGCCCAGGGGC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=56864626;WS=56864608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	56868700	rs1347591	A	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=15;PP=608;SC=GGTGAGTTAAATGCATCCTTA;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=56868708;WS=56868690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	56870474	rs112276608	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=683;ReadPosRankSum=-1.236;SC=CTGTGCACCCGTCTCTCTCTT;SOR=0.832;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=90;TCR=40;TR=49;WE=56870482;WS=56870464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,57:0.39:148
chr16	56871469	rs145442551	TTTTATTGATTAC	T	1435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=2963;ReadPosRankSum=1.134;SC=TAGTTGTTCCTTTTATTGATT;SOR=0.534;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=18;WE=56871488;WS=56871459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,40:0.37:109
chr16	56872722	rs3764265	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=329;ReadPosRankSum=-1.612;SC=AGCAATCCTTCCGCCCCAGCC;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=20;WE=56872730;WS=56872712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr16	56873495	rs1138295	C	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=945;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GAGTGGCTGCCTTCAGAAATT;SOR=1.077;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=51;WE=56873503;WS=56873485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,67:0.64:104
chr16	56904587	rs1529927	C	G	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=72;PP=2965;SC=CGCATCATTGCCGTGGTCTCG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=141;WE=56904595;WS=56904577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	56921840	rs36049418	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr16	56926176	rs12443855	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TTCTTGTGACGGTGGTGCCTG;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=8;WE=56926184;WS=56926166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr16	56926828	rs2278489	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=223;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GATGCGCGGCTGCTGGCTCTG;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=14;WE=56926836;WS=56926818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr16	56933315	rs9922270	T	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=0;PP=1037;SC=GCATGAGAATTGCTTGAACCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=56933323;WS=56933305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	56966011	rs37025	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=668;ReadPosRankSum=1.082;SC=CCGCAGAGCCGGGCGCGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=52;WE=56966019;WS=56966001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,53:0.32:166
chr16	56966071	rs37024	T	G	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=808;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AGACGTGAACTGTCGTTGCAG;SOR=0.593;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=70;WE=56966079;WS=56966061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,84:0.33:258
chr16	56968889	rs1820787	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.236;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.151;NF=28;NR=6;PP=507;ReadPosRankSum=-1.192;SC=CTCCCACAGTGCTTGGATTAC;SOR=1.722;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=34;WE=56968897;WS=56968879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,37:0.34:108
chr16	56973335	rs2133783	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=0.150;SC=AATTTTATCCATGTTACCTGT;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=6;WE=56973343;WS=56973325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr16	56994394	rs61631085	GT	G	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.03;ReadPosRankSum=2.336;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr16	56994528	rs17231506	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=-3.026;SC=GGGGCACCCTCGGTCATTGCC;SOR=0.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=17;WE=56994536;WS=56994518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr16	56994894	rs4783961	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,33:0.25:133
chr16	56995038	rs4783962	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-1.162;SC=CAGCACTTGGTCATCTGGTCA;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=4;WE=56995046;WS=56995028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr16	56995236	rs1800775	C	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=210;ReadPosRankSum=0.363;SC=CTGTATACCCCCCCAGAGTTA;SOR=0.910;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=17;WE=56995244;WS=56995226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr16	56996158	rs3816117	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=2.361;SC=ATGGGCTGAGTGGAGCTGTCA;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=13;WE=56996166;WS=56996148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr16	56996211	rs711752	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=190;ReadPosRankSum=-2.687;SC=GTTCTTTGGTGAGAAGGTCCT;SOR=0.656;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=16;WE=56996219;WS=56996201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr16	56996288	rs708272	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-0.571;SC=ACTGGGGTTCGAGTTAGGGTT;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=22;WE=56996296;WS=56996278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr16	57003723	rs891141	G	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=914;SC=GTTTGCAGGGGTGGGGACCCC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=57003731;WS=57003713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	57003977	rs891142	T	C	4721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.32;SOR=1.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	57003980	rs891143	T	C	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	57004889	rs7205804	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=893;ReadPosRankSum=0.279;SC=CACACTAGGCGCTCCATGGAT;SOR=0.784;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=61;WE=57004897;WS=57004879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,70:0.35:198
chr16	57005301	rs1532625	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.808;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=391;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CTGGTGAGTGCGTTTCTGTCT;SOR=1.096;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=34;WE=57005309;WS=57005291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr16	57007353	rs5883	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.926;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=541;ReadPosRankSum=-2.299;SC=AGCGAGTCTTCCACTCGCTGG;SOR=0.371;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=37;WE=57007361;WS=57007343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr16	57007451	rs289714	G	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=25;PP=698;SC=GCTGCTAGGGGATCCAGATGG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=57007459;WS=57007441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	57015463	rs7195984	G	A	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=15;PP=1197;SC=CTATGAGACAGAAGCACTGGC;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=57015471;WS=57015453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	57015545	rs1800774	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.117;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=624;ReadPosRankSum=0.076;SC=ATTATCATCGCTTTTTTATTT;SOR=0.791;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=41;WE=57015553;WS=57015535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,53:0.38:141
chr16	57016092	rs5882	G	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=30;PP=1180;SC=CTCCGAGTCCGTCCAGAGCTT;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=62;WE=57016100;WS=57016082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	57017474	rs289741	G	A	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=40;PP=1792;SC=AGCCCAGCTCGCCCCTCTCTC;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=57017482;WS=57017464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	57017762	rs289742	C	G	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=284;SC=CCAAGAGCTGCGGAGTCCTTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=57017770;WS=57017752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	57056064	rs4784750	G	T	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1114;ReadPosRankSum=0.496;SC=CCCTTGCTGGGTATCTCCCTG;SOR=0.566;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=64;WE=57056072;WS=57056054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,72:0.61:119
chr16	57056295	rs149634155	AGGAGGCTGT	A	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.098;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.542;NF=0;NR=14;PP=2957;ReadPosRankSum=-2.467;SC=TCCAAGCTGGAGGAGGCTGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=57056311;WS=57056285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr16	57057619	rs1684575	G	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=-1.371;SC=GTGGACTGGAGTTCCCCAAAG;SOR=0.408;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=14;WE=57057627;WS=57057609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr16	57057654	rs1672865	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CTCAGCCCAGATCCCCAGACC;SOR=0.407;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=14;WE=57057662;WS=57057644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr16	57057679	rs12445252	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=700;ReadPosRankSum=0.770;SC=TCCTCCACCCCTTCCTTTGCT;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=39;WE=57057687;WS=57057669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr16	57062177	rs1684576	T	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.557;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chr16	57068048	rs4784753	C	T	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1073;ReadPosRankSum=0.174;SC=GCTGTTTGCCCTGAGCCCTTC;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=61;WE=57068056;WS=57068038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,77:0.62:125
chr16	57070004	rs11409789	C	CT	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.899;NF=4;NR=7;PP=247;ReadPosRankSum=-1.706;SC=TTGGGCCCCCCGTCTCAGCCT;SOR=0.660;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=11;WE=57070012;WS=57069988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,14:0.20:71
chr16	57070165	rs1651668	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr16	57071113	rs1684579	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr16	57071113	.	TA	CG	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=7;PP=112;QD=10.3417421789;SC=ACAGCCTCAGTAACAACGGGC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=16;WE=57071122;WS=57071103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,16:0.36:44
chr16	57071114	rs1672867	A	G	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=17;PP=407;SC=CAGCCTCAGTAACAACGGGCT;SOR=1.201;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=43;WE=57071122;WS=57071103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	57071232	rs1684580	C	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.700;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=1.961;SC=CCCATCCCCCCCCCCATCATG;SOR=0.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=34;WE=57071240;WS=57071222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,38:0.33:115
chr16	57071335	rs1651670	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.91;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr16	57071375	rs1672866	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr16	57073683	rs864750	G	C	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=614;ReadPosRankSum=0.420;SC=CCCCTCTTTTGTCTTCACAGC;SOR=0.956;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=43;WE=57073691;WS=57073673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,50:0.36:139
chr16	57074451	rs289726	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,15:0.22:68
chr16	57075379	rs35622257	G	GT	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=4.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.142;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr16	57075781	rs289727	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GGCCTGGCAGCCCAGGGCTGT;SOR=0.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=6;WE=57075789;WS=57075771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr16	57076115	rs158482	T	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=230;SC=CAATGTAAGTTCTCGGTGAAG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=57076123;WS=57076105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	57080528	rs289723	C	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,54:0.23:231
chr16	57095842	rs142124514	AAAAG	A	1033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.625;NF=7;NR=11;PP=724;ReadPosRankSum=0.597;SC=ATTTAAGAAAAAAAGAAAGAA;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=18;WE=57095853;WS=57095832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr16	57103579	rs289710	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=233;ReadPosRankSum=2.402;SC=TCCAAGCTCTGTGGTGGCTTA;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=15;WE=57103587;WS=57103569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr16	57103854	rs289711	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-1.140;SC=GTGGAGGGATTGGGGACAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=10;WE=57103862;WS=57103844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr16	57111825	rs27392	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,44:0.28:157
chr16	57111993	rs11432614	T	TG	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=696;ReadPosRankSum=1.311;SC=TCGGGAGCAGTGGGGGGGTCC;SOR=0.507;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=57112009;WS=57111983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr16	57112001	rs75220858	T	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=698;ReadPosRankSum=0.635;SC=AGTGGGGGGGTCCAGGCCCCC;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=13;WE=57112009;WS=57111983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr16	57113229	rs42221	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=395;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CTGCCTGCCTAGGGGACCAGT;SOR=0.698;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=30;WE=57113237;WS=57113219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,32:0.35:91
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chr16	57116287	rs27195	A	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=292;ReadPosRankSum=-1.197;SC=ACAGATGGCAAAGATGGGAGG;SOR=0.483;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=22;WE=57116295;WS=57116277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr16	57116514	rs27194	T	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.887;SC=ACTGGGATAATTGACTCAGGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=57116522;WS=57116504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	57144920	rs8053682	TG	AC	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=1637;ReadPosRankSum=0.223;SC=GGATCCAGGATGTCTGATGGA;SOR=0.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=34;WE=57144929;WS=57144910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr16	57155566	.	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=735;ReadPosRankSum=0.305;SC=GTGAGTGTCTCTTTCTTTTGC;SOR=0.457;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=46;WE=57155574;WS=57155556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr16	57157206	rs2305696	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,28:0.23:124
chr16	57159248	rs4784771	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=386;ReadPosRankSum=0.813;SC=ATCGGGGAGACGGGCACTGCT;SOR=0.621;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=32;WE=57159256;WS=57159238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,37:0.28:134
chr16	57159402	rs4784772	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=0.527;SC=GCAAAGTTAGACGGGAAGAAA;SOR=0.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=13;WE=57159410;WS=57159392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr16	57170936	rs72778715	G	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=546;ReadPosRankSum=-0.826;SC=TGTCTCACAAGGCCTATGCTA;SOR=0.280;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=31;WE=57170944;WS=57170926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr16	57171233	rs2305693	C	G	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=95;PP=2795;SC=CCAGGAAACACGCACGTCCTC;SOR=2.476;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=26;TCR=95;TR=121;WE=57171241;WS=57171223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	57197745	rs62037356	G	T	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=42;PP=2753;SC=TATAAACTCTGGCCTGGTAAT;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=57197753;WS=57197735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	57247000	.	G	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=951;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GCTTGGCCGAGAAACTAGCAG;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=52;WE=57247008;WS=57246990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr16	57255363	rs7206038	T	C	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=29;PP=794;SC=ATGGGAGCAGTGGCAGTTTGC;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=57255371;WS=57255353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	57261146	rs11643790	A	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=863;SC=CATCATCCAGAAAGCTTAGAA;SOR=2.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=57261154;WS=57261136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	57272961	rs3217258	ACT	A	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=384;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAAAAAAAAAACTCTCTAATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=57272970;WS=57272951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr16	57282501	.	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACTACCTGGAGTTTGAAGACA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=57282509;WS=57282491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	57392733	rs4359426	A	C	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=70;PP=2586;SC=CAGAGCATGGATCGCCTACAG;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=128;WE=57392741;WS=57392723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	57481305	rs178602	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=399;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CTCCACGCCTTGCGCCTCTCG;SOR=0.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=26;WE=57481313;WS=57481295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr16	57486613	rs686402	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AATGTCTTCCCAGCATGTGCT;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=57486621;WS=57486603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr16	57494178	rs223868	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=427;ReadPosRankSum=-2.391;SC=TCCAAAAACCTCACTTCTTTA;SOR=0.339;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=23;WE=57494186;WS=57494168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr16	57495026	rs223870	T	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=326;SC=TGAGATGCTGTTCCTGGGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=57495034;WS=57495016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	57496494	rs178601	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=303;ReadPosRankSum=0.569;SC=GACGCTCGGCAGTTCTGGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=21;WE=57496502;WS=57496484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr16	57499841	rs223839	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=156;ReadPosRankSum=0.497;SC=GCTAAACTCCATGTCTGCTTC;SOR=1.101;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=17;WE=57499849;WS=57499831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr16	57499902	rs4937	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=371;ReadPosRankSum=-0.991;SC=ATTCCTCAGTTCTTCATGATG;SOR=0.469;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=23;WE=57499910;WS=57499892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr16	57503213	rs601194	C	T	4346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=82;PP=2427;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CCGGTCAGTGCGGGAGAGCAT;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=94;TCR=109;TR=153;WE=57503221;WS=57503203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,191:0.75:256
chr16	57503773	rs223874	G	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=802;ReadPosRankSum=1.388;SC=GCTTTAGACCGTTTTTCCAGA;SOR=1.092;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=39;WE=57503781;WS=57503763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr16	57507777	rs11458669	T	TC	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CGTTCCCCCCTCCCCCCGTAC;SOR=0.760;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=9;WE=57507785;WS=57507767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
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chr16	57601792	rs9937918	C	T	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=917;ReadPosRankSum=0.159;SC=CCTTAACACGCATCCACATGA;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=62;WE=57601800;WS=57601782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr16	57609020	rs113488753	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=758;ReadPosRankSum=0.250;SC=GCTGGAGGGCGGCCTGGAGGA;SOR=1.264;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=45;WE=57609028;WS=57609010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr16	57625470	rs11646739	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=0.549;SC=TGATCATTCCCATAGCAACCA;SOR=0.093;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=57625478;WS=57625460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr16	57687314	rs2305307	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.193;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,20:0.25:81
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chr16	57689805	rs1801255	A	C	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=386;ReadPosRankSum=-1.214;SC=ATTCCAGCCAAGTCCTGGGTG;SOR=0.352;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=38;WE=57689813;WS=57689795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,45:0.41:109
chr16	57689883	rs1376041	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=0.598;SC=TGGTGCTCACTTTCCAGCACC;SOR=0.362;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=18;WE=57689891;WS=57689873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr16	57690606	rs11866912	C	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.887;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr16	57691265	rs2305309	C	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr16	57693247	rs60907901	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=-0.548;SC=AGTCTGGGAAGGCTTCCTGGA;SOR=0.336;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=13;WE=57693255;WS=57693237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr16	57697532	rs10852554	T	G	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=624;ReadPosRankSum=-2.258;SC=AAGCAGAGATTCGGCCTCGTC;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=38;WE=57697540;WS=57697522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr16	57697568	rs10852555	C	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=425;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CCCCCGAGCCCGGCCCAGCCC;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=23;WE=57697576;WS=57697558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr16	57702473	rs7205731	T	C	135.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=64;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CTCAGCACCTTCTCTAGCCCT;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=57702481;WS=57702463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr16	57708416	rs8051879	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=657;ReadPosRankSum=0.314;SC=TAAAGCCCTGCGCTCTCAGGC;SOR=0.509;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=45;WE=57708424;WS=57708406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr16	57708483	rs4784842	T	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=580;ReadPosRankSum=-1.600;SC=CTGAAAAGGCTTCCATTCCCA;SOR=0.619;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=37;WE=57708491;WS=57708473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr16	57708642	rs4784003	T	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=1.545;SC=ACACAAGTAATCCTAGCACTT;SOR=0.569;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=9;WE=57708650;WS=57708632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr16	57710093	rs12596635	C	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=296;ReadPosRankSum=-1.303;SC=ACCCTCCCCCCATCCCTGGCC;SOR=0.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=21;WE=57710101;WS=57710083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr16	57713250	rs4238795	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=724;ReadPosRankSum=1.194;SC=GGCCTGGCAGCCACTGCAGGG;SOR=0.341;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=139;TCF=34;TCR=105;TR=49;WE=57713258;WS=57713240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,59:0.38:154
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chr16	57722328	rs12444859	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CAGTCTCCTCCTCTACTGCAA;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=19;WE=57722336;WS=57722318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
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chr16	57762401	rs2923147	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=-1.131;SC=GAAACTAACATGCTGGCAGGC;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=27;WE=57762409;WS=57762391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
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chr16	57771337	rs58845971	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=0.740;SC=ACCATTATGTAAATCATGACT;SOR=0.346;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=16;WE=57771345;WS=57771327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr16	57775537	rs61620199	C	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=25;PP=1277;ReadPosRankSum=2.098;SC=GCAGGGTCACCCCTCCTTCAC;SOR=0.917;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=75;WE=57775545;WS=57775527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,86:0.64:135
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chr16	57778550	rs2967153	C	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=39;PP=1240;SC=AGCACTAACCCGGCAGTGTGG;SOR=2.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=57778566;WS=57778540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	57786517	rs2965797	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.219;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=627;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CCGTCAGGTACGCAGGCTGTG;SOR=0.900;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=48;WE=57786525;WS=57786507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,51:0.35:146
chr16	57786711	rs2965798	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=256;ReadPosRankSum=0.629;SC=TCAACCCAGACGGCTGCTGCC;SOR=1.503;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=21;WE=57786719;WS=57786701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr16	57790920	rs6994	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=285;ReadPosRankSum=-1.066;SC=CCCACTCCTGTTCCTTGTGCA;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=16;WE=57790928;WS=57790910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr16	57793086	rs141124624	G	A	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1170;ReadPosRankSum=0.715;SC=AGTGACAGGCGTCTCACTGGT;SOR=0.889;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=236;TCF=130;TCR=106;TR=88;WE=57793094;WS=57793076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,91:0.34:266
chr16	57794888	rs2965799	A	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,61:0.28:215
chr16	57795394	rs2967172	G	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=701;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GCCCACTGCCGTCTGGGCACA;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=98;TCR=120;TR=62;WE=57795402;WS=57795384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,84:0.31:272
chr16	57797913	rs11649013	C	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=524;ReadPosRankSum=1.122;SC=AGGGCTAACACAGATAACTAC;SOR=0.420;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=137;TCF=100;TCR=37;TR=45;WE=57797921;WS=57797903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,53:0.34:156
chr16	57797949	rs58535973	C	T	3655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=47;PP=2317;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GTTGTGAGGACCAAATGAGGC;SOR=0.917;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=207;TCF=134;TCR=73;TR=140;WE=57797957;WS=57797939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,163:0.66:246
chr16	57803911	rs3803590	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=318;ReadPosRankSum=1.558;SC=GGTGCGGGAGAGAGAGGGGCA;SOR=0.550;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=22;WE=57803919;WS=57803901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr16	57805048	rs2967166	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=0.238;SC=CTTATGGGCTAGCCCTGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=57805056;WS=57805038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr16	57805078	rs2965790	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=1.447;SC=GGGCCTTGGGCTGAGGCACAG;SOR=0.155;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=57805086;WS=57805068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr16	57805176	rs2967165	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,24:0.23:104
chr16	57806030	rs2965789	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr16	57822440	rs74022043	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=398;ReadPosRankSum=0.548;SC=TCCCTCCTGCGCTGGCTTCAC;SOR=0.968;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=23;WE=57822448;WS=57822430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr16	57822734	rs74022044	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CAGGGCCCAGCGGGTCCAGTC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=31;WE=57822742;WS=57822724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr16	57837462	rs8043981	C	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CGGGCAACTCCAGGTGGGTTC;SOR=2.066;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=57837470;WS=57837452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr16	57850141	rs1477404	C	G	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.998;SC=AACCGAGGCCCGGAAAGTGTC;SOR=0.513;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=78;WE=57850149;WS=57850131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,86:0.65:132
chr16	57850806	rs41484850	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.723;SC=ACCTTGAACCATAATACTAAG;SOR=0.678;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=10;WE=57850814;WS=57850796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr16	57918035	rs13338071	T	C	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=26;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.653;SC=ACACACCTGCTGGAACTGCGC;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=82;WE=57918043;WS=57918025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr16	57921752	rs11076207	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=-1.433;SC=GTTCCCAACCACATTACCTGT;SOR=0.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=23;WE=57921760;WS=57921742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr16	57937856	rs413562	G	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=162;ReadPosRankSum=-1.184;SC=AGGTCTGTCCGGCGGTGGCGG;SOR=1.593;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=15;WE=57937864;WS=57937846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr16	57937895	rs437920	G	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=114;ReadPosRankSum=2.332;SC=TCTGGGGGAAGGGTTATGGGA;SOR=0.477;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=9;WE=57937903;WS=57937885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr16	57946973	rs434961	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=42;PP=1174;SC=ACGGGCGCCGAGACTCAGGGC;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=57946981;WS=57946963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	57949251	rs483053	G	A	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=39;PP=1529;SC=TGAAATCCCAGTGGGACACCA;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=57949259;WS=57949241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	57950057	rs376270	G	A	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=36;PP=2109;SC=ACTTCAGGTAGTTATTTCGCA;SOR=1.225;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=102;WE=57950065;WS=57950047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	57950178	rs440565	G	C	3980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=72;PP=2476;SC=ACCCCACCCTGAAACGAGCAT;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=57950186;WS=57950168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	57951421	rs691490	G	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.77;NF=2;NR=12;PP=297;SC=CATCAGCCAGGCAAGGCTCTT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=57951429;WS=57951411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	57952870	rs489106	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=618;SC=TGAAAGGTATAAAAGATCATG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=23;WE=57952878;WS=57952860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	57954268	rs166000	A	G	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=26;PP=1560;SC=ATCCAGGTAGACCCCCTCCAG;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=57954276;WS=57954258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	57957138	rs247065	G	C	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=2;PP=83;SC=CACCCTCCCCGCAGTCTTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=57957146;WS=57957128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	57973989	rs2303779	G	A	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=32;PP=2284;SC=CCAAGAGGGGGCCTCGCAGGA;SOR=1.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=109;WE=57973997;WS=57973979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	57974240	rs2303778	G	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=51;PP=1845;SC=GACCCGGGGCGGGGTGGGGAG;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=57974248;WS=57974230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	57984483	rs152143	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=646;SC=TGGGATGTGCGGGAGAGTGGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=57984491;WS=57984473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	57991123	rs34759686	GC	G	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=0.089;SC=GACCCTAACTGCCCCCCTGTG;SOR=0.602;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=9;WE=57991131;WS=57991113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr16	57991317	rs503686	C	T	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=1081;SC=AATCCTGCCACGGCCTCTTCA;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=57991325;WS=57991307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	57992119	rs399634	T	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-1.394;SC=CCTCCCCCGCTGACTGTGAAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=57992127;WS=57992117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr16	57994724	rs2288485	C	T	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1039;ReadPosRankSum=0.537;SC=AACTCCCTGCCTCTCCCTTCC;SOR=0.794;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=66;WE=57994732;WS=57994714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,71:0.72:98
chr16	57996932	rs17821448	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=549;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CCTTCTCTACGCCCTTCATGA;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=40;WE=57996940;WS=57996922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,44:0.37:119
chr16	57996960	rs13336595	C	T	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=53;PP=1801;SC=CAGTACCCTGCGGCTGGGACT;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=95;WE=57996968;WS=57996950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	57998345	rs3859043	C	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=246;SC=GGGGAGAATGCGGGCCCCCCT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=57998353;WS=57998335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	58019065	rs35768173	TG	T	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=329;ReadPosRankSum=0.702;SC=GGGCTTGTCCTGGGGGGGGGC;SOR=0.883;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=10;WE=58019078;WS=58019055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr16	58019070	rs2304485	G	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=308;ReadPosRankSum=1.704;SC=TGTCCTGGGGGGGGGCGGATG;SOR=0.735;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=12;WE=58019078;WS=58019055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr16	58019253	rs2304486	G	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
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chr16	58021395	rs2241771	A	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=333;ReadPosRankSum=1.060;SC=CTGGCCAGACAGAGGACTTAT;SOR=1.330;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=94;TCF=18;TCR=76;TR=27;WE=58021403;WS=58021385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
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chr16	58072153	rs2241774	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=777;ReadPosRankSum=1.011;SC=GCTCACCCCTCTGTGTCCATG;SOR=0.564;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=48;WE=58072161;WS=58072143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr16	58076422	rs2118018	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=557;ReadPosRankSum=-0.144;SC=ATGAGGACACAGCAGCAAGGC;SOR=0.157;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=28;WE=58076430;WS=58076412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr16	58079165	rs3743563	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CAACAAGGACGGGGGCAGCCG;SOR=0.963;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=22;WE=58079173;WS=58079155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr16	58199670	rs2242444	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=517;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GAATCCTTATCTACTAGGGCT;SOR=0.493;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=27;WE=58199678;WS=58199660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr16	58201759	rs12920269	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=304;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TATGCCTTAGAACAAGGCCAC;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=19;WE=58201767;WS=58201749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr16	58292450	.	G	C	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.235;SC=ACAGAGCTTAGAAAGGGAAAA;SOR=1.031;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=74;WE=58292458;WS=58292440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,95:0.59:162
chr16	58296542	rs9923694	T	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.90;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	58296545	rs3815802	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	58313566	rs6499945	T	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.98;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	58313578	rs71155257	CT	C	356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.43;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	58318604	rs3815803	T	C	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=73;PP=2607;SC=CTCAGGACACTCATCGTCATG;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=49;TCR=73;TR=122;WE=58318612;WS=58318594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	58318721	rs11313996	AT	A	297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=12;PP=176;SC=GAGAGTGAGAATTTTTTTTTT;SOR=3.126;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=58318730;WS=58318711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	58320211	rs4784916	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=439;SC=AGCTCATATTTCCTGTGTTAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=58320219;WS=58320201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	58327646	rs2288012	A	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=14;PP=1071;SC=TGGTGGAAGAATAGAGAAGGC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=58327654;WS=58327636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	58438652	rs11649008	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=579;ReadPosRankSum=-0.972;SC=AGAACACAGAATGGCTCCTCA;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=31;WE=58438660;WS=58438642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr16	58509708	rs148835048	C	CT	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.746;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CATGTCTCCCCTTTTTTTTTT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=58509716;WS=58509698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	58533932	rs982697	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AGCAGCCAATATGGGAGCTGG;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=58533940;WS=58533922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	58538662	rs9928398	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=1.435;SC=TCCCTGCTCTCGCTTCTCCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=58538670;WS=58538652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr16	58545426	rs42945	A	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=1010;ReadPosRankSum=1.685;SC=GCACCCACTCAGAGAGCAGCG;SOR=0.983;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=65;WE=58545434;WS=58545416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,76:0.68:112
chr16	58549932	rs4784046	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=486;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CGGAGAGCTGTTGTTCGTGGT;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=34;WE=58549940;WS=58549922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr16	58550052	.	G	GCGGGGCGGTT	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=0.431;QD=28.58;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr16	58550300	rs77328516	A	AAC	4577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=49;PP=2934;ReadPosRankSum=1.327;SC=CTGCTGCAAGAAGTTTCCCCG;SOR=0.579;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=66;WE=58550308;WS=58550290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,115:0.60:191
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chr16	58573946	rs246195	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.631;SC=TAGAGGTCTACTAGTATGTTT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=58573954;WS=58573936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr16	58576498	.	T	G	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=59.44;NF=0;NR=9;PP=101;QD=15.085690283;SC=GGTGGGGGGGTGGGGGGAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=9;WE=58576506;WS=58576488;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,9:0.38:24
chr16	58577421	rs41260	C	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=601;ReadPosRankSum=0.006;SC=TAAGTGGTAACGCCCAGTGCC;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=38;WE=58577429;WS=58577411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr16	58579158	rs42947	A	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=-1.010;SC=CAAACTCTACAACCTAGGAAT;SOR=0.830;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=15;WE=58579166;WS=58579148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr16	58579274	rs246258	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CTGTTGGATTCAGAGTAATGT;SOR=0.771;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=74;WE=58579282;WS=58579264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr16	58580519	rs246197	A	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1933;ReadPosRankSum=1.438;SC=CTTCACTGTAAGTTTTAATAA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=51;WE=58580538;WS=58580509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr16	58580530	rs173475	T	C	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=1933;ReadPosRankSum=1.220;SC=GTTTTAATAATGTGAAGGCAA;SOR=0.749;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=59;WE=58580538;WS=58580509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,65:0.59:110
chr16	58614733	rs72790275	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=152;ReadPosRankSum=0.992;SC=AATGTTTTCACTAGGCTATTG;SOR=0.409;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=14;WE=58614741;WS=58614723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr16	58616984	rs17854029	T	C	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=753;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CATCTGTTAATCCTGAATGAG;SOR=0.595;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=97;TCR=106;TR=66;WE=58616992;WS=58616974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,77:0.33:231
chr16	58622596	rs34716647	TC	T	491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=440;ReadPosRankSum=1.786;SC=CCAGCTACAATCACTTCCGGA;SOR=0.219;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=13;WE=58622604;WS=58622586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr16	58743454	rs30842	A	C	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1211;ReadPosRankSum=-1.253;SC=GTCAGCCATGACTTTCACTTC;SOR=0.775;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=69;WE=58743462;WS=58743444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,81:0.70:116
chr16	58750604	rs1058192	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.739;NF=25;NR=5;PP=659;ReadPosRankSum=0.937;SC=ATTGGCAGAGGCAAACATTAA;SOR=0.163;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=30;WE=58750612;WS=58750594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr16	58752717	.	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=721;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TTGAGAAGCAGTATTGACTCA;SOR=1.261;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=32;WE=58752725;WS=58752707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr16	58757668	rs14221	A	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=972;ReadPosRankSum=1.230;SC=CGCTAGGCAGAACGTAAGGCT;SOR=0.626;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=52;WE=58757676;WS=58757658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr16	58757683	rs257636	A	G	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=739;ReadPosRankSum=-0.479;SC=AAGGCTTTCCATTATCATCCC;SOR=0.477;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=50;WE=58757691;WS=58757673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr16	58767916	rs3217426	AGT	A	1572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=1157;ReadPosRankSum=0.009;SC=GTGGCAGAAAAGTGTGTGTGT;SOR=0.495;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=27;WE=58767925;WS=58767906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr16	60393404	rs2407146	T	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.667;NF=11;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-1.210;SC=ATCCCACCTGTCTGGAAAAGA;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=27;WE=60393412;WS=60393394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr16	61687701	rs16963768	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=615;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ATGGCGGGGCCGTGGGATCAT;SOR=0.838;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=45;WE=61687709;WS=61687691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr16	61689269	rs8054635	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TCCTCTTCCCCAACGGAATGC;SOR=0.191;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=10;WE=61689277;WS=61689259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
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chr16	61761293	rs140846478	T	TA	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.730;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=1.354;SC=TTGACTGCTTTAAAAAAAAGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=61761301;WS=61761283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr16	64982471	rs60503515	AAAGAG	A	1762.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=1051;SC=AATGTCTGAGAAAGAGTATTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=64982485;WS=64982461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	64982477	rs57831187	T	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=545;SC=TGAGAAAGAGTATTGGTCCTA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=28;WE=64982485;WS=64982461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	65005395	rs3785315	T	C	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1206;SC=ATTATAAAGATTAGTGAAAAT;SOR=4.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=49;WE=65005403;WS=65005385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	65005462	rs12597529	G	A	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=49;PP=2813;SC=CTCTGAATGCGTAGGAACCTT;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=141;WE=65005470;WS=65005452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	65005934	rs141063325	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GACCCTAATGGCCACTGGGAC;SOR=0.906;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=22;WE=65005942;WS=65005924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr16	65016087	rs35213	A	C	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=23;PP=1209;SC=TCTTCTACTGAGATCTTGACG;SOR=1.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=65016095;WS=65016077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	65016285	rs35212	C	A	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=32;PP=920;SC=TTTATAGGGACGAGTGAATAT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=65016293;WS=65016275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	65022234	rs1130821	C	T	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=55;PP=1636;ReadPosRankSum=1.622;SC=CTGACACAGACATCTGGTATA;SOR=1.454;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=82;WE=65022242;WS=65022224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,102:0.98:104
chr16	65025658	rs35196	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=11;PP=718;SC=GAAAGCCAAGTCCACCTACTT;SOR=1.556;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=36;WE=65025666;WS=65025648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	65025849	rs35194	A	G	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=33;PP=1186;SC=CTGGACAGGTAAGCAGGCAAC;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=65025857;WS=65025839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	65032846	rs7190608	G	A	1145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=938;SC=AATCTGCTGCGCACACACACA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=65032854;WS=65032836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	65038862	.	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=1.508;SC=CTCCCGGACGCGTCACGCAGA;SOR=1.123;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=13;WE=65038870;WS=65038852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr16	65839621	rs139083721	CTCT	C	1756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=1399;SC=CTTCCTGCTGCTCTTCTTCTT;SOR=1.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=33;WE=65839631;WS=65839611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	66420885	rs1130844	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=621;ReadPosRankSum=0.025;SC=AGGACACTGGCGAAAACCTGG;SOR=0.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=48;WE=66420893;WS=66420875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
chr16	66424235	rs2304527	T	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=334;ReadPosRankSum=-0.034;SC=TATGTTAGAATAGCTGAAAGA;SOR=0.384;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=23;WE=66424243;WS=66424225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr16	66432303	rs113303884	GACCACCCC	G	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=573;ReadPosRankSum=-1.774;SC=CTAAACCTCAGACCACCCCAC;SOR=0.743;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=5;WE=66432318;WS=66432293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr16	66432423	rs1049970	TC	CT	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.532;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=1276;ReadPosRankSum=0.186;SC=TTCAAATTCATCTTGAATACT;SOR=0.299;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=38;WE=66432432;WS=66432413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr16	66434571	rs6499082	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=1.335;SC=AGCAGCCCAGGGAGCACGCAG;SOR=0.247;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=9;WE=66434579;WS=66434561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr16	66437131	rs1063438	A	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=104;ReadPosRankSum=1.642;SC=GGCCAGTCAGACGCCAGGCAC;SOR=0.746;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=9;WE=66437139;WS=66437121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr16	66657495	rs12446021	G	A	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=81;PP=2692;SC=TAAGACCCACGATACCCAACC;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=133;WE=66657503;WS=66657485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	66886500	rs148837228	GAAAAGAAAAGAA	G	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.000;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr16	66919570	rs369136991	C	T	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1437;ReadPosRankSum=0.405;SC=GGAAAGCCAGCGGGCTCCACG;SOR=0.923;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=95;WE=66919578;WS=66919560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,108:0.61:177
chr16	67197776	rs5817616	C	CG	790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=653;SC=TGAGAGGGAACGGGGGGGGTG;SOR=2.910;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=27;WE=67197784;WS=67197766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	67221050	rs9924876	A	G	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=56;PP=2203;SC=GCCTGGAGATAGGTGGCCTGG;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=105;WE=67221058;WS=67221040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	67233266	rs12923138	A	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=0.619;SC=GATTGCCATCAAGATGCGTGA;SOR=0.860;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=39;WE=67233274;WS=67233256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,39:0.33:119
chr16	67298822	.	G	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GAACCACTGGGACTGACATAA;SOR=0.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=20;WE=67298830;WS=67298812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr16	67315128	rs78476762	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.376;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.022;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr16	67316600	rs7200919	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=745;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TGAGCCCCCAGTCCATAGCAG;SOR=0.878;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=194;TCF=90;TCR=104;TR=59;WE=67316608;WS=67316590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,65:0.29:223
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chr16	67964203	rs1134760	T	C	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=888;ReadPosRankSum=1.130;SC=CTGCTGCAGATGTGCTGGTGT;SOR=0.402;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=59;WE=67964211;WS=67964193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,72:0.69:105
chr16	67969930	rs20549	A	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CCCGTAGATAACGCGTGTAGC;SOR=0.824;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=64;WE=67969938;WS=67969920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,71:0.62:115
chr16	67985706	rs2292318	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=253;ReadPosRankSum=0.816;SC=AAGAGCAAGACGACGGGAGGG;SOR=0.257;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=19;WE=67985714;WS=67985696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr16	67997920	rs3785100	T	C	2422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=63;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CACAGCACCTTCGGCTGCCAT;SOR=0.596;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=142;TCF=44;TCR=98;TR=95;WE=67997928;WS=67997910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,105:0.62:168
chr16	68010074	.	C	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,45:0.24:185
chr16	68024995	rs255052	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=738;ReadPosRankSum=1.344;SC=TGTTTGGGGTGGAGTGTGAAC;SOR=0.244;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=37;WE=68025003;WS=68024985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr16	68025801	rs255051	G	C	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=58;PP=2133;SC=GTAGAAGGTAGGTAAGATGGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=118;WE=68025809;WS=68025791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	68025998	rs144339907	A	C	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CCAGCTCAGAATAGGAGGCAC;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=76;WE=68026006;WS=68025988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,82:0.64:128
chr16	68055495	rs13816	G	C	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.494;SC=AGGTTGCTTGGGGCAAAGGCT;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=103;TCR=59;TR=100;WE=68055503;WS=68055485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,120:0.62:192
chr16	68057096	rs237831	T	C	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=56;PP=1936;SC=ACCGGCCGCGTTAGAGCCATG;SOR=1.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=68057104;WS=68057086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	68088485	rs11555011	A	G	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.320;SC=AGGGGACTTCAGACGCAGAGC;SOR=0.924;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=66;WE=68088493;WS=68088475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,94:0.71:132
chr16	68090212	rs150676760	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=361;ReadPosRankSum=1.205;SC=CTTTAATTTCACCTTCTTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=24;WE=68090220;WS=68090202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr16	68094878	rs138077233	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=1.176;SC=AAGTGAGTGCCGGGGTGACGC;SOR=0.541;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=10;WE=68094886;WS=68094868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr16	68100461	rs2285912	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=1060;ReadPosRankSum=1.046;SC=TGTGGTCCTCCTCCTCAGCTA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=59;WE=68100469;WS=68100451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr16	68119555	rs3743735	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=445;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CGCCGCCTGAGGAGGAGCTGC;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=28;WE=68119563;WS=68119545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr16	68160289	rs3815173	T	G	463.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.7442;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=369;ReadPosRankSum=-1.280;SC=AAAGAAGCCATTTGAATCATT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=18;WE=68160297;WS=68160288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr16	68172416	rs12596883	A	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=285;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TTGCTCAGGAATCCAAGATAC;SOR=0.420;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=17;WE=68172424;WS=68172406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr16	68224582	rs7199588	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=312;ReadPosRankSum=1.334;SC=CCTCAGCTTACGCTGTAGTTG;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=68224590;WS=68224572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr16	68286427	rs17688076	C	A	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=42;PP=1954;ReadPosRankSum=0.637;SC=AACCCTCTTCCCACAGGAGAT;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=124;TCR=66;TR=122;WE=68286435;WS=68286417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,137:0.65:211
chr16	68286578	rs11368218	GA	G	2815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.957;NF=4;NR=63;PP=2411;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CACAGTTCTAGAAAACTAATA;SOR=0.472;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=104;TCF=9;TCR=95;TR=67;WE=68286586;WS=68286568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,99:0.69:143
chr16	68288983	rs2290700	T	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=169;ReadPosRankSum=-1.083;SC=TGGGATGGGGTTTCTGCCGGA;SOR=1.506;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=7;WE=68288991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr16	68289313	rs8062085	C	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=638;ReadPosRankSum=0.052;SC=CCCTCCCTGACGTCTCGGGAG;SOR=0.322;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=33;WE=68289321;WS=68289303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr16	68293320	rs3743739	T	C	5042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GCCTCTATGGTACTGGCGTCC;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=271;TCF=132;TCR=139;TR=176;WE=68293328;WS=68293310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,208:0.64:327
chr16	68293617	rs11550043	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGCCTCTGGGGCTGTCATGGC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=68293625;WS=68293607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr16	68335392	rs11350	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=22;PP=662;SC=GAAAGGTCTGTTTTTGTTCCC;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=68335400;WS=68335382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	68344363	rs8063446	A	C	4782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=83;PP=2711;SC=TGGCCGCTCGAGGTGGTCCCC;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=153;WE=68344371;WS=68344353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	68356187	rs7203220	A	C	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=43;SC=ACTGCAGCCTAGACTTCTTGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=68356195;WS=68356177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	68361974	rs73613962	T	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=312;SC=ATATTTATTATTGTGCCTAAT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=68361982;WS=68361964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	68363181	rs1111571	G	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=34;PP=995;SC=TAGCATAGAAGTGGGACCTCT;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=68363189;WS=68363171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	68379860	rs8058517	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=133;SC=AGTGCCCATTCGTGTGTACCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=68379868;WS=68379850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	68381516	rs7190134	G	A	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=22;PP=817;SC=ACAACTAATAGCGTGGTGTTC;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=68381524;WS=68381506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	68387341	rs79543001	C	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=21;PP=1073;SC=CTTGCTGCCACGCTTCCCTGT;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=49;WE=68387349;WS=68387331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	68387457	rs61746794	C	T	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=46;PP=1434;SC=ACATCATGGACGACATGATTA;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=68387465;WS=68387447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	68387496	rs1868159	A	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=41;PP=1241;SC=TCTGCATAGTACCCCCGACCT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=68387504;WS=68387486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	68391189	rs7192234	C	G	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=49;PP=1443;SC=GGCTTTCTAGCGGGGAAGGCT;SOR=3.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=68391197;WS=68391179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	68395061	rs2279540	T	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=13;PP=529;SC=GGCCCAGGGATGGGCTGCAGC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=68395069;WS=68395051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	68395675	rs56899435	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=30;PP=920;SC=GTCCACACATGCAGGAGGCAG;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=68395683;WS=68395665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	68397530	rs3826167	T	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=642;SC=GGGGGTGGCCTCTGTGGGTGG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=68397538;WS=68397520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	68397775	rs3743743	C	T	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=37;PP=1525;SC=GTCGTCTGTGCGGGGAGGGAG;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=68397783;WS=68397765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	68397909	rs1465470	A	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=490;SC=GTGGGATCTCAGTCCCATTCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=68397917;WS=68397899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	68398862	rs73615919	C	T	6351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=95;PP=2965;SC=CAGACCCCAGCTAGGCCCCAG;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=184;WE=68398870;WS=68398852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr16	68573945	rs1182968	C	T	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=734;SC=GTGGTGCGATCTTGTGGGAGG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=68573953;WS=68573935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	68591156	rs1728784	T	A	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=13;PP=825;SC=GGCTCAAGCGTTCTGCCGGCC;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=68591164;WS=68591146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	68591230	rs1728785	A	C	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=40;PP=1625;SC=GCATTTTATTATTAATACGGC;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=68591238;WS=68591220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	68591350	rs1645929	A	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=572;SC=GATCTCTAGGATACATAGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=68591358;WS=68591340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	68598007	rs1177648	A	G	8919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=125;PP=2965;SC=CTCTCACTCAAGATGAAAGCA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=137;TCR=125;TR=262;WE=68598015;WS=68597997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr16	68598744	.	A	AT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=61.75;NF=0;NR=3;PP=49;QD=18.3333333333;SC=CAGTAGACAGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=68598752;WS=68598734;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,3:0.30:10
chr16	68679770	rs2236393	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=9;PP=332;SC=TCAGTTCCCGGGGAGGCGCAG;SOR=1.445;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=68679778;WS=68679760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	68842578	rs200673941	C	T	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1445;ReadPosRankSum=0.173;SC=AATTCTTTTTCTTTCATTTTG;SOR=1.055;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=76;WE=68842586;WS=68842568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,101:0.67:150
chr16	68847584	rs8056633	T	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=212;ReadPosRankSum=0.069;SC=CAAGAAACTGTGCTGTGTGTG;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=11;WE=68847592;WS=68847574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	68857289	rs2276330	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=286;ReadPosRankSum=0.487;SC=TTTCTTTTTATTGCTTTCTCC;SOR=1.536;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=17;WE=68857297;WS=68857279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr16	68857441	rs1801552	T	C	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=31;PP=1447;SC=AAGGGGCCGCTGGCGTCTGTA;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=71;WE=68857449;WS=68857431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	68893781	rs17690624	C	T	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=17;PP=1256;SC=TTTTCTTCTTCAAAAGGCTCG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=68893789;WS=68893771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	68893953	rs4597312	T	C	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=89;PP=2965;SC=CACAAAACTCTGTGGATGTCA;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=85;TCR=89;TR=174;WE=68893961;WS=68893943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr16	69143481	rs2232227	T	G	7673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=125;PP=2965;SC=TTCAGAGCCTTTTTGCCTTCC;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=106;TCR=125;TR=231;WE=69143489;WS=69143471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	69155309	rs118093016	C	A	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=52;PP=1991;SC=TCATTTCAAGCCAAATTTTAA;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=69155317;WS=69155299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	69166366	.	G	GC	335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=132;SC=AGCCTCCCGTGCCCCCCGCCC;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=69166374;WS=69166356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	69201050	rs61185783	C	T	6333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=119;PP=2965;SC=CATCCGGAGGCGCACAGCTCA;SOR=1.111;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=72;TCR=119;TR=191;WE=69201058;WS=69201040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr16	69221510	rs10650	C	G	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=72;PP=2157;SC=AGATCTTCCCCGGGCTGGCTG;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=125;WE=69221518;WS=69221500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	69303943	rs17624424	G	A	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1057;SC=ATCAGGTTGGGAAAACAAAAT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=69303951;WS=69303933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	69317807	rs12325242	G	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=381;SC=CTGTATTTCAGAGACTATAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=69317815;WS=69317797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	69350035	rs3817030	A	C	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=36;PP=1456;SC=GAGTCACACGAGGGGTCCTCA;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=69350043;WS=69350025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	69350069	rs12708896	C	G	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=26;PP=1557;SC=CAGAGGGGAGCGGAGGAGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=69350077;WS=69350059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	69354682	rs17702834	C	T	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=72;PP=2300;SC=GGTGAGTCTTCCCCAGGAGAA;SOR=1.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=111;WE=69354690;WS=69354672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	69354963	rs1127231	A	G	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=47;PP=2252;SC=GGTTTGAAAAACGAATTTATA;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=69354971;WS=69354953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	69355229	rs72795270	G	T	177.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=10;PP=253;SC=GGGATGTTCGGTTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=69355237;WS=69355219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	69356695	rs11075714	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=297;SC=TCTCCAGGCCAGGCATGGTAG;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=69356703;WS=69356685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	69362777	rs1055401	T	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	69362777	.	TTC	ATA	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=108;QD=40.3669687156;SC=TTCTGACATCTTCCTCCAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=4;WE=69362787;WS=69362768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,4:0.20:20
chr16	69362779	rs1055399	C	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	69363734	rs2242414	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr16	69372927	rs3759979	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=691;SC=ACAGTACCTATCTCGAAGGCT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=69372935;WS=69372920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	69373414	rs11542583	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=17;PP=453;SC=GAGCCGCTGCTGTGGCCGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=69373422;WS=69373404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	69373894	rs11643686	T	A	4804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=59;PP=2965;SC=TCTCCAGTCCTCTTTTTGCCC;SOR=1.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=150;WE=69373902;WS=69373884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	69375658	rs8053850	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=33;ReadPosRankSum=1.593;SC=CAACACTCTGGCCTCTTCAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=5;WE=69375666;WS=69375648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr16	69395434	rs251796	A	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=25;PP=875;SC=AAACAAATTCACCCTGGATTG;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=69395442;WS=69395424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	69401182	rs62057891	T	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=0.397;SC=TTTTGAAGTTTGAAGCTTCAA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=69401190;WS=69401172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr16	69458779	rs1619397	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=286;ReadPosRankSum=-0.213;SC=TGGGAGGTGGGAGGCCTCTGA;SOR=0.871;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=23;WE=69458787;WS=69458769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr16	69599803	rs8048032	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=7;PP=199;SC=GGGGGCCGCCACGGCTCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=69599811;WS=69599793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	69602279	.	GTATATATATA	G	253	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=4;NR=0;PP=253;QD=64.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=69602296;WS=69602269;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	69704122	rs72523664	C	CTG	1326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=879;SC=TAATAAATCACTTTTTATTTC;SOR=1.044;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=69704130;WS=69704112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	69704204	rs3217435	CT	C	318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=203;SC=AAAATTTAAGCTTTTTTTATA;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=69704212;WS=69704194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	69711311	rs3743673	A	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=598;SC=TATGAAGATGACTAGCCAACC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=69711319;WS=69711301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	69745145	rs1800566	G	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=695;SC=GTCAGTTGAGGTTCTAAGACT;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=69745153;WS=69745135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	69752464	rs689452	C	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=137;SC=AAAGCACACACGGAAAACCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=69752472;WS=69752454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	69776377	rs1075935	T	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.197;NF=34;NR=31;PP=952;ReadPosRankSum=1.282;SC=CCCGGCGATGTAGTCAGGGGC;SOR=0.409;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=148;TCF=85;TCR=63;TR=65;WE=69776385;WS=69776367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr16	69873992	rs2291959	T	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=33;PP=1520;SC=GGGTGCATTCTCTTTAGCCCA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=79;WE=69874000;WS=69873982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	69876164	rs9940315	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=631;SC=AGTAGTTAAGAAAGCTAATAG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=69876172;WS=69876154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	69905668	rs1000640	G	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1234;ReadPosRankSum=0.280;SC=CCTTTTCACAGTGACTTATGT;SOR=0.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=78;WE=69905676;WS=69905658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,99:0.64:154
chr16	69942608	rs5817677	AG	A	6382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=88;PP=2966;SC=CCTTTCTAACAGGGGCCTATG;SOR=0.725;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=30;TCR=91;TR=115;WE=69942616;WS=69942598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	69959223	rs2270838	G	A	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=46;PP=2487;SC=CCTGCAAAGCGCTCAAATGTG;SOR=1.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=122;WE=69959231;WS=69959213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	69963355	rs1566452	G	A	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=55;PP=2176;SC=TGGCAGAGAAGAGACAGGACA;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=112;WE=69963363;WS=69963345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr16	69965024	rs2270840	A	T	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=74;PP=2891;SC=GAGAAATCGCATGAACCCCTG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=151;WE=69965032;WS=69965014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	69965281	rs8052727	T	G	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=20;PP=996;SC=TCTAGGAAGCTAGTTTTCATT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=69965289;WS=69965271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	69965592	rs2291961	A	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=19;PP=1641;SC=CCAGGGCGTGAGTCTTGGTGA;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=69965600;WS=69965582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	69967093	rs2102066	G	A	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=682;SC=CCTCTGCGTCGACGGACTCCT;SOR=1.547;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=69967101;WS=69967083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	69967732	rs8047818	G	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=192;SC=AGGTTAGCCCGGGTGCTTGTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=69967740;WS=69967722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	69967897	rs2270841	T	C	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=52;PP=2016;SC=TCCTGTCTCATGAGGTGCTCA;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=112;WE=69967905;WS=69967887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	69970000	rs2270842	T	G	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1396;SC=CTGAGCTCTTTTCCAGCCTCT;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=69970008;WS=69969990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	69970329	rs1983016	A	G	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=55;PP=1805;SC=TCCGGGTCACAGAGGAGAACA;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=84;WE=69970337;WS=69970319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	69973622	rs10712484	GC	G	2221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=2279;SC=GGCCTGACTGGCAGCCCCTGA;SOR=6.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=52;WE=69973630;WS=69973612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	69973655	rs4985461	C	G	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=23;PP=2965;SC=GTGGTGCAAGCCCTGTGGCCC;SOR=2.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=97;TCR=23;TR=120;WE=69973663;WS=69973645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	69973825	rs3748389	G	A	6966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=143;PP=2965;SC=AGGAGACCGAGGGCTTTGGAC;SOR=1.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=71;TCR=143;TR=214;WE=69973833;WS=69973815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr16	69988373	rs2549097	T	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=43;PP=1450;SC=GCGGGCTTGGTGTCCTTTGTC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=87;WE=69988381;WS=69988363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	69988472	rs75776403	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.448;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.50;MQRankSum=-1.441;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr16	70016242	rs142504738	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.253;NF=16;NR=1;PP=323;ReadPosRankSum=-0.562;SC=TTGTGTCAAGGCACATCTTAC;SOR=1.485;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=17;WE=70016250;WS=70016232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr16	70048199	.	A	G	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=47.28;NF=1;NR=4;PP=27;QD=12.3542425094;SC=AAGTTCAGAGATTAATTTCAG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=5;WE=70048207;WS=70048189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr16	70161159	rs142629299	G	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.26;MQRankSum=0.723;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr16	70163691	rs4985506	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.509;NF=22;NR=25;PP=725;ReadPosRankSum=-3.179;SC=ACTTAACTAGCGTCCAGGGTA;SOR=0.571;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=47;WE=70163699;WS=70163681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,23:0.19:122
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chr16	70170222	rs59034887	G	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.722;NF=24;NR=19;PP=700;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GTCTCCTGCAGTGCAGGGCTA;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=43;WE=70170230;WS=70170212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
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chr16	70172890	rs142218067	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.54;MQRankSum=-1.023;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.207;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr16	70176076	rs2549125	G	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.719;NF=12;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=2.034;SC=TAGTGGACATGGGCTACTCAG;SOR=2.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=14;WE=70176084;WS=70176066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr16	70176451	rs202169520	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.84;MQRankSum=1.032;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	70177648	rs2303200	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=780;SC=GCGCTTCTCCGGGAACCATAA;SOR=3.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=70177656;WS=70177638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	70180196	rs80088541	G	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.428;NF=9;NR=20;PP=390;ReadPosRankSum=1.449;SC=GCGGTGGCAGGTACATATTCT;SOR=0.484;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=29;WE=70180204;WS=70180186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,21:0.29:73
chr16	70182249	rs62050975	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.545;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-1.600;SC=CTTGCCTTGACGTCTGTCTCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=70182257;WS=70182239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr16	70182375	rs62050977	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-3.007;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.968;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,13:0.09:140
chr16	70182390	rs62050978	T	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-1.940;QD=1.47;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,16:0.11:146
chr16	70182489	rs145754705	ACTTCCCTTCC	A	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=3.323;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.749;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr16	70187164	rs2287979	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr16	70190401	rs6499302	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=4.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,51:0.27:192
chr16	70191029	rs4985509	T	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=254;ReadPosRankSum=0.179;SC=TCACTCAGCTTCTCGTGGTGG;SOR=0.504;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=26;WE=70191037;WS=70191019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,30:0.27:112
chr16	70191161	rs11647087	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr16	70219777	.	A	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.23;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	70285901	rs4985407	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr16	70287177	rs4081753	A	G	7645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=112;PP=2965;SC=TGACCTGGGGAACTTGACACA;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=230;WE=70287185;WS=70287167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr16	70299590	rs146880293	C	CA	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GGAGGTGTGTCAAAAAAAACA;SOR=1.179;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=70299598;WS=70299580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr16	70303580	rs2070203	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=439;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TGGTCCGAGCGTGGTCAGCCA;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=37;WE=70303588;WS=70303570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr16	70348599	.	CTA	C	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=1.449;SC=AAATATCTATCTATATATATA;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=3;WE=70348608;WS=70348589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr16	70358495	rs61757207	A	G	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=1194;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CAGCCCACAGAACTTAATTGC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=64;WE=70358503;WS=70358485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,77:0.68:113
chr16	70400857	rs8058224	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-0.654;SC=AGCGCCATGGAAAGAAGGGAA;SOR=0.765;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=4;WE=70400865;WS=70400847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr16	70500026	rs201285613	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=649;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CCAGTCCCCCGACTTCCAGGG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=50;WE=70500034;WS=70500016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,57:0.33:172
chr16	70502610	rs12446395	C	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=144;ReadPosRankSum=0.223;SC=TGGAGTCTGGCTGCTGGAGTG;SOR=0.205;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=9;WE=70502618;WS=70502600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr16	70506752	rs17884087	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=238;ReadPosRankSum=0.524;SC=GCCTGGCCCCCGACCTGAATT;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=12;WE=70506760;WS=70506742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	70513384	rs11075764	C	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=681;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TAACCAGGGGCTATATCTGTA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=37;WE=70513392;WS=70513374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
chr16	70514828	rs7919	A	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	70515600	rs6416698	T	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=222;ReadPosRankSum=0.701;SC=GTCCTGGGGGTGGTGGCATGA;SOR=0.463;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=17;WE=70515608;WS=70515590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr16	70516109	rs12447090	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=426;ReadPosRankSum=0.941;SC=TGGTCACCATGGGCCTCATAA;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=39;WE=70516117;WS=70516099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr16	70530359	rs2303793	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=37;PP=1120;SC=TGCATAGAGGAATTGACAGTG;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=70530367;WS=70530349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	70531366	rs2303792	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=0.136;SC=GGTACACTGGCCCTAGCTCTG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=70531374;WS=70531356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr16	70531754	rs2303791	T	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=591;SC=GCAGGACCAATAAATATGACA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=70531762;WS=70531744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	70546234	rs3762171	G	A	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=27;PP=1410;SC=ACCTGGGGCAGATCACCTTCC;SOR=1.040;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=67;WE=70546242;WS=70546224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	70548297	rs3931036	G	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=907;SC=GTAGCGATGAGTATGTGCTGC;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=70548305;WS=70548287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	70553382	rs7204583	G	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=201;SC=TCCAAGGACTGTTTGAAAACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=70553390;WS=70553379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	70560361	rs8051506	G	A	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=220;SC=CACCACGCCCGGTCACATATG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=70560369;WS=70560351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	70569215	rs33910368	A	T	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=50;PP=1786;SC=TCACAGTTCCAGGAGGGTCAG;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=70569223;WS=70569205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	70575852	rs11645437	A	T	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=525;SC=AAGCAGTTAGAGGTAGAAGTT;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=70575860;WS=70575842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	70588281	rs79853361	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=343;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GAGAACTCTTAGTGTTTCATT;SOR=0.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=22;WE=70588289;WS=70588271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr16	70601254	rs7197262	G	A	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=458;SC=TGGGCAGAGAGGTGAGGCCTG;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=70601262;WS=70601244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	70602221	rs12909	C	T	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=63;PP=2142;SC=TCCAGACTATCGGACATAGGG;SOR=0.980;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=108;WE=70602229;WS=70602211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	70603220	rs4985534	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=310;SC=GTAGCGAGTTTCTTAGAGAGA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=70603228;WS=70603210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	70680744	rs3813904	G	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=439;SC=TTCCCTGACTGAGTGACCACC;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=70680752;WS=70680734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	70680850	rs3813905	C	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=652;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GGAACACCACCATGCCCCGGG;SOR=1.292;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=44;WE=70680858;WS=70680840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr16	70688303	rs55704776	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=-1.274;SC=TTCCAGATCCCGTGCCCCCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=70688311;WS=70688293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	70688340	rs713499	T	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.431;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=0.398;SC=GGTGCTTGTCTCCTATGCAAA;SOR=0.277;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=12;WE=70688348;WS=70688330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr16	70690795	rs113117314	G	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr16	70690803	rs113866885	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr16	70690916	rs77769000	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=6.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=2.093;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr16	70690989	rs8046424	G	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=1014;SC=GCAGGAGGTGGAGACGCTGCT;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=70690997;WS=70690979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	70693872	.	C	CT	187	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=12;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=59.52;NF=8;NR=3;PP=187;QD=17.8181818182;SC=CTGCTGCAGTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=11;WE=70693880;WS=70693862;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr16	70708093	rs67662127	CAGTCTCAACAGCTATAGT	C	413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=1662;SC=GCCTTCAGGCCAGTCTCAACA;SOR=3.258;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=70708118;WS=70708083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	70713308	.	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=561;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CAGAGCCACTCCTGGGGCGGG;SOR=0.867;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=36;WE=70713316;WS=70713298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
chr16	70714811	.	C	CGG	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.34;ReadPosRankSum=2.597;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr16	70726795	rs2278983	C	A	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=41;PP=2446;SC=CGCTGCTCTGCGGCAGGAGCA;SOR=1.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=70726803;WS=70726785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	70726940	rs2278984	G	C	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=39;PP=1230;SC=AGCCCACACTGCCTGCCTCCG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=70726948;WS=70726930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	70732483	rs7201952	G	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=8;PP=1373;SC=GCTCACACAGGGTGTGCCCCC;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=54;WE=70732491;WS=70732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	70732761	rs9673700	G	C	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=337;SC=GACCTGGAAGGCTCTGTGTCT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=70732769;WS=70732751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	70796515	rs2305689	G	A	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=67;PP=2146;SC=ACATCTGGAGGGCAGAGAAGC;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=112;WE=70796523;WS=70796505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	70796535	rs2305690	C	T	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=61;PP=1816;SC=CAGGGGTGCCCGTGAGTGCTC;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=70796543;WS=70796525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	70816893	rs1875941	C	T	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=19;PP=1181;SC=GCAGTGGCAGCAGCAGTGGCA;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=70816901;WS=70816883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	70818759	rs2271047	A	G	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=36;PP=1102;SC=AGGCACAGACAGGGGAGGGAC;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=70818767;WS=70818749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	70935224	rs75445533	A	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=8;PP=187;SC=ATAGGTAAACACATGTCATGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=70935232;WS=70935214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	70954915	rs1798531	G	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.94;QD=31.22;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	70972595	rs79004160	T	C	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=62;PP=2895;SC=GGCATCATATTCTTCCTCATC;SOR=1.233;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=140;WE=70972603;WS=70972583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	70972784	rs1615602	A	G	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=330;SC=CTCATCCCTGATTGCAGGGGT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=70972792;WS=70972774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	71025394	rs149427312	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQRankSum=-3.030;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr16	71026137	rs145870479	TA	T	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQRankSum=-1.744;QD=21.85;ReadPosRankSum=-1.736;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	71100838	rs74361942	T	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.943;NF=11;NR=17;PP=448;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TCTGGAGCACTATGTTGAAAG;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=28;WE=71100846;WS=71100828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr16	71101433	.	G	GA	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=40.13;NF=0;NR=2;PP=33;QD=38.0;SC=ATTTTTAGTTGACAAGTTACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=71101441;WS=71101423;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr16	71163693	rs150028416	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQRankSum=-0.730;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.580;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr16	71212979	rs2158102	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.530;SC=ATTATTGTTATAGTCACACAT;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=71212987;WS=71212969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr16	71218926	rs3785347	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,17:0.25:69
chr16	71219021	rs3785346	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.732;SC=CCACTAAGTTCCCTTATAAAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=71219029;WS=71219011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	71220880	rs12927616	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=47;ReadPosRankSum=0.249;SC=ATACAGGTCATAATTTTTTTT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=6;WE=71220888;WS=71220870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr16	71237587	rs1895528	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CAAATTATTCTATTCTTATGA;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=5;WE=71237595;WS=71237577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr16	71237702	rs764600	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-0.711;SC=GAACAGATAACAGAAAATAGT;SOR=0.872;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=14;WE=71237710;WS=71237692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,19:0.29:66
chr16	71264399	rs3743954	G	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=1.127;SC=CGAAAAGAGGGGACGCCCCGG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=39;WE=71264407;WS=71264389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,41:0.30:137
chr16	71264523	rs12449210	T	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=1.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,64:0.26:243
chr16	71318577	rs3803704	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=468;ReadPosRankSum=1.262;SC=TAGCCAATTATTTCTGGAAAG;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=37;WE=71318585;WS=71318567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr16	71319539	rs3826247	C	T	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=89;PP=2954;SC=TGATTTTCCCCGCTTTATTAG;SOR=1.166;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=140;WE=71319547;WS=71319529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	71319646	rs3096380	G	A	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=35;PP=2006;SC=AATGCATTAAGTTCAGTGTGG;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=71319654;WS=71319636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	71319900	rs9928675	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=112;ReadPosRankSum=1.056;SC=CGAAATCTCATGAGCAGCAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=71319908;WS=71319890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr16	71406024	rs7203012	C	T	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=37;PP=1800;SC=CTATTTAGTGCTGAGATTGAT;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=93;WE=71406032;WS=71406014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	71411446	rs12445308	G	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.35;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	71416431	rs12919213	T	C	155.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	71417763	rs12597011	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=528;ReadPosRankSum=2.375;SC=ACCTCAGAGGAAGCATGAGCA;SOR=0.456;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=34;WE=71417771;WS=71417753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr16	71417783	rs35885273	C	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=15;PP=998;ReadPosRankSum=0.425;SC=ACGTGTCACCCGTCCTCCTTC;SOR=1.114;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=98;TCF=68;TCR=30;TR=57;WE=71417791;WS=71417773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr16	71418586	.	ACATG	A	328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=56.02;NF=3;NR=1;PP=328;QD=88.5;SC=CACACATCACACATGCACACA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=71418597;WS=71418563;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	71419595	rs4327058	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=705;SC=CCCAGGGCACAGGAGAGGCTT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=71419603;WS=71419585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	71423487	rs34538886	C	T	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.257;SC=CTTTAACCTCCATCTGTCTGA;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=54;WE=71423495;WS=71423477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr16	71465613	rs7203200	T	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=550;ReadPosRankSum=-1.520;SC=AGAGCCTCACTGGCAAGCCCT;SOR=1.172;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=30;WE=71465621;WS=71465603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr16	71466088	rs4620964	A	G	10335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=183;PP=2965;ReadPosRankSum=0.760;SC=TGATGTAGCCAGAGCCACACG;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=303;TCF=119;TCR=184;TR=301;WE=71466096;WS=71466078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,376:0.99:378
chr16	71483497	rs72795864	C	G	4813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TTTCCCCAATCCTGTACACCC;SOR=0.699;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=264;TCF=130;TCR=134;TR=174;WE=71483505;WS=71483487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,199:0.65:305
chr16	71484621	rs66920642	CA	C	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=0.944;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.635;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr16	71487206	rs2070832	T	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=21;PP=691;SC=CCCAGCTCACTTCCTCCCTCC;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=71487214;WS=71487196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	71509588	rs2288487	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,23:0.26:89
chr16	71509634	rs2288488	G	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=367;ReadPosRankSum=-1.366;SC=TACACTCATAGGGTTTCTCCC;SOR=0.705;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=35;WE=71509642;WS=71509624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
chr16	71509685	rs2288489	C	G	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=59;PP=2669;SC=CGGAACTACTCGTGAAACTAT;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=129;WE=71509693;WS=71509675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr16	71509796	rs8050871	C	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=835;ReadPosRankSum=1.478;SC=ACTCCTCACACTGATAGGGTC;SOR=0.823;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=49;WE=71509804;WS=71509786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,57:0.41:139
chr16	71571282	rs117753658	A	G	3781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=2373;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AGCATGAGCAAAAACTCAAGA;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=111;TCR=102;TR=131;WE=71571290;WS=71571272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,160:0.63:255
chr16	71603912	rs172650	C	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=578;ReadPosRankSum=-2.148;SC=TTAAAAATAGCCCCCTCATTG;SOR=0.456;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=38;WE=71603920;WS=71603902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr16	71607384	rs2432520	T	G	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.519;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=683;ReadPosRankSum=0.541;SC=CAGAAACAAGTAAAAAGGGAT;SOR=1.230;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=39;WE=71607392;WS=71607374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr16	71660115	rs4788820	G	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.996;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,40:0.27:148
chr16	71668800	rs7206470	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=0.707;SC=GAAGTTTCCAGTGCTGGAAAA;SOR=0.197;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=23;WE=71668808;WS=71668790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr16	71678679	rs7204608	G	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.128;SC=TGCAGTGTCAGGGAATGTGGT;SOR=0.431;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=21;WE=71678687;WS=71678669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr16	71682796	rs61733125	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr16	71701248	rs1423983	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=234;ReadPosRankSum=0.595;SC=TAAGGGGGGAGCATACAAACA;SOR=0.540;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=19;WE=71701256;WS=71701238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr16	71703436	rs2032918	T	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=183;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TAGGTGCTCATTGAATGCTGC;SOR=1.536;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=14;WE=71703444;WS=71703426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr16	71710428	rs61733123	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=637;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CCACAGTGCAGCTGTTCCAAG;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=46;WE=71710436;WS=71710418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,49:0.31:160
chr16	71710587	rs368863378	AAG	A	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.402;NF=2;NR=17;PP=820;ReadPosRankSum=0.461;SC=AATCATAAATAAGAGTCTATT;SOR=0.352;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=19;WE=71710596;WS=71710577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr16	71712786	rs61733126	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,48:0.27:179
chr16	71718366	rs7195059	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=503;ReadPosRankSum=1.503;SC=CAGAACATCCCATTACTTTTC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=32;WE=71718374;WS=71718356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr16	71736702	rs10626314	G	GTATTTT	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	71772795	rs904764	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=271;ReadPosRankSum=-2.246;SC=AAAAAAAAAAGCCAGCCAATC;SOR=0.148;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=15;WE=71772803;WS=71772785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
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chr16	71790166	rs8053186	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr16	71879868	rs4788563	A	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=1.466;SC=GGGCGGGACGAGCTTGACGCC;SOR=0.576;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=6;WE=71879876;WS=71879858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr16	71917058	rs2288029	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=1.190;SC=CACAGACTTTGGCAAGAAAAA;SOR=0.861;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=33;WE=71917066;WS=71917048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,34:0.34:100
chr16	71928850	rs11075908	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=222;ReadPosRankSum=0.724;SC=TACTGAATTATACCACACAGA;SOR=1.091;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=18;WE=71928858;WS=71928840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr16	71950450	rs1049794	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.181;NF=11;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=1.062;SC=GTGTGGAGCACATTATCCGGG;SOR=0.569;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=15;WE=71950458;WS=71950440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr16	71955400	rs4788450	T	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=341;ReadPosRankSum=0.458;SC=TTTGTAGGTATGACCTTCTTT;SOR=0.950;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=24;WE=71955408;WS=71955390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr16	71955426	rs56089063	C	CAT	767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.332;NF=0;NR=14;PP=543;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ACAAAAAAAACATTCTTTGCA;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=14;WE=71955434;WS=71955416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr16	71956511	rs148848854	AATGCCC	A	4685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.681;NF=12;NR=67;PP=2982;ReadPosRankSum=1.060;SC=GAACGGTGCCAATGCCCATGC;SOR=0.775;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=225;TCF=53;TCR=172;TR=79;WE=71956524;WS=71956501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,135:0.34:392
chr16	71956588	rs77712195	GTATA	G	2762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=48;PP=2363;ReadPosRankSum=1.475;SC=GGACCAGTAAGTATATATAAG;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=21;TCR=149;TR=55;WE=71956599;WS=71956578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,79:0.32:247
chr16	71981414	rs149635567	C	CTTTG	1232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.420;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=1030;ReadPosRankSum=0.968;SC=CCAAGATCCTCTTTGTTGTTC;SOR=0.330;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=22;WE=71981422;WS=71981404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,34:0.35:97
chr16	71981630	rs9934803	T	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=204;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TAATTTCACATTAATTTTTGC;SOR=1.127;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=14;WE=71981638;WS=71981620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr16	71981652	rs9934812	T	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=2.272;SC=CAATGATGGGTACCAGGAGAA;SOR=0.723;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=7;WE=71981660;WS=71981642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr16	71983664	rs1549292	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CCAATGGTTCTTCCCATCCCT;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=71983672;WS=71983654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr16	71986946	rs7204708	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=423;ReadPosRankSum=0.943;SC=TGACAGCAGTATGGATGCTGA;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=31;WE=71986954;WS=71986936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr16	71986995	rs12708919	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=-2.418;SC=TGGACGCACTGAAAGAAAAGC;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=29;WE=71987003;WS=71986985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
chr16	71987960	rs9888745	A	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=11;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=2.655;SC=AAAAAAAAAAAGGATTGCTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=71987968;WS=71987950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	71988106	rs9921412	C	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=719;ReadPosRankSum=1.618;SC=AGCCGTTGGACCCTTGTAAAC;SOR=0.471;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=46;WE=71988114;WS=71988096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,52:0.38:136
chr16	72001110	rs9928413	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=379;ReadPosRankSum=1.225;SC=TCCAAGTGGTGAGAAGGAAGA;SOR=0.966;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=29;WE=72001118;WS=72001100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,40:0.36:111
chr16	72001629	rs12708922	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr16	72001971	rs9930930	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-1.285;SC=TGCCTCCTCCAGCTGAGGAGC;SOR=0.269;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=11;WE=72001979;WS=72001961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr16	72003732	rs28629271	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=652;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TTTAATTACTCAAAACATCAT;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=40;WE=72003740;WS=72003722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr16	72003952	rs35259348	G	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=-2.784;SC=GGCAAAGAAGGTCAGGTGGTT;SOR=0.674;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=23;WE=72003960;WS=72003942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr16	72007399	rs9925415	C	T	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=707;ReadPosRankSum=-1.946;SC=GGATTCAGCACCCACGTGTAC;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=42;WE=72007407;WS=72007389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr16	72011040	rs3929023	A	G	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=14;PP=701;SC=TGAGCCTGACAGTTTGAGGCT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=72011048;WS=72011030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	72011181	rs1559401	G	T	3148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=40;PP=2070;SC=TCAGGTGGAAGTGAGTGCAGT;SOR=1.035;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=97;WE=72011201;WS=72011171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	72011193	rs1559400	A	C	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=44;PP=1996;SC=GAGTGCAGTTAGGCTGATACT;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=72011201;WS=72011171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	72011261	rs1559399	A	G	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=58;PP=2344;SC=CTCACTATCAAGGATTTCTCC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=72011269;WS=72011251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	72011450	rs1559398	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=276;SC=GTAAGGAAACGTCCTAGCTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=72011464;WS=72011440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	72011456	rs139541803	G	GGTCTTC	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=5;PP=185;SC=AAACGTCCTAGCTCTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=72011464;WS=72011440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	72012072	rs8053841	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=395;SC=TAACATAATTCCCTTTAAGTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=72012080;WS=72012062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	72012376	.	G	A	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=27;MQ=57.73;NF=0;NR=7;PP=104;QD=19.8244589353;SC=ATGTATATATGTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=72012384;WS=72012366;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,7:0.33:21
chr16	72012394	rs4045545	GTA	G	99.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=226;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=72012414;WS=72012384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	72012398	rs2878405	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.834;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	72012400	rs62053844	A	G	153.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	72012402	rs62053845	A	G	153.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	72012404	rs62053846	A	G	153.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	72012406	rs370830204	A	G	153.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	72013797	rs7185272	G	C	7174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=96;PP=2965;SC=CAGCGGTAAAGTTGATATGTT;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=118;TCR=96;TR=214;WE=72013805;WS=72013787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	72018099	rs12443563	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=29;PP=786;SC=CAAAATTACTCATACAAAATT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=72018107;WS=72018089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	72020134	rs12708923	T	C	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CCAGATGCCTTCTGCAATGAC;SOR=0.489;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=73;WE=72020142;WS=72020124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,82:0.58:141
chr16	72020294	rs4788590	G	A	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=26;PP=1023;SC=GTTCAGATGCGGCTGATGTTA;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=72020302;WS=72020284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	72020323	rs4788591	A	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=25;PP=917;SC=GTGATACTTGATAGTACTGAA;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=72020331;WS=72020313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	72027191	rs7191148	T	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=50;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GGGAATTATTTCCATTTCTTT;SOR=0.896;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=35;TCR=75;TR=72;WE=72027199;WS=72027181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,74:0.65:114
chr16	72027319	.	TAATC	T	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=28;QD=40.3895309841;SC=ACGTATGTGATAATCAGGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=72027330;WS=72027309;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr16	72033801	rs72787027	G	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=737;ReadPosRankSum=-0.972;SC=ATGTGGTGCTGGGCTGTTTAG;SOR=0.505;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=48;WE=72033809;WS=72033791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr16	72042682	rs3213422	A	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=865;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GAGACACCTGAAAGTGAGTCC;SOR=1.087;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=48;WE=72042690;WS=72042672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr16	72042825	rs3213423	T	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=144;SC=GTTTCCGGGGTCTCCTGCAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=72042833;WS=72042815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	72046268	rs1465457	C	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=304;ReadPosRankSum=-1.288;SC=CCCAAGTGAGCAGTGGGGATT;SOR=1.127;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=13;WE=72046276;WS=72046258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	72048332	rs3764310	T	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=414;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AATACCGGGATAGCCTTAGCG;SOR=0.151;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=25;WE=72048340;WS=72048322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr16	72048632	rs8062895	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GCGTTCAGAGATATAAGATCT;SOR=1.508;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=17;WE=72048640;WS=72048622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr16	72050885	rs11075914	G	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=888;SC=CTATGGTGCCGTCTCACTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=72050893;WS=72050875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	72050904	rs2278028	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=251;ReadPosRankSum=1.637;SC=TGCCCCTCCCGTGTGCTTGTG;SOR=0.725;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=18;WE=72050912;WS=72050894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
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chr16	72092017	rs2070938	A	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=104;SC=ATTGTTTAAAAATAATACAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=72092025;WS=72092014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	72110948	rs12646	C	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=3.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=-3.297;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,29:0.19:156
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chr16	72124157	rs7190995	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,54:0.36:149
chr16	72124219	rs7192730	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=372;ReadPosRankSum=0.295;SC=TATCCCACTATTGCGAGCACT;SOR=0.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=13;TCR=63;TR=25;WE=72124227;WS=72124209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
chr16	72124495	rs2303285	A	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=546;ReadPosRankSum=-1.167;SC=ATAAAAACCAATTATTTTAGA;SOR=0.933;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=37;WE=72124503;WS=72124485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr16	72130203	rs1050361	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=231;ReadPosRankSum=0.378;SC=CTTCATTACTCGGACTGGACT;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=18;WE=72130211;WS=72130193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr16	72130815	rs1050362	C	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=215;ReadPosRankSum=1.232;SC=GCGGGAGCGGCGGGAACATGG;SOR=1.151;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=16;WE=72130823;WS=72130805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr16	72131740	rs34749771	ACT	A	567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.413;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=393;ReadPosRankSum=-1.461;SC=AGAGTGAGTGACTCTCGTCTT;SOR=0.273;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=11;WE=72131749;WS=72131730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr16	72132356	rs11862813	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AGGAAAAATACATCCTGGACC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=72132364;WS=72132353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr16	72132713	rs2072142	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,48:0.28:170
chr16	72133211	rs2072141	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=1.636;SC=GGGCTGATCGGGGCTGGTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=8;WE=72133219;WS=72133201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr16	72135014	rs1050363	T	C	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1229;ReadPosRankSum=0.876;SC=TGAAGGATGCTACTTCTGACC;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=215;TCF=124;TCR=91;TR=87;WE=72135022;WS=72135004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,97:0.38:253
chr16	72135319	rs8043606	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=-2.552;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr16	72137561	rs2240243	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=758;ReadPosRankSum=1.849;SC=CTCAGCTGACGCAGTACCTGC;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=52;WE=72137569;WS=72137551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,62:0.42:149
chr16	72139184	rs2074626	C	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.604;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=372;ReadPosRankSum=-0.411;SC=ACGCGCCTGCCCTGGCTGTGC;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=34;WE=72139192;WS=72139174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,39:0.33:119
chr16	72139396	rs150617	T	C	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=29;PP=1636;SC=ATTTTTCCCTTCCTGTATGTC;SOR=1.275;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=78;WE=72139404;WS=72139386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	72139537	rs42544	T	C	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=56;PP=1641;SC=AGAGAAGACATGGGAGGCAAG;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=99;WE=72139545;WS=72139527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	72142072	rs8051882	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=0.343;SC=GGGATGTGCTCAGTGGGCCTG;SOR=0.243;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=9;WE=72142080;WS=72142062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr16	72142895	rs9926156	G	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CCTTCACTGCGTTCTGGCATG;SOR=0.845;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=18;WE=72142903;WS=72142885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr16	72146441	rs7940	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.534;SC=ATTGGGTCCTCAGCCTTCTGG;SOR=0.382;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=12;WE=72146449;WS=72146431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr16	72146570	rs6680	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=399;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GGTGGAGTTCTTCCATGCAGG;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=23;WE=72146578;WS=72146560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr16	72156842	rs16973716	T	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=678;ReadPosRankSum=-1.788;SC=TGGCAATGTATTTCACCTGCT;SOR=0.847;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=44;WE=72156850;WS=72156832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
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chr16	72158950	rs3812986	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TATTTTCTTCTCAGTGGCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=9;WE=72158958;WS=72158940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr16	72162855	rs6499562	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TGTCCCTCCCGTCTTTCCTAA;SOR=0.086;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=6;WE=72162863;WS=72162845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr16	72827758	rs699444	T	C	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=30;PP=1576;SC=CAGGCCGATCTCCGCTGTCAC;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=70;WE=72827766;WS=72827748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	72832135	rs740178	T	A	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=29;PP=1054;SC=TATGGTCCTCTGCCAGAGTGG;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=72832143;WS=72832125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	72984336	rs138232886	GA	G	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=0.876;SC=CTTTCAGAAAGAGCGCCTGAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=8;WE=72984344;WS=72984326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr16	72991660	rs10852515	C	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.213;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=727;ReadPosRankSum=1.143;SC=TTGGTTTGGTCGGCGAGGGGG;SOR=1.115;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=158;TCF=55;TCR=103;TR=48;WE=72991668;WS=72991650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,50:0.29:174
chr16	72991715	rs4788682	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=618;ReadPosRankSum=0.794;SC=CGCCGCAGCCACCGCCGCCGC;SOR=0.741;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=127;TCF=87;TCR=40;TR=41;WE=72991723;WS=72991705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,43:0.31:137
chr16	72992667	rs2073852	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=-1.375;SC=GCCTCCTCTTCGGCTGGCTCT;SOR=0.741;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=13;WE=72992675;WS=72992657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr16	72993860	rs62639999	G	A	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GGTGCTCTCCGCGAGGCGCTC;SOR=0.417;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=76;WE=72993868;WS=72993850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,99:0.79:125
chr16	73126858	rs7189194	T	G	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=52;PP=2661;SC=TATCCCTTCGTTTATGCTCTG;SOR=1.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=127;WE=73126866;WS=73126848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	73164795	rs34115176	A	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=9;PP=458;SC=GGGTGAGCCAACACGCTGGGC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=73164803;WS=73164785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	73165038	rs56203505	A	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=642;SC=TAGGGTTGACATGAGAATTCA;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=73165046;WS=73165028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	73517250	rs147828241	A	AAG	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.00;MQRankSum=0.530;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr16	74330979	rs79790131	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=1.202;SC=ACGAGCTGGGGACGCAGATAG;SOR=2.815;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=18;WE=74330987;WS=74330969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr16	74333380	rs889641	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=288;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TGAGCTCAAGTAGTCCCTGCA;SOR=0.816;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=18;WE=74333388;WS=74333370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr16	74336018	rs77448946	G	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=619;ReadPosRankSum=0.519;SC=TTGATTACAAGAAATAGCTTT;SOR=0.364;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=43;WE=74336026;WS=74336008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr16	74371543	rs72791060	C	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.135;NF=18;NR=35;PP=849;ReadPosRankSum=-2.130;SC=GGGAATGAAACAGAGAGAGTG;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=53;WE=74371551;WS=74371533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,52:0.43:121
chr16	74372914	.	GTT	G,GT	47	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.4733,0.5267;HP=18;HapScore=3;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=56.55;NF=0,0;NR=5,5;PP=8,47;QD=2.2;SC=AACGTAGTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5,5;WE=74372923;WS=74372904;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:13
chr16	74375981	rs113376705	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.57;MQRankSum=0.338;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.461;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr16	74384477	rs28550604	T	A	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.148;NF=54;NR=46;PP=1518;ReadPosRankSum=0.183;SC=CTTGGAGACATACGTTAAATA;SOR=0.858;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=236;TCF=120;TCR=116;TR=100;WE=74384485;WS=74384467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,109:0.41:264
chr16	74384499	.	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=2.951;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,47:0.16:295
chr16	74394671	rs62055171	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-6.978;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.815;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,20:0.15:135
chr16	74394765	.	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.603;NF=8;NR=15;PP=279;ReadPosRankSum=1.531;SC=CATGTCTCTCACCAACTAGAT;SOR=1.095;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=23;WE=74394773;WS=74394755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr16	74425358	rs6564065	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.719;NF=22;NR=1;PP=447;ReadPosRankSum=1.266;SC=CACAGCTGAAGCTTTAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=23;WE=74425366;WS=74425348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr16	74425447	rs918678	C	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=6.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQRankSum=-1.522;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,65:0.26:253
chr16	74425548	rs2868591	A	G	3584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=79;PP=2217;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CTGAAGGAGTATCTCCTGGTC;SOR=1.141;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=54;TCR=102;TR=117;WE=74425556;WS=74425538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,138:0.74:186
chr16	74425621	rs141339834	CCCTCTTCCACCCTCT	C	162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-3.163;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,8:0.15:54
chr16	74443401	.	T	C	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	74443542	rs146555914	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=4.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQRankSum=-2.866;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,37:0.15:253
chr16	74447514	rs2650549	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.841;NF=18;NR=29;PP=734;ReadPosRankSum=0.533;SC=TCTATCGCTGTCTGGCCTGCA;SOR=0.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=47;WE=74447522;WS=74447504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
chr16	74485788	rs3851731	C	T	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=10;PP=1097;SC=CGCCAAAATACAACATTTAGC;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=74485796;WS=74485778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	74490529	rs3760055	G	A	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=44;PP=2026;SC=TAAAAAAGGAGATTCTCTTGG;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=74490537;WS=74490519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	74490556	rs9945	G	A	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=54;PP=2454;SC=CCTTTGCTGCGTAACTCCACA;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=120;WE=74490564;WS=74490546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	74491733	rs2288054	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=407;SC=TCTTCCCAAGAGAGTTCAGAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=74491741;WS=74491723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	74501856	rs6564117	C	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=36;PP=1079;SC=CTGGCTTCTACATAGCAAAGT;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=74501864;WS=74501846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	74504005	rs2303279	T	C	3699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=71;PP=2179;SC=TCAGAAGTTTTGTGGCAACTT;SOR=1.335;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=110;WE=74504013;WS=74503995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	74504097	rs12716764	G	C	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=814;SC=TGACCCACACGTGAGACATCA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=74504105;WS=74504087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	74506447	rs8059315	G	C	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=659;SC=TCTAGTATTTGAAGTAGATAG;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=74506455;WS=74506437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	74530611	rs71376211	T	TAC	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.674;QD=8.59;ReadPosRankSum=-2.450;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr16	74537591	rs4887772	C	T	5266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=82;PP=2965;SC=GGTGATCCACCAAGCAGGAAA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=157;WE=74537599;WS=74537581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr16	74660174	rs12933037	G	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=673;SC=AAAAGTTCATGTTTTCCCTTA;SOR=3.334;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=74660182;WS=74660164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	74664743	rs7193541	T	C	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=39;PP=1730;SC=TATACCAGAATTGAACCATTG;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=86;WE=74664751;WS=74664733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	74664810	rs7188880	A	T	3238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=53;PP=2039;SC=AGCTCCAGACAGGACGTCCAG;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=100;WE=74664818;WS=74664800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	74664969	rs7193959	T	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=299;SC=ACACTCATACTCCCAAACTAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=74664977;WS=74664959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	74666634	rs4072450	G	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=789;SC=ATTCAAACTAGTTTTTCAAGT;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=74666642;WS=74666624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	74670458	rs4888262	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=15;PP=437;SC=TTTGATGTGACGTAAGTTTTT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=74670466;WS=74670448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	74671866	rs77132945	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=276;ReadPosRankSum=1.864;SC=CTTCAGTAGGGAACTAGAGGG;SOR=0.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=18;WE=74671874;WS=74671856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr16	74695079	rs8058922	G	T	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=67;PP=2928;SC=GTTCTCCACAGTGTCTTCTCC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=130;WE=74695087;WS=74695069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	74706298	rs4888274	A	T	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=23;PP=1871;SC=CACTCCTTGCACCCATAGATA;SOR=1.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=86;WE=74706306;WS=74706288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	74709737	rs7184423	C	A	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=84;PP=2690;SC=ATTGTTGCTACACACAATTGC;SOR=1.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=34;TCR=84;TR=118;WE=74709745;WS=74709727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	74712905	rs6564158	A	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=25;PP=689;SC=CGGGGAGCATAAGTACCTTTG;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=74712913;WS=74712895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	74712993	rs113430799	T	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CTGTCCACAGTTACACAGGAA;SOR=0.120;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=74713001;WS=74712983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr16	74750405	rs2301865	G	A	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=61;PP=2432;SC=CTACTGCCTCGGGCAGGATGA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=121;WE=74750413;WS=74750395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	74760292	rs11295057	CT	C	261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=128;SC=GTACAGCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=74760300;WS=74760282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr16	74908439	rs2870148	C	T	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=32;PP=906;SC=GTCTTCCTCTCAAGACTCTAG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=74908447;WS=74908429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr16	75146711	rs34195333	C	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=438;ReadPosRankSum=-1.536;SC=CACCTCTCCCCAGCAGCAGGG;SOR=0.761;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=32;WE=75146719;WS=75146701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
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chr16	75148604	rs755099	G	A	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=38;PP=1732;SC=GCGTACAGAAGGCAGCCTCAG;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=75148612;WS=75148594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	75186727	rs11859007	G	A	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=34;PP=2256;SC=GTCTCTAGGGGTTTCTAAACA;SOR=1.453;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=103;WE=75186735;WS=75186717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	75200378	rs9929570	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=250;SC=CCCGCCCACCTAGCCTCCCAA;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=75200386;WS=75200368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr16	75200595	rs71380707	CAT	C	1232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=1064;ReadPosRankSum=-2.536;SC=TGATGAATGACATAAAGTTTT;SOR=0.459;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=26;WE=75200604;WS=75200585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr16	75202998	rs12716783	A	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=587;SC=GTTTGAAAGGAAACATTTGCA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=75203006;WS=75202988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	75238103	rs4737	C	T	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=58;PP=2503;SC=ATGAGCTTGGCGACACGGGCG;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=123;WE=75238111;WS=75238093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr16	75263974	rs6564241	T	C	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=39;PP=1227;SC=GAGTTGGAACTACAGGCCGAG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=75263982;WS=75263964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	75267676	rs4888361	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=6;PP=360;SC=TCGGCCCTGCAGGGCAAGAGC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=75267684;WS=75267666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	75269267	rs3169330	A	G	5904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=104;PP=2965;SC=CACTCTGGACAGCGGCCACAG;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=80;TCR=104;TR=184;WE=75269275;WS=75269257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr16	75269534	rs3743613	C	T	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TGCCCTCTGCCGGGGCTTCAC;SOR=0.518;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=81;WE=75269542;WS=75269524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,94:0.60:156
chr16	75269958	rs10623347	C	CCA	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=0.200;SC=CAGCACCCAGCCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=3;WE=75269966;WS=75269948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	75270721	rs2278020	C	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=565;ReadPosRankSum=-0.358;SC=CCCCTGTGCACACACCCAGAC;SOR=0.490;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=35;WE=75270729;WS=75270711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr16	75276295	rs7195938	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=591;SC=GGGTGGCTGGACCCTTCTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=75276303;WS=75276285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	75276775	rs1035539	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=143;ReadPosRankSum=-0.340;SC=GGAGGGCCGGGGCCAGGCCCT;SOR=0.724;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=14;WE=75276783;WS=75276765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr16	75277344	rs4888363	A	T	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=54;PP=1968;SC=ATCACGACAAAGCTGCCAAGT;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=75277352;WS=75277334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	75277446	rs76709948	AAGAC	A	1451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.815;NF=0;NR=22;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GAACAACAATAAGACAGAGCT;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=22;WE=75277457;WS=75277436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
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chr16	75281964	rs1862737	A	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=635;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CCATCTTACTAGACAGGAAAA;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=76;TCR=81;TR=56;WE=75281972;WS=75281954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,67:0.37:183
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chr16	75300708	rs11149811	C	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=35;PP=1032;SC=GTCCAGAGCACTGTCCCGGAG;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=75300716;WS=75300698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	75301605	rs9319482	A	G	161.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=120;SC=TAGGTGCCCCAGCCAGAATGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=75301613;WS=75301599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	75301974	rs72804106	G	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GACTCACTCCGTCCTATAGGG;SOR=1.508;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=75301982;WS=75301964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	75327916	rs6624	A	G	6163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=112;PP=2965;SC=CCACTCGGTCAAGGAAGGCTT;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=74;TCR=112;TR=186;WE=75327924;WS=75327906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	75338855	rs3743607	C	T	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=46;PP=2911;SC=GGCAGTTTGTCTCCAATAAAT;SOR=1.422;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=86;TCR=46;TR=132;WE=75338863;WS=75338845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	75339131	rs7192981	T	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=757;SC=CTGATCTCTATATTAACAGTT;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=75339139;WS=75339121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	75445605	rs1109341	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=394;SC=TTGAGTTCAAGTATAACTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=75445613;WS=75445595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	75445675	rs1109342	G	A	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=633;SC=AGAGAGAGACGCTCATTTTTG;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=75445683;WS=75445665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	75445906	rs247435	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=313;SC=ATATTGTTTACAGATACTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=75445914;WS=75445896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	75448273	rs8056236	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=299;SC=TACCTATTAACATTTTCTTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=75448281;WS=75448271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	75448659	rs8051407	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=433;SC=AGACATTTTCATTAATACAAG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=75448667;WS=75448649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	75453159	.	T	C	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	75467076	rs3833048	G	GC	397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=315;SC=GAGAACAGGAGCCCCCCTGGA;SOR=3.912;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=75467084;WS=75467066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	75467223	rs75511445	A	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=982;ReadPosRankSum=0.619;SC=TCCGACGTAGAGAAGTCTTCG;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=59;WE=75467231;WS=75467213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr16	75498252	rs150429885	C	CT	3821.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=2321;SC=CGGAGGACAGCGCCCACGCCG;SOR=1.005;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=48;WE=75498261;WS=75498242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	75498253	rs34904236	G	T	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=39;PP=1378;SC=GGAGGACAGCGCCCACGCCGC;SOR=1.039;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=65;WE=75498261;WS=75498242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	75512959	rs146465655	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=642;ReadPosRankSum=0.887;SC=GCTTGAGTGTGGCGGCCTCGG;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=46;WE=75512967;WS=75512949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,51:0.31:164
chr16	75563330	rs3826107	G	A	5316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.341;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.356;SC=GAGCTGTGGCGTGAGGGTCAG;SOR=0.930;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=320;TCF=124;TCR=196;TR=207;WE=75563338;WS=75563320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,230:0.64:358
chr16	75563746	rs8048818	T	G	6643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.295;NF=130;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=0.270;SC=CCAGGCTGAATGGCTGCCGCG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=383;TCF=197;TCR=186;TR=249;WE=75563754;WS=75563736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,286:0.65:443
chr16	75564287	rs3784932	T	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=565;ReadPosRankSum=0.629;SC=GCCCATCCCATGCCCCAATTA;SOR=1.358;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=44;WE=75564295;WS=75564277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr16	75565420	rs2641806	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=236;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GATGGAGCCCAAGAAGCAGAG;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=16;WE=75565428;WS=75565410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr16	75575410	rs7202717	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=895;ReadPosRankSum=1.068;SC=GGCAGTTGAAGGCTATAAAGA;SOR=1.093;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=47;WE=75575418;WS=75575400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr16	75579233	rs2738801	A	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.339;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.896;NF=17;NR=7;PP=969;ReadPosRankSum=2.676;SC=GAGCTGGACAATGAGAAGCGC;SOR=0.146;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=24;WE=75579250;WS=75579223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr16	75579242	rs144252983	G	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.715;HP=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.182;NF=12;NR=1;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AATGAGAAGCGCTCTTACGTT;SOR=2.359;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=13;WE=75579250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
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chr16	75590113	rs3743602	C	G	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1494;ReadPosRankSum=1.164;SC=GCCATGAGCACCGCTCGCAGG;SOR=0.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=84;WE=75590121;WS=75590103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,102:0.64:159
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chr16	75665019	rs7189895	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=409;ReadPosRankSum=0.344;SC=AGAGGGAACCATTCAGCACCA;SOR=1.014;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=24;WE=75665034;WS=75665009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
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chr16	75670128	rs2289064	C	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=226;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GATTCAGGGGCCACTATTAAA;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=12;WE=75670136;WS=75670118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr16	75728506	rs143310087	C	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=1.907;SC=AACAAAGGAGCTATTAACCTA;SOR=0.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=8;WE=75728514;WS=75728496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr16	75730037	rs5817959	T	TA	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.326;NF=2;NR=28;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CAGAAGCTGTTGGGGAATTTT;SOR=0.633;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=30;WE=75730045;WS=75730027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr16	75794738	rs7205764	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.890;NF=18;NR=20;PP=733;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CAGGATCTCATTCCCATCACC;SOR=0.801;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=38;WE=75794746;WS=75794728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr16	76311602	rs59314262	G	GT	7618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=80;PP=2957;SC=CGCTACTTCTGTATCTACTCA;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=116;WE=76311610;WS=76311592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	76389441	rs2866712	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,38:0.23:162
chr16	76461273	rs7192076	A	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=3;PP=885;SC=ACACATTGCTAATAGACATTA;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=76461281;WS=76461263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	76461519	rs9927638	C	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=852;ReadPosRankSum=2.059;SC=TTATCCAATACACTGACATAG;SOR=0.925;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=52;WE=76461527;WS=76461509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr16	76461588	rs9938200	A	G	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=36;PP=947;SC=TTTTAGCTACATAAAGAGGTA;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=76461596;WS=76461578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	76482546	rs56137120	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.619;SC=GTATTTGAAACGGAATGCGTA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=76482554;WS=76482536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	76482747	rs34251012	C	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=621;ReadPosRankSum=1.112;SC=GCATTCAGTGCTCATCCAGCG;SOR=0.874;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=44;WE=76482755;WS=76482737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr16	76482910	rs3947083	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.834;SC=TAATCTCCCAGAGGAAAATAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=76482918;WS=76482900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr16	76486581	rs28584228	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=533;ReadPosRankSum=0.999;SC=AGCTGATTTCAGGGGGTATCC;SOR=0.903;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=45;WE=76486589;WS=76486571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,52:0.29:178
chr16	76496025	rs57292037	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=1.620;SC=GCCAGGCTCTATGAGCAACTG;SOR=0.024;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=76496033;WS=76496015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr16	76496131	rs34782687	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.674;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	76501542	rs1002974	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ACAGGAAATGAATTATATTTA;SOR=0.141;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=76501550;WS=76501532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr16	76523792	rs7201030	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TAAGTAAACCATGGTGTCTGT;SOR=2.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=14;WE=76523800;WS=76523782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr16	76532392	rs12932943	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=0.669;SC=TAGTTCAGAACATCTTGGTTT;SOR=0.434;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=16;WE=76532400;WS=76532382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr16	76532583	rs12933808	A	G	5059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=87;PP=2965;SC=CTGCTCTGCCAGGGAGACAGT;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=160;WE=76532591;WS=76532573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	76555015	rs11353699	CT	C	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.04;SOR=1.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	76569754	rs6564348	A	T	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=34;PP=1033;SC=GTTCTTTTCTATGCAGCTATT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=76569762;WS=76569744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	76587202	rs7202925	T	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=23;PP=1249;SC=TGGACCAGGATACTGCACTGG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=76587210;WS=76587192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	76587331	rs7184958	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=796;SC=GACACGTGACTGAGTCCAGCT;SOR=1.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=76587339;WS=76587321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	76587647	rs4243123	G	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=10;PP=1601;SC=ATAATTCTCTGTGGTTTAAAA;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=60;WE=76587655;WS=76587637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	76592313	rs7196722	T	G	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=204;SC=TTATGATGACTTATTAAGCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=76592321;WS=76592311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	76902847	rs7500280	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr16	76902850	rs7499278	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr16	77225217	rs3214483	A	AG	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=350;ReadPosRankSum=-1.397;SC=AAAGTGTTGGAGGGGGGACGT;SOR=1.284;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=13;WE=77225225;WS=77225207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr16	77227180	rs2241416	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=0.403;SC=AGATCATTGCGGGGTCCTAGG;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=77227188;WS=77227170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	77228629	rs2232503	A	G	7303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=111;PP=2965;SC=CCCAGGAGCGAAATGTGCTGG;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=111;TCR=111;TR=222;WE=77228637;WS=77228619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr16	77228866	rs2232504	T	C	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=820;ReadPosRankSum=-1.965;SC=GGCGCCTGGTTGAAGATGGGA;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=69;TCR=100;TR=68;WE=77228874;WS=77228856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,80:0.40:202
chr16	77231935	rs2232509	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.210;SC=CATGCAGCTGCACTGGGGTAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=77231943;WS=77231925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	77233338	rs8398	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=338;ReadPosRankSum=1.092;SC=GCGCAGGCCCCGCGTTGGAAA;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=24;WE=77233346;WS=77233328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr16	77233394	rs4888607	A	G	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=37;PP=1216;SC=GCCAGAAGCTACTGAGGAGGC;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=77233402;WS=77233384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	77240217	rs9928151	G	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AAACCTGTCTGTCATTCCATC;SOR=2.093;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=77240225;WS=77240207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	77242035	rs9933799	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=287;ReadPosRankSum=0.867;SC=CAGACACAGTGCTTCTCCGTC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=77242043;WS=77242025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr16	77242083	rs9934426	C	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=21;PP=912;SC=CTCTGGCTCACTCTTTCTTCC;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=77242091;WS=77242073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	77242284	rs1424146	G	A	4966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=65;PP=2965;SC=GAAGATGACTGTGCAATGTCA;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=93;TCR=65;TR=158;WE=77242294;WS=77242274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	77242513	rs2343035	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=-1.904;SC=GCACAGGCTGCTCCCTGGCCT;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=18;WE=77242521;WS=77242503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr16	77246218	rs13331769	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-1.297;SC=GTGGAGCGGCGGCTGCACTCG;SOR=1.739;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=12;WE=77246226;WS=77246208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr16	77246517	rs62049594	C	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=278;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CCGGAGCGCCCCCGAGGTCGG;SOR=0.411;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=18;WE=77246525;WS=77246507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr16	77246795	rs2278049	C	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=881;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AGGAGGATCCCGAGCCGCCGG;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=57;WE=77246803;WS=77246785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr16	77246847	rs2278048	T	G	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1182;ReadPosRankSum=0.435;SC=GACCCGCCCGTTCCCGACCTT;SOR=0.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=82;WE=77246855;WS=77246837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,112:0.58:194
chr16	77246953	rs2278047	G	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1194;ReadPosRankSum=1.283;SC=GGCGGGGCGTGCTGGGATCTC;SOR=0.684;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=79;WE=77246961;WS=77246943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,85:0.64:133
chr16	77246988	rs7203616	T	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=50;PP=1453;SC=GCCGGACCCCTCCCACCAGTC;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=69;WE=77246996;WS=77246978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	77281779	rs35625788	GTC	G	310.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=353;SC=CTGGCTTGAGGTCTCTCATCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=77281788;WS=77281769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	77325325	rs35478105	G	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.832;NF=25;NR=29;PP=759;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AGCCCTTCTCGCTGCACTTCA;SOR=0.817;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=54;WE=77325333;WS=77325315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,65:0.60:108
chr16	77327226	rs4888618	C	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=675;SC=AAAAAAACAACACACTAAATA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=77327234;WS=77327216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr16	77393207	rs2650907	G	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=637;ReadPosRankSum=0.245;SC=GTTCAAAGAGGCACTTACTTG;SOR=0.298;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=36;WE=77393215;WS=77393197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
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chr16	77398081	rs1948719	T	C	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.036;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=912;ReadPosRankSum=0.167;SC=ACACCCCCGCTTACCATGTTC;SOR=1.075;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=52;WE=77398089;WS=77398071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr16	77398386	rs2562119	A	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TAACCAACACACCACCAATCC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=77398394;WS=77398376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr16	77401684	rs2434895	T	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=759;ReadPosRankSum=0.722;SC=AGGGTTGGTTTTCAACAACTG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=48;WE=77401692;WS=77401674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,58:0.72:81
chr16	77465036	rs1366545	C	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=262;SC=TCTGGGAGCACATTAGATTAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=77465044;WS=77465026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	77756613	rs2914456	G	A	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=240;SC=TGATTTTGCAGCTCCCGCCAG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=77756621;WS=77756603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	77769288	rs6564469	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	77769369	rs308926	C	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=7;PP=272;SC=GCCAAGCAGACGCCAGCATCA;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=77769377;WS=77769359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	77769647	rs186305	C	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=493;SC=AAATAGAAGTCCAGTAAGTAT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=77769655;WS=77769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	77775459	rs11648791	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=481;ReadPosRankSum=1.950;SC=TAATTTGTCTGTTTTGTTTTC;SOR=0.403;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=31;WE=77775467;WS=77775449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr16	77822901	rs12444404	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=140;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GGATGCTGCCCGGGTAGAACC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=13;WE=77822909;WS=77822891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr16	77850966	rs2966053	T	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=889;ReadPosRankSum=1.084;SC=TGGCTCTCAATTGAAGAGTAA;SOR=0.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=46;WE=77850974;WS=77850956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr16	77850999	rs2966052	A	G	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=603;ReadPosRankSum=-0.829;SC=ATCCATTGAGACAACAAAAGA;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=34;WE=77851007;WS=77850989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr16	77918801	rs1864228	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=-1.095;SC=TTTTCCCAGATGGGTTTGTTT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=77918809;WS=77918791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr16	78005906	rs77818551	G	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.742;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=533;ReadPosRankSum=0.205;SC=AGACACGGGTGGGGTAGAAGG;SOR=0.384;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=41;WE=78005914;WS=78005896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr16	78011474	rs376847259	C	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=432;ReadPosRankSum=2.272;SC=CCCTCAATAACATCCTCTTTT;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=28;WE=78011482;WS=78011464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr16	78011559	rs3751769	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=428;ReadPosRankSum=1.585;SC=AGGGAGACAGCGAGAACAAGG;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=32;WE=78011567;WS=78011549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr16	78062159	rs2075738	C	T	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=46;PP=1333;SC=TTCTGGGGGACGTCTTTTTAA;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=67;WE=78062167;WS=78062149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	78062190	rs2735403	T	C	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=35;PP=1069;SC=GACAAATCAATAATGTGGCCA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=78062198;WS=78062180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	78062219	rs2204891	C	T	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=772;SC=GCCCCAATGCCGGGAGATGAT;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=78062227;WS=78062209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	78063000	rs7197560	T	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=25;PP=1205;SC=ACTTAAGCTATTATGATCCTA;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=78063008;WS=78062990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	78063064	rs7190832	G	T	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=37;PP=1356;SC=TTGTTCAAGAGATACACAGCT;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=78063072;WS=78063054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	78063143	rs7192416	C	T	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=824;SC=TCCAGTGCTACGGCCTAAAAC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=78063151;WS=78063133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	78085754	rs2344923	C	A	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=34;PP=2088;SC=GAGCCACCCCCCCTGGCCAAC;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=103;WE=78085762;WS=78085744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	78142209	rs4887937	T	C	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	78143607	rs2287972	C	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=21;PP=1337;SC=GGGCTCCTTCCCTTCCTGACC;SOR=1.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=66;WE=78143615;WS=78143597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr16	78725014	rs6564577	G	A	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=34;PP=2261;SC=AATACCAGTCGTTATTGCTTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=108;WE=78725022;WS=78725004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	78790765	rs7199110	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=227;ReadPosRankSum=0.060;SC=GACATCAGAGCATGTGACTTA;SOR=0.756;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=21;WE=78790773;WS=78790755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
chr16	79245465	rs384216	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=-1.257;SC=ATCACTCCTTTTCTTAAAATT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=17;WE=79245473;WS=79245455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr16	79245820	rs383362	G	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=1197;ReadPosRankSum=0.938;SC=AATAAGAGCAGTCACAACAGA;SOR=1.100;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=57;WE=79245828;WS=79245810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr16	79245956	rs2288034	C	G	3927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,100:0.69:144
chr16	79245961	rs2288033	T	C	3959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,99:0.71:140
chr16	79246078	rs2288032	G	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=0.843;SC=CACTGCAGCCGGGGGCTGGCC;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=23;WE=79246086;WS=79246068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr16	79619727	rs60080524	GAAA	G	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.40;QD=37.89;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	79628536	rs66467731	AT	A	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=0.949;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.246;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr16	79633238	.	CGTG	C	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.69;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=3.087;SC=TGGCCGGCGGCGTGGTGGTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=1;WE=79633248;WS=79633228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr16	79633805	rs5818251	TGCC	T	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr16	79998075	rs66539665	T	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.564;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,57:0.30:187
chr16	80574886	rs9922406	T	C	5097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=76;PP=2965;SC=CCACTTCCTTTTTTGTCTCCT;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=168;WE=80574894;WS=80574876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	80577098	rs8049769	G	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=9;PP=1115;SC=TAGGTATCTTGCTAAACATTA;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=80577106;WS=80577088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	80581547	rs6564762	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=12;PP=1107;SC=CTGAGCATTGCACCCTTAGTA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=80581555;WS=80581537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	80581580	rs6564763	A	C	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=29;PP=2133;SC=TTAGGATGCAAAATAAAACTG;SOR=1.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=99;WE=80581588;WS=80581570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	80581631	rs6564764	G	A	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=62;PP=2965;SC=TGCTTGCTACGTTTCCATTTT;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=99;TCR=62;TR=161;WE=80581639;WS=80581621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	80641906	rs9940301	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=-1.599;SC=TAGCAAGTCAGTGAAGCCCTC;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=15;WE=80641914;WS=80641896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr16	80641931	rs9933302	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=6.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr16	80641936	rs9940376	G	C	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=5.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr16	80654633	rs4889169	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=1.003;SC=CAGGACCCCAGGGTGTGTGAA;SOR=1.104;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=30;WE=80654641;WS=80654623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,36:0.26:138
chr16	80666886	rs59675671	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=0.876;SC=ACAGCCCAGCTTGCCCTTCCC;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=80666894;WS=80666876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr16	80704886	rs7195952	T	C	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=35;PP=1219;SC=CTCAGGATTTTGTCTCCTGGG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=80704894;WS=80704876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	80718879	rs8049284	A	G	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=48;PP=2062;SC=GACATGTGCAACCCATTGAAT;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=80718887;WS=80718869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	80719086	rs8047798	G	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=26;PP=824;SC=AACTCAGTTCGAGGCAACAAG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=80719094;WS=80719076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	81014615	rs112803874	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=0.615;SC=ACAGCCTAAGCAGAAAACAAA;SOR=0.204;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=17;WE=81014623;WS=81014605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr16	81015560	rs2549822	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=11;PP=439;SC=TAAATACTGCCACAGACATGA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=81015568;WS=81015550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	81022203	rs34522854	TA	T	1369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=650;SC=GCACGTTTCCTAAAAAAAACA;SOR=1.345;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=26;WE=81022211;WS=81022193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	81022232	rs2549833	T	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=733;SC=AATTTAAGTCTCCATACGATT;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=81022240;WS=81022222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	81025372	rs2244452	A	T	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=174;SC=TGTGGTCTTCATCCGAAAACA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=81025380;WS=81025362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81025490	rs2113196	A	C	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=28;PP=1812;SC=ATCAAAAACAAAGAAAATGTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=88;WE=81025498;WS=81025480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	81025506	rs2113197	T	A	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=33;PP=2059;SC=ATGTCACAGATAACAGGAGCC;SOR=1.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=101;WE=81025514;WS=81025496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	81050965	rs935939	A	T	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=27;PP=966;SC=AAGTTTGGGAAGTTTTTCAGA;SOR=0.950;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=47;WE=81050973;WS=81050955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	81051327	rs935940	C	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=14;PP=723;SC=ATTGTAGCTCCCTTGATTTTT;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=81051335;WS=81051317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	81053682	rs10602593	CT	C	379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=0.964;SC=GAAATTAAGCCTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=17;WE=81053702;WS=81053672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr16	81061827	rs2549887	G	A	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=34;PP=1892;SC=GGCTGAGAGGGAAGAACCCCT;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=81061835;WS=81061817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	81062030	rs2549888	G	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=687;SC=GCTCTCTCTTGCATCTTCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=81062038;WS=81062020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	81062151	rs35608064	CTT	C	5809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.04;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	81062157	rs114305409	T	C	6085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=42;PP=2390;SC=TTCCCTTTTTTTTTTTTTTAA;SOR=1.376;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=115;WE=81062179;WS=81062141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	81062171	rs2602428	C	T	6859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=92;NR=56;PP=2898;SC=TTTTTAATTTCAGGTATTGCA;SOR=1.278;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=148;WE=81062179;WS=81062141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	81069449	rs2602430	A	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=55;SC=GGGCCTACGAACTGGGCCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=81069457;WS=81069439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	81077915	rs2257378	T	C	4958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.583;NF=76;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.819;SC=ATCTGCCTGCTCAGACATTGG;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=77;TCR=85;TR=160;WE=81077923;WS=81077893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr16	81078265	rs142359892	G	T	3828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=74;PP=2396;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CTGCCTCTGGGAAGTATTCTG;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=222;TCF=107;TCR=115;TR=141;WE=81078273;WS=81078255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,167:0.63:266
chr16	81094760	rs804884	A	G	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=25;PP=1381;SC=GTTCTACCGCAACCGCTCAGA;SOR=1.375;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=73;WE=81094768;WS=81094750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	81095363	rs804885	C	T	5102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=107;PP=2965;SC=CTGGGATGGACAGCCCTCTGT;SOR=1.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=57;TCR=107;TR=164;WE=81095371;WS=81095353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	81118289	rs7187102	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=13;PP=408;SC=TCCTGTCATACAGCTATGATT;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=81118297;WS=81118279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	81121145	rs7200400	T	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=172;SC=ACAAACAAATTACTATTCAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=81121153;WS=81121135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	81129822	rs8052579	G	A	473.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.306;NF=6;NR=13;PP=376;ReadPosRankSum=1.748;SC=CGCGGCGGGTGACGGGACCGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=81129830;WS=81129812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr16	81145630	rs8053975	C	G	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=696;SC=ACAGCAAAGACACCCTGTACT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=81145638;WS=81145620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	81145664	rs8054611	A	G	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=893;SC=ACCTTCCTTGAGTTCCCAGGG;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=81145683;WS=81145654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	81145675	rs8059153	T	C	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=11;PP=1023;SC=GTTCCCAGGGTCTCCCTAACC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=81145683;WS=81145654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	81145737	rs8059318	T	G	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=40;PP=1916;SC=GCAGAGACCCTCCCCGAACTT;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=81145745;WS=81145727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	81145807	rs8054182	C	G	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=60;PP=2743;SC=GGATGACAATCATAAAGCCTG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=128;WE=81145815;WS=81145797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	81151122	rs4889238	A	C	6503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=108;PP=2965;SC=ACGTCTCTTTACTCATGCGCT;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=83;TCR=109;TR=191;WE=81151130;WS=81151112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	81151163	rs8053191	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=437;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AAGTTGCGGCCGTGACTGCCC;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=46;TCR=84;TR=39;WE=81151171;WS=81151153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,47:0.32:149
chr16	81157324	rs4889241	G	A	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=26;PP=1356;SC=GTAGACAGTGGACTCCACAAA;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=66;WE=81157332;WS=81157314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	81157521	rs4889242	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=356;SC=GGGCCACCAGGCCAACAGAGC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=81157529;WS=81157511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	81164274	rs11150345	C	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=351;SC=ACAGTCCCTGCTCAGGCAGGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=81164282;WS=81164264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	81167342	rs11150346	T	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=18;PP=480;SC=CCCCTACGTGTGCAGAGGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=81167350;WS=81167332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	81173030	rs4889243	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=381;SC=ATAAAGGAATAAAAGCCCAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=81173038;WS=81173020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81173136	rs12918619	T	C	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=28;PP=1368;SC=GTGACGAACATGCTCTCCACG;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=81173144;WS=81173126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	81173193	rs4889244	C	T	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=47;PP=1983;SC=CTGGCCCTCCCGTAGTGCAGG;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=99;WE=81173201;WS=81173183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	81183266	rs8044870	A	G	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=205;SC=CCAGCCACTAACCCTGACCTC;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=81183274;WS=81183256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	81185326	rs11649028	G	A	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=23;PP=1609;SC=CCTGGGTGGCGGAACAAGACC;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=74;WE=81185334;WS=81185316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	81185416	rs8061038	A	G	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=71;PP=2491;SC=GAAACACCTTATCGAGGACGC;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=124;WE=81185424;WS=81185406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	81190294	rs4889251	G	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.72;NF=13;NR=0;PP=352;SC=CAGGTGATCCGTCCACCTTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=81190316;WS=81190284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	81190308	rs4889252	G	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=430;SC=ACCTTGGCCTGCCAAAGTGCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=81190316;WS=81190284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	81190328	rs4889253	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.87;NF=20;NR=6;PP=607;SC=TGGGATTACAGGCGTGAGCCA;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=81190336;WS=81190318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	81190601	rs1453325	T	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=70;PP=1993;SC=TGGTGGATGTTGATGGCATTG;SOR=1.102;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=81190621;WS=81190591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	81190613	rs1453324	A	G	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=68;PP=2272;ReadPosRankSum=-1.014;SC=ATGGCATTGGACATCACCAGG;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=114;WE=81190621;WS=81190591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr16	81190708	rs1453323	A	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=25;PP=589;SC=CAACCCATAAAGGGGCTGTCA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=81190716;WS=81190698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	81193156	rs10871403	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=274;ReadPosRankSum=-2.705;SC=GCCAGAGGCACCAAAAGGGAA;SOR=1.316;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=18;WE=81193164;WS=81193146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr16	81193321	rs72628271	C	T	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1338;ReadPosRankSum=1.084;SC=AGGTCCCTGCCGGGGGCTGGC;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=76;WE=81193329;WS=81193311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,109:0.63:174
chr16	81193344	rs143351043	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=1.158;SC=CAGGTCAGACTCAGGGACCAC;SOR=0.582;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=34;WE=81193352;WS=81193334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,44:0.33:133
chr16	81194382	rs2317117	T	A,C	3583.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=24,42;NR=18,29;PP=581,934;SC=GTGCAATGTCTGGTCTCCAGT;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=42,71;WE=81194390;WS=81194372;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:152
chr16	81194528	rs11647564	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=849;ReadPosRankSum=1.086;SC=CAGAAACAATCCTATTGAAGG;SOR=0.541;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=47;WE=81194536;WS=81194518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr16	81197117	rs4889255	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=20;PP=1206;SC=GCTTGAGCCCAGGAGGCAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=81197125;WS=81197107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	81198441	rs7191852	T	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=143;SC=GAGGGAGCCCTCACACCTCCT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=81198449;WS=81198431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81199520	rs12931217	T	C	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=57;PP=1530;SC=AGCAGGAGGGTGGTCTGCACA;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=80;WE=81199528;WS=81199510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	81199572	rs12927442	A	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=32;PP=963;SC=TGGCAATCTGAAAAAGGAGGC;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=81199580;WS=81199562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	81201448	rs11313252	G	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=352;SC=GATGGGGGGGGAAAGTTCCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=81201456;WS=81201447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	81201620	rs35292101	C	A	5435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	81201625	rs34504526	G	A	5538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	81201774	rs34172014	C	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=18;PP=652;SC=CTGTGTCATTCAAGGGACAAG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=81201782;WS=81201764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	81201837	rs35055907	G	A	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=397;SC=CCTGGCACACGAGCTCCCTGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=81201845;WS=81201827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	81201853	rs72822032	C	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=92;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=318;SC=CCTGTATCTCCGGCTTGAGAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=81201861;WS=81201843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	81201868	rs34722210	G	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	81201872	rs76815905	C	T	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81204172	rs11648241	A	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=285;SC=ATAAGGAAGCACAGGAGCTGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=81204180;WS=81204166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	81204423	rs11640279	T	C	5498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=64;PP=2965;SC=GGAAAGAAGATGACAGAGGTC;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=113;TCR=64;TR=177;WE=81204431;WS=81204413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	81204751	rs79736308	G	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.222;NF=1;NR=5;PP=37;ReadPosRankSum=0.040;SC=TCAGGAAGATGCAGGGTCAGG;SOR=0.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=6;WE=81204759;WS=81204741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr16	81209207	rs2317114	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=296;ReadPosRankSum=-1.190;SC=TGCCACCACCTACCTTAGCCA;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=19;WE=81209215;WS=81209197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr16	81211663	rs75102744	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=0.213;SC=AGATTGCCCCCTGAGCTCATT;SOR=0.317;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=26;WE=81211671;WS=81211653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr16	81213081	rs4889259	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=482;SC=CAGGAGGCTGGGACAGGAGGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=81213089;WS=81213071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	81213142	rs4889260	C	T	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=24;PP=1778;SC=AGTGAGATCACATCTCTCTAT;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=81213150;WS=81213132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	81213378	rs4889261	A	G	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=59;PP=1819;SC=GCAGGCATCCAGGAGGGGCTC;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=78;WE=81213386;WS=81213368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	81213422	rs4889262	C	T	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=34;PP=951;SC=GGGCTGCTGACGCTACAGCCA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=81213430;WS=81213412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	81219052	.	G	A	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=20;QD=27.3856062736;SC=AGTGTTGGCTGAACGAATGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=2;WE=81219060;WS=81219042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr16	81219329	rs9319563	G	T	6941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=107;PP=2965;SC=CAGACACTATGATCCATCAGG;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=76;TCR=107;TR=183;WE=81219337;WS=81219319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr16	81219352	rs62052363	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=607;ReadPosRankSum=0.065;SC=CCCTGAACGTGGCACACACTG;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=44;WE=81219360;WS=81219342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,52:0.32:165
chr16	81219396	rs9674042	T	A	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=59;PP=1740;SC=TCATGAATAATAACATCAGCT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=76;WE=81219404;WS=81219386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	81222672	rs4889271	T	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=28;PP=884;SC=TGGGGTGCTGTTGGCATTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=81222680;WS=81222662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	81224234	rs12716909	T	C	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=17;PP=1198;SC=CATCTTTTCCTTGTGAGGTTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=81224242;WS=81224224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	81224319	.	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=758;ReadPosRankSum=1.492;SC=ACCGGAAGGGGCTGTGAACAC;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=48;WE=81224327;WS=81224309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,52:0.42:124
chr16	81224423	rs11647179	G	A	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=57;PP=1774;SC=CACCAGGGGCGTCAGCCTGTC;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=81224431;WS=81224413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	81232275	rs7205673	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=12;PP=569;SC=ACCTTCAACCGGAACAGCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=81232283;WS=81232265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	81232564	rs7194871	T	G	4624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=82;PP=2965;SC=CCCATCAGTTTCTGGGTTTCT;SOR=0.964;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=141;WE=81232572;WS=81232554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	81240931	rs11150368	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=294;SC=CCGGACAGCCTACCCCAGCCA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=81240939;WS=81240927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	81241098	rs11150369	C	T	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;QD=44.90;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	81241098	.	CGG	TGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=56;NR=63;PP=2947;QD=20;SC=CTTACCTCGGCGGGTTGTAGG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=119;WE=81241108;WS=81241088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,119:0.97:123
chr16	81241100	rs11150370	G	C	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;QD=45.19;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	81242102	rs6420424	G	A	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=46;PP=2139;SC=TCACCTTCCCGGCACTGGTAC;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=81242110;WS=81242092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	81242148	rs55980345	GTT	G	4462.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=41;PP=2656;SC=TCGGACACAGGTTTCCAAAGT;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=59;WE=81242159;WS=81242138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	81242151	rs5818326	T	C	4471.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=41;PP=1765;SC=GACACAGGTTTCCAAAGTAGG;SOR=0.733;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=87;WE=81242159;WS=81242138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	81242194	rs6564838	T	C	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=39;PP=1481;SC=TGACTGTAGCTCCTGGCACTG;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=81242202;WS=81242184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	81242366	rs6564839	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=201;SC=GAAGACCAGGTACTGGGCTAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=81242374;WS=81242356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81242386	rs6564840	T	G	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=138;SC=GGTACTCAGGTGAGGGAGAAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=81242394;WS=81242376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	81248716	rs12933806	C	T	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=34;PP=1679;SC=CGCCCGTAGACGGCATCCTGG;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=81248724;WS=81248706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	81250180	.	C	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	81279120	rs28370522	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=415;ReadPosRankSum=-1.673;SC=TGCTCCGCAATGGGCCTGGGA;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=45;TCR=81;TR=40;WE=81279128;WS=81279110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,52:0.30:176
chr16	81314496	rs7501331	C	T	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=25;PP=1156;SC=ATCAAAGTGGCATCTACAACA;SOR=1.068;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=81314504;WS=81314486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	81320830	rs8048342	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=403;SC=ATCTTCATGCACTCCTATTTG;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=81320838;WS=81320820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	81398520	rs4889313	G	A	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=42;PP=1877;SC=TTTAATATCTGTTCACCTGAC;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=102;WE=81398528;WS=81398510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	81641452	rs7203914	A	G	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=79;SC=GCTGTAAACCAGGTCTGACTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=81641460;WS=81641442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	81694336	rs66465921	C	CT	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr16	81703861	rs11150398	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=735;ReadPosRankSum=1.766;SC=GTGGGTCTCCGGCGCGACGTC;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=51;WE=81703869;WS=81703851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,65:0.77:84
chr16	81704033	rs8044418	C	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	81726584	rs11642818	A	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-1.172;SC=CGCCTCCTCAAAGAAGGCCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=81726592;WS=81726580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr16	81726863	rs2288011	C	G	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CCTCCGTGGCCCATGCATTCT;SOR=0.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=62;TCR=71;TR=86;WE=81726871;WS=81726853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,95:0.63:151
chr16	81730381	rs9933631	C	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=9;PP=313;SC=CGGAGTTTCCCGGCTAACACA;SOR=0.976;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=81730389;WS=81730371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81733268	rs4889369	C	T	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=734;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TGTCCCTTCACCTGGGCCTTC;SOR=0.513;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=182;TCF=117;TCR=65;TR=60;WE=81733276;WS=81733258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,69:0.33:211
chr16	81736324	rs4888167	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GTGGGTTGGTCCTCTCTGTTG;SOR=0.160;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=25;WE=81736332;WS=81736314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr16	81737695	rs72831128	G	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=712;ReadPosRankSum=1.396;SC=ACTCAGGTACGTCCTCCCGCC;SOR=0.531;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=156;TCF=60;TCR=96;TR=61;WE=81737703;WS=81737685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,80:0.42:190
chr16	81739376	rs3968320	T	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=5;PP=202;SC=CACCATTCCATGTGCCAGGAA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=81739384;WS=81739366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	81739404	rs9936604	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr16	81740829	rs67721827	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=-0.529;SC=TAATGGCAGATCAAAAAGAGT;SOR=1.641;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=18;WE=81740837;WS=81740819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr16	81743328	rs68116357	A	G	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=734;ReadPosRankSum=-0.545;SC=ACACGTGACAAGGACTCTTAT;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=49;WE=81743336;WS=81743318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,69:0.72:96
chr16	81816733	rs8045964	C	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=21;PP=1225;SC=TGGTTTCTGTCTAATTGAAGG;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=81816741;WS=81816723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	81816787	rs4476171	T	A	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=40;PP=1233;SC=TCCAGTGGACTATGGCCTAGA;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=81816795;WS=81816777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	81819486	rs4354929	C	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=5;PP=861;SC=GAAGTTCATGCCCTGTTAACT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=81819494;WS=81819476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	81819768	rs1143685	T	C	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=37;PP=976;SC=GCAAGACCGCTGACAAGATCG;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=81819776;WS=81819758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	81887903	rs4072831	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=522;SC=GAAGGAGGGGACACTGAGTCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=81887911;WS=81887893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	81887938	rs4522412	T	C	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=6;PP=1308;SC=CTTTGCGGGATCCTGTTGGGG;SOR=3.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=49;TCR=6;TR=55;WE=81887946;WS=81887928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	81887957	rs4072830	A	C	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=14;PP=1705;SC=GGAAGGAAGGAGCCAGGCTGT;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=62;TCR=14;TR=76;WE=81887965;WS=81887947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	81888152	rs1143686	A	G	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=96;PP=2902;SC=TCACCATCCTATATGGCACTC;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=54;TCR=96;TR=150;WE=81888160;WS=81888142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	81888237	rs4072828	G	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=915;SC=GTGCCTTAGTGTCTTCCTGAA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=81888245;WS=81888227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	81891998	rs4341734	G	C	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=67;PP=2554;SC=CGTAGTTGCTGATTCCTTTAT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=132;WE=81892006;WS=81891988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	81892043	rs67392656	GAAAA	G	4090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=54;PP=1322;SC=CTACAGGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.485;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=65;TCF=4;TCR=61;TR=56;WE=81892055;WS=81892033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	81892895	rs41309272	C	T	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=976;SC=TTGTGATCTGCGGATGCCATG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=81892903;WS=81892885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	81902797	rs12445580	A	G	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=37;PP=1985;SC=AGGTGACAGAACTGGGTCTCC;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=99;WE=81902805;WS=81902787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	81903055	rs4889420	G	A	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=321;SC=GAGGGATCATGGACATATCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=81903063;WS=81903045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr16	81904375	rs35039495	C	A	376.78	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=167;SC=ATTTCTGAAACAAAAATTATT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=81904383;WS=81904364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	81904433	rs34761601	TG	T	930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=792;SC=AAAAATCATGTGGTCACTTTT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=81904441;WS=81904423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	81904674	rs7192509	T	C	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=41;PP=961;SC=ATGAGAATGATGAAAGCATAC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=81904682;WS=81904664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	81904711	rs7192535	T	A	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=631;SC=ATTGGCAAAATTCTTTAACCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=81904719;WS=81904701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr16	81929379	rs13333348	G	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=894;ReadPosRankSum=1.121;SC=GTGAACACACGTGGTATTGAG;SOR=0.323;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=54;WE=81929387;WS=81929369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,57:0.81:70
chr16	81929488	rs1143688	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,59:0.28:208
chr16	81929527	rs13333716	C	G	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=59;PP=1613;ReadPosRankSum=0.812;SC=CCTTTGTTACCTCGAGGTCAG;SOR=0.635;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=68;TCR=88;TR=105;WE=81929535;WS=81929517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,124:0.67:186
chr16	81929641	rs9928597	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=479;ReadPosRankSum=0.579;SC=CTCCAAATGCGGGAAGGCCTG;SOR=0.323;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=25;WE=81929649;WS=81929631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr16	81931362	rs8053636	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=724;SC=GTTGGCCAGGTTGGTCTTGAA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=81931370;WS=81931352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	81931403	rs8049305	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=234;ReadPosRankSum=0.271;SC=TCCCGCCTCAACCTCCCAAAG;SOR=0.204;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=19;WE=81931411;WS=81931393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr16	81939150	rs4435248	G	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=604;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CTGCGGCCACGCCCCTTGCAG;SOR=0.829;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=17;WE=81939165;WS=81939140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr16	81939157	rs11859176	G	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CACGCCCCTTGCAGCTGCTTC;SOR=0.374;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=26;WE=81939165;WS=81939140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr16	81941160	rs41301803	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=210;ReadPosRankSum=-0.642;SC=AGAATTCGCCATAAATGTCTA;SOR=1.911;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=14;WE=81941168;WS=81941150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr16	81941319	rs1143689	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=141;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GCGCCATTGCCGATGCCAAGC;SOR=0.954;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=14;WE=81941327;WS=81941309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr16	81941934	rs62044874	G	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=410;ReadPosRankSum=1.398;SC=CTGGTACCCTGGGTCAGGGTG;SOR=1.701;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=25;WE=81941942;WS=81941924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr16	81946368	rs41305765	A	C	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=493;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GGGCTTGGCAAGGACAGATGC;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=37;WE=81946376;WS=81946358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr16	81953081	rs12448130	T	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=7;PP=308;SC=GTGTTCTTCCTGCTCCAGGGC;SOR=1.101;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=81953089;WS=81953071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	81953368	rs12448152	A	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=831;SC=TTCACCATGTATCTGATACTG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=81953376;WS=81953358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	81954789	rs12446127	C	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr16	81956927	rs4485360	C	G	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=231;SC=TTGGGGCCTTCGATCCTTTGC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=81956935;WS=81956917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81962071	rs4366702	A	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=774;SC=TTCCACAGGCAGTATCTCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=81962079;WS=81962061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	81964977	rs7187863	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=-0.976;SC=CGTCCCCATCAGTGCTAACCG;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=14;WE=81964985;WS=81964967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr16	81971403	rs1071644	T	C	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=65;PP=2065;SC=TTTCTCTCAATGGGCGCACGG;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=116;WE=81971411;WS=81971393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	81973474	rs4405546	C	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=974;SC=TGTGGCCTCTCATGAGCTTTG;SOR=2.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=81973482;WS=81973464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	82124776	rs2955154	G	T	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=38;PP=1096;SC=TCAGTTAAAGGGGTGAAAACA;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=82124784;WS=82124766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr16	82203705	rs2303265	A	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,42:0.20:210
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chr16	82203742	rs1134847	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=1.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,52:0.19:276
chr16	82203758	rs2303262	C	T	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.313;SOR=1.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,62:0.21:289
chr16	82203768	rs2303261	G	T	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=4.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.055;SOR=1.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,57:0.21:275
chr16	82203786	rs2303260	C	G	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=6.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.923;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,52:0.21:244
chr16	82673047	rs4782724	C	T	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=61;PP=2569;SC=TGGGCGTGACCCACCTGCAGC;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=117;WE=82673055;WS=82673037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	82882118	rs1585533	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=401;SC=TTTTTAAATTATTACTTTGTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=82882126;WS=82882113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	82882187	rs35909991	TG	T	174.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr16	82882188	rs13336316	G	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr16	82882283	rs9935254	C	G	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=510;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GCCCTTTACTCATCTGTCTCC;SOR=0.670;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=44;WE=82882291;WS=82882273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,57:0.38:151
chr16	82917768	rs929847	G	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=643;ReadPosRankSum=-0.835;SC=TCCTTATGCTGTTTCTTTCCA;SOR=0.448;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=37;WE=82917776;WS=82917758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr16	82917852	rs929848	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=447;ReadPosRankSum=0.017;SC=TGGGCTCCCATGAGAAGGAAA;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=47;WE=82917860;WS=82917842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,53:0.35:150
chr16	83065664	rs6565105	G	A	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=28;SC=ATGAGGTCTCGAGCCCATACT;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=83065672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	83065965	rs2228685	T	A	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=195;SC=AATCCAACTCTAAAAATGTAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=83065973;WS=83065955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	83159350	rs7196370	A	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=9;PP=724;SC=GTTGAAATTAAGCAGGAAGAT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=83159358;WS=83159340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	83205290	rs56165681	G	T	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1056;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CATGCTCTTTGGCAGGCACGC;SOR=0.498;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=69;WE=83205298;WS=83205280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,78:0.61:128
chr16	83214480	rs7188594	C	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=393;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TACAGAGAACCCACAATCCTA;SOR=1.194;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=27;WE=83214488;WS=83214470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr16	83542061	rs4782540	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=11;PP=300;SC=CACTCCCATACAGGCTTTCAA;SOR=1.911;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=83542069;WS=83542051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	83658857	rs17760896	C	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=392;SC=GTAATTTAAGCCAAAATGACG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=83658865;WS=83658847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	83704389	rs7203175	T	C	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1195;ReadPosRankSum=0.623;SC=TCTGCTTTGTTTGCAGTTTCA;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=62;WE=83704397;WS=83704379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,81:0.65:124
chr16	83753815	rs72797298	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.242;NF=12;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=0.841;SC=CACACACTTGTGCATGTACAC;SOR=0.507;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=24;WE=83753823;WS=83753805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr16	83753910	rs142886033	TCATGCACACA	T	921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.612;NF=0;NR=11;PP=2981;ReadPosRankSum=0.881;SC=ATACATGCACTCATGCACACA;SOR=0.700;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=11;WE=83753927;WS=83753900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr16	83775105	.	A	ATG	251.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=327;SC=ATATATATATATGTGTGTGTG;SOR=3.056;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=83775113;WS=83775095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	83816828	rs153654	A	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=544;ReadPosRankSum=-1.368;SC=AGTCTCATCCACTCTCACCAG;SOR=1.157;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=31;WE=83816836;WS=83816818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr16	83817019	rs1048612	A	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=664;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GCAACGCGGCAGGGGCCCTGC;SOR=0.719;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=38;WE=83817027;WS=83817009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr16	83842792	rs8053753	G	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=390;SC=TAACAGTGTCGAAAGAAAATT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=83842800;WS=83842782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	83873222	rs34435623	T	G	63.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	83873259	rs435383	G	A	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=137;SC=AGGAACAGAGGACTCATTTCT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=83873267;WS=83873249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	83873285	rs435367	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=4;PP=152;SC=GTGTGTGTGTGTGCTCCTGTG;SOR=1.061;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=83873293;WS=83873275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	83873300	.	T	TTGTG	491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=1.015;SC=CCTGTGTCCTTTGTGTGTGTG;SOR=0.799;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=83873320;WS=83873290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr16	83873312	rs367415	C	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.26;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	83886468	rs150603407	GTGCACACA	G	2469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.197;NF=27;NR=17;PP=2639;ReadPosRankSum=1.694;SC=GCACACACACGTGCACACATG;SOR=0.911;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=44;WE=83886483;WS=83886456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr16	83886589	rs12597522	A	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.58;MQRankSum=-2.665;NF=32;NR=46;PP=1123;ReadPosRankSum=1.280;SC=CCAGGGCTGGATTGGGTTGGA;SOR=0.822;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=195;TCF=83;TCR=112;TR=78;WE=83886597;WS=83886579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,80:0.36:222
chr16	83886664	rs141778832	G	GT	1457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.134;NF=1;NR=35;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CATCAGAAGGGTAACAAGATG;SOR=1.453;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=36;WE=83886672;WS=83886654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr16	83933296	rs446036	T	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=25;PP=774;SC=CCGCCGTCGATCCCCCGGCAG;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=83933304;WS=83933286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	83940480	rs3815804	A	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=1000;SC=GTCTTGCACAATTGTCTTATG;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=83940488;WS=83940470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	83982460	rs4782863	A	G	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=557;SC=GGATCACGTCACAAGCTCTCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=83982468;WS=83982455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	83982712	rs58056773	G	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=859;ReadPosRankSum=0.530;SC=TCACCTAACAGGTAAACAAGA;SOR=1.162;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=55;WE=83982720;WS=83982702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr16	83982960	rs4782864	C	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=397;ReadPosRankSum=-1.480;SC=TTGAGCACTCCAGGGTGGGGG;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=31;WE=83982968;WS=83982950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr16	83983071	rs4782865	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=475;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AAGTGGAGACCGAGAGGCTGC;SOR=0.462;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=39;WE=83983079;WS=83983061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr16	83983750	rs74032329	C	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr16	83983755	rs2245008	G	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.73;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	83983803	rs80216064	G	C	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=818;ReadPosRankSum=0.040;SC=GCTTCTCATTGTGCTCCCTAA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=47;WE=83983811;WS=83983793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,53:0.75:71
chr16	83983867	rs2457543	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.725;NF=25;NR=16;PP=648;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGCAGATACGCACACACAGAC;SOR=0.883;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=41;WE=83983875;WS=83983857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr16	83983882	.	GCATACATACCAGCACACACGTACACACACATGCACACGTGAGCACATGTGCACACATGCACATACATACTGGCACACACGTACACACACATGCACACATGAGCACATGTGCACACATGCA	G	542.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=1.140;QD=9.36;ReadPosRankSum=-3.993;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr16	83983887	.	C	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-0.562;QD=9.66;ReadPosRankSum=5.853;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr16	83983889	rs111895704	T	C	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-0.353;QD=11.85;ReadPosRankSum=5.414;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr16	83983892	rs62045882	CA	TG	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-0.524;QD=10.10;ReadPosRankSum=5.389;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr16	83983920	.	G	A	1752	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=72;MMLQ=28;MQ=54.39;NF=35;NR=37;PP=1752;QD=24.8162668409;SC=ACATGCACACGTGAGCACATG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=83983928;WS=83983910;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	83984776	rs28555129	A	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=36;PP=1219;SC=TCTACCAGGAACCAGCCCCAG;SOR=1.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=83984784;WS=83984766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	83984844	rs2244899	A	C	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.57;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	83984850	rs2244898	C	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	83986885	rs7203516	C	G	3946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.255;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr16	83986888	rs7203864	G	A	4000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,106:0.45:238
chr16	83992785	rs2665296	G	A	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=26;PP=1346;SC=TGAATGCGCCGCATCTAGATC;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=83992793;WS=83992775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	83994249	rs62640906	C	G	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=1711;ReadPosRankSum=0.884;SC=TGCCCTTCTACGCCCAGACAC;SOR=0.880;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=104;WE=83994257;WS=83994239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,128:0.60:212
chr16	83994569	rs2136662	G	T	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=23;PP=1350;SC=TGGACCAAAGGGTTCCTTTCC;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=83994577;WS=83994559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	83999653	rs77204347	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=0.189;SC=CTGAGAGGACAGAGATGACCA;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=12;WE=83999661;WS=83999643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr16	84035594	rs2271302	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=233;ReadPosRankSum=-0.820;SC=AGGCTGCCCCATATCTCCCGG;SOR=1.656;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=14;WE=84035602;WS=84035584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr16	84035838	rs1995866	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.58;ReadPosRankSum=-2.381;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr16	84036011	rs34037353	C	CCT	1612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.720;NF=7;NR=16;PP=894;ReadPosRankSum=1.118;SC=AAGGAAATCCCGTTTTTTTCT;SOR=0.681;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=23;WE=84036019;WS=84036001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr16	84046432	rs11864037	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCGGGCTCCTATCCTGGCTCA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=84046440;WS=84046422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	84046499	rs11864095	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.714;SC=AGGTTTCTCACCTGCAGGATG;SOR=0.538;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=9;WE=84046507;WS=84046489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr16	84046715	rs11864146	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.097;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=0.647;SC=AGCAACAAAAAGGTCCCGGGA;SOR=1.281;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=15;WE=84046723;WS=84046705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr16	84056325	rs5818479	CTT	C	548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.534;NF=5;NR=3;PP=271;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CGCTGTTACTCTTGTTTCTAC;SOR=0.616;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=8;WE=84056334;WS=84056315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr16	84063215	rs11863267	G	A	4541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.88;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,111:0.73:152
chr16	84063219	rs61432810	G	C	4544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.10;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,112:0.74:151
chr16	84063320	rs143276186	A	AAGGAAG	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr16	84065710	rs907043	A	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.51;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	84065710	.	ATCCTCATCTG	GTCCTCATCTA,GTCCTCATCTG	175	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=39;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4,6;NR=10,15;PP=175,67;QD=16.3191339187;SC=CTGCCTCACCATCCTCATCTG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=14,21;WE=84065728;WS=84065700;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.67:21
chr16	84065720	rs907044	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.512;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	84065773	.	AGTTTTGTTGTT	A	1027	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=1027;QD=151.714285714;SC=TCAGATGTAGAGTTTTGTTGT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=84065791;WS=84065763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,7:0.78:9
chr16	84065774	.	GTT	G	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-2.025;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	84067004	rs57576928	C	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=563;ReadPosRankSum=-1.608;SC=AGAGCAGGGGCAGGGTGAAGC;SOR=0.535;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=35;WE=84067012;WS=84066994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr16	84070238	rs8057543	C	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=-1.939;SC=TCCTGCTCAACTGGAAACTCC;SOR=1.061;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=84070246;WS=84070228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr16	84070500	rs1317524	C	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.84;ReadPosRankSum=1.988;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr16	84070510	rs1876962	G	A	385.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=38.60;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,10:1.00:10
chr16	84070514	rs1876960	A	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.86;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	84075563	rs1105355	C	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=2.078;SC=ACTCACTTCCCGGGGACTTAC;SOR=1.385;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=84075571;WS=84075553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr16	84088047	rs11607	C	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=508;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GTCAGCCAGGCTGCCGGTCAC;SOR=0.453;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=36;WE=84088055;WS=84088037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr16	84088268	rs74035120	G	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-2.111;SC=AGGACAGCCGGTTGAACAGGC;SOR=0.273;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=7;WE=84088276;WS=84088258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr16	84089207	rs6563996	G	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.671;SC=GGGCCTTCTGGGCTGAGGGCT;SOR=0.418;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=15;WE=84089215;WS=84089197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr16	84089536	rs11415464	T	TG	257.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=418;SC=GCCCGCCTCCTGGGGAGGGAG;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=84089544;WS=84089532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	84089767	rs17849043	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=1.195;SC=TAAAACAAAACAAAAATAAGC;SOR=0.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=9;WE=84089775;WS=84089757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr16	84093062	rs2280024	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TCAACAAAAAGGAAAATCATC;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=77;WE=84093070;WS=84093052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,87:0.62:141
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chr16	84099257	rs80053280	A	C	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1332;ReadPosRankSum=-2.373;SC=GGAGCGAGAGAAAGAAGAAGC;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=67;WE=84099265;WS=84099247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,83:0.70:118
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chr16	84115610	rs3743633	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=468;ReadPosRankSum=0.585;SC=CAAGAGGCCTGCAGTCTTGTT;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=36;WE=84115618;WS=84115600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr16	84125270	rs8050801	A	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=428;ReadPosRankSum=0.806;SC=ACTAGATATGATGCAAAGTTG;SOR=0.771;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=32;WE=84125278;WS=84125260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr16	84132533	rs4782584	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CCAGGAAAATGTTCACAATTA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=84132541;WS=84132523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr16	84132628	rs10690442	G	GAC	1522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.079;NF=16;NR=13;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AAACAGCAGAGAGAAATTTGC;SOR=0.851;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=29;WE=84132636;WS=84132618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,45:0.30:149
chr16	84135493	rs907045	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CAACATTACTAATCAGCCATC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=84135501;WS=84135483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr16	84158248	rs4378600	G	C	2853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.487;SC=GGCTGTGCAGGATAAGGCTTC;SOR=0.554;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=104;WE=84158256;WS=84158238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,128:0.61:211
chr16	84163126	rs17574602	A	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.402;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1174;ReadPosRankSum=-1.405;SC=CATTAATCTAATTATGAGACC;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=65;WE=84163134;WS=84163116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,76:0.69:110
chr16	84203612	rs17856705	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=347;ReadPosRankSum=0.311;SC=TGCCCGGAAAAGCCAAGTGGA;SOR=0.498;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=20;WE=84203620;WS=84203602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr16	84203737	rs149158199	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=256;ReadPosRankSum=-0.859;SC=AGAGGACGGAGATGGAGAGCC;SOR=0.730;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=19;WE=84203745;WS=84203727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr16	84203939	rs11644164	C	T	5629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=0.264;SC=CCACCACCACCGCCCCTGGGA;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=332;TCF=196;TCR=136;TR=218;WE=84203947;WS=84203929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,249:0.65:381
chr16	84204043	rs4578631	T	A	5227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.215;SC=CTGTGGGACCTGGGGCCTGAG;SOR=0.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=98;TCR=183;TR=180;WE=84204051;WS=84204033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,224:0.66:341
chr16	84205726	rs12926474	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=2.109;SC=CTTGTGATCCGCCCACCTTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=84205734;WS=84205720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr16	84208335	rs3826151	G	T	3931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.005;NF=77;NR=69;PP=2454;ReadPosRankSum=0.446;SC=CCAGGTTAAGGTCATTAGAAA;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=138;TCR=124;TR=146;WE=84208343;WS=84208325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,179:0.56:320
chr16	84208442	rs67628212	T	C	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.095;NF=24;NR=62;PP=1489;ReadPosRankSum=0.853;SC=GCATAAAGCATTGAATTCCCC;SOR=0.644;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=41;TCR=109;TR=86;WE=84208454;WS=84208432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,93:0.57:164
chr16	84208446	rs111554344	AT	A	5960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=97;PP=2948;SC=AAAGCATTGAATTCCCCCATA;SOR=2.115;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=1;TCR=99;TR=98;WE=84208454;WS=84208432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	84208495	rs62049864	T	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=582;ReadPosRankSum=-0.359;SC=AGAGTCTGGCTCTGTCACCCA;SOR=0.293;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=27;WE=84208503;WS=84208485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr16	84209498	rs4782899	T	C	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=552;ReadPosRankSum=0.115;SC=GATTCTGTTGTGAAAACAGAA;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=32;WE=84209506;WS=84209488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr16	84209634	rs2288019	C	G	5164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=81;PP=2965;SC=TGGAAAACCTCCCCACAGACA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=152;WE=84209642;WS=84209624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	84209738	rs2288020	T	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=872;ReadPosRankSum=0.449;SC=AAGAGGGACTTGGAAATCCGA;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=58;WE=84209746;WS=84209728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,73:0.61:120
chr16	84209816	rs2288022	T	C	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=929;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TCTGGCCAGCTACTGATGCCC;SOR=0.499;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=60;WE=84209824;WS=84209806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,72:0.67:107
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chr16	84211483	rs8692	C	T	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=29;PP=932;SC=ATGGTTTAATCATAAATGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=84211491;WS=84211473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr16	84213114	rs2230130	C	T	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=42;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.318;SC=CCTTGCGGAGCACACCCAGCC;SOR=1.645;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=58;WE=84213122;WS=84213104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,65:0.71:92
chr16	84213434	rs2230129	A	T	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=44;PP=2305;SC=GCTGAGGGCAAGGGCGGGACG;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=118;WE=84213442;WS=84213424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	84213541	rs3217259	A	AC	3049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=45;PP=2426;ReadPosRankSum=2.339;SC=TCACTCCCCCACCCAGCACAC;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=32;TCR=88;TR=62;WE=84213549;WS=84213531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,110:0.57:193
chr16	84213748	rs2278042	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=752;ReadPosRankSum=-1.210;SC=ATCTCCCACACGCCGCCCACC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=40;WE=84213756;WS=84213738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr16	84213965	rs2278043	G	A	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1416;ReadPosRankSum=1.452;SC=GGCCCGAGAAGGAAGGGGGAT;SOR=0.390;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=86;WE=84213973;WS=84213955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,97:0.76:128
chr16	84214837	rs2303234	G	C	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=67;PP=2169;SC=GTCCCAGGCCGGTGACGCTGT;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=84214845;WS=84214827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	84215133	rs4150149	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TCAAGGGTCGCGACATGCTCA;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=73;WE=84215141;WS=84215123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,82:0.64:128
chr16	84215314	rs3815814	T	C	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=64;PP=2721;SC=CAGCCCTGCCTCCAGCCCCTC;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=138;WE=84215322;WS=84215304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	84215390	rs2230127	T	C	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1333;ReadPosRankSum=1.992;SC=CCACCTGCATTGCCTGCAGAA;SOR=0.475;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=85;WE=84215398;WS=84215380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,95:0.66:145
chr16	84215692	rs2303237	C	T	4215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=75;PP=2596;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GATCAGTGCACGAGCTATGAT;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=261;TCF=139;TCR=122;TR=161;WE=84215700;WS=84215682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,186:0.62:302
chr16	84217062	rs4782591	C	T	3744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=79;PP=2386;SC=CCGATACCGGCACCCTCCGCG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=116;WE=84217070;WS=84217052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	84217274	rs4150136	G	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=1.475;SC=GAGCAGTGTGGAGTGAGCCCG;SOR=0.269;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=4;WE=84217282;WS=84217264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr16	84218606	rs4150126	G	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=620;ReadPosRankSum=1.705;SC=CTGGAAACAAGGACCAAGCAC;SOR=0.598;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=35;WE=84218614;WS=84218596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr16	84224805	rs8044351	G	C	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=855;SC=GCGCGAGATAGGGCCTAGCGC;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=84224813;WS=84224795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	84224967	rs8044695	G	A	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=26;PP=1224;SC=AGTGCCTGGGGGCCCGCGCCC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=84224975;WS=84224957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	84225327	rs8049081	C	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=36;PP=1177;SC=ACGTGGGGAGCAGGGGGTCTG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=84225335;WS=84225317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	84225372	rs111685508	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.410;SC=GCTCAGAGACACCGCCGGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=9;WE=84225380;WS=84225362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr16	84228199	rs11864937	G	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=307;ReadPosRankSum=0.432;SC=GTAATGGAGGGAGGGCCAGGC;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=29;WE=84228207;WS=84228189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr16	84228237	rs11646787	A	C	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=41;PP=1177;SC=GGACAAGAGGACTGAGGCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=84228245;WS=84228227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	84228279	rs35446963	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GTGGCTGTGCGTGTGAGCAGG;SOR=1.927;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=21;WE=84228287;WS=84228269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr16	84228305	rs11864916	C	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.738;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GGTTGCTGTACAAACCATCTG;SOR=0.069;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=8;WE=84228313;WS=84228295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr16	84228612	rs35353940	CT	C	9146.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=99;PP=2951;SC=CGGACCCAGGCTTGTAGTGTC;SOR=0.945;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=52;TCR=104;TR=151;WE=84228620;WS=84228602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr16	84228770	rs11149631	G	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,54:0.30:180
chr16	84229436	rs62049905	G	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=479;ReadPosRankSum=0.660;SC=CCCCCACCTCGGAAGGTGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=30;WE=84229444;WS=84229426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr16	84229559	rs2303238	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=35;PP=1523;SC=TGTCAGCCAGTGACAAGCTGG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=84229567;WS=84229549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	84229580	rs2303239	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=606;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CACGCTGGGCCGTGCTGGGGC;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=38;WE=84229588;WS=84229570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr16	84230067	.	GCAACCCCTTCGCT	G	1062	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=1062;QD=274.25;SC=TAATCCCAGCGCAACCCCTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=4;WE=84230087;WS=84230057;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,4:0.19:21
chr16	84230082	.	AACCCCTTC	A	233.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=9.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.233;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr16	84230091	.	GCTCAA	G	230.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.688;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.834;SOR=3.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr16	84230096	.	A	G	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=0;PP=53;QD=10.9714015684;SC=CCTTCGCTCAACCCCTTCCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=8;WE=84230104;WS=84230086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr16	84230347	rs112789102	G	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=426;ReadPosRankSum=0.068;SC=CTACCTCCTGGCCTTGAAGAC;SOR=0.719;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=31;WE=84230355;WS=84230337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr16	84230376	rs2303242	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=301;ReadPosRankSum=3.327;SC=CTGCCAAGGTTGGTTCCCCAC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=31;WE=84230384;WS=84230366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr16	84230500	rs2303243	A	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=285;ReadPosRankSum=1.443;SC=GGAGGCTCGCAGGCAGCTGTC;SOR=0.898;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=26;WE=84230508;WS=84230490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr16	84230677	rs111536022	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CATGGGTTGTGCGGGGTGAAA;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=84230685;WS=84230667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	84270381	rs244811	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=756;ReadPosRankSum=0.481;SC=TGACACACAGGCTGACGGCTG;SOR=0.624;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=52;WE=84270389;WS=84270371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,63:0.41:155
chr16	84270476	rs11646443	G	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TCGCGCAGCCGGTTCATGCAC;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=73;WE=84270484;WS=84270466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,90:0.37:242
chr16	84271158	rs3803640	C	A	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=47;PP=1643;SC=AAAGAGCAAGCAAAAGGAAGG;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=84271166;WS=84271148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	84328752	rs369797	G	T	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	84328756	rs401782	G	C	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.27;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	84328826	rs429725	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=379;SC=TGCTCCCCCAAAACGTGGCAA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=84328834;WS=84328816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	84357925	rs244786	G	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=11;PP=691;SC=AGTGAGATGGGGAGACTGAAA;SOR=1.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=84357933;WS=84357915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	84358121	rs244787	A	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=541;SC=AGGCAGTGAAAGTTTCTTATG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=84358129;WS=84358111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	84438512	rs11149650	G	A	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=15;PP=1277;SC=GACCAGAGTCGTCTTTTCTGC;SOR=1.874;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=59;WE=84438520;WS=84438502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	84444113	rs2291006	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TAGCCTGCCACGCCCTGTCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=84444121;WS=84444109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr16	84444349	rs247818	A	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=42;PP=1434;SC=GCTGACCAAGATGGTTCCTCC;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=84444357;WS=84444339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	84455961	rs2288573	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=230;ReadPosRankSum=0.683;SC=GGGGTGACAGAGAGATTCCAC;SOR=0.100;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=19;WE=84455969;WS=84455951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr16	84456705	rs185063	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=298;ReadPosRankSum=1.142;SC=ATCACTGAAGCTGTAGGATGG;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=24;WE=84456713;WS=84456695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr16	84473004	rs3085208	C	CTT	2185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.428;NF=12;NR=23;PP=1481;ReadPosRankSum=0.258;SC=GGCAACTTCTCTTCTATAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=35;WE=84473012;WS=84472994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,56:0.67:83
chr16	84473137	rs247904	G	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=515;ReadPosRankSum=0.305;SC=CGAGGTGAGTGCCAAAGGAAT;SOR=0.375;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=30;WE=84473145;WS=84473127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr16	84473192	rs931077	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr16	84473195	rs247903	T	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-1.656;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr16	84481995	rs247891	T	C	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=136;SC=GTCCAGCACCTGTGAACAGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=84482003;WS=84481985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	84485573	rs247885	C	A	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=54;PP=2885;SC=TGACGTTTCTCGGTCTTGTGG;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=95;TCR=54;TR=149;WE=84485581;WS=84485563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	84486700	rs193704	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.888;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-2.142;SC=GAGGGGTGGGGACGCGGGCCT;SOR=1.270;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=16;WE=84486708;WS=84486690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr16	84486867	rs2435172	A	G	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=57;PP=2505;SC=CTTGGCTGGCAGTGGGGCTGG;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=130;WE=84486875;WS=84486857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	84487056	rs247884	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=195;ReadPosRankSum=0.071;SC=CTCATGCGTCCGTCGGGTGAC;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=15;WE=84487064;WS=84487046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr16	84488676	rs113623854	A	AGG	1610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;NF=3;NR=31;PP=523;SC=GTGGAGATAGAGGGGGGGGTC;SOR=1.845;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=34;WE=84488684;WS=84488666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	84488754	rs247882	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.549;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CAACCCCAAGTACCAACAGCC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=84488762;WS=84488744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr16	84492683	rs693552	A	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.27;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chr16	84493032	rs3743654	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1659;ReadPosRankSum=0.676;SC=TCTCTTTACCCACCTGCGGGG;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=86;WE=84493040;WS=84493022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,92:0.67:138
chr16	84493080	rs3743655	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=503;ReadPosRankSum=-1.194;SC=CCAAGGCTATAGGGATGAACA;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=38;WE=84493088;WS=84493070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr16	84493144	rs410388	C	G	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=61;PP=1987;SC=TGTTGCACTGCAGTGAGACTG;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=92;WE=84493152;WS=84493134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	84493216	rs377261	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=70;ReadPosRankSum=0.184;SC=TGGAACTTTCTGCTCCCTCTG;SOR=0.105;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=9;WE=84493224;WS=84493206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr16	84493927	rs35858301	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=296;ReadPosRankSum=0.527;SC=GGCGGAGCCTGGAGCCTGTTT;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=19;WE=84493935;WS=84493917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr16	84493954	.	G	GA	980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=335;ReadPosRankSum=0.357;SC=GCGCAACGTTGGGGGGGGTCC;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=19;WE=84493962;WS=84493944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr16	84494020	rs393515	G	T	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=33;PP=1406;SC=TTGGCCTTACGGGGTGGTCTT;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=73;WE=84494028;WS=84494010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	84494275	rs2241640	C	T	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGGTAGAGCCCGTTGACAAAG;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=96;WE=84494283;WS=84494265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,110:0.66:166
chr16	84495457	rs143506642	G	C	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=734;ReadPosRankSum=-1.102;SC=CAGAGCTGCTGTGTGTTCTCG;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=46;WE=84495465;WS=84495447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,53:0.31:169
chr16	84495761	rs34205686	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=73;ReadPosRankSum=-1.398;SC=GGGAACGACAGGTGACCTCGA;SOR=0.871;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=9;WE=84495769;WS=84495751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr16	84497212	rs1560247	C	T	2690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=33;PP=1658;ReadPosRankSum=0.405;SC=TGTTTTCTCCCTTGGCAGATT;SOR=1.003;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=96;WE=84497220;WS=84497202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,114:0.68:167
chr16	84513463	rs899250	T	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=379;SC=GCTGCAGGCGTTGCCCTCTAC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=84513471;WS=84513453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	84520396	rs422145	A	G	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=50;PP=2164;SC=AAGAGCAGGCACCAGCGGTGC;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=84520404;WS=84520386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	84520537	rs431818	T	C	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=42;PP=1397;SC=GAGCACAGGATGAGAAAGCCC;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=75;WE=84520545;WS=84520527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	84520780	rs378384	G	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=144;SC=ACTGAGCACAGAAAACAGGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=84520788;WS=84520770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	84528235	rs62050761	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=371;SC=TTTCCAGTGTTGTCTTCCCTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=84528243;WS=84528225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	84528293	rs2082037	C	T	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=999;SC=TTTTTCTTCACGGGACATGAG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=84528301;WS=84528283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	84528317	rs2435171	G	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=26;PP=1383;SC=TCACAACCTGGTAAAAATGAG;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=84528325;WS=84528307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	84600347	rs247860	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=9;PP=470;SC=CATGGCTTCTTTTCTCCCTGG;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=84600355;WS=84600337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	84600595	rs12929880	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=-2.106;SC=GCGTTCCTATTAAGAAGGAAG;SOR=1.016;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=12;WE=84600603;WS=84600585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr16	84600676	.	AAATGGAAATTCAGCAGCAGAGTCAGTC	A	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr16	84600695	.	GAGTC	G	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=111;QD=46.0;SC=TTCAGCAGCAGAGTCAGTCAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=84600706;WS=84600685;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
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chr16	84695490	rs12928590	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=719;ReadPosRankSum=0.129;SC=CGCTGCTGCACGCCAACAGCG;SOR=0.841;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=44;WE=84695498;WS=84695480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,56:0.60:94
chr16	84774120	rs4510001	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=128;ReadPosRankSum=0.115;SC=TGTATTTAATTGCTGAATCAC;SOR=1.445;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=12;WE=84774128;WS=84774110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr16	84778685	rs1862792	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=587;ReadPosRankSum=-2.035;SC=TATGGGTGACATGCCCCCGTC;SOR=0.644;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=53;WE=84778693;WS=84778675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,69:0.33:211
chr16	84792428	rs7202832	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=771;ReadPosRankSum=2.141;SC=CCTTCCTGGACGCCGTCCGCA;SOR=0.537;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=49;WE=84792436;WS=84792418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr16	84797637	rs3213810	T	A	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1061;ReadPosRankSum=3.218;SC=GTGCCTTTTTTTTTTTTGCTG;SOR=0.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=63;WE=84797645;WS=84797627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,73:0.82:89
chr16	84798003	rs35893650	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=648;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTGCCTGCTCTTCTCTTGCAC;SOR=1.099;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=32;WE=84798011;WS=84797993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr16	84808824	rs774298	C	G	3245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1990;ReadPosRankSum=0.721;SC=CCTATCGGCTCTTTGCAGGTG;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=112;TCR=68;TR=120;WE=84808832;WS=84808814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,139:0.67:207
chr16	84808900	rs774299	G	A	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.390;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=80;PP=2074;ReadPosRankSum=-2.010;SC=CTGGGCACAGGTTTGCTGCAA;SOR=0.979;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=217;TCF=100;TCR=117;TR=140;WE=84808908;WS=84808890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,164:0.65:251
chr16	84808969	rs2303232	G	C	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=44;PP=1096;ReadPosRankSum=0.884;SC=GAGTCGGGGAGTCACGTGAGA;SOR=1.270;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=55;WE=84808977;WS=84808959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr16	84808984	rs774300	T	C	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GTGAGAGTTTTACCTGAAACT;SOR=1.789;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=47;WE=84808992;WS=84808974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr16	84872051	rs1546124	G	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=102;ReadPosRankSum=1.303;SC=AGCTCTGCCCGAGGAGCCCAG;SOR=0.627;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=7;WE=84872059;WS=84872041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr16	84882911	rs4783086	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=0.195;SC=CCCTCCCTCCTACCTGCCCGT;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=14;WE=84882919;WS=84882901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr16	84882974	rs4783087	C	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=305;ReadPosRankSum=0.829;SC=ACTGAGTGAGCGGTTTCTGCC;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=24;WE=84882982;WS=84882964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr16	84883102	rs8061351	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GCTCGGGGCCCATGTGCACGC;SOR=0.407;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=25;WE=84883110;WS=84883092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr16	84883195	rs140532417	A	ATTG	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=215;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CCCCTGGGGGATTGTCAAATC;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=84883203;WS=84883185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr16	84884072	rs4782673	T	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=588;ReadPosRankSum=-0.138;SC=ACCCTTCACCTCGTACCTCTT;SOR=1.390;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=36;WE=84884080;WS=84884062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr16	84884116	rs4783090	A	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.718;SC=AGGCCAAATGATATCACCCTT;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=74;WE=84884124;WS=84884106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,78:0.69:113
chr16	84888541	rs2646127	T	C	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.06;MQRankSum=0.726;NF=26;NR=63;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TCACCCCTCCTGGCCCTATTT;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=40;TCR=96;TR=89;WE=84888551;WS=84888531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,110:0.66:166
chr16	84888597	rs2646126	C	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=731;ReadPosRankSum=-1.695;SC=TGAGCTGAGCCTCATCTCCAG;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=34;WE=84888605;WS=84888587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr16	84900577	rs150433030	C	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=572;ReadPosRankSum=1.278;SC=TGAAGAAAACCATGTTTGGCT;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=60;TCR=91;TR=47;WE=84900585;WS=84900567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,62:0.33:187
chr16	84940360	.	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
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chr16	85011423	rs57465878	CA	C	38.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=35;SC=AAAATAATTGCAATGATTTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=85011431;WS=85011418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr16	85011622	rs8044638	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=153;ReadPosRankSum=1.503;SC=CTAGAATGAGGGGGAGATTGG;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=13;WE=85011630;WS=85011612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr16	85015541	rs16975086	G	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.803;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TGACTTCCCCGGGCTTCAGCT;SOR=0.430;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=68;WE=85015549;WS=85015531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,69:0.62:111
chr16	85023855	rs931713	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=542;ReadPosRankSum=0.452;SC=CAGCCACACCCGAGGACACTA;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=36;WE=85023863;WS=85023845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr16	85112002	rs2291967	T	G	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=71;PP=2219;ReadPosRankSum=0.222;SC=GTGTCATCATTGTGCCTTCTC;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=127;WE=85112010;WS=85111992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,157:0.70:225
chr16	85112068	rs2291966	C	G	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=55;PP=1383;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCTGGTGAGTCTGCCCAGGCA;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=78;WE=85112076;WS=85112058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,92:0.71:129
chr16	85120609	rs2291962	A	G	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=14;PP=954;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TCCCAGAGACAAGGGCCCAGC;SOR=0.316;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=93;TCF=74;TCR=19;TR=58;WE=85120617;WS=85120599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,60:0.61:98
chr16	85133872	rs3764278	G	C	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CAGGGTGGGTGGGATCCGATG;SOR=0.419;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=76;WE=85133880;WS=85133862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,98:0.72:137
chr16	85138905	rs72807606	G	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=1.271;SC=AGCCCAGGGCGCCTCCCATCC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=85138913;WS=85138895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr16	85139173	rs8050910	G	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=617;ReadPosRankSum=0.766;SC=CTTGCTAATTGGGTCATCAAA;SOR=0.148;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=37;WE=85139181;WS=85139163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,41:0.73:56
chr16	85690338	rs4843185	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GCCCTGAATCGCAGCACCTGC;SOR=0.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=11;WE=85690346;WS=85690328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr16	85690878	rs34805959	C	CA	858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.369;NF=18;NR=4;PP=900;ReadPosRankSum=-1.551;SC=TGTTTCCCCCCACAGAGAAGC;SOR=1.308;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=22;WE=85690886;WS=85690868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr16	85691294	rs7404958	A	G	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=35;PP=1040;SC=CTGTTTGCCCAACATCCTGCC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=85691302;WS=85691284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	85706047	rs9940601	A	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.116;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=630;ReadPosRankSum=0.907;SC=GGTCTCAGAAAGGGAGCGGCT;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=43;WE=85706055;WS=85706037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr16	85712105	rs3815795	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=1.068;SC=TGAAATTATGCGGCATCAAGG;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=85712113;WS=85712095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr16	85720955	rs3815797	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=522;ReadPosRankSum=1.149;SC=CGGAACAGAGGGAGCACGGAC;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=27;WE=85720963;WS=85720945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr16	85721297	rs9930592	T	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=663;SC=CCAAATGCAATTAATAAAAAC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=85721305;WS=85721287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	85721332	rs138585263	AAGCGCCTCCTG	A	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.921;NF=0;NR=4;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACTCAGAACAAAGCGCCTCCT;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=85721350;WS=85721322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	85722355	rs2303204	GC	TT	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=1096;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TGAAGGCCACGCGGGAGCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=27;WE=85722364;WS=85722345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr16	85722557	.	T	C	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,68:0.64:107
chr16	85722560	rs58171120	C	G	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr16	85743732	rs2305357	C	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=244;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CGGGCCCCCACAGCCGACCCG;SOR=1.341;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=15;WE=85743740;WS=85743722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr16	85768717	rs1862733	C	T	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=667;ReadPosRankSum=1.773;SC=CAGAGGGCTTCAACTCCCCTC;SOR=0.594;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=43;WE=85768725;WS=85768707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr16	85775064	rs388855	A	G	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=6;PP=576;SC=AGCTCCAGCCAGGATTCAGGT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=85775072;WS=85775054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	85775097	rs72803098	G	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=438;ReadPosRankSum=-0.271;SC=AGGATGCAGTGAGGGTCAGGC;SOR=0.330;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=26;WE=85775105;WS=85775087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr16	85775175	rs446444	G	A	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=46;PP=1839;SC=GAACTCCCACGTGGAGAGTTT;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=99;WE=85775183;WS=85775165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	85813231	rs8587	A	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=679;SC=CACAGGCTACAAGATATTTTA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=85813239;WS=85813221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	85813526	rs301163	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=104;SC=CGGGCGGCTTGTAACAGCATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=85813534;WS=85813516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	85813880	rs301164	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=404;SC=GGTATCATGCTTCTGGAGAAA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=85813888;WS=85813870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	85813963	rs301165	C	T	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=29;PP=2048;SC=CCAGCCCGCGCGGCAGCATGG;SOR=1.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=85813971;WS=85813953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	85814899	rs3081701	T	TAGTC	8637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=87;PP=2957;SC=GTCAAAGAAATAGGCTACCAC;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=37;TCR=96;TR=120;WE=85814907;WS=85814889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	85814995	rs301166	A	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=95;PP=2762;SC=AAAGACTGGCAGAGCCAACAG;SOR=2.203;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=30;TCR=95;TR=125;WE=85815003;WS=85814985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	85815074	rs301167	C	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=427;SC=TCTTGCTCTGCTGCCCTAGCT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=85815082;WS=85815064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	85838093	rs2599088	G	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=68;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=46.01;NF=3;NR=0;PP=49;SC=CTTCCGAGTAGCTGGGACTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=85838101;WS=85838089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	85838115	rs2733963	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=69;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=46.01;NF=3;NR=0;PP=48;SC=GGCACGTGCCGCCACGCCCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=85838123;WS=85838105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	85838166	rs2599089	G	A	185.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=1;PP=112;SC=GTTTCACCATGTTAGCCAGGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=85838174;WS=85838156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	85838195	rs2733964	A	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=4;PP=200;SC=ATCTCCTGACATCGTGATCCG;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=85838203;WS=85838185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	85838503	rs2599090	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=685;SC=GACTCTCAACTTACATGGATT;SOR=2.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=85838511;WS=85838493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	85838532	rs2733965	A	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=1006;SC=TTTATTCAATATGTTTTTCAG;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=85838540;WS=85838522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	85838653	rs2599091	T	C	3870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=67;PP=2472;SC=CCAGAAGGCATTGAAGGAGAA;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=128;WE=85838661;WS=85838643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	85838804	rs11419687	G	GA	2618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1725;SC=ACTGTCTAGAGGCAGTCTTGC;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=39;WE=85838812;WS=85838794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	85839140	rs2599092	T	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=8;PP=1056;SC=CATTTTCTTCTTTCCTTGCCC;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=85839148;WS=85839130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	85839186	rs2733966	C	T	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=23;PP=1658;SC=TGTGCACGTACGTGCGTGAAC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=81;WE=85839194;WS=85839176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	85839211	rs2075532	G	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=41;PP=2277;SC=TGTGGCCTGGGTTGGTGTATC;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=112;WE=85839219;WS=85839201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	85839543	rs2641797	C	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=942;SC=GGTGGGCTGTCGGGGACCTCC;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=85839551;WS=85839533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	85839977	rs2075553	G	C	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=9;PP=1094;SC=AGGCATTTTTGCATTCTGAAT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=85839985;WS=85839967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	85840035	rs5818557	CA	C	5662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=45;PP=2957;SC=GGGTTAATAACAGACCCGAAT;SOR=1.313;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=84;WE=85840043;WS=85840025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	85945076	rs2292980	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=1.783;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr16	85952234	rs147080359	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=468;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GGAAGCTGTTCGGGCACCTGG;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=29;WE=85952242;WS=85952224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
chr16	85953682	rs16940005	G	C	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=656;ReadPosRankSum=1.160;SC=TCTCGGCCTTGCTTGCAAACA;SOR=0.572;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=92;TCR=48;TR=53;WE=85953690;WS=85953672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,61:0.36:169
chr16	86369368	rs2581295	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=430;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CCGCAGGCCCGGGGCCTCATG;SOR=0.243;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=24;WE=86369376;WS=86369358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr16	86565826	rs3751803	C	G	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=66;PP=2618;SC=CGGGCGTCCCCGGGGAGGTTC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=135;WE=86565834;WS=86565816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	86565882	rs3751802	G	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.555;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1384;ReadPosRankSum=0.246;SC=CCCTGGTGGGGAGCCAGGGGC;SOR=0.395;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=74;WE=86565890;WS=86565872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,86:0.67:129
chr16	86574726	rs1025057	C	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=549;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCAGCAGAGACAGCATCATAA;SOR=0.565;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=47;WE=86574734;WS=86574716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,60:0.38:160
chr16	86574818	rs17192954	C	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.800;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,46:0.28:167
chr16	86575460	rs3213418	C	G	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=95;PP=2781;SC=AAAGGGGCTGCTGGGAATGCC;SOR=2.139;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=29;TCR=96;TR=124;WE=86575468;WS=86575450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	86585587	.	G	GGT	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=542;ReadPosRankSum=0.588;SC=ACCTGGAAAAGGTGTCCCCCT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=86585595;WS=86585577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	86585905	rs8046613	C	A	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=50;PP=1492;SC=CGCCCTGTTTCCAATGCAATC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=86585913;WS=86585895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	86588655	rs2354022	G	C	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=25;PP=1066;SC=GACCTCCTCGGCCGCTTCCGG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=54;WE=86588663;WS=86588645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	86588993	rs3751796	T	C	5323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=0.574;SC=CTAGTCATTGTCGAGCGCCGC;SOR=0.425;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=95;TCR=54;TR=148;WE=86589001;WS=86588983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr16	87339278	rs11646030	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=0.697;SC=CAGGTGGACGTCACCATGCCA;SOR=0.223;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=87339286;WS=87339268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr16	87349333	rs6540037	A	G	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=755;SC=CCCCACAGGGATATGTTGGGG;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=87349341;WS=87349323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	87349489	rs7193801	A	G	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=56;PP=1783;SC=GGGATGCTAGAGCACAGGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=87349497;WS=87349479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	87349529	rs7198660	T	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.44;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	87349529	.	TAATA	CAATA,CAATG	544	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=11,5;NR=37,23;PP=223,544;QD=5.37023359473;SC=TGACTCTTAATAATAAAGCCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48,28;WE=87349541;WS=87349519;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:48
chr16	87349533	rs2277850	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.375;SOR=1.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr16	87350773	rs3748393	C	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=744;ReadPosRankSum=1.501;SC=CCGGCAGCAGCGCCTGAGGCT;SOR=0.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=51;WE=87350781;WS=87350763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr16	87350997	rs4843592	A	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=527;SC=GAGCCCAACAACGCCCGCGCG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=87351005;WS=87350987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	87376605	rs2303763	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=239;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GAACAGAGTCCATCACAGCAT;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=16;WE=87376613;WS=87376595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr16	87376623	rs4843237	C	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=22;PP=753;SC=CATCCCCCACCCCAGGCAGGT;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=87376631;WS=87376613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	87377455	rs2303764	G	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=187;ReadPosRankSum=0.552;SC=GCACTGCAATGGCACAGAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=18;WE=87377463;WS=87377445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr16	87416903	rs8058715	A	T	79.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=3;PP=40;SC=CCCGCGCCCAACTGGTGGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=87416911;WS=87416893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	87426028	rs8043569	T	C	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=15;PP=470;SC=CCCAGATCCCTGCACCATGCC;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=87426036;WS=87426018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	87426256	rs72628299	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.595;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr16	87436382	rs8044820	G	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=449;SC=ATCAAAGGAAGTGTCCTGTGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=87436390;WS=87436372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	87436720	rs1054521	G	T	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=83;PP=2898;SC=AAAAAATGCAGCTCTTCTAGA;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=63;TCR=83;TR=146;WE=87436728;WS=87436710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	87436764	rs1054528	A	G	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=66;PP=1988;SC=AAAAAAAGGGATGTTACCAAC;SOR=1.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=92;WE=87436772;WS=87436754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	87445363	rs1050846	G	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=1191;ReadPosRankSum=1.437;SC=TGTAAGGGGCGTGCACGACGG;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=63;WE=87445371;WS=87445353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,70:0.61:114
chr16	87445839	rs3748400	C	T	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=26;PP=1745;SC=AGGGGGCCCACTGGCATACTG;SOR=1.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=87445847;WS=87445829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	87446053	rs2042395	G	A	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=78;PP=2965;SC=TCCCCGTGGCGGCCGTGCTGG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=148;WE=87446061;WS=87446043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr16	87449027	.	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=1.343;SC=AGGACTCTGAGAACAAAGAAC;SOR=0.242;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=12;WE=87449035;WS=87449017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr16	87452546	rs4240794	C	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=71;PP=2079;SC=AATTTACAGACAATGAAAATA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=95;WE=87452554;WS=87452536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr16	87677791	rs918367	A	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=326;ReadPosRankSum=0.886;SC=TGGCTGCTTCAACCCTGTCCG;SOR=0.252;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=18;WE=87677799;WS=87677781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr16	87678144	rs918368	T	C	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=1387;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CGCTGCTGAGTGGGCTGAAGC;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=313;TCF=152;TCR=161;TR=120;WE=87678152;WS=87678134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,132:0.38:345
chr16	87678441	rs8051448	C	T	4126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=83;PP=2939;ReadPosRankSum=0.540;SC=GCAACCGGCGCCATGGCTACG;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=107;TCR=117;TR=160;WE=87678449;WS=87678431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,170:0.68:249
chr16	87717711	rs752694	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=0.221;SC=CACCTGTGCCCCCTGCCCCCC;SOR=0.361;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=9;WE=87717719;WS=87717701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr16	87717918	rs752693	G	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=0.081;SC=GAGGGGGTGCGTGGATGGCTG;SOR=1.236;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=15;WE=87717926;WS=87717908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr16	87723838	rs34767155	T	C	7118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=125;PP=2965;SC=TGGAGACGCATCCCCAGAAAA;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=91;TCR=126;TR=216;WE=87723846;WS=87723828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr16	87729256	rs72810189	T	C	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1246;ReadPosRankSum=0.134;SC=CCATTCCCTGTGCAGCAGGTA;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=77;WE=87729264;WS=87729246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
chr16	87729334	rs34111279	C	CA	7356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=65;PP=2973;SC=CGCTCCCTCTCCCCCTGCCTG;SOR=0.913;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=122;TCF=53;TCR=69;TR=117;WE=87729342;WS=87729324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	87733993	rs76857461	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=370;ReadPosRankSum=0.048;SC=GCCGCCCTCCTGCAGTACCTT;SOR=0.462;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=38;WE=87734001;WS=87733983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr16	87734500	rs111415082	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-0.849;SC=AGGGAGGAAGCTGGAGGGCGG;SOR=1.140;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=5;WE=87734508;WS=87734490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr16	87734747	rs35750555	C	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=108;SC=ATGCACAGCGCGTGGGGGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=87734755;WS=87734737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	87735151	rs113060137	T	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=439;ReadPosRankSum=-0.166;SC=AGTGTGGGCGTGAGCTCACCC;SOR=0.067;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=25;WE=87735159;WS=87735141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr16	87735837	rs78717714	C	T	3746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=88;PP=2385;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GCCAACTCCTCCTCCACAGTG;SOR=1.008;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=230;TCF=96;TCR=134;TR=143;WE=87735845;WS=87735827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,163:0.60:270
chr16	87736160	rs113031351	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=1.046;SC=CCTCCTGGACGCTGAGCTGAC;SOR=0.960;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=18;WE=87736168;WS=87736150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr16	87741662	rs2290019	C	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=335;ReadPosRankSum=1.099;SC=ACTTGCCAGGCGCCCCTGGCA;SOR=0.344;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=27;WE=87741670;WS=87741652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
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chr16	87744756	rs60382083	A	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=5;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CCCCAATACCAAAAGGTGCTG;SOR=1.598;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=49;WE=87744764;WS=87744746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr16	87748198	rs2081981	G	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=29;PP=1469;SC=GAAAGGAATTGTGTGAGAACC;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=64;WE=87748206;WS=87748188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	87760337	rs67926154	A	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=4;PP=517;SC=TTCCCGGTCCAACGCCTTGCC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=87760345;WS=87760327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	87764267	rs9934565	A	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=819;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TGAAATAAACAAAAAGACACT;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=183;TCF=79;TCR=104;TR=59;WE=87764275;WS=87764257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,63:0.30:208
chr16	87782258	rs16943239	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=367;ReadPosRankSum=0.325;SC=CCGGAGCTCAGCTTCTCATCT;SOR=0.729;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=31;WE=87782266;WS=87782248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr16	87788864	rs2303771	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=220;ReadPosRankSum=0.455;SC=GTCCTTTCTGGTATTGTAGAC;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=19;WE=87788872;WS=87788854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,21:0.28:75
chr16	87960560	rs12922226	A	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=383;SC=CACTGCAGGGAGAGAGACGGA;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=87960568;WS=87960550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	88008712	rs71156278	C	CT	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=340;ReadPosRankSum=0.955;SC=GGCCACTCTCCGTGCTCTGGA;SOR=1.071;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=10;WE=88008720;WS=88008702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr16	88012150	rs8052854	T	G	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.32;QD=22.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr16	88017809	rs3815820	C	T	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=36;PP=1309;SC=CCATCCAGGTCCCCATGGTGG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=88017817;WS=88017799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	88052161	rs7499814	C	A	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.481;NF=27;NR=20;PP=736;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AGATGGCGCTCACGCTGCTGG;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=47;WE=88052169;WS=88052151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr16	88061150	rs74740586	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.167;NF=6;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=1.020;SC=AGCAGAGCATCGACTCCAAGT;SOR=0.844;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=10;WE=88061158;WS=88061140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr16	88066655	rs11641367	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.06;QD=45.29;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	88066659	rs11646301	C	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.32;QD=42.46;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	88104956	rs7498497	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=692;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TGTTGGAGCGCCCAGTGGATT;SOR=0.678;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=39;WE=88104964;WS=88104946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr16	88105725	rs8050209	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=726;ReadPosRankSum=1.530;SC=ACCCCGCGGCGGCGGGCGTGG;SOR=0.410;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=43;WE=88105733;WS=88105715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr16	88123598	rs8063486	C	G	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=33;PP=1428;SC=TGTCTTCTCTCTCAGGCGGCA;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=88123606;WS=88123588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	88123697	rs8063654	C	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=29;PP=1110;SC=GAGGCCCAGACCTGAGACCCC;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=88123705;WS=88123687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	88124525	rs28650772	A	G	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=179;SC=CCCACCTGCCACCTCAGAGGG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=88124533;WS=88124515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	88134285	rs11860533	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=611;SC=AGTGGGTTAGAAAACACCCGC;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=88134293;WS=88134275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	88494947	rs11648572	T	C	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=67;PP=2965;SC=TGCCCTCTCTTCCCCTGGAGC;SOR=0.946;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=158;WE=88494955;WS=88494937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr16	88494976	rs11640794	A	C	7545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=83;PP=2965;SC=CGGCCCCGAGACCCTTCTCTG;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=210;WE=88494984;WS=88494966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr16	88495407	rs7199961	G	C	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=65;PP=2965;SC=CCCGCGGGGGGCCCCGAGTGG;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=148;WE=88495415;WS=88495397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	88495654	rs12927001	A	G	5318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=96;PP=2965;SC=GCGAGTCCCCACTGCCGTCAC;SOR=1.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=153;WE=88495662;WS=88495644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	88496008	rs12918876	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=331;ReadPosRankSum=0.386;SC=GTGCGCCGCCTCCGTACCCCA;SOR=0.766;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=29;WE=88496016;WS=88495998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,37:0.27:137
chr16	88497031	rs9924504	T	C	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=63;PP=2608;SC=AGGAGCTCATTCTGAAGATCG;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=135;WE=88497039;WS=88497021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	88497400	rs9938800	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=20;PP=1376;SC=CCCGTGGCCCGTCTCGAAGCC;SOR=1.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=88497408;WS=88497390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	88497446	rs7197071	A	G	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=47;PP=2087;SC=GGGAGGCCCCAAGTGTGCTGA;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=88497454;WS=88497436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	88498221	rs4782300	C	T	9434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=118;PP=2965;SC=GCATCGCCACCGACCTTGGAG;SOR=1.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=171;TCR=118;TR=289;WE=88498229;WS=88498211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr16	88498297	rs12445417	T	G	3038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GCAGCCTGTCTGCGAACAGGG;SOR=0.828;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=364;TCF=178;TCR=186;TR=132;WE=88498305;WS=88498287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,156:0.37:424
chr16	88499539	rs9931465	C	G	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=72;PP=2965;SC=TATCCAACACCCACCCTAGCA;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=158;WE=88499547;WS=88499529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	88501034	rs12598474	G	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=759;ReadPosRankSum=-2.148;SC=CCCTGAGACCGGGCGCTCTGG;SOR=0.839;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=45;WE=88501042;WS=88501024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr16	88501971	rs3812956	T	A	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1215;ReadPosRankSum=0.106;SC=TTGGCCACTCTGGGACCTGGG;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=63;WE=88501979;WS=88501961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,71:0.66:108
chr16	88502208	rs3812954	A	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=897;ReadPosRankSum=0.542;SC=CCTGCGGAGGACAGCAGCAGG;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=69;WE=88502216;WS=88502198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,79:0.38:207
chr16	88502482	rs3812953	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=445;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CAGGCGGTCGCTTGACTAGAA;SOR=0.462;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=37;WE=88502490;WS=88502472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr16	88502505	rs1983014	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1543;ReadPosRankSum=0.488;SC=AGGAACCCGCATGTCTACGGG;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=75;WE=88502513;WS=88502495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,80:0.98:82
chr16	88504850	rs1105066	G	C	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1674;ReadPosRankSum=2.127;SC=CATGGTGTCTGAGGGGGGGCC;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=81;WE=88504858;WS=88504840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,84:0.64:131
chr16	88504868	rs904783	A	G	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=63;PP=2759;SC=GCCCCGAGGCACCTTCCACAA;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=134;WE=88504876;WS=88504858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	88505635	rs4782301	A	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=792;ReadPosRankSum=0.251;SC=CTGCCGAGCCACACACCCACC;SOR=0.748;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=181;TCF=83;TCR=98;TR=59;WE=88505643;WS=88505625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,65:0.34:191
chr16	88505734	rs4782362	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=65;PP=2181;SC=AAGATGCTTCCGAGTAATTTC;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=88505742;WS=88505724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	88555301	rs34251187	C	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=191;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AGTGAGAGCGCACCAGGAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=88555309;WS=88555291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr16	88593210	rs35678431	CT	C	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=10;NR=8;PP=746;SC=TGTTCCTACCCTCCCCCCCCA;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=18;WE=88593218;WS=88593200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	88599695	rs67712719	GGA	G	3248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	88599697	.	AG	CC	2642	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=25;NR=36;PP=2642;QD=20;SC=GCCAGAGCGGAGCCTCTGGCC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=61;WE=88599712;WS=88599687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,61:0.95:64
chr16	88599699	.	CCTCTGG	C	2684	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=36;PP=2684;QD=20;SC=CAGAGCGGAGCCTCTGGCCCA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=88599712;WS=88599687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	88599700	rs67322929	CT	C	3247.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.49;SOR=1.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	88599702	rs67873604	CTGG	C	3247.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.49;SOR=1.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	88600079	rs13335396	C	G	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=56;PP=2009;SC=GGCTCTTCCCCGGGGCCCCCA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=107;WE=88600087;WS=88600069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	88601481	rs2279777	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-0.485;SC=CTCCTGGGAACCCCGCCACGC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=16;WE=88601489;WS=88601471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr16	88620195	rs2879897	T	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=194;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TTTATACACTTTCCATTAAAA;SOR=0.519;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=14;WE=88620203;WS=88620185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr16	88620312	rs2340955	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr16	88620345	.	A	ACGCAGTGCAGAGCTGGGACGGACGCC	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.897;SOR=1.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr16	88643457	rs936621	A	G	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=21;PP=1219;SC=CCAGGAAAGTAGGGACAAGGT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=88643465;WS=88643447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	88644005	rs899728	A	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=28;PP=1162;SC=ATGAGGAGAAAGGCGAAGGCA;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=53;WE=88644013;WS=88643995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	88652794	rs12447794	C	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=246;SC=GTGCTTCTCCCTGGTGCTGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=88652802;WS=88652791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	88664758	rs3887592	T	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=767;SC=CTTCTTTCATTGTTAGCACAT;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=88664766;WS=88664748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	88666035	rs6500481	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=603;SC=CTCCCCAGAAGGACAACTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=88666043;WS=88666025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	88675177	rs9932685	A	G	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=794;SC=GCCTGCTCTTAGATGTAGTTT;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=88675185;WS=88675172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	88675194	rs9932692	A	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=2;PP=757;SC=GTTTGTGAACAGATTTCCTAA;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=88675202;WS=88675184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	88675529	rs9930974	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=521;SC=TTTTTATTTACAGTAAAAAAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=88675537;WS=88675519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	88695300	rs4782387	C	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=745;SC=GGCAGAGGGACGGGAGCCTGG;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=34;WE=88695308;WS=88695290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	88695332	rs4782306	G	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.21;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	88695338	rs4782388	C	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	88697487	rs2291160	G	A	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=167;SC=GGGGGCTCAAGGTCTTCCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=88697495;WS=88697477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	88705804	rs2254073	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=60;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TGGGCCTTGGTGGTTCTCACC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=88705812;WS=88705794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr16	88709712	rs7195830	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GCTTCGCTGCATTTATTGCAG;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=17;WE=88709720;WS=88709702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr16	88709737	rs1049255	C	T	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=29;PP=1142;SC=GTGCACCTGGCGGGAGGGCAG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=88709745;WS=88709727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	88709828	rs1049254	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=0.568;SC=CCCCGCCGCCACCGCAGCCTC;SOR=0.277;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=14;WE=88709836;WS=88709818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr16	88712712	.	T	TGCAGACCCAGGGGACGTGTGCGGACCGGGGCTGCAAAGTCTCAGCACAAG	622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr16	88712733	rs12926425	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.47;ReadPosRankSum=-2.298;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr16	88712767	rs12933505	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.532;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=691;ReadPosRankSum=0.571;SC=GGGTGTTCTCAGCCTTGATGT;SOR=3.044;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=10;WE=88712790;WS=88712757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr16	88712780	rs12933512	A	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.654;SOR=3.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr16	88712780	.	ACA	CCG	716	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=716;QD=76.9467874862;SC=CTTGATGTGGACACTAGCGGC;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=88712790;WS=88712757;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
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chr16	88713236	rs4673	A	G	3608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=66;PP=2057;ReadPosRankSum=0.509;SC=GCGGTCATGTACTTCTGTCCC;SOR=0.761;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=126;WE=88713244;WS=88713226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,159:0.68:234
chr16	88713473	rs4782308	G	A	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=1022;ReadPosRankSum=0.375;SC=GGGCCCCGCAGCCCCCGGAGA;SOR=0.561;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=56;WE=88713481;WS=88713463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr16	88713501	rs4782393	A	G	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=31;PP=1501;ReadPosRankSum=-2.271;SC=GAGCAGGAGGAGACTCACCAG;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=151;TCF=100;TCR=51;TR=90;WE=88713509;WS=88713491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,99:0.60:164
chr16	88714559	rs2306422	C	T	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=39;PP=1123;SC=GTGGGGCTCCCGTCCCGGGGG;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=88714567;WS=88714549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	88717285	rs149933335	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=-0.936;SC=CCCCACCCTGTAAGTAGCCCG;SOR=0.896;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=24;WE=88717293;WS=88717275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr16	88717386	rs8053867	T	C	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=41;PP=1170;SC=CCAGCGCCTGTTCGTTGGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=88717394;WS=88717376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	88719877	rs12926212	C	G	3439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=56;PP=1990;SC=CTACAACAGTCTACAACAGGC;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=93;WE=88719885;WS=88719867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	88721012	rs12935454	G	A	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=714;SC=CTGTCTCAGCGCCACAGCCTT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=88721020;WS=88721002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	88723538	rs112485764	T	TG	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr16	88724275	rs56812649	A	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GGATGCTCGGACCCTGCTGAC;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=6;WE=88724283;WS=88724265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	88724347	rs2279258	G	T	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=19;PP=1306;SC=GCCTGCAGCCGCGGCTGCCCC;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=88724355;WS=88724337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	88752693	rs11076698	T	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=41;PP=1938;SC=CTCCCGCCCCTCAGGGTCGAG;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=88752701;WS=88752683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	88762943	rs1132579	A	T	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.15;SOR=1.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	88772928	rs880234	C	T	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=811;SC=GCGACGGGACCCGGCGTGCCC;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=88772936;WS=88772918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	88773414	rs57958330	G	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=3;PP=1074;SC=GCCTGGGTTTGTGTGTGTACC;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=88773422;WS=88773404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	88773738	rs881633	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=505;SC=TATTCCTGCTCCTGATGGGGT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=88773746;WS=88773728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	88776141	rs4598894	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=669;SC=GGGAGGGGCCGGTGAGCCTCG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=88776149;WS=88776131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	88776297	rs4390574	T	C	7763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=110;PP=2965;SC=AGGACGCTGCTCACTGTGCGG;SOR=0.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=128;TCR=110;TR=238;WE=88776305;WS=88776287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr16	88778167	rs73262659	T	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=45;PP=1491;SC=GGATCCTCCCTCTGGTGTGGA;SOR=1.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=88778175;WS=88778157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	88778427	rs11361741	GC	G	3554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=30;PP=2595;SC=CTGATGGTGAGCGGGGGCCCA;SOR=1.485;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=88778435;WS=88778417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	88779132	rs2290895	C	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=35;PP=1164;SC=CCAGCAGCAGCATGTGCTGGG;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=88779140;WS=88779122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	88779323	.	C	T	513	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=57.98;NF=7;NR=18;PP=513;QD=21.9108485019;SC=GGTGAGGCCCCGAGAGCCCCC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=88779336;WS=88779313;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	88779328	.	GC	G	454	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=6;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=57.19;NF=1;NR=14;PP=454;QD=32.0;SC=GGCCCCGAGAGCCCCCCTTCC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=15;WE=88779336;WS=88779313;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr16	88779361	.	G	A	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9999;HP=4;HapScore=2;MGOF=54;MMLQ=16;MQ=49.08;NF=1;NR=7;PP=96;QD=16.3464015684;SC=CCCCACTCATGCCCCTGAGAG;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=88779369;WS=88779351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr16	88779655	.	T	TA	639	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=53.1;NF=15;NR=0;PP=639;QD=45.4666666667;SC=CCCCCACTCATACCCGAGAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=15;WE=88779663;WS=88779645;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr16	88779753	rs73262667	C	T	5032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=65;PP=2792;SC=CCCGAGCCCACGGCTACTCCA;SOR=1.018;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=157;WE=88779761;WS=88779743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	88779952	rs74757912	C	CCT	1790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=13;PP=1204;SC=AGTCCTGCGGCCTCGGATGGT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=26;WE=88779960;WS=88779942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	88780090	rs2290904	G	A	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=81;PP=2965;SC=ACGTGGTGGTGGTGCGGCCCA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=120;TCR=81;TR=201;WE=88780098;WS=88780080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	88780472	rs7205626	T	C	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=23;PP=2022;SC=ACGGCACCTGTCCTGGGGACT;SOR=2.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=70;TCR=23;TR=93;WE=88780480;WS=88780448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	88780518	rs3826076	A	G	4274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=54;PP=2802;SC=GGGCTTTCCCATAGCCTCCAA;SOR=1.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=98;TCR=54;TR=152;WE=88780526;WS=88780508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	88780634	rs11278302	AGGTGTG	A	6971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=91;PP=2972;SC=CACTGTGTACAGGTGTGGGTG;SOR=1.252;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=16;TCR=103;TR=106;WE=88780647;WS=88780624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	88780685	rs7191439	C	T	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=60;PP=1929;SC=GTGTGCTGTGCGCGGGTGTGT;SOR=1.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=88780693;WS=88780675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	88780923	rs8050715	C	G	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=56;PP=2965;SC=TGGGGTGATGCGGGGAGGGAG;SOR=1.114;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=140;WE=88780931;WS=88780913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	88781125	rs8043637	T	C	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=95;PP=2735;SC=CCCAGCGCTGTGGCCAGGGGG;SOR=1.219;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=153;WE=88781133;WS=88781115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	88781419	rs2306046	A	G	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=43;PP=1662;SC=GGGTGCTGGCAGGTTTCTTGG;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=88781427;WS=88781409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	88781534	rs61737996	C	T	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=56;PP=2056;SC=CCCACACTGCCGTGGCGCGTG;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=109;WE=88781542;WS=88781524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	88782217	rs35544968	G	A	11306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=156;PP=2965;SC=ATCCGCGCACGAACTTGCCGA;SOR=0.855;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=344;TCF=188;TCR=156;TR=344;WE=88782225;WS=88782207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr16	88782676	rs2290902	A	G	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=36;PP=1592;SC=GGAAGAGATTAGGGATGACCC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=73;WE=88782684;WS=88782666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	88783374	rs8044367	A	G	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=34;PP=2619;SC=GTGGTGCACCACCTTGGCCAG;SOR=1.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=90;TCR=34;TR=124;WE=88783382;WS=88783364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	88783449	rs8057031	C	G	9479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=108;PP=2965;SC=CGCCCAGCTTCAGGGTGACGG;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=170;TCR=108;TR=278;WE=88783457;WS=88783439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr16	88783521	rs6500491	T	C	12818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=188;PP=2965;SC=TGAAGAGCAGTGGGAACCAGA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=386;TCF=198;TCR=188;TR=386;WE=88783529;WS=88783511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,473:1.00:473
chr16	88783738	rs4782432	A	G	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=22;PP=630;SC=AGTATGGCACAGCGGTAGTAA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=88783746;WS=88783728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	88783903	rs7186082	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=411;SC=AGGCAGGAGAATGAAACGCAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=88783911;WS=88783893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	88785072	rs4620939	G	C	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=1;PP=85;SC=GTTACTAGGGGCCAGGGGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=88785080;WS=88785062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	88785126	rs4520817	A	G	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=55;SC=TCTTCTTTTTACTTTTTTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=88785134;WS=88785116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	88786433	.	C	T	4412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,116:0.68:171
chr16	88786437	.	C	A	4259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.055;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,106:0.65:163
chr16	88786967	rs4401037	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=874;SC=TCAGCCTGGGCCCAGTACCCG;SOR=1.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=39;WE=88786975;WS=88786957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	88787704	rs8043924	G	C	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=72;PP=2420;SC=GTCCGACCCTGGCTTCCACCT;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=88787712;WS=88787694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	88788477	rs9935872	A	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=589;SC=GCAGGCGCCTACAGGGAGACC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=88788485;WS=88788467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	88788903	rs4238687	T	G	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=44;PP=1608;SC=TCCTTTGGGGTACAAGGGAAT;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=88788911;WS=88788893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	88788934	rs4238686	A	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=37;PP=1513;SC=GGGGATGGCTAGGCGATGCCC;SOR=0.832;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=70;WE=88788942;WS=88788924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	88789666	rs11281795	G	GCCTGCT	3691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=33;PP=2875;SC=TTCCTGCCTTGCCTGCTCCTG;SOR=1.013;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=43;WE=88789674;WS=88789656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	88791703	rs78217493	G	A	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=616;SC=GTGATCATGCGGACAGGACAG;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=88791711;WS=88791693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	88792047	rs4782430	A	G	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=74;PP=2684;SC=TCCTGCGGTGAAAGTCAATGC;SOR=0.897;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=136;WE=88792055;WS=88792037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	88792097	rs4782429	A	G	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=70;PP=2293;SC=AAGCCCCTGTAGGGAGGCGGG;SOR=1.441;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=107;WE=88792105;WS=88792087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	88792118	.	G	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=573;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GATGGGGTGTGAGCACCAGGC;SOR=1.130;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=36;WE=88792126;WS=88792108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr16	88792895	rs79092320	C	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=27;PP=1099;SC=GGGTCAGGCCCAGGGCCCAGG;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=88792903;WS=88792885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	88793090	rs4516218	A	G	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	88793103	rs4424896	C	G	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.896;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=37;PP=1529;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GCGGTGGGTGCGGGGGGGCCG;SOR=1.222;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=98;WE=88793111;WS=88793080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,105:0.96:109
chr16	88793813	rs8057198	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=288;SC=GAGGTCTGCGTGCGTGCGTGC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=88793821;WS=88793812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	88793843	rs2242169	C	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=528;SC=GCCTGCAGGCCGCCATGTGCC;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=88793851;WS=88793833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	88793910	rs2242171	C	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=35;NR=20;PP=924;SC=GATTTGGGGGCGTGAATGTAC;SOR=1.467;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=55;WE=88793918;WS=88793900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	88798362	.	G	GGGAGAGGGCGGGGCAT	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-1.834;QD=4.97;ReadPosRankSum=2.241;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr16	88798365	.	G	A	426	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.62;FR=0.5143;HP=5;HapScore=2;MGOF=71;MMLQ=27;MQ=58.51;NF=1;NR=18;PP=426;QD=24.2511164499;SC=GAGTCTGGGGGGAGGGACTTT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=88798373;WS=88798355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,19:0.95:20
chr16	88798367	.	A	ATGCACTGAGTCTGGGGATGGGCGGGGTGTGGGGATGCACTGAGTCTGGGGATGGGC	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-1.834;QD=10.87;ReadPosRankSum=2.638;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr16	88802832	rs114153706	G	A	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=40;PP=1150;SC=CGGCAGAGAGGGCTGCACAGC;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=88802840;WS=88802822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	88803195	rs4782410	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=15;PP=600;SC=TCTGCAGGCCTCCCCACCCTG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=88803203;WS=88803185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	88803982	rs6500493	C	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=221;ReadPosRankSum=1.488;SC=CGCCGCAGGACGGAGCTCTGG;SOR=1.144;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=16;WE=88803990;WS=88803972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr16	88804734	rs7184427	A	G	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=56;PP=2196;SC=CCCCACCGCGACGCAGAGTCT;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=107;WE=88804742;WS=88804724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	88804924	rs34600315	TC	T	2706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=30;PP=2030;SC=ATCAGGGAACTCCCAAGACCC;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=51;WE=88804932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	88808111	rs11076707	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=416;SC=CGGGTGGGAGTGTGGATGGGT;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=88808119;WS=88808101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	88808743	rs6500495	A	G	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=40;PP=1695;SC=GCGGGGCACAATATGCAGGCA;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=84;WE=88808751;WS=88808733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	88808862	rs7201439	C	T	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=893;SC=AGGCTGGTCCCGGGGACGGGG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=88808870;WS=88808852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	88808918	rs11648555	C	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=290;SC=GCCCCCAGCCCGGCCAGAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=88808926;WS=88808908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	88809368	rs28525359	G	T	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=50;PP=2137;SC=GTTGCATCCCGATGCATGGCC;SOR=0.991;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=88809376;WS=88809358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	88809434	rs9925084	A	G	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=73;PP=2837;ReadPosRankSum=1.594;SC=CCTGCTGTGCACCAGGTCAGG;SOR=0.233;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=143;WE=88809442;WS=88809424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr16	88809480	rs9925171	A	G	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=66;PP=2411;SC=CTGTGCACCCACACCTGGCAG;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=123;WE=88809488;WS=88809470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	88809686	rs9927855	T	C	6037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=83;PP=2965;SC=AGCTCACCCTTCAGCAGGGGT;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=171;WE=88809694;WS=88809676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr16	88809773	rs8048714	G	C	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=77;PP=2813;SC=ACCCCGGCACGTGCTGGCAGG;SOR=1.065;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=130;WE=88809781;WS=88809763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	88809893	rs9933845	GG	AC	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=41;PP=2947;SC=TGGAGCTCAGGGACAGGTAGC;SOR=1.188;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=103;WE=88809902;WS=88809883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	88810129	rs8053135	A	G	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=42;PP=1263;SC=CTGACCGTGAAGCAGCCCTCA;SOR=2.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=88810137;WS=88810119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	88815647	.	CA	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=11.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-0.255;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.025;SOR=2.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr16	88815926	rs372308503	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.481;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr16	88870099	rs865103	T	C	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=11;PP=1218;SC=GCCCCGTCCCTTCCCTCCCCC;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=88870107;WS=88870089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	88870967	rs475667	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=325;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CCAGCCCCAGTACCCCCGAGG;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=28;WE=88870975;WS=88870957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,32:0.29:109
chr16	88872145	rs507329	T	C	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=20;PP=917;SC=TTTTGAGGAGTGCAATGTTGG;SOR=0.922;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=47;WE=88872153;WS=88872135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	88872229	rs480727	A	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=30;PP=1089;SC=CAAGGATGGCACCAGGAGGTC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=56;WE=88872237;WS=88872219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	88872511	rs510862	T	C	4694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=78;PP=2334;SC=TGGTGGAGCATGTCAAGGAGC;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=153;WE=88872519;WS=88872501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr16	88874632	rs572275	C	G	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=41;PP=1628;SC=CCGCGGACCTCGCCCACATCA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=88874640;WS=88874622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	88876666	rs8191489	C	G	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=48;PP=1666;SC=CTTGCTGTTACCTGGCTGTGT;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=88876674;WS=88876656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	88880811	rs11076715	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=2.243;SC=CAGGGCCAACCGGAGATTCTA;SOR=1.136;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=7;WE=88880819;WS=88880801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr16	88880965	rs11076716	C	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.778;SC=AAAGAACATGCAGTTATTCAA;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=13;WE=88880973;WS=88880955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr16	88884466	rs2303271	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=419;ReadPosRankSum=0.141;SC=GGACCAAGGCCTCCTGGTGCT;SOR=0.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=39;WE=88884474;WS=88884456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,47:0.35:133
chr16	88893013	rs3859024	C	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=227;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TGTCCAGAACCAGGAGGGCTG;SOR=0.399;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=21;WE=88893021;WS=88893003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr16	88901850	rs11076721	T	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=1.633;SC=TTCACGGAGTTCATTAAATCA;SOR=0.635;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=9;WE=88901858;WS=88901840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr16	88902183	rs1064315	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=525;ReadPosRankSum=-0.436;SC=AGACGGGTGCGTGCGTGGCGT;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=43;WE=88902191;WS=88902173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,56:0.40:141
chr16	88902276	rs12934499	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=-1.132;SC=AGAGCCACACCGTCGTCCTCC;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=25;WE=88902284;WS=88902266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr16	88902518	.	A	G	176	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=3;PP=176;QD=16.2131701959;SC=AGGTTGATGCATTCCTGTCCC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=13;WE=88902526;WS=88902508;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr16	88902780	rs12444543	A	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=457;ReadPosRankSum=0.949;SC=AAAGAAGGCTAGGGCTGGGCG;SOR=0.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=44;TCR=70;TR=35;WE=88902788;WS=88902770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,39:0.30:129
chr16	88902820	rs11076722	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr16	88902823	rs11076723	G	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr16	88907283	rs8054994	G	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=0.452;SC=AGAATCAGCTGCCGTTTCCCA;SOR=1.101;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=20;WE=88907291;WS=88907273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr16	88909028	rs71395332	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=1.678;SC=TTGATGCAGCCGCCCAGAGTC;SOR=1.362;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=14;WE=88909036;WS=88909018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr16	88909095	rs35137494	G	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=549;ReadPosRankSum=1.588;SC=TCCTGGGGGCGAGGGCCCCGC;SOR=0.337;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=124;TCF=84;TCR=40;TR=44;WE=88909103;WS=88909085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,50:0.36:138
chr16	88921493	rs12932588	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=-1.616;SC=ATGCAATTCCCTATTTACCGG;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=88921501;WS=88921483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr16	88921634	rs34150867	C	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,27:0.26:104
chr16	88926818	.	G	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.217;SC=TTTAACTTTTGAACATCATGA;SOR=0.576;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=5;WE=88926826;WS=88926808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr16	88927221	rs3826061	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CTGGAGAAGGTCCCGAGCATC;SOR=0.206;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=12;WE=88927229;WS=88927211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr16	88931363	rs141563331	A	AGGGAG	886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=9.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=1.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr16	88931914	rs889753	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,10:0.18:57
chr16	88946955	rs564705	A	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=6;PP=921;SC=GTCCTGCCCTAAGTGTGAACC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=88946963;WS=88946945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	88948971	.	GGCATGGCTGTGGGCGTGGCTGTGTGT	G	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.732;NF=1;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GCTGTGTGTGGGCATGGCTGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=1;WE=88949004;WS=88948961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr16	88958282	rs3743541	C	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=243;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GGACGGGTTTCGCATTACCTT;SOR=0.513;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=18;WE=88958290;WS=88958272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr16	88964557	rs61734177	C	G	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=838;ReadPosRankSum=1.287;SC=CCCGTCCTCTCGATCTGTAAG;SOR=0.916;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=50;WE=88964565;WS=88964547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr16	89160452	rs9938075	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-1.416;SC=GGCCGGGCGCAGAGCTCTCGG;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=9;WE=89160460;WS=89160442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	89166988	rs72817434	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	89167066	rs57558972	C	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=296;SC=TTGCCTTTCTCCAGCTCGGCC;SOR=2.124;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=18;WE=89167083;WS=89167056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	89167075	rs11273288	C	CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG	1891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=2422;SC=TCCAGCTCGGCCGCCTGTCAG;SOR=2.387;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=89167083;WS=89167056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	89167094	rs7188200	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=25;PP=1191;SC=AGTGCAATGCTGCCCCATGTG;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=89167102;WS=89167084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	89167138	rs11547019	G	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=5.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.267;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=1.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,33:0.27:123
chr16	89167140	rs7201122	G	C	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=40;PP=1301;SC=GCGCCTTGGCGTCCTGCCGGC;SOR=1.281;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=107;WE=89167148;WS=89167128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	89167395	rs6500526	C	T	8184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	89167404	rs7193255	T	C	8301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.46;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	89167431	rs6500527	G	C	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=85;PP=2965;SC=CCCAGTGGGCGTCATGGATGA;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=71;TCR=86;TR=156;WE=89167451;WS=89167421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	89167443	rs6500528	T	C	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=90;PP=2816;SC=CATGGATGAGTGGCGGTGTGG;SOR=0.977;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=159;WE=89167451;WS=89167421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	89167458	rs6500529	C	A	5095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=89;PP=2965;SC=GTGTGGCAGTCCCCCTCTACA;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=165;WE=89167466;WS=89167448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	89167792	rs8060043	C	T	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=53;PP=1523;SC=TTTCGGTGACCGCACAGCACT;SOR=3.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=61;WE=89167800;WS=89167782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	89168981	rs4782457	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=693;SC=AGTCTTGCTCTTGCTCTCAGC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=89168989;WS=89168971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	89169205	rs4782456	C	G	5380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=78;PP=2393;SC=CACCCTCAGACTAGGCGCCTT;SOR=1.539;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=114;WE=89169228;WS=89169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	89169219	rs10578141	CCT	C	4740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=65;PP=2966;SC=GCGCCTTTCCCCTGTCGGGGC;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=72;WE=89169228;WS=89169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	89169312	rs4782455	T	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=664;SC=AGACTAGGCATCTTTTCCTGG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=89169320;WS=89169302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	89178457	.	G	GTGCCTGCTCATCTTCCCACCGAGTGCTTCCTTTCCTCCGCCGCCGTGGGTCTC	1731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=91.14;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	89178773	rs4782449	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=917;SC=TTTCCTTTCAATGTTCCCTCT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=89178781;WS=89178763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	89180664	rs9940965	C	G	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=21;PP=1419;SC=CAAGGGCCGCCTCCTGAGGGG;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=89180672;WS=89180654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	89180883	rs3743979	G	A	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=51;PP=1434;SC=GACCACTGCCGTGCGCCTGCC;SOR=2.336;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=63;WE=89180891;WS=89180873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	89180935	rs3743980	G	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=644;SC=CTTCCACTGTGCTCTGAGCCC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=89180943;WS=89180925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	89187378	rs3743983	G	C	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=43;PP=1091;SC=AGGCCCCCCAGGGTGGTTACA;SOR=2.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=89187386;WS=89187368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	89188672	rs8058601	C	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=14;PP=688;SC=GGCCTGGGCCCCCCGCAGTGG;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=89188680;WS=89188662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	89212200	rs4302032	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=313;SC=AGCCAGCACCAGGACGAGTGA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=89212208;WS=89212190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	89217518	.	G	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=998;ReadPosRankSum=0.104;SC=AGGCATGCGGGCTCTGACGGG;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=55;WE=89217526;WS=89217508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,61:0.65:94
chr16	89220473	rs72819316	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=338;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GGGCAGTGCGCCTCAGGCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=22;WE=89220481;WS=89220463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr16	89234676	rs12597281	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=402;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GGAGCACAGCAGGGTCCAGGA;SOR=0.884;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=36;WE=89234684;WS=89234666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,46:0.35:130
chr16	89234723	rs72819343	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=641;ReadPosRankSum=0.095;SC=CTTCCTCCACACCCCGAGATC;SOR=0.805;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=55;WE=89234731;WS=89234713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,71:0.36:197
chr16	89235258	rs72819344	C	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=1.112;SC=GCCTCCTCACCCCGGGGTCCC;SOR=0.651;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=19;WE=89235266;WS=89235248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
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chr16	89251851	rs2287354	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=1.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr16	89254064	rs12929648	A	G	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=639;ReadPosRankSum=-0.364;SC=ATGGGGCAGGAGGATGGTGTG;SOR=0.600;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=92;TCF=6;TCR=86;TR=34;WE=89254072;WS=89254054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr16	89254412	rs139889439	AGGGTGGGAGGGGAGGGT	A	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.202;NF=7;NR=4;PP=2267;SC=GGCAGGAGGGAGGGTGGGAGG;SOR=0.892;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=11;WE=89254436;WS=89254402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr16	89258747	rs75791347	A	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=394;ReadPosRankSum=3.043;SC=CCGCTGCGGCAAGGACGGCGT;SOR=0.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=32;WE=89258755;WS=89258737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,38:0.30:127
chr16	89259993	rs3815615	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
chr16	89262657	rs117169628	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.532;NF=8;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=2.327;SC=GGTGTCCAGGGGGCCGGCTGC;SOR=0.937;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=22;WE=89262665;WS=89262647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr16	89263851	rs3743986	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=749;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CCAGGCTCTCTCCCCAGGCCT;SOR=0.797;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=58;WE=89263859;WS=89263841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr16	89265087	rs61732365	A	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TCCTCCAAGGAACTGTCCCCG;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=45;WE=89265109;WS=89265077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,52:0.35:149
chr16	89265101	rs74640353	C	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.014;SC=GTCCCCGGGGCCCACGCCACT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=46;WE=89265109;WS=89265077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr16	89265466	rs12926888	A	G	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=781;ReadPosRankSum=3.454;SC=TCATCAGGGCACCCAGCCCCT;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=52;WE=89265474;WS=89265456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,62:0.35:176
chr16	89267769	rs34679577	GC	G	385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	89287613	rs10586525	CAG	C	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=1.234;SC=TCCTGATACACAGTGTGTGTA;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=89287622;WS=89287603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr16	89288418	rs9931258	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=889;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TCCTGCTAGGATGGAATGACT;SOR=1.234;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=47;WE=89288426;WS=89288408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr16	89289624	rs12920028	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=599;ReadPosRankSum=-1.962;SC=GGACTTTACTGGACCCATCTC;SOR=0.853;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=43;WE=89289632;WS=89289614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,57:0.31:181
chr16	89291210	rs113560259	G	GGTGA	959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.777;NF=1;NR=17;PP=913;ReadPosRankSum=-0.601;SC=AGTTCTCCAAGGTAAGTGTGA;SOR=0.732;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=89291218;WS=89291200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr16	89291309	rs28533907	A	T	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=187;SC=GTGTCAAGTTAAGCGGCTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=89291317;WS=89291299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	89291945	rs11464538	A	AT	1432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=1455;ReadPosRankSum=-1.138;SC=TTTTTAGGTCATTCTTCTTTC;SOR=1.058;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=23;WE=89291959;WS=89291935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr16	89291948	rs12926996	C	T	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.83;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr16	89291951	rs12926997	C	T	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.67;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr16	89293271	rs28417933	A	C	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=58;PP=1945;ReadPosRankSum=0.350;SC=ACCTTGTTCAAAATTGGAGAG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=117;WE=89293279;WS=89293261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,133:0.64:207
chr16	89293614	rs4785626	A	G	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.744;SC=ACCCTGGGGAAAAGCCCTGTG;SOR=0.537;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=84;WE=89293622;WS=89293604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,106:0.73:145
chr16	89294381	rs28415940	T	C	2937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=1935;ReadPosRankSum=0.314;SC=AAGCCCTTTATATGTACGGTA;SOR=0.847;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=112;WE=89294389;WS=89294371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,130:0.62:208
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chr16	89294697	rs60437616	C	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=777;ReadPosRankSum=-1.668;SC=GAAGGACTCACACAGGAGAGA;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=48;WE=89294705;WS=89294687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr16	89295046	rs12927047	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCTCCAGATGTCCATGACTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=89295054;WS=89295036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr16	89299054	rs71158785	T	TA	855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=10.969;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.23;ReadPosRankSum=1.319;SOR=4.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr16	89299200	rs61078268	C	A	5509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=56;PP=2204;ReadPosRankSum=-0.288;SC=TGCATATGCACATCAACTCAC;SOR=0.514;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=250;TCF=150;TCR=100;TR=132;WE=89299208;WS=89299190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,152:0.51:300
chr16	89299227	rs62068537	C	T	5919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=65;PP=2526;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TGCAACTCAACTCACACCGTA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=158;TCR=126;TR=147;WE=89299235;WS=89299217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,175:0.50:351
chr16	89299268	.	A	ATCAACTCGCACTGCGTATGCAAC	760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=14.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=7.456;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.062;SOR=1.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,41:0.19:214
chr16	89299280	rs62068538	T	A	4090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.251;NF=75;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.401;SC=CAACTCGCACTGCGTATGCAA;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=290;TCF=134;TCR=156;TR=157;WE=89299288;WS=89299258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,187:0.53:356
chr16	89299851	rs35483107	G	A	3654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.45;MQRankSum=-10.965;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr16	89299851	.	GTG	ATA	2530	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=27;MQ=61.79;NF=43;NR=30;PP=2530;QD=20;SC=CTCGCACTGCGTGTGCAACTC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=101;TCR=76;TR=73;WE=89299861;WS=89299841;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:104,73:0.41:177
chr16	89299853	rs34789784	G	A	3654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.45;MQRankSum=-10.965;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr16	89299876	.	GTGCAACTCAACTCACACTGCGTA	G	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=62.97;NF=34;NR=47;PP=2964;QD=20;SC=CGCACTGCGTGTGCAACTCAA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=70;TCR=98;TR=81;WE=89299906;WS=89299866;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr16	89300015	rs62068548	A	G	8999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=132;PP=2965;SC=CTCATACTGCATATGCAACTC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=155;TCR=132;TR=287;WE=89300023;WS=89300005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr16	89300147	rs62068549	A	G	7149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=130;PP=2965;SC=CTCGCACTGCATATGCAACTC;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=109;TCR=130;TR=239;WE=89300155;WS=89300137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr16	89345122	rs3102367	G	A	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=772;SC=GGAGACACAGGGGGTGGCTCT;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=89345130;WS=89345112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	89345408	rs3096305	G	A	5310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=80;PP=2965;SC=CGGGCTGGAGGAAGCCGTGAC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=153;WE=89345416;WS=89345398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr16	89350038	rs2279348	G	A	7132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=1.568;SC=CTCCCGGTGCGCCTCCTCGGG;SOR=0.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=102;TCR=120;TR=220;WE=89350046;WS=89350028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr16	89350178	rs2279349	G	A	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=46;PP=1982;SC=TATGCTTTTCGGTCTGCTCTT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=89350186;WS=89350168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	89371827	rs3114912	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=31;PP=970;SC=TGTTTCATATGCCAGGAGAAG;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=89371847;WS=89371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	89371839	rs2277908	G	A	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=907;SC=CAGGAGAAGCGCATCTCTTAT;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=89371847;WS=89371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	89379936	rs3102350	T	C	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=29;PP=1577;SC=ACTGCAGAGTTGTGGGCTCCA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=89379944;WS=89379926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	89389645	rs3114900	G	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	89574166	rs3809641	C	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,22:0.21:103
chr16	89577046	rs3922633	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=362;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGCACACTTACCGCCTCAGCT;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=32;WE=89577054;WS=89577036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,37:0.26:141
chr16	89590060	rs28643511	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-1.141;SC=CGCGATCACGGCTCACTGCAG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=89590068;WS=89590050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr16	89590168	rs113476208	T	TATCTC	852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,26:0.28:93
chr16	89590243	rs3803680	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=952;ReadPosRankSum=-0.838;SC=ACAGCACAGCGTTAGTCTTTG;SOR=0.842;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=227;TCF=147;TCR=80;TR=74;WE=89590251;WS=89590233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,85:0.32:263
chr16	89590667	rs3803679	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.958;SC=TGAGTGAGGGTGCGGGAGGCC;SOR=0.358;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=10;WE=89590675;WS=89590657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr16	89598356	rs116319889	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=295;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TCCCAAAGGGCGCACTGCTGC;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=24;WE=89598364;WS=89598346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr16	89598760	rs463701	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TAGGGAATGGAGCTGGTAGCT;SOR=0.212;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=18;WE=89598768;WS=89598750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr16	89612979	rs35936864	AC	A	546	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.531;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=2.491;SC=CTACTTGGGGACCCCCCCCCC;SOR=2.030;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=24;WE=89612999;WS=89612969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,27:0.87:31
chr16	89614534	rs80324518	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.411;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=826;ReadPosRankSum=-1.559;SC=ACAGGGGGCGCGCCCTGGGTG;SOR=1.654;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=41;WE=89614542;WS=89614524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr16	89629218	rs258327	A	G	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=527;SC=GAGGTCCTCCAGGTTCTCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=89629226;WS=89629208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	89645437	rs369230	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=340;ReadPosRankSum=-2.426;SC=GGTGGCTCACGCCTGTAATCG;SOR=0.902;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=27;WE=89645445;WS=89645427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr16	89649675	rs455868	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.882;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr16	89650371	rs408800	T	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=1.128;SC=CTGGGGCCTCTGGTCCCCCAC;SOR=0.373;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=15;WE=89650379;WS=89650361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr16	89652210	rs111488481	A	AG	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.367;NF=0;NR=9;PP=309;ReadPosRankSum=1.099;SC=AGGACGGGGTAGGGGGTCCTC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=9;WE=89652218;WS=89652200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr16	89653032	rs452176	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=488;ReadPosRankSum=-0.598;SC=CCTGGTAGGTGTTCAGAGCCA;SOR=0.633;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=40;WE=89653040;WS=89653022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,54:0.39:138
chr16	89653524	.	C	CCCGCCCCATG	2148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=59.28;NF=0;NR=8;PP=2148;QD=271.5;SC=AGTCCATGGCCCCGCCCCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=89653532;WS=89653514;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,8:0.28:29
chr16	89653540	.	CCCT	C	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=7.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.637;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr16	89653545	.	AGTCCG	A	659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.68;ReadPosRankSum=0.422;SOR=3.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr16	89653552	.	GGCCCCGCCCCGCC	G	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=9.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.08;ReadPosRankSum=0.590;SOR=3.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr16	89653816	rs74213330	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=1.400;SC=GCGGTTCCCCGTGAGCCGATG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=89653824;WS=89653806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr16	89653999	rs140664874	TTGAG	T	1088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=0.217;SC=GAGTGAGCGTTTGAGTGAACC;SOR=0.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=12;WE=89654010;WS=89653989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr16	89656163	rs397564	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=520;ReadPosRankSum=-1.703;SC=TCGGTTCCCCACCTCTGGCAG;SOR=0.440;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=32;WE=89656171;WS=89656153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr16	89656251	rs464349	T	C	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1127;ReadPosRankSum=0.119;SC=AAGTGGCCCCTGTTGCAGCCA;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=67;WE=89656259;WS=89656241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,78:0.66:118
chr16	89696999	rs395593	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	89703424	rs445537	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GCATCTCCTCACGTGGGACCT;SOR=1.026;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=20;WE=89703432;WS=89703414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr16	89703519	rs461115	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr16	89704365	rs1126464	G	C	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1249;ReadPosRankSum=0.552;SC=GAGGGTCTTCGAGGCTGTGGA;SOR=0.645;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=70;WE=89704373;WS=89704355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,100:0.62:161
chr16	89712889	rs460879	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=0.723;SC=TCCCACAGCACCAGAGCGTGG;SOR=0.976;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=9;WE=89712897;WS=89712879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr16	89713174	rs460984	C	T	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1229;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CCCATGGGGCCCCACTCAGCT;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=230;TCF=111;TCR=119;TR=82;WE=89713182;WS=89713164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,106:0.37:285
chr16	89713297	rs139678649	C	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=477;ReadPosRankSum=0.085;SC=TTCCTGCCCCCCCACCCAGCC;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=31;WE=89713305;WS=89713287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr16	89713539	.	AC	A	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=478;ReadPosRankSum=0.142;SC=CCTGTGAGCCACCCCTCCCGA;SOR=0.896;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=18;WE=89713547;WS=89713529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr16	89717781	rs141950187	AAAAC	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=276;SC=TCCGTCTCAAAAAACAAACAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=89717792;WS=89717778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	89720409	rs258338	T	A	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=63;PP=1838;SC=ACTCACTAGGTTCCTTCTAGA;SOR=1.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=99;WE=89720417;WS=89720399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	89724572	rs154664	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=395;SC=TTATTCTGGATCCACGCAGGC;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=89724580;WS=89724562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	89735923	rs9937322	G	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=91;ReadPosRankSum=1.534;SC=CCTTTGCATGGCACTCGCTAC;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=89735931;WS=89735913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr16	89751895	.	T	C	172	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=57.49;NF=10;NR=4;PP=172;QD=14.7693723248;SC=CGAGCTGGTCTCGCAGTGGGC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=14;WE=89751903;WS=89751885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,14:0.30:46
chr16	89753031	rs397891	G	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.194;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,12:0.16:77
chr16	89753067	rs148588932	GGGCCGTCCGCGTCTGCGCCTGCGCGCAAGAGA	G	3654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.831;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.834;NF=19;NR=21;PP=2963;ReadPosRankSum=3.364;SC=CTGCGCCGCGGGGCCGTCCGC;SOR=1.168;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=40;WE=89753106;WS=89753057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,95:0.55:173
chr16	89753971	rs258325	T	C	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=92;PP=2965;SC=GTTGGCCTTTTCTTTTTTGTT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=149;WE=89753979;WS=89753961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	89754255	rs258324	T	G	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=29;PP=828;SC=GGAAAGGGAGTTTGAGACTAG;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=89754263;WS=89754245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	89757199	rs62068364	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=-1.655;SC=CACGCAGCCTCAGCTGTCTGC;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=89757207;WS=89757189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	89758973	rs187282	A	G	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=66;PP=2133;SC=GCTGAGGCCTAACTCTGCTGC;SOR=0.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=118;WE=89758981;WS=89758963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	89760492	rs465507	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TTCCAGGCCACCACAGGCTCT;SOR=0.163;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=8;WE=89760500;WS=89760482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr16	89760552	rs460057	T	C	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=40;PP=1481;SC=AGGAGCCGGCTGTATTGAGGT;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=91;WE=89760560;WS=89760542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	89763045	rs460367	C	T	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=10;PP=1129;SC=GCCGCCTGGGCGGGCTGTCCA;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=89763053;WS=89763035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	89763263	rs462769	T	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=61;PP=2118;SC=GCAGATTGGCTCCAGCAGAGC;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=89763271;WS=89763253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	89764549	rs3751695	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=931;ReadPosRankSum=0.316;SC=GCCGGAGGGCGAAGCAGCCCA;SOR=0.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=44;WE=89764557;WS=89764539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr16	89774396	rs1110331	G	A	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGTGTCATCTGAACGAACAGA;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=85;WE=89774404;WS=89774386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr16	89774411	rs11860230	T	C	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=61;PP=2078;SC=AACAGAAGGATACCCCCGGCC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=89774419;WS=89774401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	89775422	rs59660050	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=1.981;SC=CTGAGCCACCCCTTATACCCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=89775437;WS=89775412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr16	89775429	.	C	CCCCG	150	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=61.19;NF=0;NR=3;PP=150;QD=58.6666666667;SC=ACCCCTTATACCCCGCCCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=89775437;WS=89775412;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr16	89777761	rs12920315	C	T	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1246;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CCAGGCTGGTCACGAGTGACA;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=81;WE=89777769;WS=89777751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,93:0.59:157
chr16	89778202	rs376041423	G	GC	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CTCTGGCTCCGCCCCCCACGG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=89778210;WS=89778192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr16	89778219	rs28588261	A	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.674;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr16	89778224	rs7206836	G	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=36.09;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	89782989	rs7206570	A	G	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=52;PP=2007;SC=CAGGCTGGGGAATGGGAGCAG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=94;WE=89782997;WS=89782979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	89783187	rs4785706	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=904;SC=GCTGTGCTAGCTTCAGCATCT;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=89783195;WS=89783177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	89784521	rs10468304	T	A	8415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=148;PP=2965;SC=CTGTGATCCTTTGTGCAGCGG;SOR=0.939;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=113;TCR=148;TR=261;WE=89784529;WS=89784511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
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chr16	89787340	rs117990130	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=0.462;SC=GGAACGCAGCCGGCGCTGGTG;SOR=2.147;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=89787348;WS=89787330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr16	89789311	rs8056353	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=53;PP=1332;ReadPosRankSum=-1.527;SC=TTGAGAGAGGGACAGGGCGTG;SOR=1.151;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=32;TCR=74;TR=74;WE=89789319;WS=89789301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,87:0.69:126
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chr16	89795485	rs7204478	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=0.670;SC=TGTTCGGAAACGGGATTGGAA;SOR=0.343;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=11;WE=89795493;WS=89795475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr16	89800529	rs9935559	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=0.045;SC=TACCCATCCCCGCCCCAAGAG;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=37;WE=89800537;WS=89800519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,43:0.34:127
chr16	89800550	rs7189734	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.981;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=895;ReadPosRankSum=0.786;SC=TTGGGGGTGCGTGAAGGTGGC;SOR=0.312;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=51;WE=89800558;WS=89800540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,56:0.67:83
chr16	89805261	rs1800359	A	G	2877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1760;ReadPosRankSum=-1.823;SC=TGTCCCCCACATGGCCCAAGG;SOR=0.565;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=114;WE=89805269;WS=89805251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,133:0.60:220
chr16	89812930	rs34019730	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=750;ReadPosRankSum=-1.579;SC=AGATGCCAGAGGCAGCTGTGG;SOR=0.992;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=48;WE=89812938;WS=89812920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr16	89816086	.	ATGCTGCCCTGCCCAGGTGG	A	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.629;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.821;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr16	89818491	rs3743860	T	C	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.122;SC=AATATCTTAATAGCACGCGGC;SOR=0.511;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=62;WE=89818499;WS=89818481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,64:0.70:91
chr16	89831510	rs2159116	C	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=1.141;SC=TTCTTCATTGCGCAAGTTTCA;SOR=0.597;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=26;WE=89831518;WS=89831500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr16	89836507	rs7200990	T	C	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=68;PP=2783;SC=TGAAGACGAATTGAGAAGTAG;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=135;WE=89836515;WS=89836497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	89836899	rs1800341	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=506;ReadPosRankSum=0.216;SC=GAGTCCCTGGTCTGCAGACTT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=21;WE=89836907;WS=89836889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr16	89849480	rs2239359	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=463;ReadPosRankSum=0.753;SC=CGGTACTTGCCGGGAACCAGG;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=28;WE=89849488;WS=89849470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr16	89858759	rs17226159	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGCCACATCTCACCAGACATC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=89858767;WS=89858756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr16	89862202	rs17226075	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TCAAGACAGACGTAAAAGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=89862210;WS=89862192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr16	89866160	rs7186192	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.765;NF=0;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=-0.570;SC=ACGGCACTTCAGGAGGCCGAG;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=22;WE=89866168;WS=89866150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr16	89869761	rs1800286	T	C	3759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=80;PP=2364;ReadPosRankSum=-1.679;SC=TGAAAAACCATAAAACCAAAG;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=78;TCR=121;TR=131;WE=89869769;WS=89869751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,159:0.67:236
chr16	89883007	rs1800282	A	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=435;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGAGTTCGGGACCCACGAGTC;SOR=1.044;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=28;WE=89883015;WS=89882997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr16	89902482	rs12598477	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=252;ReadPosRankSum=1.993;SC=GTTTAGGAGGTTAAGGCAGGA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=89902490;WS=89902472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr16	89911681	rs17719345	G	C	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=867;ReadPosRankSum=-0.298;SC=AGTGTTTATTGGGGTCCCGGG;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=58;WE=89911689;WS=89911671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,68:0.73:93
chr16	89922485	rs1105691	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=416;ReadPosRankSum=-0.041;SC=CCGCAGGTCCTGCTTCCCCAC;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=33;WE=89922493;WS=89922475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr16	89925556	rs7200842	G	A	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1342;ReadPosRankSum=1.238;SC=GCAGGGCCGCGTCTGGTGTGT;SOR=0.559;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=88;WE=89925564;WS=89925546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,102:0.63:162
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chr16	89973777	.	CTCCCAGT	C	1188	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=63.98;NF=1;NR=21;PP=1188;QD=55.1818181818;SC=CACCTCCCTCCTCCCAGTTCC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=89973804;WS=89973767;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
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chr16	89981303	.	G	T	133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=59.35;NF=8;NR=0;PP=133;QD=20.9714015684;SC=ACATTTGTGTGTGTGTGCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=89981311;WS=89981293;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr16	89981345	.	T	TTG	810	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=59.57;NF=17;NR=5;PP=810;QD=37.3181818182;SC=GGGTGCACATTTGTGTGTGTG;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=22;WE=89981353;WS=89981335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr16	89986144	rs1805008	C	T	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1701;ReadPosRankSum=0.743;SC=GACCCTGCCGCGGGCGCGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=100;WE=89986152;WS=89986134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,114:0.50:228
chr16	90000044	rs77681059	C	T	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=75;PP=2029;ReadPosRankSum=1.753;SC=AAGCCCAGGTCGGTGGACGGG;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=192;TCF=71;TCR=121;TR=120;WE=90000052;WS=90000034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,138:0.64:217
chr16	90000925	rs4396536	T	C	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1557;SC=TTCTCAAGACTCTGTCCAGAG;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=90000933;WS=90000915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	90002290	rs1135425	T	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=401;ReadPosRankSum=-1.842;SC=GGAGCCATCTTGCTGCCGACA;SOR=1.362;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=23;WE=90002298;WS=90002280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr16	90004868	rs56378598	C	T	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=15;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.596;SC=CTCGTGCCCTCGGTCTCTTGC;SOR=0.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=76;TCR=22;TR=66;WE=90004876;WS=90004858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,68:0.66:103
chr16	90015960	rs6500462	G	C	2605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=47;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CGCACACCGGGGTGACTTCTC;SOR=0.487;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=100;WE=90015968;WS=90015950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,120:0.61:197
chr16	90020861	rs7195043	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=2.019;SC=TTCTTCCTGCCGCGTCCTGCG;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=16;WE=90020869;WS=90020851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr16	90027626	rs8063761	A	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=-1.808;SC=TGCCTGCTTGATATCTTTAGG;SOR=0.452;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=18;WE=90027634;WS=90027616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr16	90028106	rs8048449	T	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=435;ReadPosRankSum=1.974;SC=GTGGGGTTTTTGTGAGGCAGG;SOR=0.474;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=21;WE=90028114;WS=90028096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr16	90030355	rs13330431	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=734;ReadPosRankSum=0.387;SC=GGGGCTGCCTTAGGGAGTGGA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=46;WE=90030363;WS=90030345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr16	90037828	rs4785755	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=578;ReadPosRankSum=0.748;SC=CAGCATTTCTGTGTACATGTC;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=82;TCR=75;TR=45;WE=90037836;WS=90037818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,52:0.31:166
chr16	90050880	rs4785759	A	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,11:0.19:57
chr16	90075412	rs2241084	T	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=210;SC=GGAGAGAGTGTGCTGTGTCCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=90075420;WS=90075402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	90085646	.	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=94;ReadPosRankSum=0.514;SC=AAGGGTGAGCCCTGGGGGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7;WE=90085654;WS=90085636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr16	90093969	rs3743829	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=372;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TGCCAAATGTTCCTGGGAGCA;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=25;WE=90093977;WS=90093959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr16	90094195	rs3743827	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CAGGGTGCCTACGCCGAGTGT;SOR=0.737;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=19;WE=90094203;WS=90094185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr16	90094214	rs3743826	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=0.082;SC=GTCCATCTTGCCATGTGGATC;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=90094222;WS=90094204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr16	90095561	rs3785183	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.43;MQRankSum=2.692;NF=5;NR=15;PP=273;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GGGCAGCCTACGGGGCAGGCT;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=20;WE=90095569;WS=90095551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr16	90095597	rs71137702	T	TGGGGCAGCCTACGGGGCAGGCTGC	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.60;MQRankSum=6.508;QD=9.12;ReadPosRankSum=-2.135;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr16	90099061	rs4324129	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=438;ReadPosRankSum=-0.024;SC=ACCAGGTGTGCACAGGTACGG;SOR=0.871;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=27;WE=90099069;WS=90099051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr16	90102835	rs868045	A	G	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=15;PP=1260;ReadPosRankSum=-2.014;SC=TGAGGGACGAACTCGACTTGC;SOR=0.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=61;WE=90102843;WS=90102825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr16	90103087	rs4464078	C	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1140;ReadPosRankSum=0.947;SC=AGCTCTCCACCCCAACACACC;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=62;WE=90103095;WS=90103077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,69:0.64:107
chr16	90103117	rs7498985	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=840;ReadPosRankSum=1.772;SC=TTATAAGATTGTTTGACAATG;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=52;WE=90103125;WS=90103107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,59:0.66:89
chr16	90103246	rs4374173	C	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GAAGTGTGTTCTGGTTTGTAA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=90103254;WS=90103236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr16	90104019	rs2241036	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=0.053;SC=CGTGCTACCGGCCGGCCTTGG;SOR=0.859;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=8;WE=90104027;WS=90104009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr16	90108832	rs2241035	C	T	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=72;PP=2731;SC=CCCGTTGCCTCGGCCAAAAGA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=143;WE=90108840;WS=90108822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	90109711	rs3743825	A	G	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TCGGACAGACACTGGGCCAGG;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=62;WE=90109719;WS=90109701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
chr16	90128224	rs2077426	C	G	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=13;PP=1285;SC=CAGAGCTAACCATGTTATCCC;SOR=2.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=63;WE=90128232;WS=90128214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	90133137	rs16966444	G	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.88;NF=84;NR=24;PP=2453;SC=AATGATGATGGCAGACACTGC;SOR=2.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=84;TCR=24;TR=108;WE=90133145;WS=90133127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	90141355	rs12925933	A	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=47;PP=1937;SC=CTTCATCGGAATCTTCTGTGT;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=90141363;WS=90141345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	90141477	rs7196459	T	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=39;PP=1274;SC=AGAGCTGGGATGAGGAACAAA;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=90141485;WS=90141467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	90142087	rs35256427	G	A	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=34;PP=2897;SC=CAGAGCAGTCGCTGATGCTAG;SOR=2.006;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=99;TCR=34;TR=133;WE=90142095;WS=90142077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	90161065	rs8051193	A	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.178;NF=7;NR=6;PP=141;ReadPosRankSum=0.894;SC=GCGGGCGAGGACTGGGGTGCG;SOR=0.355;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=13;WE=90161073;WS=90161055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	90161164	rs8049480	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQRankSum=-5.885;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr16	90161167	.	CT	TG	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.221;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.465;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-6.158;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=1.128;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
chr16	90161292	rs6500468	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.626;NF=5;NR=16;PP=384;ReadPosRankSum=0.880;SC=TGGCTATTGCGTTTCCTGAGA;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=21;WE=90161300;WS=90161282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr17	69368	rs62059560	G	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=396;SC=CCAGGCTGGAGTGCACCGTGC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=69376;WS=69358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	69631	rs62059561	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=21;PP=600;SC=TACCACGTGGCGTAGCAGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=69639;WS=69621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	131516	rs12942829	C	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=5;PP=251;SC=GAGGGCATATCCAGCCCACTC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=131524;WS=131506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	171104	.	C	T	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=15;PP=597;SC=GCTCTGCCCTCTGGATGACCT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=171112;WS=171094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	177359	rs67434950	G	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=28;PP=922;SC=GGCTGGGGGTGGGGAGTCACA;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=177367;WS=177349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	260299	rs4581766	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=18;PP=1406;SC=CGGCGAGGAGGAGGAGCGGGA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=260307;WS=260289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	263294	rs35229416	C	G	146.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=4;PP=94;SC=CCGACCCCGACGCCCTCAAGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=263302;WS=263284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	263622	.	A	G	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9984;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=18;MQ=45.89;NF=3;NR=2;PP=64;QD=19.7542425094;SC=CCCCGACCCCAAGGCCCTCAA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=263630;WS=263612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	423051	rs2034088	T	C	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=21;PP=784;SC=GTGGACCAAATGTCCCGGCAC;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=423059;WS=423041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	440108	rs11653961	A	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=561;SC=GTGTGTGGGGAGGTGTCGGTA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=440116;WS=440106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	463843	rs741677	A	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=21;PP=625;SC=ACAAGTCAGCATGGAATTTCT;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=463851;WS=463833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	465993	rs36070043	G	GA	347.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.596;NF=1;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-1.844;SC=TTCCTAGGAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=12;WE=466001;WS=465983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr17	504978	rs10521105	C	G	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=265;SC=GCAAGCAGACCGATTTTCAGA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=504986;WS=504968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	505162	rs4968055	A	G	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=20;PP=739;SC=GAGAAAGAGAAGTGTTTTCTG;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=505170;WS=505152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	505250	rs4968092	A	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=144;SC=GCTATCTGATAAAGAAGAACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=505258;WS=505240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	600502	rs2657633	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=327;SC=AGGGACAGCACGTGGCTGCTG;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=600510;WS=600492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	602469	rs2543781	G	C	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=264;SC=TGGCAAACTTGAGATTTCAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=602477;WS=602459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	617869	rs11558129	G	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=29;NR=18;PP=784;SC=TTACCTGCTCGATGGCCAGCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=617877;WS=617859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	636320	rs111405529	T	TCTC	3144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=21;PP=2310;SC=CGCGCGCTGTTCTCTCCGCCC;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=42;WE=636328;WS=636310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	643741	rs71357104	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=18;PP=750;SC=TTCGTCATCCGCAGAGGCTCC;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=643749;WS=643731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	648186	rs7813	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=693;SC=TTTAAGAAGCGCTGCTCGTGT;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=648194;WS=648176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	648498	rs2740349	C	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=35;PP=1532;SC=GGAAGCCAATCACGACAGCTA;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=648506;WS=648488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	649067	rs1062923	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=23;PP=713;SC=GGCTGATACAATCTCACACAG;SOR=1.151;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=649075;WS=649057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	649547	rs910925	G	C	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=48;PP=1893;SC=GAGAATCTGGGCCAGGAACTT;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=90;WE=649555;WS=649537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	649935	rs2740348	G	C	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=48;PP=1821;SC=AAGTCTGGCTGTCGGAAGAGG;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=88;WE=649955;WS=649925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	649947	rs143168627	C	T	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1715;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CGGAAGAGGGCCCTGTTACTC;SOR=0.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=84;WE=649955;WS=649925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr17	650518	rs35696687	G	A	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=77;PP=2825;SC=CCTGGGGGTCGTCCTCTGTCA;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=650526;WS=650508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	655293	rs1884726	G	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=251;SC=GTGCGCGACAGGAGGAGACGC;SOR=2.448;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=655301;WS=655283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	673895	rs2644706	C	G	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=CTAGTCCACACTTTCCTGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=673903;WS=673885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	686296	rs34512506	GT	G	215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=2;PP=166;SC=ATAGTTACCTGTTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=686305;WS=686286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	704480	rs570710	C	A	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=85;SC=CCTGAAGAGCCGGCGTTTCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=704488;WS=704470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	706862	rs598974	G	C	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=7;PP=437;SC=GCCAGGATCAGTCCTGTGCCA;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=706870;WS=706852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	707152	rs72810274	G	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=161;SC=GCCCGCCTGAGCGGCCCCTGA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=707160;WS=707142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	767377	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=50.44;NF=21;NR=33;PP=2962;QD=20;SC=CGGTGAAGGGGCACGTTCACC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=54;WE=767417;WS=767323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:98,54:0.36:152
chr17	767384	rs2644709	C	T	2909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQRankSum=-2.251;QD=32.33;ReadPosRankSum=2.590;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,73:0.81:90
chr17	767388	rs2644710	G	A	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQRankSum=-2.433;QD=31.94;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,70:0.79:89
chr17	767395	rs2644711	G	A	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQRankSum=-2.730;QD=31.80;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,55:0.72:76
chr17	767396	rs2644712	G	C	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-2.789;QD=31.67;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr17	767410	rs62068400	A	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-2.995;QD=23.70;ReadPosRankSum=-2.967;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr17	767412	rs62068401	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-3.238;QD=18.65;ReadPosRankSum=-3.250;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr17	767416	rs62068402	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-3.807;QD=14.58;ReadPosRankSum=-3.531;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr17	767418	rs62068403	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-3.960;QD=12.76;ReadPosRankSum=-3.758;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr17	767421	rs62068404	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-3.960;QD=11.65;ReadPosRankSum=-4.386;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr17	767428	rs78294349	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-3.856;QD=9.53;ReadPosRankSum=-4.038;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr17	767429	rs77855111	G	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-3.856;QD=9.53;ReadPosRankSum=-4.283;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr17	799933	rs2467248	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=626;SC=CCCCGGCCCAAGGAAGTTTTT;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=799941;WS=799923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	800050	rs7207312	C	G	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=42;PP=1705;SC=GACACTTGAACCTCTGCAGAT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=86;WE=800058;WS=800040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	900427	rs143321619	A	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=11;PP=795;SC=CCCCTGAGACAGCGGGTTCCG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=900435;WS=900417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	902869	rs12941159	A	G	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=31;PP=1367;SC=GGCCTTGGACAACGTGCTGAG;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=902877;WS=902859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	909451	rs2586306	A	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=540;SC=TCCCTGTCCTAGGCCTCGTCC;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=909459;WS=909441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	910401	rs2586305	G	A	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=507;SC=CGGTGCCAGGGTACCTGCGCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=910409;WS=910391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	910636	rs2586304	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=322;SC=CGCTGTGGGAACTCCTGAAGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=910644;WS=910626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	915368	rs333652	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=29;PP=1444;SC=AGGGCAGAGAAAGAGGCCACC;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=915376;WS=915358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	916446	rs9894835	G	A	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=35;PP=1249;SC=CCAGCTCGGAGGCCAAGCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=916454;WS=916436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	916466	rs4968074	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=32;PP=1095;SC=GAGATCTCCCCGTGGGTCAGC;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=916474;WS=916456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	953456	rs2257540	C	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=595;SC=CCTGAACCTCCGAAGCTGGGA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=953464;WS=953446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	953737	rs2257222	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=666;SC=GAGCACGGGGTGGTGGGGTCC;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=953745;WS=953727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	954003	rs11653072	C	G	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=211;SC=CATCTTGGCTCTCTCCTCCCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=954011;WS=953993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	960178	rs62069679	C	A	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=594;SC=TTACGGGAAGCCGGCCACGCT;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=960186;WS=960168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	962184	rs62069680	A	G	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=42;PP=1418;SC=ACGACACTCCACTGTGTGTTA;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=962192;WS=962174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	970251	rs2258097	T	C	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=46;SC=TACAACTTCCTGCCTCCACCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=970259;WS=970241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	970413	rs2262150	C	T	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=24;PP=704;SC=TGGCCTCAGACTCCTCGGGGG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=970421;WS=970403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	975804	rs62067901	C	T	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=14;PP=593;SC=GGACGAGGGACCTGATACTTC;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=30;WE=975812;WS=975794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	975830	rs77792616	G	A	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;SC=CTGGGTGAGGGGCCGTGCCGG;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TCF=15;WE=975838;WS=975820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	976699	rs62067902	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=611;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TTCAGGCCCTAGCCTGGCGGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=26;WE=976719;WS=976689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr17	976711	rs2258893	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=761;SC=CCTGGCGGCATGGATACCGCG;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=976719;WS=976689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	1004061	rs76815113	C	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=316;SC=GCCCTTCCCCCCCGACCTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=1004069;WS=1004051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	1012447	rs138356399	T	C	147.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=65;SC=GACCCGGGACTGCATCCCGGA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=1012455;WS=1012437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	1083083	rs62070499	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.90;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	1183354	rs6502774	T	C	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=38;PP=2017;SC=TCCGCCGCATTCCTGGACCTG;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=100;WE=1183362;WS=1183344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	1183464	rs6502776	A	G	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=52;PP=2136;SC=GGAGCAGAACAGCCAGGGCCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=1183472;WS=1183454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	1183775	rs62090189	G	A	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=CCCAGGGTGTGGAGAAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1183783;WS=1183765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	1371818	rs8080389	C	T	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=640;SC=GTGAGGAGAGCGTCATGGTGG;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=1371826;WS=1371808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	1373612	rs8081370	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=11;PP=504;SC=TGGCGCAGGACGAAGCCTCGG;SOR=1.352;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=29;WE=1373620;WS=1373602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	1375362	rs34837599	GC	G	3279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=50;PP=2670;SC=GGCGCTGACGGCCTGTCTCCT;SOR=1.080;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=63;WE=1375370;WS=1375352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	1377878	rs2286871	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=8;PP=294;SC=CATGCACCCCTGCGCCCGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=1377886;WS=1377868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	1377943	rs2286873	A	G	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=18;PP=710;SC=CGCTCCGGTCAAAGCACTGGC;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=1377951;WS=1377933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	1378168	rs9897989	CG	TA	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=25;PP=2142;SC=AGGGGAGAACCGACGTGAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=50;WE=1378177;WS=1378158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	1381005	rs2286876	T	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=294;SC=TCACAGGGAGTCTCCACAGAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=1381013;WS=1380995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	1381521	rs45456691	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=23;PP=598;SC=AGTGGCTCAGTGGGGACACAG;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=1381529;WS=1381511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	1383054	rs73292768	A	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=486;SC=GAGCCCCAAGAGGGCAACTAG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=1383062;WS=1383044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	1384066	rs4790518	A	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=23;PP=1211;SC=TCTCCTCCTCACCCCCCTCCA;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=1384074;WS=1384056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	1386094	.	G	GCACTGA	179	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=25;MQ=59.07;NF=3;NR=0;PP=179;QD=91.0556667692;SC=TCCCACACTGGGCTTCTCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=1386103;WS=1386084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr17	1386095	.	G	C	208	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=25;MQ=59.36;NF=4;NR=0;PP=208;QD=60.6928031368;SC=CCCACACTGGGCTTCTCTCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=1386103;WS=1386084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr17	1412455	rs5818804	GC	G	262.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=161;SC=GGAACGGTCTGCCAGACCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=1412463;WS=1412445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	1419853	rs3815465	C	A	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=169;SC=CAGCGGGTCCCGGCCAGAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=1419861;WS=1419843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	1424948	rs2277669	A	G	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=205;SC=ATCTGGAACAAAAAAAGCAGG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=1424956;WS=1424938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	1479741	rs6502794	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=139;SC=TTTCCTGCCTAGCCACCATTC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=1479749;WS=1479731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	1489088	rs4790208	C	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=32;PP=1261;SC=GCTCCGGGAGCAGCTGGAGTG;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=1489096;WS=1489078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	1490379	rs143498029	A	ACACTGCGTTTCCCG	980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=629;SC=TGCATTTCCCACACTGCGTTT;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14;WE=1490387;WS=1490369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	1490409	rs8078582	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=228;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=176;SC=CATTTCCCACTAAGCGTGACT;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=1490417;WS=1490399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	1493972	rs7210368	T	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=0;PP=35;SC=GGCAGACAGCTCCTGGGATGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=1493980;WS=1493964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	1493999	rs7406591	G	C	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=167;SC=TCCATGGCCCGGCTGGCCCGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=1494007;WS=1493989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	1494027	rs4790668	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=428;SC=TAACACATTCTGGCCGGTGGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=1494035;WS=1494017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	1494567	rs12953268	G	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=13;PP=631;SC=GGGTACCTGCGGCATCCGGCT;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=1494575;WS=1494557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	1495028	.	AG	A	72	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=72;QD=34.3333333333;SC=TGGGGGGGGGAGGGGGCAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=1495036;WS=1495018;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	1495045	.	C	T	41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=41;QD=18.9428031368;SC=AGAGTTAGCCCGGGGAGGCCA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=1495053;WS=1495035;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	1516480	rs7219369	T	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=42;PP=1165;SC=TTAAAAAATCTGTACTCACTG;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=1516488;WS=1516470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	1530979	rs5818816	G	GC	208.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=242;SC=AGCTCCAGGAGCCCCCCGCAA;SOR=2.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=8;WE=1530987;WS=1530969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	1538546	rs4790250	C	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=35;PP=1127;SC=ACTGTCCGGCCACCAAGTGGG;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=1538554;WS=1538536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	1538628	rs3744644	C	G	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=25;PP=1202;SC=CTTCTGCTTCCTCTGGGCCTG;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=60;WE=1538636;WS=1538618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	1538669	rs36108564	C	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=26;PP=1526;SC=CCCTCAGGACCCGACTGCGCC;SOR=1.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=73;WE=1538677;WS=1538659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	1550106	rs2293067	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=10;PP=575;SC=AGCAGGGTGACGGGCAGAGAA;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=1550114;WS=1550096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	1611433	rs4790809	A	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=19;PP=665;SC=GCAAGCAGGCAGAGTTCAGTT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=1611441;WS=1611423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	1611545	rs4790810	A	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=267;SC=GGTCAGAGGAACCCCATGACC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=1611553;WS=1611535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	1613182	.	TGGGGGCATGGGGTGGGGACATGGGG	T	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr17	1673276	rs1136287	C	T	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=969;SC=CGATCCAGCACGAGCCCCACG;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=1673284;WS=1673266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	1673405	rs12603825	G	A	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=104;SC=TGGCCTCTGCGTAAACGTGGC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=1673413;WS=1673395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	1675127	rs4274474	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=109;SC=TGCTTGTCGTCGAGTCTCATA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=1675135;WS=1675123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	1675378	rs12103559	G	A	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=30;PP=882;SC=GGGTGAGCGCGTCTCCAATTC;SOR=1.559;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=1675386;WS=1675368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	1675451	rs5008943	T	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=355;SC=TACTCTGTAGTCCTAACTGGA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=1675459;WS=1675441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	1678256	rs2269344	G	C	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=80;SC=TCCCTTGAGTGGGGCAATTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=1678264;WS=1678246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	1678338	rs3891224	A	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=599;SC=ACTATGTCATACACTTCTTTC;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=1678346;WS=1678328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	1679805	rs2071022	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=11;PP=471;SC=GACTAACCACATGCTTTCTCA;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=1679813;WS=1679795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	1680002	rs6828	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=30;PP=787;SC=AGCTGAGTTATGAAGGCGAAG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=1680010;WS=1679992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	1684605	rs58337165	G	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=10;PP=374;SC=TACAGGGGTGGGTGGTAAGTC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=1684613;WS=1684595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	1684772	rs7224977	T	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=13;PP=416;SC=TTCACTGATTTGTGAGGCAAA;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=1684780;WS=1684762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	1686410	rs9902398	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=5;PP=293;SC=CTCCACCACGTAGAGACTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=1686418;WS=1686400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	1687560	rs9892714	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=9;PP=635;SC=GAGTCCAAAACGGTATCAGAA;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=1687568;WS=1687550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	1687796	rs3815612	A	G	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=276;SC=TGCCAGGGTCAGTTATCAACA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=1687804;WS=1687786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	1690303	rs34115092	AAG	A	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=597;SC=TATTGAAAGCAAGAGAGAGTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=1690312;WS=1690293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	1690752	rs11549830	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=6;PP=343;SC=TTTCTAATCCGCTGTGACGCC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=1690760;WS=1690742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	1703543	rs3809875	G	C	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=67;PP=2478;SC=GTTGCTTTCAGGTAAACAGAT;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=123;WE=1703551;WS=1703533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	1703982	rs9913923	C	T	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=29;PP=1188;SC=ACGCATAAGCCGATGGATGAT;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=1703990;WS=1703972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	1707762	rs8067685	A	G	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=94;SC=ATGAGCGCCCAGTCCGACTTT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=1707770;WS=1707752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	1707893	rs8072508	T	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=11;PP=562;SC=GATCCTGTCCTCTCATACCAG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=1707901;WS=1707883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	1715435	rs7503422	G	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=22;PP=638;SC=AGGAAACAAAGTAAGCAGAAA;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=1715443;WS=1715425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	1731268	rs8067660	T	C	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=57;PP=1976;SC=ATGATTTCCATTCATCCACAG;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=1731276;WS=1731258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	1761367	.	G	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.86;MQRankSum=-2.792;QD=1.69;ReadPosRankSum=1.774;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,4:0.10:40
chr17	1761373	.	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.013;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQRankSum=-3.359;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.102;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,5:0.11:45
chr17	1761377	.	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQRankSum=-3.493;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.421;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,5:0.10:49
chr17	1761391	.	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQRankSum=-4.311;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,6:0.10:58
chr17	1761401	.	G	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQRankSum=-5.500;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.167;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,9:0.12:73
chr17	1761404	.	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQRankSum=-5.500;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,9:0.12:73
chr17	1761423	.	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-7.449;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=1.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,12:0.13:90
chr17	1761425	.	C	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQRankSum=-7.278;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,11:0.12:89
chr17	1761428	.	G	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQRankSum=-7.642;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=1.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,12:0.13:91
chr17	1761431	rs3809874	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=4.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQRankSum=-7.798;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,12:0.13:95
chr17	1761436	.	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-8.807;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.479;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,15:0.16:96
chr17	1761445	.	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQRankSum=-8.473;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,16:0.16:101
chr17	1761447	.	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-8.552;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,17:0.17:101
chr17	1761457	.	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQRankSum=-8.291;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,18:0.17:106
chr17	1761482	.	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-7.493;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,17:0.17:103
chr17	1787020	rs17338990	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=9;PP=561;SC=GAAACCTGTGTCTGTCGCGTA;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=1787028;WS=1787010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	1792174	rs2270412	G	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=40;PP=1321;SC=TGAGAACCACGGTTGTGTTCA;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=1792182;WS=1792164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	1800217	rs7406062	G	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=271;SC=ACATTCAGGAGGAGGCTGTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=1800225;WS=1800207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	1839674	rs9902457	G	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=264;SC=GCAGCCGAAGGCTCTACCAGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=1839682;WS=1839664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	1840468	rs9903800	C	T	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=35;PP=1408;SC=GGTCGTGGAACGCCTTGTGGT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=1840476;WS=1840458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	1933381	rs2273981	G	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=26;PP=912;SC=GCCCCCGCTGGCCGATCGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=1933389;WS=1933371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	1940232	rs1131600	A	G	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=41;PP=1481;SC=CGACTGTCCAAAGAGGTGGAG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=1940240;WS=1940222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	1943888	rs2236375	T	C	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=80;PP=2406;SC=GCCTACTTCCTGAGGTGGATG;SOR=1.144;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=129;WE=1943896;WS=1943878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	1945041	rs7216804	A	G	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=52;PP=2149;SC=GCGAGACCCTAACCAAAGTCT;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=112;WE=1945049;WS=1945031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	1945621	rs2015866	G	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=11;PP=402;SC=GCGTCCACCCGCATTCCTCCC;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=20;WE=1945629;WS=1945611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	1960974	rs77393586	C	T	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=52;PP=1524;SC=GCCGGGAGCGCGGCTCCCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=91;WE=1960982;WS=1960964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	1964759	rs145926620	C	CG	464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=13;NR=4;PP=340;SC=AACGGTTCCACGGGGGGGGGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=17;WE=1964767;WS=1964749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	1965085	rs7214308	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=144;SC=CGGGGACCCTCCCCTGCTGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=1965104;WS=1965075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	1965096	rs12939002	C	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=CCCTGCTGGCCTAGAGAGGGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1965104;WS=1965075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	1968983	rs2232486	T	C	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=26;PP=898;SC=ACTGATGAGATAGAGCCCCAC;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=1968991;WS=1968973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	1985050	rs8076897	T	C	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=128;SC=CATCCTCTCATGCCCTAGACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=1985058;WS=1985040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	2195933	rs3215741	GA	G	2531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=48;PP=1732;SC=AACTAGAACAGAAAAAACAGT;SOR=1.233;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=54;WE=2195941;WS=2195923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	2196088	rs216206	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=11;PP=532;SC=ACAACACCCACATGGCCTACT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=2196096;WS=2196078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	2196150	rs216205	C	T	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=13;PP=851;SC=AATAACGAAGCAGAGGTAAAA;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=2196158;WS=2196140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	2200434	rs170043	A	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=562;SC=CTGTATCATTATTTTATCCTC;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=2200442;WS=2200424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	2203025	rs1885987	T	G	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=30;PP=1598;SC=TTTAGCACTGTTTTTCTGCTC;SOR=0.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=2203033;WS=2203015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	2203175	rs1885986	C	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=39;PP=1827;SC=CTTCTTCAGTCGTGGCCTCTC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=81;WE=2203183;WS=2203165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	2203348	rs216194	T	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=45;PP=1627;SC=TCCCGCGGGCTGGGTCGTCGT;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=2203356;WS=2203338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	2203453	rs216193	A	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=44;PP=1928;SC=TTTCTATCTCAGCCCTGTCTG;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=98;WE=2203461;WS=2203443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	2222325	rs8081273	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=140;SC=TGTGGTTTCCCCTTTATTTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=2222333;WS=2222315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	2239612	rs116887007	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=22;NR=32;PP=1062;SC=TTCCTTCTACGTTATCTCCTT;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=2239620;WS=2239602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	2265113	rs2429906	C	A	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=34;PP=1336;SC=GGGCCAGCCCCTTCTTCCCTC;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=2265121;WS=2265103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	2266709	rs2003969	T	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=203;SC=TTCCCAAGCCTTGAGGCCAGT;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=2266717;WS=2266699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	2266799	rs745400	G	A	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=812;SC=TCGGAGGACAGGCTGGCTGCC;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=2266820;WS=2266789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	2266812	rs2003968	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=15;PP=814;SC=TGGCTGCCTGTGCCCGCGAGT;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=2266820;WS=2266789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	2267694	rs2286881	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=385;SC=AAGCTCTCAGCGGCTGAGACG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=2267702;WS=2267684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	2268139	rs2447099	G	C	154.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=145;SC=GGCCAGCAGGGTGTGATAGCC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=2268147;WS=2268129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	2268311	rs2248821	G	A	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=18;PP=772;SC=CTGCTGCCTCGGGGACAGCTA;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=2268319;WS=2268301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	2268681	rs2429908	T	C	255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=207;SC=GAAGACGCTCTGGGAGGCGGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=2268689;WS=2268671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	2270777	rs2429910	T	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=84;SC=ACCACAGGGGTTCGAACGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=2270785;WS=2270767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	2276401	rs66956940	CTGA	C	3152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=47;PP=2874;SC=TCCCATGGGGCTGATGAGATG;SOR=1.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=52;WE=2276411;WS=2276391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	2297575	rs376023207	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=9;PP=833;SC=ACGCACGCACACACACACACA;SOR=1.244;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=21;WE=2297584;WS=2297561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	2318550	rs4613098	G	C	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=27;PP=1022;SC=TCCTGTACCAGAAACATAAGG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=2318558;WS=2318540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	2318695	rs4790335	G	A	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=312;SC=AGCAACACACGACATGCATGG;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=2318703;WS=2318685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	2322776	rs1056321	T	C	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=49;SC=CAGCTCCCTTTGTGGGATTGA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=2322784;WS=2322771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	2585113	rs6628	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=23;SC=CTCCTTCGGCCCCTCCTCCCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=2585121;WS=2585103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	2595215	rs5818873	GC	G	275.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=10;PP=283;SC=AAGGGATCAGGCCCCCCCGTG;SOR=4.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=2595223;WS=2595205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	2595245	.	GCCCCGCCACGCCCCCGCCCCGCCCCCGC	G	141.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.37;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	2595964	rs2302199	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=16;PP=676;SC=GCTGGCTGCTGGCGAAGCAGT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=2595972;WS=2595954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	2597717	rs12941928	A	G	2975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.50;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	2597723	rs59086185	G	A	2838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	2597734	rs60218044	A	G	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=30;PP=1200;SC=CAGCGGGGACACAGCGGGGAC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=2597742;WS=2597707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	2597969	rs2277663	C	T	74.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=1.282;SC=ACTGCCCCACCCGGCCCCCGG;SOR=1.447;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=4;WE=2597977;WS=2597959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr17	2598627	rs1003398	T	C	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1984;ReadPosRankSum=0.846;SC=TCCATCCCAGTCCCACAGCTC;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=92;WE=2598635;WS=2598617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr17	2651341	rs9898615	G	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=326;SC=GCAACTAGAAGCACCCCACTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=2651349;WS=2651331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	2699935	rs123059	T	C	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=35;PP=1158;SC=TTAAGTGCATTGGCGGCCGTG;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=2699943;WS=2699925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	2703967	.	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=424;SC=ATTCCAGTCCGAGTCCATGGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=2703975;WS=2703957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	2868935	rs12950923	T	C	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=264;SC=GGGTCATCCTTAGGTAGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=11;WE=2868943;WS=2868925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	2883588	rs17762452	C	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=19;PP=638;SC=CAGGTCCAAACTGAAGACGGT;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=2883596;WS=2883578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	2894569	rs8071529	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=20;PP=843;SC=AATTCCTGCCCTTATTCCTGT;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=2894577;WS=2894559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	2908816	rs2289648	A	G	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=37;PP=1247;SC=GGATGGAGCCAAATTCAGGCT;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=2908824;WS=2908806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	2921210	rs60254420	CGT	C	253.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=6;NR=2;PP=333;SC=CCTCTGTGACCGTGTGTGTGT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=2921219;WS=2921200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	2921251	rs8064800	A	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=424;SC=GTATGTGTGCACGCATACGTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=2921259;WS=2921241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	2923597	rs2304981	C	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=166;SC=CTGTGACTGGCCTGAGTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=2923605;WS=2923587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	2923767	rs2304982	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=35;PP=1433;SC=AATTTCATCGACAGCCTCCAG;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=2923775;WS=2923757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	2923933	rs11652061	T	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=21;PP=607;SC=TTGCGGGGTCTGTCAACCCCC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=2923941;WS=2923923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	2924011	rs4790416	T	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=295;SC=AGGAGATGGCTCTGCCTTCAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=2924019;WS=2924001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	2935591	rs4239039	T	C	130.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=99;SC=CCTGGGGTCCTGAATCCCTTC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=2935599;WS=2935581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	2966032	rs202049082	C	G	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.49;QD=30.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	2996217	rs769423	C	T	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=35;PP=1844;SC=AAACAGGATCCGCTGCTGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=2996225;WS=2996207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	3100802	rs2241094	C	A	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=30;PP=1600;SC=CCCTTTCATGCTGAAGAAGCC;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=80;WE=3100810;WS=3100792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	3101076	rs2241092	G	C	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=22;PP=1110;SC=ATCTCTTGGGGAGCAAGTTCA;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=3101084;WS=3101066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	3119008	rs4325604	T	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=23;PP=1020;SC=CATCCTCTTCTTGTTCATTTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=3119016;WS=3118998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	3119767	rs769427	C	T	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=30;PP=1088;SC=AATGTTAAATCCTTTCATCTA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=3119775;WS=3119757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	3119871	rs17174920	C	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=388;SC=CATTGGATACCGTAGTCACCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=3119879;WS=3119861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	3182309	rs2014057	G	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=310;SC=TCAAAGCCCCGTGGCGAGTCC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=3182317;WS=3182299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	3195503	rs703903	C	T	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=24;PP=1201;SC=GGCCAGGAATCGGTCATAGGC;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=3195511;WS=3195493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	3213690	rs61734050	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=29;PP=1341;SC=CTACAGCCCATCCTCTTTGTC;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=3213698;WS=3213680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	3214181	rs231678	T	G	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=49;PP=2161;SC=GCTCTCCTGCTCCAGTGTTCA;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=3214189;WS=3214171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	3301549	rs150988	G	A	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=32;PP=1263;SC=GGAGATGGGAGTCCAGTCGAA;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=3301557;WS=3301539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	3324004	rs146946227	C	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	3324255	rs769432	C	T	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.08;QD=24.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	3336162	rs11867612	T	C	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=19;PP=619;SC=CAAGTATTACTGTCATAGAAG;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=3336170;WS=3336152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	3336260	rs61739591	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=16;PP=679;SC=GGGTCAGCATAGGGGTCACCA;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=3336268;WS=3336250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	3337057	rs769431	A	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.64;QD=27.82;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	3352309	rs11556563	T	C	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=72;PP=2272;SC=TAATTGTTTTTGTTGTTGAGC;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=3352317;WS=3352299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	3417123	rs906418	C	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=359;SC=CCGGACTCCACCATCCCTCAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=3417131;WS=3417113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	3418119	rs10579788	AGTT	A	392.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=305;SC=GTCACACCAAAGTTGTTGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=3418129;WS=3418109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	3419689	rs8081785	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	3419689	.	CA	TG	837	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=16;NR=5;PP=837;QD=42.4032321363;SC=ATCCTGTCACCATCCTGCCCC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=21;WE=3419698;WS=3419679;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,21:0.88:24
chr17	3419690	rs8082339	A	G	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.66;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	3424183	rs8079980	A	G	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=121;SC=AATTGTTGCCAAGGCCGCCAT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=3424191;WS=3424173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	3424507	rs925101	T	C	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	3427442	rs62069862	A	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=412;SC=CCCCATCTGAAAAATGGCCAT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=3427450;WS=3427432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	3446885	rs322937	T	C	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=42;PP=1768;SC=TTCAGCCGCCTCTTTTTCCTC;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=3446893;WS=3446875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	3447914	rs1039519	C	T	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=21;PP=790;SC=TCACATCATCCTGAGGAGACT;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=3447922;WS=3447904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	3457954	rs11453205	T	TG	619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=519;SC=AAGGGCTCCCTGGGGGGGTGC;SOR=1.828;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=15;WE=3457962;WS=3457944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	3458072	rs322965	T	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=27;PP=1161;SC=TCTGGCAGGATGGCAGGGTTC;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=3458080;WS=3458062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	3475367	rs224548	T	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=731;SC=TGTCCACAGGTGAGCCCCAAA;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=3475375;WS=3475357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	3475405	rs224549	C	T	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=20;PP=1050;SC=CAGGTGGAGCCTGGGCATTAC;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=3475413;WS=3475395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	3475564	rs224550	C	T	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=983;SC=ACACCAAGGGCAGAGGAGCTG;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=3475572;WS=3475554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	3480396	rs8078936	C	T	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=26;PP=1353;SC=CCTGCCCTCCCCCAGCGCTGA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=3480404;WS=3480386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	3480447	rs8065080	T	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=46;PP=1341;SC=AAGAAGACGATGTAGACAAAC;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=3480455;WS=3480437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	3486702	rs224534	G	A	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=25;PP=950;SC=ATAGTCTCCAGTTTTTTCCAT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=3486710;WS=3486692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	3489244	rs161394	G	A	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=578;SC=AGAGAAGTGAGGTTCCCTCCT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=3489252;WS=3489234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	3493421	rs56265426	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=27;PP=1156;SC=CAGGGCCCAGGTGGGCCTCAG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=3493429;WS=3493411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	3493533	rs161387	A	G	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=32;PP=1245;SC=GGTCTGCCACACTGTCTCCCT;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=3493541;WS=3493523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	3514028	rs224496	G	C	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1545;SC=CCACGCCCCAGTCCTGGAGCT;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=3514036;WS=3514018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	3533412	rs9913319	G	A	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=19;PP=1080;SC=AGGATAACCCGACCCTTCACA;SOR=1.503;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=3533420;WS=3533402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	3552038	rs222778	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=428;SC=CATTTCCTAAGCCTAACTGCT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=3552046;WS=3552028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	3553526	rs161350	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=19;PP=727;SC=GAGGCACATCAAGATGGGCTG;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=3553534;WS=3553516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	3558417	rs459613	C	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=28;PP=1028;SC=TCAGGGTGTGCGGGCCTCACG;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=3558425;WS=3558407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	3558695	rs457419	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=250;SC=CCCTAGGAGCAGGGCGTTCCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=3558703;WS=3558685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	3561396	rs161400	C	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=17;PP=733;SC=GTGGGAGTGACCACGTGGCTG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=3561404;WS=3561386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	3563339	rs222753	C	T	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=168;SC=TTCCCGGGACCTTCCAGCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=3563347;WS=3563329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	3566857	rs11541134	C	T	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=85;SC=GAGAGAAAGCCGGTCCCAGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=3566865;WS=3566853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	3567461	rs2235107	G	A	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=23;PP=1040;SC=CCCAAACCTTGTTTCTCCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=3567469;WS=3567451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	3568012	rs8278	A	G	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=30;PP=1507;SC=TCTGGGAAGGATCCTGGTCGA;SOR=0.961;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=69;WE=3568020;WS=3568002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	3593074	rs220486	A	G	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=4;PP=103;SC=GCGCCCCAGCACCACCCACCG;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=3593082;WS=3593064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	3594276	rs3215407	TG	T	1983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=19;PP=1257;SC=TGCCGCTGGTTGGGGGTCACA;SOR=1.329;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=32;WE=3594284;WS=3594266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	3618298	rs1367950	C	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=37;PP=1120;SC=TTCAGAAAACCGGCATTCTGG;SOR=1.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=3618306;WS=3618288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	3620138	rs2293881	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=500;SC=TGAAGCAAACAAGGAAAAAAT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=3620146;WS=3620128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	3627473	rs9907144	C	T	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=50;PP=1950;SC=GCGGCGGAGGCGTCCCGGCGG;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=106;WE=3627481;WS=3627463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	3627840	rs220462	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1548;ReadPosRankSum=0.367;SC=GTCCCGAGCGGCCTCCACCTC;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=78;WE=3627848;WS=3627830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr17	3628212	rs220461	T	C	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=30;PP=1220;SC=CCAAGGGGAATAGACAGGCTG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=62;WE=3628220;WS=3628202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	3628362	rs3809806	T	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=1064;SC=TTACAGAATGTCTGCTTTTGG;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=3628370;WS=3628352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	3629698	rs170208	A	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=745;SC=TTCAACCTCCATCCCCACAGG;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=3629706;WS=3629688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	3632836	rs1716	G	A	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=30;PP=1115;SC=GCCAAAGACCGTCTTTCATTG;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=3632844;WS=3632826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	3632952	rs2915554	C	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=410;SC=GCAGTGTTGCCGTCTCAGCTC;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=3632960;WS=3632942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	3657159	rs2272606	C	T	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=42;PP=1611;SC=ATGTTTGTACCGTGGAGCCCC;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=86;WE=3657167;WS=3657149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	3657175	rs220479	T	C	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=48;PP=1375;SC=GCCCCCGCGATGTAGGAGAGG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=3657183;WS=3657165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	3664477	rs10687117	A	AATT	2941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=33;PP=1755;SC=ATTTTCTTTAAAAACACACAT;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=3664485;WS=3664467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	3665116	rs8080482	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=478;SC=CGGGAACAGCATGGCAGTCAG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=3665124;WS=3665106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	3665147	.	T	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=737;SC=AACACCAGGGTCAACCACGAG;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=3665168;WS=3665137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	3665160	rs220471	C	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=779;SC=ACCACGAGGGCTAGCACCAGC;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=3665168;WS=3665137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	3717896	rs9897428	A	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=21;SC=AGGGCCTGACAATCAGGCTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=3717904;WS=3717886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	3728903	rs12940049	T	A	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=166;SC=AATCGCTATATCCACACTAAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=3728911;WS=3728893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	3775768	rs72825472	T	C	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=18;PP=938;SC=GGTGGGGTCCTCAGAGGGCAA;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=3775776;WS=3775758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	3775848	rs7214723	T	C	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=45;PP=1903;SC=GACAACTCACTCCTCAGGAAA;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=3775856;WS=3775838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	3775916	rs7214864	T	C	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=46;PP=1190;SC=CGTCGATGAATGGGCACTGTG;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=72;WE=3775924;WS=3775906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	3776867	rs9904678	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=494;SC=CTCTGTCATGCACTCACTCGA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=3776875;WS=3776857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	3786804	rs737361	C	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=23;PP=667;SC=AATGTCACTACTGTGCAGCCA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=3786812;WS=3786794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	3786907	rs758642	G	A	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=324;SC=GCCCAGGTAAGTGTTAAGCGG;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=3786915;WS=3786897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	3818620	rs10852862	T	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=32;PP=1437;SC=ATGTGGGCACTCAGCACCAGG;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=3818628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	3818788	rs2875751	G	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=25;PP=1303;SC=GGACAGGTCCGGAGATGCCCA;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=61;WE=3818796;WS=3818778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	3818830	rs2325788	A	G	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=30;PP=1473;SC=GACCAGAACCAATCTCTGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=3818838;WS=3818820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	3819002	rs11078475	T	C	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=44;PP=1885;SC=GGGTGTGGGGTATGGCCTCTG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=3819010;WS=3818992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	3844599	.	G	A	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1123;ReadPosRankSum=0.773;SC=GGTCAGGTCCGTCTGTAGGGA;SOR=0.694;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=68;WE=3844607;WS=3844589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,89:0.67:132
chr17	3912743	rs117464936	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=186;SC=CTGGGAGAGGCGAGAGCCTCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=3912751;WS=3912734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	3922896	.	G	A	112.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=65;SC=GCCAGGAGGCGCACACCCTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=3922904;WS=3922886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	3924759	rs141226386	T	C	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=85;SC=GAAACACGAATGTATGTTTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=3924767;WS=3924749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	3985832	rs2727061	A	G	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=48;PP=1737;SC=TATTCAGAAAATCTAGTCCAT;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=86;WE=3985840;WS=3985822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	3989669	rs4790166	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=246;SC=TTCCCACAGCGGCAATCCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=3989677;WS=3989659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	3989968	rs2727060	C	T	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=132;SC=AGACAAAAAACATCAGAGAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=3989976;WS=3989958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	3994170	rs2727075	T	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=887;SC=TTGAAACTTCTCAAGGGTCTA;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=3994178;WS=3994160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	4005770	rs1869493	T	C	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=32;PP=992;SC=GAAACTAGCATGCCTATCTGT;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=4005778;WS=4005760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	4007875	rs9907500	C	T	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=214;SC=AATGGTTTTACGATTTGTCCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=4007883;WS=4007865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4027036	rs11078481	C	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=111;SC=CACCACCGTACTGGGGATGAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=4027044;WS=4027032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4027392	rs7208760	G	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=532;SC=TCAAGTAAACGAGGGCAGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=4027400;WS=4027382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	4045809	rs4239043	T	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=7;PP=651;SC=CCCTGCCCCATCCCCGCAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=4045817;WS=4045799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	4046066	.	G	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=26;PP=1017;SC=GGTAGCGCTGGAGCCGCGACG;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=4046074;WS=4046056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	4046101	rs1454121	A	G	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=27;PP=975;SC=CGTGCCCGAGACCGCGGCCCA;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=4046109;WS=4046091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	4046270	rs1454122	T	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=287;SC=CGACAGCAGCTGGCGGGCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=4046278;WS=4046260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	4071302	rs4790583	G	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=379;SC=GGCAGCCAAGGCGCCCGCAAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=4071310;WS=4071292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4071326	rs4790178	C	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=231;SC=ACTCTGGCAACTCTGCCAACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=4071334;WS=4071316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	4074261	rs897030	A	C	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=133;SC=GCTGGCAGGAAATCTGTTCAC;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=4074269;WS=4074251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4077485	rs4790585	G	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=115;SC=TGGGAGCATAGGAGCTTCACA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=4077493;WS=4077475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	4088291	rs2020118	C	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1095;SC=GGAGCTCTGCCGTGAGGTTGG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=4088299;WS=4088281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	4098573	rs5818941	A	AT	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=13;PP=475;SC=TCAATGACACATTTTTTTTTA;SOR=2.511;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=36;WE=4098581;WS=4098563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	4166804	rs2325881	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=18;PP=926;SC=AGGAGACCCACGCTCTTCCGC;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=45;WE=4166812;WS=4166794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	4192401	rs148114489	TACAC	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=480;SC=TGGGAAGAGATACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=4192412;WS=4192391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4199933	rs71749369	ATCTT	A	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=7;PP=720;SC=TGAGAAACAGATCTTTCTTAT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=14;WE=4199944;WS=4199923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	4210162	rs77200406	G	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4210164	rs74458278	C	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4210173	rs62064446	C	T	230.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	4350182	rs2047233	T	C	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=674;SC=CCCTGCCCCTTTGTTGCAGTG;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=4350190;WS=4350172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	4350367	rs2047232	A	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=30;PP=945;SC=CATTAGGGGGACGGGGGGTGG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=4350382;WS=4350357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	4350373	rs3055435	GGT	G	1364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.154;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.354;NF=0;NR=26;PP=1270;ReadPosRankSum=1.577;SC=GGGGACGGGGGGTGGTGGTCA;SOR=2.381;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=4350382;WS=4350357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr17	4350407	rs2047231	G	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=404;SC=TTGGACATGTGGGGCCTCATA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=4350415;WS=4350397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	4351396	rs6502786	C	T	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=143;SC=CCCGGGGGTCCCTTGGGCTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=4351404;WS=4351386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	4351560	rs12450838	G	A	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=43;PP=2025;SC=GAGGCTTCAGGAGCAGCTGGT;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=4351568;WS=4351550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	4351640	rs884250	G	A	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=58;PP=1904;SC=AGAAAAGCCCGTTTGTCTGCC;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=4351648;WS=4351630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	4352539	rs7224464	C	T	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=35;PP=1374;SC=GCTGGAGTTTCGTGTGGTCGA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=76;WE=4352547;WS=4352529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	4356375	rs11655342	G	T	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=46;PP=1576;SC=GGCAGAAGCTGCGAGGAGGTA;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=4356383;WS=4356365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	4402803	rs184566	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=265;SC=GCTTTTGGTCTCAGGCCTGCT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=4402811;WS=4402793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4436005	rs9892232	T	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=30;PP=734;SC=AGGGGTCTGGTGGGAAGAGAG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=4436013;WS=4435995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	4439313	rs1077200	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=5;PP=318;SC=GCCCGGGGCCAGGGCCAAGCG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=4439321;WS=4439303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	4439501	rs1076071	C	G	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=43;PP=2012;SC=CTGGCCAGGGCAGGCTGGGGG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=4439520;WS=4439491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	4439512	rs11658114	A	G	5411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=48;PP=2059;SC=AGGCTGGGGGACTGCAGGAGG;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=106;WE=4439520;WS=4439491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	4439532	rs1076072	T	C	5681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=50;PP=2169;SC=GGCTCTGCCCTGACATCCACC;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=117;WE=4439540;WS=4439522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	4439727	rs146210718	T	TG	1089.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=759;SC=CAGCAGTGAGTGGGGGGGAGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=26;WE=4439735;WS=4439717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	4440907	rs34901192	A	G	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=59;PP=2366;SC=GGCATCAAGAAGAGGCTGTGT;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=4440915;WS=4440897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	4448230	rs118012298	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=506;SC=AGGGACAGAGGCCCAGCGGTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=4448238;WS=4448220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	4448853	rs2306267	C	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=162;SC=TGGTGCAGCTCGCTGCTCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=4448861;WS=4448843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	4455500	rs7206974	T	C	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=49;PP=1328;SC=CTTCCTTGAGTGCCAGGCGGA;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=4455508;WS=4455490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	4458302	rs1871348	C	A	6651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=123;PP=2965;SC=AAGGTGCACGCCCCCGCGCAC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=81;TCR=123;TR=204;WE=4458322;WS=4458292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr17	4458314	rs1871347	C	T	5950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=114;PP=2965;SC=CCCGCGCACCCTGGCATCCAG;SOR=1.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=66;TCR=114;TR=180;WE=4458322;WS=4458292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	4463023	rs11657054	G	A	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=715;SC=CACTACACGGGCCCAGGTTCC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=4463031;WS=4463013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	4497084	rs9908079	G	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=23;PP=1171;SC=CTGGGGCCAGGGTTTGTTACT;SOR=1.143;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=59;WE=4497092;WS=4497074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	4498611	rs12103697	G	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=17;PP=581;SC=AGCAGGAAACGGCGGCCGGCA;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=4498619;WS=4498601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	4498682	rs4790655	C	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=245;SC=CCAGACGGGGCTTGGGTGGGT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=4498690;WS=4498672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	4500072	rs9906333	A	G	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=117;SC=TGGTGGTGCCAGGACAGCCTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=4500080;WS=4500062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4513974	rs111699059	A	AAAAG	3098.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=2022;SC=CCTGTCTCAAAAAAGAAAGAA;SOR=1.054;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=37;WE=4513982;WS=4513964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	4535385	rs2619112	A	G	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=55;PP=2160;SC=GTCAGTGCCTACCAAGCACGC;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=4535393;WS=4535375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	4535413	rs6502804	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=50;PP=1523;SC=GTGGTCCACCTGCACACAGAC;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=4535421;WS=4535403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	4544729	rs9906597	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=12;PP=632;SC=GCCAGAGGCCAACGGGGGCGC;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=4544737;WS=4544719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	4544978	rs369435246	G	GAGA	1377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=901;SC=CCTTCTGGTGGAGAAGGGTGG;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=4544986;WS=4544968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	4545581	rs2255888	C	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=22;PP=616;SC=CTCCCTGTTGCCTGCAGAATA;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=4545589;WS=4545571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	4577950	rs8081507	C	A	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=34;PP=1633;SC=CAGGGCTCCCCCGCGGGCTAC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=4577958;WS=4577940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	4578007	rs4790673	C	G	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=43;PP=2448;SC=AGGCAAACAACAAGGCAAGAC;SOR=1.027;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=106;WE=4578015;WS=4577997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	4579937	rs9904806	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=9;PP=520;SC=CAATGAGGCCGAAGGACACAG;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=4579945;WS=4579927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	4580137	rs6502806	A	G	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=848;SC=GGAAGAGGCCAGTGAGCCAGC;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=44;WE=4580145;WS=4580127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	4580224	rs11078530	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=510;SC=CCTGTAGACACAAGAAGCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=4580232;WS=4580214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	4586253	rs34352526	GA	G	1020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=651;SC=TGGGTCTAAAGAAAAAAATAA;SOR=1.209;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=4586261;WS=4586243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	4594847	rs7226084	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=351;SC=TGAAGTCACATCTCCTCTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=4594855;WS=4594837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	4641755	rs1050997	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=714;SC=CCTTGTTGCCCCCACACACGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=4641763;WS=4641745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	4642069	rs2250333	A	G	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=19;PP=1462;SC=AGAGGCAGGTAAAATTACCTC;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=4642077;WS=4642059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	4644491	rs9903643	A	G	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=84;SC=CTCCCTTCGGAAGCCCTCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=4644499;WS=4644481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4684095	rs13520	G	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=26;PP=852;SC=TACTGTGTCCGGGGATTGCAG;SOR=1.656;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=34;WE=4684103;WS=4684085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	4686340	rs3853643	TT	GG	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=28;PP=2326;SC=CAGGTGAAATTTCTTGCGGTG;SOR=0.798;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=57;WE=4686349;WS=4686330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	4688996	rs2279962	A	C	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=10;PP=321;SC=CGGGCCCCCCATTCACCAAGC;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=4689004;WS=4688986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	4693054	rs12951761	G	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=49;PP=1839;SC=TCGCCCGCAGGTTCCTGACTC;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=4693062;WS=4693044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	4693170	rs34850425	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=808;SC=TGGTCGCTGGTGGCCATGGCG;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=4693178;WS=4693160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	4693342	rs35910358	C	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=9;PP=463;SC=GAGGCCCGGACGCGGGCGTGC;SOR=0.997;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=4693350;WS=4693332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	4693384	rs150754782	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=9;PP=532;SC=CGGCCCTGGGTCCGCATCACC;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=4693392;WS=4693374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	4693508	rs34421346	G	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=20;PP=579;SC=GGCCGCGCTGGTCCGGGCCGC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=4693516;WS=4693498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	4712395	rs1132446	A	T	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=32;PP=1219;SC=CTTTCCACAGATTTGCCGTTG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=4712403;WS=4712385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	4713981	rs7212512	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=434;SC=TACACGCCCTATCCCTGTGCA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=4713989;WS=4713971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	4714021	rs3081314	G	GGAAA	1762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	4718027	rs2286670	G	T	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=38;PP=1150;SC=TGGTCAGGCCGCAGGGGGAGG;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=4718035;WS=4718017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	4720131	rs2302325	C	G	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=27;PP=1804;SC=GAGGGGTCAACGGTGGTACAG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=4720139;WS=4720121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	4721376	rs17854914	A	G	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=75;PP=2843;SC=ACCATCAGGGAGAGCCAGCAC;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=145;WE=4721384;WS=4721366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr17	4722133	rs3764900	C	T	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=31;PP=939;SC=GTGCTGGGGGCTGGGGGCTCA;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=4722141;WS=4722123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	4722299	rs2326097	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=431;SC=GTAGGAAGAGTTTCTGGAGTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=4722307;WS=4722293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	4750573	rs9890271	G	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=243;SC=ATGGAGTCTCGCTCAGGCTGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=4750581;WS=4750563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4758174	rs73341669	C	A	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=39;PP=1384;SC=GAGTAAGAAGCGCTGAGAAAA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=4758182;WS=4758164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	4778487	rs8078776	G	A	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=40;PP=1299;SC=AACTGAAGACGGATGAGATGA;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=4778495;WS=4778477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	4795307	rs2586532	C	T	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=32;PP=1708;SC=TAACCCTGGACGTATTCACTA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=83;WE=4795315;WS=4795297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	4795619	rs36079581	TG	T	125.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.17;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4835852	rs81663	A	T	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=140;SC=GGATGCTTCCAGGGGATGCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=4835860;WS=4835842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	4837210	rs2586529	A	G	164.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=3;PP=137;SC=CGACCACCCCAGAGCCCACCT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=4837218;WS=4837200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	4837952	rs199616811	A	AG	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=357;SC=ACAGGGTGATAGGGAGGGGTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=4837960;WS=4837942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	4845768	rs238247	G	A	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=23;PP=1004;SC=CAAGGTTGCTGAATGAGGAAG;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=4845776;WS=4845758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	4856376	rs238238	A	G	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=42;PP=1348;SC=AACATCAACAATACTCTGGGC;SOR=1.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=4856384;WS=4856366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	4856580	rs238239	T	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=44;PP=1609;SC=CTAAGCGTTGTGGATCAAGAA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=93;WE=4856588;WS=4856570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	4859112	rs2309347	C	T	184.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.86;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4859123	rs111645512	T	C	184.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.86;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4859134	rs117488294	C	T	186.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.24;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4863410	rs238224	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=33;PP=1618;SC=CAAACTCCTGAAGAAGAGCAG;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=71;WE=4863418;WS=4863400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	4875566	rs238230	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=48;PP=1503;SC=CAGCGTCCTCTGGAGCAGCCC;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=4875574;WS=4875556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	4877120	rs238229	G	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=51;PP=1440;SC=CTGGCTTGAGGTGGCCTTGGC;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=4877128;WS=4877110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	4881776	rs376516	C	G	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=23;PP=943;SC=AGTCCCTCCCCCTACGGTTCC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=4881784;WS=4881766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	4882952	rs1859434	G	A	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.55;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	4883818	rs238234	C	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=29;PP=899;SC=GGGGGGTGAGCGTGGGGGATA;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=4883826;WS=4883808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	4885982	rs238233	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=335;SC=AGCCCAGGTCGGGCTAGAGCC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=4885990;WS=4885972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	4886037	rs238232	A	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=14;PP=707;SC=TGAGCTGAATATCTGACTCTC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=4886045;WS=4886027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	4890843	rs8071428	T	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=867;SC=AGCTGCGCCCTCTGGCGCGGG;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=4890851;WS=4890833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	4890883	.	C	A	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=29;PP=1343;SC=GGCCCTGGCTCTTACCTCCCG;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=4890891;WS=4890873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	4891086	.	TC	AG	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=926;SC=GGACTCGGCTTCTAGGGCTCT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=4891095;WS=4891076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	4891956	rs426475	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=11;PP=465;SC=TCTCACCTACGTTATTTTTGT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=4891964;WS=4891946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	4893357	rs427703	G	C	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=31;PP=1281;SC=GAAATTAACCGCAGACTAGGG;SOR=0.801;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=66;WE=4893365;WS=4893347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	4916858	rs72401841	TGGA	T	3684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=24;PP=2563;SC=GTGCCAGGACTGGAGGGGTGT;SOR=1.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=51;WE=4916868;WS=4916848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	4926882	rs346828	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=511;SC=CCCCCTCGCCACCACTGTCAA;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=4926890;WS=4926872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	4936972	rs346821	G	A	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=39;PP=1501;SC=CAGCTGATGGGCCTCAGGGTC;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=4936980;WS=4936962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	4937575	rs346822	T	C	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=41;PP=1279;SC=CGGGGCCAGCTGCCTCCACAG;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=4937583;WS=4937565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr17	5036191	rs75631218	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.426;NF=48;NR=14;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.837;SC=ACTCCAACATGCCTCATTTGA;SOR=1.755;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=62;WE=5036232;WS=5036181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
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chr17	5036274	rs78465432	C	A	5593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=9.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-5.587;QD=26.39;ReadPosRankSum=2.584;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,141:0.67:212
chr17	5036281	rs76236903	G	C	5567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=8.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-5.443;QD=26.26;ReadPosRankSum=2.878;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,141:0.67:212
chr17	5036329	rs72830923	A	G	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.914;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.711;NF=27;NR=63;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TCTCTGCAGAAACAGGGGACA;SOR=0.408;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=90;WE=5036337;WS=5036319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,95:0.74:129
chr17	5036383	rs76207017	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.917;HP=6;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.491;NF=1;NR=35;PP=807;ReadPosRankSum=1.904;SC=TCTCAGAGGGCGGGTGGCACA;SOR=2.765;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=36;WE=5036391;WS=5036373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr17	5048207	rs2304447	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=627;SC=AAATGTTCTGACCACAAATAC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=5048215;WS=5048197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	5058808	rs9899177	G	A	3520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=58;PP=2402;SC=GTGCATACCCGGAAGAAAGAC;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=109;WE=5058816;WS=5058798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	5066305	rs2307138	A	T	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=607;SC=AAAGGGTAAGAATTTAGGGCC;SOR=1.259;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=5066313;WS=5066295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	5084763	rs1689965	G	A	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=65;PP=2262;SC=GTTTTCTCACGTTCTTCAAGT;SOR=1.198;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=107;WE=5084771;WS=5084753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	5085893	rs4115657	C	T	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=54;SC=CCCTAAGCTCCTCATCCTGGC;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=5085901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	5087040	rs9908414	A	G	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=37;PP=1321;SC=CTGATGTATAATAAGATTTGA;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=5087048;WS=5087030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	5087602	rs2641232	C	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=377;SC=TTCTATAATTCCTAAAATACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=5087610;WS=5087592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	5126674	rs2641256	A	G	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=22;PP=1268;SC=TGAGGCCCAGACCCACAGAGA;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=5126682;WS=5126664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	5126689	rs2585271	G	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=28;PP=1347;SC=CAGAGACAACGATGATGGCCA;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=5126697;WS=5126679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	5126876	rs2641255	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQ=57.88;NF=2;NR=6;PP=132;SC=CTCACTCTGTCGCCCAGGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=5126884;WS=5126866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	5421005	rs56750129	TC	AA	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=13;PP=1795;SC=TGTGCCCAGCTCCTTCATTGA;SOR=1.298;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=40;WE=5421014;WS=5420995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	5424129	rs12946467	C	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=84;SC=AGCCCTGAGACCTGCCCCACA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=5424137;WS=5424119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	5424376	rs12944976	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1218;SC=CTTCTGCCCCGTGGAATGTGG;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=5424384;WS=5424366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	5425077	rs11651270	T	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=227;SC=AAGTGGGCCATTTGGAACAGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=5425085;WS=5425067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	5436263	rs2301582	C	T	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=57;PP=1976;SC=GGAGAAGGCACGCACAAGAGT;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=5436271;WS=5436253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	5485367	rs12150220	A	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=796;SC=TTGGTAGAGGAGTGAGGCAGA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=5485375;WS=5485357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	5991344	rs2302836	C	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=14;PP=746;SC=ACGATGGCCACGAGAGGACTC;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=32;WE=5991352;WS=5991334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	6014176	rs2302837	A	G	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=47;PP=1397;SC=CCGGGAACACATGGGCACGGC;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=6014184;WS=6014166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	6021541	rs2302838	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=383;SC=GGGTGGGAGGCTTGTCAGTAC;SOR=1.828;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=19;WE=6021549;WS=6021531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	6330068	rs2292546	T	C	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=44;PP=1236;SC=GCACCTCCCATGGCTTCTCCT;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=6330076;WS=6330058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	6330109	rs2292545	G	A	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=34;PP=1249;SC=ATGACCTCAGGCAGCTGCCCA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=62;WE=6330117;WS=6330099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	6330153	rs925616	C	T	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.757;SC=ACTGGGCAGGCCCCCCAGAGT;SOR=0.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=51;WE=6330161;WS=6330143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr17	6331803	rs8075035	T	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1422;SC=GGCTCCGGGATAGGATGGGGT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=6331811;WS=6331793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	6331836	rs12453262	T	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=35;PP=1326;SC=GCTGTGGGGATAAACGGATGG;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=6331844;WS=6331826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	6337247	rs12449580	C	G	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=9;PP=402;SC=ACGATGGTGTCGCACCAGAAC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=6337255;WS=6337237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	6338530	rs7211442	G	T	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=23;PP=758;SC=CAGGAGGAGTGGGGGGAAGGG;SOR=1.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=6338538;WS=6338520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	6348823	rs7220100	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=530;SC=ACTTCATGAAAACAGGGACGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=6348831;WS=6348813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	6353679	rs7218283	A	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=29;PP=1165;SC=CTCTGTCTTGAAGGAAACAAG;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=62;WE=6353687;WS=6353669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	6358989	rs73346328	G	C	432.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=352;SC=GAGGGCAGGGGAGGGCAGGGC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=6358997;WS=6358979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	6364753	rs11654099	A	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=27;PP=950;SC=GCACCAGCCCATCGGAGAAGA;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=53;WE=6364761;WS=6364743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	6483046	rs3744720	T	C	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=12;PP=710;SC=GTGACACAAATGGCCTCGCCT;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=6483054;WS=6483036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	6493056	rs367918	T	C	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=161;SC=TCTAAAATTTTGCAATTTGGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6493064;WS=6493046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	6493198	rs1443417	T	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=25;PP=785;SC=GATGCTGTGCTGCATACCCGG;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=6493206;WS=6493188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	6511781	rs4796519	A	G	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=29;PP=875;SC=TTAGCCATGCAGCACTGAAAT;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=6511789;WS=6511771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	6515387	rs2289642	A	G	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=67;PP=2149;SC=TCCTTCTTCCAGAACTATATC;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=101;WE=6515395;WS=6515377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	6515454	rs2289643	C	T	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=34;PP=1001;SC=AGCTCCGTATCGGGCTGATAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=6515462;WS=6515444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	6526765	rs10521150	C	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=9;PP=522;SC=CTACACAATACTAACAAAACA;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=6526773;WS=6526755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	6531648	rs2072149	A	G	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=17;PP=1468;SC=CTTTGGCACCAGAGCTGGAGA;SOR=2.084;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=6531656;WS=6531638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	6546259	rs2285999	T	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=10;PP=506;SC=TTTGACTGTTTTTCTCTTACA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=6546267;WS=6546249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	6546457	rs72835775	A	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=GCATGTGTCTAAACAATAGAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=6546465;WS=6546447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	6547653	rs12150422	G	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=AAAGTTGGATGAAAAAGCACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=6547661;WS=6547643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	6547766	rs11078641	G	C	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=15;PP=970;SC=TGTATTAAGTGCCTCGTTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=6547774;WS=6547756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	6553456	rs72835786	G	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=564;SC=ACTGTGATTTGTTACCCCTAA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=24;WE=6553464;WS=6553446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	6553543	rs17842438	A	T	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=423;SC=GTACGCAATTATATCTATATA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=6553551;WS=6553533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	6554921	rs74504320	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=31;PP=926;SC=AGTTCCGGAAACCACGGCTCC;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=6554929;WS=6554911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	6555546	rs56268735	C	CG	4004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=44;PP=2529;SC=CCCGACCCCGCGGCCAAGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=59;WE=6555554;WS=6555536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	6558645	rs8077691	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=50;SC=GTGTGTGTGTGTGTGCATGTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=6558653;WS=6558639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	6558768	rs8078913	C	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=8;PP=284;SC=ATTCCTTCTTCCTGCGTGTTT;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=6558776;WS=6558758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	6562141	rs17842437	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	6659324	rs3785793	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=432;SC=GGGCTGGGCCATCGGAAAACT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=6659332;WS=6659314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	6661584	rs4796550	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=12;PP=463;SC=AGAGTCAAGGTGAGTGTTCAG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=6661592;WS=6661574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	6662320	rs67528158	G	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=16;PP=598;SC=CATCCTCCCTGCAAGAAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=6662328;WS=6662310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	6663144	rs71157213	CT	C	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=854;SC=CCTGACCACTCTTTTCACCCC;SOR=1.244;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=22;WE=6663152;WS=6663134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	6663895	rs2271231	C	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=174;SC=ATGTCTGTCGCAGTGAACAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=6663903;WS=6663885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	6683215	rs4796555	C	T	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=39;PP=1870;SC=ACTGATCCAGCCCCAAGACCA;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=6683223;WS=6683205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	6690161	rs17853331	C	T	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=26;PP=1075;SC=ACCTCCTCATCATATCCTGCA;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=6690169;WS=6690151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	6690354	rs28407857	T	A	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=3;PP=52;SC=AACGAAGGGCTGAATAAGGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=6690362;WS=6690344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	6690555	rs200110837	GTA	G	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.23;QD=45.23;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	6690566	.	TGTGTGTG	CGCGCGCG	626	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.8;NF=4,15;NR=1,7;PP=104,626;QD=35.4935749724;SC=TATGTGTGTGTGTGTGTGCGT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=5,22;WE=6690591;WS=6690547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr17	6690566	rs201703257	TGTGTGTG	TGCGCGTGTGTG	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4,15;NR=1,7;PP=104,626;ReadPosRankSum=-1.664;SC=TATGTGTGTGTGTGTGTGCGT;SOR=0.576;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=5,22;WE=6690591;WS=6690547;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.19:26
chr17	6690568	.	T	TGCGCGC	1954.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;QD=44.43;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	6690570	rs74809992	T	C	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.88;QD=45.36;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	6690572	rs72836242	T	C	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.86;QD=50.29;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	6690583	rs5016848	G	A	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1372;SC=GCGTGTGTGCGTGCTCATATG;SOR=1.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=6690591;WS=6690547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	6690829	rs4239266	G	A	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=882;SC=GGGCACTGCCGGCCCTTTTGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=6690837;WS=6690819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	6690853	rs67163717	CT	C	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.47;QD=43.38;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	6690857	rs111623068	A	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	6690865	.	T	TTC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=564;SC=CCACTTTTTTTTTTTGTCAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=6690873;WS=6690843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	6704273	rs2136282	G	A	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=849;SC=CTTACAAAAAGGATTAGAGTA;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=6704281;WS=6704256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	6716242	rs3744395	G	A	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=24;PP=858;SC=CACTGCTTGCGCAGATCATTG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=6716250;WS=6716232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	6716385	rs8081510	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=14;PP=430;SC=GAAACAGACCTCACGCTTTCA;SOR=1.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=6716393;WS=6716375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	6733672	rs8078571	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;PP=736;SC=GGAACTTGGGTGGAGGTTGTA;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=6733680;WS=6733662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	6899559	rs312467	C	G	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=16;PP=435;SC=AGCTGCGGCCCGCGCGGGGCG;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=6899567;WS=6899549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	6899629	rs3218667	C	T	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=4;PP=103;SC=CAGGCCCGGGCCGAGCTGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=6899637;WS=6899619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	6900362	rs2070589	C	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=4;NR=7;PP=161;SC=CAGGCGGCGTCGGGGAAGGAG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=6900370;WS=6900352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	6900383	rs312468	T	C	251.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=98;SC=GCACAAGGTCTCGGGAACTGC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=6900391;WS=6900373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	6902179	rs312470	G	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=17;PP=912;SC=CTAGACCTCGGAGTGAAATAA;SOR=1.225;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=45;WE=6902187;WS=6902169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	6902743	rs1042356	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=702;SC=TGCTGCCCTCGGGGATGGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=6902751;WS=6902733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	6902760	rs1126667	A	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=20;PP=589;SC=GAAGAGCTTCAGGCTCAACTG;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=6902768;WS=6902750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	6903537	rs2292353	G	A	270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=137;SC=TCCCAACAGGGCTCCGGTACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=6903545;WS=6903527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	6905061	rs1042357	T	G	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=49;PP=1723;SC=TGCTGAACACTCACCTGGTGG;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=6905069;WS=6905051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	6906085	rs11571338	C	CT	245.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=288;SC=ATACAGGGAACTTGGCAGAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=6906093;WS=6906075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	6909378	rs5819132	C	T	419.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	6909379	rs3934010	C	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	6915401	rs2271316	C	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=9;PP=323;SC=AAACCATGCCCGATCCCCAAA;SOR=0.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=6915409;WS=6915391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	6919093	rs14309	T	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.95;NF=35;NR=22;PP=1061;SC=CTTCTGACAGTGCGAAGTGGA;SOR=1.054;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=6919101;WS=6919083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	6927350	rs312461	A	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=211;SC=GAAGCTGCGCATGTCTCCCTT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=6927358;WS=6927340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	6927480	.	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=21;PP=934;SC=GTCCCGAAGCGAGAGGCTTCG;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=6927488;WS=6927470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	6928019	rs146207245	C	CCAG	1558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=1050;SC=GACGAGGCCTCCAGCAGCAGC;SOR=0.927;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=20;WE=6928027;WS=6928009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	6929924	rs379478	T	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=30;PP=1475;SC=TTGCCAGTCATCGTACAGTGC;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=6929932;WS=6929914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	6933217	rs421264	T	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=339;SC=GTGTGGAGGCTGCAGGGAGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=6933225;WS=6933207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	6942108	rs11078663	C	T	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=60;PP=2321;SC=TGGCCTTCTCCGTGCTGCCTG;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=6942116;WS=6942098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	6943266	rs4796576	G	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=577;SC=CCAAGGAGGGGCTGGAAGAGG;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=6943274;WS=6943256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	7011064	rs199979065	GCACACTACACACACCGCACACGTA	G	2910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=17;PP=2974;SC=ACGCACACGTGCACACTACAC;SOR=1.643;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=33;WE=7011095;WS=7011054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	7011144	rs62058755	G	A	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=64;NR=44;PP=2081;SC=ACACCCCGGAGGCTCTCTGAC;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=108;WE=7011152;WS=7011134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	7139238	rs222851	G	A	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=57;PP=2258;SC=GCCCCAGCCCGAACCTCTCAC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=118;WE=7139246;WS=7139228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	7140606	rs222852	A	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=597;SC=ATAATTTCTAAGGGCCTCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=7140614;WS=7140596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	7145492	rs58574748	C	CA	1547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=13;PP=1154;SC=CTGCCTGTCCCGATCCAAGGC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=7145500;WS=7145482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	7166660	rs77549883	C	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=302;SC=CACACTCGCCCGTTTCTCTTT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=7166668;WS=7166650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	7185788	rs222848	T	C	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1055;SC=CCCCCCCTCCTCCAGCTCAGG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=7185796;WS=7185778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	7192091	rs222842	C	T	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=19;PP=891;SC=TGGGTGTCCTCTGAGTTGAGT;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=7192099;WS=7192081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	7192198	rs222841	T	G	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=19;PP=635;SC=GTTCTTTTTGTTTTTGAGACA;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=7192206;WS=7192188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	7193055	rs3833134	GA	G	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=797;SC=CTAAGGCAAGGAACAAGGCTC;SOR=1.002;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=7193068;WS=7193045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	7193060	rs55781423	A	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=551;SC=GCAAGGAACAAGGCTCTGAGG;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=7193068;WS=7193045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	7193255	rs3744405	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=188;SC=ACACTGGAAGGGGAAGACCAA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=7193263;WS=7193245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	7193448	rs222838	A	G	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=26;PP=975;SC=CTGGAGCCAGATTATCCACAG;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=7193456;WS=7193438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	7194010	rs2521992	C	T	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=224;SC=GTGGAATGTGCTTGCACCCAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=7194018;WS=7194000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7197633	.	A	G	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=53;QD=21.9428031368;SC=GGGGTGCGGGAGCCCGGCGCC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=7197641;WS=7197623;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	7197794	rs222859	C	A	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=6;PP=129;SC=CGCTGTAGCCCCCGCTGCCGC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=7197802;WS=7197784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	7213560	rs72840907	C	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=754;SC=TTTCAGGTCACCTTGCTGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=7213568;WS=7213550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	7214824	rs11658072	C	T	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=51;PP=1843;SC=CTCCCTGCTTCTGTGCTCAGC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=7214832;WS=7214814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	7217223	.	A	AC	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=816;SC=TCCTACTCTCACCGTAAGCAC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=7217231;WS=7217213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	7217463	rs2292064	T	C	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=31;PP=1302;SC=CAGCTGATGTTAGGGTGGTCA;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=7217471;WS=7217453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	7220697	rs62059198	G	T	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=46;PP=1609;SC=TACCTGGGAGGAGAACTGGGT;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=7220705;WS=7220687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	7221385	rs1127440	G	A	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=41;PP=1528;SC=GGGACTCACCGGGAAGCAGCA;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=7221393;WS=7221375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	7221544	rs7222233	T	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=32;PP=1234;SC=AGGGTGAGGGTGGGGGAGTAG;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=7221552;WS=7221534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	7221707	rs7216490	G	T	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=52;PP=2318;SC=GACAGAGCTTGGTCAGACCCC;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=116;WE=7221715;WS=7221697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	7224319	rs3809811	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=5;PP=169;SC=TTTGCACAGATCCTGAGTGTG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=7224327;WS=7224309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7225149	rs3809814	C	G	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=39;PP=1894;SC=TCGTGATGGGCCTCGCAGCCC;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=7225157;WS=7225139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	7225425	rs2062771	T	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=720;SC=GAAATGGGGATGCCAACGCCC;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=7225433;WS=7225415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	7226250	.	G	T	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=53;PP=2176;SC=GTGGCAGGCTGAAAGCCACAT;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=102;WE=7226258;WS=7226240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	7228469	.	GCC	G	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=33;QD=19.0;SC=TCCTTGCCCCGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=7228478;WS=7228459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	7245371	rs4796407	A	G	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=31;PP=930;SC=TGGGTCCACCAGAGCCCATGA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=7245379;WS=7245361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	7245674	rs8069505	G	A	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=23;PP=1675;SC=AAGGATTGTCGGGGTGGTGGC;SOR=1.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=7245682;WS=7245664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	7246940	rs3809829	T	G	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=34;PP=1662;SC=CCTCGAGGCTTGGGGGTCTCC;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=7246948;WS=7246930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	7251134	rs113180181	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=212;SC=CACCTCTGCACGGGCCCCCAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=7251142;WS=7251124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	7251605	rs2292066	G	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=24;PP=1198;SC=GGAAGACTGCGTGCTTCTCCC;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=7251613;WS=7251595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	7253659	rs2292068	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	7254602	rs66687178	T	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=1521;SC=CGGCCTTTCCTCCCTCCCCCA;SOR=0.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=79;WE=7254610;WS=7254592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	7259073	rs6503016	C	T	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=9;PP=415;SC=GACAGGAGGGCTGATCAGGGA;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=7259081;WS=7259063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	7286326	rs1554948	T	A	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=40;PP=1496;SC=GGCCCATCCTTGAGGAGCTTA;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=7286334;WS=7286316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	7292107	rs6503018	G	A	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=39;PP=1341;SC=TCTGTCACAGGTGGAGCTGAG;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=71;WE=7292115;WS=7292097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	7293715	rs3744549	C	T	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=14;PP=902;SC=TAACTGGTGACGGCAGAGGGC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=7293723;WS=7293705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	7297452	rs4613118	A	G	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=10;PP=432;SC=GGGGTTTTCGAGATGATGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=7297460;WS=7297442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	7307103	rs56134360	ACC	A	722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.436;NF=4;NR=13;PP=216;ReadPosRankSum=1.105;SC=GAGAAAGGGCACCCCCCCCCC;SOR=0.365;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=17;WE=7307112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr17	7307287	rs9900153	T	C	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=41;PP=1749;SC=ACGCCCCAAGTACAGTCCCAT;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=7307295;WS=7307277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	7317647	rs60631713	A	AC	1615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=12;PP=1117;SC=CCACCTGCCCACCCCTCCCCA;SOR=1.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=28;WE=7317655;WS=7317637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	7318396	rs2241233	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=24;PP=1011;SC=GAGAGGACAGCGCTGAAGCTG;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=7318404;WS=7318386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	7318559	rs6503019	G	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=379;SC=TGGCAAGGAGGGATGGGCTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7318567;WS=7318549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	7318935	rs12947017	C	T	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=36;PP=1998;SC=TGCTCATCGGCGTCAACCAGG;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=101;WE=7318943;WS=7318925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	7329632	rs13290	T	G	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=74;PP=2664;SC=CTCCTCTTTCTCCTGCCACCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=147;WE=7329640;WS=7329622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	7340720	rs369868893	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=28;PP=1030;SC=GAGAATTGGCCCGGCTCCGCG;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=7340728;WS=7340710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	7345819	rs4151129	A	AGGTAC	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=289;SC=TCCCCCAAAAAGGATTTGTGC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=7345827;WS=7345809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	7346302	rs3853818	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=12;PP=651;SC=AGGGTGAATGTACGGGAAGGG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=7346310;WS=7346292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	7348625	rs17856697	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=31;PP=1469;SC=CGACTCCGGGAGAAACTTTTC;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=7348633;WS=7348615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	7349622	.	T	TTGTGTGTG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.24;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	7350544	rs2302767	G	A	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=37;PP=1214;SC=CTGACTCCCCGGCGACTCCCA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=7350552;WS=7350534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	7358803	rs7214344	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=6;PP=226;SC=ACCCACATAAGAGGGAGAGGG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=7358811;WS=7358793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	7358861	rs2302762	T	C	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.75;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7358930	rs56074046	G	A	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=3;PP=110;SC=GGGGAGGTGGGAACTAAAACA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=7358938;WS=7358920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	7385174	rs8065577	G	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=52;SC=TTCTAGCTCCGAAGAGTTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=7385182;WS=7385173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	7400041	rs9890920	C	T	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=16;PP=978;SC=AGGGAAATGGCCCACCCTCTG;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=7400049;WS=7400031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	7400137	rs9898024	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=44;PP=2369;SC=TGGCCTAGAGTTGTATGCGGA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=106;WE=7400145;WS=7400127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	7400815	rs2228128	T	C	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=38;PP=1257;SC=TGGTGGACAATGAGCTGCCTG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=7400823;WS=7400805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	7401335	rs111845660	G	GGCTCTGGGGT	1300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=2970;SC=TTCCACTCAGGGAGGGTGGCT;SOR=0.906;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=18;WE=7401343;WS=7401325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	7401572	rs41554719	A	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=468;SC=CTGAGCAGAAAGCTTTCCAAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=7401580;WS=7401562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	7402556	rs2277638	G	A	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=52;PP=2161;SC=TCAAGGTTTCGCTGCAGACAT;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=106;WE=7402564;WS=7402546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	7402600	rs2228129	T	C	3348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=54;PP=1745;SC=TTAACTGTAGTGTGACAACTC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=99;WE=7402608;WS=7402590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	7403942	rs12936464	A	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=85;SC=TGTCTGCCTTACTCTTTGTCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=7403950;WS=7403932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	7404107	rs7217707	T	C	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=25;PP=1310;SC=GTACCCACAGTACCCATCCCG;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=7404115;WS=7404097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	7404209	rs6503030	G	A	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=39;PP=1641;SC=GAATTTGGACGTGGGAGCCAG;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=7404217;WS=7404199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	7404991	rs2228130	T	C	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=48;PP=1711;SC=CTGAATACAATAACTTCAAGT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=7404999;WS=7404981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	7405074	rs8075218	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1388;SC=TTTCCATATACGGGGCCGCTG;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=7405082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	7406343	rs9890028	T	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=168;SC=ACCACTGTACTTGGTCGGCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=7406351;WS=7406340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	7411855	rs4796432	A	G	159.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=48;SC=TCAACTGGGTATGGTGGCTCA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=7411863;WS=7411845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7412212	rs9889368	A	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=9;PP=679;SC=GTTAGAAGAGACGTTTAGAGC;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=7412220;WS=7412202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	7413038	rs2269459	A	G	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=35;PP=966;SC=TGCAATCAACATTGAGGGGCG;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=50;WE=7413046;WS=7413028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	7413057	rs7213878	C	T	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=829;SC=CGGCCAGGCGCGGTGGCTCAC;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=7413065;WS=7413047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	7413120	rs7218412	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=58.31;NF=2;NR=14;PP=392;SC=ACCTGAGCTCAGGAGTTCGAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=7413128;WS=7413110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	7414958	rs2071502	G	C	93.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=67;SC=CTGGCTCTCAGGCCCCTCATT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=7414966;WS=7414948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	7416683	rs9894023	A	G	8731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=18.385;NF=120;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CCAGCTACTCACCGACATCTC;SOR=0.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=120;TCR=129;TR=248;WE=7416691;WS=7416673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,336:1.00:337
chr17	7417086	rs4344809	G	A	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=33;PP=1398;SC=CTACAGCCCAGCCTCACCCAA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=73;WE=7417094;WS=7417076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	7417551	rs9533	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=268;SC=CCCGTGCTGCTGTGCAGTTCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=7417559;WS=7417541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	7452752	rs80067372	G	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=10;PP=360;SC=GAGATGTCAGGTGGAGCGGCA;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=7452760;WS=7452742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	7453505	rs62059804	C	A	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=19;PP=969;SC=TTCGGCCTCGCAGAAGTGGTG;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=46;WE=7453513;WS=7453495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	7460559	rs4968189	T	G	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=21;PP=847;SC=AGGTGTCTGGTCTGTTGGCCC;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=7460567;WS=7460549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	7462969	rs3803800	A	G	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=25;PP=1069;SC=GCCTGGGAGAATGGGGAGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=7462977;WS=7462959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	7470285	rs58837213	CA	C	2233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=22;PP=1447;SC=AACTCCGTACCAAAGGGTTAT;SOR=0.966;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=36;WE=7470293;WS=7470275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	7474277	rs4968213	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=347;SC=GGCCACCTCCCCTAGCTCTGA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=7474285;WS=7474267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	7474539	rs28625968	C	T	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=158;SC=AGAACACTAGCTTTAGAGTCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=7474547;WS=7474529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	7477938	rs1057086	G	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=55;SC=GCATCTACGCGTATGGTTTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=7477946;WS=7477928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	7554772	rs1642762	C	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=5;PP=162;SC=AGGGCTTCAGCGCGCGGCGCC;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=7554780;WS=7554762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	7557419	rs1642763	A	G	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=50;PP=2256;SC=GCCGCCCTGGACGCTATTACG;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=7557427;WS=7557409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	7557834	rs1642764	C	T	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=2;PP=226;SC=GCTATCCTCCCGCCTCAACCT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=7557842;WS=7557824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7569698	rs8073498	A	C	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=19;PP=656;SC=AGGGTAGGGAACATGTCTGCC;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=7569706;WS=7569688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	7573036	.	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=23;PP=758;SC=AGGGAGGAGAGATGACATCAC;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=7573044;WS=7573026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	7578115	rs1625895	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=500;SC=ACTGCTCACCTGGAGGGCCAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=7578123;WS=7578105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	7578645	rs2909430	C	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=322;SC=AACAAACATGCGTAAGCACCT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=7578653;WS=7578635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	7579472	rs1042522	G	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=10;PP=546;SC=AGGGGCCACGGGGGGAGCAGC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=7579480;WS=7579462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	7579643	rs146534833	CCCCCAGCCCTCCAGGT	C	2366.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=23;PP=2983;SC=GCCCCCCAGCCCCCCAGCCCT;SOR=0.767;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=27;WE=7579666;WS=7579633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	7579801	rs1642785	G	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.06;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	7630505	rs11867551	T	C	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=24;PP=1025;SC=CACAGGAGCATGATGCCATTC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=7630513;WS=7630495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	7646166	rs2642160	A	G	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.75;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7673928	rs9909288	C	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=21;PP=845;SC=ACATAGTACCCTACAAGGATA;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=7673936;WS=7673918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	7674850	rs7212989	C	T	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=215;SC=GTCATGGTTGCGTGCTTCATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=7674858;WS=7674840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7677927	rs4791759	A	G	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=85;SC=CATGTTAGACAGTCTGGGGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=7677935;WS=7677922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	7681412	rs7359662	C	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=23;PP=1087;SC=ATGACTGTGTCATCCGCCAGA;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=7681420;WS=7681402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	7682605	rs17806045	C	T	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=4;PP=191;SC=GCATCAACATCGAGGTGCTGT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=7682613;WS=7682595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	7700712	rs1565817	C	T	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=66;PP=2192;SC=AGTTCCCTGCCCACAGAGTCT;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=113;WE=7700720;WS=7700702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	7702357	rs12949280	C	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=898;SC=CCACCTGACCCGCTGCCCCCG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=7702365;WS=7702347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	7705089	rs4791834	C	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=9;PP=402;SC=CGCCTCTCATCTCTCATCGCA;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=7705097;WS=7705079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	7708096	rs9889268	G	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=297;SC=CCCTGGGGGCGGAGGTTGCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=7708104;WS=7708086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	7720091	rs11078708	G	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=288;SC=CTTTCACTCTGCTCGCCACTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=7720099;WS=7720081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	7726665	rs55758061	C	CAG	295.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=1;PP=276;SC=GAGAAAAATACAGAGAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=7726673;WS=7726655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	7733555	rs7405476	A	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=288;SC=TGTACATGGCAGTGCTAGTGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=7733563;WS=7733545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	7750177	.	T	TACCACC	225	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=59.82;NF=4;NR=0;PP=225;QD=57.5;SC=CCACCACCATTACCACCACCA;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=4;WE=7750185;WS=7750167;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,4:0.31:13
chr17	7942901	rs76589243	C	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=16;PP=458;SC=GGGCGGGGACCCTGGTGCTGC;SOR=1.508;Source=Platypus;TCF=7;TR=23;WE=7942909;WS=7942891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	7945593	rs7503115	G	T	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=108;SC=GTCTGGCTGTGACCAGGCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=7945601;WS=7945583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7951819	rs4792147	A	G	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=27;PP=1124;SC=GAGCGGAACCAGGGCCTGGTG;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=60;WE=7951827;WS=7951809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	7976917	rs78835850	A	T	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=18;PP=1278;SC=TGGGGCATGGACGAAATTTAG;SOR=1.583;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=7976925;WS=7976907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	7977105	rs12937410	A	G	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=63;PP=1804;SC=CCCAGGCGACATCAGTCGTGC;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=7977113;WS=7977095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	7979463	rs2289586	A	G	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=40;PP=1728;SC=TGTCCACCCTAAGAGCCACCC;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=87;WE=7979471;WS=7979453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	7990545	.	G	C	249	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=58.84;NF=9;NR=2;PP=249;QD=25.7973829588;SC=GACACACACAGACACACACAG;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;WE=7990585;WS=7990535;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,11:0.41:27
chr17	7990555	rs76102404	G	C	111.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.48;QD=22.36;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	7990565	.	C	G	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQRankSum=-0.552;QD=1.47;ReadPosRankSum=2.979;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr17	7990577	rs7504003	G	C	1640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.71;QD=38.16;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	7991330	rs9909784	T	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=5;PP=303;SC=CGGGGGAGGGTAGGGGGAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=7991338;WS=7991320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	8015579	rs894505	G	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=311;SC=ATCACTGTGTGCCCCTCTGCC;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=8015587;WS=8015569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	8027593	rs3027279	G	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=454;SC=AAACTGGCCTGGGAGTGCGGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=8027601;WS=8027583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	8045060	.	CT	C	711	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=59.06;NF=8;NR=15;PP=711;QD=32.0;SC=GAGCTCAATTCTTTTTTCTCC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=23;WE=8045068;WS=8045050;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr17	8046772	rs2585405	C	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=26;NR=28;PP=1111;SC=GGACTCGGGGCGAGGGCGGGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=8046780;WS=8046762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	8048169	rs2253820	T	C	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=31;PP=849;SC=CTTCCTTCTGTGTGTGCAGGG;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=8048177;WS=8048159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	8048283	rs2735611	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=271;SC=CTGGGGCTAGGCCAGGCAGGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=8048291;WS=8048273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	8050737	rs885747	G	C	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=1140;SC=GGCTTGACCCGGCTTCCCACA;SOR=0.724;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=58;WE=8050745;WS=8050727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	8052525	rs147233293	CAAAAACA	C	1557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.33;QD=40.99;SOR=2.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	8064083	rs1061032	T	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=7;PP=435;SC=TCCAGGGGAGTGGGGGCTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=8064091;WS=8064073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	8066107	rs2304909	G	A	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=111;SC=GGGAACGCAGGAGAGACCCCG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=8066115;WS=8066097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	8076778	rs9894790	C	T	218.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=105;SC=AAGAATCAGACAGGAGCAATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=8076786;WS=8076768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	8076802	rs9901637	T	A	318.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=196;SC=GTGTTGCAAGTCCTGATTACG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=8076810;WS=8076792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	8076911	rs11655582	A	G	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	8076916	rs11650713	C	T	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	8079029	rs8064449	G	C	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=47;PP=1978;SC=AGGGAGTCCTGATAGAAGTGG;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=8079037;WS=8079019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	8092694	rs8531	T	G	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=21;PP=1239;SC=CGGGGTCGATTGGGGGAATGG;SOR=1.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=8092702;WS=8092684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	8108331	rs1059476	A	G	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.77;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	8108339	rs2241909	G	A	4057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.71;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	8110764	rs2289590	C	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=584;SC=CTTCCTCATCCCATCCTGTCC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=8110772;WS=8110754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	8132763	rs3826543	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=418;SC=GGCAGGGGAATGCTAAATAAA;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=8132771;WS=8132753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	8135061	rs3027238	T	C	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=29;PP=1560;SC=CCAGGAGCTATGAGTCGGTAC;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=80;WE=8135069;WS=8135051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	8137737	rs4792621	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=902;SC=ATGACAAAAAGGGAAATCACC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=8137745;WS=8137727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	8138427	rs145192682	C	T	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=42;PP=1608;SC=GAAGTCCTAACTGACGTTCCC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=88;WE=8138435;WS=8138417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	8139327	rs4791626	A	G	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=47;PP=2144;SC=CCTCTTTGAAAACCCACATTT;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=101;WE=8139335;WS=8139317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	8141707	rs6503093	T	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=28;PP=1298;SC=ACCTTCCACTTACCTCACAGC;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=8141715;WS=8141697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	8151178	rs12946837	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=285;SC=GTAAGAGGTAGGAGCGGACCG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=8151186;WS=8151168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	8157310	rs9891699	C	T	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=58;PP=2584;SC=GGGGGCAGCCCCTGGACACAC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=126;WE=8157318;WS=8157300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	8158273	rs6503094	A	G	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=14;PP=1030;SC=AGACAGCAGTAGGCAGGATCC;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=8158281;WS=8158263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	8159232	rs7221716	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=632;SC=CCAATAGGTGAGGAGAAATGG;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=8159240;WS=8159222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	8161149	rs4791641	C	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=13;PP=655;SC=TGGGAGGATCCAAGCTTCCAG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=8161157;WS=8161139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	8166378	rs7206953	T	C	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=29;PP=1646;SC=GGGGAGCGTATAGGAGCTTCC;SOR=1.058;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=71;WE=8166386;WS=8166368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	8167600	rs11078738	T	C	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=26;PP=1374;SC=CCGACACCCCTGCCAACCCCT;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=69;WE=8167608;WS=8167590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	8168224	rs9902252	T	C	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=9;PP=688;SC=TGGACCGCTCTGTGGGAGGCC;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=8168232;WS=8168214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	8168805	rs9897842	A	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=30;PP=1394;SC=TGGGAGCCCCAGGGAGGGGAG;SOR=1.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=75;WE=8168813;WS=8168795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	8169006	rs11655563	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=37;PP=1217;SC=GTGATCTTTGTTTGGCTCCTG;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=8169014;WS=8168996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	8193473	rs11245	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=TGGGTCTCTCGATTCCCTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8193481;WS=8193463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8194318	rs72835272	GT	AC	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=30;PP=2030;SC=GAGGAAGAGCGTTGTCAACCA;SOR=0.864;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=56;WE=8194327;WS=8194308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	8275001	rs2909439	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=160;SC=CCAGTTTTGACGCTGCCAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=8275009;WS=8274991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	8275023	rs1004151	T	G	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8283379	rs409445	C	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=218;SC=AAAGAGCCCACTTCGGCAACC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=8283387;WS=8283369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	8296383	rs12601362	C	T	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=938;SC=GGGAGCTGGGCGCTCTGGCCC;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=8296391;WS=8296373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	8296440	rs12601265	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=20;PP=856;SC=CTCCAGGCAGGGGAGGAGGCG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=8296448;WS=8296430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	8339103	.	C	T	74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=74;QD=27.1928031368;SC=CCCCCTGTGACACCAGCCCCG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=8339111;WS=8339093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8339283	rs3744652	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=18;PP=863;SC=CTGAGCCGAGCGGCTGGGCGG;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=8339291;WS=8339273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	8339307	rs8064417	G	A	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=25;PP=972;SC=TGGCCGGGCCGGCGGAGGGGA;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=8339315;WS=8339297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	8349984	rs369297844	T	TC	299.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=286;ReadPosRankSum=1.744;SC=TTCCTTGGGTTCCCCCCCACC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=8349992;WS=8349974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr17	8354072	rs72841789	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=734;SC=GTGAGTATTCCTGCCCTTGTT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=8354080;WS=8354062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	8354321	rs72841791	C	T	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=24;PP=746;SC=GATCAGCTTACGGGGGTTTGT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=8354329;WS=8354311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	8383253	rs4791316	G	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=145;SC=GTCCTCCCAGGCTCTGAATGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=8383261;WS=8383249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	8383344	rs3215073	G	GC	1090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=772;SC=GTGGTGGGGAGCCCCCCCGAA;SOR=2.494;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=27;WE=8383352;WS=8383334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	8383894	rs6503120	A	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=16;PP=495;SC=AGCACAGCACAGGAGCCTCAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=8383902;WS=8383884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	8384875	rs904417	T	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=AATTAAACTGTCAAGAAAATC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=8384883;WS=8384865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	8387438	rs113838551	G	GATGA	3001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=19;PP=1798;SC=TGAACAAATGGATAAGTAACA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=38;WE=8387446;WS=8387428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	8390655	rs7219356	C	T	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=156;SC=ACGCTGACAGCGGTGCTGTGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=8390663;WS=8390645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	8393979	rs2270743	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=306;SC=CCACTTTGGTCCCCCTGGGCC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=8393987;WS=8393969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	8395894	rs904416	T	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=29;PP=686;SC=TCTTCCACCATGTGGCTGATT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=8395902;WS=8395884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	8396010	rs3744653	A	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=113;SC=TATCACATTTAAATGCCTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=8396018;WS=8396000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	8397315	rs2277670	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=11;PP=277;SC=TGCATGAGAACGCCCAGTGAC;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=8397323;WS=8397305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	8412133	rs9889907	A	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=491;SC=ACTGTACACAATCACATGCTG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=8412141;WS=8412123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	8413358	.	A	AT	56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=61.64;NF=0;NR=4;PP=56;QD=14.75;SC=TGAGATACTAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=8413366;WS=8413348;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,4:0.27:15
chr17	8416901	rs11374	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=16;PP=694;SC=CTTCCACCTTCGTCTGCTTCT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=8416909;WS=8416891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	8417006	rs66631876	GT	G	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=24.14;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	8424270	rs8067456	G	A	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=31;PP=1328;SC=CCAGGACACCGTTACAGCGAA;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=8424278;WS=8424260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	8449767	rs4791724	A	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=18;PP=1319;SC=AAGACAGTTTATATTGATTCA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=8449775;WS=8449757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	8451744	rs57472344	GA	G	417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=326;SC=TTGATAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=18;WE=8451752;WS=8451734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	8455532	rs883811	G	A	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=105;SC=CTCTTTCAGCGTCTGTAAATT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=8455540;WS=8455522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	8473182	rs422173	G	A	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=720;SC=TTAATCTAATGTCTTTACTCA;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=8473190;WS=8473172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	8478586	rs10573578	CAAT	C	696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=506;SC=ATGTTAACAACAATGATTTAT;SOR=1.061;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=8478596;WS=8478576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	8478605	rs268460	C	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=9;PP=274;SC=ATGTGTTCCACAGGGAATTTG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=8478613;WS=8478595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	8647127	rs9895426	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=248;SC=AGCATCCCTGCCCCAGAGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=8647135;WS=8647117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	8647181	rs9902109	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=144;SC=TCCCACTTTCTACCCCATGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=8647189;WS=8647171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	8647298	.	C	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=511;SC=GCTCTAGCCACCCCACTCAGA;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=8647306;WS=8647288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	8647337	rs7218546	A	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=6;PP=539;SC=AGGCTCTCCCAGAGCCCCAGC;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=8647345;WS=8647327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	8647931	rs10852904	G	C	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=50;PP=1310;SC=GACTCATGGTGGCAGTGACCT;SOR=0.930;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=87;WE=8647939;WS=8647921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	8701116	rs2242374	G	A	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=52;PP=2348;SC=GCTGCCCAGCGAGGCAGCTCA;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=8701124;WS=8701106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	8701799	rs17854013	G	T	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=34;PP=1808;SC=TTCCCCCCAGGAAGCAAGGGG;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=87;WE=8701807;WS=8701789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	8725214	rs56322041	A	AG	3271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=49;PP=2607;SC=AGTGGCCCGCAGGAAACGGTG;SOR=1.265;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=58;WE=8725222;WS=8725204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	8726160	rs2074258	A	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=170;SC=GGGGATCAAGAGCAGCCTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=8726168;WS=8726150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	8784361	rs4791765	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=813;SC=GGTCAGCCCCAAATCCCTGGC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=8784369;WS=8784351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	8784900	rs376963225	C	CAGTA	2065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=14;PP=1512;SC=ATGCACGCTCCAGTAAGTCTC;SOR=0.976;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=26;WE=8784908;WS=8784890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	8790074	rs11078770	G	A	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.67;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	8792003	rs9915880	C	T	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=44;PP=1798;SC=GGGCCGGCCCCGAGGCCTGGG;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=8792011;WS=8791993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	8792029	rs381309	A	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=51;PP=1885;SC=GCAAGGGACAAGGTGGAGTCA;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=8792037;WS=8792019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	8792093	rs16957702	G	A	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=50;PP=2014;SC=CACAGTGCCCGTCAGTTTCCA;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=93;WE=8792101;WS=8792083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	8792171	rs11650737	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=39;PP=1381;SC=CTGGCTGGAGTAGCTCCTGTT;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=8792179;WS=8792161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	8792326	rs11654380	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=6;PP=256;SC=AGCACTGCCCCCTTGCTCTGC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=8792334;WS=8792316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	8792371	rs11654094	G	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=6;PP=255;SC=CTTTGGGGACGGGGTGGGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=8792379;WS=8792361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	8792514	rs394811	G	A	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=21;PP=1303;SC=TGGGGATGGTGTGGAGCTTCC;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=8792522;WS=8792504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	8793905	rs365024	T	C	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=77;SC=ACACCCTCTATGAGGTCAGCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=8793913;WS=8793895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8794002	rs364676	T	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.12;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	8794009	rs61759652	T	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	8794014	rs381198	A	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	8809075	rs92535	G	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=18;PP=589;SC=GAGGAGAAGGGGAATGAGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=8809083;WS=8809065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	9083377	rs9906162	G	T	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=1210;ReadPosRankSum=1.415;SC=TTTTTGGTTGGTTGAGTCTCA;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=9083385;WS=9083367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr17	9083395	rs9906347	G	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=31;PP=838;SC=TCACTGTGTCGCCCAGGCTGG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=9083403;WS=9083385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	9086228	rs2302196	C	A	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=64;PP=2119;SC=TTGAACCTCACAAAGAGATCC;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=9086236;WS=9086218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	9086293	rs2302197	G	C	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=49;PP=1278;SC=GAAGGTAAACGGCCCCCTTCG;SOR=1.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=69;WE=9086301;WS=9086283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	9086561	rs16957995	C	A	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=274;SC=TACTTGTCCACCAGCTGCCCG;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=9086569;WS=9086551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	9086676	rs16957998	T	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=537;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GGGCACAGGGTCGCACAAGCA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=26;WE=9086684;WS=9086666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,26:0.93:28
chr17	9086708	rs62068199	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=518;SC=GCCCAGGAGCTGGGCGTGGGG;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=9086716;WS=9086698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	9086743	rs62068200	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=12;PP=384;SC=CATTTTCATTCGCCTCTAACT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=9086751;WS=9086733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	9124472	rs146644536	C	CG	1106.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=10;PP=839;SC=GCTCCCCCCCCACCCCCCTGC;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=22;WE=9124480;WS=9124462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	9153861	rs8974	G	C	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=20;PP=1940;SC=TCTGTCATTGGCAGGTGTCAC;SOR=2.128;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=84;WE=9153869;WS=9153851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	9154078	rs17743659	G	C	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=62;PP=1880;SC=CCTTCAGTTTGTACGAAGTGG;SOR=2.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=80;WE=9154086;WS=9154068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	9154118	rs17675967	C	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=740;SC=TGGGGCGCCGCTGCTGCTACA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=9154126;WS=9154108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	9395033	rs6503214	A	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=115;SC=TGTAACAATCATTGACATTAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=9395041;WS=9395023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	9395231	rs9893664	G	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=160;SC=CAAGGCCTGCGTCCTGTTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=9395239;WS=9395221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	9408594	rs2249929	A	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=263;SC=CAATTCAAACACAATTTATTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=9408602;WS=9408584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	9408609	rs2125348	A	G	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=164;SC=TTATTGCATCATTAGTTTATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=9408617;WS=9408599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	9471711	rs1133295	T	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=5;PP=249;SC=TCACCTTTTCTTTCATATTGA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=9471719;WS=9471701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	9479048	rs7210038	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=172;SC=TTGCCTGCTCTCCGGAAGCCC;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=9479056;WS=9479038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	9479098	rs7224817	C	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=374;SC=CCGCCCTCACCCGGGACTCAC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=9479106;WS=9479088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	9479364	rs6503230	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=233;SC=TTAAAATTGTTAAATAGAAAC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=9479372;WS=9479354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	9487769	.	G	T	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=920;SC=TATTAAGGTTGTATCAATTTA;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=9487777;WS=9487759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	9515777	rs6503235	G	A	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=60;PP=2006;SC=TGATGCTGTCGAGGATATTGT;SOR=1.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=90;WE=9515785;WS=9515767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	9714009	rs4079466	C	A	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=40;PP=1264;SC=AATTTCTAGCCCCTTAACTGG;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=9714017;WS=9713999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	9714086	rs4791362	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=435;SC=CTGTGTGGGAGCCTGATATAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=9714094;WS=9714076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	9764613	rs2280493	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=17;PP=503;SC=GAAAATATCTATCCCTTCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=9764621;WS=9764603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	9821614	rs61532416	G	GA	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=538;SC=TTTACTTCCTGAAATCCTGCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=9821626;WS=9821604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	9821618	rs55976773	T	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=355;SC=CTTCCTGAAATCCTGCTCCGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=9821626;WS=9821604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	9830171	rs56199323	C	T	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=29;PP=861;SC=AGGGGCACCCCCACTTCCCCA;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=9830179;WS=9830161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	9846521	rs17339499	G	C	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=36;PP=1562;SC=ACCCAGCCACGGTGCCGTTGC;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=9846529;WS=9846511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	9846631	rs8066006	G	A	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=38;PP=1212;SC=GAGGGAGGACGGCTCCTAGAT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=9846639;WS=9846621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	9846724	rs733804	C	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=224;SC=CTGGTGCCCCCACTCCCAACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=9846732;WS=9846714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	9850440	rs62064532	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=497;SC=GCTCCAGGGGCCAGCATTTCA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=9850448;WS=9850430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	10205067	rs2008528	C	T	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=35;PP=1324;SC=CCTCTCAGTCCGATTATGAGG;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=10205075;WS=10205057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	10214628	rs2074867	C	T	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=41;PP=1257;SC=CAGGGATGGGCGATTCATTCA;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=10214636;WS=10214618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	10216442	rs4239113	C	A	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=31;PP=1321;SC=TGTCCTCGGGCCCCCTCTGCT;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=10216450;WS=10216432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	10219113	rs17690195	C	T	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=30;PP=1095;SC=CTCTTCCACTCGGTGGCTCAG;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=10219121;WS=10219103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	10219366	rs2240577	C	T	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=25;PP=972;SC=AAAGTCAACACGAATGGGAAG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=10219374;WS=10219356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	10219470	rs2240578	A	T	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=459;SC=AACAAAAAAAAGTTCAGTTTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=10219478;WS=10219460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	10223714	rs2074877	T	C	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=35;PP=1367;SC=TCTAGATCCATAATGGATTCC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=10223722;WS=10223704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	10227708	rs3826442	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=463;SC=CACACATGCACGCACATGTGC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=10227716;WS=10227698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	10231498	rs2277645	A	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=345;SC=CTGCACCCCCAACCTGTCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=10231506;WS=10231488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	10235360	rs8064714	G	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=184;SC=GATCAGCTAAGAAGCAGCCCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=10235368;WS=10235350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	10236465	rs2240579	G	A	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=37;PP=1186;SC=CGAGGACCCCGTTACAGCGCA;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=10236473;WS=10236455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	10243589	rs4445936	C	A	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=38;PP=1152;SC=CATTTAGCAACTGCCATTTCA;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=10243597;WS=10243579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	10243717	rs3760423	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=271;SC=CTCCGGAGTCGCCTGGAGACA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=10243725;WS=10243707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	10249888	rs34168540	G	GA	832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=868;SC=CTCTTAATGTGAAAGCTGATT;SOR=4.255;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=21;WE=10249896;WS=10249878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	10250159	rs56191439	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=750;SC=AACAGTAGCTGCTAAAGTGTC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=10250167;WS=10250149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	10254197	rs2108568	A	G	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=39;PP=1124;SC=TGGGTGGGTGAAGACTATGGG;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=10254205;WS=10254187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	10301640	rs201916027	A	AT	2433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=19;PP=2000;SC=CATTATATATATATAATACTT;SOR=1.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=43;WE=10301648;WS=10301630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	10314375	rs12601552	G	A	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=188;SC=ATGAGATACAGTTAAAACTAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=10314383;WS=10314365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	10314395	rs12601678	C	T	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=215;SC=ACGTTGCTCCCTCAAAAAATG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=10314403;WS=10314385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	10317831	rs4791406	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;SC=TCGAGTTTGAAAAAAGTATCA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WS=10317821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	10317842	rs4791407	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=530;SC=AAAAGTATCAATGCTTCTGAG;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=10317850;WS=10317821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	10317940	rs4791408	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=82;SC=AATTGCAGATAGACAGTGATT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=10317948;WS=10317930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	10318636	rs8068729	A	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=18;PP=881;SC=CATTCCTCACAGTTTTGGCAT;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=10318644;WS=10318626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	10319056	rs75077369	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=696;SC=ATCCGTTAAAAAATGCATATT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=10319064;WS=10319046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	10319148	rs7216301	A	G	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	10346781	rs3744554	T	C	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=17;PP=727;SC=GCCCGTTCCTTGGCCTCCTCC;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=38;WE=10346789;WS=10346771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	10348354	rs2277649	T	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=30;PP=1246;SC=CTCAGCCTCATCCAGACGGAG;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=56;WE=10348362;WS=10348344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	10348705	rs3833153	A	AGAAGC	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=13;PP=1239;SC=GAAAGAGAAGAGAAGCACATT;SOR=0.804;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=19;WE=10348713;WS=10348695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	10355371	rs11651295	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=37;PP=1289;SC=TCAATCTGCTCCCCAAGCTCA;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=10355379;WS=10355361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	10355763	rs917361	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=26;PP=822;SC=TTTGTAGCTGTATTGCAAGGG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=10355771;WS=10355753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	10356816	rs3744557	C	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=175;SC=CAAGTAAGTACATTGAGGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=10356824;WS=10356806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	10360016	rs2041123	C	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=300;SC=CATATCTCTCCTCCCTCAATT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=10360024;WS=10360006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	10362746	rs2058099	A	G	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=28;PP=1111;SC=GAACTACAGAACAAGATAAAT;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=10362754;WS=10362736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	10363410	rs3744561	A	G	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=37;PP=1867;SC=CACCCACTGCATTGTACACCT;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=97;WE=10363418;WS=10363400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	10364191	rs1029665	T	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=271;SC=AAGTTCACTATGTCAGCTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=10364199;WS=10364181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	10399897	rs3744563	A	G	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=77;PP=2591;SC=ACATTAGTAGAGTAATGGAAG;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=138;WE=10399905;WS=10399887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	10409277	rs114149575	G	A	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=30;PP=1895;SC=GCCATACTTCGTGGTCTATCA;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=10409285;WS=10409267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	10411632	rs35152572	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=349;SC=TCTGGCCTCTAGTTATGTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=10411640;WS=10411622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	10414284	rs8082000	C	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=2;PP=338;SC=AAAAAAGAAGCAGCTCAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=10414292;WS=10414274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	10415269	rs117790102	A	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=40;PP=2399;SC=ATCTTATCGTAGACAGCTTTG;SOR=1.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=117;WE=10415277;WS=10415259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	10415840	rs2007027	A	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=37;PP=1714;SC=CATCTGAAGTAAAGCCCAGAA;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=82;WE=10415848;WS=10415830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	10418275	rs1017068	T	G	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=25;PP=854;SC=CTTTCTATAGTGAAACAGGGC;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=10418283;WS=10418265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	10431275	rs12952334	A	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=113;SC=ACTTCTCCCCAAAATAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=10431283;WS=10431265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	10431877	rs11372676	A	AT	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=519;SC=AAAAATGCTGATTTTTTGTGC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=16;WE=10431885;WS=10431868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	10432638	rs2277651	T	C	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=27;PP=1204;SC=CCATAAGCAATTCTTTCTTAC;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=10432646;WS=10432628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	10434925	rs3744565	T	C	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=35;PP=1923;SC=TGGTTAGTGATACCAAGGGTG;SOR=1.302;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=98;WE=10434933;WS=10434915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	10435325	rs11379780	G	GA	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=515;SC=ACATGCAGATGAAAAAATTCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=10435333;WS=10435315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	10442977	rs2277653	T	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=46;PP=1488;SC=TGCAGTGTTTTAAATATCTCT;SOR=1.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=10442985;WS=10442967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	10446182	rs719277	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=409;SC=AGAATTATGACATTTCTTACC;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=10446190;WS=10446172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	10446508	rs11078849	T	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=159;SC=TTACTACCTTTTTTTTATATA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=10446516;WS=10446498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	10448769	rs11078850	A	T	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=23;PP=1188;SC=GCTTATACACAGGCAGCCACT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=10448777;WS=10448759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	10450816	rs12600539	T	C	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.89;NF=44;NR=25;PP=1527;SC=CTGCATAACGTTCTTTGAGGT;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=10450824;WS=10450806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	10595388	rs2520178	A	G	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=996;SC=AGGTGTTTTGAAAGCAGATGG;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=10595396;WS=10595378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	10596380	rs9897641	G	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=323;SC=TCATGGTGGGGGCACAAAATG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=10596388;WS=10596370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	10614051	rs3215180	AT	A	428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.63;NF=11;NR=3;PP=266;SC=TGAGATAGCAATTTTTTTTTC;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=14;WE=10614059;WS=10614041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	10614442	rs406446	A	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=30;PP=921;SC=TACAAGAAAGAAAGAGCCTTC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=10614450;WS=10614432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	10618665	rs10676707	A	AAACT	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=276;SC=GAGTTTTAAAACTATTAGCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=10618673;WS=10618655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	10632174	rs453318	A	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=232;SC=ACATTACATTAGAACTCTGAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=10632182;WS=10632164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	10632499	rs421541	G	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=203;SC=GGCATCGAGGGTACAAAATCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=10632507;WS=10632489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	10632535	rs378707	C	T	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=130;SC=CAGATGAGGACGGGTGAAGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=10632543;WS=10632525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	10633181	rs3826448	A	G	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=17;PP=604;SC=CTCGGAGAACACGGCGCGGGG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=10633189;WS=10633171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	10633245	rs202312	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=20;PP=572;SC=CGGTCCGCCTTCCTCCTTGCG;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=10633253;WS=10633235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	10633320	rs57860819	G	GT	592.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=250;SC=CCGTCGCTCCGCCCGGGGGCG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=10633329;WS=10633310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	10633321	rs60373482	C	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=7;PP=165;SC=CGTCGCTCCGCCCGGGGGCGG;SOR=1.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=10633329;WS=10633310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	10633358	rs202311	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	11455359	rs2969191	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=44;PP=1255;SC=ATCAAACACACGGTCATAAAC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=11455367;WS=11455349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	11459012	rs1030055	G	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=214;SC=ACCTGCCACAGACATGGTCCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=11459020;WS=11459002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	11511412	rs4792156	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=245;SC=GAATTGGAACACCTGCCTTTC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=11511420;WS=11511402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	11511457	rs11078022	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=401;SC=TTGTTCTACCCGTCCTGGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=11511465;WS=11511447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	11513661	rs2191072	C	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=318;SC=ATTTTCACGCCTCAGGGTTTT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=11513669;WS=11513651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	11522764	rs10852799	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=310;SC=TATTATCCTCGTGAAAAATAT;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=11522772;WS=11522754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	11523082	rs9892256	A	G	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=48;PP=1491;SC=TTCCTGGGACAACTGCACGTG;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=11523090;WS=11523072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	11532613	rs9896886	T	C	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=1;PP=138;SC=CCCCTTCCTGTGTCCATGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=11532621;WS=11532603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	11532835	rs9895535	A	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=719;SC=AAATGCATGAAGAATTTCAAG;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=11532843;WS=11532825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	11536049	rs11655911	G	A	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=919;SC=GGAGCCACTCGGTCCTGGATA;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=11536057;WS=11536039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	11543520	rs11653848	T	C	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=231;SC=TGGTGGGAGGTGTTTGCCGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=11543528;WS=11543510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	11550340	rs11870495	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=493;SC=CAGGCACCGGTGAGCTGGGAG;SOR=3.180;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=11550348;WS=11550330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	11572669	rs73975043	G	A	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=54;PP=2315;SC=CCTGCCTGCCGTTGTCTCGCT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=11572677;WS=11572659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	11583089	rs8071438	T	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=27;PP=1630;SC=CCAACCTGGATGCGTTTATAA;SOR=1.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=11583097;WS=11583079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	11593821	rs7220893	C	A	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=440;SC=TCACCCAGTTCCTGCATTGTC;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=11593829;WS=11593811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	11604598	rs7214186	T	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=299;SC=TCCTCCATGGTTGGGGCTGTC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=11604606;WS=11604588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	11622494	rs12945437	A	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=279;SC=TTGCCCGCTAAAGAGTCCTCC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=11622502;WS=11622486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	11648332	rs3744578	C	T	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=72;PP=2312;SC=GAGACCCCAACTTCGAAGCTT;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=114;WE=11648340;WS=11648322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	11648444	rs3744580	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=742;SC=ATCTCTTACTTATTGTCCAGG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=11648452;WS=11648434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	11660722	rs11078030	G	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=143;SC=CCATTTACCCGCTCACATCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=11660730;WS=11660712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	11772285	rs59647695	C	T	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=198;SC=AGATCTTCCCCGAATGTGCTT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=11772293;WS=11772275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	11778240	rs7211854	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=104;SC=TGTTCTGAGCGTGGGGTGGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=11778248;WS=11778230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	11787975	rs11078042	T	C	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=19;PP=594;SC=TGAGGGACAGTTGAGGTTGGA;SOR=1.206;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=11787983;WS=11787965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	11806266	rs3815269	T	C	156.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=61;SC=AGCATAGGCATGGGGCAAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=11806274;WS=11806256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	12569442	rs76148496	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=464;SC=GCTCCCGGGAGCCTGTTGCTG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=12569450;WS=12569432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	12606826	rs62058697	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=16;PP=1056;SC=TATAATTGCTATTCCCTCTTA;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=12606834;WS=12606816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	12647490	rs12709295	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=432;SC=TTTCCTCATCTTCTTTGCAGT;SOR=1.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=12647498;WS=12647480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	12655677	rs147831580	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=19;PP=1465;SC=AATGAATACACTTTTAAAAAT;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=12655685;WS=12655667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	12799985	rs2302068	G	A	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=974;SC=TTTTCTGTGGGGTAATGACCC;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=12799993;WS=12799975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	12820421	rs35221864	T	C	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	12820632	rs12451747	A	C	185.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=37;SC=CAGAGAAGCCAGTAGCATGGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=12820640;WS=12820622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	12855719	rs2072253	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=615;SC=GTCAGTTACAGTGGTTGGTAT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=12855727;WS=12855709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	12856005	rs2072252	A	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=ATAGCATTTTATGATGTCCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=12856013;WS=12855995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	12859125	rs3214256	C	CG	1122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=644;SC=GTCCAGTCCCCGGGGGACATG;SOR=0.927;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=17;WE=12859133;WS=12859115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	12859149	rs2190698	C	T	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=906;SC=GGTGTTGAGCCTTGGTTAAAC;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=12859157;WS=12859139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	12860160	.	CT	C	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=112;QD=31.0;SC=TGCCCACAGGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=12860168;WS=12860150;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,4:0.57:7
chr17	12860183	rs10602009	AACACAC	A	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=4;PP=321;SC=TTCCCCTATAAACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=12860196;WS=12860173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	12862309	rs11868628	T	C	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=35;PP=837;SC=ACGGGAAGGCTGCACTGACTC;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=12862317;WS=12862299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	12862359	rs9904572	G	A	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=463;SC=AACTGTATCTGCTGTGTCTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=12862367;WS=12862349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	12890651	rs57940266	T	G	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=544;SC=CTTTGGGGCATCCCTGGCCTC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=12890659;WS=12890641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	12897669	rs56329828	C	T	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=14;PP=996;SC=TGGAGACAAACGACGGCTGCT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=12897677;WS=12897659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	12898295	rs17552022	T	C	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=34;PP=1405;SC=CCAAATCACATGTTCGCAACA;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=12898303;WS=12898285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	12898454	rs73981604	C	A	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=581;SC=AAGTCTTTGGCTGGAGAACCC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=12898462;WS=12898444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	12898994	rs2286338	C	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=252;SC=AACAGCCCAGCGGGCCAGGCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=12899002;WS=12898984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	12899726	rs4792308	A	G	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=49;PP=2377;SC=TTTTGCAAAAAACCATTTCCT;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=12899734;WS=12899716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	12899963	rs11545302	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=22;PP=758;SC=GCTGCCCAAATGTGCCCTCAC;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=12899971;WS=12899953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	12901544	rs11443554	T	TA	526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=479;SC=ATTCCCAGGGTAAAGTTTGCT;SOR=4.294;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=12901552;WS=12901534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	12901688	rs56405144	G	A	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=45;PP=1726;SC=AAAAGTAAACGTGCCCTTGAT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=90;WE=12901696;WS=12901678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	12903599	rs3760316	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=501;SC=TCCCTGCAGGAAGAGAGAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=12903607;WS=12903589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	12905525	rs56341811	TG	T	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=301;SC=ATTTACTATGTGGCTATTTAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=12905533;WS=12905515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	12905574	rs55674356	T	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=568;SC=ATTCCATTAGTTCAAGATGGC;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=12905582;WS=12905564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	12905743	rs55825263	G	A	4522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=74;PP=2898;SC=ACAAGGGGCCGGTCTGAGACA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=140;WE=12905751;WS=12905733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	12907023	rs77703211	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=629;SC=CCACGCCCAGGCCATGCTCTC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=12907031;WS=12907013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	12908204	rs4792309	T	C	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=195;SC=TAAACCCAGATAGTGGTCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=12908212;WS=12908194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	12908247	rs17639379	T	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=3;PP=427;SC=AAGATGCCCATGTCGATGCTG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=12908255;WS=12908237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	12909046	rs3217019	A	AATC	1489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=1025;SC=GTAACTGCTGAATCAAGAAAA;SOR=1.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=20;WE=12909054;WS=12909036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	12914832	rs73981621	C	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	12914832	.	CCA	TCC	415	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=415;QD=66.9239821232;SC=TCTCATTCCCCCAACGGGCCA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=12914842;WS=12914822;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	12914834	rs73981622	A	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	12914920	rs41494747	A	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=13;PP=795;SC=CAAGCATTACAAGGCAGAGAA;SOR=1.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=44;WE=12914928;WS=12914910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	12915009	rs4792311	G	A	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=46;PP=1541;SC=ATTTTCATTCGACTCGGAGTC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=12915017;WS=12914999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	12916388	rs74886662	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=411;SC=ATCTTCATTCCTCAACTAAAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=12916396;WS=12916378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	12916606	rs74556312	A	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=807;SC=CAAGAAAACCACACAACAGCA;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=12916614;WS=12916596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	12917856	rs56004910	G	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=161;SC=TTGAACAAATGTAGAACACAG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=12917864;WS=12917846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	12920260	rs58809197	A	G	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=53;PP=2965;SC=CTAAGAATGAAAAAACATTTA;SOR=1.300;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=146;WE=12920268;WS=12920250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	13399486	rs11385090	A	AT	374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.98;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	13399513	rs371396064	G	A	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=10;PP=570;SC=AAATTATATGGTTATCCATCC;SOR=1.845;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=33;WE=13399521;WS=13399503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	13972811	rs6502330	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=136;SC=GCCGGAAGTGGCGGCCCGGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=13972819;WS=13972801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	13977813	rs143814384	C	CTTTA	1362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=1005;SC=TACTTTCTGCCTTTTTCTCTG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=20;WE=13977821;WS=13977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	13980350	rs2072279	G	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=41;PP=1172;SC=ATTTTGGCTCGACTATCCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=13980358;WS=13980340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	14005373	rs1017076	C	T	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=431;SC=TTTTGTCGTTCTGGCCTTTAC;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=14005394;WS=14005363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	14005386	rs2108683	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=12;SC=GCCTTTACAGTTGGGACTCCT;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=14005394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	14005439	rs2159132	G	A	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=688;SC=TCGCAGCTCTGGTTGTAAGTA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=14005447;WS=14005429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	14005647	rs3217030	C	CAT	312.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=214;SC=CTTCCAAACTCATATATTGAT;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=14005655;WS=14005637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	14063389	rs7212977	G	T	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=152;SC=AAGAAACAAAGTGATATGGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=14063397;WS=14063379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	14095309	rs2230354	A	G	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=31;PP=1692;SC=TTTCCAGCCCATTGCTAGCTG;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=86;WE=14095317;WS=14095299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	14095566	rs151441	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=13.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=-5.029;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,23:0.29:80
chr17	14095639	rs373313742	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=15.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.29;MQRankSum=0.112;QD=3.07;ReadPosRankSum=-3.263;SOR=2.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,18:0.23:79
chr17	14095682	rs2158978	T	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.84;QD=26.58;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	14139565	rs4791563	T	C	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.46;QD=24.98;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	14139774	rs4791564	C	A	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.01;QD=24.25;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	14139891	rs62052131	A	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.24;QD=23.99;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	14140080	rs17679866	C	T	179.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=7;PP=203;SC=TCGGCATCGTCGGAAAAGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=14140088;WS=14140070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	14140103	rs4792453	A	G	181.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=7;PP=187;SC=CACTCCCTCCATTCCTGAAGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=14140111;WS=14140093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	14673567	rs5819492	C	CA	2411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=29.77;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	15134175	rs13422	T	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=15;PP=796;SC=CTGCTTTCTGTTTTCCCTTCC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=15134183;WS=15134165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	15154966	rs66507245	T	A	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=10;PP=301;SC=TGGGGGCCACTTGTGTGTGGA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=15154974;WS=15154956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	15162389	rs231020	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=486;SC=GACAAGCTCATGGAGCACAAA;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=15162397;WS=15162379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	15207364	rs13961	T	G	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=35;PP=1437;SC=CATACTCGAGTGTGGCTTTGA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=15207372;WS=15207354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	15217389	rs230897	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=888;SC=CAGCCGTGGCGTGTGCCTGAC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=15217397;WS=15217379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	15217437	rs230898	C	G	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=32;PP=1566;SC=GCGGAAGTAGCCGACACCGTC;SOR=1.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=15217445;WS=15217427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	15343524	rs71150251	C	CCTT	3157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=20;PP=1852;SC=CCCAACCCTACCTTCTTTCTT;SOR=1.329;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=36;WE=15343532;WS=15343514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	15406123	rs71974269	CCTCT	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	15492409	rs151442	T	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=30.58;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	15492426	rs28445278	C	T	491.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.464;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.32;MQRankSum=2.065;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.390;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr17	15532407	.	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.48;QD=30.21;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	15535986	.	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=38;PP=1205;SC=ACTTGCAGTACTCCTGCAGAA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=15535994;WS=15535976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	15602950	rs12449956	G	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.744;NF=6;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=0.344;SC=GAGAACCGGAGTCTGGCGATG;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=15602958;WS=15602940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	15603021	rs12452845	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-5.973;QD=15.59;ReadPosRankSum=2.210;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr17	15603031	rs12450403	G	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-6.277;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.302;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr17	15604395	rs77257979	TG	CA	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=466;SC=TATGTTGAAGTGGTTTTTAGA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=15604404;WS=15604385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	15604444	rs4792655	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=12;PP=850;SC=AGGTCTCATCATTACTGCTTT;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=15604452;WS=15604434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	15607777	rs62071718	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=9;PP=550;SC=GACGGGCCCGAGCCGCATACT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=15607785;WS=15607767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	15620481	rs2530064	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.15;QD=30.13;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	15640815	rs201215351	A	G	62.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.02;QD=20.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	15643382	rs11429009	A	AC	2823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=26.89;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	15644392	rs7222367	T	C	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=445;SC=GTGGCCTCAGTCCTCCTAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=15644400;WS=15644382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	15668330	rs2955833	G	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=21;PP=982;SC=TGCTTTTGGGGTGGAATTCCT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=15668338;WS=15668320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	15668720	rs935147	C	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=9;PP=582;SC=GAGGCGGAGACCAGGGCATTC;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=15668728;WS=15668710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	15668775	rs1814454	A	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=20;PP=1048;SC=TCTCTCATTCACTAGAACCAC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=15668783;WS=15668765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	15942886	rs373591408	C	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=22;PP=1115;SC=CAAAGCTTCCCATGAGAGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=15942894;WS=15942876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	16052606	rs34511605	CAT	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=1.006;SC=AGATTTAAGTCATATATATAT;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=2;WE=16052615;WS=16052596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	16221271	rs56228407	A	AC	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=89;SC=CCTGCCCCAGACCCCTGTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=16221279;WS=16221261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	16251859	rs2286666	A	G	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=11;PP=595;SC=GCATGCTAACAGTTGGGTGGG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=16251867;WS=16251849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	16256240	rs3095172	C	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=318;SC=AGGCTCAGAGCTGAAAGGCGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=16256248;WS=16256234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	16326253	rs7225104	G	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=582;SC=AGTAAGGCCTGGTTCAAGGTC;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=16326261;WS=16326243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	16329286	rs34192401	C	T	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=938;SC=TATGGGGGTACGTGCACGTGT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=16329294;WS=16329276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	16330919	rs12936240	G	T	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=32;PP=1218;SC=GCTTCAGGGGGCTTAGAGAAA;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=60;WE=16330927;WS=16330909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	16332072	rs34166276	A	G	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=60;SC=AGCATAGGCCAGTGGGGGCTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=16332080;WS=16332070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	16335676	.	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=433;SC=GGGAGTGCTCCGGACCCTGCG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=16335684;WS=16335666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	16342833	rs11871958	T	C	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=44;PP=1800;SC=CTGATGATACTTGTAATAGGA;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=82;WE=16342841;WS=16342823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	16344600	rs4617905	T	C	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=34;PP=1495;SC=GGTGAACCTATGGTTTTCTGA;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=16344608;WS=16344590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	16350239	rs2882581	A	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.14;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	16351592	rs2351084	T	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=27;PP=691;SC=CCATGATCCCTGCCACTCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=16351600;WS=16351582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	16734809	rs2688010	A	G	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.75;QD=23.98;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	16734869	rs62074145	A	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.59;QD=24.48;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	16855878	rs8072293	C	T	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=43;PP=1671;SC=TAGCCACCCCCGTCCACAGGC;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=85;WE=16855886;WS=16855868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	17083140	.	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=360;SC=ATGGTGGTCTGAAGAGATCTA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=17083148;WS=17083130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	17083386	.	G	A	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=34;PP=1175;SC=CGGCAACTCAGAAACATCAGG;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=17083394;WS=17083376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	17122286	rs8065572	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=329;SC=CAGCCCATGACTGGCTCTCCT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=17122294;WS=17122284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	17409683	rs3816512	C	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=622;SC=CCCACCTGCCCAGGCTGGCCC;SOR=3.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=17409691;WS=17409673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	17412032	rs4646407	G	C	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=15;PP=673;SC=CCTCTGACCCGCCGGGGGAGC;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=17412040;WS=17412022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	17682484	rs1006656	G	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=647;SC=AATATTTTCCGTGGTGAGGAA;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=17682492;WS=17682474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	17698254	rs8067439	G	A	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=49;PP=2428;SC=CTGGGGAGCCGGAGGCCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=17698262;WS=17698244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	17707105	rs3818717	T	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=31;PP=1079;SC=GGGCCACCATTGGGTGCTGCC;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=17707113;WS=17707095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	17715317	rs2297508	C	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=27;NR=19;PP=878;SC=GGAAGCCTTTCCCTAGGTGCT;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=17715325;WS=17715307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	17719503	rs7501788	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	17721457	.	A	G	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=22;QD=28.3856062736;SC=TGAGGTGGGCAGGGCAGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=17721465;WS=17721447;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	17726965	rs12936927	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=377;SC=AGCGCTGCGGCGCGCCCGCCC;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=17726973;WS=17726955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	17740164	rs60282872	GC	G	425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	17750907	rs7501812	G	A	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=164;SC=CACGGGGTGCGAGCGGGGACC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=17750915;WS=17750897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	17767526	.	A	AT	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=16;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.02;NF=1;NR=1;PP=28;QD=15.5;SC=ATCCAATTTGATTTTTTTTTT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=2;WE=17767534;WS=17767516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr17	17770355	rs11657074	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=233;SC=GTCCCACCTGGGGGCTAGGGA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=17770363;WS=17770345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	17772622	rs34879782	G	GA	214.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.473;NF=3;NR=12;PP=208;ReadPosRankSum=-1.459;SC=CTTTTCAAGGGAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=15;WE=17772630;WS=17772612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr17	17774118	rs9907287	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=466;SC=CCTCAAGCCCCGCACTGAGCC;SOR=3.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=17774126;WS=17774108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	17948475	rs2955355	G	A	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=16;PP=730;SC=TGGACACGGGGAACTCTTACC;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=17948483;WS=17948465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	17997209	rs2230316	G	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=23;PP=1097;SC=AATCGGCCTCGTCCAAAGGAG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=17997217;WS=17997199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	18003671	rs2272570	T	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=647;SC=GGGGTACTCTTCCTAGGTCTC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=18003679;WS=18003661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	18003845	rs854813	C	T	4203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=68;PP=2838;SC=TGTGACCCCTCGGTCAGCAGT;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=146;WE=18003853;WS=18003835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	18039263	rs854785	A	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=228;SC=TGGGTCAGGCATGGAGGGGAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=18039271;WS=18039253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	18041529	rs141473928	G	A	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=45;PP=2252;SC=GGCATCCTGCGGATCCTTGAC;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=110;WE=18041537;WS=18041519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	18042276	rs2075658	A	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=19;PP=715;SC=GTCGGCCTGGACGCTGGTGCT;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=18042284;WS=18042266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	18042527	rs854783	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.44;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	18043766	rs854780	C	G	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=22;PP=1199;SC=CCTGCTCTCTCTTCCTCCTCA;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=18043774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	18044270	rs854779	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=5;PP=413;SC=ATATTCACCATGATAATGCCT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=18044278;WS=18044260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	18044893	rs11658477	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=530;SC=CTGGCTGGGGGCAGTAACCCC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=18044901;WS=18044883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	18046058	rs854778	A	C	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=798;SC=CCTCCCCACTACCCCAACCCA;SOR=0.997;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=46;WE=18046066;WS=18046048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	18046290	rs8065026	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=412;SC=GCTCTTTAACTTTGGCCATTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=18046298;WS=18046280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	18046898	rs854777	T	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=316;SC=AGAGTGGAGGTGCCAGGTGGA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=18046906;WS=18046888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	18047671	rs11421905	G	GC	318.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=414;SC=CCCCTCACCAGCCTCAGTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=10;WE=18047679;WS=18047661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18047772	rs11421904	T	TC	2028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=23;PP=1505;SC=TGCCTGTCAGTCCAGCTCTGT;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=18047780;WS=18047762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	18051975	rs854774	T	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=42;PP=1501;SC=ATAGGGTCCATTCTGTTCATG;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=18051983;WS=18051965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	18052466	rs4303606	A	G	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=889;SC=GGGTGCAGAAAAAAATTTGGG;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=18052474;WS=18052456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	18052867	rs2955379	T	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=699;SC=ATAGCCTCTTTGACCCTGTGC;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=18052875;WS=18052857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	18054868	rs854773	G	T	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=857;SC=CCCCCAGCCCGCCAGCCCCCT;SOR=2.200;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=18054876;WS=18054858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	18054917	rs865923	T	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=290;SC=ACCAGCTTACTGGGTTGAAGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=18054925;WS=18054907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	18055229	rs854772	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=861;SC=TCCTGAAAGGGCAGATGACCC;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=18055237;WS=18055219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	18057215	rs9916193	C	G	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=35;PP=1210;SC=AAAGAGGTGCCGAGCACAGCC;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=61;WE=18057223;WS=18057205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	18057272	rs712271	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=761;SC=GGCTGAAGCGAGCAGAGGAGG;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=18057280;WS=18057262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	18057301	rs735960	G	A	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=623;SC=CTTGGGGAGGGAGCCCAGGAG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=18057309;WS=18057291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	18057907	rs62073602	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=416;SC=GACCCCTCCCACATTGCCACT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=18057915;WS=18057897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	18063441	rs712273	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=168;SC=ATTATCTTCCTCTCACCCTCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=18063449;WS=18063431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	18064730	rs8077577	C	T	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=36;PP=1070;SC=TCCTCCAAGACGTGAGCCGGA;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=18064738;WS=18064720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	18065888	rs62073604	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=11;PP=660;SC=CTGAACTCCCTGCTTCTGCAG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=18065896;WS=18065878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	18066791	rs62073605	C	T	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=102;SC=CTCAGAAGAGCAAACTGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=18066799;WS=18066781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	18070761	rs854796	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=281;SC=ATCATTCCCCGAAACCCAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=18070769;WS=18070751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	18077175	rs854800	T	C	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=68;PP=1760;SC=GCTACCCCTATGTGGAGATTG;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=103;WE=18077183;WS=18077165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	18088094	rs11078411	C	T	5805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=96;NR=89;PP=2965;SC=TGGTGGAGCACCGCGTCATCC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=96;TCR=89;TR=185;WE=18088102;WS=18088084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	18098180	rs17436616	C	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=5;PP=295;SC=GCCGTAAGACCTAGGCCATGT;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=18098188;WS=18098170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	18111793	rs1563371	C	T	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=12;PP=409;SC=TGTTTTTGTTCATTGGGGGGT;SOR=1.101;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=18111801;WS=18111783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	18111868	rs1378602	G	A	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=8;PP=498;SC=TTGCCTGTTAGGGCTGAAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=18111876;WS=18111858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	18144720	rs2245737	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=18;PP=1226;SC=GCCCTGGGGACGAGGACAGGG;SOR=1.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=18144728;WS=18144710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	18148485	rs7498	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=23;PP=827;SC=CGCTCCAGGCGTGGAAGCAGC;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=18148493;WS=18148475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	18149854	rs2856289	A	G	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=30;PP=1657;SC=GCTGGGTCTGAGCCCCACCAC;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=18149862;WS=18149844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	18151424	rs35738574	C	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=556;SC=TGCTCTGGAACCAGCCCTGCC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=18151432;WS=18151414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	18154510	rs2071242	T	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1101;SC=AACTCTGGAGTTGGGGACTGA;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=18154518;WS=18154500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	18156541	rs2071241	A	G	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=571;SC=ACAGACCACAAGGTGGGCTCT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=18156549;WS=18156531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	18161744	rs59366579	C	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=816;SC=GCCTGCCCAGCCTCGGTCTCC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=18161752;WS=18161734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	18167505	rs2605143	T	C	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=18;PP=791;SC=CGCTGGCTGCTTCTGTCAACT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=18167513;WS=18167495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	18194011	rs3817992	C	A	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=21;PP=732;SC=CTACAGGGAGCGGCAGGTGCA;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=18194019;WS=18194001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	18194362	rs6502645	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=17;PP=525;SC=AAGAGGAGTACGAAACTCCCC;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=18194370;WS=18194352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	18202996	rs2294913	C	T	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1501;SC=AGTGCATCATCTCCATCCTTC;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=18203004;WS=18202986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	18208334	rs7225932	C	A	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=13;PP=985;SC=CTGCAGAGGACCTCATCCGTG;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=18208342;WS=18208324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	18219835	rs3829956	T	C	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=32;PP=1149;SC=AGTCCATCATTGAACATCAAG;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=18219843;WS=18219825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	18220770	rs1563632	G	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=21;PP=1158;SC=GGAGCCATCCGCTTCCAGGCA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=54;WE=18220778;WS=18220760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	18221010	rs12449313	A	G	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=54;PP=2180;SC=GAAAATGCCAACCCTTCTTCC;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=98;WE=18221018;WS=18221000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	18236339	rs2273029	G	A	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=43;PP=2062;SC=AGTTGGAGGCGAGGCTGACCT;SOR=1.142;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=105;WE=18236347;WS=18236329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	18243872	rs62072543	GC	AT	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=468;SC=ACAAAAAGCAGCAAACACACA;SOR=2.376;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=23;WE=18243881;WS=18243862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	18252010	rs3866955	T	C	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=48;PP=1187;SC=GGGTTTTGGCTGGGAGAGGTG;SOR=1.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=18252018;WS=18252000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	18259415	rs12950117	A	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	18284262	rs570145	G	A	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=51;PP=1493;SC=ATGCAAGCCAGCGCCGACCAG;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=18284270;WS=18284252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	18286916	rs112094897	A	AG	1452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=18;PP=1117;SC=GCCCTCGGGCAGCGGCAGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=24;WE=18286930;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	18286922	rs111736884	A	AG	1424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=18;PP=878;SC=GGGCAGCGGCAGGGCGGCAGG;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=18286930;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	18286930	rs200680358	A	AG	1310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.55;QD=46.81;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	18286938	rs145486982	A	AG	1074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=805;SC=GCAGGGCGGCAGGGCGGGAGG;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=18286946;WS=18286928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	18291456	rs578670	C	G	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=45.74;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr17	18291470	rs586214	C	G	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	18291544	rs586322	A	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=483;SC=TTCTGTGTCCATCTTCCTCTC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=18291552;WS=18291534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	18291618	rs586757	C	T	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=18;PP=569;SC=AAATGAAGTACCAAGAAACTA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=18291626;WS=18291608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	18314964	.	T	G	925	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=54.68;NF=37;NR=34;PP=925;QD=13.5179044021;SC=CCCAATCGTCTTCTTTCCCAG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=71;WE=18314972;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:55,71:0.56:126
chr17	18315107	rs113907775	C	CCT	2699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.663;NF=20;NR=35;PP=2182;ReadPosRankSum=0.334;SC=GCCCTCTTCTCCTCACTGTCT;SOR=0.704;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=55;WE=18315115;WS=18315097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr17	18380135	rs4924879	C	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=6;PP=352;SC=TGGCAGGTGTCAAAGGCAGTG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=18380143;WS=18380125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	18380154	rs1682220	A	G	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=7;PP=334;SC=TGGTGGCCACAGAGGCGGTGG;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=18380162;WS=18380144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	18380260	rs77759205	C	A	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=134;SC=GGACACAGTTCTGGGGCTCTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=18380268;WS=18380250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	18565143	rs55636053	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=761;SC=TAGATGCATATAGAATTGGTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=18565151;WS=18565133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	18565350	rs9912644	G	C	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.227;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.793;NF=39;NR=46;PP=1682;ReadPosRankSum=-2.158;SC=TTTCTCTCCGGTATGAGTTCT;SOR=0.216;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=85;WE=18565358;WS=18565340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,93:0.85:110
chr17	18565423	rs9912852	G	A	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=4.508;NF=46;NR=46;ReadPosRankSum=2.775;SC=CATTTGTACGGTTTCTTTCCA;SOR=0.138;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=92;WE=18565431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr17	18574794	rs201620470	C	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.91;QD=29.89;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr17	18574998	rs9635701	A	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=25;PP=1529;SC=GGTATACGGGAAGCTAGAACT;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=61;WE=18575006;WS=18574988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	18575127	rs9635680	G	A	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.65;QD=43.06;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	18575140	rs9635681	A	G	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.12;QD=40.74;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	18575675	rs55797270	T	G	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=35;PP=1370;SC=GGCACGCAACTCACCATCCAC;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=18575683;WS=18575665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	18576256	rs4924901	G	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.92;QD=24.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	18602476	rs1969051	A	G	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=20;PP=1791;SC=GTTTTTGGCAAAATGCTGGCA;SOR=1.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=18602484;WS=18602466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	18610134	rs1973459	T	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=23;PP=831;SC=TTGTAAGAGTTGAGCTCTGGC;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=18610142;WS=18610124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	18630995	rs8075739	G	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=22;PP=1061;SC=CTGGAGTACAGGAGTGCCGAG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=18631003;WS=18630985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	18638151	rs9916065	A	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=25;PP=1342;SC=ATCAGCTGTCAGTTCCTGAAC;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=71;WE=18638159;WS=18638141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	18643642	rs150131079	T	C	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.10;QD=19.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	18647539	rs116483657	G	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=30.58;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18647625	rs74502778	T	A	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.61;QD=25.75;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	18653070	rs9895749	G	A	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=20;PP=1769;SC=GTGTATATCCGAAATGAATAG;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=18653078;WS=18653060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	18670278	rs4611519	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.83;QD=27.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	18671733	rs10775382	C	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=282;SC=TACCGAGTGACTGGCAGTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=18671741;WS=18671723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18678548	rs4630608	C	T	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=70;PP=2338;SC=ACAAGTGGCACGGATGGTGGG;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=119;WE=18678556;WS=18678538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	18684487	rs59588820	A	G	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=57.45;NF=3;NR=3;PP=83;SC=GTGAGGCCGGACTGAGGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=18684495;WS=18684477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	18684642	rs75174617	G	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=129;SC=GGCTCGCTGGGAGGGTGGCGG;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=18684650;WS=18684632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	18694277	rs61075345	G	A	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.26;QD=25.68;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	18700843	rs115776459	C	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.46;QD=24.28;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	18702094	rs2270139	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=845;SC=AAATTTCACAACATGATAATT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=18702102;WS=18702084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	18702220	rs8080471	T	C	3517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=63;PP=2253;SC=TGATATTTGCTTTTAGTGCAC;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=119;WE=18702228;WS=18702210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	18708830	rs55974180	G	GT	1151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.85;MQRankSum=-0.281;QD=24.50;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,44:0.94:47
chr17	18770733	rs2305064	G	A	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=46;PP=1302;SC=CTATTGAAACGATTTGATTCA;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=18770741;WS=18770723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	18775900	rs4393623	A	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=33;NR=22;PP=1109;SC=TGCCAGAAACAAGAGTACAAA;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=18775908;WS=18775890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	18776020	rs7503678	A	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=25;PP=805;SC=GAGTGTTTAAAATAATGATAG;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=18776028;WS=18776010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	18793061	rs3803835	C	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=864;SC=TTCAACTAGCCAAGCATTTTT;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=18793069;WS=18793051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	18793225	rs3826380	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=24;PP=982;SC=TTCTGGATCTACTTCTAAGGA;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=18793233;WS=18793215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	18814661	rs55971101	T	TTA	821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=60.83;NF=1;NR=17;PP=827;SC=CGTTTTTTTTTAGTTGGCAAA;SOR=2.030;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=18814669;WS=18814651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	18833810	rs1634411	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=819;SC=CATGAAGCTACTTGGCTTTCT;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=18833818;WS=18833800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	18855611	rs2076562	T	C	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=41;PP=1250;SC=TTGCTCTGAATGTGGCCGTGG;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=18855619;WS=18855601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	18863105	rs2074276	C	T	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=17;PP=602;SC=TTGCTATTAGCCCGACTAATA;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=18863113;WS=18863095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	18882991	rs2472714	T	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=355;SC=GAGATTCTGTTTTGGGAACCA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=18882999;WS=18882981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	18916893	rs11652575	T	C	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=142;SC=GCCCAATGAGTATGGGGACTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=18916901;WS=18916883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	18918258	rs28526726	C	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=115;SC=CTTGGAGGAGCATGCAAATGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=18918266;WS=18918248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	18918530	rs9891254	A	G	125.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr17	19213335	rs2296981	C	G	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=692;SC=CAGGTCTGCACTGCATTGACT;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=19213343;WS=19213325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	19216917	rs3826405	T	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=24;PP=980;SC=ACACCCAGCGTCCCAGCTGAA;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=19216925;WS=19216907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	19231898	rs7206963	T	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=227;SC=AGTACCCTTTTGATGGCTGTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=19231906;WS=19231888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	19232078	rs6587220	T	C	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=33;PP=1432;SC=GGAGCCACCGTACAATCTGTC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=71;WE=19232086;WS=19232068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	19233096	rs2296979	T	C	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=713;SC=GAGCCTGAAGTTTCTAATTCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=19233104;WS=19233086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	19240972	rs11652712	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=8;PP=346;SC=GGCTTCCCGCGGAAGTTTCTC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=19240980;WS=19240962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	19247075	rs4924987	G	A	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=28;PP=1134;SC=TATGGGGGATGGGGGTAAGAG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=19247083;WS=19247065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	19265797	rs10445411	C	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.23;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	19314611	rs739830	T	C	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=21;PP=1373;SC=CCTCACCTTCTACCTACCGCA;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=66;WE=19314619;WS=19314601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	19318031	rs1295330	A	G	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=40;PP=1595;SC=GGTGGGGAAGACATGGGAGGC;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=19318039;WS=19318021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	19319015	rs1295329	C	T	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=41;PP=1845;SC=CTCCCTGTCACAGGACGTAGC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=85;WE=19319023;WS=19319005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	19437187	rs2252281	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=7;PP=320;SC=TGCGCGGTACTCACTGCCGGC;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=19437195;WS=19437177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	19535920	rs28672254	C	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=6;PP=1116;SC=TTGCGCCCAGCCCACAATGGC;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=45;WE=19535928;WS=19535910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	19552476	rs4646793	C	T	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=27;PP=879;SC=AAACTGGCCCCCGCCGCGCAC;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=19552484;WS=19552466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	19555976	rs1004491	T	C	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=540;SC=CTCCAACATATGTGTTTACTG;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=19555984;WS=19555966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	19559623	rs2072332	G	A	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=738;SC=GATTGCTGATGTTAGACGTTA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=19559631;WS=19559613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	19561011	rs3841513	GACTGAATT	G	3922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=26;PP=2978;SC=ATGAATATTTGACTGAATTAC;SOR=1.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=51;WE=19561026;WS=19561001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	19568486	rs59755039	CT	C	430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=395;SC=TGAGGGAGACCTTTTCCTGGT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=19568494;WS=19568476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	19578873	rs7216	A	T	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=43;PP=1938;SC=CTCTCCAGGCAGAATATTACT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=92;WE=19578881;WS=19578863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	19595540	.	CA	C	40	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=40;QD=14.6666666667;SC=GACTCCATGTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=19595548;WS=19595530;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr17	19608773	rs4925042	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=14;PP=481;SC=TGGCCACCTCGTAGATGACAG;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=19608781;WS=19608763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	19609947	rs12942065	C	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=29;PP=1472;SC=CGCCCCCCATCCTCTTCCACG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=19609955;WS=19609937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	19610104	rs35263947	C	T	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=39;PP=1145;SC=GAGCTGACAGCCTGCCCTGCT;SOR=1.692;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=56;WE=19610112;WS=19610094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	19617236	rs4924792	G	T	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=23;PP=939;SC=GGACCAGCGCGCCCCGCTGCA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=19617244;WS=19617226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	19617393	rs9900497	G	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=12;PP=333;SC=TGGCGGACCCGGCGGCCTCTG;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=19617401;WS=19617383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	19642952	rs2228100	G	C	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=27;PP=1069;SC=TGCATCACCGGGGACTGGGGG;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=19642960;WS=19642942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	19645938	rs887241	A	C	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=54;PP=1902;SC=AGGACCACTGAGTTCCCTGCA;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=19645946;WS=19645928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	19651482	rs2072327	T	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=318;SC=GGAGAGATGATGTAGGACTCT;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=19651490;WS=19651472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	19699358	rs192511	T	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=19;PP=1152;SC=AATCTATGTTTTACTATTACA;SOR=1.264;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=19699366;WS=19699348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	19699605	rs10587010	CAT	C	922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=852;SC=TCTAAAGAGACATATATATAT;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=19;WE=19699614;WS=19699595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	19713740	rs150122	C	T	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=41;PP=1624;SC=GCAGTCCCCACTGGCATATCA;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=92;WE=19713748;WS=19713730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	19729495	rs157397	T	C	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=21;PP=717;SC=GGCTAAAAAATGCTTCTGTAA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=19729503;WS=19729485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	19741748	rs192029885	T	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=350;SC=ATCTCTAGTTTTTAAATCTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=19741756;WS=19741738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	20107773	rs2703805	T	C	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=39;PP=1530;SC=GTCCAACTTCTTCCAACACTC;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=76;WE=20107781;WS=20107763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	20108239	rs2703806	A	T	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=42;PP=1610;SC=TGGAAATCAGATGTCCAGTGA;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=82;WE=20108247;WS=20108229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	20109189	rs2703807	C	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=489;SC=TAAAGGCAAACGGTGAAATTA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=20109197;WS=20109179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	20163529	rs2703791	A	G	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=16;PP=829;SC=ACCCTCTGGCAGCCTTGGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=20163537;WS=20163519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	20209474	rs2120282	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=638;SC=AACAGTTTCTCGTAGAACATT;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=20209482;WS=20209464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	20261101	rs111285254	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=797;SC=TATGTGTTCAATGTATGAAGG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=20261109;WS=20261091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	20435479	.	C	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	20768867	rs9906896	A	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.937;NF=2;NR=10;PP=155;ReadPosRankSum=-0.139;SC=ATATGGTTCAATTAATCATCT;SOR=1.112;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=12;WE=20768875;WS=20768857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr17	20799119	rs2279263	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=20;PP=740;SC=ATCGTGCTGGAGCTGGTCTAA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=20799127;WS=20799109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	20906251	rs4985956	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	20906257	rs4985957	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	20908081	rs66644145	CTAGTGGAGCTGCGGGCAGCCAA	C	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=2298;SC=GCGGCCTTTCCTAGTGGAGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=20908110;WS=20908071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	20908325	rs9797279	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=20;PP=783;SC=AACGGCAGGATTCAGCATCAT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=20908333;WS=20908315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	20911173	rs2291034	G	T	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=39;PP=1459;SC=TGGCTTTCTGGAAAACTTACT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=20911181;WS=20911163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	20916022	rs17770614	A	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=351;SC=GGCGTCTATTAATCATTTATC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=20916043;WS=20916012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	20916035	rs4985962	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=337;SC=CATTTATCTCATAGCCTCCTT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=20916043;WS=20916012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	20916362	rs719093	G	A	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=115;SC=CGCTTTAAAAGGCCATGTGAG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=20916370;WS=20916352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	20919334	rs7213684	T	G	181.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	20919337	rs7207753	G	C	181.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	20921492	rs1038107	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=412;SC=TGGATCCCAGCGGCTTCCTCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=20921500;WS=20921482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	20924523	rs2291037	G	A	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=38;NR=33;PP=1245;SC=AGATGCCTCCGTACATCAGAT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=71;WE=20924531;WS=20924513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	20924620	rs899342	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=522;SC=TTAAACACAGTGAGGTTCTGT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=20924628;WS=20924610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	20945874	rs10579510	GCA	G	1064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.47;NF=13;NR=6;PP=843;SC=ACAGGGAAAGGCAACGGGGGA;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=19;WE=20945895;WS=20945864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	20945887	rs4985967	G	A	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=667;SC=ACGGGGGAAGGGAAGAGGGCA;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=20945895;WS=20945864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	20946393	rs140762989	T	C	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	21075183	rs12936069	G	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=412;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GGCCGAGGGTGCAGGGCCTGG;SOR=0.461;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=27;WE=21075191;WS=21075173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr17	21087671	rs3744226	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=815;ReadPosRankSum=-1.385;SC=TAAGCCTCTGCATCTGTCCTC;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=54;WE=21087679;WS=21087661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr17	21117589	rs3744223	C	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=629;ReadPosRankSum=0.156;SC=CCAGACCCGGCGGAACTACCG;SOR=0.877;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=35;WE=21117597;WS=21117579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr17	21117837	rs4985988	T	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=18;PP=417;SC=CCCAGAGCACTGCGCGGAGGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=21117845;WS=21117827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	21147404	rs897926	A	G	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=15;PP=976;SC=TGGCCCTGCCACCTGCCTGCC;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=21147412;WS=21147394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	21156530	rs201190568	G	GC	460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=200;SC=GGATGGGGCAGCCTGCTCCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=21156538;WS=21156520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	21194658	.	T	TACAACACAAC	1099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=4;PP=775;SC=TACAATACAATACAACACAAC;SOR=1.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=12;WE=21194666;WS=21194648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	21194769	rs72840055	C	T	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=-3.103;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
chr17	21194771	rs114473529	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=-0.764;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,31:0.22:141
chr17	21194785	rs72840057	T	C	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=2;HapScore=4;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=1577;ReadPosRankSum=-1.607;SC=TGCAGGTGGCTGGCAATGGCC;SOR=0.840;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=53;WE=21194793;WS=21194759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr17	21194820	rs66503560	G	A	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=866;ReadPosRankSum=1.295;SC=CCGGGCCCACGTGGGGACCTT;SOR=1.032;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=58;WE=21194828;WS=21194810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr17	21194843	rs75693966	T	C	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr17	21194852	rs72840058	G	A	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,67:0.47:142
chr17	21194859	rs62056394	G	A	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.370;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,69:0.48:143
chr17	21198972	rs2363221	T	C	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.08;ReadPosRankSum=0.765;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr17	21198978	rs2363220	C	T	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.71;ReadPosRankSum=2.357;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr17	21199022	rs35804189	A	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.327;NF=25;NR=13;PP=594;ReadPosRankSum=1.001;SC=TATACCACCCAGGCCTGCGAG;SOR=0.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=38;WE=21199030;WS=21199012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr17	21199037	rs2885719	G	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.484;NF=46;NR=32;PP=1779;ReadPosRankSum=1.676;SC=TGCGAGGAGCGTGGTCCCCAC;SOR=0.332;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=78;WE=21199059;WS=21199027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,95:0.90:105
chr17	21199083	rs4442881	T	A	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.353;NF=51;NR=49;PP=1640;ReadPosRankSum=2.063;SC=CCTTGACAGGTGGGGAAACTG;SOR=0.519;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=100;WE=21199091;WS=21199072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,130:0.95:137
chr17	21199105	rs3035435	AG	A	3462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=7;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.051;NF=16;NR=49;PP=2665;ReadPosRankSum=0.151;SC=GGCTTGGTGAAGGGGGGGCCA;SOR=0.757;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=65;WE=21199119;WS=21199095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,102:0.79:129
chr17	21199111	rs55963016	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=-1.040;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,28:0.21:132
chr17	21199162	rs75120481	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.024;NF=13;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=-1.373;SC=GGGTGGCAGGCTGGGGCCAGA;SOR=0.392;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=28;WE=21199170;WS=21199152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr17	21199236	rs2363219	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=504;ReadPosRankSum=-0.281;SC=AAGGGTGGGACTCAAGGGGCT;SOR=2.911;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=24;WE=21199244;WS=21199226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr17	21199275	rs2363218	G	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.377;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr17	21199275	.	GTG	TTA	689	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.2;NF=10;NR=6;PP=689;QD=46.4042421789;SC=CAGGGTCTCTGTGCAGAGCTT;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=16;WE=21199285;WS=21199265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr17	21199277	rs2363217	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.395;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.243;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr17	21199376	rs5819736	G	GT	351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=5.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.401;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.477;SOR=1.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr17	21199390	rs4997717	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.102;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr17	21199403	rs4997718	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.214;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.190;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr17	21199499	rs2885718	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.230;SC=ATCTTGCTTCGTCCTGCAGCA;SOR=0.986;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=18;WE=21199507;WS=21199489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr17	21199515	rs5025581	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=73;ReadPosRankSum=0.425;SC=CAGCACTGTGCGGGGCAGGTG;SOR=0.368;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=6;WE=21199523;WS=21199505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr17	21201579	rs11651154	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=-1.572;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr17	21201667	rs144438122	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.752;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=591;ReadPosRankSum=1.856;SC=CTCATGGGAGTGCAGGGGACA;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=105;TCR=34;TR=46;WE=21201675;WS=21201657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,46:0.31:147
chr17	21201719	rs8076154	T	C	5013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=0.923;SC=CTTCTCTCCATTCTAGGAAAA;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=282;TCF=171;TCR=111;TR=197;WE=21201727;WS=21201709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,218:0.70:312
chr17	21201851	rs8072386	A	G	3464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.464;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=83;PP=2180;ReadPosRankSum=-1.293;SC=ACAGGGCTCAATGGAAGGAGT;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=200;TCF=70;TCR=130;TR=134;WE=21201859;WS=21201841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,149:0.68:219
chr17	21201884	rs2305875	T	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=5.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
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chr17	21201894	rs8071865	C	T	3139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=2.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.79;ReadPosRankSum=1.425;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,76:0.67:113
chr17	21201907	rs2305874	G	A	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=904;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CCTGTCCTGGGCAGCCCCTGC;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=88;TCF=12;TCR=76;TR=35;WE=21201915;WS=21201874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr17	21202056	rs34676150	G	A	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
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chr17	21202067	rs76764437	A	G	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr17	21202078	rs35477472	G	A	3423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=13;PP=2962;ReadPosRankSum=0.397;SC=AGGCGCCTCCGGGGCAGGAGG;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=99;TCR=20;TR=77;WE=21202086;WS=21202046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr17	21202095	.	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.277;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,61:0.37:163
chr17	21202102	rs35701021	C	T	4369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.074;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,114:0.65:175
chr17	21202123	rs68151103	A	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=3;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=887;ReadPosRankSum=0.471;SC=ACACTGGCCCATCTACTGCTG;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=215;TCF=149;TCR=66;TR=73;WE=21202131;WS=21202113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,84:0.34:244
chr17	21202191	rs33911218	C	A	6423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.016;SC=TCTCCACAGACCCCCCCGGAA;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=194;TCR=161;TR=233;WE=21202199;WS=21202181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,283:0.67:420
chr17	21202237	rs36047035	G	C	7074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=0.813;SC=ATTGGAGACAGAGTAGGTGCC;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=383;TCF=187;TCR=196;TR=248;WE=21202245;WS=21202227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,307:0.67:458
chr17	21202272	rs34880480	C	G	5567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CAGGGCCTCTCACTTCACCTG;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=315;TCF=138;TCR=177;TR=199;WE=21202280;WS=21202262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,243:0.66:370
chr17	21202310	rs77343934	GC	AT	5971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=4.722;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.714;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,148:0.60:247
chr17	21202316	rs78463537	T	C	5831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,142:0.61:231
chr17	21202318	rs77591777	G	T	5666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.85;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,141:0.62:228
chr17	21202370	rs34794731	G	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=69;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=1114;ReadPosRankSum=0.678;SC=GAAGAGCCTCGTCCTGCGCTG;SOR=0.972;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=7;TCR=72;TR=26;WE=21202390;WS=21202360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr17	21202382	rs35763451	TG	T	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=2;HapScore=1;MGOF=69;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=1119;ReadPosRankSum=1.649;SC=CCTGCGCTGCTGGCTGTGTGG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=17;WE=21202390;WS=21202360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr17	21202400	rs72831543	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TGGCCCTGGGCCACCCACTCT;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=14;WE=21202408;WS=21202390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr17	21203689	rs71207220	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=-0.445;SC=GGCTCAGAGAGGTTAAGTGAC;SOR=0.120;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=5;WE=21203697;WS=21203682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	21203711	rs73311537	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=0.759;SC=TGCTGAGGGTCACACAGCAGG;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=13;WE=21203719;WS=21203701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr17	21203820	rs78304829	G	C	3160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,80:0.52:153
chr17	21203825	rs75854955	C	G	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr17	21203893	rs34105301	T	C	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1796;ReadPosRankSum=0.323;SC=GGTGACCATCTCAGAACTGGG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=80;TCR=103;TR=103;WE=21203915;WS=21203883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,122:0.59:208
chr17	21203907	rs73311539	T	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,57:0.28:201
chr17	21203934	rs62057672	G	A	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,100:0.59:170
chr17	21203941	rs2305873	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,40:0.26:151
chr17	21203949	rs62057673	C	T	2482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=4;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=748;ReadPosRankSum=-0.174;SC=ACGCCCAGAGCGGCACCATCA;SOR=0.563;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=66;WE=21203957;WS=21203924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,83:0.59:140
chr17	21203998	rs62057674	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=586;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GCAGCTGGGAGGGCTCCCTGG;SOR=0.520;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=32;WE=21204006;WS=21203988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr17	21204153	rs66883103	C	T	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=1126;ReadPosRankSum=0.841;SC=GCCTCTGCCACGGCAACCTCT;SOR=0.490;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=55;WE=21204161;WS=21204143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr17	21204187	rs56067280	G	T	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.81;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr17	21204192	rs56216806	C	T	4154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.63;ReadPosRankSum=1.770;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,100:0.64:156
chr17	21204210	rs55796947	C	T	4637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.136;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=41;PP=1898;ReadPosRankSum=1.237;SC=CGTGAACTCACAGGAGCAGAA;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=181;TCF=122;TCR=59;TR=117;WE=21204218;WS=21204200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,133:0.61:217
chr17	21204257	rs56166328	G	A	4407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=5.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,195:0.58:339
chr17	21204266	rs2230435	T	C	13704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.50;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr17	21204290	rs2305872	G	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,87:0.23:385
chr17	21204308	rs55777930	G	T	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.17;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,238:0.60:400
chr17	21204314	.	TTG	T	4555.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:268,135:0.33:403
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chr17	21204318	.	A	ACG	5679.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,152:0.48:314
chr17	21204335	rs113821733	C	T	3635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,118:0.29:406
chr17	21204428	rs36191822	G	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=3.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.387;SOR=1.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,54:0.30:178
chr17	21204437	rs76549047	T	C	3607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.54;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,90:0.61:147
chr17	21204441	rs78162711	T	C	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.44;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,84:0.63:134
chr17	21205352	rs66761201	CGGA	C	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=17.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=33.56;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=3.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr17	21205354	.	GA	AG	341	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=25;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=341;QD=78.8935749724;SC=GCACACGTCGGAGAGGGGGCT;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=21205371;WS=21205344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,5:0.62:8
chr17	21205358	.	GGGGGCT	G	378	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=378;QD=131.666666667;SC=ACGTCGGAGAGGGGGCTGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=3;WE=21205371;WS=21205344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,3:0.18:17
chr17	21205360	rs74998514	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=20.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.365;SOR=3.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr17	21205361	rs67557217	GGCT	G	441.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=15.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.801;SOR=3.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	21205396	rs75974715	C	A	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr17	21205406	rs72831582	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.86;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr17	21205460	rs62057721	C	T	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=35;PP=1728;ReadPosRankSum=0.419;SC=CACAGGGAGACGTGTGGATCT;SOR=0.634;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=108;TCR=47;TR=110;WE=21205468;WS=21205450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,135:0.69:197
chr17	21205592	rs66644302	GGC	G	2771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=2.206;NF=4;NR=52;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TGGGTGGGCTGGCGGGGGGTC;SOR=0.999;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=7;TCR=83;TR=56;WE=21205614;WS=21205582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,74:0.59:126
chr17	21205604	rs62057722	T	C	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.848;NF=19;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CGGGGGGTCCTAGGTGCATAG;SOR=0.493;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=67;WE=21205614;WS=21205582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,70:0.59:118
chr17	21205606	rs2305871	G	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.787;NF=8;NR=29;PP=2131;ReadPosRankSum=1.554;SC=GGGGGTCCTAGGTGCATAGGC;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=26;TCR=76;TR=37;WE=21205614;WS=21205582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr17	21205642	rs62057723	T	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.589;NF=6;NR=26;PP=1672;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CCAGCAGGCATGGAGCCTGCC;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=32;WE=21205663;WS=21205632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr17	21205654	rs72831585	AT	GA	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=3;HapScore=4;JOINED;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.762;NF=2;NR=18;PP=1653;ReadPosRankSum=0.049;SC=GAGCCTGCCTATTGATGGTGT;SOR=1.154;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=20;WE=21205663;WS=21205632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr17	21206269	rs73982750	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=3;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=293;ReadPosRankSum=0.139;SC=AGGTGAGCCCGGGAGGATGAG;SOR=1.341;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=17;WE=21206277;WS=21206259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr17	21206294	rs73311581	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=499;ReadPosRankSum=0.529;SC=GGCAGGAGGCCGAGTGTGTCT;SOR=1.300;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=24;WE=21206302;WS=21206284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr17	21206360	rs67280439	A	G	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.39;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr17	21206372	rs72838545	G	C	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,78:0.58:135
chr17	21206379	rs112413796	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,46:0.32:146
chr17	21206385	rs72838547	C	T	3426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,90:0.58:155
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chr17	21206556	rs736103	C	T	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=69;PP=2166;SC=GGTCAGTGCCCGGCAGCCACC;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=106;WE=21206564;WS=21206546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	21206616	rs57761454	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=637;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GCGGGTGGACGTCTCCCTATG;SOR=0.340;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=37;WE=21206624;WS=21206606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,37:0.82:45
chr17	21206632	rs35678520	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=5.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=2.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr17	21206635	rs77285979	T	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.56;ReadPosRankSum=1.602;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr17	21206642	rs59259996	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.73;ReadPosRankSum=2.144;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr17	21206654	rs56821097	G	T	621.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=1377;ReadPosRankSum=1.357;SC=GAGGTGATAGGTTGTGACGTG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=22;WE=21206662;WS=21206622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr17	21207602	rs55677712	C	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=373;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GACCCTGGTGCAACCTGCCCA;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=18;WE=21207610;WS=21207592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr17	21207649	rs56342308	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.893;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=962;ReadPosRankSum=0.640;SC=GGGTCTTGGGCGAGGGAGGGG;SOR=0.151;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=49;WE=21207657;WS=21207639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr17	21207834	rs58609466	C	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,94:0.28:341
chr17	21207844	rs2230436	C	T	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=5.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,95:0.30:319
chr17	21207909	rs41301807	G	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.547;SOR=1.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr17	21207916	rs7209761	A	G	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=80;PP=1129;SC=GGCGGGGAGAAATCTGCCCAG;SOR=3.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=95;WE=21207924;WS=21207899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	21207939	rs41309278	G	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=1.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr17	21207945	rs9896440	A	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr17	21208292	rs7214432	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=730;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AGTTTGGGGATTGGGAGGCAA;SOR=0.547;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=45;WE=21208300;WS=21208282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr17	21208317	rs4456559	G	A	3187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=40;PP=2096;ReadPosRankSum=0.043;SC=TAGCCATGGGGGCTTACCTGG;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=101;TCR=51;TR=118;WE=21208325;WS=21208307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,135:0.77:175
chr17	21208347	rs4559960	C	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=864;ReadPosRankSum=-0.872;SC=TCACGCCTCACTCTTCCCTCC;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=140;TCR=90;TR=67;WE=21208357;WS=21208337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,76:0.29:266
chr17	21208349	rs7209860	C	G	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=44;PP=1832;ReadPosRankSum=1.110;SC=ACGCCTCACTCTTCCCTCCTG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=143;TCR=91;TR=114;WE=21208357;WS=21208337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,133:0.49:272
chr17	21208413	rs1657695	C	T	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,87:0.28:315
chr17	21208449	rs1657694	G	T	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,69:0.27:252
chr17	21208456	rs1657693	A	G	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,66:0.28:237
chr17	21208640	rs7209152	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=0.463;SC=GTCACTCATCGTGAAGTCCTG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=21208648;WS=21208630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	21215434	rs113634008	A	AC	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.180;HP=5;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=1291;ReadPosRankSum=-2.020;SC=GGGGCCTCTGACCCCCTGTCC;SOR=0.053;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=19;WE=21215454;WS=21215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr17	21215446	rs62055363	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.256;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=1287;ReadPosRankSum=-1.457;SC=CCCCTGTCCCCGCTGCAGATT;SOR=0.281;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=30;WE=21215454;WS=21215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr17	21215483	rs55935757	C	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=744;ReadPosRankSum=0.600;SC=GGTTCCCTTACGAGTCCTGGG;SOR=0.409;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=46;WE=21215491;WS=21215473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr17	21215537	rs55736474	C	A	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.866;SC=AGGAGCCGTCCCCCCAGCTCC;SOR=0.841;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=90;WE=21215545;WS=21215527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,104:0.47:219
chr17	21215552	rs56369732	C	T	4262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,112:0.48:235
chr17	21215557	rs35206134	G	A	4313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,115:0.47:246
chr17	21215637	rs66486636	G	A	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.844;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr17	21215643	rs73302034	A	G	3014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,78:0.57:137
chr17	21215682	rs73302038	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=677;ReadPosRankSum=-0.393;SC=TTATTCCTTTGGCAAATAAAC;SOR=0.349;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=39;WE=21215690;WS=21215672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr17	21215700	rs73302043	T	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=541;ReadPosRankSum=-0.603;SC=AACCCCCAGATGACTTGGCAT;SOR=0.296;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=31;WE=21215708;WS=21215690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr17	21216661	rs4994551	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.041;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.818;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr17	21216664	rs4081986	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.104;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.699;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	21216686	rs4994549	C	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.25;MQRankSum=1.024;NF=20;NR=2;PP=418;ReadPosRankSum=-1.568;SC=CCCTTCTTCCCTGGGTGCACG;SOR=1.565;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=22;WE=21216694;WS=21216676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr17	21216710	rs4994548	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.12;MQRankSum=1.186;NF=29;NR=6;PP=593;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCCTGCTGCTAGGCCTGGGG;SOR=1.513;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=35;WE=21216718;WS=21216700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr17	21216758	rs5819747	G	GCTTC	2650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.204;NF=23;NR=23;PP=2236;ReadPosRankSum=0.855;SC=TGGGGGCTGGGCTTCCTCCCT;SOR=0.918;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=46;WE=21216766;WS=21216748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr17	21216788	rs1673840	C	T	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.061;NF=52;NR=38;PP=1185;ReadPosRankSum=-1.428;SC=GCCACAGCTGCACTATTCTCT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=185;TCF=105;TCR=80;TR=90;WE=21216796;WS=21216778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,104:0.47:219
chr17	21216846	rs1657688	G	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.037;NF=28;NR=51;PP=1270;ReadPosRankSum=0.426;SC=ACCTGGAGCTGATGGTGAGTA;SOR=0.978;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=160;TCF=64;TCR=96;TR=79;WE=21216854;WS=21216836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,93:0.49:191
chr17	21216951	rs1673839	C	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=348;ReadPosRankSum=-2.497;SC=TGGGTAGCTCCTCTGGCTGGC;SOR=0.957;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=20;WE=21216972;WS=21216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr17	21216964	rs1657686	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=940;SC=TGGCTGGCCCTGTGTTCTCTC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=21216972;WS=21216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	21217239	rs4114291	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr17	21217258	rs4114290	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=330;ReadPosRankSum=0.913;SC=GTGGCTGGAGAGTGACCACAA;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=18;WE=21217266;WS=21217248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr17	21217290	rs1673837	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=438;ReadPosRankSum=1.336;SC=AGGAGCCACAGATGCCATCTG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=27;WE=21217298;WS=21217280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr17	21217397	rs1657685	A	G	3443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=5.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,90:0.46:194
chr17	21217400	rs1622401	G	A	3467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr17	21217411	rs1657684	T	C	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.544;SC=TGGCCACCTCTCCCTCCCGCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=98;TCR=75;TR=92;WE=21217419;WS=21217387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,102:0.50:204
chr17	21217513	rs2363198	G	A	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TGCTGCCTTCGTGAAGGAGAT;SOR=0.909;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=166;TCF=68;TCR=98;TR=86;WE=21217521;WS=21217503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,105:0.52:203
chr17	21217547	rs2363197	T	C	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=4.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.606;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,63:0.45:140
chr17	21217554	rs2363196	C	T	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.456;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr17	21217566	rs2363375	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=2526;ReadPosRankSum=1.480;SC=GACCCCACTCCGGCCCTCCAG;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=41;WE=21217574;WS=21217537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr17	21217586	rs2363374	G	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr17	21217596	rs2363373	C	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr17	21318521	rs76804083	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=334;ReadPosRankSum=0.132;SC=CCTCCAGTCACGTCTGGGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=18;WE=21318529;WS=21318511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr17	21318546	rs112960185	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.41;ReadPosRankSum=2.211;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr17	21318552	rs112854769	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.26;ReadPosRankSum=2.927;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr17	21318569	rs74584621	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr17	21318586	rs59891808	G	C	3195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,82:0.70:117
chr17	21318586	.	GTC	CTG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=43;NR=14;PP=2944;QD=20;SC=ACATGCTGTCGTCTCTGTTGC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=78;TCR=27;TR=57;WE=21318611;WS=21318576;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:48,57:0.54:105
chr17	21318588	rs77791524	C	G	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,65:0.56:117
chr17	21318595	rs58780973	G	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.995;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,18:0.14:130
chr17	21318603	rs79809401	C	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.425;SC=TTGCAGGAGCCGCCCTGCCTG;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=95;TCR=39;TR=78;WE=21318611;WS=21318576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,83:0.57:146
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chr17	21318663	rs72846666	G	A	3969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=64;PP=2640;ReadPosRankSum=0.473;SC=GGATGACCGCGGCCAGCCGGG;SOR=0.564;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=299;TCF=189;TCR=110;TR=165;WE=21318671;WS=21318653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,182:0.54:337
chr17	21318698	rs1657738	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=8.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.589;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,82:0.21:397
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chr17	21318773	rs3752034	G	A	4615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:439,146:0.25:585
chr17	21318782	rs78117732	G	A	5909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.871;SC=CGCAGGTGCCGCAACCGCTTC;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=502;TCF=279;TCR=223;TR=231;WE=21318790;WS=21318760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:321,279:0.47:600
chr17	21318826	rs142399667	G	A	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-0.522;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:529,146:0.22:675
chr17	21318867	rs73979893	G	A	6543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=661;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.953;NF=132;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TGGCTGACATGTTCACCACCT;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=544;TCF=279;TCR=265;TR=259;WE=21318875;WS=21318857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:340,311:0.48:651
chr17	21318897	rs1657739	G	C	3049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.639;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:441,165:0.27:606
chr17	21318912	rs35011501	C	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-0.513;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:449,120:0.21:569
chr17	21318918	rs79626424	G	A	7135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,242:0.45:541
chr17	21318948	rs112314728	C	T	6661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,178:0.40:450
chr17	21318951	rs75757803	C	T	6688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.623;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,175:0.40:438
chr17	21318952	rs8076599	A	G	10179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.35;ReadPosRankSum=-2.671;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,304:0.70:436
chr17	21318969	rs79666990	C	T	5989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.417;SC=TCTGGGTCATCGCGGTGGCAC;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=344;TCF=137;TCR=207;TR=134;WE=21318989;WS=21318959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,160:0.40:403
chr17	21318981	rs9909970	C	T	4789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CGGTGGCACACGGTGACCTGG;SOR=1.137;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=315;TCF=123;TCR=192;TR=110;WE=21318989;WS=21318959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,128:0.35:365
chr17	21319007	rs1657740	G	A	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=3.577;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,101:0.31:329
chr17	21319008	rs1657741	G	C	6677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=8.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.17;ReadPosRankSum=2.502;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,217:0.66:331
chr17	21319069	rs76265595	G	A	4632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,124:0.41:299
chr17	21319079	rs76518282	C	A	4858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=3.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.430;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,127:0.42:301
chr17	21319087	rs75029097	G	A	4698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.09;ReadPosRankSum=2.018;SOR=0.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,122:0.42:292
chr17	21319110	rs77283567	G	A	4804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=55;PP=1673;ReadPosRankSum=0.854;SC=GCTGTGTGACGGAGGAGTGCC;SOR=0.848;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=284;TCF=153;TCR=131;TR=125;WE=21319129;WS=21319100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,141:0.44:321
chr17	21319121	rs1714864	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=3.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,82:0.26:318
chr17	21319171	rs73313922	G	A	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=59;PP=2060;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CTGCATCATCGACTCCTTCAT;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=296;TCF=159;TCR=137;TR=126;WE=21319179;WS=21319161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,146:0.44:330
chr17	21319208	rs73979896	C	T	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=64;PP=2400;ReadPosRankSum=0.037;SC=GCCAAGATGGCAAGGCCCAAG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=310;TCF=170;TCR=140;TR=145;WE=21319216;WS=21319198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,168:0.49:346
chr17	21319230	rs1657742	G	C	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,96:0.24:393
chr17	21319251	rs73313923	C	T	6930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=78;PP=2433;ReadPosRankSum=2.649;SC=TCAGCCACAACGCCGTGGTGG;SOR=0.697;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=358;TCF=192;TCR=166;TR=166;WE=21319259;WS=21319241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,192:0.47:411
chr17	21319272	rs73313926	C	T	7716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=1.417;SC=CCCTGCGTGACGGCAAGCTCT;SOR=0.534;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=386;TCF=205;TCR=181;TR=176;WE=21319293;WS=21319262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,198:0.45:437
chr17	21319285	rs72846667	C	T	7797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.635;SC=CAAGCTCTGCCTCATGTGGCG;SOR=0.586;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=404;TCF=211;TCR=193;TR=184;WE=21319293;WS=21319262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,209:0.46:451
chr17	21319302	rs1657743	T	C	9393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.21;ReadPosRankSum=-3.543;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,246:0.63:388
chr17	21319311	rs72846668	C	T	4746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,222:0.54:408
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chr17	21319399	rs4985866	A	G	2890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:329,161:0.33:490
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chr17	21319436	rs77270326	G	A	4483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-6.078;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.370;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:292,131:0.31:423
chr17	21319439	rs76684759	T	G	4475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-6.214;QD=10.76;ReadPosRankSum=2.085;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,125:0.30:416
chr17	21319452	rs73313929	G	A	4173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.577;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.908;NF=46;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=0.549;SC=TTCTGGTGTCGCCCATCACCA;SOR=0.881;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=351;TCF=156;TCR=195;TR=110;WE=21319481;WS=21319426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,118:0.31:386
chr17	21319465	.	T	C	3945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-7.722;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,109:0.30:363
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chr17	21319473	rs1657744	G	A	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=6.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=3.182;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,115:0.34:335
chr17	21319488	rs77176173	C	T	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=3.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-7.466;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,78:0.27:287
chr17	21319519	rs78113532	G	C	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQRankSum=-8.973;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.218;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,56:0.27:207
chr17	21319523	rs77987694	C	T	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-9.077;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,57:0.28:206
chr17	21319527	rs80022364	C	T	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=-8.516;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.603;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,58:0.29:200
chr17	21319543	rs80335301	G	A	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.110;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.575;NF=27;NR=24;PP=870;ReadPosRankSum=0.442;SC=TGAGATCGTGGTCATCCTGGA;SOR=0.709;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=179;TCF=82;TCR=97;TR=51;WE=21319551;WS=21319533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,53:0.28:189
chr17	21319560	rs74801394	G	T	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.087;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.325;NF=34;NR=22;PP=880;ReadPosRankSum=1.488;SC=TGGAAGGCATGGTGGAGGCCA;SOR=1.127;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=175;TCF=85;TCR=90;TR=56;WE=21319568;WS=21319550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,57:0.30:188
chr17	21319650	.	CGAG	C	4014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.834;NF=13;NR=58;PP=2906;ReadPosRankSum=1.188;SC=CCGTGCTCTTCGAGGAGAAGA;SOR=0.686;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=179;TCF=46;TCR=133;TR=71;WE=21319660;WS=21319640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,109:0.40:270
chr17	21319682	rs80203231	C	T	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.103;NF=47;NR=60;PP=1633;ReadPosRankSum=1.291;SC=ATTGACTACTCGCACTTCCAC;SOR=0.715;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=253;TCF=117;TCR=136;TR=107;WE=21319690;WS=21319664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,109:0.39:283
chr17	21319716	rs78135255	G	A	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=5;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.957;NF=36;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.990;SC=TGCCCTCTACGCCCCGCTGCA;SOR=0.809;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=217;TCF=97;TCR=120;TR=85;WE=21319751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,88:0.36:245
chr17	21319728	rs76681424	T	C	2957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.181;NF=34;NR=43;PP=1459;ReadPosRankSum=-2.050;SC=CCCGCTGCAGTGCGAAGGATC;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=201;TCF=87;TCR=114;TR=77;WE=21319751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,81:0.36:224
chr17	21319729	.	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-8.265;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.255;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,31:0.14:221
chr17	21319743	rs76267885	A	G	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.803;NF=30;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.621;SC=AGGATCTGGTAGAGAACAAGT;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=79;TCR=102;TR=67;WE=21319751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,72:0.35:204
chr17	21319767	rs1612176	C	G	2272.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-6.586;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.655;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr17	21319785	rs1657745	C	T	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=3.906;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,43:0.32:136
chr17	21319786	rs78547883	G	A	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-7.641;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,47:0.35:134
chr17	21319845	rs72846670	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=594;ReadPosRankSum=0.985;SC=GAGACCAGGACGGCCGAAGCC;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=38;WE=21319853;WS=21319835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr17	21319860	rs2917720	C	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.933;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr17	21319868	rs73979902	G	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr17	21319908	rs66981137	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=4;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=402;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCCAGGCTGGCGGCGGGGTCC;SOR=0.319;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=30;WE=21319916;WS=21319898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr17	21319943	rs5021699	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=4;HapScore=4;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=166;ReadPosRankSum=0.992;SC=TACAGACGGGAGTCAGAGATC;SOR=1.194;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=8;WE=21319963;WS=21319933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
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chr17	21319977	rs34762677	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
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chr17	21826256	rs9989450	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=559;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AGAGGAAGCCAGGAATGGGAG;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=36;WE=21826264;WS=21826246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr17	22066735	.	CA	GG	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.052;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=16.118;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-8.200;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=3.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,10:0.14:69
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chr17	22066780	rs78507742	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=9.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQRankSum=-10.523;QD=9.96;ReadPosRankSum=-2.150;SOR=1.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,37:0.31:121
chr17	22066807	rs78727354	G	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=4.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=-11.468;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,47:0.33:144
chr17	22066822	rs137955476	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-11.283;NF=26;NR=24;PP=1903;ReadPosRankSum=1.863;SC=GAACCCTTTGCTCATGCAGAT;SOR=0.674;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=50;WE=22066878;WS=22066812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,47:0.34:140
chr17	22066835	rs147079852	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.618;NF=16;NR=24;PP=2059;ReadPosRankSum=3.699;SC=ATGCAGATGACAATACTCTTG;SOR=0.599;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=40;WE=22066878;WS=22066812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,39:0.30:131
chr17	22066856	rs138169151	CAG	C	1111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.380;NF=1;NR=25;PP=2907;ReadPosRankSum=1.149;SC=AAAATGGTGGCAGAGAAAAAA;SOR=0.580;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=76;TCF=6;TCR=70;TR=26;WE=22066878;WS=22066812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,35:0.32:110
chr17	22066870	rs79914182	G	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.104;NF=11;NR=25;PP=2029;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GAAAAAAAATGAAGGGAATAT;SOR=0.665;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=36;WE=22066878;WS=22066812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,33:0.31:105
chr17	25628820	rs6561	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=919;ReadPosRankSum=0.301;SC=TTAGTGAGATTACGTACTATA;SOR=0.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=84;TCR=40;TR=55;WE=25628828;WS=25628810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr17	25630388	rs2270761	T	C	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.048;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=36;PP=1504;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CTTCCCCCACTCCAGTCTCTT;SOR=0.423;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=178;TCF=114;TCR=64;TR=90;WE=25630396;WS=25630378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,104:0.51:205
chr17	25639104	rs11305587	CT	C	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.389;NF=5;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TTGGTTAGTTCTTCCTGGTTG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=25639112;WS=25639094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	25753033	rs13341669	T	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.163;NF=22;NR=28;PP=527;ReadPosRankSum=0.131;SC=CTGGCTTCTCTGGGTGCTGAA;SOR=0.548;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=50;WE=25753041;WS=25753023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr17	25783681	rs1829803	A	G	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=2;PP=92;SC=TGGATAGAGCAGCGCTGCGCG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=25783689;WS=25783671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr17	25887530	rs2945397	G	C	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=2758;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TTCTCTTTCCGCTCTCCTCTA;SOR=0.830;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=189;TCF=85;TCR=104;TR=76;WE=25887549;WS=25887520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,95:0.41:234
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chr17	25909816	rs2293180	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=452;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GGCAACAGCGCCCAGGGCCCA;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=32;WE=25909824;WS=25909806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr17	25912828	rs2945373	A	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=53;PP=1594;SC=GCTGGTGACCACCTCAGGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=71;WE=25912836;WS=25912818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	25915281	rs62057826	C	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=470;ReadPosRankSum=-1.575;SC=CCTCAGAGGCCAGGAGCAAGC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=25;WE=25915289;WS=25915271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr17	25917810	rs1403321	A	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=968;ReadPosRankSum=1.394;SC=GCTGGTGCAAACATGTGCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=48;WE=25917818;WS=25917800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr17	25924596	rs16966333	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=274;ReadPosRankSum=1.865;SC=ACTTGTCCGGCGCCCCAAGCA;SOR=0.542;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=25924604;WS=25924586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr17	25929036	rs4332787	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=0.111;SC=TACACTTACTATGTACCAACC;SOR=0.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=25;WE=25929044;WS=25929026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr17	25930725	rs2241904	G	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr17	25930730	rs2241905	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr17	25932940	rs11433820	A	AT	1191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=1035;ReadPosRankSum=0.668;SC=GGAAGTTCTAATAGAGGCATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=24;WE=25932948;WS=25932930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr17	25935104	rs2289569	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.680;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=932;ReadPosRankSum=0.333;SC=TGTTCCTCTCGCCCTGTTACT;SOR=1.518;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=46;WE=25935112;WS=25935094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,47:0.66:71
chr17	25944235	rs4267373	A	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=867;SC=TGAGAACATCAAAGGGACCCT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=25944243;WS=25944225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	25944557	rs4260103	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=0.348;SC=ACTTTGTTTTTTGGGGTTTTT;SOR=0.495;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=20;WE=25944565;WS=25944547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr17	25950175	rs2241906	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AGGCCTTGGACGCAGTATGAC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=25950183;WS=25950172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr17	25950220	rs1075952	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=480;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TGGCCAATCAGTCATTTTCAT;SOR=0.303;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=30;WE=25950228;WS=25950210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr17	25958304	rs3751093	G	A	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=64;PP=2070;SC=GGCCTTCAGCGGTTCCCAGGC;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=103;WE=25958312;WS=25958294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	25974545	rs4794976	T	G	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=48;PP=1519;SC=CCTTGAACAGTATGGGGGCTG;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=25974553;WS=25974535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	25974600	rs113216780	A	AATTATT	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=634;SC=GTGGCCAACAAATTATTATTA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=25974608;WS=25974590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	25982119	rs4795843	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=3;PP=1037;SC=TTTCCCATTATCCCCACTACC;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=25982127;WS=25982109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	26073050	rs138929274	T	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.96;QD=25.55;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	26073136	rs142859551	T	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.96;QD=24.99;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	26079737	rs2304887	T	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.02;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	26079849	rs71373641	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.774;NF=23;NR=1;PP=449;ReadPosRankSum=0.273;SC=CGATAACCACTATTCTGACTC;SOR=3.890;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=24;WE=26079857;WS=26079839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,9:0.12:73
chr17	26080008	rs4796027	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.640;NF=5;NR=27;PP=560;ReadPosRankSum=-0.898;SC=CATTGGGAGTGGGGAGGGCAC;SOR=0.754;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=32;WE=26080016;WS=26079998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr17	26087316	rs3729727	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=158;SC=AGCATTATCCCCACTTTACAG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=26087324;WS=26087306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	26088337	rs59685746	GC	G	246.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=156;SC=CCACACCACGGCCCTCCTTGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=26088345;WS=26088327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	26089867	rs1060826	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=564;SC=GGTGGATCTCTGTGGGCGTGT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=26089875;WS=26089857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	26092555	rs2297512	G	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=8;PP=473;SC=CTAGCCCGGGGCTCACCACTC;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=26092563;WS=26092545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	26092631	rs1060822	A	G	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=14;PP=891;SC=GCTCCAGGATACCTTGGACCA;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=26092639;WS=26092621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	26096597	rs2297518	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=486;ReadPosRankSum=1.968;SC=CATGAAGAGCGATTTCTTCAG;SOR=0.651;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=32;WE=26096605;WS=26096587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr17	26099171	rs2274894	T	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=262;SC=GTGTAAGTTTTGGAATCCCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=26099179;WS=26099161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	26100321	rs2248814	A	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=54;PP=1675;SC=GGCTTGGCTCAGCTCGCGGAT;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=76;WE=26100329;WS=26100311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	26101237	rs3729966	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=226;ReadPosRankSum=0.479;SC=CACACATACAGCCACATCTGA;SOR=0.071;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=26101245;WS=26101227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	26108040	rs2297520	T	C	5865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=98;NR=98;PP=2965;SC=CAATGGCCGGTGGCTGAGGCT;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=98;TCR=98;TR=196;WE=26108048;WS=26108030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	26108928	rs28999368	CCTGGTTTCTCCTGGAG	C	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.844;NF=13;NR=1;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TTTCTTTCTCCCTGGTTTCTC;SOR=0.468;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=14;WE=26108951;WS=26108921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr17	26109030	rs3729508	T	C	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.07;NF=66;NR=48;PP=1944;SC=CCCTGGGAAATGTGCACCGAC;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=114;WE=26109038;WS=26109020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	26116848	rs8072199	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-1.512;SC=TGTTCATGGTCGGTCTGACCA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=26116856;WS=26116838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr17	26125918	rs3730013	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=886;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GCTGAAGAAGGGAAGCAGAGG;SOR=1.160;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=46;WE=26125926;WS=26125908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr17	26206414	rs3751972	C	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=208;ReadPosRankSum=-0.464;SC=AGGCCAATGGCTCTTCCAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=26206422;WS=26206404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr17	26646434	rs5819836	G	GC	2835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1637;SC=AGGCTCTCCCGGCGCTGCGTC;SOR=1.308;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=39;WE=26646442;WS=26646424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	26669245	rs5819838	A	AG	1767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=1444;SC=CCTCACTCCCAGCCGCTTGGC;SOR=3.080;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=33;WE=26669253;WS=26669235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	26676135	rs13469	C	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=47;PP=1806;SC=AAGCCTGCAGCGAGACGTGGC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=26676143;WS=26676125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	26678960	rs2073867	G	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=144;SC=CAAACAAGGTGCTCATACATG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=26678968;WS=26678950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	26684283	rs11314852	GT	G	1572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=18;PP=1211;SC=TCCAGGCCCAGTTCCTCGCGC;SOR=1.055;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=30;WE=26684291;WS=26684273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	26684390	rs11448856	G	GC	2460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=1518;SC=GCACAGAGCGGCTTTGCCACC;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=32;WE=26684402;WS=26684380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	26684394	rs17856014	T	G	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=28;PP=921;SC=AGAGCGGCTTTGCCACCGGGC;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=47;WE=26684402;WS=26684380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	26684449	rs4795429	G	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=20;PP=645;SC=ACGGCCAGGGGCCGCCGGGCT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=26684457;WS=26684439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	26684529	rs113967755	G	GGC	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=224;SC=GCGGCCGGGCGGTTCCGCCCC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=6;WE=26684537;WS=26684519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	26687484	rs11379368	G	GC	1559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=1316;SC=AGAGGGCTGAGCCAGACTGTC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=32;WE=26687492;WS=26687474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	26687898	rs11382918	G	GC	836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=796;SC=AGGGCAGGGTGCCCTGGTGGG;SOR=1.697;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=26687906;WS=26687888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	26691321	rs9910163	A	G	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=31;PP=1568;SC=GACAATGGCCAAGGCATAGAT;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=26691329;WS=26691311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	26692224	rs11387886	A	AG	9985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=92;PP=2936;SC=GGGCCATGCCAGGCTGTGCCC;SOR=1.011;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=62;TCR=96;TR=153;WE=26692232;WS=26692214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr17	26694861	rs704	G	A	6402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=111;PP=2965;SC=GGACAGCCACGTGGCGCGGGA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=97;TCR=111;TR=208;WE=26694869;WS=26694851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr17	26695704	rs2227725	A	G	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=22;PP=918;SC=CCTGAGGAGCAGGGTGGTGGG;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=26695712;WS=26695694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	26695832	rs2071379	A	G	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=40;PP=2279;SC=CCCCAGTGAAATGTGAAAGGA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=110;WE=26695840;WS=26695822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	26699121	rs7212814	G	C	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=20;PP=712;SC=GGCCCACGGCGGGGCGCCGAG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=26699129;WS=26699111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	26699195	rs11437592	C	CG	2654.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=1242;SC=TGCGGGTGGCCCGGGCCCGCG;SOR=0.871;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=30;WE=26699213;WS=26699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	26699199	rs112387743	G	GC	2495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	26699205	rs11340312	GA	G	2280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=1184;SC=CCGGGCCCGCGAAAGTGTCGC;SOR=0.770;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=30;WE=26699213;WS=26699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	26699367	rs11437594	G	GC	4094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=51;PP=2971;SC=CCTGGCTGCTGCGGCCGTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=71;WE=26699375;WS=26699357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	26708298	.	A	AGC	17323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.44;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr17	26708302	.	GGT	G	17524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.52;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr17	26708550	rs11658194	TC	CG	12584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=117;NR=97;PP=2947;SC=CGAGCTGCTTTCGCTGCACGC;SOR=0.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=225;TCF=119;TCR=106;TR=214;WE=26708559;WS=26708540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr17	26708746	rs140811640	C	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=521;ReadPosRankSum=-0.880;SC=CGCCTCGTGCCGTTGCTCGAC;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=28;WE=26708754;WS=26708736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr17	26716821	rs4795433	C	T	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=13;PP=618;SC=GCAGGGGAATCGCTTGGGCCC;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=26716829;WS=26716811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	26716917	rs4795434	G	T	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=469;SC=ATACAAGTTGGTGTAAATGCT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=26716925;WS=26716907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	26727721	rs5819844	GA	G	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=1425;SC=GTGAGTTGAAGAATGCCGGAG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=33;WE=26727729;WS=26727711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	26729428	rs4795436	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=42;PP=1212;SC=CCATACCCCACGTGGGGCTTA;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=26729436;WS=26729418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	26816365	rs11443311	G	GC	2229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.350;NF=14;NR=33;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TCTGAGGTGAGCCCCATCCAT;SOR=0.522;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=99;TCF=25;TCR=74;TR=47;WE=26816373;WS=26816355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
chr17	26818676	rs9890678	T	C	8944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=131;PP=2965;SC=GATCTGCACATTCACTGGGAG;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=290;TCF=159;TCR=131;TR=290;WE=26818684;WS=26818666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr17	26824156	rs11567842	A	G	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TGGAGTCCTGATCATCGCACT;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=81;WE=26824164;WS=26824146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,97:0.55:177
chr17	26850810	rs10527420	TTCTCTCTCTCTCTCTC	T	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.860;NF=5;NR=2;PP=1198;ReadPosRankSum=0.398;SC=CGCTCTCTGGTTCTCTCTCTC;SOR=0.250;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=26850833;WS=26850802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	26850929	rs483434	A	C	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=31;PP=1551;SC=GTTGGTCCCCACTGGATGCTG;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=77;WE=26850937;WS=26850919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	26851501	rs614434	G	A	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=55;PP=2965;SC=TCACAGGCTCGCTACTCTCTG;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=146;WE=26851509;WS=26851491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	26851602	rs2071587	C	T	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1770;ReadPosRankSum=-0.440;SC=ACACAGCCCCCGCATTGCGTC;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=109;WE=26851610;WS=26851592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,120:0.55:217
chr17	26856261	rs548973	A	G	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CCCACTCTCCAGGGATGGGAG;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=89;TCR=107;TR=101;WE=26856269;WS=26856251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,118:0.51:231
chr17	26857737	rs12451259	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=321;ReadPosRankSum=0.088;SC=GTCAGAGGTTCGGACTCTCAG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=20;WE=26857745;WS=26857727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr17	26857788	rs12449554	T	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=691;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TCATGGCCCTTAAGAACAGTA;SOR=0.986;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=41;WE=26857796;WS=26857778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr17	26861564	rs2286521	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=0.984;SC=CAGGTGAGGCCGGCCGGGCCA;SOR=0.416;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=16;WE=26861572;WS=26861554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr17	26861618	rs9889455	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=187;ReadPosRankSum=1.184;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAATC;SOR=1.773;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=9;WE=26861626;WS=26861608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	26864302	rs532648	G	C	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.982;NF=33;NR=39;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TGACTTGGCAGCCCCGGGCAG;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=72;WE=26864310;WS=26864292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,81:0.50:163
chr17	26874314	rs2070139	G	A	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CAGCCGTGGGGTCAGGGTGTC;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=108;TCR=79;TR=76;WE=26874322;WS=26874304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,100:0.43:230
chr17	26883313	rs631905	A	G	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=53;PP=1381;ReadPosRankSum=-1.067;SC=TTGCCACAACATCATACCAGG;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=100;TCR=102;TR=105;WE=26883321;WS=26883303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,122:0.53:229
chr17	26904517	rs652677	C	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=2.050;SC=GGCAGGAGGCCCAAGCTGCTT;SOR=0.111;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=14;WE=26904525;WS=26904515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
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chr17	26916120	.	AT	A	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.502;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr17	26947652	rs688536	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=-1.081;SC=ACAGCCCCTAGATAATTGTTA;SOR=1.132;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=22;WE=26947660;WS=26947642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr17	26969332	.	T	G	3607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=79;PP=2222;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TGATCTTACATAAGCTCACCT;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=268;TCF=121;TCR=147;TR=139;WE=26969340;WS=26969322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,169:0.51:329
chr17	27000391	rs9904043	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=188;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TTCCCTAGTTATCTTCAGGCA;SOR=0.370;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=16;WE=27000399;WS=27000381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr17	27002402	rs9892089	A	G	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=744;ReadPosRankSum=0.313;SC=GCCCCAACCCATCCTTTTCCT;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=56;WE=27002410;WS=27002392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr17	27004703	rs7207976	C	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=736;ReadPosRankSum=1.864;SC=AGATAAAGTCCGTCTCACCCT;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=42;WE=27004711;WS=27004693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr17	27009749	rs12051648	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=580;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTTTAGATGGCCTGGCCAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=37;WE=27009757;WS=27009739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr17	27044482	rs11545700	C	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1368;ReadPosRankSum=0.800;SC=AACAATCACCCGGGGCCGCGG;SOR=0.812;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=79;WE=27044490;WS=27044472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,87:0.53:163
chr17	27044667	rs190293462	T	C	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.132;SC=GGATGGTTCCTACAATAACCC;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=73;WE=27044675;WS=27044657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,88:0.43:204
chr17	27053568	rs12952249	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr17	27093542	rs9900141	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=775;ReadPosRankSum=-0.964;SC=CTTCAAGGACGGCCCAAATGT;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=46;WE=27093550;WS=27093532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr17	27185827	rs2242345	C	T	4758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=75;PP=2965;SC=GCCAGGAGGACGTGAAAACAC;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=152;WE=27185835;WS=27185817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	27187636	rs9279	G	T	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=91;PP=2855;SC=GACCAGTTCTGTCCTTGGCTG;SOR=1.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=37;TCR=91;TR=128;WE=27187644;WS=27187626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	27188296	.	A	C	138	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=138;QD=28.7952020912;SC=CCCTACCCCCAATCCCACGCC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=27188304;WS=27188286;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	27188678	rs139953196	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=245;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ACTGTGAGGGGCTGGGGGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=16;WE=27188686;WS=27188668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr17	27207571	rs1060244	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=433;ReadPosRankSum=1.161;SC=AGTGGGCCTGCAGGAGCCTCA;SOR=2.027;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=24;WE=27207579;WS=27207561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr17	27210253	rs6505095	T	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.416;SC=TCTTCACCTGTCAGTGACGAC;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=60;WE=27210261;WS=27210243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr17	27213104	rs59662305	AC	A	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-1.215;SC=CAGTAATCCAACCCCCCAACT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=27213112;WS=27213094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr17	27225937	rs4795473	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=0.732;SC=AGAAAGGAGTCGGGCTAGGCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=27225945;WS=27225927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	27246368	rs68042462	CCTCCCCTCCTTGATCCTAACATT	C	2135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=2971;SC=TGTGGAACAGCCTCCCCTCCT;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=21;WE=27246398;WS=27246358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	27290969	rs11450637	T	TG	605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=509;ReadPosRankSum=0.265;SC=CCCTTTCCCCTGGGCACTCAC;SOR=1.863;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=16;WE=27290977;WS=27290959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr17	27306661	rs62068969	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.602;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=639;ReadPosRankSum=0.704;SC=GAATACACCCGCCCCAGCTTT;SOR=0.387;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=50;WE=27306669;WS=27306651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr17	27382061	rs68136852	C	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=747;ReadPosRankSum=-1.162;SC=ACCACTCATGCCACTCTGATT;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=73;TCR=17;TR=43;WE=27382069;WS=27382051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr17	27401176	rs1049848	G	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=646;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CAGCTGCACAGAGAAAGGACT;SOR=1.436;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=42;WE=27401184;WS=27401166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr17	27412805	rs7209661	T	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=-0.906;SC=GACCAGGTAGTGGGATGCGTG;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=13;WE=27412813;WS=27412795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr17	27413403	rs8080570	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=0.696;SC=GTTCCAGAGGTGGTCAAGAGG;SOR=0.709;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=12;WE=27413411;WS=27413393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr17	27413908	rs4795495	C	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=637;SC=TCAGCAGCTACTCAAGGGGCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=27413916;WS=27413903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	27419695	rs12602934	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	27420304	rs12603438	G	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=377;ReadPosRankSum=2.018;SC=CATGGGCAGGGAGCCGGCCAG;SOR=0.683;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=19;WE=27420312;WS=27420294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr17	27421911	rs2019988	T	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=909;ReadPosRankSum=-0.213;SC=TGACCCCAGGTTGTGAGGGGG;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=56;WE=27421919;WS=27421901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr17	27422053	rs2320786	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=608;ReadPosRankSum=-3.016;SC=CCTCCTCATGCGCCTGCGAGA;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=45;WE=27422061;WS=27422043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,53:0.36:146
chr17	27424163	rs748737	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CTGCCCCCAGAGTTCACTGGA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=6;WE=27424171;WS=27424153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr17	27424316	rs8067806	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=640;ReadPosRankSum=1.036;SC=GCCGTTTCTTGGTGAAGTCCA;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=42;WE=27424324;WS=27424306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr17	27425793	rs12450936	A	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=797;ReadPosRankSum=1.640;SC=AAGATAAACCAGCAAGGCTTC;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=57;WE=27425801;WS=27425783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr17	27437134	rs2279958	A	G	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=64;PP=2181;SC=CGAGGGGAAGAGACTGCCCTC;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=100;WE=27437142;WS=27437124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	27437208	rs2279959	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=825;SC=CACTGCTCACAGGGTAGCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=27437216;WS=27437198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	27437710	rs1994663	C	G	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=43;PP=1376;SC=CGCTCCTCCCCCAAGGCCCCA;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=27437718;WS=27437700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	27438469	rs8076604	G	A	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=36;PP=2499;SC=GAGCCGGGGGGCATTCTGGGT;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=88;TCR=36;TR=124;WE=27438477;WS=27438459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	27441077	rs12601535	C	G	6084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=94;PP=2965;SC=AGTCATCCGTCGGGGGTTCCA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=195;WE=27441085;WS=27441067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr17	27443631	rs144361514	G	GCACACACACACACACA	361.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=1911;SC=TGGGACAAACGCACACACACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=27443639;WS=27443621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	27449059	rs877492	C	A	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=58;PP=1681;SC=TATCCTCCCCCCCACTGCATC;SOR=2.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=77;WE=27449067;WS=27449049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	27455707	rs55939148	AC	A	272.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=161;SC=CCACGAGGCTACCCCAGGAAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=27455715;WS=27455697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	27455736	rs8075284	A	G	315.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	27456255	rs11080078	G	C	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=208;SC=CAAGCACTGAGGAGCCCAGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=27456263;WS=27456245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	27492869	rs6505113	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=383;ReadPosRankSum=-1.617;SC=GGCTCTGATAACAGCTCTTGG;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=25;WE=27492877;WS=27492859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr17	27576019	rs8080840	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=317;ReadPosRankSum=0.377;SC=AAACCCCGAGGCACAGCTAGT;SOR=0.260;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=23;WE=27576027;WS=27576009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr17	27576299	rs2286407	T	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.310;SC=CCTGTGCTCGTCCATAAGGCA;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=7;WE=27576307;WS=27576289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr17	27580756	rs1047790	C	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=873;ReadPosRankSum=1.290;SC=AAGCCATGGGCTGGTTCAACA;SOR=0.595;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=63;WE=27580764;WS=27580746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,69:0.38:184
chr17	27613677	rs12452857	G	A	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1320;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CAGAAGAGATGGGTGTTAGAG;SOR=0.619;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=69;WE=27613685;WS=27613667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr17	27614758	rs34613266	TA	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	27834884	.	T	G	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=5.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,69:0.44:156
chr17	27835138	rs508706	C	T	6149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=129;PP=2965;SC=ACCAGGCTGCCATGGAGAAAG;SOR=1.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=60;TCR=129;TR=189;WE=27835146;WS=27835128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	27835211	rs622096	A	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=688;ReadPosRankSum=-1.495;SC=AGAATTAACCAACATGGCAGT;SOR=0.435;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=33;WE=27835219;WS=27835201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr17	27857698	rs536327	C	T	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=59;PP=1707;SC=ACCACCTGAACGAAATCACAG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=67;WE=27857706;WS=27857688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	27869968	rs507577	G	A	9508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=138;PP=2965;SC=GGGGACGGACGGAGCAGGGCA;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=164;TCR=138;TR=301;WE=27869976;WS=27869958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
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chr17	27938424	rs11080107	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGCCCCTGGTCCTTGAAGCA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=27938432;WS=27938414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	27944089	rs11657079	C	T	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=63;PP=2058;ReadPosRankSum=0.506;SC=CGTGACCAGCCCTGCCCCACC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=112;TCR=118;TR=122;WE=27944097;WS=27944079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,137:0.54:256
chr17	27949934	rs77991986	G	GC	1391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=1011;SC=AGAGGGCGGGGCTAGCATAGG;SOR=1.096;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=22;WE=27949942;WS=27949924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	27959903	rs2289629	G	A	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.983;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=64;PP=1716;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TGCATTTTCCGAGTGAGACTG;SOR=1.051;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=103;WE=27959911;WS=27959890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,122:0.59:207
chr17	27975404	rs199569736	T	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=689;ReadPosRankSum=1.745;SC=GAAAATACAATAGTGGGGATA;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=45;WE=27975412;WS=27975394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr17	28004512	rs79008148	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-1.007;SC=AGTGAGAGACCCTGGCAAGTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=28004520;WS=28004508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	28029938	rs3102560	T	C	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=18;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.386;SC=ACAAAAGATATAGTTACCAAG;SOR=1.545;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=70;WE=28029946;WS=28029928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,83:0.54:153
chr17	28120851	rs2617882	A	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.205;NF=28;NR=12;PP=550;ReadPosRankSum=0.875;SC=GAGAAAAAACAATAACTACTA;SOR=0.710;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=40;WE=28120859;WS=28120841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr17	28268800	rs4567782	A	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.417;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=856;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTTGGTGATAACTTTTGGAGT;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=51;WE=28268808;WS=28268790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr17	28270598	rs185083328	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=765;ReadPosRankSum=-1.694;SC=ACAGAGTGTGCCAGACGTTCC;SOR=0.824;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=149;TCF=86;TCR=63;TR=49;WE=28270606;WS=28270588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,60:0.32:187
chr17	28296327	rs9897794	T	G	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1749;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TTACCAGAGGTTGATGAAAGA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=79;TCR=87;TR=106;WE=28296335;WS=28296317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,121:0.63:192
chr17	28320248	rs4795524	T	A	8257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=103;PP=2965;SC=GACAAAATCATAGTCAAGGTG;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=152;TCR=103;TR=255;WE=28320256;WS=28320238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr17	28323499	rs12944395	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=-1.272;SC=AGGGGCAATTAGGCTCTTCCA;SOR=0.770;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=12;WE=28323507;WS=28323489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr17	28378276	rs11653805	C	T	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=64;PP=1432;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GCTGGAGTGTCGCAGTGCACT;SOR=0.507;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=208;TCF=73;TCR=135;TR=102;WE=28378284;WS=28378266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,116:0.50:234
chr17	28381141	rs4074170	C	G	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=832;ReadPosRankSum=-0.599;SC=AAGTTCCAACCTTAAGCAGAA;SOR=0.434;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=163;TCF=63;TCR=100;TR=64;WE=28381157;WS=28381131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,71:0.39:184
chr17	28386526	rs4075623	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=381;ReadPosRankSum=0.958;SC=CAATGAACATATATCTTCCGT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=26;WE=28386534;WS=28386516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr17	28407287	rs11080114	C	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=876;ReadPosRankSum=0.808;SC=AGATTGGTTTCACCCTCCTAA;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=40;TCR=107;TR=61;WE=28407295;WS=28407277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,69:0.40:174
chr17	28407876	rs7221743	T	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=259;ReadPosRankSum=-1.003;SC=ATTATAATGGTTCATTCCTGG;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=21;WE=28407884;WS=28407866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr17	28410124	rs12941382	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=175;ReadPosRankSum=0.724;SC=TGTTATTTCTTGCTAATATTT;SOR=0.425;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=18;WE=28410132;WS=28410114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr17	28417376	rs8065059	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-2.561;SC=CAATATGTTTTGGTGGAATGA;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=28417384;WS=28417366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	28434826	rs5819880	ACTTTT	A	843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.420;NF=18;NR=1;PP=743;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTCCACTCTTACTTTTCTTTT;SOR=0.739;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=19;WE=28434838;WS=28434816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr17	28444183	rs6505162	A	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=403;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TTGCTTCCTAACCCGCGCTTG;SOR=1.355;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=19;WE=28444191;WS=28444173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr17	28444254	rs8067576	T	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	28505024	rs7221154	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.623;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=444;ReadPosRankSum=0.782;SC=TTCTCAAAAAGCATAGACTTT;SOR=1.215;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=25;WE=28505032;WS=28505014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr17	28511978	rs1979572	G	A	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=-1.000;NF=35;NR=34;PP=1129;ReadPosRankSum=0.823;SC=ATCAGCACCAGCAGAAGCAAT;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=69;WE=28511986;WS=28511968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr17	28538532	rs140701	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=564;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ACAACAGTTACAATTCTCATC;SOR=0.238;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=33;WE=28538540;WS=28538522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr17	28549898	rs6354	G	T	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=86;PP=2574;SC=TATTCTGCAAGAGAGGGCAAG;SOR=1.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=132;WE=28549906;WS=28549888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	28549978	rs25528	G	T	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=1078;SC=GGTGGTTGGTGTCGCCGTCCC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=28549986;WS=28549968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	28594068	.	A	ACAGCCTGCTCTATACAGG	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=2.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.38;MQRankSum=1.895;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr17	28778720	rs2253256	G	C	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.807;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=911;ReadPosRankSum=1.440;SC=ATTTCTGTTTGTGCTTCAGTT;SOR=1.117;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=60;WE=28778728;WS=28778710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr17	28889991	.	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,24:0.23:103
chr17	28890203	rs216455	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=288;ReadPosRankSum=-2.175;SC=CGGTAGCCTGTTCTCCCCCTC;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=17;WE=28890211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr17	28900708	rs3764416	G	T	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=7;PP=216;SC=CCTCAGTGGGGGGAGAGGTGG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=28900716;WS=28900698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	28900915	rs58713975	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	28901151	rs11080128	G	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=56.72;MQRankSum=1.211;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.093;SC=ATTAGCACAGGCCCAAGAATG;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=28901159;WS=28901141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr17	29161503	rs11080134	A	G	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GCTCCAATTGAAATTAGTAGC;SOR=0.387;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=77;WE=29161511;WS=29161493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,85:0.64:133
chr17	29221227	rs9898911	A	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=0.892;SC=GGGGAAATCAATAGAGTTTTT;SOR=2.348;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=19;WE=29221235;WS=29221217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr17	29325624	rs79533578	T	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=597;ReadPosRankSum=1.161;SC=CTTCTTAGCATGGACCATCAA;SOR=0.440;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=34;WE=29325632;WS=29325614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr17	29553336	.	G	GACACACACACAC	671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.38;QD=55.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	29553485	rs2285892	G	A	6834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=97;PP=2965;SC=GAACCCCCCCGATTTGCCGAC;SOR=0.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=102;TCR=97;TR=199;WE=29553493;WS=29553475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr17	29558082	rs2071009	T	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=38;PP=885;SC=TATGTAAAGATGCTAATCTTT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=29558090;WS=29558072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	29559932	rs2066736	C	A	3825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=36;PP=2830;SC=TATAGAAATACAAAACCTAGA;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=109;WE=29559940;WS=29559922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	29563073	.	T	TTG	1569	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MMLQ=26;MQ=62.22;NF=4;NR=54;SC=CCGCTGTTTTTTGTTTTTTTT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=58;WS=29563063;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,58:0.87:67
chr17	29563076	rs59745739	T	TG	3540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=42.15;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	29563085	rs56874702	T	TG	3386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.93;QD=43.98;SOR=1.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	29623288	rs11080149	C	T	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=55;PP=1431;ReadPosRankSum=-1.396;SC=GCATAAAATACCAGGTGTGAG;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=172;TCF=55;TCR=117;TR=77;WE=29623296;WS=29623278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr17	29670190	rs7405740	C	G	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=66;PP=1870;SC=TTATGAAGTACTATTAAGAAA;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=76;WE=29670198;WS=29670180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	29684420	rs200607880	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,37:0.19:191
chr17	29758774	rs34137478	C	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=0.336;SC=ACCCAGCTCCCTGAGTCTTCG;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=23;WE=29758782;WS=29758764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr17	29761030	rs36082230	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=178;ReadPosRankSum=1.628;SC=TCACTGTCCCGTGTGTCTGCC;SOR=1.096;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=14;WE=29761038;WS=29761020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr17	29815385	rs57391434	G	T	3363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1239;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCGGAGAGCGGACTTGGCCTG;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=83;WE=29815393;WS=29815375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,90:0.58:156
chr17	29815404	rs8075239	T	G	3369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1383;ReadPosRankSum=-1.414;SC=TGGGAGGTCGTGTTACCTGAG;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=85;WE=29815412;WS=29815394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,91:0.58:156
chr17	29848460	rs8066569	G	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=427;ReadPosRankSum=0.047;SC=GGGGGGGTGCGAGTCCTGAGC;SOR=0.396;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=25;WE=29848468;WS=29848450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr17	29849129	rs75048991	G	A	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=46;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CCTGGAGGGAGAAGCTACGGG;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=60;WE=29849137;WS=29849119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,62:0.65:96
chr17	29849479	rs60594701	C	T	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.343;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=83;PP=2001;ReadPosRankSum=0.921;SC=GCCGGGGCTCCCTGCCAGCAG;SOR=0.426;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=175;TCF=36;TCR=139;TR=108;WE=29849487;WS=29849469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,112:0.61:183
chr17	29852092	rs2023795	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=712;ReadPosRankSum=0.064;SC=GAGCTTGCCCATTGCGCTGTC;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=50;WE=29852100;WS=29852082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr17	29857460	rs61731602	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=805;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CTCTGGCTGCGGAGATAGACA;SOR=0.650;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=46;WE=29857468;WS=29857450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
chr17	30183663	rs71142094	G	GC	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GAAGCTCCAAGCAAGGCTTCC;SOR=0.527;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=6;WE=30183671;WS=30183653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr17	30183857	rs8068049	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=1.384;SC=CTCTCCTGACTGGAGTGGTCA;SOR=0.822;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=18;WE=30183865;WS=30183847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr17	30185565	rs9906443	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TGTAATAACGGTCTGTAACGT;SOR=1.347;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=8;WE=30185573;WS=30185555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr17	30185892	rs11542477	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=476;ReadPosRankSum=0.283;SC=CTGCTGACCCAGAGCGCCCAC;SOR=0.417;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=30;WE=30185900;WS=30185882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr17	30219500	rs1034626	C	G	191.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=135;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TCAAAATTTTCTACCTCAATT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=30219508;WS=30219490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	30222002	rs3760454	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=0.175;SC=TCTTCTTCTCTGGATCAGCTC;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=23;WE=30222010;WS=30221992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr17	30228656	rs2074101	G	A	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=1112;ReadPosRankSum=1.056;SC=TGAGGTCCGAGGTCTACAACC;SOR=0.857;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=59;WE=30228664;WS=30228646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,75:0.63:119
chr17	30267187	rs141697390	A	ATATT	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.691;NF=4;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.168;SC=TGCGATATAAATAGTGCGTGA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=30267195;WS=30267177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr17	30303480	rs147986570	TATATC	T	1726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.530;NF=22;NR=6;PP=1400;ReadPosRankSum=0.772;SC=TAAGGGACCATATATCATAAC;SOR=1.217;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=28;WE=30303492;WS=30303470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr17	30315287	rs530209	A	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=672;ReadPosRankSum=2.277;SC=TCTACAATTTATTTGAATTCA;SOR=0.537;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=39;WE=30315295;WS=30315277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr17	30320860	rs55811201	C	CT	827.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.884;NF=26;NR=5;PP=376;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TGGAGATTTGCTTTTTTTTTT;SOR=1.474;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=31;WE=30320868;WS=30320850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr17	30321567	rs1557731	T	G	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=16;PP=1031;ReadPosRankSum=0.219;SC=TTTTTTTTTTTACATTTTTGT;SOR=0.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=84;TCR=28;TR=60;WE=30321575;WS=30321546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,65:0.54:120
chr17	30321762	rs473356	G	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=60;PP=1473;ReadPosRankSum=0.011;SC=GGGCATATAAGAAAAGTTTAA;SOR=0.688;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=44;TCR=107;TR=83;WE=30321770;WS=30321752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,91:0.57:159
chr17	30322880	.	TT	AA	212	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=59.16;NF=0;NR=5;PP=212;QD=53.0935749724;SC=GGAACTTTTTTTAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=30322889;WS=30322870;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,5:0.25:20
chr17	30376461	rs373339302	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.164;NF=7;NR=41;PP=937;ReadPosRankSum=-1.547;SC=ATCATTTAGCGTATGCCAGGA;SOR=0.507;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=81;TCF=8;TCR=73;TR=48;WE=30376469;WS=30376451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr17	30376932	rs1843083	C	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.739;NF=5;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.485;SC=ACTCAACTGGCATACTGGGGT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=30376940;WS=30376922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	30377162	rs16967101	A	G	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.131;NF=47;NR=42;PP=1367;ReadPosRankSum=-1.756;SC=TTCAGAATACAATCCTGTGTT;SOR=0.652;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=89;WE=30377170;WS=30377152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,83:0.60:139
chr17	30380381	rs17182434	A	G	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.762;NF=49;NR=96;PP=2418;ReadPosRankSum=0.167;SC=GCCTGGAGCTATGTTTTTAAA;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=240;TCF=83;TCR=157;TR=145;WE=30380389;WS=30380371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,168:0.58:291
chr17	30469423	rs13342625	C	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.372;NF=11;NR=12;PP=431;ReadPosRankSum=1.248;SC=CGGCGCAGAGCGCGTTCGCGT;SOR=0.605;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=23;WE=30469431;WS=30469413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr17	30469470	.	CCCGCCGCCGCCGCCG	C	791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=11;PP=3000;SC=TGCCGTCGTCCCCGCCGCCGC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=30469492;WS=30469460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	30470028	rs149838766	G	GC	4776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.366;NF=28;NR=54;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.163;SC=GTCCCTATTAGCCCTAACCGC;SOR=0.872;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=51;TCR=105;TR=82;WE=30470036;WS=30470018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,168:0.62:271
chr17	30502955	rs8076276	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	30509939	rs6505286	C	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=712;SC=TTACTAAATTCGGGTTTTAAA;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=30509947;WS=30509929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	30520411	rs72827703	G	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=59;ReadPosRankSum=1.030;SC=TTTATGAGTTGGGAGGGACAG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=30520419;WS=30520401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr17	30533970	rs16967164	A	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=778;ReadPosRankSum=1.561;SC=CTGAAGCTGAAATCATTTGTG;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=47;WE=30533978;WS=30533960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,58:0.60:96
chr17	30593336	rs9889253	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=-1.362;SC=GCCCCCTCCCCGCCCGGCAAA;SOR=0.977;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=17;WE=30593344;WS=30593326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr17	30632274	rs16967266	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=438;ReadPosRankSum=0.615;SC=GTCTTAGCACGGAGCCTGCAG;SOR=0.302;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=84;TCF=69;TCR=15;TR=31;WE=30632282;WS=30632264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr17	30643361	rs2344973	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=0.801;SC=CCAGGGCCTGAGGTTCAAAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=13;WE=30643369;WS=30643351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr17	30659006	rs1019152	T	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=1.522;SC=GCCTAGAAAATGATTACCCAG;SOR=0.495;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=12;WE=30659014;WS=30658996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr17	30665005	rs35677406	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=850;ReadPosRankSum=-0.311;SC=AAAGGATGAATAATGAAGACA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=35;TCR=86;TR=52;WE=30665013;WS=30664995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,58:0.42:139
chr17	30687522	rs6505295	G	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=1.582;SC=ATCTCATGAAGTAATTTTACC;SOR=0.078;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=4;WE=30687530;WS=30687512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr17	30689814	rs9896320	G	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	30696292	rs2286645	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=300;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GTATTTAGCCCTGCGCTTATT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=21;WE=30696300;WS=30696282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr17	30791502	.	T	TC	5449.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.022;NF=56;NR=89;PP=2980;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TGTGGCTTTTTCCCCCCCCTT;SOR=0.503;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=218;TCF=89;TCR=129;TR=145;WE=30791517;WS=30791492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,254:0.75:338
chr17	30791503	rs2302276	C	T	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=-2.175;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.808;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,80:0.23:344
chr17	30791509	rs2302277	C	G	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=5.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=-2.195;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.358;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,86:0.24:364
chr17	30815681	rs8192474	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.311;SC=CTTTCCCACAGTCTCTCCCTG;SOR=1.230;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=30815689;WS=30815671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	30822034	rs9889257	C	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=51;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GCGCAGCCTGCTTCCTCCACA;SOR=0.327;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=126;TCF=32;TCR=94;TR=72;WE=30822042;WS=30822024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,80:0.59:136
chr17	30980972	rs2249638	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=692;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GCTTCTGAAAGAGAAAGGAAA;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=56;TCR=100;TR=53;WE=30980980;WS=30980962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,58:0.32:184
chr17	30981043	.	T	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=593;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GTGTACTGCTTTATAACTACA;SOR=0.555;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=31;WE=30981051;WS=30981033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr17	31204005	rs118039764	G	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=218;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TACGGGGAGGGGGCGCGCACG;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14;WE=31204013;WS=31203995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr17	31258520	rs11558976	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GATGTGACCGGGACTGAGTCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=31258528;WS=31258511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	31319024	rs2188953	A	C	5741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.22;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	31319033	rs3922357	G	C	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	31319092	rs2188952	T	G	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=27;NR=51;PP=1519;SC=TAGGGTGGGGTTATCCTGGCC;SOR=1.414;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=78;WE=31319100;WS=31319082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	31323728	rs140981292	A	AG	1732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1800;SC=AGCAGGTGGGAGGCACCTGCC;SOR=5.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=43;WE=31323736;WS=31323718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr17	31344549	rs2074215	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=97;ReadPosRankSum=0.707;SC=TTCCCTCTACTATGATTCTGA;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=12;WE=31344557;WS=31344539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr17	31355227	rs58042873	A	AG	1070.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=751;SC=GGCAGATCCCAGGGCCCTGTG;SOR=1.542;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=31355235;WS=31355217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	31618732	rs9893935	A	G	4342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=68;PP=2830;ReadPosRankSum=-1.070;SC=TGTTGCACACAGTGACGGCGG;SOR=0.933;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=282;TCF=164;TCR=118;TR=172;WE=31618740;WS=31618722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,198:0.61:327
chr17	31618997	rs112647385	C	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CTGCAGCGCCCGCTCGCCGCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=31619005;WS=31618987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr17	32364722	rs4795846	T	C	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=26;PP=1270;SC=GACTGACTTTTGGATGTGAGG;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=62;WE=32364730;WS=32364712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	32583132	rs2857657	G	C	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=2;PP=1070;SC=TGAGCTCTTTGTCTTCTCCTG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=32583140;WS=32583122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	32612894	rs1129844	G	A	3354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=52;PP=2041;ReadPosRankSum=-1.680;SC=CCAGGGGCTCGCTGGGCCAGG;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=231;TCF=144;TCR=87;TR=134;WE=32612902;WS=32612884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,152:0.58:261
chr17	32614425	rs3815341	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=0.884;SC=ATTTCTTCAAGTCAAGAGCAA;SOR=1.488;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=11;WE=32614433;WS=32614415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	32647544	rs3138036	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=229;ReadPosRankSum=0.531;SC=AACTCAGTCCATGAGAAGGAG;SOR=0.714;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=17;WE=32647552;WS=32647534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr17	32647744	rs3138037	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=0.631;SC=GCTGATCAGTTCTAGGGACCA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=11;WE=32647752;WS=32647734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	32647831	rs1133763	A	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=710;ReadPosRankSum=0.142;SC=CTTCAAGACCAAACGGGGCAA;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=42;WE=32647847;WS=32647821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr17	32684991	rs2072069	G	A	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=345;SC=GTCATCTCCTGGGTAAACCCT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=32684999;WS=32684981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	32688712	rs159271	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=365;SC=AACCTTATTCTGGTAAAATAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=32688720;WS=32688702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	32904480	rs887231	G	A	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=38;PP=2688;SC=TAAGATGAGCGAAGTGCATGA;SOR=1.464;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=119;WE=32904488;WS=32904470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	32904586	rs887230	C	T	6349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=106;PP=2965;SC=TGGTTTTGTCCTGCTCACTGT;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=90;TCR=106;TR=196;WE=32904594;WS=32904576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	32908064	rs4795938	T	C	5194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=67;PP=2873;SC=CGACTGTTGCTCTCTCGGACC;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=145;WE=32908072;WS=32908054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	32908210	rs7218304	T	C	6396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	32908217	rs7212426	G	A	6322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	32961751	rs2058164	C	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=385;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GGCAAGGGTGCGGGGTGTGTA;SOR=0.253;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=19;WE=32961759;WS=32961741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr17	32965275	.	AC	A	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=2.477;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr17	33266431	rs12452225	A	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=380;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TACAATCTTCATTTGAATTTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=20;WE=33266439;WS=33266421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr17	33279125	rs55856327	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=580;ReadPosRankSum=-1.933;SC=CTAAAATAAACCAAGGGCCCA;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=41;WE=33279133;WS=33279115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr17	33288882	rs931196	T	G	8432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=134;PP=2965;SC=CAGCGCCTCATTCCGTCAAGA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=136;TCR=134;TR=270;WE=33288890;WS=33288872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr17	33307700	rs57311484	GC	G	1362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=1125;SC=AAGGCAGCGGGCCCGGGGCGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=30;WE=33307708;WS=33307690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	33326780	rs2066505	G	A	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1394;ReadPosRankSum=1.127;SC=ACAGCCCAAAGTAGCATCTTT;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=102;TCR=129;TR=103;WE=33326788;WS=33326770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,130:0.46:282
chr17	33328221	rs145620705	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=259;ReadPosRankSum=0.621;SC=CACCACGCCCGGCCACTGATA;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=14;WE=33328229;WS=33328211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr17	33329648	rs2074522	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=0.584;SC=GGGACTATAGGTGTGCACCAC;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=33329656;WS=33329638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr17	33332655	rs60014690	A	G	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=851;ReadPosRankSum=-1.761;SC=CCAAAACTCAATCGATTTTTT;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=59;WE=33332663;WS=33332645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,63:0.32:199
chr17	33339283	rs2074520	G	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=0.565;SC=TGTAAACAAAGTCTCAGTGCA;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=33339291;WS=33339273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr17	33341834	rs2074519	T	C	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1052;ReadPosRankSum=1.257;SC=ATGGTACAAATACAGTCTCTT;SOR=0.735;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=93;TCR=111;TR=76;WE=33341842;WS=33341824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,92:0.38:244
chr17	33353332	rs3926358	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GAGGGGTCAGTGGCGCTTGCC;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=12;WE=33353340;WS=33353322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	33428487	rs28363289	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=338;ReadPosRankSum=-0.467;SC=AGCACAGAGAAATAACTTCCC;SOR=0.974;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=21;WE=33428495;WS=33428477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr17	33433487	rs4796033	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=764;ReadPosRankSum=0.227;SC=CTGGATCCTCCGGAGAGCTTC;SOR=0.405;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=42;WE=33433495;WS=33433477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr17	33433820	rs936656	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=663;SC=TGGAAGAATCAGTGTGAGTAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=33433828;WS=33433814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	33445416	rs147268486	T	TA	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=3.025;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,24:0.25:95
chr17	33445549	rs9901455	G	A	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1295;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GGATGGCAGTGGAGGTCTTCA;SOR=0.559;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=230;TCF=108;TCR=122;TR=94;WE=33445557;WS=33445539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,119:0.41:291
chr17	33448818	rs1871892	T	C	13153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=196;NR=196;PP=2965;SC=AAAACCCTTTTCAAACCCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=392;TCF=196;TCR=196;TR=392;WE=33448826;WS=33448808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,488:1.00:488
chr17	33454415	rs2306508	C	A	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=59;PP=1594;ReadPosRankSum=0.526;SC=TTGAGCACACCGTCAACAATT;SOR=1.026;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=153;TCF=45;TCR=108;TR=81;WE=33454423;WS=33454405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,93:0.51:183
chr17	33463568	rs3736143	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=0.889;SC=CACGCCTGGGCGATTAGCCCC;SOR=0.293;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=33463576;WS=33463558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	33464864	rs7215209	C	T	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=28;PP=1284;SC=GGCCAGCTTCCTGCCATCTGG;SOR=0.980;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=33464872;WS=33464854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	33469279	rs1471615	G	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=32;PP=1248;SC=ACACCCACCGGCACTGCTGCC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=33469287;WS=33469269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	33478185	rs4796042	C	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=7;PP=371;SC=TGTTCACTCGCCATTACTGAG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=33478193;WS=33478175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	33479867	rs79901966	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=657;ReadPosRankSum=1.249;SC=CTGAAATGACGTGGACCCCAC;SOR=0.857;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=44;WE=33479875;WS=33479857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr17	33497050	rs8066133	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.596;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=971;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GGACCTCACCCCTGGTTCACC;SOR=1.218;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=181;TCF=102;TCR=79;TR=62;WE=33497058;WS=33497040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,68:0.35:196
chr17	33497331	rs7213921	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-1.380;SC=TGCTGGGTCCAGACCCACAGG;SOR=0.260;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=33497339;WS=33497321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr17	33501432	rs1384220	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.241;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr17	33502937	rs11657816	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=365;ReadPosRankSum=-1.295;SC=CTGCTGCCTGGGAAGGTGTGC;SOR=0.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=20;WE=33502945;WS=33502927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr17	33503922	rs9902956	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=387;ReadPosRankSum=1.002;SC=CTGATTATACGGCAGAATTTT;SOR=0.506;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=25;WE=33503930;WS=33503912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr17	33504465	rs12451132	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=461;ReadPosRankSum=0.568;SC=GTGAGGCACTCAGGGAACAAA;SOR=0.235;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=27;WE=33504473;WS=33504455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr17	33510656	rs8074705	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=0.117;SC=GAATCTCCCCACCCACAGACC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=15;WE=33510664;WS=33510646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr17	33513591	rs3744365	A	C	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=51;PP=1001;ReadPosRankSum=0.267;SC=AGCGACCCTCAGGGATGCTGG;SOR=1.215;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=73;WE=33513599;WS=33513581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr17	33513649	rs3744366	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=639;ReadPosRankSum=-1.027;SC=GGTTCTCCTGAAGAGTCAGGT;SOR=0.265;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=33;WE=33513657;WS=33513639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr17	33591509	rs141681707	C	T	4071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=61;PP=2850;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TGAACAAAGGCGGCTACACTG;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=169;TCR=101;TR=164;WE=33591517;WS=33591499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,173:0.58:300
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chr17	33592591	rs11651240	C	T	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1410;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGTTATTCTCCGAAGGATATT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=122;TCR=100;TR=90;WE=33592599;WS=33592581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,107:0.39:272
chr17	33680807	rs9897352	G	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.76;MQRankSum=0.176;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr17	33680840	rs28571667	T	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.17;QD=32.61;SOR=7.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr17	33690466	rs12453150	C	A	8545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=138;PP=2965;SC=CGGGGCTTGACAGAGCGATCT;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=124;TCR=138;TR=262;WE=33690474;WS=33690456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr17	33690863	rs4796078	G	T	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=52;PP=1703;SC=AAGAAATGAAGTGTTACATGC;SOR=1.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=33690871;WS=33690853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	33748939	rs2671817	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=915;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TCTTGCCCCAGATCCCATAGA;SOR=0.788;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=50;WE=33748947;WS=33748929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr17	33749546	rs2586514	A	G	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=1829;ReadPosRankSum=0.078;SC=ATATCAACACAGGGCCTCTTT;SOR=0.762;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=117;WE=33749554;WS=33749536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,138:0.59:235
chr17	33749919	rs1849733	A	C	4679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=100;PP=2839;ReadPosRankSum=-0.663;SC=CTCGTGAGACACTTTCATTCT;SOR=0.795;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=295;TCF=122;TCR=173;TR=167;WE=33749927;WS=33749909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,212:0.57:372
chr17	33768199	rs1822403	G	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TCTGAAAGTAGTCCAGAAAGA;SOR=0.607;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=194;TCF=72;TCR=122;TR=74;WE=33768207;WS=33768189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,77:0.37:207
chr17	33768354	rs3744371	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.607;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.663;NF=14;NR=17;PP=470;ReadPosRankSum=0.121;SC=AGGAAAGTTTCCCGGGTCTCT;SOR=0.554;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=31;WE=33768362;WS=33768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr17	33769034	rs62078110	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=16.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQRankSum=-5.865;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,31:0.31:101
chr17	33805150	rs2304968	T	C	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.341;SC=ACGAAGAGGATAACTCTGGGA;SOR=0.870;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=231;TCF=93;TCR=138;TR=102;WE=33805158;WS=33805140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,114:0.44:261
chr17	33806863	rs12451746	G	A	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1278;ReadPosRankSum=0.745;SC=TCACAAAAATGTGAAAGTAGT;SOR=0.702;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=220;TCF=126;TCR=94;TR=83;WE=33806871;WS=33806853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,99:0.40:250
chr17	33807250	rs9905892	T	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=571;ReadPosRankSum=0.823;SC=GAGTTAAGCCTGAGAGACAGC;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=32;WE=33807258;WS=33807240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr17	33814735	rs10626701	G	GAA	4575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.038;NF=21;NR=48;PP=2896;ReadPosRankSum=0.915;SC=TAAAGAAAAAGAGAACGAACC;SOR=0.659;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=241;TCF=79;TCR=162;TR=69;WE=33814743;WS=33814725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:302,132:0.30:434
chr17	33875262	rs8073060	T	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=851;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TAATTTTCAGTAGGCTGCCCT;SOR=1.057;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=128;TCF=90;TCR=38;TR=51;WE=33875270;WS=33875252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,59:0.39:153
chr17	33879682	.	C	CAT	137	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=61.64;NF=4;NR=0;PP=137;QD=40.25;SC=TATATATACACATATATATAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=33879690;WS=33879672;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr17	33881631	rs321612	T	C	4389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=72;PP=2006;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TCCTTAAATTTGTGGACTTTT;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=318;TCF=182;TCR=136;TR=162;WE=33881639;WS=33881621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,214:0.55:389
chr17	33881718	rs321613	G	A	4200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=63;PP=1501;ReadPosRankSum=-0.004;SC=ACCAAACTGGGAGGAGCTAGA;SOR=0.457;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=64;TCR=123;TR=98;WE=33881726;WS=33881708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,120:0.55:217
chr17	33881734	rs321614	A	G	3683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=54;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CTAGACAATTACATGGAAAGT;SOR=0.491;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=40;TCR=105;TR=74;WE=33881742;WS=33881724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,91:0.57:161
chr17	33881769	rs66959492	TA	T	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-0.841;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr17	33921160	rs225305	C	T	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=652;SC=AGGCAGAATGCTGCTGACCTC;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=33921168;WS=33921150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	33933006	rs225284	A	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=904;ReadPosRankSum=-1.644;SC=TCATCCAGGGAAATTCAAACC;SOR=0.204;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=80;TCF=7;TCR=73;TR=43;WE=33933014;WS=33932996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr17	33963611	rs11345348	AT	A	1082.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=1097;SC=AATCGGAAACATTAAAATGGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=27;WE=33963619;WS=33963601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	33968871	rs225270	A	T	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=16;PP=1740;SC=ATTCTTTCACACTATCACAAA;SOR=2.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=33968879;WS=33968861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	33998802	rs1049379	G	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.685;NF=24;NR=6;PP=649;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CATCATCGGTGCCTGCAACCT;SOR=0.182;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=30;WE=33998810;WS=33998792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
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chr17	34077459	rs117559122	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=433;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GGGCAGCAGACATGGGGAGTG;SOR=0.484;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=23;WE=34077467;WS=34077449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr17	34100350	rs58543174	G	GC	10156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=115;PP=2965;SC=GCCGGCTCCGGAGATGCTCAG;SOR=0.854;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=34;TCR=118;TR=149;WE=34100358;WS=34100340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr17	34325532	rs2075746	T	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=579;ReadPosRankSum=0.588;SC=CCTCCTCGGCTAGCACTTGCT;SOR=1.038;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=31;WE=34325540;WS=34325522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr17	34328461	rs854625	A	G	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=87;PP=2833;SC=CTCACCATTTATGAACTGGGC;SOR=1.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=34328469;WS=34328451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	34340161	rs1734953	T	A	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=54;PP=2965;SC=AATGCTTCTTTAAAAAATAAT;SOR=1.396;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=106;TCR=54;TR=160;WE=34340169;WS=34340151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	34340284	rs1003645	C	T	6861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=120;PP=2965;SC=AGCATTCTCACGCAAACCTGA;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=91;TCR=120;TR=211;WE=34340292;WS=34340274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr17	34341082	rs1719204	C	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=573;SC=GGGTGGGCCACAGCAGGACCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=34341090;WS=34341072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	34391617	rs2015086	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=0.138;SC=AAGGAGAGACAACAGCTCATA;SOR=2.428;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=34391625;WS=34391607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr17	34391783	rs2015070	C	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1230;ReadPosRankSum=0.234;SC=AGTCTGTCATCCATGTGCTTT;SOR=0.738;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=68;WE=34391791;WS=34391773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,85:0.52:162
chr17	34398495	rs14304	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=453;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CCCTGGAGGCCACCTCTTCTA;SOR=0.601;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=28;WE=34398503;WS=34398485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr17	34416246	rs1719130	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=0.641;SC=TGCCTATCTCTGTCTAGAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=34416254;WS=34416236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	34416537	rs1130371	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.210;NF=16;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=1.885;SC=ACATGACACCGGGCTTGGAGC;SOR=2.364;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=17;WE=34416545;WS=34416527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr17	34416665	rs1719133	A	G	6067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=85;PP=2965;SC=GGAAGAGAATAAGCCCGAGTC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=172;WE=34416673;WS=34416655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr17	34431287	rs1049750	G	T	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=41;PP=2886;SC=AAACCTCTTTGCCACCAATAC;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=99;TCR=41;TR=140;WE=34431295;WS=34431277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	34431403	rs1719144	G	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.026;NF=26;NR=40;PP=908;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CTGCTATTTCGAGTCAAGGTG;SOR=0.652;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=82;TCR=125;TR=66;WE=34431411;WS=34431393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,85:0.34:249
chr17	34431961	rs1719146	T	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.42;QD=28.36;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	34432125	rs1719147	A	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=1033;SC=GTGATTGAGCATTGGGGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=34432133;WS=34432115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	34432581	rs1719149	T	C	6685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-8.934;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,179:0.43:421
chr17	34432586	rs1719150	A	G	6882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-8.961;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,187:0.42:443
chr17	34432663	rs1049807	AT	GA	6340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.179;NF=57;NR=75;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.553;SC=ATCCCAGTGAATCCTGGGTCC;SOR=0.687;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=351;TCF=155;TCR=196;TR=132;WE=34432672;WS=34432653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,172:0.40:433
chr17	34842521	rs4796224	A	G	7979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=619;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=0.777;SC=GCGGCGCAGTAAACAGTCTCC;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=505;TCF=254;TCR=251;TR=300;WE=34842529;WS=34842511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,364:0.59:617
chr17	34848874	rs2306589	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=0.196;SC=TTCCTTAGCCTTGAGCATCAG;SOR=1.423;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=22;WE=34848882;WS=34848864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr17	34854280	rs2306590	G	A	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=46;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AGGGGCCAGAGGCGGATTATT;SOR=0.758;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=263;TCF=134;TCR=129;TR=103;WE=34854288;WS=34854270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,124:0.40:312
chr17	34862220	rs1109442	T	C	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=943;ReadPosRankSum=0.459;SC=GCACCGATCCTGGCAGGTGCT;SOR=0.530;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=65;WE=34862228;WS=34862210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr17	34865131	rs17560870	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=1.078;SC=CTTCCGGCCTATCACGTCTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=34865139;WS=34865121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	34866546	rs2306593	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=435;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GAGCACTTGTCGGGGTCCTCC;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=31;WE=34866554;WS=34866536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr17	34867415	rs34476742	A	AGT	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.442;NF=0;NR=10;PP=422;ReadPosRankSum=-0.785;SC=TCATGGCCCAAGTGCCCATCT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=10;WE=34867423;WS=34867405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
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chr17	34869150	.	CCAGAG	ACAGAA,ACAGAG	550	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=21,35;NR=8,14;PP=550,376;QD=20.8092370642;SC=TGGAGGTAGCCCAGAGGGGCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=29,49;WE=34869163;WS=34869140;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.59:49
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chr17	34951327	rs2285639	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=0.170;SC=TGACGGGGGTCGGGGTCTGAG;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=10;WE=34951335;WS=34951317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr17	34955249	rs145977011	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=579;ReadPosRankSum=0.994;SC=AAGTCTTCCCGATGGGCATCT;SOR=0.643;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=98;TCR=16;TR=38;WE=34955257;WS=34955239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr17	34956585	rs377424786	CCA	C	1823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.680;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,56:0.26:212
chr17	35306312	rs2306658	G	C	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=25;PP=903;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGTCTCTGGCGGAGTCGGGGA;SOR=0.683;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=70;WE=35306320;WS=35306302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,77:0.60:128
chr17	35346641	rs1045056	T	C	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=792;ReadPosRankSum=-1.873;SC=CCAAGCGCTCTGTCTATCGAG;SOR=0.689;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=52;WE=35346649;WS=35346631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,68:0.65:105
chr17	35414006	rs11653434	C	T	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=1054;ReadPosRankSum=0.026;SC=TTGGCTGGTGCGGCTGCTGGT;SOR=1.034;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=56;WE=35414014;WS=35413996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,68:0.64:106
chr17	35478362	rs1470452	T	C	4481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=70;PP=2480;SC=TGGCCTGATATGTCTTAAACG;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=141;WE=35478370;WS=35478352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	35486486	rs9789070	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.116;SC=ACAATAGTTACAGACAAAGAC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=16;WE=35486494;WS=35486476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr17	35549275	rs2305099	T	C	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=76;PP=2694;SC=GAAAAAACAGTTCACAAGAGG;SOR=1.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=118;WE=35549283;WS=35549265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	35550158	rs12603097	C	T	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=13;PP=677;SC=AGAAAGGAATCGGCTTTAGTT;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=35550166;WS=35550148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	35550179	rs12603098	C	T	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=16;PP=717;SC=CTAAGACACACGTAAGGCAAC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=35550187;WS=35550169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	35550448	rs2305097	C	A	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=34;PP=907;SC=CATTTAGAAGCCAGTTTTCTA;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=35550456;WS=35550438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	35557289	rs11659129	C	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=14;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TATTAGTAAGCATAAGATTAC;SOR=0.541;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=80;TCR=22;TR=59;WE=35557297;WS=35557279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,63:0.56:113
chr17	35562546	rs2278679	C	T	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=9;PP=1111;SC=TATCCCTAAACGCAGAACTAG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=35562554;WS=35562536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	35567261	rs77476454	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GGGGAGCTCAGGACTCCCTAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=35567269;WS=35567251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	35581887	rs144469510	TTA	T	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=187;ReadPosRankSum=0.676;SC=CAGGAAAGGGTTATATATATA;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=5;WE=35581896;WS=35581877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	35608781	rs72010031	CCT	C	2207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=8;PP=1599;SC=GTCAACATCCCCTCTCTTTCT;SOR=3.056;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=35;WE=35608790;WS=35608771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	35608889	rs1519091	G	A	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=96;PP=2965;SC=TGTACTCAGGGCCATTGATTA;SOR=0.858;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=115;TCR=96;TR=211;WE=35608897;WS=35608879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr17	35609746	rs2252757	G	A	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=1;PP=1219;SC=TCATGTAGTGGCAGGGATTGA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=35609754;WS=35609736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	35609866	rs2229416	C	T	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=40;PP=2284;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TTCTGTTCATCTGAAAGCTTT;SOR=0.847;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=327;TCF=224;TCR=103;TR=135;WE=35609874;WS=35609856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,152:0.40:377
chr17	35630997	rs2542659	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=457;ReadPosRankSum=1.131;SC=ACCTTGGGTATATATCACGAG;SOR=0.902;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=28;WE=35631005;WS=35630987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr17	35632979	rs2542660	C	A	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=66;PP=2316;SC=TGACTGTAACCCCTTGGCCTC;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=112;WE=35632987;WS=35632969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	35634023	rs2302803	A	G	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=75;PP=1621;ReadPosRankSum=1.676;SC=AGGGAATACAATATAATTCAT;SOR=0.790;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=322;TCF=135;TCR=187;TR=124;WE=35634031;WS=35634013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,145:0.38:383
chr17	35696804	rs58654829	G	A	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=14;NR=12;PP=426;SC=TCCACTTCCAGAAAGACCTAG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=35696812;WS=35696794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	35696820	rs147333574	AAAAG	A	1114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=13;PP=687;SC=CCTAGAGAGAAAAAGAGAGAA;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=15;WE=35696831;WS=35696810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	35766475	rs72828246	A	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=606;ReadPosRankSum=0.365;SC=GACGTTCCAGAAGCATCTGAT;SOR=0.984;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=30;WE=35766483;WS=35766465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr17	35771468	rs7211875	C	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=55;PP=1394;ReadPosRankSum=-1.032;SC=CCGTTTGGGTCCCTTTAGCAG;SOR=0.336;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=147;TCF=44;TCR=103;TR=84;WE=35771476;WS=35771458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,97:0.58:168
chr17	35783812	rs7501983	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=254;ReadPosRankSum=1.994;SC=GGAGATCTATATCTTATTAAA;SOR=3.486;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=15;WE=35783820;WS=35783802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	35818739	rs72377203	TTGTGTG	T,TTGTG	525.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=6.232;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.447;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.083;SOR=2.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,11,9:0.52,0.43:21
chr17	35825459	rs142934801	TA	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=5.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.044;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr17	35898342	rs2074409	G	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.026;SC=TAACTTGAGAGATCTAGCTTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=35898350;WS=35898332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	35899141	rs1034686	T	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=534;ReadPosRankSum=0.270;SC=AGCCTCACCTTAGATGCATGA;SOR=0.569;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=32;WE=35899149;WS=35899131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr17	35902225	rs3110623	C	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=592;ReadPosRankSum=-1.149;SC=AACATTCGTTCGGGGTTTCTT;SOR=0.682;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=36;WE=35902233;WS=35902215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr17	35936594	rs11654048	T	C	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.707;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=662;ReadPosRankSum=-1.291;SC=TGGTTTTTTATAAAGAGCACT;SOR=1.552;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=30;WE=35936602;WS=35936584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr17	35956263	rs4795207	T	C	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=41;PP=2965;SC=ACTAAAGAAGTAAGTACCTGC;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=98;TCR=41;TR=139;WE=35956271;WS=35956253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	35984410	rs7216445	T	C	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=35;PP=1161;SC=AGTTCTCTCATGGCCAGAAGT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=35984418;WS=35984400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	35988672	rs7224513	C	T	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=45;NR=62;PP=2246;SC=TCATGTGTATCCTGAATCCTG;SOR=1.016;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=107;WE=35988680;WS=35988662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	35995638	rs4622555	T	A	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=809;SC=CATTCACCTGTTGAGGGACAT;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=35995646;WS=35995628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	36003275	rs3813911	T	A	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=969;SC=CGGGTGTCCATGTGCGCCGGC;SOR=3.611;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=39;WE=36003283;WS=36003265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	36003359	rs3813910	A	G	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=46;PP=2965;SC=CTTGGGCACAATACCTGGAAT;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=124;TCR=46;TR=170;WE=36003367;WS=36003349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	36047275	rs1800929	C	T	6202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=57;PP=2965;SC=TCGCAGGTGCCGGTCAGGTCA;SOR=1.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=138;TCR=57;TR=195;WE=36047283;WS=36047265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr17	36047417	rs3110641	A	G	6144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GAGGAGAGAGAGTGCTCAGCT;SOR=0.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=68;TCR=125;TR=192;WE=36047425;WS=36047407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,220:1.00:221
chr17	36058980	rs2269843	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr17	36059385	rs12938438	C	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ATAACCAACTCCCGAAAGCAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=36059393;WS=36059375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr17	36061297	rs2074429	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=-2.683;SC=GCCTGTTACACAGGAGATTCC;SOR=0.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=36061305;WS=36061287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	36233930	rs2677184	G	A	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.935;NF=29;NR=55;PP=1423;ReadPosRankSum=0.139;SC=CATGGGCCCAGCCTAAAAATA;SOR=1.078;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=84;WE=36233938;WS=36233920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,102:0.51:201
chr17	36234106	rs2677185	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ACCACTACTAGAAAAAGCATT;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=36234114;WS=36234096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	36352408	rs11407739	G	GT	818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-3.581;NF=25;NR=19;PP=465;ReadPosRankSum=0.592;SC=AATACTTAAAGTTTTTTTTTT;SOR=0.657;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=44;WE=36352416;WS=36352398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,43:0.30:144
chr17	36352489	rs4796259	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQRankSum=-0.164;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,29:0.17:168
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chr17	36353761	rs62074778	C	T	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.079;NF=28;NR=84;PP=1913;ReadPosRankSum=0.269;SC=ATGAGTCCACCATTCCTAAAA;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=215;TCF=53;TCR=162;TR=112;WE=36353769;WS=36353751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr17	36357295	rs79239780	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.627;NF=4;NR=31;PP=708;ReadPosRankSum=1.864;SC=AAAAAAAAAAAAGAAACAAAT;SOR=1.064;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=84;TCF=13;TCR=71;TR=35;WE=36357303;WS=36357285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr17	36357835	rs1848308	G	A	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.244;NF=35;NR=62;PP=1592;ReadPosRankSum=0.399;SC=ATAAATAGCTGTGAAACTACT;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=64;TCR=115;TR=97;WE=36357843;WS=36357825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,119:0.54:219
chr17	36358847	rs77355093	T	A	9706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.478;NF=243;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=1.390;SC=TTTACCTCTATTGCAAATTTT;SOR=0.478;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=498;TCF=349;TCR=149;TR=356;WE=36358855;WS=36358837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,399:0.70:568
chr17	36361992	rs201942294	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.49;MQRankSum=-3.394;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,22:0.17:128
chr17	36384810	rs142086381	A	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=508;ReadPosRankSum=0.071;SC=GTGAGACTCTATCTCTATTAG;SOR=0.376;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=34;WE=36384818;WS=36384800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr17	36384868	rs71252892	C	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.309;NF=24;NR=19;PP=644;ReadPosRankSum=1.868;SC=ATGACCCCCTCCTTTGGGCTT;SOR=0.558;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=43;WE=36384876;WS=36384858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr17	36398125	.	GTCTC	G	2990	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=27;MQ=55.01;NF=43;NR=32;PP=2990;QD=20;SC=ACCTGAAAATGTCTCTCTCTC;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=75;WE=36398136;WS=36398115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:75,75:0.50:150
chr17	36398156	rs147730015	ACACACACACC	A	2344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-2.997;QD=10.33;ReadPosRankSum=4.413;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,85:0.37:227
chr17	36485772	rs138451517	T	C	3252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=63;PP=2285;ReadPosRankSum=0.360;SC=GAGGCCAGCTTTGGGCAGTTC;SOR=0.445;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=231;TCF=123;TCR=108;TR=126;WE=36485780;WS=36485762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,141:0.56:252
chr17	36493644	rs111839663	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=-0.715;SC=ATGTGGGGCTTTCTCTGGAAG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=52;WE=36493652;WS=36493634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr17	36508385	rs41377745	T	C	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.672;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=1147;ReadPosRankSum=3.408;SC=GTCCGTGTCCTCCTCAGCCGC;SOR=0.988;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=70;WE=36508393;WS=36508375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,86:0.53:162
chr17	36614524	rs16965349	G	A	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CCGGCTCGCCGCTGCCCTGGT;SOR=0.813;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=83;TCR=110;TR=79;WE=36614532;WS=36614514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,90:0.40:223
chr17	36614563	rs16965350	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=848;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GGGAGGGAGACTCTTTTGTGC;SOR=0.835;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=54;WE=36614571;WS=36614553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,58:0.36:159
chr17	36617210	rs9898977	A	G	5264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=67;PP=2965;SC=GGACCTGCACAGGACTCCTCT;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=157;WE=36617218;WS=36617200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr17	36619455	rs58915644	C	T	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.119;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TCCCTGACCCCTCGTCCCATA;SOR=1.006;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=89;WE=36619463;WS=36619445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr17	36622482	rs8075324	G	C	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.639;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1386;ReadPosRankSum=1.726;SC=CAGAGCCACCGCCGATCTGCT;SOR=0.336;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=91;WE=36622490;WS=36622472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,112:0.59:190
chr17	36638179	rs144390029	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQRankSum=-2.744;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.574;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr17	36638255	rs7503829	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.457;NF=15;NR=13;PP=413;ReadPosRankSum=0.964;SC=CTGTCTCCCCCACTTCAGATG;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=28;WE=36638263;WS=36638245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr17	36638388	rs11867891	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.713;NF=5;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GAACCAGGTGAGTCTCTGCCA;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=12;WE=36638396;WS=36638378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr17	36638695	rs139165577	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.028;NF=6;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-1.608;SC=GCCTTGCATTGTCCCCTTCTT;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=9;WE=36638703;WS=36638685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr17	36642473	rs71138626	CT	C	58.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.242;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	36646291	rs12937928	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=54;PP=2510;SC=GGCCGGGAGAACAGGGGAAGG;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=36646299;WS=36646281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	36646386	rs9891156	A	G	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=40;NR=70;PP=2158;SC=TTGAGGACGCACGGGAGCGAA;SOR=1.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=110;WE=36646394;WS=36646376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	36666551	rs62074752	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=624;ReadPosRankSum=0.396;SC=GGGCGGGGGATGAGGCGGACG;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=56;WE=36666559;WS=36666541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,69:0.35:199
chr17	36718610	rs6503709	T	A	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=78;PP=2402;ReadPosRankSum=1.933;SC=GTCACCAAGGTCACCCCTGTC;SOR=0.426;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=128;WE=36718618;WS=36718600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr17	36734700	rs7503695	T	C	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=17;PP=1486;SC=CCGCTGGCCGTGGCCGCAGCC;SOR=2.129;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=67;WE=36734719;WS=36734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	36734706	rs144253512	CAGCCGG	C	3172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=21;PP=2682;SC=GCCGTGGCCGCAGCCGGAGCC;SOR=1.949;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=52;WE=36734719;WS=36734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	36830459	rs111565436	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=0.173;SC=AGGAACGCCGGGCCGCCCGGT;SOR=1.407;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=24;WE=36830467;WS=36830449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,23:0.32:72
chr17	36830562	rs79676758	G	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=975;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CGCGCCGCCAGCTCCCCAGGC;SOR=0.502;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=60;WE=36830570;WS=36830552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr17	36861983	rs17855918	T	C	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.800;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,100:0.96:104
chr17	36863026	rs2075054	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TGTGGTTGAAGGCTGGTGTTG;SOR=1.385;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=14;WE=36863034;WS=36863016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr17	36875827	rs62620198	T	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=718;ReadPosRankSum=0.121;SC=CAGGAGAGTCTGTCTTCCATG;SOR=0.436;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=49;WE=36875835;WS=36875817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr17	36886720	rs11652810	C	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=2.307;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr17	36886828	rs11658500	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TCCCTGCCAGGACCTCCGCAG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=58;WE=36886836;WS=36886818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,61:0.65:94
chr17	36889466	rs5820264	G	GCCTGC	1585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.581;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=2013;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AGCTCCTGCAGCCTGCCCTGC;SOR=1.846;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=39;WE=36889474;WS=36889456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr17	36889483	.	C	CTGCCA	954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.47;NF=30;NR=9;PP=954;QD=24.9487179487;SC=CTGCCCTGCCCCAGCAGGTGG;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=39;WE=36889491;WS=36889473;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr17	36889559	rs2879097	C	T	4353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.151;NF=94;NR=82;PP=2692;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CTTCTTCCAACGCACTGGCCT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=307;TCF=166;TCR=141;TR=176;WE=36889567;WS=36889549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,203:0.57:357
chr17	36896751	rs56171152	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=0.312;SC=GGTGGTTCACGCCTGTAATCC;SOR=0.204;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=36896759;WS=36896741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr17	36909061	rs228274	A	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=670;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CGATCGAGGGATCCTAGTACA;SOR=0.771;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=40;WE=36909069;WS=36909051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr17	36927690	rs25540	C	CTAAG	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=1.117;SC=CGCGAGCTCTCTCTAATGGGG;SOR=0.074;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=36927698;WS=36927680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr17	36932200	rs228293	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGCAAAATAACAGAGTCACAA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=12;WE=36932208;WS=36932190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr17	36934124	rs2075061	C	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=924;SC=ACTGTTCTGCCGGGAGCAACT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=36934132;WS=36934114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	36934475	rs7207178	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=408;ReadPosRankSum=1.692;SC=TGTTGACAGACGGCATGTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=23;WE=36934483;WS=36934465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr17	36959002	rs139189793	G	A	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=971;ReadPosRankSum=-2.024;SC=CTCTGCTCCCGTTCCTCATCC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=92;TCR=61;TR=69;WE=36959010;WS=36958992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,75:0.45:166
chr17	36993655	rs645686	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=0.409;SC=CCAGACCGGGTGCAGTGGCTC;SOR=1.697;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=20;WE=36993663;WS=36993645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr17	37009072	rs1239179	C	T	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=56;PP=2568;SC=ACTTCCAAAGCCCCTCCCTCC;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=37009080;WS=37009062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr17	37010150	rs923370	G	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=662;SC=TGGGAGTTGAGGTAGAAGCGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=37010158;WS=37010140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	37055077	rs17590541	G	A	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1234;ReadPosRankSum=0.393;SC=GGGTATCGGTGAAGACTGCAT;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=55;TCR=84;TR=82;WE=37055085;WS=37055066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,92:0.57:161
chr17	37070658	rs525989	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=250;ReadPosRankSum=2.979;SC=GTCGGGATTCACAGGACGGCA;SOR=1.244;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=14;WE=37070666;WS=37070648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr17	37070737	rs525767	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=102;ReadPosRankSum=-1.408;SC=GGGTGAGTGCAGGTCCTGTTG;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=37070745;WS=37070727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	37071189	rs2241009	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=421;ReadPosRankSum=-1.208;SC=GGGCTTGAGCCAGGTTGGGGG;SOR=0.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=31;WE=37071197;WS=37071179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr17	37075286	rs144614922	A	AGGGCGAGGCCCGTGG	8539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.507;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=-0.042;NF=13;NR=129;PP=2900;ReadPosRankSum=1.257;SC=TCTCTGGGGGAGGCAGGGCTG;SOR=2.253;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=250;TCF=17;TCR=233;TR=142;WE=37075294;WS=37075276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,287:0.99:289
chr17	37076331	rs646097	G	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=1021;SC=ATCTCTGAGTGGAGGAAGCCC;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=37076339;WS=37076321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	37101380	rs9906595	T	C	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=101;PP=2795;SC=CTCCAGTTTTTGGGCACTTCC;SOR=1.464;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=49;TCR=101;TR=150;WE=37101388;WS=37101370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	37111043	.	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=-1.167;SC=AAAAGAGAGATTGGATATTCT;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=15;WE=37111051;WS=37111033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr17	37224288	rs4405583	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=187;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GAGCGACAGAGCCAACCAAGA;SOR=0.148;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=37224296;WS=37224278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr17	37228765	rs9907595	A	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=34;PP=1277;SC=CAGAAGGAGCAAGATTAGTGG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=37228773;WS=37228755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	37234111	rs3744078	G	A	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=959;SC=CCAGAGGGGTGGGTAGCTCTC;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=37234119;WS=37234101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	37239671	rs9891236	A	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=20;PP=1116;SC=TCCCCTCCACAGTCGGCCAGT;SOR=1.457;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=37239679;WS=37239661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	37243927	rs12602945	A	G	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CTATGCGGTGATATTCAAAGA;SOR=0.789;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=76;WE=37243935;WS=37243917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,102:0.50:202
chr17	37244004	rs12600774	G	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=831;ReadPosRankSum=-0.971;SC=CAGGCAGAGGGCATCGAGGCC;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=52;WE=37244012;WS=37243994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,66:0.53:125
chr17	37253064	rs4795348	T	G	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1560;ReadPosRankSum=-1.357;SC=AAGAGTTTCTTAAGCAAATGA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=103;TCR=62;TR=88;WE=37253072;WS=37253054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,96:0.51:188
chr17	37253316	rs4795349	G	A	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=881;ReadPosRankSum=-2.506;SC=GAGGCTGTGAGGAGTCCTCCC;SOR=0.448;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=49;WE=37253324;WS=37253306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr17	37264070	rs145472069	TCTC	T	865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.159;NF=1;NR=16;PP=652;ReadPosRankSum=0.165;SC=GAATGTCTGTTCTCCTGGATT;SOR=2.391;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=17;WE=37264080;WS=37264060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr17	37265378	rs16490	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=427;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCATGGGAACCCCTGGAAGG;SOR=0.398;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=24;WE=37265386;WS=37265368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr17	37307816	rs188501857	C	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=0.908;SC=GAGGAGACGGCGGAGCGCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=37307824;WS=37307806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	37308644	rs535337	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-1.403;SC=ATGGCTCACCCCACCTGTCAC;SOR=0.646;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=37308652;WS=37308634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	37316988	rs16522	T	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=474;ReadPosRankSum=1.263;SC=TGAAGCATCCTGTAGAGCCTG;SOR=0.299;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=33;WE=37316996;WS=37316978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr17	37317672	rs511163	C	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=717;SC=TGCCCTCTTTCTTTCCCCACT;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=37317680;WS=37317662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	37319029	rs544198	T	G	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=779;ReadPosRankSum=-1.600;SC=ATGTCCCACATGAAGAAGTGG;SOR=0.972;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=47;WE=37319037;WS=37319019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr17	37319065	rs657672	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=425;ReadPosRankSum=1.315;SC=ATCTCCTCCACGTTGCTGCCA;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=32;WE=37319073;WS=37319055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr17	37319103	rs657723	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=0.455;SC=GACCACCTCATTGGTCAAGCT;SOR=0.435;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=19;WE=37319111;WS=37319093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr17	37321538	rs520054	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr17	37321961	rs593772	C	T	5408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.907;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.227;NF=110;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.469;SC=CCCTGTGCGCCCCTTACCCTG;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=322;TCF=190;TCR=132;TR=192;WE=37321969;WS=37321951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,237:0.60:393
chr17	37322080	rs16527	T	C	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=81;PP=2108;ReadPosRankSum=0.070;SC=GGCCCTGGTATTCGGAGCTCC;SOR=0.382;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=185;TCF=47;TCR=138;TR=114;WE=37322088;WS=37322070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,127:0.62:206
chr17	37332036	rs529955	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=573;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CTGGCTCTAGAGGAGGGGCCC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=30;WE=37332044;WS=37332026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr17	37334426	rs186559351	A	T	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-5.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr17	37334427	rs200040112	G	GT	1674.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr17	37334429	rs115149510	C	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=6.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.783;SOR=0.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr17	37349655	rs16531	T	C	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=1425;ReadPosRankSum=-1.440;SC=TCAGCTTTCCTGAGAGGCTGT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=124;TCR=128;TR=114;WE=37349663;WS=37349645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,140:0.45:308
chr17	37349710	rs16532	C	G	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=110;PP=2965;SC=ACCACCACCACGGTCCGGCTG;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=55;TCR=110;TR=165;WE=37349718;WS=37349700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
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chr17	37351403	rs2240083	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=300;SC=CCCATCCTCACGGAGAGGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=37351411;WS=37351393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	37368414	rs16545	G	A	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=535;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCTAAGCCACGGTAAGTGGCA;SOR=0.825;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=75;TCR=16;TR=33;WE=37368422;WS=37368404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,36:0.35:103
chr17	37369416	rs1859262	G	A	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=66;PP=1940;SC=GAACACCCGCGCCACACCCCA;SOR=1.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=37369424;WS=37369406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	37371141	rs8070891	G	C	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=923;ReadPosRankSum=-0.899;SC=GAAAGGGTGAGAGGCAGCAGG;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=106;TCR=68;TR=64;WE=37371149;WS=37371131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,75:0.38:199
chr17	37371519	rs11078892	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=41;PP=1275;SC=TGGCTCTGCCTCAAAGCCCTG;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=37371527;WS=37371509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	37396201	rs34473775	G	T	7117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=111;PP=2965;SC=TCTGGCTCAGGAGTCCTTGTG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=101;TCR=111;TR=212;WE=37396209;WS=37396191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr17	37399364	rs2338795	T	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=672;SC=GGCTGACAGGTGGCAGGCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=37399372;WS=37399354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	37399379	rs2879258	G	T	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=12;PP=809;SC=GGCGGGTAACGGGTTTTGGGT;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=37399387;WS=37399369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	37401051	rs11078895	A	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=10;PP=557;SC=GTTCCTCACCACCATTCGCTC;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=37401059;WS=37401041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	37410700	rs752314	C	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=574;SC=TATGTCTGGACACCTCTCTTC;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=37410708;WS=37410699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	37410892	rs2879259	C	G	8289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=106;PP=2965;SC=AAAAGGGGTGCAGTTGATCAG;SOR=0.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=138;TCR=106;TR=244;WE=37410909;WS=37410882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr17	37417575	rs3744348	C	G	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=881;SC=ATGTGTGGCTCTGGGGATCTG;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=37417583;WS=37417565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	37421767	rs2061338	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=468;SC=GAGTCATACCTGATTCTTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=37421775;WS=37421757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	37425238	rs1966916	T	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=309;SC=AATTCTTTGGTGTTTCAGAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=37425246;WS=37425228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	37425262	rs1966915	A	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=199;SC=TGTCATGCTAATTTTTTTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=37425270;WS=37425252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	37580203	rs7405667	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=10;PP=258;SC=TGGCGTGATCTTGGCTCACTG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=37580211;WS=37580193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	37587534	rs35691977	CT	C	740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=-0.198;NF=0;NR=34;PP=461;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GAAGTCTTGTCTTTTTTTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=34;WE=37587542;WS=37587523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr17	37657460	rs11406230	C	CT	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=3;PP=806;SC=TTTCAGCATTCTTTTTTTTTT;SOR=5.235;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=41;WE=37657468;WS=37657450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	37671910	rs8070799	G	A	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=6;PP=1157;SC=TATCAATAATGTAAAAATTTT;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=37671918;WS=37671900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	37673920	rs2303315	T	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GGCAACACAGTGTAGGAAAAC;SOR=0.127;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=14;WE=37673928;WS=37673910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr17	37783787	rs3751903	C	G	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=59;PP=1823;SC=GCTTCTTCGCCCTCCCAAGGC;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=86;WE=37783795;WS=37783777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	37814080	rs1877031	G	A	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1508;ReadPosRankSum=0.009;SC=GCCGTGCTGCGGCTCCGGCAC;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=89;WE=37814088;WS=37814070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,115:0.41:283
chr17	37815899	rs11658786	G	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=50;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.938;SC=AAGATTACATGGGTTGGAGCC;SOR=0.779;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=49;TCR=134;TR=65;WE=37815907;WS=37815889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,80:0.39:207
chr17	37816842	rs62077536	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=717;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TCAGTGGGATCACTGAAGCAC;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=49;WE=37816850;WS=37816832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr17	37822311	rs1053651	A	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.424;SC=AGCCCGGTGCACTTCGTCGCT;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=192;TCF=89;TCR=103;TR=73;WE=37822319;WS=37822301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,92:0.39:238
chr17	37829129	rs2247862	A	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=721;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GCTGTGGGCCAAAGGAGTAGC;SOR=1.394;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=38;WE=37829137;WS=37829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr17	37830447	rs2934956	T	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=0.062;SC=CTGAGTCTTGTGTTCACATCA;SOR=0.512;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=11;WE=37830455;WS=37830437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
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chr17	37879588	rs1136201	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=745;ReadPosRankSum=0.627;SC=GACGTCCATCATCTCTGCGGT;SOR=0.814;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=89;TCR=34;TR=56;WE=37879596;WS=37879578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr17	37879762	rs903506	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=961;ReadPosRankSum=0.526;SC=ACCGGCCCCCGGCACTGACCC;SOR=0.929;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=57;WE=37879770;WS=37879752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,58:0.35:165
chr17	37884037	rs1058808	C	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=709;ReadPosRankSum=2.108;SC=TCTGGAAAGGCCCAAGACTCT;SOR=1.089;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=47;WE=37884045;WS=37884027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,54:0.38:143
chr17	37898543	rs2952142	T	C	6896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=101;PP=2965;SC=GCCCCTCTCTTGCTCAGACGC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=105;TCR=101;TR=206;WE=37898551;WS=37898533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr17	37921899	rs2952141	C	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=468;SC=ACAGTGTTTCCCTGGCTACCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=37921907;WS=37921889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	38068514	rs1011082	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=313;SC=CTGCCACCCTTGAATCCCTTG;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=38068522;WS=38068504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	38097674	rs75270719	C	A	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.823;NF=45;NR=21;PP=1068;ReadPosRankSum=0.026;SC=CCACACACACCCCATTTTTAT;SOR=0.639;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=139;TCF=98;TCR=41;TR=66;WE=38097682;WS=38097664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,63:0.41:153
chr17	38100134	rs4795406	G	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=33;PP=1862;SC=TGGCAGTGGGGCATGCGATTC;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=38100142;WS=38100124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	38100673	rs72832968	C	G	6275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CCAGGAAGTGCTCCGGCAGGT;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=419;TCF=174;TCR=245;TR=229;WE=38100681;WS=38100663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,287:0.56:509
chr17	38121993	rs3894194	G	A	10949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=175;NR=164;PP=2965;SC=CTAAACCCTCGAGGGGACCTG;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=340;TCF=176;TCR=164;TR=339;WE=38122001;WS=38121983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr17	38126911	rs10531136	AACACACAC	A	1388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.415;NF=1;NR=27;PP=1367;ReadPosRankSum=1.494;SC=GTTTGATTCAAACACACACAC;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=28;WE=38126928;WS=38126901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr17	38127713	rs3916061	A	G	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=32;PP=1549;SC=CCCCCAACTCACGCTCCCAAT;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=81;WE=38127721;WS=38127703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	38128584	rs5820314	A	AG	783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=8;PP=756;SC=CCTCAACTTTAGAAAGACAGA;SOR=0.874;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=17;WE=38128592;WS=38128574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	38128601	rs72832993	C	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=0.709;SC=CAGATAGAGGCATATAAATAC;SOR=0.358;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=9;WE=38128609;WS=38128595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr17	38128648	rs3859192	C	T	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=9;PP=1755;SC=AGACAGAGACCGGAAGGCACA;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=68;WE=38128656;WS=38128638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	38128714	rs3859191	G	A	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=47;PP=2965;SC=CATGGGGGTGGATGAGCTAGC;SOR=1.427;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=96;TCR=47;TR=143;WE=38128722;WS=38128704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	38129996	rs60137005	A	T	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=52;PP=2253;SC=TAGTGTCTCAACCCCTGGGTA;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=123;WE=38130004;WS=38129986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	38130139	rs56326707	C	T	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=66;PP=2133;SC=GCATTAGGGGCAGAGAGAGGA;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=109;WE=38130147;WS=38130129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	38130492	rs62066853	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=521;ReadPosRankSum=1.711;SC=AGGTGCCCGATGGAGGGCTGT;SOR=0.500;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=39;WE=38130500;WS=38130482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr17	38131187	rs56030650	C	A	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=56;PP=2136;SC=CATGAAGTGACCCTGGAGGCA;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=38131195;WS=38131177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	38140524	rs3816471	T	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=13;PP=872;SC=AGTGACATCATTTTCTTCTCT;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=38140532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr17	38142978	rs3859188	C	T	4077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=97;PP=2265;ReadPosRankSum=-1.981;SC=ATCCAGGATGCAGTGAGAGCG;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=90;TCR=162;TR=150;WE=38142986;WS=38142968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,184:0.63:293
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chr17	38145828	rs57968500	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=0.322;SC=CGCACCCAGAATAGTGCTGTA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=38145836;WS=38145824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr17	38146263	rs3217173	GA	G	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.138;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=510;ReadPosRankSum=-1.323;SC=TGGTGCATAAGAGGCCCATTT;SOR=0.306;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=16;WE=38146271;WS=38146253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr17	38153554	rs2241244	G	C	3352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=40;PP=2181;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TCCTTCCCTCGCTCATCTCCT;SOR=0.848;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=204;TCF=138;TCR=66;TR=128;WE=38153562;WS=38153544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,146:0.63:233
chr17	38153714	rs10671123	T	TGA	8882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=97;PP=2957;SC=CTGGAAGGGCTGAGCTGCTCT;SOR=0.916;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=149;TCF=38;TCR=111;TR=133;WE=38153722;WS=38153704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr17	38153875	rs7021	T	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=502;ReadPosRankSum=1.565;SC=GGGGACAGGCTCTTTCCCCCT;SOR=0.516;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=31;WE=38153883;WS=38153865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr17	38171668	rs2227322	C	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=657;ReadPosRankSum=0.472;SC=TGTATAAAGGCCCCCCTAGAG;SOR=0.722;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=36;WE=38171676;WS=38171658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr17	38172192	rs2227324	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=357;SC=TGGAAGGGACGTGGGAGAATA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=38172200;WS=38172182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	38172305	rs2071369	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=133;SC=GTGGAGGCATTACATTCAGGA;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=38172313;WS=38172301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	38172452	rs2071370	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=12;PP=497;SC=GACCCGGCCATGGCGAGTCTC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=38172460;WS=38172442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	38172942	rs2227338	A	G	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=55;PP=1555;SC=CACCACAGCCAGGCCTGTGTA;SOR=4.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=58;WE=38172950;WS=38172932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	38175866	rs11555254	G	A	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=28;PP=1281;ReadPosRankSum=-1.508;SC=CCTTGGGGCTGGACATGGCTG;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=78;WE=38175874;WS=38175856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,95:0.62:154
chr17	38176476	rs9899955	A	G	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=12;PP=1647;SC=ATGAGAAGAGAGACTCGTCCA;SOR=2.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=38176484;WS=38176466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	38178627	rs3213762	A	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=983;ReadPosRankSum=0.699;SC=GAAGCCGGCGAGGGCAGCTGG;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=117;TCR=113;TR=81;WE=38178635;WS=38178617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,96:0.34:284
chr17	38179290	rs4794824	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=205;ReadPosRankSum=-1.506;SC=CCTGGCTCACGGCAGCCTCTC;SOR=0.257;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=16;WE=38179298;WS=38179280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr17	38179667	rs2302778	A	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=658;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GGGCCGAGAGAACCTGAGGCT;SOR=0.824;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=40;WE=38179675;WS=38179657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr17	38182844	rs2302775	T	C	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=569;ReadPosRankSum=1.909;SC=TAACAAGTCATCACTGGCTGG;SOR=0.446;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=26;WE=38182852;WS=38182834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr17	38184360	rs117331478	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-2.297;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr17	38186106	rs11555255	C	T	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1340;ReadPosRankSum=-1.432;SC=GCTCTCGGTCCGCTTTGCTGT;SOR=0.554;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=49;TCR=79;TR=81;WE=38186114;WS=38186096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,90:0.60:149
chr17	38188844	rs7502514	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CCAGGGTGCCACTGGTCTTGC;SOR=1.022;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=38188852;WS=38188834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	38189055	rs3935280	A	G	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.271;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=59;PP=1547;ReadPosRankSum=-2.279;SC=GAGGGTGCCCATACCCCGTCA;SOR=0.929;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=97;WE=38189063;WS=38189045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,117:0.59:199
chr17	38189793	rs11078934	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=571;ReadPosRankSum=2.303;SC=ATTTTGGCACTCCCTCCGGCA;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=32;WE=38189801;WS=38189783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr17	38191924	rs6503534	A	G	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1186;ReadPosRankSum=0.528;SC=ACCTCTGCACAAAGACAAGGC;SOR=0.633;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=77;WE=38191932;WS=38191914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,92:0.61:150
chr17	38210057	rs8070452	C	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=5;PP=232;SC=CAGACTCTCTCCTCCTGAACC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=38210065;WS=38210047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr17	38244409	rs36088892	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=451;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TTGCGGGCCTCACGGCTCCCG;SOR=1.418;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=22;WE=38244417;WS=38244399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr17	38245432	rs34996814	G	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=11;PP=1030;ReadPosRankSum=0.735;SC=CCAGCCCCTCGCCCCTCACGC;SOR=0.745;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=154;TCF=123;TCR=31;TR=62;WE=38245440;WS=38245422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,70:0.41:172
chr17	38245791	rs12939700	C	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.191;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=463;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TGAGGGAGACCCCCCCACACC;SOR=0.216;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=28;WE=38245799;WS=38245781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr17	38252582	.	G	GT	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=600;ReadPosRankSum=-1.344;SC=GACATCCCCTGGCACATGTGA;SOR=1.259;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=17;WE=38252590;WS=38252572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr17	38252667	rs939346	G	A	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=43;PP=2348;SC=GGCGGAAGAAGGGGGGAGGAT;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=109;WE=38252675;WS=38252657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	38253228	rs2102928	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=13;PP=866;SC=CCAGAATAGGTCCTGGCAAGA;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=38253236;WS=38253218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	38324766	rs11327454	AT	A	795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=698;SC=TTGAGAGAACATTTTCAGTGC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=38324774;WS=38324756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	38334359	rs66989091	A	AG	1602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=13;PP=1302;SC=CCGCCCCCTGAGAGGAAGGAG;SOR=1.455;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=38334367;WS=38334349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	38519291	rs502041	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=395;ReadPosRankSum=0.518;SC=GCGGGGCGCACGGCTCGGGGC;SOR=1.077;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=23;WE=38519299;WS=38519281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr17	38556770	rs471692	T	C	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=58;PP=2466;ReadPosRankSum=-1.520;SC=AAGAAATCCATAATTATTTAC;SOR=0.806;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=214;TCF=120;TCR=94;TR=137;WE=38556778;WS=38556760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,145:0.61:239
chr17	38563710	rs558068	C	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=200;ReadPosRankSum=0.889;SC=TCCTATTTAACTAATTTATTT;SOR=0.126;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=38563718;WS=38563700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	38566396	rs2715548	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=399;SC=GGATAAGCAAGAAGTTTGCTA;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=38566404;WS=38566386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	38572366	rs2586112	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=0.781;SC=AGTGTTTTAAGAAACATTCTG;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=38572374;WS=38572356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	38600092	rs598892	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-1.550;SC=AGGAGAAGCTGGCGCGCTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=9;WE=38600100;WS=38600082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	38609431	rs5820347	G	GAC	1512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.441;NF=2;NR=30;PP=1527;ReadPosRankSum=0.297;SC=CATGTGCATAGACACACACAC;SOR=1.057;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=32;WE=38609439;WS=38609421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr17	38634367	rs9895505	G	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=-1.586;SC=GGGCTCCCAGGCTCATGTCAC;SOR=0.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=38634375;WS=38634359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	38634383	rs8072052	A	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=1.549;SC=GTCACCCCCAACAGCCCAGAG;SOR=0.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=5;WE=38634391;WS=38634373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	38634929	rs749906	C	T	3756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=84;PP=2371;ReadPosRankSum=-1.435;SC=AGAAGGGAAGCGATGACAGCC;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=260;TCF=115;TCR=145;TR=146;WE=38634937;WS=38634919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,173:0.55:317
chr17	38635064	rs749907	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=515;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GGGGCCCTGGCGCCCCGCTCC;SOR=0.887;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=33;WE=38635072;WS=38635054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr17	38635107	rs749908	C	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TTGTCTGCCTCTGTCTTACAC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=38635115;WS=38635097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr17	38635897	rs8076413	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.851;SC=CGCCAGCCCCGGAGCCCCAGG;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=61;WE=38635905;WS=38635887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,64:0.62:103
chr17	38643780	rs3764423	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=237;ReadPosRankSum=1.107;SC=GTCAGGCTCCGGATCTGGTGA;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=38643788;WS=38643770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr17	38652220	rs78581969	C	T	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1494;ReadPosRankSum=0.911;SC=CCTCCTGGTACTGTGCCCCAA;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=89;WE=38652228;WS=38652210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,99:0.53:187
chr17	38786451	rs4890092	A	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=325;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TATTATTATTATTTTTTACCT;SOR=1.501;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=19;WE=38786459;WS=38786441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr17	38786874	.	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=990;ReadPosRankSum=-0.954;SC=GTGGCAGGTACCAGAATACTT;SOR=0.512;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=176;TCF=119;TCR=57;TR=69;WE=38786882;WS=38786864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,75:0.40:186
chr17	38802021	rs180819792	T	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=506;ReadPosRankSum=-2.773;SC=TTAACATAGATTGATAAATAT;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=29;WE=38802029;WS=38802011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr17	38813824	rs8068721	G	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=599;SC=TTCAAATATTGCTTGTTTTTT;SOR=2.124;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=24;WE=38813836;WS=38813814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	38813828	rs11412331	G	GT	627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=433;SC=AATATTGCTTGTTTTTTTTCG;SOR=3.258;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=18;WE=38813836;WS=38813814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	38816526	rs917593	A	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=16;PP=427;SC=CTGATTTGCAATATCTTCATC;SOR=1.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=26;WE=38816534;WS=38816516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	38855772	rs2462961	T	C	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1149;ReadPosRankSum=1.832;SC=AGCAATTGCTTGTACTCTGCG;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=78;WE=38855780;WS=38855762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr17	38856662	rs887376	T	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=580;ReadPosRankSum=0.189;SC=AAGACTATCGTGATGCAAACA;SOR=0.653;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=48;WE=38856670;WS=38856652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,63:0.64:98
chr17	38857446	rs874889	C	A	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.271;NF=55;NR=58;PP=1617;ReadPosRankSum=0.070;SC=TCTCAATCTGCATCTCCAGGT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=97;TCR=102;TR=113;WE=38857454;WS=38857436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,158:0.61:257
chr17	38857977	.	A	G	218.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr17	38858029	rs6416908	A	T	242.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr17	38858134	rs11309872	CA	C	4645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.421;NF=55;NR=35;PP=2954;ReadPosRankSum=0.219;SC=GCCAATCTGGCATTGTCAATG;SOR=0.766;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=90;WE=38858142;WS=38858124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,133:0.60:221
chr17	38905477	rs10491127	T	G	3851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=27;PP=2742;ReadPosRankSum=1.069;SC=AAATAAAAAATTAGCATTGCA;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=178;TCR=49;TR=136;WE=38905485;WS=38905467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,154:0.60:258
chr17	38950272	rs2250671	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.090;NF=34;NR=30;PP=746;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TCTCGGTCTCTGTCAAGGAGC;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=92;TCR=83;TR=64;WE=38950280;WS=38950262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,84:0.39:215
chr17	38950293	.	G	C	3076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.001;NF=52;NR=61;PP=1894;ReadPosRankSum=0.308;SC=ACTCCAGGGAGTGTTTCTGAG;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=113;WE=38950301;WS=38950283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,135:0.62:218
chr17	38953540	rs3813038	A	G	12555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=197;NR=185;PP=2965;SC=TCTCCTGGAGAGAAGCAAGAG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=382;TCF=197;TCR=185;TR=382;WE=38953548;WS=38953525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,469:1.00:469
chr17	38954612	rs139807956	C	G	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TCGGCCTCTACGTTTTGGTGA;SOR=1.128;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=75;WE=38954620;WS=38954602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,77:0.41:189
chr17	38954687	rs9914044	C	T	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=62;PP=2165;SC=TAAGACTACCCCAAGAAACAG;SOR=1.236;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=100;WE=38954695;WS=38954677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	38955173	rs7222207	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=460;ReadPosRankSum=-0.448;SC=ACTTACTTTAGCCTGAAATCA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=26;WE=38955181;WS=38955163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr17	38955274	rs7224150	A	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=383;ReadPosRankSum=0.090;SC=AAAACAGAGAACACAACAAGT;SOR=0.861;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=20;WE=38955282;WS=38955264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr17	38975328	rs17855579	G	A	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.101;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;MQRankSum=-4.360;QD=26.26;ReadPosRankSum=1.847;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr17	38976978	rs6503559	C	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=624;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TGTATCTGGGCAGAGACTATT;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=36;WE=38976986;WS=38976968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr17	38976998	rs1799873	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=36;PP=1047;SC=TTAAAAAGCAGCTACATAGTT;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=38977006;WS=38976988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	38977048	rs1799874	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=289;ReadPosRankSum=0.083;SC=TACAGTTCTCTTAGAAGTAAT;SOR=0.154;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=38977056;WS=38977038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	38978462	rs77919366	C	T	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=59;PP=1691;ReadPosRankSum=1.203;SC=CCTCCAAAGCCGCCTCCACCA;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=158;TCF=65;TCR=93;TR=98;WE=38978470;WS=38978452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,110:0.64:173
chr17	38978536	rs4261597	A	C	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=79;NR=80;PP=2965;SC=CCCTCCAAAGATGCCTCCATA;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=159;WE=38978544;WS=38978526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr17	38990834	rs2240078	G	C	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=17;PP=1975;SC=CCAGCTATGTGCCCTCTGTTG;SOR=2.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=64;TCR=17;TR=81;WE=38990842;WS=38990824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	38991032	rs6694	T	A	3905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.180;NF=71;NR=82;PP=2395;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GTGCTTGCGGTCATCGGTTGA;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=277;TCF=124;TCR=153;TR=153;WE=38991040;WS=38991022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,179:0.56:317
chr17	39023381	rs17566772	G	A	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.728;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1289;ReadPosRankSum=0.115;SC=GAGGAGAGCCGCCGGGACAGT;SOR=0.447;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=182;TCF=76;TCR=106;TR=91;WE=39023389;WS=39023371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,103:0.47:217
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chr17	39041052	rs7212483	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=726;ReadPosRankSum=0.153;SC=TCTCACCTGACTTCGCAGCTC;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=48;WE=39041060;WS=39041042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr17	39041309	rs17567558	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=877;ReadPosRankSum=1.369;SC=AGATGCGGATGCCCCGGCCTC;SOR=0.595;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=172;TCF=60;TCR=112;TR=64;WE=39041317;WS=39041299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,68:0.35:196
chr17	39081546	rs2269860	A	G	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8;NR=3;PP=171;SC=AGATGCACACATATACCCACA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=39081554;WS=39081540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	39081713	rs8037	A	G	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=25;PP=1173;SC=GCTCCAGTTCATGGCGTAGCT;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=39081721;WS=39081703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	39084504	rs9257	T	C	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=15;PP=2279;SC=CTGTACTGTGTCTGCAGGTCA;SOR=3.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=90;WE=39084512;WS=39084494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	39114962	rs7213256	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=809;ReadPosRankSum=-0.061;SC=AACCAGTATCCGGGACAGGGG;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=54;WE=39114970;WS=39114952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr17	39118553	rs4890151	C	T	3677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=72;PP=2312;ReadPosRankSum=1.959;SC=AAACACACAGCCAGAGACTGA;SOR=0.496;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=384;TCF=218;TCR=166;TR=152;WE=39118561;WS=39118543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:286,182:0.39:468
chr17	39119942	rs17843020	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GTGCCTCTAGGTCGGCCTTGC;SOR=0.903;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=27;WE=39119950;WS=39119932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr17	39122797	rs10491137	G	A	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=68;PP=2090;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CAAGGCGCTCGTTCAAGATTT;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=333;TCF=178;TCR=155;TR=140;WE=39122805;WS=39122787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,160:0.42:380
chr17	39123131	rs5820378	G	GT	948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.820;NF=1;NR=24;PP=803;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GCTTTAGTTTGTTCCAGGTCT;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=3;TCR=70;TR=25;WE=39123139;WS=39123121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr17	39134455	rs2271277	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=298;ReadPosRankSum=-0.527;SC=ACATTCACAAGCAGCAGTTTT;SOR=0.444;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=21;WE=39134463;WS=39134445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr17	39134528	rs16968862	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,50:0.29:175
chr17	39134561	rs2271278	C	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,61:0.28:217
chr17	39134576	rs2271279	A	C	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.819;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,67:0.29:233
chr17	39134585	rs2271280	G	A	2219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,64:0.28:226
chr17	39134590	rs2271281	G	C	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,65:0.28:231
chr17	39135084	rs8064733	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=0.119;SC=AGCAGGCCCCAGTACGTGTTG;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=20;WE=39135092;WS=39135074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr17	39135205	rs8064910	A	G	3537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.27;ReadPosRankSum=-1.747;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,98:0.40:248
chr17	39135214	rs8068970	T	C	3568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,100:0.40:252
chr17	39135322	rs8068223	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=371;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TGCAGTCTCTCGGGCCAGAGT;SOR=0.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=24;WE=39135330;WS=39135312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr17	39137104	rs9908389	A	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=438;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CAAGATCTCCATCTGGCAGCC;SOR=1.240;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=29;WE=39137112;WS=39137094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr17	39137154	rs721958	C	G	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=20;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.581;SC=GCTGATTCAGCTCTTCTGTCT;SOR=1.097;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=162;TCF=109;TCR=53;TR=71;WE=39137162;WS=39137144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,81:0.43:190
chr17	39137297	rs721957	C	T	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1384;ReadPosRankSum=-2.142;SC=CACCGTTTCACACTGACAGCG;SOR=0.902;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=248;TCF=116;TCR=132;TR=97;WE=39137305;WS=39137287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,115:0.39:298
chr17	39137387	rs2010027	C	T	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.878;SC=AAGCTGTTCACGAAGCAAGTT;SOR=0.757;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=198;TCF=101;TCR=97;TR=67;WE=39137395;WS=39137377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,79:0.37:214
chr17	39137553	rs8074364	T	G	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TTTTCACCACTTAGAAGGGCC;SOR=0.805;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=217;TCF=82;TCR=135;TR=78;WE=39137561;WS=39137543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,95:0.35:270
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chr17	39138476	rs11078973	CG	TA	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=782;ReadPosRankSum=0.854;SC=TGCCCAAATTCGATTTACAAA;SOR=0.749;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=20;WE=39138485;WS=39138466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
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chr17	39139413	rs9910145	C	A	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=613;ReadPosRankSum=-0.125;SC=ATAAATGATTCTTTGAGAGAA;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=71;TCR=116;TR=53;WE=39139421;WS=39139403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,61:0.29:207
chr17	39139430	rs9908522	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=563;ReadPosRankSum=-0.308;SC=AGAAACCTAAGTAAACTTCTA;SOR=0.752;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=47;TCR=107;TR=45;WE=39139438;WS=39139420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,51:0.30:169
chr17	39139961	rs6503570	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=564;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CTATGTATCACTAACTCTTAG;SOR=1.014;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=30;WE=39139969;WS=39139951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr17	39140221	rs1510068	C	T	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1620;ReadPosRankSum=0.586;SC=CTCCAGATAGCTGGCGAGTCT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=236;TCF=127;TCR=109;TR=100;WE=39140229;WS=39140211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,110:0.41:268
chr17	39140417	rs1510069	T	C	2884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.249;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=74;PP=1839;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GTAGCACAGGTACCGGGGAGA;SOR=1.296;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=262;TCF=111;TCR=151;TR=114;WE=39140425;WS=39140407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,135:0.44:308
chr17	39150357	rs1989365	A	G	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1332;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CATGGCTATTAGAGTCTGTGG;SOR=0.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=96;TCR=149;TR=94;WE=39150365;WS=39150347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,109:0.39:282
chr17	39150443	rs2010209	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=321;ReadPosRankSum=0.948;SC=GGGCTCTTATGTACCCTCTCC;SOR=1.808;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=19;WE=39150451;WS=39150433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr17	39156224	rs3813051	C	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=0.053;SC=CAACTGGAAGCCTTCCTGTTT;SOR=0.430;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=21;WE=39156232;WS=39156214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr17	39165174	rs112432710	G	A	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.562;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1462;ReadPosRankSum=0.257;SC=AGGGTGGGGGGCAGGTGTCAC;SOR=0.749;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=203;TCF=102;TCR=101;TR=97;WE=39165182;WS=39165164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,117:0.49:238
chr17	39165358	.	G	GAGA	1482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=1342;ReadPosRankSum=-1.631;SC=GTTGAGTTGAGAGAAGTCTGT;SOR=1.183;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=29;WE=39165366;WS=39165348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr17	39186031	rs8074117	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=165;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CACAGTAGGACGGGCGGCAGC;SOR=0.807;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=16;WE=39186039;WS=39186021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr17	39186168	rs8074887	A	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.884;NF=11;NR=12;PP=380;ReadPosRankSum=-1.815;SC=GTGCTCACAGATCCACCGCTG;SOR=0.641;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=23;WE=39186176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr17	39186220	rs8073323	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.831;NF=20;NR=8;PP=506;ReadPosRankSum=0.454;SC=TGCCACAGCCGGTTCCGCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=28;WE=39186228;WS=39186210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr17	39186382	rs8077277	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=1.897;SC=CTGAGTTTGGGCTGTACCTTC;SOR=0.664;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=30;WE=39186390;WS=39186372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr17	39190954	.	G	GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCA	1547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=2.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-6.646;QD=13.23;ReadPosRankSum=3.228;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,13:0.11:117
chr17	39240426	rs11658607	G	A	4013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.215;NF=115;NR=82;PP=2856;ReadPosRankSum=0.894;SC=CACTCTCTTGGAAACCCACCC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=438;TCF=252;TCR=186;TR=197;WE=39240434;WS=39240416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,207:0.42:492
chr17	39240504	rs11655310	A	G	4131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=13.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQRankSum=-13.449;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,125:0.32:385
chr17	39240511	rs383835	A	T	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=-10.501;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,105:0.29:368
chr17	39240661	rs11650484	C	G	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.654;NF=30;NR=33;PP=1075;ReadPosRankSum=0.214;SC=TGTCGCCCCACCTGCTGTGAG;SOR=0.486;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=168;TCF=73;TCR=95;TR=63;WE=39240669;WS=39240651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,72:0.38:188
chr17	39254335	rs201764113	A	AT	4472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.071;NF=12;NR=73;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.447;SC=GGAGTTGACCATGGTGTCAGA;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=27;TCR=159;TR=85;WE=39254343;WS=39254325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,148:0.46:319
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chr17	39258027	rs7503699	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=39;ReadPosRankSum=0.520;SC=CACAGGTTGGGTGATAGCAAG;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=6;WE=39258035;WS=39258017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
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chr17	39274069	rs349771	G	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.125;NF=13;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.605;SC=CAGGAGACTCGGCCACAGACT;SOR=0.800;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=27;WE=39274077;WS=39274059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,28:0.31:89
chr17	39274518	rs9897031	C	T	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.119;NF=58;NR=56;PP=1826;ReadPosRankSum=0.367;SC=GCAGAGGTCTCGGCCACAGCC;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=114;WE=39274526;WS=39274496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,123:0.44:279
chr17	39305956	rs1497383	G	A	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.95;MQRankSum=-1.254;NF=46;NR=29;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CAGCTGGGGCGGCAGCAGTTC;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=209;TCF=124;TCR=85;TR=75;WE=39305964;WS=39305946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,91:0.39:236
chr17	39333956	rs377518	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=0.131;SC=CACAGGTGGATCATATCAAGA;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=21;WE=39333964;WS=39333946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr17	39334133	rs389784	T	C	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.434;NF=44;NR=41;PP=1357;ReadPosRankSum=1.467;SC=GGGCTGGCAGTACACAGACTG;SOR=0.491;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=85;WE=39334141;WS=39334123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,95:0.59:160
chr17	39334456	rs493514	G	A	3592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.67;MQRankSum=-0.096;NF=36;NR=88;PP=2307;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TTTCCAGGAAGGTGGGTTTGG;SOR=0.991;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=227;TCF=75;TCR=152;TR=124;WE=39334464;WS=39334446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,151:0.55:273
chr17	39340597	rs452216	G	A	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1271;ReadPosRankSum=-1.013;SC=ACATGGACAAGTTGATATAAA;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=82;TCR=46;TR=77;WE=39340605;WS=39340587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,90:0.62:144
chr17	39340707	rs398825	C	T	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.93;MQRankSum=-0.813;NF=49;NR=52;ReadPosRankSum=0.336;SC=CAGCAAGTTGCACGGCAGCAG;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=101;WE=39340715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,118:0.60:198
chr17	39340812	.	T	C	828	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=2;MMLQ=27;MQ=52.41;NF=8;NR=14;SC=CAGCTGGACATACCACAGCTG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=22;WS=39340802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,22:0.45:49
chr17	39340826	.	T	C	828	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=23;MQ=51.99;NF=9;NR=13;PP=828;QD=39.2168732976;SC=ACAGCTGGGGTGGCAGGTGGT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=22;WE=39340834;WS=39340802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:31,22:0.42:53
chr17	39340910	.	T	C	1011	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=59.32;NF=33;NR=30;PP=1011;QD=16.5995430563;SC=ACAGACTGGGTGGCAGCAGCT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=63;WE=39340918;WS=39340900;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:44,63:0.59:107
chr17	39341158	rs452531	G	A	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=54;PP=1448;ReadPosRankSum=-2.954;SC=TGAGTTTTTCGAATGTGGGAA;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=87;WE=39341166;WS=39341148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,101:0.63:161
chr17	39341266	rs449817	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TAGATAGGCAATTATCAAGTT;SOR=1.136;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=15;WE=39341274;WS=39341256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr17	39341294	rs385122	T	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.009;SC=TGTGGGAAAATATCTGTATAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=39341302;WS=39341284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr17	39346518	rs238824	T	C	5206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.256;NF=86;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=0.743;SC=TATCAAACTATCTGCTTCAGG;SOR=0.782;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=322;TCF=150;TCR=172;TR=188;WE=39346566;WS=39346508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,224:0.58:384
chr17	39346595	rs11283848	T	TGCTGTGGGTCCAGCTGCTGCCAGCCTA	1875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=6.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=4.006;QD=9.72;ReadPosRankSum=4.084;SOR=1.178;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,60:0.31:193
chr17	39421968	rs112809229	T	C	3130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.315;NF=70;NR=59;PP=1873;ReadPosRankSum=-0.315;SC=CCTGTGCACCTGTGTACTGCA;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=215;TCF=118;TCR=97;TR=129;WE=39421976;WS=39421958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,142:0.59:240
chr17	39458476	rs1001191	A	T	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=2095;ReadPosRankSum=-1.800;SC=AAAATATAGCAGATGGGTTGA;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=121;WE=39458484;WS=39458466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,142:0.51:276
chr17	39458573	rs144150438	TGTACAGATGGTTG	T	3550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.940;SC=ATGGACTAGCTGTACAGATGG;SOR=0.996;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=119;TCF=23;TCR=96;TR=49;WE=39458593;WS=39458563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,92:0.50:184
chr17	39458893	rs758741	G	A	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=2036;ReadPosRankSum=0.789;SC=GCTGGAAGGCGGGTAGGTTGA;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=114;WE=39458901;WS=39458883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,136:0.57:239
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chr17	39464437	rs72828116	G	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1348;ReadPosRankSum=0.782;SC=CTGCAGGAAAGAGGTCGGCAG;SOR=0.554;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=171;TCF=95;TCR=76;TR=78;WE=39464445;WS=39464427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
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chr17	39464779	rs72828119	T	C	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=37;PP=1620;ReadPosRankSum=-2.504;SC=GCCTGGCAGCTACTGGTCACA;SOR=0.848;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=202;TCF=118;TCR=84;TR=94;WE=39464787;WS=39464769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,108:0.47:232
chr17	39465094	rs12453338	C	T	8144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=633;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GGCTCACAAACGGTGGCCTCA;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=538;TCF=271;TCR=267;TR=318;WE=39465102;WS=39465084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,357:0.57:625
chr17	39465389	rs12451604	T	A	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.117;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=2082;ReadPosRankSum=1.307;SC=CCAGCTGCCATGTCTGGCTCT;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=194;TCF=83;TCR=111;TR=110;WE=39465397;WS=39465379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,114:0.58:198
chr17	39471752	rs72106118	TGCCCCCGCAGCCAGA	T	2778.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.039;NF=4;NR=21;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CCGCAGCAGCTGCCCCCGCAG;SOR=0.480;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=25;WE=39471786;WS=39471742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,75:0.56:133
chr17	39471778	rs78413710	C	T	2855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=3.101;NF=38;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=0.244;SC=GCCCCCGCAGCCAGAGCCCCC;SOR=0.528;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=73;WE=39471786;WS=39471742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr17	39471888	rs34354631	C	T	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1430;ReadPosRankSum=0.106;SC=AGCAGTCCCCCGGGCAGCACC;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=91;WE=39471896;WS=39471878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,100:0.53:190
chr17	39471929	rs12449671	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CTCGCAGGTCGGTAACGCAGC;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=86;WE=39471937;WS=39471919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,97:0.55:175
chr17	39471972	rs12452669	T	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=848;ReadPosRankSum=0.024;SC=TGGCCAGCCATCTGGATGGCA;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=52;WE=39471980;WS=39471962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,58:0.57:102
chr17	39472018	rs12449683	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=561;ReadPosRankSum=0.396;SC=TGAGGGACGGGATGTTTTCTT;SOR=1.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=30;WE=39472026;WS=39472008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr17	39502398	rs16966703	A	G	2631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=60;PP=1798;ReadPosRankSum=-1.400;SC=TGCAAGGCCCACACCGAGCAC;SOR=0.537;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=249;TCF=115;TCR=134;TR=115;WE=39502406;WS=39502388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,130:0.45:288
chr17	39502574	rs75101235	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=517;ReadPosRankSum=1.583;SC=TGTAAGAATATTGTTCCTCCT;SOR=1.887;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=29;WE=39502582;WS=39502564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr17	39506659	rs16966713	G	A	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=46;PP=1910;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GCACTGTGTCGCCCACTCCTC;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=101;TCR=70;TR=113;WE=39506667;WS=39506648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,133:0.67:199
chr17	39521248	rs71373411	A	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.901;NF=17;NR=26;PP=605;ReadPosRankSum=0.756;SC=TCCAGAGAGTATCGCTGTGGT;SOR=0.633;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=64;TCR=89;TR=43;WE=39521256;WS=39521238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,55:0.29:190
chr17	39524108	rs72828144	G	A	3657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=74;PP=2268;ReadPosRankSum=0.421;SC=TCATCACTTTGTAATTCAGCC;SOR=0.629;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=363;TCF=176;TCR=187;TR=150;WE=39524116;WS=39524098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,186:0.42:446
chr17	39535388	rs2071599	T	C	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.860;NF=36;NR=38;PP=854;ReadPosRankSum=0.579;SC=GGAGCTGTAGTGGGCCTCGCT;SOR=0.594;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=74;WE=39535396;WS=39535378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,93:0.38:243
chr17	39535859	rs2239710	A	G	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.252;NF=62;NR=56;PP=1641;ReadPosRankSum=1.491;SC=CCTGCGGTTAATTTCCACCAG;SOR=0.671;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=293;TCF=157;TCR=136;TR=118;WE=39535867;WS=39535849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,132:0.39:341
chr17	39550252	rs1047448	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=209;ReadPosRankSum=-1.270;SC=CTTGCTCCTCTGGCATTCCCT;SOR=0.170;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=20;WE=39550260;WS=39550242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr17	39553547	rs6503627	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.587;NF=10;NR=28;PP=652;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CTCCAGCTCCGCGTTGTCCCG;SOR=0.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=38;WE=39553555;WS=39553537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr17	39553811	rs6503629	G	T	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=40;PP=1763;SC=AGGGAGGGAGGGAGTGCCTGG;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=84;WE=39553819;WS=39553801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	39553833	rs79496913	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=409;ReadPosRankSum=0.253;SC=TGAAGACAGAGTCTAAATTCT;SOR=0.644;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=29;WE=39553841;WS=39553823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
chr17	39577215	rs8071814	G	A	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=836;ReadPosRankSum=0.965;SC=GGAGGCAGGCGTGGAACAGGG;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=60;WE=39577223;WS=39577205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,74:0.45:166
chr17	39578424	rs2071607	G	T	5566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.906;NF=131;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.623;SC=GCAGGACATGGCCTGCAGGCT;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=345;TCF=215;TCR=130;TR=210;WE=39578432;WS=39578414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,241:0.59:408
chr17	39579010	rs116874025	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQRankSum=-4.143;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.848;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr17	39579016	.	AG	GC	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-3.753;QD=11.99;ReadPosRankSum=-3.302;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr17	39579059	rs78158550	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.482;NF=28;NR=4;PP=681;ReadPosRankSum=-0.622;SC=AGGGAGAGCTGCTCCTCCTTC;SOR=0.486;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=32;WE=39579067;WS=39579049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr17	39579112	rs16966811	G	A	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.820;NF=62;NR=30;PP=1626;ReadPosRankSum=0.361;SC=GGCCAGGGTCGCGTCATCCAG;SOR=0.668;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=176;TCF=113;TCR=63;TR=92;WE=39579120;WS=39579102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,118:0.57:208
chr17	39580130	rs78139770	G	A	4466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=55;PP=2651;ReadPosRankSum=1.713;SC=CACACACAAAGCACCATACTC;SOR=0.819;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=292;TCF=185;TCR=107;TR=159;WE=39580138;WS=39580120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,195:0.57:344
chr17	39580559	rs9916475	T	A	4769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.50;ReadPosRankSum=0.975;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,123:0.61:203
chr17	39580562	rs9916484	T	C	4769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.97;ReadPosRankSum=1.290;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,120:0.60:199
chr17	39580660	rs9916724	T	C	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1248;ReadPosRankSum=1.427;SC=GGAGGCAGCATTGGCCTCTGC;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=59;WE=39580668;WS=39580650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,70:0.59:118
chr17	39580816	rs72485487	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=1.125;SC=AGATCAGCTGGGAAGGCTGAG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=39580824;WS=39580806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	39593768	rs897416	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=265;SC=CAGGAGGGAGACGTGGAGCAC;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=39593776;WS=39593758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	39593872	rs897415	A	G	79.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	39594857	rs60786473	G	T	3853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.663;NF=104;NR=54;PP=2371;ReadPosRankSum=1.734;SC=CCTGCAGGCTGATGCCTTCAG;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=371;TCF=240;TCR=131;TR=158;WE=39594865;WS=39594847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,185:0.44:425
chr17	39594934	rs71155140	AC	A	8273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=597;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.431;NF=45;NR=158;PP=2980;ReadPosRankSum=0.101;SC=CTGGTTCTATACCCCCCCCAC;SOR=0.600;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=362;TCF=83;TCR=279;TR=203;WE=39594942;WS=39594923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,328:0.60:549
chr17	39595536	rs17494404	C	T	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.486;NF=43;NR=25;PP=838;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGGCCAGGGTCGCATCATCCA;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=195;TCF=122;TCR=73;TR=68;WE=39595544;WS=39595526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,84:0.35:239
chr17	39595661	rs2071611	T	A	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=76;PP=1860;ReadPosRankSum=1.522;SC=CAAGAGCCCCTCTCGGCTGCC;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=55;TCR=109;TR=115;WE=39595669;WS=39595651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,124:0.65:192
chr17	39596402	rs2071610	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=991;ReadPosRankSum=0.072;SC=GCCCTCCTCCGCCTGACTTAC;SOR=0.727;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=67;WE=39596410;WS=39596392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
chr17	39596611	rs1350046	T	C	8448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=157;NR=109;PP=2965;SC=TTCTCTGAGCTTTACATGGAT;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=158;TCR=109;TR=266;WE=39596632;WS=39596601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr17	39616430	rs2604953	G	T	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=41;PP=2366;SC=ACGGTGCGGGGCACGCATGGG;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=39616438;WS=39616420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	39619078	rs2857258	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=265;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTGGGCCTGCGTACTTGCAGT;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=18;WE=39619086;WS=39619068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr17	39619093	rs2604954	GT	AC	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=22;PP=2815;SC=TGCAGTCCTCGTTCTCCAGCA;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=64;WE=39619102;WS=39619083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	39619186	rs2604956	G	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=402;ReadPosRankSum=-1.766;SC=GCCGCTCCAGGTCAGCCCGGA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=35;WE=39619194;WS=39619176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,44:0.30:145
chr17	39619219	rs2857257	G	A	4186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=61;PP=2353;SC=GGGCCTCAACGTTGGTGATCA;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=126;WE=39619227;WS=39619209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr17	39619388	rs4796636	C	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=549;SC=CCAAATCTCCCTTTGATGCTG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=39619396;WS=39619378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	39620733	rs2604958	G	C	5715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=102;PP=2965;SC=ATGTGACAATGATAGGATCCT;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=69;TCR=102;TR=171;WE=39620741;WS=39620723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	39622068	rs2071561	G	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=661;ReadPosRankSum=0.553;SC=CTCCTTCAGGGACTCAACCTG;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=38;WE=39622076;WS=39622058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr17	39633317	rs2239711	A	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=443;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CTCAGAACCGACCCCCTGGGC;SOR=0.986;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=23;WE=39633325;WS=39633307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr17	39633354	rs12451652	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=659;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GCGGGGGCTGCAGTTTGTGCG;SOR=1.984;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=34;WE=39633362;WS=39633344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr17	39633610	rs72830064	G	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=25;ReadPosRankSum=1.097;SC=TGAGAGGAAAGGGGGCTTGCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=39633618;WS=39633600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	39634082	rs75126797	C	A	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.523;NF=10;NR=26;PP=628;ReadPosRankSum=1.143;SC=AGCGGGCCTCCGTCTCTGCCA;SOR=1.464;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=36;WE=39634090;WS=39634072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
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chr17	39636044	rs2011243	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=809;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CTGGAGATATGAAGAAGTTAT;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=56;WE=39636058;WS=39636034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,65:0.65:100
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chr17	39645088	rs4796716	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CAGCCCCTTCACCATTTCCAG;SOR=0.725;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=14;WE=39645096;WS=39645078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr17	39645572	rs34752082	C	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=0.954;SC=TAAAAGCTACCGTCCCATCTG;SOR=2.570;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=12;WE=39645580;WS=39645562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr17	39646021	rs1003842	A	G	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1698;ReadPosRankSum=-0.095;SC=AGCCCACAGAACGGATGGAGG;SOR=0.567;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=104;WE=39646029;WS=39646011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,127:0.60:213
chr17	39659183	rs4796698	G	A	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=83;PP=2965;SC=TGGGAGGGCCGGGTACCTTGG;SOR=0.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=183;WE=39659202;WS=39659173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	39659194	rs4796697	T	C	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=83;PP=2965;SC=GGTACCTTGGTGTGGAACCAT;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=185;WE=39659202;WS=39659173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	39659529	rs7211835	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=31;PP=1669;SC=AGCCTGCAATTCCCGCTCACC;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=77;WE=39659537;WS=39659519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	39659724	rs117151355	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=150;ReadPosRankSum=-0.460;SC=GAAATGTTTTTTGAAAAAGCA;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=12;WE=39659732;WS=39659717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr17	39659913	rs9891361	G	A	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=37;PP=1211;SC=GAAGTCGTCCGCAGCCAGCCT;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=39659921;WS=39659903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	39661689	rs8182306	G	A	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=65;PP=2489;SC=CTGATCCCCCGGACACAAACC;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=117;WE=39661697;WS=39661679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	39670912	rs897420	G	C	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=29;PP=1645;SC=TTCCCTGATGGCAATGCCAGC;SOR=1.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=39670920;WS=39670902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	39671045	rs897421	T	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=50;PP=1566;SC=CACCCACACATCTGACTCCTC;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=77;WE=39671053;WS=39671035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	39674641	rs1050784	T	C	5857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=95;PP=2965;SC=TCTGGGCTGGTTGGGGTCTGC;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=85;TCR=95;TR=180;WE=39674649;WS=39674631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	39680388	.	C	CA	1729.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=1652;ReadPosRankSum=0.530;SC=GGTGGGGGGACACATACCATG;SOR=0.851;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=43;WE=39680396;WS=39680378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,58:0.36:162
chr17	39680580	rs1869719	A	C	7349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=112;PP=2965;SC=TAGGGAACACAAAGCCCTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=115;TCR=112;TR=227;WE=39680588;WS=39680570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr17	39680796	rs1869720	T	A	4631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=92;PP=2811;ReadPosRankSum=-0.984;SC=TGATTTCCTGTAAAGATACAG;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=139;WE=39680804;WS=39680786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr17	39681475	rs4601	A	G	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=29;PP=1183;SC=CCAGACGGGCATTGTCGATCT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=69;WE=39681483;WS=39681465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	39684321	rs4602	G	C	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=50;PP=1983;SC=GCCGCCGTAGGCCCCCGAGGA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=101;WE=39684329;WS=39684311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	39684410	rs11550883	G	A	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=46;PP=1690;SC=GCGCGCGAAAGGCGACCCCCG;SOR=0.924;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=81;WE=39684418;WS=39684400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	39723451	rs6503636	A	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=640;SC=TGAGACCTTGACTCTCCACCC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=39723459;WS=39723441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	39723990	rs3890472	T	A	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=44;PP=1788;SC=TTTTTCCAGCTCCGGAGGATT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=91;WE=39723998;WS=39723980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	39724047	rs1008753	T	C	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=39;PP=1379;SC=GCGGCCCCCATACACATATAT;SOR=1.164;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=39724055;WS=39724037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	39724752	rs150892974	C	A	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1527;ReadPosRankSum=0.324;SC=TATAGCAGAACTACCAACCTT;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=99;WE=39724760;WS=39724742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,123:0.56:219
chr17	39726276	rs3816510	C	A	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=41;PP=1791;SC=ACCTGCAGACCAGCCAGGGTT;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=39726284;WS=39726266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	39727816	rs8075921	T	G	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=38;PP=1770;SC=CACCATCACCTCCTCCAGCAC;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=90;WE=39727824;WS=39727806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	39728050	rs8070680	G	A	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=58;PP=1718;SC=AACTGCCACCGCCTCCCCTCC;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=97;WE=39728058;WS=39728040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	39740323	rs2320456	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.07;MQRankSum=2.730;QD=25.36;ReadPosRankSum=1.294;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr17	39742807	rs3826550	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.434;NF=15;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CCCAAGCCAGCACCAAGGCCA;SOR=0.549;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=32;WE=39742815;WS=39742797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,35:0.32:109
chr17	39742894	rs3826551	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.391;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr17	39742898	rs11551758	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.440;QD=24.70;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr17	39742899	rs6503640	C	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=599;SC=CCCCAGCCCGCAGGCTCCCCC;SOR=1.292;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=39;WE=39742907;WS=39742884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	39766504	rs7406899	A	G	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=28;PP=1178;SC=GGAGAGAAAAAGCAGGGCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=39766512;WS=39766494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	39766611	rs56259134	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.503;NF=7;NR=8;PP=222;ReadPosRankSum=2.895;SC=AGCAGGCGGCGGTAGGTGGCA;SOR=0.275;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=15;WE=39766619;WS=39766601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr17	39767744	rs4796681	A	G	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1371;SC=GGGCCAGTTCATGCTCATACC;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=39767752;WS=39767734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	39767836	rs2100509	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=2.150;SC=TGGGTGGACCGCCCCACTCTT;SOR=1.410;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=12;WE=39767844;WS=39767826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	39871700	rs7220169	G	A	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=49;PP=2475;SC=TGCAGCGACTGTGTGTGTATG;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=122;WE=39871708;WS=39871690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	39874075	rs7213435	C	A	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=28;PP=2038;SC=CTTCTGTATCCCCGGTGGCAA;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=95;WE=39874083;WS=39874065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	39874137	rs7212417	G	A	5664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=75;PP=2965;SC=TGAGTGGCTGGTGCAGGCATT;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=176;WE=39874145;WS=39874127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	39874267	rs7218465	T	A	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=50;PP=1480;SC=TCTTAGGTCCTCGGCTGGGGC;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=39874275;WS=39874257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	39874283	rs11079007	T	A	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=38;PP=1126;SC=GGGGCTCTGTTATAAAAGACA;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=39874291;WS=39874273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	39881289	rs8075017	G	C	10813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.05;NF=147;NR=172;PP=2965;SC=CCTGGGGCACGAACTCCTCCG;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=320;TCF=147;TCR=173;TR=319;WE=39881297;WS=39881279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr17	39881487	rs11869104	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=336;SC=TCCACACAGATCCTGATGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=15;WE=39881495;WS=39881477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	39883559	rs33914436	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=677;ReadPosRankSum=1.449;SC=CCAGAGGCACGCTGTATGGGT;SOR=0.564;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=47;WE=39883567;WS=39883549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,59:0.44:134
chr17	39883595	rs7216154	T	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=49;PP=1450;SC=CAGTGGACACTGGGGGTTGCT;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=39883603;WS=39883585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	39883672	rs11867808	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TACTTCTCCCGCAGGTCCTGC;SOR=1.091;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=20;WE=39883680;WS=39883662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr17	39883972	rs4796600	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TCTGGGCCAGCGGCTCTCCAG;SOR=0.778;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=81;TCF=75;TCR=6;TR=23;WE=39883980;WS=39883962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,23:0.29:79
chr17	39884091	rs4796601	G	C	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=524;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=78;PP=1776;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GCCCCATACTGGAAGGACCCA;SOR=0.791;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=451;TCF=233;TCR=218;TR=167;WE=39884099;WS=39884071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:332,185:0.36:517
chr17	39884246	rs4796602	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.065;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=577;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GGGGAGTCACGCAGCCTGGTT;SOR=0.184;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=95;TCF=21;TCR=74;TR=37;WE=39884254;WS=39884236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr17	39884419	rs4796692	C	T	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1268;ReadPosRankSum=1.242;SC=CCCATGGGGCCACGACAAGAG;SOR=0.797;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=237;TCF=137;TCR=100;TR=84;WE=39884427;WS=39884409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,108:0.39:280
chr17	39884583	rs4796693	G	A	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=934;ReadPosRankSum=0.644;SC=GCTGGCCTCCGCTGGGGAGGG;SOR=0.884;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=59;WE=39884591;WS=39884573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
chr17	39884684	rs4796694	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TCGGCTGCTGCGCTGTGCCAG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=8;WE=39884692;WS=39884674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr17	39888455	rs3895103	G	C	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=47;PP=1936;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AGATTGGCCCGCTATCCTCTC;SOR=0.837;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=314;TCF=185;TCR=129;TR=121;WE=39888463;WS=39888445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,131:0.38:347
chr17	39890715	rs4796603	A	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,48:0.28:172
chr17	39890876	rs4796604	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GCCCAACCTCTTCGGGCGCAT;SOR=0.874;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=31;WE=39890884;WS=39890866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr17	39912145	rs1126821	T	A	4494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=83;PP=2859;SC=GTGGCATCCATGTCTGGGGAC;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=149;WE=39912153;WS=39912135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	39912259	rs141010071	A	AC	868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=816;SC=GGTGGGCCTGACCCCTCCCCA;SOR=2.468;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=21;WE=39912267;WS=39912249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	39912581	rs9890858	A	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=981;SC=GCTGGGTGCCATGGCTCACGC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=39912589;WS=39912571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	39913645	rs7216034	T	C	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=57;PP=2965;SC=CCAACTACTGTGGTCCAACCT;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=109;TCR=57;TR=166;WE=39913653;WS=39913635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	39914070	rs8067890	G	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=319;SC=CAGGGGAGAGGTGGAAAGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=39914078;WS=39914060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	39923614	rs12942034	A	G	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=17;PP=1150;SC=GCCTCGGGAGAGTTGGGGAGG;SOR=1.451;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=39923622;WS=39923604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	39925925	rs7405731	A	G	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=49;PP=1472;SC=GGTACTCCAGATCACCTGGGG;SOR=1.265;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=39925933;WS=39925915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	39959189	rs1065029	C	G	5787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=72;PP=2965;SC=CAAGCTTGAGCGGTGTGGGGT;SOR=1.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=177;WE=39959197;WS=39959179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	39959511	rs3809877	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=828;ReadPosRankSum=1.478;SC=GGCTGCATCCCCACCCCCCAA;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=46;WE=39959519;WS=39959501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr17	39962951	rs2304494	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=569;ReadPosRankSum=0.654;SC=AGCTGACCACCAGGGGCTGGG;SOR=0.454;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=32;WE=39962959;WS=39962941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr17	39964032	rs149683818	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=596;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TTACAGGCATGAGCCACCGCG;SOR=0.513;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=43;WE=39964040;WS=39964022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,48:0.36:132
chr17	39966168	rs2304493	T	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=266;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CTAAATCCAATCTCTGCCTAC;SOR=1.165;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=15;WE=39966176;WS=39966158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr17	39967087	rs1469863	C	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=921;ReadPosRankSum=0.073;SC=GTGAGAGGACCGCCCACCGTG;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=117;TCR=82;TR=67;WE=39967095;WS=39967077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,95:0.38:251
chr17	39967442	rs13412	T	C	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CAGCATCCCCTGATAGTAGTT;SOR=0.523;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=228;TCF=95;TCR=133;TR=100;WE=39967450;WS=39967432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,118:0.42:281
chr17	39968701	rs729636	T	G	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1131;ReadPosRankSum=0.840;SC=AGTCCTTCTTTCAGTCCAGCT;SOR=0.755;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=233;TCF=112;TCR=121;TR=83;WE=39968709;WS=39968691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,96:0.34:282
chr17	39977862	rs8072866	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=663;SC=GCCCAGACCCCGGCCTGACTA;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=31;WE=39977870;WS=39977852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	39983644	rs9896766	A	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAGAAGAAAGACATGAAGAGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=39983652;WS=39983634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	39983808	rs1046404	G	C	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GAAGTAACCAGAGTTCTCACA;SOR=0.774;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=200;TCF=130;TCR=70;TR=104;WE=39983828;WS=39983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,132:0.52:255
chr17	39983820	rs1046403	G	A	3145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GTTCTCACACGCAGAGCTGTT;SOR=0.834;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=221;TCF=140;TCR=81;TR=112;WE=39983828;WS=39983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,146:0.52:283
chr17	39983849	rs1128966	G	C	3224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=47;PP=2005;ReadPosRankSum=0.366;SC=ATGTGTGTATGAGCTGGCCCT;SOR=0.875;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=233;TCF=135;TCR=98;TR=119;WE=39983857;WS=39983839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,146:0.52:283
chr17	39987130	rs4796712	T	C	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=138;PP=2965;SC=GGAGATTGTGTGCTTTGGTCC;SOR=1.297;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=77;TCR=138;TR=215;WE=39987138;WS=39987120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr17	39988601	rs7208062	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=272;ReadPosRankSum=0.029;SC=CAGCCTACTCCATCTCAAGGG;SOR=0.313;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=22;WE=39988609;WS=39988591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr17	39991790	rs1319763	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.062;NF=24;NR=8;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.496;SC=TATCAGGTCCCTCCTAAGAGA;SOR=0.807;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=32;WE=39991809;WS=39991780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr17	39991801	rs71373456	T	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.053;NF=29;NR=17;PP=1645;ReadPosRankSum=-0.481;SC=TCCTAAGAGATCTCTACCATT;SOR=0.395;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=46;WE=39991809;WS=39991780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr17	39991848	rs148849516	CGCTG	C	2462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.929;NF=27;NR=53;PP=1562;ReadPosRankSum=0.032;SC=ACTGGGGAGCCGCTGGCTTGG;SOR=0.772;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=80;WE=39991859;WS=39991838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr17	39991867	rs3039772	A	ATATC	2730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.062;NF=23;NR=56;PP=2402;ReadPosRankSum=1.810;SC=GGGGAGGATAAGGCCCTAGGT;SOR=0.726;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=79;WE=39991875;WS=39991857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
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chr17	40024895	rs8079008	A	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=13;PP=2005;ReadPosRankSum=0.023;SC=CAACCCCATGAGTAAGTGGTG;SOR=1.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=75;WE=40024903;WS=40024885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr17	40025264	rs9912300	G	T	5678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ATCAACAAACGTAATGAAGAA;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=346;TCF=225;TCR=121;TR=199;WE=40025272;WS=40025254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,250:0.61:412
chr17	40025285	rs9914829	A	G	13647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=233;NR=168;PP=2965;SC=GAAAACAGCTACAATGCTCAC;SOR=1.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=401;TCF=233;TCR=168;TR=401;WE=40025293;WS=40025275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,487:1.00:487
chr17	40025453	rs3744779	T	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=43;PP=1041;ReadPosRankSum=0.717;SC=CTGTCACTACTATTACTACGA;SOR=2.099;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=84;TCF=10;TCR=74;TR=47;WE=40025461;WS=40025443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr17	40025670	rs3744780	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=198;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CGTGGCTCCTGTTTCCTCCAA;SOR=1.140;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=13;WE=40025678;WS=40025660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr17	40027869	rs1808787	A	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=224;ReadPosRankSum=0.288;SC=TGGCCTCCCAAAGTGCTGTGA;SOR=0.616;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=14;WE=40027877;WS=40027859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr17	40028450	rs8071627	A	T	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=76;PP=2016;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AGTGGGGGGAACAAAGGCCAG;SOR=0.723;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=222;TCF=87;TCR=135;TR=127;WE=40028458;WS=40028440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,145:0.55:263
chr17	40028541	rs8071753	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=681;ReadPosRankSum=0.850;SC=GTAACTACCAATCCAAGTCTA;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=34;WE=40028549;WS=40028531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr17	40028568	rs8071234	C	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=426;ReadPosRankSum=0.141;SC=CCACACAACTCTAAGGCAAAA;SOR=0.957;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=21;WE=40028576;WS=40028558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr17	40035338	rs71373464	A	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.969;SC=CAGACAAGGAAACCAAAGCAC;SOR=0.247;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=10;WE=40035346;WS=40035328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr17	40048613	rs8065502	A	G	6136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=76;PP=2965;SC=CTACCTCCGGATGCTTCCTCA;SOR=1.089;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=186;WE=40048621;WS=40048603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr17	40049171	rs4796735	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=380;SC=GGCTCAAGCAGTTCTCCCACC;SOR=2.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=17;WE=40049179;WS=40049161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	40049473	rs4796736	A	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=47;PP=1467;SC=ACATACCCCCAGGAGACCTGC;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=40049481;WS=40049463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	40052842	rs67473931	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=549;ReadPosRankSum=0.618;SC=AAAGCCACACGCGGAGTGGGG;SOR=0.667;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=42;WE=40052850;WS=40052832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr17	40053021	rs11652326	T	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=827;SC=AAAGCCCTCATCATCCCTCTC;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=40053029;WS=40053011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	40058204	rs3816121	C	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.04;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,49:0.58:85
chr17	40058211	rs60769720	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.413;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr17	40058212	rs3816122	G	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.46;ReadPosRankSum=-1.053;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr17	40062719	rs12948100	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=352;ReadPosRankSum=1.138;SC=CCACCCAGGCTACACACATGT;SOR=0.715;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=21;WE=40062727;WS=40062709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr17	40065774	rs2304497	T	G	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CTTTCTTGTCTTCAGGGGCGT;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=81;WE=40065782;WS=40065764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,97:0.47:208
chr17	40068613	rs2304499	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=1.195;SC=TGCTGACCTGGAGGTGACCAT;SOR=0.576;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=16;WE=40068621;WS=40068603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr17	40094835	rs3809878	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=848;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CCATGAAGGGCGGCCTGACTG;SOR=0.911;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=88;TCR=38;TR=54;WE=40094843;WS=40094825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,64:0.42:153
chr17	40105401	rs77012779	T	TATG	5901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.828;NF=39;NR=49;PP=2921;ReadPosRankSum=-2.151;SC=AAGTCTGACTTATGAACACAA;SOR=0.771;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=88;WE=40105409;WS=40105391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,146:0.60:244
chr17	40118807	rs4432296	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=0.757;SC=GGGCTCGGGTCGTGCCACCGC;SOR=0.693;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=10;WE=40118815;WS=40118797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	40120771	rs8078650	T	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=803;ReadPosRankSum=-0.573;SC=AGGTGGCAGGTTGGGGCCTTA;SOR=0.669;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=44;WE=40120779;WS=40120761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr17	40123829	rs12602950	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=782;ReadPosRankSum=2.388;SC=AGTGTTTTGCGCTGGGCCTCG;SOR=1.723;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=40;WE=40123837;WS=40123819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr17	40123902	.	C	G	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=49;PP=1836;ReadPosRankSum=0.751;SC=CCCGTTTTCTCCCGGCAGTCG;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=252;TCF=158;TCR=94;TR=126;WE=40123910;WS=40123892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,130:0.48:271
chr17	40125864	rs2070106	G	A	2631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1585;ReadPosRankSum=0.637;SC=TCTTCACGGGGTACTACGGGA;SOR=0.614;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=85;TCR=94;TR=105;WE=40125872;WS=40125854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,123:0.58:213
chr17	40129468	rs77147872	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=243;ReadPosRankSum=0.969;SC=CCCTCCTTTCCCAACACTTCA;SOR=0.542;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=15;WE=40129476;WS=40129458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr17	40146970	rs6503679	G	A	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=95;PP=2965;SC=GAACTGCACCGGAAAATCAGA;SOR=2.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=29;TCR=95;TR=124;WE=40146978;WS=40146960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	40152431	rs374909941	CT	C	674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=665;SC=GCCACCAGGACTTGGCAGCTA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=40152439;WS=40152421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	40169519	rs4796758	G	T	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=50;PP=1429;SC=CCGCGGCGCCGCGCCCAGAAG;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=40169527;WS=40169509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	40173851	rs9894001	A	C	8642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=151;PP=2965;SC=CTGAACAAATACGGAGGGAGA;SOR=0.989;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=111;TCR=151;TR=262;WE=40173859;WS=40173841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr17	40186128	rs4277396	C	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=6;PP=477;SC=TGGAAAATACCGACCACAGCC;SOR=1.508;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=19;WE=40186136;WS=40186118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	40215180	rs4796765	A	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=54;PP=1540;SC=TGTATCCTCTATATCCCTCTG;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=68;WE=40215188;WS=40215170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	40265652	rs145694140	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.624;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=686;ReadPosRankSum=1.096;SC=TCAGGGCTGCGGCCCAAAGAT;SOR=0.971;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=51;WE=40265660;WS=40265642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,62:0.34:182
chr17	40266939	rs17659391	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=421;ReadPosRankSum=-0.958;SC=ATGTGGGACAGCTCCGTGTAG;SOR=0.703;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=32;WE=40266947;WS=40266929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr17	40271757	rs730086	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GTGGGTGGGGGATAAAACCAG;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=21;WE=40271765;WS=40271747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr17	40271970	rs8072215	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=1.501;SC=GCTTGAGGAGAATGGAGAACA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=40271978;WS=40271960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr17	40272406	rs35184688	G	C	3534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=62;PP=1920;ReadPosRankSum=0.445;SC=ACAGATGGCAGAGTTAGGAAA;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=219;TCF=108;TCR=111;TR=118;WE=40272414;WS=40272396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,160:0.58:275
chr17	40272594	rs2285657	C	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=508;ReadPosRankSum=1.774;SC=TGGTGCACACCCCCCCCCAAC;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=33;WE=40272602;WS=40272584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr17	40274873	rs1122326	A	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=775;ReadPosRankSum=2.866;SC=ACTCGGATGCAGAGAGTCGGT;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=39;WE=40274881;WS=40274863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr17	40278081	rs2240010	T	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=307;ReadPosRankSum=0.125;SC=TGCGGCAAAGTAAGGTTAAAT;SOR=1.721;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=14;WE=40278089;WS=40278071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	40280291	rs2230326	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1233;ReadPosRankSum=1.395;SC=GGAATTCCACGGCTCTCTTGC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=69;WE=40280299;WS=40280281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,72:0.56:128
chr17	40280944	rs739637	G	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=372;ReadPosRankSum=0.611;SC=GAACCCTCAAGCCAGGAGCCA;SOR=1.484;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=21;WE=40280952;WS=40280934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr17	40359505	rs377476267	GCACA	G,GCA	1300.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-0.226;QD=27.10;SOR=2.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,12,35:0.25,0.73:48
chr17	40364242	.	A	AAC	3422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.091;NF=7;NR=43;PP=2126;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CTGATGAGAAAACAGTTGCAT;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=11;TCR=77;TR=50;WE=40364250;WS=40364232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,88:0.63:139
chr17	40469102	.	C	A	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=937;ReadPosRankSum=2.377;SC=CCAGGGGCTTCCAACCTTTGG;SOR=0.854;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=58;WE=40469110;WS=40469092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr17	40476667	rs17881940	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.673;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	40481529	rs2293152	G	C	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1641;ReadPosRankSum=1.993;SC=AGCCCTCTCCGGCAGCCAGAG;SOR=0.558;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=152;TCF=98;TCR=54;TR=100;WE=40481537;WS=40481519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,117:0.66:176
chr17	40490539	.	T	G	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5210;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=27;MQ=44.22;NF=5;NR=0;PP=77;QD=22.3542425094;SC=GAATACTCCTTGACCTGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=40490547;WS=40490532;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,5:0.83:6
chr17	40490559	.	G	T	164	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.6715;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=48.32;NF=7;NR=1;PP=164;QD=24.8464015684;SC=GAATACTCCTGGACCTGAGGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=40490567;WS=40490549;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	40497828	rs12601611	C	T	214.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=132;SC=TGAAGGCTCTCTGTCGGCGGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=40497836;WS=40497818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	40500265	rs2306581	C	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=1.081;SC=AAAGGGTGCCCCTTTATCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=40500273;WS=40500255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr17	40619937	rs4796668	A	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=349;SC=ACTTTTTGTAACCAGGTCTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=40619945;WS=40619928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	40639422	rs8069972	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=2.097;SC=CTCGTGGCCCGGAAGAGAGGT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=40639430;WS=40639412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	40642452	rs9899168	T	C	5905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=52;PP=2965;SC=GTGTAACCACTACCACAATTA;SOR=1.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=129;TCR=52;TR=181;WE=40642460;WS=40642442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr17	40651117	rs77920152	TA	T	1301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TGCTTTTGTGTAAAGAAATCA;SOR=0.639;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=87;TCF=9;TCR=78;TR=32;WE=40651125;WS=40651107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,49:0.36:136
chr17	40653356	rs72352728	CTTTTG	C	2736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.762;NF=0;NR=52;PP=2349;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AGTTACTAGACTTTTGTTTTG;SOR=1.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=3;TCR=88;TR=52;WE=40653368;WS=40653346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,69:0.64:107
chr17	40665799	.	C	T	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=774;ReadPosRankSum=-0.795;SC=AGGTTCAAAGCGCCAAGTAGC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=43;WE=40665807;WS=40665789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr17	40672739	rs8067384	G	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=266;ReadPosRankSum=1.155;SC=CATTAACGATGTTAGGCTCAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=14;WE=40672747;WS=40672729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	40689455	rs659497	T	C	7243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=115;PP=2965;SC=AAAGCTACTCTTTCGTGTGGT;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=98;TCR=115;TR=213;WE=40689463;WS=40689445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr17	40689613	rs2071046	G	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=727;SC=GGGAGCCACCGTAGGTGTTTT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=40689621;WS=40689603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	40690261	rs2676533	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=192;ReadPosRankSum=-1.260;SC=TAGCCCTAGCACCCAGCACAA;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=15;WE=40690269;WS=40690251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr17	40696233	rs86312	C	G	7445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=125;PP=2965;SC=ATATTACCCCCGCTGGGTGGC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=102;TCR=125;TR=227;WE=40696241;WS=40696223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr17	40699291	rs607740	G	A	6725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.657;SC=CGCAGTGTGTGACACAGGCCT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=217;WE=40699299;WS=40699281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,248:0.99:250
chr17	40699332	rs607795	T	C	6564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=109;PP=2965;SC=GGGAGGACGCTGTGGCCTCTG;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=106;TCR=109;TR=215;WE=40699340;WS=40699322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr17	40699475	rs67843205	G	GC	1372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=36;PP=1576;SC=CAGGGACCGGGCCCGGAGCTC;SOR=2.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=41;WE=40699483;WS=40699465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	40699921	rs2854979	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=712;ReadPosRankSum=1.354;SC=GCTCCAGCCAAGAGAGGTTAG;SOR=0.477;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=33;WE=40699929;WS=40699911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr17	40700448	rs2854973	C	G	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=64;PP=2578;SC=GCGCGCAGCCCGGGCCAGAGC;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=118;WE=40700456;WS=40700438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	40705100	rs597255	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.954;NF=26;NR=28;PP=897;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CCTTGGAGGCCAGAAGGGAAG;SOR=0.576;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=169;TCF=88;TCR=81;TR=54;WE=40705108;WS=40705090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,62:0.33:188
chr17	40706596	rs147402365	C	T	3573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.288;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=86;ReadPosRankSum=-0.902;SC=GAGGAGGTGGCGGAGGTGAGC;SOR=1.057;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=221;TCF=93;TCR=128;TR=142;WE=40706604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,155:0.63:247
chr17	40706906	rs605059	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=590;ReadPosRankSum=0.235;SC=GGCCGGGCGCGGTGCGGTGGG;SOR=0.820;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=34;WE=40706914;WS=40706896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr17	40714804	rs615942	C	A	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=29;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CAGCCCCAGTCCAGCCCCGTG;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=177;TCF=112;TCR=65;TR=84;WE=40714812;WS=40714794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,95:0.48:198
chr17	40716520	rs598126	A	G	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1079;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TCAGACATACAGAGAATGAAG;SOR=0.908;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=213;TCF=103;TCR=110;TR=79;WE=40716528;WS=40716510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,99:0.38:262
chr17	40720605	rs646174	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=466;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CCCCGACCTCGGGGGGCTCAG;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=31;WE=40720613;WS=40720595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
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chr17	40722029	rs665268	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=575;ReadPosRankSum=0.196;SC=AAGGCACACCAGGACAACCCC;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=38;WE=40722037;WS=40722019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr17	40722162	rs1474040	G	A	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=805;ReadPosRankSum=-1.736;SC=AGCTGTCAGCGTGTGTCTTCA;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=55;WE=40722170;WS=40722152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr17	40723391	rs2010750	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=822;ReadPosRankSum=0.265;SC=GTGATCCACCCGCCTTGGCCT;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=36;WE=40723399;WS=40723381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr17	40725656	rs2292752	G	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=281;ReadPosRankSum=0.319;SC=AACCACATCCGCCTGGGGTCA;SOR=0.732;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=24;WE=40725664;WS=40725646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,29:0.28:104
chr17	40735469	rs1517002	T	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.533;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,45:0.30:148
chr17	40735641	rs10454087	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=318;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CTTCTCCCAGCGTAAAATCCC;SOR=0.620;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=21;WE=40735649;WS=40735631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr17	40737043	rs9889580	G	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=604;ReadPosRankSum=-0.047;SC=AACTACCCCCGACTTCCACTT;SOR=0.392;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=33;WE=40737051;WS=40737033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr17	40737117	rs4792992	G	A	3788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=54;PP=2426;ReadPosRankSum=0.213;SC=TTGCGTAAGTGGAAAGAATGA;SOR=0.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=157;TCR=95;TR=148;WE=40737125;WS=40737107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,173:0.57:301
chr17	40744320	rs4793253	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=583;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CTAGTTATACACCTAGGGTAA;SOR=0.892;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=29;WE=40744328;WS=40744310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr17	40766546	rs1045710	C	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.628;NF=41;NR=9;PP=1013;ReadPosRankSum=1.840;SC=TCCGGGAACGCAAGTTGGCCA;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=135;TCF=112;TCR=23;TR=50;WE=40766554;WS=40766536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,47:0.36:131
chr17	40811781	rs2292750	C	T	3841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=75;PP=2481;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TCGTGTCAGCCTCTGAGACTA;SOR=0.648;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=402;TCF=228;TCR=174;TR=168;WE=40811789;WS=40811771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,192:0.40:476
chr17	40811919	rs525911	A	G	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.319;NF=18;NR=64;PP=1319;ReadPosRankSum=-1.310;SC=TCGTGGAGGAATTCGCCACCG;SOR=1.126;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=182;TCF=47;TCR=135;TR=82;WE=40811927;WS=40811909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,86:0.43:201
chr17	40812797	rs3835175	C	CT	1975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.759;NF=5;NR=47;PP=2073;ReadPosRankSum=-0.007;SC=AGGAGGTGGCCTGGATAGGTA;SOR=0.364;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=52;WE=40812805;WS=40812787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr17	40817448	rs3817331	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.258;NF=11;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=-1.483;SC=TTATTTCTATGCCCATTTTAT;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=40817456;WS=40817446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr17	40817990	rs7225374	G	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=45;PP=1470;SC=CAGAGCGGGCGACTTTCTTGC;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=67;WE=40817998;WS=40817980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	40818451	rs1554227	G	A	3865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.170;NF=104;NR=65;PP=2485;ReadPosRankSum=0.101;SC=ACCTGCCCTCGGCCCACCGGG;SOR=0.539;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=405;TCF=261;TCR=144;TR=169;WE=40818459;WS=40818441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,190:0.43:442
chr17	40818584	rs2292749	C	T	3927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=585;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.617;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.370;NF=65;NR=101;PP=2457;ReadPosRankSum=-2.226;SC=ACTCCTAACCCCCTGGCTCGC;SOR=0.890;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=479;TCF=199;TCR=280;TR=166;WE=40818592;WS=40818574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:375,201:0.35:576
chr17	40818699	rs1046097	A	G	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1650;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TAAGGAGGACATGTTCAAGGA;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=302;TCF=153;TCR=149;TR=125;WE=40818707;WS=40818689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,144:0.40:357
chr17	40822308	rs8071056	C	A	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=9;PP=469;SC=AGAAGTCCCGCTGCAGGCTCT;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=40822316;WS=40822298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	40822678	rs2277618	C	T	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=64;PP=1603;ReadPosRankSum=-1.324;SC=ATAGTCTCCACCCGGAGTCGG;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=56;TCR=114;TR=97;WE=40822686;WS=40822668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,105:0.57:183
chr17	40826525	rs35595844	AAGG	A	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=645;SC=GGGATTGAGGAAGGAGGAGTC;SOR=1.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=40826535;WS=40826515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	40835819	rs36108420	A	AT	2090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.688;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=1597;ReadPosRankSum=-2.011;SC=GCTGACTAACAGTCGGTTTCC;SOR=1.169;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=43;WE=40835827;WS=40835809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,67:0.35:194
chr17	40835922	rs2271029	A	C	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.901;NF=38;NR=43;PP=940;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TACTGCGCCGAGATTCGCCAG;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=220;TCF=107;TCR=113;TR=81;WE=40835930;WS=40835912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,90:0.36:251
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chr17	40842084	rs3760386	G	A	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.464;SC=AACTGCCTTTGTCTCAACCTA;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=65;WE=40842092;WS=40842074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr17	40849842	rs1553468	A	G	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1826;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CACAGAGGACAGAAGGGAGGG;SOR=0.787;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=253;TCF=126;TCR=127;TR=113;WE=40849850;WS=40849832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,129:0.46:278
chr17	40850552	rs112344327	CGT	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=1.693;SC=TCAAAGAGTGCGTGTGTGTGT;SOR=1.329;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=40850561;WS=40850542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	40854534	rs3841620	G	GT	965.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=801;ReadPosRankSum=1.300;SC=AAGTGCTGCCGTGGGGCCTGG;SOR=1.069;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=24;WE=40854542;WS=40854524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr17	40880759	rs368020600	CA	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQRankSum=0.236;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr17	40912760	rs1078523	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=2.806;SC=CCTGAGCTGCATGGCTCAGCT;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=21;WE=40912768;WS=40912750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr17	40913366	rs9892728	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GCCTCCTCCTCCTGCTGGGCG;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=10;WE=40913374;WS=40913356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr17	40926593	rs183640440	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=445;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TGTTTCTCAACATGGGACTGG;SOR=0.622;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=33;WE=40926601;WS=40926583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,36:0.29:124
chr17	40939342	rs55997156	G	A	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.904;SC=CCAGTGGCCCGTGCAGTACGT;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=279;TCF=150;TCR=129;TR=100;WE=40939350;WS=40939332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,125:0.35:356
chr17	40986454	rs59492997	G	GGA	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.025;NF=10;NR=9;PP=581;ReadPosRankSum=0.982;SC=GGAGATACCTGGAGAGAGAGA;SOR=1.292;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=19;WE=40986463;WS=40986444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr17	41019724	rs180855179	G	A	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.325;NF=58;NR=27;PP=1441;ReadPosRankSum=1.448;SC=TGGTGGTGGGGCCACTGCCTC;SOR=1.029;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=95;TCR=49;TR=85;WE=41019732;WS=41019714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,85:0.61:140
chr17	41046440	rs324079	T	G	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=14;PP=1112;SC=CCCTACCTGCTCAGTTCAAGG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=41046448;WS=41046430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	41059718	rs161627	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=1.013;SC=CACACCACGTATTCTTCCTCA;SOR=0.180;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=22;WE=41059726;WS=41059708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr17	41061489	rs161622	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=0.258;SC=TCCGTTTCTCTCCCTAATCAG;SOR=0.527;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=5;WE=41061497;WS=41061479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr17	41063466	rs2229611	T	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=48;PP=1170;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTTCGGTGTTTAAAGTCAACA;SOR=1.928;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=86;TCF=6;TCR=80;TR=50;WE=41063474;WS=41063456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,49:0.58:85
chr17	41103938	rs534720	T	C	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=61;PP=2368;SC=GGAGATAAGCTCTGATACTGA;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=116;WE=41103946;WS=41103928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	41113131	rs35166621	CA	C	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.294;NF=3;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CTAGAGAACCCAAACTACGTC;SOR=0.070;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=41113139;WS=41113121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	41113543	rs2670865	C	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=174;SC=CAGTCCTTTTCATTCTAAACA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=41113551;WS=41113533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	41116127	rs140103494	C	T	4666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=71;PP=2850;ReadPosRankSum=2.739;SC=TGGTACCTGTCCCCCGCCCTC;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=155;TCR=113;TR=172;WE=41116135;WS=41116117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,207:0.62:333
chr17	41116234	rs690941	G	A	7930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=150;PP=2965;SC=CGGGACAGCAGGAGACCACGG;SOR=1.131;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=100;TCR=150;TR=250;WE=41116242;WS=41116224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr17	41116291	rs11278824	CAGCCCT	C	2904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.501;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.265;NF=3;NR=69;PP=2980;ReadPosRankSum=0.616;SC=GCCCCGACCCCAGCCCTAGCC;SOR=2.885;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=100;TCF=5;TCR=95;TR=72;WE=41116304;WS=41116280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr17	41116565	rs690971	G	T	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=65;PP=2388;SC=AAGCAGGAGGGTAAGGAATGG;SOR=0.861;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=118;WE=41116573;WS=41116555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	41116723	rs690979	G	A	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=371;SC=CAAGGCACGTGGTTTAGTGAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=41116731;WS=41116713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	41121207	rs373590793	GGGGC	G	1781.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,89:0.65:136
chr17	41121210	rs113173233	GC	G	686.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,45:0.33:138
chr17	41121217	rs7217553	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,49:0.34:143
chr17	41121218	.	G	GAA	1941.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.884;SOR=0.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,91:0.65:140
chr17	41121263	rs4793187	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=4;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=428;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AGGAACATTTGTGTTAACAAA;SOR=1.086;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=28;WE=41121271;WS=41121253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr17	41122443	rs2670866	T	C	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=82;PP=2283;SC=GAAGAATGGTTGCAGCCAGAA;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=129;WE=41122451;WS=41122433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	41132578	rs692074	T	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=7;PP=783;SC=TGACGTGCGGTGGTGTTTCCG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=41132586;WS=41132568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	41133071	rs1708875	T	C	6547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=119;NR=96;PP=2965;SC=GGACCGGCCATGGTTGCGGGG;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=119;TCR=96;TR=215;WE=41133079;WS=41133061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr17	41133242	rs550285	G	A	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=77;PP=2575;SC=TGGAGTGCGGGGCCGGCTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=111;WE=41133250;WS=41133232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	41139295	rs34886583	G	A	2754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=29;PP=1798;ReadPosRankSum=0.335;SC=AAGCAAGAGCGTCTGGAAACC;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=119;TCR=48;TR=103;WE=41139303;WS=41139285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,119:0.61:196
chr17	41150949	rs2271539	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=448;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TGGGGCAGTAGCCAGTGAGCA;SOR=0.422;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=38;WE=41150957;WS=41150939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr17	41150983	rs691954	T	C	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=53;PP=1606;SC=CGTGGGAGAGTTTTTGAGAGA;SOR=2.155;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=69;WE=41150991;WS=41150973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	41154817	rs11871636	A	C	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=555;ReadPosRankSum=0.079;SC=AGGCTTTGGTAGTGAATGGTG;SOR=0.628;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=50;WE=41154825;WS=41154807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,63:0.40:156
chr17	41164126	rs692651	A	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=563;SC=AATAGGCCCCACTTCCCCTGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=41164134;WS=41164116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	41165493	rs588703	A	G	8328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=123;PP=2965;SC=CTCCCCCTAGATGTCCAGCCA;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=130;TCR=123;TR=253;WE=41165501;WS=41165483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr17	41165734	rs443759	C	T	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1244;ReadPosRankSum=1.507;SC=TGCAAGATTACGGTGCAGGGA;SOR=0.672;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=97;TCR=124;TR=91;WE=41165742;WS=41165724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,106:0.42:252
chr17	41165878	rs13229	C	T	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=51;PP=1814;SC=CGTATGTGAACGGGGAGATCC;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=41165886;WS=41165868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	41167957	rs455055	C	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=841;ReadPosRankSum=-1.938;SC=ACCACAGAGACCTTCGGGGGA;SOR=0.880;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=50;WE=41167965;WS=41167947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr17	41170898	rs429464	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=2.013;SC=GGTACAAGGCTACCTTCTTCC;SOR=0.282;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=22;WE=41170906;WS=41170888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr17	41170943	rs55845054	GTAA	G	803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=763;SC=AATAGTCATGGTAATAATAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=17;WE=41170953;WS=41170933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	41174025	rs2070835	A	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=581;ReadPosRankSum=0.277;SC=TGACAGGCAGAGGCGGGAGAC;SOR=0.667;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=43;WE=41174033;WS=41174015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr17	41180772	rs12944458	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=0.385;SC=CCCAGGCTTCCTGACCTCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=18;WE=41180780;WS=41180762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr17	41215825	rs3092994	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.120;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=-0.673;SC=AGGTGTTAAACGTTAGGTGTA;SOR=0.077;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=17;WE=41215833;WS=41215815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr17	41219560	rs8176235	C	T	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1286;ReadPosRankSum=-1.593;SC=CATGCGCCACCGTGCCTCGCC;SOR=0.998;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=75;WE=41219568;WS=41219550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,84:0.64:131
chr17	41219780	rs8176234	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TACTAGTTATTCCACCATGGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=41219788;WS=41219770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr17	41219804	rs8176233	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	41223094	rs1799966	T	C	2482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1611;ReadPosRankSum=1.774;SC=GCAGCTGGACTCTGGGCAGAT;SOR=0.323;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=88;WE=41223102;WS=41223084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,103:0.62:165
chr17	41226601	rs273900734	G	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AATCATACTTGCTGGGCAGCC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=41226609;WS=41226591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr17	41234470	rs1060915	A	G	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=2060;ReadPosRankSum=0.268;SC=CAAGGGCAGAAGAGTCACTTA;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=117;TCR=103;TR=122;WE=41234478;WS=41234460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,149:0.56:265
chr17	41244000	rs16942	T	C	3328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=75;PP=2346;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AAGCTCTCCTTTCTGGACGCT;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=80;TCR=140;TR=118;WE=41244008;WS=41243990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,137:0.54:253
chr17	41244435	rs16941	T	C	3268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=79;PP=2409;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TGAGCTGGCTTCTTTAAAAAC;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=74;TCR=126;TR=123;WE=41244443;WS=41244425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,132:0.61:218
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chr17	41256075	.	AAAAAAAAAAAAG	A	2063	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=59.7;NF=12;NR=3;PP=2063;QD=137.933333333;SC=ACTCCATCTCAAAAAAAAAAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=15;WE=41256110;WS=41256065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr17	41256100	rs147856441	AAAG	A	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=2.106;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.407;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
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chr17	41291779	rs4792978	G	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=324;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TCATCATTTAGCTCCCACTTA;SOR=0.668;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=15;WE=41291787;WS=41291769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr17	41291953	rs11657835	C	G	2458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GTTCCTGACACAAGGATTCCT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=90;WE=41291961;WS=41291943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,105:0.57:185
chr17	41296197	rs35170910	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.256;NF=20;NR=11;PP=417;ReadPosRankSum=0.308;SC=CCGAGATTGCACCACTGCACT;SOR=0.377;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=31;WE=41296205;WS=41296187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr17	41327684	rs10684756	C	CTG	4793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=20;PP=2957;SC=TTGTTCATTGCTGTCTCCCAA;SOR=2.812;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=82;WE=41327692;WS=41327674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	41332804	rs9904555	T	C	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=21;PP=580;SC=TATTTTTTGTTCTTTTAGGAG;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=41332812;WS=41332794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	41465968	rs377041387	T	C	13704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=17.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=18.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-6.868;QD=26.61;ReadPosRankSum=-9.586;SOR=1.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,332:0.64:515
chr17	41465970	rs371420425	A	G	13719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=14.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=16.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-6.850;QD=27.66;ReadPosRankSum=-9.384;SOR=1.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,321:0.65:496
chr17	41465973	.	A	C	13145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.727;ClippingRankSum=0.000;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=15.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-6.801;QD=27.27;ReadPosRankSum=-8.320;SOR=1.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,314:0.65:482
chr17	41465975	rs142037739	T	C	12746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=11.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-6.941;QD=27.53;ReadPosRankSum=-7.382;SOR=1.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,298:0.64:463
chr17	41465989	rs147059896	A	G	9799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=5.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-7.068;QD=25.52;ReadPosRankSum=-3.107;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,247:0.64:384
chr17	41465993	rs145825652	T	C	9951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-6.902;QD=27.34;ReadPosRankSum=-3.348;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,239:0.66:364
chr17	41465994	.	T	C	9967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.234;ClippingRankSum=0.000;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-6.952;QD=27.61;ReadPosRankSum=-2.923;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,236:0.65:361
chr17	41466000	.	C	CGAGGGG	9921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-6.932;QD=28.19;ReadPosRankSum=-2.095;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,231:0.66:352
chr17	41466002	.	C	CGAG	10263.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=5.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-7.219;QD=31.20;ReadPosRankSum=-0.950;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,211:0.64:329
chr17	41466003	.	T	G	9102.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=10.922;ClippingRankSum=0.000;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=10.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-7.128;QD=28.54;ReadPosRankSum=-1.428;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,207:0.65:319
chr17	41466007	.	C	CG	8335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=14.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-6.478;QD=27.97;ReadPosRankSum=2.401;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,196:0.66:298
chr17	41466009	.	GC	G	10269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.924;ClippingRankSum=0.000;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=17.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-6.715;QD=34.70;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,193:0.65:296
chr17	41466019	.	T	G	9412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=18.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-3.651;QD=30.76;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,218:0.71:306
chr17	41466022	rs79526563	G	C	8947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=15.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-3.004;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,217:0.72:300
chr17	41466035	rs79889672	A	C	5750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=96;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.286;NF=75;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.283;SC=TCAGGGAAGCAGAAGGCCTGG;SOR=0.311;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=218;TCF=93;TCR=125;TR=159;WE=41466063;WS=41466009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,240:0.78:306
chr17	41466049	rs62080661	A	G	10914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=8.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.398;QD=33.58;ReadPosRankSum=1.776;SOR=0.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,268:0.82:325
chr17	41466055	rs62080662	G	C	10886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.584;QD=35.01;ReadPosRankSum=1.334;SOR=0.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,265:0.85:311
chr17	41466073	rs4986155	T	C	6510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.085;HP=1;HapScore=1;MGOF=215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=0.681;SC=GGGGCTGGAGTTCCTCTGCCA;SOR=0.463;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=108;TCR=118;TR=190;WE=41466081;WS=41466063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,267:0.87:307
chr17	41466096	rs62080664	A	G	7100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=2.405;SC=CAGGAGGCTGACACCAGACAC;SOR=0.430;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=249;TCF=126;TCR=123;TR=221;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,284:0.90:316
chr17	41466108	rs62080665	G	C	6616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=0.679;SC=ACCAGACACCGGGCAGAGGGA;SOR=0.401;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=245;TCF=124;TCR=121;TR=223;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,281:0.92:307
chr17	41466120	rs66825422	GCGGCGCATGGA	G	10323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.353;NF=24;NR=95;PP=2971;ReadPosRankSum=2.179;SC=GCAGAGGGAGGCGGCGCATGG;SOR=0.353;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=156;TCF=36;TCR=120;TR=119;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,249:0.90:278
chr17	41561601	rs140026870	CGGAAGGA	C	14839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.058;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.399;NF=8;NR=240;PP=2984;ReadPosRankSum=1.268;SC=TTGAGGGAAGCGGAAGGAGGA;SOR=2.255;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=315;TCF=15;TCR=300;TR=248;WE=41561615;WS=41561591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,346:1.00:347
chr17	41566783	rs141196624	CTCT	C	2894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=25;PP=1900;SC=TTGTTCATGTCTCTTCTTTTC;SOR=1.066;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=41;WE=41566793;WS=41566773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	41569933	rs11870101	C	T	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=1;PP=1264;SC=AACTCTAATTCAGTTCAAAAC;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=41569941;WS=41569923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	41622562	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGTGTGTGTGTGT	2004.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.34;MQRankSum=0.035;QD=28.24;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,48,20:0.68,0.28:71
chr17	41738823	rs9898682	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=276;ReadPosRankSum=-1.811;SC=ATTGCCTTCCGAGTGGGGGTT;SOR=0.502;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=20;WE=41738831;WS=41738813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr17	41846964	rs1230403	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=550;SC=CGAGCAGAGGTGGTGGGGGTG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=41846972;WS=41846954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	41955158	rs231521	A	G	8888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=171;NR=96;PP=2965;SC=AGTGAGCCAAAGACCAGGTGA;SOR=1.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=172;TCR=96;TR=267;WE=41955166;WS=41955148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr17	41959808	rs124721	T	C	12862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=176;NR=230;PP=2965;SC=GCAGGCCTTGTTGAGCCACCA;SOR=0.980;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=406;TCF=176;TCR=230;TR=406;WE=41959816;WS=41959796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,472:1.00:472
chr17	41960343	rs124719	T	C	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=46;NR=46;PP=1389;SC=GGTTGCTGAATGTAGGGTCCA;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=92;WE=41960351;WS=41960333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	41960633	rs412849	CG	GC	7341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=41;PP=2947;SC=TGCTCAGCCACGTGCGCCAGG;SOR=1.193;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=112;WE=41960642;WS=41960623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	41961451	rs231518	T	C	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=65;PP=2639;SC=AGCCACTTTATCCCAAAGTAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=132;WE=41961459;WS=41961441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	41987062	rs3744416	A	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=788;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GTATCTCTCTAATAAAGGCCT;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=51;WE=41987070;WS=41987052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr17	42015818	.	G	A	79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=5;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=79;QD=28.4428031368;SC=GAAAGCGGGGGGTGGGGGGGG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=42015839;WS=42015808;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	42030743	rs229969	G	C	9788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=182;NR=119;PP=2965;SC=GCGTCTTCGCGGGGAGCCTCG;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=182;TCR=119;TR=301;WE=42030751;WS=42030733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr17	42083840	rs228770	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=627;ReadPosRankSum=1.839;SC=TCCGTGGGGGTAGGGGGGCAG;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=30;WE=42083848;WS=42083830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr17	42084097	rs228771	C	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.256;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=397;ReadPosRankSum=0.728;SC=GTGGGCGGGCCGGGGACTGGG;SOR=0.162;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=30;WE=42084105;WS=42084087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr17	42085150	rs228773	T	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=806;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TGGTAGGTCCTGCCACTCCCA;SOR=1.094;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=64;WE=42085158;WS=42085140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,77:0.53:146
chr17	42085972	rs186636	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=523;ReadPosRankSum=-1.865;SC=GCAGCTGACCCTCACCATGGA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=27;WE=42085980;WS=42085962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr17	42090587	rs228778	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGGCTTCCCAGAGTGTAGAAC;SOR=0.069;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=42090595;WS=42090577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	42155838	rs9913925	G	A	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CAGGGGTGAGGGCAGAGAGGT;SOR=0.686;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=78;WE=42155846;WS=42155828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,96:0.46:209
chr17	42156471	rs376816	A	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=981;ReadPosRankSum=2.670;SC=GGCCCCTCAGACCTCTGGCCT;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=61;WE=42156479;WS=42156461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr17	42157739	rs850856	C	T	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=68;PP=2358;ReadPosRankSum=1.043;SC=GGGGCTCCCACTGACTACCAT;SOR=0.447;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=241;TCF=132;TCR=109;TR=143;WE=42157747;WS=42157729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,169:0.61:278
chr17	42158310	rs377963	T	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=710;ReadPosRankSum=-1.153;SC=ATGGTCAAATTCCACCTGTCA;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=36;WE=42158318;WS=42158300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr17	42164885	rs228757	G	C	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1524;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CCTCCCCATCGTCTTCCTCGT;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=89;WE=42164893;WS=42164875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,103:0.53:194
chr17	42170181	rs67111880	TG	T	824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=3.059;NF=2;NR=25;PP=367;ReadPosRankSum=1.057;SC=TCCCCTGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=0.275;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=27;WE=42170189;WS=42170170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
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chr17	42188311	rs228767	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=383;ReadPosRankSum=1.104;SC=GCAGCCCGCACAGCACAGGTT;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=19;WE=42188319;WS=42188301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr17	42225547	rs227584	A	C	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.03;MQRankSum=1.291;NF=46;NR=54;PP=1650;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GCTCAGAGAGACAGCAAGACC;SOR=0.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=259;TCF=121;TCR=138;TR=100;WE=42225555;WS=42225537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,114:0.38:302
chr17	42232442	rs2246287	C	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=728;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GGCTTGAGCTCAGGGAAGGCC;SOR=1.514;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=43;WE=42232450;WS=42232432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr17	42239349	rs730228	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=52;PP=889;ReadPosRankSum=0.443;SC=GCTCTGGGCATGTGTCTGGTC;SOR=0.534;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=175;TCF=47;TCR=128;TR=74;WE=42239357;WS=42239339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,80:0.42:192
chr17	42248346	rs7218599	A	T	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=69;PP=2465;SC=CTGTCCACCAAGCCCTCTTCT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=42248354;WS=42248336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	42249717	rs10628218	A	ATG	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=499;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TTGGGGAGAAATGTGTGTGTG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=11;WE=42249725;WS=42249707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr17	42254011	rs7220138	C	G	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=561;ReadPosRankSum=-1.507;SC=GGACCTCAAGCTGAGAGGGGT;SOR=0.453;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=43;WE=42254019;WS=42254001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr17	42254281	rs7212573	A	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=819;ReadPosRankSum=1.558;SC=TGCGCTGAACACGGCGTGCGC;SOR=0.939;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=63;WE=42254289;WS=42254271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,73:0.37:195
chr17	42254417	rs7212854	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,20:0.22:91
chr17	42254527	rs7217858	T	G	868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=453;ReadPosRankSum=0.565;SC=CGTCCAGGACTCCCCCAACTG;SOR=0.343;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=36;WE=42254535;WS=42254517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr17	42255097	rs3826412	T	C	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=71;PP=1639;ReadPosRankSum=0.698;SC=GAAGGTATGTTTGCCTCAGGG;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=262;TCF=78;TCR=184;TR=98;WE=42255105;WS=42255087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,101:0.36:280
chr17	42264962	rs4793082	A	G	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=29;PP=2263;SC=CATGGTTAATAACATTAACCT;SOR=1.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=104;WE=42264970;WS=42264952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	42266224	rs8073555	G	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=443;SC=AGGTCTTTAGGTTTAGGTTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=42266232;WS=42266214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	42268274	rs757430	C	T	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=899;SC=TTCTCCTTTACGGCCTCCCCA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=42268282;WS=42268264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	42271881	rs74464606	G	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=659;ReadPosRankSum=-0.350;SC=ACTGCATCACGTACCTAGACC;SOR=0.677;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=43;WE=42271889;WS=42271871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,50:0.36:138
chr17	42287519	rs2071167	C	T	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=822;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CTTCGGCTGCCTTCTTAATCC;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=55;WE=42287527;WS=42287509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr17	42294198	rs2269908	G	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=61;PP=1534;SC=CCCATCTGAAGGCACAGACAA;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=42294206;WS=42294188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	42294215	rs2269907	G	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=51;PP=1426;SC=ACAAGATATGGCTCAGCCCTA;SOR=2.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=65;WE=42294223;WS=42294205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	42335135	rs5017	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=912;ReadPosRankSum=0.837;SC=CAGTGGAGATCAGCAGCTCCG;SOR=0.568;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=53;WE=42335143;WS=42335125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr17	42337091	rs2857082	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.416;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=814;ReadPosRankSum=0.942;SC=TGCTTGTGGTCGGTTTTTCAG;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=51;WE=42337099;WS=42337081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,48:0.39:123
chr17	42389814	rs72824724	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=181;ReadPosRankSum=1.122;SC=CCTGTCTCCCCACTCGCTCTG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=9;WE=42389822;WS=42389804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr17	42392077	rs68030960	T	C	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=24;PP=1350;SC=GCCTGCTGCATCCTCTGGCCC;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=52;WE=42392085;WS=42392067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	42392440	rs146658412	C	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TGGGGACGTCCTGGTCCCACC;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=61;WE=42392448;WS=42392430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,63:0.52:120
chr17	42392622	rs708386	T	C	5888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=106;PP=2679;SC=TCGTCACCGATGAGGACAGCT;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=71;TCR=106;TR=177;WE=42392630;WS=42392612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr17	42398052	rs2011951	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=44;PP=1772;SC=TTCGGCCTGAACCCATTGAGC;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=95;WE=42398060;WS=42398042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	42398757	rs2011895	C	A	6419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=116;PP=2965;SC=GGGTTTGGGCCGAGGTGGGGA;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=84;TCR=116;TR=200;WE=42398765;WS=42398747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
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chr17	42427544	rs113219200	G	GAGTC	3266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.994;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=2606;ReadPosRankSum=0.005;SC=TGTGATGGGGGAGTCACCTTC;SOR=1.085;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=47;WE=42427552;WS=42427534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr17	42427732	rs850713	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.038;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1353;ReadPosRankSum=1.213;SC=GGAGATGGGGGTATGTGGAGG;SOR=0.470;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=85;WE=42427740;WS=42427722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,86:0.58:149
chr17	42430244	rs5848	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=0.166;SC=CTAGCACCTCCCCCTAACCAA;SOR=1.127;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=10;WE=42430252;WS=42430234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr17	42449789	rs5910	G	A	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1645;ReadPosRankSum=-1.130;SC=TGAAGAAGCCGACCTGGGGGT;SOR=0.590;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=103;WE=42449797;WS=42449779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,132:0.60:221
chr17	42453065	rs5911	A	C	3982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=85;PP=2663;ReadPosRankSum=0.425;SC=GGGGCTGGGGATGGGCAGCCC;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=223;TCF=97;TCR=126;TR=148;WE=42453073;WS=42453055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,172:0.64:267
chr17	42454270	rs850731	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=-1.062;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=1.473;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=42454278;WS=42454265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr17	42454463	rs850730	G	C	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.445;NF=36;NR=44;PP=1231;ReadPosRankSum=1.326;SC=CTATCTGGGAGATGAGGAGGG;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=80;WE=42454471;WS=42454453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,96:0.68:141
chr17	42455022	rs34603233	TGAGCCCCTG	T	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=2954;ReadPosRankSum=1.486;SC=TGGTTATTCATGAGCCCCTGG;SOR=1.911;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=42455038;WS=42455012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	42475557	rs61746719	C	T	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1767;ReadPosRankSum=0.493;SC=CATCCTCAGCCCCATCTGTTG;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=113;WE=42475565;WS=42475547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,122:0.44:279
chr17	42475983	rs936019	G	C	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=824;ReadPosRankSum=-0.555;SC=TGGGCTTTCGGGTAGCTGGGA;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=72;WE=42475991;WS=42475973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr17	42483233	rs2045088	T	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr17	42483531	rs1377808	T	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTATTAGTGTTGAACACATTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=42483539;WS=42483521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr17	42501692	rs1869495	C	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=404;ReadPosRankSum=-2.000;SC=GTACCTTCTTCTGTTAGCAAG;SOR=0.705;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=27;WE=42501700;WS=42501682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr17	42751607	rs6416902	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=0.560;SC=GATAAATATACCAAGACATGC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=42751615;WS=42751597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr17	42824402	rs4793144	C	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=826;ReadPosRankSum=0.902;SC=GCTCCTCCCCCCAAGGGCCCC;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=60;WE=42824410;WS=42824392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr17	42824648	rs9893320	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=180;ReadPosRankSum=0.076;SC=GCGATCTCTATGCTGCTATGG;SOR=0.949;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=14;WE=42824656;WS=42824638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr17	42824731	rs9912745	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=555;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CTCATCTAATGCCCTGTGCTC;SOR=0.687;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=35;WE=42824739;WS=42824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr17	42846994	rs8070918	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=126;ReadPosRankSum=-1.284;SC=TGGCCACCCCTTCCCCAGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=9;WE=42847002;WS=42846984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr17	42847033	rs58726064	C	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=275;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CCCCCCGACTCCCACCTTCAG;SOR=0.862;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=17;WE=42847041;WS=42847023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr17	42851634	rs62066014	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=0.736;SC=GAGGGCAGGAGGCCATCCTGA;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=42851642;WS=42851624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	42851729	rs35936481	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=227;ReadPosRankSum=1.395;SC=CCCTGTCCCACGGCGGGGGTG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=20;WE=42851737;WS=42851719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr17	42852604	rs1558083	G	T	4375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.09;ReadPosRankSum=2.412;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,116:0.43:272
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chr17	42853427	rs4792955	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.756;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=274;ReadPosRankSum=2.241;SC=CCAGAGAGCGAGGGGCCTGGG;SOR=1.235;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=19;WE=42853435;WS=42853417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
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chr17	42854610	rs8075210	T	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=647;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GCAAGGGATCTGGCTGGGTCC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=52;WE=42854618;WS=42854600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr17	42855248	rs2070603	T	C	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GCCTGGAGCCTGGGATGGCGG;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=100;WE=42855256;WS=42855238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,109:0.46:237
chr17	42855472	rs2070604	T	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.498;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=889;ReadPosRankSum=-1.288;SC=CTGTCTGTCCTGCTCTCTATG;SOR=1.051;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=209;TCF=89;TCR=120;TR=82;WE=42855480;WS=42855462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,93:0.40:235
chr17	42855554	rs2070605	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=360;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TTGGCTCCATTGCTGGGGCTG;SOR=0.643;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=28;WE=42855562;WS=42855544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr17	42857430	rs35504352	G	A	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=66;PP=1673;ReadPosRankSum=-0.668;SC=ACTCGGGGGCGCCTGGAGGGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=298;TCF=135;TCR=163;TR=120;WE=42857438;WS=42857420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,142:0.41:344
chr17	42857517	rs16970986	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=711;ReadPosRankSum=-0.944;SC=CAGGGTCTTACCTCTCTGGGA;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=32;TCR=96;TR=49;WE=42857525;WS=42857507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,53:0.38:141
chr17	42925559	rs12164	C	T	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=24;PP=1170;SC=CACCTGACGACGAAGACTGTG;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=42925567;WS=42925549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	42927628	rs2231647	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=7;PP=873;SC=GTGAACCCCTAGGACGCCTGA;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=42927636;WS=42927618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	42927965	rs2304987	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GGGCAAGGAAGATTCTTAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=42927973;WS=42927955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr17	42929970	rs2289673	T	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=29;PP=889;SC=TAGTCAAACATAGGCCAAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=42929978;WS=42929960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	42930859	rs78620114	G	A	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.423;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1498;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TGAAGCAGATGGTCCCCTACC;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=276;TCF=138;TCR=138;TR=106;WE=42930867;WS=42930849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,122:0.40:307
chr17	42932244	rs2289672	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=245;ReadPosRankSum=-1.782;SC=ACTGTGGCATCCCTGCCTCCT;SOR=1.460;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=42932252;WS=42932234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	42934372	rs6503405	A	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=616;ReadPosRankSum=0.412;SC=TGGTGGGGGTAGAGGTGGAAG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=25;WE=42934380;WS=42934362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr17	42934694	rs2277615	T	C	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=48;PP=1407;SC=GCTGTCCAAATCATCACCAAA;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=42934702;WS=42934684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	42945296	rs2120276	A	G	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=73;PP=2662;SC=TGAGTGACCCAGGGGAAAAGG;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=139;WE=42945304;WS=42945286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	42945867	rs3785890	A	G	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=65;PP=2053;SC=GAGGAAAACGAGGACACTGAG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=88;WE=42945875;WS=42945857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	42949808	rs11654183	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=434;ReadPosRankSum=1.117;SC=GCCAGCCAGCGCTTACCAAAG;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=28;WE=42949816;WS=42949798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr17	42953409	rs2289674	A	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=-1.382;SC=TGATGCACACAGTGACTGCCA;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=19;WE=42953417;WS=42953399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr17	42957127	rs2289675	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=739;ReadPosRankSum=1.089;SC=TTTCCTCCTCGCCATAACCCC;SOR=0.853;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=44;WE=42957147;WS=42957117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr17	42957139	rs2289676	C	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=46;PP=1563;SC=CATAACCCCCCACAGGGTAAA;SOR=2.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=42957147;WS=42957117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	42957855	rs1443463	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=36;PP=1729;SC=TTCTGCTCCGAAAAGTGAGAG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=42957863;WS=42957845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	42960624	rs1561970	G	A	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=49;PP=1249;ReadPosRankSum=0.754;SC=TAGGGATAAGGAGAGAAAAAG;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=76;WE=42960632;WS=42960614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
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chr17	42978554	rs7222312	T	C	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=519;ReadPosRankSum=0.798;SC=TTATGGTGGATTATAGTAGTT;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=32;WE=42978562;WS=42978544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr17	42978855	.	G	T	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1716;ReadPosRankSum=1.146;SC=ACAGCATTAAGTCCATTGCCT;SOR=0.762;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=106;WE=42978863;WS=42978845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,119:0.58:204
chr17	42979592	rs12451394	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.822;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-0.695;SC=AAATGAGGCCGCCAAGGACCA;SOR=0.291;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=21;WE=42979600;WS=42979582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr17	42979670	rs8079610	C	A	2854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=40;PP=1991;ReadPosRankSum=-1.942;SC=GGCTCCCCTCCCTGTCACTGT;SOR=0.881;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=115;TCR=70;TR=109;WE=42979678;WS=42979660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,122:0.59:208
chr17	42980189	rs8079308	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=1.732;SC=TGACTGATGCGGCAAGCTACC;SOR=1.186;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=18;WE=42980197;WS=42980179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr17	42981239	rs35098586	G	GAGT	1324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=1038;ReadPosRankSum=0.427;SC=GGGCATGGGGGCTCCAGGCCT;SOR=0.703;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=21;WE=42981247;WS=42981229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr17	42981499	rs12937256	C	T	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1670;ReadPosRankSum=-0.960;SC=GACATGCTGACCCGCTTCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=89;TCR=88;TR=91;WE=42981507;WS=42981489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,96:0.50:192
chr17	42981654	rs3826425	A	G	3483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=65;PP=2276;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TTTCCAGGACAAGGGCCAGGA;SOR=0.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=269;TCF=142;TCR=127;TR=142;WE=42981662;WS=42981644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,164:0.52:314
chr17	42982288	rs3744473	A	G	3533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=68;PP=2402;ReadPosRankSum=1.165;SC=TCTCATGGGCACTACCCAGCC;SOR=0.608;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=223;TCF=124;TCR=99;TR=148;WE=42982296;WS=42982278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,160:0.64:250
chr17	42984687	rs11558961	G	C	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=2551;ReadPosRankSum=-0.509;SC=TCATGAGACGGGGCAGAGGCC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=60;WE=42984707;WS=42984677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,68:0.69:99
chr17	42984699	rs113487550	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=23;PP=2699;ReadPosRankSum=-0.461;SC=GCAGAGGCCACCAGGTGGGTC;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=76;WE=42984707;WS=42984677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,84:0.70:120
chr17	42984842	rs11651396	G	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1157;ReadPosRankSum=-1.423;SC=GTGTAACCTTGGGAAGTCCCC;SOR=0.922;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=64;WE=42984850;WS=42984832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,73:0.54:134
chr17	42987482	rs12941832	G	T	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=8;PP=1493;ReadPosRankSum=1.808;SC=TGGGCAAAGCGCCGTGTCTGA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=101;TCR=14;TR=69;WE=42987490;WS=42987472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,74:0.61:121
chr17	42987524	rs9916491	T	C	4329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GCCGGCGGCGTTCCATTTACA;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=270;TCF=197;TCR=73;TR=165;WE=42987532;WS=42987514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,180:0.61:294
chr17	42988092	rs2289679	G	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=1.880;SC=GGGTCTTGGTGCGGGGCCATC;SOR=0.627;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=18;WE=42988100;WS=42988082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr17	42988959	rs2289671	T	C	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=13;PP=717;SC=CAGGTCCTCGTCCCTGGCCCT;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=42988967;WS=42988949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	43010064	rs57250020	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=421;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GTCCCGACTTGGGAGATCCTG;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=24;WE=43010072;WS=43010054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr17	43010451	rs9894373	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TCTCTCCCACGTCCCCATGAC;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=43010459;WS=43010441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr17	43037823	rs112921044	GCAGACCCAGAAA	G	609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.513;NF=2;NR=11;PP=2964;ReadPosRankSum=0.254;SC=GGGAGGATCAGCAGACCCAGA;SOR=1.739;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=43037842;WS=43037813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr17	43101708	rs3837839	G	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.11;QD=26.62;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	43111162	rs9303432	A	G	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=16;PP=1838;SC=CCACTGCACAAATGAAAAAAT;SOR=2.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=43111170;WS=43111152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	43111688	rs9900173	G	A	7718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=128;PP=2965;SC=TTATGTCGCCGTTCTCCAGCA;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=102;TCR=128;TR=230;WE=43111696;WS=43111678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr17	43170907	rs2239921	C	T	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=12;PP=1647;SC=GCTGGAAAGACGGTTTGCAGT;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=70;WE=43170915;WS=43170897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	43176804	rs2239923	C	T	7345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=111;PP=2965;SC=CCCACGGAAGCTGATTGAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=224;WE=43176812;WS=43176794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr17	43181287	rs4793167	A	G	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=102;PP=2965;SC=TGCAGGGAAGAGGCAGTGGAG;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=186;WE=43181295;WS=43181277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	43183028	rs1053733	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=45;PP=1365;SC=GTGCGATTCTGGATAAAGCCA;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=43183036;WS=43183018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	43183108	rs1053739	G	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=443;SC=GAGAATCCCTGGCAAAGGGAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=43183116;WS=43183098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	43192549	rs35911033	T	TC	3468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=40;PP=2667;SC=GGGTGCAGGGTCGCAGGCGGG;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=57;WE=43192557;WS=43192539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	43192681	rs713102	C	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=5.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,56:0.72:78
chr17	43192821	rs713101	A	G	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=48;PP=2105;SC=GCAGCGGGCAACTTCTTTCCC;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=43192829;WS=43192811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	43196584	rs12603813	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=993;SC=CAGGGCAGGATTTTTTGGTTT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=43196592;WS=43196574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	43198166	rs11382448	A	AG	1596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=11;PP=1269;SC=CCCTCAGGACAGGGCCCTGCC;SOR=2.030;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=32;WE=43198174;WS=43198156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	43213772	rs2306828	A	C	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=42;PP=2216;SC=GGGACCCATCACCACCTCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=43213780;WS=43213762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	43226477	rs67016906	TC	T	402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=30.98;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	43226887	rs12051846	A	G	9842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=149;PP=2965;SC=CAGAAGTGGAACCGACGCCCG;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=140;TCR=149;TR=289;WE=43226895;WS=43226877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr17	43227214	rs1044977	T	C	11519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=187;PP=2965;SC=AGGAGCCGGATCTCAAAACCG;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=352;TCF=165;TCR=187;TR=352;WE=43227222;WS=43227204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr17	43227766	rs78243847	T	TTTGG	2335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1920;SC=TCCCCCTGGCTTTGGTTTCGT;SOR=2.628;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=35;WE=43227774;WS=43227756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	43308183	rs58744688	A	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=1.752;SC=TCAGTGGCCAATGTAGCACCT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=17;WE=43308191;WS=43308173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr17	43314515	rs35156005	TG	T	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=648;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GGCCAGGTTTTGGTGGCCACA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=18;WE=43314523;WS=43314512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr17	43316520	rs1023995	T	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=814;ReadPosRankSum=-0.056;SC=TGGGGTCAGGTAGACCTGGGT;SOR=2.343;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=38;WE=43316528;WS=43316510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr17	43318778	rs7218169	GC	CG	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=38;PP=2103;SC=CCGCCATGGGGCCCTCCAGGC;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=73;WE=43318787;WS=43318768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	43319434	rs372669041	TCCG	T	2007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.023;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=1031;ReadPosRankSum=0.503;SC=GGCCGGTGCCTCCGCCGCCGC;SOR=1.123;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=25;WE=43319444;WS=43319424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr17	43342141	rs1047833	G	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CGTCTTTGGTGACCAAGCTGA;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=72;WE=43342149;WS=43342131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,88:0.65:135
chr17	43352049	rs17685379	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GTGCTCCACACACAGAGGCTG;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=10;WE=43352057;WS=43352039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	43364293	rs56405343	C	CG	14311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=126;PP=2969;SC=GAGGCAGAGCCGCCGTAGGCC;SOR=1.128;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=98;TCR=128;TR=223;WE=43364315;WS=43364283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr17	43585698	.	A	C	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.823;NF=39;NR=23;PP=971;ReadPosRankSum=-2.053;SC=ATGCGTGATTATTTACTCTTG;SOR=0.686;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=62;WE=43585706;WS=43585688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,65:0.61:107
chr17	43902915	rs71375321	G	A	3614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.692;NF=65;NR=81;PP=2280;ReadPosRankSum=1.379;SC=CGGATTCTGGGGGTCTGGTTT;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=286;TCF=130;TCR=156;TR=146;WE=43902923;WS=43902905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,170:0.49:346
chr17	43910455	rs17689966	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQRankSum=-6.956;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.044;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr17	43923180	rs242944	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQRankSum=-4.521;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.827;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr17	43923898	rs171443	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.41;QD=29.42;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	43924412	rs242943	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.619;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=0.879;SC=GAAATCAGGGTATCAAAGAGA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=7;WE=43924420;WS=43924402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr17	44091780	rs66499584	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQRankSum=-3.267;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	44248848	rs17662853	G	A	3168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.119;NF=84;NR=96;PP=2697;ReadPosRankSum=1.339;SC=GCTATACAAAGTTGTGTGTTC;SOR=0.845;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=320;TCF=153;TCR=167;TR=180;WE=44248856;WS=44248838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,149:0.57:261
chr17	44321273	rs370516109	A	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.461;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr17	44408406	.	A	G	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.57;QD=25.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	44788253	rs78850923	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=237;SC=AGCATGTACGGATTATAACTC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=44788261;WS=44788243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	44833217	rs35732828	C	A	3828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=63;PP=2171;ReadPosRankSum=0.488;SC=CACACAGTGACCAAGGGAAGT;SOR=0.583;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=282;TCF=172;TCR=110;TR=156;WE=44833225;WS=44833207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,183:0.55:333
chr17	44950122	rs4968281	T	C	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.53;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	45000547	rs183199	G	C	6749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=116;NR=94;PP=2965;SC=CGTGGCCTGCGGGGCCGGCGA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=210;WE=45000555;WS=45000537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr17	45012248	rs169126	T	G	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=676;SC=GCCTTTGCTTTGCTTTTTCTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=45012256;WS=45012242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr17	45017859	rs758392	A	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=715;ReadPosRankSum=1.214;SC=CTAGCGCAGGACTTTTGGTAA;SOR=0.448;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=45;WE=45017867;WS=45017849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,54:0.43:126
chr17	45044147	rs11079745	C	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=56;PP=1333;ReadPosRankSum=0.225;SC=ACCTGCCTTGCAAGAATTATT;SOR=1.038;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=17;TCR=92;TR=65;WE=45044155;WS=45044137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,65:0.59:110
chr17	45050533	rs11079746	T	C	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=64;PP=2030;SC=AAAACTGGAATGCCGGATGAG;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=45050541;WS=45050523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	45291103	rs11327482	TG	T	3559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=42;PP=2263;SC=TACTTCCCTTTGGGGGGCCTT;SOR=1.149;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=69;WE=45291112;WS=45291093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	45300218	rs4968309	C	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=214;SC=CTGCCCTCCACCCACCTTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=45300226;WS=45300208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	45331502	rs115526188	C	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.753;SC=CTGAGAGGTGCCTGGTGCCTG;SOR=1.445;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=45331510;WS=45331492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	45360730	rs5918	T	C	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=49;PP=1351;ReadPosRankSum=0.217;SC=GCCCTGCCTCTGGGCTCACCT;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=304;TCF=175;TCR=129;TR=118;WE=45360738;WS=45360720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,140:0.39:360
chr17	45364722	rs2292865	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.349;SC=GGGCTCGGTTCCAGCTTGCCC;SOR=0.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=45364730;WS=45364712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	45367244	rs17218711	G	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-1.232;SC=TCAGGAAAGAGTCTCCCCTAA;SOR=0.111;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=15;WE=45367252;WS=45367234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr17	45368337	rs15908	A	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=527;ReadPosRankSum=-1.425;SC=GTTCTAAAGTAGAGCTGGAAG;SOR=0.358;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=40;WE=45368345;WS=45368316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,47:0.35:133
chr17	45369777	rs4642	A	G	2219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.397;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=0.329;SC=AGCAGGACGAATGCAGCCCCC;SOR=0.906;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=244;TCF=132;TCR=112;TR=94;WE=45369797;WS=45369767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,107:0.39:274
chr17	45369789	rs4634	G	A	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.109;SC=GCAGCCCCCGGGAGGGTCAGC;SOR=0.840;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=248;TCF=132;TCR=116;TR=101;WE=45369797;WS=45369767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,114:0.40:282
chr17	45380002	rs3760372	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=322;ReadPosRankSum=1.207;SC=CATACTTCCCTGGAAGTCCTG;SOR=0.963;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=21;WE=45380010;WS=45379992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr17	45385012	rs3809863	C	T	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1467;ReadPosRankSum=1.063;SC=CAGTAAGAGACGGGGCTGGGC;SOR=0.581;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=92;WE=45385020;WS=45385002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,109:0.65:168
chr17	45422628	rs7214410	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GCAAAAGTAGATAGTTTAATC;SOR=3.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=45422636;WS=45422618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	45425115	rs7206971	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=262;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AGAGTGGGGGGAATAAGGATA;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=15;WE=45425123;WS=45425105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr17	45425144	rs3851808	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=524;ReadPosRankSum=1.283;SC=TTTTGATTAACTAACTAAATG;SOR=1.075;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=26;WE=45425152;WS=45425134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr17	45438886	rs10538163	CAGTG	C	3007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.110;NF=2;NR=45;PP=2277;ReadPosRankSum=0.329;SC=CCTATATTGACAGTGAGTTAT;SOR=0.557;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=5;TCR=78;TR=47;WE=45438897;WS=45438876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr17	45438952	rs6504872	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CATTTTTTTCCGGATATCAAT;SOR=0.468;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=45438960;WS=45438942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr17	45451894	rs4968318	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=573;ReadPosRankSum=0.551;SC=GTTATCAAGTGTAGCAGGATG;SOR=0.424;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=35;WE=45451902;WS=45451884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr17	45479446	rs12452315	A	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=443;ReadPosRankSum=0.087;SC=GCTTTATTGGATCTGACTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=28;WE=45479454;WS=45479436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr17	45479706	rs11079774	C	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.540;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GCAGATGAAACTTGGTTTTGA;SOR=0.136;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=45479714;WS=45479696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr17	45534062	rs59134940	A	G	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.017;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.959;NF=45;NR=28;PP=974;ReadPosRankSum=-1.580;SC=TATTACAATGATCATGTGGAA;SOR=0.910;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=216;TCF=124;TCR=92;TR=73;WE=45534070;WS=45534052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,85:0.35:245
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chr17	45569815	rs2610367	A	G	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.705;NF=19;NR=29;PP=883;ReadPosRankSum=0.264;SC=TTGAGGTATGAGGGCTGCCAT;SOR=0.806;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=48;WE=45569823;WS=45569805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
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chr17	45623409	.	G	GGTGT,GGT	237.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.114;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.746;NF=6,6;NR=35,35;PP=428,676;ReadPosRankSum=2.031;SC=GCATATGTGGGGTGTGTGTGT;SOR=1.508;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=102;TCF=11;TCR=91;TR=41,41;WE=45623417;WS=45623399;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.22:40
chr17	45623439	.	T	TGTGAGAGA	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=0.247;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.604;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
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chr17	45663912	rs112743441	T	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.174;NF=9;NR=7;PP=343;ReadPosRankSum=0.136;SC=ATTTCAAGAATGCAGATGGAC;SOR=0.160;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=16;WE=45663920;WS=45663902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr17	45668339	.	T	G	71	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=43.26;NF=0;NR=8;PP=71;QD=13.2214015684;SC=ACTTTGAAAATAAGAGAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=8;WE=45668347;WS=45668329;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,8:0.21:38
chr17	45669359	rs200616431	T	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-1.854;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:352,50:0.12:402
chr17	45669428	rs59875832	T	TA	743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQRankSum=-5.308;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,42:0.35:121
chr17	45677192	rs34538095	CT	C	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.842;QD=3.32;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	45695832	rs3760370	C	T	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=61;PP=1538;ReadPosRankSum=1.324;SC=CAGTAAGTTACGGTGAAAACT;SOR=0.806;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=294;TCF=145;TCR=149;TR=115;WE=45695840;WS=45695822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,141:0.37:380
chr17	45695914	rs3760371	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=664;ReadPosRankSum=1.556;SC=TTGAGCTGCCTTAACCCTAAC;SOR=0.881;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=145;TCF=42;TCR=103;TR=41;WE=45695922;WS=45695904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,54:0.30:178
chr17	45700384	rs3065062	C	CCTA	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=388;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AACAGTATATCCTAATAAGCC;SOR=1.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=9;WE=45700392;WS=45700374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr17	45734209	rs68149542	CTTT	C	1662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=592;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TATCTTTTGTCTTTTTTTTTG;SOR=0.820;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=31;WE=45734219;WS=45734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr17	45742233	rs56226803	T	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.010;SC=TGGACCTATATTATATGGCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=45742241;WS=45742223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr17	45750596	rs3809868	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=531;ReadPosRankSum=1.495;SC=ACCTAGGTCTGTTTTCCAGAC;SOR=0.512;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=102;TCF=13;TCR=89;TR=32;WE=45750604;WS=45750586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr17	45754307	.	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,21:0.22:95
chr17	45754569	rs11301979	AC	A	2903.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=52;PP=2345;SC=TTAAATATCGACCAGGCTGGG;SOR=2.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=57;WE=45754577;WS=45754559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	45755810	rs4239162	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.944;SC=CCCTTCGTCCGCTCGCCAATG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=17;WE=45755818;WS=45755800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr17	45757598	rs7210738	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=539;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GATGGCAACAGTTCACTTTTT;SOR=0.498;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=34;WE=45757606;WS=45757588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr17	45774072	rs8078309	T	C	3603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=57;PP=1878;ReadPosRankSum=-1.513;SC=CCACCCCACCTGCAGTACCCA;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=213;TCF=116;TCR=97;TR=127;WE=45774080;WS=45774062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,164:0.60:272
chr17	45786452	rs4794057	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CCAGCCACCACGTGAAGGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=22;WE=45786460;WS=45786442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr17	45786621	rs80267077	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=569;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CCCGCGGCGCGCCTTCGAGGG;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=37;WE=45786629;WS=45786611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,54:0.60:90
chr17	45885687	rs9907142	A	G	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=16;PP=1144;SC=CCATGTTCCCATAGCCTGGCT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=45885695;WS=45885677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr17	45887951	rs2074189	G	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=976;ReadPosRankSum=0.169;SC=GAGAGTCTAAGAATCCCACCT;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=49;WE=45887959;WS=45887941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,57:0.66:87
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chr17	45892545	rs55998645	T	C	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=652;ReadPosRankSum=-1.556;SC=AGGTCCCCCCTACCCCGCCTC;SOR=0.965;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=34;WE=45892553;WS=45892534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
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chr17	45893862	rs17773860	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=583;ReadPosRankSum=1.350;SC=CAGGGAGTGGGGCAGACCATC;SOR=0.597;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=41;WE=45893870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
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chr17	45896053	rs62076126	G	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=487;ReadPosRankSum=0.343;SC=AGAAGTCAGGGCTCTGGTCCC;SOR=0.749;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=32;WE=45896061;WS=45896043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr17	45896478	rs878171	T	C	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=57;PP=1827;SC=GGGGGTGAAGTGTTGGTAGAG;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=45896486;WS=45896468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	45896637	rs8077844	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=0.390;SC=CATGTGCAGAACGCTCCCCTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=45896645;WS=45896627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	45897531	rs1985407	C	A	6188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=82;PP=2965;SC=TGTCTGGTTCCAGCTTGGCCC;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=108;TCR=82;TR=190;WE=45897539;WS=45897521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	45904420	rs11538868	C	T	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=45;PP=2319;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TTGGGGAAGACCTTCATCAGG;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=260;TCF=178;TCR=82;TR=152;WE=45904428;WS=45904410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,166:0.59:283
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chr17	45905850	rs4793671	C	T	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=32;PP=1677;SC=GTGACATGTACCCAAATTCCT;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=45905858;WS=45905840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	45912696	rs17701113	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GCTTGGTTTCCCCACTTCGGT;SOR=0.866;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=65;WE=45912704;WS=45912686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,76:0.58:130
chr17	45913847	rs16948662	C	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,30:0.24:127
chr17	45915395	rs6503875	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=507;ReadPosRankSum=-1.767;SC=CTGAGATGAGTCTGTCCGGGA;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=29;WE=45915403;WS=45915385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,38:0.32:117
chr17	45915468	rs878295	T	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=805;ReadPosRankSum=-1.576;SC=AGAAAGGAGATACCCCCCGAC;SOR=0.798;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=37;WE=45915476;WS=45915458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr17	45915788	rs7350974	T	C	6866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=109;PP=2965;SC=GCCACCCCCATCCCGAAGATG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=113;TCR=109;TR=222;WE=45915796;WS=45915778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr17	45917147	rs1004770	C	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-1.134;SC=TGGCACTGATCGTATCAAATG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=45917155;WS=45917137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	45959620	rs17616603	T	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TGGATGGTATTTGAACTTTCC;SOR=0.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=172;TCF=69;TCR=103;TR=68;WE=45959628;WS=45959610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,84:0.42:201
chr17	45992622	rs11871969	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.858;NF=22;NR=16;PP=627;ReadPosRankSum=0.758;SC=GAGGCAAGTGGGCTTGCGTTC;SOR=0.394;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=38;WE=45992630;WS=45992612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr17	46000406	rs62067380	T	C	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TGCAGCCACCTCTAACACCAC;SOR=0.554;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=234;TCF=132;TCR=102;TR=84;WE=46000414;WS=46000396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,99:0.35:282
chr17	46030644	rs3833856	T	TG	939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.250;NF=0;NR=26;PP=737;ReadPosRankSum=0.303;SC=TGGAGCAGGGTGGGGGAGACA;SOR=0.705;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=26;WE=46030652;WS=46030634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr17	46048157	rs2525084	A	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	46048165	rs2597168	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	46048168	rs2255697	C	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	46048592	rs2905846	A	G	5194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=92;PP=2965;SC=CTCCCTCCGGAAGCGGCTCAA;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=77;TCR=92;TR=169;WE=46048600;WS=46048582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	46048858	rs2525085	C	G	4794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=97;PP=2965;SC=GAGCTCTGACCCCTGAAAGCC;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=59;TCR=97;TR=156;WE=46048866;WS=46048848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	46048920	rs72823513	A	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=648;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CTGTGGCCAGACCTGCTTCCC;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=34;WE=46048928;WS=46048910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr17	46051911	rs886444	G	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=652;SC=TCTGTGAGTGGGAAGAGACTG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=46051919;WS=46051901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	46052793	rs2597172	A	G	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=997;SC=GCCTGGTTGCACCCCCTTTGG;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=46052801;WS=46052783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	46054264	rs2525087	C	A	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=59;PP=2023;SC=GTGTCTGTAACGGCATCACTT;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=100;WE=46054272;WS=46054254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	46055106	rs2597173	C	T	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=52;PP=2226;SC=GAATGTGCAGCCATTGACCTC;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=115;WE=46055114;WS=46055096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	46055347	rs2875746	A	G	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=44;PP=1326;SC=CTAGAAACAAAAAATGCAGCG;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=46055355;WS=46055337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	46055419	rs149811876	A	AG	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.98;MQRankSum=0.349;NF=0;NR=8;PP=236;ReadPosRankSum=-0.586;SC=ATGTGAGCTGAGGGGGACCAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=46055427;WS=46055409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	46103760	rs12051	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=428;ReadPosRankSum=0.765;SC=TGGGGAAATGATCTGGGGGGC;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=34;WE=46103768;WS=46103750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr17	46106634	rs9898218	G	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=-1.035;SC=CCTCTCCGAAGGCATCCTGCA;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=6;WE=46106642;WS=46106624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr17	46109371	rs72823530	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.647;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=879;ReadPosRankSum=-1.359;SC=CGCTAGTAAGGGGAAGGGCTA;SOR=1.914;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=43;WE=46109379;WS=46109361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr17	46114692	rs41280120	C	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=-0.737;SC=GGCCCTGGCCCGGGTAGACTC;SOR=2.303;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=17;WE=46114700;WS=46114682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr17	46115072	rs199699704	C	CG	1145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;QD=42.43;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	46115084	rs201261614	T	TGG	1167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	46115122	.	A	AG	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=145;SC=GGACGTGGCCAGCCTCGGGCC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=46115130;WS=46115112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	46132212	rs373501023	T	TG	982.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=17;PP=795;SC=GGAAGGGGGCTGGCTGGGCCG;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=46132220;WS=46132202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	46132424	rs72823599	C	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=414;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GGGGGCCATGCCAAAGGCAGC;SOR=0.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=26;WE=46132432;WS=46132414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr17	46190106	.	T	TC	124	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5001;HP=15;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=50.11;NF=0;NR=5;PP=124;QD=25.4;SC=TTTTTTTTTTTTTTGAGATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=46190114;WS=46190096;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,5:0.56:9
chr17	46190819	rs8080662	G	A	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=78;PP=2269;SC=GGGTGCTTATGTAGGAACTGG;SOR=1.478;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=37;TCR=78;TR=115;WE=46190827;WS=46190809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	46195926	.	C	T	328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=53.35;NF=21;NR=0;PP=328;QD=17.2748196451;SC=GGCGACAGAGCGAGACTCCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=21;WE=46195947;WS=46195916;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr17	46198876	rs3744346	G	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=427;SC=AGTGAGCTCTGGGTTCTGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=46198884;WS=46198866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	46234053	rs72825550	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TGGGGCCAAGGAATGCATGGA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=15;WE=46234061;WS=46234043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	46239985	rs208005	A	G	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=46;PP=1515;SC=TTTCCGAGGTACCCATGTTTT;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=46239993;WS=46239975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	46262171	rs2278868	C	T	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1183;SC=ATCCGTACACCGTAGCCCTTA;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=46262179;WS=46262161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	46265433	rs2305433	G	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=564;SC=CACTCCCACAGGTTATCCCAT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=46265441;WS=46265423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	46266849	rs66753385	G	A	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=62;PP=1563;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CTCCTTTTACGATGTCTTCCA;SOR=0.847;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=195;TCF=68;TCR=127;TR=92;WE=46266857;WS=46266839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,118:0.50:236
chr17	46607021	rs7226137	T	C	7071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=97;PP=2965;SC=GACCCGACCTTCCTCTCGCTC;SOR=0.913;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=218;WE=46607029;WS=46607011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	46620288	rs1042815	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=1.591;SC=AGAAGAAAGGGAGTGGATTAA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=10;WE=46620296;WS=46620278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr17	46622335	rs111979968	A	AC	511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=495;SC=ATCGGAAGGGACCCCCCTCCT;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=46622343;WS=46622325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	46629593	rs2229304	G	T	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=82;PP=2948;SC=GCCGACAGGGGCTCGGGGGCC;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=132;WE=46629601;WS=46629583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	46632725	rs72332254	AGG	A	1405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.78;MQRankSum=0.657;QD=43.93;ReadPosRankSum=1.773;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr17	46632729	.	AGG	A	1411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.70;QD=41.52;SOR=3.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	46651061	rs2288277	T	C	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=13;PP=1219;SC=GCAAACCTGCTGAAGCATCCA;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=46651069;WS=46651051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	46669430	rs9299	C	T	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=2;PP=325;SC=AGACCTAAGACCAAACGAAAT;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=46669438;WS=46669425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	46670520	rs7406798	T	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=3;PP=950;SC=AGGGGAATATTTGCGGAGTCT;SOR=3.365;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=46670528;WS=46670510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	46673723	rs12949148	TC	GT	15288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=167;NR=99;PP=2947;SC=TCTGACGCCCTCGGCTCCCCA;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=176;TCR=106;TR=266;WE=46673732;WS=46673713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr17	46675240	rs34438598	G	T	5298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=0.165;SC=CGTCGGCGCCGGAGAGTGCGC;SOR=0.656;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=340;TCF=136;TCR=204;TR=207;WE=46675248;WS=46675230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,229:0.60:382
chr17	46688256	rs7406910	T	C	11413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=185;PP=2965;SC=GAAAATAAAGTATTCGCATAA;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=336;TCF=151;TCR=185;TR=335;WE=46688264;WS=46688246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr17	46691587	rs112987208	A	AGGCCCCCTGCCC	555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.866;NF=9;NR=1;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CCGGCCTGCCAGGCCTTGGGC;SOR=1.592;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=10;WE=46691595;WS=46691577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr17	46709835	rs718079	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=196;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CCAGCTAAGCAAGGAGCAGTA;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=12;WE=46709843;WS=46709825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr17	46799812	rs1054072	A	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=521;ReadPosRankSum=0.358;SC=CTTGCAAGCAAGCATCGGCCT;SOR=1.129;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=28;WE=46799820;WS=46799802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr17	46805221	rs9899142	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CCTTCAGAGTCCTAATAACCA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=9;WE=46805229;WS=46805211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr17	46805590	rs8556	G	A	4098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=96;PP=2480;ReadPosRankSum=-1.083;SC=CAGTGGGGCGGCTGGGGTACT;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=429;TCF=191;TCR=238;TR=172;WE=46805598;WS=46805580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:312,207:0.40:519
chr17	46840178	rs12936178	T	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1054;ReadPosRankSum=0.249;SC=GTTGGCCCCATTGCTGCTACT;SOR=0.633;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=91;TCR=41;TR=68;WE=46840186;WS=46840168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr17	46862675	rs507973	T	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	46862675	.	TC	AT	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=89;QD=47.4892916207;SC=AGGAAAGCAGTCGATAGTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=46862684;WS=46862665;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr17	46862676	rs640087	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	46878625	rs17634167	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.954;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,31:0.23:135
chr17	46879079	rs12947660	G	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-1.327;SC=CCATTACTAGGTGCTCCCAGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=46879087;WS=46879069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr17	46881748	rs489005	T	C	6586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=105;PP=2965;SC=AAACAAGAACTGGAATGCACA;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=205;WE=46881756;WS=46881738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr17	46894597	rs114722761	A	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=47;ReadPosRankSum=0.513;SC=GCGCTAGGGGAGGGGCGCGCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=5;WE=46894605;WS=46894587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr17	46926772	rs551605	A	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=466;SC=ACCTTGGAGCATGGAGATCAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=46926780;WS=46926762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	46934001	rs72437948	GCATT	G	2253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=43;PP=2248;SC=TAAATGCTGTGCATTCATTCA;SOR=4.534;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=2;TCR=79;TR=44;WE=46934012;WS=46933991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	46970836	rs684682	A	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=40;PP=1322;SC=GCCGCGCCGCAGTGCTCTGTA;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=46970844;WS=46970826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	46972479	rs3080082	ATCTC	A	6050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.15;MQRankSum=1.775;NF=32;NR=66;PP=2974;ReadPosRankSum=0.636;SC=ATGCCATACTATCTCTCTGCT;SOR=0.628;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=188;TCF=72;TCR=116;TR=98;WE=46972490;WS=46972469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,156:0.56:277
chr17	46973139	rs35074390	TG	T	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=763;SC=TGAGGCTCCATGGGGGGGTCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=28;WE=46973147;WS=46973129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	46985756	rs71144541	AG	A	615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=5;PP=524;SC=GTGGAAGCGGAGGGGGTGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=15;WE=46985764;WS=46985746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	46993370	rs4378658	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=468;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGGTGTTGCCGGGCCCCAGGG;SOR=0.462;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=29;WE=46993378;WS=46993360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr17	47000251	rs1058018	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=0.195;SC=ACGACTTCTACGAGGTGGCCT;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=34;WE=47000259;WS=47000241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr17	47010795	rs72523750	CAG	C	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=986;ReadPosRankSum=-2.573;SC=AGGATACTGACAGAAAATTTA;SOR=1.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=23;WE=47010804;WS=47010785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr17	47011897	rs57901004	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=257;ReadPosRankSum=0.727;SC=ACCCAGGAGGCGGAGGTTGCA;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=23;WE=47011905;WS=47011887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr17	47013382	rs140139274	G	GTTTGT	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.623;NF=7;NR=3;PP=405;ReadPosRankSum=0.452;SC=CTTATTTTTTGTTTGTTTTTT;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=47013401;WS=47013372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr17	47013717	rs3215074	AT	A	208.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CTAGTTCCTAATTTTTTTTTA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=47013725;WS=47013707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr17	47014675	rs2132201	C	T	9273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.184;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=207;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GGTCAGACGGCTCCAGAGGGC;SOR=1.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=291;TCF=83;TCR=208;TR=290;WE=47014683;WS=47014665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,319:1.00:320
chr17	47014754	rs2132200	T	C	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.14;NF=2;NR=73;PP=2131;SC=CTTTGGGACATCGAGCTAGGT;SOR=6.413;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=75;WE=47014762;WS=47014744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	47035869	rs4793605	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TTCCTTTTCATTGGGTGGTGC;SOR=2.303;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=47035877;WS=47035859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	47036043	rs72833611	C	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=570;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GGGCAGAATCCAGTCCTGAGC;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=37;WE=47036051;WS=47036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr17	47038391	rs6504587	T	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=31;PP=1021;SC=TAGCCTGAGCTTCGCCCAGAG;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=47038399;WS=47038381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	47038434	rs75421129	G	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=167;ReadPosRankSum=0.451;SC=CACCACTGAGGGGCAGCCGCG;SOR=0.770;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=15;WE=47038442;WS=47038424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	47038471	rs4794004	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=0.377;SC=CGACACAGCTATCTCTCCGTT;SOR=1.276;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=11;WE=47038479;WS=47038461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	47039132	rs2291725	T	C	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=636;ReadPosRankSum=0.676;SC=TTAGCTTGACTGGCCAGCTCC;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=53;WE=47039140;WS=47039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr17	47039254	rs2291726	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=0.797;SC=TCTTTTAATATCTGAACCCCA;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=21;WE=47039262;WS=47039244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr17	47044463	rs62078384	C	T	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1643;ReadPosRankSum=-0.612;SC=ACCTGTCATCCCCTAACCCCT;SOR=0.852;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=189;TCF=105;TCR=84;TR=106;WE=47044486;WS=47044453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,140:0.58:240
chr17	47076551	rs2411760	G	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=7;PP=179;SC=AGCTCTTTTCGGGGGGGGTGG;SOR=0.836;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=13;WE=47076559;WS=47076541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	47109368	rs34685424	TG	T	1028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=480;ReadPosRankSum=1.848;SC=CTGGGTGCGGTGGGGGGGGGT;SOR=0.328;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=2;TCR=92;TR=35;WE=47109376;WS=47109358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr17	47109427	rs8079385	C	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=215;ReadPosRankSum=-1.670;SC=TCAGGGGGGTCTAGGCAGGCT;SOR=0.384;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=14;WE=47109435;WS=47109417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr17	47119832	rs2289637	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=444;ReadPosRankSum=0.408;SC=TGCCCTGTGCCGTGTGGCCTT;SOR=0.386;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=33;WE=47119840;WS=47119822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr17	47120776	rs2289636	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-2.149;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,22:0.33:67
chr17	47210429	rs7207842	A	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=777;ReadPosRankSum=-1.099;SC=TCCACGTGGAAGTGGCCTCTC;SOR=0.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=56;WE=47210437;WS=47210419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,72:0.30:237
chr17	47210506	rs7207403	C	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=741;ReadPosRankSum=1.248;SC=GGCTTCGGGGCTCTCTGCTTG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=47;WE=47210514;WS=47210496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,50:0.39:128
chr17	47219542	rs12453819	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=955;ReadPosRankSum=-0.064;SC=GAGGTAATGCGGGTCATGAAG;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=53;WE=47219550;WS=47219532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr17	47230360	rs62079773	T	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=43;PP=868;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GGCTCATGCCTGTAATTCCAG;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=23;TCR=109;TR=53;WE=47230368;WS=47230350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,53:0.39:137
chr17	47237802	rs1523137	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=442;SC=TCTCATCCCAACCAGGACTCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=47237810;WS=47237792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	47238028	rs8071836	C	T	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=62;PP=2293;SC=CTTGGGGCTCCGTGGTGGCAA;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=108;WE=47238036;WS=47238018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	47241604	rs8074457	T	C	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=93;PP=2965;SC=TTAAAGACAATCACGTGGAGT;SOR=1.213;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=55;TCR=93;TR=148;WE=47241612;WS=47241594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
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chr17	47484228	rs2233667	G	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=967;ReadPosRankSum=0.848;SC=TAAGGGGAGAGAGTGAGCACA;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=59;WE=47484236;WS=47484218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr17	47583581	rs55759007	A	G	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.477;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=28;PP=1574;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GGCAGGCAATAGGGGAGGGAG;SOR=0.339;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=144;TCF=102;TCR=42;TR=84;WE=47583589;WS=47583571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,92:0.58:158
chr17	47588000	rs11466155	C	T	7561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=135;PP=2965;SC=TGGTTGTGGGCCTTGTGGCCT;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=104;TCR=135;TR=239;WE=47588008;WS=47587990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr17	47688881	rs140209761	T	TAGAG	2256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=37;PP=2313;SC=TGCCAGCAGATAGACGACTTT;SOR=3.215;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=38;WE=47688889;WS=47688871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	47780065	rs73335243	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=3;PP=244;SC=GATCGTACCACTGCACTCACT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=47780073;WS=47780055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	47780707	rs375908491	TGC	T	1861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=1442;SC=ACACAAAATGTGCGCACACAC;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=35;WE=47780716;WS=47780697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	47785064	rs9908959	C	A	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=383;SC=TGGGGAGAGACTGTCGGCCCG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=47785072;WS=47785054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	47801651	rs11079874	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CACCCCCCACACAAACCTGTT;SOR=3.056;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=47801659;WS=47801641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr17	47888852	rs4462645	A	G	7247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=106;PP=2965;SC=CAACGGAGAGACAGCTTCGAT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=216;WE=47888872;WS=47888842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr17	47924289	rs185701868	T	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.408;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=19;PP=1430;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TCCTCCGTTTTGCAGGTGAGG;SOR=1.258;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=152;TCF=107;TCR=45;TR=77;WE=47924297;WS=47924279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr17	48068720	rs8081044	T	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=491;SC=GTCCATGCAATTGTCATCTGG;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=48068728;WS=48068710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	48151908	rs4793639	T	C	6310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=97;PP=2965;SC=GGTGAGATTGTTCTGCCCACC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=196;WE=48151916;WS=48151898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	48155771	rs16948648	C	T	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=38;PP=1074;SC=CAGGCCTCCACTTTCCCTGGA;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=48155779;WS=48155761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	48158680	rs141893882	A	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=992;ReadPosRankSum=0.236;SC=CCAGGATTACAGAGACTTTGA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=67;WE=48158688;WS=48158670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,74:0.64:115
chr17	48165064	rs12951197	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=34;PP=1625;SC=AGGATGGGCCTAAGCAGGCTG;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=79;WE=48165072;WS=48165054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	48172779	rs7221362	A	C	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=37;PP=2359;SC=GACCACAACCAAAGTCGCGGC;SOR=1.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=79;TCR=37;TR=116;WE=48172787;WS=48172769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	48174908	rs9839	C	T	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.146;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=58;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GCACACCCTCCGTGCAGCTGG;SOR=1.140;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=218;TCF=81;TCR=137;TR=84;WE=48174916;WS=48174898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,104:0.41:256
chr17	48184288	rs847694	G	A	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=57;PP=2508;SC=GAGAAGCCCCGGGGACCCCTC;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=48184296;WS=48184278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	48184377	rs847693	A	G	6122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=73;PP=2965;SC=CCCAGTATCAATGTCAGGAGG;SOR=1.025;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=177;WE=48184385;WS=48184367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	48186131	rs3059824	T	TCTC	2368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=43;PP=2329;SC=GGGAGGCTTCTCTCCTCACTC;SOR=3.139;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=45;WE=48186139;WS=48186121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	48186817	rs56409353	C	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=449;ReadPosRankSum=-1.894;SC=CTGATAGGACCTGGGCAGCCT;SOR=0.897;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=32;WE=48186825;WS=48186807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr17	48187470	rs60269840	G	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=-0.449;SC=AAGGGCCGCCGTGCATCTGCA;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=38;WE=48187478;WS=48187460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr17	48187546	rs61328000	G	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.967;SC=CCTCCTGGGGGAGCAGGGGGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=48187554;WS=48187536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	48191818	rs77267183	A	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=48;PP=1154;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CACACAGGACATGATAACTCA;SOR=0.527;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=126;TCF=21;TCR=105;TR=60;WE=48191826;WS=48191808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr17	48202122	.	T	TGCACGC	206	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=62.65;NF=3;NR=1;PP=206;QD=57.25;SC=CCTGCACGCGTGCACGCGCGC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=48202130;WS=48202118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	48202129	rs202016696	G	GCA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=53.79;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	48202135	.	GCACACACACA	G	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	48202147	.	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=37.35;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,8:1.00:8
chr17	48202149	.	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.16;ReadPosRankSum=2.744;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	48212647	rs11317638	GA	G	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=1222;SC=GGGGAGGGAGGAACAATGGGA;SOR=2.242;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=29;WE=48212655;WS=48212637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	48212910	rs3744535	A	G	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=14;PP=1166;SC=AGGGCGCCCCAGGCCCACCTT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=48212918;WS=48212900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	48216944	rs1569116	C	T	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=62;PP=1308;ReadPosRankSum=2.206;SC=CATACTCTCCCGTCTGCGAAG;SOR=0.931;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=202;TCF=66;TCR=136;TR=88;WE=48216952;WS=48216934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,102:0.42:241
chr17	48226445	rs112058541	G	GC	257.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=239;SC=TGGCTGGCGAGCGGGGGCGGC;SOR=1.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=6;WE=48226453;WS=48226435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	48227384	.	G	GGC	6622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=90;PP=2957;SC=GCCGCGCCGCGCTCCTTGTCG;SOR=1.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=12;TCR=92;TR=102;WE=48227392;WS=48227374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	48227403	.	G	GGC	5831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=83;PP=2973;SC=CGCCGCCTGCGCGCTGGGGCG;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=7;TCR=83;TR=90;WE=48227411;WS=48227393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	48243504	rs9911548	C	T	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=75;PP=2824;SC=GGTGGTAAGACGGAGGTGTGG;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=149;WE=48243512;WS=48243494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	48245180	rs2696297	C	T	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=947;ReadPosRankSum=0.049;SC=GGATTGGGTGCTCATTCACAG;SOR=0.288;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=58;WE=48245188;WS=48245170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,65:0.62:104
chr17	48245269	rs59944537	C	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1143;ReadPosRankSum=0.144;SC=CCACGTTTCTCCCCTAACCCA;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=132;TCR=112;TR=88;WE=48245277;WS=48245259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,115:0.39:298
chr17	48248906	rs1046329	C	G	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1309;ReadPosRankSum=-2.077;SC=ACCCTTCGAACCCCCTTGATA;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=230;TCF=120;TCR=110;TR=78;WE=48248914;WS=48248896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,101:0.36:278
chr17	48249450	rs2696293	C	G	3468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=82;PP=2499;ReadPosRankSum=0.035;SC=GAAGTCTCCACTGGGCTGCCC;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=240;TCF=102;TCR=138;TR=136;WE=48249458;WS=48249440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,144:0.57:253
chr17	48252804	rs2696288	T	C	5557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.201;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.762;SC=ACTGACAGCCTAGCCAGGTAG;SOR=0.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=183;WE=48252812;WS=48252794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr17	48253193	rs201486782	GA	G	2027.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=1515;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CAAGCAGGGAGAGGGGGTGGG;SOR=1.033;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=42;WE=48253201;WS=48253183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,66:0.39:168
chr17	48258140	rs2586484	T	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=9;PP=466;SC=CTCGCATTCTTTCCCACGCGG;SOR=1.101;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=25;WE=48258148;WS=48258130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	48258284	.	GA	G	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.277;SOR=1.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr17	48258321	rs2586485	C	T	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.971;SC=TACTGTATTCCGGTGATAGAA;SOR=0.740;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=57;WE=48258329;WS=48258311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,73:0.61:120
chr17	48262775	rs1061237	A	G	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=931;SC=TTGGCTTTTGAGGGGGTTCAG;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=48262783;WS=48262765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	48263903	rs2277632	A	G	3220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=70;PP=2283;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AGTCAGGGAAAGGGAGCAGCC;SOR=0.653;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=210;TCF=89;TCR=121;TR=123;WE=48263911;WS=48263893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,133:0.59:227
chr17	48264717	rs2696245	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=4;PP=314;SC=GATTCTTCCTCTCTTTGCCCA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=48264725;WS=48264707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	48265495	rs1800215	T	C	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=67;PP=1856;SC=ACAGGACCGGTGGGACCAGCA;SOR=2.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=89;WE=48265503;WS=48265485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	48265542	rs41316705	G	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=339;ReadPosRankSum=1.323;SC=TGAGCTCTTGGCCAGGGAAGG;SOR=2.066;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=19;WE=48265550;WS=48265532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr17	48266669	rs2586489	G	C	8039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=108;PP=2965;SC=AGGTGCCAGAGAGCAGCACAG;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=251;WE=48266677;WS=48266659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr17	48267585	rs2075558	A	C	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1385;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TCCCGTCTCCACCCTTCTCCC;SOR=0.919;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=75;WE=48267593;WS=48267575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,96:0.49:194
chr17	48268223	rs2734272	A	G	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=79;PP=2965;SC=CAATGGGGCCAGTCAGACCAC;SOR=1.232;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=139;TCR=79;TR=218;WE=48268231;WS=48268213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr17	48268443	rs2075557	G	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=410;ReadPosRankSum=1.600;SC=AAGGGTGCCTGCCTGGAGACT;SOR=1.270;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=20;WE=48268451;WS=48268433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr17	48268626	rs2696246	A	G	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=52;PP=2965;SC=AAGGGGAAGAAGGGAGGATTA;SOR=1.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=118;TCR=52;TR=170;WE=48268634;WS=48268616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr17	48269302	rs2857396	G	A	4105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=79;PP=2437;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGCCAAGTACGACGCACCTTG;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=151;TCR=151;TR=159;WE=48269310;WS=48269292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,192:0.55:352
chr17	48269903	rs2696247	A	G	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=32;PP=1617;ReadPosRankSum=1.578;SC=TAGGTGGGAAATGGGGGAAGA;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=105;TCR=54;TR=94;WE=48269911;WS=48269893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,115:0.59:194
chr17	48273439	rs2734281	T	C	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=42;PP=1875;SC=CATAACCTGCTCCCATTGTCA;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=92;WE=48273447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	48273464	rs2141279	T	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=45;PP=2187;SC=CAAGAGCAGATACTGAGACCC;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=102;WE=48273472;WS=48273454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	48276004	rs5820805	G	GC	3900.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=86;PP=2957;SC=AGACATTCCTGCAAAGATGCA;SOR=2.812;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=0;TCR=92;TR=86;WE=48276012;WS=48275994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	48277059	.	AGCCCCAG	A	611.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=3;PP=387;SC=CCCCAGCCCCAGCCCCAGGCC;SOR=2.584;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=8;WE=48277073;WS=48277049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	48356260	rs6504642	G	C	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=69;PP=2096;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GAGCCAGACAGCCCAGTGGAT;SOR=0.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=91;TCR=120;TR=122;WE=48356268;WS=48356250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,143:0.59:244
chr17	48423415	.	AG	A	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5007;HP=9;HapScore=2;MGOF=47;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=23;QD=22.0;SC=GGCGTGGAGGAGGGGGGGCGG;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=48423423;WS=48423405;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
chr17	48431032	rs739990	G	A	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1823;ReadPosRankSum=-0.702;SC=ACCCTGGCGAGGGTTCCAAGG;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=107;WE=48431040;WS=48431022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,132:0.75:176
chr17	48431197	rs739989	C	T	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CTGCCCCACCCCCGGAAGCCC;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=72;WE=48431205;WS=48431187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,75:0.64:118
chr17	48432042	rs11430429	G	GA	3312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=45;PP=2827;SC=AGGTAGCCTAGGAGGGAAACT;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=64;WE=48432050;WS=48432032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	48432324	rs12451299	G	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1476;ReadPosRankSum=0.914;SC=AGCCTCCTGAGGATGTACCTG;SOR=0.792;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=103;WE=48432332;WS=48432314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,113:0.67:168
chr17	48432681	rs2526538	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=0.773;SC=GCAAGGGGCAGAGGAAGGATG;SOR=0.180;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=48432689;WS=48432678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr17	48433081	rs886568	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=801;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TGCCAGGCGGGTGAAAGAGCT;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=47;WE=48433089;WS=48433071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr17	48433958	rs4794136	T	C	5910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.511;SC=TCCACCTGTATGGCAGCTACC;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=412;TCF=191;TCR=221;TR=241;WE=48433966;WS=48433948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,278:0.59:475
chr17	48437456	rs6504649	C	G	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1593;ReadPosRankSum=-1.813;SC=CAGCGGCACACACAGCTCACA;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=223;TCF=120;TCR=103;TR=101;WE=48437464;WS=48437446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,117:0.43:271
chr17	48440522	rs10656180	T	TCCA	6919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=80;PP=2967;SC=CCTGTCCTTCTCCACCATATT;SOR=1.324;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=27;TCR=88;TR=106;WE=48440533;WS=48440512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	48445674	rs111380254	CCTGGTCAG	C	2081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.923;NF=4;NR=29;PP=2983;ReadPosRankSum=0.532;SC=AACACACAGACCTGGTCAGCT;SOR=0.653;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=33;WE=48445689;WS=48445664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr17	48445699	rs2586438	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.848;NF=13;NR=30;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.073;SC=AGCTGGTCAGCGAGGTGGTCC;SOR=0.828;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=43;WE=48445707;WS=48445689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr17	48452481	rs17714829	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.247;SC=AGCCTGGCTATGGAACACAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=48452489;WS=48452471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr17	48452776	rs3760413	A	C	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=72;PP=2965;SC=CTGTCCCAGAAATAGCTGAAA;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=169;WE=48452784;WS=48452766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	48452978	rs3060668	A	AAGC	6590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=71;PP=2966;ReadPosRankSum=0.750;SC=TGACTGGAAAAAGCCCTTTCC;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=50;TCR=142;TR=96;WE=48452986;WS=48452968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,163:0.55:295
chr17	48455985	rs2189712	A	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=615;ReadPosRankSum=0.865;SC=AGGAGCCAACAGTACTGGTGT;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=33;WE=48455993;WS=48455975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
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chr17	48457567	rs917029	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=11;PP=1025;SC=GTAACATGGCGCCCACCTCTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=48457575;WS=48457557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	48460720	rs74695075	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=1.803;SC=AACTCCCCAGGCCCTGAAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=48460728;WS=48460710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	48460745	rs3744525	C	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	48460750	rs3744524	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	48465636	rs3760412	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=587;ReadPosRankSum=0.417;SC=GTGGTGGCTCACGCCTGTAAC;SOR=3.134;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=25;WE=48465644;WS=48465626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr17	48469724	rs757509	T	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=709;SC=CCAGGGAGTGTATAAGGAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=48469732;WS=48469714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	48472270	rs3760407	C	T	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=12;PP=1711;SC=GAAGGAGTCACGGCTGCATGC;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=76;WE=48472278;WS=48472260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	48474501	rs72832501	G	A	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=43;PP=2067;ReadPosRankSum=0.321;SC=TAGAGAAGAGGAAAGTAAGTG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=138;TCR=75;TR=122;WE=48474509;WS=48474491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,147:0.58:255
chr17	48503473	rs371898261	GCGCCC	G	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	48504132	rs9901133	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=276;ReadPosRankSum=-2.770;SC=TCATGGGCAAACTTGGGGATC;SOR=0.207;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=16;WE=48504140;WS=48504122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr17	48539763	rs2277631	C	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TGTCTCTCACCATCGTCCCCA;SOR=1.046;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=153;TCF=64;TCR=89;TR=64;WE=48539771;WS=48539753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,67:0.40:167
chr17	48539997	rs8082089	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=666;ReadPosRankSum=-0.449;SC=ATGCCCCCTGTCCCTGTGACA;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=40;TCR=95;TR=44;WE=48540005;WS=48539987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,49:0.33:149
chr17	48540960	rs3744522	C	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=407;ReadPosRankSum=-0.959;SC=AAACCCTCTTCTTCCTCACTC;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=29;WE=48540968;WS=48540950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr17	48541443	rs2277630	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=156;ReadPosRankSum=0.657;SC=CCAGCCCAGGGCCAGCTGCCA;SOR=0.731;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=15;WE=48541451;WS=48541433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,15:0.23:66
chr17	48541491	rs2277629	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=607;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AGAAAAGGGAATGTTCCTCCC;SOR=1.008;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=137;TCF=91;TCR=46;TR=45;WE=48541499;WS=48541481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,49:0.31:156
chr17	48541707	rs898455	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=392;ReadPosRankSum=-1.382;SC=TGGGATGACAGCAGATGGACA;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=27;WE=48541715;WS=48541697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr17	48542572	rs898454	C	G	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=21;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.844;SC=CCCTCCAGGGCCAGGGGGTAT;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=171;TCF=120;TCR=51;TR=73;WE=48542580;WS=48542562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,87:0.45:192
chr17	48543391	rs2231506	A	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.742;SC=ATCTCAGATAATCCAATCTAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=48543399;WS=48543381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr17	48545596	rs34864120	G	A	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1366;ReadPosRankSum=1.980;SC=GGTTCTCCACGTCGTCCAGGG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=257;TCF=130;TCR=127;TR=98;WE=48545608;WS=48545586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,107:0.37:293
chr17	48549791	rs2305998	C	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=850;ReadPosRankSum=1.151;SC=TGTCCCAGGCCCGGATCATGA;SOR=0.631;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=59;WE=48549799;WS=48549781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr17	48557326	rs2290862	G	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=729;ReadPosRankSum=-2.366;SC=TGTGGCACAGGCAGCCCACCT;SOR=0.701;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=51;WE=48557334;WS=48557316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,52:0.37:141
chr17	48557348	rs2290861	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=755;ReadPosRankSum=-1.588;SC=CCTGCAGACTTGGAAGTCACA;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=54;WE=48557356;WS=48557338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,54:0.37:146
chr17	48560550	.	A	AAAAG	323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.60;QD=35.97;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	48598785	rs1380657	G	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=623;ReadPosRankSum=-0.435;SC=TGAAGACACAGCATACTTGTG;SOR=1.390;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=41;WE=48598793;WS=48598775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
chr17	48599195	rs9893172	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=443;SC=GGAAGCTGCGTGGGAGTGGAG;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=48599203;WS=48599185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	48599450	rs7216625	A	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.472;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=296;ReadPosRankSum=0.265;SC=AAGGTAAAACAGCCTCCACCA;SOR=1.559;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=24;WE=48599458;WS=48599440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,24:0.27:89
chr17	48602098	.	T	TGTGAGAGAGA	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=3.402;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.726;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
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chr17	48606537	rs1133818	C	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.930;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=0.504;SC=ACACCCAGAGCCTGCACAGTG;SOR=0.144;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=23;WE=48606545;WS=48606527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr17	48606606	rs4793659	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=0.899;SC=TATTCATTCCGTTCAGTCTGC;SOR=0.111;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=48606614;WS=48606596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	48607280	rs6504671	G	C	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,84:0.44:190
chr17	48607614	rs4794156	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CAGCACTTTGGGAGGCCAAGG;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=8;WE=48607622;WS=48607604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr17	48608717	rs1064055	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=402;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CCCTGGTGACTGACCTGATGG;SOR=0.399;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=28;WE=48608725;WS=48608707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr17	48608951	rs2277627	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GCCCTCAGATCCCCTCCTGCC;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=48608959;WS=48608941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	48610272	rs755046	G	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.764;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=741;ReadPosRankSum=-1.344;SC=GTGCCGTCCCGCTGCTGCACA;SOR=0.427;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=48;WE=48610280;WS=48610262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr17	48613837	rs3785915	A	G	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.997;SC=CCCATCCTTCAAGACTGTGAC;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=74;WE=48613845;WS=48613827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr17	48616114	rs4794158	C	G	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=992;SC=GCTGACTGAGCGGCAAATGGC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=48616122;WS=48616104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	48618106	rs7215760	A	G	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=45;PP=2615;SC=GCCCTGGGCGAGGGATAAGGG;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=130;WE=48618114;WS=48618096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	48619249	rs4794159	C	A	5936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=105;PP=2965;SC=CGCGGGCGAGCCGGGCAGGCC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=81;TCR=105;TR=186;WE=48619257;WS=48619239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	48624523	rs9890200	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr17	48625543	rs12943759	G	A	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.447;SC=CTGGGAGCAGGGGTCCTACTG;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=98;WE=48625551;WS=48625533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,113:0.62:181
chr17	48625828	rs8076470	C	T	3852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=90;PP=2260;ReadPosRankSum=-0.338;SC=AGCACCTCTCCTGGGGCCCTG;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=386;TCF=159;TCR=227;TR=155;WE=48625836;WS=48625818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:270,190:0.41:460
chr17	48625928	rs8076632	C	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=48;PP=1223;ReadPosRankSum=-1.026;SC=CCCCTGGGGACAGGAAGCCTT;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=152;TCF=47;TCR=105;TR=71;WE=48625936;WS=48625918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr17	48626389	rs8077316	C	T	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,65:0.37:176
chr17	48626398	rs8077323	C	T	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=3.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,66:0.36:183
chr17	48626575	rs8077587	C	T	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=48;PP=1788;ReadPosRankSum=0.271;SC=AGTTGGGGGACCAGGGTGGGG;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=232;TCF=121;TCR=111;TR=105;WE=48626583;WS=48626558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,120:0.45:268
chr17	48626626	rs8076628	G	A	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1683;ReadPosRankSum=0.601;SC=TGACCTCCAGGTGTGCCCCCA;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=111;WE=48626634;WS=48626616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,121:0.47:257
chr17	48627860	rs10586811	CCT	C	1649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.490;NF=14;NR=16;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TCCCCAGTGACCTCTCTGTTC;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=30;WE=48627869;WS=48627850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,50:0.31:159
chr17	48628092	rs1132414	A	G	4141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=82;PP=2809;ReadPosRankSum=-0.589;SC=ATAGCGCAGAAGATGCAGACT;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=494;TCF=268;TCR=226;TR=185;WE=48628100;WS=48628082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:369,209:0.36:578
chr17	48628470	rs9913430	T	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=764;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CTTGCTCAATTCAGGGCTGGA;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=35;TCR=87;TR=53;WE=48628478;WS=48628460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,55:0.42:132
chr17	48628581	rs9913677	T	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-1.671;SC=ACCGAGCCTGTCTGTAGGATC;SOR=0.591;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=6;WE=48628589;WS=48628571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr17	48629312	rs8082568	G	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=0.945;SC=AGCCCCTCCCGTAATGCCTGT;SOR=0.118;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=16;WE=48629320;WS=48629302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr17	48629458	rs8065903	A	G	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=93;PP=2965;SC=ACACAGGACAAGCTCTTTTGG;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=88;TCR=93;TR=181;WE=48629466;WS=48629448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr17	48631607	rs739924	T	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=641;ReadPosRankSum=0.871;SC=CCCTATGTGCTGTAGACCAGG;SOR=1.020;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=40;WE=48631615;WS=48631597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,42:0.29:147
chr17	48631857	rs873839	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=-0.984;SC=TAGGAGGGAAGTTGGGGCTGC;SOR=0.088;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=9;WE=48631865;WS=48631847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr17	48646346	.	A	AGT	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5036;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.975;NF=3;NR=26;PP=1323;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCTGCAGGTGAGTGTGTGTGT;SOR=0.407;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=29;WE=48646354;WS=48646336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr17	48646376	.	T	TGTGTGTGGTG	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=-1.947;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.280;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr17	48652875	rs198550	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TCTTCAGGACATTTCCTCTTC;SOR=0.343;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=14;WE=48652883;WS=48652865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr17	48653130	rs116920450	G	A	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1149;ReadPosRankSum=1.586;SC=CAGGTCTCTCGGGCAGCAGGT;SOR=0.816;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=66;WE=48653138;WS=48653120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr17	48678325	rs198530	A	T	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=69;PP=2965;SC=CTGGGAGGGCACTGGAGGGGC;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=156;WE=48678333;WS=48678315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	48687430	rs11658835	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=132;ReadPosRankSum=-0.906;SC=GGGGCTGAAGCGCTGGGCTCT;SOR=0.138;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=10;WE=48687438;WS=48687420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr17	48692881	rs8066527	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=654;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CAGGTAGGAGCGAGTGGACCA;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=48;WE=48692889;WS=48692871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,51:0.41:123
chr17	48693760	rs4794171	G	C	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=53;PP=1449;SC=CGGAGAAAAGGGGGGTCTTGG;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=86;WE=48693768;WS=48693750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	48696879	.	C	CTGTGTGTGTGTTTGTG	1143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=7.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=2.553;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.042;SOR=2.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr17	48698906	rs4794172	C	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=217;ReadPosRankSum=0.216;SC=TTCCCGCCCCCCTGTGCTTCG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=17;WE=48698914;WS=48698896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr17	48701800	rs2301835	C	T	3732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=62;PP=2185;ReadPosRankSum=0.533;SC=CTCATCTGCTCCAGCCCCACA;SOR=0.922;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=141;WE=48701808;WS=48701790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,172:0.59:292
chr17	48703752	rs739925	T	C	8701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=144;PP=2965;SC=AGCGCCGGCCTACGTCCTGGC;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=112;TCR=144;TR=256;WE=48703760;WS=48703742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr17	48712336	rs201886646	G	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=269;ReadPosRankSum=-1.643;SC=TCGGCTCCAAGTTCTGGGTAA;SOR=1.096;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=22;WE=48712344;WS=48712326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr17	48712705	rs12604031	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,72:0.41:177
chr17	48712711	rs9890046	C	G	5924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=73;PP=1540;SC=CCGCGGGTTCCTGATGGAGGG;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=157;WE=48712719;WS=48712695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	48738266	rs2301837	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=-0.352;SC=ACCCACTGCTCCTTCCTCCCT;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=9;WE=48738274;WS=48738256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr17	48746135	rs879459	C	T	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.340;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=796;ReadPosRankSum=1.741;SC=GTCCTCCTTTCCCCTGCCCCC;SOR=0.540;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=36;WE=48746143;WS=48746125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr17	48746923	rs4794176	G	C	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=84;PP=2121;SC=AAGAGGCTAGGGCATAGAGCT;SOR=2.176;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=109;WE=48746931;WS=48746913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	48752890	rs2072366	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=432;ReadPosRankSum=0.630;SC=GGCCTCCCCAGGCCCTGCCAG;SOR=0.357;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=24;WE=48752898;WS=48752880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr17	48753522	rs8077268	C	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=789;ReadPosRankSum=1.000;SC=CCCCCCAAACCGTGCCCTTGC;SOR=0.235;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=42;WE=48753530;WS=48753512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr17	48755002	rs2240802	G	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=5;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.166;SC=TGGGAGTGAGGCTGGCTGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=96;TCR=9;TR=63;WE=48755010;WS=48754992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr17	48785100	rs3744519	C	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	48797210	rs11398903	T	TG	6047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=108;PP=2973;SC=CCGCGGGCCTTGGCCTGAGCC;SOR=1.637;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=10;TCR=113;TR=118;WE=48797218;WS=48797200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr17	48801239	rs117687704	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=227;ReadPosRankSum=0.085;SC=CAAGTGATCGGTCCGCCTCAG;SOR=0.869;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=17;WE=48801247;WS=48801229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr17	48821201	rs9894501	T	C	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=1.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	48821207	rs9894508	T	C	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=2.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	48822204	.	T	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.982;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTGAGGCAGATTCTTGCTCTG;SOR=0.268;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=23;WE=48822212;WS=48822194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr17	48823815	rs2302288	C	T	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=739;SC=TAAGTTTTGCCTAGTCTTGTT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=48823823;WS=48823805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	48834080	rs9303561	A	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.094;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	48834194	rs12600608	A	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=613;ReadPosRankSum=-0.590;SC=ACAGCTTCCAAAGAAGCTTTT;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=37;WE=48834202;WS=48834184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr17	48913571	rs4420571	C	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=742;ReadPosRankSum=-1.121;SC=GGGTGGGAGCCGTCGGGGAGG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=41;WE=48913579;WS=48913561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr17	48917333	rs9675120	C	T	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1736;ReadPosRankSum=0.930;SC=AGACAGTGAGCTTCCTCTGTG;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=298;TCF=159;TCR=139;TR=113;WE=48917341;WS=48917323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,125:0.35:354
chr17	48940422	rs4626	T	C	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1282;ReadPosRankSum=-2.229;SC=CTACAAAAGATTTCTCATTGA;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=80;WE=48940430;WS=48940412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,92:0.40:228
chr17	49054439	rs9332407	T	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1212;ReadPosRankSum=-2.022;SC=TCCTATTTGTTCCATGGCAGT;SOR=0.399;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=75;TCR=28;TR=67;WE=49054447;WS=49054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr17	49060107	rs12453116	T	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=607;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AACATTTTATTTGTTGTATAA;SOR=0.349;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=31;WE=49060115;WS=49060097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr17	49067763	rs9899816	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=287;ReadPosRankSum=0.777;SC=GGCATCTGAGTGTAGCCTTAG;SOR=0.238;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=24;WE=49067771;WS=49067753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr17	49076907	rs61490626	TA	T	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.228;NF=6;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=-0.922;SC=ACCCCTAGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.842;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=10;WE=49076915;WS=49076897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	49082563	rs56264945	G	A	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GTCCAAAATTGTAAACCTACA;SOR=0.531;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=88;WE=49082571;WS=49082553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,104:0.62:168
chr17	49097501	rs2286649	C	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=911;ReadPosRankSum=-1.260;SC=AATATGTCTTCATCTAACATT;SOR=0.561;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=56;WE=49097509;WS=49097491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr17	49124845	rs11400140	G	GA	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=468;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTTAAAGAAAGAAAAAATACA;SOR=0.382;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=16;WE=49124853;WS=49124835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr17	49124944	rs12453437	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=TCAGACTACTCGATTCCAAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=49124952;WS=49124934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	49156907	rs8081821	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=626;ReadPosRankSum=0.955;SC=GCCAAGCCCAATCTTTAGTGT;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=40;WE=49156915;WS=49156897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr17	49197654	rs5820842	A	AC	849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.35;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	49245891	rs60017501	G	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=585;ReadPosRankSum=-1.423;SC=TGTTAGCTGGGTGTGGTGGTG;SOR=0.968;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=25;WE=49245899;WS=49245881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr17	49270643	rs35987233	AT	A	123.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	49271018	rs12453388	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	49279300	rs183424885	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=0.554;SC=TATGTAATTGTGATTTCCGTA;SOR=0.646;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=49279308;WS=49279290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr17	49281133	rs17574235	G	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=18;PP=1165;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATTACGGTAAGGGTAAATAAA;SOR=0.843;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=127;TCR=48;TR=71;WE=49281141;WS=49281123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,80:0.39:204
chr17	49296550	rs113352672	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=0.744;SC=ACAAGAATTTTAACATGAGAA;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=49296558;WS=49296540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	49350802	rs2318789	A	C	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1125;ReadPosRankSum=1.825;SC=TTCCAAGAGGAATCTTGAAGG;SOR=1.136;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=66;WE=49350810;WS=49350792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr17	49371230	rs12940196	G	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=201;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GCTCCCAGTTGTTACACTTTA;SOR=1.127;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=14;WE=49371238;WS=49371220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr17	49371505	rs917654	C	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=28;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TTAATAAATTCTAGTCTGTTT;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=49371513;WS=49371495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr17	49710713	rs3815371	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=1.728;SC=GGAGTGTGATGGCTATTGTCA;SOR=1.936;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=14;WE=49710721;WS=49710703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr17	49711041	rs59307927	A	ACCC	405.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.506;NF=0;NR=8;PP=435;ReadPosRankSum=0.318;SC=CGTGAGATCCAACCATCCTCT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=49711050;WS=49711031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr17	49711042	rs60848939	A	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=476;ReadPosRankSum=0.496;SC=GTGAGATCCAACCATCCTCTT;SOR=1.051;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=49711050;WS=49711031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr17	49713205	rs10514986	G	T	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=908;ReadPosRankSum=0.586;SC=AATGACCAGAGAGAAACTCAC;SOR=1.016;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=63;WE=49713213;WS=49713195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,74:0.39:188
chr17	49713300	rs11870209	G	A	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1070;ReadPosRankSum=0.598;SC=TCGACCCATCGTAAGTGATGA;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=209;TCF=100;TCR=109;TR=81;WE=49713308;WS=49713290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,97:0.39:248
chr17	49713428	rs139939914	GACAT	G	533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=676;ReadPosRankSum=0.937;SC=TGGTATTGCTGACATACATAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=14;WE=49713439;WS=49713418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr17	49825262	rs145522191	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=787;ReadPosRankSum=1.151;SC=GGATCAACACCTTTTGCTTCC;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=39;WE=49825270;WS=49825252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr17	50149899	rs5820905	C	CT	158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	50212169	rs7218252	G	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=676;ReadPosRankSum=-0.879;SC=ACTGTGCCCTGGCACCATGGA;SOR=0.180;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=17;WE=50212190;WS=50212159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr17	50212182	rs1503057	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=676;ReadPosRankSum=0.618;SC=ACCATGGATGTCACTGCCATC;SOR=0.950;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=20;WE=50212190;WS=50212159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr17	51900729	rs3803824	C	T	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=2352;ReadPosRankSum=1.291;SC=CAGCGTACCGCCACGAAATGG;SOR=0.600;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=337;TCF=176;TCR=161;TR=132;WE=51900737;WS=51900719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,161:0.40:405
chr17	51901084	rs3803825	A	G	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=100;PP=2965;SC=AGACAACCTTAAAGGACCTGG;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=89;TCR=101;TR=189;WE=51901092;WS=51901074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	51901385	rs3803826	C	T	5567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.372;SC=CATTTATGCTCTGGTGGCACA;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=322;TCF=178;TCR=144;TR=195;WE=51901393;WS=51901375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,246:0.61:401
chr17	51901643	rs4561518	C	T	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=47;PP=1651;SC=CAGGCAAACACCTGTCAACGC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=51901651;WS=51901633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	51901703	rs4561519	C	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=35;PP=1720;SC=GAAGTCAGGACGGATAATGCA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=51901711;WS=51901693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	51902252	rs3826355	C	T	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=94;PP=2965;SC=TAGCCAATGGCTGGAAAACAT;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=180;WE=51902260;WS=51902242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	51902492	rs10693171	A	AAAT	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=1567;SC=AAAACTGTCCAAATTATCTAA;SOR=3.383;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=30;WE=51902500;WS=51902482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	52989920	rs72829469	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=2.655;SC=AATTATGTTTGTTAATTAGGA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=52989928;WS=52989910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	52991371	rs74969989	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr17	52993346	rs2934935	G	A	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=29;PP=771;SC=CCTGATTTCAGTTGATTTCTA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=52993354;WS=52993336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	53007655	rs12939352	T	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=0.745;SC=TGCCTACAAGTGACCCCTCTT;SOR=1.863;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=14;WE=53007663;WS=53007645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr17	53014232	rs5821077	A	ATTAAG	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.693;NF=1;NR=11;PP=684;ReadPosRankSum=1.468;SC=ACTTAATGTTATTAACGTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=12;WE=53014240;WS=53014222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr17	53038082	rs2287136	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=2.369;SC=TTTTCTAAGGGCCATCTGAGT;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=53038090;WS=53038072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	53038430	rs4793784	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=386;ReadPosRankSum=0.828;SC=AACTATCAAAACTTATTTATT;SOR=1.220;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=17;WE=53038438;WS=53038420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr17	53038783	rs1057980	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=610;ReadPosRankSum=1.127;SC=TGACAACAGCGTGAGATTTCA;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=28;WE=53038791;WS=53038773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr17	53042017	rs55801837	C	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.149;SC=AAGGAATTTACATTAATAAAG;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=27;WE=53042031;WS=53042007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr17	53042023	rs56131849	TA	T	1083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TTTACATTAATAAAGTAATCT;SOR=0.735;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=17;WE=53042031;WS=53042007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr17	53046072	rs17209882	C	G	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=54;PP=1284;ReadPosRankSum=0.283;SC=GAGGCGTGCTCCGTCTCGCGA;SOR=0.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=74;TCR=147;TR=82;WE=53046080;WS=53046062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,98:0.39:254
chr17	53063743	rs958556	C	T	145.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=149;SC=AGGATAGCAGCAATGAGTAGT;SOR=3.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=53063751;WS=53063733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	53076799	rs1156287	G	A	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=62;PP=2355;SC=CATAATTACCGGAGCCAAGTT;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=110;WE=53076807;WS=53076789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	53076986	rs11658717	G	A	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=42;PP=2965;SC=TTTCTTTTTAGTACTAGGTTA;SOR=1.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=105;TCR=42;TR=147;WE=53076994;WS=53076976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	53120855	rs1894936	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=244;ReadPosRankSum=2.224;SC=TAGAGAATTAATTTTTGGTCT;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=14;WE=53120863;WS=53120845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr17	53155666	rs1026961	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AGTCTCAAAGCAGCAATGCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=53155674;WS=53155656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	53158361	rs2628302	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=761;ReadPosRankSum=-1.138;SC=AGTAAAGATAGATGTTGTTTA;SOR=0.614;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=37;WE=53158369;WS=53158351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr17	53342796	rs10635027	G	GTTTC	14685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.128;NF=54;NR=96;PP=2977;ReadPosRankSum=0.440;SC=GGGGGCGGTTGTTTCTTTCTT;SOR=0.413;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=197;TCF=74;TCR=123;TR=150;WE=53342814;WS=53342786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,326:1.00:327
chr17	53392852	rs2287223	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=872;ReadPosRankSum=-0.286;SC=ATGGAGAGTGGGATCCACAGA;SOR=0.530;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=50;WE=53392860;WS=53392842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr17	53478675	rs3744308	A	G	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=2;PP=116;SC=CCACCATGCCAAGCTAAACAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=53478683;WS=53478665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	53485186	rs2286806	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=557;ReadPosRankSum=-0.836;SC=ACTGTCCTAGCGAGGGGGAAA;SOR=0.481;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=41;WE=53485194;WS=53485176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,51:0.39:130
chr17	53828493	rs12941739	A	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=-0.411;SC=AGCTTCTCGGAGGAGCAGTTC;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=30;WE=53828501;WS=53828483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,32:0.36:89
chr17	53828706	rs890488	C	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=514;ReadPosRankSum=0.593;SC=GACAGGGGCGCGTCTTCTCCG;SOR=0.487;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=30;WE=53828714;WS=53828696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr17	53844833	rs57156382	CT	C	3445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=71;PP=1603;SC=GCTTGCTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.360;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=12;TCR=90;TR=81;WE=53844841;WS=53844823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	53844903	rs35052837	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=171;ReadPosRankSum=2.277;SC=TCAGCTCACCGCAATCTCCGC;SOR=1.796;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=12;WE=53844911;WS=53844893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr17	53851071	rs2960063	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.357;SOR=1.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr17	53851078	rs2912558	T	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr17	53851228	rs2960062	C	T	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=746;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GCCTGGCGATCGAGAGTGACG;SOR=0.589;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=61;WE=53851236;WS=53851218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,70:0.40:177
chr17	54450038	rs957724	C	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=464;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CAATGCACCTCAACACACTGG;SOR=0.984;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=28;WE=54450046;WS=54450028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr17	54450134	rs8069322	G	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=865;ReadPosRankSum=1.081;SC=AGAAAGAGAAGCAGCTGAAAG;SOR=0.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=64;WE=54450142;WS=54450124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,80:0.59:136
chr17	54517855	rs7224536	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=243;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GTAGCAAATGTCTATTCTGAA;SOR=0.352;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=14;WE=54517863;WS=54517845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	54526301	rs2024316	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=913;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TTGGCATCGCCTGCTTGCTCT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=50;WE=54526309;WS=54526291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,61:0.72:85
chr17	54534634	rs10852985	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=507;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CTACATAGCCGTTATATTTTA;SOR=0.398;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=29;WE=54534642;WS=54534624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr17	54554821	rs373804237	CT	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-0.651;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.528;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr17	54558282	.	GTA	G	341	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=58.12;NF=1;NR=10;PP=341;QD=31.2727272727;SC=GTGTGTGTGTGTAAATTTTCC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=54558292;WS=54558272;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,11:0.73:15
chr17	54558284	.	A	G	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=57.74;NF=0;NR=5;PP=28;QD=12.5542425094;SC=GTGTGTGTGTAAATTTTCCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=54558292;WS=54558272;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	54912737	rs7225724	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=1.817;SC=TTTTGAGGAAACAAGCTAATA;SOR=1.877;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=13;WE=54912745;WS=54912727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr17	54921322	rs3760157	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=141;ReadPosRankSum=0.847;SC=TTGTTTTGTGGGTTATCATTG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=13;WE=54921330;WS=54921312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr17	54921494	rs3760158	A	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=0.199;SC=GTTATTTAACATCCATTAATC;SOR=1.085;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=13;WE=54921502;WS=54921484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr17	54925262	rs6503775	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AAAATAATTTGTCTTTTTCTT;SOR=1.781;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=9;WE=54925270;WS=54925252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr17	54925480	rs56356802	C	CAT	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=-0.383;SC=ATATACTATACATATATATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=54925488;WS=54925470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	54939715	rs9911560	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=231;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CAGTGGTTTATGGCTCATGCA;SOR=0.467;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=20;WE=54939723;WS=54939705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr17	54939737	rs3826295	T	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=-1.657;SC=CTGGTCACTGTACACTAGCGG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=11;WE=54939745;WS=54939727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr17	54978794	rs205498	G	A	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=14;PP=1480;SC=ACTGGGGGTGGGCTCCTGGAG;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=66;WE=54978802;WS=54978784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	54981571	.	CA	C	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=2.282;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr17	55019580	rs2240214	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.225;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=74;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GAAAACAACCACAAACAAACT;SOR=0.180;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=10;WE=55019588;WS=55019570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr17	55026912	rs12942251	A	G	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=69;PP=2264;SC=GAGCCCTACCAGGAACCCGTA;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=55026920;WS=55026902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	55027850	rs8071691	T	C	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=100;PP=2965;SC=CATCACAAGATTCAGACTCCG;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=80;TCR=100;TR=180;WE=55027858;WS=55027840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr17	55038062	rs9899845	T	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=395;SC=GTCTAGCGGCTTCAGGCCCGG;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=55038070;WS=55038052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	55058689	rs3095499	G	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=389;SC=AGTGAAGGGCGGATTTGGTCC;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=55058697;WS=55058679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	55065530	rs12453004	A	G	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=23;PP=1327;SC=GTGTGACTCAAAAAGCAATCA;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=67;WE=55065538;WS=55065520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	55065558	rs11437466	T	TA	3268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=2249;SC=TAATTCTGTGTAATTCCTTTT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=52;WE=55065566;WS=55065548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	55075928	rs12941709	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=838;ReadPosRankSum=0.361;SC=AATTCAGAGACCTGAATTTGT;SOR=1.927;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=106;TCF=17;TCR=89;TR=43;WE=55075936;WS=55075918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,45:0.41:110
chr17	55187278	rs11079277	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=359;ReadPosRankSum=0.912;SC=CTTGAGGAGCGGGTGTGGGGC;SOR=0.352;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=19;WE=55187286;WS=55187268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr17	55189723	rs3094444	T	G	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=4;PP=1489;SC=AAGTGTTTTGTTACCTCAAAG;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=55189731;WS=55189713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	55189837	rs117349326	C	T	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1047;ReadPosRankSum=0.922;SC=TGTCCTGCCCCCATCCGCTAT;SOR=0.749;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=236;TCF=130;TCR=106;TR=72;WE=55189845;WS=55189827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,92:0.32:292
chr17	55197802	rs4583	C	A	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1017;ReadPosRankSum=-1.106;SC=TCCTTTCTTTCTCCATACTGT;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=69;WE=55197810;WS=55197792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,90:0.62:145
chr17	55334577	.	GC	G	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5722;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=61.34;NF=0;NR=3;PP=27;QD=10.6666666667;SC=CGGTGTAGGAGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=55334585;WS=55334567;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	55363421	rs11079286	G	C	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.000;SC=GCCTCTTTCTGTCTTTCCCTC;SOR=1.040;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=81;WE=55363429;WS=55363411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,91:0.62:146
chr17	55606875	rs55990806	G	GT	2090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.430;NF=61;NR=7;PP=1384;ReadPosRankSum=1.174;SC=AAAGACCACTGTTTTTTTTTC;SOR=1.250;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=68;WE=55606883;WS=55606865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,78:0.95:82
chr17	55674423	rs6503820	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=1.544;SC=GGGGTGGGGAGGGGGCTAGAT;SOR=0.412;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=25;WE=55674431;WS=55674413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr17	55917353	rs2099914	C	G	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=691;ReadPosRankSum=2.477;SC=TCAATTAATTCGCTAAAGATA;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=37;TCR=80;TR=47;WE=55917361;WS=55917343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr17	56056550	rs1135655	C	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=-1.735;SC=CCCACAGTCTCAGTGTTTCTA;SOR=1.646;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=15;WE=56056558;WS=56056540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr17	56056604	.	T	TTGC	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.334;NF=8;NR=7;PP=483;ReadPosRankSum=0.154;SC=GTTGTTGTTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.626;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=15;WE=56056612;WS=56056594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr17	56056726	rs79121083	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.587;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=489;ReadPosRankSum=1.329;SC=AACTGTTGCCGTTTTTTTTCA;SOR=1.370;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=31;WE=56056734;WS=56056716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,37:0.30:122
chr17	56059057	rs73995412	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=1.339;SC=AAATGATCTTGCTTTACAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=56059065;WS=56059047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	56083934	rs2233911	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=262;ReadPosRankSum=-1.731;SC=ACCAGGAGGAGAAGCTCGCTC;SOR=0.395;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=21;WE=56083942;WS=56083924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr17	56235104	rs3863503	C	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.175;NF=32;NR=23;PP=762;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCTGTGCTTCCCATCCCGCCC;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=55;WE=56235112;WS=56235094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr17	56235322	rs1987665	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=0.849;SC=CACAGCTGAAGTTTGTTCTTT;SOR=0.089;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=56235330;WS=56235312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr17	56270121	rs12602891	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=-1.890;SC=CGGCTGGGGGTCCTCAAAGTG;SOR=0.160;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=12;WE=56270129;WS=56270111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	56274420	rs149610649	T	C	4870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=722;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.824;SC=GCTCACCTCCTTTGTGGACGC;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=600;TCF=296;TCR=304;TR=218;WE=56274428;WS=56274410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:457,256:0.36:713
chr17	56283118	rs185405908	C	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GTGAGACAAGCCAGAAAAGTG;SOR=0.634;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=13;WE=56283126;WS=56283108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr17	56321451	rs67390833	GACAC	G	506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.143;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr17	56351708	rs72051182	AGT	A	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;QD=16.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	56357833	rs2856857	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=663;ReadPosRankSum=0.877;SC=GCCCAGAGCAGGGATCACAAA;SOR=0.543;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=43;WE=56357841;WS=56357823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr17	56381592	rs35853224	T	TA	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=759;ReadPosRankSum=-1.617;SC=TTCCCTGGACTACAGTGGGAA;SOR=1.131;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=21;WE=56381600;WS=56381582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr17	56382512	rs11867412	C	T	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GAACCAGGCCCCTTTGTCCAT;SOR=0.633;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=290;TCF=152;TCR=138;TR=100;WE=56382520;WS=56382502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,126:0.35:361
chr17	56383187	rs3744102	C	T	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=573;ReadPosRankSum=0.255;SC=CAGGGATATTCCTTCACCTGG;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=40;WE=56383195;WS=56383177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr17	56383744	rs11079346	T	C	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=32;PP=1160;ReadPosRankSum=0.509;SC=CCCAGTTGTGTGGGCTGTGGA;SOR=0.886;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=243;TCF=155;TCR=88;TR=92;WE=56383752;WS=56383734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,100:0.36:278
chr17	56384374	rs11652816	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CTCACTCCCTATGCCCCTAGG;SOR=0.456;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=30;WE=56384382;WS=56384364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr17	56384928	rs36057095	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=290;ReadPosRankSum=2.385;SC=AGGGAAGACCCAGCTGGTGTT;SOR=0.165;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=19;WE=56384936;WS=56384918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr17	56386118	rs2680689	A	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=894;ReadPosRankSum=0.761;SC=CCTCCTGCTCATCCTCCGAAT;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=62;WE=56386126;WS=56386108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,69:0.44:156
chr17	56386358	rs2526360	T	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TGCAGTGTTCTCGGGGATCTG;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=112;TCR=119;TR=81;WE=56386366;WS=56386348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,91:0.34:265
chr17	56388238	rs2680704	C	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=-1.040;SC=GACCCTTTTGCCATCTCTCTG;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=36;WE=56388246;WS=56388228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,39:0.28:140
chr17	56388927	rs2072144	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=763;ReadPosRankSum=0.766;SC=TGGGCAGGGCTATACCTTCTG;SOR=0.678;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=54;WE=56388935;WS=56388917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,62:0.37:166
chr17	56393251	.	G	GGGAT	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.988;NF=3;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CTGGGCAGAGGGGATGGATGG;SOR=1.659;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=4;WE=56393259;WS=56393241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr17	56398006	rs2526380	C	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr17	56404349	rs2526378	A	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=-0.588;SC=CCACATAGACACCCCCAAACC;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=12;WE=56404357;WS=56404339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr17	56429673	rs2680703	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=448;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTCTCCCGCCAGCAGGCGGGG;SOR=1.896;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=23;WE=56429681;WS=56429663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr17	56435885	rs2526374	G	T	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=76;PP=2178;ReadPosRankSum=-1.129;SC=AGGTGGCTCAGTCCCCAGCCT;SOR=0.978;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=211;TCF=87;TCR=124;TR=124;WE=56435893;WS=56435875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,130:0.58:224
chr17	56438301	rs2680701	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=0.317;SC=CTGCTGAAGCGGATCCTGGGA;SOR=1.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=13;WE=56438309;WS=56438291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr17	56440526	rs2526372	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,17:0.24:72
chr17	56440542	rs2680700	G	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,22:0.24:90
chr17	56492800	rs3744093	T	C	4413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=92;PP=2914;ReadPosRankSum=0.883;SC=ACTCTGATAATAGCTTTCTGT;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=309;TCF=141;TCR=168;TR=165;WE=56492808;WS=56492790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,195:0.53:366
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chr17	56544280	rs1017089	T	G	7895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=114;PP=2965;SC=GGAAGAGGCATTGGGAGTGAC;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=234;WE=56544288;WS=56544270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr17	56569842	rs75741842	T	TGA	6513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.813;NF=42;NR=46;PP=2972;ReadPosRankSum=0.790;SC=CCCTGTTTTTTGTCATACTAA;SOR=0.856;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=88;WE=56569850;WS=56569832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,162:0.61:267
chr17	56580997	rs1860262	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=521;ReadPosRankSum=1.194;SC=GGCGACAAAGTGAGATTCCGT;SOR=0.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=34;WE=56581005;WS=56580987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr17	56581651	rs4277402	C	G	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=57;PP=1890;ReadPosRankSum=-2.034;SC=TTGTCACAGGCCTTAGGACTT;SOR=0.460;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=181;TCF=79;TCR=102;TR=106;WE=56581659;WS=56581641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,134:0.62:215
chr17	56584205	rs2302189	A	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=995;ReadPosRankSum=0.047;SC=TGTGCTCTCCACTCCAGAGCA;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=64;WE=56584213;WS=56584195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,78:0.66:118
chr17	56585872	rs3744108	G	C	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ACGTTCTGCAGGTCAAAGCCC;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=79;WE=56585880;WS=56585862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,97:0.60:163
chr17	56598213	rs10719315	GA	G	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.859;NF=5;NR=20;PP=819;ReadPosRankSum=0.233;SC=GCTAAAGGGAGAAAAGGGTTG;SOR=1.296;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=25;WE=56598221;WS=56598203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr17	56598439	rs1057068	T	C	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1239;ReadPosRankSum=2.111;SC=GTGTCTCCCGTGTCACATCCT;SOR=0.462;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=77;WE=56598447;WS=56598429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,91:0.56:162
chr17	56603934	.	A	AAC	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-1.058;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.244;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	56603978	rs2079703	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.924;NF=11;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=-1.008;SC=CACACACTCTGCTCCCTGCCC;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=20;WE=56603986;WS=56603968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr17	56609525	rs11869828	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=26;ReadPosRankSum=0.431;SC=GTGCCGGCGCGAAGTGGGTCG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=56609533;WS=56609515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	56621286	rs8071623	G	T	4108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=60;PP=2743;ReadPosRankSum=0.613;SC=CCAGTCTCGGGTCCCCGAGGA;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=164;TCR=108;TR=152;WE=56621294;WS=56621276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,176:0.56:313
chr17	56621359	rs6503867	T	C	6102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.612;SC=AGTCTGATGCTGAATGGGGAG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=409;TCF=246;TCR=163;TR=240;WE=56621367;WS=56621349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,270:0.58:462
chr17	56636854	rs7225128	T	C	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=929;ReadPosRankSum=1.520;SC=ATTTCCTTCTTTCTGGTGTAA;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=63;WE=56636862;WS=56636844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,91:0.61:150
chr17	56654690	rs1267542	T	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=681;ReadPosRankSum=2.987;SC=CCATTTAACATTGCATCTATG;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=45;WE=56654698;WS=56654680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr17	56659018	rs6503870	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=376;ReadPosRankSum=-0.284;SC=AAAATATTCACCGTCTGGAGT;SOR=0.549;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=27;WE=56659026;WS=56659008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr17	56676368	rs389389	T	C	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1322;ReadPosRankSum=1.331;SC=TTGTAGGCATTTGTAAACTCT;SOR=0.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=152;TCR=86;TR=83;WE=56676376;WS=56676358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,104:0.38:274
chr17	56692800	rs302858	G	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.049;SC=CAGAGAAATGGTCTCCACACA;SOR=1.061;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=10;WE=56692808;WS=56692790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr17	56695008	rs302860	C	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=513;ReadPosRankSum=0.258;SC=AGGAAAAAAACCTCAGAATTA;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=35;WE=56695016;WS=56694998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,37:0.35:107
chr17	56700153	rs117982431	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGAGCCTGACTCTCAGCCCAG;SOR=0.804;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=5;WE=56700161;WS=56700143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	56708019	rs694720	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TACTTTCATATATTGCTGTGA;SOR=0.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=16;WE=56708027;WS=56708009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr17	56833457	rs201186780	G	GGAACCC	4677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=3.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.76;MQRankSum=7.847;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,122:0.36:343
chr17	57076893	rs4598970	T	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=1.738;SC=CCTTCCCAAGTCTTTAAATAA;SOR=2.564;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=11;WE=57076901;WS=57076883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr17	57089588	rs72443487	G	GCAGCAGCAGCAGCAGCAC	804.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.509;NF=12;NR=6;PP=1557;ReadPosRankSum=0.377;SC=AGCAGCAGCAGCACCACCACC;SOR=1.270;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=18;WE=57089596;WS=57089578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr17	57094617	rs4932691	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=741;ReadPosRankSum=0.092;SC=TAATAAATATTTACCCCACTA;SOR=0.211;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=39;WE=57094625;WS=57094607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr17	57208752	rs9652856	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CAAATCATTATTGTGTAAACC;SOR=0.838;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=23;WE=57208760;WS=57208742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr17	57272079	rs2291193	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=591;ReadPosRankSum=1.175;SC=CAGTTGTGCTGGTTCCAATTT;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=33;WE=57272087;WS=57272069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr17	57287454	rs6503905	A	G	5717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=71;PP=2965;SC=TAATGGGAGCATCAGCCTGGA;SOR=1.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=124;TCR=71;TR=195;WE=57287462;WS=57287444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr17	57290383	rs3744383	G	A	3358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=70;PP=2067;ReadPosRankSum=-1.782;SC=CTGAGAAGAGGCCAAACTTCG;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=125;WE=57290391;WS=57290373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,150:0.60:252
chr17	57334668	rs12450435	C	G	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=59;PP=1441;ReadPosRankSum=2.326;SC=AGGTTAGAGTCAGTGACTGCA;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=35;TCR=101;TR=81;WE=57334676;WS=57334658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,86:0.59:146
chr17	57466917	rs2290266	A	G	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=79;PP=2345;SC=CTCGCTTTCCATGGCCTTGTG;SOR=1.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=30;TCR=79;TR=109;WE=57466925;WS=57466907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	57474667	rs58549129	C	T	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=55;PP=1629;SC=CCTTGCCATCCGGGGCATCCT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=57474675;WS=57474657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	57642846	rs10713316	TG	T	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=2.790;SC=GGGAAATCCCTGGGGGGTGGA;SOR=0.081;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=17;WE=57642854;WS=57642836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr17	57683041	rs150025878	T	TA	1514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.453;SC=AAAGGGTGAGTAAATCATTTG;SOR=0.797;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=15;TCR=82;TR=37;WE=57683049;WS=57683031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,60:0.41:148
chr17	57717737	rs9910530	C	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=866;SC=TTAACCTTCTCTTAGCCAATA;SOR=1.270;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=44;WE=57717745;WS=57717727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	57721907	rs113812535	T	TTTTG	822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.08;QD=43.30;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	57725043	rs8071749	T	G	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=76;PP=2532;SC=ATTTTAACTATTTTTTTATGA;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=114;WE=57725051;WS=57725033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	57733479	rs4349212	T	A	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=54;PP=1612;SC=TCCCCAAGATTAAAAAATAGA;SOR=3.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=57733487;WS=57733469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	57743691	rs9893154	G	A	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=80;PP=2841;SC=AGCTACTGAGGGGCCTACTCC;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=110;WE=57743699;WS=57743681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	57746107	rs2272411	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=335;ReadPosRankSum=-1.248;SC=AAGTGTGCCTATGCTTAATTG;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=19;WE=57746115;WS=57746097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr17	57750982	rs8065248	T	C	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=25;PP=1364;SC=AAATTTAAAGTTTCCTTTTGT;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=57750990;WS=57750972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	57754591	rs28465103	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=215;ReadPosRankSum=-1.158;SC=CTGCATTTTTAAAAACCTGTT;SOR=0.439;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=17;WE=57754599;WS=57754581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr17	57761384	rs3215190	CAT	C	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=398;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TCTCAAGACTCATAAAGTTAT;SOR=0.095;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=57761393;WS=57761374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr17	57812683	.	C	A	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=919;ReadPosRankSum=0.165;SC=TTAATCTCTGCACTATTGTTT;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=57;WE=57812691;WS=57812673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr17	57886125	rs2645487	T	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=548;SC=TTCCTACTTCTCATTAATGTT;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=57886133;WS=57886115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	57951973	rs2250526	G	A	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1569;SC=TAAATGTGGTGTATGCCAATG;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=57951981;WS=57951963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	57963537	rs1292053	A	G	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=61;NR=67;PP=2358;SC=CTTTGACAGCATTTGATTGAT;SOR=0.917;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=128;WE=57963545;WS=57963527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	57992145	rs3066247	TATC	T	1153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=922;SC=GAAGCAATCATATCATATTTT;SOR=1.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=19;WE=57992155;WS=57992135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	58011498	rs180524	G	T	6096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=61;PP=2965;SC=CTTATAATTCGGAGAATAATC;SOR=1.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=126;TCR=61;TR=187;WE=58011506;WS=58011488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr17	58012768	rs11459613	C	CA	1591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1535;SC=AAATATTGAACAAAAAAGTCT;SOR=3.300;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=46;WE=58012776;WS=58012758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	58024224	rs76853887	C	CAA	5677.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=70;PP=2957;SC=CAAGGTGAAACGACTCAAAAT;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=9;TCR=71;TR=79;WE=58024232;WS=58024214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	58024275	rs180515	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=40;PP=1191;SC=AGAACACTTCAGACACAGGAA;SOR=2.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=58024283;WS=58024265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	58030551	.	CT	C	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5002;HP=18;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=58.13;NF=0;NR=5;PP=64;QD=13.4;SC=GAAAGGGATTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=5;WE=58030559;WS=58030540;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,5:0.23:22
chr17	58031412	rs11368	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=293;SC=TTACCTGACAAATGAGAAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=58031420;WS=58031402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	58031639	rs199982924	ATC	A	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=220;ReadPosRankSum=-1.808;SC=GGATACAAACATCTCAAAGCT;SOR=0.920;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=7;WE=58031648;WS=58031629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr17	58037374	rs12600680	T	C	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=13;PP=1182;SC=TACAAAGTGCTATGAAATATA;SOR=1.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=58037382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	58042126	rs76419616	T	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=27;PP=775;SC=TCCCCGGACGTTCTCACGCGC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=58042134;WS=58042116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	58066607	rs200816848	AT	A	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQRankSum=-0.900;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr17	58149745	rs3744375	G	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.313;SC=AATGAGGCTTGCAAAAGACTA;SOR=0.513;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=197;TCF=79;TCR=118;TR=90;WE=58149753;WS=58149735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,93:0.44:211
chr17	58180062	rs8075626	T	C	4877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=509;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=92;PP=1825;ReadPosRankSum=2.863;SC=GCTTGGCCGGTGGCGGCGGAG;SOR=0.774;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=355;TCF=138;TCR=217;TR=144;WE=58180070;WS=58180052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,140:0.36:386
chr17	58180079	rs8074512	C	G	5631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=80;PP=1829;ReadPosRankSum=-3.785;SC=GGAGCTTGGCCGGCGGCGGCG;SOR=0.661;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=310;TCF=118;TCR=192;TR=125;WE=58180087;WS=58180069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,153:0.42:361
chr17	58180172	rs8075789	T	C	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=680;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CATTTCTATTTCTCATTCCAT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=39;WE=58180180;WS=58180162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr17	58227525	rs58771049	G	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=310;ReadPosRankSum=1.265;SC=CGCCCCTGCAGAGGATCCCCC;SOR=0.392;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=20;WE=58227533;WS=58227515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr17	58232859	.	TACAC	T	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.843;NF=0;NR=5;PP=193;ReadPosRankSum=-1.063;SC=GTTCCCAGCATACACACACAC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=58232870;WS=58232849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	58286977	rs185437051	A	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.708;NF=1;NR=32;PP=748;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CCTATAATCCAATCAGAGCCA;SOR=0.349;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=33;WE=58286985;WS=58286967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr17	58289316	rs114885215	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-3.786;NF=20;NR=6;PP=376;ReadPosRankSum=0.916;SC=AGCACTTTAACAGTTGAGAGA;SOR=0.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=26;WE=58289324;WS=58289306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr17	58327217	rs369758772	TTTTTTTAACAACGTACTGACTGTAAGTTAGAGACAAATATTTGTTTCACCTCATTGCATATGAACCAA	T	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.350;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr17	58503389	rs7222800	A	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=748;ReadPosRankSum=1.922;SC=GAGGTGCACCAGAGCCACCTC;SOR=0.561;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=40;WE=58503397;WS=58503379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr17	58508618	rs3760332	T	C	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1151;ReadPosRankSum=0.480;SC=CTCCAGAGACTGAACCGTAAG;SOR=0.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=76;WE=58508626;WS=58508608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,89:0.57:157
chr17	58786625	rs2643103	A	G	9459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=160;NR=120;PP=2965;SC=AGTACTGGGAATGAACCGCCT;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=280;TCF=160;TCR=120;TR=280;WE=58786633;WS=58786615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr17	58824567	rs7501675	T	C	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=85;PP=2935;SC=AGATCAGTGGTGAAGCACAAG;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=170;WE=58824575;WS=58824557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	59480289	rs200207014	GAT	G	4651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.41;QD=44.73;SOR=2.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	59480291	.	T	G	1135	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=169;MMLQ=21;MQ=60.46;NF=59;NR=21;PP=1135;QD=14.6221401568;SC=GAAGAACCGATAGAGAGAGAG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=80;WE=59480299;WS=59480281;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,80:0.94:85
chr17	59480313	rs140392356	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	G	2738.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.97;MQRankSum=-1.230;QD=27.95;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:8,90:0.92:98
chr17	59482165	rs66504335	GC	G	6180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=41;PP=2971;SC=CAGGGAGGTGGCGGCGGGGGG;SOR=0.990;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=80;WE=59482181;WS=59482152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	59482169	rs35619711	C	G	6309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.40;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	59482173	rs9891115	G	A	6378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	59485393	rs2240736	C	T	8373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=98;PP=2965;SC=GTCTAACCCTCGTCTTGTTCT;SOR=1.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=263;TCF=165;TCR=98;TR=262;WE=59485401;WS=59485383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr17	59485555	rs1057987	C	T	7054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=103;PP=2965;SC=TCTCCCGGAGCCCCTTCCTGG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=110;TCR=103;TR=213;WE=59485563;WS=59485545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr17	59489893	rs9907379	T	C	8091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=148;PP=2965;SC=CGGCAACTCCTCACAGGTCCA;SOR=1.171;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=239;TCF=90;TCR=149;TR=238;WE=59489901;WS=59489883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr17	59544863	rs758596	G	A	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1060;ReadPosRankSum=-1.988;SC=TATCTGCTCTGTTGGCAGGAT;SOR=0.758;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=182;TCF=114;TCR=68;TR=78;WE=59544871;WS=59544853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,98:0.45:217
chr17	59560463	rs7218485	C	T	4506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=79;PP=2726;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CTGGGGTGGACGACCTGCCCC;SOR=0.861;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=309;TCF=162;TCR=147;TR=174;WE=59560471;WS=59560453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,204:0.57:360
chr17	59560974	rs149977669	A	AGTGTGTGT	188.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=94.45;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr17	59763465	rs4986765	T	C	8441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=125;PP=2965;SC=CAGCCAAGGATTCCAGTGCAC;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=140;TCR=125;TR=265;WE=59763473;WS=59763455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr17	59857809	rs4988351	C	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=663;SC=TTAGAAGAGGCTGGGCAAAGT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=59857817;WS=59857799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	59924612	rs4988344	G	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=389;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TGAAGTTTAAGGTGAACTAGA;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=31;WE=59924620;WS=59924602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr17	59955426	rs606072	T	G	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=133;PP=2965;SC=ACTTGTGTGTTATTTACTGGG;SOR=1.940;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=50;TCR=133;TR=183;WE=59955434;WS=59955416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	59958635	rs73332565	G	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=57;PP=1430;ReadPosRankSum=-2.566;SC=AAGGAAAGAGGGTTATGCTCT;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=44;TCR=96;TR=83;WE=59958643;WS=59958625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,94:0.60:157
chr17	59967387	.	T	C	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=87;QD=20.2952020912;SC=AGGAGAAATGTTGCTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=59967395;WS=59967377;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr17	59971067	rs8077835	A	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr17	59982085	rs72843757	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.075;SC=ATCTCAAGTTGCCAAATGCAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=59982093;WS=59982075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	59989126	rs3744434	A	C	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=964;ReadPosRankSum=1.394;SC=CCAAATCTAAAGTATCTAAAG;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=74;WE=59989134;WS=59989116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,80:0.61:132
chr17	60043884	rs671347	G	A	8943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=115;PP=2965;SC=CATTGTTACCGTCAGCTGCCT;SOR=0.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=144;TCR=115;TR=259;WE=60043892;WS=60043874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr17	60070111	rs11375626	G	GT	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=551;SC=GATTCTTACAGTAACAAGTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=60070119;WS=60070101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	60070140	rs11375627	C	CT	50.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=9;PP=83;SC=CTTATTATTACTTTTTTTTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=60070148;WS=60070130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	60107092	.	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=-1.652;SC=AATTAATTTTAAAGATCAACA;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=17;WE=60107100;WS=60107082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr17	60142710	.	G	GC	115	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=115;QD=47.0;SC=AGGCCGCCGGGCGCCCGCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=60142718;WS=60142700;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	60215748	rs11079465	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=55.52;NF=6;NR=6;PP=227;SC=CAGCTCCCGGTGCAGCTCGGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=60215756;WS=60215738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	60217236	rs56068498	A	G	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.76;NF=27;NR=26;PP=958;SC=GGCGTTGTACATGTCCAGCGT;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=60217244;WS=60217226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	60319002	rs190137667	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.72;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=359;ReadPosRankSum=-1.633;SC=TAAAAGCTGTAAACAAAAGTG;SOR=0.856;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=20;WE=60319010;WS=60318992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr17	60360238	rs10163525	A	G	9778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=137;PP=2965;SC=GGTAGTAAGGATGAACATTCC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=102;TCR=137;TR=239;WE=60360246;WS=60360228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr17	60360261	rs62069132	T	C	8847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=126;PP=2965;SC=TTGTAGATGGTGAAGAGGAGC;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=66;TCR=127;TR=191;WE=60360269;WS=60360251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	60363906	rs202158824	G	T	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.17;QD=30.67;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	60363941	rs148555715	G	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.13;QD=32.76;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	60364233	rs4968513	A	T	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=63;PP=1863;SC=ATGTCCTATAATCCAATCAGA;SOR=3.471;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=10;TCR=64;TR=73;WE=60364241;WS=60364223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	60365992	rs149569922	C	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=33.89;SOR=7.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	60366741	rs2668983	C	G	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=48;PP=1524;SC=AGGACAGATACGAATGTGTTA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=60366749;WS=60366731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	60366787	rs200284807	CT	C	669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.00;QD=39.40;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	60366800	rs11658000	T	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.14;QD=39.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	60368373	rs201390339	TA	T	221.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.49;QD=24.64;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	60374173	rs202112984	CT	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.83;MQRankSum=0.572;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.668;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr17	60464688	rs9909704	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1223;SC=AATATTTTCACATCTTTCCTC;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=60464696;WS=60464678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr17	60491298	rs9913294	G	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.987;NF=0;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=0.094;SC=AAAACCAAGAGAATTTTTATC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=60491306;WS=60491288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr17	60503892	rs2543409	A	G	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=116;PP=2965;SC=AGTGTTCTTCAAAGAGCCTTG;SOR=2.261;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=45;TCR=117;TR=160;WE=60503900;WS=60503882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	60503921	rs2319055	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.57;QD=33.08;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	60651884	rs11314763	GT	G	632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=14.314;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.96;MQRankSum=0.471;QD=23.43;ReadPosRankSum=1.548;SOR=6.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr17	60654358	rs4539664	G	C	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=115;SC=GAGTCTCACTGTGTCTCCCAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=60654366;WS=60654348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	60657334	rs12451705	C	T	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=17;PP=1388;SC=TCAGTATTTGCCATGTTGATG;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=60657342;WS=60657324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	60683503	rs8078132	A	G	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=10;PP=1656;SC=ATTTACCACCAGAGTGTTTTG;SOR=3.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=69;TCR=10;TR=79;WE=60683511;WS=60683493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	60742348	rs2252814	G	T	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=40;PP=1224;SC=TGGGGTCCCCGATGTCCAGGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=60742356;WS=60742338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	60748926	rs729647	C	T	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=5;PP=1083;SC=TGGGAGGCCTCGCCTGTGTTG;SOR=3.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=60748934;WS=60748916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	60758273	rs2245463	G	C	9395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=126;PP=2965;SC=AGCTGACCTCGGTGCACAGCC;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=160;TCR=126;TR=286;WE=60758281;WS=60758263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr17	60759340	rs2429389	A	G	6355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.83;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	60759347	rs2460300	A	G	6336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	60766224	rs2465430	A	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=19;PP=1418;SC=CCAGCTGTGCAGTGGTCCTGC;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=71;WE=60766232;WS=60766214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	60766483	rs2465429	A	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=574;SC=TGGAAAAGCAATAGCACCCAC;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=60766491;WS=60766473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	60767015	rs2429387	G	A	5140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=72;PP=2942;SC=TGTGAGAGCCGCAATGCCAGC;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=165;WE=60767023;WS=60767005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr17	60767151	rs740698	C	T	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=59;PP=2330;SC=GCCCTGGGCCCCAGCCTTGCC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=60767159;WS=60767141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	60767461	rs2465426	C	G	3913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=61;PP=2716;SC=CATGGGCAAGCTGTCGGTGGC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=62;TCR=61;TR=123;WE=60767469;WS=60767451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	60767953	rs11357719	GC	G	5269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=47;PP=2608;SC=GGGGGACTCTGCCCCCCCCGG;SOR=1.886;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=108;WE=60767961;WS=60767943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	60768243	rs2465425	A	G	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=36;PP=2437;SC=TCTAGAACACACCTGCTCTCC;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=108;WE=60768251;WS=60768233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	60778932	rs2251393	G	A	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=15;PP=1320;SC=AGAGTGGCACGAGGTGAAAAT;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=60778940;WS=60778922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	60779025	rs2251391	A	G	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=64;PP=2508;SC=AAGGGCTGGCAGGAGAGGTCT;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=140;WE=60779033;WS=60779015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	60813245	rs17683602	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=514;ReadPosRankSum=-0.686;SC=ATGCTAATTTTGGCCTTGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=29;WE=60813253;WS=60813235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr17	60813627	rs2041283	G	A	3308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=1967;ReadPosRankSum=-0.706;SC=CGTGTGCACTGTTTACTGGGA;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=335;TCF=162;TCR=173;TR=136;WE=60813635;WS=60813617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,163:0.40:406
chr17	60814273	rs9891498	A	G	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.572;SC=TGTCCCCCCAAATCTACTTCT;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=119;TCR=72;TR=76;WE=60814281;WS=60814263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,86:0.41:209
chr17	60824224	rs17746153	A	G	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=11;PP=936;ReadPosRankSum=0.506;SC=CACTGCATTCACCTTCACAGG;SOR=0.987;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=61;WE=60824232;WS=60824214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,71:0.62:115
chr17	61315272	rs2460111	G	A	8600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=123;PP=2965;SC=AACCTTGGCAGTCTCAAAAAT;SOR=0.799;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=137;TCR=123;TR=260;WE=61315280;WS=61315262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr17	61432774	rs4968765	A	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=42;PP=1293;SC=TCTGTGATAAACAATTCTGAG;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=61432782;WS=61432764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	61457217	rs8065950	G	C	9657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=202;PP=2965;SC=CCATTTTTCCGCCATCTCTAG;SOR=1.555;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=296;TCF=94;TCR=202;TR=296;WE=61457225;WS=61457207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr17	61473325	rs2270133	C	A	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=98;PP=2965;SC=TTTTCAAGCTCTGTATTGAAG;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=71;TCR=98;TR=169;WE=61473333;WS=61473315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	61490196	rs56182741	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1094;SC=CACCTTAAAAGAAGATTTTTT;SOR=6.138;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=42;WE=61490204;WS=61490186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	61515412	rs4968774	G	T	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=6;PP=1509;SC=CCATCGTCCTGAGGCAGAGGT;SOR=4.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=60;WE=61515420;WS=61515402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	61548918	rs4277405	C	T	6410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=77;PP=2965;SC=GGGAGCCCTGCCATGCCATGT;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=183;WE=61548926;WS=61548908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr17	61548948	rs4459609	C	A	7352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=94;PP=2965;SC=TATAGTATATCTATGCCCAGC;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=124;TCR=94;TR=218;WE=61548956;WS=61548938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr17	61556298	rs4295	C	G	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=26;PP=2183;SC=GCTCCTCCTTCTAGCAGCGAG;SOR=1.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=69;TCR=26;TR=95;WE=61556306;WS=61556288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	61556527	rs4296	A	G	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=43;PP=1213;SC=GCTGCACTCCAGACCATGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=61556535;WS=61556517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	61559923	rs4309	C	T	5561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=89;PP=2965;SC=AGGATCTGCCCGTCTCCCTGC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=96;TCR=89;TR=185;WE=61559931;WS=61559913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	61560763	rs4311	T	C	6876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=77;PP=2965;SC=TCTACAAAAGTTAAATCCATC;SOR=1.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=124;TCR=77;TR=201;WE=61560771;WS=61560753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	61562309	rs4316	C	T	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=68;PP=2864;SC=TGCTGGTCCCCAGCCAGGAGG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=143;WE=61562317;WS=61562299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	61562553	rs4320	G	A	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=11;PP=1877;SC=AACCTGGAGAGGGGAGGCAGA;SOR=2.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=73;WE=61562561;WS=61562543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	61562774	rs4321	T	C	10595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=191;PP=2965;SC=AGCATGTGCATACACACAGAG;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=321;TCF=130;TCR=191;TR=321;WE=61562782;WS=61562764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr17	61564052	rs4331	A	G	9583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=170;PP=2965;SC=AACGGGCAGCACTGCCTGCCC;SOR=0.899;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=136;TCR=170;TR=306;WE=61564060;WS=61564042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr17	61564281	rs4332	T	C	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=25;PP=2497;SC=GGCCTGGGGGTAGTGCAGGCC;SOR=2.021;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=77;TCR=25;TR=102;WE=61564289;WS=61564271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	61564522	rs4333	T	C	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=38;PP=1119;SC=CAGAGTTGGGTTCCCCTCGCT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=61564530;WS=61564512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	61565990	rs4341	G	C	8156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.07;SOR=1.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	61565998	rs4342	A	C	8434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.82;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	61566031	rs4343	G	A	7000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=104;PP=2965;SC=TGATGGCCACGTCCCGGAAAT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=113;TCR=104;TR=217;WE=61566039;WS=61566021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr17	61566257	rs377012934	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=635;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CTGGAGGAGGCAGGTAATGTG;SOR=1.248;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=31;WE=61566265;WS=61566254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr17	61573761	rs4362	T	C	7881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=115;PP=2965;SC=CCAGGTACTTTGTCAGCTTCA;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=135;TCR=115;TR=250;WE=61573769;WS=61573751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr17	61574492	rs4363	G	A	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=22;NR=18;PP=681;SC=CTTGCTTCCCGCTCAGCTCGC;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=40;WE=61574500;WS=61574482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	61600717	rs71376915	A	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=12;PP=1710;SC=CCGAGGACAGACGGAGACGCC;SOR=3.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=70;WE=61600725;WS=61600707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	61611423	rs7225568	T	C	7289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=89;PP=2965;SC=TGCTCAGCGATCAGGACGAAT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=160;TCR=89;TR=249;WE=61611431;WS=61611413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr17	61615371	rs4465659	T	G	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=38;PP=2668;SC=GGTAAGCCCTTGGTGGTGTGG;SOR=1.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=123;WE=61615379;WS=61615361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	61615660	rs148485289	T	TG	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.238;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.310;NF=7;NR=55;PP=1793;ReadPosRankSum=1.804;SC=GCCCCGGGCGTGGGGGGGAGC;SOR=3.327;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=9;TCR=63;TR=62;WE=61615668;WS=61615650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr17	61621330	rs76957877	C	T	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=399;SC=GGCTGCAGCTCCCTGGGCAGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=61621338;WS=61621320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	61621805	rs8070334	T	G	4752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=75;PP=2903;SC=TGGGGGCTGGTCATGGGTAGC;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=144;WE=61621813;WS=61621795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	61623052	rs35819807	C	T	7706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=111;PP=2965;SC=GCTGTGGCAACGGACAAAACT;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=124;TCR=111;TR=235;WE=61623060;WS=61623042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr17	61660889	rs66502552	CG	C	5818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=80;PP=2972;SC=TTAGCCGGGCCGGGGGGTGGC;SOR=0.906;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=45;TCR=91;TR=117;WE=61660897;WS=61660879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	61666687	rs72845886	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=645;ReadPosRankSum=-2.127;SC=AGTTCCTGGCCAGTCACCCCA;SOR=0.277;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=44;WE=61666695;WS=61666677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr17	61710010	rs6504171	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=438;ReadPosRankSum=1.743;SC=GTATTTAAGTGTCTTAGTCCA;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=31;WE=61710018;WS=61710000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr17	61729882	rs8080211	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=740;ReadPosRankSum=0.058;SC=TTTTAAGTATACAATTAACCA;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=43;WE=61729890;WS=61729872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
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chr17	61769456	rs7211213	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GACTCCCCTTTGCTAAATCCT;SOR=0.250;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=7;WE=61769464;WS=61769446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr17	61770856	rs74430817	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=378;ReadPosRankSum=1.465;SC=GTGGGCAGGACAGCTGGGAGT;SOR=0.357;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=27;WE=61770864;WS=61770846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr17	61776479	rs1877317	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=290;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AGGCCCTGGATCAGGGCTGCA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=18;WE=61776487;WS=61776469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr17	61776538	rs3817181	G	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=321;ReadPosRankSum=0.408;SC=AAAGGGGGCCGGCAAACTCTG;SOR=0.203;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=23;WE=61776546;WS=61776528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr17	61781980	rs66871703	TG	T	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=696;ReadPosRankSum=4.292;SC=CTGTAGCGGGTGGGGGGGGGG;SOR=1.314;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=21;WE=61781992;WS=61781970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr17	61781984	rs372457035	G	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=524;ReadPosRankSum=4.512;SC=AGCGGGTGGGGGGGGGGGGTG;SOR=0.793;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=26;WE=61781992;WS=61781970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr17	61782325	rs9897229	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=368;ReadPosRankSum=0.032;SC=TCTGCCATGCTCAGGTGGATC;SOR=1.135;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=21;WE=61782333;WS=61782315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr17	61783908	rs3817182	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=1.650;SC=TAGTATTCCTAGTCTGTGTCC;SOR=0.646;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=5;WE=61783916;WS=61783904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	61805607	rs2137144	G	A	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.552;SC=CGACCCTCACGTAGAAAACCA;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=97;TCR=87;TR=75;WE=61805615;WS=61805597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,95:0.43:223
chr17	61805747	rs4968597	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=362;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TACTGTGTAGGCCTACTTCAG;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=24;WE=61805755;WS=61805737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr17	61829157	rs11283431	A	ATAGTGTT	1266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.661;NF=17;NR=3;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.869;SC=ATTCTTCTTTATAGTGTTATC;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=20;WE=61829165;WS=61829147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr17	61829989	rs3785572	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=191;ReadPosRankSum=1.458;SC=TAAGCAAGCACAGGCTTATAG;SOR=0.512;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=16;WE=61829997;WS=61829979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr17	61838259	rs11654841	G	A	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.903;NF=51;NR=33;PP=1416;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GAAAACCAGCGGGAAGAATAC;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=118;TCR=76;TR=84;WE=61838267;WS=61838249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,96:0.40:242
chr17	61877666	rs3833115	AAT	A	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=541;ReadPosRankSum=2.073;SC=TGTTCTTCTGAATATTGCTAT;SOR=2.955;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=14;WE=61877675;WS=61877656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr17	61884120	rs2251164	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=0.274;SC=GTAGAACCTTGTTGATAAGGA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=61884128;WS=61884110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	61888693	rs2584629	T	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=540;SC=GGGATAGACGTAACAAGACTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=61888701;WS=61888683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	61889213	rs3217509	G	GA	3199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=2514;ReadPosRankSum=1.750;SC=GATGCAGGTAGAAATATAATG;SOR=0.771;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=187;TCF=79;TCR=108;TR=74;WE=61889221;WS=61889203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,123:0.41:302
chr17	61898063	rs3833114	C	CGCTTGAACCTGGAAGACGG	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-3.269;NF=5;NR=0;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CAAGGAGAATCAGGCTGCAGT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=5;WE=61898071;WS=61898053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr17	61898135	rs2665836	C	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=11;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.695;NF=23;NR=11;PP=788;ReadPosRankSum=-3.045;SC=ATCTCAAAAACAAAAAATTAC;SOR=0.890;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=34;WE=61898143;WS=61898124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr17	61901197	rs2727288	T	A	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.417;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1046;ReadPosRankSum=-1.494;SC=CGGATGGTGCTCAAGGAGAAC;SOR=0.965;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=168;TCF=113;TCR=55;TR=74;WE=61901205;WS=61901187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,89:0.45:196
chr17	61901439	rs2584627	T	C	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CCCAGCTCCTTTCACCTCTTC;SOR=0.520;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=62;WE=61901447;WS=61901429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,71:0.38:189
chr17	61901641	rs894407	T	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.402;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=993;ReadPosRankSum=-1.308;SC=TTCCCAGACTTTTCCCCTGGA;SOR=0.586;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=65;WE=61901649;WS=61901631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,74:0.39:189
chr17	61901657	rs894406	A	G	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.614;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=799;ReadPosRankSum=0.838;SC=CTGGACACCCAGTCCACACCT;SOR=0.527;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=62;WE=61901665;WS=61901647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,70:0.38:186
chr17	61901880	rs752621	G	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=-1.843;SC=TAAATCAAAAGGCTCAGGCCC;SOR=0.604;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=20;WE=61901888;WS=61901870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr17	61902822	rs716880	C	G	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=1695;ReadPosRankSum=-0.980;SC=AATTAGTTGACGCACTCTGCA;SOR=0.629;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=295;TCF=181;TCR=114;TR=107;WE=61902830;WS=61902812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,133:0.39:343
chr17	61903445	rs2584625	G	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=844;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GTGATGTCCTGCTGGAGAGTC;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=44;WE=61903453;WS=61903435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr17	61904337	rs141581810	TCCACTTCCAGTTTC	T	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.650;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=1.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,18:0.28:65
chr17	61904465	rs28362566	C	CG	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=2.429;SC=ATGCAGCTAACTACTTCCGCT;SOR=0.148;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=61904473;WS=61904455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr17	61904724	rs2665834	T	C	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=9.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=1.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,36:0.38:96
chr17	61904728	rs2727287	G	A	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=9.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=1.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr17	61906846	rs2665833	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=563;ReadPosRankSum=1.715;SC=GTCTCTTGTCTGCCACAGCTG;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=50;WE=61906854;WS=61906836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr17	61908055	rs55833669	CT	C	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=6.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.441;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr17	61908271	rs968719	C	T	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=875;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TGGCTCTGAACTGGTACAGAA;SOR=0.896;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=55;WE=61908279;WS=61908261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,69:0.38:183
chr17	61908316	rs7220892	G	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=972;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTAGCAATGTGAGAAGCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=60;WE=61908324;WS=61908306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,72:0.43:169
chr17	61912261	rs2665832	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=0.141;SC=CCTGGAGCTCCGGATACTGAA;SOR=0.602;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=11;WE=61912269;WS=61912251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr17	61958669	rs2006123	G	T	4301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=76;PP=2633;ReadPosRankSum=0.830;SC=GCGGGGGAAAGTCACCCCTTC;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=416;TCF=246;TCR=170;TR=181;WE=61958677;WS=61958659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:273,214:0.44:487
chr17	61986027	rs2854152	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.907;NF=14;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=0.813;SC=CTTACACCAAATTACCCCAAT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=14;WE=61986035;WS=61986017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr17	61987405	rs2006122	A	T	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.497;NF=45;NR=21;PP=972;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATGAAGAATAAGGTGAGTTCT;SOR=0.970;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=156;TCF=98;TCR=58;TR=66;WE=61987413;WS=61987395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,87:0.47:185
chr17	61996255	rs2005172	A	C	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.250;NF=38;NR=53;PP=1292;ReadPosRankSum=0.267;SC=CCCACTGTTGACCCCACCTGT;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=240;TCF=104;TCR=136;TR=91;WE=61996263;WS=61996245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,114:0.39:294
chr17	62006497	rs1051684	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-1.416;SC=TGGGGGGTCCAGGAAAGGGGT;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=12;WE=62006505;WS=62006487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr17	62007498	rs2070776	A	G	4163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=540;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=59;PP=2418;ReadPosRankSum=-1.659;SC=ACTTCTGCTGACAGAAGTAGA;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=424;TCF=257;TCR=167;TR=157;WE=62007506;WS=62007488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:323,208:0.39:531
chr17	62019103	rs56342400	G	T	5900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=687;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=0.496;SC=ACATATCATCGATGCCCGACT;SOR=0.830;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=577;TCF=318;TCR=259;TR=240;WE=62019111;WS=62019093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:396,288:0.42:684
chr17	62020348	rs2058194	T	C	4257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=88;PP=2531;ReadPosRankSum=0.368;SC=TGGCTCTGGTTGTCTGTCTCC;SOR=0.635;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=405;TCF=215;TCR=190;TR=183;WE=62020356;WS=62020338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,204:0.45:449
chr17	62020563	.	CAGAGATGACAG	C	504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=2229;ReadPosRankSum=2.185;SC=ACAGAGATGACAGAGATGACA;SOR=0.364;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=27;WE=62020583;WS=62020553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
chr17	62022659	rs58028318	A	AG	2074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=6;PP=2433;SC=GTACAACGAGAGGACCGGGGT;SOR=4.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=54;WE=62022667;WS=62022649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	62041068	rs6504191	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=302;ReadPosRankSum=-2.200;SC=TCTCCGCTGCTGCTCTGCCTC;SOR=1.053;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=26;WE=62041076;WS=62041058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,28:0.31:91
chr17	62041317	rs2331408	G	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.062;SC=CAAACTTAGTGCAGGTGGGGG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=62041325;WS=62041307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr17	62048467	rs2302236	A	G	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=50;PP=1793;SC=CCAGGCCTGCACATGGTACGG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=62048475;WS=62048457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	62048707	rs2302237	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=106;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GATGAGGATTCCCAAGAAATT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=62048715;WS=62048697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr17	62049235	rs9892013	A	G	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=70;PP=2249;SC=GCCGGCCGGGACAGGCATGTC;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=42;TCR=70;TR=112;WE=62049243;WS=62049225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	62075994	rs76735942	G	GA	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.071;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=495;ReadPosRankSum=1.554;SC=CACTGGCCGGGGGGGTTGGGG;SOR=1.581;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=16;WE=62076002;WS=62075984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr17	62076077	rs62070903	C	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=261;ReadPosRankSum=-0.713;SC=CCCTGGGTCACCTTCCTGCAG;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=14;WE=62076085;WS=62076067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr17	62079334	rs11079520	A	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=896;ReadPosRankSum=0.042;SC=GCTGTTGTGTAAGAGCTCCCT;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=50;WE=62079342;WS=62079324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr17	62080969	rs4141180	A	C	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=49;PP=2965;SC=AAAGTGACTTATCACTCCCAA;SOR=1.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=138;WE=62080977;WS=62080959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	62083929	rs6504194	A	G	7460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=138;NR=109;PP=2965;SC=CACAGGGAACAGGGCACCCCC;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=138;TCR=109;TR=247;WE=62083937;WS=62083919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr17	62121480	rs196912	T	C	2593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.04;MQRankSum=1.020;NF=53;NR=50;PP=1345;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGAAGCGAGATGTGAAGTAGC;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=103;WE=62121488;WS=62121456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,127:0.49:257
chr17	62122145	rs196915	A	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=1495;SC=AAGATTTATAAAGAATGGATG;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=62122153;WS=62122135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	62122677	rs196917	G	A	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=16;PP=1873;SC=AGGCGGCAGCGACTTTTGCAA;SOR=2.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=84;WE=62122685;WS=62122667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	62123022	rs196918	C	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=358;SC=CTGTTCCTCACGAAGCACAGG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=62123030;WS=62123012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	62125272	rs196923	A	G	6963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=100;PP=2965;SC=GTTTGAGCACATGCTTCGCTG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=109;TCR=100;TR=209;WE=62125280;WS=62125262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr17	62130389	rs10689374	G	GCCT	1525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1297;SC=GCAACCCCAGGCCTCCTCCAA;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=24;WE=62130397;WS=62130379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	62130937	rs196929	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=-2.655;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	62132309	rs196931	C	T	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=646;SC=AGGCACTGCACCCCAGACTGC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=62132317;WS=62132299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	62132330	rs4968607	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=0.266;SC=TGCTCAGCAAGAGCCTGCCAG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=11;WE=62132338;WS=62132320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr17	62141455	rs187826	A	G	4110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=69;PP=2280;SC=CCTTGTCCCCAATGGTGACGC;SOR=1.091;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=115;WE=62141463;WS=62141445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	62144344	rs16947425	C	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=536;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ATCTTGCAACCACATCCTCTA;SOR=1.374;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=32;WE=62144352;WS=62144334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr17	62145672	rs196939	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=662;ReadPosRankSum=1.015;SC=CAGACCAGCCAGCCCATTACC;SOR=0.834;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=42;WE=62145680;WS=62145662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr17	62145728	rs196940	A	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.855;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTATCTAATTATAACAAACAA;SOR=1.341;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=29;WE=62145736;WS=62145718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr17	62156933	rs196947	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=2;PP=604;SC=AAGCTCCAGGTGGGAGACACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=62156941;WS=62156923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	62158012	rs196950	T	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=946;ReadPosRankSum=-1.503;SC=AGACTTTATATGTCACTCACT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=53;WE=62158020;WS=62158002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr17	62158278	rs196951	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=642;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TTCTCCCTCCTGTTAACCTAC;SOR=0.417;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=11;TCR=71;TR=43;WE=62158286;WS=62158268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr17	62158300	rs196952	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=498;ReadPosRankSum=0.932;SC=TGGGCTAGTGCACGTGAAGGT;SOR=0.624;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=26;WE=62158308;WS=62158290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr17	62158319	rs196953	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=0.856;SC=GTTATATGCATTTTTGTATCA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=18;WE=62158327;WS=62158309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr17	62223680	rs201014257	GGT	G	925.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.786;NF=21;NR=4;PP=1085;ReadPosRankSum=1.297;SC=CCCTGGTGTCGGTGTGTGTCG;SOR=1.681;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=25;WE=62223689;WS=62223670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr17	62228161	rs2291678	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=0.529;SC=CCAGAGCTTCTATACTTGGTG;SOR=0.439;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=16;WE=62228169;WS=62228151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr17	62232165	rs118141221	T	C	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1272;ReadPosRankSum=0.670;SC=TCCTGATCCCTGGAGACTCAG;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=273;TCF=141;TCR=132;TR=112;WE=62232173;WS=62232155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,133:0.43:311
chr17	62254983	rs1967130	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=299;SC=GTCCCACATTGTATTGGTGAC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=62254991;WS=62254973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	62265838	rs36104018	TC	T	4916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=72;PP=2951;SC=GTAAGCGGACTCCCTGAGAAA;SOR=0.980;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=15;TCR=73;TR=87;WE=62265846;WS=62265828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	62270785	rs2166290	T	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=11;PP=1458;SC=GTCATGAGAATGCACATTAGG;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=54;TCR=11;TR=65;WE=62270793;WS=62270775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	62270823	rs72009320	GCTTC	G	4950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=28;PP=2988;SC=TTCAGGGTGGGCTTCCTTCCT;SOR=1.949;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=66;WE=62270834;WS=62270813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	62270941	rs34343500	C	T	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.03;MQRankSum=1.321;NF=49;NR=50;PP=1431;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CAGAGACACCCGATGACTTCT;SOR=0.609;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=270;TCF=139;TCR=131;TR=99;WE=62270949;WS=62270931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,121:0.37:330
chr17	62290699	rs115209976	G	A	2853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=1896;ReadPosRankSum=0.144;SC=CTTCTGAAAGGCGTCGTTTAG;SOR=0.659;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=218;TCF=111;TCR=107;TR=112;WE=62290707;WS=62290689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,131:0.50:263
chr17	62385632	rs59912124	A	AC	2454.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.680;QD=21.72;ReadPosRankSum=2.300;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr17	62385633	.	A	G	1178	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=58.63;NF=49;NR=18;PP=1178;QD=18.1010628738;SC=AACAAACAAAAAACAATTTTA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=79;TCR=32;TR=67;WE=62385641;WS=62385623;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:44,67:0.60:111
chr17	62385633	.	A	AAACAAAG	2454.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=2.383;QD=20.29;ReadPosRankSum=2.044;SOR=1.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr17	62386078	rs28670385	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.716;NF=7;NR=20;PP=492;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GGAAAGGAAATTGGCCACTAT;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=27;WE=62386086;WS=62386068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr17	62401118	rs2812	T	C	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=1129;ReadPosRankSum=2.320;SC=ATACAGGGATTATCTGTTCTT;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=66;WE=62401126;WS=62401108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,74:0.53:139
chr17	62406971	rs2070783	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=802;ReadPosRankSum=-1.697;SC=GGAAGAATTCATGTGAATGCA;SOR=1.484;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=98;TCF=68;TCR=30;TR=50;WE=62406979;WS=62406961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr17	62463825	rs199721035	T	TG	1121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=991;SC=CTGAGGCAGGTGATTACTTGA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=21;WE=62463833;WS=62463815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	62502435	rs1991401	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=-0.200;SC=AGCCGCTTTTATAGTCTGGAC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=62502443;WS=62502425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr17	62506274	rs66540667	AT	A	2558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.955;NF=37;NR=57;PP=2277;ReadPosRankSum=1.738;SC=AAATTATGTGATTTTTTCCCC;SOR=0.755;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=257;TCF=92;TCR=165;TR=94;WE=62506288;WS=62506264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,142:0.37:387
chr17	62530885	rs145444747	TAAG	T	2436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.419;NF=10;NR=34;PP=1685;ReadPosRankSum=0.238;SC=CCAGCCCTGTTAAGAAGGTGA;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=28;TCR=103;TR=44;WE=62530895;WS=62530875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,69:0.33:206
chr17	62657883	rs145806567	C	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=82;SC=CCCAAGGCCACAGGCACCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=62657891;WS=62657873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	62758984	rs11374577	G	GC	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=50.42;NF=0;NR=10;PP=427;SC=TAAGTTAAAAGTAAAGCTAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=62758992;WS=62758974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	62782689	rs6504255	T	C	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=36;PP=2061;SC=GCATACCTGATTGTGGTGTCA;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=62782697;WS=62782679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	62796759	.	A	C	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.52;QD=29.79;SOR=1.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	62801318	.	T	C	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=839;SC=CGCGCAACCTTGGCTCACTGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=62801326;WS=62801308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	62811364	.	A	C	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=55;PP=1711;SC=CAACAATACCATAGAAGTTTT;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=74;WE=62811372;WS=62811354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	62820746	rs9915020	G	T	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=19;PP=1665;SC=ATCTCACTTGGGGGTGACAGC;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=74;WE=62820754;WS=62820736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	62924044	rs6504263	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.72;QD=30.58;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	62952689	rs3960389	C	G	3278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.22;QD=28.27;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	63052344	rs12945514	G	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=223;SC=GCGACACAGCGGACCAGGGCG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=63052352;WS=63052334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	63052361	rs7216195	C	G	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=6;PP=287;SC=GGCGGTGCCCCGCCCCGCACC;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=63052369;WS=63052351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	63133804	rs2585858	A	G	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=74;PP=2509;SC=AGGAGTGGAGAGCACCCCTTT;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=134;WE=63133812;WS=63133794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	63173756	rs9896245	A	G	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=35;PP=1311;ReadPosRankSum=0.323;SC=TTCTCAGCTCAATCTCACAAT;SOR=0.807;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=280;TCF=173;TCR=107;TR=97;WE=63173764;WS=63173746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,115:0.35:325
chr17	63173959	rs11651062	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=366;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGGCCTAGGTCGGATTCTGGG;SOR=0.422;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=28;WE=63173967;WS=63173949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr17	63197920	rs2292593	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.799;SC=AGTGAAGATGTGGCTCCTTTC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=63197928;WS=63197910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr17	63200479	rs79965148	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=0.597;SC=CTAAGTACCCGGAAAATTCTT;SOR=1.101;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=25;WE=63200487;WS=63200469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr17	63532767	rs28684769	C	G	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=90;PP=2681;SC=CTATTCTGCTCAGAGAGAGAG;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=25;TCR=90;TR=115;WE=63532775;WS=63532757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	63532914	rs28760438	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=12;PP=719;SC=CTGCAAAAACAGCCATTCCCA;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=63532922;WS=63532904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	63533732	.	A	ATGG	2010.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=1144;ReadPosRankSum=-1.449;SC=GGTACTGCGAATGGTGGTGGT;SOR=1.003;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=87;TCF=20;TCR=67;TR=25;WE=63533740;WS=63533722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,55:0.39:141
chr17	63533768	rs1133683	G	A	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=61;PP=2578;SC=AGCGGGAGCGGGGGCTATAGC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=132;WE=63533776;WS=63533758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	63533789	rs9915936	T	C	6628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=66;PP=2360;SC=GGCCTACGCCTGGAGACTGGC;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=141;WE=63533797;WS=63533779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	63534250	rs8078753	T	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=1065;SC=ACGCACCCCATGCACATGCGC;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=63534258;WS=63534240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	63534538	rs4541111	C	A	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=919;SC=GAGCTTCCCGCACCAGGCGCT;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=63534546;WS=63534528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	63554591	rs2240308	G	A	9154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=177;PP=2965;SC=GAAGAGACAGGCATGGGTTTG;SOR=1.155;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=290;TCF=113;TCR=177;TR=290;WE=63554599;WS=63554581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr17	63739352	rs12948946	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=-3.127;SC=TGAAAACAGCATGCTATAACT;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=24;WE=63739360;WS=63739342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr17	64001925	rs1015098	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=1.539;SC=ATTGGAAGACGAGTAAAGTTT;SOR=0.870;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=14;WE=64001933;WS=64001915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr17	64023483	rs11079627	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=-2.240;SC=TGACAGAGCAAGACTCTGTCT;SOR=0.706;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=9;WE=64023501;WS=64023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr17	64023493	rs35334393	T	TA	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=9;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=-1.921;SC=AGACTCTGTCTAAAAAAAAAG;SOR=1.265;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=9;WE=64023501;WS=64023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr17	64023552	rs12449542	A	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.533;NF=12;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=3.035;SC=GGTTTCATAAAAATCAGTCTG;SOR=0.983;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=18;WE=64023560;WS=64023542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr17	64023624	rs17704679	T	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=593;ReadPosRankSum=-0.043;SC=ATTACCTTTTTTTCATAGATG;SOR=0.521;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=33;WE=64023632;WS=64023614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr17	64023642	rs11079628	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=2.602;SC=ATGTGTTTTAAATGACTTTTC;SOR=1.265;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=12;WE=64023650;WS=64023632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr17	64023781	rs11079629	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	64024255	.	AA	TA	82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=66.83;NF=3,3;NR=0,0;PP=82,53;QD=48.6152534904;SC=CTACATCTCAAAGCATCAATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3,3;WE=64024263;WS=64024254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
chr17	64024255	.	AA	ATA	82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=66.83;NF=3,3;NR=0,0;PP=82,53;QD=48.6152534904;SC=CTACATCTCAAAGCATCAATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3,3;WE=64024263;WS=64024254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
chr17	64024303	rs4277386	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.265;NF=9;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=0.150;SC=TATACAATGCGATAAAAGAAT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=64024311;WS=64024293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	64024340	rs9901053	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.490;NF=19;NR=3;PP=466;ReadPosRankSum=1.023;SC=CATTTCTGAGTTTTATTTTTT;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=22;WE=64024348;WS=64024330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr17	64024375	rs9899985	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=707;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TGATACATCTGAATCAAGAAA;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=43;WE=64024383;WS=64024365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr17	64025056	rs11656768	T	C	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.7525;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=116;SC=TTGTGCTATATAGTAGACATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=64025076;WS=64025048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	64025068	rs11651749	C	A	57.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=1.150;SC=GTAGACATTTCGAATTTTAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=64025076;WS=64025048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	64025093	rs11651820	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTAAATACCAGTAAAAATTCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=64025101;WS=64025083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	64025331	rs11652766	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.17;MQRankSum=-0.919;NF=8;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-1.072;SC=GCTCATAATCATTTACAAGAT;SOR=0.662;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=21;WE=64025339;WS=64025321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr17	64025435	rs60700240	T	TTAATCA	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.566;NF=0;NR=3;PP=97;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ATGAAATTTTTTAATCAGCTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=64025443;WS=64025425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	64025926	rs9908964	G	T	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=426;SC=GCAGATAACTGATACAGTTAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=64025934;WS=64025920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	64049733	rs1401049	A	G	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.935;NF=67;NR=16;PP=1641;ReadPosRankSum=0.310;SC=GTAGGAAGGTAAAGTTTTTCT;SOR=1.092;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=116;TCR=30;TR=83;WE=64049741;WS=64049723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,87:0.54:161
chr17	64050007	rs11079637	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GCTACATCAGGAAATCAAGAG;SOR=0.042;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=15;WE=64050015;WS=64049997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr17	64050062	rs1401048	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GTAATTCAGCGGAAAAAATGG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=64050070;WS=64050052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	64062830	rs908713	T	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1082;ReadPosRankSum=1.384;SC=ATCAAATTTTTTTCTCCACAT;SOR=0.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=58;WE=64062838;WS=64062820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr17	64173170	rs2159557	A	G	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.25;SOR=2.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	64208230	rs6933	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GTGACATTTTGTGTGGAATCT;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=194;TCF=111;TCR=83;TR=90;WE=64208238;WS=64208220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,110:0.46:241
chr17	64208396	rs1558359	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=308;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TACATTTTACGAGTATATAGA;SOR=0.653;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=17;WE=64208404;WS=64208386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr17	64210528	rs1544556	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=408;ReadPosRankSum=1.677;SC=TTATGATGACGGGCAAGTGGG;SOR=1.083;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=26;WE=64210536;WS=64210518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr17	64213104	rs2041398	A	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=733;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TTTATTCAATAAGACATATTA;SOR=0.965;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=108;TCF=32;TCR=76;TR=44;WE=64213112;WS=64213094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr17	64216644	rs3744317	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=722;ReadPosRankSum=-1.506;SC=GCCCTACCATGCGTATTTTGT;SOR=0.685;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=85;TCR=24;TR=46;WE=64216652;WS=64216634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
chr17	64550701	rs35476409	AGGTG	A	820.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,26:0.25:104
chr17	64684265	rs17689224	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=-0.831;SC=ACTCCTGTAGCGCTTTGCTTG;SOR=0.275;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=8;WE=64684273;WS=64684263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr17	64685078	rs2227857	G	A	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=884;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GGTACAAGTTGCTTAACCAAG;SOR=1.370;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=155;TCF=101;TCR=54;TR=60;WE=64685086;WS=64685068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,63:0.37:172
chr17	64735035	rs5821506	C	CT	7542.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=126;PP=2975;SC=TGGAAACTTCCTTTTTTCCCC;SOR=1.034;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=30;TCR=138;TR=155;WE=64735043;WS=64735025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	64735157	rs9892696	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.107;NF=2;NR=17;PP=236;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CACACCACCATGCCTGGCTAA;SOR=0.326;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=19;WE=64735165;WS=64735147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr17	64737717	rs3803821	T	A	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=57;PP=2079;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TTTGAGAATGTAAAGTATACA;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=147;TCR=113;TR=133;WE=64737725;WS=64737707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,158:0.52:306
chr17	64783081	rs6504459	G	A	10774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=146;PP=2965;SC=GGCTGTTTCTGTCTGCAAAGG;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=330;TCF=184;TCR=146;TR=330;WE=64783089;WS=64783071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chr17	64785191	rs11420909	T	TG	1973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=41;PP=2048;SC=AGGAGGCCGGTGCCCCTGGCT;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=44;WE=64785199;WS=64785181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	64799890	rs58132629	G	GT	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=-0.468;SC=CCAGCCCGGAGTTCCCCAGGG;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=64799898;WS=64799880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	64875035	rs2286676	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TTGTATGGACCAACTTCAAAT;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=26;WE=64875043;WS=64875025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr17	64876921	rs3744297	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.045;NF=2;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TGCAGTGGCACGATCTTGGCT;SOR=0.034;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=20;WE=64876929;WS=64876911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr17	64881075	rs2286678	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=53;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CAGCGAGCCCATCCTCTGCTG;SOR=0.843;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=221;TCF=95;TCR=126;TR=90;WE=64881083;WS=64881065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,96:0.40:242
chr17	64961273	.	GCC	G	329	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=22;MQ=62.85;NF=1;NR=17;PP=329;QD=20.0;SC=ACCCCTCGCCGCCCCACACAC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=18;WE=64961285;WS=64961263;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,18:0.72:25
chr17	65026515	rs2240648	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=368;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TGCCCGTCCCACTGTGGGTCT;SOR=0.307;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=25;WE=65026523;WS=65026505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr17	65026886	rs11649752	C	T	4240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.190;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=97;PP=2816;ReadPosRankSum=0.352;SC=CAAGGTCCACCGAGGCCTCGC;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=281;TCF=111;TCR=170;TR=165;WE=65026894;WS=65026865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,184:0.60:309
chr17	65041073	rs16960487	G	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=43;PP=818;ReadPosRankSum=0.046;SC=TGGCAAAGTTGCCCTTGCGAA;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=30;TCR=122;TR=54;WE=65041081;WS=65041063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,59:0.35:167
chr17	65051104	rs11322532	CA	C	1525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.12;MQRankSum=0.959;NF=35;NR=7;PP=1474;ReadPosRankSum=0.754;SC=GACACACACACAATGACACAC;SOR=1.016;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=42;WE=65051112;WS=65051094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr17	65051180	rs2363844	A	G	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=1.086;NF=62;NR=44;PP=1419;ReadPosRankSum=0.336;SC=AAGAGCTCCCATGCTGAGGCC;SOR=0.554;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=227;TCF=139;TCR=88;TR=106;WE=65051188;WS=65051170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,117:0.46:253
chr17	65052304	rs1799938	G	A	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1646;ReadPosRankSum=0.231;SC=CTTTCTCGGCGGTCTCGCCCT;SOR=0.585;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=239;TCF=115;TCR=124;TR=107;WE=65052312;WS=65052294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,129:0.42:305
chr17	65104743	rs11653020	G	A	5965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=89;PP=2965;SC=TGGGTATGGAGCGCTGCCCTG;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=99;TCR=89;TR=188;WE=65104751;WS=65104733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr17	65116491	rs12709454	T	C	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=47;PP=2115;SC=CATCAGTTTATGAACAGGAGA;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=118;WE=65116499;WS=65116481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	65119931	.	CTG	C	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=0.345;SC=TCCAAAGTGACTGTGTGTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=3;WE=65119940;WS=65119921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr17	65342066	rs17647947	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=1.550;SC=ATATATCCATTTCAAATTTTA;SOR=0.234;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=20;WE=65342074;WS=65342056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr17	65528801	rs2304278	C	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=552;SC=ATGTGGCTGCCTTCTCTTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=65528809;WS=65528791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	65548540	rs2916133	G	T	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=39;PP=1426;SC=GATTTACAGTGGATTATCCAA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=65548548;WS=65548530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	65549847	rs2570046	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=17;PP=483;SC=GAATAATTCCAAGTCAGAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=65549855;WS=65549837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	65574283	rs2570035	A	G	10022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=181;NR=123;PP=2965;SC=GCTAATGAAAATTTGCTTTTC;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=181;TCR=123;TR=304;WE=65574291;WS=65574273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr17	65665608	rs36013607	AT	A	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=0.437;SC=AATTTCTTTGATTTTTTTTTT;SOR=1.085;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=6;WE=65665616;WS=65665598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr17	65683387	rs12939664	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=542;ReadPosRankSum=-1.170;SC=TGCCCGGTTCGCAACCTTCCA;SOR=0.504;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=31;WE=65683395;WS=65683377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr17	65714232	rs3760224	C	G	7033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=173;PP=2962;ReadPosRankSum=0.494;SC=GGGAGCGCCCCGACTGCCTTC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=467;TCF=177;TCR=290;TR=278;WE=65714240;WS=65714222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,315:0.59:537
chr17	65714359	rs3760226	G	A	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1295;SC=AGTGAGGTCTGGAATCTGGCT;SOR=4.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=65714367;WS=65714349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	65718798	rs5821454	TA	T	249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=171;SC=GAAATTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=65718806;WS=65718788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	65718839	rs999043	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=157;SC=GTTGCCCTGTCACCCAGGCTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=65718847;WS=65718829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	65722849	rs3744268	G	A	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1058;SC=TTTTCATTTCGTTATTACCCA;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=65722863;WS=65722839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	65730259	rs80229149	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.736;NF=6;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=1.540;SC=TTAATTGTTATTCCTGGTTCA;SOR=0.859;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=65730267;WS=65730254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	65730404	rs4790943	G	A	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=29;PP=1660;SC=ATATTTAACTGTAACTCCCCC;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=65730412;WS=65730394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	65732093	rs3760227	A	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=667;ReadPosRankSum=-1.042;SC=GTGAAGTGTCATCATTAGCAG;SOR=0.469;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=42;WE=65732101;WS=65732083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr17	65732959	rs7223990	A	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=232;SC=TATCCTTACAACTCTTAGAGC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=65732967;WS=65732949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	65733192	.	G	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=435;ReadPosRankSum=0.057;SC=TCCAGTTAAGGAGACGAAAAA;SOR=0.922;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=27;WE=65733200;WS=65733182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr17	65733223	.	G	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=378;ReadPosRankSum=1.947;SC=TTTACAGCCAGAGGTTCCACC;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=28;WE=65733231;WS=65733213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr17	65733285	.	G	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=273;ReadPosRankSum=-0.090;SC=ATTGAAATATGAAAAATCAAA;SOR=1.292;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=17;WE=65733293;WS=65733275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr17	65734514	rs1542610	A	G	9170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=189;PP=2965;SC=TCTTTATAGGATATAGTTATA;SOR=1.405;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=288;TCF=99;TCR=189;TR=288;WE=65734522;WS=65734504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr17	65736913	rs61602831	T	C	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.974;NF=44;NR=56;PP=1561;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CCATCCCACATAGAAGCAGTA;SOR=0.554;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=76;TCR=106;TR=100;WE=65736921;WS=65736903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,108:0.54:199
chr17	65737013	rs201299108	CTTCT	C	1558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.956;NF=1;NR=39;PP=1345;ReadPosRankSum=1.490;SC=TAAAAAATAACTTCTTTTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=40;WE=65737024;WS=65737003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,43:0.78:55
chr17	65739789	rs2286917	A	G	5262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.06;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	65739789	.	ACTTACTCA	GCTTACTCA,GCTTACTCT	1093	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=52,28;NR=66,33;PP=691,1093;QD=6.15060349616;SC=TCCTTAAATAACTTACTCATG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=118,61;WE=65739805;WS=65739779;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:119
chr17	65739797	rs2286918	A	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,78:0.59:132
chr17	65821481	rs12945266	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=328;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AGCCCAGGCGCCCAGGGCTCC;SOR=0.518;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=21;WE=65821489;WS=65821471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr17	65849927	rs2046323	T	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=530;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TGCTTCTTCGTATTATTTTAA;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=25;WE=65849935;WS=65849923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr17	65862853	rs76871039	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=46;PP=1036;ReadPosRankSum=0.924;SC=GAGCTAAACCGTTGGTATGAA;SOR=0.517;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=77;TCF=7;TCR=70;TR=51;WE=65862861;WS=65862843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr17	65871559	rs9890629	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=213;ReadPosRankSum=-0.666;SC=TAAAATGGCCGTTCAATGGAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=65871567;WS=65871549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr17	65871598	rs12451707	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=412;ReadPosRankSum=0.037;SC=TTTAGTAGTTGACTGAATGTG;SOR=1.685;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=21;WE=65871606;WS=65871588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr17	65882172	rs4318247	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=709;ReadPosRankSum=0.731;SC=TCCTAAAACAATTGTCTTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=31;WE=65882180;WS=65882162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr17	65882457	rs8072824	T	A	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=50;PP=1403;SC=CATCCATTCCTTTAAAGGGAA;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=65882465;WS=65882447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	65887896	rs8079754	A	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=905;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GTTTTGGTGAAATAAGGTGGT;SOR=0.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=46;WE=65887904;WS=65887886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr17	65914917	rs137937430	G	A	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1193;ReadPosRankSum=-1.816;SC=ATGATATGGCGGCCAAGGCTC;SOR=0.606;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=72;WE=65914925;WS=65914907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,89:0.39:226
chr17	65918807	rs12600941	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=1.494;SC=GGCTGCTTTCATGATACAAAG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=65918815;WS=65918806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr17	65944515	rs11870068	A	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=731;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TTAAAATTTCAGTATGTTTTC;SOR=0.679;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=58;WE=65944523;WS=65944505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,63:0.57:111
chr17	65955651	rs8068790	T	C	4485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=64;PP=2466;SC=CTTTAATTGATAACAGGAAGA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=137;WE=65955659;WS=65955641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	65955758	rs139709271	T	TCCTCCAGCC	1226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.068;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.121;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr17	65962538	rs5821446	A	AT	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=681;ReadPosRankSum=2.495;SC=TTAGGTAACTATTACTAGAGC;SOR=0.951;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=20;WE=65962546;WS=65962528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr17	65972188	rs61489754	TA	T	449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.99;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	65988049	rs9891146	T	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=950;ReadPosRankSum=-0.850;SC=TGGGTATGAATTGCACCTTGA;SOR=0.523;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=70;WE=65988057;WS=65988039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,85:0.43:196
chr17	65989048	rs28368756	T	C	7190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=109;PP=2965;SC=TGTCATTGTTTCCCATCGCTC;SOR=0.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=109;TCR=109;TR=217;WE=65989056;WS=65989038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr17	66036934	rs75756883	A	AT	957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=-1.442;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,56:0.41:137
chr17	66036943	rs141699894	T	TG	1795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.717;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,82:0.57:143
chr17	66038181	rs62084696	C	G	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=835;ReadPosRankSum=-1.839;SC=ACTTTTATTTCTCTTTTTGTT;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=57;WE=66038189;WS=66038171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr17	66038556	rs62084697	G	A	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=54;PP=1277;ReadPosRankSum=0.874;SC=TAGTGACTTTGTCAAGTTTTG;SOR=0.888;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=41;TCR=83;TR=79;WE=66038564;WS=66038546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,88:0.62:143
chr17	66039350	rs4638	A	G	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=1.166;NF=43;NR=36;PP=1142;ReadPosRankSum=1.928;SC=ATCCAGAAGTATTAGCAGATA;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=103;TCR=89;TR=79;WE=66039358;WS=66039340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,92:0.43:215
chr17	66039618	rs35594666	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TCAGGAGTTCGAGACCAGCCT;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=13;WE=66039626;WS=66039608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	66121807	rs1964244	C	T	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.894;SC=CAGCCTTAAACGACTGAAGAA;SOR=0.445;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=199;TCF=115;TCR=84;TR=106;WE=66121815;WS=66121797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,121:0.51:239
chr17	66121923	rs147265891	C	T	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1182;ReadPosRankSum=0.029;SC=GTCCTTACCTCAATAAGACAA;SOR=0.500;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=175;TCF=69;TCR=106;TR=92;WE=66121931;WS=66121913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,92:0.49:189
chr17	66122038	rs7210681	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.38;ReadPosRankSum=2.806;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr17	66122977	rs62085700	C	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.64;MQRankSum=-0.606;NF=0;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=0.128;SC=TCAGTGCCCACGTTGTTGTAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=66122985;WS=66122967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	66124489	rs2240606	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=972;ReadPosRankSum=-0.228;SC=GTCCACAGCTGTATGCCCCAG;SOR=0.568;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=35;TCR=77;TR=60;WE=66124497;WS=66124479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr17	66246416	rs3213690	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=52;PP=2405;SC=TGAGAAATTAAATGCTGGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=106;WE=66246424;WS=66246406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	66247426	rs58359332	A	ACTGTATAG	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.313;NF=1;NR=17;PP=1295;ReadPosRankSum=1.095;SC=GATATTTAAAATATTTTCAGT;SOR=0.433;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=18;WE=66247434;WS=66247416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr17	66253095	rs7105	T	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=68;ReadPosRankSum=0.601;SC=AATGCCTGGCTGTTCTCCAAA;SOR=0.158;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=8;WE=66253103;WS=66253085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr17	66265367	rs199555462	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.68;MQRankSum=-0.462;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.653;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr17	66267650	rs3744307	T	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.725;NF=15;NR=5;PP=269;ReadPosRankSum=0.991;SC=CTTTCCGATTTTCCTGGATGA;SOR=1.483;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=20;WE=66267658;WS=66267640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr17	66267691	rs7222013	A	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.785;NF=47;NR=19;PP=1144;ReadPosRankSum=1.207;SC=CCTCTGATAAAGATGGGTCTG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=69;TCR=29;TR=66;WE=66267699;WS=66267681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,78:0.66:118
chr17	66270082	rs35397826	A	G	2841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=62;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.745;SC=GATGATGCCGATGGCGACGTA;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=301;TCF=148;TCR=153;TR=122;WE=66270090;WS=66270072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,143:0.39:370
chr17	66364691	rs1558876	C	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=0.261;SC=TGTTTCAGCACCAGCGGGAGG;SOR=0.869;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=10;WE=66364699;WS=66364681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr17	66364749	rs1558877	T	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.191;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=546;ReadPosRankSum=0.756;SC=TGCCCTTACCTGTGACTCAGC;SOR=1.621;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=107;TCF=82;TCR=25;TR=35;WE=66364757;WS=66364739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,37:0.31:120
chr17	66364804	rs1558878	T	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=20;PP=979;ReadPosRankSum=-1.203;SC=TGCAGGGCTCTGGGAGATGGA;SOR=1.023;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=228;TCF=152;TCR=76;TR=72;WE=66364812;WS=66364794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,87:0.33:264
chr17	66420766	rs3785605	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CCTGTAATCCTAGCACTTTGG;SOR=0.368;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=16;WE=66420774;WS=66420756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr17	66425995	rs3785610	T	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr17	66425995	.	TCC	GCT	1104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23;NR=4;PP=1104;QD=42.8691805505;SC=CTCCCAAGGTTCCGGGATTAC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=27;WE=66426005;WS=66425985;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,27:0.39:69
chr17	66425997	rs3785611	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr17	66440514	rs1030098	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=302;ReadPosRankSum=1.545;SC=GAGATAAACCTCACTAAGACT;SOR=0.687;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=21;WE=66440522;WS=66440504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr17	66446803	rs2302782	T	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=426;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TCTTGAAAGATGTCCATCTTT;SOR=0.581;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=33;WE=66446811;WS=66446793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr17	66447073	rs2302783	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=268;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTACATGGATTGATCACTTCC;SOR=1.101;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=16;WE=66447081;WS=66447063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr17	66449122	rs883541	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=540;ReadPosRankSum=-1.664;SC=TTTAGTTCCAGTTGCTAGGGA;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=40;WE=66449130;WS=66449112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,48:0.38:126
chr17	66453305	rs71378928	C	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GTGGGGGGTGCGGCAAACCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=5;WE=66453313;WS=66453295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr17	66453320	rs67556103	A	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.526;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,4:0.14:28
chr17	66453410	rs71378929	C	T	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=779;ReadPosRankSum=0.521;SC=CCACAAGCTGCTCTCAGGACG;SOR=0.571;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=62;WE=66453418;WS=66453400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,71:0.44:160
chr17	66453572	rs146213184	GGCCCGGGAA	G	777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=2938;ReadPosRankSum=2.061;SC=TCGGGGGCTCGGCCCGGGAAG;SOR=1.572;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=16;WE=66453588;WS=66453562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
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chr17	66519857	rs35723852	C	CT	851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=614;ReadPosRankSum=-0.101;SC=ACCTTCAGTTCTTTTCTAGGT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=18;WE=66519865;WS=66519847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr17	66524987	rs2302230	G	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1366;ReadPosRankSum=0.180;SC=ATACAGAGCAGTTATTTTGAT;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=90;WE=66524995;WS=66524977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,106:0.64:166
chr17	66526027	rs2302231	G	T	2085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1443;ReadPosRankSum=1.237;SC=TTGAGAGTGTGTGTTTGTTTA;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=82;WE=66526035;WS=66526017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,90:0.69:131
chr17	66526316	rs2302233	A	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=168;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TAATGAAATTACTGATTGTCT;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=8;WE=66526324;WS=66526306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr17	66533655	rs2907373	A	G	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=33;PP=1532;ReadPosRankSum=-0.209;SC=GTCTGGGGCCAACTGTTCCAC;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=190;TCF=128;TCR=62;TR=98;WE=66533663;WS=66533645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,114:0.52:219
chr17	66536212	rs3214285	CAG	C	839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.190;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.53;MQRankSum=1.332;NF=0;NR=17;PP=1131;ReadPosRankSum=-2.109;SC=ACTTGAGAGACAGGGGTGTGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=17;WE=66536227;WS=66536202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr17	66536219	rs2286558	G	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=1139;ReadPosRankSum=-2.581;SC=AGACAGGGGTGTGAACGAAGC;SOR=1.432;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=18;WE=66536227;WS=66536202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr17	66547249	rs9789047	G	A	3857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.822;NF=82;NR=65;PP=2344;ReadPosRankSum=0.613;SC=TCAAGGAGGAGCATTCCCCTG;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=237;TCF=131;TCR=106;TR=147;WE=66547257;WS=66547239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,173:0.60:288
chr17	66547409	rs11657445	G	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AATTTTCAAGGCATGTAGTTG;SOR=0.951;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=23;TCR=78;TR=52;WE=66547417;WS=66547399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr17	66547865	rs190872111	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=2.872;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr17	66547865	.	T	TATTATTATC	506	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=63.36;NF=5;NR=2;PP=506;QD=73.0;SC=TTATTATTATTATCACCCCAA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=66547873;WS=66547855;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	66550887	rs35495396	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=610;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AGGGTGAAGAGGCTGGGTGGG;SOR=1.967;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=35;WE=66550895;WS=66550877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr17	66872802	rs1481	G	C	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=87;NR=79;PP=2965;SC=AGGTCTTCACGGGAGACTTCA;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=87;TCR=79;TR=166;WE=66872810;WS=66872792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	66873743	rs8068987	G	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=39;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CTGTCAGGTTGGGCCACAGCG;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=128;TCR=89;TR=94;WE=66873751;WS=66873733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,116:0.43:268
chr17	66880081	rs8080098	A	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=406;SC=TTCAATATCAAAGATATACTA;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=66880089;WS=66880071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	66880371	rs1470293	G	A	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=160;SC=ATAGATACCTGTATCTCTAAC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=66880379;WS=66880361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	66880405	rs3744492	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=2.436;SC=TTTCACAGTGTGTACAGAACT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=66880413;WS=66880395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	66881204	.	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=347;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AGAAAATCAATTGGATTCCGT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=19;WE=66881212;WS=66881194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr17	66883719	rs6501839	A	G	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=71;PP=2273;SC=AACTATTCAAACAAAACCTTT;SOR=2.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=94;WE=66883727;WS=66883709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	66890117	rs4148000	C	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=2.484;SC=ATGTTTTGTTCATTTTATTTT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=66890125;WS=66890107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	66890118	rs4147999	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.90;ReadPosRankSum=-2.670;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	66899710	rs3744494	C	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=1.342;SC=CTCTGCTAAGCATCTCATGAT;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=15;WE=66899718;WS=66899700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr17	66899725	rs3744495	C	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	66899733	rs3744496	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=2.154;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	66925116	rs4147980	G	A	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=5;PP=917;SC=GTTTGTAAATGATTACAGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=66925124;WS=66925106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	66925910	rs4147977	T	C	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=58;PP=1889;SC=CTGAAATGGATTCTAAGATAA;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=81;WE=66925931;WS=66925900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	66925923	rs4147976	C	T	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=47;PP=1461;SC=TAAGATAACTCTTCATTCACT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=66925931;WS=66925900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	66938232	rs4147958	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=29;PP=846;SC=TTCTTAAGAAAAAGAAATATC;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=66938240;WS=66938222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	66938260	rs4147957	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=531;SC=CAACAAAAAAACGTAGCCTAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=66938268;WS=66938250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	66972250	rs2191212	A	T	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=74;PP=2695;SC=TCCATGGATGATATAGAATCA;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=136;WE=66972258;WS=66972240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	66985383	.	C	CCTCT	526	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.42;MQRankSum=0.725;QD=40.46;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr17	66985397	.	T	TCTCTCACA	102	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=60.3;NF=1;NR=8;PP=102;QD=11.6666666667;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=66985405;WS=66985373;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,9:0.82:11
chr17	66985992	rs2302294	T	G	4602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=44;PP=2965;SC=TGTGGCAATTTTTTTCTTCCT;SOR=1.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=96;TCR=44;TR=140;WE=66986000;WS=66985982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	66986162	rs9902444	A	C	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=80;PP=2626;SC=TTTCCTTATAAAAAATCATGA;SOR=1.837;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=112;WE=66986170;WS=66986152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	66987202	rs2302293	A	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=414;SC=AGATTCATTCAGAGCACAACA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=66987210;WS=66987192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	67023755	rs6501947	A	G	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=986;SC=TTTTATGGCTATGTGACATCT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=67023763;WS=67023745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	67024585	rs12940103	T	C	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=13;PP=1330;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=2.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=67024593;WS=67024575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	67024799	rs8066758	T	A	2304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=59;PP=1862;ReadPosRankSum=0.946;SC=GGCATGATTTTAAAAAAAATT;SOR=0.903;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=83;WE=67024807;WS=67024789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr17	67028260	rs2302291	T	C	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=70;PP=2965;SC=TGATGGCTTCTTTCCCACAGA;SOR=1.060;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=174;WE=67028268;WS=67028250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr17	67031369	rs1860448	T	C	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=32;PP=1699;SC=AAAGTGAAAGTGTTACCTTAA;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=67031377;WS=67031359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	67031457	rs1860447	C	T	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2959;SC=TGCAGGAAGACGTGTATACAA;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=67031465;WS=67031447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	67075072	rs2302290	G	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=188;SC=CATAAAACATGAGTTTATAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=67075080;WS=67075068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	67075294	rs2302289	C	T	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=64;PP=2579;SC=CAGGAAAATGCATGTTGCTTT;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=133;WE=67075302;WS=67075284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	67080770	rs11657954	A	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=41;PP=1312;SC=CCTAACTCATAATTTTAAAAA;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=67080778;WS=67080760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	67080811	.	CT	C	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=28;QD=10.6666666667;SC=ACATGAAAGACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=67080819;WS=67080801;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,3:0.30:10
chr17	67081732	rs2302133	C	T	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=22;PP=1702;SC=TCATGAAATTCCTGTTTTGGA;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=67081740;WS=67081722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	67081830	rs2302134	T	C	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=68;PP=2596;SC=TCCAGCACCATTGGGTCCTAG;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=124;WE=67081838;WS=67081820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	67099129	rs2364315	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=451;SC=AGTTAATAAGAGAAGGCCATA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=67099137;WS=67099119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	67101718	rs7212506	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=384;SC=ACATAGCATACATTATATTTT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=67101726;WS=67101708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	67109662	rs11659091	G	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=465;SC=CTCTCTTGATGCATTACAATG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=67109681;WS=67109656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	67109673	rs7504026	A	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=623;SC=CATTACAATGAAAGCTCTACC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=67109681;WS=67109656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	67109894	rs9282552	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=24;PP=738;SC=TGAGAAAATACGCAACTTTTA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=67109902;WS=67109884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	67119593	rs4603621	G	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=548;SC=AATAGTAAAAGAATGCGCAAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=67119601;WS=67119583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	67125840	rs4968839	C	T	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=50;PP=1769;SC=ATAATTGTAACGAATATGGAA;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=67125848;WS=67125830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	67132022	rs7219200	T	C	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=13;PP=1517;SC=TGCATCTGCATGCTCAACACA;SOR=2.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=67132030;WS=67132012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	67150176	rs2886232	T	C	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=52;PP=1786;SC=AATGTCAGATTCACCTTTGGT;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=67150184;WS=67150166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	67160186	rs7208382	T	C	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=39;PP=1833;SC=TTATGCAATATATATATTTAG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=67160194;WS=67160176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	67170736	rs740520	A	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=19;PP=778;SC=TGTGGAAAAAATGATCACTTA;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=67170744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	67171748	rs12940557	A	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=371;SC=GAAAAACTCTAGAAGCATTCA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=67171756;WS=67171738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	67178316	rs4968849	A	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=564;SC=AGTGCTCTCCATTTGAATAAG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=67178324;WS=67178306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	67178954	rs4968851	C	T	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.53;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	67181540	rs11658738	C	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	67181548	rs11655199	T	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.84;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	67188576	rs8070232	A	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=234;SC=AGACATTTTGAGCTGTTTATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=67188584;WS=67188566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	67188668	rs8074259	T	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=15;PP=876;SC=CATATTAATATGCTCATTTAA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=67188676;WS=67188658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	67193150	.	A	AGGGAGG	365.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=75;SC=CCGTGGACAGAGGGAGGGGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=2;WE=67193158;WS=67193140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	67210992	rs11657804	T	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=18;PP=403;SC=AGGTGTGTAATCTGAGATTTA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=67211000;WS=67210982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	67211058	rs9909045	T	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=139;SC=CAATTTTTTTTAAAAAATAGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=67211066;WS=67211048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	67212031	rs11077414	A	G	10360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=135;PP=2965;SC=GAAGTTGTCTATATAACACAG;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=176;TCR=135;TR=311;WE=67212039;WS=67212021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr17	67212423	rs9909216	G	A	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1479;SC=AATACAATTGGGATTGATGTT;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=67212431;WS=67212413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	67212574	rs9912127	A	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=47;PP=1281;SC=GAAATGGTTAAGAGTAAAAGC;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=67212582;WS=67212564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	67215712	rs12941264	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=1014;SC=GGAGACCCATCACTGTCATCA;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=67215720;WS=67215702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	67219703	rs11655507	G	A	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TATTAACTTTGTATCTCACTC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=47;WE=67219711;WS=67219693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr17	67220060	rs1468513	T	G	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=224;SC=GCTTACACTGTGCATACAGGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=67220068;WS=67220050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	67245941	rs1420904	G	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=223;SC=TACAACATAAGTGCTTTTCAA;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=67245949;WS=67245938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	67257281	rs78349182	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=287;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TGAAAGAAATCAGGCAACCTA;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=12;WE=67257289;WS=67257271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr17	67260926	rs12449649	A	G	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=27;PP=1243;SC=TGAAATGCCAATAAGCTTCCT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=68;WE=67260934;WS=67260916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	67273882	rs536009	C	A	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=46;PP=1757;SC=CTCACTAGAGCAGCCTTGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=94;WE=67273890;WS=67273872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	67274054	rs12452340	C	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=167;SC=GAAGCAGGAACATTTAAAGAA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=67274062;WS=67274044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	67280310	rs564426	A	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=202;SC=ACAGCCTGTGAAACATATCAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=67280318;WS=67280300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	67282332	rs1550828	T	C	4182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=51;PP=2885;SC=GAGTATAATATAGAATAATGT;SOR=1.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=133;WE=67282340;WS=67282322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	67287327	rs34164530	G	GT	1834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.248;NF=26;NR=18;PP=954;ReadPosRankSum=0.368;SC=ATATAATGAAGTTTTTTTTTC;SOR=1.048;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=44;WE=67287335;WS=67287317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr17	67293535	rs487382	A	G	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=400;SC=GAGTTACCATAATTAGTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=67293543;WS=67293525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	67297176	rs12938097	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=725;SC=GAATATGACTTAGGGTACCCT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=67297184;WS=67297166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	67502138	rs2074027	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=505;ReadPosRankSum=2.157;SC=ACCTGAAATAGTCATCTTATC;SOR=1.681;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=21;WE=67502146;WS=67502128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr17	67512924	rs35105918	G	GTT	4652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.032;NF=59;NR=28;PP=2968;ReadPosRankSum=1.618;SC=TATCCTCAGTGGTGTGTGATT;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=103;TCR=49;TR=87;WE=67512932;WS=67512914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,119:0.55:215
chr17	67513003	rs1133228	C	A	4452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.321;NF=86;NR=95;PP=2848;ReadPosRankSum=0.409;SC=TAGACCACCTCGAGATTTAGA;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=342;TCF=168;TCR=174;TR=181;WE=67513011;WS=67512993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,209:0.53:394
chr17	67513055	rs2251855	A	G	3727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=100;PP=2552;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GTAAGAAAAAATCATGTCTGC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=97;TCR=185;TR=151;WE=67513063;WS=67513045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,167:0.53:316
chr17	67519542	rs2251160	G	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=12;PP=1219;ReadPosRankSum=0.488;SC=GTGTTGGGCAGCTTGGGGAAA;SOR=0.307;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=98;TCF=85;TCR=13;TR=63;WE=67519550;WS=67519532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,70:0.62:112
chr17	67521241	rs2716206	C	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=894;ReadPosRankSum=-1.657;SC=TCCTGCTGAGCTGGTAGGAGA;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=52;WE=67521249;WS=67521231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr17	67522919	rs2074030	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=0.988;SC=TTTCTTCCATCGGGGTTGAAT;SOR=0.602;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=12;WE=67522927;WS=67522909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr17	67522975	rs2074031	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.998;SC=GAGTATGCCCTCTCTGCTGGA;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=67522983;WS=67522965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	69334553	rs4401085	G	C	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=17;PP=985;SC=GTGTCTAGGTGTGGTTACTTT;SOR=1.371;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=46;WE=69334561;WS=69334543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	69334969	.	TTTATTTCCTTTCTTTCTTTC	T	565	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=58.03;NF=0;NR=7;PP=565;QD=85.5714285714;SC=CTTTGTTTCTTTTATTTCCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=7;WE=69335012;WS=69334959;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,7:0.22:32
chr17	69334971	.	TATTTC	T	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.48;QD=39.95;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	69334972	.	A	C	299	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=7;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=58.7;NF=6;NR=24;PP=299;QD=11.1257070849;SC=TGTTTCTTTTATTTCCTTTCT;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=30;WE=69335012;WS=69334959;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,30:0.86:35
chr17	69334978	.	TTTCTTTCTTTCTTCC	T	334.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=0.000;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.752;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr17	69334981	.	CTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	437.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=0.132;QD=19.90;ReadPosRankSum=-1.652;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	70118935	rs2229989	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=1195;ReadPosRankSum=-1.726;SC=AGAAGGACCACCCGGATTACA;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=223;TCF=149;TCR=74;TR=87;WE=70118943;WS=70118925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,105:0.40:265
chr17	70645032	rs61736066	G	A	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=58;PP=1380;ReadPosRankSum=1.046;SC=GATGGGCTCAGCCAGCACCAC;SOR=0.879;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=164;TCF=58;TCR=106;TR=88;WE=70645040;WS=70645022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,101:0.52:194
chr17	70645446	rs3924958	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=509;ReadPosRankSum=0.706;SC=TGCTGTCTGGAATAGGTGCTC;SOR=0.994;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=30;WE=70645454;WS=70645436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr17	70845688	rs12449747	C	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=528;SC=ACAATTGCCCCTTCCCCTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=70845696;WS=70845678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	70846027	rs4998297	G	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.336;NF=8;NR=32;PP=865;ReadPosRankSum=0.351;SC=AGCTACAGCAGGAAGAAGCTT;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=40;WE=70846035;WS=70846017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr17	70846116	rs4436821	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.261;SC=CACTGCAGCCCCAACTTCCCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=70846124;WS=70846106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	70943990	rs2466517	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=53;PP=2099;SC=AGTGCCAGGGTCGTCTGGGGG;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=70943998;WS=70943980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	71027543	rs9912666	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=271;SC=AGAAATCACCGATCAGTTCCT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=71027551;WS=71027533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	71081078	rs9891809	G	A	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=106;PP=2965;SC=AAAGAGCCACGCAAATAAAGA;SOR=1.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=46;TCR=106;TR=152;WE=71081086;WS=71081068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	71193633	rs11658510	G	A	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=35;PP=1080;SC=CTCTGGGGATGGAGCAGTGAA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=71193641;WS=71193623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	71197200	rs1026130	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=518;SC=TGTTTTGAAATGTCCTTAAAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=71197208;WS=71197195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	71201675	rs3829571	T	C	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=49;PP=1763;SC=GGGTGGGGACTGGGAATTCAT;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=93;WE=71201683;WS=71201665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	71206030	rs11655892	T	C	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=927;SC=GATGAAGACATATACTGGGCT;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=71206038;WS=71206020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	71208960	rs11655656	T	C	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=52;PP=1508;SC=CGTACTATAATAGCACAAGGG;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=71208968;WS=71208950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	71232804	rs904384	C	A	9289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=133;PP=2965;SC=CCAGAATCATCATTGTGTCCC;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=149;TCR=134;TR=282;WE=71232812;WS=71232794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr17	71232990	rs61729639	C	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1334;ReadPosRankSum=1.274;SC=GAAGACTCTTCGCAGCTGCAT;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=237;TCF=118;TCR=119;TR=82;WE=71232998;WS=71232980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,93:0.34:270
chr17	71239087	rs1566290	G	T	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=22;PP=725;SC=GTGGCATCACGATGCTCTTCA;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=71239095;WS=71239077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	71244630	rs8915	C	T	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=56;PP=2267;SC=TAAGAAGCAACGCTTAGATCT;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=109;WE=71244638;WS=71244620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	71244702	rs12885	G	T	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=55;PP=1791;SC=AATGCAGCGTGAGAATCCATA;SOR=1.125;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=71244710;WS=71244692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	71334473	rs3195414	G	A	3533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=55;PP=2055;ReadPosRankSum=2.932;SC=CCCCAGCTCCGTGTAATTCCC;SOR=0.474;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=127;WE=71334481;WS=71334463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,160:0.59:270
chr17	71344584	rs4969105	G	A	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=30;PP=2832;SC=GGAGGGGACAGATGGCCCATA;SOR=2.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=96;TCR=30;TR=126;WE=71344592;WS=71344574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	71344668	rs75637704	C	T	2943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=52;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.028;SC=AGCCCATCTACGTTCACTGCC;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=298;TCF=162;TCR=136;TR=118;WE=71344676;WS=71344658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,149:0.43:346
chr17	71344889	rs9905883	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=32;PP=901;SC=GGAGTGGGGCCGAGAGGTGCA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=71344897;WS=71344879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	71346347	.	G	GC	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQRankSum=3.154;QD=20.18;ReadPosRankSum=-1.485;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr17	71346353	rs28397959	A	C,ACCCGGGCACTGCTGGGCCTGGCCCCCC	2150.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQ=61.53;NF=44;NR=14;PP=1390;SC=CCTGGCCCCCAACCCACGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=58;WE=71346361;WS=71346343;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.55:33
chr17	71346750	rs1995163	C	G	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=28;PP=1549;SC=ATACATAAAACTCAAGTCCAG;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=71346758;WS=71346740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	71346943	rs4969107	A	G	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=893;SC=GAGCACAGATAGTCAGGTATA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=71346951;WS=71346933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	71347027	rs12449590	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	71353985	rs2279730	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=599;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TGGTCCTCAGTTAGCACTAAC;SOR=0.034;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=34;WE=71353993;WS=71353975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr17	71357718	rs35151121	ACT	A	2315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=2134;SC=TCTGTCCTCCACTCTGTTTCC;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=42;WE=71357727;WS=71357708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	71375794	rs62072075	C	T	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=67;PP=1997;SC=GAGGCACCCCCGCCATTCTAG;SOR=2.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=84;WE=71375802;WS=71375784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	71376869	rs12941386	C	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=936;SC=CCTACTTTTCCGTGTGTTTAG;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=71376877;WS=71376859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	71382747	rs7212508	T	C	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=54;PP=1834;SC=CGCCCCATGCTCCCACCAAGG;SOR=1.434;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=81;WE=71382755;WS=71382737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	71384010	rs35928335	G	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=0.921;NF=38;NR=37;PP=1121;ReadPosRankSum=1.059;SC=TGTGGCTCACGGAGGCCGAGT;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=75;WE=71384018;WS=71384000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr17	71390366	rs904381	C	A	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=53;PP=1284;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CCAGCACGAGCCCGTTGCGAT;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=181;TCF=75;TCR=106;TR=87;WE=71390374;WS=71390356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,109:0.47:232
chr17	71394066	rs7224026	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.172;SC=CATCAGAAAACAGAAAGAGAG;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=71394074;WS=71394063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr17	71397375	rs7226251	T	G	5311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=84;PP=2965;SC=CGTGTTGGCATGAGCTTGGCT;SOR=0.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=157;WE=71397383;WS=71397365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr17	71398170	rs9302962	G	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=860;ReadPosRankSum=-1.692;SC=TGAAGTACTCGGTGAACTTCT;SOR=0.881;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=227;TCF=124;TCR=103;TR=73;WE=71398178;WS=71398160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,87:0.33:266
chr17	71410891	rs12386051	C	T	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1274;ReadPosRankSum=0.134;SC=CCGGAGGGACCGTGGGAACTA;SOR=1.033;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=72;WE=71410899;WS=71410881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,79:0.57:139
chr17	71415245	rs8071352	G	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=16;PP=1552;SC=GTCCACTCCCGATCTTCCCCC;SOR=2.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=71415253;WS=71415235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	71418605	rs9894213	T	C	4821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=105;PP=2965;SC=CAGAAGTGGGTATCTTGGGTG;SOR=2.217;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=28;TCR=105;TR=133;WE=71418613;WS=71418595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	71420035	rs6501636	T	C	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=20;PP=1964;SC=TCTGCCGGGGTCTGGGAGGGC;SOR=2.154;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=85;WE=71420043;WS=71420025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	71426656	rs1105353	G	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=1572;ReadPosRankSum=0.448;SC=GTACCTGATGGTTACTCGGGG;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=42;WE=71426678;WS=71426646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr17	71426670	rs1105354	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=1572;ReadPosRankSum=-2.219;SC=CTCGGGGGTCGTGGGTCACTC;SOR=0.629;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=48;WE=71426678;WS=71426646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,54:0.60:90
chr17	71429674	rs11652365	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=1.376;SC=GTGATCTGCCCACCTCAACCT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=10;WE=71429682;WS=71429667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr17	71429776	rs8071524	G	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=12;PP=1106;ReadPosRankSum=0.315;SC=ACAAGTGTACGTGGGGAACCC;SOR=1.215;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=77;TCR=24;TR=60;WE=71429784;WS=71429766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,69:0.59:116
chr17	71443924	rs7209875	A	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=618;ReadPosRankSum=1.078;SC=ACAGGGGCCTAAGGGGCTCTG;SOR=0.525;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=31;WE=71443932;WS=71443914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr17	71503636	rs9895895	T	C	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=31;PP=1513;SC=TGAACTCCAGTGGCCAGCTGC;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=71503644;WS=71503626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	71746361	rs17782705	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGCCTGGCCTGAGCAGGTATG;SOR=2.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=2;WE=71746369;WS=71746351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
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chr17	71746427	rs35481671	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr17	71746435	rs34026863	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.433;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	71746479	rs2683163	C	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=461;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GCTGCGAGCACAGCCAAAAAG;SOR=0.548;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=28;WE=71746487;WS=71746469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr17	71746508	rs2683162	T	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=692;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CTCCTGTCCCTGCGGTGGGCT;SOR=1.056;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=42;WE=71746516;WS=71746498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr17	71746796	rs2620035	A	G	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=64;PP=1790;ReadPosRankSum=-0.531;SC=TGTCTGGAATATCTCCCCTTG;SOR=0.615;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=62;TCR=113;TR=100;WE=71746804;WS=71746786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,113:0.57:199
chr17	72209858	rs7206926	A	G	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1281;ReadPosRankSum=0.666;SC=ACCAGGAGGTAAGTTTACGCC;SOR=0.479;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=79;WE=72209866;WS=72209848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,89:0.57:156
chr17	72226945	rs877583	A	G	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=899;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CACCGCACCCAACCCTAAGCT;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=58;WE=72226953;WS=72226935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,67:0.64:105
chr17	72233419	rs74718342	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=944;ReadPosRankSum=0.451;SC=CTTTTGCCCCCTGCTCCTCCC;SOR=0.510;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=58;WE=72233427;WS=72233409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr17	72233559	rs62621376	G	A	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=57;PP=2128;ReadPosRankSum=0.603;SC=GGCGGGCAGCGTTGTTGTTCA;SOR=0.868;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=136;WE=72233567;WS=72233549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,169:0.61:277
chr17	72240177	rs35999669	T	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=537;ReadPosRankSum=0.054;SC=CGCTGATGGCTCTGCGGCAGT;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=37;WE=72240185;WS=72240167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr17	72240336	rs73356650	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=581;ReadPosRankSum=0.128;SC=CATCTGAACCGGCCCCTCTCG;SOR=0.454;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=36;WE=72240344;WS=72240326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr17	72245041	rs118094513	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=514;ReadPosRankSum=0.365;SC=TCCTTTGCCACCTGGGAGGGA;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=26;WE=72245049;WS=72245031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr17	72245986	rs36208397	CCACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT	C	4028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=6;NR=2;PP=2906;SC=GGCCCCTCAGCCACTGTGGGG;SOR=4.011;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=8;WE=72246022;WS=72245976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	72281367	rs6501706	A	G	9456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=176;PP=2965;SC=CCCCAGCTGCAAGAGCCCCAT;SOR=1.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=120;TCR=176;TR=296;WE=72281375;WS=72281357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr17	72285659	rs35604335	CA	C	229.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.204;NF=4;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-0.994;SC=CTCCATCTGACAAAAAAAAAA;SOR=0.283;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=11;WE=72285667;WS=72285648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr17	72295830	rs72848284	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=1.132;SC=CCCCCTTCCACTCCTTCTTCA;SOR=0.745;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=39;WE=72295838;WS=72295820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr17	72297104	rs34880269	C	T	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=310;SC=GACCCCAGGACGGTGGGGTGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=72297112;WS=72297094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	72297180	rs8076337	A	G	2777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=35;PP=1763;SC=CCCTCCTCCCACCAGGTCATG;SOR=1.365;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=98;WE=72297188;WS=72297170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	72301432	rs8073660	A	G	14222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=256;NR=152;PP=2965;SC=CGTCAGCTGAAAAGATTGTGT;SOR=1.181;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=408;TCF=256;TCR=152;TR=408;WE=72301440;WS=72301422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,511:1.00:511
chr17	72303449	rs11867486	G	A	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=86;PP=2965;SC=GACCTGTGTCGTAGAACCTGG;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=158;WE=72303457;WS=72303439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	72305534	rs2290955	C	T	7030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=119;PP=2965;SC=GAAGGTCACGCGCATGTCCCT;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=109;TCR=119;TR=228;WE=72305542;WS=72305524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr17	72305688	rs2290956	T	C	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=67;PP=1791;SC=CGATTGCTTTTGAGCGTGTGC;SOR=1.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=102;WE=72305696;WS=72305678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	72305753	rs2290957	C	T	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=40;PP=1169;SC=CACAACAGAACCACCTGGGGG;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=72305761;WS=72305743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	72306116	rs66769719	CCT	C	5615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=54;PP=2974;SC=TAACTTTGCTCCTCTCTCCTC;SOR=0.978;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=90;WE=72306125;WS=72306106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	72308319	rs1979370	G	A	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=57;PP=1942;SC=CATCATCTTCGCAGAGCTGAA;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=104;WE=72308327;WS=72308309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	72308403	rs4239008	G	A	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	72308410	rs4239009	C	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.91;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	72308447	rs1979371	G	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=579;SC=TCTGCTTGCCGACTTCCTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=72308455;WS=72308437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	72310476	rs2054400	G	A	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=81;PP=2478;SC=GTGGTGGGCTGGGAGCATCGG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=25;TCR=81;TR=106;WE=72310484;WS=72310466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	72321928	rs7207519	T	C	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=827;SC=GTGCAGACACTCACAGCACAG;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=72321936;WS=72321918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	72322881	rs8082699	G	A	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=107;PP=2965;SC=CCCAGAAGGAGGGTGGCGGTT;SOR=1.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=55;TCR=107;TR=162;WE=72322889;WS=72322871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr17	72322997	rs141207337	CGGAGTGCCTGGTTCTT	C	720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=2929;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GGATGGGGCCCGGAGTGCCTG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=12;WE=72323020;WS=72322987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr17	72324649	rs11412158	G	GC	1960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=1896;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GAGCAGGTATGCAGGGCTCTG;SOR=1.351;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=46;WE=72324657;WS=72324639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,68:0.38:180
chr17	72332849	rs1111596	A	G	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=32;PP=1559;SC=GAGACCCACAACTCTGAATCT;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=72332857;WS=72332839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	72338164	rs11285065	TC	T	3678.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=75;PP=2878;SC=CAGGAGCCCCTCCCCCACCCT;SOR=1.849;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=86;TCF=4;TCR=82;TR=78;WE=72338172;WS=72338154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	72344097	.	C	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-1.698;SC=TTCAAGCCCCCGGGCTGATCC;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=12;WE=72344105;WS=72344087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr17	72344723	rs75219617	TGTAA	T	8678.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=74;PP=2957;SC=CCCTGAGGGCTGTAAGTTTTA;SOR=1.087;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=114;WE=72344734;WS=72344713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr17	72346736	rs12451539	C	T	5046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=74;PP=2965;SC=TCCCAGGACCCTCCAGGCCCC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=143;WE=72346744;WS=72346726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	72346855	rs11077744	T	C	7448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=87;PP=2965;SC=GCTGGAAGCATGAGAAGTCCC;SOR=1.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=147;TCR=87;TR=233;WE=72346863;WS=72346845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr17	72348741	rs11655890	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=24;PP=982;SC=CACAAATGGCTCCAGCTGCCC;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=72348749;WS=72348731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	72348810	rs1814832	A	C	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=19;PP=1332;SC=CCACAGCTTAACCCCGAGGAC;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=72348818;WS=72348800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	72349067	rs2280108	C	T	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=98;PP=2965;SC=TGCAGAACAGCGCCCTCCCTC;SOR=1.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=45;TCR=98;TR=143;WE=72349075;WS=72349057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	72350277	rs2382642	T	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=909;ReadPosRankSum=0.019;SC=TCTCGGGTTGTATGTTCCCCG;SOR=0.466;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=59;WE=72350285;WS=72350267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr17	72350362	rs72852235	G	A	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GGCGGCGCTCGCGGGCCCTGG;SOR=0.896;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=99;WE=72350370;WS=72350338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,110:0.62:177
chr17	72350412	rs2271535	G	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GCGACAGAGCGCAGCAGCCTG;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=175;TCF=88;TCR=87;TR=67;WE=72350420;WS=72350402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,77:0.39:199
chr17	72351406	rs2271536	C	T	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=868;ReadPosRankSum=1.247;SC=GCCTGCCCCACGGCACAAGCA;SOR=0.666;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=60;WE=72351414;WS=72351396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,75:0.58:130
chr17	72352686	rs55690660	G	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=10;PP=1248;ReadPosRankSum=-1.435;SC=TAGGGTGGCCGGCGCCTGGCC;SOR=1.091;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=95;TCF=78;TCR=17;TR=62;WE=72352694;WS=72352676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr17	72356484	rs11870955	T	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=1.055;SC=TGCATGGGTGTGAGCAGAGGG;SOR=1.577;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=19;WE=72356492;WS=72356474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr17	72357585	rs6501712	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GTTTCCCAGCACGGCCTTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=72357593;WS=72357575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	72357805	rs12939498	C	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=1.015;SC=CCTGGCCGGCCGCGTGCAGCC;SOR=0.932;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=41;WE=72357813;WS=72357795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr17	72366695	rs2382647	C	A	6195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=105;PP=2965;SC=GCCCACGCCCCACGTCAGCGG;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=205;WE=72366703;WS=72366685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
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chr17	72368550	rs11658891	T	C	3809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=65;PP=2654;ReadPosRankSum=0.420;SC=ATGTGGCCAATATGGTGGCCA;SOR=0.862;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=255;TCF=135;TCR=120;TR=145;WE=72368558;WS=72368540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,166:0.55:303
chr17	72369704	rs12451435	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=-1.080;SC=CCAGCCACAGGAGACACAGCC;SOR=1.552;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=72369712;WS=72369694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	72439700	rs9893663	T	G	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=47;PP=2315;SC=GGGGCTGGGGTGTCTACAGTG;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=115;WE=72439708;WS=72439690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	72439808	rs3840056	TG	T	6078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=68;PP=2951;SC=ACCCCCAAGTTGGCCACTCCT;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=121;WE=72439816;WS=72439798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	72443192	rs2706527	G	T	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=101;PP=2965;SC=GGAGAGGCGGGCGGATTTGGG;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=49;TCR=102;TR=150;WE=72443200;WS=72443182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	72469958	rs1127737	A	G	3110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=-10.313;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,87:0.38:227
chr17	72469966	rs2272111	G	A	3156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-10.184;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,88:0.38:230
chr17	72473553	rs7209406	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=9.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr17	72477385	rs1879967	A	G	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=694;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CATCCTGGCCATTGTTCCGGG;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=105;TCR=64;TR=58;WE=72477393;WS=72477375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,70:0.34:207
chr17	72519798	rs1472726	C	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=349;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CCTCTAGACACAGGCAAAGTC;SOR=0.850;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=33;WE=72519806;WS=72519788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,41:0.32:127
chr17	72521897	rs17553512	G	A	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=31;PP=1244;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CTGGGTCAACGATCACTTTCA;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=130;TCR=74;TR=88;WE=72521905;WS=72521878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,114:0.44:259
chr17	72527718	rs965229	A	G	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=76;PP=2354;SC=CACAGGGCTTAAGCATCGTCA;SOR=3.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=17;TCR=76;TR=93;WE=72527726;WS=72527708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	72537878	rs2293188	G	A	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=59;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.284;SC=ACAGGGAGCTGTGGGGACACG;SOR=0.640;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=37;TCR=100;TR=81;WE=72537886;WS=72537868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,98:0.60:163
chr17	72537894	rs2140253	A	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=657;ReadPosRankSum=0.678;SC=ACACGGTGACAGGCAGTGAGT;SOR=0.705;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=21;TCR=78;TR=43;WE=72537902;WS=72537884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr17	72538917	.	A	G	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=38;QD=14.5542425094;SC=AGGGACTGGAAGAAGGGACAT;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=5;WE=72538925;WS=72538907;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	72541838	rs809740	A	G	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=20;PP=1572;SC=AGAGCTCCCCAAGTCCAGGGT;SOR=1.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=78;WE=72541846;WS=72541828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	72541980	rs783230	A	G	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=86;PP=2867;SC=ACAAAATGTAATCTCCTCCCA;SOR=1.034;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=59;TCR=86;TR=145;WE=72541988;WS=72541970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	72575977	rs7219289	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=0.375;SC=TGAGCAGAGATTACACCATTG;SOR=2.170;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=12;WE=72575985;WS=72575967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr17	72584764	rs783239	C	T	5685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=1.432;SC=ACGGTGAACACGTGGTTTTTC;SOR=0.524;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=395;TCF=225;TCR=170;TR=227;WE=72584772;WS=72584754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,256:0.57:449
chr17	72588326	rs493430	A	C	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=45;PP=2381;ReadPosRankSum=-0.576;SC=AGCAGCAGAGATGGGGACAGC;SOR=1.071;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=222;TCF=131;TCR=91;TR=120;WE=72588334;WS=72588316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,133:0.52:258
chr17	72588806	rs545652	C	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=921;ReadPosRankSum=1.473;SC=AAAGCCCATGCCCCAGGCTTC;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=56;WE=72588814;WS=72588796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,81:0.53:154
chr17	72613589	rs581157	T	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=61;PP=1928;SC=GCCGGGGCCCTTCAGAGACAA;SOR=1.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=72613597;WS=72613579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	72615293	rs12950039	C	T	9184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=130;PP=2965;SC=CCAGCAGCACCTCCTTCTAGG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=141;TCR=130;TR=271;WE=72615301;WS=72615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr17	72691928	rs2034310	T	C	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=67;PP=2627;SC=GGTAGCCTTTTGCGGGGAGGT;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=72691936;WS=72691918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	72699384	rs749780	C	A	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=187;SC=GGGGTCTGGACTGCTACTATG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=72699392;WS=72699374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	72700943	rs35489971	A	G	11493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=222;PP=2965;SC=GATTTGAGTGACAATGGAGTA;SOR=1.341;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=343;TCF=121;TCR=222;TR=343;WE=72700951;WS=72700933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr17	72736755	rs11651291	A	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=6;PP=1630;SC=CAGGGTGAAGATGGCGGCTGG;SOR=4.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=60;WE=72736763;WS=72736745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	72791088	rs3830567	A	AG	1688.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=7.587;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;MQRankSum=-0.319;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.739;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:9,70:0.89:79
chr17	72791266	rs9910463	G	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.983;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=773;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TACCCTCCTGGCCCCCAGGTT;SOR=0.299;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=50;WE=72791274;WS=72791256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
chr17	72791618	rs7221435	A	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=29;PP=1844;SC=CAGCCCAGCCAGGCGGCCTCG;SOR=1.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=101;WE=72791626;WS=72791608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	72838481	rs939536	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=630;SC=GATTTCATGGCAGAAGCCAGA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=72838489;WS=72838471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	72839130	rs139495021	A	AGCTCCGGGG	2210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=2957;SC=CAGGTCCTCCAGCTCCGGGAA;SOR=0.735;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=23;WE=72839138;WS=72839120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	72848758	rs75018418	C	CG	4646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=80;PP=2974;SC=CTCCTGGGGGCGGGCGGGGCC;SOR=2.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=2;TCR=96;TR=82;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	72848772	rs199662980	G	GC	3639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=59;PP=2416;SC=CGGGGCCTGAGCGGGGCGGGA;SOR=2.542;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=60;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	72848778	rs201209302	C	CG	2783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=45;PP=1529;SC=CTGAGCGGGGCGGGAGGGCCG;SOR=3.219;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=46;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	72851133	rs689730	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=57;PP=1880;SC=TAAACACCACAGCCACCGTCA;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=72851141;WS=72851123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	72861145	rs1996710	A	G	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=75;PP=2294;SC=GGCCTGGAGAAGGCTGGCGGC;SOR=2.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=23;TCR=75;TR=98;WE=72861153;WS=72861135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	72862705	rs2070918	G	A	4981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=86;PP=2965;SC=CAGGTCCCCCGGGAATGGGAG;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=159;WE=72862713;WS=72862695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	72888836	rs489152	G	A	6182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=99;PP=2965;SC=GAGGAGGAAGGAGACGGGTCT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=87;TCR=99;TR=186;WE=72888844;WS=72888826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr17	72889676	.	G	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.67;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=23;MQ=52.9;NF=28;NR=44;PP=2962;QD=20;SC=TAGGTTCCATGGGCTCCGTGG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=72;WE=72889693;WS=72889666;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:78,72:0.48:150
chr17	72889676	.	G	GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC	8369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.60;QD=53.31;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr17	72923357	rs374632139	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=401;ReadPosRankSum=0.089;SC=CTGCGTTCACGTCCACCTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=30;WE=72923365;WS=72923347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr17	72926660	rs61746106	C	T	4901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=80;PP=2907;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TCATCATCTACGAGGTTCAAG;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=372;TCF=211;TCR=161;TR=189;WE=72926668;WS=72926650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,228:0.52:442
chr17	72927123	rs6501741	G	T	6557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=119;PP=2965;SC=ACCCAACCCCGGGCTGGTTAG;SOR=1.006;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=85;TCR=119;TR=204;WE=72927131;WS=72927113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr17	72929380	rs2035835	G	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=908;SC=AGGATGGGCCGCCATCTAGCC;SOR=3.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=34;WE=72929399;WS=72929370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	72929391	rs2035834	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.210;SC=CCATCTAGCCACGGCCCAGCA;SOR=0.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=14;WE=72929399;WS=72929370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr17	72937605	rs7210616	G	A	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=2367;ReadPosRankSum=0.688;SC=ACCCGGCCCCGGCAGAAGTCC;SOR=0.605;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=214;TCF=110;TCR=104;TR=130;WE=72937613;WS=72937595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,149:0.62:242
chr17	72937851	rs9890664	G	A	4230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=96;PP=2664;ReadPosRankSum=1.010;SC=ACCACCCGCCGACCACACGCC;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=281;TCF=121;TCR=160;TR=171;WE=72937859;WS=72937841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,192:0.58:330
chr17	72938100	rs1542752	T	C	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=72;PP=1970;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CCTTGTCTTCTCTGTCATCGA;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=182;TCF=70;TCR=112;TR=121;WE=72938108;WS=72938090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,144:0.66:218
chr17	72939446	rs4789110	C	T	4760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=92;PP=2844;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CTAGGTAAGACTTCTCTCCCT;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=318;TCF=163;TCR=155;TR=185;WE=72939454;WS=72939436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,221:0.58:379
chr17	72939663	rs8069015	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=799;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CTGGGGAGCCGGCCAGGGTGT;SOR=0.268;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=46;WE=72939671;WS=72939653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr17	72943126	rs8066909	G	A	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=1892;ReadPosRankSum=0.145;SC=CGTGCCTGGCGGGCACAGCCA;SOR=0.655;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=114;WE=72943134;WS=72943116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,127:0.51:251
chr17	72945212	rs139084906	TAGA	T	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=324;ReadPosRankSum=1.825;SC=GCCCAAGGGTTAGAAGAAGAC;SOR=2.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=8;WE=72945222;WS=72945202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr17	72945334	rs8068514	T	C	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=799;ReadPosRankSum=1.223;SC=CACATCCTCTTCCCCAGCTGT;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=53;WE=72945342;WS=72945324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,63:0.36:175
chr17	72948369	rs17853024	A	G	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=26;PP=1142;SC=CTCACTTGTCAATGCAGATCT;SOR=1.046;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=72948377;WS=72948359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	72949146	rs2307010	C	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,63:0.52:122
chr17	72951823	rs9899490	C	T	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.12;NF=68;NR=19;PP=2069;SC=GGCTGTGCCCCCCTTATGTAG;SOR=2.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=87;WE=72951831;WS=72951813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	72951845	rs9903414	G	A	5152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.08;NF=80;NR=44;PP=2261;SC=AAGTAGGCCCGCTGGCCACCC;SOR=1.335;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=124;WE=72951853;WS=72951835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	72952017	rs9906160	A	G	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=66;PP=1953;SC=ACTTGTTGGCAGTCACCATGG;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=91;WE=72952025;WS=72952007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	72956124	rs3744198	G	A	4050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=77;PP=2512;ReadPosRankSum=-1.319;SC=TCCTTACATCGGCATCATCCA;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=263;TCF=126;TCR=137;TR=150;WE=72956132;WS=72956114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,180:0.60:298
chr17	72957962	rs10719287	CT	C	2295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.561;NF=19;NR=28;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GCCAAGGGCCCTTCACCTGTT;SOR=0.670;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=47;WE=72957970;WS=72957952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr17	72959000	rs7503218	G	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=14;PP=1281;SC=CAACTGGCCCGGCCCCAACCC;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=57;WE=72959008;WS=72958990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	72983888	rs7222918	A	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=138;SC=CGTCCCTGCCACTCCACCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=72983896;WS=72983878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	72995412	rs4789125	G	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.95;QD=26.99;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	73045495	rs72844533	A	G	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1121;ReadPosRankSum=0.775;SC=ACAGATTTCAATTTTGTTTGA;SOR=0.883;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=42;TCR=73;TR=71;WE=73045503;WS=73045485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,84:0.60:140
chr17	73089524	rs4789133	G	A	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=34;PP=1719;ReadPosRankSum=0.942;SC=CAAGGCCAACGCGTGGGCCTC;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=125;TCR=59;TR=107;WE=73089532;WS=73089514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,121:0.57:212
chr17	73089706	rs4789134	G	A	3620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=62;PP=2478;ReadPosRankSum=0.689;SC=TTGGCAGTGAGGCCGTGGCAG;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=128;WE=73089714;WS=73089696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,146:0.68:215
chr17	73089852	rs4788863	T	C	4802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.368;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=2.168;SC=CTTCACTGAATTGCAATGGGA;SOR=0.731;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=323;TCF=147;TCR=176;TR=189;WE=73089860;WS=73089842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,217:0.55:391
chr17	73094407	rs7212311	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=495;ReadPosRankSum=0.680;SC=CCTGTTATCCCAGCACTTTGG;SOR=1.460;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=25;WE=73094415;WS=73094397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr17	73096951	rs4238978	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.293;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=354;ReadPosRankSum=-2.564;SC=TAGTGTGGTAAAAGGGGAACA;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=19;WE=73096959;WS=73096941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr17	73110144	rs1531565	G	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=477;ReadPosRankSum=2.563;SC=AGCCCCAGTTGCCCAGGTCCC;SOR=0.772;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=28;WE=73110152;WS=73110134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr17	73110279	rs1531564	C	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=704;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GCAGTCTGAACGGTGACGGTG;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=42;WE=73110287;WS=73110269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr17	73124692	rs2291028	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=318;ReadPosRankSum=0.836;SC=AGCCTGGGCCCCTACCTGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=18;WE=73124700;WS=73124682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr17	73125173	rs2291027	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=167;ReadPosRankSum=0.296;SC=CTACTGCTGGAGACCACAGTC;SOR=0.399;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=10;WE=73125181;WS=73125163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	73126746	rs10715821	GT	G	7301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=118;PP=2974;ReadPosRankSum=0.439;SC=GCCTAGGACAGTGAAAGACAG;SOR=0.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=53;TCR=120;TR=170;WE=73126754;WS=73126735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,258:0.99:260
chr17	73127024	rs9910084	C	G	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=71;PP=2538;SC=GGGATAGGGACTTGGCTCTAA;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=118;WE=73127032;WS=73127014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	73127217	rs3736075	G	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=-0.912;SC=AGAAGGACGCGGTTACCGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=34;WE=73127225;WS=73127207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr17	73127683	rs4788867	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=388;ReadPosRankSum=-0.706;SC=AGCCGCGGCGTTGCTCCAGCG;SOR=0.610;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=27;WE=73127691;WS=73127673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr17	73138751	rs111454348	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.400;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr17	73138980	rs151283915	TAC	T	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=129;ReadPosRankSum=-1.675;SC=TATATGAAAATACACACACAC;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=73138989;WS=73138970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	73143574	rs1382508	T	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=284;SC=TTCCAGTGGGTGAACTGAAAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=73143582;WS=73143564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr17	73208182	rs12946479	C	T	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=4.728;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;MQRankSum=0.059;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.687;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr17	73208182	.	CG	TG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=21;MQ=59.84;NF=1,41;NR=52,96;PP=539,2944;QD=10.2641509434;SC=CGCGTGCGCGCGTGTGTGTGT;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=108;TCF=5;TCR=103;TR=53,137;WE=73208190;WS=73208172;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,137:0.96:142
chr17	73208182	.	CG	CGTG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=21;MQ=59.84;NF=1,41;NR=52,96;PP=539,2944;QD=10.2641509434;SC=CGCGTGCGCGCGTGTGTGTGT;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=108;TCF=5;TCR=103;TR=53,137;WE=73208190;WS=73208172;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr17	73208205	rs56406015	G	GTGTT,GTGTGTT	4033.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=1,1;NR=60,60;PP=867,339;SC=GTGTGTGTGTGGGTATTTTGA;SOR=2.271;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=61,61;WE=73208213;WS=73208195;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.39:82
chr17	73211642	rs9909306	A	G	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=739;SC=TAAAATCACAACCACTAAAAC;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=73211650;WS=73211632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	73221439	rs2291029	C	T	5409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=90;PP=2965;SC=TCCCTTAGCCCGGGAACACCC;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=168;WE=73221447;WS=73221429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	73222847	rs1551967	C	T	11299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=95;PP=2965;SC=CAGGGATGTTCATTTAAAATA;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=123;TCR=95;TR=218;WE=73222855;WS=73222837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr17	73222865	rs1478785	G	A	12331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=111;PP=2965;SC=ATAACATCGCGGGAAACTACT;SOR=0.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=136;TCR=111;TR=246;WE=73222873;WS=73222855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr17	73227827	rs148363627	G	GT	2862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=2099;ReadPosRankSum=2.376;SC=TTGGCTCCTTGAAGGCTTCGG;SOR=0.972;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=52;WE=73227835;WS=73227817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,82:0.67:122
chr17	73228101	rs899318	T	C	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=75;PP=1845;SC=CCCAGCCTACTGTCTGTGGGA;SOR=2.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=22;TCR=75;TR=97;WE=73228109;WS=73228091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	73230856	rs9988	C	T	8705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=149;PP=2965;SC=TGCTGACAGACGCCTTGCCCC;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=280;TCF=131;TCR=149;TR=280;WE=73230864;WS=73230846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr17	73231817	rs3841603	AT	A	4450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=99;PP=2918;SC=ATGTATATAGATTTTTTTAAA;SOR=1.688;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=6;TCR=111;TR=104;WE=73231825;WS=73231807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	73236605	rs11077781	C	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=805;SC=GTGAAGGCGCCGGGAGAAGCT;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=73236613;WS=73236595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	73240559	rs2306216	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=682;SC=CGTTACCTCCAGGGCCTAGCT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=73240567;WS=73240549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	73240836	rs4789156	T	C	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=72;PP=1823;SC=AGTGAGGGCGTGCTCGGGGCT;SOR=2.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=16;TCR=72;TR=88;WE=73240844;WS=73240826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	73242895	rs2242230	A	G	6616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=125;PP=2965;SC=CACAACAAAGAAGAGGACAAG;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=74;TCR=125;TR=199;WE=73242903;WS=73242885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr17	73242935	rs2242231	A	G	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=95;PP=2905;SC=GATGCAATGGAAGGTTTTCTT;SOR=2.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=29;TCR=95;TR=124;WE=73242943;WS=73242925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	73257830	rs2279161	C	T	5161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=66;PP=2965;SC=TTTTGGCGCTCCCCTTTGGAC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=161;WE=73257838;WS=73257820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	73257986	rs8075276	C	T	8655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=153;PP=2965;SC=GCCAAGATGGCTGCCCCCGCA;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=121;TCR=153;TR=274;WE=73257994;WS=73257976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr17	73258085	rs36039201	GGC	G	6129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=82;PP=2969;SC=GGCGAGCAGCGGCGGGGGGGC;SOR=1.171;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=11;TCR=85;TR=93;WE=73258094;WS=73258075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	73258479	rs6501772	C	T	9197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=147;PP=2965;SC=CGCGCCGCTCCCCCTCGTCGG;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=287;TCF=140;TCR=147;TR=287;WE=73258487;WS=73258469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr17	73259083	rs2279162	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=631;SC=TGCATGTGTACGGGCTTTAAT;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=73259091;WS=73259073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	73268801	rs3744231	C	T	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=33;PP=1083;SC=CCTGCACGGGCGCTGGGATCT;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=73268809;WS=73268791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	73269530	rs1809352	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=25;PP=1290;SC=TCCTTCCTGCACTCAGCGCTG;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=73269538;WS=73269520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	73269676	rs4789164	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=21;PP=659;SC=CTTCCTTTTGCAGCACCTGCT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=73269684;WS=73269666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	73279624	rs7213318	A	G	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=38;PP=1916;SC=CCCGGGCGTCATACACGCTGC;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=105;WE=73279632;WS=73279614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	73279700	rs4788882	C	T	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=67;PP=2238;SC=AAGAAGTCACCGACAGCCCAA;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=122;WE=73279708;WS=73279690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	73282299	rs2306218	C	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=486;SC=CTGCCCTGCGCGGCATTCCTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=73282307;WS=73282289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	73282636	rs2306219	C	T	5111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=67;PP=2965;SC=GGATAGAATTCCAAGTTTTAG;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=163;WE=73282644;WS=73282626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	73316679	rs8079197	G	C	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=34;PP=1037;SC=TTCCTGGTCTGTGACTGGCCA;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=73316687;WS=73316669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	73317644	rs12946365	C	T	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=782;SC=GAAGGGCGCCCGCATGTTGAG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=73317652;WS=73317634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	73328773	rs1529844	T	C	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=49;PP=2228;SC=TAATGGAGCTTAACTTACGGA;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=73328781;WS=73328763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	73389446	rs4788890	A	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=237;SC=ACCACACATCACACCAACTCA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=73389454;WS=73389436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73402246	rs7220246	C	A	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=47;PP=2147;SC=CCGGATTCTCCAATATAGGCC;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=115;WE=73402254;WS=73402236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	73482110	rs11331365	TC	T	1748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.22;NF=3;NR=39;PP=1761;SC=CCCCAACCTCTCCAGCTGTGC;SOR=2.608;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=42;WE=73482118;WS=73482100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	73482664	rs9899149	T	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=556;SC=CCACTCTCTTTTGAGCAGGGC;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=73482672;WS=73482654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	73484753	rs11652993	C	G	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=34;PP=1847;SC=CTAACCCCAGCGAATGTCTGT;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=93;WE=73484761;WS=73484743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	73485033	rs11867527	T	C	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=59;PP=1469;SC=TGGTGTCTTCTGTGAAGAGGG;SOR=1.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=92;WE=73485041;WS=73485023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	73485781	rs8079362	C	T	9759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=154;PP=2965;SC=TGCTTCCCTCCGACCCGCAGG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=126;TCR=154;TR=280;WE=73485789;WS=73485771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr17	73485819	rs147451725	G	A	3882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=79;PP=2074;ReadPosRankSum=0.473;SC=TACCCTGGCTGTCCCTCCCTC;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=100;TCR=137;TR=136;WE=73485827;WS=73485809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,179:0.58:310
chr17	73488794	rs4078259	C	T	10498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=134;PP=2965;SC=TGTGCAACATCGCCCTGCAAG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=117;TCR=134;TR=251;WE=73488802;WS=73488784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr17	73488815	rs117030777	C	T	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=78;PP=2294;ReadPosRankSum=0.417;SC=AGAGCCACAGCGCCGTGCTGC;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=113;TCR=132;TR=144;WE=73488823;WS=73488805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,162:0.59:276
chr17	73489220	rs7215753	T	C	5707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=107;PP=2965;SC=CCAGGCGAGATCTTCCAGAGC;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=62;TCR=107;TR=169;WE=73489228;WS=73489210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	73489567	rs4078474	C	G	10635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=217;NR=115;PP=2965;SC=AACTCTCTCCCCCAGGCACAG;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=332;TCF=217;TCR=115;TR=332;WE=73489575;WS=73489557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr17	73490611	rs8078131	A	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=8;PP=699;SC=CCTGGGGCCCATATGCTCATT;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=73490619;WS=73490601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	73491894	rs11077792	G	A	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=11;PP=900;SC=CAGAAGTGCCGATGTTCACAT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=73491902;WS=73491884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	73494963	rs9894026	G	A	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1437;SC=AAGCAGTGTCGGGTTCACACG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=73494971;WS=73494953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	73497415	rs8081353	T	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	73497415	.	TTT	CTC	1188	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=7;PP=1188;QD=56.4303579483;SC=ATCTAGGTGATTTCAACACCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=73497425;WS=73497405;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	73497417	rs8081354	T	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.31;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	73497439	rs8075850	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=752;SC=CTCTTATCCCGTTAGTGCCTG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=73497447;WS=73497429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	73497794	rs9892311	T	C	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=74;PP=2965;SC=AAAGGTTGGCTTGGGACTTGG;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=150;WE=73497802;WS=73497784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr17	73498483	rs7503373	T	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=31;PP=1116;SC=CCCTGGGCTCTCATCTAGTGG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=53;WE=73498491;WS=73498473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	73498623	rs7502835	A	G	6225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=121;NR=75;PP=2965;SC=TTGGGGTCACACTAGGACTGG;SOR=1.123;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=121;TCR=75;TR=196;WE=73498631;WS=73498613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr17	73499697	rs7207376	T	C	5506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=78;PP=2965;SC=CAGCTGAGGGTGACAGCACGT;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=100;TCR=78;TR=178;WE=73499705;WS=73499687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	73501752	rs8069700	G	A	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=31;PP=1002;SC=CGGGGTGGGGGACAGGTGTCA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=73501760;WS=73501742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	73502118	rs28558885	G	A	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=60;PP=1902;SC=CGATTTTACAGATGAGGACAT;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=85;WE=73502126;WS=73502108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	73504416	rs6501815	T	C	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=85;PP=2765;SC=CTGCCCTCACTCAGCATCCCT;SOR=1.206;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=135;WE=73504424;WS=73504406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	73510012	rs4789206	A	T	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=47;PP=1262;SC=GGAGCAAGTCAGGTGTCCCAG;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=53;WE=73510020;WS=73510002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	73512653	rs7216673	G	T	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=23;SC=TGGAGCCCGAGCCCGAGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=73512661;WS=73512643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	73513185	rs7218675	C	A	5490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=96;NR=80;PP=2965;SC=CGGGGACCGCCCTCCCTGCCC;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=176;WE=73513193;WS=73513175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	73518203	rs9911502	G	C	6508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=129;PP=2965;SC=GCAAGGAGAAGCTCTCCAGGC;SOR=1.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=79;TCR=129;TR=208;WE=73518211;WS=73518193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	73518284	rs6501820	G	C	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=79;PP=2863;SC=AGGTGCAGCGGTGCTCCAGCT;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=48;TCR=79;TR=127;WE=73518299;WS=73518274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr17	73519413	rs8064529	C	T	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=95;PP=2899;ReadPosRankSum=0.239;SC=GATGGAGGTGCCCGGTAAGTT;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=44;TCR=96;TR=138;WE=73519421;WS=73519403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,162:0.99:164
chr17	73539631	rs6501822	A	G	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=72;PP=2321;SC=TCGGCCAAGCAGCTCAGGCTG;SOR=1.155;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=119;WE=73539639;WS=73539621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	73552062	rs2305528	G	C	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=13;PP=1186;SC=TGCTGCAGCTGCAGCAGCCAT;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=73552070;WS=73552052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	73552079	rs148825089	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=559;ReadPosRankSum=-0.588;SC=CCATGGTGGCGCGAAGGGGAC;SOR=0.662;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=36;WE=73552087;WS=73552069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr17	73552185	rs1671036	G	A	5706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=82;PP=2965;SC=CCGTCCCTGCGCATCCTGGCC;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=97;TCR=82;TR=179;WE=73552193;WS=73552175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	73554523	rs1671033	C	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=435;ReadPosRankSum=1.933;SC=ACTGGGGCTGCGTGGCCCCAG;SOR=0.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=28;WE=73554531;WS=73554513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr17	73560733	rs12451129	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=397;ReadPosRankSum=-1.288;SC=CGCTTGAACCCAGGAGTTCAA;SOR=0.326;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=23;WE=73560741;WS=73560723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr17	73565262	rs2305526	T	A	8644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=142;PP=2965;SC=AGCTGGGTCCTGTCCCCGTGG;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=116;TCR=142;TR=258;WE=73565270;WS=73565252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr17	73587640	rs707709	T	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=33;PP=1625;SC=GGTGGTCCTATGTGCCCCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=88;WE=73587648;WS=73587630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	73587756	rs117785251	G	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TTCCTAAGCAGCCTGGAGCAG;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=79;WE=73587764;WS=73587746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr17	73587784	rs936056	A	G	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=64;PP=2763;SC=CGGGGAACCGAGAGTGTCAGG;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=125;WE=73587792;WS=73587774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	73588027	rs746840	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=321;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TACTGCTGCCCAGGGATGCTT;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=26;WE=73588035;WS=73588017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,30:0.27:111
chr17	73588058	rs736522	G	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.933;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,44:0.28:156
chr17	73588067	rs736523	A	G	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=51;PP=1227;SC=GGTGGAGGATATGCTGCCTAT;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=73588075;WS=73588048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	73588199	rs736525	T	C	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=47;PP=1989;SC=TACAATCACTTACCCTTCCTG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=73588207;WS=73588189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	73588233	rs56298033	G	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=880;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CTTCCCTGGGGTCCAGACCCT;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=44;WE=73588241;WS=73588223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,48:0.68:71
chr17	73588542	rs736521	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-1.192;SC=TGTTTTTTACAAGCTGCTGGC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=73588550;WS=73588532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr17	73590830	rs820256	T	G	6023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=GGAAAGTGCCTTTGATGCCAG;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=195;WE=73590850;WS=73590820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	73590888	rs76361517	T	G	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GAGGCACGGCTCTATGTGGCT;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=88;WE=73590896;WS=73590878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,104:0.43:240
chr17	73592352	rs7359522	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=-1.804;SC=GCAGCTAGAGGGACCTGTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=12;WE=73592360;WS=73592342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr17	73592568	rs145254299	CTG	C	2772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.467;NF=4;NR=40;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CCTGGAGCAACTGTGCAACAA;SOR=0.941;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=95;TCF=14;TCR=81;TR=44;WE=73592577;WS=73592558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr17	73592733	rs75861410	C	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=306;ReadPosRankSum=0.924;SC=GAGAGCTCTGCCTGGAAGGCC;SOR=0.402;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=22;WE=73592741;WS=73592723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr17	73598374	rs76113775	G	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=413;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TAAAGCCCCAGTGGGGAGAGT;SOR=0.387;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=28;WE=73598382;WS=73598364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr17	73598904	rs62089251	C	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GCCCTTCACCCCCACAGCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=16;WE=73598912;WS=73598894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr17	73599195	rs3803725	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.105;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1099;ReadPosRankSum=1.026;SC=GGCCCTCCCCCTCCCTGCACC;SOR=0.987;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=202;TCF=122;TCR=80;TR=69;WE=73599203;WS=73599185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,73:0.32:227
chr17	73601427	rs2444841	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQRankSum=-1.068;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr17	73602081	rs8068464	G	A	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=568;ReadPosRankSum=-0.856;SC=ATGCAGGCTCGCATGCGTGGG;SOR=0.312;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=39;WE=73602089;WS=73602071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr17	73606310	rs11657863	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=943;ReadPosRankSum=1.445;SC=TGGTGGCCCAGCCCCTGCTCC;SOR=0.345;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=58;WE=73606318;WS=73606300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,71:0.68:104
chr17	73607934	rs3743992	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=385;ReadPosRankSum=-1.058;SC=ACACCTGGATGCTCCTGGGCT;SOR=0.285;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=27;WE=73607942;WS=73607924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr17	73608203	rs820140	T	C	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.456;SC=TTGCCCTCCTTCCTCCCCAGC;SOR=0.342;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=59;WE=73608225;WS=73608193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,68:0.64:106
chr17	73608744	.	CA	C	98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=59.48;NF=7;NR=0;PP=98;QD=14.5714285714;SC=GACTCTGCCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=7;WE=73608752;WS=73608734;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,7:0.26:27
chr17	73608905	rs73995913	G	A	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.534;SC=GGCCAGGGCAGCCACTGGCGA;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=259;TCF=146;TCR=113;TR=98;WE=73608913;WS=73608895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,113:0.37:309
chr17	73609112	rs820142	G	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GATCATGGGCGCATACCTGGT;SOR=0.402;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=78;WE=73609120;WS=73609102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,90:0.55:165
chr17	73609249	.	C	T	3217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=66;PP=1859;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TTTTGCTCAGCGCCTTTCCCC;SOR=0.644;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=263;TCF=125;TCR=138;TR=128;WE=73609257;WS=73609239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,158:0.48:331
chr17	73611467	rs3803729	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=-1.537;SC=GAGAGCAGCCACCAGCTCTGG;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=21;WE=73611475;WS=73611457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr17	73611724	rs35131709	G	GTC	3784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.387;NF=10;NR=42;PP=2299;ReadPosRankSum=0.136;SC=TGGAGGAGAGGTCTGTGGCTC;SOR=0.654;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=100;TCF=26;TCR=74;TR=52;WE=73611732;WS=73611714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,99:0.61:161
chr17	73611823	rs820144	T	C	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=50;PP=1774;SC=GAGCAGCAGATGCAGCAGCGG;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=87;WE=73611831;WS=73611813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	73611908	rs3803731	C	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=585;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CCAGGAAGCCCCCCACACCCC;SOR=0.709;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=34;WE=73611916;WS=73611898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr17	73612461	rs371699907	CAGG	C	629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.930;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr17	73612642	rs11439064	A	AT	12429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=132;PP=2974;SC=TGAAGAAGCCATGAAGCAAGG;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=76;TCR=136;TR=205;WE=73612650;WS=73612632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr17	73613081	rs3743993	T	C	3422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=89;PP=2053;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TGTGTGCTGCTGCACTGGGGA;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=393;TCF=169;TCR=224;TR=161;WE=73613089;WS=73613071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,182:0.39:461
chr17	73613975	rs820145	G	A	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=54;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.004;SC=ACACCGGCACGCCCTGGAAGT;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=161;TCF=65;TCR=96;TR=85;WE=73613983;WS=73613965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr17	73614357	rs1093992	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=54;PP=1264;ReadPosRankSum=0.169;SC=TTAACACCACGTAGGGCATGT;SOR=1.188;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=114;TCF=29;TCR=85;TR=69;WE=73614365;WS=73614347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr17	73615644	rs820147	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=378;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GCAGGAGAGCCGGGGAGCAGA;SOR=0.962;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=19;WE=73615652;WS=73615634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr17	73615887	rs820148	A	G	8241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=123;PP=2965;SC=CAGGTGCGCTAGCCCACGACC;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=247;WE=73615895;WS=73615877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr17	73615933	rs820149	T	C	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=110;PP=2965;SC=CAAGGTGACCTCAGTTCATGC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=101;TCR=110;TR=211;WE=73615941;WS=73615923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr17	73615962	rs820150	T	C	8265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=100;PP=2965;SC=TGCGCAGCTTTGCGGAGGTGC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=88;TCR=100;TR=188;WE=73615970;WS=73615952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	73615983	rs820151	G	A	7607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=93;PP=2965;SC=TGGGTGTGGAGTGCCGGGGCG;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=169;WE=73615991;WS=73615973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	73616088	rs820152	T	C	6772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=105;PP=2965;SC=TATTCCTGAATGAGCTTAAGA;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=105;TCR=105;TR=210;WE=73616096;WS=73616078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr17	73616211	rs3840857	TG	T	3870.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.342;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.208;NF=14;NR=64;PP=2951;ReadPosRankSum=1.553;SC=GCCAAATCCCTGGAAGTCTGG;SOR=1.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=78;WE=73616219;WS=73616201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr17	73616239	rs820153	C	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=43;PP=2093;SC=GGTGGAGGGGCAGGCCAGCAG;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=73616247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	73616446	rs820154	A	T	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=59;PP=1796;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AGGTATCGCCAGAGGCCGGCA;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=205;TCF=98;TCR=107;TR=117;WE=73616454;WS=73616436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,127:0.56:228
chr17	73616853	rs10808	G	C	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.532;SC=CCCTCTGCCCGCTCCTGATGG;SOR=0.671;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=116;WE=73616872;WS=73616843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,128:0.55:231
chr17	73616864	rs11470	C	A	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.726;SC=CTCCTGATGGCTCGCCTTGTC;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=100;TCR=103;TR=111;WE=73616872;WS=73616843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,121:0.55:221
chr17	73616920	rs10814	A	G	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1907;ReadPosRankSum=0.874;SC=GCTGGGCTGGATGCTGCTCTT;SOR=0.842;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=189;TCF=91;TCR=98;TR=110;WE=73616928;WS=73616910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,128:0.57:225
chr17	73617104	rs820182	A	C	7108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=72;PP=2965;SC=GTTTCTTGTGATCCCAGCGCC;SOR=1.499;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=148;TCR=72;TR=220;WE=73617112;WS=73617094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	73617377	rs820183	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=82;PP=2500;SC=GCTGGGATGAAGGCAGGAGGG;SOR=3.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=11;TCR=82;TR=93;WE=73617385;WS=73617367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	73617403	rs820184	T	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=44;PP=1174;SC=CAAGCTGGGCTGTCTCCCTCT;SOR=2.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=52;WE=73617411;WS=73617393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	73619920	rs820186	G	A	3119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=2012;ReadPosRankSum=0.111;SC=AGCAGGTCACGGGACACCCCC;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=101;TCR=78;TR=114;WE=73619928;WS=73619910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,135:0.66:206
chr17	73619952	.	GCTTCT	G	8145.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.76;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	73619953	.	CT	GG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=82;NR=57;PP=2947;QD=20;SC=GGACCGGTGGCTTCTGGGGGT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=139;WE=73619965;WS=73619943;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,139:0.93:150
chr17	73619955	.	TCTG	T	2948	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=53;NR=57;PP=2948;QD=20;SC=ACCGGTGGCTTCTGGGGGTGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=110;WE=73619965;WS=73619943;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr17	73619958	.	G	GGT	8144.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	73620804	rs820187	C	A	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=73;PP=2965;SC=GTGGCAGGGCCGGGTGTGTGT;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=133;WE=73620812;WS=73620794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	73621432	rs820188	A	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=36;PP=1727;SC=GGGGCCTGTGAACATCTGTCC;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=73621440;WS=73621422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	73625286	rs820190	G	A	3119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=2069;ReadPosRankSum=-0.246;SC=TGGCAAGGGAGCTGCCCCCAG;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=200;TCF=106;TCR=94;TR=123;WE=73625294;WS=73625276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,138:0.58:236
chr17	73625478	rs820191	T	C	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=74;PP=2554;SC=TGATCCGAGTTGTCTCCATCA;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=139;WE=73625486;WS=73625468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr17	73625629	rs820192	A	C	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=31;PP=1405;SC=CTGGAGCAGTAACTCACATTG;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=57;WE=73625637;WS=73625619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	73626208	rs820193	G	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=647;SC=CAGCTTCTGCGTCAGAGTATG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=73626216;WS=73626198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	73626817	rs820194	G	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.283;NF=26;NR=26;PP=984;ReadPosRankSum=1.057;SC=CGCGGCTGGGGGAGGGCCCCG;SOR=0.430;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=52;WE=73626837;WS=73626807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr17	73626829	rs820195	C	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=49;PP=2730;SC=AGGGCCCCGGCGGGTGGCTGA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=115;WE=73626837;WS=73626807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	73626918	.	C	CTG	1328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=60.57;NF=12;NR=37;PP=1328;QD=27.8163265306;SC=CAGTTCTCATCTGTGGGGGGG;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=49;WE=73626941;WS=73626908;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr17	73626922	rs56158987	G	GT	2807.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=5.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=1.904;QD=28.95;ReadPosRankSum=5.326;SOR=0.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,71:0.73:97
chr17	73626923	.	G	T	1168	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=60.56;NF=20;NR=33;PP=1168;QD=22.6937964632;SC=CTCATCTGTGGGGGGGGGGGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=53;WE=73626941;WS=73626908;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr17	73626923	rs55982817	G	GT	2807.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=10.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.695;QD=27.26;ReadPosRankSum=5.719;SOR=0.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,71:0.69:103
chr17	73627539	rs820196	T	C	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1531;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CCTGCTGAAGTCCCCGTAGCC;SOR=0.931;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=93;WE=73627547;WS=73627529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,108:0.53:204
chr17	73627565	rs820197	A	G	5362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=79;PP=2965;SC=GGCCTCCCTCATACAGCTCGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=172;WE=73627573;WS=73627555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr17	73636368	rs117954398	C	T	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1070;ReadPosRankSum=0.157;SC=AGGCTGAGCCCGTGGAGATCG;SOR=0.463;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=220;TCF=133;TCR=87;TR=82;WE=73636376;WS=73636358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,99:0.36:276
chr17	73647138	rs1661744	CA	TG	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=1129;ReadPosRankSum=2.042;SC=CCCGACACAACAGCCTTTGCA;SOR=0.829;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=22;WE=73647147;WS=73647135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr17	73647366	rs750339	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.635;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=805;ReadPosRankSum=0.269;SC=AAAATGACCACTTAGCAAGTC;SOR=1.200;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=129;TCF=40;TCR=89;TR=49;WE=73647374;WS=73647356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr17	73658489	rs820159	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=386;SC=GGTCTTAGACTAATCTCCATC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=73658497;WS=73658485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	73661411	rs820157	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.601;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=555;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TTCTATGAAAAAGGCAAGGAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=23;WE=73661419;WS=73661401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr17	73663296	rs2165635	CT	AG	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AGCGCGAGCGCTGGCATGAGG;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=22;WE=73663305;WS=73663286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr17	73663313	rs864234	C	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=476;ReadPosRankSum=0.124;SC=GAGGGCGGAGCCAGGCGCAGG;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=27;WE=73663321;WS=73663303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr17	73663372	rs820156	A	T	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.251;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1126;ReadPosRankSum=1.675;SC=GTCTCCTGGGATCCGAAAGAA;SOR=0.379;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=139;TCF=100;TCR=39;TR=73;WE=73663380;WS=73663362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,84:0.54:157
chr17	73687495	rs820218	G	A	4052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=75;PP=2531;ReadPosRankSum=1.298;SC=AACAACCTCAGCTGAGCCTGG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=243;TCF=124;TCR=119;TR=154;WE=73687503;WS=73687485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,176:0.64:273
chr17	73698557	rs820232	C	T	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=14;PP=1135;SC=CTCCTCTTCACAGGACAAGAT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=73698565;WS=73698547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	73702317	rs820230	A	G	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=22;PP=1291;SC=GGGGTGGGCCACTTCGGGGTC;SOR=1.199;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=73702325;WS=73702307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	73702402	rs820229	T	C	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=47;PP=2442;SC=GTGATCCTGATTTCTGCTTTA;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=73702410;WS=73702392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	73720727	rs3862481	G	A	7896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=95;PP=2965;SC=TGACGGCACCGACCATGGCTG;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=146;TCR=95;TR=241;WE=73720735;WS=73720717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr17	73720900	rs820167	A	G	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=62;PP=1684;SC=TCCTGGCAGGATCATCCCTTG;SOR=2.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=79;WE=73720908;WS=73720890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	73723453	rs34275940	GC	G	8689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=133;PP=2974;SC=AATGGGTGCTGCCCCCCAGTG;SOR=0.849;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=182;TCF=34;TCR=148;TR=161;WE=73723461;WS=73723443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr17	73725301	rs34598265	C	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GGGTCTGCGGCGTCTTCCCCC;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=114;TCF=86;TCR=28;TR=66;WE=73725309;WS=73725291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr17	73732025	rs820174	C	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=7;PP=1153;SC=GCTAGCGGCACCCTGGCTCCC;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=73732033;WS=73732015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	73732045	rs820175	T	C	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=14;PP=1755;SC=CACAGCTCTGTTCCCACAGGC;SOR=2.196;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=69;WE=73732053;WS=73732035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	73732522	rs820176	T	G	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=62;PP=2209;SC=CACAGGGCAGTGTGGGCAGGA;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=107;WE=73732530;WS=73732512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	73732810	rs820177	A	C	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=80;PP=2113;SC=GGTTGCTGAGAGCCTAGGCAG;SOR=1.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=127;WE=73732818;WS=73732800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	73733315	rs820179	G	C	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=5;PP=1332;SC=GAGGCAGATCGCAGAGTAGGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=73733323;WS=73733305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	73746146	rs820387	T	C	7043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.472;SC=CCCCTGGTGGTGAAGGGGGAT;SOR=0.493;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=149;TCR=87;TR=235;WE=73746154;WS=73746136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,255:1.00:256
chr17	73751042	rs3988219	C	CACAT	2260.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=22;PP=2188;SC=CACGTGCACACGCATGCACAC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=73751050;WS=73751032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	73752999	rs2249613	C	G	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=55;PP=2732;SC=GGGCCGCAGACGCTGAAGGCA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=121;WE=73753007;WS=73752989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	73753503	rs871443	T	C	5252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=81;PP=2965;SC=ACAGATGGGCTGACCCTGGGG;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=176;WE=73753511;WS=73753493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	73753661	rs9367	C	T	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=70;PP=1983;SC=ACCCCCGCCACGTCCCACTAG;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=73753669;WS=73753651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	73759038	rs35008831	TC	T	4603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=50;PP=2970;SC=GTGGGCACACTCCCACCCAGG;SOR=1.044;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=88;WE=73759046;WS=73759028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	73759304	rs820386	G	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=48;PP=1893;SC=TCCAGGGAGAGTCCCTGCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=81;WE=73759312;WS=73759294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	73760626	rs56038529	T	C	7204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=104;PP=2965;SC=ACTGGGCCTCTCTAGGCCTCA;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=213;WE=73760634;WS=73760616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr17	73760820	rs55715426	G	A	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=71;PP=2100;SC=CAGAGGGCGGGCTTGAGCCAA;SOR=1.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=106;WE=73760828;WS=73760810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	73781075	rs11335367	GC	G	354.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.549;HP=13;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=384;ReadPosRankSum=0.390;SC=CGTACGTAGAGCCCCCCCCCC;SOR=2.447;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=73781091;WS=73781065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	73781083	.	C	T	363.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.778;SOR=2.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	73812909	rs9908146	A	G	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=27;PP=1445;SC=CCACCCAGCCAGGTCCTGTCC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=73812917;WS=73812899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	73816026	rs11868471	A	G	4695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=72;PP=2712;SC=AGAGCTCTGCACCCGTGAACA;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=137;WE=73816034;WS=73816016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	73817367	.	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GACTATTGAGCACAGGTGTAT;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=29;WE=73817375;WS=73817357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,45:0.33:138
chr17	73819525	rs8078208	C	T	4829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=77;PP=2965;SC=CCGCCTTCTCCGACCTGGAGG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=157;WE=73819533;WS=73819515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	73824121	rs7210574	T	C	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=29;PP=1541;SC=AGACCTGGGCTTCTCGGTCAC;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=73824129;WS=73824111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	73826406	rs2290769	G	C	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	73827205	rs1135688	T	C	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=51;PP=2965;SC=TGCAGGGCCTTGGGTGGCAGG;SOR=1.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=119;TCR=51;TR=170;WE=73827213;WS=73827195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	73828903	rs112267124	G	A	8064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=137;PP=2965;SC=AAGAGGGGCCGTGGGAGGAGA;SOR=0.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=109;TCR=137;TR=246;WE=73828911;WS=73828893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr17	73830996	rs17581728	C	T	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=45;PP=2269;SC=TGGAAGATGCCGCACCTCCAC;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=73831004;WS=73830986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	73832384	rs74410877	C	T	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=56;PP=2523;SC=CAGGCCCAGGCGCTGGTCTCC;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=129;WE=73832392;WS=73832374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	73833087	rs142821095	C	CCCTCCTCCAGGGCCCCTGGTGGAGAA	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=2017;SC=GGAATCGCCTCCCATCCACCA;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=73833095;WS=73833077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	73836162	rs7223416	C	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=50;PP=2676;SC=CGGTGTAGCTCGGCTGCGAGC;SOR=0.956;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=120;WE=73836170;WS=73836152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	73837142	rs8067076	A	C	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=73;PP=1736;SC=CAGACGAAGCAGTAAGTGACC;SOR=1.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=105;WE=73837150;WS=73837132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	73837209	rs11868308	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=548;SC=TCCTCCCAGCCGCATCCCTTT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=73837217;WS=73837199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	73838816	rs3744006	G	A	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1249;SC=CCAGCAGCATGGGGGGCCAGC;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=73838824;WS=73838806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	73838857	rs11870883	C	T	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=21;PP=2372;SC=TGGGTGCTCCCGCCAAGAGTC;SOR=2.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=78;TCR=21;TR=99;WE=73838865;WS=73838847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	73839214	rs3744008	G	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=25;PP=1335;SC=CTGCAGGAAGGGGGGTGGGGT;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=73839222;WS=73839204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	73839366	rs3744009	C	T	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=55;PP=1692;SC=CACGGGGTCACCTTGGGGACC;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=81;WE=73839374;WS=73839356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	73839498	rs9903200	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=15;PP=828;SC=TGCCATCAGCGTCGGCCGGCA;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=40;WE=73839506;WS=73839488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	73840243	rs3744010	G	A	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=83;NR=50;PP=2558;SC=CAGGGCACCCGTACCCGAGAC;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=83;TCR=50;TR=133;WE=73840251;WS=73840218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	73844748	rs2290771	A	G	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=47;PP=1753;SC=AGCCACCTGAAAGGGGAAGGA;SOR=1.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=73844756;WS=73844738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	73847613	rs936393	A	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=8;PP=903;SC=CAACAGCAACAAGCCTCTCAA;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=73847621;WS=73847603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	73847799	rs936391	G	A	4563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=87;PP=2901;SC=AGACAGTATGGAGACGCGACG;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=140;WE=73847807;WS=73847789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	73871467	rs3744017	G	A	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=58;PP=2965;SC=GAGGGGGCACGGGCGTCCACT;SOR=1.289;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=105;TCR=58;TR=163;WE=73871475;WS=73871457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr17	73871911	rs3744021	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=633;SC=CTGGATGGGCGCCAGGCCTGG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=73871919;WS=73871901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	73872948	rs1055129	A	G	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=1123;SC=ACAGCCCTACACTCGGGTCCC;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=73872956;WS=73872938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	73872969	rs3833085	A	AG	615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=671;SC=AGGCCTTGCCAGGGGAGAGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=73872977;WS=73872959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	73874012	rs3903010	T	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=26;PP=1031;SC=GGTGCTCCTGTGCGGCGCAGG;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=73874020;WS=73874002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	73874071	rs4600514	G	A	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=30;PP=1249;SC=TCGAGCGGCCGTAGGTGGCGC;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=65;WE=73874079;WS=73874061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	73874138	rs4072479	G	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=25;PP=784;SC=GTCCGCGGAGGGCGGGGCTGC;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=73874146;WS=73874128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	73874684	rs116044941	G	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=393;SC=GGAGGGACCCGGGCCGTTCGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=73874692;WS=73874674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	73886888	rs3760128	A	G	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=28;PP=1246;SC=CTGGGGCCCCAGAGGGAACAC;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=73886896;WS=73886878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	73887807	rs11270925	TGCACACACACACGTGCTCACA	T	1893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=2957;SC=CATACGAACATGCACACACAC;SOR=3.160;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=14;WE=73887835;WS=73887797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	73888354	rs34974290	G	A	8321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=115;PP=2965;SC=GCACCTGCAGGAAGGTCTGCT;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=138;TCR=115;TR=253;WE=73888362;WS=73888344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr17	73888423	rs7222755	A	G	13944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr17	73888427	rs7222757	A	C	14034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr17	73888672	rs3744028	T	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=1157;SC=GGGCTGAGGGTCAGGGATGTG;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=73888680;WS=73888662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	73888743	rs3744027	G	A	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=526;SC=GCTCAGCCCCGCTCCCTGCTG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=73888751;WS=73888733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	73894804	rs7370	G	A	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=790;SC=TGGGCCTGACGGGAGGGGGCC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=73894812;WS=73894794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	73897033	rs111405920	A	AC	12803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.148;NF=24;NR=125;PP=2974;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CCTGGGCAGCACCCCCTACCC;SOR=0.794;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=158;TCF=24;TCR=134;TR=149;WE=73897054;WS=73897023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,288:0.99:290
chr17	73897046	rs9902371	A	G	12975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.124;NF=111;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CCCTACCCCCAGTACTCCAGT;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=111;TCR=136;TR=247;WE=73897054;WS=73897023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,293:0.99:295
chr17	73900688	rs3744015	T	C	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=56;PP=2289;SC=CCTGCTCTGCTCGGCGCCGGT;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=120;WE=73900696;WS=73900678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	73906934	rs9302994	G	A	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=46;PP=1440;SC=GAGCTGAGAGGGAGGTGGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=73906942;WS=73906924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	73908566	rs9895947	A	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=7;PP=265;SC=TCCTACCTGGAAAGACCATTT;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=73908574;WS=73908556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	73909948	rs55793071	C	T	8354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.452;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=0.629;SC=AGGTGGGAGGCTGGGGGTGCC;SOR=0.555;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=112;TCR=142;TR=253;WE=73909956;WS=73909938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,309:1.00:310
chr17	73913729	rs4788912	C	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=464;SC=AGTGAGGTCACGGGAGTGCCG;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=73913737;WS=73913728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	73913965	rs11288315	TC	T	1616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=18;PP=1544;SC=CAGCAGCTGCTCCCCCTTCCC;SOR=1.314;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=43;WE=73913973;WS=73913955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	73922941	rs2305913	T	C	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=42;PP=1815;SC=AGAAGTCCTCTCAATGGGTCT;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=73922949;WS=73922931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	73926121	rs1135889	C	A	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=175;SC=CTCTGAGATACCTGAAACCTA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=73926129;WS=73926111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	73931787	rs59867239	G	A	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=108;PP=2965;SC=ATGACTTCAGGAGGAAAGAAG;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=62;TCR=108;TR=170;WE=73931795;WS=73931777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr17	73931847	rs7218498	C	G	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=57;PP=1754;SC=AGGCGTCAGACCTTTCAGATG;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=64;WE=73931855;WS=73931837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	73934130	rs2608882	G	A	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=45;PP=1921;SC=GGTCCTTGCCGCCCAGCCCCC;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=106;WE=73934138;WS=73934120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	73942976	rs2666003	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8;NR=28;PP=755;SC=TTGAGACTGAGTCCTGCTCTG;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=73942984;WS=73942966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	73944596	rs2666005	T	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=51;PP=1400;SC=TAGACATAATTATATGCATAT;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=56;WE=73944604;WS=73944586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	73969835	rs3744032	C	T	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=71;PP=2420;ReadPosRankSum=0.179;SC=TAATTGAGGCCCACAGGTTCC;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=253;TCF=135;TCR=118;TR=145;WE=73969843;WS=73969825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,161:0.54:297
chr17	73974886	rs3744034	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=191;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GGAATGGCGATATCCCCCCAC;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=73974894;WS=73974885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr17	73974946	rs3744035	T	C	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=532;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CCCCTAACGCTGGGCCAGAGG;SOR=0.463;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=40;WE=73974954;WS=73974936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr17	73997474	rs2069528	G	A	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=26;PP=1362;ReadPosRankSum=0.608;SC=CAAATTGCCCGGTGCCTTCTG;SOR=0.532;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=82;WE=73997495;WS=73997464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,95:0.62:154
chr17	74007846	rs2290251	A	G	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=938;ReadPosRankSum=0.843;SC=GCAAGGTCCCATCTCACCTGG;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=61;WE=74007854;WS=74007836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,74:0.57:129
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chr17	74017677	.	G	GCC	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=89;QD=21.2;SC=CTCGGACCACGCCCCCCCCAC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=5;WE=74017685;WS=74017667;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr17	74018655	rs2598417	C	T	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1092;ReadPosRankSum=-1.098;SC=CCCAAAGGACCGCGGTGGGGA;SOR=0.448;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=56;WE=74018663;WS=74018645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr17	74019356	rs60346043	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=998;ReadPosRankSum=-0.348;SC=ACTGGGGTGTGACTTTGAGTT;SOR=0.200;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=58;WE=74019364;WS=74019346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,66:0.69:95
chr17	74019572	rs2257388	T	C	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.840;NF=21;NR=36;PP=1110;ReadPosRankSum=0.297;SC=CTGCCGCAGCTCCACTCACTC;SOR=0.400;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=57;WE=74019580;WS=74019562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr17	74035543	rs7409	T	C	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=43;PP=1397;SC=CAGCGGCCCCTTTCCCAGGAG;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=74035551;WS=74035533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	74036573	rs2260516	A	T	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=68;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TTTCACAGGGATTCAGTAAGA;SOR=1.308;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=171;TCF=59;TCR=112;TR=95;WE=74036581;WS=74036563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,111:0.53:208
chr17	74036912	rs2598444	A	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=861;SC=AAACAGTAGTATGGGGTGTGA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=74036920;WS=74036902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	74037208	rs2598445	G	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=68;PP=2025;SC=ACAAAACAAAGCAAAACACTA;SOR=1.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=101;WE=74037216;WS=74037198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	74039867	rs1530834	T	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=14;PP=1601;SC=GCTGACTCCATAACCTGCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=72;WE=74039875;WS=74039857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	74046672	rs2665972	A	G	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=70;PP=2377;ReadPosRankSum=1.707;SC=CTAATGGGAGAGGAGCAAAAT;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=110;WE=74046680;WS=74046662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr17	74056413	rs2665998	C	T	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=38;PP=2002;SC=CCAAGAGACCCTCAGTGCCCC;SOR=1.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=74056421;WS=74056403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	74063523	rs4789241	G	A	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=90;PP=2557;SC=TATACTTATGGTTACTAGAAT;SOR=2.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=27;TCR=90;TR=117;WE=74063531;WS=74063513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	74066447	rs2443168	T	A	9278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=163;NR=106;PP=2965;SC=ACATCTTGTATGTGATACTAA;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=163;TCR=106;TR=269;WE=74066455;WS=74066437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr17	74077797	rs1043149	C	T	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1478;ReadPosRankSum=0.157;SC=CTCCCTGGTGCAGGCCCTGCC;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=288;TCF=138;TCR=150;TR=106;WE=74077805;WS=74077787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,122:0.37:334
chr17	74080008	rs191391860	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTTCTCCTTTTTCCCTTGAGG;SOR=0.027;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=6;WE=74080016;WS=74079998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	74080443	rs2305347	C	T	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1506;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CTTCCCCAAACACCCTTGGTC;SOR=0.545;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=248;TCF=101;TCR=147;TR=101;WE=74080451;WS=74080433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,121:0.41:298
chr17	74082339	rs140746643	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=0.483;SC=CTGGGCTTCCTTGGGCAGAGC;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=74082347;WS=74082329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr17	74133843	.	G	A	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1371;ReadPosRankSum=0.714;SC=GGGGGGCCGCGGGACCTTGGC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=83;WE=74133851;WS=74133833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,93:0.59:157
chr17	74134318	rs34418968	A	AG	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.181;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	74141485	rs3744036	A	T	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=67;PP=1710;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GGCCAAATCCAGATGGTGTCT;SOR=0.938;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=77;TCR=98;TR=116;WE=74141493;WS=74141475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,130:0.64:202
chr17	74148736	rs74560598	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=178;ReadPosRankSum=-1.468;SC=GTGTTCTCGCGCTTTCCTGCT;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=11;WE=74148744;WS=74148726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	74152366	rs881502	A	G	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=75;PP=2965;SC=GATGACGACAAGGTGAGATTC;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=161;WE=74152374;WS=74152356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	74160914	rs16968638	G	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1151;ReadPosRankSum=1.119;SC=AAGGAAGGGAGGGTAATAAAG;SOR=0.399;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=88;WE=74160922;WS=74160904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,100:0.55:183
chr17	74161533	rs16968642	C	T	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GTGTCTCACACGAAAGAAAGG;SOR=0.457;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=152;TCF=101;TCR=51;TR=86;WE=74161541;WS=74161523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,109:0.58:187
chr17	74162506	rs1376356	G	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=759;ReadPosRankSum=0.078;SC=CAAAAGAGCAGTGTGCACAGC;SOR=1.342;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=39;WE=74162514;WS=74162496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr17	74163821	rs2289603	G	A	3430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=2131;ReadPosRankSum=-0.303;SC=ACTCAACATTGTAGTGGACTT;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=211;TCF=112;TCR=99;TR=129;WE=74163829;WS=74163811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,153:0.62:248
chr17	74208424	rs9911122	G	A	7455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=91;PP=2965;SC=CCAAGTAGGAGTAAACTGATT;SOR=1.100;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=140;TCR=91;TR=231;WE=74208432;WS=74208403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr17	74208622	rs35372072	T	TA	944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=38;PP=742;SC=CTAAATCTAGTAAAAAAAAAA;SOR=3.855;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=40;WE=74208630;WS=74208612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	74261677	rs2585751	T	C	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=38;PP=1183;SC=GGCGAAGCAGTTGCTGCAGGC;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=74261685;WS=74261667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	74261929	rs71382201	A	G	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=21;PP=1891;SC=TGGGGGGCCCAGCCGCTGCGT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=78;TCR=21;TR=99;WE=74261937;WS=74261919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	74270069	rs71815	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=119;ReadPosRankSum=0.749;SC=ACAGCGGGTATTTCCCTTTCC;SOR=0.372;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=9;WE=74270077;WS=74270059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr17	74273165	rs164011	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CTGATTTTCTGGTGGCTTTAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=74273173;WS=74273164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr17	74274998	rs347676	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=0.635;SC=TCTCCACACTGTCCCACAGCA;SOR=0.983;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=16;WE=74275006;WS=74274988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr17	74275030	rs182972	TG	CA	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CACGTTCCGCTGGGCCCTCCG;SOR=1.303;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=34;WE=74275039;WS=74275020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,42:0.35:120
chr17	74276067	rs164010	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.407;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=0.785;SC=TCTGCCCTCACCCCCTGAAGA;SOR=1.845;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=9;WE=74276075;WS=74276057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr17	74283253	rs8072620	A	G	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.508;NF=53;NR=25;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CCCTGGAGCTAAAGAGTGGGG;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=111;TCR=53;TR=78;WE=74283261;WS=74283243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr17	74286082	rs4789273	C	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.747;NF=32;NR=20;PP=809;ReadPosRankSum=1.013;SC=CTTTTGCTTTCTCCTGCCAAA;SOR=0.801;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=52;WE=74286090;WS=74286072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,55:0.37:150
chr17	74286106	rs4789274	C	T	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.778;NF=34;NR=32;PP=814;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CTTTGGCTAGCGTCTTTACGG;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=66;WE=74286114;WS=74286096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,71:0.38:185
chr17	74286173	rs17509527	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=701;ReadPosRankSum=0.747;SC=GGAAAGCAGAAGCCTTATGAT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=120;TCF=36;TCR=84;TR=49;WE=74286181;WS=74286163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr17	74287204	rs2279052	C	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=855;ReadPosRankSum=0.906;SC=CTACTGAGCTCTCCCATCAGA;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=58;WE=74287212;WS=74287194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,66:0.33:198
chr17	74287389	rs2279053	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=804;ReadPosRankSum=0.292;SC=AGGAATTCCATGTCGGTCCGA;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=61;WE=74287397;WS=74287379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,64:0.42:152
chr17	74287594	rs2279054	G	A	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=565;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TGATCTGGGTGTGTAGATCCC;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=42;WE=74287602;WS=74287584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr17	74288564	rs35035566	CTGA	C	5454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.361;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=2966;ReadPosRankSum=0.446;SC=CCAAACCACGCTGATGATCTG;SOR=0.943;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=246;TCF=122;TCR=124;TR=95;WE=74288574;WS=74288554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,146:0.44:329
chr17	74289500	rs3803737	G	A	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=892;ReadPosRankSum=-1.089;SC=GCTCATCCACGACAAATGGTA;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=60;WE=74289508;WS=74289490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr17	74289705	rs6501880	A	G	4210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=85;PP=2443;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GTCTCTGGCCAAGGGTAAGTC;SOR=0.691;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=412;TCF=209;TCR=203;TR=174;WE=74289713;WS=74289695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:289,214:0.43:503
chr17	74289839	rs6501881	G	A	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=59;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GTCGTGGCACGCCAGCTTCAT;SOR=0.819;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=87;TCR=140;TR=92;WE=74289847;WS=74289829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,103:0.41:250
chr17	74289875	rs6501882	C	T	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=1080;ReadPosRankSum=0.833;SC=GCTGCTGTCTCCCAGTACCAG;SOR=1.006;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=195;TCF=86;TCR=109;TR=70;WE=74289883;WS=74289865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,84:0.38:221
chr17	74289908	rs6501883	A	G	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.725;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1111;ReadPosRankSum=-1.928;SC=TTTGTTCCCTACTGGAAACCC;SOR=0.778;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=205;TCF=104;TCR=101;TR=71;WE=74289916;WS=74289898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,83:0.36:230
chr17	74290097	rs7225131	T	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=968;ReadPosRankSum=0.999;SC=TAAGTGTTTCTGAGCCCTGGT;SOR=0.493;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=118;TCF=31;TCR=87;TR=53;WE=74290105;WS=74290087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,57:0.42:135
chr17	74297784	.	AT	A	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=59.81;NF=0;NR=2;PP=22;QD=12.5;SC=GTGTTTTATAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=74297792;WS=74297774;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr17	74307737	rs10459	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.469;SC=TCTTGGGACATTGCAGCTTCT;SOR=0.670;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=71;WE=74307745;WS=74307727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr17	74324729	rs346791	C	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr17	74326553	rs449114	G	A	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr17	74326556	rs399029	A	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr17	74381555	rs2247856	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=117;ReadPosRankSum=0.561;SC=AGGGAATGACGCCGGTGCTCC;SOR=0.132;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=10;WE=74381575;WS=74381545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr17	74381567	rs346803	G	A	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=682;SC=CGGTGCTCCTGCAGCCACGGC;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=74381575;WS=74381545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	74383475	rs3744037	T	C	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=63;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.731;SC=ACTTGGTATATGTGCCCGTGG;SOR=1.011;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=183;TCF=81;TCR=102;TR=107;WE=74383483;WS=74383465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,117:0.56:209
chr17	74387284	rs3803739	C	T	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=60;PP=1772;ReadPosRankSum=0.434;SC=GAGGCCAGGCCCTGGGCACCG;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=241;TCF=102;TCR=139;TR=103;WE=74387292;WS=74387274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,119:0.44:272
chr17	74396421	rs3809691	G	C	3879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=82;PP=2327;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TGGACTCCTGGGAGGCCAGCA;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=253;TCF=117;TCR=136;TR=150;WE=74396429;WS=74396411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,171:0.61:282
chr17	74397026	rs3809693	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=297;ReadPosRankSum=-0.183;SC=AAGGAAAGGGGCAGCAGCTCA;SOR=0.049;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=13;WE=74397034;WS=74397016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr17	74398514	rs11652985	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=263;ReadPosRankSum=-1.848;SC=AATAGGCCACGGCAGATAAGG;SOR=0.340;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=15;WE=74398522;WS=74398506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr17	74401405	rs11290311	AG	A	8783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=155;PP=2974;SC=GTCCTGGGGGAGGGGAGGAGA;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=18;TCR=163;TR=172;WE=74401413;WS=74401395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr17	74401522	rs445683	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.220;NF=40;NR=17;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.060;SC=ATGCAGAGTGCGAGGTGGGCA;SOR=0.851;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=57;WE=74401530;WS=74401512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr17	74468552	rs12942767	A	G	7040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=78;PP=2965;SC=AAGATAAATGAGGCGGTGGAG;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=143;TCR=78;TR=221;WE=74468560;WS=74468542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr17	74471298	rs12951122	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GGGCCACCCTGGCCTGGTCAC;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=23;TCR=72;TR=56;WE=74471306;WS=74471288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr17	74473593	rs3833088	A	AG	711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.343;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=681;ReadPosRankSum=0.290;SC=ATGGGGGCCCAGCAGCTCCAC;SOR=1.743;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=19;WE=74473601;WS=74473583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr17	74475024	rs3744045	G	A	3825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=67;PP=2621;SC=CGGTGGGTGCGGGGCGTGGGG;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=125;WE=74475032;WS=74475014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	74475975	rs3809694	C	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=671;ReadPosRankSum=0.467;SC=GTGGTGTGTGCAGCCCAGGTC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=55;WE=74475983;WS=74475965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,65:0.45:145
chr17	74476045	rs3826287	G	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.480;NF=18;NR=34;PP=733;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CTTCAACCCTGATTTATGCCC;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=52;WE=74476053;WS=74476035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr17	74476089	rs138608987	ATGTGTGTGTG	A	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.88;MQRankSum=2.501;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr17	74477340	rs3826288	A	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=979;SC=GGCTGCACAGACAGCAGCTGT;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=74477348;WS=74477330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	74477691	rs11870168	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AGGACCCTGACGCCAGGGCAC;SOR=0.622;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=74477699;WS=74477681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr17	74527846	rs3217541	T	TG	1127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.286;NF=0;NR=34;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TCCAGGATAGTGGGGGCTGAA;SOR=0.679;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=109;TCF=5;TCR=104;TR=34;WE=74527854;WS=74527836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,49:0.38:130
chr17	74536333	rs77817682	C	G	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	74536333	.	CGGGG	GGGGC,GGGGG	97	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=11;MQ=60.0;NF=6,7;NR=9,18;PP=97,45;QD=10.0311916575;SC=GGCGGTTGGTCGGGGGGGGGG;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=15,25;WE=74536345;WS=74536323;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.58:26
chr17	74536337	rs8176324	G	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.05;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	74538466	rs4647881	A	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=0.520;SC=TGGGGGTGACATTTCTACTCT;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=74538474;WS=74538456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr17	74539025	rs3803740	C	T	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=35;PP=1645;ReadPosRankSum=0.307;SC=AAGGGAGAGGCGGTGCTCGGA;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=228;TCF=152;TCR=76;TR=108;WE=74539033;WS=74539015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,118:0.45:260
chr17	74539092	rs4318240	C	T	12013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=209;NR=169;PP=2965;SC=TGCTGATCTGCTCTGGTTTTC;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=379;TCF=209;TCR=170;TR=378;WE=74539100;WS=74539082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,447:1.00:447
chr17	74541129	rs4232870	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=334;ReadPosRankSum=-0.017;SC=CTGGGGTGCCATGTGGGCCGG;SOR=1.519;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=22;WE=74541137;WS=74541119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr17	74557681	rs4510053	A	C	8255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=172;NR=77;PP=2965;SC=TGTTTGTAAGATTTGTTTACA;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=172;TCR=77;TR=249;WE=74557689;WS=74557671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr17	74557803	rs60161580	GT	G	6151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=147;PP=2988;SC=TGGCTCCATGGTTTTTTTTTT;SOR=1.428;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=198;TCF=14;TCR=184;TR=159;WE=74557812;WS=74557791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr17	74563653	rs2241918	A	G	4229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=85;PP=2409;ReadPosRankSum=2.251;SC=AAAAAGAGACATTTCAGCTCA;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=259;TCF=121;TCR=138;TR=158;WE=74563661;WS=74563643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,194:0.63:309
chr17	74570408	rs7207173	A	G	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1440;ReadPosRankSum=-0.436;SC=GCAGGAAGCTAAGGCAGAAGG;SOR=0.854;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=81;WE=74570416;WS=74570398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,104:0.62:167
chr17	74581914	rs3135934	C	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=442;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GCGAGCGCCCCGTCCGCTGAC;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=40;WE=74581922;WS=74581904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr17	74581945	rs12449329	AA	GC	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=1059;ReadPosRankSum=1.736;SC=GAAGGGAGAGAACCGGGTGGG;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=33;WE=74581954;WS=74581935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr17	74582025	rs1867561	G	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TGCGGCGCCTGCCCGCCCGGC;SOR=0.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=10;WE=74582033;WS=74582015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr17	74621635	rs2286595	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=375;ReadPosRankSum=-0.726;SC=AGGAGAAACACGGCCTGTAGT;SOR=0.902;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=22;WE=74621643;WS=74621625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr17	74623333	rs146144287	T	TG	714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=520;ReadPosRankSum=0.050;SC=GGAACAAGAGTGGGGGTGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=19;WE=74623341;WS=74623323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,34:0.32:107
chr17	74625870	rs11404475	T	TG	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.773;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr17	74639530	rs719430	T	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=897;ReadPosRankSum=-0.173;SC=CCCTGGGCTATCATTTTTCTG;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=56;WE=74639538;WS=74639520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr17	74681435	rs2286593	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=231;SC=CTACAACGAGACAGCCAGAGA;SOR=2.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=74681443;WS=74681425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	74684439	rs188871607	G	A	3962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=63;PP=2502;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CAAACGATGGGCCAAAGTGAC;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=134;TCR=106;TR=142;WE=74684447;WS=74684429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,170:0.59:288
chr17	74684598	rs4788942	C	T	5953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=106;PP=2965;SC=CTGCGGCCAGCAGACAAAGGG;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=90;TCR=106;TR=196;WE=74684606;WS=74684588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	74684858	rs7219390	T	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=770;SC=CTTGCAGGAATGTCAGAGGAT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=74684866;WS=74684848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	74707050	rs71383084	G	C	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.28;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	74716759	rs12943725	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=770;SC=GAGAAACCCAATACGGTGCCC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=74716767;WS=74716749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	74728938	rs4789351	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=243;SC=TTTATACAAACCCAGAAAGAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=74728946;WS=74728928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	74729588	rs34243161	C	CT	1069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.380;NF=17;NR=21;PP=488;ReadPosRankSum=2.071;SC=AAAAGAACAACTTTTTTTTTT;SOR=0.484;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=38;WE=74729596;WS=74729578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr17	74732507	rs237058	A	G	16974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=609;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=340;PP=2965;SC=ACCTGGAACGACTCCGACTCC;SOR=1.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=533;TCF=193;TCR=340;TR=533;WE=74732515;WS=74732497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,603:1.00:603
chr17	74733099	rs237057	G	A	6313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=105;PP=2965;SC=TGGTGTAGCGGTCCCGCGGGA;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=102;TCR=105;TR=207;WE=74733107;WS=74733089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	74733403	rs3744061	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=1.062;SC=TAGCGCACCTGAGTAACAACT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=12;WE=74733411;WS=74733393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr17	74734323	rs237054	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=729;SC=CCTGGCTCCTGCATCTGCCTT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=74734331;WS=74734313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	74734598	rs237053	C	T	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=96;PP=2856;SC=TGAAAATAAACGTTCATTATA;SOR=1.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=35;TCR=96;TR=131;WE=74734606;WS=74734588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	74750215	rs11399997	C	CT	9530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=102;PP=2967;SC=TCAGGAACAACTCGGCATTTG;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=43;TCR=105;TR=143;WE=74750223;WS=74750205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr17	74750331	rs116719	C	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=56;PP=1651;SC=CAACATCTCTCTAACATGGGG;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=66;WE=74750339;WS=74750321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	74857515	rs499828	A	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	74920957	rs3889146	G	T	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=31;PP=2190;SC=CTCTGCACTTGTACAGTTCAT;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=109;WE=74920965;WS=74920947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	74921257	rs8067585	G	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=451;ReadPosRankSum=-1.900;SC=CTGCCCCCACGTCCCCACTCA;SOR=0.216;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=28;WE=74921265;WS=74921247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr17	74922636	rs12450749	G	A	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=932;SC=AGGGACACACGGGGAGGTTGC;SOR=2.004;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=40;WE=74922644;WS=74922626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	74922652	rs11653088	C	T	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=10;PP=1222;SC=GTTGCTGACCCTGGTTCCTGG;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=74922660;WS=74922642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	74922706	rs33966966	C	T	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=36;PP=2731;SC=TCGACACCTTCGGGACGGAAC;SOR=1.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=88;TCR=36;TR=124;WE=74922714;WS=74922696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	74928758	rs79286496	C	T	12166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=172;PP=2965;SC=TCATGGGCTTCGTGTCCGAGG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=358;TCF=186;TCR=172;TR=358;WE=74928766;WS=74928748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,456:1.00:456
chr17	74928921	rs77352627	C	T	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.28;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	74928931	rs8078608	C	T	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	74929442	rs12600695	A	G	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=68;PP=2083;SC=TCCAGCAGCCACTCCAGGGGT;SOR=2.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=81;WE=74929450;WS=74929432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	74936576	rs8081793	G	A	8474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=139;PP=2965;SC=GCTTCAGCCCGCCCCACAGCT;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=111;TCR=139;TR=250;WE=74936594;WS=74936566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr17	74936656	rs142228172	G	A	4624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=102;PP=2965;SC=CCTGGTCCCCGATCAGGAGGG;SOR=1.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=46;TCR=102;TR=148;WE=74936664;WS=74936646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	74937066	rs9900337	C	G	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=755;SC=CATCCCTCCCCTGGTCAGACA;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=74937074;WS=74937056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	74942478	rs8067984	C	T	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=54;PP=2392;SC=ACCTACCCTACGAGTACACCT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=74942486;WS=74942468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	74944709	rs9894270	T	C	8641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=118;PP=2965;SC=CGGTGCTGTGTGGTCCCTGCC;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=158;TCR=118;TR=276;WE=74944717;WS=74944699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr17	75085226	rs3214724	TC	T	1387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=2;PP=1563;SC=TGTTACTTTTTCCCCCAAGGT;SOR=5.421;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=43;WE=75085234;WS=75085216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	75085260	rs2247814	C	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=13;PP=1933;SC=GAGAAATATCCCCCGACGATT;SOR=3.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=76;TCR=13;TR=89;WE=75085268;WS=75085250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	75085434	rs2678770	G	A	6184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=106;PP=2965;SC=GCCAAGTTGTGGGTGCAGCAT;SOR=1.025;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=180;WE=75085442;WS=75085424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	75190846	rs673918	A	C	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=72;PP=2965;SC=TTCCATCACGACCTCTTCAGA;SOR=1.054;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=101;TCR=72;TR=173;WE=75190854;WS=75190836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	75203092	rs7226135	C	T	170.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=93;SC=TTCTCTGATCCAGGGTTAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=75203100;WS=75203082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	75207966	rs2280269	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=610;SC=GGAGAGCACGATGCGCTCGCA;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=75207974;WS=75207956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	75303298	rs4789439	T	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=735;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CTCGCTCCGCTCTGGCCCCAC;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=38;TCR=110;TR=47;WE=75303306;WS=75303288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,53:0.33:162
chr17	75316497	rs3760143	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=599;ReadPosRankSum=-2.368;SC=TTATTTATGCCTGGGGGAATA;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=42;WE=75316505;WS=75316487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,45:0.38:120
chr17	75369578	rs7217986	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=646;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CCACCAGCCATCATGTCGGAC;SOR=0.786;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=57;WE=75369586;WS=75369568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,68:0.34:199
chr17	75393267	rs434143	C	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=494;ReadPosRankSum=1.310;SC=ACAAGTTTGACATCAAGGTAT;SOR=0.235;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=32;WE=75393275;WS=75393257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr17	75401190	rs2164449	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=765;ReadPosRankSum=0.030;SC=GGTGCTGGATGCACAGGGACG;SOR=0.658;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=56;WE=75401198;WS=75401180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,64:0.39:164
chr17	75401310	rs2117924	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.752;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=0.078;SC=GAGACTGTGCCGGGAGCCAGG;SOR=0.444;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=29;WE=75401318;WS=75401300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,41:0.41:99
chr17	75478481	rs425139	C	T	11030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=184;PP=2965;SC=CCCAGGGCGGCCCACAAGCCT;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=354;TCF=170;TCR=184;TR=354;WE=75478489;WS=75478471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr17	75478694	rs416438	T	C	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=59;PP=1502;SC=TCCTGATGAGTGGTCGCTGCC;SOR=1.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=75478702;WS=75478684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	75478806	rs392287	C	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.29;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	75478809	rs405253	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.62;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	75483719	rs9902607	A	G	204.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=179;SC=CATCACACACAGTCAGTGGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=75483727;WS=75483709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	75483729	.	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.19;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	75484156	rs441670	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=819;SC=CCAGGGGAACCGTCACCGGCC;SOR=3.321;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=32;WE=75484164;WS=75484149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	75484200	rs35261301	TC	T	3327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=19;PP=2951;SC=GCCATTAATTTCCCGGTGTCT;SOR=2.632;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=76;WE=75484208;WS=75484190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	75484700	rs378578	A	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=7;PP=1181;SC=CTCCCAGGGCATGCATTTCAT;SOR=3.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=57;WE=75484708;WS=75484690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	75484781	rs370531	T	C	6940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=80;PP=2965;SC=CTCATGTGCCTGCTGACTCGT;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=151;TCR=80;TR=231;WE=75484789;WS=75484771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr17	75485014	rs426885	A	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=55;PP=1619;SC=CTGGGACTGCAAGACGGTGCT;SOR=3.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=75485022;WS=75485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	75488973	rs2627198	C	T	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=34;PP=1995;SC=TTGGGGGACCCCAGGCTCAGG;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=79;WE=75488981;WS=75488963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	75489015	rs188747	T	C	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=39;PP=2893;SC=GGGGAGGGAATTGCCTTCCCG;SOR=1.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=84;TCR=39;TR=123;WE=75489023;WS=75489005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	75489216	rs312797	C	T	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=77;PP=2265;SC=CTTCTGCTGACCCAGAGCCTG;SOR=1.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=35;TCR=77;TR=112;WE=75489224;WS=75489206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	75489244	rs167498	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=56;PP=1605;ReadPosRankSum=-1.502;SC=CGCCTGAGCCAGGGACTCGTG;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=73;WE=75489252;WS=75489234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr17	75489282	rs61127839	C	CA	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=910;SC=TTGCCCCACCCAGAGGGAGGG;SOR=2.400;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=19;WE=75489290;WS=75489272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	75494705	rs2627223	A	G	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=38;PP=1185;SC=GGCCAACGGCATGGAGGAGAA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=75494713;WS=75494695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	75494746	rs1059485	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=5;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGTAGACGCCACCCTGCCCAC;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=18;WE=75494754;WS=75494736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr17	75494787	rs5822173	T	TC	224.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GTCATTTCCGTCCCCCCCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=75494795;WS=75494777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr17	75495065	rs448203	T	C	5456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=88;PP=2825;SC=ATCATCCGTCTGTGTGGGGTT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=160;WE=75495073;WS=75495055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	75495397	rs9038	T	C	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=827;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GCAGACTGCTTGGCCAGATGC;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=63;WE=75495405;WS=75495387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr17	75834770	rs9910282	A	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=939;ReadPosRankSum=2.756;SC=CTGCTCAAGAAGAAATCTTGG;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=56;WE=75834778;WS=75834760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr17	76087407	rs60735984	C	CA	603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.568;NF=15;NR=8;PP=295;ReadPosRankSum=0.107;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=23;WE=76087415;WS=76087397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,22:0.85:26
chr17	76113206	.	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=2.696;SC=TGAAGTGCACGTATTGATCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=6;WE=76113214;WS=76113203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr17	76121318	rs12449858	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=960;ReadPosRankSum=0.030;SC=AGGCTCTGGAGCTCCTTCACC;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=72;WE=76121326;WS=76121308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,85:0.62:137
chr17	76137198	rs369764	T	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=340;SC=CTGTAACCCCTACCCCTGCCT;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=76137206;WS=76137188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	76142825	rs62079077	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=616;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GTGATGGTGCCAGCTGAGTCC;SOR=1.207;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=34;WE=76142833;WS=76142815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr17	76198754	rs35822441	T	C	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=17;PP=1109;SC=GGGCGGGCCTTGCTCACACGC;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=76198762;WS=76198744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	76218857	rs4789559	G	A	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=33;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.070;SC=AAAAAATATGGTAGGGAAGGG;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=97;WE=76218865;WS=76218847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,112:0.63:177
chr17	76219123	.	TAGACTAGCTGGGGTGCCC	T	398	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=25;MQ=60.49;NF=1;NR=2;PP=398;QD=147.0;SC=CTGGGGTGCCTAGACTAGCTG;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=3;WE=76219148;WS=76219113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr17	76219591	rs2071214	G	A	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=45;PP=1683;SC=GGAAACTGCGGAGAAAGTGCG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=76219599;WS=76219581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	76219783	rs2239680	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=359;ReadPosRankSum=0.572;SC=AACTGTGCTCTTGTTTTGTCT;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=24;WE=76219791;WS=76219773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr17	76228088	rs8068943	T	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=483;SC=ACCCGTCCCCTCCCGCCGGCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=76228096;WS=76228078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	76230184	rs78780583	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1309;ReadPosRankSum=0.434;SC=GACGTTTCCACGCAGACCTGT;SOR=0.865;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=168;TCF=100;TCR=68;TR=77;WE=76230192;WS=76230174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,85:0.46:185
chr17	76230729	rs11077350	T	C	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1110;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TTCTCGTGTGTGGCTGGATCT;SOR=0.910;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=227;TCF=105;TCR=122;TR=83;WE=76230737;WS=76230719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,105:0.38:273
chr17	76235015	rs880190	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=403;ReadPosRankSum=1.302;SC=TAGCGGGGCCGGGGATGCTGA;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=27;WE=76235023;WS=76235005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr17	76268010	rs880316	C	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=50;PP=1228;ReadPosRankSum=1.184;SC=CAGTGGCTCCCTCATCCTCTG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=75;WE=76268018;WS=76268000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,88:0.57:155
chr17	76394042	rs16971107	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=493;SC=ACCTGGTGTCGTAGCGTTTCC;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=76394050;WS=76394032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	76394449	rs2292644	C	T	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=54;PP=1644;SC=GGCATGCAAGCCTGGCCCCTC;SOR=1.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=76394457;WS=76394439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	76395421	rs2292643	G	A	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.34;SOR=4.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	76395430	rs2292642	C	T	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.67;SOR=3.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	76395750	rs12450500	C	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.00;SOR=5.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	76396963	rs3817294	A	G	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=57;PP=1686;SC=ACACCCTTCTATGGCTGTGGG;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=80;WE=76396971;WS=76396953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	76400230	rs3744220	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=10.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr17	76400236	rs3744219	G	A	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=42;PP=730;SC=AGGGGGTGGGGAGCCCTGGCG;SOR=2.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=76400244;WS=76400220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	76400258	rs3744217	G	A	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	76400268	rs3826323	C	G	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	76410871	rs3744216	G	A	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=26;PP=1227;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AGGGCAGGCCGCCTTTCTCTT;SOR=0.951;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=76;WE=76410879;WS=76410861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,95:0.59:161
chr17	76411154	rs3833108	T	TG	728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.657;NF=2;NR=19;PP=698;ReadPosRankSum=-0.448;SC=AGGGTGTGGCTGGGGGCCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=21;WE=76411162;WS=76411144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr17	76419882	rs72903323	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TTAAGAGAACGAAAAACCACC;SOR=0.481;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=76419890;WS=76419872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr17	76421360	rs143392722	TTTATC	T	1611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.678;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.049;NF=21;NR=12;PP=1507;ReadPosRankSum=1.819;SC=AAGAGCTAGTTTTATCTTGTC;SOR=1.212;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=33;WE=76421372;WS=76421350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,47:0.33:144
chr17	76421464	rs35422926	C	T	3744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=0.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.391;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.957;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,107:0.34:312
chr17	76421467	rs36119275	A	G	3734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=0.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.424;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,105:0.33:316
chr17	76421709	rs8069521	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=1.599;SC=TGGGAACGACCGGGCCTTGGC;SOR=0.250;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=9;WE=76421717;WS=76421699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr17	76422473	rs4969188	T	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=548;ReadPosRankSum=-1.270;SC=GGGTGTGGGGTGTGCCGAGCT;SOR=0.443;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=39;WE=76422481;WS=76422463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr17	76422903	rs72914887	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.808;SC=GAGCAGTACCATGCTGATCCG;SOR=0.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=8;WE=76422911;WS=76422893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr17	76422933	rs72914891	G	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=298;ReadPosRankSum=0.449;SC=CTAGGCCTGGGTTGCCAGAGG;SOR=0.988;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=17;WE=76422941;WS=76422923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr17	76423097	rs2271613	G	A	4195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=77;PP=2172;ReadPosRankSum=-1.080;SC=CGACTACCACGTAGGGGGTCT;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=258;TCF=130;TCR=128;TR=151;WE=76423105;WS=76423087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,198:0.60:330
chr17	76424482	rs651806	A	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=10;PP=1293;SC=ACCCAAGCCCAAGGCTGGGGC;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=60;WE=76424490;WS=76424472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	76424502	rs691674	C	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=1.182;SC=CAGAGTGTACCTCACCAGCAA;SOR=0.465;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=34;WE=76424510;WS=76424492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr17	76424942	rs691113	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GGCTGCCCCCTGTGCTCCCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=76424950;WS=76424932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	76425176	rs691094	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=229;ReadPosRankSum=-0.989;SC=ATTACGTTGAGCTCCTGTTTA;SOR=0.712;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=16;WE=76425184;WS=76425166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr17	76425480	rs666463	A	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr17	76425490	rs1709752	TG	CA	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.675;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr17	76433685	rs2289757	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=379;ReadPosRankSum=-1.295;SC=AGGCCGTGGCATGGGATGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=22;WE=76433693;WS=76433679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
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chr17	76433898	.	TG	CA,CG	1374	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23,60;NR=34,86;PP=855,1374;QD=15.9380328923;SC=CGTGCTGTAGTGCTCCAGCTT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=63;TCR=88;TR=57,146;WE=76433907;WS=76433888;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:151
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chr17	76456017	rs34438166	C	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=801;ReadPosRankSum=0.267;SC=AGAATCATGACGGCGGCGGTG;SOR=0.950;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=45;WE=76456025;WS=76456007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr17	76456352	rs623336	T	C	6979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=124;PP=2965;SC=GGAAGGAAGATGGACAGGAGA;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=92;TCR=124;TR=216;WE=76456360;WS=76456342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr17	76456403	.	C	CGTGCATGTGTGTGCATGTGT	2611.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=48.37;SOR=4.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	76457559	rs692529	T	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=1136;SC=TGACCACACGTGGAAGCCCAG;SOR=3.365;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=76457567;WS=76457549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	76457910	rs640292	G	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=573;SC=CGTGTCTTACGACTCCCAGTG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=76457918;WS=76457900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	76462770	rs691225	G	A	6159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=73;PP=2965;SC=GGAAGCGGGCGCTGACGGACA;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=105;TCR=73;TR=178;WE=76462778;WS=76462760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	76464916	rs635874	G	A	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.316;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1284;ReadPosRankSum=-1.424;SC=CAGGAACACCGAGGGAACGTT;SOR=0.416;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=200;TCF=73;TCR=127;TR=84;WE=76464924;WS=76464906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,107:0.44:244
chr17	76468817	rs2176034	G	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=723;ReadPosRankSum=2.411;SC=CACAGCCCTCGCTGGCCCTGG;SOR=0.327;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=58;WE=76468825;WS=76468807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,78:0.39:201
chr17	76472574	rs7405804	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=278;ReadPosRankSum=0.205;SC=TGAGAGGGCTGCAGTTCTCAT;SOR=0.101;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=19;WE=76472582;WS=76472564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr17	76472768	rs7405830	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=928;ReadPosRankSum=2.041;SC=AAAGGCGGACGAGGTCCAGTG;SOR=0.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=175;TCF=62;TCR=113;TR=57;WE=76472776;WS=76472758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,72:0.34:211
chr17	76472855	rs4969207	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=0.888;SC=TCAGCTGTTACGAAGGCGAGC;SOR=0.440;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=20;WE=76472863;WS=76472845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr17	76475067	rs56372780	A	G	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=19;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CAGGCACTGGACCGTAAGGCA;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=143;TCR=50;TR=75;WE=76475075;WS=76475057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,80:0.39:203
chr17	76475809	rs28454411	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CCTGTCCTCATGTTCTAAGGT;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=76475817;WS=76475799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	76481608	rs11077370	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CCGGGTAGGCAGGGCGTGGCC;SOR=1.263;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=24;WE=76481616;WS=76481598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr17	76482256	rs691142	A	G	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.070;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1370;ReadPosRankSum=0.571;SC=CCAGCTAAGCAGGATGCTGAG;SOR=0.642;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=91;WE=76482264;WS=76482246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,110:0.45:244
chr17	76482432	rs691151	A	G	9085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=143;PP=2965;SC=GCAGGTACAGAATCGTTTGGA;SOR=0.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=119;TCR=143;TR=262;WE=76482440;WS=76482422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr17	76490083	rs691912	G	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=688;ReadPosRankSum=0.976;SC=CCACCATGCCGGATCCCTGCA;SOR=1.378;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=36;WE=76490091;WS=76490073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr17	76491127	rs691652	TG	CC	6020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=70;PP=2947;SC=CCCTCGGCCATGAGCATGATC;SOR=1.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=107;WE=76491136;WS=76491117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	76495050	rs691291	C	T	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=70;PP=2953;SC=ACGAGCCAGTCACCCGACGTG;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=88;TCR=70;TR=158;WE=76495058;WS=76495040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr17	76496350	rs35901117	A	C	9180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=63;PP=2965;SC=CTATAAAAGAAGACTCTGGGT;SOR=1.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=117;TCR=63;TR=180;WE=76496369;WS=76496340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr17	76496361	rs34124297	C	G	9682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=77;PP=2965;SC=GACTCTGGGTCCCTCCTCCGG;SOR=1.148;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=120;TCR=77;TR=197;WE=76496369;WS=76496340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
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chr17	76496577	rs2028735	C	T	5554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=105;PP=2965;SC=TGTGTGCCAGCGACCCCATGG;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=57;TCR=105;TR=162;WE=76496585;WS=76496567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
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chr17	76498692	rs930571	C	T	9225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=136;PP=2965;SC=GTTATAATCTCTGATAGCGTT;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=130;TCR=136;TR=266;WE=76498700;WS=76498682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
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chr17	76503593	rs9896398	T	C	8742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=157;PP=2965;SC=GGGAGCTGGGTGCGGATGTCT;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=128;TCR=157;TR=285;WE=76503601;WS=76503583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr17	76506607	rs867654	G	A	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=66;PP=2386;SC=AAAAAATCCAGGCAGGATTCA;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=76506615;WS=76506597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	76506665	rs2376586	T	C	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=51;PP=1348;SC=TGATCCTTCATGGAGAGCCAT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=73;WE=76506673;WS=76506655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	76521349	rs75793624	C	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=1.182;SC=CCCTGATAAACCTTCTGGGAG;SOR=1.721;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=16;WE=76521357;WS=76521339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	76522577	rs139314227	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=273;ReadPosRankSum=0.124;SC=TGCTCGCACACGTATGTGCAT;SOR=0.469;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=17;WE=76522585;WS=76522567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr17	76525475	rs884714	T	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=5;PP=1574;SC=ATGGTTGCGTTTGATGGGCTG;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=56;WE=76525483;WS=76525465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	76525565	rs4273108	A	G	7538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=69;PP=2965;SC=TGCAGCTTCAAGTGGATCTCC;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=154;TCR=69;TR=223;WE=76525573;WS=76525555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr17	76525805	rs4969212	C	G	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=113;PP=2965;SC=ATTTGTGTGGCCCCAGCCCCC;SOR=2.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=42;TCR=113;TR=155;WE=76525813;WS=76525795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	76525864	rs4597380	G	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=690;ReadPosRankSum=1.347;SC=GGGGACGACCGCGGTGAGGTC;SOR=0.950;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=32;WE=76525872;WS=76525854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr17	76526724	rs111543966	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=260;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGGGGCCAGGGTCAGCAAAG;SOR=0.536;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=16;WE=76526732;WS=76526714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr17	76528591	rs11868065	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=366;ReadPosRankSum=0.241;SC=CCAGGGTGGGCGGTGTCTTGG;SOR=0.638;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=22;WE=76528599;WS=76528581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr17	76528790	rs11651537	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=559;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CCTCATCTCTATGAGGTCTGT;SOR=0.996;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=36;WE=76528798;WS=76528780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr17	76528831	rs11077379	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=555;ReadPosRankSum=0.864;SC=GAAAGGGGCAGGGGAGAAGCA;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=34;WE=76528839;WS=76528821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr17	76533269	rs111781371	A	AAAAG	1596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=10.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.79;MQRankSum=3.766;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.064;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr17	76535759	rs7220871	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=580;ReadPosRankSum=-0.630;SC=CTAGAAACTATAGATTCTAAC;SOR=0.243;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=32;WE=76535767;WS=76535749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr17	76535948	rs7221209	T	C	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1457;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CTGCCCTGAATAGTTCTGCGT;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=54;TCR=100;TR=86;WE=76535956;WS=76535938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,99:0.57:175
chr17	76536048	rs7220203	C	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TCTGGACCGCCCGTCCATGTT;SOR=1.210;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=13;WE=76536056;WS=76536038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr17	76554114	rs62075923	A	G	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.255;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=32;PP=2065;ReadPosRankSum=-2.125;SC=ACATCTCTGAAACACACAAAC;SOR=1.082;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=216;TCF=143;TCR=73;TR=111;WE=76554122;WS=76554104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,140:0.55:253
chr17	76554147	rs4969171	A	G	5130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=65;PP=2716;ReadPosRankSum=0.161;SC=AAACCAAAACAATACAAAGCT;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=312;TCF=192;TCR=120;TR=179;WE=76554155;WS=76554137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,241:0.62:391
chr17	76556811	rs78321431	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=291;ReadPosRankSum=0.737;SC=GTCCCCACTCCTGGCACCCAC;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=76556819;WS=76556801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	76557862	rs894966	T	C	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=78;PP=2965;SC=CCAGGCTCCATTTGAGCTGCC;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=166;WE=76557870;WS=76557852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
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chr17	76803659	rs3744795	T	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=729;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CATTCCTGGATATGGGCACAC;SOR=0.806;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=49;WE=76803667;WS=76803649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,59:0.33:181
chr17	76817090	rs3744793	C	T	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1517;ReadPosRankSum=0.330;SC=TCCAGCGCGACGTCCAAGTAG;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=87;WE=76817098;WS=76817080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,105:0.56:187
chr17	76817858	rs8069830	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.877;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=0.851;SC=AGTGGCCAGGCGGGCCAAGAG;SOR=0.039;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=10;WE=76817866;WS=76817848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	76823312	.	T	G	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=69;QD=11.5301347275;SC=GGAGGGTGGGTGGGGAAGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=9;WE=76823320;WS=76823302;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,9:0.28:32
chr17	76832133	rs900349	T	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=233;SC=AATATTTAAGTCCATCCACTT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=76832141;WS=76832130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	76867185	rs55743137	G	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=1.008;SC=ACAACCTGTAGCTGGGGTACA;SOR=0.407;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=22;WE=76867193;WS=76867175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr17	76970879	rs3744166	A	G	6285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=105;PP=2965;SC=ACTGGACCTCATCCAGCATGA;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=90;TCR=105;TR=195;WE=76970887;WS=76970869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr17	77021967	.	CCAT	C	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=21;QD=36.0;SC=ATCATCATCACCATCATCATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=1;WE=77021977;WS=77021957;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,1:0.25:4
chr17	77039835	rs4789924	G	A	5175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.795;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=38;PP=1757;ReadPosRankSum=0.414;SC=ACGTGAGTGCGTCGTGAGTGC;SOR=0.367;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=176;TCF=122;TCR=54;TR=111;WE=77039843;WS=77039825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,128:0.64:199
chr17	77039852	rs4789854	G	A	5960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.775;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=50;PP=2227;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GTGCGTGTATGCATGCATGGG;SOR=0.364;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=224;TCF=152;TCR=72;TR=141;WE=77039860;WS=77039842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,169:0.66:257
chr17	77040185	rs4789853	G	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=596;ReadPosRankSum=1.575;SC=AGCTGCCGTCGCCTCCGGACC;SOR=1.218;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=31;WE=77040193;WS=77040175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr17	77071002	rs8076010	C	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=520;ReadPosRankSum=0.153;SC=CCTGCGATTGCCTCTCGGCGT;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=38;WE=77071010;WS=77070992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr17	77073647	rs62063817	T	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=787;ReadPosRankSum=-0.323;SC=GGTCAGCCCCTGCCCCCTCTC;SOR=0.483;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=49;WE=77073655;WS=77073637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr17	77073776	rs62063818	A	T	4297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=74;PP=2650;ReadPosRankSum=0.612;SC=CCACCAAACCAATCAGCTTTT;SOR=0.886;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=334;TCF=175;TCR=159;TR=163;WE=77073784;WS=77073766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,202:0.51:398
chr17	77073941	rs56353542	T	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=537;ReadPosRankSum=0.063;SC=GGTACCTGGATGACAGGTGAG;SOR=0.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=31;WE=77073949;WS=77073931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr17	77076302	rs62063824	G	A	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.439;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=29;PP=1672;ReadPosRankSum=-1.159;SC=CTTTCATCACGGAGTGGAATG;SOR=1.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=102;TCR=50;TR=94;WE=77076310;WS=77076292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,108:0.57:189
chr17	77076856	rs58975852	G	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.107;SC=GACTCCACTTGCGGGGCTGTG;SOR=3.248;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=4;WE=77076864;WS=77076846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr17	77076960	rs2889533	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr17	77076960	.	ATA	GTG	747	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12;NR=11;PP=747;QD=34.802951081;SC=CTCATGATAGATAGATCTGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=23;WE=77076970;WS=77076950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr17	77076962	rs2889532	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr17	77078109	rs1317421	A	G	5182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.857;SC=TGTTTGCTCGAGGGAACGTGG;SOR=0.922;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=383;TCF=221;TCR=162;TR=207;WE=77078117;WS=77078099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,228:0.52:435
chr17	77078451	rs3744189	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=489;ReadPosRankSum=0.509;SC=GTCCCAGCTGCGTTCCTTGAT;SOR=2.942;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=24;WE=77078459;WS=77078441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr17	77081222	rs4789984	C	T	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=18;PP=1438;ReadPosRankSum=-1.425;SC=AATCAGGCAGCCTTCTCTGGA;SOR=0.415;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=98;TCR=27;TR=77;WE=77081230;WS=77081212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,87:0.64:135
chr17	77083180	rs57241083	C	G	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=59;PP=1434;ReadPosRankSum=0.462;SC=GGAAGTGGCTCTGAGGCAGTC;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=50;TCR=102;TR=88;WE=77083188;WS=77083170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,98:0.54:180
chr17	77087005	rs112100897	C	CA	3163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.567;NF=15;NR=49;PP=2647;ReadPosRankSum=0.668;SC=TGCAGCTTCTCGGGGGAGGCA;SOR=0.574;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=64;WE=77087013;WS=77086995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,96:0.55:173
chr17	77088790	rs11286198	GA	G	782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.557;QD=15.97;ReadPosRankSum=2.287;SOR=0.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr17	77089515	rs4789891	G	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr17	77090361	rs111575648	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=0.023;SC=ACTGAGAGGGCGTGAGGGGCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=77090369;WS=77090351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	77090473	rs61042144	A	G	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=647;ReadPosRankSum=-1.626;SC=CAAGGGCCTCACCACCCATGC;SOR=0.792;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=43;WE=77090481;WS=77090463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr17	77093734	rs59021665	A	G	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=4;PP=978;ReadPosRankSum=-1.297;SC=GGGGCCAAGTAGCTGGTCTCA;SOR=0.918;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=65;TCR=9;TR=46;WE=77093742;WS=77093724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr17	77093768	rs58352742	T	C	3005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.844;NF=81;NR=26;PP=1912;ReadPosRankSum=1.615;SC=CCGCCCCAGCTTTTACCTGCA;SOR=0.607;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=141;TCR=44;TR=107;WE=77093776;WS=77093758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,132:0.59:224
chr17	77102966	rs36122090	T	TC	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=827;SC=GGCCAGATTCTCCCCACCCTT;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=20;WE=77102974;WS=77102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	77704912	rs8074547	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=326;ReadPosRankSum=-0.894;SC=ATGAGAGGCCTGGCCGTCCTC;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=27;WE=77704920;WS=77704902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr17	77705045	rs8074728	T	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.126;NF=31;NR=23;PP=765;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ACGACCAGGATGTGGACACCC;SOR=0.320;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=54;WE=77705053;WS=77705035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr17	77751983	rs71368052	C	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=2;PP=391;SC=GCGCGGCGGTCCGGGCGGGTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=77751991;WS=77751976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	77753296	rs8064780	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=1.200;SC=GTGCTGGGCGCTGCTCGCCTG;SOR=1.574;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=20;WE=77753304;WS=77753286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr17	77758484	rs3751956	G	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=747;ReadPosRankSum=0.149;SC=GTGAGAAGCTGGCTTCCAGAG;SOR=0.712;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=47;WE=77758492;WS=77758474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,63:0.37:172
chr17	77807917	.	T	TGCCGCC	3381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.622;ClippingRankSum=0.000;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=6.902;NF=5;NR=56;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.046;SC=TGGGTGCCGCTGCCGCCGCCA;SOR=1.023;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=185;TCF=34;TCR=151;TR=61;WE=77807925;WS=77807907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,95:0.43:223
chr17	77809591	.	GC	G	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=-0.458;QD=1.98;ReadPosRankSum=3.383;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,21:0.19:112
chr17	77926491	rs4889804	G	A	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=74;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TGTGGCCCAGGTCCACGCGGA;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=82;TCR=127;TR=122;WE=77926499;WS=77926481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,138:0.56:246
chr17	78013724	rs2289527	G	C	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=76;PP=2884;SC=AGGGGGAGGTGGAGACAGAAG;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=159;WE=78013732;WS=78013714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	78020941	rs76104475	GGC	TTT	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=626;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CCACGTGCCCGGCCAGGTTTT;SOR=0.420;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=10;WE=78020951;WS=78020931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr17	78039867	rs8082554	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=924;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GGGATGGATGCGTGGCTCAGG;SOR=0.727;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=92;TCR=88;TR=65;WE=78039875;WS=78039857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,75:0.36:208
chr17	78055758	rs35578653	T	G	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AGACGGATGCTGCCATCCGGG;SOR=1.100;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=75;WE=78055766;WS=78055748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,83:0.44:190
chr17	78058432	rs715041	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=394;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CTGTGCGTTTGGAATATCTCC;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=21;WE=78058440;WS=78058422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr17	78061317	rs11150839	A	C	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=849;SC=GAGAGACAAAACCTGGCTCAC;SOR=3.086;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=78061325;WS=78061307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	78061353	rs11150840	G	A	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=12;PP=1448;SC=GCCTGCGGGCGAGGACCCGTA;SOR=2.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=78061361;WS=78061343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	78061979	rs12942049	A	C	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=862;ReadPosRankSum=0.122;SC=AAGACCATGTAGGAGGCCAGG;SOR=0.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=72;TCR=127;TR=77;WE=78061987;WS=78061969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,87:0.39:224
chr17	78063635	rs118143944	C	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=750;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ATTCCGAGATCGGCCAGACGG;SOR=0.446;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=149;TCF=53;TCR=96;TR=51;WE=78063643;WS=78063625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,55:0.35:157
chr17	78063957	rs7210658	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-3.973;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.148;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,41:0.17:239
chr17	78063964	rs7210664	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-3.010;QD=4.09;ReadPosRankSum=2.612;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,37:0.16:232
chr17	78063966	rs7210665	A	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-2.375;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.544;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,37:0.16:234
chr17	78063996	rs7210679	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-1.860;QD=3.70;ReadPosRankSum=-3.925;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,29:0.15:188
chr17	78064015	rs4889953	G	C	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.515;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.665;NF=68;NR=61;PP=2624;ReadPosRankSum=-1.710;SC=CGTGCACGAAGAACACGGGAC;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=129;WE=78064023;WS=78064005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,64:0.96:67
chr17	78064145	.	A	ACAC	2924	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=23;MQ=44.69;NF=34;NR=79;PP=2924;QD=20;SC=TGCACGAACAAGGGACGCGCG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=37;TCR=81;TR=113;WE=78064153;WS=78064135;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,113:0.96:118
chr17	78064185	.	CAGCACGTGCATGAACAACACAGGACACACACAGCACGTGCATGAACAACACAGGACACACACA	C	326.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.241;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.408;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr17	78064216	.	CAGCACGTGCATGAACAACACAGGACACACACA	C	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=0.454;QD=24.28;ReadPosRankSum=3.465;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr17	78064247	.	CA	C	1599	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=55.2;NF=5;NR=48;PP=1599;QD=30.6603773585;SC=AGGACACACACAAGCACGTGC;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=53;WE=78064255;WS=78064237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,53:0.87:61
chr17	78069324	rs1561810	C	A	3351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=96;PP=2303;ReadPosRankSum=-0.454;SC=AGGAAGGCGTCTTGCTGGGTC;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=72;TCR=178;TR=135;WE=78069332;WS=78069314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,149:0.54:278
chr17	78069367	rs12601244	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=47;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CAGTGGGGGCGTGCTCAGCAC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=125;TCF=29;TCR=96;TR=59;WE=78069375;WS=78069357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr17	78071052	rs12952612	T	C	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=59;PP=2965;SC=AGGCCACCGATGAGTGCACCA;SOR=1.313;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=104;TCR=59;TR=163;WE=78071060;WS=78071042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr17	78071247	rs59252872	A	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=56;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GCCATGGAACATGCCACTCAC;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=25;TCR=81;TR=72;WE=78071255;WS=78071237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,80:0.68:117
chr17	78073201	rs55990144	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CCTTCACGCCGTCCCTTTTCA;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=78073209;WS=78073191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr17	78073355	rs56407805	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.204;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=942;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CCCTGCAGACACGCCTTAAGC;SOR=0.257;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=50;WE=78073363;WS=78073345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr17	78073562	rs2304854	A	G	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=60;PP=1586;ReadPosRankSum=0.797;SC=TCGAGTCACCAGGGCCCTCCT;SOR=0.636;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=188;TCF=80;TCR=108;TR=107;WE=78073570;WS=78073552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,128:0.58:221
chr17	78073589	rs2304853	T	C	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=56;PP=1345;ReadPosRankSum=-1.543;SC=CAGCCTGGACTCCGCCTTGCA;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=44;TCR=101;TR=80;WE=78073597;WS=78073579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,99:0.59:168
chr17	78078709	rs1800300	T	C	8112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=1.699;SC=CCCGCGGCTGTTGCTACATCC;SOR=0.311;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=137;TCR=110;TR=246;WE=78078717;WS=78078699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,285:1.00:286
chr17	78079481	rs8069491	C	G	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=27;PP=1846;SC=CTGTCCTTGGCGTGCGGGTTG;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=87;WE=78079489;WS=78079471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	78079509	rs12452721	T	G	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=45;PP=2217;SC=GAGAGTAAGGTGGCTGTGGGG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=68;TCR=45;TR=113;WE=78079517;WS=78079499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	78079544	rs3816256	C	G	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=68;PP=2965;SC=CCCATCTCTTCTAGATCAAAG;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=148;WE=78079552;WS=78079534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	78079597	rs1042393	A	G	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=83;PP=2710;SC=GAGACCCCGCATGTCCACAGC;SOR=0.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=148;WE=78079605;WS=78079587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	78079669	rs1042395	G	A	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=49;PP=1372;SC=GTGATCGTGCGCCGGCAGCTG;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=78079677;WS=78079659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	78081526	rs3071247	A	AGCAGCGG	8480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=106;PP=2980;SC=CCCACGGTACAGCGGCGGGCG;SOR=1.366;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=23;TCR=111;TR=127;WE=78081534;WS=78081516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	78081551	rs2304845	T	C	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=76;PP=2621;SC=GCGGGGGCACTGAGCTGGGGA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=78081559;WS=78081541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	78081707	rs2252455	G	A	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=62;PP=2141;SC=TAAGCTGCCCGCCGCCCAGCG;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=78081715;WS=78081697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	78081982	rs2241888	G	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=13;PP=1192;SC=TGAGCTCCTCGTGGGGAGAGA;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=78081990;WS=78081972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	78082005	rs2241887	C	T	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=24;PP=1669;SC=CTCAACTCTCCGCCTGTGATT;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=78082013;WS=78081995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	78082504	rs1800304	G	A	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=72;PP=2965;SC=AGGACGTCCAGTGGAACGACC;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=88;TCR=72;TR=160;WE=78082512;WS=78082494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	78083565	rs2278620	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.347;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr17	78083726	rs2278619	A	G	7172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=104;PP=2965;SC=TCACCTTGACAGGTTTCCCTC;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=123;TCR=104;TR=227;WE=78083734;WS=78083716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr17	78084507	rs2304844	G	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=949;SC=TCTCCCCACTGCAGCCTCTCG;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=78084515;WS=78084497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	78084688	rs2304843	C	A	7291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=114;PP=2965;SC=GGGGACTACCCCACCCTCCTC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=226;WE=78084696;WS=78084678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr17	78084769	rs1042396	G	A	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.870;SC=ACTTCATCAGGGGCTCTGAGG;SOR=0.678;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=64;TCR=108;TR=64;WE=78084777;WS=78084759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,80:0.41:197
chr17	78084940	rs199788201	GC	G	293.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	78084942	rs4889817	G	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.168;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-1.259;SC=GGAAAGGGGCGGGGGGGGGAT;SOR=0.751;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=4;WE=78084950;WS=78084930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr17	78086003	rs2304839	C	G	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=52;PP=1309;ReadPosRankSum=1.806;SC=GAGGCCCAGACCACCCGGGGC;SOR=1.002;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=11;TCR=98;TR=57;WE=78086011;WS=78085993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr17	78086043	rs2304838	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=192;ReadPosRankSum=2.267;SC=TCTCCCCACCCGCTGCCTGCA;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=13;WE=78086051;WS=78086033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr17	78086531	rs2304837	G	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=954;ReadPosRankSum=1.202;SC=ACCAGGAGGGGCTGCTCAGCA;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=51;WE=78086539;WS=78086521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr17	78086846	rs2304836	A	G	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=99;PP=2847;SC=GGGTGGCGGCATGGCAGGTGG;SOR=1.385;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=53;TCR=99;TR=152;WE=78086854;WS=78086836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	78087041	rs1800309	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=772;ReadPosRankSum=0.587;SC=CAGCTTCAGCGAGCCGGCCCA;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=55;WE=78087049;WS=78087031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,78:0.50:157
chr17	78087109	rs1800310	A	G	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1158;ReadPosRankSum=-1.266;SC=ACCTCTACACACTGTTCCACC;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=75;WE=78087117;WS=78087099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,112:0.57:197
chr17	78087260	rs72850840	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-1.262;SC=GCTGTGTTCCCCAGGACCCAG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=78087268;WS=78087250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	78090928	rs2304832	G	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.81;SOR=2.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	78090928	.	GCCCT	ACCCC,ACCCT	460	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11,12;NR=22,45;PP=460,295;QD=15.5596325716;SC=GGGACCCTAAGCCCTGGGGAG;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=33,57;WE=78090940;WS=78090918;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.58:57
chr17	78090932	rs2304831	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=16.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr17	78091405	rs1126690	G	A	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1779;ReadPosRankSum=1.262;SC=CCAGGTGCCAGTAGAGGCCCT;SOR=0.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=98;WE=78091413;WS=78091384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,117:0.98:119
chr17	78092063	rs1042397	G	A	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=668;ReadPosRankSum=0.766;SC=CCAAGGGTGGGGAGGCCCGAG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=50;WE=78092071;WS=78092053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,62:0.41:151
chr17	78111449	rs2289535	A	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.972;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=265;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ACTGGATGTAAAAACTTTTTC;SOR=0.100;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=14;WE=78111457;WS=78111439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr17	78111877	rs2361710	T	C	4075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=52;PP=2335;SC=TCTTGATTTATGTCATTCAGA;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=134;WE=78111885;WS=78111867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	78113832	rs2241886	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=688;ReadPosRankSum=2.092;SC=GAGTGCCCGCGACAACATGCT;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=51;WE=78113840;WS=78113822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,57:0.40:144
chr17	78114991	rs8082247	T	C	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=13;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TGGCAAAATGTTAATCAGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=105;TCR=23;TR=71;WE=78115004;WS=78114981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,73:0.54:135
chr17	78114996	rs12949569	C	T	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=10;PP=2435;ReadPosRankSum=0.073;SC=AAATGTTAATCAGGAAGAAAA;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=111;TCR=23;TR=61;WE=78115004;WS=78114981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr17	78115484	rs935117	A	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=380;ReadPosRankSum=0.427;SC=CATACTAGAAAATTTTAAATT;SOR=1.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=20;WE=78115492;WS=78115474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr17	78155182	rs9906472	A	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=429;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GGTCCTGCTTACCTGACAACT;SOR=0.078;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=23;WE=78155190;WS=78155172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr17	78157592	rs11656949	C	T	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=1.481;SC=CATGCTCACCCGCCCACATGC;SOR=0.223;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=7;WE=78157600;WS=78157582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	78157995	rs4889990	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=704;ReadPosRankSum=1.082;SC=CGCTGCAGGAGAAGGAGCTGG;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=47;WE=78158003;WS=78157985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr17	78158063	rs4889991	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=857;SC=GCACCCCGGCGCGACCCTGCT;SOR=3.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=78158071;WS=78158053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	78162170	rs28674001	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1331;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CCTCCCCACCGCACAGCTGTA;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=85;WE=78162178;WS=78162160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,103:0.58:177
chr17	78164427	rs12942414	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.64;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	78171944	rs2066964	G	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=0.663;SC=CCCCTGGAAGGCTTGATGTCT;SOR=0.870;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=36;WE=78171952;WS=78171934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,38:0.26:144
chr17	78175483	rs2304856	T	C	6106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=65;PP=2965;SC=GCGCCTTCTGTCTTCTGGCTG;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=120;TCR=65;TR=185;WE=78175491;WS=78175473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	78175854	rs3813063	C	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=894;SC=CCCACTGACTCCAGTGCCAGA;SOR=2.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=78175862;WS=78175844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	78176233	rs8069255	T	A	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=42;PP=1305;SC=AGCAGCTGCCTCGAGCTCGGT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=78176241;WS=78176223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	78178170	rs4889996	A	G	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=39;PP=1165;SC=CACAGGGGCCACTGGCTCCAA;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=78178197;WS=78178160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	78178182	rs4889836	T	C	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.28;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	78178189	rs4889997	G	A	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	78178830	rs11653893	A	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=643;SC=CCTCTCCTCCACAGGCTCCAG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=78178838;WS=78178820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	78178893	rs11652075	C	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=25;PP=1355;SC=TACCCTGGTGCGGCCCCATCG;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=78178901;WS=78178883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr17	78188963	rs4889839	G	A	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=104;PP=2965;SC=CATGAGGTCCGGGGCCCCCGG;SOR=1.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=63;TCR=104;TR=166;WE=78188971;WS=78188953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	78189009	rs4889840	C	T	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=65;PP=1782;SC=TGTTCTCCCACGGCCCTCCCA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=87;WE=78189017;WS=78188999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	78210944	rs8070283	G	A	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=29;PP=884;SC=CTGAGGCTGCGGTGGCCCCTG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=78210952;WS=78210934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	78215441	rs12943906	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=853;ReadPosRankSum=-1.145;SC=AATATTTTAGATGTGTATTCT;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=37;WE=78215449;WS=78215431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr17	78215566	rs12942462	T	G	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=71;PP=1967;ReadPosRankSum=-1.822;SC=TTGGTTCCCTTTAGCATCTCA;SOR=0.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=225;TCF=104;TCR=121;TR=128;WE=78215574;WS=78215556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,141:0.54:262
chr17	78219065	rs7406843	C	A	6146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=96;PP=2965;SC=GGTGAGTGACCTGTCCGCCTC;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=90;TCR=96;TR=186;WE=78219073;WS=78219055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr17	78219100	rs7406844	C	T	5559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=103;PP=2965;SC=GTTGGACGCCCTAACGTTGTT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=71;TCR=103;TR=174;WE=78219108;WS=78219090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	78219908	rs34818744	T	C	5726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=0.336;SC=GAGGTCTCCCTTTTCCCGGCC;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=349;TCF=187;TCR=162;TR=204;WE=78219916;WS=78219898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,264:0.58:455
chr17	78220106	rs146947468	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=123;ReadPosRankSum=-0.556;SC=ATGGGCCGTGCGCCCCGGGAC;SOR=0.929;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=11;WE=78220114;WS=78220096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr17	78221850	rs12941437	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=1.258;SC=GGGGGCAGAAAGCTGTCCCGC;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=78221858;WS=78221845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	78222280	rs7209848	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=12;PP=498;SC=CCTGCAGCACACTAGGTTGGG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=78222288;WS=78222270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	78222565	rs7214131	A	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=41;PP=1565;SC=CCCTGTCCCCAACGCTCTCCA;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=78222573;WS=78222555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	78222638	rs34911974	GC	G	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=373;ReadPosRankSum=1.754;SC=TCAGCCAGTGGCTGCTGCAGC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=11;WE=78222646;WS=78222628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr17	78222661	rs9904116	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=601;SC=GGGTGGTGGCCCCCCACATAT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=78222669;WS=78222651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	78223103	rs8064518	C	A	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=37;PP=1081;SC=GTGCACTGGGCTGCCTTAGGG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=78223111;WS=78223093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	78225055	rs8078855	G	T	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.341;SC=TGAGATGGCAGGTCTACCAGG;SOR=0.531;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=91;TCR=48;TR=95;WE=78225063;WS=78225045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,111:0.69:162
chr17	78298938	rs6565674	A	G	4769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=91;PP=2965;SC=GGACAACTTCAATGACATTTT;SOR=1.433;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=134;WE=78298946;WS=78298928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	78302157	rs8082521	C	A	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1088;ReadPosRankSum=-2.070;SC=CCAGGATGAACAATGTGCTGT;SOR=0.650;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=218;TCF=118;TCR=100;TR=78;WE=78302165;WS=78302147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,92:0.33:276
chr17	78305871	rs10782008	G	A	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1087;ReadPosRankSum=0.371;SC=AAATGACACCGTGACAGTGAG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=74;WE=78305879;WS=78305861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,94:0.46:204
chr17	78306102	rs9913636	G	C	3178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=48;PP=2234;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CCTTGAGCTTGAAGAGGTGTA;SOR=0.791;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=331;TCF=201;TCR=130;TR=128;WE=78306110;WS=78306092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,150:0.37:402
chr17	78306280	rs8074015	A	G	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1317;ReadPosRankSum=2.237;SC=GACCACCAGGACCAAAGAGAT;SOR=0.510;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=240;TCF=85;TCR=155;TR=85;WE=78306288;WS=78306270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,93:0.32:287
chr17	78306308	rs9908287	C	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.673;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AGGACCGAGTCGAACAGATCA;SOR=0.472;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=175;TCF=51;TCR=124;TR=68;WE=78306316;WS=78306298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,72:0.37:195
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chr17	78311508	rs4890009	G	A	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.735;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1494;ReadPosRankSum=1.257;SC=TGATCCAGGCGCCCAAAGGTG;SOR=0.456;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=241;TCF=144;TCR=97;TR=100;WE=78311516;WS=78311498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,112:0.40:277
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chr17	78333840	rs8067292	T	C	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=923;ReadPosRankSum=0.182;SC=CCTCTTCTTATCATCCCTCAC;SOR=0.797;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=62;WE=78333848;WS=78333830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,66:0.39:169
chr17	78348494	rs6565681	A	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=363;ReadPosRankSum=0.067;SC=CCACTGATGCAGCCCATCACG;SOR=0.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=22;WE=78348502;WS=78348484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr17	78354661	rs4889848	C	T	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=44;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.160;SC=AGACCGGCCACGTGCTGGGCA;SOR=0.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=234;TCF=132;TCR=102;TR=102;WE=78354669;WS=78354651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,124:0.43:289
chr17	78362300	rs6565683	A	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=353;ReadPosRankSum=1.082;SC=AGGGATACACAGGGCAGCGCG;SOR=1.062;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=22;WE=78362308;WS=78362290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
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chr17	78396091	rs9907097	C	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=551;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGGGGAAGAGCGGGGGGAGAG;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=31;WE=78396099;WS=78396081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr17	78401588	rs8065290	G	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=620;ReadPosRankSum=-0.547;SC=CAGGCGCTGCGGCGCTCCTGG;SOR=1.211;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=19;TCR=81;TR=38;WE=78401596;WS=78401578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr17	78404175	rs113730607	ATTTG	A	1345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.638;NF=3;NR=21;PP=949;ReadPosRankSum=-1.466;SC=TATTTCACATATTTGTTTGTT;SOR=0.447;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=76;TCF=7;TCR=69;TR=24;WE=78404186;WS=78404165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr17	78444658	rs12943620	T	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=868;ReadPosRankSum=-1.896;SC=TGGTGGCCCCTCCGTAGATCT;SOR=0.982;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=56;WE=78444666;WS=78444648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr17	78444679	rs28364735	T	C	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1293;ReadPosRankSum=-2.372;SC=CGATGTGGGATTCAGCCCAGG;SOR=1.072;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=74;WE=78444687;WS=78444669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,89:0.55:161
chr17	78445702	rs1131609	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=927;ReadPosRankSum=-1.881;SC=ACAAAAGGCAACTTGGCCACC;SOR=0.603;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=59;WE=78445710;WS=78445692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,80:0.60:134
chr17	78449948	rs144443274	C	T	7161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=142;PP=2962;ReadPosRankSum=1.913;SC=CCGGGCCTCGCCGGCTCCGGG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=453;TCF=213;TCR=240;TR=270;WE=78449956;WS=78449938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,308:0.61:504
chr17	78519519	rs61750765	T	C	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=964;ReadPosRankSum=1.536;SC=CTTTGGCTTTTATGAAAAAGA;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=55;WE=78519527;WS=78519509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr17	78599655	rs901065	G	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-0.225;SC=GCCTGGGCGGGGCTCGCCAAG;SOR=0.042;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=78599663;WS=78599645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	78617439	rs6565469	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=896;SC=CTTTGAAGTGTGTTATATAAG;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=78617447;WS=78617429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	78681520	rs9900445	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=312;ReadPosRankSum=1.157;SC=GGAGAAACTCAGAGCCATGTG;SOR=0.957;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=23;WE=78681528;WS=78681510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
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chr17	78765219	rs4969429	A	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=548;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TGTTCCATTCATGCCGTTCAC;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=83;TCR=40;TR=44;WE=78765227;WS=78765209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,48:0.36:134
chr17	78795868	rs9911574	A	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=5;PP=640;ReadPosRankSum=0.328;SC=GCCGTGCGCCAAGCTTCTGCT;SOR=0.431;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=110;TCF=100;TCR=10;TR=44;WE=78795876;WS=78795858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr17	78820212	rs3829572	G	A	5203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=48;PP=2965;SC=GGCAGGGGTGGGCAAGACCAG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=112;TCR=48;TR=160;WE=78820220;WS=78820202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	78820329	rs3751945	C	T	8270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=146;PP=2965;SC=TCACCATGGGCGTGGAGAACC;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=115;TCR=146;TR=261;WE=78820337;WS=78820319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr17	78829375	rs12943041	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=312;ReadPosRankSum=0.232;SC=TAACCTGGGGGCTGAGGGAGG;SOR=0.586;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=20;WE=78829383;WS=78829365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr17	78896529	rs2271603	C	T	13903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=234;PP=2965;SC=CCTAGGCCACCGTGAACGCCC;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=399;TCF=164;TCR=235;TR=398;WE=78896537;WS=78896519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,518:1.00:518
chr17	78897547	rs7217786	C	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=61;PP=1840;SC=ATGGCCTCAGCCTCAGGCTGC;SOR=3.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=78897569;WS=78897537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	78897561	rs6565491	C	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=45;PP=1296;SC=AGGCTGCTCACATCACCATGG;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=78897569;WS=78897537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	78921117	rs4969231	C	T	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=69;PP=2182;SC=AGTATCTGAACGGCCAGGACT;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=78921125;WS=78921107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	78968524	rs56236825	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=283;ReadPosRankSum=2.187;SC=GGCACCCTGTCGGCTGGGGTG;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=19;WE=78968532;WS=78968514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr17	78972326	rs10871491	A	G	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=943;SC=GGCCGTGGGCAAGCCCTGCTG;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=78972334;WS=78972316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	79004893	rs11548824	G	A	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1302;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TGAAGAACACGGGAGCCCATC;SOR=0.812;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=219;TCF=105;TCR=114;TR=87;WE=79004901;WS=79004883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,111:0.40:280
chr17	79006850	rs11870986	T	C	3262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=71;PP=2057;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GCAGGCCAGCTCAGGAAGTAA;SOR=0.747;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=322;TCF=155;TCR=167;TR=133;WE=79006858;WS=79006840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,160:0.43:375
chr17	79007075	rs11150764	C	A	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=58;PP=1809;SC=TTCCTCCAGGCGAGCAGAGCT;SOR=1.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=79007083;WS=79007065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	79009153	rs8073224	T	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=50;PP=1182;SC=CGTGTGCGCCTGGGTCGCGCG;SOR=2.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=61;WE=79009161;WS=79009143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	79010533	rs4969350	G	A	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=34;PP=2644;SC=GGGGTTGTTAGGTTTGGTTTC;SOR=1.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=91;TCR=34;TR=125;WE=79010541;WS=79010523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	79010839	rs6565527	A	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=343;SC=ACCGGGCAGTAGGCCTTCACC;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=79010847;WS=79010829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	79027318	rs148048870	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=195;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CATGGCTGGGATTTGAACTTG;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=79027326;WS=79027312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr17	79031825	rs9898347	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=1.269;SC=GGCAGCTCTGGGGCCCTGTCC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=79031833;WS=79031815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr17	79077957	rs34057293	T	C	4310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=94;PP=2921;SC=ACGTGCCTCCTCAGACCCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=44;TCR=94;TR=138;WE=79077965;WS=79077947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr17	79077980	rs57792378	A	C	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=82;PP=2447;SC=TCATGCCACAACCCTCAATAG;SOR=2.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=20;TCR=82;TR=102;WE=79077988;WS=79077970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	79078610	rs72854146	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=32;PP=936;SC=TTGTGTTTAGAGTGGCTGTGC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=79078618;WS=79078600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	79082081	rs7502590	A	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=17;PP=1377;SC=TTGGGCAGTCATTACTTTACC;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=79082089;WS=79082071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	79084574	rs56084168	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=945;SC=CAGGGAGAGCCAGAGCCCCAG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=79084582;WS=79084564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	79089428	rs12450670	A	C	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=9;PP=1410;SC=AAAGCAGCGTATATTGTCTGT;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=79089436;WS=79089418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	79089590	rs4969391	A	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=76;PP=2485;SC=GCCCACGTCCAGCTGAAGCCG;SOR=0.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=130;WE=79089598;WS=79089580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	79095629	rs7503604	C	A	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=76;PP=2965;SC=TCAGCGTGGCCGCCCGCAGAG;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=156;WE=79095637;WS=79095619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	79098838	rs141491493	GGCAGGGTGA	G	1036.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=15;PP=2527;SC=CAGGGGCAGGGGCAGGGTGAG;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=79098854;WS=79098828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	79099588	rs4969252	T	C	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=94;SC=TACAGGGCCATGTGTCCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=79099596;WS=79099578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	79102193	rs66762502	TAGG	T	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=451;SC=GGGTGGCTCCTAGGAGGAGCA;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=10;WE=79102203;WS=79102183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	79105834	rs74002050	T	C	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=40;PP=1445;SC=AGGCTGCTATTTTGAAATGTA;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=79105842;WS=79105824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	79105850	rs4969253	T	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=35;PP=965;SC=ATGTAGAGGCTGCACCTGTAT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=79105858;WS=79105840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	79108081	rs112566905	A	G	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=25;PP=1802;SC=TGATGGCCCCAGGAAGGAGGG;SOR=1.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=88;WE=79108089;WS=79108071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	79108141	rs4969397	A	G	6368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=71;PP=2965;SC=GGATCCCACGACAGCTCCCGC;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=110;TCR=72;TR=180;WE=79108149;WS=79108131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	79108318	rs11658145	T	C	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=59;PP=1462;SC=GAGAGCAGTGTGGTGAGAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=77;WE=79108326;WS=79108308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	79139473	rs2659034	C	G	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=91;PP=2965;SC=CCCTCCGTGCCCCAGTTACCT;SOR=1.063;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=62;TCR=91;TR=153;WE=79139481;WS=79139463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	79140505	rs12946891	C	G	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=11;PP=1076;SC=GCCGCCCCCCCACCCCATGCC;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=79140513;WS=79140495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	79155116	rs906180	A	G	7680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=141;PP=2965;SC=TGCTGCCCACAGACATGAGAC;SOR=1.260;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=81;TCR=141;TR=222;WE=79155124;WS=79155106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr17	79163649	rs2292182	G	A	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=29;PP=1493;SC=GCAGCCTGCAGCACACCCACA;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=85;WE=79163657;WS=79163639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	79165171	rs869370	G	A	6893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=155;PP=2965;SC=GTTGCCACCCGGAGCCGGCCC;SOR=1.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=61;TCR=155;TR=216;WE=79165179;WS=79165161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr17	79171805	rs7225364	C	A	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=540;SC=TGACTAAAGCCAGGAGGAGCC;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=79171813;WS=79171795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	79171967	rs2659016	A	G	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=28;PP=1377;SC=GCGGGGCAGCACGTCCGGCTC;SOR=1.207;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=72;WE=79171975;WS=79171957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	79173184	rs2659015	T	C	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=18;PP=1664;SC=CTCTCACCAGTATTGTTGGCC;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=77;WE=79173192;WS=79173174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	79173224	rs2725419	T	C	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=57;PP=2346;SC=TGCCGCCTGGTGTGGGGGACA;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=135;WE=79173232;WS=79173214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	79173398	rs906176	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=33;SC=GGACGACCCCAGGCTCCACAG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=79173406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	79173462	rs906175	C	T	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=17;PP=1071;SC=CAGCAGCAGCCCCGCACGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=46;WE=79173470;WS=79173452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	79173989	.	C	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=425;ReadPosRankSum=0.856;SC=GACCCAGGGTCAAGAAGGATG;SOR=0.409;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=27;WE=79173997;WS=79173979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr17	79174221	rs2466773	T	C	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=49;PP=1393;SC=ATGGTGACAGTGGCCTGGTTC;SOR=1.218;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=79174229;WS=79174211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	79180775	rs2256881	A	G	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=21;PP=2510;SC=TCCCATACAGACAGGTGGATG;SOR=2.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=97;WE=79180783;WS=79180765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	79182667	rs9896314	A	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=11;PP=1141;SC=GGAGCAGGCCAGGGTGGGGCA;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=79182675;WS=79182657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	79182778	rs62075318	T	C	5825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=94;NR=74;PP=2965;SC=TGTTGGATCTTCTAAGGTTGT;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=168;WE=79182786;WS=79182768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr17	79202956	rs2048057	T	C	5927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=125;PP=2965;SC=CCGTGCCCCCTGGGATCCGTT;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=61;TCR=125;TR=186;WE=79202964;WS=79202946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr17	79213305	rs2659009	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=7;PP=465;SC=CGGGGAGGTGGCTGGGAGGGA;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=79213313;WS=79213295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	79213562	rs2255166	T	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=37;PP=1074;SC=TGCTTTCCCGTTGGTTCAAGG;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=79213570;WS=79213552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	79219500	rs10569617	AATG	A	7143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=69;PP=2969;SC=GGTTAAGGCCAATGATGACCC;SOR=0.863;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=100;WE=79219510;WS=79219490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	79220224	rs2725405	G	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=50;PP=1699;SC=TCTCAGCTTGGCCTGGGCTGC;SOR=1.059;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=84;WE=79220232;WS=79220214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	79288124	rs9891595	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=1.348;SC=ATTTCCCTCCCCTGCCCTCCC;SOR=0.769;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=38;WE=79288132;WS=79288114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr17	79288337	rs78567895	C	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=1.359;SC=TGTACCCCCCCCAAGGTGACC;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=11;WE=79288345;WS=79288327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr17	79372952	rs146560663	T	TGC	2671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=24;NR=18;PP=1785;SC=TGTGTGTGTGTGCGAGTGTGC;SOR=1.508;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=42;WE=79372960;WS=79372942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,71:0.95:75
chr17	79381241	.	CCT	C	1870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.831;NF=1;NR=30;PP=1285;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GCTTTCTTCCCCTGAGACTTC;SOR=0.908;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=31;WE=79381250;WS=79381231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr17	79385306	rs146875944	GCCTGCCTGCCTTCCTTCCTT	G	328.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.457;NF=8;NR=10;PP=1472;ReadPosRankSum=1.969;SC=CTGCCTGCCTGCCTGCCTGCC;SOR=0.399;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=18;WE=79385333;WS=79385296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr17	79385318	rs4998275	T	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.631;NF=8;NR=4;PP=850;ReadPosRankSum=-2.442;SC=CTGCCTGCCTTCCTTCCTTCC;SOR=0.723;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=12;WE=79385333;WS=79385296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr17	79386952	rs730209	A	G	2884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=72;PP=1884;ReadPosRankSum=-0.197;SC=ACGCTCCCCAACCCCAGAGTG;SOR=0.641;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=163;TCF=53;TCR=110;TR=109;WE=79386960;WS=79386942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,123:0.65:190
chr17	79389251	rs9897258	C	T	6616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=128;NR=85;PP=2965;SC=GTAACGCGAGCGCGAGGCCCC;SOR=1.102;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=128;TCR=86;TR=213;WE=79389259;WS=79389241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr17	79389486	rs11870740	G	A	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=797;SC=CCCCTCGGTGGGAGGTGGAGC;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=79389494;WS=79389476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	79390260	rs151241907	G	GGTGT	695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.128;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr17	79390269	.	G	GTGTT	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-1.971;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr17	79390277	.	G	A	393	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=55;MMLQ=26;MQ=57.37;NF=29;NR=4;PP=393;QD=12.9627640166;SC=GTGTGTGTGTGTGTCCATGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=33;WE=79390285;WS=79390250;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:63,33:0.34:96
chr17	79390298	.	T	TGCGTGTGCGCGTGTGTGTCCATGAAAATGGGTGTGTGCATGTGTATGTCCATGAGGATGGGTGTGTGC,TGC	4756.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=50;PP=2971;SC=GATGGGTGTGTGCATGTGTGC;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=87;WE=79390314;WS=79390288;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:50
chr17	79390370	rs36169187	CGT	C	6942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=71;PP=2985;SC=GGTGTATGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=103;WE=79390379;WS=79390360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr17	79395814	rs34098647	A	AT	1496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.814;NF=11;NR=27;PP=683;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TCCTCTCGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=38;WE=79395822;WS=79395804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,64:0.94:68
chr17	79402514	rs12600846	C	T	3095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=1796;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TCTGGCGGTTCGCTTAGCCCA;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=90;TCR=79;TR=112;WE=79402522;WS=79402504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,136:0.68:200
chr17	79402603	rs77984483	C	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=654;ReadPosRankSum=0.773;SC=TCTGGAGCCCCGACGTTCTAG;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=39;TCR=81;TR=41;WE=79402611;WS=79402593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,47:0.31:150
chr17	79409309	rs12938890	A	G	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=70;PP=2396;SC=GCGGCCTGGCACGGGGGTGGT;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=127;WE=79409317;WS=79409299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	79409434	rs12939225	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.181;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACGCCGGGCCACCCCCGCCCC;SOR=1.212;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=14;WE=79409442;WS=79409424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr17	79410811	rs113391801	G	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=928;ReadPosRankSum=0.195;SC=ACCCTCTCCCGTCTGCTGTCT;SOR=0.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=71;WE=79410819;WS=79410801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr17	79411662	rs11655860	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=508;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CCGAGAGTGCGAGGCCTGACC;SOR=0.883;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=42;WE=79411670;WS=79411652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,50:0.42:118
chr17	79412465	rs116255905	C	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,46:0.37:126
chr17	79414307	rs7213444	A	G	4047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=70;PP=2571;SC=CCCCTACCCTACCGAGCGGGG;SOR=1.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=108;WE=79414315;WS=79414297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	79414634	rs61745233	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=989;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GGACTGTGGCGGAGCTCCCGA;SOR=1.195;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=66;WE=79414642;WS=79414624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,71:0.39:181
chr17	79414804	rs61739649	T	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=774;ReadPosRankSum=1.726;SC=CAGGGATTCATGGGATCGCTC;SOR=0.925;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=195;TCF=80;TCR=115;TR=61;WE=79414812;WS=79414794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,78:0.32:240
chr17	79414914	rs10871497	A	G	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=40;PP=1161;SC=GAGTCCCAGCAGTGGGACCCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=79414922;WS=79414904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	79418260	rs6565571	A	G	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=79;PP=2518;SC=GCTTCCGTGCACGAGGCCTCA;SOR=1.255;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=124;WE=79418268;WS=79418250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	79418770	rs61746096	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=735;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TGGTGGAGGCCGCTGGCCTGG;SOR=0.636;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=43;WE=79418778;WS=79418760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr17	79418983	rs34593866	G	GC	1013.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.294;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=502;ReadPosRankSum=-0.233;SC=AGGCCCCTGTGCCCCCCCCAC;SOR=0.345;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=27;WE=79418991;WS=79418973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr17	79424516	rs12601317	A	G	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=55;PP=1969;SC=GCTGCTGCACACCGGGGCCAG;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=79424524;WS=79424506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
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chr17	79478019	rs1139405	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=371;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CAATGCCCGGGTACATGGTGG;SOR=1.017;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=23;WE=79478027;WS=79478009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr17	79478916	rs9910792	G	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=575;ReadPosRankSum=0.418;SC=CACGGGCGTCGGCCGAGCCTC;SOR=1.068;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=38;WE=79478924;WS=79478906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,46:0.37:123
chr17	79479469	rs8064532	A	C	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=55;PP=1351;ReadPosRankSum=0.497;SC=TCCCGCGGGGAAGCCTCGGCC;SOR=0.518;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=176;TCF=50;TCR=126;TR=80;WE=79479477;WS=79479459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,84:0.45:187
chr17	79495519	rs2075720	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.231;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=662;ReadPosRankSum=1.874;SC=ACTCAGAGGGCGCATCCCAGG;SOR=1.441;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=41;WE=79495527;WS=79495509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,43:0.38:112
chr17	79497036	rs12937453	C	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.836;NF=13;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=0.366;SC=CGGGGTTTCACTGTGTTAGCC;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=13;WE=79497044;WS=79497033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr17	79502316	rs138055235	A	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=1.800;SC=CACCATCCGCATCCCCATCTC;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=79502324;WS=79502306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr17	79508484	rs58483803	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-1.245;SC=ACACCCCTTGGAGCAGGGTGA;SOR=0.929;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=18;WE=79508492;WS=79508474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr17	79508506	rs2228698	G	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=85;ReadPosRankSum=1.401;SC=CCTCTCCCTCGAGCTGCCTGG;SOR=0.555;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=11;WE=79508514;WS=79508496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr17	79510899	rs7406506	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=0.942;SC=GCGGCAGAGCAGACTTGGATC;SOR=0.221;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=23;WE=79510907;WS=79510889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr17	79511135	rs8077430	A	G	4491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=79;PP=2498;SC=GGCACAGGTCAGTCATGGCCA;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=135;WE=79511143;WS=79511125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	79514129	rs11552304	G	A	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1284;ReadPosRankSum=0.008;SC=TGTGTGTGGCGGGGCCAGGCC;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=106;TCR=86;TR=88;WE=79514137;WS=79514119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,104:0.46:225
chr17	79514832	rs7224579	G	A	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=961;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GTGGAGCCACGCCAGAGAGTG;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=63;WE=79514840;WS=79514822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr17	79515075	rs6565593	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=2.150;SC=TTGGCTCCCCAGAATGTTCCT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=13;WE=79515083;WS=79515065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr17	79519382	rs4076968	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=481;ReadPosRankSum=2.389;SC=GTCAGAGTGAGAAGCCCCGGC;SOR=0.082;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=29;WE=79519390;WS=79519372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr17	79526402	rs4073997	G	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=464;ReadPosRankSum=-1.183;SC=CCCCGACGGCGCCGTACTCAT;SOR=0.803;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=33;WE=79526410;WS=79526392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
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chr17	79532654	rs3934711	G	A	272.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9962;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CCAAAAGGAAGGTTCCTCTTC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=79532662;WS=79532644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
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chr17	79589242	rs6565604	G	A	5199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=78;PP=2965;SC=TTATCTCTCCGGTCTTGTTTC;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=162;WE=79589250;WS=79589232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr17	79589359	rs6565605	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1688;SC=TATCACTACACATACCATACA;SOR=1.496;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=79589379;WS=79589349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	79589371	rs6565606	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=1.648;SC=TACCATACACACCAGACACTA;SOR=0.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=23;WE=79589379;WS=79589349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr17	79596811	rs9894429	C	T	8356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=129;PP=2965;SC=TCACTCCATCCGGGGACTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=135;TCR=129;TR=264;WE=79596819;WS=79596801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr17	79603831	rs9895741	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=15;PP=625;SC=GCGAGAGAAGAGAAAGGGGCC;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=79603839;WS=79603821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	79604264	rs62074750	T	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=563;ReadPosRankSum=0.993;SC=TTTTGGAAAGTTGCGTCTGAG;SOR=0.565;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=28;WE=79604272;WS=79604254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr17	79604477	rs57463122	GTTTTT	G	5414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=27.291;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=82;PP=2989;ReadPosRankSum=3.063;SC=ACACCTTCATGTTTTTTTTTT;SOR=1.590;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=144;TCF=12;TCR=132;TR=86;WE=79604502;WS=79604467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,132:0.74:178
chr17	79604494	rs28660208	T	C	5411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=18.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.46;ReadPosRankSum=3.923;SOR=1.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,133:0.77:172
chr17	79609410	rs7406219	G	T	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=739;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CGGCGCCTGTGCTGGGGGCTT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=56;WE=79609418;WS=79609400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,66:0.40:165
chr17	79609550	rs7406636	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=330;ReadPosRankSum=0.979;SC=AGTCCCTGGGCTGGGTTCACA;SOR=0.754;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=21;WE=79609558;WS=79609540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr17	79612161	rs6565616	C	T	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.248;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1248;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TGAGTGGCACCCCCAAGAAAG;SOR=0.828;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=300;TCF=152;TCR=148;TR=99;WE=79612169;WS=79612151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,122:0.33:368
chr17	79612333	rs6565617	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=949;ReadPosRankSum=1.582;SC=GCCCCTGCCCGCAGACCCCAT;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=87;TCR=113;TR=67;WE=79612341;WS=79612323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,70:0.31:227
chr17	79612382	rs7210026	T	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=796;ReadPosRankSum=-2.517;SC=GTCAGCGCAGTGAGCCTGGCT;SOR=0.813;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=196;TCF=88;TCR=108;TR=64;WE=79612390;WS=79612372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,70:0.31:225
chr17	79612397	rs6420484	A	G	7707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=103;PP=2965;SC=CTGGCTGGCTACCTGGGCGCC;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=96;TCR=103;TR=199;WE=79612405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	79612413	rs7210043	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=904;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GCGCCCTCTGTGAGAACACCT;SOR=0.739;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=188;TCF=88;TCR=100;TR=67;WE=79612421;WS=79612403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,70:0.33:215
chr17	79612443	rs7210193	T	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1122;ReadPosRankSum=1.206;SC=GTGGCTTCTCTGGGGGCATCC;SOR=0.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=81;WE=79612451;WS=79612433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,84:0.40:212
chr17	79614481	rs9906358	A	G	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=997;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TGTCACTGCCAGGTACTGCCT;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=82;WE=79614489;WS=79614471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,104:0.45:230
chr17	79614932	rs34872037	TTAAC	T	8300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=66;PP=2972;SC=TGCAGGTACTTTAACTAACTG;SOR=1.050;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=112;WE=79614943;WS=79614922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr17	79615225	rs7406494	G	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=23;PP=628;SC=CTGCCCGCAGGGGGGCGGCGT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=79615233;WS=79615215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	79615309	rs7406516	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCGCTGCCAAGCCCGCCCGGG;SOR=1.329;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=4;WE=79615317;WS=79615299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr17	79618252	rs7217415	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=0.503;SC=CTGTGGCCCTGTTTCCCACAG;SOR=0.487;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=18;WE=79618260;WS=79618242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
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chr17	79637349	rs10438817	T	C	5032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=0.566;SC=AGGGGGAGTCTGACGGGGCCT;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=91;TCR=78;TR=167;WE=79637357;WS=79637339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
chr17	79637367	rs7226091	C	G	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CCTATATCCACCGCATGCAGC;SOR=0.762;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=83;WE=79637375;WS=79637357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,93:0.52:180
chr17	79637565	rs7215601	T	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=312;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CCTCTGCAGGTACCCTGTTTC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=18;WE=79637573;WS=79637555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr17	79637637	rs7209877	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.665;SC=TTGGCGAGTCGGAGCATCCAG;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=10;WE=79637645;WS=79637627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	79638805	rs11150805	C	T	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=1608;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TAAAGTCCGACGGAAAAAGGA;SOR=0.517;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=156;TCF=93;TCR=63;TR=114;WE=79638813;WS=79638795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,135:0.69:197
chr17	79639198	rs7502870	C	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=960;ReadPosRankSum=0.906;SC=AAGTGGGGCACGGGGACAACT;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=63;WE=79639206;WS=79639188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
chr17	79649304	rs3205137	A	G	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=51;PP=1339;ReadPosRankSum=0.459;SC=TTTTGAGACGAAGTCTCGCTC;SOR=0.925;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=33;TCR=90;TR=66;WE=79649312;WS=79649294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,76:0.55:138
chr17	79650181	rs34815730	A	G	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=1057;ReadPosRankSum=1.541;SC=ACGATGCAAAAAGAACAATAC;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=53;WE=79650189;WS=79650171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,59:0.78:76
chr17	79650675	rs8080624	C	G	3340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=47;PP=2168;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CCCCGCCCCACTCCGGGTGCC;SOR=0.692;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=196;TCF=129;TCR=67;TR=131;WE=79650683;WS=79650665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,148:0.58:254
chr17	79650828	rs8066889	T	G	6764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=568;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GCGCCGCGGCTCAAGGCCCGC;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=472;TCF=247;TCR=225;TR=266;WE=79650836;WS=79650818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,317:0.57:557
chr17	79657136	rs8074828	G	C	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=22;PP=1432;ReadPosRankSum=0.168;SC=TGCAGCTGCCGAGAGTGAGGA;SOR=1.174;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=146;TCF=101;TCR=45;TR=82;WE=79657144;WS=79657126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,87:0.54:161
chr17	79663931	rs8070488	T	C	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.547;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1218;ReadPosRankSum=0.771;SC=CCTTCAGCCCTGCCGGCTCGG;SOR=0.430;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=74;WE=79663939;WS=79663921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,94:0.56:169
chr17	79668226	rs55837949	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=514;ReadPosRankSum=-2.959;SC=CGGTTTAGCAATGGGACCCCT;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=28;WE=79668234;WS=79668216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr17	79670386	rs1132803	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=742;ReadPosRankSum=-0.155;SC=AGCGCGAGGTACGGCTAGAGC;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=43;WE=79670394;WS=79670376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr17	79682051	rs3204270	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=1094;ReadPosRankSum=0.989;SC=TGGTGCGTACCGACGGCATCC;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=61;WE=79682059;WS=79682041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr17	79682558	rs2072700	T	C	3815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=73;PP=1834;ReadPosRankSum=-0.850;SC=TGCGGGACCGTGTGGCCAAGG;SOR=0.458;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=235;TCF=103;TCR=132;TR=139;WE=79682566;WS=79682548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,181:0.61:298
chr17	79682650	rs8071492	G	A	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.218;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=57;PP=2038;ReadPosRankSum=1.670;SC=AGGGGGAGGGGCGCGGGGTGG;SOR=0.502;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=98;TCR=87;TR=117;WE=79682658;WS=79682640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,135:0.64:212
chr17	79683698	rs62077217	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=332;ReadPosRankSum=-1.782;SC=CAGGACCAGCTTCATGTTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=16;WE=79683706;WS=79683688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr17	79683997	rs140229959	T	TGCCTCACCCCTG	3016.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.311;NF=20;NR=20;PP=2897;ReadPosRankSum=1.131;SC=CCTCACCCCTTGCCTCACCCC;SOR=0.545;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=40;WE=79684005;WS=79683987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,73:0.54:134
chr17	79687218	rs11150813	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GTGGCCACCCGTCCTCCGCAG;SOR=1.247;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=23;WE=79687226;WS=79687208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr17	79766825	rs7406228	C	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=268;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GCGTACACACCCACCAGGACT;SOR=0.535;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=18;WE=79766833;WS=79766815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr17	79767019	rs200551811	TCTGTCTGC	T	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=5.457;NF=2;NR=15;PP=1426;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CTGATGGCTCTCTGTCTGCCT;SOR=1.051;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=17;WE=79767034;WS=79767009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr17	79767602	.	T	TCTGTCTGCCTGC	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.397;NF=5;NR=6;PP=969;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGTCTGCCTGTCTGTCTGCCT;SOR=0.560;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=11;WE=79767610;WS=79767592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr17	79768848	rs2272030	A	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.12;ReadPosRankSum=-2.913;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,34:0.35:97
chr17	79769466	rs28454947	T	C	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=597;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CCCAGGCAGGTGGGTGGGTGG;SOR=0.459;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=133;TCF=37;TCR=96;TR=53;WE=79769474;WS=79769456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,62:0.41:151
chr17	79770740	rs5384	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=591;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AAGTGGTCTTCGCCTTCGTGA;SOR=0.682;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=50;WE=79770748;WS=79770730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,59:0.37:160
chr17	79784101	rs374374934	GCA	G	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,17:0.15:113
chr17	79784105	rs144826913	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=486;ReadPosRankSum=2.808;SC=TTGTGTGCACACACACACACA;SOR=0.446;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=35;WE=79784113;WS=79784091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,34:0.28:120
chr17	79791597	rs35031019	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=391;ReadPosRankSum=0.704;SC=CGGGCGGGCAAAGCTGGCTCA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=25;WE=79791605;WS=79791587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr17	79791792	rs34856581	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GCCCCAACCCGGGTCAGAGGG;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=13;WE=79791800;WS=79791782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr17	79803101	rs1130674	A	G	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CGTTGTAATCAATGACCTGTG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=212;TCF=94;TCR=118;TR=81;WE=79803109;WS=79803091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,104:0.39:267
chr17	79803433	rs35649520	G	A	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1117;ReadPosRankSum=0.870;SC=GAGGGAAGGCGCACCGTCCTG;SOR=0.883;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=164;TCF=110;TCR=54;TR=75;WE=79803441;WS=79803423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,89:0.46:192
chr17	79805003	rs111301737	A	G	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=1548;ReadPosRankSum=1.345;SC=AATGCAGAAGATTCTCCCAAT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=102;TCR=138;TR=101;WE=79805011;WS=79804993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,117:0.40:293
chr17	79805134	rs2070871	G	A	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=1316;ReadPosRankSum=3.114;SC=CGGTGAACTCGATGACAAGGG;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=214;TCF=128;TCR=86;TR=84;WE=79805142;WS=79805124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,107:0.41:259
chr17	79816926	rs1533756	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=299;ReadPosRankSum=1.033;SC=GAGAACCCGGCCTGAGGAACG;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=16;WE=79816934;WS=79816916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	79817005	rs1010954	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=509;ReadPosRankSum=2.068;SC=CTTCCAAGTCGGCAGGCCAGT;SOR=1.148;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=29;WE=79817013;WS=79816995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr17	79818159	rs35766162	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=339;ReadPosRankSum=0.346;SC=AGAGCCTGGCTCAGCGGCCCC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=26;WE=79818167;WS=79818149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,27:0.30:90
chr17	79818260	rs11558886	G	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=735;ReadPosRankSum=0.285;SC=TTGCTTTTCCGCAGCACCAGG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=54;WE=79818268;WS=79818250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,65:0.32:202
chr17	79818360	rs1130664	T	G	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.948;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=655;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CGGACACGGATCAGGCGGGGC;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=59;TCR=93;TR=55;WE=79818368;WS=79818350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,70:0.40:173
chr17	79827163	rs113301975	C	T	4749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=553;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=0.810;SC=ACCCCAGCCCCAGCCCCGCCT;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=482;TCF=233;TCR=249;TR=205;WE=79827171;WS=79827153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:317,230:0.42:547
chr17	79862882	rs146889521	C	G	9725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=153;PP=2965;SC=GGGGAGGGCACGGTAAGTCTA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=150;TCR=153;TR=303;WE=79862890;WS=79862872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr17	79870973	rs192252962	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=-2.064;SC=ACCACAGATCATAACTTAAGA;SOR=0.552;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=17;WE=79870981;WS=79870963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr17	79872129	rs1879568	A	G	12175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=211;PP=2965;SC=ACCCTCGGGCAGGCAGGGGCT;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=381;TCF=170;TCR=211;TR=381;WE=79872137;WS=79872119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr17	79872241	rs1879569	A	G	9404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=152;PP=2965;SC=TCCCAGTTCAAAGGCTGCCCC;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=292;TCF=140;TCR=152;TR=292;WE=79872249;WS=79872231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr17	79891147	rs61747618	T	C	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GGCCAGAAGGTGACAGAGCGG;SOR=0.498;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=113;TCR=60;TR=172;WE=79891155;WS=79891137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr17	79893962	rs34419046	G	A	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=65;PP=2965;SC=AGCCCCACAGGGACTCAGTCT;SOR=1.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=155;TCR=65;TR=220;WE=79893970;WS=79893952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr17	79898644	rs2293098	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=821;ReadPosRankSum=0.873;SC=CCCTCGCAGAGCCTGGAGCTG;SOR=1.627;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=95;TCF=81;TCR=14;TR=42;WE=79898652;WS=79898634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr17	79899272	rs4796856	A	G	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1432;ReadPosRankSum=1.420;SC=GGCTCGGGGGAACACTCCCGC;SOR=0.607;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=209;TCF=109;TCR=100;TR=89;WE=79899280;WS=79899262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,98:0.42:236
chr17	79899495	rs4796854	G	A	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=770;ReadPosRankSum=0.053;SC=CACCCCGGTGGGCCACCAGGC;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=52;WE=79899503;WS=79899485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,62:0.39:161
chr17	79899698	rs4796852	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGTCCTCTGCGGTAGTGGCAG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=79899706;WS=79899688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	79911164	.	A	AG	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=60;QD=29.0;SC=AAACCGGGGGAGGGGGTCACA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=3;WE=79911172;WS=79911154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr17	79912103	rs4796851	C	T	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=1334;ReadPosRankSum=0.246;SC=ATGTCATGGACGCAAGCTGCC;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=247;TCF=101;TCR=146;TR=94;WE=79912111;WS=79912093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,115:0.37:314
chr17	79914661	rs35872546	T	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.815;NF=33;NR=37;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CTGCCGTGGGTCTCGTCCCCC;SOR=0.623;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=187;TCF=83;TCR=104;TR=70;WE=79914669;WS=79914651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,89:0.40:220
chr17	79915863	rs34107062	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=490;ReadPosRankSum=-1.155;SC=GCTGGCAGAGAAGTTCTTGCC;SOR=0.966;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=32;WE=79915871;WS=79915853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
chr17	79935636	rs9906594	C	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=6.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr17	79941511	rs11539917	C	T	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.422;SC=AGATGGTGCCCGCTTCCCGGA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=64;TCR=100;TR=72;WE=79941519;WS=79941501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,78:0.41:190
chr17	79954544	rs8074498	T	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.536;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=673;ReadPosRankSum=0.405;SC=GGACAGAGACTGGGGGGCCCT;SOR=0.918;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=180;TCF=80;TCR=100;TR=53;WE=79954552;WS=79954534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,69:0.32:215
chr17	79967486	.	G	C	565	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.22;NF=1;NR=9;PP=565;QD=59.9771212547;SC=ACAGCTCTGAGGGGGCCCCCC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=10;WE=79967524;WS=79967476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,10:0.22:45
chr17	79967496	.	CG	C	827	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=59.28;NF=0;NR=6;PP=827;QD=142.0;SC=GGGGGCCCCCCGTGAGGTCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=6;WE=79967524;WS=79967476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,6:0.21:28
chr17	79967515	.	A	ACGT	761	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.04;NF=0;NR=4;PP=761;QD=201.0;SC=TGTGGACGGGATGGGGCGACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=4;WE=79967524;WS=79967476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,4:0.20:20
chr17	79967516	.	T	A	406	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.11;NF=0;NR=4;PP=406;QD=110.192803137;SC=GTGGACGGGATGGGGCGACTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=4;WE=79967524;WS=79967476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,4:0.18:22
chr17	79972901	rs9895872	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=386;ReadPosRankSum=-2.146;SC=AGGCCCTTCCCGGGCCCTGCT;SOR=0.155;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=31;WE=79972909;WS=79972891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr17	79974731	rs13087	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.845;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,22:0.27:83
chr17	79977813	rs4969471	C	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=27;PP=838;SC=GTCAGCGCCACGCCCCGCCCT;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=79977821;WS=79977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	79980756	rs3934983	C	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.655;SC=CCTCAACGCGCGCCCACCGGA;SOR=0.331;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=10;WE=79980764;WS=79980746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr17	79980891	rs4444402	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.263;SC=AGCCAATGAGCCCGGAGCGCG;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=5;WE=79980899;WS=79980881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	79989546	rs190408119	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=74;ReadPosRankSum=1.478;SC=TCCGGCCGATCGCTCGGCGCT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=79989554;WS=79989536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	79990972	rs10708637	CG	C	1347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=1282;SC=AATTGCGATACGGGTTCTGCC;SOR=2.891;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=33;WE=79990980;WS=79990962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	80000798	.	GACACAC	G	4655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.693;NF=14;NR=82;PP=2989;ReadPosRankSum=-1.712;SC=AGCCACACAGGACACACACAC;SOR=0.403;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=206;TCF=20;TCR=186;TR=96;WE=80000811;WS=80000788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,125:0.51:246
chr17	80000899	rs9907483	A	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=53;PP=1574;SC=GCATATGTGAACATGCAGGCC;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=58;WE=80000907;WS=80000889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	80006504	rs1128009	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=243;ReadPosRankSum=0.423;SC=CTCACTGGTGTGGCCGTGGCA;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=14;WE=80006512;WS=80006494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr17	80006812	rs8069068	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=474;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GGGCCGTGGGCGGAGGGAGCA;SOR=0.359;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=28;WE=80006820;WS=80006802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
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chr17	80007018	rs12939972	T	C	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GTGGGCAGAGTGTGTGGCCTG;SOR=0.782;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=71;WE=80007026;WS=80007008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,87:0.61:143
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chr17	80014861	rs4969484	T	G	4744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=87;PP=2943;ReadPosRankSum=0.068;SC=GTGGGCTGGCTTGAGGGGGGG;SOR=0.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=304;TCF=154;TCR=150;TR=179;WE=80014869;WS=80014851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,214:0.62:347
chr17	80018714	rs58204115	C	T	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.332;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=68;PP=1718;ReadPosRankSum=-2.126;SC=CCTGCAAGGCCGGGCTCCCAC;SOR=1.239;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=105;WE=80018722;WS=80018704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,124:0.60:207
chr17	80020812	rs11542332	C	T	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=72;PP=2085;ReadPosRankSum=1.164;SC=GGATTTTGCACGTGACAGGAA;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=378;TCF=192;TCR=186;TR=147;WE=80020820;WS=80020802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,171:0.38:454
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chr17	80023023	rs58112725	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=849;ReadPosRankSum=0.696;SC=CAGCGGTCACCCTTCTAAGGC;SOR=0.348;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=55;WE=80023031;WS=80023013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr17	80023050	rs28374526	T	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=741;ReadPosRankSum=1.134;SC=AGTACCACCGTTGGGTCACAC;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=41;WE=80023058;WS=80023040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr17	80038952	rs4246444	T	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=511;SC=CGAAGGGCGGTATGCCTGCCG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=80038960;WS=80038946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr17	80040607	rs4969465	T	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=1189;SC=GTCTCTTCCCTACACGCCGGG;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=80040615;WS=80040597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr17	80043739	rs2229422	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=270;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GACCGTGGCCAGCCAGCACCT;SOR=0.938;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=21;WE=80043747;WS=80043729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr17	80044078	rs17848937	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGATGTCAGGGTGGGTCCTAC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=80044086;WS=80044068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr17	80044211	rs41283365	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=603;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGTCCAGGAGGCCGCTGAGCA;SOR=0.975;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=43;WE=80044219;WS=80044201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr17	80045147	rs17848935	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=463;ReadPosRankSum=0.032;SC=GACAGGCTGGGTGAGTGCGGC;SOR=0.456;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=30;WE=80045155;WS=80045137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr17	80050272	rs17848925	G	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=3;PP=220;SC=CCCAGCCATGGCGCAACCCAG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=80050280;WS=80050269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	80050554	rs10591316	CGG	C	1182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.821;HP=16;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=247;ReadPosRankSum=1.781;SC=GTGAGTGGGGCGGGGGGGGGG;SOR=3.714;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=13;WE=80050563;WS=80050544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,35:0.92:38
chr17	80051183	rs2228309	A	G	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=69;PP=2444;SC=TCAGCAGGACATTGATGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=70;TCR=69;TR=139;WE=80051191;WS=80051173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	80053166	rs45555535	C	T	3235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=66;PP=2124;ReadPosRankSum=1.208;SC=CAGGAGCCCTCGGCGCAGCAG;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=111;TCR=108;TR=133;WE=80053174;WS=80053156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,146:0.59:247
chr17	80054375	rs17848934	C	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.442;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=55;PP=1243;ReadPosRankSum=-2.437;SC=GGCCACGACACCCCCGTCAAC;SOR=2.365;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=117;TCF=21;TCR=96;TR=61;WE=80054383;WS=80054365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,60:0.51:118
chr17	80059487	rs1127678	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CCCCACAACACGTAGGTGAAA;SOR=0.399;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=16;WE=80059495;WS=80059477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr17	80059596	rs13949	T	C	5353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=73;PP=2965;SC=TTGGGGGGCCTCTGGCAGCCT;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=162;WE=80059604;WS=80059586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	80059758	rs7225637	G	A	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=67;PP=2287;SC=AGGTAAAGAGGAAAAAACAGC;SOR=1.001;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=115;WE=80059766;WS=80059748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	80065244	rs112663677	C	CGGGAGTG	906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=481;SC=ACAGATGCCGCGGGAGTGGGG;SOR=2.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=6;WE=80065252;WS=80065234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	80071244	rs7211808	T	C	5906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=47;PP=2965;SC=CAGCGTGACCTGCTCTCTCAG;SOR=1.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=115;TCR=47;TR=162;WE=80071252;WS=80071234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	80071450	rs11653662	G	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1264;ReadPosRankSum=1.676;SC=ATTCCCCCTCGCATTCCTGGA;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=110;TCR=150;TR=90;WE=80071458;WS=80071440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,110:0.36:306
chr17	80085246	.	C	T	357	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.9999;HP=2;HapScore=4;MGOF=78;MMLQ=28;MQ=53.0;NF=5;NR=1;PP=357;QD=65.2952020912;SC=AGTCAGCCTGCGCCCGGGTGT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=80085273;WS=80085239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,6:0.50:12
chr17	80085283	rs73360060	C	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=701;SC=AGTCAGCCTGCGCCCGGGTGT;SOR=3.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=29;WE=80085303;WS=80085273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	80085295	rs74001545	C	T	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=976;SC=CCCGGGTGTACGGTGCTGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=36;WE=80085303;WS=80085273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	80085326	rs62078305	G	A	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=16;PP=1869;SC=TGTGCGCCCGGGTGTACGGTG;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=62;TCR=16;TR=78;WE=80085334;WS=80085316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	80085341	rs62078306	A	G	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=26;PP=2465;SC=ACGGTGCTGCACTAGGAAATG;SOR=2.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=92;TCR=26;TR=118;WE=80085349;WS=80085331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	80085633	rs11077969	A	G	6222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=108;PP=2965;SC=CAACCTCCACATGTCCTGGAG;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=86;TCR=108;TR=194;WE=80085641;WS=80085623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr17	80085703	rs7213172	G	T	4711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=84;PP=2659;SC=TCAGGGTGCTGGGGAGCCTGG;SOR=1.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=132;WE=80085711;WS=80085693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	80086386	rs7406162	C	T	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.06;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	80086389	rs7406163	C	T	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.49;SOR=1.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	80086395	rs4625783	T	C	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	80086597	rs4459614	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=716;SC=AAGACTCACACCATTTGGTGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=80086605;WS=80086587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	80092131	rs4789753	T	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=719;ReadPosRankSum=0.604;SC=TCCTCTTGTGTTGAATGCAAA;SOR=1.064;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=47;WE=80092139;WS=80092121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr17	80092171	rs4789752	A	G	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=50;PP=1569;SC=GTTCCTTTTCAAAACCAAAGT;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=80092179;WS=80092161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	80103631	rs35131420	T	C	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=561;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TGCAGGCCCCTGAGTGGGGCT;SOR=0.593;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=30;WE=80103639;WS=80103621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr17	80141892	.	T	TGC	1957	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=18;MQ=62.52;NF=5;NR=63;PP=1957;QD=28.9117647059;SC=CAAATACACATGCGCGCGCGC;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=166;TCF=7;TCR=159;TR=68;WE=80141900;WS=80141881;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:98,68:0.41:166
chr17	80141907	.	GCA	G,GCGCACACACACA	135.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.582;NF=5;NR=69;PP=1607;ReadPosRankSum=0.362;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=1.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=6;TCR=92;TR=74;WE=80141919;WS=80141897;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.19:63
chr17	80141911	.	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=3.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.37;MQRankSum=-0.395;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.785;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr17	80146089	rs4789729	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=177;ReadPosRankSum=-1.322;SC=CCAAGCACACGCTCACTGGTC;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=15;WE=80146097;WS=80146079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr17	80159403	rs11657459	C	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=399;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GCGCGTCGGTCGGTGGCTCAC;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=27;WE=80159411;WS=80159393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr17	80159566	rs8072670	T	C	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GCCTGGCCTCTTCCCACTCCC;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=84;WE=80159574;WS=80159556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,93:0.39:238
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chr17	80195582	rs9303026	T	C	10102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=137;NR=168;PP=2965;SC=ACCTGGCGGGTTCTACGGCGG;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=137;TCR=168;TR=305;WE=80195590;WS=80195572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr17	80198007	rs9901910	G	C	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=81;PP=2000;ReadPosRankSum=0.112;SC=CTGGCCTTGCGCCAGCTGGGC;SOR=0.996;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=277;TCF=115;TCR=162;TR=131;WE=80198015;WS=80197997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,142:0.45:314
chr17	80218800	rs35693344	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=455;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CCAGGCTGGAGGGCAGTGGCA;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=22;WE=80218808;WS=80218790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr17	80231151	.	CGGGCGGCGGGCGG	C	2098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CCCGGGTCTTCGGGCGGCGGG;SOR=0.577;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=24;WE=80231171;WS=80231141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,53:0.64:83
chr17	80275253	rs3176829	T	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=31;PP=1100;SC=GGGAGAGCTCTGGAGCTGTGG;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=80275261;WS=80275243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	80280865	rs11077986	G	A	3518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=85;PP=2138;ReadPosRankSum=-0.273;SC=ACCCAGTGTCGGGGGCGGACT;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=297;TCF=123;TCR=174;TR=143;WE=80280873;WS=80280855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,172:0.47:369
chr17	80332251	rs11654140	T	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TGGCCGCCACTGGCAGCTCTG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=82;WE=80332259;WS=80332241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,86:0.40:215
chr17	80352138	rs6502106	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=348;ReadPosRankSum=1.292;SC=AGTGCTGGGATTACAGGCGTG;SOR=0.866;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=27;WE=80352146;WS=80352128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr17	80352234	rs62079522	G	A	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.406;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=46;PP=1536;ReadPosRankSum=0.971;SC=GACTCAGCACGGCAACCAAGG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=170;TCR=131;TR=106;WE=80352242;WS=80352224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,128:0.37:346
chr17	80352303	rs62079523	G	A	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1253;ReadPosRankSum=0.975;SC=CCCCTCTCGGGCGGGTGGTGA;SOR=0.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=253;TCF=118;TCR=135;TR=91;WE=80352311;WS=80352293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,97:0.35:277
chr17	80355975	rs62079527	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.341;SC=GCAGATGCTCCGTGAACTCAG;SOR=2.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=6;WE=80355983;WS=80355965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr17	80356019	rs9905077	C	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=-0.768;SC=CCACACCCACCGTGCTTGCCT;SOR=0.765;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=10;WE=80356027;WS=80356009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr17	80356315	rs6502107	A	G	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=528;SC=TTGCTCCATCACCCAGGCTGG;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=80356323;WS=80356305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	80361753	rs11655676	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=-0.656;SC=CACTCACCGTGCCCACGGGCA;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=21;WE=80361761;WS=80361743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr17	80363266	rs71375101	A	G	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=28;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TCTGTGAAAAAAGGAGTATTC;SOR=0.590;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=106;TCR=56;TR=80;WE=80363274;WS=80363256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,91:0.50:183
chr17	80367206	rs62080965	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=1.790;SC=CAAAGTTAACGGGTAAAAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=12;WE=80367214;WS=80367196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr17	80436297	rs77949156	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=388;ReadPosRankSum=0.853;SC=CGGTAGCTGCGTGTCCTGGCT;SOR=0.715;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=19;WE=80436305;WS=80436287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr17	80438165	rs367877086	GCA	G	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.810;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,16:0.25:65
chr17	80439734	rs150439849	G	A	3536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=76;PP=2342;ReadPosRankSum=-0.034;SC=TAGCCATAGCGGGTCTCCTAA;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=282;TCF=140;TCR=142;TR=149;WE=80439742;WS=80439724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,164:0.53:312
chr17	80439867	.	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.391;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=611;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CTTTCAGATGTTAAGAGCCTA;SOR=1.209;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=24;WE=80439875;WS=80439857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr17	80441255	rs112635259	A	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=420;ReadPosRankSum=0.804;SC=AGCTTGTTATACACAAAAGTT;SOR=0.535;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=24;WE=80441263;WS=80441245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr17	80517489	rs72861098	G	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=321;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CCTCGTGCCAGGCTGGTCTTC;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=21;WE=80517497;WS=80517479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr17	80521092	rs4789795	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=2.126;SC=TTGGCGACTTATAATAACACG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=12;WE=80521100;WS=80521086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr17	80540585	rs2306759	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=474;ReadPosRankSum=1.680;SC=AAATAAATATATGAATTCTAC;SOR=0.328;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=31;WE=80540593;WS=80540575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr17	80544855	rs1387545	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1271;SC=GTGTGATAGCTATCTGGTTAT;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=80544863;WS=80544845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	80545156	rs6502124	A	G	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=45;PP=1289;SC=ATGGTAAGACATGCTGGTCGG;SOR=2.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=61;WE=80545164;WS=80545146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	80574082	rs753569	T	G	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=5.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	80574532	rs12950772	A	G	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=89;PP=2965;SC=CTGTGAAGACAAGAAAAGAAA;SOR=0.868;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=199;WE=80574540;WS=80574522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr17	80577126	rs59969975	ATCT	A	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=224;SC=CACCCACATCATCTACTACTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=80577136;WS=80577116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	80583230	rs3826309	A	G	10093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=176;NR=136;PP=2965;SC=ATGTGGACCCATTTCCCATCG;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=176;TCR=136;TR=312;WE=80583238;WS=80583220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr17	80585094	rs2291393	C	T	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=1193;SC=CTCGCCGCAGCTTGACTGCCT;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=80585102;WS=80585084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	80601769	rs59318270	TA	T	6557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=78;PP=2951;SC=AGGTTAAATTTAAGACTCCGA;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=109;WE=80601777;WS=80601759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr17	80602050	rs11649788	C	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=800;SC=TGTCCTTGTACAAATGTTACT;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=80602058;WS=80602040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	80619080	rs4789706	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=240;SC=CCAATGTCCCTGAAGGGATCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=80619088;WS=80619070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	80622344	rs2279392	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=433;ReadPosRankSum=0.020;SC=CTGGGGGTGCGGGACGCTCGC;SOR=0.399;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=21;WE=80622352;WS=80622334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr17	80626104	rs12952159	T	C	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=920;ReadPosRankSum=-1.434;SC=GGGGTTTTTGTGGTCTTCAGG;SOR=0.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=253;TCF=145;TCR=108;TR=79;WE=80626112;WS=80626094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,102:0.33:307
chr17	80626210	rs7221877	T	C	7514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=154;PP=2965;SC=CCTTCCAGTCTGCAGGACTGG;SOR=1.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=89;TCR=154;TR=243;WE=80626218;WS=80626200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr17	80656616	rs2243606	T	G	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=85;SC=ACAGCGCGCATCCCCGCCCGG;SOR=1.270;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=80656624;WS=80656606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	80674643	rs2250000	C	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=15;PP=1797;SC=TGGAGGAGCTCCTGAGGCGCG;SOR=2.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=80674651;WS=80674633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	80674839	rs10714010	CG	C	3568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.64;QD=33.67;SOR=2.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	80676946	rs111661651	A	ACCACCCC	1913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=1569;SC=GCATCTTCACACCACCCCCCA;SOR=3.767;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=26;WE=80676954;WS=80676936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	80684638	rs2246103	T	C	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=37;PP=2706;SC=CTGGGGGCGGTGGGGACCTGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=129;WE=80684646;WS=80684628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	80685126	rs2243446	T	C	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=762;SC=CTTCACATGCTGGACTAGCTT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=80685134;WS=80685116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	80693705	rs2256322	A	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=20;PP=631;SC=GGGGCCTGGGAAGGCGGAGGG;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=80693713;WS=80693695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	80693805	rs2256316	C	G	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=5;PP=142;SC=GAGCCCGGCTCAAGCGTTCTG;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=80693813;WS=80693795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	80696410	rs2253149	A	C	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=21;PP=1207;SC=GGAGGCCCTCAGGAGCACGGG;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=80696418;WS=80696400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	80696542	rs2253132	G	A	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.50;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	80696547	rs2253131	T	A	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	80699093	rs2252848	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=558;SC=ATATTCTAGCATGCGTAGCCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=80699101;WS=80699090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	80700592	rs1994554	T	C	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=113;PP=2965;SC=CCTGTGCTTCTCTTGAAGAAG;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=142;TCR=113;TR=255;WE=80700600;WS=80700582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr17	80700712	rs1994553	T	C	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=104;PP=2831;SC=TCTGTCTCCTTGTCGACGCCC;SOR=1.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=48;TCR=104;TR=152;WE=80700720;WS=80700702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	80706928	rs2243416	G	A	5532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=80;PP=2965;SC=GGGTTCATCTGTAAAACGGAG;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=165;WE=80706936;WS=80706918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	80708601	rs1056534	C	G	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=41;NR=117;PP=2965;SC=GGAGCCCTTCCTTGGGCACCA;SOR=1.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=41;TCR=117;TR=158;WE=80708609;WS=80708591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	80710278	rs2451217	G	C	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=201;SC=CCGCGTGCCCGCTTCCTCCCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=80710286;WS=80710268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	80786008	rs6502134	G	A	12598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=170;NR=226;PP=2965;SC=CACCCACACAGTTGAATGTGC;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=396;TCF=170;TCR=226;TR=396;WE=80786016;WS=80785998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,461:1.00:461
chr17	80786261	rs138156874	T	TACAC	13053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=79;PP=2957;SC=CACTCACAGATACATGCACAC;SOR=1.231;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=154;WE=80786269;WS=80786251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr17	80786427	rs11364632	GC	G	11399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=193;PP=2983;SC=AATGGAATGTGCCCCCCCCGA;SOR=1.020;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=54;TCR=228;TR=237;WE=80786436;WS=80786417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr17	80786641	rs7207932	C	T	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1986;ReadPosRankSum=-0.453;SC=ACACACACATCTAATCAGATG;SOR=1.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=82;WE=80786649;WS=80786630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,85:0.98:87
chr17	80789468	rs35653278	G	A	10187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=160;NR=163;PP=2965;SC=GATCGGCCCCGGGTGAGGCAG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=323;TCF=160;TCR=163;TR=323;WE=80789476;WS=80789458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr17	80789628	rs8074277	T	C	8506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=157;NR=128;PP=2965;SC=GTGGGGTGCATGTAAGGGGAA;SOR=0.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=286;TCF=157;TCR=129;TR=285;WE=80789636;WS=80789618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr17	80790388	rs12450046	G	A	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=57;PP=1555;SC=TGTCGACGCCGCGTGCACTTC;SOR=5.010;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=59;WE=80790396;WS=80790378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	80790442	rs3744165	T	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=411;SC=TCTTTCCCGATCACTTCTATC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=80790450;WS=80790432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80827955	rs7222931	A	G	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=4;PP=2614;SC=GGAGCCCCGAACCTCTGGGTG;SOR=5.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=91;TCR=4;TR=94;WE=80827963;WS=80827945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	80828057	rs3744161	G	A	12427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=232;NR=165;PP=2965;SC=CGTGTTGCCCGTGTGGTCTGC;SOR=1.018;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=397;TCF=232;TCR=165;TR=397;WE=80828065;WS=80828047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,450:1.00:450
chr17	80858669	rs9891862	G	A	10348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=189;PP=2965;SC=AGATTCAGTTGAGCTTATAAG;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=318;TCF=129;TCR=189;TR=318;WE=80858677;WS=80858659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr17	80861206	rs2271918	A	G	5894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.961;SC=TGTCTCCCTCACTTTCTTTTT;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=131;TCR=64;TR=195;WE=80861214;WS=80861196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,229:0.99:231
chr17	80878303	.	AG	A	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=65;QD=32.0;SC=CCCTGGCAGCAGGGTAGGTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=80878311;WS=80878293;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	80878389	rs1471197	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=318;SC=AGGCGCTTTTAGAAAAGTAAC;SOR=1.981;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=17;WE=80878397;WS=80878379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80884247	rs1078334	T	C	3135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=54;PP=2060;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TAGCTTATGGTTCTTCTGTGA;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=121;TCR=90;TR=127;WE=80884255;WS=80884237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,143:0.58:245
chr17	80887206	rs729124	A	G	5316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GATCATTGGCAGCCCGGCCTT;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=374;TCF=176;TCR=198;TR=212;WE=80887214;WS=80887196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,246:0.57:433
chr17	80887451	rs2034962	A	G	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TCTTGGGAGCATGTATGGAGC;SOR=0.700;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=101;WE=80887459;WS=80887441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,109:0.60:183
chr17	80895745	rs3785520	T	C	3728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=57;PP=2099;ReadPosRankSum=1.168;SC=GCGACACTCGTGTGTGTAGGC;SOR=1.006;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=246;TCF=135;TCR=111;TR=136;WE=80895753;WS=80895735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,168:0.57:293
chr17	80897516	.	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=886;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AGCCGTGCTGCTGTAGCCGAA;SOR=0.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=43;WE=80897524;WS=80897506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr17	80923536	rs4986144	C	T	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=29;PP=2233;SC=CCTGACCTCCCTCGTTAAAGG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=80923544;WS=80923526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	80963331	rs9901757	C	T	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=36;PP=1869;SC=ACGCGCATCTCGGCGGTGAAC;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=80963339;WS=80963321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	81009622	rs59686903	C	T	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=29;PP=1366;SC=CCACGTGGGCCTGCATGGCCT;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=65;WE=81009644;WS=81009612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	81009636	rs57923322	T	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=28;PP=1267;SC=ATGGCCTGGCTCTCCTCGGAC;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=81009644;WS=81009612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	81043039	rs9908756	A	G	8074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=131;PP=2965;SC=TGCTGGTACCAGACGGGGACG;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=241;TCF=110;TCR=131;TR=241;WE=81043047;WS=81043029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr17	81050747	rs112036212	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=512;ReadPosRankSum=0.270;SC=CCTCCAGCACGTGCCGCCAAC;SOR=0.399;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=33;WE=81050755;WS=81050737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr17	81050833	rs74775917	A	AG	8920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=89;PP=2957;SC=GCTGAGTGTGAGATCCTTTGA;SOR=0.943;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=137;WE=81050841;WS=81050823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr17	81050982	rs7501742	G	C	3000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=66;PP=1890;ReadPosRankSum=0.281;SC=GTGAGTGTCTGCTCGGCAGCT;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=75;TCR=103;TR=112;WE=81050990;WS=81050972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,131:0.63:208
chr17	81051007	rs7502442	G	T	6491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=94;PP=2965;SC=CCTCCTGTGCGCCTGGTTTCT;SOR=1.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=55;TCR=94;TR=149;WE=81051015;WS=81050997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	81051887	rs7223467	T	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=412;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TGGCAGAGTCTGGGGTCAGCT;SOR=0.161;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=24;WE=81051895;WS=81051877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr17	81052407	rs1133217	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.489;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=782;ReadPosRankSum=2.177;SC=GGTGAGGGCCGCGCGCTGGGA;SOR=2.376;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=37;WE=81052415;WS=81052397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr17	81052423	rs8269	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=264;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TGGGAGCCGCGTGCCCTGGGC;SOR=0.035;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=18;WE=81052431;WS=81052413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr17	81083419	rs28399067	G	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.905;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=1.763;NF=38;NR=23;PP=913;ReadPosRankSum=0.343;SC=CAGGGCGGCCGTGTGGGCATC;SOR=0.967;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=61;WE=81083427;WS=81083409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,76:0.94:81
chr18	252559	rs657138	G	A	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=47;PP=1704;SC=GAGCTTCCTCGTCTCCCATTT;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=97;WE=252567;WS=252549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr18	334758	rs2305026	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=7;PP=160;SC=CCTCCGGTGCTGGGGTTGGCT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=334766;WS=334748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	335316	rs2012143	A	C	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=5;NR=6;PP=175;SC=AAATCTCCAAATTAAAAAAAC;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=335324;WS=335306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	346821	rs3826628	C	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=34;PP=1389;SC=TGGCAGCCAGCGTCTGCAAGC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=63;WE=346829;WS=346811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	357247	rs3810040	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=80;SC=ATAGCTGTAAGTTTAAGATAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=357255;WS=357237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	624783	rs495688	A	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=469;SC=TTTAGAATGTATACATTTCAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=624791;WS=624773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	624824	rs495799	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=588;SC=GCACATAGATTATGAAATGGA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=624832;WS=624814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	625070	rs498466	G	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=537;SC=CACAGTTCTTGAGGCACCTAT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=625078;WS=625060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	627044	.	C	T	378	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=56.2;NF=16;NR=3;PP=378;QD=21.7248006604;SC=AAGAAAGAGTCGAGAAAGAAA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=627052;WS=627034;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	645176	rs565034	C	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=534;SC=AACTTGTTTCCAAATACCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=645184;WS=645166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	649759	rs1058151	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.19;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	649879	.	C	CT	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=61.53;NF=2;NR=1;PP=45;QD=16.0;SC=TCATTGCTGCCTTTTTTTTTT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=3;WE=649887;WS=649869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr18	724612	rs537141	A	G	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=30;PP=1084;SC=ACTTGTTCTAATACTTCACGG;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=59;WE=724620;WS=724602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	905125	rs1893154	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=518;SC=TTCGCTTGGCATCGCGTCAGG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=905133;WS=905115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	905537	rs2231183	T	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=24;PP=740;SC=AGCTGGGGCTTCCCAGGCACA;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=905545;WS=905527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	907521	rs8192595	A	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=433;SC=TCCCACCCCCAGTCCTGGGAG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=907529;WS=907511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	907564	rs12967282	C	A	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	907564	.	CCT	ACC	1591	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=35;NR=18;PP=1591;QD=31.0276957521;SC=ACTTTTATCACCTGTGAAAAT;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=53;WE=907574;WS=907554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,53:0.91:58
chr18	907566	rs8192596	T	C	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.50;SOR=1.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	908128	rs8192599	G	C	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=442;SC=GGGAGTTATTGGCGAGTTCTG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=908136;WS=908118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	908229	rs2231185	A	T	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=35;PP=1515;SC=GGGGACAGAAACAGTGACCCT;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=908237;WS=908219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr18	1278665	rs1595005	C	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=30;PP=1027;SC=AATCTGAGTGCTCCCCTGTCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=1278673;WS=1278655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	2539016	rs8084295	C	G	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=41;PP=1759;SC=CCAGACTCCACAGCAATAAAA;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=92;WE=2539024;WS=2539006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr18	2544356	rs2176451	T	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=7;PP=231;SC=CACAGCTGCATTGATTTTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=2544364;WS=2544346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	2547500	rs2677879	G	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=35;PP=1267;SC=GGTATTTGCTGTATTTGCAGG;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=2547508;WS=2547490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	2656248	rs2430853	G	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=18;PP=594;SC=GATTTCGCGCGTGTGTGTGTC;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=2656256;WS=2656238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	2688798	rs637651	G	A	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=85;SC=GATAGACGGTGGGACAGAACT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=2688806;WS=2688788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	2698125	rs626994	T	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=173;SC=ATCGGTTGGGTTATTCAGGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=2698133;WS=2698115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	2705700	rs635132	A	G	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=1;PP=255;SC=AGGTCAAGACAATCAAGACAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=2705708;WS=2705690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	2724930	rs633422	A	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=18;PP=608;SC=AAATAACCAAAGGACCAAATT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=36;WE=2724938;WS=2724920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	2740625	rs521992	G	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=49;SC=TTCTAAGCATGTTTTTATAGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=2740633;WS=2740615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	2751475	rs300293	A	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=382;SC=GTAAATATATAATGTTATATA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=2751483;WS=2751465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	2763697	rs483547	C	T	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=41;PP=1822;SC=CCATTAAAGGCTCTAATGAGG;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=96;WE=2763705;WS=2763687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	2771516	rs300291	G	T	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=8;PP=448;SC=GCAAATTTTTGGTTTTTTATT;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=2771524;WS=2771506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	2891847	rs3826638	C	T	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=26;PP=978;SC=GGGAAGACCGCGCAGTACGCG;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=2891855;WS=2891837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	2892474	rs16943989	G	A	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=27;PP=796;SC=TCAAATTTCAGCCATCAGCAA;SOR=1.077;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=2892482;WS=2892464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	2892562	rs9956161	A	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=292;SC=TTTTTTGTTCATTTTTGATAT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=2892570;WS=2892552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	2909831	rs607411	C	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=26;PP=907;SC=AGTGTTTGAACGGAACTGGTA;SOR=1.159;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=2909839;WS=2909821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	2920288	rs3745012	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=518;SC=CTGAGGTGCCGCCTCAAGACA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=2920296;WS=2920278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	2921444	rs2282635	T	C	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=14;PP=1038;SC=CAAAACTGCTTTGAGAATTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=2921452;WS=2921434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	2934536	rs3765622	G	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=322;SC=AACAGTAAGAGTGACAAGCAG;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=2934544;WS=2934526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	2937646	rs3826637	A	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=17;PP=958;SC=ATAATTTACCATCTAATTTGA;SOR=1.573;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=2937654;WS=2937636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	2946291	rs643507	C	T	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.82;NF=34;NR=34;PP=1468;SC=AGTTCCTTCTCCTCAGTAGTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=2946299;WS=2946281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	2951447	rs10570659	TA	T	88.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=6;PP=82;SC=TTCACCATGGTAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=2951455;WS=2951437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	2954439	rs7226624	C	T	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=623;SC=AACGGTCCGTCTGGGCCACGT;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=2954447;WS=2954429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	2982817	rs1539792	C	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=283;SC=GTATATAATCCAAACAGAAAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=2982825;WS=2982807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	3075503	rs10667835	C	CAAA	3758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=34;PP=2211;SC=AACAAACAGACGAAGAATTTT;SOR=0.928;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=55;WE=3075511;WS=3075493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr18	3085191	rs148266515	AT	A	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=298;SC=GGTATCTGTGATTTTTTTTTT;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=3085199;WS=3085181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	3089522	rs948298	G	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=252;SC=CTTTATCCACGGCCTATTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=3089530;WS=3089512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	3094377	.	GAA	GA,G	58	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5041,0.4959;HP=15;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0,0;NR=6,6;PP=58,15;QD=10.1666666667;SC=TCCATCAAGTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6,6;WE=3094386;WS=3094367;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:12
chr18	3100429	rs7232329	G	A	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=54;PP=1850;SC=TTCGTCCTTCGGAACAAAATA;SOR=1.289;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=86;WE=3100437;WS=3100419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	3112231	rs8096379	G	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=395;SC=AGCACAGAAAGGCCGAACCTT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=3112239;WS=3112221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	3112568	rs8097874	C	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=TCAAACACTACGCAGGTGACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=3112576;WS=3112558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	3168816	rs2230167	G	A	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=9;PP=1068;SC=AAGACTCACCGTTTCTGTACC;SOR=2.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=3168824;WS=3168806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	3169070	.	C	CAAAA	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=36.13;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	3173873	rs10153407	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=136;SC=AGCATTATGGGCTAACTTATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=3173881;WS=3173863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	3173964	rs2230163	G	A	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=723;SC=AAGCCCCAGCGTGGAAGCGAG;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=3173972;WS=3173954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	3174018	rs17183883	C	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=17;PP=1202;SC=AAAACAGAAACGCATGTGAAC;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=63;WE=3174026;WS=3174008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	3174056	rs10153428	C	A	6063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.29;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr18	3174064	rs72860297	G	T	6759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.07;SOR=1.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr18	3174076	rs35188311	A	AAC	7050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=52;PP=2985;SC=AATTTTTAAAAACACACACAC;SOR=1.122;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=91;WE=3174084;WS=3174046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr18	3176017	rs17177479	C	T	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=241;SC=GTGAGCAACACATGGACACTA;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=3176025;WS=3176007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	3176040	rs8099021	C	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=5;PP=255;SC=GTTCTCTTACCCATTAATCTC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=3176048;WS=3176030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	3176063	rs2230162	C	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=458;SC=GAGTGTGCATCCCATATCGAC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=3176071;WS=3176053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	3188976	rs1962519	A	G	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=85;PP=2548;SC=GACTGTTTAGATGTTGTGATT;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=3188984;WS=3188966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr18	3214918	rs7232679	G	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=4;PP=328;SC=GTTGGAGGAGGGCGTCCGACA;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=3214926;WS=3214908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	3215230	rs1662315	C	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=490;SC=ATCCTGTGCCCCTTGAAGGAA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=3215238;WS=3215220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	3253543	rs1791105	G	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=355;SC=TAAGGTTTGAGTAAAGTGTGG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=3253551;WS=3253533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	3253569	rs6417016	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=274;SC=TGTTTCCCACCGGATCACCAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3253577;WS=3253559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	3272798	rs6506097	AG	TA	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=391;SC=TTTTACCTACAGACTTTAGGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=3272807;WS=3272788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	3272855	rs6506099	C	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=640;SC=TTTTGTTTTACGTTTTTGTGT;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=3272863;WS=3272845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	3272874	rs7407072	T	A	780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.02;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	3273153	rs7407045	C	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=330;SC=TTTTTTTGTGCGATGTACAAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=3273161;WS=3273143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	3277466	rs6506100	TG	CA	5041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=56;PP=2947;SC=AAAGTACTTCTGTGAAATAGA;SOR=1.199;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=97;WE=3277475;WS=3277456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	3277691	rs6506102	A	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=509;SC=TACGATTGACAAGCTTTAGGA;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=3277699;WS=3277681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	3447871	rs151472	T	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=29;PP=1092;SC=TCCCCCCTTCTCCTGGAAAGT;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=3447879;WS=3447861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	3580485	rs2240900	G	T	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.48;QD=28.31;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	3580568	rs143978504	C	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.46;QD=27.58;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	5196992	rs292286	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=10;PP=461;SC=TCCTCTACCCTGCTCCCCTCC;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=5197000;WS=5196982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	5232843	rs9963665	C	T	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=28;PP=1527;SC=ATTGTTACACCCGTCCACAAG;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=5232851;WS=5232833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	5233105	rs3887348	C	G	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=6;PP=186;SC=GTTTACTTGGCCCTCTGCCTC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=5233113;WS=5233095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	5238208	rs1061666	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=773;SC=AACGAGCTTACGGACCGGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=5238216;WS=5238198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	5238412	rs9627	C	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=41;PP=1149;SC=TAATTAGCTGCCTCACCGGCT;SOR=1.451;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=5238420;WS=5238402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	5238442	rs11795	G	C	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=28;PP=830;SC=GTTCGTAGTCGCCTACATCGA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=5238450;WS=5238432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	5292030	rs620652	A	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=35;PP=1523;SC=TTTTAAAGTAAGTGCTGCAGG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=5292038;WS=5292020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	5292207	rs11327444	CA	C	362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=13;PP=245;SC=AAAACTCCTACAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=5292215;WS=5292196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	5407839	rs2874686	C	T	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=858;SC=GGCACGTGTACGCTCTTGCAT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=5407847;WS=5407829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	5407911	rs2322093	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=291;SC=TAGGAAGCTTAATAAGAATAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5407919;WS=5407901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	5410574	rs3817466	A	G	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=41;PP=1341;SC=CCTCAGTGGCAGTGGTCTCCC;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=5410582;WS=5410564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	5420021	rs3752061	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=114;SC=ACTGAAAAAAAAAATACCAAC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=5420029;WS=5420011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	5423631	rs12607210	A	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=133;SC=TTACTCTGAGAGGTCATGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=5423639;WS=5423621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	5433570	rs2272130	A	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=33;PP=1336;SC=TGAGAAGAAAAATATGTTACA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=5433578;WS=5433560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	5433722	rs3931700	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=13;PP=635;SC=GCACTACAAACGAACACCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=5433730;WS=5433712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	5437961	rs5822861	T	TC	2929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=21;PP=2127;SC=GTAAGCACGCTCTTTCCGGAG;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=46;WE=5437969;WS=5437951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	5577258	rs11876037	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=3;PP=260;SC=GTATCCAATGTAGAGTTATAA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=5577266;WS=5577248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	5630531	rs4083186	G	A	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=20;PP=590;SC=GAATTCTCCGGGGTCCAGTCT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=5630539;WS=5630521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	5630676	rs56114101	G	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	5840617	rs9965310	G	T	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=7;NR=3;PP=192;SC=CTCCCATCAGGTATCTCCACT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=5840625;WS=5840607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	5840674	rs9966028	C	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=487;SC=AAGGGGTGGGCGTGAGGCGGG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=5840682;WS=5840664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	5891637	rs28656885	C	A	5265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=75;PP=2965;SC=AGGAGGAGGACGGGGAGGCGG;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=152;WE=5891645;WS=5891627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr18	5956238	rs3737353	C	T	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=7;PP=389;SC=GACTTCTTGGCCTGAGGCAAT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=5956246;WS=5956228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	5956425	rs3737354	C	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=27;PP=936;SC=AAATGTTTTGCCACGGAAGCC;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=5956433;WS=5956415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	5956483	rs3737357	G	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=11;PP=377;SC=TGTGGAACCCGTCATAGCCTC;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=5956491;WS=5956473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	5956502	rs34472471	GCT	G	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=389;SC=TCCGTGTTGAGCTCACCAGTG;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=5956511;WS=5956492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	5960165	rs505559	G	A	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=33;PP=1469;SC=CCTACAGTGCGAGATGAAAAG;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=5960173;WS=5960155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	5969320	.	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=134;SC=AAAGAATGGTCAGTGGGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=5969328;WS=5969310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	6511473	rs4798453	C	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=279;SC=CTGTAATAATCGTGGACATCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=6511481;WS=6511463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	6511669	rs4798454	T	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=25;PP=690;SC=GAGCTCTTTGTTGGTGACATT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=6511677;WS=6511659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	6588929	rs8094425	A	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=18;PP=723;SC=TAACCAGCTCACCAGGATAAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=36;WE=6588937;WS=6588919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	6837446	rs2303977	G	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=904;SC=CTCAAAAGGCGCCTAGTTTGA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=6837454;WS=6837436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	6870524	rs62082833	T	C	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=328;SC=ATTTGTTTTATAGCAAATAGT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=6870532;WS=6870514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	6889973	rs4239328	A	G	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=44;PP=1987;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TGATGGCACCAAACCTTTTCT;SOR=0.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=111;WE=6889981;WS=6889963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr18	6890434	rs1116757	A	G	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=34;PP=1357;SC=TCCAGGTTCCATCTTTCTTAA;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=72;WE=6890442;WS=6890424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	6890591	rs1116756	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=280;SC=TAGATTTGTACTCCTCAAAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=6890599;WS=6890581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	6896450	rs11081282	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=287;SC=ATCATTGAGCCGATATTCATC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=6896458;WS=6896440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	6898415	rs12185460	C	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=535;SC=CACATTAACCCGTTTTCCACT;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=6898423;WS=6898405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	6912004	rs1346931	G	A	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=49;PP=2061;SC=ATATGTGTGCGCACGCACACA;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=107;WE=6912012;WS=6911994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr18	6912143	rs1056408	A	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=842;SC=AAACCCCAACAAAGTTCTTAA;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=6912151;WS=6912133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	6927348	rs2282629	G	A	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.86;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	6927352	rs2282630	TG	CA	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.18;SOR=1.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	6942295	rs733918	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=450;SC=ATGCGATCCATAGCACAAAAG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=6942303;WS=6942285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	6947013	rs489023	C	T	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=168;SC=AAAAGGTTTTCTTGTAGCAAT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=6947021;WS=6947003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	6947143	rs2155697	A	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=13;PP=614;SC=GAAGACCCTCATGGAGAGGAA;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=6947151;WS=6947133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	6947362	rs12966847	C	G	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=294;SC=CATTTGGCCTCCTGGCTAGGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=6947370;WS=6947352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	6948614	rs62081479	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.07;NF=0;NR=10;PP=249;SC=GGGTTTGGACACATTTTCCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=6948622;WS=6948604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	6948629	rs3840904	TTCA	T	311.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.34;NF=0;NR=8;PP=354;SC=TTCCTTCCACTTCATCAGACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=6948639;WS=6948619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	6949052	rs500355	A	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=11;PP=578;SC=TACAAAATAAACACGAACACA;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=6949060;WS=6949042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	6950999	rs62081480	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=504;SC=CAGCGTTGAGAAAGGAAACTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=6951007;WS=6950989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	6951060	rs17439137	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=216;SC=TTGTTTCAGCGTTTACATTGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=6951068;WS=6951050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	6956504	rs11270496	ACAGCTCCAGCTC	A	3028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=22;PP=2989;SC=GATTTTTAGCACAGCTCCAGC;SOR=0.814;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=36;WE=6956523;WS=6956494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	6980457	rs693360	T	C	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=8;PP=319;SC=CTTCCTTATGTTCCTGAGTGA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=6980465;WS=6980447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	6980523	rs607230	T	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=7;PP=353;SC=CACTTACCTTTAGGAATTGCT;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=6980531;WS=6980513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	6982443	rs538815	C	T	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=17;PP=884;SC=GGCTGCTCAGCGAGACGCTCA;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=6982451;WS=6982433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	6985270	rs11664063	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=26;PP=1013;SC=TGGAACTCAGCGGCATGGTCC;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=6985278;WS=6985260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	6985468	rs11660907	A	C	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=20;PP=1448;SC=TGCATATAGAAAAGATGTGTG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=6985476;WS=6985458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	6985499	rs11664115	C	T	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	6985506	rs616722	T	C	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.20;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	6985655	rs617573	C	T	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=37;PP=988;SC=GCAGCAGAAACGGCATTTTAA;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=6985663;WS=6985645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	6986259	rs62081531	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=31;PP=1111;SC=TTGAAAGGACGTGGCTTGCTG;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=6986267;WS=6986249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	6993673	rs62081533	T	C	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=30;PP=819;SC=TCAATGGCTATGGCCAGGTCT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=6993681;WS=6993663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	6997818	rs12961939	A	C	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=85;PP=2965;SC=AGGTTCAGAGAAAGAACGGCA;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=198;WE=6997826;WS=6997808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr18	7010199	.	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=0.765;SC=CCATTATCACCTCTCTCATTG;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=10;WE=7010207;WS=7010189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr18	7037866	rs647595	T	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=247;SC=TCTCTAGGGATGGCATTAACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=7037874;WS=7037856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	7039034	rs62083462	G	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=799;SC=ATAGGTGTTCGGTGATCCACA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=7039042;WS=7039024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	7042099	rs9946620	A	G	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	7042104	rs9957859	C	T	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.60;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	7042402	rs648161	A	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=GGAAGATAAGATGATCCCAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=7042410;WS=7042392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	7049294	rs144543039	G	GTTTA	715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=568;SC=AATGTCAATTGTTTATTTATT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=15;WE=7049302;WS=7049284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	7947184	rs11661715	A	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=7;PP=196;SC=TGAATTCATCACTCAGGTGTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=7947192;WS=7947174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	8244335	rs12962826	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.78;NF=1;NR=5;PP=132;SC=GGTTTCTTCAGTCATTTTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=8244343;WS=8244325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	8248041	rs12964764	G	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=7;PP=555;SC=AACCCAATGCGTTTCTACAGC;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=8248049;WS=8248031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	8343381	rs16953329	T	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=323;SC=AGTTGAAACTTACAACAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=8343389;WS=8343371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	8379046	rs3826631	A	G	365.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.72;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	8379046	.	AGG	GGC	334	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=334;QD=64.5779791437;SC=TTGGGGAGGGAGGGGGAAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8379056;WS=8379036;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	8379048	rs9789240	G	C	365.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	8379095	rs3819095	G	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=346;SC=TGCATCTTTCGAAAACTGCAC;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=8379103;WS=8379085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	8380473	rs657374	T	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=36;PP=1069;SC=GGGGGTCAAGTTTGTTTTTAC;SOR=2.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=8380481;WS=8380463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	8387058	rs664201	T	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.82;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	8387065	rs594742	C	T	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	8387195	rs593978	G	A	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=578;SC=GGCAAGAGGAGTACAATGGCG;SOR=1.143;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=8387203;WS=8387185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	8387219	rs593950	G	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=355;SC=AAGGCCGCACGGTTGTGCACT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=8387227;WS=8387209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	8545593	rs7236554	A	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=639;SC=ATGGACAACTAAGGCAAATTG;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=8545601;WS=8545583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	8545617	rs7234996	G	A	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.42;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	8545622	rs7236681	A	G	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	8545736	rs7236864	A	G	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=62;PP=2425;SC=TGAAGGTAGCAATCAACACTG;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=128;WE=8545744;WS=8545726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr18	8545785	rs7236891	A	G	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=58;PP=2166;SC=GCACCAGAACAAGGACCAGGA;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=8545793;WS=8545775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr18	8545823	rs7241117	T	C	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=50;SC=TGGTGAGGCGTGAGTGGCTCT;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=83;WE=8545831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	8545859	rs7237030	A	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=37;PP=1250;SC=CATGGGGCATATGCCACAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=8545867;WS=8545849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	8705583	.	A	ACGCCGCCGCCGC	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.06;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	8705679	rs8089706	C	T	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=13;PP=475;SC=TGAACGGCCCCGCGGGCGGAG;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=8705687;WS=8705669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	8705871	rs142882599	T	G	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	8706143	rs11661625	C	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=344;SC=GGCCGCAAAGCCAAGCGCGGC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=8706151;WS=8706133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	8706186	rs11661629	C	T	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=25;NR=12;PP=739;SC=CCGTCGGCCCCCCGACCCCGG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=8706194;WS=8706176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	8783835	rs35739383	T	C	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=29;PP=1097;SC=ATGGAGGACATGCGGGGCCAG;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=64;WE=8783843;WS=8783825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	8784370	rs918272	A	G	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=42;PP=2505;SC=ACTCGGAGGAAATGTTTGAGA;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=104;WE=8784378;WS=8784360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr18	8786117	.	C	CCCCA	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=10;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=65.83;NF=9;NR=2;PP=107;QD=10.5454545455;SC=ATCCCCCCCCCCCGCCCTCCC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=11;WE=8786125;WS=8786107;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,11:0.79:14
chr18	8793236	rs556991	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=39;PP=1050;SC=GCTAGACTCCTGGGCACGTAT;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=8793244;WS=8793226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	8796503	rs2287501	C	T	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=135;SC=TCTGTTTTGTCCTTGACCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=8796511;WS=8796493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	8798185	rs12386117	G	A	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=42;PP=1545;SC=CAGTGACCGAGGCTGTGGCTT;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=8798193;WS=8798175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	8821301	rs656602	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=233;SC=GATTGTACTTTAAAGGCCTCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=8821309;WS=8821291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	8821556	rs629142	G	T	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=110;SC=GTCTTAAAATGTTGTTTTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=8821564;WS=8821546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	8824590	rs610915	C	A	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=1;PP=82;SC=GTGTGGGTGGCAGCGGGTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=8824598;WS=8824580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	8825192	rs581894	A	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=26;PP=1040;SC=ACACCAAGGGAGGCCCTCCAG;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=8825200;WS=8825182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	8826083	rs3744977	G	C	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=23;PP=1217;SC=CTGGCTACACGCTCACTGAGA;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=8826091;WS=8826073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	9105108	rs1396740	C	T	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=131;SC=ATTACTTATACAACCAGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=9105116;WS=9105098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	9117867	rs906807	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=10;PP=398;SC=CATAAGACAGTTATGCAAAAT;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=9117875;WS=9117857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	9255982	rs4798791	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=14;PP=444;SC=AGTAGAGAAAAGATGGATAGG;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=9255990;WS=9255972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	9512985	rs1813100	G	A	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=836;SC=TTCTCTTGGTGCAGGTGTAAT;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=9512993;WS=9512975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	9522606	rs329007	G	A	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=47;PP=1365;SC=TGAACTTGAGGAGATAGGTAA;SOR=1.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=9522614;WS=9522596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	9522666	rs2241943	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=322;SC=GGACAGTGTCAATGTATAAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=9522674;WS=9522656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	9553179	rs403093	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=183;SC=AGTAAGACACATATTACAGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=9553187;WS=9553169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	9562042	rs2306134	C	T	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=804;SC=GTCTGAATCGCTGTGAATATA;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=9562050;WS=9562032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr18	9775372	rs6506697	A	G	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=636;SC=CCTGTATGTCATTCTCCTTCG;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=9775380;WS=9775362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	9775411	rs6506698	A	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=274;SC=CATCAGAATGACCACTCTGTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=9775419;WS=9775401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	9814187	rs16955689	C	T	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=581;SC=TTGCCAGTAGCGTGCCACTAT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=9814195;WS=9814177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr18	9887394	rs2240910	C	T	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.549;NF=74;NR=63;PP=2303;ReadPosRankSum=0.215;SC=TAGAGGAAGCCATCCAGCCCA;SOR=0.508;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=137;WE=9887402;WS=9887384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,149:0.97:153
chr18	9887497	rs11081510	G	A	7296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=38.20;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr18	9887546	rs2240906	G	A	7180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=6.214;NF=80;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.062;SC=CCCAAGAAGGGTGACATCCCC;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=172;WE=9887554;WS=9887536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr18	9888069	rs2240905	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=16;PP=634;SC=ATAAAAAAGAAGAAAAGGTGG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=9888077;WS=9888059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	10454960	rs28769876	C	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=22;PP=893;SC=GTGCGGGAGGCCCCAGAGCAG;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=10454968;WS=10454950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	10455077	rs28379930	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.53;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	10455081	rs201120946	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.92;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	10455133	rs28484275	C	T	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=225;SC=CGCGGCACGGCCTACACTGTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=10455141;WS=10455123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	10468377	.	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr18	10485357	rs489837	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=55.99;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	10485363	rs91958	T	C	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	10485369	rs91959	G	A	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=2.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	10487918	rs3185480	C	T	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1419;ReadPosRankSum=1.629;SC=CAGAGGACCTCGCAGAAGACA;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=69;WE=10487926;WS=10487907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,76:0.97:78
chr18	10488091	rs1045584	G	T	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=10;PP=285;SC=TGACAGATTTGCTTTACCAAA;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=10488099;WS=10488081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	10526187	rs2290279	A	G	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=9;PP=284;SC=GCCTGTGTGTAGACGCCGGGT;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=10526195;WS=10526177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	10526263	rs12962879	C	G	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=52;SC=GGCTGAGGGGCCTCGGCGCGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=10526271;WS=10526253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	10530928	rs509370	T	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=23;SC=ATGCTTTCTATAAGGCTTTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=10530936;WS=10530918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	10532897	rs652521	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=TAAAATGTTTTTAAATTAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=10532905;WS=10532887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	10539739	rs640832	A	G	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=15;PP=865;SC=TGACCTGTCTACTGTATCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=10539747;WS=10539729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	10540299	rs17546495	A	G	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=30;PP=1337;SC=AAAGCAGCCAACACTTGTTTT;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=10540307;WS=10540289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	10540432	rs510110	A	C	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=617;SC=GTGTTTAACTATACTTTGAAT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=10540440;WS=10540422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	10677880	rs5823112	GA	G	201.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=7;PP=111;SC=TTTCTGTGAAGAAAAAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=10677888;WS=10677870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	10680104	rs1944383	C	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=164;SC=ATCTAAAGTTCCCATTCTTCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=10680112;WS=10680101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	10680132	rs688237	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	10680142	rs688222	T	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.13;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	10680163	rs487037	G	A	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=723;SC=ACTGGGGAAAGGGATAAATTA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=30;WE=10680171;WS=10680153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	10691192	rs3748423	T	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=278;SC=TCTTCCCCCATAAGTGACTGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=10691200;WS=10691182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	10691216	rs3748422	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=495;SC=GTTGCAGAGCGTCCTACCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=10691224;WS=10691206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	10691357	rs3748421	G	A	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=43;PP=1435;SC=ACCAAAGCTGGGCAACCAGGT;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=10691365;WS=10691347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	10696043	rs11661737	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=321;SC=TGGAGGCAGGTTGGTGCCTCT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=10696051;WS=10696033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	10696227	rs2277860	C	T	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=21;PP=961;SC=TCACCAAAAACGGCCCCGGGA;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=10696235;WS=10696217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	10696333	rs868525	C	G	3496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	10696337	rs868526	A	G	3496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	10698010	rs6146217	C	CGGATGCATTTGTGAACAATTACTGA	321.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=2613;SC=TGAGTATGCACGGCCTTGGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=10698018;WS=10698000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	10736476	rs35790059	G	GT	1792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=10;PP=1555;SC=AATTGCAGATGTAAATCAGAA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=10736484;WS=10736466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	10736515	rs12455888	T	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=32;PP=1742;SC=ATATGAATATTACAGGAGGTG;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=10736523;WS=10736505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	10741011	rs5024299	G	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=19;PP=769;SC=AGGTTGTAAGGGGATCGAGAA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=10741019;WS=10741001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	10743986	rs7233917	C	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=327;SC=GCATGAGCAACTGCCCCCGCA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=10743994;WS=10743976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	10744108	rs8093389	G	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=24;PP=1221;SC=ATCAGAAGACGGAAGGAGGAT;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=10744116;WS=10744098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	10748603	rs8096037	A	T	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1115;SC=CCCCACTGGGAAGTGTACAGG;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=10748611;WS=10748593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	10758023	rs7407105	G	A	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=18;PP=1117;SC=CCGCATCAAGGTTCATGCAGA;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=10758031;WS=10758013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	10759935	rs2865119	A	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=35;PP=1112;SC=GAGGCAAAAAAAAAAAATCAG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=10759943;WS=10759925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	10759961	rs2865118	G	A	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=925;SC=TGGGAAAGGGGACTGGTGATA;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=10759969;WS=10759951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	10762962	rs7241380	G	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=16;PP=836;SC=TAATGGTTTGGAGCTGGTACA;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=10762970;WS=10762952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	10763007	rs7227167	T	C	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=23;PP=1071;SC=ACGTCCAGACTGTGCAGACAC;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=53;WE=10763015;WS=10762997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	10763218	rs2865131	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=299;SC=ATTCCTAGCATGCGCAAGGAA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=10763226;WS=10763208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	10784733	rs3830641	GA	G	362.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=370;SC=TAGGGTTGAAGAGCTGCCTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=10784741;WS=10784723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	10785070	rs12604151	A	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=114;SC=TCGTTTATTGAATCCCTCTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=10785078;WS=10785060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	10787047	rs6505592	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=250;SC=TCTTTTTTCAGTCCAGTCATA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=10787055;WS=10787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	10787199	rs11468237	GAA	G	219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=61.19;NF=0;NR=5;PP=92;SC=ATCAGACATTGAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=10787208;WS=10787189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	10789014	rs2870106	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=425;SC=AATCTCTGCAGAGGTAGCTCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=10789022;WS=10789004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	10795041	rs6505594	A	G	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=16;PP=580;SC=TGGTCAATACAATGCTCAGTC;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=10795049;WS=10795031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	10797338	rs145681764	T	TATC	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=586;SC=ATATTATACATATCATATTAT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=12;WE=10797346;WS=10797328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	10797567	rs56112279	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=550;SC=AACATGTGACATTTGTATAAA;SOR=3.180;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=10797575;WS=10797557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	11609903	rs8087561	CA	GG	4819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=47;PP=2947;SC=TCCGAGGCCGCACCTGCTTCT;SOR=0.849;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=97;WE=11609912;WS=11609893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	11619799	rs112261054	ATGT	A	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=643;SC=CAGTTATAGAATGTTGTTGAG;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=11619809;WS=11619789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	11824829	rs1647555	A	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=513;SC=CTTGCAAAAAACAGTTTTTGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=11824837;WS=11824820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	11824880	rs1647556	T	A	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	11824886	rs1647557	T	G	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.88;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	11864707	rs4315401	A	G	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=144;SC=TGTGCATGGCAGCCCTTTCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=11864731;WS=11864697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	11864720	rs2855641	A	G	230.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	11864723	rs2855642	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	11867297	rs2855646	C	T	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=33;PP=917;SC=CTTAACTATTCTTGAATTAGA;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=11867305;WS=11867287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	11872218	.	T	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=1.745;SC=AGAGGCACTTTCATGTACTAG;SOR=3.897;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=11872226;WS=11872208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr18	11872516	rs2071140	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=TAAATCAATTTTCTTTCTACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=11872524;WS=11872506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	11884670	rs643652	C	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=168;SC=ACCAGGCACACGTTGAACACC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=11884678;WS=11884660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	11886563	rs662515	C	G	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=32;PP=1323;SC=CTTTCCTCTGCAGGAGCAGCG;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=65;WE=11886571;WS=11886553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	11893764	rs2277729	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=322;SC=GGGAATTAAGTATCAGAGAAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=11893772;WS=11893754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	11998945	.	CA	C	58	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=64.19;NF=2;NR=0;PP=58;QD=30.5;SC=CCCCCCCCCCCACCCAATGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=11998953;WS=11998935;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr18	12008391	rs17593321	C	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=48;PP=1974;SC=GAAAACCTCTCGGCAAGGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=12008399;WS=12008381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr18	12012451	rs2028624	G	A	308.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	12012457	rs635370	A	C	308.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	12014411	rs643107	T	G	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=28;PP=952;SC=ACTTCTGAAATAAAAGTGTGA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=12014419;WS=12014401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	12057195	rs9959517	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=10;PP=716;SC=GTCCTCCTCTATGAGCCGCGA;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=12057203;WS=12057185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	12057389	rs9959781	C	G	5935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=54;PP=2292;SC=GGTCCTGCAGCGCCTGCAGCT;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=12057411;WS=12057379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	12057403	rs9959774	A	G	6064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=56;PP=2177;SC=TGCAGCTCCCAGTCCTTGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=112;WE=12057411;WS=12057379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	12057809	rs9960429	G	C	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	12067762	rs7506731	C	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=12;PP=648;SC=TGCCCCTGGGCTCGTGGGGAG;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=12067770;WS=12067752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	12067777	rs6505712	T	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=13;PP=650;SC=GGGGAGGGCTTCATGGCGCCA;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=12067785;WS=12067767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	12067919	rs12966234	G	A	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=26;PP=965;SC=GGGCATTGGGGTTGTGGGGGG;SOR=1.066;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=59;WE=12067927;WS=12067909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	12068078	rs34203217	G	T	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=1632;SC=CGGAGTGCTCGCAGGCCTCTC;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=12068086;WS=12068068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	12076504	rs12966109	A	C	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=219;SC=CCCCTCGGGGACGCCCATCGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=12076512;WS=12076494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	12094006	rs9964971	C	T	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=137;SC=GAGAAGATCTCTGGCTTCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=12094014;WS=12093996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	12096249	rs1986751	G	T	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=17;PP=709;SC=GCAAATGGTGGCATTTTTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=35;WE=12096257;WS=12096239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	12097547	rs4796945	A	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=349;SC=TTCTACATGGACAGGCATATT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=12097555;WS=12097541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	12099654	rs6505715	T	C	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=12;PP=551;SC=AAACAAGAGATGTAAAAGTCT;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=12099662;WS=12099644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	12115310	rs8091585	C	T	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=13;PP=583;SC=TGTAAAAAGACGGATAATTCC;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=12115318;WS=12115300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	12115339	rs8091463	A	G	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=13;PP=532;SC=TATATTTAGTATATGCTATAA;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=12115347;WS=12115329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	12115509	rs4519391	G	A	186.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=5;PP=109;SC=GTTACTCATTGAACAAAGTGG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=12115517;WS=12115499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	12124152	rs11873244	C	G	955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=25;NR=14;PP=729;SC=CTTACAACAACAAGAAGAAGA;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=12124160;WS=12124142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	12125657	rs7243248	G	A	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=21;PP=1304;SC=GAATGAGGAAGCATTAACAAA;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=12125665;WS=12125647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	12126407	rs9303759	T	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=270;SC=AGATAAGTATTTTTCAAACTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=12126415;WS=12126397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	12254562	rs71369912	C	CCCGCGCACACACCCAT	3794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=27;PP=2973;SC=GCTCCGCGACCCCGCGCACAC;SOR=1.666;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=30;WE=12254570;WS=12254552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	12274104	rs11545881	G	T	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=19;PP=1034;SC=CAGCCAGCACGTCCCCACTTG;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=12274112;WS=12274094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	12308243	rs8087840	T	A	362.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.35;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	12308243	.	TGC	AGT	209	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=209;QD=65.6169687156;SC=GGCCCGCAGTTGCCGCTGTCG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=12308253;WS=12308233;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	12308245	rs8086821	C	T	362.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	12308377	rs8086993	C	A	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=5;PP=113;SC=AGGGCCTCTCCGCGGGTCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=12308385;WS=12308367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	12337616	.	A	G	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=776;SC=GGAGCCGGCTAAAGTGCACAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=12337624;WS=12337606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	12344255	rs200476229	A	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=23;PP=753;SC=GCCTAACAAAATAACAACAAA;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=12344263;WS=12344245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	12348285	rs11553521	T	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=10;PP=412;SC=CAATCACTCGTTCAATTGCCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=12348293;WS=12348275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	12351342	rs11080572	C	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=14;PP=463;SC=CCGGCCTAAGCAGCGCGGGGT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=12351350;WS=12351332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	12358997	rs7407640	A	G	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=34;PP=1087;SC=TCCAGCTTTCACATGTGGTGC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=12359005;WS=12358987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	12359920	rs8097342	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=23;SC=TTATATTTGAGATTACCCATC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=12359928;WS=12359912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12363950	rs2298542	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=GTTTCAGCCACACAAGGAAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=12363958;WS=12363940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12421442	rs3906620	T	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=302;SC=TATCATTTCTTGAATAGTGAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=12421450;WS=12421438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	12429313	rs3760550	C	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=357;SC=GGAGGCGGGACGACCCACTCA;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=12429321;WS=12429303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	12453005	rs499013	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=523;SC=AATAAGGAAGATAATTGGTAT;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=12453013;WS=12452995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	12512385	rs5823223	CA	C	939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=12;PP=344;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=28;WE=12512394;WS=12512374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	12512559	rs550613	C	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1022;SC=CAGGCATAAACATTTCATTAA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=12512567;WS=12512549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	12512574	rs567709	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=708;SC=CATTAAGTTATCTTCTCAAAT;SOR=4.479;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=12512582;WS=12512564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	12546608	rs35057526	GA	G	105.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.78;NF=5;NR=0;PP=121;SC=TCCAGGGGGGGAAAAAAAAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=12546616;WS=12546601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	12634934	.	CA	C	67	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=57.15;NF=6;NR=0;PP=67;QD=11.6666666667;SC=AAGTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=12634942;WS=12634924;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,6:0.50:12
chr18	12634986	rs12454931	T	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=8;PP=379;SC=TATAGTGAGATAGTTCAGTAC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=12634994;WS=12634976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	12658108	.	G	GCGCCC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	13096454	.	T	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=159;SC=GTTCTGCAGGTCAGCTGTGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=13096462;WS=13096444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	13460037	rs59728040	G	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=13;PP=439;SC=ACGTCGTCACGCCATGGTCAT;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=13460045;WS=13460027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	13460078	rs59719495	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=14;PP=398;SC=TCCAGCTTCCTTTTGAAGAGG;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=13460086;WS=13460068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	13643179	rs11080665	C	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=329;SC=GTGATCCATCCGCCTCTGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=13643187;WS=13643171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	13681962	rs35493157	A	T	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=44;PP=1853;SC=TCAGCATTGTATAAAAGTAAA;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=85;WE=13681970;WS=13681952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	13740038	rs45585137	T	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=669;SC=TTCTTTTCTTTTAAAGGAAAT;SOR=3.528;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=13740046;WS=13740028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	13742365	rs4239313	A	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=53;SC=TAGCCCAGATATAATTAAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=13742373;WS=13742363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	13762011	rs4461147	C	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=4;PP=296;SC=CACACCTTGTCGTCTAAATGT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=13762019;WS=13762001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	13825727	rs1541276	A	C	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=887;SC=GTTTTACAGTAAATTTGCTGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=13825735;WS=13825717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr18	13826391	rs2236700	C	G	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=100;PP=2965;SC=TACACATGTTCCTCCTGGCGC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=165;WE=13826399;WS=13826381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr18	13826508	rs2236701	C	T	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=40;PP=1555;SC=GCGTGTTTACCGTGTGCTGGG;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=13826516;WS=13826498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	14105923	rs2159940	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=407;SC=TAAGGCTTTTTTTGAATATGG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=14105931;WS=14105913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	14124330	.	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-8.144;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.975;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,21:0.22:95
chr18	14124335	.	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=5.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=-8.545;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,20:0.20:98
chr18	14124343	.	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=9.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-8.785;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,18:0.18:98
chr18	14124346	.	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=7.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=-8.928;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,18:0.18:101
chr18	14124359	.	G	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=18.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-9.973;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=1.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,16:0.15:109
chr18	14156143	rs149108958	A	G	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.71;QD=24.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	14156241	rs115684852	A	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.99;QD=27.84;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	14157373	rs7505684	T	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=711;SC=ATAAGATAATTTATGAAGTTT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=14157381;WS=14157363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	14378533	rs2137484	G	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=205;SC=GCGGCCGTCGGGGAAAGCTCG;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=14378541;WS=14378523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	14393945	rs56386651	G	A	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=25;SC=CCGGCCGCAGGGGGAGGGGGA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=14393953;WS=14393935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	14542979	rs200806970	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=21.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-3.015;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.811;SOR=3.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,11:0.16:70
chr18	14543139	rs28535987	T	C	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=27;PP=951;SC=CAAACCTCAGTCACCATCTGC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=14543147;WS=14543129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	14779986	rs76927023	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=85;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.506;NF=14;NR=11;PP=311;ReadPosRankSum=1.609;SC=GAATCCAAACGAGAGGAAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=25;WE=14779994;WS=14779976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr18	14780019	rs72873710	G	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=-4.361;QD=21.64;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr18	14780024	rs79199021	T	C	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQRankSum=-4.279;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
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chr18	14780056	rs200028987	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-2.339;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
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chr18	14780082	rs11080793	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.87;QD=41.59;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	14780082	.	GC	AC,AT	166	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=69;MMLQ=27;MQ=53.67;NF=2,0;NR=18,10;PP=145,166;QD=8.98856062736;SC=ATGTGAAAATGCAAAATCAGA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20,10;WE=14780091;WS=14780072;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:20
chr18	14780083	.	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQRankSum=-3.843;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.595;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr18	14780108	.	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQRankSum=-2.100;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	14780116	rs79644245	A	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQRankSum=-1.981;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr18	14780130	rs72873713	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQRankSum=-1.645;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr18	14830262	.	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.719;NF=1;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TTAGAGAAATCCAACTATCAG;SOR=1.230;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=14830270;WS=14830252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr18	14848820	rs4090319	C	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=24;PP=834;SC=ATGGAACAAACGAAAAATAAG;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=14848828;WS=14848810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	14852335	rs12386087	C	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.05;QD=29.36;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	15004191	rs34229476	G	A	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=732;SC=GCCTGGTGCTGCTGCACTTCT;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=15004199;WS=15004181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	15005736	rs4890719	G	A	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=183;SC=ACCCCAAGCCGGGCCCACCCG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=15005744;WS=15005726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	18548542	.	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GTTGGGATTACAGGCATGAGC;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=18548550;WS=18548534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr18	19065494	rs7234335	C	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=877;SC=CCTCTTACAGCGGTCATTTCT;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=19065502;WS=19065484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	19079537	rs8087553	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=306;SC=ACACGGAGCAATGTGGAGAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=19079545;WS=19079527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	19079853	rs4800747	A	G	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=52;PP=2474;SC=TGAAGCAGGAATGTGACTCCC;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=121;WE=19079861;WS=19079843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr18	19100517	rs1395251	T	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=6;PP=1641;SC=TTTAAGTTAATATTGGAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=67;WE=19100525;WS=19100507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	19100758	rs34960489	A	ATCT	3963.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=55;PP=2890;SC=GTAGGTGCTGATCTTAAGAAA;SOR=2.007;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=4;TCR=71;TR=59;WE=19100766;WS=19100748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	19100854	rs9947441	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=396;SC=GAAGATAAAGATATTTTTAAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=19100862;WS=19100844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	19115896	rs4800780	A	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=134;SC=ATTAAAACTGATCTTTACATG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=19115904;WS=19115891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	19119801	rs1818274	C	T	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=38;NR=2;PP=985;SC=AGAGCAAGACCCTGTCTCAGG;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=19119821;WS=19119791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	19119974	rs35031202	GAT	G	2567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=47;PP=2344;SC=TCCAGCCCTAGATATATATAT;SOR=2.115;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=49;WE=19119985;WS=19119964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	19153494	rs973730	C	T	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=45;PP=2489;SC=TCCCTAAAAACGTACTTTGAG;SOR=1.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=19153502;WS=19153484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr18	19284404	.	C	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.101;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AGCCTCGCGCCGCGCCTGCTA;SOR=0.743;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=21;WE=19284412;WS=19284394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr18	19408950	rs9989532	C	T	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=34;PP=1282;SC=TTTAATTCTCCCTTGGTGGTT;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=19408958;WS=19408940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	19423963	rs3216119	GT	G	401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=432;SC=TCTTCAGTAGGTCCAGGGTGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=19423971;WS=19423953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	19780527	rs11352746	AC	A	3050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=29;PP=2091;SC=GGCTGCACAGACCCCGTTCAT;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=54;WE=19780535;WS=19780517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	19996011	rs7227477	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.930;NF=15;NR=6;PP=361;ReadPosRankSum=-0.477;SC=TTTGTGGAGGGAGAGCTGAAT;SOR=1.074;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=21;WE=19996019;WS=19996001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr18	20555219	rs2336916	T	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=24;PP=932;SC=TTTTATTTTATTTAGCTATAC;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=20555227;WS=20555209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	20564800	rs3052770	TTCA	T	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=292;ReadPosRankSum=0.657;SC=GATAATGCTTTTCATCATCAT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=7;WE=20564810;WS=20564790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr18	20586245	rs72889626	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGTTTGAGTGCGTGTCATTTT;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=20586253;WS=20586235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr18	20715656	rs113232639	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-1.142;SC=CGCCGCTCGCGCCCGCCGCTT;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=13;WE=20715664;WS=20715646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr18	20889611	rs17259154	T	C	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=764;ReadPosRankSum=0.789;SC=CAGTAACTAATTGGCACTTTA;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=44;WE=20889619;WS=20889601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr18	20932384	rs8084251	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TGTTTTCTAGATCTGTGATCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=20932392;WS=20932374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr18	20953485	rs9944662	C	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=251;ReadPosRankSum=0.917;SC=TGCAGCCCTGCGGAGAAGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=14;WE=20953493;WS=20953475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr18	20953720	rs8099409	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=795;ReadPosRankSum=-1.793;SC=GCCAGGAGGAGGAGGGCACTG;SOR=1.019;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=47;WE=20953728;WS=20953710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,53:0.45:118
chr18	20964769	rs8094375	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=578;SC=ATATTCCCACATATGTCTGGT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=20964777;WS=20964759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	21017836	rs7226498	T	C	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=67;PP=2319;SC=CGTCCCCTTCTCGGGGATCCA;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=102;WE=21017844;WS=21017826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	21033582	rs8086258	G	C	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=63;PP=1706;SC=GGGACCCCGCGGACCTCGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=90;WE=21033590;WS=21033572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr18	21044087	rs2291992	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=427;ReadPosRankSum=0.305;SC=GTATTATAACCTTATTGTGAC;SOR=0.928;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=25;WE=21044095;WS=21044077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
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chr18	21046250	rs4800486	T	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=646;ReadPosRankSum=-0.603;SC=AGTAAGGATTTATAGATTTTT;SOR=0.423;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=29;WE=21046263;WS=21046240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr18	21046255	rs34308695	AT	A	945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.225;NF=1;NR=15;PP=672;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GGATTTATAGATTTTTTTTTT;SOR=0.446;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=16;WE=21046263;WS=21046240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr18	21055092	rs7235571	A	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=382;SC=CTTTTAAAAGAATTCACACAC;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=21055100;WS=21055082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	21088081	rs1652381	T	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=381;SC=AGCGGGGCATTGGGGTCGCAG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=21088089;WS=21088071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	21100240	rs1367083	C	T	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=67;PP=2143;SC=CCGTGCTTCCCGCTCGATCGA;SOR=2.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=92;WE=21100248;WS=21100230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	21103909	rs891387	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=289;SC=CCTGGATTGTTAGCTCCTTCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=21103917;WS=21103899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	21103971	rs891386	T	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=824;SC=CATTTCTTCCTTGACTACAAT;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=21103979;WS=21103961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	21107628	rs111369676	G	GTATTGTATTTCT	1716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=2957;SC=GGTCTTTAAAGTAGAGTGTCC;SOR=4.863;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=27;WE=21107636;WS=21107618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	21109250	rs1788825	T	C	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=45;PP=1360;SC=TGTCAGCCTTTGTGGAAAAGA;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=74;WE=21109258;WS=21109240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	21109269	rs1652375	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=51;PP=1380;SC=GAAGGTGGGCTGCAGCTTTCC;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=21109277;WS=21109259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	21109466	rs1652376	G	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=419;ReadPosRankSum=1.680;SC=CTGGAGCGATGTGTGCAAAAC;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=24;WE=21109474;WS=21109456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr18	21113285	rs2510344	T	C	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=42;PP=2496;SC=AATGTCCTTCTATTGTGCCAC;SOR=1.227;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=112;WE=21113293;WS=21113275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr18	21119291	rs6507720	A	G	6052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=85;PP=2965;SC=TCAGCAAAACAGGAAAGATTT;SOR=0.939;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=200;WE=21119299;WS=21119281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr18	21119777	rs1140458	G	A	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=9;PP=599;SC=GTACTGACTAGTTGTCCAGCT;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=21119785;WS=21119767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	21120035	rs7239575	T	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=334;SC=GCGAGGATCATGGAGAATAAG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=21120043;WS=21120025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	21120444	rs1805082	T	C	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=67;PP=2965;SC=TCCAATCCAATATCTACTTTG;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=132;WE=21120452;WS=21120434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr18	21123296	.	G	GA	39	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9996;HP=15;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=16;MQ=53.39;NF=2;NR=0;PP=39;QD=21.5;SC=CCGTCTCAGAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=2;WE=21123304;WS=21123286;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr18	21124945	.	C	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=28;PP=1326;SC=GACAGCTTTTCATGTGCCCCA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=21124953;WS=21124935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	21127910	rs2435307	C	T	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=46;PP=2568;SC=AAGTGCTTGCCGCAAGTGTCT;SOR=1.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=123;WE=21127918;WS=21127900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr18	21134557	.	G	A	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=23;MQ=57.57;NF=2;NR=1;PP=27;QD=20.5904041824;SC=GCGACAGAGCGAGACCCTGTC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=21134565;WS=21134547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr18	21192261	rs1652366	G	T	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=25;PP=745;SC=CCTCATACCCGTAACCTTCCT;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=21192269;WS=21192251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	21209988	rs11660305	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=348;ReadPosRankSum=2.164;SC=TAGGGCGGGTGCAGTGGCTCA;SOR=0.401;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=24;WE=21209996;WS=21209978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr18	21228995	rs117566523	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TGCTCCTGTGCCCACAGAGGG;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=12;WE=21229003;WS=21228985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr18	21294117	rs34200895	TA	T	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=0.839;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.666;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr18	21328088	rs9955745	G	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=885;ReadPosRankSum=-0.052;SC=AAAGACTATGGATTTAATTAG;SOR=0.500;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=110;TCF=26;TCR=84;TR=56;WE=21328096;WS=21328078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr18	21329577	rs10502440	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=0.663;SC=CCAATTTTTCATAATTGCGAA;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=21;WE=21329585;WS=21329567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr18	21338276	rs6507894	C	T	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=17;PP=1075;SC=CGTGATGACTCGTGTGTCAGG;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=21338284;WS=21338266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	21338515	rs11308832	TC	T	858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=708;SC=CGTGGCCTTCTCCCCCCTCTC;SOR=2.147;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=23;WE=21338523;WS=21338505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	21343354	rs7232856	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=462;ReadPosRankSum=0.274;SC=TTGACTTATTATGCTTTTTTT;SOR=0.403;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=31;WE=21343362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr18	21353351	rs6507907	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=-1.617;SC=TCAGTGACTTCAAAATTACAA;SOR=0.756;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=16;WE=21353359;WS=21353341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr18	21393229	rs11420756	A	AT	296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=12;PP=223;SC=TGATTTTGTGATTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=21393237;WS=21393219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	21395358	rs2155841	G	C	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=41;PP=1809;SC=ATACAGTGAGGCAGTTTTCAA;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=21395366;WS=21395348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	21396557	rs12608087	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=798;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CCCTAAAGATCGAGGTCAGGG;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=31;TCR=80;TR=55;WE=21396565;WS=21396547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr18	21400005	rs7244406	A	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=365;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AGTAGCTCAGATACTTCCCCA;SOR=0.330;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=20;WE=21400013;WS=21399995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr18	21400028	rs6507956	G	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=676;SC=CCAGTCTCAGGGAGCCCCCTG;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=21400036;WS=21400018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	21404334	rs1941521	A	G	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=24;PP=1503;SC=ATCTAAAATCATAACACTGAC;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=21404342;WS=21404324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	21413869	rs9962023	T	C	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=32;PP=1835;SC=CGGAGGCAGCTCAGCTGTTTG;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=21413877;WS=21413859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	21414100	rs1109949	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr18	21414110	rs1109950	G	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	21424991	rs17202961	C	A	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1154;ReadPosRankSum=-2.171;SC=TCTAGTGGTGCCTGCAGAAAA;SOR=0.340;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=80;WE=21424999;WS=21424981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,87:0.56:156
chr18	21437721	rs867448	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.023;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=691;ReadPosRankSum=-2.387;SC=GGCTTTGCACACCAATTAGTC;SOR=1.070;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=90;TCF=72;TCR=18;TR=44;WE=21437729;WS=21437711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr18	21437931	rs867449	G	C	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=59;PP=1477;ReadPosRankSum=-1.323;SC=GTGACCCAGGGACCGGGGCTT;SOR=0.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=67;TCR=127;TR=91;WE=21437939;WS=21437921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,118:0.52:229
chr18	21441717	rs12965685	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=841;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AGGAGCTGCCCGCAACCATCC;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=51;WE=21441725;WS=21441707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr18	21481340	rs1154227	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAGAGAAGCAGGGATCTTTA;SOR=3.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=21481348;WS=21481330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr18	21495483	rs1541836	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr18	21501003	rs35737354	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=779;ReadPosRankSum=0.384;SC=CCATAAACAACGGCAGAGACC;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=50;WE=21501011;WS=21500993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,66:0.42:156
chr18	21511089	rs1154233	A	G	7333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=126;PP=2965;SC=CGATAGCGGCAGCCCAATTTT;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=105;TCR=126;TR=231;WE=21511097;WS=21511079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr18	21511172	rs1258107	G	C	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=78;PP=1891;SC=CTGGGTGAGTGGAATAATACT;SOR=2.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=19;TCR=78;TR=97;WE=21511180;WS=21511162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	21526087	rs2288592	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=185;ReadPosRankSum=1.245;SC=ATACAACTCACGTATCTTTCT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=15;WE=21526095;WS=21526077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr18	21529722	rs2241643	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.514;SC=TTTCTGCTTGGTTGCAGAGCC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=10;WE=21529730;WS=21529712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr18	21531512	rs2288593	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GTCAAATGCTTCAAAAGCGGA;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=21531520;WS=21531508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr18	21531906	rs11873358	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GCTTCCGTCACTCATGGTTGC;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=21531914;WS=21531896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr18	21534701	rs1051149	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.86;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr18	21534701	.	CTC	ATT	199	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=199;QD=42.0779791437;SC=TCATTCTTCACTCAGGACACA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=21534711;WS=21534691;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,6:0.67:9
chr18	21534703	rs1051150	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.86;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr18	21662736	rs75254145	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=1.411;SC=TGGGGAAAGTCTCTGATTTTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=21662744;WS=21662726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr18	21662816	rs2305024	A	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=618;ReadPosRankSum=1.708;SC=TGGAGTTTTGAAAAATGGAAA;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=76;TCR=23;TR=37;WE=21662824;WS=21662806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr18	21693671	rs894931	G	A	6894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=117;PP=2965;SC=AGATTAAACTGATGCTTTGAA;SOR=0.930;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=93;TCR=117;TR=210;WE=21693679;WS=21693661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr18	21694618	rs4800176	G	A	5201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=103;PP=2965;SC=ATTGGTAAATGTGAAATGTCT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=61;TCR=103;TR=164;WE=21694626;WS=21694608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
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chr18	21703649	rs9956079	A	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=82;SC=GGGATTACTGACATGAACCAC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=21703657;WS=21703639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr18	21706544	.	A	G	2704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=63;PP=1568;ReadPosRankSum=-1.001;SC=AACCCTCCCAAGGAGGAACTA;SOR=0.950;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=202;TCF=92;TCR=110;TR=110;WE=21706552;WS=21706534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,127:0.53:241
chr18	21708999	rs3816822	G	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=0.948;SC=GAACACCTACGTATATGCTTG;SOR=0.392;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=14;WE=21709007;WS=21708989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr18	21710321	rs12970083	C	T	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=69;PP=2168;SC=GTCAGAATAACTTATATGTTC;SOR=1.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=93;WE=21710329;WS=21710311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	21714224	rs112724867	T	G	40.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=0.524;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr18	21714228	rs4800548	G	T	46.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.37;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	21736933	rs1049683	T	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=347;ReadPosRankSum=-2.634;SC=AGAAGGGGAATCAACAGCTGA;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=26;WE=21736941;WS=21736923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr18	21739725	rs1049684	T	C	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1146;ReadPosRankSum=0.153;SC=AACCTCTTCCTGGACATGCTG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=67;WE=21739733;WS=21739715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr18	21747400	rs35693789	A	G	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.765;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=61;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.951;SC=AACTCCTCAGAGGTGCTCATC;SOR=1.123;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=100;WE=21747408;WS=21747390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,120:0.57:212
chr18	21751296	rs12455391	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=0.729;SC=GTGCCCAGCCGACAATGTATT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=21751304;WS=21751286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr18	21759593	rs12604451	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=1.899;SC=ACATCAAAATTGTTAACTTGC;SOR=1.329;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=15;WE=21759601;WS=21759583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr18	21761321	rs113063578	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-1.113;SC=ACATAACATCCTCCTGGAAAG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=21761329;WS=21761311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr18	21883552	rs1487377	G	A	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=55;PP=2447;SC=CAACAGGTCAGTATCTATGTG;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=129;WE=21883560;WS=21883542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr18	21891975	rs2337961	A	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=35;PP=1545;SC=GGTCTGCAGCAGAAACCGTAT;SOR=1.158;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=21891983;WS=21891965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	21894351	rs12966893	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=335;ReadPosRankSum=1.094;SC=ATTCATTCACATAAAAGAGGA;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=20;WE=21894359;WS=21894341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr18	21894409	rs12966456	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.586;SC=CATGACTTAACGATACCCAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=21894417;WS=21894399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr18	21897189	rs34306542	A	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=830;ReadPosRankSum=-1.535;SC=TCAAAATAAAAATGAAATTAT;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=49;WE=21897197;WS=21897179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr18	21898556	rs12955338	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr18	21901628	rs34481824	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=359;ReadPosRankSum=0.344;SC=TGGGTATGTATGAATAAAATG;SOR=0.858;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=28;WE=21901636;WS=21901618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr18	21912865	rs2848605	A	G	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=769;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TCATTTTATAATTTCAAAATG;SOR=0.996;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=48;WE=21912876;WS=21912855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
chr18	21938384	rs7226913	T	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=11;PP=637;SC=CCTGTCCACTTCTTCCCCACC;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=21938404;WS=21938374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	21938396	rs7226922	T	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=12;PP=708;SC=TTCCCCACCCTCGTGCACAGG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=21938404;WS=21938374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	21938658	rs7227401	T	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=39;PP=1120;SC=TTAGGTGAGATAGAGAGAATT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=21938666;WS=21938648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	21946572	rs656487	T	A,TAA	1884.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.61;QD=33.07;SOR=1.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,36,21:0.63,0.37:57
chr18	21948139	rs9948425	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGATGAACTATTGCTTTAAAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=21948147;WS=21948129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr18	22008913	rs582358	C	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=45;PP=1380;SC=GTTTATATTGCTATAAAAAGA;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=22008921;WS=22008903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	22010421	rs9783924	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=660;SC=ACCTGTGAACCCTTTGTTAGA;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=22010429;WS=22010411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	22017752	rs1941814	C	A	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=1;PP=80;SC=CCTGTATTAACTACTCAGACA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=22017760;WS=22017742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	22018129	rs1791254	A	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=85;SC=ATTATAAAATACAAGTTTCTC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=22018137;WS=22018119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	22020543	rs677688	C	G	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=38;PP=1662;SC=GGAAAGTTCGCTTAAAGCATT;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=89;WE=22020551;WS=22020533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	22056615	rs17259800	C	T	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=245;SC=ATGTCTCCATCCTTTGCACAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=22056623;WS=22056605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	22774991	.	TA	T	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.605;NF=6;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TAACAGAAATTAAAAAAAAAA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=22774999;WS=22774981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr18	22804244	rs4129657	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=0.092;SC=GTGGAGAGTGTAAACATAAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=22804252;WS=22804234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr18	22901967	rs45590038	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=-1.343;SC=ATAAGTATTGTTTACCTGTCA;SOR=0.648;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=18;WE=22901975;WS=22901957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr18	22931849	rs185260009	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=318;ReadPosRankSum=0.247;SC=GCAGCGGCGGCGGCAGCAGCG;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=23;WE=22931857;WS=22931839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr18	23873463	rs1677016	T	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=472;SC=CTCAGAAAAATAGAATAAAAG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=23873471;WS=23873453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	23875336	rs1382260	T	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=382;SC=GACTGATTTCTTGGAAGGCAA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=23875344;WS=23875326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	24039964	rs3835044	AT	A	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=623;SC=CTAAGAGGTGATTTTTTTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=24;WE=24039972;WS=24039954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	24442056	rs455671	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=187;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TAGCTATTTTAGGGATGTGCC;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=12;WE=24442064;WS=24442046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr18	24442392	rs35248760	C	A	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=926;ReadPosRankSum=0.547;SC=CCATGTCGACCGGTAAAGGCT;SOR=0.908;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=59;WE=24442400;WS=24442382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr18	24445433	rs3875089	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=329;ReadPosRankSum=0.110;SC=CTAAAAAGCATCCCTTTTCTT;SOR=1.371;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=18;WE=24445441;WS=24445423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr18	24445692	rs162008	C	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=1034;ReadPosRankSum=2.120;SC=TTGCCTGCCCCGCAGCTCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=32;TCR=82;TR=62;WE=24445700;WS=24445682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,68:0.52:132
chr18	24628487	rs17703902	A	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=885;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GAAGTGGAAGATAAGTTACAG;SOR=0.891;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=58;WE=24628495;WS=24628477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr18	25562831	rs8092870	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	25565082	rs1220144	A	G	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=90;PP=2965;SC=AAACCTTCACACGCAGGATGG;SOR=1.010;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=62;TCR=90;TR=152;WE=25565090;WS=25565072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr18	25570228	rs1628684	G	C	6430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=113;PP=2965;SC=TTGACTGAGGGGGGTGCTGAA;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=94;TCR=113;TR=207;WE=25570236;WS=25570218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr18	25572837	rs1662733	G	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=914;SC=TCAGAGGAGGGGCATGGACCA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=25572845;WS=25572827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	25573308	rs1662734	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=716;SC=GGATGCCTCACGTAAGGCCCT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=25573316;WS=25573298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	25573622	rs2957286	G	C	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=1102;SC=ATAAAGATAAGAACTTAAATG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=25573630;WS=25573612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	25585687	rs874314	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=1.787;SC=TTTCCCAAAAGCATTATGAAT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=25585695;WS=25585677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr18	25593931	rs1443453	A	C	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=1.292;SC=GCAAAAAAAAACCCCTAATAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=25593939;WS=25593921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr18	25616451	rs1944294	A	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=409;ReadPosRankSum=0.560;SC=GAAAACATACAATTCTGCTTG;SOR=0.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=28;WE=25616459;WS=25616441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr18	27878818	.	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr18	27878846	.	C	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=1.067;SC=TAGTTATTCTCTAATACTATA;SOR=1.655;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=15;WE=27878854;WS=27878836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr18	27879014	.	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-2.039;SC=GGGCCATAATCACTAATGGCT;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=13;WE=27879022;WS=27879004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr18	28611139	rs276936	A	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=36;PP=1049;SC=TCCAAATTAAATGCAAGTAAA;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=28611147;WS=28611129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	28659724	rs1658128	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=246;SC=AGTGCATGTATCCAGCTTTAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=28659732;WS=28659714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	28662776	rs1790702	G	A	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=165;SC=CGCCCGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=28662784;WS=28662766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	28666526	rs35717505	T	TTAA	1524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=11;PP=1134;SC=TCAGGTTTTATTGTTTATGTT;SOR=1.244;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=20;WE=28666534;WS=28666516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	28671212	rs1790683	T	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=ATTAGCTGGGTAGGGGTGAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=28671220;WS=28671202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	28671381	rs34593516	GA	G	700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.42;NF=19;NR=3;PP=406;SC=AAGCAAAACTGAAAAAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=22;WE=28671389;WS=28671371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	28711519	rs1789072	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=532;SC=TAGCATTTAACTTCCATGTAA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=28711527;WS=28711509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	28712737	rs36112658	CA	C	53.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=3;PP=71;SC=GCATATGTCTCAAAAAATTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=28712745;WS=28712727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	28719674	rs1789043	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=184;SC=AAAACATGTCATATATTTATA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=28719682;WS=28719664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	28728384	rs2577067	C	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=406;SC=AATGATAAAACGTAAACATCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=28728392;WS=28728374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	28734749	rs2249810	A	G	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=45;PP=2110;SC=CAAACTGTTCATATTTCTCAC;SOR=1.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=28734757;WS=28734739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr18	28737198	rs2246736	C	T	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=74;SC=TTTATTTACACTAATTGTAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28737206;WS=28737188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	28737299	rs2118342	T	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=727;SC=GTAAGCATATTACTGTGCTAG;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=28737307;WS=28737289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	28739495	.	C	CAA	80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=19;MQ=62.13;NF=0;NR=4;PP=80;QD=21.25;SC=GTTAAAACCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=28739503;WS=28739485;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,4:0.44:9
chr18	28898201	rs1834582	A	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=15;PP=938;SC=TGGGAGAAAGAAAAAGAACAG;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=28898209;WS=28898191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	28898294	rs1426310	A	G	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=38;PP=1467;SC=AGTAGTTGCAATGCTGTTCAT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=69;WE=28898302;WS=28898284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr18	28906460	rs57200666	TG	CA	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=2;PP=334;SC=TATGGTTTCATGTTGTTTTTA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=28906469;WS=28906450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	28907096	rs765054	C	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=254;SC=ACTATAGTCACCTAGATGATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=28907104;WS=28907086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	28908090	rs2303465	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=783;SC=GAAAGCTGTCGTATATCAAAT;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=28908098;WS=28908080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	28913599	rs12967407	C	T	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=29;PP=1422;SC=ACCGAGATGGCGGGGCAGATG;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=28913607;WS=28913589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	28913929	rs5823800	TTC	T	581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=326;SC=CCTACTGTAGTTCTCTCTCTT;SOR=1.473;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=7;WE=28913938;WS=28913919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	28916230	rs74277377	G	GAT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=87;SC=AAGATAATAAGTTTTTTTTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=28916238;WS=28916220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	28916290	rs6506917	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=244;SC=TTCTTATAATGAAACTATTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=28916298;WS=28916280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	28923983	rs11660224	AT	CA	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=539;SC=TTTGTTTAACATCTCAAATGC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=28923992;WS=28923973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	28935375	.	C	T	37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=37;QD=23.9237375157;SC=ACTAAAAAACCAACAATGTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=28935383;WS=28935365;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	28966518	rs1460597	G	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=84;SC=GTTGTGAATTGGTGAAAACAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28966526;WS=28966513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	28968371	rs16959856	G	A	4082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=46;PP=2573;SC=TAACATACCGGATTTCTGGAG;SOR=1.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=125;WE=28968379;WS=28968361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr18	28968959	rs9956865	C	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=34;PP=1020;SC=ACACAGCCAGCATTGAAGAAA;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=28968967;WS=28968949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	28969008	rs16959863	C	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=590;SC=TCCTTCTCTACGTCACAGCAT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=28969016;WS=28968998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	28970957	rs143657134	G	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=791;SC=GTAAATAAAAGAGTAGAGAAA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=28970965;WS=28970947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	28986333	rs4799570	A	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=35;PP=1005;SC=CCTGCTACTGATTTGTAAGTA;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=28986341;WS=28986323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	28993501	rs7234288	C	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=29;PP=1033;SC=CCACATCCCCCATGACATCTC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=28993509;WS=28993491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	29055957	rs1380866	A	G	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=24;PP=950;SC=TGCTTTGTCCACCTCTGGGTC;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=29055965;WS=29055947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	29098323	rs2276149	G	A	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=33;PP=1146;SC=TTACTAGATTGAAGACACATG;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=59;WE=29098331;WS=29098313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	29101230	rs55657337	T	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;QD=21.07;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	29104698	rs2230233	C	T	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=28;PP=1398;SC=ATCAAGTCAACGTAGAAGTTA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=29104706;WS=29104688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	29116462	rs2276150	T	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=487;SC=TTGTAAGTTGTATTTCTTCTC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=29116470;WS=29116452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	29125854	rs1042769	A	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=33;PP=1261;SC=AATTCAAGACACTAGCTGAAG;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=29125862;WS=29125844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	29126670	rs1791235	T	C	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=37;PP=1429;SC=CCACCAGAGTTACCAAGCATA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=29126678;WS=29126660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	29206121	rs3764474	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=249;SC=TCAGCAAAAAATACTTCCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=29206129;WS=29206111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	29207155	rs1026123	C	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=514;SC=AAGGTTTCAGCCTTTTATGTG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=29207163;WS=29207145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	29264182	rs1449081	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=355;SC=GCCCCTGTTTGAACAGCTTCC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=29264190;WS=29264172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	29426552	rs34846731	A	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	29426868	rs682279	A	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=180;SC=AGTGGAAATAATATGGCCAAT;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=29426876;WS=29426858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	29447468	rs2291238	T	G	249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=105;SC=AAATTATACATTCCAATGAAC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=29447476;WS=29447458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	29451174	rs8084584	T	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	29487596	rs4581778	T	A	246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.68;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	29497573	rs6506948	A	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=30;PP=1241;SC=TTCATGATCCAATGCTGGCAT;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=64;WE=29497581;WS=29497563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	29793526	rs335518	C	T	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=65;PP=2149;SC=ACCACCGGTTCGTAACTCATT;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=29793534;WS=29793516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	29795076	rs173032	T	C	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=22;PP=1231;SC=ACAGGCCTTCTAAAGTGGGAA;SOR=1.051;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=54;WE=29795084;WS=29795066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	29795101	rs233223	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=30;PP=1442;SC=GGCTTTGTTCTCTAATGGAAC;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=68;WE=29795109;WS=29795091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	29972774	rs3786309	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=7;PP=394;SC=CTTTCTAGTTTACAGACAATT;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=29972782;WS=29972764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	30093722	rs11081773	A	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=7;PP=233;SC=GTCTATGAGGATTTCATGAAA;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=30093730;WS=30093712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	30672631	rs1995096	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=216;SC=GGATATCATCGTCAGATCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=30672639;WS=30672621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	30804756	rs466113	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=651;SC=TGTTCTTTGTCGAGACTTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=30804764;WS=30804746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	30846895	rs9965081	A	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=4;PP=216;SC=ATTGGTTTTTACTGTTATTTT;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=30846903;WS=30846885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	30950168	rs9965655	T	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=34;PP=1119;SC=AGAGAACAAATAGAAGTTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=30950176;WS=30950158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	30976968	rs4447495	C	G	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	30977255	rs6507018	G	A	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=85;SC=GTAAGGATACGGGAAGAAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=30977263;WS=30977245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	31225030	rs4799705	G	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=666;SC=ACATGTGAAGGTAAACAAAAT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=31225038;WS=31225020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	31241497	rs9304126	C	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=175;SC=TTTTCAATTGCAGAAAAGCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=31241505;WS=31241487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	31263320	rs8086318	G	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=23;PP=1330;SC=GTACGTACACGTTTCCCTCTA;SOR=1.488;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=31263328;WS=31263310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	31312106	rs10432168	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=323;SC=TCTCTGATTTTTCAGTCTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=31312114;WS=31312096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	31314196	rs34501189	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=323;SC=AGTTTACTCAAATGAATTACA;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=31314204;WS=31314186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	31318336	rs1845385	T	C	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=76;SC=ATGTTAATGATTATAAATGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=31318344;WS=31318334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	31318376	rs1493910	A	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=116;SC=ATTGAATACTACATTCATGAG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=31318384;WS=31318366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	31320229	rs2282632	A	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=30;PP=1603;SC=GGGATAAGAAATGAAAGTAGA;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=31320237;WS=31320219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	31324934	rs7232237	A	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1216;SC=AACACAGAACATGAAAGCTTC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=31324942;WS=31324924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	32400994	rs143240161	T	TA	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=25.23;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	32459704	rs2288085	A	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=25;PP=738;SC=TCCGCTTGGAAGCATTTTCTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=32459712;WS=32459694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	32558525	rs34534618	C	A	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=44;PP=1829;SC=AGAATGGCAACATTTCCCCTG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=91;WE=32558533;WS=32558515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	32650341	rs3744923	A	G	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=221;SC=GTCATGTGGAATGTGATTTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=32650349;WS=32650331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	32720189	rs3786314	A	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=920;SC=GGCAGTGGCAATGGGCTGGGA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=32720197;WS=32720179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	32822382	rs4799374	G	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=262;SC=ACACTCCTTCGCAAGCACAGA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=32822390;WS=32822372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	32823757	rs62096496	A	C	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=16;PP=627;SC=AGCCCAAGTAAAGGCCATACC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=32823765;WS=32823747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	32823905	rs1054890	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=20;PP=1164;SC=GTATGTCATGTTAATTTGTTT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=32823913;WS=32823895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	32826088	rs2278463	A	G	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=27;PP=1053;SC=GACATCAGAGAATTCATAGTG;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=32826096;WS=32826078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	32836089	rs4799376	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	32886528	rs147217916	T	TAGTC	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=751;SC=ACAAACATTTTAGAGTTCTGA;SOR=3.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=32886536;WS=32886518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	32887914	rs1131709	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=294;SC=CATTAAAACCACACTGGATCC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=32887922;WS=32887904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	32887933	rs9963614	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=245;SC=CCGGATACGTATGGTGGCTCA;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=32887941;WS=32887923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	32917644	rs2032729	T	C	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=36;PP=1475;SC=AACACCCATATTGAGAGTGCC;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=32917652;WS=32917634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	32917780	rs5823970	G	GA	418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=458;SC=TCTATTAAGGGAAAAGAAACC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=32917788;WS=32917770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	33514043	rs72889069	C	T	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=255;SC=CTTGAACTCCCGGGCTCAAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=33514051;WS=33514033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	33514223	rs72889071	A	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=174;SC=TCGTGGATCTACACTGTAGAT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=33514231;WS=33514213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	33557466	rs2276314	A	G	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=890;SC=TGCCACTCCTACAAGTAAACT;SOR=1.036;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=42;WE=33557474;WS=33557456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	33573400	rs16967317	A	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=263;SC=GTGAGTTTTCACATCAAAAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=33573408;WS=33573390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	33605753	rs1047866	T	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=424;SC=ATTAACACTATGTTTAAAATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=33605761;WS=33605743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	33613595	rs3737474	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=472;SC=ATTTTAATAGTTTAAGGCAAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=33613603;WS=33613585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	33647254	rs1789517	A	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=28;PP=1780;SC=TGACGATGGGACGCGAGTGTT;SOR=1.454;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=33647262;WS=33647244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr18	33691313	rs1540043	T	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=266;SC=TCCAGTGTTTTTGAGAGGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=33691321;WS=33691303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	33706614	rs1789528	C	G	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=67;PP=2651;SC=GATGCTCGTGCTCTGAGTGAT;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=130;WE=33706622;WS=33706604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr18	33709762	rs1632169	G	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=841;SC=TCAGGGGGGCGGGGCTGCCTC;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=33709770;WS=33709752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	33713132	rs1785904	T	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=174;SC=CTGAAATCTGTTTTTACTTAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=33713140;WS=33713122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	33713287	rs1785905	T	A	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=12;PP=444;SC=GCTGTAAGTATTAACCAGATT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=33713295;WS=33713277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	33718326	rs1785934	A	C	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=22;PP=774;SC=TGCATTATGTACACTGATCGT;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=33718334;WS=33718316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	33719434	rs1785932	C	T	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=380;SC=AGCCACCAGCCTCTCTCGCCC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=33719442;WS=33719424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	33722425	rs1789549	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=409;SC=ATGTTTTTCTATTGTCCCAAT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=33722433;WS=33722415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	33725874	rs1789546	T	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=692;SC=ACATGATGATTGTTGATCACC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=33725882;WS=33725864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	33725931	rs1785928	G	A	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=19;PP=939;SC=ACAGCAGCCAGTGAGATTATT;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=33725939;WS=33725921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	33726447	rs1785927	C	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=287;SC=AGTAGAGGCACTTGAAGTTCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=33726455;WS=33726437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	33744677	rs684890	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=325;SC=ACAGTTATGTTCATTTTATCT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=33744685;WS=33744667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	33750046	rs8299	C	T	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=31;PP=1305;SC=GGGGTGAGTGCGACTCCACTG;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=33750054;WS=33750036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr18	33767479	rs11665282	G	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=200;SC=GGGCCCGGCCGGCCTGGATGG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=33767487;WS=33767469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	33767749	rs4267398	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=380;SC=GGCGCATTTTGAATCGAAACT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=33767757;WS=33767739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	33778607	rs596644	C	A	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=48;PP=1798;SC=ACAAAAGAAGCGACCCTAAGT;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=33778615;WS=33778597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr18	33779821	rs646424	C	A	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=26;PP=1398;SC=AGTGGGTATGCGGAACGTGAC;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=33779829;WS=33779811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	33779855	rs623053	C	T	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=31;PP=1700;SC=GTCATATCCACCCCGGTCAGG;SOR=1.095;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=33779863;WS=33779845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	33779896	rs540967	A	G	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=44;PP=2718;SC=AGAGGAACGTAGTGCTTCAGC;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=121;WE=33779904;WS=33779886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr18	33780020	rs623558	A	G	5061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.605;SC=GGGCGGTTGCACCCTGTGAGC;SOR=0.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=66;TCR=88;TR=153;WE=33780028;WS=33780010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr18	33783030	rs579596	T	C	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=38;PP=1634;SC=GCACATGGATTGTTTTGACCA;SOR=1.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=93;WE=33783038;WS=33783020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr18	33785093	rs678560	G	A	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=11;PP=438;SC=GTATACCTACGTGGCCCTGTC;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=33785101;WS=33785083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	33785185	rs667667	A	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=14;PP=426;SC=TTCAGGGCCCAATCATCAATT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=33785193;WS=33785175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	33785304	rs667195	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	33793511	rs687387	T	C	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=79;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=88;SC=TTGCTGCCTGTGTGTCTGGGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=33793519;WS=33793501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	33795425	rs631108	G	A	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=193;SC=ACTGTTTCCAGTGTCTCTATG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=33795433;WS=33795415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	33828805	rs4799859	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=325;SC=TTGGTTACTACAGCTTTGTAG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=33828813;WS=33828795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	33828980	rs567458	C	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=22;PP=664;SC=CTCTGAAGCACGTGAAAATCT;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=33828988;WS=33828970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	33829077	rs568388	T	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=201;SC=CCAGTTGCTGTCCATTTCTCC;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=33829085;WS=33829067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	33831044	rs518413	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=TATTTTGTAACCAAACTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=33831052;WS=33831034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	33848663	rs111317566	A	ATACAT	1140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=932;SC=AATTTTTAGCATAAAGTTTCT;SOR=2.387;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=16;WE=33848671;WS=33848653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	33877687	rs188660514	T	C	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=0;PP=228;SC=AGCCTGCGAGTCCGCGAGCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=33877695;WS=33877677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	34205385	rs2644253	A	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=53;SC=AAAAATCCCTATTAGGGCAAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=34205393;WS=34205379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	34232610	rs2848901	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=15;PP=447;SC=CCTGCTGTCTCGAATGCCAGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=34232618;WS=34232600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	34232952	rs1893433	T	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=559;SC=ACACAGTGTGTTAACTGCACC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=34232960;WS=34232942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	34233231	rs1893434	C	T	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=27;PP=1468;SC=GTCTTTTTGACGCTGAAGAAT;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=34233239;WS=34233221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	34297753	rs3809994	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=233;SC=GAAGTGAGGCCCCCTTGCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=34297761;WS=34297743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	34298732	rs7240383	G	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=638;SC=GGGCTGAAGAGATTCGTTCTG;SOR=2.517;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=34298740;WS=34298722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	34310668	rs3744903	C	T	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=58;PP=1991;SC=AGAGGAGTAACGCCATCAATA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=34310676;WS=34310658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	34323855	rs11878091	T	C	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=162;SC=CCATGGATCATGGAGCATGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=34323863;WS=34323845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	34324091	rs2303510	G	A	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=1559;SC=CACCATGGTGGTAGAAAACTT;SOR=1.076;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=34324099;WS=34324081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	34324190	rs2303509	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=445;SC=TGGGCCTGGTCTCGCTGCAGC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=34324198;WS=34324180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	34398914	rs1045781	C	T	3229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=49;PP=1673;SC=TGATGGTCACCTCAGTCACAC;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=34398922;WS=34398904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	34408969	rs9958080	C	G	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=112;SC=CCTTCGCCCCCACCCTCTCGC;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=34408977;WS=34408964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	34539578	rs3744904	A	G	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=113;SC=CTGTTCCTGGACCCAAAGGTA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=34539586;WS=34539568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	34850846	rs1443638	G	A	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=617;SC=TGCTAGGCACGGCTGGTGCAG;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=34850854;WS=34850836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	35145660	rs138975334	T	TCTCG	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=711;SC=CGCTCCTCTCTCTCGCTCGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=35145668;WS=35145650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	39542407	rs33946724	GAT	G	1130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=927;SC=TTAAAAGAAAGATATATATAT;SOR=2.303;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=19;WE=39542416;WS=39542397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	39570683	rs11082257	A	G	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=141;SC=TATAACTACAACAAGATTACA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=39570691;WS=39570673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	39623942	rs534507	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=298;SC=ATGCTTTGACATAATAGTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=39623950;WS=39623932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	40323497	rs1804730	G	T	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=27;PP=1008;SC=AAGAACCTTTGAGCTTCTTCC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=40323505;WS=40323487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	42456653	rs663651	G	A	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=22;PP=821;SC=CCCATTCCCCGCAAAACCCGG;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=42456661;WS=42456643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	42456670	rs3085861	C	CTCTT	2666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=20;PP=1781;SC=CCGGTTCTCTCACTCTTCCTT;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=42456678;WS=42456660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	42533130	rs8096662	A	G	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=34;PP=1475;SC=GCACGAGATCAGAGAACCTGG;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=42533138;WS=42533120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	43204848	rs1484872	C	T	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=582;SC=CAAAAGATGCCGCTTTCCCAC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=43204856;WS=43204838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	43205630	rs41300078	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=25;PP=955;SC=TTGATGTCTGGTTGGTTTCTC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=43205638;WS=43205620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	43206985	rs1484873	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=8;PP=213;SC=GGTGATGTTCATCAACAATCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=43206993;WS=43206975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	43221341	rs7233416	T	C	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=35;PP=1117;SC=AACCAGGTTATTCTGGCTATT;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=43221349;WS=43221331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	43243679	rs8092227	A	G	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=43;SC=GATTTTTCCCAGCTCTCTGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=43243687;WS=43243669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	43245986	rs7234198	T	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=440;SC=GCTTCCTCAGTAGGAACAGGA;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=18;WE=43245994;WS=43245976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	43246156	rs9960464	G	A	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=28;PP=1159;SC=TTTCCCTATCGATACCGGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=43246164;WS=43246146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	43246779	rs2170973	C	T	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=4;PP=108;SC=GGAGGTTAAACAGCAATTTAA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=43246787;WS=43246769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	43247001	rs2156609	C	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=412;SC=GGAAAAGGGTCAGCAAAGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=43247009;WS=43246991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	43247784	rs9964193	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=495;SC=CTTCCTGCCCCGGTTCCATTT;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=43247792;WS=43247774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	43248504	rs6507631	T	C	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	43248509	rs10451385	T	C	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	43248578	rs9304319	C	A	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=382;SC=GTCCACTGGACTAATAACTAA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=43248586;WS=43248568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	43252786	rs1531926	A	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=297;SC=GGAAGGGTTCAGTGCCAAGTC;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=43252794;WS=43252776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	43307246	rs11877062	C	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=16;PP=799;SC=GATGAATGGACGGTCTTTGAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=43307254;WS=43307236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	43307338	rs11877086	C	A	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=24;PP=947;SC=CGCGCAGAGGCATCGCCCGGC;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=43307346;WS=43307328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	43307455	rs3861806	C	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=299;SC=GTATCTTTTCCGGGCAGAGCC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=43307463;WS=43307445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	43310845	rs3819178	G	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=172;SC=ACAATGGGTTGAGAGAGAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=43310853;WS=43310835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	43314401	rs35812340	G	GA	131.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=4;PP=93;SC=ATGCCTTTTTGAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=43314409;WS=43314391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	43314473	rs8096571	T	A	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=23;SC=CAAGATGAAATATGTTCTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=43314481;WS=43314463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	43316538	rs2298718	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=27;PP=1163;SC=ATTACAATCCATTCTTTCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=43316546;WS=43316528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	43319359	rs531281	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=311;SC=TCCAGATCTTCCTTGAGATCT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=43319367;WS=43319349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	43319519	rs1058396	G	A	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=22;PP=858;SC=CCCATTTGAGGACATCTACTT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=43319527;WS=43319509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	43416974	rs9950673	T	A	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=15;PP=556;SC=TAACCCGGGGTTAACTGTGTT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=43416982;WS=43416964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	43417752	rs78530686	C	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=27;PP=945;SC=CGCTGCGCGTCGAGCGCCTCG;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=43417760;WS=43417742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	43419003	rs2919643	T	C	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1241;SC=CGCTCTCGGCTTCAAGGCGCT;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=43419011;WS=43418993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	43420177	rs61104666	G	A	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=29;PP=1110;SC=CTCCCACAGAGCATCTGGACA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=65;WE=43420185;WS=43420167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	43422280	rs500899	T	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=137;SC=GCTCCTCCCCTGCTCAAGGTC;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=43422288;WS=43422270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	43435738	rs514001	A	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=470;SC=TATGACATAAAAAGATGAACA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=43435746;WS=43435728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	43438156	rs567801	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=49;SC=CACAGGCTAACGGCTGATGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=43438164;WS=43438146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	43445816	rs8099496	G	C	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=145;SC=TGCAATGAATGCTTGGGTAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=43445824;WS=43445806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	43446734	rs3826633	T	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=768;SC=AGGAACAGTCTCTGCCTTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=43446742;WS=43446724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	43450753	.	TA	T	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.9997;HP=17;HapScore=3;MGOF=17;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=95;QD=12.25;SC=TGGTTTACCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=43450762;WS=43450743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,8:0.80:10
chr18	43480926	rs3826634	A	G	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=6;PP=944;SC=AGCCACCAACATGGGAACATG;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=47;WE=43480934;WS=43480916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	43481075	rs1893523	G	A	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=66;PP=2125;SC=CGGGTGCAGAGCAAGGGGAGG;SOR=1.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=43481083;WS=43481065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr18	43490602	rs3744996	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=16;PP=673;SC=TTGCAGCATGGTGGAAGTCAG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=43490610;WS=43490592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	43505558	rs4476262	C	G	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=400;SC=GAGAATTAAACAGAAAATCCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=43505566;WS=43505556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	43547127	rs11301517	TG	T	2012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=1430;SC=CTCGGGAGGGTGGGGGAGATC;SOR=1.044;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=40;WE=43547135;WS=43547117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	44063718	rs143514947	AC	A	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=431;SC=CCTGCAGGAAACAAAAGTGTG;SOR=1.244;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=44063726;WS=44063708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	44087504	rs202043044	G	A	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=30;PP=1733;SC=GACCCACCCAGGATGTCGCTG;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=44087512;WS=44087494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	44109115	rs59252058	G	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=709;SC=AGGGAAGGAGGGTAAACTCCG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=44109123;WS=44109105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	44114473	rs436433	T	C	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=37;PP=1029;SC=AGTATGGCCTTGGCAACATCC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=44114481;WS=44114463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	44122010	rs10775482	T	C	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=350;SC=CTGGCTGATATCATTAACATG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=44122018;WS=44122000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	44124967	rs988213	A	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=383;SC=ACAACTCTACAATGCCTGGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=44124975;WS=44124957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	44126909	rs1893566	T	C	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=52;PP=2219;SC=CCGCCTCCCCTACCCTCCTCG;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=44126917;WS=44126899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	44135027	rs732108	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=644;SC=TAAAGCTATAATAATGTTTAA;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=44135035;WS=44135017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	44135050	rs732109	G	A	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=18;PP=813;SC=TGTTGGGCTAGCCGAGAAATG;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=44135058;WS=44135040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	44135143	rs11665444	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=26;PP=1259;SC=CCCAGCCTCATGGTTCTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=44135151;WS=44135107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	44135328	rs62097104	C	T	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=139;SC=GGTCAGGACCCTGGTTCCCAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=44135336;WS=44135318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	44138902	rs4243280	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=322;SC=GGCTTAGCACCGACCACAGCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=44138910;WS=44138892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	44157489	rs328167	G	T	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=72;SC=GTGGTAGGGGGTGAGAAGGGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=44157497;WS=44157487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	44157506	rs328166	G	T	164.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=102;SC=GGGAATGTGAGGCTCAGGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=44157514;WS=44157496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	44173449	rs328145	A	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=81;SC=TCCATCGTACATTTTTGTCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=44173457;WS=44173443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	44181596	rs674948	G	A	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=193;SC=TGTCCCTCTCGACCTCATTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=44181604;WS=44181586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	44197963	rs328130	A	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TCACACACATAAACTTTACAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=44197971;WS=44197960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	44272034	rs533027	A	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=4;PP=372;SC=GGGAAGATGCACGCTGAGAGC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=44272042;WS=44272024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	44426877	rs644731	C	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=182;SC=AAGATAGATACAGGATCCTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=44426885;WS=44426867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	44526798	rs2187092	A	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=547;SC=GTAACTGACTACTTTTCTCCC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=44526806;WS=44526788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	44595809	rs2289036	A	T	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=880;SC=AAGCAGGGGGATGGAGTTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=44595817;WS=44595799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	44601611	rs3816125	A	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=50;PP=1916;SC=CTTTAAGTCTATAAGCTTGAA;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=103;WE=44601619;WS=44601601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	44610718	rs16954999	T	C	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=14;PP=712;SC=ACATGCATTTTTGGGCTCCAG;SOR=1.067;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=44610726;WS=44610708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	44610879	rs7504798	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=684;SC=ACCAAGTTAAAGACAGTTCAA;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=44610887;WS=44610869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	44635048	rs2635058	C	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=20;PP=1241;SC=GATGCACACACTGCTTCACAA;SOR=1.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=44635056;WS=44635038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	44702502	rs12968552	A	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=322;SC=CCATTAGGTTACGCGCCCCCG;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=44702510;WS=44702492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	44702718	rs2277717	C	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=17;PP=523;SC=GGCGCCTCCACGGCCGGCGCC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=44702726;WS=44702708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	44746460	rs1355593	A	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=193;SC=AACATTATTGACAGTCCCATG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=44746468;WS=44746450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	44757226	rs7236105	G	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=270;SC=AAATATGGTGGAGAACAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=44757234;WS=44757216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	44771481	rs17723754	C	T	243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	44773382	rs9956387	A	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=463;SC=CTGGGGTAGCAGCAGCTGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=25;WE=44773390;WS=44773372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	45377640	.	C	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=16;PP=652;SC=ATATGTGCAACTTACCCAAGC;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=45377648;WS=45377630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	45691715	rs9646522	T	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=228;SC=TCAGAGACAATGAGTGTCCAG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=45691723;WS=45691705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	45711740	rs12455480	T	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=25;PP=868;SC=CTTCTCTTCCTGAACTGGACT;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=45711748;WS=45711730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	46196856	rs3830253	AC	A	152.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=0;PP=57;SC=TTACGGGAGGACCCCCCCCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=46196873;WS=46196846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr18	46196880	rs2279304	T	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=155;SC=CACACACAGCTTCTCTAGGGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=46196888;WS=46196870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	46284587	rs1038308	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=32;PP=1250;SC=ACAGCAGCCTTGAGGCCCCCC;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=46284595;WS=46284577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	46343806	rs28696848	G	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=630;SC=TCTGGAATGCGTCTCAGATAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=46343826;WS=46343796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	46343818	rs9951895	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=512;SC=CTCAGATAACTGGGACAAAGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=46343826;WS=46343796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	46343913	rs62103298	A	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=115;SC=TTGGGAGGCCAAGGCAGGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=46343921;WS=46343903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	46570662	rs895669	C	T	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=245;SC=CTGTGGTGTGCGGGGAGCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=46570670;WS=46570652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	46576238	rs17189079	T	C	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=58;PP=1657;SC=CCTCCCTGCATGAAAACCAGA;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=46576246;WS=46576228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	46645374	rs7240784	C	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=30;PP=847;SC=AAGAGTAATTCCCTCAAAATT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=46645382;WS=46645364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	46889624	rs3840892	A	AT	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.523;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.333;NF=2;NR=28;PP=627;ReadPosRankSum=0.408;SC=ACATAAAAAGATTTTTTTTTA;SOR=1.340;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=30;WE=46889632;WS=46889614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr18	47013723	rs6417105	A	T	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=16;PP=1603;SC=GTGTTGCCCAAGGGGCGCGGC;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=74;WE=47013731;WS=47013713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	47014953	rs35737964	G	GTGT	4317.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=30;PP=2967;SC=AAAGAAAAATGTGTTAAGTTT;SOR=1.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=58;WE=47014961;WS=47014943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	47015609	rs36084909	G	GA	866.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=8;PP=753;SC=TAAGACAGGTGAAAGGGTTGC;SOR=1.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=19;WE=47015617;WS=47015599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	47016046	rs6507920	A	G	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=379;SC=AATCATTTTTAAAAGGCAATC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=47016054;WS=47016036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	47017820	rs1943676	A	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=18;PP=799;SC=TGCATGCTAGAAAATAAAACG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=47017828;WS=47017810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	47093790	rs2000812	C	T	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=33;PP=1303;SC=GAATAAAAAACAACTTCCACT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=71;WE=47093798;WS=47093780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	47339798	rs2945506	G	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=17;PP=645;SC=GGGAGGGCAGGACCCCGAGGG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=33;WE=47339806;WS=47339788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	47363009	rs621101	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=343;SC=TAACCACCAACGAGAACAGAC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=47363017;WS=47362999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	47373466	rs3017176	G	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=358;SC=AGATGGGAGCGGGGGCTGAAG;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=47373474;WS=47373456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	47375932	rs488890	C	G	112.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=89;SC=CTCACACCCCCCTACCTTCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=47375940;WS=47375922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	47376103	rs490648	C	G	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=11;PP=322;SC=ATCCTGCTTGCAGTTGGAGGT;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=47376111;WS=47376093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	47376128	rs490697	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=5;NR=9;PP=240;SC=AGTGCGGCCCATGGGCAGCCG;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=47376136;WS=47376118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	47376162	rs17713847	G	A	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=130;SC=AGTCAGGGACGCTGCCAGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=47376170;WS=47376152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	47402280	rs657424	A	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=174;SC=GCCTCCCTCTATATCAGCCAT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=47402288;WS=47402270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	47406913	rs1217632	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=783;SC=AACTGGATACATGTAAATGCT;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=47406921;WS=47406903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	47406938	rs1217633	T	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=478;SC=TTAAGAAAATTGATTTGGTTA;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=47406946;WS=47406928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	47479855	rs1942416	A	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=312;SC=TTAAAATGCAAACCCAATAAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=47479863;WS=47479845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	47563299	rs1815930	T	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=23;PP=1056;SC=CCACTGTAGGTATAGATGACA;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=47563307;WS=47563289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	47583036	rs2852104	C	A	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=923;SC=CTGGGCCAGTCTGTCACCTGT;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=47583044;WS=47583026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	47787402	rs1899671	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=7;PP=296;SC=ACCAACTTTGGATTCTGTTTG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=47787410;WS=47787392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	47788256	rs698617	C	T	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=91;SC=TTAATATAAACATCTCAGCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=47788264;WS=47788254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	47802971	rs10775495	A	G	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=23;PP=954;SC=CCAGCCTAGCATGACACTGGA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=47802979;WS=47802961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	47806092	rs1562004	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=288;SC=AGTTACAAATAAATTTTATTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=47806100;WS=47806082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	47810251	rs3819217	C	G	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=41;PP=1697;SC=CTGCTGCGCCCCTGCTTGCTC;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=47810259;WS=47810241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	47810351	rs7228084	A	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=51;PP=2061;SC=CCTGAAGGCGAGTGCGGGCAC;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=97;WE=47810359;WS=47810341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr18	47810731	rs2276367	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=256;SC=CCCTTGAACCTCTCAGGAATG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=47810739;WS=47810721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	47812587	rs11555886	C	T	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=53;PP=1830;SC=GCTCCCGTGACTTCTTGTGCC;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=93;WE=47812595;WS=47812577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	47902337	rs1970679	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=232;SC=ATGCATTTTGATTATTCCACT;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=47902345;WS=47902327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	47906416	rs1441293	A	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=21;SC=ACAGCTATCTATTCTAAGAGT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=47906424;WS=47906406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	47906690	rs1441294	T	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=10;PP=290;SC=TTAAGTAATTTTTAAGGATGC;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=47906698;WS=47906680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	47906719	rs1441295	T	G	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=139;SC=TAATGTTTTTTGTTTATAAAT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=47906727;WS=47906709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	48190271	rs3752085	T	G	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=8;PP=741;SC=TAGCCGAGACTTGGCCTTTCC;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=48190279;WS=48190261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	48190440	rs3752087	G	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=51;PP=1994;SC=GCTGTCGGCCGTGGACAGCCG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=48190448;WS=48190430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	48326378	rs2586778	G	T	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=719;SC=GACCGGAAAAGAATTCTCTCC;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=48326386;WS=48326368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	48327815	rs2276186	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=21;PP=649;SC=ATTTCCTCCCGGCAAAGGCAG;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=48327823;WS=48327805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	48331524	rs2586776	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=6;PP=287;SC=ATTTACTTACGTCATCTAATA;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=48331532;WS=48331514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	48331553	rs2849233	T	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=9;PP=272;SC=GTCTGAAGGGTGATATCTATG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=48331561;WS=48331543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	48446953	rs674210	C	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=583;SC=AAAAAAACTTCAGGGTTTTGA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=48446961;WS=48446943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	48723217	rs35675106	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=12;PP=563;SC=GGGACCCGCCCGGGATCTGCT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=48723225;WS=48723207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	48991891	rs7241264	G	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=36;PP=1836;SC=GGAGGAGCCAGGCTGCAGAAA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=48991899;WS=48991881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	49867224	rs9951523	T	C	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=41;PP=1503;SC=AGCTTCCTTGTTCAGCGCGCA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=49867232;WS=49867214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr18	50278686	rs13381333	G	A	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=67;PP=2468;SC=ACCAATGTGAGGCATCTTTAG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=50278694;WS=50278676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr18	50432602	rs2229080	C	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=17;PP=860;SC=GCAGATCAGCCGACTCCAACC;SOR=1.157;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=50432610;WS=50432592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	50731829	rs4497763	A	G	299.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.8374;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=1.719;SC=AGACTCGCAAACTCTTGAAAC;SOR=1.609;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=11;WE=50731837;WS=50731819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr18	50923932	rs7231978	G	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=313;SC=ATATAAAATAGTTCATCCTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=50923940;WS=50923922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	50929098	rs10612041	CAAT	C	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=13;PP=1119;SC=AAATTTCCAACAATGTTTATT;SOR=1.308;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=50929108;WS=50929088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	51053218	rs113173464	T	TCACCCCAGGC	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=2532;SC=TACTGTCCATTCACCCCAGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=51053226;WS=51053208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	51750584	.	T	TGCC	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.53;NF=0;NR=5;PP=250;SC=CCGCCACCGCTGCCGCCGCCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=51750592;WS=51750574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	51795847	rs3730668	G	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=263;SC=ACTGGAGACTGTAGTCCCCCG;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=51795855;WS=51795837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	51795957	rs10584411	GCGA	G	694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.539;NF=4;NR=14;PP=848;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GAAGGCGGCGGCGACGACGAC;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=18;WE=51795967;WS=51795947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr18	51820805	rs8305	G	A	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=35;PP=1147;SC=GTGGAAGAGAGCAGGATCAGA;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=50;WE=51820813;WS=51820795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	51880841	rs7242085	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=10;PP=535;SC=CATAATTTAACTTATTTTCTT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=51880849;WS=51880831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	51880986	rs1370363	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=300;SC=AAGAATATAACCATATAAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=51880994;WS=51880976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	51889056	rs6508290	A	G	106.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=65;SC=CCAAATGATCAGAACTCTTGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=51889064;WS=51889053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	51900788	rs71297084	T	TTTAA	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=380;SC=GAGCACACTGTTTACACTAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=51900796;WS=51900778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	51904461	rs35286005	C	CTTTA	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=399;SC=TAATAGTCAACTTTATTTATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=51904469;WS=51904451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	51904641	rs3753056	A	G	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	51904644	rs3753055	G	A	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	52265308	rs9947055	A	C	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=31;PP=1514;SC=TGAATCTACAACTTCAACAGC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=52265316;WS=52265298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	52555398	rs4343367	G	A	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=37;PP=1240;SC=CTGCTGTTCAGCAAATGGAGC;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=61;WE=52555406;WS=52555388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	52571741	rs4801110	C	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=132;SC=ATACTATTCACATCAAATCTG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=52571749;WS=52571731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	52575002	rs1944382	G	A	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=1296;SC=GGGTGGAAGAGGACAGAGACC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=52575010;WS=52574992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	52585071	rs59686916	G	GAC	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.474;NF=4;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CACGTGCACAGACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=52585079;WS=52585061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr18	52608329	rs8087479	C	A	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=16;PP=554;SC=AGAAGGAAAACAAAACCATTT;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=52608337;WS=52608319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	52942827	rs1788027	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=617;SC=TGACATTCCCGTTACCGTGTA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=52942835;WS=52942817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	53146303	rs2924331	T	C	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	53177740	rs9954890	A	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TTCTAAGGATACAGAAGTCGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=53177748;WS=53177730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	53177774	rs9964328	G	C	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=106;SC=TTAATCAAGAGTAAGCTTTTA;SOR=1.270;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=53177782;WS=53177764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	53178061	rs67387556	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=105;SC=AATGATACTGGCTGTGTGTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=53178069;WS=53178051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	53252388	rs599550	G	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=330;SC=TGCAATAACCGTATGATTACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=53252396;WS=53252378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	53302845	rs610362	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=433;SC=TAGAAACTACCGTTATGTTTG;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=22;WE=53302853;WS=53302835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	53303101	rs611326	C	G	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=952;SC=GGCACCTGTGCTATTTTCTCC;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=53303109;WS=53303091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	53332089	rs796742	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=51;SC=GAGGCGGGAGCCGGCTCCCTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=53332097;WS=53332079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	53727502	rs2535724	T	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=51;PP=1316;SC=AATAAGTGTTTGTAGGTGCCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=53727510;WS=53727492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	54281790	rs655539	T	C	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=831;SC=TAGATCGGGGTAGGTTGATAA;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=54281798;WS=54281780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	54285411	rs676951	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=GTATAAAAATGTTTAAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=54285419;WS=54285401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	54305564	rs657489	C	T	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=34;PP=1622;SC=GAGCTCGAGCCTGGCCTCACC;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=80;WE=54305572;WS=54305554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	54305757	rs681176	G	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=457;SC=AAGGAGAGATGCTCAGGAAGG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=54305765;WS=54305747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	54339818	rs568078	C	G	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=35;PP=1299;SC=GCATCTCAGCCGTACTTTTAA;SOR=0.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=54339826;WS=54339808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	54339977	rs566956	A	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=169;SC=TATAGTCCCCAAATGATGCTT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=54339985;WS=54339967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	54346482	rs683248	T	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=320;SC=GTCTTCTATTTTACTATGGCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=54346490;WS=54346472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	54346510	rs597585	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=465;SC=CACTCAAATAGAAGGTTAATT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=54346518;WS=54346500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	54346745	rs11452823	A	AT	222.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.126;NF=0;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=1.282;SC=GTAGCGAGGTATTTTTTTTTT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=54346753;WS=54346735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr18	54346804	rs525682	T	G	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=6;PP=121;SC=TAAATCTAAATGTAGATATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=54346812;WS=54346794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	54348514	rs605067	C	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=11;PP=367;SC=AAAAGTCACACTCAAAGCTGA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=54348522;WS=54348504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	54353382	rs609195	A	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=731;SC=TTATTTTTTGATAATTTTCTT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=54353390;WS=54353372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	54354076	rs5825199	T	TTC	1835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=998;SC=TTACAAATCTTTCTTTTCAGG;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=22;WE=54354084;WS=54354066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	54354239	rs576095	T	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=265;SC=AGCTGTATTTTTATCCTTCAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=54354247;WS=54354229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	54361837	rs637823	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=305;SC=TATTCAAATACTTTTTTTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=15;WE=54361845;WS=54361827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	54398922	rs1421262	G	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=663;SC=TAATTTTTGAGAAATGACCCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=54398930;WS=54398912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	54483146	rs3745038	A	G	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=231;SC=GTGAACATATATATTTTTTAA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=54483154;WS=54483136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	54694452	rs3745033	C	T	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=29;PP=923;SC=TGCTGCCTGCCGCCGTGACTG;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=54694460;WS=54694442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	55019963	.	TCACA	T,TCA	592.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.87;QD=28.23;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,13:0.38,0.62:21
chr18	55027212	rs1942964	T	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=954;SC=CCAAATGTACTTATTGTTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=55027220;WS=55027202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	55143589	rs618953	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=294;SC=ATCTCTTTGTACAACTTTGTC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=55143597;WS=55143579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	55240455	rs577152	T	C	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=16;PP=763;SC=AGGTTATAATTGAGGTGTTTA;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=55240463;WS=55240445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	55247336	rs3848519	C	A	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=551;SC=GGTTTTGCACCCTGGGCATGC;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=55247344;WS=55247326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	55253710	rs317815	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=517;SC=GCGAGGGCCCGGGCGCCAGCT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=55253718;WS=55253700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	55268866	rs2070109	C	T	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=27;PP=1608;SC=CTTTCCTCCACGCTTCTGGAG;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=55268874;WS=55268856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	55273239	rs114475437	C	T	53.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	55287739	rs388644	A	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=362;SC=GCAAGTCACAAGAAAATTGAC;SOR=1.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=55287747;WS=55287729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	55288007	rs389031	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=104;SC=AGGTCCATAAGTAATTAATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=55288015;WS=55287997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	55288879	rs368935	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=805;ReadPosRankSum=1.217;SC=CCGAAACCCGACTGGAGCAGA;SOR=2.419;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=38;WE=55288887;WS=55288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr18	55317676	rs222581	C	T	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=52;PP=1923;SC=ACAGCAACAGCCAGGATGATA;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=89;WE=55317684;WS=55317666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	55319472	rs7226404	A	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=475;SC=AGGATCTAACAATCCTGAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=55319480;WS=55319462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	55329937	rs34396065	CA	C	223.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=231;SC=AAAATTGTGACAAAAAAACAA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=55329945;WS=55329927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	55335495	rs317844	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=738;SC=GATGCAGAAGAATGTGCTGGA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=55335503;WS=55335485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	55336461	rs58094309	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=228;SC=TTATCTCTTAAGCATGAGATC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=55336469;WS=55336451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	55352389	rs11659313	T	C	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=47;PP=1307;SC=TCTACACCTATGTCCAGAGGC;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=55352397;WS=55352379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	55352436	rs319459	G	A	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=961;SC=AGTGATGGTGGTAAGACCATA;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=55352444;WS=55352426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	55362532	rs319443	T	G	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=21;PP=709;SC=TTATCTAGTCTGTTATTGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=55362540;WS=55362522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	55362816	rs319442	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=TGAGTTCAAAGTGGAAGTTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=55362824;WS=55362806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	55364852	rs319438	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=8;PP=499;SC=ACACTTACCCATCCAGTTCTG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=55364860;WS=55364842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	55397512	rs319432	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=379;SC=TAGAAAGCCTTCAAGGGCAGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=55397520;WS=55397502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	55397624	rs33964473	GATA	G	3719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=2431;SC=AGAACACTATGATAATGATTT;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=55397634;WS=55397614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	55397674	rs319433	G	C	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=46;PP=1437;SC=TAGAATTTTAGGGAACACCAT;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=55397682;WS=55397664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr18	55397871	rs319434	T	C	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=45;PP=1572;SC=TTCTACTGCCTTCAGTGATGT;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=83;WE=55397879;WS=55397861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	55398756	rs651867	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=23;PP=1141;SC=GAGAAGATTCTCTCCTAGACC;SOR=0.971;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=55398764;WS=55398746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	55983330	rs2288774	T	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=225;SC=TTGTAGTCAGTGTATTTTCAG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=55983338;WS=55983320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	56040649	rs1943994	T	C	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=846;SC=GCAGCACCTTTTTGTCATGCC;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=56040657;WS=56040639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	56149048	rs3744867	A	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=5;PP=327;SC=TAGGTTACCCAGGGACGTTAG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=56149056;WS=56149038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	56149099	rs7240666	T	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=16;PP=892;SC=GCCTTCTTTATTGTCATAGAG;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=56149107;WS=56149089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	56182174	rs7505023	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=312;SC=TCGTCCCTCCTAGTCCCCAAC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=56182182;WS=56182164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	56182507	rs4940399	C	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=559;SC=TCTGAGACGTCAAGGAACTGT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=56182515;WS=56182497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	56184107	rs3809985	C	T	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=GTTCTCACACCAGAAGTGACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=56184115;WS=56184097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	56191351	rs7228617	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=78;SC=TGCATTTTTTCCTAATATACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=56191359;WS=56191341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	56196451	rs7236563	C	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=707;SC=CAGCTTGGATCTTTTTCAGTA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=56196459;WS=56196441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	56202059	rs10469211	A	G	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=24;PP=1351;SC=CAGCAACAGAACCTCACCTCT;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=56202067;WS=56202049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	56202418	rs10469212	T	C	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=33;PP=1679;SC=CCTGCAGTAATTTAGGGGCTT;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=56202426;WS=56202408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	56202768	rs3809983	C	A	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=39;PP=1973;SC=CCAAGAGAAGCGTGAGTCATT;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=56202776;WS=56202758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	56202982	rs3826594	A	T	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=40;PP=1556;SC=GAATTTGTTCAGCCTCCTGCT;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=56202990;WS=56202972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	56203074	rs3809982	G	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=36;PP=1403;SC=AAAATGGCCGGCTGGATTTCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=56203082;WS=56203064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	56203120	rs3809981	C	T	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=26;PP=1195;SC=TTGATTGACCCCCTTCTCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=56203128;WS=56203110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	56203411	rs3809980	G	C	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=37;PP=1059;SC=CCAGGAGTCTGGGTTGGCTGA;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=56203419;WS=56203401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	56203447	rs3809979	A	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=32;PP=1276;SC=GACTTCTCCAATGTACACTGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=56203455;WS=56203437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	56203891	rs3809978	G	T	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	56203898	rs3809977	T	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	56204250	rs3809976	A	C	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=45;PP=2172;SC=ATATGATCCAACTGCACTTGG;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=56204258;WS=56204240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	56204387	rs67925233	ACAGTTGATGTGTCCT	A	3764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=2933;SC=GGCAATGGTAACAGTTGATGT;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=47;WE=56204418;WS=56204377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	56204410	rs55910046	C	T	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=42;PP=1774;SC=CCTCAGTCTCCCTGGTCGCTT;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=56204418;WS=56204377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	56204671	rs4940404	A	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=1066;SC=GGTAGGTGGAATTCTCCACCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=56204679;WS=56204661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	56204747	rs3826593	G	A	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=23;PP=1214;SC=GAAAGTACTGGTAAAAAGAGG;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=56204755;WS=56204737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	56204932	rs3809973	T	G	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=38;PP=2133;SC=GAGGCGAATATTTATCAACTG;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=101;WE=56204953;WS=56204922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	56204945	rs3809972	C	G	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=46;PP=2205;SC=ATCAACTGGTCTCCCAACAAG;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=110;WE=56204953;WS=56204922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr18	56204977	rs3809971	C	T	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=50;PP=2265;SC=TATCAAAACACGTTCCTTGGT;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=113;WE=56204999;WS=56204967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	56204991	rs3809970	C	T	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=52;PP=2388;SC=CCTTGGTCACCAGCCTCAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=116;WE=56204999;WS=56204967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr18	56205262	rs12103986	A	C	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=67;PP=2548;SC=GTTTTTCTTCATGCTGTGGAC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=114;WE=56205270;WS=56205252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr18	56205481	rs9962203	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=603;SC=AGTGATATTAGTAGAATTGTT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=56205489;WS=56205471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	56205551	rs9962964	C	T	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=233;SC=CCTCAATGACCGTAATAATGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=56205559;WS=56205541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	56245968	.	A	ACACACACGCGCGCACGCGCGCG	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.980;NF=5;NR=0;PP=984;ReadPosRankSum=0.908;SC=AGGAAGAGACACACACACACA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=56245976;WS=56245958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr18	56245970	rs138127797	A	ACACACGCGCGCACGCGCGCG	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-1.169;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr18	56246442	rs12606191	T	C	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=31;PP=1666;SC=ATAAGTCCTTTCCCCCCACTC;SOR=0.888;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=74;WE=56246450;WS=56246432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	56247180	rs9958735	T	C	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=25;PP=1386;SC=TTGCCTCAGATAGCGGGAGGC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=56247188;WS=56247170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	56247567	rs9956630	A	G	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=45;PP=1878;SC=CTTCTTCCTTATAAGGATGTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=56247575;WS=56247557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	56247600	rs9944810	C	A	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=36;PP=1863;SC=TCTGATTTGCCCTTTCTTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=56247608;WS=56247590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	56274514	rs6566986	A	G	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=22;PP=1287;SC=ACAGAATATAAGGATATTAGT;SOR=1.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=56274522;WS=56274504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	56279025	rs6566987	T	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=10;PP=295;SC=TTCGGAGTCTTTCATCCTTTC;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=56279033;WS=56279015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	56412784	rs58993112	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=131;SC=CCAAAATTCACGAGAGGCCAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=56412792;WS=56412774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	56703194	rs9961940	A	C	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=500;SC=CCACGAGCAGACTTCCTTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=56703202;WS=56703184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	56711225	rs11152115	A	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=323;SC=TTTATTCTGTACAGATTGGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=56711233;WS=56711215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	56711284	rs11152116	C	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=15;PP=690;SC=GTAATTCCTGCGACAATTCTT;SOR=1.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=56711292;WS=56711274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	56887507	rs1062557	C	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=2;PP=414;SC=CATGCGCGGCCGTGAGCTCCC;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=56887515;WS=56887497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	57014889	rs8095245	T	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=50;SC=ATATTTATTGTTTTAAATAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=57014897;WS=57014879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	57021738	rs3835325	AAC	A	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=1060;SC=TAATGTAAAAAACACACACTT;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=22;WE=57021747;WS=57021728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	57022754	rs1127220	T	C	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=44;PP=1967;SC=CAGCTCCAATTCGACCTCTTC;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=57022762;WS=57022744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	57115203	rs1893788	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=373;SC=CTGTGCCCTCTTCCACACTCA;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=57115211;WS=57115193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	57134152	rs4940876	A	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=292;SC=AGAGAATACTAAGTTTCTGAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=57134160;WS=57134142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	57136869	rs632899	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=12;PP=413;SC=GCTCACATCAACTACAGGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=57136877;WS=57136859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	57136902	rs663452	C	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=219;SC=CTGGCCCTGGCCTGGAAAGGA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=57136910;WS=57136892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	57136943	rs650033	G	A	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TCAAGGGCACGTGTGAAGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=57136951;WS=57136933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	57638330	rs10871774	G	A	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=15;PP=674;SC=TTTCTGCGCAGAACTGTCGTA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=57638338;WS=57638313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	58285237	rs11874366	G	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=20;PP=561;SC=TCCATGCATTGTATTATTTGT;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=58285245;WS=58285227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	58290330	rs1560400	A	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=18;PP=485;SC=CCTCTTTTTTAAAAAAAAATC;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=58290338;WS=58290320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	58291479	rs9947661	T	C	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=44;PP=2245;SC=AACTCAGTGGTATTGAAAGGT;SOR=0.991;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=105;WE=58291487;WS=58291469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr18	58310604	rs11659206	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=203;SC=AGAAAGAAACCTTTATTTAAA;SOR=2.147;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=58310612;WS=58310594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	59157764	rs680530	T	C	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=22;PP=1128;SC=TTCTCCTTCATTTTCTGAAAA;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=59157772;WS=59157754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	59158065	rs681902	T	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=220;SC=GACCCGGGTATTGGATATTGA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=59158073;WS=59158055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	59166541	rs12964819	C	T	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=13;PP=533;SC=AGAGGCTCGACCGAGAGGAAA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=59166549;WS=59166531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	59170304	rs595093	C	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=20;PP=788;SC=CCACAACAGTCAACATCACCC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=59170312;WS=59170294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	59174817	rs1547956	C	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=TTTTTCTAAACCACTTTCATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=59174825;WS=59174807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	59206197	rs5825446	C	CT	1211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=797;SC=AACCATTACTCTTTTTTTTCT;SOR=3.056;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=33;WE=59206205;WS=59206187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	59206480	rs11875000	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=242;SC=ACTCCAGAAACGAACAGTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=59206488;WS=59206470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	59739962	.	T	TA	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=54;QD=19.6666666667;SC=AAAAATGCTGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=59739970;WS=59739952;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr18	59751715	rs1560502	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=304;SC=GACTTTATAATCTTAATCAAT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=59751723;WS=59751705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	59777011	rs2163518	T	C	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=13;PP=898;SC=GCATTTTAAATACAGATTTAA;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=59777019;WS=59777001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	59805532	rs9959632	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=262;SC=TCATTTTCACTTGGGAACCAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=59805540;WS=59805522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	59806190	rs2298779	C	T	185.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=3;PP=158;SC=CATTTTTGTGCGTGCCTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=59806198;WS=59806180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	59807635	rs12608212	T	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=248;SC=GAGTTGATAATAAAATTTTAT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=59807643;WS=59807625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	59814268	rs9320000	G	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=765;SC=TTCCATAGAAGTGGTTAAACA;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=59814276;WS=59814258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	59814324	rs9320001	G	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=412;SC=TTAATATTGTGCTTGTAGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=59814332;WS=59814314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	59815284	rs7243994	G	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TGATTTAAACGACTATATTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=59815292;WS=59815274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	59821949	rs11659731	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=131;SC=TAAAATATGAGCTAGTCATTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=59821957;WS=59821939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	59824209	rs1021952	A	T	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=129;SC=GGAAAAAAAAATACTGTAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=59824217;WS=59824200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	59824490	rs1021953	A	T	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=673;SC=AGTAATAGTTATATACACATG;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=59824498;WS=59824480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	59947118	rs2980981	G	A	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=41;PP=1562;SC=TTTTATATTCGGCATCCCTTT;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=59947126;WS=59947108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	59958678	rs2980983	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=329;SC=CCATAGGTATGATATAAGAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=59958686;WS=59958668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	60036083	rs8092336	A	G	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1142;ReadPosRankSum=0.548;SC=GTCAGGGCACATGTGTAGGAG;SOR=0.301;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=53;WE=60036091;WS=60036073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr18	60191428	rs7229802	G	A	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=34;PP=1411;SC=GGGCCCAGGAGGAACTGCTGC;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=60191436;WS=60191418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	60232405	rs4940561	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=254;SC=TTAATAGATACTGAGCTGTTG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=60232413;WS=60232395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	60237388	rs8096750	A	G	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=41;PP=1760;SC=AAACATCTTCAGAGAGTTACA;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=93;WE=60237396;WS=60237378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	60241732	rs3744926	C	T	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=25;PP=1190;SC=GTAGTACTCCCGCTTTGCATC;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=60241740;WS=60241722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	60243876	rs11557713	G	A	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.01;SOR=1.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	60562298	rs624821	A	T	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=19;PP=775;SC=GGGACTTCCCACTGGCAGTCT;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=60562306;WS=60562288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	60572437	rs3217528	GT	G	466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.51;QD=24.56;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	60985879	rs1801018	T	C	4898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=79;PP=2524;SC=TATCGTACCCTGTTCTCCCAG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=149;WE=60985887;WS=60985869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr18	61022634	rs1809319	T	C	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=28;PP=962;SC=ATTAAACCTATAGAGAAGTTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=61022642;WS=61022624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	61022791	rs2003149	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=364;SC=ATATGCAAAGCACCACCTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=61022799;WS=61022781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	61074566	.	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=197;SC=TCTTAAACTTCATTTAAATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=61074574;WS=61074556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	61154043	rs34587228	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=3;PP=620;SC=GTGCTGAGGTTGAGGAGCCTT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=61154051;WS=61154033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	61154388	rs2271254	C	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=241;SC=GTTAGACCTACAACTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=61154396;WS=61154378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	61156606	rs12454742	G	C	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=15;PP=891;SC=CGAAGAGACCGTATGCAAAGG;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=61156614;WS=61156596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	61160287	rs2289519	T	C	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=84;PP=2965;SC=GAAGAAATTTTCTGAATCAGA;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=147;WE=61160295;WS=61160277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr18	61160385	rs2289521	T	C	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=44;PP=1316;SC=TGAAAAATGATAGGGACAGAG;SOR=1.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=61160393;WS=61160375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	61170467	rs1840557	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=110;SC=CTGCTTTGAAGCTGGGCTTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=61170475;WS=61170460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	61170500	rs1455557	T	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=315;SC=TGTTTTCAATTGAGCCAGGTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=61170508;WS=61170490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	61170721	rs1455556	T	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=41;PP=1603;SC=ATATCTTCAGTGAAGACACAT;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=61170729;WS=61170711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	61170782	rs1455555	A	G	3021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=51;PP=2038;SC=ATCAAATGTTATCCACAAAGT;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=99;WE=61170790;WS=61170772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	61170925	rs8093128	T	C	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=40;PP=1425;SC=CTCGAAACATTATTTTCTTTG;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=61170933;WS=61170915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	61225801	rs7244584	C	T	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=48;PP=1546;SC=GTGATAGTTGCTTATCCCCAA;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=61225809;WS=61225791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	61226694	rs11152391	G	A	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=137;SC=AACAGAGACAGCTGACATCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=61226702;WS=61226687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	61226740	rs12103954	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=317;SC=TACAAAACACGCATCTTTTAG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=61226748;WS=61226730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	61228248	rs9676250	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=25;SC=CTCAGGAGAGTCTCACTCCTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=61228256;WS=61228238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	61231148	rs66718207	T	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=26.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	61231417	rs9957786	A	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=44;PP=1276;SC=GGAATGATTTACAATATGTAT;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=61231425;WS=61231407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	61233739	rs2077549	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=291;SC=TCTTGAAGGTTGTCACTGCCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=61233747;WS=61233729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	61254525	rs3216123	A	AT	1972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=32;PP=1267;SC=TTGGGCATAGATTTTTTTTAA;SOR=0.750;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=49;WE=61254533;WS=61254515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	61256117	rs77936810	GC	G	256.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=373;SC=AATTCATTTGGCGGGGGGGTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=61256125;WS=61256107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	61257084	.	A	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=61;ReadPosRankSum=0.132;SC=CTTTACTATTAAGCAATAATA;SOR=3.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=9;WE=61257092;WS=61257074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr18	61261515	rs11152394	T	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=37;PP=1247;SC=CAAGTCCATCTGCATCATATT;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=61261523;WS=61261505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	61261540	rs11152395	T	C	3551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=40;PP=1571;SC=ATACATATTATTTGTCATTTG;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=61261548;WS=61261530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	61261565	rs11152396	C	G	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=36;PP=1210;SC=ATGGGTCAACCTTTTTCTGTT;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=61261573;WS=61261555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	61264298	rs1020694	G	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=21;PP=1120;SC=GGTGGAGGACGGTTACGATCT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=61264306;WS=61264288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	61264468	rs1020693	C	T	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=CAGCTGCCACCGGCATAGGCT;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=61264476;WS=61264458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr18	61271065	rs7229459	G	A	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=80;SC=CAGATTCAACGGATAGTTACA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=61271073;WS=61271055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	61308895	rs2518061	A	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=20;PP=1333;SC=TCTCCACCTGAGTCGGCCAGG;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=61308903;WS=61308885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	61325905	rs7228687	T	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=495;SC=TAAGAGTAATTTATGTAACTA;SOR=1.143;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=61325913;WS=61325895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	61326505	rs8089032	T	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=591;SC=AACGGAGCTATTGCACTCTGA;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=61326513;WS=61326495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	61326597	rs8085479	A	C	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=44.79;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	61326602	rs8085482	A	G	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=46.29;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	61326609	rs8089201	T	G	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.10;QD=43.93;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	61326628	rs11370831	A	AT	3304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=38;PP=2274;SC=GCCAGGTGAAATTACCTGTAA;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=53;WE=61326636;WS=61326618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	61377579	rs1395268	A	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=738;SC=GGAGAGACTGAAGAGCAATTG;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=61377587;WS=61377569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	61383181	rs8087185	A	C	132.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=70;SC=TTTTCTCTGCATTAGAATTTT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=61383189;WS=61383171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	61387129	.	GTA	G	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr18	61388269	.	AAC	A	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=26;QD=36.0;SC=TGTGCATGTTAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=1;WE=61388278;WS=61388259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,1:0.25:4
chr18	61390515	rs34811964	T	C	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=44;PP=1923;SC=GGGGACAGCATCGCTGTAAAA;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=90;WE=61390523;WS=61390505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	61391576	rs201089647	TC	T	2246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.83;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	61391705	rs17707068	G	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=377;SC=GGATAACATGGAGCAGTAATC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=61391713;WS=61391695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	61471529	rs61735186	C	T	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=992;SC=AGGCGAATGACCTCTAAGTAT;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=61471537;WS=61471519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	61602360	rs35453062	G	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1465;SC=GAGTGAGATAGATATACGAAT;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=61602368;WS=61602350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	63430067	rs200963885	G	GA	131.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	63477317	rs11332924	GA	G	324.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=203;ReadPosRankSum=0.205;SC=ATTAAGTACTGAAAAAAAAAA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=63477325;WS=63477306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr18	63489378	rs8097752	C	T	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=34;PP=1811;SC=ATTTGCTTGTCATTCAGGCAA;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=63489386;WS=63489368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	63491797	rs974080	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=389;SC=GTTGTGCTACAATGATGCCAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=63491805;WS=63491787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	63511176	rs2306675	T	C	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1120;ReadPosRankSum=2.224;SC=TTGTGGAAGATGTAGATGAGC;SOR=0.261;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=71;WE=63511184;WS=63511166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr18	63527142	rs17075315	T	C	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=GGAATGCTGATTATGGATTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=63527150;WS=63527132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	63530016	rs2291343	A	G	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=55;PP=1954;ReadPosRankSum=2.697;SC=AGCAGCACCAACACCCTCACC;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=63530024;WS=63530006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr18	66358403	rs309228	G	T	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=7;PP=380;SC=AAAACATCAGGCATTCAAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=66358411;WS=66358393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	66358514	rs143627864	TAA	T	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=434;SC=TTACATGAGTTAAAGATTTGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=66358523;WS=66358504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	66365129	rs433550	T	G	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=141;SC=TAAATTAAATTACAATACATC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=66365137;WS=66365119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	66368825	rs3745058	A	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=11;PP=519;SC=AAGCATAAAGAAGCAGTCCCT;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=66368833;WS=66368815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	66504093	rs485613	A	C	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=25;PP=1400;SC=ACATGGTGGCACCTGCCTCAC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=66504101;WS=66504083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	66504459	rs572020	A	T	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=36;PP=1225;SC=TAGAAGCTAAAGTTACCCAGG;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=66504467;WS=66504449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	66511027	rs9962597	C	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=289;SC=AATATACATCCCAATTATAAA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=66511035;WS=66511017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	66511207	rs33926572	TA	T	212.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=106;SC=ATCTAAATACTAAAAAAAAAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=66511215;WS=66511197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	66513256	rs8088575	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=235;SC=TTATGAGTGAAAGGAATTGAG;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=66513264;WS=66513246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	66513471	rs1954878	C	G	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=172;SC=TAGGAAAATGCCTATAAAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=66513479;WS=66513461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	66513662	rs1977942	T	C	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=43;NR=46;PP=1523;SC=GAAAGAGGTATGGGGGAATAT;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=66513670;WS=66513652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	66513749	rs1970675	T	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1166;SC=GCACAACAGATAAGAGGAAGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=66513757;WS=66513739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	66513769	rs1539895	A	C	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=26;PP=878;SC=GGAGGTTAAAAATTGGAATTT;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=66513777;WS=66513759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	66513840	rs1970674	C	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.05;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	66513846	rs1970673	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.20;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	66542108	rs2004027	T	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=5;PP=104;SC=AGGGTAACGGTCGTGCCTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=66542116;WS=66542098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	66678131	rs7234663	A	G	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=117;SC=TTTTATCAGAATAGACTATAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=66678139;WS=66678121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	66678453	rs930164	A	G	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=132;SC=ATAAATATTCATATCTTAATG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=66678461;WS=66678443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	67068605	rs33984456	TG	T	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=32;PP=634;SC=GCTGGCTGCCTGGGGGGGGGG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=33;WE=67068613;WS=67068595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	67345034	rs8099030	T	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=20;PP=792;SC=GGCTCAATGATATCAGCCTTG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=67345042;WS=67345024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	67365485	rs4414587	T	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=294;SC=ATACAAATTTTGAAATATGTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=67365493;WS=67365479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	67365668	rs4426448	A	G	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=48;PP=1843;SC=TTATGCCTACACCAAACCTGG;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=104;WE=67365676;WS=67365658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	67531642	rs763361	T	C	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=37;PP=1599;SC=GTAGGTTGACTGGTAGAGATG;SOR=0.946;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=67531650;WS=67531632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	67563309	rs1630425	A	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=634;SC=ATGATTAGATACAGGTTGTCA;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=67563317;WS=67563299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	67563348	rs1788115	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=366;SC=TGGAAGATACTTAATCATAAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=67563356;WS=67563338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	67613926	.	A	G	354	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=14;NR=3;PP=354;QD=22.8688948557;SC=AAATGTTGTAAGTGGATAAAA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=67613934;WS=67613916;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	67614674	rs3214811	T	TA	573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=5;NR=10;PP=277;SC=CTGGTTCTATTAAAAAAAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=15;WE=67614682;WS=67614664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	67718688	rs4891392	A	G	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=42;PP=1688;SC=CACGGTAACAAACGGGAGTGT;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=67718696;WS=67718678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	67724802	rs12968602	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=175;SC=TCTCTTTTCTAACATCCAGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=67724810;WS=67724798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	67726975	rs11876398	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=GAGCCTAAAAAAGAATAAAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=67726983;WS=67726965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	67727003	rs1435086	A	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=162;SC=CCAGGTCACAAGAAATCTTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=67727011;WS=67726993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	67733234	rs11151561	T	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=395;SC=ACACACAAGATATCCTTAAAC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=67733242;WS=67733224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	67741117	rs1369292	G	A	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=23;PP=1173;SC=TCAAAATAAAGGACTTATGCA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=67741125;WS=67741107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	67741309	rs1369293	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=458;SC=CGCATTACAGGAAACCAATTC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=67741317;WS=67741299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	67742801	rs285228	G	A	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=20;PP=558;SC=GGGAAAGAAGGAGGAGACACT;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=67742809;WS=67742791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	67759549	rs4891394	C	A	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=404;SC=ATGAAAACAACGTGAAAATGT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=67759557;WS=67759539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	67809647	rs11665653	A	C	77.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr18	67812773	rs11662011	G	A	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=250;SC=ACAAACTGAAGAATGTCACAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=67812781;WS=67812763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	67817744	rs12606964	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=352;SC=GGTTTCTTTTTAGTTTCTCAC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=67817752;WS=67817734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	67818046	rs12604751	C	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=48;SC=CTTCTGTTTACAATCCCATTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=67818054;WS=67818036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	67860719	rs283250	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=ATAAAATTATTCTTTAGTAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=67860727;WS=67860709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	67863850	rs74941514	T	TCTC	3246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=27;PP=2312;SC=ATGCTTTCCATCTCCAAAGGC;SOR=0.836;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=44;WE=67863858;WS=67863840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	67871343	rs3911730	A	C	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=28;PP=1598;SC=GTTTGGTATGAGGCAGAAGAT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=82;WE=67871351;WS=67871333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr18	70209321	rs7237888	C	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=325;SC=CGCAGCCGCCCGGCTCGCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=70209329;WS=70209311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	70417396	rs922999	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=15;PP=784;SC=TTGCGAGTAGCTGTGTTTCAT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=70417404;WS=70417386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	70450879	rs76761660	C	T	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=37;PP=1717;SC=ATGGCATATACGAAGGAAAAA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=91;WE=70450887;WS=70450869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	70532840	rs10164255	T	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=551;SC=CATCTCTGAATGAAGAGAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=70532848;WS=70532830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	70532977	rs10163845	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=281;SC=CAGACTGTGGAGGAGGAGAAT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=70532985;WS=70532967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	70534401	rs6566677	G	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=216;SC=GGGTCCGCCGGAGCGCGGCGC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=70534409;WS=70534391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	71442075	rs11872509	T	C	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.51;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	71442075	.	TGG	CGT	1360	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=21;NR=16;PP=1360;QD=38.2018344557;SC=AAAAAGAAGTTGGAAGATGCA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=37;WE=71442085;WS=71442065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr18	71442077	rs11875403	G	T	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.76;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	71740743	rs35815390	A	G	4249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=48;PP=2600;SC=ATACTAAGATAAAGGACCAGG;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=71740751;WS=71740733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr18	71825719	rs8148	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=253;SC=TGATTAAAATAGGGTTTCTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=71825727;WS=71825709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	71920966	rs1790871	T	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.745;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=725;ReadPosRankSum=-0.675;SC=AAATCTTTGCTCCTTCTAACA;SOR=0.820;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=42;WE=71920974;WS=71920956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr18	71930734	rs2032262	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1173;SC=AGAGGTAGAATAAAAATTTTT;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=71930742;WS=71930724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	71930758	rs2032263	G	A	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.26;NF=10;NR=28;PP=800;SC=TCAGGCAAATGAATTAAGAGA;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=71930766;WS=71930748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	71930834	rs144732931	C	CTG	311.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=0;NR=8;PP=352;SC=CAACAGGAGACTAACTTGTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=71930852;WS=71930824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	71930844	rs2032264	C	G	321.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=131;SC=CTAACTTGTCCATAAATGTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=71930852;WS=71930824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	71989909	rs10164170	T	C	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=140;SC=AAGTCCTTTTTATAAATGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=71989917;WS=71989899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	71990033	rs10163785	G	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=12;PP=403;SC=TTGTTTATAGGGATTATACGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=71990041;WS=71990023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	71996377	rs1541292	G	A	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=145;SC=TAATCCCAACGGTTTGGGAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=71996385;WS=71996367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	72020475	rs8093010	T	C	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=54;NR=34;PP=1709;SC=TCTCTATCCTTTTCAGGAACA;SOR=1.125;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=88;WE=72020483;WS=72020465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr18	72021548	rs12608084	C	T	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=613;SC=ATGCTAGACCCTTAAAACCCC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=72021556;WS=72021538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	72021717	rs12606060	T	C	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=12;PP=802;SC=AAATCAAAACTTAAGAAATCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=72021725;WS=72021707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	72109174	rs1559805	C	A	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=7;PP=678;SC=CCAGCCCTGGCGGACTCTCAT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=72109182;WS=72109164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	72113730	rs3861310	A	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=407;SC=CTGCAGAAGCAACAGTAGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=72113738;WS=72113720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	72114455	rs8087020	C	T	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=55;PP=1673;SC=AACAGCAGCTCTCCCGCCACA;SOR=1.354;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=72114463;WS=72114445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	72186059	rs733062	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=637;SC=GACCTTGAACGCGGGCTTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=72186067;WS=72186049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	72223591	rs10663835	G	GTGC	1849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=1379;SC=CCTGCTGGCTGTGCTGCTGCT;SOR=2.726;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=26;WE=72223599;WS=72223581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	72228124	rs4263028	A	G	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=56;PP=1767;SC=AATACCTCCCATCATCCTGGC;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=72228132;WS=72228114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr18	72229167	rs9319909	C	G	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=12;PP=756;SC=TTTGAGCCTGCAATATTATTA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=72229175;WS=72229157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	72229212	rs9967490	G	A	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=22;PP=1037;SC=CCCATGAAACGACATTGGTTT;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=72229220;WS=72229202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	72234337	rs4891562	A	C	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=75;SC=CCATGATTCAATTACCTCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=72234345;WS=72234327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	72234635	rs12960862	C	T	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=32;PP=964;SC=CAATCACTTACGGAACCCGGG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=72234643;WS=72234625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	72238283	rs4892244	A	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=223;SC=TGAGAAACACAGAAAGTGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=72238291;WS=72238273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	72247278	rs4892247	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=356;SC=ATTAACTGTACTAATCAGTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=72247286;WS=72247268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	72250762	rs11659237	T	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=21;PP=1342;SC=GTTCTTGTCCTTACCCTATTC;SOR=1.539;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=72250770;WS=72250752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	72264397	rs7505285	A	C	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	72264406	rs7505289	A	G	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.56;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	72264473	rs7505334	C	T	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=31;PP=1432;SC=TTTTTCTCATCATCTAAAGTA;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=72264481;WS=72264463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	72343008	rs7243081	T	C	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=30;PP=1711;SC=CCGAAAATGATGAGGATGAAA;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=72343016;WS=72342998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	72493314	rs7228438	G	T	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=77;SC=TTATTCTTAAGTTCTCTTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=72493322;WS=72493304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	72593118	rs2628126	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=215;SC=GCAGAGAGGACGGCAAGACAC;SOR=1.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=72593126;WS=72593108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	72776121	rs3744913	G	A	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TCATCGTGACGGAGGAGCTGG;SOR=0.263;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=77;WE=72776129;WS=72776111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr18	72914280	rs7230037	G	A	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=19;PP=662;SC=TGTCAGATGCGTTAACACCAA;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=72914288;WS=72914270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	72997677	rs3826609	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=31;PP=1216;SC=GTCCCGACAGCGTCTCGTACC;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=65;WE=72997685;WS=72997667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	72998004	rs3744908	T	C	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=30;PP=1128;SC=CGTCCTCGTATGGGCTGCTTC;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=72998012;WS=72997994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	72998268	rs3744909	T	C	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=46;PP=1692;SC=GGAAGGAGGATGCCCAGAAGG;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=93;WE=72998276;WS=72998258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	72998886	rs3809997	T	C	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=33;PP=1383;SC=AGAAGCCGCCTGTGGCTGGCG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=72998894;WS=72998876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	72999359	rs55679337	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=20;PP=1100;SC=AAGAGCTCCCTGGCCAAGGCT;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=72999367;WS=72999349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	73130653	.	G	GTT	126	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=126;QD=23.3333333333;SC=GAATGTTCTAGTTTTTTTTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=73130661;WS=73130643;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr18	73139335	rs7235563	C	G	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=24;PP=1337;SC=TAGGACCATACCTGTGCAGTG;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=73139343;WS=73139325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	74090957	rs56087742	CG	C	1573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=31;PP=1151;SC=GAGTGTAGGACGGGGGGGCGC;SOR=1.244;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=40;WE=74090965;WS=74090947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	74092366	rs12970367	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=232;SC=TGTCTTCAGCGGGAGAAGCCA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=74092374;WS=74092356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	74153146	rs59762437	G	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=7;PP=338;SC=CTGGAAGCAGGAACCCCCTGA;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=74153154;WS=74153136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	74591992	rs5826483	G	GT	148.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-0.230;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.842;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr18	74611127	rs608433	A	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=40;PP=1556;SC=CAAGACGAATATTCCAGTCCC;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=74611135;WS=74611117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	74648536	rs630229	G	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=452;SC=TTTATGAGATGTATTTTGACC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=74648544;WS=74648526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	74680259	rs657066	C	T	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=17;PP=679;SC=TGCAGGAGGCCGCCGGCGAGT;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=74680267;WS=74680249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	74680369	rs470774	C	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=558;SC=TTGGAATCTCCGTTTTAAAGC;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=74680377;WS=74680359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	74692336	rs9199	A	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=16;PP=595;SC=GTTTTAAGGCAGTTATATTAA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=74692344;WS=74692326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	74702864	rs9676113	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=11;PP=658;SC=CTCAGTGTGCGGCTCTCCTGA;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=74702872;WS=74702854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	74702999	rs9676140	C	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=437;SC=GGGCTGAATACAGGAAAATGC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=74703007;WS=74702989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	74778515	rs7241461	G	T	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=1392;SC=CGCAGGATTCGGAATTCTGGC;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=74778523;WS=74778505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	74779972	rs112846387	C	CGT	31.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr18	74980809	rs5376	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=42;PP=1575;SC=ACTAAAGAAAGTAAAAGTCGA;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=74980817;WS=74980799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	76752263	rs35091814	C	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1137;SC=GCGCCGCCCCCCGAGGACTTC;SOR=1.394;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=76752271;WS=76752253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	76753063	rs2472643	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=8;PP=614;SC=GGCGCCCGGCCTGCCAAGTCC;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=76753071;WS=76753053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	76754226	rs117543046	G	A	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=55;PP=2426;SC=CCATCTGCCAGAAGAAGTTCA;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=114;WE=76754234;WS=76754216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr18	76754871	rs2615613	G	T	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=20;PP=1498;SC=AGGAGGAGGCGCCCTTCAGCC;SOR=1.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=76754879;WS=76754861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	76829232	rs4381664	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=258;SC=AGGGCGGGGCCTAGGGACGCC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=76829240;WS=76829229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	76829377	rs4502288	A	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.19;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	76829549	.	C	CG	801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=534;SC=GCGGCACTGGCCCCGTTCCCC;SOR=1.230;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=76829557;WS=76829539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	76829599	rs4312374	C	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=248;SC=CGCAGGAACCCGGAGCCGGGC;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=76829607;WS=76829589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	76870347	rs617890	T	G	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=870;SC=ATCTTTTGTTTCATACAGTTG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=76870355;WS=76870337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	76870397	rs492657	G	A	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=22;PP=1146;SC=GAAAGAAAGAGCTGAAAGCTC;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=76870405;WS=76870387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	76874946	rs35748278	C	T	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	76934122	rs72996104	A	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=321;SC=AGGAAGAATAAGAAAGAGTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=76934130;WS=76934112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	76934379	rs72996107	G	A	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=166;SC=AGCATTTACAGATTACAACCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=76934387;WS=76934369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	77097360	rs585033	A	T	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=48;PP=1664;SC=GGAGAGGGAGATGGAACTGCT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=77097368;WS=77097350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr18	77107598	rs304918	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	77156103	rs71359461	G	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=193;SC=CTTTCCTCCGGGGCGCGCGGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=77156111;WS=77156093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	77160367	.	C	CGCCCCG	2352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.05;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	77170006	rs182507	C	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=15;PP=745;SC=GAATGAAGAGCGGAACCCGTG;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=77170014;WS=77169996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	77171061	rs2230112	T	G	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=53;PP=1973;SC=CCGCGTCCCCTTGCAACAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=108;WE=77171069;WS=77171051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr18	77210902	rs680802	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=654;SC=CAGGCCTTTACGCTCCCGCGT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=77210910;WS=77210892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	77246406	rs754093	T	G	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=22;PP=662;SC=CTTCCCGCCCTGTCCGCAGAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=77246414;WS=77246396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	77246978	rs754096	G	A	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=54;PP=1578;SC=CCCGCCTGGCGCCATGGCGTG;SOR=1.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=77246986;WS=77246968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	77420703	rs868678	C	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=15;PP=662;SC=AGCTCCCTCCCGGGGTCTTTC;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=77420711;WS=77420693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	77439532	rs3826573	T	C	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=39;PP=1221;SC=CCCGCCATGCTCTGTCCGCGG;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=77439540;WS=77439522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	77439844	rs56006341	G	T	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	77440128	rs17855830	T	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=6;PP=192;SC=CGCGCAGTCCTCCGGGGCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=77440136;WS=77440118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	77455871	rs558700	C	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=14;PP=703;SC=AAGATAGCAGCGTGTGTCCGT;SOR=1.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=77455879;WS=77455861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	77458037	rs2242174	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=47;PP=1656;SC=CCGCGGGTCCTAGAATTTTGA;SOR=1.006;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=81;WE=77458045;WS=77458027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr18	77513721	rs626169	T	C	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=70;PP=1876;SC=GCAACGAGGATGAGGGCAGCA;SOR=1.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=77513729;WS=77513711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr18	77694128	rs3837882	TA	T	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=30;PP=508;SC=TGCATTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=30;WE=77694137;WS=77694118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	77694168	rs2277725	T	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=552;SC=GATCACAAGATTTTGGTTTTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=77694176;WS=77694158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	77728045	rs2298644	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=9;PP=544;SC=TGTGCCTCGGCGGCTCTGGAC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=77728053;WS=77728035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	77728135	rs2298645	G	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=29;PP=987;SC=AGAATGTCAAGGACTTAATGG;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=77728143;WS=77728125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	77736692	rs191101384	T	C	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=46;PP=2499;SC=ACGCATACCCTATACAACCCA;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=118;WE=77736700;WS=77736682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr18	77736735	rs4799116	T	C	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=61;PP=2538;SC=GAGGCTCCACTTTTGGAGAAT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=125;WE=77736743;WS=77736725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr18	77797321	rs748337	C	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=263;SC=GCTCTTCTTCCTGATGGAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=77797329;WS=77797311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	77805949	rs3744873	A	C	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=50;PP=1992;SC=AACGCAGATGAAAAAGGGAAG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=77805957;WS=77805939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	77894844	rs3744877	G	A	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=54;PP=2128;SC=AGGTGGTCCCGTCTGGGCTTC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=92;WE=77894852;WS=77894834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr18	77926862	rs72978384	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=26;PP=1166;SC=ACTCTCTGGCGAGGAAGGGTG;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=77926870;WS=77926852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	77927028	rs1879105	A	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=15;PP=432;SC=GAGAGCTTGCACCGGGGTGGA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=77927036;WS=77927018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	281360	rs7815	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=138;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GGACTCACAGCAGCTCCCTGC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=9;WE=281368;WS=281350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr19	287970	.	G	GT	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=0.989;SC=GGGTAAAGCTGGCCCCACCCC;SOR=0.458;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=287978;WS=287960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	290947	rs8111051	C	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	312143	rs10416918	T	C	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=24;PP=1709;SC=CGGTCAGCAGTGCCCAGGGCG;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=312151;WS=312133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	335946	rs3816322	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=1.385;SC=CCATCTGAACGGGTGGGAGCT;SOR=0.268;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=5;WE=335954;WS=335936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr19	367313	rs585487	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.231;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GAGCAACACTGAAAGACACAA;SOR=0.310;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=33;WE=367321;WS=367303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr19	371396	rs644644	G	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.55;QD=31.41;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	372551	rs652081	A	G	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=662;SC=CCTTTCCCACACAGCATCCTG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=372559;WS=372541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	373673	rs2303814	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=0.216;SC=AAGGACAGTGGGGGGGCCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=8;WE=373681;WS=373663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	374016	rs2303815	G	A	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1024;ReadPosRankSum=0.884;SC=CCCTTCCTGCGAGGAGACAGG;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=68;WE=374024;WS=374006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr19	374492	rs10410345	G	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=525;ReadPosRankSum=1.687;SC=CCAGAGAAGCGTGGGTCTTGC;SOR=0.328;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=33;WE=374500;WS=374482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr19	374547	rs648770	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CCGCCTCTCCTTTCCCTCGAG;SOR=0.074;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=374555;WS=374537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	407463	rs146964261	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=333;ReadPosRankSum=-1.333;SC=CACGTGGACCGTGTGCTCCCC;SOR=0.632;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=19;WE=407471;WS=407453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr19	407900	rs10411998	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=671;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GGGGGCTCTCAGCCAGCATGG;SOR=0.898;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=48;WE=407908;WS=407890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr19	418786	rs1115033	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=0.495;SC=ATGGTTGCACGGCTCGGATGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=418794;WS=418776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	422543	rs2287958	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CGGGTTCCCCGGGGAGTCCCT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=422563;WS=422533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	422555	rs2287957	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGAGTCCCTCGTGCACCCGTC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=422563;WS=422533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr19	425290	rs73916977	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GGCTCGCAGGGAGCAAGGCGG;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=6;WE=425298;WS=425280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr19	438868	rs113879435	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.073;SC=AGCGAGGGCGGCTGTGGGTGG;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=130;TCF=88;TCR=42;TR=75;WE=438876;WS=438858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,80:0.58:137
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chr19	501725	rs62130833	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr19	536088	.	C	T	148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=22;MQ=55.59;NF=8;NR=5;PP=148;QD=14.0593240421;SC=TTCCGGGACCCGAGGCGCTGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=13;WE=536096;WS=536078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr19	541685	rs7150	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CTTTTTCTCCCTCCCCATGTC;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=541693;WS=541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr19	544315	rs3760874	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=0.267;SC=ACATCCCGGGACCGTGGGAGA;SOR=1.739;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=16;WE=544323;WS=544305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr19	547224	rs4919846	A	G	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=24;PP=1439;SC=GGACAGTCGCAGCAGGCAGCA;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=547232;WS=547214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	547491	rs2070795	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=529;SC=CCGACGGCGCCCATTCTCTGC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=547499;WS=547481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	549595	rs1599883	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=16;PP=1468;SC=CCTCAGCAGGTGCAGAGGCTG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=549603;WS=549585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	549678	rs1599882	A	G	5134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GGTGTTGGCCAGAGTCCTGTC;SOR=0.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=89;TCR=80;TR=168;WE=549686;WS=549668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr19	582253	rs4919862	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=979;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GTGGGGCCAGTGCTGACAGGC;SOR=0.531;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=155;TCF=93;TCR=62;TR=79;WE=582261;WS=582243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,86:0.49:174
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chr19	613307	rs2301778	C	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.076;NF=27;NR=12;PP=563;ReadPosRankSum=-1.237;SC=TCGCCAACGCCGACCCCAACT;SOR=1.013;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=39;WE=613315;WS=613297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,47:0.41:114
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chr19	617205	rs2072122	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=195;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CGTGCACCCTTCCTGAAGACA;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=617213;WS=617195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr19	617379	rs62132647	G	A	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
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chr19	617528	rs55716325	T	TG	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=1.680;SC=GGTTTTGGGGTGGGGGGGGAA;SOR=0.774;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=6;WE=617536;WS=617518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr19	619021	rs14155	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.920;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
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chr19	619574	rs10853990	T	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=212;ReadPosRankSum=1.603;SC=CAGCGCGACATGCCTGGCGCA;SOR=0.324;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=15;WE=619582;WS=619564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr19	619772	rs11669381	G	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCACCTGCACGGCGGGTGGGC;SOR=1.128;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=9;WE=619780;WS=619762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	620504	rs41549114	T	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=555;ReadPosRankSum=0.640;SC=GGACAGCGGATGGGGGGCAGT;SOR=0.684;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=42;WE=620512;WS=620494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,55:0.56:98
chr19	621020	rs111437074	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	621076	rs144035257	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=309;ReadPosRankSum=0.704;SC=GTTGGTCCGCGGAGTCCAGGA;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=20;WE=621084;WS=621066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr19	621712	rs2238547	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.689;NF=10;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TGAGCAGGAAAGCACCAGAGT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=13;WE=621720;WS=621702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	622000	rs2238548	C	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=1.379;SC=CGGCCGGACACCTGCATGGAC;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=622008;WS=621990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	622336	rs2238549	T	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.631;NF=10;NR=17;PP=404;ReadPosRankSum=1.151;SC=CGCCCCCAGCTCCTCCCAGTA;SOR=1.170;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=27;WE=622344;WS=622326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr19	623064	rs41546216	TC	T	1625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=1091;ReadPosRankSum=0.077;SC=TCACCGCAGCTCCCTGCAGAG;SOR=0.344;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=32;WE=623072;WS=623054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr19	623670	rs41554313	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=409;ReadPosRankSum=-0.098;SC=AGGACCCCGAGACAGCATGGG;SOR=0.453;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=31;WE=623678;WS=623660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr19	623728	rs41542013	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=1.701;SC=CTATCGCTGACGCGGGGAAAG;SOR=1.140;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=7;WE=623736;WS=623718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr19	625198	rs1056766	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.082;NF=25;NR=17;PP=593;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GCAGGTCCGGAGTCAAGCCGG;SOR=0.290;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=42;WE=625206;WS=625188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr19	633381	rs11669858	A	G	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGAGGAGCCCACGCCGTGGCC;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=69;TCR=79;TR=83;WE=633389;WS=633371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,102:0.55:186
chr19	633529	.	G	GGCGCCGCCGCCGCCGCCGCC	683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.396;NF=0;NR=5;PP=2009;ReadPosRankSum=-2.248;SC=CGCCGCTCCAGGCCACCCCAC;SOR=2.128;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=5;WE=633537;WS=633519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr19	641215	rs7246140	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CCCACCCTCCTGGGGCTCCCA;SOR=0.460;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=18;WE=641223;WS=641205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr19	643104	.	G	GGAGGGGACTCGTGGTCTGGGGCAGGGGGGGCTCCTCGTGTCTGTCGTGGTCAT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=167.58;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	646891	rs10403235	G	A	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=74;PP=2561;SC=CAGACACGTCGCGGGACACAG;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=136;WE=646899;WS=646881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	647039	rs2074460	T	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=29;PP=913;SC=CTCCGTTAGCTGTCTCCATCG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=647047;WS=647029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	649110	rs2040736	G	C	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=85;SC=GAGCCCGCCCGGGGTCGGAGA;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=649118;WS=649100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr19	652238	rs11554788	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CTCACCTCCAACGGTGGCCGG;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=29;WE=652246;WS=652228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
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chr19	687142	rs8102982	G	A	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=44;PP=1491;SC=TCTCCCTGGCGGCCTCAGCAG;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=687150;WS=687132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr19	725939	rs3787017	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=72;ReadPosRankSum=0.712;SC=GGCAGAGCCTCGTCCCCTCCT;SOR=0.169;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=725947;WS=725929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr19	731055	rs10405821	G	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=170;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GCCCCACCGGGGATGCAGGAG;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=12;WE=731063;WS=731045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr19	731077	rs10405836	GG	CT	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=347;ReadPosRankSum=0.594;SC=CACCCTCACAGGCACACCCTC;SOR=0.526;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=12;WE=731086;WS=731067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr19	731144	rs1050457	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=239;ReadPosRankSum=-1.802;SC=CGCCCCAGCCACTGCCAAGGA;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=20;WE=731155;WS=731134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr19	740560	rs10419493	T	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=16;PP=412;SC=CGTGTGGGTCTGGCGTCTGCC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=740568;WS=740550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	746712	rs10421265	C	T	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=53;PP=1131;ReadPosRankSum=0.550;SC=CCACGGAGGCCGCCTCCAGGG;SOR=1.336;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=77;WE=746720;WS=746702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,84:0.50:167
chr19	806692	rs34792662	G	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=1.235;SC=CTCTGCTGCAGCGCTGAGACC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=806700;WS=806682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr19	827975	rs649411	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=2.506;SC=AACTCAGACTTAAAGCACAGA;SOR=1.347;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=22;WE=827983;WS=827965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr19	829568	rs12460890	C	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=1040;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TCAGGAACCCCGGGGTTAGCA;SOR=0.575;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=101;TCR=36;TR=60;WE=829576;WS=829558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,67:0.44:154
chr19	829723	rs678976	A	G	3218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.210;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=68;PP=1795;ReadPosRankSum=1.197;SC=GGATGGTGCCACCTGTGATCC;SOR=0.435;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=260;TCF=102;TCR=158;TR=122;WE=829731;WS=829713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,162:0.47:345
chr19	829824	rs6510980	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=1.029;SC=AGTGGTGGCGCGCACCTGTGG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=14;WE=829832;WS=829814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr19	830621	rs653847	A	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=458;ReadPosRankSum=-0.581;SC=GACTACAGTTAATGTCGCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=23;WE=830629;WS=830611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr19	830854	rs595844	T	C	4328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=88;PP=2345;ReadPosRankSum=0.930;SC=TTCCCAGGTTTGTCAACGTGA;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=384;TCF=202;TCR=182;TR=190;WE=830862;WS=830844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,215:0.48:448
chr19	844077	rs351112	A	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.491;SC=GCACGGCCAGAGGGCTCCGGG;SOR=0.410;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=23;WE=844085;WS=844067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr19	847993	rs12985970	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=2.248;SC=CAGCGCTGGCCGGGACCCCGA;SOR=1.075;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=11;WE=848001;WS=847983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr19	862024	rs1683561	C	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=396;SC=AGAGGGAGCGCGAAGCGGGGG;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=862032;WS=862014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	868115	rs13090	C	T	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=24;PP=988;SC=GGACGGTCCTCTGGATGCAGA;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=868123;WS=868105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	868551	rs1631848	T	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=32;PP=1020;SC=GGGCCTCCCTTACGCCTGCCC;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=868559;WS=868541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	868620	rs1651891	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=89;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=304;SC=TGCTCCCCACGTCCCCACCTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=868628;WS=868610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	869037	rs1683591	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=467;SC=GGGTGGAGGGAATGGCCGGCC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=869045;WS=869027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	871135	rs1683569	A	G	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=28;PP=1485;SC=GCAGGCGGCTAACCAGGCCGT;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=66;WE=871143;WS=871125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	871447	rs1683570	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.12;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	871447	.	AGTTCTCTCCC	GGTTCTCTCCC,GGTTCTCTCCT	379	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=23,10;NR=6,2;PP=379,226;QD=14.2679728465;SC=GTGACCCCAGAGTTCTCTCCC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29,12;WE=871465;WS=871437;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:29
chr19	871457	rs2288546	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	871724	rs73492568	G	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=699;SC=ATGTTCTGGCGGGGGGCTCAG;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=871732;WS=871714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	871898	rs191758226	A	C	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=101;SC=GAGCGGGGAGAGGGGAGGGGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=871906;WS=871888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	871987	rs78047294	G	A	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=49;PP=2605;SC=GGGTATCCGAGGTGGCCGTAT;SOR=1.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=141;WE=871995;WS=871977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	873743	rs1651888	G	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=4;PP=112;SC=GTTGCCGGACGGAGAGGAACT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=873751;WS=873733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	875389	rs11546307	G	A	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=42;PP=1419;SC=CGCACACGCGGGTCACCGTGC;SOR=1.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=68;WE=875397;WS=875379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	876910	.	C	T	439	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=25;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=8;NR=5;PP=439;QD=36.4439394267;SC=CCACCTGCCACGGGGCCCCCA;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=13;WE=876919;WS=876900;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr19	876911	rs10414386	G	A	244.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=268;SC=CACCTGCCACGGGGCCCCCAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=876919;WS=876900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	879887	.	C	G	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5083;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=20;MQ=53.1;NF=12;NR=2;PP=197;QD=16.5550866105;SC=TCGCCTTCCCCTGGTTGTCAA;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=14;WE=879895;WS=879879;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr19	884782	rs2965294	C	G	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=14;PP=1238;SC=CGAGGCGAGACGATCGCTTAG;SOR=1.903;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=54;WE=884790;WS=884772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	885818	rs1060442	A	G	5087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=74;PP=2965;SC=TGATGGCGGGAAACTTGTCCT;SOR=0.844;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=163;WE=885826;WS=885808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	886257	rs2930900	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-0.311;SC=GGGCTGCCCCATGACCCCCAG;SOR=0.377;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=14;WE=886265;WS=886247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr19	890165	rs6678	G	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=23;PP=1201;SC=GGCAGGTGATGGCCTCGTGGT;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=890173;WS=890155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	897571	rs3746149	G	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=30;PP=1057;SC=GCAAGAACGGGAGGAATTTGG;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=897579;WS=897561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	899444	rs2965284	C	T	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=1365;ReadPosRankSum=-2.163;SC=ACTTACTGGCCGAGATGAGGT;SOR=0.559;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=148;TCF=98;TCR=50;TR=82;WE=899452;WS=899434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr19	899978	rs2306718	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=442;ReadPosRankSum=0.728;SC=GACCTGCACCGGGTGAGAACC;SOR=0.233;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=29;WE=899986;WS=899968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr19	920170	rs350131	G	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=-2.187;SC=GGTGGGAGGCGCCGGTGGGGG;SOR=1.802;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=7;WE=920178;WS=920160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	920642	rs350132	T	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=251;ReadPosRankSum=-1.183;SC=GCGGAGCTGCTCCGCCTGGGG;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=15;WE=920650;WS=920632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr19	929678	rs3826948	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=0.443;SC=GAGAGCCCGAGAGTGCCCGGA;SOR=1.189;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=22;WE=929686;WS=929668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr19	929753	rs1799595	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=348;ReadPosRankSum=-2.458;SC=TGGGACACCCAGCCAGCCCCG;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=27;WE=929761;WS=929743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr19	960187	rs1637993	G	C	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=31;NR=44;PP=1543;SC=CCCCCACCCCGCTGGAGGGAG;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=960195;WS=960166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	960266	rs1683584	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=688;SC=GTGAGCACCCCGTGGCTGGAG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=960274;WS=960256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	964434	rs2240615	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=411;ReadPosRankSum=0.755;SC=CGGACCCAGTGAGTGGCGGAC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=26;WE=964442;WS=964424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr19	965043	rs12608658	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=956;SC=CAAGCACCAATGGCAGCTCCA;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=965051;WS=965033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	966693	rs6510986	C	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=51;PP=2233;SC=CAGCTGTGGCCGCACAGGCAG;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=106;WE=966701;WS=966683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	968318	rs8105235	C	T	174.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.25;QD=19.42;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	968345	rs7251219	CA	TG	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=430;SC=GGCAACAGAGCAAGACTCTGT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=9;WE=968366;WS=968335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	971933	rs1051504	A	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=52;PP=1756;SC=CCAACAAAGGAGGCGGCGGCG;SOR=1.131;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=86;WE=971941;WS=971923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	971949	rs1051505	G	A	3337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=45;PP=1481;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCAGCAG;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=77;WE=971957;WS=971939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	984218	rs8112598	C	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=170;SC=ACAAGAAAGCCCCTCTCTCCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=984226;WS=984215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	984533	rs2301810	T	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=950;ReadPosRankSum=0.036;SC=TGGGCAAGAATTACATCAGCG;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=28;WE=984545;WS=984523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr19	984537	rs61732720	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CAAGAATTACATCAGCGCCTG;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=34;WE=984545;WS=984523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr19	984554	rs4806884	C	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CCTGGGAGCTCCAGCGGAAGG;SOR=0.884;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=20;WE=984562;WS=984544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr19	984578	rs2301811	T	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-1.700;SC=GGCGGTGCGGTCTCGCTGCTG;SOR=0.910;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=13;WE=984586;WS=984568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr19	985815	rs2074573	T	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=573;ReadPosRankSum=0.429;SC=ACTGCTGTAGTAGCTCCCGTG;SOR=1.148;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=33;WE=985823;WS=985805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr19	985997	rs2074574	C	G	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=68;PP=2084;SC=AAAGCGTGAGCGTTTCCCACA;SOR=1.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=105;WE=986005;WS=985987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	989730	rs2240147	C	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=905;ReadPosRankSum=1.057;SC=GGGCTTTCCTCCCCTGACCTG;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=60;WE=989738;WS=989720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr19	990185	rs10409367	G	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=802;SC=TGTTCCCTCCGCTCCCCGCCT;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=990193;WS=990175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	990238	rs117300378	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=787;ReadPosRankSum=1.045;SC=TGCAGGCCGACCCCTCCAGGA;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=49;WE=990246;WS=990228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr19	990281	rs2158367	G	A	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=64;PP=2393;SC=GTCTCACCACGCGCTCCCCAT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=990289;WS=990271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	990394	rs2240148	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=338;ReadPosRankSum=-2.576;SC=CCACGGTCCATGAGCGGAGCC;SOR=0.489;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=26;WE=990402;WS=990384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr19	990736	rs2365709	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=0.770;SC=CACCCAAAGTCGCAAGCCCTA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=990744;WS=990728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	990819	rs2240149	G	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=463;ReadPosRankSum=-1.346;SC=TCCCCCTGCCGGGCCGAGCCC;SOR=0.856;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=28;WE=990827;WS=990809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr19	991063	rs2240150	A	C	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=54;PP=1518;ReadPosRankSum=1.253;SC=CGGCTCACACACGTCTCGGCC;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=59;TCR=108;TR=86;WE=991071;WS=991053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,96:0.51:188
chr19	991129	rs11538683	G	A	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1101;ReadPosRankSum=0.077;SC=CGCCGGGAAGGTCTTCAAAGG;SOR=0.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=62;WE=991137;WS=991119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,67:0.58:115
chr19	991196	rs60416441	CGTCCCAG	CCCCAG,C	5775.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=52;PP=2957;SC=CTGTCTGGCACGTCCCAGGTG;SOR=0.709;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=72;WE=991212;WS=991186;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:129
chr19	991199	rs201372013	CCCAGG	C	5806.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	991204	.	G	C	2311	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=53;NR=52;PP=2311;QD=22.3406782147;SC=CACGTCCCAGGTGACCCCTGT;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=105;WE=991212;WS=991186;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,105:0.90:117
chr19	991374	rs77430782	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=1.506;SC=CTGCTCGGCCCGCGGCCAGCG;SOR=0.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=21;WE=991382;WS=991364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr19	991873	rs71335284	G	T	141.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.01;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	991892	rs71335285	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=253;SC=GGGGCGGAACTTGGCTTGCTG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=991900;WS=991882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	991968	rs1127043	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr19	1000420	rs112743753	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=902;ReadPosRankSum=0.558;SC=GTGGCGAGCGACGCCGACAAC;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=63;WE=1000428;WS=1000410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,70:0.43:162
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chr19	1003857	rs4806904	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.56;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
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chr19	1004710	rs4807399	C	T	9297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=130;PP=2965;SC=TGCCTCTGCACGGCCCCCGCC;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=111;TCR=130;TR=241;WE=1004732;WS=1004700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr19	1004724	rs11880849	A	G	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.432;SC=CCCCGCCCCCACAGGGTGCCC;SOR=0.751;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=237;TCF=115;TCR=122;TR=92;WE=1004732;WS=1004700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,114:0.40:283
chr19	1004740	rs2240157	T	C	9804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=123;PP=2965;SC=TGCCCAGGTCTGGCCCAAGCT;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=122;TCR=123;TR=245;WE=1004748;WS=1004730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr19	1004823	rs4806908	G	A	4771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.148;NF=58;NR=58;PP=1734;ReadPosRankSum=1.987;SC=AGTGCCCAGCGGGGCAGCTGT;SOR=0.639;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=265;TCF=137;TCR=128;TR=116;WE=1004831;WS=1004813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,132:0.43:304
chr19	1004844	rs4806909	T	C	4720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.03;MQRankSum=1.153;NF=61;NR=61;PP=1438;ReadPosRankSum=0.824;SC=GCCTGGACCCTGGCACCAACG;SOR=0.529;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=270;TCF=144;TCR=126;TR=122;WE=1004852;WS=1004834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,134:0.43:310
chr19	1004896	rs10666583	G	GCGTT	3091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.293;NF=16;NR=41;PP=2779;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GCTGGCCAACGGCTCAGCGCC;SOR=0.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=45;TCR=116;TR=57;WE=1004904;WS=1004886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,85:0.38:225
chr19	1005230	rs2240158	C	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=937;ReadPosRankSum=-1.377;SC=CACTGGTCCACGTGGCTGGGC;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=57;WE=1005238;WS=1005220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,70:0.44:158
chr19	1005531	rs12973948	G	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=993;ReadPosRankSum=1.070;SC=TCGAGGAGCTGTCGGGGATCC;SOR=1.150;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=53;WE=1005539;WS=1005521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr19	1005598	rs11671828	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=296;ReadPosRankSum=-1.514;SC=GGGCTAGCGGTGGCCCCGGGC;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=20;WE=1005606;WS=1005588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr19	1008358	rs10403909	A	G	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=24;SC=CCTTGTCTGAAGTGACCAACC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=1008366;WS=1008348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	1009365	rs10417824	T	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=13;PP=370;SC=GCTGTGCTCCTACGGCCGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=1009373;WS=1009355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	1009485	rs10401245	C	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=379;SC=GCGGCGCGGCCAGCTCCTGGC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=1009493;WS=1009475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	1009550	rs142516571	GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT	G	1017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.904;NF=1;NR=10;PP=2915;ReadPosRankSum=1.747;SC=AGGCCAGAGCGGCCCCCGCGG;SOR=0.546;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=1009593;WS=1009540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr19	1009585	rs10401454	C	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=746;ReadPosRankSum=0.444;SC=TCTGGCCGACCGGGGAGCCAG;SOR=0.979;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=14;WE=1009593;WS=1009540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr19	1010406	rs62131162	G	A	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=508;ReadPosRankSum=0.894;SC=GGCTAGGCCCGCCTACCGCAG;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=35;WE=1010414;WS=1010396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr19	1010691	rs2240159	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=34;PP=1134;SC=CGCTGGCCCCAGGCGAGACGG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=1010699;WS=1010681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	1010908	rs7248769	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr19	1010908	.	AGT	GGC	519	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=7;NR=10;PP=519;QD=33.6745808742;SC=CGGGAGGGAGAGTGGGAGTCA;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=17;WE=1010918;WS=1010898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr19	1010910	rs7252527	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr19	1011338	rs34750262	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=0.942;SC=CCAGCACCCACTCCACCCTGC;SOR=1.387;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=12;WE=1011346;WS=1011328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr19	1011823	rs2240161	A	G	9109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=72;PP=2965;SC=AGGAAGCGCTATGAGGGGCTG;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=147;TCR=72;TR=219;WE=1011831;WS=1011813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	1011846	rs10420656	T	C	5577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.43;ReadPosRankSum=2.903;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,145:0.53:273
chr19	1011856	rs113138803	C	A	5673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=0.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.41;ReadPosRankSum=2.025;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,151:0.54:278
chr19	1012120	rs7145	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=738;ReadPosRankSum=0.606;SC=GGATGTCATCGTAGCCCAGGA;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=46;WE=1012128;WS=1012110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
chr19	1012379	rs2240162	C	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.93;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	1012379	.	CGT	GGC	457	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21;NR=5;PP=457;QD=19.6333798024;SC=CACAGCCCCCCGTCCCGCACC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=1012389;WS=1012369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr19	1012381	rs2240163	T	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.14;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	1012416	rs112926823	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=348;ReadPosRankSum=0.207;SC=AGGGAGGAGGGGAGGCCCCGC;SOR=0.803;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=20;WE=1012424;WS=1012406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr19	1012440	rs11672715	A	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=553;ReadPosRankSum=2.054;SC=GGAGCTCCCCAAGCCCAGCAG;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=37;WE=1012448;WS=1012430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr19	1012611	rs970100	A	C	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=1004;SC=GCGCCCCCACACACGTCCCCC;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=1012619;WS=1012601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	1012639	rs62131163	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GCCAGCAGGCAAGGCAGGCGT;SOR=1.013;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=16;WE=1012647;WS=1012629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr19	1013148	rs3815170	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=458;ReadPosRankSum=-1.754;SC=CAGCCAGCAGGCTGGGGATGT;SOR=1.163;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=28;WE=1013156;WS=1013138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr19	1014377	rs1058506	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=598;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GGATGCCCTCACGCGGCCACT;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=41;WE=1014385;WS=1014367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr19	1014398	rs7146	A	G	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=37;PP=1271;SC=TGTCACGCACATGCTCCAGGC;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=1014406;WS=1014388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	1014537	rs67806247	ACGTGATGGGG	A	313.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=7;PP=1886;SC=CCAAGGGCCTACGTGATGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=1014554;WS=1014527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	1020673	rs1005504	C	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=275;SC=GTGGCGCTCGCTGTCCCCAGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=1020681;WS=1020663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	1031212	rs7247087	A	G	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,83:0.48:172
chr19	1031340	rs12978059	C	G	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=9;PP=311;SC=AGGGTGGTGGCGGGGGGCGGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=1031348;WS=1031330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	1032369	rs10401325	C	T	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=526;SC=CTGTTTCCCCCGCCCCATGTT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=1032377;WS=1032359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	1032689	rs1141534	G	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=442;ReadPosRankSum=0.703;SC=TCGCCCTGGCGGGGAAGGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=14;WE=1032710;WS=1032679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr19	1032702	rs4315451	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=324;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GAAGGTGAGGCCCAGAGAGGG;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=11;WE=1032710;WS=1032679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	1032756	rs55784632	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-0.599;SC=GATGTAGCTGCTGCATTCACT;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=10;WE=1032764;WS=1032746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr19	1032778	rs143549322	TTC	T	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=250;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GTTTGCAAATTTCTGTTTGTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=1032787;WS=1032768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	1032871	rs4630683	A	G	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	1036018	rs930232	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=229;ReadPosRankSum=1.650;SC=GGCTCTGCGCGGCAGGCAGAG;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=21;WE=1036026;WS=1036008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr19	1036444	rs930231	G	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=543;ReadPosRankSum=0.708;SC=CCAGCCAGTCGGGCATGACTG;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=30;WE=1036452;WS=1036434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr19	1036552	rs2304262	T	C	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CGAACAAGTGTGCCAGCCAGG;SOR=0.461;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=79;WE=1036560;WS=1036542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,87:0.51:170
chr19	1037932	rs3848639	G	C	38.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=1.150;SC=CACATCGTCTGCCCATCTGGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=1037940;WS=1037922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	1042809	rs3764645	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GAGGCCGCTGAGGACCTGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=28;WE=1042817;WS=1042799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr19	1043103	rs72973581	G	A	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=7;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.475;SC=AGGGACCAGCGGCCCCCTGGA;SOR=1.155;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=115;TCF=92;TCR=23;TR=54;WE=1043111;WS=1043093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr19	1043864	rs4622634	G	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=544;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CTGGGGAGGTGGGATGTGGCT;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=45;WE=1043872;WS=1043854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr19	1044753	rs3764648	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGTGAGGGCCTGTCCACCTGC;SOR=0.257;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=1044761;WS=1044743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr19	1047002	rs3752234	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=507;ReadPosRankSum=1.027;SC=TCAGCGCCGCACTGCTGGTTC;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=33;WE=1047010;WS=1046992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr19	1047161	rs3752237	A	G	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.465;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CACAGCTGGGAGACATCCTCC;SOR=0.727;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=207;TCF=105;TCR=102;TR=102;WE=1047169;WS=1047151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,123:0.50:246
chr19	1048859	rs183712769	G	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=103;ReadPosRankSum=1.106;SC=CTCCTGGGGGGTGGGCTAAGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=8;WE=1048867;WS=1048849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr19	1049012	rs4147912	A	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=291;SC=AGGGTGAGGCACTACGAGGCT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=1049020;WS=1049002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	1049269	rs4147914	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=0.777;SC=CTGCAGTGCTGGTAGAAGAGG;SOR=0.728;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=25;WE=1049277;WS=1049259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr19	1050836	.	T	A	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=74;QD=18.1285354245;SC=AAAAATTTTTTAAAAACAGAA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=1050844;WS=1050826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,6:0.55:11
chr19	1050874	rs12151021	A	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1020;SC=TGTAACTGCCAGTGCACTCTG;SOR=1.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=1050882;WS=1050864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	1051214	rs3752240	A	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=565;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GTGCCGCTGTAGTGGGCCCCG;SOR=0.433;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=39;WE=1051222;WS=1051204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr19	1051370	.	TACTGAGGTCCACGTGGGTAGGCAACCTTGCCCAAGGCTGGGTGTGACAC	T	810	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=810;QD=853.0;SC=GGAAGCCGGGTACTGAGGTCC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=1;WE=1051426;WS=1051360;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,1:0.12:8
chr19	1051751	rs3764651	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=0.444;SC=AGAGTTGGGGATAGACAGAGG;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=6;WE=1051759;WS=1051741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	1052005	rs3764652	C	T	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=636;ReadPosRankSum=-0.307;SC=ACCGTGTGGCCGTGGTGGCAG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=40;WE=1052013;WS=1051995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
chr19	1053299	rs3829687	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TGAGCCGGGGCTCCCTGAAGC;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=7;WE=1053307;WS=1053289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	1053677	rs3752242	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=1.335;SC=TGGCTCAGATGTCCCTTGGGA;SOR=1.034;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=16;WE=1053685;WS=1053667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr19	1054060	rs3752243	A	G	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=69;PP=2073;ReadPosRankSum=-2.170;SC=ACGTAACCCTACGGCTCAAGA;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=98;TCR=117;TR=127;WE=1054068;WS=1054050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,146:0.57:256
chr19	1055191	rs3745842	G	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=908;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CAGTGTAGCCGGCCCGGTGCC;SOR=0.772;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=56;WE=1055199;WS=1055181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,64:0.43:149
chr19	1056018	rs3833881	GC	G	761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.640;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=472;ReadPosRankSum=0.187;SC=AGCTCTCCCGGCCCCCCCGGC;SOR=0.343;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=20;WE=1056026;WS=1056008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr19	1056065	rs881768	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=510;ReadPosRankSum=0.732;SC=GGCCCCACAGATACGGAGGCT;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=25;WE=1056073;WS=1056055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr19	1056492	rs3752246	G	C	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=71;PP=2231;SC=CTGTCTGAGGGTGCACTGTGA;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=112;WE=1056500;WS=1056482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	1059004	rs2279796	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=954;ReadPosRankSum=1.574;SC=CCTTTCTGAAAGACCTGCACT;SOR=0.680;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=57;WE=1059012;WS=1058994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,61:0.55:111
chr19	1062370	rs34606911	T	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=285;ReadPosRankSum=-0.498;SC=ACCCAGGCCGTGCCTCTAAAG;SOR=0.538;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=21;WE=1062378;WS=1062360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr19	1063930	rs4807499	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=440;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AGCCCCAAAGCACAAGGCCAC;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=23;WE=1063938;WS=1063920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr19	1064193	rs4147930	G	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=32;PP=1197;SC=GCTCGCGCCTGGCCATCATGG;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=1064201;WS=1064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	1064453	rs4147931	G	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.529;SC=CAGGAGGCGTGAGCCGGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=10;WE=1064461;WS=1064443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr19	1065018	rs4147934	G	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=21;PP=1443;SC=GTTCCCTGGGGCGGAGCTGCG;SOR=1.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=1065026;WS=1065008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	1065044	rs4147935	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=521;ReadPosRankSum=0.894;SC=CACATGGAGGCCGCCTGCGCT;SOR=0.935;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=35;WE=1065052;WS=1065034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr19	1065197	rs4147936	G	C	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=81;PP=2965;SC=GGTCGGGCTGGGGGAGGCAGG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=173;WE=1065205;WS=1065187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	1065945	rs2242436	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=2.241;SC=CCCGGTGTCCCGGAGCACAGG;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=1065953;WS=1065936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	1066256	rs4147938	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=22;PP=522;SC=ACTTGGGGAGGGGGGAGAGAG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=1066264;WS=1066246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	1068734	rs3764653	T	C	4670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.469;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,123:0.49:253
chr19	1068738	rs1801284	G	A	4642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.851;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,120:0.49:247
chr19	1071312	rs4807506	C	T	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=22;PP=847;SC=GACGGCGCACCCGGTGCTGGA;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=1071320;WS=1071302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	1073409	rs2074441	C	G	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=36;PP=1942;SC=CAAGCTCCCTCCTGTTCCCCC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=1073417;WS=1073399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	1074000	rs2074442	A	T	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=26;PP=1440;SC=CCAGCCTGGAAGACTGTGACG;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=1074008;WS=1073990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	1074064	rs12610818	C	G	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=33;PP=2028;SC=GGCCATTGCGCGGGTCGGGCC;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=96;WE=1074072;WS=1074054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	1074252	rs11084881	T	G	5259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=82;PP=2965;SC=TGAGAGCTGGTGTCCCAGCAG;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=158;WE=1074260;WS=1074242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	1077985	rs7251797	A	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=747;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GGGAGCAGGCAGCACGGCCAC;SOR=1.188;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=48;WE=1077993;WS=1077975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr19	1078101	rs72975505	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.809;NF=5;NR=15;PP=400;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CCAATGCTTGGTGTGACATTT;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=20;WE=1078109;WS=1078091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr19	1080189	rs2074453	G	C	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1370;ReadPosRankSum=-2.567;SC=CTCTGTCGGGGGCATGAAGAT;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=124;TCR=109;TR=109;WE=1080197;WS=1080179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,131:0.47:277
chr19	1080311	rs2074454	G	C	6206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=114;PP=2965;SC=TGGCGCGGCCGGAGGCTGCCG;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=93;TCR=114;TR=207;WE=1080319;WS=1080301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr19	1081120	rs8113708	A	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=20;PP=540;SC=TGGGGTGCCCAGCACCGCCGG;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=1081128;WS=1081110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	1081462	.	C	CG	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=29;QD=32.0;SC=GGGCTGTGAGCGCCCCGGGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=2;WE=1081470;WS=1081452;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr19	1081617	rs10404947	A	G	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=51;PP=1811;SC=AGAAGCTGCAAGGCCGCCTGC;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=100;WE=1081625;WS=1081607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	1085508	.	CT	C	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=57.55;NF=3;NR=0;PP=68;QD=30.0;SC=CTTGTCTCTCCTCCATCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=3;WE=1085516;WS=1085499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,3:0.21:14
chr19	1085966	rs3761028	A	G	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=62;PP=1690;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GGCGGATGACACTGGGCTCCT;SOR=0.853;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=79;TCR=121;TR=101;WE=1085974;WS=1085956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,110:0.50:220
chr19	1086043	rs3761026	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=511;ReadPosRankSum=0.954;SC=GCTTCTCTCTTGCCTGCTCCT;SOR=0.457;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=33;WE=1086051;WS=1086033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr19	1090020	rs61585798	TG	T	991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=4;NR=18;PP=404;SC=GGGGTGTGTGTGGGGGGGGAA;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=22;WE=1090028;WS=1090009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	1090803	rs3787016	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=24;PP=944;SC=ATGCACTAATAGGAACACCTG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=1090811;WS=1090793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	1094004	rs12459404	G	A	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=45;PP=2087;SC=CTTGTCCCCAGATTGGGCTTT;SOR=1.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=114;WE=1094012;WS=1093994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	1095061	rs2074445	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CGTCTCGAAACCCCCTCCCTT;SOR=0.169;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=1095069;WS=1095051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr19	1095151	rs10416031	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=85;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CCGGCCCTTCATCGCTGCTGC;SOR=1.702;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=11;WE=1095159;WS=1095141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr19	1095352	rs17554924	C	G	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr19	1095355	rs17554917	C	T	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr19	1095430	rs17554909	T	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CCCGCGCTGGTCTGTCGTCGG;SOR=2.235;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=12;WE=1095438;WS=1095420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr19	1110656	rs145346898	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=-1.347;SC=GGTGTTCCCACGAGCCCCGAG;SOR=0.616;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=1110664;WS=1110646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr19	1207238	rs3764640	G	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=-1.380;SC=GCCGGGCCGGGCCAGTCACGG;SOR=1.501;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=30;WE=1207246;WS=1207228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr19	1207280	rs3764641	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr19	1218523	rs2075604	G	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=594;ReadPosRankSum=0.224;SC=TGTTGGGACCGCGGGGCCTCC;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=39;WE=1218531;WS=1218513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr19	1219191	rs2075605	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GGCTGAGGGCAGGGTGGGCCC;SOR=0.260;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=1219199;WS=1219181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr19	1219274	rs34928889	G	A	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=26;PP=1706;SC=GTGCTCCCTGGGCCTGTGAGT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=1219282;WS=1219264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	1219443	rs147990629	G	GCGGGGGC	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-0.087;SC=CCAGGGTGGGGCGGGGGCCGG;SOR=0.180;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=4;WE=1219451;WS=1219433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr19	1251781	rs2285811	A	G	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=37;PP=2337;SC=TCCACCCCCTATTCCAGCCCA;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=114;WE=1251789;WS=1251771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	1254122	rs2301761	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=819;SC=GGCTGGGGGCGCCGCAAGCTG;SOR=1.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=1254130;WS=1254105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	1256998	rs9823	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=47;PP=2138;SC=TTGCAGGGGACCGGCTTCGGC;SOR=1.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=116;WE=1257006;WS=1256988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	1268178	rs12975875	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=109;ReadPosRankSum=0.950;SC=GGGGCAGAGAGGCAGGGGTCC;SOR=1.270;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=9;WE=1268186;WS=1268168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	1270231	rs56378951	GC	G	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=173;ReadPosRankSum=0.175;SC=CTGACAGCCAGCCCCCCCCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=13;WE=1270239;WS=1270221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr19	1271274	rs12609287	C	T	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1376;ReadPosRankSum=0.909;SC=AGCAGGAGTCCCGTCTCGAGG;SOR=0.498;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=86;WE=1271282;WS=1271264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr19	1271529	rs4807050	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=583;ReadPosRankSum=-1.304;SC=AGCTGGTACTCACTTTTTCCT;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=33;WE=1271537;WS=1271519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr19	1272040	rs12488	T	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=988;ReadPosRankSum=0.806;SC=GAGACAGTTATGACAGTTACG;SOR=1.358;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=73;WE=1272048;WS=1272030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,79:0.54:147
chr19	1274539	rs8108009	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=282;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TATGGCCCCATGGCGGGCGCC;SOR=0.178;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=21;WE=1274547;WS=1274529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr19	1277275	rs757292	G	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=616;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGGAGACGGTGTTTGAGTCCC;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=38;WE=1277283;WS=1277265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr19	1357082	rs713042	T	C	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=59;PP=1826;SC=AAATCCTCTCTCTAGAGGAAA;SOR=1.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=83;WE=1357090;WS=1357072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	1358726	rs2285972	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=658;ReadPosRankSum=0.764;SC=TCTCGTACCCCCGTGGCCTCC;SOR=0.452;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=47;WE=1358734;WS=1358716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr19	1360575	rs3826942	G	A	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1555;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TAAGAGGGGAGGAAACTCAGC;SOR=0.852;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=93;WE=1360583;WS=1360565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,102:0.52:198
chr19	1364306	rs17673260	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TCACTGTCTCATCATTGGTGG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=1364314;WS=1364296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	1366179	rs72377165	CGCTGGGGTCACCCCCAGA	C	1090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CGGGAGACTTCGCTGGGGTCA;SOR=1.232;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=16;WE=1366204;WS=1366169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr19	1366422	rs2668418	C	G	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.828;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=961;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GCCTGAGGGGCCAGGCCGGCC;SOR=0.340;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=57;WE=1366430;WS=1366412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr19	1370675	rs12608765	C	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=302;ReadPosRankSum=-0.643;SC=AGCAGGACGTCTTGGGGACCA;SOR=0.886;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=24;WE=1370683;WS=1370665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr19	1370742	rs34502536	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=411;ReadPosRankSum=1.458;SC=GTGCCCCCTGGGGCAGAGGCA;SOR=1.071;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=26;WE=1370750;WS=1370732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr19	1383649	rs3848638	G	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=266;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GGTGACTTTTGCCCTCCTGGA;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=1383657;WS=1383639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr19	1388538	rs1142530	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=1.479;SC=AGCGTGGGCCCGGCTGTGCAG;SOR=1.115;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=12;WE=1388546;WS=1388528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr19	1389064	rs7258846	G	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.562;SC=ACTCACATGCGCACATGTGCA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=66;WE=1389072;WS=1389054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr19	1389324	rs66919466	ACT	A	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.178;NF=18;NR=9;PP=1054;ReadPosRankSum=1.677;SC=ACACATGCACACTCACACACA;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=27;WE=1389333;WS=1389314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr19	1389517	rs11666067	C	A	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TGGAGATGACCCCTCCGTTTC;SOR=0.576;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=254;TCF=117;TCR=137;TR=108;WE=1389525;WS=1389505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,134:0.45:301
chr19	1391235	rs2074897	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CCCTGATGGCGCTTATCAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=14;WE=1391243;WS=1391225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr19	1422299	rs2271055	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=0.518;SC=GAAGACCACCTGTGGTGCTGG;SOR=2.200;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=15;WE=1422307;WS=1422289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr19	1453705	rs12985827	T	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=477;SC=CATATGTCTCTGCCCACACCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=1453713;WS=1453695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	1454985	.	ACC	A	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=15;MQ=56.0;NF=0;NR=2;PP=52;QD=30.5;SC=TTCAATACCCACCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=1454994;WS=1454975;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	1455933	rs146334923	C	CAGAGTCAGAGCCCAGGGCGAAGTCATCCCAGGA	906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=1.417;QD=36.27;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr19	1456544	rs2656869	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-1.807;SC=TCTGGCGTGCAGCTCATGCAG;SOR=0.829;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=5;WE=1456552;WS=1456534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr19	1456730	rs3896893	G	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=128;ReadPosRankSum=0.202;SC=CCCCTCATCTGTCCCCCAGGT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=1456738;WS=1456720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	1467684	rs265273	A	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=33;PP=1154;SC=GGGCAAGAACAGAGCAGGGCT;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=1467692;WS=1467674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	1487561	rs62128466	C	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=675;ReadPosRankSum=0.605;SC=ACCCCCTTCCCTCTCTGTCCC;SOR=0.887;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=52;WE=1487569;WS=1487551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,59:0.39:153
chr19	1488147	rs4807120	C	T	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=50;PP=1893;SC=AGGGCGCCAGCGGCCCCGTCC;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=1488155;WS=1488137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	1489817	rs12972390	C	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.094;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=852;ReadPosRankSum=0.427;SC=CAGGTGCAGGCGGTGGCCCCA;SOR=0.351;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=53;WE=1489825;WS=1489807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr19	1508738	rs265296	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=479;SC=GGTGCTCTGCGTCCAGCAACC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=1508746;WS=1508728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	1510661	rs265291	A	G	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=13;PP=698;SC=GGCTGCGCACAGAGACGCCAC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=1510669;WS=1510651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	1526931	rs2656858	A	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=974;ReadPosRankSum=0.058;SC=AACTTCCTGGACCCTGAGGTT;SOR=0.564;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=74;WE=1526939;WS=1526921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,95:0.46:206
chr19	1527051	rs11288093	CG	C	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=15.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.464;SOR=3.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr19	1527806	rs7254791	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=-0.143;SC=AGGTGCAGGCGGATGTTGGGA;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=9;WE=1527814;WS=1527796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr19	1528149	rs139924905	C	CGGCGTGGGGTCCCT	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.179;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr19	1528231	rs2668408	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=581;ReadPosRankSum=0.818;SC=CCCCGCCCTGTCCCAGGTAAC;SOR=0.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=43;WE=1528239;WS=1528221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr19	1529527	rs2668409	G	C	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=21;PP=756;SC=GCTGCAGGTGGGGAGGGAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=1529535;WS=1529517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	1529550	rs2656863	A	G	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=19;PP=773;SC=TACAAGTGACAGGGGGACCAA;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=1529558;WS=1529540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	1531869	rs118008362	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=919;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CATGGCCCTGCGACCCCCCGG;SOR=0.393;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=46;TCR=89;TR=60;WE=1531877;WS=1531859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,77:0.49:156
chr19	1534999	rs72987566	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=251;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CCTTCTGGAGCGCCACGGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=16;WE=1535007;WS=1534989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr19	1535179	rs55953917	G	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=747;ReadPosRankSum=0.201;SC=GACGTCCCGCGGAGCCACGGC;SOR=0.677;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=44;WE=1535187;WS=1535169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,57:0.52:109
chr19	1535349	rs265281	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=371;ReadPosRankSum=-1.501;SC=CCTGGGGGAGGGCTGGGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=16;WE=1535357;WS=1535339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr19	1555551	rs2277752	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=1.095;SC=GGCCACGTGGTGGTCCGCGCT;SOR=0.286;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=1555559;WS=1555541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr19	1555976	.	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=339;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GCAGCGTGGGCGAGTGGCGGG;SOR=0.292;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=21;WE=1555984;WS=1555966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr19	1605543	rs76421407	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CGCCACTGTGCGCGCAGACCC;SOR=2.800;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=3;WE=1605551;WS=1605533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr19	1619333	rs1140828	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
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chr19	1784944	rs3764606	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TGAGGTCGGCATCTGGGGACA;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=19;WE=1784952;WS=1784934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr19	1785772	rs8110462	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=461;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GAGATCAGGATCTCCTCGGGC;SOR=0.137;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=26;WE=1785780;WS=1785762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr19	1789556	rs12978609	C	T	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=1037;ReadPosRankSum=1.438;SC=CTCTGGAGTCCTGGGCTGGCG;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=56;WE=1789564;WS=1789546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr19	1792190	rs2286004	A	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=22;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TCCGAGGCTCAGCCCTCCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=1792198;WS=1792180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	1796943	rs62127692	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TCCCCCTCACCGTCCCGCGCT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=71;WE=1796951;WS=1796933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,78:0.55:141
chr19	1806210	rs7252063	A	C	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=819;SC=CTCCCTCTGCAAACCCTCCCC;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=1806218;WS=1806186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	1809598	rs9941464	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=863;ReadPosRankSum=0.709;SC=GAGGGTACCACGGCAGCTCCT;SOR=0.543;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=102;TCR=38;TR=60;WE=1809606;WS=1809588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr19	1809836	rs8107742	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=756;SC=ACCCAGGCACTGGGGAGGCCC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=1809844;WS=1809826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	1810605	rs716993	T	C	3594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=46;PP=1977;SC=CCGCCCCCTCTGCCCAGGATC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=1810613;WS=1810595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	1811547	rs12609187	A	G	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=35;PP=1581;SC=GCCTCCTCTCAGGTGCCCCTC;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=1811555;WS=1811537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	1811603	rs7250872	C	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=796;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GTCTCACCTCCGCGGATGCCA;SOR=0.747;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=57;WE=1811611;WS=1811593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,74:0.50:148
chr19	1817113	rs12976128	A	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=1.484;SC=AGAAACCCTGAGCGCTGGCCG;SOR=0.512;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=1817121;WS=1817103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	1817134	.	C	CCCAGATGGGG	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=2982;SC=GTGAGCCAGGCCCAGATGGGG;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=15;WE=1817142;WS=1817124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	1817866	rs2304612	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=2.115;SC=CTACCGAGCCCTACTAGGGAG;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=1817874;WS=1817856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	1818459	rs1610106	A	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=5;PP=472;SC=TGGGAAGGGGAAGGACCCGGG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=1818467;WS=1818449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	1818952	rs893538	C	G	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=19;PP=1208;SC=CCGTGTGGCACAGCAGGGGCT;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=1818960;WS=1818942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	1819125	rs2396359	T	C	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=795;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CTGCGGCCACTGGTTTCTGGA;SOR=0.933;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=119;TCF=43;TCR=76;TR=57;WE=1819133;WS=1819115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr19	1819234	rs113598561	ACT	A	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=202;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CTCTGCCTCAACTCCCCCTTT;SOR=0.976;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=1819243;WS=1819224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	1821637	rs4807145	A	G	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=80;PP=2591;SC=CCGTTGGAGGACTGGCTGCCG;SOR=1.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=36;TCR=80;TR=116;WE=1821645;WS=1821627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	1825662	rs12985599	A	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr19	1848243	rs12984809	A	G	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr19	1912934	rs12984675	T	C	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1244;ReadPosRankSum=0.150;SC=ACCTGTGCACTGGCTACGACC;SOR=0.535;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=204;TCF=90;TCR=114;TR=97;WE=1912942;WS=1912924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,118:0.49:241
chr19	1912986	rs76159002	C	T	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1222;ReadPosRankSum=1.174;SC=CGCCATGGCCCTGGTGCACGC;SOR=0.492;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=81;TCR=104;TR=88;WE=1912994;WS=1912976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,102:0.48:213
chr19	1914795	rs11666645	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=1.228;SC=GCACTGGAGCCGAGGGGAGGG;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=13;WE=1914803;WS=1914785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr19	1914940	rs11084918	A	G	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=68;PP=2804;SC=TGCCCAGGGCAGCTCAGGGTT;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=148;WE=1914948;WS=1914930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	1915118	rs10853957	A	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=732;SC=GCCGTTGGCAAACAGTGTCCT;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=1915126;WS=1915108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr19	1924189	rs75734024	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=720;ReadPosRankSum=0.545;SC=CGGAACCCACCGTCGAGGGAG;SOR=0.709;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=48;WE=1924197;WS=1924179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,57:0.38:150
chr19	1952841	rs2396366	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=654;ReadPosRankSum=1.087;SC=GGCCGAACCCTGCTGTGCCCT;SOR=0.806;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=92;TCR=78;TR=59;WE=1952849;WS=1952831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,69:0.35:199
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chr19	1954128	rs34797288	T	C	3253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.349;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.733;SC=ACCTGATGCGTTAAACCCATT;SOR=1.080;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=152;TCF=57;TCR=95;TR=68;WE=1954136;WS=1954116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr19	1986414	rs2286352	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=610;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TGGTGGGGGGGCCCCAGCAGC;SOR=0.299;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=32;WE=1986422;WS=1986404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr19	1986455	rs7254820	A	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=806;ReadPosRankSum=1.872;SC=GGCTATCCCCACGGAGGGAGG;SOR=0.844;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=51;WE=1986463;WS=1986445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr19	1986520	rs7253519	G	A	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GGATCTGGCCGTCCTCCACGG;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=75;WE=1986528;WS=1986510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,92:0.50:185
chr19	1987279	rs11669527	C	T	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=67;PP=1492;ReadPosRankSum=-3.416;SC=CAGGCAGCAGCGTGGATACCC;SOR=1.049;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=178;TCF=60;TCR=118;TR=94;WE=1987287;WS=1987269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,112:0.56:201
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chr19	2096861	.	G	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=219;ReadPosRankSum=1.286;SC=CCAAGCGCCCGAGTGGGGGCC;SOR=0.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=15;WE=2096869;WS=2096851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr19	2096938	.	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=722;ReadPosRankSum=-1.764;SC=GGCGGGCCGGGACGGGCATGG;SOR=0.894;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=45;WE=2096946;WS=2096928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr19	2097131	.	G	C	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=52;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.169;SC=CACGATGAAGGAGCTGCACCT;SOR=1.031;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=164;TCF=67;TCR=97;TR=82;WE=2097139;WS=2097121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,96:0.50:192
chr19	2098864	rs58783004	AG	A	2146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.024;NF=18;NR=43;PP=1888;ReadPosRankSum=1.037;SC=GAGGGGGGCTAGGGGGTCCTC;SOR=0.845;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=133;TCF=35;TCR=98;TR=61;WE=2098872;WS=2098854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr19	2099111	rs12984606	T	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=494;ReadPosRankSum=0.091;SC=CACACCCTGCTGACATCCCAG;SOR=1.339;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=27;WE=2099119;WS=2099101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr19	2099362	rs1051767	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=555;ReadPosRankSum=1.694;SC=TGGGCCTGCCCCAGGGCAACG;SOR=0.605;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=39;WE=2099370;WS=2099352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr19	2129473	rs758287	TC	CG	5729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=46;PP=2947;SC=AACAAGGGGTTCTCATCAGCA;SOR=0.757;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=100;WE=2129482;WS=2129463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	2137870	rs2240658	C	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=910;SC=TTTTGAGCCGCGGCATCAAGC;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=2137878;WS=2137860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	2138654	rs25672	T	G	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=47;PP=2090;SC=CCTTCACCGCTATGTTGTCCT;SOR=0.957;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=108;WE=2138662;WS=2138644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	2138848	rs12980238	C	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=322;SC=ATCACGAGGTCGGGAGTTTGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=2138856;WS=2138838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	2164351	rs12985346	T	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=9;PP=270;SC=CAAGCCGCGCTCACCGGTCCC;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=2164359;WS=2164341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	2190947	rs35301355	TTGG	T	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=6;PP=741;SC=GTCCCGGGTCTTGGTGGTGGA;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=16;WE=2190957;WS=2190937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	2194657	rs4807212	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=8;PP=222;SC=TCCTTTCTTGCCGATGTTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=13;WE=2194668;WS=2194647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	2194660	rs11268058	A	ATGTTGGCACATGGC	532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=1366;SC=TTTCTTGCCGATGTTGGCACA;SOR=1.270;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=2194668;WS=2194647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	2204355	.	CTG	C	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=35;QD=23.0;SC=GTTTGCATATCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=2;WE=2204364;WS=2204345;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr19	2208859	rs2301799	T	C	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=26;PP=1404;SC=GTTGCTGTTGTTACCTGGGTG;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=2208867;WS=2208849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	2211050	rs2301800	C	T	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=45;NR=20;PP=1343;SC=CTCTGCCCACCGCTCTCCCGA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=2211058;WS=2211040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	2214057	rs2074552	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=320;SC=GTCCTCTGTGCGGGTGGGAGG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=2214065;WS=2214047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	2216175	rs62119661	C	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=325;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CCCACACAAGCAGCGGGGGTC;SOR=0.400;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=23;WE=2216183;WS=2216165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr19	2226676	rs3815308	G	A	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=67;PP=2965;SC=GGGCAGCCGCGGCAAGGAGGC;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=152;WE=2226684;WS=2226666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	2226847	rs113842228	G	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.361;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1049;ReadPosRankSum=0.300;SC=CAGCGGCCCCGGCCTGGCCCC;SOR=0.962;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=62;WE=2226855;WS=2226837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,75:0.60:125
chr19	2244903	rs6510652	T	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=685;SC=CCTGGGCGCTTGAGTACGGTT;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=2244911;WS=2244893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	2246652	rs2074861	G	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=506;SC=GGCCTCCCCCGGGGTCCCGCT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=2246660;WS=2246642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	2249477	rs10407022	G	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=40;PP=1488;SC=CCTCCAGGCAGCCCACAAGAG;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=2249485;WS=2249467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	2250528	rs8112524	G	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=8;PP=339;SC=GGGGGGCATGGATTTGTTGCA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=2250536;WS=2250518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	2251512	rs7252789	T	A	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=19;PP=583;SC=TCTGCCCAGGTGGCCCCGGCG;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=2251520;WS=2251502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	2251817	rs10417628	T	C	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=112;PP=2965;SC=AAGATGCAGGTCCGTGGGGCC;SOR=1.802;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=45;TCR=113;TR=157;WE=2251825;WS=2251807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	2252990	rs80043033	C	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=695;ReadPosRankSum=0.670;SC=TGCTGCCTCCCCAGGGACGGC;SOR=0.553;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=50;WE=2252998;WS=2252980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr19	2253590	rs3746158	C	T	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=25;PP=893;SC=ACCCCAGCCTCGCCCCACCTC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=2253598;WS=2253580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	2255336	rs886363	A	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=691;SC=AGCAGGTCCCAGGCCAGGCTG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=2255344;WS=2255326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	2271282	rs2074457	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=581;SC=GCGGGGTCTTTTGGCCGAGGC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=2271290;WS=2271272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	2271323	rs2523175	A	G	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=14;PP=1175;SC=GGCCGCCCGGACGCCCTGGAG;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=2271331;WS=2271313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	2271577	rs28384674	CT	C	4030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=60;PP=2821;SC=GCCACAGGTACTTTCTTGTGC;SOR=1.149;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=8;TCR=62;TR=68;WE=2271585;WS=2271567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	2271741	rs2074458	G	A	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=49;PP=2420;SC=GTCCTGTGGGGTGAGTCAGGG;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=127;WE=2271749;WS=2271731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	2324384	rs10404826	A	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=21;PP=631;SC=GCAGCAGACCACGTCTGCGGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=2324392;WS=2324374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	2328281	rs11666344	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.29;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	2337377	rs3752204	C	G	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=19;PP=1264;SC=GGTGGGAGAACGGGCAGCTGG;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=2337385;WS=2337367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	2339949	rs3746285	T	C	9486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr19	2339958	rs1609752	T	C	9228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	2340046	rs3746287	C	T	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=58;PP=2250;SC=GCGGGCCTGGCCCCCGGCCTC;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=113;WE=2340054;WS=2340036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	2340154	rs5826760	G	GC	2930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=45;PP=2208;SC=TGCGGCGGCTGCCTTCGGCAA;SOR=1.233;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=50;WE=2340162;WS=2340144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	2340235	rs12460384	C	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.54;NF=4;NR=14;PP=357;SC=GCCCCTTTGCCGCCCCATAGC;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=2340243;WS=2340225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	2341047	rs55818311	C	T	4942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=76;PP=2854;SC=CGGCGGGCAGCGGAGTCCTCG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=84;TCR=76;TR=160;WE=2341068;WS=2341037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	2341059	rs11880345	GT	AC	8004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=73;PP=2947;SC=GAGTCCTCGGGTGCACCAGGG;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=146;WE=2341068;WS=2341037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	2341093	rs76166147	CCTCCCTGGA	CA,C	2874.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=2973;ReadPosRankSum=2.043;SC=GACTCCCTGCCCTCCCTGGAG;SOR=0.600;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=42;WE=2341111;WS=2341083;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.49:152
chr19	2341102	rs202164106	AG	A	2907.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,76:0.53:143
chr19	2341103	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24;NR=33;PP=2962;QD=20;SC=CCTCCCTGGAGGCCGCCCCAG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=125;TCF=57;TCR=68;TR=57;WE=2341111;WS=2341083;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:68,57:0.46:125
chr19	2389872	rs891174	G	C	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=67;PP=2815;SC=CGAGCGGCCAGCATTGGCGTG;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=136;WE=2389880;WS=2389862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	2389954	rs891175	G	A	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=1.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	2389958	rs891176	T	A	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	2396556	rs7252886	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=421;ReadPosRankSum=0.869;SC=CTACACAGGGCTTCCACGTGG;SOR=0.991;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=28;WE=2396564;WS=2396546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
chr19	2396611	rs17685098	C	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=-0.130;SC=CAGCAGTTTGCGGCGGGAGAC;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=44;WE=2396619;WS=2396601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr19	2398849	rs10407225	A	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=692;ReadPosRankSum=0.648;SC=GTTGCTCGGTACTGAATTATA;SOR=0.816;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=44;WE=2398857;WS=2398839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,60:0.42:142
chr19	2405641	rs4807260	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.316;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=582;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CTTAGAGCCCCTGGAAGTAAT;SOR=1.718;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=32;WE=2405649;WS=2405631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	2410484	rs4806846	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=470;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CTGGATGCCCGCTGTGAGCCC;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=34;WE=2410492;WS=2410474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
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chr19	2524819	rs8111910	C	T	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
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chr19	2524834	rs8111050	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.732;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr19	2538074	rs71337145	C	CAAACA	662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=504;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GACTCTCTCTCAAACAAAACA;SOR=0.349;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10;WE=2538082;WS=2538064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	2538668	rs16989558	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=972;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TATTTTACTTACAAGGTTCAC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=68;WE=2538676;WS=2538658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr19	2538760	rs7250546	A	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=813;ReadPosRankSum=-1.812;SC=AGATATATATATTTTTCTTTT;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=51;WE=2538768;WS=2538750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr19	2538808	rs142216309	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.156;SC=ACTCTGTCTCCCAGGCTGGAG;SOR=0.180;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=2538816;WS=2538798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr19	2557312	rs76966814	GAC	G	791.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=1178;ReadPosRankSum=0.806;SC=TACACGCACAGACACACATGT;SOR=0.521;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=2557332;WS=2557302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr19	2557323	rs71929279	GCA	G	1054.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.450;NF=29;NR=19;PP=1843;ReadPosRankSum=-0.343;SC=ACACACATGTGCACACAGACA;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=48;WE=2557332;WS=2557302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr19	2557343	.	GCACACACACAGA	G	1056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.099;NF=14;NR=19;PP=2976;ReadPosRankSum=0.994;SC=ACACACATGTGCACACACACA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=33;WE=2557362;WS=2557333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr19	2557392	rs10421267	C	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.357;NF=33;NR=28;PP=880;ReadPosRankSum=1.167;SC=CACGCAGGAGCGAGCGCCTCC;SOR=0.476;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=61;WE=2557400;WS=2557382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr19	2576272	rs1029753	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=40;PP=939;SC=CCCAGGGGACTGCAGCAAAAA;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=2576280;WS=2576262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	2643284	rs7245964	G	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-5.491;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,62:0.31:203
chr19	2643288	rs7246938	C	T	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-5.180;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,61:0.31:198
chr19	2790394	rs1736176	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=-0.735;SC=AGACCCGCCCGGCACTGGGTT;SOR=0.330;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=2790402;WS=2790384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr19	2796021	rs1736180	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=685;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CTGCCAAACTGCTCTTTGGAG;SOR=0.482;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=43;WE=2796029;WS=2796011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr19	2807375	rs1640274	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.055;SC=GGCCGCGGGCGGGCGAGCCCA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=2807383;WS=2807374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr19	2810248	rs1736184	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=0.288;SC=CCAGGCCGGCGGGAACGGGCT;SOR=0.088;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=19;WE=2810256;WS=2810238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr19	2812153	rs941407	A	G	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1302;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CCTTCTCTGGAGAAGGCTTGG;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=89;WE=2812161;WS=2812143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,112:0.55:205
chr19	2813000	rs1736185	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=435;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CTCCCTGGGAACCTGGAAGGG;SOR=0.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=23;WE=2813008;WS=2812990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr19	2819965	rs2741993	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=2.020;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr19	2820105	rs2537856	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GGCGCGCGCGGCTCCCGGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=7;WE=2820113;WS=2820095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr19	2834373	rs17605476	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.286;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=960;ReadPosRankSum=1.450;SC=AGAAGCCCTACGGGTGCGGTG;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=55;WE=2834381;WS=2834363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr19	2852744	rs35627030	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CTGAGAAAACCTACGAATGTA;SOR=0.881;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=72;WE=2852752;WS=2852734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
chr19	2853566	rs10412087	A	G	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1460;ReadPosRankSum=0.834;SC=ATATGAGAAGACATACCGCAG;SOR=0.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=81;TCR=128;TR=94;WE=2853574;WS=2853556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,101:0.43:235
chr19	2878397	rs11084965	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=488;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGCCGGGCGCAGTGGCTCACG;SOR=1.423;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=26;WE=2878405;WS=2878387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr19	2896818	rs8100809	C	T	4380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=64;PP=2622;SC=CAAATGTCCTCGAAAAGATGA;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=136;WE=2896826;WS=2896808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	2896948	rs8104326	T	C	4870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	2896953	rs8101379	A	G	4765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	2897133	rs8103080	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTTCTCCCGTGTGCATTCT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=2897141;WS=2897123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr19	2900865	rs10420989	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=302;SC=GGGGCTTAGAGATTGTCCAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=2900873;WS=2900862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	2900915	rs7255359	GA	AT	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=548;ReadPosRankSum=0.239;SC=CCGAGGGCGGGACGTTTCGTC;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=2900938;WS=2900905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	2900930	rs12981209	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=11;PP=769;SC=TTCGTCCTCCCTGCCGCGCGT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=2900938;WS=2900905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	2901114	rs11279103	CGCCGAAGTCT	C	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=2967;SC=AACCAGAGTCCGCCGAAGTCT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=2901131;WS=2901104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	2915738	rs2043336	T	A	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=91;PP=2871;SC=GGGAAAGGACTAAGACAGACA;SOR=1.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=45;TCR=91;TR=136;WE=2915746;WS=2915728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	2916048	rs2043335	T	A	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=20;PP=1641;SC=CTTATTCCTTTTGAGATTTGT;SOR=1.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=2916056;WS=2916035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	2916358	rs34115054	C	CA	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.579;NF=0;NR=9;PP=95;ReadPosRankSum=2.423;SC=GAATTTTAACCAAAAAAAAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=2916366;WS=2916348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	2917186	rs2288959	T	C	3998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=68;PP=2522;SC=ACGGAAGAACTGACACTGAGG;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=66;TCR=68;TR=134;WE=2917194;WS=2917176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	2917287	rs2288958	C	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GCAGAGAAAACCTACAAATGC;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=67;WE=2917295;WS=2917277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,88:0.42:211
chr19	2917612	rs10410539	T	C	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=54;PP=2458;SC=GGATCCACACTGGGGACAAAC;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=2917620;WS=2917602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	2933480	rs3786948	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=650;SC=CCACTGTATTCGTAGATTCAC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=2933488;WS=2933479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	2934282	rs3746073	T	C	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=37;PP=1424;SC=CTCGAAAGTATGAGGGACAGC;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=2934290;WS=2934272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	2936443	rs7251272	A	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=372;SC=CCCTGTGCCCAGCCGATACTT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=2936451;WS=2936433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	2936535	rs35699176	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=433;ReadPosRankSum=0.402;SC=AGATGCCTCTGTGGGATTTGG;SOR=1.056;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=30;WE=2936543;WS=2936525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr19	2936623	rs4807371	C	T	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=27;PP=1062;SC=ACTTTACAATCTCTTCATCAT;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=2936631;WS=2936613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	2944806	rs140057887	G	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=176;ReadPosRankSum=1.074;SC=CTCGCCCTGGGCCCGGGCTCG;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=15;WE=2944814;WS=2944796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr19	2982047	rs10445609	G	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=776;SC=AATTTAAGGTGGGGGAGTAGG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=2982055;WS=2982037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	2982293	rs11673024	T	C	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.083;NF=12;NR=56;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CCCAGCACTTTGGGAGGCCGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=68;WE=2982301;WS=2982283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr19	2989380	rs3746075	C	G	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=40;PP=1337;SC=TTGAGTCTGGCAGAGCCCAGA;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=2989388;WS=2989370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	2989697	rs6510730	T	C	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=62;PP=2140;SC=AGGCCCTGGATGCCAACCTGG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=129;WE=2989705;WS=2989687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	2989801	rs143049112	G	GA	3457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=41;PP=2246;SC=TGGGGGGTGGGAAGGGGAAGC;SOR=1.236;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=52;WE=2989818;WS=2989791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	2989810	rs504199	G	T	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1471;SC=GGAAGGGGAAGCATCCTGTGC;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=2989818;WS=2989791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	2991814	rs428113	T	C	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=51;PP=2109;SC=CTTGACCTGATTGCCTCCCGA;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=2991822;WS=2991804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	2993946	rs35271493	G	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=178;SC=AAAAAGGTGGGTGGGGAGGAT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=2993954;WS=2993936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	2994107	rs34438430	C	CT	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=472;SC=CTGCGGTGGGCTGGGGGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=2994115;WS=2994097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	2994814	rs439808	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=22;PP=1129;SC=TTTGAAGAGATGATGCTTCAT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=2994822;WS=2994804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	2994837	rs401886	A	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=31;PP=1185;SC=TTGAGCTGACAGGTGGAGACC;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=2994845;WS=2994827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	2994885	rs11084986	G	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=580;ReadPosRankSum=-1.679;SC=ACTGCCCACTGCCCCCCCTCC;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=42;WE=2994893;WS=2994875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr19	2994903	rs34831575	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=283;ReadPosRankSum=0.740;SC=TCCAGGTGCCTGAGATGTCTC;SOR=0.725;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=29;WE=2994911;WS=2994893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr19	2994921	rs34551565	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=318;ReadPosRankSum=0.642;SC=CTCCAGTCACGTGCTGTGACG;SOR=0.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=24;WE=2994929;WS=2994911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr19	2995054	rs141348286	TC	T,TCC	420.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=23.37;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,9:0.50,0.50:18
chr19	2997897	rs11150	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=704;ReadPosRankSum=0.844;SC=AGCCTGTCACGATGTATTTGT;SOR=1.319;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=43;WE=2997905;WS=2997887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr19	3006236	rs3050847	A	AAT	799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=635;ReadPosRankSum=0.048;SC=CAGATTGGCCAGAGCCCCACC;SOR=0.215;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=15;WE=3006244;WS=3006226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr19	3009788	rs216284	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=411;SC=GCCTTTCATTTAGAGTTTCCA;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=3009796;WS=3009778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	3013616	rs216271	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GTCTGCTTCGGGGCCCCCGGG;SOR=1.802;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=3013624;WS=3013606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	3014639	rs216273	A	G	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=2038;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GAGAGAGCTCATTGTGGTCAT;SOR=0.806;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=64;WE=3014655;WS=3014629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,85:0.52:163
chr19	3014647	rs1844880	C	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=2436;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TCATTGTGGTCATGCCCCTGC;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=67;WE=3014655;WS=3014629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr19	3014675	rs117415317	G	A	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=852;ReadPosRankSum=0.144;SC=CCCCCTATCCGCTCCTCAGGA;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=51;WE=3014683;WS=3014665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr19	3045627	rs112501424	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=0.050;SC=CCAGCCTGGCCAACATGGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=3045635;WS=3045617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	3053802	rs425485	T	C	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=37;NR=18;PP=1113;SC=CCAACCTCCCTGTCCCGGCCC;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=3053810;WS=3053792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	3054089	rs2302301	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=0.256;SC=ACCTGTCCCCCGCCCACCCGC;SOR=0.804;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=6;WE=3054097;WS=3054079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	3056285	rs58280427	G	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-0.978;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr19	3061354	rs112386926	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=1.840;SC=GGCGCCCCCCCTCCTGCCCCA;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=3061362;WS=3061344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr19	3062857	rs11539938	T	C	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=75;PP=2460;SC=TGCTGAGCCTTAGTTTCCTTT;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=137;WE=3062865;WS=3062847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	3062986	.	C	G	163	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=9;HapScore=3;MGOF=25;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=3;NR=9;PP=163;QD=16.4809343789;SC=TGGGGCGGGGCGGGGGTGGGT;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=12;WE=3062994;WS=3062975;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,12:0.86:14
chr19	3110349	rs11085000	T	G	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=80;PP=2665;SC=CGCGGGCGCCTGGGGAGGGGA;SOR=1.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=131;WE=3110357;WS=3110339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	3113305	rs1682811	G	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=10;PP=912;SC=AGCTCTCGACGTCTCCCCTGC;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=3113313;WS=3113295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	3119184	rs308046	T	G	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=34;PP=1577;SC=TCTGATTCCCTCTGCCTTCGC;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=3119206;WS=3119174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	3119198	rs116848044	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=683;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CCTTCGCTCCCGCCAGAACCG;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=39;WE=3119206;WS=3119174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr19	3119239	rs4900	C	T	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=45;PP=2521;SC=TGTTCCGGACCATCATCACCT;SOR=1.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=116;WE=3119247;WS=3119229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	3119405	rs370286	TG	GT	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=1419;SC=AGGGCCTTACTGGGGGGAGGG;SOR=1.191;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=58;WE=3119414;WS=3119394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	3136692	rs411210	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=201;ReadPosRankSum=1.542;SC=AGGTCAGACATTGGCATCGTG;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=12;WE=3136700;WS=3136682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr19	3149990	rs170159	G	C	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=615;SC=GTGCGGGGGGGTCGGGAGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=3149998;WS=3149986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	3150238	rs310680	A	G	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=71;PP=2288;SC=ATCCGGGCCTACTATGAGCGT;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=112;WE=3150246;WS=3150228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	3157885	rs61758985	T	C	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=4.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.02;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=1.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr19	3157885	.	TAA	CAG	1602	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=14;NR=30;PP=1602;QD=37.6242698832;SC=CCAGGGTAAGTAATTCTAGAA;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=44;WE=3157895;WS=3157875;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:64,44:0.41:108
chr19	3157887	rs72983041	A	G	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=4.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.02;ReadPosRankSum=-1.612;SOR=1.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr19	3157916	rs66509881	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=441;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCTTCAACTCCCAAAAGCAGC;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=29;WE=3157924;WS=3157906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,31:0.35:88
chr19	3162909	rs1637656	C	T	3069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.082;SC=CCCGACGCCTCTTCAGCCACT;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=113;WE=3162917;WS=3162899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,143:0.51:279
chr19	3179517	rs61731111	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=817;ReadPosRankSum=0.721;SC=CCCAGCGGCCCGCCGCAAGGC;SOR=0.964;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=55;WE=3179525;WS=3179507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,60:0.39:154
chr19	3186085	rs11551095	G	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=0.187;SC=CTTGTCTGCCGCTCGGCTTCA;SOR=0.253;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=24;WE=3186093;WS=3186075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr19	3193180	.	C	G	117	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5004;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=19;MQ=56.94;NF=7;NR=0;PP=117;QD=21.6816017925;SC=GGGACAGTCACTGGGCCCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=3193188;WS=3193170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr19	3193484	rs499877	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-1.573;SC=AGGCGTCCCCATCCCAAGGGC;SOR=0.346;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=3193492;WS=3193474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr19	3196122	rs311615	T	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=500;ReadPosRankSum=-0.395;SC=GTGCTGGGGATGCCCCCTGGC;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=31;WE=3196130;WS=3196112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr19	3201480	rs1978729	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=508;ReadPosRankSum=0.771;SC=TGCGGGAGCCGGGCGGGGGTG;SOR=1.040;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=33;WE=3201488;WS=3201470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr19	3204159	rs28372911	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=417;ReadPosRankSum=1.011;SC=GCCCCTTTCATGGATGGGTCC;SOR=0.678;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=16;WE=3204180;WS=3204149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr19	3204172	rs8106438	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=417;ReadPosRankSum=0.119;SC=ATGGGTCCGGAGCTCTGCGGA;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=16;WE=3204180;WS=3204149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr19	3206070	.	C	CCCCCGG	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.9990;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=38;QD=64.0;SC=CCCAGCCCTGCCCCCGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=1;WE=3206078;WS=3206060;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,1:0.10:10
chr19	3207338	rs312068	T	C	3345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr19	3207348	rs312069	G	C	3290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,89:0.45:196
chr19	3207422	rs3816054	T	C	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=656;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TGCTCCTGGCTGTTGGCATTG;SOR=0.548;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=55;WE=3207430;WS=3207412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr19	3207646	rs2288949	A	G	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=987;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CTCCTCTACAAGACCGTCCAG;SOR=1.012;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=59;WE=3207654;WS=3207636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr19	3251116	rs72987040	C	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TGGCTCTCAGCCTGGGGTGGG;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=27;WE=3251124;WS=3251106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr19	3273818	rs312928	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=13;PP=734;SC=ACCCCCCGCCTGCCACACCCC;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=3273826;WS=3273808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	3278206	.	G	A	25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=25;QD=29.8856062736;SC=GCTGTCATCCGGTAGCCCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=3278214;WS=3278196;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	3281298	rs36030381	G	A	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.832;SC=TCCTGACGCCGTCCCTCACAT;SOR=0.534;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=96;WE=3281306;WS=3281288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,127:0.52:246
chr19	3284819	rs3746064	T	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=456;ReadPosRankSum=-1.461;SC=TTTGTTGCTGTCCTTGCGGCT;SOR=0.653;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=33;WE=3284827;WS=3284809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr19	3293511	rs143941560	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=547;ReadPosRankSum=-1.224;SC=CCCCACCCCCGCCCAAGCCCC;SOR=0.277;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=31;WE=3293519;WS=3293490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr19	3293593	rs313784	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GTGATGCTTCAAGAGGCTACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=3293601;WS=3293583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	3366786	rs3764589	G	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCCCTGCCCGGGATGCCCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=3366794;WS=3366776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr19	3452683	rs8105687	A	G	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=72;PP=2131;SC=GGCGGGGCGCATTCGGGCCTC;SOR=1.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=27;TCR=72;TR=99;WE=3452691;WS=3452673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	3475133	rs76884950	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CCTAACTACGCGGCCTCACGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=15;WE=3475141;WS=3475123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr19	3478646	rs10413312	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=24;ReadPosRankSum=0.242;SC=CTTGGGGAGACGGGCGGGTGC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=4;WE=3478654;WS=3478636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	3480232	rs2240666	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=170;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GCCCAGCGAGAGGGAGGCCGG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=12;WE=3480240;WS=3480222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr19	3480358	rs2074961	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-1.608;SC=CCAACTCCCCTATCCCGCGAC;SOR=1.126;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=13;WE=3480366;WS=3480348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr19	3526452	rs2286543	A	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=221;SC=CCCACCTCCCAGGCACCAGCT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=3526460;WS=3526442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	3527110	rs10420193	G	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=512;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TCTCCCGTCAGCAGCAAGAGG;SOR=0.991;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=39;WE=3527118;WS=3527100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr19	3533274	rs740681	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=273;ReadPosRankSum=0.104;SC=CGACCGCAGCGCCCCCTCCGC;SOR=0.602;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=20;WE=3533282;WS=3533264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr19	3534655	rs740685	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=443;ReadPosRankSum=-0.509;SC=GTCATGTGTCGGGGCAGTGTG;SOR=0.874;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=22;WE=3534663;WS=3534645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr19	3534696	rs740686	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=631;ReadPosRankSum=0.411;SC=CACCTCCCAGCCCCTCAGGAC;SOR=0.716;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=33;WE=3534704;WS=3534686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr19	3534842	rs10155	G	A	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=72;PP=2124;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TAAACCTGCCGGGCAGGACCG;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=249;TCF=114;TCR=135;TR=136;WE=3534850;WS=3534832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,149:0.53:279
chr19	3538638	rs8644	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.492;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr19	3538646	rs114420443	A	G	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=272;SC=TCGTTCCAGCACGGTGGCGGC;SOR=3.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=30;WE=3538662;WS=3538628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	3538647	rs113259909	C	CGTGGGTGCGTG	2929.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=2897;SC=CGTTCCAGCACGGTGGCGGCG;SOR=3.258;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=25;WE=3538662;WS=3538628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	3538654	rs1128872	G	C	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=14;PP=1670;SC=GCACGGTGGCGGCGCCGTGCT;SOR=2.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=69;WE=3538662;WS=3538628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	3538740	rs117002171	C	T	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1484;ReadPosRankSum=0.109;SC=TGAGCCACTGCGTGCAGGTCT;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=97;WE=3538748;WS=3538730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr19	3539444	rs7258234	T	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=350;SC=CACTGTGGGGTCTACAGACCT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=3539452;WS=3539434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	3543397	rs12608919	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-2.282;SC=CCACGGGCCCCGGCCAGCCCC;SOR=1.276;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=12;WE=3543405;WS=3543387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	3543597	rs201749907	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-1.005;SC=TGACCCCATCGTCCCTGCCCA;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=10;WE=3543605;WS=3543587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr19	3544120	rs11667842	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.737;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CTCGCTGGCCGCCCACAACCA;SOR=0.216;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=12;WE=3544128;WS=3544110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr19	3544971	rs12976454	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GTAGGCACCGCGGGTACCACC;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=16;WE=3544979;WS=3544961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	3546340	rs11555328	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=696;ReadPosRankSum=0.959;SC=CAGCCGCTGCGTACACGGCCA;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=42;WE=3546348;WS=3546330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr19	3546463	rs28528221	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=161;ReadPosRankSum=0.939;SC=CACCACTGGGTGCCCCCAAGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=3546471;WS=3546453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr19	3548313	rs2240752	T	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=11;PP=277;SC=GGAACCTGGGTCACTTCCTCC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=3548321;WS=3548303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr19	3612914	rs6510763	T	C	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=46;PP=851;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGTGACGGAATGCACGCTCAG;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=64;WE=3612922;WS=3612904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,64:0.59:108
chr19	3613346	rs2074789	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=507;ReadPosRankSum=0.163;SC=GGTGGGCGCCGCGTCCTCAGG;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=31;WE=3613354;WS=3613336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
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chr19	3613422	rs2074790	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=539;ReadPosRankSum=-1.482;SC=ATCCTGCTCCGCGTCTGCATC;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=33;WE=3613430;WS=3613412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr19	3613596	rs57918402	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=296;ReadPosRankSum=-1.053;SC=TGGGACGCAGAGCCGGGGTCA;SOR=0.397;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=18;WE=3613604;WS=3613586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr19	3614403	rs7255692	T	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=18;PP=2251;SC=ACCGGGCCCGTGCCATGTGGG;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=79;TCR=18;TR=97;WE=3614411;WS=3614393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
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chr19	3623505	rs7252742	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.885;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=282;ReadPosRankSum=1.731;SC=CCAGCCTGGGCGACAGAGCGA;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=24;WE=3623513;WS=3623495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr19	3623534	rs7253265	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=556;ReadPosRankSum=1.352;SC=GTCAAAAAAGAAAGCTGATAG;SOR=0.361;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=32;WE=3623542;WS=3623524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr19	3626476	rs4806945	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TCCCCTTCTCTAGGAAGCCCT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=11;WE=3626484;WS=3626466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr19	3633273	rs542690	G	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=663;ReadPosRankSum=0.930;SC=GAGACACTTAGCCCACGGCCA;SOR=0.823;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=39;WE=3633281;WS=3633263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr19	3637395	rs10408855	T	C	4394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=68;PP=2842;ReadPosRankSum=1.160;SC=CTGACCTCAATTGCAGCCGTG;SOR=0.703;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=351;TCF=214;TCR=137;TR=171;WE=3637403;WS=3637385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,210:0.48:438
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chr19	3641672	rs3815338	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=-0.187;SC=AGCAGGTGGGCGCCCCGACCT;SOR=1.061;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=9;WE=3641680;WS=3641662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr19	3645947	rs12460780	G	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1817;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GGTCCCTCCCGCCTTGCGGGG;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=237;TCF=144;TCR=93;TR=120;WE=3645955;WS=3645937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,144:0.51:285
chr19	3647440	rs4806948	A	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=-0.360;SC=ATGCCAGGCCACCTCACTCAG;SOR=0.566;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=37;WE=3647448;WS=3647430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr19	3653525	rs2074957	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.508;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1117;ReadPosRankSum=0.936;SC=TCTTGCCCCCCGACTGCACGC;SOR=0.363;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=135;TCF=42;TCR=93;TR=75;WE=3653533;WS=3653515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,86:0.59:146
chr19	3656652	rs10432303	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=0.202;SC=AACTGATGACGGGTCGCTGCA;SOR=0.193;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=10;WE=3656660;WS=3656642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
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chr19	3730752	.	A	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=503;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GACACAGGGCACCGTGGTCGG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=37;WE=3730760;WS=3730742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr19	3731783	rs8101530	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-1.422;SC=ATCAGATCTCGGGTCCTACGG;SOR=0.412;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=3731791;WS=3731773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr19	3731847	rs1879039	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=538;ReadPosRankSum=-0.263;SC=TGGGAGGGCCCGCACCTGGAC;SOR=1.173;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=33;WE=3731855;WS=3731837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr19	3731985	rs1879040	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.918;NF=22;NR=36;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TTACAGATTCGGGCCTGGCTG;SOR=0.642;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=58;WE=3731993;WS=3731975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
chr19	3738649	rs599587	A	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=405;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GGTGACGCAGAGGAAGCAGGA;SOR=0.258;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=33;WE=3738657;WS=3738639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr19	3738971	rs600986	A	G	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=48;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.302;SC=AGCCCAGTCCACCGTCTGGCC;SOR=0.635;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=78;WE=3738979;WS=3738961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,86:0.55:157
chr19	3740658	rs10416362	T	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=370;ReadPosRankSum=1.101;SC=TGCGGGGTCTTCGTCGAGGAG;SOR=0.521;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=28;WE=3740666;WS=3740648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr19	3746087	rs501168	G	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=923;ReadPosRankSum=0.686;SC=AAAGTAAGCCGGGTCCTGCTA;SOR=0.625;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=62;WE=3746095;WS=3746064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,70:0.62:112
chr19	3746207	rs624300	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GAGCCCCTTTTGGAGGCTTTG;SOR=0.190;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=17;WE=3746215;WS=3746197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr19	3749971	rs7257905	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=0.462;SC=TCCCAGCCTCAGTTTTCTCAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=3749979;WS=3749969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	3750205	rs10692689	T	TGG	2746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.412;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.122;NF=18;NR=27;PP=1764;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TATTCCAGATTGGGGCCCTCA;SOR=0.807;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=45;WE=3750213;WS=3750195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,77:0.45:172
chr19	3750615	rs1046268	T	C	3547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=4.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,95:0.50:190
chr19	3750622	rs1046271	A	C	3526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,90:0.52:172
chr19	3750690	rs1046278	A	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=731;ReadPosRankSum=0.062;SC=TGACCTCTCGAAGGCTGCCAG;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=39;WE=3750698;WS=3750680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr19	3752874	rs8102086	A	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1455;ReadPosRankSum=0.985;SC=TGGAGGTGGCAGGCGCCTGGG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=98;WE=3752882;WS=3752864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,110:0.50:221
chr19	3753148	rs10414283	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr19	3753152	rs10411927	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr19	3753656	rs12609548	T	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=702;ReadPosRankSum=0.454;SC=AAAAAGAATTTAAAAATAAGC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=41;WE=3753664;WS=3753646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr19	3753769	rs3746120	C	T	2874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=1584;ReadPosRankSum=-2.463;SC=TCACGTCCTCCGCGTAGAATA;SOR=0.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=130;TCR=93;TR=101;WE=3753777;WS=3753759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,132:0.49:267
chr19	3762698	rs13960	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=826;SC=CGCAATACGTCATGGCGACCA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=3762706;WS=3762688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	3762926	rs7245624	G	A	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=67;PP=2023;SC=CAAGCGCAGAGAGGCGGATGC;SOR=1.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=90;WE=3762934;WS=3762916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	3767265	rs7239	C	T	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=11;PP=1249;SC=TCAGGCTGTTCGAGATGAACT;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=3767273;WS=3767255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	3771880	rs11085039	C	T	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=15;PP=510;SC=GGCCGGCATGCGCTCTGCATC;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=3771888;WS=3771870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	3772325	rs10419790	T	C	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=19;PP=479;SC=CACTTGGTCCTGGGCTGTTCT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=3772333;WS=3772315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	3779934	rs12610723	A	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=9;PP=295;SC=TGAAACACAGACCCCATGCTC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=3779942;WS=3779924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	3781566	rs11671881	C	A	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=68;PP=2816;SC=ACGCACCTCCCATCTTCCTTC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=138;WE=3781574;WS=3781556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	3783070	rs3746115	G	A	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=11;PP=1863;SC=CCTTCCTCCCGGACTGGGCTA;SOR=3.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=75;WE=3783078;WS=3783060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	3784757	rs2074976	T	G	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=50;PP=2136;SC=CAGGAAGGGGTCTCAGGGTGT;SOR=0.921;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=3784765;WS=3784747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	3785223	rs4807509	T	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1069;SC=CACAGGCCAGTCGGCTGGCAC;SOR=4.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=3785231;WS=3785213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	3806162	rs8109765	T	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=44;PP=1366;SC=CCCCGCCCGCTCTGCTCCCCG;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=3806170;WS=3806152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	3807276	rs56083710	C	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=887;ReadPosRankSum=-1.667;SC=GTCTTTGTGACGGGGAGTGGG;SOR=1.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=60;WE=3807284;WS=3807266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,63:0.56:112
chr19	3811457	rs10413220	G	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.74;QD=26.31;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	3819275	rs2301840	A	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.883;NF=3;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=2.624;SC=GTCTGTGGGGACCCTTGGGGA;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=14;WE=3819283;WS=3819265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr19	3820191	rs2301843	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=747;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TGGAGTGGGGCGCTGGCGGGT;SOR=0.604;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=58;WE=3820199;WS=3820181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,68:0.50:136
chr19	3820293	rs2301844	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=912;ReadPosRankSum=-0.783;SC=AGCCGCCTGCAGGACCGAGAC;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=26;WE=3820313;WS=3820283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr19	3820305	rs2301845	T	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=912;ReadPosRankSum=-1.033;SC=GACCGAGACGTGACAGAGCAT;SOR=0.725;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=24;WE=3820313;WS=3820283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr19	3820389	rs2301846	A	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=0.616;SC=GCAAGGAAGGAAGGGCCAAAG;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=16;WE=3820397;WS=3820379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr19	3820441	rs2301847	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=1.239;SC=TGCCTGCTGTATGCACAGAAG;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=10;WE=3820449;WS=3820431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	3822008	rs28510805	C	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=323;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GGCCCGACCACAGGCCTCCCA;SOR=1.578;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=19;WE=3822016;WS=3821998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	3823192	rs34503630	T	C	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=961;ReadPosRankSum=0.594;SC=GCCTGATCCATGGGAAGGTCC;SOR=0.682;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=101;TCR=48;TR=70;WE=3823200;WS=3823182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,80:0.47:172
chr19	3823237	rs2240231	G	A	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=50;PP=1803;ReadPosRankSum=0.641;SC=TGACAGCCTCGACTTACCTCC;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=246;TCF=147;TCR=99;TR=116;WE=3823245;WS=3823227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,141:0.47:301
chr19	3831198	rs12461577	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=284;ReadPosRankSum=-0.292;SC=ACCTTCTTTCAGCAGGCAGCG;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=19;WE=3831206;WS=3831188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr19	3831449	rs2240232	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=339;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CGCGGGCGGCGGGGGCAGCTG;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=21;WE=3831457;WS=3831439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr19	3831476	rs148517103	G	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=747;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GGGTCCCGGGGGAGGCGGGGG;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=44;WE=3831484;WS=3831466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,56:0.69:81
chr19	3831525	rs2240233	C	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=607;ReadPosRankSum=0.070;SC=GCGGAGTACACCGACGCGTCA;SOR=0.799;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=45;WE=3831533;WS=3831515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,54:0.39:138
chr19	3831765	rs2240235	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=392;ReadPosRankSum=-1.942;SC=GGTGTATCCCGAGGACAAGGT;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=28;WE=3831773;WS=3831755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr19	3833572	rs56713158	TA	T	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-1.423;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr19	3869128	rs35860262	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-1.611;SC=GCGCGAAGCCCTCACCTTCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=3869136;WS=3869118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	3902722	rs2060247	C	G	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=37;PP=1052;SC=TGATGGCGCTCTCATGAAGCC;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=3902730;WS=3902712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	3908201	rs3810373	T	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.627;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TGGTGGGTGGTGCGCGGGAGG;SOR=1.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=63;WE=3908209;WS=3908191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,69:0.97:71
chr19	3910933	rs4807527	G	A	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=0.804;SC=CTCAGTGTGCGTGTGTGCGTG;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=44;TCR=112;TR=153;WE=3910941;WS=3910923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,175:0.99:177
chr19	3911012	rs4807528	T	A	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=36;PP=954;SC=TGTGTGTGCATCCATGTGTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=3911020;WS=3911002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr19	3920616	rs8108660	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr19	3958324	rs3745980	C	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=662;SC=CCCGGTTTGTCCCCTCCTTCC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=3958332;WS=3958314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	3958397	rs7255123	A	G	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=32;PP=1758;SC=GCATATCCCCAGTGGCCAAGG;SOR=1.349;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=3958405;WS=3958387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	3963724	rs2278437	G	A	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=50;PP=1549;SC=ACCCTCCCAGGACCGTGGCGT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=3963732;WS=3963714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	3969505	rs2304194	G	A	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=225;SC=ATTCACAGCCGGGGCTGTCTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=3969513;WS=3969495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	3976760	rs74724893	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=493;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AGAGGGAAGCGAGAGGCTCAC;SOR=0.683;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=36;WE=3976768;WS=3976750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr19	3977486	rs36527	A	G	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=47;PP=1368;SC=GCACACTGGCATAGAGGCAGC;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=3977494;WS=3977476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	3979408	rs36526	A	G	4943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=64;PP=2943;SC=CCGCGATGATATGCTCTCCCG;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=3979416;WS=3979398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	3980824	rs36525	A	G	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=59;PP=2094;SC=GGGCCCGGCCACCGGGACCAC;SOR=1.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=103;WE=3980832;WS=3980814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	4024020	rs2028827	G	A	6633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=87;PP=2965;SC=CCCTGACCCCGTGTTTGTCTT;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=191;WE=4024028;WS=4024010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr19	4028067	rs4520954	C	T	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=36;PP=2236;SC=CGGTCTCCACCTTGTCGGGTG;SOR=1.187;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=103;WE=4028075;WS=4028057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	4028783	rs2289863	C	T	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=65;NR=64;PP=2423;SC=TCAACCTCACCCACCTCATGT;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=4028791;WS=4028773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	4032949	rs895333	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=12;PP=1143;SC=CCAATCCCTCACGGCCCCGAG;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=4032957;WS=4032939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	4033144	rs61729791	C	T	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=63;PP=1636;ReadPosRankSum=-1.936;SC=TCGCCACCACCGGTGTGCGGG;SOR=0.578;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=239;TCF=103;TCR=136;TR=115;WE=4033152;WS=4033134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,152:0.53:289
chr19	4033244	rs749449	G	C	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=55;PP=1436;SC=CCCTGGGCCCGGGGCGGCTTG;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=68;WE=4033252;WS=4033234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	4033462	rs7255988	T	C	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=CAGAGACCTGTGCCCACCTGC;SOR=1.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=4033470;WS=4033452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr19	4033614	rs12460140	G	A	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=76;PP=2429;SC=GGCCGGAGCCGGACATCCGTG;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=28;TCR=76;TR=104;WE=4033622;WS=4033604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	4037525	rs2305106	C	T	7058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=100;PP=2965;SC=CCCCACCAGCCGCGCAGTCCG;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=123;TCR=100;TR=223;WE=4037533;WS=4037515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr19	4042077	rs4410205	C	A	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=19;PP=961;SC=CTCTGAAGCACAGAGGTTAGG;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=4042085;WS=4042067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	4101062	rs10250	G	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=965;SC=CCATGGAGTCGATGAGCTGGC;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=4101070;WS=4101052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	4102449	rs17851657	G	A	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1099;ReadPosRankSum=1.165;SC=GGGAGCCGCCGTCCTAGAGGG;SOR=0.418;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=152;TCF=65;TCR=87;TR=75;WE=4102457;WS=4102439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,93:0.52:180
chr19	4117705	rs350890	T	C	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=998;SC=CCGTGGTGCATCGGCCCCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=4117713;WS=4117695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	4153659	rs350879	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.833;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=527;ReadPosRankSum=-1.428;SC=GAGCTTGCCCGGCCCCAGGTA;SOR=1.739;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=28;WE=4153667;WS=4153649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr19	4154910	rs35474881	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=1086;ReadPosRankSum=0.742;SC=CTTCTGCTGCCTGCTCCATGG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=69;WE=4154918;WS=4154900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr19	4156866	rs112691598	AC	A	711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=1859;ReadPosRankSum=0.444;SC=AGAAGCAGTAACTCATCTTGG;SOR=1.247;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=20;WE=4156889;WS=4156856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
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chr19	4156881	rs350871	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=1840;ReadPosRankSum=0.982;SC=TCTTGGAGAAGGGAAGGACAC;SOR=1.877;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=24;WE=4156889;WS=4156856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr19	4159509	rs66603362	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CCCTTCAACTCAGGCCTTGGG;SOR=1.061;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=4159517;WS=4159499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr19	4169998	rs350852	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=106;SC=CTGACCTGCCGAGTAACCTTG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=4170006;WS=4169992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	4170378	rs350851	G	A	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=709;SC=AGGCCGAGGCGGGTGGATCAC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=4170386;WS=4170368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	4174950	rs350845	A	G	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=55;PP=2513;SC=GGTCCTGCCGAGGGGCGGGAC;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=4174958;WS=4174940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	4177051	rs350844	A	G	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=12;PP=924;SC=CAGAGCCCCCACCCCTGCACC;SOR=1.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=47;WE=4177059;WS=4177041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	4177331	rs350843	A	C	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=205;SC=GGGCAAGTGGACCAACCTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=4177339;WS=4177321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	4180690	rs7260071	T	G	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=1532;SC=CAGATGGATGTGTTCTCATTC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=4180698;WS=4180680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	4180836	rs352493	C	T	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=46;PP=1696;SC=GAACACCACACTGGAAGACTG;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=4180844;WS=4180826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	4198154	rs1963331	C	T	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=18;PP=581;SC=CGGCGGCCTGCGCTGGTGAGG;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=4198162;WS=4198144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	4199809	rs112892199	C	CA	4217.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=32;PP=2969;SC=GAGCCCCTGTCGGGGGCGTGG;SOR=1.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=69;WE=4199817;WS=4199799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	4199839	rs6510793	A	C	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=52;PP=2528;SC=AGCAGCCAACACTGCCCCACG;SOR=1.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=81;TCR=52;TR=133;WE=4199847;WS=4199829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	4200156	rs2052191	G	A	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=43;PP=1247;SC=TGTCATGAGCGCGGACGGGGC;SOR=1.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=4200164;WS=4200146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	4200206	rs2052192	A	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=720;SC=AGGAGGAACTAAGCCCAGGTG;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=4200214;WS=4200196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	4201805	rs11672646	G	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=297;SC=GATCGCTTGAGCCTAGGTGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=4201813;WS=4201796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	4202683	rs352513	T	C	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=170;SC=CCTCAAATTCTCAGCTGCTTC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=4202691;WS=4202673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	4202793	rs7260407	A	G	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=29;PP=1458;SC=AGCCCAGGGTAGGGAAGGCAG;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=74;WE=4202801;WS=4202783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	4208082	rs2240670	T	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=32;PP=947;SC=TAGGAGGTCCTAGAGCTTACC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=4208090;WS=4208072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	4210017	rs67953324	G	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=10;PP=652;SC=ATGGCCCCCCGATCGGCCCCC;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=4210025;WS=4210007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	4210356	rs12978469	G	A	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=52;PP=2055;SC=CACAAGGAACGGAGGCAGCAG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=4210364;WS=4210346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	4210382	rs72980936	C	T	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=50;PP=1885;SC=TAGGAGGCCTCGGAGATTTGG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=4210390;WS=4210372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	4210401	rs60239405	C	CA	4483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=52;PP=2789;SC=GGGCGTGGGCCAGCCTGGGTG;SOR=1.190;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=61;WE=4210409;WS=4210391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	4210465	rs12710072	A	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.41;QD=26.63;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	4212808	rs58559746	C	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=340;SC=CACGTGCAAACACACGCACCA;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=4212816;WS=4212798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	4216910	rs10413818	G	A	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=40;PP=1474;SC=CACGGGAGCCGAGGCCACGGG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=4216918;WS=4216900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	4217207	rs353693	T	G	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=75;PP=2965;SC=AGGGATGGAATCCACAGGAGT;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=61;TCR=75;TR=136;WE=4217215;WS=4217197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	4217576	rs150106684	G	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CCGCCTGCGGGAGCTGGAGGC;SOR=0.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=11;WE=4217595;WS=4217566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr19	4217587	rs58333777	G	A	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=16;PP=603;SC=AGCTGGAGGCGGCCTCGGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=4217595;WS=4217566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	4217956	rs6510794	A	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=18;PP=1020;SC=GGGGCCGGGCAGCCAGTCTGG;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=4217964;WS=4217946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr19	4288205	rs888928	T	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=521;ReadPosRankSum=0.769;SC=TTGAAGGGAATGGCCCTTGAT;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=32;WE=4288213;WS=4288195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr19	4288220	rs888929	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=749;ReadPosRankSum=-1.817;SC=CTTGATGAGACATCTGTCCAT;SOR=0.534;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=47;WE=4288228;WS=4288210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr19	4288332	rs888930	A	G	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.544;SC=AGTGAGACCAACCCCCAGGAC;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=72;WE=4288340;WS=4288322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,99:0.45:222
chr19	4292597	rs888932	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TGGGATCTCTCACTCCTCTCC;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=10;WE=4292605;WS=4292587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr19	4294551	rs62129297	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-1.517;SC=TCCTCCGCCCTACCCTCCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=11;WE=4294559;WS=4294541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr19	4297968	rs6510801	C	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=829;ReadPosRankSum=1.626;SC=TCCCTCTCCCCGCTGGCTCCC;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=50;WE=4297976;WS=4297958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr19	4304774	rs17523436	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=0.161;SC=ACGGGGTGGGGCAGGGCGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=14;WE=4304782;WS=4304764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr19	4306311	rs4807578	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GTGCCAGCCGTACCTACGAGC;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=26;WE=4306319;WS=4306301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr19	4308098	rs11669091	T	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTGGCAAAAGTACATACTGAT;SOR=0.364;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=26;WE=4308106;WS=4308088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr19	4312103	rs3745989	C	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CTCTTCCAGCCTCCCGTCTCG;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=5;WE=4312111;WS=4312093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr19	4318365	rs3745990	G	A	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=651;ReadPosRankSum=0.454;SC=GCCTGGATGCGTCCACATCCC;SOR=0.508;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=47;WE=4318373;WS=4318355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,66:0.57:116
chr19	4324564	rs57455784	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TGTGGTGGCTCACGCCGGTAA;SOR=0.411;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=22;WE=4324572;WS=4324554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr19	4325327	rs10411394	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=827;ReadPosRankSum=0.347;SC=AAAGTGTAACGTGTCACATCA;SOR=0.626;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=57;WE=4325335;WS=4325317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,59:0.39:151
chr19	4325433	rs1138253	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=725;ReadPosRankSum=0.842;SC=CATCTCCAATGGGGGTCACGT;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=49;WE=4325441;WS=4325423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr19	4326898	rs62129306	C	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-2.031;SC=ATGCGGGGTCCTCGATCCCTC;SOR=0.247;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=8;WE=4326906;WS=4326888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr19	4328860	rs11882358	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=393;ReadPosRankSum=-1.860;SC=TCCGCTCTTCTGCACGTAAAC;SOR=0.920;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=34;WE=4328868;WS=4328850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr19	4331940	rs145454096	AAAAG	A	917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.286;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr19	4332105	rs7258060	A	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=527;ReadPosRankSum=0.958;SC=AAAGAATCCAAGTCAGTGAGC;SOR=0.603;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=38;WE=4332113;WS=4332095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr19	4333666	rs10413905	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-1.367;SC=ACCGCCCCTCTGCACCCCTCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=4;WE=4333674;WS=4333656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr19	4333711	rs7247504	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=254;ReadPosRankSum=-1.003;SC=ATCTCCTGATCCCGGAGAATC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=17;WE=4333719;WS=4333701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr19	4338586	rs35303066	CAGAG	C	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.071;NF=4;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=-1.696;SC=GACAGGGACTCAGAGAGGTGC;SOR=0.169;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=8;WE=4338597;WS=4338576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr19	4352763	rs11668153	C	T	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=202;SC=TGCTCCCTCCCTCCCTCTAGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=4352771;WS=4352753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr19	4352838	rs11668187	C	G	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=9;PP=670;SC=TAGCAGGGAGCGGGGGGGCAC;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=26;WE=4352846;WS=4352827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	4352959	rs11882587	A	G	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=35;NR=38;PP=1305;SC=ACGTTCTGGCAGGGGTCTCAG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=4352967;WS=4352949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	4353841	rs7246177	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=347;SC=ATTTCTTCTTTGTAAATAAGA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=4353849;WS=4353831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	4355035	rs2041772	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.72;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	4355054	rs2041773	A	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=21;PP=670;SC=GGGGCGTTGGAGGACCGGGGT;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=34;WE=4355062;WS=4355044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	4355203	rs2041774	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=4;PP=36;SC=GCATTCTGGGGAGGGTTGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=4355211;WS=4355183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	4357555	rs4807583	A	G	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=48;PP=1568;SC=CCAAGATCTCACCTTTCTGGG;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=78;WE=4357563;WS=4357545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	4362691	rs243261	G	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.657;SC=CCCGGGGCTTGGGCTTATACT;SOR=0.384;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=31;WE=4362699;WS=4362681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr19	4362761	rs116493996	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=2.026;SC=TGAGTGGACCGAGCCCGTGTC;SOR=0.653;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=26;WE=4362769;WS=4362751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr19	4363289	rs62129346	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CACCCCACAGCGAGGTGTGCT;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=4363297;WS=4363279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr19	4363564	rs139561776	TGA	T	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.358;NF=1;NR=9;PP=334;ReadPosRankSum=-1.674;SC=GCAAGGGGGCTGAGAGGGGAC;SOR=1.112;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=10;WE=4363573;WS=4363554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr19	4364279	.	T	TC	3102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=1897;ReadPosRankSum=-0.316;SC=ACTGAGACACTCCTCAGCCTT;SOR=0.559;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=112;TCF=10;TCR=102;TR=48;WE=4364287;WS=4364269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,106:0.52:204
chr19	4400314	rs62129356	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=368;ReadPosRankSum=3.490;SC=CCTGGGCCTGCGCTCACCTGG;SOR=0.871;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=28;WE=4400322;WS=4400304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr19	4400466	.	C	CCTCCGCCACCCGCTTGCCAG	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.328;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	4402659	rs200677191	G	GGCGGCAGCA	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.126;NF=1;NR=3;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CGGCGGCCGCGGCGGCAGCAG;SOR=0.525;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=4402667;WS=4402649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr19	4406160	rs243342	G	A	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=166;SC=ACTTATGCACGATTGGTGTTT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=4406168;WS=4406150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	4408751	rs243347	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=574;SC=GATTACAGGCATGAGCCACCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=4408759;WS=4408741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	4409756	rs2230636	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=428;ReadPosRankSum=-1.127;SC=CCCTCCGCAGAGTGAGTATCT;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=24;WE=4409764;WS=4409746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr19	4417845	rs34080966	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CCGTAGTCTCTCTTGTTATCT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=9;WE=4417853;WS=4417835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr19	4423419	rs11668886	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=1355;ReadPosRankSum=1.424;SC=AGAGCTTCCCCGTCCCAGCCC;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=178;TCF=66;TCR=112;TR=83;WE=4423427;WS=4423409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,90:0.46:197
chr19	4429007	rs62130978	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=1.463;SC=CTAGTGCCCTCGGGCCCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=18;WE=4429015;WS=4428997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	4431896	rs243371	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=489;ReadPosRankSum=-1.499;SC=AAAGAGTGCCCGGGCATAGGG;SOR=0.247;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=30;WE=4431904;WS=4431886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr19	4442336	rs9352	C	T	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=57;PP=2241;SC=CCGGATGCTGCGGGTGAGAAG;SOR=0.779;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=112;WE=4442344;WS=4442326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	4442529	rs243382	T	C	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=105;SC=ATGCCAGGCATCGTTCTGGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=4442537;WS=4442519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	4442999	rs243383	T	G	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=28;PP=1890;SC=CACCCTGACCTCGAGCCCACT;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=94;WE=4443007;WS=4442989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	4443046	rs2992	T	C	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.002;SC=GTATGTAGAATGCTTAGGGTG;SOR=0.327;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=75;WE=4443054;WS=4443036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,90:0.51:178
chr19	4446995	rs243389	C	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=56;PP=1627;SC=GTCCAGGGGCCCGGCTCTCGC;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=63;WE=4447003;WS=4446985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr19	4453324	rs376965	TG	CC	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=2360;SC=CCACAACCTGTGTCCACCTTG;SOR=2.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=51;WE=4453333;WS=4453314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	4454083	rs1127888	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=503;ReadPosRankSum=0.451;SC=TCTTTGTGGGCCTTTTCCCTG;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=35;WE=4454091;WS=4454073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr19	4457496	rs10425328	CG	GC	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=495;SC=CTGACCCTCGCGTGCCGCTCC;SOR=3.477;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=24;WE=4457505;WS=4457486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	4457518	rs56153949	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=372;ReadPosRankSum=-0.050;SC=AGCCCCTCATCCTCTCCGATC;SOR=0.534;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=22;WE=4457526;WS=4457508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr19	4457650	rs1044510	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=788;ReadPosRankSum=-1.277;SC=GTCCCGCGCTCTTGAACTTGA;SOR=0.646;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=52;TCR=83;TR=58;WE=4457658;WS=4457640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr19	4472322	rs61606737	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=531;ReadPosRankSum=-0.912;SC=AGCCGCTTTCCGCGGCCTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=44;WE=4472330;WS=4472312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,62:0.59:105
chr19	4475362	rs2288932	T	G	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGTGTCCCCTTCTGGGGCTTG;SOR=0.737;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=75;WE=4475370;WS=4475352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,92:0.43:212
chr19	4488926	rs10421685	G	A	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=510;ReadPosRankSum=1.910;SC=CTGATGTCTCGCCTGGCAGCT;SOR=0.432;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=33;WE=4488934;WS=4488916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr19	4491476	rs11878416	G	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=0.580;SC=GAGCTCAGCTGTCGTGGGTGG;SOR=0.818;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=4491484;WS=4491466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr19	4493708	rs892161	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=327;ReadPosRankSum=0.672;SC=AGAAGGCGCCATCAGCCTCCG;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=23;WE=4493716;WS=4493698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr19	4496198	rs2288930	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=336;ReadPosRankSum=1.314;SC=GTGGAGGGCGACAGAAAGGGT;SOR=1.345;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=18;WE=4496206;WS=4496188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	4498212	rs2288927	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CCCATGACAAATCCTCCAGAG;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=7;WE=4498220;WS=4498202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr19	4498245	rs2288926	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=1.496;SC=CTGCCCTTGAACAGCTGGCCC;SOR=1.302;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=10;WE=4498253;WS=4498235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr19	4498440	rs2288924	T	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CTCCCTTAGATGTCTCGGGAA;SOR=0.506;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=35;WE=4498448;WS=4498430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr19	4498700	rs10406139	A	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=309;SC=TTCTGCAGATACAGCTCCCCT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=4498708;WS=4498697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	4499023	rs67274054	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=0.526;SC=CCTGGGTCAGCGAGGAGGCCG;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=21;WE=4499031;WS=4499013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr19	4499632	rs72100503	AAGCTGGCCGGGGAGG	A	2545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=33;PP=2933;SC=GGCCGAGGAGAAGCTGGCCGG;SOR=2.794;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=5;TCR=68;TR=35;WE=4499654;WS=4499622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	4502287	rs7254167	G	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=11;PP=281;SC=TGGGGCGCAGGCGGCAGTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=4502295;WS=4502277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	4504480	rs182777366	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=447;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCTACTGCCCGCCAGCGGGCA;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=33;WE=4504488;WS=4504470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr19	4508945	rs8105775	A	G	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=91;PP=2965;SC=CCTTTGGCCCAGGCTGGGAGG;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=177;WE=4508953;WS=4508935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	4509059	rs4991027	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=428;ReadPosRankSum=0.978;SC=CGGCGGTTCCCGCCTGTGATC;SOR=0.192;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=25;WE=4509067;WS=4509049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr19	4510389	rs8105610	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=15.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=1.086;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr19	4510560	rs7251858	C	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TGTGTGGTGGCCAAAAGCCCC;SOR=0.624;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=70;WE=4510568;WS=4510550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr19	4510723	rs78776990	G	A	2741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=48;PP=1812;ReadPosRankSum=-1.310;SC=CCTCTTGGGGGCTCAGGGCAG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=119;TCR=90;TR=113;WE=4510731;WS=4510713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,124:0.52:237
chr19	4511140	rs7255715	C	G	8012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=150;PP=2965;SC=TCTGGACGGTCCCTTTGGCCA;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=101;TCR=150;TR=251;WE=4511148;WS=4511130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr19	4511341	rs74202324	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=32.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-4.726;QD=1.74;ReadPosRankSum=-3.563;SOR=1.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:322,63:0.16:385
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chr19	4511453	rs7255187	G	A	13956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=512;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=195;NR=198;PP=2965;SC=GGCCACGTTCGCAGCACCGGT;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=399;TCF=201;TCR=198;TR=393;WE=4511461;WS=4511443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,510:1.00:510
chr19	4511525	rs7256712	A	G	13304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=189;NR=188;PP=2965;SC=GTCTACACCCATCTGGACGGC;SOR=0.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=379;TCF=190;TCR=189;TR=377;WE=4511533;WS=4511515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,493:1.00:493
chr19	4511575	rs62115185	C	G	4840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=19.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-5.147;QD=12.54;ReadPosRankSum=-8.148;SOR=1.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,137:0.35:386
chr19	4511578	rs62115186	A	G	4797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=17.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-5.442;QD=12.59;ReadPosRankSum=-8.754;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,128:0.34:381
chr19	4511580	rs78884463	CA	TG	4563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=18.148;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-5.837;QD=12.07;ReadPosRankSum=-9.210;SOR=1.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,123:0.33:378
chr19	4511598	rs76022477	AC	GG	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=7.247;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-7.765;QD=5.04;ReadPosRankSum=-8.585;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,56:0.17:328
chr19	4511647	rs7256387	C	G	4688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.646;NF=52;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=15.879;SC=CTTTGGCCAACTTCACAGCCC;SOR=0.459;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=144;WE=4511655;WS=4511637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:140,188:0.57:328
chr19	4511725	rs73920825	T	C	6451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=2.615;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.93;MQRankSum=-1.721;QD=21.72;ReadPosRankSum=14.640;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:140,157:0.53:297
chr19	4511730	rs62115190	T	C	7771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=4.504;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.08;MQRankSum=-0.894;QD=24.36;ReadPosRankSum=13.894;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:140,179:0.56:319
chr19	4511737	rs57610751	T	C	7982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=9.065;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.36;MQRankSum=0.376;QD=22.42;ReadPosRankSum=16.151;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:142,214:0.60:356
chr19	4511830	rs7257142	A	G	4513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.569;NF=86;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=2.910;SC=TGGTCTGGACAGTCCCTTTGG;SOR=0.716;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=445;TCF=227;TCR=218;TR=195;WE=4511838;WS=4511820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:299,228:0.43:527
chr19	4511908	rs10423606	C	T	6180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.842;NF=86;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=2.746;SC=CGGTCTTGGCCGTGTCTACAC;SOR=0.854;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=410;TCF=210;TCR=200;TR=145;WE=4511943;WS=4511898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,170:0.40:426
chr19	4511927	rs10422025	G	A	7631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.692;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,195:0.43:456
chr19	4511927	.	GCA	ACG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MMLQ=24;NF=100;NR=104;PP=2944;QD=20;SC=ACCTGTCTGGGCAGCCCCTTT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=434;TCF=222;TCR=212;TR=204;WE=4511943;WS=4511898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:230,204:0.47:434
chr19	4511929	rs10424401	A	G	7726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.683;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.467;SOR=1.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,198:0.43:461
chr19	4511955	rs7260518	T	C	8536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.170;NF=131;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.434;SC=TTCACAGCACTGGTCACCCCA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=488;TCF=263;TCR=225;TR=243;WE=4511963;WS=4511945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:298,254:0.46:552
chr19	4512514	rs7259625	G	C	3525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.314;NF=73;NR=63;PP=2274;ReadPosRankSum=0.131;SC=TGTCCAGGCCGCCCTGGACGG;SOR=0.558;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=248;TCF=138;TCR=110;TR=136;WE=4512522;WS=4512504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,158:0.54:295
chr19	4512669	rs55901236	T	C	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=66;PP=1920;ReadPosRankSum=-2.179;SC=CTGCAGACGGTGTCCTTTGTA;SOR=0.914;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=118;WE=4512677;WS=4512659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,128:0.43:296
chr19	4512748	rs112063407	T	C	10197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=168;PP=2965;SC=TCGCTGCCCCTGTGAGCCCAG;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=157;TCR=168;TR=325;WE=4512756;WS=4512738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr19	4513143	rs4807595	CA	TG	4700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.553;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.446;NF=80;NR=21;PP=2704;ReadPosRankSum=0.469;SC=TTCATGGCACCAGTCACCCCA;SOR=2.562;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=85;TCR=25;TR=101;WE=4513152;WS=4513133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr19	4513559	rs4807597	A	G	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=59;PP=2380;SC=GCTGGACACCACCTCCTTGGT;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=112;WE=4513567;WS=4513549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	4524016	rs1062223	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=465;ReadPosRankSum=0.730;SC=GGCAGGCCCCGCACGCTGGAC;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=33;WE=4524024;WS=4524006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr19	4525046	rs1610090	A	G	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=22;PP=819;SC=TTCCCAGGGCAGGCCGGGGCG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=4525054;WS=4525036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	4525149	rs142219459	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=419;ReadPosRankSum=0.598;SC=GGGGGTCGGGGTGGGGTCCAG;SOR=0.379;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=27;WE=4525157;WS=4525139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr19	4531919	rs76461382	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TCTGGGCCAGGACGAGGGATG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=10;WE=4531927;WS=4531909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr19	4550383	rs28667487	G	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=496;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CGACCCTCAGGTTTTTTGTTT;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=32;WE=4550391;WS=4550373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
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chr19	4555310	rs10853973	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AAGCCCCAAATCCCGCTGAGC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=4555318;WS=4555300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr19	4714044	rs2277733	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=250;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CAGGGAACTGTGGTCCCAGAT;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=16;WE=4714052;WS=4714034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
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chr19	4723906	rs76065513	G	A	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=997;ReadPosRankSum=-0.861;SC=ACGTACCAAGGCGTCCGCGGC;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=71;WE=4723914;WS=4723896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr19	4772202	rs3760955	A	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=778;ReadPosRankSum=0.428;SC=TCCACCTCCAACCAGAGCTCC;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=43;WE=4772210;WS=4772192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
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chr19	4816160	rs8120	A	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=22;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CACTGTCCACAGGGCACAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=4816168;WS=4816150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	4816719	rs2292151	G	A	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TCCGCTCACCGTCCAGGTGTT;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=73;WE=4816727;WS=4816709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,89:0.49:180
chr19	4818378	rs7255265	T	C	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=52;PP=984;ReadPosRankSum=0.768;SC=GTGATGGGCCTGTGCAGGCCA;SOR=1.060;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=151;TCF=56;TCR=95;TR=77;WE=4818386;WS=4818368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,89:0.51:176
chr19	4844633	rs17363814	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=255;SC=AGAGTGGCATCGGGACTCCAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=4844641;WS=4844623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	4844665	rs36066928	TC	T	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=824;SC=CACCCCCCAGTCCCCTCATGG;SOR=4.091;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=20;WE=4844673;WS=4844655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	4847713	rs9973235	A	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;PP=918;SC=CAGGCTTAGGACCTGCGACAG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=4847721;WS=4847703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	4847874	rs9304915	A	G	3699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=59;PP=2268;SC=ACGCGACGTCAAAGCCATCCA;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=110;WE=4847882;WS=4847864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	4852106	rs2271058	A	G	8197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=136;PP=2965;SC=ACCCCACTCAACACCATCTGG;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=114;TCR=136;TR=250;WE=4852124;WS=4852096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr19	4859937	rs8289	T	C	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=24;PP=1129;SC=ACAGTCTTGATGTGCGGGTAG;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=4859945;WS=4859927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	4902754	rs2779168	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.667;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=-1.412;SC=TCAGGGTTAAGATCACCTGCC;SOR=1.066;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=40;WE=4902762;WS=4902744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr19	4929124	rs5826865	GC	G	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=323;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GATGCAGATTGCCCCCCCCCC;SOR=0.586;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=21;WE=4929132;WS=4929114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr19	4929413	rs2251520	T	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=564;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CCACCCACGGTGAGGCGGCCG;SOR=0.506;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=46;WE=4929421;WS=4929403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,54:0.43:126
chr19	4929473	rs2123731	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=429;ReadPosRankSum=1.762;SC=ATGAGACGGAATTGGGGCTGT;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=27;WE=4929481;WS=4929463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr19	4941456	rs2251519	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=456;ReadPosRankSum=0.025;SC=CCAGGCATCCCGAGAACCCGT;SOR=0.545;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=26;WE=4941464;WS=4941446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr19	4944555	rs2602730	G	A	5847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=120;PP=2965;SC=CCAGGGGTCAGGGTGGTTACC;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=60;TCR=120;TR=180;WE=4944563;WS=4944545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	4944596	rs2251117	T	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.663;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=48;PP=893;ReadPosRankSum=-0.346;SC=AGGAGGGGTGTGGAAAGCCTG;SOR=1.477;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=54;WE=4944604;WS=4944586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
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chr19	4945974	rs2250978	T	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.51;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr19	4954679	rs55946225	G	GC	2248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=12;PP=2635;SC=CCCGAGCAGGGCGGGTCCCCG;SOR=2.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=59;WE=4954687;WS=4954669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr19	5047691	rs2620818	G	A	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=80;PP=2213;SC=GTGAGTGTCTGCACTGGCCCT;SOR=2.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=17;TCR=80;TR=97;WE=5047699;WS=5047681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
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chr19	5111994	rs2613736	A	G	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=50;PP=1430;SC=GCCAGGCACGATCGCTCACAC;SOR=3.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=5112002;WS=5111984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	5132051	rs2620839	G	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=39;PP=1182;SC=GGCTCTCATCGGCCCTGCTCC;SOR=2.221;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=5132059;WS=5132041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	5135392	rs2620836	A	G	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=67;PP=2965;SC=CTCCCTCGGAAAGGGCTGCCC;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=167;WE=5135400;WS=5135382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	5137192	rs2613790	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.937;SC=CCAAGTTACCCGGCCCCTCCC;SOR=1.688;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=22;WE=5137207;WS=5137182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr19	5137199	rs113545259	T	TC	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=9;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.580;SC=ACCCGGCCCCTCCCCCTGAGT;SOR=1.229;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=21;WE=5137207;WS=5137182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr19	5137846	rs2613786	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-0.497;SC=AGGAGCATACGCCTGCACCGA;SOR=1.051;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=6;WE=5137854;WS=5137836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	5174025	rs12975415	A	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-1.995;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr19	5174030	rs2620822	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.929;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr19	5174180	rs2620821	C	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=0.158;SC=AGCAAAGTCTCGTCACCACGG;SOR=1.110;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=24;WE=5174188;WS=5174170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr19	5206775	rs1143700	A	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=43;PP=2600;SC=GCCTGGGGGGAACCATGGCTT;SOR=1.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=82;TCR=43;TR=125;WE=5206783;WS=5206765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	5208216	rs60630722	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=525;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TCCCCAGCAGGGCCAAAAGCT;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=31;WE=5208224;WS=5208206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr19	5208236	rs55727125	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=660;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TGGGACACTCGAGGGAGCTCA;SOR=0.518;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=45;WE=5208244;WS=5208226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr19	5208514	rs139873720	TG	T	1094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=961;ReadPosRankSum=1.694;SC=GTTTTTGAGATGGAGTTTCAC;SOR=0.238;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=26;WE=5208522;WS=5208504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr19	5210622	rs2302224	G	A	3146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=51;PP=2224;ReadPosRankSum=0.943;SC=AGGAGATGGCGGCCGTGGTCA;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=147;TCR=97;TR=127;WE=5210630;WS=5210612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,134:0.52:258
chr19	5210782	rs1143698	G	A	4544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=107;PP=2708;ReadPosRankSum=1.602;SC=GTCTCCGCCAGCGGCCCCTGT;SOR=0.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=367;TCF=150;TCR=217;TR=176;WE=5210790;WS=5210772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,223:0.47:471
chr19	5211568	rs55858361	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=386;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GGCTCCTTCTGGGGCCCTGAG;SOR=0.136;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=23;WE=5211576;WS=5211558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr19	5212380	rs1064300	C	T	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=978;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CGGCATCTGGCGGGTTGCAGG;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=63;WE=5212388;WS=5212370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr19	5212482	rs2230611	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=550;ReadPosRankSum=0.946;SC=GGCGGACCTCGCGTTTCTCAC;SOR=0.680;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=38;WE=5212490;WS=5212472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr19	5212586	rs4807696	G	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=240;ReadPosRankSum=0.803;SC=CGGGTGTGGTGGCTCATGCCT;SOR=0.485;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=19;WE=5212594;WS=5212576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr19	5214533	rs9304921	A	G	5535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=82;PP=2965;SC=GGACAGGCTGACTGGCAGGGG;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=95;TCR=82;TR=177;WE=5214541;WS=5214523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	5214697	rs4807697	A	G	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=94;PP=2965;SC=GCGTTCTGACACCGGTAGCCG;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=83;TCR=95;TR=176;WE=5214705;WS=5214687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	5215474	rs73919781	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=1.245;SC=CTGTGAGGCCGAGGTGATGAG;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=31;WE=5215482;WS=5215464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr19	5216896	rs5826875	C	CG	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=77;ReadPosRankSum=0.702;SC=ACGCGGACAACGGGGGGTATG;SOR=0.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=5216904;WS=5216886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	5220900	rs10412973	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=293;SC=TGATAGGGTCTGTGTTTCATA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=5220908;WS=5220890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	5222071	rs3746132	G	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=10;PP=1160;SC=TGAGCCTTAAGCCCTGCTGAA;SOR=2.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=5222079;WS=5222061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	5222088	rs3746131	C	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.461;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=782;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGAACTACAACCCCTGACCCT;SOR=0.389;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=43;WE=5222096;WS=5222078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
chr19	5257341	rs112290142	G	A	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=81;PP=2823;SC=AACAAGCTTCGCTGGGTGCCG;SOR=0.890;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=147;WE=5257349;WS=5257331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	5260878	rs36016542	T	C	6460.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=80;PP=2265;SC=ACAAGGCGGTTGTTGGGGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=135;WE=5260887;WS=5260868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	5260879	rs10708972	GT	G	6451.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=79;PP=2969;SC=CAAGGCGGTTGTTGGGGGGCC;SOR=1.037;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=12;TCR=82;TR=91;WE=5260887;WS=5260868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	5260933	rs7246162	A	T	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=54;PP=1547;SC=GCCAGGCCTCAGCACTCTGCC;SOR=2.271;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=69;WE=5260941;WS=5260923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	5263061	rs55840918	G	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.48;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	5264967	rs4807017	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1143;SC=GATGCTCCCCACCCCCTGCTG;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=5264975;WS=5264957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	5265222	rs4807703	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=0.713;SC=GGGCAGAGACGTGAGAGAAAT;SOR=0.316;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=16;WE=5265230;WS=5265212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr19	5274384	rs1034917	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=488;ReadPosRankSum=-0.595;SC=GAAGGGGGGGCGCTGATGGGT;SOR=0.430;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=30;WE=5274392;WS=5274374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr19	5455611	rs2240743	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=733;ReadPosRankSum=1.360;SC=GCCCTCGCGTCCTGGCCACAG;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=53;WE=5455619;WS=5455601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr19	5455796	rs420325	A	G	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=51;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CCGCGCAGGCAGTGGTACGGG;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=117;TCR=96;TR=113;WE=5455804;WS=5455786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,137:0.54:252
chr19	5455971	rs8103406	G	T	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,88:0.52:168
chr19	5455978	rs8107825	T	C	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.61;ReadPosRankSum=2.578;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,89:0.50:177
chr19	5455990	rs17304380	G	A	3470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.56;ReadPosRankSum=2.311;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,95:0.51:187
chr19	5456450	rs8111108	T	C	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1427;ReadPosRankSum=2.335;SC=TGGATGAGTATGAGGAGGGCG;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=110;WE=5456458;WS=5456440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,128:0.51:250
chr19	5456930	rs2240747	A	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.921;SC=ACCCATCCCCATCAAGCCTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=5456938;WS=5456920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	5590113	rs141240896	TTTC	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=115;SC=TGTTCTATGCTTTCTTCTTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=5590123;WS=5590112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	5595354	rs10413286	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=169;SC=GCCCACAGCCTCACCCAGCTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=5595362;WS=5595344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	5600370	rs2285969	A	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=479;ReadPosRankSum=0.443;SC=ACGTCCACACAAAACAAATCA;SOR=0.696;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=33;WE=5600378;WS=5600360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr19	5612427	rs147705212	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GATCCTTGTATGATCTGGATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=5612435;WS=5612417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	5663920	rs3745628	T	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=321;ReadPosRankSum=0.267;SC=GAGAGAACACTCTTGGTGAAA;SOR=0.667;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=22;WE=5663928;WS=5663910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr19	5667204	rs148831822	AC	A	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.431;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.061;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,11:0.15:74
chr19	5687059	rs113901360	G	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=2.222;SC=CCGGTGGTCCGTTCCCTTCGC;SOR=0.346;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=12;WE=5687067;WS=5687049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
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chr19	5694630	rs2436514	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=0.908;SC=GGTGGGGTGACGGGCACAGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=5694638;WS=5694620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr19	5775232	.	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=180;ReadPosRankSum=-0.887;SC=AATGTAGAAATGAAAACTTAA;SOR=0.853;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=16;WE=5775240;WS=5775222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr19	5789565	rs2436487	T	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=672;ReadPosRankSum=-0.447;SC=CCCTCGGGCCTCAGGTGGGCC;SOR=0.747;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=50;WE=5789573;WS=5789555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr19	5791167	rs2290776	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=0.866;SC=GCCCCTCACATCCGCTCTGGA;SOR=0.481;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=14;WE=5791175;WS=5791157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr19	5827620	rs8106995	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.220;SC=AAATTTGGGACCTGGGAGTGA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=5827628;WS=5827618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr19	5831724	rs112313064	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.50;MQRankSum=-0.539;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr19	5844537	rs778986	A	G	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=70;PP=1750;ReadPosRankSum=0.252;SC=CACGATGACCATGTCTGCCTG;SOR=1.007;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=236;TCF=102;TCR=134;TR=114;WE=5844545;WS=5844527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,140:0.49:287
chr19	5844649	rs812936	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=689;ReadPosRankSum=0.158;SC=GGCCATGTCCGTAGCAGGATC;SOR=0.988;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=42;WE=5844657;WS=5844639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr19	5866585	rs778982	C	T	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=21;PP=1293;SC=AGTGAGGTCCCGGCAGCCCAG;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=5866593;WS=5866575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	5866654	rs778983	A	G	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=35;PP=1062;SC=TCTGGTACCTAGATTCCTGCT;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=5866662;WS=5866644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	5866736	rs57100281	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.90;QD=27.04;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	5867191	rs10412834	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.539;NF=23;NR=15;PP=586;ReadPosRankSum=1.083;SC=CCAGCCAGCCGTAGGGCGTGA;SOR=0.684;Source=Platypus;TCR=25;TR=38;WE=5867199;WS=5867181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr19	5867748	rs778971	G	T	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=63;PP=1460;ReadPosRankSum=0.840;SC=GGTCAGAGTAGCTGGGAAGAG;SOR=1.237;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=195;TCF=68;TCR=127;TR=89;WE=5867756;WS=5867738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,99:0.43:229
chr19	5892317	rs1626918	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=61.19;MQRankSum=0.282;NF=5;NR=2;PP=130;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCTCAGCGCGCGCATCCGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=7;WE=5892325;WS=5892307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr19	5892382	rs1678867	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.238;NF=12;NR=5;PP=288;ReadPosRankSum=0.318;SC=CCTGGAGGGCCGGGGAAGGGC;SOR=1.260;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=17;WE=5892390;WS=5892372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr19	5892486	rs1628564	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=665;ReadPosRankSum=1.022;SC=ACTAGTCTTTCCTCCTGTCCA;SOR=0.454;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=47;WE=5892494;WS=5892476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
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chr19	5892585	rs60236148	G	A	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=1187;ReadPosRankSum=2.633;SC=AGGATGCATGGGAAGGAAGGG;SOR=1.105;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=74;WE=5892593;WS=5892575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
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chr19	5903807	rs8108064	G	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=747;ReadPosRankSum=0.474;SC=GACTTCTCGGGCTGCGCGCGC;SOR=0.937;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=47;WE=5903815;WS=5903797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr19	5905141	rs10406399	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=0.335;SC=GGTAGGCGGAGGCAGAGCCGA;SOR=1.081;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=16;WE=5905149;WS=5905131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr19	5908969	rs10404195	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.140;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=845;ReadPosRankSum=0.197;SC=GACATCTGCCGCCGCCGGCCA;SOR=0.256;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=55;WE=5908977;WS=5908959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr19	5928185	rs274793	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=112;ReadPosRankSum=0.454;SC=CACCAGATCATGTACTCCACA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=5928193;WS=5928175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr19	5994823	rs71942694	CGAG	C	1712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.840;NF=7;NR=21;PP=1195;ReadPosRankSum=1.884;SC=TTTGGAACCTCGAGGAGGCGC;SOR=0.631;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=28;WE=5994833;WS=5994813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr19	5995450	rs452767	T	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=991;SC=CACCTGCTGCTCAGGCATCAC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=5995458;WS=5995440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	5995582	rs2302222	T	C	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.318;SC=CCTGGGAGGGTCGTGGTGGGA;SOR=0.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=65;WE=5995590;WS=5995572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr19	6002917	rs28421560	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-0.810;SC=AGGGGTTCGCAGGGAGAGCCT;SOR=0.363;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=19;WE=6002925;WS=6002907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr19	6141471	rs10853992	C	A	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=12;PP=1149;SC=TTGGCCTCATCCCTACAGCCC;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=6141479;WS=6141461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	6141758	rs9304926	G	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=523;SC=CCACCCTTTTGTTTTGAGACA;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=22;WE=6141766;WS=6141748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	6141809	rs9304927	G	A	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=228;SC=CAGTGGTGCAGTCATAGCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=6141817;WS=6141799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	6147743	rs9304929	G	C	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=59;PP=1797;SC=ATAGGTAACAGACATACATAC;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=71;WE=6147751;WS=6147733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	6151549	rs10422296	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=348;SC=CTCGAACTTCTGGCCTCAAGC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=6151557;WS=6151539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	6151703	rs7252466	C	T	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=23;PP=985;SC=TTTCTGTTTGCTTTTTCCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=6151711;WS=6151693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	6156483	rs4807840	T	C	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=83;PP=2965;SC=TCTGCCGAGGTTTGTCAATAT;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=166;WE=6156491;WS=6156473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	6190809	rs72157010	CAT	C	137.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-1.140;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	6190811	rs34836033	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=1.368;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr19	6190823	.	T	TACACAC	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.02;QD=38.25;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	6333290	rs2335192	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=1037;SC=ACCACAGAGCTTGGCATCAAG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=6333298;WS=6333280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	6361845	rs57445020	G	GC	5506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=72;PP=2973;SC=TCGGCTGGCTGCCCCGGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=97;WE=6361853;WS=6361835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	6373101	.	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=1.029;SC=GGGACGTGGAGCATCAGATGG;SOR=0.758;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=10;WE=6373109;WS=6373091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	6387532	.	G	A	4025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=80;PP=2203;ReadPosRankSum=-2.271;SC=GTAGTAGGACGTGTTCTCTGT;SOR=0.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=169;TCR=157;TR=164;WE=6387540;WS=6387522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,197:0.49:398
chr19	6415443	rs1616305	T	C	5958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=121;PP=2965;SC=GCTGTGGGGGTGCTCCGGGCT;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=80;TCR=121;TR=201;WE=6415451;WS=6415433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	6418142	rs2860167	C	T	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=79;PP=2512;SC=TGCCCCACACCCCCCCACCTC;SOR=1.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=34;TCR=79;TR=113;WE=6418150;WS=6418123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	6430106	rs34488963	C	T	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1555;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GAGCGGAAGCCGCCCTCCTGG;SOR=0.591;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=89;TCR=123;TR=107;WE=6430115;WS=6430096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,133:0.53:253
chr19	6443675	rs348341	G	A	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=38;PP=1174;SC=CATCTCCAGTGAAAATCACAA;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=6443683;WS=6443665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	6452305	rs173229	A	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=17;PP=917;SC=GGGAAAGAGGAACGCGCTGCC;SOR=1.262;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=6452313;WS=6452295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	6456218	rs348367	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=576;SC=TCAAGGGCTGCGCTTCAATCA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=6456226;WS=6456208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	6457367	rs348370	T	C	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=453;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=6457375;WS=6457357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	6466482	rs348362	A	G	3882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=49;PP=2101;SC=TGCAGCGTCCAGAAGCCATCA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=6466490;WS=6466472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	6468331	rs62107586	T	C	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=74;PP=2948;ReadPosRankSum=1.655;SC=TTGGCTCCCATGCTAAGACTG;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=98;TCR=75;TR=172;WE=6468339;WS=6468321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr19	6469042	rs150679157	CT	C	2774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=4;NR=33;PP=740;SC=TTTAGTTAGTCTTTTTTTTTT;SOR=1.127;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=37;WE=6469061;WS=6469032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	6469053	rs55698874	T	G	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=34;PP=1045;SC=TTTTTTTTTTTTTGTTTGAAA;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=56;WE=6469061;WS=6469032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	6471170	rs11882213	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=6;PP=625;SC=TTGCCCTAACCGGTCTCAAAC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=6471178;WS=6471160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	6471567	rs8105247	G	A	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=916;SC=CCAGCACTTCGAAGCCTGCCT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=6471575;WS=6471557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	6475163	rs12976944	A	C	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=36;PP=2965;SC=CCATCTCGGCATCCCAAAGTG;SOR=2.072;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=101;TCR=36;TR=137;WE=6475171;WS=6475153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	6475613	rs3745571	T	C	6598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=102;PP=2965;SC=AAAAGCGGGGTCGGCCGCTCA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=85;TCR=102;TR=187;WE=6475621;WS=6475603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr19	6476796	.	A	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GCCAGGAATCAGCCCCCTTGT;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=14;WE=6476804;WS=6476786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr19	6477256	rs348398	G	T	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=41;PP=1632;SC=GGGTAGGGGGGGGGATACCCT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=6477264;WS=6477246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	6477324	rs348399	G	C	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=38;PP=2009;SC=CTGTGGTCATGATGGCTGGGA;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=6477332;WS=6477314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	6495064	rs446199	C	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=0.009;SC=TTAGGGTCAGCGGGGAGTCAG;SOR=1.445;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=6495072;WS=6495054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr19	6501998	rs11672092	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=1.126;SC=CCAGTCTGGCCCTGCCACCCC;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=15;WE=6502006;WS=6501988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	6532953	rs76771492	T	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CGCTGCTGTCTCTGAAAGCTG;SOR=0.250;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=6532961;WS=6532943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	6535080	rs2234182	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.950;NF=15;NR=21;PP=556;ReadPosRankSum=1.622;SC=CGGAATAACGTCCAGCCTGGG;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=36;WE=6535088;WS=6535070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr19	6585921	rs453462	G	C	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=107;SC=CCACCACTACGCCCCACCACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=6585929;WS=6585911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	6589960	rs11361927	CT	C	814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=5;PP=834;SC=CTGTCTCCCCCTCTCCGTTTC;SOR=2.124;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=17;WE=6589968;WS=6589951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	6665020	rs344560	T	C	8128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=129;PP=2965;SC=ACGACCACCTTCTCCCCAGCC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=114;TCR=129;TR=243;WE=6665028;WS=6665010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr19	6677989	rs17030	G	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CGTCCTCCTCGGGCCAGTGCT;SOR=0.985;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=58;WE=6677997;WS=6677979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr19	6678474	rs11569565	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=384;ReadPosRankSum=2.333;SC=ACACTGTGGGGGAGAGGCAGA;SOR=0.465;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=26;WE=6678482;WS=6678464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr19	6679360	rs344555	T	C	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=28;PP=1547;SC=ATGGGATAGATGACCTGGGTA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=75;WE=6679368;WS=6679350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	6679511	rs2277984	C	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.251;NF=42;NR=42;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CTTTCCTCTGCGGGCAGATGT;SOR=0.601;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=194;TCF=92;TCR=102;TR=84;WE=6679519;WS=6679501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,92:0.39:234
chr19	6679563	rs2277983	T	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.07;MQRankSum=1.127;NF=24;NR=39;PP=709;ReadPosRankSum=-0.919;SC=CCAAAGACCATGCCTGGGAGG;SOR=0.555;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=63;WE=6679571;WS=6679553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,63:0.45:141
chr19	6686089	rs11569536	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=0.425;SC=GTGGGAAGCCGCAGGAGACAG;SOR=0.238;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=6686097;WS=6686079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr19	6690613	rs3745568	T	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=388;ReadPosRankSum=-1.073;SC=TAAGGTAGGGTAGGGTGGGAA;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=26;WE=6690621;WS=6690603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
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chr19	6696496	rs2287847	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=714;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GAGTGAGAGATACCGATGGCT;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=49;WE=6696504;WS=6696486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,58:0.42:138
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chr19	6697829	rs366510	G	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=1.220;SC=GACAGAACACGGAGTGTCAAG;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=6697837;WS=6697819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	6702042	rs433594	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TAAAGTGCCAAGAAACATAGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=6702050;WS=6702032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr19	6702157	rs428453	C	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=360;ReadPosRankSum=1.320;SC=CCGACATGCTCACAGCCAGAA;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=28;WE=6702165;WS=6702147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr19	6702246	rs432823	T	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=513;ReadPosRankSum=0.900;SC=GAGGTTGGGGTATTAGGAGAT;SOR=0.761;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=36;WE=6702254;WS=6702236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr19	6702598	rs406514	G	A	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=50;PP=1239;ReadPosRankSum=0.244;SC=TACCTGCAGGGGGTTTAGATC;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=44;TCR=84;TR=75;WE=6702606;WS=6702588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,88:0.58:151
chr19	6708107	rs10659507	T	TTCTC	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
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chr19	6710782	rs2230203	G	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=589;ReadPosRankSum=0.080;SC=TGATGGACAGGGGCAGCACCA;SOR=0.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=41;WE=6710790;WS=6710772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr19	6713175	rs11085197	G	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=311;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GTGGTCCTGAGCCTGGCCTTC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=23;WE=6713183;WS=6713165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr19	6713262	rs1047286	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=829;ReadPosRankSum=0.093;SC=TTCTGCTCGGGGGTTCTGCAC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=52;WE=6713270;WS=6713252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr19	6718387	rs2230199	G	C	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1385;ReadPosRankSum=2.178;SC=AACTTGTTGCGCCCCTTTTCT;SOR=0.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=94;TCR=101;TR=86;WE=6718395;WS=6718374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,101:0.45:225
chr19	6718534	rs2250656	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=0.197;SC=TTCTTGGTCTTCCGAGGTGGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=12;WE=6718542;WS=6718524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr19	6731057	rs2279624	T	C	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=36;PP=1983;SC=ACGGGTTGTTTCCTGTGGGCT;SOR=1.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=6731065;WS=6731047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	6731304	rs2279626	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=361;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGCAGGGGCGCGAGCAGGCG;SOR=0.268;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=24;WE=6731312;WS=6731294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr19	6731766	rs1702375	C	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=9;PP=439;SC=GAAAGAGAGGCCAGACTGGGG;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=24;WE=6731774;WS=6731756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	6732018	rs2291666	C	T	7977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=113;PP=2965;SC=AGCCTCAGCCCGGGGGCAGGG;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=143;TCR=113;TR=256;WE=6732026;WS=6732008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr19	6732615	rs2047139	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=168;ReadPosRankSum=0.354;SC=GGGAGGCTGATGGTGGTGGTG;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=16;WE=6732623;WS=6732605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr19	6732982	rs2012357	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=199;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GCTGCTCCCCGGTCCAAGGCT;SOR=0.418;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=18;WE=6732990;WS=6732972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	6733517	rs339395	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=507;ReadPosRankSum=0.914;SC=GGGGTGAGGCACTCTGGGCCC;SOR=0.868;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=35;WE=6733525;WS=6733507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr19	6734131	rs339397	C	G	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GGGAAAACGGCATGGGGAGTG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=79;TCR=105;TR=99;WE=6734139;WS=6734121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,113:0.51:223
chr19	6737481	rs340138	T	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=39;PP=1692;SC=CAGCGCCAGCTGGTGGATGCG;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=98;WE=6737489;WS=6737471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	6737509	rs339401	G	A	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=46;PP=1780;SC=CAGCCACCCAGCAGCAGCACC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=6737517;WS=6737499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	6739710	rs2303109	G	T	143.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=2.200;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr19	6739934	rs344633	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CACCCTCCGCTCTCTCTCGAA;SOR=0.197;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=7;WE=6739942;WS=6739924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr19	6743399	rs381897	A	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.44;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	6743399	.	ACCCCTA	TCCCCTA,TCCCCTG	93	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4,0;NR=7,5;PP=42,93;QD=6.97920114065;SC=TACTCCCTTGACCCCTACTTA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11,5;WE=6743413;WS=6743396;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:11
chr19	6743405	rs2277986	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.185;SOR=2.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	6743634	rs339407	G	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.776;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=582;ReadPosRankSum=1.462;SC=GGCGGGGGGGGGGTGCGGGGT;SOR=0.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=37;WE=6743645;WS=6743624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr19	6744762	rs339405	A	C	5394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.850;SC=AGAGGGAGGTACCCATAGGCT;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=162;WE=6744770;WS=6744752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,190:0.99:192
chr19	6751029	rs145723501	AT	A	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=329;ReadPosRankSum=0.869;SC=AAAATAATAAATTTTGCCTAA;SOR=1.981;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=6751037;WS=6751019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr19	6751279	rs1049229	A	G	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.51;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr19	6751279	.	AGC	GGT	2699	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=36;PP=2699;QD=20;SC=GGCCACGGGGAGCCCCAGGAC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=52;WE=6751301;WS=6751269;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr19	6751281	rs1049230	C	T	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.77;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr19	6751293	rs1049232	T	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=2599;ReadPosRankSum=0.875;SC=CCAGGACCTATGCACTTTATT;SOR=0.285;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=43;WE=6751301;WS=6751269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr19	6754188	rs2305807	T	C	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1411;ReadPosRankSum=0.364;SC=GGAGAAGAGATCTGAGCACGC;SOR=0.864;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=86;WE=6754196;WS=6754178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,106:0.60:177
chr19	6754774	rs168129	C	A	5745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=89;PP=2965;SC=TCAGGTGAAGCGTGATTATGT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=83;TCR=89;TR=172;WE=6754782;WS=6754764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	6755007	rs2305806	T	C	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1159;ReadPosRankSum=0.735;SC=CCTGTGGTCTTGTAAAACATC;SOR=0.802;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=88;WE=6755015;WS=6754997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,106:0.49:217
chr19	6760974	rs7258236	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=630;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AAGTCGCCATTTTGCTGAAGA;SOR=0.513;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=39;WE=6760982;WS=6760964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr19	6761008	rs7258083	A	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr19	6761011	rs7246122	T	G	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=9.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.90;ReadPosRankSum=2.826;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr19	6763718	rs2305805	A	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=485;ReadPosRankSum=0.738;SC=CGTGGTACCAAGGTTGGCCAG;SOR=0.509;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=35;WE=6763726;WS=6763708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr19	6772872	rs45448796	G	C	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=753;ReadPosRankSum=0.990;SC=GGGTGCTGCCGCCCAGCCACC;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=122;TCF=87;TCR=35;TR=47;WE=6772880;WS=6772862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr19	6820951	rs164016	C	T	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=509;SC=ATATACAAGACGCAAATAGCA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=6820959;WS=6820941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	6821931	rs906331	G	C	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1165;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GGTGGAGGGTGTGGGGGGACA;SOR=0.615;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=72;WE=6821939;WS=6821921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,77:0.57:136
chr19	6822219	rs347033	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=-1.435;SC=ATCCCTGACCTCACAACCCAC;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=14;WE=6822227;WS=6822209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr19	6825032	rs12979659	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=21;PP=784;SC=GGGAATCTTATCTTCCGTCAT;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=6825040;WS=6825022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	6833072	rs308200	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=GACCCAAAAGCCAATCAATGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=6833080;WS=6833062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	6833777	rs186295	A	G	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=51;PP=1662;SC=CCTGTGTACCACAAATAATGG;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=85;WE=6833785;WS=6833767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	6833989	rs308199	G	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=14;PP=556;SC=GTTGCTGTGTGGGGGCAGGAG;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=6833997;WS=6833979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	6836271	rs308196	A	C	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=145;SC=AAATAGTTTTACAAAGAGTAT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=6836279;WS=6836261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	6836836	rs308194	G	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=517;SC=CCATTGAGCAGAGAGATGGAC;SOR=3.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=6836873;WS=6836826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	6836844	rs6146454	GACACACACACACACACACACAC	G	1595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;NF=5;NR=3;PP=3000;SC=CAGAGAGATGGACACACACAC;SOR=3.981;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=6836873;WS=6836826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	6850767	rs36097961	C	T	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1034;ReadPosRankSum=0.276;SC=CGGGGGCTTACGGTAAGGGTC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=71;TCR=74;TR=71;WE=6850775;WS=6850757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr19	6913811	rs457857	A	G	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=81;PP=2369;SC=CTCAGCAAATATCACTCCGGC;SOR=2.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=23;TCR=81;TR=104;WE=6913819;WS=6913801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	6913878	rs462913	G	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=883;SC=TACACCTAGGGGATGATTTTG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=6913886;WS=6913868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	6919529	rs171674	T	C	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=3;PP=229;SC=AAACGATTCCTTCCTTTTTTT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=6919537;WS=6919519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	6919624	rs373533	A	C	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=21;PP=1114;SC=GCGCTTCTTCAAAGACCACCA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=6919632;WS=6919614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	6919753	rs461645	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=32;PP=1073;SC=TCTGGAGAACATTCAGGTTTG;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=6919761;WS=6919743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	6919879	rs252566	C	T	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=187;SC=CCACAATTTCCAGCAATTCAA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=6919887;WS=6919869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	6935113	rs252551	C	T	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=79;PP=2965;SC=TCACCTCCCCCCCTCTTTTAA;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=147;WE=6935129;WS=6935103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	6935121	rs1160969	T	TAA	7866.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=76;PP=2966;SC=CCCCCTCTTTTAATTTCCTCT;SOR=0.859;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=96;WE=6935129;WS=6935103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	6937683	rs388711	A	G	3342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=70;PP=2189;SC=TGCTCCCTGCAGGTGCTGGTC;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=106;WE=6937691;WS=6937673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	6939910	rs463891	G	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=792;SC=TAACATTTTAGTGTTTATCCT;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=6939918;WS=6939900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	6940189	rs464849	G	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=460;SC=TGTTGGGGGCGGTCTTCCTGT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=6940197;WS=6940179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	6954725	rs11085209	G	A	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=77;PP=2601;SC=AAATTTGAGTGGAGAGGTCCG;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=40;TCR=77;TR=117;WE=6954733;WS=6954715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	6960834	rs459883	A	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=442;SC=GAATCCAAGGAAAGAAAAGTG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=6960842;WS=6960824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	6961182	rs460698	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=726;SC=ATTTTAGATGGAGTCAGATGT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=6961190;WS=6961172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	6972204	rs112335904	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=453;ReadPosRankSum=0.085;SC=GAGGATAACTCACAAATTCTC;SOR=1.002;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=21;WE=6972212;WS=6972194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr19	6972357	rs252579	C	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=934;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CGTGGACCAGCGGCCTCCCTC;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=71;WE=6972365;WS=6972347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr19	6974564	rs466123	C	T	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=28;PP=1251;ReadPosRankSum=2.039;SC=TTCAAACCGACGGTGCCGCTC;SOR=0.967;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=162;TCF=97;TCR=65;TR=78;WE=6974572;WS=6974554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,97:0.51:192
chr19	6977211	rs4807919	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=858;ReadPosRankSum=-0.739;SC=AAATAAAACAATGATGTGTAG;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=48;WE=6977219;WS=6977201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr19	6977409	rs7255801	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=699;ReadPosRankSum=0.489;SC=AAGTCTCATACCTAAATAATT;SOR=0.307;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=41;WE=6977417;WS=6977399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr19	6980939	rs2035972	T	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=564;SC=TTTTTGAAAATGGAGTCCTTC;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=6980947;WS=6980929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	6981582	rs2035971	A	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GTGTCCCCAGACATTGACAGA;SOR=1.259;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=15;WE=6981590;WS=6981572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	6981849	rs1874003	T	C	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=57;PP=1722;SC=TCCCTTCTTCTAGTCACCCTC;SOR=4.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=6981857;WS=6981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	6981885	rs1874002	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=304;ReadPosRankSum=-1.790;SC=CTAATAATTCTGCAGCCCATC;SOR=0.392;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=18;WE=6981893;WS=6981875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr19	6984708	rs7247453	G	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=920;ReadPosRankSum=-0.679;SC=GGTTCTTACCGTAACAATCCG;SOR=0.820;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=61;WE=6984716;WS=6984698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
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chr19	6988662	rs8107779	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-2.048;SC=AAACAGCTCTTGGGACCTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=6988670;WS=6988652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
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chr19	6994972	rs10416745	G	A	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=34;PP=1778;ReadPosRankSum=0.622;SC=TCTGCAAAACGTAGCTAAGAA;SOR=1.033;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=248;TCF=163;TCR=85;TR=113;WE=6994980;WS=6994962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,136:0.46:295
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chr19	7012026	rs8108169	A	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr19	7083629	rs966591	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=406;ReadPosRankSum=-0.591;SC=ATGTTCTCTCATCCGTTAAGA;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=27;WE=7083637;WS=7083619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr19	7083761	rs8110740	A	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=430;ReadPosRankSum=-2.320;SC=TGTGAATTCAATAACTGTGGG;SOR=0.509;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=27;WE=7083769;WS=7083751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr19	7116963	rs1051690	T	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=302;SC=CTGAACTCCATTGGACATGGT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=7116971;WS=7116955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	7122511	rs34073323	AT	A	643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=662;SC=AAAAAGAAGTATCTTGCCCCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=7122519;WS=7122501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	7150418	rs2252673	C	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=379;SC=CAAAAAGCCACAGAAACCCCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=7150426;WS=7150408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	7163230	rs2245648	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AGAAAGGAAATGGGTCCATCA;SOR=0.559;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=20;WE=7163238;WS=7163220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr19	7166109	rs2059807	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.833;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=691;ReadPosRankSum=0.855;SC=GCATCAGCCTATTAAAAGCAA;SOR=1.199;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=45;WE=7166117;WS=7166099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr19	7293898	rs7508518	G	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=55;SC=GCCCCCGGTGGCCATGGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=7293906;WS=7293888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	7427607	rs11260007	T	C	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=8;PP=1056;SC=AGAATCCAGGTCCTGGCTTCC;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=7427615;WS=7427597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	7504669	rs11668829	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	7504767	rs10401415	G	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=1.033;NF=10;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GCCTGGAGGGGTTGTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=14;WE=7504775;WS=7504757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	7504982	rs10422503	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=916;ReadPosRankSum=-1.733;SC=GAGCCCCGGGCGCGAACATGG;SOR=0.746;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=53;WE=7504990;WS=7504972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr19	7506668	rs2287909	T	G	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=852;ReadPosRankSum=-2.141;SC=TCATCTCCGCTCTCTCGCGGC;SOR=0.597;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=45;WE=7506676;WS=7506658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr19	7506755	rs2287910	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=335;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTGGGGTGGCATGGCTCTGGG;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=20;WE=7506763;WS=7506745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr19	7506982	rs10424311	C	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GCCCTCCACTCTCTTCTCTGC;SOR=0.948;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=12;WE=7506990;WS=7506972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr19	7507010	rs200202576	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C,CCCTTCCTTCCTT	508.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.93;QD=39.13;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,7:0.46,0.54:13
chr19	7509436	rs12983399	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=1.308;SC=TTGCCGTGTCGCCCAGGCTGG;SOR=2.376;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=15;WE=7509444;WS=7509426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr19	7509492	rs12983450	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AACCTCTCAGGCTCAGGTGAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=7509500;WS=7509482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr19	7518268	rs11463454	T	TC	532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=596;SC=ACCTCATAGATCCACATGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=7518276;WS=7518258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr19	7531722	rs112677825	A	AAAGGAAGAAG	1299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.177;NF=15;NR=5;PP=2594;ReadPosRankSum=1.136;SC=AGTTAAAAAAAAAGAAGAAGA;SOR=0.582;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=20;WE=7531730;WS=7531712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr19	7532252	rs2303142	G	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=400;ReadPosRankSum=0.154;SC=AGGAGCGCGCGGCCCTGGAGA;SOR=1.639;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=29;WE=7532260;WS=7532242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr19	7533767	rs10405143	T	G	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=32;PP=1565;SC=AGGGCCCTCGTGTGAGCATGC;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=7533775;WS=7533757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	7533850	rs9329368	A	G	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=38;PP=1599;SC=CCCACCGAGAACCGGCTGGCC;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=7533858;WS=7533840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	7534075	rs2241396	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CAGGCTCTAGCGGCTCGCTGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=7534083;WS=7534065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	7535249	rs12972299	C	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TCTCTGGGGACCCCCATGGGG;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=6;WE=7535257;WS=7535239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr19	7538039	rs11880122	A	G	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=56;PP=2508;SC=GGCCATGAGTATGAAATCATC;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=7538047;WS=7538029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	7538117	rs11880140	A	G	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AGGGTTTCCCATCACAAGGGG;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=78;WE=7538125;WS=7538107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr19	7568966	rs113706007	A	ATCTCTCTC	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=638;ReadPosRankSum=1.925;SC=GGGAATCTCAATCTCTCTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=12;WE=7568974;WS=7568956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	7570729	.	G	A	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=21;QD=27.8856062736;SC=AGTGCTACCAGGTGGGGCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=2;WE=7570737;WS=7570719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr19	7570978	rs685034	T	C	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=687;ReadPosRankSum=-0.304;SC=ACTACTGCCCTTCAGAGTGGA;SOR=0.588;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=46;WE=7570986;WS=7570968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,65:0.54:121
chr19	7571094	rs3826735	G	T	84.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr19	7584223	rs11555037	A	G	5434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=540;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.011;SC=CTAGACCCCAATCCTGAAGAT;SOR=0.862;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=454;TCF=271;TCR=183;TR=219;WE=7584231;WS=7584213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,258:0.48:537
chr19	7593589	rs612862	C	T	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=718;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TGCTGCAGAACGTGAGGCTTC;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=49;WE=7593597;WS=7593579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr19	7594159	rs625910	G	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=571;ReadPosRankSum=-2.476;SC=CCCTACACACGCAGCCCTCAC;SOR=0.490;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=42;WE=7594167;WS=7594149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr19	7595121	rs11880842	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CCCCAGCCCCCGGTTCCTGGC;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=7595129;WS=7595113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	7606737	rs492092	G	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=21;PP=1099;SC=CGAGGAAGCTGTGGCCTCGTC;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=54;WE=7606745;WS=7606727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	7607441	rs574930	C	T	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=48;PP=1851;SC=CCCTGCCTGCCTGCAGGCTTG;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=102;WE=7607449;WS=7607431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	7607564	rs620744	T	C	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=33;PP=1865;SC=CGGGTAAGGCTTGGGACCCTG;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=83;WE=7607572;WS=7607554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	7615585	rs577219	T	G	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=138;SC=CCTCGACAACTCACACACATC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=7615593;WS=7615575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	7615682	rs66529260	GA	G	320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=355;SC=CATTTCGTTGGAAAAAGGGGA;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=7615690;WS=7615674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	7616347	rs473899	G	A	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=92;PP=2869;SC=GGCCCAGAGCGTGCTGGGAGA;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=156;WE=7616355;WS=7616337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr19	7616474	rs661825	C	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=376;SC=AAGTAGGACCCAGGTGCAGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7616482;WS=7616464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	7618660	rs508740	A	G	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=21;PP=1335;SC=CACAGGAGCAAGAATTTCAGA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=7618668;WS=7618650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	7619199	rs534464	C	G	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=45;PP=1631;SC=GGTGGGTGGGCCTGGAGCCTC;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=77;WE=7619207;WS=7619189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	7619229	rs563266	T	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	7619239	rs597582	T	C	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	7619329	rs598023	G	A	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.40;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	7619338	rs598028	G	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	7619647	rs599328	GT	CC	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=999;SC=CCCACCTCGGGTCCCGTCCTT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=20;WE=7619656;WS=7619637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	7619700	rs524530	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=16;PP=800;SC=CCCTCGCCATGGGGGTAGGCG;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=7619708;WS=7619690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	7621648	rs489056	C	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=11;PP=284;SC=ACCGCTGACGCCACGTGGGGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=7621656;WS=7621638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	7621981	rs2446176	A	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=13;PP=729;SC=CAGCGAGCCCATCGGGCCGGC;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=38;WE=7621989;WS=7621971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	7622226	rs1645800	G	A	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1447;SC=CCACACACACGCACACGCGTG;SOR=1.387;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=69;WE=7622234;WS=7622214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	7623700	rs535208	G	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=603;SC=CCGGGCCCCCGAGGGGAGCAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=7623708;WS=7623690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	7624078	rs538850	C	T	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=75;PP=2297;SC=ATAGGTGGTCCGGCTAAGCTT;SOR=1.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=106;WE=7624086;WS=7624068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	7670033	.	GGT	G	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=6.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.676;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr19	7690718	rs373630807	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=0.047;SC=CCCGAGTGTCGGAGGGAGACC;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=24;WE=7690726;WS=7690708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr19	7735089	rs10402265	G	C	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=22;PP=1454;SC=CCACGCTCCTGTGTTCCGGGC;SOR=1.367;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=7735097;WS=7735079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	7735318	rs112669651	AGATGATGAT	A	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=2589;SC=ATAAACCTGGAGATGATGATG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=7735334;WS=7735308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	7742345	rs8107661	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATGTGTGTGTGGTGTGATCAC;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=7742353;WS=7742335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	7742710	.	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=194;ReadPosRankSum=0.988;SC=AGGGAGGAAGCGATGGGGAAG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=10;WE=7742718;WS=7742700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr19	7743615	rs75848689	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AAGTTGTGGAGGGGCGATGGG;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=7743623;WS=7743605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	7743821	rs72996468	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CATAAAAAACATTGACACAAA;SOR=0.293;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=8;WE=7743829;WS=7743811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	7743879	rs4804766	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=200;ReadPosRankSum=-2.066;SC=CGTAAGTTGGCGCCCCGACAG;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=13;WE=7743887;WS=7743869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr19	7744075	rs112807024	ACC	A	151.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.37;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	7754194	rs8102872	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=602;ReadPosRankSum=0.204;SC=TGTGGCCAGCCGGTCGCACAC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=34;WE=7754202;WS=7754184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr19	7763703	rs2287866	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=391;ReadPosRankSum=-1.105;SC=TCTGAGTCCCACGCCTGCAAC;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=29;WE=7763711;WS=7763693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr19	7763878	rs12981234	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TCTCAGTGGACCCCCAGCTCC;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=9;WE=7763886;WS=7763868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	7764157	rs12984870	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=325;SC=CTCCCCAGCCACTTTCCCAGG;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=7764165;WS=7764147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	7764363	rs61499635	GTTTTT	G	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.11;MQRankSum=2.050;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr19	7764436	rs12980031	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.473;NF=3;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=0.651;SC=CCCTCAATTTGCCACTCCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8;WE=7764444;WS=7764426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	7764545	rs3214456	G	GC	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=1.734;SC=GGACTGGGGAGCCCCGCTTCT;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=8;WE=7764553;WS=7764535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
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chr19	7795813	rs6603117	G	A	40.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=10.02;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr19	7833876	rs62128260	T	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=642;ReadPosRankSum=0.670;SC=GACGAATAGTTGTTTCCCTGC;SOR=0.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=37;WE=7833884;WS=7833866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr19	7912816	rs2307003	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.297;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=0.451;SC=AGGTGGGGGGCGGCCAGGCAG;SOR=0.143;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=25;WE=7912824;WS=7912806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr19	7913752	rs3826742	C	T	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=16;PP=1322;SC=TGGGTGGCCACGGGGAGGCTG;SOR=2.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=7913760;WS=7913742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr19	7936208	rs525420	A	G	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=68;PP=2965;SC=AGAAGGTGAGATCAAAGAAGC;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=164;WE=7936216;WS=7936198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	7937967	rs56119987	A	G	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=521;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CTTTCACCCAATTTGTGCCCA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=31;WE=7937975;WS=7937957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr19	7938223	rs62125153	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.604;NF=13;NR=14;PP=455;ReadPosRankSum=0.261;SC=GCCCCGGAGAGGTGGCAGTGG;SOR=0.601;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=27;WE=7938231;WS=7938213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr19	7938306	rs58971992	A	AG	2842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=34;PP=2005;SC=CTGGGGTACCAGGTTTCGGGA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=45;WE=7938314;WS=7938296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr19	7944849	rs11260038	A	C	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=49;PP=1629;SC=GACAGATGGAATTGACGTGAG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=7944857;WS=7944839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr19	7976529	rs2303700	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GGGGAGGCAATGGCAGGAGGG;SOR=0.627;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=7976537;WS=7976519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr19	7986638	rs475002	C	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=639;ReadPosRankSum=1.973;SC=GGAAGAAGCCCTGGCAGTGGC;SOR=0.881;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=45;WE=7986646;WS=7986628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
chr19	7992249	rs34491552	TG	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr19	7997870	rs4804243	C	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=658;ReadPosRankSum=0.251;SC=GAAACACAACCCTCCCTCACA;SOR=1.095;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=40;WE=7997878;WS=7997860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
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chr19	8032680	rs1077340	C	T	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=845;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CAAACCTTTTCAACAAATCAA;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=63;WE=8032688;WS=8032670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,79:0.46:173
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chr19	8122767	rs2303165	T	C	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=68;PP=2770;SC=TCAGCAGCAGTAAGAGGAATG;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=8122775;WS=8122757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	8127075	rs34145389	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-3.794;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr19	8131034	rs148313867	T	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1244;ReadPosRankSum=2.033;SC=TCCGGCCCTCTAGACCCTCCA;SOR=0.795;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=84;WE=8131042;WS=8131024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,87:0.46:190
chr19	8136839	rs73005512	G	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=0.726;SC=GCTCCTTCTTGGGGGGGCTGA;SOR=0.301;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=8136847;WS=8136829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	8137102	rs7256904	G	T	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=100;PP=2895;SC=GATGGGCAGGGTGGAGGGGTT;SOR=2.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=24;TCR=100;TR=124;WE=8137110;WS=8137092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
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chr19	8137850	rs376197094	CGTGTGT	C	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.563;NF=8;NR=1;PP=400;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CACAAAGCCCCGTGTGTGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=9;WE=8137863;WS=8137840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
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chr19	8156290	rs8104453	A	G	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=883;ReadPosRankSum=0.991;SC=TTTTCTGGGCAATCTGACCCT;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=67;WE=8156298;WS=8156280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,81:0.49:166
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chr19	8162121	rs45624733	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=441;ReadPosRankSum=1.685;SC=TGCACAGTGGCGGACATGCAT;SOR=1.401;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=31;WE=8162129;WS=8162111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
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chr19	8167873	rs56921504	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=0.320;SC=TGGCTTGTCCAGGCACAGTGG;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=10;WE=8167881;WS=8167863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr19	8168399	rs4289098	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=314;ReadPosRankSum=-2.188;SC=CCATGCCCAGGTGCTGCTTCT;SOR=0.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=22;WE=8168407;WS=8168389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr19	8168545	rs33967815	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=-0.389;SC=CCACAGATGCCGGAGTGTGTG;SOR=1.011;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=35;WE=8168553;WS=8168535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
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chr19	8196423	rs3813775	C	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=682;ReadPosRankSum=-1.376;SC=GGGGACCGGGCAGCCGGATGC;SOR=1.561;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=37;WE=8196431;WS=8196413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
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chr19	8196508	rs12974280	G	C	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=1627;ReadPosRankSum=-0.997;SC=AGCAGCACTCGGACTTGGTGA;SOR=0.898;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=48;WE=8196516;WS=8196489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr19	8197865	rs11666450	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=307;ReadPosRankSum=-0.963;SC=GCTCCAGGCTCACCCATGCAG;SOR=0.705;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=18;WE=8197873;WS=8197855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
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chr19	8206553	rs73922237	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=320;SC=GCCCCCCAGGTCATGAGTCAC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=8206561;WS=8206543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr19	8207070	rs12162237	G	A	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=83;PP=2698;SC=GCCCCTGTCTGGAGATCTCTG;SOR=1.152;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=49;TCR=83;TR=132;WE=8207078;WS=8207060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	8209926	rs899208	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=366;SC=ACAGCAAGCCTGTCTTCACCC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=8209934;WS=8209916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	8315847	rs379983	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=395;SC=CTGGTTGTCAACTGCGCTGAT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=8315855;WS=8315837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	8321182	rs28334	A	T	898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=-0.872;SC=TGAGTGGCAGAGTGTGTGTGA;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=42;WE=8321190;WS=8321172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,49:0.43:115
chr19	8321946	rs36247	T	C	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=40;PP=980;SC=ACGATTCCTCTGACTACCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=51;WE=8321954;WS=8321936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	8321969	rs36248	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GAGGTGGGCCCGACCCCTGCC;SOR=0.458;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=14;WE=8321977;WS=8321959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	8322594	rs36250	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.822;NF=9;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GATTACAGGCGTGAGCCACCA;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=8322602;WS=8322584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr19	8326904	rs36259	G	A	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=39;PP=1546;SC=AAAGAACGGGGCAGCTGGAGG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=8326912;WS=8326894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	8367033	rs250510	T	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=135;SC=CAACTTTAATTGCCACCCTCA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=8367041;WS=8367023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	8367525	rs2227288	G	C	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=31;SC=GTAAGGAGGGGGAAGGCAAGA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=8367533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	8370120	rs2232778	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=614;SC=CTGGCTGTGATCCGCAGGAGA;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=8370128;WS=8370110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	8376204	rs35669830	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CAGGAGGATCGCTTGAGGCCA;SOR=1.518;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=8376212;WS=8376194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	8381489	rs12986323	T	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=836;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TTGGAGAGCTTGTGGCTAGGA;SOR=0.530;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=50;WE=8381507;WS=8381479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,67:0.54:123
chr19	8386701	rs2241590	G	A	5207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=88;PP=2965;SC=ATTTCATCACGGGGTTCTGAT;SOR=0.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=84;TCR=89;TR=172;WE=8386709;WS=8386691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr19	8387207	rs1057232	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=36;PP=985;SC=GTCTGTCACAGTCTGCTCCTT;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=8387215;WS=8387197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	8387809	rs71702233	GGA	G	2474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=40;PP=1996;SC=GACTCGCTCTGGAGAGAGGGG;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=43;WE=8387818;WS=8387799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	8388310	rs11260079	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=18;PP=638;SC=TGCCAGGCGCGATGGCTCACA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=8388318;WS=8388300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	8388380	rs11260080	G	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=430;SC=AACCTGGGAGGTGGAGGTTGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=8388388;WS=8388370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	8389405	rs12981073	G	A	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=36;PP=1640;SC=CAGCCTCCAGGGCGATGGCCA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=8389413;WS=8389395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	8389892	rs111905975	GTCC	G	4548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.245;NF=7;NR=95;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.618;SC=CCACAGCCATGTCCTCCTCTT;SOR=1.361;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=7;TCR=103;TR=102;WE=8389902;WS=8389882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr19	8398006	rs7249069	C	T	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=47;PP=1924;SC=GCCAGCAGTTCGGGTCCCAGG;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=109;WE=8398014;WS=8397996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	8398121	rs7248298	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=633;SC=CGCCCTGCAAGGGACAGGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=8398129;WS=8398111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	8399272	rs8106699	G	A	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=62;PP=2588;SC=CAGGTGTGCCGTCTCTCTTCT;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=134;WE=8399280;WS=8399262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	8399628	rs710949	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=10;PP=414;SC=GGTGCTCCAGACTGGCGCGCA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=8399636;WS=8399618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	8400651	rs11669559	C	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=19;NR=29;PP=875;SC=CGGCGGGGACCGGGCACAGGC;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=8400659;WS=8400641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	8402473	rs2017507	G	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=529;SC=CAAGTGATCCGCCCACCGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=8402481;WS=8402463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	8402505	rs1807414	C	T	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=826;SC=GCTGGGATTACAGGCATGAGC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=8402513;WS=8402495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	8402603	rs737229	C	T	3348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=49;PP=2142;SC=CTGTAGGCTGCGTCCACACAC;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=111;WE=8402611;WS=8402593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	8402642	rs737228	C	T	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=60;PP=2447;SC=TCTGTGCATGCGCACACACAC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=8402650;WS=8402632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	8438716	rs11672433	G	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=638;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GCTACTACCCGCTGCAGGCCA;SOR=0.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=41;WE=8438724;WS=8438706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr19	8454318	rs28364584	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=66;ReadPosRankSum=-1.366;SC=AAAAGAGGGGTAGTGGTAGGA;SOR=1.012;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=8;WE=8454326;WS=8454308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr19	8486953	rs10469477	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=0.720;SC=TCTCTCTGGGCGCAGTGAGTT;SOR=0.667;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=27;WE=8486961;WS=8486943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr19	8503574	rs11259981	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=9;PP=222;SC=GACACCATGCAGAGCCTAGTC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=8503582;WS=8503564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	8528277	rs3764570	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=379;ReadPosRankSum=0.151;SC=TGTGACATAAATCATATTTTT;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=22;WE=8528285;WS=8528267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr19	8528310	rs8102587	A	G	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=17;PP=1324;SC=ACTGTCATTGATATTTACTAT;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=8528318;WS=8528300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr19	8536373	rs12973706	A	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=17;PP=623;SC=AATTATTGGGACAACTGGACT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=8536381;WS=8536363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr19	8576307	rs2910443	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GGTATCCACCAGACCCCGCAG;SOR=0.998;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=16;WE=8576315;WS=8576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr19	8576888	rs2042302	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=1.119;SC=CCTCCAGGGGCACCAGGGAGA;SOR=0.194;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=15;WE=8576896;WS=8576878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr19	8576947	rs73002688	G	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-1.645;SC=ACGGAGCCTGGGCACTAATCA;SOR=0.175;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=8576955;WS=8576937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr19	8576969	.	C	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
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chr19	8579081	rs2287862	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=1.216;SC=CTGCGCAGGGCGCTCGGAGAG;SOR=0.807;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=14;WE=8579089;WS=8579071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr19	8601959	rs34256101	G	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=908;ReadPosRankSum=0.541;SC=AAGTGAAGACGGGTGGGTGGG;SOR=0.522;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=52;WE=8601967;WS=8601949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr19	8610681	rs117536602	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=959;ReadPosRankSum=1.410;SC=ACCCTTCCCCCCATGTCCTCT;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=58;WE=8610689;WS=8610671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr19	8645786	rs7252299	A	C	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=1031;SC=CCTAGTGGCCATGGCAGGTTT;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=8645794;WS=8645776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	8662350	rs7248483	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	8808373	rs4804079	G	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1080;ReadPosRankSum=1.205;SC=GCGGTCAGGTGGTTGCCCGCC;SOR=0.962;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=57;WE=8808381;WS=8808363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr19	8808900	rs10410943	A	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=853;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AATAACCACCACGCCGGTCTT;SOR=0.868;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=58;WE=8808908;WS=8808890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,69:0.39:177
chr19	8808942	rs2340550	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=685;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CATGCCGGGGAAGTCCCGCTG;SOR=0.531;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=50;WE=8808950;WS=8808932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,58:0.32:179
chr19	8841558	rs28324	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1184;ReadPosRankSum=0.025;SC=CCCGGCTCCATACACCCATGT;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=69;WE=8841566;WS=8841548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr19	8923117	rs250315	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=419;SC=CCAGGAACACAGCATTCTCAA;SOR=2.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=8923125;WS=8923107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	8932092	rs2910347	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.063;NF=0;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=0.105;SC=AGCACGAGATGTTGGGGGGGG;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=11;WE=8932100;WS=8932082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	8953801	rs2969292	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=946;ReadPosRankSum=1.097;SC=AATTTCTGGTTACTGAGGAAG;SOR=0.827;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=76;TCR=45;TR=57;WE=8953809;WS=8953791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr19	8953922	rs2972588	C	T	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1427;ReadPosRankSum=-1.516;SC=CCAAGAAGGCCGTCCTGAAAA;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=96;TCR=121;TR=97;WE=8953930;WS=8953912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,112:0.46:243
chr19	8961981	rs1035442	C	G	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=1409;ReadPosRankSum=1.350;SC=CATGTGATGACTCCCAGGAGT;SOR=0.607;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=205;TCF=90;TCR=115;TR=100;WE=8961989;WS=8961971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,127:0.50:256
chr19	8962389	rs72999925	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=137;ReadPosRankSum=0.895;SC=TCTGTTGGGAGAATACCCTAG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=10;WE=8962397;WS=8962379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
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chr19	8992980	.	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-3.618;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.249;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
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chr19	8992988	rs371102230	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-3.726;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,2:0.12:16
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chr19	8994373	rs873869	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=406;ReadPosRankSum=1.038;SC=TAGGTGGAACAAGACAAGGTG;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=25;WE=8994381;WS=8994363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr19	8995853	rs11672574	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCTCAGATCTTTCCCTCATG;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=5;WE=8995861;WS=8995843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	8998532	rs57902801	T	C	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=561;SC=GTGTCCCCTTTCTTATCCCTA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=8998540;WS=8998522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr19	8998763	rs375722672	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=7.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-7.915;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,15:0.15:101
chr19	8998766	.	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=2.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-8.556;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,13:0.13:100
chr19	8998775	.	G	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-7.921;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,11:0.12:91
chr19	8998782	.	T	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.969;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-6.400;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,13:0.15:84
chr19	8998830	.	G	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=6.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-5.586;QD=9.29;ReadPosRankSum=-2.442;SOR=1.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr19	8998832	.	AT	A	406.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.889;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=15.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-6.639;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.791;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,14:0.21:68
chr19	8998834	.	T	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=15.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-6.436;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.573;SOR=3.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,13:0.20:66
chr19	8998837	.	T	TGA	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=12.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-6.162;QD=4.87;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,12:0.19:63
chr19	8998839	.	GAC	G	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=10.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-5.862;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=2.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr19	8998851	.	T	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.077;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-5.303;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,7:0.13:54
chr19	8998857	.	G	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-4.750;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=2.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,6:0.12:50
chr19	8998863	.	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-4.643;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=2.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,6:0.12:48
chr19	8998867	.	G	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-5.029;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=2.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,5:0.11:46
chr19	8998870	.	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-4.467;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,4:0.09:44
chr19	8999383	rs79909361	A	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-9.036;QD=7.25;ReadPosRankSum=-3.536;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,40:0.23:171
chr19	8999386	rs77049866	A	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-9.279;QD=7.09;ReadPosRankSum=-2.673;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,39:0.22:174
chr19	8999429	.	G	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-7.935;QD=2.13;ReadPosRankSum=1.991;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,27:0.11:236
chr19	8999438	rs77891947	A	T	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=2.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-9.511;QD=8.82;ReadPosRankSum=2.846;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,63:0.27:236
chr19	8999441	rs80293661	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-5.876;QD=3.80;ReadPosRankSum=2.290;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,38:0.15:246
chr19	8999443	.	T	C	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-5.876;QD=3.71;ReadPosRankSum=2.574;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,38:0.15:246
chr19	8999449	rs76798407	G	T	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-10.435;QD=8.46;ReadPosRankSum=2.889;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,66:0.26:253
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chr19	9003706	rs11085778	T	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=933;ReadPosRankSum=-1.275;SC=GTAAAAGGTGTGGAAACAAAC;SOR=0.916;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=60;WE=9003714;WS=9003696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
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chr19	9005041	rs62118260	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=405;ReadPosRankSum=1.012;SC=TCAGCTGGGATTCTGATTAGC;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=27;WE=9005049;WS=9005031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
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chr19	9007748	rs11673136	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;ReadPosRankSum=1.047;SC=TATGAGGAGGAGTAGCTCCTG;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=17;WE=9007756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr19	9009570	rs80323209	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=8.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-6.457;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,15:0.21:70
chr19	9009581	.	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-7.510;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,14:0.18:77
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chr19	9010720	rs73005893	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-8.868;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.965;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,26:0.13:203
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chr19	9010743	.	G	GC	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-8.014;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.566;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,22:0.13:172
chr19	9010748	.	A	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=2.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-6.758;QD=1.55;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,17:0.10:169
chr19	9012840	.	G	A	763	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=27;MQ=47.98;NF=49;NR=13;PP=763;QD=12.8672776217;SC=TGTCCTCCTCGTACTGCAGGT;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=197;TCF=130;TCR=67;TR=62;WE=9012848;WS=9012830;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:135,62:0.31:197
chr19	9012905	.	T	TG	1597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=7.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-14.173;QD=6.44;ReadPosRankSum=3.925;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,53:0.21:248
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chr19	9012918	rs75899847	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=5.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-13.590;QD=6.72;ReadPosRankSum=3.482;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,51:0.22:237
chr19	9012930	rs76135098	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=10.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-13.764;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.596;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,45:0.21:211
chr19	9012937	.	A	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=12.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-13.304;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,45:0.23:198
chr19	9012947	.	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=16.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-12.627;QD=7.22;ReadPosRankSum=-2.464;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,41:0.23:180
chr19	9012958	rs76003547	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.873;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.441;NF=18;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-4.593;SC=GAGTTTGCAATAGACTTATCT;SOR=0.415;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=163;TCF=42;TCR=121;TR=59;WE=9012966;WS=9012898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,24:0.16:150
chr19	9012982	.	GA	AC	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=7.899;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-8.576;QD=0.77;ReadPosRankSum=-2.856;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,7:0.09:75
chr19	9016830	.	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.577;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.046;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CTGGGTCTGTCTTTGGAGCTG;SOR=0.236;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=36;WE=9016838;WS=9016820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr19	9016986	.	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-7.644;QD=0.91;ReadPosRankSum=-3.040;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,5:0.08:60
chr19	9016991	.	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-8.029;QD=0.60;ReadPosRankSum=-2.565;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,6:0.09:66
chr19	9016999	.	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-8.513;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.766;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,7:0.09:74
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chr19	9017005	.	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-9.028;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,7:0.08:83
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chr19	9019353	.	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=-5.633;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.590;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,9:0.09:103
chr19	9021118	.	C	T	2051	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=17;MQ=48.87;NF=30;NR=34;PP=2051;QD=32.590175196;SC=CATGTCCTCCCCATACTGCAG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=64;WE=9021146;WS=9021086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:104,64:0.38:168
chr19	9021159	.	T	C	703	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=50.22;NF=8;NR=37;PP=703;QD=16.3949158344;SC=GGGTGAATGGTACCAGGAGAG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=45;WE=9021167;WS=9021149;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:111,45:0.29:156
chr19	9024758	rs1862463	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=525;SC=GGGAGTGTGATCTCTAGTTAG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=9024766;WS=9024748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	9024994	rs67631215	C	T	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=45;PP=1255;SC=CCATCTTTCTCGGGCCTGGGG;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=64;WE=9025002;WS=9024984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	9025826	rs7256118	T	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=694;SC=TGGAGTAAAGTGGCATGATCT;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=9025834;WS=9025816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	9027148	rs117188963	C	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=0.318;SC=TATGATTTTCCATCTTCATCT;SOR=0.235;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=23;WE=9027156;WS=9027138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr19	9028242	rs199790313	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=32.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-9.458;QD=1.10;ReadPosRankSum=-2.234;SOR=4.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,9:0.10:91
chr19	9028245	rs200670536	G	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=34.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-9.771;QD=0.66;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=4.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,9:0.09:97
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chr19	9028432	rs10411029	C	T	4503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=88;PP=2959;SC=GTCCATCCACCTCTCCATCCT;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=143;WE=9028440;WS=9028422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	9033314	rs76381387	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	9048342	rs10854118	C	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GGGGTCACCACTCCTGATACC;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=60;WE=9048350;WS=9048332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr19	9048895	rs2012761	A	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.305;NF=26;NR=30;PP=930;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CTTCCCCATGACTGGTGGCCA;SOR=0.612;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=56;WE=9048903;WS=9048885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,64:0.40:162
chr19	9057408	rs1423051	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=565;ReadPosRankSum=0.304;SC=TTCCACAAAGAGAGAGCTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=39;WE=9057416;WS=9057398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,42:0.30:140
chr19	9057687	rs1895364	A	G	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AGGGATGTGTATTCTATTAGA;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=55;WE=9057695;WS=9057677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr19	9058907	rs1833777	G	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=729;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TTTCAAAAACGTGAATTGCCT;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=40;WE=9058915;WS=9058897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr19	9059159	rs12462651	T	G	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1398;ReadPosRankSum=0.916;SC=GAGGGCTGTTTTTTTCCACAG;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=99;TCR=88;TR=90;WE=9059167;WS=9059149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,115:0.49:236
chr19	9059307	rs12461695	C	T	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=2074;ReadPosRankSum=3.164;SC=GGTAAAGGTACCCTGCGAGGT;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=274;TCF=128;TCR=146;TR=132;WE=9059315;WS=9059297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,150:0.50:303
chr19	9059808	rs7508222	A	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=758;ReadPosRankSum=-2.549;SC=GACTTCAGTGATGGCCAGTAT;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=47;WE=9059816;WS=9059798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
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chr19	9060605	rs2194168	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=739;ReadPosRankSum=1.263;SC=CTTGTCTAGCGCTGATGGTGC;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=44;WE=9060613;WS=9060595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
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chr19	9068530	rs7250080	C	T	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1269;ReadPosRankSum=0.251;SC=GTGGTCCCCACATTGGCCACT;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=80;TCR=99;TR=77;WE=9068538;WS=9068520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,87:0.43:201
chr19	9070079	rs1559170	C	G	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1466;ReadPosRankSum=0.554;SC=TCTCCTCAGACGTCCTGGTGT;SOR=1.029;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=83;WE=9070087;WS=9070069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,95:0.50:190
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chr19	9070225	rs1559172	G	C	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.109;SC=TTGGATGTGTGTGAATCAGCT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=244;TCF=108;TCR=136;TR=95;WE=9070233;WS=9070215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,106:0.38:282
chr19	9070837	rs2547067	G	A	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1217;ReadPosRankSum=1.733;SC=GCTATTGTGGGCCGATCAAGG;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=77;WE=9070845;WS=9070827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr19	9071763	rs10422567	T	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=751;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GCTAGAAGAGTTGACCCCTGT;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=53;WE=9071771;WS=9071753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr19	9075565	rs17000836	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=465;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GAAGCATGTTCGGAACTTGTG;SOR=0.603;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=30;WE=9075573;WS=9075555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
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chr19	9077196	rs7254941	C	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.063;SC=ATCCACAGATCGACTTGTCTG;SOR=0.757;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=66;WE=9077204;WS=9077186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr19	9080343	.	GAAAGAAAAGA	G	850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.843;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr19	9080362	rs200183504	G	GAA	1752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.89;MQRankSum=2.247;QD=22.76;ReadPosRankSum=-2.440;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
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chr19	9082514	rs17000871	C	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=757;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TCTTCTTCTGCAATGGTCTGG;SOR=0.664;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=49;WE=9082522;WS=9082504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr19	9083791	rs60106152	G	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=2.965;SC=AAGACTATCCGAAGCTATAGT;SOR=1.069;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=33;WE=9083799;WS=9083781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,39:0.41:96
chr19	9084401	rs142278154	C	T	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=933;ReadPosRankSum=-0.460;SC=AAAGTTCTTACTGGTCTAGAC;SOR=1.040;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=53;WE=9084409;WS=9084391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,61:0.39:155
chr19	9085958	rs1108380	A	G	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1270;ReadPosRankSum=1.934;SC=TCTGGTCCTGAGGTTATGCCT;SOR=0.474;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=71;WE=9085966;WS=9085948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr19	9086145	rs45611441	G	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=659;ReadPosRankSum=1.720;SC=TGTGAGTGCTGTTTCCCATAG;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=39;WE=9086153;WS=9086135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
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chr19	9088017	rs1596797	T	G	6586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=106;PP=2965;SC=CCATGGTAAGTTTGATGGTGC;SOR=0.898;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=198;WE=9088025;WS=9088007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
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chr19	9204307	rs4804097	A	G	8324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=103;PP=2965;SC=TCTGCCACCCATTGCACTACG;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=169;TCR=103;TR=272;WE=9204315;WS=9204297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr19	9212864	rs4804399	A	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=382;SC=GGAGACAGAGAAAGACTCCAT;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=9212872;WS=9212863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	9213026	rs4804400	T	C	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=42;PP=2268;SC=TCAAGGTTCCTTTCATGTCCT;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=105;WE=9213034;WS=9213016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	9213079	rs4804401	A	C	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=50;PP=2851;SC=ATTTGAGGGAACACAGAATAC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=132;WE=9213087;WS=9213069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	9213132	rs12610094	A	G	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=69;PP=2965;SC=GTCAGTAACCACAGAACTAAT;SOR=1.042;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=166;WE=9213140;WS=9213122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	9225387	.	GAAAAA	G	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.943;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr19	9346427	rs1968136	T	C	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=95;PP=2965;SC=TATGTGGCCATGGCACTGCTG;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=184;WE=9346444;WS=9346417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	9346599	rs1985937	C	G	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=60;PP=2530;SC=GGGTCTATCTCAGTTCTGCTG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=113;WE=9346620;WS=9346589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	9408811	rs55772378	AT	A	122.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	9434930	rs10411624	T	C	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=100;PP=2965;SC=TGGGCGGCGTTCGGTGGTGTC;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=61;TCR=100;TR=161;WE=9434938;WS=9434909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	9435320	rs368039177	GA	G	450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=18.78;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	9448917	rs8113427	T	G	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=133;SC=GATCAGTTTCTTTTTTGGCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=9448925;WS=9448907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	9449149	rs8110197	A	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=489;SC=GGATTCTCAGATTTTATTTCT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=9449157;WS=9449139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	9449337	rs8110584	G	A	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=647;SC=AGTGGAACAGGGCCCCTGCAA;SOR=1.259;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=35;WE=9449345;WS=9449327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	9452026	rs55837495	ACT	A	3754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=39;PP=2334;SC=TTTGACAAACACTCTAAACAT;SOR=0.867;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=50;WE=9452035;WS=9452016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	9489132	rs2304110	C	T	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=66;PP=2114;SC=CTTCATCTTCCGCAGCTCCCA;SOR=1.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=110;WE=9489140;WS=9489122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	9490358	rs12461520	C	T	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=462;SC=TTGGGAATGTCACTCAGTGAA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=9490366;WS=9490348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	9490814	rs2217652	C	T	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=62;PP=2666;SC=GGCATAAACACGGTAAGACTT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=131;WE=9490822;WS=9490804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	9491210	rs1347165	C	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=1;PP=394;SC=TCATACGCACCTACTGAAAAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=9491218;WS=9491200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	9492141	rs3826783	C	T	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=47;PP=2082;SC=AAGCCTTCATCGATCAGTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=9492149;WS=9492131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	9492370	rs2230752	A	T	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=50;PP=2734;SC=TTATAAATGTATTCAGTGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=132;WE=9492378;WS=9492360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	9524185	rs2241356	A	G	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=39;PP=1991;SC=GAAACTTAAAAGCTTTGCCAC;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=94;WE=9524193;WS=9524175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	9646739	rs888872	C	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=262;SC=ACAGGCAGAGCCTGACTCACA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=9646747;WS=9646729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	9673271	rs147918159	CTCT	C	821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=620;SC=CTCTCTCCTCCTCTTCCCAGG;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=9673281;WS=9673261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	9958878	rs2010457	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=21;PP=579;SC=GGTAGAGGCCAGGAGGGTCTG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=9958886;WS=9958868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr19	10071063	rs10406152	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=273;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GGCTCCCTCATGGTCCCTCCC;SOR=0.382;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=15;WE=10071071;WS=10071053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
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chr19	10077931	rs3786698	C	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CCCAGTGCTGCGCACGGAAGG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=10077939;WS=10077921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
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chr19	10080691	.	T	TG	167	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=7;PP=167;QD=25.125;SC=TATGGATGAGTGGGGTCTGTA;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=10080699;WS=10080681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,8:0.44:18
chr19	10081276	rs1895371	C	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=478;ReadPosRankSum=0.026;SC=GCTGAGGACCCAGGAGGTGGC;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=35;WE=10081284;WS=10081266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr19	10081322	rs61729461	G	A	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=4.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,80:0.56:142
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chr19	10084292	rs2287813	C	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=468;ReadPosRankSum=1.389;SC=AGCGTCCCCTCGCTCACCCTG;SOR=0.448;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=32;WE=10084300;WS=10084282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr19	10084551	rs2287811	T	G	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1437;ReadPosRankSum=0.394;SC=TAGGAAATGGTTGTCCCCATC;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=192;TCF=89;TCR=103;TR=96;WE=10084559;WS=10084541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,118:0.50:238
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chr19	10087886	rs114827216	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.246;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=1.191;SC=ACCCTGCCCCACTGGGGACCT;SOR=1.964;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=11;WE=10087894;WS=10087876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr19	10088204	rs115981461	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=0.300;SC=GCAGGAGCCATGTCCTGGGAT;SOR=0.789;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=38;WE=10088212;WS=10088194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr19	10088271	rs2161468	C	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=393;ReadPosRankSum=1.186;SC=GTCACTTACCCGGGACCCCTT;SOR=0.685;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=30;WE=10088279;WS=10088261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr19	10089262	rs12610207	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=320;ReadPosRankSum=0.143;SC=TGGCCCCCACGGGCCCTGGGG;SOR=1.588;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=20;WE=10089270;WS=10089252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr19	10090467	.	GAA	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5239;HP=19;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=26;MQ=57.57;NF=0;NR=5;PP=47;QD=10.2;SC=GTCTCAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=5;WE=10090476;WS=10090457;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	10090649	rs11879687	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=257;ReadPosRankSum=0.716;SC=CCCAACCCCCAATGAGGGTGA;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=17;WE=10090657;WS=10090639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr19	10091267	rs144086896	A	ATCTC	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=558;ReadPosRankSum=-1.450;SC=TCCACTCAGAATCTCTCTCTC;SOR=0.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=10;WE=10091275;WS=10091257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	10091294	.	T	TCA	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.001;NF=9;NR=5;PP=437;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ACACACACATTCACACACACA;SOR=0.593;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=14;WE=10091302;WS=10091284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr19	10096482	rs11670705	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=1.696;SC=GAATCCTGCCCATATCCATCT;SOR=0.073;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=13;WE=10096490;WS=10096472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr19	10096681	rs11670525	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr19	10096686	rs1862473	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.07;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr19	10097187	rs60604169	G	GC	1115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=833;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TCTTCCCCGAGCCCCCAGACC;SOR=0.893;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=26;WE=10097195;WS=10097177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr19	10097443	rs111955359	T	TAA	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.91;MQRankSum=3.128;QD=6.93;ReadPosRankSum=-2.100;SOR=0.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr19	10097536	rs8113693	G	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=1.870;SC=CCCAAGAGGAGGCTAGGCAGA;SOR=1.276;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=17;WE=10097544;WS=10097526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
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chr19	10102676	rs7252953	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=431;ReadPosRankSum=1.132;SC=CACAGGGCACATACCACATTG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=35;WE=10102684;WS=10102666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr19	10103583	rs2010448	C	T	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1037;ReadPosRankSum=1.228;SC=GAATTATTTCCACATCACCTC;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=69;WE=10103591;WS=10103573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,82:0.46:180
chr19	10103892	rs11672571	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=420;ReadPosRankSum=0.151;SC=TTCCATTCAGGCCCCTGACTC;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=23;WE=10103900;WS=10103882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr19	10106671	rs3745592	C	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=688;ReadPosRankSum=-0.395;SC=TTTCCCCATCCAGCACTGTAT;SOR=0.418;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=52;WE=10106679;WS=10106661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr19	10106871	rs10415783	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=0.923;SC=CCACGCAGTCGCCTTACTCAC;SOR=0.184;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=35;WE=10106879;WS=10106861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr19	10106936	rs1559186	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=169;ReadPosRankSum=0.027;SC=CTTTCATAGAGAGCTGGAAAG;SOR=0.446;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=12;WE=10106944;WS=10106926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	10108714	rs7254800	G	A	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=999;ReadPosRankSum=0.407;SC=GAAGGGAGAAGTGAGTGTCGG;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=69;WE=10108722;WS=10108704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr19	10108850	rs3745594	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.920;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr19	10108861	rs3745595	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=1252;ReadPosRankSum=1.937;SC=GAGAAAAGAGATGTGAACTTG;SOR=0.422;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=31;WE=10108869;WS=10108840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr19	10108908	rs143525824	GCA	G	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=161;ReadPosRankSum=0.496;SC=ACACACACTTGCACACACACA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=5;WE=10108919;WS=10108898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr19	10112091	rs113865073	C	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CCAAAGTGTTCGGATTACAGG;SOR=0.960;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=14;WE=10112099;WS=10112081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr19	10112346	rs2287803	T	C	6997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=94;PP=2965;SC=TCCAAGCTCCTCTGAGAACGT;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=115;TCR=94;TR=209;WE=10112354;WS=10112336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr19	10114893	rs73007122	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=182;ReadPosRankSum=1.348;SC=CCCCTAACCCCCAGCAGTCCT;SOR=0.235;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=10114901;WS=10114883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr19	10116076	rs11085529	G	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=2;PP=466;SC=CACAATCACAGGCTGCAACGG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=10116084;WS=10116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr19	10116508	rs2303098	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=289;ReadPosRankSum=0.646;SC=GGGGAGGGGGCGGAAGGGGTC;SOR=0.923;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=21;WE=10116516;WS=10116498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr19	10116703	rs11085530	A	G	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=994;ReadPosRankSum=0.487;SC=AGGGCCCAGCAGTGCCTCCCT;SOR=0.846;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=72;WE=10116711;WS=10116693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,97:0.49:197
chr19	10127668	rs2233792	C	T	79.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=1.282;SC=ATCACAGACACGTGGCGCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=10127676;WS=10127658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	10129262	rs1644733	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.907;SC=GTTTAAAGGTTACCAAGGTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=10129270;WS=10129252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	10131999	rs1644731	T	C	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1274;ReadPosRankSum=2.003;SC=CAGGTTTCTATGGCTGAGTTC;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=78;WE=10132007;WS=10131989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,88:0.54:163
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chr19	10157743	rs77259842	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr19	10169477	rs11667515	G	A	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1795;ReadPosRankSum=1.860;SC=CCTCCCTCTGGCCCTCTAGAA;SOR=0.466;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=76;WE=10169485;WS=10169467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr19	10192425	rs112439574	G	GGAA	840.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.86;QD=42.04;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr19	10218524	rs2305791	C	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.785;SC=CCTTCCAGGTCAAGAAGGTGA;SOR=0.684;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=65;WE=10218532;WS=10218514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,83:0.54:153
chr19	10221151	rs2305792	C	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=670;ReadPosRankSum=0.501;SC=ACCCGCGTCTCTTGGCTCAGT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=41;WE=10221159;WS=10221141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr19	10221907	rs144495354	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=0.397;SC=ATGTGGCCCTCGGTTTCCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=10221915;WS=10221897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	10222558	rs2010353	G	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=204;ReadPosRankSum=0.051;SC=GAGGTCGAGGGGGGTGGAACA;SOR=1.270;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=13;WE=10222566;WS=10222548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
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chr19	10224580	rs117405797	T	C	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.254;SC=ACTGGCGCTATGGGGAGGCCG;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=97;WE=10224588;WS=10224570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,103:0.43:240
chr19	10225682	rs3816556	G	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.857;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1017;ReadPosRankSum=1.544;SC=AGAACAAAAAGAACCAAGTAG;SOR=1.008;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=159;TCF=90;TCR=69;TR=70;WE=10225690;WS=10225672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,88:0.43:207
chr19	10225777	rs7401	A	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.06;MQRankSum=0.911;NF=36;NR=43;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.687;SC=CCGAGTACACAGTGGCAGCTG;SOR=0.431;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=79;WE=10225785;WS=10225767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,100:0.55:181
chr19	10226052	rs2305795	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.247;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=349;ReadPosRankSum=0.984;SC=AAAACCAGCCGGGGGACTGTT;SOR=1.688;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=19;WE=10226060;WS=10226042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr19	10226256	rs7710	A	G	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=958;ReadPosRankSum=-1.444;SC=TGATGAAGGCAAAGCCCTGTG;SOR=0.910;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=59;WE=10226264;WS=10226246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr19	10226340	rs71188883	GTGCC	G	3033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.552;NF=11;NR=37;PP=2135;ReadPosRankSum=0.545;SC=CAGCCCCACCGTGCCTGCCTG;SOR=0.599;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=48;WE=10226351;WS=10226330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr19	10229297	rs11667630	C	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=403;ReadPosRankSum=0.753;SC=TCCGGGAGCACGGTTTTCCAA;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=23;WE=10229305;WS=10229287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr19	10229521	rs2290687	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=510;ReadPosRankSum=-0.461;SC=AGGGTCCCCACTCCCTGCACC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=33;WE=10229529;WS=10229511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr19	10229726	rs149991692	TGGCAGTCCTCACTCACCTCCC	T	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.505;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr19	10230032	rs112407609	C	T	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1480;ReadPosRankSum=1.391;SC=GATGGGAGATCCCTCGTAGGA;SOR=0.523;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=83;WE=10230040;WS=10230022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr19	10251747	rs2290684	A	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=26;PP=1934;SC=GTTACAGAAGAATAACTTGAA;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=10251755;WS=10251737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	10260358	.	GAGA	G	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=736;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CGGGCATGGGGAGAAAGTTCT;SOR=0.473;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=9;WE=10260372;WS=10260348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr19	10265312	rs721186	T	C	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=53;PP=2145;SC=GCATGCAGGGTGTCAGGAAGA;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=117;WE=10265320;WS=10265302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	10270746	rs3079962	GA	G	1500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.272;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.136;NF=12;NR=47;PP=612;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CGTTCTGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.129;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=126;TCF=21;TCR=105;TR=59;WE=10270755;WS=10270736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,76:0.53:143
chr19	10334443	rs2116941	A	C	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=3;PP=148;SC=AGTAGCCCCAAGTCTCTATCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=10334451;WS=10334442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	10334663	rs2116942	T	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.800;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=598;ReadPosRankSum=-0.077;SC=ACCCCCGGCCTCCAGCACTGC;SOR=0.327;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=39;WE=10334671;WS=10334653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr19	10363455	rs35087032	C	CT	1417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.221;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.744;NF=1;NR=28;PP=1057;ReadPosRankSum=-1.167;SC=TGACTTTGGGCTTGTACCCTT;SOR=0.291;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=29;WE=10363463;WS=10363445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,47:0.66:71
chr19	10370542	rs11115	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=0.143;SC=TTGGGAGCCTCAGGCCCACGC;SOR=1.036;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=23;WE=10370550;WS=10370532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr19	10394792	rs1799969	G	A	2875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=58;PP=1860;ReadPosRankSum=-1.462;SC=TTCCCTGGACGGGCTGTTCCC;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=226;TCF=109;TCR=117;TR=109;WE=10394803;WS=10394782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,126:0.51:247
chr19	10395683	rs5498	A	G	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=45;PP=1658;SC=GGTCACCCGCAAGGTGACCGT;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=10395691;WS=10395673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	10402131	rs901886	T	C	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=36;PP=1698;SC=CAAGTCCCGGTGTTCAAAGAG;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=10402139;WS=10402121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	10402938	rs1056538	G	A	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=47;PP=1354;SC=CAGGCAGCTGGTCTGCAACGT;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=10402946;WS=10402928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	10403368	rs2228615	G	A	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=70;PP=2965;SC=CGCAGCTGGGGCCCAAGCTCT;SOR=1.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=125;TCR=70;TR=195;WE=10403376;WS=10403358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	10403947	rs2569702	T	C	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=47;PP=1676;SC=GCAGGGTGCATTTCTATCTGG;SOR=1.190;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=75;WE=10403955;WS=10403937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	10404227	rs2569703	C	G	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=1077;SC=AGAGTGCATGCCTCGACTAGC;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=10404235;WS=10404220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	10405906	rs34124276	C	CT	1145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=890;SC=AGGCAGGATCCTCTTCTGCCC;SOR=2.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=20;WE=10405914;WS=10405896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	10407169	rs710845	G	C	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=19;PP=618;SC=CCGTGTGTCTGAACGGAGCGG;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=28;WE=10407177;WS=10407159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	10416777	rs35251981	A	ATAT	97.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	10418784	rs281416	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=329;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CCGACGCCAGAGAGCACCCCT;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=18;WE=10418792;WS=10418774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr19	10418838	rs35063123	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=354;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AGAAAGGGCGGCCTGGCCCCA;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=27;WE=10418846;WS=10418828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr19	10419468	rs55905227	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	10426024	rs1124765	T	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=10.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr19	10426422	rs378395	A	C	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=641;ReadPosRankSum=-2.016;SC=CCTCCTCTCCAGCCGGGCGCG;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=41;WE=10426430;WS=10426412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr19	10426628	rs395782	T	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=981;ReadPosRankSum=-1.048;SC=CAGCCTGCAGTAGAACCCTGG;SOR=0.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=56;WE=10426636;WS=10426618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr19	10428790	rs12459144	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=1.602;SC=AAGACCAACCCCTGCCACCAC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=10428798;WS=10428780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	10429120	rs281427	T	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=48;PP=1183;SC=ATCTTCCCTCTGCCTCCCAGG;SOR=1.497;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=10429128;WS=10429110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	10431300	rs34942709	A	AG	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.184;NF=12;NR=9;PP=730;ReadPosRankSum=1.764;SC=ATTTGGCCTTAGGGGACAGAG;SOR=0.867;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=21;WE=10431308;WS=10431290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr19	10432334	rs12983649	T	G	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1318;ReadPosRankSum=0.429;SC=GGGGGCAGGGTGGCCCAGGGA;SOR=0.828;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=81;WE=10432342;WS=10432324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,96:0.48:202
chr19	10441117	rs3181049	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=10.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr19	10444826	rs2278442	G	A	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=75;PP=2965;SC=GCAGCCCCGTGTTAGCTCACC;SOR=0.934;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=146;WE=10444834;WS=10444816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
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chr19	10659737	rs12979378	C	T	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=992;ReadPosRankSum=-1.817;SC=TCTAGGACACCTCCACCTGGG;SOR=0.888;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=61;WE=10659745;WS=10659727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,79:0.44:178
chr19	10665691	rs10419405	T	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=583;SC=CAACAAGAGGTTGACGGAGCC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=10665699;WS=10665681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	10665912	rs6146467	C	CCCGCCCTGCCCGCAGCGCACCTGGCT	2280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=2975;SC=CCCGAGGCTGCCCGCCCTGCC;SOR=1.659;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=8;WE=10665920;WS=10665902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr19	10666112	rs12459941	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.831;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr19	10668383	rs3745256	T	C	3428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.571;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=76;PP=1778;ReadPosRankSum=0.595;SC=GCCAGGCTGCTGGGCTATGCC;SOR=0.525;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=284;TCF=121;TCR=163;TR=138;WE=10668391;WS=10668373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,168:0.50:333
chr19	10668452	rs3745255	A	G	5021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=98;PP=2965;SC=CACCGGGTTCAAACACGGGCT;SOR=1.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=57;TCR=98;TR=155;WE=10668460;WS=10668442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	10668673	rs1982074	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=639;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CTCACAGTGCAGCTCCTGCTG;SOR=0.745;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=45;WE=10668681;WS=10668663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr19	10668953	rs875569	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=391;ReadPosRankSum=-0.604;SC=GAGCCCACTCGAGACATAGGA;SOR=0.471;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=26;WE=10668961;WS=10668943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr19	10669032	rs892084	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=501;SC=TAGGGCTCCCTACAGCCCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=10669040;WS=10669022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	10670184	rs3826709	C	G	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1195;ReadPosRankSum=0.293;SC=TGCTTGAGCTCTTCCTGCTTC;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=72;WE=10670192;WS=10670174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr19	10670992	rs3745249	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=607;ReadPosRankSum=0.830;SC=GCTCACCCCTCCTCTTCCTCC;SOR=0.629;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=42;WE=10671000;WS=10670982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,54:0.43:126
chr19	10671664	rs7259124	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=941;ReadPosRankSum=0.393;SC=TCAGCGACCATGCGTGAGAAC;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=59;WE=10671672;WS=10671654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr19	10672493	rs12984043	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=273;ReadPosRankSum=0.268;SC=GAAGTCTCCCCGTCTGAGTTC;SOR=0.877;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=16;WE=10672501;WS=10672483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr19	10673302	rs35523350	C	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=2.021;SC=AGCCACCATGCCCGGCCCAGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=10673310;WS=10673293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	10673340	rs12977138	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=1.513;SC=TCTCCTGCCCCTAAGACCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=10673348;WS=10673330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	10676311	rs35247747	TC	T	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GGTTGGGGGTTCCCCCCCGTC;SOR=0.223;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=10676319;WS=10676301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr19	10676343	rs3745246	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.681;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CGGGGTGCAGAGGGGGGCTTG;SOR=1.668;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=17;WE=10676351;WS=10676333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr19	10676423	rs3745245	G	A	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=820;ReadPosRankSum=0.948;SC=CCGACTCGGAGCTGGAGTCGC;SOR=1.008;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=53;WE=10676431;WS=10676413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr19	10676487	rs34864064	G	GCC	1935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=909;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CAGACGGGATGCCCCCCCCCA;SOR=0.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=51;WE=10676495;WS=10676477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,67:0.45:149
chr19	10676681	rs3218222	T	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-0.650;SC=GGCATGGCGGTTCTGTGGCCC;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=22;WE=10676689;WS=10676671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr19	10679067	rs33926515	GAGA	G	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=0.045;SC=TGAAAGCCTAGAGAAGAAGGA;SOR=0.495;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=4;WE=10679077;WS=10679057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr19	10679240	rs1968445	C	G	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=37;PP=1388;SC=GCACCAGCTCCCGGTGCAGAA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=75;WE=10679248;WS=10679230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	10685859	rs1560712	G	C	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=41;PP=1185;SC=GAGATACCATGTCTACAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=10685867;WS=10685849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	10687757	rs7252007	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=3;PP=236;SC=TCATGAGCCATCACACCTGAC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=10687765;WS=10687747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	10689518	rs73018654	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=295;ReadPosRankSum=0.153;SC=GTGAGCCACCGCACCCACCCG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=23;WE=10689526;WS=10689508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr19	10690321	rs73018660	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TGAGCCACTGCGCTGGGCCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=10690329;WS=10690311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	10690557	rs10426276	G	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=33;PP=1133;SC=GTGGAGAGTGGAGAGTGACCC;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=10690565;WS=10690547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	10692000	rs1045361	T	C	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=650;ReadPosRankSum=-1.811;SC=CTGGCATTCCTGACAGAAACA;SOR=0.436;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=51;WE=10692008;WS=10691990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr19	10692117	rs2304161	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=2449;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CTCCGTCTCCTGCAGCCAGGC;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=66;WE=10692137;WS=10692107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,74:0.41:181
chr19	10692129	rs2304160	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=2449;ReadPosRankSum=-1.677;SC=CAGCCAGGCCGTGGAAGGGGT;SOR=0.853;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=76;WE=10692137;WS=10692107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,83:0.44:189
chr19	10694239	rs11085739	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.823;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr19	10694244	rs11085740	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.981;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr19	10697773	rs75323740	A	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=895;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GTGTTCCCAGACCTCTTCCTG;SOR=1.001;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=83;TCR=43;TR=56;WE=10697781;WS=10697763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,59:0.42:139
chr19	10697801	rs75192074	G	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1112;ReadPosRankSum=0.400;SC=CGGAGGGGTCGCCCCTGAATC;SOR=1.027;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=71;WE=10697809;WS=10697791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,79:0.41:195
chr19	10738639	rs3087969	C	T	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=51;PP=1725;SC=ACCCCACTGACAGCCGGGGCG;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=10738647;WS=10738629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	10741681	.	C	CA	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5021;HP=15;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=18;MQ=59.8;NF=7;NR=6;PP=130;QD=10.2307692308;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=13;WE=10741689;WS=10741671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,13:0.32:40
chr19	10741907	rs12972963	A	G	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=78;PP=2817;SC=AGTCCTGAGCAGTCTGCCCCA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=153;WE=10741915;WS=10741897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	10742170	rs2288904	A	G	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=59;PP=2393;SC=GAGGTGCTTCAAGATGGTGAC;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=10742178;WS=10742160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	10742287	rs1560711	C	T	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=52;PP=2781;SC=TGGTGCCATCCTCTGCTCCAT;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=121;WE=10742295;WS=10742277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	10742443	rs1560710	C	T	5958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=90;PP=2965;SC=TATTGGCGCACCGCGCCAGGG;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=176;WE=10742451;WS=10742433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr19	10742463	rs1560709	G	T	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=85;PP=2965;SC=GTCTCACTTTGCTGGGTGGGA;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=165;WE=10742471;WS=10742453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	10745764	rs2163832	T	C	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.290;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1295;ReadPosRankSum=0.215;SC=GGGGCCAGGGTGCCAGGGGCC;SOR=0.881;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=205;TCF=102;TCR=103;TR=96;WE=10745772;WS=10745754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr19	10748820	rs3859514	T	C	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=41;PP=1664;SC=GATTTCTGTCTTCTGTGATGA;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=10748828;WS=10748810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	10751769	rs111569642	G	GA	104.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=3.680;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.366;NF=1;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=1.068;SC=TCTCAGGAGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.108;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=6;WE=10751777;WS=10751759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	10752952	.	AG	A	1002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.911;NF=29;NR=6;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CAGCAGGGGAAGGATGTGGTC;SOR=1.254;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=35;WE=10752976;WS=10752942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr19	10752968	rs10405617	A	G	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=20;PP=2486;SC=TGGTCCCAGCATAGGATGGAC;SOR=2.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=73;TCR=20;TR=93;WE=10752976;WS=10752942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	10793749	rs2738039	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=776;SC=CTCCCATGTGACTGGAATGCC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=10793757;WS=10793739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	10794630	rs2229383	G	T	8194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=158;PP=2965;SC=GAGGCAACTCGGCGACAGCAG;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=101;TCR=159;TR=258;WE=10794638;WS=10794620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr19	10794793	rs892087	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=499;SC=AGACGGCCCTCGACCCCCACC;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=10794801;WS=10794783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	10818092	rs892085	G	A	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=114;PP=2965;SC=GGGATATGTGGTGGGAGGGGA;SOR=1.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=186;WE=10818100;WS=10818082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	10883126	rs3826803	C	G	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=32;PP=1969;SC=AGCTCTTTCTCATTTTCAGCA;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=97;WE=10883134;WS=10883116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
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chr19	10961024	rs73009507	C	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=384;ReadPosRankSum=0.896;SC=ATGCATGGCCCCTGGGAACTT;SOR=0.497;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=23;WE=10961032;WS=10961014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr19	10970558	rs8100581	A	G	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=624;SC=GGCAACCCTGATCCCTGTCAC;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=10970566;WS=10970548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	11019927	.	G	GT	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=-0.435;SC=TTCTGTCTCGGTTTTTTTTTT;SOR=1.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=9;WE=11019935;WS=11019917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr19	11038843	rs892010	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=14;PP=693;SC=TAGGGTTGACGCTGGGATGGG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=11038851;WS=11038833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	11136060	rs372849082	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=623;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CCCCAGGAGGGCAAGACCCCA;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=38;WE=11136068;WS=11136050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr19	11221454	rs2738442	T	C	13823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr19	11221457	rs12710260	G	C	13880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr19	11224181	rs1003723	C	T	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=44;PP=2360;SC=GGGCTCCTGGCGCTGATGCCC;SOR=1.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=106;WE=11224189;WS=11224171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	11224265	rs5930	A	G	5286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=70;PP=2965;SC=TCATCAGCAGAGACATCCAGG;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=163;WE=11224273;WS=11224255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	11224491	rs1569372	A	G	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=57;PP=1653;SC=AGCAGGAAGGAGCTTCAGGAA;SOR=1.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=11224499;WS=11224481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	11227480	rs2738447	A	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=2;NR=2;PP=53;SC=GGCCCTCAGGACCCTCTGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=11227488;WS=11227470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	11227602	rs688	C	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=552;SC=TCGATGTCAACGGGGGCAACC;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=11227610;WS=11227592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	11230645	rs2569549	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.36;NF=25;NR=1;PP=714;SC=AGTGAAACTCTGTCTGAAACA;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=26;WE=11230661;WS=11230635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	11230650	rs145643854	GAAAC	G	1491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=907;SC=AACTCTGTCTGAAACAAACAA;SOR=4.863;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=19;WE=11230661;WS=11230635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	11230881	rs5925	T	C	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=69;PP=2965;SC=AGGATATGGTTCTCTTCCACA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=135;WE=11230889;WS=11230871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	11233941	rs5927	A	G	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=68;PP=2218;SC=CAACCACCCGACCTGTTCCCG;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=11233949;WS=11233931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	11238492	rs12459476	A	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=444;SC=ACCTTCTTAAACCGGAATTGA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=11238500;WS=11238482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	11238548	rs2569538	A	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=13;PP=985;SC=GTGGCCTCTCACAGACTTGGG;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=11238556;WS=11238538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	11241915	rs6413504	A	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=20;PP=1615;SC=TGTTTCCTGAATGCTGGACTG;SOR=1.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=11241923;WS=11241905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	11242307	rs2738464	G	C	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=4;PP=115;SC=GATGAAAGGGGAGGGGATGTC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=11242315;WS=11242297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	11266584	rs892114	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=469;SC=GGGGAACAGGATCTTAGACTG;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=11266592;WS=11266574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	11277395	rs200597892	G	GTGGCCCC	1047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=1049;ReadPosRankSum=0.719;SC=GGAGGGAGGCGTGGCCCCTGG;SOR=0.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=17;WE=11277403;WS=11277385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr19	11285390	rs440677	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TCAGGTGGGAGAGGATGTGAG;SOR=0.239;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=12;WE=11285398;WS=11285380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr19	11286705	rs11880059	G	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=674;ReadPosRankSum=0.414;SC=AGTAAGCCCCGCTGCGGTGCC;SOR=0.479;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=43;TCR=62;TR=47;WE=11286713;WS=11286695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,60:0.45:134
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chr19	11303469	rs7254270	C	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.369;HP=11;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.138;NF=43;NR=30;PP=1805;ReadPosRankSum=3.829;SC=GCCCCCCCCCCCCAAGCCATT;SOR=0.373;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=73;WE=11303477;WS=11303449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,80:0.57:140
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chr19	11319491	rs8409	G	A	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CCTCTAGCACGTTGGATGAGA;SOR=0.550;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=192;TCF=100;TCR=92;TR=97;WE=11319499;WS=11319481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,115:0.51:224
chr19	11323671	rs112685241	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=-2.057;SC=CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=11323679;WS=11323670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	11324890	rs12609620	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=19;PP=1005;SC=CATGAGCCACTGTGCTCAGCC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=11324898;WS=11324880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	11325417	rs2163830	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-1.950;SC=CCCAGGGGGCACTGGCTCCCT;SOR=0.317;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=11325425;WS=11325407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr19	11325924	rs11673129	C	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=265;ReadPosRankSum=-2.698;SC=CGGCCCATGCCCGGCTAATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=16;WE=11325932;WS=11325918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr19	11326119	rs2304155	A	G	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.767;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr19	11326125	rs2304154	C	T	3302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,88:0.45:194
chr19	11326629	rs10403991	C	A	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=54;PP=1697;SC=ACTGGGGTTCCAGGCTGACTC;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=11326637;WS=11326619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	11327571	rs4804150	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=428;ReadPosRankSum=0.743;SC=TCCATCATCTCCTGCCCACGC;SOR=0.494;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=36;WE=11327579;WS=11327561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr19	11327608	rs4804151	T	C	7306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=51;PP=2511;SC=CAAAGGCAGCTAGGCAAAGGT;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=11327616;WS=11327598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	11327626	rs4804152	A	G	7613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=59;PP=2551;SC=GGTACAGCAAATCCAACAGAC;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=136;WE=11327634;WS=11327616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr19	11332570	rs3810307	T	A	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1472;ReadPosRankSum=0.880;SC=GTGCAATCGATAGCAGTGGCA;SOR=0.906;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=176;TCF=97;TCR=79;TR=85;WE=11332578;WS=11332560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,103:0.49:210
chr19	11346252	rs6511729	A	C	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=974;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTCTCGTCTCACAGGGATTTC;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=55;WE=11346260;WS=11346242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr19	11347598	rs78327524	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=382;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CAGCCCTCCCTGACTGATCAG;SOR=0.452;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=31;WE=11347606;WS=11347588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr19	11348911	rs7252937	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=554;ReadPosRankSum=0.085;SC=GCACTCGCACAGCAAGGTTGC;SOR=0.503;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=40;WE=11348919;WS=11348901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr19	11348960	rs12609039	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=362;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GAGGCTGTGCGGGTACACGTA;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=27;WE=11348968;WS=11348950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr19	11350340	rs892066	C	G	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1246;ReadPosRankSum=1.812;SC=TGTGCCTGCTCTGGGCCCTGG;SOR=0.466;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=159;TCF=65;TCR=94;TR=82;WE=11350348;WS=11350330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,92:0.52:176
chr19	11358799	rs12978266	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=859;ReadPosRankSum=0.026;SC=GGGTGGCTCTGGGCGGCTACA;SOR=0.774;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=55;WE=11358807;WS=11358789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr19	11363146	rs8113582	A	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=343;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GCTGCCCCTAAGTCAGACTCA;SOR=0.686;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=23;WE=11363154;WS=11363136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr19	11406839	rs453766	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=-2.810;SC=AACCATCAGGCAGCCAGGACA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=11406847;WS=11406829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr19	11406952	rs374409	A	G	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=994;ReadPosRankSum=0.017;SC=TTAAATGTTCAGGGTGCCCCA;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=77;WE=11406960;WS=11406942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,88:0.56:156
chr19	11409061	rs377665	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=0.198;SC=TCCCCACACACACAAATCTTT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=11409069;WS=11409051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr19	11409684	rs422496	A	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=792;ReadPosRankSum=1.270;SC=GGACGGGCACAGTGGCTCACG;SOR=0.395;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=54;WE=11409692;WS=11409674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr19	11411868	rs420703	C	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=659;ReadPosRankSum=0.661;SC=TTCCTGTCCTCTCTGTGAGGT;SOR=1.066;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=45;WE=11411876;WS=11411858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr19	11417200	rs322151	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=1.383;SC=CCATACTAGACGGTAGCCATG;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=11417208;WS=11417190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	11436302	rs56363898	A	AG	2632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=47;PP=2301;SC=AAGACCCCTGAGGGCAGAGTC;SOR=1.552;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=55;WE=11436310;WS=11436292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	11473415	rs12983706	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=508;ReadPosRankSum=1.775;SC=CACCAGCTCTCTGACCCAAGA;SOR=1.088;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=37;WE=11473423;WS=11473405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr19	11495381	.	T	TTTCCTTCC	272.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.22;QD=38.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	11517522	.	T	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=399;ReadPosRankSum=-0.261;SC=GTCAGAAGTTTGGGCAACTCT;SOR=0.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=25;WE=11517530;WS=11517512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr19	11526765	rs167479	G	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=667;SC=ATGGGCAGGGGGGTCTCGGAA;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=11526773;WS=11526755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	11534503	rs57892201	TG	T	931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=17;NR=10;PP=425;SC=CCGTCTGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=2.049;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=27;WE=11534512;WS=11534493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	11541685	rs34095	G	A	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=923;ReadPosRankSum=-0.184;SC=ATCCACCGCCGCGGGAACCCT;SOR=0.531;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=53;WE=11541693;WS=11541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr19	11541712	rs34094	T	C	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=2095;ReadPosRankSum=-1.027;SC=ACCCCTTTGCTCCTTACCTTG;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=92;WE=11541720;WS=11541702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr19	11558240	rs186375	T	C	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=71;NR=49;PP=1730;SC=CCGACCGCACTGCTCACCCGC;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=120;WE=11558248;WS=11558230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	11624491	rs4804168	C	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=648;SC=AAGAGGGATTCGGAGAGGGAG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=11624499;WS=11624481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	11660012	rs8100751	T	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	11725413	rs12151212	G	A	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1532;ReadPosRankSum=0.882;SC=ATCCTTCCCAGAAGAATCTCT;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=92;WE=11725421;WS=11725403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,102:0.47:217
chr19	11727384	rs4411616	G	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=0;PP=24;SC=GTTCACGCCTGGGCAACATAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=11727392;WS=11727380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	11727503	rs4545929	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=359;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CTCATTTTTCTGACAAGTCAT;SOR=0.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=21;WE=11727511;WS=11727493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr19	11728257	rs143884853	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=682;ReadPosRankSum=1.639;SC=AGGAATGCGGGAAGGCTTTGA;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=47;WE=11728265;WS=11728247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr19	11878095	rs384148	T	G	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TGGCACCAGGTCTTCCCCGCC;SOR=0.502;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=79;WE=11878103;WS=11878085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,108:0.55:197
chr19	11889347	rs371134	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.328;SC=GATCATAGCTCGCTGTAGCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=11889355;WS=11889337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	11891003	rs799193	G	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=23;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TAATTGCTACGTTAGAGTTGA;SOR=1.573;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=76;WE=11891011;WS=11890993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr19	11918093	rs71166630	AT	A	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.872;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=477;ReadPosRankSum=1.401;SC=GAGAAATGCTATTTTTTAATT;SOR=0.098;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=19;WE=11918101;WS=11918083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr19	11941221	rs424132	T	A	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.839;NF=31;NR=46;PP=1177;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CCTGACCTCTTTAGGTAAGGA;SOR=1.041;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=188;TCF=84;TCR=104;TR=77;WE=11941229;WS=11941211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,77:0.39:198
chr19	11941256	rs421355	A	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.948;NF=26;NR=30;PP=814;ReadPosRankSum=2.913;SC=CCCTCAGTCCATTAGTGAACC;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=56;WE=11941264;WS=11941246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,56:0.34:165
chr19	11941363	rs2545810	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.153;NF=10;NR=11;PP=387;ReadPosRankSum=0.885;SC=AATCATGGGCGTAGAATCTAA;SOR=0.520;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=21;WE=11941371;WS=11941353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
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chr19	11942771	rs436411	G	A	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1908;ReadPosRankSum=-0.006;SC=AATATCAGGAGTGTGGGAAAG;SOR=1.146;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=241;TCF=132;TCR=109;TR=119;WE=11942779;WS=11942761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,136:0.48:284
chr19	11943697	rs400106	G	A	3636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=56;PP=2233;SC=ATGGAGAGAAGCCCTATGCAT;SOR=0.838;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=11943721;WS=11943687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	11943713	rs56167415	G	A	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=958;ReadPosRankSum=0.623;SC=TGCATGTAAGGAATGTGGGAA;SOR=0.782;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=58;WE=11943721;WS=11943687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr19	11943823	rs375049	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.562;NF=15;NR=21;PP=646;ReadPosRankSum=-0.383;SC=TATGTGGGAGGGGCTTTTATT;SOR=0.868;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=36;WE=11943831;WS=11943813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr19	11943852	rs3745669	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.016;NF=13;NR=17;PP=484;ReadPosRankSum=-1.028;SC=TCATTTCAAATACATGAAAAA;SOR=0.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=30;WE=11943860;WS=11943842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr19	11977572	rs11671596	G	C	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=168;SC=GATCAAGGCTGAGGGCTCACT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=11977580;WS=11977562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	11979164	rs10500209	T	C	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.001;SC=AATCTTCAATTGCATGGTAGG;SOR=0.535;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=82;WE=11979172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,94:0.48:195
chr19	11979305	rs72994214	C	G	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1109;ReadPosRankSum=0.800;SC=TGTGGGAAAGCCTTCAGATAT;SOR=0.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=70;WE=11979313;WS=11979295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr19	11998756	rs3810315	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=441;ReadPosRankSum=0.730;SC=GCTGTAGTCACAGGAGGTGTA;SOR=1.176;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=32;WE=11998764;WS=11998746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr19	12014820	rs28588743	C	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.542;NF=10;NR=19;PP=477;ReadPosRankSum=-1.244;SC=TCTCTCTAGACAATCTTAGAA;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=29;WE=12014828;WS=12014810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr19	12035792	rs73003933	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.774;SC=AGTCTGGCTCTGCGGGGCCTG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=12035800;WS=12035788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	12035868	rs73003935	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=532;ReadPosRankSum=0.376;SC=CCAATCAGAGGTGCTGGGGCG;SOR=0.686;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=33;WE=12035876;WS=12035858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr19	12037544	rs279236	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=351;ReadPosRankSum=1.400;SC=TTTAGGGGTAAGCTTTTATAA;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=24;WE=12037552;WS=12037534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr19	12058336	rs376075	A	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.831;QD=22.13;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr19	12058341	rs77752522	GT	AA	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.856;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr19	12058572	rs192494	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.615;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TGTAATCCCAGTCCTTTGAGA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=12058580;WS=12058562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	12076060	rs7250805	G	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=368;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CCGAGACGGGGTAGAGGCTGC;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=23;WE=12076068;WS=12076050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr19	12076171	rs7251835	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-1.537;SC=GCCCTCGGTCCCCTCGGCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=13;WE=12076179;WS=12076161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	12088164	rs72988671	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=712;ReadPosRankSum=0.665;SC=TTCAGGACTACTTTTCTGTGT;SOR=0.992;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=39;WE=12088172;WS=12088154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr19	12088388	rs147622996	A	AT	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=-0.671;SC=ATATATTTACATGTGACTAAG;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=12088396;WS=12088378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	12089363	rs7253997	TG	CT	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.408;NF=23;NR=30;PP=2416;ReadPosRankSum=-1.863;SC=GTGGGAAAGCTGTCCATTGTC;SOR=0.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=53;WE=12089372;WS=12089353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr19	12089549	rs7254258	T	C	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1557;ReadPosRankSum=1.143;SC=GTTCCAGTTCTTTTCAAGCAC;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=91;WE=12089557;WS=12089539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,100:0.46:217
chr19	12089709	rs7254529	T	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=851;ReadPosRankSum=-1.148;SC=ATTCCGTAGTTACAGATCCTA;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=51;WE=12089717;WS=12089699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,59:0.41:144
chr19	12089743	rs7250795	C	T	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1145;ReadPosRankSum=-2.014;SC=AGGAGTCACACGGGAGAGAAG;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=73;WE=12089751;WS=12089733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,85:0.47:179
chr19	12089805	rs7250894	C	G	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1604;ReadPosRankSum=2.084;SC=CAGTTCCCTTCGTAGACATGA;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=100;TCR=95;TR=108;WE=12089813;WS=12089795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,119:0.55:218
chr19	12089947	rs111486980	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=-1.180;NF=24;NR=27;PP=905;ReadPosRankSum=0.708;SC=TGGGAAAGGCCTTTATTCTGC;SOR=0.765;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=51;WE=12089955;WS=12089937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr19	12089983	rs72988677	A	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.064;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.160;NF=21;NR=30;PP=933;ReadPosRankSum=-1.343;SC=ACATGAAAAAACTCACACTGG;SOR=1.072;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=51;WE=12089991;WS=12089973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr19	12157334	rs4804176	T	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=12;PP=946;SC=CATTGCACCTTTGTCTCATTT;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=12157342;WS=12157324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	12203136	.	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=492;ReadPosRankSum=1.069;SC=CTGTGCTAACGACCGTTGGAA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=28;WE=12203144;WS=12203126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr19	12222381	rs1866382	C	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=31;PP=1835;SC=AAGGATTCTGCGAAGACATTT;SOR=1.068;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=12222389;WS=12222371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	12383210	rs374495462	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=586;ReadPosRankSum=-1.595;SC=TGCTTTCCCACATTCCATACA;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=38;WE=12383218;WS=12383200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr19	12404005	.	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.280;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CTTTTTACAGGAATGATATAC;SOR=0.119;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=16;WE=12404013;WS=12403995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr19	12491302	rs145317058	TTTC	T	3054.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.040;NF=18;NR=39;PP=2296;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ATTCATAGAGTTTCTTCTCTC;SOR=0.493;Source=Platypus;TR=57;WE=12491312;WS=12491292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr19	12491498	rs4804664	C	T	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1831;ReadPosRankSum=0.260;SC=AGTGGTTTCACGTCTTTGAAG;SOR=0.748;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=209;TCF=106;TCR=103;TR=101;WE=12491506;WS=12491488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,111:0.46:239
chr19	12491639	rs59301182	A	G	5033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.537;NF=54;NR=71;PP=1894;ReadPosRankSum=-1.522;SC=ACATTCATACAGTTTCTCCCC;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=253;TCF=110;TCR=143;TR=125;WE=12491647;WS=12491629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,141:0.49:290
chr19	12491654	rs57371898	C	T	4651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.646;NF=48;NR=62;PP=1744;ReadPosRankSum=2.093;SC=CTCCCCAGTACGTGTTCTTTC;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=229;TCF=96;TCR=133;TR=110;WE=12491662;WS=12491644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,122:0.47:262
chr19	12491779	rs17706075	T	C	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.203;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.484;NF=54;NR=47;PP=1424;ReadPosRankSum=-1.467;SC=GCCAGAAAAATGCTTTCCCAC;SOR=0.484;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=217;TCF=125;TCR=92;TR=101;WE=12491787;WS=12491769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,123:0.47:259
chr19	12491949	rs11668955	T	C	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=9.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,88:0.54:162
chr19	12491955	rs11668074	A	C	3363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=9.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.16;ReadPosRankSum=1.182;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,88:0.55:159
chr19	12492036	rs10417283	A	T	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.758;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr19	12492039	rs10414984	G	T	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,58:0.59:99
chr19	12494612	rs10418011	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.60;QD=37.24;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	12494621	rs10412448	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.02;QD=42.63;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	12502457	rs4804669	A	G	6897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=129;PP=2965;SC=ACATTCATACAGTTTCTCCCC;SOR=0.993;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=102;TCR=129;TR=231;WE=12502465;WS=12502447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	12503074	rs62111328	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=28.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.20;MQRankSum=1.375;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr19	12503077	rs62111329	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=27.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQRankSum=1.328;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr19	12503096	rs62111330	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=20.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQRankSum=1.323;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr19	12540818	rs28438452	G	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.113;NF=8;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGGTATCAAGGGATGACTGTA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=12540826;WS=12540809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	12540971	rs28559848	T	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.021;NF=33;NR=21;PP=891;ReadPosRankSum=-1.032;SC=GAGAGAATGCTAGTGAGTCTT;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=54;WE=12540979;WS=12540961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,55:0.41:134
chr19	12541214	rs7256321	G	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.878;NF=37;NR=47;PP=1242;ReadPosRankSum=0.707;SC=ACCACATTGTGGACATTCATA;SOR=0.675;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=84;WE=12541222;WS=12541204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,78:0.43:183
chr19	12541532	rs10422063	C	A	9521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.76;QD=43.88;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr19	12541532	.	CAGGCTTTCCCAA	AAGGCTTTCCCAA,AAGGCTTTCCTAC	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=56.88;NF=88,35;NR=108,44;PP=2962,2934;QD=20;SC=GAAATCAATACAGGCTTTCCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=88;TCR=108;TR=196,79;WE=12541555;WS=12541522;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:196
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chr19	12542852	rs148948402	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr19	12542904	rs78266625	C	T	57.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	12543121	rs74181652	C	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.013;NF=25;NR=7;PP=533;ReadPosRankSum=1.677;SC=TTCTTTGCTTCTTTTTAAATT;SOR=0.487;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=32;WE=12543129;WS=12543111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr19	12543251	rs138584869	A	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=-5.229;QD=0.53;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=2.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,8:0.12:64
chr19	12543333	rs3979432	C	T	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.54;QD=30.16;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	12543866	rs138105074	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.65;MQRankSum=-2.376;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.615;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	12551616	rs35084134	C	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=304;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GGACCCGGGTCCGTAGATCCC;SOR=1.136;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=12551624;WS=12551609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr19	12551671	rs11878378	G	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-3.987;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr19	12551674	rs11878523	C	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-3.842;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.762;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr19	12551715	rs11881297	A	C	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=50;PP=2942;SC=ACGCCGGCCCAGCACACGCAC;SOR=1.475;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=102;TCR=50;TR=152;WE=12551723;WS=12551705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	12551789	rs3745658	A	C	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=1249;ReadPosRankSum=-0.344;SC=TGCGTGTTCCAGCCAGACAAA;SOR=0.682;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=218;TCF=111;TCR=107;TR=107;WE=12551797;WS=12551779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,133:0.49:270
chr19	12551895	rs3745657	A	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=433;ReadPosRankSum=0.019;SC=TCAACCACACACACTTCTCTG;SOR=0.607;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=27;WE=12551903;WS=12551885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr19	12576049	rs7259240	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.766;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=1191;ReadPosRankSum=1.954;SC=ACGTTTTCCCGCATTCTTTAC;SOR=0.953;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=72;WE=12576057;WS=12576039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,80:0.49:163
chr19	12576573	rs10404972	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=1.593;SC=AAAACAAAACGCACAATTAGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=12576581;WS=12576563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	12659875	rs146138143	C	CCATA	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=21;ReadPosRankSum=1.383;SC=GAGAAACCTACCATACATGTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=12659883;WS=12659865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr19	12661335	rs2861411	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=21;SC=CCGGTCGTGGCGGCGCATGCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=12661343;WS=12661325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	12662318	rs79749579	G	GC	2950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=47;PP=2368;SC=GTTGAACATTGCCCCTGTCCC;SOR=1.280;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=59;WE=12662326;WS=12662308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	12786449	rs35092999	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=329;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CAGTGCTGGCGAGAGGAGGCC;SOR=1.005;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=23;WE=12786457;WS=12786439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr19	12830046	rs375461253	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=648;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GCAGGGTCCCGATCGCATGGA;SOR=0.348;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=40;WE=12830054;WS=12830036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr19	12865821	rs17706412	C	T	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1437;ReadPosRankSum=0.529;SC=TCCGCGACAACAGCGCCCTTA;SOR=0.558;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=190;TCF=84;TCR=106;TR=95;WE=12865829;WS=12865811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,109:0.50:218
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chr19	12878951	rs16978662	G	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=515;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AACACAGAGAGGGGAGGAATA;SOR=1.077;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=36;WE=12878959;WS=12878941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr19	12910979	rs10413408	G	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=0.695;SC=CGGGCTGAGGGTCCCACAGTA;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=30;WE=12910987;WS=12910969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr19	12911285	rs10427027	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr19	12911926	rs10422248	C	T	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1330;ReadPosRankSum=-1.719;SC=CAGCTTCTCTCATGCACGGCC;SOR=0.486;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=181;TCF=114;TCR=67;TR=88;WE=12911934;WS=12911916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,106:0.50:212
chr19	12917520	rs11554400	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=802;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAGACAATACAGGCCGCTGTC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=60;WE=12917528;WS=12917510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,73:0.42:172
chr19	12917686	rs13345720	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=-1.380;SC=GGGATTGCACTGCACCAAGGG;SOR=1.093;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=8;WE=12917694;WS=12917676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	12920935	rs7257575	G	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=857;ReadPosRankSum=1.206;SC=CGCGGCTGCAGCAAAGTTTTC;SOR=0.626;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=58;WE=12920943;WS=12920925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr19	12921120	rs7247253	T	C	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=958;ReadPosRankSum=-2.015;SC=AGGTGCCTGTTTTGCCCACAG;SOR=0.860;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=52;WE=12921128;WS=12921110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr19	12921186	rs7247284	T	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=563;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CTGCAGGACTTGGATACTGAT;SOR=0.504;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=42;WE=12921194;WS=12921176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr19	12924157	rs76634951	C	T	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.980;SC=ACTCAGCATCCGAGAATCAGG;SOR=0.717;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=76;WE=12924165;WS=12924147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,92:0.54:171
chr19	12936617	rs13628	C	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=802;ReadPosRankSum=0.097;SC=AGCTTCCCGGCCCCGTCGTCC;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=60;TCR=35;TR=48;WE=12936625;WS=12936607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr19	12936881	rs4804736	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGGAGTCTATGTGCGGAACGT;SOR=0.297;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=23;WE=12936889;WS=12936871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr19	12939792	rs1466306	T	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=32;PP=990;SC=CCCTGTGAGCTAGGGTCTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=12939800;WS=12939782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	12939858	rs10423639	AA	CC	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=202;ReadPosRankSum=0.784;SC=CAGGGGAGACAACAATTACAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=5;WE=12939867;WS=12939848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	12958360	rs2290689	T	C	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=766;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GGTTACATCTTGGGGCGGGGG;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=60;WE=12958368;WS=12958350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,73:0.42:173
chr19	12958697	rs2290688	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=625;ReadPosRankSum=-0.958;SC=TGCGCGACTTTACCCGCGCCT;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=36;WE=12958705;WS=12958687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr19	12962648	rs7250751	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=208;ReadPosRankSum=-1.115;SC=CACCTGTAAGATGGGACAGTA;SOR=0.896;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=12;WE=12962656;WS=12962638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr19	12963143	rs1078264	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=468;ReadPosRankSum=-2.182;SC=CCTCCCTAGATGTGGTGCATC;SOR=0.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=31;WE=12963151;WS=12963133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr19	12963285	rs2077544	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=163;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGCTTCTTTGCCCTCAGGCTT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=12963293;WS=12963275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	12975599	rs2242512	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=456;ReadPosRankSum=0.106;SC=CCCTTTTTATGCGGGCCCATT;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=28;WE=12975607;WS=12975589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr19	12976481	rs150724539	AAAC	A	3111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=40;PP=1952;ReadPosRankSum=2.774;SC=TCCTGTGTCCAAACAACAACA;SOR=0.555;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=108;TCF=31;TCR=77;TR=48;WE=12976494;WS=12976471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr19	12985576	rs11085822	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=773;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TCTTGGGCTCAGGCACCAAGC;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=51;WE=12985584;WS=12985566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr19	12989560	rs2293682	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=499;ReadPosRankSum=1.022;SC=TATGAGGCCAGCTGTATGCAG;SOR=0.685;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=33;WE=12989568;WS=12989550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr19	12996740	rs2072597	A	G	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=982;ReadPosRankSum=0.151;SC=TGCGCCCCGGAGGCCTCGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=70;WE=12996748;WS=12996730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr19	13002400	rs1799918	G	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=326;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TGCCGCAGGTGGACTCTGTCC;SOR=0.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=25;WE=13002408;WS=13002390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr19	13006685	rs2238641	T	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.276;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr19	13006685	.	TGG	CGA	1063	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=22;NR=4;PP=1063;QD=42.9410721101;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCTAA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=26;WE=13006695;WS=13006675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,26:0.47:55
chr19	13006687	rs12151303	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=1.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr19	13008607	rs1060218	G	T	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=950;ReadPosRankSum=-1.761;SC=TGCTGGGGGGGAATGGGATTT;SOR=0.508;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=59;WE=13008615;WS=13008597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,69:0.37:187
chr19	13010520	rs8012	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=257;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GAAGTCGTTCAGATGTGTTCC;SOR=0.734;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=21;WE=13010528;WS=13010510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr19	13010643	rs9384	G	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=-0.488;SC=AGAGTGACATGGAAGCAACTC;SOR=0.661;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=29;WE=13010651;WS=13010633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr19	13015530	rs17706531	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=1.063;SC=AGAGTACAGGAAGCGGCCAGG;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=13015538;WS=13015520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	13029188	rs2965214	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=420;ReadPosRankSum=1.268;SC=AAGGAGGGAGGATGAGGAGTG;SOR=2.133;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=21;WE=13029196;WS=13029178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr19	13030939	.	AT	A	302	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=57.96;NF=8;NR=0;PP=302;QD=38.125;SC=ACACACACACATAATTATATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=13030947;WS=13030929;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,8:0.53:15
chr19	13031210	rs2967897	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=0.148;SC=TCTAGACAGATAGGCCTTGCT;SOR=1.127;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=15;WE=13031218;WS=13031200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr19	13035006	rs1045913	G	A	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1273;ReadPosRankSum=2.318;SC=ACACGTTCTCGGGAAGCCCCA;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=78;WE=13035014;WS=13034996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr19	13039284	rs2293683	A	G	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1341;ReadPosRankSum=0.606;SC=GGTGGGAGACACAGCCTGACT;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=95;WE=13039292;WS=13039274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,113:0.56:200
chr19	13044544	rs2974750	C	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=0.790;SC=TGTCCGGGCCCGGGTGGGCGG;SOR=0.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=25;WE=13044552;WS=13044534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr19	13220676	rs10414282	G	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=978;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GGTGGTTGGTGGGGAGGGAGG;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=61;WE=13220684;WS=13220666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr19	13249244	rs8112067	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=989;ReadPosRankSum=0.809;SC=CCGCGGGGCCACACACTTCCC;SOR=1.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=44;WE=13249252;WS=13249234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr19	13255536	rs2304095	T	C	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=44;PP=2026;SC=CACACCAGGGTGGCCGAGAGC;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=13255544;WS=13255526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	13260240	.	A	AAAAG	793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.19;QD=37.80;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	13317490	rs143342886	GTTA	G	1112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.180;NF=8;NR=14;PP=898;ReadPosRankSum=1.248;SC=ATTGTTTATTGTTATTATTAT;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=22;WE=13317500;WS=13317480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr19	13318811	rs147221323	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=213;ReadPosRankSum=0.847;SC=GGCCCCGCCGCGGAGTGCTGG;SOR=1.003;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=16;WE=13318819;WS=13318801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	13318982	rs148672975	AGGAGGG	A	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.89;MQRankSum=1.707;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.306;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	13319693	rs16051	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-2.490;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr19	13319989	rs10413221	T	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=640;SC=TTCCTGCAGCTGCTGCCTGGC;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=13320010;WS=13319979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	13320002	rs2304093	C	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=7;PP=615;SC=TGCCTGGCCCCCTCTGTCCCC;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=13320010;WS=13319979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	13322822	rs3217380	AG	A	690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=687;SC=TGAGTCCGGCAGGGAGGGGAT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=13322830;WS=13322812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	13323124	rs16048	T	G	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=33;PP=1329;SC=TGTGTGTGTGTGGGGGGCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=13323132;WS=13323114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	13325497	rs80216489	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=500;ReadPosRankSum=1.167;SC=TGCAAAGCCATAGGCTCCCGA;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=24;WE=13325505;WS=13325487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr19	13335432	rs3816027	G	A	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=34;PP=1481;SC=GGAGATCCCCGGTTCCACCCT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=13335440;WS=13335422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	13338180	rs143245670	AAAG	A	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=7;PP=601;SC=CACTAAAAAAAAAGAAGAAGA;SOR=0.941;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=14;WE=13338190;WS=13338170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	13355900	rs16039	T	G	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=614;SC=AGCTATGGCTTCCGGGACACA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=13355908;WS=13355890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	13356150	rs16035	T	G	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=75;PP=2428;SC=GCTGGCCGGGTGCATGTTAGA;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=114;WE=13356158;WS=13356140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	13364012	rs8103699	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=467;SC=GGCAACACTCCAGCCCCAGGC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=13364020;WS=13364002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	13373477	rs16031	A	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=411;SC=TGAGCAGTGTACAACCTGCTC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=17;WE=13373485;WS=13373467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	13409390	rs16025	C	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=740;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CCTTGTCCTCCCTCCGCGCGT;SOR=0.984;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=45;WE=13409398;WS=13409380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr19	13409472	rs16023	T	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=441;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GCCCTCGCCCTCGCCCTCGCC;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=28;WE=13409480;WS=13409462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr19	13409696	rs16022	C	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=351;ReadPosRankSum=-1.027;SC=CGGCCTCGCCCTCCCAGAACC;SOR=0.767;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=29;WE=13409704;WS=13409686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	13410235	rs12985136	G	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TGACCCAGGCGAACCAACCCA;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=17;WE=13410243;WS=13410225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr19	13411482	rs16018	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=652;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TAAAAGGCACGTGGAATCTTT;SOR=1.055;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=48;WE=13411490;WS=13411472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr19	13423688	rs10407951	A	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=2.429;SC=TATCATTTTTAAACTTTTTAT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=13423696;WS=13423678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	13443770	rs16008	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=685;ReadPosRankSum=-0.285;SC=GTTAAGCTCCTGCATTTGGAG;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=59;WE=13443778;WS=13443760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,73:0.46:160
chr19	13445144	rs2306348	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=1.327;SC=CTTTGTACTCCGTGGCCTGGG;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=8;WE=13445152;WS=13445134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr19	13445208	rs2248069	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=347;ReadPosRankSum=-1.801;SC=TTGAGATCCACTCCATGTACC;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=29;WE=13445216;WS=13445198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr19	13445369	rs201437979	GTGTGTT	G	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=318;ReadPosRankSum=0.303;SC=ACGTTTGTGTGTGTGTTTGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=3;WE=13445383;WS=13445359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr19	13445407	rs138143360	TTGTG	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.189;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	13563887	.	A	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=445;ReadPosRankSum=1.955;SC=TGACAAGATCAGGGAACCAGC;SOR=1.777;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=30;WE=13563895;WS=13563877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr19	13616693	rs16003	C	T	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.34;SOR=3.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	13865070	rs378189	C	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=35;NR=27;PP=1087;SC=ATATCAGCCTCTCTCTGAGTC;SOR=0.908;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=62;WE=13865078;WS=13865060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	13866793	rs392725	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=231;SC=TAAATAAATAAGAGAGGGACT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=13866801;WS=13866790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	13866866	rs417186	T	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=6;PP=1104;SC=TGCCCCCTATTGCTATGAACA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=13866874;WS=13866856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	13866957	rs2910225	T	C	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=74;PP=2780;SC=GGCAGAAAATTGTGAGCTCCT;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=164;WE=13866965;WS=13866947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	13868117	rs693151	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=436;SC=TCCCGTTAACAGGGCAGTCTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=13868125;WS=13868107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	13868171	rs75450630	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=516;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AGTCGCAGGTGTGGAGACCCA;SOR=0.118;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=31;WE=13868179;WS=13868161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr19	13870153	rs371671	C	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=9;PP=210;SC=TCCAGCCCTCCCCCCACCACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=13870161;WS=13870143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	13875258	.	C	G	221	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=15;MQ=58.12;NF=10;NR=3;PP=221;QD=19.6747086575;SC=TGGAATCCGCCTCCTGGGAAC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=13875266;WS=13875256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	13875626	rs2922288	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=55;SC=GGCGGCCGGGTTGGAGGTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=13875634;WS=13875616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	13879622	rs346152	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=777;ReadPosRankSum=1.086;SC=CAACTTCTCATACGCCCCCTC;SOR=0.434;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=43;WE=13879630;WS=13879612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr19	13883099	rs1469071	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.618;SC=GATGTAACCAACTCAGCTCTC;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=68;WE=13883107;WS=13883089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,81:0.55:146
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chr19	14038791	rs2305777	C	T	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=491;ReadPosRankSum=-3.404;SC=CAGTTGGAGACGACGACAGAG;SOR=0.425;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=37;WE=14038799;WS=14038781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr19	14040896	rs11669628	G	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1180;ReadPosRankSum=0.735;SC=CTCAGAATACGCAGCCCAGCT;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=96;WE=14040904;WS=14040886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,108:0.54:199
chr19	14044287	rs2305778	G	A	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=882;ReadPosRankSum=0.624;SC=AGAGAGGGTCGGTGTTAGGTG;SOR=1.033;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=46;WE=14044295;WS=14044277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr19	14044818	rs139159656	A	G	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TGGAGAAGGAAGAAGAGAATG;SOR=0.606;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=68;WE=14044826;WS=14044808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,79:0.63:126
chr19	14045033	rs2305779	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=382;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGTGAAGAGAGTCTGGCCCGG;SOR=0.787;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=25;WE=14045041;WS=14045023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr19	14063806	rs67764456	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=1.607;SC=GCTCCCATGGTTGCTCCATAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=14063814;WS=14063796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	14065488	rs1056143	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=601;ReadPosRankSum=-2.739;SC=GGAGGCTTCAACACCAGGCTG;SOR=1.550;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=33;WE=14065496;WS=14065478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr19	14071762	rs149379888	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=825;ReadPosRankSum=0.263;SC=GGTGCTCCCTGAAGGTTCTGG;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=56;WE=14071770;WS=14071752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,65:0.43:152
chr19	14091543	rs146048336	T	TGCATCCTCTCTGGGGTGGGCTC	1344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.72;MQRankSum=10.330;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,42:0.33:129
chr19	14139004	rs1982632	A	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=-1.798;SC=CGTTCAAAGCATCTCCGTCCA;SOR=0.287;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=15;WE=14139012;WS=14138994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr19	14142616	rs6511905	C	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=241;ReadPosRankSum=-0.847;SC=ACCCAGAGCTCGAAGAGGAGC;SOR=1.371;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=13;WE=14142624;WS=14142606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr19	14142705	rs113593439	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=802;ReadPosRankSum=1.281;SC=GCAGGGGCGCCCCTTTCTGGC;SOR=0.490;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=50;WE=14142713;WS=14142695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr19	14150303	rs75852614	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=753;ReadPosRankSum=-1.408;SC=ATCTCATCCCCGCCTCTCTCC;SOR=0.666;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=47;WE=14150311;WS=14150293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr19	14157478	rs75452068	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TTAGAGCAGACGGATGGGTGG;SOR=0.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=14157486;WS=14157468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr19	14161547	rs10424865	A	G	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=707;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CACCTCCCCAACTTCTTTGGT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=48;WE=14161555;WS=14161537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr19	14161745	rs10404803	T	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=106;ReadPosRankSum=-1.616;SC=TACTCCACAGTGGGGAGAGGT;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=14161753;WS=14161735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	14162676	rs2306190	A	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=0.548;SC=TGCCCTGACTACTCCTGTCTT;SOR=0.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=29;WE=14162684;WS=14162666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr19	14163109	rs375588233	C	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=259;ReadPosRankSum=1.126;SC=CTGAACCACACGTCTGGCTGG;SOR=0.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=20;WE=14163117;WS=14163099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr19	14168326	rs7250611	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=0.379;SC=CCTCCCTCCTCCGCGGGGCTC;SOR=0.610;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=11;WE=14168334;WS=14168316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr19	14200896	.	C	CG	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=22;NF=4;NR=0;PP=157;QD=44.5;SC=TGTGGCGGCGCCGGCGGGGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=14200904;WS=14200886;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	14231256	rs3745463	T	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=522;ReadPosRankSum=-1.237;SC=GCTGGGACACTCTGGGTTCCT;SOR=0.922;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=28;WE=14231264;WS=14231246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr19	14294288	rs61051191	GC	G	3590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=41;PP=1823;SC=CATTTTATCTGCCCCCCCCAG;SOR=1.266;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=77;WE=14294296;WS=14294278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr19	14507128	rs75902260	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.110;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.791;NF=15;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=0.335;SC=CTACGGGCATCCTTCACCCTC;SOR=2.833;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=16;WE=14507136;WS=14507118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr19	14507307	rs62122581	C	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=5.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-9.215;QD=4.54;ReadPosRankSum=-2.336;SOR=1.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,87:0.27:320
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chr19	14507345	rs62122583	C	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=10.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-13.263;QD=3.70;ReadPosRankSum=-3.321;SOR=1.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,30:0.16:193
chr19	14508223	rs10412108	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.840;NF=4;NR=21;PP=430;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ACTGAGGGGGAAGGCTCAGGG;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=25;WE=14508231;WS=14508213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr19	14508964	rs7508244	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=652;ReadPosRankSum=0.859;SC=AAGGGCAGGATGCTGGGGGAC;SOR=0.893;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=51;WE=14508972;WS=14508954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr19	14520829	rs12461754	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TCGCTCAAAAGCTGGATGTAA;SOR=1.197;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=17;WE=14520837;WS=14520819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	14522434	rs55968966	GCCTTA	G	6774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=72;PP=2971;SC=TAAGAAGAGGGCCTTACCTTA;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=13;TCR=81;TR=83;WE=14522446;WS=14522424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	14561722	rs8107892	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=19;PP=920;SC=AGGAGAAATTAACAGAATCCA;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=41;WE=14561730;WS=14561711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	14581756	rs59891980	TGCCTCAAGGGCCTCGTTGC	T	1596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=2974;SC=CTAGCCGCTTTGCCTCAAGGG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=25;WE=14581782;WS=14581746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	14582468	rs10846	G	A	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=68;PP=2305;SC=CCGCACCGACGTCAGCAACTT;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=132;WE=14582476;WS=14582458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr19	14583264	rs2241363	G	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=593;SC=CGGGACACACGGTCCTGCCTG;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=14583272;WS=14583254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr19	14627050	rs4926222	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=350;ReadPosRankSum=1.860;SC=CCCAGAGGCCGTCTGCCATAG;SOR=1.044;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=24;WE=14627058;WS=14627040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr19	14629150	rs3962158	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=-1.513;SC=TCTGGTAGTAGTCTTTACCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=14629158;WS=14629140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr19	14655865	rs7252966	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=336;ReadPosRankSum=0.234;SC=GAGTTGTTTCTAAGCCTCTCA;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=23;WE=14655873;WS=14655855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr19	14674235	rs891089	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CGTGGCACTCCGCAGGAACGC;SOR=1.038;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=14674243;WS=14674225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	14682804	rs9543	G	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=379;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GGACCAGGTGGGCCCCCATGG;SOR=1.007;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=29;WE=14682812;WS=14682794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr19	14719854	rs10404194	T	C	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=14;PP=1163;SC=TCAGGTGATCTACCCGTCTTG;SOR=1.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=52;WE=14719862;WS=14719844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	14721019	rs6511944	C	T	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=30;PP=890;SC=AGCCCAGGGCCGAGGCTGGGG;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=14721027;WS=14721009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	14743902	rs2045912	C	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=891;SC=ACACAGGAGTCCTACCCTCTT;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=14743910;WS=14743892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	14744181	rs899217	T	A	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=24;PP=760;SC=ACATAAAGTGTCTCTTTTCCT;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=14744189;WS=14744171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	14752325	rs8102646	C	T	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=49;PP=2965;SC=GCTGGTGTTCCGGATGGCTTT;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=85;TCR=49;TR=134;WE=14752333;WS=14752315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	14769339	rs4606855	C	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=29;PP=872;SC=TTCCTGCCCTCGGTTGTCTTT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=14769347;WS=14769329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	14779550	rs4239642	C	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=677;SC=CCACTGGAGACCATGAGTGGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=14779558;WS=14779540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	14804183	rs10407394	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=415;ReadPosRankSum=1.130;SC=TTTGATTGTGACCACTCTGCT;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=26;WE=14804191;WS=14804173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr19	14805719	rs3850141	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=631;ReadPosRankSum=0.605;SC=GGATTTTCCATGCCTGCTGTG;SOR=1.469;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=38;WE=14805727;WS=14805709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr19	14806017	rs3813144	G	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=0.967;SC=GCCATGTGAAGAAGACAGACG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=14806025;WS=14806007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	14817062	rs4808319	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TTTCCTGAGCGAGCAGCTGCC;SOR=1.230;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=16;WE=14817070;WS=14817052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	14817145	rs4809215	G	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGCCTGCTCCGCATTCACGCA;SOR=0.086;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=14817153;WS=14817135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	14817548	rs6511961	T	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=0.671;SC=CAGTGCCTACTCTGGGCCACC;SOR=1.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=28;WE=14817556;WS=14817538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr19	14819310	rs34925577	C	CAG	1914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.928;NF=6;NR=21;PP=1093;ReadPosRankSum=0.969;SC=TCTCAGGGGACGGGAGAGTTC;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=27;WE=14819318;WS=14819300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr19	14826849	rs4078586	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=746;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TTCCCCAGGCTTGCCAGCCTC;SOR=0.344;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=41;WE=14826857;WS=14826839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr19	14828347	rs111714886	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=262;ReadPosRankSum=-0.760;SC=AATTTCTTCCCGTACATAGGA;SOR=1.831;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=14;WE=14828355;WS=14828337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr19	14829749	rs3764626	C	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1094;ReadPosRankSum=-2.464;SC=TATGAGTGCGCGACTTGCGGT;SOR=0.714;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=70;WE=14829757;WS=14829739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,82:0.49:168
chr19	14846897	rs1859257	T	A	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=27;PP=1462;ReadPosRankSum=1.607;SC=ATTGAATGCCTAGCACGCCTT;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=111;TCR=49;TR=90;WE=14846905;WS=14846887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,107:0.55:195
chr19	14857179	rs1029476	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=-1.062;SC=TTTTGAAACCTGTTATCTCTT;SOR=1.984;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=10;WE=14857187;WS=14857169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	14857673	rs117913748	C	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.012;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=355;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TGACCCTCAGCGGGGCAGCGA;SOR=1.872;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=23;WE=14857681;WS=14857663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr19	14857891	rs10403842	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.334;SC=CAACAATATTAAGTGTTTCTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=14857899;WS=14857881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr19	14862430	rs2524383	C	G	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=78;PP=2605;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GCATCCAGGTCAAGGTGGCCA;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=139;TCR=150;TR=152;WE=14862438;WS=14862420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,174:0.51:344
chr19	14862517	rs3752189	A	G	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=70;PP=1791;ReadPosRankSum=0.391;SC=CAGAGCGGCGATCAGATTTGA;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=231;TCF=92;TCR=139;TR=111;WE=14862525;WS=14862507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,128:0.49:259
chr19	14866698	rs28420691	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=0.034;SC=GCCTGCAGGGCGAGGCCAAGG;SOR=1.739;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=14866706;WS=14866688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	14866974	rs2253472	T	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=19;PP=1049;ReadPosRankSum=1.489;SC=ATCTTTAAATTTCTTATTTTT;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=89;TCR=35;TR=65;WE=14866982;WS=14866964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr19	14867186	rs2524386	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=705;ReadPosRankSum=0.765;SC=ACATAAGGGGGGTTAGGTTAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=38;WE=14867194;WS=14867176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr19	14875201	rs7253782	G	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1123;SC=GAAGGAGACAGAAAACATGCA;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=14875209;WS=14875191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	14875388	rs35612307	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=-1.913;SC=GTCCCCAGGGGCCTCCAGCAG;SOR=0.487;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=23;WE=14875396;WS=14875378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr19	14877630	rs6511971	T	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=56.62;MQRankSum=-2.764;NF=5;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-1.109;SC=GTGTGGCGAGTCCTTCCTGGG;SOR=0.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=14877638;WS=14877625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr19	14877799	rs12976472	G	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-8.332;QD=0.64;ReadPosRankSum=-4.321;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,18:0.11:168
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chr19	14885023	rs56957458	A	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQRankSum=0.398;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	14887596	rs2286362	A	G	4288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=102;PP=2570;ReadPosRankSum=1.891;SC=CGGCAGGAGCAGCAGGGGAAA;SOR=1.041;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=310;TCF=127;TCR=183;TR=161;WE=14887604;WS=14887586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,200:0.52:385
chr19	14910210	rs73004304	C	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1020;ReadPosRankSum=0.373;SC=AAGGTGACCACTGAGAGGTGG;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=61;WE=14910218;WS=14910200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr19	14910321	rs16979912	A	G	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1729;ReadPosRankSum=1.499;SC=CCAGTGAAGGAAATCACACCC;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=216;TCF=123;TCR=93;TR=108;WE=14910329;WS=14910311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,132:0.49:269
chr19	14910438	rs10415312	C	T	5697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=108;PP=2965;SC=ATTTCCATTTCGGTGCAGAAG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=66;TCR=108;TR=174;WE=14910446;WS=14910428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	14910573	rs10415562	C	T	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=61;PP=2338;SC=GGGTGACAGACGGCCACGAAG;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=14910581;WS=14910563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	14910654	rs17230134	T	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=-1.109;SC=AAAATCTGACTGAGACAGCCT;SOR=0.345;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=44;WE=14910662;WS=14910644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr19	14938616	rs2190686	T	C	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=63;PP=2210;ReadPosRankSum=1.110;SC=TCCAGGATGCTAGAACCAGCA;SOR=0.705;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=117;WE=14938624;WS=14938596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,129:0.51:253
chr19	14951889	rs3752194	A	G	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=1051;ReadPosRankSum=0.331;SC=CTGTGTGTGAATTGTGGGTGG;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=29;WE=14951906;WS=14951879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr19	14951898	rs3752195	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=474;ReadPosRankSum=-1.550;SC=AATTGTGGGTGGCAGCAGAAC;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=12;WE=14951906;WS=14951879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr19	14974930	rs10407452	G	A	5392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=69;PP=2965;SC=GCTGCAAAATGCATCACCATG;SOR=1.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=112;TCR=69;TR=181;WE=14974938;WS=14974920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	14975040	rs10407682	G	A	2875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1795;ReadPosRankSum=0.157;SC=CAACTGCAATGTCACTAAGCT;SOR=0.610;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=199;TCF=98;TCR=101;TR=111;WE=14975048;WS=14975030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,129:0.56:229
chr19	14975368	rs10415965	A	G	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=78;PP=2593;SC=GTGTGGAGGCAGGAGTCTGAG;SOR=1.590;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=114;WE=14975376;WS=14975358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	14975471	rs11085912	C	T	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=36;PP=1380;SC=ATTCTTGTTTCTCTGAAAATC;SOR=1.098;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=61;WE=14975479;WS=14975461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	14991643	rs10401818	G	A	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1576;ReadPosRankSum=-0.521;SC=AGAAAAAGTGGGGGATTTCCA;SOR=0.558;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=221;TCF=119;TCR=102;TR=100;WE=14991651;WS=14991633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,126:0.46:271
chr19	14991963	rs10404119	C	A	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.435;NF=35;NR=39;PP=1220;ReadPosRankSum=0.950;SC=CAGATGTCTGCAAAGGACAGG;SOR=0.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=74;WE=14991971;WS=14991953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
chr19	14992031	rs10405129	A	G	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.356;NF=27;NR=27;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.114;SC=TGTGGCCAGGATGATGAGCAG;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=54;WE=14992053;WS=14992021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr19	14992042	rs10405136	A	G	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-4.446;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr19	14992045	rs10404335	C	T	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=4.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-4.311;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr19	15052983	rs3044711	T	TATC	7974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=87;PP=2957;SC=GTCCTAAGAGTATCTGCCAGA;SOR=1.198;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=23;TCR=105;TR=108;WE=15052991;WS=15052973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	15061216	rs12461006	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=416;ReadPosRankSum=-1.884;SC=GTACAGGGGAGAAAGAAGCTG;SOR=0.454;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=29;WE=15061224;WS=15061206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr19	15063757	rs2229896	A	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.055;SC=AGTCCACGGCAATGATGAGCG;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=90;WE=15063765;WS=15063747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr19	15064065	rs10417793	A	G	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=163;SC=ATCCCCACCCACCCCGCCCCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=15064073;WS=15064055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	15064858	rs2269913	A	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=9;PP=807;SC=GCTCCAGCTGAGGCCCCCTCC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=15064866;WS=15064848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	15065169	rs757465	T	C	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=160;SC=GGACTGAGGATGGGGCGTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=15065177;WS=15065159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr19	15083693	rs3746295	C	A	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=33;PP=932;SC=CGCTCTCCCGCAGGAACAGGC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=15083701;WS=15083683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	15124474	rs11085935	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=449;ReadPosRankSum=-0.779;SC=ATTCTCTCCTCGTTTTCTAGG;SOR=2.694;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=22;WE=15124482;WS=15124464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr19	15124694	rs11085936	A	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.520;SC=AATTCCTTCAAGCCACACTGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=15124702;WS=15124684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	15131213	rs7248834	G	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=137;SC=GAAATCACTTGCATCCACTTC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=15131221;WS=15131203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	15132545	rs736737	T	C	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=960;ReadPosRankSum=-2.842;SC=GGTGAGAGCCTTCGGGGGTGG;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=60;WE=15132553;WS=15132535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr19	15132574	rs757463	C	G	4616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=63;PP=2965;SC=GTGCCGGTGGCTGGAGGCTGG;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=141;WE=15132582;WS=15132564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	15133762	rs8111625	G	C	4270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=74;PP=2638;ReadPosRankSum=-0.879;SC=AAGAACCTCAGCTGGGGCCTC;SOR=0.916;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=337;TCF=185;TCR=152;TR=174;WE=15133770;WS=15133752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,199:0.49:404
chr19	15162916	rs2239364	T	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-1.569;SC=ACCACTTGAGTGCTATTTGGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=15162924;WS=15162906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr19	15198292	rs8104843	C	G	4028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=68;PP=2258;ReadPosRankSum=-0.233;SC=ATGTGCTCCCCTGTCTGTGGG;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=290;TCF=167;TCR=123;TR=157;WE=15198300;WS=15198282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,194:0.57:343
chr19	15198363	rs76524797	A	C	4510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=84;PP=2662;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CACCTGCCTCATGGCTCAACT;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=317;TCF=154;TCR=163;TR=164;WE=15198371;WS=15198353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,205:0.51:400
chr19	15198507	rs8108721	T	C	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=1710;ReadPosRankSum=1.478;SC=CACCAGCCCATTCTCCTGCAT;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=80;TCR=103;TR=104;WE=15198515;WS=15198497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,122:0.55:220
chr19	15198631	rs8105737	A	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=755;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TCACTGTCCTATGGGACCATC;SOR=0.761;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=40;WE=15198639;WS=15198621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr19	15198720	rs75323205	A	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=907;ReadPosRankSum=-0.612;SC=TGGGGTGTTCATCCCCATGCT;SOR=0.469;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=51;WE=15198728;WS=15198710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr19	15198764	rs12975625	T	C	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=57;PP=2198;SC=GGAACAAGGATATGAAGGCAG;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=107;WE=15198772;WS=15198754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	15219797	rs3214220	TC	T	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CACCCACTGATCAATTGCACA;SOR=0.527;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=5;WE=15219805;WS=15219796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr19	15220295	rs56153523	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=44;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.446;SC=CTCACACTCCCTCCTCCCAGA;SOR=0.651;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=65;WE=15220303;WS=15220285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,86:0.52:166
chr19	15220850	rs2240297	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=303;ReadPosRankSum=1.091;SC=GGTGGGTCCCGCAGCCCGGGC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=23;WE=15220858;WS=15220840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
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chr19	15223466	rs4808977	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=369;SC=TCAGTGTCTTAGGCTTGAAGC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=15223474;WS=15223456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr19	15226611	rs2074261	C	A	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=873;ReadPosRankSum=0.439;SC=CCCCTGGTGACATCTCCCAGA;SOR=0.690;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=56;WE=15226619;WS=15226601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,62:0.65:95
chr19	15226970	rs2074262	G	A	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TACCAGGATCGAGCCAGCGCA;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=109;TCR=110;TR=107;WE=15226988;WS=15226960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,123:0.50:248
chr19	15227030	rs2074263	G	A	3344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1995;ReadPosRankSum=0.410;SC=CGAAGTCCCCGCCATCCACCA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=166;TCR=142;TR=136;WE=15227038;WS=15227020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,167:0.43:391
chr19	15227638	rs875803	A	G	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=928;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GAAACACTCAATGAAAAGAGC;SOR=0.741;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=56;WE=15227646;WS=15227628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr19	15227798	rs12972958	G	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=767;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GTGAGGCTCTGCCGCTGTTCA;SOR=0.635;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=48;WE=15227806;WS=15227788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr19	15229993	rs1131177	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=0.270;SC=GGACAATGACATCCGCCTTCT;SOR=0.572;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=20;WE=15230001;WS=15229983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,23:0.26:88
chr19	15230219	rs12463209	C	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=778;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GCAGGGCTGGCGCTTCTCACC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=56;WE=15230227;WS=15230209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,77:0.49:156
chr19	15233581	rs2074265	C	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=36;PP=1948;SC=AGTAGGGGTACAGCACGTCAA;SOR=1.227;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=15233589;WS=15233571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	15233631	rs2074266	G	A	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=54;PP=2583;SC=GGGACAGGGAGGACGCTGAGT;SOR=0.952;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=127;WE=15233639;WS=15233621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	15235932	rs4141356	G	A	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=19;PP=614;SC=GAACCTCTCCGGAAGAAATCG;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=15235940;WS=15235922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	15271771	rs1044009	G	A	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=50;PP=1745;SC=TGCCCCAGCCGCCGGGTACTC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=15271779;WS=15271761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	15273221	rs757472	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.70;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	15273231	rs4809028	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.58;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	15273248	rs4809029	A	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=372;SC=CACTGCTGACACCCAGTGGAC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=15273256;WS=15273238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	15273381	rs4809030	A	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=24;PP=938;SC=TCCCTGGAGGATGAAGGGGAG;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=15273389;WS=15273371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	15276007	rs2886698	C	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=399;SC=CCCTGAGGCACCCTAAGGACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=15276015;WS=15275997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	15276055	rs2074617	C	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=815;SC=CTTCATGAAGCCTGGTTATGT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=15276063;WS=15276045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	15276143	rs2074618	C	T	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=38;PP=1889;SC=CAGGTGACACCAACCCAGCTT;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=15276151;WS=15276133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	15276919	rs2074619	G	A	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=1.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	15276923	rs10416777	C	T	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.19;SOR=1.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	15277006	rs45591935	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	15277009	rs62113791	CA	TG	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	15277938	rs1548554	C	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=13;PP=1005;SC=TTGCTGAATACACACACCCTT;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=15277946;WS=15277928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	15278057	rs1548555	A	G	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=58;PP=2251;SC=CACTGTCACTAACCTGGGCCA;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=106;WE=15278065;WS=15278047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	15281386	rs2074620	C	A	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=74;PP=2186;SC=AAGCAGAGGGCGGGGCTTCAG;SOR=2.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=13;TCR=74;TR=87;WE=15281394;WS=15281376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	15285052	rs1044006	T	C	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=43;PP=1403;SC=GTAGCTCCTCTGGCGGCAGCA;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=15285060;WS=15285042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	15285272	rs10422818	T	C	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=53;PP=1927;SC=ACAATCCCCTTCCATGCATTC;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=15285280;WS=15285262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	15285382	rs71168591	ATTTT	A	536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=189;SC=TCACTGGATAATTTTTTTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=15285393;WS=15285372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	15289613	rs11670823	A	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=13;NR=5;PP=256;SC=TCCTCCTCCAAAGGCCGCCAC;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=15289621;WS=15289603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	15290125	rs56061231	G	A	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=46;PP=2076;SC=GGTCAAGAGGGAATGAAGACA;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=15290133;WS=15290115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	15290236	rs112197217	G	T	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.898;SC=ATGAACCCCCGTGCTGGCAGG;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=80;WE=15290244;WS=15290226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,92:0.52:176
chr19	15290412	rs2074621	G	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=27;PP=883;SC=GACACACACAGATGTTCAGCG;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=15290420;WS=15290402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	15292088	rs7257550	G	C	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=196;SC=CCCTTATCTCGGCAAGAAGCT;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=15292096;WS=15292078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	15292366	rs11669982	C	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=712;SC=TCCCTGCTCTCCAAGCAGAGG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=15292374;WS=15292356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	15292437	rs1043997	T	C	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=33;PP=1318;SC=CTCCGTAGCCTGGCGGGCAGG;SOR=0.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=79;WE=15292445;WS=15292427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	15294991	rs2074616	C	T	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=519;SC=ATAAATAAAACGGGAAAAGTA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=15294999;WS=15294981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	15295134	rs1043996	G	A	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=61;PP=2450;SC=TGTCCTGATCGCAGGAAGGGC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=15295142;WS=15295124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	15300069	rs10423702	T	C	6601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TCACAGACGATGGAGCTCCCC;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=115;TCR=104;TR=216;WE=15300077;WS=15300059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,247:0.99:249
chr19	15302844	rs1043994	T	C	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=82;PP=2924;SC=ATGGTGAGGGTGCACAGGGCA;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=71;TCR=82;TR=153;WE=15302852;WS=15302834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	15349764	rs113881069	C	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=300;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCCGGGCCTGCTCCAGCGCAT;SOR=0.598;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=21;WE=15349772;WS=15349754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr19	15471856	rs4809184	T	C	4952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=86;PP=2582;SC=ACTCCCCATCTGGGCCCACGT;SOR=0.979;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=62;TCR=87;TR=148;WE=15471864;WS=15471846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	15485350	rs4809185	C	T	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=19;PP=1981;SC=CGGGCTGACCCGCCTGGCCTT;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=84;WE=15485358;WS=15485340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	15508130	rs7247749	G	A	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=29;PP=837;SC=GGGCCCAGGTGCCTAAGATAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=15508138;WS=15508120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	15508362	rs2058322	G	C	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=833;SC=TGTAGATTTGGTGGATGAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=15508370;WS=15508352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	15529777	.	C	G	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=959;ReadPosRankSum=0.255;SC=GCTTCTGCTGCTCTGAACATC;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=70;WE=15529785;WS=15529767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr19	15539439	rs887898	A	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=532;SC=TCCAAGACTCAGGCCGCAGAT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=15539447;WS=15539429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	15549255	rs1005953	C	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=192;SC=AGGTGGCCTTCACTGTGGCTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=15549263;WS=15549250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	15549939	rs929613	C	T	3922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.05;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	15550004	rs148386640	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=926;ReadPosRankSum=1.820;SC=TGTGGGTGGACGGTGCTTTTG;SOR=0.534;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=59;WE=15550012;WS=15549994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr19	15572142	.	GAGGC	G	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.059;NF=2;NR=11;PP=564;ReadPosRankSum=0.086;SC=TCAGAGAGGGGAGGCAGGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=13;WE=15572153;WS=15572132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr19	15648148	rs4310987	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-1.482;SC=TTTTGAGTCACCATTTTCCCT;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=15648156;WS=15648138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr19	15648715	rs11666601	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=-1.563;SC=AGGGCTCAGCGGTCTCCCTTG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=15;WE=15648723;WS=15648705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr19	15651539	rs201608860	GCC	G	1207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.699;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=310;ReadPosRankSum=2.586;SC=GTGAGGCTGGGCCCCCTGGAA;SOR=1.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=8;WE=15651548;WS=15651529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr19	15651548	rs372183725	AAT	A	1212.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.25;ReadPosRankSum=2.332;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr19	15651551	rs372614865	T	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.39;ReadPosRankSum=2.545;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr19	15651553	rs62113202	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.03;ReadPosRankSum=2.153;SOR=1.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr19	15651556	.	G	GAGC	1218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.01;ReadPosRankSum=2.514;SOR=1.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr19	15651560	rs62113205	C	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.791;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr19	15651562	rs139932061	CG	C	1065.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=523;ReadPosRankSum=1.055;SC=GCTGGCCTCCCGAGGGCTGGC;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=8;WE=15651576;WS=15651552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
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chr19	15726721	rs148338083	A	AACTCACTCATTCCTCTGATC	921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;QD=43.89;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	15730498	rs55848814	G	GC	5989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=60;PP=2965;SC=ACCGTCGCTTGTGACGCCTGC;SOR=1.000;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=85;WE=15730510;WS=15730488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	15730502	rs61746468	C	T	5992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=61;PP=2420;SC=TCGCTTGTGACGCCTGCCTTC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=103;WE=15730510;WS=15730488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	15730632	rs11668616	T	C	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=57;PP=1893;SC=TCACATACAATTGGGTCTGGA;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=93;WE=15730640;WS=15730622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	15739084	rs4239613	T	C	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=10;PP=1417;SC=GTGTATGCTCTCTGGATAATT;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=58;WE=15739092;WS=15739074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	15739274	rs2056820	C	T	7351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=111;PP=2965;SC=GAGGAGGGTCCTGGGCAGGGC;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=117;TCR=111;TR=228;WE=15739282;WS=15739264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr19	15739315	rs2056821	T	C	9631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=155;PP=2965;SC=CGGACCTTGTTCTTACTGTCC;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=303;TCF=148;TCR=155;TR=303;WE=15739323;WS=15739305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr19	15739446	rs11669673	G	T	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=70;PP=2965;SC=GGGCCTGGTCGGGGGAGGGGT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=133;WE=15739454;WS=15739436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	15739597	rs2056822	A	C	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=106;PP=2965;SC=GCTTCGACCCAGAAAACGCCC;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=95;TCR=106;TR=201;WE=15739605;WS=15739587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr19	15739992	rs2239366	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=572;SC=ACCTTCCACCTTGGCCCCCAG;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=15740000;WS=15739987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	15740220	rs4239614	C	T	4147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=75;PP=2483;SC=TTTGCACCAACTACCTTTTCA;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=121;WE=15740228;WS=15740210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	15740268	rs2239367	C	G	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.28;SOR=1.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	15740275	rs2283605	G	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.34;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	15757927	rs1290626	T	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=75;PP=2906;SC=TGAGTATCTGTAGGTGAACAG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=140;WE=15757935;WS=15757917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	15760053	rs1053037	G	A	5791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=81;PP=2965;SC=TGGACAGTCTGCAGAAATGTG;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=178;WE=15760061;WS=15760043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	15763577	rs2733750	A	C	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=49;PP=1853;SC=AGGTTGCTGTACACCCTCGGG;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=15763585;WS=15763567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	15763691	rs1805041	G	A	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=38;PP=1673;SC=CAAAGCACCCGGAATACCAGG;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=15763699;WS=15763681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	15763775	rs4646511	G	A	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=54;PP=1709;SC=GAGTGCAGGTGCTGGTGCCCT;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=97;WE=15763783;WS=15763765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	15763798	rs2683039	G	C	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=51;PP=1654;SC=TCCTGAGCCTGTCTCATTGGC;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=85;WE=15763806;WS=15763788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	15763929	rs2683040	C	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=144;SC=ACTGTCTGGGCAAAGGTTATA;SOR=3.611;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=15763937;WS=15763919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	15769625	rs1915390	A	G	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=42;PP=1819;SC=CCCAGGTAAGAGCGGCCTGTG;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=15769633;WS=15769615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	15770012	rs56167713	T	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.05;QD=24.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	15770027	rs55876862	A	T	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=160;SC=CTCCCTCCCCAAGGAACTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=15770035;WS=15770017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	15784061	rs7254013	C	A	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=47;PP=2070;SC=TTCCTGGTAACTGGACTCCTA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=98;WE=15784069;WS=15784051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	15784116	rs7253210	G	A	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=62;PP=2047;SC=GACTCTAATCGGCCCATCTCT;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=106;WE=15784124;WS=15784106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	15784152	rs17641206	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=411;ReadPosRankSum=-1.340;SC=GTTACCAGGTTACTGGAGGCC;SOR=0.890;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=28;WE=15784160;WS=15784142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr19	15784167	rs7254627	A	G	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=47;PP=1453;SC=GAGGCCACTTAGTTGTTGGTT;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=15784175;WS=15784157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	15784195	rs10414690	G	C	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.37;SOR=1.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	15784200	rs55794585	C	T	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	15784214	rs56398124	C	T	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=26;PP=860;SC=TCTCAGCCCTCGTTTACTCAC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=15784222;WS=15784185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	15784285	rs56205003	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=617;SC=ACACTGTCCCCGGAGCTCTTC;SOR=0.957;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=15784293;WS=15784275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	15784319	rs56124328	G	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=981;SC=TCCTCACCCTGCATCCCCTCT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=15784327;WS=15784309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	15784386	rs16995378	C	T	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=32;PP=2234;SC=CCGGTGGCAACGTCCCCATGG;SOR=1.667;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=109;WE=15784394;WS=15784376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	15784617	rs61666630	A	G	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=59;PP=1708;SC=TCAGTGAGCTAGGTATTGATG;SOR=2.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=71;WE=15784625;WS=15784607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	15784660	rs62104452	A	G	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=629;SC=GAGAAGCAAGAGAGATGGCTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=15784668;WS=15784650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	15788996	rs28523893	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=761;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GGCTATCTGGGCATCCCTTAG;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=44;WE=15789004;WS=15788986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr19	15789034	rs28416595	C	A	4589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=50;PP=2756;SC=CTAAAATTAACCATCACAGGA;SOR=1.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=89;TCR=50;TR=139;WE=15789042;WS=15789024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	15789098	rs609636	A	G	5157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=80;PP=2965;SC=GGGCTTGAAGAACTCGACCCA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=156;WE=15789106;WS=15789088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	15789140	rs609290	A	G	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=79;PP=2678;SC=GGGCTTTACGATATGGCTGGG;SOR=1.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=124;WE=15789148;WS=15789130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	15791132	rs2074568	T	A	2589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=64;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GTGAAAGGGGTTGGGGACAAC;SOR=0.925;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=240;TCF=97;TCR=143;TR=101;WE=15791140;WS=15791122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,124:0.43:288
chr19	15791180	rs8100667	C	T	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=108;PP=2965;SC=CTCTTGCCCACTGTCCTTGGC;SOR=1.479;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=56;TCR=108;TR=164;WE=15791188;WS=15791170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	15793062	rs7253816	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-0.048;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr19	15793068	rs7254785	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.11;NF=12;NR=2;PP=160;SC=GTCTGGTCCTCGCTGGCAATG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=15793076;WS=15793052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	15793235	rs2285888	T	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.129;NF=38;NR=39;PP=955;ReadPosRankSum=-1.990;SC=GGGCAGCAGTTGTCTGGACAT;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=77;WE=15793243;WS=15793225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,84:0.48:175
chr19	15795842	rs2018030	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=24;PP=1011;SC=GTCCACCCTCCGGTGCTGAAG;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=15795850;WS=15795832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	15807884	rs593818	A	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1372;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCTGAATGTAAGCTTGCAGTG;SOR=0.661;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=220;TCF=109;TCR=111;TR=92;WE=15807892;WS=15807874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,117:0.44:266
chr19	15808025	rs11669240	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=0.403;SC=AAGGGGCCTAACCTGGGTGGG;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=15808033;WS=15808015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr19	15838746	rs11672695	A	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1124;SC=GCTTGGACAGATGAAGGAGGC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=15838761;WS=15838736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	15838753	rs34728106	AG	A	2027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.23;NF=42;NR=3;PP=1847;SC=CAGATGAAGGAGGCGCTCTCA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=15838761;WS=15838736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	15838967	rs2285955	G	A	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=25.313;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.217;NF=82;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=2.298;SC=ACCTGTTCACGCTGCTGGGCA;SOR=0.275;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=191;TCF=96;TCR=95;TR=176;WE=15838975;WS=15838957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:15,215:0.93:230
chr19	15839168	rs2003905	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.76;MQRankSum=2.154;QD=13.54;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr19	15839174	rs2285956	C	T	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=26.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQRankSum=3.068;QD=30.56;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=0.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,62:0.85:73
chr19	15839459	rs11669315	G	A	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=968;ReadPosRankSum=0.984;SC=GCGTGGGCTTGGTATGTATCA;SOR=0.658;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=58;WE=15839467;WS=15839449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr19	15839921	rs11669723	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=102;ReadPosRankSum=0.136;SC=TATATGACAACACTCATCACA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=15839929;WS=15839911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr19	15852872	rs2240228	G	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=969;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TGTCTTCATTGTGGCTGCCAT;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=70;TCR=67;TR=69;WE=15852880;WS=15852862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,99:0.54:185
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chr19	15882980	rs3752143	AT	GG	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.588;NF=13;NR=21;PP=1210;ReadPosRankSum=0.442;SC=GGCCAGAGAAATGAAGACGGC;SOR=0.623;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=34;WE=15882989;WS=15882970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,16:0.20:82
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chr19	15890388	rs7259595	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=407;SC=GAGTGAGTGAATGAGCCGCCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=15890396;WS=15890383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15890517	rs11669449	A	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=892;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CTGCTGCCACACTCACGAGGT;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=52;WE=15890525;WS=15890507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr19	15890625	rs11673423	C	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=49;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GCCAGGAAGCCGGCCAGGAGC;SOR=0.515;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=153;TCF=56;TCR=97;TR=81;WE=15890633;WS=15890615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
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chr19	15890777	rs55926517	G	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	15890800	rs56180406	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=-1.408;SC=CAGTGGAGAGAAGCAGGGAAG;SOR=0.631;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=15890808;WS=15890790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	15904853	rs11085991	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1171;ReadPosRankSum=0.694;SC=ACTAGGGGTGGCCGCCATGCA;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=98;TCR=78;TR=81;WE=15904861;WS=15904843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,99:0.48:206
chr19	15905002	rs4808379	T	C	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.544;NF=28;NR=27;PP=860;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TCATGGCCACTGTCTGGAGCG;SOR=0.537;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=55;WE=15905010;WS=15904992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,62:0.42:148
chr19	15905206	rs4808380	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.894;NF=19;NR=11;PP=383;ReadPosRankSum=0.013;SC=TCCTGCTCACTGTCATGGGCT;SOR=0.725;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=30;WE=15905214;WS=15905196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr19	15905431	rs4808381	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.344;NF=33;NR=37;PP=804;ReadPosRankSum=1.429;SC=CCTGTGGAGATGATGTGCTGG;SOR=0.645;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=77;TCR=87;TR=70;WE=15905439;WS=15905421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,75:0.41:185
chr19	15905639	rs3746151	C	T	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.631;NF=38;NR=37;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.281;SC=CGTCATTTACCTGAAGCCCAA;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=75;WE=15905647;WS=15905629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr19	15905941	rs56117700	T	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.31;QD=31.93;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	15918434	rs1859299	C	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.279;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.891;NF=17;NR=26;PP=555;ReadPosRankSum=1.587;SC=CGCAGCCCCGCGGGCTCATGA;SOR=1.346;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=43;WE=15918442;WS=15918424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr19	15918455	rs61739573	G	A	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.967;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.514;NF=32;NR=35;PP=1073;ReadPosRankSum=0.718;SC=GCACGTTGTAGCGCAGGGGGT;SOR=0.287;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=67;WE=15918463;WS=15918445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,68:0.67:101
chr19	15918802	rs4808383	C	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.200;NF=28;NR=32;PP=820;ReadPosRankSum=0.568;SC=ACAGAGAAGCCGACGAGGATG;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=60;WE=15918810;WS=15918792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr19	15932760	rs3761011	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=825;ReadPosRankSum=-0.926;SC=GCATTTTCACATCTTTGAAGG;SOR=0.519;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=60;WE=15932768;WS=15932750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
chr19	15932941	rs3761012	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=41;PP=1505;SC=GTTTGCGTCCAAGGCGATCTC;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=15932949;WS=15932931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	15934656	rs10411865	A	G	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=55;PP=1935;SC=TGAGACTGACAGCCCTGGGTA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=15934664;WS=15934646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	15989811	rs201777106	T	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.251;NF=3;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=1.688;SC=ATCAAGCCGGTAACCTGGCCT;SOR=0.664;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=9;WE=15989819;WS=15989801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr19	15989857	rs376410257	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.113;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GTTTGAGGAATAGAGAAGGGG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=4;WE=15989865;WS=15989847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr19	15990048	rs3093198	A	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=18;PP=1151;SC=GGTGAGGGAAAGAGAGCTGGA;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=15990056;WS=15990038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	15996820	rs2074900	G	A	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=30;PP=1245;SC=GCTTTGCAAGGTGGTACAGGA;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=60;WE=15996828;WS=15996810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	15997136	rs3093159	A	AC	2185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=15;NR=34;PP=1212;SC=GAAGGCAGTAACCCCCCCCAA;SOR=0.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=49;WE=15997144;WS=15997126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	16024538	rs1060467	A	G	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=52;PP=2561;SC=GGTGGGTAGGACAGTCACTGT;SOR=1.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=131;WE=16024546;WS=16024528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	16024662	rs1064796	G	C	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=71;PP=1935;SC=AGTGCAGCAGGGTGAGCGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=116;WE=16024670;WS=16024652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	16025176	rs1060463	C	T	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=20;PP=1089;SC=TTCTCTTGGTCGAAACGGAAG;SOR=1.098;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=52;WE=16025184;WS=16025166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	16025312	rs12985248	T	G	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=38;PP=1559;SC=GTGTCTCCATTGAGGAGAGGT;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=72;WE=16025320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	16033379	rs4808409	G	T	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=39;PP=1079;SC=GATGTCTCTTGGTCACCACCA;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=16033387;WS=16033369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	16034714	rs8104361	A	G	8446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=158;PP=2965;SC=GGGAGGGTGCAGCGCCGCTCC;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=115;TCR=158;TR=273;WE=16034722;WS=16034704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr19	16035517	rs3746156	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=676;SC=TCCTTTTCCAGCCTACTCCCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=16035525;WS=16035516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	16038334	rs2219358	G	A	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=53;PP=1712;SC=GGAGAGGGGTGAGAGAAGGAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=78;WE=16038342;WS=16038324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	16038390	rs2305803	G	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=597;SC=GCACTTCCACGCATCCCACCC;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=16038398;WS=16038380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	16040292	rs3765070	A	G	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=27;PP=1020;SC=TAGGCCGGATAATGTCAGGGT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=16040300;WS=16040282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	16040473	rs4808414	T	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=414;SC=CCTGAATTAATCATGAATTCC;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=16040481;WS=16040463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	16045141	rs2305801	T	C	5099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=103;PP=2965;SC=GCCAGGAGCCTCCAACCAGCA;SOR=1.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=56;TCR=103;TR=159;WE=16045149;WS=16045131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	16060827	rs1594685	T	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=26;PP=807;SC=CTGTTGTAAGTGTTCAGGTAT;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=16060835;WS=16060817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	16130594	rs11669662	G	C	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	16130604	rs7250074	T	C	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.08;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	16131679	rs757545	T	C	6468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=134;PP=2965;SC=ATGTTGGGACTCCACCAACGC;SOR=1.558;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=63;TCR=134;TR=197;WE=16131687;WS=16131669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	16136405	rs4808423	C	T	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=33;PP=1710;SC=GCCCTGAAACCCGGCCCTGCC;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=86;WE=16136413;WS=16136395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	16136528	rs140634016	G	GCAGCACCTGGC	4388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=29;PP=2986;SC=GGCAGCCGGGGCAGCACCTGG;SOR=0.761;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=43;WE=16136536;WS=16136518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	16136923	rs757546	T	C	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=70;PP=2199;SC=AGCACTCATCTGGGGTTGGCA;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=125;WE=16136931;WS=16136913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	16137025	rs757547	C	A	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=726;SC=AAACCCAGCCCAGCAAGCAGC;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=16137033;WS=16137015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	16137052	rs757548	A	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=744;SC=CCGGGCCCCCAAGCCCGCCAG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=16137060;WS=16137042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	16146400	rs17683335	A	G	7252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=103;PP=2965;SC=GTGCATGGAGATGGAGTCCCT;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=120;TCR=103;TR=223;WE=16146408;WS=16146390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr19	16186815	rs10633690	C	CCA	1491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=5;PP=607;SC=GGGACGTGACCCCCCCCCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=22;WE=16186823;WS=16186805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	16192898	rs3826722	A	G	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=67;PP=2408;SC=GTTTGCTTTTAGAAAATGGGG;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=124;WE=16192906;WS=16192888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	16192958	rs3786577	A	G	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=51;PP=1588;SC=CAAGGTCACAAGGACATGCAT;SOR=1.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=69;WE=16192966;WS=16192948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	16197377	rs2303150	C	T	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=45;PP=1551;SC=GATGGCGCAGCAGCAGGAAGT;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=16197385;WS=16197367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	16197421	rs2303149	A	G	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=47;PP=1557;SC=TAGGGAGGACACCGGGGCCAA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=16197440;WS=16197405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr19	16229122	rs2233146	C	T	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=55;PP=1396;ReadPosRankSum=0.582;SC=CTCTGTCATTCTCTCCACCTG;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=50;TCR=92;TR=84;WE=16229130;WS=16229112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,111:0.58:192
chr19	16232508	rs55692650	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=224;ReadPosRankSum=1.790;SC=TCTCCTACTGAGGACAGTTAT;SOR=0.725;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=16;WE=16232516;WS=16232498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr19	16238279	rs1043308	C	T	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=928;ReadPosRankSum=-0.198;SC=AGATGATACTCGGGAACAAGT;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=65;WE=16238287;WS=16238269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr19	16242887	rs200560717	T	TTTGG	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.06;ReadPosRankSum=1.245;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr19	16254422	rs4321304	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=428;ReadPosRankSum=-0.975;SC=TGACTTGAGCTGTCCTTGTTC;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=22;WE=16254430;WS=16254412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr19	16254597	rs35735569	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=581;ReadPosRankSum=-0.175;SC=ATGTGACCCAAGAGCCTCAGC;SOR=0.537;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=43;WE=16254605;WS=16254587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,53:0.43:123
chr19	16254694	rs2446366	A	G	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=803;SC=GGGATTTTCTAGGGGCATGGG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=16254702;WS=16254684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	16265247	.	C	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=214;ReadPosRankSum=-2.175;SC=ATCTCTTCCTCTACTCCAACG;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=17;WE=16265255;WS=16265237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr19	16265494	rs111524	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=1.168;SC=CTTTCTGCCTGTCACCTACCC;SOR=1.447;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=16265502;WS=16265484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	16268207	rs5827321	TA	T	7081.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=96;PP=2975;SC=CGGCAGCAGCTAAAAAAGCCA;SOR=0.858;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=50;TCR=102;TR=140;WE=16268215;WS=16268197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	16275515	rs6512086	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=799;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GTGGGCGGTGACGGAGAGCAT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=43;WE=16275523;WS=16275505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr19	16275655	rs6512087	C	T	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.338;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1576;ReadPosRankSum=-1.065;SC=GGCACTCAGCCCCCCCCGCGT;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=183;TCF=84;TCR=99;TR=101;WE=16275663;WS=16275645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,116:0.54:214
chr19	16275772	rs4808461	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=674;ReadPosRankSum=0.907;SC=CAGGAGGGCTAGGCCGGCTGT;SOR=0.274;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=41;WE=16275780;WS=16275762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr19	16280634	rs2003419	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=504;ReadPosRankSum=0.975;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCGGT;SOR=1.296;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=27;WE=16280642;WS=16280624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr19	16301312	rs206231	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.516;SC=ACTCACCTCCATGTCTCTTCT;SOR=1.171;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=25;WE=16301320;WS=16301302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr19	16301544	rs2242143	G	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=430;ReadPosRankSum=0.820;SC=GGGAGCCCAGGGTTCAGGAGT;SOR=0.457;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=32;WE=16301552;WS=16301534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr19	16320075	rs2290802	C	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=338;ReadPosRankSum=0.926;SC=GGCAAAGCCCCGAGAGCCGTT;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=22;WE=16320083;WS=16320065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr19	16321047	rs7258138	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr19	16337423	rs2305939	T	C	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=759;ReadPosRankSum=0.615;SC=CATTACAGCCTAGGGCAGGGT;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=43;WE=16337431;WS=16337413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
chr19	16338532	rs2124904	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=784;ReadPosRankSum=-0.324;SC=CTGGGCTGTCGGCAGACTCCT;SOR=0.913;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=49;WE=16338540;WS=16338522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr19	16339069	rs2305937	G	A	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=957;ReadPosRankSum=0.266;SC=TCTCTGGCCCGTCCCAGGAGC;SOR=0.253;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=141;TCF=36;TCR=105;TR=67;WE=16339077;WS=16339059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,77:0.50:153
chr19	16339715	rs3752797	C	T	3100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=76;PP=2062;ReadPosRankSum=2.636;SC=ACAGCGAGATCGTGTGGTCCA;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=97;TCR=147;TR=126;WE=16339723;WS=16339705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,143:0.50:288
chr19	16344528	rs2279060	C	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=402;ReadPosRankSum=1.586;SC=CAGTCAGCTGCAATCAGGACC;SOR=0.678;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=23;WE=16344536;WS=16344518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr19	16345099	rs897774	T	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.776;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=630;ReadPosRankSum=0.029;SC=AGTGAGGCCCTACCCGTGGGG;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=39;WE=16345107;WS=16345089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr19	16435717	rs8106384	T	C	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=29;PP=1039;SC=CCGCGTCCTTTCTCCCCGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=16435725;WS=16435707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	16436262	rs3745318	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=30;PP=786;SC=GATGCGCCGCTGGGGCCCGCA;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=53;WE=16436270;WS=16436252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	16513357	rs34782743	CT	C	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr19	16539347	rs71178694	G	GAAGA	1331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=45.92;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	16547778	rs33914440	C	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=547;ReadPosRankSum=-0.047;SC=CTGCAGAGGGCGGTGTGACCA;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=34;WE=16547786;WS=16547768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr19	16582785	rs7252649	G	T	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=13;PP=415;SC=TCCGAGCGCCGGGGGAACGGG;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=16582793;WS=16582775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	16591464	rs9305079	G	A	5484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=79;NR=87;PP=2965;SC=AATTATCTGCGTACTCTTCAT;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=79;TCR=87;TR=166;WE=16591472;WS=16591454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	16593189	rs138347151	CAACAA	C	1880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=6;PP=1595;SC=GACCCTGTCTCAACAAAACAA;SOR=3.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=26;WE=16593211;WS=16593179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	16593203	rs75847259	A	G	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.78;QD=39.85;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	16593415	rs8100755	G	A	4465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=86;PP=2965;SC=AACCATATGGGGTGGTCTCAA;SOR=1.246;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=140;WE=16593423;WS=16593405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	16594967	rs10413787	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=377;SC=TTAAATCCTCAATTTCTTTTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=16594987;WS=16594957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	16594979	rs7252242	C	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=51.22;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	16601154	rs3810196	T	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=14;PP=1584;SC=CTAGAAGTGGTTGTGTTGCAC;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=16601162;WS=16601144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	16601194	rs3810198	C	T	4624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=43;PP=2885;SC=TAATATAGTACTGCGATTTTC;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=100;TCR=43;TR=143;WE=16601202;WS=16601184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	16606742	rs3810199	G	C	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=57;PP=1910;SC=GGGGACCCTCGAGGATTCGAG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=16606750;WS=16606732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	16606766	rs3810200	G	C	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=41;PP=1404;SC=TCGCTGCCGTGGACCCCGTGG;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=16606774;WS=16606756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	16611527	rs62118143	T	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=0.226;SC=TGTGAGCTTTTGCCAAGTAGG;SOR=2.303;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=16611535;WS=16611517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr19	16611978	rs728116	T	C	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=30;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCGCCGATGCTGGTCTTCCAA;SOR=1.008;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=153;TCF=93;TCR=60;TR=84;WE=16611986;WS=16611968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,98:0.54:181
chr19	16612011	rs728117	T	C	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=44;PP=1328;ReadPosRankSum=0.309;SC=GAATCCTCTCTGGGGGTGCAC;SOR=0.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=104;WE=16612019;WS=16612001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,122:0.51:240
chr19	16612365	rs7251978	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.572;NF=1;NR=15;PP=447;ReadPosRankSum=-1.460;SC=TATTTTCGGTGAGATTTTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=16;WE=16612376;WS=16612355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr19	16612368	rs11397471	A	AT	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.519;NF=0;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=-2.038;SC=TTTCGGTGAGATTTTTTTTTT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=11;WE=16612376;WS=16612355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr19	16617646	rs28716321	T	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.938;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr19	16631322	rs2303119	T	C	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=47;PP=867;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GGGTCCGCTGTGGGGAGAGGC;SOR=0.926;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=152;TCF=48;TCR=104;TR=64;WE=16631330;WS=16631312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr19	16631776	rs8111801	G	C	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CCACAAGGAAGTCGTGAAAAA;SOR=0.820;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=74;WE=16631784;WS=16631766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,98:0.48:204
chr19	16633950	rs1043481	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=33;PP=1175;SC=TGATGTGGGGTGGGCCCTGTC;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=16633958;WS=16633940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	16641501	rs45537744	G	C	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1485;ReadPosRankSum=1.425;SC=GGTGGGAGGAGAGAGAGGCCG;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=92;WE=16641509;WS=16641491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,110:0.50:222
chr19	16665857	rs731617	C	T	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=10;PP=1136;SC=TGGCAAAGCTCTGACATACAA;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=16665865;WS=16665847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	16675947	rs11673650	C	T	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1055;ReadPosRankSum=1.301;SC=GCAGACCCTGCAGGTGGCAAA;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=49;TCR=81;TR=72;WE=16675955;WS=16675937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr19	16677289	rs1559201	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=0.739;SC=CAACAAAGCACCTATTCTGGA;SOR=0.432;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=10;WE=16677297;WS=16677279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr19	16682261	rs62116871	G	A	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1427;ReadPosRankSum=0.765;SC=CACGTCACCAGTTGGCAACAG;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=92;TCR=82;TR=97;WE=16682269;WS=16682251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,116:0.57:205
chr19	16764802	rs372368447	A	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=575;ReadPosRankSum=0.217;SC=CTGGAGAAGGAGACTAAGAGA;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=37;WE=16764810;WS=16764792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
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chr19	16855990	rs7247028	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.449;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=1.115;SC=GCGAAAGGGGAAATTCCTTAT;SOR=1.196;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=10;WE=16855998;WS=16855980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
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chr19	16860105	rs706764	G	A	5720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=94;PP=2965;SC=CTGCCTGGACGCTGATGCCCA;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=174;WE=16860113;WS=16860095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	16872940	rs773852	G	A	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=64;PP=2274;SC=CACTGAACTTGGACCGAAAGG;SOR=1.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=96;WE=16872948;WS=16872930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	16876099	rs4808526	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=44;PP=1332;SC=TTTTCATCAATTCTCATACCT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=16876107;WS=16876089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	16890361	rs189090180	C	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=38;ReadPosRankSum=-0.904;SC=ATTCACTTCTCTGTATTGAAA;SOR=1.148;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=7;WE=16890369;WS=16890351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr19	16899838	rs2608737	A	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=782;SC=ACCCTCGCCAACTCTGCTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=16899846;WS=16899828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	16905474	rs2431802	G	T	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=166;SC=GGTTAGCAACGTTTTCTGCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=16905482;WS=16905464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	16923494	rs773894	C	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.34;SOR=2.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	16976286	rs773911	A	G	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	16976289	rs2303091	T	C	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	16988456	rs2303090	A	G	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=32;PP=981;SC=CAGAGGTAAGAGGCCCTGAGA;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=16988464;WS=16988446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	16988476	rs2258663	T	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=695;SC=ATGCATGCTCTGTTCCTTCCT;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=16988484;WS=16988466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	16999897	rs773905	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=169;SC=GGTTTATCTCTACCGGCGCGA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=16999905;WS=16999888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	17000131	rs773904	G	A	3493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=59;PP=2092;SC=TGGCTTTGGGGTGCAGAGATG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=109;WE=17000139;WS=17000121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	17000231	rs773903	C	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=670;SC=CTCTGTATCCCGTCTCTGACC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=17000239;WS=17000221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	17000632	rs773902	G	A	5243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=84;PP=2965;SC=GAACCTCGCGGCTGCTGACCT;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=170;WE=17000640;WS=17000622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr19	17003789	rs773901	T	G	4509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=67;PP=2666;SC=ACGTGTATTCTTGTCAATATC;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=145;WE=17003797;WS=17003779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	17006714	.	GCA	G	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.728;NF=2;NR=11;PP=629;ReadPosRankSum=1.583;SC=GCGCGCGCACGCACACACACA;SOR=0.596;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=13;WE=17006723;WS=17006704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr19	17006738	rs2981474	A	G	1052.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.127;NF=15;NR=24;PP=846;ReadPosRankSum=-0.038;SC=ACACACACACACGCGCGCGTG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=39;WE=17006746;WS=17006728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr19	17008578	rs2608732	G	C	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=27;PP=1289;SC=GTGGGCTGTGGGTGCTGACGT;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=17008586;WS=17008568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	17011950	rs77345177	A	AC	3378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=37;PP=2460;SC=AGCCAGCCTGACCTGGGTGCC;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=17011958;WS=17011940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	17017878	rs56408444	G	A	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1272;SC=GGCCAGGGGCGCAGCAGACTC;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=17017886;WS=17017868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	17025292	rs706761	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=878;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CAGCGGGACAGTGCCGTGGAT;SOR=0.476;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=52;WE=17025300;WS=17025282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr19	17025311	rs45485597	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=938;ReadPosRankSum=0.822;SC=ATCCCACCCTGCAAGGGGACT;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=58;WE=17025319;WS=17025301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr19	17032550	rs3745331	A	G	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr19	17032559	rs3745332	T	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr19	17107825	rs3745337	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=723;ReadPosRankSum=0.537;SC=CAGGGGATCCGTTTTCAGCTG;SOR=1.008;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=44;WE=17107833;WS=17107815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr19	17108053	rs12974937	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.47;MQRankSum=-0.451;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr19	17108135	rs3745340	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.124;NF=24;NR=24;PP=710;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GTCGAAGTCCCGGGAGCCGAG;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=48;WE=17108143;WS=17108118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr19	17108283	rs12982311	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=0.800;SC=GGCATACCCAATCTATGCCAC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=17108291;WS=17108273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr19	17111297	rs4808551	A	G	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1337;SC=CATGTTGATCATTAAGGCACC;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=17111305;WS=17111287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	17111411	rs4808064	A	G	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=62;PP=2084;SC=GGCCAGGTTGACATAGTGTGG;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=96;WE=17111419;WS=17111401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	17112874	rs3745342	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.994;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr19	17112881	rs3745343	T	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr19	17112921	rs3745344	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=190;ReadPosRankSum=0.459;SC=AGGGGAGGGGCACACCCCAGG;SOR=0.324;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=14;WE=17112929;WS=17112911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	17113001	rs12972329	C	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=325;ReadPosRankSum=0.223;SC=AGGGGAACGACCTTGAGGGAG;SOR=0.574;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=24;WE=17113009;WS=17112991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr19	17113147	rs3745345	A	G	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=973;ReadPosRankSum=-2.566;SC=TCAGAAGCTCAAACTTGGGCA;SOR=0.861;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=73;WE=17113155;WS=17113137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,90:0.55:163
chr19	17119560	rs897768	T	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=42;PP=976;SC=CAGAAGGGGATGGGCTGGGCC;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=17119568;WS=17119550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	17137290	rs11878608	A	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=1000;ReadPosRankSum=0.550;SC=TCGCTGCAACACTCTGAGCCA;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=64;WE=17137298;WS=17137280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,81:0.56:145
chr19	17137450	.	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.442;NF=2;NR=18;PP=367;ReadPosRankSum=0.533;SC=GGGCGCCGCTCATTTTTCGGC;SOR=1.893;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=20;WE=17137458;WS=17137440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr19	17166981	rs2278997	G	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=357;SC=TCCCAAGAGAGCCAAGTGGAT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=17166989;WS=17166971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	17169758	rs2305757	G	C	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=75;PP=2347;SC=CCAGCAGGGGGAGAACTCTGG;SOR=1.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=121;WE=17169766;WS=17169748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	17170540	rs1551552	GG	AT	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=504;SC=TTCTAATGATGGGTTTATTGG;SOR=4.548;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=17170549;WS=17170530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	17170885	rs1130222	C	T	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=63;PP=2646;SC=TCACCCTTTCCGACCCCACTG;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=137;WE=17170893;WS=17170875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	17173487	rs3816550	A	G	3909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=58;PP=2281;SC=TCACTGCCCGAGGACCATGGC;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=119;WE=17173495;WS=17173477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	17179789	rs2305754	G	A	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=28;PP=1418;SC=AATTCCAGTTGCTCAGAACCT;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=72;WE=17179797;WS=17179779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	17186127	rs2305752	A	C	9624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	17186136	rs2305751	C	A	10305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.59;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr19	17256032	rs59360945	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=0.617;SC=GTTGCAGTGAGCCAAGATTGT;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=15;WE=17256040;WS=17256029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr19	17264961	rs2305769	G	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.07;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	17264961	.	GCC	CCT	958	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=11;NR=23;PP=958;QD=29.749055143;SC=GTCAGAGGCAGCCTGCCCTGG;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=34;WE=17264971;WS=17264951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,34:0.92:37
chr19	17264963	rs2305768	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.33;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	17273753	rs12980061	C	T	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=8;PP=1025;SC=CTGGCTCCCTCGGGGTGCACC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=17273761;WS=17273743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	17273893	rs7256689	G	T	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=48;PP=2130;SC=ATGAGCAGCTGCAGTATTACT;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=17273901;WS=17273883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	17283303	rs2279008	T	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=1010;SC=TGTCTGCCCATCACCACTGGT;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=17283311;WS=17283293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	17283383	rs11463235	A	AG	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=11;PP=801;SC=GCGAGGTTCCAGGTGCTCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=18;WE=17283391;WS=17283373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	17296679	rs2279004	G	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=30;PP=1454;SC=ACAGAACAGCGGCTGTCAGGG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=17296687;WS=17296669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	17298679	rs7249926	G	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=490;SC=GCCTGAGCCAGCAACAGACTT;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=17298687;WS=17298669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	17298724	rs9305088	G	C	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=18;PP=1007;SC=CCTGCCTGATGTCTCGCATTC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=17298732;WS=17298714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	17298893	rs3826689	G	T	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=42;PP=1449;SC=CACCTGTTCCGTGGCAAAGGC;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=17298901;WS=17298883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	17298946	rs3826690	T	C	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=31;PP=988;SC=GAGTGTAAACTCAGCAGGTTG;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=17298954;WS=17298936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	17299009	rs3826691	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=447;SC=AGGCTGAGGCAGGCGGATCAC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=17299017;WS=17298999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	17301706	rs62126162	G	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=530;SC=CACACACCTCGGCCTCCCAAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=17301714;WS=17301704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	17301733	rs34092109	T	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=815;SC=GGAGTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=17301741;WS=17301723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	17301863	rs962919	G	A	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=71;PP=2965;SC=TCGCTGGCCAGAACACTCACC;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=151;WE=17301871;WS=17301853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	17301880	rs4808072	T	C	5152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=77;PP=2965;SC=CACCTAGATTTTCCTTTCTCC;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=154;WE=17301888;WS=17301870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	17302056	rs962918	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=351;SC=TCGGGGCACTACAAACCCACA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=17302064;WS=17302046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17302112	rs10541498	ACT	A	83.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=63.51;NF=0;NR=3;PP=94;SC=CCCCAGGGCCACTCTCTGAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=17302121;WS=17302102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	17303460	rs4808594	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=202;SC=ACACCAGCCTAGGTCTCACTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=17303468;WS=17303451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	17303774	rs1545620	T	G	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=36;PP=1714;SC=CCTCCAGGCCTCATGGAGGGG;SOR=1.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=17303782;WS=17303764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	17305440	rs1064305	T	C	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1719;SC=CAAGAGCAGGTGCTGAGGAGG;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=17305448;WS=17305430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	17306031	rs2279003	T	C	5594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=88;PP=2965;SC=CACCGGCCCCTGGCAGCGCCC;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=89;TCR=88;TR=176;WE=17306039;WS=17306021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr19	17311442	rs2305766	C	G	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=5;PP=725;SC=TCCTGTCCCCCCTCAGCCCCC;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=17311450;WS=17311432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	17312992	rs2305765	C	T	7462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=114;PP=2965;SC=ACCAGATCGTCGTCAGCAACC;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=223;WE=17313000;WS=17312982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr19	17313178	rs11392202	A	AT	360.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.07;NF=0;NR=10;PP=410;SC=CGCCATCCTTAGCCACGCCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=17313186;WS=17313168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	17313619	rs8101251	C	A	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=7;PP=1398;SC=CCAGGGGGGCCCCCGCCAACC;SOR=2.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=17313627;WS=17313609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	17313833	rs2305764	G	A	7354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=108;PP=2965;SC=TTTTTCCCCCGGCATATACGG;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=117;TCR=108;TR=225;WE=17313841;WS=17313817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr19	17316253	rs2305763	T	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=63;PP=1914;SC=GAGCAGCCAGTAGGGGGCGGC;SOR=1.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=17316261;WS=17316243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	17316782	rs7248508	T	C	3658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=51;PP=2415;SC=GAGCCAGGCGTTGAGCCTGGC;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=119;WE=17316790;WS=17316772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	17317252	rs2279002	A	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=26;PP=811;SC=CGCTGTGACCAGCCCAGGAGG;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=17317260;WS=17317242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	17317955	rs8110964	A	G	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=23;PP=1180;SC=ACCGCATGTCACCTGGGGCGC;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=17317963;WS=17317945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	17321487	rs12982797	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=473;SC=TCGCCCACTCAGAGATGTCAG;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=17321495;WS=17321477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	17321669	rs12463169	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=956;SC=CAAGTGGCTCAGTCCCCTCCC;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=17321677;WS=17321659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	17330060	rs414528	T	C	4519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=67;PP=2177;SC=GAGAAGCAGTTGGCAGCTGAG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=135;WE=17330068;WS=17330050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	17336962	rs7255142	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GCCAGGTCAGCCCCGCCCCCA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=17336970;WS=17336952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	17337223	rs2288542	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=39;ReadPosRankSum=0.911;SC=TGCGCGCCCTGGAGGTCGAGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=5;WE=17337231;WS=17337213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
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chr19	17343560	rs6512178	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.133;SC=GATGGCTCACGGCCACAGTCC;SOR=2.419;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=8;WE=17343568;WS=17343550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	17351535	rs2288539	G	A	3316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=81;PP=2127;ReadPosRankSum=-0.048;SC=ACTGGCACTGGTTCCGGTGGT;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=245;TCF=95;TCR=150;TR=130;WE=17351543;WS=17351525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,153:0.52:293
chr19	17360878	rs3745168	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GCCTGGCCACACCCCATCAGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=17360886;WS=17360868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	17361064	rs10415471	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=428;ReadPosRankSum=1.488;SC=GCTGGGGAGGCGGGAGGGGAG;SOR=1.209;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=32;WE=17361072;WS=17361054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr19	17362526	rs10469471	A	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=40;PP=1297;SC=GTTGCGAAGGAGAAGAGAGGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=17362534;WS=17362516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	17362941	rs7247493	A	C	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=652;SC=TCAGAGACCCACATCTGGTTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=17362949;WS=17362931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	17366110	rs35026554	CA	C	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-0.944;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.540;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
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chr19	17366313	rs12459398	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=892;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AGCAGGAGCACGTGAGCTGGA;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=55;WE=17366321;WS=17366303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,62:0.57:108
chr19	17367435	rs9676419	T	C	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=78;PP=2831;SC=AGAATCTTCATTAGAGAACGG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=68;TCR=78;TR=146;WE=17367443;WS=17367425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	17367585	rs4464206	G	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=423;SC=GGTGGGTTAAGTTCATGCCAA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=17367593;WS=17367575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	17370190	rs11880383	T	G	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1350;ReadPosRankSum=0.209;SC=TGTATCCCTGTAGCACAGCTG;SOR=0.808;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=81;WE=17370198;WS=17370180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,108:0.51:210
chr19	17374726	rs8112782	G	C	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=842;ReadPosRankSum=0.526;SC=GTAGGTGTGTGAGCAGAGCAG;SOR=0.904;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=47;WE=17374734;WS=17374716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr19	17382505	rs10420922	A	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=39;PP=1164;SC=CAGCCATGGCAGGGAGGGTCC;SOR=2.119;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=17382513;WS=17382495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	17392483	rs7246262	C	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=20;PP=863;SC=TCCTCCCACCCGGGCTCTTAT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=48;WE=17392491;WS=17392473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	17392629	rs35586766	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=1.647;SC=CCTGGAGAGGGGCCCCCCGAG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=19;WE=17392637;WS=17392619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr19	17392894	rs8100241	G	A	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=826;ReadPosRankSum=0.555;SC=GCGCTGCGGCGCGGACCCTAA;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=59;WE=17392902;WS=17392884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,70:0.49:142
chr19	17393015	rs1864116	C	T	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.42;NF=3;NR=22;PP=597;SC=GACCCCAACGCTCGGTAAGAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=17393023;WS=17393005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	17393504	rs1864113	G	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=9;PP=768;SC=TGGCCGCCGCGTGGGGCTGCC;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=17393512;WS=17393494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17393530	rs8108174	T	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=517;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GGCCTGGAGCTGCTGCTGAGC;SOR=0.216;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=34;WE=17393538;WS=17393520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr19	17393925	rs56069439	C	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=0.216;SC=CTATTTGTGGCCAGCTCTTTC;SOR=0.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=17;WE=17393933;WS=17393915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr19	17394124	rs2363956	T	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GACATTGGCTTGGAGGCTGAC;SOR=1.152;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=62;WE=17394132;WS=17394114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr19	17394504	rs891017	A	C	7630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=117;PP=2965;SC=ACGGACACCAACCCCTGGAGC;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=109;TCR=117;TR=226;WE=17394512;WS=17394494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr19	17395003	rs11086065	A	G	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=50;PP=1749;SC=CAGTTTGAGCAGCCAGATCCT;SOR=1.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=17395011;WS=17394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	17395055	rs11882562	C	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=36;PP=1118;SC=CTAGCTTCACCTATCTGCTGC;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=17395063;WS=17395045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	17395182	rs4808614	G	T	263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=276;SC=ATCATCAGCTGCTTCTTCTTC;SOR=1.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=17395200;WS=17395172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	17395192	rs60208686	CT	C	216.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=166;SC=GCTTCTTCTTCTTTTTTTTTA;SOR=2.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=17395200;WS=17395172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	17396549	rs751599	T	C	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=54;PP=1845;SC=GTGGTTGCGGTGTTGTGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=17396557;WS=17396539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	17396761	rs891018	T	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=354;SC=AACCTGCACATGCATGTATTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=17396769;WS=17396751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	17397483	rs367668712	G	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=1.049;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.188;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr19	17397493	rs371454519	G	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=0.806;QD=12.52;ReadPosRankSum=2.291;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr19	17397497	.	GTGTT	G	394.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=0.806;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.840;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr19	17397501	rs1465582	T	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-0.854;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr19	17397700	rs10401700	A	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=353;SC=GGGCAACTCCACCTGGAATAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=17397708;WS=17397690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	17403414	rs113634768	C	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GGCGCAGGCTCGGGCCTCCTC;SOR=0.375;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=17;WE=17403422;WS=17403407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr19	17416590	rs3217329	CT	C	3812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=43;PP=2628;SC=CCAACGGCCTCTTTTTTGCAC;SOR=1.347;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=81;WE=17416598;WS=17416580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	17417080	rs11548548	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=791;ReadPosRankSum=1.513;SC=AGCCGAGCAACATCAAACGCA;SOR=0.592;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=54;WE=17417088;WS=17417070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,64:0.40:159
chr19	17417130	rs201529220	C	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=666;ReadPosRankSum=-1.210;SC=AGCACGCCGGCCGGCGTGCAG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=47;WE=17417138;WS=17417119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr19	17417252	rs2288464	C	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=1.209;SC=CCTTGCCTGGCGCTATTTTTG;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=17417260;WS=17417242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	17424898	rs374142177	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=390;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CGCGGACTCCGTGTGCAAAGC;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=27;WE=17424906;WS=17424888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr19	17424932	rs2288463	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=23;SC=TGTTCCTGGGACTGGGAGGAA;SOR=0.818;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=45;WE=17424940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	17424947	rs12327712	T	G	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=22;PP=963;SC=GAGGAATTGGTCACTTCCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=17424955;WS=17424937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	17434587	rs12977101	T	G	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=24;SC=GCCAGCAGCCTGCGGGCGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=17434595;WS=17434577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	17435851	rs755124	G	T	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1485;ReadPosRankSum=-1.159;SC=TGGTGGCTCCGGCCCCTGCAG;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=98;WE=17435859;WS=17435841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,112:0.47:237
chr19	17435884	rs755123	T	C	6393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=109;PP=2965;SC=ATGTGGCCCCTGACGAGAGGA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=100;TCR=109;TR=209;WE=17435892;WS=17435874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr19	17438642	rs8102944	A	G	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=91;PP=2965;SC=AGAAGAGCACAACGTAGCCGA;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=89;TCR=91;TR=180;WE=17438650;WS=17438632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr19	17438923	rs113207944	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=384;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CGGTGTGTCCCGTCCCCGGCG;SOR=0.313;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=22;WE=17438931;WS=17438913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr19	17439320	rs76655932	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.258;SOR=1.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr19	17440542	rs8110408	C	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=731;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GCAGGGGGGACTGCCGCTGGG;SOR=0.795;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=54;WE=17440550;WS=17440532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,57:0.38:151
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chr19	17448961	rs1864112	A	C	9122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=146;PP=2965;SC=GAATTCTCACAGCACCCCGAG;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=303;TCF=157;TCR=146;TR=303;WE=17448969;WS=17448951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr19	17449157	rs75326392	C	G	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.535;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,132:0.29:460
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chr19	17449699	rs45541332	A	G	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=934;ReadPosRankSum=0.419;SC=GGGCTGGACAAATTGGGTGTG;SOR=0.471;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=206;TCF=119;TCR=87;TR=68;WE=17449707;WS=17449689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,73:0.32:229
chr19	17450016	rs3810206	T	C	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=69;PP=1882;SC=CGCTCAGGGGTGCACGTAGTG;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=17450024;WS=17450006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	17450446	rs4808623	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=300;ReadPosRankSum=-0.613;SC=GGAACGCGGGGCCCTTTCTCT;SOR=0.166;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=18;WE=17450454;WS=17450436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	17451736	rs75893526	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=170;ReadPosRankSum=1.843;SC=TCCTCCCTCCCGACCTCACGC;SOR=0.148;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=17451744;WS=17451726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr19	17452527	rs919333	G	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=192;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATCCAGGGAAGTCGCACCCAA;SOR=0.407;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=15;WE=17452535;WS=17452517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr19	17488141	rs10417806	A	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
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chr19	17514440	rs919265	G	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=459;SC=TCCCCGCCCCGCTTCCCCAGC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=17514448;WS=17514430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17514646	rs113321277	T	TGGG	8869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=81;PP=2924;SC=GCGGTACAGATGGCAAATCAG;SOR=1.167;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=6;TCR=91;TR=87;WE=17514654;WS=17514636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr19	17516400	rs111617488	A	AGCTGAAAG	5363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=46;PP=2965;SC=TCTCCCCTTTAGAGTCTGGCC;SOR=1.629;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=49;WE=17516408;WS=17516390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	17531450	rs2303680	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=548;ReadPosRankSum=1.391;SC=TCCAGTAAGGGCTGCTTCGGA;SOR=0.446;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=36;WE=17531458;WS=17531440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr19	17533126	rs2303678	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=367;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TCACTCCCCTACCCCCCACTC;SOR=0.365;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=22;WE=17533134;WS=17533116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr19	17534693	rs2288408	T	C	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=39;PP=1964;SC=ATCTTCCTACTTCCCTCTCCC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=17534701;WS=17534683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	17534898	rs13345062	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=359;ReadPosRankSum=0.893;SC=TCTCAGGGAGCCTGGGTCTGC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=27;WE=17534906;WS=17534888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr19	17535546	rs4808636	C	T	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=30;PP=1370;SC=CCTGAGGGGCCGGCACCCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=17535554;WS=17535536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	17535658	rs4808637	A	C,G	2949.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=30,30;NR=20,28;PP=712,880;SC=CTAAGTACCCACTCTGCCATT;SOR=0.882;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=60;TCR=48;TR=50,58;WE=17535666;WS=17535648;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.52:125
chr19	17535867	rs201974585	CCTCACTGCATCCTGGGGCCACCCCCA	C	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.733;NF=0;NR=6;PP=739;ReadPosRankSum=-1.585;SC=GGCCACCCCCCCTCACTGCAT;SOR=0.418;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=17535900;WS=17535857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr19	17544165	rs10415889	C	T	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=40;PP=1596;SC=AGATCACCTCCGTTTGTAAAG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=17544173;WS=17544155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	17547292	rs4808641	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=2.405;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
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chr19	17559076	rs4808643	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGCAGCAGCGTCCCGGCCGCG;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=28;WE=17559084;WS=17559066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
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chr19	17622614	rs11086075	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=481;ReadPosRankSum=0.019;SC=CGCGCTCGGCCTGTCGGGCGG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=34;WE=17622622;WS=17622604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr19	17628587	rs6743	A	G	3326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=58;PP=2047;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TGACCCTCACACTACCTGTCC;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=241;TCF=138;TCR=103;TR=137;WE=17628595;WS=17628577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,159:0.55:290
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chr19	17643065	rs12984143	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=550;ReadPosRankSum=-0.899;SC=GCTCCCTCTTTCTGCAGAAGC;SOR=0.841;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=35;WE=17643073;WS=17643055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr19	17648350	rs8107859	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=250;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CTTCAGGGCATAGGTGGGTCT;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=13;WE=17648358;WS=17648340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr19	17651370	rs11878663	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=880;ReadPosRankSum=0.483;SC=AGAGCCCCTCAGGCACGCGGC;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=61;WE=17651378;WS=17651360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
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chr19	17660300	rs11666267	G	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1317;ReadPosRankSum=0.673;SC=CACTCTGGACGGCTGCTTGGA;SOR=0.887;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=84;WE=17660308;WS=17660290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,98:0.51:191
chr19	17679597	rs3848645	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=671;ReadPosRankSum=-0.636;SC=CCAGTTCAGAACACACTGAAG;SOR=1.094;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=33;WE=17679605;WS=17679587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr19	17691751	rs891184	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=1.064;SC=TGGGGTTTCACGGTGGGTCTG;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=25;WE=17691759;WS=17691741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr19	17692324	rs8100092	T	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=368;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGACATCAGGTCCACCTCTGG;SOR=0.386;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=24;WE=17692332;WS=17692314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr19	17721045	rs140453033	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=0.473;SC=GAGGCCAAGGCGGGTGGATCA;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=17721053;WS=17721035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	17728502	rs2287851	T	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=690;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GCGGTCTGGGTACCCTTACCC;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=45;WE=17728510;WS=17728492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr19	17729148	rs2287849	C	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=519;ReadPosRankSum=0.036;SC=AATGTGGGTCCGAGGCGAGCC;SOR=0.177;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=28;WE=17729156;WS=17729138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr19	17729672	rs56145097	T	TG	2001.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.298;NF=12;NR=36;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CACATGAGTTTGGGGGGCAGT;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=28;TCR=86;TR=48;WE=17729680;WS=17729662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,85:0.44:195
chr19	17729787	rs56257446	T	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.211;NF=9;NR=19;PP=520;ReadPosRankSum=1.121;SC=GGTAACAACATACAGCTGGGT;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=28;WE=17729795;WS=17729777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
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chr19	17735631	rs148883310	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=676;ReadPosRankSum=-0.991;SC=CCCCCTGCAGGTCTCACCGTC;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=43;WE=17735639;WS=17735621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
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chr19	17750183	rs11882798	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=262;ReadPosRankSum=1.545;SC=TCACTTGTCCTGGGAGCTGGG;SOR=0.687;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=21;WE=17750191;WS=17750173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr19	17750207	rs11879994	C	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=299;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CCTAGAGAACCCTCCTTGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=23;WE=17750215;WS=17750197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr19	17758368	rs4808675	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CCAAGGCGAGAGCCCCGCCCC;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=21;WE=17758376;WS=17758358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr19	17760232	rs11665838	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=743;ReadPosRankSum=0.747;SC=CCCCCAACCCCAGGTTGACCA;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=44;WE=17760240;WS=17760222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,53:0.41:129
chr19	17760508	rs73009926	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.189;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=0.455;SC=TGGGTCCCTCAAAAAAAAGAT;SOR=3.327;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=17;WE=17760516;WS=17760498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
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chr19	17763392	rs1159365	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=572;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CCAGCCTTGGACTTGGGGTTC;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=39;WE=17763400;WS=17763382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr19	17766900	rs34752754	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=837;ReadPosRankSum=0.436;SC=TCACGCTGGGCATAGCTGCCC;SOR=0.412;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=51;WE=17766908;WS=17766890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr19	17769166	rs7258943	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.134;SC=CTTACGGTGCCGCTACCGAAG;SOR=0.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=17769174;WS=17769156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	17777431	rs10424761	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=516;ReadPosRankSum=1.422;SC=TTCAGCTGATACCCAAGGAAG;SOR=0.400;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=36;WE=17777439;WS=17777421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr19	17777508	rs9305092	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=-2.401;SC=CATCTTGGAACGAATACTGAA;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=20;WE=17777516;WS=17777498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr19	17778832	rs7248783	A	G	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=12;PP=872;ReadPosRankSum=0.335;SC=AGGGAAAGACAAGCTTAGAGA;SOR=1.209;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=118;TCF=87;TCR=31;TR=56;WE=17778840;WS=17778822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr19	17783019	rs4808677	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=-0.048;SC=AGAGCAAGATGGAAGGTGTAT;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=14;WE=17783027;WS=17783009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr19	17837090	rs12975100	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=1060;ReadPosRankSum=1.143;SC=ACAGCCTCCCCGGCCTCAACA;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=55;WE=17837098;WS=17837080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,72:0.54:134
chr19	17837512	rs12983721	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1080;ReadPosRankSum=1.935;SC=CCGCCCGCCTGCCTCCTGGAC;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=76;WE=17837520;WS=17837502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,85:0.58:147
chr19	17844325	rs2287860	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=571;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TAAGCTGTGTTCCCCAGGCCA;SOR=0.869;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=35;WE=17844333;WS=17844315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr19	17881171	rs12327667	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=451;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CTGACATCACGTGGAGTGTTT;SOR=0.973;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=29;WE=17881179;WS=17881161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr19	17881552	rs3746197	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=179;ReadPosRankSum=-1.201;SC=CTGGGGGAGGCCCCCTGAGTA;SOR=0.760;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=10;WE=17881560;WS=17881542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
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chr19	17885308	rs2287858	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-0.163;SC=ACCCCTGCCCGGTCTGGCCCA;SOR=0.193;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=20;WE=17885316;WS=17885298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr19	17885325	rs2287857	A	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CCCAGGCTAGACCGAGATCCC;SOR=0.238;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=16;WE=17885344;WS=17885315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr19	17885336	rs2287856	C	T	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=565;SC=CCGAGATCCCCTCCCCTGCCC;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=17885344;WS=17885315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	17886940	rs2287854	G	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=1056;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GGGCCACCGCGGGCAGCCTCA;SOR=0.877;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=55;WE=17886948;WS=17886930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr19	17887024	rs2287853	T	C	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=56;PP=2364;SC=GCTGGATGCATTCGTGTGTGA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=105;WE=17887032;WS=17887014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	17887563	rs13345379	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=2.279;SC=CCATGTCTCCGCCTGGTGTTC;SOR=0.512;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=9;WE=17887571;WS=17887553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	17888787	rs4808690	G	A	96.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr19	17888847	.	C	CA	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5165;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=18;MQ=59.82;NF=3;NR=1;PP=46;QD=13.0;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=4;WE=17888855;WS=17888837;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,4:0.31:13
chr19	17889044	rs34062212	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=256;ReadPosRankSum=0.343;SC=ACAGGTGATGGGGATAAGGGA;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=17;WE=17889052;WS=17889034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	17892193	rs2287852	G	C	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=42;PP=2323;SC=TGGGGGTCGCGTCTGGGGTCC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106;WE=17892201;WS=17892183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	17892478	rs2042299	A	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=9;PP=405;SC=CTATATTCACACTGTCTATCC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=17892486;WS=17892468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	17892591	rs2042298	A	G	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=27;PP=1105;SC=CAGCCTTCACAGAGTATGTCC;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=17892599;WS=17892581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	17894878	rs265558	C	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=647;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GGGCATGTCCCGAGGATTGGG;SOR=1.058;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=41;WE=17894886;WS=17894868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr19	17895707	.	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=449;ReadPosRankSum=-1.338;SC=CTGTGACCAACGTCCGCTTGC;SOR=0.437;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=28;WE=17895715;WS=17895697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr19	17898717	rs265553	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GGCAAGCCCCGGGGTGTGGGG;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=18;WE=17898725;WS=17898707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr19	17922795	rs36686	G	A	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CCATCGCAACGCCTGTCCTCC;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=64;TCR=126;TR=189;WE=17922803;WS=17922785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr19	17932138	rs6523	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TCGCCTCCGGTCGCAGGCCTC;SOR=0.928;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=23;WE=17932146;WS=17932128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr19	17937429	rs3008	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=408;ReadPosRankSum=0.160;SC=ATGCAATGTCATGGGGGTGTT;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=31;WE=17937437;WS=17937419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr19	17940705	rs60485073	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=0.240;SC=TAAGGCATTACTATTCTCATT;SOR=0.910;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=17940713;WS=17940695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr19	17941294	rs2302603	T	C	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=433;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GGCTGGGGGCTCTGGGAAGCC;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=30;WE=17941302;WS=17941284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr19	17942005	rs3212774	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=764;ReadPosRankSum=0.490;SC=GCCGTGGGGAATAGGGGCGGA;SOR=1.319;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=43;WE=17942013;WS=17941995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr19	17946054	rs2072496	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=2.064;SC=GAAAATGCCCGGGAGGGTTTG;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=15;WE=17946062;WS=17946044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr19	17951178	rs3212741	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=0.412;SC=AGGGAATGGGGAGGAGTCAGA;SOR=0.364;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=20;WE=17951186;WS=17951168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr19	17952185	rs3212733	G	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.571;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=367;ReadPosRankSum=1.793;SC=GGGAATGGGGGACAGGTCCTT;SOR=1.162;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=23;WE=17952193;WS=17952175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
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chr19	17955021	rs3212711	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
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chr19	18047521	rs12151269	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=498;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CAGGCGCTGTCGCTCACGCCT;SOR=0.178;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=29;WE=18047529;WS=18047511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr19	18053340	rs4808105	T	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=145;SC=TTGTTCCTGGTATGTCCCCTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=18053348;WS=18053331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	18053557	rs4808106	C	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=1.556;SC=TCAAGGGCGGCAAGGCGCCGC;SOR=0.818;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=12;WE=18053565;WS=18053547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	18054643	rs1052564	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=-1.683;SC=CGCCGGGCCCCGGGGCCATGC;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=8;WE=18054651;WS=18054633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	18096073	rs2278993	G	A	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=33;PP=2493;SC=GGAGGCAAAGGGGATGGTATA;SOR=1.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=83;TCR=33;TR=116;WE=18096081;WS=18096063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	18170265	rs3833286	T	TC	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=413;ReadPosRankSum=-1.847;SC=CATCTAGGGTTCCCCCGCAGG;SOR=0.148;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=13;WE=18170273;WS=18170255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr19	18171886	rs383483	A	G	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1471;ReadPosRankSum=1.960;SC=CTTGTCCAGCATGTGCACCCA;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=106;WE=18171894;WS=18171876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,132:0.48:273
chr19	18177573	rs17878265	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=0.447;SC=ACAGTGGCTCGCACCTGTAAT;SOR=0.035;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=18;WE=18177581;WS=18177563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr19	18180413	rs401502	C	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=721;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GCAAGGCCCCCGTCCTGGCCC;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=46;WE=18180421;WS=18180403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr19	18180451	rs375947	A	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.723;SC=GCAATACGTCATGCTCTGAGC;SOR=0.812;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=73;WE=18180459;WS=18180441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,83:0.52:161
chr19	18180646	rs391410	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AGGGCCAGGGGTGTCTGTGTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=18180654;WS=18180636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr19	18186575	rs17852635	G	A	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.076;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=928;ReadPosRankSum=1.313;SC=GAACGCACACGGGGCTGCTCC;SOR=1.136;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=55;WE=18186583;WS=18186565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr19	18186618	rs11575934	T	C	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=1003;ReadPosRankSum=0.556;SC=GCTCCCCAGCTGCCGTCGTCG;SOR=1.140;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=62;WE=18186626;WS=18186608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr19	18186752	rs429774	T	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.019;NF=21;NR=43;PP=937;ReadPosRankSum=-0.450;SC=AACCATCATGTGCTTATTGAG;SOR=1.223;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=64;WE=18186760;WS=18186742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr19	18186824	rs17885316	C	CT	539.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.361;NF=1;NR=14;PP=551;ReadPosRankSum=1.585;SC=AGGCCAGGCCCTGTCCTCTTA;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=15;WE=18186832;WS=18186814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr19	18191664	rs11086087	C	G	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1027;ReadPosRankSum=0.018;SC=GCTGCAGGGTCACCTCAGGAG;SOR=0.833;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=59;WE=18191672;WS=18191654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr19	18218444	rs62123561	A	G	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.268;SC=TTCACCTGGGACTGGCGGGCT;SOR=0.547;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=72;WE=18218452;WS=18218434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr19	18232754	rs11086090	G	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=623;ReadPosRankSum=-2.328;SC=CCGGCTTTGGGAGACAGTGCG;SOR=0.561;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=115;TCF=43;TCR=72;TR=47;WE=18232762;WS=18232744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,59:0.38:154
chr19	18232778	rs273483	A	G	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=64;PP=1856;SC=ACCACGGGCAAGGGTTGGGCA;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=93;WE=18232786;WS=18232768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	18233279	rs273486	C	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=354;SC=GGCAGCTGGACTCACGGGGGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=18233291;WS=18233269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	18233283	rs55849352	C	CG	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.649;SC=GCTGGACTCACGGGGGGGCTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=18233291;WS=18233269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	18234005	rs12611216	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1113;ReadPosRankSum=0.357;SC=TCATGGCTCTGATCCCCACCA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=79;WE=18234013;WS=18233995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,85:0.46:185
chr19	18234441	rs740691	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=517;ReadPosRankSum=0.307;SC=TGATGAATCACGTGTACCGGG;SOR=0.968;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=38;WE=18234449;WS=18234431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr19	18234567	rs740692	G	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=204;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTGCCAGTCTGTTCATTTCTG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=12;WE=18234575;WS=18234557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr19	18235352	rs123202	T	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=20;PP=1451;SC=GGAGACCCAGTGGGTGAGCTG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=18235360;WS=18235342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	18235424	rs123203	T	C	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=36;PP=2405;SC=AACCAAGCCCTGGGTGACCAG;SOR=1.537;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=116;WE=18235432;WS=18235414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	18242669	rs3826967	G	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	18242675	rs273497	C	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.99;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	18245512	rs2270623	C	T	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1326;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GAGAGTTCATCGACAAGCAGG;SOR=0.523;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=77;WE=18245520;WS=18245502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,89:0.47:190
chr19	18245807	rs12983325	C	T	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.07;ReadPosRankSum=2.917;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr19	18245813	rs273499	T	C	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.95;SOR=1.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	18248146	rs541225	T	C	12504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=210;PP=2965;SC=AGCTCGAAGCTGAGGATGATA;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=403;TCF=193;TCR=210;TR=403;WE=18248154;WS=18248136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,476:1.00:476
chr19	18252829	rs613339	A	G	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=39;PP=1497;SC=ACATCCGGTAAGTGGCCTGGG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=76;WE=18252837;WS=18252819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	18255359	rs8108738	G	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=555;ReadPosRankSum=2.248;SC=TCTGGATGCCGGCCGGGGCCG;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=38;WE=18255367;WS=18255349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr19	18255593	rs11086092	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=1.194;SC=GAGGCTGGGGATGAGCCCCAG;SOR=0.845;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=32;WE=18255601;WS=18255583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr19	18256418	rs11305984	TC	T	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=931;SC=GAGTAGGAGTTCCCCCAGGAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=26;WE=18256426;WS=18256416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	18257750	rs2072490	C	T	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=514;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TCAAGGTGGGCCCCGCCCGGA;SOR=0.517;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=37;WE=18257758;WS=18257740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr19	18257875	rs273279	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GGCGGGGCCACGGGGACTGGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=18257883;WS=18257865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	18258459	rs1566030	A	G	255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=7;PP=194;SC=ACCCCCCACCACCCCGGCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=18258467;WS=18258449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	18272190	rs2241088	A	C	175.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=4;PP=59;SC=CCGCGTGGCCAGCCGCGCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=18272198;WS=18272180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	18273047	rs1011320	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=11;PP=991;SC=AAAGCCGGCCTCCACAGTCCT;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=18273055;WS=18273037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	18273410	rs2006885	A	G	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=288;SC=TCAAGAATGGAGGGCCAGGCA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=18273418;WS=18273400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	18276856	rs4808755	T	C	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=46;SC=AATGACACTCTGATAGAGGGA;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=18276864;WS=18276854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	18276891	.	G	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CTCCGTATCAGAGTTGAGATG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=18276899;WS=18276881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	18277187	.	G	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.230;SC=GAAGGAAGCAGAAGGAGGCCA;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=9;WE=18277195;WS=18277177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr19	18277206	rs3730179	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-1.377;SC=CAGCCACTTGGAGGCAAAGAG;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=18277214;WS=18277196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr19	18278041	.	G	C	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1240;ReadPosRankSum=0.422;SC=TCGGACAACAGAGAGATCGAC;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=82;WE=18278049;WS=18278031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,95:0.44:215
chr19	18279638	rs273269	T	C	7025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.457;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.941;SC=AGATGCTGAGTGGCAAGCGGG;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=119;TCR=93;TR=211;WE=18279646;WS=18279628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr19	18279816	rs3746187	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=609;ReadPosRankSum=-1.510;SC=CATCCGGGACAGGGGAGCACG;SOR=0.413;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=35;WE=18279824;WS=18279806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr19	18280096	rs149081991	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=136;ReadPosRankSum=0.136;SC=GCCGCCTGCCGCCCGCTGAGC;SOR=1.061;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=11;WE=18280104;WS=18280086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	18284651	rs2241089	G	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=467;ReadPosRankSum=-1.529;SC=CCCCTGCTGCGATGACCCTGT;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=26;WE=18284659;WS=18284641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
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chr19	18305578	rs16982263	G	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=229;SC=TTCTTGGTTTGCTTCCCAGGC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=18305586;WS=18305568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	18305824	rs2271881	C	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=944;ReadPosRankSum=1.244;SC=TCGTGCCCCCCCAATTTCGAG;SOR=0.452;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=192;TCF=114;TCR=78;TR=71;WE=18305832;WS=18305814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,94:0.38:247
chr19	18306751	rs62120383	G	A	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=768;ReadPosRankSum=-0.080;SC=AGGGCAGGTAGAGGGACAGGG;SOR=1.226;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=44;WE=18306759;WS=18306741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr19	18306990	rs17683509	G	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1084;ReadPosRankSum=-1.194;SC=CTTCAGCTCCGGAGCATTGGG;SOR=1.009;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=80;WE=18306998;WS=18306980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr19	18307108	rs1044821	C	T	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GAACCTCATGCGACCTGTGAC;SOR=1.034;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=82;WE=18307116;WS=18307098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,91:0.46:199
chr19	18308508	rs8109807	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=1.262;SC=ACCCTGGCCACGCCCTATGCC;SOR=0.223;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=18;WE=18308516;WS=18308498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr19	18309365	rs2271882	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=595;SC=TCTGCATGGCAAACTCCTACA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=18309373;WS=18309355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	18311111	rs3803919	A	G	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr19	18311199	rs1046565	A	G	2643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1580;ReadPosRankSum=0.471;SC=TGAAGCCCATAGCGCCCCGGT;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=93;TCR=105;TR=104;WE=18311207;WS=18311189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,124:0.54:229
chr19	18322095	rs12611244	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=619;SC=ACCTGTGGCGGGGGGTGGGGC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=18322103;WS=18322085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	18324329	rs2302209	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=0.786;SC=AGGTGACAGGCGCGAGGACCC;SOR=0.380;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=19;WE=18324337;WS=18324319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr19	18329240	rs1042050	T	C	6806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=107;PP=2965;SC=GGTAGTGACCTTCCAGCATCA;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=97;TCR=107;TR=204;WE=18329248;WS=18329230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr19	18329784	rs2229228	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=165;ReadPosRankSum=0.062;SC=TGTGAGGGGCCGGTTCCCACT;SOR=0.870;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=11;WE=18329792;WS=18329774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr19	18331357	rs5827400	AC	A	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=931;SC=GGCCTGCCCAACCCCCCCGCT;SOR=2.303;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=34;WE=18331365;WS=18331347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	18331859	.	T	TCCGCCAGGCCCCGCCCCACC	97.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	18337260	rs4808768	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CCGAGCGCCGGCTGCGCGGGA;SOR=1.901;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=18337268;WS=18337250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	18344273	rs35421958	AC	A	1526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.944;NF=10;NR=31;PP=574;ReadPosRankSum=-1.960;SC=GGCTGAAGAGACCCCCCCCCA;SOR=0.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=41;WE=18344281;WS=18344263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr19	18358783	rs4808122	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-0.061;SC=ACACCTGTCCAGGTTCAGCAG;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=18358791;WS=18358773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	18368810	rs999813	G	T	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=965;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CCGCCTGGGAGGCACCACCGC;SOR=0.487;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=73;WE=18368818;WS=18368800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,87:0.49:179
chr19	18368969	rs999814	G	A	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=977;ReadPosRankSum=0.835;SC=AGGATTCTGGGGGCTATAGGA;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=65;WE=18368977;WS=18368959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,79:0.43:184
chr19	18368988	rs999815	G	A	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=829;ReadPosRankSum=1.068;SC=GAGTCCTGCCGTCTCCACGGT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=67;WE=18368996;WS=18368978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr19	18369120	rs2891654	G	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=511;ReadPosRankSum=-0.095;SC=TCCCCAGTGCGGATGACGGGC;SOR=0.664;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=31;WE=18369128;WS=18369110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
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chr19	18369270	rs3810433	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=470;ReadPosRankSum=1.580;SC=CTACCATGCACGGATCTGTAG;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=36;WE=18369278;WS=18369260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr19	18375563	rs12608744	G	A	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.916;SC=GCATGCTCTGGGGCAGGGCTT;SOR=0.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=68;WE=18375571;WS=18375553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr19	18375659	rs12608843	C	T	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=1630;ReadPosRankSum=-1.850;SC=CTTTGGCCAACAGAGTGCGGA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=120;TCR=76;TR=104;WE=18375667;WS=18375649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,124:0.53:234
chr19	18376407	rs8110972	T	A	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TACAGGCACATACACGTGAGG;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=75;WE=18376415;WS=18376397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,85:0.52:163
chr19	18376522	rs2277922	T	G	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1200;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TGTTTCTGGGTGCCAGTCTTG;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=69;WE=18376530;WS=18376512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr19	18377274	rs3746186	A	G	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=820;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GGTGGTGGTCATCGTGGACGC;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=49;WE=18377282;WS=18377264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr19	18377496	rs8104533	C	G	3464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=66;PP=2112;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGTCCGGGCACTTACACGTTT;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=153;TCR=144;TR=136;WE=18377504;WS=18377486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,163:0.46:357
chr19	18377647	rs8103906	G	C	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=1122;ReadPosRankSum=0.143;SC=AGGAAGGCCAGCCCCCGGACT;SOR=0.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=59;WE=18377655;WS=18377637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr19	18378219	rs1469023	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=798;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CATTTTGTCCAGGAGACTGGG;SOR=0.814;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=56;WE=18378227;WS=18378209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr19	18391142	rs41352349	A	AG	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-0.795;SC=ACACTCGGGGAGGGGGGGTCC;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=18391150;WS=18391132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	18392873	rs7247222	C	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.924;SC=TCCCGCATGGCTAAATAACTC;SOR=0.619;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=8;WE=18392881;WS=18392863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr19	18392894	rs7247237	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=136;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CTTGGCGCCTCCTGCTCTGCT;SOR=0.450;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=12;WE=18392902;WS=18392884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr19	18392913	rs7247767	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=0.589;SC=CTGTGCCGCCAGGGCCTCCCC;SOR=0.593;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=12;WE=18392921;WS=18392903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr19	18423402	rs2232968	T	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CGTTGGTGGGTGCAGCACCCA;SOR=1.000;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=158;TCF=103;TCR=55;TR=68;WE=18423410;WS=18423392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,74:0.40:183
chr19	18426950	rs2232965	T	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=320;ReadPosRankSum=-1.597;SC=GTCCCACCCATGACTCATAGA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=28;WE=18426958;WS=18426940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr19	18451381	rs7251555	A	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=349;ReadPosRankSum=0.257;SC=ACCGGGGGCGAGGCCGGGGGC;SOR=0.176;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=23;WE=18451389;WS=18451371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr19	18453629	rs66732430	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=259;ReadPosRankSum=0.864;SC=ACTGGGAAGGGCCACTCTTGG;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=20;WE=18453637;WS=18453619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr19	18466840	rs34068189	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.848;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=607;ReadPosRankSum=-1.482;SC=TGCCAAGGGGCGGCACTTCCT;SOR=1.345;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=38;WE=18466848;WS=18466830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr19	18496989	rs141542836	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=-2.153;SC=AGAGCCGCAACCTGCACAGCC;SOR=0.730;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=18496997;WS=18496979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	18497024	rs1059519	G	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=353;ReadPosRankSum=-0.688;SC=ACTCAGGACGGTGAATGGCTC;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=17;WE=18497032;WS=18497014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr19	18497141	rs1059369	T	A	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1259;ReadPosRankSum=0.257;SC=AGAGTTGCACTCCGAAGACTC;SOR=0.866;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=83;WE=18497149;WS=18497131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,99:0.58:170
chr19	18497305	rs199975964	A	AC	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=5.442;QD=1.74;ReadPosRankSum=-2.486;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,20:0.18:114
chr19	18499238	rs1804826	G	T	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=914;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TGACACGACCGCTGCGGCGTC;SOR=0.854;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=54;WE=18499246;WS=18499228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
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chr19	18499780	.	AGGAC	GGGAC,GGGAG	410	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12,5;NR=34,19;PP=222,410;QD=5.58198288146;SC=ACCTGCGCGGAGGACGCGACC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46,24;WE=18499792;WS=18499770;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:46
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chr19	18700047	rs2074175	A	G	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=46;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.212;SC=ACCTTCACGAAAAAGGCCCCA;SOR=0.553;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=199;TCF=113;TCR=86;TR=103;WE=18700055;WS=18700037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,126:0.54:235
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chr19	18709175	rs35521276	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GTGCAGGGGACCCCTCGGGAT;SOR=1.765;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=11;WE=18709183;WS=18709165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	18709768	rs8108207	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=-2.085;SC=GCTGAGCCTCGGCTGAGGGGT;SOR=0.655;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=13;WE=18709776;WS=18709758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	18717264	rs113093604	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	18726856	rs709679	T	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=442;ReadPosRankSum=-1.509;SC=GCAATGACCTTGTCAACTCAG;SOR=0.745;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=31;WE=18726864;WS=18726846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr19	18731439	rs7258375	C	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=2.332;SC=TGGGTCCAGCCTTGAGCCCCT;SOR=0.245;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=17;WE=18731447;WS=18731429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr19	18778445	rs10421503	C	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=632;ReadPosRankSum=0.355;SC=CAGCCACTGCCAGCCACACGT;SOR=0.396;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=36;WE=18778453;WS=18778435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr19	18870766	.	G	A	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=5;NR=4;PP=75;QD=12.1968013941;SC=TGTCCCCGCCGCCAGCCCCGC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=9;WE=18870774;WS=18870756;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
chr19	18870766	.	G	GCCAGCCCCCTGTCCCCGCCA	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	18876309	rs3746266	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.866;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GGCATCGCCCACCCTGTCCCC;SOR=1.355;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=22;WE=18876317;WS=18876299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr19	18886367	rs12611313	A	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=1.687;SC=TGCGGGCAGGACAGCCACAGC;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=18886375;WS=18886357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	18886431	rs12609934	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=399;ReadPosRankSum=-0.278;SC=CCTCACAGCCTGGTGTGCCTC;SOR=0.908;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=25;WE=18886439;WS=18886421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr19	18893811	rs28494505	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=612;ReadPosRankSum=-1.557;SC=TGAGAAGGCCAGCAGGGCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=41;WE=18893819;WS=18893801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,49:0.44:112
chr19	18897526	rs5827423	A	AG	1945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=38;PP=1865;SC=CATTAGGATGAGCCAGCCTGA;SOR=2.137;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=18897534;WS=18897516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	18942888	rs4808161	C	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=11;PP=1056;SC=CGCCGGGGCGCGCGGTTTGGT;SOR=2.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=46;WE=18942896;WS=18942878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	18956699	rs59045002	G	A	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=681;SC=ATGAGGCCAGGGTGTCACACC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=18956707;WS=18956689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	18971322	rs757115	T	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=401;SC=ATTCTACTTATTTTTAACATG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=18971330;WS=18971312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	18976985	rs73001386	C	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=208;ReadPosRankSum=0.135;SC=GGCAAGCCCCCCTGGAGCAGG;SOR=0.869;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=16;WE=18976993;WS=18976975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr19	18979324	rs11673194	A	C	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=415;SC=CCTCCCCACCACCCAGGCAAG;SOR=1.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=18979332;WS=18979314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	18980172	rs4808863	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=8;PP=244;SC=CGCGGCCGAGGCAGGCTCCGA;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=18980180;WS=18980162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	18980213	rs4808864	A	G	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=5;PP=204;SC=GGGAGGTAGGAACAGGAACTC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=18980221;WS=18980203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	18993503	rs62138063	C	T	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	19006666	rs3746263	G	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=16;PP=365;SC=CGGAGCGCAGGGCGGTCCAGC;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=19006674;WS=19006656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	19011244	rs1127821	T	C	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=54;PP=1628;SC=CCAGCGTCTCTGGGTAGCCAC;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=76;WE=19011252;WS=19011234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	19016450	rs4808874	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.669;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=508;ReadPosRankSum=-1.935;SC=TGCAGGACAGGGCGAGGGGGC;SOR=1.199;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=25;WE=19016458;WS=19016440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr19	19018866	rs758032	A	G	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=39;PP=1748;SC=AAGCTTCCTGAGGCTCCAGCA;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=19018874;WS=19018856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	19021970	rs1468461	T	C	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=101;PP=2965;SC=AGACAGGAAGTCCCTGCCCCA;SOR=1.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=51;TCR=101;TR=152;WE=19021978;WS=19021960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	19022007	rs1468462	C	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.107;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=62;PP=1998;ReadPosRankSum=1.004;SC=CCAGCATGGGCCACCTCCACT;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=89;WE=19022015;WS=19021997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr19	19023853	rs3177137	T	C	4896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=76;PP=2932;SC=CTGGGCTTGATAGCTGTGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=150;WE=19023861;WS=19023843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	19023881	rs111654958	C	T	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=871;ReadPosRankSum=0.053;SC=TGAGTCAGGACGCACAGTGGG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=63;WE=19023889;WS=19023871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr19	19032637	rs2231997	T	C	3812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=55;PP=1947;SC=CTGCCTCTCATGCTCTGTCCC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=121;WE=19032645;WS=19032627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	19035159	rs5827425	CT	C	1748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=37;PP=1640;SC=CCTGGGATACCTTCCCCGCCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=19035167;WS=19035149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	19035354	rs2301659	GC	TT	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=21;PP=2947;SC=GACTGTCCCGGCCTCCACCCT;SOR=1.821;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=78;WE=19035363;WS=19035344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	19037053	rs2301661	T	C	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=70;PP=2506;SC=AGGATCTACCTTTATTCGCCC;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=128;WE=19037061;WS=19037043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	19037294	rs2301662	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=49;SC=GCCTGCTCCCGTGAGCAGATT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=19037302;WS=19037284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	19039908	rs62138076	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=841;SC=ATCTGCAAGCGGCTTATAACT;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=19039916;WS=19039898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	19040312	rs1059240	G	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=802;SC=GCTCAAACAGGCTGACGTCCA;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=19040320;WS=19040302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	19049198	rs1064351	G	A	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.397;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1968;ReadPosRankSum=-0.094;SC=AGCCCAGGCCGTAGACTGTGT;SOR=0.530;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=99;WE=19049206;WS=19049188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr19	19105773	rs3180770	G	A	5234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=60;PP=2965;SC=ACAGAAAGGAGCCCTGTAAAC;SOR=1.010;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=150;WE=19105781;WS=19105763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr19	19120591	rs55722325	A	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=489;SC=GGCCCCCCCAATTCTAAAGAG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=19120599;WS=19120581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	19135319	rs6511010	A	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=3;PP=1381;SC=TAAAATCCTGATATGTTTCCA;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=19135327;WS=19135309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	19136541	rs4808907	C	T	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=75;PP=2965;SC=ACTTGACTGCCGCCCCTAAGC;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=144;WE=19136549;WS=19136531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	19145193	rs2269806	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=25;PP=735;SC=AGATAGAGAAGGTGCGGATAA;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=19145201;WS=19145183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	19150183	rs12979565	C	T	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=5;PP=909;SC=AGACTTGAAACAGTCCTCCCA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=19150191;WS=19150173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	19151692	rs8104799	T	C	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=61;NR=65;PP=2501;SC=CTACCAGGCATCCCTTAGGGT;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=126;WE=19151700;WS=19151682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	19153801	rs3214143	G	GC	425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=420;SC=GAAACCAGGTGCCATTGGGCC;SOR=2.147;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=19153809;WS=19153791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	19168183	rs7258637	C	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=142;SC=GGACCCCACCCCAAAGCCCCA;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=19168191;WS=19168173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	19215612	rs56247515	T	TA	902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=926;SC=GGGACAAGATTGGGGGGAAAA;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=19215620;WS=19215602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	19230868	rs756791	A	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=18;PP=835;SC=GGCCACCCAGAGCCCCGGCAA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=19230876;WS=19230858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	19243843	rs10414676	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=3;PP=670;SC=GGGCCGGTCCTGTGTCCCTGA;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=19243851;WS=19243833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	19245771	rs3746259	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=26;PP=894;SC=AACCCAGGCTATTTATAGAGA;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=19245779;WS=19245761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	19348947	rs12981871	T	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=457;SC=GAGGGGTGATTTCGCCCCGCA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=19348955;WS=19348937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	19431423	rs3934667	T	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=42;PP=787;SC=CGACTGGGTTTTTTTTTTTTT;SOR=3.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=47;WE=19431431;WS=19431410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	19431963	rs12460764	G	T	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=67;PP=2251;SC=GGGCCGGGCCGCGAGGGAGGA;SOR=1.006;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=117;WE=19431971;WS=19431953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	19446936	rs769267	G	A	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=37;PP=1764;SC=ACTAGATCCCGCAGTTCGAAG;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=19446944;WS=19446926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	19449603	rs2074089	G	A	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=43;PP=2108;SC=GGCAGGTACCGTAAAACTGAT;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=106;WE=19449611;WS=19449593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	19449686	rs2074090	G	T	4186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=76;PP=2519;SC=ACCTGGTGTCGGCCTGTGACC;SOR=0.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=19449694;WS=19449676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	19451591	rs2965190	A	G	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=37;PP=1464;SC=CCTTGGGGTAATCACAGTCAT;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=83;WE=19451599;WS=19451581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	19453521	rs2965191	T	G	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=35;PP=1586;SC=GGGCCAGGGCTGGGGGCGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=75;WE=19453529;WS=19453511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	19453560	rs2301669	C	A	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=42;PP=2322;SC=CCCTGGTAACCCCTGCTGTCT;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=104;WE=19453568;WS=19453550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	19453742	rs2965192	A	G	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=38;PP=1132;SC=GCCAGACGCTAGCTGTACCAG;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=19453750;WS=19453732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	19454828	rs2965193	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=27;PP=951;SC=GACTGAATTCGCCAAGTGCAT;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=19454836;WS=19454818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	19547086	rs2916077	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=45;PP=1062;SC=CAGCAGGCTTTGGTCAGCTTC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=19547094;WS=19547076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	19637930	rs7251447	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=1.426;SC=CTCTGCCCACAGCCCTTGCCC;SOR=1.034;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=6;WE=19637938;WS=19637920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr19	19735257	rs1266503	G	T	9927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=121;PP=2965;SC=CATTGACCAGGGAGTTGGCCT;SOR=0.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=285;TCF=164;TCR=121;TR=285;WE=19735265;WS=19735247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr19	19737686	rs33982830	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=766;ReadPosRankSum=1.078;SC=TGTGCAGCTGCACGGCCATCA;SOR=0.594;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=47;WE=19737694;WS=19737676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr19	19740729	rs880090	C	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.567;SC=ATGGGTCCGTCTTCACAATCT;SOR=0.239;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=9;WE=19740737;WS=19740719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	19758190	rs892035	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.648;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,40:0.38:105
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chr19	19843551	rs247774	A	G	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=1024;ReadPosRankSum=0.588;SC=GGGCTCCAGGACCGGGGGCCG;SOR=0.928;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=54;WE=19843559;WS=19843541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr19	19868879	rs247782	A	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=649;ReadPosRankSum=0.565;SC=AGACTTTTCCATGAATCTTCC;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=33;WE=19868887;WS=19868869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr19	19910250	rs72620574	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=619;ReadPosRankSum=0.715;SC=CATTCCTCTTTATAGACCACC;SOR=0.650;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=40;WE=19910258;WS=19910240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr19	19976701	rs2304169	A	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=509;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GTTTATCCTCAGTGTTCTGTG;SOR=0.388;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=33;WE=19976709;WS=19976691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr19	20003109	rs8106559	A	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=889;ReadPosRankSum=-0.604;SC=CCTTTCACCTATCCTCACACC;SOR=0.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=44;WE=20003117;WS=20003099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
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chr19	20012070	rs28590063	T	C	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=58;PP=1383;ReadPosRankSum=1.871;SC=CGGCTGCGCTTATAGCGCAGC;SOR=1.384;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=21;TCR=97;TR=68;WE=20012078;WS=20012060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr19	20044041	rs12151060	G	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.534;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=770;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GAACATAAAAGATTCTTTCCA;SOR=1.182;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=46;WE=20044049;WS=20044031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
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chr19	20150125	rs2286921	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=520;ReadPosRankSum=0.388;SC=TGCCCCCACCTCGGGATGCGC;SOR=0.297;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=38;WE=20150133;WS=20150115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr19	20150175	rs2286922	G	C	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=875;ReadPosRankSum=1.914;SC=CCGGGATGTCGTGGAGTCTTA;SOR=0.519;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=56;WE=20150183;WS=20150165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,86:0.55:157
chr19	20150247	rs2286923	A	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=-2.585;SC=GTCACCGGGAACTACTAGAGC;SOR=0.417;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=47;WE=20150255;WS=20150237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr19	20150380	rs2335896	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	20228446	rs141713782	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.884;NF=26;NR=12;PP=576;ReadPosRankSum=-0.251;SC=TCAGAATCTAGCAATTGAAGT;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=38;WE=20228454;WS=20228436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr19	20228941	rs61998186	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=266;ReadPosRankSum=1.388;SC=ACACATAAGAAAATTCATACT;SOR=0.904;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=18;WE=20228949;WS=20228931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr19	20295146	rs1097510	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.929;NF=25;NR=17;PP=583;ReadPosRankSum=0.820;SC=GAAAATGTGTGTGTGTGTGTG;SOR=0.390;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=42;WE=20295154;WS=20295145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr19	20296738	rs836897	C	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;ReadPosRankSum=0.362;SC=GAGCACATTACTAGCTTGTAA;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=14;WE=20296746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr19	20369503	rs8103002	C	G	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1294;ReadPosRankSum=0.017;SC=TTATTGACTGCTGTAGTGGTA;SOR=0.591;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=67;TCR=97;TR=73;WE=20369511;WS=20369493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,86:0.45:190
chr19	20414254	rs10425483	A	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=467;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GAGAGAAACCATACAAGTGTG;SOR=0.249;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=34;WE=20414262;WS=20414244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr19	20415575	rs73000781	C	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=-0.086;SC=AGCAGTTGCTCAAGCTTTGTT;SOR=0.211;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=20415583;WS=20415565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr19	20727463	rs10411329	T	C	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=810;ReadPosRankSum=0.225;SC=TTAAAGCCTTTGCCACATTCT;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=63;WE=20727471;WS=20727453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr19	20727932	rs33926	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.808;NF=35;NR=40;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.830;SC=GAATTATCTTGTGTGTAGTAA;SOR=0.753;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=75;WE=20727940;WS=20727922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,84:0.55:154
chr19	20735196	rs7250860	A	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=520;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AGCTTCCCAAATCACACTTTA;SOR=0.340;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=32;WE=20735204;WS=20735186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr19	20735272	rs7251976	T	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=812;ReadPosRankSum=0.798;SC=CATTTTCACTTGCACCTACCT;SOR=0.843;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=66;WE=20735280;WS=20735262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr19	20736677	rs2562632	A	G	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1403;ReadPosRankSum=2.575;SC=TTTACCAAGTAGCCAAGGGTG;SOR=0.591;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=180;TCF=71;TCR=109;TR=91;WE=20736685;WS=20736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,114:0.51:223
chr19	20748522	rs12979592	C	A	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1288;ReadPosRankSum=0.236;SC=GCCACAGAGGCTGGGCCTCTA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=72;TCR=131;TR=89;WE=20748531;WS=20748512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,94:0.43:220
chr19	20806770	rs34554673	T	TCA	580.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=4;PP=411;SC=ATATCAATTCTTAGTTAGAAA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=20806778;WS=20806762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	20806824	rs10409289	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=564;SC=CACATTCACATGGTTTCTCTC;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=20806832;WS=20806814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	20806893	rs11085364	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=311;ReadPosRankSum=0.255;SC=CTTTACCACATTATTCACATC;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=20;WE=20806901;WS=20806883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr19	20808149	rs1991528	A	G	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=53;PP=2139;SC=AAGCTTTGCCACATTCTATAT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=20808157;WS=20808139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	20808515	rs1968385	T	A	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=53;PP=1556;SC=AATATAAATATATATATGCAG;SOR=1.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=71;WE=20808523;WS=20808505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	20844340	rs3217340	G	GAAGT	6126.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=65;PP=2969;SC=GCCTTTAGGAGAAGAACCAGA;SOR=1.162;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=76;WE=20844348;WS=20844330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	20976530	rs115207700	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=302;ReadPosRankSum=1.117;SC=TGAGCACATTACTAGCTTGTA;SOR=1.140;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=16;WE=20976538;WS=20976520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr19	20988555	rs34589343	A	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=585;SC=AGTTTGTATAATTTTATAGGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=20988563;WS=20988545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	21120153	rs34083865	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=15;PP=608;SC=AGTTTTTATAAACCAGTTTCA;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=21120161;WS=21120143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	21131728	rs12972502	A	G	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=60;PP=2383;SC=GACTTAACCAATGTCTCACAG;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=121;WE=21131736;WS=21131718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	21203552	rs2081054	C	T	5288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=57;PP=2965;SC=CCCTGTGACCCGCAGGTATTG;SOR=1.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=100;TCR=57;TR=157;WE=21203560;WS=21203542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	21203732	.	G	A	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=894;ReadPosRankSum=0.992;SC=CCGAGTTCTTGCCCAGCTGGG;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=53;WE=21203740;WS=21203722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr19	21216536	rs3760839	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=483;SC=TTCCATATAGGAAAGAATTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=21216544;WS=21216526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	21217211	.	A	G	103	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=103;QD=27.5542425094;SC=CAAGTTTGCTATCAGAACCAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=21217219;WS=21217201;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	21299774	rs36125838	T	TATA	7278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=80;PP=2924;SC=CAAAAAAGGTTATGAACTAAA;SOR=0.879;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=24;TCR=84;TR=102;WE=21299782;WS=21299764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	21300142	rs112722125	A	C	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.89;NF=48;NR=53;PP=2065;SC=TTCATACTGGAGAGAAACCCT;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=101;WE=21300150;WS=21300132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	21300964	rs111456417	T	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=54;PP=2005;SC=TTACTAAACATAGGAAAATTC;SOR=1.138;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=87;WE=21300972;WS=21300954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	21326358	rs17445374	A	G	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1809;ReadPosRankSum=1.054;SC=CCATAGGACGACTTGAAATAT;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=101;WE=21326366;WS=21326348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,120:0.98:122
chr19	21349311	rs7256576	C	T	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=81;PP=2520;SC=CTAAATGTTTCATGTCTCTTT;SOR=1.264;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=49;TCR=81;TR=130;WE=21349319;WS=21349301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	21477379	rs504280	C	T	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=67;PP=2573;SC=TGTCACACACCGGTTAAGTCC;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=135;WE=21477387;WS=21477369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	21491951	rs685844	T	A	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=19;PP=2469;SC=CTAGAAACTTTGGAACACAGA;SOR=2.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=91;TCR=19;TR=110;WE=21491959;WS=21491941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	21492062	rs547516	G	A	7846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.11;MQRankSum=-0.464;NF=109;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GGGTTTGGCTGCCATCTCGTG;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=110;TCR=141;TR=249;WE=21492070;WS=21492052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,287:0.99:289
chr19	21558311	rs2914645	C	T	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=298;SC=ATTATCCATGCAGAAAAAAAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21558319;WS=21558301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	21558818	rs376940300	CA	C	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=14.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=-0.496;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.761;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,13:0.22:58
chr19	21560141	rs1875256	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=116;SC=ACTGCCTTCAGTTCCTCTCTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=21560149;WS=21560135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	21560314	rs112058265	G	GCACA	2138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=1314;ReadPosRankSum=1.214;SC=ACACAGACGTGCACACACACA;SOR=1.390;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=31;WE=21560322;WS=21560304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr19	21561508	rs145776873	TCTC	T	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=589;SC=TTCAAGCAGTTCTCCTACCTC;SOR=0.963;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=21561518;WS=21561498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	21580012	rs62110379	T	G	5702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=81;PP=2965;SC=CTTCGTGACCTGAAGATACTG;SOR=0.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=190;WE=21580020;WS=21580002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	21607525	rs201105659	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=5.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-11.034;QD=1.25;ReadPosRankSum=-2.563;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,17:0.10:165
chr19	21607526	rs202237831	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-10.707;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.145;SOR=1.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,15:0.09:162
chr19	21607537	.	A	AGCCTTTAGCCTGTCCCTCCAATTTACTGC	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=4.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-10.972;QD=0.30;ReadPosRankSum=-3.715;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,12:0.08:148
chr19	21607878	rs34723025	ATAAT	A	3313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=2108;SC=TACACATAAGATAATTAATGC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=43;WE=21607889;WS=21607868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	21688495	rs73017722	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=1.479;SC=TTCTTAGAGGCCCAGCCTGTG;SOR=0.372;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=41;WE=21688503;WS=21688485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr19	21688602	rs10420016	C	G	7287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=131;NR=102;PP=2965;SC=CTGACATCCCCAGAGAGGGGG;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=131;TCR=102;TR=233;WE=21688610;WS=21688592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr19	21712415	rs35176838	T	TTC	1396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.991;NF=17;NR=9;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.264;SC=GTCAATATATTTCTCTCTCTT;SOR=0.829;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=26;WE=21712423;WS=21712405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr19	21719401	rs35782355	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=295;ReadPosRankSum=0.696;SC=GCAAATCATTTTGCATGCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=19;WE=21719409;WS=21719391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr19	21720803	rs2562473	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=0.414;SC=TGTGGTGGCTCATGCCTGTAA;SOR=0.929;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=14;WE=21720811;WS=21720793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr19	21736788	rs2562502	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=38;PP=1233;SC=TTGGTTTTTTTACATACTCCC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=21736796;WS=21736778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	21838002	rs7351091	G	T	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=15;PP=840;SC=AGCAGGACATGAAAGATTCTT;SOR=1.201;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=21838010;WS=21837992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	21838113	rs34320073	A	AGAT	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=1391;SC=TACACAAAGAAGATAACAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=23;WE=21838121;WS=21838103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	21838146	rs7351088	C	T	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.69;QD=43.65;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	21838146	.	CA	TG	1185	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8;NR=18;PP=1185;QD=47.6333798024;SC=TGATAACTACCAAGAGCAATA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=26;WE=21838155;WS=21838136;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr19	21838147	rs7351087	A	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.68;QD=45.21;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	21838240	rs6511279	C	A	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=13;PP=804;SC=TAGAAAGAAACCTTTCAAATG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=21838248;WS=21838230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	21838351	rs7508059	A	G	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=48;PP=2089;SC=TTGTGGCAAAACCTTCAACTG;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=21838359;WS=21838341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	21838492	rs6511280	C	G	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=30;PP=1861;SC=TGGAGAGAAACCGTACAGATG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=69;WE=21838500;WS=21838482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	21838565	rs6511281	T	C	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=52;PP=2746;SC=AGAATTCATATTGGAGAGAAA;SOR=1.149;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=130;WE=21838573;WS=21838555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	21838657	rs7508494	G	A	4844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=82;PP=2965;SC=TGCTGGAGAGGAGCCCTACAA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=154;WE=21838665;WS=21838647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	21838785	rs10422946	C	T	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=43;PP=1919;SC=TTAACCACTCCTCAACTCCTA;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=85;WE=21838793;WS=21838775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	21838830	rs10422804	A	C	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=38;PP=1819;SC=GAGAGAAACCATACAAATGTG;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=21838838;WS=21838820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	21909948	rs7246400	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.313;NF=27;NR=21;PP=760;ReadPosRankSum=-0.546;SC=CTTATGTTTAGTAAGGTATGA;SOR=0.891;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=48;WE=21909956;WS=21909938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
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chr19	21933669	rs35577863	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=-1.455;SC=CGCTGACCTATTGCGTGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=14;WE=21933677;WS=21933659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr19	21948570	rs12974842	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=981;ReadPosRankSum=0.268;SC=AGAGGACACATTCCATACCTC;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=70;TCR=58;TR=62;WE=21948578;WS=21948560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr19	21948726	rs117844908	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=-1.649;SC=TGAGGACACATCACCCCATAG;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=21948734;WS=21948716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	21948748	rs11085493	T	C	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=385;SC=TTTTTCCAAATCAAAACCTTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=21948756;WS=21948738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	21950337	rs10412066	G	C	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1671;ReadPosRankSum=-0.092;SC=ACACAGAGAAGTGAGAGCAAA;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=106;WE=21950345;WS=21950327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,117:0.57:205
chr19	21950402	rs6511291	T	C	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=902;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CCGGAAGCCGTCCAGTCCGCT;SOR=0.596;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=39;TCR=80;TR=56;WE=21950410;WS=21950392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr19	22153495	rs2359812	A	T	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=33;PP=1212;SC=TCATTTGTAGAGTTTCTCTCC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=22153503;WS=22153485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	22154954	rs2214301	C	T	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=48;PP=2182;SC=CTTATGATAACTAAGGGTTGA;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=22154962;WS=22154944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	22157302	rs10419899	G	A	6689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=111;PP=2965;SC=ATGATCTGACGTATTCTTTAC;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=103;TCR=111;TR=214;WE=22157310;WS=22157292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	22171880	rs4574045	C	T	478.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.92;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	22193451	rs2040654	C	G	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=19;PP=1412;SC=ATGGCTGAACCGGACTGAGGT;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=74;WE=22193459;WS=22193441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	22235307	rs415291	C	G	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=13;PP=1193;SC=CGCTCTAGCCCGAGCTGCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=22235315;WS=22235297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	22235491	rs387343	T	G	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=105;PP=2965;SC=GGTTGGAACCTGTGGGAAGTC;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=79;TCR=105;TR=184;WE=22235499;WS=22235481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	22235526	rs387315	T	C	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=98;PP=2572;SC=CAGGCCTCCTTGCAGTCAGCC;SOR=1.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=52;TCR=98;TR=150;WE=22235534;WS=22235516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	22235577	rs408312	C	T	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=64;PP=1830;SC=AGCTCGGCCTCGGTCCCCCTC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=77;WE=22235585;WS=22235567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	22235620	rs423926	G	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=34;PP=994;SC=TGACAGCCGGGACCCCGGGCG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=22235628;WS=22235610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	22363826	rs7252593	G	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=14.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-3.733;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.767;SOR=1.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,45:0.25:182
chr19	22363844	rs7252604	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=8.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-6.373;QD=4.78;ReadPosRankSum=-5.124;SOR=1.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,28:0.16:177
chr19	22364492	rs10419666	A	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=-0.191;SC=AAGCAAGACGACATTGCAATA;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=22364500;WS=22364482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	22375868	rs8104929	C	T	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=65;PP=1646;ReadPosRankSum=0.943;SC=GGGCTCTTTTCCTTGCTCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=203;TCF=71;TCR=132;TR=98;WE=22375876;WS=22375858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,118:0.50:236
chr19	22379587	rs2360001	G	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=760;ReadPosRankSum=1.607;SC=AACTTTTAATGTGACTCAAGG;SOR=0.173;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=41;WE=22379595;WS=22379577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr19	22469233	rs808373	G	C	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=21;PP=1894;SC=CGTTGTTTCTGGTTGCAGCCG;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=88;WE=22469241;WS=22469223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	22575777	rs200167484	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.417;NF=3;NR=19;PP=417;ReadPosRankSum=0.221;SC=AAAATAAGAATATACAACTGA;SOR=1.562;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=22;WE=22575785;WS=22575767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr19	22585517	.	A	C	893	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=43.99;NF=48;NR=0;PP=893;QD=19.3285669281;SC=ATTTTAAGGAATGGCTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=48;WE=22585542;WS=22585507;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,48:0.94:51
chr19	22586192	rs1368476	A	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.22;QD=27.34;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr19	22605120	rs11669356	G	T	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=81;PP=2570;SC=ACGAGACCAGGAACTCCGGCT;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=113;WE=22605128;WS=22605110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
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chr19	22848028	rs3745115	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.68;MQRankSum=-0.623;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr19	22867876	rs12974117	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=-0.048;SC=GTTAGAGCCTGTAATATTTTG;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=22867884;WS=22867866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr19	22869592	rs35335083	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=1.876;SC=CTTGTTTGTAAGTAGGGTAAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=22869600;WS=22869582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	22937238	rs62119143	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=1.258;SC=AATTATCTTATGTGTAATAAG;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=11;WE=22937246;WS=22937228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr19	22937334	rs62119144	G	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TTTAGTATGAGTTGAAGACCA;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=11;WE=22937342;WS=22937324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	22939096	rs55681804	T	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CATTTGTAGGTTTTCCCTCCA;SOR=0.756;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=53;WE=22939104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr19	22939326	rs56115674	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=938;ReadPosRankSum=2.448;SC=GCTTTGCCACGTTCTTCACAT;SOR=1.058;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=55;WE=22939334;WS=22939316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr19	22941591	rs62119159	A	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.079;NF=18;NR=10;PP=449;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GCTTTGCCGCATTCTTCATAT;SOR=1.161;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=28;WE=22941599;WS=22941581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr19	22941617	rs58653025	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.447;NF=17;NR=12;PP=488;ReadPosRankSum=0.251;SC=GGGTTTCTCTTCAGTATGAAT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=29;WE=22941625;WS=22941607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr19	22942061	rs61753878	A	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=472;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CTTATGTTTAATAAGGGTTGA;SOR=0.768;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=26;WE=22942069;WS=22942051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr19	22942325	rs7255780	G	C	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr19	22942335	rs61740110	G	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr19	22952111	rs34726149	A	G	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=906;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GTCACATCCCAAAATGTCAAC;SOR=1.011;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=54;WE=22952119;WS=22952101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,68:0.42:163
chr19	22952946	rs12980509	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.111;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=-2.489;SC=TTTTGTTAAATATTCAGCAAG;SOR=0.309;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=18;WE=22952954;WS=22952936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr19	22966902	rs7248586	C	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=882;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GCTAAGGACACAGAGCAGTAA;SOR=0.519;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=56;WE=22966910;WS=22966892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr19	23328940	rs7247102	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=769;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CATACTGGAGGGAAACCCTAC;SOR=0.896;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=48;WE=23328948;WS=23328930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr19	23406165	rs2885604	T	C	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=42;PP=1150;SC=TAAGGGTTGATGATTGGTTAA;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=64;WE=23406173;WS=23406155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	23406801	rs8110795	G	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=22;PP=577;SC=GAAGGTCTTGGGCAAAATAAC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=23406809;WS=23406791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	23413937	rs7256859	A	G	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=6;PP=2050;SC=TGCCCGCCTTAGCCTCTCCAA;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=75;WE=23413945;WS=23413927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	23414167	rs4932841	T	G	4444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.96;NF=36;NR=106;PP=2965;SC=GCAATACCTGTTTTATTAAAA;SOR=1.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=36;TCR=106;TR=142;WE=23414175;WS=23414157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	23433107	rs10405424	G	C	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=78;PP=2817;SC=TTGCAGGTCAGAGGGCCACAG;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=126;WE=23433115;WS=23433097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	23542697	rs1821845	G	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=720;ReadPosRankSum=0.244;SC=TAAAAGCTTTGCCACATTCTT;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=42;WE=23542705;WS=23542687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr19	23545250	rs1044095	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=362;ReadPosRankSum=0.931;SC=ATTTCTTTCCAGTATGTCTTA;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=25;WE=23545258;WS=23545240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr19	23557876	.	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=592;ReadPosRankSum=1.411;SC=AATACAGAATGACTTGTGTAT;SOR=0.678;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=43;WE=23557884;WS=23557866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr19	23837145	rs11671053	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=477;ReadPosRankSum=-1.042;SC=GCAGAAATTCACCTTGGTATA;SOR=1.153;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=27;WE=23837153;WS=23837135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr19	23837365	rs4380159	A	C	4491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=78;PP=2888;SC=CCCTTGTGCAACTTACATTCA;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=66;TCR=78;TR=144;WE=23837373;WS=23837355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	23845038	rs10418600	T	G	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=43.32;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	23845042	rs10418602	T	C	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=45.97;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	23869684	rs4020520	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=24;PP=1730;SC=TCTTATGGCTGCAGGGGACTG;SOR=1.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=86;WE=23869692;WS=23869674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	23869823	rs2364624	T	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1728;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GTCGCACCCGTAACTCTCACC;SOR=0.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=112;WE=23869831;WS=23869813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,121:0.53:230
chr19	23869941	rs2364625	A	G	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=64;PP=2125;SC=ACACAGAGCAATGAAAGCGAG;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=101;WE=23869949;WS=23869931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	23926332	rs10405811	G	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=199;SC=CTTCACACTTGTAGGTTTTTT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=23926340;WS=23926322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	23927252	rs1818990	C	T	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=53;PP=2241;SC=TTCTTCACATCTGTAGGGCTT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=23927260;WS=23927242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	23927468	rs1818989	A	G	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=32;PP=1149;SC=AGTAAGGGTTAAGGACTGATT;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=23927476;WS=23927458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	23927741	rs61397759	CCA	C	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=457;ReadPosRankSum=-0.014;SC=AAAGGCTTTTCCACAGTCTTC;SOR=0.633;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=12;WE=23927750;WS=23927731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr19	23928102	rs7248674	C	G	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=62;PP=1776;SC=GGTGAAAAGTCTTGGGCAAAA;SOR=2.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=81;WE=23928110;WS=23928092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	23941459	rs6417220	G	A	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=37;PP=2533;SC=GGAGAACTCAGGGCGCAAATT;SOR=1.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=119;WE=23941467;WS=23941449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	29704002	rs11666764	T	C	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-2.182;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.751;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,39:0.34:115
chr19	29704010	rs8100724	A	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.915;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.524;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr19	30097268	rs2303754	C	G	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=52;PP=2153;SC=GGGTTGGGGACGTTAAGGGTC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=30097276;WS=30097258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	30099457	rs1465585	A	G	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=17;PP=1498;SC=GACTACAGGTATGAGCCACTG;SOR=1.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=30099465;WS=30099447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	30102856	rs2288477	A	G	3878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=65;PP=2607;SC=CGTAAGTTGCATTCCTGAAGC;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=130;WE=30102864;WS=30102846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	30103153	rs4804893	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1025;SC=GTGGAGACCCAGGGCGTGTGT;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=30103161;WS=30103143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	30193608	.	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=-0.991;SC=CCACCTCCCCGGAGGTGCGGC;SOR=1.154;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=14;WE=30193616;WS=30193598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr19	30193721	rs10424582	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=988;ReadPosRankSum=0.796;SC=TGACCAGCGCGGTCAGCTGCA;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=64;WE=30193729;WS=30193711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr19	30303714	rs3218029	T	TC	1423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.001;NF=16;NR=26;PP=988;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTGGGGAGCATCCCCCCCATC;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=42;WE=30303722;WS=30303704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,60:0.51:118
chr19	30313523	rs67602822	CCTT	C	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=339;ReadPosRankSum=0.963;SC=CAGTGCTGCTCCTTCTTTCAG;SOR=0.039;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=30313533;WS=30313513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr19	30313576	rs3218069	C	T	338.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=0.855;SC=ATAGGCCAGCCGCGGTGGTTC;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=13;WE=30313584;WS=30313566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr19	30314666	rs7257694	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=527;ReadPosRankSum=0.088;SC=AGCAGAGCAGCGGGCCGGAAA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=31;WE=30314674;WS=30314656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr19	30433668	rs1990903	C	T	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=14;NR=19;PP=503;SC=CCCAGCTGCCCGGGCCCCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=30433676;WS=30433658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr19	30505697	rs75312381	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.697;SC=CTCGTGAATTTACTTTTAATG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=30505705;WS=30505690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr19	31770009	rs28609894	C	T	3811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=76;PP=2581;ReadPosRankSum=0.729;SC=TCATGTGCACCGTCAACTCCA;SOR=0.541;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=266;TCF=120;TCR=146;TR=145;WE=31770017;WS=31769999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,164:0.55:300
chr19	31770213	rs61742321	G	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=1126;ReadPosRankSum=0.628;SC=CGAAGCTCCCGCTGCCACAGC;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=60;WE=31770221;WS=31770203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,66:0.57:115
chr19	31840190	rs71173962	AG	A	1206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=932;SC=ACAGGGAGGGAGGGGGCGGCG;SOR=2.073;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=26;WE=31840198;WS=31840180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	31930388	rs8103449	A	T	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=25;PP=1770;SC=GGTCTGGATAACTTGCACAGA;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=86;WE=31930396;WS=31930378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	31930590	.	AGAG	A	1335.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=1825;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AGTGAGAGAGAGAGAGGGTTG;SOR=0.687;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=22;WE=31930602;WS=31930580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr19	31930594	.	A	AT	1341.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=1825;ReadPosRankSum=-1.855;SC=AGAGAGAGAGAGGGTTGGGAG;SOR=0.657;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=22;WE=31930602;WS=31930580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr19	32083696	rs7245697	T	C	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=102;PP=2965;SC=ATGGCTCTACTGCCGTCCACC;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=89;TCR=102;TR=191;WE=32083704;WS=32083686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	32873698	rs2270399	A	G	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1506;ReadPosRankSum=0.516;SC=CTGGAAGTTCAGAAAATGCAG;SOR=0.753;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=89;WE=32873706;WS=32873688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,101:0.58:175
chr19	32923539	rs2287294	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.133;SC=TTCAAGTTGCAGTTATGTATC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=32923547;WS=32923529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	32930069	rs6510249	G	A	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1238;ReadPosRankSum=-1.303;SC=AGAACTGGGCGCTGCCATTCT;SOR=0.531;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=82;WE=32930077;WS=32930059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,96:0.52:184
chr19	32954725	rs1544511	G	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=421;ReadPosRankSum=0.540;SC=CAGAATCCAGGTTTATATACA;SOR=0.414;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=32;WE=32954733;WS=32954715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr19	32955406	rs7252536	A	T	41.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	32959551	rs79236931	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=493;ReadPosRankSum=0.099;SC=ATTATATGCAGTTTATCTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=27;WE=32959559;WS=32959541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr19	33072069	rs10402931	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=588;SC=TGGATTGGTGGCGCCTGGGCC;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=33072077;WS=33072059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	33072085	rs10405535	A	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=12;PP=806;SC=GGGCCCCGCGAGCGCCTGCGC;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=33072093;WS=33072075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	33072266	rs10411464	T	C	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=41;PP=1267;SC=GGCTTGGCCCTCGCGGGGCGC;SOR=1.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=33072274;WS=33072256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	33122492	rs201689511	GCAGTAT	G	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=-0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	33182746	rs10413279	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	33182750	rs80137870	CA	TG	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	33183291	rs8108621	G	A	4999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=101;PP=2535;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CTGCTGCTGCGGCCCAGGACT;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=280;TCF=82;TCR=198;TR=145;WE=33183299;WS=33183281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,161:0.52:309
chr19	33183316	rs8109823	A	G	3678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.621;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=77;PP=1789;ReadPosRankSum=1.371;SC=CACCAGGCCCAGCACCCGGGC;SOR=1.748;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=190;TCF=38;TCR=152;TR=88;WE=33183324;WS=33183306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr19	33211069	rs13346373	C	T	55.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	33239450	rs4805805	C	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=45;PP=937;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AAGCCAGTGCCTGATCACTGC;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=35;TCR=97;TR=62;WE=33239458;WS=33239440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,66:0.44:150
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chr19	33264348	rs12608647	G	T	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=922;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CTGAAGAAAAGTTTTCTTTTA;SOR=0.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=64;WE=33264356;WS=33264338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,82:0.46:179
chr19	33281924	rs11881633	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1098;ReadPosRankSum=0.329;SC=GAACAAGATCAAGCCCTGCTT;SOR=0.505;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=69;WE=33281932;WS=33281914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr19	33282109	rs11878874	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTTGAGATTACAGGCATGAGC;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=11;WE=33282117;WS=33282099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	33285656	.	C	T	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=905;ReadPosRankSum=0.032;SC=TGCTCTACCTCCTACCAGTGT;SOR=0.646;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=61;WE=33285664;WS=33285646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr19	33292568	rs12976876	A	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=462;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TCACAGATAAATTAAAGTGCT;SOR=0.850;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=33;WE=33292576;WS=33292558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr19	33294082	rs10404371	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=983;ReadPosRankSum=2.256;SC=TTAAACTGATGTATAACCTGC;SOR=0.810;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=59;WE=33294090;WS=33294072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
chr19	33304690	rs8107900	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.149;SC=ATGGTAAGTACGCATTTTTTC;SOR=1.833;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=12;WE=33304698;WS=33304680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr19	33304711	rs67051599	ATTTG	A	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=355;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TTAGAAATAAATTTGTTTGAA;SOR=0.909;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=5;WE=33304725;WS=33304701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr19	33304717	rs61062732	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr19	33308824	rs34549089	AG	A	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.292;NF=14;NR=2;PP=498;ReadPosRankSum=1.196;SC=CAGCCCACCCAGGCATCCTAG;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=16;WE=33308832;WS=33308814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr19	33316928	rs140235732	G	GTA	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=892;ReadPosRankSum=0.007;SC=GTACAAAAAAGTATATATATA;SOR=0.726;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=23;WE=33316936;WS=33316918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr19	33321447	rs2287884	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TTTATTCGTAAGAAAAAAAGG;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=33321455;WS=33321437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr19	33321717	.	AG	GG	965	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0,6;NR=21,21;PP=965,826;QD=49.2814289733;SC=CCCTGTGCTCAGGATGGCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=21,27;WE=33321725;WS=33321707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr19	33321717	.	AG	AGGG	965	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0,6;NR=21,21;PP=965,826;QD=49.2814289733;SC=CCCTGTGCTCAGGATGGCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=21,27;WE=33321725;WS=33321707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr19	33321717	rs3214460	A	G,AGG	2123.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.16;QD=33.18;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,29,35:0.45,0.55:64
chr19	33332952	rs2287882	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=0.144;SC=CTCTAAAATACGATATTTTAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=13;WE=33332960;WS=33332942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	33333155	rs2287881	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1089;ReadPosRankSum=0.930;SC=ACAGCCATGCGGCAAAGCTGA;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=65;WE=33333163;WS=33333145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,70:0.43:162
chr19	33349488	rs2287879	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=428;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GGGTCTTTCTTGGCCTCCAAG;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=36;WE=33349496;WS=33349478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr19	33370070	rs745961	A	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.388;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=1012;ReadPosRankSum=0.374;SC=CGCAGATTCTAGCAGGTGGGG;SOR=0.077;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=18;WE=33370092;WS=33370060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr19	33370084	rs745960	T	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=1012;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GGTGGGGGCATGAGACTTCAG;SOR=1.387;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=28;WE=33370092;WS=33370060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr19	33370161	rs745959	A	C	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=34;PP=1606;ReadPosRankSum=-2.184;SC=GGCTGGGGGCAACCAGAGCTC;SOR=0.870;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=174;TCF=106;TCR=68;TR=92;WE=33370169;WS=33370151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,103:0.53:194
chr19	33390693	rs10420862	T	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=467;ReadPosRankSum=1.038;SC=GATCATTTTTTAAAATACTCT;SOR=0.416;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=29;WE=33390701;WS=33390683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr19	33390796	rs10418340	G	A	6388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=84;PP=2965;SC=CCTGGGTTATGTTTTCTGCCA;SOR=1.087;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=126;TCR=84;TR=210;WE=33390804;WS=33390786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr19	33392087	rs7253415	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=741;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CCACTGTACCCAGACCATTTG;SOR=0.677;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=69;TCR=18;TR=40;WE=33392095;WS=33392077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr19	33406442	rs7246178	A	G	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=54;PP=1961;SC=CAAAAGAGGAAGATAAAAACT;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=101;WE=33406450;WS=33406432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	33406484	rs7260149	G	T	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.48;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	33406484	.	GGGCTATTAG	TGGCTATTAC,TGGCTATTAG	518	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=16,31;NR=27,50;PP=518,443;QD=13.2899505782;SC=ACACAATTATGGGCTATTAGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=43,81;WE=33406501;WS=33406474;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:81
chr19	33406493	rs35219657	G	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr19	33406549	rs7246326	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=24;PP=704;SC=CTTTTGAGCCAGACGTGGTGG;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=33406557;WS=33406539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr19	33409413	rs2278404	G	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TTTGCAGTCAGGCGAGGAAGG;SOR=2.704;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=13;WE=33409421;WS=33409403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr19	33414420	rs4805825	A	G	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=66;PP=1786;ReadPosRankSum=-1.132;SC=CACTTCTTGGACTCGCATCCT;SOR=0.961;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=201;TCF=80;TCR=121;TR=103;WE=33414431;WS=33414410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,131:0.53:247
chr19	33418037	rs141452719	CCCAT	C	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TACCCACCTACCCATCCATCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=33418048;WS=33418027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	33430746	rs73051180	A	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=0.310;SC=ATCAGTTTTTAAAAAAAATGA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=33430754;WS=33430736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr19	33439158	rs12710001	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=8;PP=380;SC=AAAATTGTGGTTTTTTTTTTC;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=33439166;WS=33439148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	33439390	rs3764634	C	T	158.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GAGCTTCCTCCATGGGCACTT;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=33439398;WS=33439380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr19	33444453	rs75223967	T	G	11220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,473:0.74:640
chr19	33444453	.	TGCA	GGCA,GGCG	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=244,178;NR=151,109;PP=1648,2944;QD=4.26018028493;SC=TCCTTAGCAATGCACTAATTT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=542;TCF=341;TCR=201;TR=395,287;WE=33444464;WS=33444443;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.73:542
chr19	33444456	rs2944021	A	G	11542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,449:0.68:662
chr19	33444479	rs79480383	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:608,104:0.15:712
chr19	33444511	rs80283382	T	C	9303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=668;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=216;NR=290;PP=2962;ReadPosRankSum=1.762;SC=ACTGGGAACATAGAAAACACC;SOR=0.879;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=707;TCF=320;TCR=387;TR=506;WE=33444519;WS=33444501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,402:0.62:652
chr19	33444556	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=121;NR=253;PP=2962;QD=20;SC=AGGTCATCACTGTGGCCTCCT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=555;TCF=193;TCR=362;TR=374;WE=33444564;WS=33444546;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:181,374:0.67:555
chr19	33444576	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=28;MQ=59.93;NF=71;NR=203;PP=2962;QD=20;SC=TCTGTCCTCCCGGGCACTGAC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=421;TCF=125;TCR=296;TR=274;WE=33444598;WS=33444566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:147,274:0.65:421
chr19	33444588	.	T	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=28;MQ=59.92;NF=28;NR=177;PP=2962;QD=20;SC=GGCACTGACATCCCCCAATTC;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=330;TCF=74;TCR=256;TR=205;WE=33444598;WS=33444566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:125,205:0.62:330
chr19	33464225	rs73037453	C	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.047;NF=38;NR=11;PP=879;ReadPosRankSum=0.745;SC=GGCCTGCCCTCTGCCAGCCCT;SOR=0.771;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=49;WE=33464233;WS=33464215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr19	33467515	rs3816032	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=527;ReadPosRankSum=0.681;SC=AATGCTTCCATTGGGGAACTG;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=35;WE=33467523;WS=33467505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr19	33467620	rs7247715	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=317;SC=CATCTTCTCCTGAGACCACAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=33467628;WS=33467610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	33470874	rs8099835	A	G	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.963;NF=37;NR=16;PP=699;ReadPosRankSum=-2.400;SC=GGAAATGTTCAGGGCCTGAAC;SOR=0.521;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=76;TCR=31;TR=53;WE=33470882;WS=33470864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr19	33471279	rs12971408	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=0.605;SC=TTTGGGAGGCCGAGGAAGGCG;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=33471287;WS=33471269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	33481388	rs7250684	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.662;NF=22;NR=6;PP=521;ReadPosRankSum=-1.576;SC=TCCACGCCACCACTGACTGCC;SOR=0.668;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=28;WE=33481396;WS=33481378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr19	33486810	rs4805026	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=592;SC=CTCAGTCCCTACCCTGTGCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=33486830;WS=33486808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	33486822	.	T	C	144	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=48.26;NF=8;NR=0;PP=144;QD=22.3464015684;SC=CCTGTGCAGCTCTCCTTGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=33486830;WS=33486808;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,8:0.42:19
chr19	33487071	rs12610600	G	C	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.912;NF=34;NR=33;PP=897;ReadPosRankSum=-0.760;SC=TGCAGAGGCTGGCCTCCCGCA;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=67;WE=33487079;WS=33487061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,83:0.53:156
chr19	33487182	rs11084689	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.260;NF=7;NR=24;PP=507;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CAGAGCATAAAGGCCCAAGGG;SOR=0.675;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=31;WE=33487190;WS=33487172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr19	33487251	rs8110730	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.803;NF=1;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGCTAGAGCCTGTGATACCCT;SOR=2.584;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=33487259;WS=33487241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	33490480	rs74603434	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQRankSum=-6.779;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.939;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr19	33490487	.	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=11.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-6.026;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=2.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr19	33490585	rs78615454	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQRankSum=-4.693;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,23:0.18:126
chr19	33490685	rs8109247	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TTCTCTACCATGTCTCCAGCT;SOR=0.293;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=8;WE=33490693;WS=33490675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr19	33493334	rs12610963	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=341;ReadPosRankSum=0.066;SC=ACACTGGGAAGGGGCAGCCCG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=25;WE=33493342;WS=33493324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr19	33503799	rs12460205	T	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.374;SC=TAGTTTTTTTTAATACGGAGT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=33503807;WS=33503789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	33512632	rs34594918	CA	C	4313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.01;MQRankSum=0.003;NF=5;NR=86;PP=2948;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CTCAGCAGCCCAAGCTCAGGT;SOR=1.010;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=173;TCF=13;TCR=160;TR=91;WE=33512640;WS=33512622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,139:0.50:278
chr19	33572089	rs28372855	G	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=311;ReadPosRankSum=-0.280;SC=GGCGGGGCCCGGAAGAGCAGG;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=22;WE=33572097;WS=33572079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr19	33579128	rs7259333	T	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr19	33584479	rs12460195	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=643;ReadPosRankSum=0.800;SC=TTGCATATGTGTGATTCTCTT;SOR=0.492;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=42;WE=33584487;WS=33584469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr19	33585197	rs74257353	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=-1.464;SC=AATTGATTAACTGTTATCACT;SOR=1.418;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=15;WE=33585205;WS=33585187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr19	33586739	rs13345542	G	C	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.844;SC=ATTGCATGGTGTGACTGACCT;SOR=0.689;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=79;WE=33586747;WS=33586729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,93:0.44:209
chr19	33592301	rs10410778	C	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=-1.097;SC=ATGACACGTACTATTTATGTT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=33592309;WS=33592291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	33597816	rs10408093	T	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=717;ReadPosRankSum=1.378;SC=GTATGTGCCATGGAGAAGACG;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=64;WE=33597824;WS=33597806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,68:0.40:170
chr19	33597930	rs3760893	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=0.345;SC=TGTGGAAATACCACTATTTAT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=8;WE=33597938;WS=33597920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr19	33600764	rs2287679	T	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=1016;ReadPosRankSum=2.521;SC=AGAGCCCAGCTCTCCCCTGCA;SOR=0.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=60;WE=33600772;WS=33600754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,74:0.52:142
chr19	33602757	rs10420258	C	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=530;ReadPosRankSum=2.462;SC=GGTTCACTCACGCCAAGGAGG;SOR=0.407;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=44;WE=33602765;WS=33602747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr19	33602881	rs3786933	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=86;ReadPosRankSum=0.603;SC=TAGTTTTTTCCTTTTTTTTGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=8;WE=33602889;WS=33602871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr19	33603288	rs3837972	AC	A	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.459;NF=14;NR=9;PP=796;ReadPosRankSum=1.874;SC=TATAGCACAAACTTTTTTCAC;SOR=0.922;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=23;WE=33603296;WS=33603278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr19	33605300	rs10416265	A	G	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GAGGAAGAGCATGCACCAGAA;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=296;TCF=129;TCR=167;TR=141;WE=33605320;WS=33605290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,172:0.49:352
chr19	33605312	rs10421769	T	C	3226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=0.347;SC=GCACCAGAATTATCCGCAAAT;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=276;TCF=114;TCR=162;TR=129;WE=33605320;WS=33605290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,156:0.48:324
chr19	33608733	rs2287681	C	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CAATACAGACCGTCAACAAAG;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=33608741;WS=33608723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr19	33620897	rs3826906	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.006;NF=8;NR=2;PP=103;ReadPosRankSum=0.638;SC=CTTCATTGTGGGTTATTGTGA;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=33620905;WS=33620887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	33620993	rs35506888	T	TCC	1477.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.961;NF=10;NR=12;PP=1006;ReadPosRankSum=0.614;SC=GTTTTTCACTTTAGCTAACTT;SOR=0.476;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=22;WE=33621001;WS=33620983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr19	33635761	rs3848596	C	T	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=623;ReadPosRankSum=0.538;SC=ATCCGGTGGACGGTTCTGTGG;SOR=0.620;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=48;WE=33635769;WS=33635751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,67:0.44:154
chr19	33635853	rs3848597	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=523;ReadPosRankSum=0.378;SC=CCTTTCCCTCGTCTTACACTG;SOR=0.199;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=35;WE=33635861;WS=33635843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr19	33635877	rs3848598	T	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=11.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.03;ReadPosRankSum=2.607;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr19	33635887	rs3848599	T	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=13.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr19	33635991	rs10410058	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GGTCTCAAGCGATTCTCCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=33635999;WS=33635981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr19	33642273	rs12327849	A	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=693;SC=CCCATTCATGACTTCCTGAAT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=33642281;WS=33642263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	33647379	rs11881580	T	C	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=516;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GTTTCGAAACTGTGGAGCCTG;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=36;WE=33647387;WS=33647369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr19	33651233	rs3909410	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=311;ReadPosRankSum=0.106;SC=ATGAGGTGGTGCCTCGCCAAG;SOR=1.802;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=19;WE=33651241;WS=33651223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr19	33665038	rs79215236	G	A	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=42;PP=2774;SC=GACTACAGGCGCAAGCTATCC;SOR=1.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=95;TCR=42;TR=137;WE=33665046;WS=33665028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	33665188	rs4805855	C	G	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=95;PP=2832;ReadPosRankSum=1.049;SC=CAGGCTTCCCCGAGGCCTGCC;SOR=0.840;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=39;TCR=96;TR=134;WE=33665196;WS=33665178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr19	33665205	rs4805856	A	G	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=82;PP=2497;SC=TGCCCCAGGTAGGGTTTACCC;SOR=2.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=109;WE=33665213;WS=33665195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	33666154	rs200092325	A	AAAACAAAC	477.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.74;QD=47.77;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	33685836	rs60145560	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=0.064;SC=CTGACCGACCTCCTCTCCGGC;SOR=0.582;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=10;WE=33685844;WS=33685826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr19	33695830	rs11666900	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CCGGCCCACAGGGGCGGCACC;SOR=0.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=19;WE=33695838;WS=33695820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr19	33696708	rs2112800	T	C	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=61;PP=2167;SC=GCCGCCTCACTGTGGCCTACC;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=33696716;WS=33696698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	33698291	rs3745974	T	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=23;PP=1357;SC=GAGCCACTGGTAGACGGCCCA;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=33698299;WS=33698281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	33698655	rs376080905	C	CGG	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.43;QD=43.15;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	33698657	.	G	GGGC	574	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=23;MQ=61.78;NF=2;NR=16;PP=574;QD=33.7222222222;SC=GGACTGAACGGCGGGGGGGAG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=18;WE=33698665;WS=33698647;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,18:0.82:22
chr19	33699664	rs57394649	T	TA	1046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=1230;SC=AGGGCTTCCTTAAACAGGCTT;SOR=4.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=30;WE=33699672;WS=33699654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	33700445	rs2303093	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=42;PP=1168;SC=GCTGTCTGTACCCCCGACCCC;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=33700453;WS=33700435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	33702259	rs61759827	A	G	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TAGAGAGGCCATGTGTAAGGC;SOR=0.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=93;WE=33702267;WS=33702249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,109:0.54:201
chr19	33703103	rs11669156	C	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=13;PP=1568;SC=AGGACCAGCCCGAGCCTTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=33703111;WS=33703093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	33703706	rs11673535	A	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=16;PP=954;SC=GGCAGGATGGAGCCCGGGCAG;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=33703714;WS=33703696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	33878198	rs1061338	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=406;ReadPosRankSum=0.729;SC=GCCCATCACGAAAAGAGGTTG;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=19;WE=33878206;WS=33878188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr19	33878837	rs17570	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=340;ReadPosRankSum=0.867;SC=TCGCGGTTAAGGAAGGAGGCG;SOR=0.379;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=22;WE=33878845;WS=33878827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr19	33882222	rs17569	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=671;ReadPosRankSum=0.019;SC=CTCCCACGTCGTGCACGTCAA;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=52;WE=33882230;WS=33882212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,65:0.43:152
chr19	33953831	rs75449530	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=519;ReadPosRankSum=-0.271;SC=TCTCATCTGTTACTCACTCAG;SOR=0.776;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=36;WE=33953839;WS=33953821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,48:0.39:124
chr19	34003374	rs77298244	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=0.514;SC=CTTCCCAGGCGAGGAAACAGA;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=34003382;WS=34003367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr19	34288178	.	TGTGTGTGTGTGC	T	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.32;MQRankSum=1.496;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr19	34288202	rs1139231	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.677;NF=18;NR=5;PP=1360;ReadPosRankSum=1.476;SC=CGCGCGCGCGCGCGCGCTTGT;SOR=0.193;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=23;WE=34288210;WS=34288168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr19	34298013	rs147333556	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.385;SC=CATGGTAACCATAAAAAGTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=34298021;WS=34298003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	34304260	rs60235724	A	AT	1010.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=948;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GAGATGGCTTATTTTCTACAG;SOR=0.741;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=27;WE=34304268;WS=34304250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr19	34885006	rs8108038	A	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=56;PP=1674;SC=GGAGTCAGCAAGATTTGTGGG;SOR=1.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=79;WE=34885014;WS=34884996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	34890322	rs2301263	G	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=22;PP=1180;SC=GGCTTGGGGCGTGCCTGGCTT;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=34890330;WS=34890312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	34904539	rs9653103	C	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=113;SC=ACTGCGCCTGCCCTGATAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=34904547;WS=34904529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	34922865	rs3217243	T	TGTATAAA	2190.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=1502;SC=ATTGCAAAGTTGTATAAGGGT;SOR=1.157;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=22;WE=34922873;WS=34922855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	34942872	rs2161472	A	T	1025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.31;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	34954873	rs10412944	C	G	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=286;SC=TTTAAAAAATCAACCTGACTG;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=34954881;WS=34954863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	34957830	rs45482396	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=0.191;SC=GGTGATGCCCCGGAAAAAGTG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=34957838;WS=34957820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	34959812	rs7258977	A	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=512;SC=CGTAATGTGTAAAGTGAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=34959820;WS=34959802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	34959979	rs7259160	A	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=26;PP=1147;SC=TAGTTGATTCAGATGAAGAAG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=34959987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	34971763	rs7257588	T	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=18;PP=1008;SC=CCCTGACAGATAACGGTTTGG;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=34971771;WS=34971753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	34971846	rs4344866	C	T	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=35;PP=1582;SC=CCCTAGTCACCTCTCGATTCC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=34971854;WS=34971836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	34971998	rs7248705	G	A	2771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=35;PP=1837;SC=GGGGAGGCTCGCCGCCCACCG;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=91;WE=34972006;WS=34971988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	34972146	rs7248847	G	C	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=66;PP=2249;SC=TTCAGAGGCCGGTGCGCGGCC;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=122;WE=34972154;WS=34972136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	34972892	rs12609305	A	C	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.89;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	34973413	rs1465433	T	C	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=4;PP=80;SC=CGGGGCCGGCTCCCTTCCCGC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=34973421;WS=34973403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	34973476	rs8107479	G	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=2;PP=106;SC=GCGCGGCCGAGCGGCGGCTGG;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=34973484;WS=34973466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	34981505	rs4321301	G	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=878;SC=CCCAGGCTGGGCTGTGGAGGA;SOR=4.461;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=34981513;WS=34981495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	34985466	rs11671685	C	T	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=37;PP=1435;SC=CAGCTGATCACTTCTGGTTTC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=34985474;WS=34985456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	34986767	rs35126035	A	C	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.38;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	34986776	rs35570240	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.42;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	35036089	rs7259820	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=549;SC=GAATTCAGCCGTTTACTTAGG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=35036097;WS=35036083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	35174227	rs66509108	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=671;ReadPosRankSum=-0.051;SC=AGCATTTTAGGGATACTGTCT;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=42;WE=35174235;WS=35174217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr19	35175592	rs10425561	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.087;NF=19;NR=24;PP=703;ReadPosRankSum=-1.662;SC=TCAATCCTCAGTCGCCACTGG;SOR=0.550;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=43;WE=35175600;WS=35175582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr19	35175749	rs10401309	C	G	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.932;SC=TTAGCCATGGCTCATCACTTA;SOR=0.849;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=159;TCF=97;TCR=62;TR=60;WE=35175757;WS=35175739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,64:0.39:166
chr19	35231472	rs11426796	T	TA	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	35270362	rs11673342	G	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=590;ReadPosRankSum=1.115;SC=TGAACTCTCTGATGTTTACTG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=36;WE=35270370;WS=35270352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr19	35420841	rs2546001	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1196;ReadPosRankSum=0.602;SC=AGTTCTTACAATTCTCAAAGC;SOR=0.568;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=157;TCF=69;TCR=88;TR=73;WE=35420849;WS=35420831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,86:0.46:188
chr19	35420966	rs2651123	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=1.002;SC=CTAATTGCCTACTTGATTCCT;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=12;WE=35420974;WS=35420956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	35422808	rs10422961	C	T	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=58;PP=1771;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ATAGCCTTCTCCCAGCAGGAG;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=203;TCF=98;TCR=105;TR=110;WE=35422816;WS=35422798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,130:0.56:234
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chr19	35434448	rs62122088	A	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=999;ReadPosRankSum=-1.994;SC=GCCTTTGTTAAGCATGGGAGA;SOR=1.025;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=60;WE=35434456;WS=35434438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr19	35434512	rs2651109	T	C	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.206;SC=AGACTATTAGTGGTAGCTATC;SOR=0.691;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=70;WE=35434520;WS=35434502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
chr19	35435006	rs1345658	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1383;ReadPosRankSum=0.483;SC=GAATGCGGGAGAACCTTCAGT;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=83;WE=35435014;WS=35434996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,102:0.53:192
chr19	35448803	rs1063235	C	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=260;ReadPosRankSum=0.332;SC=CGCTGATAAACTCTACAGTAA;SOR=1.445;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=13;WE=35448811;WS=35448793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr19	35449409	rs2651081	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=604;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CACCACACCCGTGAGGCCGCT;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=44;WE=35449417;WS=35449399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr19	35449760	rs2651080	G	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=676;ReadPosRankSum=1.429;SC=GGCTTTCACCGGTGTGAACCC;SOR=0.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=44;WE=35449768;WS=35449750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,60:0.43:138
chr19	35450229	rs2651079	C	T	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.454;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=66;PP=1606;ReadPosRankSum=-1.938;SC=CACCTGTTTCCGGGGAAGGTT;SOR=1.206;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=226;TCF=102;TCR=124;TR=107;WE=35450237;WS=35450219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,116:0.46:252
chr19	35450505	rs117383413	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=-0.238;SC=GGTGAAGTTCGTATAAACTTT;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=21;WE=35450513;WS=35450495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr19	35451330	rs2546024	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	35451742	rs2651078	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=562;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGAGGAGCTCGGGACACCGGG;SOR=0.667;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=30;WE=35451750;WS=35451732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr19	35452045	rs2546026	A	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=219;ReadPosRankSum=0.624;SC=CCACTGTGTCAGCCCGCAGCA;SOR=0.259;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=19;WE=35452053;WS=35452035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr19	35454459	rs181712515	C	T	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1408;ReadPosRankSum=-1.792;SC=AGAACAAAGCCATCTTTTGCG;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=187;TCF=110;TCR=77;TR=92;WE=35454467;WS=35454449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,117:0.48:242
chr19	35454604	rs2546028	AA	CG	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=1408;ReadPosRankSum=0.229;SC=ACGGTGCGGGAAACCACGGGG;SOR=0.544;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=37;WE=35454613;WS=35454594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr19	35491326	rs3072398	A	AGCCCT	399.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=206;SC=CGCGCAGCCCAGCCCTGCCCT;SOR=1.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4;WE=35491334;WS=35491316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	35500244	rs200149712	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1045;ReadPosRankSum=0.687;SC=GTTGGTGCAAGCCCAGGTGGG;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=64;WE=35500252;WS=35500234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr19	35513896	rs4806072	C	T	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=13;PP=682;SC=CCCCATGCCCCCCAGCTCCCC;SOR=1.040;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=31;WE=35513904;WS=35513886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	35524964	rs72558028	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.890;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1217;ReadPosRankSum=1.042;SC=GGGCTTGCCCGGGATAATAAT;SOR=0.590;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=193;TCF=93;TCR=100;TR=80;WE=35524972;WS=35524954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,104:0.44:239
chr19	35533550	rs11399986	A	AC	604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=540;SC=ATGCATCCCCACCCCTGTTAG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=14;WE=35533558;WS=35533540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	35577870	rs7250814	G	A	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=1819;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CTGTGTGTCCGTCTTTGCCGA;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=188;TCF=104;TCR=84;TR=112;WE=35577878;WS=35577860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,127:0.57:221
chr19	35578055	rs17718894	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=541;ReadPosRankSum=1.254;SC=GCTTTGGGACGTGTCGTTTCT;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=29;WE=35578063;WS=35578045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr19	35590180	rs1687994	T	A	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=54;PP=1966;SC=CCTGTGGGTGTGACATGCATA;SOR=1.049;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=97;WE=35590188;WS=35590170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	35597215	rs10422803	C	A	132.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TTGTGCCGAGCCTGCCCTGCC;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=35597223;WS=35597206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr19	35602372	.	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TTTGTAAAAACTAAAGGTACA;SOR=1.981;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=8;WE=35602380;WS=35602362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	35602445	rs71856123	TG	T	92.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.02;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr19	35608148	rs1688021	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TGGGACTGGACGTTGTTTTGC;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=26;WE=35608156;WS=35608138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr19	35609972	rs10543115	GGAC	G	2985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=11;PP=2680;SC=TGTCCAGTGAGGACAACAGCG;SOR=2.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=35609989;WS=35609962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	35609981	rs10426785	C	T	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=15;PP=1630;SC=AGGACAACAGCGGGCAGTGGC;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=35609989;WS=35609962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	35610245	rs2278994	A	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=37;PP=1337;SC=TGCTAAGGCCAGACCTCCCGC;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=35610253;WS=35610235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	35612168	rs1688016	T	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-1.322;SC=CCGTGCCCCCTTTCCCCTCCC;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=15;WE=35612176;WS=35612158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr19	35612286	rs2290650	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GTTACTGAATATGCCACACAG;SOR=0.737;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=17;WE=35612294;WS=35612276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr19	35613623	rs1688017	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=1.059;SC=GGGACAGATGGAGAGGACACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=35613631;WS=35613620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	35614272	rs937088	A	G	900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=7.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.149;QD=14.07;ReadPosRankSum=2.265;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr19	35614274	rs937089	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=7.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.149;QD=11.11;ReadPosRankSum=2.191;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr19	35614336	rs1672974	T	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=455;ReadPosRankSum=-0.511;SC=ACCCCATCACTTCCCGCAGGC;SOR=0.993;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=31;WE=35614344;WS=35614326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr19	35615995	rs14358	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=-0.176;SC=ACGTGGCCCACGGTCAGCAGC;SOR=0.165;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=15;WE=35616003;WS=35615985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr19	35616016	rs1048690	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=538;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TCACAGGCGGGCCATCACCCC;SOR=0.512;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=27;WE=35616024;WS=35616006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr19	35616086	rs11084800	C	T	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.237;SC=CCCAGAGTCCCGTTGGTGGTC;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=178;TCF=113;TCR=65;TR=81;WE=35616094;WS=35616068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,95:0.47:203
chr19	35616315	rs12610146	GC	AT	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.858;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=1219;ReadPosRankSum=0.682;SC=AGGATGGCCAGCTGGTCCCTG;SOR=1.105;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=35;WE=35616324;WS=35616305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr19	35616464	rs12976269	G	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=371;ReadPosRankSum=-0.363;SC=TCTGGGGGCCGTGGAACAGCT;SOR=0.788;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=28;WE=35616472;WS=35616454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr19	35616562	rs12978414	C	G	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=26;PP=1301;ReadPosRankSum=1.206;SC=CACACACATGCAGTTGTTCTG;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=171;TCF=106;TCR=65;TR=75;WE=35616570;WS=35616552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,87:0.43:204
chr19	35616663	rs1630545	A	G	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.608;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1268;ReadPosRankSum=1.856;SC=TTCTCCCACCACCTCTGGCTG;SOR=0.453;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=187;TCF=80;TCR=107;TR=84;WE=35616671;WS=35616653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,104:0.46:226
chr19	35616692	rs1672976	C	T	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCCCTCCTGACTGGACCATCC;SOR=0.701;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=68;WE=35616700;WS=35616682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,84:0.51:165
chr19	35616953	rs1632457	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GAGCCAGCATTTGGGGGTAGA;SOR=0.136;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=35616961;WS=35616943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr19	35617122	rs937087	A	G	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=1.122;NF=51;NR=45;PP=1539;ReadPosRankSum=0.302;SC=TTAGTGTGCAAGATTGGGTCA;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=96;WE=35617130;WS=35617112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,108:0.45:242
chr19	35617270	rs1319969	T	C	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1251;ReadPosRankSum=0.391;SC=CGGGGATGTCTGTGCGTCTCT;SOR=0.508;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=89;WE=35617278;WS=35617260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,104:0.50:209
chr19	35617639	rs1687998	C	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.226;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=899;ReadPosRankSum=0.091;SC=CGAAGAGGCTCGGGCCCAGCA;SOR=0.974;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=45;WE=35617647;WS=35617629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr19	35622492	rs1688001	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=0.593;SC=GGCTGCGACCCGGCTTCCACG;SOR=0.461;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=27;WE=35622500;WS=35622482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr19	35622695	rs1673007	A	G	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=9;PP=679;SC=AGCCTCACACATGAGTAAGGG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=35622703;WS=35622685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	35624890	rs11666576	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=605;ReadPosRankSum=0.583;SC=TGTGCATAAACGCACACTCCC;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=47;WE=35624898;WS=35624880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr19	35631669	.	C	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TCCTTCCTCTCTGATTCCACC;SOR=0.472;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=18;WE=35631677;WS=35631659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr19	35631721	.	C	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=1.391;SC=GTGTCACTGTCTATGTGATAC;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=10;WE=35631729;WS=35631711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr19	35632165	rs151269496	TCTGGCCCCGCCTCTCCCTGGCCCCGCCTCTCCCTAGCCCCCCTCTCC	T	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	35632634	rs12461849	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=403;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CTGGGACCAAGCGAGGAAAAA;SOR=0.474;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=26;WE=35632642;WS=35632624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr19	35633236	rs1687986	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=714;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CCTCATTTCTGGCGGACCCCG;SOR=0.269;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=47;WE=35633244;WS=35633226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr19	35633503	rs1673004	C	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=485;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TCCCTGGCTGCGTAGAGGGAA;SOR=2.151;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=29;WE=35633511;WS=35633493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr19	35642651	rs36072726	G	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=486;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AAGGGAAGTCGCGGGGATGGA;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=26;WE=35642659;WS=35642641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr19	35648291	rs74836246	C	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=296;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GGGGACCAGGCTCCCTCCTGA;SOR=0.061;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=17;WE=35648299;WS=35648281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr19	35648365	rs1688005	T	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=713;ReadPosRankSum=1.317;SC=TTCAGCAGACTCAACTATCAT;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=45;WE=35648373;WS=35648355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr19	35649281	rs1128882	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=545;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CCACCTCTCCAACCCCAACCT;SOR=0.264;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=37;WE=35649289;WS=35649271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr19	35649324	rs1633915	C	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.033;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=918;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CAGGGGCAGGCGGCGGGGACA;SOR=2.613;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=36;WE=35649332;WS=35649313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr19	35649352	rs79003548	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GACAAACAAAGTTTCCCCTCT;SOR=0.217;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=16;WE=35649360;WS=35649342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr19	35650278	rs61709658	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=1.381;SC=ACTGTGTGCTGTGTTTGTGTG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=35650286;WS=35650271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	35651531	rs1617607	A	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=6;PP=865;SC=ATACAGACATAAGCCACCGCG;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=35651539;WS=35651521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	35655151	rs1672994	T	C	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=49;PP=1592;SC=GCCATCTGGTTAGTAACTGCC;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=35655159;WS=35655141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	35657284	rs75807286	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=1.148;SC=GACTTATGACGGAGGGCTGGG;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=18;WE=35657292;WS=35657274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr19	35657351	rs8106303	A	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=9;PP=344;SC=AGCTGCATATACATACAAACC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=35657359;WS=35657341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr19	35660508	rs12110	G	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=31;PP=965;SC=TGCCGGAATCGTTGCAGGTGA;SOR=1.123;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=35660516;WS=35660498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr19	35757250	rs916147	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=439;ReadPosRankSum=0.996;SC=CCTGTTGATTGTGTCCTCACA;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=34;WE=35757258;WS=35757240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr19	35758275	rs142507475	G	GGGA	5295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=30;PP=2967;SC=GAGTAATGGTGGGAGAAGCCG;SOR=1.382;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=60;WE=35758283;WS=35758265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	35761519	rs28365133	A	G	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=937;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TAGAAGTCAGATTGGCAGGTG;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=65;WE=35761527;WS=35761509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
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chr19	35769561	rs28365136	T	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=819;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TCAGGCATGATCCGTCAGCGA;SOR=0.445;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=86;TCR=22;TR=49;WE=35769569;WS=35769551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
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chr19	35770174	rs12742	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CGCCACCACCACGCAGCCGCC;SOR=0.596;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=15;WE=35770182;WS=35770164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr19	35785378	rs55976703	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=0.410;SC=ACTGTGTGGCCTTGGGCGAGT;SOR=1.105;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=14;WE=35785386;WS=35785368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr19	35791333	rs77800808	C	T	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1360;ReadPosRankSum=0.298;SC=TGTGCGTCCACACGCCCACCT;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=94;WE=35791341;WS=35791323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,107:0.56:192
chr19	35793589	rs1126770	C	T	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=59;PP=1526;ReadPosRankSum=1.175;SC=AGAGGGCCACCGCCTTCAACC;SOR=0.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=53;TCR=107;TR=87;WE=35793597;WS=35793579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,103:0.51:200
chr19	35800720	rs10411883	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=-1.113;SC=AGGAGTCTCCGGGGCCGGGCC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=35800728;WS=35800717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	35801221	rs73031732	G	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=107;ReadPosRankSum=0.275;SC=AAGCCGCCCTGAGTTTGCCCC;SOR=1.850;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=5;WE=35801229;WS=35801211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	35832910	.	G	GTCCT	581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=10;PP=596;SC=GTGGTGGTCAGTCCTTCCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=35832918;WS=35832900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	35836751	rs4805119	A	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=1.478;SC=CCTCATTCCCACTCGGCAACA;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=16;WE=35836759;WS=35836741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr19	35836859	rs4805120	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=0.187;SC=TCAAGACCTCATGATACACAC;SOR=3.014;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=35836867;WS=35836849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr19	35991043	rs11666154	G	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACACCTGCCTGCTCCCCTCCT;SOR=0.562;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=28;WE=35991051;WS=35991033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr19	35991373	rs2293695	C	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1016;ReadPosRankSum=0.914;SC=ATTGCCCAGACCCGGGAGCAA;SOR=0.653;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=68;WE=35991381;WS=35991363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
chr19	35991442	rs909072	T	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=43;PP=1426;SC=CACCTGATCGTCTCTGCCTGC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=35991450;WS=35991432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr19	35993661	rs11084816	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=1.590;SC=AGGGTGGCTGCCTTGAGGGAG;SOR=1.284;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=19;WE=35993669;WS=35993651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
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chr19	35997363	rs6510492	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=299;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ACACCTCAAGCAAATGAGATT;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=19;WE=35997371;WS=35997353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	35997457	rs6510493	G	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=723;ReadPosRankSum=1.481;SC=CAACACCTTGGTCTGGTGGTG;SOR=0.388;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=53;WE=35997465;WS=35997447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,61:0.69:89
chr19	35997644	rs6510494	C	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GGCTGGGCATCGTGGGTCACG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=35997652;WS=35997634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	35998213	rs4358061	A	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=485;ReadPosRankSum=0.068;SC=GGATCCCAGAACCCTGTTTTG;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=27;WE=35998221;WS=35998203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr19	35998362	rs4254439	T	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=562;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AGGCTCACCCTATAATTGTCT;SOR=0.976;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=35;WE=35998370;WS=35998352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr19	35999251	rs11084818	C	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=521;ReadPosRankSum=1.111;SC=TAATGGCACTCTCTTTTGGAA;SOR=0.592;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=32;WE=35999259;WS=35999241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr19	36002393	rs11667007	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=2.123;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.753;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr19	36002421	.	A	ACTGCTGCTG	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.73;MQRankSum=2.518;QD=4.27;ReadPosRankSum=2.088;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr19	36004106	rs4806163	A	G	3735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=73;PP=2261;ReadPosRankSum=1.219;SC=AGCATCTGCTACGCCAAAGCC;SOR=0.674;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=131;TCR=132;TR=147;WE=36004114;WS=36004096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,169:0.57:297
chr19	36015491	rs67543901	G	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=329;ReadPosRankSum=0.786;SC=AGGTTGGAGGGTCTTTGCAGA;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=21;WE=36015499;WS=36015481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr19	36015865	rs2285511	A	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AACCCCACAAACGCGGAGGGT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=36015873;WS=36015855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr19	36017598	rs75962883	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=752;ReadPosRankSum=-0.445;SC=ATTATGAGCATTCTGCAGCTC;SOR=0.831;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=45;WE=36017606;WS=36017588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,56:0.60:93
chr19	36017928	rs10775583	G	C	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1679;ReadPosRankSum=1.512;SC=AAACTGCCCCGCCTCCCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=117;TCR=100;TR=105;WE=36017936;WS=36017907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,124:0.50:248
chr19	36018272	rs12461911	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.950;NF=34;NR=23;PP=748;ReadPosRankSum=0.674;SC=CGGCCTGCCCCGCAGCATGGT;SOR=0.858;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=57;WE=36018280;WS=36018262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,59:0.32:182
chr19	36018407	.	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=9.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-2.991;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.555;SOR=1.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,21:0.12:171
chr19	36018413	rs368150998	T	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=12.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-3.209;QD=1.90;ReadPosRankSum=-2.460;SOR=1.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,19:0.11:166
chr19	36018695	.	A	G	756	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=58.1;NF=30;NR=24;PP=756;QD=14.6439113435;SC=CCTCATTTCCAGCCTGCCCTG;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=54;WE=36018703;WS=36018685;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr19	36033460	rs2239945	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=715;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CAATGTTCGTCATGGGTGTCA;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=47;WE=36033468;WS=36033450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr19	36038221	rs759996	T	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=744;ReadPosRankSum=-1.571;SC=GACATTTTCCTGCAGGACCTT;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=51;WE=36038229;WS=36038211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr19	36038390	rs7599	A	G	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=42;PP=1348;SC=TCCCTGCCTCACTCCAGGTTT;SOR=1.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=36038398;WS=36038380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	36042207	rs2301617	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=0.805;SC=GAGTTATTGGCCAGTTAGAAA;SOR=0.375;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=12;WE=36042215;WS=36042197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr19	36042531	rs12977572	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=155;ReadPosRankSum=0.720;SC=CCTGAGTCCCGGCGGAGAGCC;SOR=0.527;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=11;WE=36042539;WS=36042521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
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chr19	36104890	rs45510191	C	T	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1233;ReadPosRankSum=0.525;SC=ATTGCCCTCCCCCCTAGAAGC;SOR=0.648;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=57;TCR=90;TR=83;WE=36104898;WS=36104880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,93:0.57:163
chr19	36105908	rs7249516	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=1654;ReadPosRankSum=-2.311;SC=GCTGAGCCCCGATCAGACCAT;SOR=0.794;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=45;WE=36105925;WS=36105898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr19	36105917	rs34572637	A	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=1104;ReadPosRankSum=0.190;SC=CGATCAGACCATCTGACCCTG;SOR=0.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=35;WE=36105925;WS=36105898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr19	36106337	rs3814983	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=0.653;SC=CAGACATTCTCTTAGAGACCT;SOR=0.207;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=19;WE=36106345;WS=36106327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr19	36113459	rs2285413	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=288;ReadPosRankSum=1.994;SC=AGGTACCAGCGAGCCAGAGGA;SOR=0.395;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=18;WE=36113467;WS=36113449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr19	36113658	rs2285414	A	G	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=58;PP=2765;SC=CGTGCCGCGGATGGGAAACAG;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=134;WE=36113676;WS=36113648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	36122441	rs2285415	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=738;SC=CCTAAAGCACGAACCTGATCA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=36122449;WS=36122431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	36124176	rs8106576	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=85;ReadPosRankSum=-1.981;SC=CAGGGAACTAACGGTCAGATG;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=9;WE=36124184;WS=36124166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	36133982	rs3214104	TG	T	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.035;NF=0;NR=9;PP=254;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AGGTGGGGACTGGGGTCCCGA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=36133990;WS=36133972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr19	36134208	rs2285419	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=477;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GTGGTCCGGGGACTGGACAGA;SOR=0.691;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=33;WE=36134216;WS=36134198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr19	36134665	rs145198089	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=848;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GGTGAGAGGGCCGCAAAGACT;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=50;WE=36134673;WS=36134655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr19	36135279	rs3835005	C	CT	2562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=1572;SC=CAGCCAAATCCGCCCCGTCTC;SOR=1.249;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=35;WE=36135287;WS=36135269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	36135783	rs117704954	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.662;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr19	36135793	rs6510501	A	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr19	36142296	rs61220012	G	A	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1456;ReadPosRankSum=1.573;SC=GTCACTCACCGCTTGCCTCTT;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=189;TCF=76;TCR=113;TR=106;WE=36142318;WS=36142286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,126:0.53:237
chr19	36159368	rs2267586	T	G	3888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=66;PP=2486;ReadPosRankSum=0.830;SC=GTCAGGCCTGTCCCTGTTTGC;SOR=0.734;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=301;TCF=163;TCR=138;TR=147;WE=36159376;WS=36159357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,176:0.49:361
chr19	36164108	rs75289222	G	T	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=896;ReadPosRankSum=1.604;SC=TCTGCCCGACGGGCCGTCCTC;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=96;TCR=59;TR=67;WE=36164116;WS=36164098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr19	36168646	rs73602806	A	G	112.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=58;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AAGGGCGCACAGTGACTCTCG;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=6;WE=36168654;WS=36168640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	36168872	rs2285420	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=234;ReadPosRankSum=0.565;SC=CTGCCTCCTCGCCAGCTCCCG;SOR=0.382;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=17;WE=36168880;WS=36168862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr19	36168914	rs2285421	T	C	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=27;NR=13;PP=635;SC=TTCTACACCATGCTCTGAGGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=36168922;WS=36168904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr19	36206986	rs2234371	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=857;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CAGTGAGTTGGCGCTGGGATT;SOR=0.645;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=57;WE=36206994;WS=36206976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
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chr19	36222857	rs16970649	C	T	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GTTCTTGTCCCTGGAGCTCCT;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=81;WE=36222865;WS=36222847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,101:0.48:210
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chr19	36223747	rs73590585	A	G	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=922;ReadPosRankSum=-1.708;SC=TTGGGGCTGCAGGGGACAGGG;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=82;TCR=75;TR=72;WE=36223755;WS=36223737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,83:0.46:180
chr19	36224161	rs112013670	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TGCCCCCAGGCCCCCTCCTCG;SOR=0.250;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=36224169;WS=36224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr19	36224705	rs231591	A	G	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1569;SC=CTTCCGGAAGATGGTCCTCCC;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=36224713;WS=36224695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	36228667	rs73590598	C	T	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=960;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGCTGGGGGGCGGGTGGTGGT;SOR=0.620;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=67;WE=36228675;WS=36228657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr19	36230767	rs34562867	A	G	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1410;ReadPosRankSum=-1.265;SC=TCCTTGGGCCAGCAGAGATGC;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=97;WE=36230775;WS=36230757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,114:0.55:206
chr19	36233200	rs3893069	C	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.167;SC=GGCTAGGGCTCCTCCCACCTG;SOR=2.409;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=6;WE=36233208;WS=36233190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	36235655	rs34632325	G	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=0.332;SC=TGAACAGAGAGTGAGGCATGA;SOR=0.527;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=5;WE=36235663;WS=36235645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr19	36236120	rs231597	A	G	4565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=61;PP=2467;SC=AACCCTGGAAAAGGTGCAAAG;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=62;TCR=61;TR=123;WE=36236128;WS=36236110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	36237227	rs3817622	T	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.398;SC=TGTGGGAGAGTTTCTTCCAAA;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=65;WE=36237235;WS=36237217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,75:0.55:136
chr19	36237245	rs2293688	C	G	5682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=62;PP=2965;SC=AAATAGATCTCGGTGGGAGTT;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=144;WE=36237253;WS=36237235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	36242998	rs11878987	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=1.920;SC=AGGACACGCACGCCCTTCCCT;SOR=0.869;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=24;WE=36243006;WS=36242988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr19	36243089	rs170758	T	C	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=59;PP=2777;SC=CTGGAGATGGTCAAAGCCCGG;SOR=1.058;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=85;TCR=59;TR=144;WE=36243097;WS=36243079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	36243190	rs231244	T	C	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=67;PP=1880;SC=GGCACCCTGGTGGGTTGGGCC;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=48;TCR=68;TR=115;WE=36243198;WS=36243180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	36243813	rs231243	G	A	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=52;PP=2260;SC=CTCCCTACGCGGGCCATCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=36243821;WS=36243803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	36245413	rs231241	G	A	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.550;SC=ACATCCCCCAGCTCCACACTG;SOR=1.029;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=64;WE=36245421;WS=36245403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,74:0.57:130
chr19	36250646	rs7254581	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=945;ReadPosRankSum=-0.593;SC=GGATGACCCATGAGACCTCAC;SOR=0.567;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=66;WE=36250654;WS=36250636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr19	36253317	rs807479	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=996;SC=AGCCCTAGGACAGAATTAGAA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=36253325;WS=36253307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	36255965	rs7252936	C	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1382;ReadPosRankSum=0.068;SC=CCTCCTCCCTCAGCCCCAGCG;SOR=0.832;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=85;WE=36255973;WS=36255955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,101:0.56:180
chr19	36257932	rs35876904	CCT	C	1413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=1262;SC=GACCCTCCACCCTCTCTCTCT;SOR=1.802;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=27;WE=36257941;WS=36257922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr19	36258842	rs231217	G	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.654;NF=16;NR=33;PP=583;ReadPosRankSum=-1.498;SC=CCACAGTCAAGGCCTCGCCGC;SOR=1.030;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=49;WE=36258850;WS=36258832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr19	36258937	rs5827939	AG	A	2360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=26;PP=1969;SC=CTGCTTGCCCAGGGCCGCCCT;SOR=1.263;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=50;WE=36258945;WS=36258927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	36259292	rs11881839	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=0.405;SC=TCTGCTCTCCCGGCCTTTCTC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=7;WE=36259300;WS=36259282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	36259415	rs35178229	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=487;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GCTAAGAAGGGAAGGAGATTC;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=33;WE=36259423;WS=36259405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr19	36259494	.	C	A	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=7;PP=108;QD=14.2771212547;SC=TTTTTTTTTTCATACAGTTAC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=10;WE=36259502;WS=36259484;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,10:0.37:27
chr19	36268471	rs12982672	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=277;ReadPosRankSum=2.437;SC=CTCTGGACCCGCGCTGCCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=17;WE=36268479;WS=36268461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr19	36268771	rs231228	C	T	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=75;PP=2965;SC=CTGACTGCGCCCATTTCCACT;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=165;WE=36268779;WS=36268761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	36268923	rs807491	C	T	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=30;PP=861;SC=CTGCTGCACGCGTCTGAGCAG;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=36268931;WS=36268913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	36269915	rs231230	T	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=353;SC=AGAGGCCCACTCTGACAACCT;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=36269923;WS=36269905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	36270052	rs231231	A	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=30;PP=1347;SC=GGGCTTGGAGATTCCGAGTGG;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=36270060;WS=36270042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	36271139	rs231233	C	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=952;ReadPosRankSum=0.622;SC=GGCGACTGCTCCTCAGTGAGG;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=66;WE=36271147;WS=36271129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr19	36273230	rs231223	C	G	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=5;PP=1080;SC=CGTGAGCGAGCCCCTCTGACC;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=36273238;WS=36273220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	36273308	rs35297478	G	A	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1082;ReadPosRankSum=0.005;SC=TCCCGGAGCTGTCTGGCCCTG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=101;TCR=43;TR=74;WE=36273316;WS=36273298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr19	36276403	rs120959	T	G	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=57;PP=1637;SC=AGGCGGGCAATTGGGGGGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=81;WE=36276411;WS=36276393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	36278470	rs231235	C	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=32;PP=1530;SC=AGGTCAGTGCCCAGCTCAGGG;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=36278478;WS=36278460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	36279862	rs59882609	AG	A	745.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=710;SC=ATCTGCAGAGAGGGGAACCAT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=36279870;WS=36279852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	36302921	rs12462360	T	C	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=59;PP=2079;SC=AGGAGGCTCCTGGCCTTCTGA;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=124;WE=36302929;WS=36302911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	36303664	rs3848666	G	C	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=731;ReadPosRankSum=1.318;SC=GCCCCTGGAGGGGGGACCAGC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=59;WE=36303672;WS=36303654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,72:0.55:130
chr19	36317556	rs77309273	C	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=1.146;SC=CCCTGACAGGCAAAAAGTGGA;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=12;WE=36317564;WS=36317546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr19	36321910	rs731934	G	A	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=41;PP=1530;SC=TCCAGGCGTCGGGGGTACCTC;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=36321918;WS=36321900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	36322270	rs2071327	C	T	7086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=94;PP=2965;SC=GGTCCTCTTCCGACCTTCCAG;SOR=1.045;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=131;TCR=94;TR=225;WE=36322278;WS=36322260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr19	36336453	rs145554982	G	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=-1.412;SC=CTGTGGAACCGGGGTCAAGCC;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=24;WE=36336461;WS=36336443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr19	36342212	rs3814995	C	T	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GGCCCCATCTCAGAGCGGCCG;SOR=0.870;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=82;TCR=96;TR=88;WE=36342220;WS=36342202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,100:0.48:208
chr19	36355595	rs382789	A	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=31;PP=1446;SC=TCTGGAGGAGAAAGGGACTCT;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=36355603;WS=36355585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	36361635	.	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=343;ReadPosRankSum=0.540;SC=GCAGTGAGCCGAGATTGTACC;SOR=1.106;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=18;WE=36361643;WS=36361625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr19	36435936	rs144984680	CT	C	154.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=118;SC=GCGCCCCCCCCTCTAAGGGTC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=36435944;WS=36435926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	36486445	rs7249826	G	C	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=45;PP=2257;SC=GGCGTGGGTTGCCAGCCTGAC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=36486453;WS=36486435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
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chr19	36526281	rs66987345	TATA	T	1230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=787;ReadPosRankSum=0.456;SC=CAAGCCCACGTATAATGTCTT;SOR=0.473;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=20;WE=36526291;WS=36526271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
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chr19	36530343	rs10421966	C	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1976;ReadPosRankSum=-2.171;SC=TTGCAGCCTCCGCACCCGGCG;SOR=0.834;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=62;WE=36530351;WS=36530322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,83:0.53:156
chr19	36536938	rs7258807	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AAACTATGGTAATGTGGTTTG;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=9;WE=36536946;WS=36536928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr19	36558113	rs12608517	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.578;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=168;ReadPosRankSum=-1.122;SC=AGACTTGGAGTGGGGACGAGC;SOR=0.135;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=16;WE=36558121;WS=36558103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	36558712	rs10423651	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=0.989;SC=TATCTCACTACGCCCTCTGTG;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=12;WE=36558720;WS=36558702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr19	36572279	rs142105577	G	GTCATTTTC	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=593;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AAATGCAACAGTAAGTCATAG;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=8;WE=36572287;WS=36572269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	36572564	rs7246292	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=482;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TGATGGACCCTAGATGTTAGG;SOR=0.171;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=29;WE=36572572;WS=36572554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr19	36581263	rs3746271	G	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=595;ReadPosRankSum=1.332;SC=GGCTTCCAGGGGAGGGGAGGA;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=46;WE=36581271;WS=36581253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr19	36582270	rs2301736	G	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=643;ReadPosRankSum=1.123;SC=CTCTGACTCCGAAGGCAAGTG;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=42;WE=36582278;WS=36582260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr19	36590329	rs2285745	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=667;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GCAGATGGCTTGGCCTTCCAC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=34;WE=36590337;WS=36590319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr19	36592752	rs2311004	G	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=198;ReadPosRankSum=-1.155;SC=CTAAGCACAGGCCCTGCACTT;SOR=0.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=14;WE=36592760;WS=36592742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr19	36594659	rs2074435	A	T	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=64;PP=1606;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGGCTCCTGCAGCCCCCCGTG;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=218;TCF=87;TCR=131;TR=104;WE=36594667;WS=36594649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,120:0.47:253
chr19	36595436	rs1008328	A	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.744;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=723;ReadPosRankSum=0.735;SC=TTGGTCTGTTACAGGGCAGCC;SOR=0.311;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=51;WE=36595444;WS=36595426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,60:0.40:151
chr19	36602729	rs1003470	G	C	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TGAAAGCAAGGCACTGTTCTA;SOR=0.608;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=68;WE=36602737;WS=36602719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr19	36603703	rs2072605	T	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=0.382;SC=CCAGGGGCCCTGGGACGCTGG;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=18;WE=36603711;WS=36603693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	36605647	rs2227260	T	C	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.704;SC=AGGGGTTAGTTCTGGAGCCAT;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=73;TCR=96;TR=73;WE=36605655;WS=36605637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,83:0.44:189
chr19	36605794	rs2231568	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CCCAGCCTTCCGCGCTTGCTC;SOR=2.336;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=36605802;WS=36605784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	36612396	rs2075474	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=1.269;SC=CCCGGCCGACACCCCAACTGA;SOR=0.984;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=34;WE=36612404;WS=36612386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr19	36640642	rs17879464	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=561;ReadPosRankSum=1.044;SC=TTTGCCAGCCGTCCCTGGGTG;SOR=0.895;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=36;WE=36640650;WS=36640632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr19	36640769	rs14100	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=611;SC=GCCCCCTCACTGCCTTGCTAT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=36640777;WS=36640759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	36642310	rs2008683	T	C	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=6;PP=1293;SC=CAGCCACCTCTTACTCTGGGT;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=51;WE=36642318;WS=36642300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	36642552	.	A	AC	636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
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chr19	36642562	rs2285599	A	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
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chr19	36940760	rs2967532	G	T	3641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=81;PP=2035;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TTAAACTGCCGATTACATTCC;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=127;TCR=165;TR=146;WE=36940768;WS=36940750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,174:0.50:351
chr19	36940965	rs2912441	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CAAAACTTCAATCAATATGGG;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=36940973;WS=36940955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	36963637	rs2967539	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=237;ReadPosRankSum=0.767;SC=AGGAGAAAAGCAGGCAAAGTG;SOR=1.078;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=14;WE=36963645;WS=36963627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr19	36964376	rs2967540	C	T	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=49;PP=1248;ReadPosRankSum=1.627;SC=ACAATAACCACGTATATGACT;SOR=1.086;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=33;TCR=78;TR=67;WE=36964384;WS=36964366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,77:0.58:133
chr19	36967352	rs150830509	T	TTTTC	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=0.936;SC=AAGGTGTTGTTTTTCTAACAT;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=2;WE=36967360;WS=36967342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr19	36981218	rs2967473	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=725;ReadPosRankSum=1.094;SC=AATGAGTGGGGCAGGAAGTAA;SOR=0.887;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=52;WE=36981226;WS=36981208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr19	37004938	rs2967505	T	C	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=690;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TAATGTGATGTGACTTTTGGC;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=46;WE=37004946;WS=37004928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr19	37039069	rs2912444	A	C	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGTCCTTGTAAGTCAATCTTG;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=216;TCF=107;TCR=109;TR=114;WE=37039077;WS=37039059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,134:0.53:252
chr19	37064240	rs2967442	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=401;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CGCGGCCCTGAGGCCTGTGGG;SOR=0.688;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=25;WE=37064248;WS=37064230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr19	37064267	rs3096618	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=0.338;SC=AGTCCAACAACGAAAGAGCCC;SOR=0.612;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=29;WE=37064275;WS=37064257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr19	37065914	rs3108597	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AGTTTGCTTTGCTATGTTTGT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=37065922;WS=37065904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	37068081	rs2912410	G	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=385;SC=GGGCTGGTCTGGAACTCCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=37068089;WS=37068071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	37068235	rs3108598	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=0.208;SC=GGTCCTCCCATGTTACATTGT;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=14;WE=37068243;WS=37068225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr19	37117302	rs3108171	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=650;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ACTGGATGGGAGAAATCACTC;SOR=0.510;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=40;WE=37117310;WS=37117292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,43:0.41:106
chr19	37147330	rs12981751	T	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=596;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TGCAAGAGCTTCCTGTGCTTG;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=35;WE=37147338;WS=37147320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr19	37203249	rs1830031	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=-1.216;SC=TGTACCTGGCTAAGTCCACCT;SOR=0.826;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=16;WE=37203257;WS=37203239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr19	37210805	rs3108201	C	T	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=1599;ReadPosRankSum=0.115;SC=AGAAACCCTACATTTGTAAAG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=105;WE=37210813;WS=37210795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,117:0.52:225
chr19	37239278	rs11672680	C	A	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGTGAATTCGCCGATGTTGGA;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=67;WE=37239286;WS=37239268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr19	37241141	rs1673082	A	G	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1442;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GTTGAATAAGATGTGCAGACG;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=80;TCR=98;TR=88;WE=37241149;WS=37241131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
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chr19	37440363	rs17242235	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=181;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GTTATTAATAGTCTAGTGGTA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=10;WE=37440371;WS=37440353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr19	37854580	rs3745764	C	T	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=67;PP=2733;SC=CACCAGAGGACACATTCAGGA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=133;WE=37854588;WS=37854570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	37864925	rs61161652	A	AC	2398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=16;PP=1952;SC=CCACCCCGCCACCCTGGCCAG;SOR=2.030;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=46;WE=37864933;WS=37864915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	37918609	rs7254009	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=1.535;SC=AATCATGATGCTTGCAATAAA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=37918617;WS=37918599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr19	38024271	rs12977460	T	G	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=860;ReadPosRankSum=0.280;SC=CACCATGGATTGGTGAGGCAG;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=60;WE=38024279;WS=38024261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr19	38028865	.	G	C	202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=20;MQ=55.41;NF=0;NR=10;PP=202;QD=23.6771212547;SC=CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=38028873;WS=38028855;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,10:0.83:12
chr19	38046946	rs112514764	C	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=559;ReadPosRankSum=-1.581;SC=TTTTTCTGCACCTTTGGAGCT;SOR=1.024;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=37;WE=38046954;WS=38046936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr19	38057251	rs118051536	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.092;SC=AATAAAAATTCTATGGTAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=38057259;WS=38057241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr19	38077661	rs8111055	G	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1100;ReadPosRankSum=1.243;SC=ACAAGGAAAAGAAGCCACAAG;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=63;WE=38077669;WS=38077651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr19	38135403	rs2972458	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=12;PP=1173;SC=CCACTGCACTTCAGCCTGGTG;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=38135411;WS=38135393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	38135444	rs71298747	C	CAAAAAG	6376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=39;PP=2906;SC=TGGAAAAAAACAAAGACAGCC;SOR=1.441;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=79;WE=38135452;WS=38135434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	38138887	rs2290999	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TCCATTCCTATATGCAACTCC;SOR=0.204;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=38138895;WS=38138877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	38161070	rs73037036	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=68;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CTGATGTTTCATATGATTTGT;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=38161078;WS=38161060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr19	38184262	rs17246792	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=397;ReadPosRankSum=0.851;SC=GAGGGTTTCCCGGTGGCCCTC;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=23;WE=38184270;WS=38184252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr19	38189440	rs958305	T	C	8197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=0.979;SC=TTCAAAGGGTTTCTTACCACT;SOR=0.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=101;TCR=147;TR=248;WE=38189448;WS=38189430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,293:1.00:294
chr19	38189616	rs2075284	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=31;PP=1279;SC=GTTTCTCTCCTGTATGAATTC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=38189624;WS=38189606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	38190845	rs5827990	GT	G	113	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=3;PP=141;SC=AAATGTCAATGTTATTGTAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=38190853;WS=38190835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	38202515	rs12461753	G	A	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr19	38202515	.	GA	AC	889	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=34;NR=21;PP=889;QD=17.1357795429;SC=ACTTACATAGGACATGGTTTG;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=55;WE=38202524;WS=38202505;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:68,55:0.45:123
chr19	38202516	rs2909097	A	C	5348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=51;PP=1213;SC=CTTACATAGGACATGGTTTGA;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=122;WE=38202524;WS=38202505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	38229378	rs1291	G	A	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=31;PP=2227;SC=TGGCGCGCTCGTACTCTTTAC;SOR=1.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=105;WE=38229386;WS=38229368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	38229824	rs3095726	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=17;PP=885;SC=TAGGGTTTCATACCAGTATGA;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=38229832;WS=38229814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	38230720	rs3752365	C	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=439;ReadPosRankSum=-0.103;SC=AAAGGCCTTCCCACACTGCCT;SOR=1.230;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=23;WE=38230728;WS=38230710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr19	38315089	rs117840276	G	A	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=1145;ReadPosRankSum=1.733;SC=CTTCCATGGCGTCTGTGGCCT;SOR=1.005;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=71;WE=38315097;WS=38315079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,87:0.46:188
chr19	38375666	rs73027451	C	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=963;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GATCCCATACCGGGCAATGCC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=62;WE=38375674;WS=38375656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr19	38376485	rs10408510	T	A	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=1061;ReadPosRankSum=0.999;SC=AATGGCTTCATGTTTGGCCAG;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=63;WE=38376493;WS=38376475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
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chr19	38382328	rs953370	C	T	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1373;ReadPosRankSum=2.060;SC=AAGAAAAAGCCGGCTTTTCAT;SOR=0.691;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=229;TCF=105;TCR=124;TR=93;WE=38382336;WS=38382318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,115:0.41:280
chr19	38384421	rs3894129	C	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.08;MQRankSum=1.126;NF=28;NR=26;PP=911;ReadPosRankSum=0.642;SC=GTCCAGAATGCCTATGAGTCT;SOR=0.642;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=54;WE=38384429;WS=38384411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,60:0.45:134
chr19	38621473	rs861304	G	A	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=45;PP=1194;SC=CTGGCATGAGGCCTCCCTGGC;SOR=2.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=56;WE=38621481;WS=38621463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	38633159	rs2304132	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=0.054;SC=CCTCCCAGGGCAGGGGTACCC;SOR=1.781;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=12;WE=38633167;WS=38633149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	38652993	rs332864	C	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=419;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GCAAAGATTCCCCCAACAGGC;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=30;WE=38653001;WS=38652983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr19	38696708	rs74573108	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr19	38696714	rs10419131	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	38708329	rs2304174	A	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=13;PP=573;SC=TCAGCCAGAGACCTGAGCAGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=38708337;WS=38708319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	38708398	rs2304175	A	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=31;PP=1236;SC=GTCTCTGGGCACCCCTCTCTC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=38708406;WS=38708388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	38709532	rs2288907	C	G	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=42;PP=2726;SC=AGGGGTGAGACGAAGCCATGC;SOR=1.422;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=85;TCR=42;TR=127;WE=38709540;WS=38709522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	38709552	rs2288909	C	T	5149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=0.827;SC=CAGCGGGGGTCCCCCAGAGGT;SOR=0.355;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=154;WE=38709560;WS=38709542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,194:0.99:195
chr19	38709568	rs2255456	C	T	6080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=75;PP=2965;SC=GAGGTGGGCCCACCTGACAGT;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=176;WE=38709576;WS=38709558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	38817110	rs7250755	A	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=703;SC=AGGATCACTTAGGTCCAGGAG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=38817118;WS=38817100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	38849967	rs150469402	G	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=320;SC=GGTTTGGGGTGGGGGGCGGGA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=38849975;WS=38849957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	38855629	.	A	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=845;ReadPosRankSum=0.099;SC=CCAAGCCTGGAGGGGAGGGTG;SOR=1.214;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=49;WE=38855637;WS=38855619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr19	38861333	rs1052375	G	A	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=79;PP=2527;SC=CGAGCATGCCGTCTCTGAGAC;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=132;WE=38861341;WS=38861323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	38877997	rs62123482	G	T	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=49;PP=1443;SC=TTGATCTAATGCGTCCGCACC;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=62;WE=38878005;WS=38877987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	38935280	rs2229139	A	G	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=37;PP=2091;SC=TGCAGACACTATGGAACATGA;SOR=1.222;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=99;WE=38935288;WS=38935270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	38935350	rs35018208	T	TC	5853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=77;PP=2975;SC=TAAATGGAGATCCCCCCAAAA;SOR=0.825;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=95;WE=38935358;WS=38935340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr19	38939408	rs10406027	T	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=36;PP=932;SC=TCACCTATGCTGCTCCAGACC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=38939416;WS=38939398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	38939505	rs4476278	T	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=219;SC=ATCGCTTGAGTCCAGGAGGTC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=38939513;WS=38939495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	38942714	rs4802469	G	A	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=187;SC=GGATCGCTTGGGCCCAGGAGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=38942722;WS=38942704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	38943728	rs12460768	G	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=13;PP=325;SC=GGGCCACGGCGCTGGGCGGGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=38943736;WS=38943718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	38945851	rs7254832	T	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=31;PP=1412;SC=CCTATTGTGATGCCTCTTATT;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=38945859;WS=38945841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	38946182	rs2288888	G	A	4967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=93;PP=2965;SC=TGGAGGCCTCGTCTGGTAGGA;SOR=1.034;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=71;TCR=93;TR=164;WE=38946190;WS=38946172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	38946215	rs2288889	G	C	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=83;PP=2434;SC=GTGGGACAGAGGCTTGTGGGA;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=131;WE=38946223;WS=38946205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	38948356	rs2071085	T	C	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=58;PP=1984;SC=ATGGATGTCCTTTCCTTAATC;SOR=1.261;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=93;WE=38948364;WS=38948346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	38948420	rs73044990	C	G	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=990;SC=TGGCCCCACTCTCCCTTGGCA;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=38948428;WS=38948410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	38949904	rs3745847	C	T	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=43;PP=1452;SC=ACGGCTGCCCCGTGCAGGGTG;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=86;WE=38949912;WS=38949894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	38950947	rs2304147	C	T	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=705;SC=GCTTCCATGTCCCCCACTGAC;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=38950955;WS=38950937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	38953996	rs2304148	A	G	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=43;PP=2420;SC=GTGTTCTTGGAAAGAGGGGTC;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=118;WE=38954004;WS=38953986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	38955202	rs143827627	A	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=0.931;SC=GGAGCTGGAGACCCTGAGGCC;SOR=2.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=9;WE=38955210;WS=38955192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr19	38956726	rs45585535	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=0.357;SC=CTACCATGCCCGCAGGTATAT;SOR=0.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=34;WE=38956734;WS=38956716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,42:0.41:103
chr19	38956803	rs2228069	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CGGCGCAGACGACACTGGTGG;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=86;WE=38956811;WS=38956793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,107:0.58:183
chr19	38956839	rs2228070	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=655;ReadPosRankSum=0.492;SC=ATGGGCACAACGTGTGGGCCC;SOR=0.422;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=53;WE=38956847;WS=38956829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,69:0.40:171
chr19	38959680	rs11083462	C	T	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GCTGTATGATCGACCTCACAG;SOR=0.571;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=90;WE=38959688;WS=38959670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,101:0.45:224
chr19	38968225	rs77702866	G	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=405;ReadPosRankSum=0.375;SC=GGGGGACTCAGATCCAACAAC;SOR=1.244;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=26;WE=38968233;WS=38968215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr19	38985308	rs75563090	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATCCCCTTGGGTAATGAATAC;SOR=0.407;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=20;WE=38985316;WS=38985298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr19	38990336	rs2228071	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.757;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr19	38990345	rs2229147	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr19	38990676	rs2234709	C	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=0.752;SC=TGAGCCAGGGCAGGATGGGAA;SOR=1.044;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=25;WE=38990684;WS=38990666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr19	38991640	rs2960323	C	G	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GGTGAGCAACCCTGCCCAGCC;SOR=0.337;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=66;WE=38991648;WS=38991630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,77:0.73:106
chr19	38993372	rs1469695	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=714;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CTGCAGGTGGAGCGGGGCAGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=38;WE=38993380;WS=38993362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr19	38993448	.	GGGAGGA	G	268	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.75;NF=7;NR=0;PP=268;QD=39.7142857143;SC=CAGGGGCAGGGGGAGGAGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=38993461;WS=38993438;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,7:0.33:21
chr19	38993547	rs2229142	C	T	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.940;NF=68;NR=26;PP=1372;ReadPosRankSum=-0.055;SC=TGCTGCAGCACCTGTTGCGCC;SOR=0.896;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=198;TCF=139;TCR=59;TR=94;WE=38993555;WS=38993537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,105:0.45:231
chr19	38993638	rs1469699	A	G	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTAGCATCTCATTTCCAGGCC;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=95;TCR=125;TR=106;WE=38993646;WS=38993628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,116:0.46:254
chr19	38994910	rs2229144	G	A	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=620;ReadPosRankSum=1.026;SC=GCCTACCCACGGGCTGGGCCA;SOR=0.415;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=38;WE=38994918;WS=38994900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr19	38995152	rs2915949	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=0.475;SC=TTGAGGCTTCGATTTGGAGGT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=38995160;WS=38995142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	38995355	rs10532729	ACCT	A	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.033;NF=9;NR=4;PP=484;ReadPosRankSum=0.832;SC=GCTTATAGCGACCTCCTACCC;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=38995365;WS=38995345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr19	38995438	rs2960340	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.904;NF=33;NR=20;PP=754;ReadPosRankSum=0.757;SC=TGTGCGCCATTGCCGGGGCTC;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=53;WE=38995446;WS=38995428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
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chr19	38995975	rs2915952	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=228;ReadPosRankSum=-0.620;SC=CCTATGGAGAGAACATAGACG;SOR=0.257;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=19;WE=38995983;WS=38995965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
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chr19	38997459	rs2915958	G	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.572;NF=9;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=0.964;SC=TCTGGTCTTTGCCTCCCCAGG;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=22;WE=38997467;WS=38997449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr19	38997609	rs2915959	T	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GGGTTGGGGCTCCCGCGGAAG;SOR=2.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=38997617;WS=38997599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr19	38997679	rs2960347	G	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GAGGGGTGGAGCCGAGAGGAA;SOR=1.170;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=38997687;WS=38997669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	38998497	rs5828009	G	GC	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.910;NF=0;NR=12;PP=391;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GCTTATGCCCGCCCCACCTGC;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=38998505;WS=38998487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr19	39002725	rs2071089	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=727;ReadPosRankSum=-1.447;SC=CAGACGCCCCAGCTGTGGTCA;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=51;WE=39002733;WS=39002715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,57:0.42:137
chr19	39010023	rs2229145	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TGGTGCGGGACGAGTTCTCTG;SOR=0.280;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=28;WE=39010031;WS=39010013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
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chr19	39018161	rs112541479	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=0.960;SC=AAACAAAAAGATGAAGAAGAA;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=19;WE=39018169;WS=39018151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr19	39018280	rs2960354	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=839;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CTTCTTCCTCCCTTCAGGTCG;SOR=0.502;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=53;WE=39018288;WS=39018270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr19	39028759	rs2071091	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CTCTGGAGGCTGGGCGCAGTG;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=39028767;WS=39028749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	39034322	rs45555835	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=750;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CCCCTGGGGCGGGAGTGGGAA;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=48;WE=39034330;WS=39034312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr19	39056291	rs113579185	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=152;ReadPosRankSum=-0.190;SC=GGGCGGTGGCCGTGACCGATG;SOR=0.136;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=11;WE=39056299;WS=39056281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr19	39061169	rs111512034	C	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=352;ReadPosRankSum=1.753;SC=ACTTTGATTGCAGGTAAATGA;SOR=1.603;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=23;WE=39061177;WS=39061159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr19	39061258	rs35959206	C	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=447;ReadPosRankSum=-0.692;SC=ACTACCTGTCCCGGAACTTTT;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=30;WE=39061266;WS=39061248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
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chr19	39077895	.	AAT	A	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.98;NF=2;NR=0;PP=44;QD=26.5;SC=CCTGTCTAAAAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=2;WE=39077904;WS=39077885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
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chr19	39196736	rs11553600	G	A	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=2522;ReadPosRankSum=-1.480;SC=AGACAGCCCCGTATAAGAACG;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=79;WE=39196753;WS=39196726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
chr19	39196745	rs3745859	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=1336;ReadPosRankSum=1.385;SC=CGTATAAGAACGTCAATGTGC;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=43;WE=39196753;WS=39196726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,55:0.36:154
chr19	39212392	rs77822825	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=709;ReadPosRankSum=-1.521;SC=AGACTGGTGGCGGCAGCACGC;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=44;TCR=73;TR=49;WE=39212400;WS=39212382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,62:0.43:145
chr19	39215333	rs3786851	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=176;ReadPosRankSum=0.859;SC=TTCTCACCACCCAGGGGCCGT;SOR=0.321;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=10;WE=39215341;WS=39215323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr19	39219780	rs1136956	T	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=738;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CTTCAAGGTCTTAGCAGGGGA;SOR=0.730;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=48;WE=39219788;WS=39219770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,60:0.50:119
chr19	39221715	rs141208726	CCCATGCCCCA	C	1340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.666;NF=6;NR=14;PP=2973;ReadPosRankSum=1.071;SC=ACCCCTTCCCCCCATGCCCCA;SOR=0.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=20;WE=39221732;WS=39221705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr19	39224413	rs4801861	A	G	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=64;PP=2374;SC=CGAACTTGTTAAATATGGCCT;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=117;WE=39224421;WS=39224403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	39227107	rs202243527	TTTGACCAAGCCCCAGGGCAGG	T	707.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=5.477;NF=3;NR=6;PP=490;ReadPosRankSum=-0.841;SC=CCCAGGGCAGTTTGACCAAGC;SOR=0.152;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=9;WE=39227135;WS=39227097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr19	39228244	rs73038948	T	C	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=752;ReadPosRankSum=0.786;SC=ATCTGCACGGTGTCGAAATGG;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=57;WE=39228252;WS=39228234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr19	39228868	rs34488364	G	GCA	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=86;SC=GAACCCCTTGGCAGAGACCCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=39228876;WS=39228858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	39233146	rs936524	A	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=59;PP=1909;SC=GGGAGGCGGCAGCTGCAAGGA;SOR=1.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=80;WE=39233154;WS=39233136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	39234511	rs4802775	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CCCAGGAGTCCATGCCTCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=10;WE=39234519;WS=39234501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	39299280	.	A	AAAAG	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	39306425	rs2075588	A	C	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=981;ReadPosRankSum=-1.471;SC=ATAAAGCATGAGAGCACCCTG;SOR=0.823;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=197;TCF=92;TCR=105;TR=76;WE=39306433;WS=39306415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,88:0.38:230
chr19	39307925	rs2287953	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=134;ReadPosRankSum=0.174;SC=ACCTGGGGAGCACCCGAGCAG;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=9;WE=39307933;WS=39307915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr19	39322087	rs9419	T	G	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=49;PP=1228;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TCCGGAAGCCTCCTCTTGTGC;SOR=1.063;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=54;TCR=99;TR=73;WE=39322095;WS=39322077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,87:0.47:187
chr19	39328145	rs2278010	A	C	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=735;ReadPosRankSum=0.038;SC=GGGGAAAAGTAAAGGTTTTAG;SOR=0.654;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=45;WE=39328153;WS=39328135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr19	39334811	rs2278011	T	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=-0.966;SC=TACCCCAGAGTGTGATAAGGA;SOR=1.085;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=20;WE=39334819;WS=39334801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr19	39334830	rs2278012	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=0.266;SC=GACAAGGTAGCACCCCAAGAC;SOR=0.986;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=18;WE=39334838;WS=39334820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr19	39338125	rs862454	G	A	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1067;ReadPosRankSum=0.622;SC=ACAAGATGACGCCCCACTGGC;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=64;WE=39338133;WS=39338115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,77:0.45:170
chr19	39338142	rs862455	A	G	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TGGCCTCTGTACTGTTGTAGA;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=58;WE=39338150;WS=39338132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,70:0.46:153
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chr19	39360720	rs8110393	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=724;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GGCGGGGGCGGGGCTCTGCCC;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=41;WE=39360728;WS=39360710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
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chr19	39380031	rs11083483	A	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=956;ReadPosRankSum=0.364;SC=GCTGAGATTCACACCCAGGCA;SOR=0.338;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=57;WE=39380039;WS=39380021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,66:0.64:103
chr19	39381338	rs58117317	GAA	G	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=1.003;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
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chr19	39384230	rs145562881	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GGATGTCTCCGGCACCCTGGC;SOR=0.148;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=22;WE=39384238;WS=39384220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr19	39385307	rs138613379	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.34;ReadPosRankSum=2.111;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr19	39385532	rs10410544	T	C	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CTCTCTGCCCTCAGATCCGGG;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=90;WE=39385540;WS=39385522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,107:0.45:237
chr19	39395634	rs111943225	C	G	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1418;ReadPosRankSum=0.330;SC=TTTGCCCTCTCACCCCGGTCT;SOR=0.632;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=104;TCR=60;TR=87;WE=39395642;WS=39395624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,96:0.51:188
chr19	39396013	rs201990071	C	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.976;NF=44;NR=31;PP=1098;ReadPosRankSum=1.712;SC=CCGCCCCCGGCGCCCCAGGGA;SOR=0.524;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=75;WE=39396021;WS=39396003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,82:0.49:166
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chr19	39406442	rs11670675	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=926;ReadPosRankSum=3.264;SC=CCTCCCCGGCGCTGAGCTGCC;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=57;WE=39406450;WS=39406432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,65:0.63:103
chr19	39407014	rs4801945	C	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.214;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=-0.013;SC=GCAAGAGGAACAAATGGAAAC;SOR=0.213;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=19;WE=39407022;WS=39407004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr19	39408360	rs7508411	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GCCCCTCTCCACACCGGAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=12;WE=39408368;WS=39408350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr19	39408688	rs4803034	C	G	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=827;ReadPosRankSum=-0.133;SC=GGAGGGAAGACTGATTGTCAC;SOR=0.885;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=55;WE=39408696;WS=39408678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,74:0.51:146
chr19	39409236	rs11083489	C	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=0.446;SC=TTTTACAGTCCCAACCCCAGC;SOR=0.934;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=19;WE=39409244;WS=39409226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr19	39416966	rs4803045	GA	TT	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=406;ReadPosRankSum=-2.181;SC=GAGAAAAGGAGATGAAGCAGC;SOR=0.905;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=14;WE=39416975;WS=39416956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr19	39421388	rs730078	A	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TTGGACCGGGAACAAGGCGGC;SOR=0.362;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=24;WE=39421396;WS=39421378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr19	39433299	rs8113389	A	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=25;PP=1201;ReadPosRankSum=-1.095;SC=CAAGGGCGCCATAGTGCCCCA;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=104;TCR=49;TR=82;WE=39433307;WS=39433289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr19	39433497	rs11313800	GT	G	598.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=557;ReadPosRankSum=-2.378;SC=TCCTGCGCTAGTTTGCTGGGG;SOR=1.051;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=39433507;WS=39433487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
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chr19	39435485	rs10416055	G	A	263.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5739;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=1.608;SC=AGAAGGGCTCGATACTTCTTA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=39435493;WS=39435475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr19	39441046	rs78365239	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TTGTCCCCCAGGGCGCAAGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=39441054;WS=39441036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	39522891	rs3848623	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GGCCCGGCTGTGGCTGCGGGA;SOR=1.042;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=11;WE=39522899;WS=39522881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr19	39589334	rs560364	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=916;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TTGAGGAGGAGTGGGAAGAGG;SOR=1.222;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=61;WE=39589342;WS=39589324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,65:0.45:145
chr19	39589869	.	CG	C	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=62;QD=31.0;SC=GCGCGCGGGTCGGGGGCGGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=39589877;WS=39589859;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr19	39590955	rs8110736	G	A	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1424;ReadPosRankSum=2.169;SC=CCAGCCTGCCGTACATGACAT;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=180;TCF=83;TCR=97;TR=91;WE=39590963;WS=39590945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,105:0.49:215
chr19	39734220	rs4803217	C	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.939;NF=18;NR=7;PP=386;ReadPosRankSum=-0.296;SC=ATAAATTAAGCCAAGTGGCTA;SOR=0.411;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=25;WE=39734228;WS=39734210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr19	39734923	rs11881222	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=274;ReadPosRankSum=0.288;SC=GTGGTCAGGTAGGAGCAGAGG;SOR=0.515;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=16;WE=39734931;WS=39734913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr19	39735106	rs8103142	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.546;NF=3;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=-1.303;SC=GGAGCGGCACTTGCAGTCCTT;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=14;WE=39735114;WS=39735096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr19	39735644	rs28416813	C	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.450;NF=17;NR=19;PP=554;ReadPosRankSum=1.688;SC=TGAGGGAATGCAGAGGCTGCC;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=36;WE=39735652;WS=39735634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr19	39745695	rs35963157	G	GC	3553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.984;NF=23;NR=48;PP=2741;ReadPosRankSum=-1.650;SC=TGCCACACTTGCACGAGACAC;SOR=0.677;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=182;TCF=68;TCR=114;TR=71;WE=39745703;WS=39745685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,118:0.44:271
chr19	39760069	rs30481	G	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=871;SC=TCTCTATCCTGCTCCCCAACC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=39760077;WS=39760059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	39789115	rs30461	A	G	5988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.632;SC=GGCCGATGGGAACCTGTGTCT;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=404;TCF=205;TCR=199;TR=219;WE=39789123;WS=39789105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,275:0.53:516
chr19	39804554	rs12979175	G	A	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1027;ReadPosRankSum=3.013;SC=CCCTGGGACTGCAGCACCCGC;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=75;WE=39804562;WS=39804544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,92:0.52:177
chr19	39819527	.	C	A	191	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=58.41;NF=9;NR=2;PP=191;QD=20.5246556861;SC=TTTAAAAAAACAAAAACAAAA;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=11;WE=39819535;WS=39819509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,11:0.31:36
chr19	39819802	rs28668750	G	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=25;ReadPosRankSum=-0.819;SC=CCTGCAGCTTGCCAAGGGTCC;SOR=0.148;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=39819810;WS=39819792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	39826597	rs251905	A	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=196;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CTTCCCATAGAACCCCTGGCC;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=19;WE=39826605;WS=39826587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr19	39826838	rs251906	C	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ACCAGGGTTCCAAAGCTTCCT;SOR=3.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=39826846;WS=39826828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr19	39869047	rs73547916	T	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=0.072;SC=CCAGCCTGAGTCTCCTGTTCC;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=39869055;WS=39869038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr19	39870486	rs57479776	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCTGGGATTACAGCTTGAGCC;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=10;WE=39870494;WS=39870476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr19	39877605	rs59446951	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.146;SC=GCTCAAGGTATTGAGGGCAGG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=39877613;WS=39877595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr19	39900425	.	GGGGC	G	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
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chr19	39913634	rs10407035	G	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1127;ReadPosRankSum=0.678;SC=ATTCCCAGCCGCTGTGAAATT;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=73;WE=39913642;WS=39913624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,93:0.49:189
chr19	39914308	rs31725	C	T	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=46;PP=2051;SC=GGTCCGGGTACGTGGTTGGCA;SOR=0.932;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=39914316;WS=39914298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	39914748	rs31726	G	A	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=107;PP=2965;SC=CCTGAGCATAGAAGTCACATG;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=107;TCR=107;TR=214;WE=39914756;WS=39914738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	39915637	rs31727	G	A	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=34;PP=1236;SC=ATATCAGCCAGAGCCTGGCTC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=39915645;WS=39915627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	39915733	rs138077206	C	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=615;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTTCGCCGCCCCCCCAGCCCC;SOR=0.856;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=39;WE=39915741;WS=39915723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr19	39915758	rs31728	C	G	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=33;PP=1489;SC=ACCACCTCCCCCAGCCAGGCG;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=39915766;WS=39915748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	39916110	rs16746	GGGA	G	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=646;SC=GGATGGGGAAGGGAGGAATGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=39916120;WS=39916100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	39924129	rs566130	T	C	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=59;PP=2965;SC=CACACACCCATCTACCTCATG;SOR=1.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=105;TCR=59;TR=164;WE=39924137;WS=39924105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr19	39926509	rs17628	A	C	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=43;PP=1219;SC=AGACCTGCACAGACTGCAGCG;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=39926529;WS=39926499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	39926521	rs17626	G	A	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=40;PP=1193;SC=ACTGCAGCGGGCCCTTGGACG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=39926529;WS=39926499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	39932023	rs1865090	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=366;ReadPosRankSum=1.343;SC=GGAGGGACCATCTATGGGAAC;SOR=0.105;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=25;WE=39932031;WS=39932013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr19	39932066	rs1865091	T	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=607;SC=CTGCTGGATCTCCTGGGGTCC;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=39932074;WS=39932056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	39936502	rs1932	G	A	6634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=90;PP=2965;SC=ACGCGCCAAGGCTGCTGTCTT;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=106;TCR=90;TR=196;WE=39936510;WS=39936492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	39936693	rs2116932	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=647;SC=GAGGGGTTCACAGCGGGCTCT;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=39936701;WS=39936683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	39944082	rs1130180	C	T	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=33;PP=1393;SC=AGGAGGAATACGATGAGGAAG;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=75;WE=39944090;WS=39944072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	39948871	.	CCCACCA	C	202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=202;QD=103.0;SC=TCTGCCCTCGCCCACCACCAC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=2;WE=39948884;WS=39948861;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr19	39949764	rs1529733	C	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=802;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GGTCCCTAAGCGGGAAGGGGC;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=57;WE=39949772;WS=39949754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
chr19	39955533	rs2304217	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=772;ReadPosRankSum=-1.777;SC=AGGCCATTGAGGGGGTGGGCA;SOR=0.503;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=49;WE=39955541;WS=39955523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr19	39957232	rs57236251	TGG	T	1444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.714;NF=20;NR=10;PP=702;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ATCTGTGGCCTGGGGGGGAGG;SOR=0.784;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=30;WE=39957241;WS=39957222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr19	39957472	rs8103333	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=457;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CAGGGGTGGCCCCGCCACAGG;SOR=1.839;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=24;WE=39957480;WS=39957462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr19	39963415	rs74921826	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=626;ReadPosRankSum=-0.968;SC=TGGGCACAGCCGTGGGGGACC;SOR=1.106;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=39;WE=39963423;WS=39963405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr19	39963828	rs45568533	T	A	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1120;ReadPosRankSum=0.652;SC=CCCCATTTGTTCTCTGCGTCC;SOR=0.360;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=137;TCF=81;TCR=56;TR=72;WE=39963836;WS=39963818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
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chr19	39978610	rs74178079	GTGTA	G	1995.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-3.902;NF=33;NR=16;PP=2577;ReadPosRankSum=0.322;SC=GTGTGATGCTGTGTATGTATG;SOR=2.483;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=49;WE=39978621;WS=39978600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr19	39990245	rs3212275	G	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TCCCAGACCAGTAACTCTACC;SOR=0.204;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=4;WE=39990253;WS=39990235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr19	39991237	rs2304223	C	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=442;ReadPosRankSum=0.965;SC=TCATCTCCCCCTTCCTTCACC;SOR=0.571;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=40;WE=39991245;WS=39991227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,58:0.37:155
chr19	39993415	rs2278440	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=-2.025;SC=CATGTTCGGCCGGGCCCACCC;SOR=0.454;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=22;WE=39993423;WS=39993405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr19	39993560	rs8107127	T	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GAGCTGCGCTTCTCGTACCGC;SOR=0.275;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=10;WE=39993568;WS=39993550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	39993591	rs8106337	C	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=2.065;SC=AGCCGCCTGCCGTCGGGACCG;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=5;WE=39993599;WS=39993581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	39994711	rs1110627	T	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=16;PP=955;SC=TCCCCCATAGTGGTGTGCCGA;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=39994719;WS=39994701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	39996027	rs2304214	C	T	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1174;ReadPosRankSum=0.349;SC=ACTGCCCACCCGGTTTCCAAG;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=77;WE=39996035;WS=39996017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,97:0.51:190
chr19	39998431	.	TAA	T	777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.525;NF=10;NR=7;PP=592;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TCTGAGAATTTAAAGAGTCTG;SOR=0.752;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=17;WE=39998440;WS=39998421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr19	40009396	rs56149652	A	G	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1308;ReadPosRankSum=-2.422;SC=CTACTGAAAAAGAGCCTGGAG;SOR=0.810;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=84;WE=40009404;WS=40009386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,105:0.61:173
chr19	40009683	rs4802034	C	T	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GGTGGGAGACCTGTGTGCTTT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=44;TCR=84;TR=62;WE=40009691;WS=40009673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr19	40023308	rs1123301	A	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=54;PP=2144;SC=GGCCTTCCCGAGCCTCCTGCA;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=94;WE=40023316;WS=40023298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	40030654	rs76765165	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=11;PP=472;SC=CCGCCTGCGGGACGTCTCTGT;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=40030662;WS=40030644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	40093111	rs3764843	C	A	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=26;PP=2432;SC=GAATGAAGCCCGAGGGCAAGG;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=81;TCR=26;TR=107;WE=40093119;WS=40093101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	40096127	rs2233709	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=382;SC=CAGGGTCCATCTCCCATAACT;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=40096135;WS=40096117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	40149297	rs1860134	T	A	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=66;PP=2010;SC=TACGTGTGTCTCAATGAGTAT;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=40149305;WS=40149287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	40174236	rs7258833	G	A	7161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=115;PP=2965;SC=GCAACTCCAAGGAGAAACTGG;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=97;TCR=115;TR=212;WE=40174244;WS=40174226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr19	40197507	rs116947325	C	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.355;SC=AGCCACGGAACCTAGGGGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=40197515;WS=40197497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	40197924	rs4830	T	C	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=38;PP=1578;SC=CATGAACAGTTGTGTGTTTGG;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=89;WE=40197932;WS=40197914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	40199914	rs10755	C	G	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=48;PP=2051;SC=TGCAAGTCTTCAGAGATATCT;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=40199922;WS=40199904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	40224833	rs375867	A	T	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=544;SC=CCGGGGACAGAGGGAGTTATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=40224841;WS=40224823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	40224869	rs391646	T	A	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=888;SC=AAGAGCTGCCTCCTGCTCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=40224877;WS=40224859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	40224887	rs391660	T	C	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=1126;SC=TGAGATCCCATGGAAGCCGGG;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=40224909;WS=40224877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	40224901	rs453827	G	A	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=23;PP=1548;SC=AGCCGGGTGCGGGGAGCTCCT;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=75;WE=40224909;WS=40224877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	40224986	rs384138	A	G	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=57;PP=2717;SC=GAAAGGGCATATTCTTGGATT;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=128;WE=40224994;WS=40224976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	40225168	rs399641	T	A	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=36;PP=991;SC=AGCAGGTCCCTTTCTTGTGGG;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=40225176;WS=40225158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	40225646	rs17608	G	A	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=52;PP=1814;SC=CAAGAAACAGGCAAGTGGTCG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=95;WE=40225654;WS=40225636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	40318086	rs12977762	A	G	8848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr19	40318086	.	AG	GA,GG	1927	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=45,103;NR=49,105;PP=1385,1927;QD=15.3028497326;SC=GCAGGGGTCAAGGTCATCAGG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=214;TCF=105;TCR=109;TR=94,208;WE=40318095;WS=40318076;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:214
chr19	40318087	rs56110449	G	A	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
chr19	40327312	rs3760924	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=430;ReadPosRankSum=1.569;SC=ACCATTGCTAAGGAGAAAGGA;SOR=0.509;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=25;WE=40327320;WS=40327302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr19	40328327	rs649908	C	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CCTACCCCACCGGGGCCACCC;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=9;WE=40328335;WS=40328317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr19	40328615	rs616650	C	T	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=140;SC=ATGACTATTGCTATCATGTCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=40328623;WS=40328605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	40330874	rs148300955	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=292;ReadPosRankSum=0.132;SC=AGTTCTCACCGAAATCGAGAC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=17;WE=40330882;WS=40330864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr19	40337080	rs11881344	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=1.218;SC=CCCCCGGGCCCCTTCCCCGCC;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=40337088;WS=40337070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr19	40360845	rs3760929	C	T	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=967;ReadPosRankSum=2.499;SC=CCACCCCAAGCCCCTACTCAC;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=68;WE=40360853;WS=40360835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,84:0.54:157
chr19	40360928	rs1053686	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=667;ReadPosRankSum=-1.322;SC=AAAGCAGGAAGCGGTCGTCGC;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=45;WE=40360936;WS=40360918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr19	40362573	rs10422312	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=20;NR=6;PP=484;SC=GTGGGAGAAGAAGTTGTGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=40362581;WS=40362563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	40364280	rs113103150	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=467;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGGCCCACGGGTACGCAGGTG;SOR=0.682;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=35;WE=40364288;WS=40364270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr19	40366362	rs3855679	G	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=26;PP=1084;SC=CCACAGCCTTGAGGTCGTCTG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=40366382;WS=40366352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	40366374	rs2053089	G	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.817;NF=10;NR=14;PP=352;ReadPosRankSum=0.215;SC=GGTCGTCTGCGGGGTCCTGGT;SOR=0.981;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=24;WE=40366382;WS=40366352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr19	40367862	rs6508920	T	C	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.75;QD=22.09;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	40367998	.	C	CAGAG	311.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=281;SC=TGGGAGGAGACAGAGATACTA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=40368012;WS=40367988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	40368004	.	T	C	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=145;SC=GAGACAGAGATACTAGGGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=40368012;WS=40367988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	40368274	.	C	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=24.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQRankSum=-4.742;QD=25.96;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr19	40368280	rs62106924	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=11.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.94;MQRankSum=-5.244;QD=23.27;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr19	40368391	rs76288738	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQRankSum=-1.044;QD=1.06;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,21:0.17:126
chr19	40368395	rs28472548	C	T	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.979;NF=34;NR=46;PP=1569;ReadPosRankSum=-1.275;SC=AAGAATGTCACGGTCCCCACC;SOR=0.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=80;WE=40368403;WS=40368381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,87:0.69:126
chr19	40368498	rs12610683	AA	CC	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=17;PP=1062;SC=GTGCCAGATGAAAGGGGTCCG;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=25;WE=40368507;WS=40368488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	40368520	rs36079378	G	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=414;SC=AGAAGCCAGGGCCCTCGTACT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=40368528;WS=40368510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	40373889	.	CCA	TTG	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQRankSum=1.077;QD=17.15;ReadPosRankSum=3.268;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr19	40392359	rs56242719	T	C	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.21;QD=24.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr19	40739513	rs33933140	A	G	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1150;ReadPosRankSum=1.494;SC=TAAAACCTGAATCTCCAACCG;SOR=0.652;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=80;WE=40739521;WS=40739503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,105:0.50:210
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chr19	40788641	rs11880261	T	C	211.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=5;PP=91;SC=TCTGATAAGATGCGGTGGAAG;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=40788649;WS=40788631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr19	41040334	rs1165858	G	A	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=74;SC=GGTATGTCAAGTGGAGGGGAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=41040342;WS=41040324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr19	41071177	rs375958583	AAAAAG	A	161.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=150;SC=TCTCAAAAAAAAAAAGAAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=41071189;WS=41071167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	41072890	rs1165835	C	A	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.04;QD=22.64;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	41075662	rs1165837	G	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=22;PP=612;SC=GGTGGGGATAGGAGGACCCCT;SOR=1.132;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=41075670;WS=41075652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	41077891	rs8101070	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=17;PP=1084;SC=CAGAGTGCTGCGGCTCTGCCT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=41077899;WS=41077881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	41078220	rs1165841	G	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=1022;SC=CCAGATCTCTGAAGTCCTGTG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=41078228;WS=41078210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	41082993	rs35684786	GC	G	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=13;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=60;ReadPosRankSum=0.914;SC=GGGTTGCTCCGCCCCCCCCCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=41083001;WS=41082983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	41117754	rs41470347	C	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=855;ReadPosRankSum=0.270;SC=CATTGGTCCCCTCTGCCCCAG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=56;WE=41117766;WS=41117744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr19	41123093	rs59030801	A	AG	4672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=79;PP=2936;SC=CTCTGTGACCAGGTTACGAGG;SOR=1.719;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=10;TCR=84;TR=89;WE=41123101;WS=41123083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	41128162	rs12979249	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=-1.035;SC=GACAGAGGAGCGTGAGAGGTG;SOR=0.177;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=41128170;WS=41128152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr19	41128415	rs35079932	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=0.548;SC=AGGGCCCTGTGGGGAGTGGGC;SOR=0.970;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=33;WE=41128423;WS=41128405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr19	41133192	rs35809725	A	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=845;ReadPosRankSum=1.345;SC=CGCTGGCCCTATCGGTCCCGG;SOR=0.343;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=56;WE=41133200;WS=41133182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
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chr19	41173880	rs2604901	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.953;NF=12;NR=10;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GCTGTTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=22;WE=41173905;WS=41173870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr19	41173892	rs141662737	CTGCTGT	C	747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.881;NF=7;NR=8;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGTTGCT;SOR=0.891;Source=Platypus;TR=15;WE=41173905;WS=41173870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr19	41174137	rs35172225	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=0.409;SC=GATCAGAGCACGGACTCTGGA;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=12;WE=41174145;WS=41174127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	41179415	.	G	A	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=887;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GGCGCCGGGGGATGGCGGCCG;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=33;TCR=70;TR=53;WE=41179423;WS=41179405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr19	41188890	rs34359675	T	TGG	509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=10;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.655;NF=2;NR=25;PP=285;ReadPosRankSum=-0.954;SC=TTGGAGGGAATGGGGGGGGGG;SOR=1.426;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=27;WE=41188898;WS=41188880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr19	41190561	rs12984927	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.948;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=0.235;SC=GGTCAGATAACAAGATAACTG;SOR=0.208;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=18;WE=41190569;WS=41190551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	41192610	rs112258640	T	TTGAG	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=539;ReadPosRankSum=0.563;SC=ATGTGAGTGTTTGTGACTCTG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=41192625;WS=41192600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr19	41192617	rs59449188	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.327;NF=8;NR=0;PP=517;ReadPosRankSum=1.121;SC=TGTTTGTGACTCTGCACTTGA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=41192625;WS=41192600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr19	41206060	rs36012476	G	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=812;ReadPosRankSum=0.094;SC=CAGACACAGCGTCAGGAGCTG;SOR=0.887;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=53;WE=41206068;WS=41206050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr19	41206208	rs2246095	A	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=358;ReadPosRankSum=0.497;SC=GCCACCAGACAGCATACCTGG;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=25;WE=41206216;WS=41206198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr19	41211056	rs3865452	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=604;ReadPosRankSum=2.699;SC=CTCAAAGATGTGCTGCAGCTG;SOR=0.192;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=50;WE=41211064;WS=41211046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr19	41220529	rs11673492	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=587;ReadPosRankSum=-1.303;SC=CCCCCACCTTCAGCCACATTG;SOR=1.480;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=44;WE=41220537;WS=41220519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr19	41231166	rs7253502	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.783;SC=GTCCCCTTTCGTTCCCTCTCA;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=41231174;WS=41231156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	41251180	rs2369302	T	G	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=917;SC=CTGGGAGTGGTCGTATCCAGG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=41251188;WS=41251170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	41255500	rs2254343	C	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=26;PP=1030;SC=GAAGACATGACGGGGAGCAGG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=41255508;WS=41255490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	41257176	rs1457141	G	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=818;SC=CTCCGTCCTTGCCCCTACTCC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=41257184;WS=41257166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	41265201	rs736625	C	T	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=682;SC=GTGATCTGCTCGCTTTAGCCT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=41265209;WS=41265191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	41269076	rs2305797	T	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTGGGTGGTCTGGGCAGGCCC;SOR=0.490;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=22;WE=41269084;WS=41269066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr19	41283365	rs2233159	C	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=21;PP=600;SC=CCCTCCTTGGCTTTATGCAAA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=41283373;WS=41283355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	41306362	rs11547373	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr19	41312612	rs76443752	G	C	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1169;ReadPosRankSum=0.710;SC=GGGTGGCGCTGGGGCTAGGGC;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=82;WE=41312620;WS=41312602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
chr19	41313202	rs3736329	C	A	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=2008;ReadPosRankSum=-0.641;SC=CTTCTGGAGACGCACCCAGGT;SOR=0.922;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=238;TCF=112;TCR=126;TR=117;WE=41313210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,137:0.50:274
chr19	41316355	rs41530251	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.612;NF=6;NR=26;PP=589;ReadPosRankSum=0.745;SC=ACAGATAACATTGGATACAGC;SOR=1.195;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=32;WE=41316363;WS=41316345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr19	41316370	rs11552615	T	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.605;NF=5;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=0.902;SC=TACAGCATTATCCAGTAGCCG;SOR=0.766;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=26;WE=41316378;WS=41316360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr19	41324832	rs2545773	T	C	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.02;QD=26.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr19	41400913	rs140473451	AAAAC	A	554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=1453;ReadPosRankSum=0.250;SC=AGACAGGCTGAAAACAAACAA;SOR=0.636;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=12;WE=41400924;WS=41400896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr19	41401950	rs4803398	G	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.427;NF=11;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=1.822;SC=CTGCCTTTTCGGGGTGTTAAA;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=16;WE=41401958;WS=41401940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr19	41402162	rs3956342	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr19	41403325	rs7252852	T	C	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.136;NF=27;NR=39;PP=844;ReadPosRankSum=-0.335;SC=ATCCCTAAAGTGCAGAGGAGT;SOR=0.548;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=66;WE=41403333;WS=41403315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,82:0.57:144
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chr19	41416750	rs10419589	T	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=114;SC=ATCTTCCTTTTCCAGCCCCCT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=41416758;WS=41416740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr19	41447492	rs73038475	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.91;QD=43.59;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	41447928	rs3865460	G	A	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=67;PP=2884;SC=CAAGGCTACAGCCTCTCCTGA;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=152;WE=41447936;WS=41447918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	41558800	rs11083604	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.956;NF=30;NR=22;PP=598;ReadPosRankSum=1.411;SC=CCACCGCACCTGGCCTGTTTG;SOR=0.465;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=52;WE=41558808;WS=41558790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr19	41558878	rs56156262	G	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.431;NF=15;NR=29;PP=702;ReadPosRankSum=-2.299;SC=TCGGGAGACAGGCAGCTTGGA;SOR=1.033;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=44;WE=41558886;WS=41558868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr19	41564417	rs12978001	C	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=435;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CCAGGCAAGGCGCCTTGGATG;SOR=1.195;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=22;WE=41564425;WS=41564407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr19	41627330	rs188279309	G	A	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=843;ReadPosRankSum=-0.461;SC=TGCACATCGCGTCTTCCTGAT;SOR=1.004;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=61;WE=41627338;WS=41627320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,67:0.42:158
chr19	41700343	rs338600	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=687;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TGGTAGAGGGCGTAGAAGCTA;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=53;WE=41700351;WS=41700333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,60:0.45:134
chr19	41700493	rs338599	G	C	4937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=91;PP=2965;SC=ACCTGGGACCGTGGCGGCCTG;SOR=1.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=52;TCR=91;TR=143;WE=41700501;WS=41700483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	41703660	rs338594	T	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=201;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GCCGGTCCCTTTTTGAGTCTA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=14;WE=41703668;WS=41703650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr19	41703793	rs57266494	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TGATCCAGGCGGAGGCCCGGT;SOR=0.653;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=25;WE=41703801;WS=41703783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr19	41704304	rs338593	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TGGGTTCAGCTCCAACCTGCT;SOR=1.002;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=19;WE=41704312;WS=41704294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	41704832	rs338592	A	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=37;PP=1106;SC=CTGAATGGGCATGGTGACCTG;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=62;WE=41704840;WS=41704822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	41707094	rs1628289	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=-1.233;SC=TTTACTTCCCAAAGGCTGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=41707102;WS=41707084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr19	41711755	rs338586	G	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=0.163;SC=GATGCCATTAGGTTTTGTGAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=41711763;WS=41711745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	41711815	rs338585	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=538;ReadPosRankSum=0.583;SC=AGGACCAAATGGACTGGGGTG;SOR=1.262;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=32;WE=41711823;WS=41711805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
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chr19	41712268	.	G	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.767;NF=22;NR=15;PP=587;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CTTCTCCCTGGAGAGCCCGTG;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=37;WE=41712276;WS=41712258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
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chr19	41759631	rs3835078	ACCC	A	1280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=12;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=836;ReadPosRankSum=4.507;SC=CCTTTCAGGGACCCCCCCCCC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=21;WE=41759645;WS=41759621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr19	41759637	rs116056574	C	T	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=11;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=806;ReadPosRankSum=4.313;SC=AGGGACCCCCCCCCCCCAACT;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=28;WE=41759645;WS=41759621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr19	41762525	rs2304232	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=552;ReadPosRankSum=0.571;SC=TGGTAGGTGCACTCCCGCCAA;SOR=1.057;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=32;WE=41762533;WS=41762515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr19	41765407	rs4591267	A	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=549;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TCCAGAATGCACCCCTTCTGA;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=38;WE=41765415;WS=41765397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr19	41774064	rs2304230	T	C	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.727;SC=GCCTTCTGGATGCTTTGGTCC;SOR=0.509;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=61;WE=41774072;WS=41774054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,69:0.59:117
chr19	41798111	rs3752705	A	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=545;ReadPosRankSum=1.201;SC=TGCCTATGGCAAGAGTTGGCA;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=43;WE=41798119;WS=41798101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,51:0.43:119
chr19	41798468	rs112745840	GACAC	G	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=4;PP=112;ReadPosRankSum=-1.579;SC=AGACAGAGGAGACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=41798479;WS=41798458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	41807700	rs7248164	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TGGCTCCCCAGTGATTTCTTT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=41807708;WS=41807690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr19	41808432	rs11881940	A	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=291;ReadPosRankSum=1.034;SC=CCTTCTGTCTATGTCTTTCTT;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=23;WE=41808440;WS=41808422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr19	41809995	rs1056854	A	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=932;ReadPosRankSum=-0.070;SC=AACAGCCGCCACCACAGCAGC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=61;WE=41810003;WS=41809985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr19	41825776	rs3826714	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=219;ReadPosRankSum=0.561;SC=CAGTAGCAGGAAGACCCCAGA;SOR=0.392;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=16;WE=41825784;WS=41825766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr19	41838206	rs8179181	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=236;ReadPosRankSum=1.879;SC=GGAGAGACGCGTCAGGGGCAG;SOR=1.525;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=14;WE=41838214;WS=41838196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr19	41858921	rs1800470	G	A	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=57;PP=2030;SC=TAGCAGCAGCGGCAGCAGCCG;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=98;WE=41858929;WS=41858911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	41863777	rs11668109	A	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=555;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CTCAGCCTGGACCCGGGTCCA;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=42;WE=41863785;WS=41863767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr19	41863884	.	C	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=1.533;SC=TGTCCACTTGCGTTTGGCCCT;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=31;WE=41863892;WS=41863874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,39:0.32:120
chr19	41869392	rs2241714	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.489;NF=16;NR=15;PP=425;ReadPosRankSum=0.476;SC=CGCTGGCCCCTATGATCTGCC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=31;WE=41869400;WS=41869382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr19	41869468	rs2241713	G	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.825;NF=10;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=0.117;SC=TGTGAGGTAAGTGTATTATCT;SOR=1.008;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=27;WE=41869476;WS=41869458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr19	41869487	rs3217387	C	CA	720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.890;NF=1;NR=14;PP=588;ReadPosRankSum=0.484;SC=CTCCATTTGACGGGGGGGAAA;SOR=0.663;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=15;WE=41869495;WS=41869477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr19	41889423	rs11880674	A	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	41889429	rs7259900	A	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	41889748	rs12602	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=598;ReadPosRankSum=-1.541;SC=TGACCCTGGCTGCCTACCTTG;SOR=1.157;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=41;WE=41889756;WS=41889738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
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chr19	41897688	rs878083	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=343;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ATATGTATCCGCCAGGAGGGA;SOR=1.675;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=10;WE=41897696;WS=41897664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
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chr19	41928701	rs284653	C	T	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=932;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CCCGTCAGCACCCCCACAGCA;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=61;WE=41928709;WS=41928691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr19	41928724	rs284654	G	A	2543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1022;ReadPosRankSum=0.538;SC=GACAGCCACCGTAGCATCTTC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=73;WE=41928732;WS=41928714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,78:0.46:168
chr19	41928765	rs284655	C	T	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.14;MQRankSum=2.148;NF=42;NR=34;PP=1039;ReadPosRankSum=1.636;SC=CAAAACATGGCCTTATCACCT;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=76;WE=41928773;WS=41928755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,89:0.40:224
chr19	41928867	rs3217385	G	GC	1583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.844;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.154;NF=9;NR=26;PP=1087;ReadPosRankSum=0.237;SC=ACTCCAGGGAGCCCACACTGA;SOR=0.442;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=35;WE=41928875;WS=41928857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,62:0.40:156
chr19	41930396	rs4674	A	G	3808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=68;PP=2024;ReadPosRankSum=-1.495;SC=ACCCCAACCTACTCTTCTCAG;SOR=0.637;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=308;TCF=156;TCR=152;TR=140;WE=41930404;WS=41930386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,183:0.48:384
chr19	41931454	rs113478859	A	AGGCCAGGGCCGG	911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.212;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=1617;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CCAGAGGCCCAGGCCAGGTCA;SOR=1.747;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=12;WE=41931462;WS=41931444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr19	41932084	rs284660	G	T	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=68;PP=1961;ReadPosRankSum=2.064;SC=GGCTCTCCCAGGCCACTAGTG;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=226;TCF=103;TCR=123;TR=120;WE=41932092;WS=41932074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,126:0.51:245
chr19	41932120	rs284661	C	T	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=1748;ReadPosRankSum=1.042;SC=CCGCCTCACCCACCGGAGACC;SOR=0.800;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=195;TCF=88;TCR=107;TR=104;WE=41932128;WS=41932110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,110:0.51:214
chr19	41932275	rs284662	T	C	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=920;ReadPosRankSum=0.930;SC=GAGACTTGGCTGCCACCACCT;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=68;WE=41932283;WS=41932265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr19	41932612	rs284663	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=806;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CGGATGTCCACTCGATGTACA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=59;WE=41932620;WS=41932602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr19	41937095	rs17318596	G	A	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AGAGCTCAGCGCGGCGCCCAA;SOR=0.807;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=195;TCF=118;TCR=77;TR=75;WE=41937103;WS=41937085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,107:0.42:253
chr19	41939297	rs1043413	C	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=815;ReadPosRankSum=2.327;SC=GTCCACGTGGCAGCAGCGCTG;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=48;WE=41939305;WS=41939287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr19	41944237	rs2231940	T	C	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=881;ReadPosRankSum=0.248;SC=CTTCTTCTGATTGCCCTCTGG;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=52;WE=41944245;WS=41944227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr19	41945837	rs13346603	T	A	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=1772;ReadPosRankSum=0.861;SC=AAGGGGCCGGTCTTATCCCAC;SOR=0.678;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=53;WE=41945856;WS=41945827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr19	41945848	rs13344547	G	T	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=1772;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CTTATCCCACGCTCCTGGTTC;SOR=0.878;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=58;WE=41945856;WS=41945827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr19	41945904	rs13344563	G	C	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=601;ReadPosRankSum=-0.858;SC=TTTTCTAACCGTCCTCTTAAA;SOR=0.997;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=43;WE=41945912;WS=41945894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,58:0.45:130
chr19	41949870	rs3745286	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=386;SC=CCCCTTGCTCTCTGGGGTGGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=41949878;WS=41949860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr19	42027514	rs4803476	T	A	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.713;NF=34;NR=41;PP=2674;ReadPosRankSum=0.616;SC=AGTGTATTTTTTGAACAGTGA;SOR=0.467;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=75;WE=42027522;WS=42027490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
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chr19	42127907	rs4803488	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=1.100;SC=GGAATGAGAGGGAAGGATTCC;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=11;WE=42127915;WS=42127897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr19	42128202	rs8111279	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=403;ReadPosRankSum=2.080;SC=AAACCATAAGGGGCATTGCAG;SOR=0.366;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=29;WE=42128210;WS=42128192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr19	42132314	rs1126454	G	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=575;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GTGGGCGGGTGCCAGAAGGTT;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=37;WE=42132322;WS=42132304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr19	42188032	rs34670266	GC	G	1108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.477;NF=2;NR=23;PP=753;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GCCCTGTGTGGCCCCCTTGGT;SOR=0.567;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=25;WE=42188040;WS=42188022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr19	42190859	rs8102488	A	T	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AGGGTATAGAATCCTGCGTCA;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=65;WE=42190867;WS=42190849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
chr19	42212753	rs111973464	A	AGCACAGAGACTG	2165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.775;NF=5;NR=19;PP=2954;ReadPosRankSum=2.960;SC=GGGAGGAGGGAGCTGGGGTCT;SOR=0.752;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=24;WE=42212761;WS=42212743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,55:0.64:86
chr19	42213744	rs10402825	T	C	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.391;NF=56;NR=58;PP=1503;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GGTACAAAGGTGAAAGAGTGG;SOR=0.566;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=219;TCF=102;TCR=117;TR=114;WE=42213752;WS=42213734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,126:0.49:255
chr19	42213772	rs12971352	A	G	4010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQRankSum=-12.963;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,109:0.48:229
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chr19	42213868	rs34155934	A	G	3067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-7.969;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,82:0.46:179
chr19	42213872	rs35091611	T	C	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-7.908;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr19	42221607	rs7249230	A	G	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1752;ReadPosRankSum=-0.829;SC=AATCCAGAACAAATTAAGTGT;SOR=0.820;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=99;TCR=116;TR=104;WE=42221615;WS=42221597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,120:0.49:247
chr19	42265866	rs28547939	C	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=0.800;SC=GCTTTATTCTCTTTCCTCCAG;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=21;WE=42265874;WS=42265856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr19	42265889	rs11548735	G	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=6.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr19	42311060	rs5828129	A	AAAG	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.25;MQRankSum=1.193;NF=14;NR=2;PP=577;ReadPosRankSum=-1.092;SC=GGAGTTGGCCAAATAGGAGAT;SOR=1.051;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=16;WE=42311068;WS=42311054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr19	42313803	rs3795022	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=0.666;SC=GGGTCCTTCCTCTCTGCTCAG;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=42313811;WS=42313793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr19	42313921	rs734107	G	T	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TGAAAATGGGGTTCCCTTCTT;SOR=0.622;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=63;WE=42313929;WS=42313911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr19	42315281	rs899662	G	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=366;ReadPosRankSum=2.637;SC=CTTAGCTTCCGCCAGGAGCTG;SOR=0.575;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=22;WE=42315289;WS=42315271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr19	42315300	rs2008808	G	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=281;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TGCTCCTGTGGGTTGATGGAG;SOR=0.358;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=21;WE=42315308;WS=42315290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr19	42342319	rs2290695	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TAAAGCCCACAACTCCCCTTG;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=15;WE=42342327;WS=42342309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
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chr19	42342923	rs10414356	T	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=686;ReadPosRankSum=0.890;SC=AGAGCAAGCATAACGAAATTG;SOR=0.624;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=42;WE=42342931;WS=42342913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
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chr19	42373893	rs2075751	C	T	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1463;SC=GCCCATACTTCGTCAGGTAGA;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=42373901;WS=42373883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr19	42409336	rs41307033	T	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GCTGGTGTGCTCTCATCACTG;SOR=1.773;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=27;WE=42409344;WS=42409326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr19	42462788	rs1075728	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CCTGGGCGGTGAGAGGAGGGA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=16;WE=42462796;WS=42462778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	42463447	rs735571	C	T	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=84;PP=2965;SC=GCTGCCATGTCTGCGTCGTGA;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=161;WE=42463455;WS=42463437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	42471050	rs919390	G	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=21;NR=11;PP=594;SC=CCTGGGCCTGGGGGACGGGGA;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=32;WE=42471058;WS=42471040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	42489516	rs2217342	A	C	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=823;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GGTTGTCGTGAGTGCAGTCGG;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=50;TCR=71;TR=54;WE=42489524;WS=42489506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,80:0.49:162
chr19	42558629	rs3736109	G	A	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1079;ReadPosRankSum=1.032;SC=TGACAGCTGCGGTGGGACAGA;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=61;WE=42558637;WS=42558619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr19	42566884	rs200980578	G	T	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.791;SC=TCCCCACAAAGCGCCGGCCCA;SOR=1.214;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=61;WE=42566892;WS=42566874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
chr19	42566942	rs137867437	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=610;ReadPosRankSum=1.059;SC=CTCACGGTGGAGGCAGATGCT;SOR=0.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=40;WE=42566950;WS=42566932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr19	42603776	rs1205817	A	G	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1476;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CAGGCCTGGAAAGACAAGGGG;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=201;TCF=93;TCR=108;TR=95;WE=42603784;WS=42603766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,110:0.48:229
chr19	42703833	rs2303652	A	G	3276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=71;PP=1816;ReadPosRankSum=1.922;SC=CACAAACCACAGAGCCCAGGT;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=111;TCR=144;TR=126;WE=42703841;WS=42703823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,162:0.51:319
chr19	42713835	rs3745231	A	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=787;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GCATTGCCAAAGCCTACAGAC;SOR=0.564;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=50;WE=42713843;WS=42713825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
chr19	42728836	rs3810151	T	C	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=730;ReadPosRankSum=0.141;SC=ACACAGAATGTTGGCCTGGAG;SOR=0.613;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=46;WE=42728844;WS=42728826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr19	42735177	rs74259566	C	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=1.852;SC=TAAAGGGCCACGATAGTAACT;SOR=1.236;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=16;WE=42735185;WS=42735167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr19	42736267	rs851609	A	G	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=25;PP=1327;SC=GAGGAGGGATAAGAATGGCGT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=68;WE=42736275;WS=42736257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	42741124	rs2302485	A	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=432;ReadPosRankSum=-1.711;SC=CTCAGAATACAACCAACTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=25;WE=42741132;WS=42741114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr19	42746548	.	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	42747029	.	C	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=983;ReadPosRankSum=0.093;SC=GGAGTCCACTCACTCAGTCTA;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=91;TCR=60;TR=62;WE=42747037;WS=42747019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,68:0.38:178
chr19	42747229	rs11878620	GG	AC	3729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TTAAGCCCCAGGTGGATACTG;SOR=0.736;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=92;TCR=88;TR=87;WE=42747238;WS=42747219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr19	42747474	rs79021928	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACCTGACCCTCTGTGAGGCCA;SOR=0.846;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=42747482;WS=42747464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr19	42753034	rs35493131	A	G	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1284;ReadPosRankSum=0.190;SC=CTGCCCCCTCAGCCAGCCCGC;SOR=0.917;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=81;WE=42753042;WS=42753024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
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chr19	42753649	rs11557114	G	C	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=59;PP=2965;SC=GTGGTCGGGCGCGGGGATCCT;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=42753657;WS=42753639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	42754403	rs76292187	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=5.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.353;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
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chr19	42795554	rs10410185	T	C	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=840;ReadPosRankSum=1.030;SC=AAGTCCTGGCTGCCACTGCAC;SOR=1.166;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=63;WE=42795562;WS=42795544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,76:0.47:160
chr19	42820530	rs1206009	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=221;ReadPosRankSum=-1.654;SC=CTGGAGTCCTAAGGGAGGAGG;SOR=0.248;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=12;WE=42820538;WS=42820520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr19	42848764	rs874002	A	G	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=31;PP=1155;SC=GTGGGCCGGCAGGAGGGGGCC;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=42848772;WS=42848754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	42848815	rs1206044	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=361;ReadPosRankSum=0.128;SC=ACCCCCTGTCTTCTCAGAGCA;SOR=0.575;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=24;WE=42848823;WS=42848805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr19	42852480	rs1676211	G	A	5184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.932;SC=AGACAGATGTGTCCCTGGTCT;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=355;TCF=168;TCR=187;TR=206;WE=42852488;WS=42852470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,244:0.56:433
chr19	42852549	rs34922891	C	T	3107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=85;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GGGCTGAGGACGTGGCCGTGT;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=214;TCF=67;TCR=147;TR=123;WE=42852557;WS=42852539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,139:0.56:247
chr19	42853782	rs28621009	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=504;ReadPosRankSum=-1.662;SC=GCCAGCTCAATGGCTCGGCAG;SOR=0.925;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=42;WE=42853790;WS=42853772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr19	42857179	rs149155949	C	T	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.763;SC=CTCCCACACCCGCCCCGGGTC;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=74;WE=42857187;WS=42857169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,80:0.68:118
chr19	42858793	rs61995685	T	C	3526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=77;PP=1784;ReadPosRankSum=0.927;SC=ACACTGGTGTTGTCCAGTCGG;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=272;TCF=125;TCR=147;TR=145;WE=42858801;WS=42858783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,173:0.53:329
chr19	42863035	rs1206038	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=590;ReadPosRankSum=0.031;SC=AGTCAGGAAGAAGATGGCTCT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=36;WE=42863043;WS=42863025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr19	42872559	rs79915295	TC	T	1120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.566;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.759;NF=18;NR=13;PP=929;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TAAGCTTATTTCCCCATCTCT;SOR=0.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=31;WE=42872567;WS=42872549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
chr19	42893236	rs73556315	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CCTCGCAGCATCTCCTGGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=8;WE=42893244;WS=42893226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr19	42893754	rs8108964	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GTCCAAGGGACGCTGGATACT;SOR=1.284;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=18;WE=42893762;WS=42893744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr19	42906271	rs35595562	G	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=1.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr19	42906271	.	GAC	CAG	546	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=11;PP=546;QD=42.8191339187;SC=GTGGGGGACAGACAGACCGGG;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=14;WE=42906281;WS=42906261;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,14:0.33:42
chr19	42906273	rs35639038	C	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=1.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr19	42927521	rs10422283	T	C	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1146;ReadPosRankSum=-1.894;SC=CACTGCCCCGTAGGATGTACG;SOR=0.930;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=66;WE=42927529;WS=42927511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,77:0.56:138
chr19	42946867	rs11380022	T	TC	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTGCCACATTTCTCCCCCCGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=42946875;WS=42946864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	42947113	rs11673645	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=-1.466;SC=TAGTCCCAGGCCAGCGTTCCC;SOR=0.527;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=8;WE=42947121;WS=42947103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr19	43013363	rs11666350	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=469;ReadPosRankSum=-0.477;SC=TCAGGGTAGAATAAGTAACTT;SOR=0.729;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=34;WE=43013371;WS=43013353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr19	43013394	rs10405906	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=-2.314;SC=AAAAGCACAAATAATGATCAG;SOR=0.909;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=29;WE=43013402;WS=43013384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr19	43021011	rs10412463	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=-1.510;SC=ATGGTGAAACGCCATCTCTAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=7;WE=43021019;WS=43021001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr19	43257439	rs80050376	G	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=285;ReadPosRankSum=0.264;SC=AGCTTATAGGGCTTCTGGAAC;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=15;WE=43257447;WS=43257429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	43268069	rs7255164	A	G	4242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.263;NF=91;NR=74;PP=2549;ReadPosRankSum=1.637;SC=ATCACTCACGATATAAGGTGA;SOR=0.668;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=293;TCF=164;TCR=129;TR=165;WE=43268077;WS=43268059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,197:0.56:352
chr19	43268140	rs11355507	AG	A	4193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.455;NF=20;NR=75;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TGTAAGGTGTAGGATCCTGCG;SOR=0.942;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=186;TCF=46;TCR=140;TR=95;WE=43268148;WS=43268130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,136:0.49:277
chr19	43268197	rs149961067	T	C	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.495;NF=29;NR=54;PP=1397;ReadPosRankSum=-2.316;SC=TTGGAATATATTGTTTCTCGT;SOR=1.228;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=180;TCF=71;TCR=109;TR=83;WE=43268205;WS=43268187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,81:0.41:199
chr19	43268216	rs7256456	T	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.443;NF=22;NR=42;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.372;SC=GTCCACTGTATGCAGGCCCAT;SOR=1.450;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=155;TCF=65;TCR=90;TR=64;WE=43268224;WS=43268206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,65:0.37:176
chr19	43269699	rs7260508	C	T	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.051;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr19	43269704	rs62112127	TG	CA	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.723;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.079;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.469;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr19	43420264	rs2074856	C	T	4588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=53;PP=2540;SC=AGGGATCATGCGGAATCACTC;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=136;WE=43420272;WS=43420254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	43420451	rs3198831	G	C	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=50;PP=2063;SC=ATTTGACCGTGTACTACATAT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=95;WE=43420459;WS=43420441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	43422100	rs58309502	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=52.81;MQRankSum=1.210;NF=2;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=0.355;SC=GGGTCAGGCCCAGGACACCTC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=43422108;WS=43422090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	43428981	rs200700777	A	AG	261.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.03;QD=32.72;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	43433570	rs2074857	A	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=10;PP=707;SC=CAGCCTGGCTAACAGAGGAAC;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=43433578;WS=43433560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	43433805	rs1065178	A	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=38;PP=1367;SC=CACAGGTTAAAATCACAGCCT;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=43433813;WS=43433795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	43439694	rs113247044	A	G	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=72;PP=2549;SC=ACTGTTTCTCATCCACTGTAT;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=127;WE=43439702;WS=43439684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	43439739	rs58684857	T	C	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=54;PP=2181;SC=CCGTCTACTATATATGATGTA;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=98;WE=43439747;WS=43439729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	43439793	rs7245978	G	A	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=38;PP=1429;SC=TACCAGATGTGGCCAGTAAGA;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=43439801;WS=43439783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	43439848	rs113195821	G	A	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=31;PP=1274;SC=CCTTCCCCTCGGAAACTTTTG;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=43439856;WS=43439838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	43448156	rs55931787	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.25;QD=28.84;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	43448321	.	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=13.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-6.185;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.605;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr19	43448324	.	A	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.552;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=13.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-6.119;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.393;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr19	43519362	rs11083680	C	T	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=21;PP=1294;SC=TTGGAGTAATCTGAGGGATAA;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=43519370;WS=43519352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	43519442	rs10414166	T	C	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=40;PP=1590;SC=GGGTTAGAGTTTGCGAAGCAG;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=80;WE=43519450;WS=43519432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	43530379	rs2526716	A	G	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=56.99;NF=7;NR=1;PP=156;SC=TATTTTTTAGAACCCCAGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=43530398;WS=43530377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	43530390	rs2736151	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=288;SC=ACCCCAGGAGCCTCTCCAGGA;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=43530398;WS=43530377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr19	43690506	rs8107936	G	C	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=17;PP=1286;SC=GTGAGCAGGAGCCCCTTCCAG;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=57;WE=43690514;WS=43690496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	43690667	rs12610783	CT	TC	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=4.349;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-1.970;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr19	43690678	rs12610809	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=15.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-1.747;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=3.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr19	43690700	rs12609374	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=55.95;MQRankSum=-1.964;NF=0;NR=6;PP=30;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GGCTCATGGGTGGGGTCAGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=6;WE=43690708;WS=43690690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr19	43708245	rs3170216	G	C	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=38;PP=1077;SC=TAATGGTAGAGGTATGTCATT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=43708253;WS=43708241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	43708849	rs142232112	C	CCCCG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=84;SC=TCTGTCTTCCCCCCACGATGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=43708857;WS=43708839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	43708853	rs4802164	A	C	128.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	43708926	rs11673307	G	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=16;PP=830;SC=TGGAACAGGCGGCAGACTCCT;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=43708934;WS=43708916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	43708968	rs11669435	T	C	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=25.90;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	43708978	rs67183694	TC	T	3094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=1510;SC=TCTGGATGTTTCTTTTTCCCC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=43708986;WS=43708958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	43709072	rs56700032	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=434;SC=TATAGTTATTGTTATCATTTT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=43709080;WS=43709062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	43772270	rs3746296	G	T	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.021;NF=29;NR=43;PP=1194;ReadPosRankSum=0.306;SC=CTTCGGCAGTGGTGGGCGGGT;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=72;WE=43772278;WS=43772260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,85:0.59:145
chr19	43858044	rs45553433	A	T	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1089;ReadPosRankSum=0.702;SC=ACAGTTCAGCATGTGTGGAAG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=71;WE=43858052;WS=43858034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,84:0.47:178
chr19	43858066	rs45571738	G	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=936;ReadPosRankSum=0.900;SC=TGTCCGACCTGCCCCGGCAAT;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=57;TCR=80;TR=67;WE=43858074;WS=43858056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr19	43858578	rs77156507	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=777;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AGAGGGAGGGGCTGCTAGAAG;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=47;WE=43858586;WS=43858568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr19	43859549	rs1962260	T	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=6;PP=262;SC=CAGGTGTGAGTCACCACACCC;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=43859557;WS=43859539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	43860053	rs71350665	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=475;SC=GAGGAGGGTGGGCCTGGCTTC;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=43860061;WS=43860043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	43860192	rs71337594	T	G	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	43860251	rs199668750	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	43864548	rs10425835	C	A	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=83;PP=2423;SC=GCTGCTGCTCCTAGATGTAGG;SOR=1.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=115;WE=43864556;WS=43864538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	43865499	rs71339512	T	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.49;QD=26.32;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	43865840	rs28464741	G	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=338;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GGGAGGAGGCGCTGGGGGCCT;SOR=1.447;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=15;WE=43865848;WS=43865830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr19	43866449	rs78718189	G	A	3174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=2129;ReadPosRankSum=0.787;SC=GCTGTGGTGGGGAGTGGTTTG;SOR=0.692;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=263;TCF=133;TCR=130;TR=121;WE=43866457;WS=43866439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,138:0.48:289
chr19	43866617	rs36081957	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=789;ReadPosRankSum=0.506;SC=TTCATATCTACTCACCTAACA;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=19;TCR=74;TR=43;WE=43866625;WS=43866607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr19	43876891	rs7246785	G	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=762;ReadPosRankSum=-0.970;SC=GGGGGAAATGGAGTTAGCAGG;SOR=0.682;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=48;WE=43876899;WS=43876881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr19	43877394	rs3745996	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQRankSum=-0.120;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.814;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr19	43883273	rs113172076	G	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.216;NF=17;NR=25;PP=445;ReadPosRankSum=0.352;SC=AAGGATCCTGGGTCTAGGGAA;SOR=0.828;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=42;WE=43883281;WS=43883263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
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chr19	43920612	rs35033974	G	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=617;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TCACCTCCCGGCCTGATCGTG;SOR=0.499;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=39;WE=43920620;WS=43920602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
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chr19	43982467	rs2682543	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GAGACTGGGCACAGAAACTGG;SOR=1.518;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=43982475;WS=43982457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	43999256	.	A	G	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MMLQ=27;MQ=59.01;NF=4;NR=0;PP=31;QD=16.4428031368;SC=TGGACTCCTGAGTCTGAGGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=43999264;WS=43999250;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr19	43999271	.	G	GA	790	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=59.26;NF=8;NR=0;PP=790;QD=102.125;SC=GAGGGAGGAGGGGCTGGGGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=8;WE=43999300;WS=43999261;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,8:0.36:22
chr19	43999292	.	G	GGTCTGAGGGAGGAGGAGACTCGGGGCAGGACCCCTGA	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-2.817;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr19	43999634	rs1125030	A	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AGGGCAGGTGACAGGTAGCTC;SOR=0.754;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=69;WE=43999642;WS=43999624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr19	44001891	rs2682549	T	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=429;ReadPosRankSum=1.107;SC=AAGAACCAGATGCCATTACCT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=29;WE=44001899;WS=44001881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr19	44005876	rs112058634	CCAAA	C	3917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.229;NF=9;NR=48;PP=2491;ReadPosRankSum=0.599;SC=ACCCGGTGAGCCAAACAGACC;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=20;TCR=112;TR=57;WE=44005887;WS=44005866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,106:0.40:264
chr19	44012005	rs2599452	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.377;NF=9;NR=2;PP=183;ReadPosRankSum=-0.976;SC=CAGGAGTCCAGGCCCCCAGCC;SOR=2.494;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=11;WE=44012013;WS=44011995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr19	44012880	rs2682578	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=1.738;SC=TTTACACTCCACTTTCAAAGT;SOR=0.793;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=9;WE=44012888;WS=44012870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr19	44031324	rs3810381	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GTACAGCCTCCGCCATCGCGC;SOR=0.591;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=13;WE=44031332;WS=44031314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr19	44047493	rs72484243	CGTGT	C	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.502;NF=5;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.236;SC=TTAAATGCATCGTGTGTGTGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=5;WE=44047504;WS=44047483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr19	44047550	rs3547	T	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=383;ReadPosRankSum=0.494;SC=TACTTCAGGCTTGCGGCACCA;SOR=0.193;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=22;WE=44047558;WS=44047540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr19	44047826	rs2682557	T	A	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=55;PP=1793;SC=TCACTCATATTGTCCTCGAGC;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=84;WE=44047834;WS=44047816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	44050195	rs25479	C	T	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.248;SC=CCCCCAGCCCCAGCCCTACCT;SOR=0.929;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=17;WE=44050203;WS=44050185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr19	44055582	rs2139720	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CCAGCCCCTGCCCCGCTCCTC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=44055590;WS=44055572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr19	44055726	rs25487	T	C	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.696;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=727;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GCCTTACCTCTGGGAGGGCAG;SOR=0.614;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=58;WE=44055734;WS=44055716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr19	44055898	rs25486	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=0.156;SC=CAAAGGGGAACGAGACAGGGG;SOR=2.442;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=19;WE=44055906;WS=44055888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr19	44057227	rs915927	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.294;SC=TAGGTCCTGCTGGGTCGCTGG;SOR=0.126;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=13;WE=44057235;WS=44057217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr19	44079687	rs3213245	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.485;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=464;ReadPosRankSum=-1.528;SC=AGTGGGAGGGGGCGGGGTGCG;SOR=3.219;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=20;WE=44079695;WS=44079677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr19	44081288	rs2682585	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=247;ReadPosRankSum=-0.983;SC=GTCCAGACCCACCCCTCCTCA;SOR=0.852;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=18;WE=44081296;WS=44081278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr19	44081499	rs2682586	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TAGAGAGAGAAAGAGCCTTCA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=20;WE=44081507;WS=44081489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr19	44081601	rs3810378	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGGGGTCCCAGAGAAGAAAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=44081609;WS=44081591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr19	44082791	rs12608635	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=529;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GCAGGTGCCATGGCCAAATGA;SOR=0.998;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=40;WE=44082799;WS=44082781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr19	44082945	rs304731	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=665;ReadPosRankSum=-0.069;SC=GGGATCATCATGGTTCTCAAG;SOR=0.840;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=52;WE=44082953;WS=44082935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr19	44117582	rs10410000	T	C	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=40;PP=2134;SC=GGCGAGAGATTGCAGCCGATC;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=44117590;WS=44117578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	44118188	rs3815422	A	C	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=109;PP=2965;SC=TAGCAAGGAGAGCGACCCCAG;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=211;WE=44118196;WS=44118178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	44118353	rs2302421	G	A	5812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=104;PP=2965;SC=CAGTCAAGCCGACGCCACCAC;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=76;TCR=104;TR=180;WE=44118361;WS=44118343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	44118680	rs1860149	A	G	160.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=90;SC=CACTGCTGGCATGGGGCACAG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=44118688;WS=44118670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	44130453	rs3746003	G	A	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=79;PP=2604;SC=GCCACACCCCGGTCAGACACT;SOR=1.591;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=117;WE=44130461;WS=44130443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	44131297	rs407049	T	C	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=56;PP=2585;SC=AGGATGCGTCTGACAAGGGGG;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=141;WE=44131305;WS=44131287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	44156472	rs2302524	T	C	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=40;PP=1479;SC=GCTGTTCCCCTTGCAGCTGTA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=44156480;WS=44156462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	44223125	rs346049	C	T	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1422;ReadPosRankSum=-1.656;SC=CTTCTTCCTGCTGGTCTCCCC;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=85;WE=44223133;WS=44223115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,101:0.46:221
chr19	44223145	rs34439296	C	T	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1416;ReadPosRankSum=0.541;SC=CCCGCCGCTGCGGGGCCGTCG;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=90;WE=44223153;WS=44223135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,103:0.48:216
chr19	44223412	rs34471331	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=682;ReadPosRankSum=-1.152;SC=CCTGGGAGCACGACCTGCCCT;SOR=0.977;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=41;WE=44223420;WS=44223402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr19	44224161	rs346048	T	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=1.561;SC=AAATCCAAATTACCAACAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=18;WE=44224169;WS=44224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr19	44248878	rs346532	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CCCTGCTCCCAGTGGGTGCCC;SOR=2.215;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=44248886;WS=44248868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr19	44254972	rs164070	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=1.587;SC=CTAGACTATACGAAGTCCCTT;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=18;WE=44254980;WS=44254962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr19	44276370	rs3760979	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.538;SC=ATACCCTCCCATCCCCTTCCC;SOR=1.329;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=44276378;WS=44276360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	44280837	rs514328	G	A	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=14;PP=481;SC=GTCTCCCTCCGCCTGGCCCTC;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=27;WE=44280845;WS=44280827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	44280980	.	T	G	94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=94;QD=25.7542425094;SC=CCCAGTGCGGTGGCTCACACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=44280988;WS=44280970;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	44284709	.	G	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-3.195;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr19	44284715	.	CTG	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-3.460;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr19	44284718	.	A	AAG	65.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-3.460;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr19	44284722	.	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-3.460;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.665;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr19	44302624	rs349053	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=875;ReadPosRankSum=1.184;SC=CATTCTGCCATTGCCCTGGAA;SOR=0.740;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=60;WE=44302632;WS=44302614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr19	44303066	rs11547806	C	G	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=46;PP=1610;SC=AGCGCGTCCGCGTTCGATTGC;SOR=0.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=44303074;WS=44303056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	44306389	rs72214885	GCCCCCA	G	1462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=1140;ReadPosRankSum=0.153;SC=AGGAGTCCAGGCCCCCAGTCT;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=23;WE=44306402;WS=44306379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr19	44351107	rs10421861	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.393;NF=15;NR=1;PP=294;ReadPosRankSum=0.688;SC=AGTCAAAAACGTATGAGACCA;SOR=2.168;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=16;WE=44351115;WS=44351097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr19	44351166	rs79626467	GGGAGAT	G	1350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.996;NF=15;NR=9;PP=1192;ReadPosRankSum=0.278;SC=TTTTCCCAGTGGGAGATGAAG;SOR=1.307;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=24;WE=44351179;WS=44351156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,39:0.34:115
chr19	44351694	rs2195980	C	T	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1078;ReadPosRankSum=1.162;SC=AAAATTCATACTGGTGTGAAA;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=61;WE=44351702;WS=44351684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr19	44351836	rs957569	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=915;ReadPosRankSum=0.318;SC=GTGGCTATCAGCTTACTCAGC;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=51;WE=44351844;WS=44351826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr19	44352665	rs2356437	TG	CA	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=2241;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GACCTTTACTTGTGGCTCAAA;SOR=0.552;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=66;WE=44352674;WS=44352655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr19	44352688	rs2883946	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=804;ReadPosRankSum=-1.721;SC=TTGTTCATGAGAGAACTCATA;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=55;WE=44352696;WS=44352678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
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chr19	44418343	rs406968	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CACACTGATACGGTTTCTCTC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=64;WE=44418351;WS=44418333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr19	44418544	rs425221	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=993;ReadPosRankSum=0.874;SC=TACAATGAATATTAAGGTGTG;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=62;WE=44418552;WS=44418534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,71:0.44:162
chr19	44418680	rs388685	G	C	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.275;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=2246;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACACTTATATGGTTTCTTTCC;SOR=0.951;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=69;WE=44418701;WS=44418670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,89:0.46:194
chr19	44418693	rs388706	T	C	3035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=2246;ReadPosRankSum=0.638;SC=TTCTTTCCAGTGTGAACTTTC;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=69;WE=44418701;WS=44418670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr19	44418824	rs399098	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=836;ReadPosRankSum=2.353;SC=CCCAACATTCCTCCCACACTC;SOR=1.025;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=44;WE=44418832;WS=44418814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr19	44419030	rs420242	A	G	7555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=106;PP=2965;SC=TCTCTCCTGCATGAGCCCTTT;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=223;WE=44419038;WS=44419020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr19	44422982	rs423320	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=563;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TATCTCCAAGGCTAACAGAAA;SOR=0.876;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=35;WE=44422990;WS=44422972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr19	44423195	rs423752	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=1.809;SC=TCATTTCATCGTCTTCAGGAC;SOR=0.223;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=12;WE=44423203;WS=44423185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr19	44423981	rs384329	T	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=558;ReadPosRankSum=-2.329;SC=TTCAACTTTATTACAGTTAAA;SOR=1.030;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=27;WE=44423989;WS=44423971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr19	44426265	rs413093	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=318;ReadPosRankSum=0.204;SC=AATAAGGTGTATGTAATCTTT;SOR=0.941;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=16;WE=44426273;WS=44426255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr19	44426467	rs57712519	T	TG	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.265;NF=0;NR=12;PP=362;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TGTTTTGTTTTTTTTAACGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=44426475;WS=44426457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr19	44469577	rs451601	T	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=664;SC=TTGCCAAACTTCTTTCATAAC;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=44469585;WS=44469567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	44470189	rs454301	T	A	5447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=97;PP=2965;SC=TAAACAGTCCTTCAGTGATGT;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=68;TCR=98;TR=165;WE=44470197;WS=44470179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	44470420	rs439676	T	C	6232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=83;PP=2965;SC=ACCATTCAAATGTGGGCAATG;SOR=0.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=115;TCR=83;TR=198;WE=44470428;WS=44470410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr19	44470548	rs453640	A	G	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=85;PP=2965;SC=CACAGCTTCAAGAACATCAGA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=172;WE=44470556;WS=44470538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	44470663	rs435590	G	C	10884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=149;PP=2965;SC=AGGAGAAAAAGCATTCAGATG;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=334;TCF=185;TCR=149;TR=334;WE=44470671;WS=44470645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr19	44471209	rs365745	T	A	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=43;PP=2391;SC=TACTCAGAGTTCACAACTTCA;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=107;WE=44471217;WS=44471199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	44471323	rs366111	G	A	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=85;PP=2965;SC=GAGGGTCCACGGGGGAGAGCG;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=168;WE=44471331;WS=44471313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	44500478	rs398235	A	T	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=46;PP=2009;SC=TAAACAGTCCATCAGTGATGT;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=44500486;WS=44500468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	44500761	rs448921	G	A	9059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.94;NF=144;NR=130;PP=2965;SC=AATGTTCATCGTAAATTACAC;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=145;TCR=130;TR=274;WE=44500769;WS=44500751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr19	44501116	rs388812	A	G	9261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=139;PP=2965;SC=ACACAGGAGAAAAACCATATA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=127;TCR=139;TR=266;WE=44501124;WS=44501106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr19	44501227	rs388471	A	G	8068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=129;PP=2965;SC=AAGAATGTGGAAAGGGATTTT;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=102;TCR=130;TR=230;WE=44501235;WS=44501217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr19	44501627	rs35292176	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=49;PP=1456;SC=TGACACATAATTGTTCATATT;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=44501635;WS=44501617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	44503379	rs452554	C	T	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=23;PP=945;SC=TACATTTCATCCAGTCCTGTA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=44503387;WS=44503369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	44503541	rs11314755	TA	T	936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=652;SC=AGACAGACCTTAAGAGTTCAT;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=44503549;WS=44503531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	44503569	rs7252394	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=369;SC=TTTACAAAACGAATCATGAAC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=44503577;WS=44503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	44503607	rs7253205	T	C	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=113;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=171;SC=CACTAGAATGTCAGTGACATG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=44503615;WS=44503597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	44511202	rs2356549	A	T	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=48;PP=2297;SC=TACTCAAGACACTGAAGACTC;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=44511210;WS=44511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	44511223	rs424147	T	G	4463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=52;PP=2855;SC=CAAAAAGTAGTAGGAAAAATG;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=123;WE=44511231;WS=44511213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	44511389	rs2191566	G	T	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=55;PP=1656;SC=TGTCTCTTTTGTGTTGACTTT;SOR=2.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=69;WE=44511397;WS=44511379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	44530390	rs8101750	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=58;PP=1848;SC=TACATGATCTTCACAGTGGCA;SOR=1.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=83;WE=44530398;WS=44530380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	44530444	rs3830527	GAC	G	1098.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=1036;SC=ATGGGCGTGAGACACAGGTGG;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=22;WE=44530453;WS=44530434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	44535999	rs7258517	G	T	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=41;PP=2610;SC=GATGGAGACTGTTCCAGAAGC;SOR=1.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=44536007;WS=44535989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	44564401	rs12610472	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=816;SC=AAGACTTCTTTGTCGTTGGAC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=44564409;WS=44564391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	44564981	rs3826941	G	A	7730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=113;PP=2965;SC=CAACCCAAAGGGAAGGGAATT;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=113;TCR=113;TR=226;WE=44564989;WS=44564971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr19	44565125	rs4502339	A	G	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=62;PP=1819;SC=CCTTCCAGCTAGTGGCCCTGC;SOR=2.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=77;WE=44565133;WS=44565115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	44570393	rs6509138	C	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1014;ReadPosRankSum=0.617;SC=TGAGGAAGGACTATCTATAAT;SOR=0.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=59;WE=44570401;WS=44570383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr19	44570551	rs4375771	G	A	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=29;PP=1531;SC=ACATCTCAGCGCTTCATATTC;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=44570559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	44571154	rs4433920	T	C	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1505;ReadPosRankSum=0.181;SC=ACTTGCACCATAGAGCCCACA;SOR=0.570;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=91;WE=44571162;WS=44571137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,107:0.52:207
chr19	44580758	rs57895932	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=348;SC=ATTTATGTTATGAGTAGAAAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=44580766;WS=44580748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	44585159	rs4803674	T	A	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=31;PP=2255;SC=CATACGTTTGTTGTTGTAGGA;SOR=1.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=100;WE=44585167;WS=44585149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	44586076	rs4553729	T	C	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=34;PP=1476;SC=ACCATATCAGTGTTCAAGTTC;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=44586084;WS=44586066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	44589999	rs139900131	TCTC	T	3295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.368;NF=20;NR=37;PP=2617;ReadPosRankSum=-1.485;SC=AGCTCTCAGTTCTCCACACAA;SOR=0.858;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=57;WE=44590009;WS=44589989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr19	44590558	rs7255701	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=881;ReadPosRankSum=0.644;SC=CCATGGTCCACATGCAAGAGA;SOR=0.624;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=45;WE=44590566;WS=44590548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr19	44591360	rs8113249	G	A	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=67;PP=1949;SC=GAAGCGCTACGAGAGGCGCTT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=83;WE=44591368;WS=44591350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	44604914	rs62115526	T	C	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=32;PP=2147;SC=CCAGGAATCATTGGTCATGAG;SOR=1.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=100;WE=44604922;WS=44604904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	44610665	rs2068061	A	G	6984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=104;PP=2965;SC=TCAAGACTTGATGATAAATAG;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=207;WE=44610673;WS=44610655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr19	44610798	rs4239529	A	T	5726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=94;PP=2965;SC=GATGTCTCCCACTTTGATTTT;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=78;TCR=94;TR=172;WE=44610806;WS=44610788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr19	44610843	rs72480796	C	T	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1157;ReadPosRankSum=1.060;SC=AAATCTCATACGTGTGATGAG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=66;WE=44610851;WS=44610833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr19	44611066	rs7508149	T	C	9482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.799;SC=ATGTTCATCATAAATTACACA;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=143;TCR=142;TR=282;WE=44611074;WS=44611054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,337:0.99:339
chr19	44611420	rs4508518	A	G	10800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=148;NR=179;PP=2965;SC=ACACGGGAGAAAAGCCATATA;SOR=0.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=149;TCR=179;TR=327;WE=44611428;WS=44611410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
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chr19	44652748	rs3817595	C	T	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=13;PP=1475;SC=TTTACTGACACTAAGGAAAAT;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=64;WE=44652756;WS=44652738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr19	44660967	rs12609635	A	G	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=90;NR=122;PP=2965;SC=AGGAATGTGGAAGGGCCTTCA;SOR=0.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=91;TCR=124;TR=212;WE=44660975;WS=44660957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr19	44663805	rs62117771	G	A	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=23;PP=775;SC=ATTTTTATCAGCCCCCTTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=44663813;WS=44663795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	44754426	rs116986038	GA	AT	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.467;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr19	44871287	rs8113807	T	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=45.05;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	44871293	rs2571074	T	C	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=43.89;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	44890697	rs1836280	A	G	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.869;NF=69;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.436;SC=CACGCTCACAATGTGTGTACT;SOR=1.309;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=108;WE=44890705;WS=44890675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,117:0.85:137
chr19	44890801	rs12610859	T	C	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=89;PP=2965;SC=GGCCTCTCTCTTGTGTGGACT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=92;TCR=89;TR=181;WE=44890809;WS=44890791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	44891784	rs2571089	T	C	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=66;PP=2965;SC=TTTCCCACAGTTGGGATGTCT;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=145;WE=44891792;WS=44891774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	44892333	rs2571090	A	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=54;PP=1484;SC=TGAGAAAATGAAATATGATGG;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=65;WE=44892341;WS=44892323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	44896487	rs2571123	G	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=11;PP=1471;SC=CCAGTGGTCTGATGCTCAGTT;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=44896495;WS=44896477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	44896740	rs147067333	A	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=721;ReadPosRankSum=1.237;SC=AACAAAATAAACTTATTTCTT;SOR=0.819;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=36;WE=44896748;WS=44896730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr19	44896857	rs2571122	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=244;SC=GTGTCCTTACGTGGCAGAGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=44896865;WS=44896847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	44898662	rs2571124	C	T	100.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	44901526	rs2722650	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=255;SC=TCCTCTCACTAGATATCATCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=44901534;WS=44901516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	44901557	rs2722651	A	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.58;NF=1;NR=6;PP=175;SC=TGAACAGACTAAACTCCCACC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=44901565;WS=44901547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	44934489	rs2571174	G	A	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=57;PP=2160;SC=ACTGTCCAGGGAATTCTCAAT;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=96;WE=44934497;WS=44934479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	44947050	rs204548	T	C	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=64;PP=2038;SC=CTGCTAGGTTTTCTGCGAGCA;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=89;WE=44947058;WS=44947040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	44947184	rs204547	T	C	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=131;SC=GTCCAGAGCGTGACTGCTTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=44947192;WS=44947174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	44976058	rs2571053	C	T	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=28;PP=1669;SC=GTAGCAAATGCCATTATCAAA;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=44976066;WS=44976048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	44977071	rs1897824	C	T	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=64;PP=2461;SC=AAGGATTTTGCGTATAGCTCT;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=120;WE=44977079;WS=44977061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	44977240	rs1897823	A	G	6911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=61;PP=2965;SC=GACTTCAGTCAGAATTCAGAT;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=145;WE=44977248;WS=44977230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	44977262	rs17714261	T	C	6737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=64;PP=2965;SC=TTCGTGTTCATCTCAGAGTCC;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=44977270;WS=44977252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	44977382	rs1897822	C	T	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.869;NF=37;NR=74;PP=2474;ReadPosRankSum=1.852;SC=AGTACACACACTGTGAGCGTG;SOR=1.526;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=111;WE=44977390;WS=44977372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,111:0.98:113
chr19	44977405	rs1897821	C	T	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=58;PP=2221;SC=AAGGACCTTCCGACTCATCAA;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=93;WE=44977425;WS=44977395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	44977417	rs55771561	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.686;NF=13;NR=24;PP=713;ReadPosRankSum=0.593;SC=ACTCATCAAAAACTACATAAG;SOR=0.650;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=37;WE=44977425;WS=44977395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr19	44981375	rs954314	T	C	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;PP=1210;SC=ACTTTCCACATTGATTGCATT;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=44981383;WS=44981365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	44981883	rs1897820	C	G	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=55;PP=2106;SC=AAATCCATAGCATTTATCTTT;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=44981891;WS=44981873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	44983567	rs2253563	C	G	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=28;PP=1026;SC=GAGCAGGGTTCCAAGTACCCT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=44983575;WS=44983557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	44983728	rs35167767	TG	T	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=590;SC=ATTGGTGACCTGGGGAGTTGT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=44983736;WS=44983718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	45001232	rs2571109	C	T	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=25;PP=1466;SC=CATGAGGGCCCCAAACCCCCT;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=68;WE=45001240;WS=45001222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	45001346	rs2571108	G	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=52;PP=1810;SC=CTGTGCACAGGCCTTCGGGGG;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=89;WE=45001354;WS=45001336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	45016990	rs5828200	CT	C	3144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=2219;SC=GACTGGGGTCCTTCTGTTGTT;SOR=0.716;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=54;WE=45016998;WS=45016980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	45017249	rs1465723	T	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=20;PP=1280;SC=ATTTCTGATGTAGAGAAAATA;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=45017257;WS=45017239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	45017477	rs10706694	TA	T	1633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=32;PP=1337;SC=CGTTGGGAGGTAATCAGATTG;SOR=1.714;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=45017485;WS=45017467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	45024581	rs12982449	C	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=28;PP=1546;SC=CATAGGGCCCCGTGTCATTCC;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=45024589;WS=45024571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	45024875	rs12975863	T	C	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=13;NR=39;PP=1087;SC=TCCAGGAGTGTGTGCGTGTGT;SOR=2.170;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=52;WE=45024887;WS=45024865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	45024879	rs144346131	C	CGTGT	1633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=18;PP=780;SC=GGAGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=18;WE=45024887;WS=45024865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	45028169	rs7260180	C	T	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=49;PP=1665;SC=TGGAACACAACGGAGAGGTTG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=45028177;WS=45028159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	45033379	.	G	GCA	95	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=59.6;NF=4;NR=3;PP=95;QD=14.0;SC=TTCCTCGAGTGCACACACACA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=7;WE=45033388;WS=45033369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,7:0.30:23
chr19	45121424	rs10412507	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=645;ReadPosRankSum=1.365;SC=CTGCCTTCTCGGAGCTGCCCT;SOR=0.558;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=46;WE=45121432;WS=45121414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,58:0.46:125
chr19	45126994	rs846857	A	G	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=36;PP=1510;ReadPosRankSum=1.066;SC=TTCCCTGTTTACACAGACAGC;SOR=0.600;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=171;TCF=107;TCR=64;TR=91;WE=45127002;WS=45126984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,103:0.51:202
chr19	45138648	.	TTCTC	T	429	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=429;QD=43.2;SC=ATGATTCTTATTCTCTCTCTC;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=45138659;WS=45138638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	45138669	rs60475615	TC	T	559.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.822;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr19	45138671	rs370451038	TCTC	T	559.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.108;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	45147340	rs11540084	G	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=391;ReadPosRankSum=0.377;SC=CAGAGCGAGCGGGCGCCGGGA;SOR=0.139;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=23;WE=45147348;WS=45147330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr19	45147518	rs5828211	C	CA	4646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=49;PP=2869;SC=GTCTGGCTCCCGCTCCGCATC;SOR=0.811;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=62;WE=45147526;WS=45147508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	45147542	rs439446	T	C	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=32;NR=48;PP=1423;SC=GCCGGGTACTTGCCCCCTTGG;SOR=0.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=45147550;WS=45147532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	45147576	rs5828212	CG	C	2398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=38;PP=1715;SC=ACGGCCCCGCCGCGGCGCCAC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=45147584;WS=45147566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	45157113	rs71171278	A	AG	7383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=67;PP=2974;SC=AATCCCGCGTACCCCAGGCCC;SOR=1.097;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=133;WE=45157121;WS=45157103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	45162038	rs203710	A	G	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=41;PP=1780;SC=ACTCAGGCATATCCCGTAACG;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=45162046;WS=45162028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	45162189	rs35385129	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CCAGAGCTGCCGTAATTGAGC;SOR=0.947;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=16;WE=45162197;WS=45162179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	45385759	rs3745150	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.732;SC=GGTCTAAATGGAGTAGGGAGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=45385767;WS=45385749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	45389224	rs283814	A	G	4823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=63;PP=2731;SC=ACAAGCCACCAACCCCAAAAG;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=141;WE=45389232;WS=45389214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	45404431	rs741780	T	C	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=1285;SC=TGGGGCCACTTGCTAATTCTC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=45404439;WS=45404421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	45404691	rs405697	A	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=42;PP=1433;SC=CCACATTACCAGGGAACACTT;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=45404699;WS=45404681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	45409167	rs440446	C	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=7;PP=282;SC=ACCCTGGGAACCCCTGGCCTC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=45409175;WS=45409157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	45430280	rs5112	C	G	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=22;PP=957;SC=TTCTGTCGATCGTCTTGGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=45430288;WS=45430270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	45448036	rs1132899	T	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
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chr19	45452335	rs4803776	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-1.356;NF=6;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-1.420;SC=GGAGTCCAGGTCCCCAGACCC;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=9;WE=45452343;WS=45452325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	45458146	rs3760629	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=1.821;SC=AGGGGTCAGAAGACAAGGGTG;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=45458154;WS=45458138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr19	45458593	rs2238682	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	45458925	rs7252480	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-0.955;SC=GGGTCGGTTCCCCTGCACGCT;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=45458933;WS=45458915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr19	45465363	rs35566032	GA	G	2075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.947;NF=2;NR=43;PP=1451;ReadPosRankSum=0.699;SC=TTTGTTCACCGAAAACATTCA;SOR=0.837;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=45;WE=45465371;WS=45465353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr19	45476422	rs204481	T	C	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=70;PP=2323;SC=CCGGAGGAGCTCCACGCGTCG;SOR=1.290;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=109;WE=45476430;WS=45476412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	45477910	rs11318909	CT	C	1719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=48;PP=1821;SC=ACTGAAGGACCTTTTCCTCCA;SOR=5.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=48;WE=45477918;WS=45477900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	45488434	rs204472	A	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=9;PP=591;SC=TGCAGGTGCCAGCAGGTCTCA;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=45488442;WS=45488424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	45488567	rs204471	T	C	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=52;PP=1508;SC=TCAAGGTAAATGGGCAGGGTT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=98;WE=45488575;WS=45488557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	45489548	rs58800134	A	AG	1293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=1208;SC=GCTTGAGCCCAGAATTCGAGA;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=26;WE=45489556;WS=45489538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	45490570	rs3786505	A	G	3894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=87;PP=2564;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CCTTCTGCCCACTCTCGCTTT;SOR=0.511;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=312;TCF=130;TCR=182;TR=158;WE=45490578;WS=45490560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,177:0.51:346
chr19	45490636	rs204468	T	C	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=64;PP=1417;ReadPosRankSum=0.519;SC=ACTTCCTGGGTGATGAGTTGT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=63;TCR=125;TR=97;WE=45490644;WS=45490626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,98:0.48:204
chr19	45493635	rs875255	C	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=277;ReadPosRankSum=0.881;SC=CTGGTTCCCCCCTACCCCCTG;SOR=0.844;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=20;WE=45493643;WS=45493625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr19	45494247	rs11405080	A	AC	8808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=133;PP=2936;SC=GTCTCCAGGTACCACGTATCC;SOR=1.479;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=13;TCR=142;TR=145;WE=45494255;WS=45494237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr19	45494349	rs11333249	TC	T	1640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=28;PP=1673;SC=CATAACTGCTTCCCTGGGCGA;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=45494357;WS=45494339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	45495668	rs2075618	G	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.232;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=1298;ReadPosRankSum=1.036;SC=GGTGAGGCCCGGTGGGCAGGT;SOR=1.255;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=38;WE=45495690;WS=45495658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr19	45495682	rs2075619	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GGCAGGTGGGAGCTCCCACCG;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=33;WE=45495690;WS=45495658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr19	45496303	rs9193	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=52;PP=1526;SC=CAGCGTGTGATGTAGGGGCCG;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=83;WE=45496311;WS=45496293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	45506772	rs7251460	T	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=50;PP=2267;SC=GACAGGTAAATCTTACCACCT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=99;WE=45506780;WS=45506762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	45513146	rs150557566	GGCCTTC	G	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=1.602;SC=AGGGGGTCTTGGCCTTCCTTG;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=12;WE=45513159;WS=45513136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr19	45528799	rs2288918	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=27;PP=1177;SC=CCCTTCCCCGTTCCCCTGTAC;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=45528807;WS=45528789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr19	45535672	rs147163954	CA	C	254.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=171;SC=GCAAGACTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=45535680;WS=45535663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr19	45662459	rs8109620	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=0.279;SC=GGGGGCCAGAGTATTCTTGGG;SOR=1.051;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=7;WE=45662467;WS=45662449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	45668327	rs10410833	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=460;ReadPosRankSum=0.775;SC=CCTCCCCGCCCGGGGCCTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=28;WE=45668335;WS=45668317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr19	45681560	rs7254936	T	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=54;PP=1293;SC=TCTTGCGTCATGGCGCGAGCC;SOR=2.272;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=68;WE=45681568;WS=45681550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	45682876	rs75792246	C	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CGCGCGCTCGCTCCTGCAACT;SOR=0.995;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=33;WE=45682884;WS=45682866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr19	45716678	rs346740	G	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=37;PP=1099;SC=ACCCAACCCAGCCGTGGACCC;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=45716686;WS=45716668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	45769386	rs2240671	G	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=510;ReadPosRankSum=-0.726;SC=GTGCCTTGGGGAGGCCTGGGG;SOR=0.829;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=26;WE=45769394;WS=45769376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr19	45769575	rs2240672	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=647;ReadPosRankSum=0.031;SC=CAGGGACCACGGCTCAGCCCA;SOR=1.112;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=41;WE=45769583;WS=45769565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr19	45774680	rs12984234	A	G	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=802;ReadPosRankSum=0.769;SC=CGTCCATGAAAGGCTTTGGCC;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=50;WE=45774688;WS=45774670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr19	45781916	rs141826060	C	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=1.597;SC=GGATGGAGTGCAGTGGTGCAA;SOR=1.646;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=45781924;WS=45781906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr19	45801579	rs139000043	GGGTCTGTGCGT	G	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=2938;SC=GTGGATGTGAGGGTCTGTGCG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=45801597;WS=45801569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	45803008	rs73570398	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GAGGCAGTGGGTTGCGGGAGG;SOR=2.247;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=16;WE=45803016;WS=45802998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr19	45810035	rs4884	A	G	7852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=106;PP=2965;SC=TCATGTCGTCAATGGACTGGC;SOR=1.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=161;TCR=106;TR=267;WE=45810043;WS=45810025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr19	45814947	rs17875617	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=145;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGAGGAGGGCCGTTGCAGGAC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=7;WE=45814955;WS=45814938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	45815033	rs17875616	G	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=561;ReadPosRankSum=0.868;SC=CGGGCCAGTCGCGGGCCATGC;SOR=0.689;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=34;WE=45815041;WS=45815023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr19	45815248	rs10402747	T	C	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=33;PP=1049;SC=GCCCAGGGTTTCCCCTGCTGC;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=45815256;WS=45815238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	45818628	rs377993	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-1.969;SC=CCCTACTTTGAAAAGCGGGGG;SOR=0.078;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=45818636;WS=45818618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	45818835	rs1133190	A	G	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=901;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GCACGTAGTTAGGGTCCAGGT;SOR=0.906;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=58;WE=45818843;WS=45818825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
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chr19	45849690	rs12979984	G	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=9;PP=461;SC=AGAATCTGGGGGTGTCGTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=27;WE=45849698;WS=45849680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr19	45849909	rs9749618	A	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=33;PP=1529;SC=TGCGGGAGGAACTGGAGGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=45849917;WS=45849899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	45852950	.	A	AGGGTG	97.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.48;QD=48.68;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr19	45854503	rs143201119	CCCTCA	C	3730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=36;PP=2859;SC=TAACACTTGCCCCTCACCTCC;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=52;WE=45854515;WS=45854493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	45854919	rs13181	T	G	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=38;PP=1513;SC=TCTATCCTCTTCAGCGTCTCC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=45854927;WS=45854909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	45855060	rs1799790	C	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=469;SC=CAACCACCCCCCCGAATGGCC;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=45855068;WS=45855050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	45855524	rs1052555	G	A	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GGACACCCTCGTCCACGGTCA;SOR=0.626;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=60;WE=45855532;WS=45855514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr19	45856144	rs1799787	G	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=760;SC=AGCCTCACGCGACCCAGGATG;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=34;WE=45856152;WS=45856134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	45856468	rs238417	G	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=29;PP=1382;SC=CCACCTCCCCGACCCCTCTCC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=45856476;WS=45856458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	45865002	rs171140	C	A	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=71;PP=2965;SC=GTCTCCCCAGCCAATGAGCAC;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=153;WE=45865010;WS=45864992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	45865217	rs238403	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=289;SC=TTTGTTCAGATGGAGTCTTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=45865225;WS=45865207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	45867259	rs1799793	C	T	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=30;PP=1382;SC=AGCACTTCGTCGGGCAGCACG;SOR=0.908;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=66;WE=45867267;WS=45867249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	45868006	rs238405	A	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=592;SC=GACTCACAGCAAGCAACAGAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=45868014;WS=45867996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	45868038	rs1799786	G	A	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=5;PP=1094;SC=GACAGGAGACGGGCGGGCAGC;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=45868046;WS=45868028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	45868309	rs238406	T	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=53;PP=2030;SC=CCTCATAGAATCGGCAGTGGG;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=45868317;WS=45868299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	45868478	rs238407	T	A	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1208;SC=CTTCAAACCCTGGTCTCCACA;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=45868486;WS=45868468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	45872036	rs1799783	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=18;PP=910;SC=GGAGCTTGTGCTCATTGGAGG;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=45872044;WS=45872026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	45873942	rs3810366	G	C	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=40;PP=1311;SC=CGCTAGGGCAGAGCCAATCGG;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=45873950;WS=45873932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	45911319	rs11314106	CA	C	731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.13;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	45912489	rs35729377	CAAG	C	6393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=67;PP=2988;SC=CCACATCCACCAAGAAGAAGA;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=35;TCR=80;TR=97;WE=45912499;WS=45912479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	45912682	.	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=590;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGGGCCGCCACTGAATTCAGA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=36;WE=45912690;WS=45912672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr19	45912736	rs3212986	C	A	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=822;SC=GAAGCGGAAGCAGCAGCAGCA;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=45912744;WS=45912726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	45913086	rs3212985	C	G	299.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	45913093	rs1007616	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	45923496	rs3212955	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=562;SC=AGGCTTCTCATAGAACAGTCC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=45923504;WS=45923486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	45923653	rs11615	A	G	6666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=100;PP=2965;SC=CCCAGGGCACATTGCGCACGA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=109;TCR=100;TR=209;WE=45923661;WS=45923643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr19	45924362	rs3212948	G	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=231;SC=AGACCTCCTTGCACTGGAGTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=45924370;WS=45924352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	45971961	rs2282695	C	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=0.055;SC=CCACCGCCGCCGCCTCCCAGG;SOR=0.730;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=13;WE=45971969;WS=45971951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr19	45974593	rs2276469	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=768;SC=AGAGGGGATGTTGAGGGGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=45974601;WS=45974583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr19	46057081	rs3826860	A	G	6872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=101;PP=2965;SC=CGCCCAGCTCAGCTGCCGCCT;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=107;TCR=101;TR=208;WE=46057089;WS=46057071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
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chr19	46124564	rs146103183	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=942;ReadPosRankSum=1.267;SC=CTGCCACGGTGCGCACAGGGC;SOR=0.690;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=64;WE=46124572;WS=46124554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,74:0.51:145
chr19	46180150	rs4803846	A	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=11;PP=1447;SC=GCTGGGGGAGACTGGGAGACA;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=46180158;WS=46180140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr19	46204878	rs11083779	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TCTTAGACTCTGAGGGATTGA;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=46204886;WS=46204868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr19	46204938	rs4803847	C	T	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=11;PP=1753;SC=CTGGCATTCACTCTTGTTGGG;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=65;TCR=11;TR=76;WE=46204946;WS=46204928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	46205050	rs4803848	T	C	2835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=53;PP=1967;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TCGCCCCCACTTCCAGAGAAG;SOR=0.673;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=213;TCF=107;TCR=106;TR=113;WE=46205058;WS=46205040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,128:0.50:254
chr19	46214700	rs138545162	TA	T	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.180;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.713;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr19	46216642	rs11537711	G	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=-0.353;SC=CCAGGCTCAGGGCAGGCTGAT;SOR=0.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=22;WE=46216650;WS=46216632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr19	46238555	rs2041975	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=6;PP=276;SC=ATAGGGAAGATGAAGGGTGCC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=46238563;WS=46238545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	46248407	rs10404220	G	A	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=30;PP=1615;SC=TGTGGAATTCGTTTTGGATGT;SOR=1.313;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=81;WE=46248415;WS=46248397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	46258024	rs918164	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=768;SC=TTTCAGTAAGATGCCACTCTG;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=46258032;WS=46258014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	46260375	rs4802275	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=10;PP=786;SC=CCAAAGGGGCCCCATAGCAGT;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=46260383;WS=46260365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	46265029	rs8112282	C	T	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.14;NF=16;NR=52;PP=1532;SC=TCTCGCTGAGCGGGAACAGCA;SOR=1.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=46265037;WS=46265019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	46265047	rs139434566	A	ATCCAGC	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=810;SC=GCAAGGCGCCATCCAGCTCCA;SOR=1.519;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=13;WE=46265055;WS=46265037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	46269076	rs2014576	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=35;PP=1486;SC=GGGGAGAAGGGCAGGCTGGTG;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=46269084;WS=46269066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	46269313	rs2014377	G	C	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=54;PP=1554;SC=CCCTGCTGCAGGGCCACACCC;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=46269321;WS=46269303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	46274171	rs635299	A	C	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=3;PP=193;SC=GCGGGTGGCAAGGGGCGGGTG;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=46274179;WS=46274161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	46274392	rs2854300	G	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=0.892;SC=AGACAGCGAGGGGAATCGAGG;SOR=0.606;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=19;WE=46274400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr19	46274972	rs915915	A	C	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=66;PP=2830;SC=ACGAGAGGGGATGCCAAGGGT;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=141;WE=46274980;WS=46274962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	46275976	rs527221	G	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=602;ReadPosRankSum=0.408;SC=TCGGCCTCCAGTTCCATGGGT;SOR=1.027;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=35;WE=46275984;WS=46275966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr19	46276056	rs16939	C	A	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=520;SC=AATGCTGATTCTCTGGTGGAG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=46276064;WS=46276046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	46281745	rs1799894	A	G	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=7;PP=1003;SC=GCCATGCTGCACCCACCTGTG;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=46281753;WS=46281735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	46282503	rs572634	A	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=0.362;SC=CTTCCTAGTCACCCCGGCCCG;SOR=0.798;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=33;WE=46282511;WS=46282493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr19	46287200	rs617988	C	G	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=24;PP=1632;SC=GGCGGGGAGTCTCTCCCCAGG;SOR=1.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=46287208;WS=46287190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	46288706	rs3760843	A	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=265;SC=GAGGTCTTGTACTGAGACACT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=46288714;WS=46288696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	46289392	rs8110017	G	C	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=34;PP=1616;SC=GGGCCAGGGGGGGGTGCGGGT;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=46289400;WS=46289382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	46289509	rs11545326	G	A	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=48;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.119;SC=AGAGCGGGGCGCCCCCGGCCG;SOR=0.819;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=86;WE=46289517;WS=46289499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,95:0.52:182
chr19	46303628	rs28637549	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=323;ReadPosRankSum=1.080;SC=CCCACCCTGGCGAGTTGCCCA;SOR=0.843;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=26;WE=46303636;WS=46303618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr19	46305530	rs35653379	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=186;ReadPosRankSum=2.187;SC=GCCCTGGGGGTGGGGGGAAGC;SOR=0.627;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=15;WE=46305538;WS=46305520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr19	46313758	rs10402263	G	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=-0.412;SC=ACTGGATTGTGCAATGCTGTC;SOR=0.071;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=46313766;WS=46313748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr19	46313825	rs10407137	A	T	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=25;PP=1662;SC=GCCCCCACTGACCCTGATGCC;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=77;WE=46313833;WS=46313815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	46318963	rs3810331	C	A	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=27;PP=1063;SC=CTCCTGGTGACCGGGGAAGGA;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=46318971;WS=46318953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	46326200	rs12976060	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=545;SC=TGGGGAGCTGAGGGCAAGCTC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=46326208;WS=46326190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	46327053	rs7251942	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=824;ReadPosRankSum=2.518;SC=GCAGACATCTCGTGACCAGTG;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=57;WE=46327061;WS=46327043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr19	46327185	rs7252416	G	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=26;PP=830;SC=TTAGGGGAGGGTCAGGTGTTG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=46327193;WS=46327175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	46327209	rs11284049	CT	C	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=821;SC=GGCAGGGTGGCTTGCGGGGCA;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=46327217;WS=46327199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	46329438	rs7246155	G	A	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=4;PP=1078;SC=GGCCCAGAGCGCGGACACAGC;SOR=3.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=46329446;WS=46329428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr19	46332142	rs3826893	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=0.433;SC=GTGACGAAGAGGGAGGTGGTC;SOR=0.175;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=7;WE=46332150;WS=46332132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
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chr19	46367901	rs1363538	T	C	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=44;PP=1220;SC=CTTGGGCAGCTGAGGAACTGG;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=46367909;WS=46367891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr19	46387344	rs11550348	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=665;ReadPosRankSum=0.619;SC=CGCCCTGCATGAAGGCCCAGG;SOR=0.867;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=41;WE=46387352;WS=46387334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr19	46387503	rs3745926	T	C	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1336;ReadPosRankSum=1.767;SC=GGGTGTCTTCTAGCCGCTCCC;SOR=0.776;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=178;TCF=81;TCR=97;TR=83;WE=46387511;WS=46387493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,104:0.49:212
chr19	46394268	rs150220406	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.972;SC=CCCGGATGGCGTTGGCAGTCT;SOR=0.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=19;WE=46394276;WS=46394258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr19	46394322	rs114387602	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=1.616;SC=CTGAGGCCGAGAGCGTGGGTG;SOR=0.730;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=6;WE=46394330;WS=46394312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	46404579	rs10423899	A	G	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.259;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1170;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CGTAGCGCTGAGGGCAGGCGC;SOR=0.442;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=78;WE=46404587;WS=46404569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,90:0.49:184
chr19	46417429	rs66529687	G	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=746;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GGAGTTCTGGGGGCCAGAAAT;SOR=1.078;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=45;WE=46417437;WS=46417419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr19	46443739	rs28742045	T	G	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;ReadPosRankSum=-0.233;SC=AGCCGTAACTTGCCAGCGTGT;SOR=0.795;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=86;WE=46443747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,119:0.41:288
chr19	46443886	rs1047061	C	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=832;ReadPosRankSum=0.395;SC=CCGCGGCTGGCAGCACATCCG;SOR=0.503;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=45;WE=46443894;WS=46443876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr19	46464225	rs35514609	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr19	46506203	rs12608903	C	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=588;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TGAGGCCTGGCCTTCCAACTC;SOR=1.034;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=39;WE=46506211;WS=46506193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr19	46511548	rs2287305	T	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=11;NR=29;PP=820;SC=AGATCTGGCATCTGCGGGAGC;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=46511556;WS=46511538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr19	46520069	rs144277506	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=290;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CCCCTAACCGCTCCCGAAACC;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=22;WE=46520077;WS=46520059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr19	46520506	rs61742389	G	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.966;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=0.212;SC=TTTTCTCAGGGGTCACCGCCG;SOR=1.572;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=21;WE=46520514;WS=46520496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr19	46525867	rs2072561	T	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=-1.887;SC=TGAGGTTCAGTAAGCTGCTCA;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=46525875;WS=46525857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr19	46526298	rs2072562	T	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=26;PP=760;SC=GGCGGCAGGGTCCGGGAGACC;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=46526306;WS=46526288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	46543249	rs756401	T	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=43;PP=1129;SC=GTAGCAGCAGTGGCGGGGAAG;SOR=2.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=46543257;WS=46543239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	46543566	rs17271272	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=783;ReadPosRankSum=0.499;SC=GCCGCAGAGCCGGGTCTGGTT;SOR=0.561;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=45;WE=46543574;WS=46543556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr19	46627592	rs2287307	G	A	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=62;PP=2012;SC=AGGGAGAAAGGAAAAAGGTTG;SOR=1.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=46627600;WS=46627582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	46640551	rs1990765	C	A	10290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=149;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.028;SC=ACACCACATGCAATATTATCT;SOR=0.278;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=174;TCR=149;TR=321;WE=46640563;WS=46640541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,369:1.00:370
chr19	46652396	rs138711585	TCTCTCTCTCTCC	T	321.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=40.22;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr19	46814003	rs79263603	C	G	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=49;PP=1704;SC=TTATTGTCATCATTACTTTTT;SOR=1.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=46814011;WS=46813993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	46815297	rs8101216	T	C	4658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=64;PP=2917;SC=TTCTCTCGGTTACAATCCTTC;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=46815318;WS=46815287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	46815310	rs12461322	G	A	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=67;PP=2965;SC=AATCCTTCTCGACATCTTGCT;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=152;WE=46815318;WS=46815287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	46815499	rs8101480	T	C	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=80;PP=2725;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TGGACTCCGATGCGGTCAGCA;SOR=0.245;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=164;WE=46815507;WS=46815489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr19	46815703	rs66668057	ATATT	A	3620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=2184;SC=CAGTCCCCAGATATTTCTCTC;SOR=0.718;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=39;WE=46815719;WS=46815693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	46815711	rs116478928	C	T	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=36;NR=31;PP=1256;SC=AGATATTTCTCTCCCCATTTG;SOR=0.741;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=67;WE=46815719;WS=46815693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	46823702	rs3764609	A	G	5208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TACCCCAGCCAGGTGGAAGAG;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=170;WE=46823710;WS=46823692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,197:0.99:199
chr19	46823751	rs3764610	C	T	5673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=104;PP=2965;SC=CGGAGCAACACTCTCGCAGAC;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=73;TCR=104;TR=177;WE=46823759;WS=46823741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	46834683	rs11665853	A	G	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=178;SC=CTGATCTTCTAGTTTCACTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=46834691;WS=46834673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	46857257	rs41275764	G	A	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=22;PP=685;SC=GTGAGCTGGGGAGTGGGCCAG;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=46857265;WS=46857247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	46878989	rs4239538	G	A	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=52;PP=1518;SC=TGGTGGACTCGCTGGACATCG;SOR=1.580;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=78;WE=46878997;WS=46878979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	46887007	rs1024781	G	C	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=36;PP=1957;SC=CTCTCGGCCCGTCCCTCTCCG;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=46887015;WS=46886997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	46887199	rs4803937	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=635;SC=TCAGGTCTGCACAGAGTGGGA;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=46887207;WS=46887189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	46892111	rs759290	C	T	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.46;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	46892118	rs3815505	C	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.43;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	46892168	rs8106745	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=311;SC=AGCCTGTGAGTGCTGACCAGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=46892176;WS=46892158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	46893238	rs759291	A	C	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=26;PP=1105;SC=TTGCCCAGCCATTCCTTCTCT;SOR=0.871;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=58;WE=46893246;WS=46893228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	46893465	rs2311213	A	G	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=33;PP=1500;SC=GGTAAGGGGCAGGGGTAGGTT;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=46893473;WS=46893455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	46971773	rs45575940	T	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=544;ReadPosRankSum=-1.418;SC=GACTTGGTACTTCTTCCTTGT;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=38;WE=46971781;WS=46971763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr19	46973981	rs4803960	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=718;ReadPosRankSum=0.627;SC=TTAAAAACTCGGCATCCTGGG;SOR=0.784;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=48;WE=46973989;WS=46973971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr19	46974233	rs3826851	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=885;ReadPosRankSum=-0.223;SC=ACCTGTGGATGTCCACTTCCA;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=93;TCR=96;TR=74;WE=46974241;WS=46974223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,87:0.38:231
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chr19	46974307	rs3826852	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=2662;ReadPosRankSum=0.649;SC=CGGCTCTGAACCTACTATGTG;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=72;WE=46974315;WS=46974296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,82:0.63:130
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chr19	46997016	rs147338403	C	CCGGCCT	864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=662;ReadPosRankSum=0.788;SC=GAGTGACGCCCCGGCCTCGGC;SOR=0.462;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=11;WE=46997024;WS=46997006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
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chr19	46998236	rs4803967	C	T	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1546;ReadPosRankSum=-1.190;SC=TTTCTGCGACCCCGACGGCCC;SOR=0.583;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=91;WE=46998244;WS=46998226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,108:0.48:226
chr19	47023025	.	G	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
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chr19	47104310	rs17551870	TGG	T	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.49;MQRankSum=1.610;NF=0;NR=14;PP=442;ReadPosRankSum=-2.719;SC=GAAAGTGAAGTGGGCCCGGGA;SOR=0.520;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=14;WE=47104319;WS=47104300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr19	47105585	rs35630463	A	AT	1686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.070;NF=7;NR=38;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GAAAGACAGAATTTTTTTAAC;SOR=0.880;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=102;TCF=20;TCR=82;TR=45;WE=47105593;WS=47105575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
chr19	47105716	rs73056645	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.171;SC=TGGCAGTCAGGGGGGCCTAGG;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=13;WE=47105724;WS=47105706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr19	47109011	rs3729510	T	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=765;SC=GGGCCGAGGGTCTGGGCTGAG;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=47109019;WS=47109001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	47111663	rs3729760	T	C	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=62;PP=2965;SC=AGGGAGCCTCTCTCAGGGTGA;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=47111671;WS=47111653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	47112648	rs10113	T	C	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=60;PP=1239;ReadPosRankSum=-1.330;SC=CTTCCATCCATGTCTTCCAAG;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=80;TCR=126;TR=98;WE=47112656;WS=47112638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,115:0.48:239
chr19	47112740	rs710889	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=309;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TGGCTCTCCTCCATTTTGGTT;SOR=0.501;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=19;WE=47112748;WS=47112730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr19	47124714	rs2229129	T	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=482;ReadPosRankSum=0.667;SC=CCCTCCTCCCTGAGGCGAGCT;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=35;WE=47124722;WS=47124704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr19	47126614	rs12459883	C	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=482;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CACGATGTCTCACCTCTTTTG;SOR=0.389;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=32;WE=47126622;WS=47126604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr19	47127324	rs2229128	C	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=647;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CCAGTCCGGTCACCAGCACCG;SOR=0.439;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=39;WE=47127332;WS=47127314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr19	47137162	rs1005774	C	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	47137459	rs12974613	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.799;NF=11;NR=26;PP=501;ReadPosRankSum=0.994;SC=CTGCCTGCGACACCTGCGAGC;SOR=0.545;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=37;WE=47137467;WS=47137449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,39:0.40:97
chr19	47137481	rs3833245	GAT	G	1585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.870;NF=1;NR=33;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CCCGGGTGGAGATGTCACCGC;SOR=1.444;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=34;WE=47137490;WS=47137471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr19	47138014	rs3745623	C	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr19	47177913	rs314665	A	G	7262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=104;PP=2965;SC=CTCCCAGCGCACGTCGTCACT;SOR=0.858;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=119;TCR=104;TR=222;WE=47177921;WS=47177903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr19	47193850	rs314671	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=210;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGCGGCCTGGTGGTTACCTGC;SOR=0.369;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=16;WE=47193858;WS=47193840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr19	47228985	rs313844	G	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr19	47228990	rs3848529	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr19	47548327	rs10423289	A	T	171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr19	47549962	rs73566538	G	A	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=43;PP=1468;SC=AGGGGGACATGGGGGGATTAA;SOR=1.310;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=67;WE=47549970;WS=47549952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr19	47700542	rs117605411	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=582;ReadPosRankSum=0.827;SC=CTGATACATATGAGGAAGATT;SOR=1.005;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=43;WE=47700550;WS=47700532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr19	47761646	rs12985905	G	C	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=49;PP=2036;SC=TTGGCTCCACGCAGCCAGCGA;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=47761654;WS=47761636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	47823038	rs4467185	G	A	5560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=57;PP=2965;SC=TTCCCCTTAGGACTCCTTCAA;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=94;TCR=57;TR=151;WE=47823046;WS=47823028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
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chr19	47823484	rs4804049	T	C	4980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=78;PP=2965;SC=TCCGAGGGGCTGGCTTGGCCT;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=159;WE=47823492;WS=47823474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
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chr19	47885180	rs889167	A	G	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=30;PP=2341;SC=ATTTGGGTGCAGGTAGACCTG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=91;TCR=30;TR=121;WE=47885188;WS=47885170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	47916598	rs11673488	C	T	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.09;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	47922426	rs62130535	G	A	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=247;SC=CTGACGGCCCGCGGTGTTGAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=47922434;WS=47922416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	47933190	rs142312177	A	AG	1003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=8;PP=839;SC=GACACAGAACAGGGCAATCAA;SOR=1.839;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=47933198;WS=47933180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	47933728	rs8104926	A	G	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=34;PP=963;SC=CGTGTCTGCGAGGCAGAGACA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=47933736;WS=47933718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	47935352	rs4801722	T	C	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=14;PP=1449;SC=CACCTCATTTTGGCAGGATCC;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=65;WE=47935360;WS=47935342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	47944710	rs2254560	T	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=591;SC=GTGCAGGGGGTAAGGGGGAGG;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=47944718;WS=47944700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	47980153	rs2293424	G	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=23;PP=870;SC=GGTCACTGCCGGGCAGGAGAA;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=47980161;WS=47980143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	48182522	rs56106931	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=273;ReadPosRankSum=1.586;SC=GCTGTGGCCTAAGCGTAGCCC;SOR=0.420;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=17;WE=48182530;WS=48182512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr19	48182568	rs2911005	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=489;ReadPosRankSum=1.590;SC=CCACCTTTCCCGGCCTGCAGC;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=33;WE=48182576;WS=48182558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr19	48182787	rs4802382	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=0.154;SC=CGCTGGAGGCCGAGGCTGAGC;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=14;WE=48182795;WS=48182777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr19	48182946	rs2911006	T	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=227;ReadPosRankSum=-0.144;SC=AGGGCCCGCCTACCGTGCTGA;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=17;WE=48182954;WS=48182936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr19	48183114	rs2914438	A	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CGGCGGCCACACTGGGCCTGG;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=24;WE=48183122;WS=48183104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr19	48183771	rs1035938	C	T	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=1677;ReadPosRankSum=0.011;SC=AACCCATGAGCGTCCACCTCC;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=275;TCF=126;TCR=149;TR=120;WE=48183779;WS=48183761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,152:0.45:341
chr19	48184474	rs3745762	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=604;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGGGCAGCCGCCCTCTGCCAC;SOR=0.388;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=45;WE=48184482;WS=48184464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr19	48184642	rs58014830	TG	T	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=0.124;SC=CTGTGGCAGCTGGGGGGGGAA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=48184650;WS=48184632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	48198675	rs13346368	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=329;ReadPosRankSum=-0.934;SC=CAACCTCCCGACCCTGAATGT;SOR=1.795;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=17;WE=48198683;WS=48198665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr19	48198817	rs2241612	T	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=457;ReadPosRankSum=0.948;SC=AGGGAGACACTGGAAGACGCG;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=23;WE=48198825;WS=48198807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr19	48202125	rs7248050	C	G	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=29;PP=2275;SC=AGCCGCAGGTCCACGGTGCGC;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=48202133;WS=48202115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	48205725	rs3745760	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=80;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GCCGGGACAGTCGGGTGTCCG;SOR=0.485;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=9;WE=48205733;WS=48205715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	48239574	rs371335701	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=378;ReadPosRankSum=0.542;SC=TGTGTTTTAACAAGCTCCCTG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=19;WE=48239582;WS=48239564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr19	48244045	rs34197064	C	CT	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.279;NF=6;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=-1.281;SC=CAGCTACCCCCGAGCTTCTCC;SOR=0.037;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=48244053;WS=48244035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	48244194	rs7255434	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=799;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CGAAGCTGCTAGAGGCACTGG;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=49;WE=48244202;WS=48244184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr19	48244401	rs35910701	G	A	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=47;PP=1805;ReadPosRankSum=0.399;SC=TGGTGACCAAGGACAAGTCCA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=118;TCR=96;TR=105;WE=48244409;WS=48244391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,119:0.49:242
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chr19	48244692	rs3833256	C	CG	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.931;NF=1;NR=11;PP=350;ReadPosRankSum=-1.414;SC=CCGAGTGAGCCGGCCCCCCTC;SOR=1.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=48244700;WS=48244682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
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chr19	48254707	rs113310396	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=280;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TGTGGAGGGATTGGGGGGGAG;SOR=0.864;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=24;WE=48254715;WS=48254697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr19	48255804	rs1042558	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=410;ReadPosRankSum=-0.008;SC=CGTCCCAGGCACCCGCCGTGG;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=30;WE=48255812;WS=48255794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr19	48258551	rs10406879	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=326;ReadPosRankSum=0.616;SC=AGAGAGAAGGTCTCCCTGTGT;SOR=0.855;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=27;WE=48258559;WS=48258541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr19	48258578	rs10405135	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=290;ReadPosRankSum=0.726;SC=CACCGGCCTGAGCCCTGACCC;SOR=0.839;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=26;WE=48258586;WS=48258568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr19	48258717	rs1804994	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=0.475;SC=GCGCGGCGGCAGAGGCGGCGG;SOR=0.622;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=15;WE=48258725;WS=48258707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr19	48258772	rs11083895	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5254;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.768;SC=GAAGGCTGGGGCGGCTCAAGT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=48258780;WS=48258762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr19	48258826	rs10411523	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr19	48259220	rs8105677	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-2.503;SC=GCTGAGGGCACGGGATGCTGG;SOR=0.377;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=20;WE=48259228;WS=48259210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr19	48260079	rs889142	T	C	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=584;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CAGGGCCCCTTCCAGAGTGTG;SOR=0.307;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=33;WE=48260087;WS=48260069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr19	48282077	rs111841672	C	CGCAGCGG	1866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.324;NF=6;NR=21;PP=1514;ReadPosRankSum=2.890;SC=TATTGGTAAGCCCAGCGGCCA;SOR=0.884;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=27;WE=48282085;WS=48282067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr19	48282172	rs1862485	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=1.402;SC=ATGGGAGCCCTTGTATGGGAA;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=23;WE=48282185;WS=48282162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr19	48321645	.	C	CTCCA	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.147;NF=14;NR=0;PP=723;ReadPosRankSum=-1.369;SC=CCATCCATCCCTCCATCCATC;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=14;WE=48321653;WS=48321639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	48382226	rs11083904	G	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=760;ReadPosRankSum=0.873;SC=GCGGGATGGAGGGAATTTAAG;SOR=0.486;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=41;WE=48382234;WS=48382216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr19	48382480	rs2547238	G	C	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=66;PP=1671;ReadPosRankSum=0.395;SC=GCTTGTTAACGTATGATTGAC;SOR=0.849;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=195;TCF=74;TCR=121;TR=104;WE=48382488;WS=48382470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,117:0.52:224
chr19	48389425	rs11083907	A	G	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=66;PP=2965;SC=CCCTTATCACAAACTCATCAC;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=143;WE=48389433;WS=48389415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	48495128	rs11671612	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.425;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr19	48511854	rs12977319	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=420;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CTAGGAGGTAATGGGAAGAGG;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=23;WE=48511862;WS=48511844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr19	48512010	rs34842242	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=995;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GACACTCAAAGCAACAGGGAG;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=61;WE=48512018;WS=48512000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,68:0.50:135
chr19	48517341	rs62129077	T	C	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1250;ReadPosRankSum=0.256;SC=CGGACATTCATATTAAAGCAA;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=92;TCR=42;TR=72;WE=48517349;WS=48517331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,94:0.56:169
chr19	48517538	rs62129078	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CGTGTACAACGGCCAGTGGAA;SOR=0.519;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=28;WE=48517546;WS=48517528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr19	48519158	rs34129198	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AGATTACCCACGCTGTATCTT;SOR=0.777;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=27;WE=48519166;WS=48519148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr19	48519205	rs34647554	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=3.081;SC=ATAACAGCTGCATCTCCCAGG;SOR=0.521;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=18;WE=48519213;WS=48519195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr19	48519244	rs35792818	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=-1.706;SC=TGTGGTGCTCAGTCACCTCTG;SOR=0.387;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=13;WE=48519252;WS=48519234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr19	48522869	rs3815908	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=1.242;SC=GAATCCAATGTGACGTTGCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=48522890;WS=48522859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	48522882	rs10422382	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=2.100;SC=CGTTGCCTTTAATGGGATAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=48522890;WS=48522859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	48523128	rs35362679	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=274;ReadPosRankSum=-1.414;SC=TTTCTGTGCCGACACCAGTAA;SOR=1.718;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=16;WE=48523136;WS=48523118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr19	48523197	rs2303691	C	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GCTCAACAAACACCTCCTGAA;SOR=1.371;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=48523205;WS=48523187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	48525507	rs2303690	G	A	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=67;PP=2965;SC=CTGCACTAACGAAGGATCAAA;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=146;WE=48525515;WS=48525497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	48525694	rs114249913	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TTTTTCAAGCGTGTCTGATTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=48525702;WS=48525684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr19	48533700	rs77128495	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=1.492;SC=CCCTCCCTCCCGCCTGCCCTC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=48533708;WS=48533690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr19	48533727	rs1171097	G	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=728;ReadPosRankSum=-1.433;SC=TGCTTTAAGGGGATCTGGGGC;SOR=0.133;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=14;WE=48533749;WS=48533717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr19	48533741	rs35341698	T	G	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=1108;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTGGGGCTTTTGGGCTTTGGT;SOR=0.570;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=28;WE=48533749;WS=48533717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr19	48533856	rs35063174	A	G	3758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=58;PP=2235;ReadPosRankSum=3.589;SC=AGAAAAAAAAAAATCCCCAGT;SOR=0.861;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=252;TCF=138;TCR=114;TR=133;WE=48533864;WS=48533837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,167:0.56:296
chr19	48537585	rs3745746	A	G	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=70;PP=2693;SC=CTGTAGCTCCACCAGGGTGAT;SOR=0.857;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=131;WE=48537593;WS=48537575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	48537777	rs35163057	GT	G	262.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.79;QD=23.88;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	48542349	rs5828329	GA	G	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.385;NF=7;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.674;SC=ACCATGGCTGGAAAAAAAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=48542357;WS=48542345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	48543862	rs8105198	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=-2.132;SC=CTGGACTCACGGTTCATGCGG;SOR=0.141;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=14;WE=48543870;WS=48543852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr19	48543906	rs34862923	G	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=631;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TTCCATCTCCGTGGGCATGTA;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=37;WE=48543914;WS=48543896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr19	48543923	rs12982629	C	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=337;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGTAACCCATCGTCCTCATGA;SOR=0.674;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=21;WE=48543931;WS=48543913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr19	48544120	rs139505728	AGAAACAAAAC	A	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.736;NF=0;NR=5;PP=1531;ReadPosRankSum=0.139;SC=AGCGTACATTAGAAACAAAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=48544137;WS=48544110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	48544753	rs3745745	G	A	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=25;PP=1130;SC=GAATTTATACGGAAATGCACA;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=48544761;WS=48544743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	48544948	rs74807006	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CTCCTCCCCACGCTCTCGTGG;SOR=1.127;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=15;WE=48544956;WS=48544938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr19	48551546	rs9226	A	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CCAGGTGGACATCAGGGCCCT;SOR=0.037;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=48551554;WS=48551536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	48558003	rs744399	A	C	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=169;SC=GAGGCCTCTCAATCCATGCTG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=48558011;WS=48557993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	48558286	rs2307281	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GGCGGCAGTAGTCAGTGGTAG;SOR=1.387;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=13;WE=48558294;WS=48558276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr19	48558342	rs3217328	TCTCCAGAAGACCC	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=854;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTGCAAGACCTCTCCAGAAGA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=48558362;WS=48558332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr19	48565468	rs4802425	G	T	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=39;PP=1171;SC=GCAAGACTTGGAAATGGAAGG;SOR=1.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=48565476;WS=48565458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	48581253	rs1019785	C	G	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr19	48598916	rs156632	A	G	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=810;SC=GGAATGTAGCAGGTATGCAGG;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=48598924;WS=48598906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr19	48601454	rs251684	T	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=683;ReadPosRankSum=0.619;SC=CTGCAAATATTGGGTAGGGTA;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=47;WE=48601462;WS=48601444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr19	48601528	rs251683	G	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.263;NF=16;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=0.951;SC=TTTGGGAGAAGGTGCCAAGAC;SOR=0.864;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=39;WE=48601536;WS=48601518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,42:0.39:107
chr19	48601593	rs11432234	A	AT	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.071;NF=0;NR=11;PP=159;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CGTAGGCCACATTTTTTTTTA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=48601601;WS=48601583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr19	48602948	rs2303744	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=215;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TGCTTAGAGATAACCATGTAG;SOR=0.330;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=19;WE=48602956;WS=48602938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr19	48613788	rs138501838	T	TGCTCCGGAATCCGGTGCGGAGGCTTGG,TGCTTGG	582.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.244;NF=2;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=-1.891;SC=GTGGAGCTTGTGCTCCGGAAT;SOR=1.447;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=3;WE=48613796;WS=48613778;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:20
chr19	48619154	rs35100567	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=589;ReadPosRankSum=0.936;SC=TGGCCTGCTCCGGCTGCTTGT;SOR=0.606;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=42;WE=48619162;WS=48619144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr19	48621036	rs13436	C	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=474;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCAGCACCAGCGCCTGCAGTG;SOR=0.890;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=35;WE=48621044;WS=48621026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr19	48622427	rs20581	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=320;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CCAGCTCCTCATCACTGAAGC;SOR=0.965;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=25;WE=48622435;WS=48622417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr19	48622483	rs156647	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=627;ReadPosRankSum=-0.268;SC=AGGCTCAGCCAGCCACAGGCC;SOR=1.180;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=42;WE=48622491;WS=48622473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr19	48624625	rs153023	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=-0.209;SC=GCGCCCAAGGCGGGGCCCTCA;SOR=0.473;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=27;WE=48624633;WS=48624615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr19	48630700	rs61230848	GCC	G	840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=0.497;SC=TCTCCCTCTCGCCCCACCTAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=19;WE=48630709;WS=48630690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr19	48631408	rs156641	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CAGGTGCACACAGATGCTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=16;WE=48631416;WS=48631398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	48631459	.	TGA	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr19	48634319	rs392891	T	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=327;ReadPosRankSum=0.266;SC=TGCAAGTGTGTGGCAGACGCC;SOR=0.382;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=25;WE=48634327;WS=48634309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr19	48636534	rs2288883	T	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=188;ReadPosRankSum=1.004;SC=CCCCCGGCCTTCCTTCCAGGT;SOR=0.773;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=12;WE=48636542;WS=48636524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr19	48639235	rs2288882	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	48639472	rs3730976	T	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=421;ReadPosRankSum=0.167;SC=CCTTGATGTATGTAGACCCTC;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=41;WE=48639480;WS=48639462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr19	48646732	rs3730938	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AAGGCAGCACAGACCGCCATG;SOR=0.260;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=48646740;WS=48646722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr19	48646883	rs2288878	T	C	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=816;ReadPosRankSum=0.743;SC=GACGCAAGAGTGACAGTGGTG;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=67;WE=48646891;WS=48646873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,79:0.50:158
chr19	48646993	rs415465	C	T	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=77;PP=2606;SC=CCCAGGGCTGCCTCTCTGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=125;WE=48647001;WS=48646983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	48654553	rs20580	G	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=625;ReadPosRankSum=1.552;SC=CCTTCTCTGTGGCCACTTCAG;SOR=0.485;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=48;WE=48654561;WS=48654543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr19	48660243	rs3730867	GAAGGGGCA	G	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.255;NF=4;NR=5;PP=407;ReadPosRankSum=1.065;SC=GCAGGCGACTGAAGGGGCAGG;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=9;WE=48660258;WS=48660233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr19	48660445	rs274862	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=1.985;SC=AAGGAGGGACTCCATTTTCCA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=10;WE=48660453;WS=48660435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr19	48664798	rs3730862	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=678;ReadPosRankSum=0.906;SC=GTAAAGGGGCGACTACAGCAG;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=38;WE=48664806;WS=48664788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr19	48668709	rs3730850	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=272;ReadPosRankSum=0.055;SC=CTAACGTAAGAGTTTTTGTTT;SOR=0.193;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=20;WE=48668717;WS=48668699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr19	48668795	rs3730849	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=928;ReadPosRankSum=0.189;SC=AGGGGCAAGGGAGGGTGCTCA;SOR=0.570;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=55;WE=48668803;WS=48668785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr19	48673458	rs3730840	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=884;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CGCACCCGCCGCCCTCCGCCT;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=64;WE=48673466;WS=48673448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,82:0.43:190
chr19	48692832	rs10418095	C	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.74;ReadPosRankSum=-3.698;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	48693928	rs57930203	C	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-1.885;SC=TCTTGGCAAGCGGCAAAAGAT;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=16;WE=48693936;WS=48693918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr19	48695381	rs409135	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=1.002;SC=TTTTATATTTATTTATCCTTG;SOR=1.123;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=17;WE=48695389;WS=48695371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr19	48697808	rs34897645	TGG	T	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=6;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-0.353;SC=AATGAATGGGTGGTCCCATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=48697817;WS=48697807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	48697961	rs12973411	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=815;ReadPosRankSum=2.450;SC=GGTGTTCTTCCTGACGTCGCG;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=54;WE=48697969;WS=48697951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,77:0.58:132
chr19	48707581	rs1965759	G	A	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	48707581	.	GTG	ATA	2448	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=23;NR=36;PP=2448;QD=42.3977605909;SC=GATGGAGGGTGTGCCGGAGGA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=59;WE=48707591;WS=48707571;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr19	48707583	rs1965758	G	A	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	48709635	rs8110489	G	A	8256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=107;PP=2965;SC=TTCAGGAAGCGCCTACCGTAT;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=254;TCF=146;TCR=108;TR=253;WE=48709643;WS=48709625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr19	48715153	rs3745718	T	C	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=71;PP=2474;SC=CCTCATTGTCTTGGAGATCAT;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=131;WE=48715161;WS=48715143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	48715269	rs2008521	T	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=26;PP=787;SC=TTGAGAATCGTTCACTTACAG;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=48715277;WS=48715259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	48722180	rs10500299	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=806;ReadPosRankSum=0.285;SC=TTTCAGTAATCTCAAGTTGAA;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=49;WE=48722188;WS=48722170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,60:0.41:146
chr19	48735287	rs4802448	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=-0.563;SC=ATTCCATAAGACTTTCTGGGA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=17;WE=48735295;WS=48735277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr19	48736706	rs4802449	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=748;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CGCTTTTCTCGGAAGGATTCT;SOR=1.220;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=110;TCF=41;TCR=69;TR=42;WE=48736714;WS=48736696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,49:0.39:125
chr19	48737551	rs2288877	T	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=539;ReadPosRankSum=-0.867;SC=AGCTCATTCATTCTCCCCTGA;SOR=0.743;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=31;WE=48737559;WS=48737541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr19	48737764	rs2288876	A	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1194;ReadPosRankSum=1.032;SC=AGATGTCACAAAGGGTCTCAG;SOR=0.969;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=158;TCF=55;TCR=103;TR=68;WE=48737772;WS=48737754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,78:0.42:185
chr19	48744164	rs11670259	C	T	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1333;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGAACTATAACGAAACACAGA;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=92;WE=48744172;WS=48744154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,116:0.48:240
chr19	48744345	rs16981853	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=1.025;SC=GGAGGTTGTATTTAGGTACTT;SOR=0.250;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=18;WE=48744353;WS=48744335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr19	48788904	rs140236127	GGAAAGAAA	G	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=8.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.312;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr19	48800338	rs7252988	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=844;ReadPosRankSum=1.701;SC=CGCTCGAATCAGACGCTGTGC;SOR=0.765;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=60;WE=48800346;WS=48800328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,69:0.51:135
chr19	48800751	rs61747754	C	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=603;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TGGCGCTGCGCCTCCGCCTGC;SOR=0.829;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=38;WE=48800759;WS=48800741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr19	48800791	rs2292113	A	G	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=816;ReadPosRankSum=0.789;SC=GGGAAGGTGAACTGGGCCCCG;SOR=0.682;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=46;WE=48800799;WS=48800781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
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chr19	48821896	rs73047547	C	A	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1143;ReadPosRankSum=1.110;SC=TCACTAAAGGCAGGACCCAGG;SOR=0.509;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=76;WE=48821904;WS=48821886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,91:0.49:186
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chr19	48830286	rs10415654	T	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
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chr19	48836673	rs3826828	G	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=529;ReadPosRankSum=0.731;SC=ACCTCCGACCGGAGCCACCTG;SOR=0.745;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=29;WE=48836681;WS=48836663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr19	48848708	rs112116754	T	TTTAC	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.843;NF=0;NR=11;PP=301;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTTTCATTTATTTATTTATTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=48848716;WS=48848698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr19	48863386	rs438767	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=732;ReadPosRankSum=0.716;SC=CCACGTGGGCCGAGAACGCCT;SOR=0.904;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=42;WE=48863394;WS=48863376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr19	48866457	rs73049222	G	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=1.383;SC=GGAGGCGCCAGGGCAGCTCTC;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=48866465;WS=48866447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	48866482	rs3826824	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=335;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GCAACTAGGGCCCTGCCGCCG;SOR=0.877;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=48866490;WS=48866472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr19	48869178	rs919804	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=750;ReadPosRankSum=0.101;SC=GACCATCACGCGGGTCTTCGA;SOR=0.898;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=54;WE=48869186;WS=48869168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,68:0.53:129
chr19	48876661	rs2569713	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=601;ReadPosRankSum=2.121;SC=AAAGAGGGAGAGGTCCAGACG;SOR=0.735;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=34;WE=48876669;WS=48876651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr19	48893675	rs276701	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=323;ReadPosRankSum=1.183;SC=GGGGTGGAGCCTCTACCTTCA;SOR=0.782;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=24;WE=48893683;WS=48893665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr19	48908631	rs34833452	AG	A	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=572;ReadPosRankSum=0.288;SC=CTGGAATGGGAGGGGTGTGGG;SOR=0.375;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=18;WE=48908639;WS=48908621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr19	48918157	rs3786746	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.407;SC=AAAAGCGCTGCTGCAAGGGTT;SOR=0.776;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=65;WE=48918165;WS=48918147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,70:0.49:142
chr19	48922772	rs11302654	CT	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=0.705;SC=GTAGTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.897;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=12;WE=48922780;WS=48922762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr19	48945880	rs62130268	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=79;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GCTGCAGCGCTGAGGCCGCCC;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=48945888;WS=48945870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	48946325	rs111420822	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	48949286	rs1643487	G	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AGGGTCGGCGGCGCACGTGTG;SOR=0.053;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=19;WE=48949294;WS=48949276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr19	48949766	rs929743	C	G	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1118;ReadPosRankSum=2.207;SC=ACAGGTAAGACCCGAGGCTTT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=64;WE=48949774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr19	48954571	rs1799274	A	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.295;SC=TCCTCCTTGAATAGTTTTACA;SOR=0.818;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=48954579;WS=48954561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr19	48977019	rs1799258	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=370;ReadPosRankSum=-0.337;SC=ATTGGTGAGACTGGATCATGT;SOR=0.487;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=25;WE=48977027;WS=48977009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr19	49090368	rs34482710	T	TA	722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=6;PP=514;SC=GACTCTGTCTTAAAAAAAAAT;SOR=2.387;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=24;WE=49090376;WS=49090358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	49096065	rs2302948	C	T	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=0.297;SC=CTACGAGGAGCTGCAGCAGGT;SOR=0.872;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=48;WE=49096073;WS=49096055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,60:0.41:147
chr19	49096161	rs16982163	C	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GTCTCAGGACCCCTCCGCTTC;SOR=3.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=49096169;WS=49096151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	49102782	rs10410524	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-1.505;SC=TCAGAGTCCCGCCCAGAGGCA;SOR=0.437;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=49102790;WS=49102772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	49113919	rs10853802	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TCACAGGACCCCCTGGCCCGG;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=14;WE=49113927;WS=49113909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr19	49114236	rs454715	T	G	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=18;PP=471;SC=AAAGTTCAGGTGGGCTAAAGG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=49114244;WS=49114226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	49116076	rs2617801	C	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=220;SC=TAGGGGTGTGCGCTTGCAAGT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=49116084;WS=49116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	49116134	rs2617800	T	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=556;SC=CCCAGTCTGGTGAATGGACAC;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=49116142;WS=49116124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	49116555	rs368654	A	G	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1213;SC=CGGAATATAGAAAGCCGGGGC;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=49116563;WS=49116545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	49141406	rs137896889	AAGAC	A	2392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=29;PP=1783;SC=CATCCACTGTAAGACAGAGAA;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=49141417;WS=49141396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	49141532	rs3848543	T	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=7;PP=173;SC=CAGAATGTACTAGGTCGAGAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=49141540;WS=49141522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	49143025	rs2303147	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=25;PP=1296;SC=TCCCTCCCTCTGAATCTCGCC;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=49143033;WS=49143015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	49148781	rs10426317	C	T	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=73;PP=2678;SC=TCCCCACCTCCACCCTCCCTC;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=137;WE=49148789;WS=49148771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	49164952	rs281392	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=674;ReadPosRankSum=-1.513;SC=CCGGCCTGGGACTGGGTGTGG;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=40;WE=49164960;WS=49164942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr19	49166875	rs371690	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=0.668;SC=CCATCCCTCCGTTCCATCTTG;SOR=0.116;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=18;WE=49166883;WS=49166865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr19	49168005	rs17851884	G	A	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1077;ReadPosRankSum=1.924;SC=AGCGTCGGGCGTGCTGGTTGC;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=73;WE=49168013;WS=49167995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,91:0.61:149
chr19	49168182	rs373002	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTATCTTTTTTTTTTGAGAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=49168190;WS=49168172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	49183705	rs3826846	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.192;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1130;ReadPosRankSum=0.323;SC=CGCTGTGTCCGCCTCACGGGC;SOR=0.889;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=69;WE=49183713;WS=49183695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,86:0.57:152
chr19	49206108	rs679574	C	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=-1.627;SC=AGTAGAAGCACACACACACCC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=14;WE=49206116;WS=49206098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr19	49206145	rs516316	G	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=514;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CCACCGCATGGCCACGTTCAC;SOR=0.853;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=27;WE=49206153;WS=49206135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr19	49206172	rs516246	C	T	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=791;ReadPosRankSum=1.615;SC=CCCGGGCCTCCATCTCCCAGC;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=44;WE=49206180;WS=49206162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr19	49206417	rs492602	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=876;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CGATCAATGCAATAGGCCGCC;SOR=0.438;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=54;WE=49206425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr19	49206462	rs681343	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.118;NF=18;NR=19;PP=662;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CCACACTGTACGCCCTGGCCA;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=37;WE=49206470;WS=49206452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr19	49206603	rs281377	C	T	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.708;NF=36;NR=37;PP=980;ReadPosRankSum=-0.614;SC=ACCACCTGAACGACTGGATGG;SOR=0.515;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=73;WE=49206611;WS=49206593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,96:0.58:165
chr19	49206674	rs601338	G	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=947;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CCCTGCTCCTGGACCTTCTAC;SOR=0.803;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=61;WE=49206682;WS=49206664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr19	49206985	rs602662	G	A	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CACCTCCCACGGTGATGTGGT;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=79;TCR=89;TR=88;WE=49206993;WS=49206975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr19	49207206	rs485186	A	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=910;ReadPosRankSum=0.696;SC=CGGAGTGGACAGGGATTGCCG;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=56;WE=49207214;WS=49207196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr19	49207255	rs485073	A	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr19	49207255	.	ATT	GTC	965	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=19;PP=965;QD=46.2939943119;SC=ATGCTGGCCCATTCTTTGAGA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=22;WE=49207265;WS=49207245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr19	49207257	rs603985	T	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.42;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr19	49216926	rs281384	A	G	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=14;PP=1502;SC=GCAGGAGTCCAGAACCTCAGC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=49216934;WS=49216916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	49217261	rs281385	A	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=636;SC=TATCCGCGGCACGTGGAAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=49217269;WS=49217251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	49217305	rs281386	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GGCTTGACCTAGAGCAGCCAA;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=9;WE=49217313;WS=49217295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	49217520	rs281387	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=4;PP=289;SC=TTCCTACCGCTGGTCCTCGCC;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=49217528;WS=49217510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	49217605	rs281388	T	G	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=17;PP=860;SC=GTCCGCAAGCTCATAGCCCCG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=49217613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	49218060	rs35866622	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=295;ReadPosRankSum=-0.664;SC=ACCCCAAACTCACCGTCAGCT;SOR=2.267;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=16;WE=49218068;WS=49218050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr19	49218111	rs33988101	G	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=418;ReadPosRankSum=1.308;SC=TGTGTGGGGGGGGCGAGGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=34;WE=49218119;WS=49218101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr19	49218430	rs12978750	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr19	49218437	rs12978752	A	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr19	49218602	rs12979278	C	T	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=773;ReadPosRankSum=1.704;SC=CTTGGGGGTCCGCCCTGGATC;SOR=0.648;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=44;WE=49218610;WS=49218592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr19	49228272	rs2287921	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=0.421;SC=CCAGGAAGCTTCAGGGTAATA;SOR=0.748;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=30;WE=49228280;WS=49228262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr19	49232226	rs2287922	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=445;ReadPosRankSum=-0.890;SC=CGGGCCAGGCGGCCCAGCAGT;SOR=0.700;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=30;WE=49232234;WS=49232216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr19	49232966	rs12973151	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=0.444;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr19	49244219	rs2307018	CG	AA	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=560;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TTTGCTCGGCCGCTCCACTGC;SOR=0.496;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=17;WE=49244228;WS=49244209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr19	49246866	rs838147	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CTGGGGCCAGATCATCTATGA;SOR=0.269;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=19;WE=49246874;WS=49246856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	49247601	rs11672046	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=375;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AAGGAGGAGGCAGTTGGGGAA;SOR=1.358;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=22;WE=49247609;WS=49247591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr19	49247693	rs8108136	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=373;ReadPosRankSum=0.506;SC=GGGACACCGACTCCCATCTTC;SOR=1.270;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=26;WE=49247701;WS=49247683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr19	49247786	rs8108468	G	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=516;ReadPosRankSum=1.487;SC=GCTCCTTCACGAAGAGATCGC;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=31;WE=49247794;WS=49247776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr19	49247900	rs8111288	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=182;ReadPosRankSum=1.479;SC=AGGAAAGGGCGCTACAACTGA;SOR=3.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=11;WE=49247908;WS=49247890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr19	49248640	rs12982115	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=0.257;SC=CACTGGGCAAAGATAGGCCTG;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=40;WE=49248648;WS=49248630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr19	49248730	rs838145	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=318;ReadPosRankSum=2.394;SC=TAGGGAAAACGGTATTTACTA;SOR=0.086;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=19;WE=49248738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr19	49253389	rs4015	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=0.652;SC=TCTGAAGCCACGTACTGCTGG;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=49253397;WS=49253379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr19	49259529	rs838133	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=611;ReadPosRankSum=-0.387;SC=AGCACTCAGGACTGTGGGTTT;SOR=1.034;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=35;WE=49259537;WS=49259519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr19	49261267	rs3745710	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=0.179;SC=CCGAAGCCCACGGCCTCCCGC;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=31;WE=49261275;WS=49261257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr19	49261368	rs739320	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=212;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CCCCCCGCACTCCCGGAGCCA;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=15;WE=49261376;WS=49261358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr19	49261613	rs3745707	G	A	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=55;SC=AGTGTCTGAGGGAAGACATGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=49261621;WS=49261603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	49299533	rs557106	A	G	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=41;PP=1971;SC=AGAGCAGCACAGAAAGCCCAC;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=98;WE=49299541;WS=49299523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
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chr19	49317098	rs78535883	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.868;SC=TCATGCCCTCCTTGAAGGCTG;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=49317106;WS=49317088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
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chr19	49459104	rs1805419	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TGGGCCCCTGAGGACCCAGAA;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=14;WE=49459112;WS=49459094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
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chr19	49519466	rs1056917	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=1.045;SC=CGGGGTCCACACCACGCGGGC;SOR=1.251;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=6;WE=49519474;WS=49519456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr19	49519785	rs140502544	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.245;NF=2;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.457;SC=GCATCTGCCCCTGGCCCCAGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=2;WE=49519793;WS=49519775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
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chr19	49519855	rs1056914	T	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.377;NF=2;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TGATGCACACTGGGCAGCCCT;SOR=0.732;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=6;WE=49519863;WS=49519845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
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chr19	49529404	rs2387592	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.136;NF=1;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GGAGGCTGGGATTAGAGAAGA;SOR=1.071;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=6;WE=49529412;WS=49529394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
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chr19	49558667	rs111775228	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=5.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=-6.690;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.275;SOR=1.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,9:0.18:51
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chr19	49558729	rs12461085	G	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-5.398;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr19	49559329	rs3810179	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=266;ReadPosRankSum=-2.593;SC=GGAGGACATTGTCTGGACTTA;SOR=0.468;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=18;WE=49559337;WS=49559319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr19	49559518	rs3810180	C	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=742;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GGGGCTGGCCCGGCAGGCTCC;SOR=0.882;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=51;WE=49559526;WS=49559508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr19	49559693	rs79891871	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=545;ReadPosRankSum=0.025;SC=GAGCTGTAGGTTTCCTGAGCC;SOR=1.298;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=32;WE=49559701;WS=49559683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr19	49560461	rs3810182	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.82;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=169;ReadPosRankSum=0.023;SC=ATACTGTGAAGGGTGGGCCAG;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=11;WE=49560469;WS=49560451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	49560521	rs3810183	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.16;MQRankSum=1.086;NF=3;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.647;SC=CAAGATTGGGGGAGGAGGCAT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=8;WE=49560529;WS=49560511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr19	49573206	rs11083959	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=0.980;SC=CCACTCGTTACGACTTAACCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=49573214;WS=49573196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr19	49573438	rs1017219	A	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=579;ReadPosRankSum=1.437;SC=ACAAGGCTGCATGTCCACATG;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=48;WE=49573446;WS=49573428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,63:0.43:145
chr19	49574125	rs1611775	G	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=263;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GCCATTCAGCGGAGCGGGGAA;SOR=1.056;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=17;WE=49574133;WS=49574115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr19	49588746	rs11539822	C	T	2848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1723;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TGAGCAGCGGCCTGGTGCGCT;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=259;TCF=157;TCR=102;TR=120;WE=49588754;WS=49588736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,142:0.46:308
chr19	49604855	rs78616533	CCT	C	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.120;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	49605530	rs10419811	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=687;SC=CCCTCCTCCCACCCCAGTCGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=49605538;WS=49605520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	49621964	rs2232003	T	C	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=107;NR=90;PP=2965;SC=AGGACAACGCTGCCTACCCTT;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=197;WE=49621972;WS=49621954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
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chr19	49632309	rs4802566	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=522;ReadPosRankSum=-0.671;SC=AATGGAAACCTATAGTTGACT;SOR=0.414;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=31;WE=49632317;WS=49632299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
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chr19	49632772	rs1559155	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=417;ReadPosRankSum=1.639;SC=GGGCTGCCCACGGGGCGGAGC;SOR=0.504;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=25;WE=49632780;WS=49632762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr19	49636633	rs2287761	G	C	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=16;PP=468;SC=AACAAGGTGCGGGGAGGACTC;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=49636641;WS=49636623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	49638956	rs745124	C	G	4038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=46;PP=2421;ReadPosRankSum=1.068;SC=ACCCCTGGCCCTAGGTCTGTC;SOR=0.539;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=90;TCR=46;TR=135;WE=49638964;WS=49638946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr19	49646006	rs4545921	A	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=448;SC=CATCTCTCCGATTTTCTCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=49646014;WS=49646004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	49649051	rs3764625	T	G	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=9;PP=1246;SC=TGCCCTATAATAAGAATCATT;SOR=2.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=49649059;WS=49649041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	49651790	rs4802576	G	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=166;SC=TCCTGAGGGGGTCAACAGTCA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=49651798;WS=49651780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	49652128	rs112505587	GT	G	3028.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=26;PP=1898;SC=CACCATAACCGTGGGGGTGGA;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=42;WE=49652138;WS=49652118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	49652130	rs116573491	G	A	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=26;PP=1203;SC=CCATAACCGTGGGGGTGGAGC;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=60;WE=49652138;WS=49652118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	49655174	rs1423520	A	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=3;PP=536;SC=CCACCAGCCTACCGGGCCAGG;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=49655182;WS=49655164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	49658367	rs3745298	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=783;ReadPosRankSum=0.308;SC=GACTCCAGTGCTGTTGTTCCG;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=47;WE=49658375;WS=49658357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr19	49658390	rs3745299	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=685;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TTCTGAAGCCTAGCCCATCCC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=37;WE=49658398;WS=49658380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr19	49661582	rs3760664	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=477;ReadPosRankSum=1.407;SC=CCGCGGATGGTCACGCCCCAG;SOR=0.247;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=31;WE=49661590;WS=49661572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr19	49685708	rs201110201	CCCAT	C	805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=2.016;NF=12;NR=7;PP=651;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CATCCATCCACCCATCCATCC;SOR=0.527;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=19;WE=49685719;WS=49685698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr19	49794028	rs45549132	G	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=-1.549;SC=AAGGAACCTGGAGAAGGGCCA;SOR=0.207;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=15;WE=49794036;WS=49794018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	49797887	rs3214611	TA	T	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=-0.272;SC=ATCTTCAAGATAAAAAAGGCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=49797895;WS=49797877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	49812403	rs2278405	G	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=402;ReadPosRankSum=0.433;SC=GCATAAGGGGGTTGTAAAAGA;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=26;WE=49812411;WS=49812393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr19	49814310	rs144293339	C	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GCAAGGAGGACCTCACTCTCT;SOR=0.563;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=80;WE=49814318;WS=49814290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,98:0.52:187
chr19	49838891	rs354020	C	A	4511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=60;PP=2836;SC=GGCTACCCAGCCGGGGCCCAG;SOR=0.995;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=144;WE=49838899;WS=49838881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	49839015	rs354021	T	C	5167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=92;PP=2784;SC=GGATCCTCATTGACAAGACCA;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=167;WE=49839023;WS=49839005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	49841054	rs354026	G	T	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=42;PP=1736;SC=AGTACACAGAGCTAGCCATTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=49841062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	49845895	rs8108669	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GAGAGACCCACGGGTCACCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=49845903;WS=49845885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	49869051	rs2303759	T	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TCCTCACAGATGACCGACAAC;SOR=0.838;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=74;WE=49869059;WS=49869041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr19	49878115	rs1054770	G	A	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=714;ReadPosRankSum=0.987;SC=CCTGGAGGGCGGCCACTGGCT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=46;WE=49878123;WS=49878105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr19	49894027	rs61018355	T	TC	1117.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AGGACACCATTTCCTGCTTCT;SOR=0.969;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=20;WE=49894036;WS=49894017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr19	49894028	rs57104627	T	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GGACACCATTTCCTGCTTCTC;SOR=0.969;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=29;WE=49894036;WS=49894017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr19	49894152	rs7256629	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=765;ReadPosRankSum=0.998;SC=TGGACCTGCCCGAGGGCCCGG;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=44;WE=49894160;WS=49894142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
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chr19	49903008	rs8110789	G	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=0.227;SC=GTGGACCAGTGCCTCCCTTCT;SOR=0.293;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=49903016;WS=49902998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr19	49925667	rs12974629	T	G	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=34;PP=2358;SC=GCGCAGGAACTAGGCGCAGTC;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=84;TCR=34;TR=118;WE=49925675;WS=49925657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	49930721	rs4802605	T	C	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=60;PP=2287;SC=GAGTCCAACGTCCCTCCTCCC;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=117;WE=49930729;WS=49930711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	49935927	rs5828394	A	AG	1295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=1206;SC=ACAGGTGTACAGGGACACTAG;SOR=1.552;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=29;WE=49935935;WS=49935917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	49939719	rs2946848	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=328;ReadPosRankSum=0.882;SC=GGCCTGGACGTCTGGTGGGTG;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=49939727;WS=49939709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr19	49940131	rs3826718	G	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=29;PP=636;SC=CCAGGATCCAGGGCAAAACCT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=49940139;WS=49940121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	49944730	rs58045148	CA	C	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=19;PP=791;SC=TCCCGGGGTCCAGCCCCGGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=49944738;WS=49944720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	49949652	rs7462	G	A	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=48;PP=2035;SC=AGAAGGCACCGGCAGAAGCGG;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=104;WE=49949660;WS=49949642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	49950298	rs13394	C	T	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=102;PP=2965;SC=GGGAGGTCAACTTCGGCCAAG;SOR=1.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=64;TCR=102;TR=166;WE=49950306;WS=49950288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr19	49950356	rs12443	C	G	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=66;PP=2053;SC=GCTTTTCAGGCCTGAGGAGGA;SOR=2.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=88;WE=49950364;WS=49950346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	49950413	rs2335090	C	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=33;PP=930;SC=GCCTGGCGTGCTGTCCCTTTT;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=49950421;WS=49950403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	49954356	.	G	A	100	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=100;QD=22.4618687579;SC=CCGAGGTCTCGGCTCATTGCA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=49954364;WS=49954346;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr19	49954803	rs2293013	C	T	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	49954807	rs2293012	T	G	4419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	49955016	rs2293011	G	T	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=743;SC=TCAAATCCGTGGGGAATATGT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=49955024;WS=49955006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	49962892	rs62128062	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=382;SC=GCTGAGGGCCGTTGGAAAATG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=49962900;WS=49962882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	49963229	.	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=262;ReadPosRankSum=0.609;SC=GTGCAGTGGCGCAATCTTGGC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=49963237;WS=49963219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	49963987	.	C	T	266	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=15;MQ=58.95;NF=10;NR=4;PP=266;QD=21.4836580391;SC=TTTTTTTTTTCCTAATGTAGC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=14;WE=49963995;WS=49963977;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr19	49964833	.	T	C	374	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=60;MMLQ=24;MQ=56.62;NF=11;NR=1;PP=374;QD=34.0642677123;SC=GAGGAGGGGCTGGGCCTGGAC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=49964841;WS=49964823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	49964833	.	T	TGGGCCTGGACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCC	506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.95;QD=72.39;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	49964977	rs1320303	C	G	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=37;PP=1744;SC=CCTGAATGTCCTCAGTGGCCC;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=90;WE=49964985;WS=49964967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	49967808	rs34601909	C	T	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=38;PP=1357;SC=CGTCACCAGCCCCCCCGCCGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=73;WE=49967816;WS=49967798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	49967981	rs11558188	T	G	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=59;PP=1988;SC=GCCTCGCTGTTCCCTCAACCC;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=49967989;WS=49967971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	49969085	rs10853810	C	T	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=86;PP=2965;SC=CGTCTGGCAACCTCCATGGCT;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=144;WE=49969093;WS=49969075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	49969310	rs2914668	A	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=7;PP=329;SC=CCAGGATGCCAACCCCCACTG;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=49969318;WS=49969300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	49995254	rs701717	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=-1.217;SC=AAGCACTCGGAGAATTGTGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=49995262;WS=49995244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr19	50028306	rs71724821	CCTGCTG	C	1621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.046;NF=2;NR=25;PP=1591;ReadPosRankSum=0.683;SC=CATCTTCCATCCTGCTGCTGC;SOR=0.813;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=8;TCR=77;TR=27;WE=50028319;WS=50028296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr19	50040131	.	GC	AG	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=-1.455;SC=CCAAAGTGCTGCTATTACAGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=50040140;WS=50040121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr19	50059982	rs4594362	C	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=867;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TGGGGCAGGTCACCGTGCGGG;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=51;WE=50059990;WS=50059972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr19	50086626	rs3745473	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=210;ReadPosRankSum=0.286;SC=TCAGGAATGTTTCTAGTCCTT;SOR=0.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=11;WE=50086634;WS=50086616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	50086806	rs3745474	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=25;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CAGAAGTCTTCCTGGGTCCCC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=70;WE=50086814;WS=50086796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
chr19	50091798	rs2288920	G	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=460;ReadPosRankSum=0.607;SC=GGGGCTGACAGGTGGCATCCT;SOR=0.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=35;WE=50091806;WS=50091788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr19	50092002	rs2288921	T	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=-0.084;SC=ATGAAAGACCTAAGGACACAG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=6;WE=50092010;WS=50091992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	50093454	rs4429389	A	T	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=3;PP=1251;SC=CCCCATGCAAAGGTCTAGGGG;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=49;WE=50093462;WS=50093444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	50093572	rs7249925	A	G	3987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=75;PP=2895;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TCCTGGTTGAAGGGGGGAGAA;SOR=0.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=297;TCF=172;TCR=125;TR=176;WE=50093580;WS=50093560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,189:0.56:336
chr19	50095047	rs146415405	AGCCGG	A	697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.536;NF=1;NR=13;PP=645;ReadPosRankSum=0.492;SC=GTGGGAGCCCAGCCGGGCCGG;SOR=0.418;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=14;WE=50095059;WS=50095037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	50096421	rs10404887	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-2.057;SC=TTGAGCACCCCGATTCCCTTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=50096429;WS=50096415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	50097547	rs7251877	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=165;ReadPosRankSum=2.110;SC=CCCCTCATTCATGTCTCATTA;SOR=0.836;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=14;WE=50097555;WS=50097537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr19	50097607	rs57940349	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.58;ReadPosRankSum=2.042;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr19	50097784	rs10414643	T	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=850;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TCATGAACCTTATCTCGGCCC;SOR=1.060;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=48;WE=50097792;WS=50097774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr19	50097932	rs16981329	G	C	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1336;ReadPosRankSum=0.131;SC=TCTCTCTGACGCGCGGTCTTC;SOR=0.476;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=144;TCF=80;TCR=64;TR=78;WE=50097940;WS=50097922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr19	50119297	rs201889627	C	T	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1172;ReadPosRankSum=0.475;SC=AGTCTCGCCACGGGACAACCT;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=74;WE=50119305;WS=50119287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,81:0.58:140
chr19	50154904	rs7251334	A	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=23;PP=967;SC=CGCCCGGCCTACACCGGCCGC;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=50154912;WS=50154894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	50156896	rs10401743	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=800;ReadPosRankSum=0.546;SC=GCTGCCCACGTTGCCCCCGCC;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=46;WE=50156904;WS=50156886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr19	50168174	.	C	T	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=4;PP=49;QD=13.9618687579;SC=GTTTCCGCACCCAGACCTCCT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=6;WE=50168182;WS=50168158;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	50183980	rs1433102	TT	CC	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=299;SC=TGCTGCGCACTTCCTAGGGTC;SOR=3.014;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=50183989;WS=50183970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	50190041	rs141919954	G	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	50195770	rs10423579	TT	CG	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=0.159;SC=CCCCTTTTTCTTAGAATTTTG;SOR=0.250;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=15;WE=50195779;WS=50195760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	50209095	rs7249356	T	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=454;ReadPosRankSum=0.184;SC=CTAAGAAGTATATAATAAATG;SOR=0.583;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=31;WE=50209103;WS=50209085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr19	50216118	rs56405217	T	TG	4208.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=64;PP=2974;SC=TGAGTGGAGCTGGGCGCGCTG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=84;WE=50216126;WS=50216108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	50250872	rs8109529	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=293;SC=CCTTGGCTAAGGGGATGGCTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=50250880;WS=50250862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	50265549	rs3745477	T	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=22;PP=635;SC=TGGGCCCTCCTGCCTTCCTTT;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=50265557;WS=50265539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr19	50304392	rs10421561	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=543;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CCCAGGGGTCTCAGGGCAGGC;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=27;WE=50304400;WS=50304382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr19	50304439	rs10421754	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=0.313;SC=TCCACCCCAATCCACCTAGCA;SOR=0.098;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=50304447;WS=50304429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	50305688	rs2159984	G	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,69:0.51:134
chr19	50306198	rs28736735	G	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=-1.475;SC=TCTGCTCCATGCCTCCAGCCC;SOR=0.986;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=50306206;WS=50306188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr19	50308893	rs8101959	T	C	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=638;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CGGGGCCTAATGGAGCCTCCC;SOR=0.513;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=51;WE=50308901;WS=50308883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr19	50312653	rs2305921	C	T	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=702;ReadPosRankSum=0.027;SC=TCCCGTGCGGCAGGTACACCG;SOR=0.807;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=51;WE=50312661;WS=50312643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr19	50315423	rs8104825	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AAGTGTTGGTGGTCTGCACTC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=50315431;WS=50315413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	50315698	rs2305919	A	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=325;ReadPosRankSum=1.314;SC=CCTCTCTCAGACCAACCTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=24;WE=50315706;WS=50315688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr19	50315773	rs2305918	T	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=566;ReadPosRankSum=0.100;SC=CATAGCCAAATTAACAGCTGC;SOR=0.597;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=32;WE=50315781;WS=50315763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr19	50322611	.	T	TGATGGCTTGGGTGGTTGGGGTCCCTGTAAGGGGCCGTGCATGAGG	1449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.368;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.853;SOR=1.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr19	50322619	.	TG	T	2963	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=59.54;NF=0;NR=27;PP=2963;QD=20;SC=AGTGATGGCTTGGGGTGGTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=27;WE=50322665;WS=50322609;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr19	50331678	rs5828413	CT	C	953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.164;NF=15;NR=8;PP=814;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GATGGCAACCCTGGGGGCTGA;SOR=1.306;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=23;WE=50331686;WS=50331668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr19	50333318	rs112946131	G	C	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=65;PP=1304;ReadPosRankSum=1.345;SC=CCTTCTCTCTGGGGTTGGCCA;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=200;TCF=81;TCR=119;TR=111;WE=50333326;WS=50333308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,125:0.53:237
chr19	50335354	rs367774572	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=1.580;SC=GCATCGCCCCCAGGAAGACGG;SOR=1.101;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=20;WE=50335362;WS=50335344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr19	50335510	rs3745480	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CTGCCTCATGTCCCCGCCTCA;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=50335518;WS=50335500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	50338453	rs752522	C	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=803;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TGACAGTCCCCAAACCAGCAC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=37;TCR=82;TR=50;WE=50338461;WS=50338443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr19	50342111	rs10403127	G	A	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=64;PP=1479;ReadPosRankSum=0.074;SC=ATTAACAGAAGTGGCGCGGCA;SOR=0.857;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=33;TCR=109;TR=81;WE=50342119;WS=50342101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,95:0.60:159
chr19	50354211	rs7260222	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1215;ReadPosRankSum=2.298;SC=CCACCCCATTCGGTAGGGGCT;SOR=0.307;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=154;TCF=65;TCR=89;TR=79;WE=50354219;WS=50354201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,88:0.48:182
chr19	50358133	rs75478119	T	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=826;ReadPosRankSum=-0.445;SC=AGCTGATCCCTCAGCAGCTGC;SOR=0.564;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=49;WE=50358141;WS=50358123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr19	50358170	rs1290657	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=587;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TCCCACCCCATCCACTCTGAG;SOR=1.569;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=10;WE=50358191;WS=50358160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr19	50358183	rs2278836	C	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=1099;ReadPosRankSum=2.210;SC=ACTCTGAGCACCCCCATGCCT;SOR=0.667;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=30;WE=50358191;WS=50358160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr19	50363175	rs1290646	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=440;ReadPosRankSum=-1.535;SC=CCACGGCATGATGCCGTGGTT;SOR=0.456;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=30;WE=50363183;WS=50363165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr19	50368361	rs1290649	T	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=408;ReadPosRankSum=1.307;SC=GGCGGCTCCCTCAGCCCTCGG;SOR=0.179;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=24;WE=50368369;WS=50368351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr19	50369787	rs3739172	T	C	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=797;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TGCTTCAGGCTATAGCATCCA;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=45;WE=50369795;WS=50369777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,53:0.64:83
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chr19	50380858	rs731826	T	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=343;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CACCCGCTCCTTCTCTAGAAC;SOR=1.109;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=20;WE=50380866;WS=50380848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
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chr19	50386340	rs746738	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=601;ReadPosRankSum=0.236;SC=AAACGTGAGTTCTCAGGAGGC;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=44;WE=50386348;WS=50386330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr19	50392014	rs11668716	T	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-1.955;SC=TGCAGTTGGCTTCTTGTTGGT;SOR=0.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=50392022;WS=50392004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	50394203	.	CCT	C	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=60.98;NF=3;NR=0;PP=77;QD=28.6666666667;SC=GCCCCCCCCCCCTGCCCGCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=50394212;WS=50394193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	50399384	rs3840921	G	GC	2093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=35;PP=1816;SC=TTGTTCCAGAGCCCCTCCCCT;SOR=1.162;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=45;WE=50399392;WS=50399374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	50404939	rs1290754	T	G	5524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=CCATGGCCTTTATGGTTAGCC;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=50404947;WS=50404929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	50411742	rs892028	A	G	7974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=110;PP=2965;SC=TGAGCTGTGCATCGATGTTCT;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=133;TCR=110;TR=243;WE=50411750;WS=50411732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr19	50412417	rs999583	G	A	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=893;ReadPosRankSum=2.231;SC=TGGGCCCAGTGCTGGTGATGG;SOR=0.864;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=56;WE=50412425;WS=50412407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,63:0.53:118
chr19	50435747	rs283525	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=456;ReadPosRankSum=-1.067;SC=GGAGCCTCCCTTACCCCCCGG;SOR=1.382;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=25;WE=50435755;WS=50435737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
chr19	50435862	rs283526	C	T	195.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GATGCCCCGCCCCTCCCACCA;SOR=0.399;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=8;WE=50435870;WS=50435852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr19	50436371	rs8667	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGTGGCTTCTGGGGGCTGGTC;SOR=1.557;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=22;WE=50436379;WS=50436361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr19	50453317	rs9304690	C	T	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=60;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TCTTGATCTCCGAGTACTCGG;SOR=0.496;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=230;TCF=89;TCR=141;TR=102;WE=50453325;WS=50453307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,130:0.47:276
chr19	50462244	rs1811375	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.434;NF=21;NR=23;PP=577;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TGGGCCCCCAGTTTGGCACTG;SOR=0.583;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=44;WE=50462252;WS=50462234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr19	50462298	rs62113133	G	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.851;NF=8;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=-0.168;SC=TGTCCTGTTTGCTTGGGAAAC;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=25;WE=50462306;WS=50462288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr19	50462396	rs140838254	ACTATC	A	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.719;NF=0;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=0.171;SC=GGTAAAGGGAACTATCCTGGA;SOR=0.027;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=50462408;WS=50462386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	50463693	rs201127706	G	GT	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.190;NF=20;NR=19;PP=1315;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GACAGAGACCGGGTGGGAGAT;SOR=0.449;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=39;WE=50463701;WS=50463683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr19	50463982	rs9676436	T	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.33;MQRankSum=-2.438;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,36:0.38:96
chr19	50475985	rs76060754	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=-1.649;SC=GGGGAGGGGCGGAGAGGGCAA;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=50475993;WS=50475975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr19	50484130	rs10533547	AAGG	A	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAGAGGTGTAAGGAGAAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=50484140;WS=50484120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	50484155	rs4802645	C	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=219;ReadPosRankSum=-0.957;SC=CAAGATGGATCTGAGCCACCA;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=12;WE=50484163;WS=50484145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
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chr19	50496281	rs113770287	G	GAC	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TGCAGACCAGGAGGGAGCCCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=50496289;WS=50496271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr19	50720795	rs10412634	G	A	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr19	50726459	rs654877	T	C	6361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=94;PP=2965;SC=GGAGCTTGCCTGAGGTCATTG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=194;WE=50726467;WS=50726449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr19	50726570	rs4801822	G	A	3685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=77;PP=2424;SC=CCCACGTGGCGTCGTCTCCAA;SOR=1.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=124;WE=50726578;WS=50726560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	50727510	rs56354891	T	C	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=51;PP=1535;SC=ATCTTCTTGGTAGACAGGGCC;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=74;WE=50727518;WS=50727500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	50735340	rs11666328	C	T	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=738;ReadPosRankSum=1.560;SC=GAGTGAGCCCCGTGGAGGCCA;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=59;WE=50735348;WS=50735330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,70:0.47:149
chr19	50747428	rs600730	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.109;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=514;ReadPosRankSum=-1.370;SC=TAAGTTACATGTTTAAGGGGC;SOR=1.675;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=32;WE=50747436;WS=50747418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr19	50750419	rs607227	C	T	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=83;PP=2615;SC=GAAAGAGCCGCGCACCCCGGC;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=139;WE=50750427;WS=50750409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	50760716	rs378811	C	G	3212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=66;PP=1795;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GTTTTGTCCGCTGCATTGTCC;SOR=0.750;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=275;TCF=136;TCR=139;TR=127;WE=50760724;WS=50760706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,153:0.45:339
chr19	50760829	rs73068986	T	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=652;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CCACATCTGATTCGAGGACCC;SOR=1.125;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=88;TCF=17;TCR=71;TR=36;WE=50760837;WS=50760819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr19	50762418	rs1651553	A	G	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=66;PP=2312;SC=AGCTGGAGCCACGGCTGGTGC;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=115;WE=50762426;WS=50762408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	50763886	rs28482851	C	T	2907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CTCCCCACCCCTCCCTGCTCA;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=250;TCF=160;TCR=90;TR=123;WE=50763897;WS=50763876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,132:0.46:286
chr19	50763889	rs12981413	C	T	3541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=0.295;SC=CCCACCCCTCCCTGCTCATTG;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=162;TCR=94;TR=128;WE=50763897;WS=50763876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,158:0.53:296
chr19	50764005	rs149039486	C	CGT	1608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=92;PP=1166;ReadPosRankSum=0.279;SC=TGCGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.369;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=141;TCF=6;TCR=135;TR=97;WE=50764025;WS=50763995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr19	50764017	rs146099002	T	TGC	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=93;PP=1046;ReadPosRankSum=1.682;SC=TGTGTGTGTGTGCGTGCATGA;SOR=1.156;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=119;TCF=5;TCR=114;TR=98;WE=50764025;WS=50763995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr19	50764079	rs140241247	A	AGT	1681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=43;PP=1747;SC=TGTGTGTGCAAGTGTGTGTGC;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=50764087;WS=50764069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	50766403	rs1968381	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-0.056;SC=TTGCAGTGAGCCCAGATCATG;SOR=0.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=50766411;WS=50766393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr19	50771635	rs930086	T	C	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=13;PP=428;SC=GTCTGGCCCCTTGCATGCCCA;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=50771643;WS=50771625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	50775742	rs1651543	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=13;PP=575;SC=GTGACTGGGGACCTGTGGTCT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=50775750;WS=50775732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr19	50794480	rs73058373	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CTTCTTCTTCTATTTTACATT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=50794488;WS=50794470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr19	50796905	rs3745509	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGAGCAACTCGGAGCTGCTCA;SOR=1.296;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=13;WE=50796913;WS=50796895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr19	50805138	rs3826772	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TAGGTGAGAGCGGAGGCCACA;SOR=0.441;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=31;WE=50805146;WS=50805128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr19	50812221	rs889002	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=185;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GAGTGATGACAGTACCTGGAG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=13;WE=50812229;WS=50812211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr19	50813263	rs627491	T	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=1.481;SC=AGGGAGGCAATGACTGGAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=50813271;WS=50813253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr19	50819119	rs138988257	G	GGCT	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=288;ReadPosRankSum=1.001;SC=CAAAGCCTGGGGCTGCCTGCA;SOR=1.201;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=7;WE=50819127;WS=50819109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	50832152	rs375912738	T	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.93;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	50837859	rs56849250	C	CA	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=28.00;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	50863023	rs638294	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.571;NF=18;NR=18;PP=553;ReadPosRankSum=-2.579;SC=GCCAGTAGGCAGGGACCGTGA;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=36;WE=50863031;WS=50863013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr19	50865535	rs676314	A	G	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1343;ReadPosRankSum=-1.894;SC=TAGGTTCAGGATCCTGCGTCC;SOR=0.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=69;TCR=86;TR=83;WE=50865543;WS=50865525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,99:0.53:187
chr19	50868754	rs1274517	A	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=591;ReadPosRankSum=-0.010;SC=AAGAGGCAGAAAATCCCTCCT;SOR=0.707;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=32;WE=50868762;WS=50868744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr19	50880741	rs2695121	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=334;ReadPosRankSum=-1.019;SC=AGTAGGGTCTTTGGAGAGATG;SOR=0.458;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=18;WE=50880749;WS=50880731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr19	50881326	rs28514894	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=-0.115;SC=GCTCTTTGCCTGGGGATCTCC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=50881334;WS=50881320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	50881820	rs55652650	A	AAAC	1258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.153;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,62:0.38:164
chr19	50881822	rs34296657	A	ACAG	2236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.227;NF=19;NR=70;PP=1510;ReadPosRankSum=0.724;SC=AGATTCGGAAACAGCAGCAGG;SOR=0.847;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=24;TCR=77;TR=89;WE=50881830;WS=50881810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,95:0.61:157
chr19	50882169	rs2248949	A	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr19	50882172	rs41432149	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.125;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr19	50882918	rs2303045	G	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr19	50885201	rs2303044	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=364;ReadPosRankSum=0.576;SC=GAGGGAGTCACGGGCTGCCTC;SOR=0.634;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=19;WE=50885209;WS=50885191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr19	50902196	rs3218772	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=54;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TGATGCACCTCGGCCATCCCA;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=50902204;WS=50902186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr19	50909389	rs1673041	T	G	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=14;PP=1516;SC=TCTTCAGGCTTATGTGACGGG;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=50909397;WS=50909379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	50919797	rs3218776	C	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=15;PP=730;SC=TACGGGGGCACCAGGGGACTG;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=50919805;WS=50919787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	50922370	rs2244095	A	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=16;PP=486;SC=GGAGGGGTCCACCCTGTCTCT;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=50922378;WS=50922360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	50926264	rs1673030	TG	CC	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=10;PP=659;SC=CTGGCCTCCCTGCATACCCCA;SOR=1.426;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=17;WE=50926273;WS=50926254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	50926742	rs3745516	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=709;SC=AAAGGCCAAAATCTAGGCTGT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=50926750;WS=50926732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	50939844	rs117858598	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=447;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GGGTGGTCCCGTGCACCCACA;SOR=0.968;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=27;WE=50939852;WS=50939834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
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chr19	50951689	rs2445835	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=248;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TAGGGTGTGCATAGCAGTTAG;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=18;WE=50951697;WS=50951679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
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chr19	50986074	rs14031	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.529;SC=CTGGATGGCCGGGGGCTTCTG;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=12;WE=50986082;WS=50986064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr19	51015404	rs12977172	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=220;ReadPosRankSum=1.515;SC=CAGGAGGCTCTGCCAGAAGGC;SOR=0.616;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=17;WE=51015412;WS=51015394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	51015574	rs12976250	G	C	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.396;SC=AGTCAGTCTGGAGAGCCTGGA;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=95;WE=51015582;WS=51015564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,112:0.51:218
chr19	51015869	rs2305761	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=528;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AGGGGGAGTGGGGTCTTTGCA;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=36;WE=51015877;WS=51015859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr19	51017824	rs76503780	C	T	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=48;PP=2446;ReadPosRankSum=0.338;SC=CCCTCCCGTTCCCCAGCTCGC;SOR=1.037;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=64;WE=51017843;WS=51017814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,76:0.56:135
chr19	51017835	rs889131	G	A	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=46;PP=2446;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CCCAGCTCGCGTCAGCCCAGG;SOR=1.379;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=60;WE=51017843;WS=51017814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr19	51020903	rs61751956	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=550;ReadPosRankSum=1.110;SC=AGTTGAGGCCAGGCGGGCCTT;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=37;WE=51020911;WS=51020893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr19	51021057	rs61751957	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=323;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCCACTGGCCACGGCGGCCGC;SOR=1.048;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=20;WE=51021065;WS=51021047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr19	51052189	rs11880112	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.085;SOR=1.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	51128661	rs16986142	T	C	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=66;PP=2583;SC=AGTCGTAGTCTACCACGGCGA;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=51128669;WS=51128651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	51128856	rs10426057	A	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=763;SC=ACAGAGACTCACTCCCTCAGA;SOR=2.242;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=33;WE=51128864;WS=51128846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	51132905	.	G	A	171	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=27;MQ=44.81;NF=12;NR=0;PP=171;QD=17.1476010456;SC=CCTCAGACCCGGGAGTCCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=12;WE=51132913;WS=51132899;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,12:0.67:18
chr19	51132979	.	G	A	1023	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=27;MQ=56.07;NF=35;NR=11;PP=1023;QD=22.9950263597;SC=CCTCAGACCCGGGAGTCCAGA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=51132987;WS=51132969;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	51133356	rs10407511	C	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=46;PP=1480;SC=GGGCAGGTGGCCGCTCCTCAC;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=72;WE=51133364;WS=51133346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	51159571	rs4801844	T	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=636;ReadPosRankSum=-1.187;SC=ACCACCAGCTTCCCAGCCCCT;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=42;WE=51159579;WS=51159561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,66:0.42:157
chr19	51161088	rs10404821	C	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.486;SC=CTCCTTTGACCATAGCGACAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=51161096;WS=51161078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	51170706	rs3745521	A	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=30;PP=1166;SC=TCCGCTCGTCACAGGGGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=51170714;WS=51170696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	51171188	rs750578	G	A	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=16;PP=1137;SC=GGGCCTTGCCGGTCAGCGGGT;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=51171196;WS=51171178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	51200466	rs4802735	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.214;SC=AGCCCTGACTGCACCCTCCCC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=15;WE=51200474;WS=51200456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
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chr19	51207508	rs187882127	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GGGCAGGGAACGTGGCGAGGT;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=16;WE=51207516;WS=51207498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr19	51207775	rs41275786	C	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=639;ReadPosRankSum=0.622;SC=AGGTCTCCTGCGGGTAATGGC;SOR=0.982;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=38;WE=51207783;WS=51207765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr19	51217550	rs3745530	G	A	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=633;ReadPosRankSum=-0.502;SC=AACCCCGTCTGAGCCATGGGC;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=53;WE=51217558;WS=51217540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
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chr19	51228802	rs1053020	T	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=0.348;SC=CTCCGGAATCTCCCTTCCCTT;SOR=0.586;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=17;WE=51228810;WS=51228792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr19	51261829	rs73046516	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1055;ReadPosRankSum=2.448;SC=GGTGCCGTGGGTGACTGTCTT;SOR=0.883;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=63;WE=51261837;WS=51261819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr19	51261951	rs11880363	G	T	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=53;PP=1730;SC=CCAGGCAGTGGCTCCTTGGAG;SOR=1.145;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=51261959;WS=51261941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	51262056	rs11883166	T	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=685;SC=GTTGCATCTCTGTCCTCTACC;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=51262064;WS=51262046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	51262620	rs10424138	A	C	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=38;PP=1485;SC=CCAGTCTTTGACTTCTGCCCT;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=51262642;WS=51262610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	51262634	rs11880526	G	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.720;NF=6;NR=16;PP=377;ReadPosRankSum=0.519;SC=CTGCCCTGGCGAGGGCGTTTG;SOR=1.373;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=22;WE=51262642;WS=51262610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr19	51274836	rs1864011	T	C	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.003;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.470;NF=19;NR=37;PP=986;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CCAAGAAAAGTTTTTCCAGTC;SOR=1.105;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=129;TCF=52;TCR=77;TR=56;WE=51274844;WS=51274826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,66:0.45:148
chr19	51321919	rs3212841	C	CCAGCCTTCGCAGGCCACACCCTGAAGCCACTCTCCACCCGCT	831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=15.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=4.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	51322312	rs5519	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr19	51323232	rs5517	T	C	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1374;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TGGGCTTTTTTGCACTCATCA;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=101;WE=51323240;WS=51323222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,105:0.45:231
chr19	51323473	rs5516	C	G	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1534;ReadPosRankSum=0.287;SC=TCGGGTTCCTCGGTGGGCAAC;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=90;WE=51323481;WS=51323463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,102:0.52:198
chr19	51323501	rs1054713	A	G	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1175;ReadPosRankSum=0.894;SC=CCTTCACAGCATCTGTGATGG;SOR=0.353;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=75;WE=51323509;WS=51323491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,85:0.49:173
chr19	51323881	rs2659103	T	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=362;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AGATGAAAGATTTTGAGAGTG;SOR=0.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=19;WE=51323889;WS=51323871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr19	51330932	rs3745522	G	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=395;ReadPosRankSum=-1.448;SC=TTTGGCAGTGGGCCGCAGACA;SOR=0.711;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=24;WE=51330940;WS=51330922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr19	51331199	rs142271509	G	GT	893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.56;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	51331204	.	T	TTG	654	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=15;PP=654;QD=42.5;SC=GCCCTGTTTTTGTTTGTTGTT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=16;WE=51331213;WS=51331194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,16:0.76:21
chr19	51331205	.	G	T	417	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=15;PP=417;QD=26.5747772087;SC=CCCTGTTTTTGTTTGTTGTTG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=17;WE=51331213;WS=51331194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr19	51331205	rs372866981	G	GT	924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	51334890	rs3745523	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=378;SC=TTCTGACCACCGGTATCCCCT;SOR=1.143;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=51334898;WS=51334880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	51358333	rs266881	C	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=490;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CTTTCCCCCCCAACCCAGCAC;SOR=0.307;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=30;WE=51358341;WS=51358323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr19	51359497	rs11573	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	51359503	rs1135766	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	51361315	rs12946	C	T	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=1016;ReadPosRankSum=1.516;SC=GTCGGCACAGCCTGTTTCATC;SOR=0.810;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=65;WE=51361323;WS=51361305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr19	51361472	rs2003783	C	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=1046;ReadPosRankSum=0.299;SC=GCCTGCCGAGCTCACGGATGC;SOR=0.694;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=63;WE=51361480;WS=51361462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr19	51361644	rs1810020	A	G	4209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=51;PP=2833;SC=CAGGACTCCTAGGTCTGAGGG;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=129;WE=51361652;WS=51361634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	51362716	rs66592214	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=349;ReadPosRankSum=0.635;SC=CCTGGGCCCTTACCCAGCCTC;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=19;WE=51362724;WS=51362706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
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chr19	51379893	rs198972	C	T	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TCATGCTGCTCCGCCTGTCAG;SOR=0.520;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=70;WE=51379901;WS=51379883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,88:0.49:179
chr19	51380110	rs6070	T	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.159;SC=CACAGCCCAGTTTTTCTCTGA;SOR=0.969;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=63;WE=51380118;WS=51380100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,79:0.53:150
chr19	51380445	rs8105275	G	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=245;ReadPosRankSum=0.309;SC=CAACACAAGAGGTGATTCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=16;WE=51380453;WS=51380435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr19	51381777	rs198977	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=924;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GGTGCATTACCGGAAGTGGAT;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=60;WE=51381785;WS=51381767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr19	51411636	rs2569527	G	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=997;SC=CCTTCTGGTCGTGCCCTCCGC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=51411644;WS=51411626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	51412666	rs1654552	C	A	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=685;ReadPosRankSum=0.687;SC=CAGAGACGAGCGATCCTGAGG;SOR=0.425;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=51;WE=51412674;WS=51412656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr19	51413790	rs2242669	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=-1.890;SC=AGTTGCAGGGGCACAGCCATG;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=51413810;WS=51413780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	51413802	rs198969	G	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=778;ReadPosRankSum=1.026;SC=ACAGCCATGGGGGACGGATAA;SOR=0.711;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=20;WE=51413810;WS=51413780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr19	51413906	rs2978642	A	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=843;ReadPosRankSum=1.168;SC=CCAAGCACGGACAGACACACA;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=62;WE=51413914;WS=51413896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr19	51447065	rs1701949	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=185;ReadPosRankSum=0.079;SC=AAGGGGGGCATGAGAGAGGCA;SOR=0.432;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=15;WE=51447073;WS=51447055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	51452250	rs183854	T	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=38;PP=1154;SC=AGCATGAGGTTGTTAGAGTGG;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=51452258;WS=51452240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	51455814	rs2739412	A	C	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.883;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=850;ReadPosRankSum=1.527;SC=CAATCCCACAACCCTCCCACC;SOR=0.363;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=56;WE=51455822;WS=51455804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,62:0.57:108
chr19	51456005	rs2659093	T	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.848;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	51456015	rs11553092	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	51465200	rs112376245	A	AC	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CTCCCCAGTCACCCCCCAACC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=51465208;WS=51465190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr19	51466516	rs1654537	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CACTTCCCCAAGTAGCCAGTA;SOR=1.390;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=13;WE=51466524;WS=51466506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr19	51480671	rs59354651	AGGTT	A	745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=657;ReadPosRankSum=-0.421;SC=ACAGGGCATGAGGTTGGTTTA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=14;WE=51480682;WS=51480661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	51482969	rs1701924	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=309;SC=CCCAGTCACTCGGGTCAAGCT;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=51482977;WS=51482959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	51484984	rs1991820	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.87;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	51484990	rs1991819	T	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=1.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	51485013	rs1991818	C	T	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=829;SC=GAGACTTGGGCGGCACCTACT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=51485021;WS=51485003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	51485194	rs1654523	C	T	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=49;PP=1664;SC=TGGAGGAGCACGTGGGTAGCT;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=51485202;WS=51485184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	51485622	rs2659067	A	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=61;PP=1902;SC=GATAGCAGTAAGATCTGCAGG;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=106;WE=51485630;WS=51485612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	51487067	rs1275221	T	C	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=28;PP=1158;SC=AGCATCACCCTCTCCCCTACA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=61;WE=51487075;WS=51487057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	51487175	rs1624358	T	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=29;PP=896;SC=AAAATCTTCATCCCTCTGCTG;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=51487183;WS=51487165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	51499195	rs1612902	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.832;SC=CCCCACCTAGTCTGCCAGCAG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=51499203;WS=51499185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr19	51503524	rs1701946	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=476;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CCTGTAATGGTGGGGATAGTT;SOR=0.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=32;WE=51503532;WS=51503514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr19	51504075	rs1701947	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=-0.160;SC=ACAGGCCCCGAGTACTCCCAG;SOR=0.016;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=51504083;WS=51504065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	51507020	rs2075802	T	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=649;ReadPosRankSum=1.558;SC=CCGAGATGTGTCCAGGGTATG;SOR=0.877;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=39;WE=51507028;WS=51507010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr19	51518222	rs2075696	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GGGGTGGCAGGAAGGAGAGAT;SOR=1.802;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=51518230;WS=51518212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr19	51519114	rs2075691	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=0.683;SC=CCTGAGGTTCCGGCCTCAGAG;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=11;WE=51519122;WS=51519104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	51519236	rs2075690	A	G	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=655;ReadPosRankSum=-3.226;SC=GCGGGGCCCCAGCACTACGGG;SOR=0.512;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=122;TCF=81;TCR=41;TR=56;WE=51519244;WS=51519226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,74:0.47:158
chr19	51519259	rs2075689	C	T	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=908;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGGCCAGCTTCAGCAACATGA;SOR=0.629;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=63;WE=51519267;WS=51519249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,90:0.47:191
chr19	51519346	rs1061368	G	C	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=754;ReadPosRankSum=-1.770;SC=CAGAGCGAGTGGTCCGGCGGA;SOR=0.383;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=64;WE=51519354;WS=51519336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,79:0.49:162
chr19	51519364	rs2075688	T	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=629;ReadPosRankSum=1.626;SC=GGAGCTGCTCTCCCTGAAGAA;SOR=0.444;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=43;WE=51519372;WS=51519354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr19	51519451	rs2075687	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=1.134;SC=AAACCCTTCATAGGGACTGGG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=23;WE=51519459;WS=51519441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr19	51519480	rs12981039	C	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=277;ReadPosRankSum=0.802;SC=TGGGCAGTGACGCAGGGCCTG;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=17;WE=51519488;WS=51519470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	51520487	rs3745535	A	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr19	51522286	rs2304156	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.67;ReadPosRankSum=-2.260;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	51522291	rs2304157	G	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=-2.232;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr19	51530693	rs1474520	G	A	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=13;PP=1017;SC=CAGGCAGCCCGAGTCCAGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=51530701;WS=51530683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	51534020	rs75565227	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CTGGTGACCACGCACGCTGCC;SOR=1.802;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=12;WE=51534028;WS=51534010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr19	51535130	rs3745540	A	G	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=53;PP=1529;ReadPosRankSum=0.851;SC=TGGGCCCCTTACTCCGTGGGT;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=78;TCR=99;TR=93;WE=51535138;WS=51535120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,108:0.52:209
chr19	51535460	rs10635364	T	TCC	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=414;ReadPosRankSum=0.139;SC=CCACGGACACTCAGGCGCTCC;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=51535468;WS=51535450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr19	51563965	rs2569474	G	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=9;PP=289;SC=GGTAAGGGTCGGATTATTGCC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=51563973;WS=51563955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	51566943	rs2736433	G	A	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=29;PP=1452;SC=AGGGAGTGTCGCCAGAGGAGA;SOR=1.065;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=71;WE=51566951;WS=51566933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	51567176	rs2736431	G	A	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=55;PP=2007;SC=TAACATCTGCGTCTGTCCCCG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=95;WE=51567184;WS=51567166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	51567990	rs10500306	T	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=61;PP=1492;SC=CGCGAACCCATGTCTTTCAGC;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=83;WE=51567998;WS=51567980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	51568029	rs2736434	G	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=35;PP=961;SC=AGCCTTGAACGCGGGAGGGGC;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=51568037;WS=51568019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	51568066	rs12979090	A	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=508;SC=TGGGAGGTGAAGGGTCTGGGG;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=51568074;WS=51568056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	51582994	rs11671800	G	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.178;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr19	51583003	rs6509518	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
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chr19	51728641	rs2455069	A	G	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=50;PP=1870;SC=CATTATATCCAGGGACTCTCC;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=51728649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr19	51837213	rs7255412	A	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=19;PP=610;SC=ATTGAGAGGCAGAAGAGAAGC;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=51837221;WS=51837203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	51837332	rs10418551	A	G	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=570;SC=GTAGGAGGGCAGGATGGATGA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=51837352;WS=51837322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	51837344	rs11672414	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=294;ReadPosRankSum=1.088;SC=GATGGATGACCTATGACGGCA;SOR=0.432;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=16;WE=51837352;WS=51837322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	51841417	rs34380065	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=781;ReadPosRankSum=1.032;SC=CTCCCCCAACCGTGTCTCTGC;SOR=1.018;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=44;WE=51841425;WS=51841407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr19	51843589	rs6509528	G	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=675;ReadPosRankSum=0.739;SC=CGAGTGTCAGGGTCACCTGGG;SOR=0.640;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=40;WE=51843597;WS=51843579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr19	51843808	rs7259266	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=572;ReadPosRankSum=0.647;SC=CCTCTGAGCGCATCCGGGGCG;SOR=0.558;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=35;WE=51843816;WS=51843798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr19	51844978	rs8105710	G	T	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.036;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1156;ReadPosRankSum=0.454;SC=CAGAGAAGGGGGAAACCGGGC;SOR=1.335;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=69;WE=51844986;WS=51844968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,79:0.59:135
chr19	51845371	rs10414211	T	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=438;ReadPosRankSum=0.908;SC=AGCCTGTGGGTTGTCCATGGT;SOR=0.934;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=27;WE=51845379;WS=51845361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr19	51850290	rs1130426	G	A	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=717;ReadPosRankSum=-0.539;SC=CCCCTCCAGCGTCACCTGGGA;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=49;WE=51850298;WS=51850280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr19	51853468	rs4802789	C	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=381;SC=TGAGGCAATCCGAGGGAACAG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=51853476;WS=51853467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	51856604	rs111522316	C	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.398;NF=11;NR=18;PP=439;ReadPosRankSum=4.931;SC=AGGAGTCTGGCTCGCAGCCCC;SOR=0.614;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=29;WE=51856612;WS=51856594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,45:0.83:54
chr19	51856619	rs2004309	T	C	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=26;PP=829;SC=AGCCCCTCCTTCCTCAGACCC;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=51856649;WS=51856609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	51856631	rs3889312	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.40;QD=42.43;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	51856641	rs3889313	G	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.23;QD=45.19;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	51856675	rs367705257	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=94;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=3;PP=27;SC=CCAGGAGTCCAGGCCCCCATC;SOR=1.022;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=6;WE=51856683;WS=51856665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr19	51869346	rs3786625	G	A	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=10;PP=767;SC=CGTGACCCCGGAGGGATCGGA;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=51869354;WS=51869336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	51871195	rs3745403	G	A	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=62;PP=2375;SC=CGCCCTCGTCGCACCGAATCC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=51871203;WS=51871185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	51874950	rs3009	G	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=8;PP=777;SC=GGGCAGATGTGGGACCAGACT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=51874958;WS=51874940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	51883727	rs2547318	G	A	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=13;PP=967;SC=TCTGCCCCAGGCACTGACCTT;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=51883735;WS=51883717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	51919507	rs62114257	T	C	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=44;PP=1979;SC=CCTCATCCCCTGAAGCCTTTT;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=108;WE=51919515;WS=51919497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	51919949	rs9304711	G	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=571;SC=GGTCCTCTGTGCGCTCACACC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=51919957;WS=51919939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	51920613	rs1010425	C	T	6213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=87;PP=2965;SC=CTGTCCAGTCCTGTCGGGGGT;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=97;TCR=87;TR=183;WE=51920621;WS=51920603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr19	51981753	rs11878388	G	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.087;SC=TGGTCAGAGTGCACCCTGGGG;SOR=0.404;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=8;WE=51981761;WS=51981743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr19	51981965	rs75818312	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=333;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GATGCTGGATGCTGGATGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=21;WE=51981973;WS=51981955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr19	51984725	rs8106673	T	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=498;ReadPosRankSum=1.771;SC=GCTGACTGCCTCACAAATGTC;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=38;WE=51984733;WS=51984715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr19	51994813	rs16982733	G	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=0.939;SC=ATGGAGGGCTGTTAATTCTAA;SOR=0.540;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=51994821;WS=51994803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	51994851	rs16982735	C	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=367;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TTCTTTGCTGCAGGGGTCGTG;SOR=1.814;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=20;WE=51994859;WS=51994841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr19	52000624	rs3752135	T	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=626;ReadPosRankSum=0.699;SC=GATGCAGAAGTACAGGAAGAC;SOR=0.743;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=37;WE=52000632;WS=52000614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr19	52000672	rs3829658	G	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=760;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TGCCCCTAGCGTCACTCCTGA;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=49;WE=52000680;WS=52000662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr19	52002317	rs4801871	G	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=171;ReadPosRankSum=-1.775;SC=GGAGGGGGGGGCCGGGGCTCA;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=14;WE=52002325;WS=52002307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr19	52002488	rs968491	C	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=335;ReadPosRankSum=1.055;SC=CAGAAAGACACGGAGTTCCCA;SOR=0.530;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=24;WE=52002496;WS=52002478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr19	52002729	rs2009362	G	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=484;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TCATGGTCACGCCGGCCCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=31;WE=52002737;WS=52002719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr19	52003058	rs10420446	C	T	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1009;ReadPosRankSum=0.302;SC=CTTACTCCTCCCCTGAGCCAG;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=66;WE=52003066;WS=52003048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr19	52003089	rs10420457	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=812;ReadPosRankSum=0.382;SC=CCTCCAACTCCCTCCCAGGAT;SOR=0.529;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=47;WE=52003097;WS=52003079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr19	52003331	rs6509544	G	C	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=863;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GGAATCGACCGTGGGTATCCT;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=51;WE=52003339;WS=52003321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr19	52004469	rs3810108	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.340;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.781;NF=23;NR=18;PP=677;ReadPosRankSum=0.437;SC=CCATCACCCCCGGCCCCCTCC;SOR=0.245;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=41;WE=52004477;WS=52004459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr19	52004551	rs3810109	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.954;NF=34;NR=24;PP=925;ReadPosRankSum=0.535;SC=TCTTGGAGCCCGTGCCTTACC;SOR=0.805;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=58;WE=52004559;WS=52004541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,64:0.37:173
chr19	52004743	rs3810110	G	A	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1480;ReadPosRankSum=-1.664;SC=CACTGCTCGAGCTGGGTTGTT;SOR=0.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=89;WE=52004751;WS=52004733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,115:0.49:235
chr19	52004791	rs66949844	G	GC	4501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=2933;ReadPosRankSum=1.086;SC=ATGGTCCCCTGCCCGGAACCA;SOR=0.839;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=151;TCF=53;TCR=98;TR=69;WE=52004803;WS=52004781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,115:0.51:226
chr19	52004795	rs61742108	G	T	4504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=1.583;SC=TCCCCTGCCCGGAACCAGTAG;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=104;TCR=94;TR=93;WE=52004803;WS=52004781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,117:0.50:232
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chr19	52031648	rs10419617	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGAACCCGGAACCAGCCTCTT;SOR=1.300;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=12;WE=52031656;WS=52031638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr19	52032964	rs3976745	C	G	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1500;ReadPosRankSum=0.389;SC=TCGCGCACCTCCCCCCACACT;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=175;TCF=102;TCR=73;TR=85;WE=52032972;WS=52032954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,92:0.46:198
chr19	52033742	rs2305772	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=592;ReadPosRankSum=0.307;SC=GGAGCATCTGGGGTGGAAAGA;SOR=0.800;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=41;WE=52033750;WS=52033732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr19	52034338	rs146883710	CG	C	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.375;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.914;NF=6;NR=14;PP=617;ReadPosRankSum=0.135;SC=CCTCCCAAGACGGGGCTCCCG;SOR=0.368;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=20;WE=52034346;WS=52034328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr19	52034940	rs1551559	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-0.585;SC=GGAAGGACTGCGGGGAGGAAC;SOR=0.509;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=15;WE=52034948;WS=52034930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	52085095	rs35431178	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=385;ReadPosRankSum=-0.245;SC=AAAAGGAGCCGCGTGTGGAGG;SOR=0.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=25;WE=52085103;WS=52085085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr19	52085291	rs1543923	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=236;ReadPosRankSum=-0.777;SC=GCTATAAATGTTAAATGTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=52085299;WS=52085281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	52089806	rs10439118	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TTGTGTTCTGTGTCAATCAGC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=52089814;WS=52089799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr19	52090014	rs35625154	C	T	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1349;ReadPosRankSum=1.005;SC=GGATGCTGACCGCACAAAGAA;SOR=0.515;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=185;TCF=107;TCR=78;TR=89;WE=52090022;WS=52090004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,95:0.45:211
chr19	52090100	rs45541134	T	C	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=1880;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CAGAAAGCAATTGTGAATATA;SOR=0.556;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=231;TCF=126;TCR=105;TR=111;WE=52090108;WS=52090090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,121:0.47:257
chr19	52092821	rs1054328	C	G	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=57;PP=1790;ReadPosRankSum=0.185;SC=GCTTGCCCCCCCTTTCCATCT;SOR=0.642;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=293;TCF=154;TCR=139;TR=118;WE=52092829;WS=52092811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,132:0.38:344
chr19	52097177	rs7253296	T	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=487;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TCCTTGGTTTTGGGATCTTGC;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=27;WE=52097185;WS=52097167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr19	52097261	rs58301181	C	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=25;PP=1447;ReadPosRankSum=0.442;SC=GACGATTGTGCGTAACTGTTC;SOR=1.237;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=78;WE=52097269;WS=52097251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,85:0.47:181
chr19	52101918	rs1868947	T	C	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=477;ReadPosRankSum=0.277;SC=GTGCAGCACATGGTGCTTGTG;SOR=0.350;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=36;WE=52101926;WS=52101908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr19	52102232	rs58593232	TGA	T	663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.027;NF=0;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=-0.571;SC=ATCATCTTAGTGAGAGATGAA;SOR=1.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=14;WE=52102241;WS=52102222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr19	52104489	rs8113451	C	G	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=17;PP=1018;SC=ACATGGTGGACACCGTGCTCA;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=52104497;WS=52104479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	52104560	rs3752127	T	C	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=34;PP=1323;SC=GCTAGGGGGGTGCCCTTCCGC;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=52104568;WS=52104550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	52104713	rs3752126	G	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=687;SC=TGCTGGACCTGGTGCACTCGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=52104721;WS=52104703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	52115645	rs3829655	G	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=92;ReadPosRankSum=0.957;SC=TGATCTCCGGGGCTGTCTGGC;SOR=0.721;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=9;WE=52115653;WS=52115635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr19	52115833	rs12462938	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	52130788	rs8104955	G	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=0.966;SC=TGAGGTCGGAGCTGAGCCCCC;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=43;WE=52130796;WS=52130778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr19	52130830	rs8107754	C	A	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=37;PP=1038;SC=TGGCCCAGGGCCCAGCTGAGC;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=52130838;WS=52130820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	52130925	rs8108074	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=-0.581;SC=GGGGCCGGCCGGGCTCGAAAG;SOR=1.555;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=7;WE=52130933;WS=52130915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	52132524	.	TAC	T,TACACAC	310.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.09;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=7,7;NR=1,1;PP=208,264;SC=CTGTCTTCCTTACACACACAC;SOR=3.442;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8,8;WE=52132533;WS=52132514;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.64,0.36:11
chr19	52148980	rs11424909	C	CA	243.19	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQRankSum=-0.667;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr19	52148981	.	C	A	482	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=26;MQ=48.3;NF=17;NR=10;PP=482;QD=19.1396745388;SC=ACACACACACCCCCCTCACTC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=27;WE=52148989;WS=52148971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
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chr19	52223121	rs7248778	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=449;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GAGCAGCGGCAGGCTGCAGGA;SOR=0.829;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=32;WE=52223129;WS=52223111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr19	52223251	rs59168688	T	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr19	52227137	rs58597876	T	TACAC	475.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=5.304;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=1.875;SC=CATGGCTGTATACACACACAC;SOR=3.442;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=4;WE=52227145;WS=52227127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr19	52249071	.	CT	C	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.7630;HP=14;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=111;QD=23.0;SC=GACACAAAGGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=52249093;WS=52249061;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,5:0.71:7
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chr19	52249672	rs1042229	A	C	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=1185;ReadPosRankSum=0.297;SC=CAACGGCCACATTTATCCTCT;SOR=0.891;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=65;WE=52249680;WS=52249662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,76:0.50:153
chr19	52249947	rs2070745	C	G	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=45;PP=2044;SC=ATGGTAAAGACGAATTTGCAC;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=90;WE=52249955;WS=52249937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr19	52328133	rs7254019	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=222;ReadPosRankSum=1.573;SC=TTCTGACAGTGTTTTTCTTCC;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=14;WE=52328141;WS=52328123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr19	52376507	rs2288868	T	C	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1328;ReadPosRankSum=1.720;SC=TTTCCGCATTTGCTGCATCTG;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=90;TCR=73;TR=83;WE=52376515;WS=52376497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,94:0.49:191
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chr19	52504920	rs2903709	T	C	56.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTCCATACTATAACAAAAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=52504928;WS=52504910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	52505641	rs10714016	GT	G	1275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.963;NF=3;NR=35;PP=823;ReadPosRankSum=0.267;SC=AGCTGGTGGGGTTTTTTTCTT;SOR=0.869;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=8;TCR=71;TR=38;WE=52505649;WS=52505631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr19	52506985	rs1433089	T	C	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1000;ReadPosRankSum=1.108;SC=ATTTGGGAAATGACTGCTAAC;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=69;WE=52506993;WS=52506975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,81:0.48:169
chr19	52519608	rs8104890	C	T	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=882;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TGATGTATAACGAGAGTGCGT;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=62;WE=52519616;WS=52519598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,78:0.38:203
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chr19	52520714	rs12976476	G	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=50;SC=CCCAGCACTTGGGGAGGCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=52520722;WS=52520704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	52521192	rs61287503	A	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=-1.327;SC=TACTTCATATATGTGACACCT;SOR=1.802;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=22;WE=52521200;WS=52521182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr19	52521296	rs9636139	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=437;ReadPosRankSum=1.932;SC=AGCATCTGTTGTCCATGGTTC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=32;WE=52521304;WS=52521286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr19	52537576	rs11666149	T	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=482;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GCTTCTCTCCTGTATGAGTTC;SOR=1.252;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=30;WE=52537584;WS=52537566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr19	52587907	rs11084141	G	A	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.19;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
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chr19	52693277	rs13344984	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
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chr19	52803669	rs3217319	CTG	C	2027.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=1477;ReadPosRankSum=-1.051;SC=AAGAGTCATGCTGTGTGATGA;SOR=0.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=84;TCF=16;TCR=68;TR=36;WE=52803678;WS=52803659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr19	52825235	rs8102373	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=711;ReadPosRankSum=-1.020;SC=GTCGCAATTCACACCTTGCAG;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=43;WE=52825243;WS=52825225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr19	52852523	rs321953	T	C	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=38;PP=1618;SC=GTTCTCTCTGTTTCTTTCTGA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=52852531;WS=52852513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	52856955	rs1961205	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=665;ReadPosRankSum=0.743;SC=CATTCATGGACGTGGCCATCG;SOR=0.407;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=36;WE=52856963;WS=52856945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr19	52868883	rs11881435	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.329;SC=GGCTGATTCTGGTCCCTCCAC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=52868891;WS=52868873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	52869022	rs2241586	G	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=18;PP=903;SC=AACCCTTGAGGCACATCTGTC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=52869030;WS=52869012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	52869278	rs321937	G	C	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=28;PP=1180;SC=TTTAGAGTCCGTGCAAGCCTT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=52869286;WS=52869268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	52869312	rs162120	T	C	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=29;PP=1014;SC=TAATCCATACTGCAGAGAAAC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=52869320;WS=52869302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	52870052	rs1054612	C	G	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=892;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GAATTCACACCTAGCACAACA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=55;WE=52870060;WS=52870042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr19	52873023	rs707312	A	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=546;SC=CTCTGCCGGGACACAATCTAT;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=52873031;WS=52873021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	52877507	rs112064222	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.302;SC=GGGGTTTCACCGTGTTAGCCA;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=11;WE=52877515;WS=52877497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr19	52882733	rs10445583	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTGCAACCTTCGCTTCCTGG;SOR=0.437;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=8;WE=52882741;WS=52882723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr19	52882805	rs10445584	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TGAGCCTCCGCGCCTGGCCTC;SOR=0.892;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=12;WE=52882813;WS=52882795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr19	52882824	rs10445585	T	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=0.120;SC=TCATTTTTAATTTTTTTAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=12;WE=52882832;WS=52882814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	52887145	rs34470614	TA	T	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.280;NF=5;NR=18;PP=599;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACAAGTCTCTTAAAAATCAAC;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=23;WE=52887153;WS=52887135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr19	52887246	rs34678014	T	TCAA	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=696;ReadPosRankSum=0.722;SC=GAAAAACCTATCAACAATTCC;SOR=0.368;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=15;WE=52887254;WS=52887236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr19	52887427	rs8104808	A	C	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr19	52887437	rs8104812	A	C	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=1.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,82:0.53:155
chr19	52887904	rs2042913	T	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=751;ReadPosRankSum=0.483;SC=GTAATAAATGTGGCAAGGTCT;SOR=0.545;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=42;WE=52887912;WS=52887894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr19	52888210	rs56151179	T	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=639;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GATTTCATACTGGAGAGAAAC;SOR=0.952;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=48;WE=52888218;WS=52888200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr19	52888245	rs55748277	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=728;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GAATGTGGCAAGGACTTCACT;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=51;WE=52888253;WS=52888235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr19	52888620	rs3170100	T	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=1.838;SC=CAGCATGAGATAATTCATTCA;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=20;WE=52888628;WS=52888610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr19	52893473	rs7253837	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TGTCCCCTGCACTGGCCCGCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=52893481;WS=52893463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	52905067	rs324091	A	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=14;PP=557;SC=CTCAGTTAGGATAAATCAGAC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=52905075;WS=52905057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	52909303	rs2290745	C	T	7693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=112;PP=2965;SC=ATAATGTCCCCTCAGAAGCCG;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=123;TCR=112;TR=234;WE=52909311;WS=52909293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr19	52909458	rs2245620	T	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=758;SC=CTTTCTTCAGTTATTCTCCTC;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=52909466;WS=52909448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	52909989	rs11668956	A	G	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=726;SC=TGCGGTGGCAATCATAGCTCA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=52909997;WS=52909979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	52917590	rs162124	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=51;PP=1738;SC=GGGACTGAACGAAGGGGGCGA;SOR=2.334;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=66;WE=52917598;WS=52917579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	52917626	rs162123	A	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=30;PP=855;SC=ACAAAGGTGTATATTTGGAAG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=52917634;WS=52917616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	52918901	.	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=608;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TCATACTGGAGAGAAGCCTTA;SOR=0.881;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=38;WE=52918909;WS=52918891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,45:0.39:116
chr19	52920006	rs10664588	C	CTG	4888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=67;PP=2957;SC=TCCCTACAAACTGTATGGCAA;SOR=1.739;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=6;TCR=73;TR=73;WE=52920014;WS=52919996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	52934751	rs73588012	A	G	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.718;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.119;NF=47;NR=22;PP=1174;ReadPosRankSum=-1.244;SC=AGGTAAGGTAATGTTCTCAGT;SOR=0.356;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=133;TCF=96;TCR=37;TR=69;WE=52934759;WS=52934741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr19	52934778	rs73588013	G	C	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.321;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.189;NF=51;NR=36;PP=1393;ReadPosRankSum=0.326;SC=TTCTGTCTCTGTTTCTTCCTG;SOR=0.421;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=87;WE=52934786;WS=52934768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr19	52937100	rs2560996	G	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=560;ReadPosRankSum=0.930;SC=TGTGGATTTGGCGCAGTGCTC;SOR=0.267;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=42;WE=52937108;WS=52937090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr19	52937530	rs2560997	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=662;SC=AAATGGTTCACGAGGTCAGGA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=52937538;WS=52937520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	52938361	rs11084161	C	A	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=50;PP=2678;SC=CTGAGTGTTACCTCCATGTTG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=52938369;WS=52938351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	52938417	rs11084162	A	G	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=77;PP=2804;SC=AGTGAAAATAATAAACAATCC;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=143;WE=52938425;WS=52938407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	52938459	rs11084163	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=70;PP=2266;SC=AGGTGTGAACACAGGTGAGAG;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=106;WE=52938467;WS=52938449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	52940931	rs1428179	A	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=218;SC=TTTCTGTCAGACTTTAAACAT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=52940939;WS=52940921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	52941171	rs1428180	T	C	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=24;PP=1350;SC=ATAAGTTTTTTCAGTGTCAAA;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=52941179;WS=52941161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	52941540	rs1366257	G	A	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=44;PP=1878;SC=AAAGAATGTGGGAAAGTCTTT;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=90;WE=52941548;WS=52941530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	52941618	rs1366258	A	C	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=34;PP=1773;SC=AAATGTAGTGAATGTGGCAAA;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=74;WE=52941626;WS=52941608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	52941847	rs1366259	A	T	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=46;PP=2248;SC=TTCATACTGGAGAGAAACCTT;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=96;WE=52941855;WS=52941837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	52942159	rs2608497	A	G	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=67;PP=2965;SC=CAAACCTTCAACGACATAGGA;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=148;WE=52942167;WS=52942149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	52942445	rs2608498	C	T	11974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=134;PP=2965;SC=AGAGAAGCCTCACAGTTGTAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=133;TCR=134;TR=267;WE=52942453;WS=52942435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr19	52942495	rs2561001	G	A	11663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.579;NF=129;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=5.665;SC=CACACCTTGCGCGACATAGGA;SOR=0.580;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=129;TCR=135;TR=264;WE=52942503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:11,297:0.96:308
chr19	52942734	rs2446079	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=792;SC=CAGTGGCTCACGTCTGTAATC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=52942742;WS=52942724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	52954507	rs324104	T	C	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=32;PP=1224;SC=CCGGAGGTGCTGAGGAGCCAA;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=52954515;WS=52954497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	53005249	rs9304729	A	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=58;PP=1996;SC=ATGTATTGTAACAGCCAGTCT;SOR=1.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=84;WE=53005257;WS=53005239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr19	53077280	rs162833	C	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=758;ReadPosRankSum=1.039;SC=GTGTTACAGGCAGGAGGTGTG;SOR=0.945;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=49;WE=53077288;WS=53077270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
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chr19	53085393	rs62117246	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=0.844;SC=AATATTTACACATTTCAGTAT;SOR=0.023;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=12;WE=53085401;WS=53085383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr19	53085416	rs12975229	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=765;ReadPosRankSum=1.618;SC=TATAACTTCCGTACTTAATTT;SOR=2.846;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=35;WE=53085424;WS=53085406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr19	53085659	rs366793	C	T	5511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=90;PP=2965;SC=ATGACAAAAACCAAAAAGTTG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=170;WE=53085667;WS=53085649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	53085813	rs3745101	T	C	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=927;ReadPosRankSum=0.341;SC=TTGAGAAGGCTATCAACGATG;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=55;WE=53085821;WS=53085803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,63:0.56:113
chr19	53086124	rs373554	C	A	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=58;PP=2663;SC=AATCCTTACACGTGTAATGAG;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=125;WE=53086132;WS=53086114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	53086598	rs3745102	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.424;NF=25;NR=17;PP=653;ReadPosRankSum=-1.543;SC=GCATGTCATCGTAGACTTCAT;SOR=1.111;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=42;WE=53086606;WS=53086588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr19	53099965	rs2279151	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.511;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr19	53099975	rs2279152	C	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	53100323	rs7250630	A	G	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=723;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TGGAGAATCCATAATGAAGAC;SOR=0.783;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=58;WE=53100331;WS=53100313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,79:0.46:171
chr19	53100377	rs7250969	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=662;ReadPosRankSum=-1.099;SC=TTCAGACATCGATCATATCTT;SOR=0.806;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=42;WE=53100385;WS=53100367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,55:0.40:139
chr19	53100585	rs1802617	G	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=832;ReadPosRankSum=-1.144;SC=ATACTGGACAGAAATCTTACA;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=59;WE=53100593;WS=53100575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,71:0.46:153
chr19	53116933	.	GCCACACTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTTGTGCAAGGTGTGAAATATGATGGAAGACCTTT	G	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-2.495;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.962;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,36:0.33:110
chr19	53117017	.	T	G	261	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=58.88;NF=5;NR=10;PP=261;QD=19.7180808365;SC=GGAAGACCTTTCCACATACAT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=15;WE=53117025;WS=53117007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:38,15:0.28:53
chr19	53117531	rs1056185	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=268;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GCCACGCTCACTACATTTGTA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=19;WE=53117539;WS=53117521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr19	53117809	rs10406458	C	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=404;ReadPosRankSum=0.444;SC=CATCCTTTCTCCCATGCATGT;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=26;WE=53117817;WS=53117799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr19	53270384	rs1820128	A	G	4704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=86;PP=2965;SC=TGACATCTACAATGGCATGTA;SOR=1.144;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=147;WE=53270392;WS=53270374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	53303527	rs8107444	A	G	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=49;PP=2513;SC=TTCATTACACATGTATGGTTT;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=116;WE=53303535;WS=53303517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	53303705	rs10417163	T	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=981;ReadPosRankSum=1.349;SC=TTGTATGGTTTCTCTGCAGTA;SOR=1.014;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=55;WE=53303713;WS=53303695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,59:0.46:128
chr19	53303890	rs57548937	C	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=926;ReadPosRankSum=-2.258;SC=AGTATGAATCCTCTTATGTCT;SOR=0.702;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=59;WE=53303898;WS=53303880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,73:0.56:130
chr19	53304563	rs13382164	T	C	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.715;NF=48;NR=33;PP=1464;ReadPosRankSum=1.437;SC=CAACAAATTCTTTGGGATGTT;SOR=0.997;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=81;WE=53304571;WS=53304553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,81:0.45:182
chr19	53311395	rs7257656	G	A	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=75;PP=2539;SC=CCCTGAAATGGAAACACATTT;SOR=1.163;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=47;TCR=75;TR=122;WE=53311403;WS=53311385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	53343939	rs9749464	T	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=853;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CTTACAGGGTTGAATTGTGAT;SOR=0.481;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=115;TCF=83;TCR=32;TR=50;WE=53343947;WS=53343929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,50:0.40:124
chr19	53344118	rs10419826	C	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.859;NF=27;NR=32;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GATGTCTGACCGAAGGTCTTG;SOR=0.674;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=59;WE=53344126;WS=53344108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,46:0.31:148
chr19	53344701	rs10420793	A	G	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1257;ReadPosRankSum=0.280;SC=GGGATGAATTATGACCAAAGG;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=78;WE=53344709;WS=53344691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr19	53344919	rs58239286	T	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=841;ReadPosRankSum=0.031;SC=TTTTCTCTCATGTGTACTTCC;SOR=0.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=46;WE=53344927;WS=53344909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,50:0.38:133
chr19	53345447	rs60596790	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.225;NF=7;NR=28;PP=646;ReadPosRankSum=1.097;SC=TAAGTACAGACGGTATATAAT;SOR=0.817;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=35;WE=53345455;WS=53345437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr19	53345480	rs142157651	GA	G	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AAATATCACAGAAAAAAAACA;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=15;WE=53345488;WS=53345470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr19	53345515	rs62117470	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=0.196;SC=CTTCCCAAACGTGAGCTTCAA;SOR=0.096;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=53345523;WS=53345505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr19	53351266	rs7256165	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=228;ReadPosRankSum=1.155;SC=ACGAGAAATACCCACAGGTAT;SOR=1.008;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=15;WE=53351274;WS=53351256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr19	53369486	.	CAT	C	150	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=5;NR=0;PP=150;QD=32.0;SC=TATGATTATACATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=53369495;WS=53369478;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,5:0.56:9
chr19	53369845	rs11669868	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TTTATCATGTCGAGCTCTTTG;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=8;WE=53369853;WS=53369835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr19	53384185	rs6509701	C	T	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=50;PP=2178;SC=ATGCGAGGTACGCTTTTGTAC;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=103;WE=53384193;WS=53384175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	53452965	rs3745177	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=399;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TTATGAATGACGTCTGAAAAA;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=24;WE=53452973;WS=53452955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr19	53453777	rs8110062	C	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=884;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CAGTATGAATCTTCCTATGTC;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=56;WE=53453785;WS=53453767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr19	53454475	rs33949217	C	CACT	6646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=56;PP=2924;SC=GAGGAAGCACCGATAGACTTG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=99;WE=53454483;WS=53454465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	53454789	rs12459008	A	T	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=1181;ReadPosRankSum=-1.614;SC=TTCTCCTGTAATACTGTGCCT;SOR=1.243;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=63;WE=53454797;WS=53454779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr19	53456645	.	C	CAA	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5843;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=57.57;NF=0;NR=3;PP=64;QD=24.3333333333;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=53456653;WS=53456635;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr19	53553497	rs2195311	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	53576465	rs329734	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=4.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=-1.598;SC=ATGTAAGTGACAACATGCAGT;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=17;WE=53576473;WS=53576455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr19	53576589	rs329733	C	G	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=47;PP=1976;ReadPosRankSum=-1.239;SC=TGAGAACAATCTTAGAAGATA;SOR=0.849;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=231;TCF=135;TCR=96;TR=119;WE=53576597;WS=53576579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,141:0.50:284
chr19	53577419	rs8105668	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=271;ReadPosRankSum=-0.966;SC=GACACATTCCGGCGTTCTTGG;SOR=1.287;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=21;WE=53577427;WS=53577409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr19	53577668	rs167918	C	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=2.619;SC=TGCCTGTAATCCCAGCATTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=53577676;WS=53577658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	53589677	rs329718	C	T	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=58;PP=1857;SC=CACAGTCACACGCACAGATCT;SOR=1.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=53589685;WS=53589667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	53612311	rs4803051	T	C	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.455;SC=ACTCTTTACATGTGTAAGGTT;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=75;WE=53612319;WS=53612301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,83:0.56:149
chr19	53612745	rs1133327	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=2579;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TGGGTTTTGATGGTAGAAGAA;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=59;WE=53612765;WS=53612735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr19	53612757	rs1054485	T	G	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=2579;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GTAGAAGAAATTATTTGGGGT;SOR=0.566;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=69;WE=53612765;WS=53612735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr19	53618445	rs8099853	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	53618588	rs11434848	C	CA	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.629;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-2.719;SC=AACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.565;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=53618596;WS=53618578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr19	53619720	rs16984484	A	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=543;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TTTCACCAAGAGGTTATGAAG;SOR=1.510;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=29;WE=53619728;WS=53619710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr19	53619866	rs66667460	C	T	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=24.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr19	53651845	rs10694633	T	TTC	2119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=8;PP=1596;SC=GAATTCAAACTTGTTTTCCCA;SOR=2.786;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=34;WE=53651853;WS=53651835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	53667637	rs4803054	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=1.133;SC=GTGATCCCCCCGCCTCGGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=11;WE=53667645;WS=53667627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	53667804	rs4801958	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.423;SC=CCAGTATGGACTGCCATATGG;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=67;WE=53667812;WS=53667794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,87:0.51:169
chr19	53667913	rs12459469	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1061;ReadPosRankSum=0.159;SC=CAAGATGTGAATTTTGAGTGA;SOR=0.839;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=66;WE=53667921;WS=53667903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr19	53667940	rs12459471	A	G	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TGCCACATTCATTACATTTGT;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=55;WE=53667948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,74:0.48:154
chr19	53669273	rs4801959	T	C	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=50;PP=2257;SC=TTTCCCTTCATGTTGAAATTG;SOR=1.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=126;WE=53669281;WS=53669263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	53669492	rs12460170	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1012;ReadPosRankSum=0.596;SC=GGACAAGCCTACAGTGTCACA;SOR=0.737;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=58;WE=53669500;WS=53669482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr19	53669653	rs12460233	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGGTAAATAACTATTTCCCAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=53669661;WS=53669643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	53678924	rs4289099	C	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=472;ReadPosRankSum=-1.624;SC=GTTCAATTCACGTAAGCAGAC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=24;WE=53678932;WS=53678914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr19	53706984	rs12610332	G	A	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=45;PP=2762;SC=TCTTCCTAACGTCCCTAAATG;SOR=1.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=89;TCR=45;TR=134;WE=53706992;WS=53706974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	53707097	rs11084225	T	C	4350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=87;PP=2574;SC=CTCTCCCCCATGTGCTTGGTA;SOR=1.144;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=142;WE=53707105;WS=53707087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	53707289	rs7249771	C	T	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=35;PP=2491;SC=CATTCAGGGACGTGGCCATCG;SOR=1.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=111;WE=53707297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	53716118	rs75398478	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=363;ReadPosRankSum=-0.237;SC=AAAGGCTTATGTGAAGTGGTC;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=19;WE=53716126;WS=53716108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr19	53716190	rs10775558	A	G	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=44;PP=1961;SC=TACCAAATGCAGCAAGGCCTT;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=101;WE=53716198;WS=53716180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	53716278	rs10853858	A	G	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=59;PP=2223;SC=GAGTGTGGAAAAACCTTTACC;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=107;WE=53716286;WS=53716268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	53716460	rs10853859	A	G	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=18;PP=1142;SC=GTCAAAATTCACACCTTGTAA;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=53716468;WS=53716450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	53727097	rs36114232	G	A	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=528;SC=CTTGGTATTGGTTTTGTTTTT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=28;WE=53727108;WS=53727087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	53727100	rs35443981	T	TTA	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=7;PP=863;SC=GGTATTGGTTTTGTTTTTGCC;SOR=2.049;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=19;WE=53727108;WS=53727087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	53727282	rs11084227	A	G	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;PP=873;SC=CAAAGGGGTAAGACCTCCAGC;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=53727290;WS=53727272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	53727392	rs10401578	T	C	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=21;PP=1420;SC=CTGTCAAATCTTCATAGTAAT;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=53727400;WS=53727382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	53727573	rs12985503	A	G	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=79;PP=2936;SC=AGTAGTGCAGACCTGAATGTG;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=134;WE=53727581;WS=53727563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	53727591	rs10401984	T	C	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.55;QD=44.36;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	53727591	.	TCA	CCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=52.13;NF=37;NR=69;PP=2947;QD=20;SC=GTGATACTTTTCAACTGGCTT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=40;TCR=75;TR=106;WE=53727601;WS=53727581;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,106:0.92:115
chr19	53727593	rs11673594	A	G	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.28;QD=46.44;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
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chr19	53728218	rs11666631	G	C	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=45;PP=1156;SC=TTTGCTTTAGGGGGGTTATAC;SOR=1.552;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=66;WE=53728226;WS=53728208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	53728280	rs7248812	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=500;SC=ACTTCATGTAAAGCATCAGAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=53728288;WS=53728270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	53728332	rs78599127	G	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=1.309;SC=GTTGGTGTGTGTGCTGTCATT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=53728340;WS=53728322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr19	53740822	rs8113436	T	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=27;PP=1089;SC=GGCTTGAACGTTCAGCAAAGG;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=53740830;WS=53740812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	53741068	rs12984188	C	T	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=55;PP=2144;SC=TAGTGAGGTTCGAACACTGGT;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=99;WE=53741076;WS=53741058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	53741188	rs12984473	C	T	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=43;PP=1900;SC=AGTCATTACACTTGTATGATT;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=85;WE=53741196;WS=53741178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	53754736	rs2965240	T	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=12;PP=692;SC=GTCCAAAATATGGCATTTCAG;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=53754744;WS=53754726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr19	53761740	rs2965249	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.573;SC=TAAATATCAGTGCAGCCTGGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=53761748;WS=53761739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	53770569	rs115785997	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQRankSum=-9.495;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,31:0.16:196
chr19	53788159	rs56156132	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQRankSum=-4.771;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr19	53793042	rs8109165	G	A	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.714;SC=ACAGCGATATGTCTGTCCATG;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=91;WE=53793050;WS=53793032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,109:0.49:222
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chr19	53802207	rs2115305	C	T	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=169;SC=GGGCTGACCCCGCACAGGGCT;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=53802215;WS=53802197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr19	53802342	rs1965724	G	A	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.38;QD=38.20;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	53818436	rs7256991	C	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.806;NF=29;NR=18;PP=783;ReadPosRankSum=1.147;SC=TTATCACAGACCGTGGTGGGA;SOR=0.733;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=47;WE=53818444;WS=53818426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr19	53818473	rs7257010	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.271;NF=28;NR=20;PP=708;ReadPosRankSum=1.412;SC=CTCTTCTTCTCCATTATCTCT;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=48;WE=53818481;WS=53818463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr19	53818502	rs2865265	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.527;NF=28;NR=24;PP=830;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TGCACTGGGTACAGGTTAAGG;SOR=0.477;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=52;WE=53818510;WS=53818492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr19	53818564	rs73055190	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.137;NF=22;NR=25;PP=735;ReadPosRankSum=-1.737;SC=CTTAGCTCTCCGCTGTAAAGG;SOR=0.627;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=47;WE=53818572;WS=53818554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr19	53818603	rs10439122	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.014;NF=19;NR=27;PP=669;ReadPosRankSum=-2.565;SC=AGCTTTTGGGGTTAGATATTT;SOR=0.631;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=46;WE=53818611;WS=53818593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr19	53849446	rs4803089	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=105;SC=TCTGTTTCATGTTATCTGTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=53849454;WS=53849436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	53849599	rs8108958	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=0.077;SC=GCAGCAGTGCCGTATGTGATC;SOR=1.062;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=17;WE=53849607;WS=53849589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr19	53849632	rs11406858	G	GC	1215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=1107;SC=AGCCGGCTTCGCTCTCGTGCT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=24;WE=53849640;WS=53849622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr19	53856349	rs55874600	A	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1076;ReadPosRankSum=0.313;SC=AGTGTAATGAATGTGGCAAGA;SOR=0.532;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=62;WE=53856357;WS=53856339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
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chr19	53888388	rs2708713	T	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CTTGAATATCTACATTTTTTT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=53888396;WS=53888378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	53905129	.	TA	T	276	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=59.2;NF=17;NR=5;PP=276;QD=12.7272727273;SC=ACTCCACCTTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=22;WE=53905137;WS=53905119;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,22:0.56:39
chr19	53905469	rs3975046	A	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=45;PP=1375;SC=CCTCCTGGGGATGTGCCCTTG;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=53905477;WS=53905459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	53910912	rs2061773	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=11;PP=1223;SC=TTTACCATCTGTACTTAATTT;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=53910920;WS=53910902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	53911973	rs10425136	A	G	8336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=129;PP=2965;SC=TAATGAGTGTAGCAAGACCTT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=127;TCR=129;TR=256;WE=53911981;WS=53911963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr19	53912242	rs10426347	G	A	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=84;PP=2965;SC=TCAGCCGGACGTCATCCCTTA;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=55;TCR=84;TR=139;WE=53912250;WS=53912232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	53926318	rs36087592	T	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.44;QD=42.61;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	53926320	rs34818233	T	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.25;QD=47.09;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	53952695	rs35065977	T	TCC	2373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.812;NF=20;NR=41;PP=2400;ReadPosRankSum=-2.683;SC=TTCACCTCTCTTCTTCTCATT;SOR=1.063;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=61;WE=53952703;WS=53952685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,63:0.41:153
chr19	53958126	rs2708743	T	G	8206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=117;PP=2965;SC=TTGACAGGTATTACAGAACGA;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=123;TCR=117;TR=240;WE=53958134;WS=53958116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr19	53958263	rs1984432	G	A	11155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=171;NR=156;PP=2965;SC=TGTGAAGTCTGTCCACGATGC;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=327;TCF=171;TCR=156;TR=327;WE=53958271;WS=53958253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr19	53991335	rs2617675	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=57.22;NF=10;NR=1;PP=307;SC=CTGGAGTGCAGTGGCACAATC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=53991343;WS=53991330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	53993670	rs2617667	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.345;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.518;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,63:0.27:235
chr19	53993719	rs140217321	A	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.318;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.669;NF=43;NR=29;PP=1066;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CAAAGACATGAAAGTCATCAC;SOR=1.030;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=230;TCF=126;TCR=104;TR=72;WE=53993727;WS=53993709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,84:0.30:276
chr19	53994178	rs10421308	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:275,93:0.25:368
chr19	53994821	rs201526537	CAA	C	3883.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.483;NF=22;NR=49;PP=2530;ReadPosRankSum=-0.515;SC=CTGAGTGTGTCAAGACGTTCA;SOR=0.659;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=217;TCF=57;TCR=160;TR=71;WE=53994830;WS=53994811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,111:0.33:337
chr19	53995004	rs2708845	G	A	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=82;PP=2965;SC=GTTTTAATCGGAAAACACACC;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=53995012;WS=53994994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	54006799	.	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.242;NF=15;NR=8;PP=363;ReadPosRankSum=0.669;SC=ACCTAATTGTAGCCAACACCG;SOR=0.629;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=23;WE=54006807;WS=54006789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr19	54007145	rs72487103	G	A	2095.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=2.880;NF=35;NR=49;PP=1285;ReadPosRankSum=4.475;SC=ATACTGTTCTGCTGCTGATCA;SOR=0.801;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=84;WE=54007153;WS=54007135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:11,92:0.89:103
chr19	54072757	rs3746304	C	T	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=47;PP=1316;SC=TGTTTCCCAGCTCTTTCTATT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=56;WE=54072765;WS=54072747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	54072782	rs3746303	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-5.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=277;ReadPosRankSum=2.043;SC=TGAATGATAATGCCACGTAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=17;WE=54072790;WS=54072772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	54080067	rs61744130	T	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=950;ReadPosRankSum=0.269;SC=TAACTGGATATGTGAAGGTAC;SOR=0.819;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=75;WE=54080075;WS=54080057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr19	54080144	rs8109631	A	G	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=63;PP=2490;SC=ATGTCAAAAGACCTGCTACTA;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=110;WE=54080152;WS=54080134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	54080279	rs1351	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=487;ReadPosRankSum=1.722;SC=TCCATACTGGTGAGAAACCTT;SOR=0.695;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=34;WE=54080287;WS=54080269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr19	54080780	rs16985052	C	T	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=967;ReadPosRankSum=-1.067;SC=AGATCCACACCGGTGAGAAGC;SOR=0.996;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=58;WE=54080788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr19	54080999	rs1056393	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=759;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TCATTTATGGATCGAGCCTCG;SOR=1.314;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=46;WE=54081007;WS=54080989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
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chr19	54106547	rs1541925	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTCCCTACTCGGCCCCCTGCC;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=54106555;WS=54106537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr19	54197761	rs10415265	T	C	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=66;PP=1585;ReadPosRankSum=-1.641;SC=TGCTGATCTTTGTAATATCTT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=106;TCR=134;TR=118;WE=54197769;WS=54197751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,136:0.47:287
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chr19	54198559	rs10420348	A	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=755;ReadPosRankSum=-2.969;SC=GGAAAGCAACAGTGAAGTTGA;SOR=0.949;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=54;WE=54198567;WS=54198549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,65:0.40:161
chr19	54200922	rs57056811	T	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=960;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TTGCAGAGCATGCTTATAATT;SOR=0.072;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=67;WE=54200930;WS=54200912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,75:0.68:110
chr19	54203199	rs2116850	G	A	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1360;ReadPosRankSum=0.581;SC=ATGCATCTTTGTTTTTGTGTC;SOR=0.673;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=112;TCR=62;TR=86;WE=54203207;WS=54203189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,97:0.49:198
chr19	54205961	rs10414727	T	A	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=0.502;SC=AACAGCAACATCAAAAAACCA;SOR=0.851;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=41;WE=54205969;WS=54205951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr19	54206144	rs115619728	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=128;ReadPosRankSum=1.857;SC=TCAGACGTGGACGATGGTGGG;SOR=0.045;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=54206152;WS=54206134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	54211903	rs7256241	T	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=491;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CAGAAAACGGTCAAACAGCGA;SOR=0.345;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=30;WE=54211911;WS=54211893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr19	54216790	.	T	TTTGG	974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=6.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQRankSum=1.542;QD=21.66;ReadPosRankSum=-1.577;SOR=0.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr19	54216813	rs2865855	A	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.36;ReadPosRankSum=-2.686;SOR=0.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr19	54219769	rs4801998	G	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=502;ReadPosRankSum=0.553;SC=GGGCCAATACGTGCATCTTTA;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=34;WE=54219777;WS=54219759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
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chr19	54224191	rs12973211	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=513;ReadPosRankSum=0.237;SC=GCTTGAACCCAGGAGGCGGAG;SOR=0.416;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=28;WE=54224199;WS=54224181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr19	54224285	rs58416318	CA	C	2403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.116;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,110:0.45:245
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chr19	54257190	rs62144158	AC	GA	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.12;QD=45.06;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr19	54297234	rs10410581	G	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.665;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=431;ReadPosRankSum=0.237;SC=CATTATGCTGGGGGGGTGATG;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=24;WE=54297242;WS=54297224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr19	54307322	rs12460528	G	A	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=82;PP=2699;SC=GGTTGGTGCCGAGCACAGAAG;SOR=1.000;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=141;WE=54307330;WS=54307312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	54308554	rs4806773	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=28;PP=1623;SC=GCAGCCTGCACTGGGGATGCC;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=80;WE=54308562;WS=54308544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	54310961	rs2866112	G	C	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1535;SC=TGTTACTGGTGCTTGACAACT;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=54310969;WS=54310951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	54311090	rs11084300	C	T	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=CCACAACCTCCGCCTCCTGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=54311098;WS=54311080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr19	54318322	rs77330585	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=119;ReadPosRankSum=-0.638;SC=ATTACGTCGAAATGCCTGCAT;SOR=0.330;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=54318330;WS=54318312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr19	54501527	rs34604090	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1396;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TCTTCACCACGGGGGAGAATG;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=89;TCR=93;TR=91;WE=54501535;WS=54501517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,105:0.50:212
chr19	54502786	rs7247590	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=335;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TTCTTCTCTCGTCCCGAATCT;SOR=0.100;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=23;WE=54502794;WS=54502776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr19	54515415	rs12980121	G	C	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=26;PP=1293;ReadPosRankSum=0.145;SC=GGGTCCCTCTGTCCCAAGCGG;SOR=0.742;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=102;TCR=58;TR=75;WE=54515423;WS=54515405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,90:0.49:185
chr19	54544177	rs1035829	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=18;PP=693;SC=TTGGCCAGCACGATCCCCCCT;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=54544185;WS=54544167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	54554942	rs4442924	C	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr19	54579363	rs4806706	C	A	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=42;PP=2628;SC=CCTTTCCCAGCGATTCTCCTT;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=117;WE=54579371;WS=54579353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	54600232	rs1657535	A	C	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=23;PP=1599;SC=GCAGCGGTAAATTCCCCCTTG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=77;WE=54600240;WS=54600222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	54604194	rs3760698	G	C	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TTACGGAAGAGAGTATCGAGG;SOR=0.869;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=72;WE=54604202;WS=54604184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr19	54604319	rs7253859	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.367;SC=AATACTAGTCAGGAGGTGGAG;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=54604327;WS=54604309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	54606209	rs254260	T	G	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=32;PP=1500;SC=AAGTGCAGGTTCCGGTGGCGC;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=54606217;WS=54606199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	54606405	rs254259	T	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=710;ReadPosRankSum=-3.099;SC=GGGTGACGCTTCTTGCCACCC;SOR=0.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=42;WE=54606413;WS=54606395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,47:0.36:129
chr19	54609027	rs254257	A	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=750;ReadPosRankSum=1.215;SC=GTTAGGCTCCAACCCCTACCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=44;WE=54609035;WS=54609017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr19	54609170	rs254256	A	G	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.659;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr19	54609178	rs254255	C	G	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.540;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr19	54609692	rs254266	T	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.967;NF=3;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=1.180;SC=TAGCCAGGATTGTCTCGATCT;SOR=0.223;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=54609700;WS=54609682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	54609746	rs8100254	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.231;NF=3;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=0.874;SC=AAAGTGCTGGGATTACAGGTG;SOR=0.551;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=6;WE=54609754;WS=54609736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr19	54611560	rs254263	C	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=0.887;SC=TCCTGGCAGGCAGGAGGGGGA;SOR=0.777;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=16;WE=54611568;WS=54611550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
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chr19	54632423	rs655240	T	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=991;SC=CGCCTCCTCTTCCCCCTAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=54632431;WS=54632413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr19	54647078	rs34281370	T	TGG	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GGGTAGGGGTTGGGGGGGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=4;WE=54647086;WS=54647068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr19	54649671	rs36665	T	C	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=67;PP=2508;SC=CCACCTCCCCTCCCAGCCACA;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=122;WE=54649679;WS=54649661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	54651774	rs35247489	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=0.449;SC=GTGGGGGCAGCGAGGCCAGAG;SOR=0.061;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=11;WE=54651782;WS=54651764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
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chr19	54653572	rs36661	C	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.493;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.466;NF=3;NR=22;PP=464;ReadPosRankSum=-1.820;SC=GCTGCACCCCCTGCCCCCACC;SOR=1.525;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=25;WE=54653580;WS=54653562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr19	54653597	rs1611078	CTT	C	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.678;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.827;NF=1;NR=11;PP=410;ReadPosRankSum=0.018;SC=TTCTGGATCTCTTTCTCTGGC;SOR=2.694;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=12;WE=54653606;WS=54653587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr19	54656766	.	G	GC	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.675;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.871;NF=8;NR=15;PP=628;ReadPosRankSum=0.117;SC=GCAGCCTCGGGCCCCCCGGCT;SOR=0.295;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=23;WE=54656774;WS=54656756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr19	54657069	rs42318	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=773;ReadPosRankSum=1.078;SC=CTCTGCTCATCGGCACATTCT;SOR=0.379;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=47;WE=54657077;WS=54657059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr19	54657877	rs4806718	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=583;ReadPosRankSum=0.380;SC=GCACACTCGCTTGGGGTGTGG;SOR=0.746;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=29;WE=54657885;WS=54657867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr19	54664209	rs36657	G	C	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1060;ReadPosRankSum=1.628;SC=CTCACCGTCTGTCTCTGACGT;SOR=0.489;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=64;WE=54664217;WS=54664199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr19	54664752	rs36656	A	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=693;ReadPosRankSum=-0.679;SC=ATGGACCACAAAGCTTAGAAG;SOR=0.570;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=50;WE=54664760;WS=54664742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr19	54665970	rs36655	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=842;ReadPosRankSum=-0.523;SC=CCTGGAACTCCTGGGTCCCCG;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=50;WE=54665978;WS=54665960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr19	54666060	rs12978996	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=46;ReadPosRankSum=2.441;SC=GTCAGGGGAGTGGCGGCCTGG;SOR=0.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=54666068;WS=54666050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr19	54666357	rs2289146	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=0.191;SC=CGATGGGGCACGGCCTCGTCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=54666365;WS=54666347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	54668392	rs113570942	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=317;ReadPosRankSum=1.046;SC=GGGCCTCCCGGTTCCCCAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=18;WE=54668400;WS=54668382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr19	54668487	rs36653	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=0.645;SC=TGGTTCCACCCGCTCCAGGAA;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=12;WE=54668495;WS=54668477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr19	54672460	rs6509847	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-1.151;SC=CAGGACCAGCCCCTCCTACCC;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=12;WE=54672468;WS=54672450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	54672510	rs201671673	TTTTC	T	111	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.75;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	54676763	rs641738	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.09;MQRankSum=0.903;NF=14;NR=32;PP=747;ReadPosRankSum=1.511;SC=GGCCAGCCACCCCCTAGAGGA;SOR=0.962;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=46;WE=54676771;WS=54676753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr19	54676814	.	G	GC	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.959;NF=1;NR=13;PP=442;ReadPosRankSum=-1.982;SC=TTCTTCCATGGCCCAGGCTGG;SOR=0.119;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=14;WE=54676822;WS=54676804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr19	54677759	rs4806721	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=296;SC=GGAGCTTCTCTGGGGCAAGGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=54677767;WS=54677749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	54691225	rs1865961	T	C	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=24;PP=821;SC=GCCTTGGCCATTCACTCCACG;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=54691233;WS=54691215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54695163	rs593073	T	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=150;SC=TGCAGCGGTCTGCGGCGCGCA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=54695171;WS=54695153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	54696292	.	C	CT	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.8060;HP=19;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=58.28;NF=0;NR=3;PP=33;QD=12.3333333333;SC=CTGCGTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=54696300;WS=54696282;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	54697079	rs7595	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=17;PP=1083;SC=GCTGGGCCCCCGAGGACACCA;SOR=1.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=54697087;WS=54697069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	54697602	rs36622	G	A	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=39;PP=1274;SC=GGCCTGGAGGGGGGGGACTGA;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=54697610;WS=54697592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	54705207	rs36615	G	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1182;ReadPosRankSum=1.942;SC=TTAGCACGTGGATGAAGGTGC;SOR=0.691;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=78;WE=54705215;WS=54705197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr19	54705317	rs158366	C	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=533;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TGTGCCAGTACGTGGGACTAC;SOR=0.302;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=29;WE=54705325;WS=54705307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr19	54705340	rs2304524	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=346;ReadPosRankSum=0.813;SC=TTGTCCACCCCCTTCTCCCCA;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=19;WE=54705348;WS=54705330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	54705588	rs17305304	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=689;ReadPosRankSum=-1.492;SC=GATAAATGGAACCAGCCTTCT;SOR=0.752;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=43;WE=54705596;WS=54705578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr19	54705619	rs36614	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=38;PP=1111;SC=GGCACTTGTGAAGTAGGAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=54705627;WS=54705609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	54705641	rs17305311	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=0.853;SC=TGTATCTGGATCAGTCTTTGC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=19;WE=54705649;WS=54705631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr19	54711258	rs2304523	T	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=440;ReadPosRankSum=-0.974;SC=CCTTGTCGCTTCTTCCAGGGT;SOR=0.764;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=31;WE=54711266;WS=54711248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr19	54720896	rs3745410	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=610;ReadPosRankSum=-1.586;SC=CACTGGGGGCAGCTCCCGTGC;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=36;WE=54720904;WS=54720886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr19	54723355	rs255774	A	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=52;PP=1219;ReadPosRankSum=0.569;SC=CGGGAGTCTGACCTGCAGCCC;SOR=0.503;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=131;TCF=25;TCR=106;TR=66;WE=54723363;WS=54723345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr19	54723738	rs255772	G	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.626;NF=5;NR=4;PP=353;ReadPosRankSum=0.580;SC=CCTCACTCACGATTCTGAGGG;SOR=1.171;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=9;WE=54723746;WS=54723728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr19	54723813	rs8101337	G	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-4.616;QD=4.81;ReadPosRankSum=-3.020;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,15:0.20:76
chr19	54723822	rs2885369	GT	AC	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=4.528;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-5.366;QD=4.10;ReadPosRankSum=-3.771;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,12:0.15:78
chr19	54723829	rs4023903	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=6.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-7.189;QD=1.25;ReadPosRankSum=-3.218;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,7:0.09:76
chr19	54724457	.	TA	CG	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=33.834;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.02;MQRankSum=1.903;QD=19.33;ReadPosRankSum=3.545;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,99:0.72:137
chr19	54725798	rs75069054	G	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=26;PP=981;SC=GTGGCTGGGGGTCACGGGGCC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=54725806;WS=54725788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54726162	.	T	G	593	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=46.34;NF=26;NR=7;PP=593;QD=19.0233700772;SC=GTCATCACCATCTCCAGGGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=97;TCR=25;TR=33;WE=54726170;WS=54726152;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:89,33:0.27:122
chr19	54726226	rs75672336	T	C	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=0.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQRankSum=-13.026;QD=7.79;ReadPosRankSum=2.186;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,85:0.28:308
chr19	54726241	rs77279742	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQRankSum=-11.373;QD=1.45;ReadPosRankSum=3.889;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,62:0.18:336
chr19	54726665	rs373978777	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.39;MQRankSum=0.674;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.450;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	54726701	rs200031404	G	GTCC	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.49;MQRankSum=-3.703;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.210;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr19	54726711	rs140063405	G	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQRankSum=-4.171;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.555;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
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chr19	54743057	rs73053480	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,18:0.19:93
chr19	54743747	rs10403230	C	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=8.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.202;NF=1;NR=51;PP=962;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TGGGGGAGGCCGCGCTCCCCA;SOR=2.764;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=151;TCF=15;TCR=136;TR=52;WS=54743737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,51:0.34:148
chr19	54743758	rs7246746	C	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=35.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.90;MQRankSum=0.987;QD=4.49;ReadPosRankSum=2.042;SOR=0.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,32:0.26:123
chr19	54745507	.	TG	CA	304	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=46.59;NF=3;NR=5;PP=304;QD=44.6834843578;SC=GGGGGGTGTTTGTATAATAGT;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=8;WE=54745516;WS=54745486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,8:0.22:37
chr19	54746051	rs620207	A	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.258;NF=53;NR=39;PP=1408;ReadPosRankSum=0.535;SC=ATTTCTGTCCAAGGGCTCTGG;SOR=0.979;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=267;TCF=141;TCR=126;TR=92;WE=54746059;WS=54746041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,74:0.29:253
chr19	54746081	rs28445220	T	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.890;NF=78;NR=79;PP=2037;ReadPosRankSum=3.198;SC=TTTATCCAGTTGGTACTCCTG;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=273;TCF=128;TCR=145;TR=157;WE=54746089;WS=54746071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,135:0.52:260
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chr19	54754752	rs433291	T	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=23;PP=681;SC=TCAAGCTGTGTAGCTGGGCGT;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=54754760;WS=54754742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	54754820	rs429425	T	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.11;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr19	54756024	rs405443	A	C	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=63;PP=1603;SC=GAGACTTCTCAGTCCTGCCAG;SOR=1.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=108;WE=54756032;WS=54756014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	54756118	rs405152	A	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=21;PP=632;SC=GGTTCAGACCACCTCCCCCTT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=54756126;WS=54756108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	54756142	rs72087	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=10;PP=377;SC=CCCAGACCCCTCCCAGCCTGT;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=54756150;WS=54756132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	54756302	rs415860	A	G	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=29;PP=1185;SC=GGGCAGTGAGAGGGCTGTGCG;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=54756310;WS=54756292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	54756657	rs434755	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=656;ReadPosRankSum=0.760;SC=TGACTTTCCTCTGTGTTTGGT;SOR=1.002;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=37;WE=54756665;WS=54756647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,42:0.36:117
chr19	54760648	rs144513332	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=0.359;SC=TAGAATGGAATCAGAGGCTGG;SOR=1.493;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=14;WE=54760656;WS=54760638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	54778694	rs62134981	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.912;NF=9;NR=8;PP=258;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CTGCAGCGGGGGAGAGTGAGA;SOR=0.793;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=17;WE=54778715;WS=54778684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	54778707	rs57307400	T	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=6.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQRankSum=-3.845;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.114;SOR=1.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr19	54779679	.	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.058;NF=7;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-1.050;SC=GGGAGGCAGCGTGCTGGACAA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=54779687;WS=54779677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	54781466	rs3859538	C	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.324;NF=11;NR=6;PP=221;ReadPosRankSum=-1.962;SC=TGGGTCAGGACGGGGAGGTGA;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=17;WE=54781474;WS=54781456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
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chr19	54781541	rs450937	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.909;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.569;NF=6;NR=0;PP=415;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GGCCCCAACACTTCTCTCTGC;SOR=3.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=6;WE=54781565;WS=54781536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
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chr19	54782724	rs7247538	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=7.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-4.640;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
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chr19	54783375	rs373032	T	A	6888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=93;PP=2965;SC=GTGGGTGTTCTTCTTCTCCTT;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=192;WE=54783383;WS=54783365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr19	54783521	rs383925	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GAAGGAGGCACCGTGTTAAAT;SOR=0.498;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=28;WE=54783529;WS=54783511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr19	54783923	rs366337	A	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=52;PP=1738;SC=TGGGCTTGGGAATGGTCCCTG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=71;WE=54783931;WS=54783913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	54786022	rs4112253	G	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=387;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TCTTCAGATGGACAAGGAGAC;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=24;WE=54786030;WS=54786012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr19	54797848	rs103294	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=797;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TCCCAAGGTTCCACCACTCTG;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=52;WE=54797856;WS=54797838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr19	54800222	rs368178	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr19	54800225	rs368177	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
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chr19	54848157	rs76665615	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=12.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-14.266;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,37:0.18:207
chr19	54848986	rs36068997	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-0.483;SC=AAAGATGAGTCGGGACTCGGA;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=11;WE=54848994;WS=54848976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr19	54849942	rs2241384	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=922;ReadPosRankSum=1.232;SC=GATGGGTTTGGGTAGGTTTTC;SOR=0.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=58;WE=54849950;WS=54849932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr19	54870191	rs111949142	T	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.501;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=1.616;SC=CTCCTCATTCTTGGTGCATCA;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=54870199;WS=54870181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	54875881	rs62132211	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.327;NF=13;NR=10;PP=346;ReadPosRankSum=1.760;SC=ACTGGGAAGACGGGACGAAGG;SOR=0.307;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=23;WE=54875889;WS=54875871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr19	54876324	rs3745441	T	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.823;NF=27;NR=14;PP=596;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GAGCAGGGAATTTTCCAGACC;SOR=0.433;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=41;WE=54876332;WS=54876314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr19	54926249	rs17516390	T	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=4;PP=1146;SC=GGACTTCTTATCCATGGAATT;SOR=4.450;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=47;WE=54926257;WS=54926239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	54930822	rs35134302	A	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=860;SC=CAATTTCCACATCTGTAAACT;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=54930830;WS=54930812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	55009317	rs3865498	G	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.88;QD=30.55;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	55009452	.	C	T	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.687;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.844;NF=35;NR=23;PP=981;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GGGTTGCATCCGGGCCAGAAG;SOR=1.060;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=58;WE=55009460;WS=55009442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr19	55019402	rs2277974	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GGTGAAAGGTAAGGACGTCAC;SOR=0.074;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=55019410;WS=55019392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	55043810	rs17606773	G	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=657;SC=GTTCAAGTCAGGCCTTTGTTA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=55043818;WS=55043800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr19	55049088	rs10632924	A	AAAAGAAAG	2125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.97;QD=54.51;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr19	55087313	rs7249811	T	G	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1697;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GTGCAGCCGGTCCCCACAGTA;SOR=0.849;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=211;TCF=121;TCR=90;TR=100;WE=55087321;WS=55087303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,116:0.44:262
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chr19	55088977	rs7257319	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=201;ReadPosRankSum=0.294;SC=GGGTCCCTGGGCCATCTCAAG;SOR=1.218;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=17;WE=55088985;WS=55088967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr19	55105666	rs28635090	G	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-5.248;QD=12.92;ReadPosRankSum=2.074;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,32:0.37:86
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chr19	55105727	rs28469702	A	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQRankSum=-7.092;QD=11.92;ReadPosRankSum=-2.580;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
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chr19	55105803	rs10410699	C	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-4.908;NF=7;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=0.452;SC=CCACAGCCGACCTCTAGTCCC;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=15;WE=55105811;WS=55105793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr19	55106317	rs10416917	A	G	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1205;ReadPosRankSum=0.870;SC=TCCCCATCCCATCCATCACCT;SOR=0.602;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=222;TCF=107;TCR=115;TR=93;WE=55106325;WS=55106307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,102:0.39:264
chr19	55106663	rs10417589	A	G	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GGCATTTGGCAGCTTCATTCT;SOR=0.626;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=216;TCF=109;TCR=107;TR=96;WE=55106671;WS=55106653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,132:0.48:273
chr19	55106778	rs10418391	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.433;NF=27;NR=36;PP=953;ReadPosRankSum=1.946;SC=AGCCCGAGTCGCAGGTGGTCG;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=63;WE=55106786;WS=55106768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr19	55106865	rs373854	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.943;NF=9;NR=27;PP=577;ReadPosRankSum=0.695;SC=CTCCTGGTCCTAGGTGAGAAA;SOR=1.391;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=36;WE=55106873;WS=55106855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr19	55107308	rs35534776	G	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQRankSum=-2.314;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
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chr19	55107343	rs10425981	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQRankSum=-3.422;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	55107354	rs61739190	C	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.35;MQRankSum=-3.623;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	55107629	rs28516458	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=708;ReadPosRankSum=-1.305;SC=TGGGGCAGCCTCTCACCCATC;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=44;WE=55107637;WS=55107619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr19	55142101	rs3760861	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.312;NF=33;NR=12;PP=742;ReadPosRankSum=-0.409;SC=ACCCCACAACGCTGAGCTGAT;SOR=1.118;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=45;WE=55142109;WS=55142091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,45:0.38:117
chr19	55142930	rs3843752	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=489;ReadPosRankSum=-1.445;SC=AGTTAGAATCCGACTCCTGAT;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=25;WE=55142938;WS=55142920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr19	55143083	rs1061679	T	C	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.198;NF=54;NR=42;PP=1635;ReadPosRankSum=0.746;SC=AAAACAGCACTCTGGATTACA;SOR=0.780;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=96;WE=55143091;WS=55143073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,123:0.54:228
chr19	55146462	rs67481620	GT	G	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQRankSum=-0.489;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr19	55146565	rs10416070	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.47;MQRankSum=1.020;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr19	55148390	rs8101262	C	A	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AGCTGCCCCCCCAGTGGACAC;SOR=0.675;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=31;WE=55148398;WS=55148368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr19	55174498	rs28366008	T	C	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=793;ReadPosRankSum=0.978;SC=GATCCCCACCTTCACGGCTCT;SOR=0.878;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=55;WE=55174506;WS=55174488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,69:0.49:140
chr19	55175596	rs3050015	T	TGTGGGAG	4096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=20;PP=2969;SC=CTGGGGATGATGTGGGAGCCC;SOR=1.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=55;WE=55175604;WS=55175586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	55175740	rs3745871	C	T	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1891;ReadPosRankSum=0.058;SC=TGGACACTTTCCTTCTGATCA;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=109;TCR=118;TR=108;WE=55175748;WS=55175730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,132:0.49:268
chr19	55176262	rs731170	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=867;ReadPosRankSum=0.534;SC=TCCTTGGAGGATCCCAGGCCC;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=57;WE=55176270;WS=55176252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr19	55176535	rs1925241	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-0.922;SC=CGAGCTGATGCGGGGAGCAGG;SOR=0.459;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=18;WE=55176543;WS=55176525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	55177929	rs760186	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=381;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GTGGAGCTGGGGGTCCCAAAA;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=20;WE=55177937;WS=55177919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr19	55239129	rs144626680	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.72;QD=30.60;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	55258731	rs62122557	T	C	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;QD=20.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	55266447	rs2916031	A	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.75;QD=22.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	55278607	rs2365247	C	T	5054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=61;PP=2965;SC=TCCTGGAAAACGTGAGCACCC;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=100;TCR=61;TR=161;WE=55278615;WS=55278597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	55278805	rs34684434	A	C	7398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=144;PP=2965;SC=CCAGATCCAAAGTTGTCTCCT;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=98;TCR=144;TR=242;WE=55278813;WS=55278795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr19	55278865	rs35075966	C	T	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=76;PP=2309;SC=AGGGAGACAACAGCCCTGTCT;SOR=1.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=106;WE=55278873;WS=55278855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
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chr19	55281368	.	TGA	CGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=41.98;NF=29;NR=35;PP=2947;QD=20;SC=AGGGAGGGAGTGAGGGGATGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=64;WE=55281378;WS=55281358;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,64:0.90:71
chr19	55281370	rs4806555	A	C	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.94;QD=46.81;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	55284858	rs116929762	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.15;QD=27.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	55286795	rs12982263	T	C	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.54;QD=30.03;SOR=3.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	55286822	rs28465191	C	A	7022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.32;QD=44.73;SOR=1.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	55286828	rs376821145	G	A	7211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.46;QD=42.67;SOR=1.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	55286864	rs77397437	A	C	6260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.98;QD=25.66;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	55287015	rs367995568	C	T	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.56;QD=42.94;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	55287019	rs371816488	G	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.83;QD=43.36;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	55294927	.	A	G	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=20;PP=1278;SC=GTTGACTTCCATCTTCTACAG;SOR=1.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=55294935;WS=55294917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	55297955	rs4806560	T	C	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.26;QD=26.31;SOR=1.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr19	55328959	rs149236621	G	T	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	55378008	rs3745902	C	T	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=48;PP=1574;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CAGGAGGTGACGTACGCACAG;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=116;TCR=99;TR=107;WE=55378016;WS=55377998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,126:0.52:240
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chr19	55386890	rs11084377	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=0.314;SC=AAGAAATTGAAGAATAGCCTG;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=21;WE=55386898;WS=55386880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr19	55386920	rs8112766	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=1.529;SC=TCTTATTTTAATCCCCATTCT;SOR=0.318;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=16;WE=55386928;WS=55386910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr19	55396613	rs10402324	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=401;SC=TCCCCATGGCGAGCCACCTCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=55396621;WS=55396603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	55396900	rs1865096	A	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=40;PP=1356;SC=GGCACTACAGATTCCGGTACA;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=55396921;WS=55396890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	55396913	rs11666735	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=463;ReadPosRankSum=0.565;SC=CCGGTACAGTGACACCCTGGA;SOR=0.523;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=25;WE=55396921;WS=55396890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr19	55399311	rs7258679	G	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.93;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	55399311	.	GAAG	TAAG,TAAT	170	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14,7;NR=0,0;PP=120,170;QD=11.0550866105;SC=ATAACAATAAGAAGAAGAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14,7;WE=55399322;WS=55399301;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.93:15
chr19	55399314	rs74672836	G	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr19	55401170	rs16986050	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-0.957;SC=ACCGAGCTGGAGCCAACAGAT;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=17;WE=55401178;WS=55401160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr19	55420801	rs3765013	C	A	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=63;PP=1877;ReadPosRankSum=-2.468;SC=CACAGCCCACCGAGGGACATA;SOR=0.488;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=240;TCF=110;TCR=130;TR=122;WE=55420809;WS=55420791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,142:0.51:280
chr19	55420924	rs3765014	C	G	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=827;ReadPosRankSum=0.577;SC=GCCGCCATGTCCTACCTGGAG;SOR=0.504;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=50;WE=55420932;WS=55420914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr19	55423488	rs73619967	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=541;ReadPosRankSum=0.686;SC=AGTGCTGGGGTGGAGGAGGTC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=40;WE=55423496;WS=55423478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr19	55423530	rs73619969	C	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=977;ReadPosRankSum=-2.800;SC=CTTCCCTTATCATCAGCAGAC;SOR=0.961;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=66;WE=55423538;WS=55423520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr19	55435267	rs34438464	TC	T	1844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.446;SC=ACACAAATGTTCCCAGAAATT;SOR=0.540;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=37;WE=55435275;WS=55435257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr19	55438940	.	AAAAC	A	4622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.99;QD=43.61;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	55439166	rs269933	T	C	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=26;PP=757;SC=AACATGGAAATCCACGCATTC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=55439174;WS=55439156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	55439197	rs269934	A	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=212;SC=TAGTGGCTCAAGCGTGTAATC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=55439205;WS=55439187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	55441769	rs269949	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=328;SC=GACCGAAGCCGCAGTGAGCCG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=55441777;WS=55441759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	55441902	rs269950	T	C	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=52;PP=2086;SC=GATTCTCTAATGCCTGACAGA;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=124;WE=55441910;WS=55441892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	55441995	rs269951	A	G	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=52;PP=1593;SC=CCTCTGAGAGATATCTACAGC;SOR=1.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=55442003;WS=55441985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	55447572	rs775876	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	55451613	rs104895529	T	G	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=46;PP=2060;ReadPosRankSum=-0.977;SC=CAGTCCAGCATACACTTTTTG;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=250;TCF=141;TCR=109;TR=112;WE=55451625;WS=55451603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,131:0.41:317
chr19	55458816	rs703473	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=579;ReadPosRankSum=0.231;SC=CAAAGAAATCGATGCAAGAAC;SOR=0.772;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=39;WE=55458824;WS=55458806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr19	55488180	.	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=16.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-1.380;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.868;SOR=2.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr19	55492892	rs56091361	C	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=391;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CCCTCCCCCCCGCCCCATCAG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=30;WE=55492900;WS=55492882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr19	55494881	rs11672113	C	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=898;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TGCAGGAGCTCCTCGGCTGTC;SOR=0.993;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=56;WE=55494889;WS=55494871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr19	55512137	rs12768	C	A	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GGTTGAAAATCGATGACTTTA;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=101;TCR=76;TR=81;WE=55512145;WS=55512127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,99:0.43:228
chr19	55525388	rs10417981	G	T	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=26;PP=1190;SC=AATGTATACAGAATTGTACAT;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=55525396;WS=55525378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	55525497	rs1671150	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=28;PP=970;SC=TTTGAGACAAAGTCAGGCTTC;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=55525505;WS=55525487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	55525586	rs10418074	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	55525596	rs1654412	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=11;PP=281;SC=CTCAGCCCCCTGAGTTGCTGG;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=55525604;WS=55525576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	55525894	rs1671151	G	A	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=64;PP=2965;SC=AGGGAAGCACGGGAGGATTTT;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=55525902;WS=55525884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	55526345	rs1671152	T	G	4986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=55;PP=2477;SC=TGACCCCCGTTTGATTTCCGG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=55526381;WS=55526335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	55526359	rs1654413	A	T	4998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=51;PP=2140;SC=TTTCCGGGTCAGCGGGAGGGG;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=97;WE=55526381;WS=55526335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	55526373	rs2304166	G	C	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=975;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GGAGGGGCGGGAGGGGCGGAA;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=60;WE=55526381;WS=55526335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr19	55527081	rs2304167	C	T	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=47;PP=2413;SC=TTTGGACTGGCGGTGATACTC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=55527089;WS=55527071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	55527189	rs1671153	G	T	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=69;PP=2188;SC=ACACACATGGGGAGGCACAAT;SOR=1.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=105;WE=55527197;WS=55527179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	55527276	rs1654484	T	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=633;SC=GAGGCTGAGGTAGGAGGCTGG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=55527284;WS=55527266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	55529836	rs1654415	C	T	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=131;SC=TCACCCAAAACGCTCCTCCTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=55529844;WS=55529826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	55529933	rs1671192	A	G	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=12;PP=1456;SC=CGGTGAAGTGATTAAAAGCCT;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=55529941;WS=55529923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	55530035	rs1654416	C	T	3852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=63;PP=2618;SC=GTGAAGACTTCGTTTGTGAAT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=128;WE=55530043;WS=55530025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	55536595	rs1613662	G	A	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=13;PP=1240;SC=CCTGCTACCGGGGAAGGTGGT;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=55536603;WS=55536585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	55538980	rs1654425	T	C	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=20;PP=1203;SC=CGCTGGGGGCTGACCACAGGT;SOR=1.508;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=62;WE=55538988;WS=55538970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	55539061	rs892089	A	G	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=57;PP=2757;SC=TGATGATGGGAAAACTAGCCC;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=130;WE=55539080;WS=55539051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	55539072	rs892090	T	G	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=59;PP=2448;SC=AAACTAGCCCTGTACCATCTC;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=128;WE=55539080;WS=55539051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	55539303	rs59293899	C	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.390;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr19	55539308	rs61145631	C	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.51;ReadPosRankSum=2.269;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr19	55543973	rs41275824	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=686;ReadPosRankSum=0.671;SC=CTGCTGGGCGCGGTGATAAGA;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=43;WE=55543981;WS=55543963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr19	55559715	rs2305543	G	A	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1046;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CGCCGGCTCAGCTCCTTGGTG;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=70;WE=55559723;WS=55559705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr19	55570574	rs1654447	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=804;ReadPosRankSum=1.867;SC=CTGTGTTGGCACCCGTCACGA;SOR=0.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=55;WE=55570582;WS=55570564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,64:0.60:107
chr19	55574429	rs113253419	A	AGGCGTCC	1018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.746;NF=3;NR=15;PP=981;ReadPosRankSum=1.639;SC=GTCAGGCGTCAGGGGTCGGCG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=18;WE=55574437;WS=55574419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr19	55574512	rs3816043	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.954;NF=5;NR=8;PP=193;ReadPosRankSum=0.012;SC=GGCGAGCGGAGGCGCAGGCGC;SOR=1.110;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=13;WE=55574520;WS=55574502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr19	55589544	rs10411094	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=47;PP=1370;SC=TGGGTCTAAAGAAACAGGACC;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=70;WE=55589552;WS=55589534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	55589619	rs12984354	T	G	464.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.18;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=3.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,13:0.93:14
chr19	55589628	rs12984365	T	G	344.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=34.49;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=3.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr19	55593837	rs144463157	G	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.713;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.923;NF=35;NR=37;PP=776;ReadPosRankSum=-1.291;SC=GAACACGTCGGGGGGGCCGGA;SOR=0.515;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=72;WE=55593845;WS=55593827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,77:0.47:165
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chr19	55598003	rs3217645	G	GC	411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.45;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr19	55653297	rs67795913	A	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=483;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GGCTGAGTGGACAGAAACACA;SOR=0.979;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=32;WE=55653305;WS=55653287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr19	55660537	rs9636153	T	C	6841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.818;SC=ACCTAGGCTGTGTCTGAGATG;SOR=1.050;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=85;TCR=127;TR=210;WE=55660545;WS=55660527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,265:0.99:267
chr19	55665584	rs7252610	A	C	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=45;PP=1382;SC=TCTGGGGGCAAACGAGGGGGT;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=55665592;WS=55665574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	55669055	rs12973773	G	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=0.561;SC=AGGGTCCCAGGGACCGTCAGT;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=16;WE=55669063;WS=55669045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr19	55671337	rs890872	C	T	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.91;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	55699454	rs890870	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=28;PP=1677;SC=ACCTGGTACTTGTCTGCAAAA;SOR=1.454;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=55699462;WS=55699444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	55708475	rs2288522	G	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=525;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GGCAGGAAGGGGATTCTCACA;SOR=0.497;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=32;WE=55708483;WS=55708465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr19	55708557	rs2288521	A	G	5609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=72;PP=2965;SC=AAATTGTACAACGTCCCGGGT;SOR=0.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=158;WE=55708565;WS=55708547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	55709928	rs2288519	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=-1.575;SC=TACTCTTCATCTCCCAAGGAG;SOR=0.257;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=16;WE=55709936;WS=55709918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr19	55713411	rs144253410	G	A	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1052;ReadPosRankSum=0.905;SC=AACAAATGGCGACTGCCTCTC;SOR=0.497;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=163;TCF=90;TCR=73;TR=79;WE=55713419;WS=55713401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,88:0.48:185
chr19	55713535	rs2288515	G	A	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=57;PP=2229;SC=ATGTTGGTGTGTGCTGTGCTT;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=112;WE=55713543;WS=55713525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	55713614	rs10416122	A	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-8.131;NF=26;NR=26;PP=788;ReadPosRankSum=-1.374;SC=GGTCTGGGCCATCGGGGACCT;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=52;WE=55713622;WS=55713604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,45:0.38:119
chr19	55715309	rs45535035	C	T	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=2.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,123:0.42:292
chr19	55715319	rs9304763	C	G	9542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.96;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr19	55716800	rs2288516	A	G	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=72;PP=2880;SC=CGGTGATGTTAGTGTGTGCTG;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=138;WE=55716808;WS=55716790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	55718695	rs76990668	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr19	55738634	rs4644955	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=0.111;SC=GATCACCAGGTGGGCATGGGG;SOR=0.674;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=17;WE=55738642;WS=55738624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr19	55741961	rs28678477	G	C	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr19	55742071	rs116604313	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GGAGAGAGGGGATGTGCAGAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=55742079;WS=55742061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr19	55751123	rs8104509	G	A	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=20;PP=1008;SC=TATCGGTGGCGGTGGGAGGCT;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=55751131;WS=55751113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr19	55758628	rs7258327	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=30;PP=917;SC=GGCCCCGCCCCGGGACTGCCC;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=55758636;WS=55758618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr19	55800789	rs62126358	C	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=313;ReadPosRankSum=-1.549;SC=AGTGGGAGACCAGGCCCTTTG;SOR=2.165;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=19;WE=55800797;WS=55800779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr19	55815894	rs1172820	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=903;ReadPosRankSum=0.292;SC=TCCACTCGCTTATCTCAGTCT;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=26;WE=55815914;WS=55815884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr19	55815906	rs12977268	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=903;ReadPosRankSum=0.378;SC=TCTCAGTCTCCTGTCCTCTGC;SOR=0.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=27;WE=55815914;WS=55815884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr19	55816775	rs35949773	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=480;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GGGATGCAGGGGATTCATGCC;SOR=1.759;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=24;WE=55816783;WS=55816765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
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chr19	55824332	rs7246479	T	G	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=575;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGTCAACGGCTAAGAGACCGA;SOR=1.111;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=38;WE=55824340;WS=55824322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr19	55831723	rs897797	T	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=-1.538;SC=TGGCTGGGCTTGGGAGCACTG;SOR=2.712;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=55831731;WS=55831713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	55832427	rs10412726	T	G	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1351;ReadPosRankSum=1.139;SC=AGGTGAAGGATCGGGGCTGAG;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=79;WE=55832435;WS=55832417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,99:0.56:177
chr19	55854389	rs12610863	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.647;SC=TGTGGCTACCGTGGTGCCGCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=55854397;WS=55854379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	55856083	rs11084395	T	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=385;ReadPosRankSum=1.376;SC=GGACTCAGGATGCTGTCCAGA;SOR=1.503;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=28;WE=55856091;WS=55856073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr19	55856211	rs10405231	C	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=867;ReadPosRankSum=1.949;SC=GATGGGGCACCCCGGGAGGCA;SOR=0.269;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=52;WE=55856219;WS=55856201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr19	55865350	rs12461665	G	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=18;PP=593;SC=GCGGGCGGGGGTCACGCGGCA;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=55865358;WS=55865340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	55866468	rs12971931	G	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	55869879	rs67168196	GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT	G	1235.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr19	55869892	rs28420516	C	T	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.065;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
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chr19	55872864	rs11673515	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.732;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=0.213;SC=CCTACCCAGCGAGAGGCCTAG;SOR=0.214;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=11;WE=55872872;WS=55872854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr19	55879872	rs1126757	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CCAGTGCCCCCGCACTCATGG;SOR=0.747;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=28;WE=55879880;WS=55879862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr19	55880385	rs62128183	G	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TGGACTCCCGGGTCTGAGGGA;SOR=1.565;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=7;WE=55880393;WS=55880375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr19	55913038	rs7608	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.335;NF=21;NR=8;PP=450;ReadPosRankSum=0.166;SC=GGGCCCGAGCCGCATACTCCT;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=29;WE=55913046;WS=55913028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr19	55913286	rs11393810	T	TC	496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=464;SC=TCATCTTTGCTCCTGTCTCCC;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=55913294;WS=55913276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr19	55966347	rs113162090	G	A	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=954;ReadPosRankSum=-2.136;SC=GCGGCCAGGCGGGCATTACCT;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=63;WE=55966355;WS=55966337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,81:0.53:153
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chr19	55993790	rs7254184	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=354;ReadPosRankSum=0.365;SC=GCCACGTGGAAGAGGCCGCGG;SOR=0.866;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=25;WE=55993798;WS=55993780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr19	55993876	rs10423355	T	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	55994240	rs12981044	C	T	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=987;ReadPosRankSum=1.075;SC=GCCACGTGCACACTGGCGAGA;SOR=0.857;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=65;WE=55994248;WS=55994230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,71:0.46:153
chr19	55994708	rs114775834	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=482;ReadPosRankSum=0.771;SC=TCCTGGTGCAAACTGCCCAGG;SOR=0.467;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=30;WE=55994716;WS=55994698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
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chr19	55996939	rs3745450	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GTCCTGATCTGGGAAGTGCCG;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=7;WE=55996947;WS=55996929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr19	56009215	rs7254234	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=185;ReadPosRankSum=-2.227;SC=CGGCTTCCCCGACTCTAATTC;SOR=0.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=13;WE=56009223;WS=56009205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr19	56011091	rs4801314	G	A	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=802;SC=AATGGGAACTGGGTGAGTGAC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=56011099;WS=56011081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	56011460	rs4801713	C	T	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CAGACCTAACCTCACAGACCA;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=75;WE=56011468;WS=56011450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,103:0.45:230
chr19	56012381	rs11084400	T	C	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=843;ReadPosRankSum=0.380;SC=GGGTCAACCATTACCCCAATT;SOR=0.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=50;WE=56012389;WS=56012371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,65:0.61:107
chr19	56012590	rs11669496	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr19	56024519	rs671542	T	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=34;PP=884;SC=CCTCCAACTCTGAGAGTCCAT;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=56024527;WS=56024509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr19	56024599	rs671152	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=383;SC=GTAAAGAGACAGATTCCAGAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=56024607;WS=56024589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	56029465	rs4801331	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=13;PP=380;SC=CCACCACGATGCCTCATCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=56029473;WS=56029455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr19	56030428	rs10217	C	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.071;SC=ACAAAAAAAACCCCCAAAGTA;SOR=0.976;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=48;WE=56030436;WS=56030418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr19	56041255	rs620251	C	G	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=19;PP=750;SC=TCGGCCGCGGCGGCCAGGCCG;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=56041263;WS=56041245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	56042734	rs117964325	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=329;ReadPosRankSum=-0.985;SC=GGGACAGGTATGGGAGGCGTG;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=23;WE=56042742;WS=56042724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr19	56047448	rs310453	A	G	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=46;PP=1997;SC=CGGCCATAGCAACCCTGGCCC;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=106;WE=56047456;WS=56047438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	56052008	rs34837414	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=273;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTGGATCCTGCGTCTGAGAGA;SOR=0.648;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=21;WE=56052016;WS=56051998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
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chr19	56052770	rs654439	C	T	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=57;PP=2200;SC=GGCTGCAGACCGGGTCGAAGA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=111;WE=56052778;WS=56052760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
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chr19	56089908	rs113850871	C	CCCG	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CTCCGTTCTGCCCTTCTCCCC;SOR=0.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=8;WE=56089916;WS=56089898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	56090493	rs12974617	A	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=273;ReadPosRankSum=0.770;SC=GCCACGTCTCAGGCCACGCTG;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=18;WE=56090501;WS=56090483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr19	56104136	rs7247236	T	C	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=854;ReadPosRankSum=2.118;SC=CGGGCGGCGGTCGCCGCCTCC;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=53;WE=56104144;WS=56104126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr19	56104524	rs10403432	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=408;ReadPosRankSum=2.118;SC=CGGCCCAGGCCTGCGCTGGGG;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=31;WE=56104532;WS=56104514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr19	56104560	rs10403462	C	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=488;ReadPosRankSum=0.330;SC=GCAGGTCGTGCGTCAGCTTGT;SOR=0.945;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=35;WE=56104568;WS=56104550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr19	56114045	rs1077806	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=924;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CGCACCACCACCGCGTGCACT;SOR=0.500;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=56;WE=56114053;WS=56114035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr19	56114237	rs310459	G	A	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=61;PP=2075;SC=GGGCCGAGGAGGAGGAGGAGA;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=103;WE=56114245;WS=56114227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	56135983	rs117034576	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=0.875;SC=GGGGTGGGGCTCGAACTGGCG;SOR=1.480;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=16;WE=56135991;WS=56135973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr19	56156447	rs11084406	A	G	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=50;PP=1288;ReadPosRankSum=0.986;SC=ACTCTGGGGAACGCCCGTTTC;SOR=1.261;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=143;TCF=52;TCR=91;TR=72;WE=56156455;WS=56156437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr19	56160399	rs7246799	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=470;SC=CTGGGGTCCGTAGGAAGCCGC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=56160407;WS=56160389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	56162776	rs2287791	C	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=693;SC=AAGAAGGCAGCGCCAGTGAGA;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=56162784;WS=56162766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	56162881	rs519856	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=0.547;SC=GTGCATGGGGCGGGCGCTGAG;SOR=0.399;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=8;WE=56162889;WS=56162871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	56163704	rs73062531	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TCGCCGAGATCCTTTCTTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=10;WE=56163712;WS=56163694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr19	56170771	rs537728	G	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=25;PP=809;SC=GTGTTGGCCGGCCTGTGGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=56170779;WS=56170761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	56171778	rs507498	A	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=8;PP=489;SC=TGGAGCTTACATGGTTGCGGG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=56171786;WS=56171769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	56175149	rs310444	G	A	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=39;PP=1251;SC=TTCTCCCCCAGTCCTGTTCCC;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=56175157;WS=56175139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	56180732	rs681804	T	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=24;PP=981;SC=TGGGGGGGCATGTGAGGGGCC;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=56180740;WS=56180722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	56180968	rs617073	C	T	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=26;PP=792;SC=TCGTGGAGGACGTGCGGGACG;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=56180976;WS=56180958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	56185250	rs664684	G	A	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=27;PP=1796;SC=ACGCTGACTGGCTGTTGGGCG;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=90;WE=56185258;WS=56185240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr19	56223486	rs59900917	G	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=2.105;SC=GCTCCTGGGGGACGTATGTCT;SOR=0.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=56223494;WS=56223476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
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chr19	56369189	rs441827	G	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=938;ReadPosRankSum=-1.071;SC=TCCCAAGGAAGCTGGGAAACA;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=61;WE=56369197;WS=56369179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,68:0.42:163
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chr19	56369593	rs421810	T	C	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=57;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.304;SC=TGCTCATCGCTATCAAACCCG;SOR=1.124;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=181;TCF=82;TCR=99;TR=95;WE=56369601;WS=56369583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,106:0.51:207
chr19	56370166	rs379327	C	T	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TCAAGAGCCACCTTGATCATC;SOR=0.683;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=199;TCF=100;TCR=99;TR=94;WE=56370174;WS=56370156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,111:0.45:245
chr19	56373437	.	A	G	2576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1545;ReadPosRankSum=0.540;SC=GAAATACCTGAGCTTCACCCT;SOR=1.040;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=217;TCF=93;TCR=124;TR=102;WE=56373445;WS=56373427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,124:0.47:266
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chr19	56392875	rs302456	T	G	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1346;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CCCAGGCACTTCTGACGGCTG;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=79;WE=56392883;WS=56392865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,95:0.44:218
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chr19	56410340	rs302828	T	G	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=52;PP=1471;SC=GGGAAAGTAATTGCGTCCCGA;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=67;WE=56410348;WS=56410330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	56413583	rs302835	A	G	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=47;PP=1390;SC=TGCAGGGTGAAAGCCACAGAG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=56413591;WS=56413573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	56416288	rs76515504	T	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=0.199;SC=TATCTAGAAATGGAAGTAGGG;SOR=1.487;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=20;WE=56416296;WS=56416278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr19	56419263	rs17711239	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=497;ReadPosRankSum=-1.657;SC=CAGCTTGCTGTTACCCTGAAG;SOR=0.795;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=33;WE=56419271;WS=56419253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr19	56421775	rs11670284	C	T	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=102;SC=CTACTTTGCCCAAGTAGCAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=56421783;WS=56421765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	56421826	rs12982016	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=-0.758;SC=CTCCTGAGCACGTAGCTTGCC;SOR=0.327;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=8;WE=56421834;WS=56421816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr19	56421861	rs12982043	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=210;ReadPosRankSum=1.303;SC=CAACCACACTCATCAAAAGAG;SOR=1.385;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=14;WE=56421869;WS=56421851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr19	56421905	.	G	C	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=874;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GTATCTTCTTGAGCTGCTGGC;SOR=0.457;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=53;WE=56421913;WS=56421895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr19	56422976	rs1436079	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GCACGAATACATAACGACAAC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=56422984;WS=56422966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr19	56423033	rs4801643	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=361;ReadPosRankSum=1.691;SC=CCTGAGAAAACAGGAGAAAGC;SOR=1.195;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=24;WE=56423041;WS=56423023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr19	56423074	rs977070	C	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=669;ReadPosRankSum=-2.522;SC=ATACTCACTCCAGAATTTCCA;SOR=0.491;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=48;WE=56423082;WS=56423064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr19	56423254	rs304002	G	A	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=61;PP=1790;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CCTGGGACTCGTGTAGGCAGT;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=115;TCR=125;TR=120;WE=56423262;WS=56423244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,142:0.48:295
chr19	56423668	rs304001	G	A	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=43;PP=2043;SC=CCAGGCCCTCGATCTCAGTGT;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=56423676;WS=56423658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	56423692	rs304000	C	T	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1796;ReadPosRankSum=0.519;SC=CTTTGTTAAACGTGAAGTTCA;SOR=0.280;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=87;WE=56423700;WS=56423682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr19	56423728	rs303999	A	G	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=39;PP=2086;SC=CTATGGCCAGACTGCAGAGGG;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=56423736;WS=56423718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	56423893	rs303998	G	A	7150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=102;PP=2965;SC=AGGAACATACGGTCCAACACA;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=110;TCR=102;TR=212;WE=56423901;WS=56423883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr19	56424443	rs303997	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=71;PP=2108;SC=CAGCATAGCCTGCATTGCCAA;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=118;WE=56424451;WS=56424433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	56424532	rs731338	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=410;ReadPosRankSum=0.976;SC=GATCCAGTAGGCGCTGCAGTT;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=29;WE=56424540;WS=56424522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr19	56443864	rs145915426	T	TTTTTTG	319.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=579;SC=AGTACACTTTTTTGTTGTTGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=56443872;WS=56443854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	56459302	rs77942970	A	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.783;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGACACCCCCATTCCCTTTTC;SOR=1.550;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=23;WE=56459310;WS=56459292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr19	56459342	rs306507	C	T	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=24;PP=1101;SC=TCTCATATTCCGCCCTGGACA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=60;WE=56459350;WS=56459332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	56459614	rs306506	G	C	5543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=85;PP=2965;SC=AATGTGTGTTGTAGTCCGCAG;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=167;WE=56459622;WS=56459604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	56459703	rs1436077	A	G	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=56;PP=1618;SC=TACTCTAGTCACCACCCCTAT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=6;TCR=56;TR=62;WE=56459711;WS=56459693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	56464058	rs306501	C	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=27;PP=1015;SC=CTAAGGCAAGCCAGATTTTAA;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=56464066;WS=56464048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr19	56473645	rs11671531	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=0.599;SC=CTTTATGGAGATGGTCTGTTT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=56473653;WS=56473635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr19	56477687	rs306497	A	G	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=64;PP=2119;SC=TGGAGTCCAAAGCTGTGAAGC;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=106;WE=56477695;WS=56477677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	56477710	rs306496	T	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.254;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=472;ReadPosRankSum=0.857;SC=CTATGCAGGGTGCTGAGATCC;SOR=0.336;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=41;WE=56477718;WS=56477700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr19	56487430	rs306483	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.638;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	56487450	rs306482	T	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr19	56487603	rs306481	A	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1210;ReadPosRankSum=0.660;SC=AATAGCCTGAAGGATGATGGG;SOR=0.907;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=78;WE=56487611;WS=56487593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,104:0.56:187
chr19	56490778	rs306475	C	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=452;SC=ACTGCCTGTTCACCTCCATCT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=56490786;WS=56490768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	56490943	rs11084419	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=337;ReadPosRankSum=1.723;SC=AAGTCTCCACCGGGTTTCCTG;SOR=1.008;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=27;WE=56490951;WS=56490933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr19	56499279	rs306457	G	C	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=71;PP=1765;SC=TTAATCCTTAGGCCGTCCAGT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=92;WE=56499287;WS=56499269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	56499345	rs306455	A	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=23;PP=658;SC=GGCAAATACCAGGCGTTATCA;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=56499353;WS=56499335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	56510965	rs62123572	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=207;ReadPosRankSum=0.743;SC=CCAGCCCTTCCGACCGGCTCA;SOR=0.676;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=15;WE=56510973;WS=56510955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr19	56511082	rs35427984	C	G	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.71;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	56511082	.	CGATGTTAT	GGATGTTAC,GGATGTTAT	756	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=27,44;NR=21,38;PP=756,473;QD=16.8639140596;SC=CTTTCCATGGCGATGTTATCA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=48,82;WE=56511098;WS=56511072;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.59:82
chr19	56511090	rs76756220	T	C	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.037;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr19	56511217	rs12462690	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CATGACACACGGATCGAATCC;SOR=0.339;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=17;WE=56511225;WS=56511207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr19	56511233	rs12462663	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=131;ReadPosRankSum=0.641;SC=AATCCCCTGCCCTCGCTGCTG;SOR=0.257;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=13;WE=56511241;WS=56511223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	56515334	rs1560691	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1120;ReadPosRankSum=1.127;SC=AGAATGCCAACGTGGAATGTC;SOR=0.469;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=74;WE=56515342;WS=56515324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,86:0.51:168
chr19	56520091	rs12460573	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=379;ReadPosRankSum=1.431;SC=ACATTCTTATCCTTGGCTTGG;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=24;WE=56520099;WS=56520081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr19	56520129	rs12460633	G	A	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=566;ReadPosRankSum=-0.249;SC=ATTGAGGCCAGTCTCCCTTTT;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=41;WE=56520137;WS=56520119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr19	56520150	rs12460592	C	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=667;ReadPosRankSum=0.596;SC=TCTTTGTCTTCCAGGACATTC;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=42;WE=56520158;WS=56520140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr19	56520355	rs76148349	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=351;ReadPosRankSum=0.274;SC=ATTAGCTGACCGGATGGGTTC;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=19;WE=56520363;WS=56520345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr19	56538203	rs3103612	C	A	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=269;SC=TGACCTCCCACAGTGCTGGGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=56538211;WS=56538193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	56539240	rs397977	C	T	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=56;PP=1518;ReadPosRankSum=0.073;SC=CAGTGTTTGACGGTGACGACC;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=92;TCR=126;TR=97;WE=56539248;WS=56539230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,115:0.47:243
chr19	56549510	rs16986899	T	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=625;ReadPosRankSum=-1.669;SC=CAGGGAGTAATGCCTCTCAGT;SOR=0.708;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=48;WE=56549518;WS=56549500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr19	56549532	rs306447	A	G	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=57;PP=2392;SC=ATGCCTTGAGAGTCTCCCAGT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=119;WE=56549540;WS=56549522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
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chr19	56561749	rs2574762	A	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=225;SC=GGGAATGAGCATCACGATCTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=56561757;WS=56561739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr19	56599405	rs4077285	C	G	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=170;SC=GCCCTCCCCACCGCGGCACTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=56599413;WS=56599395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	56599437	rs5828672	CTCG	C	1212.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=6;PP=575;SC=CGCCCGCGGCCTCGTCGTCGT;SOR=1.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=11;WE=56599447;WS=56599427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	56658379	rs375032586	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=-0.444;SC=ACGCGCCGGGCCCGCGGGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=11;WE=56658387;WS=56658369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr19	56688618	.	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=793;ReadPosRankSum=0.327;SC=TCCCTGCCCTCTGGGAAGAGT;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=55;WE=56688626;WS=56688608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr19	56693643	rs274174	T	C	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=50;PP=1398;SC=GGGAGTTAGATGTCTTCTCCT;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=56693651;WS=56693633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr19	56717353	rs10419548	A	G	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.929;SC=GAGCCACCACAGTCCATGCCA;SOR=0.751;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=83;WE=56717361;WS=56717343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,96:0.51:187
chr19	56718585	rs4801690	A	G	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=55;PP=1433;ReadPosRankSum=1.053;SC=CAGGCCAGCCAAGAGCTGCAG;SOR=0.928;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=185;TCF=82;TCR=103;TR=93;WE=56718593;WS=56718575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,104:0.49:211
chr19	56718698	rs9807807	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=0.452;SC=TCGTGTGGCCACTGGACTGAT;SOR=0.056;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=13;WE=56718706;WS=56718688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr19	56719405	rs12979551	A	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=338;ReadPosRankSum=1.114;SC=ATTCTCAGGAAGAGGACTTCC;SOR=1.091;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=24;WE=56719413;WS=56719395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr19	56719822	rs1865101	G	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.748;NF=20;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=3.051;SC=TTCCAGCAGGGGTGGTGGGAG;SOR=0.571;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=37;WE=56719830;WS=56719812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr19	56719853	rs1865102	C	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.602;NF=19;NR=18;PP=481;ReadPosRankSum=-1.997;SC=GAAGGAACCCCAAAAAAGAGC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=37;WE=56719861;WS=56719843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr19	56733425	rs34187696	C	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=989;ReadPosRankSum=-1.246;SC=GCTCGCAGGGCCTGGGGAATG;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=132;TCF=42;TCR=90;TR=63;WE=56733433;WS=56733415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr19	56758938	rs35779585	G	A	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=725;ReadPosRankSum=0.556;SC=CAGAGGGAGTGCCCTAGATAG;SOR=0.396;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=13;TCR=63;TR=41;WE=56758946;WS=56758928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr19	56901293	rs6509995	C	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=14;PP=784;SC=CAGGGAAGATCTTCTAAGACA;SOR=1.287;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=56901301;WS=56901283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	56904509	.	T	TA	220	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=18;MQ=60.99;NF=3;NR=13;PP=220;QD=14.0625;SC=CCTCTCAGATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=16;WE=56904517;WS=56904499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:24,16:0.40:40
chr19	56918560	rs4801159	T	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=11;PP=330;SC=GAACATTTTGTTTTTCTTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=56918582;WS=56918550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	56918574	rs2288862	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=351;SC=TCTTCCAAAATTCTGCAACCT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=56918582;WS=56918550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	56918598	rs2288863	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=236;SC=AAGGTTCCATTCATCCAGTGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=56918606;WS=56918588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr19	56953585	rs3760849	T	C	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=81;NR=69;PP=2965;SC=ATTGAAGGCTTTTCCGCACTT;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=56953593;WS=56953575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
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chr19	57062073	rs379214	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=418;ReadPosRankSum=0.527;SC=TAGGAAACTTTACCCAGGGTC;SOR=0.734;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=24;WE=57062081;WS=57062063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
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chr19	57085769	rs10421285	G	C	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TTAGGGTTCAGTGACTTTCAC;SOR=0.683;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=68;WE=57085777;WS=57085759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,83:0.43:193
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chr19	57133633	rs35011777	C	T	3921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=-0.152;NF=77;NR=82;PP=2629;ReadPosRankSum=-1.118;SC=AGAAGCCCTACGTGTGCGGCG;SOR=0.554;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=360;TCF=167;TCR=193;TR=159;WE=57133641;WS=57133623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,179:0.45:402
chr19	57175484	rs7250003	A	G	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1481;ReadPosRankSum=0.448;SC=GGCAGGGGTAAGGCCGCTCTC;SOR=0.834;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=93;WE=57175492;WS=57175474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,112:0.55:202
chr19	57175578	rs12610410	C	T	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GGGCTTCTCGCCTGTGTGGAT;SOR=0.803;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=96;WE=57175586;WS=57175568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,122:0.50:242
chr19	57176096	rs77114013	C	G	3374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=66;PP=2132;ReadPosRankSum=1.718;SC=TGTGCGTGCGCTGGTGCAGGG;SOR=0.573;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=283;TCF=151;TCR=132;TR=135;WE=57176104;WS=57176086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,162:0.51:318
chr19	57176198	rs8108756	T	G	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=56;PP=1331;ReadPosRankSum=0.104;SC=AGATGAACGCTGAACAGTAGC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=246;TCF=99;TCR=147;TR=96;WE=57176206;WS=57176188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,107:0.38:285
chr19	57176304	rs12460400	T	G	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.976;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1274;ReadPosRankSum=0.513;SC=CTTCGGGCTCTCCCCAGGCGC;SOR=0.897;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=84;WE=57176312;WS=57176294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,93:0.47:197
chr19	57176482	rs12462469	C	T	2731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1698;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TCCTGGTTTTCCTGCAGGTCC;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=213;TCF=103;TCR=110;TR=101;WE=57176490;WS=57176472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,125:0.52:242
chr19	57176820	rs12462993	C	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=2.164;SC=TCCACACTGGCTGCCAGGGAC;SOR=1.463;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=16;WE=57176828;WS=57176810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr19	57176838	rs12462995	C	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=2.157;SC=GACACTACCCCTCAACCCCTG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=16;WE=57176846;WS=57176828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr19	57184136	rs10409943	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.190;NF=5;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=1.401;SC=GAAGAAAAAACTTCATGACCC;SOR=0.527;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=57184144;WS=57184126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr19	57184167	rs12327605	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.498;NF=14;NR=5;PP=271;ReadPosRankSum=1.144;SC=GCTCCTCTCCAGGCTTGCGTC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=19;WE=57184175;WS=57184157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr19	57293394	rs2286751	A	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=26;PP=1303;SC=CACTAAGGGAACTAAGTTCCT;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=57293402;WS=57293384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	57327503	rs33931963	A	G	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=1740;ReadPosRankSum=0.086;SC=ATTTTGCCTCATAGACATTTT;SOR=0.679;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=108;WE=57327511;WS=57327483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,130:0.57:228
chr19	57335022	rs1860565	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=823;ReadPosRankSum=2.465;SC=TGTCGTCGTCGCTGGTCACGT;SOR=0.601;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=58;WE=57335030;WS=57335012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr19	57335179	rs1860566	T	C	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=48;PP=1457;SC=CATTTCTGAGTTCAAAACCCT;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=57335187;WS=57335169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	57641146	rs1027392	A	G	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=63;PP=2965;SC=TTTTCTGGCAACATGCAGAAT;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=129;WE=57641154;WS=57641136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	57642098	rs3764574	G	A	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=65;PP=2965;SC=TTCAAGAGGTGCCTCAACATC;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=154;WE=57642106;WS=57642088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	57642782	rs9973206	C	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=943;SC=AGGGGGAATACGAAGGTGACT;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=57642790;WS=57642772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	57646570	rs4801433	T	C	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=48;PP=2070;SC=TTATGTTGAATGAGGTTTTTC;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=100;WE=57646578;WS=57646560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	57647015	rs7251328	A	G	6726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=96;PP=2965;SC=GCTTGTAGGCATTTCCACAGT;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=124;TCR=96;TR=220;WE=57647023;WS=57647005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr19	57647236	rs7252632	T	C	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=67;PP=2405;SC=GATGGATTATTGCCAACTAAT;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=115;WE=57647244;WS=57647226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	57648277	rs4801200	A	T	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=44;PP=2421;SC=TCTTCCTCCAACCATGGCTCC;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=113;WE=57648285;WS=57648267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	57648433	rs2370135	T	C	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=54;PP=1303;SC=CGTATGCTTGTGTGAATATTT;SOR=1.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=57648441;WS=57648423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	57649900	rs2370134	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=634;ReadPosRankSum=-1.495;SC=TTTCTCTGTTCGGGATTCAGC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=40;WE=57649908;WS=57649890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr19	57653864	rs11084488	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=4;PP=195;SC=GTAGAGTGTGTGTTACCTTTT;SOR=1.244;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=12;WE=57653872;WS=57653854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	57654065	rs58537382	T	C	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=63;PP=2338;SC=TGAGGGAAAATGGAAAAGAAC;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=131;WE=57654073;WS=57654055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	57654104	rs59976893	T	C	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=68;PP=2456;SC=GCTTTGGAAGTTGGGGATCAT;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=120;WE=57654112;WS=57654094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	57654217	rs10426157	T	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.43;SOR=2.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	57665750	rs8108591	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=440;ReadPosRankSum=2.098;SC=GTCCAGTTGATATTATCAAGT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=30;WE=57665758;WS=57665740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr19	57665888	rs10420848	A	G	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=539;ReadPosRankSum=-2.752;SC=AATGTAAGAGATCAGCTTATA;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=31;WE=57665896;WS=57665878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr19	57665927	rs74258096	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGCCTTTTCCCACCTTTTCTT;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=10;WE=57665935;WS=57665917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	57723007	rs2074858	G	C	4572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	57723013	rs917340	G	A	4480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	57742472	rs11084490	G	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=229;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=40;PP=1414;SC=CTGTGTAGCAGTGAGACATCA;SOR=1.232;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=112;WE=57742480;WS=57742462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	57742489	rs58264281	C	T	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=41;PP=1967;SC=ATCAGTGAGGCTGCAGGACGA;SOR=1.081;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=106;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	57742493	rs142269286	AGGACGAGCAGGATT	A	5104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=42;PP=2974;SC=GTGAGGCTGCAGGACGAGCAG;SOR=1.074;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=59;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	57742514	rs150998448	G	GC	3609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=42;PP=2512;SC=GATTGGAAGCGCCCCGGCCAG;SOR=0.990;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=60;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	57743039	rs758098	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.22;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	57752326	rs8111661	C	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=41;PP=1232;SC=TGCTTTTCTGCTAGTTCGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=59;WE=57752334;WS=57752316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	57760018	rs2014572	G	A	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CTAGAGCATGGGCAGGAGCCA;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=53;WE=57760026;WS=57760008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr19	57760057	rs3746231	G	A	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=34;PP=2008;SC=CTCTCCCAAGGCACCTGTCCA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=95;WE=57760065;WS=57760047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	57760216	rs1019071	G	A	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=45;PP=1286;SC=TGGTTTCTCCGTCCTCCCAGC;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=54;WE=57760224;WS=57760206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr19	57765432	rs8100154	A	G	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=47;PP=2031;SC=CCTACCTCAAAAGGCACCAGC;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=99;WE=57765440;WS=57765422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr19	57832257	rs4801462	T	C	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=43;PP=1342;SC=GACGAGGTTTTGGCCTTGCTG;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=80;WE=57832265;WS=57832247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	57835252	rs4801216	C	T	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=663;SC=CTCCACAGCCCACTTGTTCTG;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=57835260;WS=57835242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	57835279	rs4801467	G	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=383;SC=CTGGCACCACGCAGGGGTGTT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=57835287;WS=57835269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr19	57838018	rs6510057	C	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=2.507;SC=TTTGTTCAAACCAGAGCTGAT;SOR=0.984;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=14;WE=57838026;WS=57838008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr19	57839150	rs8100491	A	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=955;ReadPosRankSum=-1.076;SC=CTCCAGGAACAACTGACACAA;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=47;WE=57839158;WS=57839140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr19	57839567	rs1968090	T	A	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=71;SC=CTTCAGCACCTCATCATCCAC;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=139;WE=57839589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	57863149	rs34172522	T	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=341;ReadPosRankSum=0.649;SC=TTCAGGGTGCTCACTCCGTCG;SOR=0.701;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=21;WE=57863157;WS=57863139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr19	57865082	rs862703	T	C	5726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=58;PP=2965;SC=CAGCTGTACTTATCATGGCAG;SOR=1.128;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=96;TCR=58;TR=154;WE=57865090;WS=57865072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	57865149	rs862704	C	T	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1480;ReadPosRankSum=0.299;SC=AGTGGGAACTCCTTGAGGAGG;SOR=0.507;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=184;TCF=97;TCR=87;TR=97;WE=57865157;WS=57865139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,111:0.50:220
chr19	57865365	.	GT	G	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=24;QD=12.0;SC=TATTTTGAGGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=57865373;WS=57865355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
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chr19	57868336	rs862709	A	G	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=62;SC=TAAGTGCAACAAATGTGGGAA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=126;WE=57868344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	57889072	rs141614487	G	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1141;ReadPosRankSum=0.873;SC=TATGAGTGCAGTGAATGTGGG;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=68;WE=57889080;WS=57889062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr19	57890000	rs2361119	C	T	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=557;ReadPosRankSum=0.007;SC=GCCAAAATGACGAACAACACC;SOR=0.591;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=37;WE=57890008;WS=57889990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr19	57901422	rs75599624	G	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=992;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGCCTTTGTCGCTCCCGCCCC;SOR=0.695;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=66;WE=57901430;WS=57901412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,80:0.54:147
chr19	57909872	rs4801478	G	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=627;ReadPosRankSum=-1.430;SC=AGAGGTTACAGCTTCAAAGCC;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=43;WE=57909880;WS=57909862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr19	57922664	rs4801480	T	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=719;SC=TGAGGCTCGGTTGAATCGGTT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=57922672;WS=57922654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	57931303	rs2014827	C	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=767;ReadPosRankSum=0.586;SC=AGGAACCTCACATGCATGCAG;SOR=0.750;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=48;WE=57931311;WS=57931293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr19	57932027	rs2158009	C	T	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=978;ReadPosRankSum=-1.655;SC=ATGAATGCAACGAATGTGGGA;SOR=0.558;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=55;WE=57932035;WS=57932017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
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chr19	57956828	rs7246856	T	G	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=62;PP=2234;SC=AAACATCAGATAATTCATACT;SOR=1.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=57956836;WS=57956818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
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chr19	57985889	rs7257644	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ACCAAGGTCATAGGACTGTTG;SOR=0.904;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=23;WE=57985897;WS=57985879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
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chr19	57987905	rs2067055	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=348;ReadPosRankSum=0.205;SC=CCAAGAGATCGGAGAGTAGCA;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=10;WE=57987913;WS=57987885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
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chr19	58004931	rs2074077	A	G	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=ACATCAGAGAATTCACACTGG;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=58004939;WS=58004921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
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chr19	58016474	rs150811873	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=14.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.18;MQRankSum=0.570;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
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chr19	58117223	rs2360543	T	A	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=34;PP=1472;SC=TTGAGCTCCATGCCTCACCCT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=58117231;WS=58117213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr19	58213952	rs2074078	C	A	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1449;ReadPosRankSum=0.337;SC=GATGGCCCCACCGTCGCTTTT;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=67;TCR=102;TR=82;WE=58213960;WS=58213942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,93:0.48:192
chr19	58231807	rs2239986	A	G	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=689;ReadPosRankSum=-0.074;SC=ATAGTAAGTCAGGGGCATTGG;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=49;WE=58231815;WS=58231797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr19	58258466	rs60751243	G	T	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1014;ReadPosRankSum=1.721;SC=TCAGGTAATTGTGGCGTCTTC;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=68;WE=58258474;WS=58258456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
chr19	58258589	rs2074081	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=445;ReadPosRankSum=0.179;SC=CGCTCTCTATGGGCCCCCGTT;SOR=1.293;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=25;WE=58258597;WS=58258579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr19	58262454	rs11419013	C	CT	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=374;ReadPosRankSum=0.917;SC=ACTGCCCTCTCTCTCCTTGAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=58262462;WS=58262444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	58281192	rs74911211	T	TC	1707.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=680;ReadPosRankSum=0.947;SC=GAGCCCGCGTTCCCCCCCCGC;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=38;WE=58281200;WS=58281182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,76:0.52:146
chr19	58281374	rs2285614	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GCGCCGGCGGGTGGGATCCCT;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=58281382;WS=58281364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr19	58291228	rs2158013	A	G	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=56;PP=1363;ReadPosRankSum=0.985;SC=AGTTCACACCAGATCAAGGTG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=40;TCR=108;TR=76;WE=58291236;WS=58291218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr19	58301766	rs72530696	TG	T	3150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.224;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.552;NF=20;NR=43;PP=2130;ReadPosRankSum=-0.226;SC=ATATCCTCCCTGGGTAAGGTA;SOR=0.943;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=143;TCF=40;TCR=103;TR=63;WE=58301774;WS=58301756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,110:0.46:241
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chr19	58326001	rs2303817	A	G	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1178;ReadPosRankSum=2.198;SC=AGAGCCGTAAACAGGTGCCGC;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=105;TCR=86;TR=78;WE=58326009;WS=58325991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,93:0.40:235
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chr19	58361334	rs28577146	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.208;NF=15;NR=6;PP=281;ReadPosRankSum=-0.535;SC=AATCGTCCTCGGTGCCCAGAG;SOR=1.103;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=21;WE=58361342;WS=58361324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr19	58361371	rs139873841	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.938;NF=24;NR=9;PP=491;ReadPosRankSum=0.839;SC=GTGACGGCGACCACTGCTCCC;SOR=1.746;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=33;WE=58361379;WS=58361361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr19	58361549	rs58754895	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=478;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CCGGCGTAGGAACACTGAGGC;SOR=1.798;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=24;WE=58361557;WS=58361539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr19	58371136	rs10405648	G	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.774;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.034;NF=50;NR=20;PP=1117;ReadPosRankSum=0.063;SC=ATCATCTTCTGGTTCATGAGA;SOR=1.847;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=160;TCF=99;TCR=61;TR=70;WE=58371144;WS=58371126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,62:0.37:168
chr19	58374149	rs112449475	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.821;NF=16;NR=10;PP=390;ReadPosRankSum=0.663;SC=CCGGAGGCAGGGTGCCACCTC;SOR=1.078;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=26;WE=58374157;WS=58374139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr19	58455381	rs257652	C	T	4875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.439;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=1.115;SC=GAAGACCCCACTCCTTCCAGG;SOR=0.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=88;TCR=70;TR=157;WE=58455389;WS=58455371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr19	58500271	rs11880378	T	G	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=131;SC=CTCATATTTGTTATATACTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=58500279;WS=58500261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	58512626	rs45628537	G	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.935;SC=AATGATAGGGGAGGCCCAGGA;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=58512634;WS=58512616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr19	58514715	rs4801540	C	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=648;SC=GTGAGTTTTCCTCTATCGATA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=58514723;WS=58514705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	58549593	rs2241406	C	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=14;PP=626;SC=CGCAGGCTTCCTGCCCCGGGC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=58549601;WS=58549583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	58570714	rs146738840	A	AGGCCG	1207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=43.13;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	58570794	rs8110363	C	T	249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=149;SC=CAGCAGCGCGCGTCTGTGTGG;SOR=1.085;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=58570802;WS=58570784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	58571615	rs151015554	GGTGCCCGGCCTCTACTC	G	508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=1344;SC=GGCCTCTACTGGTGCCCGGCC;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=58571639;WS=58571605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	58572979	rs1469087	G	A	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=52;PP=2150;SC=GTGGTAGTGGGCTTCAGCCAG;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=114;WE=58572987;WS=58572969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	58578578	rs2229375	C	T	2925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=61;PP=1797;ReadPosRankSum=0.385;SC=AGAGACCTTACGAATGTCACG;SOR=0.581;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=215;TCF=90;TCR=125;TR=108;WE=58578586;WS=58578568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,132:0.51:259
chr19	58579923	rs2229379	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGAAACGTACATTCATACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=58579931;WS=58579913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	58597405	rs1064267	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=476;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CTCACTCAGACACGGTGGTGG;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=26;WE=58597413;WS=58597395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr19	58598784	rs2260914	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=379;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGGGAGAAGGAGAGGCAGAGC;SOR=0.446;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=26;WE=58598792;WS=58598774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr19	58601221	rs2547354	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=554;ReadPosRankSum=-1.570;SC=TTCTCCTCTGTGACAGCCCAC;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=40;WE=58601229;WS=58601211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr19	58629830	rs8108978	A	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=22;PP=795;SC=GCCTAGTGCGACGAGGGCGGG;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=58629844;WS=58629820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	58629836	rs200243319	G	GCGGGGC	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	58629878	rs8109275	G	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=195;SC=GGCCGCAGCTGCCTGGCAGCC;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=58629886;WS=58629868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	58640964	rs45589034	G	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=0.730;SC=TAGGTGTAAAGATGTGTATTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=58640972;WS=58640954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr19	58718360	rs59557917	A	AG	2445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=30;PP=2036;SC=GGTCCCCGGGAGCCCTGGACC;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=45;WE=58718368;WS=58718350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	58773014	rs142898242	C	T	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1175;ReadPosRankSum=0.772;SC=TAACATCATTCAGACTACAGA;SOR=0.553;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=84;WE=58773022;WS=58773004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,96:0.53:180
chr19	58774071	rs260462	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=621;ReadPosRankSum=0.202;SC=TTCCGGCAGCAATCTCAACTT;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=38;WE=58774079;WS=58774061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr19	58774223	rs34204906	GC	G	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=-1.419;SC=CGTGTATTAAGCCAGCGGTTG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=58774231;WS=58774213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	58790675	rs437229	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=653;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CCGTCCTGGCTGGTCAGAGAG;SOR=0.884;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=27;TCR=78;TR=48;WE=58790683;WS=58790665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr19	58790713	rs374431	G	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=424;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CAGGCGCCTGGCCCCCGAATG;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=23;WE=58790721;WS=58790703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr19	58790784	rs260502	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CGAGAGAATCGAGCAGGCCCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=58790792;WS=58790774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	58791213	rs260500	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=1.865;SC=CAATAATTATCCTTCCTCAAG;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=8;WE=58791221;WS=58791203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr19	58791254	rs77570482	A	T	64.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	58797344	rs400733	A	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.633;SC=GCCCTTTTCCATCACCATGCA;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=58797352;WS=58797334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
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chr19	58858231	rs3214663	GC	G	1576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=1255;SC=TTTAAACAGAGCCTCTCTTCA;SOR=2.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=31;WE=58858239;WS=58858221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr19	58859054	rs113490434	GC	G	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	58859066	rs1265959	A	G	278.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.83;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	58861821	rs147512196	G	A	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1346;ReadPosRankSum=1.251;SC=TGTAGTTGGCGGAGTCAGCCA;SOR=0.775;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=88;WE=58861829;WS=58861811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,103:0.47:220
chr19	58864479	rs893184	T	C	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.089;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=2446;ReadPosRankSum=-0.713;SC=AGTCTCCAGGTGGGCCTGGCA;SOR=0.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=136;WE=58864487;WS=58864469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr19	58864867	rs2375470	A	G	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1167;SC=ATGAGGCCCCAAGGGAGGGCG;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=58864887;WS=58864857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	58864879	rs3833872	T	TG	1773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=1231;SC=GGGAGGGCGGTGGGGTGGCTC;SOR=1.302;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=30;WE=58864887;WS=58864857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	58868480	rs12609654	G	T	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;PP=1748;ReadPosRankSum=0.700;SC=TGAGCTGCGAGTGCGCGCGGA;SOR=0.660;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=197;TCF=100;TCR=97;TR=104;WE=58868488;WS=58868470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,117:0.53:222
chr19	58869515	rs6146577	GTCCCC	G	1554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.867;NF=10;NR=17;PP=1125;ReadPosRankSum=-1.346;SC=TCCCTGGGTAGTCCCCTCCAC;SOR=0.816;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=27;WE=58869527;WS=58869505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,44:0.37:119
chr19	58870003	rs10692126	T	TGAG	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=569;ReadPosRankSum=-1.207;SC=CTAGCAGATCTGAGAAAACAA;SOR=1.547;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=16;WE=58870011;WS=58869993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr19	58870087	rs11332731	TG	T	2367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.265;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=1799;ReadPosRankSum=1.291;SC=CACACAGGTGTGGACTGGAGA;SOR=1.262;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=50;WE=58870095;WS=58870077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,77:0.48:159
chr19	58871130	rs6510138	C	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=-1.335;SC=ACGAGGTCAGCAATTCCAAGA;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=58871138;WS=58871120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	58879660	rs61746138	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=315;ReadPosRankSum=1.242;SC=CCGCTCGCTGTAGTCCCCGCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=17;WE=58879668;WS=58879650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr19	58879701	rs61746129	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=388;ReadPosRankSum=-0.669;SC=AGGCGCGCCGCGCCAGGACGG;SOR=1.845;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=19;WE=58879709;WS=58879691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr19	58879965	rs7255489	A	G	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=2225;ReadPosRankSum=-0.779;SC=ACACTGGGGGACTCTTGCCCG;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=100;WE=58879984;WS=58879954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,107:0.98:109
chr19	58879976	rs7255596	C	T	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=57;PP=1931;SC=CTCTTGCCCGCCTGCTGCTGC;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=97;WE=58879984;WS=58879954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	58880016	rs7255916	G	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=551;ReadPosRankSum=-0.990;SC=TCCCGCACCGGGCACACGGAC;SOR=0.926;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=39;WE=58880024;WS=58880006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr19	58880184	rs7256809	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=416;ReadPosRankSum=-1.598;SC=CGCCAGTCCCTGGTTGGCACG;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=33;WE=58880192;WS=58880174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr19	58880242	rs7256940	T	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=505;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GGGGTGGTTCTGGATCCGCTC;SOR=0.676;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=37;WE=58880250;WS=58880232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr19	58880761	rs62116383	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=766;ReadPosRankSum=1.731;SC=GAGGTTGGCGGTTCCCAGGAG;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=54;WE=58880769;WS=58880751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr19	58880848	rs72629171	G	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=-0.826;SC=GCTCTCTGCAGATGCGAAAGG;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=25;WE=58880856;WS=58880838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
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chr19	58907443	rs12611212	C	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=0.241;SC=TCCTCTCCTCCCAGGTCCATC;SOR=0.223;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=58907451;WS=58907433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr19	58943606	.	T	TGGGTGC	2742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=1846;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TGGGGAGTGATGGGTGCCAAG;SOR=0.774;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=34;WE=58943614;WS=58943596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr19	58945962	rs9941466	C	T	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=57;PP=2663;SC=CAGTGTGAAACTTTTTATTAC;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=116;WE=58945970;WS=58945952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	58965536	.	C	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr19	58965590	.	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=215;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TGCTCCTCCTCACAGGACTCT;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=16;WE=58965598;WS=58965580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr19	58982044	rs28444973	C	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=798;ReadPosRankSum=0.615;SC=TCAGCCTGCCCTGGTCCTCTC;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=48;WE=58982052;WS=58982034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr19	58982384	rs10418774	A	G	6821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=94;PP=2965;SC=TCCGGCTTAGAGAAAAGACAC;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=112;TCR=94;TR=206;WE=58982392;WS=58982374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr19	59010593	rs4801274	A	G	4576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=97;PP=2941;SC=TCCATCTGCAAGGAGGGAGCC;SOR=1.525;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=46;TCR=97;TR=143;WE=59010601;WS=59010583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	59010819	rs2278497	G	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.850;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=702;ReadPosRankSum=-2.037;SC=AGCGTCCGTGGCCCCGCGCCA;SOR=2.726;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=33;WE=59010827;WS=59010809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr19	59025685	rs4801602	A	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=40;PP=922;SC=CCCCTGCGGAAGACAGGGCGG;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=59025693;WS=59025675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	59059729	rs2305120	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=735;ReadPosRankSum=1.060;SC=GCGAGATGAAGTTTCAGTGGG;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=48;WE=59059737;WS=59059719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr19	59069766	.	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr20	76962	rs6111385	T	C	8800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=127;PP=2965;SC=TGCCACCATCTGAGGCCACTA;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=120;TCR=128;TR=247;WE=76970;WS=76952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr20	126310	rs11467417	ACC	A	13302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=162;PP=2969;SC=GATGGCTCCTACCCCCGTTTC;SOR=1.386;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=198;TCF=16;TCR=182;TR=177;WE=126319;WS=126300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr20	138004	rs6055356	G	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=85;SC=TGGGTGGCCTGAAATTTCCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=138012;WS=137995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	138125	rs2298108	G	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=10;PP=505;SC=GAGGAAGGTAGCATAGTGTGC;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=138133;WS=138115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	138148	rs2298109	C	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=10;PP=662;SC=TTCACTGGACCAAAAGCTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=138156;WS=138138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	139409	rs12624951	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=3;PP=1049;SC=TCCTTTCTGTGTATAGTAACC;SOR=3.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=139417;WS=139399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	139456	rs12624954	G	A	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=27;PP=2363;SC=CTATGTACAAGGACATTGCAG;SOR=1.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=107;WE=139464;WS=139446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	139576	rs16995685	C	A	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=128;PP=2965;SC=AAAGCCACCTCGTCCAAAGCC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=104;TCR=128;TR=232;WE=139584;WS=139566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr20	139741	rs76169392	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.746;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr20	139745	rs4142304	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=145;SC=CTTCTTCCTTTTGGTTTCTTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=139753;WS=139731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	207889	rs2298149	G	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=708;SC=GAGCTCAGGAGCATCAACCCA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=207897;WS=207879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	208168	rs6110460	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=476;SC=AACTGCCAGATTGTGTCCAGT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=208176;WS=208158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	210061	rs13045643	G	A	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=41;PP=1831;SC=AAAACTACCTGCAATATGGAA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=210069;WS=210051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr20	238435	rs66489228	CTGGTCT	C	1341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.351;NF=7;NR=16;PP=1151;ReadPosRankSum=0.191;SC=GTTCCTGCTCCTGGTCTTGGC;SOR=0.790;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=23;WE=238448;WS=238425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr20	238507	rs373225	A	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.315;NF=7;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=0.329;SC=GGAAAGGAAAACTGGGAACGA;SOR=0.723;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=25;WE=238515;WS=238497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr20	238530	rs412143	T	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=2.352;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr20	238540	rs416360	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=2.347;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.027;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
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chr20	257733	rs2277781	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=519;ReadPosRankSum=0.881;SC=GAATCTTGTCAGACAAGGATT;SOR=0.438;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=45;WE=257741;WS=257723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,52:0.34:151
chr20	257803	rs6075583	G	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.187;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,38:0.31:121
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chr20	259156	rs6035505	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=2.233;SC=GGAGTCCCCAGTCCCAACCTC;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=259164;WS=259146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr20	259969	rs7271033	G	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=544;ReadPosRankSum=-1.171;SC=TCCTGAGCGAGGTCTGCGGGC;SOR=0.431;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=133;TCF=41;TCR=92;TR=51;WE=259977;WS=259959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,60:0.38:159
chr20	264498	rs6137055	A	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=0.606;SC=TGTGAGGAAGAAATGAGTCAA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=264506;WS=264488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr20	270414	rs11478105	TC	T	919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=1312;ReadPosRankSum=0.352;SC=ACTTGACCTCTCCTGAGCCTC;SOR=0.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=20;WE=270436;WS=270404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr20	270428	rs6035784	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.942;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GAGCCTCAATCTTCTCATCTG;SOR=0.307;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=24;WE=270436;WS=270404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr20	271135	rs3215551	G	GC	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=727;ReadPosRankSum=0.838;SC=AAGACCGAGGGCGACCTCGAG;SOR=0.977;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=18;WE=271143;WS=271125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr20	278515	rs2223665	T	C	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=717;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCCGCGGGGATCCGAAGGGCC;SOR=0.430;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=39;WE=278523;WS=278505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,49:0.80:61
chr20	278687	rs5839847	CCGG	C	2315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=14;PP=1816;SC=CCAGGATGAGCCGGCGGCGGC;SOR=1.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=38;WE=278697;WS=278677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	278806	rs1057189	C	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.06;MQRankSum=-0.651;NF=24;NR=17;PP=514;ReadPosRankSum=0.424;SC=TCCTGCGCTCCATCGGCATGG;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=41;WE=278814;WS=278796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,52:0.31:170
chr20	279483	rs1046560	T	C	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=985;ReadPosRankSum=-1.522;SC=AGCCAGCTTATCCCTCTTAAG;SOR=0.553;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=65;WE=279491;WS=279473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,72:0.44:162
chr20	334317	rs5839855	TC	T	1724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.563;NF=4;NR=37;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CCTGGATCCTTCCCCCCTTCT;SOR=1.002;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=41;WE=334325;WS=334307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr20	371972	rs6051637	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=263;ReadPosRankSum=0.441;SC=TGGAGCCCTATGCGCGGCTGC;SOR=0.448;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=20;WE=371980;WS=371962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr20	377226	rs6115830	C	T	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=955;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TGCCCTTAGCCCCAACCCGAT;SOR=0.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=62;WE=377234;WS=377216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,71:0.58:123
chr20	389280	rs41306771	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-1.708;SC=GGCTTGGGCCGCGCCGGAGGC;SOR=1.664;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=10;WE=389288;WS=389270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr20	390646	rs41281892	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=549;ReadPosRankSum=0.973;SC=TGAAGCCTGAGGTCTCCCCAA;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=39;WE=390654;WS=390636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr20	391025	rs6139109	T	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=6;PP=348;SC=GCTCATATTGTTTCTCTCACC;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=391033;WS=391015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	398039	.	T	TTG	162	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=162;QD=27.5;SC=AGACTGGGGTTTGTGTGTGTG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=398048;WS=398029;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr20	400507	rs6051889	G	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	400511	.	C	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	400515	.	AC	TG	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	400522	rs112445559	T	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	402710	rs2057251	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=756;SC=CATGTGAGGGATGGAGTCCCC;SOR=1.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=34;WE=402724;WS=402700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	409292	rs6037624	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=680;SC=CAGGTGGGGGCTGGGGGCTTC;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=409300;WS=409282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	409802	rs6051957	T	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=25;PP=626;SC=AGAGGAGGGCTGGGAAAACTA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=409810;WS=409792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	422348	rs6084439	T	G	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=53;PP=1876;SC=AGGGAGACAATTCAATAAGCC;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=86;WE=422356;WS=422338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr20	425865	rs6052047	G	A	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=384;SC=GGCCTAGAGGGCACATGTCAG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=425873;WS=425855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	476285	rs157816	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=1.069;SC=CCTGTGACAACACAAGGGATA;SOR=2.371;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=18;WE=476293;WS=476275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr20	476469	rs41310171	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=817;ReadPosRankSum=0.286;SC=CGGGTCAGAAAGGAGTTAGCC;SOR=0.385;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=51;WE=476477;WS=476459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,58:0.43:136
chr20	488930	rs74119	C	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=1123;SC=ACTCTGCTTCCTCACTGCAAA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=488938;WS=488920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	590456	rs282164	A	G	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=44;PP=1950;SC=TGCCCGCGGCACGGAAGCACG;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=98;WE=590464;WS=590446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr20	590542	rs2754502	CG	GC	7234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=66;PP=2947;SC=GCCAGGCGCACGGTCTCGATC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=590551;WS=590532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr20	590900	rs183989	T	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=9;PP=231;SC=GCCGCGTCCCTCCGTGCGCCG;SOR=1.101;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=590908;WS=590890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	628742	rs41282132	G	A	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=558;ReadPosRankSum=-0.981;SC=AGAAGGTGACGGGTCCAGCTA;SOR=0.568;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=41;WE=628750;WS=628732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,53:0.36:146
chr20	633548	rs140429049	GACCTCCCTCCTCCGGCA	G	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.450;NF=5;NR=7;PP=2954;ReadPosRankSum=2.847;SC=CCATCGCAGCGACCTCCCTCC;SOR=0.399;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=12;WE=633572;WS=633538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr20	656181	rs76595598	G	A	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=18;PP=805;SC=GTAGGTGGGGGCCGGCACCCC;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=656189;WS=656171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	741847	rs910857	A	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=778;SC=CCTTGACGTAACTGAGGCAGC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=741855;WS=741837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	742237	rs3746801	G	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	742237	.	GGT	AGC	584	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=1;PP=584;QD=53.1223229052;SC=TTCCCGGGAGGGTCCCACAGA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=12;WE=742247;WS=742235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,12:0.86:14
chr20	742239	rs6054589	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	744050	rs8122335	A	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=707;ReadPosRankSum=0.946;SC=CTTAACCACTACATGTACAGC;SOR=0.162;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=39;WE=744058;WS=744040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr20	744450	rs3746805	G	A	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=926;ReadPosRankSum=-1.908;SC=GGTCATTGAGGAGGTCTTCCA;SOR=0.919;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=52;WE=744458;WS=744440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr20	744662	rs3833341	A	ACAGGTCAAT	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=2957;SC=AAAGGACAAGACAGATCCCTG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=744670;WS=744652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	746423	rs11467076	GTATCTGCCC	G	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,9:0.17:52
chr20	825678	rs538094	T	C	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=54;PP=2929;SC=AGCCGCTCTTTAGCCCTGAGA;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=137;WE=825686;WS=825668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr20	854940	rs944110	T	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=662;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CAGACATCACTTGGGCACACT;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=52;WE=854948;WS=854930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr20	861743	rs4816045	C	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr20	861757	rs148734460	G	GGGAA	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr20	1099329	rs2072962	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-1.681;SC=AGAGGGAAGCAGAGTTATAGC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=1099337;WS=1099328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr20	1099523	rs1803415	T	G	3472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=62;PP=2077;ReadPosRankSum=0.958;SC=CACGGTTACTTCGGCTTGGGT;SOR=0.594;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=222;TCF=110;TCR=112;TR=129;WE=1099531;WS=1099513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,161:0.58:276
chr20	1099666	rs2072961	G	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=485;ReadPosRankSum=0.515;SC=GTCTGGGGCAGATGGCAGCGT;SOR=1.645;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=26;WE=1099674;WS=1099656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr20	1108122	rs6514113	C	T	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=1795;ReadPosRankSum=0.729;SC=ATGATTATATCGATGCAGAAC;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=104;WE=1108130;WS=1108112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,126:0.70:180
chr20	1108262	rs6040024	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=-0.679;SC=ATGGAAGAACCTTTTATTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=17;WE=1108270;WS=1108252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr20	1115529	rs4813939	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=729;ReadPosRankSum=-1.910;SC=GGTGGTAAACAAGGAGGGGCA;SOR=0.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=47;WE=1115537;WS=1115519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr20	1115681	rs45443791	C	T	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=0.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
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chr20	1277157	rs6109320	G	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=500;ReadPosRankSum=0.976;SC=TGCAGTATGTGTTTGAGCAAA;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=24;WE=1277165;WS=1277147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr20	1286711	rs4813082	T	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=25;PP=579;SC=GGGCCCATTCTGGCAGCGGCG;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=1286719;WS=1286701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	1291018	rs11449	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr20	1291076	rs1048628	G	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr20	1291393	rs2273956	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=264;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CGGGAGGTGAAGGGGATGGCA;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=17;WE=1291401;WS=1291383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr20	1292964	rs4814110	T	C	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=29;PP=2002;SC=CCCTCCCTGGTGCGGCCACCA;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=1292972;WS=1292954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	1293008	rs2273958	C	T	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TCTGCCCGTCCACCTCACACA;SOR=0.636;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=176;TCF=107;TCR=69;TR=78;WE=1293016;WS=1292998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,88:0.42:211
chr20	1293046	rs1048621	G	A	3536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=60;PP=2211;ReadPosRankSum=-1.736;SC=AGCCCGTTGCGGGCCGCAGAA;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=136;WE=1293054;WS=1293036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,160:0.60:266
chr20	1293247	rs2273959	C	T	4574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=77;PP=2564;ReadPosRankSum=2.232;SC=CGAACCACCACGACAATCTTA;SOR=0.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=277;TCF=137;TCR=140;TR=158;WE=1293255;WS=1293237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,205:0.58:352
chr20	1298794	rs6078610	G	A	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1281;SC=AGTGGTTTTCGTGAAGCCTCA;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=1298802;WS=1298784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	1300433	rs11087032	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr20	1356261	rs6074549	G	C	8966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=117;PP=2965;SC=TGAAAAAGACGACTGTAACAT;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=144;TCR=117;TR=261;WE=1356269;WS=1356251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr20	1424303	rs6891	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=228;ReadPosRankSum=-1.921;SC=ACTGCTGGGTGTGCACAAGGG;SOR=0.760;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=16;WE=1424311;WS=1424293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr20	1426393	rs9575	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.803;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr20	1435905	rs6042377	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=964;SC=TACTGGCTAGTTGGGAACACA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=1435913;WS=1435895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	1459060	rs6042507	T	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=52;PP=2024;SC=CACCGCTGTCTCCTTGGGGTG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=1459068;WS=1459050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr20	1517979	rs2256229	G	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=741;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GCAAAACTATGTGTTCCATGA;SOR=0.545;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=51;WE=1517987;WS=1517969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
chr20	1520819	.	C	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=363;ReadPosRankSum=-0.886;SC=AAGATTTATTCTATGCTGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=20;WE=1520827;WS=1520809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr20	1520883	rs2256520	T	C	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=33;PP=1677;SC=AGGGAATATGTTCTCTCCTAG;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=1520891;WS=1520873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	1532595	rs2249317	T	C	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=91;PP=2965;SC=GGTAAGGTATTGGGTACGCTG;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=177;WE=1532603;WS=1532585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr20	1538249	rs2250055	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=247;ReadPosRankSum=1.040;SC=GCAGCAGATACAGCAGTAAGG;SOR=1.414;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=18;WE=1538257;WS=1538239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr20	1538379	rs73604175	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=-1.252;SC=GCAGAGAAGACAGTTCTTGCC;SOR=0.474;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=17;WE=1538387;WS=1538369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr20	1546742	rs2243602	T	A	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=38;PP=2498;SC=TGGGCCCTCCTGCTGGCCTTG;SOR=1.525;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=120;WE=1546750;WS=1546732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr20	1546911	rs2243603	C	G	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=59;PP=1801;SC=GCCAGCGCTGCTTCTGGAAAT;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=1546919;WS=1546901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	1551485	rs2254458	C	T	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=61;PP=2965;SC=CCTTCTGGTGCGCTGAGATCT;SOR=0.995;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=1551493;WS=1551475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr20	1552430	rs2253427	T	C	6355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=88;PP=2965;SC=TGATGTGGGCTATCTCGCAGA;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=204;WE=1552438;WS=1552420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
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chr20	1592141	rs141518677	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.11;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	1592150	.	TGA	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.50;QD=46.56;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	1592154	.	G	GAC	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.75;QD=38.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	1592175	rs201724217	T	G	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=202;SC=TTGTTACCCGTGGGAAGTGGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=1592183;WS=1592165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	1592193	rs371465078	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=6;PP=343;SC=GGCCTTCTTTCTGATTGTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=1592201;WS=1592183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	1592215	rs41289057	C	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=567;SC=TAATTCCCGGCCTGGTCCAGC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=1592223;WS=1592205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	1592265	rs45471597	A	G	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=80;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=23;PP=820;SC=GGATCAGGGAAGTCACAGTGC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=1592273;WS=1592255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	1592284	rs1135196	G	A	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=90;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=26;NR=30;PP=965;SC=GCAGTGCAGAGTGGCCGACTC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=56;WE=1592292;WS=1592274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	1592312	rs72484087	T	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=97;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=19;NR=27;PP=732;SC=GCAACTGATATGGACTTGTCA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=1592320;WS=1592302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	1592343	rs200963975	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.48;QD=41.05;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	1592349	.	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.65;QD=47.07;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	1592352	rs139138248	A	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.95;QD=53.94;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr20	1592358	rs145917713	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.31;QD=48.09;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	1592383	rs139926854	A	ATT	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.48;QD=33.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	1592390	rs144483378	C	T	210.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=52.71;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	1592399	rs200926806	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=53.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr20	1610790	rs3746719	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.939;SC=GGTGCTGCATGGCATGTGGGC;SOR=0.626;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=17;WE=1610798;WS=1610780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr20	1610812	rs3746720	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=251;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GGGCCTTCCTGTTGGCCTTGC;SOR=0.931;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=22;WE=1610820;WS=1610802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr20	1610894	rs3746721	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=338;ReadPosRankSum=0.330;SC=TCCAGGGGACGTAGATGGGGC;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=21;WE=1610902;WS=1610884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr20	1610939	rs3746722	G	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=20;PP=647;SC=GCGCAGTAAGGGATGATGCCG;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=1610947;WS=1610929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	1615959	rs9305125	T	C	4746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=53;PP=2965;SC=CTGTGACCTCTAGGGCAAGGC;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=146;WE=1615967;WS=1615949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	1616137	rs6034239	G	A	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=52;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TCCATTCTCCGACCAGGTCAG;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=57;TCR=94;TR=83;WE=1616145;WS=1616127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,96:0.57:169
chr20	1616206	rs6043409	A	G	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=1297;SC=CTGGTTCCCCACCCTCATGGG;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=1616214;WS=1616196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	1616816	rs71964196	GGT	G	1621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=1.311;NF=18;NR=14;PP=1238;ReadPosRankSum=0.772;SC=GCTTGGGCTGGGTGTGAGGGT;SOR=0.916;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=32;WE=1616825;WS=1616806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,46:0.37:123
chr20	1616892	rs2277760	A	G	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.05;MQRankSum=-1.242;NF=54;NR=53;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GCAAGGTGACATGGGCCACCT;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=107;WE=1616900;WS=1616882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,127:0.61:208
chr20	1617069	rs2277761	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=455;ReadPosRankSum=1.288;SC=GAGAGAAGCCATGGGACTCAC;SOR=0.434;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=27;WE=1617077;WS=1617059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr20	1629547	rs6110775	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=343;SC=GTCCCTGGGCTTCAACTCACC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=1629555;WS=1629537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	1629604	rs6074948	A	C	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.45;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	1629604	.	AAA	CAA,CAG	443	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28,17;NR=13,10;PP=179,443;QD=5.21393201335;SC=TGAGCACTGAAAATCACACCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=41,27;WE=1629614;WS=1629594;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:42
chr20	1629606	rs6110777	A	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr20	1629906	rs6079967	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=803;ReadPosRankSum=0.630;SC=AGATTAATTCCCGGCCTGGTC;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=50;WE=1629914;WS=1629896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
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chr20	1895630	rs111980944	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.420;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr20	1895889	rs72620874	G	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-8.669;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,15:0.15:99
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chr20	1896060	rs114499682	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=5.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-5.566;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.603;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,16:0.20:82
chr20	1896100	rs6136375	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-3.694;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
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chr20	2082732	rs6112857	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=0.550;SC=TGCTCGGTCCCGGAGGCAGCC;SOR=0.180;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=12;WE=2082740;WS=2082722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr20	2290333	rs214803	C	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=642;SC=AACTGGCAGACGGCCTTCAAC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=2290341;WS=2290323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr20	2290547	rs214805	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=37;PP=1095;SC=CAAGGACTGACGGGGACCACA;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=2290555;WS=2290537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	2297790	rs214814	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=0.688;SC=GACCCAAGGAGCTGGAACGGC;SOR=0.902;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=12;WE=2297798;WS=2297780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
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chr20	2321105	rs214830	G	C	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GCCCAAGGAGGGGTCCCGGGT;SOR=1.032;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=67;WE=2321113;WS=2321085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,74:0.57:129
chr20	2361505	rs9680025	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=46;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGAGTGTCCCAAGGTTTTCCT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=2361513;WS=2361495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr20	2361684	rs2422753	C	T	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=577;ReadPosRankSum=-2.665;SC=TCAAGAAACACGGGTCTGTGG;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=44;WE=2361692;WS=2361674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,52:0.68:76
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chr20	2375440	rs7266902	G	T	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr20	2411731	rs71329366	CAG	C	1462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.475;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-5.655;NF=0;NR=38;PP=1824;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GTGGATGAGCCAGAGAGAAGT;SOR=2.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=38;WE=2411740;WS=2411721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,49:0.96:51
chr20	2413125	rs2076653	CC	TT	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=779;SC=TCTCCCCTCCCCTTCCTCCAG;SOR=2.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=35;WE=2413134;WS=2413115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	2413320	rs2076652	T	C	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=36;PP=1209;SC=GGGGTGGATTTGGCCCCTGTC;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=2413328;WS=2413310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	2442273	rs6049216	C	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=407;SC=AAATAAAGATCCATAGGTGCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=2442281;WS=2442263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	2451503	rs4815262	G	A	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.217;NF=24;NR=51;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.653;SC=TGGAGTTCCGGCCCCGGAGCG;SOR=0.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=75;WE=2451511;WS=2451493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr20	2474081	rs4815270	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.670;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr20	2539387	rs6050063	G	A	5013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=78;PP=2965;SC=ATTCCGAGGAGGGAGGAGAAG;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=153;WE=2539395;WS=2539377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr20	2542747	rs4815323	G	T	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=276;SC=TCCCCAAAGGGGCTTGATGTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=2542755;WS=2542737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	2552805	rs1883981	T	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.874;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr20	2552926	rs1883980	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=33;PP=735;SC=GTGTGTGGGGTGGGGGCAGTG;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=2552934;WS=2552916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	2559778	rs6083735	G	C	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=32;PP=1861;SC=AGAGTTTTACGTCTTTTATTT;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=81;WE=2559786;WS=2559768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr20	2572816	rs6050433	T	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.52;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	2591005	rs1883978	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=364;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGGAGTGCAGAGATGGCAGCC;SOR=0.445;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=25;WE=2591013;WS=2590995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr20	2591232	rs6050576	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=1.980;SC=TGATGGATGACGTCCACCTCA;SOR=1.387;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=10;WE=2591240;WS=2591222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr20	2593006	rs1015159	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=233;ReadPosRankSum=-1.344;SC=TACACTCTCTAAAAAGGTGAC;SOR=1.041;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=15;WE=2593014;WS=2592996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr20	2593863	rs6515646	T	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=590;ReadPosRankSum=0.459;SC=TGACGGTGTCTGACATGCTGG;SOR=1.511;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=34;WE=2593871;WS=2593853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr20	2596969	rs4621228	T	A	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=49;PP=2039;SC=CTCTCTGAACTCCCCTCTTTC;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=2596977;WS=2596959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr20	2596998	rs4481063	G	A	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=53;PP=2028;SC=AATCAAGAGCGGGACTAGATG;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=99;WE=2597006;WS=2596988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	2597073	rs4544508	T	G	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=48;PP=1456;SC=GGGAGAGGGGTTGGTGGAGGA;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=2597081;WS=2597063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	2597978	rs4815428	G	A	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=51;PP=2488;SC=TCAGTTGCCCGGGAGCACCTC;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=111;WE=2597986;WS=2597968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr20	2598019	rs6083866	C	T	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=56;PP=2714;SC=CAGAGGGCCTCGGCCCAGAAT;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=126;WE=2598027;WS=2598009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr20	2616556	rs910271	T	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=16;PP=1262;SC=ATAGGAGGCATGCTTTTCTCT;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=2616564;WS=2616546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	2616679	rs2422808	C	G	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=67;PP=2354;SC=TCATCCTGGACGGTAAAAAGA;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=114;WE=2616687;WS=2616669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr20	2617993	.	C	T	151	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=59.52;NF=9;NR=0;PP=151;QD=20.6412458386;SC=GAGTTCACGCCGCTGCACTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=2618001;WS=2617983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	2618094	rs6037181	G	A	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=29;PP=1978;SC=CCTGGGCCAGGACCAACAGTT;SOR=1.279;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=2618102;WS=2618084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr20	2618140	rs6083915	T	C	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=55;PP=2965;SC=TTGAGAAGAGTCACAAATCTG;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=138;WE=2618148;WS=2618130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr20	2618308	rs6050771	C	T	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=43;PP=1164;SC=TATGAAACAGCGTGAAATCAG;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=2618316;WS=2618298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	2621998	rs6050798	T	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=979;SC=TCCCCACTGATGGCTAGGACT;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=2622006;WS=2621988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	2633234	rs6115305	T	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.55;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	2633244	rs4815467	A	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.52;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	2633331	.	C	CG	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=0.312;SC=TTGCGGGGCGCGGGCGACGCG;SOR=0.559;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=17;WE=2633339;WS=2633321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr20	2633378	rs149713688	A	AGAGCCTGGGCCT	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.982;HP=3;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GGCCGCAGACAGGGCCTGGGC;SOR=1.668;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=19;WE=2633388;WS=2633368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr20	2633380	rs6115306	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=694;ReadPosRankSum=0.187;SC=CCGCAGACAGGGCCTGGGCCT;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=24;WE=2633388;WS=2633368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr20	2633398	.	GGCCTGC	G	453.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=643;ReadPosRankSum=0.073;SC=CCTGGGCCTGGGCCTGCGCCT;SOR=0.385;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=13;WE=2633430;WS=2633388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr20	2633404	rs6115307	C	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.114;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr20	2633422	.	C	CG	313	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=7;PP=313;QD=30.0909090909;SC=CCTGCGCCTGCCCTGGGAACG;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=11;WE=2633430;WS=2633388;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr20	2633842	rs73070665	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTTAAGAGCTTCCAAGGCTGA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=2633850;WS=2633832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr20	2633936	rs2073194	T	C	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=32;PP=1447;SC=TGGAGGAGTCTGTGCTCAACC;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=2633944;WS=2633926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr20	2634167	rs6050911	C	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=73;ReadPosRankSum=0.363;SC=AGTATTTGAGCCATACAATGT;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=8;WE=2634175;WS=2634157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr20	2636218	rs742842	C	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=750;ReadPosRankSum=0.069;SC=TGGCCTCTTGCATTCACACTT;SOR=0.720;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=142;TCF=75;TCR=67;TR=49;WE=2636226;WS=2636208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,60:0.34:174
chr20	2637071	rs8958	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=29;PP=1497;SC=GGGGTAACACTCCAAAATATG;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=2637079;WS=2637061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	2638527	rs144652695	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=397;ReadPosRankSum=0.995;SC=TTGCTGAAGATGTAATGAGCA;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=33;WE=2638535;WS=2638517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr20	2638579	rs6753	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.75;MQRankSum=-1.508;NF=12;NR=13;PP=308;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CTTTAGGAGATGAGTGAAAAA;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=25;WE=2638587;WS=2638569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr20	2638882	rs5856	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.154;NF=1;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=-0.858;SC=GAAGAGGCGGTTGGCAAGAGC;SOR=3.056;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=14;WE=2638890;WS=2638872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr20	2639570	rs6037255	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=1.094;SC=GGAAATGGAAGCCAAGAATGC;SOR=0.136;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=2639578;WS=2639560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr20	2640102	rs2235955	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=387;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TTCCCCAGAGGGTAGTGCCGA;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=25;WE=2640110;WS=2640092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr20	2644407	rs2073193	C	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=28;PP=1030;SC=TCCTCGGCCTCAATTGGGGGA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=2644415;WS=2644397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	2673644	.	GGGCGCT	G	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	2674174	rs55820831	A	G	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=54;SC=AGCCACCCGGACTCGGCGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=2674182;WS=2674170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	2690383	rs13042775	G	A	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=38;PP=1100;SC=AGGGAGGAGCGGAGCAGCCCC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=2690391;WS=2690373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	2732902	rs2235813	C	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CCCCGGGGCCCGAGCCGGGTG;SOR=0.560;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=11;WE=2732910;WS=2732892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr20	2732951	rs149223102	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=0.836;SC=GGCGCCGCCACCGCCCCTCCC;SOR=0.235;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=12;WE=2732959;WS=2732941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr20	2739583	rs2073125	T	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.910;SC=CTGACAAGTTTCACTCTCCAG;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=71;WE=2739591;WS=2739573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,81:0.60:136
chr20	2777459	rs1985525	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=109;ReadPosRankSum=1.069;SC=GAGGAAGGGGTAGGACTGGGG;SOR=0.435;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=9;WE=2777467;WS=2777449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr20	2777828	rs742707	G	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=598;ReadPosRankSum=-1.250;SC=ACCCTGGCCTGACTGCCCACC;SOR=0.844;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=34;WE=2777836;WS=2777818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,35:0.35:100
chr20	2778075	rs127076	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=44;PP=1331;SC=CCTCCAAGCTTACTGTCTCCC;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=2778083;WS=2778065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	2779257	rs215541	G	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=0.285;SC=TGAGCCTAAGGTTGCTCCTGC;SOR=1.242;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=16;WE=2779265;WS=2779247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr20	2797015	rs215561	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=-2.301;SC=CTGCCAGGCCGTCCTGGGCGC;SOR=0.752;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=22;WE=2797023;WS=2797005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
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chr20	3147762	rs6051612	A	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=37;PP=1034;SC=CCAGGAGAGGATCCCGCCCTG;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=3147770;WS=3147752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	3171628	rs2295546	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.70;ReadPosRankSum=-2.461;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
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chr20	3175556	rs2295549	C	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CCCTAGCAAGCCCACAGGGTT;SOR=1.445;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=19;WE=3175564;WS=3175546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr20	3175742	rs2295551	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=24;ReadPosRankSum=0.674;SC=TGGCCACTAAAGCCTGCTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=4;WE=3175750;WS=3175733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr20	3176009	rs2295552	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=368;ReadPosRankSum=0.259;SC=CCTGTGGACATAGGAGGCAAA;SOR=1.115;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=22;WE=3176017;WS=3175999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr20	3184134	rs2295553	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=1.298;SC=AGCGGCAGCCCGGAAGCCTCA;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=18;WE=3184142;WS=3184124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr20	3185123	rs11697186	A	T	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1099;ReadPosRankSum=-1.103;SC=GACGGTCCACAAAGGCTCAGA;SOR=0.470;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=71;WE=3185131;WS=3185113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr20	3190039	rs45620433	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=0.880;SC=GCCGCCACCGCGAGCCCACTC;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=10;WE=3190047;WS=3190033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr20	3193842	rs1127354	C	A	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.535;SC=AGATAAGTTTCCATGCACTTT;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=98;WE=3193850;WS=3193832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,119:0.63:190
chr20	3193978	rs8362	G	A	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=49;PP=1597;SC=CGGAGTACCAGGGGGAGCCGG;SOR=1.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=67;WE=3193986;WS=3193968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	3199373	rs2422861	G	A	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=720;SC=GGTGGTGGGAGGGGCGCCTTG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=3199381;WS=3199363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	3203950	rs2236206	T	A	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=33;PP=1440;SC=GAGGTAGGGTTGGGAGGGGGT;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=3203958;WS=3203940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	3204084	rs9101	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=-0.836;SC=AGCTGCAGGAGTACTTTGGCA;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=24;WE=3204092;WS=3204074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr20	3209371	rs2281575	G	A	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=65;PP=2729;SC=GGCCCGAGCCGCGAGTGTCAC;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=129;WE=3209379;WS=3209361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr20	3210692	rs6139039	A	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=6;PP=392;SC=TGCCAGCCCAAGGCTCCCAGA;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=3210700;WS=3210683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	3211064	rs3810561	A	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=6;PP=258;SC=TTGGGGCAGCAATATGGTGGG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=3211072;WS=3211062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	3211719	rs3803953	T	G	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.546;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1247;ReadPosRankSum=0.481;SC=GAATGGGGGATGGGAGAGAGG;SOR=0.840;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=235;TCF=120;TCR=115;TR=89;WE=3211727;WS=3211709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,96:0.37:257
chr20	3212222	rs147477986	T	TG	1785.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.90;MQRankSum=7.967;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr20	3212223	.	A	T	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.02;MQRankSum=7.967;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr20	3212225	.	A	G	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.13;MQRankSum=8.043;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr20	3214020	rs2144771	G	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=622;SC=ACATGTTTCTGACACACCCAC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=3214028;WS=3214010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr20	3214581	rs3803956	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=516;ReadPosRankSum=0.709;SC=TGCAGAGCCACGACTGCTGGT;SOR=0.430;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=33;WE=3214589;WS=3214571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
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chr20	3219894	rs6107260	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=-0.219;SC=ACACACCCCCACGCCGCGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=3219902;WS=3219884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr20	3236015	rs1569942	A	G	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=29;PP=955;SC=TCTATTACACAACTAAGATCT;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=3236023;WS=3236005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	3245276	rs6051694	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr20	3285126	rs2254916	A	T	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GATCCTTGGAAATGATGATAC;SOR=1.294;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=63;WE=3285148;WS=3285116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr20	3285140	rs2422864	T	C	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=57;PP=2459;SC=ATGATACTTCTATGACGACAG;SOR=1.374;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=87;WE=3285148;WS=3285116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	3355567	rs2208030	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=-1.136;SC=TTGGTAAAAATAGACGAAGGG;SOR=0.877;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=15;WE=3355575;WS=3355557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr20	3541633	rs235577	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=50;PP=1450;SC=TGTTTAGAAAAGTTCAACCTA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=61;WE=3541641;WS=3541623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	3556469	rs41279370	T	G	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1167;ReadPosRankSum=0.775;SC=TTGTTTTCTTTGCAGCTCTTG;SOR=0.842;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=72;WE=3556477;WS=3556459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr20	3564672	rs235540	C	T	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=48;PP=1587;SC=CCAATGCCTACGTGGCCTCCT;SOR=1.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=3564680;WS=3564662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	3564772	rs170976	T	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=499;SC=GCATGCCCTCTGTATAGGCAA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=3564780;WS=3564762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	3565546	rs235538	C	G	4908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=91;PP=2965;SC=CCTTGCATATCCAAATTCAAG;SOR=1.212;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=147;WE=3565554;WS=3565536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr20	3575248	rs235532	G	C	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=46;PP=1219;SC=GGACCACCAGGGAGGACCAAG;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=3575256;WS=3575238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr20	3605059	rs235519	A	G	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=29;PP=1901;ReadPosRankSum=1.795;SC=CTTCTTTAAAATGTAAGCTCT;SOR=0.615;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=192;TCF=141;TCR=51;TR=105;WE=3605067;WS=3605049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,126:0.55:229
chr20	3624704	rs2246799	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=524;ReadPosRankSum=0.838;SC=TTATATACCTGAAATTGATGG;SOR=0.944;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=32;WE=3624712;WS=3624694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr20	3624830	rs2246808	G	A	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1452;ReadPosRankSum=0.116;SC=CACTGGAGCCGTGTTTTGGCA;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=216;TCF=104;TCR=112;TR=101;WE=3624838;WS=3624820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,122:0.44:277
chr20	3640467	rs635674	C	T	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=11;PP=1033;SC=GGTAAGCCAGCCCCTTCTCAA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=3640475;WS=3640457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	3640499	rs679393	C	T	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.853;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=16;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GCCACAGAGGCGGCCCAGGCA;SOR=1.095;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=60;WE=3640507;WS=3640489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,62:0.59:105
chr20	3640823	rs2853208	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=346;ReadPosRankSum=2.313;SC=GGCTGTGCTCCGGGTCTCCCT;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=21;WE=3640831;WS=3640813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr20	3643876	rs12624874	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=326;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GCGCACAGGCCTCTCACTGGC;SOR=0.454;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=25;WE=3643884;WS=3643866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr20	3649713	rs628965	A	G	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	3649721	rs628977	T	C	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.25;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	3650066	rs630712	C	A	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=30;PP=1160;SC=TCAGCAGGAGCCCCTGGGGCT;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=55;WE=3650074;WS=3650056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	3651693	.	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=1.038;SC=CAGCTGCATCGCTGCAGATGG;SOR=1.511;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=17;WE=3651701;WS=3651683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr20	3653825	rs7267301	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=374;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TACCGTTGAGAATCCACTTTG;SOR=0.858;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=26;WE=3653833;WS=3653815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr20	3657803	rs568251	AT	GA	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=41;PP=2534;SC=GGGCAAGAAAATGTGTGGAGC;SOR=1.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=62;WE=3657812;WS=3657793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	3671891	rs3859664	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CAATATCCGTGAAGCCTTCAC;SOR=1.445;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=8;WE=3671899;WS=3671881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr20	3672647	rs35964604	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1171;ReadPosRankSum=1.047;SC=CTTGCACCTGCAGCCGTAGGG;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=159;TCF=68;TCR=91;TR=76;WE=3672655;WS=3672637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,80:0.45:177
chr20	3672836	rs910653	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=28;ReadPosRankSum=0.759;SC=ACAGGACAGCGTCCTGAGGGG;SOR=0.986;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=6;WE=3672844;WS=3672826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr20	3673815	rs2474436	A	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=35;PP=1066;SC=AGTCACAGGCAGCAGCCTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=50;WE=3673823;WS=3673805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	3674064	rs3827110	G	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;ReadPosRankSum=0.415;SC=TCATTCCTGTGAGTCCCACCC;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=30;WE=3674072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr20	3674821	.	GACACACACACAC	G,GACACACACACACACACAC	970.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.695;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-0.432;QD=24.27;ReadPosRankSum=0.569;SOR=2.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,21,15:0.52,0.38:40
chr20	3675333	rs3746638	G	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=883;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GCTGATGGGTGCAGCTAGGCT;SOR=0.807;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=56;WE=3675341;WS=3675323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr20	3675498	rs709012	T	G	5398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=84;PP=2915;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GACTCCTGTGTGTACCTGGCA;SOR=0.606;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=64;TCR=84;TR=147;WE=3675512;WS=3675488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr20	3677095	rs11471725	T	TGCTG	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=326;SC=GGAGGCCTTCTGCTGGCTGGA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=3677103;WS=3677094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	3677357	rs501538	T	C	5073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=75;PP=2965;SC=TGGCCTCAGCTTTAGCCTGGA;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=154;WE=3677365;WS=3677347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr20	3677736	rs673114	T	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=780;SC=ACCCACAGAGTACACTCAGGA;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=3677744;WS=3677726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	3682011	rs1018493	G	A	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=43;PP=2296;SC=AGTCCAGGGTGGAGGTTGCAT;SOR=1.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=3682019;WS=3682001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	3682149	rs13037869	G	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=961;ReadPosRankSum=2.416;SC=CACTGTCCCCGGAGGTGGAGG;SOR=0.473;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=61;WE=3682157;WS=3682139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,69:0.51:134
chr20	3682275	rs1018492	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=838;SC=TCAGGACTGGAGTGAGAGGCG;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=3682283;WS=3682265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	3684022	rs611847	A	G	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1412;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TGGGTGCCTCATTGGGTGTGT;SOR=0.932;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=211;TCF=83;TCR=128;TR=95;WE=3684030;WS=3684012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,116:0.46:253
chr20	3684729	rs625372	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=731;ReadPosRankSum=2.309;SC=CTTCACACCCTTGGGGGCATC;SOR=1.760;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=34;WE=3684737;WS=3684719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr20	3686436	rs6037651	C	T	5135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=61;PP=2951;SC=TGATTGGCCACGGAGAGCTGG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=147;WE=3686444;WS=3686426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr20	3686512	rs6052021	G	A	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1515;ReadPosRankSum=1.762;SC=GGTGGCCGACGCCGGTGGGCT;SOR=0.568;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=102;WE=3686520;WS=3686502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,114:0.51:223
chr20	3721456	rs3827077	C	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=831;ReadPosRankSum=-0.038;SC=CGTCTCTTCTCTGCAGGCTCC;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=48;WE=3721464;WS=3721446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr20	3723091	rs611073	A	G	2383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=48;PP=1565;SC=GAGGTGGGGAAGGTGGGGAGT;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=3723099;WS=3723081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	3726687	rs41279388	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=565;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TGGTGAGGACGTGCAGGCGGG;SOR=0.315;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=36;WE=3726695;WS=3726677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr20	3730524	rs62206555	G	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=986;ReadPosRankSum=-2.770;SC=GCGGCGCCCCGGTACCCAGCG;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=61;WE=3730532;WS=3730514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr20	3731622	rs2474437	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=600;ReadPosRankSum=0.120;SC=AATTCCCCCCCATCAGTGCCT;SOR=0.404;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=41;WE=3731630;WS=3731612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr20	3732633	rs541760	C	T	4330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=71;PP=2570;ReadPosRankSum=1.204;SC=TGCGCAAATGCGGCGCGCTCA;SOR=0.868;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=353;TCF=183;TCR=170;TR=162;WE=3732641;WS=3732623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,200:0.48:414
chr20	3740620	rs11470482	GCA	G	1533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.010;NF=6;NR=21;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.711;SC=ACTCACACATGCACACACACA;SOR=0.726;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=27;WE=3740631;WS=3740610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
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chr20	3759528	rs2281478	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.944;SC=CTTCCACTCTCACAAGTGACA;SOR=0.877;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=71;WE=3759536;WS=3759518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,86:0.45:191
chr20	3760548	rs6116037	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=-1.890;SC=GTGGAGATGCGGAAAGGGGAA;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=3760556;WS=3760538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	3778433	rs3746644	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=415;ReadPosRankSum=-0.968;SC=TCTGCCTGTGTCAGGAGAGTT;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=25;WE=3778441;WS=3778423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr20	3780857	rs140901750	T	TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=13.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=-2.643;SOR=4.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr20	3783649	rs592687	G	C	6287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=84;PP=2965;SC=TTTCTAGGCAGATTTGGGACT;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=124;TCR=84;TR=208;WE=3783657;WS=3783639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr20	3784110	rs1056720	C	T	3549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=2111;ReadPosRankSum=0.866;SC=AGAGCCCCATCGCGCCCTGTA;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=271;TCF=145;TCR=126;TR=134;WE=3784118;WS=3784100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,164:0.51:320
chr20	3844929	rs45437096	C	T	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=1089;ReadPosRankSum=1.743;SC=CACACCATCCCGTGGGCCTGT;SOR=1.161;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=62;WE=3844937;WS=3844919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,81:0.53:153
chr20	3846843	rs3746660	C	T	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=51;PP=1742;SC=TCCTGCAGTACACCTGGCCCC;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=3846851;WS=3846833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr20	3870124	rs3737084	G	C	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=76;PP=2194;SC=CGGATGGGAGGGGGCCGGCTC;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=127;WE=3870132;WS=3870114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr20	3954789	rs2143236	T	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=158;SC=TTAACTGATTTAAAAAAAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=3954797;WS=3954780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	4053254	rs6139288	A	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=39;PP=1358;SC=GAAGAAGGGAAACCAGGCAGG;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=4053262;WS=4053244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	4055656	rs6139292	C	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-0.812;SC=ACCCTCATGGCCCTCATGCAA;SOR=0.045;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=14;WE=4055664;WS=4055646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr20	4155948	rs1741315	G	A	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=58;PP=1852;SC=ACCTCCCCAGGTCACCTTTAG;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=83;WE=4155956;WS=4155938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr20	4157853	rs1535225	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=0.242;SC=GAGGACCTTCGTTGGTTGCCA;SOR=0.132;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9;WE=4157861;WS=4157846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	4162411	rs1124983	T	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=791;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GATGGAGGTGTGATGAGGTGT;SOR=2.557;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=35;WE=4162419;WS=4162401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr20	4163242	rs28927676	C	T	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=2129;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TTCTGGAATTCGAGGAGCCCT;SOR=0.668;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=115;WE=4163250;WS=4163232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,131:0.52:251
chr20	4163302	rs1051904	A	G	7673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=114;PP=2965;SC=AGGACGAAGCAGAGAGCCACA;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=250;WE=4163310;WS=4163292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr20	4163513	rs45449404	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-2.485;SC=ACGTGCCCCACGACCCGCTTC;SOR=0.395;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=15;WE=4163521;WS=4163503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr20	4164283	rs1741327	A	G	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=54;PP=1585;SC=TGCCGTACACAGAGAGCTCAA;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=4164291;WS=4164273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	4202802	rs835873	A	G	3112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=68;PP=2089;SC=GACCGATACTATTTAGCTGCT;SOR=1.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=90;WE=4202810;WS=4202792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr20	4229514	rs184418609	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	4705718	rs2245220	C	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=2044;ReadPosRankSum=1.092;SC=ATCTGGCTCACGGTGAAATAA;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=40;TCR=88;TR=57;WE=4705727;WS=4705708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr20	4705719	rs45475194	G	A	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=2580;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TCTGGCTCACGGTGAAATAAG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=37;TCR=84;TR=66;WE=4705727;WS=4705708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr20	4705756	rs2756263	T	C	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=462;ReadPosRankSum=-0.631;SC=CAGTACAGAGTGCAGCAGCGA;SOR=0.203;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=37;WE=4705764;WS=4705746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr20	4768183	rs2422986	G	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=631;ReadPosRankSum=0.137;SC=GGGCATGGTCGTTGGTCAAAA;SOR=0.492;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=42;WE=4768191;WS=4768173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr20	4768475	rs111533115	A	AAGGGACT	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=556;ReadPosRankSum=0.650;SC=CAGGGGTCCAAAGGCACCTTA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=10;WE=4768483;WS=4768465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr20	4770440	rs2422992	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.073;SC=ACGATACTCAGAATGTACTCC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=4770448;WS=4770430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr20	4773338	rs1998291	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=0.494;SC=AGACGCCCCCGCACCCGCTGG;SOR=0.929;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=19;WE=4773346;WS=4773328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr20	4776445	rs2423004	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=216;ReadPosRankSum=2.634;SC=TCCCTGCCCCGTCTCTCCTCA;SOR=1.292;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=14;WE=4776453;WS=4776435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr20	4776718	rs2423005	C	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=517;ReadPosRankSum=-0.982;SC=GGCTGGGGGCCCCCAGACTGT;SOR=1.464;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=30;WE=4776726;WS=4776708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr20	4776764	rs2423006	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.520;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=1.519;SC=AGTTCACACCGCAGCTCTGAG;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=4776772;WS=4776754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr20	4778799	rs3830974	CTT	C	2334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.239;NF=3;NR=36;PP=1334;ReadPosRankSum=0.552;SC=GTTGTTCCCTCTTTCTCTCAC;SOR=0.830;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=91;TCF=14;TCR=77;TR=39;WE=4778808;WS=4778789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr20	4837929	.	TACACACACACACACACAC	T	568	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=61.14;NF=1;NR=5;PP=568;QD=95.1666666667;SC=GTCAAACACATACACACACAC;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=4837954;WS=4837919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr20	4843370	rs3737321	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=708;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AACACCATGACCCCTATTAAA;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=47;WE=4843378;WS=4843360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,53:0.36:149
chr20	4843470	rs34073337	C	A	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CCGGAAGGGACGCAAAGAGGG;SOR=0.692;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=69;WE=4843478;WS=4843460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,95:0.45:209
chr20	4880132	rs71993570	AGCTCAATGCCTTCTGC	A	847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=2957;SC=CAAACGGCGCAGCTCAATGCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=4880155;WS=4880122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	4880308	rs1776964	G	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=777;ReadPosRankSum=0.171;SC=ACATGGCATCGGCCAACAGGA;SOR=0.330;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=43;WE=4880316;WS=4880298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr20	5087008	rs77129042	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.872;NF=16;NR=16;PP=442;ReadPosRankSum=0.033;SC=AATGCAAATACCTGGGTTCAA;SOR=0.430;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=32;WE=5087016;WS=5086998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr20	5099636	rs25406	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=632;ReadPosRankSum=1.093;SC=TGGAGGGTAAGCGGACTGCTG;SOR=0.633;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=39;WE=5099644;WS=5099626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr20	5149085	rs11287231	GA	G	121.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQRankSum=0.469;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr20	5159344	rs2295508	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=0.191;SC=TGAGCTGTCCCGGGGGACTCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=5159352;WS=5159336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr20	5169877	rs6038087	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=-0.599;SC=TCCCTCACCCATCTTCTGCCT;SOR=0.404;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=22;WE=5169885;WS=5169867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr20	5283256	rs3746682	C	G	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TAAAGAGGACCGTTTCTGTTG;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=77;WE=5283264;WS=5283246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,90:0.54:167
chr20	5296488	rs910971	G	C	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=605;ReadPosRankSum=2.161;SC=GACCAAGAATGGGGAGTCCTA;SOR=0.840;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=128;TCF=68;TCR=60;TR=56;WE=5296496;WS=5296478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr20	5296549	rs910972	C	T	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GGCGCGCGCCCGGGCTGGGAC;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=72;WE=5296557;WS=5296539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,79:0.43:182
chr20	5296651	rs910973	T	G	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=36;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCGGCCGCACTGTCGGCGTCT;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=90;WE=5296659;WS=5296641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,106:0.47:224
chr20	5297172	rs4544519	T	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=0.408;SC=TGCGCTCTGCTGCTCCGGAAG;SOR=1.011;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=33;WE=5297180;WS=5297162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr20	5297193	rs4315595	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=448;ReadPosRankSum=0.921;SC=CCGGATCGAGAGTCACAGTGT;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=27;WE=5297201;WS=5297183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr20	5454400	rs606389	A	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.689;NF=20;NR=18;PP=594;ReadPosRankSum=2.359;SC=CTCCAGTACCACTCAAATCAG;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=38;WE=5454408;WS=5454390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,24:0.26:94
chr20	5482307	rs6053447	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQRankSum=1.445;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr20	5482406	rs116753100	T	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.820;NF=19;NR=23;PP=545;ReadPosRankSum=0.588;SC=GGAGAAAGGCTGTGGTGTCTT;SOR=0.404;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=42;WE=5482414;WS=5482396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr20	5528518	rs3747910	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=56;PP=1662;SC=CAAATACAAAACACATAAAAT;SOR=3.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=65;WE=5528526;WS=5528508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	5528534	rs3747911	A	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=55;PP=1603;SC=AAAATACTGTAATTTTATGGT;SOR=4.479;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=5528542;WS=5528524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	5542052	rs2273371	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=717;SC=GACAGGAATGAAAGAATTTTT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=5542060;WS=5542042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	5542092	rs2273372	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=662;SC=TAGAATGTGCTGCATAGAGAA;SOR=1.259;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=36;WE=5542100;WS=5542082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	5551034	rs1056244	G	C	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=710;SC=AAAACAATGGGTTTTCTCTTT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=5551042;WS=5551024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	5556686	rs144724629	TAC	T	268.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=8;PP=337;SC=TACATACATATACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=5556695;WS=5556676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	5564774	rs6053517	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=217;SC=CATATGAGACTGCTGCTGCAC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=5564782;WS=5564764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	5574134	rs1983694	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=8;PP=231;SC=TTCACAAAACTCCTCAAATAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=5574142;WS=5574124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	5752917	rs237420	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=-1.668;SC=GGGGCCATTAATAAGTAAAAT;SOR=0.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=18;WE=5752925;WS=5752907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr20	5753579	rs237422	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=537;ReadPosRankSum=0.416;SC=CTGCCATCAGCGTGTGACATA;SOR=0.832;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=34;WE=5753587;WS=5753569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr20	5843812	rs1699233	T	C	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=874;ReadPosRankSum=-0.323;SC=AAATGTTTGGTCATCCACAGC;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=54;WE=5843820;WS=5843802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr20	5844121	rs1699232	CA	TG	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=1501;ReadPosRankSum=1.160;SC=TGGTGCCGGGCAGTGTGCAGG;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=31;TCR=77;TR=41;WE=5844130;WS=5844111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,49:0.42:118
chr20	5935385	rs236114	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=289;ReadPosRankSum=-0.462;SC=ATCTTACCAATGTATTCGAGG;SOR=0.841;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=30;WE=5935393;WS=5935375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr20	5948227	rs16991615	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=797;ReadPosRankSum=1.834;SC=CTCAAATGCGGAAGAAGGTAG;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=44;WE=5948235;WS=5948217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr20	5948290	.	C	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.232;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=1.059;SC=CAACGTTCATCTTTTCTAAGA;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=21;WE=5948298;WS=5948280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr20	5948706	rs236100	A	G	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=42.64;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	5948712	rs236101	C	T	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=42.64;SOR=1.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	5953693	.	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=564;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TTCTTTTTTCGCACTTGAGCT;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=41;WE=5953701;WS=5953683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr20	5953815	rs34464794	A	G	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1212;ReadPosRankSum=0.530;SC=TTGGAGATCCAGGCCTAGGAA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=87;WE=5953823;WS=5953805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,103:0.55:187
chr20	5987212	rs149662716	AGGC	A	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.464;NF=0;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CGTACCGATGAGGCGGCGGCG;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=5987222;WS=5987202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr20	5987267	rs2294971	A	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.349;NF=5;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=0.789;SC=TCAGGTAACAAGCTCTGGGTG;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=10;WE=5987275;WS=5987257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr20	5988095	rs4813786	A	G	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=968;ReadPosRankSum=-0.238;SC=CTCTCCTAACATTAACTTTGA;SOR=0.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=67;WE=5988103;WS=5988085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr20	5990726	.	T	TG	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=16;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=58.11;NF=0;NR=4;PP=50;QD=13.25;SC=ATATGGGATTTTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=5990734;WS=5990716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr20	5990727	rs6117033	T	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.498;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr20	6011882	rs2423132	G	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=250;SC=TAATGCATATGAGTACTCTTC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=6011890;WS=6011872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	6033004	rs6117050	G	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=490;ReadPosRankSum=1.631;SC=AGGGCGCGGAGGCTGCTCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=31;WE=6033012;WS=6032994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr20	6033025	rs1884643	T	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=429;ReadPosRankSum=0.374;SC=GCGGGCCCGGTGCACGGCGGC;SOR=0.550;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=36;WE=6033033;WS=6033015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr20	6033628	rs751681	T	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=1.752;SC=CTCCCCTGTCTGCTTTTGCCC;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=13;WE=6033636;WS=6033618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr20	6058041	rs35637712	GA	G	862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.801;NF=2;NR=22;PP=366;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AAGGAATGATGAAAAAAAAAG;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=24;WE=6058049;WS=6058031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr20	6064554	rs753929	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-2.270;SC=AAGTGTCAGGACTATTTATAA;SOR=1.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=10;WE=6064562;WS=6064544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
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chr20	6064710	rs753927	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=911;ReadPosRankSum=0.742;SC=AGGTGAGGCCAAACTCAGGCA;SOR=0.987;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=61;WE=6064718;WS=6064700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
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chr20	6064839	rs2232077	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=0.938;SC=TCAACCTCTCTTCACATGCAC;SOR=0.412;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=5;WE=6064847;WS=6064829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr20	6065729	rs2232074	C	T	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
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chr20	6065731	rs2232073	T	C	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.01;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr20	6088265	rs62200482	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=479;ReadPosRankSum=-0.230;SC=ATAAGGGAGCGTGAGGAGTCT;SOR=0.702;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=35;WE=6088273;WS=6088255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr20	6091175	rs11087717	T	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.87;ReadPosRankSum=1.050;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr20	6091183	rs11087718	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr20	6093177	rs16991866	A	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=553;ReadPosRankSum=0.997;SC=ATCTTCAATTATGGGTTCCTT;SOR=0.650;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=37;WE=6093185;WS=6093167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr20	6096632	rs1056141	G	A	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=836;ReadPosRankSum=1.360;SC=TGGGTTTTCAGAAGCCAGCAA;SOR=0.917;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=54;WE=6096640;WS=6096622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr20	6100002	rs6038363	C	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=683;SC=TGGTGATGCACCAGACAGGGT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=6100010;WS=6099992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	6100088	rs10373	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=648;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CTCCTCCAACATGAAGGTCTC;SOR=0.640;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=49;WE=6100096;WS=6100078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr20	6100230	rs2273423	A	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.974;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=493;ReadPosRankSum=1.356;SC=CTGCTGAACAAAAAGGCAGAC;SOR=0.179;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=27;WE=6100238;WS=6100220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr20	6751034	rs1049007	A	G	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=58;PP=1508;ReadPosRankSum=1.510;SC=GCAGGCACTCAGGTCAGCCGG;SOR=0.534;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=211;TCF=79;TCR=132;TR=95;WE=6751042;WS=6751024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,106:0.46:232
chr20	6759115	rs235768	A	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1332;ReadPosRankSum=1.584;SC=CCGTGACCAGACTTTTGGACA;SOR=0.940;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=228;TCF=113;TCR=115;TR=93;WE=6759123;WS=6759105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,105:0.37:283
chr20	7864284	rs34249643	T	C	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=623;ReadPosRankSum=0.632;SC=ACCAATGTCTTGTCGATGACT;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=46;TCR=73;TR=50;WE=7864292;WS=7864274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr20	7980390	rs1012891	C	T	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1180;ReadPosRankSum=-2.400;SC=TTAGAGAAGCCGGGGATTTCC;SOR=0.717;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=80;WE=7980398;WS=7980380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,97:0.51:189
chr20	7999537	rs2294247	C	A	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=14;PP=1595;SC=ATGACATCTCCAGGTCTTCAA;SOR=2.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=7999545;WS=7999527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	7999642	rs2294248	G	A	5375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=83;PP=2965;SC=CATACTGCACGTGGATGTCAC;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=165;WE=7999650;WS=7999632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr20	8000014	rs147786758	G	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=504;ReadPosRankSum=0.315;SC=GATCGCCACCGGGCCGCGCGG;SOR=0.351;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=37;WE=8000022;WS=8000004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr20	8130943	rs16994453	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=276;ReadPosRankSum=1.917;SC=ATTTCTAGGACTCAACTATTG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=21;WE=8130951;WS=8130933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr20	8626859	rs41275582	G	T	2547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1537;ReadPosRankSum=-1.522;SC=TGCTAAGGGCGTTGCTTCTTC;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=244;TCF=102;TCR=142;TR=97;WE=8626867;WS=8626849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,127:0.43:296
chr20	8637727	rs6140670	G	A	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.23;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr20	8769423	rs2076411	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TTATTTTATTTTGTACGTCAG;SOR=0.288;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=17;WE=8769431;WS=8769413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
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chr20	8770130	rs2327090	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.104;NF=24;NR=11;PP=660;ReadPosRankSum=-0.688;SC=TTCTGGATGAATTGGTATAAT;SOR=0.321;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=35;WE=8770138;WS=8770120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
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chr20	8773295	rs6056119	T	C	3000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=63;PP=1600;ReadPosRankSum=1.407;SC=CATCTTTTTGTGTCTGGATTT;SOR=0.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=103;TCR=103;TR=125;WE=8773303;WS=8773285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,143:0.58:246
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chr20	9346202	rs17481185	A	G	3069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=68;PP=1651;ReadPosRankSum=1.350;SC=TCCCGGGTCAACGCTTGTCAT;SOR=1.110;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=244;TCF=109;TCR=135;TR=111;WE=9346210;WS=9346192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,146:0.48:304
chr20	9352763	.	A	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=-0.059;SC=ACTGATGTACACGCACTGTTT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=9352771;WS=9352753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr20	9364799	rs2076234	A	G	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=885;ReadPosRankSum=-0.065;SC=AACATGAGATATGCATCTTCA;SOR=0.208;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=48;WE=9364807;WS=9364789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr20	9453567	rs2206389	T	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=354;SC=AGCCACCAGATCTCTAGCTAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=9453575;WS=9453557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	9497057	rs2232267	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=470;ReadPosRankSum=-0.292;SC=AACTCGCAGAACAGGCTTGGA;SOR=0.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=27;WE=9497065;WS=9497047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
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chr20	9546469	rs78019328	T	C	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=917;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AAAATGTACATGTGTATAACT;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=94;TCR=41;TR=63;WE=9546477;WS=9546459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,67:0.44:152
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chr20	10393145	rs221667	C	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GATTTATTAACTGTAAGAGGC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=13;WE=10393153;WS=10393135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr20	10438780	rs6104617	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CCAAATAAAAAGAAATTTTAA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=10438788;WS=10438770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	10439002	rs6039947	T	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.591;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=0.928;SC=CTCTGCAAAATTTTTTTTTTT;SOR=0.252;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=19;WE=10439010;WS=10438992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr20	10439037	rs6039948	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=0.233;SC=GTTCTGGGGCATGTGTGCAGG;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=10439045;WS=10439027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr20	10620275	rs1051421	G	A	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1535;ReadPosRankSum=-1.711;SC=CTACCAGCGTGTACGCCGGCT;SOR=0.493;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=200;TCF=94;TCR=106;TR=93;WE=10620283;WS=10620265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,101:0.45:222
chr20	10620386	rs1051419	A	G	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TCTTGTTCTCATAATCCTTGA;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=94;TCR=101;TR=95;WE=10620394;WS=10620376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,109:0.49:222
chr20	10622080	rs3215563	CA	C	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=205;ReadPosRankSum=0.017;SC=ATCCACCATTCAAAAAAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=16;WE=10622088;WS=10622070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr20	10624924	.	T	TCTCACA	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.433;NF=6;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TGGGTGATTCTCACACACACA;SOR=0.232;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=10;WE=10624934;WS=10624914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr20	10633237	rs1131695	G	A	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=41;PP=1275;SC=CTTGCCAGCCGTACTGGCACC;SOR=0.972;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=74;WE=10633245;WS=10633227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	10633313	rs6040055	T	C	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=31;PP=845;SC=ACAATTCAAATGGAAGACTGC;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=10633321;WS=10633303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	10639385	rs2273060	A	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=802;SC=AGACAAAGTGATGAATCATGT;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=10639393;WS=10639375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	10653469	rs1051415	C	T	3538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=2197;ReadPosRankSum=-1.172;SC=TGCAGGGCCCCCCGGCCGTGA;SOR=0.594;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=264;TCF=146;TCR=118;TR=134;WE=10653477;WS=10653459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,159:0.52:307
chr20	12990044	rs3761895	T	C	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=60;PP=2108;SC=TAAGAGGCACTCTCCCCTACT;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=12990052;WS=12990034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr20	13029764	rs1431433	A	C	9016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=145;PP=2965;SC=AGCTGTGGAAAGAAAAGAACA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=134;TCR=145;TR=279;WE=13029772;WS=13029754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr20	13029862	rs919604	C	T	5809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=94;PP=2965;SC=AGGTGCAGATCCTAGAAAGCA;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=77;TCR=94;TR=171;WE=13029870;WS=13029852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr20	13029920	rs934335	C	G	5564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=91;PP=2965;SC=ATCTCCACCTCCTAAACCCCA;SOR=1.097;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=152;WE=13029928;WS=13029910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr20	13053018	rs243887	T	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=54;PP=2063;SC=TCTGTTTGATTTGATGGAGAG;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=100;WE=13053026;WS=13053008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr20	13053035	rs243888	A	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=49;PP=1741;SC=AGAGGGTATCAGACGACTATA;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=88;WE=13053043;WS=13053025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	13071871	rs243874	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=1.047;SC=AATTGTTAACCTAATTGTCTT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=13071879;WS=13071861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr20	13074235	rs708937	G	A	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=48;PP=1469;SC=GTGAGTATCAGTGTATTTTCT;SOR=1.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=13074243;WS=13074225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	13134931	rs2073303	C	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=639;SC=CCACCTGTCACTCTATCAGCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=13134939;WS=13134921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	13202367	rs56184254	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=0.383;SC=TCCCCCGGCGTCACCGCCGCC;SOR=0.838;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=8;WE=13202375;WS=13202357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
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chr20	13269438	rs34117863	C	CT	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.280;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.770;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr20	13698006	rs4239710	T	C	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=22;PP=1099;SC=GCCTGGTGTCTATGGTTACCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=13698014;WS=13697996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr20	13743298	rs754796	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=0.319;SC=TAATAATTCTAACAGTAAGCC;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=13743306;WS=13743288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr20	13747441	rs3180370	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
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chr20	13763896	rs28372964	C	CATTA	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr20	13782409	rs1015517	A	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=845;SC=AGAAAACTGTATGTGTTCATG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=13782417;WS=13782399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	13845987	rs761811	C	T	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=30;PP=2154;SC=AATTTTAACTCATCTTACTAG;SOR=1.374;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=13845995;WS=13845977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	13847420	rs660710	A	G	6045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=103;PP=2965;SC=AATAAATGGCAAGGGGCTGCC;SOR=0.986;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=76;TCR=103;TR=179;WE=13847428;WS=13847410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr20	13856558	rs73085418	G	A	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=24;PP=1803;SC=ACTTCTCCAGGACACAAAACT;SOR=1.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=83;WE=13856566;WS=13856548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr20	13868745	rs243910	T	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=1088;SC=CCTAGCTCCATAATGACCCAT;SOR=2.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=13868753;WS=13868735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	14306953	rs6079391	G	T	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=85;PP=2965;SC=CTGTGGTTTGGTGATCCTTAG;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=154;WE=14306961;WS=14306943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr20	14830453	rs438632	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.401;SC=TAAGTAGTAACTCTCACATCT;SOR=1.130;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=8;WE=14830461;WS=14830443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr20	14830596	rs6079581	C	G	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=872;ReadPosRankSum=-0.894;SC=TTCTCCTACACCTGAAGAGAT;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=54;WE=14830604;WS=14830586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr20	15480226	rs2180526	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.612;SC=TCTGTACTGGTGTAGGACCAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=11;WE=15480234;WS=15480225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr20	15480308	rs2145014	G	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=726;ReadPosRankSum=1.190;SC=TGTACTTATTGGTTGAACTGA;SOR=0.496;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=45;WE=15480316;WS=15480298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,52:0.41:126
chr20	15480548	rs2145015	T	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TGATGCTCAGTTCCCCCCAAA;SOR=1.182;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=22;WE=15480556;WS=15480538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr20	15874325	rs932501	A	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TAGCCCAAAGACCCAGAAGCG;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=112;TCR=70;TR=80;WE=15874333;WS=15874315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,98:0.45:220
chr20	15967327	rs34675181	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=318;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AGCTACGGTCATGCATATCAC;SOR=1.358;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=22;WE=15967335;WS=15967317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
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chr20	15967533	rs6043660	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.819;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr20	16223865	rs2144897	T	C	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GAGGTGGATCTGGTTTTGGAA;SOR=0.792;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=180;TCF=92;TCR=88;TR=80;WE=16223873;WS=16223855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,98:0.45:218
chr20	16223922	rs1541065	T	C	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=1348;ReadPosRankSum=1.869;SC=ATATTTCTACTAGCAAGACAT;SOR=0.508;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=80;WE=16223930;WS=16223912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,96:0.50:192
chr20	16223957	rs1000121	T	C	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.323;SC=GATATTTGAGTCTGAAATCCA;SOR=0.441;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=142;TCF=60;TCR=82;TR=81;WE=16223965;WS=16223947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,101:0.61:165
chr20	16224066	rs2144898	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=-3.004;SC=ATTGAGGTGGCGGGAGAGGAT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=25;WE=16224074;WS=16224056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr20	16351329	rs2144893	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AGCAAGTTCACGGGGCGGGGG;SOR=0.622;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=13;WE=16351337;WS=16351319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr20	16359567	rs6034464	A	G	4589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=62;PP=2924;SC=TTCAATCTCCATGCCCAGGGT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=148;WE=16359575;WS=16359557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr20	16475112	rs6044027	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=1.309;SC=AAATGAGATCGCGACTTTTAC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=16475120;WS=16475102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr20	16486698	rs2295115	G	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=703;ReadPosRankSum=-3.104;SC=CCAGAGTCACGAGGGACTTGT;SOR=0.552;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=43;WE=16486706;WS=16486688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr20	16492242	rs6135772	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=311;ReadPosRankSum=1.265;SC=CAACACATAACAGCAGCAACC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=18;WE=16492250;WS=16492232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr20	16493533	rs6135775	T	C	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1219;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GACTGAAGAGTCCTTCACAGA;SOR=0.829;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=158;TCF=92;TCR=66;TR=73;WE=16493541;WS=16493523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,88:0.45:194
chr20	16493580	rs6135776	A	G	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1364;ReadPosRankSum=1.263;SC=TGCATGGGAAAGACCAATGTC;SOR=0.724;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=192;TCF=96;TCR=96;TR=95;WE=16493588;WS=16493570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,118:0.51:231
chr20	16496362	rs6044046	T	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=621;ReadPosRankSum=0.247;SC=ATTTTAATAATAGCCCCTTCA;SOR=1.061;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=33;WE=16496370;WS=16496352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr20	16496415	rs6131837	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-2.414;SC=CTCTTAAGGATTAGACCATAT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=16496423;WS=16496405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr20	16506939	rs6034517	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=0.277;SC=GACTAAAAACCATTTCATTCC;SOR=0.297;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=10;WE=16506947;WS=16506929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr20	16554067	rs4814510	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GTTCCGCGGCAGCCCCACCTG;SOR=1.508;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=15;WE=16554075;WS=16554057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr20	16729138	rs6135876	T	C	4029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=92;PP=2545;ReadPosRankSum=0.796;SC=TCCAAGAAGCTCTGTGCAGAT;SOR=0.803;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=277;TCF=119;TCR=158;TR=158;WE=16729146;WS=16729128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,185:0.56:329
chr20	16729654	rs10627353	A	AAGATG	1711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.514;NF=9;NR=20;PP=1582;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CTGGCAGTGTAAGATAATTTA;SOR=0.354;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=29;WE=16729662;WS=16729644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr20	16730464	rs6075100	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.67;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	16730464	.	TAT	CAC,CAT	208	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=11,18;NR=2,6;PP=208,131;QD=20.1129134509;SC=TGATTCTCACTATCAGCAAAG;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=13,24;WE=16730487;WS=16730454;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.54:24
chr20	16730466	rs6131861	T	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr20	16730479	rs6075101	C	T	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=634;SC=GCAAAGAGGACGCCTGCGAGT;SOR=1.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=16730487;WS=16730454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	16730522	rs6135878	T	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=494;ReadPosRankSum=0.488;SC=AGCTTTTTCCTGATTGCTATT;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=36;WE=16730530;WS=16730512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr20	17389830	rs2217182	T	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=6;PP=952;SC=GGACTAGAAATGTTTAAAGTC;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=17389838;WS=17389820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	17436895	rs2021789	G	A	4918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.93;SOR=2.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr20	17474690	rs6105762	T	G	7025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=75;PP=2965;SC=TGGCCCCAAATACATTTTATC;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=130;TCR=75;TR=205;WE=17474698;WS=17474680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr20	17474968	rs6080718	T	C	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=67;PP=2632;SC=CAGGTATAGATGGTTCCTCTG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=17474976;WS=17474958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr20	17475217	rs6136118	C	T	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=55;PP=2244;SC=CAGAGTCTTCCGCAACAGAAA;SOR=0.790;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=105;WE=17475225;WS=17475207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	17477592	rs6080719	C	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=11;PP=785;SC=CCTTTCCCACCGGATCCAGTG;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=17477600;WS=17477582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	17477751	rs6044850	A	G	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=21;PP=773;SC=AAAAATGAAAAAAAAGCTTTC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=17477759;WS=17477741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	17539168	rs6044883	A	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=282;SC=TCAGACTACTACTGAGCCAAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=17539176;WS=17539158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	17594714	rs35586556	GC	G	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=362;SC=TTCTCTCGGAGCTACCGGAAG;SOR=3.442;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=17594722;WS=17594704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	17595329	rs7261001	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=539;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTGCCTCCCCGGGGCTCCCGG;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=27;WE=17595337;WS=17595319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr20	17596731	rs2236250	C	T	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=104;PP=2965;SC=GCACAGGCACCGCTCTCTAGC;SOR=1.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=54;TCR=104;TR=158;WE=17596739;WS=17596721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr20	17597331	rs911347	C	T	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=11;PP=821;SC=GGCCTGCACTCTTCTGGGATT;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=17597339;WS=17597321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	17597361	rs911348	A	G	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=13;PP=1120;SC=TCTGGGGACCAGCTCACCGCC;SOR=1.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=17597369;WS=17597351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	17599214	rs2328181	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=16;PP=1321;SC=GTCACACTCCTGGCATGGGGA;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=17599222;WS=17599204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	17600357	rs11960	G	A	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=76;PP=2965;SC=CTCCAAATGCGACGTGTGCTC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=17600365;WS=17600347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr20	17602028	rs2236253	T	C	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=8;PP=764;SC=GGCCACCTCCTGCCCCATAGG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=17602036;WS=17602018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	17605016	rs2236254	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=1.236;SC=TCCTAGTGCCTCTGTGTGTCC;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=10;WE=17605024;WS=17605006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr20	17605240	rs6034867	A	T	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=29;PP=1207;SC=GGTCAGGGAGAGCAGCTTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=17605248;WS=17605230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	17606372	rs2295672	T	C	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1153;SC=GGACGGTCCCTTCTGGCTGCC;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=17606380;WS=17606362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	17610729	rs6044917	T	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=12;PP=277;SC=CTGGTCCATGTGGGAAGGAAA;SOR=1.445;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=17610737;WS=17610719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	17617531	rs6044923	T	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=64;SC=CCAGCTGCAGTGGGAACGACG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=17617539;WS=17617521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	17622429	rs2236255	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=237;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CTCCGAGCCCACTCAGGCTGT;SOR=1.201;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=15;WE=17622437;WS=17622419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr20	17640009	rs13040917	A	C	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=42;NR=55;PP=2011;SC=GCCCCCTCGGACTTTTTGCCC;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=97;WE=17640017;WS=17639999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	17674451	rs6080781	G	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=0.187;SC=TGTGTCCAGTGGGAGGAGGTG;SOR=0.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=17674459;WS=17674441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr20	17705677	rs4814640	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=445;ReadPosRankSum=1.051;SC=GGAGATGGACAACATGTCTCC;SOR=0.820;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=27;WE=17705685;WS=17705667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr20	17932210	rs2273448	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CACCAAACATCTCTTTAGTAT;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=12;WE=17932218;WS=17932200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	17932415	rs2273449	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=0.241;SC=AACCCAAACATAGGTAGGTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=17932423;WS=17932405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr20	17933511	rs910900	C	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=87;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TAGTTAGATACTAAGGCAGTT;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=17933519;WS=17933501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr20	17937801	rs3790301	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.783;NF=4;NR=5;PP=140;ReadPosRankSum=1.214;SC=TCAGTTGAGCTGGGCGCGGCG;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=9;WE=17937809;WS=17937791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr20	17968923	rs28455091	T	C	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=50;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TGAACCATGATACCAACTACA;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=63;TCR=98;TR=81;WE=17968931;WS=17968913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,88:0.48:184
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chr20	18123084	rs78016265	CT	C	588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=402;SC=GTATCTTCATCTTTTTTTTTG;SOR=2.737;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=21;WE=18123092;WS=18123074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr20	18142564	rs3828013	A	G	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.792;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TAAAAGAGAAAAGGTCTCGAA;SOR=0.532;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=191;TCF=102;TCR=89;TR=77;WE=18142572;WS=18142554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,88:0.41:216
chr20	18143117	rs1205193	T	G	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=79;PP=2965;SC=GTGGTTGGGGTCAGAAAGAAG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=18143125;WS=18143107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr20	18143355	rs1205194	C	T	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1679;ReadPosRankSum=-1.376;SC=AAGCTTGTCCCGGTGCTGTTG;SOR=0.508;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=192;TCF=121;TCR=71;TR=101;WE=18143363;WS=18143345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,109:0.52:211
chr20	18167977	rs2747404	T	C	4021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=50;PP=2203;SC=CAAGCAACCCTGCTATGCTAC;SOR=0.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=120;WE=18167985;WS=18167967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr20	18296072	rs1033545	T	A	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=58;PP=2872;SC=CCCAGCTCAGTCAGGGAACCC;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=129;WE=18296080;WS=18296062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr20	18361603	rs1883938	T	C	4538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=72;PP=2965;SC=AGGACAAGTCTGCAAAGCAGA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=150;WE=18361611;WS=18361593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr20	18393312	rs6075337	C	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=440;SC=TGATGGCTGTCAGGAGGGGTT;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=18393320;WS=18393302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	18393499	rs6075338	C	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=34;PP=958;SC=ACATCGGGGCCATGCGTGAGG;SOR=1.316;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=18393507;WS=18393489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	18395988	rs6035037	C	T	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=38;PP=1857;SC=CCACACCAGCCGCAGAAGGAC;SOR=0.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=89;WE=18395996;WS=18395978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr20	18414356	rs6035042	A	G	3043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=40;PP=1842;SC=CACACACCACACAGATGGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=18414364;WS=18414346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	18429497	.	T	C	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=47.48;NF=5;NR=0;PP=95;QD=25.9542425094;SC=GGTGACAGAGTGAGACTCCGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=18429505;WS=18429495;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	18432690	rs2424196	T	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=815;SC=CAACCATACCTGACCGTTAGA;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=18432698;WS=18432680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	18445963	rs6035051	A	G	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=91;PP=2965;SC=GGCACTCGTAATGGTATGATC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=74;TCR=92;TR=165;WE=18445971;WS=18445953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr20	18446050	rs111987137	A	ATGTGCACTTATAGC	2133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1286;SC=ATAAATTCCAATGTACACAAA;SOR=3.398;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=23;WE=18446058;WS=18446040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	18448079	rs1474974	C	A	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=20;PP=1963;SC=TCCACTGGTTCCCCGGGTTCC;SOR=2.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=92;WE=18448087;WS=18448069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	18460614	rs6035056	A	T	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=16;PP=1445;SC=CTGTTCCAAAATATAGGTGTT;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=18460622;WS=18460604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	18460641	rs6081160	G	A	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=29;PP=1777;SC=TTTGGAAATTGTTATCTTATA;SOR=1.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=88;WE=18460649;WS=18460631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr20	18461237	.	GT	G	123	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=18;MQ=61.94;NF=0;NR=8;PP=123;QD=16.125;SC=GACCCACATTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=18461245;WS=18461227;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,8:0.73:11
chr20	18462421	rs1055171	A	G	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=104;PP=2965;SC=TCCCTCCCACAGGTTTGGTCC;SOR=1.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=52;TCR=105;TR=156;WE=18462429;WS=18462411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr20	18462492	rs4813332	A	G	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=31;PP=900;SC=TTGACTGCCCACGGGTGCAAG;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=18462500;WS=18462482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	18462518	rs6111983	C	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=530;SC=CATTAAGAAACAGAGCAAGCA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=18462526;WS=18462508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	18464110	rs3827965	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.12;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	18470664	rs3748450	A	G	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=30;PP=1070;SC=ATCTTTCAGTACCCATGGATA;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=18470672;WS=18470654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	18470980	rs2424217	A	G	7357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=99;PP=2965;SC=TTTACAACCTAAACAGACAGC;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=138;TCR=99;TR=236;WE=18470988;WS=18470970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr20	18474566	rs17734238	C	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=511;SC=ATGACTGGAGCCCACAAAGGG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=18474574;WS=18474556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	18477614	rs2247746	A	G	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=17;PP=1550;SC=GGGCTTTGCTAGAGGGGATTA;SOR=1.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=18477622;WS=18477604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr20	18477870	rs2247757	T	A	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=38;PP=1104;SC=CCCAGCCTGCTCCCGCAGGGA;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=18477878;WS=18477860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	18505403	rs3762200	G	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=907;SC=GCCCAGGCTGGAGTTCAGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=18505411;WS=18505393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	18506616	rs911115	T	C	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=588;SC=ATCATACAAATGTGCTCTCAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=18506624;WS=18506606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	18511456	rs6081189	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.72;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	18511504	rs3762201	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.21;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	18523864	rs2295557	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=651;SC=TTCTGCTTTACTTTCGAGAAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=18523872;WS=18523854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	18529233	rs3736775	T	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=37;PP=2094;SC=CATTTCTCTTTCCGTTCTTTG;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=18529241;WS=18529223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr20	18535982	rs1555363	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=291;SC=GAATAACATTACTGGGCCGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=18535990;WS=18535972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	18548425	rs6075366	A	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=560;SC=GGAATTATTAATACCTTGTAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=18548433;WS=18548415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	18549848	.	CT	C	99	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=15;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=6;NR=2;PP=99;QD=13.0;SC=TTCAGGTGTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=8;WE=18549869;WS=18549838;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,8:0.50:16
chr20	18568902	rs6075371	G	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	18568918	rs6075372	A	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr20	18576912	rs1884875	C	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=17;PP=500;SC=CATCCAGGAACGGGTCTTTGG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=18576920;WS=18576902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	18576980	rs6081237	A	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=175;SC=CTTTTCTGGAAAGTCATTGTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=18576988;WS=18576970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	19193682	rs6106031	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.751;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=0.707;SC=CGGCTCGGGGCTCCCGGGGCT;SOR=1.230;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=26;WE=19193690;WS=19193672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr20	19261623	rs1569767	G	A	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CATGGACCTCGTAGGGGAAGA;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=80;WE=19261631;WS=19261613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,88:0.51:172
chr20	19261922	rs3790176	G	A	126.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.332;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=2.100;SC=CTCTGTGTTCGTTTTCTACTG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=19261930;WS=19261912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr20	19560555	rs11087288	GA	G	2383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GATGACAGAAGACATTATCAA;SOR=0.482;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=36;WE=19560563;WS=19560545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,69:0.60:115
chr20	19560664	rs3790261	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TGTTCTATGCGCTGGCCATTG;SOR=0.531;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=65;WE=19560672;WS=19560654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,72:0.49:147
chr20	19634732	rs3790278	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=704;ReadPosRankSum=0.812;SC=CCTGGTGCCTGCTGAGGGATT;SOR=0.786;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=47;WE=19634740;WS=19634722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr20	19634747	rs3790279	T	C	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=755;ReadPosRankSum=0.424;SC=GGGATTCTATTTACTACACGC;SOR=0.695;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=46;WE=19634755;WS=19634737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr20	19654454	rs1406971	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=1.288;SC=GAGTCACTGTAATTTTGATTA;SOR=0.970;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=15;WE=19654462;WS=19654444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr20	19941538	rs199562	A	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-1.424;SC=AGCTCTGGTTATGAGATGGGC;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=19941546;WS=19941528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr20	19970705	rs2076584	C	T	3551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=34;PP=2382;SC=TCAAGGGGCACGTGGAGGCCA;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=77;TCR=34;TR=111;WE=19970713;WS=19970695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	19970888	rs35151304	G	A	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=926;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TGTATTCGCCGGAAAAGAAGG;SOR=1.040;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=59;WE=19970896;WS=19970878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,65:0.44:149
chr20	20071634	rs6046614	T	C	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=966;ReadPosRankSum=-0.673;SC=AGTGACTGATTCATGTGGGAA;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=65;WE=20071642;WS=20071624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr20	20079360	rs6075614	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=246;ReadPosRankSum=0.061;SC=CAACTGCTGCATGAGTGCTTT;SOR=0.944;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=25;WE=20079368;WS=20079350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr20	20139951	rs11475376	GC	G	1219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.027;NF=11;NR=11;PP=814;ReadPosRankSum=0.562;SC=TTGCTCCAGAGCTTGGACTCT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=22;WE=20139959;WS=20139941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr20	20140196	rs2179823	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=0.723;SC=TCCCTGCCTGTCTCCACCAGT;SOR=0.055;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=20140204;WS=20140186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	20144772	rs6081901	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=565;ReadPosRankSum=3.057;SC=GGCATCGCTCGTACTGCCTGA;SOR=0.564;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=40;WE=20144780;WS=20144762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr20	20146875	rs6046679	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=0.933;SC=TACTGACATACGAAGCTTGCG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=20146883;WS=20146865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr20	20150027	rs6075630	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=679;ReadPosRankSum=1.225;SC=TCATCCAGAACTTCGTGAAAA;SOR=0.823;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=39;WE=20150035;WS=20150017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr20	20150182	rs6112802	A	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=1.507;SC=CCCTGCTATTATAATTTAATA;SOR=0.455;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=25;WE=20150190;WS=20150172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr20	20152462	rs996197	A	C	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=878;ReadPosRankSum=0.349;SC=GCATCACCAGAGTGTCAAAGG;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=184;TCF=97;TCR=87;TR=83;WE=20152470;WS=20152452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,102:0.46:223
chr20	20152581	rs2328500	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=373;ReadPosRankSum=-0.093;SC=ACAGGGAAGGGTGGAATGAGA;SOR=0.435;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=24;WE=20152589;WS=20152571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr20	20168497	rs2179825	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=-0.977;SC=AGTGTGATATATTACAATTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=20168505;WS=20168487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr20	20180288	rs11474984	AT	A	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=1.620;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.142;SOR=1.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	20269631	rs1410263	C	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TTAGGTATGGCTCAGCAGTCA;SOR=0.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=13;WE=20269639;WS=20269621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr20	20350516	rs6137007	T	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=741;SC=CGCCCTGCACTCCCCGAACCC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=20350524;WS=20350506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	20377421	rs11426947	A	AC	7782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.04;QD=31.77;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr20	20493222	rs35039408	G	A	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=75;PP=2965;SC=AGGGTCCTCGGGGCTCCACTG;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=163;WE=20493230;WS=20493212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr20	20609964	.	AAC	A	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=9.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.383;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr20	21106714	rs5840900	C	CG	1319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=894;ReadPosRankSum=0.950;SC=CCCGGCCGAACGGCCACCCAG;SOR=0.935;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=24;WE=21106722;WS=21106704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr20	21126194	rs6047271	C	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=-0.392;SC=ATCAAACTTTCTTTATATTTA;SOR=0.876;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=22;WE=21126202;WS=21126184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr20	21142523	rs4815025	C	G	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.522;NF=41;NR=21;PP=1118;ReadPosRankSum=0.814;SC=TTGCAGTGCACGAGGGGATTA;SOR=0.438;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=62;WE=21142531;WS=21142513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr20	21142813	rs2236178	T	C	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.629;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=63;PP=1708;ReadPosRankSum=2.044;SC=GGTGAGAAAATGCCAGTCACA;SOR=0.470;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=283;TCF=153;TCR=130;TR=125;WE=21142821;WS=21142803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,149:0.46:321
chr20	21186161	rs11087346	A	AG	3705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=36;PP=2594;SC=AGACGTACCGAGGCACAGGTG;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=62;WE=21186169;WS=21186151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr20	21186296	.	TAA	T	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.525;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr20	21227314	rs6047326	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=454;SC=AGTTTTCTCACTGTTTTATGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=21227322;WS=21227304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	21302885	rs202835	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.550;SC=CACTAACGTCGTATAAAAATG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=21302893;WS=21302875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr20	21307107	rs2296728	A	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=653;ReadPosRankSum=2.251;SC=ATTATATTACATTGTTTGGTT;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=40;WE=21307115;WS=21307097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr20	21312288	rs202837	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=268;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CTTACTTACCAATATTTGATT;SOR=0.370;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=17;WE=21312296;WS=21312278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr20	21313109	rs11481754	T	TA	603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.674;NF=3;NR=25;PP=337;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GTTGCCTCATTAAAAAAAAAA;SOR=0.412;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=28;WE=21313117;WS=21313099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr20	21314079	rs202840	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=2.357;SC=ACTTGTGATATTAAAATGGAT;SOR=2.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=9;WE=21314087;WS=21314069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr20	21319828	rs202844	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=824;SC=AGTAGGACTTAGTCAGGGACG;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=21319836;WS=21319818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	21321294	rs202845	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=410;SC=GCCCTTCTTTCCTTTCTGTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=21321302;WS=21321284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	21328715	rs11087351	GT	G	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=374;SC=TCTAATTTTTGTTTTTTTTAA;SOR=4.514;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=15;WE=21328723;WS=21328705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr20	21362703	rs11476840	TA	T	1946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.096;NF=9;NR=35;PP=1444;ReadPosRankSum=1.166;SC=CAGGTAATATTAAAAGTAGAC;SOR=0.735;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=17;TCR=74;TR=44;WE=21362711;WS=21362693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr20	21362758	rs6047417	T	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=563;ReadPosRankSum=-1.183;SC=GGGTTTATGGTTTTTATGGAA;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=44;WE=21362766;WS=21362748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr20	22562674	rs1212275	T	C	5505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.38;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr20	23016970	rs3746726	T	G	4876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GCTGAACCTCTTCGTGACCAG;SOR=0.851;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=383;TCF=182;TCR=201;TR=210;WE=23016978;WS=23016960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,235:0.51:462
chr20	23017017	rs2567609	T	C	4007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.042;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=107;PP=2874;ReadPosRankSum=1.801;SC=CCCTTATCCTTAGCTATGCCA;SOR=1.221;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=304;TCF=115;TCR=189;TR=158;WE=23017025;WS=23017007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,174:0.49:352
chr20	23017044	rs3746728	C	T	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=25.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=92;PP=2226;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GCGCCAACCCCATTCTCTATG;SOR=1.631;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=266;TCF=98;TCR=168;TR=125;WE=23017052;WS=23017034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,143:0.45:318
chr20	23017082	rs2567608	T	C	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1614;ReadPosRankSum=-1.439;SC=TTCCGCCGATTCTTCCAGCGG;SOR=0.884;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=225;TCF=99;TCR=126;TR=90;WE=23017090;WS=23017072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,105:0.39:269
chr20	23064810	rs11087413	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=351;ReadPosRankSum=1.565;SC=AAACCTGGGCCTGCTCTTGCT;SOR=1.004;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=21;WE=23064818;WS=23064800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr20	23065209	rs3746731	G	A	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1678;ReadPosRankSum=1.428;SC=CAGACGCCTGGGGACCCACTG;SOR=0.878;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=197;TCF=103;TCR=94;TR=98;WE=23065217;WS=23065199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,116:0.50:231
chr20	23065342	rs3746732	A	G	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=57;PP=1620;ReadPosRankSum=0.217;SC=CTGTTGCAGCACGGGGCACGG;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=82;TCR=107;TR=100;WE=23065350;WS=23065332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,122:0.52:233
chr20	23345844	rs6048760	A	C	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=34;PP=2104;SC=GAGATGGAGCAGGTTTCCAAA;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=99;WE=23345852;WS=23345834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr20	23349607	rs3833333	CA	C	2738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=71;PP=1584;SC=TTAGTTTGGCCAAAAAAAAAA;SOR=2.124;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=8;TCR=78;TR=79;WE=23349615;WS=23349597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	23358233	rs6083099	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=426;SC=TACTAACTTTCTTCATCATTT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=23358241;WS=23358223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	23360171	rs2224074	G	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=17;PP=530;SC=AGTTCTGTAAGATGAAGTCCC;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=23360179;WS=23360161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	23401904	rs200080949	ACCCC	A	6040.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1867;SC=AAGTACGGAGACCCCCCCCCC;SOR=1.187;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=72;WE=23401915;WS=23401894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	23424613	rs3746736	T	C	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=35;PP=2418;SC=GAAGATTGGCTGGACCAAATG;SOR=1.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=114;WE=23424621;WS=23424603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr20	23472391	rs2983288	A	G	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=45;PP=2243;SC=AGAATGAGACAGGGGTGCTGA;SOR=1.266;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=121;WE=23472399;WS=23472381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	23528536	rs6076084	T	C	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=46;PP=1177;SC=GGGCTTGGGATGCAGAAGCTT;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=63;WE=23528544;WS=23528526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	23528662	rs6083145	G	A	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=104;SC=GACTTTCAGGGTGATCTGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=23528670;WS=23528652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	23529377	rs3004129	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=522;SC=ACCTGTGTCCGCACCACACCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=23529385;WS=23529367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	23529418	rs6083147	G	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=12;PP=773;SC=ATCCAGGAGGGAAGCTGGTGT;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=23529426;WS=23529408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	23530941	rs1028560	A	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=378;SC=TAGACTACAAATGGTGAACCA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=23530949;WS=23530931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	23531276	rs1028561	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=41;PP=1267;SC=CCTGCTCGGCGGCAGACTCCA;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=23531284;WS=23531266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	23546639	rs2295564	T	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=20;PP=1548;SC=TTCTTGGAAATGGCAGTTGTC;SOR=1.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=23546647;WS=23546629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	23546871	rs2208284	T	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=594;SC=GGAGATCTTCTTTAGATTGGG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=23546879;WS=23546861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	23548774	rs2983617	T	C	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=759;SC=AGACCCCCTGTCCCCACCCCA;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=23548782;WS=23548764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	23549166	rs6083172	C	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=329;SC=CAGACCCAGCCCTTAATCTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=23549174;WS=23549156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	23584116	rs726217	G	A	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=12;PP=1391;SC=TAAGGCACAAGCAGGGCAGCC;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=23584124;WS=23584106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	23586184	rs2983639	T	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=743;SC=AGACTAGACATCTTGGTCCCT;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=23586192;WS=23586174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	23586360	rs2983640	G	A	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=48;PP=2226;SC=ACTGTGGCGAGGAACATAGGA;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=109;WE=23586368;WS=23586350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	23618395	rs6138024	T	C	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1183;SC=GGCCTCCCACTAGGCGCGGCG;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=23618403;WS=23618385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	23666588	rs143990199	G	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.951;NF=44;NR=25;PP=996;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGGGAACTTCGTAGATCTCGA;SOR=0.986;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=69;WE=23666596;WS=23666578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,83:0.43:194
chr20	23728342	rs2982	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.494;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=0.538;SC=GTCTCTTGGCGCAGGCACATG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=23728350;WS=23728332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	23728612	rs142422717	G	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.165;NF=20;NR=48;PP=1226;ReadPosRankSum=1.141;SC=TGAGATGTCAGAGCCTGGGTG;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=35;TCR=87;TR=68;WE=23728620;WS=23728602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr20	23729722	rs3188314	G	T	13578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=237;NR=185;PP=2965;SC=TACATATGGTGCGGCCCACCT;SOR=0.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=423;TCF=237;TCR=186;TR=422;WE=23729730;WS=23729712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,497:1.00:497
chr20	23731412	rs2070856	G	A	3821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.088;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=0.186;SC=GATGCCACCCGGGATTATCCT;SOR=0.887;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=84;WE=23731434;WS=23731402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,107:0.45:240
chr20	23731426	rs13045477	C	T	3635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TTATCCTATCCTCCTCCTTGG;SOR=1.056;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=186;TCF=85;TCR=101;TR=75;WE=23731434;WS=23731402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,98:0.44:223
chr20	23731494	rs6076122	A	G	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=77;PP=2422;SC=GTACTCAGATACTGGGCCATG;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=24;TCR=77;TR=101;WE=23731502;WS=23731484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	23731560	rs6076123	C	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=837;SC=GGTGAGAGCCCGAGGCAGGGA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=23731568;WS=23731550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	23731589	rs113896553	G	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=0.746;SC=CAGCAGGCAGGTGTGCATTTA;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=10;WE=23731597;WS=23731579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr20	23805832	rs6036548	G	A	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=7;PP=1946;SC=CCTGGGACCCGCATCAGGAAC;SOR=4.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=73;TCR=7;TR=80;WE=23805840;WS=23805822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr20	23807028	rs4407312	A	C	7251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=110;PP=2965;SC=GGCAACAAACAAGGCTGGGAC;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=116;TCR=110;TR=226;WE=23807036;WS=23807018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr20	23860178	rs1799841	A	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1111;ReadPosRankSum=0.018;SC=TCCAGGGCACACTGCACACTC;SOR=0.736;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=79;WE=23860186;WS=23860168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
chr20	23966694	rs3004173	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQRankSum=0.306;QD=2.73;ReadPosRankSum=-3.824;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr20	24524218	rs4815274	C	G	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=44;PP=1460;SC=CTGGAGGTCACAGGATGTGTT;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=24524226;WS=24524208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	24524245	rs4813519	A	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=1038;SC=AGGCCCTCTAAGAATGTGTGA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=24524253;WS=24524235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	24939590	rs1056033	G	C	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=23;PP=839;SC=AATATATGCTGGAGGTGGAAA;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=24939598;WS=24939580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	24944933	rs761368	T	C	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=10;PP=541;SC=CTGGATGGCCTGGCTGAACTG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=24944941;WS=24944923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	24945079	rs10534910	AGGC	A	4312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=34;PP=2828;SC=CATTTCAAATAGGCAAGGTGC;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=58;WE=24945089;WS=24945069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	24950373	rs2064404	A	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=697;SC=TATGGGCCTGAAGAAGGTGAC;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=24950381;WS=24950363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	24954162	rs66649227	AG	A	1014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=1002;SC=TCCATCTACTAGATGGTCAGA;SOR=3.611;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=23;WE=24954170;WS=24954152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	24959382	rs11087491	C	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	24959385	rs6083703	A	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.30;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	24987438	rs6083718	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=910;SC=TGGTTCTCACCGCCCCAACCA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=24987446;WS=24987428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	25004071	rs4813543	G	T	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=634;SC=ATATGACCTCGCCTCAAACTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=25004079;WS=25004061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	25027331	rs6132792	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-1.469;SC=TTCGCAGGCAGATGGAGCTGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=25027339;WS=25027326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr20	25038372	rs62217194	G	A	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1034;ReadPosRankSum=1.664;SC=CCCAAGAGTTGGGGGCGTCCT;SOR=0.523;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=73;WE=25038380;WS=25038362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr20	25038798	rs7265950	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	25053105	rs743018	G	A	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=15;PP=1116;SC=CCCCCAGGCCGATACTGTCCT;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=25053113;WS=25053095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	25057191	rs11427085	T	TA	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.066;NF=0;NR=10;PP=130;ReadPosRankSum=-1.134;SC=GCATCCCTTGTAAAAAAAAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=25057199;WS=25057181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr20	25059381	rs56157240	A	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=997;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GCTATAGAGAAGGGACTGCTG;SOR=0.577;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=66;WE=25059389;WS=25059371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,74:0.43:171
chr20	25059546	rs12480307	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=381;ReadPosRankSum=0.655;SC=CCTCGCTGAATGCCTTCTCCA;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=29;WE=25059554;WS=25059536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr20	25061865	rs145972043	AATC	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=0.648;SC=AGGACCCGTCAATCATTCGAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=2;WE=25061883;WS=25061855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr20	25061875	rs61304082	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.156;SC=AATCATTCGATCATTTCCGCC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=3;WE=25061883;WS=25061855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr20	25062001	rs7344824	T	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=979;ReadPosRankSum=0.100;SC=GGGGGAAAAATGGCCCTCTGG;SOR=0.646;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=64;WE=25062009;WS=25061991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,74:0.52:142
chr20	25062145	rs6050306	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=801;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GGGCAGGCGGCGCAGCTCCGC;SOR=0.607;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=50;WE=25062153;WS=25062135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr20	25062715	rs8123716	C	A	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=987;ReadPosRankSum=-1.498;SC=CGTCGGAAAGCGAGTCCCGGC;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=130;TCF=76;TCR=54;TR=65;WE=25062723;WS=25062705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr20	25176296	rs6083773	A	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=13;PP=640;SC=CCGCCTGCGCATGCGCGGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=25176304;WS=25176286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	25195509	rs6050446	A	G	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=18;PP=952;SC=TTAGGTGAAAAAAGTATTTAA;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=25195517;WS=25195499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	25197982	rs4815394	T	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=14;PP=1190;SC=ATTGGCTCCTTATTGCCTGCT;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=25197990;WS=25197972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	25249734	rs13038092	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=821;ReadPosRankSum=2.434;SC=ATTGAGTAACATTAAAATGCT;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=57;WE=25249742;WS=25249724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,64:0.42:151
chr20	25252257	rs67867367	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=308;ReadPosRankSum=-0.432;SC=AATGTGGAGCAGGTCAGGGTA;SOR=0.588;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=18;WE=25252265;WS=25252247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr20	25255338	rs2227894	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=952;ReadPosRankSum=2.089;SC=CCCCCGACGGCGTGAAGTGGC;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=73;WE=25255346;WS=25255328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr20	25255415	rs45587239	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.210;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=679;ReadPosRankSum=0.624;SC=GGGGCTGCTGCGGCTCATTTG;SOR=1.305;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=43;WE=25255423;WS=25255405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,49:0.42:116
chr20	25255551	rs6050515	C	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=0.524;SC=GCTTCCCAAACAGTGGAAGCG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=25255559;WS=25255541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr20	25258916	rs11466827	G	GCCCTGGGACTGGGTCATGGGGCATGTGCC	631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=1148;ReadPosRankSum=1.247;SC=GAGGAGAATGGCCCAGCCTGC;SOR=2.110;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=5;WE=25258924;WS=25258906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr20	25263756	rs7272959	G	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=510;ReadPosRankSum=0.129;SC=GGTGGCTAGGGGGCCCAGCCT;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=37;WE=25263764;WS=25263743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr20	25268883	rs145579534	G	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=271;ReadPosRankSum=-2.653;SC=GTTCCTGGTGGGTGGGCAGGT;SOR=0.587;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=25;WE=25268891;WS=25268873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr20	25273396	rs73621608	A	AG	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.132;NF=1;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=0.808;SC=GCCTGCCTGCAGGGGTGACCA;SOR=0.064;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=8;WE=25273404;WS=25273386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr20	25284343	rs2260197	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=417;ReadPosRankSum=0.560;SC=GGCAGGGATCTGGGTTCAGGG;SOR=0.287;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=37;WE=25284351;WS=25284333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr20	25288632	rs6107027	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=260;ReadPosRankSum=0.746;SC=TAGCTTCTTCGCGGATATTAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=22;WE=25288640;WS=25288622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr20	25295787	rs2297496	T	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=389;SC=AGATGCCAACTGCCACTGCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=25295795;WS=25295777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	25320228	rs6050544	T	A	4596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=54;PP=2873;SC=TTGAAAGACATAGAAATAGCT;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=140;WE=25320236;WS=25320218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr20	25371112	rs139848340	GGCCCCC	G	1109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=8;PP=804;SC=GTGAGGGACCGGCCCCCCCCC;SOR=1.358;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=17;WE=25371133;WS=25371102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	25371125	rs77202707	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.11;MQRankSum=-1.285;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr20	25371378	rs145380090	G	GGCCTCCGCC	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=10;PP=2192;SC=GGCGCCCGCTGGCCTGCGCCG;SOR=1.292;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=25371386;WS=25371368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	25388258	rs73331878	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GCGGCTGAGCGGTGGATGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=25388266;WS=25388257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr20	25398790	rs6076347	G	A	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1397;ReadPosRankSum=-1.007;SC=ATATGGTAGCGTCTTGCCAAA;SOR=0.661;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=88;WE=25398798;WS=25398780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,111:0.49:228
chr20	25398876	rs4815425	G	C	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=69;PP=2076;SC=AAATGCTAAAGTTCTGGCATT;SOR=2.040;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=92;WE=25398884;WS=25398866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	25434059	rs16987767	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.964;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=706;ReadPosRankSum=-2.050;SC=GATGTGCTTTCGAATGAATCC;SOR=1.268;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=44;WE=25434067;WS=25434049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr20	25442989	rs3036810	G	GGGGAGCC	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.52;ReadPosRankSum=2.385;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr20	25442991	.	T	TGGTG	277.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr20	25442992	rs2387889	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.697;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr20	25442997	rs559771	C	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr20	25447931	rs404148	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=615;ReadPosRankSum=0.857;SC=TTAGAAGAATATTCTCTACTT;SOR=0.347;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=36;WE=25447939;WS=25447921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr20	25456698	rs35666277	C	T	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.111;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1230;ReadPosRankSum=-2.271;SC=TCTCTCAAATCTACATGTTTC;SOR=0.467;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=177;TCF=111;TCR=66;TR=85;WE=25456706;WS=25456688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,98:0.49:202
chr20	25462472	rs66467007	C	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=346;ReadPosRankSum=0.216;SC=AAAGTCCCTGCAGAGCAGACC;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=19;WE=25462480;WS=25462462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr20	25472184	.	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=569;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ACACATCACACGTCAGACATG;SOR=0.981;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=43;WE=25472192;WS=25472174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,53:0.39:137
chr20	25479058	rs400357	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.568;SC=TCCCTCCCTGATCCAGGGCCT;SOR=0.293;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=19;WE=25479066;WS=25479048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr20	25484445	rs409401	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TGGCCTCCCATATACATGCGT;SOR=2.030;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=12;WE=25484453;WS=25484435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr20	25507011	rs10536286	CTT	C	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=475;ReadPosRankSum=0.249;SC=AGACCCCGTGCTTTCCTTTAT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=25507027;WS=25507001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr20	25507019	rs11087523	T	TA	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.629;NF=6;NR=1;PP=461;ReadPosRankSum=0.141;SC=TGCTTTCCTTTATGACAATGA;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=25507027;WS=25507001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr20	25520827	rs11472175	A	AAC	3146.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1901;SC=GATAAAAAGCAACAGTTTCTC;SOR=1.340;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=41;WE=25520835;WS=25520817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	25597236	rs6050712	C	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TGGAAAATAACTCCATTAACA;SOR=0.363;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=24;WE=25597244;WS=25597226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr20	25604655	rs8120065	A	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=347;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GACTGCCCAGAGAGACGTGGG;SOR=1.467;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=22;WE=25604663;WS=25604645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr20	25666737	rs926487	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=1.850;SC=TCCACAGTGACATCCCCAAAT;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=33;WE=25666745;WS=25666727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
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chr20	25755988	rs138477230	AAGAGAG	A	144.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.324;NF=1;NR=23;PP=259;ReadPosRankSum=0.899;SC=ATCAGAAAGAAAGAGAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=24;WE=25756001;WS=25755974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr20	25756020	rs139676733	CA	C	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=10.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQRankSum=-1.737;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
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chr20	25829312	rs78355493	G	T	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-15.955;QD=5.08;ReadPosRankSum=2.138;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,56:0.19:289
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chr20	29625745	rs73621455	A	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.68;MQRankSum=-3.134;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
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chr20	29625838	rs62198353	C	A	13517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=622;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.451;NF=311;NR=189;PP=2962;ReadPosRankSum=4.719;SC=ATTTTCTCTCCGTTTTTAACT;SOR=0.550;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=613;TCF=383;TCR=230;TR=500;WE=29625846;WS=29625828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,477:0.77:621
chr20	29625854	.	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQRankSum=-5.280;QD=0.24;ReadPosRankSum=2.025;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:618,50:0.07:668
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chr20	29652065	rs73611950	A	G	3091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-2.745;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.221;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:268,95:0.26:363
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chr20	29652099	rs74613177	G	T	4842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.620;QD=7.72;ReadPosRankSum=2.105;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:480,147:0.23:627
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chr20	29652172	rs78862124	T	C	29932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=832;ExcessHet=3.0103;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-2.669;QD=36.86;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,716:0.88:812
chr20	29652172	.	TGGAGTGCCTCGGCAGCCTC	CAGAGTGCCTCAGCAGCCTT,CGGAGTGCCTCGGCAGCCTC	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=64;MMLQ=28;MQ=58.86;NF=47,353;NR=64,401;PP=2924,2962;QD=20;SC=AGGCGACCCATGGAGTGCCTC;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=834;TCF=393;TCR=441;TR=111,754;WE=29652204;WS=29652156;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.13:834
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chr20	29652183	rs71276709	G	A	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=812;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=0.929;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:615,173:0.22:788
chr20	29652190	rs76344754	T	G	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=766;ExcessHet=3.0103;FS=0.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-0.325;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:663,85:0.11:748
chr20	29652191	rs62206784	C	T	23163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=761;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.401;NF=254;NR=362;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TCGGCAGCCTCGTCATTGCAT;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=775;TCF=325;TCR=450;TR=616;WE=29652204;WS=29652156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,566:0.76:743
chr20	29652194	rs34913243	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=2.521;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:641,79:0.11:720
chr20	29652236	rs62206786	G	C	14133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.890;HP=3;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.821;NF=105;NR=289;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CTGCAACCACGTTTCTACAGG;SOR=1.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=490;TCF=136;TCR=354;TR=394;WE=29652244;WS=29652225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,354:0.84:420
chr20	29652254	rs77357187	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQRankSum=-1.750;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,81:0.27:301
chr20	29652294	rs148337041	C	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.95;MQRankSum=-1.711;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,39:0.32:123
chr20	29652303	rs62206787	T	C	3011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=2;HapScore=1;MGOF=75;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.050;NF=9;NR=84;PP=1625;ReadPosRankSum=1.610;SC=TCATTTTACATACTAAGGACA;SOR=0.427;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=11;TCR=113;TR=93;WE=29652311;WS=29652284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,76:0.78:97
chr20	29847211	rs6088879	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=1.019;SC=TCTTTAATTGTATTTATTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=29847219;WS=29847201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr20	29965014	rs709045	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=277;ReadPosRankSum=0.314;SC=CAGGTCTCTGTGCCCAGAGAG;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=15;WE=29965022;WS=29965004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr20	29966275	rs2223527	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=843;ReadPosRankSum=1.225;SC=AAAAACATCCGCGTTCCAGCA;SOR=0.371;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=50;WE=29966283;WS=29966265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr20	29966362	rs2206383	A	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AACTGAGAGCAACCCAAGTTG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=29966370;WS=29966352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr20	29977156	rs2295500	G	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=379;ReadPosRankSum=-0.558;SC=AGTGAGTAATGCCAGACCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=20;WE=29977164;WS=29977146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr20	29978216	rs2206381	T	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=479;ReadPosRankSum=1.703;SC=CCGAGAGAGGTTCACGTTACC;SOR=0.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=34;WE=29978224;WS=29978206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr20	30037783	rs2273468	C	T	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=29;PP=1247;ReadPosRankSum=0.813;SC=AAATCCGGAGCCTACTTGTTA;SOR=0.775;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=172;TCF=109;TCR=63;TR=84;WE=30037791;WS=30037773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,96:0.48:200
chr20	30053255	rs6059440	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=428;ReadPosRankSum=-0.618;SC=CAGGCGAGCAGGCAGAAAGAA;SOR=0.485;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=28;WE=30053263;WS=30053245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr20	30060720	rs111402081	G	GCA	914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.29;MQRankSum=1.404;NF=5;NR=12;PP=667;ReadPosRankSum=-1.908;SC=GCACACATGTGCACACACACA;SOR=0.388;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=17;WE=30060729;WS=30060710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr20	30064331	rs1006459	A	G	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.994;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CCACGGGGCCACCAGCCTGGC;SOR=0.460;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=104;TCR=81;TR=86;WE=30064339;WS=30064321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,101:0.50:204
chr20	30070239	rs2233832	C	A	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=808;ReadPosRankSum=-1.946;SC=TGCCCATCATCCTCGTGGGCA;SOR=0.594;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=50;TCR=78;TR=60;WE=30070255;WS=30070229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,72:0.46:156
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chr20	30354417	rs13044019	G	A	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=945;ReadPosRankSum=-0.742;SC=AATCCATTCCGTCAAATGCTT;SOR=0.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=102;TCR=65;TR=71;WE=30354425;WS=30354407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,94:0.43:218
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chr20	30412101	rs41293106	C	T	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TGGAGAAAGCCACAGGCCTCA;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=162;TCF=64;TCR=98;TR=72;WE=30412109;WS=30412091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,91:0.45:201
chr20	30414578	rs11699351	G	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.959;SC=GGAGCAAGCCGTGGAGGGGTC;SOR=0.799;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=79;WE=30414586;WS=30414568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,88:0.48:184
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chr20	30421459	rs6089093	C	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=761;ReadPosRankSum=0.628;SC=GCTGCTCAGACACCCTGCAGC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=56;WE=30421467;WS=30421449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr20	30433139	rs6089096	G	A	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1498;ReadPosRankSum=0.389;SC=TGAGTGACAGGTTGTGGCGGA;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=88;WE=30433147;WS=30433129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,93:0.54:171
chr20	30433352	rs6121246	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=459;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GCATGCTGGCCGGGCTGCCAG;SOR=0.829;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=28;WE=30433360;WS=30433342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr20	30436088	rs8118150	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-0.424;SC=GTGGAAGGCCGCGATCCACCT;SOR=0.368;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=30436096;WS=30436078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	30437522	rs3746599	A	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=703;ReadPosRankSum=0.227;SC=GCGCTGGGCAATGGGTCGGGG;SOR=0.490;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=43;WE=30437530;WS=30437512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr20	30449325	rs947310	C	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=599;ReadPosRankSum=-1.181;SC=AGGCGCTGCACGGTTCCCTCG;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=35;WE=30449333;WS=30449315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr20	30449516	rs11417441	G	GC	354.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=326;SC=GTCAAGGCCGGCGCGGGGCGG;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=30449524;WS=30449506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr20	30452709	rs41310803	A	G	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=926;ReadPosRankSum=-1.559;SC=CCCCCACCACAGAAGGCAGCT;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=68;WE=30452717;WS=30452699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,87:0.43:202
chr20	30467811	rs6089106	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=0.557;SC=AATGGGTAGGGGTGGGGCGGG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=11;WE=30467819;WS=30467801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr20	30661297	rs2297304	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=1.108;SC=CCTCTGAAGTGCTTTGCGCAG;SOR=0.413;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=30;WE=30661305;WS=30661287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr20	30671875	rs242607	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.596;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=562;ReadPosRankSum=0.205;SC=GTGACATCCCCACCACGATGG;SOR=0.191;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=37;WE=30671883;WS=30671865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr20	30681999	rs6121337	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CACTCAGAGATTTTGAGGAGA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=30682007;WS=30681989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr20	30753270	rs14316	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=-1.053;SC=ACGGCCAAGCTTGCTCCGTCC;SOR=0.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=27;WE=30753278;WS=30753260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
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chr20	30777860	rs11907235	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GGACCCGGCCATTTTCCAGGC;SOR=0.745;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=17;WE=30777868;WS=30777850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr20	30795819	rs1923095	T	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=726;ReadPosRankSum=-1.825;SC=CGGGGATGCCTGCGGGCTCCT;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=55;WE=30795827;WS=30795809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr20	30818850	rs17268666	C	T	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=65;PP=1714;ReadPosRankSum=-1.167;SC=GCTCCAACAGCTCTTCAAAGG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=106;WE=30818858;WS=30818840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,117:0.53:220
chr20	30915461	rs1129012	T	C	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1145;ReadPosRankSum=1.184;SC=AGGCCCGATATAGGGTGAGAA;SOR=0.964;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=128;TCF=55;TCR=73;TR=76;WE=30915469;WS=30915451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr20	30919183	rs1029116	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=0.816;SC=AGAGACTAGCAAAAAGCTGCA;SOR=1.284;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=14;WE=30919191;WS=30919173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr20	30959704	rs2424879	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.631;SC=CTGGCCCTCTATTATCTCATA;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=16;WE=30959712;WS=30959694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr20	31019024	rs2295765	C	T	2925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1801;ReadPosRankSum=0.378;SC=GCAGATAACTCCTGGGTAGCT;SOR=0.898;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=257;TCF=136;TCR=121;TR=119;WE=31019032;WS=31019014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,140:0.48:293
chr20	31022959	rs6058694	T	C	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=43;PP=1481;SC=GGTCCCATTCTGTCTCTAGTG;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=83;WE=31022967;WS=31022949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr20	31035129	rs1737887	A	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=738;ReadPosRankSum=1.682;SC=GCGCCTTGTCAGGGGAGCCCC;SOR=0.957;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=41;WE=31035137;WS=31035119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr20	31035518	.	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=100;ReadPosRankSum=0.037;SC=GGGCTGAGCTGAGCGGTGGGC;SOR=0.697;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=8;WE=31035526;WS=31035508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr20	31035726	rs144443155	A	AGTT	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=0.189;SC=GCCCACTGTGAGTTGGGCACT;SOR=2.800;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=31035734;WS=31035716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr20	31074372	rs6141734	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=702;ReadPosRankSum=0.875;SC=TGGGACTCTGGTTTGCCATTA;SOR=1.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=39;WE=31074380;WS=31074362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr20	31097877	rs293566	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr20	31099311	rs159428	T	C	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=52;PP=1353;SC=GCGGGCCTGTTGCCCACATGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=81;WE=31099319;WS=31099301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	31108805	rs6141745	T	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=615;ReadPosRankSum=0.252;SC=GGTCTGAGCTTTGGTGGCAGG;SOR=0.300;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=46;WE=31108813;WS=31108795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr20	31189411	rs2029086	A	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=529;ReadPosRankSum=0.736;SC=AGGGAGCATGAAGCACCTTGC;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=28;WE=31189419;WS=31189401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr20	31196471	rs8114375	A	G	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=62;PP=1699;ReadPosRankSum=-1.558;SC=AGCTCTGTGCAGCCTCCCTGC;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=97;TCR=125;TR=110;WE=31196479;WS=31196461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,129:0.48:268
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chr20	31291161	rs9421	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=313;ReadPosRankSum=-1.578;SC=GGAACGGGGCCAGGGGAGATG;SOR=1.030;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=21;WE=31291169;WS=31291151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr20	31294655	rs28548540	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.605;SC=GACCTAAAGGACAAAAGGAAC;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=31294663;WS=31294645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr20	31369136	rs3835238	AC	A	1014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=887;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CACAAAACAGACTCCTGGCTG;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=23;WE=31369144;WS=31369126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr20	31374259	rs2424913	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=911;ReadPosRankSum=0.487;SC=CGCCAGACCCCAGGCCTCCAG;SOR=0.629;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=52;WE=31374267;WS=31374249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,58:0.62:93
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chr20	31374991	rs4911107	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=433;ReadPosRankSum=1.162;SC=TCTGGTCACCGACATCCTTTG;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=27;WE=31374999;WS=31374981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
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chr20	31383530	rs875041	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=442;ReadPosRankSum=1.577;SC=AGTCATCCCCCTCACACCCTG;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=26;WE=31383538;WS=31383520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr20	31386347	rs6058891	T	C	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1039;ReadPosRankSum=0.846;SC=CCTGGAGCTGTTACATGTGTC;SOR=0.537;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=66;WE=31386355;WS=31386337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr20	31386449	rs2424922	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=480;ReadPosRankSum=0.089;SC=GGCTTGAATATGTAAGCCACA;SOR=0.480;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=42;WE=31386457;WS=31386439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr20	31387954	rs1997797	C	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=528;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CTCTGGCCCCCACAGGCTACC;SOR=0.380;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=38;WE=31387962;WS=31387944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr20	31388636	rs2424928	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=954;ReadPosRankSum=-1.022;SC=GTCTCTCTCTTTCAGATTGAA;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=58;WE=31388644;WS=31388626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr20	31389009	rs2065576	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=301;ReadPosRankSum=0.112;SC=TGGGAACCTGCTGGTCTCAGG;SOR=0.634;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=20;WE=31389017;WS=31388999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr20	31427484	rs150424676	TTTTG	T	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.418;NF=4;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-0.907;SC=CTTGTGGATTTTTTGTTTGTT;SOR=1.085;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=5;WE=31427495;WS=31427474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr20	31427635	rs2070090	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=714;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GCAACGGAGACGACGAGGCAG;SOR=0.764;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=45;WE=31427643;WS=31427625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,60:0.48:124
chr20	31446645	rs853853	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=10;PP=791;SC=TCATTTCCCTAGTTCTAAATA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=31446653;WS=31446635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	31446742	rs3746386	G	C	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GTTGAGATGGGAGTTGGAAAG;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=57;WE=31446750;WS=31446732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr20	31446936	rs185447925	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.290;SC=TTTCAATGCATGTATCCTTAA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=31446944;WS=31446926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	31473180	rs4911271	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr20	31473180	.	ATG	GTT	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=65;QD=29.6169687156;SC=TGGCGTGCGCATGTGCGTGCG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=4;WE=31473190;WS=31473170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr20	31473182	rs4911272	G	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr20	31473428	rs139861538	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=759;ReadPosRankSum=0.814;SC=AGTCCTTCTCGCTGATGAGCT;SOR=0.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=52;WE=31473436;WS=31473418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr20	31473483	rs6119300	G	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.700;SC=ACACATGGGTGATTGGAGAGC;SOR=1.218;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=20;WE=31473491;WS=31473473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr20	31480052	rs62208904	G	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=349;ReadPosRankSum=-3.168;SC=AAATGTGTCCGGGCCTTCACC;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=25;WE=31480060;WS=31480042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr20	31480936	rs62208906	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=577;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TGTGAGCCACCGCGCCCAGCC;SOR=0.977;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=36;WE=31480944;WS=31480926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr20	31480961	rs2377734	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=827;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CAACCTCTTCCGTCTCCATCT;SOR=1.002;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=49;WE=31480969;WS=31480951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr20	31484439	.	C	T	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=901;ReadPosRankSum=0.217;SC=TCAGTCTTAGCCCTTGGGGTT;SOR=0.665;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=43;TCR=82;TR=60;WE=31484447;WS=31484429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr20	31486206	rs6058948	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=0.298;SC=ATCTCTGGGCACCTCCAGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=14;WE=31486214;WS=31486196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr20	31494382	rs6120033	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=0.021;SC=TCAGTGCTGCGTTTAAGGAAA;SOR=0.853;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=27;WE=31494390;WS=31494372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr20	31494915	rs57106662	G	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=229;ReadPosRankSum=-1.254;SC=CCTAGCAGGAGGGGCCCCGGG;SOR=0.228;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=22;WE=31494923;WS=31494905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr20	31505292	rs13037781	C	T	8846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=158;PP=2965;SC=AGGAGCCCCTCGCCCTTGCAG;SOR=1.010;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=272;TCF=113;TCR=159;TR=271;WE=31505300;WS=31505282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr20	31549044	rs76404073	A	G	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=554;ReadPosRankSum=-2.482;SC=AGACCAGCACATCCGCCTGGT;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=43;WE=31549052;WS=31549034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr20	31573528	rs2274343	A	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=16;PP=1165;SC=AGCTCCCTGCAGGGGAGTGCT;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=31573536;WS=31573518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	31583578	rs73119670	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=376;ReadPosRankSum=-1.386;SC=ATTTGTGATGCGTTGTTGTTA;SOR=0.269;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=23;WE=31583586;WS=31583568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr20	31585432	rs41312288	G	T	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=33;PP=2177;SC=CCTGAGGAGGGTGCACACTCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=74;TCR=33;TR=107;WE=31585440;WS=31585422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr20	31587793	rs15850	A	G	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=43;PP=1931;SC=GTCACGTGGCAGTGCAGTGTC;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=95;WE=31587801;WS=31587783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	31590745	rs6059011	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=905;SC=ATAAGATTCATAGTCGCATTT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=31590753;WS=31590735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	31598781	rs6120085	T	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=24;PP=1245;SC=TTCTTGCTACTTGGTGGTTCC;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=31598789;WS=31598771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	31598994	rs6141358	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=463;SC=CCAGGTGGGTGCTTCAGTCCA;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=31599002;WS=31598984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	31603405	rs35897534	TAA	T	103	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=66;SC=TGCTTGGGATTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=31603414;WS=31603395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	31606237	rs3746388	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=507;SC=CCTAAAGGAGCGGGGGAGTGG;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=31606245;WS=31606227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	31607654	rs45626037	T	C	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=50;PP=1686;SC=CACACTATTGTCTTCGCTGTT;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=31607662;WS=31607644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	31608250	rs6057703	C	A	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=64;PP=2622;SC=TCTTCTGTGCCATGGGTCCAT;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=31608258;WS=31608240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	31609246	rs62207506	G	A	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=603;SC=CCACCTCCCAGGCTCACAGGG;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=31609254;WS=31609236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	31609433	rs13043556	T	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=7;PP=1092;SC=GCATCCATCTTCCAGATGCCT;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=31609441;WS=31609423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	31609581	rs17124003	C	T	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=765;ReadPosRankSum=0.615;SC=TCCACTATGTCGCCCCTGAGA;SOR=0.878;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=55;WE=31609589;WS=31609571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,67:0.39:174
chr20	31647935	rs2424936	G	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=252;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GCCAGCTGCGGGGGCCTGAAC;SOR=0.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=21;WE=31647943;WS=31647925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr20	31649781	rs398444	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=459;ReadPosRankSum=-1.336;SC=CCGGGCCTGCTGACCGGCCTT;SOR=0.296;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=29;WE=31649789;WS=31649771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr20	31651583	rs403461	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=1.354;SC=GCAGGATCTCAGGGTCCTTTA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=31651591;WS=31651573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr20	31652596	rs2093066	C	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=824;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TTCAACACCACGTTTGGACTC;SOR=1.220;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=54;WE=31652604;WS=31652586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr20	31656837	rs2424938	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=1.054;SC=GGGGGTGACTGTCTCCAGGAC;SOR=1.588;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=15;WE=31656845;WS=31656827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr20	31660543	rs378098	C	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=965;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TGTTGGAATTCCCCTGCCTAA;SOR=0.917;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=65;WE=31660551;WS=31660533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,70:0.41:169
chr20	31669467	rs221983	T	A	2342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GGGTGAGGGTTGGCATGGGGT;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=90;WE=31669475;WS=31669457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,107:0.54:198
chr20	31669517	rs221984	C	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1046;ReadPosRankSum=0.302;SC=ACCCAGGAACCTCCTCCTGCT;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=67;WE=31669525;WS=31669507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr20	31669544	rs221985	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=746;ReadPosRankSum=0.502;SC=GTTCACATCGGGAGGCTGGGT;SOR=0.425;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=42;WE=31669552;WS=31669534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr20	31671619	rs2424943	G	T	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr20	31671628	rs2424944	C	T	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr20	31671663	rs2424945	T	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TCCTCAGCACTGTGCAAGGCA;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=26;WE=31671671;WS=31671653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr20	31672882	rs73264111	C	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=1.206;SC=GCTAGGAAGACCTAAACTTCT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=16;WE=31672890;WS=31672872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr20	31673983	rs41305787	C	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.699;SC=GAGTGCTAGCCGGCAGTGGAG;SOR=0.554;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=71;WE=31673991;WS=31673973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr20	31674061	rs41311298	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TGCCCATAGGCTCTGGGGTGG;SOR=1.298;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=32;WE=31674069;WS=31674051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr20	31676622	rs2424949	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=255;ReadPosRankSum=-1.004;SC=CCAAGGTGAAGGTACTCTGTC;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=15;WE=31676630;WS=31676612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr20	31677476	rs6057722	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=2.189;SC=GCCCTTGAAGTGAGGAGTGGC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=31677484;WS=31677466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr20	31680234	rs2070327	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=127;ReadPosRankSum=0.083;SC=TTCTCCCTCCCTGTGACCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=10;WE=31680242;WS=31680224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr20	31682778	rs2024934	C	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=1.028;SC=AGGGGTCTTTCAGGGAGAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=10;WE=31682786;WS=31682768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr20	31688241	rs11699009	T	C	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=55;PP=2328;SC=GGACACAGAATTCTTGGCCTC;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=119;WE=31688249;WS=31688231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	31688260	rs11696307	C	T	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=60;NR=61;PP=2063;SC=TCATTTTCCACAGAAGGAGAT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=121;WE=31688268;WS=31688250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr20	31688330	rs11696310	C	T	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=51;PP=1452;SC=GGGGTCCTGACGGTGCTGGTG;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=65;WE=31688338;WS=31688320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	31695373	rs62210238	T	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=5.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.279;SC=ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA;SOR=0.319;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=20;WE=31695394;WS=31695363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr20	31695386	.	G	C	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.604;SC=AGGTTGCAATGAGCCGAGATT;SOR=0.547;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=31;WE=31695394;WS=31695363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr20	31757202	rs76950763	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=307;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GGCTACTCTTTATGGGCGGTT;SOR=0.484;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=18;WE=31757210;WS=31757192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr20	31760708	rs6579083	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=426;ReadPosRankSum=0.610;SC=TAAGTGGTGCGTGACACAAAA;SOR=1.536;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=21;WE=31760716;WS=31760698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr20	31768145	rs747136	A	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCCTGTGGGGAAGGTACTGTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=31768153;WS=31768135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	31768320	.	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.879;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=462;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GATTTTGTTTCTTCAGATAAT;SOR=0.422;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=32;WE=31768328;WS=31768310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr20	31768363	rs34968847	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=1.972;SC=AAACCCTCATCTGAAGAGGAC;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=30;WE=31768371;WS=31768353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr20	31811551	rs725914	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=254;ReadPosRankSum=0.238;SC=CCCAGGCCTCCGAATCCCAAG;SOR=0.242;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=17;WE=31811559;WS=31811541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr20	31812923	rs3818222	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=452;ReadPosRankSum=1.182;SC=TAACAACATCGTAAAGATGTG;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=34;WE=31812931;WS=31812913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr20	31814348	rs1570033	G	A	5634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=113;PP=2965;SC=CCGAGGGTTAGGGCATATATC;SOR=1.526;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=49;TCR=113;TR=162;WE=31814356;WS=31814338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr20	31825436	rs58831055	A	AG	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=636;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CCCAGGTGTCAGGGCAGGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=19;WE=31825444;WS=31825426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr20	31826027	rs6059183	T	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.587;NF=20;NR=38;PP=663;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TTGAGTGAGTTGTCCTAAAAT;SOR=1.245;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=58;WE=31826035;WS=31826017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr20	31826088	rs36225274	GGCAGTGACCCTGAA	G	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=5.625;NF=1;NR=21;PP=1837;ReadPosRankSum=-2.196;SC=GCCAGCCCCAGGCAGTGACCC;SOR=0.923;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=22;WE=31826109;WS=31826078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr20	31826130	rs6141898	G	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=5.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQRankSum=2.488;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.905;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr20	31827439	rs6141899	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=49;ReadPosRankSum=0.691;SC=GAAAAGACCTAGTGTGTGACT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=31827447;WS=31827429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr20	31828254	rs6059186	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=414;ReadPosRankSum=0.606;SC=GGATGGATGATTGGAAAGCTG;SOR=1.104;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=25;WE=31828273;WS=31828244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr20	31828265	rs6059187	A	G	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=1021;SC=TGGAAAGCTGAGACAATGAGA;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=31828273;WS=31828244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	31828336	.	A	AGATG	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.549;NF=1;NR=5;PP=279;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GAGCGTGGAAAGATGGATGGA;SOR=1.179;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=31828344;WS=31828326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr20	31829083	rs2273529	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GACAAGGCTCGGCTTTAGTGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=31829091;WS=31829073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	31873821	rs3746393	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.379;SC=GCCTCAGGTCCCTCTGTGCTC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=31873829;WS=31873811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	31876485	rs2295576	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=283;SC=AGCCTGGAGCTCCCACCAAGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=31876493;WS=31876475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	31876681	rs1078761	A	G	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=54;PP=1956;SC=CCTGAAGCACATCATCTGGTG;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=112;WE=31876689;WS=31876671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	31877565	rs1078944	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=-1.615;SC=GGAGAGGAGTCGGTGGGCAGG;SOR=1.802;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=14;WE=31877573;WS=31877555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr20	31887740	.	G	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1047;ReadPosRankSum=0.429;SC=TCTGGAGTTTGACCTTCTGTA;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=75;WE=31887748;WS=31887730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr20	31897554	rs1999663	G	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=864;ReadPosRankSum=-1.479;SC=TGGAAACCCAGCTCTCCTGTC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=61;WE=31897562;WS=31897544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr20	31954890	rs291674	C	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=629;SC=GCACAGAGGGCGACCATGTTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=31954898;WS=31954880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	31981849	rs291700	T	C	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=77;NR=105;PP=2772;SC=TGATAGAGCATGTGACAAGGA;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=77;TCR=105;TR=182;WE=31981857;WS=31981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	32000351	rs291694	A	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=835;SC=CGGAAGAGAGAGAGGGATAGG;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=32000359;WS=32000341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	32245546	rs13037669	T	C	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=205;SC=AGGAGACAAGTCCTGGTCTTT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=32245554;WS=32245538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	32378732	rs2747565	G	A	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=47;PP=2243;SC=TATTCCCAGCGCAGGGCACTG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=109;WE=32378740;WS=32378722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr20	32664864	rs10649600	C	CCAG	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=518;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GGAGGTGGCGCCGGCGGCGGC;SOR=1.457;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=11;WE=32664872;WS=32664854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr20	32665084	rs74408725	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=812;ReadPosRankSum=1.268;SC=GACTGGGACTCGACTGTGCTC;SOR=1.008;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=46;WE=32665092;WS=32665074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr20	32891200	rs819146	G	T	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=46;PP=1478;SC=TATCTTCCTCGCACTTGCATA;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=32891208;WS=32891190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr20	32996689	rs3761147	G	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr20	33037336	rs3736762	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-1.306;SC=TTTTTGTTCTCTTCCAATTGT;SOR=0.937;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=23;WE=33037344;WS=33037326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr20	33053985	rs11480899	A	AT	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TGATCATGTGATTTTTTCCCC;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=33053993;WS=33053975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr20	33057954	rs6059856	G	C	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1067;ReadPosRankSum=1.291;SC=TCTCTGTACTGCCTTAACTTT;SOR=0.844;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=47;TCR=102;TR=63;WE=33057962;WS=33057944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,76:0.43:178
chr20	33057974	rs10716089	CT	C	1533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=1238;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TGTTGTGTTGCTTTATATTAC;SOR=0.625;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=95;TCF=6;TCR=89;TR=38;WE=33057982;WS=33057964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr20	33068563	rs6059861	A	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=198;ReadPosRankSum=0.154;SC=CATGTAATTTATTAAAATATA;SOR=0.507;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=14;WE=33068571;WS=33068553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr20	33104592	rs2424993	G	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=835;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GGCAACCCTGGCAACGTTTCC;SOR=0.560;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=54;WE=33104600;WS=33104582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,56:0.35:162
chr20	33114201	rs8116198	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr20	33128574	rs142735783	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.996;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GGCGGCTCTTCTCCCCCACCA;SOR=0.120;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=16;WE=33128582;WS=33128564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr20	33147737	rs6059915	C	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=45;PP=1289;SC=GGGAGTCGGGCGGCCCCGGTC;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=33147745;WS=33147727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	33148861	rs6059916	T	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=1049;SC=CTGGCAGGTGTTGTTGGAAGA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=33148869;WS=33148851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr20	33337751	rs3787220	T	C	7059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=115;PP=2965;SC=CTTGCATGTTTGGAGTTGGTC;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=109;TCR=115;TR=224;WE=33337759;WS=33337741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr20	33342439	rs1884432	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=480;SC=CCAAGACTTATTACTTATCTG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=33342447;WS=33342429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	33342477	rs6087625	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=252;ReadPosRankSum=2.111;SC=TCAAGTCTACGACACAATGCT;SOR=0.150;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=21;WE=33342485;WS=33342467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr20	33346556	rs11468960	ATC	A	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=620;ReadPosRankSum=0.955;SC=TTTTATAATGATCTGTGCAGA;SOR=0.596;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=16;WE=33346565;WS=33346546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr20	33356511	rs2295353	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=226;ReadPosRankSum=0.462;SC=AGTTTACCACCAGAAAAATGG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=33356519;WS=33356501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr20	33364584	rs6060043	C	T	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=27;PP=1205;SC=AGGCAATGAACGGAAAGCCGT;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=33364592;WS=33364574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	33364655	rs6120723	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=455;ReadPosRankSum=-0.309;SC=ATAGAATAGGCTCATGCCTAT;SOR=1.284;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=26;WE=33364663;WS=33364645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr20	33370266	rs6060048	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CAACAATGTATAATTCATAGT;SOR=1.022;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=7;WE=33370274;WS=33370256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr20	33470514	rs6088638	T	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=499;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TATAATTTGGTCCTGTGTATA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=25;WE=33470522;WS=33470504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr20	33470694	rs4911163	C	T	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GGAAAATCTTCATTGAGTGGA;SOR=0.797;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=62;WE=33470702;WS=33470684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr20	33500378	rs2378294	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GAGCCACCGCGCCTGGCCAAT;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=10;WE=33500386;WS=33500368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr20	33509275	rs3818273	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=934;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AGTGAGTGAAGGGTACAGAAG;SOR=1.109;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=58;WE=33509296;WS=33509265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr20	33509523	rs2273683	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.835;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=282;ReadPosRankSum=0.639;SC=GTTCTGGGGCCCCTTGGGAGT;SOR=1.244;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=17;WE=33509531;WS=33509513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr20	33533736	rs734111	A	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=207;ReadPosRankSum=-1.037;SC=CTGGCCCCCCAATGCTTCACT;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=14;WE=33533744;WS=33533726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr20	33565480	rs6060137	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=463;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ACCGTGGTGCCGAGGTAGGTG;SOR=1.424;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=29;WE=33565488;WS=33565470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr20	33572941	rs2425007	A	G	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=56;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CTGTGAGTCAACCCCCTGCGG;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=161;TCF=57;TCR=104;TR=85;WE=33572949;WS=33572931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,96:0.52:183
chr20	33574022	rs2425008	G	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=319;ReadPosRankSum=-1.478;SC=GTACGATGAAGGGGGTGGGAG;SOR=0.430;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=30;WE=33574030;WS=33574012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr20	33575347	rs3053708	C	CAT	1629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=1155;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TTACCCCACTCGTGCCCTGCC;SOR=0.490;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=25;WE=33575355;WS=33575337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr20	33578899	rs2425009	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=-2.168;SC=CCCCAACAGGTTGCTCTACAC;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=29;WE=33578907;WS=33578889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr20	33581955	rs2425012	G	A	3419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=59;PP=2115;ReadPosRankSum=0.408;SC=CTAGGGATGCGCTGTTCACCA;SOR=0.621;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=286;TCF=172;TCR=114;TR=144;WE=33581963;WS=33581945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,166:0.49:337
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chr20	33583037	rs61501849	C	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.69;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr20	33584822	rs11167250	T	TG	121.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=97;SC=GGGGGCGTTATGGGGTCCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=33584830;WS=33584813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr20	33584864	rs11167251	C	CT	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=366;SC=CCTGTGCTGGCCACCCACTCT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=33584872;WS=33584854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	33587553	rs369393561	TCC	T	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=0.377;SC=CCACTGGCCATCCCCCCCCCC;SOR=0.776;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=11;WE=33587562;WS=33587543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr20	33590096	rs4911167	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=0.476;SC=TGCTGCCTTCAGCCTTCCCTG;SOR=0.188;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=33590104;WS=33590086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	33591197	rs11481073	A	AG	2461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CACCCCCTTGAGGGTGGGGCA;SOR=0.761;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=59;WE=33591205;WS=33591187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,90:0.52:174
chr20	33592474	rs752449	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=1.206;SC=CTCTGAAGCTAGGAGCTCATC;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=19;WE=33592482;WS=33592464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr20	33593457	rs3746431	T	C	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1105;ReadPosRankSum=0.326;SC=CCAGCATTCTTACCCTGCATG;SOR=0.600;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=73;WE=33593465;WS=33593447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr20	33593674	rs3746430	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=249;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CCCGGGGGGATAGTCACTACA;SOR=0.859;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=33593682;WS=33593664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr20	33594226	rs6060151	G	T	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=962;ReadPosRankSum=-1.347;SC=CAGAGCCCTGGGTTAACTTTA;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=65;WE=33594234;WS=33594216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr20	33595300	rs2273636	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=0.968;SC=GACACAGCAACGCGTGGGCTG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=16;WE=33595308;WS=33595290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr20	33604042	rs3736802	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=0.625;SC=TCAGGACAAGTATCAGTACTG;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=32;WE=33604050;WS=33604032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr20	33632203	.	G	GA	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.4996;HP=15;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=16;MQ=51.99;NF=2;NR=0;PP=22;QD=12.5;SC=CTCAAAAAAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=2;WE=33632211;WS=33632193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,2:0.15:13
chr20	33632600	rs3803938	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CCCTTACATACGGGGCTTAGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=33632608;WS=33632590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr20	33637606	rs2281626	T	G	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1116;ReadPosRankSum=1.811;SC=TATTATTCAGTTTTGAGAATC;SOR=0.924;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=80;TCR=47;TR=73;WE=33637614;WS=33637596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,80:0.52:155
chr20	33642732	rs4911462	G	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr20	33642737	rs4911463	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=6.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.256;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr20	33645273	rs41290906	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=526;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CCACCGTATCGGCAGGTTGGA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=30;WE=33645281;WS=33645263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr20	33657126	rs1998233	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=620;ReadPosRankSum=2.161;SC=AGTCAAAAATGTAAGTATTTG;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=44;WE=33657134;WS=33657116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
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chr20	33711624	rs6120838	T	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GATGGAGCCTTGTAGAGGGGA;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=33711632;WS=33711614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr20	33713963	rs2295885	T	C	161.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=-0.489;SC=ACTCAAGCAATTAACAAAGTA;SOR=2.526;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=33713983;WS=33713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr20	33713975	rs2295886	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=304;ReadPosRankSum=1.030;SC=AACAAAGTACATTATTTGACT;SOR=2.800;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=33713983;WS=33713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr20	33714187	rs2295887	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.526;SC=CTCTGCAGTGGGGGAGATGGG;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=8;WE=33714195;WS=33714177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
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chr20	33762489	rs2069948	C	T	2373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=-1.114;NF=56;NR=30;PP=1421;ReadPosRankSum=-1.830;SC=CAGGCTGAAGCTGACTCTGCC;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=100;TCR=53;TR=86;WE=33762497;WS=33762479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,110:0.56:197
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chr20	33855284	rs2425031	T	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=41;PP=924;ReadPosRankSum=1.284;SC=CTCCCCGACATCATGGAGCTG;SOR=1.940;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=110;TCF=22;TCR=88;TR=46;WE=33855292;WS=33855274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr20	33857711	rs2254207	A	C	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=745;ReadPosRankSum=1.201;SC=GGTAATGTAGACTGTGCTGTG;SOR=1.296;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=48;WE=33857719;WS=33857701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,69:0.44:157
chr20	33859244	rs6058219	G	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=430;ReadPosRankSum=0.453;SC=CTCAGGCTTCGTGCCCTTCCC;SOR=0.807;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=25;WE=33859252;WS=33859234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr20	33867248	rs2297789	A	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=453;ReadPosRankSum=-0.264;SC=ATGCTCTCACACTCGAGAAGC;SOR=1.828;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=24;WE=33867256;WS=33867238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr20	33867697	rs619865	A	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=1113;SC=AACACTAGGCAAAAGGATCTG;SOR=1.453;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=33867705;WS=33867687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	33867924	rs2250205	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=564;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TCTGTCTCCTGTCAATCAAAG;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=33;WE=33867932;WS=33867914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr20	33868702	rs2425043	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=0.085;SC=AGGATACCACTCAGCCCAGCC;SOR=1.440;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=33868710;WS=33868692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr20	33872215	rs1802241	C	A	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=57;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CCGATCGCTACCAGACAGTAG;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=273;TCF=141;TCR=132;TR=119;WE=33872223;WS=33872205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,147:0.42:346
chr20	33872311	rs2275275	G	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=54;PP=1235;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GGCGGCGGAGGCGGGAGTTCA;SOR=0.924;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=148;TCF=39;TCR=109;TR=71;WE=33872319;WS=33872301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,82:0.48:172
chr20	33874720	rs2425049	C	T	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1885;ReadPosRankSum=-0.596;SC=ATCTGGTGCCCGTCTGGCAGG;SOR=0.620;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=187;TCF=91;TCR=96;TR=105;WE=33874728;WS=33874710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,113:0.54:208
chr20	33879478	rs2425050	A	G	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=1105;SC=ATAGTGCCAGAGGTGCTGGTC;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=33879486;WS=33879468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	33894463	rs878639	A	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=0.660;SC=GGAAAGGGTCACTCACCTGTT;SOR=0.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=27;WE=33894471;WS=33894453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr20	33896757	rs8117705	G	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-1.833;SC=GACCTCAAGTGATCTGCCTGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=33896765;WS=33896750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr20	33971914	rs4911494	C	T	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=705;ReadPosRankSum=-0.341;SC=ACCACATGCTCGGGACTGGCT;SOR=0.573;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=49;WE=33971922;WS=33971904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr20	33972053	rs4911496	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=0.646;SC=CCCACTTCCCCGTGATCAGCT;SOR=0.484;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=22;WE=33972061;WS=33972043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr20	33974051	rs6141549	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=124;ReadPosRankSum=-1.076;SC=AAAAATCTAGTTTCCAAACTC;SOR=0.654;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=8;WE=33974059;WS=33974041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr20	33974163	rs6088812	T	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-1.694;SC=ATGGAACACATGGAATGAAAA;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=15;WE=33974171;WS=33974153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr20	33997291	rs6142378	T	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.483;SOR=1.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr20	34022387	rs224331	A	C	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=76;PP=1709;ReadPosRankSum=-2.150;SC=TCCAGCAAGGAGGCCGGCTGC;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=244;TCF=99;TCR=145;TR=124;WE=34022395;WS=34022377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,152:0.52:290
chr20	34025756	rs143384	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-0.953;SC=CGGCAGCAGCAAAGGTGCCTC;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=12;WE=34025764;WS=34025746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr20	34079200	rs224373	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.581;SC=GGGAGTAGGGAAGAAAGGGGC;SOR=0.419;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=29;WE=34079208;WS=34079190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr20	34144107	rs224420	T	C	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=66;PP=1755;SC=TCCTGCATTTTGTTCCGTCAG;SOR=1.496;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=98;WE=34144115;WS=34144097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	34153197	rs11907536	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=586;ReadPosRankSum=0.447;SC=GATAACCCAAGGTTACCTTTG;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=34;WE=34153205;WS=34153187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr20	34164422	rs1557202	T	C	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=48;PP=1997;SC=AATTCTTCCTTCAGGGACCTG;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=34164430;WS=34164412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	34170035	rs6060486	C	G	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=45;PP=1794;SC=GACTCCACACCTTGCCCAGCC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=34170043;WS=34170025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr20	34170174	rs6119628	C	A	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=54;PP=1955;SC=AAATGGGCACCCGGATGTTGG;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=34170182;WS=34170164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr20	34170316	rs6060487	C	A	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=22;PP=597;SC=GGGGCTCCACCTCACTGGGCA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=34170324;WS=34170306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	34173046	rs1536147	C	T	5809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=77;PP=2965;SC=GTCCCCTCACCGTGAGCATTA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=100;TCR=77;TR=177;WE=34173054;WS=34173036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr20	34173178	rs6060488	A	G	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=71;PP=2068;SC=AGACCAGCACATCGGGGAGGG;SOR=2.212;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=90;WE=34173186;WS=34173168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	34208516	rs2425067	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=240;SC=ATTGAATACACAGAAGATCCT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=34208524;WS=34208506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	34320202	.	TA	T	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9997;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=26;QD=14.5;SC=TAATCATACTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=2;WE=34320210;WS=34320192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr20	34328274	rs1538426	G	A	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=488;SC=TTATAAGACTGTTAGAAGATT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=34328282;WS=34328264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	34328952	.	C	T	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5252;HP=25;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=48.68;NF=0;NR=4;PP=54;QD=22.1928031368;SC=AAACATTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=34328960;WS=34328942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr20	34582947	rs76775934	T	G	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=990;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CCTATGTCCCTTGCTGTGTTC;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=68;TCR=60;TR=70;WE=34582955;WS=34582937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr20	34776503	.	AACACAC	A	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=51.61;NF=1;NR=0;PP=21;QD=24.0;SC=CTGGACTGCCAACACACACAC;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=1;WE=34776516;WS=34776493;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,1:0.20:5
chr20	35064912	rs1275393	G	A	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=5;PP=109;SC=TGCTTCTTGAGAGAACCCCTT;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=35064920;WS=35064902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	35068018	rs1275396	A	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=739;SC=ACAGTCAAATACAAGCTGGTG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=35068026;WS=35068008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	35090820	rs1275391	C	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=18;PP=1492;SC=CTGAAGGCCCCCCTTTGAGCC;SOR=2.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=78;WE=35090828;WS=35090810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	35422936	rs35707272	G	T	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GGGCATCTCCGCCAGCAAGGT;SOR=0.890;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=79;WE=35422944;WS=35422926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,97:0.51:191
chr20	35491033	rs1291099	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=321;ReadPosRankSum=0.076;SC=GACCCCTGCGACCTCCCTTTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=17;WE=35491041;WS=35491023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr20	35491551	rs6029806	A	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=20;PP=721;SC=CCGTGAGGAGAACGCGGCGCT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=35491559;WS=35491541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	35507542	rs3748459	G	A	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TGTACCGGCGGATGGAGGGCT;SOR=0.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=54;TCR=99;TR=152;WE=35507550;WS=35507532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr20	35507621	rs3748461	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=543;ReadPosRankSum=0.317;SC=GGCACCACCCGAGGCTCTGGG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=30;WE=35507629;WS=35507611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr20	35508931	rs116897774	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=455;ReadPosRankSum=1.188;SC=AGCCCCCATGCCCCAGCTCTG;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=31;WE=35508939;WS=35508921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr20	35569619	rs6030312	G	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=420;SC=ACTAACAGAAGTTAGATTGGA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=35569627;WS=35569609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	35710283	rs62206488	A	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=13;PP=609;SC=ATCTGAGAGGAGACTCACCAG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=35710291;WS=35710273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	35710453	rs1892205	T	C	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=22;PP=584;SC=GCACAGAGCATGTGTCTCTAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=35710461;WS=35710443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	35738841	rs1744759	G	C	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=65;PP=2173;SC=TGGGGTCAGAGACTCTATCAG;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=99;WE=35738849;WS=35738831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	35748039	rs138010782	G	GAAAGA	2974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.75;QD=47.22;SOR=1.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	35748894	rs1624888	C	G	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=65;PP=2965;SC=AGCTTCTAAACAATGAGTCTT;SOR=1.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=151;WE=35748902;WS=35748884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr20	35749079	rs8120336	T	A	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=821;SC=CAGAGGGCATTGTCTCAGGGC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=35749087;WS=35749069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	35766102	rs16986445	G	A	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=4;PP=1020;SC=TGTATACTGTGTCTTCTCCAC;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=35766110;WS=35766092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	35766337	rs8115854	A	G	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=90;PP=2949;SC=CTGATTATGGATAACTGGGCA;SOR=1.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=141;WE=35766345;WS=35766327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	35769592	rs1744769	T	C	5952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=93;PP=2965;SC=CTGTATTTTTTGCCAAAGTTA;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=175;WE=35769600;WS=35769582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr20	35786188	rs1780687	A	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=1029;SC=ACCACTGAATACTTCCACATT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=35786196;WS=35786178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	35786397	rs55732474	C	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=561;ReadPosRankSum=1.221;SC=CCTGGCCCCACGTGAAGTTCC;SOR=0.338;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=39;WE=35786405;WS=35786387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr20	35787472	rs372257295	G	T	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=771;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CAGCAAGCTGGAAAGACGGTT;SOR=0.832;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=56;WE=35787480;WS=35787462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr20	35807790	rs11467214	G	GCTTATAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	3448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=2900;SC=GTTGCGCGTGGCTTTGGGGAG;SOR=1.123;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=8;WE=35807798;WS=35807780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	35812526	rs16986470	C	A	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=24;PP=1630;SC=ATCATTGGGACTGTGTATAGC;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=35812534;WS=35812516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	35826683	rs2076399	T	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=703;SC=ACTAAATTCATGTAGCTCATT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=35826691;WS=35826673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	35827682	rs2076398	G	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=463;SC=GGTCCTATCCGAAGAGGGCTC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=35827690;WS=35827672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	35828696	rs6032013	A	G	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=188;SC=CCGGCTGCCCAGCTAATTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=35828704;WS=35828686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	35828757	.	ATT	A	1273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=6;PP=555;SC=GCCGGTTGTAATTTTTTTTTT;SOR=3.855;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=31;WE=35828766;WS=35828747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	35835657	rs11698281	C	T	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=16;PP=1135;SC=GAAACAGCTGCATTTCGCATT;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=35835665;WS=35835647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	35835889	rs1079657	A	G	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=43;PP=1464;SC=CCCTCTGATTATCATTCCTAG;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=35835897;WS=35835879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	35838372	rs2272950	T	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=762;SC=TTGCAACCTATAGATAAAGCA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=35838380;WS=35838362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	35838591	rs2050091	T	C	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=57;PP=1939;SC=CATATTTTGGTGGGGCGCTGA;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=100;WE=35838599;WS=35838581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr20	35838756	rs3817885	G	A	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=240;SC=TTCATTCTCTGTTTCTAGTTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=35838764;WS=35838746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	35852395	rs2076397	A	C	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=59;PP=1853;SC=CCACCTGATCACTCAGGGAGC;SOR=2.513;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=35852403;WS=35852385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	35852450	rs2076396	G	C	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=679;SC=ACTGAGCCCTGCAGGCATCAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=35852458;WS=35852440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	35865054	rs4608	C	T	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=82;PP=2951;SC=CCTGGCCATCCTGGGCAGTGT;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=135;WE=35865062;WS=35865044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr20	35869619	rs2050093	C	T	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=14;PP=870;SC=GGGAGAGTACCTTAGTCTCTC;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=35869627;WS=35869609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	36030939	rs1885257	G	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=69;PP=2463;SC=GCAAAGTGGCGGACTTTGGGC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=36030947;WS=36030929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr20	36031097	rs2145792	A	G	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=65;PP=2965;SC=TGCTTATCTAACAGAGCGGTC;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=145;WE=36031105;WS=36031087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	36375071	rs2297154	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=50;PP=1817;SC=CTGTTACTCTTTCTCCTGTCT;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=36375079;WS=36375061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	36488508	rs3833308	TCTCA	T	2518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.18;NF=18;NR=21;PP=2161;SC=TTAGGTGGACTCTCACTCAGG;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=39;WE=36488519;WS=36488498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	36488911	rs1474623	G	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=GTCAGAATACGGAAGACTAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=36488919;WS=36488901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	36531978	rs6021782	G	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CAGTCGTGGCGGGCATCCCGG;SOR=0.801;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=11;WE=36531986;WS=36531968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr20	36561882	rs1998049	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=2.820;SC=TGCCACCCCACCCCCACCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=36561890;WS=36561872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr20	36572310	rs11365082	AC	A	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.698;NF=8;NR=17;PP=257;ReadPosRankSum=2.438;SC=CGATCTTGGGACCCCCCCCCC;SOR=0.644;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=25;WE=36572319;WS=36572300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr20	36685915	rs2256288	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=484;ReadPosRankSum=-1.716;SC=TCAAATTTATTACTTTCTCTT;SOR=0.545;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=28;WE=36685923;WS=36685905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr20	36769801	.	G	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=557;ReadPosRankSum=0.611;SC=AGGGGGATAGGGGGGCGGGAA;SOR=0.523;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=40;WE=36769809;WS=36769791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
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chr20	36841914	rs3746471	G	A	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=66;PP=2744;SC=AGGAGCATCCGGATCTCCTCA;SOR=0.945;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=119;WE=36841922;WS=36841904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr20	36845738	rs760998	C	T	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=54;PP=2338;SC=TGGGTCAGCTCAGCCTGGAAG;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=36845746;WS=36845728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr20	36859711	rs1205418	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GGGGCCGCCCGGCCCTGTCCC;SOR=0.807;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=16;WE=36859719;WS=36859701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr20	36868191	rs1205433	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=0.801;SC=AAGGGGAAAACGTCTCCTCTT;SOR=0.459;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=39;WE=36868199;WS=36868181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr20	36869005	rs41282820	G	A	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=823;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GATTTGGCTCGGTTGGGTTTA;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=80;TCR=53;TR=57;WE=36869013;WS=36868995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr20	36869516	rs1205434	C	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=714;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AGCTTTCTGGCTTTGTGCAAG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=44;WE=36869524;WS=36869506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr20	36870122	rs1205435	T	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=811;ReadPosRankSum=-0.428;SC=AGGCTGGCTCTGGAACAGGCT;SOR=0.910;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=51;WE=36870130;WS=36870112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr20	36919616	rs6014601	G	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=624;SC=GTTTCCCACAGTGTGTCCCCG;SOR=2.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=36919624;WS=36919606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	36919758	rs10446011	A	G	3936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=66;PP=2191;SC=CAGACAAGACAGGAGACTGGA;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=126;WE=36919766;WS=36919748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr20	36932551	rs1341022	G	C	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=36;PP=1857;SC=CATTTCCCCAGCCGACTCTTT;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=90;WE=36932559;WS=36932541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr20	36932660	rs1341023	C	T	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=54;PP=1674;SC=CCGAGATGGGCGTCCCTGATG;SOR=1.212;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=86;WE=36932668;WS=36932650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	36932676	rs1341024	G	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=50;PP=1267;SC=TGATGGTGCTGGTCGCCATAG;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=36932684;WS=36932666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr20	36937599	rs150762103	T	TC	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=484;SC=AGGAAATTCTTCACATGAGAA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=36937607;WS=36937589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	36940169	rs3746476	A	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=8;PP=381;SC=AGGGTGCCAAAACCTGTTTCT;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=36940177;WS=36940159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	36940314	rs5743509	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=17;PP=528;SC=ATTGAGTCTGCGCTTCGAAAC;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=36940322;WS=36940304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	36946168	rs41310018	G	A	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=53;PP=1630;SC=TTTTACAGATGAAGAAATAGA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=84;WE=36946176;WS=36946158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	36946916	rs148138176	GA	G	1601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=1275;SC=GAAAGGAACAGAAATGGGAGG;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=36946924;WS=36946906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	36948457	rs5743510	T	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=390;SC=GAGAGCTCCCTGGAGAAGGTG;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=36948465;WS=36948447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	36977970	rs1739654	G	A	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=55;PP=2256;SC=AGGGGCTATTGGCTCTGCAGA;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=36977978;WS=36977960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr20	36978182	rs1739655	G	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=84;SC=TCTCCGGGGCGGACAGTGGGA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=36978190;WS=36978172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	36997632	rs1780627	T	C	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=CCTAATTCTGTTCCCAGTTAG;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=169;WE=36997640;WS=36997622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr20	36999897	rs2232616	C	T	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=41;PP=1799;SC=AAGCCCACACCTTTTAATCTT;SOR=0.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=36999905;WS=36999887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	37001631	rs2232617	C	T	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=21;PP=1583;SC=GTTTGCTTTTCCCAAGCGTTT;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=37001639;WS=37001621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	37001761	rs2232618	T	C	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=65;PP=2391;SC=CCTTAACACCTTCTACCCCAA;SOR=1.092;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=108;WE=37001769;WS=37001751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	37005536	rs745144	T	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=33;PP=1096;SC=CCACCCTCCCTGACTGGCCTG;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=37005544;WS=37005526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr20	37055875	rs707578	T	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=1.762;SC=AAGCATGATGTCCCCCCGCAC;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=37055883;WS=37055865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr20	37163879	rs6070496	C	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=159;ReadPosRankSum=-1.480;SC=TTATTTTAACCCAACAGCCTT;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=18;WE=37163887;WS=37163869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr20	37168469	rs6070521	G	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=752;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TCAGTTCTGTGTGCACCTACA;SOR=0.893;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=47;WE=37168477;WS=37168459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr20	37169654	rs805542	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.051;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=386;ReadPosRankSum=-2.276;SC=AGGTGTGTTCTAAAAATTGAT;SOR=1.341;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=22;WE=37169662;WS=37169644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr20	37199539	rs6070645	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=550;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTTTAACATATTGATTGCAGC;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=33;WE=37199547;WS=37199529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr20	37252210	rs6064778	C	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=635;ReadPosRankSum=-1.395;SC=GGGTGAGAGACCCTGGCGGGG;SOR=0.839;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=42;WE=37252218;WS=37252200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr20	37257384	rs35399405	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-1.327;SC=AGCCAGCCAGACTTGGGCCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=37257392;WS=37257374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	37257590	rs6070809	C	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=675;ReadPosRankSum=0.330;SC=CAGAGAATGGCGACTCCGGTA;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=43;WE=37257598;WS=37257580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr20	37266205	rs6026964	C	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=0.541;SC=TCAAGAGGAGCGGTTTGGGTC;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=14;WE=37266213;WS=37266195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr20	37272589	rs419162	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=1.402;SC=CCCTCTGGGTGCAGCTGCCGT;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=12;WE=37272597;WS=37272579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr20	37274559	rs11426603	C	CA	771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=943;ReadPosRankSum=0.499;SC=GTCCCGTGTCCAACAAATGCA;SOR=1.863;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=55;TCF=49;TCR=6;TR=26;WE=37274567;WS=37274549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr20	37274861	rs117796	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=595;ReadPosRankSum=1.057;SC=ACAGGTGGAGAAGGGCCGAGG;SOR=0.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=31;WE=37274869;WS=37274851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr20	37277153	rs220527	G	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=269;ReadPosRankSum=1.114;SC=TCCTTATGCTGCTTCTCCCCA;SOR=0.293;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=20;WE=37277161;WS=37277143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr20	37277271	rs220526	C	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,90:0.60:150
chr20	37278612	rs220522	T	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=276;ReadPosRankSum=0.605;SC=ATTCCAAGGCTTCCTTTTCTG;SOR=0.745;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=20;WE=37278620;WS=37278602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr20	37278823	rs220521	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=-1.261;SC=CCCTCCACCCTCCAGCCCTCC;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=37278831;WS=37278813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	37278946	rs220520	T	C	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AAAAATGCAGTACCTTTATCA;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=61;WE=37278954;WS=37278936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr20	37279255	rs220519	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=508;ReadPosRankSum=-2.634;SC=AATATGTAAACGTAATTGTTT;SOR=0.789;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=36;WE=37279263;WS=37279245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr20	37555322	.	C	CGCG	3236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.882;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.356;NF=9;NR=35;PP=2072;ReadPosRankSum=1.788;SC=GAGAGGAGGGCGCGGCGGCGG;SOR=0.383;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=27;TCR=100;TR=44;WE=37555330;WS=37555312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,81:0.53:154
chr20	39609426	rs4812473	C	T	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=38;PP=1359;SC=TGCGCTCTCCCTCTTCCAAGC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=39609434;WS=39609416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	39634616	rs1000411	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=326;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CATCACTACACTAGGGACTTT;SOR=0.422;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=21;WE=39634624;WS=39634606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr20	39690342	rs1997833	T	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=414;SC=GCAAGTATGTTTAATTTTCTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=39690350;WS=39690332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr20	39726776	rs78221809	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=269;ReadPosRankSum=-0.276;SC=GGTGCTTGGGTGTATTTGCAA;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=39726784;WS=39726766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
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chr20	39798686	rs35432552	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CAGTGCCTGCGGTGTGGAGTG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=39798694;WS=39798676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr20	39802667	rs56012336	G	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.871;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=719;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TGCAGCAGGGGTGGGCTGGCC;SOR=1.105;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=42;WE=39802675;WS=39802657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,58:0.39:148
chr20	39830122	rs2235367	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=55;SC=TTTCGAGTACAATCCAGAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=39830130;WS=39830112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr20	39977650	rs78339899	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=337;ReadPosRankSum=1.538;SC=TTCACCTTACCAAGCCCCTGA;SOR=0.511;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=19;WE=39977658;WS=39977640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
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chr20	39986085	rs12625565	A	C	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=54;PP=1982;SC=ACAAAATCCAACTGTGAGTGC;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=39986093;WS=39986075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr20	39990377	rs61739314	G	C	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AGCCAAGAAGGCATCAGAGTA;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=183;TCF=107;TCR=76;TR=73;WE=39990385;WS=39990367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,95:0.41:229
chr20	39990614	rs2235592	C	T	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.753;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1497;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TGCCACGAGGCTGTCCAGGAT;SOR=0.641;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=143;TCF=74;TCR=69;TR=85;WE=39990622;WS=39990604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,91:0.56:162
chr20	39990700	rs41278104	T	C	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1735;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GCTCTGTCTGTACAAGGGGCC;SOR=0.928;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=177;TCF=80;TCR=97;TR=106;WE=39990708;WS=39990690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,121:0.58:210
chr20	39991144	rs41307177	A	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=728;ReadPosRankSum=1.161;SC=CCCGGCCATCAAGGCTCTGGT;SOR=0.525;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=49;WE=39991152;WS=39991126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr20	39991171	rs61739307	G	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TCCGGCTGGCGGCCTGACCCT;SOR=0.475;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=67;WE=39991179;WS=39991161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
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chr20	40116207	rs3092194	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=402;ReadPosRankSum=2.265;SC=TACCAGGAACGTGACAACTTG;SOR=0.242;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=21;WE=40116215;WS=40116197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr20	40120211	rs4810321	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=0.666;SC=TGTGCAAAGACTACCACCCTA;SOR=1.659;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=40120219;WS=40120201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr20	40126048	rs41304645	G	A	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1622;ReadPosRankSum=0.599;SC=GCTTCATCTGGGCTTGTTTAT;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=217;TCF=110;TCR=107;TR=95;WE=40126056;WS=40126038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,112:0.44:255
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chr20	40979160	rs2071854	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=247;ReadPosRankSum=0.514;SC=GGAAGCTTTGTTCCTGGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=16;WE=40979168;WS=40979150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr20	41101212	rs41279262	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=1.089;SC=TCTGCAAAACATGCAGGCAAG;SOR=0.502;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=41101220;WS=41101202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr20	41101274	rs6065487	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTTCTGCTACAACAGGGAAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=41101282;WS=41101264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr20	41306488	rs111229158	G	GA	466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=288;SC=TGGAGCCTGGGAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=17;WE=41306496;WS=41306478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	41306600	rs2425516	A	G	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=45;PP=1776;SC=CATACTCAACATCGGGGTCCA;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=104;WE=41306608;WS=41306590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr20	41420095	rs17811401	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CTGTTCACCATCATGAAAGAT;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=21;WE=41420103;WS=41420085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr20	41514690	.	CAT	C	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=34;QD=40.0;SC=GAAGATTTTCCATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=1;WE=41514699;WS=41514680;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,1:0.11:9
chr20	41818289	rs2867655	C	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=7;NR=8;PP=226;SC=CACTCACCTGCGGCGCTCTGA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=41818297;WS=41818279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	42089511	rs2235611	T	C	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=37;PP=1761;SC=CCCGATCCCCTAAAGAAAATG;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=89;WE=42089519;WS=42089501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	42159696	rs41303935	C	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GGGTCCAGGGCCAGAGATGGG;SOR=0.275;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=11;WE=42159704;WS=42159686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr20	42163768	rs2071968	C	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=1.222;SC=AGCAGTGCTTCTGGCTACCCC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=10;WE=42163776;WS=42163758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr20	42199704	rs11467250	GGTGT	G	661.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5693;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=2.032;NF=6;NR=6;PP=534;ReadPosRankSum=1.529;SC=CTGCCAGGTTGGTGTGTGTGT;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=12;WE=42199715;WS=42199694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,17:0.85:20
chr20	42199925	rs3127060	G	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=442;SC=CATGTACATAGGGGGCAGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=42199933;WS=42199915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	42205061	rs763227	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=727;SC=CATGGGGCTCGCAGCTTCCTG;SOR=2.964;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=32;WE=42205069;WS=42205051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	42208522	rs2301483	T	G	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=795;SC=GCCAGTTGCTTGTGGAGCTCT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=42208530;WS=42208512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	42225114	rs2664519	G	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=899;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TAAATGGAGTGAAACTGTGGA;SOR=0.520;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=51;WE=42225122;WS=42225104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,59:0.58:102
chr20	42242700	rs4473450	C	T	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=34;PP=938;SC=CAGAAGGCTTCTATATGTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=42242708;WS=42242690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	42249398	rs1555348	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=365;SC=TTTAATCTTTCTTCCTTTATC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=42249406;WS=42249388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	42249479	rs11483104	C	CT	1569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;MQRankSum=0.267;QD=27.54;ReadPosRankSum=1.703;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr20	42264502	rs6031007	G	A	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=59;PP=2611;SC=ACACAGTGTGGTCAGTTAGAC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=128;WE=42264510;WS=42264492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr20	42264726	rs2273523	T	C	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=369;SC=AGGCATTCGCTGTGGTCCCTT;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=42264734;WS=42264716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	42265700	rs6065638	T	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=322;SC=TTAGTTATGATTTTGGACAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=42265708;WS=42265690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	42265966	rs6031008	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=631;SC=GCAATGGTGCGATCTCGGCTC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=42265974;WS=42265956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	42275499	rs393115	G	T	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=11;PP=1662;SC=AATCTCTAAAGTCCAAAGCAC;SOR=3.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=71;WE=42275507;WS=42275489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	42302201	rs826949	C	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=440;SC=CATTTGAGTCCAGGAGTTCAA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=42302209;WS=42302191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	42302371	rs826950	C	T	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=56;PP=2609;SC=GTGGGCTGGCCGCTGCCTACA;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=129;WE=42302379;WS=42302361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr20	42310509	rs442143	T	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=36;PP=966;SC=AGTACAGTCCTGCTGTGGCCC;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=42310517;WS=42310499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	42321114	rs181239097	A	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=0.570;SC=TCTGCACATAACTGGCACTTG;SOR=0.169;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=13;WE=42321122;WS=42321104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	42328639	rs285162	T	C	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=45;PP=1396;SC=TCCTCATCCCTGCTGTGGGTT;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=73;WE=42328647;WS=42328629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	42328749	rs285163	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=394;SC=CTTCTCTCTCAGGCCCACATC;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=42328757;WS=42328739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr20	42697255	rs8125734	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=420;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GGAGAGGTACCCAACAGCTTT;SOR=0.430;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=33;WE=42697263;WS=42697245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr20	42743454	rs6093935	A	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=29;PP=1449;SC=GGAGGTGAACAAAGAGGATGG;SOR=1.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=81;WE=42743462;WS=42743444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	42744265	rs56061946	G	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-2.034;SC=GCTACCTCTAGGGAACCCGAC;SOR=1.843;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=5;WE=42744273;WS=42744255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr20	42744587	rs74352869	G	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-1.636;SC=GTGGGGGCTCGGGCGGCGTGG;SOR=0.526;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=33;WE=42744595;WS=42744577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,40:0.39:103
chr20	42745115	rs6073336	T	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=1.206;SC=CGAGCCTCATTCATGGGCTCA;SOR=0.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=10;WE=42745123;WS=42745105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr20	42806429	rs2064381	A	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=640;SC=TTGTCCTCAAATATCCTCCCG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=42806437;WS=42806419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	42814931	rs6031442	T	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=819;SC=CCTCCCTGGCTCCACCCCACC;SOR=2.476;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=35;WE=42814939;WS=42814921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	42815190	rs1883790	G	A	6654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=128;PP=2965;SC=TGGGCCAGGTGTAGACACCTG;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=81;TCR=128;TR=209;WE=42815198;WS=42815180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr20	42825929	rs8268	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=963;ReadPosRankSum=-0.067;SC=AAAAGGAATACACTTCCATAT;SOR=0.634;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=58;WE=42825937;WS=42825919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,61:0.43:141
chr20	42826350	rs9346	A	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CTGAGTTCTCACTGCTCCTCG;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=28;WE=42826358;WS=42826340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr20	42826379	rs11274	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=0.416;SC=TCCTTGTAGACCTAAAGAGGA;SOR=1.402;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=19;WE=42826387;WS=42826369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr20	42939750	rs6073401	T	C	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=60;PP=2321;SC=GCACCAGCGTTCCCCGCAACA;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=42939758;WS=42939740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr20	43034660	rs736824	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-2.000;SC=TGACATTCTGTTCTTCCTGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=43034668;WS=43034650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr20	43034693	rs745975	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TCTCTCCTGGCGCAGACACGT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=7;WE=43034701;WS=43034683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr20	43036691	rs8122476	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GAGCACAACATTTATTAAGGT;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=7;WE=43036699;WS=43036681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr20	43052570	rs2273618	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CCTTGTGTGATACAAGTCAGG;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=43052578;WS=43052560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr20	43058018	rs3746574	T	C	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=143;SC=GATTATCTGGTTTAATTAATT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=43058026;WS=43058008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	43058096	rs3746575	C	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=288;ReadPosRankSum=0.509;SC=CTTTCCCGGGCCTCTTCATTT;SOR=0.306;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=23;WE=43058104;WS=43058086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr20	43254490	rs244074	A	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=351;SC=CCAGGCCCTAACATGTCCCTC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=43254498;WS=43254480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	43264927	rs394105	C	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=22;PP=803;SC=CATGCAGTTCCACCTGCAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=43264935;WS=43264917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	43343897	.	TGTGTGAGC	T	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=4;PP=174;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGAGCGC;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=43343916;WS=43343887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	43343908	rs1980803	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=11;NR=4;PP=293;SC=GTGTGAGCGCGCGCGCGCGCG;SOR=0.859;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=15;WE=43343916;WS=43343887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	43343930	rs1980804	T	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=22;NR=7;PP=453;SC=GCGTGTGTACTCGTGCGTGTG;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=43343938;WS=43343920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	43534934	rs2425675	G	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=699;SC=ATTTTAAACTGTCGAGTGAGA;SOR=1.244;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=29;WE=43534942;WS=43534924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	43538733	rs2072727	T	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=6;PP=1364;SC=AGCGCGGGGCTGCTGGGTGAC;SOR=3.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=57;WE=43538741;WS=43538723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr20	43547677	rs2075960	T	G	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=74;PP=2965;SC=GGACCTCTTCTCCCAGTTTGG;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=165;WE=43547685;WS=43547667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr20	43559043	rs3746580	G	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=944;SC=GGGAGGCAGCGCAGCCCCAGG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=43559051;WS=43559033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr20	43565804	rs6094057	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=104;SC=GCATCTGTGCGTTTGGTAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=43565812;WS=43565794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr20	43567442	rs6073572	T	C	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=959;ReadPosRankSum=1.048;SC=TGTAAGGAAATAGGCAGGGAC;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=61;WE=43567450;WS=43567432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,70:0.56:125
chr20	43577620	rs2234206	C	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=0.441;SC=CTACAATCCTCTCTCCCAGAG;SOR=0.385;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=14;WE=43577628;WS=43577610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr20	43577644	rs1884440	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.965;SC=TCCTCCCCTGCTGTAAATCAT;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=11;WE=43577652;WS=43577634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr20	43588802	rs2234200	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=406;ReadPosRankSum=-2.763;SC=TGGTTGCGGGAGTTGGAGGAG;SOR=1.085;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=22;WE=43588810;WS=43588792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr20	43600673	rs6130717	C	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	43623658	rs6017460	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTCTTTTTTTCTCTGTAGACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=43623666;WS=43623648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	43625565	rs67595276	CTTGA	C	2436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.214;NF=8;NR=22;PP=1502;ReadPosRankSum=2.702;SC=AATAAAAAAGCTTGATTGATG;SOR=0.203;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=30;WE=43625576;WS=43625555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr20	43681951	rs2284275	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TAAATGCCTGCGGTTTTTGAC;SOR=0.836;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=18;WE=43681959;WS=43681941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr20	43739056	.	G	A	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1026;ReadPosRankSum=0.398;SC=GCAGGATCCCGGCAATCCCGC;SOR=0.500;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=82;TCR=39;TR=68;WE=43739064;WS=43739046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr20	43803725	rs1983649	T	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=401;SC=AGGGAGCACTTCTGAAGCAGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=43803733;WS=43803715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	43964407	rs2072791	G	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=278;SC=CGCCTGCCCAGCACACCTTCC;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=43964415;WS=43964397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	43976875	.	G	GC	1039.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.349;NF=26;NR=8;PP=711;ReadPosRankSum=0.623;SC=CCCCCGATCTGCCCCCCCCCA;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=34;WE=43976883;WS=43976865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr20	43995410	rs6032142	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.257;SC=ACACTTATCTCGTCACTTCTG;SOR=0.242;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=43995418;WS=43995400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr20	44002665	rs2231626	C	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=649;ReadPosRankSum=0.167;SC=CCAGCAGAAACCTCGGTGTTA;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=40;WE=44002673;WS=44002655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr20	44004155	rs10546815	CATT	C	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.113;NF=0;NR=11;PP=399;ReadPosRankSum=1.189;SC=TGGAACTCTTCATTATTTTGT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=44004165;WS=44004145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr20	44006078	rs2231614	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AGCCAAGGGCCGGCCTGCTGG;SOR=1.201;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=17;WE=44006086;WS=44006068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr20	44038574	rs1127497	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=677;ReadPosRankSum=-0.289;SC=CTGGGCAGGGATGGACAACCA;SOR=0.547;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=36;WE=44038582;WS=44038564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr20	44049916	rs3092450	T	TC	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5568;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=302;ReadPosRankSum=-1.573;SC=GCAGGGCTGTTCCCCATCTAC;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=44049924;WS=44049906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr20	44052992	rs13217	G	A	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=44;PP=1539;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CCGAGTACACGCCAGATCCTA;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=211;TCF=127;TCR=84;TR=108;WE=44053000;WS=44052982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,120:0.49:247
chr20	44053069	rs2741566	T	C	3038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=64;PP=1956;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GACCTACCCTTTCTGCTGCTT;SOR=0.728;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=241;TCF=112;TCR=129;TR=121;WE=44053077;WS=44053059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,139:0.49:286
chr20	44054349	rs707577	T	C	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=75;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CCGTGTGCTATGGCTCCTTCT;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=212;TCF=89;TCR=123;TR=132;WE=44054357;WS=44054339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,157:0.62:254
chr20	44141201	rs11470736	TCACACA	T	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-1.026;NF=9;NR=2;PP=657;ReadPosRankSum=0.884;SC=AACCTCTTGTTCACACACACA;SOR=0.320;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=11;WE=44141214;WS=44141191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr20	44141331	rs6032259	A	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1077;ReadPosRankSum=-1.548;SC=TTCTTTCCTCAAAAAGTTGTT;SOR=0.830;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=70;WE=44141339;WS=44141321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,83:0.43:191
chr20	44144118	rs8125061	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.660;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=0.561;SC=CCCACCACCCCGCCCCCCAGC;SOR=1.404;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=29;WE=44144126;WS=44144108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
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chr20	44170712	rs11594	C	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=12;PP=1155;SC=CTGGAGCATCCGTCAGGTACA;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=44170720;WS=44170702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr20	44180813	rs17348421	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=914;ReadPosRankSum=0.509;SC=GACTTTATGGGGTAAAAGAAA;SOR=1.091;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=54;WE=44180821;WS=44180803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,64:0.39:163
chr20	44180868	rs17433181	A	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=521;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GACAAATTTGAGGAATCTTGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=28;WE=44180876;WS=44180858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr20	44181980	rs3817886	C	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=538;ReadPosRankSum=1.147;SC=TTCAAAGAGCCTTTCCTTCTC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=32;WE=44181988;WS=44181970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr20	44182081	rs6032299	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCATCATATCATGGGATATGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=44182089;WS=44182071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr20	44184375	rs2250860	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=39;ReadPosRankSum=1.219;SC=GGCATCCTCATTTAAGAAGTT;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=6;WE=44184383;WS=44184365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr20	44190705	rs3817887	T	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=944;ReadPosRankSum=-0.670;SC=TCATCCCCAATAATGCTTTCT;SOR=0.823;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=68;TCR=45;TR=58;WE=44190713;WS=44190695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,70:0.49:142
chr20	44190996	rs2272956	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr20	44208011	rs7273669	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GCCAGTCTGCCCCTCTAGCCC;SOR=0.172;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=44208019;WS=44208001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr20	44238741	rs2245898	T	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=225;ReadPosRankSum=1.196;SC=GGGATCTTTGTTCCAGAAGCT;SOR=0.395;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=15;WE=44238749;WS=44238731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr20	44259490	rs1487323	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=914;ReadPosRankSum=0.543;SC=TTTATTTACCGTTCTATTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=56;WE=44259498;WS=44259480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr20	44259673	rs1487322	G	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=394;ReadPosRankSum=-0.202;SC=AGAGTGGGCTGGGATGTGCAT;SOR=0.803;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=30;WE=44259681;WS=44259663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr20	44314609	rs232729	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=516;ReadPosRankSum=-0.165;SC=AACCAGGACAAGCAGCAGAGT;SOR=1.211;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=34;WE=44314617;WS=44314599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,34:0.35:97
chr20	44331043	rs6032445	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.697;SC=ATCTGGGCCTCAGGTTTTTAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=44331051;WS=44331033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr20	44333052	rs980984	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCTGTTGGTGAGGCCCTTCTC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=44333060;WS=44333042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr20	44334394	rs232291	A	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGCAAGAGAAATGAGCTTCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=44334402;WS=44334384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr20	44334588	rs232290	C	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=911;ReadPosRankSum=-0.737;SC=GATTTGGTCTCGCCTTCCTCA;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=64;WE=44334596;WS=44334578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,83:0.43:195
chr20	44350931	rs232262	C	G	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1282;ReadPosRankSum=0.034;SC=TAGGTGAGCTCAACCGTCTCA;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=66;WE=44350939;WS=44350921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr20	44352620	rs6017667	G	A	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1499;ReadPosRankSum=0.950;SC=TGTCTTCTCCGGCTGTAATGG;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=90;WE=44352628;WS=44352610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,102:0.45:225
chr20	44352740	rs1487317	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.311;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=886;ReadPosRankSum=0.657;SC=GGTAGTAAAAGAAGAGGTTTT;SOR=1.473;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=108;TCF=29;TCR=79;TR=49;WE=44352748;WS=44352730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr20	44354087	rs6032473	G	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=776;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CACATACTAAGCAATGATTAA;SOR=0.882;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=40;WE=44354095;WS=44354077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
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chr20	44354387	rs232259	A	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=0.399;SC=AAGCTTCCATATGTTTGCTAT;SOR=0.428;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=17;WE=44354395;WS=44354377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
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chr20	44420637	rs2664539	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=1.601;SC=TGGGGGCCGGGGGCGCCATGG;SOR=0.883;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=32;WE=44420645;WS=44420627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
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chr20	44422373	rs6032544	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.309;SC=ATGCACTTCATAGAGTTATTA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=44422381;WS=44422363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr20	44422705	rs6032545	G	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=305;ReadPosRankSum=-0.959;SC=CTCATGAGGAGCCCAGTCCTT;SOR=0.387;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=15;WE=44422713;WS=44422695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr20	44423843	rs6104350	C	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=1.635;SC=GAATCTAAATCTGGCTGATCC;SOR=3.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=44423851;WS=44423840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr20	44441322	rs189025920	C	T	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=713;ReadPosRankSum=-1.755;SC=GTCTCTCTGCCAACGCCGCCC;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=49;WE=44441330;WS=44441312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr20	44451901	rs8860	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=328;ReadPosRankSum=0.771;SC=CCACAAGGGGTCGCGCCTCCC;SOR=0.307;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=20;WE=44451909;WS=44451891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr20	44452697	rs4629	C	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.509;SC=TCTCCTCGTCCGTCACGTGCT;SOR=0.826;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=72;TCR=78;TR=62;WE=44452705;WS=44452687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,82:0.42:193
chr20	44452896	rs41305819	A	G	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=571;ReadPosRankSum=0.466;SC=TCTGACTGCTAAGCCCCTCCC;SOR=1.007;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=29;WE=44452904;WS=44452886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr20	44453335	rs144529565	A	AC	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
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chr20	44468982	rs11418101	A	AC	1074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.644;NF=13;NR=9;PP=750;ReadPosRankSum=-0.913;SC=AGAAGAACTAATGCTCTATGG;SOR=1.265;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=22;WE=44468990;WS=44468972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr20	44469290	rs4638862	G	A	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1162;ReadPosRankSum=0.601;SC=CTACACCCTCGCCGTGATCGG;SOR=0.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=173;TCF=101;TCR=72;TR=82;WE=44469298;WS=44469280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
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chr20	44472163	rs55931834	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=894;ReadPosRankSum=0.265;SC=GCCCCACACTCACCGGCCCAG;SOR=0.787;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=61;WE=44472171;WS=44472153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr20	44501458	rs6130959	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CACTGTGCACACAATAGGTAC;SOR=0.402;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=18;WE=44501466;WS=44501448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr20	44505973	rs2903808	T	C	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1318;ReadPosRankSum=0.731;SC=GCGGAGACAGTCACCTCTGTG;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=77;WE=44505981;WS=44505963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
chr20	44506418	rs1045493	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=694;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GCCTCTTTCGGGAACAGCAGT;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=43;WE=44506426;WS=44506408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
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chr20	44516444	rs7268221	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=0.942;SC=TCTTGCCCTAACCTTGAACGA;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=44516452;WS=44516434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
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chr20	44518843	rs3817731	A	T	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=15;PP=1011;ReadPosRankSum=-3.099;SC=AGTAGATTCCAGTCCCCACAC;SOR=0.996;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=122;TCF=86;TCR=36;TR=59;WE=44518851;WS=44518833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr20	44519643	rs2868362	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=0.581;SC=CTCGGCCATAGGGCAGGCCAG;SOR=0.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=22;WE=44519651;WS=44519633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr20	44520237	rs3080212	CCTG	C	1061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.212;NF=21;NR=9;PP=1300;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CGCCGCTGTTCCTGCTGCTGC;SOR=1.649;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=30;WE=44520247;WS=44520227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,49:0.41:119
chr20	44522005	rs742034	A	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=857;ReadPosRankSum=0.135;SC=ACATGATCTCAGGTCTGTCCT;SOR=0.824;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=53;WE=44522013;WS=44521995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr20	44522594	rs4810476	A	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=668;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TCCCACCAGCAGCTGATGCGC;SOR=1.292;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=42;WE=44522602;WS=44522584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr20	44523248	rs2075962	T	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=929;ReadPosRankSum=-1.510;SC=GTGGAGAGGCTGGGGATCTGT;SOR=0.471;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=135;TCF=94;TCR=41;TR=63;WE=44523256;WS=44523238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
chr20	44523442	rs3215446	TC	T	2877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.881;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.337;NF=16;NR=51;PP=2084;ReadPosRankSum=-0.946;SC=CCACACCCATTCCCCCACCTC;SOR=0.446;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=133;TCF=27;TCR=106;TR=67;WE=44523450;WS=44523432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr20	44523547	rs2075961	G	A	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.091;NF=34;NR=29;PP=1008;ReadPosRankSum=1.408;SC=TCAGGTGTGCGAGGGCGTGGG;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=63;WE=44523555;WS=44523537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr20	44523782	rs4608591	C	T	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=54;PP=1283;ReadPosRankSum=-1.312;SC=AGTGAGGTTCCGTGGCCACCT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=59;TCR=105;TR=82;WE=44523790;WS=44523772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,95:0.48:197
chr20	44525464	rs11468785	GC	G	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.921;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.638;NF=4;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.326;SC=TAGAGAGGTGGCCCCCCCCCA;SOR=0.307;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=11;WE=44525481;WS=44525454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr20	44526619	rs77361881	G	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=980;ReadPosRankSum=-1.513;SC=GCTGCTGTAGGCTGATGTCTT;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=63;WE=44526627;WS=44526609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr20	44526783	rs7270170	G	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=620;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TAACTGGGCCGGAGGCAAAGG;SOR=0.475;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=36;WE=44526791;WS=44526773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr20	44530838	rs553359	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=1.267;SC=TACTTTAAGCGCAACATCCCT;SOR=1.688;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=44530846;WS=44530828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr20	44538427	rs378114	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=11;PP=392;SC=CTACCAAACCTTCCTATCAAC;SOR=1.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=44538435;WS=44538417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	44538484	rs435306	G	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=408;SC=ATGAAGAAACGGAAACTCAGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=44538492;WS=44538474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	44540178	rs394643	A	G	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=65;PP=2286;SC=CATAAGTGGGAACTAGCCTGG;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=44540186;WS=44540168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	44574533	rs11696196	C	T	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GTAAGAGCTGCGGGGAGGAAG;SOR=0.885;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=85;WE=44574541;WS=44574523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr20	44578776	rs6065910	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;ReadPosRankSum=1.357;SC=CTGCTACTGTACCCAGTGGTG;SOR=1.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=15;WE=44578784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr20	44586036	rs3746506	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=1.465;SC=GATACCCTGCGGCCTCCGTGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=44586044;WS=44586030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr20	44588109	rs3746507	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=0.647;SC=AAGTCTGCCCGTCCCTAGCCT;SOR=0.425;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=33;WE=44588117;WS=44588099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr20	44596207	rs6032606	C	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=663;ReadPosRankSum=-1.817;SC=TTCCTCTTGGCTCTTGGTGGA;SOR=0.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=45;WE=44596215;WS=44596197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,51:0.39:130
chr20	44596545	rs3848719	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=1.325;SC=GCACCGGGGAGCTGGGCCCAC;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=39;WE=44596553;WS=44596535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,47:0.41:114
chr20	44599839	rs6017715	G	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=269;ReadPosRankSum=1.070;SC=CCGTCCAGCCGGGTCCATACC;SOR=0.576;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=24;WE=44599847;WS=44599829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr20	44639511	rs3918253	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=907;ReadPosRankSum=-0.952;SC=AGCGCACAATCTGCGCAGCAG;SOR=0.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=54;WE=44639519;WS=44639501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,73:0.44:166
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chr20	44642833	rs13969	A	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=259;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TGGGCCTGGGAGCCGACGTGG;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=20;WE=44642841;WS=44642823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr20	44645010	rs20544	C	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=47;PP=1153;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGGACTAGGGCTCCCGTCCTG;SOR=1.164;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=72;WE=44645018;WS=44645000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr20	44663475	rs11699481	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-0.918;SC=AGCCCCATTTTCCCAATGCGC;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=44663483;WS=44663465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr20	44674743	rs2297199	A	C	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=39;PP=1543;SC=CAACCCCAGGAAGTTCCCCAT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=44674751;WS=44674733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	44675136	rs3848727	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=352;SC=CCAATCCTCATCTTACTCCAG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=44675144;WS=44675126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	44678348	rs6032635	G	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=25;PP=1440;SC=AGCTGAAGGCGGGGAAGGGCC;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=44678356;WS=44678338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	44681510	rs55947855	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=247;ReadPosRankSum=0.587;SC=AGTGCTGGCTGCCAGGAGCCC;SOR=0.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=17;WE=44681518;WS=44681500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr20	44693897	rs17450969	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=382;ReadPosRankSum=0.470;SC=CCAGGTGAGCGACCAACTCCA;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=25;WE=44693905;WS=44693887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr20	44746982	rs1883832	T	C	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1345;SC=CTCACCTCGCTATGGTTCGTC;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=44746990;WS=44746972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	44747086	rs745307	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.548;SOR=1.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr20	44757213	rs3765457	A	G	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1366;ReadPosRankSum=0.249;SC=AGAGCCTAACACTGGCTGTTC;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=90;TCR=97;TR=91;WE=44757221;WS=44757203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,108:0.47:228
chr20	44757407	rs3765459	G	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=832;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GCACTGACCCGCCGTCTGGGA;SOR=0.643;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=62;WE=44757415;WS=44757397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr20	44806875	rs2281335	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=695;ReadPosRankSum=1.000;SC=ACTTGGGGCCGGGGGTCAGCA;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=49;WE=44806883;WS=44806865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr20	44845440	rs202149090	C	T	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=37;PP=1471;ReadPosRankSum=1.293;SC=ACAGACGCGCCTTCCTCTGGG;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=193;TCF=114;TCR=79;TR=94;WE=44845448;WS=44845430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,117:0.50:233
chr20	44979641	rs4810503	TA	GC	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=1344;SC=ATCAAGATCTTACTGAAATCC;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=26;WE=44979650;WS=44979631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	44985307	rs911435	T	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=45;PP=1382;SC=ACAGGACAGCTTGGGAGGTCC;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=44985315;WS=44985297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	44987318	rs1044369	C	G	2920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=65;PP=1799;ReadPosRankSum=1.647;SC=GAGCCCCAGGCAGAGTCCTCA;SOR=0.541;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=218;TCF=87;TCR=131;TR=111;WE=44987326;WS=44987308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,132:0.54:245
chr20	44996182	rs2257495	A	G	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=53;PP=1827;SC=CACTGAGGCCATCAATCCAGA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=107;WE=44996190;WS=44996172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	44998791	rs2261964	C	T	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=27;PP=1667;SC=CAATGTTATACACTATACGAT;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=83;WE=44998799;WS=44998781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr20	45003326	rs2261213	A	G	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=34;PP=954;SC=GTCTCCGTGTATGCAGGGACC;SOR=2.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=44;WE=45003334;WS=45003316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	45003788	rs2257545	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=263;SC=CACCATGGGGTTGGTTGTCAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=45003796;WS=45003778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	45188971	rs910062	C	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=597;SC=GGACACAGACCCAGGTCGGTA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=45188979;WS=45188961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	45192249	.	A	AAGAGAGAG	785	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=2;NR=8;PP=785;QD=82.0;SC=CGACCACAGCAAGAGGGAGAG;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=45192262;WS=45192239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,10:0.43:23
chr20	45192253	rs59207395	G	GA	1067.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;QD=41.07;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	45192254	.	G	A	572	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=59.22;NF=6;NR=19;PP=572;QD=24.2708485019;SC=ACAGCAAGAGGGAGAGAGAGA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=25;WE=45192262;WS=45192239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr20	45192254	rs35374760	G	GAGAGAGA	1067.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;QD=41.07;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	45204266	rs1880898	G	A	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=42;PP=1897;SC=TGATGTTCCAGGGCACTGTCT;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=45204274;WS=45204256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr20	45318042	rs2664523	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=895;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TAGTAGCTCTGGCCGCCGCCA;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=60;WE=45318050;WS=45318032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,67:0.47:142
chr20	45318069	rs2664574	C	G	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=944;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CTCGGCGCAACAGCTCCAACC;SOR=0.746;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=55;WE=45318077;WS=45318059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,63:0.45:141
chr20	45629941	rs3746492	G	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=967;SC=AGCATCTGTGGTGGAGAAAGC;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=45629949;WS=45629931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	45630157	rs6094549	T	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=48;PP=1338;SC=CCACCTTTTCTTCTTTCTTGG;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=45630165;WS=45630147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	45717943	rs36002838	C	T	3703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=78;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CAGGCCGCACCGGGCCTCCGA;SOR=0.523;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=279;TCF=125;TCR=154;TR=149;WE=45717951;WS=45717922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,178:0.51:350
chr20	45725959	rs947018	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=402;ReadPosRankSum=-0.655;SC=AATTCCTATGACATTTTCCTT;SOR=0.154;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=21;WE=45725967;WS=45725949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr20	45795618	rs192179398	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=456;ReadPosRankSum=0.446;SC=ATGTCACTCCGCCAGCATCAT;SOR=0.672;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=30;WE=45795626;WS=45795608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr20	45795744	rs3091782	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=279;ReadPosRankSum=-2.554;SC=GCATCCCTTATGACTCTTGGC;SOR=0.648;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=24;WE=45795752;WS=45795734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr20	45797883	rs3091653	C	T	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CATTGATTGACTGATTGATTA;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=71;TCR=83;TR=81;WE=45797891;WS=45797873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,99:0.57:174
chr20	45797954	rs3091593	T	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=739;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AAGGACAAGGTGTGCCTGCCT;SOR=0.724;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=37;WE=45797962;WS=45797944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr20	45798014	rs3091985	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=0.273;SC=TCACAACTAGCCGGGTGTGGT;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=15;WE=45798022;WS=45798004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr20	45801319	rs3827049	T	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TGCACCCCCCTGCACTAACAC;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=45801327;WS=45801309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr20	45809652	rs2235907	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr20	45811860	rs8124918	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=1.080;SC=TGCAGGCACCAAGCTCTTAAT;SOR=0.116;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=24;WE=45811868;WS=45811850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr20	45816594	rs3818012	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=-0.405;SC=AAGTCCCCACGTGCTAGACTT;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=45816602;WS=45816584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr20	45816639	rs3818013	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.02;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr20	45816649	rs3818014	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr20	45853037	rs2664544	A	G	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=77;PP=2965;SC=CACAGTAGCTAGTGTTCCAAC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=159;WE=45853045;WS=45853027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr20	45856045	rs1124178	A	G	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=791;SC=GAGAGTGAGCATCTTCAAAAG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=45856053;WS=45856035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	45891189	rs2294560	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=383;ReadPosRankSum=0.230;SC=AAGTATGGCATTGTTAAAAGA;SOR=0.408;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=24;WE=45891197;WS=45891179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr20	45905651	rs3746485	T	C	154.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-0.180;QD=22.01;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr20	45923383	rs2076402	G	T	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1250;ReadPosRankSum=0.431;SC=TCATTTACGCGTATACCAAGA;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=115;TCR=61;TR=78;WE=45923391;WS=45923373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,98:0.46:211
chr20	45923539	rs6066270	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=893;ReadPosRankSum=-1.904;SC=AAGTCAAAGTCATACATAAAC;SOR=0.604;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=28;TCR=85;TR=55;WE=45923547;WS=45923529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr20	46267950	rs4810648	C	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=72;PP=2155;SC=AGTATGGGTACGTTATTTCTA;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=27;TCR=72;TR=99;WE=46267958;WS=46267940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	46279814	.	TGCAGCAGCA	T	1662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.686;NF=5;NR=25;PP=2924;ReadPosRankSum=0.680;SC=GCTATGATGATGCAGCAGCAG;SOR=0.722;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=80;TCF=15;TCR=65;TR=30;WE=46279846;WS=46279804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
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chr20	46288433	rs41302563	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.011;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=576;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AATAATAAAACGAAATACCTG;SOR=0.918;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=29;WE=46288441;WS=46288423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
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chr20	47244598	rs6095217	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=-2.046;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr20	47246181	rs11699725	A	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=493;ReadPosRankSum=-0.332;SC=ACCACACATAACCGGGGAGTT;SOR=0.969;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=36;WE=47246189;WS=47246171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr20	47247161	rs3827041	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=662;ReadPosRankSum=0.636;SC=GGGCTTTGGGGCTAGAATCTG;SOR=0.327;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=45;WE=47247169;WS=47247151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr20	47247396	rs3810534	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCCCCTACCCAGGTCTCAACT;SOR=0.996;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=25;WE=47247404;WS=47247386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr20	47248808	rs4616535	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=581;ReadPosRankSum=1.406;SC=GGACCCCAGGCGGATACCTGA;SOR=0.540;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=41;WE=47248816;WS=47248798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
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chr20	47249170	rs4487146	G	A	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=817;ReadPosRankSum=0.885;SC=GGTAGAAGACGTTGGTGTCTG;SOR=0.850;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=59;WE=47249178;WS=47249160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,69:0.38:181
chr20	47249189	rs4413212	T	C	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=1755;ReadPosRankSum=1.311;SC=TGCGGAAGGATATGGGGCAGG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=48;WE=47249208;WS=47249179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,55:0.38:143
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chr20	47260936	rs6019344	A	G	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1595;ReadPosRankSum=0.320;SC=GGCCGCTGCCACTCCACTCAC;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=205;TCF=113;TCR=92;TR=109;WE=47260944;WS=47260926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,126:0.54:234
chr20	47261017	rs6066802	T	C	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1660;ReadPosRankSum=-0.877;SC=GGACCGAGTCTCGATTGCTGT;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=182;TCF=76;TCR=106;TR=95;WE=47261025;WS=47261007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,114:0.52:219
chr20	47262322	rs6066804	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=207;ReadPosRankSum=-0.770;SC=ATGTTGCCACGGGTCCGTGGC;SOR=0.084;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=47262330;WS=47262312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
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chr20	47273037	rs723291	C	T	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.372;NF=19;NR=29;PP=799;ReadPosRankSum=0.543;SC=CATCAGCTTCCTTCTGCTCTT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=48;WE=47273045;WS=47273027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
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chr20	47292823	rs6125428	C	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=393;ReadPosRankSum=0.245;SC=AGAAGGTGAGCGCACAGTGAG;SOR=0.627;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=22;WE=47292831;WS=47292813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr20	47296365	rs3817991	G	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=-0.878;SC=CCCAGCATTGGCCTTCACTGC;SOR=1.201;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=16;WE=47296373;WS=47296355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
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chr20	47361519	rs3746816	T	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=729;SC=AAGCCCACTTTTCAAAAACTA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=47361527;WS=47361509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	47361725	rs8123336	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GTTAAGGCTCAGAGGGAGAGC;SOR=1.243;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=24;WE=47361733;WS=47361715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr20	47538333	rs2273101	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=0.350;SC=CGGACGCGGCCGGTGCCGGCC;SOR=1.306;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=17;WE=47538341;WS=47538323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr20	47580347	rs2295031	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=767;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TGTGTTTTGTATATTTGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=48;WE=47580355;WS=47580337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr20	47610896	rs2295033	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=335;ReadPosRankSum=0.950;SC=CTCCATTGAACCAACTTTTTT;SOR=0.459;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=24;WE=47610904;WS=47610886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr20	47626736	rs2295579	A	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=0.624;SC=TCTCCAAAGTACAGACGATAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=47626744;WS=47626726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr20	47626847	rs2295580	T	C	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.415;SC=TCCGCTCAGGTTGGAAGAACA;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=63;WE=47626855;WS=47626837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr20	47627095	rs6095395	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-1.337;SC=CTTGATGAGTATTAATCTTGA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=47627103;WS=47627085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr20	47628368	rs371203595	ATG	A	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=4.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.687;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,21:0.14:149
chr20	47628434	rs2273531	T	C	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.057;NF=88;NR=70;PP=2136;ReadPosRankSum=0.872;SC=CCTGGTCTTATGAAAAATGTG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=330;TCF=181;TCR=149;TR=158;WE=47628442;WS=47628424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,180:0.47:379
chr20	47639464	rs2426106	G	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=1.383;SC=CCAGCCTGGAGAACGTAGTGA;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=47639472;WS=47639454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	47639737	rs7270848	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=-0.334;SC=AGGAGGCCTCAGGAAGAGCAT;SOR=1.528;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=21;WE=47639745;WS=47639727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr20	47645002	rs73623293	G	GT	1379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TAGATTTCTAGTCATACACAG;SOR=1.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=35;WE=47645010;WS=47644992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr20	47675176	rs2064853	T	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.270;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr20	47685320	rs2227946	G	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=55;PP=1608;ReadPosRankSum=-2.713;SC=TTTCTTCCCTGATCCTGATCT;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=95;TCR=142;TR=92;WE=47685328;WS=47685310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,107:0.40:265
chr20	47689036	rs79186842	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=578;ReadPosRankSum=0.010;SC=TTCTCTCCCTATCTCCTCCAA;SOR=0.695;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=34;WE=47689044;WS=47689026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr20	47691211	rs2075676	C	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=748;ReadPosRankSum=0.907;SC=CTGATGGGAACGAATTCTTTG;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=46;WE=47691219;WS=47691201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr20	47701765	rs1885163	T	C	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=897;ReadPosRankSum=-1.020;SC=AAGGGTAATCTGCAGTGACAA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=108;TCR=82;TR=76;WE=47701773;WS=47701755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,88:0.39:228
chr20	47705763	rs3092348	GTT	G	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr20	47739814	rs2295714	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=-1.393;SC=TGTTATTCACCGCATGAACTT;SOR=1.125;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=34;WE=47739822;WS=47739804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
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chr20	47841660	rs11553387	G	T	3656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=87;PP=2489;ReadPosRankSum=0.632;SC=GAAGCAGGAGGATTTTTTGAA;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=299;TCF=130;TCR=169;TR=149;WE=47841668;WS=47841650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,164:0.49:336
chr20	47842853	rs238162	C	T	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=354;SC=GTTTGTGGAACGAATGATTGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=47842861;WS=47842843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	47843146	rs6067024	A	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=0.041;SC=GACTTACCAAAGGCTGGTTTG;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=22;WE=47843154;WS=47843136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr20	47845220	rs238165	T	A	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=23;PP=970;SC=CTAAACTTCTTCTCATTGCTT;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=47845228;WS=47845210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	47846586	rs171130	T	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=245;SC=AGTGCGTTTCTGGGAAACCCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=47846594;WS=47846576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	47850182	rs238148	C	T	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=70;PP=2510;SC=TGGCTCCCTTCCTGCGGCAGG;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=115;WE=47850190;WS=47850172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr20	47852822	rs238152	G	A	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=91;PP=2965;SC=TTGCCTCTTCGCACCCCCCTT;SOR=0.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=170;WE=47852830;WS=47852812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr20	47856037	rs238156	T	G	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=188;SC=GGTGTGGGGGTTGCATTAGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=47856045;WS=47856027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	47858290	rs35759030	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=143;ReadPosRankSum=-2.622;SC=ACAGGCACGAGCTACTGCACT;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=47858298;WS=47858280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	47859015	rs238204	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=2;PP=1412;SC=ACAGAATGAAAATAGTCTTTG;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=47859023;WS=47859005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	47859217	rs1130146	G	A	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.167;NF=40;NR=77;PP=1935;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GTATCGAGCTGGGTAGGATTT;SOR=0.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=71;TCR=141;TR=117;WE=47859225;WS=47859207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,135:0.54:250
chr20	47859254	rs71186444	CTTTTTTTTTTTTTT	C	5397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=22;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=56;PP=3000;SC=CCTTGGTATTCTTTTTTTTTT;SOR=2.929;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=6;TCR=71;TR=59;WE=47859275;WS=47859244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	47863282	rs8123912	G	C	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=975;ReadPosRankSum=-1.973;SC=GAAGGGGTGAGATTTGTTAAC;SOR=1.159;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=53;WE=47863290;WS=47863272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr20	47863409	rs144647523	ATT	A	3060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=55;PP=860;SC=AAAAAGAATGATTTTTTTTTT;SOR=1.809;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=56;WE=47863418;WS=47863399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr20	47865372	rs238208	G	A	6315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=95;PP=2965;SC=TCTGAACACAGCTGCACACAG;SOR=0.794;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=204;WE=47865380;WS=47865362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr20	47865509	rs238209	G	A	6942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=111;PP=2965;SC=CCGAGGAATGGTTTTGGGCAC;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=211;WE=47865517;WS=47865499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr20	47865784	rs6512577	C	T	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.333;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=853;ReadPosRankSum=0.587;SC=AGAGCCGGAGCATGGGGCCTA;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=54;WE=47865792;WS=47865774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr20	47866411	rs6063378	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GTTAGTCATTGTGTGCTTCAT;SOR=0.765;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=10;WE=47866419;WS=47866401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr20	47871197	rs56335217	G	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=0.400;SC=CTGGAGAATGGGAAGAACCAA;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=47871205;WS=47871187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr20	47872327	rs238220	A	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=41;PP=1881;SC=TGGGTTGGCTAGATGTGGAAC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=47872335;WS=47872317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr20	47872377	rs238221	C	G	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=50;PP=1841;SC=TGAGGTCCAGCTGCCAAACAT;SOR=0.820;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=93;WE=47872385;WS=47872367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr20	47874005	rs3021	A	G	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=806;ReadPosRankSum=0.909;SC=CAGTGCCACAATGGTCTAGCC;SOR=0.499;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=51;WE=47874013;WS=47873995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr20	47874239	rs11295162	CT	C	63.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-0.712;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.366;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr20	47874278	.	GC	G	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=56.46;NF=0;NR=3;PP=50;QD=33.0102999566;SC=TCGCTCTTTTGCCCAGGGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=47874286;WS=47874268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr20	47882893	rs238178	T	A	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.43;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	47886684	rs57950	G	A	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=36;PP=1810;SC=GGGTAAAGTCGTATCTGCCCC;SOR=0.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=86;WE=47886692;WS=47886674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	47892270	rs238191	T	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=11;PP=888;SC=ATTTCCTTCTTTTATTACTAG;SOR=1.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=47892278;WS=47892260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	47897106	rs1133114	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=-0.347;SC=CATATAAAATTGGTAAGTGGT;SOR=0.269;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=17;WE=47897114;WS=47897096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr20	47942174	.	C	CTGTTGTGAGGATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACGGGGTTATTAGATGGATGTTGTGAGAATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACGGGGTTATTAGATGGA	4708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.58;SOR=0.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:154,0:0:154
chr20	47942184	.	G	GATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACGGGGTTATTAGATGGATGTTGTGAGA	1134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=4.77;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,0:0:238
chr20	48184560	rs116939356	G	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=217;SC=TGGCGGGGCCGAGCGGAGCAG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=48184568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	48257149	rs421801	C	T	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=80;PP=2965;SC=CTTTCATTGCCTCTTGAAAGC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=153;WE=48257157;WS=48257139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr20	48259034	rs2235855	A	G	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=40;PP=2292;SC=GCAAACTGCAAGCGCTGGCGC;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=101;WE=48259042;WS=48259024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	48273299	rs4810968	T	C	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=62;PP=1840;SC=TAAAAAAACATACCACATAGC;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=83;WE=48273307;WS=48273289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	48300990	rs6019972	C	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.27;NF=20;NR=2;PP=604;SC=GTCCCAGCTGCTGGGGAGGCT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=48300998;WS=48300980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	48301146	rs6512586	G	A	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=72;PP=2541;SC=ACATATCAAGGACATAAGCAC;SOR=0.895;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=130;WE=48301154;WS=48301136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	48330030	rs12329570	G	C	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=12;PP=1464;SC=CTCCCGGCCGGGGCCCCTTAG;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=48330038;WS=48330020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	48429316	rs11281224	A	AGACGGAGG	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=413;SC=CGGGCCACTGAGACGGAGGGA;SOR=1.863;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=48429324;WS=48429306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	48429508	rs58677849	GG	CC	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.259;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=1708;ReadPosRankSum=-0.122;SC=TTTCCCGGGCGGCGGAGGCGG;SOR=1.125;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=44;WE=48429517;WS=48429498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr20	48456238	rs2025958	G	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=78;SC=ATATTATTATGTTATATATCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=48456246;WS=48456228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	48467560	rs532237	G	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TGAATCAAAAGTATCCTAAAG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=48467568;WS=48467550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	48479356	rs3092598	TATGA	T	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=598;SC=TGAATGATGGTATGAATGAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=48479367;WS=48479352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	48491207	rs56309244	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=984;ReadPosRankSum=-1.224;SC=GGGATCACACGGCAGTGCTTT;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=99;TCR=40;TR=56;WE=48491215;WS=48491197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,68:0.42:163
chr20	48491258	rs542234	T	G	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TGGCCATCCTTTTCTCAGGCA;SOR=0.893;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=97;WE=48491266;WS=48491248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,112:0.44:252
chr20	48503461	rs7270636	T	C	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1003;ReadPosRankSum=1.857;SC=GGCCACACTTTCTGGGGGTCC;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=67;WE=48503469;WS=48503451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr20	48503565	rs76161485	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=197;ReadPosRankSum=2.099;SC=CCAGGCCGCCGCCTCCCGATC;SOR=0.077;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=48503573;WS=48503555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	48522124	rs78700554	T	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TCGGTTGATGTAGCCCTTGGA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=19;WE=48522132;WS=48522114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr20	48522585	rs492702	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=719;ReadPosRankSum=-1.281;SC=TGGAGAGGGCGGACTCTTTGG;SOR=1.052;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=45;WE=48522593;WS=48522575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr20	48524827	rs2769982	A	G	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=852;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CCACCACCTCATAGAACTGGA;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=58;WE=48524835;WS=48524817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr20	48561893	rs4810993	A	G	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=11;PP=1051;SC=TCACTAACTTATGGGCTCTGA;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=48561901;WS=48561883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	48562083	rs11473738	G	GTTGGACACC	3518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=2900;SC=ATACAAAGAGGTTGCATGCCC;SOR=1.240;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=41;WE=48562091;WS=48562073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr20	48599480	rs6020172	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
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chr20	48599561	rs4647955	G	C	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.274;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=14;PP=2311;ReadPosRankSum=0.149;SC=CTGCGCTACTGCTGCGCGAAT;SOR=1.119;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=64;WE=48599569;WS=48599539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr20	48600557	rs4647959	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=460;ReadPosRankSum=0.077;SC=CCCTGTCAGATGAGGACAGTG;SOR=0.733;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=37;WE=48600565;WS=48600547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr20	48600631	rs4647958	T	C	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=1020;ReadPosRankSum=1.356;SC=TCTACTTCAGTCTCTTCCTTG;SOR=0.907;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=61;WE=48600639;WS=48600621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
chr20	48600809	rs1063210	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=743;ReadPosRankSum=-1.023;SC=GAAGCCACACGCTGCCCTGCG;SOR=0.539;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=45;WE=48600817;WS=48600799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr20	48600924	rs4647957	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=339;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CCGTTGCTCTCTCTGGCAGCT;SOR=1.292;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=19;WE=48600932;WS=48600914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr20	48700947	rs67366514	T	C	3599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=80;PP=2364;ReadPosRankSum=1.304;SC=AGTTCTATACTAGTTCCTACA;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=248;TCF=92;TCR=156;TR=132;WE=48700955;WS=48700937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,156:0.54:291
chr20	48713049	rs6012831	G	A	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=44;PP=2033;SC=GCATCAGAGGGGGTTCAAATA;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=48713057;WS=48713039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr20	48729677	rs126907	C	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=43;PP=1642;SC=TTGCGTCGCTCTTGCTTGAAG;SOR=1.203;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=48729685;WS=48729667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	48729711	rs761214	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=7;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=572;ReadPosRankSum=0.035;SC=TCACCCCCCCCTTACCCGTCC;SOR=0.990;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=34;WE=48729719;WS=48729701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr20	48747697	rs55894522	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCAAGACTCATGTGCTTGGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=48747705;WS=48747687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr20	48760238	rs10574784	CTT	C	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-0.508;QD=24.03;ReadPosRankSum=1.909;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr20	48770159	rs232733	T	C	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=51;PP=1470;SC=CCCGGCCAGTTCTCGGCGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=48770167;WS=48770149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	48808011	rs4253439	C	T	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=990;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GCCTGGGGGCCGCCAAGGGCG;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=64;WE=48808019;WS=48808001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,86:0.51:168
chr20	48894872	rs3761180	T	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=45;PP=926;ReadPosRankSum=0.599;SC=ATTAAAACTGTGGGCCAGCCC;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=69;WE=48894880;WS=48894862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr20	48894919	rs12625213	C	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=752;ReadPosRankSum=-1.237;SC=TAAGGGATCTCTGTTGCTTGG;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=46;WE=48894927;WS=48894909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr20	49181345	rs16995294	T	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=340;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AAAATCCCAGTCGCCCCATAC;SOR=0.641;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=20;WE=49181353;WS=49181335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr20	49191228	rs1885177	A	C	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1554;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TCAGGCGGCTACTGGTTCACA;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=92;TCR=104;TR=90;WE=49191236;WS=49191218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,105:0.42:250
chr20	49194866	rs3215684	A	AT	948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=1090;ReadPosRankSum=0.660;SC=TTAGAGGTAGAGAGTGGAAGG;SOR=3.072;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=29;WE=49194874;WS=49194856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr20	49210953	rs914458	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=223;ReadPosRankSum=1.107;SC=AGCTGAGAAAGCTCCTCCGTC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=49210961;WS=49210943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr20	49214156	rs6020624	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1104;ReadPosRankSum=0.534;SC=CAGCTCATCCAGGGCGAAGTC;SOR=0.485;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=150;TCF=93;TCR=57;TR=78;WE=49214164;WS=49214146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr20	49225953	rs73615305	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=702;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AGGGCCTCTAACCATCCCTGC;SOR=0.358;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=41;WE=49225961;WS=49225943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr20	49227294	rs4811083	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CTGATCCCTGTTTCGAGGGCA;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=14;WE=49227302;WS=49227284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
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chr20	49236478	rs6122953	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=508;ReadPosRankSum=1.483;SC=AGGAGGCGAGGTAGAGGAATG;SOR=0.361;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=35;WE=49236486;WS=49236468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
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chr20	49620783	rs1054268	G	T	6515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=93;PP=2965;SC=TGCCGCTCAGGATGCTGCTCA;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=106;TCR=93;TR=199;WE=49620791;WS=49620773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr20	49621149	rs6122993	T	C	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=52;PP=2317;ReadPosRankSum=0.677;SC=TGCGACGGCCTGCGGCGGCGC;SOR=0.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=133;WE=49621157;WS=49621139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr20	49621399	rs4811110	G	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=42;PP=1023;SC=AGGAAAGGAGGGCAGAAGCTC;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=49621407;WS=49621389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	49626971	rs6122994	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=1.199;SC=ATGCAGATTCCGCAGATATTC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=49626979;WS=49626961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr20	50008006	rs71192523	A	AG	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.193;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr20	50015107	.	TA	T	250	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=13;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=61.6;NF=11;NR=3;PP=250;QD=18.2142857143;SC=ATACTTTACTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=14;WE=50015128;WS=50015097;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,14:0.74:19
chr20	50071258	rs228840	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=0.179;SC=TCACTGTGATAAGGGGAGATG;SOR=0.703;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=20;WE=50071266;WS=50071248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr20	50092027	rs6013193	T	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=-1.879;SC=GCTCCAAGGGTATCTCCAGGA;SOR=0.361;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=16;WE=50092035;WS=50092017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr20	50092287	rs6021231	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=0.185;SC=TCATGGGCAGTAGAGAGACTA;SOR=0.760;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=50092295;WS=50092277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr20	50223975	rs2273090	G	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=411;ReadPosRankSum=0.149;SC=TTTCAGATTCGTTTCTTCTCT;SOR=1.495;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=23;WE=50223983;WS=50223965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr20	50224161	rs2273089	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.931;HP=7;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=-0.233;SC=GCCGGTTTCGCGGGGGGCTCA;SOR=1.287;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=20;WE=50224169;WS=50224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr20	50224206	rs3818004	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=-1.420;SC=TTATTCTCCCGCTAACGAGAT;SOR=2.147;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=50224214;WS=50224196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	50225206	rs3827032	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TGGCTGACGCGATAGGAGCTA;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=52;WE=50225214;WS=50225196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr20	50225235	rs6021312	G	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=680;ReadPosRankSum=-1.516;SC=GCCAGCCTCCGGCACCCAAGT;SOR=0.855;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=31;WE=50225243;WS=50225225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr20	50230462	rs2235863	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=938;ReadPosRankSum=1.220;SC=CATTGTAGGAAATCTTTGAAG;SOR=1.021;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=53;WE=50230470;WS=50230452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
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chr20	50241714	rs2235859	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=253;ReadPosRankSum=2.641;SC=CCCTTCCCTGCGGGCAGCCCG;SOR=0.385;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=13;WE=50241722;WS=50241704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr20	50243941	.	A	G	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=45;QD=19.9428031368;SC=AGAAGCGAGGAAATGGGCCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=50243949;WS=50243934;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr20	50244098	rs2426317	T	C	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=42;PP=1678;SC=GGGAGGCAGGTGGGGCTGCAA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=50244106;WS=50244088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	50245732	rs2426318	G	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGTTTTTTCAGTTGGCTGAAG;SOR=1.928;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=15;WE=50245740;WS=50245722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr20	50255762	rs2426333	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=248;SC=TATATTCCCTTGTTAGTCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=50255770;WS=50255752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	50255849	rs6063682	A	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=725;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TGGGGTACTTAAGCACTTTAA;SOR=1.174;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=39;WE=50255857;WS=50255839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr20	50256107	rs2426334	T	C	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=143;SC=CAGGCTGTGCTATGAACACAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=50256115;WS=50256097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr20	50287736	rs2255341	C	T	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CGGGGATTTTCGAGTCCCTTC;SOR=0.810;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=219;TCF=126;TCR=93;TR=102;WE=50287744;WS=50287726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,124:0.48:258
chr20	50287790	rs2255342	A	G	7642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=124;PP=2965;SC=CCAGGTTCACACGCAAACTAG;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=117;TCR=124;TR=241;WE=50287798;WS=50287780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr20	50287925	rs2255358	A	G	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=1260;SC=GCACACTGCCAGAGCTGAACG;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=50287933;WS=50287915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	50290654	rs6091346	T	C	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=40;PP=2290;SC=GAGAAGAAGATGTCACGGCAG;SOR=1.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=117;WE=50290662;WS=50290644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	50305755	rs6067898	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr20	50305761	rs6067899	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.000;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr20	50307502	rs4811222	G	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=436;ReadPosRankSum=0.252;SC=GGAAAGAAGAGGAAAGTCCTC;SOR=1.172;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=27;WE=50307510;WS=50307492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr20	50310466	rs6021389	T	C	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.071;NF=35;NR=28;PP=724;ReadPosRankSum=-0.716;SC=TGCCATCCCATGCCTGGCCCC;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=63;WE=50310474;WS=50310456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
chr20	50310483	rs143733288	A	ATC	7580.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=68;PP=2957;SC=CCCCCCAGGTATGAGTTTGAG;SOR=0.843;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=94;WE=50310491;WS=50310473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr20	50310709	rs6013259	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=203;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TCTGGGCAGCGTCTGCTCTGG;SOR=0.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=15;WE=50310717;WS=50310699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr20	50314052	rs58432772	C	T	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=56;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GATACATCACCATCTTAATTC;SOR=0.772;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=161;TCF=55;TCR=106;TR=82;WE=50314060;WS=50314042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,91:0.50:183
chr20	50314200	rs1205690	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=315;SC=TTCAACCGCTACAGAGGCCGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=50314208;WS=50314190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	50329416	rs1205698	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=16;PP=1139;SC=TTCCCACACCTGCGGCCCGGG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=50329424;WS=50329406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	50329704	rs1205699	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=461;ReadPosRankSum=0.056;SC=CAGGAAAGGCGAGAGGTCACT;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=25;WE=50329712;WS=50329694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr20	50342285	rs1205708	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=511;ReadPosRankSum=1.229;SC=CCAGATGCCTAAGTGAGAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=27;WE=50342293;WS=50342275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr20	50342555	rs1205709	C	T	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=37;PP=1074;SC=TGAATAACATCTAAAAACATT;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=50342563;WS=50342545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	50401355	rs58347405	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GACTTACAGCGGGGTTATGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=50401363;WS=50401345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr20	50406807	rs41274696	C	A	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.101;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1501;ReadPosRankSum=0.782;SC=TTAAAAGGGGCAGGACCCACT;SOR=0.512;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=90;WE=50406815;WS=50406797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,108:0.51:210
chr20	50407162	rs6021437	T	C	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1559;ReadPosRankSum=-1.947;SC=TCTTAATGGATGTGTTGGTTC;SOR=0.529;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=223;TCF=125;TCR=98;TR=112;WE=50407170;WS=50407152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,127:0.51:251
chr20	50407502	rs6126344	A	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=-1.411;SC=CCCAGGCTGCAGGTCACCGGG;SOR=0.877;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=32;WE=50407510;WS=50407492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,34:0.33:104
chr20	50408482	rs6013281	A	G	4970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=82;PP=2965;SC=GCAAGGTCACATTAGTGTTGG;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=81;TCR=82;TR=163;WE=50408490;WS=50408472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr20	50705211	rs2273382	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=444;ReadPosRankSum=0.600;SC=TCAAAGTTAAAGGTTTTTTGG;SOR=0.935;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=28;WE=50705219;WS=50705201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr20	50705584	rs973341	C	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=751;ReadPosRankSum=0.229;SC=GGCATCTCCCCCTAGGCTGTT;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=40;WE=50705592;WS=50705574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr20	50713652	rs10715971	TA	T	6725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=106;PP=2988;SC=CTGGCTGCCCTAAAAAAAAAA;SOR=0.840;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=184;TCF=67;TCR=117;TR=163;WE=50713661;WS=50713642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
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chr20	52198967	rs1326862	A	G	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1941;ReadPosRankSum=0.630;SC=ATGTCTGCCCACATACCTCAC;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=130;TCR=130;TR=123;WE=52198975;WS=52198957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,139:0.48:290
chr20	52199495	rs3748501	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=307;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AGTTCAAAAGAAAGTGTATAG;SOR=0.399;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=16;WE=52199503;WS=52199485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr20	52592140	rs11471112	GTA	G	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=65;ReadPosRankSum=0.272;SC=AATGAAAACGGTATATATATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=52592149;WS=52592130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr20	52611427	rs146234679	TACACACAC	T	939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.508;NF=8;NR=3;PP=1669;ReadPosRankSum=0.535;SC=ATAGATATGATACACACACAC;SOR=2.182;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=11;WE=52611442;WS=52611417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr20	52645534	rs466264	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=207;ReadPosRankSum=-0.884;SC=ACATAAACAGTGGTTATTCAG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=22;WE=52645542;WS=52645524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr20	52674615	rs465184	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=263;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TTCCCAGAGTAGCACTGACCT;SOR=0.397;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=17;WE=52674623;WS=52674605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr20	52675188	rs394732	G	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=0.178;SC=TACACTACCTGGTAAGTCTCT;SOR=1.730;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=14;WE=52675196;WS=52675178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr20	52684924	rs6068765	C	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=792;ReadPosRankSum=-1.024;SC=ATGTGCCAGGCAGCACCAGGG;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=54;WE=52684932;WS=52684914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,59:0.42:139
chr20	52685084	rs290446	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=57;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TCACACACATTGTCTCCTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=52685092;WS=52685074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	52779082	rs6127119	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=1.054;SC=GGCACCGTGGCATAGATGCTG;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=52779090;WS=52779072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr20	52781091	rs6068816	C	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=753;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TCCTCCCAAACGTGCTCATCA;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=55;WE=52781099;WS=52781081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr20	52781264	rs6013905	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=107;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CTGGGAGCAATGCCCGTACCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=52781272;WS=52781254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr20	52782438	rs4809958	T	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=508;ReadPosRankSum=0.569;SC=TATGTTTAGCTGGTTATTAAA;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=36;WE=52782446;WS=52782428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr20	52788314	rs2259735	T	C	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=608;ReadPosRankSum=-1.708;SC=AAACAAACACTGAGAATCATG;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=50;WE=52788322;WS=52788304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr20	52789743	rs2248137	C	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=17;PP=930;SC=GGGGACCCTCCCTGCCCAGAC;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=52789751;WS=52789733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	53259964	rs6064099	G	C	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=881;ReadPosRankSum=-0.012;SC=CCCCAGTGTTGCTGACGCACA;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=51;WE=53259972;WS=53259954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr20	54823779	rs13044293	G	T	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.061;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=35;PP=1901;ReadPosRankSum=1.268;SC=AAACTCTAAGGCCAGATTGAA;SOR=1.000;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=93;WE=54823787;WS=54823769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr20	54935064	rs76529327	G	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=110;ReadPosRankSum=0.501;SC=CACCTTCCCAGCAAGAGTTTG;SOR=0.073;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=54935072;WS=54935054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr20	54935242	rs17362677	A	T	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1325;ReadPosRankSum=-2.062;SC=CTCCAGTCCGACAGGTGGCAC;SOR=0.715;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=83;WE=54935250;WS=54935232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,92:0.49:189
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chr20	54940427	rs111968423	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr20	54945783	rs10485805	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=516;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GCTAACAATCATTAAAGAGTC;SOR=0.531;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=34;WE=54945791;WS=54945773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
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chr20	54959296	rs2298016	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=271;ReadPosRankSum=0.895;SC=TAGTAGAACAGTACAGAACTT;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=20;WE=54959308;WS=54959286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr20	54961463	rs1047972	T	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=37;PP=2273;SC=TGCAAAGGAATGCGCTGGGAA;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=54961471;WS=54961453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	54961541	rs2273535	A	T	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=1435;ReadPosRankSum=2.585;SC=TGACAAGGAAATTGCTGAGTC;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=221;TCF=123;TCR=98;TR=91;WE=54961549;WS=54961531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,104:0.40:260
chr20	54963149	rs67542863	C	CGACAAGACCAACCTCCATGTGGGTTTATAAATGTGAATGAGATTACAGATTATTCAATTTA,CA	936.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=58;SC=AAAGAATTCCCGACAAGACCA;SOR=0.693;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=4;WE=54963157;WS=54963139;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
chr20	54974424	rs2426617	C	A	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=36;PP=1084;SC=GTATGTGAGACGTTGATGTTA;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=54974432;WS=54974414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	55028167	rs2870738	G	A	5942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=90;PP=2965;SC=AGAAAAATAGGGCAAATATCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=182;WE=55028175;WS=55028157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr20	55033476	rs3746623	C	G	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=86;PP=2965;SC=ACTGCCGGCTCTACTTTGGGG;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=172;WE=55033484;WS=55033466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr20	55033635	rs3746624	C	T	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=69;PP=2437;SC=ACGTGCGCAACGAGATCCTCC;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=58;TCR=69;TR=127;WE=55033655;WS=55033625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr20	55033647	rs3746625	T	C	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=68;PP=2248;SC=AGATCCTCCGTGGCAGCAGTC;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=54;TCR=68;TR=122;WE=55033655;WS=55033625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr20	55033713	rs3746626	G	A	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=49;PP=1712;SC=CCGTGCTCACGTACCCCAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=55033721;WS=55033703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	55033856	rs4811697	A	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=652;SC=CACACCCACAACTTGTGCAAC;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=55033864;WS=55033846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	55045632	rs6024898	G	A	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=64;PP=2965;SC=CCTGGGTGACGGGATCATCTT;SOR=0.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=55045640;WS=55045622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	55045843	rs6014740	T	C	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=832;SC=AGTTGAGGGTTTGGAGATTTT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=32;WE=55045851;WS=55045833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	55047632	rs11482055	T	TA	190.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=1.036;SC=TTCTGAACTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=55047640;WS=55047622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr20	55048283	rs6024901	A	G	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=466;SC=TACTGAATATACTTTTATATG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=55048291;WS=55048273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	55048496	rs11471796	T	TGAG	2797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=34;PP=2199;SC=TAAGTGATTTTGAGAATTTTG;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=39;WE=55048504;WS=55048486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	55049908	rs1474890	A	G	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=71;PP=2383;SC=CGCCTTAAAGACTGAACTCAG;SOR=2.526;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=19;TCR=72;TR=90;WE=55049916;WS=55049898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	55071620	rs6014752	T	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=412;SC=AGTCAGTCAATCAATCAATCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=55071628;WS=55071612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	55072472	rs6024911	A	G	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=85;PP=2965;SC=TTTGCAATTTAGGGGGCCGCC;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=81;TCR=86;TR=164;WE=55072480;WS=55072461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr20	55088404	rs1059768	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=12;PP=797;SC=TGATGTCATCATGCTCAATGG;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=55088412;WS=55088394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	55205661	rs6025019	C	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.600;SC=CCTGTGCGCGCGCTCCCTCTT;SOR=1.085;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=6;WE=55205669;WS=55205651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr20	55212711	rs6025024	T	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=0.757;SC=CCAGCCTCAGTGTAGTTGGTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=55212719;WS=55212701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chr20	55800770	rs6025451	A	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=0.812;SC=TATATTTTTTAAATTTAACCA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=55800778;WS=55800760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr20	55800888	rs76027718	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=527;ReadPosRankSum=-0.332;SC=CACCCTATTCCCTTCCTTGCT;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=39;WE=55800896;WS=55800878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr20	55800937	rs6070031	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=538;ReadPosRankSum=-1.447;SC=TCTGCTGGAACGTGAGCTTCC;SOR=0.834;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=34;WE=55800945;WS=55800927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr20	55904891	rs201339461	G	C	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=880;ReadPosRankSum=-0.358;SC=CTAGGACAGGGGCTTCTGGAG;SOR=0.478;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=74;WE=55904899;WS=55904881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,85:0.49:173
chr20	55905029	.	A	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=686;ReadPosRankSum=0.166;SC=GGAGCCCCCAACTGGGGGAAG;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=46;WE=55905037;WS=55905019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,55:0.40:139
chr20	55905156	rs28368065	C	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TGAGGAGGCACCCCTTGGCGG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=55905164;WS=55905146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr20	55908405	rs28368074	G	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TTTATTTGTTGCTAGTTAAAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=55908413;WS=55908395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr20	55909085	rs16980893	T	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr20	55909723	rs16980896	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GCCAGTAATTCAGCAGATGAA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=55909731;WS=55909713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr20	55910542	rs3764674	T	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=1.238;SC=CTATTTAAACTTTTGGAATGT;SOR=1.532;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=9;WE=55910550;WS=55910532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr20	55912780	rs11476029	AT	A	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.397;HP=9;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=484;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TATAATGTACATTTTTTTTTC;SOR=0.416;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=38;WE=55912788;WS=55912770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr20	55913500	rs75714022	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.510;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr20	55914312	rs6099558	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.566;SC=GTGGGCAAGCAGCATTATTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=55914320;WS=55914302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr20	55915254	rs6092461	C	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TATAGCAGAACTAGGATATTT;SOR=0.645;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=25;WE=55915262;WS=55915244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr20	55918290	rs6099559	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.652;SC=CTTAAGACTATTGTCCCTGGT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=55918298;WS=55918280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr20	55918377	rs6099560	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=480;ReadPosRankSum=0.664;SC=GGTATGAGTACATTTTACTTT;SOR=0.573;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=32;WE=55918385;WS=55918367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr20	55929881	rs4811837	T	C	2373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=62;PP=1709;ReadPosRankSum=-1.120;SC=ATGTAAGTGCTCCTTAAATAC;SOR=0.700;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=66;TCR=118;TR=99;WE=55929889;WS=55929871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,106:0.48:222
chr20	55940426	rs6099582	G	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=516;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GGAGCAAAGTGTTTACGGCAT;SOR=0.993;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=32;WE=55940434;WS=55940416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr20	55949894	rs41304419	C	G	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=55;PP=1780;ReadPosRankSum=-1.148;SC=TGCTCCAAGGCAGCAGAGCCA;SOR=0.792;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=243;TCF=110;TCR=133;TR=98;WE=55949902;WS=55949884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,112:0.42:268
chr20	55966994	.	C	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CCAGGCGCCTCCAGCCGGCGC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=55967002;WS=55966984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr20	55967642	.	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=694;ReadPosRankSum=-0.197;SC=GTGCCAGGGCGGAGCCGTCTG;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=33;WE=55967650;WS=55967632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr20	55968530	rs139495052	G	C	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=572;ReadPosRankSum=0.461;SC=GTGAAGAGAAGGCAGATTGCA;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=44;WE=55968538;WS=55968520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr20	55975099	rs6014986	T	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=383;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TACTTCTCTCTCCCGCCCACC;SOR=0.876;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=24;WE=55975107;WS=55975089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
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chr20	56075580	rs6099660	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCTGGTGTACCGGCAGAGCAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=56075588;WS=56075570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	56082984	rs73176793	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=279;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CAACAGCACTATTCTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=56082992;WS=56082974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr20	56089869	rs11086612	GT	G	1075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=3.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
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chr20	56098733	rs6025606	T	C	4395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=53;PP=2965;SC=ATCAGTCCAGTAGTTTCAGCC;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=134;WE=56098741;WS=56098723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr20	56136536	rs1042521	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.672;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1179;ReadPosRankSum=-1.061;SC=TGGACAGCCTACCCCAGGCAG;SOR=0.875;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=68;WE=56136544;WS=56136526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,87:0.55:159
chr20	56137687	rs1040566	A	C	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=708;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CCTGGGAAAAAAATGCTGGTC;SOR=0.591;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=48;WE=56137695;WS=56137677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr20	56137798	rs1062600	G	A	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr20	56137807	rs1042523	A	G	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.19;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr20	56137834	rs1062601	A	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=801;ReadPosRankSum=0.548;SC=TGACGGATTCACCCTACGTGG;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=50;WE=56137842;WS=56137824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr20	56137895	rs707555	G	C	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=51;PP=1980;SC=CCTGGAAGCAGTGGGCGATGG;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=56137903;WS=56137885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	56138040	rs2070755	G	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=750;ReadPosRankSum=0.228;SC=GGACCCCCAAGCAGGGCCCTG;SOR=1.076;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=47;WE=56138048;WS=56138030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr20	56139403	rs2070756	T	C	6136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=97;PP=2965;SC=TAGCTTCAGGTGTCACCATCA;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=95;TCR=97;TR=192;WE=56139411;WS=56139393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr20	56139967	rs1023049	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GCTTGGTGAACGCAAAACTAG;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=56139975;WS=56139957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr20	56140076	rs59716278	C	CTT	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.513;NF=6;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=-2.295;SC=GAACATTTCTCTTTTTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=11;WE=56140084;WS=56140066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr20	56140980	rs1042531	T	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CACCACACCGTGAGCAGATCT;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=56140988;WS=56140970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr20	56179875	rs8118279	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr20	56186884	rs2865394	T	C	4810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=69;PP=2391;ReadPosRankSum=-0.547;SC=CAGTATGGACTGCTCCATGTG;SOR=0.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=150;WE=56186892;WS=56186874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr20	56187120	rs138510618	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr20	56190634	rs2073145	C	T	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=628;ReadPosRankSum=2.594;SC=TGGGGCCTCTCGGCTGCAGAA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=42;WE=56190642;WS=56190624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr20	56191172	rs11468882	CAG	C	3964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.018;NF=16;NR=47;PP=2536;ReadPosRankSum=0.245;SC=AACCAAGGCACAGAGAGAGGA;SOR=0.659;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=148;TCF=46;TCR=102;TR=63;WE=56191181;WS=56191162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,112:0.50:224
chr20	56227532	rs6025699	T	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=829;ReadPosRankSum=-2.754;SC=AGATGGTGGGTGGCAGGTCGA;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=66;WE=56227540;WS=56227522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr20	56228019	rs8183538	G	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=543;ReadPosRankSum=-0.692;SC=AGCCCACACTGTTCCAGCCGC;SOR=1.184;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=30;WE=56228027;WS=56228009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr20	56470456	rs113808830	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=631;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CTGTACAGACCCCGGGGAGCC;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=42;WE=56470464;WS=56470446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr20	56726107	rs6070358	C	T	6863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=110;PP=2965;SC=TGGGATCGGGCAACGCGGTGG;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=99;TCR=110;TR=209;WE=56726115;WS=56726097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr20	56793546	rs583987	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=1036;SC=CGTTCCCACCAGGAGCTAATG;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=56793554;WS=56793536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	56793706	rs584855	G	A	4285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=71;PP=2729;SC=TGGTTCAGGCGGTGTGCAATG;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=132;WE=56793714;WS=56793696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr20	56793764	rs1192511	G	A	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=62;PP=1927;SC=TGGAGGCCCCGTGCTGGAGCA;SOR=1.241;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=56793772;WS=56793754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr20	56796267	rs521615	C	T	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=212;SC=GGGACCCTGACTGGTGGCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=56796275;WS=56796257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	56803676	.	C	CCCG	177.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.53;NF=1;NR=1;PP=71;SC=CCCGCCGCCGCCCGCCGCATC;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=56803684;WS=56803666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	56807969	rs3818744	A	G	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=33;PP=957;SC=CAAAGAAGTCATTTCAGAATC;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=56807977;WS=56807959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	56811400	rs474212	C	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=720;SC=GGCAAAAAAACAAAATTATTG;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=24;WE=56811408;WS=56811390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	56820702	rs595292	G	T	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=12;PP=1363;SC=CCTCTCAATGGGTATACAGTG;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=56820710;WS=56820692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	56820880	rs3746406	C	T	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=121;PP=2965;SC=CTGCAAGCTACCAAGGACTTT;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=85;TCR=121;TR=206;WE=56820888;WS=56820870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	56821127	rs3746405	A	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=29;PP=1101;SC=AGCTTTGAGCAGGCGCTGGTC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=56821135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr20	56822236	rs1541117	C	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=537;SC=TTACTTTTTGCTTCTTTACAT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=56822244;WS=56822226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	56822536	rs4811972	G	A	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=12;PP=360;SC=TGAAGGGGCCGAGGGACTGGA;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=56822544;WS=56822526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	56823390	.	GTTTT	G	227	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=65.97;NF=0;NR=9;PP=227;QD=27.1111111111;SC=AGCAGAACCTGTTTTTTTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=56823401;WS=56823380;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,9:0.64:14
chr20	56823395	rs518929	T	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=28.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	56825826	rs2282205	A	C	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=161;SC=GAAGTTATGAAATTTGAAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=56825834;WS=56825816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	56826934	rs6064631	T	A	2507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=59;PP=1911;SC=TAAATTTTTTTAAAAAATCGA;SOR=1.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=87;WE=56826942;WS=56826924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr20	56838389	rs6128295	A	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=662;SC=CTTATGGGACAGTGCCCACAG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=56838397;WS=56838379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	56846580	rs6015238	T	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.75;SOR=1.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	56861637	rs6026181	A	G	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=189;SC=GAATCGCAACATTGAGAATTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=56861645;WS=56861627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	57045667	rs1980576	T	C	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=625;ReadPosRankSum=-0.555;SC=AGTCTTACCCTGTGGAGATCC;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=53;WE=57045675;WS=57045657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,69:0.56:123
chr20	57045765	rs3946003	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CAGCGCAGGCAGCTGCCCCCG;SOR=0.859;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=15;WE=57045773;WS=57045755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr20	57089814	rs77359399	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=442;ReadPosRankSum=0.713;SC=GGTGCGCAAGGGGAGGCGCGG;SOR=1.773;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=25;WE=57089822;WS=57089804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr20	57244493	rs2296524	G	A	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=784;ReadPosRankSum=1.253;SC=GGCACGCACAGTCAGGCTACC;SOR=0.657;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=58;WE=57244501;WS=57244483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr20	57246480	.	T	TTTA	260	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=260;QD=41.9967820507;SC=CACCTGTCCTTTATGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=57246488;WS=57246470;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr20	57266592	rs6128401	C	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=0.775;SC=GCTGAGCAGACAGACCTGGAG;SOR=1.059;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=18;WE=57266600;WS=57266582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr20	57266700	rs6123822	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GGAAAACCTCTCACACCACGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=57266708;WS=57266690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr20	57266781	rs6128402	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=371;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CATTTTTAGGCTGGTTATGAA;SOR=0.735;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=19;WE=57266789;WS=57266771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
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chr20	57273885	rs2296526	T	C	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=42;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TGTCATAGACTCCCAGGAGAG;SOR=0.960;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=60;WE=57273893;WS=57273875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,62:0.61:101
chr20	57274077	rs6092684	T	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=0.090;SC=GAAATGAGAGTGTGTGGAGGG;SOR=0.138;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=57274085;WS=57274067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr20	57274151	rs2296528	G	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=166;ReadPosRankSum=0.601;SC=TCCCCGACGCGGCACAGGCAG;SOR=0.280;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=17;WE=57274159;WS=57274141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr20	57275949	rs6070554	A	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=486;SC=GGCAGGGAGCACCAGGCTCAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=57275957;WS=57275939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	57280575	rs6100174	T	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1229;ReadPosRankSum=-0.091;SC=ACGAATACAGTGGCTCCCGGA;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=74;TCR=90;TR=99;WE=57280583;WS=57280565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,107:0.57:188
chr20	57288744	rs1570894	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GGAGCTGCCCGTCAAGCTTGG;SOR=1.048;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=21;WE=57288752;WS=57288734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr20	57290347	rs6026468	C	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=168;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGAGGGGGACCTGGGGAGGGA;SOR=1.619;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=15;WE=57290355;WS=57290337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr20	57292888	rs2426776	G	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1069;ReadPosRankSum=0.258;SC=TTTCCAGGTCGTGGCCACAGC;SOR=0.785;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=76;WE=57292896;WS=57292878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr20	57293089	rs6026470	A	G	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1091;ReadPosRankSum=0.618;SC=GGCCTGGGAGAGGACCCAGAT;SOR=0.679;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=66;WE=57293097;WS=57293079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,84:0.48:174
chr20	57293118	rs2426777	T	C	3756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=2962;ReadPosRankSum=1.256;SC=CCAGAACTGATGGAAAATCTC;SOR=0.944;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=79;WE=57293132;WS=57293108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,98:0.46:212
chr20	57293124	rs10470038	A	AG	3720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=2966;ReadPosRankSum=0.818;SC=CTGATGGAAAATCTCTCCCCA;SOR=0.876;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=126;TCF=46;TCR=80;TR=50;WE=57293132;WS=57293108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,100:0.47:215
chr20	57293350	rs12480759	G	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=508;ReadPosRankSum=-1.905;SC=ATTCAGAAGGGACTGGGTGTT;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=32;WE=57293358;WS=57293340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr20	57299030	rs201658287	GGAGGAGGAA	G	1123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.70;MQRankSum=1.598;QD=25.54;ReadPosRankSum=2.341;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr20	57393453	rs140156686	G	A	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=772;ReadPosRankSum=0.383;SC=AGGAGGATGGGACTGGCTGTT;SOR=0.931;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=50;WE=57393461;WS=57393443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr20	57415110	rs1800900	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=506;SC=CTTCGGAGCCACTCTCTGCAG;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=57415118;WS=57415100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	57415995	rs1800905	A	G	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=70;PP=2165;SC=GGAGCAGCGCAGGTGGAAAGG;SOR=1.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=100;WE=57416003;WS=57415985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr20	57478448	rs2295583	A	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=3.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=0.103;SC=AGCTACCTCCAATCTTTGCAC;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=57478456;WS=57478438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr20	57556295	rs151333	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CCCGCCCGCCCGTCCCCGCCT;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=6;WE=57556303;WS=57556285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr20	57556488	rs3746703	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=419;ReadPosRankSum=0.385;SC=GCGGGCCGGCCCCACTCCCGG;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=28;WE=57556496;WS=57556478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr20	57562102	rs2273359	C	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr20	57563061	rs6070684	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-1.050;SC=GACATGCTTGCACGCAAGAGG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=57563069;WS=57563051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr20	57565943	rs163782	G	C	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=48;PP=2739;SC=TAGTAACGGGGTCTATGGTTT;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=124;WE=57565951;WS=57565933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr20	57570568	rs13720	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=472;SC=CGCAGCCAGTGCCACGCTGTC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=57570576;WS=57570558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	57570854	rs3787492	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=943;SC=ATCTGCAGCCGTCTCCCGCTC;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=57570862;WS=57570844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	57571763	rs9760	A	G	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=2161;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ACCCAGCCACAGAAACGACAT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=125;TCR=119;TR=139;WE=57571771;WS=57571753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,159:0.54:295
chr20	57572614	rs417847	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr20	57572675	rs163785	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=5;PP=453;SC=GACCATTTGCATAGATTTCTG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=57572683;WS=57572665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	57572839	rs2295357	G	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TCAGCATGAGGCCGTCTCCTC;SOR=1.262;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=24;WE=57572847;WS=57572829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr20	57582279	rs200474697	T	TCGGCCC	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=-0.589;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.847;SOR=1.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	57582285	rs71181993	C	CCGGCCT	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.589;NF=2;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GGCCTCGGCCCAGCACCCGGC;SOR=0.707;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=5;WE=57582293;WS=57582269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	57594490	rs150072434	G	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GACCACAGTTGTGTTGGGCTC;SOR=1.085;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=9;WE=57594498;WS=57594480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr20	57594684	rs34524896	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=606;ReadPosRankSum=-1.582;SC=TCCATAGAGGCGGACAACCAA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=47;WE=57594692;WS=57594674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr20	57597970	rs463312	AG	CC	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=2445;ReadPosRankSum=-2.042;SC=TCGGCCTTGCAGCTGGAGAGA;SOR=0.787;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=65;WE=57597979;WS=57597960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr20	57599016	rs163777	T	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=25;PP=1708;SC=TGTCGGACACTGTGGTGGAGC;SOR=1.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=57599024;WS=57599006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	57599402	rs6070697	G	A	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.392;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.186;NF=48;NR=41;PP=1591;ReadPosRankSum=1.119;SC=GACCTCCGCCGTGGCCGCTAC;SOR=0.694;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=89;WE=57599410;WS=57599392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,106:0.59:180
chr20	57610059	rs151358	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CCAACTGTCACGATCACTTCT;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=57610067;WS=57610058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr20	57612390	rs151359	C	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=414;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CTTACCAAGTCTATCAATATT;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=32;WE=57612398;WS=57612380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr20	57613373	rs151360	T	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-5.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=540;ReadPosRankSum=-1.401;SC=CATTATACACTCATAATTCAA;SOR=1.292;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=26;WE=57613381;WS=57613363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr20	57767043	rs259984	G	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=609;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CGACGGCAGCGGAGAAGCCCT;SOR=0.522;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=50;WE=57767051;WS=57767033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr20	57768399	rs442091	T	C	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.226;SC=ATGTAGAGGCTCCCAGGCCAG;SOR=0.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=49;TCR=63;TR=75;WE=57768407;WS=57768389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,80:0.63:127
chr20	57768657	rs41276962	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=552;ReadPosRankSum=0.816;SC=AGGATGCCGATCCCGGGGAGG;SOR=1.194;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=34;WE=57768665;WS=57768647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr20	57768743	rs56057707	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=621;ReadPosRankSum=1.321;SC=TTGGCTGCTGCTTCTGTTGCC;SOR=0.687;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=42;WE=57768751;WS=57768733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr20	57769140	rs55786258	G	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=482;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GGGCACAGTTGGGGGGGGACA;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=37;WE=57769148;WS=57769129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr20	57769854	rs454356	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=2.097;SC=TTGAGAGAGCATGTTGTTATC;SOR=0.343;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=19;WE=57769862;WS=57769844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr20	57828914	.	T	TC	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=61.34;NF=5;NR=0;PP=51;QD=13.6;SC=CCAATTAACCTCCCCCCCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=57828931;WS=57828904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,5:0.36:14
chr20	57828923	rs259957	A	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.89;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr20	57876044	.	C	T	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=25;QD=14.9428031368;SC=GCTCTGCACTCGTGAAGACGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=4;WE=57876052;WS=57876034;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr20	58318345	rs199698043	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=553;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GTGACAGGCGCGGGCAGGCTG;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=37;WE=58318353;WS=58318335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr20	58330128	rs1182477	G	C	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=1015;SC=AGAGGGGTGGGGGACCACCCA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=58330136;WS=58330118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	58342130	rs2426831	T	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=440;SC=AGGTCACTGCTCTGTATGCTC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=58342138;WS=58342120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	58411441	rs2426849	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTTCTCTCCTTCCAATTTTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=58411449;WS=58411431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr20	58415393	rs11479086	AT	A	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=0.892;SC=TCTCTTTGTTATTTTTTTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=20;WE=58415401;WS=58415383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr20	58416428	rs2281930	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGATACTTAACTATGATGATC;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=58416436;WS=58416418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr20	58416667	rs6064846	T	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=1.303;SC=GGGAGTTTATTCATAGACAAT;SOR=1.201;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=13;WE=58416675;WS=58416657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr20	58420336	rs1416388	G	A	4294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=61;PP=2768;SC=ATTTGTTTCTGTGAATTTCAT;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=138;WE=58420344;WS=58420326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr20	58425413	rs2865768	C	T	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=40;PP=1624;SC=AAATCCTAATCGTACTATTAA;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=58425421;WS=58425403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	58439322	rs6070976	C	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr20	58439454	rs11086679	G	GAA	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CTATAGCCAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=8;WE=58439462;WS=58439444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr20	58439512	rs11086680	GAA	G	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr20	58440333	rs6070977	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CTAAAACTATTTTCTCTCAAC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=58440341;WS=58440323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr20	58441502	rs6070980	G	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=228;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TCAGAATATAGGAATATGTAG;SOR=0.281;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=17;WE=58441510;WS=58441492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr20	58442826	rs6070981	C	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=415;ReadPosRankSum=0.629;SC=TCATCTCTATCCCTGCAAATT;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=34;WE=58442834;WS=58442816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr20	58442920	rs142112394	TCTG	T	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.843;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=444;ReadPosRankSum=0.024;SC=ATGAAAACAATCTGCTGAAGT;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=11;WE=58442930;WS=58442910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr20	58443798	rs6070982	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=305;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGTTGAATAACGGTATGACTT;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=18;WE=58443806;WS=58443788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr20	58449145	rs78214780	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=0.947;SC=AAAAAGAAAATAGATGGCAAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=58449153;WS=58449135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr20	58452582	rs61733222	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TGTCTTGTCCATCTTTTTTGT;SOR=0.465;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=15;WE=58452590;WS=58452572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr20	58452891	rs11472207	T	TCAAA	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-0.439;SC=TAAAATGGAGTCAAAGGCCAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=58452899;WS=58452881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr20	58453226	rs11473766	T	TTA	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=146;ReadPosRankSum=-0.414;SC=AAAGCATGTGTTAGCATTTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=58453234;WS=58453216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr20	58456249	rs117766988	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=0.180;SC=AAATAACTATATTGGATTAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=58456257;WS=58456239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr20	58456564	rs148253329	C	CATT	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=0.668;SC=TGTAAATAAACAAAAAAAAAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=58456572;WS=58456554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
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chr20	58456951	rs6070994	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CATGGTAAATGCAATGTAACT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=58456959;WS=58456941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr20	58476774	rs6027186	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=467;ReadPosRankSum=0.537;SC=CTAGTGATGCGTCAAAATACA;SOR=0.733;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=38;WE=58476782;WS=58476764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr20	58482569	rs35098779	G	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CAGGAACTATGAATTCTTTTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=58482577;WS=58482559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr20	58486796	rs6071026	T	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=0.635;SC=CCAACCAAATTAAACTTACAT;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=16;WE=58486804;WS=58486786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr20	58486951	rs6027195	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=1.099;SC=TTAGAAATAACAGACAATTAT;SOR=0.193;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=9;WE=58486959;WS=58486941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr20	58490458	rs41276966	C	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=-2.991;SC=TCATAGTTGTCTGTCTTATAA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=10;WE=58490466;WS=58490448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr20	58533744	rs6071043	T	G	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=820;ReadPosRankSum=1.022;SC=GGACTGGTCATCAGCTGCACG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=55;WE=58533752;WS=58533734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,65:0.46:140
chr20	58533759	rs6071044	G	T	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=760;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGCACGTTCTGGGTCTGTCTT;SOR=0.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=55;WE=58533767;WS=58533749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr20	58545317	rs78153451	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.803;SC=GGAAGATTAAGTCTTGAAAGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=58545325;WS=58545307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr20	58558082	rs76721730	A	G	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=1835;ReadPosRankSum=-1.549;SC=CCCAGTTTCCAGAGAAGGAAT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=232;TCF=92;TCR=140;TR=116;WE=58558090;WS=58558072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,132:0.49:269
chr20	58562571	rs11086690	C	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=927;ReadPosRankSum=0.992;SC=GGTTCAAGATCGAGATTCTCC;SOR=1.034;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=121;TCF=86;TCR=35;TR=53;WE=58562579;WS=58562561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr20	58564146	rs28409250	A	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1003;ReadPosRankSum=0.148;SC=TTCATTGTCAATAAAGAGGAG;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=69;WE=58564154;WS=58564136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr20	58567311	rs6071064	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.366;SC=TCTTAGAATTTCTCAAATTAC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=58567319;WS=58567301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	58569193	.	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=1.067;SC=TTGAAAGGGAAACAGTTCCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=14;WE=58569201;WS=58569183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr20	58569563	rs6071068	T	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=543;ReadPosRankSum=1.679;SC=TTGTATTGGTTACGGGCAAAG;SOR=0.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=40;WE=58569571;WS=58569553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr20	58570825	rs147024816	G	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=688;ReadPosRankSum=1.428;SC=TTCAGTAAGCGTGTGTTGAGC;SOR=0.403;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=36;WE=58570833;WS=58570815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr20	58571125	rs3746711	G	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-0.147;SC=TGGTCTGTAGGGGTGTCCTGG;SOR=0.765;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=10;WE=58571133;WS=58571115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr20	58571864	rs6064876	A	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=720;ReadPosRankSum=0.528;SC=ATTCACTAATACACAGACATA;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=44;WE=58571872;WS=58571854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr20	58576432	rs41310817	A	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=523;ReadPosRankSum=-1.572;SC=GCAGCGAGTCAGTCAGCCCAA;SOR=0.363;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=40;WE=58576440;WS=58576422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr20	58577957	rs6071073	T	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=1.779;SC=TGAACAAATTTACCTTATTGT;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=32;WE=58577965;WS=58577947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr20	58578068	rs6123961	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-1.942;SC=GAAGGAGAAGCGAACGTGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=12;WE=58578076;WS=58578058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr20	58581863	rs195004	G	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.577;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr20	58581873	rs195005	A	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.773;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
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chr20	58644995	rs6071100	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=462;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GAGGCTCTTCTGGGGCCAGCC;SOR=0.973;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=28;WE=58645003;WS=58644985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
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chr20	58645262	rs35835192	A	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=719;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TGGAATGCAAACATATTTAGA;SOR=0.172;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=40;WE=58645270;WS=58645252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr20	59091946	rs6064934	A	C	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=221;SC=AAAACACATAAAATTATATTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=59091954;WS=59091936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	59224926	rs846222	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=321;ReadPosRankSum=0.790;SC=GCTGGTGCTACTCTAAGAAAC;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=22;WE=59224934;WS=59224916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr20	59431577	.	TACACACACAC	TAC,T	658.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-2.734;NF=0,0;NR=28,28;PP=787,763;ReadPosRankSum=-0.077;SC=AGAAAGTATGTACACACACAC;SOR=0.525;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=28,28;WE=59431594;WS=59431567;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.41:54
chr20	59431607	rs58904166	CA	C	723.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=16.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.79;MQRankSum=2.931;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr20	59431609	.	CACACACACA	C	723.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=16.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.82;MQRankSum=2.931;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr20	59793299	.	CAGGTGCAGGTGT	C	1441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.586;NF=22;NR=15;PP=2893;ReadPosRankSum=0.676;SC=GGTGTAGGTGCAGGTGCAGGT;SOR=1.034;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=37;WE=59793319;WS=59793289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr20	59829847	rs3752252	C	T	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.856;NF=52;NR=41;PP=1508;ReadPosRankSum=1.041;SC=TTTCTGTGAACTTATTGTTTT;SOR=0.486;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=93;WE=59829855;WS=59829837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,112:0.58:192
chr20	59908320	rs72064063	TACAC	T	2379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=32;PP=1791;SC=CACACACATGTACACACACAC;SOR=2.522;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=34;WE=59908331;WS=59908310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	59908349	rs11086735	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=35;PP=1079;SC=ACACATGCACACACACCTGCA;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=59908357;WS=59908339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	59908377	rs11908491	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=0.592;SC=GCTGGCAAGTTTCTCTTTTTC;SOR=2.252;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=14;WE=59908385;WS=59908367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr20	60145672	rs2252560	T	G	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=29;PP=1775;SC=CCTGGTGTGTTTGGGAATGGG;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=60145680;WS=60145662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr20	60469999	.	A	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.631;SC=CGTTCAGGCCACAGATATGGA;SOR=0.931;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=76;WE=60470007;WS=60469989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,93:0.45:206
chr20	60485327	rs1776237	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGGGCTGACACGGTGTGTTCT;SOR=1.721;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=60485335;WS=60485317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr20	60485627	rs2427240	C	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=677;ReadPosRankSum=1.440;SC=TCCGCACAGACCCCGTAACCA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=44;WE=60485635;WS=60485617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr20	60572663	rs2296081	C	A	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=29;PP=1636;SC=TGGGCCCGATCGCTGCTAGTG;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=60572671;WS=60572653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	60574216	rs2296083	C	T	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=39;PP=1233;SC=GCCCAGCAAGCAAAGGGGTTG;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=60574224;WS=60574206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	60575830	rs2281733	G	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=46;PP=1300;SC=TCATCGGGAGGTGGGCTGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=52;WE=60575838;WS=60575820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	60582540	rs2281735	T	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=8;PP=779;SC=GCACACTTGGTGCATCTGCGC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=60582548;WS=60582530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	60584072	rs2296086	T	G	6213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=70;PP=2965;SC=GCAACAGGCTTTAGGGGAAAG;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=125;TCR=70;TR=195;WE=60584080;WS=60584062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr20	60585322	rs112501116	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=398;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GCCTCCCTGCGGTGGCCAGGA;SOR=0.037;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=24;WE=60585330;WS=60585312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr20	60587836	rs3818344	T	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=291;SC=TCGTGGCCCCTGCAGCCTCAA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=60587844;WS=60587826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	60588049	rs2273991	G	C	5914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=103;PP=2965;SC=CCCACCCCCAGGTACACAGAA;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=83;TCR=103;TR=186;WE=60588057;WS=60588039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr20	60640305	rs200074661	TGCCAGG	T	361.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=316;SC=CCGGCGGGCTTGCCAGGGCCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=60640318;WS=60640295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	60699938	.	C	CT	31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=20;MQ=54.16;NF=0;NR=2;PP=31;QD=18.0;SC=GAGGAATAACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=60699946;WS=60699928;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr20	60704117	rs4925345	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=844;SC=TTTCCTCCTGATTCAGAGGGC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=60704125;WS=60704107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	60708216	rs6089657	G	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1019;SC=CAGAGCTGACGGGGCCGCCCC;SOR=4.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=60708224;WS=60708206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	60712174	rs3078903	CAGCAGT	C	525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=694;SC=AAGTATTAAGCAGCAGTAGCA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=60712187;WS=60712164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	60712284	rs2057169	G	A	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=872;SC=GACGTATGGGGAGCCTCAGAA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=60712292;WS=60712274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	60712347	rs2057168	G	A	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=26;PP=2367;ReadPosRankSum=-0.830;SC=GTTTCCTTCGGAACTGGTACT;SOR=0.927;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=103;WE=60712355;WS=60712337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr20	60712511	rs2281740	A	G	7860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=135;PP=2965;SC=AGGAGCATTAACCACCTTTCC;SOR=0.976;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=100;TCR=135;TR=235;WE=60712519;WS=60712501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr20	60713311	rs7076	G	A	4833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=90;PP=2950;SC=CCAGGAACTCGCGCACTGACT;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=54;TCR=90;TR=144;WE=60713319;WS=60713301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr20	60713332	rs1135961	A	G	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=75;PP=2502;SC=TGGCACCCCGACCTATGGCAT;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=111;WE=60713340;WS=60713322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr20	60718420	rs3746651	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=21;PP=573;SC=ACTCACGGCCCGCGCGCACCC;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=60718428;WS=60718410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	60768497	rs2236527	C	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=549;ReadPosRankSum=2.060;SC=CAAGGTGTTTCTCAGCAAGAT;SOR=0.621;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=40;WE=60768505;WS=60768487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr20	60773041	rs6062140	G	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=684;ReadPosRankSum=1.910;SC=GAGACTGCCGGACCTGGCCCT;SOR=0.607;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=34;WE=60773049;WS=60773031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr20	60773684	rs4925355	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=339;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GCCTGCTGTTCCCCAGGTCCC;SOR=0.923;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=24;WE=60773692;WS=60773674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr20	60774035	rs6142990	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=630;ReadPosRankSum=-0.531;SC=CCATCAGTACACTGCTGACTT;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=35;WE=60774043;WS=60774025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr20	60776182	rs1054885	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=218;ReadPosRankSum=-0.283;SC=GCAAACCTGGGTGTGAATTCG;SOR=0.022;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=60776190;WS=60776172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr20	60791404	rs3787429	C	T	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=710;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GCTTCTCCAGCGAGGCCGAGG;SOR=1.184;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=36;WE=60791412;WS=60791394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr20	60831300	rs6089706	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=43;PP=1300;SC=AGAACCAACTGGGGACGTACT;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=60831308;WS=60831290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	60848248	rs6061476	G	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=318;SC=AACTGAAAACGCACACGGAAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=60848256;WS=60848247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	60859381	rs4925225	A	G	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.277;NF=15;NR=32;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GATGAACCATATATTGTGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=47;WE=60859389;WS=60859371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr20	60859486	rs4925226	A	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=175;SC=AGGCTGGAGTACAGTGGTGCA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=60859494;WS=60859476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	60861782	rs2297592	A	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1003;SC=GTGTCCCTCCATGGCCTGACG;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=60861790;WS=60861772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	60881330	rs2427273	G	A	5769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=69;PP=2965;SC=TGCCTGGGGCGCTGGGGGCCA;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=102;TCR=69;TR=171;WE=60881338;WS=60881320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr20	60881643	rs2427274	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=15;PP=867;SC=GCGCAGGCAGTGCGGTGGGGC;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=60881651;WS=60881633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	60881780	rs2427275	T	C	4509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=63;PP=2640;SC=CAGCCGGCCTTGGAGGACTGG;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=142;WE=60881788;WS=60881770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	60882277	rs2427277	C	T	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=161;SC=ACCCGCCCCACGCCGCTCCTC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=60882285;WS=60882273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	60882888	rs2427278	A	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=38;PP=1521;SC=CAGCAAGGTAACGTGTGCTGT;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=60882896;WS=60882878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	60883273	rs2236523	A	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=22;PP=586;SC=CTGTGTGCTCAGGGAGTGGGC;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=60883281;WS=60883263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	60885428	rs41310032	C	A	5406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=47;PP=2009;SC=CCTCCTGGAGCCCCCTGCCCT;SOR=0.848;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=101;WE=60885436;WS=60885418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	60885448	rs944897	A	G	5577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=54;PP=2260;SC=TGCCCTGCTGAGGCCTGGGAT;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=109;WE=60885456;WS=60885438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr20	60886987	rs944896	G	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=726;ReadPosRankSum=0.023;SC=CCGTGGCATTGCTGTAGAAGG;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=46;WE=60886995;WS=60886977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr20	60888921	rs34102933	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.195;NF=4;NR=32;PP=876;ReadPosRankSum=-0.724;SC=GAGTGGGCACGGAGAGATGAG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=36;WE=60888929;WS=60888911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr20	60889313	rs72487383	A	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=9;PP=1047;SC=CGAACGGGCAAGGGCCCTGCA;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=60889321;WS=60889303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	60891288	rs2065578	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=372;SC=GTCTCAGCGTAGCCTCTGTTC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=60891296;WS=60891278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	60892526	rs2427281	A	G	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=54;PP=2363;SC=TCCGAGCCCCATCCAGGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=60892534;WS=60892516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr20	60892692	rs6062216	C	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=21;PP=957;SC=GATGGGGTGGCGACAGGGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=60892700;WS=60892682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	60893458	rs73144993	A	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=616;SC=GAGGGATTGCAGGGAGGAGGC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=60893466;WS=60893448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	60893506	rs113604626	T	G	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=18;PP=1563;SC=TCCGGGGTCCTCACCAGGGCT;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=82;WE=60893514;WS=60893496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr20	60894870	rs73149117	C	T	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1295;ReadPosRankSum=0.928;SC=GAAGAGCCCACTAGCCCACGC;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=68;WE=60894878;WS=60894860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr20	60895697	rs2297587	C	T	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=29;PP=1413;SC=CGTCTCATGGCGGGGGCCCAG;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=60895705;WS=60895687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	60895738	rs6089346	A	G	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=41;PP=1850;SC=GTGGGAGGCGAAAGGTGAAGG;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=60895746;WS=60895728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	60897071	rs2274936	A	G	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.228;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=66;PP=2444;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TGTTGAGGACACACCTTCACA;SOR=0.405;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=124;WE=60897079;WS=60897061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr20	60897488	rs2274933	G	A	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=38;PP=1202;SC=CGCAGCCATCGAAACCAAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=60897496;WS=60897478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	60897561	rs76706776	CC	GA	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	60897570	rs71323580	C	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.45;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	60897772	rs6143021	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=7;PP=163;SC=GTGCCCGCTGTGGGGGTCGCA;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=60897780;WS=60897762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	60899182	rs11698080	C	T	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=23;PP=1363;SC=ACACAGGGGGCGCTGGGGTCG;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=60899190;WS=60899172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	60899422	rs34599961	C	T	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=22;PP=1232;SC=GAAGTGCAGCCCCTGGTCTTC;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=60899430;WS=60899412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	60900481	rs2427284	A	G	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=34;PP=2579;SC=CCTGCGCAGGAAGACAGCCGA;SOR=1.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=115;WE=60900489;WS=60900471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr20	60900579	rs2427285	C	A	8050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=107;PP=2965;SC=CAGTGTTGCGCGTCTCCGTAT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=113;TCR=107;TR=220;WE=60900587;WS=60900569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr20	60901875	rs45505291	G	A	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=803;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GTGCCACTGCGCCACGCCCAC;SOR=0.766;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=55;WE=60901883;WS=60901865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr20	60902214	rs944894	G	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=10;NR=4;PP=248;SC=GACAGACCCCGCTCCTGGCTC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=60902222;WS=60902204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	60902490	rs944892	C	T	7763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=108;PP=2965;SC=TGGCTGCACACGGGTGGATGC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=140;TCR=108;TR=247;WE=60902498;WS=60902480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr20	60902544	rs944891	A	C	8431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=138;PP=2965;SC=CCCACCTAAGACCTCCCCGAG;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=118;TCR=138;TR=256;WE=60902552;WS=60902534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr20	60903419	rs7262393	C	T	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=59;PP=1908;SC=GCTGGCACAGCAGGCAGTCGG;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=60903438;WS=60903409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr20	60904853	rs2427286	T	C	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=71;PP=2299;SC=CACCGGCCCTTGGGCACACGC;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=124;WE=60904861;WS=60904843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr20	60905717	rs2095235	T	C	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=67;PP=2437;SC=GAGCCCCTGCTGCCCCCTGGA;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=138;WE=60905725;WS=60905707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr20	60905878	rs3810548	A	G	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=31;PP=1474;SC=AGCTGGGGACATGGCTGGAGT;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=60905886;WS=60905868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	60906269	.	C	T	192	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=56.79;NF=0;NR=8;PP=192;QD=28.3464015684;SC=GGGGTGCAGGCGGTACGATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=60906285;WS=60906259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	60906277	.	T	TG	39	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9998;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=55.84;NF=0;NR=2;PP=39;QD=30.0;SC=GGCGGTACGATGGGGGGGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=60906285;WS=60906259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr20	60907446	rs2151513	T	C	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1942;ReadPosRankSum=-0.639;SC=AGCGTGCCTGTTCGGCTGTGA;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=90;WE=60907454;WS=60907436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
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chr20	60908964	rs13044266	G	A	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.00;SOR=2.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	60908969	rs13042941	T	C	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.57;SOR=1.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	60909060	rs13038331	A	G	5791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=76;PP=2925;SC=AGAAAAGGTCAGGGGAGGTCA;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=168;WE=60909068;WS=60909050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr20	60909466	rs2379127	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=8;PP=347;SC=GCGGCCCCGGGTCTCCAGGGA;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=60909474;WS=60909456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	60909518	rs1105019	G	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=8;PP=491;SC=GACACGGAGAGGCCCGGAGGA;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=60909526;WS=60909508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	60909786	rs149378083	G	GTCAGGGC	117	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	60909814	.	C	CT	116	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=53.25;NF=0;NR=2;PP=116;QD=64.5;SC=GGGCTCAGGGCGAGGGCGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=2;WE=60909823;WS=60909804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr20	60909815	.	G	C	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=53.8;NF=0;NR=2;PP=94;QD=64.3856062736;SC=GGCTCAGGGCGAGGGCGAGGG;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=2;WE=60909823;WS=60909804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr20	60909974	rs12625368	T	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=9;PP=1197;SC=TCACCCGGGCTTCATGCTGCC;SOR=2.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=60909982;WS=60909964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	60912117	rs3810550	C	T	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=48;PP=1290;SC=GTGTGACACACGTCTGAACAA;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=63;WE=60912125;WS=60912107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	60912683	rs2427289	T	C	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=32;PP=1214;SC=CGGGCACACATGTGTCACACC;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=60912691;WS=60912673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	60913127	rs8124907	A	G	3878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=54;PP=2423;SC=AATGAGGTCCAGCAAACTCAG;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=123;WE=60913135;WS=60913117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr20	60920545	rs6143034	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=253;SC=TCACTGCAGCTTCGGCCTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=60920553;WS=60920537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	60920700	rs6143035	T	C	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=35;PP=1498;SC=GGCTTTATGCTGACCTATATT;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=87;WE=60920708;WS=60920690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	60921324	rs2427291	G	A	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=960;SC=CTCAAGGGGTGGGCTCCAAGA;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=60921332;WS=60921314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	60921643	rs4925229	T	C	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=40;PP=2601;SC=TTGACGCCGGTGGTGTGGTGC;SOR=1.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=111;WE=60921651;WS=60921633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr20	60921701	rs4925387	A	G	8107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=70;PP=2965;SC=GCCCCACCTCAGGGCCAGCCC;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=170;WE=60921709;WS=60921691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr20	60921721	rs6143036	C	A	8930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=76;PP=2965;SC=CATTCCCAGCCCTCTAGCCCA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=114;TCR=77;TR=189;WE=60921729;WS=60921711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr20	60921896	rs4925388	A	G	8340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=135;NR=138;PP=2965;SC=CGCCCTCCACAGGCCCGGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=135;TCR=138;TR=273;WE=60921904;WS=60921886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr20	60927257	rs2427294	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=719;SC=CCACCTCTCCGTTCTCCAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=60927265;WS=60927247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	60927349	rs483876	C	T	4955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=96;NR=60;PP=2934;SC=TGCAGATGGCCGCGTCGTCCC;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=96;TCR=60;TR=156;WE=60927357;WS=60927339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr20	60927431	rs2427295	G	A	4850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=82;PP=2798;SC=GGGGAATGGCGGGAGGGGAGG;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=137;WE=60927439;WS=60927421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr20	60927475	rs2427296	G	A	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=61;PP=1942;SC=GGGTCCCCGCGGTGCCCGGGC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=86;WE=60927483;WS=60927465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	60937597	rs477859	A	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=-1.460;SC=TGCAGATGTCACAGTACTGGC;SOR=0.468;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=27;WE=60937605;WS=60937587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr20	60962624	rs755726	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=424;ReadPosRankSum=0.612;SC=CTTTCATTCTTACCGCCCAAG;SOR=0.898;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=24;WE=60962632;WS=60962614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr20	60963055	rs911077	T	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.853;SC=GGTGCCTGAGTAGATCTGCTG;SOR=0.437;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=153;TCF=59;TCR=94;TR=88;WE=60963063;WS=60963045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,97:0.55:175
chr20	60963346	rs11315364	CT	C	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=1.261;QD=10.02;ReadPosRankSum=2.605;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr20	60966318	rs6089219	G	T	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=37;PP=1645;SC=GATGAGCTGCGTCACGCCGCT;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=60966326;WS=60966308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr20	60968596	rs1570027	A	G	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=37;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GCAGCAGGCCATGGCTGTCAC;SOR=0.888;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=180;TCF=113;TCR=67;TR=103;WE=60968604;WS=60968586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,107:0.51:210
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chr20	60969929	rs2427310	C	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=202;ReadPosRankSum=1.392;SC=TGGGCCTGGCCGAGACCAGGC;SOR=0.199;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=18;WE=60969937;WS=60969919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr20	60970123	rs2427311	A	G	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=642;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GGCTCAAGGTACTGCTGCTTC;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=38;WE=60970131;WS=60970113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr20	60971306	rs748036	G	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=259;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TTGGCTGACAGGGGCAGGACC;SOR=0.216;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=15;WE=60971314;WS=60971296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr20	60971327	rs748037	A	C	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=7;PP=1409;SC=CCGTGGGCTTATGGAGACCAC;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=60971335;WS=60971317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	60982024	rs146975578	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;ReadPosRankSum=0.239;SC=TGGGGCTGAGCAGGCCCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=60982032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr20	60982118	rs184691263	G	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.915;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr20	60986019	rs2236200	A	C	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.389;SC=AGTGGCTGTCAGTTTCCTTCT;SOR=1.115;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=74;WE=60986027;WS=60986009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,85:0.45:188
chr20	60987737	rs6089366	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=394;ReadPosRankSum=0.531;SC=TGCCCGTGCTCCTGGGTGCAG;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=24;WE=60987745;WS=60987727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr20	60989185	rs10888228	C	T	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AGGCCTGCTGCGGCCAGAGCT;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=83;WE=60989193;WS=60989175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr20	60990162	rs62196317	G	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=820;ReadPosRankSum=0.892;SC=GGGTGAGGGTGGGGCAGGCGG;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=56;WE=60990170;WS=60990152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr20	60992224	rs2427325	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.012;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=336;ReadPosRankSum=1.234;SC=TGTCACCTCCTCCTCTCCTGA;SOR=1.017;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=26;WE=60992232;WS=60992214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr20	60992402	rs6061521	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTAAAGTGGGGTCCTGTTCCA;SOR=0.465;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=14;WE=60992410;WS=60992392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr20	61040453	rs6061243	C	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=436;ReadPosRankSum=-1.995;SC=GCTTGGCTTTCGAAGTGGCTG;SOR=0.482;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=27;WE=61040461;WS=61040443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr20	61040951	rs6587239	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=397;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GGATGCTTTCCTTCTTCATAG;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=26;WE=61040959;WS=61040941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr20	61041653	rs6061244	G	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=271;ReadPosRankSum=-2.042;SC=CCGGGTGCGCGGCTGGAGCAG;SOR=0.456;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=24;WE=61041661;WS=61041643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr20	61048549	rs41305803	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=974;ReadPosRankSum=-0.803;SC=GGCCGGTGCCGTCTCGGCGCC;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=72;WE=61048557;WS=61048539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,84:0.52:160
chr20	61143487	rs3934574	T	C	8774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=137;NR=127;PP=2965;SC=AGACCCCGAATCCACGGCTGT;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=138;TCR=127;TR=264;WE=61143495;WS=61143477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr20	61143945	rs3934573	T	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.41;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	61143951	rs45612436	G	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.89;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	61150928	rs12624794	A	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=530;SC=GTCTGGCCTCAGGAGCAAGGA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=61150936;WS=61150918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	61150959	rs116355995	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TCCCGGAGAAGGAGGAGGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=61150967;WS=61150949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr20	61162267	rs6062251	T	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=40;PP=1202;SC=ACCCAGCAGGTGGCGCGGGGA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=61162275;WS=61162257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	61162423	rs6062250	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=621;SC=AGCTGGGTGCTCCTGCTTGTT;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=61162431;WS=61162413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	61167632	.	G	GT	394	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=15;NR=2;PP=394;QD=23.7058823529;SC=CCTGCCCTGGGTTTTTTTTTT;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=17;WE=61167640;WS=61167622;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,17:0.50:34
chr20	61167883	rs6143064	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1071;SC=AGCCACTGCTGAAGGGACTCC;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=61167891;WS=61167873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	61167934	rs6143063	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=378;SC=AACGGGTATCTAGGCCCACCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=61167942;WS=61167924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr20	61273640	rs74455850	G	C	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=44;PP=855;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AGCTGGAGCGGGGAGTCCAGG;SOR=0.979;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=59;WE=61273648;WS=61273630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr20	61273717	rs6122141	G	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=130;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGTGCCCTGGGGGGGAGGAGG;SOR=0.197;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=16;WE=61273725;WS=61273707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr20	61289958	rs2427369	G	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1041;SC=TCCCAGGCACGGGGCCCCACA;SOR=2.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=61289966;WS=61289948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	61292373	rs144381587	G	GAGCCCCC	290.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=5;NR=0;PP=161;SC=CCACCTCCGGGAGCCCCCAGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=61292381;WS=61292363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	61326380	rs2427394	C	T	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=86;PP=2965;SC=TAGGATCCAGCCCTGAGCTTC;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=101;TCR=86;TR=186;WE=61326388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr20	61326636	rs13036933	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=44;PP=1462;SC=GGCAAAATCAGAGAAATAAGG;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=61326644;WS=61326626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr20	61326746	rs60990764	G	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.379;SC=TTTCCCAGAGGCACACATGTG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=4;WE=61326754;WS=61326736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr20	61331678	rs4809531	C	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=444;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CATCCTTAGCCCAAGGAGGAA;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=34;WE=61331686;WS=61331668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr20	61341286	rs3746780	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1219;ReadPosRankSum=0.151;SC=GAGCCTCAGTAACCAGCCCCG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=72;WE=61341294;WS=61341276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr20	61428423	rs11696245	A	C	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=27;PP=1574;SC=CTTTCTCCTCACCGCTCACCG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=61428431;WS=61428413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr20	61439708	rs760276	G	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GGCAGCCGGCGCTTCCATCCT;SOR=0.958;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=137;TCF=54;TCR=83;TR=71;WE=61439716;WS=61439698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr20	61440970	rs373508388	C	T	3473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CAGAACTGGACGGACAACTAT;SOR=0.579;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=271;TCF=144;TCR=127;TR=133;WE=61440979;WS=61440960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,161:0.51:313
chr20	61440971	rs1048792	G	A	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=1.059;SC=AGAACTGGACGGACAACTATG;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=271;TCF=141;TCR=130;TR=136;WE=61440979;WS=61440960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,150:0.48:313
chr20	61441035	rs2277772	G	A	6679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=134;PP=2965;SC=GGAGGATGGGGGGATGGGGGG;SOR=1.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=78;TCR=134;TR=212;WE=61441043;WS=61441025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr20	61441797	rs2277771	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=37;PP=1719;SC=GCACCTGCCCAAGGTCTGGAA;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=93;WE=61441805;WS=61441787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	61442043	rs6010749	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr20	61443547	rs2075776	A	G	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=36;PP=1417;SC=GAGGGGCCCCAGCCATTGACC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=78;WE=61443555;WS=61443537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	61443636	rs13038939	G	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=740;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGGGTGAGCTGGGCCTCGAGC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=50;WE=61443644;WS=61443626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr20	61443660	rs3204347	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=542;ReadPosRankSum=-2.468;SC=TCCAGGCGCCGCTGGTCCGCT;SOR=1.011;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=39;WE=61443668;WS=61443650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr20	61443870	rs11086139	C	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.001;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=711;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GCTCTCTGCCCCATCCGCTCG;SOR=1.414;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=42;WE=61443878;WS=61443860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr20	61453348	rs8114983	T	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=15;PP=617;SC=ACCAGCACAGTCCGTGGGAGT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=61453356;WS=61453338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	61453549	rs2294988	G	A	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=32;PP=1501;SC=AAGAAGTGCTGGGCATGGACT;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=68;WE=61453557;WS=61453539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr20	61455666	rs2746258	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=2.347;NF=15;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=-0.850;SC=TCCTGTCACCATGAGGAGTGG;SOR=1.162;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=20;WE=61455674;WS=61455656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr20	61455965	rs2734514	G	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=372;SC=CCTGGTTCCAGGGTTGCCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=61455973;WS=61455955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	61457062	rs2734515	G	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=26;PP=1298;SC=AGCTGTGAAGGGGGCAACACC;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=73;WE=61457070;WS=61457052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	61457670	rs11699142	C	T	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=929;SC=TTGTCTGCACCTCCAGACTTC;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=61457678;WS=61457660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	61458547	rs2249766	A	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=10;PP=726;SC=TCTCCGACCAACTCCATGGTG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=61458555;WS=61458537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	61458811	rs2249780	C	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=409;SC=AGGGCCCGAGCTCTCTCCCTG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=61458819;WS=61458801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	61459366	rs34492576	C	T	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=64;PP=2572;SC=GCTCCTCCCCCGGGTCCTGGG;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=61459374;WS=61459356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	61460053	rs2249897	A	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=10;PP=681;SC=CCCCCAGGGCAGGACTGTAGA;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=61460061;WS=61460043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	61460338	rs6062700	C	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	61460338	.	CGG	TGC	719	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=719;QD=70.2243522602;SC=GGTGAGTGCCCGGCGGGTGGG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=61460348;WS=61460328;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr20	61460340	rs114458036	G	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.32;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	61460372	rs73157303	C	T	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=194;SC=GCCACAGCTTCTGCCTGCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=61460380;WS=61460362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	61460913	rs3215568	T	TG	2417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1416;SC=GGCAAGGGGCTGGGGGGCCAG;SOR=0.908;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=44;WE=61460921;WS=61460903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	61461795	rs3830838	T	TG	4166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=61;PP=2899;SC=GGGCCTGGCATGGGGGGCGGC;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=86;WE=61461803;WS=61461785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	61462009	.	CATGA	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	61462015	.	A	ACC	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	61462018	.	C	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	61462020	.	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.23;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	61463501	rs741758	T	C	4198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=83;PP=2754;SC=TCTCTCCACATCCAGGGTCCG;SOR=1.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=130;WE=61463509;WS=61463491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr20	61467898	rs910152	G	C	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=79;PP=2382;SC=AGTCAGCCACGTGCACCGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=99;WE=61467906;WS=61467888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr20	61468413	rs73157316	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GAGTAAACGCCTGCACCCTTG;SOR=1.015;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=32;WE=61468421;WS=61468403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr20	61468571	rs2294995	T	C	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=831;ReadPosRankSum=0.274;SC=GAGGACCCCCTGGATACCGCG;SOR=0.704;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=64;WE=61468579;WS=61468560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr20	61468733	rs181375686	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=0.100;SC=CCCCTGGAACGTGGGGGCCTC;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=23;WE=61468741;WS=61468723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr20	61472131	.	G	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.066;SC=AAGCACAGTGGACGGTCATGA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=67;WE=61472139;WS=61472121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr20	61512606	rs910148	T	C	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=46;PP=2618;SC=CCGGTCTCAGTGGCCAGGCGC;SOR=1.213;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=123;WE=61512614;WS=61512596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr20	61524133	rs2294998	C	T	5831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=67;PP=2965;SC=AAGACACACACACGCACACAC;SOR=1.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=129;TCR=67;TR=196;WE=61524141;WS=61524123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr20	61524384	rs11362069	CT	C	390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=17;PP=248;SC=AGTAGAAAGCCTTTTTTTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=61524392;WS=61524374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	61526001	rs750079	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=1.465;SC=TTGAGACCCACGGGGGAGAAA;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=6;WE=61526009;WS=61525991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr20	61526023	rs1883846	T	G	161.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=71;SC=AAGGACCATCTAATACAAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=61526031;WS=61526013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	61527480	rs755740	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=5;PP=1600;SC=AGAAACGTCTTAGCTTTCCTG;SOR=4.277;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=60;WE=61527488;WS=61527470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	61527563	rs2013097	T	C	6425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=73;PP=2965;SC=AATACTCCAATGCACCGACAC;SOR=1.113;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=117;TCR=73;TR=190;WE=61527571;WS=61527553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr20	61528074	rs910149	T	C	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=74;PP=2965;SC=AGGCAGCCGTTGCCGCTGCAG;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=150;WE=61528082;WS=61528064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr20	61528271	rs1883847	C	T	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.781;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=875;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TTGCCCACCGCGGAGCCTGGA;SOR=0.402;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=175;TCF=64;TCR=111;TR=68;WE=61528279;WS=61528261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,92:0.42:217
chr20	61528306	rs1883848	A	G	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=90;PP=2722;SC=TGAGGCTGCCATGGCTGCCGC;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=135;WE=61528314;WS=61528296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
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chr20	61538390	rs11479019	GC	G	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.870;NF=12;NR=3;PP=372;ReadPosRankSum=0.254;SC=CCACGTGTGCGCCCCCCTACA;SOR=0.399;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=61538398;WS=61538382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
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chr20	61588745	rs2427457	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=906;ReadPosRankSum=1.204;SC=GGTGGTGCCCCTTGGTCCTGC;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=60;WE=61588753;WS=61588735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,70:0.61:114
chr20	61594493	rs3729555	G	A	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.288;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=15;PP=1204;ReadPosRankSum=1.012;SC=GGAGGCTGGCGCCCATGTGCA;SOR=1.001;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=114;TCR=34;TR=72;WE=61594501;WS=61594483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr20	61594679	rs2427463	A	G	10332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=184;PP=2965;SC=TCCAGGCACAACAGAGTCCCC;SOR=1.074;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=308;TCF=124;TCR=184;TR=308;WE=61594687;WS=61594669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr20	61595537	rs2427464	A	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=29;PP=2105;SC=AGATGGCCAGATGCCGGCCCT;SOR=1.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=61595545;WS=61595527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
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chr20	61597946	rs5842409	CT	C	8154.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=94;PP=2951;SC=AGGACCTTGCCTTACCCCAGC;SOR=0.807;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=41;TCR=98;TR=135;WE=61597954;WS=61597936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr20	61598899	rs3746750	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=850;SC=CAGCAGCCCCAGGACACAGGG;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=61598907;WS=61598889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	61847068	rs6090310	C	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=0.366;SC=CCGGCCCCGACGCGCGGTCAC;SOR=0.361;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=20;WE=61847076;WS=61847058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr20	61869223	rs6062855	T	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=880;ReadPosRankSum=-0.132;SC=TGGGTGGGACTTGGCTGGGGC;SOR=1.105;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=59;WE=61869231;WS=61869213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,66:0.49:135
chr20	61869607	rs6010878	C	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=554;ReadPosRankSum=1.257;SC=GGCGTCTCCACAGCAGCCCTC;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=35;WE=61869615;WS=61869597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr20	61869826	rs2273487	C	T	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TGCTGGGCTCCTGGGTGAGCG;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=84;TCR=122;TR=91;WE=61869834;WS=61869816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,106:0.43:245
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chr20	61870167	rs744591	C	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.832;SC=CCCCCAGTGCCAGGCCCCATT;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=101;TCR=59;TR=82;WE=61870175;WS=61870157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr20	61870220	rs744592	T	C	2852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1377;ReadPosRankSum=0.169;SC=GCCCATTGCCTGTCGCCATAC;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=112;WE=61870228;WS=61870210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,141:0.52:270
chr20	61870465	rs1075557	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=632;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GGGCCGGCCCAGCTTTCTCCT;SOR=0.543;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=51;WE=61870473;WS=61870455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr20	61870605	rs3215649	T	TG	704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.764;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=690;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CGGGACCCCCTGGGTGAGGGC;SOR=1.394;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=20;WE=61870613;WS=61870595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr20	61870634	rs1075556	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=308;ReadPosRankSum=-1.656;SC=GGGAGGGCTGAGGGACCCCGA;SOR=0.745;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=19;WE=61870642;WS=61870624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr20	61872905	rs1047826	A	G	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1534;ReadPosRankSum=-1.762;SC=GGGCTGGGGCAGCCACTGGGG;SOR=0.350;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=201;TCF=126;TCR=75;TR=105;WE=61872913;WS=61872895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,130:0.53:245
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chr20	61873080	rs1047819	T	A	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=705;ReadPosRankSum=0.187;SC=TTTGCTGACATCTCAGTGGGG;SOR=1.140;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=98;TCF=23;TCR=75;TR=42;WE=61873088;WS=61873070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr20	61875497	rs2236186	A	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=213;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GGTGTCATTGAGGCGATGTGG;SOR=0.272;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=22;WE=61875505;WS=61875487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr20	61878632	rs2236193	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=290;ReadPosRankSum=0.428;SC=GAGGCGGGGTGTCTCGGCCTG;SOR=0.442;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=19;WE=61878640;WS=61878622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr20	61878649	rs4809512	T	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=396;ReadPosRankSum=-1.030;SC=CCTGATCCGATTCCTTCCCAC;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=24;WE=61878657;WS=61878639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr20	61878830	rs13038098	C	T	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=907;ReadPosRankSum=0.571;SC=ACGCCTGAGGCCAGGTCAGCT;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=62;WE=61878838;WS=61878820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,74:0.51:144
chr20	61878950	rs872808	A	C	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=526;ReadPosRankSum=0.386;SC=ATCTGCAGGCAACTGTGTAGG;SOR=0.594;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=30;WE=61878958;WS=61878940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr20	61880169	rs1129659	T	G	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=1761;ReadPosRankSum=1.208;SC=GCACTCACCTTTAAGAGGCCA;SOR=0.454;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=253;TCF=138;TCR=115;TR=130;WE=61880177;WS=61880159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,146:0.50:290
chr20	61880274	rs2273497	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=708;ReadPosRankSum=-1.067;SC=ATGGGGCGGCAGCTGAACACA;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=116;TCF=33;TCR=83;TR=43;WE=61880282;WS=61880264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,42:0.36:118
chr20	61881296	rs927081	A	G	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=799;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CCACCATGACATAGCGCAGCC;SOR=0.472;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=59;WE=61881304;WS=61881286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr20	61885452	rs34203226	G	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.307;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr20	61885459	rs34830843	G	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=931;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GAAGGCTTCCGTCCGGCCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=22;WE=61885467;WS=61885442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr20	61907075	rs6011712	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=244;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGCCTGTAGTTCTGGGACCCT;SOR=0.481;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=61907083;WS=61907065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr20	61912715	rs2236195	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=286;ReadPosRankSum=-1.283;SC=TCACTGCCCCTGCCATGCCAC;SOR=1.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=19;WE=61912723;WS=61912705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr20	61914265	.	G	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=572;ReadPosRankSum=0.634;SC=CTGACGTCACGTGCAGCACCT;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=38;WE=61914273;WS=61914255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr20	61916379	rs13042357	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=774;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TGGGACTCAGCGAGGCCAAGC;SOR=1.030;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=57;WE=61916387;WS=61916369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,66:0.46:145
chr20	61917241	rs6090342	A	G	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1659;SC=TATGGAAACAACTTGGCCCAC;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=61917249;WS=61917231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	61918164	rs6062431	C	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=525;ReadPosRankSum=0.430;SC=GCTGGCGCTGCTCTGCTGTTC;SOR=1.143;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=31;WE=61918172;WS=61918154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr20	61940535	rs6062884	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCCTCGGGAGCGCCTGGCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=61940543;WS=61940534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr20	61941747	rs4809287	A	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=46;PP=1813;SC=TGGTGGAGGGACCCGCCGCCT;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=96;WE=61941755;WS=61941737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr20	61946692	rs6090357	C	T	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=34;PP=1340;SC=CCCTCCCCAGCGGTCTGTCAG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=61946700;WS=61946682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	61951326	rs11478836	CT	C	2467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=1937;SC=CTGGCCTGGCCTTGGGGGCTC;SOR=1.296;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=48;WE=61951334;WS=61951316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	61951489	rs6089881	G	C	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=46;PP=1497;SC=CACCCGCTGCGGGCTTCGTCA;SOR=1.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=61951497;WS=61951479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr20	61951789	rs6062891	C	T	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=32;PP=925;SC=GGTCACAGTGCCTGGGGTCAG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=61951797;WS=61951779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	61952490	rs4809533	A	G	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=1203;SC=ACCAGGGAACACTGGCCAATG;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=61952498;WS=61952480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	61953365	rs1884821	T	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=10;PP=501;SC=TCCTCTACCTTGGTTGGGTAG;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=27;WE=61953373;WS=61953355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	61956782	rs2314251	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=33;PP=1303;SC=CAGCCCATCTTCCCCCTCCAG;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=61956790;WS=61956772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr20	61960762	rs5842416	CTG	C	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=1121;SC=CAGGAGGCGCCTGTGTGGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=23;WE=61960771;WS=61960752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	61981104	rs1044397	C	T	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GCGGGGGCGGCGCTTTGGTGC;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=73;TCR=102;TR=95;WE=61981112;WS=61981094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,102:0.53:193
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chr20	61981554	rs2229959	C	A	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.063;SC=ACGGTGAGGGCGGGTGCAGGC;SOR=0.945;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=74;WE=61981562;WS=61981544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr20	61982085	rs1044394	A	G	4468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AGATCTCGGCACAGCACTCGT;SOR=0.922;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=422;TCF=237;TCR=185;TR=202;WE=61982093;WS=61982075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,218:0.47:461
chr20	61982124	rs1044393	A	G	5020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=546;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.189;SC=TGCCCACGGCATCCACGATGA;SOR=0.701;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=482;TCF=263;TCR=219;TR=229;WE=61982132;WS=61982114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:292,248:0.46:540
chr20	61982496	.	T	C	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=49;QD=20.9428031368;SC=CACGCCCACATCCACGTCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=61982504;WS=61982486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr20	61990874	rs6090384	T	C	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=895;ReadPosRankSum=0.740;SC=TCAGTCACAGTGCACGATGGC;SOR=0.596;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=64;WE=61990882;WS=61990864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr20	61992285	rs11698563	A	C	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=163;SC=GTGCGAGCGCAGCCTGTGCGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=61992293;WS=61992275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	61992467	rs79739740	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.095;SC=TCCCCAGAAGCAGCAGCAGCG;SOR=1.038;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=9;WE=61992475;WS=61992457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr20	61992547	rs6090387	G	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=12;PP=301;SC=CTCTAGATGCGGGCGGCTCCC;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=61992555;WS=61992537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	62005458	rs35318934	G	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=848;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CACAGATGCCGCCATCCGTCC;SOR=0.820;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=51;WE=62005466;WS=62005448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr20	62043227	rs62208003	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=327;ReadPosRankSum=-0.043;SC=ACCCACAATCATATCTATCCT;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=25;WE=62043235;WS=62043217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr20	62046496	rs112006486	C	CGACAGACA	10384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=83;PP=2980;SC=CCACGGGAACCGACAGACAGA;SOR=1.022;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=123;TCF=17;TCR=106;TR=98;WE=62046507;WS=62046486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	62119559	rs2750403	C	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr20	62119595	.	C	G	86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=86;QD=40.2570708491;SC=GGGGCCCGGGCCCGGGGTTCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=62119603;WS=62119580;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr20	62119615	rs2750402	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=1;PP=292;SC=GGAGCGCGGCACCGCCGGGGA;SOR=2.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=62119623;WS=62119605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	62121702	rs310607	A	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=29;PP=1751;SC=ACAGGCGTGAACCACTGCGCC;SOR=1.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=62121710;WS=62121692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	62121726	rs310608	T	C	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=31;PP=2020;SC=CCTGAGGGTCTGGTTTTCTCC;SOR=1.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=102;WE=62121734;WS=62121716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr20	62121820	rs45510898	G	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1143;ReadPosRankSum=2.457;SC=TGGACCCAGCGCAGCCCCCCA;SOR=0.946;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=78;WE=62121828;WS=62121810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,83:0.44:187
chr20	62124459	rs12480745	G	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=-0.750;SC=AGCTGGCCAGGCAGGAGCTCC;SOR=0.097;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=62124467;WS=62124449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr20	62124731	rs113504041	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=974;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GAGTACTGCTGTTCAGGCTAA;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=60;WE=62124739;WS=62124721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr20	62127121	rs310618	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=327;ReadPosRankSum=1.135;SC=CAGGAGACCCTACCATCCCAG;SOR=1.201;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=17;WE=62127129;WS=62127111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr20	62127521	rs310619	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.339;SC=GCTCTCCGTCGGGGTCCTGGG;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=9;WE=62127529;WS=62127511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr20	62161161	rs45520941	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CTGCCCCTTCCTGGGGCCTTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=62161169;WS=62161151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr20	62161389	rs117636275	A	G	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=14;PP=874;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GACCTCCCCCACTCTGCCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=91;TCR=29;TR=59;WE=62161397;WS=62161379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr20	62161418	rs374800	G	C	3922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=5.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.683;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,100:0.49:206
chr20	62161422	rs6011874	G	A	3966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,107:0.49:218
chr20	62161998	rs310642	A	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=1.832;SC=CAGGGGCCGCATCCTGCTCCC;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=62162006;WS=62161995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
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chr20	62163817	.	G	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.605;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr20	62163863	rs74927664	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=376;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CAAGAGCCCCGGCCCATGCCA;SOR=1.189;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=21;WE=62163871;WS=62163853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr20	62164868	rs113862030	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=461;ReadPosRankSum=0.429;SC=AGGGCAGGCACGGGGCCACAC;SOR=1.032;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=27;WE=62164876;WS=62164858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr20	62172269	rs310654	C	A	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.427;SC=AGCATGAGCACGTAGACCTCC;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=224;TCF=106;TCR=118;TR=96;WE=62172289;WS=62172259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,112:0.43:261
chr20	62172281	rs310655	C	T	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TAGACCTCCGCCGGGCAGGCA;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=211;TCF=97;TCR=114;TR=89;WE=62172289;WS=62172259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,107:0.43:250
chr20	62173029	rs310656	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=340;SC=CGGTGAGGCCAGCGTCCACCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=62173037;WS=62173019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	62173741	rs310658	G	A	2695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1674;ReadPosRankSum=0.680;SC=GGGCTTGAGGGTTGGACAGCA;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=92;WE=62173749;WS=62173731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,115:0.54:212
chr20	62173817	rs34969822	C	T	3083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=51;PP=1576;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TTGATCGCCACGGGCAGGGAG;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=247;TCF=131;TCR=116;TR=112;WE=62173825;WS=62173807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,152:0.46:329
chr20	62173925	rs404613	T	G	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,63:0.52:122
chr20	62173925	.	TCG	GCA	1967	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=14;NR=35;PP=1967;QD=41.2340382625;SC=ACGTCCTGCCTCGGGGCCTTC;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=103;TCF=23;TCR=80;TR=49;WE=62173935;WS=62173915;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:54,49:0.48:103
chr20	62173927	rs378483	G	A	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.42;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr20	62174867	rs6011894	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=0.323;SC=ACCCCTGCCTTGGCTGCCAGC;SOR=0.970;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=26;WE=62174875;WS=62174857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr20	62187187	rs3746348	T	C	6701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=78;PP=2965;SC=CGGACCTGAGTCCGCACCTGC;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=171;WE=62187195;WS=62187177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr20	62187439	rs734750	T	C	8631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=166;PP=2965;SC=CTGAGCTGGATGCCCTGCTCC;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=109;TCR=166;TR=275;WE=62187447;WS=62187429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr20	62191321	rs3810477	A	G	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=41;PP=1717;SC=TGACAGCCACATTCACTTGGT;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=62191329;WS=62191311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	62191475	rs3810478	T	G	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=26;PP=761;SC=GAGGCCCTGCTGCCGCTGCGC;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=62191483;WS=62191465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	62191558	rs3810479	G	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=0.288;SC=CGGCCACCCCGGCGATGCCCT;SOR=0.643;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=22;WE=62191566;WS=62191548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr20	62192374	rs3810480	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=821;ReadPosRankSum=2.052;SC=ACAGGGCACCCCAGGTGGGAG;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=40;WE=62192382;WS=62192364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr20	62193019	rs11551684	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=979;ReadPosRankSum=0.529;SC=TGCCCACACGCGGCACTGGGA;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=58;WE=62193027;WS=62193009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr20	62193414	rs310629	A	G	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=90;PP=2965;SC=CTCCCCCGGCATGGGCCCTAC;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=170;WE=62193422;WS=62193404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr20	62193445	rs3810481	G	A	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.500;SC=CTGAATGACCGTGAAAGGCTT;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=70;WE=62193453;WS=62193435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,83:0.48:174
chr20	62193587	rs3810482	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=5.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr20	62194030	rs3810483	G	C	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=60;PP=2170;SC=TCCCAGTCCTGCGTCTGCCCG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=106;WE=62194038;WS=62194020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	62194103	rs3810484	A	G	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=41;PP=2072;SC=TGCTGGGCCCAGGGCGTGGGC;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=62194111;WS=62194093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr20	62194128	rs3810485	G	A	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=1126;ReadPosRankSum=0.589;SC=CGTGGGAGCCGGCAGCCCCTC;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=71;WE=62194136;WS=62194118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr20	62194713	rs3810486	A	C	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=819;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CTCCACGGCCAGGGTGTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=63;WE=62194721;WS=62194703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
chr20	62195220	rs3827022	C	T	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=97;PP=2965;SC=CTGGTGGCCCCGGGCGCAGCG;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=188;WE=62195228;WS=62195210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
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chr20	62196182	rs3810488	G	C	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=89;NR=80;PP=2965;SC=CTCGGCGGCCGGCAACCCGGC;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=89;TCR=80;TR=169;WE=62196190;WS=62196172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr20	62196807	rs310632	T	C	8537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=129;NR=137;PP=2965;SC=GGGCTCCGCGTGCAGCAGCTT;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=129;TCR=137;TR=266;WE=62196815;WS=62196797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr20	62196884	rs310633	A	G	5592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=87;PP=2965;SC=GCCTGGCGACAGTGTCCAGCA;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=179;WE=62196892;WS=62196874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr20	62198348	rs438363	C	T	10855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=185;PP=2965;SC=CCGGTCTGGGCTGCCCGCCAC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=328;TCF=143;TCR=185;TR=328;WE=62198356;WS=62198338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr20	62198662	rs367440	A	G	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=66;PP=2688;SC=CGTGCGAGGCATAGGCCAGCG;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=136;WE=62198670;WS=62198652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr20	62199126	rs3810491	C	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1071;SC=TGGTGTCCCTCCTGTCAGGAG;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=62199134;WS=62199116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	62200471	rs6089923	C	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=21;PP=991;SC=GCTCCTGCTACCCCAGCTGCT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=62200479;WS=62200461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	62200575	rs1741594	TG	CA	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=28;PP=2518;SC=AGTTGGTTGGTGAGATGGGGC;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=58;WE=62200584;WS=62200565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	62200860	rs1757752	A	G	7608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=122;PP=2965;SC=CGAACGAGGCAGCCTGCACAC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=121;TCR=122;TR=243;WE=62200868;WS=62200850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr20	62202240	rs402211	A	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=574;SC=CAGGGAGGTCAGCAGGGCTAC;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=62202248;WS=62202230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	62202301	rs3746346	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=431;SC=CCCTCAGCCCAATACTGGCCT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=62202309;WS=62202291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	62203748	rs34681475	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=132;SC=TCTCCACGGCGCTGTGTGCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=62203756;WS=62203738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	62221364	rs2297427	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=1.206;SC=CCAGCCCTGCGGCCTCTGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=62221372;WS=62221356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr20	62221610	rs311496	T	C	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=59;PP=2867;SC=TGAGCAGCTGTAGCGGGCTGA;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=62221618;WS=62221600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr20	62221766	rs2297428	C	T	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1425;ReadPosRankSum=-1.716;SC=GCGGGGAGGCCGGGGAGCTGG;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=89;WE=62221774;WS=62221756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,110:0.53:208
chr20	62221988	rs137882845	C	T	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GCAGGGAGACCGGCGTCAGCG;SOR=0.575;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=95;WE=62221996;WS=62221978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr20	62223371	rs311494	A	G	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=24;PP=2468;SC=TGGTCTCAGCATACCTGCCAG;SOR=2.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=97;TCR=24;TR=120;WE=62223379;WS=62223361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr20	62224595	rs2236503	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=1.261;SC=AAGTGTACCTGCCTTATATTT;SOR=0.914;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=62224603;WS=62224585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr20	62227081	rs311489	A	G	5168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=82;PP=2965;SC=AGACCTTGTCATGCTGGTAGA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=87;TCR=82;TR=169;WE=62227089;WS=62227071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr20	62227180	rs2282157	C	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=-1.197;SC=GCACCTGGCCCGCCCACCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=30;WE=62227188;WS=62227170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr20	62229072	rs2297429	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=546;ReadPosRankSum=1.279;SC=TGCCAGGGCCCCTTCCAGCAG;SOR=1.379;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=28;WE=62229080;WS=62229062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr20	62229244	rs2297430	T	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TGGGTCAAGCTTGGCCGGGAC;SOR=0.370;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=168;TCF=71;TCR=97;TR=78;WE=62229252;WS=62229234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,91:0.46:198
chr20	62229337	rs414897	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=1.701;SC=GGCTCTGACCGGTGCAGGCCT;SOR=0.737;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=24;WE=62229345;WS=62229327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr20	62234240	rs4809312	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
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chr20	62234241	rs2145262	A	G	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=262;SC=GGATGCACTCAGCACAGCTGC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=62234249;WS=62234230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr20	62309392	rs114703330	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=1.755;SC=CCTCTTCCTTTCCATGTTGGT;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=7;WE=62309400;WS=62309382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr20	62312299	rs2297440	T	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr20	62319604	rs2777941	A	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=-0.687;SC=CTGGTAGGGAACCCTGCAGAC;SOR=0.988;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=38;WE=62319612;WS=62319594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,44:0.36:123
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chr20	62323006	rs2236507	G	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=594;ReadPosRankSum=0.990;SC=GGGCTCCTTGGGACCATCTTC;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=46;WE=62323014;WS=62322996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr20	62326110	rs3208008	A	C	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=1051;ReadPosRankSum=2.010;SC=CTGGCAGCCAACCACAGTGGG;SOR=0.465;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=114;TCF=84;TCR=30;TR=59;WE=62326118;WS=62326100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
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chr20	62328375	rs2738787	A	G	5614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=92;PP=2965;SC=GGAACTACCTAGAGCGCTGCC;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=79;TCR=92;TR=171;WE=62328383;WS=62328365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr20	62328453	rs2258056	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=719;ReadPosRankSum=0.010;SC=CCCACAACCGTGCCTGCCGCT;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=49;WE=62328461;WS=62328443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr20	62328742	rs909341	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=563;ReadPosRankSum=0.053;SC=CAGCCAGCAGCTCCAGCTCAG;SOR=0.407;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=37;WE=62328750;WS=62328732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr20	62328829	rs1291205	C	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=326;ReadPosRankSum=-1.800;SC=CCCATGACACCCTGTGCACCA;SOR=0.779;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=21;WE=62328837;WS=62328819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr20	62331989	rs1048665	T	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=541;ReadPosRankSum=0.110;SC=TCAGGCAATCTCGCCTGCCGA;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=38;WE=62331997;WS=62331979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr20	62332436	rs2738788	A	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=322;SC=TCAGTGATGGAGGCAGTCTGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=62332444;WS=62332426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	62332638	rs374497353	A	AC	1931.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.180;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=1812;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GTGAAGATTCACCTGGCCCTC;SOR=0.930;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=14;TCR=74;TR=42;WE=62332649;WS=62332628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
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chr20	62333115	rs2236508	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr20	62333350	.	GCCCC	G	82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=61.07;NF=1;NR=4;PP=82;QD=17.2;SC=CACTCCCTCTGCCCCCCCCCC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=62333361;WS=62333340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr20	62337622	rs1291211	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=501;SC=GGTAAGGAAAACTGCTGAGGA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=62337630;WS=62337612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	62340115	rs1291212	C	G	4687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=53;PP=2604;SC=GGAAGAGCAGCTTGTTGGCCG;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=122;WE=62340123;WS=62340105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr20	62364885	rs6011068	T	A	6439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=71;PP=2965;SC=GGTGGTTCCCTTCAGTGGCAC;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=123;TCR=71;TR=194;WE=62364893;WS=62364875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	62366478	rs2427534	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=3;PP=128;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GGGGTCCCGCAGCCACAGCAC;SOR=1.140;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=10;WE=62366486;WS=62366468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr20	62367377	rs2427535	A	G	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=52;PP=1486;SC=TGGGGCGTGCAGACACTGCTG;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=62367385;WS=62367367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	62368804	rs2236510	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=265;ReadPosRankSum=-0.955;SC=GCCCCGCAGCCGCGGGAGGTG;SOR=0.065;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=17;WE=62368812;WS=62368794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr20	62369300	rs914559	C	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr20	62369426	rs150938918	C	CGGGGCG	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.252;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr20	62369895	rs1151624	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=717;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GGGCCGGCAGATCCTCAGCAG;SOR=0.565;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=47;WE=62369903;WS=62369885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,51:0.45:113
chr20	62370349	rs1056441	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GTCCCCGGGCTGCCAGCCCGT;SOR=1.041;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=12;WE=62370357;WS=62370339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr20	62372706	rs4809221	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=163;ReadPosRankSum=2.314;SC=CCCGCACCCCGCCCCCATCTC;SOR=0.660;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=12;WE=62372714;WS=62372696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr20	62372813	rs2427536	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=32;PP=1258;SC=TGGGGGCCCCGGTTGCAGCCT;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=62372821;WS=62372803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	62372956	rs2253823	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=1.630;SC=AATGGACTCCCGCACCCTCAG;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=62372964;WS=62372946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	62373707	rs8957	G	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=622;ReadPosRankSum=1.396;SC=CAGAGCCTGAGCAGAGTGATG;SOR=0.918;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=42;WE=62373715;WS=62373697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr20	62373983	rs2256814	G	A	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=890;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GTGAGGCCACGGGTGGCAGCT;SOR=0.907;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=57;WE=62373991;WS=62373973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr20	62374219	rs1151626	A	C	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=53;PP=2838;SC=ATGTCCTGTGACCCCCCGCAC;SOR=1.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=131;WE=62374227;WS=62374209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr20	62374389	rs1058319	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=770;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TCCCTCCCCACCCCCTCCAGG;SOR=0.762;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=49;WE=62374397;WS=62374379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr20	62374441	rs6742	T	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=27;PP=769;SC=AGGGGCTGGCTTTCACCAGCT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=62374449;WS=62374431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	62384309	rs2281926	G	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=457;ReadPosRankSum=0.984;SC=CCAGCAGCCAGGACGGGCTGT;SOR=1.031;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=31;WE=62384317;WS=62384299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr20	62507947	rs76235411	T	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=1.773;SC=CTGTGGGATTTTTTCATCTGT;SOR=0.627;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=7;WE=62507955;WS=62507937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr20	62518729	rs3795156	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.413;SC=GGTGCCCCCCATGAGGCCAAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=62518737;WS=62518719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr20	62518766	rs3795157	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=491;ReadPosRankSum=0.998;SC=GAGTTTCCTTCGGGGGCATTG;SOR=1.209;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=22;WE=62518774;WS=62518756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr20	62520671	rs6062569	T	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr20	62520674	rs6010690	G	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr20	62559964	rs817362	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=587;SC=TGTGTAATGTGCTCCTTATAG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=62559972;WS=62559954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	62571417	rs35264801	AG	A	3623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=-0.062;NF=44;NR=49;PP=1770;ReadPosRankSum=0.361;SC=CCCTGGAAAAAGGGGGGGGGG;SOR=1.187;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=93;WE=62571437;WS=62571407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,145:0.99:147
chr20	62573064	rs817370	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-1.268;SC=CTCTTGGCTGTCCCGTCCCGC;SOR=1.460;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=10;WE=62573072;WS=62573054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr20	62578077	rs111264888	A	AT	589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=521;SC=CCCACAGGGCACCCCCCCCAC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=62578085;WS=62578067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr20	62663235	rs45597833	C	T	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GTCCTGCAGCCACTCACTCTG;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=68;WE=62663243;WS=62663225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr20	62664365	rs7550	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=964;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTGCCATGGCCGGTCTCCGTG;SOR=0.918;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=64;WE=62664373;WS=62664355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr20	62670369	rs118165004	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=641;ReadPosRankSum=0.699;SC=CTTCGCCTGCCTCTCTGTGGG;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=42;WE=62670377;WS=62670359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr20	62697751	rs4809251	T	C	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=30;PP=1606;SC=CCTTGTGTTCTCCTCCAGTAG;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=62697759;WS=62697741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	62698188	rs34848242	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.785;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.193;NF=25;NR=2;PP=522;ReadPosRankSum=0.875;SC=GTCCTGTGGGGGCCACCAAGG;SOR=2.101;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=27;WE=62698196;WS=62698178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr20	62698239	rs140296093	T	TC	1901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.973;NF=24;NR=23;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GGCCCCTGCCTCCCCCAACCC;SOR=0.700;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=47;WE=62698247;WS=62698229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,75:0.52:144
chr20	62698484	rs10460612	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=372;ReadPosRankSum=0.556;SC=GAGCCAGGTCGCTTGGGAGTG;SOR=1.850;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=21;WE=62698492;WS=62698474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr20	62701092	rs4809393	A	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=583;ReadPosRankSum=1.017;SC=CCAGTGGGGGAAGCTAGTCAG;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=43;WE=62701100;WS=62701082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr20	62703791	rs6011278	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CTCCCTGGGGTTGGGCAGTGC;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=16;WE=62703799;WS=62703781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr20	62705140	rs6011280	A	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=-1.999;SC=CCTGCCGACAACAACACCTGA;SOR=0.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=62705148;WS=62705130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr20	62714783	rs6010717	C	G	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=68;PP=2965;SC=CACTCTCAGTCGCCGTCACCG;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=62714791;WS=62714773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr20	62715089	rs4337532	G	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=16;PP=551;SC=AGCGCGCGCCGAGCCCCGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=28;WE=62715097;WS=62715079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	62715548	rs4431000	C	A	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=9;PP=373;SC=CCCTTGCGCCCGCCCTCCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=62715556;WS=62715538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	62729431	rs2229205	C	T	3342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=82;PP=2211;ReadPosRankSum=0.593;SC=CCCAGGCTGTCAATGTGGCCA;SOR=0.834;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=255;TCF=108;TCR=147;TR=138;WE=62729439;WS=62729421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,153:0.53:286
chr20	62730165	rs2229206	C	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=0.231;SC=AGGCGTGGACCTGCCCATGGT;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=23;WE=62730173;WS=62730155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr20	62737028	.	G	A	21	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=140;MMLQ=16;MQ=56.62;NF=1;NR=2;PP=21;QD=18.5904041824;SC=GATGATGGGCGTGATGATGGG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=62737036;WS=62737025;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr20	62737318	rs13036542	G	A	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=80;PP=2965;SC=GTGGGGTCTGGGGCAGGTCCG;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=136;WE=62737326;WS=62737308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr20	62838933	rs6090069	T	C	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=16;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CACGTTGATTTTGATTTTGTG;SOR=1.181;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=102;TCR=34;TR=74;WE=62838941;WS=62838923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr20	62839888	rs59834539	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=278;ReadPosRankSum=-0.427;SC=CTTTCACCCCTGCCCCAGGTG;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=20;WE=62839896;WS=62839878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr20	62843515	.	A	G	658	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=59.84;NF=8;NR=32;PP=658;QD=17.3192803137;SC=GCTGGGCCGTAGTGGGGGCCA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=40;WE=62843523;WS=62843505;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr20	62845108	rs1569995	G	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr20	62859179	rs6089798	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=0.571;SC=GGGTGAGATGAACGGGTGTGA;SOR=1.109;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=16;WE=62859187;WS=62859169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
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chr21	9907416	.	C	T	3961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.516;NF=31;NR=86;PP=1780;ReadPosRankSum=0.286;SC=AAGCTTCTCCCGCAGCGCTGT;SOR=0.699;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=324;TCF=81;TCR=243;TR=117;WE=9907424;WS=9907406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,105:0.33:316
chr21	9907503	.	C	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.60;MQRankSum=0.815;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr21	10793776	rs368569117	GGAGTT	G	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.63;QD=43.13;SOR=4.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	10793779	.	GTTGAATGGAGCAGAATGGAA	G	959	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=117;MMLQ=17;MQ=48.52;NF=29;NR=3;PP=959;QD=30.6875;SC=GAAGAATGGAGTTGAATGGAG;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=32;WE=10793806;WS=10793770;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr21	10793781	.	T	G	2514	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=134;MMLQ=28;MQ=51.42;NF=35;NR=2;PP=2514;QD=20;SC=AGAATGGAGTTGAATGGAGCA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=37;WE=10793806;WS=10793770;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,37:0.80:46
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chr21	10793822	rs143361187	G	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=12.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=1.852;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,11:0.15:75
chr21	10793825	rs139250106	T	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=10.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQRankSum=1.999;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,11:0.14:76
chr21	10793860	.	T	TGG	4717.19	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.40;MQRankSum=-2.096;QD=38.35;ReadPosRankSum=-1.793;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:9,114:0.93:123
chr21	10793861	.	A	G	2951	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=77;MMLQ=18;MQ=53.74;NF=86;NR=71;PP=2951;QD=20;SC=GGAATGGAGTAGAATGGAATG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=10793869;WS=10793851;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr21	10793861	.	A	AATGGAATGGAATGGAGTG	8240.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.68;QD=45.53;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr21	10793885	rs200167075	A	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=2.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=0.362;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,23:0.10:239
chr21	10793891	rs28490105	T	G	10251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=68;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=91;PP=2965;SC=GGACACGAATTGGATGGACTT;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=171;WE=10793899;WS=10793881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr21	10793906	rs146787155	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQRankSum=-1.035;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,30:0.12:249
chr21	10793912	rs200243265	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=-1.156;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,31:0.12:257
chr21	10793925	rs28641787	T	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=2.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.99;MQRankSum=-0.797;QD=3.87;ReadPosRankSum=-2.226;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,59:0.24:247
chr21	10793946	.	C	CGAATAGAATGGACTT	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.945;HP=1;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.746;NF=6;NR=49;PP=2954;ReadPosRankSum=3.094;SC=GGAATGGAGTCGAATAGAATG;SOR=0.583;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=11;TCR=103;TR=55;WE=10793954;WS=10793936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,23:0.12:196
chr21	10793961	.	T	TGAATGGAATGGACTC	2212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.976;NF=5;NR=51;PP=2974;ReadPosRankSum=1.949;SC=AGAATGCACTTGAATGGAATG;SOR=1.475;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=8;TCR=86;TR=56;WE=10793969;WS=10793951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,97:0.82:119
chr21	10793969	.	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=7.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.97;MQRankSum=-2.375;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,17:0.10:178
chr21	10793981	rs199550473	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=9.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.17;MQRankSum=-2.039;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.855;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,13:0.12:105
chr21	10794006	rs373540490	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=6.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-2.254;QD=0.72;ReadPosRankSum=-3.104;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,5:0.08:64
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chr21	10794047	rs28970391	G	A	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=43.82;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr21	10862618	rs3916251	T	C	11101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=91;PP=2965;SC=CACAGCTCCTTACCATGGACT;SOR=1.097;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=137;TCR=91;TR=227;WE=10862626;WS=10862608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
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chr21	10862846	.	ATCACCAG	TTCACCAA,TTCACCAG	2814	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=53.34;NF=76,119;NR=60,102;PP=2814,1268;QD=20;SC=TGGATACACCATCACCAGCTA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=136,221;WE=10862861;WS=10862836;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.61:222
chr21	10862853	rs1961808	G	A	3839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-0.183;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,156:0.65:239
chr21	10862874	rs1807747	A	G	7042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.953;NF=151;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CACTGGGTGCACCAGGTCCAT;SOR=1.152;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=152;TCR=97;TR=247;WE=10862882;WS=10862864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,260:0.99:262
chr21	10862947	rs3883944	G	A	9922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=173;NR=158;PP=2965;SC=GCTATGCACAGAAGTTCCAGG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=331;TCF=173;TCR=158;TR=331;WE=10862955;WS=10862937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr21	10863087	rs28521368	T	G	8430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=151;PP=2965;SC=TCTTGAGAGTTTCAGAAACTG;SOR=1.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=108;TCR=151;TR=259;WE=10863095;WS=10863077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr21	10910291	rs150480	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.333;NF=64;NR=39;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.421;SC=GCAGAGGCTACTTTGTGATTA;SOR=0.843;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=285;TCF=175;TCR=110;TR=103;WE=10910299;WS=10910281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,104:0.30:343
chr21	10910311	rs9996	T	G	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.532;NF=66;NR=45;PP=1512;ReadPosRankSum=1.092;SC=ACTCACCGAATAGAAAAACTG;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=319;TCF=185;TCR=134;TR=111;WE=10910319;WS=10910301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,117:0.29:402
chr21	10910347	rs150482	A	G	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.938;NF=62;NR=64;PP=1767;ReadPosRankSum=0.515;SC=ATACAGAGGTAGACCGTCGAA;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=341;TCF=167;TCR=174;TR=126;WE=10910355;WS=10910337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,140:0.33:425
chr21	10916293	rs150483	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.304;NF=16;NR=11;PP=334;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CTGTATATACAACTATGAGCA;SOR=0.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=27;WE=10916301;WS=10916283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chr21	10920098	rs212146	T	C	6801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=121;PP=2965;SC=GAAGGAGTTTTTACTCCCTGA;SOR=1.001;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=89;TCR=121;TR=210;WE=10920106;WS=10920088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr21	10935116	rs625018	T	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.588;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CATCTTCTAGTGGAGATTCAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=10935124;WS=10935106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr21	10942660	rs373444942	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=4.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.450;QD=1.55;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,50:0.16:307
chr21	10944828	rs146327494	CAAG	C	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.826;NF=0;NR=11;PP=395;ReadPosRankSum=-0.258;SC=TTCCCCCCTGCAAGAAGAGAT;SOR=0.928;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=11;WE=10944838;WS=10944818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr21	10959881	rs212112	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.452;NF=5;NR=34;PP=699;ReadPosRankSum=1.832;SC=TATTTGAATAGCAAGAATCCC;SOR=0.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=39;WE=10959889;WS=10959871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr21	10971892	rs10433039	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-1.766;SC=TCTTTGTTTTGGCTGGGATTT;SOR=0.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=10971900;WS=10971882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
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chr21	10973798	rs469961	T	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=6.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.636;NF=7;NR=39;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CAAAAGAATATAGTCAGACAG;SOR=1.822;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=142;TCF=36;TCR=106;TR=46;WE=10973806;WS=10973777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,44:0.29:150
chr21	10998165	rs364232	C	A	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.28;QD=29.27;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	11026960	rs369640717	T	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.255;NF=10;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TAGATAAGTATTAAAAGACCT;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=15;WE=11026968;WS=11026950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr21	11027065	.	C	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.439;NF=6;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-0.715;SC=AGGCCTGTCACTGTGAACGCT;SOR=0.348;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=15;WE=11027073;WS=11027055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,18:0.25:71
chr21	11027085	rs6421268	A	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.767;NF=4;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=1.558;SC=TATCAGCAAGACTTTGCATGA;SOR=0.495;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=12;WE=11027093;WS=11027075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr21	11038649	rs28565510	C	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQRankSum=0.945;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr21	11038796	rs71227100	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-11.322;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:330,83:0.20:413
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chr21	11038868	rs67736403	C	T	3328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=6.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=26.236;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.774;NF=136;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.988;SC=AGGGTAATTACGCAGCATGTC;SOR=1.446;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=400;TCF=221;TCR=179;TR=234;WE=11038876;WS=11038858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,151:0.43:349
chr21	11039033	rs28369127	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=0.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQRankSum=-2.532;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:640,91:0.12:731
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chr21	11039152	rs2740231	A	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.176;QD=1.69;ReadPosRankSum=-1.890;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:484,63:0.12:547
chr21	11049364	rs468502	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.774;NF=31;NR=2;PP=538;ReadPosRankSum=0.045;SC=TGAACAACCTCTATTATATTA;SOR=0.605;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=103;TCR=7;TR=33;WE=11049372;WS=11049354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,26:0.27:95
chr21	11049395	rs467462	T	C	4547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=1.596;QD=29.92;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,129:0.85:152
chr21	11049395	.	TAATAGGGTC	CAATAGGGTC,CAATAGGGTG	1765	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=49.16;NF=112,69;NR=38,24;PP=959,1765;QD=6.62514141698;SC=TAGCGCCTAGTAATAGGGTCC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=183;TCF=138;TCR=45;TR=150,93;WE=11049412;WS=11049385;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.82:183
chr21	11049404	rs2259244	C	G	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQRankSum=1.985;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr21	11049503	rs7280925	T	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.97;MQRankSum=0.205;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.203;SOR=1.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr21	11049516	rs468629	G	A	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.25;QD=32.22;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	11058119	rs2261873	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.175;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.797;NF=37;NR=6;PP=903;ReadPosRankSum=-1.407;SC=TTTCAGTAAACACATTGGTTG;SOR=1.343;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=43;WE=11058127;WS=11058109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr21	11058226	rs4913558	G	C	3875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.773;NF=87;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=3.190;SC=ATCCTGAAAGGTGTCGGCTCC;SOR=0.802;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=351;TCF=220;TCR=131;TR=154;WE=11058237;WS=11058216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,176:0.51:344
chr21	11058227	rs2775343	T	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=10.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQRankSum=-9.989;QD=2.67;ReadPosRankSum=-8.024;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,42:0.12:347
chr21	11058229	rs55883018	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=10.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQRankSum=-10.579;QD=2.60;ReadPosRankSum=-8.225;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:309,47:0.13:356
chr21	11058349	rs209032	T	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=29.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.31;MQRankSum=0.558;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=3.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,31:0.12:261
chr21	11058404	rs58094605	A	ACT	1019.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.77;MQRankSum=-2.809;QD=31.87;ReadPosRankSum=1.005;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr21	11059734	rs75838613	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQRankSum=1.365;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr21	11059735	rs2775349	T	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.24;MQRankSum=-1.601;QD=37.62;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,40:0.93:43
chr21	11059736	rs7279429	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQRankSum=-4.484;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr21	11059744	rs57566895	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQRankSum=-3.547;QD=30.04;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr21	11059799	rs74827812	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-4.376;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr21	11059841	rs77547988	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-3.874;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,13:0.17:77
chr21	11059845	rs7364036	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.323;NF=15;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-1.053;SC=ATTAGCCGGACGTGGTGGCAG;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=31;WE=11059862;WS=11059831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr21	11059853	rs75278999	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=6.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.351;SOR=1.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,13:0.15:87
chr21	11059854	rs75079963	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.000;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.078;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,18:0.20:88
chr21	11059877	rs7364059	T	C	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=726;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CCCAGCTACTTAGGAGGCTGA;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=42;WE=11059885;WS=11059867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr21	11059951	rs75112368	T	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-2.579;QD=0.85;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,7:0.14:49
chr21	11060013	rs2838200	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.260;NF=0;NR=6;PP=135;ReadPosRankSum=1.940;SC=GGTATTAATGTATTAGAAACA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=11060021;WS=11060003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr21	11060029	rs112803135	A	AAAAAT	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.189;NF=0;NR=5;PP=253;ReadPosRankSum=2.189;SC=AAACACAGAAAAAATATTTGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=11060037;WS=11060019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr21	11098626	rs1967649	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.530;NF=30;NR=18;PP=676;ReadPosRankSum=1.271;SC=ATCTCTAGCCGGTCAAGAGCA;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=48;WE=11098634;WS=11098616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr21	11098664	rs75742769	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=20.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-5.544;QD=0.86;ReadPosRankSum=-3.345;SOR=3.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,17:0.09:190
chr21	11098673	.	GTACTCCTAC	G	203.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.828;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=26.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-5.540;QD=1.01;ReadPosRankSum=-1.812;SOR=3.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,18:0.09:201
chr21	11098674	rs1752238	T	C	4190.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=26.205;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=5.470;NF=84;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=1.612;SC=ACTCAGGCTGTACTCCTACCA;SOR=0.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=156;WE=11098712;WS=11098664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,177:0.91:195
chr21	11098685	.	CTCCAGCCGCCA	C	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=25.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-5.319;QD=2.18;ReadPosRankSum=-2.014;SOR=2.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,19:0.10:197
chr21	11098704	rs74415742	A	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=12.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-4.324;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=1.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,26:0.14:187
chr21	11098723	rs73151874	T	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=10.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-5.055;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,34:0.19:175
chr21	11098728	rs113315187	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=9.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-5.002;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.898;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,34:0.20:172
chr21	11098827	rs79274499	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.358;NF=1;NR=11;PP=142;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCATCCAGAGCGAGACGAGCC;SOR=0.770;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=12;WE=11098835;WS=11098817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr21	11098863	rs75318310	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.112;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-2.244;SC=CCAGCCTCCAACTCCCCCTTC;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=5;WE=11098871;WS=11098853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr21	14756428	.	T	TAC	1179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=15.013;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.257;NF=27;NR=10;PP=744;ReadPosRankSum=1.109;SC=TATATATATATACACACACAT;SOR=3.289;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=37;WE=14756457;WS=14756418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr21	14756449	.	A	ATGTG,ATG	1836.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.19;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=11,11;NR=14,14;PP=738,54;SC=ATATATATATATGTGTGTGTG;SOR=1.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=25,25;WE=14756457;WS=14756418;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.96:46
chr21	14756794	rs2792526	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=68;PP=2965;SC=TTCTGCTCCAGAGACTCCTGC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=138;WE=14756802;WS=14756784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr21	14757043	rs2257596	T	C	4949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.156;NF=136;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.592;SC=ACATCAACATTCATTATTCCT;SOR=0.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=137;TCR=74;TR=207;WE=14757051;WS=14757033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr21	14760151	rs2775777	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.92;QD=27.22;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	14760203	rs2775779	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=24;PP=940;SC=TTTAAGTTCCCTTCCTCTTTC;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=14760211;WS=14760193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	14765864	rs143497898	A	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	14766093	rs2775805	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=13;PP=439;SC=ATTTATTATCGGTCATAAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=14766101;WS=14766083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	14771323	.	TTC	T	2422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.56;QD=44.05;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	14771325	.	CTT	TGC	940	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=46.39;NF=14;NR=31;PP=940;QD=22.299286108;SC=ATCTTCTTTTCTTCCTAATTC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=45;WE=14771335;WS=14771315;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,45:0.94:48
chr21	14771327	.	T	TGC	2422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.46;QD=44.05;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	14917181	rs62215474	C	T	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=67;PP=2804;SC=CATTTCACTGCCAGTGAAGAG;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=14917189;WS=14917171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr21	15352253	rs56270809	A	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=23;SC=CTCCCAACCAACTGCTCTTGA;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=15352261;WS=15352243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	15373420	rs1297087	C	A	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=103;PP=2965;SC=GTTGATCTTACGGTAACATGC;SOR=1.308;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=165;WE=15373428;WS=15373410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr21	15374334	.	TA	T	683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQRankSum=-5.742;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr21	15399864	rs2298673	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.287;NF=15;NR=14;PP=331;ReadPosRankSum=-1.703;SC=TGTGACCTGCTGGCATTGAAT;SOR=0.393;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=29;WE=15399872;WS=15399854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr21	15481157	rs1136522	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.040;SC=ACTGTATGCATTTTTTATTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=15481176;WS=15481147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr21	15481168	rs62208635	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.100;SC=TTTTTATTTTCTTTATTTTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=15481176;WS=15481147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr21	15481234	rs7279700	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=262;ReadPosRankSum=1.629;SC=TTGAACAGTGCATTATAAAAG;SOR=0.874;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=17;WE=15481242;WS=15481224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr21	15481365	rs7278737	G	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=1.373;SC=CTTCCTCTCTGTCTTTAAGTA;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=19;WE=15481373;WS=15481355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr21	15516976	rs7283442	T	A	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=22;PP=867;SC=TTAACATGAGTCTCTGGATCT;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=15516984;WS=15516966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	15524843	rs57726121	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=0.401;SC=GGGATACTGAAGAAAGCAAAC;SOR=1.911;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=6;WE=15524851;WS=15524833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr21	15554338	rs381352	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=1.298;SC=AGTGAATGAATAGCAGGTAAC;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=15554346;WS=15554328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr21	15558346	rs397517	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=448;ReadPosRankSum=1.346;SC=GAGCCCCTAAGCTCACACCTA;SOR=0.416;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=30;WE=15558354;WS=15558336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
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chr21	15561781	rs416402	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TACTGGGATAGTATTTTATTC;SOR=0.111;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=9;WE=15561789;WS=15561771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr21	15583220	rs440287	G	A	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.619;SC=AGGAAATTCCGTAACTCATTG;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=90;WE=15583228;WS=15583210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr21	15583332	rs380272	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=817;ReadPosRankSum=0.782;SC=GGTAGTTTGTTTTCTCCCACT;SOR=0.403;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=48;WE=15583340;WS=15583322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr21	15596772	rs409782	T	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.655;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr21	15596882	rs410052	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GCATTTTATTTAGTATATAAT;SOR=0.141;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=8;WE=15596890;WS=15596872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr21	15599118	rs2822443	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=0.261;SC=ACTCATGGCTATTGTATAATA;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=19;WE=15599126;WS=15599108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr21	15599144	rs2822444	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=387;ReadPosRankSum=-1.641;SC=AAACTGTTAATTTTTTTTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=26;WE=15599152;WS=15599134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr21	15599466	rs7280643	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.333;NF=11;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AAATGGACTCACCAACAACCA;SOR=0.277;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=19;WE=15599474;WS=15599456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr21	15646397	rs8129984	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=243;ReadPosRankSum=0.436;SC=GCCAGCGGCCAGGCGCCCCGC;SOR=0.395;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=19;WE=15646405;WS=15646387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr21	15652069	rs2254297	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CTCAAAGTGAATAGTTGTACA;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=8;WE=15652077;WS=15652059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr21	15660716	rs1153305	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=0.224;SC=ATTTTCTTTAGTTATGTAGGT;SOR=0.425;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=15660724;WS=15660706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr21	15663777	rs34559607	A	AGTGT,AGTGTGTGTGTGT	1584.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=25,25;NR=4,4;PP=1450,761;SC=AACAGGTAAGAGTGTGTGTGT;SOR=4.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=29,29;WE=15663785;WS=15663767;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.55,0.45:33
chr21	15748186	rs2822642	C	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=466;ReadPosRankSum=0.026;SC=AGGATGCGATCAAGTAATCTC;SOR=0.924;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=26;WE=15748194;WS=15748176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr21	15755349	rs7281846	T	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=968;ReadPosRankSum=0.349;SC=CAACCACCCCTGCCCACTCTG;SOR=0.947;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=69;WE=15755357;WS=15755339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,79:0.48:165
chr21	15870638	rs2274796	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.303;SC=ATGAAAATACCTATTTTATGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=15870646;WS=15870629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr21	15884949	rs3761320	A	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.71;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	15884949	.	ACATTGA	TCATTGA,TCATTGT	295	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8,5;NR=21,13;PP=79,295;QD=3.92314526025;SC=ACAGAGATGTACATTGAGTAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29,18;WE=15884963;WS=15884939;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:29
chr21	15884955	rs3761321	A	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr21	15884974	rs10679308	C	CAAG	599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=540;ReadPosRankSum=0.567;SC=ATTTAATAGACACATATTTTA;SOR=0.668;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=15884982;WS=15884964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr21	15893567	rs760344	A	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=381;ReadPosRankSum=-0.572;SC=AGAAAAAGCAAAGGAAACTTA;SOR=0.568;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=27;WE=15893575;WS=15893557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr21	15893594	rs760345	T	C	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=35;PP=1176;SC=ATTTTCACTGTCCAAACTGAT;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=15893602;WS=15893584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	15918577	rs7281104	G	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=348;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GCTTTCTCTTGAGCATTTTGA;SOR=1.332;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=27;WE=15918585;WS=15918567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr21	15918714	rs12329657	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=-1.763;SC=TTCCTCCTTCAGTCAGGATAT;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=15;WE=15918722;WS=15918704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr21	15954528	rs2822785	G	A	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=21;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GAGGAGCAGTGGTCCCAGGGT;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=69;WE=15954536;WS=15954518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr21	15954553	rs375632704	T	C	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.312;SC=CTTGTGCTATTTGGAAATCAA;SOR=0.843;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=70;WE=15954561;WS=15954543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,88:0.47:189
chr21	15954593	rs2822786	G	A	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1348;ReadPosRankSum=0.012;SC=TTCAGGAAAAGGCTTCCAGTG;SOR=0.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=87;WE=15954601;WS=15954583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,105:0.44:240
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chr21	15966421	rs460852	T	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GAAAAGGAAATAGAGACAACT;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=16;WE=15966429;WS=15966411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr21	15974409	rs456067	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=501;SC=AGAAAATCATTTTCATTTAGA;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=15974417;WS=15974399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	15984982	rs2822809	C	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;ReadPosRankSum=1.009;SC=TAAATATAAACGGAAAATATT;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=50;WE=15984990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr21	15991786	rs1292586	C	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=234;SC=GACTCATTTACGATCAAGCAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=15991794;WS=15991776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	15991865	rs138968358	A	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=276;ReadPosRankSum=0.044;SC=TTGGAATTGCACAAGTCATTC;SOR=0.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=23;WE=15991873;WS=15991855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr21	16015250	rs458292	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=14;PP=1106;SC=TGTATTAATAAGTATCATTAG;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=16015258;WS=16015240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	16340289	rs2229741	C	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1125;ReadPosRankSum=0.593;SC=GCATGCCAGACCCCTGATATG;SOR=0.636;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=70;WE=16340297;WS=16340279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr21	17533071	rs57492212	C	CT	1795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=43.80;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	17533075	rs70941248	T	TTC	1828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=44.60;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	17560174	rs10629120	T	TTCCTTCCC	1757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=45.07;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	17763803	rs2218735	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AATCTACTAAGTTGCTGATTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=17763811;WS=17763799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr21	18814243	rs208893	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TTCTACTGCTTCTGTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=18814254;WS=18814233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr21	18914370	rs1542800	T	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=421;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GGTGATTTTTTAATAAGATTT;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=29;WE=18914378;WS=18914360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr21	18915188	rs2824340	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=1.750;SC=GGGCCGCTGTCTGAGACCAAG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=18915196;WS=18915178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr21	18915218	rs2824341	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=165;ReadPosRankSum=0.829;SC=TTTGTCTTATGTAATTTGTGT;SOR=0.551;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=18915226;WS=18915208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr21	18933828	rs2824359	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=651;ReadPosRankSum=0.074;SC=ACTGATGTATACCAAATATAT;SOR=0.630;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=40;WE=18933836;WS=18933818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr21	18966724	rs5842649	GACAA	G	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=1072;SC=TCTCATTAAAGACAAACAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=22;WE=18966735;WS=18966714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	18976385	rs67787603	C	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TGATCTTTCACAACTCTATTC;SOR=0.093;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=7;WE=18976393;WS=18976375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr21	19165942	rs2824493	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=786;SC=TGCAGAAAGCCGGTGCTATGA;SOR=3.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=19165950;WS=19165932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	19169155	rs1047978	G	C	5261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=85;PP=2965;SC=GTACTTGGGAGTCAAACTGTG;SOR=0.904;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=151;WE=19169163;WS=19169145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr21	19190427	rs243556	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=20;SC=TCATTGAAGACATTTTAGTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=19190435;WS=19190424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	19506651	rs2824646	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=799;ReadPosRankSum=-0.910;SC=ATAAACAGTGGTGACTTCACT;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=48;WE=19506659;WS=19506641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr21	19506694	rs9977750	T	G	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=1002;ReadPosRankSum=0.502;SC=TGGAGGTGTTTTAAGTCAAGC;SOR=0.962;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=60;WE=19506702;WS=19506684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,71:0.43:164
chr21	19506715	rs2824647	C	T	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.069;SC=TGGCATCTCACTCTTGTAGGT;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=137;TCF=72;TCR=65;TR=67;WE=19506723;WS=19506705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr21	19642285	rs7276699	G	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=828;ReadPosRankSum=-1.137;SC=TAAGAAATGCGCTAATGTAGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=54;WE=19642293;WS=19642275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr21	19647472	rs2824713	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=0.674;SC=TATAACACCAGTGCTTTCTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=19647480;WS=19647462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr21	19666901	rs1540000	T	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.293;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=619;ReadPosRankSum=-1.033;SC=AAGTGGGATATGACAACATAT;SOR=1.512;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=19;WE=19666918;WS=19666891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr21	19666910	rs2824718	A	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=1214;ReadPosRankSum=-1.390;SC=ATGACAACATATTTACTTACA;SOR=0.276;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=35;WE=19666918;WS=19666891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr21	19670118	rs2824721	G	A	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=48;PP=1686;SC=CCATCGGTAGGGAAGATTGGC;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=78;WE=19670126;WS=19670108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	19685405	rs7281534	A	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=669;ReadPosRankSum=1.536;SC=CTAAAGACACAGAGAGCATAA;SOR=0.816;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=44;WE=19685413;WS=19685395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,55:0.38:143
chr21	19687376	rs2144203	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=578;ReadPosRankSum=1.308;SC=GGTCCTAATAGACACAGTTAT;SOR=1.592;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=28;WE=19687384;WS=19687366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr21	19701421	rs68023548	GCT	G	1524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=9;PP=1063;SC=ATTAAGAAACGCTCTTTCCAT;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=24;WE=19701430;WS=19701411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	19704296	rs1155847	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=850;SC=ACATGATAGGCGTACCCATGT;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=19704304;WS=19704286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	19713821	rs2824751	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=728;ReadPosRankSum=-2.052;SC=TGTCATCCAACGCAATATCAC;SOR=0.958;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=50;WE=19713829;WS=19713811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr21	19770562	rs2824804	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=701;ReadPosRankSum=2.089;SC=CACTGAGAGTTTGTCTTGCAA;SOR=0.367;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=44;WE=19770570;WS=19770552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr21	20058298	rs6517825	C	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=18;PP=1007;SC=CCATTAGTAACAACGTTAAAA;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=20058306;WS=20058288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	22371166	rs6518017	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=1.085;SC=GAGGGGAATCGGTGAGCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=22371174;WS=22371156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr21	22643600	rs13433438	T	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-1.674;SC=TCCAGACCTGTGCTGGGTTTA;SOR=0.743;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=16;WE=22643608;WS=22643590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr21	22643720	rs8127865	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr21	22652720	rs9306013	C	T	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=219;SC=AAATGCATAACAAAGTAATAT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=22652728;WS=22652710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr21	22658544	rs111713483	TTTTGTGA	T	1453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=1118;ReadPosRankSum=1.346;SC=GCAATGATACTTTTGTGATTT;SOR=0.769;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=21;WE=22658558;WS=22658534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr21	22696837	rs232467	C	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=32;PP=1069;SC=TATGCACCCCCCTCCCTCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=22696845;WS=22696827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	22696881	rs11334381	TG	T	2051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1487;SC=GGAACAGTATTGGGGATCTTA;SOR=1.498;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=22696889;WS=22696871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	22710680	rs2298578	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.953;SC=CCTCCAATACCGGTTGAGTAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=7;WE=22710688;WS=22710670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr21	22746187	rs232518	T	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=901;ReadPosRankSum=-1.772;SC=AAACAGAGCCTGGACGGCCGT;SOR=0.429;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=131;TCF=83;TCR=48;TR=68;WE=22746195;WS=22746177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,87:0.55:158
chr21	22790919	rs10470112	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=470;ReadPosRankSum=-0.406;SC=TTTTGAGATCGCACACAATAT;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=32;WE=22790927;WS=22790909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr21	22790936	rs986372	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=443;ReadPosRankSum=1.200;SC=ATATTTCTGAGAGCAAATGAA;SOR=0.459;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=26;WE=22790944;WS=22790926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr21	22804674	rs2826833	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.076;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=-1.635;SC=TTGGCTTTTTCGGTTTCCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=13;WE=22804682;WS=22804664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr21	22840930	rs2250501	A	C	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=861;ReadPosRankSum=0.503;SC=AATATAGTTTATCTAGGTATC;SOR=0.372;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=82;TCF=67;TCR=15;TR=48;WE=22840938;WS=22840920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr21	22841123	rs2250508	G	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=599;ReadPosRankSum=-1.969;SC=CTTGTTTATTGTCATATCATG;SOR=0.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=36;WE=22841131;WS=22841113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr21	22910116	rs2826891	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	22910123	rs9979040	T	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	26959986	rs67668070	TATGA	T	2020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=1727;ReadPosRankSum=1.406;SC=CACAAACTTATATGAATAATT;SOR=0.602;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=33;WE=26959997;WS=26959976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr21	26960189	rs2829806	T	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=1.001;SC=GCTTAACCAGTGTTTGTGGCA;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=8;WE=26960197;WS=26960179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr21	26961086	rs2829807	T	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=497;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTGGTTGTTATTGGTTAATTT;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=29;WE=26961094;WS=26961076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr21	26965100	rs2829809	C	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=19;PP=1212;SC=AATTGGAAGACCTAGAACTTT;SOR=1.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=26965108;WS=26965090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr21	26965148	rs1135638	G	A	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=39;PP=1522;SC=GTAAAGACACGCCCTGGAATC;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=26965156;WS=26965138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr21	26965205	rs1057885	T	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=43;PP=1414;SC=GAACTGCTGATACTTCATACT;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=26965213;WS=26965195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr21	26966317	rs13048408	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CAAAATATGTAAAAAGGTGTT;SOR=1.371;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=26966325;WS=26966307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr21	26969703	rs1135618	T	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=7;PP=376;SC=CATGAGCATCTTTTGTGAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=26969711;WS=26969693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	26973663	rs140202502	A	ATATACT	5655.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=27;PP=2832;SC=ACAAAAAGACATATATGTATA;SOR=1.278;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=50;WE=26973671;WS=26973653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr21	26976250	rs7278164	A	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GCTTAAATCTAGAAATTTAAA;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=77;WE=26976258;WS=26976240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,85:0.48:177
chr21	26978950	rs3989369	A	G	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=79;PP=2599;SC=TGAGAAGCTGACGATGTTGCT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=24;TCR=79;TR=103;WE=26978958;WS=26978940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr21	26979620	rs61100311	C	T	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=28;PP=2683;ReadPosRankSum=-1.153;SC=CCTTCCTCTGCCCCGCGGGAC;SOR=0.517;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=109;TCR=57;TR=80;WE=26979636;WS=26979610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,99:0.51:194
chr21	26979628	rs9653688	G	A	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=33;PP=2962;ReadPosRankSum=0.233;SC=TGCCCCGCGGGACCTCCCCGG;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=118;TCR=63;TR=95;WE=26979636;WS=26979610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,107:0.50:214
chr21	27056250	rs8133602	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=479;ReadPosRankSum=0.466;SC=TCACAGCAGTAGAGTACCAAG;SOR=1.036;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=37;WE=27056258;WS=27056240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr21	27078270	rs2276220	G	A	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1072;ReadPosRankSum=0.779;SC=ATATTTATGCGTAATTTATTT;SOR=0.275;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=68;WE=27078278;WS=27078260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,80:0.63:127
chr21	27086413	rs6516687	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=2.343;SC=AACAGGATTTGTCTGCCTCTG;SOR=1.659;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=27086421;WS=27086403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr21	27086916	rs8134513	C	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-1.164;SC=AATATGAATTCATATATTTAA;SOR=0.495;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=12;WE=27086924;WS=27086906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr21	27097053	rs73161764	G	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=375;ReadPosRankSum=-1.686;SC=TATGTAGAATGCTCAAGATTT;SOR=1.292;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=22;WE=27097061;WS=27097043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr21	27097458	rs11909995	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=149;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CTGTCATTCAGTTCTCTAAAA;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=14;WE=27097466;WS=27097448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr21	27101899	rs3216073	CT	C	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=598;ReadPosRankSum=0.829;SC=AACTTACATACTTTGAATATT;SOR=1.060;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=18;WE=27101907;WS=27101889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr21	27124132	rs66996867	G	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=1.699;SC=ACTAGTAAAAGAATTCTTGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=27124140;WS=27124122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr21	27137213	rs3216072	GT	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ACTTGTTTATGTTTTTTTCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=27137221;WS=27137203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr21	27141273	rs56048433	C	CATTT	1987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=1315;SC=TAAGAAGTCTCATTTTTTCTG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=28;WE=27141281;WS=27141263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	27141292	rs7276647	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=447;ReadPosRankSum=0.634;SC=TGAAGTCTCTAATTTTTTTTT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=28;WE=27141300;WS=27141282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr21	27326859	rs2829997	G	A	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=8;PP=841;SC=TCCTCTGGGGGAAAATACATG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=27326867;WS=27326849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	27327100	rs417676	G	A	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=119;SC=ACGGAGTCTCGCTCTGTCGCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=27327108;WS=27327090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	27327862	rs2251337	G	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=422;SC=CGGAGAATGCGTGGGATCCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=27327870;WS=27327852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	27328175	rs440666	T	C	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=39;PP=1204;SC=CATGTGAACGTACTGTGAGTC;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=27328183;WS=27328165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	27348372	rs3737413	A	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.934;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=777;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TGAATTTAAAATCATCAGTTC;SOR=1.883;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=36;WE=27348380;WS=27348362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr21	27369481	rs2051504	C	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=414;SC=GTCAATGATGCTCTTAGCCCA;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=27369489;WS=27369471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	27382362	rs11455808	A	AG	3148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1959;SC=GGGAAGACTGACATGTACACC;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=42;WE=27382370;WS=27382352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	27382417	rs2409166	C	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=885;SC=AGCAGGCAAACAACCTACAGA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=27382425;WS=27382407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	27852724	rs966410	A	G	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CTATTCCAAAAACAATGCCCG;SOR=0.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=76;WE=27852732;WS=27852714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,92:0.51:179
chr21	28210657	rs229042	T	C	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=47;PP=1774;SC=ATTATTTAGCTTAAAAACACA;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=28210665;WS=28210647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	28212760	rs436525	G	A	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=51;PP=2109;SC=TGGCTGCATCGGGGCAGTGTT;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=104;WE=28212768;WS=28212750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr21	28215619	rs422381	T	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=192;SC=CCAGGCATGATTGATTATTTG;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=28215627;WS=28215609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	28215826	rs373460567	C	CACA	4668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=41;PP=2971;SC=AAGCACTGCACAGAGAGAAGG;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=58;WE=28215844;WS=28215816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	28215836	rs3838077	GC	G	3394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=2285;SC=CAGAGAGAAGGCCGTAGCAGG;SOR=0.782;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=60;WE=28215844;WS=28215816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	28215987	rs417301	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=620;SC=TCAGCCCGCCTGGGTCAGCCT;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=28215995;WS=28215977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	28216038	rs422803	C	A	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=21;PP=802;SC=GAACAGAGATCCTAGCGTAGC;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=28216046;WS=28216028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	28216066	rs370850	C	T	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=20;PP=853;SC=GGTACCTTCCCAGGTCACCAT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=28216074;WS=28216056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	28216240	rs451792	G	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.13;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	28216299	rs428616	T	C	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=475;SC=TGCTTTGCTTTAGTTTGCAGA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=28216307;WS=28216289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	28216445	rs408358	A	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=231;SC=CGGACTTATGATCCTGCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=28216453;WS=28216435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	28216595	rs428785	C	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=47;PP=1912;SC=GACCACTGAGCCCCTTCGTCC;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=102;WE=28216603;WS=28216585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr21	28216692	rs445784	G	T	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=43;PP=1801;SC=ACGTGCCGCCGACGTCGCCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=86;WE=28216700;WS=28216682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	28217178	rs434857	T	G	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=54;PP=2184;SC=GCGTGGGTACTGGCCCAAAGC;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=28217186;WS=28217168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr21	28217320	rs402007	C	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=47;PP=1360;SC=GAGCGAGGGACCTTTAGTTCG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=28217328;WS=28217310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr21	28296324	rs151065	A	G	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=24;PP=1571;SC=CGACTGCATCAGTGCTGAATC;SOR=1.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=28296332;WS=28296314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	28302355	rs226794	A	G	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=47;PP=1475;SC=ATTACTGTACAGCCTACATTC;SOR=1.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=28302363;WS=28302345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr21	28307173	rs162495	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=299;SC=GAGCACGAGGCACCCATGAAT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=28307181;WS=28307163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	28326276	rs233894	G	A	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=500;SC=GCAAAAATTGGGCTCATTTAG;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=28326284;WS=28326266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	28338423	rs55933916	C	G	9970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=159;PP=2965;SC=AGAGGAACCTCCGGCCGCCCG;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=303;TCF=144;TCR=159;TR=303;WE=28338431;WS=28338413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr21	30250555	rs2205446	T	C	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=29;PP=1731;SC=GAATAATCCTTTTGGTGAAAG;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=30250582;WS=30250545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr21	30250566	.	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.568;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr21	30250574	.	G	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr21	30250615	rs2205447	T	C	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=40;NR=39;PP=1565;SC=CCGACCATTTTTGCCACCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=30250623;WS=30250605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr21	30250812	rs2205448	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=174;SC=TCATCATTTTTTAGTGTGTAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=30250820;WS=30250802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	30254695	rs2254507	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=300;ReadPosRankSum=0.209;SC=AAAATTAGAACGTATTCAATA;SOR=1.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=15;WE=30254703;WS=30254685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr21	30257418	rs1997605	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=422;ReadPosRankSum=-0.492;SC=TCATCTGCAAGTGGACCCCGC;SOR=0.752;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=25;WE=30257426;WS=30257408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr21	30257560	rs1997606	C	G	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=3.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr21	30257568	rs1997607	T	C	7376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.13;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr21	30257729	rs2859734	A	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=0.080;SC=GCATGCCCTCACCCTCATGCG;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=18;WE=30257737;WS=30257719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr21	30303388	rs58119493	GGTGTGT	GGT,G	968.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=20,20;NR=0,0;PP=936,50;SC=ACATTGTGTAGGTGTGTGTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=20,20;WE=30303401;WS=30303378;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:25
chr21	30315681	rs2705666	T	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=244;ReadPosRankSum=-0.202;SC=ACATTATTTTTAAATATGTGA;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=16;WE=30315689;WS=30315671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr21	30316304	.	T	TTTAA,TTTAAGATTTAAGAA	366.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.515;NF=0;NR=5;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.986;SC=AACAATCAAATGTCATTTAAG;SOR=1.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=5;WE=30316316;WS=30316293;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:22
chr21	30316305	rs3053575	G	GATTTAAGAAA	364.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr21	30316308	rs2026246	A	T	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr21	30318466	rs2243552	T	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=368;ReadPosRankSum=0.161;SC=GTATAAAGTATCACCTACCAA;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=25;WE=30318474;WS=30318456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr21	30324755	rs2832146	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=TATCCAAAGAGCTGAGAGTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=30324763;WS=30324745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	30325875	rs2243491	A	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=399;SC=CTGAGAATATATGTCTGATAC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=30325883;WS=30325865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	30333995	rs79679931	CTTT	C	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=197;ReadPosRankSum=-1.728;SC=TTGGACAAATCTTTTAATCAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=30334005;WS=30333985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr21	30338293	rs5843357	G	GC	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=1209;SC=ATGGGGTTTTGTATGTTGCCC;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=30338301;WS=30338283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	30339120	rs34191159	C	A	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=40;PP=2012;SC=AATTCCCAGCCTTCAATCTTC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=87;WE=30339128;WS=30339110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr21	30339234	rs61735768	T	C	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TTCAATGAGCTCTTCGGCTTC;SOR=0.328;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=149;TCF=97;TCR=52;TR=78;WE=30339242;WS=30339224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,83:0.53:156
chr21	30341891	rs2254796	A	G	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=889;SC=CGAGGACTCTAAAGAGCTGGT;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=30341899;WS=30341881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	30354610	rs2832150	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=356;ReadPosRankSum=-1.756;SC=ATCCTTAACATGAGTTACAAT;SOR=0.232;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=23;WE=30354618;WS=30354600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr21	30357307	rs2245434	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-1.328;SC=CAGACATTTCCGGATATGCTA;SOR=0.293;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=30357315;WS=30357297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr21	30358831	rs151269924	C	CA	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5131;FS=2.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=233;ReadPosRankSum=-0.169;SC=ACTATACAGCCAAAATTCCAA;SOR=1.492;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=30358839;WS=30358821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr21	30391671	.	GAA	G	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.9989;HP=15;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=67;QD=11.6666666667;SC=CGACCTACCGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=30391680;WS=30391661;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr21	30400111	.	T	G	122.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATAATATACGTGGCTTAGTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=30400119;WS=30400101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr21	30407208	rs61735763	G	A	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1282;ReadPosRankSum=2.017;SC=ACTATCTGACGCCAAGATCTG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=83;WE=30407216;WS=30407198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,103:0.44:233
chr21	30407335	rs62222370	T	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=506;ReadPosRankSum=0.896;SC=TTAAATATGTTTAAGAAGAAA;SOR=1.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=28;WE=30407343;WS=30407325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr21	30409879	rs62222372	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.974;SC=GAGTAATTTATTTCTATGTAT;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=30409887;WS=30409869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr21	30442481	rs2183570	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.135;SC=GAAGTCATACCATAACATCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=30442489;WS=30442471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr21	30464141	rs8132105	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=1.017;SC=ACTCCCATCTGCTGAGTGCTT;SOR=1.009;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=12;WE=30464149;WS=30464131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr21	30464623	rs147901306	A	AACTCCAGTTTATAGG	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=520;ReadPosRankSum=0.536;SC=TCCAGATTTAAACCATTAACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=2;WE=30464631;WS=30464613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr21	30464916	rs2832170	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=0.453;SC=AGTATTCCGTCCACTTTCTGG;SOR=1.044;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=19;WE=30464924;WS=30464906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr21	30481371	rs2832181	G	T	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=43;PP=2387;SC=GTTGACATTCGTAACCTTCCT;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=30481379;WS=30481361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr21	30481612	rs2832182	G	A	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=716;SC=TGCTTATTTTGTGCCCATTTA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=30481620;WS=30481602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	30505836	rs9636820	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=1071;SC=GTTGCATGCTTGCATGACCTG;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=30505844;WS=30505826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	30532146	rs66780570	TA	T	938.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.217;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.516;NF=30;NR=8;PP=513;ReadPosRankSum=2.222;SC=GTTCTCACGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.726;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=38;WE=30532155;WS=30532136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr21	30532437	rs2832224	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=550;ReadPosRankSum=0.993;SC=AGGACCAGGGGCAATGGGCAG;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=36;WE=30532445;WS=30532427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr21	30714776	rs388707	T	C	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.417;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=983;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CAACTCTGGGTGAGACAAAGC;SOR=0.466;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=87;WE=30714784;WS=30714766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,95:0.52:183
chr21	30830393	rs9981313	T	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=440;ReadPosRankSum=0.193;SC=GGGATTTCAGTTAACTTATCA;SOR=1.011;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=33;WE=30830401;WS=30830383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr21	31026967	rs10637196	A	AAAAG	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.578;NF=10;NR=1;PP=474;ReadPosRankSum=-1.325;SC=AAGAAAGAAAAAAAGCCTGCT;SOR=0.776;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=11;WE=31026975;WS=31026957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr21	31233892	.	GGGATT	G	277.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr21	31233898	.	A	AACCAACACT	277.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr21	31233900	rs55707309	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr21	31233904	rs142587327	G	GT	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GATTATAGGTGTGAGCCAACA;SOR=1.314;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=4;WE=31233912;WS=31233882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr21	31233994	rs468413	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.911;NF=13;NR=13;PP=403;ReadPosRankSum=0.349;SC=TGAATGAATATTGGGTTTTGC;SOR=0.351;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=26;WE=31234002;WS=31233984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr21	31655212	rs1557291	A	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1130;SC=TACTGCAGACACCAGGATAGC;SOR=2.041;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=53;WE=31655220;WS=31655202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	31709691	rs2244485	G	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=1004;ReadPosRankSum=0.773;SC=TGATTGGCACGCTGTCCTTTC;SOR=0.537;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=61;WE=31709699;WS=31709681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,74:0.55:134
chr21	31720287	rs762377	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=765;ReadPosRankSum=-0.429;SC=AATATTAATAAGTTTAAAACA;SOR=0.343;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=44;WE=31720295;WS=31720277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr21	31744127	rs877346	A	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=829;ReadPosRankSum=1.507;SC=AAGGGAAGCCACAGCTTCCAT;SOR=0.327;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=49;WE=31744135;WS=31744117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr21	31802768	rs2226548	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1291;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CTGGGAGCCCGCCAGCTGCCA;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=82;WE=31802776;WS=31802758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,104:0.65:161
chr21	31803159	rs1539783	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=400;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TCCCAATATCTTTTTATTCTT;SOR=0.544;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=20;WE=31803167;WS=31803149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr21	31803210	rs1539784	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.727;SC=TGGCAGACTGCGAAATTAATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=31803218;WS=31803200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr21	31812772	rs2832873	C	A	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1261;ReadPosRankSum=0.264;SC=TACCTGCCAACTGGGCTCCTC;SOR=0.618;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=75;WE=31812780;WS=31812762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr21	31869286	rs2298437	T	C	3821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=60;ReadPosRankSum=0.891;SC=TGGGCGGCAGTAGCCATATCC;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=123;TCR=103;TR=129;WE=31869294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,165:0.58:285
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chr21	31964916	rs9305426	A	C	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1518;ReadPosRankSum=0.255;SC=GGCTTTGGCTATGGAGGCCTG;SOR=0.539;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=89;WE=31964924;WS=31964906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr21	31973342	rs198913	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=1.405;SC=CATTTAAGGCCCTTATTATAA;SOR=0.560;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=31973350;WS=31973332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr21	31973405	rs198914	C	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=547;ReadPosRankSum=-2.155;SC=AGAATCTGATCCTGCTATACA;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=43;WE=31973413;WS=31973395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr21	31973516	rs198915	T	A	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=1461;SC=GGCTGTGGTCTTAGCGGCTAT;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=31973524;WS=31973506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr21	31973645	rs6147476	G	GTGTTATTTATAATAATGA	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.69;MQRankSum=1.742;NF=0;NR=5;PP=1651;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TTTTCTTCCCGTGTTTTTTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=5;WE=31973653;WS=31973635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr21	31973685	rs1961491	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5657;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=0.319;SC=AAAATTTAGCCCACATTGCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=31973693;WS=31973675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr21	31992864	rs1702405	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=8;PP=924;SC=ATATGAAACCAAACGGCCTCA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=31992872;WS=31992854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	32015170	rs198873	T	C	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=542;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CTAAAACTTATGCTGGCCTCT;SOR=0.659;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=37;WE=32015178;WS=32015160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr21	32090908	rs2833031	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=0.288;SC=TGCTCAATGGCATTTCTTAGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=32090916;WS=32090898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr21	32119495	rs12053674	C	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=757;ReadPosRankSum=0.425;SC=GCCCCCACAGCAGTTTCTGTA;SOR=1.112;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=43;TCR=68;TR=45;WE=32119503;WS=32119485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,53:0.38:140
chr21	32119576	rs2833074	C	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=-1.543;SC=TGAAGTGTGACTGTCCTCTAC;SOR=1.341;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=15;WE=32119584;WS=32119566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr21	32201822	rs9982910	G	T	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.840;HP=5;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=2059;ReadPosRankSum=1.144;SC=CATAGCAGCCGCCCAGGTTGT;SOR=1.308;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=48;WE=32201843;WS=32201812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,58:0.43:136
chr21	32201835	rs9982675	A	C	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.761;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=2059;ReadPosRankSum=0.482;SC=CAGGTTGTTGATGTTGCTACC;SOR=1.257;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=56;WE=32201843;WS=32201812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
chr21	32201866	rs9982755	A	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.856;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=-1.014;NF=39;NR=27;PP=961;ReadPosRankSum=-0.957;SC=TAGCCCAGGGAGCTGTAGCCA;SOR=0.853;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=66;WE=32201874;WS=32201856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr21	32201951	rs9982775	A	G	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.225;NF=18;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=0.326;SC=TGAAGGTCCCATGGAAGTTGG;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=53;WE=32201959;WS=32201941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,62:0.61:102
chr21	32201969	rs35359062	GA	G	3904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=53;PP=2432;SC=TGGTCCCATAGAATAGGGTAT;SOR=1.346;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=60;WE=32201977;WS=32201959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	32202106	rs2833118	T	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CAGGGCTTTTTATACCTCAAG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=32202114;WS=32202096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr21	32362038	.	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=1.235;SC=AGAAATAACACTTCACTTCTG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=32362046;WS=32362028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr21	32493031	rs762194	A	G	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1138;ReadPosRankSum=0.050;SC=CAGTGTCCCCACCACCGGGGG;SOR=0.790;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=69;TCR=100;TR=75;WE=32493039;WS=32493021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr21	32493204	rs2073371	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.219;SC=CATGCTTTACGTGAGATGAAA;SOR=0.382;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=28;WE=32493212;WS=32493194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr21	32499473	rs2070410	A	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=606;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CTCTGCATCTAAAGAAATTAA;SOR=0.737;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=40;WE=32499481;WS=32499463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr21	32519135	rs67690846	C	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=-1.050;SC=TAGATTTCTGCCCAAAAGCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=32519143;WS=32519125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr21	32524852	rs9305453	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=374;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CCTTAGGAACAGACCCCACTG;SOR=0.616;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=28;WE=32524860;WS=32524842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr21	32525302	rs723470	A	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=937;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TTTCAGTGTTACGCATGTCCC;SOR=0.887;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=55;WE=32525310;WS=32525292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
chr21	32525345	rs723469	G	A	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GTCAAACCACGGTATGATGGT;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=75;WE=32525353;WS=32525335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr21	32526525	rs12482307	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=342;ReadPosRankSum=0.219;SC=CACTCCTTTACGAGGCAGAGG;SOR=1.204;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=19;WE=32526533;WS=32526515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr21	33068962	rs7280330	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=-2.069;SC=CAGGGGGTACTGCGGCAGCAG;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=20;WE=33068970;WS=33068952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr21	33069126	rs11701923	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=0.571;SC=CAAAAAACTTTATGAAAACAA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=33069134;WS=33069116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr21	33073985	rs204734	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=413;SC=GAAAAGCAGATGTATTTTCTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=33073993;WS=33073975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	33355760	rs737103	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=230;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CCAAGCGCTGGTTTAAAAATT;SOR=0.216;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=17;WE=33355768;WS=33355750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr21	33368188	rs2070371	T	C	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1184;ReadPosRankSum=-1.390;SC=CAGGCTCGCTTATGACACAGA;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=75;WE=33368196;WS=33368178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,81:0.52:155
chr21	33371540	rs2070372	T	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=287;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AAACAGCAACTGAACAGAGCT;SOR=1.298;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=18;WE=33371548;WS=33371530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr21	33416324	rs141311372	AGT	A	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=-1.830;SC=TGTACACATGAGTGTGTGTGC;SOR=0.200;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=7;WE=33416333;WS=33416314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr21	33690293	rs2070380	C	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.441;SC=GTCAGCACTGCGGCACCCTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=33690301;WS=33690283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr21	33691502	rs11402028	G	GC	936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=10;PP=752;SC=GGCCAGAAGGGCCCCCTGGCG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=22;WE=33691510;WS=33691492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	33691754	rs958828	G	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CCTTCAATCCGCCACATCCTG;SOR=0.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=31;WE=33691762;WS=33691744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr21	33694224	rs3761342	C	G	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=78;PP=2965;SC=TGCCGCAGAACGCCAAACACC;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=160;WE=33694232;WS=33694214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr21	33705812	.	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TGAAACACCTGGGATCAGAAA;SOR=1.616;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=23;WE=33705820;WS=33705802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr21	33719695	rs2070378	C	T	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1376;ReadPosRankSum=1.895;SC=GGTGTCTTTCCTTCCCGGGGG;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=93;TCR=97;TR=89;WE=33719703;WS=33719685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,110:0.47:233
chr21	33721843	rs743306	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=0.181;SC=GGTTCACAGCTACCAGGCAGT;SOR=0.264;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=33721851;WS=33721833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr21	33726201	rs2298363	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=384;ReadPosRankSum=0.121;SC=ACAGACTAGCCGGCCAGGTGC;SOR=1.697;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=20;WE=33726209;WS=33726191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr21	33727758	rs75189665	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=599;ReadPosRankSum=-2.095;SC=ATGTGCTTACGCGTTCCAGAA;SOR=1.036;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=39;WE=33727766;WS=33727748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,43:0.38:112
chr21	33733468	.	A	AAAAGAAAGAAAG	535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.66;QD=48.70;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	33740637	rs7276783	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=844;SC=TCGGCCTCCCGAAGTGCTGGG;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=33740645;WS=33740627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	33749533	rs4816431	A	C	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=27;PP=2421;SC=AGCCTACGGGAACAGAGGCCA;SOR=1.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=75;TCR=27;TR=102;WE=33749541;WS=33749523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr21	33755763	rs2833795	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=431;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AGGGTGTACAGGGTCTTTTTA;SOR=0.801;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=34;WE=33755771;WS=33755753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,44:0.37:118
chr21	33887629	rs1046769	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-1.841;SC=TCGTGAGGCCAGGAAGCTATT;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=33887637;WS=33887619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr21	33949059	rs7520	G	A	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=1090;ReadPosRankSum=0.274;SC=GAGTGACACAGGTGTCCGAGG;SOR=0.775;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=61;WE=33949067;WS=33949049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,75:0.45:165
chr21	33964605	rs1783091	T	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr21	33964609	rs1720127	G	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.064;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr21	33964722	rs146391380	CA	C	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=234;ReadPosRankSum=2.208;SC=TGGAAAGTGGCAAAAATCTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=33964730;WS=33964712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr21	33974108	rs1043330	T	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.718;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr21	33975696	rs844995	T	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=1.318;SC=GGGGACAGATTTCTCCCCGTG;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=18;WE=33975704;WS=33975686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr21	33997466	rs701730	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=0.749;SC=TCTATTGACTACTTTTTTTTT;SOR=0.184;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=12;WE=33997474;WS=33997456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr21	34003928	rs71640263	A	AAGTATT	3649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.206;NF=23;NR=39;PP=2963;ReadPosRankSum=0.424;SC=ACAGAACTCAAAACATTACTT;SOR=0.819;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=149;TCF=49;TCR=100;TR=62;WE=34003936;WS=34003918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,90:0.41:219
chr21	34014192	rs11702774	G	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=847;ReadPosRankSum=-0.007;SC=GGCCCCAGGCGAGGTTTTACC;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=55;WE=34014200;WS=34014182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,68:0.57:119
chr21	34014283	rs2833929	C	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=547;ReadPosRankSum=-2.360;SC=CGTCCTGGAACAAAGACATCA;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=35;WE=34014291;WS=34014273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr21	34017857	rs2406	T	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TAGAAAAAACTGTAAAATCCA;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=34017865;WS=34017847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr21	34018437	rs844978	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.846;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=422;ReadPosRankSum=1.801;SC=AAATAGTTAACGGGTTCATAC;SOR=1.534;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=27;WE=34018445;WS=34018427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr21	34050937	.	AAT	A	1892	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=18;NR=9;PP=1892;QD=71.037037037;SC=TAACAAATAAAATATAAAGTG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=27;WE=34050950;WS=34050927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr21	34050939	rs201012663	TA	T	1581.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=4.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.100;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr21	34050941	rs150500694	TA	T	1581.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=4.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.100;QD=17.01;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr21	34050942	.	A	T	1884	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.1;NF=27;NR=10;PP=1884;QD=51.8586814202;SC=AATAAAATATAAAGTGCACAT;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=37;WE=34050950;WS=34050927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr21	34059207	rs844975	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=239;ReadPosRankSum=-1.056;SC=CTGGAAGAATCTGATTACTGT;SOR=1.356;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=15;WE=34059215;WS=34059197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr21	34059352	rs2254562	T	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TATTATTTGTTTACCATATAA;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=19;WE=34059360;WS=34059342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr21	34128717	rs7279405	G	A	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=831;ReadPosRankSum=0.869;SC=GTGGAATACAGAGATGTCTGT;SOR=0.520;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=52;WE=34128725;WS=34128707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr21	34157235	rs35174687	GT	G	751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=21;PP=347;SC=CCCATGGTAAGTTTTTTTTTT;SOR=1.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=22;WE=34157255;WS=34157225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	34165864	rs2231391	C	A	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=126;SC=GTTTCTTTTTCTTTTGTTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=34165872;WS=34165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	34166190	rs74617086	A	T	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=58;PP=2754;SC=TATATGATTTAAAGGCTGAGT;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=124;WE=34166198;WS=34166180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr21	34166343	rs2231390	C	T	6412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=90;PP=2965;SC=GATGCTTGGCCTCCATGTTGA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=98;TCR=90;TR=188;WE=34166351;WS=34166333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr21	34169181	rs762228	A	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=12;PP=1120;SC=CCTTAAAAGAAAAAAGAGGGG;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=34169189;WS=34169171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	34169317	rs72564613	C	CT	6128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=63;PP=2936;SC=TATTGGTTTGCGGAACATGTG;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=78;WE=34169325;WS=34169307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr21	34399401	rs762178	A	G	7673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=108;PP=2965;SC=GCTTCAAGTCATCCTCGTCCA;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=137;TCR=108;TR=245;WE=34399409;WS=34399391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr21	34538065	rs11444667	C	CT	3913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=48;PP=2708;SC=TGGCCTCCTTCTTGTATCCCC;SOR=0.995;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=59;WE=34538073;WS=34538055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr21	34540594	rs11379155	C	CT	1794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=1;PP=1914;SC=TGCTATAGAGCTGGAATTTAT;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=34540602;WS=34540584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	34542150	rs2834117	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TGGAGACAGGGCCCCAAGGAA;SOR=1.461;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=20;WE=34542158;WS=34542140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr21	34616157	rs2834156	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-1.686;SC=TCTTTCTCTGTAAAAGGAGCT;SOR=0.211;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=5;WE=34616165;WS=34616147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr21	34617213	rs2834158	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=56;PP=2354;SC=AGAATACAACTGTGGGTTCCA;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=133;WE=34617221;WS=34617203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr21	34617729	rs2252639	A	G	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=16;PP=945;SC=AAGTCCTGTTATCTGAGGACA;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=34617737;WS=34617719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	34617950	rs2252650	A	T	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=164;SC=GACATAATGGATGGAGTCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=34617958;WS=34617940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	34624386	.	C	CATCTATCTATCT	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=10.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.82;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr21	34624917	rs2236757	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=349;SC=ATTAAGGCCTACCTCTAAATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=34624925;WS=34624916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	34638859	rs2239573	G	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=519;ReadPosRankSum=0.189;SC=TGGGAACCGGGAGGCCCCGCG;SOR=0.599;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=35;WE=34638867;WS=34638849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr21	34660676	rs66527331	ACG	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr21	34660686	.	GCA	G	91	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=91;QD=15.8333333333;SC=ACGCGCGCGCGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=34660697;WS=34660674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr21	34660707	rs67118950	CACAG	C	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr21	34666376	rs1467845	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=646;ReadPosRankSum=0.534;SC=CTGCTGGCATAAGCTCTCACC;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=35;WE=34666384;WS=34666366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr21	34668747	rs3171425	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1177;ReadPosRankSum=-1.276;SC=GGCAGCAAACAAGGGCCAAGA;SOR=0.697;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=77;WE=34668755;WS=34668737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr21	34697197	rs145550964	G	GGTGTGT,GGTGTGTGT	739.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=14,14;NR=1,1;PP=322,226;SC=GCGGAGGGGCGGTGTGTGTGT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15,15;WE=34697205;WS=34697187;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.50:18
chr21	34697264	rs2850015	T	C	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=34;NR=20;PP=898;SC=GCAGCGCGTGTGCAGAGGGGC;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=34697272;WS=34697254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr21	34707808	rs2243592	T	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=347;ReadPosRankSum=0.722;SC=TATAATGTTCTTATTTCTTGT;SOR=0.397;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=29;WE=34707816;WS=34707798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr21	34708061	rs2243594	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=1.498;SC=TCTATTTTTTAGAAATGTTAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=34708069;WS=34708051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr21	34717726	rs17875880	C	T	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.881;NF=25;NR=42;PP=993;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CTTCTTTTCGCTCTGCATCAG;SOR=0.950;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=63;TCR=89;TR=67;WE=34717734;WS=34717716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,85:0.44:192
chr21	34721348	rs2834196	A	G	107.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=0.674;SC=TGGCAATTGTAAATACTTAAT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=34721356;WS=34721338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr21	34726127	rs2856973	T	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=-0.167;SC=AACAGCTAGGTAATGAACAGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=20;WE=34726135;WS=34726117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr21	34783049	.	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GCTGGGATTACAGGCGTGAGC;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=34783057;WS=34783039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr21	34793706	rs2834214	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=381;ReadPosRankSum=0.158;SC=AATAAACCTGCGTTTTGAACA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=24;WE=34793714;WS=34793696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr21	34799350	rs11910627	C	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=651;ReadPosRankSum=-2.202;SC=GCAAGAGCATCTTTCTTTTTT;SOR=0.811;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=37;WE=34799358;WS=34799340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr21	34804966	rs1532	T	C	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=507;ReadPosRankSum=1.574;SC=CATTAACTGATGTTTGTGTTG;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=40;WE=34804974;WS=34804956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr21	34805197	rs17883129	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.378;NF=2;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-1.345;SC=GCACACATCTCTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=7;WE=34805205;WS=34805187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr21	34809049	rs2040120	T	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=2.365;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr21	34823252	rs2834220	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=424;ReadPosRankSum=-1.623;SC=TATGCTTTGACAGGTACTTCA;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=26;WE=34823260;WS=34823242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr21	34837623	rs2248820	C	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=247;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTGTCAACACCCATTAACAGC;SOR=0.954;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=19;WE=34837631;WS=34837613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr21	34839533	rs743334	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=653;ReadPosRankSum=-1.792;SC=TGGGCTGGGTACAGAGGCTCA;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=34;WE=34839541;WS=34839523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr21	34876708	rs2070388	G	C	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.976;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GGTAGAAAAAGACATACTCAC;SOR=0.624;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=214;TCF=103;TCR=111;TR=103;WE=34876716;WS=34876698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,120:0.48:248
chr21	34894623	rs2834234	T	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=26;PP=885;SC=CACCTAAACGTCAGGGAAAAT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=34894631;WS=34894613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	34897113	rs8788	C	T	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=47;PP=2875;SC=CGAAAGCCGACGTCTTTCCTA;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=90;TCR=47;TR=137;WE=34897121;WS=34897103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
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chr21	34902053	rs148913441	CT	GG	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.961;NF=13;NR=7;PP=726;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GCATGAGCCACTGCGCCTGGC;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=20;WE=34902062;WS=34902043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr21	34915324	rs1041745	CG	GC	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=4;PP=725;SC=CGAATTGGCCCGTGCGCCTCC;SOR=3.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=36;WE=34915333;WS=34915314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	34925142	rs13433428	C	T	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=34;PP=1389;SC=GTGCCATCATCACCATCTGAA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=34925150;WS=34925132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr21	34926043	rs61743204	G	A	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.182;SC=AGATTGGCATGCAGGAGATTG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=63;TCR=63;TR=72;WE=34926051;WS=34926033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr21	34926260	rs13047599	C	T	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1461;ReadPosRankSum=0.504;SC=GACTAAACAGCGCACAGTATT;SOR=0.624;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=207;TCF=113;TCR=94;TR=92;WE=34926268;WS=34926250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,104:0.44:238
chr21	34945721	rs3174808	T	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=443;ReadPosRankSum=-1.385;SC=AAGAAGGCAATAAGGAACCCA;SOR=1.078;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=32;WE=34945729;WS=34945711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr21	34948684	rs34377180	G	GA	3854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=39;PP=2534;SC=TTGAGAAATGGAGCCCTTACC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=34948704;WS=34948674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	34948696	rs34373121	GA	G	3960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=2522;SC=GCCCTTACCAGACCCAATTGT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=34948704;WS=34948674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	34954602	rs77179527	AG	A	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=239;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AGTATTTAACAGGCATGCTGT;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=34954610;WS=34954592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr21	34959776	rs7283856	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=0.068;SC=CAAATCCTATGAAAAAAAAGT;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=34959784;WS=34959766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr21	34968503	rs2834240	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=550;ReadPosRankSum=0.839;SC=TGTAACTAGAATGCTGAAAAA;SOR=1.123;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=32;WE=34968511;WS=34968493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr21	34969423	rs3761351	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.869;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.513;SC=TGATCCGCCCGCCGCGGCCTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=34969431;WS=34969418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr21	34971373	.	A	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=699;ReadPosRankSum=0.182;SC=GTGCATTAATAATTATGCCCT;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=31;WE=34971381;WS=34971363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr21	35012719	rs6517185	GG	CT	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=1580;SC=AGTTTGAATCGGGGCTTTCCT;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=29;WE=35012728;WS=35012709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	35124253	rs2834255	A	G	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=37;PP=1015;SC=GGTTAAGGCCATTACCTGATT;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=35124261;WS=35124243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	35127735	rs2154434	C	A	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=39;PP=1158;SC=GAAATATGATCTTTGTTTTCA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=53;WE=35127743;WS=35127725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	35134084	rs11444980	G	GC	2579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=19;PP=2106;SC=TTTTTACAAAGCCCTGCGGTA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=50;WE=35134092;WS=35134074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr21	35138326	rs2248815	A	G	3260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=81;PP=1948;ReadPosRankSum=-3.319;SC=GGTAAGGAACATGGGCTCTGA;SOR=0.801;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=226;TCF=81;TCR=145;TR=122;WE=35138334;WS=35138316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,148:0.57:258
chr21	35166803	rs2073368	G	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=951;ReadPosRankSum=-1.692;SC=GGACTCATCTGGAAGGAACTT;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=63;WE=35166811;WS=35166789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,85:0.50:171
chr21	35166945	rs2073369	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=0.816;SC=TGCATGTATCAGTACCCTCTG;SOR=1.127;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=35166953;WS=35166935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr21	35174897	rs11390596	T	TA	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.478;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=172;ReadPosRankSum=-0.960;SC=TTGTGCTTTTTAAAAAAAAAG;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=16;WE=35174905;WS=35174887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr21	35186127	.	C	CT	161	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=15;MQ=61.13;NF=12;NR=0;PP=161;QD=13.75;SC=GGAGTGCTTGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=35186135;WS=35186117;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,12:0.71:17
chr21	35190802	rs2236613	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=441;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TCTGCTTGTATTTGATGAAAA;SOR=0.189;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=22;WE=35190810;WS=35190792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr21	35201281	rs2245099	G	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=849;ReadPosRankSum=3.027;SC=GGTCCCTCCTGTAACGTGAAA;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=60;WE=35201289;WS=35201271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr21	35201947	rs1108000	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGGTTATTGCCTCATACACCG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=35201955;WS=35201937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr21	35228953	rs9305535	A	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=759;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGCCCTCAGGACCCAGCAGCC;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=40;WE=35228961;WS=35228943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr21	35230921	rs2073366	G	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=594;ReadPosRankSum=-1.639;SC=GCTCTCAGCGGATCGGCGTGT;SOR=0.780;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=29;WE=35230929;WS=35230911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr21	35237349	rs9984732	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=443;ReadPosRankSum=0.564;SC=AGTGGCCCTTAAGGCTGTGCC;SOR=0.343;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=24;WE=35237357;WS=35237339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr21	35237608	rs9976801	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=542;ReadPosRankSum=0.589;SC=AGAAGACGGATGAGGCCCCAG;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=12;TCR=67;TR=37;WE=35237616;WS=35237598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr21	35247611	rs2298681	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=481;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TCACAGGCCCGCCCACATTGC;SOR=0.586;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=32;WE=35247619;WS=35247601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr21	35247873	rs933130	C	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=366;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CAGAGCCTCGCCTGCCAGCCT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=20;WE=35247881;WS=35247863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr21	35260481	rs2073370	T	C	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1164;ReadPosRankSum=-2.527;SC=CGGAGATCCGTGTGGCGGACA;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=74;WE=35260489;WS=35260471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,94:0.55:172
chr21	35275955	rs9980730	G	A	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=99;PP=2965;SC=TACAAAAGAAGTAAGACTGGA;SOR=1.025;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=169;WE=35275963;WS=35275945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr21	35276209	rs2834293	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=379;ReadPosRankSum=-1.123;SC=ATAACCCGAGAAAACGTACCA;SOR=0.550;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=25;WE=35276217;WS=35276199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr21	35278919	rs3831798	A	ACT	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=718;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ATTATAGCCCACTATCAAGTC;SOR=0.380;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=16;WE=35278927;WS=35278909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr21	35281393	rs4591	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=285;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CACTGATCAGATTGGTAGTGA;SOR=0.775;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=17;WE=35281401;WS=35281383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr21	35284734	rs2211873	A	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.014;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr21	35446136	rs79607614	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=0.760;SC=GCCGCGGGACCCCGGGCCTTC;SOR=0.770;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=18;WE=35446144;WS=35446126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr21	35467372	rs11295804	AC	A	855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=853;SC=AAAGACTTTGACCCTGCTGTG;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=35467380;WS=35467362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	35467472	rs11295803	AG	A	6568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=52;PP=2965;SC=CTGTCATTGGAGCGCTATTAT;SOR=1.456;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=107;WE=35467480;WS=35467462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr21	35467645	rs8129891	A	G	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=66;PP=2858;SC=GACCTGGGTAACAATTGGTGC;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=126;WE=35467653;WS=35467635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr21	35469193	rs4817617	C	A	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=51;PP=2787;SC=GGAACCATACCAAATGCAAGA;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=129;WE=35469201;WS=35469183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr21	35469708	rs35685523	G	GA	427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=519;SC=GGTCTTTGGGGAAAAAAGTTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=35469716;WS=35469698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	35772295	rs3833347	A	AC	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.236;NF=0;NR=14;PP=476;ReadPosRankSum=0.301;SC=CGACCACTCAACTTTCAGCCT;SOR=0.711;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=14;WE=35772303;WS=35772285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr21	35774487	rs9980218	G	A	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.790;QD=23.74;ReadPosRankSum=1.760;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr21	35774491	rs71677268	ATTT	A	2205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.542;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.593;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,62:0.60:104
chr21	35791953	rs12482902	A	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=631;ReadPosRankSum=-1.082;SC=GGTCCGGATGAGATCCAGCGT;SOR=0.976;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=41;WE=35791961;WS=35791943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr21	35821821	rs1805127	T	C	9898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=189;PP=2965;SC=TTGCCGTCACTGCTGCGGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=297;TCF=108;TCR=189;TR=297;WE=35821829;WS=35821811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr21	35893737	rs8131131	T	C	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=702;ReadPosRankSum=1.928;SC=TACTGCTCCCTGGTGCAGGGC;SOR=1.030;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=48;WE=35893745;WS=35893727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr21	35985895	rs915540	C	T	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=7;PP=1332;SC=AGGAAAAGGTCTGAAATGCTG;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=35985903;WS=35985885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	36041577	rs62213788	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=286;ReadPosRankSum=3.047;SC=TCCCGGAGCCGGCGTCCTTCA;SOR=1.432;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=20;WE=36041585;WS=36041567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr21	36041638	rs73357389	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=637;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCACCGACCCTTAAGCAGCGT;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=44;WE=36041646;WS=36041628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr21	36041978	rs7280973	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=12;PP=459;SC=AGGTGCCCCAAGGAGGGGAGG;SOR=1.044;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=36041986;WS=36041968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	36042203	rs9680380	G	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=23.99;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	36042462	.	GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA	G	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=3.669;NF=2;NR=5;PP=510;ReadPosRankSum=1.530;SC=GGCGGGGGACGGCGTAGAAGC;SOR=0.159;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=7;WE=36042499;WS=36042452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr21	36042579	rs13049028	C	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=2.254;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr21	36042584	rs13049239	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=2.186;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.617;SOR=1.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr21	36079492	rs2070367	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=357;ReadPosRankSum=1.002;SC=TTATCAACCTGCAATGATTTT;SOR=1.022;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=20;WE=36079500;WS=36079482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr21	36080204	rs6517253	A	G	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=498;SC=CCAGATTCTCACGGTGGCCCA;SOR=3.334;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=36080212;WS=36080194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	36080290	rs6517254	C	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=37;PP=1966;SC=ACCCTCCTTTCATGACTTTTG;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=98;WE=36080298;WS=36080280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	36080908	rs2834597	G	A	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=3;PP=713;SC=TCATTTTTATGCCCAGAGAAA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=36080916;WS=36080898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	36164405	rs13051066	G	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr21	36165041	rs11700756	T	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=253;SC=ATGCTACTGCTGGGGAGGACG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=36165049;WS=36165031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	36193871	rs2018329	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.569;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr21	36206932	rs11702841	G	A	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.58;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	36252859	.	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=324;ReadPosRankSum=1.146;SC=CGTACCTCTTCCACTTCGACC;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=24;WE=36252867;WS=36252849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr21	36410869	.	CCTCTCTCTCTCTCTCTCT	C	921	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=16;MQ=55.01;NF=5;NR=2;PP=921;QD=132.0;SC=TGAATGCTGGCCTCTCTCTCT;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=7;WE=36410894;WS=36410859;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr21	36411119	rs3746865	G	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=740;ReadPosRankSum=-0.933;SC=AAGCCTGGCAGCCTTGGCCGA;SOR=0.794;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=33;TCR=76;TR=45;WE=36411127;WS=36411109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr21	36419858	.	A	T	943	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=52.57;NF=12;NR=3;PP=943;QD=65.1847475031;SC=ACACACACACACTCTCTCTCT;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=15;WE=36419868;WS=36419848;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr21	36419860	.	T	A	389	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=53.3;NF=13;NR=1;PP=389;QD=30.2693723248;SC=ACACACACACTCTCTCTCTCT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=14;WE=36419868;WS=36419848;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,14:0.29:49
chr21	36419920	rs75759495	C	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=1005;ReadPosRankSum=0.851;SC=TTTCAGGGACCCGGAAACATA;SOR=1.058;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=54;WE=36419928;WS=36419910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr21	36421036	rs8133634	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=0.220;SC=GACAGGGAACTGGCAGGCACC;SOR=0.330;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=23;WE=36421044;WS=36421026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr21	36422282	rs71324342	A	AAC	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.730;NF=2;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=0.932;SC=GTACAGTCTTAACACACACAC;SOR=0.223;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=4;WE=36422290;WS=36422272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr21	37408608	rs68024241	AACGT	A	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=258;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TATTTCACAGAACGTACGTAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=7;WE=37408619;WS=37408598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr21	37414194	rs35392556	C	CAA	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.979;SC=TTTCTATATTCAAAAAAAAAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=37414202;WS=37414184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr21	37425955	rs762360	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=738;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TAAATCCTACCATAACTTCAA;SOR=0.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=26;TCR=85;TR=54;WE=37425963;WS=37425945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr21	37425971	rs762361	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=734;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TTCAAGGTCCCAGAGATAACT;SOR=0.719;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=14;TCR=72;TR=42;WE=37425979;WS=37425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr21	37429679	rs7282629	G	C	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=1127;SC=CGCAATGACTGACTTCTGTAT;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=37429687;WS=37429669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	37443155	.	T	TTG	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=23;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=64.32;NF=7;NR=0;PP=73;QD=10.8571428571;SC=CACTAAGTTTTTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=37443170;WS=37443145;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	37443480	rs1005696	T	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=533;ReadPosRankSum=-1.219;SC=TCTGTGCTTTTTCTCCTGCCA;SOR=0.834;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=33;WE=37443488;WS=37443470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr21	37443565	rs1005695	G	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-0.252;SC=CCTCCCTGTCGCACTGGTCTT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=13;WE=37443573;WS=37443555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr21	37445039	rs2230192	G	A	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1445;ReadPosRankSum=0.664;SC=CAGGGTGGGTGAGAACTGACA;SOR=0.793;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=202;TCF=103;TCR=99;TR=100;WE=37445047;WS=37445029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,125:0.50:249
chr21	37507501	rs8133052	G	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=986;ReadPosRankSum=-0.446;SC=ATGTCGTCCTGCAGCCGCGTG;SOR=0.579;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=67;WE=37507509;WS=37507491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr21	37507745	rs881711	C	T	6393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=102;PP=2965;SC=GGGGGCTCAACGTACTGGTCA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=102;TCR=102;TR=204;WE=37507753;WS=37507735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr21	37509995	rs12626192	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=0.254;SC=TCACCGACCTCGTTCTTAAAA;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=37510003;WS=37509993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr21	37518362	rs2835286	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=356;SC=TATATTTATCATTCTGTTTCA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=37518370;WS=37518352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	37518706	rs1056892	G	A	3182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1905;ReadPosRankSum=1.816;SC=CATCAGGACTGTGGAGGAGGG;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=254;TCF=132;TCR=122;TR=130;WE=37518714;WS=37518696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,153:0.50:306
chr21	37571593	rs2243723	A	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=47;PP=1569;SC=TACCCAAGTAACCGGTATTTC;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=37571601;WS=37571583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	37571667	rs7281674	T	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=627;SC=TGCAACAGTTTATCATAAAGC;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=37571675;WS=37571657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	37571692	rs2835316	G	A	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=380;SC=ACCAGGAGACGTCACTGGGCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=37571700;WS=37571682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	37580927	rs2156412	T	A	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=20;PP=1441;SC=CCGCTGTGGTTCTTCATGCAG;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=72;WE=37580935;WS=37580917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	37599824	rs7280662	T	G	150.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=1;PP=149;SC=CAGCCTGGGCTACAGAGCAAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=37599832;WS=37599816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	37599842	rs11431401	C	CA	162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=1;PP=184;SC=AAGACTCTGTCAAAAAAAAAG;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=37599850;WS=37599832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	37603038	rs117763400	A	G	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1423;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CGTCAGGAGAAGAAAGCAAGT;SOR=0.511;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=217;TCF=96;TCR=121;TR=98;WE=37603046;WS=37603028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,105:0.43:246
chr21	37609571	rs2835322	T	C	3758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=79;PP=2043;ReadPosRankSum=1.468;SC=GGGTGGCTCGTGTGCTTTGGA;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=294;TCF=144;TCR=150;TR=154;WE=37609579;WS=37609561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,183:0.50:367
chr21	37617630	rs4817788	T	G	6266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=83;PP=2965;SC=TACAAGCTCCTGCCACACGGA;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=181;WE=37617638;WS=37617620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr21	37617724	rs3746866	C	A	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1403;ReadPosRankSum=0.564;SC=GCACCCATCCCCATGGGGGGC;SOR=0.861;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=92;WE=37617732;WS=37617714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,100:0.50:201
chr21	37619724	rs1023367	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1118;ReadPosRankSum=0.922;SC=GTGATCTCTCCCTAGTTCCTG;SOR=0.488;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=115;TCF=90;TCR=25;TR=56;WE=37619732;WS=37619714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr21	37619931	rs5843755	A	AT	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=245;ReadPosRankSum=-1.386;SC=AAAAAGGTAAATTTTTTTTTT;SOR=0.540;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=81;TCF=5;TCR=76;TR=24;WE=37619939;WS=37619921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr21	37642196	rs11700664	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=0.586;SC=TTAATGGTACGTATATGCTCA;SOR=0.622;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=14;WE=37642204;WS=37642186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr21	37653942	rs73902193	C	T	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=680;ReadPosRankSum=2.149;SC=TTTTTTGCTGCTATAACAGAA;SOR=0.417;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=41;WE=37653950;WS=37653932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr21	37661041	rs58117793	A	AT	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ACTTGAATGCATTTTTTTTTC;SOR=0.859;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=6;WE=37661049;WS=37661031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr21	37661405	rs3827183	G	A	3445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=63;PP=2224;ReadPosRankSum=1.198;SC=CCCTCAGTGGGGGAGATACCC;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=300;TCF=169;TCR=131;TR=138;WE=37661413;WS=37661395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,162:0.47:348
chr21	37692589	rs2236433	A	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=932;ReadPosRankSum=-2.022;SC=CCCGCGGGATACGCCTCAGCG;SOR=1.151;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=52;WE=37692597;WS=37692579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr21	37716872	rs117131605	T	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=605;ReadPosRankSum=1.567;SC=TATGTTATTTTCCAGGCTTAT;SOR=1.832;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=32;WE=37716880;WS=37716862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr21	37728892	rs141327973	C	CTTGAA	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=-0.816;SC=AGAATTTTTTCTTGATTTTAT;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=37728900;WS=37728882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr21	37729088	rs2835339	G	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGAGTAAAGGGATTGTACAAT;SOR=0.163;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=12;WE=37729096;WS=37729078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr21	37749689	rs2850081	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=690;ReadPosRankSum=1.211;SC=CACTTAGATACTTTTTGCTCT;SOR=0.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=39;WE=37749697;WS=37749679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr21	37784070	rs218630	G	A	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=116;SC=TCTGTCACCCGGGCTGGAGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=37784078;WS=37784060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr21	38302769	rs2073425	C	T	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=1115;SC=AAACTGAGGGCACTCACAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=38302777;WS=38302759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr21	38439686	rs11702061	A	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=865;ReadPosRankSum=2.024;SC=AATATCTGCCAAAGAGAATAT;SOR=0.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=48;WE=38439694;WS=38439676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
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chr21	38444881	rs73200245	G	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.578;HP=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;ReadPosRankSum=-2.081;SC=GTGCTCCGTGGCACCATTGAT;SOR=1.366;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=47;WS=38444871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr21	38444890	rs2298682	A	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.962;HP=1;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=1116;ReadPosRankSum=2.173;SC=GGCACCATTGATCCATTCTCG;SOR=0.284;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=32;WE=38444898;WS=38444871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr21	38444995	rs7280542	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=446;SC=GCGCATACAGACACCCAGGCT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=38445003;WS=38444985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	38459725	rs2835583	A	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=341;ReadPosRankSum=-0.832;SC=CTAATTTTTCATTTTTGACAT;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=28;WE=38459733;WS=38459715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr21	38460338	rs2835584	T	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr21	38461326	rs2835586	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=0.798;SC=TAAATCTGCTGTCCATCAGTG;SOR=1.051;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=14;WE=38461334;WS=38461316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr21	38462614	rs3787780	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=723;ReadPosRankSum=2.273;SC=AAACTGGCACAGCCACTGTGG;SOR=0.794;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=49;WE=38462622;WS=38462604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr21	38462716	rs2835588	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=0.568;SC=ATTGACTTCTATATTTTCCTT;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=11;WE=38462724;WS=38462706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr21	38466261	rs3753070	T	A	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.463;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-1.638;SC=TGTTTTTTTTTAAACAAATGT;SOR=2.584;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=8;WE=38466269;WS=38466251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr21	38467857	rs2251161	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=-1.844;SC=CCAACTTGTGCAGAATAGATT;SOR=1.044;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=22;WE=38467865;WS=38467847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr21	38468958	rs2835600	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.696;SC=GTTGGTTAAAATATCTCAACC;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=18;WE=38468966;WS=38468948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr21	38469017	rs2835601	T	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-2.174;SC=TTTCTGTTTTTCAGGTATACA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=9;WE=38469025;WS=38469007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr21	38470120	rs1108966	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.244;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr21	38495185	rs11440324	G	GT	1867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=15;PP=1562;SC=TAAATTTGAGGTCCTTACTAT;SOR=1.565;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=34;WE=38495193;WS=38495175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	38495213	rs11440325	G	GA	1971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;PP=1702;SC=AAGTAAATTTGAAATCTTTTA;SOR=1.278;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=38495221;WS=38495203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr21	38495270	rs11440326	A	AT	2585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=35;PP=2161;SC=TGTGTGTGTGATGACTTTTAT;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=38495278;WS=38495260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	38501279	rs2835617	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=249;ReadPosRankSum=0.560;SC=CAGATTTTAGGAACAAATACT;SOR=0.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=17;WE=38501287;WS=38501269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr21	38504928	rs67638494	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=0.899;SC=TTTTCTTTATATGAGTAGAAC;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=5;WE=38504936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
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chr21	38517058	rs764175	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=1.291;SC=CTCCCTTACACGCATTTCCCC;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=28;WE=38517066;WS=38517048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
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chr21	38523266	rs3737540	C	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=1.254;SC=CTAAATTATGCCTTTTTAAAA;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=38523274;WS=38523256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr21	38525356	rs1053808	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AATACAGCCATGCTTCTCAAA;SOR=1.018;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=29;WE=38525364;WS=38525346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr21	38525652	rs767998	T	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=223;ReadPosRankSum=1.845;SC=CATTTTCATTTTCCTGCCATA;SOR=1.154;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=15;WE=38525660;WS=38525642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr21	38528866	rs2835635	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=187;ReadPosRankSum=0.502;SC=GCAAACTATAATCAGCTGGCT;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=13;WE=38528880;WS=38528856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr21	38528872	rs10706050	TG	T	1321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=8;PP=966;SC=TATAATCAGCTGGCTTTCAGA;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=23;WE=38528880;WS=38528856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	38531863	rs4817852	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.90;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	38531863	.	TACACTTGT	CACACTTGC,CACACTTGT	107	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=24;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4,7;NR=2,3;PP=107,15;QD=26.7446458104;SC=GTTTCTAAACTACACTTGTGT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6,10;WE=38531879;WS=38531853;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.60:10
chr21	38531871	rs2835636	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr21	38531921	rs1787365	C	A	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=706;SC=TAGTATGAGGCGTTATTTTAA;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=38531929;WS=38531911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	38532058	rs34771928	TG	T	4652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=58;PP=2974;SC=GTAAGTTACTTGGATCACTTG;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=38532076;WS=38532048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr21	38532068	rs113972351	G	GA	4331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=59;PP=2974;SC=TGGATCACTTGAATCTTACGT;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=74;WE=38532076;WS=38532048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr21	38532086	rs34586966	TG	T	4471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=61;PP=2957;SC=CGTTCTAATCTGATGTTAAAC;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=38532094;WS=38532076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr21	38532192	rs34367119	A	AT	669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=761;SC=ACGTACTATTATTCATTAGAA;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=38532200;WS=38532182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	38532901	rs5843796	G	GT	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=164;SC=CTTAATTTTAGTATACATTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=38532918;WS=38532892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	38532904	rs5843798	T	TA	233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.75;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	38532910	rs5843800	A	AG	267.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=267;SC=AGTATACATTAGTATTATTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=38532918;WS=38532892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	38534228	rs11424055	A	AT	856.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=275;SC=AATTTTAATGATTTTTCTCTT;SOR=1.127;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=38534242;WS=38534218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	38534234	rs57522570	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=289;SC=AATGATTTTTCTCTTTAATGG;SOR=1.127;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=38534242;WS=38534218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	38537743	rs2835641	A	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr21	38537937	.	G	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=267;ReadPosRankSum=-1.707;SC=TTTCCCAGAAGAAACTCGACA;SOR=0.633;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=18;WE=38537945;WS=38537927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr21	38538546	.	C	T	4064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.494;NF=82;NR=84;PP=2468;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AGGTTTGCCCCAGTACACCAG;SOR=0.586;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=388;TCF=182;TCR=206;TR=166;WE=38538554;WS=38538536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,199:0.42:477
chr21	38539718	rs2000413	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-1.368;SC=ACATGTTTACGGAAAGCATGG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=38539726;WS=38539708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr21	38539745	rs5843802	G	GA	493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=233;SC=ATCTAAATGGGAAAAAAAACT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=13;WE=38539753;WS=38539735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	38539836	rs5843803	T	TA	2192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=23;PP=1705;SC=AAGTGAATTTTATTTTTTGTT;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=38539844;WS=38539826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	38540089	rs2000416	T	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=104;SC=TTGTTGAAATTTGAGAAGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=38540097;WS=38540079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	38567902	rs2835659	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.037;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr21	38567911	rs7280251	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr21	38568009	rs1053966	G	C	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GTCTTCAGGCGACGATGGCCA;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=87;TCR=68;TR=66;WE=38568017;WS=38567999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,80:0.44:183
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chr21	38599934	rs11300896	TG	T	3318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=34;PP=2604;SC=CCATGAGGGCTGGGAGGCGAG;SOR=1.143;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=63;WE=38599942;WS=38599924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	38600154	rs10716173	CG	C	410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=356;SC=GCAGAGGCTGCGGGGTCCACA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=38600162;WS=38600144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	38850640	rs928763	G	A	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=65;PP=1824;SC=CTATCTTGCAGTATGTCATTG;SOR=3.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=77;WE=38850648;WS=38850630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr21	38858938	rs55650427	G	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=800;ReadPosRankSum=0.980;SC=GGCAAACAGCGCAGTGTGCCC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=52;WE=38858946;WS=38858928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr21	38862862	rs67837743	C	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=245;SC=TTGCGGTTTTCGCCATTGCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=38862870;WS=38862852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	38865507	rs2835772	C	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=364;ReadPosRankSum=-1.077;SC=TTCATAATTTCTTTTTGTCTT;SOR=1.358;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=25;WE=38865515;WS=38865497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr21	38997701	rs702859	G	A	4702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=76;PP=2652;SC=CGTAGAACCCGTCCTCCAGGG;SOR=0.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=137;WE=38997709;WS=38997691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr21	39086965	rs2070995	T	C	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=89;PP=2965;SC=TAATTCCCTCTGGGCATTTAT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=167;WE=39086973;WS=39086955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr21	39089582	rs857961	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=578;SC=CAAATACCAGAATAGGTGTTG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=39089590;WS=39089572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	39212857	rs55948847	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=400;ReadPosRankSum=-0.989;SC=GTAAGAGCAAAAGAGAAGGAC;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=29;WE=39212865;WS=39212847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr21	39325234	rs2836061	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=799;ReadPosRankSum=-0.174;SC=AAACTGTGCGCTCCAGGCTCT;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=49;WE=39325242;WS=39325224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr21	39671476	rs2230033	G	A	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=55;PP=1387;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TTAGAACCCGGTGAGCCCATT;SOR=0.885;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=203;TCF=89;TCR=114;TR=91;WE=39671484;WS=39671466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,105:0.46:228
chr21	39739478	rs62217874	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-1.815;SC=TGCAAAGAGAAGGCCACGCTG;SOR=1.802;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=13;WE=39739486;WS=39739468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr21	39739665	rs2836346	T	A	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CTGCACAGACTTTCATCAACA;SOR=0.608;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=69;WE=39739673;WS=39739655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,86:0.49:174
chr21	39764211	rs2836359	T	A	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=851;ReadPosRankSum=-1.060;SC=AAATCACAGATTAACCACAGA;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=102;TCR=65;TR=65;WE=39764219;WS=39764201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,79:0.42:188
chr21	39764437	rs2836360	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=0.629;SC=GGTTTTTTATTTGATTTTGTA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=11;WE=39764445;WS=39764427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr21	39764516	rs56136844	T	C	65.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	39775373	rs2836373	A	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=458;SC=TCTGAAGCTCAGGTCATAAGA;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=39775381;WS=39775363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	39818923	rs2836409	G	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=52;PP=1278;SC=ACATAAATAAGGGTGCTTCCC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=39818931;WS=39818913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr21	39822650	rs2211871	G	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=367;SC=TACACCACTTGTCACATTTTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=39822658;WS=39822640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	39822906	rs9305648	G	C	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=89;PP=2965;SC=GTTTGTGTCTGTGAATGGAAT;SOR=1.360;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=141;WE=39822914;WS=39822896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr21	39823349	rs2051165	T	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=683;SC=GATGTGTTCATTGCAGGTGGA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=39823357;WS=39823339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	39870310	rs2836441	G	A	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=50;PP=1463;SC=GCCATAATGCGATCAAGTTTA;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=39870318;WS=39870300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr21	40190620	rs10854389	C	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=573;ReadPosRankSum=-0.567;SC=ATTCTGAGAACCCCAGAGCCA;SOR=0.491;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=30;WE=40190628;WS=40190610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
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chr21	40191709	.	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=382;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GGAACTCCGAGAGCCTGGCCG;SOR=4.013;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=19;WE=40191717;WS=40191699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr21	40547387	rs9305670	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ACTACAATTAATTTTTTACAA;SOR=0.631;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=5;WE=40547395;WS=40547377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr21	40552307	rs3171465	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1056;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TCCAGAGTTTAGCACAACCAA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=62;WE=40552315;WS=40552297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,75:0.49:153
chr21	40553845	rs6517522	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.967;SC=AACTTCAATATAAACAGTATC;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=12;WE=40553853;WS=40553835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr21	40571246	rs1041439	A	G	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=104;PP=2965;SC=CACTGGTAATAGTTGATTTTC;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=85;TCR=104;TR=189;WE=40571254;WS=40571236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr21	40574305	rs2183573	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=18;PP=1046;SC=CTTTCTGATGATTCTGCTGAA;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=40574313;WS=40574295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	40574552	rs2150411	G	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CTAAATAGAAGTATATCATAT;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=40574560;WS=40574542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr21	40584598	rs6517529	C	T	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=20;PP=710;SC=TTACTCTCCTCCTTCCAGAAG;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=40584606;WS=40584588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	40585330	rs142696785	AAAGCCAACATTTTCTTCACTTT	A	1135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=2922;ReadPosRankSum=1.366;SC=TTGGTACTACAAAGCCAACAT;SOR=1.260;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=12;WE=40585359;WS=40585320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr21	40587049	rs4818004	A	G	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=108;SC=GACGGCCTTCACTTCCCAAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=40587057;WS=40587039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	40597215	rs139986112	A	AAAG	1190.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=1276;SC=TACAGATAAAAAAGCCAAAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=25;WE=40597223;WS=40597205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	40597236	rs9977787	A	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=100;ReadPosRankSum=-1.356;SC=CACAATACAAAAACAGGCAAG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=40597244;WS=40597226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr21	40600313	rs11702268	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=464;SC=ATATCTCTTCTGGAATTTACA;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=40600321;WS=40600303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	40604429	rs2836950	C	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1102;ReadPosRankSum=2.174;SC=CAAATTCTACCAAGGGGAAGA;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=49;TCR=71;TR=71;WE=40604437;WS=40604419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr21	40642189	rs6517532	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=20;PP=1330;SC=ATTTGTTACACTGTACCAGAA;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=40642197;WS=40642179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	40646226	rs145636658	A	AGC	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQRankSum=2.028;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr21	40646230	rs9977574	C	A	956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=1.931;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr21	40648265	rs2836969	G	A	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=550;SC=GTGTTGCTTAGCCCTGTCATT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=40648273;WS=40648255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	40649088	rs139067275	TA	T	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr21	40650621	rs973521	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.39;QD=27.63;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	40652040	rs2836971	A	C	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=22;PP=1540;SC=CTACATTAAAAAACAAAACCT;SOR=1.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=72;WE=40652048;WS=40652030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr21	40670460	rs2056844	G	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=432;ReadPosRankSum=0.225;SC=CCGATGCGCTGGCAGATTTGC;SOR=0.901;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=32;WE=40670468;WS=40670450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,38:0.30:125
chr21	40684975	rs35687055	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=0.164;SC=CCCGAGGGAGCGCGGGGACGG;SOR=0.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=40684983;WS=40684965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr21	40685239	rs34240248	A	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	40685246	rs34436313	A	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	40685283	.	C	CCGGGG	362.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.90;ReadPosRankSum=-1.564;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr21	40685284	rs35182074	A	C,AGCCG	662.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.7500;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=5;NR=7;PP=413;SC=GGACGGGGCCAGGGGAGCCGG;SOR=2.049;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=12;WE=40685292;WS=40685270;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:16
chr21	40685515	.	G	GCGC	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=3.268;SC=TCTCAGGCGCGCGCCGCCGCC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=1;WE=40685523;WS=40685505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr21	40686020	rs35994303	C	T	3954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=64;PP=2375;ReadPosRankSum=1.329;SC=TTTCACGGACCGGTCGTCTGG;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=151;TCR=117;TR=148;WE=40686028;WS=40686010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,179:0.55:323
chr21	40686078	rs9981301	G	C	9420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=154;PP=2965;SC=TTCGAGGACAGGAAAGCTTTT;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=142;TCR=154;TR=296;WE=40686086;WS=40686068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr21	40686327	rs4624474	T	C	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=74;PP=2199;SC=ACGGCTCGGCTGGATCCATCC;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=136;WE=40686335;WS=40686317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr21	40686382	rs9981349	A	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=933;ReadPosRankSum=0.034;SC=GGTGGTGCAGACGGGCCGCAG;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=50;WE=40686390;WS=40686372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr21	40715132	rs2070867	G	A	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=35;PP=1025;SC=ACACGTTGTCGTTTTATTTAT;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=40715140;WS=40715122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	40715167	rs2070866	A	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=202;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TCTTTAAAAAAGTCAATAACC;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=40715175;WS=40715157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr21	40769017	rs1060180	G	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=260;SC=CTTTATGAGAGAGTCTTATAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=40769025;WS=40769007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	40799955	rs2837028	A	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=292;SC=TTCCTAATTTATTCTATAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=40799963;WS=40799945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	40823981	rs6517549	G	A	4838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=70;PP=2965;SC=CGCATTCCCTGACAGGGGTGT;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=40823992;WS=40823971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr21	40824136	rs62225184	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=766;ReadPosRankSum=0.665;SC=AATATGGCCAACGTTGGCCTT;SOR=1.095;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=44;WE=40824144;WS=40824126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr21	40847249	rs760284	T	G	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=43;PP=1334;SC=AAATTAACATTACTTTAGTAC;SOR=2.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=40847257;WS=40847239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	40871810	rs9974333	T	C	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=44;NR=38;PP=1415;SC=AGTGAAGATGTGGGCAACCTC;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=82;WE=40871818;WS=40871800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	40880881	rs138818478	CTTGAA	C	1936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=1657;SC=TTTAAACGTACTTGAATTATG;SOR=2.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=30;WE=40880893;WS=40880871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	40883671	rs3831201	G	GAGA	1908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=11;PP=1243;SC=ACTGCAGAAGGAGAAGAGCCT;SOR=1.312;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=24;WE=40883679;WS=40883661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	40969620	rs2091883	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=335;ReadPosRankSum=0.096;SC=AATGGAAGAGGCGGGAGAGAG;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=20;WE=40969628;WS=40969610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr21	40969826	rs662571	G	C	7584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=117;PP=2965;SC=CGTGGATCCTGCACCAGAGCT;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=118;TCR=117;TR=235;WE=40969834;WS=40969816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr21	40981430	.	GA	G	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr21	41032740	rs3746887	T	C	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=1417;ReadPosRankSum=0.676;SC=AAAGAGAGGATGGTGAAGGGA;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=92;WE=41032748;WS=41032730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,107:0.52:206
chr21	41032804	rs734413	G	A	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=1783;ReadPosRankSum=0.258;SC=CAGCGGAAACGAAAGAGGTGG;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=115;WE=41032812;WS=41032794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,127:0.55:231
chr21	41117368	rs403527	G	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=617;SC=ATCAGAGGAAGTAGATTCAGA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=41117376;WS=41117358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	41117533	rs425320	T	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=29;PP=828;SC=GCTGGGAGGTTGGGACGACAG;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=41117541;WS=41117523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	41137362	rs9784201	A	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=422;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TGGATGGACAACCTGGGGGTT;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=24;WE=41137370;WS=41137352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr21	41137499	rs12626544	A	G	4741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.344;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,127:0.45:280
chr21	41137507	rs2205204	G	C	4665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.214;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,125:0.45:277
chr21	41160242	rs456818	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=383;ReadPosRankSum=-0.677;SC=ATTAAGTACCAGAGGTAGACA;SOR=0.331;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=27;WE=41160250;WS=41160232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr21	41165301	rs464574	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=491;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CATTCTAAAGAGATGGGATCT;SOR=1.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=41165309;WS=41165291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr21	41165462	rs2837225	C	A	4347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=75;PP=2650;ReadPosRankSum=-1.098;SC=CTGTTGCAGACACCGCTTCTC;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=346;TCF=195;TCR=151;TR=174;WE=41165477;WS=41165452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,205:0.49:417
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chr21	41434671	rs2837408	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=-0.848;SC=AAATTACAGTTTTTTCTAAAA;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=41434679;WS=41434661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr21	41434841	rs2837409	T	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=567;ReadPosRankSum=0.054;SC=GGAAAGAAAGTTAACATTAGT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=29;WE=41434849;WS=41434831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr21	41447313	rs378877	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.980;SC=TATTTATTTCCCTCCCTCTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=41447321;WS=41447303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr21	41506058	rs403892	A	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=612;SC=TCATCTGGACACGAGAATTCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=41506066;WS=41506048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	41514421	rs11701139	G	C	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=753;SC=AACTAGGAGGGGTCTGCAAAT;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=41514429;WS=41514411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	41514688	rs35155500	TA	T	1782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1670;SC=AGCAAAGCAATAACCGAAAAA;SOR=2.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=39;WE=41514696;WS=41514678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	42615293	rs2252576	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=504;ReadPosRankSum=-1.119;SC=GTAAATATTTCCTGTCCCAGG;SOR=1.283;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=27;WE=42615301;WS=42615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr21	42622657	rs960231	G	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=13;PP=1234;SC=CATGGTTTCTGATGTGATCTT;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=42622665;WS=42622647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	42622786	rs1046210	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=931;ReadPosRankSum=1.337;SC=ACCTGAGAGACGAGAACTCCA;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=62;WE=42622794;WS=42622776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,77:0.45:172
chr21	42688931	rs66482320	C	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.517;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=554;ReadPosRankSum=0.946;SC=TTAGCAAAAGCGGGAGGGCTG;SOR=0.843;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=40;WE=42688939;WS=42688921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr21	42694633	rs2838010	A	T	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=980;ReadPosRankSum=0.061;SC=CTTGCCCTGGAAAGCATTCCT;SOR=0.719;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=96;TCR=98;TR=75;WE=42694641;WS=42694623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,98:0.42:235
chr21	42710175	rs2158354	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-1.424;SC=TGGAAACCCTTCCCCCTCAGG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=42710183;WS=42710165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr21	42710566	rs2253894	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GAGAGCATCCAAGTGGAAATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=42710574;WS=42710556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr21	42717662	rs417708	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=501;ReadPosRankSum=1.339;SC=TGTATGAAGGTGGTAAGAAAA;SOR=0.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=40;WE=42717670;WS=42717652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr21	42767733	rs440364	T	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=221;SC=TCAGGAAAGCTCTGGAATTAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=42767741;WS=42767723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	42771176	rs2301803	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=619;ReadPosRankSum=0.130;SC=GAGAAGAAGTTGTAAGGGAGA;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=44;WE=42771184;WS=42771166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr21	42773822	rs73905358	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=616;ReadPosRankSum=-1.367;SC=AGCAAGACTTTATAAAACTGT;SOR=2.147;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=31;WE=42773830;WS=42773812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr21	42775179	rs112479250	G	GT	618.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=374;ReadPosRankSum=-2.242;SC=TCTCCTTTTTGCTTTTTTTGG;SOR=1.071;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=23;WE=42775188;WS=42775169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr21	42775180	rs459763	C	T	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=18;PP=1835;SC=CTCCTTTTTGCTTTTTTTGGT;SOR=2.414;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=80;WE=42775188;WS=42775169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr21	42775555	rs462161	A	G	5531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=71;PP=2965;SC=CTCCACCGAGAACTGGCTGGT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=173;WE=42775563;WS=42775545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr21	42775687	rs73905359	C	T	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=969;ReadPosRankSum=1.199;SC=ACTCTTCCCCCGAGTTACCTT;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=60;WE=42775695;WS=42775677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr21	42808015	rs468207	A	G	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=86;PP=2495;SC=TACCACAGACAGGGTGGCTTA;SOR=1.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=33;TCR=86;TR=119;WE=42808023;WS=42808005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr21	42808054	rs468451	C	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=51;PP=1453;SC=TCTCACAGTTCTGGAGACTGG;SOR=5.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=53;WE=42808062;WS=42808044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	42809206	rs468646	A	C	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=55;PP=1680;SC=ACATCAGGCCACGGTTCCTTC;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=62;WE=42809214;WS=42809196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr21	42812891	rs467960	C	T	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=30;PP=1160;SC=ATGTGGACATCGCCACCACAG;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=42812899;WS=42812881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	42813933	rs145807679	A	AGTGTGT	754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.912;NF=1;NR=19;PP=1133;ReadPosRankSum=1.452;SC=AGATGTGTGGAGTGTGTGTGT;SOR=2.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=20;WE=42813941;WS=42813923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr21	42817582	rs469288	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=366;SC=TTCCTTCTTCACTCCCCCAAG;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=42817590;WS=42817572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	42817612	rs469382	G	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=5;PP=162;SC=AAGACATCTGGCCCGTAGCAC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=42817620;WS=42817602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	42817930	rs469390	G	A	5245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=44;PP=2965;SC=TTGACAGAAAGTTAATGCCTT;SOR=1.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=110;TCR=44;TR=154;WE=42817938;WS=42817920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr21	42818106	rs467773	C	T	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=65;PP=1793;SC=CTGCTACAACCGAATACCTGA;SOR=3.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=74;WE=42818114;WS=42818096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	42818132	rs364199	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=41;PP=1213;SC=GGTCATTTATAAACAGTAGAA;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=42818140;WS=42818122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	42821113	rs2070229	T	C	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=969;ReadPosRankSum=-0.425;SC=ATCAGTATCGTGGTAGAGAGC;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=66;WE=42821121;WS=42821103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,73:0.54:134
chr21	42822983	rs1050080	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.566;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr21	42824733	rs469304	G	A	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=882;ReadPosRankSum=0.659;SC=GGGCTTTCCAGTCCAGCTCGG;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=53;WE=42824741;WS=42824723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr21	42824874	rs467798	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=1.711;SC=TAGTCTTGCTCTCTCTGTAGG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=42824882;WS=42824864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr21	42837848	rs62217525	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=422;ReadPosRankSum=-0.722;SC=AACCAGCCGGCCATCACCCCT;SOR=0.397;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=23;WE=42837856;WS=42837838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr21	42840580	rs462321	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=201;SC=CAGCCCTATTTTCCAGCCCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=42840588;WS=42840570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	42842713	rs112132031	C	CCTAAGGCCTCGGG	2232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=2900;SC=GCGGGTATCACCTATGTCTCC;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=17;WE=42842721;WS=42842703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	42842771	rs28524972	C	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr21	42843960	rs464431	A	G	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.65;SOR=2.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	42843960	.	AGT	GGA,GGT	543	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6,15;NR=14,41;PP=268,543;QD=16.0733937431;SC=CAGAGCTCTCAGTGGATGAAC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=20,56;WE=42843970;WS=42843950;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:56
chr21	42843962	rs458213	T	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr21	42845383	rs17854725	A	G	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=32;PP=1351;SC=CGCCGCCCACAATCCTGCTCT;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=42845391;WS=42845373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr21	42848560	rs140530035	CAG	C	9198.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=104;PP=2957;SC=GCAAAAAGAACAGGGGAAATT;SOR=1.032;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=16;TCR=107;TR=120;WE=42848569;WS=42848550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr21	42852320	rs734056	C	A	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=8;PP=968;SC=TGTGCCGGTGCTTTCACAGGG;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=42852328;WS=42852310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	42860307	rs422471	C	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=13;PP=633;SC=TTCCCAAGGTCAAGGCTGACT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=42860315;WS=42860297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	42860485	rs386416	G	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=40;PP=1452;SC=GCTGAGAAACGCAATGAGCCT;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=42860493;WS=42860475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr21	42879724	rs8126497	G	A	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=167;SC=GGACTCGCAGGACCACCTGCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=42879732;WS=42879714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	43132878	rs11701067	T	A	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr21	43133145	rs6586229	A	G	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=767;ReadPosRankSum=0.185;SC=TGTCGGGAAAAACAAACAAAC;SOR=0.963;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=48;WE=43133153;WS=43133135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr21	43133242	rs58060925	A	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.29;ReadPosRankSum=1.370;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr21	43133247	rs60605755	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.157;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr21	43133829	rs2838096	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=0.565;SC=GGGTAGCAGCATCCCTGGAAA;SOR=0.346;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=9;WE=43133837;WS=43133819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr21	43161022	rs7276592	C	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=578;ReadPosRankSum=0.075;SC=GCCGCAGGAGCGTGGCGGCGG;SOR=1.210;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=32;WE=43161030;WS=43161012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
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chr21	43161877	rs3746893	C	T	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=67;PP=1897;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TGATCTTCCGCGCCAGCAGGA;SOR=0.858;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=239;TCF=112;TCR=127;TR=123;WE=43161885;WS=43161867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,131:0.49:268
chr21	43162150	rs3746894	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=621;ReadPosRankSum=0.392;SC=CGTCTGTGGTGCCCAGATCTG;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=44;WE=43162158;WS=43162140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr21	43162200	rs3746895	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=441;ReadPosRankSum=1.527;SC=TGGCTGCACATCCAGGGACGT;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=33;WE=43162208;WS=43162190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr21	43164232	rs2277789	C	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=446;ReadPosRankSum=-1.875;SC=GCTGTGAGAGCAGCTCGGAGA;SOR=0.992;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=36;WE=43164240;WS=43164222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,38:0.41:92
chr21	43164345	rs2277790	A	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-1.563;SC=CCTGCCATAGACCGCATGGCC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=43164353;WS=43164335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr21	43177124	rs59885183	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=1.562;SC=TGTCACATCACGAATGCAGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=43177132;WS=43177114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr21	43221483	rs3850706	A	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=724;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TGCGGCTGCGAGGGTGGCAAG;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=46;WE=43221491;WS=43221473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr21	43231296	rs28461265	A	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=69;PP=2000;SC=TAGGGCCTTCAGGAGAAGGTG;SOR=1.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=26;TCR=69;TR=95;WE=43231304;WS=43231286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr21	43231342	rs28484650	C	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=43;PP=1153;SC=AACGCTCATCCCCAGCCTCGG;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=46;WE=43231350;WS=43231332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	43236252	rs28657504	A	G	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=70;PP=2169;SC=CTGGGGGCCCATGCCCGAGAC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=43236260;WS=43236242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	43239972	rs28477638	A	G	5681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=94;PP=2965;SC=ACTCGCGGACATTGTCGTGCA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=99;TCR=94;TR=193;WE=43239980;WS=43239962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr21	43242207	rs28360603	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=737;SC=GCCTTGAAACGACCACCTTCC;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=43242215;WS=43242197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	43243585	rs28545527	A	G	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=29;PP=1708;SC=TGCCCTGCCCACAGAACTCTG;SOR=1.496;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=90;WE=43243593;WS=43243575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	43246223	rs28559700	C	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=942;SC=CAAATCTTCCCTGCAATATTC;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=43246231;WS=43246213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	43246495	rs28473463	T	G	2794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=69;PP=1889;SC=GCCAGCATCCTTTCCAGCGCA;SOR=1.993;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=93;WE=43246503;WS=43246485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	43254463	rs2839388	A	G	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=10;PP=2556;SC=CCCATGTGCGACAGCCCTGGT;SOR=4.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=87;TCR=10;TR=97;WE=43254471;WS=43254453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	43255359	rs2839391	G	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=803;SC=TTACTGGAAAGTTTCCATCTG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=43255367;WS=43255349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	43255727	rs2839393	T	G	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=672;SC=TCCACGCCTGTGTCTGTTATG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=43255735;WS=43255717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	43256172	rs17766525	T	C	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=414;ReadPosRankSum=-1.373;SC=GTCAGTTGTCTGTGTTGTCCA;SOR=0.909;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=29;WE=43256180;WS=43256162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr21	43256252	rs4920098	C	T	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=42;PP=2026;SC=AGGAAACGTGCTGCTTTAGGC;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=104;WE=43256260;WS=43256242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	43256438	rs4920101	T	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=827;SC=GCTGCAGAGATGATCGCCCAC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=43256446;WS=43256428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	43258000	rs8127003	T	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=8;PP=1018;SC=GCTGCCAGCATTGTCTGTCCA;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=43258008;WS=43257990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	43258353	rs6586335	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=187;SC=ACATTTACTAGTACAAACAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=43258361;WS=43258343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	43267260	rs2277793	C	T	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=50;PP=2056;SC=ACTGGCTGGGCTCCGACTCCA;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=109;WE=43267268;WS=43267250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr21	43277279	rs3833355	C	CT	3902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=43;PP=2936;SC=TGGCAACAGCCTTTACCTTCA;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=70;WE=43277287;WS=43277269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr21	43298846	rs143393748	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=575;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GGTCCAGGGACCCCCCCGTGC;SOR=0.435;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=47;WE=43298854;WS=43298836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
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chr21	43325742	rs35279709	CA	C	3694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=29;PP=2787;SC=CAACTTTTTCCAAATTCTGAA;SOR=1.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=68;WE=43325750;WS=43325732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr21	43327856	rs3746906	A	G	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=48;PP=1761;SC=GCTGCTTCTTAAATAAGTCCA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=96;WE=43327864;WS=43327846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
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chr21	43334669	rs3746907	G	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=0.790;SC=GGGGCTGGAAGAGCCCCTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=17;WE=43334677;WS=43334659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr21	43334896	rs3746908	A	G	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=54;PP=1747;SC=GGAAGTAGCCACTGGACTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=43334904;WS=43334886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	43362203	rs59312488	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
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chr21	43362513	rs3746910	C	G	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=109;SC=ATATCAGGAGCTCTGCACATC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=43362521;WS=43362503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	43413553	rs871546	T	G	5149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=66;PP=2965;SC=TCAAGAGACTTTGCATATACC;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=148;WE=43413561;WS=43413543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr21	43413731	rs915837	C	T	6506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=120;PP=2965;SC=TTTTTCCTTGCGCTTCGTTTC;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=84;TCR=120;TR=204;WE=43413739;WS=43413721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr21	43496017	rs220285	C	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=466;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GGGAGGTGTGCTCTCACTTGC;SOR=0.433;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=26;WE=43496025;WS=43496007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr21	43496381	rs220286	G	T	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=44;PP=962;ReadPosRankSum=0.749;SC=GCTGGGCTGGGGCGGGGCCAC;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=22;TCR=80;TR=55;WE=43496389;WS=43496371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr21	43510514	rs2839464	C	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AAGCTCCAGCCACGTCTCCAC;SOR=1.140;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=23;WE=43510522;WS=43510504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr21	43519032	rs220312	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=431;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CTGTGCTTTCGTAGATTGTCC;SOR=0.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=35;WE=43519040;WS=43519022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr21	43522349	rs220109	T	C	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=65;PP=1357;ReadPosRankSum=1.010;SC=ACCGCAGCAGTGTGGAGTACC;SOR=0.805;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=78;TCR=117;TR=105;WE=43522357;WS=43522339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,126:0.52:242
chr21	43523941	rs220111	C	A	3116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=63;PP=2201;ReadPosRankSum=0.316;SC=GTCGTGAAGACGTTGATGGAT;SOR=0.668;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=123;WE=43523949;WS=43523931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,136:0.56:245
chr21	43529515	rs220120	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.082;SC=AGGCCGTAAGGTTGTCATGAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=43529523;WS=43529505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr21	43529548	rs35742122	A	AG	494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.394;NF=9;NR=2;PP=384;ReadPosRankSum=-0.146;SC=ATGCCCCAAAATGCCCCTGCT;SOR=0.502;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=43529556;WS=43529538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr21	43529819	rs11203186	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-1.395;SC=GGTACGTGTCGACCCCCCTGC;SOR=0.126;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=43529827;WS=43529809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr21	43530897	rs220125	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=726;ReadPosRankSum=0.516;SC=GGGATGCAGAGCAGTCCTGCT;SOR=1.061;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=35;WE=43530905;WS=43530887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr21	43531008	rs220126	T	C	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GTGAGCCCCATGGGCGGTGGA;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=97;WE=43531016;WS=43530998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,115:0.56:207
chr21	43531403	rs220127	C	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CCCCAGCCAGCGGAGCACCAG;SOR=0.715;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=11;WE=43531411;WS=43531393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr21	43531553	rs220128	A	C	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=25;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CCCGAAGGCTACTGGGTCAAC;SOR=0.948;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=166;TCF=111;TCR=55;TR=84;WE=43531561;WS=43531543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,103:0.51:202
chr21	43531632	rs220129	T	C	3461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=60;PP=2202;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GGAAACTCCATCATGGAGCCA;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=155;TCR=119;TR=139;WE=43531640;WS=43531622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,161:0.51:313
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chr21	43539523	rs220147	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=2.319;SC=TGAAAGATGTCGTGTTGTGCC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=43539531;WS=43539513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr21	43541342	rs220150	C	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=589;ReadPosRankSum=0.940;SC=AAGGTAATGTCGTCAGAGTTT;SOR=0.954;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=39;WE=43541350;WS=43541332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr21	43541478	.	CGT	C	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=72;QD=39.5;SC=TGTGGGTGCACGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=43541487;WS=43541468;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr21	43546705	rs220157	T	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=499;SC=TTCCTTGAGATGGAATATACA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=43546713;WS=43546695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	43547788	rs220158	T	C	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=29;PP=1721;SC=TCAGCTGCCCTGTGCCCAACA;SOR=1.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=87;WE=43547796;WS=43547778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	43548239	rs2839470	T	C	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=40;NR=60;PP=2088;SC=CTTGCCATGATACCTAGTGCT;SOR=1.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=100;WE=43548247;WS=43548229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr21	43549794	rs7275646	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=635;ReadPosRankSum=0.636;SC=ATTAATTTGACGTTTCTCTTC;SOR=0.275;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=36;WE=43549816;WS=43549784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr21	43557736	rs220178	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=458;ReadPosRankSum=0.326;SC=AATAGGAGGCGCAGGCTGACA;SOR=0.987;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=32;WE=43557744;WS=43557726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr21	43697195	rs2234718	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-1.241;SC=TGGGACAGGCAACATTTCAGG;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=15;WE=43697203;WS=43697185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr21	43704650	rs2234719	C	T	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=44;PP=2876;SC=AGGCGTCTCACGGTGCCTCTT;SOR=1.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=139;WE=43704658;WS=43704640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr21	43720525	rs1023156	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=708;ReadPosRankSum=2.369;SC=ACACACACATACACACACATA;SOR=0.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=32;WE=43720533;WS=43720515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr21	43720875	rs35803624	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=1.254;SC=TAGATACTTATAAAGAATAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=43720883;WS=43720865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr21	43766560	rs225334	G	A	7932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=117;PP=2965;SC=ATTTCATGAAGTATGAAGCTG;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=138;TCR=117;TR=255;WE=43766568;WS=43766550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr21	43769909	rs34333540	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=320;SC=GGCCTCCTCCGGCCCCTGCTC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=43769917;WS=43769899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	43770926	rs5844113	CT	C	358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=10;NR=4;PP=230;SC=TATGGTTGTGCTTTTTTTTTT;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=14;WE=43770934;WS=43770916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	43782547	rs13276	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=1.022;SC=GTGCTGGGGACGGCACCGCGT;SOR=0.646;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=9;WE=43782555;WS=43782537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr21	43786512	rs225358	C	T	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=25;PP=1905;SC=GGAAGAAGCACGCCTTACCTG;SOR=1.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=43786520;WS=43786502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	43792869	rs13047838	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=437;ReadPosRankSum=0.398;SC=TCCCCTTCCTCTTCAGGTTTT;SOR=1.032;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=32;WE=43792877;WS=43792859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,40:0.38:105
chr21	43796913	rs1078272	T	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=21;PP=547;SC=CTCTGGTGTGTCGCAACAGCG;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=43796921;WS=43796903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	43803412	rs8129105	T	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=427;SC=TCACTGCCCCTGCTCCCAGAG;SOR=3.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=43803420;WS=43803402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	43803880	.	C	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=588;ReadPosRankSum=0.612;SC=TGGCTGTCTCCCCCACCTGAC;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=39;WE=43803888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr21	43804265	.	C	CA	62	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=19;MQ=58.31;NF=0;NR=2;PP=62;QD=33.0;SC=AGTCTATGTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=43804273;WS=43804255;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr21	43805637	rs2839501	C	T	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=88;PP=2965;SC=TATCTGAACTCACATAGCTGC;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=179;WE=43805645;WS=43805627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr21	43805656	rs8130564	T	C	6147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=99;PP=2965;SC=GCAAGCACATTGGAAAGACAG;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=184;WE=43805664;WS=43805646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr21	43823910	rs2277797	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=184;ReadPosRankSum=0.905;SC=CTGATATCTCATGCAAACAGG;SOR=1.473;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=13;WE=43823918;WS=43823900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr21	43824106	rs2277798	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=0.034;SC=CAAGCTCAAGAGCCGCAGCAG;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=28;WE=43824114;WS=43824096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr21	43824123	rs2277799	G	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=385;ReadPosRankSum=-0.395;SC=GCAGCCCCTCGCTCCTGGAGC;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=25;WE=43824131;WS=43824113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr21	43826344	rs3746923	C	T	3998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=78;PP=2254;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TGTGCAAGGCCACACCCTGCC;SOR=0.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=302;TCF=158;TCR=144;TR=157;WE=43826352;WS=43826334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,190:0.52:362
chr21	43826391	rs3746924	T	C	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=78;PP=2080;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CGACGTGACTTTGTGTCTGTG;SOR=1.015;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=269;TCF=115;TCR=154;TR=125;WE=43826399;WS=43826381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,165:0.49:335
chr21	43829758	rs11702374	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=747;ReadPosRankSum=-1.747;SC=ACGGCAGCTGGAGGCATTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=45;WE=43829766;WS=43829748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr21	43846729	rs2839509	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TCAAGTACATACATGACCAGA;SOR=0.678;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=14;WE=43846737;WS=43846719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr21	43852146	rs58639264	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=459;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GAGAGCTGCCATTGGTGCAAG;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=12;WE=43852168;WS=43852136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr21	43852160	rs2839512	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=459;ReadPosRankSum=0.052;SC=GTGCAAGTCCAGTGAGTTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=15;WE=43852168;WS=43852136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr21	43852232	rs13052676	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=302;ReadPosRankSum=0.056;SC=CAAGGAAGAGCGTGCTGGTGG;SOR=0.707;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=24;WE=43852245;WS=43852222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr21	43852355	rs2839513	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=776;ReadPosRankSum=0.767;SC=ACACTGTAGATCTAACCAATG;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=55;WE=43852363;WS=43852345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,63:0.42:150
chr21	43854985	rs17114925	A	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=665;ReadPosRankSum=0.888;SC=GCAGTCTGCCAAGACGGAGTC;SOR=0.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=51;WE=43854993;WS=43854975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr21	43862466	rs2254368	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=466;SC=TGATTTAGACGTGTGTGTGAC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=43862474;WS=43862456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	43863521	rs868092	A	G	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=49;PP=1667;SC=ACACCTGTCCACAGGACAGTA;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=43863529;WS=43863511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	43864519	rs4920104	G	A	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=443;SC=CTTCTAGCCCGGGGGTCTCGC;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=43864527;WS=43864515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	43867059	rs3827232	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=1.251;SC=CCTGGGCAGTCGCAGACCCTC;SOR=0.460;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=13;WE=43867067;WS=43867049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr21	43892775	rs11203205	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GAGCAGTGGCGCGATCTCCAC;SOR=0.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=15;WE=43892783;WS=43892765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr21	43896143	rs117385282	C	T	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=1693;ReadPosRankSum=2.153;SC=GCCTCCTCCCCGGGTTCTCCT;SOR=0.662;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=218;TCF=92;TCR=126;TR=115;WE=43896151;WS=43896133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,126:0.50:252
chr21	43897366	rs150348163	C	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=0.451;SC=ACACCCTCTGCCCCCTCCACC;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=43897374;WS=43897356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr21	43905887	rs2839536	C	T	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=65;PP=2044;SC=TGCCCGTCTCCGCGTATAAAT;SOR=1.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=91;WE=43905895;WS=43905877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	43906351	rs2839537	G	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=4;PP=1902;SC=AGAAAGATTGGACCTGCCTGG;SOR=4.587;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=67;TCR=4;TR=71;WE=43906359;WS=43906341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr21	43916339	rs1573413	G	A	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=61;PP=1969;SC=GCCTCTAGCAGGTGGGTAGCA;SOR=2.128;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=80;WE=43916347;WS=43916329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	43938673	rs4919990	T	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=42;PP=1385;SC=AGGTGAGGGCTACTGTGCAGG;SOR=2.041;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=43938681;WS=43938663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	43955427	rs228056	A	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=382;SC=GAAACTGAACAGAAAATGCAC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=43955435;WS=43955417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	43959770	rs228063	A	G	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=76;PP=2534;SC=AAGGGTTTGGATCCGTGGCTC;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=136;WE=43959778;WS=43959760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr21	43959908	rs58348531	TC	T	442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=491;SC=ACAAAGTCCTTCCCTTTCTCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=43959916;WS=43959898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	43963401	rs228074	T	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=327;SC=TCGCGAGTCCTGCATGGCACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=43963409;WS=43963392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	43963759	rs228075	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=31;PP=974;SC=GAGGCCTCGGATTTCCCTGCC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=43963767;WS=43963749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	43967126	rs228082	G	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=453;SC=CGGTGCTCCCGTGTTGCCCTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=43967134;WS=43967116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	43984126	rs7282730	C	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=788;SC=AGGGTCAGGCCGTCACCTGGG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=43984134;WS=43984116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr21	43985955	rs228104	G	A	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=42;PP=2071;SC=CTTCTCCACCGTCAGCAAGAT;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=110;WE=43985963;WS=43985945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr21	43986117	rs36113965	T	TC	3669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=62;PP=2973;SC=GCTAAAATTGTCCGTGTCCTC;SOR=1.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=72;WE=43986125;WS=43986107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr21	43986175	rs4919992	C	T	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=41;PP=1183;SC=CTCCCCAGTGCGAGGCTTGCC;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=43986183;WS=43986165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	43987325	rs9977293	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.23;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr21	43988437	rs7280392	G	A	8440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=122;PP=2965;SC=ATGCTGTGGCGATAACTGCAC;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=147;TCR=122;TR=269;WE=43988445;WS=43988427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr21	43999983	rs453592	T	C	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=46;PP=1425;SC=ATCTGCCTTCTGCACCTGGCT;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=82;WE=43999991;WS=43999973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr21	44000052	rs380152	A	G	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=30;PP=1057;SC=CTTCACTCTCACTTTTTCTTT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=44000071;WS=44000042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	44000063	rs380161	T	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=24;PP=888;SC=CTTTTTCTTTTCTAATAAATA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=44000071;WS=44000042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	44000078	rs453647	T	C	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=634;SC=TAAATACCTCTGGATGGGTTA;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=44000086;WS=44000068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	44000366	rs388907	A	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=24;PP=1511;SC=GGCTCCCCATAGGATTTGCAC;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=44000374;WS=44000356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr21	44073833	rs185830982	C	G	216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.68;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	44107960	rs2839573	T	A	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=13;PP=1476;SC=TGGCCCCATGTGTACATTCAA;SOR=2.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=63;WE=44107968;WS=44107950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr21	44107989	rs2839574	A	G	3668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=35;PP=2421;SC=CCCAGAGCACACTATGGGCGA;SOR=1.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=89;TCR=35;TR=124;WE=44107997;WS=44107979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr21	44118958	rs1515755	T	A	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.12;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr21	44152149	rs2269153	G	A	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=48;PP=2061;SC=TCTTGTCCGTGTTCCATCTGT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=101;WE=44152157;WS=44152139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr21	44163839	rs6586344	A	G	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=26;PP=1200;SC=GAGATCCTCCACATTCGTCCG;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=44163847;WS=44163829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr21	44174275	rs4919999	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.837;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr21	44178992	rs11702144	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-0.190;SC=GAGGGGGAGAACCCACCTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=44179000;WS=44178982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr21	44180443	rs13047953	C	T	3012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=43;PP=1607;ReadPosRankSum=0.384;SC=CGCAGTTCTGCGTCCACGACA;SOR=0.822;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=230;TCF=134;TCR=96;TR=110;WE=44180451;WS=44180433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,144:0.51:285
chr21	44180866	rs55905735	ACC	A	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=0.342;SC=ACCCAATTCCACCCCCCCTCA;SOR=0.743;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=7;WE=44180875;WS=44180856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr21	44180916	rs1547379	G	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=624;ReadPosRankSum=0.766;SC=AAACACCTACGCCCTGTTTTC;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=40;WE=44180924;WS=44180906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr21	44182135	rs2269168	C	G	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=670;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GTTGCTCCCCCGTGCAGGTAC;SOR=1.436;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=42;WE=44182143;WS=44182125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr21	44188249	rs68104891	GC	G	1399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.968;NF=17;NR=12;PP=965;ReadPosRankSum=1.034;SC=GCAGCAGCAGGCCCGTGTTCT;SOR=1.227;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=29;WE=44188257;WS=44188239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr21	44188485	rs2284977	T	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CGAGCACGCCTGGGTGGTCCC;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=19;WE=44188493;WS=44188475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr21	44188504	rs67260236	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-1.654;SC=CCGCATATTCCCCGGGCTGCC;SOR=0.631;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=8;WE=44188512;WS=44188494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr21	44189166	rs1045382	T	C	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr21	44189172	rs3087994	A	C	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr21	44189387	rs55990449	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.267;SC=ATGCACACACGTACACAGATA;SOR=0.192;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=7;WE=44189395;WS=44189377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr21	44190680	rs2269172	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=2.387;SC=GCAGCAGAGCCGGCACGAGGG;SOR=2.761;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=44190688;WS=44190670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr21	44192747	.	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.234;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr21	44270402	rs6586251	C	G	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=12;PP=413;SC=GAACATGGGACTCGGCCACCA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=44270410;WS=44270392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	44273858	rs15736	G	A	7045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=105;PP=2965;SC=TAGACCACAGGAGTGCTTGCC;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=200;WE=44273866;WS=44273848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr21	44274845	rs1107831	A	G	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=65;PP=2141;SC=CCCACATATCAAGGAAGAGGA;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=109;WE=44274853;WS=44274835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr21	44275945	rs62215012	G	A	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=33;PP=1038;SC=CCGTCAGGTAGGGTGACAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=44275953;WS=44275935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	44279668	rs149300976	C	CCAGGGGCCAGCGATCCA	796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=1809;SC=CCACAGCCAGCCAGGGGCCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=44279676;WS=44279658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	44293744	rs2248490	C	G	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=57;PP=2965;SC=AGCTGCCAGACTTGGAGAAGG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=96;TCR=57;TR=153;WE=44293752;WS=44293734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr21	44296933	rs71332377	AT	A	3387.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=52;PP=909;SC=GAAATAACAAATTTTTTTTTT;SOR=3.312;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=53;WE=44296943;WS=44296923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr21	44296935	rs116944707	T	A	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=39.96;SOR=3.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr21	44299604	rs142849945	A	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=481;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AGAGCCCGCCATGTACCCGCC;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=33;WE=44299612;WS=44299594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr21	44323590	rs4148973	T	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=43;PP=1431;SC=CTTCATCCTCTTCCAGCTCCT;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=44323598;WS=44323580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	44324365	rs10595	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=35;PP=991;SC=CGCGCCAGGGGACGACCGAGG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=44324373;WS=44324355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	44327015	rs2839604	G	A	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=69;PP=2124;SC=CTCTTTAAATGAGACATCGTT;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=105;WE=44327023;WS=44327005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr21	44328830	rs4148976	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=467;SC=AAGCGCCTGTATGTGAGCCAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=44328838;WS=44328820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	44371114	rs451887	T	C	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=52;PP=1511;SC=TGTGATATTATTCATAATATC;SOR=3.258;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=62;WE=44371122;WS=44371104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	44424689	rs3216136	G	GA	1667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.18;NF=0;NR=42;PP=1239;SC=TTCGTGTTCAGAAAAAAAGCC;SOR=3.422;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=42;WE=44424697;WS=44424679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	44430325	rs234781	T	C	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=63;PP=1590;SC=ATCCAGAAACTGATAATTTAG;SOR=1.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=89;WE=44430333;WS=44430315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr21	44437142	rs3737434	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=629;ReadPosRankSum=1.071;SC=AAATGGACACACTCTCCATGA;SOR=0.769;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=41;WE=44437150;WS=44437132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr21	44445185	rs234719	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=2.005;SC=CCAACTGAGACGGGGTCTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=16;WE=44445193;WS=44445175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr21	44448763	rs170916	G	C	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=12;PP=2956;ReadPosRankSum=0.955;SC=TCCTGTATAGGGTCTTTACGA;SOR=1.020;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=116;TCR=32;TR=63;WE=44448783;WS=44448753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,67:0.41:165
chr21	44448775	rs234728	G	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.592;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=18;PP=2956;ReadPosRankSum=0.082;SC=TCTTTACGAAGGCTGTTTTCA;SOR=1.155;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=183;TCF=133;TCR=50;TR=80;WE=44448783;WS=44448753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,88:0.43:205
chr21	44449095	rs234729	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=20;PP=551;SC=TGGTGAACGAGAGTGCGTGGT;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=44449103;WS=44449085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	44449917	rs234733	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=2.392;SC=TAGGTCAAACGAGCAAACAGC;SOR=1.329;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=12;WE=44449925;WS=44449907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr21	44452424	rs141407897	T	TTCCCTCACCACCCTCCGTCTCTTCG	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.655;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr21	44452455	rs378528	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=350;SC=CTTCGGCTGCTTGCTCTTTAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=44452463;WS=44452445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	44473867	rs1051319	G	C	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=608;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TCTGTGCCGTGTGCAGGGATA;SOR=0.364;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=46;WE=44473875;WS=44473857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr21	44475714	rs2124459	T	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=392;SC=CCTTGCATTTTGGGGAAACGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=44475722;WS=44475704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	44475786	rs2124460	C	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr21	44475877	rs8132811	C	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=833;ReadPosRankSum=0.744;SC=TCTTGGGGGCCGTGCCGTCTC;SOR=0.798;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=47;WE=44475885;WS=44475867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
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chr21	44477095	rs1005584	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=1.335;SC=AAAGCCCACCCGGGAGGCAGT;SOR=0.684;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=28;WE=44477103;WS=44477085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr21	44478175	rs180700498	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.296;NF=21;NR=3;PP=422;ReadPosRankSum=0.400;SC=TTTGAGCTGCGTGTAGGTGAC;SOR=0.725;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=61;TCR=11;TR=24;WE=44478183;WS=44478165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr21	44480616	rs1801181	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=509;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GCTCCTGCGCGGCCTTCACGG;SOR=0.548;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=30;WE=44480624;WS=44480606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr21	44488033	rs234714	T	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TCCCTCCACGTTCTTGAGCCT;SOR=2.093;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=15;WE=44488041;WS=44488023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr21	44488755	.	G	GA	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5070;HP=14;HapScore=2;MGOF=69;MMLQ=18;MQ=57.4;NF=0;NR=4;PP=46;QD=12.5;SC=AATTATTCAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=44488763;WS=44488745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr21	44515685	rs2839634	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=360;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TCGTTATACATTACAAAGTGT;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=24;WE=44515693;WS=44515675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr21	44527669	rs17115876	T	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.950;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=478;ReadPosRankSum=0.199;SC=GCCGACGCCCTCGGGAGACGT;SOR=0.297;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=34;WE=44527677;WS=44527659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr21	44579990	rs68189421	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-0.112;SC=CACTATAGATGTACCACACAC;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=44579998;WS=44579980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr21	44580019	rs143864709	AACACACACC	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=1023;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CCACCTATACAACACACACCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=44580035;WS=44580009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr21	44589215	rs872331	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=785;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TGAACATGGACGTGACCATCC;SOR=0.734;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=179;TCF=97;TCR=82;TR=66;WE=44589223;WS=44589205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,76:0.38:202
chr21	44590059	rs870137	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TAGGCATCAACGCCAGGGTGC;SOR=1.229;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=6;WE=44590067;WS=44590049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr21	44837551	rs430552	G	A	3916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.20;ReadPosRankSum=2.010;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,102:0.50:204
chr21	44837555	rs430554	G	A	3989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.719;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,105:0.50:210
chr21	44838908	rs28510483	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.929;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=-1.567;SC=TACATGGCGCGGTGAGTGGGG;SOR=2.387;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=11;WE=44838916;WS=44838898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr21	44839654	rs229346	A	G	80.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr21	44985272	rs9637218	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.566;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.005;NF=35;NR=20;PP=759;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGGTCCACCCCGACACCGGCA;SOR=1.102;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=151;TCF=87;TCR=64;TR=55;WE=44985280;WS=44985262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,41:0.31:131
chr21	45053011	rs7277539	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.764;SC=ATATACGATAAGTATTCAATA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=45053019;WS=45053001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr21	45064296	rs2246602	C	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=683;ReadPosRankSum=0.585;SC=CATAAAATTACTCAAGATATT;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=43;WE=45064304;WS=45064286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr21	45076373	rs2838340	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=311;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GGACTGTAAGAGTACCTTAAA;SOR=0.588;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=17;WE=45076381;WS=45076363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr21	45076443	rs2838341	A	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=17;PP=1029;ReadPosRankSum=0.339;SC=GTTACCACCAATGACTGCTGA;SOR=0.940;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=90;TCR=37;TR=62;WE=45076451;WS=45076433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,67:0.47:142
chr21	45077865	rs2838342	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=1.242;SC=GTCTCCGAGCGCACGGGGCGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=45077873;WS=45077855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr21	45078035	rs2838343	C	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=714;ReadPosRankSum=1.844;SC=TGACCCCTCACGCCAGAAAGC;SOR=0.930;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=52;WE=45078043;WS=45078025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,69:0.54:128
chr21	45089877	rs2838344	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=368;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TCATGCTCCCGGGTTCTTGCT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=26;WE=45089885;WS=45089867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr21	45092095	rs11909064	G	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=1.147;SC=ACCTTCCCACGAGCGGAAGTG;SOR=1.230;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=7;WE=45092103;WS=45092085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr21	45092257	rs2251253	T	A	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=36;PP=1426;ReadPosRankSum=-2.082;SC=GTAAGTCCTGTTGTTTCTTCT;SOR=0.905;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=91;WE=45092265;WS=45092247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,103:0.54:191
chr21	45096206	rs2155722	G	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1191;ReadPosRankSum=0.326;SC=AAATTGCTGCGAAGACGAAGG;SOR=0.815;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=75;WE=45096214;WS=45096196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,99:0.54:182
chr21	45107285	rs2838348	C	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=1.197;SC=GAACTTTCCTCGTGGTAGAAT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=45107293;WS=45107275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr21	45107518	rs7279959	A	G	6199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=118;PP=2965;SC=GTGCAGCCCCATCCCTGGAAC;SOR=1.144;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=78;TCR=118;TR=196;WE=45107526;WS=45107508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr21	45107562	rs9306160	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=55;PP=1303;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCCTCTGGGCTGAAAGCCCTG;SOR=1.370;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=146;TCF=55;TCR=91;TR=80;WE=45107570;WS=45107552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,86:0.56:154
chr21	45111512	.	A	AT	113	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=57.81;NF=1;NR=4;PP=113;QD=27.0;SC=CCATTTCTTTATTTTTATTTT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=45111520;WS=45111502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr21	45169005	rs9974827	A	G	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=546;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TTATTTTTCAAGATGGGTCTC;SOR=1.199;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=34;WE=45169013;WS=45168995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr21	45170285	rs1106797	A	G	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=704;ReadPosRankSum=0.074;SC=GGGGATGGGGATTTCCAGAGC;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=53;WE=45170293;WS=45170275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr21	45170614	rs3042235	A	ATG	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=356;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ATGTTTGTGCATGTGTGTGTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=45170622;WS=45170604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr21	45172628	rs2010795	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=0.665;SC=ATCCAGCACCGGGATGACACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=45172636;WS=45172618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr21	45175958	rs7527	T	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=581;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCCCGCCGCTTGCCCGTGACA;SOR=1.026;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=43;WE=45175966;WS=45175948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr21	45220787	rs2329576	A	G	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=44;PP=2420;SC=GGCACTGACAATGGCACCACC;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=117;WE=45220795;WS=45220777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr21	45388079	rs11324107	CG	C	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr21	45389261	rs73906692	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-0.808;SC=ACCCCATGAGAGCCTCTGCAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=45389269;WS=45389251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr21	45390737	rs78512431	T	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr21	45391139	rs3737358	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TTCTCCCCAGGACGGGGCCAG;SOR=0.558;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=15;WE=45391147;WS=45391129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr21	45400781	rs17004619	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=446;ReadPosRankSum=-0.980;SC=AGGTTGAGTCGTTTTTCATTG;SOR=0.441;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=27;WE=45400789;WS=45400771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr21	45404562	.	AT	A	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=28;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=41;QD=11.75;SC=GAATGTTTGAATTTTTTTTTT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=45404582;WS=45404552;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr21	45404574	rs200193131	T	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr21	45404846	rs73373146	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=253;ReadPosRankSum=0.028;SC=CTCTGCACCCAGTCCTTGAGC;SOR=0.813;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=15;WE=45404854;WS=45404836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr21	45404974	rs11911398	C	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=868;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GGCGTCTGGCCGGTCAAGCTC;SOR=0.796;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=78;TCR=13;TR=47;WE=45404982;WS=45404964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr21	45478904	rs71326023	C	CGTAAT	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=525;ReadPosRankSum=1.808;SC=CTTTCTCTGTCGTTTAATGGC;SOR=1.675;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=8;WE=45478912;WS=45478894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr21	45494183	rs2277805	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=0.984;SC=CCCCTCACACGTTCGCATTTG;SOR=1.034;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=13;WE=45494191;WS=45494173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr21	45500059	rs182329148	A	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=323;ReadPosRankSum=-0.692;SC=ATATTACAGAAGTAAAAAAGA;SOR=0.950;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=29;WE=45500067;WS=45500049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr21	45509650	rs2277806	A	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=737;ReadPosRankSum=1.370;SC=TCTGGGCAGCAGTGGTGGTGG;SOR=1.206;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=49;WE=45509658;WS=45509640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr21	45512094	rs3788104	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=278;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTGGATCGAGGCTTGCTCCTG;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=45512102;WS=45512084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr21	45514141	rs11287102	TG	T	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=823;SC=TTTGGGAGGGTGGGGGTGAAA;SOR=2.019;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=45514157;WS=45514131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	45514149	rs9941801	A	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=619;SC=GGTGGGGGTGAAAAAATGAAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=45514157;WS=45514131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	45514168	rs4819371	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=408;SC=AAGATGGCATCATGTTCTTTA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=45514176;WS=45514158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr21	45528919	rs2020945	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=881;ReadPosRankSum=-1.487;SC=TTTTACCTGCGATGGAAATTC;SOR=0.753;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=61;WE=45528927;WS=45528909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
chr21	45534032	rs2243999	C	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1204;ReadPosRankSum=0.718;SC=GGGGTAGCTGCGCGGTGGTGA;SOR=0.808;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=77;WE=45534040;WS=45534022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,90:0.57:159
chr21	45538512	rs5844173	TG	T	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=569;ReadPosRankSum=1.053;SC=AGTGAATTGTTGGAGTCTGGT;SOR=1.552;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=17;WE=45538520;WS=45538502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr21	45538647	rs756553	T	C	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1709;ReadPosRankSum=0.141;SC=TCTGCAGCATTTCAGATCAGA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=105;TCR=83;TR=109;WE=45538655;WS=45538637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,133:0.56:236
chr21	45538725	rs756554	C	A	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GTTTGTCCCCCGCCTGGGTGG;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=56;TCR=81;TR=79;WE=45538733;WS=45538715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,92:0.56:164
chr21	45538782	rs756555	A	T	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=683;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GGCTACAGGCATACTTGACAG;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=40;WE=45538790;WS=45538772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr21	45539240	rs2855652	G	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GCCTGAGCCGGGTACCCCAGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=20;WE=45539248;WS=45539230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr21	45539426	rs2071142	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=678;ReadPosRankSum=1.176;SC=TCCCCGTCCCGTTGGCCTCTG;SOR=0.888;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=44;WE=45539434;WS=45539416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr21	45540143	rs2855653	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=252;ReadPosRankSum=0.137;SC=AGCATCTTAGGTGGGGCGGCA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=16;WE=45540151;WS=45540133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr21	45540207	rs2850157	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=803;ReadPosRankSum=0.388;SC=GGTCTGCCCCCGCCCCTCCTG;SOR=0.229;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=50;WE=45540215;WS=45540197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr21	45540919	rs2071143	A	G	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=66;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GGGACAAGACAGTGCGCCTAT;SOR=1.027;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=246;TCF=103;TCR=143;TR=102;WE=45540927;WS=45540909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,125:0.42:295
chr21	45544594	rs2187313	T	C	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1143;ReadPosRankSum=0.595;SC=CAACCTGTCTTTGGACGCCAT;SOR=0.571;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=158;TCF=63;TCR=95;TR=76;WE=45544602;WS=45544584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,92:0.49:189
chr21	45550460	rs11311220	TC	T	720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=629;SC=GCATTGACCATCCCCTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=17;WE=45550468;WS=45550450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	45553430	rs2187314	A	C	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=13;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CCCACCGGCGAACTCACTGGA;SOR=0.870;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=97;TCR=32;TR=59;WE=45553438;WS=45553420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr21	45553476	rs968713	A	C	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=1464;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GGCTCCGCCCAGAAGGCTGCG;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=209;TCF=127;TCR=82;TR=101;WE=45553484;WS=45553466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,119:0.49:241
chr21	45553596	rs968714	T	C	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=65;PP=1859;ReadPosRankSum=0.438;SC=GCTGTGAGGGTCCTGGTGGCC;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=230;TCF=95;TCR=135;TR=108;WE=45553604;WS=45553586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,126:0.47:267
chr21	45560331	rs2838492	C	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=285;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CTCACAGCTGCTTTTCTTGTT;SOR=0.631;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=15;WE=45560339;WS=45560321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr21	45561039	rs1059813	T	C	3947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.940;NF=77;NR=81;PP=2383;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGTCTCCCCATCCACAGTCAC;SOR=0.548;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=329;TCF=175;TCR=154;TR=158;WE=45561047;WS=45561029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,193:0.47:409
chr21	45564575	rs2838496	G	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=166;ReadPosRankSum=-0.279;SC=CCAGGAGCGAGTTCTCCTCTT;SOR=0.144;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=13;WE=45564583;WS=45564565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
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chr21	45642817	rs35694117	TA	T	954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.820;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
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chr21	45649778	rs4568033	A	G	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1352;ReadPosRankSum=0.289;SC=AGGAAATGCCATGCGCACCAT;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=210;TCF=106;TCR=104;TR=99;WE=45649786;WS=45649768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,124:0.51:244
chr21	45649848	rs13052840	T	C	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CTTTTGCCTTTTGAAAGTTTT;SOR=0.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=86;WE=45649856;WS=45649838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,103:0.47:217
chr21	45650009	rs2236668	T	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.909;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=293;ReadPosRankSum=-1.444;SC=GCAGCAGCGATGGGGGGTGTC;SOR=0.237;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=24;WE=45650017;WS=45649999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr21	45651413	rs3746962	A	G	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=41;PP=1164;SC=AAGTGTTGCAAGGAAGTATTT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=45651421;WS=45651403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr21	45679527	rs138041176	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=855;ReadPosRankSum=1.279;SC=TACATGGGGCGCAGATCCCTC;SOR=0.893;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=46;WE=45679535;WS=45679517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr21	45681153	rs2070565	T	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=467;SC=GGGGATGCTGTGTCAGGACAC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=45681161;WS=45681143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	45709651	.	T	C	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=770;ReadPosRankSum=0.502;SC=CCGAAGCCTCTGGTTCGAGCC;SOR=0.996;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=57;WE=45709659;WS=45709641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr21	45716404	.	C	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=-0.241;SC=GCTCCCCACTCTGGGGGAGGA;SOR=0.610;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=45716412;WS=45716394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr21	45717550	rs1133779	T	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=500;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ACACCTTCGATGGCATCCTGC;SOR=0.554;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=41;WE=45717558;WS=45717540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr21	45724055	rs8134520	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=0.928;SC=CATTGTCTCCGGGCGTCAAAG;SOR=0.913;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=16;WE=45724063;WS=45724045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr21	45725055	rs55730776	CA	TG	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.282;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr21	45725200	rs117846062	G	A	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=560;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GCTGGAGAGCGGATGAGAAGC;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=43;WE=45725208;WS=45725190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,64:0.41:155
chr21	45725715	rs9975113	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=608;ReadPosRankSum=1.336;SC=CCGCTGGGACAGACTGTTTCT;SOR=0.542;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=46;WE=45725723;WS=45725705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr21	45725857	rs9977591	TC	CT	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.664;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=771;ReadPosRankSum=0.417;SC=GCAGTGCTGTTCCCTGGGTGG;SOR=0.071;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=22;WE=45725866;WS=45725847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr21	45725910	rs67861360	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-1.065;SC=CATCTCATTGCGGAGGAAGGA;SOR=0.394;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=20;WE=45725918;WS=45725900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr21	45726480	.	T	G	120	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=120;QD=14.0701102316;SC=AGGCCTCCCCTACCCCCTGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=11;WE=45726488;WS=45726470;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,11:0.34:32
chr21	45726499	.	T	TGGG	566	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=59.75;NF=8;NR=1;PP=566;QD=66.6666666667;SC=TCCTCTGAGATGGGGAGGGTG;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=9;WE=45726512;WS=45726489;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr21	45726504	.	A	G	565	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=7;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10;NR=1;PP=565;QD=54.5246556861;SC=TGAGATGGGGAGGGTGTCCAG;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=11;WE=45726512;WS=45726489;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
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chr21	45742115	rs2277808	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=440;ReadPosRankSum=-0.893;SC=GTACCTGGGGGCAGGAGGGCC;SOR=0.438;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=26;WE=45742123;WS=45742105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr21	45743594	rs12482028	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=250;ReadPosRankSum=-1.485;SC=AGCCTGTCCCCGGCCCACCCT;SOR=0.471;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=15;WE=45743602;WS=45743584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr21	45744982	rs928303	C	G	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=900;ReadPosRankSum=-2.323;SC=GACTCAGGATCGGGGGGAGAC;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=56;WE=45744990;WS=45744972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,63:0.53:118
chr21	45746225	rs4818906	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=0.655;SC=GGTGTGCCAGGCCCAGCCCCA;SOR=0.288;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=16;WE=45746233;WS=45746215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr21	45750346	rs2070573	C	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1197;ReadPosRankSum=0.476;SC=AGTGACTGACCGGCACACTCG;SOR=0.725;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=65;WE=45750354;WS=45750336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,86:0.51:168
chr21	45753891	rs35498868	C	T	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=31;PP=1676;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TCCCTTCACTCGGGGTTTCCC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=116;TCR=59;TR=94;WE=45753899;WS=45753881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,107:0.52:204
chr21	45755808	rs62220411	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=1.443;SC=TGAGGGGCACGGCCTTACTCA;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=19;WE=45755816;WS=45755798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr21	45784271	rs2276252	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCTGGCAAAGCTCCAGGGTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=45784279;WS=45784261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr21	45789011	rs34543751	A	AG	1702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=1594;SC=CCTGGGTGTCAGGTGCCCCTC;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=45789019;WS=45789001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	45789352	rs45552731	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CCGGGCGCTGTGGGGAGCAGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=45789360;WS=45789342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr21	45799164	rs2838556	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=387;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CCAGGACTCATGGACCGATGC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=26;WE=45799172;WS=45799154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr21	45802738	rs372839724	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=-0.704;SC=AATGGGGTGGAGGCCAGAACG;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=17;WE=45802746;WS=45802728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr21	45811343	rs1556314	T	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=45;PP=1052;ReadPosRankSum=-1.403;SC=TGGTGGAGGATCCCGAGCGCC;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=57;TCR=97;TR=69;WE=45811351;WS=45811333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr21	45815547	.	CTGTGGAGGGG	C	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5011;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.960;NF=0;NR=14;PP=2105;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CACGTGGAGGCTGTGGAGGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=14;WE=45815564;WS=45815537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
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chr21	45815575	rs150668005	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.05;MQRankSum=-1.781;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr21	45815580	.	TG	T	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.17;MQRankSum=-1.605;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr21	45815583	.	AGGATGTGG	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.17;MQRankSum=-1.605;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr21	45817620	rs1785436	T	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=576;ReadPosRankSum=0.283;SC=GTGGCTCCTCTGGTCCCCAGA;SOR=0.708;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=44;WE=45817628;WS=45817610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr21	45821529	rs9974831	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=507;ReadPosRankSum=0.159;SC=CTGGCCCTGGTGGTCACTGTC;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=24;WE=45821537;WS=45821519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr21	45821794	rs1785437	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=446;ReadPosRankSum=0.105;SC=CAGCCCCACCCGCTTTTCCAC;SOR=0.659;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=29;WE=45821802;WS=45821784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
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chr21	45826434	rs1785454	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.885;SC=CAGTGAGCATCGGGGGCCAGG;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=25;WE=45826442;WS=45826424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
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chr21	45845807	rs762428	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=196;SC=ATCCTGGCTCCCAGCCACTGC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=45845815;WS=45845797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	45854925	rs41277556	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=254;ReadPosRankSum=-1.075;SC=GGCTCCTGACGCCCGCTGTCC;SOR=1.705;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=16;WE=45854933;WS=45854915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr21	45861790	rs1055540	T	C	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=756;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GGACTCAGGCTGTTCCTGGGC;SOR=0.299;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=95;TCF=19;TCR=76;TR=55;WE=45861798;WS=45861780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr21	45942026	rs62218855	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=983;ReadPosRankSum=0.716;SC=TGGGGGCAGGGAGGCAGATTC;SOR=1.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=66;WE=45942034;WS=45942016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,71:0.45:159
chr21	45942111	rs233230	A	G	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=764;SC=ACCCACGAGGACAAGGCCAAC;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=45942119;WS=45942101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	45951460	rs75933048	G	GGT	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=295;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACATGAATTCGGGGGGGGCAC;SOR=0.148;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=14;WE=45951468;WS=45951450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr21	45959312	rs233317	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=0.337;SC=GCAGGCGGGCCGGCATACAGG;SOR=0.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=18;WE=45959320;WS=45959302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr21	45970812	rs2329834	G	A	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=52;PP=2775;SC=CTGCTGACACGGGGAGGAGGT;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=123;WE=45970820;WS=45970802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr21	45971380	rs6147532	A	AGTGAGTGAGTGT	656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=1644;SC=GAGGTGTGTGAGTGAGTGAGT;SOR=1.473;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=10;WE=45971388;WS=45971370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	45978488	rs12483390	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.511;NF=15;NR=8;PP=350;ReadPosRankSum=1.058;SC=GGGCCGGGGCGCAGCAGCTGG;SOR=1.264;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=23;WE=45978511;WS=45978478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr21	45978499	rs377549	T	G	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;QD=45.72;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	45978503	rs435424	G	A	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=43.11;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	45978677	rs62220866	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=382;ReadPosRankSum=-0.321;SC=AGTGAGTGATCGTGCCAGGCC;SOR=0.077;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=24;WE=45978685;WS=45978667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr21	45987779	rs76207741	C	T	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.251;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=69;PP=1549;ReadPosRankSum=0.957;SC=GTGCGGGGGGCGGCTACTGAG;SOR=0.953;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=185;TCF=62;TCR=123;TR=99;WE=45987787;WS=45987769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,114:0.54:212
chr21	45999753	rs464424	C	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=526;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GAGATGGGCACGCAGCAGGCG;SOR=0.947;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=30;WE=45999761;WS=45999743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr21	46000398	rs2020221	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=346;ReadPosRankSum=-1.115;SC=GGGCAGTCGTCCACTCGCCAG;SOR=0.530;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=25;WE=46000406;WS=46000388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr21	46011170	rs233302	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.481;NF=7;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCTGCCCCATCTTCTGAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=11;WE=46011178;WS=46011160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr21	46012240	rs543542	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.447;NF=7;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=-1.620;SC=AGGGGGGCTCACAGCAGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=10;WE=46012248;WS=46012230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
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chr21	46020527	rs1211103	C	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.861;NF=25;NR=19;PP=597;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CCAGCATGGCCGCGTCCACTA;SOR=0.956;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=44;WE=46020535;WS=46020517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
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chr21	46021390	rs446817	G	C	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.577;NF=32;NR=44;PP=1231;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GGGGCTTCCAGTTCATGCTGC;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=154;TCF=61;TCR=93;TR=76;WE=46021398;WS=46021380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr21	46021481	rs437334	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.765;NF=11;NR=24;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TCTGCCGCCCTGTGTGCAGGC;SOR=0.929;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=35;WE=46021502;WS=46021471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr21	46021494	rs369720	A	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.928;NF=14;NR=19;PP=1474;ReadPosRankSum=0.459;SC=GTGCAGGCCCACCTGCTGCGT;SOR=0.714;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=33;WE=46021502;WS=46021471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr21	46021607	rs370092	A	G	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=774;ReadPosRankSum=0.167;SC=GCTCCCGCCCAGCCTGCTGTG;SOR=0.545;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=59;WE=46021615;WS=46021597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,74:0.47:159
chr21	46021722	rs12627104	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=0.836;SC=TACCCTTGACGGCTCTCCACA;SOR=0.283;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=25;WE=46021730;WS=46021712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr21	46021759	rs659638	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-2.374;SC=TGCAGTGGACATCAGTGGTCA;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=46021767;WS=46021749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr21	46032094	rs411254	A	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.07;MQRankSum=0.974;NF=36;NR=29;PP=816;ReadPosRankSum=0.518;SC=GACGTGGGCCATGTCAGCCGA;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=65;WE=46032102;WS=46032084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr21	46047418	rs8126553	C	T	6671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=97;PP=2965;SC=CTGTGTGCTGCGTGCCCGTCT;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=222;WE=46047426;WS=46047408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr21	46047633	rs8127342	A	G	10092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=0.112;NF=159;NR=159;PP=2965;ReadPosRankSum=0.806;SC=CAGCAGTCCTACTGTGTGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=320;TCF=159;TCR=161;TR=318;WE=46047641;WS=46047623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,358:0.99:360
chr21	46047710	rs8131142	T	C	7394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.91;NF=87;NR=149;PP=2965;SC=GGCTTCCTCTTTGTGCTGCCA;SOR=1.338;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=87;TCR=149;TR=236;WE=46047718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr21	46047857	rs9980129	C	T	3745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=59;PP=2394;SC=CACCTCCTCCCGCCAGCCCAG;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=116;WE=46047865;WS=46047847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	46047925	rs9979457	G	T	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=59;PP=2031;SC=GCTCCCGCCCGGCCTGCTACA;SOR=0.838;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=46047933;WS=46047915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr21	46047971	rs463217	T	C	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=58;PP=1809;SC=CTGCTGACGGTCATGTCCCCC;SOR=1.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=46047979;WS=46047961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	46048053	rs59484649	G	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-1.270;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr21	46048060	rs57944973	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=-1.596;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.795;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr21	46057391	rs9306108	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr21	46057391	.	AGT	GGA	283	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=59.89;NF=9;NR=13;PP=283;QD=15.2939943119;SC=CTTGGCGGGTAGTCGACTGCC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=22;WE=46057401;WS=46057381;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr21	46057393	rs2838602	T	A	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.89;NF=25;NR=30;PP=542;SC=TGGCGGGTAGTCGACTGCCCA;SOR=0.836;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=55;WE=46057401;WS=46057381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	46057417	rs114653592	AG	CC	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.334;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr21	46057422	rs112205018	T	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.000;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.010;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr21	46057548	rs4818947	A	C	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=36;PP=2398;SC=CTCCTGCACAACCCCATGCTA;SOR=1.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=46057556;WS=46057538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr21	46057612	rs66931310	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	6149.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.502;NF=28;NR=59;PP=2974;ReadPosRankSum=1.172;SC=TGCCAGCAGGCCTGCTGTGTG;SOR=0.307;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=87;WE=46057634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr21	46057711	rs4818948	G	C	3558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.530;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,97:0.46:209
chr21	46057720	rs4818949	A	C	3696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=0.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.499;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,102:0.47:215
chr21	46057806	rs4818950	G	A	5619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=110;PP=2965;SC=CGTCTGCTATGTGCCTGTGTG;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=79;TCR=110;TR=189;WE=46057814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
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chr21	46057958	rs4818951	C	T	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=41;PP=1599;SC=CCGTCCCCTCCTGCGGTGCCT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=71;WE=46057966;WS=46057948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	46058060	rs13051517	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.617;NF=12;NR=15;PP=287;ReadPosRankSum=-1.883;SC=CCTGCTACAGCCTCTGCTCTG;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=27;WE=46058068;WS=46058050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr21	46058229	rs1785474	A	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.67;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	46066764	rs4818952	C	T	5329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=98;PP=2965;SC=TGCCGGCAGTCTAGCTGCCAG;SOR=1.050;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=168;WE=46066772;WS=46066754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr21	46067180	rs462007	C	T	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=37;PP=2045;SC=CAGCTGCTGCCGCCCGGCCTC;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=90;WE=46067188;WS=46067170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	46074104	rs2073437	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=-1.209;SC=CAGTTTGCTGTGGGAGGATGT;SOR=0.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=46074112;WS=46074094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr21	46074202	rs9984726	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=255;ReadPosRankSum=1.505;SC=CTCAGCAGCCAGTGGGGGTGC;SOR=0.558;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=22;WE=46074210;WS=46074192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr21	46077812	rs2838617	A	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=331;ReadPosRankSum=1.429;SC=CCCAGATGACAGGACCCAGGT;SOR=0.239;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=23;WE=46077820;WS=46077802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr21	46077946	rs9306111	A	G	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.395;SC=TGCTGCATACACAGCCCCTGC;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=164;TCF=103;TCR=61;TR=74;WE=46077954;WS=46077936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr21	46078220	rs9306112	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GGTACACACCTGTATCCCTCC;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=8;WE=46078228;WS=46078210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr21	46086377	rs2838622	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.163;NF=17;NR=1;PP=338;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CAGCAGGAAGAGATACTGTAG;SOR=0.631;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=18;WE=46086385;WS=46086367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr21	46086718	rs7275281	GA	CG	6225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=91;PP=2944;ReadPosRankSum=0.442;SC=TGCCTGGCAGGAGCTGGGCAC;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=290;TCF=88;TCR=202;TR=133;WE=46086727;WS=46086708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,163:0.49:336
chr21	46086757	rs7275298	GC	AT	3599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=66;PP=2944;ReadPosRankSum=1.129;SC=GGGGCTGGGCGCGCAGCAGGC;SOR=0.663;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=29;TCR=130;TR=80;WE=46086766;WS=46086747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,93:0.52:179
chr21	46191256	rs4818975	C	A	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=12;PP=919;SC=TGCTGAGCTGCTTGGCGGTGT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=46191278;WS=46191246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	46191270	rs11569	C	T	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=1090;SC=GCGGTGTGTGCGCGCCTGTGC;SOR=1.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=46191278;WS=46191246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	46197450	rs2294157	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=522;SC=AGGCCGGGTGCGGTGGCTCAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=46197458;WS=46197440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	46198896	rs11702743	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TAAATCTTCAGTTAAAAAATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=46198904;WS=46198886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr21	46221494	rs28728356	G	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=0.557;SC=GGACCCACAGGGGGGCTCACG;SOR=1.214;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=9;WE=46221502;WS=46221484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr21	46226786	rs1051331	A	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=601;ReadPosRankSum=0.888;SC=TTCCGCAGACACCTTTGTGGT;SOR=1.148;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=44;WE=46226794;WS=46226776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr21	46233863	rs13050872	G	C	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=556;ReadPosRankSum=2.645;SC=CACACGGGGAGGCTCTGCGGG;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=49;WE=46233871;WS=46233853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,67:0.51:131
chr21	46271452	rs235314	C	T	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=51;PP=2276;SC=GGCTGCGGAGCGTGCACCTCA;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=111;WE=46271460;WS=46271442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr21	46271660	rs235315	A	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=438;SC=AACAACGGGCATTGTAAGCAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=46271668;WS=46271650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	46275047	rs235317	A	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=635;ReadPosRankSum=-0.237;SC=ATCTCAGGCCACACTGGCACT;SOR=0.412;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=36;WE=46275055;WS=46275037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr21	46281314	rs235276	T	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=1220;SC=AACCTCCCCCTCAACGCCTCA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=46281322;WS=46281304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	46293692	rs235373	T	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=876;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CCTCGCCATCTGCCCCGCCCC;SOR=1.341;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=21;WE=46293706;WS=46293682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr21	46293698	rs11388069	G	GC	794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=882;ReadPosRankSum=-1.033;SC=CATCTGCCCCGCCCCTCGCCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=15;WE=46293706;WS=46293682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
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chr21	46311813	rs235326	A	G	6575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=96;PP=2965;SC=ACTGGGGAAGAACCTGCACGG;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=203;WE=46311821;WS=46311803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr21	46313442	rs2230529	G	T	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=814;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GATCCAGGAAGACCCTGGAGG;SOR=0.765;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=55;WE=46313450;WS=46313432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr21	46314907	rs235330	T	A	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=85;PP=2965;SC=TCTTAATGAGTTGGACCACAT;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=180;WE=46314915;WS=46314897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr21	46315022	rs2838725	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=658;ReadPosRankSum=-1.545;SC=ACCTGTGCCACGGCATCTCCA;SOR=1.307;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=79;TCF=14;TCR=65;TR=37;WE=46315030;WS=46315012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr21	46315091	rs2838726	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=1.116;SC=CGGTCCTCAACGCAGTTTTGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=46315099;WS=46315081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr21	46318940	rs2838728	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1231;ReadPosRankSum=1.257;SC=TGGCTGAAACATGCCCCCACC;SOR=0.606;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=108;TCR=77;TR=94;WE=46318948;WS=46318930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,101:0.45:222
chr21	46320403	rs5030670	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=1.848;SC=GAGAAGAAGGCGTGGGGGGCA;SOR=0.770;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=22;WE=46320411;WS=46320393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr21	46328099	rs760462	T	C	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=46;PP=1077;SC=AGCCGCTCCCTGTGGGACGCA;SOR=3.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=52;WE=46328107;WS=46328089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	46330674	rs11088969	C	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=845;ReadPosRankSum=0.093;SC=CCAGGGCGAGCAGTGGGGGGC;SOR=0.784;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=52;WE=46330682;WS=46330664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr21	46354055	rs9974172	A	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=639;SC=TTGGGCTGGCACCCAGGGCCT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=46354063;WS=46354045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	46389017	rs12106383	C	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=23;PP=950;SC=AACTTTCCATCTGGGCAGAAA;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=46389025;WS=46389007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr21	46389189	rs12106389	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=330;SC=AGCGGCCGCCCGGAGTGGCGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=46389197;WS=46389179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	46393090	rs3827260	C	T	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=54;PP=1626;SC=TGCTGACTCACGTGGCTTCTC;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=46393098;WS=46393080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr21	46554658	rs144000111	C	G	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.971;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,64:0.56:115
chr21	46554804	rs139882953	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=288;ReadPosRankSum=1.489;SC=CCCTGGCTGCCGTTGACAGCT;SOR=0.174;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=19;WE=46554812;WS=46554794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr21	46572572	rs420085	A	G	4377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=56;PP=2560;SC=CTTTTTCAGCATCATGGGGCG;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=46572580;WS=46572562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr21	46641968	rs1051367	G	A	3609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.362;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=73;PP=2179;ReadPosRankSum=2.061;SC=AGATTACCAAGCCCAACGTGT;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=308;TCF=146;TCR=162;TR=140;WE=46641976;WS=46641958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,179:0.45:398
chr21	46685560	rs72316840	ATCACAGAGGTTCCAGAGTCAGGGAGAACTGGCG	A	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.061;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.771;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr21	46698256	rs914215	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GGCAGGCTGCTGTCTGGCCTC;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=5;WE=46698264;WS=46698246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr21	46702506	rs2236449	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=412;ReadPosRankSum=0.632;SC=ACTTACTGATCGTGACTGCAG;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=21;WE=46702514;WS=46702496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr21	46705345	rs2297284	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=621;ReadPosRankSum=0.698;SC=TAACTGAGGGGGCACAAAGCT;SOR=0.442;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=39;WE=46705353;WS=46705335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr21	46705621	rs2297285	G	A	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.413;SC=ACTCGATGACGGGGATGTTTT;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=245;TCF=118;TCR=127;TR=113;WE=46705629;WS=46705611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,128:0.44:293
chr21	46825200	.	C	CGGCTGCGG	830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.22;QD=41.54;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	46825214	rs113272297	G	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.961;QD=28.44;ReadPosRankSum=2.885;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr21	46825223	rs60499034	G	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.935;SOR=1.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr21	46825229	.	C	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.223;SOR=2.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr21	46825234	.	C	CTGGGT	346.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=2.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr21	46825235	.	C	CCTGCGG	346.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=16.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=3.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr21	46825251	.	C	CCT	252	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=252;QD=54.6;SC=CTGCGGGGGTCGCGGGGGTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=5;WE=46825259;WS=46825241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,5:0.42:12
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chr21	46876173	rs2236452	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=656;ReadPosRankSum=0.238;SC=GACTCTCGCCCGCCGCAGCCG;SOR=0.831;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=41;WE=46876181;WS=46876163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,52:0.41:127
chr21	46876306	rs11702494	G	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=1063;ReadPosRankSum=0.237;SC=GCTCCCGGGCGCACTGTCTCA;SOR=0.603;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=69;WE=46876314;WS=46876296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr21	46876580	rs8133886	C	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=1.687;SC=CTGCTGCAGACGCACTGCCAC;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=44;WE=46876588;WS=46876570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr21	46895521	rs35616809	CAT	C	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TGGGGTGACACATGTGCACAC;SOR=0.703;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=12;WE=46895530;WS=46895511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr21	46896458	rs80289899	T	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=548;ReadPosRankSum=0.412;SC=TAACGTGTGTTTGTGTGATGG;SOR=0.381;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=38;WE=46896466;WS=46896448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr21	46896489	rs79633299	T	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.534;NF=5;NR=21;PP=417;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GTGTGATGTATGGTGTGTGTA;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=26;WE=46896497;WS=46896479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr21	46898174	rs2236464	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=337;ReadPosRankSum=-1.397;SC=TGCATTTCCATGTAGACACTG;SOR=1.162;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=22;WE=46898182;WS=46898164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr21	46899947	rs9979845	G	A	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=869;ReadPosRankSum=0.298;SC=GGCTGTGTGCGTGCCCAGGGT;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=61;WE=46899955;WS=46899937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,71:0.44:160
chr21	46900214	rs9980181	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.940;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=243;ReadPosRankSum=0.376;SC=TGTGGTGGGAGCCCCCATCCA;SOR=0.203;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=17;WE=46900222;WS=46900204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr21	46900546	rs28608951	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=638;ReadPosRankSum=1.379;SC=GAGGCCCGTTCTGGGGGTGGT;SOR=0.381;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=40;WE=46900554;WS=46900536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr21	46900856	rs9983599	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=-0.160;SC=GCCCCTGCCCCGCCTCAGGCC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=20;WE=46900864;WS=46900846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr21	46901973	rs12482088	A	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=0.350;SC=GTGAGTGGGAACCAGCACCAC;SOR=1.107;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=30;WE=46901981;WS=46901963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr21	46902180	rs12482563	T	C	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=866;ReadPosRankSum=-0.153;SC=ATGGGCACCCTGCGAGATCTG;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=75;WE=46902188;WS=46902170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,98:0.45:216
chr21	46902273	rs2236468	A	G	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CCGGGGCCCCAGGCGTTTGTG;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=71;WE=46902281;WS=46902263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr21	46902380	rs12482373	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.500;SOR=1.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr21	46902390	rs2236469	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.496;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr21	46906627	rs2274808	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=0.135;SC=AGAAAGGCTGCTGTGGGGCCT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=46906635;WS=46906617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr21	46906711	rs2274809	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=177;ReadPosRankSum=-0.754;SC=ACGTGTCTACGCTGGGGTTGC;SOR=0.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=15;WE=46906719;WS=46906701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr21	46907287	rs9977268	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr21	46907479	rs9976784	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=462;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TGTTGCCTGGGGCAGGAGAGT;SOR=1.100;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=26;WE=46907487;WS=46907469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr21	46908355	rs11702425	T	C	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1625;ReadPosRankSum=0.736;SC=TGCCGGGACTTAAGGTCAGTG;SOR=0.519;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=182;TCF=81;TCR=101;TR=105;WE=46908363;WS=46908345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,110:0.53:209
chr21	46909516	rs8131819	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=1.190;SC=AGATCAGCTCGGGGCGGCCTT;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=29;WE=46909524;WS=46909506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr21	46910321	rs2838947	T	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=484;ReadPosRankSum=0.340;SC=GGGACTATGCTAAGATGAAAG;SOR=1.388;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=30;WE=46910329;WS=46910311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr21	46910352	rs116274237	CC	GT	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=802;ReadPosRankSum=0.425;SC=ATGTGCCCTCCCGGGTCCCTG;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=17;WE=46910373;WS=46910342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr21	46910365	rs73228766	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=3;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=821;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGTCCCTGGGTCTCCATGTGC;SOR=1.360;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=17;WE=46910373;WS=46910342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
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chr21	46910426	rs151172738	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr21	46910432	rs71851609	CCA	C	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr21	46910445	.	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.90;ReadPosRankSum=-2.278;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr21	46910574	rs71240730	G	GGGTCTCT	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=428;ReadPosRankSum=-0.362;SC=GCCCACTCCCGGAGCGCCAGG;SOR=0.387;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=9;WE=46910582;WS=46910564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr21	46911276	rs62216329	G	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=0.354;SC=GACCCCCCACGGGGTGCAGAG;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=46911284;WS=46911266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr21	46912658	rs11270246	G	GCCCGCCACTGCCCT	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.925;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=2050;ReadPosRankSum=1.194;SC=GCTGCATGCTGCCCGGCTGGG;SOR=3.601;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=4;WE=46912666;WS=46912648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr21	46912970	rs2297289	T	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.153;SC=GGTCGGGCTGTCGAGGCAGGC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=3;WE=46912978;WS=46912964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr21	46913300	rs749625	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=436;ReadPosRankSum=-0.940;SC=GTCACCTCCCGTGAAAGGACC;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=30;WE=46913308;WS=46913290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr21	46913517	rs749627	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=263;ReadPosRankSum=-1.118;SC=TCCTTCCGGCAGGCGTGGGGG;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=17;WE=46913525;WS=46913507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr21	46914242	rs192701728	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-3.009;SC=CCCCAAACCCGACCCTCCCCT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=46914250;WS=46914232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr21	46914261	rs60331963	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=0.712;SC=CTCACCAGTGGCTCCTGTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=46914269;WS=46914251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr21	46914642	rs9977637	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=273;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GTGAGGCTGCAGTGGGCTCCT;SOR=0.379;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=16;WE=46914650;WS=46914632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr21	46916516	rs5844240	AC	A	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=239;ReadPosRankSum=1.700;SC=TCCTACAGCCACCCTTGGCTG;SOR=0.675;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=9;WE=46916524;WS=46916506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr21	46918574	rs2282120	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=277;ReadPosRankSum=-1.629;SC=ATGGAAGATGTGCCCATGCCA;SOR=0.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=29;WE=46918582;WS=46918564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr21	46924425	rs149296338	CGGCCCCCCA	C	1650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	46926002	rs10483080	C	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=685;SC=GCCAGCGCTTCTTAAACTTTC;SOR=3.477;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=46926010;WS=46925992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	46927489	rs12483761	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=41;PP=1878;SC=AGGCCCGGACACCACTCCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=96;WE=46927505;WS=46927479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr21	46927604	rs148777640	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=590;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GTCCTTTGGAGTCCTGGAGCT;SOR=0.644;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=35;WE=46927612;WS=46927594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr21	46929553	rs78487064	C	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=16;NR=13;PP=470;SC=CTCCATCTAGCCCCTCGGCTC;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=46929561;WS=46929543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	46929618	rs138768565	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=163;ReadPosRankSum=1.492;SC=CCCAGGCTTCGGCCATGGGTG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=9;WE=46929626;WS=46929608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr21	46931004	rs148407279	T	TAC	2849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=2211;SC=CACACACACATACACACGGTT;SOR=0.880;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=44;WE=46931012;WS=46930994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	46931109	rs12483377	G	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.499;NF=27;NR=32;PP=751;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CTTCTCCTTTGACGGCAAGGA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=59;WE=46931117;WS=46931099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,75:0.60:125
chr21	46951556	rs12659	A	G	6056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=102;PP=2965;SC=CGCCTGGGCCAGGATTCATGC;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=81;TCR=102;TR=183;WE=46951564;WS=46951546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr21	46952094	rs914231	T	C	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=103;PP=2498;SC=CCCCACCAGGTGTTAGCAATG;SOR=1.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=42;TCR=103;TR=145;WE=46952102;WS=46952084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr21	46954343	rs2330184	T	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=28;PP=1990;SC=GGGCACAGGTTCTGCCCACAG;SOR=1.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=92;WE=46954351;WS=46954333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr21	46957794	rs1051266	T	C	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=56;PP=1919;SC=GCACACGAGGTGCCGCCAGGA;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=112;WE=46957802;WS=46957784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	46957916	rs1131596	G	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.39;NF=4;NR=23;PP=641;SC=CGAAGGTGACGCTGTGCCTGG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=46957924;WS=46957906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	46957982	rs13052294	G	A	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=61.19;NF=1;NR=8;PP=188;SC=TCCCTACCCCGCAAAACGAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=46957990;WS=46957972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	47320377	rs2075891	C	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=580;SC=CTGGTTTGCTCCTCCAGCACA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=47320385;WS=47320367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	47320425	rs7281638	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=15;PP=589;SC=TGGGCCAGGCTGCTCCCCACC;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=47320433;WS=47320415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47320605	rs2075890	G	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=215;SC=CCCAGGCTCTGCCCCTGCCGA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=47320613;WS=47320595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	47320633	rs2075889	T	C	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=155;SC=CCTGTGCTCTTGGCCAGCCGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=47320641;WS=47320623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	47329352	rs2277812	T	C	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=734;ReadPosRankSum=0.830;SC=CCAGCCAGTGTGGGTCCCTGA;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=56;TCR=96;TR=62;WE=47329360;WS=47329342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,71:0.42:169
chr21	47330800	rs200486523	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=510;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TCCCTTCCAATGTCCCCTCTC;SOR=0.949;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=30;WE=47330808;WS=47330790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr21	47401760	rs7671	C	G	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=9;PP=872;SC=CCGCAGGCCCCAGACATGAGG;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=47401768;WS=47401750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	47404302	rs11553519	G	A	4693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.02;MQRankSum=-0.949;NF=109;NR=71;PP=2683;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CTCAAAAGCAGCGTGGACGCG;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=380;TCF=226;TCR=154;TR=180;WE=47404310;WS=47404292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,228:0.48:479
chr21	47404397	rs3746993	A	G	9327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=191;PP=2965;SC=AGTGGCCCCCAGCCTCCTGCC;SOR=1.229;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=307;TCF=116;TCR=191;TR=307;WE=47404408;WS=47404387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr21	47406612	rs754507	C	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=28;PP=780;SC=AGGCACCGGCCCCCCCCGGCA;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=47406620;WS=47406602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47407362	rs62215498	C	T	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1506;ReadPosRankSum=1.455;SC=GTGTCCCAGCCGTATGTCCGT;SOR=0.539;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=181;TCF=102;TCR=79;TR=95;WE=47407370;WS=47407352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,115:0.53:218
chr21	47409113	rs8129814	C	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=671;SC=GACTAGGCCTCGGAAACTTCC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=47409121;WS=47409103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	47409503	rs2277814	A	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=682;SC=GTGTCTCACCATCTCCTCCTG;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=47409511;WS=47409493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	47410378	.	GAATGGGGC	G	1689.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=12.153;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.30;ReadPosRankSum=2.400;SOR=2.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr21	47410388	.	AGATGGGGAGGGACGGAGTGGACGGCGTGAAGGTGACC	A	1653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=17.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.289;SOR=2.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,41:0.85:48
chr21	47410481	rs78836670	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.951;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=0.529;SC=CGGGGAGGGACGGGGAGGGAT;SOR=1.879;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=5;WE=47410489;WS=47410471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr21	47410626	rs1980981	T	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=17;PP=748;SC=AGTCTGACAGTTGATTGGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=47410634;WS=47410616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	47410931	rs1980982	T	C	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=1625;ReadPosRankSum=0.300;SC=GAGACCCCGGTGCCTTTGGAC;SOR=0.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=122;TCR=96;TR=112;WE=47410939;WS=47410921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,132:0.51:261
chr21	47412751	rs2850173	A	C	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1172;SC=GGAGCTGGGAACCACCCCAGG;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=47412759;WS=47412741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	47412840	rs2075893	C	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=270;SC=GGCCCCTCAACGTGGCCAGCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=47412848;WS=47412830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	47417147	rs148786363	CCAGGCCCTTCGTG	C	987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=2936;SC=ACACTTGTGCCCAGGCCCTTC;SOR=4.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=19;WE=47417167;WS=47417143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	47417206	rs11701583	A	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=7;PP=784;SC=CTCCCCCTGCACTGATGGGAC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=47417214;WS=47417196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47417303	rs2839077	T	C	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=62;PP=2023;SC=GTGAGGCCTGTGGTCCAACGT;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=116;WE=47417311;WS=47417293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr21	47417415	rs2276254	C	A	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=39;PP=1423;SC=CCACTCCCCACCCACACCCGC;SOR=0.948;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=47417423;WS=47417405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	47417432	rs3216137	A	AG	1978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=29;PP=1380;SC=CCGCCCACCCAGGGGGGCCTG;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=41;WE=47417440;WS=47417422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr21	47417975	rs3737437	A	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=23;PP=1167;SC=GGCCTGTGCCAGCCAGTGGGT;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=47417983;WS=47417965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr21	47418728	rs141212516	C	CT	2921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=2074;SC=CCTCTCTTATCTTTATTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=52;WE=47418736;WS=47418718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	47419697	rs8131101	C	T	5410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.08;NF=49;NR=77;PP=2371;SC=CTCCTGTAGACGCTGCTCACG;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=126;WE=47419714;WS=47419687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	47419706	rs11464071	C	CG	5080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=62;PP=2108;SC=ACGCTGCTCACGGGGGGGTGG;SOR=1.198;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=8;TCR=69;TR=70;WE=47419714;WS=47419687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	47419747	rs8131632	A	G	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=80;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=52;PP=1490;SC=GCCAGGCCCTAGGGACCCGTG;SOR=2.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=65;WE=47419755;WS=47419737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr21	47419770	rs73908116	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=45.14;SOR=3.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr21	47419794	rs8126900	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.11;QD=43.77;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	47419804	rs8131227	C	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.80;QD=51.28;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	47419817	rs79767796	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.13;QD=38.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	47419829	.	T	TA	143	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.44;QD=35.75;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	47419830	.	G	GA	143	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.44;QD=35.75;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	47420565	rs142824931	AGGAGGGCGGCCGGGGAG	A	3838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=25;PP=2967;SC=AGGCCGGGGAAGGAGGGCGGC;SOR=1.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=68;WE=47420589;WS=47420555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	47420726	rs7276098	C	G	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=103;PP=2965;SC=TCCCGGGGGTCGGGGAGCGAG;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=68;TCR=103;TR=171;WE=47420734;WS=47420716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr21	47420761	rs7283989	G	A	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=2.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr21	47420769	rs7276782	A	G	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.66;SOR=2.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	47421315	rs11701124	C	T	6069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=137;PP=2965;SC=GGCCTCGCCCCGCCCGGCTTT;SOR=1.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=58;TCR=137;TR=195;WE=47421323;WS=47421305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr21	47421793	rs8132377	C	T	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.21;SOR=1.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	47421797	rs8131313	G	A	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.31;SOR=1.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	47421864	rs8132521	C	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=56;PP=1950;SC=ACCCCGGTGCCGGTCCCACAG;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=47421872;WS=47421854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr21	47422412	rs35796750	C	T	8983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=109;PP=2965;SC=GAGCAGGCTGCGCCACACCGA;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=156;TCR=109;TR=265;WE=47422420;WS=47422402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr21	47422639	rs2236485	A	G	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=44.35;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	47422644	rs2236486	G	A	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=45.74;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr21	47422679	rs2236487	G	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=-0.112;NF=7;NR=27;PP=639;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GCGCGGGGCCGCCCGGGCAGT;SOR=0.527;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=34;WE=47422687;WS=47422669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr21	47423133	rs2236489	C	G	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=70;PP=2110;SC=TCTGAGAGGACGGGGCTCTGG;SOR=1.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=47423141;WS=47423123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	47423233	rs59769541	C	T	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;PP=982;SC=GGAGCTTAGACGCTCTCTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=47423241;WS=47423223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	47532544	rs1010688	C	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CACGGTGGGCCGTCCACCCAC;SOR=1.198;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=50;WE=47532552;WS=47532534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr21	47536546	rs762438	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=1.316;SC=CTCACTGCGCCGGCTTTCCTC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=32;WE=47536554;WS=47536536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr21	47536840	.	T	TAC	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.180;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr21	47537666	rs5844252	T	TG	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.244;SC=TCACTGAGCCTGGGCCTCACA;SOR=0.465;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=4;WE=47537674;WS=47537656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr21	47537882	rs7279347	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=625;ReadPosRankSum=0.054;SC=CGGGGCAGGCGGGGTCACCAG;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=45;WE=47537890;WS=47537872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr21	47538050	rs7279535	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=0.622;SC=GGGCGGCCCCGCCGCTGCTCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=47538058;WS=47538040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr21	47539790	rs3737362	A	G	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=898;ReadPosRankSum=0.190;SC=GAGGCAGCCCAGGGTCTCACT;SOR=0.769;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=72;WE=47539798;WS=47539780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,90:0.57:157
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chr21	47545155	rs2839113	A	G	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1513;ReadPosRankSum=0.163;SC=CGGGGGGACTACCCTGCCTGC;SOR=0.909;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=169;TCF=100;TCR=69;TR=90;WE=47545163;WS=47545145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr21	47545768	rs1042917	G	A	4376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=70;PP=2442;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GACGACGAACGTATCGACTCC;SOR=0.865;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=309;TCF=167;TCR=142;TR=160;WE=47545776;WS=47545758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,206:0.53:391
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chr21	47556793	rs12774	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=458;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TGCCCACCTACCCTCCGGGCC;SOR=0.868;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=30;WE=47556801;WS=47556783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
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chr21	47558473	rs1047179	G	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=207;ReadPosRankSum=2.270;SC=GTTCCTGCAGGGCCGGCCACA;SOR=0.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=19;WE=47558481;WS=47558463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr21	47558586	rs60525628	A	G	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.90;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr21	47558591	rs62214031	A	G	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr21	47558994	rs1980983	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=244;ReadPosRankSum=1.393;SC=TATAGCCCTTAGCATCAGGCT;SOR=0.299;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=47559002;WS=47558984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr21	47566090	rs80225292	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=2.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=364;ReadPosRankSum=-1.345;SC=GGACTCAGCCGGGTCTCCACG;SOR=1.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=17;WE=47566098;WS=47566080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr21	47566345	rs3746999	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CCCCTGCCCCGAGCACACAGG;SOR=0.324;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=21;WE=47566353;WS=47566335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr21	47570266	rs55761347	G	A	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=940;ReadPosRankSum=0.948;SC=AGATCGGCTCGCCCCTCACAG;SOR=0.543;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=86;TCR=36;TR=58;WE=47570274;WS=47570256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
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chr21	47571845	rs61729391	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CCCGGATGGCCGGCAGGGTCC;SOR=1.160;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=32;WE=47571853;WS=47571835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
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chr21	47609510	rs9717	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=402;SC=AGCCCTGGACTGCACACCAAG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=47609518;WS=47609500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	47609677	rs914247	A	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=51;PP=2115;SC=AAGAGCAGATAAGGAGGTATA;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=47609685;WS=47609667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr21	47612466	rs2187120	A	G	4453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.06;QD=44.10;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
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chr21	47612512	rs146297977	C	CTG	4648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=42;PP=2969;SC=GTACGTATGTCTGTGTGGCAC;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=65;WE=47612520;WS=47612502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr21	47614469	rs2254524	A	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=24;PP=1318;SC=GCACTCTGCAAATAACGCCGC;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=47614477;WS=47614459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr21	47616071	rs7282841	G	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.60;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47616080	rs2839140	G	A	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.95;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	47628375	rs73144751	G	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=36;PP=1087;SC=TGCGAGGCGCGCGAGGGCCTG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=47628383;WS=47628365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	47633789	rs9974665	C	G	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=101;PP=2965;SC=CGCTCCAGACCCACAGCAGCC;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=75;TCR=101;TR=176;WE=47633797;WS=47633779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr21	47635302	rs5844259	T	TC	297.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=232;SC=GACTTGCCCTTCCCAGGGTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=47635310;WS=47635292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	47635627	rs9980968	C	G	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=47;PP=2443;SC=GCCAGCTGTGCGGCGTGTACA;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=118;WE=47635635;WS=47635617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr21	47635713	rs11701729	G	A	4796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=74;PP=2735;SC=AGCTCCTGGTGGGGGCAGTGT;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=140;WE=47635721;WS=47635703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr21	47635856	rs2839153	C	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=411;SC=GACCCCGAGGCCACATGAAGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=47635864;WS=47635846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47639492	rs2277826	C	G	5370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=116;PP=2965;SC=ACCACCTGAGCGGGGAGAGAA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=53;TCR=116;TR=169;WE=47639500;WS=47639482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr21	47641700	rs2839157	G	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=411;SC=TTTCTGTATCGCGTTTGTGAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=47641708;WS=47641690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47656712	rs2839166	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=42;NR=14;PP=1277;SC=TTAATTCTTATGTAAATGCCA;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=47656720;WS=47656702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	47662920	rs60691594	C	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.31;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	47678774	rs2839178	A	G	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=28;PP=1820;SC=TACAGAAACTAATAGCTCATA;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=47678782;WS=47678764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	47681127	rs2839180	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=431;SC=GCATCGTGGCTAGGGTCAGTT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=47681135;WS=47681117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	47686152	rs2839182	C	T	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=545;SC=AGTGCCCTGCCGAGTACTGCA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=47686160;WS=47686142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	47686174	rs4818831	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=280;SC=GCCCCTTGGGTGTCACCACAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=47686182;WS=47686164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	47687144	rs2839183	G	A	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=598;SC=CATGGCCAGCGTGGGGCACAT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=47687152;WS=47687134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	47697650	rs17182664	A	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=38;PP=1191;SC=TAAACACCACACTGAGGGCCC;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=47697658;WS=47697640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	47703649	rs11702450	G	A	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=44;PP=1301;SC=AGTCAGGGATGTTCTTGCACT;SOR=2.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=58;WE=47703657;WS=47703639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	47704896	rs9975588	G	A	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=59;PP=2850;SC=CAGCACAGATGAACTTGAAGG;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=47704904;WS=47704886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr21	47716230	rs1888539	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=497;SC=ACCCTCCATCTTGACCGCCCC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=47716238;WS=47716220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	47717350	rs2839206	C	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=247;SC=GGGCGGCCGGCTTCCCCCAAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=47717358;WS=47717349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	47717616	rs8651	G	A	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=49;PP=1821;SC=GGTCGCACACGAATAAATAAC;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=47717624;WS=47717606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr21	47717686	rs2839207	G	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=35;PP=1104;SC=GGTATTTTTCGTTATTGTAAA;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=47717694;WS=47717676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	47722391	rs1556337	A	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=12;PP=768;SC=GCTGGGGGCTAAGCCTACCTG;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=47722399;WS=47722381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	47722578	rs1974171	G	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=24;PP=674;SC=CCAGAGAACAGGTGTGTCTGT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=47722586;WS=47722568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	47744037	rs3842460	CG	C	966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=647;SC=ACAGTTGTCGCGGGGGGAGGG;SOR=1.911;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=21;WE=47744045;WS=47744027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	47766139	rs9982233	T	C	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=66;PP=1675;SC=CGGCGGGGCCTGCACAGGCTC;SOR=2.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=83;WE=47766147;WS=47766129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	47766650	rs2839217	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=39;PP=1598;SC=CCTTTTCTCCGCCGCAGGCCG;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=47766658;WS=47766640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	47773103	rs2249057	C	A	6347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=AGCATGAGTCCGAACTGGAGC;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=195;WE=47773111;WS=47773093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr21	47776847	rs201668274	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.856;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr21	47777063	rs2839223	G	A	3899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=68;PP=2446;SC=AATTTGTATGGGAAGTTGCAG;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=130;WE=47777071;WS=47777053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr21	47777222	rs2839224	A	G	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=322;SC=AGTGCTGTACATGGCACATTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=47777230;WS=47777212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	47783796	rs8131546	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=73;PP=2123;SC=GGGAGCTTGCTGCGCTCCACG;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=49;TCR=73;TR=122;WE=47783809;WS=47783786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr21	47786449	rs9637173	T	A	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=16;PP=1860;SC=GCAAGGGTCATTGCTTCCTGA;SOR=2.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=60;TCR=16;TR=76;WE=47786457;WS=47786439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr21	47786494	rs2839226	C	T	4621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=49;PP=2965;SC=ACTTTGTTGCCGCAGGTTTTT;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=139;WE=47786502;WS=47786484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr21	47786817	rs2839228	C	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=41;PP=2142;SC=CCTGTTACCTCTCTGAATTTC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=92;WE=47786825;WS=47786807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr21	47787002	rs6518289	T	C	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=52;PP=1320;SC=CGAACCGAAGTGAGCACAGAG;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=47787010;WS=47786992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr21	47805836	.	C	G	2435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=1606;ReadPosRankSum=0.572;SC=AGCGGGAGAACCGGGAAGGCG;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=68;TCR=114;TR=96;WE=47805844;WS=47805826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,114:0.51:224
chr21	47810480	rs141693899	T	TGAC	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=783;SC=GCCTGGGTGGTGACGGCCTGA;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=16;WE=47810488;WS=47810470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	47811272	rs3737438	C	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=468;SC=CAGCCACGGACGCCGAGGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=47811280;WS=47811262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	47836653	rs2070425	C	T	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=37;PP=1420;SC=ACCCAGGGGCCGGGGCTGCTT;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=47836661;WS=47836643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	47845992	rs11702810	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=16.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.77;MQRankSum=4.722;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr21	47850405	rs2839257	C	T	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=30;PP=1329;SC=GATTGTTCTGCGATGTCTCCA;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=68;WE=47850413;WS=47850395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr21	47850484	rs2070426	G	C	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=32;PP=839;SC=AGAGTGAGCAGGGGAAGGGGC;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=47850492;WS=47850474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	47851753	rs2073376	A	G	4437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=66;PP=2965;SC=GCTCTGCTGCAGAAGCTGAAG;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=152;WE=47851761;WS=47851743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr21	47852151	rs5844270	A	AG	608.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=521;SC=CTGCCGGCGGACGTCCACACC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=47852159;WS=47852141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47856053	rs61735826	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=370;ReadPosRankSum=0.037;SC=CCAGCCAGGCCGTGGACAGGT;SOR=0.926;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=30;WE=47856061;WS=47856043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr21	47856106	rs2236616	C	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=25;PP=707;SC=CTTGCAGCCACCCCTCTGTCC;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=47856114;WS=47856096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	47859937	rs78656506	C	CT	2722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=22;PP=1941;SC=GGCTGCGTCTCTAAGATGCTC;SOR=1.091;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=40;WE=47859945;WS=47859927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr21	47862624	rs2839262	A	G	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=36;PP=1178;SC=ATTCCGTCAGAGCAGTCGTCC;SOR=1.385;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=47862632;WS=47862614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	47863757	rs2073380	A	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=31;PP=1092;SC=CTCCACCCAGAACCAGAGAGT;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=47863765;WS=47863747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	47878892	rs11701121	T	C	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=24;PP=1892;SC=GGTGCGTTGCTGTCCTGGCCG;SOR=1.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=96;WE=47878900;WS=47878882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr21	47904585	rs718496	A	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=247;SC=CAGTGTTTCCAGTTTTTCAAT;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=47904593;WS=47904575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	47910523	rs7279002	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=49;PP=2019;SC=GAATAGACCCATCTCTGCAAG;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=113;WE=47910531;WS=47910513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr21	47910659	rs9976530	A	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=908;SC=GGCAGTGGGGAAGGTGGACGG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=47910667;WS=47910649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	47917047	rs11315869	CT	C	6724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=133;PP=2983;SC=TCAAGTGTGGCTTTTTTTTGA;SOR=1.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=12;TCR=147;TR=144;WE=47917055;WS=47917037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr21	47957332	rs2070432	G	A	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=54;PP=2965;SC=GGGCCCACTCGCCCTAAGCAT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=47957340;WS=47957322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr21	47959692	rs1008548	G	A	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	47959698	rs1008549	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	47961711	rs2070435	G	A	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=60;PP=2729;SC=AAGCAGTCCTGTCGATGAACG;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=134;WE=47961719;WS=47961701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr21	47966810	rs2839318	G	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=768;ReadPosRankSum=-0.582;SC=GAGTCTTGACGCACACCCTTT;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=51;WE=47966818;WS=47966800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr21	47971539	rs2255526	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=742;ReadPosRankSum=1.653;SC=GAGTTCCCCCGTTTCTAGAGG;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=48;WE=47971547;WS=47971529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
chr21	47974396	rs36059970	C	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CCCCCAGCACCACCTCCCCTC;SOR=2.147;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=16;WE=47974404;WS=47974389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr21	47974582	rs1107065	A	G	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=66;PP=2032;SC=TCGGCACCACACTGCCCACCG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=108;WE=47974590;WS=47974572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	47978321	rs34920477	G	GC	5795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=60;PP=2966;SC=GGTGCCTGGGGCTGCGGTTCT;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=99;WE=47978329;WS=47978311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr21	47980570	rs2070429	A	G	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1255;ReadPosRankSum=-1.033;SC=ATGCAGCTGTACCTGTAGAAA;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=81;TCR=42;TR=70;WE=47980578;WS=47980560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,76:0.55:137
chr21	47983657	rs762253	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=488;ReadPosRankSum=-1.402;SC=GACCTGACATGAGCACATCAG;SOR=1.000;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=31;WE=47983665;WS=47983647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr21	47985554	rs143626098	T	TG	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=620;ReadPosRankSum=1.080;SC=TCTTGGCCAGTGGATGTCTCG;SOR=1.038;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=18;WE=47985562;WS=47985544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr21	47986633	rs3819044	C	A	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=117;PP=2965;SC=CACGTGGTCCCTCCAGCCCTT;SOR=1.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=52;TCR=117;TR=169;WE=47986641;WS=47986623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr21	48019239	rs9722	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=547;ReadPosRankSum=1.368;SC=TTGCATGACCGTCTCTGTTAC;SOR=0.263;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=37;WE=48019247;WS=48019229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr21	48022144	rs2839356	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=424;ReadPosRankSum=-0.152;SC=ACAGATGGATTTTAAGAGGAG;SOR=2.015;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=25;WE=48022152;WS=48022134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr21	48022175	rs80199493	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=672;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TGTCAAGTTTAAAAAGCAAGA;SOR=0.745;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=42;WE=48022183;WS=48022165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr21	48022230	rs1051169	C	G	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1086;ReadPosRankSum=0.837;SC=TGAGCTCCTTCAGTTCGGATT;SOR=0.539;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=70;WE=48022238;WS=48022220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,87:0.51:171
chr21	48022375	rs2186358	C	A	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=35;PP=1052;SC=ATACCTCATCCTAAAACATTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=48022383;WS=48022365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	48063476	rs10854485	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GCAGTGAGGCCGGTCTCCTGC;SOR=0.601;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=9;WE=48063484;WS=48063466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr22	16157827	.	C	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.63;MQRankSum=-2.636;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.662;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr22	17052949	rs182041500	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.853;NF=18;NR=9;PP=381;ReadPosRankSum=0.566;SC=AATGAATTAAGGGAAAATGAC;SOR=0.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=27;WE=17052957;WS=17052939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr22	17055458	rs35893428	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.994;NF=40;NR=42;PP=1202;ReadPosRankSum=3.557;SC=TAGGCAAGTCGAGGCAATGGA;SOR=0.495;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=82;WE=17055466;WS=17055448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr22	17055569	rs3729688	T	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.621;NF=10;NR=28;PP=761;ReadPosRankSum=-0.824;SC=TTCACTGCAGTGGGGCAGAGT;SOR=0.237;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=38;WE=17055577;WS=17055559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr22	17063359	rs2006108	A	G	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=16;PP=1709;SC=TGGCAGGGAAAGGTTGCTGTC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=74;WE=17063367;WS=17063349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	17072483	rs2236639	A	G	7402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=120;PP=2965;SC=ATCTCCATCCAAGACCTAGCT;SOR=0.969;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=151;TCR=120;TR=271;WE=17072491;WS=17072473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr22	17073066	rs5747988	A	G	6131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=92;PP=2965;SC=GAGGCAGGCCAGCCTTCAGCA;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=191;WE=17073074;WS=17073056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr22	17156061	rs8142573	A	G	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=24;PP=1561;SC=TTTCTTTTAAAAGAGTGCATT;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=17156069;WS=17156051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	17178601	rs116224412	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.06;QD=23.71;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	17325688	rs112669458	T	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=465;ReadPosRankSum=0.195;SC=CATTGAGAGTTGGCTTGGTGT;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=26;WE=17325696;WS=17325678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr22	17326914	rs165927	G	A	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=37;PP=1554;SC=TGGAAGACTCGGTGGAGAAGG;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=80;WE=17326922;WS=17326904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	17327068	rs165588	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=591;SC=CCGGGCACTGACCAAGCTCCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=17327076;WS=17327058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	17445502	rs5748765	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TGCCTGATACACCTGTGCTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=17445510;WS=17445493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr22	17446991	rs4819925	C	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=942;SC=AAGACTTACCCTTCTGGTTAG;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=17446999;WS=17446981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	17449076	rs5748768	C	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=3;PP=1090;SC=ACCTAGGCAGCCTCCTAGGAG;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=17449084;WS=17449066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	17488727	rs5748800	A	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=504;SC=AGTCGCCTCCACCCGCAGCTC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=17488735;WS=17488723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	17488823	rs11378060	C	CG	2394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=22;PP=1783;SC=CCCCACTGCCCCACTCACAAA;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=17488831;WS=17488813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	17565888	rs13053694	C	A	3016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1630;ReadPosRankSum=-1.713;SC=CAAAGTGGAGCCGACTCGAAC;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=205;TCF=122;TCR=83;TR=105;WE=17565896;WS=17565878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,136:0.54:250
chr22	17565932	rs917864	T	C	9020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=136;NR=126;PP=2965;SC=AGAACGTTCGTTCGCTGCGTC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=136;TCR=126;TR=262;WE=17565940;WS=17565922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr22	17565974	rs917865	G	C	6741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=121;PP=2965;SC=CGCGACGCCAGCCGGGCCATG;SOR=0.852;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=101;TCR=121;TR=222;WE=17565982;WS=17565964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr22	17566206	rs2270241	G	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=13;PP=378;SC=GGGACTACGCGCCCGGGCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=17566214;WS=17566196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	17566229	rs2270242	T	A	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=13;PP=323;SC=AGGCAGGAAGTCCGCGCCGCG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=17566237;WS=17566219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	17582788	rs41454546	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=0.929;SC=GACAGGCTCCCAGTGGGGAAA;SOR=0.602;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=17582796;WS=17582778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr22	17585808	rs721930	G	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=420;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AGGGAGGAGAGTTTAGTTTAA;SOR=0.437;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=26;WE=17585816;WS=17585798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr22	17586471	rs2241046	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=673;ReadPosRankSum=0.072;SC=TTCCTCTGTTCTCATTGCAGA;SOR=0.597;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=42;WE=17586479;WS=17586461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr22	17586583	rs2241047	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=356;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GCCAGGCAGACAAGGCTGAAC;SOR=0.301;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=22;WE=17586591;WS=17586573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr22	17586609	rs144979983	GT	G	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=3;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=840;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CCAGCCCGGGGTGGGGGGTGA;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=14;WE=17586622;WS=17586599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr22	17586614	rs35078252	G	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;ReadPosRankSum=-1.539;SC=CCGGGGTGGGGGGTGAGACCA;SOR=1.863;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=14;WE=17586622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr22	17586631	rs4819959	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=4;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=-1.323;SC=ACCATGGTTTGTCGTGGTGGG;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=10;WE=17586639;WS=17586621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr22	17586715	rs56736183	ATCAC	A	1078.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=621;ReadPosRankSum=-1.450;SC=GCCCCGCCGCATCACTCACGC;SOR=0.310;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=14;WE=17586726;WS=17586705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr22	17600148	rs9605220	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-0.666;SC=GGTGCAGAAGAACACCCTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=17600156;WS=17600138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
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chr22	17623837	rs5747009	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5447;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CAGAGGTGGTAAGTGGCAGAT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=17623845;WS=17623827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr22	17623880	rs34058953	G	GC	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.476;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.803;NF=13;NR=7;PP=622;ReadPosRankSum=1.782;SC=TGACTCCAAGGCCCCTTGCTG;SOR=0.197;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=20;WE=17623888;WS=17623870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr22	17629544	rs3214349	G	GA	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.545;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.850;NF=1;NR=8;PP=225;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CCTAGGGAAGGAAAAAACCCG;SOR=0.160;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=17629552;WS=17629534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr22	17630378	rs2286956	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=2.000;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	17630486	rs1034859	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-2.328;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr22	17640022	rs11550530	G	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=1.057;SC=TCACCTGAGCGGGGCCCACAG;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=14;WE=17640030;WS=17640012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr22	17640176	.	GC	G	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=12.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=1.313;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.794;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr22	17662699	rs58754958	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GGGAGGACACAGGACACTCAC;SOR=1.244;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=10;WE=17662707;WS=17662689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr22	17662793	rs7289170	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=363;ReadPosRankSum=0.879;SC=CATAGAAATCATAGGACAAGC;SOR=1.247;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=30;WE=17662801;WS=17662783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr22	17669151	rs2231496	C	T	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=715;SC=TAGGCTCTAACCCTGAGGCAT;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=17669159;WS=17669141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	17669199	rs7284498	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.514;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=621;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GACCACCTCCGCTGCCTCTGC;SOR=0.337;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=43;WE=17669207;WS=17669189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr22	17669406	rs9619005	G	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=441;ReadPosRankSum=-1.069;SC=GCGCGCCCTGGAGCCTGTGCA;SOR=1.148;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=22;WE=17669414;WS=17669396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr22	17671133	rs2286348	C	G	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=51;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.597;SC=TATCAAAGACCCTTGCTGGCT;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=81;WE=17671141;WS=17671123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,95:0.59:161
chr22	17680306	rs144627322	T	TCCTCCCTCCCCTCCTCTATCCTCTTCC	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=18.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=2.169;SOR=1.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr22	17680519	rs17807317	A	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.09;MQRankSum=-1.158;NF=22;NR=39;PP=982;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TGGGATCGCCATTTGAGGTGG;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=61;WE=17680527;WS=17680509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr22	17690409	rs362129	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=573;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CCTCCTTGGTGTTCAGCACCA;SOR=0.475;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=33;WE=17690417;WS=17690399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr22	17956759	rs4819593	C	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=62;PP=2061;SC=CATTTCTTGCCCCAAGAACTA;SOR=1.188;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=102;WE=17956767;WS=17956749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr22	17978600	rs7284169	G	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=46;PP=874;ReadPosRankSum=0.989;SC=TTCAGTGTTAGGGCATGATAG;SOR=0.924;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=130;TCF=40;TCR=90;TR=64;WE=17978608;WS=17978590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr22	18018489	rs2300685	G	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=39;PP=967;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TTGTTTGTTTGTTGTTAAATA;SOR=0.669;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=7;TCR=66;TR=43;WE=18018497;WS=18018479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr22	18018913	rs62241413	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=309;ReadPosRankSum=1.654;SC=AGGACAGTGAACAGAATGTGT;SOR=1.230;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=15;WE=18018921;WS=18018903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr22	18021505	rs2268776	T	C	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TTTCCTCTTCTTGCTTTGTTC;SOR=0.437;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=182;TCF=83;TCR=99;TR=95;WE=18021513;WS=18021495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,119:0.55:217
chr22	18021760	rs1296795	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GTCCTTTCCCAAAGAGTCTGT;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=7;WE=18021768;WS=18021750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr22	18028150	rs201137830	T	C	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1370;ReadPosRankSum=1.042;SC=AACGGAGTCATTGGGGAAGCA;SOR=0.650;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=71;TCR=74;TR=82;WE=18028158;WS=18028140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,88:0.52:168
chr22	18030096	.	TA	T	128	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9999;HP=17;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=59.54;NF=0;NR=12;PP=128;QD=10.9166666667;SC=CTGACCAAGGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=12;WE=18030105;WS=18030086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:36,12:0.25:48
chr22	18032459	.	GTTTTTTTT	G	137	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=85;MMLQ=15;MQ=51.71;NF=1;NR=0;PP=137;QD=140.0;SC=GCTTACTTAAGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=1;WE=18032474;WS=18032449;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,1:0.17:6
chr22	18072333	rs34661208	A	ACTT	1597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=1206;ReadPosRankSum=-1.880;SC=TTCACTACTTACTTTAACTTT;SOR=0.932;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=25;WE=18072341;WS=18072323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
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chr22	18171650	rs5013026	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=1.482;SC=TCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=11;WE=18171672;WS=18171640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr22	18178859	rs2257083	C	T	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=30;PP=2226;SC=TCTGGAAATACAGAATTTTCC;SOR=1.817;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=78;TCR=30;TR=108;WE=18178867;WS=18178849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	18189469	rs2587086	G	A	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=728;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TGGTTCATGTGCTGTGATTCT;SOR=0.956;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=73;TCR=31;TR=47;WE=18189477;WS=18189459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,57:0.46:125
chr22	18209613	rs4488761	A	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=722;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TGTCACTGTCAGCTAGCCAGA;SOR=1.032;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=41;WE=18209621;WS=18209603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr22	18209718	rs2535688	C	T	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1085;ReadPosRankSum=0.151;SC=TAGACAGCAACGGAGCTGGAG;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=74;WE=18209726;WS=18209708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,81:0.49:164
chr22	18210409	rs725768	T	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr22	18218464	rs181382	T	C	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=527;SC=TGCAAAAACATGTTCTCCAGA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=18218483;WS=18218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	18218475	rs181383	C	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=409;SC=GTTCTCCAGACCCCTGAAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=18218483;WS=18218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	18220831	rs11538	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=352;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GGTTAATAAAATTCACTGTTG;SOR=0.366;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=28;WE=18220839;WS=18220821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr22	18222089	rs372897	C	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=349;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CTTGCCCGCCCACGCGGTCCT;SOR=1.734;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=19;WE=18222097;WS=18222079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr22	18222263	rs181390	A	G	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=44;PP=1399;SC=ATCTGTGTTCAGGCAGGGGCG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=18222271;WS=18222253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	18223012	rs139131030	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=610;ReadPosRankSum=1.748;SC=AAATACCCAGCACTTAATACA;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=45;WE=18223020;WS=18223002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,55:0.39:140
chr22	18233000	rs181405	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=427;ReadPosRankSum=0.292;SC=AGGACCCCTCGGGAGGACGAC;SOR=0.687;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=29;WE=18233008;WS=18232990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr22	18257138	rs443912	T	G	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=26;NR=23;PP=864;SC=GGGGCGCGGGTGCACTCACCA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=18257146;WS=18257128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	18274092	rs451548	G	C	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=57;PP=1377;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTTGTGTCGGGTGCAGGGAGT;SOR=0.840;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=173;TCF=50;TCR=123;TR=77;WE=18274100;WS=18274082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,85:0.47:181
chr22	18300240	rs5992854	T	C	3605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=2063;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CGGCTTCTTCTAGGAGGTTGG;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=256;TCF=139;TCR=117;TR=130;WE=18300248;WS=18300230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,167:0.53:318
chr22	18300775	rs61744842	G	A	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1512;ReadPosRankSum=1.219;SC=CTCGGGGCGCGGCCAGCAGGA;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=159;TCF=102;TCR=57;TR=82;WE=18300783;WS=18300765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,93:0.54:172
chr22	18304695	rs5992112	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=0.688;SC=GGTGTGCACCATGGCTCTGCT;SOR=1.002;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=18;WE=18304703;WS=18304685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr22	18304753	rs67527329	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.048;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=464;ReadPosRankSum=0.571;SC=ATGGCCCTCGTAGGAATTCTG;SOR=1.200;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=33;WE=18304761;WS=18304743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,38:0.33:114
chr22	18304784	rs5992113	A	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=589;ReadPosRankSum=-2.265;SC=CTCCCATCAAAGACAGGCTCA;SOR=1.013;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=48;WE=18304792;WS=18304774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr22	18304821	rs45514595	G	A	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TCGGTGAGGCGGGCAGCTTCT;SOR=0.919;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=151;TCF=87;TCR=64;TR=78;WE=18304829;WS=18304811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,91:0.53:172
chr22	18304891	rs45544141	C	T	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1126;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GCACGGCAAACGCAGCTCTCT;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=79;WE=18304899;WS=18304881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,93:0.56:167
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chr22	18324564	rs750559	C	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.305;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=557;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGCGGGTGGGCGCCCTGCAGC;SOR=0.900;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=33;WE=18324572;WS=18324554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr22	18348823	rs2277832	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=555;ReadPosRankSum=-1.792;SC=AGCCAGGCACGGATCCTGAAC;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=32;WE=18348831;WS=18348813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr22	18368548	rs2289718	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=510;ReadPosRankSum=-0.598;SC=CGAACGCTGGGGTCTGTGACA;SOR=0.870;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=33;WE=18368556;WS=18368538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr22	18369916	rs4819644	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=798;ReadPosRankSum=0.515;SC=CATTCTAGCAATTCCCCAAGT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=55;WE=18369924;WS=18369906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,63:0.45:141
chr22	18370066	rs4819472	C	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=49;PP=1932;SC=CTTTGCAGCCCATCAAGAGAC;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=18370074;WS=18370056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	18372020	rs3747032	A	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=550;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CAAGGAAAACATATCAAGATA;SOR=0.866;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=30;WE=18372028;WS=18372010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr22	18374150	rs2075453	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=0.911;SC=TATCTTACTATGTACCTCATT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=16;WE=18374158;WS=18374140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr22	18378002	rs2034113	T	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=365;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GAATTCTCATTGGTCCTGCAG;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=24;WE=18378010;WS=18377992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr22	18379160	rs3213927	T	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.995;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=0.783;SC=ATAATTAAAATATAACACACC;SOR=1.877;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=21;WE=18379168;WS=18379150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr22	18562888	rs464541	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=1.051;SC=CCCTCCAGATCGGATTCTTTC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=18562896;WS=18562878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	18655860	rs4819484	G	A	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=44;PP=2065;SC=GTATAAATGTGTGAGGCAGTC;SOR=1.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=111;WE=18655868;WS=18655850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr22	18896169	rs426065	C	T	4789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=40;PP=2469;SC=AGATGCCGCCCCATCATTCTG;SOR=1.462;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=111;WE=18896177;WS=18896159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	18896189	rs425576	T	C	5397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=53;PP=2815;SC=GTGAGCACTTTCTTGCTTTCT;SOR=1.072;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=130;WE=18896197;WS=18896179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr22	18897416	rs436638	C	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.96;NF=5;NR=6;PP=228;SC=CCCGCCTGCCCCCTCCAGCTG;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=18897424;WS=18897406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	18898289	rs441862	G	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=25;PP=1296;SC=GGAGAGGCCTGGGTGTGGTGA;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=70;WE=18898297;WS=18898279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	18898874	rs76227209	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=0.389;SC=TGGGGGCAGAGGCTCAGATTC;SOR=3.611;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=13;WE=18898882;WS=18898865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr22	18898908	.	A	G	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=57.42;NF=0;NR=5;PP=62;QD=19.3542425094;SC=TGGGGGCAGAAGCTCAGATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=5;WE=18898916;WS=18898898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr22	18899016	rs428224	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=676;SC=GGGCCTGGGGGTCACTCTGGC;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=18899024;WS=18899006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	18900669	rs383964	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=497;SC=GCTGGAGGCTAAGGGTGTGCT;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=18900677;WS=18900659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	18900750	rs372055	G	A	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=23;PP=1110;SC=AGCCACAGCAGCTGCCGCTCC;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=18900758;WS=18900740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	18901004	rs450046	C	T	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=72;PP=2435;SC=AAAGTACACCCGGTGGTCAGC;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=120;WE=18901012;WS=18900994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr22	18901090	rs385440	A	G	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CACTGTCCCCAGTGCAGGGAT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=18901098;WS=18901080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr22	18904414	rs455072	A	G	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=34;NR=23;PP=1025;SC=TGCGCAGTGCAAAGCGCACTG;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=57;WE=18904422;WS=18904404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr22	19028476	rs2073775	T	C	3768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,93:0.60:155
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chr22	19034079	rs715539	A	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=272;ReadPosRankSum=0.344;SC=GGGTGGCAAGAGTAGACACTC;SOR=0.425;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=17;WE=19034087;WS=19034069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr22	19034240	rs2012929	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=605;ReadPosRankSum=-1.571;SC=GCCACAGGGCAGGCAGAGCAG;SOR=0.521;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=40;WE=19034248;WS=19034230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr22	19036232	rs17743444	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.190;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=468;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CCACACTGCCAAAAAAGGTAG;SOR=2.506;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=22;WE=19036240;WS=19036222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr22	19048413	rs2238739	A	G	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1165;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TGTGCAGGGTACCGACACATG;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=94;TCR=73;TR=78;WE=19048421;WS=19048403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,100:0.49:206
chr22	19048449	rs2238740	G	A	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1232;ReadPosRankSum=1.697;SC=TATGTACCATGGTATCACTCA;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=77;WE=19048457;WS=19048439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,93:0.46:202
chr22	19050599	rs111427599	T	TCCATGTC	1128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.864;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.291;NF=25;NR=1;PP=1431;ReadPosRankSum=1.022;SC=GCTCACCCACTCCCTGCACAG;SOR=4.573;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=26;WE=19050607;WS=19050589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr22	19050635	rs5993488	G	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=1.130;NF=58;NR=30;PP=1559;ReadPosRankSum=-1.708;SC=GGCAGCACTGGGTAAGAGGGA;SOR=0.998;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=120;TCR=65;TR=88;WE=19050643;WS=19050625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,87:0.44:196
chr22	19050878	rs9617765	A	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=-1.244;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCGCT;SOR=0.836;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=20;WE=19050886;WS=19050868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr22	19076797	rs73158837	C	A	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=35;PP=1368;ReadPosRankSum=0.520;SC=ACAGCACACACCTCCACCCCT;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=209;TCF=126;TCR=83;TR=93;WE=19076805;WS=19076784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,107:0.44:243
chr22	19077049	rs2800960	C	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=739;SC=TGGCAGTAGGCCAGCAAACCA;SOR=4.332;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=19077057;WS=19077039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr22	19109753	.	A	ACCCCGCTGGG	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-4.061;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr22	19109764	rs11550626	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-4.279;QD=8.95;ReadPosRankSum=-3.108;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr22	19109812	rs11550627	A	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr22	19118701	rs3747050	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1047;ReadPosRankSum=1.641;SC=GACCCTGTTCTCCCTCAGCCC;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=72;TCR=65;TR=64;WE=19118709;WS=19118691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,74:0.46:160
chr22	19119545	rs45604134	C	T	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=1281;ReadPosRankSum=1.927;SC=TCATGGTCTGCGGCTCCATGC;SOR=1.063;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=65;WE=19119553;WS=19119535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr22	19119686	rs1052756	C	T	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1685;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CCGACGTCAGCCAGCGGCTCC;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=122;TCR=90;TR=105;WE=19119694;WS=19119676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,133:0.51:259
chr22	19119751	rs1052763	C	T	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=58;PP=1635;ReadPosRankSum=1.258;SC=CCCAAAGCCACGTCTTCTGCC;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=124;TCR=120;TR=115;WE=19119759;WS=19119741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,128:0.44:289
chr22	19119938	rs1052773	G	A	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1834;ReadPosRankSum=1.208;SC=AGACCTCCAGGGCCAAAGACC;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=243;TCF=111;TCR=132;TR=116;WE=19119946;WS=19119928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,128:0.46:278
chr22	19122498	rs2240110	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TGCCTCCACACGGTCAGGGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=19122506;WS=19122488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr22	19125136	rs3765612	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr22	19189003	rs11386977	A	AC	3022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=33;PP=2109;SC=GCGGTCTCCAACTACGGATAA;SOR=0.742;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=46;WE=19189011;WS=19188993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	19197896	rs698423	T	C	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1053;ReadPosRankSum=1.366;SC=CCTCATACAGTGCGCTGCTGA;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=77;WE=19197904;WS=19197886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,78:0.51:154
chr22	19211665	rs9604935	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GATGACCCTGCTCCACTCTCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=19211673;WS=19211655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr22	19220648	rs807458	G	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=408;ReadPosRankSum=0.621;SC=TCAACCACACGTGAGTAATCT;SOR=0.184;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=21;WE=19220656;WS=19220638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr22	19318622	rs1210690	T	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=173;SC=AGCAGCATGGTGCCTGCAGCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=19318630;WS=19318612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr22	19712094	rs1059196	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=1.085;SC=TGGACCGGTCCCCGCCTCCTC;SOR=0.495;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=19712102;WS=19712084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr22	19766782	rs4819522	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AAAGCTGAGACGTCTAGGAAC;SOR=0.835;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=76;WE=19766790;WS=19766772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr22	19794366	rs737860	C	A	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=39;PP=1264;SC=GCGATTAGCCCGGGCTGCTGT;SOR=2.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=19794374;WS=19794356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	19808769	rs5748449	C	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=-0.209;SC=GAGGAGCGGGCGCCCCTGAGC;SOR=0.747;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=33;WE=19808777;WS=19808759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr22	19867771	rs1139795	C	T	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.678;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1068;ReadPosRankSum=0.226;SC=CATACTCCAGCGGGGTGAAGA;SOR=0.707;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=67;WE=19867779;WS=19867761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr22	19867914	rs13054713	C	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=428;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GAGCAGGCTGCAAGCACAGTA;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=29;WE=19867922;WS=19867904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr22	19868218	rs1139793	A	G	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=65;PP=2003;SC=CATGATCGCTATGGGTGTCAG;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=99;WE=19868226;WS=19868208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	19868255	rs34827823	AG	A	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=457;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GGGAAGGCACAGGGGGGCCAC;SOR=1.532;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=19;WE=19868263;WS=19868245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr22	19871097	rs13057374	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=0.295;SC=GCAGTGGCTCCTGCCTGTAAT;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=18;WE=19871105;WS=19871087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr22	19921003	rs5746847	T	C	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=845;ReadPosRankSum=1.241;SC=GCAGGGCCCTTGTTAGGTCAT;SOR=0.393;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=59;WE=19921011;WS=19920993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,65:0.57:115
chr22	19950428	rs2239393	A	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=687;SC=TTATCACCCCATTTCCAGGGG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=19950436;WS=19950418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	19951207	rs4818	C	G	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=57;PP=2907;SC=GGGCGAGGCTCATCACCATCG;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=140;WE=19951215;WS=19951197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr22	19956262	rs362204	G	GC	1325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1079;SC=GGCCCTGACTGCCCCCCCGGC;SOR=2.687;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=36;WE=19956270;WS=19956252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	19958669	rs165849	G	A	7374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=68;PP=2965;SC=TGCAGGCAGCGGAGACTAACA;SOR=1.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=160;TCR=68;TR=228;WE=19958677;WS=19958659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr22	19959366	rs165824	G	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=16;PP=1158;SC=CCCTAGACACGGGGCCTCACC;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=19959374;WS=19959356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	19959473	rs165815	C	T	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=56;PP=2248;SC=CCGCTCCCTCCGGTCCACCGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=19959481;WS=19959463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr22	19959955	rs2073744	A	G	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=92;PP=2965;SC=GGAGGAGGAGACGGGCTGCAT;SOR=1.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=42;TCR=92;TR=134;WE=19959963;WS=19959945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr22	19960188	rs2518823	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=695;SC=CTCCTTCACCTTCACCCAAGG;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=19960196;WS=19960178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	19964418	rs2240718	T	G	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1157;SC=CCACCAGGGGTACAAGAAGAG;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=19964426;WS=19964408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	19969075	rs2073747	A	G	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=47;PP=2189;SC=AGCCACCCCCACTGCTGAGGT;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=109;WE=19969083;WS=19969065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr22	20074575	rs2073778	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=-0.222;SC=ACATCTAGGCCCCCTGAGAGC;SOR=0.188;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=20074583;WS=20074565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr22	20079603	rs11089328	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=4.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr22	20094263	rs4819529	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=139;ReadPosRankSum=1.387;SC=GCTGGGCGGGCGGCCCCTGGT;SOR=0.839;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=10;WE=20094271;WS=20094253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr22	20096314	rs146291827	G	GCGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA	1291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=247;SC=GACCCTGGGCGCGCCTGCCTT;SOR=3.716;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=10;WE=20096322;WS=20096304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	20100596	rs1633445	T	C	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1003;ReadPosRankSum=0.164;SC=AGCCACCCCATGTGTCCTCGT;SOR=0.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=69;TCR=82;TR=83;WE=20100604;WS=20100586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,96:0.54:177
chr22	20102090	rs885980	T	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=679;ReadPosRankSum=0.137;SC=CAGGGACTCATGGCTACCTGG;SOR=0.652;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=51;WE=20102098;WS=20102080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr22	20102750	rs2073777	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=491;ReadPosRankSum=1.488;SC=GCTCCCACACCGCATAGGACT;SOR=0.613;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=31;WE=20102758;WS=20102740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr22	20104301	rs395446	T	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=10;NR=6;PP=319;SC=TTTCCTCCCCTATCGCACCTG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=20104309;WS=20104291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	20127554	rs175174	A	G	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=928;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GGTTGGGAGGAGGTTTGTCCA;SOR=0.989;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=57;WE=20127562;WS=20127544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr22	20132972	rs175179	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=5;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=162;ReadPosRankSum=1.041;SC=CCAGGACCCCACAGCGCACCC;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=7;WE=20132987;WS=20132962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr22	20132979	rs146417481	AC	A	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=8;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=0.702;SC=CCCACAGCGCACCCCCCCTCC;SOR=0.148;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=20132987;WS=20132962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr22	20136379	rs4819867	C	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=286;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GGGCTGGGCTCTGCCGTGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=21;WE=20136387;WS=20136369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr22	20137723	rs139050179	C	T	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.922;NF=31;NR=39;PP=857;ReadPosRankSum=1.201;SC=ACTGCTGCCCCGGCCCCAGGA;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=70;WE=20137731;WS=20137713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,86:0.48:178
chr22	20137822	rs3887519	C	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.030;NF=2;NR=13;PP=224;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GCCGCTCCTGCGGCTGGGGCT;SOR=0.301;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=15;WE=20137830;WS=20137812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr22	20137948	.	G	GTGGGGC	149	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=62.13;NF=3;NR=0;PP=149;QD=54.3333333333;SC=CAGGCGGTGGGTGGGGCTGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=20137956;WS=20137938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr22	20138105	rs73391926	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=411;ReadPosRankSum=-1.989;SC=CTCCCTCCCGTGACAGGGGTG;SOR=0.901;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=29;WE=20138113;WS=20138095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr22	20255020	rs854929	T	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=7;PP=848;SC=CTGCAGATGGTGGGCGTTGCT;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=20255028;WS=20255010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	20295420	rs4425183	G	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-0.768;SC=AGCCTGTGCAGCAGAGATCGG;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=16;WE=20295428;WS=20295410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr22	20303854	rs5993964	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GGTGTCTGCAGTGGGGAGGAT;SOR=1.061;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=8;WE=20303862;WS=20303844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr22	20378438	.	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.10;MQRankSum=-1.068;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr22	20385739	rs146242498	TTGTC	T	1260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.930;NF=0;NR=20;PP=826;ReadPosRankSum=1.881;SC=AAGAACTTGATTGTCTGGCCG;SOR=0.361;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=20;WE=20385750;WS=20385729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,36:0.34:107
chr22	20394502	rs201085493	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQRankSum=-0.041;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr22	20718525	rs2277833	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.89;QD=30.45;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	20718692	rs1807536	G	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.092;NF=17;NR=35;PP=827;ReadPosRankSum=0.624;SC=CCCGAGGCCCGACTCTGGGAC;SOR=0.275;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=52;WE=20718700;WS=20718682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr22	20718726	rs28540966	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.296;NF=1;NR=16;PP=208;ReadPosRankSum=0.166;SC=AAAACAGTCCTGACCCACGGC;SOR=1.276;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=17;WE=20718734;WS=20718716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr22	20724622	rs79737013	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.785;NF=1;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=-1.239;SC=AAGGCTAAGTCGGCACGACAG;SOR=0.197;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=15;WE=20724630;WS=20724612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr22	20729885	rs148868491	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQRankSum=-1.235;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.518;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr22	20731304	rs142942616	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.870;NF=10;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CAGGAGAATCGCTTGAACCCG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=20731312;WS=20731294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr22	20731566	rs61752242	C	G	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.552;NF=19;NR=35;PP=895;ReadPosRankSum=0.005;SC=GAAAAAAATGCTGAGGGCAAG;SOR=0.757;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=54;WE=20731574;WS=20731556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr22	20738879	rs7286096	G	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=350;ReadPosRankSum=0.088;SC=CCGGCATAATGTTAAAGTCTT;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=16;WE=20738887;WS=20738869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr22	20743771	rs361766	C	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=526;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GCGCCTGGGGCATGACTGCCC;SOR=0.956;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=25;WE=20743779;WS=20743761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr22	20745201	rs362125	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.174;NF=5;NR=18;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.190;SC=ACAGTGAGGCACACACACACA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=23;WE=20745214;WS=20745191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr22	20745206	rs10683060	C	CAT	1140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.278;NF=0;NR=22;PP=1914;ReadPosRankSum=0.620;SC=GAGGCACACACACACATACAC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=22;WE=20745214;WS=20745191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr22	20754039	rs361860	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CACCCCACCCGGCCTTGCTAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=20754047;WS=20754029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	20755098	rs1990249	A	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=986;ReadPosRankSum=-1.547;SC=GCCTTCTTCTACATGGTAGAT;SOR=0.491;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=136;TCF=49;TCR=87;TR=62;WE=20755106;WS=20755088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr22	20755226	rs4581986	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=0.627;SC=GAAGTCCCCAAGGGACAGCGT;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=20755234;WS=20755216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr22	20759534	rs5761555	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=118;ReadPosRankSum=0.054;SC=CTCTGCCTGCACCTTCCAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=10;WE=20759542;WS=20759524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr22	20761063	rs2228236	G	A	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1506;ReadPosRankSum=0.398;SC=TGCACAGCGAGGGGAAGCCCT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=85;WE=20761071;WS=20761053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,104:0.51:202
chr22	20779604	rs7286419	T	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=484;SC=GCGTGGGAGGTGTGGGGTGGC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=20779612;WS=20779594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	20779768	rs874101	G	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=37;PP=1407;SC=GGTCTCAGGCGCGGGCAAGTC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=20779776;WS=20779758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	20779822	rs874100	G	C	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.82;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	20779946	rs759612	CG	GC	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=22;PP=593;SC=TTGCCGCGCACGTCAGCGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=37;WE=20779955;WS=20779936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	20779973	rs5844418	C	CG	883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=626;SC=GAGGCAGCCTCGGCGCGCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=17;WE=20779981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr22	20780031	rs2329378	G	C	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=2.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr22	20780097	rs759609	G	C	5877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr22	20784217	rs882745	C	T	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1196;SC=GGTCCAGGGTCCCAGAACCGG;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=20784225;WS=20784207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	20795757	rs1153427	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=15;PP=997;SC=TTCCTGGGGACGCAGCTTGGG;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=20795765;WS=20795747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	20800983	rs1058990	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=496;ReadPosRankSum=-1.594;SC=GCCACCAGGAGAAATGGCGTG;SOR=1.226;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=30;WE=20800991;WS=20800973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr22	20811930	rs362087	C	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCATGGGGCCTCATCAATGC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=20811938;WS=20811926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	20843885	rs165613	T	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=201;SC=CTCCCCAATTTTAAAAAGAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=20843893;WS=20843875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	20862646	rs5750324	T	G	6440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=98;PP=2965;SC=TCAGAGGAACTCTAGCCCCTC;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=85;TCR=98;TR=183;WE=20862654;WS=20862636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr22	20891259	rs2269830	C	A	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=193;SC=TTCCCATATGCCTCTCCTGGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=20891267;WS=20891258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	20891545	rs4821915	A	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=29;PP=799;SC=AGAGGAGAGCATCACAGACTC;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=20891553;WS=20891535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	20891568	rs2269831	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=607;SC=GAACCCCTCTGTTGGGTGTCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=20891576;WS=20891558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	21034809	rs28668558	G	A	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=17;PP=695;SC=GAATCAAAGAGCTCCTCAACC;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=21034817;WS=21034799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	21081964	rs4820583	C	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=20;PP=1286;SC=AGTTGCCAAGCGGCTGTTTTT;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=21081972;WS=21081954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	21153964	rs61752247	G	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=650;ReadPosRankSum=0.055;SC=CGTACTTGTCGCTCTCCTGAG;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=46;WE=21153972;WS=21153954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr22	21213380	rs1061063	C	T	5544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=70;PP=2965;SC=TTTCCCAGACCGAGAGCCGCG;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=111;TCR=70;TR=181;WE=21213388;WS=21213370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr22	21213416	rs1061064	A	G	8222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=116;PP=2965;SC=CTTACCCTAAAAGCTACAATC;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=148;TCR=116;TR=264;WE=21213424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr22	21311531	rs81027	C	T	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=24;PP=998;SC=TTACCTGGGGCTGGGGAGGTG;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=21311539;WS=21311521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	21311721	rs178251	T	G	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=53;PP=2215;SC=TTTACTCATGTCCCCGCATCG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=102;WE=21311729;WS=21311711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	21322325	rs11334069	TC	T	1010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.32;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	21322351	rs178254	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=442;SC=CTGCACTCGGTAGGCCTCCGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=21322359;WS=21322341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	21322376	rs74610147	T	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	21322377	rs75810376	C	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	21322380	rs71317868	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	21322383	rs432390	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.41;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	21322409	rs2097674	C	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=116;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=288;SC=AATACGCTGCCGCCAGGAGGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=21322417;WS=21322399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	21327834	rs178265	C	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=264;SC=TGCCTGGGAGCGGGGATCAGG;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=13;WE=21327842;WS=21327824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	21329123	rs733455	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=312;SC=GGGTGGGGCAAGTAGGGACCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=21329131;WS=21329113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	21331043	rs178269	A	T	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=38;PP=2568;SC=GCGTGGGTCGAGCCCTCATGA;SOR=1.227;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=105;WE=21331051;WS=21331033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr22	21331950	rs178276	C	G	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=11;PP=1510;SC=ACGCAGAAGGCAGGGACAGGG;SOR=2.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=21331958;WS=21331940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	21334873	rs13057408	G	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=4;PP=988;SC=TCACCCTCTGGGAGAGAGCTC;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=21334881;WS=21334863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	21337415	rs178281	C	G	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=1580;SC=GGACCAGGTACGGAGAAGTAC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=21337423;WS=21337405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	21340088	rs178287	T	C	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=50;PP=2275;SC=CACTGCAGAGTAGACCTGGCT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=120;WE=21340096;WS=21340078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr22	21342169	rs178289	G	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=1.196;SC=GCAGCAGGTCGTTCCGGGGCT;SOR=0.454;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=24;WE=21342177;WS=21342159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr22	21342509	rs2269779	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CCTGAGGGCACGCAATAGCAG;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=22;WE=21342517;WS=21342499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr22	21343965	.	GGAGGAGGTGAGGGGCGTGGGGAGCCAGGGCGCAGGTA	G	299	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=62.17;NF=4;NR=17;PP=299;QD=15.619047619;SC=TCACCTGCTGGGAGGAGGTGA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=21;WE=21344010;WS=21343955;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:49,21:0.30:70
chr22	21343982	rs138025454	TGGGGAGCCAGGGCGCAGGTAGAGGAGGTGAGGGGCAC	T	2438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.41;QD=38.71;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	21344002	.	A	G	1191	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=63.9;NF=10;NR=9;PP=1191;QD=64.5142743446;SC=GGGCGCAGGTAGAGGAGGTGA;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=19;WE=21344010;WS=21343955;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr22	21344018	.	AC	GT	516	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5029;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=19;MQ=65.39;NF=11;NR=28;PP=516;QD=14.6017403811;SC=GGTGAGGGGCACGGGGAGCCA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=39;WE=21344027;WS=21344008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,39:0.87:45
chr22	21344905	rs178290	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.026;SC=CCTGGTGGCCATGGTAACCAT;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=14;WE=21344913;WS=21344895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr22	21346485	rs112544	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CTCATGCCCATGTGTCTCCCC;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=8;WE=21346493;WS=21346475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr22	21346719	rs756876	A	C	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=918;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TGTGATCAACACCTCTCACAC;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=160;TCF=65;TCR=95;TR=67;WE=21346727;WS=21346709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,88:0.46:192
chr22	21348084	rs178291	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=501;ReadPosRankSum=0.600;SC=CTGCTGTGCCTGGGCAGTGGG;SOR=1.380;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=31;WE=21348092;WS=21348074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr22	21349037	rs178292	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=715;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GGGTCAGCGCAATCAGGGTTG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=43;WE=21349045;WS=21349015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,48:0.38:127
chr22	21349676	rs412470	TC	AT	4045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=2805;ReadPosRankSum=-1.260;SC=TTCCCCCAGCTCTCCCTGGGG;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=79;WE=21349685;WS=21349666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,104:0.55:189
chr22	21350461	rs178294	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.591;SC=CACCCACCTCAGGTGGCTTTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=21350469;WS=21350451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr22	21350880	rs178295	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=346;ReadPosRankSum=-0.046;SC=TTGGAGAGCATGCTGGCGTGG;SOR=0.340;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=22;WE=21350888;WS=21350870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr22	21354970	rs426938	C	G	5768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=91;PP=2965;SC=CTGACTTCAGCGGGGCCAGGT;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=104;TCR=91;TR=195;WE=21354978;WS=21354960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr22	21356488	rs118007347	GA	TT	4207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=2571;ReadPosRankSum=-1.190;SC=GGGGCGGGGCGAGGTCCTAGC;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=74;TCR=101;TR=77;WE=21356511;WS=21356478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,109:0.50:220
chr22	21356538	rs368989	A	T	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=76;PP=2375;SC=CGAGTTTCTGACGCGCCCGCG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=21;TCR=76;TR=97;WE=21356557;WS=21356528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	21356549	rs385427	T	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=852;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CGCGCCCGCGTCGTCCCAGCT;SOR=0.620;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=42;WE=21356557;WS=21356528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr22	21356566	rs369250	A	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=520;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AGCTCCCTGGACTACCAGTAT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=27;WE=21356574;WS=21356556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr22	21357006	rs4822808	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=1.026;SC=CGGCTCACTGCAAACTCCGCC;SOR=0.048;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=21357014;WS=21356996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr22	21365668	rs1210564	A	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	21365743	rs389623	GG	AT	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	21365759	rs146547300	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr22	21369676	rs3893495	G	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.304;NF=0;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GGGAAGAGGTGGGGGGTGGGG;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=21369684;WS=21369666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr22	21372405	rs2073598	G	T	2526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=64;PP=1517;ReadPosRankSum=-0.565;SC=CAGCCCCAGGGGGCCACCCGT;SOR=0.645;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=194;TCF=73;TCR=121;TR=105;WE=21372413;WS=21372395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,121:0.51:238
chr22	21372467	rs2073599	C	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=882;ReadPosRankSum=1.142;SC=TGCTCGGTGTCCCCCAGGCAC;SOR=0.648;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=46;WE=21372475;WS=21372457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr22	21376863	rs372351	G	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=483;ReadPosRankSum=1.687;SC=AGGTGGGAAGGGGGCCTGTCC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=31;WE=21376871;WS=21376853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
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chr22	21377334	rs1548412	C	T	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1339;ReadPosRankSum=-1.799;SC=CGTAAGTGTCCCCACAATCCC;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=79;WE=21377342;WS=21377324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,90:0.41:220
chr22	21377958	rs929671	A	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=6;PP=201;SC=TCGCCCTCTCACTGTGGCGGC;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=21377966;WS=21377948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	21380064	rs1477145	G	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=988;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GGGCAAAGCAGGTCACCAGAG;SOR=0.791;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=68;WE=21380072;WS=21380054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,90:0.54:166
chr22	21383312	rs2075279	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	21384578	rs2270384	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=430;ReadPosRankSum=0.490;SC=AGCCCATCGGCGGCCATGGCA;SOR=0.667;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=31;WE=21384586;WS=21384568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr22	21386019	rs2072550	G	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=783;ReadPosRankSum=0.869;SC=CGTCTCCATGGTGGAGTCCTC;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=56;WE=21386027;WS=21386009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr22	21388605	rs2541956	T	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=590;SC=GAGGCTGAGGTGAGAGGATCA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=21388613;WS=21388595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	21403375	rs28504593	CC	AT	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.387;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.36;MQRankSum=-1.618;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.545;SOR=1.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	21409619	rs2241224	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=196;ReadPosRankSum=0.697;SC=TGGGGCCTGGCCCTCCTCTTC;SOR=0.248;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=12;WE=21409627;WS=21409609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr22	21411598	rs46148	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=593;SC=CCCTGCCCAGTTACACAGCGT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=21411606;WS=21411588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	21797094	rs486362	C	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.44;QD=41.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	21797102	rs1210228	G	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.44;QD=41.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	21800042	rs467181	T	C	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=49;PP=2095;SC=CGGCCTCTGCTCCTCCCGTTG;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=21800050;WS=21800032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	21800444	rs128477	T	C	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=69;PP=2965;SC=GCAGCGGCCATGCCAGCGCCC;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=162;WE=21800452;WS=21800434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr22	21822001	rs183213118	A	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.19;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	21822725	rs430214	T	C	408.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.837;NF=4;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGCAGGTGCTTGAGCGGGAC;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=18;WE=21822733;WS=21822715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr22	21822744	rs395295	G	C	176.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.75;QD=44.23;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	21829480	rs402694	G	T	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.44;QD=24.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	21829507	rs140118179	G	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.04;QD=47.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	21829513	rs113567369	TTGTC	T	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.81;QD=40.07;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	21842655	rs143994138	C	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.48;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	21846329	.	C	G	30.29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.00;QD=10.10;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	21947467	rs2266963	C	G	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=175;SC=GAGTCCTGAGCTTTGCAGATC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=21947475;WS=21947457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	21982892	rs2298428	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=699;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CAAGAGAAAGCGTCGGGGCCT;SOR=0.719;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=55;WE=21982900;WS=21982882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr22	21983260	rs2298429	A	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=457;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GCGGAGGGACAGAGGCAGCTA;SOR=0.483;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=38;WE=21983268;WS=21983250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr22	21984205	rs710177	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-1.999;SC=CGCTGGTCACAGCCCCGGCCA;SOR=2.804;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=8;WE=21984213;WS=21984195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr22	21984379	rs3747093	G	A	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=112;SC=GACGCTGCCCGGGCCCCGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=21984387;WS=21984369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	22007143	rs395006	G	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=359;SC=GAAGACCCCAGGGACGCACCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=22007151;WS=22007133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	22007370	rs372150	T	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=34;PP=1169;SC=TCCCTCCCTATAACCCTCACC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=22007378;WS=22007360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	22007426	rs373001	C	T	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=23;PP=642;SC=GCCCTCCCCTCCCCCCTACCC;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=22007434;WS=22007416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	22024507	rs402225	G	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=529;SC=ATAAGTAAATGAAATACAAAA;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=22024515;WS=22024497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	22025476	rs108815	A	G	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=58;PP=1691;SC=CCTTGGGGACATGGCAGCAAT;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=22025484;WS=22025466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	22041438	rs436496	C	T	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=1103;SC=TGCCCTGTGTCCTTCCTAGGG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=22041446;WS=22041428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	22048862	rs5999098	C	T	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=28;PP=1707;SC=CGCAGACCCACCTCTGTCTCC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=22048870;WS=22048852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	22049783	rs12484060	C	T	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=53;PP=1493;SC=CTGGTAGCAGCAGGTTGGCCG;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=22049791;WS=22049773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	22055280	rs710172	A	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1365;SC=GAGATGGCCGAGAGTGTCAAG;SOR=2.540;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=50;WE=22055288;WS=22055270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	22055394	rs1860	A	G	6370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=92;PP=2965;SC=AACAGCATTCAAAGGAGAAGG;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=202;WE=22055402;WS=22055384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr22	22055581	rs861816	C	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=455;SC=TTGGCAAAAACCCCCCCCAAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=22055589;WS=22055571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	22058355	rs2236643	A	G	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=34;PP=1937;SC=CGGAGCTGCAAGCTGTTTTTC;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=83;WE=22058363;WS=22058345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	22312315	rs71316717	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.179;NF=19;NR=27;PP=521;ReadPosRankSum=0.468;SC=GCTACTCTGGCGGCAGCAGGA;SOR=0.901;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=46;WE=22312323;WS=22312305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,53:0.31:173
chr22	22312350	rs2187583	GG	CC	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=2.493;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQRankSum=-3.922;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.053;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,37:0.27:135
chr22	22319757	rs71197632	AG	A	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.329;NF=6;NR=14;PP=649;ReadPosRankSum=2.295;SC=CCTGGAAGACAGGACAGTCAA;SOR=0.562;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=20;WE=22319765;WS=22319747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr22	22516883	rs34221567	TC	T	3024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.119;NF=25;NR=40;PP=2454;ReadPosRankSum=1.982;SC=TCGCATGGCATCAGCAGCAGC;SOR=0.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=65;WE=22516891;WS=22516873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,91:0.45:203
chr22	22516998	rs2073453	C	T	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1539;ReadPosRankSum=0.424;SC=TGGGGCTGACCGCTACCTCAC;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=95;TCR=103;TR=95;WE=22517006;WS=22516988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,109:0.47:233
chr22	22517026	rs738885	T	C	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AACCTCCAGTTTGAGGATGAG;SOR=0.450;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=85;WE=22517034;WS=22517016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,99:0.49:203
chr22	22517205	rs737842	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CCTCTGATTTAGAACAATTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=22517213;WS=22517195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	22550339	rs9623052	G	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1302;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CATCTCTCCCGACTGATCTCT;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=85;WE=22550347;WS=22550329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr22	22550450	rs2073447	C	G	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CTCCTGCACCCGCAGCAGTGG;SOR=0.625;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=59;WE=22550458;WS=22550440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,69:0.41:168
chr22	22550510	rs2073448	T	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.435;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1273;ReadPosRankSum=-2.406;SC=CCCGGGCAGTTCCCCCACCAC;SOR=1.178;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=74;WE=22550518;WS=22550500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr22	22550760	rs5757323	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=0.964;SC=TGTCTCCACCAGAGAGGGTAG;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=26;WE=22550768;WS=22550750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr22	22556270	rs5995639	T	C	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=65;PP=2712;SC=AGCCGCCCTCTCTGTCTGCAT;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=134;WE=22556278;WS=22556260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr22	22556368	rs9306341	C	T	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=48;PP=2221;SC=CAGCAGAAGCCAGGGAGCTCT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=96;WE=22556376;WS=22556358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr22	22556662	rs2330029	A	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=64;PP=1764;SC=CATTAAATACAGGATTGTTGT;SOR=3.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=77;WE=22556670;WS=22556652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	22569448	rs5750741	T	A	6673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=113;PP=2965;SC=AACAGCAACATTGTTGGCAAC;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=213;WE=22569456;WS=22569438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr22	22569554	rs6001413	C	A	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1397;ReadPosRankSum=-2.075;SC=CAGAGAGATTCTCTGCATCCA;SOR=0.967;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=171;TCF=77;TCR=94;TR=84;WE=22569562;WS=22569544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,102:0.46:222
chr22	22569640	rs6001415	T	G	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=55;PP=1763;SC=TGCTCAGCATTGGACAGCAGC;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=91;WE=22569648;WS=22569630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	22578408	rs9623095	C	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=28;PP=803;SC=GCTACTCTGGCGGCAGCAGGA;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=22578416;WS=22578398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	22578443	rs76789895	GG	CC	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=16;PP=859;SC=TCTCACTCCCGGGGCAGCCTG;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=25;WE=22578452;WS=22578433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	22599808	rs2285019	C	T	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=50;PP=1427;SC=GAGGGTGGAGCCGCCGCCCGA;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=69;WE=22599816;WS=22599798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	22698027	rs1894246	A	G	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=75;PP=2547;SC=TCCAGGAAGAAGATGAGAGTG;SOR=1.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=125;WE=22698035;WS=22698017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr22	22712021	rs10674947	C	CCGGG	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=299;SC=GGTCAAAAACCGGGGGGATCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=22712036;WS=22712011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	22712028	rs56355304	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=285;SC=AACCGGGGGGATCTGATTTGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=22712036;WS=22712011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	22712261	rs3753077	C	T	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.23;QD=32.64;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	22712276	rs5757971	A	G	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=29.32;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	22712467	rs5757973	T	G	6888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=118;PP=2965;SC=TCATCTATAGTAATAATCAGC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=101;TCR=118;TR=219;WE=22712475;WS=22712457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr22	22712742	rs3753078	A	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=586;SC=CATGGGTCCAAGGGCATCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=22712750;WS=22712732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	22724135	rs11324703	GT	G	2481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=41;PP=1330;SC=ATATATGTCTGTTTTTTTTGT;SOR=1.116;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=58;WE=22724143;WS=22724125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	22724394	rs7292000	T	C	3542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=66;PP=2150;SC=CTGACCCTTTTGGGTGCGCAG;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=22724402;WS=22724384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	22735736	rs448848	A	G	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=84;PP=2724;SC=CCAGGCCAATAGGGAACTGAG;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=134;WE=22735744;WS=22735726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr22	22782150	rs56060925	G	A	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1536;ReadPosRankSum=0.340;SC=CATCAATGTTGGTAGCTACAA;SOR=0.493;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=194;TCF=78;TCR=116;TR=97;WE=22782158;WS=22782140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,120:0.51:234
chr22	22782394	rs165704	A	G	10614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=169;PP=2965;SC=CACAGATGGGAAAGTGGGACA;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=145;TCR=169;TR=314;WE=22782402;WS=22782384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr22	22786410	rs165657	C	T	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=40;PP=1692;SC=AGAGAGAGGCCCTGGGAAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=22786418;WS=22786400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr22	22842206	rs11109	T	C	4407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=49;PP=2666;SC=GAGGTTCCAGTGACACTTGAA;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=132;WE=22842214;WS=22842196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	22842957	rs2236729	T	G	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=80;PP=2965;SC=CAATTCATTTTCCCTATCAAG;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=54;TCR=80;TR=134;WE=22842965;WS=22842947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr22	22843118	rs2236730	C	T	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=55;PP=2171;SC=CTGAAGGGAACGAAGCTGAAG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=104;WE=22843126;WS=22843108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	22868211	rs361558	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=730;SC=ATGTCACTGTGAAAAACAACC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=22868219;WS=22868201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	22868493	rs361666	G	T	7734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr22	22868497	rs361762	G	C	7769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr22	22868773	rs361737	G	A	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.44;QD=44.46;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr22	22868776	rs362173	G	A	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.44;QD=45.52;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr22	22869123	rs362003	T	C	8301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=111;PP=2965;SC=TAGTAAAAGTTGCTAAGTAAC;SOR=0.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=145;TCR=111;TR=256;WE=22869131;WS=22869113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr22	22869209	rs362124	C	G	11708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.69;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr22	22869218	rs362132	T	C	11590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr22	22869538	rs361611	A	G	6989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.68;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr22	22869545	rs361580	T	G	7448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.55;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr22	22869548	rs362011	T	C	7311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr22	22869649	rs361721	G	C	4409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=64;PP=2622;SC=ACAGAGAAACGGGCATGATGG;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=130;WE=22869657;WS=22869639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	22869742	rs361959	C	A	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=70;PP=2965;SC=TTCTTCTTGACTTTGAGCCTG;SOR=1.114;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=175;WE=22869750;WS=22869732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	22891081	rs2072049	G	T	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=43;PP=1259;SC=AATAGACAAAGCAGTTAGTGC;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=22891089;WS=22891071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	22899234	rs1129172	A	G	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=28;PP=1330;SC=CTTCTTACCCACAAACGCCTT;SOR=0.878;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=65;WE=22899242;WS=22899224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	22899363	rs8139318	GA	AG	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=893;SC=CCAAAAAGAAGAATACATGTA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=22899372;WS=22899353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	22899414	rs2283800	A	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=258;SC=AAACCTCCGCAAATACTGCTG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=22899422;WS=22899404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	22901979	rs113160976	CG	C	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=474;SC=TGAAAGGGGTCGGGGGGGGGA;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=21;WE=22901996;WS=22901969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	22901988	rs28364788	G	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.42;NF=5;NR=20;PP=534;SC=TCGGGGGGGGGACCCCAACAT;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=22901996;WS=22901969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	22930770	rs6002909	A	G	5408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=84;PP=2965;SC=CCTCTGAGCTAATGCTTGGTC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=169;WE=22930778;WS=22930760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr22	22989256	rs2904923	A	G	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=65;NR=48;PP=1992;SC=CCGGTCAGCGAGATCCTGTTC;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=113;WE=22989264;WS=22989246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr22	23010943	rs406876	G	A	4366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=72;PP=2933;SC=CTGGCAATGCGTCCTTTGTCC;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=149;WE=23010951;WS=23010933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	23029263	rs443102	T	C	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=66;PP=2965;SC=TCTCCCCCTCTTCACTCTCTG;SOR=1.050;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=161;WE=23029271;WS=23029253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr22	23029374	rs451369	G	A	5819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=102;PP=2965;SC=AAGCCCAGACGCAGCCTCTGG;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=191;TCF=89;TCR=102;TR=190;WE=23029382;WS=23029364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr22	23029698	rs443756	T	C	6666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=122;PP=2965;SC=AGGCAGAAGATGAGGCTGACT;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=101;TCR=122;TR=223;WE=23029706;WS=23029688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr22	23029846	rs200665672	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.570;NF=6;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=-2.790;SC=AAGCCATGAGTAGGCTTGGCC;SOR=0.370;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=21;WE=23029854;WS=23029836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
chr22	23029871	.	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-5.210;QD=0.89;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,4:0.10:39
chr22	23029876	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=6.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-4.988;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,4:0.11:36
chr22	23040362	rs5996349	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTCTGAGGCAAAGGGGATAAG;SOR=1.302;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=23040370;WS=23040352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr22	23040389	rs6003229	G	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTGGGGCAGGGCCAGTGCTGG;SOR=1.127;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=12;WE=23040397;WS=23040379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr22	23040462	rs1312	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=444;ReadPosRankSum=1.850;SC=TGCTCCTCACTCTCCTCACTC;SOR=0.485;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=36;WE=23040470;WS=23040452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,45:0.38:120
chr22	23040767	rs5751516	G	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.664;NF=17;NR=12;PP=426;ReadPosRankSum=-0.271;SC=ATTTATGAGGGCAGTAAGCGG;SOR=0.754;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=29;WE=23040775;WS=23040757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr22	23055440	rs1008910	C	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=650;ReadPosRankSum=-0.118;SC=GGCCCCAGGACAGACGGCCAG;SOR=0.954;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=43;WE=23055448;WS=23055430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr22	23055752	rs2304533	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=232;ReadPosRankSum=0.983;SC=CCCTCTTGCTCCAGCCCCGGG;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=13;WE=23055760;WS=23055742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	23063547	.	C	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=963;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGCTCCAGCTCAGGAAACACA;SOR=0.903;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=60;WE=23063555;WS=23063537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr22	23063645	rs11090173	T	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=878;ReadPosRankSum=2.454;SC=CCATCTCACATTGACACAGAC;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=56;WE=23063653;WS=23063635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr22	23077258	rs451894	T	C	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.029;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.239;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,60:0.56:108
chr22	23077262	rs451895	T	C	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.975;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr22	23077271	rs392011	A	G	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=4.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-2.342;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,63:0.57:110
chr22	23077555	rs4822296	T	C	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.014;NF=38;NR=45;PP=1338;ReadPosRankSum=0.443;SC=TACTGCAGCTTATATACAAGC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=83;WE=23077563;WS=23077545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,94:0.54:173
chr22	23089759	rs2040563	A	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1145;ReadPosRankSum=1.533;SC=CTGGTTTGAGAGACATCTCTC;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=68;WE=23089767;WS=23089749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,79:0.44:178
chr22	23089826	rs1978004	G	A	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=58;PP=1882;ReadPosRankSum=0.917;SC=GACTGCCCCCGAAAGCCTGAG;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=132;TCR=121;TR=119;WE=23089834;WS=23089816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,146:0.45:325
chr22	23089857	rs2040564	G	A	5414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,144:0.49:296
chr22	23089865	rs2040565	A	G	5353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,139:0.49:284
chr22	23089941	rs3087123	ACT	A	2380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=1870;ReadPosRankSum=1.488;SC=CCCCCTCCTCACTCTCTGCAC;SOR=0.549;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=45;WE=23089950;WS=23089931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr22	23090423	rs34605189	G	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.850;NF=9;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=-2.157;SC=GTGACACAAGGAGACAGGGAA;SOR=0.782;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=29;WE=23090431;WS=23090413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,34:0.36:95
chr22	23090438	rs56223989	A	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.004;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.856;NF=3;NR=20;PP=409;ReadPosRankSum=-1.212;SC=AGGGAAGTGAAACATAAACCC;SOR=1.802;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=23;WE=23090446;WS=23090428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr22	23090468	rs58198190	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=8.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQRankSum=-7.199;QD=5.98;ReadPosRankSum=-3.104;SOR=2.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
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chr22	23101280	rs1894244	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.384;NF=28;NR=12;PP=607;ReadPosRankSum=0.260;SC=GCACAGGTGACGCCTCCAGGG;SOR=1.337;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=40;WE=23101288;WS=23101270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr22	23101301	rs4822305	A	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.819;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.575;NF=34;NR=15;PP=673;ReadPosRankSum=0.958;SC=AAGGGGCTTCAGGGACCTCTG;SOR=1.473;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=49;WE=23101309;WS=23101291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr22	23101347	rs1894245	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.161;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.756;NF=38;NR=30;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CAGGCTCACCGGGGCCCAGCA;SOR=0.793;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=68;WE=23101355;WS=23101337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr22	23101559	rs4134484	G	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.607;NF=20;NR=25;PP=711;ReadPosRankSum=-1.430;SC=TGATTTATGAGGTCAGTAATC;SOR=0.848;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=45;WE=23101567;WS=23101549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr22	23135588	rs2016511	G	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=862;SC=CCCTGTGCAAGGGGCTTCCTG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=23135596;WS=23135578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	23165333	rs201141491	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=266;ReadPosRankSum=-1.987;SC=GGCTCTGCTCCTCCTCACCCT;SOR=0.967;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=18;WE=23165341;WS=23165323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr22	23165839	rs5844528	G	GC	3994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=58;PP=2866;SC=GGGCTCTCAGGCCCCTTCTTG;SOR=0.963;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=69;WE=23165847;WS=23165829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	23223070	rs378183	G	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=864;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CAGGGCCCCCGCCTGTGGTGG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=52;WE=23223078;WS=23223060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr22	23247028	rs464478	A	G	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=12;PP=1476;SC=TCTGTGGGTTAAGTGTGGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=23247036;WS=23247018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	23247082	rs2009433	C	T	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=47;PP=2647;SC=GGACCACTGGCCCCAGCTTCC;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=85;TCR=48;TR=132;WE=23247090;WS=23247072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr22	23248758	rs1059142	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.09;QD=24.40;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	23248839	rs7117	A	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.11;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	23256464	rs463185	G	C	6676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=107;PP=2965;SC=GTGAGGGGACGGAGCTGACCG;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=98;TCR=108;TR=205;WE=23256472;WS=23256454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr22	23260276	rs139283039	GGC	G	376.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.095;NF=22;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=-2.852;SC=GGGGTTGGGGGGCGGGGTGGC;SOR=1.314;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=38;WE=23260287;WS=23260266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr22	23260278	rs59884698	CGG	C	675.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.188;NF=21;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=2.398;SC=GGTTGGGGGGCGGGGTGGCCT;SOR=0.280;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=37;WE=23260287;WS=23260266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr22	23260507	rs410521	T	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=675;SC=CTGGCCCCAATTTCCTCCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=23260515;WS=23260497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	23262162	rs375081	C	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=52;SC=ATCCTCAGTCCACCAGAAACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=23262170;WS=23262152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	23263602	rs373405	C	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=21;PP=1208;SC=CAGCTGACCGCCCTCGGTAAG;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=23263610;WS=23263592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	23263708	rs737885	T	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CCTGTCTGGATGTCTGGAATC;SOR=0.487;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=22;WE=23263716;WS=23263698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr22	23438191	rs1805058	C	T	3460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=89;PP=2299;ReadPosRankSum=1.399;SC=GCGCCTACGACGCTGTGCAGC;SOR=0.999;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=260;TCF=98;TCR=162;TR=136;WE=23438199;WS=23438181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,155:0.53:291
chr22	23478695	rs9612240	C	T	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=27;PP=801;SC=TATCAGGTCCCTGGTCAGGGA;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=23478703;WS=23478685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	23479758	rs34504974	G	GT	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.180;NF=1;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.602;SC=CTTTCCTGCTGTTTTTTTTCC;SOR=0.649;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=7;WE=23479766;WS=23479748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr22	23480962	rs5759598	T	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=318;SC=GCAGCTCAAGTGCATCCACCC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=23480970;WS=23480952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	23482460	rs4822360	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=15;PP=1033;SC=AGGTCACACAAGGCCATGAGG;SOR=1.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=23482468;WS=23482450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	23482718	rs4822361	C	T	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=427;SC=TACTTCTCATCTGATCCTCCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=23482726;WS=23482708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	23482744	rs4822362	C	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=254;SC=TGAGGGCAGGCAAATGGGTAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=23482752;WS=23482734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr22	23498332	rs56254210	G	GAAA	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.809;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
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chr22	23501286	rs2246716	T	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=927;ReadPosRankSum=0.360;SC=GGCAGCTGCCTATCCCCCTGG;SOR=0.524;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=58;WE=23501294;WS=23501276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr22	23502987	rs9612252	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=-0.788;SC=AGGGTAGGCTAGCCTGGCTTT;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=23502995;WS=23502977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr22	23503121	rs5759611	G	A	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=967;ReadPosRankSum=-1.299;SC=TCGAGCAGTCGGTGCTGCAGG;SOR=0.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=83;TCR=33;TR=56;WE=23503129;WS=23503111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,72:0.53:137
chr22	23503170	rs5759612	A	G	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1044;ReadPosRankSum=0.164;SC=CCAGGTCGGCAATGGAGACCT;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=70;WE=23503178;WS=23503160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,77:0.44:175
chr22	23503205	rs5759613	G	C	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=935;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GGTGTGACTGGGTTGGGCTGG;SOR=0.679;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=69;TCR=79;TR=73;WE=23503213;WS=23503195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,82:0.45:182
chr22	23503266	rs5759614	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=719;ReadPosRankSum=1.234;SC=GTCACCTGAGGCCTTGCCATT;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=48;WE=23503274;WS=23503256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr22	23503319	rs5759615	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=0.224;SC=CCCTCCTCTCAGGGTGTCACT;SOR=0.350;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=26;WE=23503327;WS=23503309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr22	23503382	rs5759616	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.061;SC=CAGACACCCTCCCTAGCCCTC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=23503390;WS=23503372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr22	23503533	rs5759617	G	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=0.394;SC=GTGCCTGGAAGGCCCTCTCTT;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=23503541;WS=23503523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr22	23503580	rs9608085	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GAACAGCAGGCCCAGAAGCTT;SOR=0.484;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=32;WE=23503588;WS=23503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr22	23503651	rs713682	C	T	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1361;ReadPosRankSum=0.023;SC=TACAGGATTCCTGGTTGATGC;SOR=0.635;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=81;WE=23503659;WS=23503641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,109:0.59:186
chr22	23503756	rs737818	G	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=39;PP=917;ReadPosRankSum=0.073;SC=TGCTAACTGGGGCCTGCGTGG;SOR=1.183;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=48;WE=23503764;WS=23503746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr22	23503819	rs737819	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.975;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=153;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GACTGTGGTGTGGAGACTGGA;SOR=2.833;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=13;WE=23503827;WS=23503809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	23504862	rs5759619	C	T	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1239;ReadPosRankSum=-0.382;SC=AGCCCCAGGCCCCTGTCACCT;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=192;TCF=111;TCR=81;TR=85;WE=23504870;WS=23504852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,106:0.46:231
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chr22	23504959	rs5759621	C	T	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.065;SC=ATCAGTACTGCTCTCCTAGGG;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=155;TCF=61;TCR=94;TR=71;WE=23504967;WS=23504949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,74:0.44:169
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chr22	23505101	.	C	CT	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5298;HP=14;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=20;MQ=57.74;NF=0;NR=4;PP=41;QD=11.25;SC=ATATAAATGACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=23505109;WS=23505091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr22	23541488	rs2071436	C	T	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GAGGAAGCATCGGAGACTGGG;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=47;TCR=95;TR=83;WE=23541496;WS=23541478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,91:0.54:168
chr22	23585132	rs1004040	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=0.353;SC=CCTGGTGACAACATCTCTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=20;WE=23585140;WS=23585122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr22	23596756	rs11435513	G	GC	1726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GTGGACCCACGCCCCCCCTCA;SOR=0.893;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=13;TCR=98;TR=46;WE=23596764;WS=23596746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr22	23610878	rs9612268	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TGCGCAGACCGAAGGAGCAGC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=23610886;WS=23610868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	23613539	rs9608093	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CATCCAGGGCATCCTGCGTGC;SOR=1.402;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=22;WE=23613547;WS=23613529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr22	23626081	rs8139664	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GGGTCAACCTGCTCCTGCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=23626089;WS=23626077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr22	23627369	rs140504	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=642;SC=CAGATCAAGAATGACATCCAG;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=23627377;WS=23627359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	23627441	rs131675	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=295;SC=GTGGCAGCAGTCCCCGCACAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=23627449;WS=23627431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	23629552	rs5759681	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=0.303;SC=TTCACTTGGATGCGCCCCACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=23629560;WS=23629542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr22	23631639	rs11090228	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.095;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=537;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GGAGGTCCAGTGGGAGGGGCC;SOR=0.390;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=36;WE=23631647;WS=23631629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr22	23631801	rs2227939	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr22	23631813	rs113087899	G	GC	1153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr22	23631823	rs62219796	T	C	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.30;ReadPosRankSum=-1.285;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr22	23632513	rs16802	A	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=604;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GACCTCTTTGATCTCTTGCGC;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=39;WE=23632521;WS=23632503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr22	23632621	rs9608101	G	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=602;ReadPosRankSum=0.327;SC=GTTTGGGGAGGAGGGTTGCAG;SOR=1.402;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=33;WE=23632629;WS=23632611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,42:0.40:104
chr22	23632636	rs5759683	C	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=597;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TTGCAGCGGCCGAGCCAGGGT;SOR=0.897;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=33;WE=23632644;WS=23632626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr22	23632665	rs131677	C	A	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=43;PP=1505;SC=AGGAAGGACTCATCGGGCAGG;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=23632673;WS=23632655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	23632777	rs112463208	G	GT	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=-0.997;SC=GTGTGGAATTGTTTTTCCCGG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=23632785;WS=23632767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr22	23637200	rs2239666	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=325;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CCTTCTCCCTTGGGGCTGCAG;SOR=0.416;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=25;WE=23637208;WS=23637190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr22	23656148	rs66569843	T	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CCCACCGCCTTCTGCAGCTCT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=23656156;WS=23656139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr22	23657477	rs180810	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.560;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=1.904;SC=CCCCACCCCCATCTCACTGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=23657485;WS=23657467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr22	23657495	rs180811	C	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GTAAGGGGTTCATGACACCAG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=9;WE=23657503;WS=23657485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr22	23982775	rs12627958	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.576;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.561;NF=26;NR=36;PP=797;ReadPosRankSum=-0.915;SC=CAGCATATGTCCCCCTCTCTG;SOR=1.033;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=62;WE=23982783;WS=23982765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
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chr22	24035970	rs2070446	C	T	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=1029;ReadPosRankSum=-2.000;SC=GGTGGTGCTCCACGAATGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=61;WE=24035978;WS=24035960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr22	24038847	rs1007298	T	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=425;ReadPosRankSum=0.393;SC=CCCCAGAGAGTCCAGATGAGG;SOR=0.943;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=25;WE=24038855;WS=24038837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr22	24106674	rs140181	G	A	5779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=79;PP=2965;SC=GGCCCTGTCCGGCCTCCCACC;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=173;WE=24106682;WS=24106664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr22	24108288	rs140182	C	G	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=53;NR=54;PP=1876;SC=TCCCCCTCCCCGCCTGAGTCG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=107;WE=24108296;WS=24108267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	24108412	rs80027270	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=353;SC=GCCTGATCTCGTAGGCGCAGG;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=24108420;WS=24108402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	24109550	rs131444	T	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=345;SC=TCTCTTGGACTCGCTGCTCAC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=24109558;WS=24109540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	24109774	rs179468	T	G	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=4;NR=5;PP=158;SC=AGGGCGCGGCTGGGCGGCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=24109782;WS=24109764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	24121378	rs738792	C	T	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=42;PP=1726;SC=GCCTAGGACGCCCACCACCTC;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=24121386;WS=24121368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	24122499	rs9612427	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=4;PP=585;SC=CTCAGCCATCGGGGGCTGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=24122507;WS=24122489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	24125565	rs2877173	G	A	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=40;PP=2381;SC=CCCAGTGTCCGCTCGCCCAGG;SOR=1.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=122;WE=24125573;WS=24125555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr22	24129553	rs55705149	GGC	G	1126.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.79;QD=36.35;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	24143502	rs738797	C	G	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=90;PP=2897;SC=CTCTCTGGCCCCTCAAGTGGA;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=141;WE=24143510;WS=24143492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr22	24145395	rs5760030	A	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=12;PP=1438;SC=GGTTTGCAGAAGCCTGCTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=24145403;WS=24145385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	24145675	rs5751738	G	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=246;SC=GAACAGTCCCGTTTCCTGCCA;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=24145683;WS=24145665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	24176677	rs5030614	GCAACAGGTCATGTTCAATTTCTT	G	1116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,35:0.25:142
chr22	24176959	rs35305666	CA	C	3308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=31;PP=2376;SC=AGGCTCAGGGCAAGAGGCTCT;SOR=1.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=57;WE=24176967;WS=24176949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	24179724	rs2070462	G	C	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=192;SC=GCAGGAAGATGGGGATGGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=24179732;WS=24179723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	24180992	rs369579523	G	C	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=834;ReadPosRankSum=-0.650;SC=GTCAAGAGCTGCCCGGGAGCC;SOR=0.682;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=56;WE=24181000;WS=24180982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr22	24199248	.	A	AGT	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.76;ReadPosRankSum=-2.350;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,25:0.83:30
chr22	24199764	rs11393545	A	AC,ACC	88.82	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5738;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=80;SC=GTGACCCCAAACCCCCCCCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=24199772;WS=24199754;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:6
chr22	24204158	rs2275979	A	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=1;PP=266;SC=TCTGTGCCTCACTTTCCTCAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=24204166;WS=24204157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	24284825	rs6003982	C	G	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=29;PP=1837;SC=CTCAACAGCTCCAAGCTAGCT;SOR=1.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=24284833;WS=24284815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	24285057	rs201546417	TAAAACAAAAACA	T	1444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=2988;SC=AAGGAAATACTAAAACAAAAA;SOR=2.899;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=19;WE=24285076;WS=24285047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	24325006	rs200925305	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.59;MQRankSum=-2.362;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	24325024	rs201723657	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.59;MQRankSum=-2.362;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	24325047	rs149686121	C	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.59;MQRankSum=-2.362;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	24340851	rs7291160	G	C	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=47;PP=1769;SC=AAAGAGGCCAGAGCCAATATT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=87;WE=24340859;WS=24340841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	24340938	rs140290	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=30;PP=981;SC=CATGGGCTGTAGATAGACGAA;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=24340946;WS=24340928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	24452885	rs2070467	A	G	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=52;PP=1413;SC=TACACCATCAATAACATTTCT;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=24452893;WS=24452875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	24459438	rs762273	T	C	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=71;PP=2965;SC=CTCGGAACTGTCCTGCTGGTA;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=101;TCR=71;TR=172;WE=24459446;WS=24459428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr22	24472270	rs2283807	A	G	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=46;PP=1281;SC=CTGCCAGTGCAGGGCAGGGCT;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=24472278;WS=24472260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	24480503	rs4820581	G	A	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=42;PP=2928;SC=TGAATGTGTTGCTAATCTGCC;SOR=1.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=104;TCR=42;TR=146;WE=24480511;WS=24480493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr22	24492061	rs2236622	T	C	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=47;PP=1573;SC=TAGCACCCTTTAGGCGACCCC;SOR=1.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=24492069;WS=24492048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	24578987	.	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQRankSum=-4.382;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.271;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr22	24578995	rs62231980	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQRankSum=-5.196;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr22	24579049	rs62231981	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.900;NF=18;NR=6;PP=339;ReadPosRankSum=0.334;SC=TGCTCCATGCGCTGTGGCGCC;SOR=0.715;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=24;WE=24579057;WS=24579039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr22	24579157	rs200945728	GA	TC	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.751;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.065;NF=11;NR=16;PP=768;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CCCTACTCAGGATCCATGATG;SOR=0.951;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=27;WE=24579166;WS=24579147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chr22	24621491	rs12627971	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=54;PP=2613;SC=TTGTGGACCCCGGGTGGGAAG;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=24621499;WS=24621481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr22	24622648	rs2275984	T	C	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=59;PP=2872;SC=CCTCTGCCCCTTGGCAAACTT;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=148;WE=24622656;WS=24622638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	24627309	rs12159878	C	T	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	24629380	rs9624434	C	T	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=134;SC=ACAGCCTGTCCGTGAGGCGCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=24629388;WS=24629370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	24717518	rs3747113	G	A	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=65;PP=2564;SC=ATCTTCTCACGCTGGCAAAAA;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=118;WE=24717526;WS=24717508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	24717850	rs204710	A	G	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=82;PP=2965;SC=ATCACCCCTGATAACCAGAGC;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=24717858;WS=24717840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr22	24730587	rs5760351	C	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=748;SC=CGGTTGTGTTCACTTACCTTA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=24730595;WS=24730577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	24761467	rs204718	G	A	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=37;PP=2032;SC=TAGTGAAGAAGTGAAACGGGA;SOR=1.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=91;WE=24761475;WS=24761457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	24808435	rs743363	G	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=667;SC=GAGGGTGGCCGGGCCTAGTGC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=24808443;WS=24808425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	24837301	rs5751876	T	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=56;PP=1869;SC=CCAATGGCTATGCCCTGGGGC;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=91;WE=24837309;WS=24837291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr22	24891292	rs2070474	C	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=4;PP=1081;SC=GGGCGCCTGACCGGGCCTGGG;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=24891300;WS=24891282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	24898310	rs2232866	C	T	7573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=143;PP=2965;SC=GAAAGTTCTCCGTCCACATCA;SOR=1.137;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=91;TCR=143;TR=233;WE=24898318;WS=24898300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr22	24936970	rs9704	A	G	6585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=95;PP=2965;SC=CTATTCTAACAATTTTACCAG;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=88;TCR=95;TR=183;WE=24936978;WS=24936960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr22	24938908	rs8139822	A	G	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=10;PP=866;SC=GGGCCAGGGCATCCTGAGCGG;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=24938916;WS=24938898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	24944053	rs4822506	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=34;PP=998;SC=TGCAGGTAGACGAGCTGGGGA;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=24944061;WS=24944043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	24944782	rs1003580	A	G	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=12;PP=881;SC=AGCCCCAACCAAAGATAGCTA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=24944790;WS=24944772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	24953479	rs11427005	C	CT	202.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5346;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AGGAGCTGAGCTTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=24953487;WS=24953469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr22	24953571	rs5760472	A	G	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=36;PP=2129;SC=GATGTGTGCCACATGCCTTTT;SOR=1.951;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=117;WE=24953579;WS=24953561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	24964128	rs4597	T	C	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=50;PP=1585;SC=GAAAAGCTGCTATTCTCAAGG;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=24964136;WS=24964118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr22	25124095	rs738827	C	T	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=37;PP=2324;SC=AAGAGAATCTCAAGTTTTATT;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=101;WE=25124103;WS=25124085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr22	25129964	rs5760612	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=323;SC=CAGGAAACCAACAACAACATT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=25129972;WS=25129954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	25145453	rs1892723	C	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=62;PP=1853;SC=AATTCTTTCACAATGCTATAA;SOR=2.128;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=20;TCR=62;TR=82;WE=25145461;WS=25145443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	25145471	rs1892722	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TAATCTTTACATATTTCATCT;SOR=1.230;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=30;WE=25145479;WS=25145461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr22	25151638	rs6004259	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=714;ReadPosRankSum=1.238;SC=ACTCTCTTAATACATGAGGAC;SOR=0.274;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=39;WE=25151646;WS=25151628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr22	25151890	rs5760623	CA	AC	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=7.974;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-1.370;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.343;SOR=3.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr22	25158326	rs5751975	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=449;ReadPosRankSum=0.797;SC=GTACAGGCACATATCTCTTGC;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=40;WE=25158334;WS=25158316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr22	25158532	rs56274547	G	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GAGTTGCCTGGTGTCTTACTC;SOR=0.624;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=32;WE=25158540;WS=25158522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr22	25158597	rs738822	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=218;ReadPosRankSum=-1.346;SC=TAAAGGAAGAGGTGTGTTTGG;SOR=0.465;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=16;WE=25158605;WS=25158587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr22	25282765	rs139719	T	C	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=46;PP=1080;SC=GGCTGGGGAGTGCTGGTTCCA;SOR=1.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=60;WE=25282773;WS=25282755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	25297755	rs139738	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=424;ReadPosRankSum=0.022;SC=ACTTAGATGTGATTTTTCATT;SOR=0.277;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=33;WE=25297763;WS=25297745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr22	25315753	rs5752018	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr22	25334037	rs10658230	C	CTCATTCAT	1947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=999;ReadPosRankSum=0.961;SC=TGCTCACAGACTCATTCATTC;SOR=0.389;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=15;WE=25334045;WS=25334027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr22	25466553	rs6004423	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=244;ReadPosRankSum=-0.738;SC=AAAAGGAAACGGGCTTGGTTT;SOR=1.038;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=10;WE=25466561;WS=25466543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr22	25577554	rs9612886	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=415;ReadPosRankSum=0.576;SC=AGCGTCTTCTGTGCAGGTCTG;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=25;WE=25577562;WS=25577544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr22	25577688	rs763279	G	A	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1600;ReadPosRankSum=2.267;SC=CCAGGAAGGAGGAGTCGGATG;SOR=0.546;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=93;TCR=107;TR=103;WE=25577696;WS=25577678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,127:0.55:232
chr22	25577733	rs9612887	T	C	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=51;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.652;SC=AGAGGACCCCTGTCAGCCATC;SOR=0.782;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=52;TCR=96;TR=77;WE=25577741;WS=25577723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,92:0.55:166
chr22	25577846	rs6004466	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-2.707;SC=ACCTTAGCAGTGTAAAGAATA;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=25577854;WS=25577836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	25586564	rs713707	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=641;ReadPosRankSum=0.690;SC=GCTTGCCCCAACCCCGCCTGG;SOR=0.484;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=31;WE=25586572;WS=25586554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr22	25601076	rs150956294	G	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AGCAGGTTTGGGGGTGGGTGT;SOR=0.379;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=27;WE=25601084;WS=25601066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr22	25617602	rs739315	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.054;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=-0.732;SC=ACACAGTTGGAGCTGATACTG;SOR=0.230;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=20;WE=25617610;WS=25617592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr22	25624049	rs5760923	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.001;NF=4;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-2.157;SC=ACCAGGAAGGGGCCCGCCCCT;SOR=0.606;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=23;WE=25624057;WS=25624039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr22	25625554	rs55700037	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.379;NF=18;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=0.499;SC=ACGTAAGTGCGTTGCCAGCCC;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=40;WE=25625562;WS=25625544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr22	25713933	rs133156	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.43;QD=29.52;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	25714218	rs2072869	A	T	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=70;PP=2947;SC=TGCCCCTCACACCCAGCAGGT;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=135;WE=25714226;WS=25714208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr22	25716068	rs133162	C	G	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.63;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	25750814	rs141812512	C	CAGGGCA	2523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=38;PP=2616;SC=CTGGATGGGCCAGGGCCATGC;SOR=2.428;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=40;WE=25750822;WS=25750804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	25753231	rs133194	G	A	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1205;SC=CCTCGATCTTGTCTGTCTTGG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=25753239;WS=25753221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	25853368	rs6423498	T	C	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.331;NF=21;NR=34;PP=638;ReadPosRankSum=1.784;SC=CGGAGTGGCATGTAAGTGCAT;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=55;WE=25853376;WS=25853358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr22	26157068	rs61734946	C	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=926;ReadPosRankSum=1.069;SC=GCATGGCCATCTCATCACGCC;SOR=0.545;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=56;WE=26157076;WS=26157058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
chr22	26157144	rs17623980	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=522;ReadPosRankSum=-0.715;SC=GCAGGGACTGACTCGACCCTC;SOR=0.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=26;WE=26157152;WS=26157134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr22	26159129	rs133884	C	CTT	1982.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=1269;ReadPosRankSum=0.974;SC=CCATCACAAACTTTGAAGGGC;SOR=0.502;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=32;WE=26159137;WS=26159119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,53:0.58:91
chr22	26159289	rs133885	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=356;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CTGGTCCGGGGGACTGAAAAA;SOR=0.760;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=20;WE=26159297;WS=26159279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr22	26163996	rs133901	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=295;ReadPosRankSum=0.248;SC=AAGTGAACAATGAAATGAATG;SOR=1.270;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=20;WE=26164004;WS=26163986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr22	26164079	rs133902	C	T	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1220;ReadPosRankSum=0.829;SC=TTCTTTCTCCCAGATCCCAGA;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=73;WE=26164087;WS=26164069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,96:0.59:164
chr22	26166011	rs133903	C	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GAGAAACCCCCGTGTAAGGTA;SOR=0.481;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=15;WE=26166019;WS=26166001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr22	26166900	rs3859866	G	C	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=42;PP=1457;SC=TGAGACTTTGGATTGATGCTG;SOR=1.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=26166908;WS=26166890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	26173661	rs5761170	T	C	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=1076;SC=GGCCCTGGGCTGGAGTGGCGC;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=26173669;WS=26173651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	26177593	rs28729695	G	A	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=0;PP=278;SC=AAAAAAAAAAGAGTGGATCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=26177601;WS=26177585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	26181594	rs13053299	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=441;SC=GTGGAAGAGTTGGCACTGCCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=26181602;WS=26181584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	26193824	rs2877299	C	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=738;SC=AAATGACCCCCGCATTCCTTC;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=26193832;WS=26193814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	26193982	rs738642	C	G	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=63;PP=2328;SC=TGGAGATGCTCGGCATCTCAG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=116;WE=26193990;WS=26193972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr22	26194045	rs738643	T	C	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=61;PP=1499;SC=ACCACCTGGGTGCGGCGGGGG;SOR=1.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=86;WE=26194053;WS=26194035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr22	26194093	rs738644	G	A	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=30;PP=882;SC=GCTCACCTGGGAGGGCAGCTG;SOR=1.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=42;WE=26194101;WS=26194083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	26219412	rs5752226	T	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=6;PP=1426;SC=TCCTCTCGGGTGTTCATTCAC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=56;WE=26219420;WS=26219402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	26219605	rs4820658	G	A	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=77;PP=2005;ReadPosRankSum=1.363;SC=TGACGTTTGGGCCAAGCCGAT;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=254;TCF=101;TCR=153;TR=131;WE=26219613;WS=26219595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,154:0.54:286
chr22	26222505	rs2331162	G	A	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=801;SC=TTGGCCTCTTGCAGGTGCACA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=26222513;WS=26222495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	26228757	rs35045598	TA	T	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=336;ReadPosRankSum=-1.001;SC=TGCCAAAATTTAAAAAAACGA;SOR=0.674;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=18;WE=26228765;WS=26228747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr22	26228797	rs3859879	A	G	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr22	26228797	.	ATCCTCTCC	GTCCTCTCC,GTCCTCTCT	988	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=64,22;NR=42,15;PP=988,463;QD=9.64878502403;SC=GGTGATGGAAATCCTCTCCGC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106,37;WE=26228813;WS=26228787;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:106
chr22	26228805	rs11090413	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr22	26239850	rs5761268	C	A	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=49;PP=1437;SC=AGGTCCTGCACCAGTCAAAAA;SOR=1.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=68;WE=26239858;WS=26239840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	26239906	rs5761269	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=523;SC=CATTGGAGGCACTGTGTTTTC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=26239914;WS=26239896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	26239950	rs5761271	A	G	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=196;SC=ACTACAACACAGTGTGGGAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=26239958;WS=26239940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	26241928	rs2072011	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=260;SC=GGGAGCAGCTGGGACACATGA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=26241936;WS=26241918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	26241994	rs2072012	T	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=12;PP=565;SC=CTTGTTCCCTTTGCCACCACC;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=26242002;WS=26241984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	26273789	rs5761293	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=308;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TTATTTGTTATAGTCACCATT;SOR=0.265;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=20;WE=26273797;WS=26273779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr22	26273834	rs4822666	A	C	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr22	26273834	.	ACG	CCT	1608	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=29;NR=16;PP=1608;QD=36.9215083303;SC=ATTCCTCCTAACGGAAACTTT;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=45;WE=26273858;WS=26273824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr22	26273836	rs4822667	G	T	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr22	26273850	rs695428	G	C	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=37;PP=2335;SC=ACTTTGTGCCGTTTGCTCACT;SOR=1.386;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=104;WE=26273858;WS=26273824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	26273889	rs5752240	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=2163;ReadPosRankSum=0.300;SC=TAATCTCTGGCCTGGAATGGT;SOR=0.964;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=59;WE=26273901;WS=26273879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr22	26273893	rs4822668	G	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=2303;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CTCTGGCCTGGAATGGTTTCT;SOR=0.456;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=64;WE=26273901;WS=26273879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr22	26298754	rs2072016	G	A	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=27;PP=911;SC=GCTAAATCTCGGGAAACTGCA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=26298762;WS=26298744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	26298874	rs2072017	T	C	198.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=145;SC=TGGTGGCTGGTAAATTGATAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=26298882;WS=26298864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	26298891	rs5761306	T	G	198.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=78;SC=ATAATCAGACTTTGAGCAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=26298899;WS=26298881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	26317078	rs117544445	G	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=1.510;SC=AGGAAACTGAGGCTCGGAGAG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=26317086;WS=26317068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	26317155	rs739284	A	G	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.80;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	26317155	.	ATTCCG	GTTCCA,GTTCCG	510	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24,50;NR=6,18;PP=493,510;QD=18.2155958287;SC=AGGGAACCTGATTCCGGAAAA;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=30,68;WE=26317168;WS=26317145;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.43:69
chr22	26317160	rs739285	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.494;SOR=1.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr22	26342056	rs4820662	C	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.48;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	26343805	rs2072007	A	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=30;PP=1126;SC=GTAGTGAATGAGACCTTGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=60;WE=26343813;WS=26343795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	26346311	rs10600754	AT	A	1826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.37;SOR=1.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	26346484	.	A	ATGTGTGTGTATGTGTG	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.69;QD=42.90;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	26388337	rs916425	C	T	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1373;ReadPosRankSum=1.306;SC=AGGAGAAGTACGTGGAGGAAC;SOR=0.959;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=167;TCF=93;TCR=74;TR=78;WE=26388345;WS=26388327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr22	26388548	rs9613067	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CTGGGGCCACATTCACTGGGA;SOR=1.042;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=13;WE=26388556;WS=26388538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr22	26688292	rs11702954	A	C	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=948;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CGCCCTTAGGAGGGCCACCCT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=71;WE=26688300;WS=26688282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr22	26688388	rs35377445	A	C	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1228;ReadPosRankSum=-1.876;SC=TTCCCGAGGGAGATGCTAGCC;SOR=0.687;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=87;WE=26688396;WS=26688378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,110:0.46:237
chr22	26769234	rs1076660	T	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CTTCTCTTGGTAACTTAGGAA;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=26769242;WS=26769224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	26769539	rs1076661	A	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTATTTAGACACTTAAAAAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=26769547;WS=26769529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr22	26777795	rs482902	A	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=1.655;SC=ACAGACGGGCACAGTGGCATT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=10;WE=26777803;WS=26777785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr22	26830478	rs3788398	A	G	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=69;PP=2143;SC=GTATGTTGCAAGGACAGGGGT;SOR=1.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=100;WE=26830486;WS=26830468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr22	26853905	rs1894704	C	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=40;PP=1182;SC=AGCGGCGATCCTGCGGGGTGG;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=26853913;WS=26853895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	26853980	rs1894705	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=245;SC=AGTTACCTTCTGCCCTCCCAC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=26853988;WS=26853970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	26854441	rs1894706	G	A	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=55;PP=2406;SC=CGGTCGTAATGTGTGAAGTTG;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=26854449;WS=26854431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr22	26854682	rs4822722	T	C	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=204;SC=CAGTGCTTTGTGAGACCGAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=26854690;WS=26854672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr22	26862153	rs739289	C	A	5478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=107;PP=2965;SC=CATAAAAGACCGCCGTTCTCA;SOR=1.301;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=60;TCR=107;TR=167;WE=26862161;WS=26862143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr22	26862212	rs713998	T	C	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=52;PP=1775;SC=CGGGGCATCCTCTCCCGTAGG;SOR=1.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=26862220;WS=26862202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	26864658	rs739290	A	G	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=86;PP=2752;SC=AATTTTAAAGATGCCTAACAG;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=60;TCR=86;TR=146;WE=26864666;WS=26864648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr22	26867490	rs5761549	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=0.701;SC=TGGAGCCTCCGGAGCTGCTGA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=26867498;WS=26867480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr22	26877539	rs739291	C	T	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=460;SC=CGATGGCTCACGTGCTTGATT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=26877547;WS=26877529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	26879823	rs968425	C	A	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=195;SC=GATGACGTGCCGAGTGCGCCG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=26879831;WS=26879813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	26879946	rs66831137	GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA	G	1778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=2974;SC=CGCGGCGGAGGGAGGCGGCGC;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=17;WE=26879974;WS=26879936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	26882142	rs5761561	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.675;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AACGCCGCCCGCCCCTTACAG;SOR=2.303;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=10;WE=26882150;WS=26882132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr22	26884039	rs4820682	G	A	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=19;PP=1552;SC=ACAACTGAAGGCCCCTGTGGG;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=70;WE=26884047;WS=26884029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	26886953	rs34878449	GT	G	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=7;PP=805;SC=TAATCATGGTGTTTTTTTTTT;SOR=3.334;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=43;WE=26886961;WS=26886943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	26887099	rs4820683	T	A	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=87;PP=2610;SC=AATTCTATCTTTCTTTACAGG;SOR=0.926;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=62;TCR=90;TR=149;WE=26887107;WS=26887089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr22	26887829	rs1045523	A	G	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=123;SC=GCATTGTCCCATTTTACATCC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=26887837;WS=26887819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	26894985	rs2187956	C	T	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=46;PP=1850;SC=GGCTCTCCAGCCCTCCCTGCC;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=26894993;WS=26894975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	26895061	rs2157586	G	A	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=35;PP=1505;SC=GATTTTCCCAGCAACTCACTT;SOR=0.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=69;WE=26895069;WS=26895051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	26895337	rs1008530	G	A	8214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=118;PP=2965;SC=TCTCCAGCTCGTGGAAGAGGT;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=150;TCR=118;TR=268;WE=26895345;WS=26895327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr22	26899474	rs134136	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr22	26906089	rs34002213	G	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=138;ReadPosRankSum=0.230;SC=ACACCCCGTAGGTGGCTTCTT;SOR=0.093;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=12;WE=26906097;WS=26906079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr22	26924149	rs2283821	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=639;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CCAGAAGCAGCGGGAACCCCC;SOR=0.488;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=40;WE=26924157;WS=26924139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr22	26924312	rs2283822	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=409;ReadPosRankSum=1.108;SC=CTCAGCATCACTGAGTCATGC;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=24;WE=26924320;WS=26924302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr22	26924336	rs2283823	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-1.730;SC=TGCTTATTCACGTAGTATTTA;SOR=0.475;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=14;WE=26924344;WS=26924326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr22	26932150	rs3752523	G	A	4908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=77;PP=2965;SC=CAGATGACCAGGAATTGAGAG;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=139;WE=26932158;WS=26932140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	26937327	rs4822735	C	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=34;PP=2096;SC=CCTCGGGGTGCGCGTCCAGCA;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=87;WE=26937335;WS=26937317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	26951317	rs28402932	A	G	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=5;PP=102;SC=GAATGCAATCATCGTGGAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=26951325;WS=26951307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	27004089	rs5761626	A	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=56;PP=1706;SC=AGCCCTGAGGACAGTAGGAAA;SOR=3.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=65;WE=27004097;WS=27004079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	27019128	rs2071860	C	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=22;NR=5;PP=442;SC=GATCCTGGGGCGAGCCCCCAA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=27019136;WS=27019118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr22	28293980	rs738451	G	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=239;ReadPosRankSum=-0.159;SC=AAGGTGACCAGGTTCTAAGTC;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=22;WE=28293988;WS=28293970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr22	28316591	rs75321888	T	TG	2382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=1196;SC=AGGCAGTCCCTGGAGTCACCG;SOR=1.263;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=29;WE=28316599;WS=28316581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	28386620	rs470100	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
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chr22	28693496	rs5762549	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=218;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TTGCATATTATTCTCATTCAT;SOR=0.435;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=17;WE=28693504;WS=28693486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
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chr22	29108082	rs142417218	G	GTATTAGAATTTACAGACATTCCA	739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr22	29108112	rs16986640	A	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.512;SOR=1.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr22	29126347	rs200932714	GAAAGGA	G	2859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.040;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.540;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr22	29126617	rs189426023	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AGGCCGAGGCGGGTGGATCAC;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=29126625;WS=29126607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr22	29130458	rs1805129	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=655;ReadPosRankSum=-0.252;SC=GCTCCTCAGGTTCTTGGTCCT;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=36;WE=29130466;WS=29130448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr22	29137944	rs2236142	G	C	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=9;PP=1300;SC=GTTTAGAAGGGAGAGCGGAAC;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=29137952;WS=29137934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	29179739	rs2347447	C	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=1.242;SC=TCTCCTGATCCCCAGGCAATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=29179747;WS=29179729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	29196494	rs5762809	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=496;ReadPosRankSum=-0.373;SC=GGGTTCGGCGCGGCTGCCACC;SOR=0.509;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=37;WE=29196502;WS=29196484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr22	29279991	rs1065497	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=568;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CCTACACCACCGGCCTCACGG;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=43;WE=29279999;WS=29279981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
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chr22	29414001	rs2347790	A	G	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTATGCCTTAACTTTTCAGAA;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=36;TCR=94;TR=65;WE=29414009;WS=29413991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr22	29438327	rs12484832	A	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=0.443;SC=TATAGATGGGAAAATTGAGGA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=29438335;WS=29438317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	29439201	rs9613785	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=263;ReadPosRankSum=0.047;SC=CAGGTATTCAGTGTTCCTTCC;SOR=0.407;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=22;WE=29439209;WS=29439191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr22	29440692	rs713834	A	C	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=30;PP=2023;SC=TTATCCTGACAAAGCCAAGAT;SOR=1.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=96;WE=29440700;WS=29440682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	29446611	rs5997435	A	C	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=60;PP=2693;SC=CCGAGGAACCACCGCCCGGCT;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=122;WE=29446619;WS=29446601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
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chr22	29449477	.	A	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=47;QD=40.8856062736;SC=GGCCTGCCACATGCTGGGGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=2;WE=29449489;WS=29449467;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
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chr22	29692488	rs140065	G	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
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chr22	29693990	rs3747142	A	G	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AGTACACTTCATACCCTTGAG;SOR=1.205;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=63;WE=29693998;WS=29693980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
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chr22	29711251	rs2519485	T	C	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=72;PP=2186;SC=GCCGGCGCTGTCGCTCCCCGC;SOR=2.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=21;TCR=72;TR=93;WE=29711259;WS=29711241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	29725893	rs2071578	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=591;SC=AGAAGCAGAGTTTGGGGCTGT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=29725901;WS=29725883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr22	29727886	rs2857465	T	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=22;NR=47;PP=1102;SC=TGGAGGGGGGTGGCGGGGGCC;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=29727894;WS=29727876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
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chr22	29746253	rs737883	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.444;SC=ACCTTCCTCATCACAGTGGGA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=29746261;WS=29746243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	29755888	rs2072051	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=47;PP=1843;SC=AGAGGTATACTAGCTTCTTCA;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=29755896;WS=29755878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr22	29759188	rs6006105	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.08;MQRankSum=-0.366;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr22	29763074	.	C	T	650	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=42.67;NF=18;NR=1;PP=650;QD=36.0405901341;SC=AAGCTCTAGGCCATTCCTGCC;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=19;WE=29763095;WS=29763064;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr22	29802801	rs141826381	C	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQRankSum=-6.585;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr22	29819004	rs3044108	CAT	C	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.85;MQRankSum=0.366;QD=12.97;ReadPosRankSum=-2.450;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr22	29833639	rs174718	C	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.376;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.266;NF=9;NR=12;PP=367;ReadPosRankSum=0.537;SC=ACCAATAAAACGCCCTCATGT;SOR=0.673;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=21;WE=29833647;WS=29833629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
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chr22	29835060	rs16987627	T	C	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.526;NF=37;NR=62;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CAGGCCCAGTTGGCAGCTAGA;SOR=0.958;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=192;TCF=79;TCR=113;TR=99;WE=29835068;WS=29835050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,118:0.53:223
chr22	29837884	rs12484086	C	T	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.556;NF=37;NR=46;PP=1218;ReadPosRankSum=-1.291;SC=CCGCAAGTTACAGCGAGTGGG;SOR=0.562;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=218;TCF=92;TCR=126;TR=83;WE=29837892;WS=29837866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,98:0.41:238
chr22	29881828	rs165734	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=675;ReadPosRankSum=0.259;SC=TAGAGATAGCCGCTTACAGGT;SOR=0.592;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=45;WE=29881836;WS=29881818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr22	29881884	rs4823040	G	A	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=36;PP=1050;SC=TTGTGTTCCTGCGAGACGCTA;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=29881892;WS=29881874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	29885567	rs147489453	A	AAAGTCCCCTGAGAAGGCC	1496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.94;MQRankSum=3.085;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,67:0.34:195
chr22	29885861	rs165923	T	C	7918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=125;PP=2965;SC=AGGAAGAAGCTAAGTCCCCAG;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=112;TCR=127;TR=236;WE=29885869;WS=29885851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr22	29886043	rs165602	A	C	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=979;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CCCCTGAAGGAGGATGCCAAG;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=58;WE=29886051;WS=29886033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr22	29886413	rs165625	A	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=21;PP=784;SC=AGACAGAGGTAGCCAAGAAGG;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=29886421;WS=29886403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	29886893	rs1061373	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=0.588;SC=CCTGCCCCCAGGCCCTCCCCA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=29886901;WS=29886883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr22	29908154	rs2007668	G	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=2.124;SC=GGGGAAATGCGCAGTTCTAAG;SOR=0.869;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=26;WE=29908162;WS=29908144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr22	29912885	rs12161054	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=1.062;SC=TTGCTGAACAGGCTCTCACGA;SOR=0.593;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=8;WE=29912893;WS=29912875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr22	29913272	rs737976	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=862;ReadPosRankSum=0.342;SC=TCATGGGCAACTGTCACCCAT;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=54;WE=29913280;WS=29913262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,56:0.40:139
chr22	29915144	rs2072301	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=662;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CACGTGTGCTCCCCCATCCCT;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=12;TCR=67;TR=38;WE=29915152;WS=29915134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr22	29916171	.	T	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.985;SC=CCTCCCACCCTCCCATGCCCC;SOR=0.634;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=9;WE=29916179;WS=29916161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr22	29952016	rs148052790	CAG	C	1187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.447;NF=1;NR=20;PP=860;ReadPosRankSum=0.719;SC=AGAGGTCACACAGGGGGCTCA;SOR=1.136;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=21;WE=29952025;WS=29952006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr22	29957321	rs6361	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=461;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GGCCTCATTCGCAGGCCCTGA;SOR=1.241;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=25;WE=29957329;WS=29957311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr22	29957570	rs1058642	G	A	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.503;SC=AGCTGAACTCGAGGAGCAGCT;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=74;WE=29957578;WS=29957560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,87:0.51:170
chr22	29957911	rs469295	T	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=501;SC=GATGACCTCCTCAAGGTTGGC;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=29957919;WS=29957901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	29957944	rs468986	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=6;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=1.367;SC=ACGGGGGAGGCGGGGTGGCCT;SOR=2.636;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=29957952;WS=29957934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr22	29960335	rs456300	A	G	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.997;SC=CTGTATGGATAGAAATCTACC;SOR=0.822;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=207;TCF=98;TCR=109;TR=98;WE=29960343;WS=29960325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,121:0.47:257
chr22	29965168	rs467669	G	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=740;ReadPosRankSum=1.556;SC=GCACTAGGGAGGTGAGCGCCT;SOR=1.087;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=51;WE=29965176;WS=29965158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr22	29966083	rs456285	C	T	4411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=57;PP=2857;SC=GAGGATGTTCCGCAAATTTGC;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=133;WE=29966091;WS=29966073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr22	29966317	rs457930	C	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=280;ReadPosRankSum=1.316;SC=CCAGACCCTCCCATCTCCTTC;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=29966325;WS=29966307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr22	30077361	rs140086	G	A	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=162;SC=CTTGTGGGCCGCAGAGCACCT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=30077369;WS=30077351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	30124968	rs9614042	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=351;ReadPosRankSum=1.943;SC=GGCCTGTCACCGGGTCTGTAT;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=16;WE=30124976;WS=30124958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr22	30134523	rs146621560	T	TG	710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.538;NF=0;NR=17;PP=692;ReadPosRankSum=-1.444;SC=TGGTAGGCCCTGAGCAAGCCT;SOR=1.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=17;WE=30134531;WS=30134513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
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chr22	30403996	rs2074204	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=0.117;SC=CAAACCGAGCCAAAGGAGGAG;SOR=1.078;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=17;WE=30404004;WS=30403986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr22	30405151	rs41157	T	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=76;PP=2030;SC=CATTTTGCATTGCTCTTAAAT;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=117;WE=30405159;WS=30405141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr22	30412465	rs41164	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=156;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AGCTGACTTATCAGAGTGTGC;SOR=0.346;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=12;WE=30412473;WS=30412455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr22	30418161	rs41168	A	C	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=39;PP=1145;SC=GAGTGCCATCAATTTAACTGT;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=30418169;WS=30418151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	30660517	rs1476576	A	C	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=52;PP=1600;SC=ACAGACAAGTAAGCCTTGAAA;SOR=1.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=30660525;WS=30660507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	30661184	rs5763918	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=320;ReadPosRankSum=-2.502;SC=AAGCCACAGATGGGAGCCTCG;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=29;WE=30661201;WS=30661174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr22	30681797	rs6147585	T	TCTGCCCCAGCCCTTGGTGCTCCCC	4480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=13;PP=2965;SC=CACTCTCCCCTCTGCCCCAGC;SOR=1.259;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=21;WE=30681805;WS=30681787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	30683285	rs5753058	C	G	2927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=57;PP=2156;ReadPosRankSum=-0.795;SC=ACCTGGGCCACAGCAGATGGC;SOR=0.696;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=214;TCF=107;TCR=107;TR=118;WE=30683293;WS=30683275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,125:0.53:234
chr22	30685364	rs5763932	G	A	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=1053;ReadPosRankSum=-1.172;SC=TCCCGAACCCGGGCGCGCACC;SOR=0.492;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=72;WE=30685372;WS=30685354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,97:0.56:174
chr22	30685560	rs1860217	G	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CGGGGGTGGTGCCCGAGCCTT;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=15;WE=30685568;WS=30685550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr22	30691631	rs2097919	G	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=17;PP=973;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TGGGGGCACCGAGCTTCTAAA;SOR=0.750;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=95;TCR=41;TR=61;WE=30691639;WS=30691621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr22	30700607	rs4823089	T	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.750;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=796;ReadPosRankSum=0.473;SC=CCTCCAGGGGTACTTCCTCCA;SOR=1.244;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=47;WE=30700615;WS=30700597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr22	30714684	rs740219	A	C	6347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=91;PP=2965;SC=TGAACCAAGCACTAATGATTT;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=103;TCR=91;TR=194;WE=30714692;WS=30714674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr22	30730711	rs5749063	A	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=725;ReadPosRankSum=1.026;SC=GTGCCTTAGCATGGGGCAACC;SOR=0.505;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=49;WE=30730719;WS=30730701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr22	30733111	rs2229807	C	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=612;ReadPosRankSum=1.315;SC=GTGGGGGATGCACAGGGGGCA;SOR=0.887;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=33;WE=30733119;WS=30733101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr22	30736147	rs2074732	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=0.531;SC=GCTGTAATTCGGAGACTACCA;SOR=0.045;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=30736155;WS=30736137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr22	30736559	rs13057861	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-1.408;SC=TGTAACAGACGGGCTTGCAAT;SOR=0.190;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=12;WE=30736567;WS=30736549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr22	30738161	rs9608885	C	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=992;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCTGGCTCCCCATCTGGAGTC;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=69;WE=30738169;WS=30738151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,82:0.49:169
chr22	30738737	rs5753080	G	A	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=52;PP=2444;SC=ACTGTTTTCAGACATAAAACA;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=124;WE=30738745;WS=30738727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr22	30741230	rs67616715	CAGGGG	C	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GAACAGGCTCCAGGGGAGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=23;WE=30741242;WS=30741220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr22	30742623	rs740221	T	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=0.000;SC=AACCAGCCCATCCCTCAGCAG;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=11;WE=30742631;WS=30742613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr22	30752696	rs5994293	G	T	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=777;ReadPosRankSum=1.234;SC=CCGGCTGCAGGCTGAGGGGCG;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=58;WE=30752704;WS=30752686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr22	30762178	rs41281643	G	A	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1557;ReadPosRankSum=1.126;SC=ACCATGTTCCGGGTGACCCCG;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=90;TCR=99;TR=95;WE=30762186;WS=30762168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,122:0.51:238
chr22	30768297	rs41304671	G	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GCCCTCGCTAGCCTGGGCATC;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=21;WE=30768305;WS=30768287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr22	30770141	.	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=48;ReadPosRankSum=1.762;SC=GCTGAGGGCTCGTGTGGGCAG;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=5;WE=30770149;WS=30770131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr22	30770603	rs5749082	T	A	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=63;PP=2498;SC=GGGCAAATCCTTTTGCAGAGC;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=131;WE=30770611;WS=30770593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr22	30771554	rs2015035	T	G	11658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=208;PP=2965;SC=GCAAGTGCAGTCCAACGACAT;SOR=1.034;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=356;TCF=148;TCR=208;TR=356;WE=30771562;WS=30771544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr22	30772686	rs2286442	C	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=709;ReadPosRankSum=0.893;SC=TGTCACCTGGCCGGGGACAGG;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=44;WE=30772694;WS=30772676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr22	30774340	rs9619104	A	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=17;PP=464;SC=TTGAGAAGCCAGGCGCAGTGG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=30774348;WS=30774330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	30776419	rs757870	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=131;ReadPosRankSum=-2.267;SC=ATCAGGGACATGGGGCCACCC;SOR=1.078;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=12;WE=30776427;WS=30776409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr22	30782089	rs5997629	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=-1.323;SC=TCAGGATGAGAAGAAGCAGGG;SOR=0.483;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=7;WE=30782097;WS=30782079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr22	30793137	rs757660	G	A	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=982;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CTGAGCCCCAGGCAGAAGGAG;SOR=0.563;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=64;WE=30793145;WS=30793127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr22	30793270	rs887098	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=2.100;SC=GGCGGGCGGCGGAGGGAACAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=30793278;WS=30793260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr22	30802444	rs2072157	C	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=436;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTTCTTTTGCCGCACCTCCCA;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=30;WE=30802452;WS=30802434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr22	30803702	.	CT	C	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9999;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=19;MQ=59.94;NF=0;NR=2;PP=22;QD=12.5;SC=AAGGCCCAGCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=30803710;WS=30803692;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,2:0.17:12
chr22	30812549	rs5997642	C	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=431;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AGAAATCTAGCCTTGGAGACT;SOR=0.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=22;WE=30812557;WS=30812539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr22	30822920	rs5844906	T	TG	4058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=68;PP=2965;SC=AAAGTCCCTGTGGACACTCCA;SOR=1.417;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=76;WE=30822928;WS=30822910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr22	30823065	rs2072159	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=261;ReadPosRankSum=-2.704;SC=CAAGTCCACTGGCCACTTGCC;SOR=0.538;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=14;WE=30823073;WS=30823055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr22	30823196	rs5753130	T	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=923;ReadPosRankSum=0.416;SC=CCAGGGTGACTGTGGCTGTGG;SOR=0.780;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=74;WE=30823204;WS=30823186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr22	30823250	rs9606726	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=800;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TGGCCATTCCGGGCTTCACCA;SOR=0.671;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=57;WE=30823258;WS=30823240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,80:0.42:190
chr22	30857373	rs2240345	A	C	6479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=84;PP=2965;SC=TGGGTAGAACATCTGTCATCT;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=104;TCR=84;TR=188;WE=30857381;WS=30857363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr22	30857448	rs5749104	A	G	6281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=97;PP=2965;SC=TGTCCGCACCATCAGATGAGA;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=102;TCR=97;TR=199;WE=30857456;WS=30857438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr22	30862146	rs1047917	C	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=333;SC=TAAGGCCAACCCTAGAAGTTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=30862154;WS=30862136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	30862400	rs1057995	T	A	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=49;PP=1427;SC=CCAAGAGAGATCCCTTCAGAG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=30862408;WS=30862390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	30863163	rs5997653	C	T	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=11;PP=301;SC=TTCTAGACCCCGACTCTGTCC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=30863171;WS=30863153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	30863232	.	CCA	C	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=53;QD=24.0;SC=ATCCATCCATCCACATCCATC;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=3;WE=30863241;WS=30863222;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr22	30863234	.	A	ACATCCATCCATCCATC	141	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.25;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	30864437	rs138903951	A	AT	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.912;NF=9;NR=1;PP=358;ReadPosRankSum=-2.730;SC=TCTGAGACCAATCCCCCCGGC;SOR=2.147;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=30864445;WS=30864427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr22	30864610	rs4820853	A	G	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1142;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AAGTGGCCCAATGATGTCATA;SOR=1.214;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=68;WE=30864618;WS=30864600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,76:0.38:202
chr22	30864692	rs4820854	G	A	5264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=90;PP=2965;SC=ACCTGGGCATGAAAAGATGCA;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=169;WE=30864700;WS=30864682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
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chr22	30864817	rs2269963	A	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=42;PP=1240;SC=AGACAGTGCTATTGTCTCAGG;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=30864825;WS=30864807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	30867139	rs5997658	GC	TT	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=567;SC=AGGTGTGGTGGCACATGCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=30867148;WS=30867129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	30886388	rs73392179	C	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-1.429;SC=CTGTCCAGGACAGTGGGTGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=30886396;WS=30886378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr22	30887555	rs76073588	C	T	2741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CCCCGCAGCTCTTACAGACGC;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=244;TCF=143;TCR=101;TR=113;WE=30887563;WS=30887545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,131:0.46:284
chr22	30927975	rs5749118	C	T	4437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=72;PP=2613;SC=TTTCTCCACCCTCTTCCCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=122;WE=30927983;WS=30927965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr22	30929905	rs4820864	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=392;ReadPosRankSum=-1.095;SC=TGGATGGATGAATGAATGAAT;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=27;WE=30929913;WS=30929895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr22	30930080	rs5753187	T	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=585;ReadPosRankSum=1.351;SC=CACTCCAGGCTTCTGGAGAGA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=42;WE=30930088;WS=30930070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr22	30930158	rs2899151	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GTTCTTGACCTGGGGAGCCAC;SOR=0.184;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=11;WE=30930166;WS=30930148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr22	30934816	rs5753190	T	C	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.423;SC=ATCCTTACCTTGGAGCCAGCG;SOR=1.023;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=175;TCF=83;TCR=92;TR=88;WE=30934824;WS=30934806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,103:0.50:207
chr22	30934887	rs5753191	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=848;ReadPosRankSum=-0.707;SC=TGTTCTCCCGGAACTGAGGAC;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=52;WE=30934895;WS=30934877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,69:0.48:144
chr22	30953295	rs2267161	C	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=741;ReadPosRankSum=0.657;SC=TAGGAGTACACCAGCAGCAGG;SOR=0.776;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=47;WE=30953303;WS=30953285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr22	30973146	rs34323294	AG	A	1002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=740;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GGTCAGGCTGAGGTATGTGTA;SOR=0.648;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=21;WE=30973154;WS=30973136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr22	30981508	rs4820017	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.857;SC=GCCCAAGCGGACAGACAGAGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=30981516;WS=30981498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr22	30987861	rs737953	G	C	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=47;NR=45;PP=1585;SC=CGCGTACAGGGAGCTCCACTT;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=30987869;WS=30987851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr22	30987933	rs17526668	T	A	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=33;PP=1151;SC=TGTCTGTTTGTGCGGGCTGCC;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=30987941;WS=30987923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	30987960	rs16988803	C	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=27;SC=GATGCCTGTACAAGTCCAGGG;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=30987968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	31006860	rs9606756	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=574;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TTTCTAAGAAATACCAGAGAT;SOR=1.154;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=35;WE=31006868;WS=31006850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr22	31011557	rs2267163	T	C	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=49;PP=1736;ReadPosRankSum=1.310;SC=GCCGGCTGACTTCCTCTCTCT;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=123;TCR=102;TR=108;WE=31011565;WS=31011547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,130:0.50:261
chr22	31011610	rs1801198	G	C	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=1713;ReadPosRankSum=0.270;SC=TCCCCCATGCGTGGGGCAGAA;SOR=0.709;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=233;TCF=117;TCR=116;TR=112;WE=31011618;WS=31011600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,129:0.48:268
chr22	31011882	rs4820021	A	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=831;SC=TCAGCACAAGATTGTGGGTGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=31011890;WS=31011872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	31013419	rs9621049	C	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=865;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CAGTCCATCTCTGTTCTGGCC;SOR=0.626;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=66;TCR=89;TR=65;WE=31013427;WS=31013409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,81:0.44:184
chr22	31018777	rs2301956	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=-1.046;SC=TCGGGGGTCTGGAGGGGAAGG;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=31018785;WS=31018767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr22	31022272	rs2072194	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-1.850;SC=GGAACCCTGTGGGAAGCTGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=31022280;WS=31022262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr22	31022301	rs12168392	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=0.466;SC=CTTTGAGCAGGCTTTAGGGAG;SOR=3.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=14;WE=31022309;WS=31022291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr22	31022590	rs12169610	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.342;SC=AACAGGAACTCGCCTGACCCT;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=31022598;WS=31022580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	31032920	rs5997714	A	G	2921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=80;PP=1949;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GCCACCACCCACTTCAGTTGG;SOR=0.819;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=288;TCF=109;TCR=179;TR=125;WE=31032928;WS=31032910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,139:0.42:329
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chr22	31266546	rs2301816	T	C	5362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=94;PP=2965;SC=AGCACGGCGCTGCACTCCAGC;SOR=0.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=174;WE=31266554;WS=31266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr22	31266777	rs4820909	T	C	237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=7;PP=159;SC=CCATTTCCTGTGGTTCCACGG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=31266785;WS=31266767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	31285680	rs5749186	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=553;ReadPosRankSum=-0.480;SC=TTTCCTGTGCGTGGATGAGCA;SOR=1.393;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=28;WE=31285688;WS=31285670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr22	31301734	rs10625967	A	AGG	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=1028;SC=GCGACCCGGGAGGAGACACCG;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=22;WE=31301742;WS=31301724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	31302125	rs3804084	C	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=203;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GCCGCAGGGACGGATTCCGGG;SOR=0.513;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=14;WE=31302133;WS=31302115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr22	31302233	rs3804085	T	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=336;ReadPosRankSum=-0.650;SC=AGAGGCTGGATCCGCTGACCG;SOR=0.805;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=29;WE=31302241;WS=31302223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr22	31329056	rs2074578	G	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=259;ReadPosRankSum=1.030;SC=GAAAACTAGCGTAGAGTCCCT;SOR=0.082;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=19;WE=31329064;WS=31329046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr22	31329954	rs5753398	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.175;SC=CTGCTGGTGGATGGTATAGAC;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=31329962;WS=31329944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr22	31333631	rs3747151	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.744;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=327;ReadPosRankSum=1.424;SC=GCTCACTGGATGGGGGCTGGT;SOR=1.232;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=22;WE=31333639;WS=31333621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr22	31335654	rs368475981	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=530;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GCTTCTCTGCGCAGAGTGATG;SOR=0.700;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=35;WE=31335662;WS=31335644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr22	31335724	rs1005252	T	A	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.449;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=534;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TGAGGGGAGGTGGCACTCTAG;SOR=0.160;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=29;WE=31335732;WS=31335714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr22	31336149	rs739896	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=429;ReadPosRankSum=-1.166;SC=AGAGTAGGGGGAGCTATGGCT;SOR=0.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=30;WE=31336157;WS=31336139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr22	31342376	rs2072132	G	C	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=829;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GGAAGAGGCAGGTCATGGTGT;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=62;WE=31342384;WS=31342366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr22	31342594	rs5753403	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=519;SC=CCACAGCCCTCGTTCCCTCTC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=31342602;WS=31342584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	31354653	rs737924	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GTTCAGCAAGGGCACCAAACA;SOR=1.295;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=25;WE=31354661;WS=31354643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr22	31493164	rs41282559	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TCTCTGCCTGCGGCTATCACC;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=15;WE=31493172;WS=31493154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr22	31493460	rs5753458	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.966;NF=3;NR=12;PP=172;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GAGGCCGAGGTGGGCGGATCA;SOR=0.071;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=15;WE=31493468;WS=31493450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr22	31494568	rs33991833	A	AC	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.292;NF=7;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-0.314;SC=GTGCTACAAGACCCCCCCTCC;SOR=0.556;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=10;WE=31494576;WS=31494558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr22	31497054	rs5753459	A	C	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=36;PP=1216;SC=CGCCGCCTCTACCACCTGCCC;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=66;WE=31497062;WS=31497044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	31500536	rs10304	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-1.328;SC=TCCGCCCACCGCTGCCCTGTC;SOR=2.368;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=15;WE=31500544;WS=31500526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr22	31501833	rs2283875	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=348;ReadPosRankSum=-1.245;SC=CCCCCCTCCCCGCCCCAGTCA;SOR=0.242;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=17;WE=31501841;WS=31501823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr22	31521404	rs2240432	G	A	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=55;PP=2566;SC=GGCATCAGGCGCAGCCTCTGT;SOR=0.864;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=126;WE=31521412;WS=31521394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr22	31521850	rs2240431	A	C	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=51;PP=2519;SC=GGCTTGGCACACAGAGTACAG;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=99;WE=31521858;WS=31521840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
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chr22	31533967	rs2074739	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=290;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GCACTGTGCCGTACATCCTAC;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=20;WE=31533975;WS=31533957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
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chr22	31536133	rs2232176	A	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1112;ReadPosRankSum=-1.185;SC=CAGCTACATGACTGCAGCCTC;SOR=0.917;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=77;TCR=57;TR=67;WE=31536141;WS=31536123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr22	31669267	rs2040532	A	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=654;SC=GTTCACCTACAGCTGAGGAAG;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=31669275;WS=31669257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	31687142	rs5753544	G	C	8178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=111;NR=158;PP=2965;SC=CCAGCCCCGGGGCCGTCCCCC;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=111;TCR=158;TR=269;WE=31687150;WS=31687132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr22	31687313	rs4820044	A	G	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=72;PP=2201;SC=CGGACACAGAATAGCGGGCAG;SOR=1.246;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=117;WE=31687321;WS=31687303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	31741067	rs714909	G	A	5413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=63;PP=2965;SC=GGGGGCGAAAGAGCATTATAT;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=158;WE=31741075;WS=31741057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr22	31795552	.	C	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=662;ReadPosRankSum=-0.437;SC=ACGCGGAACTCTCTCGCGGTA;SOR=0.245;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=32;WE=31795560;WS=31795547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr22	31795866	rs4820047	T	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=1281;SC=TCTGCCACGATTAGGAGTCCC;SOR=3.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=50;WE=31795874;WS=31795856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	31843567	rs2273251	G	C	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=20;PP=623;SC=GAAAAGGAGAGGGGAGGGTCA;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=31843575;WS=31843557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	31844293	rs738658	A	C	6491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=114;PP=2965;SC=TTAATGCATGACATTTCTTGC;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=80;TCR=114;TR=194;WE=31844301;WS=31844283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr22	31854434	rs11293411	AT	A	3169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=35;PP=1983;SC=TTAACCACACATTTTTTAAGT;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=61;WE=31854442;WS=31854424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr22	31904170	rs2413054	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=607;SC=GAGCTGGCATATAGTTCAGAA;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=31904178;WS=31904160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	31904262	rs146128116	CTT	C	1117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=633;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AGATAAAAGACTTTGATTCAT;SOR=0.726;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=18;WE=31904271;WS=31904252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr22	31926725	rs3818134	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=614;SC=AGGCATTTGCCGGCCATTTTA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=31926733;WS=31926715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	31942770	rs1968023	G	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=654;SC=TTCATGAGACGGCAAGAATAT;SOR=4.091;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=31942778;WS=31942760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	31971071	rs10570167	CGTGT	C	233.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.79;QD=38.96;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	31971172	rs10657905	A	ATCT	3436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=23;PP=2123;SC=TTTCCAGCTCATCTAACCTTA;SOR=1.349;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=46;WE=31971180;WS=31971162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	31971258	rs5753700	T	C	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=69;PP=2511;SC=GCTCCAGATATACTTCTGTGA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=31971266;WS=31971248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr22	31983287	rs112798271	A	ATTTGTTTTGT	6470.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=51;PP=2982;SC=ATGCCAATTTATTTGTTTTGT;SOR=1.435;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=108;TCF=14;TCR=94;TR=56;WE=31983295;WS=31983277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr22	32179850	rs138286	G	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=9;PP=1478;SC=AACTGAAACTGTATATGGCAT;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=32179858;WS=32179840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	32333783	rs3788441	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AGGGGCAGTGGTGGGAAGAAT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=32333791;WS=32333773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr22	32334021	rs1984388	T	A	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1406;ReadPosRankSum=0.281;SC=TGTCTTTTGATGCAGCCCTGT;SOR=0.785;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=175;TCF=91;TCR=84;TR=85;WE=32334029;WS=32334011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,95:0.48:197
chr22	32334203	rs3788442	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=537;ReadPosRankSum=1.334;SC=CCAGCTTTCCCGGACCATGCA;SOR=1.170;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=35;WE=32334211;WS=32334193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr22	32334229	rs3788443	A	C	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=32;PP=996;SC=GCCCCTCCCAACCCAGCCCAC;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=32334237;WS=32334219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	32334295	rs3788444	C	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=199;SC=CAAGCCAAAACGTCTAGAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=32334303;WS=32334285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	32340565	rs71697452	TGCCTGCA	T	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=0.936;SC=GCGGCGGCGCTGCCTGCAGCC;SOR=0.048;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=32340579;WS=32340555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr22	32340837	rs71845980	CG	C	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.92;ReadPosRankSum=-2.372;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr22	32340880	rs138873821	C	CG	408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=348;ReadPosRankSum=1.010;SC=TGGCCGCGGGCGCGTTCCCCT;SOR=0.264;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=32340888;WS=32340870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr22	32341669	rs2301415	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=1.096;SC=TTTTCTGTAAATGAATATTTC;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=11;WE=32341677;WS=32341659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr22	32341684	rs7290696	C	T	285.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATTTCCTCTCCCTGCGTCAA;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=12;WE=32341692;WS=32341674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr22	32343613	rs10631788	G	GCTCT	1219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.061;NF=0;NR=26;PP=1331;ReadPosRankSum=0.743;SC=GTATCTTCAAGCTCTATCTCA;SOR=0.125;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=26;WE=32343621;WS=32343603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr22	32346468	rs4820059	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=0.049;SC=CCTTCAATTCGGATGCCTCTA;SOR=0.025;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=32346476;WS=32346458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr22	32352791	rs1049583	G	A	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.624;SC=GATCCTTCAGGTCCCCTGGCC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=79;WE=32352799;WS=32352781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,92:0.53:174
chr22	32435409	rs130262	G	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=257;SC=CTGCTTCTCTGGGCTTTCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=32435417;WS=32435399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	32463875	rs135110	G	A	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=930;SC=TTTTTCTGCAGCAGCTGAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=32463883;WS=32463865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	32478972	rs131880	A	AG	4428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=33;PP=2975;SC=GAAGGCCAGCAGAAGTAGAGG;SOR=1.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=72;WE=32478980;WS=32478962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	32545849	rs58570639	C	CA	2966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=39;PP=2166;SC=CACTTGGTGACGTAGAAAACA;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=32545857;WS=32545839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	32554985	rs5998267	A	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=931;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GGACATCTTCAGCATCTTCGG;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=57;WE=32554993;WS=32554975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,69:0.68:101
chr22	32579550	rs136428	T	C	8009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	32579559	rs136429	A	G	8143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr22	32579676	rs136430	A	G	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=66;PP=2063;SC=AAGAATCACTATATTTATCAG;SOR=1.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=96;WE=32579684;WS=32579666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr22	32579742	rs1297809	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=8.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-2.001;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=2.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr22	32579751	rs136431	C	G	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=290;SC=CCAGACCTATCAGCATGATAA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=32;WE=32579759;WS=32579732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	32586632	rs136466	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=272;SC=AGATTAAGTACAATCAAGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=32586640;WS=32586623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	32586854	rs136467	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.02;QD=30.82;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	32586875	rs136468	G	A	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.26;QD=45.82;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	32586878	rs136469	A	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.48;QD=44.22;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	32586926	rs136470	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.86;QD=30.82;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	32587023	rs55974778	C	G	8339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.82;QD=45.08;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr22	32587027	rs136472	G	C	8344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.05;QD=43.92;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	32587478	rs136473	T	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=285;SC=CTTCATGAGGTAACTTCCCTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=32587486;WS=32587468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	32589023	rs136478	C	T	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.674;NF=50;NR=51;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CATGGAAGAGCAACAGCAAAG;SOR=0.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=104;TCR=103;TR=101;WE=32589042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,119:0.50:239
chr22	32589034	rs136479	T	C	7051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=100;PP=2965;SC=AACAGCAAAGTAGATCCTCCC;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=112;TCR=100;TR=212;WE=32589042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr22	32589090	rs8135276	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.036;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.786;NF=45;NR=38;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.782;SC=AGGCAGACGGCGCATCCACAC;SOR=0.897;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=219;TCF=115;TCR=104;TR=83;WE=32589098;WS=32589080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,83:0.36:233
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chr22	32617062	rs5998317	G	A	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=62;PP=1848;SC=GTTTGCAATAGTATAATAGAA;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=91;WE=32617070;WS=32617052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr22	32617121	rs73164040	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=-1.026;SC=AAACCATACAGGAGAATATAG;SOR=0.118;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=16;WE=32617129;WS=32617111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr22	32621619	rs2294208	C	T	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=45;PP=2820;SC=AGCAGGGAAACTTTTTTTCCA;SOR=1.344;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=130;WE=32621627;WS=32621609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr22	32625210	rs5998322	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=732;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CTTTCTCCGACGCTTGCTTCC;SOR=0.761;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=47;WE=32625218;WS=32625200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
chr22	32626908	rs2068209	G	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=7;PP=1147;SC=CTCGAGGCCCGTCTTAGACAG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=32626916;WS=32626898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	32633505	rs5998328	G	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=193;SC=CCCTTGCCTTGCCCTGATTCA;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=32633513;WS=32633495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	32634877	rs5998331	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=760;ReadPosRankSum=1.659;SC=CCTTTACCTCGGCAGTGACAA;SOR=0.427;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=47;WE=32634885;WS=32634867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr22	32643447	rs370994036	AC	A	1805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.956;NF=4;NR=31;PP=2255;ReadPosRankSum=0.225;SC=GGAGAGGTAGACCTGGAGTCG;SOR=0.532;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=35;WE=32643468;WS=32643437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr22	32643460	rs62239058	C	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.908;NF=19;NR=30;PP=2269;ReadPosRankSum=0.364;SC=TGGAGTCGCTCCCCACCAAAC;SOR=0.449;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=49;WE=32643468;WS=32643437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr22	32649994	rs2235170	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=326;ReadPosRankSum=1.726;SC=TCTCGAACTCCTGACCTCAGA;SOR=1.981;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=16;WE=32650002;WS=32649984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr22	32650200	rs2235171	C	T	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=793;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TTCAGCATCGCCTGAGCAGAA;SOR=1.170;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=48;WE=32650208;WS=32650190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr22	32753961	rs147764109	C	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.021;NF=22;NR=3;PP=431;ReadPosRankSum=-2.664;SC=AATAGAACTTCAAATCTCTGA;SOR=0.428;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=25;WE=32753969;WS=32753951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr22	32756652	rs201161881	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=19.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-9.093;QD=0.25;ReadPosRankSum=-2.123;SOR=2.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,22:0.11:194
chr22	32756684	rs61729165	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=5.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-12.958;QD=1.71;ReadPosRankSum=1.167;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,40:0.18:218
chr22	32756703	rs73166367	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-12.225;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,50:0.21:241
chr22	32766927	rs12168441	A	G	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=902;ReadPosRankSum=-0.019;SC=AAAGACCAGAATCTGTGAAAA;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=63;WE=32766935;WS=32766917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,89:0.45:199
chr22	32791003	rs2072818	A	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=294;ReadPosRankSum=2.109;SC=ACAAACGTAGAGCTACGTACT;SOR=1.721;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=15;WE=32791011;WS=32790993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr22	32791929	rs3215463	GC	G	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTTGTGATCCGCCCCCCCTCG;SOR=2.303;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=7;WE=32791937;WS=32791919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr22	32804313	rs5754073	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=631;SC=ACTGTATAACGTGAAGAGGTA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=32804321;WS=32804303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	32804656	rs2076043	G	A	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	32804665	rs2076044	T	C	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=1.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	32811952	rs5998478	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=250;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TGTGGATTGGACAGAGGAAAT;SOR=0.533;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=19;WE=32811960;WS=32811942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr22	32831540	rs2076050	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=673;SC=ATGTTCACTCCACAATTCCCT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=32831548;WS=32831536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	32853430	rs12165345	A	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=-1.600;SC=TCTTTGGTCAATTAAATCCAA;SOR=3.091;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=26;WE=32853438;WS=32853420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
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chr22	33229830	rs242076	A	G	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1466;ReadPosRankSum=-3.889;SC=AGCATTTAGCACTGATCATGC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=77;TCR=101;TR=95;WE=33229838;WS=33229820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,115:0.52:222
chr22	33562683	rs743794	T	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=572;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TCCAACATGCTGTAAAATTAG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=37;WE=33562691;WS=33562672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr22	33562887	rs9609729	G	T	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1246;SC=TCTATGCAATGATACTGGCTA;SOR=3.076;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=33562895;WS=33562877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	33832735	rs713740	A	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	34000230	rs695504	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.191;SC=AAAGTGGATTTTGTGCACTCA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=34000238;WS=34000227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	34022284	rs86487	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=810;ReadPosRankSum=1.583;SC=CATTGTATCCGGCGCAGACAA;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=47;WE=34022292;WS=34022274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr22	34022374	rs68171942	AG	A	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=305;ReadPosRankSum=0.038;SC=CTGGTGCTTCAGATCACACTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=34022382;WS=34022364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr22	35463162	rs361863	A	G	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=36;PP=2052;SC=GAAGAAGCTGAGCCTGTCCTT;SOR=1.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=93;WE=35463170;WS=35463152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	35463179	rs361668	T	C	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=41;PP=1965;SC=CCTTCTCCATTGAGGCGATCC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=35463187;WS=35463169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr22	35463249	rs362090	C	T	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=63;PP=2200;SC=TGAAGAGGGCCCCGGAGAAGC;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=35463257;WS=35463239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr22	35478486	rs2899241	A	C	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=17;PP=1838;SC=GGCCACTGACACAACTTGGAC;SOR=2.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=77;WE=35478494;WS=35478476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	35478688	rs725267	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=609;ReadPosRankSum=-1.640;SC=CCTCAGCCCCCAGCCTCCATG;SOR=0.450;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=37;WE=35478696;WS=35478678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr22	35481373	.	A	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=727;ReadPosRankSum=-1.769;SC=TGCCCAAGCCATGGAGGGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=51;WE=35481381;WS=35481363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,58:0.59:99
chr22	35481776	rs3810619	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=22;PP=676;SC=GGAAATCGATTTCACAATCCA;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=35481784;WS=35481766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	35658225	rs4820189	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CCTTCCAGTCAGCCCTTGGAT;SOR=1.022;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=35658233;WS=35658215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr22	35660875	rs1053593	G	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=544;ReadPosRankSum=-0.593;SC=GAGGATGGTGGCTCCCACAAA;SOR=1.139;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=37;WE=35660883;WS=35660865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr22	35679951	rs2272789	T	C	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CTATGCGGCATTAGCCAAAAA;SOR=0.834;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=72;TCR=61;TR=77;WE=35679959;WS=35679941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,89:0.61:147
chr22	35680095	rs2272790	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=219;ReadPosRankSum=-0.858;SC=GAAGCAGTGCGATTAATTTCT;SOR=0.880;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=16;WE=35680103;WS=35680085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr22	35683238	rs741995	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-1.426;SC=GCCCGCCTCTTACTATTGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=35683246;WS=35683228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	35684533	rs5750093	G	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=204;SC=TCTCAGGATGGCGTAACATAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=35684541;WS=35684523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	35695802	rs4461	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=-1.341;SC=CGAGCTTCGCGGTGCCACCGC;SOR=0.492;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=20;WE=35695810;WS=35695792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr22	35696077	rs138728	G	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=207;ReadPosRankSum=-2.278;SC=GGGAGGGCAAGGAGGCTGGCG;SOR=0.056;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=20;WE=35696085;WS=35696067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr22	35727265	.	CT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr22	35796652	rs743813	C	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=295;SC=GCTCACACGCCTCTACCAGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=35796660;WS=35796642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	35797333	rs743815	T	C	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=47;PP=2212;SC=TAGGATTCACTTCACTTCGCT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=35797341;WS=35797323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr22	35799542	rs713618	C	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=35;PP=1007;SC=GAAGGTGGGTCGGAGGGCAGT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=35799550;WS=35799532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	35808708	rs2307344	C	T	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=925;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TTTGGGGAGGCGGCTGATGAT;SOR=1.038;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=65;WE=35808716;WS=35808698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,75:0.61:122
chr22	35810052	rs80433	T	C	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=37;PP=1048;SC=CTCTGGGTCCTCAGGACACCT;SOR=3.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=42;WE=35810060;WS=35810042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	35812504	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C,CTGTGTGTGTGTGTG	330	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=55.87;NF=4,4;NR=0,0;PP=181,330;QD=46.0;SC=GGCCTAGAATCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=4,4;WE=35812531;WS=35812494;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.20:20
chr22	35817257	rs2071743	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGCTGGCTGGGGAGGAAGGGA;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=35817265;WS=35817247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr22	35817553	rs2071744	C	T	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=1055;ReadPosRankSum=0.082;SC=CAGTGTGTGTCTTGCTTCTCT;SOR=0.620;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=58;WE=35817561;WS=35817543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr22	35817597	rs133431	C	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=49;PP=1702;SC=TTCTTTTTGCCATAAGACCCC;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=35817605;WS=35817587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	35947585	rs41279993	C	A	6254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=79;PP=2965;SC=CCTGGATAACCGGGAGTCCTT;SOR=1.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=126;TCR=79;TR=205;WE=35947593;WS=35947575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr22	36006923	rs35171458	G	GC	2018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=15;PP=1852;SC=CCCAGGCTCTGCTCCTACCTC;SOR=2.024;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=42;WE=36006931;WS=36006913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	36114047	rs4821438	C	T	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.72;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	36114054	rs2899256	C	T	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.53;SOR=2.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	36116493	rs34534260	T	TCTAA	1156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.705;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.638;NF=18;NR=3;PP=446;ReadPosRankSum=-2.767;SC=TTTGTTGTATTCTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=21;WE=36116501;WS=36116483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr22	36116535	rs33921037	A	G	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=827;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TTAGACAGCCAACTTTCCCGG;SOR=1.054;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=52;WE=36116543;WS=36116525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr22	36122517	rs17723764	T	C	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=72;PP=2187;ReadPosRankSum=0.333;SC=ACGAGTTGCTTACCAAGACCA;SOR=0.875;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=258;TCF=113;TCR=145;TR=125;WE=36122525;WS=36122507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,146:0.49:296
chr22	36122930	rs2076671	C	T	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=60;PP=1499;ReadPosRankSum=-1.171;SC=CCTTTCTGGACGGCTAGAGGG;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=182;TCF=70;TCR=112;TR=93;WE=36122938;WS=36122920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,110:0.52:210
chr22	36124860	rs2076673	C	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=0.712;SC=AGGACAGTCTCTGCCCCAAGG;SOR=0.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=26;WE=36124868;WS=36124850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr22	36357789	rs78630440	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=1.213;SC=GTTTTCCGTTCTCCCCACACC;SOR=0.885;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=18;WE=36357797;WS=36357779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr22	36424450	rs9607299	A	C	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=13;PP=338;SC=GAGGCGGCTGATGCGGCTGGG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=36424458;WS=36424440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	36537500	rs132618	A	T	7378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=116;PP=2965;SC=CTGCTTGACCACCACTTCCAG;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=109;TCR=116;TR=225;WE=36537508;WS=36537490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr22	36541725	rs1807672	G	T	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=66;SC=GGTGGTTCGAGGTTAATCCTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=36541733;WS=36541715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	36545137	rs132642	A	T	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=36;PP=1620;SC=GAGACTTTCCATGGAGCTCTC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=36545145;WS=36545127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	36545780	rs7290574	C	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=606;SC=GACTGGGCTCCACTCCCTTAA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=36545788;WS=36545770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	36545826	rs132644	T	C	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=20;PP=1787;SC=TACATGCTTATTGTAAATGAC;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=75;WE=36545834;WS=36545816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	36550537	rs66799354	CAAG	C	2813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=20;PP=2045;SC=TTGGTTTTAACAAGAAGAGCA;SOR=1.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=45;WE=36550547;WS=36550527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr22	36556823	rs132653	G	T	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=54;PP=2109;SC=CGTTCTCCAGGCTCTGAGATA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=36556831;WS=36556813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr22	36556964	rs916334	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=0.781;SC=CACCCTTGGTCCCACCCTCCT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=15;WE=36556972;WS=36556954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
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chr22	36587223	rs6000173	G	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=471;ReadPosRankSum=1.345;SC=CTCGGATTTTGCCCCCTTGTG;SOR=0.710;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=30;WE=36587231;WS=36587213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr22	36587279	rs6000174	A	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=668;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CCAGCACAACAAGGACACCTG;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=41;WE=36587287;WS=36587269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr22	36587486	rs2227167	A	G	2869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1933;ReadPosRankSum=-1.469;SC=CAAGTGCAAAAGAAAGCACAT;SOR=0.687;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=223;TCF=112;TCR=111;TR=109;WE=36587494;WS=36587476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,126:0.50:251
chr22	36587511	rs2227168	C	T	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TGTGATGTCACGCAGAATGTC;SOR=0.934;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=221;TCF=104;TCR=117;TR=104;WE=36587519;WS=36587501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,121:0.49:248
chr22	36587704	rs132700	T	C	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1023;ReadPosRankSum=0.885;SC=GGTGCCAACATAACGCCAATG;SOR=0.522;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=212;TCF=119;TCR=93;TR=71;WE=36587712;WS=36587694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,85:0.37:229
chr22	36587845	rs3075364	A	ACT	8468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.979;NF=25;NR=90;PP=2927;ReadPosRankSum=-0.952;SC=ATTTGAGGAAACTTTCAAAAA;SOR=0.755;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=229;TCF=47;TCR=182;TR=115;WE=36587853;WS=36587835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,216:0.51:421
chr22	36587952	rs2227169	C	T	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=46;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GAGCATCTGCCTCTTCCCTGT;SOR=0.285;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=100;TCF=16;TCR=84;TR=57;WE=36587960;WS=36587942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,61:0.58:105
chr22	36591274	rs132704	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=468;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CTGGAGGAGGTGTGCCTGCCA;SOR=0.999;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=24;WE=36591282;WS=36591264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr22	36591380	rs2007468	A	G	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=0.461;SC=CCACACGCACAAATCTCTTCC;SOR=0.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=53;WE=36591388;WS=36591370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,63:0.45:140
chr22	36593628	rs112900962	A	AC	1107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.270;NF=9;NR=9;PP=872;ReadPosRankSum=1.045;SC=AACAGCTGTAACCCCCCATGA;SOR=0.636;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=18;WE=36593648;WS=36593618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr22	36593640	rs6000178	A	T	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQ=60.12;MQRankSum=1.254;NF=18;NR=11;PP=863;ReadPosRankSum=0.780;SC=CCCCCATGAAACTGCAAGCTA;SOR=0.828;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=29;WE=36593648;WS=36593618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr22	36597877	rs132734	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr22	36597881	rs132735	G	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr22	36598049	rs80587	C	G	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,72:0.54:134
chr22	36598058	rs132736	T	C	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr22	36598187	rs132737	G	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-2.209;SC=CCGTTTTGCTGTGTCACCCAG;SOR=0.175;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=36598195;WS=36598177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr22	36623731	rs132760	T	C	7798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=122;PP=2965;SC=CGCCCAATGATATGCGGGGGT;SOR=0.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=110;TCR=123;TR=231;WE=36623739;WS=36623721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr22	36633427	rs2157251	G	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=1020;ReadPosRankSum=1.118;SC=AGGGAAAGAGGAGTCGAAATG;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=49;TCR=84;TR=63;WE=36633435;WS=36633417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr22	36633452	rs1557535	C	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=843;ReadPosRankSum=0.032;SC=CCTGAGAAATCGTCATTTTCA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=49;WE=36633460;WS=36633442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr22	36633564	rs916263	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=12;PP=705;SC=AAGTGATCCTTCTGCCTCAGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=36633572;WS=36633554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	36633836	rs916264	A	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=294;SC=GATGCTCTGGACCCCACCTTC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=36633844;WS=36633826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	36635430	rs113056287	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	36635444	rs136144	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr22	36635445	rs1974458	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr22	36635756	rs5756111	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr22	36657789	rs136164	T	C	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=949;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TGGGGTTACCTCCATTGGGCA;SOR=0.755;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=25;TCR=77;TR=54;WE=36657797;WS=36657779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr22	36661149	rs136169	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.183;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr22	36661152	rs28480494	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.929;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr22	36661330	rs2239785	G	A	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1070;ReadPosRankSum=0.769;SC=GTTGAAAAGTGAGCTTGAGGA;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=61;WE=36661338;WS=36661320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr22	36661536	rs136174	C	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1786;ReadPosRankSum=0.469;SC=GAATCACAGCCGCTTTGACCG;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=229;TCF=103;TCR=126;TR=104;WE=36661544;WS=36661526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,120:0.44:275
chr22	36661566	rs136175	G	A	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1714;ReadPosRankSum=-1.521;SC=GCAGTACCATGGACTACGGAA;SOR=0.920;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=224;TCF=102;TCR=122;TR=102;WE=36661574;WS=36661556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,112:0.44:257
chr22	36661646	rs136176	G	A	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1420;ReadPosRankSum=1.746;SC=AAGGAGGTGAGGGAGTTTTTG;SOR=0.569;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=84;WE=36661654;WS=36661636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
chr22	36661842	rs136177	G	A	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=1052;ReadPosRankSum=0.032;SC=AGGTGGAGAGGGTTAATGAAC;SOR=0.552;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=60;WE=36661850;WS=36661832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,79:0.56:141
chr22	36678913	rs143762624	T	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=1.553;SC=CATCTCAAAGTGAATTCGAGA;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=10;WE=36678921;WS=36678903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr22	36681163	rs56327920	G	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=394;ReadPosRankSum=1.453;SC=CCAGGGGCACGTACTTGGTCT;SOR=0.396;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=26;WE=36681171;WS=36681153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr22	36684980	rs11549907	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=952;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TCTCCAGCTCGTGGACCTGAG;SOR=0.614;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=65;WE=36684988;WS=36684970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr22	36687962	rs6000233	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CTTTCTCTGATGGGCCCTTTG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=36687970;WS=36687952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr22	36690120	rs56020676	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=628;ReadPosRankSum=0.154;SC=CGCGCCAGGGTCCTGGCGGAG;SOR=0.827;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=85;TCF=70;TCR=15;TR=37;WE=36690128;WS=36690110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr22	36691607	rs710181	A	C	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=14;PP=859;SC=CTGTTTTCAGAGCCTCTAGCT;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=36691615;WS=36691597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	36691691	rs875725	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=595;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CTTCCTGGAGTTCAGAGATCT;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=38;WE=36691699;WS=36691681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr22	36694954	rs41279999	C	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=417;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TCCTGCTCGTCACCCCCTCAC;SOR=1.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=23;WE=36694962;WS=36694944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr22	36695123	rs16996650	G	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=157;ReadPosRankSum=0.985;SC=ATTTAGTGTTGGTTGAGCACA;SOR=0.723;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=36695131;WS=36695113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr22	36695173	rs2187776	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=313;SC=GCCCGGAAATCTGGGGCTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=36695181;WS=36695163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	36696087	rs6000235	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.866;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=305;ReadPosRankSum=0.119;SC=GCAGCAGCAGCGGGGAGCCAG;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=20;WE=36696095;WS=36696077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr22	36702149	rs8138016	G	A	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=819;ReadPosRankSum=3.437;SC=TAGAACAGTCGGAGAATAGTC;SOR=0.582;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=59;WE=36702157;WS=36702139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,70:0.41:170
chr22	36705529	rs1557529	A	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=53;PP=1430;SC=AACCCCATGCATGGAAAAGTC;SOR=3.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=63;WE=36705537;WS=36705519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	36708084	rs2413396	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=506;ReadPosRankSum=2.010;SC=TCCCCGTGAGCGCTCCTCACC;SOR=0.572;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=33;WE=36708092;WS=36708074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr22	36712472	rs5756152	A	G	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=7;PP=891;SC=AGATCGATGCAGGACCATGAG;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=36712480;WS=36712462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	36714522	rs139973547	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TCATTACCAGGACAACCGCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=36714530;WS=36714512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	36716202	rs3833922	C	CT	4080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=22;PP=2963;SC=CCTGATGCCCCGAGGCCGTGG;SOR=1.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=36716217;WS=36716192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr22	36716209	rs3752463	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.635;NF=38;NR=17;PP=814;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CCCCGAGGCCGTGGGTACCAG;SOR=0.680;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=55;WE=36716217;WS=36716192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,58:0.54:107
chr22	36716778	rs76083769	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=145;ReadPosRankSum=-1.240;SC=ATGTCTACGGTCCAATTCTGG;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=36716786;WS=36716768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr22	36722534	rs8136336	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=820;SC=AGCTGAAGCCGGGACCACTAA;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=36722542;WS=36722524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	36722838	rs11316214	CG	C	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.354;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=385;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TGGCAGAAAACGGGACTGCCA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=13;WE=36722846;WS=36722828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr22	36723697	rs5756157	T	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AGGAGCATCTTCGGGGGAGAG;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=36723705;WS=36723687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr22	36737703	rs11913874	C	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=0.401;SC=TCCCTGATGGCCCTTGCTCCC;SOR=0.299;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=14;WE=36737711;WS=36737693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr22	36744886	rs56147525	GC	G	1744.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.117;NF=24;NR=12;PP=1739;ReadPosRankSum=2.946;SC=GGGAAGACCCGCCCCCCCCCC;SOR=1.017;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=36;WE=36744906;WS=36744876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,39:0.83:47
chr22	36744888	rs56084634	C	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=-3.273;QD=34.27;ReadPosRankSum=2.346;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,43:0.84:51
chr22	36744888	.	CCC	GCT	1481	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.51;NF=25;NR=9;PP=1481;QD=45.1314080842;SC=GAAGACCCGCCCCCCCCCCCC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=34;WE=36744906;WS=36744876;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr22	36744890	rs55932404	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=-2.927;QD=32.98;ReadPosRankSum=3.173;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,43:0.81:53
chr22	36872750	rs2281082	T	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=590;SC=TATACTGGCTTCCCTGTGGCA;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=36872758;WS=36872740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	36891786	rs5756218	G	C	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=33;PP=2021;SC=GCCTGGCGGAGAGCACGACAC;SOR=1.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=96;WE=36891794;WS=36891776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	36891858	rs5756219	C	A	4826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=76;PP=2965;SC=GTTCATCATTCTCGGACCTTC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=158;WE=36891866;WS=36891848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr22	36900271	rs2277841	T	C	6394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=96;PP=2965;SC=CTGGTTGGTGTTGGCTTCTTC;SOR=0.811;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=206;WE=36900279;WS=36900261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr22	36900806	rs760718	A	G	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=63;PP=2103;SC=GTGGCTACAAAGAGGACGCTG;SOR=1.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=36900814;WS=36900796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	36907098	rs728785	T	C	5985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=105;PP=2965;SC=TGTGATATGATGTTCACTTTC;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=88;TCR=105;TR=193;WE=36907106;WS=36907088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr22	36962353	rs2267338	C	G	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=45;PP=2321;SC=TGAGCACCCACACCCCAGCCT;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=110;WE=36962361;WS=36962343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr22	37159202	rs117098009	A	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=0.773;SC=CCCACAGGGAAAGCCGGGGGT;SOR=1.426;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=17;WE=37159210;WS=37159192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr22	37159819	rs739002	T	C	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=8;PP=1159;SC=GGCTGCTAAGTGGCAGGGCCA;SOR=2.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=37159827;WS=37159809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	37163329	rs1048012	C	T	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=74;PP=2564;SC=CTGAGTTCCCCTGGGTAAAGG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=131;WE=37163337;WS=37163319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr22	37171611	rs2009667	A	G	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1142;ReadPosRankSum=0.553;SC=CCTTTGGGAGAGAGAAAGGAA;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=71;WE=37171619;WS=37171601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,79:0.46:171
chr22	37207319	rs113051616	CTAAATAAATAAA	C	278.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=1434;SC=GAGACTGTCTCTAAATAAATA;SOR=2.584;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=37207338;WS=37207309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	37207667	rs34262500	T	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=483;SC=TTTCTCTTCATCAGGTAGGTT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=37207675;WS=37207657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	37266322	rs2075938	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TAAACAACGCATTTCTGTTAT;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=6;WE=37266330;WS=37266312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr22	37267767	rs2072708	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.768;SC=CCCCGCCCCCACGCTGGCCAG;SOR=1.000;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=21;WE=37267775;WS=37267757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr22	37268257	rs5756374	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=377;ReadPosRankSum=-1.264;SC=CTTATTCTCCCCAAGCCTCAG;SOR=0.817;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=28;WE=37268265;WS=37268247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr22	37268501	rs2072710	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=383;ReadPosRankSum=-1.485;SC=GGTGAGATTGAAGGTGAGGTT;SOR=0.665;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=21;WE=37268509;WS=37268491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr22	37268555	rs2072711	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=0.036;SC=GTGGAAGTGCAATTGGAGGTG;SOR=0.515;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=16;WE=37268563;WS=37268545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr22	37271882	rs2075939	T	C	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=56;PP=1055;ReadPosRankSum=0.013;SC=CTACGACCACTGCCCCTCACA;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=77;TCR=120;TR=91;WE=37271890;WS=37271872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,120:0.48:248
chr22	37328751	rs2075936	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr22	37328968	rs4339047	G	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.537;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=1526;ReadPosRankSum=1.528;SC=TGCCCAGGGAGGGGAGAAACA;SOR=1.067;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=41;WE=37328976;WS=37328956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr22	37329999	rs1801117	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=715;ReadPosRankSum=1.021;SC=GGATCTGGAGCGAGTGGAGTG;SOR=0.704;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=48;WE=37330007;WS=37329989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr22	37330082	rs2075937	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=510;ReadPosRankSum=-1.851;SC=GACCAGCTCATAGTTTCTCAC;SOR=0.810;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=34;WE=37330090;WS=37330072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr22	37331305	rs2239749	A	G	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=611;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CGGGGTCTTAAGGAATACTGC;SOR=1.323;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=39;WE=37331313;WS=37331295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr22	37333794	rs131840	A	G	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=42;PP=2062;SC=CGATGGGACCAGGACAGGCCG;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=105;WE=37333802;WS=37333784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr22	37453259	rs710184	A	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=354;SC=GGTGCCTGGTAAATGCCTGGT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=37453267;WS=37453249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	37453452	rs710185	C	T	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=35;PP=1302;SC=CACCCAAGCACGTGTACCGCG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=37453460;WS=37453442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	37462926	rs2235321	G	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=7.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr22	37462936	rs855791	A	G	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=7.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.330;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr22	37464624	rs877908	T	C	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=487;ReadPosRankSum=0.400;SC=GTTCTAATCTTTGCTCCAGTC;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=36;WE=37464632;WS=37464614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,53:0.65:82
chr22	37467270	rs5756504	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCAGACTGGCCTATTGAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=37467278;WS=37467260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	37469386	rs111916270	AGATG	A	533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.003;NF=4;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=-2.052;SC=GGAGACCAGAAGATGGATGGA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=6;WE=37469397;WS=37469376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr22	37469591	rs4820268	G	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1119;ReadPosRankSum=1.982;SC=ACTGCTCTTCGTCGCTGCCGT;SOR=0.761;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=67;WE=37469599;WS=37469581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr22	37470536	rs2076086	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=259;ReadPosRankSum=0.069;SC=TTCCTGGGTGCTCATAATGGA;SOR=0.134;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=19;WE=37470544;WS=37470526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr22	37470604	rs2072860	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=577;ReadPosRankSum=0.817;SC=TGAGGAAGGAGAAGGGATGGG;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=39;WE=37470612;WS=37470594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr22	37480797	rs2111833	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=314;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GGGTTTGGGGCGAGTAGTAGC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=22;WE=37480805;WS=37480787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr22	37481041	rs2179229	G	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=663;ReadPosRankSum=1.306;SC=TCTGTAAAATGAGGACAGTAA;SOR=0.770;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=35;WE=37481049;WS=37481031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr22	37485595	rs2235326	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr22	37485724	rs2235324	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=480;ReadPosRankSum=-1.719;SC=ATGAGGTCCTTGGGGCCCTGC;SOR=0.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=35;WE=37485732;WS=37485714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr22	37491545	rs2743824	T	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,79:0.60:131
chr22	37491839	rs2543509	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=0.985;SC=TGGGGGGCCCACCCTGACAGC;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=13;WE=37491847;WS=37491837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr22	37492201	rs2743825	T	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CCCCTGCTCATGCACATCGAG;SOR=0.218;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=20;WE=37492209;WS=37492191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr22	37492585	rs5756512	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTAGTTTCCCCATTTGAAACA;SOR=1.087;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=13;WE=37492593;WS=37492575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr22	37499692	rs5756515	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
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chr22	37524619	rs228942	G	T	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=1189;ReadPosRankSum=3.714;SC=CCTCATCAGGGTCTTCCTCTG;SOR=0.831;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=71;WE=37524627;WS=37524609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,87:0.47:187
chr22	37531257	rs3830742	A	AGT	942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=1113;SC=TGTTCATGTAAGTGTGTGTGT;SOR=3.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=23;WE=37531265;WS=37531247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr22	37533795	rs228958	G	C	4641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.51;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	37535328	rs2281093	C	G	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=48;PP=1481;SC=GGGAGGCCACCGGGATGACCT;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=37535336;WS=37535318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	37539713	rs2235330	T	C	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=45;PP=1187;SC=TGACTGTAGGTGCCCACAGCC;SOR=1.305;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=37539721;WS=37539703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	37580442	rs11089827	A	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=679;ReadPosRankSum=1.060;SC=GCCGTCAGCCACCACAGCCTG;SOR=0.918;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=50;WE=37580450;WS=37580432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr22	37581383	rs7290488	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=828;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CCGTTGGCAGCCGCTGGCCAC;SOR=0.706;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=48;WE=37581391;WS=37581373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr22	37602583	rs11406761	G	GC	5306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=58;PP=2936;SC=CTTTCCCCAGGCCCTACAGGT;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=87;WE=37602591;WS=37602573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	37622999	rs62235085	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.606;NF=1;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=0.982;SC=CCATACACCCCTCCCACGCCA;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=37623007;WS=37622989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr22	37627845	rs8135343	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=107;ReadPosRankSum=-1.045;SC=GCCCTGGTTGGCACTGGGGAC;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=37627853;WS=37627835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr22	37628053	rs11374583	A	AG	1885.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.368;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.696;NF=6;NR=26;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AGAGCAAGCGAGGTTGCTAGT;SOR=0.358;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=32;WE=37628061;WS=37628043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,62:0.69:90
chr22	37628145	rs2285110	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.179;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=360;ReadPosRankSum=-0.110;SC=CACCCCAGGGAATGCTGGGGA;SOR=0.166;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=22;WE=37628153;WS=37628135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr22	37637841	rs2239775	C	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=145;ReadPosRankSum=0.048;SC=GAGATGCCCCCTGTCTGTGTT;SOR=0.180;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=37637849;WS=37637831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr22	37678551	rs3213556	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=31;PP=1491;SC=GCCAGCCCGAACAGCAGCTGG;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=78;WE=37678573;WS=37678541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	37678565	rs3213557	G	A	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=34;PP=1667;SC=CAGCTGGGTCGGCAAGCGACA;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=37678573;WS=37678541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	37678814	rs5995410	C	T	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=606;SC=GGACACACAGCAGTAGCAAAG;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=37678822;WS=37678804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	37678837	rs5995411	C	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=311;SC=GACGCTGTTTCCCCCTTCATA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=37678845;WS=37678827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	37691907	rs2269590	A	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=563;SC=GGTGGTTCCCATGCAGGACCC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=37691915;WS=37691897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	37695256	rs2301435	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=23;NR=24;PP=823;SC=CCCTTCCGCCTCCTCCCCCAG;SOR=0.854;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=37695264;WS=37695246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	37699377	rs2239822	T	C	12505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=185;NR=197;PP=2965;SC=GGCCGCCTTTTGAGCGCTTTG;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=382;TCF=185;TCR=197;TR=382;WE=37699385;WS=37699367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,465:1.00:465
chr22	37700177	rs2284050	T	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=22;PP=1350;SC=CTGGAAGTCTTCACAGAGGAG;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=37700185;WS=37700167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr22	37707140	rs55662193	C	T	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1270;ReadPosRankSum=0.402;SC=CCCCTGCCCCCGCCTCTCCCC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=81;WE=37707148;WS=37707130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,100:0.52:193
chr22	37707962	rs2269591	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=385;SC=AGGGCTGTCACGCTGATCAGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=37707970;WS=37707955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	37708004	rs2269593	T	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=501;SC=CTGAGCCTCCTGGAGGGCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=37708012;WS=37707994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	37770066	rs8142615	G	T	7339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=114;PP=2965;SC=TGCGCACCTCGATATAGTTGC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=110;TCR=114;TR=224;WE=37770074;WS=37770056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr22	37770357	rs7292751	A	G	8090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;PP=2965;SC=TAACCATGCCAAAGAGGCAGC;SOR=1.245;Source=Platypus;TCF=92;WE=37770365;WS=37770347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
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chr22	37888868	rs5756696	G	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=32;PP=1056;SC=ATACCAGCTCGTCGATACCCC;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=37888876;WS=37888858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr22	37899101	rs5756705	A	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=702;ReadPosRankSum=-1.046;SC=TGCAGGCCAAAGGTAGCGCAG;SOR=0.431;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=40;WE=37899109;WS=37899091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr22	37900243	rs3817802	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=1.306;SC=GGATGGAGCCGGCACTGGGGG;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=32;WE=37900251;WS=37900233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr22	37902177	rs738304	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=1.426;SC=TGCCAGGACCTCCACAATCTT;SOR=0.180;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=37902185;WS=37902167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr22	37902500	rs1997674	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=61;ReadPosRankSum=0.890;SC=CTATCACTTACTGAGCACTGT;SOR=0.018;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=9;WE=37902508;WS=37902490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr22	37904957	rs932326	C	G	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=37;PP=1674;SC=GACAAGTTCACCCAGGATTAT;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=37904965;WS=37904947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr22	37905173	rs932327	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-1.551;SC=CCCATGAAACACACTGGCTCT;SOR=1.402;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=37905181;WS=37905163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr22	37906262	rs9610775	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=518;ReadPosRankSum=-1.172;SC=CGCCGTCAGCCGCTGGTTCTC;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=30;WE=37906270;WS=37906252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr22	37906493	rs9610776	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TACAGGGGTGGGAAGACCTGC;SOR=0.092;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=15;WE=37906501;WS=37906483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr22	37964299	rs2281098	C	G	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=42;PP=1510;SC=TCATGAGCCTCCCAGAAGCCC;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=37964307;WS=37964289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	37964408	rs200195385	CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT	C	1600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=13;NR=19;PP=2975;SC=TGCAAACCCCCCAGCGCCTGC;SOR=0.741;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=32;WE=37964436;WS=37964398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	37964898	rs45487894	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-0.159;SC=CTGGTTCCTACCAGACCGGAG;SOR=1.051;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=17;WE=37964906;WS=37964888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr22	38015671	rs8138728	T	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=-0.944;NF=31;NR=11;PP=593;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GCGTGAGCCATGGCCTCCGGC;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=42;WE=38015679;WS=38015661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr22	38025375	rs2071766	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=347;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CAGAAAGGGGTAGGGAGCCCC;SOR=1.501;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=17;WE=38025383;WS=38025365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr22	38035851	rs13055139	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=1.245;SC=GCAGCTTGGGACGGTGAGTGT;SOR=0.805;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=29;WE=38035859;WS=38035841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr22	38037240	rs76166598	G	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=838;ReadPosRankSum=0.555;SC=GCAGAGGGCCGGGGCGGGGAC;SOR=0.577;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=56;WE=38037248;WS=38037230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr22	38039128	rs74516928	A	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=517;ReadPosRankSum=-0.607;SC=CCATCCTCAAACACAAGAAAA;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=31;WE=38039136;WS=38039118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr22	38039634	rs1894528	C	G	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.436;SC=ACCAGCTCACCTTGGGATCAT;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=82;WE=38039642;WS=38039624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,103:0.53:194
chr22	38039708	rs1894529	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=885;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GCAGCCCGGGTAGTCACAGCC;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=52;WE=38039716;WS=38039698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr22	38040842	rs713977	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=514;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TCAGCTTCCCCCACTTCCGCT;SOR=1.047;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=32;WE=38040850;WS=38040832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr22	38042982	rs45529337	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GGGGGAGGGGGTGCAGTGGCT;SOR=1.300;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=18;WE=38042990;WS=38042959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr22	38043062	rs78338419	T	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=0.969;SC=CTCGGGTTCTTAATGTGGGGT;SOR=0.586;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=7;WE=38043070;WS=38043052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr22	38043579	rs12165814	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=0.302;SC=AGCCCAGCTGAGGTCACGGAC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=38043587;WS=38043569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
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chr22	38051999	rs12483880	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
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chr22	38109353	rs144634857	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=674;ReadPosRankSum=-0.344;SC=CGAGGACCCCGGCTCTGACCC;SOR=0.515;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=41;WE=38109361;WS=38109343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr22	38120542	rs142024473	C	T	11800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.177;NF=220;NR=175;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GATCCCAGAGCCTCCTCTCCT;SOR=0.086;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=404;TCF=228;TCR=176;TR=395;WE=38120550;WS=38120532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,448:0.98:456
chr22	38121013	rs41302575	C	G	8183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=125;PP=2965;SC=AACCCCAGAACTTGTATTCAA;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=125;TCR=125;TR=250;WE=38121021;WS=38121003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr22	38130472	rs8140958	T	C	5430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=86;PP=2965;SC=CCCTCATCCTTGGAGTCCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=38130480;WS=38130462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr22	38146847	rs6519081	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=9;PP=373;SC=CACCGCCCACTCCACTGAGCC;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=38146855;WS=38146837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	38151000	rs56016429	A	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=20;PP=1370;SC=AGGTGAGGCCATGGGTGTACT;SOR=1.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=38151008;WS=38150990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	38155317	rs5756810	C	G	4948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=59;PP=2943;SC=CAGATTTCTGCTTGCCGTGTT;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=143;WE=38155325;WS=38155307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	38161835	rs3833924	T	TG	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=291;SC=GTATGGACCCTGGGGGGGGCA;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=13;WE=38161843;WS=38161825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	38165449	rs112733082	G	A	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=604;SC=GGGCACCCCCGCCATAGGCTG;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=38165457;WS=38165439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	38168508	rs762984	T	C	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=818;SC=TGAAGCGAGGTATCTGCGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=38168516;WS=38168498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	38211954	rs2285179	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=221;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GCTTCTGCCTGTTCCCCTCCC;SOR=0.569;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=14;WE=38211962;WS=38211944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr22	38212068	rs739269	C	T	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=9;PP=490;SC=CCTGGCTCCCCTCTGCCTCTT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=38212076;WS=38212058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	38212762	rs13911	A	G	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=43;PP=1281;SC=AGGTCCGCCTACTGCCACAGG;SOR=1.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=38212770;WS=38212752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	38220964	rs8138029	T	C	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=395;SC=TGCCCGTGGCTGTGGTGAGCC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=38220972;WS=38220954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	38227821	rs3091367	C	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=510;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CCCACGGCATCTGCGGGTGAG;SOR=0.376;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=34;WE=38227829;WS=38227811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr22	38228644	rs143173080	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=630;ReadPosRankSum=-1.746;SC=TGCAGCTCACCTGCTCTTTGG;SOR=1.006;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=39;WE=38228652;WS=38228634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr22	38243675	rs5750504	A	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=554;ReadPosRankSum=-1.012;SC=AATTTTACAAAAGCAAAGGAC;SOR=0.634;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=36;WE=38243683;WS=38243665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr22	38245262	rs6000907	C	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=582;ReadPosRankSum=1.022;SC=GCCTCCCAAACTGGTGGGGTT;SOR=1.052;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=32;WE=38245270;WS=38245252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr22	38246737	rs76025187	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTCCTGAAACGTTATAGTGAC;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=38246745;WS=38246727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr22	38251629	rs11551384	C	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=1.305;SC=AGGCTGAAGCCATTGCTCCAC;SOR=2.431;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=20;WE=38251637;WS=38251619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr22	38251686	rs2157472	T	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=27;PP=799;SC=GTGCACTGAGTGGAATCCAGT;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=38251694;WS=38251676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	38266376	rs79618396	C	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=1.853;SC=AGGCCGACAGCCGTGGCCTGC;SOR=0.882;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=19;WE=38266384;WS=38266366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr22	38273749	rs9466	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=231;ReadPosRankSum=-3.058;SC=CCATGCGTATTGATGAGAGCA;SOR=0.807;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=22;WE=38273757;WS=38273739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr22	38307909	rs6519091	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=701;ReadPosRankSum=0.402;SC=CGCCCCTATTTCCCAGTCACC;SOR=0.726;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=48;WE=38307917;WS=38307899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,54:0.39:138
chr22	38308048	rs3041723	ATGTG	A	1068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.964;NF=1;NR=23;PP=983;ReadPosRankSum=-1.792;SC=GGCTCTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=0.735;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=24;WE=38308059;WS=38308038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr22	38308291	rs1003689	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.150;SC=GCTGAGGGGTCGCCCCCTAAC;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=38308299;WS=38308281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr22	38323507	rs9610875	G	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=698;ReadPosRankSum=0.869;SC=GTCTGAGAGCGCCAGCCAGAC;SOR=0.336;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=41;WE=38323515;WS=38323497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr22	38341134	rs139859	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGTCCTTCCCTGTGGCAAAGA;SOR=0.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=31;WE=38341142;WS=38341124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr22	38369976	rs139884	A	G	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1018;ReadPosRankSum=1.469;SC=AGCTGCTCACATGGCCTGGGT;SOR=0.458;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=66;WE=38369984;WS=38369966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,76:0.49:155
chr22	38453679	rs5845366	A	AG	1058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=1043;SC=GTCCCGTATGAGGTGGTGGAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=25;WE=38453687;WS=38453669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	38481516	rs9610902	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=470;SC=TCCTTGCCCCGCTTCATCTTT;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=20;WE=38481524;WS=38481506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	38482352	rs66500630	GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA	G	1451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=7;NR=5;PP=2966;SC=CCGGCTTGGGGTGCGGGAGCG;SOR=1.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=12;WE=38482401;WS=38482342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	38483155	rs142739979	T	TTCATGGGTG	1597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.281;NF=15;NR=25;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GTTCCCGGGGTTCATGGGTGT;SOR=0.938;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=40;WE=38483163;WS=38483145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr22	38483174	rs200930717	A	ACATGGAGGT	1613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.717;NF=12;NR=27;PP=2981;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GTCATGGGGGACATGGAGGTC;SOR=0.719;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=39;WE=38483182;WS=38483164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr22	38485064	rs62235125	C	G	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=18;PP=528;SC=CCCCGCGCCTCTCCCGGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=38485072;WS=38485054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	38485540	rs17856487	A	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=7;PP=314;SC=ATGTCCAGGCAGGTGGGCGTC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=38485548;WS=38485530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	38490056	rs4373009	C	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=777;SC=GGAAGCCAGTCGCAAAAGAGC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=38490064;WS=38490046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	38494005	rs147676763	CGGTCTCGCCCCGA	C	1741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=17;NR=4;PP=2936;SC=TCCCAGGGCCCGGTCTCGCCC;SOR=2.191;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=21;WE=38494025;WS=38493995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	38503847	rs6001006	C	T	6149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=103;PP=2965;SC=GGCCCTGGGGCCTGATACTCA;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=92;TCR=104;TR=195;WE=38503855;WS=38503837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr22	38503968	rs13054158	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=-0.657;SC=CAGCCTGCCCCGCCCACCCAC;SOR=1.592;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=31;WE=38503976;WS=38503958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr22	38504372	rs5750540	T	C	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=46;PP=1281;SC=GGGACAGGTCTGGTCCAGCCC;SOR=1.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=38504380;WS=38504362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr22	38505347	rs6001008	G	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.27;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	38505356	rs6001009	A	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.18;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	38506509	rs4820313	A	G	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=45;PP=1636;SC=TGGACCTGTAAAACTGGTCCA;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=82;WE=38506517;WS=38506499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr22	38512402	rs11089863	G	A	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.906;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=65;PP=2164;ReadPosRankSum=-1.114;SC=CTGGAGGAGTGTCAGATTGGT;SOR=0.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=107;WE=38512410;WS=38512392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr22	38512562	rs12167576	G	A	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=17;PP=486;SC=CACTGCAGACGTTAGAAAAAG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=38512570;WS=38512552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	38528888	rs11570680	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=400;ReadPosRankSum=0.105;SC=CGGGCATCCGCGTTGGCCCCG;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=25;WE=38528896;WS=38528878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr22	38535946	rs12329956	G	A	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=16;PP=1562;SC=CAGGAGAGCTGGAGCCCAGCA;SOR=2.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=38535954;WS=38535936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	38539041	rs4375	T	C	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=6;PP=1064;SC=CACCTGAGCCTAGGGGCCCAA;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=38539049;WS=38539031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	38540837	rs149247706	CATAAAATAAA	C	133	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=62.13;NF=2;NR=2;PP=679;SC=CATAACGTAACATAAAATAAA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=38540854;WS=38540827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	38543453	rs2284060	T	C	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=69;PP=2107;SC=GAGAGTGCGTTGATTAACAGT;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=38543461;WS=38543443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr22	38559448	rs731821	C	A	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=17;PP=2106;SC=GCGTGGCACACCACCAGGCAT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=89;WE=38559456;WS=38559438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	38564041	rs9622746	C	G	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=65;PP=2464;SC=CTTCCAGACGCAGAGTAGCTC;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=117;WE=38564049;WS=38564031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
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chr22	38699050	rs3830720	GAGGC	G	5921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=91;PP=2973;SC=TCAGGGGTCAGAGGCAGGCAG;SOR=1.576;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=109;TCF=13;TCR=96;TR=101;WE=38699061;WS=38699040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr22	38823136	rs196059	T	C	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=945;ReadPosRankSum=-0.454;SC=TGTGAAAACGTGAGTAGTCCA;SOR=0.670;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=198;TCF=102;TCR=96;TR=86;WE=38823144;WS=38823126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,105:0.44:240
chr22	38823838	rs79928737	C	T	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=56;PP=1789;ReadPosRankSum=1.625;SC=CACCACCCGCCGCCGGGCCCC;SOR=0.868;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=207;TCF=100;TCR=107;TR=101;WE=38823846;WS=38823828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,108:0.46:236
chr22	38875549	rs401933	C	T	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=29;PP=1910;SC=GTAAATAGGCCGGGAAATGAC;SOR=1.585;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=38875557;WS=38875539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	38917543	.	TAC	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.297;NF=4;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ACCCCGTCTCTACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=38917552;WS=38917533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr22	39016403	rs5995598	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=0.000;SC=GACACCCACCAGATCTAGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=11;WE=39016411;WS=39016393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr22	39024961	rs5995602	G	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=44;PP=1195;SC=AAAATTCACAGTATTATTATT;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=58;WE=39024969;WS=39024951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	39078861	rs200420197	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TCATGCTCACCCTCTGGGGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=39078869;WS=39078851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr22	39112647	.	C	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=728;ReadPosRankSum=0.629;SC=ATGGGTTCATCTACACGCAGG;SOR=1.508;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=41;WE=39112655;WS=39112637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr22	39178701	rs760482	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=426;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTCGCTTATAATCAGCCTCAT;SOR=0.439;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=28;WE=39178709;WS=39178691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr22	39222574	rs139762084	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.615;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=879;ReadPosRankSum=0.358;SC=TGGCCTGCCCGGGCACTGAGT;SOR=0.836;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=59;WE=39222582;WS=39222564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,64:0.37:174
chr22	39222652	rs5757299	G	A	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=78;PP=2965;SC=CGGTGAATGCGTAGAGCTCGG;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=160;WE=39222660;WS=39222642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	39224248	rs5757300	T	C	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=50;PP=2046;SC=GGCTCTGTCATCCTGAGGACC;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=108;WE=39224256;WS=39224238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr22	39239172	rs3747176	C	G	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=107;SC=CGGGGACCGCCGGACGACCGC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=39239180;WS=39239162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	39267312	rs1122771	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGGCTGAGGCCTGCCATCAGG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=39267320;WS=39267302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr22	39355415	rs1977069	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GAGGTTTGGAAGTGTGCTAAG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=12;WE=39355423;WS=39355405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr22	39355717	rs5750717	G	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=444;SC=ATCCGAATCCGGGCAGGGCCC;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=39355725;WS=39355707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	39382079	rs5995649	C	A	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=60;PP=2352;SC=GCCCGCGTGACGATCATGGAC;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=111;WE=39382087;WS=39382069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr22	39413668	rs1969643	C	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=934;SC=AATAAGGAAACGGCCCGGGGC;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=39413676;WS=39413658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	39414166	rs4820361	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=14;PP=658;SC=GGACCGGGCCAGCGCCCACTG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=39414174;WS=39414156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	39414224	rs4821854	A	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=9;PP=977;SC=GCCCAGGGCCAGGAGAGAGGC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=39414232;WS=39414214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	39477123	rs5757465	T	C	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=0.891;NF=55;NR=57;PP=1526;ReadPosRankSum=1.606;SC=TGACCATCTTTGTTGCCCGCC;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=96;TCR=100;TR=112;WE=39477131;WS=39477113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,136:0.56:242
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chr22	39496322	rs140936762	TAAC	T	2502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.228;NF=9;NR=30;PP=2717;ReadPosRankSum=-1.051;SC=GCTTACAGTTTAACAACAAGC;SOR=0.683;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=27;TCR=80;TR=39;WE=39496344;WS=39496312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,69:0.40:171
chr22	39496336	rs139293	G	T	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.190;NF=27;NR=34;PP=2711;ReadPosRankSum=-1.052;SC=AACAAGCGCCGCCTCAGAAGG;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=65;TCR=82;TR=61;WE=39496344;WS=39496312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr22	39496412	rs139294	G	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.013;NF=10;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=0.705;SC=CCACGCCCACGAGAGGCTACT;SOR=0.270;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=33;WE=39496420;WS=39496402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr22	39497181	rs9611092	T	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=0.718;SC=CCGCCCCCAGTCACATGACTC;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=39497189;WS=39497171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr22	39497404	rs139297	G	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=524;ReadPosRankSum=1.151;SC=TCTGAACCTGGGCATCTTCGC;SOR=1.035;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=47;WE=39497412;WS=39497394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr22	39497452	rs139298	A	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr22	39497452	.	AAG	GAC	705	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=17;PP=705;QD=30.3387149945;SC=GCCCCAGCAGAAGGGGCTGCG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=25;WE=39497462;WS=39497442;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr22	39497454	rs139299	G	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr22	39497509	rs139300	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=513;SC=GGGCTTCCCAAGTAGGAAAGA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=39497517;WS=39497499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	39497811	rs139301	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=1.889;SC=AGAATTCCCCAGACAGAGCAA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=15;WE=39497819;WS=39497803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr22	39498038	rs139302	G	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=767;ReadPosRankSum=0.687;SC=GACGGCTTGAGAGGATAAAGG;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=48;WE=39498046;WS=39498028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr22	39498373	rs139304	TA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=356;SC=AGGCTGGTCTTAGAACTCTTG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=39498381;WS=39498363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	39498677	rs139305	A	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr22	39499575	rs139313	G	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CAGGCCTTCTGGGCCCTTCTG;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=39499583;WS=39499565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr22	39499604	rs139314	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=1.392;SC=TCTTTTCTCTTCCTAATGATC;SOR=1.193;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=12;WE=39499612;WS=39499594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr22	39499653	rs139315	C	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CTGTGGTGTCCCACCAGTTGG;SOR=0.770;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=25;WE=39499661;WS=39499643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr22	39499763	rs139316	T	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=600;ReadPosRankSum=1.000;SC=ATCCCACTCATTATCAAGAAG;SOR=0.588;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=40;WE=39499771;WS=39499753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr22	39499902	rs139317	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-1.843;SC=AGAAGACCTTCCTTTCCTCCT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=39499910;WS=39499892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr22	39530601	rs370683851	G	A	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=960;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GGGAAGGGCAGGGTGGGCACC;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=62;WE=39530609;WS=39530591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,88:0.58:152
chr22	39626024	rs2239769	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-0.173;SC=ATTTTTAAGACCGGCCCCTGC;SOR=2.670;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=39626032;WS=39626014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr22	39626375	rs4821874	A	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.330;SC=GTGGGGCAAAAGCTTTGGCCC;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=39626383;WS=39626365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	39629329	rs11704525	C	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=338;ReadPosRankSum=0.712;SC=GTGGGGGGAACGGGAGTTGTA;SOR=0.374;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=22;WE=39629337;WS=39629319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr22	39636928	rs5757575	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.17;MQRankSum=0.663;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.334;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
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chr22	39636930	rs5757576	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.36;MQRankSum=3.354;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
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chr22	39712981	rs137623	A	G	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=42;PP=1432;SC=CTTTTCCACCAGCAAGCGGAG;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=78;WE=39712989;WS=39712971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	39713105	rs470081	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=480;SC=CCTTTCTGCCCTGGGGAAGCC;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=39713113;WS=39713095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	39713128	rs2072872	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CTCAGTGATGAAGGAAATGGG;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=5;WE=39713136;WS=39713118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr22	39714490	rs6509	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.251;NF=15;NR=35;PP=753;ReadPosRankSum=-1.638;SC=CCGGCTTGGACGGGTCATCCT;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=50;WE=39714498;WS=39714480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr22	39714908	rs137625	A	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=9;PP=919;SC=GCAGCTTTATATGCCAATTAG;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=39714916;WS=39714898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	39715140	rs470082	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=463;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CTCCAGAGGCCTTCGGAGTGC;SOR=1.402;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=24;WE=39715148;WS=39715130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr22	39715608	rs143897309	C	T	4000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=82;PP=2163;ReadPosRankSum=0.381;SC=ACCATCACGCCATCAAATCCC;SOR=0.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=347;TCF=174;TCR=173;TR=166;WE=39715616;WS=39715598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,205:0.47:432
chr22	39746186	rs142884306	ACCGACC	A	1057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.029;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.095;NF=0;NR=24;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GCGCGCCCGGACCGACCCCGA;SOR=1.813;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=4;TCR=61;TR=24;WE=39746199;WS=39746176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr22	39770597	rs4821888	A	G	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=88;PP=2965;SC=CACAGAGTCTACAGAGGGCTG;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=148;WE=39770605;WS=39770587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr22	39770780	rs4820377	G	A	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=405;SC=GCAGGGGAGCGTGGATGGGAT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=39770788;WS=39770770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	39777822	rs149306472	C	CCAA	8706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=87;PP=2924;SC=TACGTGGAGCCCACTGGGCCG;SOR=1.087;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=6;TCR=92;TR=93;WE=39777830;WS=39777812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	39795683	rs4821892	G	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=292;SC=CCCTCTTCGGGCGTGGGGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=39795691;WS=39795673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	39812986	rs6001585	C	A	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=29;PP=1009;SC=GAGCAACAGGCGTTAGGGAGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=39812994;WS=39812976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr22	39966856	rs3747178	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=769;ReadPosRankSum=-1.374;SC=GCCCCCCATCCTCCCCGCCAG;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=47;WE=39966864;WS=39966846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr22	39969767	rs5750851	T	C	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=38;PP=1486;SC=CTCACCTCCATCCTCAGGTCA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=39969775;WS=39969757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr22	39994105	rs760546	A	G	4756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=54;PP=2708;SC=GGTGCACCCCAGCCCCCACGG;SOR=1.316;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=100;TCR=54;TR=154;WE=39994113;WS=39994095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	40015493	rs12628643	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TAGCCAATGCCCACCCCCCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=12;WE=40015501;WS=40015483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
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chr22	40054948	rs5757761	T	C	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.001;SC=TCTGGGAGATTGTGGGGCAGG;SOR=0.775;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=84;TCR=70;TR=78;WE=40054956;WS=40054938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
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chr22	40057273	rs136852	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=352;ReadPosRankSum=1.090;SC=GAAAGAGCAGTGTCATGTCTC;SOR=1.107;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=34;WE=40057281;WS=40057263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr22	40058186	rs136853	A	G	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=646;ReadPosRankSum=0.117;SC=CGCCCACCACATTCATCACGG;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=49;WE=40058194;WS=40058176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr22	40058999	rs136854	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=1.444;SC=CGGACCCTCCCGGCCCAGAGG;SOR=1.112;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=40059007;WS=40058989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr22	40061683	rs136855	A	G	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1492;ReadPosRankSum=-1.706;SC=GGGAAAAGGAAGTCTCAGACA;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=81;WE=40061691;WS=40061673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,85:0.52:164
chr22	40075400	rs2294369	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=300;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GGCGGGCGGCGGGGGCGACAC;SOR=0.213;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=15;WE=40075408;WS=40075390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr22	40075473	rs7288746	T	C	238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=6;PP=137;SC=TGGAGAGGTGTGAGGGTCGCC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=40075481;WS=40075463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	40075948	rs58439755	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=-0.981;SC=TGTCCGAGGGCAGAGCCTGGC;SOR=0.392;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=40075956;WS=40075938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr22	40161181	rs71326782	T	TTG	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.917;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.924;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
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chr22	40415140	rs2071771	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=1.694;SC=GTGTAGACACCGTGTGCCTCA;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=16;WE=40415148;WS=40415130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr22	40417571	rs35823589	G	A	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=55;PP=1700;ReadPosRankSum=0.366;SC=GGAGGCGGGCGGCAACCCGGA;SOR=0.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=196;TCF=85;TCR=111;TR=93;WE=40417579;WS=40417561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr22	40417780	rs5995793	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.892;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1523;ReadPosRankSum=0.056;SC=CCAGCCGAAACGGCATGGGAG;SOR=1.081;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=178;TCF=70;TCR=108;TR=89;WE=40417788;WS=40417770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,103:0.50:205
chr22	40417820	rs5995794	A	G	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1167;ReadPosRankSum=-1.670;SC=CGCCCCCGCCAGGCGCTTCAG;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=72;WE=40417828;WS=40417810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr22	40545998	rs35899845	C	CA	955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=408;ReadPosRankSum=-2.046;SC=TGAAAGCCAACAAAAAATTGA;SOR=0.752;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=16;WE=40546006;WS=40545988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr22	40546041	rs35629137	C	CA	1228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=773;ReadPosRankSum=0.461;SC=AAAGTAGAGTCAAAAAGGTTT;SOR=0.551;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=23;WE=40546049;WS=40546031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr22	40546153	rs5995826	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=184;ReadPosRankSum=-1.367;SC=AGGCCAAGGCGGGCAGATCAC;SOR=0.714;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=13;WE=40546161;WS=40546143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr22	40574170	rs6001827	T	A	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=1062;ReadPosRankSum=1.784;SC=CAATTTTTTTTAACCAATTGA;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=82;TCR=39;TR=64;WE=40574178;WS=40574160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr22	40641980	rs3752513	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=397;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GATTGTGAATGTAGATGTATA;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=23;WE=40641988;WS=40641970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr22	40673999	rs2413621	C	T	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=44;PP=2164;SC=TCTTTATTTTCCAGAGTCAGA;SOR=0.902;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=102;WE=40674007;WS=40673989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr22	40676986	rs5750929	T	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TATTATCAGATCCAAATTCCA;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=40676994;WS=40676976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr22	40677001	rs929070	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=486;SC=ATTCCATCCTTGGTTATTGCT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=40677009;WS=40676991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	40681788	rs6001862	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=722;ReadPosRankSum=0.721;SC=AGCAATTTTACGTTCCTGTGA;SOR=0.817;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=45;WE=40681796;WS=40681778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr22	40697377	rs5995843	A	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=820;ReadPosRankSum=-2.382;SC=TTAGAAATCTACCTCTCTAGG;SOR=1.074;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=48;WE=40697385;WS=40697367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr22	40708679	rs2072858	T	C	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1412;ReadPosRankSum=0.514;SC=GCATCTCTTATATGTTCAACA;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=194;TCF=90;TCR=104;TR=90;WE=40708687;WS=40708669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,116:0.50:234
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chr22	40803748	rs112435981	C	T	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.384;SC=AGGCGCTGGCCCAGGGCACCC;SOR=0.543;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=65;WE=40803756;WS=40803738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,72:0.50:144
chr22	40814500	rs878756	T	C	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=79;PP=2837;SC=TTGATGAGGCTGGGGCCCTGA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=163;WE=40814508;WS=40814490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr22	40814594	rs56211152	C	T	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.552;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=81;PP=2633;ReadPosRankSum=-0.687;SC=ACGGGGGCCCCGGGGCCACAG;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=140;WE=40814602;WS=40814580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr22	40816749	rs2072856	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=3;PP=420;SC=CAGACCAGCGGGTCCTTAAAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=40816757;WS=40816746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	41170063	rs2076674	T	C	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=871;ReadPosRankSum=1.239;SC=ACTGTTGCTGTTTTTTAAAAT;SOR=0.459;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=58;WE=41170071;WS=41170053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr22	41172351	rs6002128	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=381;SC=GAGTGCTTCAAAAAAGCTAAA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=41172359;WS=41172341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	41175263	rs5758077	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=0.583;SC=GGTAAGGTGTCTCTTTGTGCC;SOR=0.634;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=14;WE=41175271;WS=41175253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	41194909	rs138306	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-1.891;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr22	41195191	rs113851841	A	AGTGGCATGGTT	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.064;NF=0;NR=9;PP=2954;ReadPosRankSum=0.893;SC=GCTGGAGTGCAGTGGTTTACG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=41195199;WS=41195181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr22	41228266	.	ATTAT	A	3915.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=51;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.539;SC=GGTAATGCTAATTATAGATTT;SOR=0.656;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=18;TCR=92;TR=60;WE=41228279;WS=41228256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,100:0.55:182
chr22	41228271	.	A	G	3929.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TGCTAATTATAGATTTTCTAT;SOR=0.592;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=48;TCR=92;TR=77;WE=41228279;WS=41228256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,100:0.57:175
chr22	41302973	rs5995963	A	T	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.206;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=25;PP=2473;ReadPosRankSum=-0.715;SC=ACCAAGCCCCATTATGGTCAC;SOR=2.063;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=96;WE=41302981;WS=41302962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr22	41513094	rs2144342	G	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=307;SC=GAGTGAGGTTGGGAAATGACA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=41513102;WS=41513084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	41537234	rs6002267	G	T	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=70;PP=2248;SC=CTAGTAAGTGGTTTTTGTTAT;SOR=1.304;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=110;WE=41537242;WS=41537224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr22	41542753	rs61756763	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=634;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ATGGCCCTCTACCTGACCCAA;SOR=0.893;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=46;WE=41542761;WS=41542743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,52:0.34:154
chr22	41550954	rs4822011	C	T	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=7;PP=1708;SC=TAAAGTTCTTCTGCTTAATTG;SOR=4.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=68;TCR=8;TR=75;WE=41550962;WS=41550944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	41551039	rs20552	T	A	8129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.17;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr22	41568480	rs2076577	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=1;PP=1133;SC=GAAATTCCTATATGTACATGC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=41568488;WS=41568470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	41569609	rs2076578	C	T	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=12;PP=1693;SC=TTCTTGTCTCCTTTGTGCTAC;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=72;WE=41569617;WS=41569599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	41604399	rs4820432	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=7;PP=299;SC=CTCCCAAAGTGCTGGGATTAC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=41604407;WS=41604389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	41623029	.	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GCCTCCGGGCCGGGGCAAGCC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=41623037;WS=41623019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr22	41645500	rs139500	TG	T	2139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.402;NF=10;NR=47;PP=1293;ReadPosRankSum=4.276;SC=CAAAGTCACCTGGGGGGGCCC;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=57;WE=41645508;WS=41645490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,87:0.51:171
chr22	41645757	rs71948	C	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1287;ReadPosRankSum=1.455;SC=TGTGCACGAGCAGCCTGGTGA;SOR=0.494;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=76;WE=41645765;WS=41645747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr22	41652345	rs470112	C	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GGCCAGGACACCAGGTTCTAC;SOR=0.432;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=37;WE=41652353;WS=41652335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr22	41660645	rs2235851	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=451;ReadPosRankSum=0.538;SC=GGGACTCTGCGGGGAGGGGGC;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=28;WE=41660653;WS=41660635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr22	41660964	rs139520	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=1.074;SC=TGCAGAACCAACACAGACACA;SOR=0.156;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=17;WE=41660972;WS=41660954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr22	41829794	rs6609	C	G	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.36;QD=30.24;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	41833116	rs202641	C	T	8933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=149;PP=2965;SC=CATCTTCCACCGCCAGGCCAC;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=118;TCR=149;TR=267;WE=41833124;WS=41833106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr22	41864216	rs505533	A	C	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=67;PP=2341;SC=GGAGAAGTACATCCTCGAGCT;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=116;WE=41864224;WS=41864206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr22	41911525	rs1799932	C	T	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=17;PP=556;SC=CCCCTGGGAGCTGAAGTGCCC;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=34;WE=41911533;WS=41911515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	42016699	rs2267437	C	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=314;ReadPosRankSum=0.340;SC=CCTCGGCCAGCCGCCACCCTC;SOR=3.451;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=17;WE=42016707;WS=42016689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr22	42059768	rs132788	G	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.927;NF=2;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGAAGAGTGGGCTGAAGAAGC;SOR=1.078;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=13;WE=42059776;WS=42059758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr22	42076381	rs5758405	C	A	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=40;PP=1437;SC=ATGGGGGGGACATAAAAATAT;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=42076389;WS=42076371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr22	42089623	rs739134	T	C	5827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=67;PP=2965;SC=CCAGGAATCATGGGCCCAGAA;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=103;TCR=67;TR=170;WE=42089631;WS=42089613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr22	42109917	rs5758431	A	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=259;SC=GCAAATCACTATCCTGCACTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=42109925;WS=42109907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	42111896	rs9306355	A	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1110;SC=CCAGTGGGGGAGCTGGACACT;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=42111904;WS=42111886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	42139054	rs5751147	G	A	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=413;SC=TTGCCTTACCGTGAACCTGCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=42139062;WS=42139044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	42139078	rs5751148	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=5;PP=492;SC=GTCTCTCTGGATGCAGGAAGG;SOR=1.688;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=42139086;WS=42139068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	42140792	rs56663311	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=60.46;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42140793	rs62236786	C	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=60.46;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42140798	rs56138604	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	42140800	rs58323591	C	CTTTG	339.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=56.62;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	42141871	rs79093738	C	CA	1321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.045;NF=11;NR=14;PP=1019;ReadPosRankSum=1.793;SC=TGGATATACTCACACATTGAT;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=25;WE=42141879;WS=42141861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr22	42148467	rs715498	G	A	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=28;PP=2151;SC=CTAGACAGTGGTGGAGTACAT;SOR=1.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=75;TCR=28;TR=103;WE=42148475;WS=42148457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr22	42150146	rs1534932	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=30;PP=834;SC=AGTACAGCCACGAGATTTCTT;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=42150154;WS=42150136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	42159229	rs2050033	G	T	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=50;PP=2693;SC=TCCTCCTGTCGCTGCAGGACC;SOR=1.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=121;WE=42159237;WS=42159219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr22	42172080	rs5996064	C	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=793;ReadPosRankSum=0.846;SC=ACCCTCTGATCTCTGGCTTTC;SOR=0.478;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=47;WE=42172088;WS=42172070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr22	42190309	rs738247	A	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=303;ReadPosRankSum=0.465;SC=CAATAGGAGAAGGTCCTCTTG;SOR=1.276;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=18;WE=42190317;WS=42190299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr22	42274034	rs9623465	G	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=959;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TTGTGAAGCTGCTGGTTCATG;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=59;WE=42274042;WS=42274024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,78:0.50:155
chr22	42276742	rs2228314	G	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=751;ReadPosRankSum=0.308;SC=GCTGCTGCCGGCAACCTACAA;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=43;WE=42276750;WS=42276732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr22	42301712	rs2157590	T	C	918.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=748;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTCTCTCTCTCCCCCTCAGC;SOR=0.384;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=49;WE=42301720;WS=42301702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr22	42306369	rs146103768	CGTGCGCCCAG	C	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=2513;ReadPosRankSum=1.095;SC=TCCGGGAGCTCGTGCGCCCAG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=7;WE=42306386;WS=42306359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr22	42388841	rs133299	G	A	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=39;PP=1314;SC=GCATCTATAGGTCAAGGCACT;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=42388849;WS=42388831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	42390093	rs133301	C	T	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=797;SC=GATGTCGTGCCCATTGTAGCT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=42390101;WS=42390083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	42390887	.	C	CTGTG	999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.910;NF=0;NR=20;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.888;SC=AGCATCTTGTCTGTGTGTGTG;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=20;WE=42390895;WS=42390873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr22	42416056	rs133335	A	G	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=88;PP=2965;SC=AGAAATGGAGATGCCATTGAA;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=185;WE=42416064;WS=42416046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr22	42418185	rs133341	T	C	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=7;PP=1390;SC=GTTAATTGTTTAGTTGATATC;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=42418193;WS=42418175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	42423110	rs2301521	G	C	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=57;PP=2228;SC=CCAGGCCTCAGGAATCTACAG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=116;WE=42423118;WS=42423100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr22	42423317	.	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TTTGGAAGGGCAATCTTATGG;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=23;WE=42423325;WS=42423307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr22	42428727	rs133349	A	T	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=47;PP=1868;SC=GGTGGGGCAGACAACCATGGA;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=42428735;WS=42428709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	42463366	rs133367	C	T	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=48;PP=1514;SC=TATCTGACCCCGTCCCATTAA;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=42463374;WS=42463356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	42463689	rs133368	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=2;PP=375;SC=ATCTCAATCATGTAAGTGAGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=42463697;WS=42463679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	42463814	rs133369	C	T	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=23;PP=844;SC=GCTTGGGATCCGGCATCAGGC;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=42463822;WS=42463804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	42473603	rs133383	C	T	6800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=89;PP=2965;SC=ACCTGCTGGCCGCAGAAGGGC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=105;TCR=89;TR=194;WE=42473611;WS=42473593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr22	42522613	rs1135840	G	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=10;PP=439;SC=GGGGGATGGGGTCACCAGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=42522621;WS=42522603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	42523309	.	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQRankSum=-4.379;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.747;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr22	42523315	.	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQRankSum=-3.903;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.132;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr22	42523409	rs1985842	G	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.974;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.836;NF=35;NR=8;PP=843;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TATCACCAGGGGCTGGTGCTG;SOR=1.924;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=43;WE=42523417;WS=42523399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr22	42523943	rs16947	A	G	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=51;NR=40;PP=1718;SC=ACCACTATGCACAGGTTCTCA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=91;WE=42523951;WS=42523933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr22	42524708	rs111564371	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-1.635;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr22	42524713	rs112568578	C	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-1.409;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr22	42524743	rs113889384	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.719;NF=11;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=1.403;SC=GGCACCTCTCGGGAGCTCGCC;SOR=1.110;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=14;WE=42524751;WS=42524733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr22	42524795	.	A	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.487;NF=18;NR=12;PP=471;ReadPosRankSum=2.465;SC=CCTCGCGCAGAAAGCCCGACT;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=30;WE=42524803;WS=42524785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr22	42524924	rs111606937	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=30.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQRankSum=-3.642;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.052;SOR=4.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,10:0.14:69
chr22	42525132	rs1058164	G	C	5216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=72;PP=2965;SC=GCAAGGTGGAGACGGAGAAGC;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=154;WE=42525140;WS=42525122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	42525952	rs71328650	C	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.53;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	42526484	rs28371699	A	C	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=199;SC=TTCTCCAGGAAGTCCCCCAAA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=42526492;WS=42526474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	42526524	rs29001678	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=89;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.230;NF=7;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CTGGCTTCTGGTCCAGCCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=8;WE=42526532;WS=42526514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr22	42526549	rs56011157	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=10;PP=620;SC=TCACCCACCACCCATGTTTGC;SOR=1.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=31;WE=42526588;WS=42526539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	42526561	rs28695233	GG	TC	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.43;QD=44.14;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	42526567	rs76312385	G	A	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.30;QD=45.47;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	42526571	rs74644586	C	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.55;QD=45.45;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	42526573	rs1080996	T	G	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.79;QD=46.70;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	42526580	rs1080995	G	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.44;QD=41.31;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	42536211	rs2092118	G	A	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=213;SC=CAGGGGACCCGAGTTGGAACT;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=42536219;WS=42536201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	42536660	rs143457816	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.331;NF=22;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=0.183;SC=TCTTCCAGACGGCCTCATCCT;SOR=0.675;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=42;WE=42536668;WS=42536643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr22	42537196	rs56404506	T	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.523;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.803;NF=20;NR=9;PP=472;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TTCGATGTCATGGGATGTCAT;SOR=1.367;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=42537204;WS=42537186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr22	42537271	rs28510588	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=18;PP=1100;SC=GGCAGTGGTGTAGGGCATGTG;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=42537279;WS=42537261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr22	42537597	rs1800754	A	G	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.96;NF=44;NR=28;PP=1490;SC=CAGCGTGGTCAAGGTGGTCAC;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=72;WE=42537605;WS=42537587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	42538029	rs1058167	A	G	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=69;PP=2371;SC=TGGGATGTGCAGGAGGACGGG;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=42538037;WS=42538019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	42538103	rs3021083	T	C	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=1000;SC=TCTGCGTTCATCTGGACCAGT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=42538111;WS=42538093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	42538618	rs2267448	A	G	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.25;QD=29.43;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	42538669	rs2856955	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=17;PP=849;SC=GGTAAGGGGTCGCCTTCTCCG;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=42538677;WS=42538659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	42538704	rs2743459	G	T	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=937;SC=AGTTCCCGCTGTGTGCCCTTC;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=42538712;WS=42538694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	42538876	rs3020732	A	T	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=78;PP=2756;SC=CGCGACAGGAACACCCCTGGG;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=66;TCR=78;TR=144;WE=42538884;WS=42538866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr22	42538897	rs2854740	A	G	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=74;PP=2902;SC=GGCGGGACGGACACGTGGGCG;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=132;WE=42538905;WS=42538887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr22	42539623	rs769261	C	A	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42540551	rs2743461	A	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=307;SC=GGACACTCTCAGCACACCGAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=42540559;WS=42540541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	42783130	rs11913215	G	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=275;ReadPosRankSum=-1.010;SC=GTGTAGAGGGGCAGTCCCTGG;SOR=0.638;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=23;WE=42783138;WS=42783120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr22	42807314	rs2247576	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=341;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=0.388;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=26;WE=42807322;WS=42807304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr22	42807351	rs2072863	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=620;ReadPosRankSum=-0.259;SC=ATCCAAAGTCCCAAACTGCCA;SOR=0.380;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=37;WE=42807359;WS=42807341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr22	42896553	rs71311440	TGGGGC	T	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=793;ReadPosRankSum=0.130;SC=GTGGCCTGACTGGGGCGGGGC;SOR=0.804;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=17;WE=42896565;WS=42896543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr22	42905177	rs1056566	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.858;NF=14;NR=30;PP=612;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CAGGAATCTCTGGGAGGGGGC;SOR=0.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=44;WE=42905185;WS=42905167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr22	42910376	rs9611811	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.239;NF=3;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.659;SC=CGCCCTCCACGCCCTCCTCCC;SOR=0.197;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=42910384;WS=42910366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr22	42912029	rs3201001	G	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=788;ReadPosRankSum=0.665;SC=GAACTGGCTTGGGATGAAAAA;SOR=0.559;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=50;WE=42912037;WS=42912019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr22	42912501	rs5751292	A	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=5;PP=130;SC=GTATTTTGAGAAGAGACAGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=42912509;WS=42912491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	42962218	rs9623626	C	G	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=742;ReadPosRankSum=-1.042;SC=GCCCTGGCTGCAAAGGCCTGG;SOR=1.302;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=45;WE=42962226;WS=42962208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr22	42967235	rs137046	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=6.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-8.543;QD=5.10;ReadPosRankSum=-3.966;SOR=1.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr22	42967241	rs9620065	G	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-8.448;QD=4.41;ReadPosRankSum=-2.620;SOR=1.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,12:0.16:73
chr22	42969854	rs137053	T	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=184;SC=GGAGCTGGAATGCTGTGGGAG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=42969862;WS=42969844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	42969877	rs137054	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=8;PP=294;SC=CCCTGACCCCGGGGCCCATGG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=15;WE=42969885;WS=42969867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	42970032	rs137055	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.033;NF=19;NR=14;PP=394;ReadPosRankSum=-1.352;SC=CTTCTTACAGTGCACACACAT;SOR=0.552;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=33;WE=42970040;WS=42970022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr22	42971987	rs137064	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.552;NF=13;NR=9;PP=291;ReadPosRankSum=0.295;SC=CAGCTCTTTTTGGCTGCGCTT;SOR=0.709;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=22;WE=42971995;WS=42971977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr22	42972021	rs140265136	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.736;NF=10;NR=8;PP=258;ReadPosRankSum=-1.192;SC=TCCAGCACCCGCAAGCTGGCT;SOR=0.893;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=18;WE=42972029;WS=42972011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr22	42972179	rs3752507	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.46;MQRankSum=-1.115;NF=2;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=0.976;SC=TGGGACCTCCCGCAGCCTCCA;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=42972187;WS=42972169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	42972228	rs137065	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5241;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=55.98;MQRankSum=0.876;NF=3;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AAGTCAGAACTGCCCTGAGCC;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=42972236;WS=42972218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr22	42981167	rs137086	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=328;ReadPosRankSum=0.202;SC=CAAGCCAAGAGCTTAGATAGA;SOR=0.828;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=23;WE=42981175;WS=42981157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr22	42981349	rs137087	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=642;ReadPosRankSum=1.683;SC=CACCAGGGCTCTCCATCCCCT;SOR=0.650;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=46;WE=42981357;WS=42981339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,61:0.58:105
chr22	42998776	.	C	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=-2.307;SC=CACAACTCACCTGGATGGTTT;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=13;WE=42998784;WS=42998766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr22	43015716	rs137124	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=0.822;SC=GGGAGGTGACTGGGTGAGCGT;SOR=0.116;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=43015724;WS=43015711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr22	43023527	rs137136	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr22	43023535	rs137137	A	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.843;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr22	43024410	rs137139	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=-0.252;SC=GGCCTTCTCCCGTGGAGCCCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=43024418;WS=43024400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr22	43026792	rs5758820	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=0.640;SC=TGCACAGGGCAGGAGCGGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=7;WE=43026800;WS=43026782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	43032870	rs2285141	G	T	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=71;PP=1950;ReadPosRankSum=0.307;SC=GACAGGACCCGCGGGGTCAGT;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=91;TCR=145;TR=117;WE=43032878;WS=43032860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,146:0.49:295
chr22	43035849	rs59947151	CTT	C	540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=0;PP=250;SC=GCTTGATTCACTTTTTTTTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=17;WE=43035871;WS=43035839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	43035928	rs12628044	C	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=755;ReadPosRankSum=0.320;SC=CAACAACACTCAAATAATAAA;SOR=0.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=44;WE=43035936;WS=43035918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr22	43036245	rs6519327	G	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=788;ReadPosRankSum=0.917;SC=CCAGTGCTGGGGTCTTCTCCA;SOR=1.024;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=45;WE=43036253;WS=43036235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr22	43088549	rs3747194	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=362;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CCCTTAGCACCGGCCTCTGCC;SOR=1.248;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=27;WE=43088557;WS=43088539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr22	43089055	rs6002904	G	C	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=1240;ReadPosRankSum=0.105;SC=GCAGCTCCTCGGGGTTGATGT;SOR=0.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=79;WE=43089063;WS=43089045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,88:0.52:168
chr22	43193641	rs4393836	G	A	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=1242;ReadPosRankSum=-1.520;SC=GGAAGTTCACGACCATTCAGC;SOR=1.027;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=70;WE=43193649;WS=43193631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,95:0.43:221
chr22	43195147	rs1128013	A	G	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=72;PP=1785;ReadPosRankSum=1.465;SC=TGGGCAGCACACTGGACAGGC;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=219;TCF=78;TCR=141;TR=115;WE=43195155;WS=43195137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,128:0.51:252
chr22	43195172	rs117877473	C	T	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=52;PP=1150;ReadPosRankSum=-2.461;SC=GTTCCCTGCACACACACAGCA;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=54;TCR=118;TR=77;WE=43195180;WS=43195162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,90:0.48:188
chr22	43203137	rs738535	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=714;ReadPosRankSum=-0.095;SC=AGGAACTTGCCGACAGCCTCT;SOR=0.766;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=47;WE=43203145;WS=43203127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr22	43206950	rs1018448	A	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=70;PP=2370;SC=CGTCAAAGTAACTGTAGGAGC;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=43206958;WS=43206940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr22	43213631	rs147339109	C	CA	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TAATGAATAACAAAAAAAAAT;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=16;WE=43213639;WS=43213621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr22	43213724	rs76140411	G	C	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1257;ReadPosRankSum=0.421;SC=CAAGAAAGCAGTCTCACATAC;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=79;WE=43213732;WS=43213714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr22	43218463	rs5758957	C	T	4441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=81;PP=2718;SC=TTGAAAGCTTCTGTGACTACA;SOR=1.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=123;WE=43218471;WS=43218453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	43218516	rs113561506	A	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=640;ReadPosRankSum=1.428;SC=GCACTGTGACAAGCACTCTAC;SOR=0.317;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=39;WE=43218524;WS=43218506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr22	43223095	rs10654612	C	CAT	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=1153;SC=CTCAGTGCTACATCTTATCCA;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=43223103;WS=43223085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr22	43272085	rs5751396	G	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=0.758;SC=AAAAAAGACCGCCCACAGCCT;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=43272093;WS=43272076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr22	43272792	rs5751397	C	T	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=11;PP=1088;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CTGCAGAGCTCCGTGCATTGC;SOR=0.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=58;WE=43272800;WS=43272782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,59:0.70:84
chr22	43272830	rs35041824	C	CAG	3472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=2600;ReadPosRankSum=1.802;SC=GACCCCTGGACAGAGAGAGAG;SOR=0.401;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=60;WE=43272838;WS=43272820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,102:0.61:166
chr22	43275250	rs2073199	G	A	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=71;PP=2136;SC=CTCAGTTCCTGCCCAGCGAGC;SOR=1.841;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=27;TCR=72;TR=98;WE=43275258;WS=43275240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	43278148	rs5759010	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=1222;ReadPosRankSum=-1.837;SC=GGCCCAGGTCCTCTTCCAGGC;SOR=0.439;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=34;WE=43278170;WS=43278138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr22	43278162	rs4822217	T	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=1423;ReadPosRankSum=1.633;SC=TCCAGGCTGATGAGCTCATGG;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=41;WE=43278170;WS=43278138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr22	43278220	rs2899365	C	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=902;ReadPosRankSum=1.043;SC=TGGCCATGCCCGGCCCGTGAT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=56;WE=43278228;WS=43278210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr22	43280650	rs2273143	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=436;SC=TCTCAGGCCTTCCCAGATTCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=43280658;WS=43280640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	43286876	rs5759012	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=510;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AGGAAGTCCTAGGTGCAGGAG;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=29;WE=43286884;WS=43286866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr22	43289473	rs5759013	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=380;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CTTTCTCCACGAGCTGCCTCC;SOR=0.186;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=21;WE=43289481;WS=43289463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr22	43289738	rs2076158	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.042;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=361;ReadPosRankSum=-1.952;SC=GTTTACCACACCCCTCTCCAA;SOR=0.319;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=23;WE=43289746;WS=43289728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr22	43435668	rs2072883	G	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.81;NF=18;NR=0;PP=519;SC=AAGTGCCTTCGTTTATTTACA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=43435676;WS=43435663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	43442599	rs5759111	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=496;ReadPosRankSum=0.089;SC=GAAAGACCCATGTTCCTCACC;SOR=1.397;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=41;WE=43442607;WS=43442589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr22	43447891	rs9607998	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=607;ReadPosRankSum=0.088;SC=TGTTCATCACCGGCTGGAGAG;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=46;WE=43447899;WS=43447881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr22	43455531	rs1132079	C	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.067;SC=GGTTGTAGTCCTCCTGGTGAC;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=64;WE=43455539;WS=43455521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,85:0.55:154
chr22	43455592	rs17415203	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=490;ReadPosRankSum=0.635;SC=GGAACCCAGCGGAACCGTTGC;SOR=0.270;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=33;WE=43455600;WS=43455582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr22	43455665	rs5759126	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=628;SC=GCAAACATCCAGACCCCTGCC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=43455673;WS=43455655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	43459846	rs1052160	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=1002;ReadPosRankSum=1.074;SC=CGACGTTGGTGAGATGAACGA;SOR=0.913;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=57;WE=43459854;WS=43459836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
chr22	43471386	rs2294413	G	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr22	43555194	rs3937387	C	G	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=36;PP=1834;SC=ATGCCCTCACCCAGCCCTGTC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=43555202;WS=43555184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	43558926	rs6971	A	G	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=26;PP=1336;SC=GCTGGCCTTCACGACCACACT;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=43558934;WS=43558916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	43558972	rs6972	G	A	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=50;PP=2127;SC=CATGGCTGGCGTGGGGGACGG;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=108;WE=43558980;WS=43558962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr22	43559137	rs6973	G	T	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=914;SC=CTTCAGAGGTGGCCCCACCTG;SOR=1.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=42;WE=43559145;WS=43559127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	43564963	rs138931	C	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=685;SC=TCAGAACAGCCTCTCAAGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=43564971;WS=43564953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	43564978	rs9623764	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=569;SC=AAGAGGGGGTCTGCTGCCCCT;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=43564986;WS=43564968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	43565703	rs2071727	C	T	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=87;PP=2965;SC=CAGCCAACCCCGAACCCTCAG;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=75;TCR=87;TR=162;WE=43565711;WS=43565693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr22	43568512	rs34074034	C	T	7197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=117;PP=2965;SC=ACCTTTCCCACGTCTTCTCGA;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=222;WE=43568520;WS=43568502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr22	43570068	rs762953	G	A	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=593;SC=CCTGCGGTCCGTGAAGACGGC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=43570076;WS=43570058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	43570463	rs2269525	A	G	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=54;PP=2608;SC=AGTGCCTAGAAGCCCTGACTG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=43570471;WS=43570453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	43570659	rs2269526	A	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=989;SC=CCCGGCTCCCAAGTGTCCAAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=43570667;WS=43570649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	43572540	rs56878018	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.416;SC=GCTCGAGACCAGCCTGGCCAA;SOR=0.012;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=7;WE=43572548;WS=43572530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr22	43575774	rs138945	A	C	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=54;PP=1990;SC=CCAAGACATGAGTGCCCATCA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=108;WE=43575782;WS=43575764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	43575935	rs33970602	C	T	3740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=50;PP=2387;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CGAAGCTGGGCACGTCCGCGT;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=299;TCF=187;TCR=112;TR=140;WE=43575943;WS=43575925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,169:0.47:359
chr22	43576904	rs2071723	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=539;ReadPosRankSum=0.194;SC=GCTGGCGCGCGTGCTCCACAC;SOR=0.639;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=32;WE=43576912;WS=43576894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr22	43599917	rs138983	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=-0.958;SC=CCCAAGGTGGTGTGGAGGCCC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=43599925;WS=43599907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr22	43600000	rs8141806	C	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=968;ReadPosRankSum=0.130;SC=CCGCTCCCCCCGGTTATTTGT;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=77;TCR=31;TR=60;WE=43600008;WS=43599990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,72:0.58:125
chr22	43603423	rs72619548	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.096;NF=22;NR=1;PP=338;ReadPosRankSum=0.075;SC=CTCCTCTCCCATCACCACCCA;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=23;WE=43603431;WS=43603413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr22	43603466	rs34576033	G	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=913;ReadPosRankSum=-1.250;SC=CCAGGGCTGGGGCAGGGGCGG;SOR=0.530;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=62;WE=43603474;WS=43603456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr22	43603510	rs17003557	C	T	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1307;ReadPosRankSum=1.464;SC=CCCAGGGTTACGTGGATTCCC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=90;WE=43603518;WS=43603500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,111:0.49:227
chr22	43603665	rs72619549	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=383;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GGGGCTTGAGGCCCACGTGCT;SOR=0.954;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=23;WE=43603673;WS=43603655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr22	43604034	rs878034	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TCCAGGGCCCCGCCTGAGCCG;SOR=0.543;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=61;WE=43604042;WS=43604024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,66:0.46:143
chr22	43606143	rs5759217	C	T	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1315;ReadPosRankSum=0.127;SC=TTGGGGGAGGCGCGATGTGCC;SOR=0.461;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=98;WE=43606151;WS=43606133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,112:0.47:237
chr22	43608338	rs7364122	A	G	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=92;SC=GGTTCGCCACATGGAGGAGAT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=43608346;WS=43608328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	43608531	rs7284575	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=385;ReadPosRankSum=1.589;SC=CAGGCTGGTACGTGCCCACGG;SOR=0.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=32;WE=43608539;WS=43608521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr22	43608673	rs138989	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-1.532;SC=TCTCAGGCCCCGCTCTTGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=43608681;WS=43608663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr22	43608690	rs7284854	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=2.522;SC=GGCCCTTGCCCGGCCCTGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=43608698;WS=43608680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	43610207	rs138993	A	G	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=67;PP=2582;SC=GGCATACATGACACACACTGG;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=43610215;WS=43610197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr22	43614588	rs5759218	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-1.843;SC=ACATTCTCACAACAGTCCTGG;SOR=1.688;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=43614596;WS=43614578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr22	43623612	rs55853243	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=827;SC=CCACCGAGTCGGACAGCATCA;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=43623620;WS=43623602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	43739395	rs7286392	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr22	43830848	rs6519374	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=820;SC=TGGATCTGAGCGGGATTGATG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=43830856;WS=43830838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	43830996	rs2413761	C	T	7994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=117;PP=2965;SC=CTCCAGGCTACACCCGCTTCG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=132;TCR=117;TR=249;WE=43831004;WS=43830986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr22	43831056	rs4331615	C	T	7940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=136;PP=2965;SC=AGATGCCGTACGGCGACGTGC;SOR=0.999;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=97;TCR=136;TR=233;WE=43831064;WS=43831046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr22	43976396	rs9614382	G	A	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=21;PP=1642;SC=CTTCCTCACAGCCTCCTGTGG;SOR=1.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=43976404;WS=43976386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	43976675	rs4823114	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=329;SC=TTCGCTGTACGTGCAGACATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=43976683;WS=43976665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	44079557	rs9614259	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=0.874;SC=GTTGTTATTGGTCTTGTTCTG;SOR=0.197;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=11;WE=44079565;WS=44079547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr22	44083442	rs5764214	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=210;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TTGATTTTAGTGGTGGCTTTA;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=13;WE=44083450;WS=44083432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr22	44112845	rs5764234	C	T	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=25;PP=867;SC=GATTCTCCAACGAGACCTCTG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=44112853;WS=44112835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	44223635	rs71313366	C	CCA,CCACA	178.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=0,0;NR=4,4;PP=83,81;SC=CGCTGCTTCACCACACACACA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4,4;WE=44223643;WS=44223625;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:6
chr22	44229492	rs138069	G	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=18;PP=901;SC=CAGGGCACCCGGAGGACAGCT;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=44229500;WS=44229482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr22	44236005	rs4149443	G	A	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=10;PP=371;SC=AGGAAGGGGTGGGGTTCAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=44236013;WS=44235995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	44280394	rs5764010	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=0.905;SC=CTGCGCTCATCGTTGTCCGTG;SOR=1.358;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=18;WE=44280402;WS=44280384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr22	44280412	rs5764011	G	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=576;SC=GTGAGACAAGGGGTGTATGCC;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=44280420;WS=44280402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	44282276	rs739231	A	G	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=73;PP=2487;SC=CCCCCCTTCCAGCGTTGGTCA;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=130;WE=44282284;WS=44282266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr22	44282307	rs739232	G	A	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=63;PP=1923;SC=CCCAGTTTCCGTCAGCCGGGG;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=44282315;WS=44282297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	44283556	rs5764380	A	G	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=60;PP=2428;SC=GGCAAGGGTGAGATGGGCAAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=44283564;WS=44283546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr22	44283676	.	G	GAC	4187.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=38;PP=2328;SC=AGGGCTCAGGGCAGGAGCCTG;SOR=1.661;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=44;WE=44283697;WS=44283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	44283677	.	CAGGAG	C	4232.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.51;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	44283687	rs143992164	GGCA	G	3922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=2948;SC=CAGGAGCCTGGGCAGGACCTT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=41;WE=44283697;WS=44283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	44285667	rs713864	G	A	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=278;SC=CGGGGTTCCAGAGTGCACTCA;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=44285675;WS=44285657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	44285765	rs2017461	A	G	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=19;PP=1057;SC=AAGAGTCAGCAGGAACACAAC;SOR=1.257;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=44285773;WS=44285755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	44287062	rs2071884	A	G	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=48;PP=1724;SC=GGGGCAGAGCATCCTGCAGCT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=44287070;WS=44287052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	44287629	rs74445350	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=615;ReadPosRankSum=1.469;SC=AACCGTAGATGCGGCGGGCGC;SOR=0.464;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=41;WE=44287637;WS=44287619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr22	44322970	rs2076212	G	T	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1000;ReadPosRankSum=-1.009;SC=CGGCAAAATAGGCATCTCTCT;SOR=0.645;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=66;WE=44322978;WS=44322960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr22	44323074	rs139047	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=522;ReadPosRankSum=2.205;SC=TCTGGACGTTGTCAAGTTAGA;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=30;WE=44323082;WS=44323064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr22	44324676	rs139051	A	G	4031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=40;PP=2922;SC=GCTCTCGCCTATAACTTCTCT;SOR=1.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=115;WE=44324684;WS=44324666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr22	44420156	rs112388263	T	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	44489868	rs1983609	T	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=47;PP=1224;SC=CCCGCCCTGGTGGATGTTCAC;SOR=1.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=44489876;WS=44489858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	44489896	rs738479	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=301;ReadPosRankSum=-0.661;SC=ACACCCAGCTTGGTACGGGGG;SOR=0.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=30;WE=44489904;WS=44489886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
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chr22	44515806	rs761166	G	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=2.253;SC=GGCAAAGAACGGAAGAGCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=44515814;WS=44515796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr22	44559715	rs56412646	GA	G	1793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.000;NF=12;NR=19;PP=1247;ReadPosRankSum=0.819;SC=CCCTAACGCTGACCCACCCCC;SOR=0.610;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=31;WE=44559723;WS=44559705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
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chr22	44559995	rs2272940	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=1.930;SC=GGAGGACTTCGCTGGTGGAGC;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=44560003;WS=44559985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr22	44564297	rs139095	A	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=187;SC=AGCTCTCACAAAACCTGTGTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44564305;WS=44564288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	44564407	rs139096	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=479;ReadPosRankSum=-0.391;SC=ATGCTGGAGACGTGGCTTCTG;SOR=0.202;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=35;WE=44564415;WS=44564397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr22	44569142	rs139103	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.848;SC=AGCGGCCAGGAGCACAGGCTG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=44569150;WS=44569132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr22	44582499	rs79478	T	C	6363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=112;PP=2965;SC=GGACACCATCTGTGGTCTTGC;SOR=0.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=96;TCR=112;TR=208;WE=44582507;WS=44582489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr22	44586522	rs2272942	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=961;ReadPosRankSum=0.251;SC=CAACCAACGTCCAGGTGGAGG;SOR=1.411;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=141;TCF=54;TCR=87;TR=59;WE=44586530;WS=44586512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,65:0.42:155
chr22	44589857	rs139142	T	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TTGTCCCTCTTTCTGTCTGTC;SOR=0.334;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=23;WE=44589865;WS=44589847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr22	44594476	rs139151	T	C	5418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=53;PP=2965;SC=TTCCATGTGATTGTCTCCAGT;SOR=1.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=117;TCR=53;TR=170;WE=44594484;WS=44594466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	44594584	rs139152	C	G	3901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=79;PP=2248;ReadPosRankSum=-0.894;SC=ACCTCACTCCCAACTCTCCTG;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=295;TCF=147;TCR=148;TR=155;WE=44594592;WS=44594574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,189:0.52:360
chr22	44602001	rs139185	G	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.341;SC=ATTCAGAGGAGGACTGGCCAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=44602009;WS=44601991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	44602229	rs139186	A	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=0.901;SC=GAGCACACTGAGGGTGCTCTA;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=75;WE=44602237;WS=44602219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,90:0.56:162
chr22	44681612	rs135388	A	G	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=720;ReadPosRankSum=0.706;SC=ACTCCCAACAAGGCGGTGTAA;SOR=0.865;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=46;WE=44681620;WS=44681602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr22	44965320	rs138593	G	A	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=29;PP=1232;ReadPosRankSum=-1.911;SC=TGTGACATGGGAGTAAGTTTG;SOR=1.264;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=78;WE=44965328;WS=44965310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,81:0.50:161
chr22	44967767	rs138596	C	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=833;SC=AGAGAAATAACGAGGCCCGAA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=44967775;WS=44967757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	45075738	rs763213	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=400;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CCGGAAAAGATGCCGGCGCAG;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=36;WE=45075746;WS=45075728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr22	45127435	rs2269572	G	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=1.357;SC=TAAGCAGTGGGCCCAGGGCCA;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=45127443;WS=45127425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr22	45128232	rs8141631	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=348;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CCCATGCCCGTGTGCCCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=25;WE=45128240;WS=45128222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr22	45128288	rs5764979	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=334;ReadPosRankSum=0.624;SC=ACAGTGGGCAGAGGGTCGGGC;SOR=0.889;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=20;WE=45128296;WS=45128278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr22	45128449	rs5764980	G	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=77;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGCTGTGGGTGCAGGAGAGCT;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=45128457;WS=45128439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr22	45131053	rs2269573	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.319;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=1.481;SC=GTAGGGGTCCGCCTGGGCCTT;SOR=2.030;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=21;WE=45131061;WS=45131043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
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chr22	45133238	rs3329	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CGCCAGCCCTATCGGCCTCGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=45133246;WS=45133228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr22	45243780	rs9626578	G	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=929;ReadPosRankSum=1.389;SC=CGTGGGCAGGGGAGTGTCATA;SOR=0.603;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=61;WE=45243788;WS=45243770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,70:0.42:167
chr22	45244001	rs9626251	C	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=570;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GGCCTCAGAGCGGAGGCAGGG;SOR=1.802;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=31;WE=45244009;WS=45243991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr22	45255527	rs4490294	A	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.923;NF=10;NR=3;PP=753;ReadPosRankSum=0.388;SC=TGTCCTTCCTACACCCCTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=13;WE=45255541;WS=45255517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr22	45255532	rs3216832	CCT	C	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.045;NF=8;NR=4;PP=754;ReadPosRankSum=0.312;SC=TTCCTACACCCCTGTTCTCCT;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=12;WE=45255541;WS=45255517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr22	45255580	rs7510897	G	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.96;MQRankSum=-0.514;NF=26;NR=13;PP=521;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GGCCCCTCTGGAGCTCAGCAG;SOR=0.580;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=39;WE=45255588;WS=45255570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr22	45255630	rs61756769	T	C	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.555;QD=20.58;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr22	45255637	rs6007344	G	C	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.552;QD=19.39;ReadPosRankSum=2.000;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr22	45255727	rs2349855	G	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=645;ReadPosRankSum=-0.916;SC=GAGTGGGGAAGGGGGGAGCTT;SOR=0.871;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=53;WE=45255735;WS=45255717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr22	45255779	rs2882262	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CTGGGCCCGCATGGACCAGTC;SOR=0.623;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=24;WE=45255787;WS=45255769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr22	45255802	rs9614955	T	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTCCTTGCCCTGGGTCTGGGG;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=19;WE=45255810;WS=45255792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr22	45258053	rs8139133	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=68;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GTCCAGTGCTCCTCTCACTAC;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=45258061;WS=45258043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr22	45258333	rs9614957	C	G	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1447;ReadPosRankSum=0.968;SC=CCGGAGGCACCTGGGGAGCAC;SOR=0.794;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=96;TCR=78;TR=96;WE=45258341;WS=45258323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,101:0.54:188
chr22	45258495	rs8777	A	G	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=89;PP=2801;SC=CACTCTGTATATTTCGAGCTA;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=140;WE=45258503;WS=45258485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	45279320	rs3747224	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr22	45283897	rs6006901	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=1.728;SC=TCTTGAGGGGCGGCTCCAGGC;SOR=0.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=23;WE=45283905;WS=45283887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr22	45287076	rs2285124	A	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=1.017;SC=CCCAGGTCAGACCAGTGGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=5;WE=45287084;WS=45287066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr22	45287420	rs6007370	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=1.356;SC=AGCACGCAGGAATGGCTGAGG;SOR=3.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=45287428;WS=45287410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr22	45291833	rs3752467	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=1.057;SC=CAGACCACCCATCATCACACC;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=45291841;WS=45291823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	45309653	rs3213527	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr22	45312113	rs2239793	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=575;ReadPosRankSum=-1.487;SC=CTCGGCCTCCTGTATGCGGCC;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=37;WE=45312121;WS=45312103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr22	45312244	rs6519902	G	A	2286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=56;PP=1496;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CCATGGCGGCGGCATTGCTGG;SOR=0.864;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=216;TCF=96;TCR=120;TR=98;WE=45312252;WS=45312234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,113:0.44:255
chr22	45316507	rs4823420	T	A	961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=29;PP=882;SC=TTATGATTTTTAAAAAATCAC;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=45316515;WS=45316497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	45577372	rs372438307	TCAAGTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA	TTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA,T	1346.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=2967;SC=TTGCCTGCTCTCAAGTGGAAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=45577419;WS=45577362;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:31
chr22	45577377	rs376698610	TGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTAA	T	1339.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.22;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	45577411	.	A	T	195	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=195;QD=32.8244589353;SC=AGTTTATTTAAAAATCCAGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=45577419;WS=45577362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,7:0.64:11
chr22	45579422	rs6006950	A	G	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=31;PP=1252;SC=TTTTTCAGTTAGCACAAAATC;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=45579430;WS=45579412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	45595721	rs5765217	A	G	4723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=72;PP=2965;SC=ACTGAAGGGCACGGGGACCCT;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=156;WE=45595729;WS=45595711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr22	45598833	rs732373	C	T	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=31;PP=1817;SC=GTGAACTTGACGGATGGGAGC;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=85;WE=45598841;WS=45598823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	45603533	.	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CAGCTGTGCTGACTGGGGGCC;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=16;WE=45603541;WS=45603523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr22	45622014	rs6007506	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.874;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=361;ReadPosRankSum=-0.208;SC=AGAGAGCACGCGGCAGCCTCT;SOR=2.004;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=19;WE=45622022;WS=45622004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr22	45680824	rs2255432	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=6;PP=331;SC=GTGCCCTGGCAGGGACAGGTC;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=45680832;WS=45680814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	45682975	rs2673087	A	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=283;SC=AAGGATGATCAGGCATTTGAT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=45682983;WS=45682965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	45683246	rs2673088	C	T	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=63;PP=2426;ReadPosRankSum=1.309;SC=CCTACCTGGTCAGGGTGGGTG;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=127;WE=45683254;WS=45683236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr22	45683304	rs1057353	G	C	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=62;PP=2265;SC=CCTCTGTAACGCACCCCTGTC;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=110;WE=45683312;WS=45683294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr22	45718922	rs34063912	C	CTG	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.050;NF=12;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TCAGAGGGGACTGTGTGTGTG;SOR=0.627;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=13;WE=45718931;WS=45718912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr22	45723854	rs9615108	C	G	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1095;ReadPosRankSum=2.309;SC=GCGCCATGGTCCTGACCACCA;SOR=0.591;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=84;TCR=100;TR=72;WE=45723862;WS=45723844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,92:0.41:225
chr22	45723960	rs9614638	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQRankSum=2.060;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr22	45723968	rs28412847	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=2.162;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr22	45726345	rs7285172	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TTTTGAAGGTATAAGTGTAAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=45726353;WS=45726335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr22	45731182	rs738176	C	T	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=639;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CCGAGGAGGACGAGCTCTTGG;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=40;WE=45731190;WS=45731172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr22	45732328	rs11704481	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=681;ReadPosRankSum=1.752;SC=GAGCTGCCTCGGGTCTCTCTT;SOR=0.485;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=44;WE=45732336;WS=45732318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr22	45736153	rs3827393	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=-1.045;SC=GGTTTTCAAAGTCTTCCGTAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=45736161;WS=45736143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr22	45736485	rs2064068	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=517;ReadPosRankSum=0.887;SC=AGGAGGGTGACGCGGACACAT;SOR=1.292;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=25;WE=45736493;WS=45736475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr22	45741543	rs5765260	G	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=848;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGTCTGGTCAGTTTAGGTGAC;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=42;WE=45741551;WS=45741533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr22	45748284	rs11375006	C	CT	3816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=37;PP=2885;SC=GGAAGGTCCCCTGGCTTCTGC;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=64;WE=45748292;WS=45748274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr22	45748339	rs5765275	A	G	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.989;NF=31;NR=33;PP=940;ReadPosRankSum=2.852;SC=ACCTGTGCACAGCAAACAGGA;SOR=0.601;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=64;WE=45748347;WS=45748329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr22	45749801	rs9614652	C	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-1.036;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr22	45749983	rs5764698	G	T	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1590;ReadPosRankSum=-1.034;SC=TGCCTACACAGTCTGGCTTCC;SOR=0.690;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=237;TCF=120;TCR=117;TR=106;WE=45749991;WS=45749973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,118:0.44:271
chr22	45754517	rs5764701	G	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=-0.719;SC=AAAATGATTCGGTAAGATTTA;SOR=0.317;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=45754525;WS=45754507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
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chr22	45767369	rs470062	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=213;ReadPosRankSum=1.490;SC=TCTTTTCTTGAAATTCTTTAA;SOR=0.382;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=16;WE=45767377;WS=45767359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr22	45767455	rs136569	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=235;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TCACTTTGTAACTGAGATTGT;SOR=0.673;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=17;WE=45767463;WS=45767445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr22	45767599	rs136570	G	A	86.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5102;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGGATAAAAGGTTAAATACCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=45767607;WS=45767589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr22	45779335	rs136585	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=772;ReadPosRankSum=0.559;SC=AACTTTTATGACATGGATTTA;SOR=0.987;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=42;WE=45779343;WS=45779325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr22	45782646	rs136591	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=295;ReadPosRankSum=-1.835;SC=AAAAAGAACACATAAAACGCA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=15;WE=45782654;WS=45782636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr22	45785847	rs5764719	A	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=525;ReadPosRankSum=-1.058;SC=ATTATTTTCTAATGTAACAAA;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=24;WE=45785855;WS=45785837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr22	45789642	rs136603	A	C	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=56;PP=1698;SC=TCTTCATTAAATTCAGACATT;SOR=2.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=45789650;WS=45789632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	45789743	rs136604	T	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CAACAAATTATACAGCAAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=45789751;WS=45789733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr22	45794925	rs79154	C	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=325;ReadPosRankSum=0.366;SC=TAATTCAAAGCAGCTGAAATA;SOR=2.697;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=16;WE=45794933;WS=45794915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr22	45809624	rs2272804	C	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.123;NF=21;NR=11;PP=670;ReadPosRankSum=0.291;SC=TGCGGCGTCACTGGGAGCCCG;SOR=1.368;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=32;WE=45809632;WS=45809614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr22	45810278	rs59404993	A	AC	7018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=106;PP=2936;SC=TAGACATGAAACTTTGGTGAG;SOR=1.341;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=110;TCF=2;TCR=108;TR=107;WE=45810286;WS=45810268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr22	45813433	rs11320557	AT	A	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.436;HP=9;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=1637;ReadPosRankSum=0.378;SC=ATTCAAATTTATTTTTTCCTC;SOR=1.511;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=28;WE=45813453;WS=45813423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr22	45813445	rs5764723	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=1627;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TTTTTCCTCTGAATCCTAAGC;SOR=0.750;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=44;WE=45813453;WS=45813423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr22	45821715	rs1022476	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=298;ReadPosRankSum=0.638;SC=CCGACTCCTGCTGCCCTTAGC;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=16;WE=45821723;WS=45821705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr22	45821887	rs1022477	G	A	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.615;SC=AGGACAACTTGGCCGAGATCA;SOR=0.529;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=172;TCF=80;TCR=92;TR=87;WE=45821895;WS=45821877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,107:0.48:221
chr22	45821956	rs1022478	C	G	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=1171;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CCAGCTCCTTCGGGCCCCACC;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=67;WE=45821964;WS=45821946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,83:0.61:135
chr22	45822161	rs5765345	C	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTGCCCTAGCACCTGCCCTC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=45822169;WS=45822151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	45826880	rs2072770	G	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=780;ReadPosRankSum=-0.485;SC=CAGTGGCGGCGGCAGCGCGAC;SOR=0.762;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=62;WE=45826888;WS=45826870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr22	45827020	rs5765352	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=0.353;SC=GGTCAAGGACGAGGAGGGGGC;SOR=0.120;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=12;WE=45827028;WS=45827010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr22	45918877	rs2018279	A	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=16;PP=788;SC=AGAAAGTAATAAGTCCGTCTG;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=45918885;WS=45918867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	45923827	rs136730	A	G	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=50;PP=2021;SC=CAGGTCTTCCAGGCATGCTGT;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=45923835;WS=45923817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr22	45924001	rs136731	T	TG	854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=857;SC=CATGTGATCGTGGGGCTGGCA;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=45924009;WS=45923991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr22	45929577	rs105199	T	C	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=28;PP=2076;SC=CACATTCCTTTCTAGGATGTA;SOR=1.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=45929585;WS=45929567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	45929594	rs3216851	TG	T	1493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=1155;ReadPosRankSum=1.462;SC=TGTATTAGGATGGGTCGTTCT;SOR=0.600;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=35;WE=45929602;WS=45929584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr22	45931262	rs2071938	C	T	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=46;PP=1279;SC=CCAGGAGGGGCCAGCGACCTA;SOR=4.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=45931270;WS=45931252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	45937061	rs136756	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=417;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TGGGTTCTGGGACACCCTCCA;SOR=0.801;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=29;WE=45937069;WS=45937051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr22	45937149	rs9682	C	T	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=645;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CGTGCCCTATCGGGCATACAT;SOR=0.762;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=42;WE=45937157;WS=45937139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr22	45937378	rs136758	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	45937384	rs470068	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	45954029	rs2097484	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=11;PP=350;SC=TGGAGACCACGGGCATTTGAG;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=45954037;WS=45954019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	45961213	rs1118	C	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=385;SC=CTTTGAGCTGCACCTGCCCCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=45961221;WS=45961203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	45961904	rs1985671	G	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=1;PP=47;SC=ATCGGAGTATGGCACACCAGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=45961912;WS=45961894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	46114244	rs2071852	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=829;ReadPosRankSum=1.311;SC=GGGCATGTCTCTTTTACTATG;SOR=0.733;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=46;WE=46114252;WS=46114234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr22	46114398	rs138156	G	T	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.321;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=67;PP=1810;ReadPosRankSum=-0.436;SC=AGCGTGGTCTGGAGTATTTAG;SOR=0.985;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=210;TCF=92;TCR=118;TR=112;WE=46114406;WS=46114388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,133:0.54:248
chr22	46156446	rs60308683	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=1100;ReadPosRankSum=0.944;SC=TCAGAAGCTAGGAAGGCTTCT;SOR=1.056;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=61;WE=46156454;WS=46156436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,68:0.53:129
chr22	46156572	rs59406530	A	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr22	46156581	rs60514881	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr22	46156622	rs58099513	C	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CAGAATGGTTCAGTAGTGTAC;SOR=0.818;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=46156630;WS=46156612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr22	46202925	rs3827398	A	G	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GTGAATTACCATGCACAAGTT;SOR=0.670;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=84;WE=46202933;WS=46202915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,103:0.53:196
chr22	46368130	rs62226057	T	C	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=22;NR=21;PP=585;SC=TGGGCCGGCGTGCCTGGCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=46368138;WS=46368120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	46402714	rs28477160	A	G	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=49;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AGGCCCAGCCAGGGCAGGGGA;SOR=0.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=218;TCF=133;TCR=85;TR=121;WE=46402722;WS=46402704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,133:0.54:246
chr22	46449891	rs12159707	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TGCGGGGTTGGGGGGGGAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=23;WE=46449899;WS=46449881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr22	46498868	rs73177017	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TAGCCCCACCGTGGAGCAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=46498876;WS=46498858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	46505986	rs2474020	T	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=44;PP=1357;SC=GTGAGCACTGTAGGCTCTAGG;SOR=1.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=46505994;WS=46505976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	46659268	.	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr22	46677607	rs130642	T	C	4476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=69;NR=71;PP=2738;SC=CTCAGAGACCTTCTGGAAGGT;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=140;WE=46677615;WS=46677597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr22	46682993	rs141331617	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=540;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TGCAGGCCAACGATGCAATGC;SOR=0.933;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=39;WE=46683001;WS=46682983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr22	46722400	rs140054	T	C	4625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=52;PP=2462;SC=GCTGAGCGCATGGCGTGTGTC;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=140;WE=46722408;WS=46722390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr22	46724558	rs140053	T	C	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=80;PP=2965;SC=AGAGACATTTTCTCATAAGTT;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=174;WE=46724566;WS=46724548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr22	46752911	rs55905826	G	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=625;ReadPosRankSum=1.279;SC=TGACAGAGATGGATCTGCTAG;SOR=1.004;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=46;WE=46752919;WS=46752901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr22	46762116	.	G	A	416	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=28;MQ=58.7;NF=10;NR=0;PP=416;QD=45.0771212547;SC=GGCGGGGAGGGAAGGTGCGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,10:1.00:10
chr22	46762126	.	GGCA	G	1012	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=59.42;NF=19;NR=0;PP=1012;QD=55.0526315789;SC=GAAGGTGCGGGGCAGGGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,19:1.00:19
chr22	46762146	.	GT	G	1410	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=60.94;NF=23;NR=0;PP=1410;QD=63.4361260813;SC=GAAGTTGCGGGTGGGAAGAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=23;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,23:0.92:25
chr22	46762152	.	A	G	1053	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=22;MQ=60.77;NF=33;NR=1;PP=1053;QD=31.9932709573;SC=GCGGGTGGGAAGAAGGTGCGG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=34;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,34:0.72:47
chr22	46765181	rs11273699	G	GTCAGGTCGCCGAC	10325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=74;PP=2967;SC=GCCGATCAATGTCTTCTCTCT;SOR=1.538;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=136;TCF=20;TCR=116;TR=91;WE=46765189;WS=46765171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr22	46929359	rs5767248	C	G	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=160;SC=GGGCCTAGGCCGGGCGCCCAC;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=46929367;WS=46929353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	46929692	rs4823561	A	G	11181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=184;NR=156;PP=2965;SC=GCCGGGATGCAGCCGATCACG;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=341;TCF=185;TCR=156;TR=340;WE=46929700;WS=46929682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr22	46931077	rs4823850	G	C	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=41;PP=1799;SC=CATGGGGGGCGAGCCGTGGTC;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=46931085;WS=46931067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr22	46931793	rs1009154	G	C	6860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=108;PP=2965;SC=CCTCCACCAGGAGCTGGTACT;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=95;TCR=108;TR=203;WE=46931801;WS=46931783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr22	46931838	rs1009155	G	A	6790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=98;PP=2965;SC=CCGCCCGTGTGCTCACCACGC;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=100;TCR=98;TR=197;WE=46931846;WS=46931828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr22	47057191	rs2076707	C	T	4203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=3.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,107:0.55:195
chr22	47057197	rs2076708	C	T	4293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=3.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.115;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,114:0.53:215
chr22	47058992	rs2542040	T	C	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=61;PP=2501;SC=ACGAGCGGTTTGGGGAGTACG;SOR=1.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=149;WE=47059000;WS=47058982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	47059597	rs2542035	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=269;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GTGCATGGCCATTCTGTGCAC;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=21;WE=47059605;WS=47059587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr22	47064164	rs2748338	C	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CGCCGGCCTCCGCTGCTGCCT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=47064172;WS=47064154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	47064665	rs9616088	C	T	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=1172;ReadPosRankSum=1.261;SC=CTGCGGCGCCCGCCCGGCCTG;SOR=0.456;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=59;WE=47064673;WS=47064655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr22	47064837	rs2076711	A	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=0.997;SC=CTGTAGCTTCAGGAGGAGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=47064845;WS=47064827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr22	47068929	rs11350999	TG	T	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=782;ReadPosRankSum=1.982;SC=GATGGGGGGATGGGGGGCCAC;SOR=0.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=15;WE=47068943;WS=47068919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr22	47068935	rs135662	G	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=765;ReadPosRankSum=1.654;SC=GGGATGGGGGGCCACGAAGCC;SOR=0.260;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=16;WE=47068943;WS=47068919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr22	47070432	rs2073275	G	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=607;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CTCACTGTGGGTGTGACGTGA;SOR=0.196;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=35;WE=47070440;WS=47070422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr22	47070747	rs34212133	G	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=173;ReadPosRankSum=0.134;SC=AGGTTTTCCTGAGTGGTGGCC;SOR=1.414;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=12;WE=47070755;WS=47070737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr22	47071531	rs2073276	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=945;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CCCTATAGACTTCTGCCAGCC;SOR=0.706;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=55;WE=47071539;WS=47071521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,63:0.53:119
chr22	47072477	rs2236028	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CTGTGGTGACGGCCACGCTTT;SOR=0.914;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=14;WE=47072485;WS=47072467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr22	47083010	rs2542014	T	C	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=1.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,74:0.42:176
chr22	47083010	.	TGT	CGA	2080	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=35;NR=22;PP=2080;QD=37.4292609625;SC=TTTCCCAGTTTGTGAGCAGGA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=57;WE=47083020;WS=47083000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:84,57:0.40:141
chr22	47083012	rs2748349	T	A	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=6.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,76:0.42:180
chr22	47083172	.	CTGGACAGGGGCTGCAGTAAACCCCACGTGTCCCTCACTCAAAGCTGGCCCTGAGCACCGCTCT	C	599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.759;QD=9.23;ReadPosRankSum=-4.222;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr22	47083219	.	GC	G	518	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.51;NF=0;NR=5;PP=518;QD=113.406179974;SC=CTCAAAGCTGGCCCTGAGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=47083243;WS=47083209;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr22	47091321	rs135676	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=26;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CTGCCTAAACCGTCTGCAGGA;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=47091329;WS=47091311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	47095409	rs6007953	C	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=2.316;SC=CCTCCAGCCCCGCCCCATCCA;SOR=2.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=15;WE=47095417;WS=47095399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
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chr22	47116905	rs12166204	G	A	3346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=66;PP=1933;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CAGGCACAGAGCAGGCATCTG;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=238;TCF=111;TCR=127;TR=123;WE=47116913;WS=47116895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,154:0.53:292
chr22	47134147	rs3747262	G	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr22	47274638	rs131869	C	T	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=1321;SC=CACCGCACCGCCCATCAGCGC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=47274646;WS=47274628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	47287369	rs79173093	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=817;ReadPosRankSum=-0.612;SC=ATGTTTTATCAAAACCATGTG;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=45;WE=47287377;WS=47287359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr22	47311287	.	A	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=867;ReadPosRankSum=0.642;SC=CTGTTCCTTCAGAGAACAGAG;SOR=0.642;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=54;WE=47311295;WS=47311277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr22	47311404	rs738935	A	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=713;ReadPosRankSum=1.106;SC=TGCAGCTGCCAGTGGCACTAG;SOR=0.818;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=43;WE=47311412;WS=47311394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr22	47370060	rs4436	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TCATTTAGCTAGACTGATGAG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=52;WE=47370068;WS=47370050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr22	47370343	rs4437	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CAGCCCCTGCGGTGAAGAGAG;SOR=0.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=22;WE=47370351;WS=47370333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr22	47393400	rs3747263	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=1.321;SC=TGTGTTTCTCGAGATAAAATC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=47393408;WS=47393390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	47857537	rs130877	T	C	3567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.138;NF=38;NR=34;PP=2131;ReadPosRankSum=-1.887;SC=TGTGTTCCCTTAGTTGCACCT;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=72;WE=47857559;WS=47857527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,90:0.57:158
chr22	47857551	rs130878	T	G	3768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.967;NF=40;NR=34;PP=2131;ReadPosRankSum=0.388;SC=TGCACCTCTGTTCTTGAGCTT;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=74;WE=47857559;WS=47857527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,95:0.56:169
chr22	47857576	rs130879	A	G	3432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.936;NF=36;NR=33;PP=947;ReadPosRankSum=2.478;SC=TCTTTCTGCAAAACTAAACCA;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=69;WE=47857584;WS=47857566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,87:0.55:157
chr22	47857656	rs202008662	TTA	T	366.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=21.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.16;MQRankSum=2.414;QD=15.95;ReadPosRankSum=2.248;SOR=4.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr22	47859199	rs2294230	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=0.893;SC=CTCAGTGCCGCGGAGAAAAGA;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=25;WE=47859207;WS=47859189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr22	48023241	rs8137874	G	T	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=35;PP=2141;SC=TGCAGAAGTGGGTCTGGCCCA;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=107;WE=48023249;WS=48023231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr22	48940553	rs4823540	T	C	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=1506;ReadPosRankSum=-1.922;SC=CACTCCGGGCTGCGGGGAGGC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=93;TCR=136;TR=104;WE=48940561;WS=48940543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,119:0.45:262
chr22	48940644	rs9615919	C	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=911;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TGGGGTCCCACGCTGCCTCTG;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=40;TCR=86;TR=56;WE=48940652;WS=48940634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr22	48942566	rs739155	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-0.258;SC=TGCAGTTCTGGAAAGGCTCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=48942574;WS=48942556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr22	49042630	rs117408268	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.152;SC=CTTCCCTGACGCGGCCCCTTA;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=49042638;WS=49042620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	49103380	rs130147	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.898;SC=CCCTGGGCCCAGTGTCCCTGT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=49103388;WS=49103370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	49103660	rs132234	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=668;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CACCACGGTATGTGGCCCTCG;SOR=2.143;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=85;TCF=13;TCR=72;TR=40;WE=49103668;WS=49103650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr22	49176220	rs6010527	C	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=967;ReadPosRankSum=-1.192;SC=CTCTGGGTCACTGAGATGAGA;SOR=0.740;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=59;WE=49176228;WS=49176210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,84:0.58:146
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chr22	49246747	rs28556787	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=1.141;SC=TCGCAGCGGATAGCTAAAGAG;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=49246755;WS=49246737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr22	49246786	rs28635747	C	T	120.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5727;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GCCTGGAGTCCGCCAAGAAGG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=49246794;WS=49246776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr22	49667985	rs7289562	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=312;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GAAAGTCCCCGGGCAAACAGG;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=23;WE=49667993;WS=49667975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr22	49668188	rs2688112	T	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=20;PP=489;SC=CCAGGCTAGATGCAATTTAGC;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=49668196;WS=49668178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	49834624	rs11705513	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=238;ReadPosRankSum=1.208;SC=CCCTGTGAGCATCTTTCAGGG;SOR=0.182;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=18;WE=49834632;WS=49834617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr22	49834747	rs1016809	C	T	8516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=116;PP=2965;SC=CTAGTACCGTCTCCTTCTCCC;SOR=0.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=145;TCR=116;TR=261;WE=49834762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr22	50014002	rs135877	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=491;SC=CTGCTGTCCCAAGCTTGTCAC;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=50014010;WS=50013992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	50014071	rs146382025	C	CCCTT	1592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=1188;ReadPosRankSum=1.499;SC=CCCTGCCCAGCCCTTCCCCAC;SOR=1.054;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=26;WE=50014079;WS=50014061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr22	50017234	rs916362	A	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=800;ReadPosRankSum=0.680;SC=CACGTGCTGCAGAGCTCAGGG;SOR=0.855;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=60;WE=50017242;WS=50017224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,81:0.49:164
chr22	50018045	rs763128	G	A	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=11;PP=690;SC=AGTGATGCTCGGGGCTGCTGA;SOR=1.418;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=33;WE=50018053;WS=50018035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	50018069	rs2011097	A	G	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=1117;SC=TTGTGGGGAGAGCACAGTGAT;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=50018077;WS=50018059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	50018497	rs5770594	G	A	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1396;ReadPosRankSum=0.203;SC=TGCCTCTGATGACACCCACCT;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=84;WE=50018505;WS=50018487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,98:0.49:201
chr22	50018639	rs4524218	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=645;ReadPosRankSum=0.456;SC=CCCTGACGCCGGGCTGACGGC;SOR=0.238;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=32;WE=50018662;WS=50018629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr22	50018651	rs135879	C	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.24;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	50018654	rs135880	T	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.99;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	50051007	rs6009803	A	G	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=16;PP=864;SC=GAAAGACCTAACTGAGACTGG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=50051015;WS=50050997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	50277835	rs910796	T	C	4931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=69;PP=2965;SC=AAAATGGCAGTGTGTCTGCCG;SOR=0.799;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=148;WE=50277843;WS=50277825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	50277883	rs910797	A	G	5245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=74;PP=2965;SC=TGCTTCCACCACAGCCTGCGG;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=162;WE=50277891;WS=50277873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr22	50278438	rs910798	A	G	4781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=75;PP=2965;SC=CCTCGTCTCCAGTAAAGCCGG;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=81;TCR=76;TR=156;WE=50278446;WS=50278428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	50278568	rs910799	A	G	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=73;PP=2965;SC=TTCCGATGACATAGGGGAGGC;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=154;WE=50278576;WS=50278558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr22	50278642	rs910800	C	T	5880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=89;PP=2965;SC=TTGAATCTGGCGCCATCTTCC;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=193;WE=50278650;WS=50278632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr22	50280136	rs5770755	T	C	9320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=137;NR=179;PP=2965;SC=CCTTCGAGGCTGCGAGCCGGG;SOR=0.950;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=316;TCF=137;TCR=179;TR=316;WE=50280144;WS=50280126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr22	50298118	rs62233155	C	T	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=972;ReadPosRankSum=0.252;SC=GCAGAGACCCCGCTTTGTACA;SOR=1.314;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=142;TCF=57;TCR=85;TR=63;WE=50298126;WS=50298108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,77:0.44:176
chr22	50304069	rs78916708	G	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=777;ReadPosRankSum=-1.202;SC=AGGCCCGGCCGGCAGCTACGT;SOR=0.485;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=106;TCF=82;TCR=24;TR=50;WE=50304077;WS=50304059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr22	50315904	.	TAGTCAGGACCGGCCTCTCCGATTCTTACGCCCCTCAGC	T	1287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=5.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.404;SOR=1.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr22	50356274	rs28645887	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CCAGCAGGGACCTCGCCGTCT;SOR=0.193;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=50356282;WS=50356264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr22	50356302	rs28691713	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GGCTCTGCCTCTGTGGTGGGC;SOR=0.245;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=21;WE=50356310;WS=50356292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr22	50356555	rs4078443	T	C	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=44;PP=1753;SC=CTCGCCCTGCTTGGGCCCTCC;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=50356563;WS=50356545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	50356693	rs4077129	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=50;PP=1868;SC=GACGGGGGCGTCCCGGAGAGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=50356701;WS=50356683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	50356850	rs1801645	C	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=297;SC=CCCTGACTTTCTCCTGCGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=50356858;WS=50356840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr22	50436846	rs79102851	G	GTCC	2706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=42;PP=2292;SC=GTCCAGCGCAGTCCTATGGGT;SOR=3.150;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=44;WE=50436854;WS=50436836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	50437976	rs7290572	G	T	369.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=1.340;SC=GGGAGGGCGGGGGTGGTCTGG;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=13;WE=50437984;WS=50437966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr22	50439194	rs9617090	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=462;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGCTGCCCCCCCTGCTGCCGG;SOR=0.498;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=28;WE=50439202;WS=50439184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr22	50439430	rs137845	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=209;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AGGCCGCCCAAGGTTTGATGG;SOR=1.004;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=17;WE=50439438;WS=50439420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr22	50439755	rs137846	G	GCA	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=187;ReadPosRankSum=0.766;SC=CCCTGGGGCTGCAGTCTTTGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=50439763;WS=50439745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	50453795	rs113243952	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr22	50468817	.	C	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=0.253;SC=ATGCAGCAGGCGGCCCCCAAG;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=9;WE=50468825;WS=50468807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr22	50468907	rs738333	C	G,T	1279.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=13,17;NR=8,10;PP=269,393;SC=GTCTTCAGGCCCCGCAGCACA;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=21,27;WE=50468915;WS=50468897;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.43,0.57:54
chr22	50468933	rs79298	G	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=528;ReadPosRankSum=2.017;SC=CAGCGGGTGCGCATTTAGCTG;SOR=0.842;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=32;WE=50468941;WS=50468923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr22	50470516	rs11101958	C	T	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=55;PP=1359;ReadPosRankSum=2.300;SC=TTCTGGACGGCGTTGTTGCAC;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=94;TCR=121;TR=98;WE=50470524;WS=50470506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,110:0.45:247
chr22	50471620	rs5845912	AC	A	1687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.506;NF=22;NR=15;PP=1306;ReadPosRankSum=0.314;SC=CAGGTCGCCCACCGCACTGAC;SOR=0.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=37;WE=50471628;WS=50471610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr22	50472712	rs12484423	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=6.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCCTCACTCACGGCTCCTGGC;SOR=2.245;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=50472720;WS=50472710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	50479856	rs9617137	A	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=1.550;SC=GACAGACACCACAATACTCAA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=50479864;WS=50479846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr22	50480108	rs9628315	C	T	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1172;ReadPosRankSum=0.722;SC=GTGAGGTCCTCCACGGCATCT;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=77;WE=50480116;WS=50480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,91:0.58:156
chr22	50483850	rs8138121	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=825;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GCCCTATCTGTCCGAGCCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=56;WE=50483858;WS=50483840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr22	50483889	rs8137790	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=549;ReadPosRankSum=1.964;SC=GGCCAGGGCCACGGAGGCTCC;SOR=0.392;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=32;WE=50483897;WS=50483879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr22	50483926	rs8138277	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=0.352;SC=CCCGCCCTCATAGCCGATGGG;SOR=0.321;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=13;WE=50483934;WS=50483916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr22	50485793	rs137906	T	C	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=68;PP=1706;SC=TGGGATGGAGTGAGGCAACCA;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=103;WE=50485801;WS=50485783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr22	50487567	rs137911	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=10;PP=929;SC=GGCTTTGCCCTCGCCGGGCTG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=50487575;WS=50487557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	50493638	rs76127602	C	G	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1155;ReadPosRankSum=-1.203;SC=GTCCCCCTCCCCACCGAGTCC;SOR=0.843;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=195;TCF=112;TCR=83;TR=87;WE=50493646;WS=50493628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,111:0.45:244
chr22	50512617	rs2038048	C	T	3178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=27;PP=2244;SC=CCCAGAGCGGCGGCGGGCGGG;SOR=1.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=76;TCR=27;TR=103;WE=50512625;WS=50512607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	50515677	rs6010166	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=258;SC=CCCTCCTGGCCGGGGTTTCTG;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=50515685;WS=50515667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	50518723	rs79301	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=24;PP=1258;SC=ACTGTCTGTCAGCCCCTCCGG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=68;WE=50518731;WS=50518713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	50523433	rs137930	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=143;SC=CTGAGGAAACTTCAATAAGTT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=50523441;WS=50523423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	50546788	rs138215	G	C	10894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.72;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr22	50546797	rs138216	T	C	10367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.67;SOR=1.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr22	50547247	rs138217	A	G	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=58;PP=1771;SC=TCTGGAGGGCACTTTGTATGA;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=50547255;WS=50547237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr22	50555486	rs126241	G	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=473;SC=CTAAAGATGAGTCTTAACTCT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=50555494;WS=50555476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	50555619	rs138222	C	T	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=38;PP=1795;SC=TCCTTTTGCTCTGTTTTTCCG;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=88;WE=50555627;WS=50555609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr22	50564413	.	A	G	178	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=56.17;NF=6;NR=2;PP=178;QD=26.5964015684;SC=AGTAGAGATGAGGTTTCGCCG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=50564421;WS=50564403;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	50585626	.	A	G	440	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=59.88;NF=0;NR=16;PP=440;QD=29.6732007842;SC=TCTCAGAGGCACTCTGTGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=50585634;WS=50585616;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	50587979	rs138270	T	G	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=17;PP=1771;SC=TTTGCCAGTGTGTCAGAGGCA;SOR=1.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=73;WE=50587987;WS=50587969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr22	50588131	rs138271	C	T	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=73;PP=2155;SC=TGATGTCGGACATCAGTGGCC;SOR=1.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=99;WE=50588139;WS=50588121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	50598296	rs17781047	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=605;SC=ATCTAAAGGGGCAGAGGCTGA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=50598304;WS=50598286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	50616656	rs7286904	T	C	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=163;SC=CGCCCGCCCCTGACAAGAAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=50616664;WS=50616646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50616806	rs5771206	A	G	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=450;SC=ACTGTGGGCTAGGCCTGGCCC;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=50616814;WS=50616796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	50635627	rs5771095	C	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=773;SC=AGCGCACCCCCGCACCCGCCC;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=50635635;WS=50635617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	50637625	rs55810238	A	C	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=690;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GTCTGTCCCGAGTGGGCTCGC;SOR=0.966;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=54;WE=50637633;WS=50637615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,66:0.56:117
chr22	50639367	rs7293065	A	C	159.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=205;SC=CCCTCCCCCCACCCGCCCCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=50639375;WS=50639364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	50639371	.	G	C	159.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	50639473	rs5771225	T	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=12;PP=763;SC=CGGATGGCCGTATACAGGGCA;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=50639481;WS=50639463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	50639528	rs5771226	T	C	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=38;NR=35;PP=1334;SC=TGCCCCTCGGTCGCTGTTCCC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=50639536;WS=50639518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	50639636	rs6010201	C	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=14;PP=374;SC=CCCTGCGCGCCCTGCCCGTGG;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=50639644;WS=50639626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	50639778	rs3747942	T	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=5;PP=292;SC=CGCGCTGGCGTTGCTGGGCCT;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=50639786;WS=50639768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	50639965	rs2272846	C	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=20;PP=690;SC=TGCACGGCGACCGGCGAGCGC;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=50639973;WS=50639955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	50644969	rs2294399	G	A	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=39;PP=1344;SC=GGGGCCTTTCGGCCTGTCTAC;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=50644977;WS=50644959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr22	50646859	.	CA	C	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=59.95;NF=4;NR=1;PP=60;QD=12.6;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=50646867;WS=50646849;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,5:0.33:15
chr22	50646936	rs5771102	G	C	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=24;PP=1443;SC=TCAGGTTTGGGCTGTTGACGC;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=50646944;WS=50646926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	50649297	rs36098069	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=903;ReadPosRankSum=1.038;SC=TGGAGGAAGACGGGGCGCTGG;SOR=1.014;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=62;WE=50649305;WS=50649287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr22	50654428	rs2294402	T	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=457;SC=CAGGGACAGATTCAGTCAGGG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=50654436;WS=50654418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	50655098	rs2272851	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=12;PP=603;SC=GCTACCTCCCAGACACCCTGG;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=50655106;WS=50655088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	50656096	rs2038050	A	G	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=68;PP=2965;SC=CTCAGCCCCCACCCAGGAGAG;SOR=0.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=50656104;WS=50656086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr22	50656428	rs35381394	G	A	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1528;ReadPosRankSum=0.459;SC=TCTGCACCCCGCGGGCCCCCA;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=277;TCF=135;TCR=142;TR=109;WE=50656436;WS=50656418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,142:0.41:348
chr22	50657010	rs4838864	C	G	7981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=135;PP=2965;SC=TACTTGCTCACGCAGCCCTCG;SOR=0.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=111;TCR=135;TR=246;WE=50657018;WS=50657000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr22	50658053	rs6537642	A	G	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1134;SC=CTCCCTGCCAACAGCAACTGC;SOR=1.098;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=54;WE=50658061;WS=50658043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	50658274	rs2272854	C	G	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=52;PP=2756;SC=GTCCCCACAACCAGCTTGTGC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=123;WE=50658282;WS=50658264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr22	50658424	rs11703226	T	C	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=113;PP=2965;SC=AGGTCCTCAGTGTCCCCGCTC;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=78;TCR=113;TR=191;WE=50658432;WS=50658414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr22	50658501	rs9617119	A	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=47;PP=1538;SC=TGGCGGGTACAGAGCCGAGCC;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=66;WE=50658509;WS=50658491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	50658570	rs17248273	A	G	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=19;PP=1145;SC=CCTGGCTGACAAGGAGGCCTG;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=50658578;WS=50658560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	50664612	rs4838865	A	G	7473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=110;PP=2965;SC=TGTCCAGTACAACTTATCTAA;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=247;TCF=137;TCR=110;TR=247;WE=50664620;WS=50664602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr22	50678571	rs5771109	T	C	244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=119;SC=ACACACCCCATCCAAGGCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=50678579;WS=50678561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	50682061	.	AAAG	A	371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.78;ReadPosRankSum=-1.505;SOR=1.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr22	50682865	rs5771270	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=578;ReadPosRankSum=0.559;SC=ACAGGTCGTCGAACAGCTGCG;SOR=0.437;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=34;WE=50682873;WS=50682855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr22	50684296	rs13058062	T	C	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=39;PP=1512;SC=ACTGGTCCTTTCCCTCGTCCC;SOR=0.824;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=50684304;WS=50684286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	50685508	rs4838866	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=216;SC=TCAGCCACACATCTTCTTACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=50685516;WS=50685498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	50688235	rs738334	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1346;SC=CCTCCTGCGCTGCCCCTTGCT;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=50688243;WS=50688225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	50688348	rs1555048	A	G	4534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=73;PP=2965;SC=TGTTGAACACACAGAACCCGT;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=155;WE=50688356;WS=50688338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	50689030	rs909688	A	G	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=48;PP=1316;SC=CCTGGGATTCATGGTGGGAGT;SOR=3.952;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=51;WE=50689038;WS=50689020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	50691920	.	T	G	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=57.38;NF=0;NR=6;PP=87;QD=20.2952020912;SC=CTGGCGGGGGTGGGGGGGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=6;WE=50691928;WS=50691910;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,6:0.30:20
chr22	50693479	rs5771281	A	G	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=430;SC=CAGGGCCCACAGGGTCCACAC;SOR=2.670;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=24;WE=50693487;WS=50693469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	50693521	rs5771282	C	T	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=37;NR=13;PP=1060;SC=ACTCACGGGTCCACACAGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=50693546;WS=50693511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	50693534	rs6010218	A	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.91;SOR=2.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	50693538	rs6010219	G	A	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.97;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	50693554	rs6010220	A	G	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=23;PP=1653;SC=CCCAACTCACAGGTCCACACA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=82;WE=50693562;WS=50693544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	50694297	rs1129880	A	G	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=48;PP=1739;SC=TGCAGCCCACAGACCAGATGT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=50694305;WS=50694287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr22	50695270	rs5771284	A	C	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=12;PP=1114;SC=GTGGCTCAGCACCCAGACCCC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=50695278;WS=50695260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	50696662	rs73187284	C	T	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=62;PP=2883;SC=CAGCCCAGGTCGGCACTCACA;SOR=0.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=149;WE=50696670;WS=50696652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	50700030	.	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=1.577;SC=CTCGGGCCGGCTCCGCGCCGC;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=50700038;WS=50700020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr22	50705466	rs760748	A	G	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=92;PP=2965;SC=GCGCCAGCCCAAAATCCAGGA;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=59;TCR=92;TR=151;WE=50705474;WS=50705456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	50713866	rs1042979	G	C	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=25;PP=1009;SC=TCAAATCACTGGAGACTCGAC;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=50713874;WS=50713856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	50715029	rs5771119	T	C	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=52;PP=2472;SC=CGGGGAGGGCTGTGGGTGCGT;SOR=1.172;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=141;WE=50715037;WS=50715019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr22	50715973	rs28637964	G	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=6;PP=1088;SC=GCCTCCTGGGGACAGACCCAG;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=50715981;WS=50715963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr22	50717129	rs28718510	T	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=39;PP=1355;SC=CGCCACTCTGTGGGAAGAGAC;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=50717137;WS=50717119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr22	50722167	rs28470336	T	C	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.355;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=74;PP=1987;ReadPosRankSum=-1.263;SC=AGGGGGCCCGTCTCAGGCTGG;SOR=0.920;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=134;WE=50722175;WS=50722157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,154:0.49:312
chr22	50722408	rs79966207	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=472;ReadPosRankSum=-0.675;SC=AAGGAGCAGTTGTAGAGGGTC;SOR=1.217;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=37;WE=50722416;WS=50722398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr22	50722939	rs146267024	A	AC	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.376;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=352;ReadPosRankSum=1.175;SC=CCTGAAGGTGACCCCCCACCC;SOR=0.148;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=14;WE=50722947;WS=50722929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr22	50724172	.	A	AC	117	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=21;MQ=57.16;NF=4;NR=1;PP=117;QD=30.2;SC=ACCGGCCGGCACCCCTCCCTC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=5;WE=50724180;WS=50724162;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,5:0.26:19
chr22	50724190	.	G	T	118	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=7;NR=3;PP=118;QD=15.2771212547;SC=CTCCGCACCTGAGCCTGCCTG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=10;WE=50724198;WS=50724180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr22	50725553	rs28513473	T	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=492;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GGCCTGGCGGTGTGACGGGGA;SOR=0.909;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=36;WE=50725561;WS=50725543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
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chr22	50728062	rs28379706	T	C	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1105;ReadPosRankSum=-1.526;SC=GCGTGCACCTTGTCCAGCGGG;SOR=0.874;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=174;TCF=85;TCR=89;TR=78;WE=50728070;WS=50728052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,94:0.44:214
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chr22	50752150	rs68178377	C	T	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=0.228;SC=TTCTTCTGCACGCCCTGCAGG;SOR=0.767;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=36;WE=50752158;WS=50752140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr22	50752169	rs73891220	G	A	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=494;ReadPosRankSum=1.471;SC=GGGGAGAGAGGGCCAGGCCCT;SOR=0.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=37;WE=50752177;WS=50752159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr22	50753334	rs73439311	G	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=517;ReadPosRankSum=1.865;SC=ATATGAGTCAGCACAGGCCGG;SOR=0.364;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=36;WE=50753342;WS=50753324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr22	50753973	rs62241228	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=1.682;SC=CTGCCTCCCTTGGGCAGTCCC;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=6;WE=50753981;WS=50753963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr22	50754052	rs71964200	TACTC	T	1338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=996;ReadPosRankSum=0.154;SC=CGCACACACATACTCACACAC;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=22;WE=50754063;WS=50754042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr22	50754363	rs35812349	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=137;ReadPosRankSum=0.380;SC=GGGTGAACCAAGGAAGCAGGT;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=50754371;WS=50754362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr22	50754466	rs62241230	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=588;ReadPosRankSum=-0.182;SC=CTTGGTCAAACTGCTTCGGAG;SOR=0.616;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=34;WE=50754474;WS=50754456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr22	50754648	rs11553141	T	C	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.436;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1356;ReadPosRankSum=0.172;SC=TCTGCCCAGGTGCAGGCGCCG;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=87;WE=50754656;WS=50754638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,101:0.57:176
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chr22	50757470	rs67488807	T	C	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=58;PP=1397;ReadPosRankSum=0.534;SC=ACACCATCTGTCCGAGGAGGC;SOR=1.057;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=154;TCF=44;TCR=110;TR=77;WE=50757478;WS=50757460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
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chr22	50874893	rs13054572	C	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=693;ReadPosRankSum=0.641;SC=TGAGGAGGCTCGGGGCTGCCC;SOR=0.542;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=49;WE=50874901;WS=50874883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr22	50876077	rs9306550	T	C	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1139;ReadPosRankSum=0.071;SC=CGGCTCTCCCTGCTGCTGAGC;SOR=0.677;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=187;TCF=87;TCR=100;TR=90;WE=50876085;WS=50876067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,114:0.50:229
chr22	50876235	rs5770779	T	C	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=59;PP=1837;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GCAGTGGGCCTGGAGGAACGC;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=171;TCR=116;TR=146;WE=50876243;WS=50876225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,174:0.50:346
chr22	50876357	rs5770890	C	G	2925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=76;PP=1886;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TGTGGGGTGCCGCCACCCTTT;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=103;TCR=166;TR=123;WE=50876365;WS=50876347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,140:0.46:306
chr22	50877166	rs4824131	G	C	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1118;ReadPosRankSum=-0.377;SC=AGAAGGAAGCGCCCCCTGTGG;SOR=0.686;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=70;WE=50877174;WS=50877156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr22	50878196	rs13057311	G	A	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=863;ReadPosRankSum=0.500;SC=GGAGTGGTGAGGGACGTGGGT;SOR=0.697;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=55;WE=50878204;WS=50878186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
chr22	50882590	rs6010031	G	A	2286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1332;ReadPosRankSum=-1.672;SC=GACAGGGCCCGCAGCCCGCAC;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=89;WE=50882598;WS=50882580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,106:0.56:189
chr22	50882752	rs59017944	CT	C,CTT	251.27	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001,0.4999;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.641;NF=0,0;NR=15,15;PP=148,25;ReadPosRankSum=0.474;SC=GTGATGCAATCTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=15,15;WE=50882760;WS=50882742;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.81:16
chr22	50885244	rs113982913	TTC	T	2130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.902;NF=7;NR=30;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GTGGCGTTAGTTCTCTCTTTA;SOR=0.514;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=37;WE=50885253;WS=50885234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr22	50885775	rs1053744	A	G	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1115;ReadPosRankSum=0.788;SC=TCTCGTCCACAGTCTTAGGGG;SOR=0.687;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=87;WE=50885783;WS=50885765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,98:0.44:225
chr22	50895133	rs4824117	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=0.986;SC=AAGCACCCAAAGGGGGCCAGG;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=32;WE=50895141;WS=50895123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr22	50899755	rs35628474	AG	A	1155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=8.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.713;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr22	50899758	rs2073280	G	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.508;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=601;ReadPosRankSum=2.717;SC=GAAGGTAAGGGGGGGGGGGTC;SOR=0.429;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=28;WE=50899766;WS=50899745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr22	50901259	rs9617014	G	T	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.641;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=823;ReadPosRankSum=1.194;SC=CACCAGGAAGGGGGGGCTGGG;SOR=0.383;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=48;WE=50901267;WS=50901249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr22	50901534	rs5771039	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.317;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CCCAGGCCCCAGCACCTGCCC;SOR=0.039;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=50901542;WS=50901524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr22	50902721	rs188038325	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=428;ReadPosRankSum=-0.824;SC=TCTGAAACCCGCTGCCCTGGC;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=24;WE=50902729;WS=50902711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr22	50903221	rs2076714	C	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.659;SC=GGCGGTACGACGCCCTCCCGT;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=71;WE=50903229;WS=50903211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,89:0.66:134
chr22	50904608	rs201776298	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TGGAAGGCCGCGTTGACCCCA;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=70;WE=50904616;WS=50904598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr22	50906491	.	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.050;SC=CCTGGGGACACGTGGCCTCCT;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=50906499;WS=50906481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	50906917	rs9616852	C	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=677;ReadPosRankSum=0.100;SC=GGGGTCAGAGCACCCAACCCG;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=48;WE=50906925;WS=50906907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr22	50913394	rs373485644	CGCG	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TGGTTCGCTCCGCGGCGGCGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=50913404;WS=50913384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	50913429	rs4824154	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-2.260;SC=GCGGCCCAGGTTCCCGCCGCC;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=6;WE=50913437;WS=50913419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	50921644	rs13056677	G	A	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=70;PP=1869;ReadPosRankSum=1.161;SC=CAGAAGCTGGGCCCTGAACAC;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=93;TCR=138;TR=116;WE=50921652;WS=50921634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,121:0.50:241
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chr22	50925771	rs2232879	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=847;ReadPosRankSum=0.805;SC=TCCTCGTGGAGCTGACATGAT;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=51;WE=50925779;WS=50925761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr22	50927447	rs139170143	C	CGTCCCTCCT	1106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.916;NF=10;NR=5;PP=2013;ReadPosRankSum=1.497;SC=CATGGCCTCCCGTCCCTCCTG;SOR=0.312;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=15;WE=50927455;WS=50927437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr22	50941985	rs6009975	T	C	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=26;PP=988;SC=CTAGCAGGGCTTGCACAAATC;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=50941993;WS=50941975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	50944163	rs128941	G	A	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=65;PP=1620;ReadPosRankSum=1.850;SC=TGGTCGTCCAGCAGCGCAGTG;SOR=0.666;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=232;TCF=115;TCR=117;TR=120;WE=50944171;WS=50944153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,146:0.52:282
chr22	50945256	rs131824	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=621;ReadPosRankSum=0.637;SC=AGTAGATGACAGGGTGGCGCA;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=40;WE=50945264;WS=50945246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr22	50946965	rs131823	T	C	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=115;SC=CGCCCCACCGTCTCCACGCCT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=50946973;WS=50946955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	50957520	rs3091397	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TCTGGGCTCCGTGACTAAAGC;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=13;WE=50957528;WS=50957510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr22	50960101	rs131814	G	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.143;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1700;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGCATGAGGTGGGGGGGTGGG;SOR=0.926;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=101;WE=50960109;WS=50960091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,110:0.53:206
chr22	50961169	rs131813	A	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=665;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GGTTAGAGGGAGACGGGGAGG;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=41;WE=50961177;WS=50961158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr22	50961854	rs2782	T	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=-1.336;SC=AGGAGCCGTGTGTCTGCTCCT;SOR=0.275;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=21;WE=50961862;WS=50961844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr22	50962208	rs12148	T	G	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1270;ReadPosRankSum=0.701;SC=CCTTGGGGCCTGCATTGTAGT;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=87;WE=50962216;WS=50962198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,92:0.46:202
chr22	50962782	rs140523	C	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=956;ReadPosRankSum=-1.456;SC=AGGGAGGACCCGAGGCTTGAG;SOR=1.075;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=64;WE=50962790;WS=50962772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr22	50964153	rs131805	T	C	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=864;ReadPosRankSum=0.326;SC=CCCTGGATCCTTCCGCTCCCG;SOR=0.856;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=56;WE=50964161;WS=50964143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr22	50964862	rs131804	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=0.668;SC=CAGCGCCCTGGGCCTGAGTCC;SOR=1.061;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=11;WE=50964870;WS=50964852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr22	50966914	rs470119	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=639;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CAACCTGGATTAATGACTGAT;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=41;WE=50966932;WS=50966904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr22	50987287	rs5770886	A	G	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=681;ReadPosRankSum=0.787;SC=GCCTTTGCCCAGCAGCACGGA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=49;WE=50987295;WS=50987277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr22	50988062	rs140519	G	T	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=83;PP=2016;ReadPosRankSum=0.684;SC=GCGACATCGTGGCACTGGGGG;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=237;TCF=93;TCR=144;TR=134;WE=50988070;WS=50988052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,148:0.52:286
chr22	50988193	rs131779	A	G	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.93;MQRankSum=6.558;NF=34;NR=41;PP=1642;ReadPosRankSum=-1.491;SC=GCCCCACTGCACTGCACCACC;SOR=1.206;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=75;WE=50988201;WS=50988183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr22	51008121	rs12160714	G	A	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GAAGGGTGAAGAAGGCATAAA;SOR=0.631;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=77;WE=51008129;WS=51008111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,92:0.48:192
chr22	51009953	rs470117	C	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=841;ReadPosRankSum=-0.477;SC=TAGGAACTCTCGATGACCGCC;SOR=0.518;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=61;WE=51009961;WS=51009943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr22	51010788	rs131761	T	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=42;PP=1298;SC=TGTCCAGAGGTGCCTGACCTG;SOR=1.488;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=51010796;WS=51010778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	51011936	rs131760	T	C	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=36;PP=1805;SC=AGTCCCTTCCTAGAGGCCAAT;SOR=1.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=95;WE=51011944;WS=51011926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	51015210	rs140515	G	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=575;ReadPosRankSum=0.734;SC=TGCCTCTCCCGTCTAGCTCAG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=36;WE=51015218;WS=51015200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr22	51015481	rs131759	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=0.831;SC=AGAGGGGCAAGGGCTGCAGGG;SOR=1.589;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=23;WE=51015489;WS=51015471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr22	51018579	rs140514	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=572;ReadPosRankSum=1.619;SC=CAAGAGCCCTATGGGAACAGA;SOR=0.798;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=42;WE=51018587;WS=51018569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
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chr22	51020668	rs86337	C	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr22	51042513	rs140511	C	CG	5134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=40.12;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr22	51043278	rs3219201	G	A	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=19;PP=1000;SC=TGGTGGATGAGCACACGCAGC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=51043286;WS=51043268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	51045190	rs1140555	C	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=592;ReadPosRankSum=0.455;SC=GAGGAGGGCCCGAGGTGGGAG;SOR=0.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=35;WE=51045198;WS=51045180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr22	51045433	rs131736	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=508;ReadPosRankSum=-1.977;SC=AGAGTCTGACCGTCCCCGAGT;SOR=0.429;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=34;WE=51045441;WS=51045423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr22	51045480	rs131735	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=-0.824;SC=GAGTCCAACCGCCCCCTGAGT;SOR=1.048;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=16;WE=51045488;WS=51045470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr22	51048400	rs2269380	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=860;ReadPosRankSum=0.423;SC=GGGAGAGTGGACGCCCCTGGT;SOR=0.661;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=53;WE=51048408;WS=51048390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr22	51048514	rs2269379	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=961;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TTGTGCGACCCCCACACTCCT;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=56;WE=51048522;WS=51048504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr22	51048612	rs373388773	C	T	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=50;PP=1410;ReadPosRankSum=0.200;SC=AGGGCTCTGACGTGCCCTCCA;SOR=0.772;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=93;WE=51048620;WS=51048602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr22	51048781	rs5770941	T	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=371;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GGGTGCAGGGTTACGGAGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=22;WE=51048789;WS=51048771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr22	51048812	rs9616798	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GTGAGCAGGTGGGGGCAGGAG;SOR=0.340;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=9;WE=51048820;WS=51048802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr22	51063987	rs762674	G	C	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=84;NR=70;PP=2965;SC=CGGGGGGAGGGATCCACGGGG;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=154;WE=51063995;WS=51063977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr22	51064039	rs743616	G	C	7040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=98;PP=2965;SC=GTACTTTCCAGTCCGCACAGC;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=205;WE=51064047;WS=51064029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr22	51064141	rs762673	G	A	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=81;PP=2309;SC=ACGGGGCGGGGCAGGCCCCAA;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=38;TCR=81;TR=119;WE=51064149;WS=51064131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr22	51064818	rs762672	T	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=583;SC=GTGCCCAGCATGAGCCCGGCA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=29;WE=51064826;WS=51064808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	51065229	rs6151416	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TAGGGGTCACGGGCAGCCAGG;SOR=1.014;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=70;WE=51065237;WS=51065219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,91:0.54:167
chr22	51065322	rs113990230	A	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=40;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CCATGAGGTCATGGGCGAAAG;SOR=1.004;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=94;WE=51065330;WS=51065312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,98:0.42:233
chr22	51113801	rs34190400	C	CTGTG	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=2;PP=118;SC=GGGGTGGAGGCTGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=51113809;WS=51113791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	51135451	rs9616939	G	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr22	51135545	rs9616818	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=0.828;SC=AGTGGAGGAGTGAGAGCTCAG;SOR=1.123;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=16;WE=51135553;WS=51135535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr22	51135595	rs28735993	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GAAGGTGGGCATCACGCAGTG;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=18;WE=51135603;WS=51135585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr22	51137094	rs9616942	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CCCCACTGACGGCCTGTCTGG;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=14;WE=51137102;WS=51137084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr22	51137249	rs1557620	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=492;ReadPosRankSum=-0.693;SC=ACCCCACGGCTCCCCGGGCAG;SOR=0.655;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=36;WE=51137257;WS=51137239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr22	51143309	rs8141844	G	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=782;ReadPosRankSum=1.506;SC=GTTCTGGCCGGTGCTGCCCAG;SOR=0.877;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=42;WE=51143317;WS=51143299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr22	51150167	rs5770819	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=0.317;SC=CAGGGTGGCCTGGAAGCCTGG;SOR=0.290;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=20;WE=51150175;WS=51150157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr22	51150225	.	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr22	51179000	rs2283675	C	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.960;NF=18;NR=3;PP=376;ReadPosRankSum=-1.074;SC=GGAAGGGGACCGGTGGTTGGT;SOR=0.730;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=21;WE=51179008;WS=51178990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr22	51182399	rs56238942	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.52;MQRankSum=0.674;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	51182485	rs6009961	A	G	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=31;PP=2139;SC=TGGTCTGACTATAGCCCCCAG;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=73;TCR=31;TR=104;WE=51182493;WS=51182475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	51208005	rs144874090	GTC	G	2337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.728;NF=7;NR=39;PP=1833;ReadPosRankSum=2.658;SC=TAGGACATTGGTCTGTCTGTC;SOR=0.450;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=100;TCF=19;TCR=81;TR=46;WE=51208014;WS=51207995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
chr22	51215028	rs143621081	C	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.220;NF=6;NR=4;PP=135;ReadPosRankSum=0.217;SC=TATGAACCTTCCCTCACCTCC;SOR=0.591;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=10;WE=51215036;WS=51215018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr22	51219006	rs28729663	G	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.587;NF=41;NR=15;PP=847;ReadPosRankSum=1.433;SC=CTTGAGTCCAGTCAAAACTGA;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=85;TCR=31;TR=56;WE=51219014;WS=51218996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chrX	2700157	rs5939319	G	A	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=42;PP=1385;SC=CGAGAATCCCGACAGCGGTGG;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=2700165;WS=2700147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	2700202	rs5939320	A	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=28;PP=820;SC=CTCTTTCTCAATCTGGTTTGA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=2700210;WS=2700192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	2715425	rs4484858	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=17;NR=25;PP=691;SC=TGGGCATGCGATGGTGGGTGG;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=2715433;WS=2715415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	2724760	rs3749988	T	C	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=8;PP=1042;SC=GGCTATAGACTCAACTCTCGT;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=2724768;WS=2724750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	2726396	rs6567645	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=289;SC=GTATGTATATAAAGTAGCTCC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=2726404;WS=2726386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	2729540	rs11439714	T	TA	699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.378;NF=1;NR=22;PP=438;ReadPosRankSum=-0.539;SC=AAGCCTGATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=23;WE=2729548;WS=2729530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chrX	2732356	rs34201156	C	CT	362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=6;PP=261;SC=TTTAATAAGACTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=11;WE=2732364;WS=2732346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	2748051	rs57068689	T	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=13;PP=1021;SC=GGGGTGACACTGGCGGGGCCT;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=2748059;WS=2748041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	2748253	rs6642032	G	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=43;PP=1295;SC=AGCTCAAGCTGCTTCAGTTCA;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=2748261;WS=2748243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	2748292	rs6641656	C	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=561;SC=GCTTGGGTGACAGATTGGTCT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=2748300;WS=2748282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	2774478	rs5939132	A	G	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=32;PP=1339;SC=CACATCTCGCATTCTTGGAGT;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=2774486;WS=2774468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	2774700	rs5939133	T	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=195;SC=CTGCCAGATCTGCCACTACCG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=2774708;WS=2774690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	2777985	rs2306734	C	T	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=41;PP=1498;SC=CAAGGCTCAGCGTCCAGCAGC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=2777993;WS=2777975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	2779570	rs2306735	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=599;SC=CAGCTTTGCCACAGTGATGTG;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=2779578;WS=2779560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	2832661	rs111318153	A	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chrX	2832668	rs139484145	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=1.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chrX	2832696	rs113031742	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=1369;ReadPosRankSum=-2.151;SC=GCAGCCTCACTGGTCCTCTCC;SOR=1.324;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=25;WE=2832723;WS=2832686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chrX	2832708	rs112408163	G	T	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=5.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chrX	2832715	rs73632953	T	C	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.101;SOR=1.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chrX	2832742	rs211648	G	C	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=46;PP=1964;SC=AAGACAGCGTGTCTGCATTGT;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=99;WE=2832750;WS=2832732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chrX	2832771	rs78142040	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=397;ReadPosRankSum=0.316;SC=TTAACTTTATCGCTTCACTTT;SOR=0.707;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=40;WE=2832779;WS=2832761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
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chrX	2832860	rs73632955	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.515;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=686;ReadPosRankSum=0.014;SC=AAGTAATTGGGAATACTGAAG;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=10;WE=2832888;WS=2832850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
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chrX	2833533	rs369423737	GTTACGCCC	G	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=1670;ReadPosRankSum=0.962;SC=TGGCCAGTCTGTTACGCCCTA;SOR=1.270;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=9;WE=2833560;WS=2833523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chrX	2833551	rs114724695	A	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=8.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.474;SOR=2.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chrX	2833551	.	AC	TG	1674	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=1;PP=1674;QD=132.88214422;SC=CTATGTTCAAACCTGAGGCCG;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=13;WE=2833560;WS=2833523;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:37,13:0.26:50
chrX	2833552	rs115030126	C	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=5.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.737;SOR=2.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chrX	2833580	rs112594989	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=0.907;SC=GTGAGGCTCCATGGTACCTTG;SOR=2.590;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=19;WE=2833588;WS=2833570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,19:0.23:82
chrX	2833605	rs111939179	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=516;ReadPosRankSum=-1.697;SC=ACCTATGAGCCAGTCCATCTC;SOR=1.040;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=32;WE=2833613;WS=2833595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,32:0.29:109
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chrX	2833749	rs112924969	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.653;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,42:0.31:137
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chrX	2833771	rs200976696	T	C	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chrX	2833780	rs115636789	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,32:0.31:103
chrX	2833803	rs112173548	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=186;ReadPosRankSum=-1.514;SC=TGCACCCATACGTTCACTCCA;SOR=0.951;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=15;WE=2833811;WS=2833793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chrX	2833855	rs73632957	T	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chrX	2835831	rs75490251	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=-1.519;SC=CTTTAAGATGCGATGGTTGCT;SOR=0.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=18;WE=2835839;WS=2835821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,15:0.23:65
chrX	2835863	rs78034736	G	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=429;ReadPosRankSum=-0.974;SC=ATAGGAAACAGCTTCCTTTAG;SOR=0.400;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=29;WE=2835871;WS=2835853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chrX	2835964	rs73632972	G	A	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=3;HapScore=1;MGOF=89;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.886;NF=28;NR=23;PP=714;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GCACAAACCCGAAGGAGGAGT;SOR=0.786;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=51;WE=2835972;WS=2835954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,69:0.38:181
chrX	2835985	.	G	A	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=3.150;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,57:0.34:167
chrX	2835989	rs143238998	A	C	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=3.095;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,58:0.35:166
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chrX	2835995	rs150899882	C	A	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=3.123;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,58:0.35:168
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chrX	2836181	rs73632975	A	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,39:0.32:121
chrX	2836184	rs73632976	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chrX	2836211	rs73632977	A	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=272;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TCCGTGGTTCAGGGGGTGGTG;SOR=0.631;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=23;WE=2836219;WS=2836201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chrX	2836238	rs73632978	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=186;ReadPosRankSum=-0.306;SC=ATCCCCGCGGGATGCACAATT;SOR=0.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=16;WE=2836246;WS=2836228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chrX	2847133	rs3747394	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=213;SC=TACATTTTGGAGACTACAAGG;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=2847141;WS=2847123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	2847157	rs3747395	C	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=274;SC=CGGACACAACCACGCCCTTTA;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=2847165;WS=2847147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	2852951	rs11222	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=425;SC=GTCTCCAGATGTTGCCCAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=2852959;WS=2852941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	2856155	rs35143646	C	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=10;PP=424;SC=GGCACCTCGCCGCCCGCCAGC;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=2856163;WS=2856145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	2871011	rs211640	G	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=605;SC=TATTTCTTGAGTATCTACTTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=2871019;WS=2871001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	2877835	rs211636	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=462;SC=GGTGGCTCATGCCCATTATCT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=2877843;WS=2877825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	2877876	rs211637	T	C	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=188;SC=GTGGGAGCATTGCCTGAGCCC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=2877884;WS=2877866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	2942109	rs5939407	T	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=22;PP=912;SC=CAACCACACCTTGGTGTACTT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=2942117;WS=2942099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	2950961	rs5982634	A	G	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=250;SC=GAGTATTATCAATCACTAGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=2950969;WS=2950951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	2950998	rs5939411	C	T	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=496;SC=ACATCTTTAACGAAAAGAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=2951006;WS=2950988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	2951434	rs5939155	C	G	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=254;SC=TGAGACCATGCGGACCACGTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=2951442;WS=2951424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	2990073	rs150668857	C	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=33;NR=0;PP=823;SC=CCAGGAGACCCTTGGTCTTCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=2990081;WS=2990063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	2998812	rs113654711	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=109;SC=CCTCCTAAAAGCCCTACCTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=2998820;WS=2998802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	2999141	rs5983001	G	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=326;SC=TCTTGGAAACGCTGTATTTTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=2999149;WS=2999131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	3002219	rs5983002	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=558;SC=CTCACATGGTTTTTGCAATGT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=3002227;WS=3002209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	3002475	rs112461718	A	G	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=37;PP=1234;SC=TGCCATTGCCATCCTCACCCT;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=3002483;WS=3002465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	3002687	rs5983003	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=21;PP=705;SC=TGGTGAAGGAAGCGATTTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=3002695;WS=3002677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	3028260	rs17051478	C	T	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=34;PP=1333;SC=TGGCTCCTACCTGCACGCCGT;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=72;WE=3028268;WS=3028250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	3028289	rs5983011	C	T	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=35;PP=1305;SC=TCCCCAAGGACGACAGTGAGT;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=3028297;WS=3028279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	3028385	rs5983012	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=527;SC=TCTCTAGACCGGTCCTTTCAT;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=3028393;WS=3028375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	3028405	rs5982644	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=443;SC=TTCCAGGGCTCACTGAACACA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=3028413;WS=3028395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	3030181	rs7053230	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=412;SC=GCTGAAGTGCGCATCATTTGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=3030189;WS=3030171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	3030426	rs10522044	G	A	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=42;PP=1523;SC=TTAAAAAGGTGGCCAACGCCC;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=3030434;WS=3030416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	3190121	.	CGT	C	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=22;MQ=60.49;NF=4;NR=0;PP=77;QD=20.5;SC=GCTTAATGAGCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=4;WE=3190130;WS=3190111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,4:0.21:19
chrX	3530512	rs7066317	A	C	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1122;SC=CATTTATGAAAGCGGCAATCT;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=3530520;WS=3530502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	3592847	rs7880937	C	T	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=443;SC=TTAAGTCTTCCGACAAAGGAA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=3592855;WS=3592837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	3631167	rs3752362	A	G	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=17;PP=571;SC=CAGGCTGTACACAGGCGGCTC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=34;WE=3631175;WS=3631157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	3736489	rs1133336	C	T	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=24;PP=1330;SC=TCACCAACAGCGTATAAGCAA;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=3736497;WS=3736479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	5811807	rs61095217	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=270;SC=TCTGCTCTTCATATATATTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=5811815;WS=5811797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	6975752	rs5978220	G	T	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=911;SC=GTGCGGTCAGGTGTCATCAGA;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=6975760;WS=6975742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	6975782	rs868756	C	G	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=1215;SC=CAGTTGATTACACAGAAGGAG;SOR=1.392;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=6975790;WS=6975772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	6995315	rs2379206	C	T	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=19;PP=909;SC=GGAAGATGTCCGGGTCTGGCT;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=6995323;WS=6995305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	6995537	rs3747390	C	A	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=42;PP=1284;SC=AGGCCTCCACCATAAGACCTT;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=6995545;WS=6995527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	7066051	rs1473666	A	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=32;PP=1341;SC=CCACGCCCACACAAGACCGCC;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=7066059;WS=7066041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	7890215	rs1183732	C	T	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=23;PP=705;SC=ACTTGGGATTCTATAGACCCA;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=7890223;WS=7890205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	8095173	rs1037521	T	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=384;SC=AAACATAATGTTATGTGGAAA;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=8095181;WS=8095163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	8138080	rs1058239	G	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=8;PP=356;SC=AACTTAGTCGGTGCTCTCGGA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=8138088;WS=8138070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	8138160	rs1058238	T	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.20;QD=40.81;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	8138165	rs1058237	C	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.58;QD=45.41;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	8138170	rs75657421	CT	GC	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.49;QD=46.40;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	8138182	rs41305169	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=8;PP=209;SC=CTCCTGACTCAGGGGGTCGTG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=8138190;WS=8138150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	8270569	.	AAAAGAAAGAAAGAAAG	A	2081.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.49;MQRankSum=0.000;QD=38.55;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chrX	8467239	rs372703313	AAAAG	A	2696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.16;QD=42.81;SOR=1.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	8503641	rs809446	G	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=18;PP=775;SC=CGGAAGGCAGGATCTGGGACT;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=8503649;WS=8503631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	8504773	rs808120	G	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=469;SC=TGCTGACACCGTAGACCTAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=8504781;WS=8504763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	8504833	rs808119	C	T	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=905;SC=AGGCAGCCAACAGGCTTGTGG;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=8504841;WS=8504823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	8700168	rs1236390	A	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=25;SC=GACCAGGCAGACGCCGCGACT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=8700176;WS=8700158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	8761553	rs5978272	T	G	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=71;SC=ATGTTAAATTTGGAACAATAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=8761561;WS=8761545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	8761625	rs2188935	G	A	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=558;SC=CCATACATTCGGAAACAAACA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=8761633;WS=8761615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	8766291	rs2018496	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=240;SC=TGGGAAGATATGTCTTATGTG;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=8766299;WS=8766281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	9000594	rs200449273	TG	T	1386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.775;NF=2;NR=37;PP=622;ReadPosRankSum=0.928;SC=TAGACTTTTTTGGGGGGGGGG;SOR=1.329;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=39;WE=9000603;WS=9000584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chrX	9659490	rs67241809	A	G	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=-1.978;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chrX	9659766	rs2301675	G	A	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=47;SC=GGATGTCAGGGTGGGGGGCGC;SOR=2.338;Source=Platypus;TCF=13;TR=60;WS=9659756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	9659767	rs3214138	T	TG	2904.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=36;PP=1369;SC=GATGTCAGGGTGGGGGGCGCT;SOR=2.483;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=41;WE=9659775;WS=9659756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	9659863	rs2301674	G	A	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=223;SC=TTCTTACCCCGGTGTGTGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=9659871;WS=9659853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	9661075	rs17255209	C	T	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=131;SC=TTAAAGAACACGCAGTGGCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=9661083;WS=9661065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	9661110	rs3747431	C	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=321;SC=CCTGGATCCTCGGAGAGGCTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=9661118;WS=9661100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	9661165	rs3747430	G	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=20;PP=1261;SC=TTTTTGTGGGGTTTTGTCTCT;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=9661173;WS=9661155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	9665368	rs2239411	C	A	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=15;PP=452;SC=AAAACTTTGCCAGAATAGTTA;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=9665376;WS=9665358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	9677599	rs1006912	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=9;PP=512;SC=GTGCACCCCCGGGAGGAATGA;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=9677607;WS=9677589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	9693652	rs3044	G	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=4;PP=315;SC=AGAAGCTCTAGCTGGTGATGA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=9693660;WS=9693642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	9859098	rs6640543	A	G	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=23;PP=848;SC=CGGCCTCCCCATTCACCTCCA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=9859106;WS=9859088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	9859197	rs6640544	A	G	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=35;PP=1147;SC=AGCCTTCTGCAGGGAGCGCAC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=9859205;WS=9859187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	9935526	rs5934730	G	T	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=58;PP=2648;SC=AAGACACCTCGCTCTACCCCC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=124;WE=9935534;WS=9935516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chrX	9935844	rs5934731	C	T	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=40;PP=1780;SC=TCCAGAACTACGATGCCGTCA;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=84;WE=9935852;WS=9935834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	10166198	rs2240019	A	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=353;SC=TTTTACTTCTACTAACTCATT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=10166206;WS=10166188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	11313027	rs946252	T	C	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=40;PP=1260;SC=AAAAATCTGCTCATAGTTGGT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=11313035;WS=11313017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	11786839	rs2525868	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=8;PP=354;SC=ATGGTTCCTTTATTTGTGATT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=11786847;WS=11786829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	12628036	rs2304605	A	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=616;SC=TTTCCTGGGAATGTCTGCCAC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=12628057;WS=12628026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	12628049	rs2304604	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=414;SC=TCTGCCACACTCTGCCAGAAT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=12628057;WS=12628026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	12633034	rs6654760	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=320;SC=CCTGTTCTGCTTTGAAGGCTG;SOR=1.230;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=12633042;WS=12633024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	12722616	rs4469660	C	G	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=41;PP=1262;SC=TATCACATTTCCATCTTAAAA;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=59;WE=12722624;WS=12722606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	12809661	rs1731469	G	A	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=37;NR=32;PP=1035;SC=ATCAGGACCTGTCCCAGCGCG;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=12809669;WS=12809651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	12837558	rs5935399	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=499;SC=GCTACATTCCCAAAATACAAC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=12837566;WS=12837548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	12838934	rs917580	A	G	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=41;PP=1430;SC=TACTGTCTATACACCAAAGGC;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=67;WE=12838942;WS=12838924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	12939928	rs2109135	T	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=31;PP=1549;SC=GGGATTGGGATCCGGGATTGG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=73;WE=12939936;WS=12939918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	12993511	rs115781169	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=517;SC=TGGCGTTTTGCCGTGCCGCTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=12993519;WS=12993501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	13056654	rs4830483	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=85;SC=GTGATTAAAATTGGGTAAATT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=13056662;WS=13056644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	13681115	rs2361159	C	T	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=65;PP=2645;SC=GGCAAGAGATCGAGTGAGTTG;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=116;WE=13681123;WS=13681105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chrX	13681638	rs5935649	C	T	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=37;PP=1029;SC=TAATTTGTAACGAATGTGGGG;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=13681646;WS=13681628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	13681679	rs5935650	G	T	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=777;SC=TGGGTGTGCTGGTAACTGTAA;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=13681687;WS=13681669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	13956661	rs3833419	CG	C	1636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=23;PP=1127;SC=GTGAGGGCTGCGGGGCGTTCG;SOR=0.818;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=30;WE=13956669;WS=13956651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	15307899	.	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chrX	15307905	.	G	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chrX	15333842	rs4830529	T	A	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=75;SC=GTTACCGAGATCTCTGTAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=15333850;WS=15333832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	15792527	rs4364812	T	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.89;QD=28.75;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	15794764	rs5980183	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=266;SC=CCTGAGAACCGTCACCTCGGC;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=15794772;WS=15794754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	15794815	rs5936050	G	A	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=484;SC=ATAATGACTCGGTTATCTCTT;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=15794823;WS=15794805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	15808795	rs4830994	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=18;PP=484;SC=TGGTGCGCGCTCTGGTGCCCT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=15808803;WS=15808785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	15864086	.	T	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=27;PP=1206;SC=GGGTAATTAGTTCATTGTCCT;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=15864094;WS=15864076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	16189670	rs12839379	G	A	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=76;SC=TGTCTACCGCGTGTTCCTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=16189678;WS=16189660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	16608793	rs1527805	G	A	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=20;PP=1135;SC=CCTGTGAGGCGAGTCCTATAA;SOR=1.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=16608801;WS=16608783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	16711184	.	TA	T	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=22;QD=12.5;SC=CGTCTCAAATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=16711192;WS=16711174;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chrX	16762002	rs4830562	A	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=658;SC=CATGGCCTCCATTATGTGCTC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=16762010;WS=16761992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	16887655	rs67984110	C	T	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=36;PP=1416;SC=AGGGGCTGCGCGACCCAGTCG;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=16887663;WS=16887645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	17070688	rs933946	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=133;SC=GACTACAGGAGTGAATACAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=17070696;WS=17070678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	17080492	rs713355	G	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=224;SC=GCACAGAAAAGCTGATGGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=17080500;WS=17080482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	17092152	rs1346246	G	T	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=17;PP=1281;SC=ACATTTACCTGTTGATGTGTT;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=17092160;WS=17092142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	17122102	rs714070	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=111;SC=AGAAAGTTTCCTCAATAAGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=17122110;WS=17122092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	17157148	rs1946395	T	A	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=854;SC=AGCTTTTTTTTAATTTAATAG;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=17157156;WS=17157138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	17705685	rs17312492	A	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=263;SC=AGTTGTCCCTATCAGTATCAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=17705693;WS=17705684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	17705850	rs5901624	C	CT	3421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=33;PP=2426;SC=CGCCCTGTTTCTTGTCTTGCA;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=56;WE=17705858;WS=17705840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	17770154	rs17246603	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=272;SC=AGGTCTTTCAGTTGGATACTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=17770162;WS=17770144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	17819377	rs6527818	T	C	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=43;PP=1589;SC=CTCTGAGGCATCGGGATGGGG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=17819385;WS=17819367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	18671795	rs56396491	AT	GA	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=944;SC=TGTTGTTAAGATCAAAAACCA;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=20;WE=18671804;WS=18671785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	18779721	rs2269584	A	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=769;SC=CTAAATATTAACATTTTTCTT;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=18779729;WS=18779711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	18824794	rs2239437	T	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=351;SC=CAACAAAATGTAAATAGTTCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=18824802;WS=18824784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	18844012	rs2273247	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=381;SC=TGTATGTTGGGGATACAAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=18844020;WS=18844002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	18929128	rs11291764	CT	C	297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=2;NR=9;PP=144;SC=AAGAACAACACTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=11;WE=18929136;WS=18929118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	18954384	rs12862285	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=271;SC=CAGACACAGGGCAAAGAAATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=18954392;WS=18954374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	18966985	.	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=414;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CCATGTTGCAGAGAGCTGCCA;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=28;WE=18966993;WS=18966975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chrX	19041592	rs5909263	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=10;PP=468;SC=ACAAAAAACACGTATACACAT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=19041600;WS=19041582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	19058405	rs6633185	C	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=196;SC=TAAAATTGTACTATATTAAGG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=19058413;WS=19058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	19363863	rs71737866	TC	T	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.091;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.207;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chrX	21861434	rs3213451	A	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1423;SC=TGCTTTACCAATGGTATTCTT;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=21861442;WS=21861424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	21874560	rs730678	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=478;SC=CGTTCTTTTTCCCACGGTCTT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=21874568;WS=21874550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	21875821	rs11339991	TA	T	47.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=3;PP=46;SC=CTAAGAGTTTTAAAAAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=21875829;WS=21875811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	21985464	rs3747276	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=22;PP=715;SC=GTTCTTCATACCTGGTCACTT;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=21985472;WS=21985454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	21990455	rs7051872	G	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=6;PP=642;SC=AGGGATAGTTGGTATGGGAGA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=21990463;WS=21990433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	22002711	rs2239674	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=546;SC=CTGCCACTCAATGAGTGAACT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=22002719;WS=22002701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	22051034	rs178710	A	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=264;SC=AAGAGCAAGAAAGCCTTGGAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=22051042;WS=22051026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	22230975	rs3213493	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=529;SC=GTACTCATCATTGAATCAATC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=22230983;WS=22230965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	22231249	rs11416169	C	CA	1002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=1001;SC=TCCTTGTTACCAGGGTGTATG;SOR=2.468;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=22231257;WS=22231239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	22239720	rs3752433	C	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=533;SC=CGAACTTTTCCTTTTGCTAGG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=22239728;WS=22239710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	22244435	.	T	TTGAA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=390;SC=CTCTGATTTATTGAATGTGAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=22244443;WS=22244425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	23018270	.	G	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=9;PP=590;SC=GCAGTGGCTGGAGTGGCCCCT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=23018278;WS=23018260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	23019792	rs201459158	T	C	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=44;PP=2180;SC=CACACATGTATATAATTATGA;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=90;WE=23019800;WS=23019782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chrX	23398214	rs5926304	T	C	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=37;PP=1415;SC=CCATCCTGTGTTGCTCTATGC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=23398222;WS=23398204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	23682877	rs477914	T	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=626;SC=GCTGGCATCATCTTTTTCATC;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=23682885;WS=23682867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	23682929	rs478051	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=355;SC=AGAAAGCAGAGTATACAGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=23682937;WS=23682919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	23682976	rs476316	A	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=115;SC=GGAAAGGGGAAATTTTCTATC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=23682984;WS=23682966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	23685964	rs496067	T	C	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=53;PP=1708;SC=GGAGGGGAGATTCCGGAGACA;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=23685972;WS=23685954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	23689636	rs513572	AT	TC	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=35;PP=2710;SC=CATGTATTTTATTTTCTTAGT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=70;WE=23689645;WS=23689626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	23697485	rs795493	G	A	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=341;SC=TTATGAAATAGAAGAACAAAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=23697493;WS=23697475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	23700473	rs552105	G	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=453;SC=ACATAAATGAGAAGAAATGAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=23700481;WS=23700463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	23700693	rs795489	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=651;SC=AGATAGCATAATTAGTTAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=23700701;WS=23700683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	23701662	rs2665364	G	A	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=131;SC=TCATGTGCTCGGTGGTCTGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=23701670;WS=23701652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	23722835	rs11175	A	G	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=34;PP=1086;SC=GGGAAAACCAATGGCACTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=67;WE=23722843;WS=23722825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	23723261	rs2270142	T	C	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=849;SC=AATTGTTTCCTCTAACAACTA;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=23723269;WS=23723251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	23739857	rs5970601	A	G	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=88;SC=CCCACCATCCATATGACATGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=23739865;WS=23739849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	23740681	rs55779124	C	CA	90.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=23740689;WS=23740678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chrX	23801593	rs3764885	A	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=282;SC=CGTTTCCCAGAGTGGGGTGAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=23801601;WS=23801583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	23801702	rs3764884	G	C	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	23928489	rs2707164	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=7;PP=362;SC=ACAAAAAGTTCGCAGAGTACA;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=23928497;WS=23928479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	23934202	rs2520230	A	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=113;SC=TTCATTACCAATTCTTTACAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=23934210;WS=23934192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	24073761	rs36018672	C	T	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=857;SC=CACTTTCACACGAAGTTATCA;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=24073769;WS=24073751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	24536954	rs71925765	GCACA	G	305.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=3;NR=1;PP=216;SC=ATGCACATGTGCACACACACA;SOR=1.863;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=4;WE=24536965;WS=24536944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	24665273	rs1207651	G	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=19;PP=618;SC=TCTCCTCCCAGGCAGAGAATG;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=24665281;WS=24665263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	24751958	rs4058344	T	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=400;SC=ATATGAAGCATCTGTTTGTTT;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=24751966;WS=24751948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	27479339	rs12842916	A	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=40;PP=1417;SC=TGGCATAACTACTTCTCCTGC;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=27479347;WS=27479329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	28807345	rs12009069	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=77;SC=TCATTGCACCGATCATGTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28807353;WS=28807335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	28807442	rs6526806	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=558;SC=TTTAGGGAACGGCCTTTAAGA;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=28807450;WS=28807432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	29417510	rs4829347	C	A	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=134;SC=GATATTTTTACTCTCTAAAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=29417518;WS=29417500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	30236658	rs6526962	T	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=260;SC=ATACTAACCATCTATTCTTCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=30236666;WS=30236648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	30236878	rs2529541	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=37;PP=1379;SC=CATTCCCCAGGAGCCTCAGAG;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=30236886;WS=30236868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	30236913	rs5973792	G	A	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=35;PP=1539;SC=CCGCTGCTGCGGCTGCGGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=70;WE=30236921;WS=30236903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	30237003	rs2074793	C	T	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=34;PP=1471;SC=CCTCAACATCCACTAAGAGCC;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=30237011;WS=30236993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	30254376	rs2071309	T	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=29;PP=1334;SC=GACCCTCTAATCATGAAGACA;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=30254384;WS=30254366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	30261002	rs2071311	A	G	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=18;SC=AAGATCTGGTACAGGAAAAAT;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=30261010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	30261158	rs2856733	G	C	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=58;PP=2163;SC=ACTTCCCACTGCTTTATGAAG;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=106;WE=30261166;WS=30261148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	30577846	rs887369	A	C	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=57;PP=2180;SC=ACTCATTCAGAACTGCATTAG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=30577854;WS=30577836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	30671896	rs12854653	G	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=410;SC=GGATGCCCCAGCCAGGCCTGG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=30671904;WS=30671886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	30709444	rs55895067	G	A	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=116;SC=TCTTTTTCCCGGATAATTGAG;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=30709452;WS=30709434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	30712796	rs5927587	G	C	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=174;SC=AACAGGAGAAGTTTTCAGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=30712804;WS=30712786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	30715827	rs2035432	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.90;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	30725794	rs4617310	C	T	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=75;SC=TACTATTAAACAACTTTTAGT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=30725802;WS=30725784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	30742592	rs75486718	GA	G	236.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.67;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	30745790	rs5927596	A	T	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=242;SC=GAAAATCAATAAAAGGTCTAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=30745798;WS=30745780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	30872602	rs5927629	A	G	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=56;PP=2007;SC=TGTTGATTCCATGGAGATGGT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=106;WE=30872610;WS=30872592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	31165667	rs200534475	AAAAG	A	622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=41.52;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	31191589	rs2404496	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=765;SC=TTTAAAATATCATAGGTTAGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=31191597;WS=31191579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	31200832	rs3833412	A	AT	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.615;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQ=60.59;MQRankSum=0.785;NF=19;NR=9;PP=508;ReadPosRankSum=-0.635;SC=AAAAAATGACATTTTTTTTTT;SOR=1.201;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=28;WE=31200840;WS=31200822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,44:0.85:52
chrX	31224684	rs2293668	A	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=18;PP=1630;SC=TACAGCATTAATATACACGAC;SOR=1.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=31224692;WS=31224674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	31224881	rs2293667	G	A	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=712;SC=GAAAAATAAAGGAGTAAAGTG;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=31224889;WS=31224871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	31496350	rs1800280	C	T	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=32;PP=1667;SC=TTGAAGTTCCCGGAGTCTTTC;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=31496358;WS=31496340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	32053662	rs2222852	G	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=996;SC=AATTGCATGAGAGTTCCTTAA;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=32053670;WS=32053652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	32235242	.	A	T	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=139;SC=GATTATAGAGATATAGCGTAT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=32235250;WS=32235232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	32360138	rs3833416	CTT	C	575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=33.87;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	32380996	rs1801187	C	T	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=39;PP=1360;SC=GTGGTCACCGCGGTTTGCCAT;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=32381004;WS=32380986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	32503194	rs228406	T	C	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=46;PP=1590;SC=AGGTTGAAGATCTGATAGCCG;SOR=1.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=32503202;WS=32503184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	34148805	.	CGAGACTGGACGTCCGACGAGTCTTGGGAGGCTCCGAGCG	C	2186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.83;QD=39.05;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	35820265	rs5928990	C	T	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=29;PP=1701;SC=TTCTTCATTGCCTGCCCTCCT;SOR=1.233;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=35820273;WS=35820255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	35820425	rs1410961	C	T	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=69;PP=2707;SC=GGAGAAGACCCTCCTCTCCTC;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=35820433;WS=35820415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chrX	35820696	rs1410962	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=24;PP=882;SC=CTGCACAAGTGTCAGATGAAA;SOR=0.726;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=35820704;WS=35820686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	35820795	rs5973488	A	G	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=19;PP=876;SC=GCTTCTGAGCACCTAGAGATG;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=35820803;WS=35820785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	35821055	rs4829390	AT	GA	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=22;PP=2209;SC=AGAGCCCAGAATGCTCATCAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=35821064;WS=35821045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	35821127	rs4829392	C	T	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=31;PP=1389;SC=TGATCCTGCACGATATGAATT;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=35821135;WS=35821117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	35821302	rs4829393	C	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.80;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	35821308	rs4829394	C	T	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	37699840	.	A	G	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.17;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	37883167	rs145326096	AAAGT	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=221;SC=GGTTGGTGTAAAAGTAATTGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=37883178;WS=37883157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	37883303	rs34578085	G	GA	143.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=118;ReadPosRankSum=0.887;SC=AAGTTCTGTAGAAAAAAAAAT;SOR=0.595;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=37883311;WS=37883293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chrX	37961813	rs41298456	T	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=467;SC=CATTGTAAGATCCTGCTTGCC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=37961821;WS=37961803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	38079975	rs72249350	CGCA	C	2722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=2190;SC=GGGCGGGACGCGCAGCAGCAG;SOR=2.231;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=45;WE=38079985;WS=38079965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	38145180	rs199896738	CTCCCCTTCCACT	C	508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=9;PP=1509;SC=CCCCTTCCACCTCCCCTTCCA;SOR=2.147;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=10;WE=38145199;WS=38145170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	38160433	rs11266204	T	C	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=142;SC=ACTTATTTTCTATGAAATACT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=38160441;WS=38160423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	38169777	rs35587043	T	TA	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=11;PP=609;SC=CTTACCACAATAAAAAAATGA;SOR=1.308;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=21;WE=38169785;WS=38169767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	38177967	rs3810691	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=393;SC=TGAAAGCACATAGATAGTCGA;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=38177975;WS=38177957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	38262808	rs2235125	G	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=367;SC=TTTAACCTTAGTAATTGCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=38262816;WS=38262798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	38271377	rs3215429	A	AT	594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=518;SC=TGTAACATCTATTTTTTTCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=18;WE=38271385;WS=38271367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	39932907	rs6520618	T	C	3802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=58;PP=2221;SC=CTGGGCGGCCTGCACTCGACA;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=123;WE=39932915;WS=39932897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chrX	39933339	rs5917933	A	G	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=64;PP=2314;SC=GTGAGCTGCCATCTTTTCTGT;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=119;WE=39933347;WS=39933329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chrX	39934488	rs6610384	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=17;PP=596;SC=GGCAGCAGCACCCAAAGACAC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=39934496;WS=39934478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	40456961	rs3112299	G	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=33;PP=1127;SC=ATTAATTTCCGTCTTTTTAAA;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=40456969;WS=40456951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	40506697	rs6610447	A	G	3548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=36;PP=2201;SC=CGCAGCAGTAACAGGCAGTGG;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=40506705;WS=40506687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	40514322	rs11266293	G	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=436;SC=ACTATTTTGAGGGGGAAAAAT;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=40514330;WS=40514312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	41002844	rs5918122	T	C	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=49;SC=CAGGAATCTTTTTGAAATAAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=41002852;WS=41002834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	41012486	rs55649554	TAA	T	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=130;SC=GCCAGCAGTTTAAGAGTCTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=41012495;WS=41012476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	41043944	rs5918130	T	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=25;PP=831;SC=ACAGACTTTTTAAAAATCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=41043952;WS=41043934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	41055311	rs6520734	G	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=556;SC=CCTGGACATAGAGCTTAAGTT;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=41055319;WS=41055301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	41084534	rs2302378	G	C	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=209;SC=GTAAATAACAGGTTCTCCCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=41084542;WS=41084524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	41203119	rs2275944	G	A	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=1034;SC=AACTTTGTAGGTGGCCATTGA;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=41203127;WS=41203109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	41483731	.	CAA	C	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=290;ReadPosRankSum=2.115;SC=TGGTAAAGGTCAAAATGAGGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=41483740;WS=41483721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chrX	41530567	rs149954887	G	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=15;PP=1155;SC=GAGTTGGGGTGGGGTGGAATG;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=58;WE=41530575;WS=41530557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	41554814	rs913602	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=713;SC=GTAGGAAAAATCTGAAGACAT;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=41554822;WS=41554804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	41587218	rs1023065	T	C	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=22;PP=776;SC=TTTTATTAGATAAAACATTCA;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=41587226;WS=41587208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	43599897	.	A	AT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9998;HP=18;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=55.77;NF=2;NR=0;PP=30;QD=16.5;SC=CCCTAACTTTATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=43599905;WS=43599887;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chrX	43741616	rs1181251	G	C	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1094;SC=CCAGTCCTGCGTGCCAGCCAG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=43741624;WS=43741606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	44171875	rs61636783	C	T	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=64;PP=2569;SC=ATATATGCTACATTTAGGCTT;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=136;WE=44171883;WS=44171865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	44202890	rs5902346	G	GC	2565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=1233;SC=GCAGGCAGCGGCGCCTCCCGG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=27;WE=44202898;WS=44202880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	44833841	rs6611055	C	A	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=168;SC=ATCTTGTTACCGTGTTTGTTA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=44833849;WS=44833831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	45011340	rs4824527	T	C	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=117;SC=CGGTGGCTCATGCCTGTAATC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=45011348;WS=45011330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	45016802	rs6521006	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=243;SC=AGCCACAGCACTTTCACACTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=45016810;WS=45016792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	45017166	rs5952693	A	C	124.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.81;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	45050973	rs4239958	C	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=112;SC=TTCACACCCCCTTCCCATGGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=45050981;WS=45050963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	45606319	.	AGTGT	A	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.27;MQRankSum=0.967;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chrX	46356713	.	GT	G	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=60.58;NF=0;NR=2;PP=51;QD=47.0;SC=TCTATCCCAAGTCCCTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=46356721;WS=46356703;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	46387921	rs56160764	G	A	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1344;SC=TATTAATGCTGAGGAATTCCA;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=46387929;WS=46387911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	46388442	rs2003665	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=485;SC=TGCCCTTTGAGGTCCTTTACA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=46388450;WS=46388432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	46388458	rs5906232	T	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=329;SC=TTACATGTACTAAAGATTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=46388466;WS=46388448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	46466775	rs1883255	G	A	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=130;SC=AGCCTCTAGCGTGGTAACTGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=46466783;WS=46466765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	46472666	rs6611276	C	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=131;SC=CTTCTTCCTACGTAAGACACT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=46472674;WS=46472656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	46472826	rs3208940	G	A	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=13;PP=356;SC=TGGGCTTCAGGTAACTTTAAA;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=46472834;WS=46472816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	46618321	rs1056846	C	G	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=17;NR=21;PP=725;SC=TGCTGTCCTCCGCCGCCGCCC;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=46618329;WS=46618311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	46737138	.	G	GGTGT	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=61.34;NF=0;NR=2;PP=88;QD=45.5;SC=GAATTTTTGGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=46737146;WS=46737128;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chrX	46737168	.	T	TGTG	92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=23.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	46893249	rs5906311	G	A	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=171;SC=GTTCCCCACAGCATTCAGACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=46893257;WS=46893239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	47007061	rs200972382	C	CCTGTGCT	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=640;SC=TGAGCCAGGACCTGTGCTAGG;SOR=4.047;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=47007069;WS=47007051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	47057647	rs4468050	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=6;PP=613;SC=TCCCGCCGCCATCCCTGGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=47057655;WS=47057637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	47060844	rs4239963	C	G	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=52;PP=1944;SC=GTACCCTGGGCCTGTTTCTGA;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=95;WE=47060852;WS=47060834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	47061018	rs4239964	C	G	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=784;SC=GGGTGAGCTGCGACCATGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=47061026;WS=47061008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	47065186	rs4339766	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=217;SC=CTGGGAAGTTGAGGCTGCAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=47065194;WS=47065180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	47086681	rs5902386	A	AC	377.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.644;NF=5;NR=4;PP=165;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GGAAACAGGGACCCCCCCCCT;SOR=1.609;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=9;WE=47086689;WS=47086671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chrX	47372903	rs3748520	A	C	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=3;PP=137;SC=CCCTCGGACAACCCCTCTCCC;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=47372911;WS=47372893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chrX	47430165	rs2858769	C	T	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=8;PP=739;SC=TTGATACTGACAGTACCCCAG;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=47430173;WS=47430155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	47430457	rs2854412	A	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=612;SC=TGACTCTGGGATAGAGGAAGA;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=47430465;WS=47430447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	47430509	.	AGT	A	434	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5003;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=434;QD=87.4;SC=TCAGAGGTATAGTGTGTGTGT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=47430518;WS=47430499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chrX	47430623	.	T	G	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.13;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	47430670	rs66838530	TG	T	2271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=19;PP=1933;SC=CTGGGGCTGTTGGGATGCCCA;SOR=1.646;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=45;WE=47430678;WS=47430660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	47443111	rs55696512	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=441;SC=GCCCACCACAGGATCTGCATG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=47443119;WS=47443101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	47444879	rs5953060	G	C	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=30;PP=1416;SC=CGGGCCTTTGGCAGCTTGGCA;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=47444887;WS=47444869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	47444985	rs4898	T	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=38;PP=1366;SC=CCTGCAGTTTTGTGGCTCCCT;SOR=0.782;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=75;WE=47444993;WS=47444975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	47445286	rs6609533	A	G	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=71;PP=2469;SC=CCGTGTGATCACCTGTCCCTC;SOR=1.213;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=114;WE=47445294;WS=47445267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chrX	47464291	rs3842471	GC	G	401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=392;SC=TCTTGATATCGCACTGCTGAT;SOR=3.442;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=47464299;WS=47464281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	47466361	rs1142636	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=352;SC=CCTTCACCCCATTCCGAAGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=47466369;WS=47466351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	47483800	rs1048118	G	A	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1077;SC=AGAAGGTCACGTTCTTCTCGC;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=47483808;WS=47483790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	47483925	rs2235182	A	G	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=157;SC=TGCCTGCTATATGCCGAGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=47483933;WS=47483915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	47486486	rs909523	C	A	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=977;SC=CAGAGCATCTCTGCCCTCAAT;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=47486494;WS=47486476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	47487912	rs11436787	T	TG	3750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=32;PP=2054;SC=ATTGGAAGGCTGCATGGCCAA;SOR=0.741;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=45;WE=47487924;WS=47487902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	47487916	rs8177072	T	A	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=34;PP=1330;SC=GAAGGCTGCATGGCCAACACC;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=68;WE=47487924;WS=47487902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	47755110	rs11796175	C	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=TCCTCCTTGACTTGTCTGAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=47755118;WS=47755100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	47755164	rs3949810	C	A	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=277;SC=CTCAGTTCCCCATGAAATGTG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=47755172;WS=47755154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	47757758	rs5906510	T	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=36;PP=1096;SC=TCACTGGGAGTGGGCAGTCTC;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=47757766;WS=47757748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	47920356	rs727079	A	G	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1360;SC=CAATCTGCTCATTCTGGTCAT;SOR=1.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=47920364;WS=47920346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	48049666	rs5906557	C	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=43;PP=1196;SC=GCACTCCCTTCGAATCATTTC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=48049674;WS=48049656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	48053521	rs4239967	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=17;PP=1320;SC=TGAAAAGCAGTTGCGCTTGAG;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=48053529;WS=48053511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	48054740	rs4824675	C	G	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=42;PP=1760;SC=TGCATCTTCTCTGGTATTTGA;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=48054748;WS=48054730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	48073924	rs4593689	T	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=656;SC=TTATCTGTCATCTTCACATTA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=48073932;WS=48073914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	48164138	rs5906631	A	G	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=784;SC=CAGTATCTCTATCCTCCCCTC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=48164146;WS=48164129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	48317386	rs17281188	A	G	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=59;PP=2022;SC=ACTGACGGCCATGAAGAGGAC;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=110;WE=48317394;WS=48317376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	48320301	rs2293952	C	G	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=29;PP=976;SC=TCCCAATGTCCAATATCCAGC;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=48320309;WS=48320291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	48326216	rs2293953	A	G	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=63;PP=2591;SC=GGGAAATCCTAACCCCTGATC;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=127;WE=48326224;WS=48326206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chrX	48339985	rs2070991	C	T	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=53;PP=2144;SC=GAGGAGGAAGCGGCAGTCATG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=48339993;WS=48339975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	48369969	rs111771187	G	A	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=511;SC=AGGGAGGGTGGTGAGATTCCC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=48369977;WS=48369959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	48399666	rs41312120	T	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=325;SC=TGCACCTCACTCTTCAGCATG;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=48399674;WS=48399656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	48418126	rs2293948	A	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=32;PP=1634;SC=CAGCGAGCGAACCCTGAGGAC;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=48418134;WS=48418116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	48418659	rs235836	G	A	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=54;PP=1917;SC=AGTGGCAGACGCTGGTTTTGG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=104;WE=48418667;WS=48418649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	48460314	rs235842	A	G	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=46;PP=1657;SC=GGTGATGACCATGGCAGTGTC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=48460322;WS=48460304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chrX	48544650	rs235423	A	G	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=104;SC=ATGGACGAGCAGGTGCATGGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=48544658;WS=48544640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	48649426	rs139472040	A	AG	1029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=46.81;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	48649449	rs62600348	T	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;QD=44.03;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	48649456	rs66717003	T	G	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=41.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	48690416	rs6520383	G	T	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=372;SC=GCTGGGCTGCGAGGGCGGCAG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=48690424;WS=48690406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	48690538	rs186964289	G	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=17;PP=669;SC=CAGACGCGCAGCAGCTGCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=33;WE=48690546;WS=48690528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	48751471	rs1128363	A	G	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=38;PP=1491;SC=GGCCACAGTCAATGGTGGAGA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=85;WE=48751479;WS=48751461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	48759204	rs741932	C	T	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=12;PP=992;SC=TGCGGCCCCACAGCGGGCTCC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=48759212;WS=48759194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	48760793	rs2239453	C	T	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=54;PP=1610;SC=GCTAGGCTGGCAGGCGGGTTT;SOR=1.583;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=81;WE=48760801;WS=48760783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	48858802	rs28727466	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=355;SC=AAACCGACGAGTCAGGTGAAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=48858810;WS=48858792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	48888074	rs3027472	T	C	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=34;PP=1309;SC=GAGTGGGAGGTACTGGCAGGC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=48888082;WS=48888064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	48898183	rs7056903	C	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=8;PP=253;SC=AGACAGAGAGCGGGGGAGAAC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=48898191;WS=48898173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	48900900	rs4824738	T	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=393;SC=GGGCGGCGTCTGGGAGATGGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=48900908;WS=48900890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	49021256	rs5906744	A	G	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=71;PP=2443;SC=GGTAAGGCACATAGTGCTCCG;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=58;TCR=71;TR=129;WE=49021264;WS=49021246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chrX	49021537	rs5905720	G	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=48;PP=1881;SC=GGTCGGGGACGTCGTGCTCCA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=49021545;WS=49021527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	49022276	rs5953269	C	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	49022286	rs72619037	C	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	49022291	.	GT	G	1807.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=917;SC=CAGAACGCCTGTCAAGGGAGA;SOR=4.021;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=49022319;WS=49022266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	49022293	rs75416104	C	G	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.29;SOR=4.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	49022293	.	CAA	GAG	653	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=26;NR=1;PP=653;QD=26.1654768467;SC=GAACGCCTGTCAAGGGAGATT;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=27;WE=49022319;WS=49022266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,27:0.68:40
chrX	49022295	rs138365388	A	G	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.15;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	49022309	rs73634213	C	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	49022309	.	CAA	AAG	1964	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=39;NR=16;PP=1964;QD=36.6812340884;SC=AGATTTCTCTCAAGGTCAGGG;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=55;WE=49022319;WS=49022266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,55:0.90:61
chrX	49022311	rs7880193	A	G	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	49022700	rs4824462	T	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=18;PP=559;SC=GGCAGCGCAGTTCGCTCAGGA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=49022708;WS=49022690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	49077121	rs56114689	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=9;PP=272;SC=TATGGCTGGGCGCAGTGGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=49077129;WS=49077111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	49104815	rs2280882	T	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.51;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	49105610	rs2294021	T	C	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=39;PP=1450;SC=GGCTCATGGCTGCCATGGTGT;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=90;WE=49105618;WS=49105600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chrX	49369711	rs3747318	A	G	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=28;PP=884;SC=ATCAAATGGCAAGAGACCGTT;SOR=1.077;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=49369719;WS=49369701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	49767832	rs456615	A	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	49767835	rs456617	A	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	49767904	rs149259	A	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=251;SC=AAGGGAGGTAAACCCTCTCTT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=49767912;WS=49767894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	49774447	rs149202543	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=325;SC=ATCTGTATGTCACCTCTCAGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=49774455;WS=49774437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	50121146	rs11415594	A	AG	1194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=876;SC=AATTTTGATAAGCCTGGTCTC;SOR=0.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=20;WE=50121154;WS=50121136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	50213429	rs181372233	T	C	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=24;PP=1119;SC=TGGCTGGTTCTGGGGTCGGTT;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=50213437;WS=50213419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	50341598	rs2295544	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=45;PP=1360;SC=ACTGATTTGTGCCTGTAACCT;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=50341606;WS=50341588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	50341675	rs2295543	G	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=382;SC=GGAAACTTGGGCAAGTCATGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=50341683;WS=50341665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	51239295	.	ATCCTCGAGGCAGCC	A	3642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=2957;SC=TTTGCACTTCATCCTCGAGGC;SOR=0.961;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=39;WE=51239316;WS=51239285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	51486659	rs974285	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=243;SC=ACCCCGCCGGCGGAGCCCGCT;SOR=2.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=51486667;WS=51486649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	52825471	rs2806837	A	G	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=489;SC=CTAGGTCTTCATCCTCCTGTG;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=52825479;WS=52825461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	52825546	rs2806838	C	G	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=19;PP=880;SC=GGTCATTCTCCAGTTGATTTG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=52825554;WS=52825536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	52891512	rs78471253	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chrX	52891513	rs114568211	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chrX	52891523	rs75536354	G	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chrX	52891542	rs78672295	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=5;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.254;SC=ATGAACAAAAAATGTGCAAGA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=52891550;WS=52891532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chrX	52891565	rs79831867	A	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=269;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TCTTTGGAGAAAGCTGCAAAA;SOR=1.927;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=15;WE=52891573;WS=52891555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chrX	52891584	rs5943751	C	A,T	1561.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=16,18;NR=4,11;PP=308,423;SC=AAGTTTATTTCGATATTTTTA;SOR=1.567;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=20,29;WE=52891592;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.41,0.59:54
chrX	52891619	.	GT	G	763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=526;ReadPosRankSum=0.815;SC=GATAAAAACAGTTTTGTGTTG;SOR=0.610;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=19;WE=52891627;WS=52891609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,32:0.36:88
chrX	52891645	rs75808475	A	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chrX	52891653	rs73206488	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chrX	52891732	rs201414570	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.601;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chrX	52891736	rs75971120	G	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chrX	52891738	rs79449844	CA	TG	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.397;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chrX	52891832	.	CT	C	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=94;QD=47.6769666233;SC=TCTGTAGAGACTTTGAAGATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=3;WE=52891840;WS=52891808;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chrX	52895579	.	GGT	G	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=9;PP=480;SC=TGGAACCAGGGGTGTGTGTGT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=52895588;WS=52895569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	53222043	rs146836963	A	AC	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=6;NR=6;PP=365;SC=AGGGATGGCCACCCCCCTACC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=12;WE=53222051;WS=53222033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	53225751	rs1536247	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=381;SC=GGGGAGAGTCAATACAGTAAC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=53225759;WS=53225741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	53228148	rs1977364	C	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=69;PP=2694;SC=TCCAGAAAGGCCCATGCTCAC;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=53228156;WS=53228138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chrX	53265835	rs2296541	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=187;SC=GACCAGCCCTTGTCTCCCCCA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=53265843;WS=53265825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	53271147	rs2274307	T	G	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=230;SC=GCTTCAGGCCTCCTGGCACCT;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=53271155;WS=53271137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	53280421	rs7886988	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=17;PP=528;SC=AGGGAAGAATGGTGGAAGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=53280429;WS=53280411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	53407010	rs112727682	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=8;PP=464;SC=CAGGGCGGGAGGGCAAAAATA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=53407018;WS=53407000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	53436232	rs1264008	G	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=839;ReadPosRankSum=0.598;SC=GAGTTACTCCGGCTGGTGAGA;SOR=0.464;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=37;WE=53436240;WS=53436222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chrX	53449336	rs11462431	A	AG	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=3;PP=362;SC=GGAACCCGTAAGGTCCGCGAC;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=9;WE=53449344;WS=53449329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	53563589	rs426298	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=10;PP=370;SC=GCAGGAGCCCACCAGCATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=53563597;WS=53563579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	53607754	rs266786	A	C	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=275;SC=CCAGGCCACAAACTTAATATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=53607762;WS=53607744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	53619629	.	C	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=890;SC=CATTTTGCTTCAATTCAAAGC;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=53619637;WS=53619619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	53622078	rs1244413	T	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=140;SC=CCATTTTAAGTAGTATAGGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=53622086;WS=53622068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	53652852	.	T	TGCCGGG	241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=2;PP=89;SC=CCGGGGCCGGTGCCGGGACTG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=53652860;WS=53652842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	54107692	rs2516098	T	C	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=40;PP=2331;SC=TAGGCATTTTTCCAAGGAGGC;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=111;WE=54107700;WS=54107682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	54112185	rs41304786	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=408;SC=GGGGAAGTGGCATGGAGCCCA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=54112193;WS=54112175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	54117740	rs2495797	C	A	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=11;PP=793;SC=GGTACATGAACTCACCTTGAG;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=54117748;WS=54117730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	54161859	rs4826523	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=290;SC=ATATATAGCCCTGACAGTCTA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=54161867;WS=54161849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	54209387	rs2495783	A	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=29;PP=1226;SC=ATGGTGCCGAATCGGCCCCGC;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=54209395;WS=54209377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	54481833	rs3830137	C	G	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1073;SC=CATATCTGAACAAAAGGGAGG;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=54481841;WS=54481823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	54492350	rs2269570	A	G	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=197;SC=TTCCCCCACAAGTTTCCAGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=54492358;WS=54492340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	54836361	rs1043031	A	G	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=22;PP=1053;SC=CCCAGGCCTCATCTACTACTC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=54836369;WS=54836351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	54836505	rs1043034	A	G	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=32;PP=1476;SC=TGGCTGATACAAAGGTCAATA;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=54836513;WS=54836495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	54837340	rs1043044	C	T	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=19;PP=934;SC=TCTCAAAGGCCCTAATGGCCT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=54837348;WS=54837330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	54838077	rs2071932	C	T	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=27;PP=960;SC=CAGGCTATTCCTTGGAGAAGG;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=54838085;WS=54838067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	54838437	rs2071934	G	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=244;SC=CATTTGCAGCGTGTTTACCGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=54838445;WS=54838434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	54840013	rs763183	C	T	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=22;PP=794;SC=GTTCATGTGTCCCATGCATTT;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=54840021;WS=54840003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	54841737	rs11555927	G	A	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=29;PP=1257;SC=CGATGGAAGCGGATTTGAAGG;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=54841745;WS=54841727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	55041605	rs17250674	G	A	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=215;SC=GGCAGTCGTAGCTGATAATTC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=55041613;WS=55041595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	55116466	rs1845444	C	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=716;SC=GAGTGAGCTTCTAAGAGCAAG;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=55116474;WS=55116456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	55173732	rs11327722	TA	T	4467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=51;PP=2949;SC=GGTCACACAGTAACACTGTCC;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=70;WE=55173740;WS=55173722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	55246965	rs5914272	C	T	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=8;PP=469;SC=GGACAGGTCCCGTGGCACAGT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=55246973;WS=55246955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	55247030	rs5914273	C	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=13;PP=439;SC=CCCCCAGGTCCTGATGCAGGC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=55247038;WS=55247020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	55248376	rs5914275	A	G	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=51;PP=1400;SC=ATTTTGTGACATACCAGTAAC;SOR=4.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=55248384;WS=55248366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	55249049	rs2148982	T	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=40;PP=2432;SC=CTTTTTATCTTTAAGGGACTG;SOR=1.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=111;WE=55249057;WS=55249039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chrX	55289593	rs2148981	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=783;SC=CTTTCTATTGCTTTTTTCCTC;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=55289601;WS=55289583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	55289774	rs4826381	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=21;PP=823;SC=AGCTGGTCATTACTGGGCAGC;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=55289782;WS=55289764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	55514818	rs3126255	C	T	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=34;PP=1213;SC=CAAACTCGACCTCCAGCAACC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=55514826;WS=55514808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	55651001	rs2375465	T	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=24;PP=1035;SC=GAGACTCGTGTCTTAGCCTTT;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=55651009;WS=55650991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	55748820	rs1473761	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=228;SC=GAGGTTGGGGAATTTGTTATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=55748828;WS=55748810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	55757744	rs5960480	T	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=250;SC=AGGCTATAAGTAGGAGTGATT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=55757752;WS=55757734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	56291516	rs1033565	T	G	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=126;SC=ATTCCTTCCATGTGAAATGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=56291524;WS=56291506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	56292257	rs5960671	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=30;PP=868;SC=GTCTCTTTTCACTTCCTCCAA;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=56292265;WS=56292247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	56295245	rs3747284	T	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=18;PP=1099;SC=TAATAAGGAATATTTGACAGC;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=56295253;WS=56295235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	56295438	rs59394346	AAC	A	1014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=1017;SC=AGTTCAATTCAACACACACAC;SOR=1.329;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=22;WE=56295447;WS=56295428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	56295958	rs200952140	ATG	A	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=909;SC=GTCTTTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=4.615;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=18;WE=56295967;WS=56295948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	56296488	rs12862304	G	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=580;SC=TTTCTTTTTGGGGGGACCTAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=56296496;WS=56296478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	57405163	rs4826543	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=24;PP=968;SC=CTATGTGCCGTTATGCTGAAG;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=57405171;WS=57405153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	57474943	rs1821118	A	T	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=632;SC=TTGATATATGATATCATTCTG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=57474951;WS=57474933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	57475132	rs1367830	T	C	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=68;PP=2443;ReadPosRankSum=0.619;SC=TAACACGGCCTTTCAACTTTG;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=118;WE=57475140;WS=57475122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,140:0.99:142
chrX	57619648	rs1057328	G	T	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=42;PP=2121;SC=ACTTCGAACCGGAGAGGCCTT;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=102;WE=57619656;WS=57619638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	63570024	rs17301157	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=TTGGAAATACGTATTTTGGTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=63570032;WS=63570014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	65382685	rs5919015	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=20;PP=531;SC=TGGAGAAAAGTGTCTGCTCCT;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=65382693;WS=65382675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	65390966	rs5965106	C	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=13;PP=451;SC=ATATTTATTTCAGATATGTGA;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=65390974;WS=65390956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	65392181	rs5964495	T	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=882;SC=TTATGACTCTTTTTCTTCTTT;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=65392189;WS=65392171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	65393658	rs5918591	A	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=45;PP=1339;SC=AGGTCCCAAGAATAAGCTATG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=65393666;WS=65393648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	65408445	rs6624875	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=27;PP=913;SC=ATCCACTGGGCCTAGTATTTG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=65408453;WS=65408435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	65415174	rs2206203	T	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=772;SC=GGCAGAATTATTTGCCATATG;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=65415182;WS=65415164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	65420609	rs1264215	A	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=277;SC=GTGCCTTAGCAGCTGGCCCTA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=65420617;WS=65420599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	65427040	rs806607	T	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=7;PP=355;SC=CCTCTAGTTATGGTTACATTT;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=65427048;WS=65427030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	65427124	rs809363	A	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=539;SC=CTGATGGTACATTCAGGATCC;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=65427132;WS=65427114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	65822607	rs1385698	T	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=531;SC=ACTGTGGGTGTATCTGCCTCC;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=65822615;WS=65822597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	66766356	.	TGGCGGCGGCGGC	T	410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=1;PP=1060;SC=GTGGGGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=2.494;Source=Platypus;TR=6;WE=66766375;WS=66766346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	66941597	rs1337076	T	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=339;SC=TGGCGAGGGATGGCAATCAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=66941605;WS=66941596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	67331903	rs56107322	GCACA	G	93.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=132;SC=ATGCACACATGCACACACACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=67331914;WS=67331893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	67412906	rs1191948	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=33;PP=1067;SC=GGTACACTAGGGTCAATTCAG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=67412914;WS=67412896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	67429834	rs57516402	CT	C	157.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5619;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=7;NR=0;PP=199;SC=TCAGTTTCTCCTTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=67429855;WS=67429824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	67431814	rs2225124	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=7;PP=805;SC=TATACTAAATATTTGTGATCC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=67431822;WS=67431804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	67652748	rs41303733	C	T	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=36;PP=1390;SC=TCTTTGATTACGTCTTTGATG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=67652756;WS=67652738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	67719085	rs12843249	G	T	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=27;PP=857;SC=GGCCCTTCTTGTACCCGATGC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=67719093;WS=67719075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	68381264	rs11539157	C	A	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=65;PP=2965;SC=CAGTTGCCACCTCCCCCTTCA;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=161;WE=68381272;WS=68381254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chrX	68381787	rs5937160	C	T	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=58;PP=2010;SC=GCTGCCAGCACTGGCCCCGGC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=99;WE=68381795;WS=68381777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	68382836	rs7067170	G	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=24;PP=942;SC=CCGAACTCTCGCTGTCGTCCC;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=68382844;WS=68382826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	68424753	rs5937177	G	A	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.72;NF=6;NR=5;PP=163;SC=CTATTACCCCGAGTGGAGTGG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=68424761;WS=68424743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	68725640	rs1171942	T	C	4166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=58;PP=2965;SC=CCTGACTCCCTTTCCCGTGCC;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=141;WE=68725648;WS=68725630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chrX	68749379	rs35383499	G	A	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=727;SC=TCAGCTCCCCGAGCACCCCAC;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=68749387;WS=68749369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	68890248	rs5936723	C	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=194;SC=TAACTGTTTGCGAACTTTTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=68890256;WS=68890238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	68890298	rs5980833	C	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=23;SC=CCCAAGACTTCGGAAGTTGTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=68890306;WS=68890288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	69080840	rs1203003	G	A	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=42;PP=1291;SC=CTGTTAAATGGACATTTATAT;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=69080848;WS=69080830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	69250308	rs2296765	C	T	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=23;PP=825;SC=CTATCCTTCTCATCCTGCCAG;SOR=0.883;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=69250316;WS=69250298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	69262423	rs2296767	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=320;SC=GGGAGCAAAGTAGCAGTAAGC;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=69262431;WS=69262413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	69368853	rs650028	T	C	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=524;SC=CTGAGGTGGGTGGATCACCTG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=69368861;WS=69368843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	69459945	rs1152194	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=408;SC=AAGAGGAGGTCCTAACACTTT;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=69459953;WS=69459935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	69489155	rs41303717	G	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=824;SC=GGAGTGGGGTGAGAAGAATAG;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=69489163;WS=69489145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	69496228	rs1572732	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=374;SC=CCATTTCTTTTGTATTTGTTT;SOR=1.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=69496236;WS=69496218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	69500857	rs186127204	G	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=472;SC=GAAGTTGGGGGGGGGGGAAGT;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=69500865;WS=69500847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	69502054	rs5936549	A	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=11;PP=772;SC=TTTGGCTGCAACCTACCTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=69502062;WS=69502044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	69502479	rs1626469	A	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=1126;SC=CATTTTTGCCACTCTTCTTGG;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=69502487;WS=69502469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	69510335	rs1199470	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=343;SC=AGGGAATTCCCGTAAGAGTGG;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=69510343;WS=69510325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	69572242	rs1199428	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=23;SC=TTTTATAAGAGCTACACAATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=69572250;WS=69572235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	69606982	.	A	AT	164.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.282;NF=6;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.967;SC=TAGAAATTGGATTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=69606990;WS=69606972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chrX	69639698	rs1886892	G	T	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=35;PP=1239;SC=TTATCTATGAGAGACCAGTAG;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=69639706;WS=69639688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	69652762	rs2296542	A	G	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=31;PP=1383;SC=CTCCCCACAGAAGATTTGTTA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=69652770;WS=69652752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	69668463	rs2281868	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=31;PP=1275;SC=GAACCCTGAGACACTGAAGCA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=69668471;WS=69668453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	69672462	rs12850410	G	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=227;SC=AGGGGAGAGAGAGAGGAGCTA;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=69672470;WS=69672452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	69672655	rs12010766	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=10;PP=322;SC=AGGGAGGGAGTCTCGCCCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=69672663;WS=69672645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	69673811	rs2274309	T	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=199;SC=GGACCGGGACTAGACTTATCT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=69673819;WS=69673801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	69718314	rs1886890	C	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=640;SC=ACGGGGAGTACTGTACAGAAG;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=69718322;WS=69718304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	69718533	rs3215810	CTCAT	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=281;SC=GAAGGCTTGACTCATGGCACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=69718544;WS=69718523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	69749852	rs1536250	AT	GA	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=1242;SC=TAGTCTTTCTATAATCCAAGA;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=26;WE=69749861;WS=69749842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	69774517	rs4844240	A	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=22;PP=1267;SC=TTGTTTCAAAAGTTTTAGTTT;SOR=1.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=69774525;WS=69774507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	69825109	rs17301881	A	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=529;SC=GGAATTAGCCATTACAAACTT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=69825117;WS=69825099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	69826685	rs12014919	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=49;SC=TTCCTGCTTACATATATATTA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=69826693;WS=69826675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	69898742	.	GA	G	102	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=60.9;NF=1;NR=6;PP=102;QD=15.2857142857;SC=TTGGTGAGCTGAAAAAAAAAA;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=69898750;WS=69898732;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,7:0.64:11
chrX	69964084	.	G	GA	57	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=68.12;NF=0;NR=3;PP=57;QD=24.6666666667;SC=CATTAAAAAGGAAAAAAAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=69964092;WS=69964074;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	70053469	rs17301944	A	G	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1050;SC=AATGTCAATAATTGGTTAAAA;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=70053477;WS=70053459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	70148927	rs5936605	T	A	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1028;SC=AGTCCCTGCCTTTTTCACCTA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=70148935;WS=70148917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	70149360	rs5936606	G	A	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=104;SC=CAGCAAACCCGCACATTTAGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70149368;WS=70149357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	70282696	rs34211894	A	G	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=883;SC=CAGAGAACAAAGCCATACCTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=70282704;WS=70282686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	70321631	rs5980742	T	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=40;PP=1351;SC=CATAGCCTATTACCACTCCTA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=70321639;WS=70321621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	70324157	rs1130009	C	T	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=24;PP=980;SC=CCGGGACACTCGCAGGGGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=70324165;WS=70324147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	70324397	rs12857595	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=107;SC=GGAGATATACGGAGAAGATGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=70324405;WS=70324387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	70339498	rs12850852	C	T	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=14;PP=850;SC=CCTGTCTGCCCCTTCTTCCCA;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=70339506;WS=70339488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	70340738	rs4844282	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=607;SC=GATTACAGGCATGAGCCACCG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=70340746;WS=70340728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	70341122	.	T	TACTTTATCTGCTTC	401.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=614;SC=TCTTTTCATTTACTTTATCTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=70341130;WS=70341112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	70341169	rs62609586	A	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=574;SC=CTCCCCTGGTACCCATAGGAT;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=70341177;WS=70341159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	70342820	rs7053139	A	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=31;PP=1336;SC=AGCAGAGCATATCTGCAGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=60;WE=70342828;WS=70342810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	70343621	rs12841977	A	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=20;PP=643;SC=TCAGTTACCCACCACTGTCAT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=70343629;WS=70343611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	70344331	rs59024650	G	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=260;SC=TTGCCTGGGGGAGGGGGGTAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=70344339;WS=70344321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	70344763	rs5030616	G	T	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=67;PP=2754;SC=CTTTTGGCATGTTTTTTTGCC;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=128;WE=70344771;WS=70344753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chrX	70345683	rs73214869	T	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=12;PP=333;SC=AAACCTTTGCTTCACTGTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=70345691;WS=70345673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	70348344	rs5030618	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=12;PP=483;SC=GCAGGGGGCTGGTTGTGATCC;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=70348352;WS=70348334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	70349947	rs5030619	A	C	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.424;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=793;ReadPosRankSum=1.578;SC=TGCAAGACCCAGTGTTGAGTA;SOR=0.581;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=42;WE=70349955;WS=70349937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chrX	70352417	rs10521349	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=16;PP=624;SC=TGGACCAAGATTGAGGGGTAG;SOR=0.746;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=70352425;WS=70352407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	70352516	rs12843026	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=319;SC=AAGAGTGGGCATGGCTGAGCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=70352524;WS=70352506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	70352617	.	CCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTT	C	607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.00;QD=37.98;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	70354102	rs200721936	C	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=210;SC=AAAAAAAAAACTCAAGCATGA;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=70354110;WS=70354092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	70355258	rs34862123	CTT	C	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=130;SC=GAGCAAATCACTTAACTTTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=70355267;WS=70355248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	70361608	.	T	C	64	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=55.23;NF=6;NR=0;PP=64;QD=16.4618687579;SC=GCCAAGATCATGCCACTGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70361616;WS=70361598;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	70361651	.	C	CA	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=59.1;NF=4;NR=4;PP=144;QD=19.125;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=8;WE=70361659;WS=70361641;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,8:0.62:13
chrX	70361967	rs36072155	G	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=22;PP=930;SC=AGCTTTCCTCGTGCATACCCA;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=49;WE=70361975;WS=70361957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	70469182	rs2341539	G	A	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=13;PP=910;SC=AAAACATAACGGATACAATTG;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=70469190;WS=70469172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	70601673	.	T	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.16;NF=26;NR=20;PP=938;SC=ATATGGACGCTGGGAGGACAA;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=70601681;WS=70601663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	70617443	rs5980760	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=548;SC=AGTGATTCTCATGCCTCAACT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=70617451;WS=70617433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	70775702	rs6525488	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=279;SC=AATTTTCTGTAGCATTACCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=70775710;WS=70775697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	70776730	rs3736670	G	A	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=7;PP=568;SC=AAATAACAACGGAATAAGTTA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=70776738;WS=70776720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	70781575	rs35924897	C	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=262;SC=GTCATTAAAACTAATTGATCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=70781583;WS=70781565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	70814136	rs5937097	C	T	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=6;PP=604;SC=TTGCTTATGGCGTCGATAGCC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=70814144;WS=70814126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	71349753	rs12397326	G	A	4348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=48;PP=2680;SC=GCACAGGGGGGCGTCTTCGAA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=136;WE=71349761;WS=71349743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chrX	71349774	rs12393722	T	C	5668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=63;PP=2965;SC=CTTGGCGTTGTCCTAAACGAC;SOR=1.184;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=105;TCR=63;TR=168;WE=71349782;WS=71349764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chrX	71351443	rs62614085	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=14;PP=444;SC=GGGAACTGGAACTACGGGCGG;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=71351451;WS=71351433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	71352187	rs7471996	C	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=9;PP=231;SC=AAGATAAAGACAGAGAGTTTA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=71352195;WS=71352177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	71357093	rs6625949	G	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=337;SC=CACCACAGCTGATTCCCCAGT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=71357101;WS=71357083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	71357160	rs6625950	G	T	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=49;SC=TGTGGTGATGGGGAACAGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=71357168;WS=71357150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	71363415	rs6624597	C	T	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=46;PP=1498;SC=CCGATAACCCCAGTACCTAAG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=80;WE=71363423;WS=71363405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chrX	71364479	rs11094247	A	C	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=39;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.855;SC=CTGTTCCAAAAACCAAGAACA;SOR=1.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=51;WE=71364487;WS=71364469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chrX	71379702	rs7884806	T	C	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=30;PP=1587;SC=ATCATGATTATCTACTGGGAC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=71379710;WS=71379692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	71379853	rs7880917	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=823;SC=GAAATGCCTCCGCTGAAGGCC;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=71379861;WS=71379843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	71380152	rs7881332	C	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=614;SC=TGGTGTGACCCGATATATGAT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=71380160;WS=71380142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	71401607	rs6525589	G	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	71401614	rs7058353	C	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	71493691	rs7580	C	T	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=28;PP=1520;SC=TGCCAGTCTCCAAATCAATCT;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=65;WE=71493699;WS=71493681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	71495344	rs3827426	C	T	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1460;SC=TATTTGGATACCATAGGGCTG;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=71495352;WS=71495334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	71495388	rs34563981	T	TCTA	4822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=43;PP=2967;SC=ATTTAAAACTTCTTACCCATG;SOR=0.730;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=58;WE=71495396;WS=71495378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chrX	71495869	rs3747303	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=575;SC=TTGGAAGTGGAGGACAGCTAG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=71495877;WS=71495859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	71518799	rs5958780	G	T	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=42;PP=1389;SC=CTCAGACCAAGGCTTACACCA;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=71518807;WS=71518789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	71521867	rs3012627	G	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=33;PP=1390;SC=GTTTCTGCAGGTGCATACTAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=71521875;WS=71521857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	71549512	rs660392	G	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=34;PP=1334;SC=AACCCTGCCTGTCAGCTGCCT;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=63;WE=71549520;WS=71549502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	71570963	.	CTT	C	38.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	71813191	.	C	CT	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5016;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=58.91;NF=0;NR=7;PP=72;QD=11.0;SC=AGTCTTTGAACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=71813199;WS=71813181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chrX	71933512	.	T	TCA	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=9.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=0.320;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.524;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chrX	72223371	.	A	G	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=85;SC=TGCGGATGCGAATGCGAAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=72223379;WS=72223364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	72899365	rs6648376	T	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=234;SC=TACAAGGTATTTTTAAGTGCT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=72899373;WS=72899355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	73043817	rs1620574	T	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=24;PP=1044;SC=CTGTAGGCTTTGTAAATCTAC;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=73043825;WS=73043807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	73066439	rs1894271	T	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=1103;SC=TCACTTACAATTGTGCACCTA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=73066447;WS=73066429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	73641569	rs6647476	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=453;SC=AGAGCCGGAGTCTGAGCCGGA;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=73641577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	73744159	rs372573580	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=11;PP=682;SC=TGCTGGTCAGGCTGCTGAGGA;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=73744167;WS=73744149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	74332585	rs4148838	G	GT	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=0;PP=240;SC=CAATTAATATGTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=12;WE=74332593;WS=74332575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	74332834	rs146592667	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=1236;SC=CCAAGCAGTCCGTTAGCTATT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=74332842;WS=74332824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	74375871	rs1039123	G	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=5;PP=431;SC=CCCGAGGTCAGGAGGGCAACC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=74375879;WS=74375861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	74376420	rs5981325	C	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=15;PP=944;SC=AACGAATCATCTCTTCGTGCG;SOR=1.287;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=44;WE=74376428;WS=74376410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	74494470	rs4892396	T	G	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=48;PP=1767;SC=CCATCATCCGTGACAAGTAAG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=74494491;WS=74494460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	74494483	rs5981831	A	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=45;PP=1544;SC=CAAGTAAGCCAAGAGCGGAAG;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=74494491;WS=74494460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	74511202	rs5981834	G	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=509;SC=TTATCAGATAGAAGATAATTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=74511210;WS=74511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	74517585	rs41307373	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=203;SC=AACTACAGAGCGTATTCCCTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=74517593;WS=74517575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	74523367	rs972561	A	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=244;SC=TAAAATAATTATCTTATGTAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=74523375;WS=74523357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	74598903	rs5937369	G	A	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=497;SC=CTCCCAAGCCGCCTTCTTAGC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=74598911;WS=74598893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	74961968	rs5938183	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=19;PP=621;SC=GTTCCTTATCGTTTCCATCAT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=74961976;WS=74961958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	75395172	rs2301863	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=257;SC=TGATTTCATCTAGGATGTAGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=75395180;WS=75395162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	75395187	rs2301862	C	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=280;SC=TGTAGACTGTCGACACTTCCT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=75395195;WS=75395177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	76139959	rs232961	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	76937963	rs3088074	G	C	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1370;SC=GTAAAACTCTGCTCTTTCCCA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=76937971;WS=76937953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	76940534	rs35268552	A	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=580;SC=AATTTAATTCAAAATTGATAA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=76940542;WS=76940524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	77254265	.	G	GT	386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=508;SC=TTGTAACTATGTTATGATTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=77254273;WS=77254255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	77268502	rs2227291	G	C	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=58;PP=2252;SC=TATTCTTCTAGTTGCAATGTA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=77268510;WS=77268492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chrX	77276413	rs113968994	C	A	629.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=492;SC=GCTTCTTCTTCTTATTATTGT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=77276421;WS=77276403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	77296047	rs5913631	G	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=16;PP=651;SC=TCTCCTTTCAGTATATTCCAA;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=77296055;WS=77296037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	77298857	rs4826245	G	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=806;SC=CTTATCAAGAGAGACAGTCAA;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=77298865;WS=77298847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	77381002	rs2073177	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=576;SC=GAGTGGAGAAAGTTAGAAGGT;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=77381022;WS=77380992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	77381014	rs2073178	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=11;PP=458;SC=TTAGAAGGTAGTGTTGTCATT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=77381022;WS=77380992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	77395191	.	G	GAGCGGGAGGAGGGA	2826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=2973;SC=CCCCTGCGGGGAGCGGGAGGA;SOR=2.448;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=35;WE=77395199;WS=77395181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	78617053	rs1736662	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=370;SC=TAAAAGTGCAAGTTTGTTACT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=78617061;WS=78617043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	78617999	rs1751133	T	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=352;SC=TTTGGACAAATTCATTATTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=78618007;WS=78617989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	78618050	rs1751134	A	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=11;PP=769;SC=AAATGCTTATATAAAAATTTG;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=78618058;WS=78618040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	78618841	rs3761590	C	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=50;SC=CTAGTCACCACTACAGAATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=78618849;WS=78618831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	79698593	rs1113265	C	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=47;PP=2631;SC=CCATGTTAGACTTCTACAGTG;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=118;WE=79698601;WS=79698583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chrX	79942599	.	GTA	G	99	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=57.88;NF=0;NR=3;PP=99;QD=34.6666666667;SC=CTGTATGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=79942608;WS=79942589;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chrX	79943569	rs3122407	T	C	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=51;PP=1809;SC=TTTACTCACCTTTCTTCCAGA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=85;WE=79943577;WS=79943559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	79947186	rs12689192	C	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=169;SC=AATATTAAAACTAGAATCACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=79947194;WS=79947176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	79989018	rs4240018	C	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=12;PP=403;SC=ACAGATTTTTCGTTAAAATGG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=79989026;WS=79989008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	79999796	rs58601634	T	TCAC	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=478;SC=AAGCAGAAATTCACAATACCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=79999804;WS=79999786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	80048998	rs7054751	C	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=366;SC=AAAACAAAAACAACATTGGCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=80049006;WS=80048988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	82764040	rs5921978	A	G	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=1.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	82764040	.	AGG	GGC	1751	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=47;NR=28;PP=1751;QD=24.0595716648;SC=GCAGGTTCGAAGGCTTGCAGC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=75;WE=82764050;WS=82764030;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,75:0.91:82
chrX	82764042	rs5921979	G	C	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.00;SOR=1.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chrX	82764523	.	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=432;SC=ATTTTTCTCTCTCTCTCGTTC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=82764531;WS=82764513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	83119939	rs5922000	T	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=561;SC=TTGAATAGCCTAAAAACTTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=83119947;WS=83119929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	83124802	rs5968237	A	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	83352970	rs10521366	T	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=139;SC=AAAACTTCAATCATTTTATGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=83352978;WS=83352960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	83411025	rs182681547	C	T	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=15;PP=1276;SC=CGTATGTGTTCACTTTTTTTG;SOR=2.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=83411033;WS=83411015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	84258843	rs3747422	C	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=515;SC=TGGGGCTGTCCTAAGGGAAGC;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=84258851;WS=84258833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	84349807	rs4828124	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=52;SC=AAAAAAACTGGGTTTATACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=84349815;WS=84349797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	84350010	rs4828326	A	G	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=30;PP=982;SC=AATCTGAAATATCAATTCATA;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=55;WE=84350018;WS=84350000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	84350128	rs4828327	G	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=369;SC=AAACTGAAGTGAATATTTTGG;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=84350136;WS=84350118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	84358864	rs5922146	C	T	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=23;PP=861;SC=CCACAAAACACCTTACCAGCT;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=84358872;WS=84358854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	84363140	rs10126146	A	G	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=28;PP=1610;SC=CTTGCACTCCATTGGTTCATG;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=88;WE=84363148;WS=84363130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	84520143	rs72549428	A	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=15;PP=1070;SC=AAATTGTCACAGAGAGTGAGT;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=84520151;WS=84520133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	84534383	rs2227090	A	C	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.97;ReadPosRankSum=2.399;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chrX	84563135	rs363774	T	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=18;PP=1009;SC=CTTACTGTCATATCATTTTGA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=84563143;WS=84563125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	85905927	rs6617253	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=24;SC=CAAGCCTCAGTATCATGCAAT;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=85905935;WS=85905921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	85906213	rs6623751	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=33;PP=971;SC=TCTTACTGTTCTATTGTGGGG;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=85906221;WS=85906203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	86877348	rs2273050	G	T	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=31;PP=1164;SC=AGTGGGTGGGGCATGATGTGC;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=86877356;WS=86877338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	86887244	rs222084	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=13;PP=732;SC=ACCTCAGGACCAACAGTTGGC;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=86887252;WS=86887234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	88008423	rs5940915	A	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=788;SC=AGGATGAGTTATCCTACTAAA;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=88008431;WS=88008413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	88008807	rs5984611	G	A	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=43;PP=1582;SC=CACAAAACTCGTTTTCGACTT;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=88008815;WS=88008797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	88009322	rs5984613	A	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=14;PP=416;SC=TGGGAATTAAATTAAATTGGG;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=88009330;WS=88009312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	92927634	rs1045686	G	C	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=40;PP=1773;SC=ATTTCTTTAGGAACTTCCTTT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=80;WE=92927642;WS=92927624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	95990839	rs20386	A	T	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=20;PP=550;SC=GTTGCCTTTTAATTAAAATGG;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=95990847;WS=95990829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	95990883	rs5949989	A	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=12;PP=310;SC=TGTAAGATACAAAATGTCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=95990891;WS=95990873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	96013128	rs2297827	CC	TT	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=15;PP=2745;SC=TTATCAATGCCCACAGTAAAT;SOR=2.062;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=61;WE=96013137;WS=96013118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	96018052	rs11339405	GT	G	854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.90;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	96197175	rs5920973	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=329;SC=ATTGTGTTTTGTGCCTTCTGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=96197183;WS=96197165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	99919733	rs2022475	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=11;PP=553;SC=CCAGATAGTCGCACAAGCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=99919741;WS=99919723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	99930886	rs10623103	T	TAC	133	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=78;SC=TACATGTTTGTACACATACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=99930900;WS=99930876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	99930892	rs4828041	T	C	173.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=105;SC=TTTGTACACATACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=99930900;WS=99930876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	99936147	rs4828043	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=251;SC=AACAGTGCTAACCAGTAGCCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=99936155;WS=99936137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	99941705	rs2022039	T	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=19;PP=928;SC=AGTGGATTAATAGTGTCCCGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=99941713;WS=99941695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	100075741	rs2859166	T	G	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	100075747	rs2859167	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	100077193	rs2859168	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=3;PP=261;SC=AGCAGGAACCCTGTATGTGTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=100077201;WS=100077183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	100087557	rs5921665	A	G	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=59;SC=TCTAGAATACATGGATTTATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=100087565;WS=100087552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	100098355	rs148448908	TAAG	T	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=885;SC=TGAGCAAAAATAAGAATAAAT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=100098365;WS=100098345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	100105418	rs5921669	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=952;SC=AACTCTAATGACGACAGGGAC;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=100105426;WS=100105408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	100212432	rs12842818	C	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=33;PP=1223;SC=TAAATGAGGCCTCTCGCTCCC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=100212440;WS=100212422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	100356021	rs200931377	ATAACT	A	2879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=2255;SC=CTGATTAATGATAACTTAACA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=42;WE=100356033;WS=100356011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	100357194	rs12156858	C	G	318.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.54;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	100357201	rs12156663	T	C	351.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.09;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	100357417	rs59141949	CT	C	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=106;SC=TGAGGAAATGCTTTTTTTTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=100357425;WS=100357407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	100395547	rs2273379	T	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=260;SC=GTTCAAAATTTGATGTGGTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=100395555;WS=100395540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	100400023	rs2295376	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=11;PP=1141;SC=TTGCTACTCTATATCTGAATG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=100400031;WS=100400013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	100505617	rs3747280	G	C	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=524;SC=GTTGCAGGAAGGGTGGGAAGA;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=100505625;WS=100505607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	100505881	rs4827893	C	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=491;SC=CTCAGTCATTCCCATTGGTCT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=100505889;WS=100505871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	100511098	rs3213505	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=246;SC=TTTCCCCACACCCATGCAGAG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=100511106;WS=100511088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	100514986	rs5967281	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=653;SC=GAGTCTGTCAGAGTAAGGTCA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=100514994;WS=100514976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	100530312	.	GA	G	42	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=42;QD=15.6666666667;SC=GAGTCTCAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=100530320;WS=100530302;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chrX	100531204	rs3761514	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=398;SC=GATAACTTCTTGAGCTTAGCT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=100531212;WS=100531194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	100531413	rs199759165	TTCATCC	T	2144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=30;PP=1840;SC=TGTCTTCATCTTCATCCTCAT;SOR=1.519;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=33;WE=100531426;WS=100531403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	100532924	rs3788765	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=519;SC=CATTTCAAAGAATCTTAAGTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=100532932;WS=100532914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	100532985	rs3788764	T	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=21;PP=1036;SC=TTCGTCAGCATGTACAAATGG;SOR=1.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=100532993;WS=100532975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	100533273	rs4986657	C	T	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=109;SC=ATAAAGGAATCTTTAGCCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=100533281;WS=100533263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	100537154	rs5991927	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=289;SC=GATTACAAGCGTGAGCCACCG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=100537162;WS=100537144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	100547933	rs5951328	A	G	3825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=53;PP=2145;SC=ACGGTCGACAAGAATTTGGGG;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=110;WE=100547941;WS=100547923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chrX	100604757	rs700	T	G	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=976;SC=AGGGGCCTTTTTGTATTGAGT;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=100604765;WS=100604747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	100609547	rs2071223	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=12;PP=839;SC=GATTAAAACTGTAACACCTAC;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=100609555;WS=100609537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	100617372	rs2071222	T	C	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=67;SC=TCACATAGCTTGGAGAGCAGA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=100617380;WS=100617362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	100742551	rs2361298	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=14;PP=730;SC=TGTTCTACCAGGGACTCGGTT;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=100742559;WS=100742541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	100743037	rs963618	C	T	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=15;PP=704;SC=TTAGGGTGTACTGCCAAGAGA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=100743045;WS=100743027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	100743826	rs5951332	A	G	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=31;PP=1327;SC=AAGTGGGCCTAGGGCTGAAGT;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=100743834;WS=100743816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	100745825	rs5951333	T	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=41;PP=2194;SC=TCTGCCCGGCTCCAGGCTGTG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=91;WE=100745833;WS=100745815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chrX	100748078	rs5991911	A	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=31;PP=1476;SC=TCCTGGGCTGACACTGGGGAC;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=100748086;WS=100748068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	100749127	rs5951336	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=196;SC=TGGGGCTGGGATTTGGTCCTG;SOR=1.911;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=100749135;WS=100749117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	100749585	rs3174476	C	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=22;PP=992;SC=AGTTTGCACACCAAAGTGAGG;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=100749593;WS=100749575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	100753309	rs73250691	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=461;SC=TGAAGACTCCATCATTGGTGG;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=100753317;WS=100753299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	100911066	rs3850315	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=30;PP=1385;SC=CAAGCAGGTGCTGGTAGTCAT;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=100911074;WS=100911056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	101090953	rs6621219	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=479;SC=CTCTTCTGAGGTCCCAACTTC;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=101090961;WS=101090943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	101091164	rs6621220	T	C	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=37;PP=1876;SC=TTATCATTCATGATGCACAGA;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=99;WE=101091172;WS=101091154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	101096219	rs201887839	G	A	185.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.07;QD=23.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	101138792	rs5944882	T	C	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=26;PP=1420;SC=CTGATGTTTCTGTTTATGACC;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=101138800;WS=101138782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	101141776	rs67953349	AC	A	319.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=371;SC=TTAGAACTGGACCAAAAATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=101141784;WS=101141766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	101395780	rs11408120	T	TG	902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.29;QD=32.24;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	101437635	rs5945049	A	G	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=63;PP=2583;SC=ATTTATCTCCAGGTAAGATTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=130;WE=101437643;WS=101437625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	102320931	.	ATGTGTG	A	240	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=58.57;NF=0;NR=2;PP=240;QD=121.5;SC=CAATTTATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=102320944;WS=102320921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,2:0.17:12
chrX	102339606	rs1029305	T	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=18;PP=687;SC=TTTCACTGGCTGGTACATTCC;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=102339614;WS=102339596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	102342405	rs5945935	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=484;SC=AAAATCTGAAGACATTTGTGA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=102342413;WS=102342395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	102755551	rs1180895	T	A	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=36;PP=2135;SC=CCCCCCGAGATGGCTGTACGG;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=102755559;WS=102755541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	102831217	rs221946	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=GTAAATATTTCAGGCTTTGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=102831225;WS=102831207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	102840421	rs221931	G	T	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	102842041	rs11010	T	C	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=61;PP=1866;SC=AGGCCATACATGATATGAATT;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=110;WE=102842049;WS=102842031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	102864442	.	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQRankSum=-3.423;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.630;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chrX	102978806	rs5945807	G	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=707;SC=GCATCGTGCAGGTCTGGATGT;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=102978814;WS=102978796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	102979486	rs4907817	T	C	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=28;PP=1085;SC=GTCTTGGTGATGGAGCTGAAA;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=63;WE=102979494;WS=102979476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	102979992	rs2239814	A	G	144.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=91;SC=GAGGCCAGTTATGTGCTGCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=102980000;WS=102979982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	103031700	rs11371342	A	AG	433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.36;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	103036412	rs521895	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=313;SC=TTGCCCACACAACTTCGTTAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=103036420;WS=103036402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	103042882	rs1126707	T	C	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=25;PP=707;SC=TCTGTGCTGATGCCAGAATGT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=103042890;WS=103042872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	103267865	rs553509	C	T	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=28;PP=970;SC=GCGGGCCAGGCGACCAGCCTC;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=103267873;WS=103267855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	103268333	rs578953	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=39;PP=1327;SC=GGATGGTCCCGTTGCGTGGCA;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=103268341;WS=103268323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	103274226	rs494006	A	G	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=190;SC=GCAAAAAGTAAACAAATGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=103274234;WS=103274216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	104464276	rs375033944	CA	C	2602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=1511;SC=CCACAACCTCCAACATCCCCT;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=104464289;WS=104464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	104464281	rs367644904	TC	T	2621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=1253;SC=ACCTCCAACATCCCCTCTGCT;SOR=0.726;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=34;WE=104464289;WS=104464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	105132225	rs17332342	T	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=768;SC=TACTGTACTTTAGGGACTTAT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=105132233;WS=105132215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	105153001	rs209372	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=52;PP=1821;SC=TGAAGGCTAAAGCCTCTAAAC;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=105153009;WS=105152991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chrX	105179132	rs209095	C	T	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=13;PP=1116;SC=TAGTAATTTCCCTTATTATCT;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=105179140;WS=105179122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	105279499	rs2234034	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=167;SC=CTACAGTCAACCAGTTTTACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=105279507;WS=105279489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	106144537	rs55662019	A	T	134.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=20;SC=TCTAGAAAAGACAGCCTTGGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=106144545;WS=106144535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	106789140	.	C	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=10;PP=271;SC=AGCTCTCGCTCTGGGGCTTCT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=106789148;WS=106789130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	107415825	rs2881142	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=455;SC=CCCTCTTACTTCCTCACCCCT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=107415833;WS=107415815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	107418281	rs2295914	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=12;PP=748;SC=TATGAAGCCTCTCTTGAGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=107418289;WS=107418271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	107418906	rs4623610	A	G	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=45;PP=1771;SC=GAGTACCAGCACGTCCAGATG;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=107418914;WS=107418896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	107423674	.	TACAC	T	1392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.772;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.64;SOR=2.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chrX	107430579	rs1266715	G	A	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=31;PP=923;SC=TCTGACTACAGGAAAGAGGTA;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=107430587;WS=107430569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	107433688	rs1042065	A	G	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=40;PP=1830;SC=GGGAACCCTGACTCTTTGTTG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=107433696;WS=107433678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	107437848	rs1266719	G	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=33;PP=1908;SC=CCACTAAGTGGAAAGTATGAG;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=83;WE=107437856;WS=107437838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	107438119	rs1266720	G	T	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=228;SC=GGCAAGGCACGGAATTTGACA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=107438127;WS=107438115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	107448639	rs1266730	G	T	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=49;PP=1666;SC=GCATATGGAAGGCAGACTGTA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=107448647;WS=107448629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	107449938	rs1266731	G	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=413;SC=TCAAAAATTGGAAATGTTCCA;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=107449946;WS=107449928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	107450101	rs1266732	T	G	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=15;PP=460;SC=AAGGCTAGAGTTTATATCATT;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=107450109;WS=107450091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	107455014	rs1266736	C	T	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=200;SC=CACACACTTACAGTCTTTTTA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=107455022;WS=107455004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	107463090	rs201304389	CCCATATTGTATT	C	1338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=2966;SC=TACCCCCCTCCCCATATTGTA;SOR=2.376;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=107463109;WS=107463080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	107939643	.	GAT	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=47;QD=28.5;SC=TTTAAAATGTGATATATATAT;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=2;WE=107939652;WS=107939633;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chrX	108638614	rs35726803	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=17;PP=668;SC=TCTGCAGCCTCAGCCCAGCAC;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=108638622;WS=108638604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	108708516	rs502209	C	T	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1586;SC=CCTTAGGACCCGGTAGGGGGT;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=108708524;WS=108708506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	108708552	rs12008095	A	G	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=34;PP=1728;SC=ACTGTAGAGCAGGGCATCATA;SOR=1.122;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=108708560;WS=108708542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	108904729	rs839408	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=384;SC=TTTTGACTTACGAAACAAAAA;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=108904737;WS=108904719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	108917757	rs5942830	T	C	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=235;SC=AAACATGTTGTAATTCAAGTA;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=108917765;WS=108917747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	108917773	rs5943413	A	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=204;SC=AAGTATTAATAACAAATACAG;SOR=2.147;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=108917781;WS=108917763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	109387928	rs946820	G	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=7;PP=910;SC=TGGGATTGCTGAAATATGGGT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=109387936;WS=109387918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	109507755	.	C	T	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=32;NR=33;PP=1205;SC=AATGCAAATTCATGGCAGAAA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=109507763;WS=109507745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	109694685	rs2073787	T	A	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=31;PP=1697;SC=CTTCTGGAGGTACATCACCCC;SOR=1.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=109694693;WS=109694675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	109931799	rs5943052	A	G	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=41;PP=1711;SC=GTCAACCAAAAGCAGGGCCTC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=109931807;WS=109931789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chrX	109931856	rs5943053	T	C	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=53;PP=2270;SC=CCTTGCAGCATTTTCCGTCTA;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=105;WE=109931864;WS=109931846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chrX	111195716	rs45526434	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1250;SC=AGATACGTGGAGGTCTCAAGT;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=111195724;WS=111195706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	113949525	rs5988103	G	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=215;SC=AGCAGAAGTCGCTTCTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=113949533;WS=113949515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	113961410	rs2248440	G	A	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=711;SC=TTATTTTAGTGAAAAGATAAC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=113961418;WS=113961400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	113965735	rs6318	G	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=19;PP=1189;SC=GTTTGGCAATGTGATATTTCT;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=113965743;WS=113965725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	114238774	rs17094994	T	G	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=138;SC=GCAAACAAAGTGAAGCATTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=114238782;WS=114238764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	114239897	rs17095003	C	T	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=11;PP=440;SC=AAAAATCACACGGAAAGGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=114239905;WS=114239887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	114400318	rs4361922	T	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=199;SC=TGTAAGAGTTTGCTAAAGACA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=114400326;WS=114400308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	114424148	rs62601525	G	A	4049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=54;PP=2519;SC=CCAACAAGTCGAGGGGCTTCG;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=114424156;WS=114424138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chrX	114424438	rs62601527	C	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=36;PP=1401;SC=TACAGGGCCCCGATGCCCAGG;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=114424446;WS=114424428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	114424505	rs62601528	G	A	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=36;PP=1193;SC=GGGCCACGCCGTCGAGCCTGG;SOR=0.897;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=114424513;WS=114424495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	114424836	rs62601529	G	A	5649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=86;PP=2965;SC=CTTGAGAGGCGACGGCAACCA;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=182;WE=114424844;WS=114424826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chrX	114424941	rs62601530	G	A	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=67;PP=2405;SC=CCCATGCGGCGCTGCCCCTGT;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=120;WE=114424949;WS=114424931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chrX	114425181	.	A	AGAGGCCGCTCGCCCAACGCCCACAGCG	6003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=30;PP=2965;SC=CGAGGAGTACAGAGGCCGCTC;SOR=0.990;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=44;WE=114425189;WS=114425171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chrX	114425238	rs55718100	G	A	5142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.26;NF=85;NR=71;PP=2965;SC=CAACAGTTACGGCCAGAGCCA;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=156;WE=114425246;WS=114425228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chrX	114425923	rs142223554	C	A	5155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=6.179;NF=82;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TCCCTTGATGCCAACAGTGGA;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=166;WE=114425931;WS=114425913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,192:0.98:196
chrX	114426171	rs5946294	C	T	7074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=0.609;SC=CAGCGGAGGCCGCTCGCCTGA;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=103;TCR=117;TR=219;WE=114426179;WS=114426161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,251:1.00:252
chrX	114426385	rs80194951	G	A	6768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=105;PP=2965;SC=AGCGGAGGCCGCTCACCCAAT;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=116;TCR=106;TR=220;WE=114426393;WS=114426375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chrX	115568993	rs12720074	T	A	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=28;PP=967;SC=TCCATGTTGGTGAAAATGATG;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=115569001;WS=115568983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	115573812	rs12720079	T	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=115;SC=AAGTAAATTTTACTTGAGTTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=115573820;WS=115573802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	115575989	rs12391221	A	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=174;SC=ATACAATATTAATGAAGCTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=115575997;WS=115575979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	115586016	rs191613883	C	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=385;SC=CATTGCTTTTCGCATTTTAGC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=115586024;WS=115586006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	115593235	rs148475461	G	GAA	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=746;SC=CCAAACTACCGAAACAACTTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=115593243;WS=115593225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	117677349	rs1294781	G	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=4;PP=243;SC=CATAAAGGAAGATCCCAGTAC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=117677357;WS=117677339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	117677642	rs1294780	A	G	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=503;SC=GGCCGGGTGCAGTGGCTCACG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=117677650;WS=117677632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	117679234	rs55694052	CT	C	289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=22.29;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	117718670	rs1781090	T	A	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=146;SC=TTTTTTTTTTTAAAAAAATGC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=117718678;WS=117718660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	117742356	rs5910394	C	T	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=34;PP=1073;SC=CAAAAGCAGCCATAGACACAC;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=117742364;WS=117742346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	117748780	rs41300207	G	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=384;SC=TCAGACATCTGAGCATAAGAC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=117748788;WS=117748770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	117810831	rs5957040	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=355;SC=AAAGAAAGAACAGGGGCTTTG;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=117810839;WS=117810821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	117817266	rs4372173	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=33;PP=933;SC=TCAAAATGCACAACCTTAAAG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=117817274;WS=117817256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	117874898	rs2246663	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=290;SC=TACTGTCTTGTCCTCTAGGAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=117874906;WS=117874888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	118143043	rs2168379	A	G	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=961;SC=GCTGATTGCTACGTATTACCT;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=118143051;WS=118143033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	118147233	rs2290514	G	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=110;SC=AAAGATAGTTGTGAAAGGATT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=118147241;WS=118147223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	118148229	rs2278954	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=37;PP=1595;SC=ATCAGCAAGCATCATTGTGGT;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=118148237;WS=118148219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	118250710	rs5957111	A	C	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=132;SC=ATGAGAGGAAAGAGGACCATG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=118250718;WS=118250700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	118281538	rs5910522	C	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=383;SC=CACTGCAGTGCCACAAAAGCA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=118281546;WS=118281528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	118370175	.	G	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=228;SC=GGGAGGCGGGGCTTGGAGGCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=118370183;WS=118370165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	118533366	rs217976	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=329;SC=GTCGGGGCTCGATGGCTACGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=118533374;WS=118533356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	118544448	rs16274	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=234;SC=TGACTGCTCATAAATACTGTG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=118544456;WS=118544438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	118603729	rs143413528	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-4.908;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,5:0.11:44
chrX	118603742	rs148294496	A	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-4.478;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
chrX	118699320	rs5910616	A	G	6890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=86;PP=2965;SC=TTTCGGCATGATTCCCAAGAG;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=121;TCR=86;TR=207;WE=118699328;WS=118699310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chrX	118758107	.	GT	G	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=16;MQ=51.1;NF=1;NR=3;PP=75;QD=20.25;SC=TTTATTATGGGTTTTTTTTTT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=118758115;WS=118758097;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chrX	118892888	rs2782222	G	C	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=11;NR=11;PP=304;SC=CGGCTCCTGCGGGGTGGCTGT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=118892896;WS=118892878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	118893054	rs2782223	C	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=21;PP=964;SC=GCTGCTGCTGCGGGGCGACCC;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=118893062;WS=118893044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	118893137	rs2782224	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=34;PP=1325;SC=TGGTACACGATTTCGCCCTAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=118893145;WS=118893127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	118893413	rs2782225	T	C	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=1536;SC=ACAACAGCAGTGGCACCACTG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=118893421;WS=118893403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	118920809	rs7885997	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=283;SC=TTTCTCTCCTCTAACAAGTTT;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=118920817;WS=118920799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	118921530	rs73214964	A	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=145;SC=AGGGTATATAATCTTACGTAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=118921538;WS=118921520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	118925181	rs41304508	C	A	5361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=98;PP=2965;SC=ACGGGCAGCCCACAGTCAGGC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=77;TCR=98;TR=175;WE=118925189;WS=118925171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chrX	118925705	rs2240448	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=379;SC=GGTGCGCTCCCGTGGCGCCGT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=118925713;WS=118925695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	119054001	rs3829719	C	T	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=43;PP=1324;SC=AGCAGTTGCGCAACAACAGAT;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=119054009;WS=119053991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	119065893	rs194302	G	A	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=27;PP=1271;SC=ACACACTGCTGCTTACTTCAA;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=62;WE=119065901;WS=119065883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	119070411	rs194307	T	A	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=225;SC=AAGTACAAATTAAAAAATTAT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=119070419;WS=119070401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	119070567	rs194308	A	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=137;SC=CCCTTTTTTTAAAAATACCTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=119070575;WS=119070557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	119387833	rs201958171	C	CTGA	5459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.191;NF=28;NR=40;PP=2988;ReadPosRankSum=1.742;SC=GTTACCGATTCTGATGATGAT;SOR=1.046;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=68;WE=119387841;WS=119387823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chrX	119394904	rs3752341	G	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=310;SC=AAAAGAAAACGTTAGTTTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=119394912;WS=119394894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	119402264	rs41300936	A	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=654;SC=CACAAATTAGAAACAACATAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=119402272;WS=119402254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	119445015	rs3810749	C	T	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=3;PP=704;SC=TCCCGCTCTCCGGCTTTTGGG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=119445023;WS=119445005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	119510144	rs3213723	C	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=336;SC=CCTGAGGAAGCATGACTGGGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=119510152;WS=119510134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	119510456	rs3213724	G	C	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=140;SC=TTTCCAGAAAGCATTCAATTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=119510464;WS=119510446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	119590533	rs12097	T	A	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=6;PP=168;SC=TTTCATAGCGTACTGTGAAAT;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=119590541;WS=119590523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	121376194	rs34950105	G	T	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=36;PP=1429;SC=TAGGCATTTGGCTGTCTCTGC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=121376202;WS=121376184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	122318386	rs58044961	A	AG	3585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=42;PP=2448;SC=TTTTAGGCGTACATGGCCAGG;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=122318394;WS=122318376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	122319917	rs2269551	T	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=41;PP=1023;SC=ACTTAGGGTCTGTGTATGTGC;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=122319925;WS=122319907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	122336448	rs2285127	T	C	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=209;SC=AGGAGACCTATGGCCAGAAGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=122336456;WS=122336438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	122336600	rs11452643	T	TG	1335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;PP=1041;SC=GTTCACCAGGTGGGCCCGCCA;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=26;WE=122336608;WS=122336590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	122338337	rs3752471	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=704;SC=AGTGAGCATCATGGAGGGAGA;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=122338345;WS=122338327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	122528803	rs550640	T	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=11;PP=606;SC=TCATGATCCTTTCAATGTCTT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=122528811;WS=122528793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	122537277	rs502434	T	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=7;PP=495;SC=GCTACTGGAATGAGTATGAAA;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=122537285;WS=122537267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	122537418	rs504096	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=25;PP=798;SC=GCAAGACTTCCGTTTTCTGAA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=122537426;WS=122537408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	122805421	rs2105889	C	A	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=15;NR=8;PP=454;SC=TTGAGAACCTCGAACCAACCC;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=122805429;WS=122805411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	123034511	rs5956583	A	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=485;SC=GACAGTATGCAAGATGAGTCA;SOR=1.044;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=123034519;WS=123034501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	123041111	rs12838858	G	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=235;SC=TAAGTAATCAGGATTGAATTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=123041119;WS=123041101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	123183965	rs147386628	C	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=143;SC=TACTTGGCATCTCTTGAATAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=123183973;WS=123183955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	123184027	rs7063522	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=528;SC=TTTTCCTTCCCCCATTCAGTG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=123184035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	123184284	rs74386199	T	A	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=33;PP=866;SC=CCCTTTATTCTTTTCTATCTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=123184292;WS=123184274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	123191922	rs76876596	A	G	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=165;SC=CTTGTAGCACAGTAAATTGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=123191930;WS=123191912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	123195035	rs2297651	A	C	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=15;PP=1226;SC=GGCTAGTATGATAATTGTCTA;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=123195043;WS=123195025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	123202318	.	C	CTATA	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=81;QD=41.3333333333;SC=GTTAATAAAGCTATGAGATAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=123202326;WS=123202308;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	123498106	rs139732597	C	A	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=166;SC=TCTCTGTAGGCCTAGGCTAAT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=123498114;WS=123498096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	123538802	.	TAAACAAAC	T	3358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=2995;SC=GCTCTGCAGTTAAACAAACAA;SOR=1.996;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=37;WE=123538817;WS=123538792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	123554105	rs141516847	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=5;PP=413;SC=TTTCCCAGTATAATACAATTT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=123554113;WS=123554095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	123621139	.	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=32;PP=1182;SC=TCATCAGTATCATTGAACATG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=123621147;WS=123621129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	123630812	rs73215108	C	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=418;SC=TTCATATTATCTTGCTTTTTG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=123630820;WS=123630802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	125298690	rs3761552	G	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=32;PP=1891;SC=AGCCTCTGCCGCAGGCAAGCT;SOR=1.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=88;WE=125298698;WS=125298680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	125299188	rs12014937	T	G	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=52;PP=1877;SC=GGGCATATACTGGGAGACCCA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=125299196;WS=125299178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	125299467	rs10126452	G	T	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=25;PP=1769;SC=CGCAGCCCTGGTGGGCCTGGG;SOR=1.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=88;WE=125299475;WS=125299457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	125953932	rs5931715	A	G	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=25;PP=740;SC=ACAGGGATGAATGGGTTGGAG;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=125953940;WS=125953922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	125955428	rs2269777	G	A	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=32;PP=1194;SC=CTCCTCCTCCGATATTTGGTC;SOR=0.992;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=55;WE=125955436;WS=125955418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	125955644	rs2269776	A	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=242;SC=ACTTGAAACCACGTACCCTCC;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=125955652;WS=125955634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	128875978	rs5975146	G	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=9;PP=483;SC=AGCTTCGTGCGTTTCAAAGGA;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=128875986;WS=128875968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	128885571	rs5932673	A	G	1511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.70;QD=30.85;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	128887344	rs147165535	C	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=734;SC=GCAAGCTGGGCGCGGTGGCTC;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=128887352;WS=128887334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	128947526	.	A	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.93;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	128948893	rs5932686	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=316;SC=GTAAAAAATATAGGGTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=128948901;WS=128948883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	128957640	rs2275605	T	C	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=23;PP=979;SC=GCAATGTCCCTGTAGTTTTAC;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=128957648;WS=128957630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	129147079	rs4830173	T	C	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=26;PP=1777;SC=GGCTGAGGGCTTCTTGGTGCC;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=77;WE=129147087;WS=129147069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	129269980	rs209998	G	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=15;PP=737;SC=CACAGGCTAGGGAGAATGAAT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=129269988;WS=129269970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	129283520	rs1139851	A	G	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=60;PP=1863;SC=ATCTTTTTTCATCCTCTTTCA;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=101;WE=129283528;WS=129283510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chrX	129290699	rs189994	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=CGTTAAATGATCAAGAAAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=129290707;WS=129290689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	129349295	rs209238	T	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=13;NR=19;PP=598;SC=ACTTGTGAATTCCCCGACGAC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=129349303;WS=129349285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	129354240	.	C	A	135	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=135;QD=28.2952020912;SC=AGATCTTATTCCTTCTATCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=129354263;WS=129354231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	129354254	.	TAA	T	137	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=13;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=61.53;NF=7;NR=0;PP=137;QD=20.8571428571;SC=CTATCCATAATAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=129354263;WS=129354231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	130217020	rs5932835	G	C	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=524;SC=TTCGCCCGCTGGGCAGAGCTC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=130217028;WS=130217010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	130409884	rs55936630	A	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=189;SC=ACTCTCCCTAACCCCTTCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=130409892;WS=130409874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	130410965	rs4830219	A	G	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=617;SC=TAGAAAAGTCATAATATCGGC;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=130410973;WS=130410955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	130412178	rs4524963	C	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=276;SC=CTCAGGGTCACTTTGTCAGCA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=130412186;WS=130412168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	130415818	rs1128617	T	C	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=60;PP=2200;SC=CCAGAGAAAATTCCAGTACTG;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=104;WE=130415826;WS=130415808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	130416958	rs5932877	C	T	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=36;PP=1527;SC=TCTTACCAGTCACCCAGATTT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=130416966;WS=130416948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chrX	130420006	rs5930458	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=20;PP=525;SC=TCCACAACTCTGGTTGAGGGT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=130420014;WS=130419996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	130420415	rs4495600	T	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=19;PP=1031;SC=ACTTACCTATTGATGTCATAC;SOR=1.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=130420423;WS=130420405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	130423359	rs6637829	C	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=289;SC=CCCCTCCCTGCGCCGGGCTCG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=130423367;WS=130423349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	130423543	rs6637830	G	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=22;PP=805;SC=TCACTGTATTGTGGGGGGGAG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=130423551;WS=130423533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	131212512	rs5977623	A	G	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	131212518	.	G	A	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.14;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	131228271	rs5933067	C	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=263;SC=AATGGTGCCCCCAGTCAGTCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=131228279;WS=131228261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	131231430	rs57806249	T	TAC	195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=286;SC=CAGTTATAGGTACACACACAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=131231438;WS=131231420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	131234733	rs5930546	G	A	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=39;PP=1607;SC=ATGCCTTCCCGGATGACTTTT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=131234741;WS=131234723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	132161673	rs41304540	C	T	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=1088;SC=TCAAGAATTCCTCATTCATCT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=132161681;WS=132161663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	132437337	rs1048369	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=608;SC=GCCCTGGTTGGCTAATCCATT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=132437345;WS=132437327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	132438872	rs1129980	C	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=764;SC=GTTTCAGTTTCTCCTTGACAT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=132438880;WS=132438862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	132549013	rs2073288	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=15;PP=411;SC=CGGGGCGGACGCGTTCCCACC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=132549021;WS=132549003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	132730659	.	C	T	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=976;SC=TGCATCAGCTCTTCATATTTC;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=132730667;WS=132730649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	133379551	rs2428577	C	T	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=51;PP=2133;SC=GAACAGAAATCTAAAAGAAGC;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=133379559;WS=133379541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	133923388	rs150146844	T	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=402;SC=CATAGTTCTCTGCTTCAAATA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=133923396;WS=133923378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	134025744	rs6529648	A	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=377;SC=AACACTGGCCACCACAGACCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=134025752;WS=134025734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	134155904	rs62599865	G	T	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=615;SC=GGCTGAGCTGGCACGAGAGGG;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=134155912;WS=134155894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	134155953	rs74634293	A	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=285;SC=CAGGGGCGGCAGCAGGAGCCT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=134155961;WS=134155943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	134156121	rs2475853	G	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=8;PP=445;SC=CCAGAGCACCGGTCCCCAGGC;SOR=1.136;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=134156129;WS=134156111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	134185997	rs2498776	T	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=819;SC=ATGTAGGAGCTCGTCTGCACG;SOR=1.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=37;WE=134186005;WS=134185987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	134294240	.	TGACTGAA	T	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.319;NF=3;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAGAGCCATTGACTGAAGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=134294254;WS=134294230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chrX	134421168	rs1129093	C	T	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=25;PP=776;SC=ATAAGCTACACGTATAAGGCT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=134421176;WS=134421158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	134480966	rs140129178	C	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	134493747	rs4829778	A	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=492;SC=CTGTCCAAGAAATCAGCCTAA;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=134493755;WS=134493737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	134703108	rs1937729	T	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=105;SC=ATATATAATTTTGGTAAATAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=134703116;WS=134703098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	134713855	rs2298301	G	A	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=38;PP=1618;SC=TGGATTCTCTGTCTGACGACT;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=134713863;WS=134713845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	134948034	rs2034920	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=497;SC=TGCTGGTAACATTTCCTCCCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=134948042;WS=134948024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	135055694	rs6635201	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=284;SC=CCCTTAGAAGTGCGCCCACAC;SOR=3.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=135055702;WS=135055684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	135252234	rs3215593	AC	A	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=917;SC=CTTTATTTGTACCAGGAGGTT;SOR=2.049;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=23;WE=135252242;WS=135252224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	135290250	rs2236003	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=441;SC=TATTATTCCCGTTTTACAGAT;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=135290258;WS=135290240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	135292022	rs2076705	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=301;SC=CTTTTTTTTTCCCCCCAGGGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=135292030;WS=135292012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	135307049	rs5929742	G	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=967;SC=TCTATTTAAAGGAAAATAAAA;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=135307057;WS=135307039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	135310785	rs2273221	T	C	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=42;PP=1509;SC=TGCTGACCTTTGCTGCATTTC;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=90;WE=135310793;WS=135310775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	135313034	rs1055497	T	G	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=65;PP=2777;SC=ACAAGCATTTTCAGGAGATGA;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=128;WE=135313042;WS=135313024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chrX	135318458	.	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=765;SC=GGTTACTATCTCTTCTATTTA;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=135318466;WS=135318448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	135322440	rs5975706	A	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=326;SC=TTCTGAAATAAACATAAATGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=135322448;WS=135322430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	135323452	rs5975707	G	A	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=34;PP=965;SC=TAAAATAAAAGCCAACATATT;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=135323460;WS=135323442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	135326732	rs41301501	T	C	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=17;PP=1445;SC=GAGAAAACAATATTCTAGACT;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=135326740;WS=135326722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	135338312	rs5975709	C	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=622;SC=CTCCTCTCGTCGCTCACTCTT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=135338320;WS=135338302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	135732669	.	GAC	G	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.4999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=20;QD=33.0;SC=CAGACACACAGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=1;WE=135732678;WS=135732659;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,1:0.33:3
chrX	135956506	rs77794331	C	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.907;NF=10;NR=25;PP=559;ReadPosRankSum=-1.020;SC=GTAACTGTCTCGACTTCCACC;SOR=1.102;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=35;WE=135956514;WS=135956496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chrX	135956571	.	T	TGG	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.528;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.714;NF=0;NR=7;PP=374;ReadPosRankSum=-1.055;SC=CACCATAAGATGGCGGGGGCC;SOR=3.232;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=7;WE=135956583;WS=135956561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chrX	135956575	rs78646793	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.528;HP=4;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.783;NF=0;NR=7;PP=409;ReadPosRankSum=-0.746;SC=ATAAGATGGCGGGGGCCCTCG;SOR=4.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=7;WE=135956583;WS=135956561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chrX	135961587	rs2011584	G	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=424;SC=CTTCAACCATGTTTTTTTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=20;WE=135961595;WS=135961577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	136113464	rs1190736	C	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=41;PP=1799;SC=ACTGACACCACGACAATGGTG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=85;WE=136113472;WS=136113454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	137749997	rs5976185	A	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=311;SC=TCTGTTGTGAATCTATGTGGG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=137750005;WS=137749987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	138067202	rs34825181	A	G	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=32;PP=1457;SC=TTCCTCCTGAAGAACTCAAAT;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=138067210;WS=138067192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	138067368	rs5974786	G	A	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=732;SC=TAAATGTTTCGCAGATTTACA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=138067376;WS=138067358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	138633280	rs6048	A	G	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=22;PP=1872;SC=CCGTGCTGAGACTGTTTTTCC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=138633288;WS=138633270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	138667452	rs5909018	C	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=272;SC=ATGGATTAACCAATCTAATGT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=138667460;WS=138667442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	138672139	rs41310474	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=AATATGAAATTACATTAAATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=138672147;WS=138672129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	138679712	rs1051619	T	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=11;PP=295;SC=ACAGAGCAGATCCTTCACAGT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=138679720;WS=138679702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	138689704	rs41300934	T	A	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=72;SC=AGGCTATAGGTTGGCCAGGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=138689712;WS=138689694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	138697246	rs2076501	A	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=502;SC=GAAATATTTTATGAAATGAGG;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=138697254;WS=138697236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	138698652	rs68033160	GA	G	222.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=37.13;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	138698665	rs5909056	T	C	231.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.93;QD=38.64;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	138713463	rs56186070	G	GT	1057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=766;SC=GTTTTGTTTTGTTTTTTTCAA;SOR=2.432;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=25;WE=138713471;WS=138713453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	138724725	rs926563	G	A	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=25;PP=810;SC=TCAACGCAACGTTGATGAAAT;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=138724733;WS=138724715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	138727961	rs41310454	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	138774209	rs4824861	C	T	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=44;PP=1368;SC=GTGCAGCCATCTGGGTTCTGG;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=138774217;WS=138774199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	138811003	rs2094702	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=11;PP=542;SC=AGTGTGTTGCGTATCAAGTAT;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=138811011;WS=138810993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	138825675	rs1268015	T	C	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=132;SC=GAAAGTATTATAAAAACAGTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=138825683;WS=138825665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	138880785	.	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=379;SC=ACTATTTATTCACAGCCTTTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=138880793;WS=138880775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chrX	139298295	rs396467	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.52;MQRankSum=-5.085;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,22:0.17:131
chrX	139586572	.	G	C	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=49;PP=2531;SC=TATCTTTCTTGAGCAGCGTCT;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=118;WE=139586580;WS=139586562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
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chrX	140714251	rs2239835	A	G	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=40;PP=1588;SC=AGGTTACCGAAGAAGTAGGAG;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=140714259;WS=140714241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	140714769	rs2239837	A	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.29;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	140714777	rs2239838	G	C	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	140785714	rs5953618	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=-7.235;QD=2.81;ReadPosRankSum=-3.286;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chrX	140785739	rs149295712	A	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-5.795;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.481;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chrX	140785739	.	AAA	CAC	852	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=55.39;NF=14;NR=6;PP=852;QD=45.2733937431;SC=ATGTTCTTTTAAAGTTCCTCC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=20;WE=140785749;WS=140785729;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chrX	140785741	rs144554749	A	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-5.783;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chrX	140785855	rs146412887	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.837;NF=6;NR=14;PP=405;ReadPosRankSum=1.158;SC=TGTTAAGAAAACAGGGAGAGG;SOR=1.041;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=20;WE=140785863;WS=140785845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chrX	140967165	rs11095909	T	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=25;PP=1007;SC=CTACACCCTTTCCCTTCCTGC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=140967173;WS=140967155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	140967195	rs11095910	T	A	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=21;PP=773;SC=TGGAAAAAGGTTGTGGGGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=42;WE=140967203;WS=140967185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	140967295	rs113184895	G	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=249;SC=GGCAGGAAGGGGTGGAAAGGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=140967303;WS=140967285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	140983031	rs176023	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=9;PP=835;SC=AGGAGGCCCCACCCCACGCTG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=140983039;WS=140983021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	140983064	rs176024	G	A	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=25;PP=1472;SC=GCCCTGGTCAGCCTTGGCAGG;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=140983072;WS=140983054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	140983127	rs176026	G	A	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=43;PP=1912;SC=AGGACCTGAAGCATTTTGCGA;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=140983135;WS=140983117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	140993150	rs5953637	T	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=9;PP=487;SC=TCCTCCTGTTTTTCTTTCTCA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=140993158;WS=140993140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	142967468	rs237520	T	G	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=31;PP=1484;SC=AGAATAAGTTTAGATATTTTG;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=142967476;WS=142967458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	144904882	rs2748588	T	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=38;PP=1491;SC=GTCCAACTCCTCGAGTGACTG;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=144904890;WS=144904872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	146312362	rs5905008	A	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=29;PP=1205;SC=TGGTGGTGGCACTGACCATCT;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=146312370;WS=146312352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	146312603	rs144088020	A	AAT	1636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=1184;SC=CACAGCGGAAAATGTCCCTCA;SOR=1.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=146312611;WS=146312593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	146312673	rs5905009	G	C	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=145;SC=GCAGAATATAGTCAATAGATT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=146312691;WS=146312663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	146312683	rs375595449	TA	T	122.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=103;SC=GTCAATAGATTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=146312691;WS=146312663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	146340338	rs36092315	CT	C	1685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=1227;SC=ATGATTGCCACTGTCTGCAGT;SOR=2.147;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=29;WE=146340346;WS=146340328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	147003564	rs1270092	T	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=18;PP=646;SC=GCTAATTCTATTCTTCATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=147003572;WS=147003554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	147014960	rs4824232	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=167;SC=TCTAAAAAGTCCCAAAGCTAG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=147014968;WS=147014950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	147015021	rs4824233	C	T	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=167;SC=TAGTAATTCTCCATTTTGACT;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=147015029;WS=147015011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	147019192	rs25700	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=410;SC=TATTTTGGATGTTTTCTCTGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=147019200;WS=147019182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	147088249	rs764631	C	T	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=32;PP=1971;SC=AATCAGGTGGCAAAGCCTTGT;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=94;WE=147088257;WS=147088239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	147733265	rs5904246	G	GA	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=889;SC=CAAGGGAAGAGATTTTGCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=147733273;WS=147733255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	147891558	rs11117555	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=174;SC=GGAATCCTGATATTCTACTTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=147891566;WS=147891548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	147919063	rs375432534	CAGTTA	C	898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=789;SC=AGTATTAGGTCAGTTAAGTTA;SOR=3.816;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=15;WE=147919075;WS=147919053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	147919376	rs375240169	C	G	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TCTAGACTCTCTTGCCCCTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=147919384;WS=147919366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	148037055	rs16994868	G	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=581;SC=GCTTTTAGTAGTAGTCTCTGT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=148037063;WS=148037045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	148055144	rs5980615	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=724;SC=TCAGGTGAATAGCCTTTCTGC;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=148055152;WS=148055134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	148062377	rs12688573	G	A	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=569;SC=ATAGACCCCAGATATTTTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=148062385;WS=148062367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	148062498	rs5936462	C	G	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=163;SC=AAAAGATGTGCTTCAGAGTTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=148062506;WS=148062488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	148582350	rs139515077	CATT	C	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=275;SC=TCTGTCAAAACATTATCACAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=148582360;WS=148582341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	148582549	rs1141608	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=31;PP=1596;SC=GAGAATCATCGGTATGGTTAG;SOR=0.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=148582557;WS=148582539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	148619841	.	CAG	C	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=40.01;NF=0;NR=2;PP=71;SC=GCGGCAGCCACAGAGTCTTAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=148619850;WS=148619831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	148622730	rs3747443	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=7;PP=400;SC=GTCTCGGGGAGGCAGAGGACT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=148622738;WS=148622720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	148622745	rs3747442	T	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=400;SC=AGGACTGTTCTTTCCTGTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=148622753;WS=148622735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	148627384	rs145921071	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.91;QD=32.66;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	148628490	.	A	T	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.87;QD=25.53;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	148713418	.	T	TCGCCGC	627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=11;PP=659;SC=GCCGTCGCCGTCGCCGCCGCC;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=148713426;WS=148713408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	148794953	rs1970766	G	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=27;PP=822;SC=TCCAAGGCACGGTGGCCACAT;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=148794961;WS=148794943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	148797348	rs2233048	C	T	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=39;PP=1754;SC=GTAAGTAGGCCTTTGTTAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=90;WE=148797356;WS=148797338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	148798223	rs2233050	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=9;PP=437;SC=AGAGGCTCCTTACCCAAAATT;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=148798231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	149013727	rs5983916	A	G	4644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=76;PP=2851;SC=TCTGGGAAGCATTGAGTGTGA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=146;WE=149013735;WS=149013717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chrX	149114389	.	G	A	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=29.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	149613617	rs6526057	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=325;SC=AGGAATGTGGTTGACTCCACA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=149613625;WS=149613607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	149680221	rs659188	G	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=406;SC=GGCCACAGCCGAAGTCGAGGA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=149680229;WS=149680211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	149680554	rs2070779	C	T	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=33;PP=1428;SC=ATATGCAGAGCCCCAAGGCCA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=149680562;WS=149680544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	149862214	rs222346	A	C	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	149887056	rs526164	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=289;SC=GTTTGGTGTCCTTTTTTTTTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=149887064;WS=149887046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	149931106	rs16995747	C	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=34;PP=1030;SC=GTGTGGAGGGCCTACAGCGGG;SOR=1.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=149931114;WS=149931096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	150348228	rs1202874	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=366;SC=CTCCCTCCCTCGATATGTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=150348236;WS=150348218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	150349871	rs13440581	A	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=54;PP=1785;SC=TGTCGTGGTTATTGATGTTGA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=89;WE=150349879;WS=150349861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	150565330	rs176451	G	C	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=58;PP=2119;SC=GTCTCCTTGCGGCCCCCAGCT;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=125;WE=150565338;WS=150565320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chrX	150565560	rs176452	G	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=133;SC=CCCCCGCGCCGGCAACAGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=150565568;WS=150565550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	150789334	rs5904324	T	TA	859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=587;SC=TTAACACAGATAAAAAAGTTT;SOR=1.863;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=16;WE=150789342;WS=150789324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	150789950	rs945815	C	T	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=192;SC=TCTCTTTTTACTAGAAACACA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=150789958;WS=150789940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	150791503	rs5924977	A	G	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.84;ReadPosRankSum=1.893;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chrX	150791512	rs5924978	C	T	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	150794129	rs142544047	A	AC	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=228;SC=AAAAAGAAACAAACGGGCCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=150794137;WS=150794119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	150817094	rs5924658	C	G	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=39;PP=1689;SC=TAGTAGCTCTCAAGGTCAAAG;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=86;WE=150817102;WS=150817084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	150840597	rs7886849	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=79;SC=TGTTAAATAAGTTTCTGGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=150840605;WS=150840587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	150840916	rs41299110	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=19;PP=1026;SC=GAAGCAGCAGCTGCAAGAGCA;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=49;WE=150840924;WS=150840906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	150868761	rs41301309	C	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=21;PP=579;SC=AGGGCCATCACGGAGCAGATA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=150868769;WS=150868751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	150868861	rs41302168	C	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=5;PP=476;SC=TGCTGCCTCTCTGGTAACTCT;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=150868869;WS=150868851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	150869267	rs4323608	A	G	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=48;PP=1607;SC=GAGGCAGCGAACAGCCCCCAG;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=78;WE=150869275;WS=150869257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	150873651	rs3761541	G	T	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=112;SC=ACTCTACTCCGTTATTTATCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=150873659;WS=150873641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	150911512	.	GT	AC	269	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=269;QD=46.066839266;SC=ACATATATATGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=150911521;WS=150911502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,7:0.78:9
chrX	151080854	rs2245422	C	T	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=282;SC=CAGGACCTCTCGCCTCCTCCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=151080862;WS=151080848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	151138179	rs1139916	A	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=18;PP=557;SC=CTGTTGACGGAGATCTCAACA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=151138187;WS=151138169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	151303393	rs210586	C	T	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=31;PP=1547;SC=TCTATGAAGACTATGCTTAGG;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=73;WE=151303401;WS=151303383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	151303596	rs210585	C	T	6048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=94;PP=2965;SC=TTCATAATTTCTTATGACACT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=92;TCR=94;TR=186;WE=151303604;WS=151303586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chrX	151821277	rs3810651	T	A	4234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=76;PP=2610;SC=TGACAGTATTTTTCCTACCGA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=126;WE=151821285;WS=151821267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chrX	151899760	rs2515830	A	G	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=944;SC=TGGGCCTCATATCACACGAGG;SOR=4.351;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=151899768;WS=151899750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	151909156	rs2515848	A	G	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=59.89;NF=37;NR=47;PP=1519;SC=AGACAACCCAAAAGGGAAAAG;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=151909164;WS=151909146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	152018832	rs5969919	T	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=10;PP=507;SC=CAGTGATCGGTGGCTCTGGAT;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=152018840;WS=152018822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	152082946	.	A	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=1029;SC=GCAAGACACTACAAATGCATG;SOR=1.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=152082954;WS=152082936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	152089039	rs2071258	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=13;PP=435;SC=ATGAAAGGGTGGGTGGAGAGA;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=152089047;WS=152089029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	152090551	rs2071259	T	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=16;PP=1099;SC=CAGTATGCTGTCCTTATCCTG;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=152090559;WS=152090541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	152090809	rs12558188	T	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=886;SC=AGGTAATCCATTGCGCTCATC;SOR=2.531;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=152090817;WS=152090799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	152091153	rs2071261	A	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=12;PP=672;SC=TGGCAGTAGCATGCCATTGTC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=152091161;WS=152091143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	152106850	rs5969927	A	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=355;SC=AGAAGCCCCAACCAGAACCCT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=152106858;WS=152106840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	152158979	rs56350208	T	C	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=52;PP=1693;SC=GTTTCACTAATGGGGGTAAGC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=152158987;WS=152158969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chrX	152225379	rs73244173	C	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=131;SC=CCTGATCACTCCCCCCAAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=152225387;WS=152225375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	152226542	rs6526155	T	C	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=28;PP=1183;SC=AGTTTTGATGTGAGGCCTTCC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=152226550;WS=152226532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	152727446	rs3020966	T	A	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=247;SC=GAAAACCAGCTGTAGCCCAAC;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=152727454;WS=152727436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	152727535	rs138590468	TA	T	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=328;SC=TCTTCAGATATAAAAAAAAGA;SOR=0.776;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=14;WE=152727543;WS=152727525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	152728155	rs2980032	T	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=42;PP=1359;SC=GAGCCCATCATGGCAGGCACC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=152728163;WS=152728145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chrX	152736686	rs2980037	C	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=216;SC=CCTCTTTGCCCTCACCTAATG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=152736694;WS=152736676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	152770402	rs2980053	A	G	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=37;PP=1066;SC=TCTGAAGGGGACACATGCTGG;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=152770410;WS=152770392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	152771214	rs11363938	GA	G	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=35;SC=AGCATGGACTGAACCTCCTCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=152771222;WS=152771208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	152771509	rs1126499	C	T	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=45;PP=1388;SC=GAGTGTTCAGCGGGCTCCGGA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=152771517;WS=152771499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	152773615	rs5945215	G	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=7;PP=647;SC=TTGAAGTAGGGTGCAGAGGCA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=152773623;WS=152773605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	152807425	rs762733	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=466;SC=AAGGAAGCTCGGCTCCTGCTT;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=152807433;WS=152807415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	152807665	rs2980012	A	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=694;SC=GTTCCCCAGAAGGAGGAGGGC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=152807673;WS=152807655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	152807923	rs2980013	G	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=82;PP=2128;SC=GCCACCCTCCGGGCCAGCCTG;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=115;WE=152807931;WS=152807913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chrX	152814373	rs2285034	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=262;SC=TAAGAAGTCATTGGGCGCCTT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=152814381;WS=152814363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	152815089	rs3020949	A	G	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=71;NR=53;PP=2287;SC=CCTACCTAGGAGACACCCACT;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=152815097;WS=152815079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chrX	152821887	rs3020957	C	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=194;SC=GTAGCCGAGCCCCCACACCCC;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=152821895;WS=152821877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	152825414	rs3020959	G	T	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=43;PP=1259;SC=GGCTGGCCAGGGGCACCCGGG;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=152825422;WS=152825404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	152825433	rs2980018	A	G	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=940;SC=GGAGGACTTCAGGACACTGTT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=152825441;WS=152825423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	152830322	rs4243536	A	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=11;PP=741;SC=GGGACCTTACACCAGGCAGAT;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=152830330;WS=152830312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	152834770	rs139078412	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=29;PP=948;SC=CTTGCAAGGGGCATTTCTGAC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=152834778;WS=152834760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	152864477	rs199537978	G	GC	197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=108;SC=GGCGCCGGCTGCCCTCCGGGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=152864485;WS=152864467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	152864513	rs200645137	G	GC	317.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=238;SC=CCCCTCCGCCGCCTCCGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=152864521;WS=152864503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	152864609	rs201833882	G	GC	124	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=111;SC=CGCGGCGGGCGTGCCGCCCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=152864617;WS=152864599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	152909047	rs72616448	G	C	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=28;PP=630;SC=GAGAGAGCCCGGCGCTGAAAT;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=152909055;WS=152909037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	152938409	rs10542443	TAC	T	1004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=2;NR=16;PP=945;SC=CTCACACAGGTACACACACAC;SOR=0.756;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=18;WE=152938422;WS=152938399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	152954025	rs384573	A	G	218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=2;PP=122;SC=CGGCCCGCCGAGGCCATGGCG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=152954033;WS=152954015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	152969531	.	C	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=436;SC=AAATGAGAGTCACCAGGCGTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=152969539;WS=152969521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	153035798	rs2266879	G	A	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=50;PP=1612;SC=CCCAGACCACGTCACTGTGCC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=153035806;WS=153035788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	153037275	rs6643644	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=2;PP=179;SC=CAGAGTGGAGCGTGGGTGCGG;SOR=1.371;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=153037283;WS=153037265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	153037594	rs11156607	C	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=24;PP=1588;SC=GCTGTCCCCTCCGTCCCTGAG;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=68;WE=153037602;WS=153037584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	153037808	rs2266882	G	A	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=52;PP=1578;SC=AAGGACAGGCGCCTAGTAAGG;SOR=1.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=79;WE=153037816;WS=153037798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	153037999	rs2266883	G	C	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=160;SC=GAGCAGTGAGGGCAGGGGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=153038007;WS=153037989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	153038516	rs5945161	C	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=486;SC=CACTCCCATACGCCTCAGTGG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=153038524;WS=153038506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	153038661	rs2266885	G	C	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=23;NR=14;PP=756;SC=GCCGAGATGAGAGACCCCACT;SOR=1.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=153038669;WS=153038651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	153039502	rs6643791	G	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=43;PP=1410;SC=TCAGCCGCGAGGGGCCTGCCC;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=153039510;WS=153039492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	153039615	rs1543781	A	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=37;PP=1267;SC=GGGGGCCAGCAGCTTAGGCTC;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=153039623;WS=153039605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	153041544	rs5987155	T	C	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=795;SC=AGCAGCGAGATGCAGCGCGTG;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=153041552;WS=153041534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	153042419	rs34966902	G	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=17;PP=743;SC=TGGCCCAGAGGTGCCCCTTGG;SOR=1.040;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=153042427;WS=153042409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153047809	rs1981439	A	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=224;SC=CCCCGCCCCCAGGTAACTGTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=153047817;WS=153047799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	153048647	rs201302475	GT	G	127.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=3.680;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=39;ReadPosRankSum=1.068;SC=GTTCCTCCCTGTCCCCCCCCA;SOR=0.636;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=153048656;WS=153048637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chrX	153048656	rs201877372	CA	C	127.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.981;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chrX	153052661	rs2269482	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=355;SC=ACAGTCAGCCAGAGGGACGGG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=153052669;WS=153052651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	153073752	rs3761532	T	C	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=23;PP=1248;SC=AGGTGGCCTGTCCTCTCTGGA;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=153073760;WS=153073742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	153149118	rs5945167	A	G	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=141;SC=CTGAACCACGAGGGAGGGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=153149126;WS=153149114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	153149708	rs77883713	G	GC	2239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=1462;SC=ACTGCCCATCGTGGGATCCTG;SOR=1.244;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=32;WE=153149723;WS=153149698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	153149715	rs6643650	C	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=951;SC=ATCGTGGGATCCTGAGCGCCT;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=153149723;WS=153149698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	153151277	rs56026845	C	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	153151280	rs143464562	G	GCC	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.39;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	153151284	rs199975679	GT	G	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	153151423	rs58566947	G	GCGGC	444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=357;SC=ACCGGGCCGGGACTCCCTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=153151431;WS=153151413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153151456	rs12837217	T	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.25;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	153151461	rs12837218	T	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153151467	rs199929222	CG	C	288.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=155;SC=GTGGTGTCGCCGGGGGATCGC;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=153151475;WS=153151446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153151491	rs36095229	GT	G	285.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=221;SC=CGCGGCCCGGGTCGCACGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=153151499;WS=153151481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	153170447	rs55712963	G	GC	238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=192;SC=TACTGCCACCGACACGTGCAC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=153170455;WS=153170437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	153170980	rs56689668	T	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=489;SC=CCCGACTCCTTCCCAGCTGTG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=153170988;WS=153170970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	153174819	rs11394527	T	TG	3249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=37;PP=2407;SC=CCACTCCCACTGGCCAAAGCC;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=153174827;WS=153174809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	153174867	rs11405331	T	TG	3417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=46;PP=2610;SC=AGCACACGTGTGGCCCCCTGA;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=60;WE=153174875;WS=153174857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	153175053	rs56015121	G	GC	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=609;SC=AGGGCCAGCAGCTCCGCGCCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=153175061;WS=153175043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	153178459	rs5904376	G	GC	1068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=15;PP=827;SC=CAGGGCCCCAGCCCTCAGGGA;SOR=0.818;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=21;WE=153178467;WS=153178449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	153186412	rs34153599	A	AG	916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=13;PP=803;SC=CTAGGGAGAGAGGCCTTTGCC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=19;WE=153186420;WS=153186401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	153186484	rs11428457	T	TC	1697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=17;PP=1197;SC=GCGGTGTTCCTCCCCACTGTG;SOR=1.077;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=29;WE=153186492;WS=153186474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	153208197	rs11372702	T	TG	163.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=194;SC=CTTCCCCAGGTGGGACATCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=153208205;WS=153208196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	153210179	rs146096296	T	TG	157.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.30;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	153215839	rs3027875	G	A	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=33;PP=1249;SC=GGCTGGGCCCGCAGTACACCC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=153215847;WS=153215829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	153277889	rs2239673	C	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=159;SC=GGCTGCCCCACGCCCTCAGCG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=153277897;WS=153277887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	153278829	rs1059703	G	A	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=17;PP=853;SC=GGCGGCCTCCGAATGCCCGGG;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=153278837;WS=153278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	153279858	rs5945174	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=ATGGGGTCTCGCTTTGTTGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=153279866;WS=153279848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	153284192	rs1059702	A	G	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=53;PP=1573;SC=GCAAAACGGAAAGGGGCGGGC;SOR=2.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=69;WE=153284200;WS=153284182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	153284483	rs1059701	G	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=14;PP=686;SC=CAGGGCTTGGGACCAGGCCGA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=153284491;WS=153284473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153416487	rs146138552	C	G	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=155;SC=CTCCTCCAGCCACCTCATGAT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=153416495;WS=153416477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	153420176	rs78093925	A	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=53;PP=1759;SC=CGCTATCATCATGCTCTGCTA;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=97;WE=153420184;WS=153420166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	153421912	rs1065439	T	C	4449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=72;PP=2584;SC=CCAACCCTGGTTACGCCTTCC;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=131;WE=153421920;WS=153421902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chrX	153577719	rs7063300	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=14;PP=652;SC=CCGGGGGCCCGGGTTGCCCAC;SOR=1.206;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=153577727;WS=153577709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	153629155	rs12012747	A	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.72;QD=29.44;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	153633359	rs1130929	G	C	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=58;PP=1916;SC=GAAGCAGGAGGGGGATGGCGC;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=104;WE=153633367;WS=153633349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chrX	153633953	rs1050094	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=286;SC=TCCAGGCTGCTCCAGGGTGCG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=153633961;WS=153633943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	153637305	rs2070807	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=2;PP=455;SC=CCAGAGAGAGTGACGGTTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=153637313;WS=153637295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	153640406	rs62617809	C	T	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=56;PP=2241;SC=AGCGCCTGACCTCTCCTTCCC;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=114;WE=153640414;WS=153640396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	153657083	rs28497482	A	G	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=25;PP=821;SC=TGGGGCCGCGATGCGCCCAGG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=153657091;WS=153657073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	153660041	rs11156577	C	T	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=98;SC=CACACAGTTGCGCTCCACCAT;SOR=3.056;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=153660049;WS=153660038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	153668172	rs68141802	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=12;PP=580;SC=AAAAAGGGTGAAGAGGTTAAC;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=153668180;WS=153668162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	153668232	rs186878348	G	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=17;PP=971;SC=TGCCCTGCTGGGATGGAGAGT;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=153668240;WS=153668222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	153706549	rs41299136	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=235;SC=TGGCGCTCCTTAGGGCTCATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=153706557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	153714251	rs149580851	C	T	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=49;PP=1848;SC=GCACCTTCTCCAGGGGTTTGA;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=153714259;WS=153714241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	153736694	.	T	G	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=16;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=26;QD=15.1928031368;SC=TGGGGGGGGGTGGGGGGGACG;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=4;WE=153736702;WS=153736674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chrX	153994596	rs2728532	G	T	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=19;PP=697;SC=ACAGTGGTACGCTGGATCCCA;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=153994604;WS=153994586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	154013483	rs3215184	A	AC	269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=7;PP=183;SC=CTCCCCTCATACCCCCCCCAG;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=154013491;WS=154013473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	154020114	rs1126762	C	A	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=46;PP=1760;SC=TCAGCTTCAGCGTGATTCCCT;SOR=0.839;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=154020122;WS=154020104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	154051891	rs6643620	G	A	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=6;PP=892;SC=AGAAAATGAAGGCAAAGGATG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=154051899;WS=154051881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	154456747	rs572013	A	G	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.34;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	154774663	rs2305517	G	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=249;SC=TTCTTACCACGATTTTATCAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=154774671;WS=154774653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	154774707	rs2305518	C	T	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=426;SC=CCAAAGCAAACATTTCTTACC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=154774715;WS=154774697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrY	14898094	rs13305774	A	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=401;SC=TTAATAACACATGAGTTACAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=14898102;WS=14898084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrY	14898435	.	C	CT	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=62.99;NF=2;NR=1;PP=45;QD=16.0;SC=ATATACTCTCCTTTTTTTTTT;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=3;WE=14898443;WS=14898425;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chrY	14958218	rs13304344	C	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=76;SC=ACCCTCTTAGCTTTTTTTTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=14958226;WS=14958208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	15026424	rs2032624	A	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=221;SC=CATTTAGAACACTTTGTCATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=15026432;WS=15026414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrY	15027529	rs2032636	T	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=8;PP=939;SC=TCAACTGAGGTTTTTCGTAAT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=15027537;WS=15027519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrY	21154323	rs10465459	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-0.259;SC=AGATGGGGAAGTTTAGAAGAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=21154331;WS=21154313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chrY	21154426	rs52812045	G	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chrY	21154466	rs10465460	T	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GCCAACCCAGTGTTGGAAGTA;SOR=0.986;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=21;WE=21154474;WS=21154456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67